diff --git a/MANIFEST.in b/MANIFEST.in index 259e876b..37541aff 100644 --- a/MANIFEST.in +++ b/MANIFEST.in @@ -1,5 +1,6 @@ recursive-include src/QligFEP/FF * recursive-include src/QligFEP/INPUTS * recursive-include src/QligFEP/resources * -recursive-include src/q6/ *.f90 -recursive-include src/q6/ makefile +recursive-include src/q6 *.f90 *.F90 +include src/q6/makefile +include src/q6/bin/q6/* diff --git a/README.md b/README.md index e95f051c..e245989c 100644 --- a/README.md +++ b/README.md @@ -1,156 +1,184 @@ # QligFEP +**Q** is a set of Molecular Dynamics (MD) tools tailored to the following specific kinds of free energy calculations: + +1. Free Energy Perturbation (FEP) +2. Empirical Valence Bond (EVB) +3. Linear Interaction Energies (LIE) + +This repository is devoted to **QligFEP**, an automated workflow for small molecule free energy calculations in Q. + +## Table of Contents + +- [⚙️ Installation](#️-installation) + - [Linux](#linux) + - [MacOS](#macos) + - [Compiling Q for HPC (MPI support)](#compiling-q-for-hpc-mpi-support) + - [Compiling Q for local use (non-MPI)](#compiling-q-for-local-use-non-mpi) + - [Setting up HPC configurations](#setting-up-hpc-configurations) +- [⌨️ Command line interface (CLI)](#️-command-line-interface-cli) +- [📊 Benchmarking](#-benchmarking) +- [📚 Citations](#-citations) +- [⏩ Q-GPU](#-q-gpu) + - [Note to the current version](#note-to-the-current-version) + - [Testing](#testing) + ## ⚙️ Installation -The current conda environment is available in the `environment.yml` file, but installing it with `conda env create -f environment.yml` will take a long time. Instead, we recommend that you use `mamba` or its lightweight version `micromamba`. Please check this Gist on how to [install micromamba](https://gist.github.com/David-Araripe/3ecd90bfbfd1c8e813812a203384b3c0). +We recommend that you use `mamba` or, preferably, its lightweight version `micromamba`. Please check this link on how to [install it](https://mamba.readthedocs.io/en/latest/installation/micromamba-installation.html). Once you have `micromamba` installed and have already cloned this repo, you can create the environment with: -### 🐧 Linux +### Linux ```bash micromamba create -n qligfep_new python=3.11 -``` -Now, activate the environment and update the following conda packages: -```bash micromamba activate qligfep_new -micromamba install openff-toolkit=0.16.4 "openff-utilities>=0.1.12" openff-forcefields=2024.09.0 openmm=8.1.1 "openff-nagl>=0.3.8" lomap2 kartograf michellab::fkcombu -c conda-forge --yes +micromamba install gfortran=11.3.0 openff-toolkit=0.16.4 "openff-utilities>=0.1.12" openff-forcefields=2024.09.0 openmm=8.1.1 "openff-nagl>=0.3.8" lomap2 kartograf michellab::fkcombu -c conda-forge --yes ``` -Now that you have the environment ready and activated, install qligfep through the command: +Now that you have the environment ready and activated, [clone the repository](https://docs.github.com/en/repositories/creating-and-managing-repositories/cloning-a-repository), enter the `Q` directory with `cd Q/`, and install qligfep: ```bash python -m pip install -e . ``` +The `qprep` Fortran binary will be automatically compiled during installation. +
-In one line... +To install everything in one line... ```bash -micromamba create -n qligfep_new python=3.11 -c conda-forge -y && micromamba activate qligfep_new && micromamba install openff-toolkit=0.16.4 "openff-utilities>=0.1.12" openff-forcefields=2024.09.0 openmm=8.1.1 "openff-nagl>=0.3.8" lomap2 kartograf michellab::fkcombu -c conda-forge --yes && python -m pip install -e . +micromamba create -n qligfep_new python=3.11 gfortran=11.3.0 openff-toolkit=0.16.4 "openff-utilities>=0.1.12" openff-forcefields=2024.09.0 openmm=8.1.1 "openff-nagl>=0.3.8" lomap2 kartograf michellab::fkcombu -c conda-forge --yes && micromamba activate qligfep_new && python -m pip install -e . ```
-### 🍎 MacOS +### MacOS -The environment provided doesn't build on Mac due to missing libraries. If you're using this operating system, you'll have to create the environment by scratch through the commands: +Similar to Linux, [clone the repository](https://docs.github.com/en/repositories/creating-and-managing-repositories/cloning-a-repository), enter the `Q` directory with `cd Q/`, create the environment and install: ``` bash -micromamba create -n qligfep_new python=3.11 openff-toolkit=0.16.4 "openff-utilities>=0.1.12" openff-forcefields=2024.09.0 openmm=8.1.1 lomap2 kartograf michellab::fkcombu -c conda-forge --yes +micromamba create -n qligfep_new python=3.11 gfortran=11.3.0 openff-toolkit=0.16.4 "openff-utilities>=0.1.12" openff-forcefields=2024.09.0 openmm=8.1.1 "openff-nagl>=0.3.8" lomap2 kartograf davidararipe::kcombu_bss -c conda-forge --yes micromamba activate qligfep_new python -m pip install joblib scipy tqdm python -m pip install -e . ``` -### 🛠️ Compiling Q +The `qprep` Fortran binary will be automatically compiled during installation. -To compile the Q binaries, you will need to have the `gfortran` compiler installed. To access this compiler on different HPCs, you can use the `module load` command. Check [here](/src/QligFEP/settings/settings.py) for a list of the different HPCs we have already ran RBFE simulations on. +
+To install everything in one line... -E.g.: To compile Q on Snellius, you will have to run the following commands: -```bash -module load 2021 -module load gompi/2021a -``` -Finally, compiling Q can be done with the following commands: ```bash -make all COMP=gcc && make mpi COMP=gcc +micromamba create -n qligfep_new python=3.11 gfortran=11.3.0 openff-toolkit=0.16.4 "openff-utilities>=0.1.12" openff-forcefields=2024.09.0 openmm=8.1.1 lomap2 kartograf davidararipe::kcombu_bss -c conda-forge --yes && micromamba activate qligfep_new && python -m pip install joblib scipy tqdm && python -m pip install -e . ``` +
-## ⌨️ Command line interface (CLI) +### Compiling Q for HPC (MPI support) -Now you're set with the qligfep package. This includes the command-linde-interfaces (CLIs): +> [!IMPORTANT] +> The current Q implementation relies on `slurm` for job management and submission. The basic `qprep` tool for topology creation is automatically compiled during pip installation and is sufficient for preparing inputs. When submitting jobs, QligFEP uses the MPI-enabled `qdynp` program (_p for parallel_) to run the molecular dynamics simulations. To actually run these simulations, you need to compile Q as described below: -1. `qparams`: used to generate ligand parameters; -1. `pdb2amber`: formats a PDB file to be used with Q's implementation of the AMBER forcefield; -1. `qlomap`: wraps `Lomap` to generate the `.json` perturbation mapping; -1. `qmapfep`: in-house developed method to generate the `.json` perturbation mapping, interactively visualize and add or remove edges. -1. `qligfep`: main CLI for running QligFEP simulations. -1. `setupFEP`: sets up all the the QligFEP files for a simulation, including protein and water systems. -1. `qligfep_analyze`: CLI to analyze the results of a QligFEP simulation. -1. `qcog`: calculates the center of geometry (COG) of a ligand in a PDB/SDF file. If multiple ligands are found in sdf, the program will calculate the COG for all of them -1. `qprep_prot`: creates an input file for qprep (fortran program) and runs it to either: 1) solvate the protein structure; 2) create the water sphere. +On your HPC system, load the appropriate modules (system-dependent). We recommend using the GCC compiler suite and OpenMPI, as those are commonly available and compatible with `qdynp`. To check for module availability, use the command `module spider openmpi` or `module avail openmpi`. -# Q-GPU # -Version control of **Q-GPU**, an adaptation of **Q** version 5.06 running on GPUs. +In the output, look for a version compiled with GCC (e.g., `OpenMPI/4.1.4-GCC-11.3.0`) and load it using the `module load` command. After loading the module, navigate to the `src/q6` folder in the Q repository and compile both the serial and MPI versions of Q with the commands `make all` and `make mpi`. In the example, we show how to do this on the Snellius, the Dutch national supercomputer: -**Q** is a set of Molecular Dynamics (MD) tools tailored to the following specific kinds of free energy calculations: +```bash +module load 2021 +module load gompi/2021a +``` -1. Free Energy Perturbation (FEP) -2. Empirical Valence Bond (EVB) -3. Linear Interaction Energies (LIE) +Then compile the serial and the MPI-enabled versions of Q: +```bash +cd src/q6 +make all COMP=gcc +make mpi COMP=gcc +``` -This version includes a translation of the original **Q** fortran code to C/CUDA and Python. +> [!TIP] +> Module names and versions are system-dependent. When in doubt, reach out to your system administrator. In general, we recommend finding an OpenMPI module compiled with GCC version 11.3.0. Users can also refer to the `settings.py` file in this repository, which outlines the modules we used on other HPC systems, as [described below](#setting-up-hpc-configurations). +### Compiling Q for local use (non-MPI) -## Authors ## -Chiel Jespers, Willem Jespers, Mauricio Esguerra, Johan Åqvist, Hugo Gutiérrez‐de‐Terán +For your convenience, our base environment installation includes `gfortran=11.3.0`, which enables you to compile Q locally without MPI support. This is useful for testing purposes. To compile it, navigate to the `src/q6` folder in the Q repository and run: +```bash +cd src/q6 +make all COMP=gcc +``` +## Setting up HPC configurations + +Currently, we require job configurations to be set in the `settings.py` file located in `src/QligFEP/settings/`. Check [here](/src/QligFEP/settings/settings.py) for a list of different HPCs we have successfully ran RBFE simulations on. To add your own HPC system, please follow the format used in the file. In the example, we show how to add a custom HPC configuration named `MY_HPC`: + +```python +MY_HPC = { + "NODES": "1", # We recommend not to change this + "NTASKS": "8", # Number tasks (processes). Check the preprint for guidance on this value + "TIME": "0-06:00:00", # time for job execution; formatted as d-hh:mm:ss + "MODULES": nljoin( + [ + "module purge", # Clear all loaded modules + "module load OpenMPI/4.1.4-GCC-11.3.0", # Load the MPI module used for compiling Q + ] + ), + **Q_PATHS, # Keep this line as is; it passes the paths to Q executables +} + +CLUSTER_DICT = { + "CSB": CSB, + # ... + "MY_HPC": MY_HPC, # Make sure to add your HPC configuration here to use it on the CLI +} +``` -## Installation ## -The frontend is built on Python and will run in versions > 3.6. It mainly uses native python libraries and only needs numpy as additional package with no further dependencies. +When using the created configuration, make sure to pass the cluster name (e.g., `MY_HPC`) to the `qligfep` or to the `setupFEP` CLI using the `--cluster` argument. -To compile the qdyn engine source code, you need a CUDA compiler. The code has been tested with the following versions: +## ⌨️ Command line interface (CLI) -- CUDA/10.1.243 +Now you're set with the qligfep package. This includes the command-linde-interfaces (CLIs): -To succesfully install and compile the code (Fortran): +1. `qcog`: calculates the center of geometry (COG) of a ligand in a PDB/SDF file. If multiple ligands are found in sdf, the program will calculate the COG for all of them +2. `pdb2amber`: formats a PDB file to be used with Q's implementation of the AMBER forcefield; +3. `qprep_prot`: creates an input file for qprep (fortran program) and runs it to either: 1) solvate the protein structure; 2) create the water sphere. +4. `qparams`: used to generate ligand parameters; +5. `qlomap`: wraps `Lomap` to generate the `.json` perturbation mapping; +6. `qmapfep`: in-house developed method to generate the `.json` perturbation mapping, interactively visualize and add or remove edges. +7. `qligfep`: main CLI for running QligFEP simulations. +8. `setupFEP`: sets up all the the QligFEP files for a simulation, including protein and water systems. +9. `qligfep_analyze`: CLI to analyze the results of a QligFEP simulation. +10. `ligalign`: aligns a set of ligands to a reference ligand based on their maximum common substructure (MCS). -```bash -unset SSH_ASKPASS -mkdir ~/software -cd ~/software -git clone https://yourgitusernamehere@github.com/qusers/qgpu.git -cd Q -git checkout refactor/qligfep-david -cd src/q6 -make -``` +## Tutorials -After this, also install the python package. You should be able to do it through: -```bash -cd Q -conda env create -f environment.yml -conda activate qligfep_new -# make sure you have the correct environment installed -python -m pip install -e . -``` +We are working on the documentation and tutorials for QligFEP. In the meantime, please refer to the Tyk2 case study available in the [tutorials directory](/tutorials/Tyk2/README.md). In addition to that, you can check the [benchmarking section](#-benchmarking) below, which contains the link to our benchmarking repository with scripts to reproduce the results. -After succesful compilation of **Q-GPU** you have to add the program to your system path by modifying your shell initiation script. -If your shell is bash, you can add the following lines to your .bashrc file using a text editor. The following assumes that your user name is "johndoe" and the home directory is "/Users/johndoe/": +# 📊 Benchmarking -```bash -SOFT=/Users/johndoe/software -export QDIR=$SOFT/qgpu -export PATH=$QDIR/bin:$QDIR/src:$PATH -``` -Where $SOFT will be the place where your software folder is located at, e.g. /Users/johndoe/software +To check and reproduce QligFEP performance results, please refer to our [benchmarking repository](https://github.com/qusers/qligfepv2-BenchmarkExperiments). -Once the q binaries are declared in your path you should be able to call all q binaries from your terminal. -To test that the path to your compiled **Q** binaries has been correctly assigned you can issue the following commands in the terminal: +For the preprint describing the benchmarking results, see: -```bash -source ~/.bashrc -env | grep qgpu +> Alencar Araripe D, Díaz Holguín A, Poso A, van Westen GJP, Åqvist J, Gutiérrez-de-Terán H, et al. Doing More with Less: Accurate and Scalable Ligand Free Energy Calculations by Focusing on the Binding Site. ChemRxiv. 2025; [doi:10.26434/chemrxiv-2025-x3r3z](https://doi.org/10.26434/chemrxiv-2025-x3r3z-v3) -QDIR=/Users/johndoe/software/qgpu -``` +# 📚 Citations +Q6: https://doi.org/10.1016/j.softx.2017.12.001 -Additiontally you can search for the main **Q-GPU** binary file with: +Q https://doi.org/10.1016/S1093-3263(98)80006-5 -```bash -which qdyn -``` +QligFEP: https://doi.org/10.1186/s13321-019-0348-5 + +QresFEP: https://doi.org/10.1021/acs.jctc.9b00538 +# ⏩ Q-GPU -## NOTE to the current version ## -The Qprep tool from **Q** is needed for the preparation of molecular topology files required by the MD engine Qdyn. Currently, Qprep is provided as fortran code, which compiles on CPUs. The workflow for a **Q-GPU** free energy simulation consists then in: +**Q-GPU** is an adaptation of **Q** version 5.06 to run on GPUs. + +## Note to the current version +The Qprep tool from **Q** is needed for the preparation of molecular topology files required by the MD engine Qdyn. Currently, Qprep is provided as fortran code, which is compiled upon installation. The workflow for a **Q-GPU** free energy simulation consists then in: - An initial topology preparation stage that runs on a regular CPU - MD sampling using Qdyn, which runs on a CUDA-based GPU - The FEP analysis tool (qfep) provided in python (running both in GPU or CPU) - -## Troubleshooting ## -If you receive error messages during compilation please report them to the program authors including the compiler used (e.g. CUDA), the compiler version (e.e. 10.1.243), and the error message. - +> ⚠️ Integration with the QligFEP workflow is currently under active development and not yet available. For now, we only provide instructions to run our test cases. A publication describing Q-GPU and its performance is in preparation. Please refrain from using this version until the publication is out. ## Testing ## **Q-GPU** includes various tests that compare the output of the original fortran code with the C/CUDA code. They are situated in the test folder and include: @@ -158,26 +186,37 @@ If you receive error messages during compilation please report them to the progr 1. interactions 2. physical-properties -The first folder includes test cases for the different type of interactions in **Q**, that is water-water (w-w), solute-solute (p-p) and Qatom-Qatom (q-q) interactions, and any mixture thereof. -These tests run a single point energy calculation and are compared with the output from Q5.07. The tests can be run separately following the instructions in each folder, or all at once using the run_test.py script (TODO!). +The first folder includes test cases for the different type of interactions in **Q**, that is water-water (w-w), solute-solute (p-p) and Qatom-Qatom (q-q) interactions, and any mixture thereof. These tests run a single point energy calculation and are compared with the output from Q5.07. -In the second folder, we provide test cases for the calculation of solvation free energies of side-chain mimics, and several protein-ligand binding cases (CDk2 and A2aAR, TODO!). The details for such calculations are described in our QligFEP paper: +To compile the code and run the tests, you must checkout the GPU feature branch and build the components individually in their respective folders. -- Jespers et al. (). +**Prerequisites:** +* Installation of QligFEP environment as described above. +* A CUDA compiler (Tested on CUDA/10.1.243) -## Benchmarking ## +**Steps:** -We have included a benchmark set of water spheres of sizes 10-30A (in increments of 5). Table generated with https://www.tablesgenerator.com/markdown_tables +1. **Checkout the feature branch:** + ```bash + git checkout feature/qgpu + ``` -| sphere | cpu Intel(R) Xeon(R) CPU E5-2650 v4 @ 2.20GHz Time in seconds | gpu NVIDIA GeForce GTX 1080 Time in seconds | -|--------|:-------------------------------------------------------------:|:--------------------------------------------:| -| 10A | 6.838 | 1.988 | -| 15A | 60.698 | 4.882 | -| 20A | 368.657 | 19.233 | -| 25A | 1257.150 | 59.948 | -| 30A | 4060.083 | 192.180 | +2. **Build the test suite (q6):** + Navigate to the `q6` folder and build: + ```bash + cd src/q6 + make test + ``` -# VERSION NOTES: # +3. **Build the QGPU engine (core):** + Navigate to the `core` folder and build: + ```bash + cd ../core + make + ``` -**19/08/2020** -Generating first version of **Q-GPU** readme. +4. **Run the tests:** + Once compiled, you can run the test scripts. + ```bash + python runTEST.py -a gpu -t 100 + ``` diff --git a/benchmark-data-shevsea/QmapFEP/maps/CDK2_network.txt b/benchmark-data-shevsea/QmapFEP/maps/CDK2_network.txt deleted file mode 100644 index d61606e3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/QmapFEP/maps/CDK2_network.txt +++ /dev/null @@ -1,23 +0,0 @@ -28 30 -28 1h1s -29 28 -30 1h1s -29 30 -30 31 -32 1h1s -1h1s 1oiy -1oiu 1h1r -32 1oiu -31 26 -26 21 -26 1oi9 -26 1h1q -21 22 -1oi9 1h1q -1oiy 1oi9 -1h1r 1h1q -17 1h1q -1h1r 17 -20 1h1r -22 1h1r -20 17 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13a.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13a.lib deleted file mode 100644 index a4bc1016..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13a.lib +++ /dev/null @@ -1,131 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 39 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.3780 - 7 C7 XC7 -0.1100 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 0.0000 - 13 C13 XC13 0.0000 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 0.1800 - 18 Cl18 XCl18 -0.1800 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 -0.1150 - 21 C21 XC21 0.6225 - 22 O22 XO22 -0.5000 - 23 H23 XH23 0.0600 - 24 H24 XH24 0.0600 - 25 H25 XH25 0.0600 - 26 H26 XH26 0.4600 - 27 H27 XH27 0.3451 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.0600 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H23 -C1 H24 -C1 H25 -N2 C3 -N2 C21 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H26 -N4 H39 -N5 C6 -N5 H27 -C6 C7 -C6 C8 -C6 C21 -C7 H28 -C7 H29 -C7 H30 -C8 C9 -C8 C20 -C9 C10 -C9 H31 -C10 C11 -C10 H32 -C11 C12 -C11 H33 -C12 C13 -C12 C20 -C13 C14 -C13 C19 -C14 C15 -C14 H34 -C15 C16 -C15 H35 -C16 C17 -C16 H36 -C17 Cl18 -C17 C19 -C19 H37 -C20 H38 -C21 O22 - -[impropers] -C21 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H39 C3 N4 H26 -C6 H27 N5 C3 -C9 C20 C8 C6 -C10 H31 C9 C8 -C11 H32 C10 C9 -C12 H33 C11 C10 -C13 C20 C12 C11 -C14 C19 C13 C12 -C15 H34 C14 C13 -C16 H35 C15 C14 -C17 H36 C16 C15 -Cl18 C19 C17 C16 -C17 H37 C19 C13 -C12 H38 C20 C8 -N2 C6 C21 O22 - -[charge_groups] -C1 H23 H24 H25 -N2 -C3 -N4 H26 H39 -N5 H27 -C6 -C7 H28 H29 H30 -C8 -C9 H31 -C10 H32 -C11 H33 -C12 -C13 -C14 H34 -C15 H35 -C16 H36 -C17 -Cl18 -C19 H37 -C20 H38 -C21 -O22 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13a.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13a.prm deleted file mode 100644 index f9bee3a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13a.prm +++ /dev/null @@ -1,591 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl18 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC21 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO22 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH23 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH24 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH25 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH26 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH27 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH23 680.0 1.090 -XC1 XH24 680.0 1.090 -XC1 XH25 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC21 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH26 868.0 1.010 -XN4 XH39 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH27 868.0 1.010 -XC6 XC7 536.0 1.529 -XC6 XC8 634.0 1.510 -XC6 XC21 634.0 1.522 -XC7 XH28 680.0 1.090 -XC7 XH29 680.0 1.090 -XC7 XH30 680.0 1.090 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XC20 938.0 1.400 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH31 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH32 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH33 734.0 1.080 -XC12 XC13 750.0 1.464 -XC12 XC20 938.0 1.400 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC19 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH34 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH35 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH36 734.0 1.080 -XC17 XCl18 600.0 1.725 -XC17 XC19 938.0 1.400 -XC19 XH37 734.0 1.080 -XC20 XH38 734.0 1.080 -XC21 XO22 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH23 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH24 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH25 70.00 109.500 -XH23 XC1 XH24 66.00 107.800 -XH23 XC1 XH25 66.00 107.800 -XH24 XC1 XH25 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC21 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC21 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH26 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH39 70.00 120.000 -XH26 XN4 XH39 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH27 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH27 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC8 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC21 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC8 140.00 112.175 -XC7 XC6 XC21 126.00 111.100 -XC8 XC6 XC21 140.00 109.443 -XC6 XC7 XH28 75.00 110.700 -XC6 XC7 XH29 75.00 110.700 -XC6 XC7 XH30 75.00 110.700 -XH28 XC7 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC7 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC7 XH30 66.00 107.800 -XC6 XC8 XC9 140.00 120.000 -XC6 XC8 XC20 140.00 120.000 -XC9 XC8 XC20 126.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH31 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH31 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH33 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH33 70.00 120.000 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC20 126.00 120.000 -XC13 XC12 XC20 120.00 122.760 -XC12 XC13 XC14 120.00 122.760 -XC12 XC13 XC19 120.00 122.760 -XC14 XC13 XC19 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH34 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH34 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH35 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH35 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH36 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH36 70.00 120.000 -XC16 XC17 XCl18 150.00 120.000 -XC16 XC17 XC19 126.00 120.000 -XCl18 XC17 XC19 150.00 120.000 -XC13 XC19 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC19 XH37 70.00 120.000 -XC17 XC19 XH37 70.00 120.000 -XC8 XC20 XC12 126.00 120.000 -XC8 XC20 XH38 70.00 120.000 -XC12 XC20 XH38 70.00 120.000 -XN2 XC21 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC21 XO22 180.00 118.720 -XC6 XC21 XO22 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH23 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH23 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH23 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH23 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH23 XC1 XN2 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH23 XC1 XN2 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH23 XC1 XN2 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH23 XC1 XN2 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC21 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC21 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC21 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC21 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC21 XO22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC21 XO22 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC21 XO22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC21 XO22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC21 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC21 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC21 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC21 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC21 XO22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC21 XO22 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC21 XO22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC21 XO22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH26 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH39 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH26 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH39 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH27 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH27 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC8 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC8 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC8 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XN5 XC6 XC7 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XN5 XC6 XC7 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XN5 XC6 XC7 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XN5 XC6 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XN5 XC6 XC8 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XN5 XC6 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XN5 XC6 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XN5 XC6 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XN5 XC6 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XN5 XC6 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XN5 XC6 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH28 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH28 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH29 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH29 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH30 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH30 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC6 XC7 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC6 XC7 XH28 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC6 XC7 XH28 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC6 XC7 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC6 XC7 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC6 XC7 XH29 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC6 XC7 XH29 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC6 XC7 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC6 XC7 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC6 XC7 XH30 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC6 XC7 XH30 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC6 XC7 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XH28 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XH28 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XH29 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XH29 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XH30 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XH30 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC8 XC9 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC8 XC9 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC8 XC9 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC8 XC20 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC8 XC20 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC8 XC20 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC8 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC8 XC9 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC8 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC8 XC20 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC8 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC8 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC8 XC9 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC8 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC8 XC20 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC8 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC8 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XO22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XO22 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XO22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XO22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XO22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XO22 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XO22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XO22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC6 XC21 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC6 XC21 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC6 XC21 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC6 XC21 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC6 XC21 XO22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC6 XC21 XO22 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC6 XC21 XO22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC6 XC21 XO22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC8 XC9 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC8 XC9 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC8 XC9 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC8 XC9 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC8 XC9 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC8 XC9 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC8 XC9 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC8 XC9 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC8 XC20 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC8 XC20 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC8 XC20 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC8 XC20 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC8 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC8 XC20 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC8 XC20 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC8 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC20 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC20 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC20 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC20 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC20 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC20 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC12 XC13 XC14 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC12 XC13 XC14 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC12 XC13 XC14 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC12 XC13 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC12 XC13 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC12 XC13 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC12 XC13 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC20 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC20 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC20 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC20 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC20 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC20 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC20 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC20 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC20 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC20 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC20 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC20 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC13 XC14 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC13 XC14 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC13 XC14 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC13 XC14 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC19 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC19 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC19 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC19 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC19 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC19 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC19 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC19 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC19 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC19 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC19 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC19 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XCl18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XCl18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XCl18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XCl18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XCl18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XCl18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XCl18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XCl18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC21 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH39 XC3 XN4 XH26 1.000 180.000 -XC6 XH27 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC9 XC20 XC8 XC6 4.000 180.000 -XC10 XH31 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH32 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH33 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC13 XC20 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC14 XC19 XC13 XC12 4.000 180.000 -XC15 XH34 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH35 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH36 XC16 XC15 1.100 180.000 -XCl18 XC19 XC17 XC16 4.000 180.000 -XC17 XH37 XC19 XC13 1.100 180.000 -XC12 XH38 XC20 XC8 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC21 XO22 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13b.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13b.lib deleted file mode 100644 index 0c85806b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13b.lib +++ /dev/null @@ -1,138 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 42 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.1800 - 2 C2 XC2 -0.0500 - 3 C3 XC3 0.3780 - 4 C4 XC4 -0.1150 - 5 C5 XC5 -0.1150 - 6 C6 XC6 -0.1150 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 0.0000 - 9 C9 XC9 0.0000 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 0.1800 - 14 Cl14 XCl14 -0.1800 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 N17 XN17 -0.5282 - 18 C18 XC18 0.5687 - 19 N19 XN19 -0.9138 - 20 N20 XN20 -0.0184 - 21 C21 XC21 -0.0090 - 22 C22 XC22 0.6225 - 23 O23 XO23 -0.5000 - 24 H24 XH24 0.0600 - 25 H25 XH25 0.0600 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.1150 - 30 H30 XH30 0.1150 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.3451 - 38 H38 XH38 0.4600 - 39 H39 XH39 0.0600 - 40 H40 XH40 0.0600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.4600 - -[bonds] -C1 C2 -C1 H24 -C1 H25 -C1 H26 -C2 C3 -C2 H27 -C2 H28 -C3 C4 -C3 N17 -C3 C22 -C4 C5 -C4 C16 -C5 C6 -C5 H29 -C6 C7 -C6 H30 -C7 C8 -C7 H31 -C8 C9 -C8 C16 -C9 C10 -C9 C15 -C10 C11 -C10 H32 -C11 C12 -C11 H33 -C12 C13 -C12 H34 -C13 Cl14 -C13 C15 -C15 H35 -C16 H36 -N17 C18 -N17 H37 -C18 N19 -C18 N20 -N19 H38 -N19 H42 -N20 C21 -N20 C22 -C21 H39 -C21 H40 -C21 H41 -C22 O23 - -[impropers] -C5 C16 C4 C3 -C6 H29 C5 C4 -C7 H30 C6 C5 -C8 H31 C7 C6 -C9 C16 C8 C7 -C10 C15 C9 C8 -C11 H32 C10 C9 -C12 H33 C11 C10 -C13 H34 C12 C11 -Cl14 C15 C13 C12 -C13 H35 C15 C9 -C8 H36 C16 C4 -C3 H37 N17 C18 -N19 N20 C18 N17 -H42 C18 N19 H38 -C22 C18 N20 C21 -C3 N20 C22 O23 - -[charge_groups] -C1 H24 H25 H26 -C2 H27 H28 -C3 -C4 -C5 H29 -C6 H30 -C7 H31 -C8 -C9 -C10 H32 -C11 H33 -C12 H34 -C13 -Cl14 -C15 H35 -C16 H36 -N17 H37 -C18 -N19 H38 H42 -N20 -C21 H39 H40 H41 -C22 -O23 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13b.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13b.prm deleted file mode 100644 index 09d384fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13b.prm +++ /dev/null @@ -1,639 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC2 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC3 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC4 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC5 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC6 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl14 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN17 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC18 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN19 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN20 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO23 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH24 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH25 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH30 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH38 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH39 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH40 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XC2 536.0 1.529 -XC1 XH24 680.0 1.090 -XC1 XH25 680.0 1.090 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC2 XC3 536.0 1.529 -XC2 XH27 680.0 1.090 -XC2 XH28 680.0 1.090 -XC3 XC4 634.0 1.510 -XC3 XN17 674.0 1.463 -XC3 XC22 634.0 1.522 -XC4 XC5 938.0 1.400 -XC4 XC16 938.0 1.400 -XC5 XC6 938.0 1.400 -XC5 XH29 734.0 1.080 -XC6 XC7 938.0 1.400 -XC6 XH30 734.0 1.080 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XH31 734.0 1.080 -XC8 XC9 750.0 1.464 -XC8 XC16 938.0 1.400 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XC15 938.0 1.400 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH32 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH33 734.0 1.080 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XH34 734.0 1.080 -XC13 XCl14 600.0 1.725 -XC13 XC15 938.0 1.400 -XC15 XH35 734.0 1.080 -XC16 XH36 734.0 1.080 -XN17 XC18 962.0 1.340 -XN17 XH37 868.0 1.010 -XC18 XN19 962.0 1.340 -XC18 XN20 962.0 1.340 -XN19 XH38 868.0 1.010 -XN19 XH42 868.0 1.010 -XN20 XC21 674.0 1.463 -XN20 XC22 690.0 1.422 -XC21 XH39 680.0 1.090 -XC21 XH40 680.0 1.090 -XC21 XH41 680.0 1.090 -XC22 XO23 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XC2 XC1 XH24 75.00 110.700 -XC2 XC1 XH25 75.00 110.700 -XC2 XC1 XH26 75.00 110.700 -XH24 XC1 XH25 66.00 107.800 -XH24 XC1 XH26 66.00 107.800 -XH25 XC1 XH26 66.00 107.800 -XC1 XC2 XC3 116.70 112.700 -XC1 XC2 XH27 75.00 110.700 -XC1 XC2 XH28 75.00 110.700 -XC3 XC2 XH27 75.00 110.700 -XC3 XC2 XH28 75.00 110.700 -XH27 XC2 XH28 66.00 107.800 -XC2 XC3 XC4 140.00 112.175 -XC2 XC3 XN17 160.00 111.200 -XC2 XC3 XC22 126.00 111.100 -XC4 XC3 XN17 150.00 112.420 -XC4 XC3 XC22 140.00 109.443 -XN17 XC3 XC22 140.00 113.515 -XC3 XC4 XC5 140.00 120.000 -XC3 XC4 XC16 140.00 120.000 -XC5 XC4 XC16 126.00 120.000 -XC4 XC5 XC6 126.00 120.000 -XC4 XC5 XH29 70.00 120.000 -XC6 XC5 XH29 70.00 120.000 -XC5 XC6 XC7 126.00 120.000 -XC5 XC6 XH30 70.00 120.000 -XC7 XC6 XH30 70.00 120.000 -XC6 XC7 XC8 126.00 120.000 -XC6 XC7 XH31 70.00 120.000 -XC8 XC7 XH31 70.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 120.00 122.760 -XC7 XC8 XC16 126.00 120.000 -XC9 XC8 XC16 120.00 122.760 -XC8 XC9 XC10 120.00 122.760 -XC8 XC9 XC15 120.00 122.760 -XC10 XC9 XC15 126.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH33 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH33 70.00 120.000 -XC11 XC12 XC13 126.00 120.000 -XC11 XC12 XH34 70.00 120.000 -XC13 XC12 XH34 70.00 120.000 -XC12 XC13 XCl14 150.00 120.000 -XC12 XC13 XC15 126.00 120.000 -XCl14 XC13 XC15 150.00 120.000 -XC9 XC15 XC13 126.00 120.000 -XC9 XC15 XH35 70.00 120.000 -XC13 XC15 XH35 70.00 120.000 -XC4 XC16 XC8 126.00 120.000 -XC4 XC16 XH36 70.00 120.000 -XC8 XC16 XH36 70.00 120.000 -XC3 XN17 XC18 100.00 123.200 -XC3 XN17 XH37 70.00 118.400 -XC18 XN17 XH37 70.00 120.000 -XN17 XC18 XN19 140.00 120.000 -XN17 XC18 XN20 140.00 120.000 -XN19 XC18 XN20 140.00 120.000 -XC18 XN19 XH38 70.00 120.000 -XC18 XN19 XH42 70.00 120.000 -XH38 XN19 XH42 70.00 120.000 -XC18 XN20 XC21 100.00 123.200 -XC18 XN20 XC22 130.00 120.700 -XC21 XN20 XC22 100.00 121.900 -XN20 XC21 XH39 70.00 109.500 -XN20 XC21 XH40 70.00 109.500 -XN20 XC21 XH41 70.00 109.500 -XH39 XC21 XH40 66.00 107.800 -XH39 XC21 XH41 66.00 107.800 -XH40 XC21 XH41 66.00 107.800 -XC3 XC22 XN20 150.00 111.380 -XC3 XC22 XO23 160.00 120.400 -XN20 XC22 XO23 180.00 118.720 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH24 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH24 XC1 XC2 XC3 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH24 XC1 XC2 XH27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XC2 XH27 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH24 XC1 XC2 XH27 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XC2 XH27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH24 XC1 XC2 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XC2 XH28 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH24 XC1 XC2 XH28 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XC2 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC3 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XH27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XH27 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XH27 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XH27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XH28 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XH28 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC3 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XH27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XH27 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XH27 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XH27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XH28 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XH28 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XC4 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XC4 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XC4 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XN17 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XN17 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XN17 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XN17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XC22 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XC22 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XC22 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC2 XC3 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC2 XC3 XC4 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC2 XC3 XC4 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC2 XC3 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC2 XC3 XN17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC2 XC3 XN17 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC2 XC3 XN17 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC2 XC3 XN17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC2 XC3 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC2 XC3 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC2 XC3 XC22 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC2 XC3 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XC4 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XC4 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XN17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XN17 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XN17 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XN17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XC22 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC5 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC16 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC3 XC4 XC5 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC3 XC4 XC5 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC3 XC4 XC5 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC3 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC3 XC4 XC16 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC3 XC4 XC16 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC3 XC4 XC16 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC3 XC4 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC3 XC4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC3 XC4 XC5 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC3 XC4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC3 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC3 XC4 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC3 XC4 XC16 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC3 XC4 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC3 XC4 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XN17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XN17 XC18 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XN17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XN17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XN17 XH37 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XN17 XH37 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XN17 XH37 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XN17 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XN17 XC18 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XN17 XC18 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XN17 XC18 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XN17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XN17 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XN17 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XN17 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XN17 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC3 XN17 XC18 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC3 XN17 XC18 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC3 XN17 XC18 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC3 XN17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC3 XN17 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC3 XN17 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC3 XN17 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC3 XN17 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XC22 XN20 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XC22 XN20 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XC22 XN20 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XC22 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XC22 XO23 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC22 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC22 XN20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC22 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC22 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC22 XO23 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC3 XC22 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC3 XC22 XN20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC3 XC22 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC3 XC22 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC3 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC3 XC22 XO23 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC3 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC3 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH29 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC4 XC5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC4 XC5 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC4 XC5 XH29 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC4 XC5 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC4 XC5 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC16 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC16 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC16 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC16 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC16 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC16 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC16 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC16 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC16 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC16 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC16 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC16 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC16 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC16 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC16 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC16 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC15 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC15 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC15 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC8 XC9 XC10 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC8 XC9 XC10 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC8 XC9 XC10 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC8 XC9 XC15 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC8 XC9 XC15 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC8 XC9 XC15 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC8 XC9 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC16 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC16 XC4 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC16 XC4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC16 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC16 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC16 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC16 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC16 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC16 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC16 XC4 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC16 XC4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC16 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC16 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC16 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC16 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC16 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC15 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC15 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC15 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC15 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC15 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC15 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC15 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC15 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC15 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC15 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC15 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC15 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XCl14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XCl14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XCl14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XCl14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XCl14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XCl14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XCl14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XCl14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl14 XC13 XC15 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl14 XC13 XC15 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl14 XC13 XC15 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl14 XC13 XC15 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl14 XC13 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl14 XC13 XC15 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl14 XC13 XC15 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl14 XC13 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN17 XC18 XN19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN17 XC18 XN19 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN17 XC18 XN19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN17 XC18 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN17 XC18 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN17 XC18 XN20 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN17 XC18 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN17 XC18 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XN17 XC18 XN19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XN17 XC18 XN19 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XN17 XC18 XN19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XN17 XC18 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XN17 XC18 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XN17 XC18 XN20 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XN17 XC18 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XN17 XC18 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH38 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH42 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH38 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH42 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC21 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC22 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC21 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC22 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH39 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH40 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH41 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XC3 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XC3 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XC3 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XO23 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XC3 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XC3 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XO23 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC5 XC16 XC4 XC3 4.000 180.000 -XC6 XH29 XC5 XC4 1.100 180.000 -XC7 XH30 XC6 XC5 1.100 180.000 -XC8 XH31 XC7 XC6 1.100 180.000 -XC9 XC16 XC8 XC7 4.000 180.000 -XC10 XC15 XC9 XC8 4.000 180.000 -XC11 XH32 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH33 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC13 XH34 XC12 XC11 1.100 180.000 -XCl14 XC15 XC13 XC12 4.000 180.000 -XC13 XH35 XC15 XC9 1.100 180.000 -XC8 XH36 XC16 XC4 1.100 180.000 -XC3 XH37 XN17 XC18 1.000 180.000 -XN19 XN20 XC18 XN17 10.500 180.000 -XH42 XC18 XN19 XH38 1.000 180.000 -XC22 XC18 XN20 XC21 1.000 180.000 -XC3 XN20 XC22 XO23 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13c.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13c.lib deleted file mode 100644 index 2ffed585..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13c.lib +++ /dev/null @@ -1,145 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 45 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.1800 - 2 C2 XC2 0.0100 - 3 C3 XC3 -0.1800 - 4 C4 XC4 0.3780 - 5 C5 XC5 -0.1150 - 6 C6 XC6 -0.1150 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 0.0000 - 10 C10 XC10 0.0000 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 0.1800 - 15 Cl15 XCl15 -0.1800 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 -0.1150 - 18 N18 XN18 -0.5282 - 19 C19 XC19 0.5687 - 20 N20 XN20 -0.9138 - 21 N21 XN21 -0.0184 - 22 C22 XC22 -0.0090 - 23 C23 XC23 0.6225 - 24 O24 XO24 -0.5000 - 25 H25 XH25 0.0600 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.0600 - 31 H31 XH31 0.0600 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.3451 - 41 H41 XH41 0.4600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.0600 - 44 H44 XH44 0.0600 - 45 H45 XH45 0.4600 - -[bonds] -C1 C2 -C1 H25 -C1 H26 -C1 H27 -C2 C3 -C2 C4 -C2 H28 -C3 H29 -C3 H30 -C3 H31 -C4 C5 -C4 N18 -C4 C23 -C5 C6 -C5 C17 -C6 C7 -C6 H32 -C7 C8 -C7 H33 -C8 C9 -C8 H34 -C9 C10 -C9 C17 -C10 C11 -C10 C16 -C11 C12 -C11 H35 -C12 C13 -C12 H36 -C13 C14 -C13 H37 -C14 Cl15 -C14 C16 -C16 H38 -C17 H39 -N18 C19 -N18 H40 -C19 N20 -C19 N21 -N20 H41 -N20 H45 -N21 C22 -N21 C23 -C22 H42 -C22 H43 -C22 H44 -C23 O24 - -[impropers] -C6 C17 C5 C4 -C7 H32 C6 C5 -C8 H33 C7 C6 -C9 H34 C8 C7 -C10 C17 C9 C8 -C11 C16 C10 C9 -C12 H35 C11 C10 -C13 H36 C12 C11 -C14 H37 C13 C12 -Cl15 C16 C14 C13 -C14 H38 C16 C10 -C9 H39 C17 C5 -C4 H40 N18 C19 -N20 N21 C19 N18 -H45 C19 N20 H41 -C23 C19 N21 C22 -C4 N21 C23 O24 - -[charge_groups] -C1 H25 H26 H27 -C2 H28 -C3 H29 H30 H31 -C4 -C5 -C6 H32 -C7 H33 -C8 H34 -C9 -C10 -C11 H35 -C12 H36 -C13 H37 -C14 -Cl15 -C16 H38 -C17 H39 -N18 H40 -C19 -N20 H41 H45 -N21 -C22 H42 H43 H44 -C23 -O24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13c.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13c.prm deleted file mode 100644 index 9539fb23..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13c.prm +++ /dev/null @@ -1,687 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC2 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC3 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC4 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC5 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC6 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl15 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN18 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC19 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN20 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN21 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC22 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC23 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO24 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH25 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH41 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH44 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH45 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XC2 536.0 1.529 -XC1 XH25 680.0 1.090 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC2 XC3 536.0 1.529 -XC2 XC4 536.0 1.529 -XC2 XH28 680.0 1.090 -XC3 XH29 680.0 1.090 -XC3 XH30 680.0 1.090 -XC3 XH31 680.0 1.090 -XC4 XC5 634.0 1.510 -XC4 XN18 674.0 1.463 -XC4 XC23 634.0 1.522 -XC5 XC6 938.0 1.400 -XC5 XC17 938.0 1.400 -XC6 XC7 938.0 1.400 -XC6 XH32 734.0 1.080 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XH33 734.0 1.080 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH34 734.0 1.080 -XC9 XC10 750.0 1.464 -XC9 XC17 938.0 1.400 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XC16 938.0 1.400 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH35 734.0 1.080 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XH36 734.0 1.080 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH37 734.0 1.080 -XC14 XCl15 600.0 1.725 -XC14 XC16 938.0 1.400 -XC16 XH38 734.0 1.080 -XC17 XH39 734.0 1.080 -XN18 XC19 962.0 1.340 -XN18 XH40 868.0 1.010 -XC19 XN20 962.0 1.340 -XC19 XN21 962.0 1.340 -XN20 XH41 868.0 1.010 -XN20 XH45 868.0 1.010 -XN21 XC22 674.0 1.463 -XN21 XC23 690.0 1.422 -XC22 XH42 680.0 1.090 -XC22 XH43 680.0 1.090 -XC22 XH44 680.0 1.090 -XC23 XO24 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XC2 XC1 XH25 75.00 110.700 -XC2 XC1 XH26 75.00 110.700 -XC2 XC1 XH27 75.00 110.700 -XH25 XC1 XH26 66.00 107.800 -XH25 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XC1 XC2 XC3 116.70 112.700 -XC1 XC2 XC4 116.70 112.700 -XC1 XC2 XH28 75.00 110.700 -XC3 XC2 XC4 116.70 112.700 -XC3 XC2 XH28 75.00 110.700 -XC4 XC2 XH28 75.00 110.700 -XC2 XC3 XH29 75.00 110.700 -XC2 XC3 XH30 75.00 110.700 -XC2 XC3 XH31 75.00 110.700 -XH29 XC3 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC3 XH31 66.00 107.800 -XH30 XC3 XH31 66.00 107.800 -XC2 XC4 XC5 140.00 112.175 -XC2 XC4 XN18 160.00 111.200 -XC2 XC4 XC23 126.00 111.100 -XC5 XC4 XN18 150.00 112.420 -XC5 XC4 XC23 140.00 109.443 -XN18 XC4 XC23 140.00 113.515 -XC4 XC5 XC6 140.00 120.000 -XC4 XC5 XC17 140.00 120.000 -XC6 XC5 XC17 126.00 120.000 -XC5 XC6 XC7 126.00 120.000 -XC5 XC6 XH32 70.00 120.000 -XC7 XC6 XH32 70.00 120.000 -XC6 XC7 XC8 126.00 120.000 -XC6 XC7 XH33 70.00 120.000 -XC8 XC7 XH33 70.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH34 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH34 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 120.00 122.760 -XC8 XC9 XC17 126.00 120.000 -XC10 XC9 XC17 120.00 122.760 -XC9 XC10 XC11 120.00 122.760 -XC9 XC10 XC16 120.00 122.760 -XC11 XC10 XC16 126.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH35 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH35 70.00 120.000 -XC11 XC12 XC13 126.00 120.000 -XC11 XC12 XH36 70.00 120.000 -XC13 XC12 XH36 70.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH37 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH37 70.00 120.000 -XC13 XC14 XCl15 150.00 120.000 -XC13 XC14 XC16 126.00 120.000 -XCl15 XC14 XC16 150.00 120.000 -XC10 XC16 XC14 126.00 120.000 -XC10 XC16 XH38 70.00 120.000 -XC14 XC16 XH38 70.00 120.000 -XC5 XC17 XC9 126.00 120.000 -XC5 XC17 XH39 70.00 120.000 -XC9 XC17 XH39 70.00 120.000 -XC4 XN18 XC19 100.00 123.200 -XC4 XN18 XH40 70.00 118.400 -XC19 XN18 XH40 70.00 120.000 -XN18 XC19 XN20 140.00 120.000 -XN18 XC19 XN21 140.00 120.000 -XN20 XC19 XN21 140.00 120.000 -XC19 XN20 XH41 70.00 120.000 -XC19 XN20 XH45 70.00 120.000 -XH41 XN20 XH45 70.00 120.000 -XC19 XN21 XC22 100.00 123.200 -XC19 XN21 XC23 130.00 120.700 -XC22 XN21 XC23 100.00 121.900 -XN21 XC22 XH42 70.00 109.500 -XN21 XC22 XH43 70.00 109.500 -XN21 XC22 XH44 70.00 109.500 -XH42 XC22 XH43 66.00 107.800 -XH42 XC22 XH44 66.00 107.800 -XH43 XC22 XH44 66.00 107.800 -XC4 XC23 XN21 150.00 111.380 -XC4 XC23 XO24 160.00 120.400 -XN21 XC23 XO24 180.00 118.720 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH25 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC3 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC4 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC4 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XH28 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XH28 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC3 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC4 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC4 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XH28 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XH28 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC3 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC4 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC4 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XH28 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XH28 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH29 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH29 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH30 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH30 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH31 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH31 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC2 XC3 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC2 XC3 XH29 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC2 XC3 XH29 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC2 XC3 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC2 XC3 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC2 XC3 XH30 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC2 XC3 XH30 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC2 XC3 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC2 XC3 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC2 XC3 XH31 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC2 XC3 XH31 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC2 XC3 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XH29 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XH29 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XH30 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XH30 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XH31 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XH31 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC3 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC4 XC5 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC4 XC5 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC4 XC5 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC4 XN18 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC4 XN18 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC4 XN18 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC4 XN18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC4 XC23 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC4 XC23 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC4 XC23 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC4 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC4 XC5 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC4 XC5 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC4 XC5 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC4 XN18 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC4 XN18 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC4 XN18 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC4 XN18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC4 XC23 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC4 XC23 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC4 XC23 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC4 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC4 XC5 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC4 XC5 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC4 XN18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC4 XN18 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC4 XN18 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC4 XN18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC4 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC4 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC2 XC4 XC23 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC2 XC4 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC4 XC5 XC6 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC4 XC5 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC4 XC5 XC17 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC4 XC5 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC4 XC5 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC4 XC5 XC6 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC4 XC5 XC6 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC4 XC5 XC6 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC4 XC5 XC17 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC4 XC5 XC17 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC4 XC5 XC17 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC4 XC5 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC4 XC5 XC6 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC4 XC5 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC4 XC5 XC17 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC4 XC5 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC4 XC5 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC4 XN18 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC4 XN18 XC19 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC4 XN18 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC4 XN18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC4 XN18 XH40 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC4 XN18 XH40 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC4 XN18 XH40 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC4 XN18 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XN18 XC19 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XN18 XC19 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XN18 XC19 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XN18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XN18 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XN18 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XN18 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XN18 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC4 XN18 XC19 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC4 XN18 XC19 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC4 XN18 XC19 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC4 XN18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC4 XN18 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC4 XN18 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC4 XN18 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC4 XN18 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC4 XC23 XN21 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC4 XC23 XN21 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC4 XC23 XN21 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC4 XC23 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC4 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC4 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC4 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC4 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC23 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC23 XN21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC23 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC23 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC4 XC23 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC4 XC23 XN21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC4 XC23 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC4 XC23 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC4 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC4 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC4 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC4 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC5 XC6 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC5 XC6 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC5 XC6 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC5 XC6 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC17 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC17 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC17 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC17 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC17 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC17 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC5 XC17 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC5 XC17 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC5 XC17 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC5 XC17 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC5 XC17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC5 XC17 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC5 XC17 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC5 XC17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC6 XC7 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC6 XC7 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC6 XC7 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC6 XC7 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC7 XC8 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC7 XC8 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC7 XC8 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC7 XC8 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC16 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC16 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC16 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC9 XC10 XC11 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC9 XC10 XC11 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC9 XC10 XC11 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC9 XC10 XC16 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC9 XC10 XC16 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC9 XC10 XC16 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC9 XC10 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC17 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC17 XC5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC17 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC17 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC17 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC17 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC17 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC17 XC5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC17 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC17 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC17 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC17 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC10 XC11 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC10 XC11 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC10 XC11 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC10 XC11 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC16 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC16 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC16 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC16 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC16 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC16 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC10 XC16 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC10 XC16 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC10 XC16 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC10 XC16 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC10 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC10 XC16 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC10 XC16 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC10 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC12 XC13 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC12 XC13 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC12 XC13 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC12 XC13 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XCl15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XCl15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XCl15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XCl15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC13 XC14 XCl15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC13 XC14 XCl15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC13 XC14 XCl15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC13 XC14 XCl15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC13 XC14 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC13 XC14 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC13 XC14 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC13 XC14 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XN18 XC19 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XN18 XC19 XN20 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XN18 XC19 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XN18 XC19 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XN18 XC19 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XN18 XC19 XN21 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XN18 XC19 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XN18 XC19 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN20 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN21 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH41 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH41 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC22 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC23 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC22 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC23 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH42 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH43 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH44 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XC4 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XC4 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XC4 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XO24 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XC4 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XC4 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XC4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XO24 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC6 XC17 XC5 XC4 4.000 180.000 -XC7 XH32 XC6 XC5 1.100 180.000 -XC8 XH33 XC7 XC6 1.100 180.000 -XC9 XH34 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XC17 XC9 XC8 4.000 180.000 -XC11 XC16 XC10 XC9 4.000 180.000 -XC12 XH35 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC13 XH36 XC12 XC11 1.100 180.000 -XC14 XH37 XC13 XC12 1.100 180.000 -XCl15 XC16 XC14 XC13 4.000 180.000 -XC14 XH38 XC16 XC10 1.100 180.000 -XC9 XH39 XC17 XC5 1.100 180.000 -XC4 XH40 XN18 XC19 1.000 180.000 -XN20 XN21 XC19 XN18 10.500 180.000 -XH45 XC19 XN20 XH41 1.000 180.000 -XC23 XC19 XN21 XC22 1.000 180.000 -XC4 XN21 XC23 XO24 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13d.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13d.lib deleted file mode 100644 index 6f432ff9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13d.lib +++ /dev/null @@ -1,142 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 43 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.4480 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 0.0000 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 0.1800 - 17 Cl17 XCl17 -0.1800 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 -0.0600 - 21 C21 XC21 -0.1200 - 22 C22 XC22 -0.1200 - 23 C23 XC23 0.6225 - 24 O24 XO24 -0.5000 - 25 H25 XH25 0.0600 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.4600 - 29 H29 XH29 0.3451 - 30 H30 XH30 0.1150 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.0600 - 39 H39 XH39 0.0600 - 40 H40 XH40 0.0600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H25 -C1 H26 -C1 H27 -N2 C3 -N2 C23 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H28 -N4 H43 -N5 C6 -N5 H29 -C6 C7 -C6 C20 -C6 C23 -C7 C8 -C7 C19 -C8 C9 -C8 H30 -C9 C10 -C9 H31 -C10 C11 -C10 H32 -C11 C12 -C11 C19 -C12 C13 -C12 C18 -C13 C14 -C13 H33 -C14 C15 -C14 H34 -C15 C16 -C15 H35 -C16 Cl17 -C16 C18 -C18 H36 -C19 H37 -C20 C21 -C20 C22 -C20 H38 -C21 C22 -C21 H39 -C21 H40 -C22 H41 -C22 H42 -C23 O24 - -[impropers] -C23 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H43 C3 N4 H28 -C6 H29 N5 C3 -C8 C19 C7 C6 -C9 H30 C8 C7 -C10 H31 C9 C8 -C11 H32 C10 C9 -C12 C19 C11 C10 -C13 C18 C12 C11 -C14 H33 C13 C12 -C15 H34 C14 C13 -C16 H35 C15 C14 -C18 Cl17 C16 C15 -C16 H36 C18 C12 -C11 H37 C19 C7 -N2 C6 C23 O24 - -[charge_groups] -C1 H25 H26 H27 -N2 -C3 -N4 H28 H43 -N5 H29 -C6 -C7 -C8 H30 -C9 H31 -C10 H32 -C11 -C12 -C13 H33 -C14 H34 -C15 H35 -C16 -Cl17 -C18 H36 -C19 H37 -C20 H38 -C21 H39 H40 -C22 H41 H42 -C23 -O24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13d.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13d.prm deleted file mode 100644 index 88aada87..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13d.prm +++ /dev/null @@ -1,708 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl17 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC23 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO24 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH25 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH29 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH30 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH39 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH40 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH25 680.0 1.090 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC23 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH28 868.0 1.010 -XN4 XH43 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH29 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC20 550.0 1.510 -XC6 XC23 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC19 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH30 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH31 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH32 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC19 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC18 938.0 1.400 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH33 734.0 1.080 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH34 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH35 734.0 1.080 -XC16 XCl17 600.0 1.725 -XC16 XC18 938.0 1.400 -XC18 XH36 734.0 1.080 -XC19 XH37 734.0 1.080 -XC20 XC21 520.0 1.509 -XC20 XC22 520.0 1.509 -XC20 XH38 680.0 1.088 -XC21 XC22 520.0 1.509 -XC21 XH39 680.0 1.088 -XC21 XH40 680.0 1.088 -XC22 XH41 680.0 1.088 -XC22 XH42 680.0 1.088 -XC23 XO24 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH25 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XH25 XC1 XH26 66.00 107.800 -XH25 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC23 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC23 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH28 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH43 70.00 120.000 -XH28 XN4 XH43 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH29 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH29 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC20 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC23 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC20 140.00 111.440 -XC7 XC6 XC23 140.00 109.443 -XC20 XC6 XC23 126.00 111.100 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC19 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC19 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH30 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH30 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH31 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH31 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC19 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC18 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC18 126.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH33 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH33 70.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH34 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH34 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH35 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH35 70.00 120.000 -XC15 XC16 XCl17 150.00 120.000 -XC15 XC16 XC18 126.00 120.000 -XCl17 XC16 XC18 150.00 120.000 -XC12 XC18 XC16 126.00 120.000 -XC12 XC18 XH36 70.00 120.000 -XC16 XC18 XH36 70.00 120.000 -XC7 XC19 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC19 XH37 70.00 120.000 -XC11 XC19 XH37 70.00 120.000 -XC6 XC20 XC21 120.00 120.940 -XC6 XC20 XC22 120.00 120.940 -XC6 XC20 XH38 80.00 115.045 -XC21 XC20 XC22 20.00 60.0050 -XC21 XC20 XH38 75.00 117.200 -XC22 XC20 XH38 75.00 117.200 -XC20 XC21 XC22 20.00 60.0050 -XC20 XC21 XH39 75.00 117.200 -XC20 XC21 XH40 75.00 117.200 -XC22 XC21 XH39 75.00 117.200 -XC22 XC21 XH40 75.00 117.200 -XH39 XC21 XH40 70.00 114.300 -XC20 XC22 XC21 20.00 60.0050 -XC20 XC22 XH41 75.00 117.200 -XC20 XC22 XH42 75.00 117.200 -XC21 XC22 XH41 75.00 117.200 -XC21 XC22 XH42 75.00 117.200 -XH41 XC22 XH42 70.00 114.300 -XN2 XC23 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC23 XO24 180.00 118.720 -XC6 XC23 XO24 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XO24 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XO24 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH28 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH43 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH28 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH43 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC23 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC23 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC23 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC20 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC20 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC20 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH38 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH38 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC21 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC21 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC21 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC22 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC22 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC22 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XH38 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XC22 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC21 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC21 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC21 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC22 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC22 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC22 XC21 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC22 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC22 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC23 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH43 XC3 XN4 XH28 1.000 180.000 -XC6 XH29 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC19 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH30 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH31 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH32 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC19 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC18 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC14 XH33 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC15 XH34 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH35 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC18 XCl17 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC16 XH36 XC18 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH37 XC19 XC7 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC23 XO24 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13e.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13e.lib deleted file mode 100644 index 50e166ef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13e.lib +++ /dev/null @@ -1,149 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 46 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.4480 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 0.0000 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 0.1800 - 17 Cl17 XCl17 -0.1800 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 -0.0600 - 21 C21 XC21 -0.1200 - 22 C22 XC22 -0.1200 - 23 C23 XC23 -0.1200 - 24 C24 XC24 0.6225 - 25 O25 XO25 -0.5000 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.4600 - 30 H30 XH30 0.3451 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.0600 - 40 H40 XH40 0.0600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.0600 - 44 H44 XH44 0.0600 - 45 H45 XH45 0.0600 - 46 H46 XH46 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H26 -C1 H27 -C1 H28 -N2 C3 -N2 C24 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H29 -N4 H46 -N5 C6 -N5 H30 -C6 C7 -C6 C20 -C6 C24 -C7 C8 -C7 C19 -C8 C9 -C8 H31 -C9 C10 -C9 H32 -C10 C11 -C10 H33 -C11 C12 -C11 C19 -C12 C13 -C12 C18 -C13 C14 -C13 H34 -C14 C15 -C14 H35 -C15 C16 -C15 H36 -C16 Cl17 -C16 C18 -C18 H37 -C19 H38 -C20 C21 -C20 C23 -C20 H39 -C21 C22 -C21 H40 -C21 H41 -C22 C23 -C22 H42 -C22 H43 -C23 H44 -C23 H45 -C24 O25 - -[impropers] -C24 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H46 C3 N4 H29 -C6 H30 N5 C3 -C8 C19 C7 C6 -C9 H31 C8 C7 -C10 H32 C9 C8 -C11 H33 C10 C9 -C12 C19 C11 C10 -C13 C18 C12 C11 -C14 H34 C13 C12 -C15 H35 C14 C13 -C16 H36 C15 C14 -Cl17 C18 C16 C15 -C16 H37 C18 C12 -C11 H38 C19 C7 -N2 C6 C24 O25 - -[charge_groups] -C1 H26 H27 H28 -N2 -C3 -N4 H29 H46 -N5 H30 -C6 -C7 -C8 H31 -C9 H32 -C10 H33 -C11 -C12 -C13 H34 -C14 H35 -C15 H36 -C16 -Cl17 -C18 H37 -C19 H38 -C20 H39 -C21 H40 H41 -C22 H42 H43 -C23 H44 H45 -C24 -O25 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13e.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13e.prm deleted file mode 100644 index 6091b5b8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13e.prm +++ /dev/null @@ -1,768 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl17 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC23 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC24 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO25 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH40 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH44 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH45 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH46 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC24 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH29 868.0 1.010 -XN4 XH46 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH30 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC20 520.0 1.519 -XC6 XC24 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC19 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH31 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH32 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH33 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC19 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC18 938.0 1.400 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH34 734.0 1.080 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH35 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH36 734.0 1.080 -XC16 XCl17 600.0 1.725 -XC16 XC18 938.0 1.400 -XC18 XH37 734.0 1.080 -XC19 XH38 734.0 1.080 -XC20 XC21 536.0 1.529 -XC20 XC23 536.0 1.529 -XC20 XH39 680.0 1.090 -XC21 XC22 536.0 1.529 -XC21 XH40 680.0 1.090 -XC21 XH41 680.0 1.090 -XC22 XC23 536.0 1.529 -XC22 XH42 680.0 1.090 -XC22 XH43 680.0 1.090 -XC23 XH44 680.0 1.090 -XC23 XH45 680.0 1.090 -XC24 XO25 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC24 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC24 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH29 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH46 70.00 120.000 -XH29 XN4 XH46 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH30 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH30 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC20 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC24 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC20 140.00 112.175 -XC7 XC6 XC24 140.00 109.443 -XC20 XC6 XC24 126.00 111.100 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC19 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC19 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH31 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH31 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH33 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC19 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC18 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC18 126.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH34 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH34 70.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH35 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH35 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH36 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH36 70.00 120.000 -XC15 XC16 XCl17 150.00 120.000 -XC15 XC16 XC18 126.00 120.000 -XCl17 XC16 XC18 150.00 120.000 -XC12 XC18 XC16 126.00 120.000 -XC12 XC18 XH37 70.00 120.000 -XC16 XC18 XH37 70.00 120.000 -XC7 XC19 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC19 XH38 70.00 120.000 -XC11 XC19 XH38 70.00 120.000 -XC6 XC20 XC21 130.00 119.520 -XC6 XC20 XC23 130.00 119.520 -XC6 XC20 XH39 90.00 112.728 -XC21 XC20 XC23 126.00 92.0000 -XC21 XC20 XH39 75.00 110.700 -XC23 XC20 XH39 75.00 110.700 -XC20 XC21 XC22 126.00 92.0000 -XC20 XC21 XH40 75.00 110.700 -XC20 XC21 XH41 75.00 110.700 -XC22 XC21 XH40 75.00 110.700 -XC22 XC21 XH41 75.00 110.700 -XH40 XC21 XH41 66.00 107.800 -XC21 XC22 XC23 126.00 92.0000 -XC21 XC22 XH42 75.00 110.700 -XC21 XC22 XH43 75.00 110.700 -XC23 XC22 XH42 75.00 110.700 -XC23 XC22 XH43 75.00 110.700 -XH42 XC22 XH43 66.00 107.800 -XC20 XC23 XC22 126.00 92.0000 -XC20 XC23 XH44 75.00 110.700 -XC20 XC23 XH45 75.00 110.700 -XC22 XC23 XH44 75.00 110.700 -XC22 XC23 XH45 75.00 110.700 -XH44 XC23 XH45 66.00 107.800 -XN2 XC24 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC24 XO25 180.00 118.720 -XC6 XC24 XO25 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC20 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC20 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC20 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC23 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC23 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC23 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH39 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC23 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC23 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC23 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH39 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC21 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC21 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC21 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC23 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC23 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC23 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XH39 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 -0.710 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.384 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XC22 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XC22 -0.710 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XC22 0.384 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC23 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC23 XC22 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC23 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XC23 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC23 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC24 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH46 XC3 XN4 XH29 1.000 180.000 -XC6 XH30 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC19 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH31 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH32 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH33 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC19 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC18 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC14 XH34 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC15 XH35 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH36 XC15 XC14 1.100 180.000 -XCl17 XC18 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC16 XH37 XC18 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH38 XC19 XC7 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC24 XO25 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13f.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13f.lib deleted file mode 100644 index 7e8ccdd0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13f.lib +++ /dev/null @@ -1,156 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 49 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.3780 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 0.0000 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 0.1800 - 17 Cl17 XCl17 -0.1800 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 0.0100 - 21 C21 XC21 -0.1200 - 22 C22 XC22 -0.1200 - 23 C23 XC23 -0.1200 - 24 C24 XC24 -0.1200 - 25 C25 XC25 0.6225 - 26 O26 XO26 -0.5000 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.4600 - 31 H31 XH31 0.3451 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.0600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.0600 - 44 H44 XH44 0.0600 - 45 H45 XH45 0.0600 - 46 H46 XH46 0.0600 - 47 H47 XH47 0.0600 - 48 H48 XH48 0.0600 - 49 H49 XH49 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H27 -C1 H28 -C1 H29 -N2 C3 -N2 C25 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H30 -N4 H49 -N5 C6 -N5 H31 -C6 C7 -C6 C20 -C6 C25 -C7 C8 -C7 C19 -C8 C9 -C8 H32 -C9 C10 -C9 H33 -C10 C11 -C10 H34 -C11 C12 -C11 C19 -C12 C13 -C12 C18 -C13 C14 -C13 H35 -C14 C15 -C14 H36 -C15 C16 -C15 H37 -C16 Cl17 -C16 C18 -C18 H38 -C19 H39 -C20 C21 -C20 C24 -C20 H40 -C21 C22 -C21 H41 -C21 H42 -C22 C23 -C22 H43 -C22 H44 -C23 C24 -C23 H45 -C23 H46 -C24 H47 -C24 H48 -C25 O26 - -[impropers] -C25 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H49 C3 N4 H30 -C6 H31 N5 C3 -C8 C19 C7 C6 -C9 H32 C8 C7 -C10 H33 C9 C8 -C11 H34 C10 C9 -C12 C19 C11 C10 -C13 C18 C12 C11 -C14 H35 C13 C12 -C15 H36 C14 C13 -C16 H37 C15 C14 -Cl17 C18 C16 C15 -C16 H38 C18 C12 -C11 H39 C19 C7 -N2 C6 C25 O26 - -[charge_groups] -C1 H27 H28 H29 -N2 -C3 -N4 H30 H49 -N5 H31 -C6 -C7 -C8 H32 -C9 H33 -C10 H34 -C11 -C12 -C13 H35 -C14 H36 -C15 H37 -C16 -Cl17 -C18 H38 -C19 H39 -C20 H40 -C21 H41 H42 -C22 H43 H44 -C23 H45 H46 -C24 H47 H48 -C25 -O26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13f.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13f.prm deleted file mode 100644 index 0acb2ca1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13f.prm +++ /dev/null @@ -1,816 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl17 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC23 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC24 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC25 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO26 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH44 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH45 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH46 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH47 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH48 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH49 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC25 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH30 868.0 1.010 -XN4 XH49 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH31 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC20 536.0 1.529 -XC6 XC25 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC19 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH32 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH33 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH34 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC19 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC18 938.0 1.400 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH35 734.0 1.080 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH36 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH37 734.0 1.080 -XC16 XCl17 600.0 1.725 -XC16 XC18 938.0 1.400 -XC18 XH38 734.0 1.080 -XC19 XH39 734.0 1.080 -XC20 XC21 536.0 1.529 -XC20 XC24 536.0 1.529 -XC20 XH40 680.0 1.090 -XC21 XC22 536.0 1.529 -XC21 XH41 680.0 1.090 -XC21 XH42 680.0 1.090 -XC22 XC23 536.0 1.529 -XC22 XH43 680.0 1.090 -XC22 XH44 680.0 1.090 -XC23 XC24 536.0 1.529 -XC23 XH45 680.0 1.090 -XC23 XH46 680.0 1.090 -XC24 XH47 680.0 1.090 -XC24 XH48 680.0 1.090 -XC25 XO26 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC25 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC25 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH30 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH49 70.00 120.000 -XH30 XN4 XH49 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH31 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH31 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC20 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC25 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC20 140.00 112.175 -XC7 XC6 XC25 140.00 109.443 -XC20 XC6 XC25 126.00 111.100 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC19 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC19 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC19 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC18 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC18 126.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH35 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH35 70.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH36 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH36 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH37 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC16 XCl17 150.00 120.000 -XC15 XC16 XC18 126.00 120.000 -XCl17 XC16 XC18 150.00 120.000 -XC12 XC18 XC16 126.00 120.000 -XC12 XC18 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC18 XH38 70.00 120.000 -XC7 XC19 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC19 XH39 70.00 120.000 -XC11 XC19 XH39 70.00 120.000 -XC6 XC20 XC21 116.70 112.700 -XC6 XC20 XC24 116.70 112.700 -XC6 XC20 XH40 75.00 110.700 -XC21 XC20 XC24 116.70 112.700 -XC21 XC20 XH40 75.00 110.700 -XC24 XC20 XH40 75.00 110.700 -XC20 XC21 XC22 116.70 112.700 -XC20 XC21 XH41 75.00 110.700 -XC20 XC21 XH42 75.00 110.700 -XC22 XC21 XH41 75.00 110.700 -XC22 XC21 XH42 75.00 110.700 -XH41 XC21 XH42 66.00 107.800 -XC21 XC22 XC23 116.70 112.700 -XC21 XC22 XH43 75.00 110.700 -XC21 XC22 XH44 75.00 110.700 -XC23 XC22 XH43 75.00 110.700 -XC23 XC22 XH44 75.00 110.700 -XH43 XC22 XH44 66.00 107.800 -XC22 XC23 XC24 116.70 112.700 -XC22 XC23 XH45 75.00 110.700 -XC22 XC23 XH46 75.00 110.700 -XC24 XC23 XH45 75.00 110.700 -XC24 XC23 XH46 75.00 110.700 -XH45 XC23 XH46 66.00 107.800 -XC20 XC24 XC23 116.70 112.700 -XC20 XC24 XH47 75.00 110.700 -XC20 XC24 XH48 75.00 110.700 -XC23 XC24 XH47 75.00 110.700 -XC23 XC24 XH48 75.00 110.700 -XH47 XC24 XH48 66.00 107.800 -XN2 XC25 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC25 XO26 180.00 118.720 -XC6 XC25 XO26 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH49 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH49 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH49 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH49 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC20 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC20 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC20 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC24 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC24 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC24 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH40 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC24 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC24 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC24 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH40 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XC21 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XC21 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XC21 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XC24 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XC24 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XC24 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XH40 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC20 XC21 XC22 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC20 XC21 XC22 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC20 XC21 XC22 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC20 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC20 XC21 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC20 XC21 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XC22 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC24 XC23 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC24 XC23 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC24 XC23 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC24 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC24 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC24 XH47 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC24 XH47 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC24 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC24 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC24 XH48 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC24 XH48 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC24 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC24 XC23 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC24 XC23 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC24 XC23 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC24 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC24 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC24 XH47 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC24 XH47 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC24 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC24 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC24 XH48 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC24 XH48 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC24 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC24 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC24 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC24 XC23 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC24 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC24 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC24 XH47 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC24 XH47 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC24 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC24 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC24 XH48 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC24 XH48 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC24 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC23 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC23 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC24 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC24 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC24 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH46 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC24 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH46 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XC24 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH46 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XC20 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XC20 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XC20 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH47 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH47 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH48 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH48 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH45 XC23 XC24 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH45 XC23 XC24 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH45 XC23 XC24 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH45 XC23 XC24 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH45 XC23 XC24 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH45 XC23 XC24 XH47 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH45 XC23 XC24 XH47 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH45 XC23 XC24 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH45 XC23 XC24 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH45 XC23 XC24 XH48 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH45 XC23 XC24 XH48 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH45 XC23 XC24 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH47 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH47 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH48 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH48 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC25 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH49 XC3 XN4 XH30 1.000 180.000 -XC6 XH31 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC19 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH32 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH33 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH34 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC19 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC18 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC14 XH35 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC15 XH36 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH37 XC15 XC14 1.100 180.000 -XCl17 XC18 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC16 XH38 XC18 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH39 XC19 XC7 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC25 XO26 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13g.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13g.lib deleted file mode 100644 index 41ab1ab6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13g.lib +++ /dev/null @@ -1,163 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 52 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.3780 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 0.0000 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 0.1800 - 17 Cl17 XCl17 -0.1800 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 0.0100 - 21 C21 XC21 -0.1200 - 22 C22 XC22 -0.1200 - 23 C23 XC23 -0.1200 - 24 C24 XC24 -0.1200 - 25 C25 XC25 -0.1200 - 26 C26 XC26 0.6225 - 27 O27 XO27 -0.5000 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.0600 - 31 H31 XH31 0.4600 - 32 H32 XH32 0.3451 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.0600 - 44 H44 XH44 0.0600 - 45 H45 XH45 0.0600 - 46 H46 XH46 0.0600 - 47 H47 XH47 0.0600 - 48 H48 XH48 0.0600 - 49 H49 XH49 0.0600 - 50 H50 XH50 0.0600 - 51 H51 XH51 0.0600 - 52 H52 XH52 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H28 -C1 H29 -C1 H30 -N2 C3 -N2 C26 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H31 -N4 H52 -N5 C6 -N5 H32 -C6 C7 -C6 C20 -C6 C26 -C7 C8 -C7 C19 -C8 C9 -C8 H33 -C9 C10 -C9 H34 -C10 C11 -C10 H35 -C11 C12 -C11 C19 -C12 C13 -C12 C18 -C13 C14 -C13 H36 -C14 C15 -C14 H37 -C15 C16 -C15 H38 -C16 Cl17 -C16 C18 -C18 H39 -C19 H40 -C20 C21 -C20 C25 -C20 H41 -C21 C22 -C21 H42 -C21 H43 -C22 C23 -C22 H44 -C22 H45 -C23 C24 -C23 H46 -C23 H47 -C24 C25 -C24 H48 -C24 H49 -C25 H50 -C25 H51 -C26 O27 - -[impropers] -C26 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H52 C3 N4 H31 -C6 H32 N5 C3 -C8 C19 C7 C6 -C9 H33 C8 C7 -C10 H34 C9 C8 -C11 H35 C10 C9 -C12 C19 C11 C10 -C13 C18 C12 C11 -C14 H36 C13 C12 -C15 H37 C14 C13 -C16 H38 C15 C14 -Cl17 C18 C16 C15 -C16 H39 C18 C12 -C11 H40 C19 C7 -N2 C6 C26 O27 - -[charge_groups] -C1 H28 H29 H30 -N2 -C3 -N4 H31 H52 -N5 H32 -C6 -C7 -C8 H33 -C9 H34 -C10 H35 -C11 -C12 -C13 H36 -C14 H37 -C15 H38 -C16 -Cl17 -C18 H39 -C19 H40 -C20 H41 -C21 H42 H43 -C22 H44 H45 -C23 H46 H47 -C24 H48 H49 -C25 H50 H51 -C26 -O27 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13g.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13g.prm deleted file mode 100644 index ee2318d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13g.prm +++ /dev/null @@ -1,864 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl17 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC23 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC24 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC25 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC26 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO27 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH44 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH45 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH46 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH47 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH48 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH49 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH50 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH51 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH52 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XC1 XH30 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC26 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH31 868.0 1.010 -XN4 XH52 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH32 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC20 536.0 1.529 -XC6 XC26 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC19 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH33 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH34 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH35 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC19 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC18 938.0 1.400 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH36 734.0 1.080 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH37 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH38 734.0 1.080 -XC16 XCl17 600.0 1.725 -XC16 XC18 938.0 1.400 -XC18 XH39 734.0 1.080 -XC19 XH40 734.0 1.080 -XC20 XC21 536.0 1.529 -XC20 XC25 536.0 1.529 -XC20 XH41 680.0 1.090 -XC21 XC22 536.0 1.529 -XC21 XH42 680.0 1.090 -XC21 XH43 680.0 1.090 -XC22 XC23 536.0 1.529 -XC22 XH44 680.0 1.090 -XC22 XH45 680.0 1.090 -XC23 XC24 536.0 1.529 -XC23 XH46 680.0 1.090 -XC23 XH47 680.0 1.090 -XC24 XC25 536.0 1.529 -XC24 XH48 680.0 1.090 -XC24 XH49 680.0 1.090 -XC25 XH50 680.0 1.090 -XC25 XH51 680.0 1.090 -XC26 XO27 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH30 70.00 109.500 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC1 XH30 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC26 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC26 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH31 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH52 70.00 120.000 -XH31 XN4 XH52 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH32 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH32 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC20 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC26 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC20 140.00 112.175 -XC7 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC20 XC6 XC26 126.00 111.100 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC19 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC19 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH35 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH35 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC19 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC18 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC18 126.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH36 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH36 70.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC16 XCl17 150.00 120.000 -XC15 XC16 XC18 126.00 120.000 -XCl17 XC16 XC18 150.00 120.000 -XC12 XC18 XC16 126.00 120.000 -XC12 XC18 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC18 XH39 70.00 120.000 -XC7 XC19 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC11 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC6 XC20 XC21 116.70 112.700 -XC6 XC20 XC25 116.70 112.700 -XC6 XC20 XH41 75.00 110.700 -XC21 XC20 XC25 116.70 112.700 -XC21 XC20 XH41 75.00 110.700 -XC25 XC20 XH41 75.00 110.700 -XC20 XC21 XC22 116.70 112.700 -XC20 XC21 XH42 75.00 110.700 -XC20 XC21 XH43 75.00 110.700 -XC22 XC21 XH42 75.00 110.700 -XC22 XC21 XH43 75.00 110.700 -XH42 XC21 XH43 66.00 107.800 -XC21 XC22 XC23 116.70 112.700 -XC21 XC22 XH44 75.00 110.700 -XC21 XC22 XH45 75.00 110.700 -XC23 XC22 XH44 75.00 110.700 -XC23 XC22 XH45 75.00 110.700 -XH44 XC22 XH45 66.00 107.800 -XC22 XC23 XC24 116.70 112.700 -XC22 XC23 XH46 75.00 110.700 -XC22 XC23 XH47 75.00 110.700 -XC24 XC23 XH46 75.00 110.700 -XC24 XC23 XH47 75.00 110.700 -XH46 XC23 XH47 66.00 107.800 -XC23 XC24 XC25 116.70 112.700 -XC23 XC24 XH48 75.00 110.700 -XC23 XC24 XH49 75.00 110.700 -XC25 XC24 XH48 75.00 110.700 -XC25 XC24 XH49 75.00 110.700 -XH48 XC24 XH49 66.00 107.800 -XC20 XC25 XC24 116.70 112.700 -XC20 XC25 XH50 75.00 110.700 -XC20 XC25 XH51 75.00 110.700 -XC24 XC25 XH50 75.00 110.700 -XC24 XC25 XH51 75.00 110.700 -XH50 XC25 XH51 66.00 107.800 -XN2 XC26 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC26 XO27 180.00 118.720 -XC6 XC26 XO27 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH52 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH52 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH52 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH52 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH52 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH52 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH52 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH52 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC20 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC20 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC20 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC25 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC25 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC25 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH41 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC25 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC25 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC25 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH41 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XC21 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XC21 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XC21 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XC25 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XC25 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XC25 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XH41 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC20 XC21 XC22 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC20 XC21 XC22 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC20 XC21 XC22 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC20 XC21 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC20 XC21 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC20 XC21 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC20 XC21 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC20 XC21 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC20 XC21 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC25 XC24 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC25 XC24 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC25 XC24 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC25 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC25 XH50 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC25 XH50 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC25 XH50 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC25 XH50 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC25 XH51 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC25 XH51 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC25 XH51 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC25 XH51 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC25 XC24 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC25 XC24 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC25 XC24 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC25 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC25 XH50 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC25 XH50 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC25 XH50 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC25 XH50 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC25 XH51 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC25 XH51 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC25 XH51 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC25 XH51 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC25 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC25 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC25 XC24 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC25 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC25 XH50 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC25 XH50 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC25 XH50 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC25 XH50 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC25 XH51 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC25 XH51 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC25 XH51 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC25 XH51 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC23 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XC23 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC24 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC24 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC24 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH46 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH47 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH47 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XC24 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH46 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH47 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH47 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH44 XC22 XC23 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH45 XC22 XC23 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH45 XC22 XC23 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH45 XC22 XC23 XC24 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH45 XC22 XC23 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH45 XC22 XC23 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH45 XC22 XC23 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH45 XC22 XC23 XH46 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH45 XC22 XC23 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH45 XC22 XC23 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH45 XC22 XC23 XH47 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH45 XC22 XC23 XH47 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH45 XC22 XC23 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XC25 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XC25 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XC25 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH48 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH48 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH49 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH49 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XC25 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH48 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH48 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH49 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH49 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH46 XC23 XC24 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH47 XC23 XC24 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH47 XC23 XC24 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH47 XC23 XC24 XC25 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH47 XC23 XC24 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH47 XC23 XC24 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH47 XC23 XC24 XH48 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH47 XC23 XC24 XH48 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH47 XC23 XC24 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH47 XC23 XC24 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH47 XC23 XC24 XH49 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH47 XC23 XC24 XH49 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH47 XC23 XC24 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC24 XC25 XC20 0.568 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC24 XC25 XC20 -0.075 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC24 XC25 XC20 0.200 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC24 XC25 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC24 XC25 XH50 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC24 XC25 XH50 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC24 XC25 XH50 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC24 XC25 XH50 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC24 XC25 XH51 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC24 XC25 XH51 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC24 XC25 XH51 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC24 XC25 XH51 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH48 XC24 XC25 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH48 XC24 XC25 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH48 XC24 XC25 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH48 XC24 XC25 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH48 XC24 XC25 XH50 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH48 XC24 XC25 XH50 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH48 XC24 XC25 XH50 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH48 XC24 XC25 XH50 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH48 XC24 XC25 XH51 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH48 XC24 XC25 XH51 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH48 XC24 XC25 XH51 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH48 XC24 XC25 XH51 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH49 XC24 XC25 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH49 XC24 XC25 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH49 XC24 XC25 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH49 XC24 XC25 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH49 XC24 XC25 XH50 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH49 XC24 XC25 XH50 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH49 XC24 XC25 XH50 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH49 XC24 XC25 XH50 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH49 XC24 XC25 XH51 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH49 XC24 XC25 XH51 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH49 XC24 XC25 XH51 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH49 XC24 XC25 XH51 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC26 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH52 XC3 XN4 XH31 1.000 180.000 -XC6 XH32 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC19 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH33 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH34 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH35 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC19 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC18 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC14 XH36 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC15 XH37 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH38 XC15 XC14 1.100 180.000 -XCl17 XC18 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC16 XH39 XC18 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH40 XC19 XC7 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC26 XO27 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13h.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13h.lib deleted file mode 100644 index ddc4bb50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13h.lib +++ /dev/null @@ -1,149 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 46 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.4480 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 0.0000 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 0.1800 - 17 Cl17 XCl17 -0.1800 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 0.0000 - 21 C21 XC21 -0.1800 - 22 C22 XC22 -0.1200 - 23 C23 XC23 -0.1200 - 24 C24 XC24 0.6225 - 25 O25 XO25 -0.5000 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.4600 - 30 H30 XH30 0.3451 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.0600 - 40 H40 XH40 0.0600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.0600 - 44 H44 XH44 0.0600 - 45 H45 XH45 0.0600 - 46 H46 XH46 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H26 -C1 H27 -C1 H28 -N2 C3 -N2 C24 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H29 -N4 H46 -N5 C6 -N5 H30 -C6 C7 -C6 C20 -C6 C24 -C7 C8 -C7 C19 -C8 C9 -C8 H31 -C9 C10 -C9 H32 -C10 C11 -C10 H33 -C11 C12 -C11 C19 -C12 C13 -C12 C18 -C13 C14 -C13 H34 -C14 C15 -C14 H35 -C15 C16 -C15 H36 -C16 Cl17 -C16 C18 -C18 H37 -C19 H38 -C20 C21 -C20 C22 -C20 C23 -C21 H39 -C21 H40 -C21 H41 -C22 C23 -C22 H42 -C22 H43 -C23 H44 -C23 H45 -C24 O25 - -[impropers] -C24 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H46 C3 N4 H29 -C6 H30 N5 C3 -C8 C19 C7 C6 -C9 H31 C8 C7 -C10 H32 C9 C8 -C11 H33 C10 C9 -C12 C19 C11 C10 -C13 C18 C12 C11 -C14 H34 C13 C12 -C15 H35 C14 C13 -C16 H36 C15 C14 -Cl17 C18 C16 C15 -C16 H37 C18 C12 -C11 H38 C19 C7 -N2 C6 C24 O25 - -[charge_groups] -C1 H26 H27 H28 -N2 -C3 -N4 H29 H46 -N5 H30 -C6 -C7 -C8 H31 -C9 H32 -C10 H33 -C11 -C12 -C13 H34 -C14 H35 -C15 H36 -C16 -Cl17 -C18 H37 -C19 H38 -C20 -C21 H39 H40 H41 -C22 H42 H43 -C23 H44 H45 -C24 -O25 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13h.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13h.prm deleted file mode 100644 index 141b2aff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13h.prm +++ /dev/null @@ -1,756 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl17 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC23 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC24 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO25 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH40 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH44 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH45 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH46 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC24 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH29 868.0 1.010 -XN4 XH46 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH30 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC20 550.0 1.510 -XC6 XC24 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC19 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH31 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH32 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH33 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC19 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC18 938.0 1.400 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH34 734.0 1.080 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH35 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH36 734.0 1.080 -XC16 XCl17 600.0 1.725 -XC16 XC18 938.0 1.400 -XC18 XH37 734.0 1.080 -XC19 XH38 734.0 1.080 -XC20 XC21 550.0 1.510 -XC20 XC22 520.0 1.509 -XC20 XC23 520.0 1.509 -XC21 XH39 680.0 1.090 -XC21 XH40 680.0 1.090 -XC21 XH41 680.0 1.090 -XC22 XC23 520.0 1.509 -XC22 XH42 680.0 1.088 -XC22 XH43 680.0 1.088 -XC23 XH44 680.0 1.088 -XC23 XH45 680.0 1.088 -XC24 XO25 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC24 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC24 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH29 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH46 70.00 120.000 -XH29 XN4 XH46 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH30 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH30 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC20 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC24 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC20 140.00 111.440 -XC7 XC6 XC24 140.00 109.443 -XC20 XC6 XC24 126.00 111.100 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC19 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC19 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH31 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH31 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH33 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC19 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC18 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC18 126.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH34 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH34 70.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH35 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH35 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH36 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH36 70.00 120.000 -XC15 XC16 XCl17 150.00 120.000 -XC15 XC16 XC18 126.00 120.000 -XCl17 XC16 XC18 150.00 120.000 -XC12 XC18 XC16 126.00 120.000 -XC12 XC18 XH37 70.00 120.000 -XC16 XC18 XH37 70.00 120.000 -XC7 XC19 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC19 XH38 70.00 120.000 -XC11 XC19 XH38 70.00 120.000 -XC6 XC20 XC21 116.70 112.700 -XC6 XC20 XC22 120.00 120.940 -XC6 XC20 XC23 120.00 120.940 -XC21 XC20 XC22 120.00 120.940 -XC21 XC20 XC23 120.00 120.940 -XC22 XC20 XC23 20.00 60.0050 -XC20 XC21 XH39 90.00 109.384 -XC20 XC21 XH40 90.00 109.384 -XC20 XC21 XH41 90.00 109.384 -XH39 XC21 XH40 66.00 107.800 -XH39 XC21 XH41 66.00 107.800 -XH40 XC21 XH41 66.00 107.800 -XC20 XC22 XC23 20.00 60.0050 -XC20 XC22 XH42 75.00 117.200 -XC20 XC22 XH43 75.00 117.200 -XC23 XC22 XH42 75.00 117.200 -XC23 XC22 XH43 75.00 117.200 -XH42 XC22 XH43 70.00 114.300 -XC20 XC23 XC22 20.00 60.0050 -XC20 XC23 XH44 75.00 117.200 -XC20 XC23 XH45 75.00 117.200 -XC22 XC23 XH44 75.00 117.200 -XC22 XC23 XH45 75.00 117.200 -XH44 XC23 XH45 70.00 114.300 -XN2 XC24 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC24 XO25 180.00 118.720 -XC6 XC24 XO25 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC20 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC20 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC20 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC23 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC23 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC23 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC23 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC23 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC23 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC21 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC21 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC21 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC22 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC22 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC22 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC23 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC23 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC23 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC20 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC23 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC23 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC23 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XC23 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XC23 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XC23 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC22 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC20 XC22 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC20 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XC22 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XC22 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XC22 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XC22 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XC22 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XC22 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC23 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC22 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC22 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC22 XC23 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC22 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC22 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH44 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH45 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC24 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH46 XC3 XN4 XH29 1.000 180.000 -XC6 XH30 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC19 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH31 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH32 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH33 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC19 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC18 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC14 XH34 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC15 XH35 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH36 XC15 XC14 1.100 180.000 -XCl17 XC18 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC16 XH37 XC18 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH38 XC19 XC7 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC24 XO25 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13i.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13i.lib deleted file mode 100644 index 32f11d03..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13i.lib +++ /dev/null @@ -1,149 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 46 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.3780 - 7 C7 XC7 -0.0500 - 8 C8 XC8 -0.0600 - 9 C9 XC9 -0.1200 - 10 C10 XC10 -0.1200 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 0.0000 - 16 C16 XC16 0.0000 - 17 C17 XC17 -0.1150 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 0.1800 - 21 Cl21 XCl21 -0.1800 - 22 C22 XC22 -0.1150 - 23 C23 XC23 -0.1150 - 24 C24 XC24 0.6225 - 25 O25 XO25 -0.5000 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.4600 - 30 H30 XH30 0.3451 - 31 H31 XH31 0.0600 - 32 H32 XH32 0.0600 - 33 H33 XH33 0.0600 - 34 H34 XH34 0.0600 - 35 H35 XH35 0.0600 - 36 H36 XH36 0.0600 - 37 H37 XH37 0.0600 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.1150 - 42 H42 XH42 0.1150 - 43 H43 XH43 0.1150 - 44 H44 XH44 0.1150 - 45 H45 XH45 0.1150 - 46 H46 XH46 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H26 -C1 H27 -C1 H28 -N2 C3 -N2 C24 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H29 -N4 H46 -N5 C6 -N5 H30 -C6 C7 -C6 C11 -C6 C24 -C7 C8 -C7 H31 -C7 H32 -C8 C9 -C8 C10 -C8 H33 -C9 C10 -C9 H34 -C9 H35 -C10 H36 -C10 H37 -C11 C12 -C11 C23 -C12 C13 -C12 H38 -C13 C14 -C13 H39 -C14 C15 -C14 H40 -C15 C16 -C15 C23 -C16 C17 -C16 C22 -C17 C18 -C17 H41 -C18 C19 -C18 H42 -C19 C20 -C19 H43 -C20 Cl21 -C20 C22 -C22 H44 -C23 H45 -C24 O25 - -[impropers] -C24 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H46 C3 N4 H29 -C6 H30 N5 C3 -C12 C23 C11 C6 -C13 H38 C12 C11 -C14 H39 C13 C12 -C15 H40 C14 C13 -C16 C23 C15 C14 -C17 C22 C16 C15 -C18 H41 C17 C16 -C19 H42 C18 C17 -C20 H43 C19 C18 -Cl21 C22 C20 C19 -C20 H44 C22 C16 -C15 H45 C23 C11 -N2 C6 C24 O25 - -[charge_groups] -C1 H26 H27 H28 -N2 -C3 -N4 H29 H46 -N5 H30 -C6 -C7 H31 H32 -C8 H33 -C9 H34 H35 -C10 H36 H37 -C11 -C12 H38 -C13 H39 -C14 H40 -C15 -C16 -C17 H41 -C18 H42 -C19 H43 -C20 -Cl21 -C22 H44 -C23 H45 -C24 -O25 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13i.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13i.prm deleted file mode 100644 index ce233738..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13i.prm +++ /dev/null @@ -1,756 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC8 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC9 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC10 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl21 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC23 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC24 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO25 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH32 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH33 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH34 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH35 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH36 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH37 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH46 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC24 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH29 868.0 1.010 -XN4 XH46 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH30 868.0 1.010 -XC6 XC7 536.0 1.529 -XC6 XC11 634.0 1.510 -XC6 XC24 634.0 1.522 -XC7 XC8 550.0 1.510 -XC7 XH31 680.0 1.090 -XC7 XH32 680.0 1.090 -XC8 XC9 520.0 1.509 -XC8 XC10 520.0 1.509 -XC8 XH33 680.0 1.088 -XC9 XC10 520.0 1.509 -XC9 XH34 680.0 1.088 -XC9 XH35 680.0 1.088 -XC10 XH36 680.0 1.088 -XC10 XH37 680.0 1.088 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XC23 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XH38 734.0 1.080 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH39 734.0 1.080 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH40 734.0 1.080 -XC15 XC16 750.0 1.464 -XC15 XC23 938.0 1.400 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XC22 938.0 1.400 -XC17 XC18 938.0 1.400 -XC17 XH41 734.0 1.080 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XH42 734.0 1.080 -XC19 XC20 938.0 1.400 -XC19 XH43 734.0 1.080 -XC20 XCl21 600.0 1.725 -XC20 XC22 938.0 1.400 -XC22 XH44 734.0 1.080 -XC23 XH45 734.0 1.080 -XC24 XO25 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC24 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC24 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH29 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH46 70.00 120.000 -XH29 XN4 XH46 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH30 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH30 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC11 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC24 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC11 140.00 112.175 -XC7 XC6 XC24 126.00 111.100 -XC11 XC6 XC24 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 112.373 -XC6 XC7 XH31 75.00 110.700 -XC6 XC7 XH32 75.00 110.700 -XC8 XC7 XH31 90.00 109.384 -XC8 XC7 XH32 90.00 109.384 -XH31 XC7 XH32 66.00 107.800 -XC7 XC8 XC9 120.00 120.940 -XC7 XC8 XC10 120.00 120.940 -XC7 XC8 XH33 80.00 115.045 -XC9 XC8 XC10 20.00 60.0050 -XC9 XC8 XH33 75.00 117.200 -XC10 XC8 XH33 75.00 117.200 -XC8 XC9 XC10 20.00 60.0050 -XC8 XC9 XH34 75.00 117.200 -XC8 XC9 XH35 75.00 117.200 -XC10 XC9 XH34 75.00 117.200 -XC10 XC9 XH35 75.00 117.200 -XH34 XC9 XH35 70.00 114.300 -XC8 XC10 XC9 20.00 60.0050 -XC8 XC10 XH36 75.00 117.200 -XC8 XC10 XH37 75.00 117.200 -XC9 XC10 XH36 75.00 117.200 -XC9 XC10 XH37 75.00 117.200 -XH36 XC10 XH37 70.00 114.300 -XC6 XC11 XC12 140.00 120.000 -XC6 XC11 XC23 140.00 120.000 -XC12 XC11 XC23 126.00 120.000 -XC11 XC12 XC13 126.00 120.000 -XC11 XC12 XH38 70.00 120.000 -XC13 XC12 XH38 70.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH39 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH39 70.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH40 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH40 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 120.00 122.760 -XC14 XC15 XC23 126.00 120.000 -XC16 XC15 XC23 120.00 122.760 -XC15 XC16 XC17 120.00 122.760 -XC15 XC16 XC22 120.00 122.760 -XC17 XC16 XC22 126.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 126.00 120.000 -XC16 XC17 XH41 70.00 120.000 -XC18 XC17 XH41 70.00 120.000 -XC17 XC18 XC19 126.00 120.000 -XC17 XC18 XH42 70.00 120.000 -XC19 XC18 XH42 70.00 120.000 -XC18 XC19 XC20 126.00 120.000 -XC18 XC19 XH43 70.00 120.000 -XC20 XC19 XH43 70.00 120.000 -XC19 XC20 XCl21 150.00 120.000 -XC19 XC20 XC22 126.00 120.000 -XCl21 XC20 XC22 150.00 120.000 -XC16 XC22 XC20 126.00 120.000 -XC16 XC22 XH44 70.00 120.000 -XC20 XC22 XH44 70.00 120.000 -XC11 XC23 XC15 126.00 120.000 -XC11 XC23 XH45 70.00 120.000 -XC15 XC23 XH45 70.00 120.000 -XN2 XC24 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC24 XO25 180.00 118.720 -XC6 XC24 XO25 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC11 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC11 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC11 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC11 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH31 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH31 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH32 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH32 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC6 XC7 XC8 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC6 XC7 XC8 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC6 XC7 XC8 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC6 XC7 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC6 XC7 XH31 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC6 XC7 XH31 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC6 XC7 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC6 XC7 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC6 XC7 XH32 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC6 XC7 XH32 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC6 XC7 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XH31 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XH31 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XH32 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XH32 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC11 XC12 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC11 XC12 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC11 XC12 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC11 XC23 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC11 XC23 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC11 XC23 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC11 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC11 XC12 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC11 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC11 XC23 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC11 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC11 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC11 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC11 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC11 XC23 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC11 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC11 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC6 XC24 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC6 XC24 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC6 XC24 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC10 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC10 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC10 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC9 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC9 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC10 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC10 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XH33 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XH33 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC7 XC8 XC9 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC7 XC8 XC9 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC7 XC8 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC7 XC8 XC10 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC7 XC8 XC10 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC7 XC8 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC7 XC8 XH33 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC7 XC8 XH33 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC8 XC9 XH34 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC8 XC9 XH34 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC8 XC9 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC8 XC9 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC8 XC9 XH35 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC8 XC9 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH35 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC10 XC9 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC10 XC9 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC10 XC9 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC10 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC10 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC10 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC10 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC10 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC10 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC10 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC10 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC10 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC10 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC10 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC10 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC10 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC10 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC10 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC10 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC10 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC10 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC10 XC9 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC10 XC9 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC10 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC10 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC10 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC10 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC10 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC10 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC10 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC10 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC10 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC8 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC8 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC8 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC8 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC11 XC12 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC11 XC12 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC11 XC12 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC11 XC12 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC11 XC23 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC11 XC23 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC11 XC23 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC11 XC23 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC11 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC11 XC23 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC11 XC23 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC11 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC12 XC13 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC12 XC13 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC12 XC13 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC12 XC13 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC13 XC14 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC13 XC14 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC13 XC14 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC13 XC14 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC14 XC15 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC14 XC15 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC14 XC15 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC14 XC15 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC22 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC22 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC22 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC15 XC16 XC17 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC15 XC16 XC17 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC15 XC16 XC17 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC15 XC16 XC22 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC15 XC16 XC22 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC15 XC16 XC22 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC15 XC16 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC23 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC23 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC23 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC23 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC23 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC23 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC15 XC23 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC15 XC23 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC15 XC23 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC15 XC23 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC15 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC15 XC23 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC15 XC23 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC15 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC16 XC17 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC16 XC17 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC16 XC17 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC16 XC17 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC22 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC22 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC22 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC22 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC22 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC22 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC16 XC22 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC16 XC22 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC16 XC22 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC16 XC22 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC16 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC16 XC22 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC16 XC22 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC16 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC17 XC18 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC17 XC18 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC17 XC18 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC17 XC18 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC17 XC18 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC17 XC18 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC17 XC18 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC18 XC19 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC18 XC19 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC18 XC19 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC18 XC19 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XCl21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XCl21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XCl21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XCl21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC19 XC20 XCl21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC19 XC20 XCl21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC19 XC20 XCl21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC19 XC20 XCl21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC19 XC20 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC19 XC20 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC19 XC20 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC19 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC22 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC22 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC22 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC22 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC22 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC22 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl21 XC20 XC22 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl21 XC20 XC22 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl21 XC20 XC22 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl21 XC20 XC22 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl21 XC20 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl21 XC20 XC22 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl21 XC20 XC22 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl21 XC20 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC24 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH46 XC3 XN4 XH29 1.000 180.000 -XC6 XH30 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC12 XC23 XC11 XC6 4.000 180.000 -XC13 XH38 XC12 XC11 1.100 180.000 -XC14 XH39 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC15 XH40 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XC23 XC15 XC14 4.000 180.000 -XC17 XC22 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC18 XH41 XC17 XC16 1.100 180.000 -XC19 XH42 XC18 XC17 1.100 180.000 -XC20 XH43 XC19 XC18 1.100 180.000 -XCl21 XC22 XC20 XC19 4.000 180.000 -XC20 XH44 XC22 XC16 1.100 180.000 -XC15 XH45 XC23 XC11 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC24 XO25 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13j.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13j.lib deleted file mode 100644 index 118d1bf4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13j.lib +++ /dev/null @@ -1,154 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 45 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 0.0000 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 0.1800 - 17 Cl17 XCl17 -0.1800 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 0.3700 - 21 C21 XC21 -0.4470 - 22 C22 XC22 0.2270 - 23 C23 XC23 -0.4470 - 24 C24 XC24 0.4730 - 25 N25 XN25 -0.6780 - 26 C26 XC26 0.6225 - 27 O27 XO27 -0.5000 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.0600 - 31 H31 XH31 0.4600 - 32 H32 XH32 0.3451 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.1550 - 42 H42 XH42 0.0650 - 43 H43 XH43 0.1550 - 44 H44 XH44 0.0120 - 45 H45 XH45 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H28 -C1 H29 -C1 H30 -N2 C3 -N2 C26 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H31 -N4 H45 -N5 C6 -N5 H32 -C6 C7 -C6 C20 -C6 C26 -C7 C8 -C7 C19 -C8 C9 -C8 H33 -C9 C10 -C9 H34 -C10 C11 -C10 H35 -C11 C12 -C11 C19 -C12 C13 -C12 C18 -C13 C14 -C13 H36 -C14 C15 -C14 H37 -C15 C16 -C15 H38 -C16 Cl17 -C16 C18 -C18 H39 -C19 H40 -C20 C21 -C20 N25 -C21 C22 -C21 H41 -C22 C23 -C22 H42 -C23 C24 -C23 H43 -C24 N25 -C24 H44 -C26 O27 - -[impropers] -C26 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H45 C3 N4 H31 -C6 H32 N5 C3 -C8 C19 C7 C6 -C9 H33 C8 C7 -C10 H34 C9 C8 -C11 H35 C10 C9 -C12 C19 C11 C10 -C13 C18 C12 C11 -C14 H36 C13 C12 -C15 H37 C14 C13 -C16 H38 C15 C14 -Cl17 C18 C16 C15 -C16 H39 C18 C12 -C11 H40 C19 C7 -C21 N25 C20 C6 -C22 H41 C21 C20 -C23 H42 C22 C21 -C24 H43 C23 C22 -N25 H44 C24 C23 -N2 C6 C26 O27 - -[charge_groups] -C1 H28 H29 H30 -N2 -C3 -N4 H31 H45 -N5 H32 -C6 -C7 -C8 H33 -C9 H34 -C10 H35 -C11 -C12 -C13 H36 -C14 H37 -C15 H38 -C16 -Cl17 -C18 H39 -C19 H40 -C20 -C21 H41 -C22 H42 -C23 H43 -C24 H44 -N25 -C26 -O27 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13j.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13j.prm deleted file mode 100644 index f7d5a77a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13j.prm +++ /dev/null @@ -1,687 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl17 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC21 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC23 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN25 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC26 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO27 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XC1 XH30 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC26 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH31 868.0 1.010 -XN4 XH45 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH32 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC20 634.0 1.510 -XC6 XC26 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC19 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH33 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH34 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH35 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC19 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC18 938.0 1.400 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH36 734.0 1.080 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH37 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH38 734.0 1.080 -XC16 XCl17 600.0 1.725 -XC16 XC18 938.0 1.400 -XC18 XH39 734.0 1.080 -XC19 XH40 734.0 1.080 -XC20 XC21 938.0 1.400 -XC20 XN25 966.0 1.339 -XC21 XC22 938.0 1.400 -XC21 XH41 734.0 1.080 -XC22 XC23 938.0 1.400 -XC22 XH42 734.0 1.080 -XC23 XC24 938.0 1.400 -XC23 XH43 734.0 1.080 -XC24 XN25 966.0 1.339 -XC24 XH44 734.0 1.080 -XC26 XO27 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH30 70.00 109.500 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC1 XH30 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC26 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC26 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH31 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH45 70.00 120.000 -XH31 XN4 XH45 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH32 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH32 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC20 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC26 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC20 140.00 112.047 -XC7 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC20 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC19 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC19 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH35 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH35 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC19 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC18 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC18 126.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH36 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH36 70.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC16 XCl17 150.00 120.000 -XC15 XC16 XC18 126.00 120.000 -XCl17 XC16 XC18 150.00 120.000 -XC12 XC18 XC16 126.00 120.000 -XC12 XC18 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC18 XH39 70.00 120.000 -XC7 XC19 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC11 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC6 XC20 XC21 140.00 120.000 -XC6 XC20 XN25 150.00 115.747 -XC21 XC20 XN25 140.00 124.000 -XC20 XC21 XC22 126.00 120.000 -XC20 XC21 XH41 70.00 120.000 -XC22 XC21 XH41 70.00 120.000 -XC21 XC22 XC23 126.00 120.000 -XC21 XC22 XH42 70.00 120.000 -XC23 XC22 XH42 70.00 120.000 -XC22 XC23 XC24 126.00 120.000 -XC22 XC23 XH43 70.00 120.000 -XC24 XC23 XH43 70.00 120.000 -XC23 XC24 XN25 140.00 124.000 -XC23 XC24 XH44 70.00 120.000 -XN25 XC24 XH44 70.00 116.000 -XC20 XN25 XC24 140.00 117.000 -XN2 XC26 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC26 XO27 180.00 118.720 -XC6 XC26 XO27 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XC21 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XN25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XN25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XN25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XN25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN25 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN25 XC20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN25 XC20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN25 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN25 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN25 XC20 XC21 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN25 XC20 XC21 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN25 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XN25 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XN25 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XN25 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XN25 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XN25 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XN25 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XN25 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XN25 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XN25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XN25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XN25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XN25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC23 XC24 XN25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC23 XC24 XN25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC23 XC24 XN25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC23 XC24 XN25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC23 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC23 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC23 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC23 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC24 XN25 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC24 XN25 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC24 XN25 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC24 XN25 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH44 XC24 XN25 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH44 XC24 XN25 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH44 XC24 XN25 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH44 XC24 XN25 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC26 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH45 XC3 XN4 XH31 1.000 180.000 -XC6 XH32 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC19 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH33 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH34 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH35 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC19 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC18 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC14 XH36 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC15 XH37 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH38 XC15 XC14 1.100 180.000 -XCl17 XC18 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC16 XH39 XC18 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH40 XC19 XC7 1.100 180.000 -XC21 XN25 XC20 XC6 4.000 180.000 -XC22 XH41 XC21 XC20 1.100 180.000 -XC23 XH42 XC22 XC21 1.100 180.000 -XC24 XH43 XC23 XC22 1.100 180.000 -XN25 XH44 XC24 XC23 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC26 XO27 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13k.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13k.lib deleted file mode 100644 index 6ee971a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13k.lib +++ /dev/null @@ -1,154 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 45 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.4070 - 8 C8 XC8 0.2270 - 9 C9 XC9 -0.4470 - 10 C10 XC10 0.4730 - 11 N11 XN11 -0.6780 - 12 C12 XC12 0.4730 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 0.0000 - 18 C18 XC18 0.0000 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 -0.1150 - 21 C21 XC21 -0.1150 - 22 C22 XC22 0.1800 - 23 Cl23 XCl23 -0.1800 - 24 C24 XC24 -0.1150 - 25 C25 XC25 -0.1150 - 26 C26 XC26 0.6225 - 27 O27 XO27 -0.5000 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.0600 - 31 H31 XH31 0.4600 - 32 H32 XH32 0.3451 - 33 H33 XH33 0.0650 - 34 H34 XH34 0.1550 - 35 H35 XH35 0.0120 - 36 H36 XH36 0.0120 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.1150 - 42 H42 XH42 0.1150 - 43 H43 XH43 0.1150 - 44 H44 XH44 0.1150 - 45 H45 XH45 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H28 -C1 H29 -C1 H30 -N2 C3 -N2 C26 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H31 -N4 H45 -N5 C6 -N5 H32 -C6 C7 -C6 C13 -C6 C26 -C7 C8 -C7 C12 -C8 C9 -C8 H33 -C9 C10 -C9 H34 -C10 N11 -C10 H35 -N11 C12 -C12 H36 -C13 C14 -C13 C25 -C14 C15 -C14 H37 -C15 C16 -C15 H38 -C16 C17 -C16 H39 -C17 C18 -C17 C25 -C18 C19 -C18 C24 -C19 C20 -C19 H40 -C20 C21 -C20 H41 -C21 C22 -C21 H42 -C22 Cl23 -C22 C24 -C24 H43 -C25 H44 -C26 O27 - -[impropers] -C26 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H45 C3 N4 H31 -C6 H32 N5 C3 -C8 C12 C7 C6 -C9 H33 C8 C7 -C10 H34 C9 C8 -N11 H35 C10 C9 -N11 H36 C12 C7 -C14 C25 C13 C6 -C15 H37 C14 C13 -C16 H38 C15 C14 -C17 H39 C16 C15 -C18 C25 C17 C16 -C19 C24 C18 C17 -C20 H40 C19 C18 -C21 H41 C20 C19 -C22 H42 C21 C20 -Cl23 C24 C22 C21 -C22 H43 C24 C18 -C17 H44 C25 C13 -N2 C6 C26 O27 - -[charge_groups] -C1 H28 H29 H30 -N2 -C3 -N4 H31 H45 -N5 H32 -C6 -C7 -C8 H33 -C9 H34 -C10 H35 -N11 -C12 H36 -C13 -C14 H37 -C15 H38 -C16 H39 -C17 -C18 -C19 H40 -C20 H41 -C21 H42 -C22 -Cl23 -C24 H43 -C25 H44 -C26 -O27 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13k.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13k.prm deleted file mode 100644 index 494f409c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13k.prm +++ /dev/null @@ -1,687 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN11 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC21 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl23 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC25 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC26 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO27 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XC1 XH30 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC26 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH31 868.0 1.010 -XN4 XH45 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH32 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC13 634.0 1.510 -XC6 XC26 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC12 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH33 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH34 734.0 1.080 -XC10 XN11 966.0 1.339 -XC10 XH35 734.0 1.080 -XN11 XC12 966.0 1.339 -XC12 XH36 734.0 1.080 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC25 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH37 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH38 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH39 734.0 1.080 -XC17 XC18 750.0 1.464 -XC17 XC25 938.0 1.400 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XC24 938.0 1.400 -XC19 XC20 938.0 1.400 -XC19 XH40 734.0 1.080 -XC20 XC21 938.0 1.400 -XC20 XH41 734.0 1.080 -XC21 XC22 938.0 1.400 -XC21 XH42 734.0 1.080 -XC22 XCl23 600.0 1.725 -XC22 XC24 938.0 1.400 -XC24 XH43 734.0 1.080 -XC25 XH44 734.0 1.080 -XC26 XO27 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH30 70.00 109.500 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC1 XH30 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC26 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC26 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH31 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH45 70.00 120.000 -XH31 XN4 XH45 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH32 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH32 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC13 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC26 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC13 140.00 112.047 -XC7 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC13 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC12 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC12 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC9 XC10 XN11 140.00 124.000 -XC9 XC10 XH35 70.00 120.000 -XN11 XC10 XH35 70.00 116.000 -XC10 XN11 XC12 140.00 117.000 -XC7 XC12 XN11 140.00 124.000 -XC7 XC12 XH36 70.00 120.000 -XN11 XC12 XH36 70.00 116.000 -XC6 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC6 XC13 XC25 140.00 120.000 -XC14 XC13 XC25 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 120.00 122.760 -XC16 XC17 XC25 126.00 120.000 -XC18 XC17 XC25 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC19 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC24 120.00 122.760 -XC19 XC18 XC24 126.00 120.000 -XC18 XC19 XC20 126.00 120.000 -XC18 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC20 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC19 XC20 XC21 126.00 120.000 -XC19 XC20 XH41 70.00 120.000 -XC21 XC20 XH41 70.00 120.000 -XC20 XC21 XC22 126.00 120.000 -XC20 XC21 XH42 70.00 120.000 -XC22 XC21 XH42 70.00 120.000 -XC21 XC22 XCl23 150.00 120.000 -XC21 XC22 XC24 126.00 120.000 -XCl23 XC22 XC24 150.00 120.000 -XC18 XC24 XC22 126.00 120.000 -XC18 XC24 XH43 70.00 120.000 -XC22 XC24 XH43 70.00 120.000 -XC13 XC25 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC25 XH44 70.00 120.000 -XC17 XC25 XH44 70.00 120.000 -XN2 XC26 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC26 XO27 180.00 118.720 -XC6 XC26 XO27 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XN11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XN11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XN11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XN11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XN11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XN11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XN11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XN11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XN11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XN11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XN11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XN11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XN11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XN11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XN11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XN11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XN11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XN11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XN11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XN11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XN11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XN11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XN11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XN11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XCl23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XCl23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XCl23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XCl23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XCl23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XCl23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XCl23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XCl23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC26 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH45 XC3 XN4 XH31 1.000 180.000 -XC6 XH32 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC12 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH33 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH34 XC9 XC8 1.100 180.000 -XN11 XH35 XC10 XC9 1.100 180.000 -XN11 XH36 XC12 XC7 1.100 180.000 -XC14 XC25 XC13 XC6 4.000 180.000 -XC15 XH37 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH38 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH39 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XC25 XC17 XC16 4.000 180.000 -XC19 XC24 XC18 XC17 4.000 180.000 -XC20 XH40 XC19 XC18 1.100 180.000 -XC21 XH41 XC20 XC19 1.100 180.000 -XC22 XH42 XC21 XC20 1.100 180.000 -XCl23 XC24 XC22 XC21 4.000 180.000 -XC22 XH43 XC24 XC18 1.100 180.000 -XC17 XH44 XC25 XC13 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC26 XO27 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13m.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13m.lib deleted file mode 100644 index 7ca20a54..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13m.lib +++ /dev/null @@ -1,151 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 44 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.6070 - 8 C8 XC8 0.6530 - 9 N9 XN9 -0.8390 - 10 C10 XC10 0.8740 - 11 N11 XN11 -0.8390 - 12 C12 XC12 0.6530 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 0.0000 - 18 C18 XC18 0.0000 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 -0.1150 - 21 C21 XC21 -0.1150 - 22 C22 XC22 0.1800 - 23 Cl23 XCl23 -0.1800 - 24 C24 XC24 -0.1150 - 25 C25 XC25 -0.1150 - 26 C26 XC26 0.6225 - 27 O27 XO27 -0.5000 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.0600 - 31 H31 XH31 0.4600 - 32 H32 XH32 0.3451 - 33 H33 XH33 0.0110 - 34 H34 XH34 -0.0320 - 35 H35 XH35 0.0110 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.1150 - 42 H42 XH42 0.1150 - 43 H43 XH43 0.1150 - 44 H44 XH44 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H28 -C1 H29 -C1 H30 -N2 C3 -N2 C26 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H31 -N4 H44 -N5 C6 -N5 H32 -C6 C7 -C6 C13 -C6 C26 -C7 C8 -C7 C12 -C8 N9 -C8 H33 -N9 C10 -C10 N11 -C10 H34 -N11 C12 -C12 H35 -C13 C14 -C13 C25 -C14 C15 -C14 H36 -C15 C16 -C15 H37 -C16 C17 -C16 H38 -C17 C18 -C17 C25 -C18 C19 -C18 C24 -C19 C20 -C19 H39 -C20 C21 -C20 H40 -C21 C22 -C21 H41 -C22 Cl23 -C22 C24 -C24 H42 -C25 H43 -C26 O27 - -[impropers] -C26 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H44 C3 N4 H31 -C6 H32 N5 C3 -C8 C12 C7 C6 -N9 H33 C8 C7 -N11 H34 C10 N9 -N11 H35 C12 C7 -C14 C25 C13 C6 -C15 H36 C14 C13 -C16 H37 C15 C14 -C17 H38 C16 C15 -C18 C25 C17 C16 -C19 C24 C18 C17 -C20 H39 C19 C18 -C21 H40 C20 C19 -C22 H41 C21 C20 -Cl23 C24 C22 C21 -C22 H42 C24 C18 -C17 H43 C25 C13 -N2 C6 C26 O27 - -[charge_groups] -C1 H28 H29 H30 -N2 -C3 -N4 H31 H44 -N5 H32 -C6 -C7 -C8 H33 -N9 -C10 H34 -N11 -C12 H35 -C13 -C14 H36 -C15 H37 -C16 H38 -C17 -C18 -C19 H39 -C20 H40 -C21 H41 -C22 -Cl23 -C24 H42 -C25 H43 -C26 -O27 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13m.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13m.prm deleted file mode 100644 index d466a4d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13m.prm +++ /dev/null @@ -1,666 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN9 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN11 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC21 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl23 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC25 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC26 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO27 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XC1 XH30 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC26 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH31 868.0 1.010 -XN4 XH44 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH32 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC13 634.0 1.510 -XC6 XC26 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC12 938.0 1.400 -XC8 XN9 966.0 1.339 -XC8 XH33 734.0 1.080 -XN9 XC10 1004.0 1.324 -XC10 XN11 1004.0 1.324 -XC10 XH34 734.0 1.080 -XN11 XC12 966.0 1.339 -XC12 XH35 734.0 1.080 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC25 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH36 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH37 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH38 734.0 1.080 -XC17 XC18 750.0 1.464 -XC17 XC25 938.0 1.400 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XC24 938.0 1.400 -XC19 XC20 938.0 1.400 -XC19 XH39 734.0 1.080 -XC20 XC21 938.0 1.400 -XC20 XH40 734.0 1.080 -XC21 XC22 938.0 1.400 -XC21 XH41 734.0 1.080 -XC22 XCl23 600.0 1.725 -XC22 XC24 938.0 1.400 -XC24 XH42 734.0 1.080 -XC25 XH43 734.0 1.080 -XC26 XO27 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH30 70.00 109.500 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC1 XH30 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC26 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC26 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH31 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH44 70.00 120.000 -XH31 XN4 XH44 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH32 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH32 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC13 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC26 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC13 140.00 112.047 -XC7 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC13 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC12 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC12 126.00 120.000 -XC7 XC8 XN9 140.00 124.000 -XC7 XC8 XH33 70.00 120.000 -XN9 XC8 XH33 70.00 116.000 -XC8 XN9 XC10 140.00 118.600 -XN9 XC10 XN11 140.00 129.100 -XN9 XC10 XH34 70.00 115.450 -XN11 XC10 XH34 70.00 115.450 -XC10 XN11 XC12 140.00 118.600 -XC7 XC12 XN11 140.00 124.000 -XC7 XC12 XH35 70.00 120.000 -XN11 XC12 XH35 70.00 116.000 -XC6 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC6 XC13 XC25 140.00 120.000 -XC14 XC13 XC25 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH36 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH36 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH37 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH38 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 120.00 122.760 -XC16 XC17 XC25 126.00 120.000 -XC18 XC17 XC25 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC19 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC24 120.00 122.760 -XC19 XC18 XC24 126.00 120.000 -XC18 XC19 XC20 126.00 120.000 -XC18 XC19 XH39 70.00 120.000 -XC20 XC19 XH39 70.00 120.000 -XC19 XC20 XC21 126.00 120.000 -XC19 XC20 XH40 70.00 120.000 -XC21 XC20 XH40 70.00 120.000 -XC20 XC21 XC22 126.00 120.000 -XC20 XC21 XH41 70.00 120.000 -XC22 XC21 XH41 70.00 120.000 -XC21 XC22 XCl23 150.00 120.000 -XC21 XC22 XC24 126.00 120.000 -XCl23 XC22 XC24 150.00 120.000 -XC18 XC24 XC22 126.00 120.000 -XC18 XC24 XH42 70.00 120.000 -XC22 XC24 XH42 70.00 120.000 -XC13 XC25 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC25 XH43 70.00 120.000 -XC17 XC25 XH43 70.00 120.000 -XN2 XC26 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC26 XO27 180.00 118.720 -XC6 XC26 XO27 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XN9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XN9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XN9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XN9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XN9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XN9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XN9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XN9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XN11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XN11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XN11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XN11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XN11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XN11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XN11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XN11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XN9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XN9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XN9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XN9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XN9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XN9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XN9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XN9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XN9 XC10 XN11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XN9 XC10 XN11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XN9 XC10 XN11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XN9 XC10 XN11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XN9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XN9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XN9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XN9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN9 XC10 XN11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN9 XC10 XN11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN9 XC10 XN11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN9 XC10 XN11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XN11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XN11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XN11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XN11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XN11 XC12 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC19 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC19 XC20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC19 XC20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC19 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC19 XC20 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC19 XC20 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC19 XC20 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC19 XC20 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XCl23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XCl23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XCl23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XCl23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XCl23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XCl23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XCl23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XCl23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC26 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH44 XC3 XN4 XH31 1.000 180.000 -XC6 XH32 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC12 XC7 XC6 4.000 180.000 -XN9 XH33 XC8 XC7 1.100 180.000 -XN11 XH34 XC10 XN9 1.100 180.000 -XN11 XH35 XC12 XC7 1.100 180.000 -XC14 XC25 XC13 XC6 4.000 180.000 -XC15 XH36 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH37 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH38 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XC25 XC17 XC16 4.000 180.000 -XC19 XC24 XC18 XC17 4.000 180.000 -XC20 XH39 XC19 XC18 1.100 180.000 -XC21 XH40 XC20 XC19 1.100 180.000 -XC22 XH41 XC21 XC20 1.100 180.000 -XCl23 XC24 XC22 XC21 4.000 180.000 -XC22 XH42 XC24 XC18 1.100 180.000 -XC17 XH43 XC25 XC13 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC26 XO27 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13n.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13n.lib deleted file mode 100644 index 78f8575c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13n.lib +++ /dev/null @@ -1,151 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 44 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 0.0000 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 0.1800 - 17 Cl17 XCl17 -0.1800 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 0.7270 - 21 N21 XN21 -0.8390 - 22 C22 XC22 0.6530 - 23 C23 XC23 -0.6890 - 24 C24 XC24 0.6530 - 25 N25 XN25 -0.8390 - 26 C26 XC26 0.6225 - 27 O27 XO27 -0.5000 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.0600 - 31 H31 XH31 0.4600 - 32 H32 XH32 0.3451 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.0110 - 42 H42 XH42 0.1970 - 43 H43 XH43 0.0110 - 44 H44 XH44 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H28 -C1 H29 -C1 H30 -N2 C3 -N2 C26 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H31 -N4 H44 -N5 C6 -N5 H32 -C6 C7 -C6 C20 -C6 C26 -C7 C8 -C7 C19 -C8 C9 -C8 H33 -C9 C10 -C9 H34 -C10 C11 -C10 H35 -C11 C12 -C11 C19 -C12 C13 -C12 C18 -C13 C14 -C13 H36 -C14 C15 -C14 H37 -C15 C16 -C15 H38 -C16 Cl17 -C16 C18 -C18 H39 -C19 H40 -C20 N21 -C20 N25 -N21 C22 -C22 C23 -C22 H41 -C23 C24 -C23 H42 -C24 N25 -C24 H43 -C26 O27 - -[impropers] -C26 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H44 C3 N4 H31 -C6 H32 N5 C3 -C8 C19 C7 C6 -C9 H33 C8 C7 -C10 H34 C9 C8 -C11 H35 C10 C9 -C12 C19 C11 C10 -C13 C18 C12 C11 -C14 H36 C13 C12 -C15 H37 C14 C13 -C16 H38 C15 C14 -Cl17 C18 C16 C15 -C16 H39 C18 C12 -C11 H40 C19 C7 -N21 N25 C20 C6 -C23 H41 C22 N21 -C24 H42 C23 C22 -N25 H43 C24 C23 -N2 C6 C26 O27 - -[charge_groups] -C1 H28 H29 H30 -N2 -C3 -N4 H31 H44 -N5 H32 -C6 -C7 -C8 H33 -C9 H34 -C10 H35 -C11 -C12 -C13 H36 -C14 H37 -C15 H38 -C16 -Cl17 -C18 H39 -C19 H40 -C20 -N21 -C22 H41 -C23 H42 -C24 H43 -N25 -C26 -O27 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13n.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13n.prm deleted file mode 100644 index 3a5154ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13n.prm +++ /dev/null @@ -1,666 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl17 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN21 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC23 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN25 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC26 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO27 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XC1 XH30 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC26 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH31 868.0 1.010 -XN4 XH44 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH32 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC20 634.0 1.510 -XC6 XC26 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC19 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH33 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH34 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH35 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC19 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC18 938.0 1.400 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH36 734.0 1.080 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH37 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH38 734.0 1.080 -XC16 XCl17 600.0 1.725 -XC16 XC18 938.0 1.400 -XC18 XH39 734.0 1.080 -XC19 XH40 734.0 1.080 -XC20 XN21 1004.0 1.324 -XC20 XN25 1004.0 1.324 -XN21 XC22 966.0 1.339 -XC22 XC23 938.0 1.400 -XC22 XH41 734.0 1.080 -XC23 XC24 938.0 1.400 -XC23 XH42 734.0 1.080 -XC24 XN25 966.0 1.339 -XC24 XH43 734.0 1.080 -XC26 XO27 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH30 70.00 109.500 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC1 XH30 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC26 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC26 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH31 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH44 70.00 120.000 -XH31 XN4 XH44 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH32 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH32 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC20 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC26 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC20 140.00 112.047 -XC7 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC20 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC19 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC19 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH35 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH35 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC19 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC18 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC18 126.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH36 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH36 70.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC16 XCl17 150.00 120.000 -XC15 XC16 XC18 126.00 120.000 -XCl17 XC16 XC18 150.00 120.000 -XC12 XC18 XC16 126.00 120.000 -XC12 XC18 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC18 XH39 70.00 120.000 -XC7 XC19 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC11 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC6 XC20 XN21 150.00 115.747 -XC6 XC20 XN25 150.00 115.747 -XN21 XC20 XN25 140.00 129.100 -XC20 XN21 XC22 140.00 118.600 -XN21 XC22 XC23 140.00 124.000 -XN21 XC22 XH41 70.00 116.000 -XC23 XC22 XH41 70.00 120.000 -XC22 XC23 XC24 126.00 120.000 -XC22 XC23 XH42 70.00 120.000 -XC24 XC23 XH42 70.00 120.000 -XC23 XC24 XN25 140.00 124.000 -XC23 XC24 XH43 70.00 120.000 -XN25 XC24 XH43 70.00 116.000 -XC20 XN25 XC24 140.00 118.600 -XN2 XC26 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC26 XO27 180.00 118.720 -XC6 XC26 XO27 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN21 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN21 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XN21 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XN25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XN25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XN25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC20 XN25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XN21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XN21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XN21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN25 XC20 XN21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN25 XC20 XN21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN25 XC20 XN21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN25 XC20 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XN25 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XN25 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XN25 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XN25 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC20 XN25 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC20 XN25 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC20 XN25 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC20 XN25 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XN25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XN25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XN25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XN25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC23 XC24 XN25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC23 XC24 XN25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC23 XC24 XN25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC23 XC24 XN25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC23 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC23 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC23 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC23 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC24 XN25 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC24 XN25 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC24 XN25 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC24 XN25 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC24 XN25 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC24 XN25 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC24 XN25 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC24 XN25 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC26 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH44 XC3 XN4 XH31 1.000 180.000 -XC6 XH32 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC19 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH33 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH34 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH35 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC19 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC18 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC14 XH36 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC15 XH37 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH38 XC15 XC14 1.100 180.000 -XCl17 XC18 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC16 XH39 XC18 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH40 XC19 XC7 1.100 180.000 -XN21 XN25 XC20 XC6 4.000 180.000 -XC23 XH41 XC22 XN21 1.100 180.000 -XC24 XH42 XC23 XC22 1.100 180.000 -XN25 XH43 XC24 XC23 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC26 XO27 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13o.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13o.lib deleted file mode 100644 index eb35f3e3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13o.lib +++ /dev/null @@ -1,145 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 42 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 0.0000 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 0.1800 - 17 Cl17 XCl17 -0.1800 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 0.1859 - 21 N21 XN21 -0.4803 - 22 C22 XC22 0.1862 - 23 C23 XC23 -0.3376 - 24 S24 XS24 0.0010 - 25 C25 XC25 0.6225 - 26 O26 XO26 -0.5000 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.4600 - 31 H31 XH31 0.3451 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.0981 - 41 H41 XH41 0.2317 - 42 H42 XH42 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H27 -C1 H28 -C1 H29 -N2 C3 -N2 C25 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H30 -N4 H42 -N5 C6 -N5 H31 -C6 C7 -C6 C20 -C6 C25 -C7 C8 -C7 C19 -C8 C9 -C8 H32 -C9 C10 -C9 H33 -C10 C11 -C10 H34 -C11 C12 -C11 C19 -C12 C13 -C12 C18 -C13 C14 -C13 H35 -C14 C15 -C14 H36 -C15 C16 -C15 H37 -C16 Cl17 -C16 C18 -C18 H38 -C19 H39 -C20 N21 -C20 S24 -N21 C22 -C22 C23 -C22 H40 -C23 S24 -C23 H41 -C25 O26 - -[impropers] -C25 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H42 C3 N4 H30 -C6 H31 N5 C3 -C8 C19 C7 C6 -C9 H32 C8 C7 -C10 H33 C9 C8 -C11 H34 C10 C9 -C12 C19 C11 C10 -C13 C18 C12 C11 -C14 H35 C13 C12 -C15 H36 C14 C13 -C16 H37 C15 C14 -Cl17 C18 C16 C15 -C16 H38 C18 C12 -C11 H39 C19 C7 -N21 S24 C20 C6 -C23 H40 C22 N21 -S24 H41 C23 C22 -N2 C6 C25 O26 - -[charge_groups] -C1 H27 H28 H29 -N2 -C3 -N4 H30 H42 -N5 H31 -C6 -C7 -C8 H32 -C9 H33 -C10 H34 -C11 -C12 -C13 H35 -C14 H36 -C15 H37 -C16 -Cl17 -C18 H38 -C19 H39 -C20 -N21 -C22 H40 -C23 H41 -S24 -C25 -O26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13o.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13o.prm deleted file mode 100644 index f919da29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-13o.prm +++ /dev/null @@ -1,642 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl17 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN21 1026.83 1026.83 29.10 726.08 20.58 14.0070 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC23 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XS24 2558.75 2558.75 56.71 1809.31 40.10 32.0600 -XC25 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO26 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC25 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH30 868.0 1.010 -XN4 XH42 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH31 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC20 590.0 1.488 -XC6 XC25 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC19 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH32 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH33 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH34 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC19 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC18 938.0 1.400 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH35 734.0 1.080 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH36 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH37 734.0 1.080 -XC16 XCl17 600.0 1.725 -XC16 XC18 938.0 1.400 -XC18 XH38 734.0 1.080 -XC19 XH39 734.0 1.080 -XC20 XN21 976.0 1.335 -XC20 XS24 500.0 1.765 -XN21 XC22 820.0 1.394 -XC22 XC23 1040.0 1.370 -XC22 XH40 734.0 1.080 -XC23 XS24 530.0 1.745 -XC23 XH41 734.0 1.080 -XC25 XO26 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC25 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC25 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH30 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH42 70.00 120.000 -XH30 XN4 XH42 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH31 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH31 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC20 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC25 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC20 140.00 112.000 -XC7 XC6 XC25 140.00 109.443 -XC20 XC6 XC25 140.00 106.380 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC19 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC19 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC19 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC18 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC18 126.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH35 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH35 70.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH36 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH36 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH37 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC16 XCl17 150.00 120.000 -XC15 XC16 XC18 126.00 120.000 -XCl17 XC16 XC18 150.00 120.000 -XC12 XC18 XC16 126.00 120.000 -XC12 XC18 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC18 XH38 70.00 120.000 -XC7 XC19 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC19 XH39 70.00 120.000 -XC11 XC19 XH39 70.00 120.000 -XC6 XC20 XN21 130.00 125.577 -XC6 XC20 XS24 130.00 125.494 -XN21 XC20 XS24 160.00 114.577 -XC20 XN21 XC22 140.00 110.000 -XN21 XC22 XC23 140.00 111.000 -XN21 XC22 XH40 70.00 120.000 -XC23 XC22 XH40 70.00 128.200 -XC22 XC23 XS24 160.00 111.292 -XC22 XC23 XH41 70.00 130.700 -XS24 XC23 XH41 80.00 122.382 -XC20 XS24 XC23 240.00 89.0440 -XN2 XC25 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC25 XO26 180.00 118.720 -XC6 XC25 XO26 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN21 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XS24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XS24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XS24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XS24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN21 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XS24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XS24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XS24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XS24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XN21 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XS24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XS24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XS24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC20 XS24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC13 XC14 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XN21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XN21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XN21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XS24 XC20 XN21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XS24 XC20 XN21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XS24 XC20 XN21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XS24 XC20 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XS24 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XS24 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XS24 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XS24 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC20 XS24 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC20 XS24 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC20 XS24 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC20 XS24 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XC23 2.400 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XH40 2.400 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XS24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XS24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XS24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XS24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XS24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XS24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XS24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XS24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XS24 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XS24 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC23 XS24 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC23 XS24 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC23 XS24 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC23 XS24 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC23 XS24 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC23 XS24 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC25 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH42 XC3 XN4 XH30 1.000 180.000 -XC6 XH31 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC19 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH32 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH33 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH34 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC19 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC18 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC14 XH35 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC15 XH36 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH37 XC15 XC14 1.100 180.000 -XCl17 XC18 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC16 XH38 XC18 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH39 XC19 XC7 1.100 180.000 -XN21 XS24 XC20 XC6 4.000 180.000 -XC23 XH40 XC22 XN21 1.100 180.000 -XS24 XH41 XC23 XC22 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC25 XO26 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17a.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17a.lib deleted file mode 100644 index 49745ab5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17a.lib +++ /dev/null @@ -1,143 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 43 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.4480 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 0.0000 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 0.1800 - 15 Cl15 XCl15 -0.1800 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 0.1800 - 18 Cl18 XCl18 -0.1800 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 -0.1150 - 21 C21 XC21 -0.0600 - 22 C22 XC22 -0.1200 - 23 C23 XC23 -0.1200 - 24 C24 XC24 0.6225 - 25 O25 XO25 -0.5000 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.4600 - 30 H30 XH30 0.3451 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.0600 - 39 H39 XH39 0.0600 - 40 H40 XH40 0.0600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H26 -C1 H27 -C1 H28 -N2 C3 -N2 C24 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H29 -N4 H43 -N5 C6 -N5 H30 -C6 C7 -C6 C21 -C6 C24 -C7 C8 -C7 C20 -C8 C9 -C8 H31 -C9 C10 -C9 H32 -C10 C11 -C10 H33 -C11 C12 -C11 C20 -C12 C13 -C12 C19 -C13 C14 -C13 H34 -C14 Cl15 -C14 C16 -C16 C17 -C16 H35 -C17 Cl18 -C17 C19 -C19 H36 -C20 H37 -C21 C22 -C21 C23 -C21 H38 -C22 C23 -C22 H39 -C22 H40 -C23 H41 -C23 H42 -C24 O25 - -[impropers] -C24 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H43 C3 N4 H29 -C6 H30 N5 C3 -C8 C20 C7 C6 -C9 H31 C8 C7 -C10 H32 C9 C8 -C11 H33 C10 C9 -C12 C20 C11 C10 -C13 C19 C12 C11 -C14 H34 C13 C12 -Cl15 C16 C14 C13 -C17 H35 C16 C14 -Cl18 C19 C17 C16 -C17 H36 C19 C12 -C11 H37 C20 C7 -N2 C6 C24 O25 - -[charge_groups] -C1 H26 H27 H28 -N2 -C3 -N4 H29 H43 -N5 H30 -C6 -C7 -C8 H31 -C9 H32 -C10 H33 -C11 -C12 -C13 H34 -C14 -Cl15 -C16 H35 -C17 -Cl18 -C19 H36 -C20 H37 -C21 H38 -C22 H39 H40 -C23 H41 H42 -C24 -O25 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17a.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17a.prm deleted file mode 100644 index 5bc30e2a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17a.prm +++ /dev/null @@ -1,708 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl15 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl18 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC23 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC24 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO25 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH39 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH40 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC24 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH29 868.0 1.010 -XN4 XH43 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH30 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC21 550.0 1.510 -XC6 XC24 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC20 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH31 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH32 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH33 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC20 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC19 938.0 1.400 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH34 734.0 1.080 -XC14 XCl15 600.0 1.725 -XC14 XC16 938.0 1.400 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH35 734.0 1.080 -XC17 XCl18 600.0 1.725 -XC17 XC19 938.0 1.400 -XC19 XH36 734.0 1.080 -XC20 XH37 734.0 1.080 -XC21 XC22 520.0 1.509 -XC21 XC23 520.0 1.509 -XC21 XH38 680.0 1.088 -XC22 XC23 520.0 1.509 -XC22 XH39 680.0 1.088 -XC22 XH40 680.0 1.088 -XC23 XH41 680.0 1.088 -XC23 XH42 680.0 1.088 -XC24 XO25 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC24 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC24 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH29 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH43 70.00 120.000 -XH29 XN4 XH43 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH30 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH30 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC21 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC24 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC21 140.00 111.440 -XC7 XC6 XC24 140.00 109.443 -XC21 XC6 XC24 126.00 111.100 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC20 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC20 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH31 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH31 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH33 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC20 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC20 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC19 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH34 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH34 70.00 120.000 -XC13 XC14 XCl15 150.00 120.000 -XC13 XC14 XC16 126.00 120.000 -XCl15 XC14 XC16 150.00 120.000 -XC14 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC14 XC16 XH35 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH35 70.00 120.000 -XC16 XC17 XCl18 150.00 120.000 -XC16 XC17 XC19 126.00 120.000 -XCl18 XC17 XC19 150.00 120.000 -XC12 XC19 XC17 126.00 120.000 -XC12 XC19 XH36 70.00 120.000 -XC17 XC19 XH36 70.00 120.000 -XC7 XC20 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC20 XH37 70.00 120.000 -XC11 XC20 XH37 70.00 120.000 -XC6 XC21 XC22 120.00 120.940 -XC6 XC21 XC23 120.00 120.940 -XC6 XC21 XH38 80.00 115.045 -XC22 XC21 XC23 20.00 60.0050 -XC22 XC21 XH38 75.00 117.200 -XC23 XC21 XH38 75.00 117.200 -XC21 XC22 XC23 20.00 60.0050 -XC21 XC22 XH39 75.00 117.200 -XC21 XC22 XH40 75.00 117.200 -XC23 XC22 XH39 75.00 117.200 -XC23 XC22 XH40 75.00 117.200 -XH39 XC22 XH40 70.00 114.300 -XC21 XC23 XC22 20.00 60.0050 -XC21 XC23 XH41 75.00 117.200 -XC21 XC23 XH42 75.00 117.200 -XC22 XC23 XH41 75.00 117.200 -XC22 XC23 XH42 75.00 117.200 -XH41 XC23 XH42 70.00 114.300 -XN2 XC24 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC24 XO25 180.00 118.720 -XC6 XC24 XO25 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH43 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH43 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC21 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC21 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC21 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC20 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC20 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC20 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC8 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC20 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC20 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC22 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC22 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC22 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC23 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC23 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC23 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XH38 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC22 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC22 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC22 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC23 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC23 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC23 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XH38 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC22 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC22 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC22 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC23 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC23 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC23 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XH38 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XCl15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XCl15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XCl15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XCl15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XCl15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XCl15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XCl15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XCl15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl15 XC14 XC16 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC16 XC17 XCl18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC16 XC17 XCl18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC16 XC17 XCl18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC16 XC17 XCl18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC16 XC17 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC16 XC17 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC16 XC17 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC16 XC17 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC16 XC17 XCl18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC16 XC17 XCl18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC16 XC17 XCl18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC16 XC17 XCl18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC16 XC17 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC16 XC17 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC16 XC17 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC16 XC17 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl18 XC17 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XC23 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XC23 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XC23 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC23 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XC22 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XC22 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XC22 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XC22 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XC21 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XC21 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC24 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH43 XC3 XN4 XH29 1.000 180.000 -XC6 XH30 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC20 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH31 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH32 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH33 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC20 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC19 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC14 XH34 XC13 XC12 1.100 180.000 -XCl15 XC16 XC14 XC13 4.000 180.000 -XC17 XH35 XC16 XC14 1.100 180.000 -XCl18 XC19 XC17 XC16 4.000 180.000 -XC17 XH36 XC19 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH37 XC20 XC7 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC24 XO25 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17b.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17b.lib deleted file mode 100644 index 709dca50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17b.lib +++ /dev/null @@ -1,151 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 47 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 0.1100 - 2 O2 XO2 -0.2850 - 3 C3 XC3 0.0850 - 4 C4 XC4 -0.1150 - 5 C5 XC5 -0.1150 - 6 C6 XC6 -0.1150 - 7 C7 XC7 0.0000 - 8 C8 XC8 0.0000 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 0.4480 - 14 C14 XC14 -0.0600 - 15 C15 XC15 -0.1200 - 16 C16 XC16 -0.1200 - 17 N17 XN17 -0.5282 - 18 C18 XC18 0.5687 - 19 N19 XN19 -0.9138 - 20 N20 XN20 -0.0184 - 21 C21 XC21 -0.0090 - 22 C22 XC22 0.6225 - 23 O23 XO23 -0.5000 - 24 C24 XC24 -0.1150 - 25 C25 XC25 -0.1150 - 26 H26 XH26 0.0300 - 27 H27 XH27 0.0300 - 28 H28 XH28 0.0300 - 29 H29 XH29 0.1150 - 30 H30 XH30 0.1150 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.0600 - 36 H36 XH36 0.0600 - 37 H37 XH37 0.0600 - 38 H38 XH38 0.0600 - 39 H39 XH39 0.0600 - 40 H40 XH40 0.3451 - 41 H41 XH41 0.4600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.0600 - 44 H44 XH44 0.0600 - 45 H45 XH45 0.1150 - 46 H46 XH46 0.1150 - 47 H47 XH47 0.4600 - -[bonds] -C1 O2 -C1 H26 -C1 H27 -C1 H28 -O2 C3 -C3 C4 -C3 C25 -C4 C5 -C4 H29 -C5 C6 -C5 H30 -C6 C7 -C6 H31 -C7 C8 -C7 C25 -C8 C9 -C8 C24 -C9 C10 -C9 H32 -C10 C11 -C10 H33 -C11 C12 -C11 H34 -C12 C13 -C12 C24 -C13 C14 -C13 N17 -C13 C22 -C14 C15 -C14 C16 -C14 H35 -C15 C16 -C15 H36 -C15 H37 -C16 H38 -C16 H39 -N17 C18 -N17 H40 -C18 N19 -C18 N20 -N19 H41 -N19 H47 -N20 C21 -N20 C22 -C21 H42 -C21 H43 -C21 H44 -C22 O23 -C24 H45 -C25 H46 - -[impropers] -C4 C25 C3 O2 -C5 H29 C4 C3 -C6 H30 C5 C4 -C7 H31 C6 C5 -C8 C25 C7 C6 -C9 C24 C8 C7 -C10 H32 C9 C8 -C11 H33 C10 C9 -C12 H34 C11 C10 -C13 C24 C12 C11 -C13 H40 N17 C18 -N19 N20 C18 N17 -H47 C18 N19 H41 -C22 C18 N20 C21 -C13 N20 C22 O23 -C12 H45 C24 C8 -C7 H46 C25 C3 - -[charge_groups] -C1 H26 H27 H28 -O2 -C3 -C4 H29 -C5 H30 -C6 H31 -C7 -C8 -C9 H32 -C10 H33 -C11 H34 -C12 -C13 -C14 H35 -C15 H36 H37 -C16 H38 H39 -N17 H40 -C18 -N19 H41 H47 -N20 -C21 H42 H43 H44 -C22 -O23 -C24 H45 -C25 H46 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17b.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17b.prm deleted file mode 100644 index caafcbc2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17b.prm +++ /dev/null @@ -1,743 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XO2 445.13 445.13 18.25 314.75 12.91 15.9994 -XC3 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC4 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC5 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC6 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC14 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC15 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC16 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN17 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC18 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN19 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN20 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO23 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC25 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH30 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH36 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH37 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH38 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH39 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH40 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH41 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH44 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH45 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH46 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH47 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XO2 640.0 1.410 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XO2 XC3 900.0 1.364 -XC3 XC4 938.0 1.400 -XC3 XC25 938.0 1.400 -XC4 XC5 938.0 1.400 -XC4 XH29 734.0 1.080 -XC5 XC6 938.0 1.400 -XC5 XH30 734.0 1.080 -XC6 XC7 938.0 1.400 -XC6 XH31 734.0 1.080 -XC7 XC8 750.0 1.464 -XC7 XC25 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XC24 938.0 1.400 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH32 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH33 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH34 734.0 1.080 -XC12 XC13 634.0 1.510 -XC12 XC24 938.0 1.400 -XC13 XC14 550.0 1.510 -XC13 XN17 674.0 1.463 -XC13 XC22 634.0 1.522 -XC14 XC15 520.0 1.509 -XC14 XC16 520.0 1.509 -XC14 XH35 680.0 1.088 -XC15 XC16 520.0 1.509 -XC15 XH36 680.0 1.088 -XC15 XH37 680.0 1.088 -XC16 XH38 680.0 1.088 -XC16 XH39 680.0 1.088 -XN17 XC18 962.0 1.340 -XN17 XH40 868.0 1.010 -XC18 XN19 962.0 1.340 -XC18 XN20 962.0 1.340 -XN19 XH41 868.0 1.010 -XN19 XH47 868.0 1.010 -XN20 XC21 674.0 1.463 -XN20 XC22 690.0 1.422 -XC21 XH42 680.0 1.090 -XC21 XH43 680.0 1.090 -XC21 XH44 680.0 1.090 -XC22 XO23 1140.0 1.229 -XC24 XH45 734.0 1.080 -XC25 XH46 734.0 1.080 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XO2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XO2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XO2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XC1 XO2 XC3 150.00 111.000 -XO2 XC3 XC4 140.00 120.000 -XO2 XC3 XC25 140.00 120.000 -XC4 XC3 XC25 126.00 120.000 -XC3 XC4 XC5 126.00 120.000 -XC3 XC4 XH29 70.00 120.000 -XC5 XC4 XH29 70.00 120.000 -XC4 XC5 XC6 126.00 120.000 -XC4 XC5 XH30 70.00 120.000 -XC6 XC5 XH30 70.00 120.000 -XC5 XC6 XC7 126.00 120.000 -XC5 XC6 XH31 70.00 120.000 -XC7 XC6 XH31 70.00 120.000 -XC6 XC7 XC8 120.00 122.760 -XC6 XC7 XC25 126.00 120.000 -XC8 XC7 XC25 120.00 122.760 -XC7 XC8 XC9 120.00 122.760 -XC7 XC8 XC24 120.00 122.760 -XC9 XC8 XC24 126.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH33 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH34 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH34 70.00 120.000 -XC11 XC12 XC13 140.00 120.000 -XC11 XC12 XC24 126.00 120.000 -XC13 XC12 XC24 140.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 140.00 111.440 -XC12 XC13 XN17 150.00 112.420 -XC12 XC13 XC22 140.00 109.443 -XC14 XC13 XN17 160.00 111.200 -XC14 XC13 XC22 126.00 111.100 -XN17 XC13 XC22 140.00 113.515 -XC13 XC14 XC15 120.00 120.940 -XC13 XC14 XC16 120.00 120.940 -XC13 XC14 XH35 80.00 115.045 -XC15 XC14 XC16 20.00 60.0050 -XC15 XC14 XH35 75.00 117.200 -XC16 XC14 XH35 75.00 117.200 -XC14 XC15 XC16 20.00 60.0050 -XC14 XC15 XH36 75.00 117.200 -XC14 XC15 XH37 75.00 117.200 -XC16 XC15 XH36 75.00 117.200 -XC16 XC15 XH37 75.00 117.200 -XH36 XC15 XH37 70.00 114.300 -XC14 XC16 XC15 20.00 60.0050 -XC14 XC16 XH38 75.00 117.200 -XC14 XC16 XH39 75.00 117.200 -XC15 XC16 XH38 75.00 117.200 -XC15 XC16 XH39 75.00 117.200 -XH38 XC16 XH39 70.00 114.300 -XC13 XN17 XC18 100.00 123.200 -XC13 XN17 XH40 70.00 118.400 -XC18 XN17 XH40 70.00 120.000 -XN17 XC18 XN19 140.00 120.000 -XN17 XC18 XN20 140.00 120.000 -XN19 XC18 XN20 140.00 120.000 -XC18 XN19 XH41 70.00 120.000 -XC18 XN19 XH47 70.00 120.000 -XH41 XN19 XH47 70.00 120.000 -XC18 XN20 XC21 100.00 123.200 -XC18 XN20 XC22 130.00 120.700 -XC21 XN20 XC22 100.00 121.900 -XN20 XC21 XH42 70.00 109.500 -XN20 XC21 XH43 70.00 109.500 -XN20 XC21 XH44 70.00 109.500 -XH42 XC21 XH43 66.00 107.800 -XH42 XC21 XH44 66.00 107.800 -XH43 XC21 XH44 66.00 107.800 -XC13 XC22 XN20 150.00 111.380 -XC13 XC22 XO23 160.00 120.400 -XN20 XC22 XO23 180.00 118.720 -XC8 XC24 XC12 126.00 120.000 -XC8 XC24 XH45 70.00 120.000 -XC12 XC24 XH45 70.00 120.000 -XC3 XC25 XC7 126.00 120.000 -XC3 XC25 XH46 70.00 120.000 -XC7 XC25 XH46 70.00 120.000 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH26 XC1 XO2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XO2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XO2 XC3 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XO2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XO2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XO2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XO2 XC3 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XO2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XO2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XO2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XO2 XC3 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XO2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 1.958 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC25 1.958 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XC5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH29 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XC5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XH29 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XH46 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XH46 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC4 XC5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC4 XC5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC4 XC5 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC4 XC5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC4 XC5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC5 XC6 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC5 XC6 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC5 XC6 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC5 XC6 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC6 XC7 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC6 XC7 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC6 XC7 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC6 XC7 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC24 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC24 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC24 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC9 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC9 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC9 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC24 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC24 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC24 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XC3 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XH46 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XC3 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XH46 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC11 XC12 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC11 XC12 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC11 XC12 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC11 XC12 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN17 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN17 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN17 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC22 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XN17 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XN17 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XN17 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XN17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC22 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC15 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC15 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC15 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC16 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC16 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC16 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XH35 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC15 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC15 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC15 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC16 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC16 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC16 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XH35 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XC18 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XC18 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XC18 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XC18 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XH40 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XH40 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XH40 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XC18 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XC18 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XC18 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XN20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XO23 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XN20 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XN20 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XN20 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XO23 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XN20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XO23 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC15 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC15 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC15 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC16 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC16 XC15 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC16 XC15 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC16 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC16 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC16 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC16 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC14 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC14 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC14 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC14 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN19 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN20 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XN17 XC18 XN19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XN17 XC18 XN19 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XN17 XC18 XN19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XN17 XC18 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XN17 XC18 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XN17 XC18 XN20 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XN17 XC18 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XN17 XC18 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH41 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH47 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH41 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH47 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC21 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC22 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC21 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC22 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH42 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH43 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH44 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XC13 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XC13 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XC13 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XO23 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XC13 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XC13 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XO23 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC4 XC25 XC3 XO2 4.000 180.000 -XC5 XH29 XC4 XC3 1.100 180.000 -XC6 XH30 XC5 XC4 1.100 180.000 -XC7 XH31 XC6 XC5 1.100 180.000 -XC8 XC25 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XC24 XC8 XC7 4.000 180.000 -XC10 XH32 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH33 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH34 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC13 XC24 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC13 XH40 XN17 XC18 1.000 180.000 -XN19 XN20 XC18 XN17 10.500 180.000 -XH47 XC18 XN19 XH41 1.000 180.000 -XC22 XC18 XN20 XC21 1.000 180.000 -XC13 XN20 XC22 XO23 10.500 180.000 -XC12 XH45 XC24 XC8 1.100 180.000 -XC7 XH46 XC25 XC3 1.100 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17c.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17c.lib deleted file mode 100644 index 698983e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17c.lib +++ /dev/null @@ -1,145 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 44 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.4480 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 0.0000 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 0.0350 - 17 C17 XC17 0.3950 - 18 N18 XN18 -0.4300 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 -0.1150 - 21 C21 XC21 -0.0600 - 22 C22 XC22 -0.1200 - 23 C23 XC23 -0.1200 - 24 C24 XC24 0.6225 - 25 O25 XO25 -0.5000 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.4600 - 30 H30 XH30 0.3451 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.0600 - 40 H40 XH40 0.0600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.0600 - 44 H44 XH44 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H26 -C1 H27 -C1 H28 -N2 C3 -N2 C24 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H29 -N4 H44 -N5 C6 -N5 H30 -C6 C7 -C6 C21 -C6 C24 -C7 C8 -C7 C20 -C8 C9 -C8 H31 -C9 C10 -C9 H32 -C10 C11 -C10 H33 -C11 C12 -C11 C20 -C12 C13 -C12 C19 -C13 C14 -C13 H34 -C14 C15 -C14 H35 -C15 C16 -C15 H36 -C16 C17 -C16 C19 -C17 N18 -C19 H37 -C20 H38 -C21 C22 -C21 C23 -C21 H39 -C22 C23 -C22 H40 -C22 H41 -C23 H42 -C23 H43 -C24 O25 - -[impropers] -C24 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H44 C3 N4 H29 -C6 H30 N5 C3 -C8 C20 C7 C6 -C9 H31 C8 C7 -C10 H32 C9 C8 -C11 H33 C10 C9 -C12 C20 C11 C10 -C13 C19 C12 C11 -C14 H34 C13 C12 -C15 H35 C14 C13 -C16 H36 C15 C14 -C17 C19 C16 C15 -C16 H37 C19 C12 -C11 H38 C20 C7 -N2 C6 C24 O25 - -[charge_groups] -C1 H26 H27 H28 -N2 -C3 -N4 H29 H44 -N5 H30 -C6 -C7 -C8 H31 -C9 H32 -C10 H33 -C11 -C12 -C13 H34 -C14 H35 -C15 H36 -C16 -C17 -N18 -C19 H37 -C20 H38 -C21 H39 -C22 H40 H41 -C23 H42 H43 -C24 -O25 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17c.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17c.prm deleted file mode 100644 index c11b01e3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17c.prm +++ /dev/null @@ -1,719 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1831.61 1831.61 37.67 1295.14 26.63 12.0110 -XN18 1026.83 1026.83 29.10 726.08 20.58 14.0070 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC23 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC24 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO25 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH40 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH44 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC24 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH29 868.0 1.010 -XN4 XH44 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH30 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC21 550.0 1.510 -XC6 XC24 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC20 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH31 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH32 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH33 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC20 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC19 938.0 1.400 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH34 734.0 1.080 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH35 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH36 734.0 1.080 -XC16 XC17 800.0 1.451 -XC16 XC19 938.0 1.400 -XC17 XN18 1300.0 1.157 -XC19 XH37 734.0 1.080 -XC20 XH38 734.0 1.080 -XC21 XC22 520.0 1.509 -XC21 XC23 520.0 1.509 -XC21 XH39 680.0 1.088 -XC22 XC23 520.0 1.509 -XC22 XH40 680.0 1.088 -XC22 XH41 680.0 1.088 -XC23 XH42 680.0 1.088 -XC23 XH43 680.0 1.088 -XC24 XO25 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC24 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC24 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH29 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH44 70.00 120.000 -XH29 XN4 XH44 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH30 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH30 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC21 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC24 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC21 140.00 111.440 -XC7 XC6 XC24 140.00 109.443 -XC21 XC6 XC24 126.00 111.100 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC20 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC20 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH31 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH31 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH33 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC20 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC20 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC19 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH34 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH34 70.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH35 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH35 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH36 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH36 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 140.00 120.000 -XC15 XC16 XC19 126.00 120.000 -XC17 XC16 XC19 140.00 120.000 -XC16 XC17 XN18 300.00 180.000 -XC12 XC19 XC16 126.00 120.000 -XC12 XC19 XH37 70.00 120.000 -XC16 XC19 XH37 70.00 120.000 -XC7 XC20 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC20 XH38 70.00 120.000 -XC11 XC20 XH38 70.00 120.000 -XC6 XC21 XC22 120.00 120.940 -XC6 XC21 XC23 120.00 120.940 -XC6 XC21 XH39 80.00 115.045 -XC22 XC21 XC23 20.00 60.0050 -XC22 XC21 XH39 75.00 117.200 -XC23 XC21 XH39 75.00 117.200 -XC21 XC22 XC23 20.00 60.0050 -XC21 XC22 XH40 75.00 117.200 -XC21 XC22 XH41 75.00 117.200 -XC23 XC22 XH40 75.00 117.200 -XC23 XC22 XH41 75.00 117.200 -XH40 XC22 XH41 70.00 114.300 -XC21 XC23 XC22 20.00 60.0050 -XC21 XC23 XH42 75.00 117.200 -XC21 XC23 XH43 75.00 117.200 -XC22 XC23 XH42 75.00 117.200 -XC22 XC23 XH43 75.00 117.200 -XH42 XC23 XH43 70.00 114.300 -XN2 XC24 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC24 XO25 180.00 118.720 -XC6 XC24 XO25 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC21 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC21 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC21 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC20 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC20 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC20 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC8 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC20 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC20 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC22 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC22 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC22 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC23 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC23 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC23 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XH39 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC22 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC22 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC22 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC23 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC23 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC23 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XH39 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC22 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC22 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC22 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC23 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC23 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC23 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XH39 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XC14 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XN18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XN18 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XN18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XN18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC16 XC17 XN18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC16 XC17 XN18 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC16 XC17 XN18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC16 XC17 XN18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XC23 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XC23 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XC23 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC23 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XC22 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XC22 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XC22 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC23 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC23 XC22 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC23 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC23 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XC21 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XC21 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XH43 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC22 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC24 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH44 XC3 XN4 XH29 1.000 180.000 -XC6 XH30 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC20 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH31 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH32 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH33 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC20 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC19 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC14 XH34 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC15 XH35 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH36 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XC19 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC16 XH37 XC19 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH38 XC20 XC7 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC24 XO25 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17d.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17d.lib deleted file mode 100644 index bee18d03..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17d.lib +++ /dev/null @@ -1,138 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 42 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.4480 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 -0.2920 - 13 C13 XC13 0.2270 - 14 C14 XC14 -0.4470 - 15 C15 XC15 0.4730 - 16 N16 XN16 -0.6780 - 17 C17 XC17 0.4730 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 C19 XC19 -0.0600 - 20 C20 XC20 -0.1200 - 21 C21 XC21 -0.1200 - 22 C22 XC22 0.6225 - 23 O23 XO23 -0.5000 - 24 H24 XH24 0.0600 - 25 H25 XH25 0.0600 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.4600 - 28 H28 XH28 0.3451 - 29 H29 XH29 0.1150 - 30 H30 XH30 0.1150 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.0650 - 33 H33 XH33 0.1550 - 34 H34 XH34 0.0120 - 35 H35 XH35 0.0120 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.0600 - 38 H38 XH38 0.0600 - 39 H39 XH39 0.0600 - 40 H40 XH40 0.0600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H24 -C1 H25 -C1 H26 -N2 C3 -N2 C22 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H27 -N4 H42 -N5 C6 -N5 H28 -C6 C7 -C6 C19 -C6 C22 -C7 C8 -C7 C18 -C8 C9 -C8 H29 -C9 C10 -C9 H30 -C10 C11 -C10 H31 -C11 C12 -C11 C18 -C12 C13 -C12 C17 -C13 C14 -C13 H32 -C14 C15 -C14 H33 -C15 N16 -C15 H34 -N16 C17 -C17 H35 -C18 H36 -C19 C20 -C19 C21 -C19 H37 -C20 C21 -C20 H38 -C20 H39 -C21 H40 -C21 H41 -C22 O23 - -[impropers] -C22 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H42 C3 N4 H27 -C6 H28 N5 C3 -C8 C18 C7 C6 -C9 H29 C8 C7 -C10 H30 C9 C8 -C11 H31 C10 C9 -C12 C18 C11 C10 -C13 C17 C12 C11 -C14 H32 C13 C12 -C15 H33 C14 C13 -N16 H34 C15 C14 -N16 H35 C17 C12 -C11 H36 C18 C7 -N2 C6 C22 O23 - -[charge_groups] -C1 H24 H25 H26 -N2 -C3 -N4 H27 H42 -N5 H28 -C6 -C7 -C8 H29 -C9 H30 -C10 H31 -C11 -C12 -C13 H32 -C14 H33 -C15 H34 -N16 -C17 H35 -C18 H36 -C19 H37 -C20 H38 H39 -C21 H40 H41 -C22 -O23 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17d.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17d.prm deleted file mode 100644 index bf166acc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17d.prm +++ /dev/null @@ -1,687 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN16 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC20 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO23 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH24 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH25 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH28 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH29 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH30 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH38 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH39 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH40 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH24 680.0 1.090 -XC1 XH25 680.0 1.090 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC22 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH27 868.0 1.010 -XN4 XH42 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH28 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC19 550.0 1.510 -XC6 XC22 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC18 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH29 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH30 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH31 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC18 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC17 938.0 1.400 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XH32 734.0 1.080 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH33 734.0 1.080 -XC15 XN16 966.0 1.339 -XC15 XH34 734.0 1.080 -XN16 XC17 966.0 1.339 -XC17 XH35 734.0 1.080 -XC18 XH36 734.0 1.080 -XC19 XC20 520.0 1.509 -XC19 XC21 520.0 1.509 -XC19 XH37 680.0 1.088 -XC20 XC21 520.0 1.509 -XC20 XH38 680.0 1.088 -XC20 XH39 680.0 1.088 -XC21 XH40 680.0 1.088 -XC21 XH41 680.0 1.088 -XC22 XO23 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH24 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH25 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XH24 XC1 XH25 66.00 107.800 -XH24 XC1 XH26 66.00 107.800 -XH25 XC1 XH26 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC22 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC22 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH27 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH42 70.00 120.000 -XH27 XN4 XH42 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH28 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH28 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC19 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC22 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC19 140.00 111.440 -XC7 XC6 XC22 140.00 109.443 -XC19 XC6 XC22 126.00 111.100 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC18 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC18 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH29 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH29 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH30 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH30 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH31 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH31 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC18 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC18 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC17 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC17 126.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 126.00 120.000 -XC12 XC13 XH32 70.00 120.000 -XC14 XC13 XH32 70.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH33 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH33 70.00 120.000 -XC14 XC15 XN16 140.00 124.000 -XC14 XC15 XH34 70.00 120.000 -XN16 XC15 XH34 70.00 116.000 -XC15 XN16 XC17 140.00 117.000 -XC12 XC17 XN16 140.00 124.000 -XC12 XC17 XH35 70.00 120.000 -XN16 XC17 XH35 70.00 116.000 -XC7 XC18 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC18 XH36 70.00 120.000 -XC11 XC18 XH36 70.00 120.000 -XC6 XC19 XC20 120.00 120.940 -XC6 XC19 XC21 120.00 120.940 -XC6 XC19 XH37 80.00 115.045 -XC20 XC19 XC21 20.00 60.0050 -XC20 XC19 XH37 75.00 117.200 -XC21 XC19 XH37 75.00 117.200 -XC19 XC20 XC21 20.00 60.0050 -XC19 XC20 XH38 75.00 117.200 -XC19 XC20 XH39 75.00 117.200 -XC21 XC20 XH38 75.00 117.200 -XC21 XC20 XH39 75.00 117.200 -XH38 XC20 XH39 70.00 114.300 -XC19 XC21 XC20 20.00 60.0050 -XC19 XC21 XH40 75.00 117.200 -XC19 XC21 XH41 75.00 117.200 -XC20 XC21 XH40 75.00 117.200 -XC20 XC21 XH41 75.00 117.200 -XH40 XC21 XH41 70.00 114.300 -XN2 XC22 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC22 XO23 180.00 118.720 -XC6 XC22 XO23 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH24 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH24 XC1 XN2 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC22 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC22 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC22 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC22 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC22 XO23 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC22 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC22 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC22 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC22 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC22 XO23 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH27 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH27 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH28 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH28 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC19 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC22 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC22 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC22 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XN5 XC6 XC19 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XN5 XC6 XC19 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XN5 XC6 XC19 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XN5 XC6 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XN5 XC6 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XN5 XC6 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XN5 XC6 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XN5 XC6 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC18 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC18 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC18 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC6 XC7 XC8 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC6 XC7 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC6 XC7 XC18 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC6 XC7 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC6 XC7 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC6 XC7 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC6 XC7 XC18 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC6 XC7 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC6 XC7 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC19 XC20 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC19 XC20 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC19 XC20 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC19 XC21 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC19 XC21 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC19 XC21 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC19 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC19 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC19 XH37 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC19 XC20 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC19 XC20 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC19 XC20 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC19 XC21 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC19 XC21 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC19 XC21 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC19 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC19 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC19 XH37 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC6 XC19 XC20 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC6 XC19 XC20 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC6 XC19 XC20 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC6 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC6 XC19 XC21 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC6 XC19 XC21 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC6 XC19 XC21 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC6 XC19 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC6 XC19 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC6 XC19 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC6 XC19 XH37 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC6 XC19 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC22 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC22 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC22 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC22 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC22 XO23 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC22 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC22 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC22 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC22 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC22 XO23 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC6 XC22 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC6 XC22 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC6 XC22 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC6 XC22 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC6 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC6 XC22 XO23 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC6 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC6 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH29 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC7 XC8 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC7 XC8 XH29 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC7 XC8 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC7 XC8 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC18 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC18 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC18 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC18 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC18 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC18 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC18 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC18 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC18 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC18 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC18 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC18 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC18 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC18 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC18 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC18 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC8 XC9 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC8 XC9 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC8 XC9 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC8 XC9 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC9 XC10 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC9 XC10 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC9 XC10 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC9 XC10 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC10 XC11 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC10 XC11 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC10 XC11 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC10 XC11 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC17 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC17 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC17 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC11 XC12 XC17 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC11 XC12 XC17 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC11 XC12 XC17 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC11 XC12 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC18 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC18 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC18 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC18 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC18 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC18 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC18 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC18 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC18 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC18 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC18 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC18 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC18 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC18 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC18 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC18 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC12 XC13 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC12 XC13 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC12 XC13 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC12 XC13 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC17 XN16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC17 XN16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC17 XN16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC17 XN16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC17 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC17 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC17 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC17 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC17 XN16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC17 XN16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC17 XN16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC17 XN16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC17 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC17 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC17 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC17 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC13 XC14 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC13 XC14 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC13 XC14 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC13 XC14 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XN16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XN16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XN16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XN16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC14 XC15 XN16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC14 XC15 XN16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC14 XC15 XN16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC14 XC15 XN16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC14 XC15 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC14 XC15 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC14 XC15 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC14 XC15 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XN16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XN16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XN16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XN16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC15 XN16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC15 XN16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC15 XN16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC15 XN16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XN16 XC17 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XN16 XC17 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XN16 XC17 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XN16 XC17 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XN16 XC17 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XN16 XC17 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XN16 XC17 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XN16 XC17 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC19 XC20 XC21 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC19 XC20 XC21 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC19 XC20 XC21 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC19 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC19 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC19 XC20 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC19 XC20 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC19 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC19 XC20 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC19 XC20 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC19 XC20 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC19 XC20 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC19 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC19 XC20 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC19 XC20 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC19 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC19 XC20 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC19 XC20 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC19 XC20 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC19 XC20 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC19 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC19 XC20 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC19 XC20 XC21 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC19 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC19 XC20 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC19 XC20 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC19 XC20 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC19 XC20 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC19 XC20 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC19 XC20 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC19 XC20 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC19 XC20 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC19 XC21 XC20 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC19 XC21 XC20 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC19 XC21 XC20 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC19 XC21 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC19 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC19 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC19 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC19 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC19 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC19 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC19 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC19 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC19 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC19 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC19 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC19 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC19 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC19 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC19 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC19 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC19 XC21 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC19 XC21 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC19 XC21 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC19 XC21 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC19 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC19 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC19 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC19 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC19 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC19 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC19 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC19 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XC19 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XC19 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XC19 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XC19 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC22 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH42 XC3 XN4 XH27 1.000 180.000 -XC6 XH28 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC18 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH29 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH30 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH31 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC18 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC17 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC14 XH32 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC15 XH33 XC14 XC13 1.100 180.000 -XN16 XH34 XC15 XC14 1.100 180.000 -XN16 XH35 XC17 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH36 XC18 XC7 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC22 XO23 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17e.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17e.lib deleted file mode 100644 index f02f0f8a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17e.lib +++ /dev/null @@ -1,148 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 46 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 0.1100 - 2 O2 XO2 -0.3000 - 3 C3 XC3 -0.1920 - 4 C4 XC4 0.4730 - 5 N5 XN5 -0.6780 - 6 C6 XC6 0.4730 - 7 C7 XC7 -0.2920 - 8 C8 XC8 0.0000 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 0.4480 - 14 C14 XC14 -0.0600 - 15 C15 XC15 -0.1200 - 16 C16 XC16 -0.1200 - 17 N17 XN17 -0.5282 - 18 C18 XC18 0.5687 - 19 N19 XN19 -0.9138 - 20 N20 XN20 -0.0184 - 21 C21 XC21 -0.0090 - 22 C22 XC22 0.6225 - 23 O23 XO23 -0.5000 - 24 C24 XC24 -0.1150 - 25 C25 XC25 0.2270 - 26 H26 XH26 0.0300 - 27 H27 XH27 0.0300 - 28 H28 XH28 0.0300 - 29 H29 XH29 0.0120 - 30 H30 XH30 0.0120 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.0600 - 35 H35 XH35 0.0600 - 36 H36 XH36 0.0600 - 37 H37 XH37 0.0600 - 38 H38 XH38 0.0600 - 39 H39 XH39 0.3451 - 40 H40 XH40 0.4600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.0600 - 44 H44 XH44 0.1150 - 45 H45 XH45 0.0650 - 46 H46 XH46 0.4600 - -[bonds] -C1 O2 -C1 H26 -C1 H27 -C1 H28 -O2 C3 -C3 C4 -C3 C25 -C4 N5 -C4 H29 -N5 C6 -C6 C7 -C6 H30 -C7 C8 -C7 C25 -C8 C9 -C8 C24 -C9 C10 -C9 H31 -C10 C11 -C10 H32 -C11 C12 -C11 H33 -C12 C13 -C12 C24 -C13 C14 -C13 N17 -C13 C22 -C14 C15 -C14 C16 -C14 H34 -C15 C16 -C15 H35 -C15 H36 -C16 H37 -C16 H38 -N17 C18 -N17 H39 -C18 N19 -C18 N20 -N19 H40 -N19 H46 -N20 C21 -N20 C22 -C21 H41 -C21 H42 -C21 H43 -C22 O23 -C24 H44 -C25 H45 - -[impropers] -C4 C25 C3 O2 -N5 H29 C4 C3 -C7 H30 C6 N5 -C8 C25 C7 C6 -C9 C24 C8 C7 -C10 H31 C9 C8 -C11 H32 C10 C9 -C12 H33 C11 C10 -C13 C24 C12 C11 -C13 H39 N17 C18 -N19 N20 C18 N17 -H46 C18 N19 H40 -C22 C18 N20 C21 -C13 N20 C22 O23 -C12 H44 C24 C8 -C7 H45 C25 C3 - -[charge_groups] -C1 H26 H27 H28 -O2 -C3 -C4 H29 -N5 -C6 H30 -C7 -C8 -C9 H31 -C10 H32 -C11 H33 -C12 -C13 -C14 H34 -C15 H35 H36 -C16 H37 H38 -N17 H39 -C18 -N19 H40 H46 -N20 -C21 H41 H42 H43 -C22 -O23 -C24 H44 -C25 H45 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17e.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17e.prm deleted file mode 100644 index 852eacee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17e.prm +++ /dev/null @@ -1,722 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XO2 445.13 445.13 18.25 314.75 12.91 15.9994 -XC3 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC4 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC14 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC15 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC16 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN17 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC18 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN19 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN20 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO23 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC25 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH30 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH35 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH36 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH37 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH38 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH39 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH40 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH46 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XO2 640.0 1.410 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XO2 XC3 900.0 1.364 -XC3 XC4 938.0 1.400 -XC3 XC25 938.0 1.400 -XC4 XN5 966.0 1.339 -XC4 XH29 734.0 1.080 -XN5 XC6 966.0 1.339 -XC6 XC7 938.0 1.400 -XC6 XH30 734.0 1.080 -XC7 XC8 750.0 1.464 -XC7 XC25 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XC24 938.0 1.400 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH31 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH32 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH33 734.0 1.080 -XC12 XC13 634.0 1.510 -XC12 XC24 938.0 1.400 -XC13 XC14 550.0 1.510 -XC13 XN17 674.0 1.463 -XC13 XC22 634.0 1.522 -XC14 XC15 520.0 1.509 -XC14 XC16 520.0 1.509 -XC14 XH34 680.0 1.088 -XC15 XC16 520.0 1.509 -XC15 XH35 680.0 1.088 -XC15 XH36 680.0 1.088 -XC16 XH37 680.0 1.088 -XC16 XH38 680.0 1.088 -XN17 XC18 962.0 1.340 -XN17 XH39 868.0 1.010 -XC18 XN19 962.0 1.340 -XC18 XN20 962.0 1.340 -XN19 XH40 868.0 1.010 -XN19 XH46 868.0 1.010 -XN20 XC21 674.0 1.463 -XN20 XC22 690.0 1.422 -XC21 XH41 680.0 1.090 -XC21 XH42 680.0 1.090 -XC21 XH43 680.0 1.090 -XC22 XO23 1140.0 1.229 -XC24 XH44 734.0 1.080 -XC25 XH45 734.0 1.080 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XO2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XO2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XO2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XC1 XO2 XC3 150.00 111.000 -XO2 XC3 XC4 140.00 120.000 -XO2 XC3 XC25 140.00 120.000 -XC4 XC3 XC25 126.00 120.000 -XC3 XC4 XN5 140.00 124.000 -XC3 XC4 XH29 70.00 120.000 -XN5 XC4 XH29 70.00 116.000 -XC4 XN5 XC6 140.00 117.000 -XN5 XC6 XC7 140.00 124.000 -XN5 XC6 XH30 70.00 116.000 -XC7 XC6 XH30 70.00 120.000 -XC6 XC7 XC8 120.00 122.760 -XC6 XC7 XC25 126.00 120.000 -XC8 XC7 XC25 120.00 122.760 -XC7 XC8 XC9 120.00 122.760 -XC7 XC8 XC24 120.00 122.760 -XC9 XC8 XC24 126.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH31 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH31 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH33 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH33 70.00 120.000 -XC11 XC12 XC13 140.00 120.000 -XC11 XC12 XC24 126.00 120.000 -XC13 XC12 XC24 140.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 140.00 111.440 -XC12 XC13 XN17 150.00 112.420 -XC12 XC13 XC22 140.00 109.443 -XC14 XC13 XN17 160.00 111.200 -XC14 XC13 XC22 126.00 111.100 -XN17 XC13 XC22 140.00 113.515 -XC13 XC14 XC15 120.00 120.940 -XC13 XC14 XC16 120.00 120.940 -XC13 XC14 XH34 80.00 115.045 -XC15 XC14 XC16 20.00 60.0050 -XC15 XC14 XH34 75.00 117.200 -XC16 XC14 XH34 75.00 117.200 -XC14 XC15 XC16 20.00 60.0050 -XC14 XC15 XH35 75.00 117.200 -XC14 XC15 XH36 75.00 117.200 -XC16 XC15 XH35 75.00 117.200 -XC16 XC15 XH36 75.00 117.200 -XH35 XC15 XH36 70.00 114.300 -XC14 XC16 XC15 20.00 60.0050 -XC14 XC16 XH37 75.00 117.200 -XC14 XC16 XH38 75.00 117.200 -XC15 XC16 XH37 75.00 117.200 -XC15 XC16 XH38 75.00 117.200 -XH37 XC16 XH38 70.00 114.300 -XC13 XN17 XC18 100.00 123.200 -XC13 XN17 XH39 70.00 118.400 -XC18 XN17 XH39 70.00 120.000 -XN17 XC18 XN19 140.00 120.000 -XN17 XC18 XN20 140.00 120.000 -XN19 XC18 XN20 140.00 120.000 -XC18 XN19 XH40 70.00 120.000 -XC18 XN19 XH46 70.00 120.000 -XH40 XN19 XH46 70.00 120.000 -XC18 XN20 XC21 100.00 123.200 -XC18 XN20 XC22 130.00 120.700 -XC21 XN20 XC22 100.00 121.900 -XN20 XC21 XH41 70.00 109.500 -XN20 XC21 XH42 70.00 109.500 -XN20 XC21 XH43 70.00 109.500 -XH41 XC21 XH42 66.00 107.800 -XH41 XC21 XH43 66.00 107.800 -XH42 XC21 XH43 66.00 107.800 -XC13 XC22 XN20 150.00 111.380 -XC13 XC22 XO23 160.00 120.400 -XN20 XC22 XO23 180.00 118.720 -XC8 XC24 XC12 126.00 120.000 -XC8 XC24 XH44 70.00 120.000 -XC12 XC24 XH44 70.00 120.000 -XC3 XC25 XC7 126.00 120.000 -XC3 XC25 XH45 70.00 120.000 -XC7 XC25 XH45 70.00 120.000 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH26 XC1 XO2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XO2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XO2 XC3 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XO2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XO2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XO2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XO2 XC3 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XO2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XO2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XO2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XO2 XC3 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XO2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 1.958 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC25 1.958 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XN5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH29 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XN5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XH29 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC3 XC4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC25 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC25 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XN5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC4 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC4 XN5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC4 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC4 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XN5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XN5 XC6 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XN5 XC6 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XN5 XC6 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XN5 XC6 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC6 XC7 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC24 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC24 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC24 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC9 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC9 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC9 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC24 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC24 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC24 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC7 XC8 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XC3 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC25 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XC3 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC25 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC8 XC9 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN17 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN17 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN17 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC22 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XN17 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XN17 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XN17 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XN17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC22 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC15 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC15 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC15 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC16 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC16 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC16 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XH34 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XH34 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC14 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC15 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC15 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC15 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC16 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC16 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC16 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XH34 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XH34 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XC14 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XC18 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XC18 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XC18 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XC18 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XH39 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XH39 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XH39 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XN17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XC18 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XC18 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XC18 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC13 XN17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XN20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XO23 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XN20 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XN20 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XN20 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XO23 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XN20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XO23 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC13 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH35 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC16 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC16 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH35 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC15 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC15 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC15 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC16 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC16 XC15 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC16 XC15 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC16 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC16 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC16 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC16 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC16 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC16 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC14 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC14 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC14 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC14 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC15 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN19 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN20 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XN17 XC18 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XN17 XC18 XN19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XN17 XC18 XN19 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XN17 XC18 XN19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XN17 XC18 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XN17 XC18 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XN17 XC18 XN20 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XN17 XC18 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XN17 XC18 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH40 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH46 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN19 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH40 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH46 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC18 XN19 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC21 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC22 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN17 XC18 XN20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC21 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC22 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC18 XN20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH41 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH42 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH43 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC21 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN20 XC21 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XC13 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XC13 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XC13 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XO23 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XN20 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XC13 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XC13 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XO23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XO23 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XO23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN20 XC22 XO23 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC4 XC25 XC3 XO2 4.000 180.000 -XN5 XH29 XC4 XC3 1.100 180.000 -XC7 XH30 XC6 XN5 1.100 180.000 -XC8 XC25 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XC24 XC8 XC7 4.000 180.000 -XC10 XH31 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH32 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH33 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC13 XC24 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC13 XH39 XN17 XC18 1.000 180.000 -XN19 XN20 XC18 XN17 10.500 180.000 -XH46 XC18 XN19 XH40 1.000 180.000 -XC22 XC18 XN20 XC21 1.000 180.000 -XC13 XN20 XC22 XO23 10.500 180.000 -XC12 XH44 XC24 XC8 1.100 180.000 -XC7 XH45 XC25 XC3 1.100 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17f.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17f.lib deleted file mode 100644 index 7aab60ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17f.lib +++ /dev/null @@ -1,142 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 43 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.4480 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 -0.2920 - 13 C13 XC13 0.4730 - 14 N14 XN14 -0.6780 - 15 C15 XC15 0.4730 - 16 C16 XC16 -0.2570 - 17 C17 XC17 0.3950 - 18 N18 XN18 -0.4300 - 19 C19 XC19 0.2270 - 20 C20 XC20 -0.1150 - 21 C21 XC21 -0.0600 - 22 C22 XC22 -0.1200 - 23 C23 XC23 -0.1200 - 24 C24 XC24 0.6225 - 25 O25 XO25 -0.5000 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.4600 - 30 H30 XH30 0.3451 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.0120 - 35 H35 XH35 0.0120 - 36 H36 XH36 0.0650 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.0600 - 39 H39 XH39 0.0600 - 40 H40 XH40 0.0600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H26 -C1 H27 -C1 H28 -N2 C3 -N2 C24 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H29 -N4 H43 -N5 C6 -N5 H30 -C6 C7 -C6 C21 -C6 C24 -C7 C8 -C7 C20 -C8 C9 -C8 H31 -C9 C10 -C9 H32 -C10 C11 -C10 H33 -C11 C12 -C11 C20 -C12 C13 -C12 C19 -C13 N14 -C13 H34 -N14 C15 -C15 C16 -C15 H35 -C16 C17 -C16 C19 -C17 N18 -C19 H36 -C20 H37 -C21 C22 -C21 C23 -C21 H38 -C22 C23 -C22 H39 -C22 H40 -C23 H41 -C23 H42 -C24 O25 - -[impropers] -C24 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H43 C3 N4 H29 -C6 H30 N5 C3 -C8 C20 C7 C6 -C9 H31 C8 C7 -C10 H32 C9 C8 -C11 H33 C10 C9 -C12 C20 C11 C10 -C13 C19 C12 C11 -N14 H34 C13 C12 -C16 H35 C15 N14 -C17 C19 C16 C15 -C16 H36 C19 C12 -C11 H37 C20 C7 -N2 C6 C24 O25 - -[charge_groups] -C1 H26 H27 H28 -N2 -C3 -N4 H29 H43 -N5 H30 -C6 -C7 -C8 H31 -C9 H32 -C10 H33 -C11 -C12 -C13 H34 -N14 -C15 H35 -C16 -C17 -N18 -C19 H36 -C20 H37 -C21 H38 -C22 H39 H40 -C23 H41 H42 -C24 -O25 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17f.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17f.prm deleted file mode 100644 index a4113974..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17f.prm +++ /dev/null @@ -1,698 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN14 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1831.61 1831.61 37.67 1295.14 26.63 12.0110 -XN18 1026.83 1026.83 29.10 726.08 20.58 14.0070 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC23 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC24 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO25 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH39 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH40 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC24 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH29 868.0 1.010 -XN4 XH43 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH30 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC21 550.0 1.510 -XC6 XC24 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC20 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH31 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH32 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH33 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC20 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC19 938.0 1.400 -XC13 XN14 966.0 1.339 -XC13 XH34 734.0 1.080 -XN14 XC15 966.0 1.339 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH35 734.0 1.080 -XC16 XC17 800.0 1.451 -XC16 XC19 938.0 1.400 -XC17 XN18 1300.0 1.157 -XC19 XH36 734.0 1.080 -XC20 XH37 734.0 1.080 -XC21 XC22 520.0 1.509 -XC21 XC23 520.0 1.509 -XC21 XH38 680.0 1.088 -XC22 XC23 520.0 1.509 -XC22 XH39 680.0 1.088 -XC22 XH40 680.0 1.088 -XC23 XH41 680.0 1.088 -XC23 XH42 680.0 1.088 -XC24 XO25 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC24 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC24 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH29 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH43 70.00 120.000 -XH29 XN4 XH43 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH30 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH30 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC21 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC24 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC21 140.00 111.440 -XC7 XC6 XC24 140.00 109.443 -XC21 XC6 XC24 126.00 111.100 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC20 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC20 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH31 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH31 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH33 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC20 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC20 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC19 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC13 XN14 140.00 124.000 -XC12 XC13 XH34 70.00 120.000 -XN14 XC13 XH34 70.00 116.000 -XC13 XN14 XC15 140.00 117.000 -XN14 XC15 XC16 140.00 124.000 -XN14 XC15 XH35 70.00 116.000 -XC16 XC15 XH35 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 140.00 120.000 -XC15 XC16 XC19 126.00 120.000 -XC17 XC16 XC19 140.00 120.000 -XC16 XC17 XN18 300.00 180.000 -XC12 XC19 XC16 126.00 120.000 -XC12 XC19 XH36 70.00 120.000 -XC16 XC19 XH36 70.00 120.000 -XC7 XC20 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC20 XH37 70.00 120.000 -XC11 XC20 XH37 70.00 120.000 -XC6 XC21 XC22 120.00 120.940 -XC6 XC21 XC23 120.00 120.940 -XC6 XC21 XH38 80.00 115.045 -XC22 XC21 XC23 20.00 60.0050 -XC22 XC21 XH38 75.00 117.200 -XC23 XC21 XH38 75.00 117.200 -XC21 XC22 XC23 20.00 60.0050 -XC21 XC22 XH39 75.00 117.200 -XC21 XC22 XH40 75.00 117.200 -XC23 XC22 XH39 75.00 117.200 -XC23 XC22 XH40 75.00 117.200 -XH39 XC22 XH40 70.00 114.300 -XC21 XC23 XC22 20.00 60.0050 -XC21 XC23 XH41 75.00 117.200 -XC21 XC23 XH42 75.00 117.200 -XC22 XC23 XH41 75.00 117.200 -XC22 XC23 XH42 75.00 117.200 -XH41 XC23 XH42 70.00 114.300 -XN2 XC24 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC24 XO25 180.00 118.720 -XC6 XC24 XO25 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH43 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH43 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC21 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC21 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC21 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XN5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC20 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC20 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC20 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC8 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC20 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC7 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC20 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC22 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC22 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC22 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC23 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC23 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC23 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XH38 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC21 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC22 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC22 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC22 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC23 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC23 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC23 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XH38 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC21 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC22 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC22 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC22 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC23 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC23 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC23 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XH38 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC21 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC6 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC7 XC8 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC8 XC9 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC9 XC10 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC10 XC11 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC11 XC12 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XN14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XN14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XN14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XN14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC12 XC13 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XN14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XN14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC13 XN14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC13 XN14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XN18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XN18 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XN18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XN18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC16 XC17 XN18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC16 XC17 XN18 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC16 XC17 XN18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC16 XC17 XN18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC16 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XC23 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XC23 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XC23 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC23 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XC22 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XC22 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XC22 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC21 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC21 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XC22 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XC21 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC22 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XC21 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH42 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC22 XC23 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC24 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH43 XC3 XN4 XH29 1.000 180.000 -XC6 XH30 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC20 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH31 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH32 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH33 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC20 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC19 XC12 XC11 4.000 180.000 -XN14 XH34 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC16 XH35 XC15 XN14 1.100 180.000 -XC17 XC19 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC16 XH36 XC19 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH37 XC20 XC7 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC24 XO25 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17g.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17g.lib deleted file mode 100644 index 5a817b0d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17g.lib +++ /dev/null @@ -1,139 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 42 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.4480 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 -0.2920 - 13 C13 XC13 0.4730 - 14 N14 XN14 -0.6780 - 15 C15 XC15 0.4730 - 16 C16 XC16 -0.0720 - 17 F17 XF17 -0.2200 - 18 C18 XC18 0.2270 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 -0.0600 - 21 C21 XC21 -0.1200 - 22 C22 XC22 -0.1200 - 23 C23 XC23 0.6225 - 24 O24 XO24 -0.5000 - 25 H25 XH25 0.0600 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.4600 - 29 H29 XH29 0.3451 - 30 H30 XH30 0.1150 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.0120 - 34 H34 XH34 0.0120 - 35 H35 XH35 0.0650 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.0600 - 38 H38 XH38 0.0600 - 39 H39 XH39 0.0600 - 40 H40 XH40 0.0600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H25 -C1 H26 -C1 H27 -N2 C3 -N2 C23 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H28 -N4 H42 -N5 C6 -N5 H29 -C6 C7 -C6 C20 -C6 C23 -C7 C8 -C7 C19 -C8 C9 -C8 H30 -C9 C10 -C9 H31 -C10 C11 -C10 H32 -C11 C12 -C11 C19 -C12 C13 -C12 C18 -C13 N14 -C13 H33 -N14 C15 -C15 C16 -C15 H34 -C16 F17 -C16 C18 -C18 H35 -C19 H36 -C20 C21 -C20 C22 -C20 H37 -C21 C22 -C21 H38 -C21 H39 -C22 H40 -C22 H41 -C23 O24 - -[impropers] -C23 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H42 C3 N4 H28 -C6 H29 N5 C3 -C8 C19 C7 C6 -C9 H30 C8 C7 -C10 H31 C9 C8 -C11 H32 C10 C9 -C12 C19 C11 C10 -C13 C18 C12 C11 -N14 H33 C13 C12 -C16 H34 C15 N14 -C18 F17 C16 C15 -C16 H35 C18 C12 -C11 H36 C19 C7 -N2 C6 C23 O24 - -[charge_groups] -C1 H25 H26 H27 -N2 -C3 -N4 H28 H42 -N5 H29 -C6 -C7 -C8 H30 -C9 H31 -C10 H32 -C11 -C12 -C13 H33 -N14 -C15 H34 -C16 -F17 -C18 H35 -C19 H36 -C20 H37 -C21 H38 H39 -C22 H40 H41 -C23 -O24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17g.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17g.prm deleted file mode 100644 index 2507d3b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17g.prm +++ /dev/null @@ -1,687 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN14 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XF17 264.71 264.71 11.43 187.18 8.09 19.00 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC23 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO24 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH25 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH29 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH30 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH38 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH39 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH40 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH25 680.0 1.090 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC23 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH28 868.0 1.010 -XN4 XH42 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH29 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC20 550.0 1.510 -XC6 XC23 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC19 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH30 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH31 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH32 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC19 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC18 938.0 1.400 -XC13 XN14 966.0 1.339 -XC13 XH33 734.0 1.080 -XN14 XC15 966.0 1.339 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH34 734.0 1.080 -XC16 XF17 840.0 1.354 -XC16 XC18 938.0 1.400 -XC18 XH35 734.0 1.080 -XC19 XH36 734.0 1.080 -XC20 XC21 520.0 1.509 -XC20 XC22 520.0 1.509 -XC20 XH37 680.0 1.088 -XC21 XC22 520.0 1.509 -XC21 XH38 680.0 1.088 -XC21 XH39 680.0 1.088 -XC22 XH40 680.0 1.088 -XC22 XH41 680.0 1.088 -XC23 XO24 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH25 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XH25 XC1 XH26 66.00 107.800 -XH25 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC23 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC23 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH28 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH42 70.00 120.000 -XH28 XN4 XH42 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH29 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH29 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC20 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC23 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC20 140.00 111.440 -XC7 XC6 XC23 140.00 109.443 -XC20 XC6 XC23 126.00 111.100 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC19 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC19 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH30 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH30 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH31 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH31 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC19 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC18 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC18 126.00 120.000 -XC12 XC13 XN14 140.00 124.000 -XC12 XC13 XH33 70.00 120.000 -XN14 XC13 XH33 70.00 116.000 -XC13 XN14 XC15 140.00 117.000 -XN14 XC15 XC16 140.00 124.000 -XN14 XC15 XH34 70.00 116.000 -XC16 XC15 XH34 70.00 120.000 -XC15 XC16 XF17 160.00 120.000 -XC15 XC16 XC18 126.00 120.000 -XF17 XC16 XC18 160.00 120.000 -XC12 XC18 XC16 126.00 120.000 -XC12 XC18 XH35 70.00 120.000 -XC16 XC18 XH35 70.00 120.000 -XC7 XC19 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC19 XH36 70.00 120.000 -XC11 XC19 XH36 70.00 120.000 -XC6 XC20 XC21 120.00 120.940 -XC6 XC20 XC22 120.00 120.940 -XC6 XC20 XH37 80.00 115.045 -XC21 XC20 XC22 20.00 60.0050 -XC21 XC20 XH37 75.00 117.200 -XC22 XC20 XH37 75.00 117.200 -XC20 XC21 XC22 20.00 60.0050 -XC20 XC21 XH38 75.00 117.200 -XC20 XC21 XH39 75.00 117.200 -XC22 XC21 XH38 75.00 117.200 -XC22 XC21 XH39 75.00 117.200 -XH38 XC21 XH39 70.00 114.300 -XC20 XC22 XC21 20.00 60.0050 -XC20 XC22 XH40 75.00 117.200 -XC20 XC22 XH41 75.00 117.200 -XC21 XC22 XH40 75.00 117.200 -XC21 XC22 XH41 75.00 117.200 -XH40 XC22 XH41 70.00 114.300 -XN2 XC23 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC23 XO24 180.00 118.720 -XC6 XC23 XO24 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XO24 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XO24 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH28 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH28 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC23 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC23 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC23 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC20 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC20 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC20 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH37 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH37 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC21 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC21 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC21 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC22 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC22 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC22 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XH37 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XN14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XN14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XN14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XN14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XN14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XN14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XN14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XN14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XF17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XF17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XF17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XF17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XF17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XF17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XF17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XF17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XF17 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XF17 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XF17 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XF17 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XF17 XC16 XC18 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XF17 XC16 XC18 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XF17 XC16 XC18 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XF17 XC16 XC18 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XC22 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC21 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC21 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC21 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XC21 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC23 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH42 XC3 XN4 XH28 1.000 180.000 -XC6 XH29 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC19 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH30 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH31 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH32 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC19 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC18 XC12 XC11 4.000 180.000 -XN14 XH33 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC16 XH34 XC15 XN14 1.100 180.000 -XC18 XF17 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC16 XH35 XC18 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH36 XC19 XC7 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC23 XO24 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17h.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17h.lib deleted file mode 100644 index b2ba188a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17h.lib +++ /dev/null @@ -1,139 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 42 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.4480 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 0.0000 - 12 C12 XC12 -0.2920 - 13 C13 XC13 0.4730 - 14 N14 XN14 -0.6780 - 15 C15 XC15 0.4730 - 16 C16 XC16 -0.1120 - 17 Cl17 XCl17 -0.1800 - 18 C18 XC18 0.2270 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 -0.0600 - 21 C21 XC21 -0.1200 - 22 C22 XC22 -0.1200 - 23 C23 XC23 0.6225 - 24 O24 XO24 -0.5000 - 25 H25 XH25 0.0600 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.4600 - 29 H29 XH29 0.3451 - 30 H30 XH30 0.1150 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.0120 - 34 H34 XH34 0.0120 - 35 H35 XH35 0.0650 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.0600 - 38 H38 XH38 0.0600 - 39 H39 XH39 0.0600 - 40 H40 XH40 0.0600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H25 -C1 H26 -C1 H27 -N2 C3 -N2 C23 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H28 -N4 H42 -N5 C6 -N5 H29 -C6 C7 -C6 C20 -C6 C23 -C7 C8 -C7 C19 -C8 C9 -C8 H30 -C9 C10 -C9 H31 -C10 C11 -C10 H32 -C11 C12 -C11 C19 -C12 C13 -C12 C18 -C13 N14 -C13 H33 -N14 C15 -C15 C16 -C15 H34 -C16 Cl17 -C16 C18 -C18 H35 -C19 H36 -C20 C21 -C20 C22 -C20 H37 -C21 C22 -C21 H38 -C21 H39 -C22 H40 -C22 H41 -C23 O24 - -[impropers] -C23 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H42 C3 N4 H28 -C6 H29 N5 C3 -C8 C19 C7 C6 -C9 H30 C8 C7 -C10 H31 C9 C8 -C11 H32 C10 C9 -C12 C19 C11 C10 -C13 C18 C12 C11 -N14 H33 C13 C12 -C16 H34 C15 N14 -Cl17 C18 C16 C15 -C16 H35 C18 C12 -C11 H36 C19 C7 -N2 C6 C23 O24 - -[charge_groups] -C1 H25 H26 H27 -N2 -C3 -N4 H28 H42 -N5 H29 -C6 -C7 -C8 H30 -C9 H31 -C10 H32 -C11 -C12 -C13 H33 -N14 -C15 H34 -C16 -Cl17 -C18 H35 -C19 H36 -C20 H37 -C21 H38 H39 -C22 H40 H41 -C23 -O24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17h.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17h.prm deleted file mode 100644 index 9bdb94f6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17h.prm +++ /dev/null @@ -1,687 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN14 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl17 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC21 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC22 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC23 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO24 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH25 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH29 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH30 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH38 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH39 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH40 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH25 680.0 1.090 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC23 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH28 868.0 1.010 -XN4 XH42 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH29 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC20 550.0 1.510 -XC6 XC23 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC19 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH30 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH31 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH32 734.0 1.080 -XC11 XC12 750.0 1.464 -XC11 XC19 938.0 1.400 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XC18 938.0 1.400 -XC13 XN14 966.0 1.339 -XC13 XH33 734.0 1.080 -XN14 XC15 966.0 1.339 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH34 734.0 1.080 -XC16 XCl17 600.0 1.725 -XC16 XC18 938.0 1.400 -XC18 XH35 734.0 1.080 -XC19 XH36 734.0 1.080 -XC20 XC21 520.0 1.509 -XC20 XC22 520.0 1.509 -XC20 XH37 680.0 1.088 -XC21 XC22 520.0 1.509 -XC21 XH38 680.0 1.088 -XC21 XH39 680.0 1.088 -XC22 XH40 680.0 1.088 -XC22 XH41 680.0 1.088 -XC23 XO24 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH25 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XH25 XC1 XH26 66.00 107.800 -XH25 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC23 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC23 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH28 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH42 70.00 120.000 -XH28 XN4 XH42 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH29 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH29 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC20 160.00 111.200 -XN5 XC6 XC23 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC20 140.00 111.440 -XC7 XC6 XC23 140.00 109.443 -XC20 XC6 XC23 126.00 111.100 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC19 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC19 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH30 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH30 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH31 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH31 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 120.00 122.760 -XC10 XC11 XC19 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC19 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC13 120.00 122.760 -XC11 XC12 XC18 120.00 122.760 -XC13 XC12 XC18 126.00 120.000 -XC12 XC13 XN14 140.00 124.000 -XC12 XC13 XH33 70.00 120.000 -XN14 XC13 XH33 70.00 116.000 -XC13 XN14 XC15 140.00 117.000 -XN14 XC15 XC16 140.00 124.000 -XN14 XC15 XH34 70.00 116.000 -XC16 XC15 XH34 70.00 120.000 -XC15 XC16 XCl17 150.00 120.000 -XC15 XC16 XC18 126.00 120.000 -XCl17 XC16 XC18 150.00 120.000 -XC12 XC18 XC16 126.00 120.000 -XC12 XC18 XH35 70.00 120.000 -XC16 XC18 XH35 70.00 120.000 -XC7 XC19 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC19 XH36 70.00 120.000 -XC11 XC19 XH36 70.00 120.000 -XC6 XC20 XC21 120.00 120.940 -XC6 XC20 XC22 120.00 120.940 -XC6 XC20 XH37 80.00 115.045 -XC21 XC20 XC22 20.00 60.0050 -XC21 XC20 XH37 75.00 117.200 -XC22 XC20 XH37 75.00 117.200 -XC20 XC21 XC22 20.00 60.0050 -XC20 XC21 XH38 75.00 117.200 -XC20 XC21 XH39 75.00 117.200 -XC22 XC21 XH38 75.00 117.200 -XC22 XC21 XH39 75.00 117.200 -XH38 XC21 XH39 70.00 114.300 -XC20 XC22 XC21 20.00 60.0050 -XC20 XC22 XH40 75.00 117.200 -XC20 XC22 XH41 75.00 117.200 -XC21 XC22 XH40 75.00 117.200 -XC21 XC22 XH41 75.00 117.200 -XH40 XC22 XH41 70.00 114.300 -XN2 XC23 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC23 XO24 180.00 118.720 -XC6 XC23 XO24 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XN2 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XN2 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XO24 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XO24 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH28 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH28 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH29 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC23 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC23 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC23 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC20 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC20 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC20 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XN5 XC6 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC7 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH37 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH37 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC21 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC21 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC21 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC22 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC22 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC22 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XH37 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC6 XC20 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XN2 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XN2 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XN2 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC6 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC7 XC8 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC11 XC12 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC19 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XN14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XN14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XN14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XN14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC12 XC13 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC18 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC18 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XN14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XN14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XN14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XN14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XN14 XC15 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN14 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XCl17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XCl17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XCl17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XCl17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC15 XC16 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC18 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl17 XC16 XC18 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XC20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XC22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XC22 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC21 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC21 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC21 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC21 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC20 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC20 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XC21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XC21 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC20 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC20 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC20 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH40 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC21 XC22 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC23 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH42 XC3 XN4 XH28 1.000 180.000 -XC6 XH29 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC19 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH30 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH31 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH32 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC19 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC13 XC18 XC12 XC11 4.000 180.000 -XN14 XH33 XC13 XC12 1.100 180.000 -XC16 XH34 XC15 XN14 1.100 180.000 -XCl17 XC18 XC16 XC15 4.000 180.000 -XC16 XH35 XC18 XC12 1.100 180.000 -XC11 XH36 XC19 XC7 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC23 XO24 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17i.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17i.lib deleted file mode 100644 index 6aad66c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17i.lib +++ /dev/null @@ -1,145 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 45 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0170 - 2 C2 XC2 -0.4550 - 3 C3 XC3 0.4730 - 4 N4 XN4 -0.6780 - 5 C5 XC5 0.4730 - 6 C6 XC6 -0.2920 - 7 C7 XC7 0.0000 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 0.4480 - 13 C13 XC13 -0.0600 - 14 C14 XC14 -0.1200 - 15 C15 XC15 -0.1200 - 16 N16 XN16 -0.5282 - 17 C17 XC17 0.5687 - 18 N18 XN18 -0.9138 - 19 N19 XN19 -0.0184 - 20 C20 XC20 -0.0090 - 21 C21 XC21 0.6225 - 22 O22 XO22 -0.5000 - 23 C23 XC23 -0.1150 - 24 C24 XC24 0.2270 - 25 H25 XH25 0.0600 - 26 H26 XH26 0.0600 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0120 - 29 H29 XH29 0.0120 - 30 H30 XH30 0.1150 - 31 H31 XH31 0.1150 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.0600 - 34 H34 XH34 0.0600 - 35 H35 XH35 0.0600 - 36 H36 XH36 0.0600 - 37 H37 XH37 0.0600 - 38 H38 XH38 0.3451 - 39 H39 XH39 0.4600 - 40 H40 XH40 0.0600 - 41 H41 XH41 0.0600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.1150 - 44 H44 XH44 0.0650 - 45 H45 XH45 0.4600 - -[bonds] -C1 C2 -C1 H25 -C1 H26 -C1 H27 -C2 C3 -C2 C24 -C3 N4 -C3 H28 -N4 C5 -C5 C6 -C5 H29 -C6 C7 -C6 C24 -C7 C8 -C7 C23 -C8 C9 -C8 H30 -C9 C10 -C9 H31 -C10 C11 -C10 H32 -C11 C12 -C11 C23 -C12 C13 -C12 N16 -C12 C21 -C13 C14 -C13 C15 -C13 H33 -C14 C15 -C14 H34 -C14 H35 -C15 H36 -C15 H37 -N16 C17 -N16 H38 -C17 N18 -C17 N19 -N18 H39 -N18 H45 -N19 C20 -N19 C21 -C20 H40 -C20 H41 -C20 H42 -C21 O22 -C23 H43 -C24 H44 - -[impropers] -C3 C24 C2 C1 -N4 H28 C3 C2 -C6 H29 C5 N4 -C7 C24 C6 C5 -C8 C23 C7 C6 -C9 H30 C8 C7 -C10 H31 C9 C8 -C11 H32 C10 C9 -C12 C23 C11 C10 -C12 H38 N16 C17 -N18 N19 C17 N16 -H45 C17 N18 H39 -C21 C17 N19 C20 -C12 N19 C21 O22 -C11 H43 C23 C7 -C6 H44 C24 C2 - -[charge_groups] -C1 H25 H26 H27 -C2 -C3 H28 -N4 -C5 H29 -C6 -C7 -C8 H30 -C9 H31 -C10 H32 -C11 -C12 -C13 H33 -C14 H34 H35 -C15 H36 H37 -N16 H38 -C17 -N18 H39 H45 -N19 -C20 H40 H41 H42 -C21 -O22 -C23 H43 -C24 H44 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17i.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17i.prm deleted file mode 100644 index ba6d0597..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-17i.prm +++ /dev/null @@ -1,723 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC2 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC3 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC5 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC6 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC13 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC14 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC15 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN16 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC17 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN18 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN19 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC20 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC21 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO22 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XC23 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XH25 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH26 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH29 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH30 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH34 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH35 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH36 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH37 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH38 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH39 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH40 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH41 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XC2 634.0 1.510 -XC1 XH25 680.0 1.090 -XC1 XH26 680.0 1.090 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC2 XC3 938.0 1.400 -XC2 XC24 938.0 1.400 -XC3 XN4 966.0 1.339 -XC3 XH28 734.0 1.080 -XN4 XC5 966.0 1.339 -XC5 XC6 938.0 1.400 -XC5 XH29 734.0 1.080 -XC6 XC7 750.0 1.464 -XC6 XC24 938.0 1.400 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC23 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH30 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH31 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH32 734.0 1.080 -XC11 XC12 634.0 1.510 -XC11 XC23 938.0 1.400 -XC12 XC13 550.0 1.510 -XC12 XN16 674.0 1.463 -XC12 XC21 634.0 1.522 -XC13 XC14 520.0 1.509 -XC13 XC15 520.0 1.509 -XC13 XH33 680.0 1.088 -XC14 XC15 520.0 1.509 -XC14 XH34 680.0 1.088 -XC14 XH35 680.0 1.088 -XC15 XH36 680.0 1.088 -XC15 XH37 680.0 1.088 -XN16 XC17 962.0 1.340 -XN16 XH38 868.0 1.010 -XC17 XN18 962.0 1.340 -XC17 XN19 962.0 1.340 -XN18 XH39 868.0 1.010 -XN18 XH45 868.0 1.010 -XN19 XC20 674.0 1.463 -XN19 XC21 690.0 1.422 -XC20 XH40 680.0 1.090 -XC20 XH41 680.0 1.090 -XC20 XH42 680.0 1.090 -XC21 XO22 1140.0 1.229 -XC23 XH43 734.0 1.080 -XC24 XH44 734.0 1.080 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XC2 XC1 XH25 70.00 109.500 -XC2 XC1 XH26 70.00 109.500 -XC2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XH25 XC1 XH26 66.00 107.800 -XH25 XC1 XH27 66.00 107.800 -XH26 XC1 XH27 66.00 107.800 -XC1 XC2 XC3 140.00 120.000 -XC1 XC2 XC24 140.00 120.000 -XC3 XC2 XC24 126.00 120.000 -XC2 XC3 XN4 140.00 124.000 -XC2 XC3 XH28 70.00 120.000 -XN4 XC3 XH28 70.00 116.000 -XC3 XN4 XC5 140.00 117.000 -XN4 XC5 XC6 140.00 124.000 -XN4 XC5 XH29 70.00 116.000 -XC6 XC5 XH29 70.00 120.000 -XC5 XC6 XC7 120.00 122.760 -XC5 XC6 XC24 126.00 120.000 -XC7 XC6 XC24 120.00 122.760 -XC6 XC7 XC8 120.00 122.760 -XC6 XC7 XC23 120.00 122.760 -XC8 XC7 XC23 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH30 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH30 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH31 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH31 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 140.00 120.000 -XC10 XC11 XC23 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC23 140.00 120.000 -XC11 XC12 XC13 140.00 111.440 -XC11 XC12 XN16 150.00 112.420 -XC11 XC12 XC21 140.00 109.443 -XC13 XC12 XN16 160.00 111.200 -XC13 XC12 XC21 126.00 111.100 -XN16 XC12 XC21 140.00 113.515 -XC12 XC13 XC14 120.00 120.940 -XC12 XC13 XC15 120.00 120.940 -XC12 XC13 XH33 80.00 115.045 -XC14 XC13 XC15 20.00 60.0050 -XC14 XC13 XH33 75.00 117.200 -XC15 XC13 XH33 75.00 117.200 -XC13 XC14 XC15 20.00 60.0050 -XC13 XC14 XH34 75.00 117.200 -XC13 XC14 XH35 75.00 117.200 -XC15 XC14 XH34 75.00 117.200 -XC15 XC14 XH35 75.00 117.200 -XH34 XC14 XH35 70.00 114.300 -XC13 XC15 XC14 20.00 60.0050 -XC13 XC15 XH36 75.00 117.200 -XC13 XC15 XH37 75.00 117.200 -XC14 XC15 XH36 75.00 117.200 -XC14 XC15 XH37 75.00 117.200 -XH36 XC15 XH37 70.00 114.300 -XC12 XN16 XC17 100.00 123.200 -XC12 XN16 XH38 70.00 118.400 -XC17 XN16 XH38 70.00 120.000 -XN16 XC17 XN18 140.00 120.000 -XN16 XC17 XN19 140.00 120.000 -XN18 XC17 XN19 140.00 120.000 -XC17 XN18 XH39 70.00 120.000 -XC17 XN18 XH45 70.00 120.000 -XH39 XN18 XH45 70.00 120.000 -XC17 XN19 XC20 100.00 123.200 -XC17 XN19 XC21 130.00 120.700 -XC20 XN19 XC21 100.00 121.900 -XN19 XC20 XH40 70.00 109.500 -XN19 XC20 XH41 70.00 109.500 -XN19 XC20 XH42 70.00 109.500 -XH40 XC20 XH41 66.00 107.800 -XH40 XC20 XH42 66.00 107.800 -XH41 XC20 XH42 66.00 107.800 -XC12 XC21 XN19 150.00 111.380 -XC12 XC21 XO22 160.00 120.400 -XN19 XC21 XO22 180.00 118.720 -XC7 XC23 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC23 XH43 70.00 120.000 -XC11 XC23 XH43 70.00 120.000 -XC2 XC24 XC6 126.00 120.000 -XC2 XC24 XH44 70.00 120.000 -XC6 XC24 XH44 70.00 120.000 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH25 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH25 XC1 XC2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH26 XC1 XC2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XN4 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH28 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC2 XC3 XN4 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC2 XC3 XH28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC2 XC3 XH28 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC2 XC3 XH28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC2 XC3 XH28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC24 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC24 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC24 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC24 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC24 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC24 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC24 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XN4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XN4 XC5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XN4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XN4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC3 XN4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC3 XN4 XC5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC3 XN4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC3 XN4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XH29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XH29 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XH29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XH29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC5 XC6 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC23 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC23 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC23 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC23 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC23 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC23 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC6 XC7 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC24 XC2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC24 XC2 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC24 XC2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC24 XC2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XC2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XC2 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XC2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XC2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC7 XC8 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC7 XC8 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC7 XC8 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC7 XC8 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC23 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC23 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC23 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC23 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC23 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC23 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC23 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC23 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC8 XC9 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XN16 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XN16 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XN16 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XN16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC21 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XC13 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XN16 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XN16 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XN16 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XN16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XC21 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC11 XC12 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC23 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC23 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC23 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC23 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC15 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC15 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC15 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN16 XC12 XC13 XC14 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN16 XC12 XC13 XC14 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN16 XC12 XC13 XC14 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN16 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN16 XC12 XC13 XC15 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN16 XC12 XC13 XC15 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN16 XC12 XC13 XC15 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN16 XC12 XC13 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN16 XC12 XC13 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN16 XC12 XC13 XH33 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN16 XC12 XC13 XH33 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN16 XC12 XC13 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC12 XC13 XC14 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC12 XC13 XC14 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC12 XC13 XC14 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC12 XC13 XC15 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC12 XC13 XC15 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC12 XC13 XC15 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC12 XC13 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC12 XC13 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC12 XC13 XH33 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC12 XC13 XH33 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC12 XC13 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XN16 XC17 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XN16 XC17 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XN16 XC17 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XN16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XN16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XN16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XN16 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XN16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XN16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XN16 XC17 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XN16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XN16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XN16 XH38 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XN16 XH38 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XN16 XH38 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XN16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC12 XN16 XC17 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC12 XN16 XC17 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC12 XN16 XC17 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC12 XN16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC12 XN16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC12 XN16 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC12 XN16 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC12 XN16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC21 XN19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC21 XN19 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC21 XN19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC21 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC21 XO22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC21 XO22 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC21 XO22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC21 XO22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC21 XN19 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC21 XN19 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC21 XN19 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC21 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC21 XO22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC21 XO22 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC21 XO22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC21 XO22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN16 XC12 XC21 XN19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN16 XC12 XC21 XN19 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN16 XC12 XC21 XN19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN16 XC12 XC21 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN16 XC12 XC21 XO22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN16 XC12 XC21 XO22 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN16 XC12 XC21 XO22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN16 XC12 XC21 XO22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC13 XC14 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC13 XC14 XH34 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC13 XC14 XH34 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC13 XC14 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC13 XC14 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC13 XC14 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC13 XC14 XH35 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC13 XC14 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XC15 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XC15 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XH34 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XH34 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XH35 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC14 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XC14 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XC14 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XC14 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC15 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC15 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC15 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC15 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC15 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC15 XC14 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC15 XC14 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC15 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC15 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC15 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC15 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC13 XC15 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC13 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC13 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC13 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC13 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC13 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XN16 XC17 XN18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XN16 XC17 XN18 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XN16 XC17 XN18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XN16 XC17 XN18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XN16 XC17 XN19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XN16 XC17 XN19 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XN16 XC17 XN19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XN16 XC17 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XN16 XC17 XN18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XN16 XC17 XN18 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XN16 XC17 XN18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XN16 XC17 XN18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XN16 XC17 XN19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XN16 XC17 XN19 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XN16 XC17 XN19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XN16 XC17 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN16 XC17 XN18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN16 XC17 XN18 XH39 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN16 XC17 XN18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN16 XC17 XN18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN16 XC17 XN18 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN16 XC17 XN18 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN16 XC17 XN18 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN16 XC17 XN18 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC17 XN18 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC17 XN18 XH39 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC17 XN18 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC17 XN18 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC17 XN18 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC17 XN18 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC17 XN18 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC17 XN18 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN16 XC17 XN19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN16 XC17 XN19 XC20 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN16 XC17 XN19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN16 XC17 XN19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN16 XC17 XN19 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN16 XC17 XN19 XC21 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN16 XC17 XN19 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN16 XC17 XN19 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC17 XN19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC17 XN19 XC20 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC17 XN19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC17 XN19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC17 XN19 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC17 XN19 XC21 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC17 XN19 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC17 XN19 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XN19 XC20 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XN19 XC20 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XN19 XC20 XH40 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XN19 XC20 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XN19 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XN19 XC20 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XN19 XC20 XH41 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XN19 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XN19 XC20 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XN19 XC20 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XN19 XC20 XH42 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XN19 XC20 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN19 XC20 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN19 XC20 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN19 XC20 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN19 XC20 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN19 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN19 XC20 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN19 XC20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN19 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN19 XC20 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN19 XC20 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN19 XC20 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN19 XC20 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XN19 XC21 XC12 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XN19 XC21 XC12 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XN19 XC21 XC12 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XN19 XC21 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XN19 XC21 XO22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XN19 XC21 XO22 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XN19 XC21 XO22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XN19 XC21 XO22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN19 XC21 XC12 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN19 XC21 XC12 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN19 XC21 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN19 XC21 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN19 XC21 XO22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN19 XC21 XO22 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN19 XC21 XO22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN19 XC21 XO22 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC3 XC24 XC2 XC1 4.000 180.000 -XN4 XH28 XC3 XC2 1.100 180.000 -XC6 XH29 XC5 XN4 1.100 180.000 -XC7 XC24 XC6 XC5 4.000 180.000 -XC8 XC23 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH30 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH31 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH32 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC23 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC12 XH38 XN16 XC17 1.000 180.000 -XN18 XN19 XC17 XN16 10.500 180.000 -XH45 XC17 XN18 XH39 1.000 180.000 -XC21 XC17 XN19 XC20 1.000 180.000 -XC12 XN19 XC21 XO22 10.500 180.000 -XC11 XH43 XC23 XC7 1.100 180.000 -XC6 XH44 XC24 XC2 1.100 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-24.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-24.lib deleted file mode 100644 index 66590bf4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-24.lib +++ /dev/null @@ -1,151 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 47 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.1800 - 2 C2 XC2 0.0000 - 3 C3 XC3 -0.0350 - 4 C4 XC4 -0.2570 - 5 C5 XC5 0.4730 - 6 N6 XN6 -0.6780 - 7 C7 XC7 0.4730 - 8 C8 XC8 -0.2920 - 9 C9 XC9 0.0000 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 0.4480 - 15 C15 XC15 -0.0600 - 16 C16 XC16 -0.1200 - 17 C17 XC17 -0.1200 - 18 N18 XN18 -0.5282 - 19 C19 XC19 0.5687 - 20 N20 XN20 -0.9138 - 21 N21 XN21 -0.0184 - 22 C22 XC22 -0.0090 - 23 C23 XC23 0.6225 - 24 O24 XO24 -0.5000 - 25 C25 XC25 -0.1150 - 26 C26 XC26 0.2270 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.0120 - 31 H31 XH31 0.0120 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.0600 - 36 H36 XH36 0.0600 - 37 H37 XH37 0.0600 - 38 H38 XH38 0.0600 - 39 H39 XH39 0.0600 - 40 H40 XH40 0.3451 - 41 H41 XH41 0.4600 - 42 H42 XH42 0.0600 - 43 H43 XH43 0.0600 - 44 H44 XH44 0.0600 - 45 H45 XH45 0.1150 - 46 H46 XH46 0.0650 - 47 H47 XH47 0.4600 - -[bonds] -C1 C2 -C1 H27 -C1 H28 -C1 H29 -C2 C3 -C3 C4 -C4 C5 -C4 C26 -C5 N6 -C5 H30 -N6 C7 -C7 C8 -C7 H31 -C8 C9 -C8 C26 -C9 C10 -C9 C25 -C10 C11 -C10 H32 -C11 C12 -C11 H33 -C12 C13 -C12 H34 -C13 C14 -C13 C25 -C14 C15 -C14 N18 -C14 C23 -C15 C16 -C15 C17 -C15 H35 -C16 C17 -C16 H36 -C16 H37 -C17 H38 -C17 H39 -N18 C19 -N18 H40 -C19 N20 -C19 N21 -N20 H41 -N20 H47 -N21 C22 -N21 C23 -C22 H42 -C22 H43 -C22 H44 -C23 O24 -C25 H45 -C26 H46 - -[impropers] -C5 C26 C4 C3 -N6 H30 C5 C4 -C8 H31 C7 N6 -C9 C26 C8 C7 -C10 C25 C9 C8 -C11 H32 C10 C9 -C12 H33 C11 C10 -C13 H34 C12 C11 -C14 C25 C13 C12 -C14 H40 N18 C19 -N20 N21 C19 N18 -H47 C19 N20 H41 -C23 C19 N21 C22 -C14 N21 C23 O24 -C13 H45 C25 C9 -C8 H46 C26 C4 - -[charge_groups] -C1 H27 H28 H29 -C2 -C3 -C4 -C5 H30 -N6 -C7 H31 -C8 -C9 -C10 H32 -C11 H33 -C12 H34 -C13 -C14 -C15 H35 -C16 H36 H37 -C17 H38 H39 -N18 H40 -C19 -N20 H41 H47 -N21 -C22 H42 H43 H44 -C23 -O24 -C25 H45 -C26 H46 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-24.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-24.prm deleted file mode 100644 index 2a26ca1b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-24.prm +++ /dev/null @@ -1,729 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC2 1831.61 1831.61 37.67 1295.14 26.63 12.0110 -XC3 1831.61 1831.61 37.67 1295.14 26.63 12.0110 -XC4 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC5 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN6 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC15 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC16 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC17 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN18 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC19 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN20 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN21 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC22 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC23 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO24 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XC25 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC26 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH36 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH37 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH38 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH39 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH40 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH41 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH42 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH43 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH44 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH45 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH46 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH47 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XC2 780.0 1.470 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XC2 XC3 1970.0 1.221 -XC3 XC4 800.0 1.451 -XC4 XC5 938.0 1.400 -XC4 XC26 938.0 1.400 -XC5 XN6 966.0 1.339 -XC5 XH30 734.0 1.080 -XN6 XC7 966.0 1.339 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XH31 734.0 1.080 -XC8 XC9 750.0 1.464 -XC8 XC26 938.0 1.400 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XC25 938.0 1.400 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH32 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH33 734.0 1.080 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XH34 734.0 1.080 -XC13 XC14 634.0 1.510 -XC13 XC25 938.0 1.400 -XC14 XC15 550.0 1.510 -XC14 XN18 674.0 1.463 -XC14 XC23 634.0 1.522 -XC15 XC16 520.0 1.509 -XC15 XC17 520.0 1.509 -XC15 XH35 680.0 1.088 -XC16 XC17 520.0 1.509 -XC16 XH36 680.0 1.088 -XC16 XH37 680.0 1.088 -XC17 XH38 680.0 1.088 -XC17 XH39 680.0 1.088 -XN18 XC19 962.0 1.340 -XN18 XH40 868.0 1.010 -XC19 XN20 962.0 1.340 -XC19 XN21 962.0 1.340 -XN20 XH41 868.0 1.010 -XN20 XH47 868.0 1.010 -XN21 XC22 674.0 1.463 -XN21 XC23 690.0 1.422 -XC22 XH42 680.0 1.090 -XC22 XH43 680.0 1.090 -XC22 XH44 680.0 1.090 -XC23 XO24 1140.0 1.229 -XC25 XH45 734.0 1.080 -XC26 XH46 734.0 1.080 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XC2 XC1 XH27 70.00 108.500 -XC2 XC1 XH28 70.00 108.500 -XC2 XC1 XH29 70.00 108.500 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XC1 XC2 XC3 60.00 179.488 -XC2 XC3 XC4 60.00 179.532 -XC3 XC4 XC5 140.00 120.000 -XC3 XC4 XC26 140.00 120.000 -XC5 XC4 XC26 126.00 120.000 -XC4 XC5 XN6 140.00 124.000 -XC4 XC5 XH30 70.00 120.000 -XN6 XC5 XH30 70.00 116.000 -XC5 XN6 XC7 140.00 117.000 -XN6 XC7 XC8 140.00 124.000 -XN6 XC7 XH31 70.00 116.000 -XC8 XC7 XH31 70.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 120.00 122.760 -XC7 XC8 XC26 126.00 120.000 -XC9 XC8 XC26 120.00 122.760 -XC8 XC9 XC10 120.00 122.760 -XC8 XC9 XC25 120.00 122.760 -XC10 XC9 XC25 126.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH32 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH33 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH33 70.00 120.000 -XC11 XC12 XC13 126.00 120.000 -XC11 XC12 XH34 70.00 120.000 -XC13 XC12 XH34 70.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC12 XC13 XC25 126.00 120.000 -XC14 XC13 XC25 140.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 140.00 111.440 -XC13 XC14 XN18 150.00 112.420 -XC13 XC14 XC23 140.00 109.443 -XC15 XC14 XN18 160.00 111.200 -XC15 XC14 XC23 126.00 111.100 -XN18 XC14 XC23 140.00 113.515 -XC14 XC15 XC16 120.00 120.940 -XC14 XC15 XC17 120.00 120.940 -XC14 XC15 XH35 80.00 115.045 -XC16 XC15 XC17 20.00 60.0050 -XC16 XC15 XH35 75.00 117.200 -XC17 XC15 XH35 75.00 117.200 -XC15 XC16 XC17 20.00 60.0050 -XC15 XC16 XH36 75.00 117.200 -XC15 XC16 XH37 75.00 117.200 -XC17 XC16 XH36 75.00 117.200 -XC17 XC16 XH37 75.00 117.200 -XH36 XC16 XH37 70.00 114.300 -XC15 XC17 XC16 20.00 60.0050 -XC15 XC17 XH38 75.00 117.200 -XC15 XC17 XH39 75.00 117.200 -XC16 XC17 XH38 75.00 117.200 -XC16 XC17 XH39 75.00 117.200 -XH38 XC17 XH39 70.00 114.300 -XC14 XN18 XC19 100.00 123.200 -XC14 XN18 XH40 70.00 118.400 -XC19 XN18 XH40 70.00 120.000 -XN18 XC19 XN20 140.00 120.000 -XN18 XC19 XN21 140.00 120.000 -XN20 XC19 XN21 140.00 120.000 -XC19 XN20 XH41 70.00 120.000 -XC19 XN20 XH47 70.00 120.000 -XH41 XN20 XH47 70.00 120.000 -XC19 XN21 XC22 100.00 123.200 -XC19 XN21 XC23 130.00 120.700 -XC22 XN21 XC23 100.00 121.900 -XN21 XC22 XH42 70.00 109.500 -XN21 XC22 XH43 70.00 109.500 -XN21 XC22 XH44 70.00 109.500 -XH42 XC22 XH43 66.00 107.800 -XH42 XC22 XH44 66.00 107.800 -XH43 XC22 XH44 66.00 107.800 -XC14 XC23 XN21 150.00 111.380 -XC14 XC23 XO24 160.00 120.400 -XN21 XC23 XO24 180.00 118.720 -XC9 XC25 XC13 126.00 120.000 -XC9 XC25 XH45 70.00 120.000 -XC13 XC25 XH45 70.00 120.000 -XC4 XC26 XC8 126.00 120.000 -XC4 XC26 XH46 70.00 120.000 -XC8 XC26 XH46 70.00 120.000 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH27 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XC2 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XC2 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XC4 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XC4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC5 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XC4 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XN6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XN6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XN6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XN6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC4 XC5 XN6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC4 XC5 XN6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC4 XC5 XN6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC4 XC5 XN6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC4 XC5 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC4 XC5 XH30 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC4 XC5 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC4 XC5 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC26 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC26 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC26 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC26 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC26 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC26 XH46 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC26 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC26 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC26 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC26 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC26 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC26 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC26 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC26 XH46 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC26 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC26 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XN6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XN6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XN6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XN6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC5 XN6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC5 XN6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC5 XN6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC5 XN6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XN6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XN6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XN6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XN6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XN6 XC7 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XN6 XC7 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XN6 XC7 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XN6 XC7 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN6 XC7 XC8 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN6 XC7 XC8 XC26 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN6 XC7 XC8 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN6 XC7 XC8 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC26 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC7 XC8 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC25 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC25 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC25 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC8 XC9 XC10 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC8 XC9 XC10 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC8 XC9 XC10 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC8 XC9 XC25 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC8 XC9 XC25 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC8 XC9 XC25 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC8 XC9 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC26 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC26 XC4 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC26 XC4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC26 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC26 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC26 XH46 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC26 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC26 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC26 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC26 XC4 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC26 XC4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC26 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC26 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC26 XH46 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC26 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC26 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC9 XC10 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC9 XC10 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC9 XC10 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC9 XC10 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC25 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC25 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC25 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC25 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC25 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC25 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC25 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC25 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC25 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC25 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC25 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC25 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC25 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC25 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC25 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC25 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC10 XC11 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC11 XC12 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC12 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XN18 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XN18 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XN18 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XN18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC23 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.042 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XN18 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XN18 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XN18 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XN18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC23 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC17 -0.037 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC17 0.372 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC17 -0.473 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.432 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC14 XC15 XC16 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC14 XC15 XC16 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC14 XC15 XC16 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC14 XC15 XC17 1.345 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC14 XC15 XC17 -0.310 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC14 XC15 XC17 0.955 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC14 XC15 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC14 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC14 XC15 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC14 XC15 XH35 -0.291 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC14 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC14 XC15 XC16 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC14 XC15 XC16 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC14 XC15 XC16 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC14 XC15 XC17 -0.957 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC14 XC15 XC17 -0.182 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC14 XC15 XC17 0.294 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC14 XC15 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC14 XC15 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC14 XC15 XH35 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC14 XC15 XH35 -0.113 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC14 XC15 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XN18 XC19 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XN18 XC19 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XN18 XC19 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XN18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XN18 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XN18 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XN18 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XN18 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XN18 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XN18 XC19 0.256 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XN18 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XN18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XN18 XH40 -0.095 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XN18 XH40 -0.208 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XN18 XH40 0.209 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XN18 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC14 XN18 XC19 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC14 XN18 XC19 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC14 XN18 XC19 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC14 XN18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC14 XN18 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC14 XN18 XH40 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC14 XN18 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC14 XN18 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC23 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC23 XN21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC23 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC23 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC23 XN21 1.397 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC23 XN21 -0.080 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC23 XN21 -0.188 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC23 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC14 XC23 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC14 XC23 XN21 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC14 XC23 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC14 XC23 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC14 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC14 XC23 XO24 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC14 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC14 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC15 XC16 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC15 XC16 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC15 XC16 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC15 XC16 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC15 XC16 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC15 XC16 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC15 XC16 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC15 XC16 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC17 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC17 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH36 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH36 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH37 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH37 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC16 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC17 XC16 0.079 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC17 XC16 -0.040 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC17 XC16 0.673 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC17 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC17 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC17 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC17 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC17 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC17 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC17 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC15 XC17 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC15 XC17 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC15 XC17 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC15 XC17 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC15 XC17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC15 XC17 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC15 XC17 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC15 XC17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC17 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC17 XC16 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC17 XC16 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC17 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC17 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC17 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC17 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC17 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC17 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC15 XC17 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC15 XC17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XC15 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XC15 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC16 XC17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC16 XC17 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC16 XC17 XC15 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC16 XC17 XC15 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC16 XC17 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC16 XC17 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC16 XC17 XH38 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC16 XC17 XH38 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC16 XC17 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC16 XC17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC16 XC17 XH39 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC16 XC17 XH39 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC16 XC17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XN18 XC19 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XN18 XC19 XN20 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XN18 XC19 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XN18 XC19 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XN18 XC19 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XN18 XC19 XN21 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XN18 XC19 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XN18 XC19 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN20 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN21 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XN18 XC19 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH41 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH47 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN20 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH41 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH47 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC19 XN20 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC22 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC23 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN18 XC19 XN21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC22 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC23 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC19 XN21 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH42 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH43 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH44 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN21 XC22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XC14 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XC14 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XC14 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XO24 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN21 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XC14 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XC14 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XO24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XO24 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XO24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN21 XC23 XO24 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC5 XC26 XC4 XC3 4.000 180.000 -XN6 XH30 XC5 XC4 1.100 180.000 -XC8 XH31 XC7 XN6 1.100 180.000 -XC9 XC26 XC8 XC7 4.000 180.000 -XC10 XC25 XC9 XC8 4.000 180.000 -XC11 XH32 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH33 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC13 XH34 XC12 XC11 1.100 180.000 -XC14 XC25 XC13 XC12 4.000 180.000 -XC14 XH40 XN18 XC19 1.000 180.000 -XN20 XN21 XC19 XN18 10.500 180.000 -XH47 XC19 XN20 XH41 1.000 180.000 -XC23 XC19 XN21 XC22 1.000 180.000 -XC14 XN21 XC23 XO24 10.500 180.000 -XC13 XH45 XC25 XC9 1.100 180.000 -XC8 XH46 XC26 XC4 1.100 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4a.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4a.lib deleted file mode 100644 index 7c442b92..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4a.lib +++ /dev/null @@ -1,156 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 46 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 0.0000 - 18 C18 XC18 0.0000 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 -0.1150 - 21 C21 XC21 -0.1150 - 22 C22 XC22 -0.1150 - 23 C23 XC23 -0.1150 - 24 C24 XC24 -0.1150 - 25 C25 XC25 0.6225 - 26 O26 XO26 -0.5000 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.4600 - 31 H31 XH31 0.3451 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.1150 - 42 H42 XH42 0.1150 - 43 H43 XH43 0.1150 - 44 H44 XH44 0.1150 - 45 H45 XH45 0.1150 - 46 H46 XH46 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H27 -C1 H28 -C1 H29 -N2 C3 -N2 C25 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H30 -N4 H46 -N5 C6 -N5 H31 -C6 C7 -C6 C13 -C6 C25 -C7 C8 -C7 C12 -C8 C9 -C8 H32 -C9 C10 -C9 H33 -C10 C11 -C10 H34 -C11 C12 -C11 H35 -C12 H36 -C13 C14 -C13 C24 -C14 C15 -C14 H37 -C15 C16 -C15 H38 -C16 C17 -C16 H39 -C17 C18 -C17 C24 -C18 C19 -C18 C23 -C19 C20 -C19 H40 -C20 C21 -C20 H41 -C21 C22 -C21 H42 -C22 C23 -C22 H43 -C23 H44 -C24 H45 -C25 O26 - -[impropers] -C25 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H46 C3 N4 H30 -C6 H31 N5 C3 -C8 C12 C7 C6 -C9 H32 C8 C7 -C10 H33 C9 C8 -C11 H34 C10 C9 -C12 H35 C11 C10 -C11 H36 C12 C7 -C14 C24 C13 C6 -C15 H37 C14 C13 -C16 H38 C15 C14 -C17 H39 C16 C15 -C18 C24 C17 C16 -C19 C23 C18 C17 -C20 H40 C19 C18 -C21 H41 C20 C19 -C22 H42 C21 C20 -C23 H43 C22 C21 -C22 H44 C23 C18 -C17 H45 C24 C13 -N2 C6 C25 O26 - -[charge_groups] -C1 H27 H28 H29 -N2 -C3 -N4 H30 H46 -N5 H31 -C6 -C7 -C8 H32 -C9 H33 -C10 H34 -C11 H35 -C12 H36 -C13 -C14 H37 -C15 H38 -C16 H39 -C17 -C18 -C19 H40 -C20 H41 -C21 H42 -C22 H43 -C23 H44 -C24 H45 -C25 -O26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4a.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4a.prm deleted file mode 100644 index acb49be3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4a.prm +++ /dev/null @@ -1,708 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC21 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC23 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC25 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO26 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH46 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC25 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH30 868.0 1.010 -XN4 XH46 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH31 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC13 634.0 1.510 -XC6 XC25 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC12 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH32 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH33 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH34 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH35 734.0 1.080 -XC12 XH36 734.0 1.080 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC24 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH37 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH38 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH39 734.0 1.080 -XC17 XC18 750.0 1.464 -XC17 XC24 938.0 1.400 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XC23 938.0 1.400 -XC19 XC20 938.0 1.400 -XC19 XH40 734.0 1.080 -XC20 XC21 938.0 1.400 -XC20 XH41 734.0 1.080 -XC21 XC22 938.0 1.400 -XC21 XH42 734.0 1.080 -XC22 XC23 938.0 1.400 -XC22 XH43 734.0 1.080 -XC23 XH44 734.0 1.080 -XC24 XH45 734.0 1.080 -XC25 XO26 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC25 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC25 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH30 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH46 70.00 120.000 -XH30 XN4 XH46 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH31 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH31 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC13 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC25 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC13 140.00 112.047 -XC7 XC6 XC25 140.00 109.443 -XC13 XC6 XC25 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC12 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC12 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH35 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH35 70.00 120.000 -XC7 XC12 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC12 XH36 70.00 120.000 -XC11 XC12 XH36 70.00 120.000 -XC6 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC6 XC13 XC24 140.00 120.000 -XC14 XC13 XC24 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 120.00 122.760 -XC16 XC17 XC24 126.00 120.000 -XC18 XC17 XC24 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC19 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC23 120.00 122.760 -XC19 XC18 XC23 126.00 120.000 -XC18 XC19 XC20 126.00 120.000 -XC18 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC20 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC19 XC20 XC21 126.00 120.000 -XC19 XC20 XH41 70.00 120.000 -XC21 XC20 XH41 70.00 120.000 -XC20 XC21 XC22 126.00 120.000 -XC20 XC21 XH42 70.00 120.000 -XC22 XC21 XH42 70.00 120.000 -XC21 XC22 XC23 126.00 120.000 -XC21 XC22 XH43 70.00 120.000 -XC23 XC22 XH43 70.00 120.000 -XC18 XC23 XC22 126.00 120.000 -XC18 XC23 XH44 70.00 120.000 -XC22 XC23 XH44 70.00 120.000 -XC13 XC24 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC24 XH45 70.00 120.000 -XC17 XC24 XH45 70.00 120.000 -XN2 XC25 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC25 XO26 180.00 118.720 -XC6 XC25 XO26 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC23 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC23 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC23 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC23 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC23 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC23 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC25 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH46 XC3 XN4 XH30 1.000 180.000 -XC6 XH31 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC12 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH32 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH33 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH34 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH35 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC11 XH36 XC12 XC7 1.100 180.000 -XC14 XC24 XC13 XC6 4.000 180.000 -XC15 XH37 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH38 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH39 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XC24 XC17 XC16 4.000 180.000 -XC19 XC23 XC18 XC17 4.000 180.000 -XC20 XH40 XC19 XC18 1.100 180.000 -XC21 XH41 XC20 XC19 1.100 180.000 -XC22 XH42 XC21 XC20 1.100 180.000 -XC23 XH43 XC22 XC21 1.100 180.000 -XC22 XH44 XC23 XC18 1.100 180.000 -XC17 XH45 XC24 XC13 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC25 XO26 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4b.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4b.lib deleted file mode 100644 index ddb988f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4b.lib +++ /dev/null @@ -1,166 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 50 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 0.1100 - 2 O2 XO2 -0.2850 - 3 C3 XC3 0.0850 - 4 C4 XC4 -0.1150 - 5 C5 XC5 -0.1150 - 6 C6 XC6 -0.1150 - 7 C7 XC7 0.0000 - 8 C8 XC8 0.0000 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 0.5630 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 -0.1150 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 N20 XN20 -0.5282 - 21 C21 XC21 0.5687 - 22 N22 XN22 -0.9138 - 23 N23 XN23 -0.0184 - 24 C24 XC24 -0.0090 - 25 C25 XC25 0.6225 - 26 O26 XO26 -0.5000 - 27 C27 XC27 -0.1150 - 28 C28 XC28 -0.1150 - 29 H29 XH29 0.0300 - 30 H30 XH30 0.0300 - 31 H31 XH31 0.0300 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.1150 - 42 H42 XH42 0.1150 - 43 H43 XH43 0.3451 - 44 H44 XH44 0.4600 - 45 H45 XH45 0.0600 - 46 H46 XH46 0.0600 - 47 H47 XH47 0.0600 - 48 H48 XH48 0.1150 - 49 H49 XH49 0.1150 - 50 H50 XH50 0.4600 - -[bonds] -C1 O2 -C1 H29 -C1 H30 -C1 H31 -O2 C3 -C3 C4 -C3 C28 -C4 C5 -C4 H32 -C5 C6 -C5 H33 -C6 C7 -C6 H34 -C7 C8 -C7 C28 -C8 C9 -C8 C27 -C9 C10 -C9 H35 -C10 C11 -C10 H36 -C11 C12 -C11 H37 -C12 C13 -C12 C27 -C13 C14 -C13 N20 -C13 C25 -C14 C15 -C14 C19 -C15 C16 -C15 H38 -C16 C17 -C16 H39 -C17 C18 -C17 H40 -C18 C19 -C18 H41 -C19 H42 -N20 C21 -N20 H43 -C21 N22 -C21 N23 -N22 H44 -N22 H50 -N23 C24 -N23 C25 -C24 H45 -C24 H46 -C24 H47 -C25 O26 -C27 H48 -C28 H49 - -[impropers] -C4 C28 C3 O2 -C5 H32 C4 C3 -C6 H33 C5 C4 -C7 H34 C6 C5 -C8 C28 C7 C6 -C9 C27 C8 C7 -C10 H35 C9 C8 -C11 H36 C10 C9 -C12 H37 C11 C10 -C13 C27 C12 C11 -C15 C19 C14 C13 -C16 H38 C15 C14 -C17 H39 C16 C15 -C18 H40 C17 C16 -C19 H41 C18 C17 -C18 H42 C19 C14 -C13 H43 N20 C21 -N22 N23 C21 N20 -H50 C21 N22 H44 -C25 C21 N23 C24 -C13 N23 C25 O26 -C12 H48 C27 C8 -C7 H49 C28 C3 - -[charge_groups] -C1 H29 H30 H31 -O2 -C3 -C4 H32 -C5 H33 -C6 H34 -C7 -C8 -C9 H35 -C10 H36 -C11 H37 -C12 -C13 -C14 -C15 H38 -C16 H39 -C17 H40 -C18 H41 -C19 H42 -N20 H43 -C21 -N22 H44 H50 -N23 -C24 H45 H46 H47 -C25 -O26 -C27 H48 -C28 H49 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4b.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4b.prm deleted file mode 100644 index 316b260b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4b.prm +++ /dev/null @@ -1,743 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XO2 445.13 445.13 18.25 314.75 12.91 15.9994 -XC3 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC4 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC5 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC6 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN20 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC21 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN22 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN23 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC24 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC25 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO26 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XC27 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC28 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH44 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH45 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH46 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH47 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH48 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH49 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH50 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XO2 640.0 1.410 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XC1 XH30 680.0 1.090 -XC1 XH31 680.0 1.090 -XO2 XC3 900.0 1.364 -XC3 XC4 938.0 1.400 -XC3 XC28 938.0 1.400 -XC4 XC5 938.0 1.400 -XC4 XH32 734.0 1.080 -XC5 XC6 938.0 1.400 -XC5 XH33 734.0 1.080 -XC6 XC7 938.0 1.400 -XC6 XH34 734.0 1.080 -XC7 XC8 750.0 1.464 -XC7 XC28 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XC27 938.0 1.400 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH35 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH36 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH37 734.0 1.080 -XC12 XC13 634.0 1.510 -XC12 XC27 938.0 1.400 -XC13 XC14 634.0 1.510 -XC13 XN20 674.0 1.463 -XC13 XC25 634.0 1.522 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XC19 938.0 1.400 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH38 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH39 734.0 1.080 -XC17 XC18 938.0 1.400 -XC17 XH40 734.0 1.080 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XH41 734.0 1.080 -XC19 XH42 734.0 1.080 -XN20 XC21 962.0 1.340 -XN20 XH43 868.0 1.010 -XC21 XN22 962.0 1.340 -XC21 XN23 962.0 1.340 -XN22 XH44 868.0 1.010 -XN22 XH50 868.0 1.010 -XN23 XC24 674.0 1.463 -XN23 XC25 690.0 1.422 -XC24 XH45 680.0 1.090 -XC24 XH46 680.0 1.090 -XC24 XH47 680.0 1.090 -XC25 XO26 1140.0 1.229 -XC27 XH48 734.0 1.080 -XC28 XH49 734.0 1.080 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XO2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XO2 XC1 XH30 70.00 109.500 -XO2 XC1 XH31 70.00 109.500 -XH29 XC1 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC1 XH31 66.00 107.800 -XH30 XC1 XH31 66.00 107.800 -XC1 XO2 XC3 150.00 111.000 -XO2 XC3 XC4 140.00 120.000 -XO2 XC3 XC28 140.00 120.000 -XC4 XC3 XC28 126.00 120.000 -XC3 XC4 XC5 126.00 120.000 -XC3 XC4 XH32 70.00 120.000 -XC5 XC4 XH32 70.00 120.000 -XC4 XC5 XC6 126.00 120.000 -XC4 XC5 XH33 70.00 120.000 -XC6 XC5 XH33 70.00 120.000 -XC5 XC6 XC7 126.00 120.000 -XC5 XC6 XH34 70.00 120.000 -XC7 XC6 XH34 70.00 120.000 -XC6 XC7 XC8 120.00 122.760 -XC6 XC7 XC28 126.00 120.000 -XC8 XC7 XC28 120.00 122.760 -XC7 XC8 XC9 120.00 122.760 -XC7 XC8 XC27 120.00 122.760 -XC9 XC8 XC27 126.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH35 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH35 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH36 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH36 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH37 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH37 70.00 120.000 -XC11 XC12 XC13 140.00 120.000 -XC11 XC12 XC27 126.00 120.000 -XC13 XC12 XC27 140.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 140.00 112.047 -XC12 XC13 XN20 150.00 112.420 -XC12 XC13 XC25 140.00 109.443 -XC14 XC13 XN20 150.00 112.420 -XC14 XC13 XC25 140.00 109.443 -XN20 XC13 XC25 140.00 113.515 -XC13 XC14 XC15 140.00 120.000 -XC13 XC14 XC19 140.00 120.000 -XC15 XC14 XC19 126.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 126.00 120.000 -XC16 XC17 XH40 70.00 120.000 -XC18 XC17 XH40 70.00 120.000 -XC17 XC18 XC19 126.00 120.000 -XC17 XC18 XH41 70.00 120.000 -XC19 XC18 XH41 70.00 120.000 -XC14 XC19 XC18 126.00 120.000 -XC14 XC19 XH42 70.00 120.000 -XC18 XC19 XH42 70.00 120.000 -XC13 XN20 XC21 100.00 123.200 -XC13 XN20 XH43 70.00 118.400 -XC21 XN20 XH43 70.00 120.000 -XN20 XC21 XN22 140.00 120.000 -XN20 XC21 XN23 140.00 120.000 -XN22 XC21 XN23 140.00 120.000 -XC21 XN22 XH44 70.00 120.000 -XC21 XN22 XH50 70.00 120.000 -XH44 XN22 XH50 70.00 120.000 -XC21 XN23 XC24 100.00 123.200 -XC21 XN23 XC25 130.00 120.700 -XC24 XN23 XC25 100.00 121.900 -XN23 XC24 XH45 70.00 109.500 -XN23 XC24 XH46 70.00 109.500 -XN23 XC24 XH47 70.00 109.500 -XH45 XC24 XH46 66.00 107.800 -XH45 XC24 XH47 66.00 107.800 -XH46 XC24 XH47 66.00 107.800 -XC13 XC25 XN23 150.00 111.380 -XC13 XC25 XO26 160.00 120.400 -XN23 XC25 XO26 180.00 118.720 -XC8 XC27 XC12 126.00 120.000 -XC8 XC27 XH48 70.00 120.000 -XC12 XC27 XH48 70.00 120.000 -XC3 XC28 XC7 126.00 120.000 -XC3 XC28 XH49 70.00 120.000 -XC7 XC28 XH49 70.00 120.000 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH29 XC1 XO2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XO2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XO2 XC3 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XO2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XO2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XO2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XO2 XC3 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XO2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XO2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XO2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XO2 XC3 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XO2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 1.958 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC28 1.958 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XC5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XC5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XH49 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XH49 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XH49 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XH49 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC28 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC6 XC7 XC28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC6 XC7 XC28 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC6 XC7 XC28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC6 XC7 XC28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC27 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC27 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC27 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC28 XC7 XC8 XC9 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC28 XC7 XC8 XC9 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC28 XC7 XC8 XC9 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC28 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC28 XC7 XC8 XC27 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC28 XC7 XC8 XC27 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC28 XC7 XC8 XC27 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC28 XC7 XC8 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC28 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC28 XC3 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC28 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC28 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC28 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC28 XH49 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC28 XH49 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC28 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC28 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC28 XC3 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC28 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC28 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC28 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC28 XH49 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC28 XH49 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC28 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC8 XC9 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC8 XC9 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC8 XC9 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC8 XC9 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC27 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC27 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC27 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC27 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC27 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC27 XH48 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC27 XH48 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC27 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC27 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC27 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC27 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC27 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC27 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC27 XH48 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC27 XH48 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC27 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC27 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XC27 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN20 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN20 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN20 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC12 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC12 XC13 XN20 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC12 XC13 XN20 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC12 XC13 XN20 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC12 XC13 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC12 XC13 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC12 XC13 XC25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC12 XC13 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC12 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC27 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC27 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC27 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC27 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC27 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC27 XH48 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC27 XH48 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC27 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC27 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC27 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC27 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC27 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC27 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC27 XH48 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC27 XH48 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC27 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC13 XC14 XC15 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC13 XC14 XC15 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC13 XC14 XC15 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC13 XC14 XC19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC13 XC14 XC19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC13 XC14 XC19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC13 XC14 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC19 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN20 XC21 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN20 XC21 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN20 XC21 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN20 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN20 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XN20 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XN20 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XN20 XC21 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XN20 XC21 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XN20 XC21 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XN20 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XN20 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XN20 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XN20 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XN20 XC21 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XN20 XC21 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XN20 XC21 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XN20 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XN20 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XN20 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XN20 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XN23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XN23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XN23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XN23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XN23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XN23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC13 XC25 XN23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC13 XC25 XN23 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC13 XC25 XN23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC13 XC25 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC13 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC13 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC13 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC13 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC19 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC19 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC19 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC19 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC19 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC19 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC19 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC19 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC19 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC19 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC19 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC19 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC19 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC19 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC19 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC19 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC18 XC19 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC18 XC19 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC18 XC19 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC18 XC19 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC18 XC19 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC18 XC19 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC18 XC19 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC18 XC19 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XN20 XC21 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XN20 XC21 XN22 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XN20 XC21 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XN20 XC21 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XN20 XC21 XN23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XN20 XC21 XN23 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XN20 XC21 XN23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XN20 XC21 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XN20 XC21 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XN20 XC21 XN22 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XN20 XC21 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XN20 XC21 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XN20 XC21 XN23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XN20 XC21 XN23 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XN20 XC21 XN23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XN20 XC21 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XN22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XN22 XH44 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XN22 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XN22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XN22 XH50 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XN22 XH50 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XN22 XH50 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XN22 XH50 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN23 XC21 XN22 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN23 XC21 XN22 XH44 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN23 XC21 XN22 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN23 XC21 XN22 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN23 XC21 XN22 XH50 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN23 XC21 XN22 XH50 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN23 XC21 XN22 XH50 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN23 XC21 XN22 XH50 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XN23 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XN23 XC24 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XN23 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XN23 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XN23 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XN23 XC25 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XN23 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XN23 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN22 XC21 XN23 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN22 XC21 XN23 XC24 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN22 XC21 XN23 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN22 XC21 XN23 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN22 XC21 XN23 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN22 XC21 XN23 XC25 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN22 XC21 XN23 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN22 XC21 XN23 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN23 XC24 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN23 XC24 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN23 XC24 XH45 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN23 XC24 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN23 XC24 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN23 XC24 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN23 XC24 XH46 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN23 XC24 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN23 XC24 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN23 XC24 XH47 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN23 XC24 XH47 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN23 XC24 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN23 XC24 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN23 XC24 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN23 XC24 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN23 XC24 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN23 XC24 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN23 XC24 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN23 XC24 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN23 XC24 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN23 XC24 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN23 XC24 XH47 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN23 XC24 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN23 XC24 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN23 XC25 XC13 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN23 XC25 XC13 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN23 XC25 XC13 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN23 XC25 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN23 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN23 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN23 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN23 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN23 XC25 XC13 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN23 XC25 XC13 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN23 XC25 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN23 XC25 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN23 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN23 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN23 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN23 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC4 XC28 XC3 XO2 4.000 180.000 -XC5 XH32 XC4 XC3 1.100 180.000 -XC6 XH33 XC5 XC4 1.100 180.000 -XC7 XH34 XC6 XC5 1.100 180.000 -XC8 XC28 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XC27 XC8 XC7 4.000 180.000 -XC10 XH35 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH36 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH37 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC13 XC27 XC12 XC11 4.000 180.000 -XC15 XC19 XC14 XC13 4.000 180.000 -XC16 XH38 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH39 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XH40 XC17 XC16 1.100 180.000 -XC19 XH41 XC18 XC17 1.100 180.000 -XC18 XH42 XC19 XC14 1.100 180.000 -XC13 XH43 XN20 XC21 1.000 180.000 -XN22 XN23 XC21 XN20 10.500 180.000 -XH50 XC21 XN22 XH44 1.000 180.000 -XC25 XC21 XN23 XC24 1.000 180.000 -XC13 XN23 XC25 XO26 10.500 180.000 -XC12 XH48 XC27 XC8 1.100 180.000 -XC7 XH49 XC28 XC3 1.100 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4c.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4c.lib deleted file mode 100644 index 52e83231..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4c.lib +++ /dev/null @@ -1,166 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 50 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 0.1100 - 2 O2 XO2 -0.2850 - 3 C3 XC3 0.0850 - 4 C4 XC4 -0.1150 - 5 C5 XC5 -0.1150 - 6 C6 XC6 0.0000 - 7 C7 XC7 0.0000 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 0.5630 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 -0.1150 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 N19 XN19 -0.5282 - 20 C20 XC20 0.5687 - 21 N21 XN21 -0.9138 - 22 N22 XN22 -0.0184 - 23 C23 XC23 -0.0090 - 24 C24 XC24 0.6225 - 25 O25 XO25 -0.5000 - 26 C26 XC26 -0.1150 - 27 C27 XC27 -0.1150 - 28 C28 XC28 -0.1150 - 29 H29 XH29 0.0300 - 30 H30 XH30 0.0300 - 31 H31 XH31 0.0300 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.1150 - 42 H42 XH42 0.3451 - 43 H43 XH43 0.4600 - 44 H44 XH44 0.0600 - 45 H45 XH45 0.0600 - 46 H46 XH46 0.0600 - 47 H47 XH47 0.1150 - 48 H48 XH48 0.1150 - 49 H49 XH49 0.1150 - 50 H50 XH50 0.4600 - -[bonds] -C1 O2 -C1 H29 -C1 H30 -C1 H31 -O2 C3 -C3 C4 -C3 C28 -C4 C5 -C4 H32 -C5 C6 -C5 H33 -C6 C7 -C6 C27 -C7 C8 -C7 C26 -C8 C9 -C8 H34 -C9 C10 -C9 H35 -C10 C11 -C10 H36 -C11 C12 -C11 C26 -C12 C13 -C12 N19 -C12 C24 -C13 C14 -C13 C18 -C14 C15 -C14 H37 -C15 C16 -C15 H38 -C16 C17 -C16 H39 -C17 C18 -C17 H40 -C18 H41 -N19 C20 -N19 H42 -C20 N21 -C20 N22 -N21 H43 -N21 H50 -N22 C23 -N22 C24 -C23 H44 -C23 H45 -C23 H46 -C24 O25 -C26 H47 -C27 C28 -C27 H48 -C28 H49 - -[impropers] -C4 C28 C3 O2 -C5 H32 C4 C3 -C6 H33 C5 C4 -C7 C27 C6 C5 -C8 C26 C7 C6 -C9 H34 C8 C7 -C10 H35 C9 C8 -C11 H36 C10 C9 -C12 C26 C11 C10 -C14 C18 C13 C12 -C15 H37 C14 C13 -C16 H38 C15 C14 -C17 H39 C16 C15 -C18 H40 C17 C16 -C17 H41 C18 C13 -C12 H42 N19 C20 -N21 N22 C20 N19 -H50 C20 N21 H43 -C24 C20 N22 C23 -C12 N22 C24 O25 -C11 H47 C26 C7 -C28 H48 C27 C6 -C27 H49 C28 C3 - -[charge_groups] -C1 H29 H30 H31 -O2 -C3 -C4 H32 -C5 H33 -C6 -C7 -C8 H34 -C9 H35 -C10 H36 -C11 -C12 -C13 -C14 H37 -C15 H38 -C16 H39 -C17 H40 -C18 H41 -N19 H42 -C20 -N21 H43 H50 -N22 -C23 H44 H45 H46 -C24 -O25 -C26 H47 -C27 H48 -C28 H49 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4c.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4c.prm deleted file mode 100644 index 0c5fa0d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4c.prm +++ /dev/null @@ -1,743 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XO2 445.13 445.13 18.25 314.75 12.91 15.9994 -XC3 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC4 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC5 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC6 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN19 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC20 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN21 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN22 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC23 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC24 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO25 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XC26 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC27 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC28 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH43 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH44 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH45 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH46 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH47 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH48 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH49 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH50 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XO2 640.0 1.410 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XC1 XH30 680.0 1.090 -XC1 XH31 680.0 1.090 -XO2 XC3 900.0 1.364 -XC3 XC4 938.0 1.400 -XC3 XC28 938.0 1.400 -XC4 XC5 938.0 1.400 -XC4 XH32 734.0 1.080 -XC5 XC6 938.0 1.400 -XC5 XH33 734.0 1.080 -XC6 XC7 750.0 1.464 -XC6 XC27 938.0 1.400 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC26 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH34 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH35 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH36 734.0 1.080 -XC11 XC12 634.0 1.510 -XC11 XC26 938.0 1.400 -XC12 XC13 634.0 1.510 -XC12 XN19 674.0 1.463 -XC12 XC24 634.0 1.522 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC18 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH37 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH38 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH39 734.0 1.080 -XC17 XC18 938.0 1.400 -XC17 XH40 734.0 1.080 -XC18 XH41 734.0 1.080 -XN19 XC20 962.0 1.340 -XN19 XH42 868.0 1.010 -XC20 XN21 962.0 1.340 -XC20 XN22 962.0 1.340 -XN21 XH43 868.0 1.010 -XN21 XH50 868.0 1.010 -XN22 XC23 674.0 1.463 -XN22 XC24 690.0 1.422 -XC23 XH44 680.0 1.090 -XC23 XH45 680.0 1.090 -XC23 XH46 680.0 1.090 -XC24 XO25 1140.0 1.229 -XC26 XH47 734.0 1.080 -XC27 XC28 938.0 1.400 -XC27 XH48 734.0 1.080 -XC28 XH49 734.0 1.080 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XO2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XO2 XC1 XH30 70.00 109.500 -XO2 XC1 XH31 70.00 109.500 -XH29 XC1 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC1 XH31 66.00 107.800 -XH30 XC1 XH31 66.00 107.800 -XC1 XO2 XC3 150.00 111.000 -XO2 XC3 XC4 140.00 120.000 -XO2 XC3 XC28 140.00 120.000 -XC4 XC3 XC28 126.00 120.000 -XC3 XC4 XC5 126.00 120.000 -XC3 XC4 XH32 70.00 120.000 -XC5 XC4 XH32 70.00 120.000 -XC4 XC5 XC6 126.00 120.000 -XC4 XC5 XH33 70.00 120.000 -XC6 XC5 XH33 70.00 120.000 -XC5 XC6 XC7 120.00 122.760 -XC5 XC6 XC27 126.00 120.000 -XC7 XC6 XC27 120.00 122.760 -XC6 XC7 XC8 120.00 122.760 -XC6 XC7 XC26 120.00 122.760 -XC8 XC7 XC26 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH34 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH34 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH35 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH35 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH36 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH36 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 140.00 120.000 -XC10 XC11 XC26 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC26 140.00 120.000 -XC11 XC12 XC13 140.00 112.047 -XC11 XC12 XN19 150.00 112.420 -XC11 XC12 XC24 140.00 109.443 -XC13 XC12 XN19 150.00 112.420 -XC13 XC12 XC24 140.00 109.443 -XN19 XC12 XC24 140.00 113.515 -XC12 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC12 XC13 XC18 140.00 120.000 -XC14 XC13 XC18 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 126.00 120.000 -XC16 XC17 XH40 70.00 120.000 -XC18 XC17 XH40 70.00 120.000 -XC13 XC18 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC18 XH41 70.00 120.000 -XC17 XC18 XH41 70.00 120.000 -XC12 XN19 XC20 100.00 123.200 -XC12 XN19 XH42 70.00 118.400 -XC20 XN19 XH42 70.00 120.000 -XN19 XC20 XN21 140.00 120.000 -XN19 XC20 XN22 140.00 120.000 -XN21 XC20 XN22 140.00 120.000 -XC20 XN21 XH43 70.00 120.000 -XC20 XN21 XH50 70.00 120.000 -XH43 XN21 XH50 70.00 120.000 -XC20 XN22 XC23 100.00 123.200 -XC20 XN22 XC24 130.00 120.700 -XC23 XN22 XC24 100.00 121.900 -XN22 XC23 XH44 70.00 109.500 -XN22 XC23 XH45 70.00 109.500 -XN22 XC23 XH46 70.00 109.500 -XH44 XC23 XH45 66.00 107.800 -XH44 XC23 XH46 66.00 107.800 -XH45 XC23 XH46 66.00 107.800 -XC12 XC24 XN22 150.00 111.380 -XC12 XC24 XO25 160.00 120.400 -XN22 XC24 XO25 180.00 118.720 -XC7 XC26 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC26 XH47 70.00 120.000 -XC11 XC26 XH47 70.00 120.000 -XC6 XC27 XC28 126.00 120.000 -XC6 XC27 XH48 70.00 120.000 -XC28 XC27 XH48 70.00 120.000 -XC3 XC28 XC27 126.00 120.000 -XC3 XC28 XH49 70.00 120.000 -XC27 XC28 XH49 70.00 120.000 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH29 XC1 XO2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XO2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XO2 XC3 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XO2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XO2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XO2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XO2 XC3 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XO2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XO2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XO2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XO2 XC3 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XO2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 1.958 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC28 1.958 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XO2 XC3 XC28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XC5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC4 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XC5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC28 XC3 XC4 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XC27 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XH49 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XH49 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO2 XC3 XC28 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XC27 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XH49 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XH49 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC3 XC28 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC4 XC5 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC4 XC5 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC27 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XC27 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC5 XC6 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC26 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC26 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC26 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC8 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC8 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC8 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC26 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC26 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC26 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XC28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XC28 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XC28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XC28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XH48 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XH48 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XC28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XC28 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XC28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XC28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XH48 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XH48 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XH47 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XH47 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC26 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC26 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XN19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XN19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XN19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC13 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XN19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XN19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XN19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XH47 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XH47 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC18 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC14 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC14 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC14 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC18 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC18 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC18 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC18 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XC20 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XC20 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XC20 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XC20 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XC20 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XC20 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XC20 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XC20 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XC20 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XH42 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XN22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XN22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XN22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC17 XC18 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN21 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN22 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XN19 XC20 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XN19 XC20 XN21 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XN19 XC20 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XN19 XC20 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XN19 XC20 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XN19 XC20 XN22 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XN19 XC20 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XN19 XC20 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH43 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH50 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH50 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH50 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH50 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH43 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH50 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH50 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH50 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH50 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC23 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC24 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC23 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC24 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH44 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH45 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH46 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XC12 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XC12 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XC12 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XC12 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XC12 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC27 XC28 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC27 XC28 XC3 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC27 XC28 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC27 XC28 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC27 XC28 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC27 XC28 XH49 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC27 XC28 XH49 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC27 XC28 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH48 XC27 XC28 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH48 XC27 XC28 XC3 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH48 XC27 XC28 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH48 XC27 XC28 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH48 XC27 XC28 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH48 XC27 XC28 XH49 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH48 XC27 XC28 XH49 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH48 XC27 XC28 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC4 XC28 XC3 XO2 4.000 180.000 -XC5 XH32 XC4 XC3 1.100 180.000 -XC6 XH33 XC5 XC4 1.100 180.000 -XC7 XC27 XC6 XC5 4.000 180.000 -XC8 XC26 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH34 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH35 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH36 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC26 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC14 XC18 XC13 XC12 4.000 180.000 -XC15 XH37 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH38 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH39 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XH40 XC17 XC16 1.100 180.000 -XC17 XH41 XC18 XC13 1.100 180.000 -XC12 XH42 XN19 XC20 1.000 180.000 -XN21 XN22 XC20 XN19 10.500 180.000 -XH50 XC20 XN21 XH43 1.000 180.000 -XC24 XC20 XN22 XC23 1.000 180.000 -XC12 XN22 XC24 XO25 10.500 180.000 -XC11 XH47 XC26 XC7 1.100 180.000 -XC28 XH48 XC27 XC6 1.100 180.000 -XC27 XH49 XC28 XC3 1.100 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4d.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4d.lib deleted file mode 100644 index 97ab0c01..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4d.lib +++ /dev/null @@ -1,173 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 53 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.1800 - 2 C2 XC2 0.1400 - 3 O3 XO3 -0.2850 - 4 C4 XC4 0.0850 - 5 C5 XC5 -0.1150 - 6 C6 XC6 -0.1150 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 0.0000 - 9 C9 XC9 0.0000 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 0.5630 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 -0.1150 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 C19 XC19 -0.1150 - 20 C20 XC20 -0.1150 - 21 N21 XN21 -0.5282 - 22 C22 XC22 0.5687 - 23 N23 XN23 -0.9138 - 24 N24 XN24 -0.0184 - 25 C25 XC25 -0.0090 - 26 C26 XC26 0.6225 - 27 O27 XO27 -0.5000 - 28 C28 XC28 -0.1150 - 29 C29 XC29 -0.1150 - 30 H30 XH30 0.0600 - 31 H31 XH31 0.0600 - 32 H32 XH32 0.0600 - 33 H33 XH33 0.0300 - 34 H34 XH34 0.0300 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.1150 - 42 H42 XH42 0.1150 - 43 H43 XH43 0.1150 - 44 H44 XH44 0.1150 - 45 H45 XH45 0.1150 - 46 H46 XH46 0.3451 - 47 H47 XH47 0.4600 - 48 H48 XH48 0.0600 - 49 H49 XH49 0.0600 - 50 H50 XH50 0.0600 - 51 H51 XH51 0.1150 - 52 H52 XH52 0.1150 - 53 H53 XH53 0.4600 - -[bonds] -C1 C2 -C1 H30 -C1 H31 -C1 H32 -C2 O3 -C2 H33 -C2 H34 -O3 C4 -C4 C5 -C4 C29 -C5 C6 -C5 H35 -C6 C7 -C6 H36 -C7 C8 -C7 H37 -C8 C9 -C8 C29 -C9 C10 -C9 C28 -C10 C11 -C10 H38 -C11 C12 -C11 H39 -C12 C13 -C12 H40 -C13 C14 -C13 C28 -C14 C15 -C14 N21 -C14 C26 -C15 C16 -C15 C20 -C16 C17 -C16 H41 -C17 C18 -C17 H42 -C18 C19 -C18 H43 -C19 C20 -C19 H44 -C20 H45 -N21 C22 -N21 H46 -C22 N23 -C22 N24 -N23 H47 -N23 H53 -N24 C25 -N24 C26 -C25 H48 -C25 H49 -C25 H50 -C26 O27 -C28 H51 -C29 H52 - -[impropers] -C5 C29 C4 O3 -C6 H35 C5 C4 -C7 H36 C6 C5 -C8 H37 C7 C6 -C9 C29 C8 C7 -C10 C28 C9 C8 -C11 H38 C10 C9 -C12 H39 C11 C10 -C13 H40 C12 C11 -C14 C28 C13 C12 -C16 C20 C15 C14 -C17 H41 C16 C15 -C18 H42 C17 C16 -C19 H43 C18 C17 -C20 H44 C19 C18 -C19 H45 C20 C15 -C14 H46 N21 C22 -N23 N24 C22 N21 -H53 C22 N23 H47 -C26 C22 N24 C25 -C14 N24 C26 O27 -C13 H51 C28 C9 -C8 H52 C29 C4 - -[charge_groups] -C1 H30 H31 H32 -C2 H33 H34 -O3 -C4 -C5 H35 -C6 H36 -C7 H37 -C8 -C9 -C10 H38 -C11 H39 -C12 H40 -C13 -C14 -C15 -C16 H41 -C17 H42 -C18 H43 -C19 H44 -C20 H45 -N21 H46 -C22 -N23 H47 H53 -N24 -C25 H48 H49 H50 -C26 -O27 -C28 H51 -C29 H52 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4d.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4d.prm deleted file mode 100644 index 38088f7a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4d.prm +++ /dev/null @@ -1,791 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC2 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XO3 445.13 445.13 18.25 314.75 12.91 15.9994 -XC4 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC5 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC6 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN21 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC22 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN23 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN24 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC25 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC26 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO27 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XC28 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC29 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH32 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH33 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH34 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH46 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH47 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH48 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH49 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH50 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH51 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH52 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH53 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XC2 536.0 1.529 -XC1 XH30 680.0 1.090 -XC1 XH31 680.0 1.090 -XC1 XH32 680.0 1.090 -XC2 XO3 640.0 1.410 -XC2 XH33 680.0 1.090 -XC2 XH34 680.0 1.090 -XO3 XC4 900.0 1.364 -XC4 XC5 938.0 1.400 -XC4 XC29 938.0 1.400 -XC5 XC6 938.0 1.400 -XC5 XH35 734.0 1.080 -XC6 XC7 938.0 1.400 -XC6 XH36 734.0 1.080 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XH37 734.0 1.080 -XC8 XC9 750.0 1.464 -XC8 XC29 938.0 1.400 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XC28 938.0 1.400 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH38 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH39 734.0 1.080 -XC12 XC13 938.0 1.400 -XC12 XH40 734.0 1.080 -XC13 XC14 634.0 1.510 -XC13 XC28 938.0 1.400 -XC14 XC15 634.0 1.510 -XC14 XN21 674.0 1.463 -XC14 XC26 634.0 1.522 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XC20 938.0 1.400 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH41 734.0 1.080 -XC17 XC18 938.0 1.400 -XC17 XH42 734.0 1.080 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XH43 734.0 1.080 -XC19 XC20 938.0 1.400 -XC19 XH44 734.0 1.080 -XC20 XH45 734.0 1.080 -XN21 XC22 962.0 1.340 -XN21 XH46 868.0 1.010 -XC22 XN23 962.0 1.340 -XC22 XN24 962.0 1.340 -XN23 XH47 868.0 1.010 -XN23 XH53 868.0 1.010 -XN24 XC25 674.0 1.463 -XN24 XC26 690.0 1.422 -XC25 XH48 680.0 1.090 -XC25 XH49 680.0 1.090 -XC25 XH50 680.0 1.090 -XC26 XO27 1140.0 1.229 -XC28 XH51 734.0 1.080 -XC29 XH52 734.0 1.080 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XC2 XC1 XH30 75.00 110.700 -XC2 XC1 XH31 75.00 110.700 -XC2 XC1 XH32 75.00 110.700 -XH30 XC1 XH31 66.00 107.800 -XH30 XC1 XH32 66.00 107.800 -XH31 XC1 XH32 66.00 107.800 -XC1 XC2 XO3 100.00 109.500 -XC1 XC2 XH33 75.00 110.700 -XC1 XC2 XH34 75.00 110.700 -XO3 XC2 XH33 70.00 109.500 -XO3 XC2 XH34 70.00 109.500 -XH33 XC2 XH34 66.00 107.800 -XC2 XO3 XC4 150.00 111.000 -XO3 XC4 XC5 140.00 120.000 -XO3 XC4 XC29 140.00 120.000 -XC5 XC4 XC29 126.00 120.000 -XC4 XC5 XC6 126.00 120.000 -XC4 XC5 XH35 70.00 120.000 -XC6 XC5 XH35 70.00 120.000 -XC5 XC6 XC7 126.00 120.000 -XC5 XC6 XH36 70.00 120.000 -XC7 XC6 XH36 70.00 120.000 -XC6 XC7 XC8 126.00 120.000 -XC6 XC7 XH37 70.00 120.000 -XC8 XC7 XH37 70.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 120.00 122.760 -XC7 XC8 XC29 126.00 120.000 -XC9 XC8 XC29 120.00 122.760 -XC8 XC9 XC10 120.00 122.760 -XC8 XC9 XC28 120.00 122.760 -XC10 XC9 XC28 126.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH38 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH38 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH39 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH39 70.00 120.000 -XC11 XC12 XC13 126.00 120.000 -XC11 XC12 XH40 70.00 120.000 -XC13 XC12 XH40 70.00 120.000 -XC12 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC12 XC13 XC28 126.00 120.000 -XC14 XC13 XC28 140.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 140.00 112.047 -XC13 XC14 XN21 150.00 112.420 -XC13 XC14 XC26 140.00 109.443 -XC15 XC14 XN21 150.00 112.420 -XC15 XC14 XC26 140.00 109.443 -XN21 XC14 XC26 140.00 113.515 -XC14 XC15 XC16 140.00 120.000 -XC14 XC15 XC20 140.00 120.000 -XC16 XC15 XC20 126.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH41 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH41 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 126.00 120.000 -XC16 XC17 XH42 70.00 120.000 -XC18 XC17 XH42 70.00 120.000 -XC17 XC18 XC19 126.00 120.000 -XC17 XC18 XH43 70.00 120.000 -XC19 XC18 XH43 70.00 120.000 -XC18 XC19 XC20 126.00 120.000 -XC18 XC19 XH44 70.00 120.000 -XC20 XC19 XH44 70.00 120.000 -XC15 XC20 XC19 126.00 120.000 -XC15 XC20 XH45 70.00 120.000 -XC19 XC20 XH45 70.00 120.000 -XC14 XN21 XC22 100.00 123.200 -XC14 XN21 XH46 70.00 118.400 -XC22 XN21 XH46 70.00 120.000 -XN21 XC22 XN23 140.00 120.000 -XN21 XC22 XN24 140.00 120.000 -XN23 XC22 XN24 140.00 120.000 -XC22 XN23 XH47 70.00 120.000 -XC22 XN23 XH53 70.00 120.000 -XH47 XN23 XH53 70.00 120.000 -XC22 XN24 XC25 100.00 123.200 -XC22 XN24 XC26 130.00 120.700 -XC25 XN24 XC26 100.00 121.900 -XN24 XC25 XH48 70.00 109.500 -XN24 XC25 XH49 70.00 109.500 -XN24 XC25 XH50 70.00 109.500 -XH48 XC25 XH49 66.00 107.800 -XH48 XC25 XH50 66.00 107.800 -XH49 XC25 XH50 66.00 107.800 -XC14 XC26 XN24 150.00 111.380 -XC14 XC26 XO27 160.00 120.400 -XN24 XC26 XO27 180.00 118.720 -XC9 XC28 XC13 126.00 120.000 -XC9 XC28 XH51 70.00 120.000 -XC13 XC28 XH51 70.00 120.000 -XC4 XC29 XC8 126.00 120.000 -XC4 XC29 XH52 70.00 120.000 -XC8 XC29 XH52 70.00 120.000 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH30 XC1 XC2 XO3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XO3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XO3 0.234 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XO3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XH33 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XH33 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XH34 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XH34 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XC2 XO3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XC2 XO3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XC2 XO3 0.234 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XC2 XO3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XC2 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XC2 XH33 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XC2 XH33 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XC2 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XC2 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XC2 XH34 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XC2 XH34 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XC2 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC1 XC2 XO3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC1 XC2 XO3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC1 XC2 XO3 0.234 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC1 XC2 XO3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC1 XC2 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC1 XC2 XH33 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC1 XC2 XH33 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC1 XC2 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC1 XC2 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC1 XC2 XH34 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC1 XC2 XH34 0.150 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC1 XC2 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XO3 XC4 -0.329 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XO3 XC4 -0.358 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XO3 XC4 0.340 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XO3 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC2 XO3 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC2 XO3 XC4 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC2 XO3 XC4 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC2 XO3 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC2 XO3 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC2 XO3 XC4 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC2 XO3 XC4 0.081 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC2 XO3 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XO3 XC4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XO3 XC4 XC5 1.958 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XO3 XC4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XO3 XC4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XO3 XC4 XC29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XO3 XC4 XC29 1.958 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XO3 XC4 XC29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XO3 XC4 XC29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO3 XC4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO3 XC4 XC5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO3 XC4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO3 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO3 XC4 XC5 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO3 XC4 XC5 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO3 XC4 XC5 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO3 XC4 XC5 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC29 XC4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC29 XC4 XC5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC29 XC4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC29 XC4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC29 XC4 XC5 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC29 XC4 XC5 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC29 XC4 XC5 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC29 XC4 XC5 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO3 XC4 XC29 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO3 XC4 XC29 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO3 XC4 XC29 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO3 XC4 XC29 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XO3 XC4 XC29 XH52 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XO3 XC4 XC29 XH52 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XO3 XC4 XC29 XH52 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XO3 XC4 XC29 XH52 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC29 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC29 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC29 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC29 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC29 XH52 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC29 XH52 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC4 XC29 XH52 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC4 XC29 XH52 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC4 XC5 XC6 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC5 XC6 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC5 XC6 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC5 XC6 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC5 XC6 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC6 XC7 XC8 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC6 XC7 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC6 XC7 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC6 XC7 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC6 XC7 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC29 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC7 XC8 XC29 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC7 XC8 XC29 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC7 XC8 XC29 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC7 XC8 XC29 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC28 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC28 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC28 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC29 XC8 XC9 XC10 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC29 XC8 XC9 XC10 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC29 XC8 XC9 XC10 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC29 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC29 XC8 XC9 XC28 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC29 XC8 XC9 XC28 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC29 XC8 XC9 XC28 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC29 XC8 XC9 XC28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC29 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC29 XC4 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC29 XC4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC29 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC29 XH52 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC29 XH52 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC29 XH52 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC29 XH52 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC29 XC4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC29 XC4 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC29 XC4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC29 XC4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC29 XH52 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC29 XH52 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC8 XC29 XH52 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC8 XC29 XH52 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC28 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC28 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC28 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC28 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC28 XC9 XC10 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC28 XC9 XC10 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC28 XC9 XC10 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC28 XC9 XC10 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC28 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC28 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC28 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC28 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC28 XH51 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC28 XH51 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC28 XH51 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC28 XH51 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC28 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC28 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC28 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC28 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC28 XH51 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC28 XH51 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC9 XC28 XH51 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC9 XC28 XH51 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC10 XC11 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC10 XC11 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC10 XC11 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC10 XC11 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC11 XC12 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC11 XC12 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC11 XC12 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC11 XC12 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC11 XC12 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC28 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC12 XC13 XC14 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC12 XC13 XC28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC12 XC13 XC28 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC12 XC13 XC28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC12 XC13 XC28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XN21 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XN21 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XN21 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC26 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC28 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC28 XC13 XC14 XC15 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC28 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC28 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC28 XC13 XC14 XN21 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC28 XC13 XC14 XN21 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC28 XC13 XC14 XN21 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC28 XC13 XC14 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC28 XC13 XC14 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC28 XC13 XC14 XC26 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC28 XC13 XC14 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC28 XC13 XC14 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC28 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC28 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC28 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC28 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC28 XH51 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC28 XH51 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC28 XH51 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC28 XH51 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC28 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC28 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC28 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC28 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC28 XH51 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC28 XH51 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC28 XH51 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC28 XH51 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC20 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC14 XC15 XC16 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC14 XC15 XC16 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC14 XC15 XC16 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC14 XC15 XC20 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC14 XC15 XC20 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC14 XC15 XC20 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC14 XC15 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC14 XC15 XC16 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC14 XC15 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC14 XC15 XC20 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC14 XC15 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC14 XC15 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XN21 XC22 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XN21 XC22 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XN21 XC22 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XN21 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XN21 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XN21 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XN21 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XN21 XC22 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XN21 XC22 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XN21 XC22 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XN21 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XN21 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XN21 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XN21 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC14 XN21 XC22 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC14 XN21 XC22 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC14 XN21 XC22 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC14 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC14 XN21 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC14 XN21 XH46 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC14 XN21 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC14 XN21 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC26 XN24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC26 XN24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC26 XN24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC26 XN24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC26 XN24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC26 XN24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC26 XN24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC26 XN24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC14 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC14 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC14 XC26 XN24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC14 XC26 XN24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC14 XC26 XN24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC14 XC26 XN24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC14 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC14 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC14 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC14 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC15 XC16 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC15 XC16 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC15 XC16 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC15 XC16 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC20 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC20 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC20 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC20 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC20 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC20 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC20 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC20 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC15 XC20 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC15 XC20 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC15 XC20 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC15 XC20 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC15 XC20 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC15 XC20 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC15 XC20 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC15 XC20 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC17 XC18 XC19 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC17 XC18 XC19 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC17 XC18 XC19 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC17 XC18 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC17 XC18 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC17 XC18 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC17 XC18 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC18 XC19 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC18 XC19 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC18 XC19 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC18 XC19 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH44 XC19 XC20 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH44 XC19 XC20 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH44 XC19 XC20 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH44 XC19 XC20 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH44 XC19 XC20 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH44 XC19 XC20 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH44 XC19 XC20 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH44 XC19 XC20 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XN21 XC22 XN23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XN21 XC22 XN23 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XN21 XC22 XN23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XN21 XC22 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XN21 XC22 XN24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XN21 XC22 XN24 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XN21 XC22 XN24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XN21 XC22 XN24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH46 XN21 XC22 XN23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH46 XN21 XC22 XN23 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH46 XN21 XC22 XN23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH46 XN21 XC22 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH46 XN21 XC22 XN24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH46 XN21 XC22 XN24 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH46 XN21 XC22 XN24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH46 XN21 XC22 XN24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XN23 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XN23 XH47 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XN23 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XN23 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XN23 XH53 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XN23 XH53 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XN23 XH53 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XN23 XH53 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN24 XC22 XN23 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN24 XC22 XN23 XH47 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN24 XC22 XN23 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN24 XC22 XN23 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN24 XC22 XN23 XH53 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN24 XC22 XN23 XH53 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN24 XC22 XN23 XH53 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN24 XC22 XN23 XH53 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XN24 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XN24 XC25 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XN24 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XN24 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XN24 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XN24 XC26 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XN24 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XN24 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN23 XC22 XN24 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN23 XC22 XN24 XC25 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN23 XC22 XN24 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN23 XC22 XN24 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN23 XC22 XN24 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN23 XC22 XN24 XC26 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN23 XC22 XN24 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN23 XC22 XN24 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN24 XC25 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN24 XC25 XH48 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN24 XC25 XH48 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN24 XC25 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN24 XC25 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN24 XC25 XH49 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN24 XC25 XH49 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN24 XC25 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN24 XC25 XH50 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN24 XC25 XH50 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN24 XC25 XH50 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN24 XC25 XH50 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN24 XC25 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN24 XC25 XH48 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN24 XC25 XH48 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN24 XC25 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN24 XC25 XH49 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN24 XC25 XH49 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN24 XC25 XH49 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN24 XC25 XH49 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN24 XC25 XH50 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN24 XC25 XH50 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN24 XC25 XH50 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN24 XC25 XH50 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN24 XC26 XC14 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN24 XC26 XC14 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN24 XC26 XC14 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN24 XC26 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC22 XN24 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC22 XN24 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC22 XN24 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC22 XN24 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN24 XC26 XC14 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN24 XC26 XC14 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN24 XC26 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN24 XC26 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN24 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN24 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN24 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN24 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC5 XC29 XC4 XO3 4.000 180.000 -XC6 XH35 XC5 XC4 1.100 180.000 -XC7 XH36 XC6 XC5 1.100 180.000 -XC8 XH37 XC7 XC6 1.100 180.000 -XC9 XC29 XC8 XC7 4.000 180.000 -XC10 XC28 XC9 XC8 4.000 180.000 -XC11 XH38 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH39 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC13 XH40 XC12 XC11 1.100 180.000 -XC14 XC28 XC13 XC12 4.000 180.000 -XC16 XC20 XC15 XC14 4.000 180.000 -XC17 XH41 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XH42 XC17 XC16 1.100 180.000 -XC19 XH43 XC18 XC17 1.100 180.000 -XC20 XH44 XC19 XC18 1.100 180.000 -XC19 XH45 XC20 XC15 1.100 180.000 -XC14 XH46 XN21 XC22 1.000 180.000 -XN23 XN24 XC22 XN21 10.500 180.000 -XH53 XC22 XN23 XH47 1.000 180.000 -XC26 XC22 XN24 XC25 1.000 180.000 -XC14 XN24 XC26 XO27 10.500 180.000 -XC13 XH51 XC28 XC9 1.100 180.000 -XC8 XH52 XC29 XC4 1.100 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4i.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4i.lib deleted file mode 100644 index 093d6f20..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4i.lib +++ /dev/null @@ -1,153 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 45 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 -0.0446 - 18 C18 XC18 0.5296 - 19 C19 XC19 -0.4470 - 20 C20 XC20 0.2270 - 21 C21 XC21 -0.4470 - 22 C22 XC22 0.4730 - 23 N23 XN23 -0.6780 - 24 C24 XC24 -0.1150 - 25 C25 XC25 0.6225 - 26 O26 XO26 -0.5000 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.4600 - 31 H31 XH31 0.3451 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1550 - 41 H41 XH41 0.0650 - 42 H42 XH42 0.1550 - 43 H43 XH43 0.0120 - 44 H44 XH44 0.1150 - 45 H45 XH45 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H27 -C1 H28 -C1 H29 -N2 C3 -N2 C25 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H30 -N4 H45 -N5 C6 -N5 H31 -C6 C7 -C6 C13 -C6 C25 -C7 C8 -C7 C12 -C8 C9 -C8 H32 -C9 C10 -C9 H33 -C10 C11 -C10 H34 -C11 C12 -C11 H35 -C12 H36 -C13 C14 -C13 C24 -C14 C15 -C14 H37 -C15 C16 -C15 H38 -C16 C17 -C16 H39 -C17 C18 -C17 C24 -C18 C19 -C18 N23 -C19 C20 -C19 H40 -C20 C21 -C20 H41 -C21 C22 -C21 H42 -C22 N23 -C22 H43 -C24 H44 -C25 O26 - -[impropers] -C25 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H45 C3 N4 H30 -C6 H31 N5 C3 -C8 C12 C7 C6 -C9 H32 C8 C7 -C10 H33 C9 C8 -C11 H34 C10 C9 -C12 H35 C11 C10 -C11 H36 C12 C7 -C14 C24 C13 C6 -C15 H37 C14 C13 -C16 H38 C15 C14 -C17 H39 C16 C15 -C18 C24 C17 C16 -C19 N23 C18 C17 -C20 H40 C19 C18 -C21 H41 C20 C19 -C22 H42 C21 C20 -N23 H43 C22 C21 -C17 H44 C24 C13 -N2 C6 C25 O26 - -[charge_groups] -C1 H27 H28 H29 -N2 -C3 -N4 H30 H45 -N5 H31 -C6 -C7 -C8 H32 -C9 H33 -C10 H34 -C11 H35 -C12 H36 -C13 -C14 H37 -C15 H38 -C16 H39 -C17 -C18 -C19 H40 -C20 H41 -C21 H42 -C22 H43 -N23 -C24 H44 -C25 -O26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4i.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4i.prm deleted file mode 100644 index 6d21c8d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4i.prm +++ /dev/null @@ -1,687 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC21 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN23 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC25 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO26 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC25 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH30 868.0 1.010 -XN4 XH45 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH31 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC13 634.0 1.510 -XC6 XC25 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC12 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH32 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH33 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH34 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH35 734.0 1.080 -XC12 XH36 734.0 1.080 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC24 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH37 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH38 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH39 734.0 1.080 -XC17 XC18 750.0 1.464 -XC17 XC24 938.0 1.400 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XN23 966.0 1.339 -XC19 XC20 938.0 1.400 -XC19 XH40 734.0 1.080 -XC20 XC21 938.0 1.400 -XC20 XH41 734.0 1.080 -XC21 XC22 938.0 1.400 -XC21 XH42 734.0 1.080 -XC22 XN23 966.0 1.339 -XC22 XH43 734.0 1.080 -XC24 XH44 734.0 1.080 -XC25 XO26 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC25 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC25 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH30 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH45 70.00 120.000 -XH30 XN4 XH45 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH31 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH31 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC13 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC25 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC13 140.00 112.047 -XC7 XC6 XC25 140.00 109.443 -XC13 XC6 XC25 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC12 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC12 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH35 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH35 70.00 120.000 -XC7 XC12 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC12 XH36 70.00 120.000 -XC11 XC12 XH36 70.00 120.000 -XC6 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC6 XC13 XC24 140.00 120.000 -XC14 XC13 XC24 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 120.00 122.760 -XC16 XC17 XC24 126.00 120.000 -XC18 XC17 XC24 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC19 120.00 122.760 -XC17 XC18 XN23 140.00 116.692 -XC19 XC18 XN23 140.00 124.000 -XC18 XC19 XC20 126.00 120.000 -XC18 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC20 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC19 XC20 XC21 126.00 120.000 -XC19 XC20 XH41 70.00 120.000 -XC21 XC20 XH41 70.00 120.000 -XC20 XC21 XC22 126.00 120.000 -XC20 XC21 XH42 70.00 120.000 -XC22 XC21 XH42 70.00 120.000 -XC21 XC22 XN23 140.00 124.000 -XC21 XC22 XH43 70.00 120.000 -XN23 XC22 XH43 70.00 116.000 -XC18 XN23 XC22 140.00 117.000 -XC13 XC24 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC24 XH44 70.00 120.000 -XC17 XC24 XH44 70.00 120.000 -XN2 XC25 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC25 XO26 180.00 118.720 -XC6 XC25 XO26 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XN23 0.043 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XN23 0.589 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XN23 0.228 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XN23 0.043 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XN23 0.589 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XN23 0.228 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XN23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XN23 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XN23 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XN23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XN23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XN23 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XN23 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XN23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XN23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XN23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XN23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XN23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XN23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XN23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XN23 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XN23 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XN23 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XN23 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XN23 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XN23 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC22 XN23 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC22 XN23 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC25 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH45 XC3 XN4 XH30 1.000 180.000 -XC6 XH31 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC12 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH32 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH33 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH34 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH35 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC11 XH36 XC12 XC7 1.100 180.000 -XC14 XC24 XC13 XC6 4.000 180.000 -XC15 XH37 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH38 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH39 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XC24 XC17 XC16 4.000 180.000 -XC19 XN23 XC18 XC17 4.000 180.000 -XC20 XH40 XC19 XC18 1.100 180.000 -XC21 XH41 XC20 XC19 1.100 180.000 -XC22 XH42 XC21 XC20 1.100 180.000 -XN23 XH43 XC22 XC21 1.100 180.000 -XC17 XH44 XC24 XC13 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC25 XO26 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4j.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4j.lib deleted file mode 100644 index 7f0c45cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4j.lib +++ /dev/null @@ -1,153 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 45 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 0.0000 - 18 C18 XC18 -0.2920 - 19 C19 XC19 0.2270 - 20 C20 XC20 -0.4470 - 21 C21 XC21 0.4730 - 22 N22 XN22 -0.6780 - 23 C23 XC23 0.4730 - 24 C24 XC24 -0.1150 - 25 C25 XC25 0.6225 - 26 O26 XO26 -0.5000 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.4600 - 31 H31 XH31 0.3451 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.0650 - 41 H41 XH41 0.1550 - 42 H42 XH42 0.0120 - 43 H43 XH43 0.0120 - 44 H44 XH44 0.1150 - 45 H45 XH45 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H27 -C1 H28 -C1 H29 -N2 C3 -N2 C25 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H30 -N4 H45 -N5 C6 -N5 H31 -C6 C7 -C6 C13 -C6 C25 -C7 C8 -C7 C12 -C8 C9 -C8 H32 -C9 C10 -C9 H33 -C10 C11 -C10 H34 -C11 C12 -C11 H35 -C12 H36 -C13 C14 -C13 C24 -C14 C15 -C14 H37 -C15 C16 -C15 H38 -C16 C17 -C16 H39 -C17 C18 -C17 C24 -C18 C19 -C18 C23 -C19 C20 -C19 H40 -C20 C21 -C20 H41 -C21 N22 -C21 H42 -N22 C23 -C23 H43 -C24 H44 -C25 O26 - -[impropers] -C25 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H45 C3 N4 H30 -C6 H31 N5 C3 -C8 C12 C7 C6 -C9 H32 C8 C7 -C10 H33 C9 C8 -C11 H34 C10 C9 -C12 H35 C11 C10 -C11 H36 C12 C7 -C14 C24 C13 C6 -C15 H37 C14 C13 -C16 H38 C15 C14 -C17 H39 C16 C15 -C18 C24 C17 C16 -C19 C23 C18 C17 -C20 H40 C19 C18 -C21 H41 C20 C19 -N22 H42 C21 C20 -N22 H43 C23 C18 -C17 H44 C24 C13 -N2 C6 C25 O26 - -[charge_groups] -C1 H27 H28 H29 -N2 -C3 -N4 H30 H45 -N5 H31 -C6 -C7 -C8 H32 -C9 H33 -C10 H34 -C11 H35 -C12 H36 -C13 -C14 H37 -C15 H38 -C16 H39 -C17 -C18 -C19 H40 -C20 H41 -C21 H42 -N22 -C23 H43 -C24 H44 -C25 -O26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4j.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4j.prm deleted file mode 100644 index d10309cc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4j.prm +++ /dev/null @@ -1,687 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC21 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN22 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC23 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC25 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO26 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC25 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH30 868.0 1.010 -XN4 XH45 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH31 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC13 634.0 1.510 -XC6 XC25 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC12 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH32 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH33 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH34 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH35 734.0 1.080 -XC12 XH36 734.0 1.080 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC24 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH37 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH38 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH39 734.0 1.080 -XC17 XC18 750.0 1.464 -XC17 XC24 938.0 1.400 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XC23 938.0 1.400 -XC19 XC20 938.0 1.400 -XC19 XH40 734.0 1.080 -XC20 XC21 938.0 1.400 -XC20 XH41 734.0 1.080 -XC21 XN22 966.0 1.339 -XC21 XH42 734.0 1.080 -XN22 XC23 966.0 1.339 -XC23 XH43 734.0 1.080 -XC24 XH44 734.0 1.080 -XC25 XO26 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC25 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC25 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH30 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH45 70.00 120.000 -XH30 XN4 XH45 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH31 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH31 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC13 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC25 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC13 140.00 112.047 -XC7 XC6 XC25 140.00 109.443 -XC13 XC6 XC25 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC12 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC12 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH35 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH35 70.00 120.000 -XC7 XC12 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC12 XH36 70.00 120.000 -XC11 XC12 XH36 70.00 120.000 -XC6 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC6 XC13 XC24 140.00 120.000 -XC14 XC13 XC24 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 120.00 122.760 -XC16 XC17 XC24 126.00 120.000 -XC18 XC17 XC24 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC19 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC23 120.00 122.760 -XC19 XC18 XC23 126.00 120.000 -XC18 XC19 XC20 126.00 120.000 -XC18 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC20 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC19 XC20 XC21 126.00 120.000 -XC19 XC20 XH41 70.00 120.000 -XC21 XC20 XH41 70.00 120.000 -XC20 XC21 XN22 140.00 124.000 -XC20 XC21 XH42 70.00 120.000 -XN22 XC21 XH42 70.00 116.000 -XC21 XN22 XC23 140.00 117.000 -XC18 XC23 XN22 140.00 124.000 -XC18 XC23 XH43 70.00 120.000 -XN22 XC23 XH43 70.00 116.000 -XC13 XC24 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC24 XH44 70.00 120.000 -XC17 XC24 XH44 70.00 120.000 -XN2 XC25 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC25 XO26 180.00 118.720 -XC6 XC25 XO26 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC23 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC23 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC23 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC23 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC23 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC23 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XN22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XN22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XN22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XN22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XN22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XN22 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XC21 XN22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XC21 XN22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XN22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XN22 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XN22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XN22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN22 XC23 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN22 XC23 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN22 XC23 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN22 XC23 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XN22 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XN22 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XN22 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XN22 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC25 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH45 XC3 XN4 XH30 1.000 180.000 -XC6 XH31 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC12 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH32 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH33 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH34 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH35 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC11 XH36 XC12 XC7 1.100 180.000 -XC14 XC24 XC13 XC6 4.000 180.000 -XC15 XH37 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH38 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH39 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XC24 XC17 XC16 4.000 180.000 -XC19 XC23 XC18 XC17 4.000 180.000 -XC20 XH40 XC19 XC18 1.100 180.000 -XC21 XH41 XC20 XC19 1.100 180.000 -XN22 XH42 XC21 XC20 1.100 180.000 -XN22 XH43 XC23 XC18 1.100 180.000 -XC17 XH44 XC24 XC13 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC25 XO26 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4k.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4k.lib deleted file mode 100644 index 83d9fb3d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4k.lib +++ /dev/null @@ -1,153 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 45 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 0.0000 - 18 C18 XC18 0.2920 - 19 C19 XC19 -0.4470 - 20 C20 XC20 0.4730 - 21 N21 XN21 -0.6780 - 22 C22 XC22 0.4730 - 23 C23 XC23 -0.4470 - 24 C24 XC24 -0.1150 - 25 C25 XC25 0.6225 - 26 O26 XO26 -0.5000 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.4600 - 31 H31 XH31 0.3451 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1550 - 41 H41 XH41 0.0120 - 42 H42 XH42 0.0120 - 43 H43 XH43 0.1550 - 44 H44 XH44 0.1150 - 45 H45 XH45 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H27 -C1 H28 -C1 H29 -N2 C3 -N2 C25 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H30 -N4 H45 -N5 C6 -N5 H31 -C6 C7 -C6 C13 -C6 C25 -C7 C8 -C7 C12 -C8 C9 -C8 H32 -C9 C10 -C9 H33 -C10 C11 -C10 H34 -C11 C12 -C11 H35 -C12 H36 -C13 C14 -C13 C24 -C14 C15 -C14 H37 -C15 C16 -C15 H38 -C16 C17 -C16 H39 -C17 C18 -C17 C24 -C18 C19 -C18 C23 -C19 C20 -C19 H40 -C20 N21 -C20 H41 -N21 C22 -C22 C23 -C22 H42 -C23 H43 -C24 H44 -C25 O26 - -[impropers] -C25 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H45 C3 N4 H30 -C6 H31 N5 C3 -C8 C12 C7 C6 -C9 H32 C8 C7 -C10 H33 C9 C8 -C11 H34 C10 C9 -C12 H35 C11 C10 -C11 H36 C12 C7 -C14 C24 C13 C6 -C15 H37 C14 C13 -C16 H38 C15 C14 -C17 H39 C16 C15 -C18 C24 C17 C16 -C19 C23 C18 C17 -C20 H40 C19 C18 -N21 H41 C20 C19 -C23 H42 C22 N21 -C22 H43 C23 C18 -C17 H44 C24 C13 -N2 C6 C25 O26 - -[charge_groups] -C1 H27 H28 H29 -N2 -C3 -N4 H30 H45 -N5 H31 -C6 -C7 -C8 H32 -C9 H33 -C10 H34 -C11 H35 -C12 H36 -C13 -C14 H37 -C15 H38 -C16 H39 -C17 -C18 -C19 H40 -C20 H41 -N21 -C22 H42 -C23 H43 -C24 H44 -C25 -O26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4k.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4k.prm deleted file mode 100644 index fdfeb335..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4k.prm +++ /dev/null @@ -1,687 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC20 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN21 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC23 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC25 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO26 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC25 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH30 868.0 1.010 -XN4 XH45 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH31 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC13 634.0 1.510 -XC6 XC25 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC12 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH32 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH33 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH34 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH35 734.0 1.080 -XC12 XH36 734.0 1.080 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC24 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH37 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH38 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH39 734.0 1.080 -XC17 XC18 750.0 1.464 -XC17 XC24 938.0 1.400 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XC23 938.0 1.400 -XC19 XC20 938.0 1.400 -XC19 XH40 734.0 1.080 -XC20 XN21 966.0 1.339 -XC20 XH41 734.0 1.080 -XN21 XC22 966.0 1.339 -XC22 XC23 938.0 1.400 -XC22 XH42 734.0 1.080 -XC23 XH43 734.0 1.080 -XC24 XH44 734.0 1.080 -XC25 XO26 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC25 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC25 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH30 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH45 70.00 120.000 -XH30 XN4 XH45 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH31 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH31 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC13 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC25 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC13 140.00 112.047 -XC7 XC6 XC25 140.00 109.443 -XC13 XC6 XC25 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC12 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC12 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH35 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH35 70.00 120.000 -XC7 XC12 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC12 XH36 70.00 120.000 -XC11 XC12 XH36 70.00 120.000 -XC6 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC6 XC13 XC24 140.00 120.000 -XC14 XC13 XC24 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 120.00 122.760 -XC16 XC17 XC24 126.00 120.000 -XC18 XC17 XC24 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC19 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC23 120.00 122.760 -XC19 XC18 XC23 126.00 120.000 -XC18 XC19 XC20 126.00 120.000 -XC18 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC20 XC19 XH40 70.00 120.000 -XC19 XC20 XN21 140.00 124.000 -XC19 XC20 XH41 70.00 120.000 -XN21 XC20 XH41 70.00 116.000 -XC20 XN21 XC22 140.00 117.000 -XN21 XC22 XC23 140.00 124.000 -XN21 XC22 XH42 70.00 116.000 -XC23 XC22 XH42 70.00 120.000 -XC18 XC23 XC22 126.00 120.000 -XC18 XC23 XH43 70.00 120.000 -XC22 XC23 XH43 70.00 120.000 -XC13 XC24 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC24 XH44 70.00 120.000 -XC17 XC24 XH44 70.00 120.000 -XN2 XC25 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC25 XO26 180.00 118.720 -XC6 XC25 XO26 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC23 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC23 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC23 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC23 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC23 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC23 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XC20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XC20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XC20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC18 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XN21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XN21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XC20 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XN21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XN21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC20 XN21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC20 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XN21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XN21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC20 XN21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC20 XN21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC22 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC25 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH45 XC3 XN4 XH30 1.000 180.000 -XC6 XH31 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC12 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH32 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH33 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH34 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH35 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC11 XH36 XC12 XC7 1.100 180.000 -XC14 XC24 XC13 XC6 4.000 180.000 -XC15 XH37 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH38 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH39 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XC24 XC17 XC16 4.000 180.000 -XC19 XC23 XC18 XC17 4.000 180.000 -XC20 XH40 XC19 XC18 1.100 180.000 -XN21 XH41 XC20 XC19 1.100 180.000 -XC23 XH42 XC22 XN21 1.100 180.000 -XC22 XH43 XC23 XC18 1.100 180.000 -XC17 XH44 XC24 XC13 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC25 XO26 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4l.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4l.lib deleted file mode 100644 index 5dcf7bdb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4l.lib +++ /dev/null @@ -1,150 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 44 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 0.0000 - 18 C18 XC18 0.2340 - 19 C19 XC19 0.1920 - 20 N20 XN20 -0.4680 - 21 C21 XC21 0.1920 - 22 C22 XC22 0.1920 - 23 N23 XN23 -0.4680 - 24 C24 XC24 -0.1150 - 25 C25 XC25 0.6225 - 26 O26 XO26 -0.5000 - 27 H27 XH27 0.0600 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.4600 - 31 H31 XH31 0.3451 - 32 H32 XH32 0.1150 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.0420 - 41 H41 XH41 0.0420 - 42 H42 XH42 0.0420 - 43 H43 XH43 0.1150 - 44 H44 XH44 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H27 -C1 H28 -C1 H29 -N2 C3 -N2 C25 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H30 -N4 H44 -N5 C6 -N5 H31 -C6 C7 -C6 C13 -C6 C25 -C7 C8 -C7 C12 -C8 C9 -C8 H32 -C9 C10 -C9 H33 -C10 C11 -C10 H34 -C11 C12 -C11 H35 -C12 H36 -C13 C14 -C13 C24 -C14 C15 -C14 H37 -C15 C16 -C15 H38 -C16 C17 -C16 H39 -C17 C18 -C17 C24 -C18 C19 -C18 N23 -C19 N20 -C19 H40 -N20 C21 -C21 C22 -C21 H41 -C22 N23 -C22 H42 -C24 H43 -C25 O26 - -[impropers] -C25 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H44 C3 N4 H30 -C6 H31 N5 C3 -C8 C12 C7 C6 -C9 H32 C8 C7 -C10 H33 C9 C8 -C11 H34 C10 C9 -C12 H35 C11 C10 -C11 H36 C12 C7 -C14 C24 C13 C6 -C15 H37 C14 C13 -C16 H38 C15 C14 -C17 H39 C16 C15 -C18 C24 C17 C16 -C19 N23 C18 C17 -N20 H40 C19 C18 -C22 H41 C21 N20 -N23 H42 C22 C21 -C17 H43 C24 C13 -N2 C6 C25 O26 - -[charge_groups] -C1 H27 H28 H29 -N2 -C3 -N4 H30 H44 -N5 H31 -C6 -C7 -C8 H32 -C9 H33 -C10 H34 -C11 H35 -C12 H36 -C13 -C14 H37 -C15 H38 -C16 H39 -C17 -C18 -C19 H40 -N20 -C21 H41 -C22 H42 -N23 -C24 H43 -C25 -O26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4l.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4l.prm deleted file mode 100644 index 346da457..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4l.prm +++ /dev/null @@ -1,666 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN20 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC21 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN23 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC25 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO26 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH27 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH27 680.0 1.090 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC25 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH30 868.0 1.010 -XN4 XH44 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH31 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC13 634.0 1.510 -XC6 XC25 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC12 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH32 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH33 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH34 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH35 734.0 1.080 -XC12 XH36 734.0 1.080 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC24 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH37 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH38 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH39 734.0 1.080 -XC17 XC18 750.0 1.464 -XC17 XC24 938.0 1.400 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XN23 966.0 1.339 -XC19 XN20 966.0 1.339 -XC19 XH40 734.0 1.080 -XN20 XC21 966.0 1.339 -XC21 XC22 938.0 1.400 -XC21 XH41 734.0 1.080 -XC22 XN23 966.0 1.339 -XC22 XH42 734.0 1.080 -XC24 XH43 734.0 1.080 -XC25 XO26 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH27 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XH27 XC1 XH28 66.00 107.800 -XH27 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC25 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC25 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH30 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH44 70.00 120.000 -XH30 XN4 XH44 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH31 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH31 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC13 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC25 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC13 140.00 112.047 -XC7 XC6 XC25 140.00 109.443 -XC13 XC6 XC25 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC12 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC12 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH32 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH35 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH35 70.00 120.000 -XC7 XC12 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC12 XH36 70.00 120.000 -XC11 XC12 XH36 70.00 120.000 -XC6 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC6 XC13 XC24 140.00 120.000 -XC14 XC13 XC24 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH37 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 120.00 122.760 -XC16 XC17 XC24 126.00 120.000 -XC18 XC17 XC24 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC19 120.00 122.760 -XC17 XC18 XN23 140.00 116.692 -XC19 XC18 XN23 140.00 124.000 -XC18 XC19 XN20 140.00 124.000 -XC18 XC19 XH40 70.00 120.000 -XN20 XC19 XH40 70.00 116.000 -XC19 XN20 XC21 140.00 117.000 -XN20 XC21 XC22 140.00 124.000 -XN20 XC21 XH41 70.00 116.000 -XC22 XC21 XH41 70.00 120.000 -XC21 XC22 XN23 140.00 124.000 -XC21 XC22 XH42 70.00 120.000 -XN23 XC22 XH42 70.00 116.000 -XC18 XN23 XC22 140.00 117.000 -XC13 XC24 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC24 XH43 70.00 120.000 -XC17 XC24 XH43 70.00 120.000 -XN2 XC25 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC25 XO26 180.00 118.720 -XC6 XC25 XO26 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH27 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH30 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XN5 XC6 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC6 XC13 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC25 XO26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC8 XC9 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC9 XC10 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC10 XC11 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC11 XC12 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC13 XC14 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC14 XC15 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC15 XC16 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC16 XC17 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XN23 0.043 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XN23 0.589 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XN23 0.228 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XN23 0.043 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XN23 0.589 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XN23 0.228 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC17 XC18 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XN20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN23 XC18 XC19 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XN23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XN23 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XN23 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XN23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XN23 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XN23 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XN23 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XN23 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XN20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC19 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC19 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XN23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XN23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XN23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XN23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XN23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XN23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XN23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC21 XC22 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XN23 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XN23 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XN23 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XN23 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XN23 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XN23 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC22 XN23 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC22 XN23 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC25 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH44 XC3 XN4 XH30 1.000 180.000 -XC6 XH31 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC12 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH32 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH33 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH34 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH35 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC11 XH36 XC12 XC7 1.100 180.000 -XC14 XC24 XC13 XC6 4.000 180.000 -XC15 XH37 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH38 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH39 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XC24 XC17 XC16 4.000 180.000 -XC19 XN23 XC18 XC17 4.000 180.000 -XN20 XH40 XC19 XC18 1.100 180.000 -XC22 XH41 XC21 XN20 1.100 180.000 -XN23 XH42 XC22 XC21 1.100 180.000 -XC17 XH43 XC24 XC13 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC25 XO26 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4m.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4m.lib deleted file mode 100644 index 94230ce5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4m.lib +++ /dev/null @@ -1,160 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 48 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0170 - 2 C2 XC2 -0.4550 - 3 C3 XC3 0.4730 - 4 N4 XN4 -0.6780 - 5 C5 XC5 0.4730 - 6 C6 XC6 -0.2920 - 7 C7 XC7 0.0000 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 0.5630 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 -0.1150 - 18 C18 XC18 -0.1150 - 19 N19 XN19 -0.5282 - 20 C20 XC20 0.5687 - 21 N21 XN21 -0.9138 - 22 N22 XN22 -0.0184 - 23 C23 XC23 -0.0090 - 24 C24 XC24 0.6225 - 25 O25 XO25 -0.5000 - 26 C26 XC26 -0.1150 - 27 C27 XC27 0.2270 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.0600 - 31 H31 XH31 0.0120 - 32 H32 XH32 0.0120 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.3451 - 42 H42 XH42 0.4600 - 43 H43 XH43 0.0600 - 44 H44 XH44 0.0600 - 45 H45 XH45 0.0600 - 46 H46 XH46 0.1150 - 47 H47 XH47 0.0650 - 48 H48 XH48 0.4600 - -[bonds] -C1 C2 -C1 H28 -C1 H29 -C1 H30 -C2 C3 -C2 C27 -C3 N4 -C3 H31 -N4 C5 -C5 C6 -C5 H32 -C6 C7 -C6 C27 -C7 C8 -C7 C26 -C8 C9 -C8 H33 -C9 C10 -C9 H34 -C10 C11 -C10 H35 -C11 C12 -C11 C26 -C12 C13 -C12 N19 -C12 C24 -C13 C14 -C13 C18 -C14 C15 -C14 H36 -C15 C16 -C15 H37 -C16 C17 -C16 H38 -C17 C18 -C17 H39 -C18 H40 -N19 C20 -N19 H41 -C20 N21 -C20 N22 -N21 H42 -N21 H48 -N22 C23 -N22 C24 -C23 H43 -C23 H44 -C23 H45 -C24 O25 -C26 H46 -C27 H47 - -[impropers] -C3 C27 C2 C1 -N4 H31 C3 C2 -C6 H32 C5 N4 -C7 C27 C6 C5 -C8 C26 C7 C6 -C9 H33 C8 C7 -C10 H34 C9 C8 -C11 H35 C10 C9 -C12 C26 C11 C10 -C14 C18 C13 C12 -C15 H36 C14 C13 -C16 H37 C15 C14 -C17 H38 C16 C15 -C18 H39 C17 C16 -C17 H40 C18 C13 -C12 H41 N19 C20 -N21 N22 C20 N19 -H48 C20 N21 H42 -C24 C20 N22 C23 -C12 N22 C24 O25 -C11 H46 C26 C7 -C6 H47 C27 C2 - -[charge_groups] -C1 H28 H29 H30 -C2 -C3 H31 -N4 -C5 H32 -C6 -C7 -C8 H33 -C9 H34 -C10 H35 -C11 -C12 -C13 -C14 H36 -C15 H37 -C16 H38 -C17 H39 -C18 H40 -N19 H41 -C20 -N21 H42 H48 -N22 -C23 H43 H44 H45 -C24 -O25 -C26 H46 -C27 H47 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4m.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4m.prm deleted file mode 100644 index 63433481..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4m.prm +++ /dev/null @@ -1,723 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC2 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC3 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC5 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC6 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN19 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC20 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN21 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN22 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC23 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC24 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO25 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XC26 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC27 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH32 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH42 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH43 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH44 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH45 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH46 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH47 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH48 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XC2 634.0 1.510 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XC1 XH30 680.0 1.090 -XC2 XC3 938.0 1.400 -XC2 XC27 938.0 1.400 -XC3 XN4 966.0 1.339 -XC3 XH31 734.0 1.080 -XN4 XC5 966.0 1.339 -XC5 XC6 938.0 1.400 -XC5 XH32 734.0 1.080 -XC6 XC7 750.0 1.464 -XC6 XC27 938.0 1.400 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC26 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH33 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH34 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH35 734.0 1.080 -XC11 XC12 634.0 1.510 -XC11 XC26 938.0 1.400 -XC12 XC13 634.0 1.510 -XC12 XN19 674.0 1.463 -XC12 XC24 634.0 1.522 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC18 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH36 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH37 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH38 734.0 1.080 -XC17 XC18 938.0 1.400 -XC17 XH39 734.0 1.080 -XC18 XH40 734.0 1.080 -XN19 XC20 962.0 1.340 -XN19 XH41 868.0 1.010 -XC20 XN21 962.0 1.340 -XC20 XN22 962.0 1.340 -XN21 XH42 868.0 1.010 -XN21 XH48 868.0 1.010 -XN22 XC23 674.0 1.463 -XN22 XC24 690.0 1.422 -XC23 XH43 680.0 1.090 -XC23 XH44 680.0 1.090 -XC23 XH45 680.0 1.090 -XC24 XO25 1140.0 1.229 -XC26 XH46 734.0 1.080 -XC27 XH47 734.0 1.080 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XC2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XC2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XC2 XC1 XH30 70.00 109.500 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC1 XH30 66.00 107.800 -XC1 XC2 XC3 140.00 120.000 -XC1 XC2 XC27 140.00 120.000 -XC3 XC2 XC27 126.00 120.000 -XC2 XC3 XN4 140.00 124.000 -XC2 XC3 XH31 70.00 120.000 -XN4 XC3 XH31 70.00 116.000 -XC3 XN4 XC5 140.00 117.000 -XN4 XC5 XC6 140.00 124.000 -XN4 XC5 XH32 70.00 116.000 -XC6 XC5 XH32 70.00 120.000 -XC5 XC6 XC7 120.00 122.760 -XC5 XC6 XC27 126.00 120.000 -XC7 XC6 XC27 120.00 122.760 -XC6 XC7 XC8 120.00 122.760 -XC6 XC7 XC26 120.00 122.760 -XC8 XC7 XC26 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH35 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH35 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 140.00 120.000 -XC10 XC11 XC26 126.00 120.000 -XC12 XC11 XC26 140.00 120.000 -XC11 XC12 XC13 140.00 112.047 -XC11 XC12 XN19 150.00 112.420 -XC11 XC12 XC24 140.00 109.443 -XC13 XC12 XN19 150.00 112.420 -XC13 XC12 XC24 140.00 109.443 -XN19 XC12 XC24 140.00 113.515 -XC12 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC12 XC13 XC18 140.00 120.000 -XC14 XC13 XC18 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH36 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH36 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH37 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH37 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH38 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH38 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 126.00 120.000 -XC16 XC17 XH39 70.00 120.000 -XC18 XC17 XH39 70.00 120.000 -XC13 XC18 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC18 XH40 70.00 120.000 -XC17 XC18 XH40 70.00 120.000 -XC12 XN19 XC20 100.00 123.200 -XC12 XN19 XH41 70.00 118.400 -XC20 XN19 XH41 70.00 120.000 -XN19 XC20 XN21 140.00 120.000 -XN19 XC20 XN22 140.00 120.000 -XN21 XC20 XN22 140.00 120.000 -XC20 XN21 XH42 70.00 120.000 -XC20 XN21 XH48 70.00 120.000 -XH42 XN21 XH48 70.00 120.000 -XC20 XN22 XC23 100.00 123.200 -XC20 XN22 XC24 130.00 120.700 -XC23 XN22 XC24 100.00 121.900 -XN22 XC23 XH43 70.00 109.500 -XN22 XC23 XH44 70.00 109.500 -XN22 XC23 XH45 70.00 109.500 -XH43 XC23 XH44 66.00 107.800 -XH43 XC23 XH45 66.00 107.800 -XH44 XC23 XH45 66.00 107.800 -XC12 XC24 XN22 150.00 111.380 -XC12 XC24 XO25 160.00 120.400 -XN22 XC24 XO25 180.00 118.720 -XC7 XC26 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC26 XH46 70.00 120.000 -XC11 XC26 XH46 70.00 120.000 -XC2 XC27 XC6 126.00 120.000 -XC2 XC27 XH47 70.00 120.000 -XC6 XC27 XH47 70.00 120.000 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH28 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XC2 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XC2 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XC2 XC27 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XC2 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XC2 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XC2 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XC2 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XC2 XC27 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XC2 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XC2 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XC3 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XC27 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XC2 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XN4 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC3 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC2 XC3 XN4 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC2 XC3 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC2 XC3 XH31 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC2 XC3 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC2 XC3 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC27 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC27 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC27 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC27 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC27 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC27 XH47 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XC2 XC27 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XC2 XC27 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC27 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC27 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC27 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC27 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC27 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC27 XH47 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XC2 XC27 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XC2 XC27 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XN4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XN4 XC5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC2 XC3 XN4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC2 XC3 XN4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC3 XN4 XC5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC3 XN4 XC5 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC3 XN4 XC5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC3 XN4 XC5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XC6 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XH32 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN4 XC5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC27 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC5 XC6 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC5 XC6 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XC5 XC6 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XC5 XC6 XC27 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XC5 XC6 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XC5 XC6 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC26 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC26 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC26 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC7 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC8 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC8 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC8 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC26 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC26 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC26 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XC2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XC2 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XC2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XC2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XH47 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC5 XC6 XC27 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XC2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XC2 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XC2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XC2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XH47 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XH47 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XH47 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XH47 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XH46 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC26 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XH46 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC26 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC26 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC26 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XN19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XN19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XN19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC13 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XN19 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XN19 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XN19 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XN19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC24 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC11 XC12 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XH46 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC26 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XH46 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC11 XC26 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC18 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC13 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC14 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC14 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC14 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC18 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC18 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC18 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC13 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC18 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XC13 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XC20 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XC20 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XC20 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XN19 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XC20 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XC20 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XC20 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XN19 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XC20 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XC20 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XC20 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XC20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XH41 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC12 XN19 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XN22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC11 XC12 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XN22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC12 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XN22 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XO25 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC12 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC14 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC13 XC14 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC13 XC18 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC18 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC14 XC15 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC15 XC16 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC16 XC17 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC17 XC18 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC17 XC18 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC17 XC18 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC17 XC18 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC17 XC18 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC17 XC18 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC17 XC18 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC17 XC18 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN21 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN22 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XN19 XC20 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XN19 XC20 XN21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XN19 XC20 XN21 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XN19 XC20 XN21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XN19 XC20 XN21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XN19 XC20 XN22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XN19 XC20 XN22 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XN19 XC20 XN22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XN19 XC20 XN22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH42 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH48 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH48 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN21 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH42 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH48 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH48 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH48 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN22 XC20 XN21 XH48 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC23 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC24 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN19 XC20 XN22 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC23 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC24 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN21 XC20 XN22 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH43 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH44 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH45 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH43 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH44 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH45 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XN22 XC23 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XC12 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XC12 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XC12 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC20 XN22 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XC12 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XC12 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XO25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XO25 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XO25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XN22 XC24 XO25 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC3 XC27 XC2 XC1 4.000 180.000 -XN4 XH31 XC3 XC2 1.100 180.000 -XC6 XH32 XC5 XN4 1.100 180.000 -XC7 XC27 XC6 XC5 4.000 180.000 -XC8 XC26 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH33 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH34 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH35 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XC26 XC11 XC10 4.000 180.000 -XC14 XC18 XC13 XC12 4.000 180.000 -XC15 XH36 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH37 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH38 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XH39 XC17 XC16 1.100 180.000 -XC17 XH40 XC18 XC13 1.100 180.000 -XC12 XH41 XN19 XC20 1.000 180.000 -XN21 XN22 XC20 XN19 10.500 180.000 -XH48 XC20 XN21 XH42 1.000 180.000 -XC24 XC20 XN22 XC23 1.000 180.000 -XC12 XN22 XC24 XO25 10.500 180.000 -XC11 XH46 XC26 XC7 1.100 180.000 -XC6 XH47 XC27 XC2 1.100 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4n.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4n.lib deleted file mode 100644 index 6e50d86a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4n.lib +++ /dev/null @@ -1,157 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 46 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 0.0000 - 18 C18 XC18 -0.2920 - 19 C19 XC19 0.4730 - 20 N20 XN20 -0.6780 - 21 C21 XC21 0.4730 - 22 C22 XC22 -0.2570 - 23 C23 XC23 0.3950 - 24 N24 XN24 -0.4300 - 25 C25 XC25 0.2270 - 26 C26 XC26 -0.1150 - 27 C27 XC27 0.6225 - 28 O28 XO28 -0.5000 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.0600 - 31 H31 XH31 0.0600 - 32 H32 XH32 0.4600 - 33 H33 XH33 0.3451 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.1150 - 42 H42 XH42 0.0120 - 43 H43 XH43 0.0120 - 44 H44 XH44 0.0650 - 45 H45 XH45 0.1150 - 46 H46 XH46 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H29 -C1 H30 -C1 H31 -N2 C3 -N2 C27 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H32 -N4 H46 -N5 C6 -N5 H33 -C6 C7 -C6 C13 -C6 C27 -C7 C8 -C7 C12 -C8 C9 -C8 H34 -C9 C10 -C9 H35 -C10 C11 -C10 H36 -C11 C12 -C11 H37 -C12 H38 -C13 C14 -C13 C26 -C14 C15 -C14 H39 -C15 C16 -C15 H40 -C16 C17 -C16 H41 -C17 C18 -C17 C26 -C18 C19 -C18 C25 -C19 N20 -C19 H42 -N20 C21 -C21 C22 -C21 H43 -C22 C23 -C22 C25 -C23 N24 -C25 H44 -C26 H45 -C27 O28 - -[impropers] -C27 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H46 C3 N4 H32 -C6 H33 N5 C3 -C8 C12 C7 C6 -C9 H34 C8 C7 -C10 H35 C9 C8 -C11 H36 C10 C9 -C12 H37 C11 C10 -C11 H38 C12 C7 -C14 C26 C13 C6 -C15 H39 C14 C13 -C16 H40 C15 C14 -C17 H41 C16 C15 -C18 C26 C17 C16 -C19 C25 C18 C17 -N20 H42 C19 C18 -C22 H43 C21 N20 -C23 C25 C22 C21 -C22 H44 C25 C18 -C17 H45 C26 C13 -N2 C6 C27 O28 - -[charge_groups] -C1 H29 H30 H31 -N2 -C3 -N4 H32 H46 -N5 H33 -C6 -C7 -C8 H34 -C9 H35 -C10 H36 -C11 H37 -C12 H38 -C13 -C14 H39 -C15 H40 -C16 H41 -C17 -C18 -C19 H42 -N20 -C21 H43 -C22 -C23 -N24 -C25 H44 -C26 H45 -C27 -O28 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4n.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4n.prm deleted file mode 100644 index 091d357f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4n.prm +++ /dev/null @@ -1,698 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN20 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC21 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC23 1831.61 1831.61 37.67 1295.14 26.63 12.0110 -XN24 1026.83 1026.83 29.10 726.08 20.58 14.0070 -XC25 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC26 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC27 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO28 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH32 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH33 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH46 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XC1 XH30 680.0 1.090 -XC1 XH31 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC27 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH32 868.0 1.010 -XN4 XH46 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH33 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC13 634.0 1.510 -XC6 XC27 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC12 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH34 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH35 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH36 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH37 734.0 1.080 -XC12 XH38 734.0 1.080 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC26 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH39 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH40 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH41 734.0 1.080 -XC17 XC18 750.0 1.464 -XC17 XC26 938.0 1.400 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XC25 938.0 1.400 -XC19 XN20 966.0 1.339 -XC19 XH42 734.0 1.080 -XN20 XC21 966.0 1.339 -XC21 XC22 938.0 1.400 -XC21 XH43 734.0 1.080 -XC22 XC23 800.0 1.451 -XC22 XC25 938.0 1.400 -XC23 XN24 1300.0 1.157 -XC25 XH44 734.0 1.080 -XC26 XH45 734.0 1.080 -XC27 XO28 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH30 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH31 70.00 109.500 -XH29 XC1 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC1 XH31 66.00 107.800 -XH30 XC1 XH31 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC27 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC27 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH32 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH46 70.00 120.000 -XH32 XN4 XH46 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH33 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH33 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC13 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC27 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC13 140.00 112.047 -XC7 XC6 XC27 140.00 109.443 -XC13 XC6 XC27 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC12 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC12 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH34 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH34 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH35 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH35 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH36 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH36 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH37 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH37 70.00 120.000 -XC7 XC12 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC12 XH38 70.00 120.000 -XC11 XC12 XH38 70.00 120.000 -XC6 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC6 XC13 XC26 140.00 120.000 -XC14 XC13 XC26 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH39 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH39 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH40 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH40 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH41 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH41 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 120.00 122.760 -XC16 XC17 XC26 126.00 120.000 -XC18 XC17 XC26 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC19 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC25 120.00 122.760 -XC19 XC18 XC25 126.00 120.000 -XC18 XC19 XN20 140.00 124.000 -XC18 XC19 XH42 70.00 120.000 -XN20 XC19 XH42 70.00 116.000 -XC19 XN20 XC21 140.00 117.000 -XN20 XC21 XC22 140.00 124.000 -XN20 XC21 XH43 70.00 116.000 -XC22 XC21 XH43 70.00 120.000 -XC21 XC22 XC23 140.00 120.000 -XC21 XC22 XC25 126.00 120.000 -XC23 XC22 XC25 140.00 120.000 -XC22 XC23 XN24 300.00 180.000 -XC18 XC25 XC22 126.00 120.000 -XC18 XC25 XH44 70.00 120.000 -XC22 XC25 XH44 70.00 120.000 -XC13 XC26 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC26 XH45 70.00 120.000 -XC17 XC26 XH45 70.00 120.000 -XN2 XC27 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC27 XO28 180.00 118.720 -XC6 XC27 XO28 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC27 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC27 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XN2 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XN2 XC27 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH31 XC1 XN2 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH31 XC1 XN2 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC27 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC27 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC27 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC27 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC27 XO28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC27 XO28 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC27 XO28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC27 XO28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC27 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC27 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC27 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC27 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC27 XO28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC27 XO28 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC27 XO28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC27 XO28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH46 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH33 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH33 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC27 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC27 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC27 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XN5 XC6 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XN5 XC6 XC13 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XN5 XC6 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XN5 XC6 XC27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XN5 XC6 XC27 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XN5 XC6 XC27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XN5 XC6 XC27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC26 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC26 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC26 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC26 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC13 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC13 XC26 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC27 XC6 XC13 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC27 XC6 XC13 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC27 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC27 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC27 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC27 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC27 XO28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC27 XO28 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC27 XO28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC27 XO28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XO28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XO28 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XO28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC27 XO28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC27 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC27 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC27 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC27 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC27 XO28 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC27 XO28 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC27 XO28 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC27 XO28 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC8 XC9 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC9 XC10 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC10 XC11 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH37 XC11 XC12 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC13 XC14 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC13 XC14 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC13 XC14 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC13 XC14 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC26 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC26 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC26 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC26 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC26 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC26 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC26 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC26 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC26 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC26 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC26 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC26 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC26 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC26 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC26 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC26 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC14 XC15 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC14 XC15 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC14 XC15 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC14 XC15 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC15 XC16 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC15 XC16 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC15 XC16 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC15 XC16 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC26 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XC26 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC16 XC17 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC25 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC25 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC25 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC17 XC18 XC25 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC17 XC18 XC25 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC17 XC18 XC25 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC17 XC18 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC26 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC26 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC26 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC26 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC26 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC26 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC26 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC26 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC26 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC26 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC26 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC26 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC26 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC26 XH45 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC26 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC26 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC18 XC19 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC18 XC19 XN20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC18 XC19 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC18 XC19 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC18 XC19 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC18 XC19 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC18 XC19 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC18 XC19 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC25 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC25 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC25 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC25 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC25 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC25 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC25 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC25 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC19 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC19 XN20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC19 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC19 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XC23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XC23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XC23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XC23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH43 XC21 XC22 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XN24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XN24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XN24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC23 XN24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC22 XC23 XN24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC22 XC23 XN24 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC22 XC23 XN24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC22 XC23 XN24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC25 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC25 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC25 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC25 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC22 XC25 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC22 XC25 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC22 XC25 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC22 XC25 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC23 XC22 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC23 XC22 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC23 XC22 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC23 XC22 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC27 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH46 XC3 XN4 XH32 1.000 180.000 -XC6 XH33 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC12 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH34 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH35 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH36 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH37 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC11 XH38 XC12 XC7 1.100 180.000 -XC14 XC26 XC13 XC6 4.000 180.000 -XC15 XH39 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH40 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH41 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XC26 XC17 XC16 4.000 180.000 -XC19 XC25 XC18 XC17 4.000 180.000 -XN20 XH42 XC19 XC18 1.100 180.000 -XC22 XH43 XC21 XN20 1.100 180.000 -XC23 XC25 XC22 XC21 4.000 180.000 -XC22 XH44 XC25 XC18 1.100 180.000 -XC17 XH45 XC26 XC13 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC27 XO28 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4o.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4o.lib deleted file mode 100644 index 0e3ab1df..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4o.lib +++ /dev/null @@ -1,154 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 45 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 0.0000 - 18 C18 XC18 -0.2920 - 19 C19 XC19 0.4730 - 20 N20 XN20 -0.6780 - 21 C21 XC21 0.4730 - 22 C22 XC22 -0.0720 - 23 F23 XF23 -0.2200 - 24 C24 XC24 0.2270 - 25 C25 XC25 -0.1150 - 26 C26 XC26 0.6225 - 27 O27 XO27 -0.5000 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.0600 - 31 H31 XH31 0.4600 - 32 H32 XH32 0.3451 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.0120 - 42 H42 XH42 0.0120 - 43 H43 XH43 0.0650 - 44 H44 XH44 0.1150 - 45 H45 XH45 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H28 -C1 H29 -C1 H30 -N2 C3 -N2 C26 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H31 -N4 H45 -N5 C6 -N5 H32 -C6 C7 -C6 C13 -C6 C26 -C7 C8 -C7 C12 -C8 C9 -C8 H33 -C9 C10 -C9 H34 -C10 C11 -C10 H35 -C11 C12 -C11 H36 -C12 H37 -C13 C14 -C13 C25 -C14 C15 -C14 H38 -C15 C16 -C15 H39 -C16 C17 -C16 H40 -C17 C18 -C17 C25 -C18 C19 -C18 C24 -C19 N20 -C19 H41 -N20 C21 -C21 C22 -C21 H42 -C22 F23 -C22 C24 -C24 H43 -C25 H44 -C26 O27 - -[impropers] -C26 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H45 C3 N4 H31 -C6 H32 N5 C3 -C8 C12 C7 C6 -C9 H33 C8 C7 -C10 H34 C9 C8 -C11 H35 C10 C9 -C12 H36 C11 C10 -C11 H37 C12 C7 -C14 C25 C13 C6 -C15 H38 C14 C13 -C16 H39 C15 C14 -C17 H40 C16 C15 -C18 C25 C17 C16 -C19 C24 C18 C17 -N20 H41 C19 C18 -C22 H42 C21 N20 -F23 C24 C22 C21 -C22 H43 C24 C18 -C17 H44 C25 C13 -N2 C6 C26 O27 - -[charge_groups] -C1 H28 H29 H30 -N2 -C3 -N4 H31 H45 -N5 H32 -C6 -C7 -C8 H33 -C9 H34 -C10 H35 -C11 H36 -C12 H37 -C13 -C14 H38 -C15 H39 -C16 H40 -C17 -C18 -C19 H41 -N20 -C21 H42 -C22 -F23 -C24 H43 -C25 H44 -C26 -O27 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4o.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4o.prm deleted file mode 100644 index d6fe38a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4o.prm +++ /dev/null @@ -1,687 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN20 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC21 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XF23 264.71 264.71 11.43 187.18 8.09 19.00 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC25 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC26 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO27 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XC1 XH30 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC26 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH31 868.0 1.010 -XN4 XH45 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH32 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC13 634.0 1.510 -XC6 XC26 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC12 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH33 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH34 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH35 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH36 734.0 1.080 -XC12 XH37 734.0 1.080 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC25 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH38 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH39 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH40 734.0 1.080 -XC17 XC18 750.0 1.464 -XC17 XC25 938.0 1.400 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XC24 938.0 1.400 -XC19 XN20 966.0 1.339 -XC19 XH41 734.0 1.080 -XN20 XC21 966.0 1.339 -XC21 XC22 938.0 1.400 -XC21 XH42 734.0 1.080 -XC22 XF23 840.0 1.354 -XC22 XC24 938.0 1.400 -XC24 XH43 734.0 1.080 -XC25 XH44 734.0 1.080 -XC26 XO27 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH30 70.00 109.500 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC1 XH30 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC26 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC26 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH31 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH45 70.00 120.000 -XH31 XN4 XH45 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH32 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH32 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC13 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC26 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC13 140.00 112.047 -XC7 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC13 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC12 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC12 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH35 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH35 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH36 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH36 70.00 120.000 -XC7 XC12 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC12 XH37 70.00 120.000 -XC11 XC12 XH37 70.00 120.000 -XC6 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC6 XC13 XC25 140.00 120.000 -XC14 XC13 XC25 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH38 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH39 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH40 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH40 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 120.00 122.760 -XC16 XC17 XC25 126.00 120.000 -XC18 XC17 XC25 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC19 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC24 120.00 122.760 -XC19 XC18 XC24 126.00 120.000 -XC18 XC19 XN20 140.00 124.000 -XC18 XC19 XH41 70.00 120.000 -XN20 XC19 XH41 70.00 116.000 -XC19 XN20 XC21 140.00 117.000 -XN20 XC21 XC22 140.00 124.000 -XN20 XC21 XH42 70.00 116.000 -XC22 XC21 XH42 70.00 120.000 -XC21 XC22 XF23 160.00 120.000 -XC21 XC22 XC24 126.00 120.000 -XF23 XC22 XC24 160.00 120.000 -XC18 XC24 XC22 126.00 120.000 -XC18 XC24 XH43 70.00 120.000 -XC22 XC24 XH43 70.00 120.000 -XC13 XC25 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC25 XH44 70.00 120.000 -XC17 XC25 XH44 70.00 120.000 -XN2 XC26 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC26 XO27 180.00 118.720 -XC6 XC26 XO27 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XN20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC19 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC19 XN20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC19 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC19 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XF23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XF23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XF23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XF23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XF23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XF23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XF23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XF23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XF23 XC22 XC24 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XF23 XC22 XC24 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XF23 XC22 XC24 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XF23 XC22 XC24 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XF23 XC22 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XF23 XC22 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XF23 XC22 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XF23 XC22 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC26 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH45 XC3 XN4 XH31 1.000 180.000 -XC6 XH32 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC12 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH33 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH34 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH35 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH36 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC11 XH37 XC12 XC7 1.100 180.000 -XC14 XC25 XC13 XC6 4.000 180.000 -XC15 XH38 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH39 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH40 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XC25 XC17 XC16 4.000 180.000 -XC19 XC24 XC18 XC17 4.000 180.000 -XN20 XH41 XC19 XC18 1.100 180.000 -XC22 XH42 XC21 XN20 1.100 180.000 -XF23 XC24 XC22 XC21 4.000 180.000 -XC22 XH43 XC24 XC18 1.100 180.000 -XC17 XH44 XC25 XC13 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC26 XO27 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4p.lib b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4p.lib deleted file mode 100644 index c938e141..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4p.lib +++ /dev/null @@ -1,154 +0,0 @@ -{LIG} ! atoms no 45 total charge 1.000 - -[info] - SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C1 XC1 -0.0090 - 2 N2 XN2 -0.0184 - 3 C3 XC3 0.5687 - 4 N4 XN4 -0.9138 - 5 N5 XN5 -0.5282 - 6 C6 XC6 0.5630 - 7 C7 XC7 -0.1150 - 8 C8 XC8 -0.1150 - 9 C9 XC9 -0.1150 - 10 C10 XC10 -0.1150 - 11 C11 XC11 -0.1150 - 12 C12 XC12 -0.1150 - 13 C13 XC13 -0.1150 - 14 C14 XC14 -0.1150 - 15 C15 XC15 -0.1150 - 16 C16 XC16 -0.1150 - 17 C17 XC17 0.0000 - 18 C18 XC18 -0.2920 - 19 C19 XC19 0.4730 - 20 N20 XN20 -0.6780 - 21 C21 XC21 0.4730 - 22 C22 XC22 -0.1120 - 23 Cl23 XCl23 -0.1800 - 24 C24 XC24 0.2270 - 25 C25 XC25 -0.1150 - 26 C26 XC26 0.6225 - 27 O27 XO27 -0.5000 - 28 H28 XH28 0.0600 - 29 H29 XH29 0.0600 - 30 H30 XH30 0.0600 - 31 H31 XH31 0.4600 - 32 H32 XH32 0.3451 - 33 H33 XH33 0.1150 - 34 H34 XH34 0.1150 - 35 H35 XH35 0.1150 - 36 H36 XH36 0.1150 - 37 H37 XH37 0.1150 - 38 H38 XH38 0.1150 - 39 H39 XH39 0.1150 - 40 H40 XH40 0.1150 - 41 H41 XH41 0.0120 - 42 H42 XH42 0.0120 - 43 H43 XH43 0.0650 - 44 H44 XH44 0.1150 - 45 H45 XH45 0.4600 - -[bonds] -C1 N2 -C1 H28 -C1 H29 -C1 H30 -N2 C3 -N2 C26 -C3 N4 -C3 N5 -N4 H31 -N4 H45 -N5 C6 -N5 H32 -C6 C7 -C6 C13 -C6 C26 -C7 C8 -C7 C12 -C8 C9 -C8 H33 -C9 C10 -C9 H34 -C10 C11 -C10 H35 -C11 C12 -C11 H36 -C12 H37 -C13 C14 -C13 C25 -C14 C15 -C14 H38 -C15 C16 -C15 H39 -C16 C17 -C16 H40 -C17 C18 -C17 C25 -C18 C19 -C18 C24 -C19 N20 -C19 H41 -N20 C21 -C21 C22 -C21 H42 -C22 Cl23 -C22 C24 -C24 H43 -C25 H44 -C26 O27 - -[impropers] -C26 C3 N2 C1 -N2 N4 C3 N5 -H45 C3 N4 H31 -C6 H32 N5 C3 -C8 C12 C7 C6 -C9 H33 C8 C7 -C10 H34 C9 C8 -C11 H35 C10 C9 -C12 H36 C11 C10 -C11 H37 C12 C7 -C14 C25 C13 C6 -C15 H38 C14 C13 -C16 H39 C15 C14 -C17 H40 C16 C15 -C18 C25 C17 C16 -C19 C24 C18 C17 -N20 H41 C19 C18 -C22 H42 C21 N20 -Cl23 C24 C22 C21 -C22 H43 C24 C18 -C17 H44 C25 C13 -N2 C6 C26 O27 - -[charge_groups] -C1 H28 H29 H30 -N2 -C3 -N4 H31 H45 -N5 H32 -C6 -C7 -C8 H33 -C9 H34 -C10 H35 -C11 H36 -C12 H37 -C13 -C14 H38 -C15 H39 -C16 H40 -C17 -C18 -C19 H41 -N20 -C21 H42 -C22 -Cl23 -C24 H43 -C25 H44 -C26 -O27 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4p.prm b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4p.prm deleted file mode 100644 index d5409664..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/CAT-4p.prm +++ /dev/null @@ -1,687 +0,0 @@ -[options] - -[atom_types] -! Ligand vdW parameters -XC1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XN2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC3 58.02 58.02 5.09 41.03 3.60 12.0110 -XN4 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XN5 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC6 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.0110 -XC7 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC8 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC9 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC10 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC11 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC12 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC13 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC14 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC15 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC16 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC17 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC18 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC19 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XN20 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.0070 -XC21 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC22 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XCl23 1692.25 1692.25 43.06 1196.60 30.44 35.0000 -XC24 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC25 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.0110 -XC26 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.0110 -XO27 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 15.9994 -XH28 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH29 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH30 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.0080 -XH31 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH32 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -XH33 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH34 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH35 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH36 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH37 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH38 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH39 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH40 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH41 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH42 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH43 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH44 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.0080 -XH45 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.0080 -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -! Ligand bond parameters -XC1 XN2 674.0 1.463 -XC1 XH28 680.0 1.090 -XC1 XH29 680.0 1.090 -XC1 XH30 680.0 1.090 -XN2 XC3 962.0 1.340 -XN2 XC26 690.0 1.422 -XC3 XN4 962.0 1.340 -XC3 XN5 962.0 1.340 -XN4 XH31 868.0 1.010 -XN4 XH45 868.0 1.010 -XN5 XC6 674.0 1.463 -XN5 XH32 868.0 1.010 -XC6 XC7 634.0 1.510 -XC6 XC13 634.0 1.510 -XC6 XC26 634.0 1.522 -XC7 XC8 938.0 1.400 -XC7 XC12 938.0 1.400 -XC8 XC9 938.0 1.400 -XC8 XH33 734.0 1.080 -XC9 XC10 938.0 1.400 -XC9 XH34 734.0 1.080 -XC10 XC11 938.0 1.400 -XC10 XH35 734.0 1.080 -XC11 XC12 938.0 1.400 -XC11 XH36 734.0 1.080 -XC12 XH37 734.0 1.080 -XC13 XC14 938.0 1.400 -XC13 XC25 938.0 1.400 -XC14 XC15 938.0 1.400 -XC14 XH38 734.0 1.080 -XC15 XC16 938.0 1.400 -XC15 XH39 734.0 1.080 -XC16 XC17 938.0 1.400 -XC16 XH40 734.0 1.080 -XC17 XC18 750.0 1.464 -XC17 XC25 938.0 1.400 -XC18 XC19 938.0 1.400 -XC18 XC24 938.0 1.400 -XC19 XN20 966.0 1.339 -XC19 XH41 734.0 1.080 -XN20 XC21 966.0 1.339 -XC21 XC22 938.0 1.400 -XC21 XH42 734.0 1.080 -XC22 XCl23 600.0 1.725 -XC22 XC24 938.0 1.400 -XC24 XH43 734.0 1.080 -XC25 XH44 734.0 1.080 -XC26 XO27 1140.0 1.229 -! End ligand bond parameters - -[angles] -! Ligand angle parameters -XN2 XC1 XH28 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH29 70.00 109.500 -XN2 XC1 XH30 70.00 109.500 -XH28 XC1 XH29 66.00 107.800 -XH28 XC1 XH30 66.00 107.800 -XH29 XC1 XH30 66.00 107.800 -XC1 XN2 XC3 100.00 123.200 -XC1 XN2 XC26 100.00 121.900 -XC3 XN2 XC26 130.00 120.700 -XN2 XC3 XN4 140.00 120.000 -XN2 XC3 XN5 140.00 120.000 -XN4 XC3 XN5 140.00 120.000 -XC3 XN4 XH31 70.00 120.000 -XC3 XN4 XH45 70.00 120.000 -XH31 XN4 XH45 70.00 120.000 -XC3 XN5 XC6 100.00 123.200 -XC3 XN5 XH32 70.00 120.000 -XC6 XN5 XH32 70.00 118.400 -XN5 XC6 XC7 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC13 150.00 112.420 -XN5 XC6 XC26 140.00 113.515 -XC7 XC6 XC13 140.00 112.047 -XC7 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC13 XC6 XC26 140.00 109.443 -XC6 XC7 XC8 140.00 120.000 -XC6 XC7 XC12 140.00 120.000 -XC8 XC7 XC12 126.00 120.000 -XC7 XC8 XC9 126.00 120.000 -XC7 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC9 XC8 XH33 70.00 120.000 -XC8 XC9 XC10 126.00 120.000 -XC8 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC10 XC9 XH34 70.00 120.000 -XC9 XC10 XC11 126.00 120.000 -XC9 XC10 XH35 70.00 120.000 -XC11 XC10 XH35 70.00 120.000 -XC10 XC11 XC12 126.00 120.000 -XC10 XC11 XH36 70.00 120.000 -XC12 XC11 XH36 70.00 120.000 -XC7 XC12 XC11 126.00 120.000 -XC7 XC12 XH37 70.00 120.000 -XC11 XC12 XH37 70.00 120.000 -XC6 XC13 XC14 140.00 120.000 -XC6 XC13 XC25 140.00 120.000 -XC14 XC13 XC25 126.00 120.000 -XC13 XC14 XC15 126.00 120.000 -XC13 XC14 XH38 70.00 120.000 -XC15 XC14 XH38 70.00 120.000 -XC14 XC15 XC16 126.00 120.000 -XC14 XC15 XH39 70.00 120.000 -XC16 XC15 XH39 70.00 120.000 -XC15 XC16 XC17 126.00 120.000 -XC15 XC16 XH40 70.00 120.000 -XC17 XC16 XH40 70.00 120.000 -XC16 XC17 XC18 120.00 122.760 -XC16 XC17 XC25 126.00 120.000 -XC18 XC17 XC25 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC19 120.00 122.760 -XC17 XC18 XC24 120.00 122.760 -XC19 XC18 XC24 126.00 120.000 -XC18 XC19 XN20 140.00 124.000 -XC18 XC19 XH41 70.00 120.000 -XN20 XC19 XH41 70.00 116.000 -XC19 XN20 XC21 140.00 117.000 -XN20 XC21 XC22 140.00 124.000 -XN20 XC21 XH42 70.00 116.000 -XC22 XC21 XH42 70.00 120.000 -XC21 XC22 XCl23 150.00 120.000 -XC21 XC22 XC24 126.00 120.000 -XCl23 XC22 XC24 150.00 120.000 -XC18 XC24 XC22 126.00 120.000 -XC18 XC24 XH43 70.00 120.000 -XC22 XC24 XH43 70.00 120.000 -XC13 XC25 XC17 126.00 120.000 -XC13 XC25 XH44 70.00 120.000 -XC17 XC25 XH44 70.00 120.000 -XN2 XC26 XC6 150.00 111.380 -XN2 XC26 XO27 180.00 118.720 -XC6 XC26 XO27 160.00 120.400 -! End ligand angle parameters - -[torsions] -! Ligand torsion parameters -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH28 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH29 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.088 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC3 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH30 XC1 XN2 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN4 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 4.000 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XN2 XC3 XN5 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.498 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 1.540 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC1 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.671 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 1.421 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.187 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 3.045 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN2 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH31 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC3 XN4 XH45 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN2 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 3.968 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XC6 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 1.500 -2.000 180.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN4 XC3 XN5 XH32 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -1.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 -0.125 -2.000 180.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.250 -3.000 0.000 1.000 -XC3 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH32 XN5 XC6 XC26 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC8 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC7 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 -0.060 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 0.305 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 0.092 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC14 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.043 -2.000 180.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC26 XC6 XC13 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN5 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XN2 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.301 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC6 XC26 XO27 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XC9 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC12 XC7 XC8 XH33 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC7 XC12 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC7 XC12 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC7 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XC10 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH33 XC8 XC9 XH34 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC8 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XC11 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH34 XC9 XC10 XH35 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC9 XC10 XC11 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XC12 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XH36 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XH36 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XH36 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH35 XC10 XC11 XH36 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC10 XC11 XC12 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XC7 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XC7 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XC7 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XC7 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XH37 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XH37 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XH37 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH36 XC11 XC12 XH37 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC14 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XC15 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH38 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH38 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH38 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC13 XC14 XH38 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC6 XC13 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC13 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC13 XC14 XC15 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XC16 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XC16 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XC16 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XC16 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XH39 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XH39 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XH39 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH38 XC14 XC15 XH39 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC14 XC15 XC16 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XC17 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XC17 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XC17 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XC17 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XH40 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XH40 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XH40 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH39 XC15 XC16 XH40 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC15 XC16 XC17 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC25 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC25 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC25 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH40 XC16 XC17 XC25 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC18 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC19 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 -0.195 -1.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 0.633 -2.000 180.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 0.074 -3.000 0.000 1.000 -XC25 XC17 XC18 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC16 XC17 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XC13 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH44 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH44 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH44 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC17 XC25 XH44 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC19 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XN20 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XN20 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XN20 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XN20 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH41 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH41 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH41 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC24 XC18 XC19 XH41 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC17 XC18 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XC18 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC18 XC19 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH41 XC19 XN20 XC21 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH41 XC19 XN20 XC21 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH41 XC19 XN20 XC21 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH41 XC19 XN20 XC21 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XC22 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH42 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH42 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH42 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC19 XN20 XC21 XH42 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XCl23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XCl23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XCl23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XCl23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XN20 XC21 XC22 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XCl23 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XCl23 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XCl23 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XCl23 0.000 4.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC24 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC24 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC24 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XH42 XC21 XC22 XC24 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XC21 XC22 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XC18 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XC18 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XC18 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XC18 0.000 4.000 180.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XH43 0.000 -1.000 0.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XH43 3.625 -2.000 180.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XH43 0.000 -3.000 0.000 1.000 -XCl23 XC22 XC24 XH43 0.000 4.000 180.000 1.000 -! End Ligand torsion parameters - -[impropers] -! Ligand improper parameters -XC26 XC3 XN2 XC1 1.000 180.000 -XN2 XN4 XC3 XN5 10.500 180.000 -XH45 XC3 XN4 XH31 1.000 180.000 -XC6 XH32 XN5 XC3 1.000 180.000 -XC8 XC12 XC7 XC6 4.000 180.000 -XC9 XH33 XC8 XC7 1.100 180.000 -XC10 XH34 XC9 XC8 1.100 180.000 -XC11 XH35 XC10 XC9 1.100 180.000 -XC12 XH36 XC11 XC10 1.100 180.000 -XC11 XH37 XC12 XC7 1.100 180.000 -XC14 XC25 XC13 XC6 4.000 180.000 -XC15 XH38 XC14 XC13 1.100 180.000 -XC16 XH39 XC15 XC14 1.100 180.000 -XC17 XH40 XC16 XC15 1.100 180.000 -XC18 XC25 XC17 XC16 4.000 180.000 -XC19 XC24 XC18 XC17 4.000 180.000 -XN20 XH41 XC19 XC18 1.100 180.000 -XC22 XH42 XC21 XN20 1.100 180.000 -XCl23 XC24 XC22 XC21 4.000 180.000 -XC22 XH43 XC24 XC18 1.100 180.000 -XC17 XH44 XC25 XC13 1.100 180.000 -XN2 XC6 XC26 XO27 10.500 180.000 -! End ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/generate.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/generate.py deleted file mode 100644 index 8fb2750f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/generate.py +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -import glob -from subprocess import check_output -import shlex - -for pdb in glob.glob('*.pdb'): - name = pdb.split('.')[0] - generate = 'python /home/jespers/software/setupFEP/generate_prms.py' - options = ' -l ' + name + ' -FF OPLS2015 -o Q -m' - args = shlex.split(generate + options) - out = check_output(args) - print out diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/pairs.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/pairs.txt deleted file mode 100644 index 007b3084..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/pairs.txt +++ /dev/null @@ -1,58 +0,0 @@ -CAT-13b CAT-17g -CAT-17g CAT-17f -CAT-13a CAT-17g -CAT-17g CAT-13i -CAT-13e CAT-17g -CAT-13g CAT-17g -CAT-17g CAT-13c -CAT-17g CAT-17d -CAT-17g CAT-17c -CAT-17f CAT-17e -CAT-13d CAT-17d -CAT-13c CAT-17i -CAT-24 CAT-17e -CAT-24 CAT-17i -CAT-13a CAT-17i -CAT-13o CAT-17i -CAT-13e CAT-17i -CAT-13g CAT-17i -CAT-13h CAT-17i -CAT-17i CAT-17a -CAT-17i CAT-13f -CAT-4j CAT-4o -CAT-4m CAT-4j -CAT-17b CAT-17e -CAT-17b CAT-13d -CAT-4m CAT-4p -CAT-4p CAT-13k -CAT-13d CAT-17h -CAT-13o CAT-17h -CAT-4m CAT-4n -CAT-4n CAT-13k -CAT-4o CAT-4d -CAT-13k CAT-4d -CAT-4m CAT-4c -CAT-4m CAT-13j -CAT-4m CAT-13m -CAT-4m CAT-4k -CAT-4m CAT-13k -CAT-4m CAT-4l -CAT-4c CAT-4o -CAT-4o CAT-4b -CAT-13j CAT-4o -CAT-4k CAT-4o -CAT-4a CAT-4o -CAT-13d CAT-13h -CAT-17c CAT-17e -CAT-13d CAT-13f -CAT-13n CAT-4i -CAT-13n CAT-13a -CAT-13n CAT-13k -CAT-13d CAT-13b -CAT-4i CAT-13m -CAT-13a CAT-13m -CAT-13k CAT-4b -CAT-4l CAT-13k -CAT-4a CAT-13k -CAT-13d CAT-17a -CAT-13d CAT-13i diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/setup.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/setup.py deleted file mode 100644 index ba97d765..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/inputfiles/1.BACE/setup.py +++ /dev/null @@ -1,30 +0,0 @@ -import os -import shutil -import glob - -systems = ['protein', 'water'] -cnt = 0 -setupFEP = 'python /home/jespers/software/setupFEP/setupFEP.py' -cysbond = '2442:5627,3403:5974,4220:5016' - -for system in systems: - cnt += 1 - directory = str(cnt) + '.' + system - os.mkdir(directory) - with open('pairs.txt') as infile: - - for line in infile: - line = line.split() - mol1 = line[0] - mol2 = line[1] - if system == 'water': - - call = setupFEP + ' -l1 ' + mol1 + ' -l2 ' + mol2 + ' -FF OPLS2015 -s water -c HEBBE -r 25 -l 0.5' - - if system == 'protein': - call = setupFEP + ' -l1 ' + mol1 + ' -l2 ' + mol2 + ' -FF OPLS2015 -s protein -c HEBBE -r 25 -l 0.5 -b ' + cysbond - - src = 'FEP_' + mol1 + '-' + mol2 - dst = directory + '/FEP_' + mol1 + '-' + mol2 - os.system(call) - shutil.move(src, dst) diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/Barplots_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/Barplots_dG.png deleted file mode 100644 index b295d17f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/Barplots_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/UMAP.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/UMAP.png deleted file mode 100644 index 7e9e5e48..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/UMAP.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/UMAP.svg b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/UMAP.svg deleted file mode 100644 index f1b5d3dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/UMAP.svg +++ /dev/null @@ -1,3854 +0,0 @@ - - - - - - - - - 2022-03-04T10:49:38.840292 - image/svg+xml - - - Matplotlib v3.3.4, https://matplotlib.org/ - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/dG_MAE_barplot_data.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/dG_MAE_barplot_data.txt deleted file mode 100644 index 8c9fd335..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/dG_MAE_barplot_data.txt +++ /dev/null @@ -1,64 +0,0 @@ -OPLS2015 - BACE - 1.4±0.19 -openFF - BACE - 1.65±0.21 -openFF2 - BACE - 1.31±0.15 -FEP+_5ns - BACE - 0.68±0.11 -OPLS2015 - CDK2 - 0.89±0.13 -openFF - CDK2 - 1.22±0.2 -openFF2 - CDK2 - 1.09±0.24 -FEP+_5ns - CDK2 - 0.86±0.13 -OPLS2015 - JNK1 - 1.31±0.2 -openFF - JNK1 - 1.23±0.1 -openFF2 - JNK1 - 1.2±0.13 -FEP+_5ns - JNK1 - 1.07±0.1 -OPLS2015 - MCL1 - 1.56±0.16 -openFF - MCL1 - 1.7±0.2 -openFF2 - MCL1 - 1.57±0.17 -FEP+_5ns - MCL1 - 0.85±0.1 -OPLS2015 - PTP1B - 1.15±0.18 -openFF - PTP1B - 1.6±0.23 -openFF2 - PTP1B - 1.36±0.19 -FEP+_5ns - PTP1B - 0.59±0.1 -OPLS2015 - Thrombin - 0.99±0.23 -openFF - Thrombin - 0.99±0.22 -openFF2 - Thrombin - 0.8±0.16 -FEP+_5ns - Thrombin - 0.41±0.11 -OPLS2015 - Tyk2 - 0.56±0.1 -openFF - Tyk2 - 0.73±0.12 -openFF2 - Tyk2 - 0.66±0.12 -FEP+_5ns - Tyk2 - 0.45±0.09 -OPLS2015 - p38 - 0.79±0.1 -openFF - p38 - 1.1±0.14 -openFF2 - p38 - 1.41±0.17 -FEP+_5ns - p38 - 0.85±0.08 -OPLS2015 - CDK8 - 1.44±0.15 -openFF - CDK8 - 1.98±0.22 -openFF2 - CDK8 - 1.83±0.22 -FEP+_5ns - CDK8 - 1.21±0.15 -OPLS2015 - cMET - 1.18±0.18 -openFF - cMET - 1.55±0.29 -openFF2 - cMET - 1.04±0.2 -FEP+_5ns - cMET - 0.81±0.12 -OPLS2015 - EG5 - 1.54±0.3 -openFF - EG5 - 1.35±0.2 -openFF2 - EG5 - 1.28±0.24 -FEP+_5ns - EG5 - 0.64±0.11 -OPLS2015 - HIF2A - 1.61±0.2 -openFF - HIF2A - 1.74±0.2 -openFF2 - HIF2A - 1.53±0.18 -FEP+_5ns - HIF2A - 0.84±0.11 -OPLS2015 - PFKFB3 - 1.15±0.16 -openFF - PFKFB3 - 1.71±0.21 -openFF2 - PFKFB3 - 1.6±0.24 -FEP+_5ns - PFKFB3 - 1.08±0.1 -OPLS2015 - SHP2 - 2.12±0.23 -openFF - SHP2 - 2.09±0.27 -openFF2 - SHP2 - 2.2±0.29 -FEP+_5ns - SHP2 - 0.75±0.13 -OPLS2015 - SYK - 1.76±0.27 -openFF - SYK - 1.51±0.19 -openFF2 - SYK - 1.76±0.23 -FEP+_5ns - SYK - 0.88±0.13 -OPLS2015 - TNKS2 - 0.81±0.1 -openFF - TNKS2 - 0.83±0.12 -openFF2 - TNKS2 - 0.85±0.12 -FEP+_5ns - TNKS2 - 1.23±0.19 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/dG_OPLS2015_linplot_data.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/dG_OPLS2015_linplot_data.txt deleted file mode 100644 index 9730d79d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/dG_OPLS2015_linplot_data.txt +++ /dev/null @@ -1,200 +0,0 @@ -Ligand,Pred. dG,Exp. dG,CCC path error -ejm-48,-9.82,-9.0,0.023 -ejm-47,-9.934,-9.7,0.023 -ejm-46,-10.407,-11.31,0.0 -jmc-27,-10.896,-11.28,0.167 -ejm-45,-9.728,-9.56,0.294 -jmc-28,-10.978,-10.98,0.167 -ejm-42,-9.796,-9.78,0.294 -jmc-23,-11.372,-11.7,0.216 -jmc-30,-10.447,-10.94,0.122 -ejm-50,-9.201,-8.98,0.514 -ejm-31,-8.451,-9.54,0.592 -ejm-54,-9.208,-10.53,0.592 -ejm-55,-9.87,-9.21,0.42 -ejm-43,-9.314,-8.26,0.947 -ejm-44,-7.828,-7.42,0.947 -ejm-49,-8.688,-7.75,0.753 -p38a-3fln,-10.193,-10.88,0.0 -p38a-2x,-8.787,-10.23,0.52 -p38a-2g,-11.361,-10.66,0.604 -p38a-2ff,-10.935,-11.44,0.733 -p38a-2e,-9.504,-10.7,0.087 -p38a-2l,-12.258,-12.26,0.035 -p38a-2m,-12.164,-10.96,0.058 -p38a-2j,-10.15,-10.08,0.886 -p38a-2k,-10.088,-10.55,0.058 -p38a-2v,-6.949,-8.97,0.704 -p38a-2gg,-10.014,-10.66,0.445 -p38a-2ee,-10.825,-12.26,0.733 -p38a-3flz,-10.584,-9.49,0.886 -p38a-2h,-9.624,-9.48,0.854 -p38a-2f,-7.913,-8.48,0.147 -p38a-2c,-10.703,-10.46,1.253 -p38a-2t,-10.979,-11.85,0.074 -p38a-2r,-11.075,-10.79,0.38 -p38a-2n,-12.501,-11.85,0.38 -p38a-2s,-12.669,-11.11,0.156 -p38a-2p,-12.334,-11.2,0.607 -p38a-2o,-11.068,-10.49,0.607 -p38a-2q,-12.893,-12.26,0.163 -p38a-2u,-13.303,-12.26,0.163 -p38a-2i,-11.047,-10.05,1.253 -p38a-3fly,-9.345,-11.42,1.295 -p38a-2y,-10.414,-9.78,1.295 -p38a-2aa,-8.777,-9.27,1.737 -p38a-3flq,-9.799,-9.93,1.708 -p38a-3flw,-10.246,-10.68,1.737 -p38a-3fmh,-10.383,-10.83,1.16 -p38a-3fmk,-13.297,-11.83,1.137 -p38a-2z,-11.22,-10.36,1.636 -p38a-2bb,-9.171,-9.06,1.708 -18659-1,-9.893,-9.47,0.655 -18658-1,-9.293,-9.7,0.655 -18634-1,-9.943,-9.99,0.57 -18660-1,-10.253,-8.7,1.0 -18631-1,-9.703,-9.41,0.148 -17124-1,-12.463,-9.68,0.57 -18628-1,-6.766,-8.7,0.145 -18625-1,-6.779,-8.11,0.148 -18635-1,-6.034,-7.29,0.205 -18624-1,-6.904,-8.49,0.0 -18636-1,-7.22,-7.51,0.131 -18630-1,-6.776,-9.14,0.953 -18629-1,-6.737,-8.67,0.352 -18627-1,-8.359,-8.48,0.953 -18626-1,-8.352,-8.87,0.352 -18633-1,-8.628,-9.17,1.049 -18632-1,-7.415,-9.08,0.514 -18637-1,-12.461,-10.14,0.534 -18638-1,-12.139,-10.09,1.005 -18639-1,-12.096,-9.74,0.774 -18652-1,-12.886,-10.68,1.005 -1h1s,-9.974,-11.25,0.754 -30,-9.735,-9.81,0.176 -1oiy,-10.068,-9.79,0.266 -1oiu,-11.057,-9.08,0.414 -32,-8.334,-9.75,0.754 -28,-10.174,-11.11,0.334 -29,-10.635,-9.88,0.224 -31,-10.27,-9.54,0.139 -26,-8.984,-8.43,0.133 -1oi9,-10.171,-9.74,0.188 -1h1q,-8.581,-8.18,0.0 -1h1r,-6.631,-7.67,0.398 -17,-7.217,-7.04,0.398 -21,-7.101,-7.83,0.355 -20,-10.629,-8.72,0.51 -22,-6.121,-7.86,0.355 -23476,-10.114,-9.41,0.774 -20670-2qbs-,-9.393,-9.08,0.225 -23474,-10.197,-9.11,0.277 -23479,-9.183,-9.14,0.894 -23330-2qbq-,-11.987,-10.13,0.774 -23482,-10.805,-10.01,0.894 -23475,-8.889,-8.72,0.0 -23477,-8.925,-8.85,0.462 -23468,-6.258,-7.75,0.157 -20669-2qbr-,-8.678,-8.61,0.307 -23480,-8.359,-8.72,1.35 -23483,-11.842,-9.87,0.813 -20667-2qbp-,-12.538,-11.42,0.813 -23486,-13.708,-12.47,0.84 -23485,-9.783,-11.01,0.84 -23484,-11.343,-7.75,0.748 -23469,-7.375,-7.72,0.253 -23473,-8.666,-8.39,0.367 -23472,-7.062,-8.65,0.931 -23471,-5.381,-7.75,0.299 -23470,-5.345,-7.72,0.299 -23466,-6.125,-7.85,0.209 -23467,-5.513,-7.34,0.253 -27.0,-5.976,-6.12,0.0 -41.0,-10.356,-7.13,0.208 -32.0,-5.727,-6.58,0.179 -33.0,-7.198,-6.88,0.396 -30.0,-5.198,-7.85,0.725 -38.0,-9.476,-7.02,0.433 -34.0,-5.513,-6.87,0.725 -28.0,-3.934,-6.62,0.396 -39.0,-8.676,-7.03,0.208 -40.0,-10.846,-7.25,0.433 -43.0,-8.732,-7.03,0.686 -46.0,-8.029,-7.6,0.457 -47.0,-4.129,-5.78,0.686 -35.0,-7.295,-8.81,0.884 -36.0,-8.721,-8.18,0.884 -37.0,-6.874,-8.95,0.306 -64.0,-8.784,-9.5,0.56 -31.0,-6.671,-7.92,1.025 -52.0,-5.738,-9.23,1.178 -49.0,-7.225,-8.36,1.033 -67.0,-10.073,-7.58,0.328 -53.0,-10.281,-9.96,0.706 -56.0,-10.745,-9.26,0.328 -50.0,-8.096,-9.33,0.562 -54.0,-9.258,-9.78,0.32 -61.0,-8.668,-8.08,0.528 -42.0,-7.825,-8.9,1.803 -29.0,-3.975,-6.94,1.803 -48.0,-3.945,-6.66,0.897 -45.0,-7.465,-8.95,0.611 -44.0,-9.24,-8.67,0.361 -51.0,-9.251,-8.45,1.536 -68.0,-5.724,-7.69,0.552 -23.0,-8.406,-8.83,0.775 -62.0,-10.013,-7.96,1.237 -66.0,-10.319,-8.43,1.237 -26.0,-7.658,-8.24,0.946 -60.0,-10.342,-8.92,0.352 -65.0,-11.015,-8.41,0.57 -63.0,-10.583,-9.06,0.375 -58.0,-11.754,-9.41,0.352 -57.0,-9.517,-9.04,0.345 -6b,-8.064,-8.89,0.522 -6a,-8.859,-9.18,0.503 -7a,-6.523,-8.22,0.597 -6e,-8.832,-8.91,0.445 -1b,-8.701,-8.46,0.52 -3a,-7.191,-8.32,0.652 -5,-6.946,-7.58,0.0 -1d,-10.284,-8.25,0.52 -1a,-6.659,-7.48,0.144 -1c,-9.329,-8.56,0.052 -3b,-10.323,-7.86,0.652 -CAT-13g,-9.821,-9.09,0.436 -CAT-13f,-10.117,-9.09,0.436 -CAT-13e,-9.534,-9.96,0.502 -CAT-13d,-8.294,-10.47,0.0 -CAT-17a,-9.114,-10.73,0.502 -CAT-17h,-10.134,-10.33,0.036 -CAT-13i,-7.216,-9.27,0.25 -CAT-17b,-10.768,-10.02,0.488 -CAT-17c,-8.728,-9.86,0.488 -CAT-13h,-4.542,-9.63,0.25 -CAT-17d,-7.665,-9.42,0.304 -CAT-17i,-7.856,-9.47,0.36 -CAT-17g,-8.9,-9.74,0.36 -CAT-17e,-11.372,-10.02,0.69 -CAT-24,-12.279,-11.35,0.576 -CAT-4j,-9.857,-9.02,0.437 -CAT-17f,-9.412,-9.42,0.69 -CAT-4n,-11.25,-9.09,0.745 -CAT-4m,-11.461,-9.15,0.594 -CAT-4p,-11.684,-10.08,0.72 -CAT-4o,-9.882,-9.38,0.664 -CAT-13m,-10.519,-8.76,0.72 -CAT-4k,-7.427,-7.85,0.494 -CAT-4l,-9.207,-9.34,0.423 -CAT-13k,-8.303,-9.7,0.594 -CAT-4a,-9.097,-7.93,0.494 -CAT-4c,-8.788,-7.85,0.705 -CAT-4i,-8.907,-8.26,0.485 -CAT-4d,-13.283,-9.11,0.454 -CAT-4b,-12.999,-9.63,0.705 -CAT-13n,-8.661,-8.54,1.028 -CAT-13j,-9.507,-8.73,0.552 -CAT-13o,-7.102,-8.54,1.028 -CAT-13b,-7.078,-9.12,0.354 -CAT-13a,-8.44,-8.84,0.354 -CAT-13c,-6.909,-9.32,0.372 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/dG_amber_linplot_data.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/dG_amber_linplot_data.txt deleted file mode 100644 index 7ea0152b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/dG_amber_linplot_data.txt +++ /dev/null @@ -1,200 +0,0 @@ -Ligand,Pred. dG,Exp. dG,CCC path error -ejm_31,-9.462,-9.54,0 -ejm_42,-9.622,-9.78,0 -ejm_43,-8.622,-8.26,0 -ejm_44,-6.732,-7.42,0 -ejm_45,-9.872,-9.56,0 -ejm_46,-10.202,-11.31,0 -ejm_47,-9.652,-9.7,0 -ejm_48,-9.742,-9.0,0 -ejm_49,-9.572,-7.75,0 -ejm_50,-9.532,-8.98,0 -ejm_54,-12.802,-10.53,0 -ejm_55,-10.242,-9.21,0 -jmc_23,-10.342,-11.7,0 -jmc_27,-10.182,-11.28,0 -jmc_28,-8.772,-10.98,0 -jmc_30,-10.582,-10.94,0 -2aa,-9.528,-9.27,0 -2bb,-10.728,-9.07,0 -2c,-11.428,-10.469999999999999,0 -2e,-7.428,-10.709999999999999,0 -2ee,-13.028,-12.27,0 -2f,-8.648,-8.49,0 -2ff,-9.198,-11.45,0 -2g,-10.678,-10.67,0 -2gg,-6.848,-10.67,0 -2h,-8.598,-9.49,0 -2i,-12.048,-10.059999999999999,0 -2j,-10.518,-10.09,0 -2k,-8.838,-10.559999999999999,0 -2l,-11.538,-12.27,0 -2m,-11.778,-10.969999999999999,0 -2n,-11.188,-11.86,0 -2o,-9.918,-10.5,0 -2p,-10.858,-11.209999999999999,0 -2q,-12.958,-12.27,0 -2r,-9.028,-10.799999999999999,0 -2s,-9.058,-11.12,0 -2t,-9.978,-11.86,0 -2u,-12.748,-12.27,0 -2v,-10.128,-8.98,0 -2x,-12.248,-10.24,0 -2y,-10.858,-9.78,0 -2z,-10.678,-10.36,0 -3fln,-9.738,-10.89,0 -3flq,-12.648,-9.93,0 -3flw,-11.378,-10.68,0 -3fly,-12.858,-11.43,0 -3flz,-8.988,-9.5,0 -3fmh,-14.668,-10.83,0 -3fmk,-12.108,-11.84,0 -17124,-9.932,-9.68,0 -18624,-7.682,-8.5,0 -18625,-6.452,-8.11,0 -18626,-9.192,-8.879999999999999,0 -18627,-9.462,-8.49,0 -18628,-7.912,-8.709999999999999,0 -18629,-9.662,-8.68,0 -18630,-9.422,-9.15,0 -18631,-7.632,-9.42,0 -18632,-9.812,-9.09,0 -18633,-9.332,-9.18,0 -18634,-9.732,-10.0,0 -18635,-8.642,-7.289999999999999,0 -18636,-6.822,-7.52,0 -18637,-9.712,-10.15,0 -18638,-10.062,-10.1,0 -18639,-11.362,-9.75,0 -18652,-8.732,-10.69,0 -18658,-9.882,-9.709999999999999,0 -18659,-8.532,-9.469999999999999,0 -18660,-11.312,-8.709999999999999,0 -17,-8.966,-7.04,0 -20,-8.726,-8.717,0 -21,-8.376,-7.827,0 -22,-8.646,-7.861,0 -26,-7.886,-8.43,0 -28,-9.236,-11.111,0 -29,-10.056,-9.881,0 -30,-8.466,-9.811,0 -31,-8.536,-9.538,0 -32,-10.026,-9.749,0 -1h1q,-7.576,-8.178,0 -1h1r,-9.076,-7.668,0 -1h1s,-9.806,-11.245000000000001,0 -1oi9,-10.286,-9.74,0 -1oiu,-10.626,-9.082,0 -1oiy,-9.376,-9.784,0 -20667,-10.861,-11.42,0 -20669,-8.421,-8.59,0 -20670,-9.811,-9.08,0 -23330,-11.461,-10.12,0 -23466,-7.411,-7.84,0 -23467,-7.591,-7.33,0 -23468,-7.311,-7.74,0 -23469,-5.791,-7.71,0 -23470,-7.761,-7.71,0 -23471,-7.381,-7.74,0 -23472,-8.211,-8.629999999999999,0 -23473,-9.231,-8.379999999999999,0 -23474,-10.351,-9.1,0 -23475,-9.321,-8.71,0 -23476,-9.951,-9.4,0 -23477,-9.251,-8.85,0 -23479,-9.301,-9.14,0 -23480,-9.341,-8.719999999999999,0 -23482,-9.831,-10.0,0 -23483,-9.751,-9.87,0 -23484,-9.641,-7.75,0 -23485,-8.421,-11.01,0 -23486,-10.911,-12.47,0 -23,-8.013,-8.83,0 -26,-7.103,-8.23,0 -27,-5.913,-6.12,0 -28,-4.783,-6.63,0 -29,-5.863,-6.94,0 -30,-6.703,-7.86,0 -31,-7.703,-7.93,0 -32,-5.633,-6.58,0 -33,-7.933,-6.88,0 -34,-5.923,-6.88,0 -35,-6.963,-8.82,0 -36,-7.753,-8.19,0 -37,-7.723,-8.96,0 -38,-9.903,-7.03,0 -39,-6.423,-7.03,0 -40,-8.313,-7.25,0 -41,-8.843,-7.13,0 -42,-7.143,-8.9,0 -43,-7.873,-7.04,0 -44,-6.733,-8.67,0 -45,-8.513,-8.96,0 -46,-6.873,-7.6,0 -47,-5.123,-5.78,0 -48,-4.583,-6.67,0 -49,-7.923,-8.37,0 -50,-8.123,-9.33,0 -51,-6.853,-8.45,0 -52,-8.523,-9.23,0 -53,-11.103,-9.97,0 -54,-9.833,-9.78,0 -56,-9.753,-9.27,0 -57,-7.763,-9.040000000000001,0 -58,-12.773,-9.41,0 -60,-10.203,-8.92,0 -61,-9.643,-8.08,0 -62,-7.413,-7.96,0 -63,-12.403,-9.07,0 -64,-10.973,-9.49,0 -65,-11.323,-8.41,0 -66,-9.683,-8.43,0 -67,-9.293,-7.59,0 -68,-7.493,-7.69,0 -1a,-7.515,-7.48,0 -1b,-8.945,-8.46,0 -1c,-8.905,-8.56,0 -1d,-8.565,-8.25,0 -3a,-8.555,-8.32,0 -3b,-8.385,-7.86,0 -5,-6.315,-7.58,0 -6a,-9.135,-9.18,0 -6b,-8.225,-8.89,0 -6e,-8.875,-8.91,0 -7a,-8.285,-8.22,0 -13a,-10.521,-8.83,0 -13b,-8.371,-9.11,0 -13c,-7.691,-9.31,0 -13d,-10.371,-10.46,0 -13e,-8.101,-9.95,0 -13f,-8.141,-9.08,0 -13g,-8.021,-9.08,0 -13h,-7.351,-9.620000000000001,0 -13i,-9.351,-9.26,0 -13j,-7.631,-8.72,0 -13k,-10.731,-9.69,0 -13m,-13.171,-8.75,0 -13n,-8.271,-8.53,0 -13o,-7.851,-8.53,0 -17a,-10.901,-10.72,0 -17b,-10.581,-10.01,0 -17c,-9.561,-9.85,0 -17d,-7.071,-9.41,0 -17e,-10.701,-10.01,0 -17f,-8.861,-9.41,0 -17g,-8.271,-9.73,0 -17h,-10.581,-10.32,0 -17i,-9.521,-9.46,0 -24,-12.991,-11.34,0 -4a,-8.961,-7.92,0 -4b,-11.011,-9.620000000000001,0 -4c,-9.331,-7.84,0 -4d,-10.161,-9.1,0 -4i,-9.721,-8.25,0 -4j,-7.801,-9.01,0 -4k,-7.401,-7.84,0 -4l,-8.801,-9.33,0 -4m,-9.971,-9.14,0 -4n,-9.631,-9.08,0 -4o,-8.441,-9.370000000000001,0 -4p,-9.901,-10.07,0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/dG_consensus_linplot_data.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/dG_consensus_linplot_data.txt deleted file mode 100644 index b670d33b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/dG_consensus_linplot_data.txt +++ /dev/null @@ -1,200 +0,0 @@ -Ligand,Pred. dG,Exp. dG,CCC path error -ejm_31,-10.766,-9.54,0 -ejm_42,-10.456,-9.78,0 -ejm_43,-8.289,-8.26,0 -ejm_44,-5.971,-7.42,0 -ejm_45,-10.845,-9.56,0 -ejm_46,-10.575,-11.31,0 -ejm_47,-8.525,-9.7,0 -ejm_48,-9.416,-9.0,0 -ejm_49,-8.75,-7.75,0 -ejm_50,-10.215,-8.98,0 -ejm_54,-11.926,-10.53,0 -ejm_55,-9.984,-9.21,0 -jmc_23,-10.497,-11.7,0 -jmc_27,-9.941,-11.28,0 -jmc_28,-9.365,-10.98,0 -jmc_30,-10.419,-10.94,0 -2aa,-9.655,-9.27,0 -2bb,-9.589,-9.07,0 -2c,-12.332,-10.469999999999999,0 -2e,-9.275,-10.709999999999999,0 -2ee,-10.597,-12.27,0 -2f,-9.227,-8.49,0 -2ff,-10.948,-11.45,0 -2g,-10.448,-10.67,0 -2gg,-10.251,-10.67,0 -2h,-7.749,-9.49,0 -2i,-10.301,-10.059999999999999,0 -2j,-10.088,-10.09,0 -2k,-10.21,-10.559999999999999,0 -2l,-12.179,-12.27,0 -2m,-11.581,-10.969999999999999,0 -2n,-12.356,-11.86,0 -2o,-10.473,-10.5,0 -2p,-11.729,-11.209999999999999,0 -2q,-13.492,-12.27,0 -2r,-11.836,-10.799999999999999,0 -2s,-11.129,-11.12,0 -2t,-11.73,-11.86,0 -2u,-14.098,-12.27,0 -2v,-8.97,-8.98,0 -2x,-10.196,-10.24,0 -2y,-10.102,-9.78,0 -2z,-9.549,-10.36,0 -3fln,-10.598,-10.89,0 -3flq,-10.024,-9.93,0 -3flw,-10.643,-10.68,0 -3fly,-10.403,-11.43,0 -3flz,-9.531,-9.5,0 -3fmh,-10.465,-10.83,0 -3fmk,-11.105,-11.84,0 -17124,-10.823,-9.68,0 -18624,-7.781,-8.5,0 -18625,-7.781,-8.11,0 -18626,-8.392,-8.879999999999999,0 -18627,-8.099,-8.49,0 -18628,-8.103,-8.709999999999999,0 -18629,-8.183,-8.68,0 -18630,-8.156,-9.15,0 -18631,-9.872,-9.42,0 -18632,-8.413,-9.09,0 -18633,-8.199,-9.18,0 -18634,-10.434,-10.0,0 -18635,-7.976,-7.289999999999999,0 -18636,-7.059,-7.52,0 -18637,-10.688,-10.15,0 -18638,-10.343,-10.1,0 -18639,-10.327,-9.75,0 -18652,-11.478,-10.69,0 -18658,-10.428,-9.709999999999999,0 -18659,-9.938,-9.469999999999999,0 -18660,-8.808,-8.709999999999999,0 -17,-7.899,-7.04,0 -20,-8.879,-8.717,0 -21,-8.006,-7.827,0 -22,-7.304,-7.861,0 -26,-9.378,-8.43,0 -28,-10.378,-11.111,0 -29,-9.436,-9.881,0 -30,-9.921,-9.811,0 -31,-9.411,-9.538,0 -32,-9.217,-9.749,0 -1h1q,-8.367,-8.178,0 -1h1r,-7.662,-7.668,0 -1h1s,-9.894,-11.245000000000001,0 -1oi9,-9.492,-9.74,0 -1oiu,-11.072,-9.082,0 -1oiy,-9.343,-9.784,0 -20667,-9.918,-11.42,0 -20669,-9.865,-8.59,0 -20670,-8.586,-9.08,0 -23330,-9.159,-10.12,0 -23466,-8.087,-7.84,0 -23467,-8.127,-7.33,0 -23468,-8.426,-7.74,0 -23469,-9.084,-7.71,0 -23470,-8.27,-7.71,0 -23471,-8.559,-7.74,0 -23472,-10.176,-8.629999999999999,0 -23473,-9.342,-8.379999999999999,0 -23474,-10.188,-9.1,0 -23475,-9.155,-8.71,0 -23476,-9.973,-9.4,0 -23477,-8.376,-8.85,0 -23479,-8.762,-9.14,0 -23480,-8.562,-8.719999999999999,0 -23482,-9.514,-10.0,0 -23483,-9.28,-9.87,0 -23484,-7.913,-7.75,0 -23485,-8.747,-11.01,0 -23486,-9.241,-12.47,0 -23,-7.611,-8.83,0 -26,-8.485,-8.23,0 -27,-6.947,-6.12,0 -28,-6.544,-6.63,0 -29,-5.987,-6.94,0 -30,-7.561,-7.86,0 -31,-6.661,-7.93,0 -32,-7.104,-6.58,0 -33,-7.314,-6.88,0 -34,-7.811,-6.88,0 -35,-7.756,-8.82,0 -36,-7.623,-8.19,0 -37,-9.124,-8.96,0 -38,-8.595,-7.03,0 -39,-7.771,-7.03,0 -40,-8.733,-7.25,0 -41,-7.885,-7.13,0 -42,-7.974,-8.9,0 -43,-6.75,-7.04,0 -44,-8.442,-8.67,0 -45,-8.3,-8.96,0 -46,-6.314,-7.6,0 -47,-5.621,-5.78,0 -48,-4.583,-6.67,0 -49,-7.511,-8.37,0 -50,-8.484,-9.33,0 -51,-7.058,-8.45,0 -52,-8.933,-9.23,0 -53,-11.179,-9.97,0 -54,-9.152,-9.78,0 -56,-10.001,-9.27,0 -57,-8.47,-9.040000000000001,0 -58,-11.502,-9.41,0 -60,-9.265,-8.92,0 -61,-8.429,-8.08,0 -62,-7.064,-7.96,0 -63,-10.825,-9.07,0 -64,-8.823,-9.49,0 -65,-10.002,-8.41,0 -66,-8.419,-8.43,0 -67,-10.074,-7.59,0 -68,-6.713,-7.69,0 -1a,-8.294,-7.48,0 -1b,-8.889,-8.46,0 -1c,-8.899,-8.56,0 -1d,-8.811,-8.25,0 -3a,-8.994,-8.32,0 -3b,-8.324,-7.86,0 -5,-7.638,-7.58,0 -6a,-8.496,-9.18,0 -6b,-8.061,-8.89,0 -6e,-7.245,-8.91,0 -7a,-8.058,-8.22,0 -13a,-8.795,-8.83,0 -13b,-8.813,-9.11,0 -13c,-8.051,-9.31,0 -13d,-10.545,-10.46,0 -13e,-10.503,-9.95,0 -13f,-10.938,-9.08,0 -13g,-9.629,-9.08,0 -13h,-8.861,-9.620000000000001,0 -13i,-9.367,-9.26,0 -13j,-8.268,-8.72,0 -13k,-8.834,-9.69,0 -13m,-9.252,-8.75,0 -13n,-8.467,-8.53,0 -13o,-7.992,-8.53,0 -17a,-10.952,-10.72,0 -17b,-9.482,-10.01,0 -17c,-9.566,-9.85,0 -17d,-7.86,-9.41,0 -17e,-8.964,-10.01,0 -17f,-8.715,-9.41,0 -17g,-8.399,-9.73,0 -17h,-9.978,-10.32,0 -17i,-9.587,-9.46,0 -24,-11.599,-11.34,0 -4a,-9.45,-7.92,0 -4b,-10.603,-9.620000000000001,0 -4c,-8.248,-7.84,0 -4d,-10.446,-9.1,0 -4i,-10.134,-8.25,0 -4j,-8.959,-9.01,0 -4k,-7.889,-7.84,0 -4l,-8.166,-9.33,0 -4m,-9.832,-9.14,0 -4n,-9.033,-9.08,0 -4o,-9.253,-9.370000000000001,0 -4p,-10.32,-10.07,0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/ddG_amber_linplot_data.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/ddG_amber_linplot_data.txt deleted file mode 100644 index 7605f9b8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/ddG_amber_linplot_data.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Ligand_1,Ligand_2,Pred. ddG,Exp. ddG,CCC error diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/linreg_dG_OPLS2015.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/linreg_dG_OPLS2015.png deleted file mode 100644 index b4baa9f8..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/linreg_dG_OPLS2015.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/linreg_dG_amber.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/linreg_dG_amber.png deleted file mode 100644 index 1b94d832..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/linreg_dG_amber.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/linreg_dG_consensus.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/linreg_dG_consensus.png deleted file mode 100644 index 93676eed..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/plots/linreg_dG_consensus.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/CDK2_results.csv b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/CDK2_results.csv deleted file mode 100644 index 9efe5ddf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/CDK2_results.csv +++ /dev/null @@ -1,18 +0,0 @@ -"#Ligand dGexptl absolute_flare cresset_valid schrodinger amber gaff cgenff consensus gaff_raw cgenff_raw consensus_raw" -"17 -7.04 -7.68 -7.62 -9.06 -8.97 -7.54 -8.10 -7.90 6.52 4.19 5.04" -"20 -8.72 -9.78 -9.72 -8.69 -8.73 -8.80 -9.00 -8.88 1.27 0.42 0.94" -"21 -7.83 -6.98 -6.92 -8.46 -8.38 -7.40 -8.52 -8.01 7.12 2.44 4.59" -"22 -7.86 -7.18 -7.12 -8.99 -8.65 -6.70 -7.81 -7.30 10.06 5.40 7.53" -"26 -8.43 -8.78 -8.72 -8.79 -7.89 -9.32 -9.51 -9.38 -0.91 -1.68 -1.15" -"28 -11.11 -9.78 -9.72 -10.29 -9.24 -10.51 -10.04 -10.38 -5.86 -3.92 -5.33" -"29 -9.88 -9.88 -9.82 -9.11 -10.06 -9.67 -9.03 -9.44 -2.35 0.33 -1.39" -"30 -9.81 -9.78 -9.72 -8.81 -8.47 -9.90 -10.13 -9.92 -3.33 -4.29 -3.42" -"31 -9.54 -10.08 -10.02 -9.01 -8.54 -9.73 -9.00 -9.41 -2.63 0.44 -1.28" -"32 -9.75 -9.58 -9.52 -9.46 -10.03 -9.94 -8.39 -9.22 -3.52 3.00 -0.48" -"1h1q -8.18 -7.88 -7.82 -8.15 -7.58 -8.06 -8.65 -8.37 4.37 1.88 3.08" -"1h1r -7.67 -7.88 -7.82 -8.84 -9.08 -7.58 -7.69 -7.66 6.36 5.92 6.03" -"1h1s -11.25 -9.58 -9.52 -9.77 -9.81 -10.40 -9.89 -9.89 -5.43 -3.31 -3.31" -"1oi9 -9.74 -10.28 -10.22 -8.65 -10.29 -9.79 -9.35 -9.49 -2.85 -1.04 -1.63" -"1oiu -9.08 -10.88 -10.82 -10.81 -10.63 -10.86 -11.30 -11.07 -7.35 -9.21 -8.23" -"1oiy -9.78 -10.58 -10.52 -8.75 -9.38 -9.45 -9.24 -9.34 -1.46 -0.56 -1.00" -"sum -145.66 -146.61 -145.66 -145.66 -145.66 -145.66 -145.66 -145.66 0.00 0.00 0.00" diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/README.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/README.txt deleted file mode 100755 index ad83b7cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/README.txt +++ /dev/null @@ -1,14 +0,0 @@ -The subfolders in wang_2015_datasets contain csv files with ddG values for all perturbations of the different approaches by - - "cresset_valid" as supplied by Kuhn et al. (this study) - - "schrodinger" as supplied in the supporting information of Wang et al., J. Am. Chem. Soc. 2015, 137, 7, 2695-2703; https://doi.org/10.1021/ja512751q - - "amber" as supplied in the supporting information of Song et al., J. Chem. Inf. Model. 2019, 59, 7, 3128-3135; https://doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00105 - - "gaff", "cgenff" and "consensus" as supplied online by Gapsys et al., Chem. Sci., 2020, Advance Article; https://doi.org/10.1039/C9SC03754C on - https://github.com/deGrootLab/pmx/tree/master/protLig_benchmark/ddg_data, downloaded on 23 January 2020 -Other files in the subfolders contain the experimental dG values as specified in the sdf files from the supporting information by Wang et al. ("experimental_dG.csv"). - -The file "final_results_all.xlsx" contains all dG values of the different approaches. Results for Kuhn et al. and Gapsys. et al. were calculated from the ddG values provided using Flare's internal free energy analysis tool. dG values for Wang et al. and Song et al. were taken from the supporting information of the corresponding papers (cf. above). - -The Jupyter Notebook "recalculate_ddG.ipynb" contains the results for R, MUE, RMSE and Kendall's tau based on the input files supplied in the subfolders. -Note that the error estimates were obtained by bootstrapping and may deviate slightly upon rerunning the notebook. - -The Jupyter Notebook "Statistics.ipynb" presents per-link statistics for each data set (as opposed to the per-compound statistics presented elsewhere in this paper) \ No newline at end of file diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/Statistics.ipynb b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/Statistics.ipynb deleted file mode 100755 index 67bc42ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/Statistics.ipynb +++ /dev/null @@ -1,403 +0,0 @@ -{ - "cells": [ - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "**Assessment of Binding Affinity via Alchemical Free Energy Calculations**\n", - "\n", - "Maximilian Kuhn, Stuart Firth-Clark, Paolo Tosco, Antonia S.J.S. Mey, Mark Mackey, Julien Michel\n", - "\n", - "This notebook generates correlation plots for data of this study of the raw DDG edges. \n", - "\n", - "Analysis adapted from freenergyframework and a plotting example by Hannah Bruce McDonald:\n", - "https://github.com/choderalab/freeenergyframework/blob/master/freeenergyframework/examples/WhyNotToUseR2ForDDG.ipynb" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 1, - "metadata": {}, - "outputs": [ - { - "name": "stdout", - "output_type": "stream", - "text": [ - "Populating the interactive namespace from numpy and matplotlib\n" - ] - } - ], - "source": [ - "%pylab inline\n", - "import pandas as pd\n", - "import numpy as np\n", - "import seaborn as sns\n", - "import itertools\n", - "import sklearn.metrics\n", - "import scipy.stats\n", - "import copy\n", - "import os\n", - "\n", - "sns.set_context(\"notebook\", font_scale=1.2)" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 2, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "#Set the base directory for your analysis here:\n", - "base_dir = '/Users/toni_brain/Downloads/Flare_results/wang_2015_datasets/'" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 3, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "def compute_statistic(y_true_sample, y_pred_sample):\n", - " \"\"\"Compute requested statistic.\n", - "\n", - " Parameters\n", - " ----------\n", - " y_true : ndarray with shape (N,)\n", - " True values\n", - " y_pred : ndarray with shape (N,)\n", - " Predicted values\n", - " statistic : str\n", - " Statistic, one of ['RMSE', 'MUE', 'R2', 'rho']\n", - "\n", - " \"\"\"\n", - " RMSE = np.sqrt(sklearn.metrics.mean_squared_error(y_true_sample, y_pred_sample))\n", - " MUE = sklearn.metrics.mean_absolute_error(y_true_sample, y_pred_sample)\n", - " _, _, r_value, _, _ = scipy.stats.linregress(y_true_sample, y_pred_sample)\n", - " rho = scipy.stats.pearsonr(y_true_sample, y_pred_sample)[0]\n", - " tau = scipy.stats.kendalltau(y_true_sample, y_pred_sample)[0]\n", - " return RMSE, MUE, r_value, rho, tau" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 4, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "def plotting_data(x,y, error=None):\n", - " fig = figure(figsize=(6,6))\n", - " xmin = min(x)\n", - " xmax = max(x)\n", - " corrline = np.linspace(-xmax,xmax,10)\n", - "\n", - " plt.plot(corrline,corrline, 'k-', alpha=0.5, lw=0.5)\n", - "\n", - " plt.fill_between(corrline, corrline-1, corrline+1, color='gray', alpha=0.2)\n", - " plt.plot([0, 0], [-xmax, xmax], 'k:', lw=0.5)\n", - " plt.plot([-xmax, xmax], [0, 0], 'k:', lw=0.5)\n", - "# plt.plot([-xmin, -xmax], [xmin, xmax], 'k:') \n", - " \n", - " plt.errorbar(x,y, yerr=error, lw=0,elinewidth=2, marker='o' )\n", - " title = []\n", - " RMSE, MUE, r_value, rho, tau = compute_statistic(x,y)\n", - " plt.title(f'RMSE:{RMSE:.2}\\n MUE:{MUE:.2}\\n R:{r_value:.2}\\n rho:{rho:.2}\\n tau:{tau:.2}\\n')\n", - " #plt.show()\n", - " sns.despine()\n", - " plt.xlabel(r'experimental $\\Delta \\Delta$G [kcal/mol] ')\n", - " plt.ylabel(r'computed $\\Delta \\Delta$G [kcal/mol]')\n", - " return RMSE, MUE, r_value, rho, tau" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "## Reading data" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 5, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "def extract_computed_experimental(name='bace', base_dir=base_dir):\n", - " computed_data_name = os.path.join(base_dir,name,'results','summary','fep_results_freenrgworkflow_cresset_valid.csv')\n", - " experi_data_name = os.path.join(base_dir,name,'results','experimental_dG.csv')\n", - " computed_df = pd.read_csv(computed_data_name,comment='#',names=['i', 'j','DDG', 'error'] )\n", - " computed_df.i = computed_df.i.astype(str)\n", - " computed_df.j = computed_df.j.astype(str)\n", - " experi_df = pd.read_csv(experi_data_name, names=['name', 'dG'])\n", - " experi_df.name = experi_df.name.astype(str)\n", - " computed = []\n", - " error_comput = []\n", - " experiment = []\n", - " for index, row in computed_df.iterrows():\n", - " i = experi_df.loc[experi_df['name'] == row['i']]\n", - " j = experi_df.loc[experi_df['name'] == row['j']]\n", - " if str(row['i']).lower().startswith('mk') or str(row['j']).lower().startswith('mk'):\n", - " continue\n", - " elif str(row['i']).endswith('mk') or str(row['j']).endswith('mk'):\n", - " continue\n", - " else:\n", - " ddG = j['dG'].values[0]-i['dG'].values[0]\n", - " experiment.append(ddG)\n", - " computed.append(row['DDG'])\n", - " error_comput.append(row['error'])\n", - " return experiment, computed, error_comput" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "## Plotting data" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "### Bace" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 6, - "metadata": {}, - "outputs": [ - { - "data": { - "image/png": "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\n", - "text/plain": [ - "
" - ] - }, - "metadata": { - "needs_background": "light" - }, - "output_type": "display_data" - } - ], - "source": [ - "X,Y,error = extract_computed_experimental()\n", - "RMSE_start, MUE_start, R_start, rho_start, tau_start = plotting_data(X,Y,error)" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "### CDK2" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 7, - "metadata": {}, - "outputs": [ - { - "data": { - "image/png": "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\n", - "text/plain": [ - "
" - ] - }, - "metadata": { - "needs_background": "light" - }, - "output_type": "display_data" - } - ], - "source": [ - "X,Y,error = extract_computed_experimental(name='cdk2')\n", - "RMSE_start, MUE_start, R_start, rho_start, tau_start = plotting_data(X,Y,error)" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "### jnk1" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 8, - "metadata": {}, - "outputs": [ - { - "data": { - "image/png": "iVBORw0KGgoAAAANSUhEUgAAAZAAAAHkCAYAAAAQDHkbAAAABHNCSVQICAgIfAhkiAAAAAlwSFlzAAALEgAACxIB0t1+/AAAADh0RVh0U29mdHdhcmUAbWF0cGxvdGxpYiB2ZXJzaW9uMy4xLjAsIGh0dHA6Ly9tYXRwbG90bGliLm9yZy+17YcXAAAgAElEQVR4nOzdeXhbZ5X48e/xEnm3Yydx4iSN2yTNTjfokjRJWUpYZqDAPMDALBQYKDAM8Bs607LDsBQKw86UsrTsMANtGShQhkJa2nQodNJiO3tiJ47jOIn3Tfv5/XElV1YkW5KvLMk+n+fRY+vq6t5Xsq3je8897xFVxRhjjElXUa4HYIwxpjBZADHGGJMRCyDGGGMyYgHEGGNMRiyAGGOMyYgFEGOMMRmxAGKMMSYjFkDMvCcid4uIRm4hETkpIt8WkeUJ1vlJguffEHksGLf8JSLyiIj0icioiBwRke+JSE3k8eaY/cbf3j3FeJdFttMmIkER+U2Kr/NlIvJLETkd2cffpP4uGXM+CyDGOH4PLAMuAF4DXAb8V9w6J4C/FJHGuOVvAo7HLhCR5wD3AP8DXAs8A3gbMAR44p7/0si+Y29fmWKsHqAP+HcgpeARUQU8DrwljecYk1RJrgdgTJ7wq+rpyPddInIn8AURqVHVocjywziB4nXAJwFE5ALgeuCjwPtjtvcS4ElV/XDMsqPAAwn23Rez72mpagfw9sj+twMrUnzed6Lfi0iquzMmKTsCMSaOiDQBfwWEIrdYdwJvlKc/gd8IPEjcEQjQDawRkStdGE+HiNw90+0Y4zYLIMY4rhOREREZA7qAHcDnVHU0br0fA/WR9YuB1+MElXhfBB4G/iAi3SJyn4i8Q0QaEqz768i+Y2/XxDx+FCcgGZNX7BSWMY4/AH8PlAGvxDkt9f74lVTVKyLfAf4BqMb5G/oZ8Nq49caAl4hIM3AdcCVwK/B+EdmuqvtjVr8ReCJuVydjtvXcGbwuY7LGAogxjnFVPRL5vlVELga+jHOEEe+rwF6chPtdqhpIllOI5CvuBu4WkfcCh4B/wQkaUV0x+zamYNgpLGMS+xDw9yLyzPgHIkcPfwS2Al9PdYOq2g+cBpa4NEZjcsqOQIxJQFUPiMjPgU/gnM6KtwsoU9W+RM8XkQ/hXDZ7P9AR+f7vgc3A5+NWrxeRpXHLRlV1OLKtB4HHVfXWmO1fGn0uUBW9r6pPRh5fjpPcv1VV740sq8c5aoq6IPK8PlU9keStMCYpCyDGJPcp4BEROS8HEclxjE3x3IeAm4C7gKXACHAQ+BtV/V7cuj9N8PwvA/8Y+X410Bn3+N4k96Pn0kqBdUBtzDoviYwn6mOR27dwLk02Ji1iHQmNMcZkwnIgxhhjMmIBxBhjTEYsgBhjjMmIBRBjjDEZsQBijDEmIxZAjImI6cXxlwkeuy/y2Ndjlu2OvR+zfEVk3esi9zPq+xF57sUi8oCIjInIORG5Q0Qqp3lOhYh8VkROiMi4iBwVkQ9H5u6KrrNDRH4qIscj43hfCm+RMZNYHYgxk53AmefqZ9EFIrIMeBHn12Kk66U4/ThiDSVaMbLfKpxiwD/jVL3XA98E6oBXT7Gf24EbcKZLOQQ8E6f+w4tTGAlOYeM+4PvA59J8HcYAFkCMifdN4H0islxVuyLL3oDTcKo4+dNSklbfD5zGVouA16jqIICIvA34uYjcqqrtSZ63Dfihqv46cr9DRP4aZ0JHAFT1F8AvItv8ZJqvwxjATmEZE+8oThX5jQAiUoQTQL6W7R0n6PuxDXgsGjwifg2EI48l8wjwQhG5MLLdS3G6It7v7ojNfGcBxJjz3Qm8IRI8no8zbfs9Lmw33b4fy3AmX5ygqgGcdrbLptjPu4DdwDERCQD/B3xJVVOe+NGYVNgpLGPOdy9OQ6jn4fQ7/5aq+l1oA+tm34+p5iB6K/AC4BU4bXivAD4rIj2qmqj5lTEZsQBiTJxIf49vAe8FrgGekWRVH5MnK4yqi3z1xi1Pt+9HN7AydoGIlOIk0xPmUkSkDGcSyL9T1ehRU4uIrAQ+QOLuicZkxE5hGZPYncB24H9V9UCSdQ4AV8ReHhtxJU6e4vAMx/AocI2I1MQsux7n7/bRJM8pjdzCcctDPD1TrzGusABiTAKRI4VFOKeCkrkDZ6r2u0TkChFZLSKvBj4OfFtVe+PWrxeRpXG36uiDIvKgiHwiZv3vA+eA74vIJSLybJxp3n8UvQJLRJaLyAEReVlk3MPA74CPicj1kRqUVwD/TEweR0SqROTSSIJ9AbA0cn9NBm+XmacsgBiThKr2Rfp+JHt8P3A1zimrn+HUa7wX+HfgzQme8lOc01Kxt9iAsZqY5LiqjuDkYRYAjwE/xrkK6w0xz0nU9+PVOEn0b+IcJX0K54jqX2LWeSZOD5G9kX2+LfK9JdpNyqwfiDHGmIzYEYgxxpiMWAAxxhiTEQsgxhhjMmIBxBhjTEYsgBhjjMmIBRBjjDEZsQBiTAbimkKNicg+Efl/KT53mYj8p4gMRW4/FJEl0zznZhF5TET6RWRARB4RkfOKHCPNpG6LzOzrF5EuEflwpq/TmKnYXFjGZO4fgZ8A5Tiz9n5JREammrAwMsPvz3GmGrkeZ3qRrwD3icg2TV6Y9RycwsA/AuM4Ta9+LiI7VfXRyLaLcaZsr8EpZDyIU02/aKYv1JhErJDQmAyIiAJ/q6rfjVn2BNChqq+Y4nnPBx4A1qvqwciyTUAr8GxV3Z3GGFqAX6vqP0fu3wh8HlijqmfSf1XGpMdOYRkzQ+J4LrAB8Mc9tltEdscs2ga0R4MHgKq24Uzrfm0a+yzC6VNyLmbxK3Ba5r4j0g/9mIh8TUQa0n1NxqTCTmEZk7mvi8gdgAfnb2mM8/uLn4i7f16TqIjTTN0kKt57cObg+k7MstXAhUAQeCVQCXwW+KmIbJ/i9JgxGbEAYkzm3oszQeJS4DbgJ6r6h9gVVPXv0theSh/wIvJWnADyElU9GfNQMU5O5dWqOhBZ9/U4eZPLcDoTGuMaO4VlTOZ6VPWIqj4CvAz4oIhcN81zunECTrxGkjSJiiUi7wZuxwkev4l7+BTQHQ0eEW2Rr6um27Yx6bIAYowLVPUsztVUn5epe98+ClwoImujC0RkA07nwUem2oeIfAT4IPCiBMED4Pc4fT1iG1Cti3ztmPZFGJMmCyDGuOcLOB/Yr4kuEJFvi8i3Y9b5Dc6ppO+KyJUichVOHuN/gYdinndARP4x5v7ngJuBvwUOxjSkiu0D8hWcS3y/JSKbReRK4GuR7T7p8ms1xgKIMW5R1dM4weAjkd7lABdEbtF1wsBf4CTXHwT+BzgKvDQuyb2OyfUb7wDKgHuZ3JDq8zHb7sapF6nDuRrrXuAp4OWWQDfZYHUgxhhjMmJHIMYYYzJiAcQYY0xGLIAYY4zJiAUQY4wxGbEAYkwaROS6yBTuK3I9FmNyzQKIMXlERK4SkT0i4hWRbhH5RGSa9mTr14nI50SkTURGReS0iPxERNYnWHeViHxPRM5Ftn9IRG7I7isyc5kFEGNSJCILsrz9lTh1IQeBK4C34PT1+NgUT1uGM4HiB4DLcWpMqoDfisjCmG0vxylWlMg663F6inS6/kLMvGF1IMYkICLNQDvwN8BrgZ3Af+A0g/odTgOp9wPPxJkm5F2q+kDM89cB/x55HpHnvEtVj0yxz48DfwdcECk4RETeBnwKWKKqoymOvQFnmveXqOrPIsu+BVysqteksg1jUmFHIMZM7ZPA94EtwJdjln8a+DhwCfAn4EciUgcgIuXAr3Eqx3dGblXAr2KPYiK5lA/FbHMbToOocMyyXwEVOLPppio6vcm5yH6KgBuAx0TkByJyRkRaRORWEbEZuU3GLIAYM7Wvqup3VfWYqrbHLP+wqv5KVQ8D/4LzoX1V5LHXAIuBV6nqE6r6BPBqYHnka9RBJjeEStQr5HTMY9OK5Eu+gjOFe3Rq+cU4bW7finPKahfO9PM3A9Yv3WTM/vswZmqPJ1k+MTmhqp4WkRDOlOwAm4B9qnouZp0eETkYeSy67LxEdwIa9zWpSPD4NnAxsCPmSCaahP+zqv5L5Pu9IrIM5zTce1MYhzHnsSMQY6aWLO/gT7As9u8p0Qe+JFkelahXSPT+lL1CIqfG/hPnKOi6uEZTZ4EAsC/uaW1ATWyy3Zh0WAAxxn1twCYRmZhNV0QacY4M2pI+y+kVcn0kZxH1ApxWuXuTPUlEKoD/BjbiHHlMaqOrqgGc01nr4p66DhhU1f5pX5ExCVgAMcZ938f5r/9HInK5iFwB/BDoAn4UXSm+5wfOVV61wNdEZJOIvAT4N+CL0SuwIj1EDkR6fSAi1cADOMHgVUA4pldIecy2PwFcJSIfEJE1kW2/l5jp4I1JlwUQY1ymquM4l/n6gIdxGjqNAi9Q1dhTX5N6fqhqZ+R5G4AngDsjt9gcRUXkeRWR+1cA1wLNOL0/YnuFvCpm278A/hp4JdAKfCZy+7eZv2IzX1kdiDHGmIzYEYgxxpiMWAAxxhiTEQsgxhhjMmIBxBhjTEYsgBhjjMmIBRBjEhCRFZHJDq+b5f2+TkQOiogvUu/x2hSe8zkR+YOIjIlIMMk6F4nIjyMTKY6KyF4ReXWidY1JlQUQY/JEpLnTN4A7cGb5/RrwbRF54TRPLcYpXvzKFOv8DKfm5IU4MwvfA3xfRLbOdNxm/rI6EGMSEJH4P4zjqtosIhfiFOBdDdQBR4FPqep3Yp67Gziiqm+MWfY+4I2q2jzFPvcAHar6mphl/wUsVtXrUhjz64Cvq2pJ3PI6oJ+Y/iCR5b3AR1TVqtFNRuwIxJjELo98fQXOVOrPityvAh7EmaNqC06l+F0i8ux0Nh7TW/26yP0FkX38Km7VXwFXT9XWdjqqOoBTff5aEakVkaLI6auKyGsxJiM2nbsxiZ2NfO1T1YmZcFW1BWiJWe+LIvI8nB4gv0tj+2M4/UDGIvcX4fw9JuoH4gHqY8aUietxZusdAIKR/b5CVVtnsE0zz1kAMSYNkZlvPwD8Jc6RyQKcD/h0ggeq+jhOX/KUn5LO9mOJiABfwgkc1wGDwMuBH4rIsyMNr4xJmwUQY9JzO/BS4J+BAziTJH6Gp9vIAoRxen/EKp1mu+dwPuDj+4E04kzKOJMp159N5FRczNHUkyKyDXgXTt93Y9JmORBjEovOmhufe9gBfE9Vf6SqTwHHcPp8xDoDNMUtu5wpRGbp/SNOu9lYLwD+V1VDqQ48gcrI1/hthDg/0BmTMgsgxiR2DhgBnh/prRHt2ncQeGmkL8dGnCR6fLD4DfA8EXllpPfGLcD22BXi+3pEfAp4lYi8Q0TWicj/wznV9MmY5/2jiByI29YaEbkUuCBy/9LIrSqyyh6c/Mndkf4ka0TkX4DnAfdm+P4YYwHEmEQi/cTfhtM/o5OnOwK+CziOk/N4EKdJ1I/jnv4t4Ms4eYc/ASuBL8StE9/XA1W9D3hjZL8twJuB16nqL2Oet4jzOwt+PTK+D+McMe2N3J4Z2W4vTp8RcJpPPQm8FniDqsaP3ZiUWR2IMcaYjNgRiDHGmIxYADHGGJMRCyDGGGMyYgHEGGNMRiyAGGOMyYgFEGOMMRmxAGKMMSYjFkCMMcZkxAKIMcaYjFgAMcYYkxELIMYYYzJiAcQYY0xGLIAYY4zJiAUQY4wxGbEAYowxJiMWQIwxxmTEAogxxpiMWAAxxhiTEQsgxhhjMmIBxBhjTEbmRQARkRIRaRaRklyPxRhj5or58oG6Amhvb2/P9TiMMabQSLIH5sURiDHGGPdZADHGGJMRCyDGGGMyYgHEGGNMRiyAGGOMyYgFEGOMMRmxAGKMMSYjFkCMMcZkxAKIMcaYjFgAMcYYk5GCCSAi8mEROSQi4yLSIyLfE5GluR6XMcbMVwUTQIADwJuBDcBfAhcA38rpiIwxZh4rmMkUVfUHMXc7RORTwA+SrW+MMSa7CiaAxBKRWuA1wKMJHqsD6uIWr5iNcRljzHxSSKewEJHXisgIMABcCPx1gtXeCbTH3X4/a4M0xpg80nzL/TTfcn9Wtl1QAQT4b+Ay4LlAAPhqgnU+hxNcYm/bZ2uAxhgzXxTUKSxVHQaGgcMichA4KSIbVXVfzDoDOEcoE0SS9kMxxpg56769XRPfb7vtt9y8ax03XLbcte0X2hFIrGhUCOV0FMYYk4fu29vFrfe0TNzvGhjn1ntaJgWVmSqIACIipSLyMRF5loisEpFrge8A/wcczvHwjDEm79z+wEHGA5P/vx4PhLj9gYOu7aMgAgigOPUf/w0cAr4HHAH+QlXDuRyYMcbko1MD42ktz0RB5EBUNQi8PNfjMMaYQtFUV05XgmDRVFfu2j4K5QjEGGNMGm7etY7y0uJJy8pLi7l51zrX9lEQRyDGGGPSE73a6p0/ehKA5XXldhWWMcaY1MQGi0dveY6rwQPsCMQYY+a0jttenLVt2xGIMcaYjFgAMcYYkxELIMYYYzJiAcQYY0xGLIAYY4zJiAUQY4wxGbEAYowxJiMWQIwxxmTEAogxxpiMWAAxxhiTEQsgxhhjMmIBxBhjTEYsgBhjzBymqqhqVrZtAcQYY+YgVWVsbIyTJ0/S19eXlX3YdO7GGDOHhMNhRkdH6e3tJRAIoKqUlZVlZV8WQIwxZg4Ih8OMjIzQ29tLMBjE4/FQWVmJ1+vN2j4tgBhjTAELhUIMDQ3R19dHOBymrKwMj8czK/u2AGKMMQUoGAwyODjIwMAAAB6Ph6Ki2U1rWwAxxpgC4vf7JwJHUVFRTgJHlAUQY4wpAD6fj/7+foaHhykuLqaiogIRyemYLIAYY0yeUlW8Xi/9/f2MjIxQUlKSF4EjygKIMcbkGVVlfHyc3t5evF4vJSUlVFVV5XpY57EAYowxeUJVGRkZob+/H5/PR2lpKZWVlbkeVlIWQIwxJsdiazhCoRALFizI68ARZQHEGGNyJBQKMTw8PFHDsWDBglmr4XCDBRBjjJll0RqO/v5+AMrKynJ2Ke5MWAAxxphZEggEGBgYYHBwEBEp2MARZQHEGGOyzOfzMTAwwNDQEMXFxZSXl+fNpbgzYQHEGGOyJLaGI1+K/9xkAcQYY1wUW8MxPj6e95fizoQFEGOMcYGqMjo6Sl9f30QNRz4W/7nJAogxxsxAtIajr6+PQCBQMDUcbiiI9L+IvFdEnhSRURE5KSJfEJG5HdqNMXktFAoxMDBAR0cHPT09FBUVUVlZSWlpaa6HNmsK5QhkK/Ap4AmgEbgTqAZuzOWgjDHzTzAYZGhoiP7+flQVj8eTtZax+a4gAoiqvjjm7kEReT/w1VyNxxgz/wQCgUkNnAq9hsMNBRFAElgEDOR6EMaYuc/v908U/xUVFVngiFFwAUREaoF3A99M8ngdUBe3eEW2x2WMmVvmeg2HGwoqgIiIB/gJcAy4Lclq7wQ+OGuDMsYUlOZb7geg47YXn/dYtIFTX18fY2NjedfAKd8UTAARkRLghzjJ8+eqajDJqp8D7o5btgL4ffZGZ4wpZKrK2NgYvb29BdGHI18URAARkSLg28AaYKeqjiRbV1UHiMuP2H8PxhiA+/Z2TXy/7bbf8u7r1/K8i+vo7e2ddzUcbiiUTNCdwHXA3wILRGRp5Fac22EZYwrFfXu7uPWelon7XQPj3HJvC9975NC8rOFwQ6EEkDcAy4C9QHfMbWUuB2WMKRy3P3CQ8UBo0jJfULnr/3opKSmIkzF5pyDeNVW1c1DGmIwFAgFODYwnfOzMcGCWRzN3FEQAMcaYTMTWcCyuKuHMyPnX3iypttNWmSqUU1jGGJMyr9fL6dOnOXHiBMPDw1RUVPCWbcvxlEw+meEpEW7a2pSjURY+OwIxxswJ8TUc8Z3/dq2rB+DDDxwHoLG6lJu2Nk0sN+mzIxAzpzXfcv9E4ZiZm6J9OE6ePMnJkycJBAJUVlZSVlZ23iX8u9bVs+efLgOgZzhgwWOGpj0CEZH3ZLDdL6vqYAbPM8aYlITDYUZHR62GI4dSOYX1UeAkEJpuxYiVOBXjFkBMTsUXjd28ax03XLY8hyMybog2cOrt7SUYDOLxeNIKHA8c7Jv4/mV3tdpprBlINQfyTFU9k8qKIjI8g/EY44pERWPR+xZEClMoFGJoaIi+vj7C4TBlZWV4PJ60tvHAwT5ue/DExP2e4cDEfQsi6UslB/IZYDSNbX4e6M9sOMa4I1HR2HggxO0PHMzRiEymgsEgvb29dHR00NfXN3HEUVyc/kQUd+w5hS+ok5b5gsode065Ndx5ZdojEFW9OZ0Nqur7Mh+OMe5IVjSWbLk531Sz1s4Gv98/0cCpqKgIj8cz4z4cyYoGrZgwM3YZr5mTmurK6UoQLJrqynMwGpMOn89Hf38/w8PDFBUVuTqd+pLqUnoSBAsrJsxMKldh/TrVjanq82c2HGPccfOuddx6T8uk01jlpcXcvGtdDkdVOGb7AoTYGo7R0dGs9eG4aWsTtz14YtJpLCsmzFwqRyBd069iTH6Jfti980dPArC8rtyuwkrRbF6AoKqMj4/T29uL1+ulpKSEqqoqV/cRy4oJ3SWqOv1aBU5EmoH29vZ2mpubczsYM6tyfR6/EG277bcJT/8tryvn0Vue48o+VJWRkRH6+vrw+/2UlpayYMECV7adiq1f2AswUVQ4l3m9Xqqrq1m8eHGmm0h6GJh2DkREng28F9gEKNAGfExVd2c6OmOyxQJH+rJ5AcJMazjcMh8Cx2xI65IGEflr4DfAEE5P8k8BI8BvRORV7g/PGDPbkl1oMJMLEEKhEP39/XR0dNDT00NJSQmVlZXWh6PApXtN3PuA96nqy1X186r6OVV9GfAB4P3uD88YM9tu3rWO8tLJNRaZXoAQreFob2+nt7d3YrqRTGo4TP5JN/yvAf4rwfL/xAkixpgC58YFCIFAYKIPh4hQVlY24xoOk3/S/YmeBZ6RYPmlkceMMXNAbLB49JbnpBw8fD4fPT09dHR0MDw8THl5OeXl5RY8cmR8fJw///nPWdt+ukcg3wW+KiKLgd/jJNF3Av8GfM3lsRkzK3J1pVa+XyGWzri8Xi/9/f2MjIxQXFyclRoOk7qhoSFaW1spLi5mzZo1WdtPugHkfUAxznxXpTiXd/mAL2CnsEwBytWMvbH7veJDv+D9L72k4GpUEtVw2HTqudXX10dbWxvl5eVcfvnllJWV4fV6s7a/tAKIqgaBm0XkAzj5EIAjqmoTDJmCk6sZe+P32+vVgpopONrAqa+vD5/PR2lpqQWOHOvu7ubQoUMsXLiQa665ZtaubstoL5GA0TLtisbksalm7M3mB3mu9jtT8TUc1sApt1SVEydO0N7eTmNjI9u3b5/1XFMmhYS7gOcCS4hLwqvq37k0rjkv389/zwe5mrE30/3m6ncmFAoxPDxMX18foVAIj8eTdh8O4x5V5ciRI3R1dbFy5Up27tyZs3xTWgFERD4KvAf4M3AaJ4luTEHK1Yy9hTJTcDAYnGjgBODxeCgrK8vxqOavUCjE/v376e3tZc2aNVx33XW5HlLal/G+CXidql6qqi9Q1RfG3rIxwLkoPnEbe9/MHjcL5rK939n8nQkEApw7d26igVNZWRkVFRVW/Jcjfr+fvXv38uijj9LY2MjOnTtZvjw/TnWmeworDOzJxkDmC2u1mj9yNWNv/H6XVi/glhdtTLrf2fqd8fl8DA4OMjg4SFFREeXl5XYpbg6Nj4/T2tqK3+9n06ZN1NXV5XpI50n3COQrwBuzMZD5wlqt5pdMC+bc3O/XXrJ0yv1m+3fG6/XS3d3NiRMnGBkZoaKiwoJHDg0PD/PYY4/x1FNPsWHDBrZt25aXwQPSPwL5N+DnIvIUTh5kUmsvVX29WwObq6zVav7J1YUM0f3u3r17yvWy8TsT28BpbGwsaw2c4s2nadTT1dfXx759+/B4PFx22WUFkW9KN4B8BHghsA9YhiXR01YoCVSTP9z8nVFVxsbG6O3ttRqOPNHT08PBgwepqanhqquuorS0cNrrpnsK6x+B16vqZlV9nqpeH3vLxgDnmlwlbk3+2rBhw5SPu/E7Ew6HGR4e5vjx45w6dQpVpbKyclabOD1wsG/i+5fd1Trp/nyjqnR2drJ79256e3vZtm0bl156aUEFD0j/CMQPPJKNgcwX1mrVxOvt7aWxsTHp4zP5nQmFQhPFf9EajlwccTxwsI/bHjwxcb9nODBxfz61k1VVjh49ysmTJ1mxYkVOazjckO4RyJ3AG7IxkPkkV4lbk5/OnDkz7Trp/s4Eg8GJBk5nz56dOFWVqwZOd+w5hS84+Yy3L6jcsedUTsYz20KhEPv27ePhhx/G4/Gwc+dO1qxZU9DBA9I/AlkGvCJSjf4U5yfR3+TWwOY6q0A36UrldyYQCDA4OMjAwABA3vThODMcSGv5XBEIBGhra2NoaIh169axcePGXA/JVekGkNXAk5Hvm+Mes4S6MRm4+OKLZ7wNv98/0cCpqKgobwJH1JLqUnoSBIsl1YV1zj9VXq+XlpYWfD4fGzdupL5+bp6mS3c23mdnayDGzFfDw8MZP9fr9TIwMMDw8DBFRUV524fjpq1N3PbgiUmnsTwlwk1bm3I4KveNjo7S0tKCqrJ582aqq6tzPaSsSimAiMiPgXuAn6vqUHaHZMz80t3dzbp1qV9RFV/DUQgNnKKJ8g8/cByAxupSbtraNGcS6P39/bS1teHxeLjkkksoL58fl+WnegTSBvwrcJeI7AbuBX6qqt3ZGpgxZrJoDUdfXx9er7fgajh2raufCCD33rg5x6Nxx5kzZzhw4ADV1dVceeWVs3pZdD4Q1dRTFyKyGnhZ5PYs4E84weReVT2SlRE+ve+XA28DngnUqGrK/26JSDPQ3t7eTnNzc1bGZ+ae2Zo+vbOzk5UrVyZ9PBwOMzo6Sm9vL4FAgAULFhRcvcBc09XVxZEjR2hoaGDDhg15PdGk1+ulurqaxYsXZ7qJpJ+16eZAjgKfBj4tIkuBG4CXAx8TkYM4weRuVT2W6UinUAH8FvgN8PEsbN+YnPD7/QmXR4v/+vr6CAaDOavhMA5V5dixY3R2drJ8+XJ27NiR16cNZ0PGl2mo6gbPmSkAACAASURBVGlVvUNVnw80Ap8CNuMEFNep6ndV9WPAY9nYvjGxZnP69M7Ozkn3Q6EQ/f39tLe3c+bMmYle47mq4ZjvwuEw+/fv5+GHH6akpISdO3eydu3aeR88IMOWtvFUtR/4TuRmTEHL1ZT7gUCAoaEhBgYGUNW8uxR3vgkGg+zbt4+BgQHWrl077ZQz89G0AUREfp3itlRVd81wPDMmInVA/NzHK3IxFlOYZrtneVNTE2fPnmVgYICioiI8Ho8Fjhzy+Xy0tLQwPj7Opk2beMYznpHrIeWtVI5ACq1d3juBD+Z6EKZwzdaU+z6fj/7+frq6urJ2Ka5Nn566sbExWlpaCIVCbN68mZqamlwPKe9NG0BU9cbZGIiLPgfcHbdsBfD72R+KKUTZnHI/UQ3HuXPn0qoDSVX87Ldzqe7CTYODg7S2tlJaWsoznvGMeVPD4YY5l5VT1QFgIHaZJbtMOm7etY5b72mZdBprplPuqyrj4+P09vaeV8ORjd9Pm/12eufOnWPfvn1UVVXxzGc+E4/Hk+shFZy0A4iILAReAKwCJlXNqOpHXBpXov3WAxcAayL3L408tE9VE18HaUwG3JxyX1UnplMPBAIJi/+amtyfzmOq2W/newA5deoUhw8fpqGhga1bt9rVbTOQ1jsnIs8CfoVTWFIDnAWWAGNAN07Hwmx5CXBXzP29ka8XAh1Z3K+Zh264bPmMEubhcHgicExXw+FWUWBsvmO+zn6bjKrS0dHB8ePHWbZsGdu3b7cLFVyQbui9HfgJcBMwCGzDaTL1feCz7g5tMlW9m/NzG8bklVAoxNDQEP39/YRCIcrKyqY9NXL8+HGWL3f36q75NvttMuFwmMOHD9Pd3c2qVasKvoFTvkk3gFwKvEVVwyISBhao6jER+VfgmziV6MbMO8FgcKIPRy5qOOIT5tuaa7h/f9+cn/02mWAwyP79++nr62Pt2rVZuUjBpB9AQjhHHABngJXAAeAcTk7EmHnF7/czODjI4OAgIpJRDceSJUtmNIZECfP79/fx4g313NPSC8y92W+T8fl8tLW1MTIywsaNG9myZUuuhzSnpRtA/oxzFHIU+F/gPSJSBPwDcNDlsRmTt6I1HMPDwxQXF1NeXp7xqZGqqqoZjSVZwvzRjqc7L8yV2W+TGR8fp6WlhUAgwObNm6mtrc31kOaFdAPIx4Dob/v7gfuBX+Ik0//KxXEZk5e8Xi/9/f2MjIy4Vvx37Ngxli5dmvHzp0qY51MBYTaKGoeGhmhtbaW4uJgtW7ZQUVHh2rbN9NKdjfc3Md93AJsil9f2azrzwhtTQOJrOKKTG+aL+Zgw7+3tZd++fVRUVHDFFVdYDUeOzDjLp6p9FjzMXBSt4ejs7KSrq4tQKERlZaXrH1aLFi2a0fNv2tqEp2TyUVC+Jczjk/yx99PR3d3Nww8/TFdXF9dcc40FjxxLtw7kP4EnVfXjcctvAS5T1Ve5OThjciG2hiMUCrFgwYKsHnEsXLhwRs/P93axM62KV1VOnDhBe3s7S5cu5dprr7UajjyR7k9hJ/CLBMt/CeyY+XCMyZ1QKMTAwAAdHR2cOXNmIseR7Urlw4cPz3gbsR/E9964OW+CB0xdFT8VVeXw4cM89NBDhEIhdu7cyfr16y145JF0/zJqgZEEy8eAmf0bZUyOBINBhoaG6OtzTqt4PJ68blGaTD4lzGOlWxUfCoW46gP3ERob4OfvfgHXXXddFkdnZiLdAHIUuB6I739+PdDuyoiMmSWBQGCi+A/IWQOnmZ7CynepJvn9fj9tbW3OpdFVC1nQeJHrFfrGXekGkK8AnxSRMuB/AAV2AR8C3uvu0IzJDp/Px8DAAENDQxQVFc2ohsMNixcvztm+Z8NNW5u47cETSavix8fHaW1txefzsXnzZv7QE6a40snn2DT0+S3dy3i/LCJLcOpBPh1Z7AM+o6pfdHtwxrgpGzUcbjh69OiMr8TKZ8mS/FubSnnssccQEbZs2UJlZaVNQ19g0j5eV9UPAouAqyO3xar6/shRiTF5RVUZGxujq6uLzs5OvF4vFRUVlJWV5UXwAOec/1wX++H/jZc2UXGmjYMHD3LZZZdx9dVXT1zllmnC3eRGupfxfkZV/1lVx4A/xiwvA36GkwuZd5pvuR+AjttenOORmKho4Ojt7cXn8yXsw5Ev5kvr1Htf1cTBgwfp7Ozk6quvTjiNvU1DX1jSzYG8WkROqepnogtEZAFwH85RiTE5FQ6HGR0dnWjglO0aDjc0NjbmeghZo6qcPHmSY8eOsXjxYrZt2zblFW7zsaq+kKV7CuvFwPtE5DUAIlIK3IPTc/x5Lo+tINy3t2vi+223/XbSfTN7QqEQg4ODdHR0cPr0aYqKiqisrHStWVM2dXR05HoIrlNVjhw5wkMPPYTP52PHjh1s3Lhx2sujC6Gq3jwt3ST6kyLyV8C9IjIAvAlYDVynqr3ZGGA+u29vF7fe0zJxv2tgfOL+TLrZmdQFg0GGh4fp6+tDVfF4PJSVFVY6LhCYO6dnQqEQBw4c4Ny5c1x00UVpN3DK96p6M1naJbaq+qCIvAn4b+AYsENVe1wfWQG4/YGDjAcmJ0DHAyFuf+CgBZAsy5caDjfMdDr3fBAIBGhra2NoaIh169axadOmjLe1a139RACZ69PQz4ZsTlU4bQARkTuTPNSNU1D4keh/GKr6JveGlv9ODYyntdzMnN/vZ2BggMHBQYqKigo6cEQtW7Ys10PImNfrpaWlBZ/Px8aNG6mvn/mRQjamfZ+P/H4/fr+fsrKyrF2okcoRyNoky48A5TGPz7sZeZvqyulKECya6spzMJq5LV9rONzQ2dlZcMWEIyMjtLQ4p2u3bNni2lFU/Ky9dvoqPaqK3+8nGAxSUVFBY2NjVi9ZnzaAqOqzs7LnOeDmXeu49Z6WSaexykuLuXmX9V92g6ri9Xrp6+tjbGxszgWOKK/Xm+shpKy/v5+2tjY8Hg+XXnop5eXu/bNkRYSZU1V8Ph+hUIiqqioWLlw4K7nA7E4zOsdF8xzv/NGTACyvK+fmXess/zFDsTUcXq+3IC7FnYlCSPqfOXOGAwcOUFNTw5VXXsmCBQtc38dURYQWQBILh8P4fD7C4TA1NTUsXLgwKz+bZFLJgbwI+B9VTelSERF5PvCwqhbOv1UzcMNlyy1guCRRDcdcSDBPZ+XKlRPf59v5/5MnT3L06FEaGhqmreFIxVSvz4oIUxcOhyeOXOvq6qitrc3JJeupHIH8DFiK0/c8FT8GLsW5QsuYaYXD4YlLcYPBIB6PZ04fccTr7u7OqxyIqnLs2DE6OztZsWIFO3bsmJXThlZEOL1QKITP5wOgvr6empqarPermUoqexbg30Uk1UuLrL+kSUkoFJrowxEOhykrK5uX7UlHRpwWO7lOIIfDYQ4ePMiZM2e48MIL067hmM50r2+6WXvns2AwiM/no7i4mEWLFlFdXZ0XPWtSCSAP41Sap2oPYNexmqSiNRyDg4Oo6py4FHcmSktLc5pADgaDtLW1MTg4yMUXX8yGDRtc30cqr8+KCM8XCATw+/2UlJTQ2NhIVVVVXv2tSDaLTPKFiDQD7e3t7TQ3N+d2MPNYfA2Hx+PJqz+GXDl79ixv+nlPwtM3jdWlWSum83q9tLa2Mj4+zqZNm1yp4UjmZXe1pvz68i0PlAt+v59AIIDH46G+vp7KyspcXn2YdMd2FZbJOp/Px7oP/gaAB/9hfc4vxc23D6ienp5ZTSCPjo6y/UP3gIbZ/YGXzcpswNO9vtifSb78XHLB5/MRCAQoLy9nyZIlOW92Nh0LICYr4ms4otysG5grhoaGWFJdk/UE8uDgIK2trZSWlrJg6RqKSrNXoRzPEuTJxddwLFu2rCAu7YYMGkoZM5VoDcfJkyc5efIkgUCAR076Jh5/2V2tk5Kpsy0+kZvLsUQVFxdndRbac+fO8fDDD3P06FGe9axn0V/rBA+YvfdgqteXjz+T2RD9J2tsbIzKykouuOCCggoeYEcgxiXJ+nDkU3VxPo0l1urVq1m0yP0EcldXF0eOHKGhoYGtW7dSUlKSs/cgWYIcyMufSTZFi/9UldraWurq6gqi7UAidgRiZiQcDjM0NMTx48cT9uHIpxal+TSWWGfPOiVWsR+Y9964OaMPUFWlvb2d3bt3O7mO7dvZvHnzRK1ALt+DRK8vX38m2RAOhxkbG8Pr9VJXV0dzczOLFy8u2OABdgRiMpRqDUe+VBdHk7SJJErkTvVct5O8/f39M952OBzm0KFDnD59mubm5qQ1HG7+PKZ7v1J5Lfny+5FNbtZw5Fv77JQCiIisAP5ZVd8Vud8CxJYKB4HnqeqJRM83c0cwGJzow5FKDUchJE/zaSzpCgaD7N+/n76+PtauXcv69eunXD/ffh75Nh43RQNHvtZwuCHVV3MTkyvMm4F7gW9Ebr3AO1wdmckrfr+fs2fP0tHRwcDAAB6Ph4qKimn/IPKhRelUSdnpErmJnut2onft2mQdE5Lz+Xw88cQTPPbYYzQ1NbFz506amqZ/T936eaTyfsW/T4key4ffD7f5/X5GR0cBWLp0Kc3NzdTU1Mw4eORj++yUCglFZC9wi6o+ELk/DFyiqsci918I3K6qedk+zAoJM+fz+ejv72d4eJji4mI8Hk/a16U/cLAvZ9XF0aRx/Hn22LEACafQePGGeu7f35fwuZ4S4ZbnXuDK6zh06BAXX3xxSuuOjY3R2tpKMBhk06ZN1NbWpr2/mf48Er2nyd6v6PsEid/j6GNzofrc5/MRDAYpKyujoaHB1RqOaPvs+NYRn3j5ltmYzDXpi0g1gPQBV6rqkcj9R4FXqmpX5P6FQKuq5uUMeBZA0jc+Pk5/fz+jo6MZB45YuSreS1YBHTuWZOsUCYSn+PNwq0p8z549bN26dcp1hoaGaG1tpbi4mC1btlBRUTGjfc7k55Hu+9UYOR01VSV6vhV3pipawxEMBqmsrKS+vj4rDZy23fbbhM3rlteV8+gtz3F1XwnMuBLdA0xcnKyq2+Ien5U5t0XkVuDtQB3wa+BNqnpmNvY9H6gq4+PjE304SkpKXJsVN9UPBrc/SJIlYyWFdaYKHlM9z029vb3s27ePiooKrrjiCtcmm5zJ+5vu+zXV+xR9rBADh9frJRwOU11dzcKFC7M6EWi+ts9O9aRcB/CMKR6/NLJO1ojIjcB7gLcBW3GCyA+yuc/5QlUZGRmhs7OTrq4uQqEQlZWVsz4zbjYKypIlY2OXJ1unaJp/It1K9F500UXnLevu7ubhhx/m1KlTXHPNNa4Gj5lK9/1aUl2a0s+hEITDYcbHxxkbG6OmpoZVq1axdOnSrP9skrXJznX77FQDyH8DHxaR8/4dFZEa4IORdbLp7cC/q+q9qvok8HrgOSKSl3mXQhCt4ejo6OD06dMAVFZWzmpHs6hkBW4zDSKpJGmTrXPD5gZKp4gi25rdmQYkOp27qnL8+HF2797N4OAg1157LVu2bMlpv4dEpnq/kr3XhZ4sjxbK+nw+6urquPDCC1m8ePGs/a3cvGsd5aWTL/3Nh/bZqf5mfgp4DXBIRL4AHIgs34jzwR4Abnd/eA4R8QCXAO+KLlPVYyLSAVwFtMasW4dzdBIrneno57xQKDTRwCkcDrNgwYKc/3ebrXamqUwRPtU6vznUT8CX+NzMox1DvDvjkT2tp6eHcDjMqVOnuOCCC1zvw+G2qd6vLU1VU77XhZYsD4VCeL1eioqKWLRoETU1NTnpw5Gv7bNTns49UgvyH8ALefrIJQz8EnirqnZmZYTOvpuALmCjqu6PWf44cK+qfiJm2YdwjojOk2kSfffu3WzYsIHe3l7OnHFSLhdffDHDw8N0d3cDznQUfr+fzk7nbYjup6OjA3Dali5YsICjR48CsGzZMqqrqzl06BAAS5YsoaGhgf37nZfX0NBAY2MjBw8eJBQKUVdXx7Jlyzh69Ch+v5/q6mpWrFhBR0cH4+PjlJeX09zczMmTJxkeHmbBggWsXr2a7u5uBgYGKC4uZvXq1Rw7dozjx50/4g0bNjA0NMS5c+cA51TKyMjIxGtctWoVgUCAU6dOTbwGYOI1NjU1UVpaOrG9JUuWUFVVxbFjTjPKRYsWsXDhQg4fPgzAwoULWbx4MUePHiUUCvFP93dTXLWQLz2vmnc8VkyiXJ0A/3FdMSMjI5SWltLc3ExPTw9DQ0MTr+ns2bMTxXhr166lv7/ftdf07j9NdYpA+cb15ZNeU01NDY2NjXR0dBAIBCYmx+vs7MTr9VJWVsZbHhggONzL51+0jK6uLjo7OydOUc3Ga0r355TKa1q5ciXd3d05+zm5/ZpKS0tZsmQJZ8+epbi4mNraWtauXTvp72ndunX09PTQ29sLkNefEY2NjTO5gGhmV2FNeoLIQmBNZKOHVbVfRC4A3qiqH8h0hNPsczlwktQCSLIjkN/P16uwog2cBgYGEJG86cMRmzBPp1/EbJrqKq5Mx3bNZx/H33OMz76oiQ0bNuD3+1m+PLf/SRpHtIFTaWkpDQ0NVFZW5sXfSo4lDSBpvzOq2q+qfwT+BOwUkV/g9D9/b+bjm9Y5nKOdJXHLFwOTrsJS1QFV7Yi94QSfecfn89HT00NHRweDg4OUl5dTXl6eF38Q8Qnzbc01eXmO/KatTQnzIMVC2mMbHx/nP37xJ1SVBcsu5rNH6/m/vmICgbkzbUehihb/FRUVsXz5clatWkV1dXVe/K3ks7TfHRFpFpGPAp3AD3Ha197i9sBiqaoPeAp4dsw4LsSpiP9DNvddiLxeL93d3Zw4cYLR0VEqKiryqjFNooT5/fv7ePGGp8+HN1aXulaoNxO71tXznusvmLSsxlPE+56/KuWxDQ8Ps2fPHr75YAv/2V5CUckCRGTiQoGftfRkY+hmGtFLcUdHRyktLWXFihWsWLEi5w3PCkmqc2EVAy8F3gw8F+fo46PADyOnsDYBn8zaKB1fAj4XqYrvAD4L/E5VW6d81jwRreGINnAqLS3N2z+EZAnzRzuGJu7n8rRVvF3r6ieSvwC/evMlKT2vr6+PtrY2ysvLufzyy7n9B0fwhSYfbfiCyi+7Sni7qyM2U4kGDlWlqqoq6zUcc1mqV2F1Aj7gu8DbVfVQ9oaUmKp+U0QagTuAWuB/gDfN9jjyTbSBU29vLz6fj9LSUqqqZqWuM2NTzcA6XUFZriqW09nf6dOnOXToELW1tVx99dUT03Une92DfvdPk8TOIFxoRXrZEu3DEQ6HJ/pw5OKS9bkk1QCyGPgdsB/I2Yy7kWT5J6ZdcR4Ih8OMjIzQ19c3qYFTIZiLM7CqKp2dnbS3t7N48WKuvfba886fJ3vdDeV2nj2bwuEwXq8XgLq6Omprawu6B0c+SfU3dwVOAPko0CMi3xSRHdkblkkmFAoxODhIR0cHPT095zVwKgSZFpXlY+tTVeXIkSM89NBDBAIBduzYwcaNGxMmX5O97uuXel0d06d/N/l/vOd+5cm8eK9mWygUmij+a2hooLm5mUWLFhXU30q+S+kIRFV7gE+IyG3ALpxTR78RkS7gO8D/ZW+IBpzeAtHiP1XF4/EUVO/kWKkU98XLt3a0oVCIAwcOcO7cOVavXp1S8V+y113de2Cqp6Xl0787wT0tvZOWjQeVf4vsM9cXJcyG2AZO0fqQXBT/zQdp14FMPFFkKfBG4A3AKkBVNS9/SoU8G29sDQcwbQOnQpJOPiNf6kQCgQBtbW0MDQ2xfv16liyJv7J8evGvu6Ojw7Xfy2u/uDfppIa5rqnJNqvhyJoZz8Z7HlU9DXxURD6GU50+7xPabvL7/QwMDDA4OEhRUdGcChxRyQJHosCS69an4+PjtLa24vP52LRpEwsXLsx4W/Gv281TKlPNIJzKe1WI06r7/X78fj9lZWU0NTXl7dWHc9GMZ2lTVRWRVuDPLoxn3vN6vfT39zMyMkJxcbH9MUTkKvE+MjJCa6tzpfjmzZuzcoXb8ePHXatEn6qHSSFfpBBPVfH7/QSDQSoqKmhsbMxKHw4ztYz/pRWRIhG5YZYq0ee0aA1HdF4kr9dLRUXFvPyDiE0AX/vFvRP3Z3s21/7+fh555BH279/PJZdcwtVXX533l0cD3LC5IeHyIqavnM/HixTiRWs4xsbGJubgWr58eV4Vys4naR+BRPIJbwRuBBqA+3Eq0bNdSDjnxNZweL3egroUNxviE8BhZeL+u589O61Pz5w5w4EDB6ipqeGqq66alSt2MsmjJBN9n2Lfx/IS4V+mqerPt4sU4lkNR35KtaVtokr0bzG5Ev3PlkRPTbS3QG9v70QNh11amDwBXCTwyNudc/LZOEevqnR1dXH06FEWLVrE+vXrZ/WqndOnT7N06VJXt5luIWG+XKQQz2o48sKMk+g5r0QvFM233A9Ax20vPu+xUCg0UfwXDAbxeDzz+ogjXrJz97HL3Q4cx44do7OzkxUrVrBjx46cnAY5duyY6wEk3fcp1xcpxAuFQvh8PkSE+vp6ampq8q6xVj6Y6vNmNhRUJXqhCoVCDA0NTTRwKisrs7l3EkiWAJ6utWy6wuEwBw4c4OzZs1x44YV538BpNuTL7ACxNRyLFi2iurraajjymFWiu+i+vV0T32+77bf85E/HOXfuHB0dHfT29k4ccdgfRGLJEsDJlqcrEAjw1FNP8cgjj1BfX8/OnTu54IILch48Fi1alNP9w+xfpBAvEAgwOjpKOByeaH5UV1dnfytTiP+8ib0/W9IqJBTnLy1aif4XOF0Co5XoP5nPOZD79nZx6z0tjAdCE8s8xcL/27GUF29aMudqOLIlNpFeJE7wiCaGM+X1emltbWV8fJxNmzZRX5/7pHCss2fPsnjx4lwPgwcO9s16y1m/308gEMDj8VBfX09lZWXOA3ohSPR5U15azCdeviUbbW7d60g48USrRJ9k222/pWtg/LzluU5CFiK3EuWjo6O0tLQQDofZsmUL1dXVbgzPdXv27GHr1q25HgYwO4WE0RqOQCBAeXk5DQ0NdhlumpJ93iyvK+fRW57j9u6sEj1boteln0rww4TcJSEL2Uw/vAYGBmhra2PBggVccskllJdP1de8sLn9gZ/twOHz+QiFQhM9yAt1PrdcS/Z5k2x5trhSiQ78InKbN6LFf9EajiVVpfSM5D4JOZ+dO3eOffv2UVVVxbOe9ayCqRPIdFqU+MK/2TjllInoP1nhcJiamhrq6ursIpIZaqorT3gE0lQ3u/8s2XVxaUpUw1FZWclN25q47cETkzrt5UNP7/mgq6uLI0eO0NDQwLZt2wou8ZpJ/iPfC//g6eI/VZ0o/rMaDnfcvGtdwhzIzbvWzeo4LICkKNrAqbe3N2ENRyZTlJvMqSrt7e2cOHGCpqYmtm/fXrAXKkQLGNORrC3wHXtO5fx3LlrDAc7RVW1trdVwuCyaKH/nj54EnNzHzbvWZSOBPiX7qaZgZGSEnp6eaWs4dq2rz/kf71wXDoc5dOgQPT09rFq1Ki9qOGaahwiFQtOvFGc2Cv/SfV1WwzG7brhs+awHjHgWQFIwMjJCUVHRnE7G5rtgMMi+ffsYGBhgzZo1rF+/PtdDck1NTU3az8mXwj94OnCUlJTQ2NhIVVVVwR4NmvTYTzlFuf4vd77y+Xw88cQTPPbYYyxfvpwdO3bQ1JQ/eSU3ZrBtbGxM+znZLvxL5XX5/X5GR0cBWLZsGc3NzdTU1FjwmEemPQIRkcNASsUiqnrxjEdkDDA2NkZLSwuhUIhNmzZRW1ub6yGdx61EdkdHR9qJ9Gzm3KZ7XT6fj2AwSFlZGUuWLLEajnkslVNY34353gO8DTgEPBJZthVYD3zJ3aGZ+WhoaIiWlhZKSkrYsmULFRUVuR5SUm4lsgOBzPIWu9bVTwQQN4tVk72u/3i0i23LF1BVVcXSpUvnZb8aM9m0AURVPxz9XkS+AtypqjfHriMin8TpDWJMUlMlZXt7e2lra6OyspJ3/6EUKSllz1XuBQ+3C+5ip0uPl24ieyaNqrJR+Jds/GdHgqxatcpqOLIk1zPrZiLdJPqrgGsSLP8G8AfgphmPyMwrp06d4vDhw9TX17N161ZKSkqQR5N/OBeCdBPZy5Yty9JIMpMsQd9UV27Bw0ySbrarGEiU55jd6hVTcOKTst995CC7d+9maGiI7du3s2XLFkpKSrLSVtXtbU71/EwS2Z2dnTMaj5vC4TCvv6LhvAR9LorU5pN8mFk3E+kGkB8AXxeR14vIBhFZLyJvAO4Efuj+8MxckCgp+/WnxvAt3cL69esnrtpJlrydyQe+29uM316sxupSbpmmdWwi0Y57uRQKhRgdHcXn8/HKqy7iEy/bMvHY8rrybM3yanh6Zt2oroFxbr2npSCCSLoB5B04QeTLQCuwL/L9j4B3uTs0M1fc8ej5SVl/CO54rHvyelMkpTPet8vbTLS9qHtv3JzRVVC5nFAwGAwyOjpKMBiksbGRCy+8kIULF/LyK1ZOrPPoLc+x4JFFtz9wcNKUJADjgRC3P3AwRyNKXVo5EFX1A+8SkfcCq3Gm+T2iqmPZGJwpbH6/n9bWVnpGINGM0PHJ2mxUV7u9zWTPm8m1SCtXrpx+JZcFAgH8fj+lpaUsXbqUysrK8+o3osncXCR3CzGhnKl8mVk3ExlV/EQCximgxYKHiTc+Ps7jjz/OH//4Ry666CIaqxPPihufbE6WfJ5JdbXb28zGGLu7u6dfySXR4r+ioiKWL1/OqlWrqK6utuK/HEo2g+5sz6ybibR+a0SkWEQ+LCL9QA9wYWT5bSLy5mwM0BSO4eFh9uzZw5///Gc2bdrEtm3bqKurS7lqOhvV1W5vMxtjHBkZyfi5qYhOpz46OkppaSkrVqxgxYoVVFRUTFvHkYvkbqEmlDN18651lJdOnjOsUC5aSPcy3n8F/h74J+CrMcv3Au+MW2bm7YFULAAAIABJREFUib6+Ptra2igvL+fyyy8/75x+qlXT2aiudnub2RhjtqY4j+3DUV1dzcKFC9O6DDdZchfIWk4kF/vMtXyZWTcT6fZEPwi8Q1V/JSLDwCWqekxENgK/V9W8LCacaUvb06dP4/V6C6ZB0Ww5ffo0hw4dora2lo0bN077QZhqMV822qpmq5DQje253RM92ocjHA5P9OHI5Hd3ltum5myf+SKP8z6utbS9ANifYHkQyP8TdiahdD4MVZXOzk7a29tZsmQJ1157bcrnz1P9sN3zT5ex9Qt72fqFvXnbqtXN7fX09LgSQMLhMF6vFxGhtraW2traaYP6VB9auUjuFnJCeabyMHBMK93MWQdwSYLl1wMHZjwaM+tSLbJTVY4cOcJDDz1EIBBgx44dbNiwISvJ12wUE+azoaGhGT0/toajoaGBVatWsWjRommDx3S5hlwkdws5oTwfpfvX/xXg8yLy/Mj9tSLyVuBjwBddHZnJulSK7EKhEG1tbTz88MOUlZVx3XXXsXr16qxNopeNYsJ8l2nTpdgajiVLltDc3MzChQtT6v6XSvFaLpK7hZxQno/SrQP5oog0APfinLL6JeAFPq6qd2VhfCaLpiqye85F1bS2tjI8PMz69evZtGlTzsc0V7s9rl69Oq31U6nhmM5UxWvR5G0ukruFnFCej9LuSKiqH4rMvrsJ5wimTVVHXR+ZybpkRXE9w34ef/xxNm7cyMKFC/NiTG62as03Z8+eTaknut/vx+/3U1ZWRlNTU0qX4UbF5zpSzTVko23qdMnifGjValKTbh3IDhEpUdVxVf2Tqj6uqqMiUiIiO7I1SBF5uYg8KCKDIpL6ZWNmSkmL4ipL2bZt26wHD8hOoV6+6+/vT/qYquLz+SZqOFauXMnKlSuprKyc0WlEyzUYN6SbA/kdkOg8Qm3ksWypAH4L3JbFfcw7N21twlN8flHcW67N3X9/2W7VWiiiNRxjY2OUlZWxcuVKli9fnlH3v0TJ8lzlGuZbkeBcl24AERK3t60Fsjaliap+V1U/BjyWrX3MN2fOnKG8p5W/XqNEa4EynU3WTbvW1XPLcy+YuJ8PY8q2tWvXTnwfDocZHx9nbGyMqqoqVq1axbJlyzKecHGqwrxPvHx2Z9wt5FlnTWIp5UBE5JuRbxX4gojEnigtBq4AnnB5bBkRkTqgLm7xilyMJd+oKl1dXRw9epRFixaxbds2dhQXc/dBpw7EzbaoM5GtVq35qr+/n4aGholp3evq6lKq4UjFVMnyR295zkSyejaK9FJJ3JvCkmoSPTpdqABNgD/mMT+wG/iMe8OakXcCH8z1IPKJqnL06FFOnjzJihUr2LFjx6TTINloizpT+TimbAiFQrz6zscou2CUvf+6lerq6pQuw03VdMny2Sxem89FgnNVSr+pqno9gIjchTOVycwqnyJE5G6cubWS+Zaqvi7NzX4OuDtu2Qrg92lup+CFw2EOHDjA2bNnueiii9i5c2fW6jdMeoLBID6fb1INSDYuWmiqK084NUgukuX5NBbjjrRyIKp6o1vBI+IdwLIpbu9Id4OqOqCqHbE34KR7Q85/gUCAp556ikceeYT6+np27tzJypUrLXjkgUAgwOjoKOFwmKVLl/JUfymeFU6NTTaSyvlUmJdPYzHuSOtYWUTaSZxEB0BVL0pne6o6CAym8xyTnNfrpbW1lfHxcTZt2sQllySadcbkgt/vJxAI4PF4Jmo4fvrkKd5zXxtS5HyoZmPm2XwqzMunsRh3pHuy9RtMDiClOAn0a4HPuzWoeCJSjzOR45rI/UsjD+2LdEmc10ZHR2lpaUFV2bx5M9XV1bkeksHJPfn9foLBIOXl5SxZsmTSZbizlVS+4bLls5osL5SxmJlLdyqTjyZaLiL/SnavdHoJEDtVyt7I1wtxJniclwYGBmhtbcXj8XDJJZdQXp6/55KzMUV7vooW/4VCIaqqqli4cGHCy3BnM6mcTzO95tNYzMy4dbnHj4E/Am93aXuTqOrdnJ8Yn7fOnj3L/v37qa6u5sorr7Q+JXkitoFTTU0NdXV1UzZwsqSyKXRuzcV9OZMv7TVZ0NXVxUMPPURPTw/btm3jsssuK4jgMdenZw+Hw4yNjTE+Pk5tbS3Nzc00NjZO2/3Pksqm0KWbRL8zfhFOXcjzgC+7NSjzNFWlvb2dEydO0NTUxPbt27PSgyNbkk3PDhR8dXkoFMLn8wFQX19PTU1NWjUc0TzHP33vcYpKFlhS2RScdE9hrY27HwbOAG8FvuXKiAzg/Fd76NAhenp6aG5uLtgajrk4PXswGMTv91NUVMSiRYuorq7OuKfHDZct56bbD1B2wTMsqWwKTrpJ9GdnayDGEQwG2bdvHwMDA6xdu5b169fnekgzMpemZ48GjuLiYpYsWUJV1f9v7/6j5CrrO46/v1kW9vdMsmY32STNBNG0JLFgldoUJZbDCVpsUbFW2yoiKqdW5XhImwBSKYrBH6dKW48/0BMVa2ktUI/Ug/w48Wf9USWQECEJTapJCAViQrKbnd3sPv3jubPcHWZ2596d2Xvvzud1zpzduXPn3u9zn5n7nfvjeZ6uuhwN/ujGN1EoFGYeoMgsi3UR3czagdIoOI8559QXwQwVi0W2b9/O0NAQq1at4kUvelHSIdVFX3crT1RIFlnqnj3chqM0gFMWjwZF6i3qNZDTgJuAdwGn4q+BFINrI3/jnBuuf4hz29DQENu3b2dsbIzVq1fT09OTdEh1dcXaATbf98tJp7Gy0j17sVjk5MmTtLW1PacNRz3t27dPRyCSSVGPQP4R3ybjvcAP8AlkLfB3+DE73lHX6Oawo0ePsmPHDlpbW1mzZg0dHR1Jh9QQpescpd51+7tbuWLtQGqvf4TbcHR2ds6oK3WRuS5qAvkT4M3OubtC0x42s4PAP6MEMq2nnnqKnTt30tnZyUte8pJpb/WcC7LQPXs4cXR3dzN//vxZq5tly5ZNP5NICkVNICPAngrTHwOyd1V0Fh08eJDdu3ezYMEC1q5dW9cuu+ulka3FG90CPW7s4+PjFItFnHPkcjlyudyst63JQlsekUqi3kJyC/B+C50IDv5/L76fLAlxzrFv3z62bt3KsWPHePnLX86aNWtSmTyy3NgvTuylxn/FYpF8Pk+hUGDhwoWJ7Mwfe+yxWV+nSD1E3ZP1AZcAF5jZT4JpLwV6ga+HGxo6595ZnxCzZ3x8nN27d/P444+zfPny1LfhyHJjv6ixj42NMTw8TEtLC729vfT09MRuwyHS7KImkNOBnwf/9wd/fxk8nh+ar2qX73PZyZMneeSRR3j66ac544wzWLduXdIh1STLjf1qjb00gNMpp5xCf39/3dpw1MPixYuTDkEkFjUkrIORkRF27NjB8ePHOfPMM1m9Op0XiqvJcmO/6WIfHR1lZGSE1tbWiTYcs5E4Chv9fSa19Dyr7vclq9J3Mj5DTpw4wfbt2xkdHWXVqlXk8/mkQ4oly439qsbe1crg4CBtbW0sWbKkYW046mHXrl0MDKS/XYxIucgJxMzWA+fjr4dM+innnHtLneJKtWeeeYYdO3Ywb9481qxZQ2dnZ9IhzUiWG/tVjL3FuGLtYpYuXUpbW9usJ47wsLS/v/l+dZAoc1bUlugfAq4GHgIO0WTXOg4fPszDDz9Me3s7L37xi+dMA7OsNfYLW79yATjH9d/2F84XdZ/KVRe8gEvOKSQSz50PHJgYlhZqG6a2r69vVmITqbeoRyDvBC51zn25EcGk1aFDh3jooYdYuHAhL3vZy2htTf+pnaiy0NivXKkNx7nLnk3kP7rmggQjijdMbW9v72yEJlJ3URPIOPDDRgSSVs45jh07xrnnnjtnjjiqycpws+Pj4wwPD2Nm5PN5enp62Le5fKSBZMQZpvYXv/gF/f39VV8XSauot6N8Gri8EYGklZnxghe8IDW3fDazsbExBgcHKRaL9Pb2UigU6O3tTdURYbXhaKcapjYrt3uLlIt6BHID8E0zexB/HWTS7S/OucvqFZhISbgNR19fH93d3alN6BvWr2TT7dsnncbSMLUyV0VNIH8HvArYCSymyS6iy+xKqg3HTJSuc1x52zYADVMrc1rUBPJXwGXOuS0NiEUEeHYAp7a2NgYGBujo6EhtG45KLj57yUQC0TC1MpfF6Y33+40IRNKhkT3yTiXcnXpHRwf9/f2JtOGol1paoItkXdQE8jng7cCmBsQiTcg5x/DwMOPj43R1dTF//vw5f7ebyFwRNYEsBl4ftEZ/kOdeRG/aHnjngvJu0RvZmLDUhmN8fJxcLkc+n9e4GCIZEzWBPB/YFvxfKHtNF9QzbLa6dC+14QDI5/PkcrlU3YYrIrVTb7wCNL5L97GxMYrFImZGb28v3d3dqRxYS0Rqp2+wAI3r0r3UhqOlpYWFCxfS1dWlAZxE5ojIN9Wb2SvN7F4ze9zMDprZPWa2rgGxySyq1nV73C7dR0dHGRwcZHx8nEWLFlEoFMjlckoeInNIpARiZm8C7gWeATYDHwWOA/ea2RvrH57MlivWDnDaKZNvmY3TpfvIyAiDg4OYGQMDAyxfvjzVLcdFJL6op7CuBa51zn0kNO2TZnY18AHgtrpFJrNqJl26O+cYGRnh5MmTtLe309fXl+oBnESkPqL+LDwD+LcK0/81eE0yLJws7njb6mmTR6kNx9DQEG1tbSxbtoylS5dmruW4iMQT9QjkSeBFwJ6y6WcFr0nG1dICPdz4r6enh3w+z2mnnTYL0YlImkRNILcCnzWzhcD38G0/zsP30vv5OscmKaM2HCISFucaSAvwKaAVMKAI3AxcV9/QJC1KbTgAFixYQE9Pj9pwiEjkhoQngQ1mdh3PXvPY45yrPtyaZFa4Dcfznvc8uru7dRuuiEyIlEDM7F+Bbc65G4HtoekbgbOdc7qVdw4ID+DU399PV1eXbsMVkeeIulc4D/jPCtO/Bbxi5uFUZmbXmNk2Mxs0s/1mdrOZdTVqfc2q1IYDYPHixRQKBXp6epQ8RKSiqCeyc/iGg+WGgPkzD6eqtfhGiz8D+vHdyncDb2vgOptGsVjk5MmTtLW1qQ2HiNQsagJ5DLiA597GewGwty4RVeCcC4/O86iZfQD4bKPW1wzCAzhpHA4RiSNqAvk0cJOZtQH34G/jXQ98ELimvqFN6XnAkUovmFkeyJdNXtrwiDIinDjUhkNEZiLqXVj/ZGZ9wIeBjweTi8AnnHP/UO/gKjGzHHAV8MUqs1wJ/O1sxJIlpQGcnHPkcjlyuZwGcBKRGTHnoo8DZWYdwKrg6U7n3GCslZttAd46xSxfcs5dGpr/NOAu/JHPq4LbisuXWe0I5Ht79+6lUChEjvPQoUMMDw9ncocbbvw3f/58crmc2nCISBRVL4jG2pM454aAn8YO51nvAzZO8fpE+xIzOwX4F/zF8/MrJY8gtiOUnd5qxgvCY2NjDA8P09LSQm9vLz09PWrDISJ1lehPUefcUeDodPOZ2Tzgy/jGi+c55yrdCSaoDYeIzJ6snMv4HLAOeDVwqpktCqY/6ZwbSyyqFBkZGWF0dJTW1lYWLVpEV1dXUx55icjsyUoCeXvw94Gy6SuAfbMbSrqoDYeIJCUTCcQ5pz1iSPhW3I6ODhYtWkRbW5sSh4jMqkwkEPHC43B0d3czf/58teEQkcQogWRAqQ3H+Pj4xDgcWbylWETmFiWQFCu14TAz8vk8PT09GsBJRFJDCSSFSm045s2bpzYcIpJaSiApojYcIpIlSiApMDo6ysjIyEQbjs7OTiUOEUk9JZAElRr/tbW1MTAwQEdHh27FFZHMUAKZZeVtOPr7+9WGQ0QySQlklpS34cjn8xrASUQyTQmkwcJtOHK5HPl8Xm04RGROUAJpkPA4HKXGf2rDISJziRJInY2NjVEsFjEzent76e7u1gBOIjInac82jcLGuwDYesWqKecrteFoaWlh4cKFdHV1qfGfiMxpSiAzpDYcItKstKebwp0PHJj4/4237uLuRw9PPB8ZGWFwcBAzY2BggOXLl9Pd3a3kISJNQ0cgVdz5wAE23b594vkTx0fZfN8vOTk6yroVXWrDISJNTz+Xq/jY3Y9yYnTyaLnFk44v/PRJli1bxpIlSzT6n4g0NSWQKg4eOVFx+hPHRtUAUEQEJZCqBvLtkaaLiDQbJZAqNqxfSXvr5Ntw21tb2LB+ZUIRiYikiy6iV3Hx2UsAuPK2bQAsybezYf3KiekiIs1ORyBTCCeLH2z8AyUPEZEQHYFMY9/mP0w6BBGRVNIRiIiIxKIEIiIisSiBiIhILEogIiISixKIiIjEogQiIiKxKIGIiEgsSiAiIhKLEoiIiMSiBCIiIrEogYiISCxKICIiEosSiIiIxJKJBGJm15vZLjM7YWZPmNlXzWxR0nGJiDSzTCQQ4BHgXcBvAa8BfgP4UqIRiYg0uUyMB+Kc+1ro6T4z+yjwtWrzi4hI42XlCGSCmeWANwM/SDoWEZFmlokjEAAz+zPgs0An8GPg1VXmywP5sslLGxudiEjzSfQIxMy2mJmb4rElNPs3gLOB84FRfDKp5Epgb9nje40rhYhkVWHjXRQ23pV0GJmV9BHI+4CNU7x+ovSPc+4YcAzYbWaPAvvN7Ezn3M6y93wS2FI2bSlKIiIidZVoAnHOHQWOxnirBX/HKizzCHBk0sxm5bOJSJO784EDE////ub72bB+JRefvSTBiLIn9RfRzazVzD5sZi81s+Vmdi7wFeDnwO6EwxORDLrzgQNsun37xPMDR06w6fbtk5KKTC/1CQRw+PYf3wB2AV8F9gAXOefGkwxMRLLpY3c/yonRyScwToyO8bG7H00oomxK+hrItJxzJ4HXJR2HiMwdB4+ciDRdKsvCEYiISF0N5NsjTZfKlEBEpOlsWL+S9taWSdPaW1vYsH5lQhFlU+pPYYmI1Fvpbqsrb9sGwJJ8u+7CisGcc0nH0HBmVgD27t27l0KhkGwwIiLZUrUdhE5hiYhILEogIiISixKIiIjEogQiIiKxKIGIiEgsSiAiIhKLEoiIiMSiBCIiIrEogYiISCxKICIiEosSiIiIxKIEIiIisSiBiIhILM3SnXsLwP79+5OOQ0QkU1asWFEA9gejw07SLN25nwt8L+k4REQyaoVzbl/5xGZJIKcBLwUeB8Yivn0pPvm8HMj6IYzKkj5zpRygsqRVPcpS8QikKU5hOeeKwPfjvNdsYiyV/ZUycJaoLOkzV8oBKktaNbIsuoguIiKxKIGIiEgsSiAiIhKLEsj0jgDXB3+zTmVJn7lSDlBZ0qphZWmKu7BERKT+dAQiIiKxKIGIiEgsSiAiIhKLEkgFZvY6M7vPzI6a2bQXicysYGau7JH4xbeo5Qje80Iz22pmJ8xsr5ld2uAwa2Zmm8zsoJkNmdmdZtY3xbypqpOIsae2DqD2sqStDsJifMdTWydRylLvOlECqawDuB/YHPF95wCLg8cL6x1UDJHKYWatwF3AE/iuXz4EfM7MzmtYhDUys7cBVwPvBtYCeeBrNbw18TqJEnua6wBi10PidVBBzd+NtNcJ8fZX9akT55weVR7AOr+Jpp2vADigkHTMMyzHHwFDQGdo2peBr6egDD8Hrg89Pz3Y5qvTXidRYk9zHcQoS2rqYIryTPvdSHudRCxLXetERyD19d3g0P4uM1uddDAxnAP82Dk3GJp2H/C7CcUDTHSG+dv4X1kAOOf+B9jH9LElWicxYk9lHcCM6kHfi/SpS50ogdTHceC9wGuBS4BBfAX1JxpVdH3A/5VNezKYnqRe/Gc1SmxpqZOosae1DiB6WdJSBzOV5jqJqq510lQJxMy2VLiAFH5sibNc59xTzrl/cM79zDn3Q+BN+A/YW+oZf0mjygHY9LPUV41liRzXbNfJFKLGPut1EEGk2FJUBzOV5jqJpN510hTduYe8D9g4xesn6rES59yYmT2EP9/YCI0qxxPAGWXTFvLcX1/1VEtZhoFx/C++X4Reqzm2WaiTap4iWuxJ1EGtopZlkgTrYKbSXCczMtM6aaoE4pw7Chxt9HrMzIAzgZ82YvkNLMdPgPebWYdzbiiY9gfAjxuwLqD2spjZg8Arge8Ez1fgP/Q1xdboOqnGOVeMGPus10GtYpRlkqTqoA5SWyczNeM6SfrOgTQ+gAXAWcDl+DsWzgoepwavnwM8AiwJnr8Bfyj4QmANcAt+p7g0Y+U4FdiDvy1zFXAZMAKcl4I6uQx4Bvhjnr2Qe3/o9dTWyVSxZ6kOYpQlNXVQoRxVvxsZrJMoZalrnSRe+DQ+gEuDiih/FILX15U9vwTYib/V72ng28DvZK0cwbSVwFb8aaN9wKVJlyMU2yb8sMRDwH8A/aHXUl0n1WLPWh1EKUva6qCsDFW/G1mrkyhlqXedqDdeERGJpanuwhIRkfpRAhERkViUQEREJBYlEBERiUUJREREYlECERGRWJRAREQkFiUQERGJRQlEUiXonffepOOYqayVIxiutdQD8kVl029p8LoT3Vbl6zezj4e2xbVJxZUFSiCSNu/D99eTCmZ27wy6x691HYvMbNTMDgXDp8aaz8wWmNlHzGyn+fHKf21m28zsw2a2rIZQ/hk/xOk9MyhO3ZjZ9WZ2ewKrvh6/HfYnsO5MUQKRVDCzU8H3zuuc+3XS8cyyy/C92xbxnRRGni9IEA8AfwJ8BHgZfsS8TfiBoK6qIY4TzrlDzrli1AI0yGuBO2Z7pc65Y865Q8DYbK87a5RAmoyZvcfMHjGzYTPbbWbXmNkpZtZrZr8ys0+F5u0zs8fN7KbQtK1m9kUz22xmT5nZM2Z2i5m117KesuV8wcxuMLPHgQPB9PLTCaX5PmRm/2dmR4Jf1PPM7Doze8LMnjSzD9da1rJl32JmHwh+1R8O1t9ZigU4H3hr6JTGOjO7IHjvYTM7ambfMbNzYtbHPOAdwBbgVuCdMef7NL731bOdc19xzj3knNvlnPuWc+4K4Mo48VWI4yzzQ6H+fdAVOGb27uCopxjU0ddD88faVmb2fOC3gG8Gz2N9DsysNfisHjCzkSDON9djWwjqjbeZHsAHgf/F/7JbAbwa+CVwQ/D6K4BR4DX4UdjuBn4EtIaWsRXfnffn8V/w1+AH1rm51vWElnMM+Ax+PII1wfQtwL1l8x0FbsJ3QX0ZvnfR/wQ+Gkx7azDtVTFiOAL8PfCbwIXB8+uD13PAd4HbgEXB49RgmW8I1r0K3yX2YaA3tOxJ5ZiiTi4MtkMHvsfXMeD0KPPhu/MeA66ewWdjK3DLVNPxyfQI8Neh16/HD5P6V8H2eDFwbej1WNsK2ADcU4fPwcfwvc6WYrgaPyjW+dPVFb7X3Wun23bN/Eg8AD1mqaL9jmcIuLBs+luAI6Hnf4sfee4Twc5iRdn8W4MvVkto2jvxp1U6I6xnK7ALmFc236QvczDftrJ5Hga2l017EPh4xLJuBR4qm+czwH+Fnt8LbJlm284Dfg38WbVyTPHeO8LLxw9SdGOU+fBjPjjgtWXv+SF+534ceHiaOLYyRQLBjyFxHPiL0Gud+BEjr4rwOaxpWwWx/2UdPgfF8HJC2/L+qdYfTN+HEsiUD53Cah6rgHbg383seOkBfBbImdnCYL4b8Dv29wPvcs7trbCsnzjnwueHf4D/Zf78COsB+JlzbryG2B8se34IeKjCtL6IZQXYVracA0D/VMGY2Qoz+4qZ7TGzZ/BHZDlgeQ1lCS9nMXAR8KXQ5C8Bbys71TbdfNXG7H4jfmChz+F39nFdiD9t9qfOua+Epq8C2vBjSlQUZ1sF5T0HP9ZIWNTPwRn4z+V3y+b5ThC7zFBTDWnb5Eo/Ft6ATxDlDgd/F+MP9ceCv7UI78BqXQ/AYI3LHy177qpMK607SgwjUyynmm/ij9LeDfwqWMb38TurKN4OHMT/ui75F/wptT8Cbq9xvq340zJnErro7Jz7FYCZhcsbxw78QErvMLNvO+cqbbNq4myri4H/ds4dKJse9XNQLT6bJmapkY5AmsfD+J3A6c65PRUeY8GF2luDeS8BrjOzcyss66Vm1hJ6/nv4HcNjtaynoaX06hnDCDBRVjPrxe+oNzvn7nbO7QzW1Vfl/RUF2/py4FYXnC8BcM4dBu4iuEhey3zB/98C3mNmuShx1Gg//vrYSuAOMzstmF4q+/pKb5rBtnod9bn7ag/+FNZ5ZdNfgf+MyAzpCKRJOOeOm9mNwI3BzTP34Ot/Df7Onb8Brgmen+Wc229mnwG+amZnucm31vYC/2T+jq3T8ae9Pu+cGwSoYT1pKGut9gKvDO4KOoq/kP0k/tf4Y/ht8VH8tYAoLsSfxvmZma0ue+2HwE1mVsDvgGuZ7y/xpxIfMLMP4k/NHcfv9C9ihrekOucOmtk64D7gG2Z2cbCdPwF80MxO4LdzO/Bq59xH8Nc6Im0rM5uPH4b13TOJN4h5yMxuBm4wsyfx2+QN+FugL5jp8kUJpKk4524ws4PAe4CP47/Iu4AtZrYWuA54vXOu1IDqKvyvtVuA14cW9XX8jrR0KuLfgL+uZT0NK1yZOsbwCXzieRB/HeGV+J3Qzfjz7/+Lv7PnpmoLqOJdwd9/n2Key4N1Tzufc+5aMzsbf/fSJvx42OAT4N3Ap6q8t2bOuUNBErkX+KaZvQb4AD5JvBd/Su3XBNccnHPjZhZ1W10E7HLOVTr1GMc1+NN7nwQW4o9K/tw5d1+dlt/UNCa6RGJmW4E9zrnLk45F6ict9Wpmd+DvGEu8CxEz24e/M+1DSceSVroGIiIlbw3uWLswwRj+i1k8Uq0kaKB4HPiNJOPIAh2BSCRp+aUq9WVmS/DXLwAOOueGkownScHF//nB06dd83WtUzMlEBERiUWnsEREJBYlEBERiUUJREREYlECERGRWJRAREQkFiUQERGJRQlERERiUQIREZFY/h/oDA0ZFCydAAAAAUlEQVTR2eyfqgAAAABJRU5ErkJggg==\n", - "text/plain": [ - "
" - ] - }, - "metadata": { - "needs_background": "light" - }, - "output_type": "display_data" - } - ], - "source": [ - "X,Y,error = extract_computed_experimental(name='jnk1')\n", - "RMSE_start, MUE_start, R_start, rho_start, tau_start = plotting_data(X,Y,error)" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "### mcl1" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 9, - "metadata": {}, - "outputs": [ - { - "data": { - "image/png": "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\n", - "text/plain": [ - "
" - ] - }, - "metadata": { - "needs_background": "light" - }, - "output_type": "display_data" - } - ], - "source": [ - "X,Y,error = extract_computed_experimental(name='mcl1')\n", - "RMSE_start, MUE_start, R_start, rho_start, tau_start = plotting_data(X,Y,error)" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "### p38" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 10, - "metadata": {}, - "outputs": [ - { - "data": { - "image/png": "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\n", - "text/plain": [ - "
" - ] - }, - "metadata": { - "needs_background": "light" - }, - "output_type": "display_data" - } - ], - "source": [ - "X,Y,error = extract_computed_experimental(name='p38')\n", - "RMSE_start, MUE_start, R_start, rho_start, tau_start = plotting_data(X,Y,error)" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "### p2p1b" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 11, - "metadata": {}, - "outputs": [ - { - "data": { - "image/png": "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\n", - "text/plain": [ - "
" - ] - }, - "metadata": { - "needs_background": "light" - }, - "output_type": "display_data" - } - ], - "source": [ - "X,Y,error = extract_computed_experimental(name='ptp1b')\n", - "RMSE_start, MUE_start, R_start, rho_start, tau_start = plotting_data(X,Y,error)" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "### thrombin" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 12, - "metadata": {}, - "outputs": [ - { - "data": { - "image/png": "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\n", - "text/plain": [ - "
" - ] - }, - "metadata": { - "needs_background": "light" - }, - "output_type": "display_data" - } - ], - "source": [ - "X,Y,error = extract_computed_experimental(name='thrombin')\n", - "RMSE_start, MUE_start, R_start, rho_start, tau_start = plotting_data(X,Y,error)" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": null, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": null, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [] - } - ], - "metadata": { - "kernelspec": { - "display_name": "Python 3", - "language": "python", - "name": "python3" - }, - "language_info": { - "codemirror_mode": { - "name": "ipython", - "version": 3 - }, - "file_extension": ".py", - "mimetype": "text/x-python", - "name": "python", - "nbconvert_exporter": "python", - "pygments_lexer": "ipython3", - "version": "3.6.7" - } - }, - "nbformat": 4, - "nbformat_minor": 4 -} diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/final_results_all.xlsx b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/final_results_all.xlsx deleted file mode 100755 index a6ef10ef..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/final_results_all.xlsx and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/recalculate_ddG.ipynb b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/recalculate_ddG.ipynb deleted file mode 100755 index 5b34724d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/recalculate_ddG.ipynb +++ /dev/null @@ -1,1246 +0,0 @@ -{ - "cells": [ - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Import packages" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 1, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "import os\n", - "import sys\n", - "import random\n", - "import numpy as np\n", - "import pandas as pd\n", - "from scipy import stats\n", - "from matplotlib import pyplot as plt" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Specify name of approaches and dataset folders." - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 2, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "who = ['cresset_valid','schrodinger','amber','gaff','cgenff','consensus']\n", - "folders = ['bace', 'cdk2', 'jnk1', 'mcl1', 'ptp1b', 'p38', 'thrombin', 'tyk2']\n", - "mue_rmse = {}\n", - "kcal = 4.184 #kJ to kcal ratio" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Adjust your OS and path to the directory here if you wish to rerun the notebook." - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 3, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "os_name = 'windows'\n", - "def set_wd(os_name):\n", - " if os_name.lower() == 'linux':\n", - " os.chdir('/home/max/')\n", - " elif os_name.lower() == 'windows':\n", - " os.chdir('C:/kuhn_et_al/wang_2015_datasets/')\n", - " else:\n", - " os.chdir('/some/path/to/directory')\n", - "def freenrgworkflow_init(base_folder, subfolder):\n", - " results_dir = 'wang_2015_datasets/%s%s/' %(base_folder, subfolder)\n", - " os.chdir(results_dir+'/results')" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Get results of free energy calculations obtaining MUE per compound (MUE(c))." - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 4, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "def f_statistics(exp, com):\n", - " F_of_R = 0.5*np.log((1+np.corrcoef(exp,com)[0,1])/(1-np.corrcoef(exp,com)[0,1]))\n", - " var_of_F = 1/(len(exp)-3)\n", - " F = (F_of_R - np.sqrt(var_of_F), F_of_R + np.sqrt(var_of_F))\n", - " R_of_F = ((np.e**(2*F[0])-1)/(np.e**(2*F[0])+1), (np.e**(2*F[1])-1)/(np.e**(2*F[1])+1))\n", - " ci = (R_of_F[0]**2, R_of_F[1]**2)\n", - " t99 = stats.t.ppf(0.99, len(exp)-2)\n", - " Rcrit = (t99/np.sqrt(len(exp)+t99**2))**2\n", - " return(ci, Rcrit)" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 5, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "def analyze_results(who, which, n_bootstrap, gen_plot):\n", - " if n_bootstrap < 1000:\n", - " raise ValueError('Please set n_bootstrap to at least 1000 iterations.')\n", - " \n", - " print('Calculating results for %s from %s.' %(which.upper(), who.upper()))\n", - " set_wd(os_name)\n", - " \n", - " #Get results\n", - " affs = pd.read_csv('wang_2015_datasets/final_results_%s.csv' %which)\n", - " affs = affs.drop(len(affs)-1) # to drop the \"sum\" row\n", - " exp = affs.loc[:,'dGexptl']\n", - " com = affs.loc[:,who]\n", - " mue = abs(com-exp)\n", - " rmse = mue**2\n", - " fstat,R_ref = f_statistics(exp, com)\n", - " \n", - " #generate plot\n", - " if gen_plot:\n", - " plt.scatter(exp,com)\n", - " plt.grid()\n", - " \n", - " #Bootstrapping\n", - " boot_affs = []\n", - " boot_mues = []\n", - " boot_rmses = []\n", - " boot_taus = []\n", - " for _ in range(n_bootstrap):\n", - " exps = []\n", - " coms = []\n", - " mues = []\n", - " rmses = []\n", - " for i in range(len(affs)-1):\n", - " r = random.randint(0,len(exp)-1)\n", - " exps.append(exp[r])\n", - " coms.append(com[r])\n", - " mues.append(mue[r])\n", - " rmses.append(rmse[r])\n", - " boot_affs.append(np.corrcoef(exps,coms))\n", - " boot_mues.append(np.mean(mues))\n", - " boot_rmses.append(np.sqrt(sum(rmses)/len(rmses)))\n", - " boot_taus.append(stats.kendalltau(exps,coms))\n", - " bootaffs = (np.mean(boot_affs), np.std(boot_affs))\n", - " bootmues = (np.mean(boot_mues), np.std(boot_mues))\n", - " bootrmses = (np.mean(boot_rmses), np.std(boot_rmses))\n", - " boottaus = (np.mean(boot_taus), np.std(boot_taus))\n", - " \n", - " #Print Results\n", - " print('Number of ligands: %s' %len(exp))\n", - " print('R: %.2f +/- %.2f' %(np.corrcoef(exp,com)[0,1],bootaffs[1]))\n", - " print('R²: %.2f' %np.corrcoef(exp,com)[0,1]**2)\n", - " print('CI_0.95 for R²: [%.2f - %.2f]' %fstat)\n", - " print('critical R² for p=0.99: %.2f' %R_ref)\n", - " print('MUE(l): %.2f +/- %.2f' %(np.mean(mue), bootmues[1]))\n", - " print('RMSE(l): %.2f +/- %.2f' %(np.sqrt(np.mean(rmse)), bootrmses[1]))\n", - " print('Kendall tau: %.2f +/- %.2f' %(stats.kendalltau(exp,com)[0], boottaus[1]))\n", - " print('-'*52)" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Calcualte the error per perturbation (MUE(p))." - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 6, - "metadata": { - "scrolled": true - }, - "outputs": [], - "source": [ - "def error_per_perturbation(who, folders, n_bootstrap, info): #True for info\n", - " if n_bootstrap < 1000:\n", - " raise ValueError('Please set n_bootstrap to at least 1000 iterations.')\n", - " \n", - " for folder in folders:\n", - " print(who.upper(), '-', folder.upper())\n", - " dataset_name = folder\n", - " set_wd(os_name)\n", - " freenrgworkflow_init(dataset_name, '')\n", - " tmp = errors_for_dataset(who, info) \n", - " errors = single_topology_errors(tmp[0], dataset_name.rsplit('_')[-1], tmp[1], tmp[2], info)\n", - " print('Number of calculations considered:', len(errors))\n", - " \n", - " #Bootstrapping\n", - " boot_means = []\n", - " boot_rmses = []\n", - " for _ in range(n_bootstrap):\n", - " bootsample = np.random.choice(errors, size = len(errors), replace=True)\n", - " boot_means.append(bootsample.mean())\n", - " boot_rmses.append(np.sqrt(sum(bootsample**2)/len(bootsample)))\n", - " bootmean_std = np.std(boot_means)\n", - " bootrmse_std = np.std(boot_rmses)\n", - " \n", - " #Print results\n", - " print('MUE(p): %.2f +/- %.2f kcal/mol, %.2f +/- %.2f kJ/mol'\n", - " %(np.mean(errors), bootmean_std, np.mean(errors)*kcal, bootmean_std*kcal))\n", - " print('RMSE(p): %.2f +/- %.2f, kcal/mol %.2f +/- %.2f kJ/mol'\n", - " %(np.sqrt(sum(errors**2)/len(errors)), bootrmse_std,\n", - " np.sqrt(sum(errors**2)/len(errors))*kcal, bootrmse_std*kcal))\n", - " print('-'*53)\n", - " mue_rmse[folder] = [folder, 'MUE(p): %.2f +/- %.2f kcal/mol, %.2f +/- %.2f kJ/mol'\n", - " %(np.mean(errors), bootmean_std, np.mean(errors)*kcal, bootmean_std*kcal),\n", - " 'RMSE(p): %.2f +/- %.2f, kcal/mol %.2f +/- %.2f kJ/mol'\n", - " %(np.sqrt(sum(errors**2)/len(errors)), bootrmse_std,\n", - " np.sqrt(sum(errors**2)/len(errors))*kcal, bootrmse_std*kcal)]\n", - " \n", - " #Print summary\n", - " print('Summary for %s:' %who.upper())\n", - " [print(mue_rmse[res][0].ljust(8),'-',mue_rmse[res][1],mue_rmse[res][2]) for res in mue_rmse.keys()]\n", - " print('='*117,'\\n')" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 7, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "def errors_for_dataset(who, info):\n", - " exp = {}\n", - " com = []\n", - " errors = []\n", - " no_exp = 0\n", - " \n", - " #convert kJ to kcal if dataset from Gapsys et al., 2020\n", - " if who in ['gaff', 'cgenff', 'consensus']:\n", - " kcal = 4.184\n", - " else:\n", - " kcal = 1.000\n", - " \n", - " #read the experimental affinities\n", - " with open ('experimental_dG.csv', 'r') as f:\n", - " lines = f.readlines()\n", - " for line in lines:\n", - " if line[0] != '#':\n", - " exp[line.split(',')[0]] = float(line.split(',')[1])\n", - " if info:\n", - " print('Experimental affinities from mulit-sdf file of Wang et al., 2015:')\n", - " [print(e,exp[e]) for e in exp.keys()]\n", - " \n", - " #read results from computations\n", - " if who == 'cresset_valid':\n", - " com_both = []\n", - " with open ('summary/fep_results_freenrgworkflow_cresset_valid.csv', 'r') as f:\n", - " lines = f.readlines()\n", - " [com_both.append(line) for line in lines if not '#' in line]\n", - " for i in range(len(com_both)):\n", - " if i %2 == 0:\n", - " fw = float(com_both[i].split(',')[2])\n", - " bw = float(com_both[i+1].split(',')[2])\n", - " fw_err = float(com_both[i].split(',')[3])\n", - " bw_err = float(com_both[i+1].split(',')[3])\n", - " com.append('%s,%s,%s,%s' %(com_both[i].split(',')[0], com_both[i].split(',')[1], \\\n", - " round((fw-bw)/2,3), round((fw_err+bw_err)/2,3)))\n", - " else:\n", - " with open ('summary/fep_results_freenrgworkflow_%s.csv' %who, 'r') as f:\n", - " lines = f.readlines()\n", - " [com.append(line) for line in lines if not '#' in line]\n", - " if info:\n", - " print('Computed affnities according to %s.' %who)\n", - " [print(c) for c in com]\n", - " \n", - " #calculate difference between experimental and computed values\n", - " if info:\n", - " print('-'*23,'\\nlig1,lig2,com,exp,error\\n','-'*21)\n", - " for entry in com:\n", - " try:\n", - " A,B,co = entry.split(',')[0:3]\n", - " co = float(co)/kcal\n", - " ex = round(exp[B]-exp[A],3)\n", - " if info:\n", - " print(A,B,round(co,2),ex,round(abs(co-ex),2))\n", - " errors.append(round(abs(co-ex),3))\n", - " except:\n", - " no_exp += 1\n", - " if info:\n", - " print('No experimental ddG for:', entry.strip('\\n').strip(','))\n", - " pass\n", - " if info:\n", - " print(errors)\n", - " errors = np.array(errors)\n", - " \n", - " #print results\n", - " if info:\n", - " print('Number of calculations considered:', len(errors))\n", - " print('Missing experimental affinities: %s perturbations' %no_exp)\n", - " print('MUE (p):', round(np.mean(errors),4))\n", - " print('RMSE (p):', round(np.sqrt(sum(errors**2)/len(errors)),4))\n", - " \n", - " #return results\n", - " return(list(errors), exp, com)" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 8, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "#Function for generating ligand pairs using intermediate ligands (only used in the Cresset validation dataset).\n", - "def single_topology_errors(list_of_errors, dataset, experimental, computed, info):\n", - " err_add = list_of_errors\n", - " err_dict = {}\n", - " if info:\n", - " print('Checking for further perturbations.')\n", - " \n", - " #Check whether and which additional perturbations exists\n", - " if dataset not in ['bace', 'p38', 'ptp', 'tyk']:\n", - " triples = []\n", - " errors = []\n", - " if info:\n", - " print('No further perturbations found.')\n", - " elif dataset == 'tyk':\n", - " triples = [('ejm31', 'jmc28', 'jul01'), ('ejm31', 'ejm49', 'jul01'), ('ejm31', 'ejm48', 'jul01'), \\\n", - " ('ejm31', 'ejm47', 'jul01'), ('ejm31', 'ejm46', 'jul01')]\n", - " elif dataset == 'p38':\n", - " triples = [('3fly', '2j', 'mk3'), ('3fly', '3fln', 'mk3'), ('2c', '3flz', 'mk1'), ('2c', '2f', 'mk1'), \\\n", - " ('2x', '2j', 'mk3'), ('2u', '2k', 'mk2'), ('2q', '2k', 'mk2'), ('3fly', '2v', 'mk4'), \\\n", - " ('2y', '2v', 'mk4'), ('2bb', '2v', 'mk4'), ('3fmh', '2v', 'mk4'), ('3fmk', '2v', 'mk4')]\n", - " elif dataset == 'ptp':\n", - " triples = [('23466', '23471', 'MK2'), ('23466', '23468', 'MK2'), ('23466', '20669', 'MK1'), \\\n", - " ('23466', '23474', 'MK2')]\n", - " elif dataset == 'bace':\n", - " triples = [( '4b', '4p', 'mk3'), ( '4d', '4p', 'mk3'), ('13k', '4p', 'mk3'), ('13m', '4p', 'mk3'), \\\n", - " ('13j', '4p', 'mk3'), ('13n', '4p', 'mk3'), ('13e', '4p', 'mk2'), ('13f', '4p', 'mk2'), \\\n", - " ('13g', '4p', 'mk2'), ('13e', '13d', 'mk1'), ('13f', '13d', 'mk1'), ('13g', '13d', 'mk1'), \\\n", - " ('13o', '13d', 'mk1'), ('13a', '13d', 'mk1'), ('13i', '13d', 'mk1'), ( '4p', '17h', 'mk2')]\n", - " \n", - " #generate affinity pairs for A <=> B by combining A <=> I and I <=> B \n", - " for triple in triples:\n", - " counter = 1\n", - " for entry in computed:\n", - " entry = entry.split(',')\n", - " if entry[0] == triple[2]:\n", - " if entry[1] == triple[0]:\n", - " counter += 1\n", - " step1 = -float(entry[2])\n", - " if entry[1] == triple[1]:\n", - " counter += 1\n", - " step2 = float(entry[2])\n", - " if entry[1] == triple[2]:\n", - " if entry[0] == triple[0]:\n", - " counter += 1\n", - " step1 = float(entry[2])\n", - " if entry[0] == triple[1]:\n", - " counter += 1\n", - " step2 = -float(entry[2])\n", - " if counter %3 == 0:\n", - " counter += 1\n", - " exp = round(experimental[triple[1]] - experimental[triple[0]],3)\n", - " err_dict['%s_to_%s' %(triple[0],triple[1])] = (round(step1+step2,3), exp)\n", - " if info:\n", - " print('Found: %s_to_%s' %(triple[0],triple[1]), (round(step1+step2,3), exp))\n", - " \n", - " #append the generated affinity pairs to the error dictionary\n", - " for key in err_dict.keys():\n", - " err_add.append(round(abs(err_dict[key][0] - err_dict[key][1]),3))\n", - " errors = np.array(err_add)\n", - " return(errors)" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Run part 1 (Results and MUE(c))." - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 9, - "metadata": {}, - "outputs": [ - { - "name": "stdout", - "output_type": "stream", - "text": [ - "Calculating results for BACE from CRESSET_VALID.\n", - "Number of ligands: 36\n", - "R: 0.44 +/- 0.30\n", - "R²: 0.19\n", - "CI_0.95 for R²: [0.08 - 0.32]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.14\n", - "MUE(l): 0.76 +/- 0.09\n", - "RMSE(l): 0.94 +/- 0.10\n", - "Kendall tau: 0.28 +/- 0.17\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for CDK2 from CRESSET_VALID.\n", - "Number of ligands: 16\n", - "R: 0.74 +/- 0.15\n", - "R²: 0.54\n", - "CI_0.95 for R²: [0.34 - 0.71]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.30\n", - "MUE(l): 0.69 +/- 0.14\n", - "RMSE(l): 0.87 +/- 0.15\n", - "Kendall tau: 0.43 +/- 0.26\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for JNK1 from CRESSET_VALID.\n", - "Number of ligands: 21\n", - "R: 0.72 +/- 0.15\n", - "R²: 0.52\n", - "CI_0.95 for R²: [0.35 - 0.67]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.23\n", - "MUE(l): 0.76 +/- 0.13\n", - "RMSE(l): 0.96 +/- 0.15\n", - "Kendall tau: 0.55 +/- 0.28\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for MCL1 from CRESSET_VALID.\n", - "Number of ligands: 42\n", - "R: 0.74 +/- 0.14\n", - "R²: 0.55\n", - "CI_0.95 for R²: [0.43 - 0.65]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.12\n", - "MUE(l): 1.18 +/- 0.14\n", - "RMSE(l): 1.50 +/- 0.18\n", - "Kendall tau: 0.56 +/- 0.28\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for PTP1B from CRESSET_VALID.\n", - "Number of ligands: 23\n", - "R: 0.69 +/- 0.16\n", - "R²: 0.48\n", - "CI_0.95 for R²: [0.31 - 0.63]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.22\n", - "MUE(l): 0.72 +/- 0.13\n", - "RMSE(l): 0.95 +/- 0.16\n", - "Kendall tau: 0.57 +/- 0.29\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for P38 from CRESSET_VALID.\n", - "Number of ligands: 34\n", - "R: 0.63 +/- 0.19\n", - "R²: 0.40\n", - "CI_0.95 for R²: [0.26 - 0.53]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.15\n", - "MUE(l): 0.94 +/- 0.14\n", - "RMSE(l): 1.25 +/- 0.20\n", - "Kendall tau: 0.54 +/- 0.28\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for THROMBIN from CRESSET_VALID.\n", - "Number of ligands: 11\n", - "R: 0.91 +/- 0.07\n", - "R²: 0.82\n", - "CI_0.95 for R²: [0.67 - 0.91]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.42\n", - "MUE(l): 0.20 +/- 0.05\n", - "RMSE(l): 0.25 +/- 0.05\n", - "Kendall tau: 0.76 +/- 0.39\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for TYK2 from CRESSET_VALID.\n", - "Number of ligands: 16\n", - "R: 0.73 +/- 0.17\n", - "R²: 0.53\n", - "CI_0.95 for R²: [0.32 - 0.69]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.30\n", - "MUE(l): 0.71 +/- 0.13\n", - "RMSE(l): 0.87 +/- 0.13\n", - "Kendall tau: 0.54 +/- 0.28\n", - "----------------------------------------------------\n", - "==================================================== \n", - "\n", - "Calculating results for BACE from SCHRODINGER.\n", - "Number of ligands: 36\n", - "R: 0.78 +/- 0.12\n", - "R²: 0.61\n", - "CI_0.95 for R²: [0.50 - 0.71]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.14\n", - "MUE(l): 0.66 +/- 0.09\n", - "RMSE(l): 0.85 +/- 0.09\n", - "Kendall tau: 0.56 +/- 0.29\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for CDK2 from SCHRODINGER.\n", - "Number of ligands: 16\n", - "R: 0.47 +/- 0.29\n", - "R²: 0.23\n", - "CI_0.95 for R²: [0.06 - 0.44]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.30\n", - "MUE(l): 0.88 +/- 0.14\n", - "RMSE(l): 1.04 +/- 0.14\n", - "Kendall tau: 0.28 +/- 0.23\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for JNK1 from SCHRODINGER.\n", - "Number of ligands: 21\n", - "R: 0.84 +/- 0.09\n", - "R²: 0.71\n", - "CI_0.95 for R²: [0.58 - 0.81]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.23\n", - "MUE(l): 1.05 +/- 0.10\n", - "RMSE(l): 1.14 +/- 0.10\n", - "Kendall tau: 0.76 +/- 0.38\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for MCL1 from SCHRODINGER.\n", - "Number of ligands: 42\n", - "R: 0.77 +/- 0.12\n", - "R²: 0.60\n", - "CI_0.95 for R²: [0.49 - 0.69]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.12\n", - "MUE(l): 0.84 +/- 0.10\n", - "RMSE(l): 1.04 +/- 0.12\n", - "Kendall tau: 0.61 +/- 0.31\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for PTP1B from SCHRODINGER.\n", - "Number of ligands: 23\n", - "R: 0.80 +/- 0.11\n", - "R²: 0.65\n", - "CI_0.95 for R²: [0.50 - 0.76]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.22\n", - "MUE(l): 0.60 +/- 0.11\n", - "RMSE(l): 0.80 +/- 0.15\n", - "Kendall tau: 0.70 +/- 0.36\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for P38 from SCHRODINGER.\n", - "Number of ligands: 34\n", - "R: 0.65 +/- 0.19\n", - "R²: 0.42\n", - "CI_0.95 for R²: [0.29 - 0.55]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.15\n", - "MUE(l): 0.86 +/- 0.08\n", - "RMSE(l): 0.97 +/- 0.09\n", - "Kendall tau: 0.47 +/- 0.24\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for THROMBIN from SCHRODINGER.\n", - "Number of ligands: 11\n", - "R: 0.71 +/- 0.23\n", - "R²: 0.50\n", - "CI_0.95 for R²: [0.23 - 0.71]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.42\n", - "MUE(l): 0.42 +/- 0.11\n", - "RMSE(l): 0.54 +/- 0.13\n", - "Kendall tau: 0.45 +/- 0.28\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for TYK2 from SCHRODINGER.\n", - "Number of ligands: 16\n", - "R: 0.89 +/- 0.07\n", - "R²: 0.79\n", - "CI_0.95 for R²: [0.67 - 0.88]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.30\n", - "MUE(l): 0.44 +/- 0.09\n", - "RMSE(l): 0.57 +/- 0.11\n", - "Kendall tau: 0.70 +/- 0.36\n", - "----------------------------------------------------\n", - "==================================================== \n", - "\n", - "Calculating results for BACE from AMBER.\n", - "Number of ligands: 36\n", - "R: 0.43 +/- 0.31\n", - "R²: 0.19\n", - "CI_0.95 for R²: [0.08 - 0.32]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.14\n", - "MUE(l): 1.03 +/- 0.14\n", - "RMSE(l): 1.32 +/- 0.20\n", - "Kendall tau: 0.29 +/- 0.18\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for CDK2 from AMBER.\n", - "Number of ligands: 16\n", - "R: 0.47 +/- 0.27\n", - "R²: 0.22\n", - "CI_0.95 for R²: [0.05 - 0.43]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.30\n", - "MUE(l): 0.90 +/- 0.15\n", - "RMSE(l): 1.08 +/- 0.14\n", - "Kendall tau: 0.25 +/- 0.20\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for JNK1 from AMBER.\n", - "Number of ligands: 21\n", - "R: 0.47 +/- 0.30\n", - "R²: 0.22\n", - "CI_0.95 for R²: [0.07 - 0.40]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.23\n", - "MUE(l): 0.90 +/- 0.15\n", - "RMSE(l): 1.13 +/- 0.17\n", - "Kendall tau: 0.34 +/- 0.20\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for MCL1 from AMBER.\n", - "Number of ligands: 42\n", - "R: 0.65 +/- 0.19\n", - "R²: 0.42\n", - "CI_0.95 for R²: [0.30 - 0.54]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.12\n", - "MUE(l): 1.24 +/- 0.13\n", - "RMSE(l): 1.48 +/- 0.15\n", - "Kendall tau: 0.49 +/- 0.25\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for PTP1B from AMBER.\n", - "Number of ligands: 23\n", - "R: 0.71 +/- 0.16\n", - "R²: 0.50\n", - "CI_0.95 for R²: [0.33 - 0.64]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.22\n", - "MUE(l): 0.76 +/- 0.14\n", - "RMSE(l): 1.01 +/- 0.17\n", - "Kendall tau: 0.64 +/- 0.33\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for P38 from AMBER.\n", - "Number of ligands: 34\n", - "R: 0.38 +/- 0.32\n", - "R²: 0.15\n", - "CI_0.95 for R²: [0.05 - 0.28]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.15\n", - "MUE(l): 1.28 +/- 0.17\n", - "RMSE(l): 1.62 +/- 0.20\n", - "Kendall tau: 0.28 +/- 0.17\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for THROMBIN from AMBER.\n", - "Number of ligands: 11\n", - "R: 0.76 +/- 0.17\n", - "R²: 0.57\n", - "CI_0.95 for R²: [0.31 - 0.76]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.42\n", - "MUE(l): 0.37 +/- 0.11\n", - "RMSE(l): 0.51 +/- 0.14\n", - "Kendall tau: 0.56 +/- 0.31\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for TYK2 from AMBER.\n", - "Number of ligands: 16\n", - "R: 0.57 +/- 0.25\n", - "R²: 0.33\n", - "CI_0.95 for R²: [0.13 - 0.53]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.30\n", - "MUE(l): 0.89 +/- 0.18\n", - "RMSE(l): 1.13 +/- 0.19\n", - "Kendall tau: 0.45 +/- 0.25\n", - "----------------------------------------------------\n", - "==================================================== \n", - "\n", - "Calculating results for BACE from GAFF.\n", - "Number of ligands: 36\n", - "R: 0.46 +/- 0.29\n", - "R²: 0.21\n", - "CI_0.95 for R²: [0.09 - 0.34]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.14\n", - "MUE(l): 0.74 +/- 0.08\n", - "RMSE(l): 0.88 +/- 0.09\n", - "Kendall tau: 0.28 +/- 0.17\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for CDK2 from GAFF.\n", - "Number of ligands: 16\n", - "R: 0.85 +/- 0.09\n", - "R²: 0.72\n", - "CI_0.95 for R²: [0.56 - 0.83]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.30\n", - "MUE(l): 0.47 +/- 0.12\n", - "RMSE(l): 0.67 +/- 0.16\n", - "Kendall tau: 0.62 +/- 0.32\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for JNK1 from GAFF.\n", - "Number of ligands: 21\n", - "R: 0.80 +/- 0.12\n", - "R²: 0.64\n", - "CI_0.95 for R²: [0.49 - 0.76]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.23\n", - "MUE(l): 0.80 +/- 0.12\n", - "RMSE(l): 0.97 +/- 0.15\n", - "Kendall tau: 0.67 +/- 0.34\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for MCL1 from GAFF.\n", - "Number of ligands: 42\n", - "R: 0.77 +/- 0.12\n", - "R²: 0.59\n", - "CI_0.95 for R²: [0.48 - 0.68]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.12\n", - "MUE(l): 0.86 +/- 0.11\n", - "RMSE(l): 1.13 +/- 0.13\n", - "Kendall tau: 0.61 +/- 0.31\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for PTP1B from GAFF.\n", - "Number of ligands: 23\n", - "R: 0.72 +/- 0.19\n", - "R²: 0.52\n", - "CI_0.95 for R²: [0.35 - 0.66]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.22\n", - "MUE(l): 0.77 +/- 0.10\n", - "RMSE(l): 0.90 +/- 0.09\n", - "Kendall tau: 0.37 +/- 0.22\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for P38 from GAFF.\n" - ] - }, - { - "name": "stdout", - "output_type": "stream", - "text": [ - "Number of ligands: 34\n", - "R: 0.68 +/- 0.17\n", - "R²: 0.46\n", - "CI_0.95 for R²: [0.33 - 0.59]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.15\n", - "MUE(l): 0.62 +/- 0.08\n", - "RMSE(l): 0.76 +/- 0.08\n", - "Kendall tau: 0.50 +/- 0.26\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for THROMBIN from GAFF.\n", - "Number of ligands: 11\n", - "R: 0.24 +/- 0.43\n", - "R²: 0.06\n", - "CI_0.95 for R²: [0.01 - 0.29]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.42\n", - "MUE(l): 0.66 +/- 0.11\n", - "RMSE(l): 0.75 +/- 0.11\n", - "Kendall tau: 0.24 +/- 0.28\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for TYK2 from GAFF.\n", - "Number of ligands: 16\n", - "R: 0.69 +/- 0.21\n", - "R²: 0.47\n", - "CI_0.95 for R²: [0.26 - 0.65]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.30\n", - "MUE(l): 0.87 +/- 0.11\n", - "RMSE(l): 0.97 +/- 0.11\n", - "Kendall tau: 0.41 +/- 0.24\n", - "----------------------------------------------------\n", - "==================================================== \n", - "\n", - "Calculating results for BACE from CGENFF.\n", - "Number of ligands: 36\n", - "R: 0.56 +/- 0.25\n", - "R²: 0.32\n", - "CI_0.95 for R²: [0.19 - 0.45]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.14\n", - "MUE(l): 0.75 +/- 0.12\n", - "RMSE(l): 1.02 +/- 0.15\n", - "Kendall tau: 0.38 +/- 0.20\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for CDK2 from CGENFF.\n", - "Number of ligands: 16\n", - "R: 0.61 +/- 0.22\n", - "R²: 0.38\n", - "CI_0.95 for R²: [0.17 - 0.57]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.30\n", - "MUE(l): 0.77 +/- 0.15\n", - "RMSE(l): 0.95 +/- 0.16\n", - "Kendall tau: 0.51 +/- 0.27\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for JNK1 from CGENFF.\n", - "Number of ligands: 21\n", - "R: 0.74 +/- 0.15\n", - "R²: 0.55\n", - "CI_0.95 for R²: [0.37 - 0.69]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.23\n", - "MUE(l): 0.52 +/- 0.11\n", - "RMSE(l): 0.72 +/- 0.13\n", - "Kendall tau: 0.60 +/- 0.31\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for MCL1 from CGENFF.\n", - "Number of ligands: 42\n", - "R: 0.55 +/- 0.24\n", - "R²: 0.31\n", - "CI_0.95 for R²: [0.19 - 0.43]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.12\n", - "MUE(l): 1.09 +/- 0.13\n", - "RMSE(l): 1.36 +/- 0.15\n", - "Kendall tau: 0.42 +/- 0.22\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for PTP1B from CGENFF.\n", - "Number of ligands: 23\n", - "R: 0.55 +/- 0.25\n", - "R²: 0.30\n", - "CI_0.95 for R²: [0.14 - 0.47]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.22\n", - "MUE(l): 0.70 +/- 0.18\n", - "RMSE(l): 1.09 +/- 0.28\n", - "Kendall tau: 0.51 +/- 0.27\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for P38 from CGENFF.\n", - "Number of ligands: 34\n", - "R: 0.71 +/- 0.16\n", - "R²: 0.50\n", - "CI_0.95 for R²: [0.37 - 0.62]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.15\n", - "MUE(l): 0.95 +/- 0.14\n", - "RMSE(l): 1.23 +/- 0.18\n", - "Kendall tau: 0.52 +/- 0.27\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for THROMBIN from CGENFF.\n", - "Number of ligands: 11\n", - "R: -0.03 +/- 0.57\n", - "R²: 0.00\n", - "CI_0.95 for R²: [0.14 - 0.10]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.42\n", - "MUE(l): 0.69 +/- 0.26\n", - "RMSE(l): 1.07 +/- 0.38\n", - "Kendall tau: 0.05 +/- 0.36\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for TYK2 from CGENFF.\n", - "Number of ligands: 16\n", - "R: 0.65 +/- 0.22\n", - "R²: 0.42\n", - "CI_0.95 for R²: [0.21 - 0.61]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.30\n", - "MUE(l): 0.99 +/- 0.14\n", - "RMSE(l): 1.13 +/- 0.12\n", - "Kendall tau: 0.38 +/- 0.23\n", - "----------------------------------------------------\n", - "==================================================== \n", - "\n", - "Calculating results for BACE from CONSENSUS.\n", - "Number of ligands: 36\n", - "R: 0.56 +/- 0.25\n", - "R²: 0.31\n", - "CI_0.95 for R²: [0.18 - 0.44]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.14\n", - "MUE(l): 0.63 +/- 0.09\n", - "RMSE(l): 0.83 +/- 0.10\n", - "Kendall tau: 0.34 +/- 0.19\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for CDK2 from CONSENSUS.\n", - "Number of ligands: 16\n", - "R: 0.77 +/- 0.14\n", - "R²: 0.59\n", - "CI_0.95 for R²: [0.40 - 0.74]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.30\n", - "MUE(l): 0.56 +/- 0.13\n", - "RMSE(l): 0.76 +/- 0.17\n", - "Kendall tau: 0.62 +/- 0.32\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for JNK1 from CONSENSUS.\n", - "Number of ligands: 21\n", - "R: 0.89 +/- 0.06\n", - "R²: 0.80\n", - "CI_0.95 for R²: [0.70 - 0.87]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.23\n", - "MUE(l): 0.59 +/- 0.05\n", - "RMSE(l): 0.64 +/- 0.06\n", - "Kendall tau: 0.78 +/- 0.39\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for MCL1 from CONSENSUS.\n", - "Number of ligands: 42\n", - "R: 0.69 +/- 0.17\n", - "R²: 0.48\n", - "CI_0.95 for R²: [0.35 - 0.58]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.12\n", - "MUE(l): 0.87 +/- 0.09\n", - "RMSE(l): 1.04 +/- 0.10\n", - "Kendall tau: 0.53 +/- 0.27\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for PTP1B from CONSENSUS.\n", - "Number of ligands: 23\n", - "R: 0.45 +/- 0.29\n", - "R²: 0.20\n", - "CI_0.95 for R²: [0.07 - 0.37]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.22\n", - "MUE(l): 0.92 +/- 0.15\n", - "RMSE(l): 1.15 +/- 0.21\n", - "Kendall tau: 0.36 +/- 0.19\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for P38 from CONSENSUS.\n", - "Number of ligands: 34\n", - "R: 0.77 +/- 0.12\n", - "R²: 0.59\n", - "CI_0.95 for R²: [0.47 - 0.69]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.15\n", - "MUE(l): 0.58 +/- 0.10\n", - "RMSE(l): 0.81 +/- 0.11\n", - "Kendall tau: 0.66 +/- 0.34\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for THROMBIN from CONSENSUS.\n", - "Number of ligands: 11\n", - "R: 0.04 +/- 0.53\n", - "R²: 0.00\n", - "CI_0.95 for R²: [0.09 - 0.14]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.42\n", - "MUE(l): 0.61 +/- 0.13\n", - "RMSE(l): 0.73 +/- 0.16\n", - "Kendall tau: 0.11 +/- 0.34\n", - "----------------------------------------------------\n", - "Calculating results for TYK2 from CONSENSUS.\n", - "Number of ligands: 16\n", - "R: 0.65 +/- 0.22\n", - "R²: 0.42\n", - "CI_0.95 for R²: [0.21 - 0.61]\n", - "critical R² for p=0.99: 0.30\n", - "MUE(l): 1.00 +/- 0.11\n", - "RMSE(l): 1.09 +/- 0.09\n", - "Kendall tau: 0.38 +/- 0.23\n", - "----------------------------------------------------\n", - "==================================================== \n", - "\n" - ] - } - ], - "source": [ - "for i in who:\n", - " for f in folders:\n", - " analyze_results(i,f,10000, False) #who,which,n_bootstrap,generate_plot\n", - " print('='*52,'\\n')" - ] - }, - { - "cell_type": "markdown", - "metadata": {}, - "source": [ - "Run part 2 (MUE(p))." - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": 10, - "metadata": {}, - "outputs": [ - { - "name": "stdout", - "output_type": "stream", - "text": [ - "CRESSET_VALID - BACE\n", - "Number of calculations considered: 55\n", - "MUE(p): 0.95 +/- 0.10 kcal/mol, 3.96 +/- 0.41 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.20 +/- 0.12, kcal/mol 5.01 +/- 0.50 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CRESSET_VALID - CDK2\n", - "Number of calculations considered: 22\n", - "MUE(p): 0.95 +/- 0.12 kcal/mol, 3.98 +/- 0.50 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.11 +/- 0.12, kcal/mol 4.65 +/- 0.49 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CRESSET_VALID - JNK1\n", - "Number of calculations considered: 34\n", - "MUE(p): 0.77 +/- 0.10 kcal/mol, 3.24 +/- 0.42 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.97 +/- 0.11, kcal/mol 4.08 +/- 0.47 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CRESSET_VALID - MCL1\n", - "Number of calculations considered: 64\n", - "MUE(p): 1.36 +/- 0.12 kcal/mol, 5.71 +/- 0.52 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.69 +/- 0.16, kcal/mol 7.09 +/- 0.67 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CRESSET_VALID - PTP1B\n", - "Number of calculations considered: 26\n", - "MUE(p): 1.09 +/- 0.18 kcal/mol, 4.58 +/- 0.76 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.43 +/- 0.22, kcal/mol 5.99 +/- 0.93 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CRESSET_VALID - P38\n", - "Number of calculations considered: 46\n", - "MUE(p): 1.16 +/- 0.16 kcal/mol, 4.86 +/- 0.67 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.59 +/- 0.21, kcal/mol 6.66 +/- 0.88 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CRESSET_VALID - THROMBIN\n", - "Number of calculations considered: 14\n", - "MUE(p): 0.23 +/- 0.05 kcal/mol, 0.95 +/- 0.20 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.29 +/- 0.05, kcal/mol 1.21 +/- 0.20 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CRESSET_VALID - TYK2\n", - "Number of calculations considered: 16\n", - "MUE(p): 0.66 +/- 0.10 kcal/mol, 2.77 +/- 0.41 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.77 +/- 0.10, kcal/mol 3.21 +/- 0.40 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "Summary for CRESSET_VALID:\n", - "bace - MUE(p): 0.95 +/- 0.10 kcal/mol, 3.96 +/- 0.41 kJ/mol RMSE(p): 1.20 +/- 0.12, kcal/mol 5.01 +/- 0.50 kJ/mol\n", - "cdk2 - MUE(p): 0.95 +/- 0.12 kcal/mol, 3.98 +/- 0.50 kJ/mol RMSE(p): 1.11 +/- 0.12, kcal/mol 4.65 +/- 0.49 kJ/mol\n", - "jnk1 - MUE(p): 0.77 +/- 0.10 kcal/mol, 3.24 +/- 0.42 kJ/mol RMSE(p): 0.97 +/- 0.11, kcal/mol 4.08 +/- 0.47 kJ/mol\n", - "mcl1 - MUE(p): 1.36 +/- 0.12 kcal/mol, 5.71 +/- 0.52 kJ/mol RMSE(p): 1.69 +/- 0.16, kcal/mol 7.09 +/- 0.67 kJ/mol\n", - "ptp1b - MUE(p): 1.09 +/- 0.18 kcal/mol, 4.58 +/- 0.76 kJ/mol RMSE(p): 1.43 +/- 0.22, kcal/mol 5.99 +/- 0.93 kJ/mol\n", - "p38 - MUE(p): 1.16 +/- 0.16 kcal/mol, 4.86 +/- 0.67 kJ/mol RMSE(p): 1.59 +/- 0.21, kcal/mol 6.66 +/- 0.88 kJ/mol\n", - "thrombin - MUE(p): 0.23 +/- 0.05 kcal/mol, 0.95 +/- 0.20 kJ/mol RMSE(p): 0.29 +/- 0.05, kcal/mol 1.21 +/- 0.20 kJ/mol\n", - "tyk2 - MUE(p): 0.66 +/- 0.10 kcal/mol, 2.77 +/- 0.41 kJ/mol RMSE(p): 0.77 +/- 0.10, kcal/mol 3.21 +/- 0.40 kJ/mol\n", - "===================================================================================================================== \n", - "\n", - "SCHRODINGER - BACE\n", - "Number of calculations considered: 58\n", - "MUE(p): 0.84 +/- 0.08 kcal/mol, 3.52 +/- 0.32 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.03 +/- 0.08, kcal/mol 4.29 +/- 0.35 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "SCHRODINGER - CDK2\n", - "Number of calculations considered: 25\n", - "MUE(p): 0.91 +/- 0.13 kcal/mol, 3.81 +/- 0.54 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.11 +/- 0.13, kcal/mol 4.66 +/- 0.53 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "SCHRODINGER - JNK1\n", - "Number of calculations considered: 31\n", - "MUE(p): 0.78 +/- 0.11 kcal/mol, 3.28 +/- 0.46 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.99 +/- 0.13, kcal/mol 4.16 +/- 0.56 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "SCHRODINGER - MCL1\n", - "Number of calculations considered: 71\n", - "MUE(p): 1.16 +/- 0.10 kcal/mol, 4.84 +/- 0.40 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.41 +/- 0.11, kcal/mol 5.91 +/- 0.44 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "SCHRODINGER - PTP1B\n", - "Number of calculations considered: 49\n", - "MUE(p): 0.89 +/- 0.12 kcal/mol, 3.74 +/- 0.50 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.22 +/- 0.17, kcal/mol 5.12 +/- 0.73 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "SCHRODINGER - P38\n", - "Number of calculations considered: 56\n", - "MUE(p): 0.80 +/- 0.09 kcal/mol, 3.36 +/- 0.36 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.03 +/- 0.10, kcal/mol 4.30 +/- 0.41 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "SCHRODINGER - THROMBIN\n", - "Number of calculations considered: 16\n", - "MUE(p): 0.76 +/- 0.13 kcal/mol, 3.16 +/- 0.56 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.93 +/- 0.15, kcal/mol 3.87 +/- 0.62 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "SCHRODINGER - TYK2\n", - "Number of calculations considered: 24\n", - "MUE(p): 0.75 +/- 0.11 kcal/mol, 3.14 +/- 0.47 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.93 +/- 0.12, kcal/mol 3.90 +/- 0.51 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "Summary for SCHRODINGER:\n", - "bace - MUE(p): 0.84 +/- 0.08 kcal/mol, 3.52 +/- 0.32 kJ/mol RMSE(p): 1.03 +/- 0.08, kcal/mol 4.29 +/- 0.35 kJ/mol\n", - "cdk2 - MUE(p): 0.91 +/- 0.13 kcal/mol, 3.81 +/- 0.54 kJ/mol RMSE(p): 1.11 +/- 0.13, kcal/mol 4.66 +/- 0.53 kJ/mol\n", - "jnk1 - MUE(p): 0.78 +/- 0.11 kcal/mol, 3.28 +/- 0.46 kJ/mol RMSE(p): 0.99 +/- 0.13, kcal/mol 4.16 +/- 0.56 kJ/mol\n", - "mcl1 - MUE(p): 1.16 +/- 0.10 kcal/mol, 4.84 +/- 0.40 kJ/mol RMSE(p): 1.41 +/- 0.11, kcal/mol 5.91 +/- 0.44 kJ/mol\n", - "ptp1b - MUE(p): 0.89 +/- 0.12 kcal/mol, 3.74 +/- 0.50 kJ/mol RMSE(p): 1.22 +/- 0.17, kcal/mol 5.12 +/- 0.73 kJ/mol\n", - "p38 - MUE(p): 0.80 +/- 0.09 kcal/mol, 3.36 +/- 0.36 kJ/mol RMSE(p): 1.03 +/- 0.10, kcal/mol 4.30 +/- 0.41 kJ/mol\n", - "thrombin - MUE(p): 0.76 +/- 0.13 kcal/mol, 3.16 +/- 0.56 kJ/mol RMSE(p): 0.93 +/- 0.15, kcal/mol 3.87 +/- 0.62 kJ/mol\n", - "tyk2 - MUE(p): 0.75 +/- 0.11 kcal/mol, 3.14 +/- 0.47 kJ/mol RMSE(p): 0.93 +/- 0.12, kcal/mol 3.90 +/- 0.51 kJ/mol\n", - "===================================================================================================================== \n", - "\n", - "AMBER - BACE\n", - "Number of calculations considered: 58\n", - "MUE(p): 1.20 +/- 0.11 kcal/mol, 5.00 +/- 0.48 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.47 +/- 0.12, kcal/mol 6.17 +/- 0.50 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "AMBER - CDK2\n", - "Number of calculations considered: 25\n", - "MUE(p): 0.97 +/- 0.11 kcal/mol, 4.06 +/- 0.48 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.13 +/- 0.14, kcal/mol 4.72 +/- 0.57 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "AMBER - JNK1\n", - "Number of calculations considered: 31\n", - "MUE(p): 1.07 +/- 0.17 kcal/mol, 4.47 +/- 0.73 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.45 +/- 0.23, kcal/mol 6.07 +/- 0.96 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "AMBER - MCL1\n", - "Number of calculations considered: 71\n", - "MUE(p): 1.52 +/- 0.12 kcal/mol, 6.35 +/- 0.51 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.83 +/- 0.13, kcal/mol 7.67 +/- 0.54 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "AMBER - PTP1B\n", - "Number of calculations considered: 49\n", - "MUE(p): 1.07 +/- 0.13 kcal/mol, 4.46 +/- 0.54 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.40 +/- 0.18, kcal/mol 5.86 +/- 0.74 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "AMBER - P38\n", - "Number of calculations considered: 56\n", - "MUE(p): 1.20 +/- 0.13 kcal/mol, 5.02 +/- 0.56 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.56 +/- 0.15, kcal/mol 6.54 +/- 0.64 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "AMBER - THROMBIN\n", - "Number of calculations considered: 16\n", - "MUE(p): 0.46 +/- 0.10 kcal/mol, 1.94 +/- 0.44 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.62 +/- 0.14, kcal/mol 2.61 +/- 0.57 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "AMBER - TYK2\n", - "Number of calculations considered: 24\n", - "MUE(p): 1.07 +/- 0.14 kcal/mol, 4.49 +/- 0.57 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.27 +/- 0.14, kcal/mol 5.30 +/- 0.58 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "Summary for AMBER:\n", - "bace - MUE(p): 1.20 +/- 0.11 kcal/mol, 5.00 +/- 0.48 kJ/mol RMSE(p): 1.47 +/- 0.12, kcal/mol 6.17 +/- 0.50 kJ/mol\n", - "cdk2 - MUE(p): 0.97 +/- 0.11 kcal/mol, 4.06 +/- 0.48 kJ/mol RMSE(p): 1.13 +/- 0.14, kcal/mol 4.72 +/- 0.57 kJ/mol\n", - "jnk1 - MUE(p): 1.07 +/- 0.17 kcal/mol, 4.47 +/- 0.73 kJ/mol RMSE(p): 1.45 +/- 0.23, kcal/mol 6.07 +/- 0.96 kJ/mol\n", - "mcl1 - MUE(p): 1.52 +/- 0.12 kcal/mol, 6.35 +/- 0.51 kJ/mol RMSE(p): 1.83 +/- 0.13, kcal/mol 7.67 +/- 0.54 kJ/mol\n", - "ptp1b - MUE(p): 1.07 +/- 0.13 kcal/mol, 4.46 +/- 0.54 kJ/mol RMSE(p): 1.40 +/- 0.18, kcal/mol 5.86 +/- 0.74 kJ/mol\n", - "p38 - MUE(p): 1.20 +/- 0.13 kcal/mol, 5.02 +/- 0.56 kJ/mol RMSE(p): 1.56 +/- 0.15, kcal/mol 6.54 +/- 0.64 kJ/mol\n", - "thrombin - MUE(p): 0.46 +/- 0.10 kcal/mol, 1.94 +/- 0.44 kJ/mol RMSE(p): 0.62 +/- 0.14, kcal/mol 2.61 +/- 0.57 kJ/mol\n", - "tyk2 - MUE(p): 1.07 +/- 0.14 kcal/mol, 4.49 +/- 0.57 kJ/mol RMSE(p): 1.27 +/- 0.14, kcal/mol 5.30 +/- 0.58 kJ/mol\n", - "===================================================================================================================== \n", - "\n", - "GAFF - BACE\n", - "Number of calculations considered: 58\n" - ] - }, - { - "name": "stdout", - "output_type": "stream", - "text": [ - "MUE(p): 0.84 +/- 0.09 kcal/mol, 3.51 +/- 0.39 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.09 +/- 0.10, kcal/mol 4.58 +/- 0.44 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "GAFF - CDK2\n", - "Number of calculations considered: 25\n", - "MUE(p): 0.68 +/- 0.12 kcal/mol, 2.86 +/- 0.51 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.92 +/- 0.15, kcal/mol 3.84 +/- 0.62 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "GAFF - JNK1\n", - "Number of calculations considered: 31\n", - "MUE(p): 0.80 +/- 0.12 kcal/mol, 3.36 +/- 0.51 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.05 +/- 0.16, kcal/mol 4.41 +/- 0.68 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "GAFF - MCL1\n", - "Number of calculations considered: 71\n", - "MUE(p): 1.23 +/- 0.11 kcal/mol, 5.17 +/- 0.48 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.56 +/- 0.13, kcal/mol 6.54 +/- 0.54 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "GAFF - PTP1B\n", - "Number of calculations considered: 49\n", - "MUE(p): 0.90 +/- 0.10 kcal/mol, 3.76 +/- 0.40 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.12 +/- 0.11, kcal/mol 4.67 +/- 0.47 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "GAFF - P38\n", - "Number of calculations considered: 56\n", - "MUE(p): 0.77 +/- 0.07 kcal/mol, 3.21 +/- 0.30 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.93 +/- 0.07, kcal/mol 3.90 +/- 0.31 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "GAFF - THROMBIN\n", - "Number of calculations considered: 16\n", - "MUE(p): 0.77 +/- 0.15 kcal/mol, 3.24 +/- 0.63 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.98 +/- 0.15, kcal/mol 4.09 +/- 0.64 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "GAFF - TYK2\n", - "Number of calculations considered: 24\n", - "MUE(p): 1.01 +/- 0.16 kcal/mol, 4.25 +/- 0.65 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.27 +/- 0.17, kcal/mol 5.33 +/- 0.70 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "Summary for GAFF:\n", - "bace - MUE(p): 0.84 +/- 0.09 kcal/mol, 3.51 +/- 0.39 kJ/mol RMSE(p): 1.09 +/- 0.10, kcal/mol 4.58 +/- 0.44 kJ/mol\n", - "cdk2 - MUE(p): 0.68 +/- 0.12 kcal/mol, 2.86 +/- 0.51 kJ/mol RMSE(p): 0.92 +/- 0.15, kcal/mol 3.84 +/- 0.62 kJ/mol\n", - "jnk1 - MUE(p): 0.80 +/- 0.12 kcal/mol, 3.36 +/- 0.51 kJ/mol RMSE(p): 1.05 +/- 0.16, kcal/mol 4.41 +/- 0.68 kJ/mol\n", - "mcl1 - MUE(p): 1.23 +/- 0.11 kcal/mol, 5.17 +/- 0.48 kJ/mol RMSE(p): 1.56 +/- 0.13, kcal/mol 6.54 +/- 0.54 kJ/mol\n", - "ptp1b - MUE(p): 0.90 +/- 0.10 kcal/mol, 3.76 +/- 0.40 kJ/mol RMSE(p): 1.12 +/- 0.11, kcal/mol 4.67 +/- 0.47 kJ/mol\n", - "p38 - MUE(p): 0.77 +/- 0.07 kcal/mol, 3.21 +/- 0.30 kJ/mol RMSE(p): 0.93 +/- 0.07, kcal/mol 3.90 +/- 0.31 kJ/mol\n", - "thrombin - MUE(p): 0.77 +/- 0.15 kcal/mol, 3.24 +/- 0.63 kJ/mol RMSE(p): 0.98 +/- 0.15, kcal/mol 4.09 +/- 0.64 kJ/mol\n", - "tyk2 - MUE(p): 1.01 +/- 0.16 kcal/mol, 4.25 +/- 0.65 kJ/mol RMSE(p): 1.27 +/- 0.17, kcal/mol 5.33 +/- 0.70 kJ/mol\n", - "===================================================================================================================== \n", - "\n", - "CGENFF - BACE\n", - "Number of calculations considered: 58\n", - "MUE(p): 1.03 +/- 0.10 kcal/mol, 4.31 +/- 0.42 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.29 +/- 0.11, kcal/mol 5.38 +/- 0.47 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CGENFF - CDK2\n", - "Number of calculations considered: 25\n", - "MUE(p): 0.84 +/- 0.13 kcal/mol, 3.51 +/- 0.55 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.06 +/- 0.14, kcal/mol 4.44 +/- 0.60 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CGENFF - JNK1\n", - "Number of calculations considered: 31\n", - "MUE(p): 0.67 +/- 0.12 kcal/mol, 2.80 +/- 0.49 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.93 +/- 0.15, kcal/mol 3.89 +/- 0.63 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CGENFF - MCL1\n", - "Number of calculations considered: 71\n", - "MUE(p): 1.53 +/- 0.13 kcal/mol, 6.40 +/- 0.55 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.90 +/- 0.16, kcal/mol 7.95 +/- 0.66 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CGENFF - PTP1B\n", - "Number of calculations considered: 49\n", - "MUE(p): 0.92 +/- 0.14 kcal/mol, 3.84 +/- 0.60 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.37 +/- 0.18, kcal/mol 5.72 +/- 0.76 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CGENFF - P38\n", - "Number of calculations considered: 56\n", - "MUE(p): 1.07 +/- 0.12 kcal/mol, 4.46 +/- 0.50 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.39 +/- 0.14, kcal/mol 5.82 +/- 0.59 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CGENFF - THROMBIN\n", - "Number of calculations considered: 16\n", - "MUE(p): 0.89 +/- 0.27 kcal/mol, 3.73 +/- 1.13 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.39 +/- 0.40, kcal/mol 5.83 +/- 1.69 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CGENFF - TYK2\n", - "Number of calculations considered: 24\n", - "MUE(p): 1.33 +/- 0.18 kcal/mol, 5.58 +/- 0.77 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.61 +/- 0.19, kcal/mol 6.74 +/- 0.80 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "Summary for CGENFF:\n", - "bace - MUE(p): 1.03 +/- 0.10 kcal/mol, 4.31 +/- 0.42 kJ/mol RMSE(p): 1.29 +/- 0.11, kcal/mol 5.38 +/- 0.47 kJ/mol\n", - "cdk2 - MUE(p): 0.84 +/- 0.13 kcal/mol, 3.51 +/- 0.55 kJ/mol RMSE(p): 1.06 +/- 0.14, kcal/mol 4.44 +/- 0.60 kJ/mol\n", - "jnk1 - MUE(p): 0.67 +/- 0.12 kcal/mol, 2.80 +/- 0.49 kJ/mol RMSE(p): 0.93 +/- 0.15, kcal/mol 3.89 +/- 0.63 kJ/mol\n", - "mcl1 - MUE(p): 1.53 +/- 0.13 kcal/mol, 6.40 +/- 0.55 kJ/mol RMSE(p): 1.90 +/- 0.16, kcal/mol 7.95 +/- 0.66 kJ/mol\n", - "ptp1b - MUE(p): 0.92 +/- 0.14 kcal/mol, 3.84 +/- 0.60 kJ/mol RMSE(p): 1.37 +/- 0.18, kcal/mol 5.72 +/- 0.76 kJ/mol\n", - "p38 - MUE(p): 1.07 +/- 0.12 kcal/mol, 4.46 +/- 0.50 kJ/mol RMSE(p): 1.39 +/- 0.14, kcal/mol 5.82 +/- 0.59 kJ/mol\n", - "thrombin - MUE(p): 0.89 +/- 0.27 kcal/mol, 3.73 +/- 1.13 kJ/mol RMSE(p): 1.39 +/- 0.40, kcal/mol 5.83 +/- 1.69 kJ/mol\n", - "tyk2 - MUE(p): 1.33 +/- 0.18 kcal/mol, 5.58 +/- 0.77 kJ/mol RMSE(p): 1.61 +/- 0.19, kcal/mol 6.74 +/- 0.80 kJ/mol\n", - "===================================================================================================================== \n", - "\n", - "CONSENSUS - BACE\n", - "Number of calculations considered: 58\n", - "MUE(p): 0.87 +/- 0.09 kcal/mol, 3.64 +/- 0.37 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.10 +/- 0.10, kcal/mol 4.61 +/- 0.41 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CONSENSUS - CDK2\n", - "Number of calculations considered: 25\n", - "MUE(p): 0.70 +/- 0.12 kcal/mol, 2.91 +/- 0.52 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.93 +/- 0.15, kcal/mol 3.89 +/- 0.63 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CONSENSUS - JNK1\n", - "Number of calculations considered: 31\n", - "MUE(p): 0.47 +/- 0.08 kcal/mol, 1.96 +/- 0.34 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.66 +/- 0.11, kcal/mol 2.74 +/- 0.45 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CONSENSUS - MCL1\n", - "Number of calculations considered: 71\n", - "MUE(p): 1.26 +/- 0.11 kcal/mol, 5.28 +/- 0.47 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.57 +/- 0.13, kcal/mol 6.58 +/- 0.52 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CONSENSUS - PTP1B\n", - "Number of calculations considered: 49\n", - "MUE(p): 0.77 +/- 0.10 kcal/mol, 3.23 +/- 0.41 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.04 +/- 0.13, kcal/mol 4.34 +/- 0.54 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CONSENSUS - P38\n", - "Number of calculations considered: 56\n", - "MUE(p): 0.72 +/- 0.08 kcal/mol, 3.00 +/- 0.32 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.92 +/- 0.09, kcal/mol 3.84 +/- 0.37 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CONSENSUS - THROMBIN\n", - "Number of calculations considered: 16\n", - "MUE(p): 0.53 +/- 0.14 kcal/mol, 2.23 +/- 0.57 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 0.76 +/- 0.20, kcal/mol 3.19 +/- 0.85 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "CONSENSUS - TYK2\n", - "Number of calculations considered: 24\n", - "MUE(p): 1.00 +/- 0.16 kcal/mol, 4.17 +/- 0.69 kJ/mol\n", - "RMSE(p): 1.27 +/- 0.17, kcal/mol 5.31 +/- 0.72 kJ/mol\n", - "-----------------------------------------------------\n", - "Summary for CONSENSUS:\n", - "bace - MUE(p): 0.87 +/- 0.09 kcal/mol, 3.64 +/- 0.37 kJ/mol RMSE(p): 1.10 +/- 0.10, kcal/mol 4.61 +/- 0.41 kJ/mol\n", - "cdk2 - MUE(p): 0.70 +/- 0.12 kcal/mol, 2.91 +/- 0.52 kJ/mol RMSE(p): 0.93 +/- 0.15, kcal/mol 3.89 +/- 0.63 kJ/mol\n", - "jnk1 - MUE(p): 0.47 +/- 0.08 kcal/mol, 1.96 +/- 0.34 kJ/mol RMSE(p): 0.66 +/- 0.11, kcal/mol 2.74 +/- 0.45 kJ/mol\n", - "mcl1 - MUE(p): 1.26 +/- 0.11 kcal/mol, 5.28 +/- 0.47 kJ/mol RMSE(p): 1.57 +/- 0.13, kcal/mol 6.58 +/- 0.52 kJ/mol\n", - "ptp1b - MUE(p): 0.77 +/- 0.10 kcal/mol, 3.23 +/- 0.41 kJ/mol RMSE(p): 1.04 +/- 0.13, kcal/mol 4.34 +/- 0.54 kJ/mol\n", - "p38 - MUE(p): 0.72 +/- 0.08 kcal/mol, 3.00 +/- 0.32 kJ/mol RMSE(p): 0.92 +/- 0.09, kcal/mol 3.84 +/- 0.37 kJ/mol\n", - "thrombin - MUE(p): 0.53 +/- 0.14 kcal/mol, 2.23 +/- 0.57 kJ/mol RMSE(p): 0.76 +/- 0.20, kcal/mol 3.19 +/- 0.85 kJ/mol\n", - "tyk2 - MUE(p): 1.00 +/- 0.16 kcal/mol, 4.17 +/- 0.69 kJ/mol RMSE(p): 1.27 +/- 0.17, kcal/mol 5.31 +/- 0.72 kJ/mol\n", - "===================================================================================================================== \n", - "\n" - ] - } - ], - "source": [ - "for i in who:\n", - " error_per_perturbation(i, folders, 10000, False) #who, folders, n_bootstrap, info/verbose" - ] - } - ], - "metadata": { - "kernelspec": { - "display_name": "Python 3", - "language": "python", - "name": "python3" - }, - "language_info": { - "codemirror_mode": { - "name": "ipython", - "version": 3 - }, - "file_extension": ".py", - "mimetype": "text/x-python", - "name": "python", - "nbconvert_exporter": "python", - "pygments_lexer": "ipython3", - "version": "3.6.5" - } - }, - "nbformat": 4, - "nbformat_minor": 2 -} diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/wang_2015_datasets/thrombin/results/experimental_dG.xlsx b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/wang_2015_datasets/thrombin/results/experimental_dG.xlsx deleted file mode 100755 index 687bc116..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/SI-Cresset/wang_2015_datasets/thrombin/results/experimental_dG.xlsx and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/final_results_all.xlsx b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/final_results_all.xlsx deleted file mode 100755 index 41631f3e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/final_results_all.xlsx and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 74a6f900..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.pngCCC_BACE_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.pngCCC_BACE_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index e16b9f11..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.pngCCC_BACE_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 5ca27446..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.pngCCC_BACE_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.pngCCC_BACE_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 48be528c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.pngCCC_BACE_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index b1de0c62..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 85020ff0..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 85658dff..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 9b620b4b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index d5e0ea8b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 13173188..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index c6b0d0ea..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index ff0b837d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 9a0fed70..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 36def1b5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 9d455683..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 7b44cac9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 4da612c5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 029c4b4b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index b7a5f39b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 8b7db492..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index ac7f2e6e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 29b6e6c4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 6b5be80f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index fbe7a8ce..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 90747cc2..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 162f8980..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 98659a8f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d16dfc62..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 9556a16a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d97d71e6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 79689a64..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index d7a277fd..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 064bd9ef..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 238a2fef..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 9311a399..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 6efe0969..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 8df92407..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 032fa2fc..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d841fbf9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 4fd4f234..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index ebe7697f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 71f579af..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index a336ad91..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF/MCL1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF/MCL1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index db9c2c15..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF/MCL1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index fa6c461a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 16f4e22e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF2/MCL1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF2/MCL1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 66110c53..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/MCL1/openFF2/MCL1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index b026b780..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 3233d58b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index e065bd6e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 3910b4dd..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d923aab4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 79242837..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 931c9f9a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index b5613c51..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 89662337..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 56ef653b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index a7ba321b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 2888112c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 06de8f71..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d6cee033..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 13dfa14d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 429be70c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 2e38d748..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index da2fa36c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index b4e9c3ea..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index ffd7a8cd..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index ed6e0f95..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index bb043ade..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 96669aa8..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index ff0deeff..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 60a51f3e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 428fe221..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 74e72171..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 7d53171c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index e5bd97ad..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 00c0dc08..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index d221b974..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index c6e6967e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index d855f84d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index dad6d305..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0af99ce4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/OPLS2015/p38_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/OPLS2015/p38_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 55ed49e6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/OPLS2015/p38_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index ec7a4829..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index ff1858e4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index f2082f3c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 2d510890..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index f6b7fae5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF2/p38_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF2/p38_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 6bae2382..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/JACS/p38/openFF2/p38_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 003c2a21..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 1d88c5e6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0165c87f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 749d918f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 821ee714..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 8d4a2aa7..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index f44c019a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index aad9a6de..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 78e7730e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index d68c913b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index aad2f189..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index dd029d34..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index b236724a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.pngCCC_cmet_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.pngCCC_cmet_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 098380f2..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.pngCCC_cmet_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index e67b236f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.pngCCC_cmet_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.pngCCC_cmet_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index abeb57dd..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.pngCCC_cmet_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 3f7c5088..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 2a87235b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 80f2124c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 9d325ea3..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 4efca239..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 984ffa4d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index b19114cb..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 43b27b21..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.pngCCC_eg5_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.pngCCC_eg5_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 82ff6cb7..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.pngCCC_eg5_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index fd4d6f71..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.pngCCC_eg5_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.pngCCC_eg5_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index e16b56ba..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.pngCCC_eg5_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 797aeff0..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 9bb5c815..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index d9cd999b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 6fe57789..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 4a66812c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF2/eg5_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF2/eg5_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index dca0469c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/eg5/openFF2/eg5_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 977dcb7e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d5d2f034..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 846ac650..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 70d2218f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 468665b2..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index c21bef40..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 91e4e85d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index cbd16ad3..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index dc25a3b4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 89c1bf41..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF2/hif2a_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF2/hif2a_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index f6e15a72..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/hif2a/openFF2/hif2a_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index a6233616..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index e2729182..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 49d7b542..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 57be3e50..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 178e9728..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0a20db33..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 01468b8b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 5f171ce3..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 96c9dc9c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 7ef40e65..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 5952ab65..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 5a6d14b6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 1e1c2941..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index eb6883e7..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.pngCCC_shp2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.pngCCC_shp2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d0080cf1..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.pngCCC_shp2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 03272f8a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 6b9280b0..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index db10d00f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 20cbb7fe..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 8a717cf9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index d5519082..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 07ba637b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 9ec0bc94..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.pngCCC_syk_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.pngCCC_syk_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d30b6259..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.pngCCC_syk_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index da3d89d0..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.pngCCC_syk_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.pngCCC_syk_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 2e63533b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.pngCCC_syk_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 1a45d47c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index d2507a82..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 58aa9821..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 56d31119..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 97682d9d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index a2152257..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index a9bedcc0..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index f6d0e327..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 7884f569..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index e708c4d5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 1abb6fe7..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index b3a0d06d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 6bf2cdd8..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index bf17a44a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index de380754..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index f9d33923..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 501dde1e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/merged_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.pngCCC_BACE_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.pngCCC_BACE_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index e16b9f11..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.pngCCC_BACE_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index a34c7c58..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.pngCCC_BACE_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.pngCCC_BACE_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 48be528c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.pngCCC_BACE_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index e16b9f11..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 48be528c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 85658dff..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 9b620b4b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index d5e0ea8b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 13173188..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 41e939cc..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 059e3417..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 9c46e25f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 2286a799..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 9d455683..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 7b44cac9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 64eebf6b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 029c4b4b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index b7a5f39b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 8b7db492..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index ac7f2e6e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 45f14fa1..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 3a790ee3..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index fbe7a8ce..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d16dfc62..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d97d71e6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 98659a8f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d16dfc62..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 81d45992..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d97d71e6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 79689a64..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index d7a277fd..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 064bd9ef..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index c0a93326..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 946dff3e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 6efe0969..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d841fbf9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index ebe7697f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d841fbf9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index cbfbd64f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index ebe7697f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 71f579af..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index a336ad91..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF/MCL1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF/MCL1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index db9c2c15..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF/MCL1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index fa6c461a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 16f4e22e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF2/MCL1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF2/MCL1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 66110c53..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/MCL1/openFF2/MCL1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index e065bd6e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d923aab4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index b3480b75..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 748241f5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index e065bd6e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 1bb0765c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d923aab4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index e065bd6e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 1bb0765c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d923aab4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 79242837..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 931c9f9a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index b5613c51..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 89662337..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 56ef653b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index a7ba321b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d6cee033..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 429be70c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d6cee033..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index c59b92c3..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 429be70c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 2e38d748..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index da2fa36c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index b4e9c3ea..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index ffd7a8cd..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index ed6e0f95..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index bb043ade..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 60a51f3e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 74e72171..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 60a51f3e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0be027c7..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 74e72171..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 7d53171c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index e5bd97ad..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 00c0dc08..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index d221b974..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index c6e6967e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index d855f84d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 7c1e8ab4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 245682cc..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index ec7a4829..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index ff1858e4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index f2082f3c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 2d510890..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index f6b7fae5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF2/p38_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF2/p38_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 6bae2382..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/JACS/p38/openFF2/p38_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0165c87f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 821ee714..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0165c87f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 1325812e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 821ee714..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 8d4a2aa7..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index f44c019a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index aad9a6de..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 78e7730e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index d68c913b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index aad2f189..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 2cb10724..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 5ab9b932..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.pngCCC_cmet_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.pngCCC_cmet_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 098380f2..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.pngCCC_cmet_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 9afbcc3a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.pngCCC_cmet_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.pngCCC_cmet_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index abeb57dd..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.pngCCC_cmet_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 3f7c5088..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 2a87235b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 80f2124c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 9d325ea3..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 4efca239..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 984ffa4d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 7ff1c75e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index fb614798..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.pngCCC_eg5_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.pngCCC_eg5_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 82ff6cb7..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.pngCCC_eg5_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 97c446ad..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.pngCCC_eg5_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.pngCCC_eg5_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index e16b56ba..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.pngCCC_eg5_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 797aeff0..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 9bb5c815..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index d9cd999b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 6fe57789..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 4a66812c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF2/eg5_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF2/eg5_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index dca0469c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/eg5/openFF2/eg5_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 846ac650..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 468665b2..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 846ac650..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0ebbae0b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 468665b2..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index c21bef40..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 91e4e85d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index cbd16ad3..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index dc25a3b4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 89c1bf41..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF2/hif2a_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF2/hif2a_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index f6e15a72..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/hif2a/openFF2/hif2a_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 49d7b542..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 178e9728..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 49d7b542..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index ac2bf6da..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 178e9728..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0a20db33..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 01468b8b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 5f171ce3..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 96c9dc9c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 7ef40e65..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 5952ab65..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 6c3097f3..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d0080cf1..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 56681af5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.pngCCC_shp2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.pngCCC_shp2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d0080cf1..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.pngCCC_shp2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 03272f8a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 6b9280b0..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index db10d00f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 20cbb7fe..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 8a717cf9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index d5519082..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d1d742ed..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index b0e4a21d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.pngCCC_syk_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.pngCCC_syk_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d30b6259..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.pngCCC_syk_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 92d4e478..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.pngCCC_syk_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.pngCCC_syk_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 2e63533b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.pngCCC_syk_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 1a45d47c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index d2507a82..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 58aa9821..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 56d31119..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 97682d9d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index a2152257..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index a78e2a7a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index e0666e2f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 7884f569..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 905ebc8c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 1abb6fe7..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index b3a0d06d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 6bf2cdd8..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index bf17a44a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index de380754..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index f9d33923..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 501dde1e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 74a6f900..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.pngCCC_BACE_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.pngCCC_BACE_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index e16b9f11..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.pngCCC_BACE_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index f6f28204..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.pngCCC_BACE_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.pngCCC_BACE_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 48be528c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.pngCCC_BACE_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 75cbb8a9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 435f2826..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 65954a96..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 33339da5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index e39f73b9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 09bfb695..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 842a9e40..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 3ac72d33..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0482e5c0..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 574332eb..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 9d455683..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 7b44cac9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 08268819..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 029c4b4b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0baed07b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 84bb8574..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index ff2d9cf0..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index f87b3299..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index aff80d22..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index fbe7a8ce..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 3028cee6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index a76a905a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 98659a8f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d16dfc62..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index b0337221..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d97d71e6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 7379c34d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 11856fc5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 70f97bc5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0a17fad5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index c3ebc0b9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 34c15ba8..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index f1dfc538..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index f7125a5e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d841fbf9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 53ca9809..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index ebe7697f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index c05c3849..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 43eca062..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF/MCL1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF/MCL1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index a884a56d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF/MCL1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 9b14dba0..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 7143df65..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF2/MCL1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF2/MCL1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 9874c667..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/MCL1/openFF2/MCL1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 28d2912f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d3d86b76..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 70d882ca..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index e065bd6e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index c28accf6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d923aab4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 1eea6baf..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 6b6469cd..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index f6997cfe..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index d9755567..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 48d3d908..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 2ea6040d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 5bde85c7..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d043e409..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index dd4ec9d9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d6cee033..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0d11c9a8..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 429be70c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index d989d93b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 8ac45496..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index b4e9c3ea..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index db186e83..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 802fd37d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index bb043ade..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 8c4371aa..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 42b9b98b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 9f4741e3..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 60a51f3e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 20ca0b4e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 74e72171..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 79e7019f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index abef96a1..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 9dce9e39..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 18289bb0..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index c65fd82c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index d855f84d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 06fd7dce..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 661ec795..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/OPLS2015/p38_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/OPLS2015/p38_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 6a2ebdbf..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/OPLS2015/p38_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 471342f1..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index fb13643d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF/p38_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF/p38_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF/p38_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF/p38_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF/p38_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 00a52876..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF/p38_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index a9801214..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 099e8479..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF2/p38_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF2/p38_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index f35fe8e2..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/JACS/p38/openFF2/p38_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 049aac2f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index a12256f3..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0165c87f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 060a9990..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 821ee714..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.pngCCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 1440d091..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index e7849efe..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 47a69c38..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index fe47a81c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 18ae4a2e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 9467ae03..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index a58527aa..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 5531bcea..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.pngCCC_cmet_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.pngCCC_cmet_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 098380f2..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.pngCCC_cmet_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index f6caca35..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.pngCCC_cmet_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.pngCCC_cmet_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index abeb57dd..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.pngCCC_cmet_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index fb9a3c0e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index c173fbd8..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index af65b791..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 391aa8d0..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index fead795f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 984ffa4d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 6d205e02..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 5e5c6d3f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.pngCCC_eg5_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.pngCCC_eg5_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 82ff6cb7..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.pngCCC_eg5_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index fd4d6f71..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.pngCCC_eg5_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.pngCCC_eg5_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index e16b56ba..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.pngCCC_eg5_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index d03baba3..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index c4bf4a00..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index d9cd999b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 8718ca5c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index d7682aa8..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF2/eg5_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF2/eg5_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index dca0469c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/eg5/openFF2/eg5_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0a7b705c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index b9f637e9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 846ac650..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d0f564ba..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 468665b2..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.pngCCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index b89dc210..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 90b7f28d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 923c6425..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 62981f03..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0c27a90f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF2/hif2a_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF2/hif2a_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index af59c21a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/hif2a/openFF2/hif2a_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 88a460d8..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 6f2882ff..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 49d7b542..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 93482dc5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 178e9728..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.pngCCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 69704dfc..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index e926d8ec..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 11b90719..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 74f673fc..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 58289b4c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 5c4681cc..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index cf1e94b5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 7e23d1ec..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 931b4989..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.pngCCC_shp2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.pngCCC_shp2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d0080cf1..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.pngCCC_shp2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index c707c3d1..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 99d1165a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 36b5f8d1..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 1365d4c6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 5fc89f43..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 62b8af8a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 41c1ff3c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 43e08e28..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.pngCCC_syk_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.pngCCC_syk_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d30b6259..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.pngCCC_syk_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 5c1d6b2c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.pngCCC_syk_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.pngCCC_syk_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 2e63533b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.pngCCC_syk_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 28336376..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 552c8ca9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF/syk_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF/syk_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF/syk_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF/syk_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF/syk_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 58aa9821..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF/syk_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 144b5bb1..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 8afc106f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 7c9bf834..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 2ef635eb..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 7f59d9e6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 7884f569..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index bdfbd850..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 1abb6fe7..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.pngCCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index aa80b665..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 1904e7f8..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index ec660fd8..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 9a72c5fb..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index a399e657..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0bcd80a7..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/new_results_2/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 74a6f900..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.pngCCC_BACE_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.pngCCC_BACE_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index e16b9f11..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_dG.pngCCC_BACE_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 5ca27446..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.pngCCC_BACE_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.pngCCC_BACE_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 48be528c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/BACE_OPLS2015_ddG.pngCCC_BACE_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 4140d91b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index c508e21f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/OPLS2015/CCC_BACE_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 85658dff..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF/BACE_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 9b620b4b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index d5e0ea8b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF/CCC_BACE_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 13173188..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF2/BACE_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index c6b0d0ea..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index ff0b837d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/BACE/openFF2/CCC_BACE_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index adc11f6a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 72f043dc..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 9d455683..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 7b44cac9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_dG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 4da612c5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 029c4b4b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/OPLS2015/CDK2_OPLS2015_ddG.pngCCC_CDK2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index b7a5f39b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 8b7db492..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF/CCC_CDK2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index ac7f2e6e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF/CDK2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 29b6e6c4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 6b5be80f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF2/CCC_CDK2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index fbe7a8ce..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/CDK2/openFF2/CDK2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 853baf82..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 3634f555..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/CCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 98659a8f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d16dfc62..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_dG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 9556a16a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d97d71e6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/OPLS2015/JNK1_OPLS2015_ddG.pngCCC_JNK1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 79689a64..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index d7a277fd..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF/CCC_JNK1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 064bd9ef..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF/JNK1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 238a2fef..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 9311a399..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF2/CCC_JNK1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 6efe0969..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/JNK1/openFF2/JNK1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index feff53f5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 114ed971..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/CCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d841fbf9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_dG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 4fd4f234..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index ebe7697f..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/OPLS2015/MCL1_OPLS2015_ddG.pngCCC_MCL1_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 71f579af..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index a336ad91..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF/CCC_MCL1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF/MCL1_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF/MCL1_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index db9c2c15..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF/MCL1_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index fa6c461a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 16f4e22e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF2/CCC_MCL1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF2/MCL1_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF2/MCL1_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 66110c53..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/MCL1/openFF2/MCL1_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d82d912e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index c315f6dc..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/CCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index e065bd6e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_dG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 3910b4dd..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index d923aab4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/OPLS2015/PTP1B_OPLS2015_ddG.pngCCC_PTP1B_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 79242837..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 931c9f9a..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF/CCC_PTP1B_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index b5613c51..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF/PTP1B_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 89662337..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 56ef653b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF2/CCC_PTP1B_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index a7ba321b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/PTP1B/openFF2/PTP1B_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 4ef0ef74..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 1acec183..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/CCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index d6cee033..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_dG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 13dfa14d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 429be70c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/OPLS2015/Thrombin_OPLS2015_ddG.pngCCC_Thrombin_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 2e38d748..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index da2fa36c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF/CCC_Thrombin_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index b4e9c3ea..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF/Thrombin_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index ffd7a8cd..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index ed6e0f95..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF2/CCC_Thrombin_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index bb043ade..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Thrombin/openFF2/Thrombin_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 608faa88..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index adec4990..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/CCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 60a51f3e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_dG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 428fe221..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 74e72171..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/OPLS2015/Tyk2_OPLS2015_ddG.pngCCC_Tyk2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 7d53171c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index e5bd97ad..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF/CCC_Tyk2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 00c0dc08..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF/Tyk2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index d221b974..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index c6e6967e..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF2/CCC_Tyk2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index d855f84d..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/Tyk2/openFF2/Tyk2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 9944aae4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 17fbe4b9..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/OPLS2015/CCC_p38_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/OPLS2015/p38_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/OPLS2015/p38_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/OPLS2015/p38_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/OPLS2015/p38_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/OPLS2015/p38_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 55ed49e6..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/OPLS2015/p38_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index ec7a4829..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index ff1858e4..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF/CCC_p38_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index f2082f3c..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF/p38_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 2d510890..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index f6b7fae5..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF2/CCC_p38_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF2/p38_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF2/p38_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 6bae2382..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/JACS/p38/openFF2/p38_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/OPLS2015/CCC_cdk8_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/OPLS2015/cdk8_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF/CCC_cdk8_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF/cdk8_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF2/CCC_cdk8_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cdk8/openFF2/cdk8_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/OPLS2015/CCC_cmet_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/OPLS2015/cmet_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF/CCC_cmet_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF/cmet_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF2/CCC_cmet_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/cmet/openFF2/cmet_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/OPLS2015/CCC_eg5_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/OPLS2015/eg5_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF/CCC_eg5_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF/eg5_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF2/CCC_eg5_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF2/eg5_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF2/eg5_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/eg5/openFF2/eg5_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/OPLS2015/CCC_hif2a_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/OPLS2015/hif2a_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF/CCC_hif2a_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF/hif2a_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF2/CCC_hif2a_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF2/hif2a_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF2/hif2a_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/hif2a/openFF2/hif2a_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/CCC_pfkfb3_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/OPLS2015/pfkfb3_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF/CCC_pfkfb3_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF/pfkfb3_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF2/CCC_pfkfb3_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/pfkfb3/openFF2/pfkfb3_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/OPLS2015/CCC_shp2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/OPLS2015/shp2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF/CCC_shp2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF/shp2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF2/CCC_shp2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/shp2/openFF2/shp2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/OPLS2015/CCC_syk_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/OPLS2015/syk_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF/CCC_syk_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF/syk_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF2/CCC_syk_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/syk/openFF2/syk_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/OPLS2015/CCC_tnks2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/OPLS2015/tnks2_OPLS2015_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF/CCC_tnks2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF/tnks2_openFF_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF2/CCC_tnks2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_dG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_dG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_dG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_ddG.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_ddG.png deleted file mode 100644 index 0974b30b..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/old_results/Merck/tnks2/openFF2/tnks2_openFF2_ddG.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 3e8f880a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1020 ,KEBNE ,17040184,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:39:44 CET,0.0 0.388 0.597 0.755 0.891 1.002 1.1 1.211 1.43 1.54 1.641 1.621 1.86 1.939 2.08 2.215 2.346 2.409 2.532 2.646 2.801 2.903 3.004 3.152 3.28 3.395 3.512 3.626 3.781 3.93 4.065 4.221 4.363 4.487 4.62 4.776 4.942 5.121 5.309 5.496 5.681 5.886 6.094 6.288 6.491 6.678 6.85 6.978 7.068 7.016 6.638 5.949 5.238 4.525 3.849 3.243 2.707 2.207 1.763 1.302 0.888 0.523 0.17 -0.175 -0.521 -0.829 -1.131 -1.416 -1.675 -1.948 -2.208 -2.412 -2.631 -2.878 -3.086 -3.285 -3.488 -3.705 -3.919 -4.07 -4.235 -4.491 -4.668 -4.853 -4.943 -5.144 -5.374 -5.634 -5.767 -6.063 -6.166 -6.306 -6.431 -6.722 -6.915 -7.12 -7.345 -7.615 -7.923 -8.317 -9.504 -2 ,4688 ,KEBNE ,17040185,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:42:07 CET,0.0 0.648 0.898 1.084 1.277 1.419 1.552 1.675 1.88 1.972 2.07 2.09 2.339 2.419 2.576 2.722 2.854 2.915 3.036 3.159 3.337 3.448 3.554 3.711 3.87 4.015 4.139 4.261 4.423 4.585 4.736 4.916 5.084 5.244 5.429 5.623 5.797 5.98 6.178 6.373 6.567 6.777 7.023 7.235 7.45 7.721 7.993 8.23 8.398 8.434 8.248 7.816 7.278 6.667 6.036 5.471 4.976 4.477 4.019 3.543 3.125 2.739 2.365 2.047 1.744 1.447 1.127 0.831 0.587 0.365 0.126 -0.092 -0.299 -0.522 -0.712 -0.905 -1.1 -1.292 -1.504 -1.664 -1.83 -2.099 -2.294 -2.485 -2.584 -2.801 -3.026 -3.249 -3.36 -3.652 -3.711 -3.822 -3.965 -4.342 -4.564 -4.778 -5.009 -5.279 -5.578 -5.937 -6.84 -3 ,31555 ,KEBNE ,17040186,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:42:30 CET,0.0 0.284 0.514 0.689 0.817 0.933 1.04 1.133 1.3 1.385 1.471 1.484 1.732 1.803 1.917 2.045 2.174 2.238 2.364 2.483 2.655 2.761 2.865 3.007 3.14 3.263 3.386 3.501 3.627 3.744 3.854 4.008 4.16 4.297 4.454 4.616 4.769 4.933 5.106 5.284 5.466 5.655 5.853 6.046 6.233 6.416 6.598 6.726 6.764 6.636 6.273 5.548 4.73 3.952 3.222 2.604 2.099 1.602 1.147 0.691 0.311 -0.033 -0.383 -0.747 -1.116 -1.454 -1.77 -2.031 -2.261 -2.508 -2.782 -3.019 -3.261 -3.5 -3.684 -3.874 -4.066 -4.272 -4.498 -4.651 -4.818 -5.094 -5.29 -5.49 -5.592 -5.8 -6.018 -6.252 -6.366 -6.648 -6.715 -6.851 -6.994 -7.323 -7.51 -7.696 -7.902 -8.141 -8.428 -8.829 -9.994 -4 ,28252 ,KEBNE ,17040187,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:42:15 CET,0.0 0.557 0.758 0.896 1.04 1.178 1.301 1.41 1.63 1.735 1.828 1.84 2.086 2.155 2.285 2.409 2.532 2.595 2.714 2.818 2.961 3.064 3.167 3.307 3.43 3.549 3.671 3.792 3.94 4.079 4.206 4.349 4.486 4.618 4.758 4.928 5.102 5.277 5.46 5.632 5.797 5.992 6.21 6.423 6.665 6.913 7.181 7.419 7.596 7.637 7.438 6.927 6.329 5.733 5.196 4.706 4.225 3.74 3.34 2.921 2.533 2.158 1.815 1.529 1.249 0.982 0.705 0.467 0.255 0.032 -0.215 -0.436 -0.675 -0.929 -1.118 -1.319 -1.532 -1.742 -1.968 -2.128 -2.298 -2.572 -2.744 -2.922 -3.031 -3.261 -3.5 -3.75 -3.881 -4.186 -4.292 -4.44 -4.583 -4.9 -5.091 -5.295 -5.497 -5.721 -6.0 -6.41 -7.532 -5 ,27614 ,KEBNE ,17040188,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:40:41 CET,0.0 0.382 0.589 0.772 0.906 1.03 1.158 1.271 1.454 1.539 1.63 1.625 1.865 1.942 2.096 2.236 2.352 2.414 2.533 2.642 2.801 2.9 3.003 3.147 3.267 3.396 3.533 3.643 3.776 3.914 4.032 4.178 4.341 4.49 4.636 4.788 4.939 5.11 5.294 5.472 5.657 5.879 6.11 6.298 6.497 6.667 6.809 6.894 6.915 6.865 6.52 5.837 5.129 4.385 3.665 3.005 2.392 1.82 1.31 0.784 0.353 0.01 -0.288 -0.586 -0.887 -1.15 -1.424 -1.679 -1.913 -2.166 -2.445 -2.679 -2.928 -3.191 -3.379 -3.566 -3.763 -3.977 -4.202 -4.359 -4.519 -4.767 -4.947 -5.128 -5.219 -5.423 -5.656 -5.9 -6.023 -6.317 -6.401 -6.535 -6.692 -7.034 -7.225 -7.428 -7.659 -7.93 -8.258 -8.656 -9.84 -6 ,242 ,KEBNE ,17040189,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:41:32 CET,0.0 0.315 0.534 0.71 0.847 0.966 1.078 1.175 1.356 1.446 1.526 1.509 1.751 1.82 1.953 2.074 2.184 2.244 2.356 2.465 2.637 2.744 2.85 2.998 3.131 3.269 3.409 3.539 3.694 3.831 3.966 4.122 4.264 4.408 4.576 4.764 4.929 5.107 5.299 5.49 5.677 5.868 6.099 6.325 6.541 6.758 6.963 7.146 7.272 7.183 6.736 5.938 5.06 4.254 3.534 2.859 2.26 1.677 1.178 0.685 0.268 -0.068 -0.418 -0.759 -1.077 -1.383 -1.681 -1.929 -2.174 -2.45 -2.714 -2.944 -3.185 -3.433 -3.64 -3.848 -4.046 -4.247 -4.46 -4.615 -4.772 -5.0 -5.181 -5.369 -5.46 -5.662 -5.88 -6.102 -6.216 -6.515 -6.627 -6.766 -6.906 -7.219 -7.399 -7.601 -7.83 -8.091 -8.378 -8.767 -10.016 -7 ,23616 ,KEBNE ,17040190,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:40:14 CET,0.0 0.498 0.711 0.881 1.054 1.216 1.359 1.492 1.724 1.829 1.918 1.918 2.156 2.232 2.369 2.472 2.582 2.637 2.755 2.875 3.039 3.15 3.255 3.392 3.518 3.63 3.752 3.873 4.021 4.165 4.288 4.446 4.608 4.758 4.922 5.09 5.256 5.43 5.614 5.789 5.959 6.15 6.357 6.566 6.771 6.952 7.151 7.383 7.574 7.612 7.312 6.59 5.852 5.164 4.581 4.044 3.552 3.09 2.659 2.209 1.842 1.51 1.168 0.829 0.496 0.16 -0.188 -0.498 -0.765 -1.028 -1.299 -1.517 -1.755 -2.005 -2.19 -2.402 -2.647 -2.888 -3.12 -3.272 -3.434 -3.705 -3.88 -4.067 -4.174 -4.374 -4.597 -4.832 -4.94 -5.247 -5.391 -5.544 -5.703 -6.081 -6.283 -6.5 -6.711 -6.952 -7.253 -7.637 -8.65 -8 ,10033 ,KEBNE ,17040191,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:41:39 CET,0.0 0.435 0.611 0.78 0.952 1.105 1.222 1.34 1.567 1.663 1.762 1.767 2.012 2.088 2.23 2.372 2.505 2.564 2.682 2.797 2.952 3.054 3.145 3.248 3.355 3.472 3.592 3.707 3.84 3.965 4.092 4.24 4.381 4.508 4.653 4.824 4.994 5.178 5.365 5.545 5.727 5.93 6.131 6.324 6.539 6.766 7.0 7.172 7.293 7.278 6.917 6.21 5.422 4.677 4.017 3.391 2.82 2.284 1.815 1.338 0.94 0.594 0.245 -0.066 -0.367 -0.661 -0.973 -1.252 -1.491 -1.743 -2.013 -2.247 -2.48 -2.703 -2.87 -3.074 -3.305 -3.521 -3.733 -3.897 -4.072 -4.333 -4.507 -4.7 -4.815 -5.054 -5.294 -5.532 -5.656 -5.958 -6.039 -6.165 -6.291 -6.591 -6.763 -6.919 -7.08 -7.307 -7.613 -7.917 -8.819 -9 ,23432 ,KEBNE ,17040192,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:39:31 CET,0.0 0.41 0.596 0.783 0.954 1.108 1.241 1.344 1.543 1.639 1.733 1.74 1.994 2.076 2.22 2.357 2.49 2.552 2.668 2.772 2.922 3.026 3.118 3.246 3.375 3.496 3.613 3.734 3.893 4.036 4.175 4.336 4.495 4.647 4.806 4.995 5.169 5.35 5.557 5.782 6.006 6.237 6.491 6.735 6.978 7.187 7.424 7.678 7.852 7.876 7.715 7.25 6.669 6.045 5.457 4.917 4.391 3.887 3.403 2.883 2.422 1.975 1.551 1.151 0.766 0.453 0.153 -0.117 -0.339 -0.568 -0.814 -1.02 -1.223 -1.443 -1.63 -1.831 -2.038 -2.273 -2.543 -2.731 -2.911 -3.179 -3.384 -3.605 -3.717 -3.949 -4.193 -4.429 -4.549 -4.864 -5.008 -5.167 -5.327 -5.672 -5.871 -6.077 -6.276 -6.527 -6.834 -7.193 -8.11 -10 ,10234 ,KEBNE ,17040193,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:41:47 CET,0.0 0.293 0.51 0.69 0.824 0.936 1.041 1.138 1.351 1.457 1.545 1.55 1.794 1.872 2.012 2.143 2.278 2.338 2.457 2.58 2.742 2.841 2.94 3.096 3.232 3.352 3.472 3.587 3.734 3.874 4.006 4.162 4.306 4.441 4.587 4.742 4.893 5.056 5.234 5.42 5.6 5.796 6.031 6.257 6.48 6.719 6.97 7.164 7.279 7.24 6.866 6.057 5.21 4.463 3.793 3.134 2.51 1.931 1.435 0.963 0.57 0.214 -0.155 -0.533 -0.896 -1.253 -1.636 -1.989 -2.299 -2.601 -2.898 -3.13 -3.351 -3.563 -3.731 -3.913 -4.096 -4.316 -4.559 -4.718 -4.891 -5.153 -5.328 -5.51 -5.602 -5.775 -5.966 -6.196 -6.305 -6.573 -6.652 -6.801 -6.959 -7.283 -7.447 -7.616 -7.807 -8.052 -8.367 -8.688 -9.754 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 0b071810..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17630 ,KEBNE ,17040194,Wed Dec 22 23:57:39 CET,Thu Dec 23 01:42:25 CET,0.0 0.287 0.442 0.593 0.732 0.848 0.947 1.033 1.208 1.296 1.384 1.391 1.623 1.686 1.808 1.934 2.054 2.109 2.219 2.327 2.479 2.567 2.659 2.802 2.922 3.025 3.13 3.236 3.369 3.489 3.598 3.745 3.887 4.003 4.132 4.271 4.404 4.558 4.716 4.866 5.003 5.159 5.34 5.482 5.602 5.704 5.783 5.797 5.683 5.378 4.598 3.416 2.352 1.417 0.515 -0.342 -1.091 -1.766 -2.317 -2.869 -3.367 -3.822 -4.268 -4.712 -5.138 -5.512 -5.895 -6.256 -6.577 -6.913 -7.251 -7.523 -7.845 -8.19 -8.438 -8.694 -8.954 -9.234 -9.577 -9.835 -10.077 -10.429 -10.665 -10.886 -11.006 -11.262 -11.521 -11.829 -12.002 -12.341 -12.513 -12.714 -12.941 -13.398 -13.65 -13.94 -14.246 -14.606 -15.058 -15.692 -17.508 -2 ,27501 ,KEBNE ,17040195,Wed Dec 22 23:57:39 CET,Thu Dec 23 01:40:08 CET,0.0 0.724 0.948 1.102 1.23 1.354 1.471 1.591 1.808 1.898 1.982 1.983 2.234 2.312 2.449 2.564 2.671 2.731 2.846 2.949 3.109 3.204 3.284 3.401 3.514 3.62 3.725 3.827 3.958 4.083 4.202 4.334 4.456 4.578 4.723 4.878 5.0 5.126 5.275 5.421 5.557 5.714 5.887 6.025 6.156 6.263 6.372 6.461 6.371 6.01 5.178 3.957 2.824 1.743 0.779 -0.06 -0.808 -1.512 -2.129 -2.725 -3.263 -3.744 -4.184 -4.593 -4.968 -5.361 -5.799 -6.198 -6.536 -6.854 -7.222 -7.55 -7.862 -8.196 -8.466 -8.747 -9.019 -9.31 -9.673 -9.942 -10.212 -10.573 -10.839 -11.128 -11.263 -11.543 -11.87 -12.258 -12.456 -12.809 -13.009 -13.22 -13.46 -13.995 -14.264 -14.533 -14.826 -15.176 -15.561 -16.164 -18.863 -3 ,26180 ,KEBNE ,17040196,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:42:15 CET,0.0 0.353 0.582 0.742 0.862 0.965 1.064 1.161 1.343 1.422 1.496 1.476 1.698 1.758 1.877 1.992 2.105 2.164 2.273 2.369 2.492 2.582 2.672 2.792 2.91 3.013 3.119 3.232 3.377 3.517 3.642 3.792 3.945 4.078 4.215 4.37 4.501 4.613 4.735 4.879 5.042 5.22 5.38 5.509 5.657 5.795 5.92 5.99 5.95 5.67 4.892 3.729 2.652 1.629 0.722 -0.11 -0.839 -1.517 -2.129 -2.725 -3.226 -3.692 -4.174 -4.644 -5.085 -5.472 -5.859 -6.19 -6.469 -6.791 -7.149 -7.444 -7.752 -8.116 -8.446 -8.791 -9.091 -9.359 -9.633 -9.817 -10.008 -10.336 -10.568 -10.802 -10.931 -11.218 -11.538 -11.89 -12.085 -12.468 -12.731 -12.956 -13.191 -13.654 -13.912 -14.206 -14.537 -14.905 -15.392 -16.001 -17.649 -4 ,5173 ,KEBNE ,17040197,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:42:10 CET,0.0 0.497 0.749 0.916 1.058 1.196 1.332 1.442 1.653 1.757 1.845 1.849 2.099 2.178 2.314 2.438 2.556 2.613 2.722 2.826 2.98 3.073 3.154 3.275 3.396 3.504 3.604 3.704 3.832 3.946 4.06 4.201 4.333 4.461 4.594 4.73 4.868 5.006 5.134 5.274 5.417 5.568 5.727 5.857 5.99 6.127 6.237 6.281 6.187 5.922 5.234 4.085 2.987 1.989 1.108 0.253 -0.526 -1.214 -1.826 -2.439 -2.958 -3.438 -3.909 -4.35 -4.759 -5.133 -5.527 -5.875 -6.167 -6.472 -6.798 -7.08 -7.388 -7.75 -8.037 -8.324 -8.62 -8.932 -9.248 -9.482 -9.732 -10.114 -10.367 -10.613 -10.742 -10.993 -11.262 -11.533 -11.695 -12.061 -12.261 -12.456 -12.66 -13.1 -13.352 -13.622 -13.921 -14.262 -14.665 -15.23 -16.949 -5 ,11035 ,KEBNE ,17040198,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:40:06 CET,0.0 0.36 0.535 0.7 0.835 0.964 1.08 1.173 1.326 1.393 1.467 1.466 1.706 1.79 1.946 2.087 2.217 2.271 2.375 2.477 2.612 2.705 2.799 2.925 3.038 3.151 3.258 3.355 3.488 3.622 3.744 3.888 4.021 4.142 4.275 4.411 4.538 4.673 4.818 4.96 5.109 5.272 5.438 5.607 5.785 5.918 5.989 6.023 5.975 5.749 5.13 4.066 3.055 2.101 1.241 0.462 -0.233 -0.856 -1.406 -1.95 -2.404 -2.807 -3.23 -3.642 -4.013 -4.353 -4.699 -5.021 -5.323 -5.626 -5.92 -6.168 -6.425 -6.696 -6.911 -7.137 -7.372 -7.616 -7.874 -8.042 -8.21 -8.503 -8.731 -8.975 -9.105 -9.403 -9.711 -9.998 -10.154 -10.496 -10.705 -10.914 -11.15 -11.69 -11.983 -12.305 -12.648 -12.987 -13.382 -13.934 -15.722 -6 ,22528 ,KEBNE ,17040199,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:40:37 CET,0.0 0.427 0.604 0.743 0.862 0.97 1.079 1.168 1.327 1.418 1.506 1.485 1.707 1.767 1.887 2.023 2.147 2.208 2.336 2.452 2.609 2.694 2.782 2.913 3.028 3.128 3.224 3.322 3.457 3.584 3.697 3.835 3.963 4.083 4.216 4.359 4.502 4.636 4.768 4.916 5.068 5.225 5.391 5.544 5.692 5.835 5.966 6.024 5.941 5.63 4.853 3.683 2.64 1.662 0.694 -0.224 -0.997 -1.7 -2.333 -2.98 -3.541 -4.049 -4.521 -4.971 -5.401 -5.813 -6.3 -6.702 -7.006 -7.325 -7.703 -8.044 -8.404 -8.78 -9.059 -9.378 -9.731 -10.109 -10.484 -10.7 -10.917 -11.274 -11.549 -11.848 -11.997 -12.296 -12.584 -12.882 -13.059 -13.426 -13.635 -13.814 -14.022 -14.495 -14.736 -15.017 -15.332 -15.687 -16.093 -16.637 -18.653 -7 ,2078 ,KEBNE ,17040200,Wed Dec 22 23:57:38 CET,Thu Dec 23 01:40:11 CET,0.0 0.335 0.588 0.763 0.894 0.991 1.092 1.206 1.409 1.506 1.601 1.61 1.852 1.926 2.061 2.189 2.304 2.358 2.469 2.571 2.701 2.788 2.871 2.995 3.119 3.238 3.355 3.46 3.596 3.722 3.838 3.976 4.094 4.195 4.315 4.458 4.585 4.709 4.839 4.986 5.129 5.278 5.431 5.572 5.731 5.867 5.97 6.013 5.955 5.7 5.023 3.921 2.813 1.83 0.979 0.195 -0.527 -1.177 -1.763 -2.378 -2.916 -3.414 -3.899 -4.352 -4.762 -5.137 -5.581 -6.023 -6.368 -6.689 -7.031 -7.307 -7.619 -7.996 -8.306 -8.607 -8.891 -9.184 -9.498 -9.719 -9.956 -10.345 -10.609 -10.886 -11.039 -11.354 -11.678 -12.001 -12.168 -12.525 -12.761 -12.959 -13.175 -13.652 -13.913 -14.208 -14.527 -14.866 -15.29 -15.87 -17.701 -8 ,18505 ,KEBNE ,17040201,Wed Dec 22 23:57:39 CET,Thu Dec 23 01:41:02 CET,0.0 0.731 0.962 1.131 1.276 1.413 1.548 1.663 1.862 1.961 2.056 2.076 2.324 2.398 2.529 2.657 2.78 2.841 2.957 3.056 3.201 3.306 3.398 3.514 3.625 3.738 3.85 3.952 4.091 4.213 4.32 4.459 4.591 4.717 4.853 4.979 5.109 5.276 5.442 5.598 5.743 5.885 6.032 6.15 6.289 6.431 6.523 6.536 6.405 6.078 5.312 4.182 3.182 2.258 1.307 0.388 -0.386 -1.071 -1.635 -2.182 -2.698 -3.262 -3.819 -4.286 -4.689 -5.05 -5.442 -5.79 -6.09 -6.446 -6.862 -7.177 -7.46 -7.742 -7.98 -8.243 -8.533 -8.855 -9.192 -9.437 -9.678 -10.012 -10.241 -10.493 -10.631 -10.924 -11.213 -11.516 -11.677 -12.013 -12.206 -12.384 -12.579 -13.005 -13.239 -13.517 -13.829 -14.182 -14.591 -15.127 -17.03 -9 ,19916 ,KEBNE ,17040202,Wed Dec 22 23:57:39 CET,Thu Dec 23 01:42:13 CET,0.0 0.796 1.076 1.246 1.391 1.519 1.643 1.754 1.935 2.023 2.113 2.128 2.37 2.446 2.591 2.729 2.87 2.936 3.059 3.171 3.314 3.409 3.505 3.639 3.759 3.874 3.976 4.072 4.208 4.34 4.474 4.621 4.748 4.859 4.979 5.129 5.25 5.365 5.509 5.668 5.813 5.959 6.114 6.241 6.383 6.52 6.614 6.662 6.611 6.337 5.538 4.423 3.446 2.472 1.611 0.858 0.153 -0.492 -1.102 -1.763 -2.312 -2.804 -3.265 -3.664 -4.031 -4.364 -4.723 -5.065 -5.393 -5.735 -6.083 -6.412 -6.743 -7.051 -7.284 -7.532 -7.797 -8.083 -8.428 -8.656 -8.854 -9.176 -9.42 -9.678 -9.816 -10.1 -10.397 -10.697 -10.849 -11.201 -11.446 -11.677 -11.902 -12.357 -12.613 -12.895 -13.222 -13.602 -14.06 -14.649 -16.607 -10 ,18780 ,KEBNE ,17040203,Wed Dec 22 23:57:39 CET,Thu Dec 23 01:41:10 CET,0.0 0.321 0.529 0.71 0.862 0.985 1.092 1.19 1.382 1.47 1.541 1.518 1.745 1.819 1.958 2.075 2.182 2.225 2.317 2.411 2.549 2.646 2.74 2.872 2.999 3.12 3.242 3.36 3.508 3.635 3.745 3.892 4.029 4.152 4.285 4.421 4.553 4.679 4.809 4.963 5.124 5.303 5.5 5.662 5.831 6.0 6.1 6.14 6.095 5.817 5.108 4.0 2.858 1.813 0.887 0.022 -0.715 -1.382 -1.966 -2.557 -3.081 -3.566 -4.02 -4.452 -4.841 -5.189 -5.571 -5.907 -6.202 -6.518 -6.853 -7.13 -7.431 -7.781 -8.041 -8.29 -8.545 -8.816 -9.113 -9.317 -9.524 -9.848 -10.083 -10.341 -10.481 -10.781 -11.072 -11.402 -11.603 -11.957 -12.154 -12.35 -12.565 -13.032 -13.288 -13.589 -13.881 -14.196 -14.605 -15.196 -17.354 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt deleted file mode 100644 index b407d42a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9346 ,KEBNE ,17040204,Wed Dec 22 23:57:39 CET,Thu Dec 23 01:42:42 CET,0.0 1.051 1.414 1.643 1.822 1.979 2.128 2.265 2.501 2.618 2.729 2.779 3.04 3.138 3.33 3.502 3.673 3.754 3.897 4.041 4.24 4.357 4.461 4.61 4.758 4.904 5.051 5.196 5.382 5.553 5.71 5.89 6.054 6.211 6.397 6.606 6.815 7.043 7.282 7.528 7.778 8.046 8.343 8.627 8.949 9.295 9.624 9.927 10.19 10.301 10.094 9.533 8.924 8.29 7.652 7.05 6.504 6.001 5.57 5.137 4.736 4.339 3.958 3.613 3.297 3.015 2.7 2.406 2.169 1.929 1.668 1.452 1.223 0.98 0.799 0.605 0.396 0.173 -0.067 -0.236 -0.419 -0.697 -0.882 -1.074 -1.168 -1.381 -1.614 -1.857 -1.989 -2.277 -2.35 -2.492 -2.647 -2.997 -3.193 -3.397 -3.632 -3.898 -4.178 -4.642 -6.6 -2 ,26486 ,KEBNE ,17040205,Wed Dec 22 23:57:39 CET,Thu Dec 23 01:40:33 CET,0.0 0.829 1.101 1.303 1.467 1.613 1.747 1.872 2.098 2.206 2.305 2.359 2.629 2.723 2.901 3.058 3.199 3.274 3.412 3.535 3.726 3.85 3.972 4.158 4.333 4.484 4.611 4.728 4.896 5.064 5.233 5.44 5.634 5.814 6.015 6.24 6.451 6.669 6.884 7.125 7.379 7.649 7.978 8.286 8.61 8.956 9.288 9.594 9.874 10.046 9.964 9.459 8.759 8.108 7.473 6.845 6.296 5.79 5.362 4.925 4.538 4.163 3.767 3.379 3.025 2.732 2.433 2.155 1.909 1.635 1.353 1.121 0.858 0.585 0.38 0.162 -0.086 -0.345 -0.599 -0.768 -0.945 -1.228 -1.424 -1.643 -1.752 -1.971 -2.225 -2.489 -2.614 -2.902 -3.019 -3.171 -3.316 -3.668 -3.894 -4.137 -4.385 -4.687 -5.07 -5.569 -7.147 -3 ,26491 ,KEBNE ,17040206,Wed Dec 22 23:57:39 CET,Thu Dec 23 01:41:53 CET,0.0 0.844 1.161 1.414 1.616 1.788 1.941 2.085 2.327 2.437 2.556 2.612 2.859 2.938 3.092 3.251 3.402 3.465 3.603 3.756 3.966 4.097 4.226 4.4 4.558 4.708 4.852 4.995 5.196 5.379 5.542 5.743 5.933 6.107 6.314 6.54 6.742 6.964 7.209 7.468 7.733 8.014 8.316 8.594 8.902 9.211 9.503 9.758 10.002 10.188 10.084 9.543 8.955 8.346 7.723 7.123 6.547 6.007 5.549 5.075 4.663 4.278 3.909 3.569 3.25 2.944 2.624 2.348 2.107 1.84 1.558 1.332 1.091 0.842 0.639 0.435 0.216 -0.035 -0.281 -0.442 -0.611 -0.881 -1.098 -1.328 -1.435 -1.647 -1.859 -2.093 -2.228 -2.535 -2.666 -2.817 -3.005 -3.467 -3.71 -3.982 -4.282 -4.618 -5.003 -5.467 -7.101 -4 ,24237 ,KEBNE ,17040207,Wed Dec 22 23:57:39 CET,Thu Dec 23 01:42:20 CET,0.0 0.867 1.157 1.381 1.547 1.698 1.843 1.968 2.214 2.326 2.436 2.49 2.744 2.835 3.009 3.171 3.316 3.383 3.537 3.683 3.863 3.969 4.08 4.257 4.431 4.589 4.731 4.867 5.06 5.257 5.432 5.629 5.803 5.976 6.17 6.374 6.584 6.811 7.04 7.266 7.505 7.787 8.088 8.361 8.663 8.952 9.265 9.561 9.817 9.922 9.74 9.202 8.592 7.966 7.332 6.735 6.176 5.623 5.132 4.661 4.248 3.89 3.501 3.113 2.788 2.46 2.094 1.75 1.443 1.148 0.835 0.548 0.275 -0.004 -0.238 -0.474 -0.737 -1.028 -1.311 -1.486 -1.662 -1.942 -2.153 -2.386 -2.506 -2.758 -3.024 -3.293 -3.426 -3.744 -3.938 -4.13 -4.304 -4.677 -4.905 -5.138 -5.409 -5.761 -6.199 -6.791 -8.896 -5 ,18987 ,KEBNE ,17040208,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:44:46 CET,0.0 0.773 1.027 1.255 1.461 1.616 1.747 1.871 2.123 2.244 2.367 2.425 2.68 2.772 2.948 3.099 3.254 3.327 3.456 3.585 3.787 3.914 4.041 4.223 4.389 4.554 4.696 4.818 4.979 5.136 5.285 5.457 5.637 5.814 6.005 6.223 6.437 6.663 6.902 7.148 7.386 7.647 7.937 8.199 8.498 8.816 9.134 9.451 9.741 9.962 9.902 9.435 8.853 8.229 7.649 7.086 6.52 5.96 5.485 5.018 4.625 4.291 3.971 3.672 3.387 3.126 2.861 2.599 2.367 2.128 1.889 1.698 1.491 1.271 1.09 0.891 0.692 0.499 0.276 0.11 -0.041 -0.261 -0.429 -0.598 -0.684 -0.895 -1.113 -1.34 -1.473 -1.78 -1.905 -2.037 -2.158 -2.448 -2.621 -2.819 -3.033 -3.291 -3.624 -4.108 -5.915 -6 ,25677 ,KEBNE ,17040209,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:45:47 CET,0.0 0.827 1.057 1.237 1.414 1.583 1.722 1.836 2.082 2.208 2.326 2.378 2.632 2.719 2.879 3.025 3.182 3.259 3.399 3.535 3.729 3.845 3.964 4.149 4.316 4.466 4.605 4.728 4.876 5.028 5.169 5.345 5.54 5.72 5.907 6.109 6.314 6.533 6.739 6.955 7.173 7.431 7.73 7.991 8.282 8.58 8.893 9.201 9.505 9.742 9.674 9.049 8.322 7.682 7.101 6.513 5.99 5.514 5.051 4.518 4.046 3.659 3.31 2.976 2.664 2.384 2.078 1.783 1.515 1.239 0.955 0.719 0.471 0.215 0.021 -0.188 -0.408 -0.636 -0.885 -1.059 -1.228 -1.487 -1.686 -1.895 -1.999 -2.251 -2.561 -2.907 -3.084 -3.419 -3.617 -3.813 -4.027 -4.506 -4.736 -4.973 -5.233 -5.553 -5.975 -6.544 -8.334 -7 ,14398 ,KEBNE ,17040210,Thu Dec 23 00:01:44 CET,Thu Dec 23 01:44:58 CET,0.0 0.891 1.159 1.375 1.561 1.704 1.841 1.972 2.2 2.307 2.41 2.442 2.691 2.788 2.965 3.118 3.272 3.346 3.499 3.642 3.826 3.937 4.05 4.227 4.389 4.53 4.668 4.801 4.957 5.116 5.284 5.489 5.681 5.854 6.051 6.267 6.479 6.71 6.94 7.177 7.434 7.702 7.99 8.288 8.612 8.943 9.299 9.638 9.937 10.123 9.946 9.272 8.551 7.852 7.171 6.547 5.986 5.484 5.054 4.631 4.267 3.907 3.554 3.227 2.918 2.624 2.307 2.041 1.817 1.559 1.29 1.055 0.824 0.598 0.401 0.186 -0.038 -0.257 -0.476 -0.63 -0.788 -1.037 -1.204 -1.371 -1.467 -1.695 -1.913 -2.133 -2.252 -2.533 -2.644 -2.787 -2.941 -3.296 -3.476 -3.687 -3.953 -4.278 -4.669 -5.109 -6.448 -8 ,643 ,KEBNE ,17040211,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:44:46 CET,0.0 0.909 1.176 1.386 1.566 1.723 1.862 1.984 2.191 2.283 2.383 2.414 2.674 2.767 2.923 3.088 3.238 3.303 3.425 3.551 3.757 3.884 4.001 4.175 4.336 4.472 4.604 4.748 4.94 5.128 5.309 5.504 5.681 5.847 6.047 6.279 6.497 6.728 6.956 7.195 7.449 7.724 8.022 8.286 8.566 8.877 9.176 9.403 9.594 9.734 9.606 9.042 8.422 7.848 7.286 6.735 6.218 5.724 5.278 4.818 4.406 4.032 3.679 3.362 3.084 2.805 2.496 2.217 1.965 1.707 1.434 1.205 0.966 0.714 0.519 0.324 0.13 -0.085 -0.323 -0.479 -0.629 -0.858 -1.025 -1.217 -1.312 -1.499 -1.717 -1.945 -2.065 -2.352 -2.444 -2.58 -2.735 -3.082 -3.278 -3.495 -3.725 -3.987 -4.333 -4.789 -6.185 -9 ,29001 ,KEBNE ,17040212,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:45:12 CET,0.0 0.815 1.135 1.359 1.543 1.722 1.88 2.011 2.255 2.37 2.487 2.548 2.819 2.917 3.082 3.233 3.388 3.466 3.612 3.744 3.94 4.073 4.199 4.371 4.533 4.689 4.842 4.984 5.164 5.35 5.537 5.749 5.929 6.098 6.296 6.51 6.719 6.944 7.174 7.427 7.685 7.955 8.259 8.518 8.793 9.103 9.449 9.833 10.128 10.238 10.11 9.627 9.009 8.362 7.766 7.184 6.626 6.114 5.654 5.184 4.782 4.403 4.03 3.664 3.318 2.981 2.614 2.303 2.025 1.723 1.388 1.107 0.829 0.532 0.298 0.065 -0.174 -0.424 -0.716 -0.911 -1.093 -1.407 -1.647 -1.895 -2.026 -2.318 -2.618 -2.917 -3.067 -3.391 -3.551 -3.7 -3.832 -4.127 -4.29 -4.441 -4.591 -4.769 -4.972 -5.306 -6.11 -10 ,31731 ,KEBNE ,17040213,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:45:38 CET,0.0 0.863 1.166 1.374 1.54 1.691 1.836 1.976 2.245 2.372 2.491 2.539 2.794 2.887 3.075 3.237 3.382 3.461 3.618 3.753 3.932 4.049 4.159 4.318 4.458 4.589 4.734 4.879 5.064 5.238 5.406 5.605 5.786 5.951 6.134 6.337 6.518 6.728 6.947 7.147 7.372 7.642 7.949 8.231 8.535 8.885 9.238 9.557 9.844 10.01 9.909 9.412 8.828 8.168 7.501 6.876 6.345 5.872 5.442 5.013 4.631 4.279 3.917 3.533 3.162 2.854 2.554 2.281 2.05 1.815 1.574 1.366 1.128 0.892 0.714 0.514 0.297 0.064 -0.18 -0.344 -0.51 -0.776 -0.977 -1.176 -1.277 -1.49 -1.7 -1.941 -2.07 -2.362 -2.466 -2.611 -2.765 -3.13 -3.36 -3.602 -3.868 -4.166 -4.513 -4.966 -6.957 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 80599969..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27747 ,KEBNE ,17040214,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:43:54 CET,0.0 0.482 0.715 0.852 0.983 1.105 1.22 1.313 1.468 1.557 1.645 1.641 1.888 1.969 2.115 2.262 2.403 2.472 2.602 2.719 2.89 2.998 3.09 3.225 3.361 3.48 3.586 3.697 3.858 4.007 4.146 4.321 4.464 4.596 4.764 4.949 5.121 5.303 5.497 5.695 5.906 6.145 6.383 6.616 6.888 7.162 7.455 7.715 7.903 7.968 7.86 7.435 6.887 6.316 5.769 5.292 4.828 4.301 3.787 3.298 2.847 2.39 1.949 1.553 1.183 0.844 0.491 0.17 -0.116 -0.406 -0.691 -0.947 -1.203 -1.459 -1.675 -1.91 -2.166 -2.429 -2.687 -2.869 -3.061 -3.361 -3.568 -3.763 -3.859 -4.06 -4.272 -4.508 -4.638 -4.947 -5.043 -5.194 -5.364 -5.713 -5.924 -6.153 -6.406 -6.669 -6.963 -7.357 -8.572 -2 ,8919 ,KEBNE ,17040215,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:43:54 CET,0.0 0.483 0.675 0.829 0.999 1.166 1.302 1.407 1.598 1.689 1.77 1.768 2.026 2.108 2.26 2.402 2.536 2.607 2.742 2.863 3.032 3.137 3.247 3.399 3.536 3.67 3.792 3.911 4.063 4.194 4.321 4.479 4.627 4.77 4.928 5.106 5.291 5.502 5.712 5.906 6.129 6.381 6.632 6.851 7.083 7.34 7.59 7.804 8.008 8.151 7.991 7.492 6.875 6.143 5.441 4.776 4.181 3.674 3.186 2.66 2.235 1.859 1.467 1.09 0.758 0.436 0.097 -0.201 -0.459 -0.744 -1.078 -1.337 -1.59 -1.86 -2.059 -2.263 -2.506 -2.768 -3.027 -3.202 -3.378 -3.664 -3.859 -4.048 -4.15 -4.376 -4.611 -4.863 -5.013 -5.334 -5.42 -5.567 -5.729 -6.032 -6.207 -6.44 -6.684 -6.935 -7.229 -7.589 -8.674 -3 ,24593 ,KEBNE ,17040216,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:43:59 CET,0.0 0.365 0.567 0.709 0.866 1.017 1.133 1.24 1.42 1.51 1.6 1.61 1.875 1.958 2.094 2.236 2.385 2.447 2.558 2.668 2.825 2.928 3.026 3.165 3.294 3.423 3.547 3.659 3.803 3.952 4.089 4.238 4.371 4.507 4.678 4.876 5.055 5.23 5.413 5.611 5.827 6.069 6.313 6.511 6.735 6.963 7.186 7.399 7.529 7.503 7.061 6.265 5.581 4.947 4.345 3.782 3.281 2.8 2.388 1.919 1.433 1.026 0.643 0.25 -0.095 -0.413 -0.76 -1.05 -1.298 -1.556 -1.843 -2.089 -2.344 -2.638 -2.875 -3.105 -3.356 -3.627 -3.89 -4.067 -4.251 -4.548 -4.761 -4.972 -5.083 -5.329 -5.579 -5.844 -5.985 -6.293 -6.397 -6.544 -6.709 -7.038 -7.22 -7.447 -7.701 -7.929 -8.179 -8.531 -9.486 -4 ,1286 ,KEBNE ,17040217,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:44:44 CET,0.0 0.346 0.492 0.64 0.813 0.957 1.075 1.18 1.343 1.425 1.511 1.491 1.728 1.792 1.909 2.017 2.119 2.169 2.27 2.37 2.53 2.64 2.742 2.877 2.997 3.118 3.236 3.347 3.492 3.633 3.767 3.922 4.078 4.224 4.391 4.583 4.75 4.93 5.121 5.319 5.527 5.762 6.04 6.318 6.623 6.921 7.184 7.365 7.502 7.609 7.494 7.005 6.414 5.796 5.244 4.765 4.335 3.916 3.524 3.054 2.605 2.212 1.832 1.467 1.112 0.785 0.429 0.131 -0.119 -0.398 -0.679 -0.925 -1.192 -1.474 -1.693 -1.923 -2.153 -2.381 -2.612 -2.783 -2.989 -3.292 -3.486 -3.69 -3.791 -4.015 -4.264 -4.516 -4.649 -4.954 -5.079 -5.241 -5.411 -5.784 -5.987 -6.189 -6.425 -6.74 -7.081 -7.461 -8.442 -5 ,24972 ,KEBNE ,17040218,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:43:54 CET,0.0 0.282 0.47 0.638 0.822 0.968 1.087 1.204 1.422 1.522 1.618 1.649 1.896 1.969 2.121 2.265 2.393 2.461 2.593 2.71 2.882 2.993 3.1 3.241 3.363 3.481 3.606 3.727 3.864 3.998 4.138 4.307 4.463 4.608 4.767 4.938 5.115 5.302 5.484 5.671 5.866 6.08 6.317 6.544 6.781 7.04 7.338 7.569 7.772 7.893 7.562 6.878 6.258 5.663 5.139 4.666 4.207 3.752 3.353 2.954 2.571 2.187 1.814 1.424 1.023 0.684 0.365 0.094 -0.152 -0.429 -0.72 -0.958 -1.198 -1.474 -1.684 -1.879 -2.093 -2.332 -2.586 -2.762 -2.937 -3.204 -3.399 -3.607 -3.71 -3.925 -4.174 -4.428 -4.542 -4.831 -4.923 -5.058 -5.197 -5.51 -5.691 -5.895 -6.144 -6.411 -6.704 -7.061 -7.921 -6 ,32603 ,KEBNE ,17040219,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:44:15 CET,0.0 0.452 0.705 0.871 1.006 1.144 1.271 1.391 1.6 1.694 1.78 1.766 2.004 2.077 2.212 2.345 2.471 2.532 2.653 2.761 2.933 3.052 3.156 3.298 3.419 3.525 3.634 3.744 3.9 4.047 4.181 4.336 4.477 4.606 4.744 4.903 5.053 5.197 5.36 5.537 5.715 5.899 6.086 6.27 6.472 6.657 6.802 6.904 6.953 6.757 6.097 4.963 3.848 2.888 2.047 1.209 0.42 -0.32 -1.003 -1.68 -2.188 -2.6 -3.007 -3.422 -3.809 -4.164 -4.569 -4.931 -5.212 -5.48 -5.759 -6.017 -6.305 -6.598 -6.809 -7.017 -7.243 -7.495 -7.772 -7.972 -8.169 -8.462 -8.672 -8.887 -8.991 -9.199 -9.419 -9.648 -9.77 -10.064 -10.138 -10.281 -10.426 -10.729 -10.9 -11.08 -11.294 -11.544 -11.84 -12.283 -13.543 -7 ,27745 ,KEBNE ,17040220,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:45:28 CET,0.0 0.309 0.537 0.696 0.862 1.011 1.123 1.251 1.506 1.615 1.709 1.709 1.945 2.018 2.159 2.297 2.422 2.484 2.605 2.721 2.901 3.008 3.104 3.234 3.349 3.456 3.577 3.692 3.822 3.955 4.073 4.21 4.34 4.478 4.65 4.83 4.991 5.163 5.347 5.53 5.716 5.91 6.113 6.298 6.502 6.706 6.883 6.999 7.008 6.852 6.421 5.668 4.831 4.005 3.247 2.563 1.945 1.373 0.867 0.351 -0.081 -0.465 -0.828 -1.2 -1.578 -1.914 -2.251 -2.555 -2.828 -3.102 -3.373 -3.621 -3.898 -4.183 -4.394 -4.614 -4.848 -5.097 -5.368 -5.544 -5.716 -5.985 -6.187 -6.405 -6.513 -6.732 -6.98 -7.245 -7.376 -7.681 -7.794 -7.955 -8.13 -8.514 -8.718 -8.916 -9.129 -9.406 -9.76 -10.269 -11.543 -8 ,23901 ,KEBNE ,17040221,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:44:35 CET,0.0 0.363 0.567 0.732 0.885 1.002 1.106 1.209 1.38 1.458 1.538 1.533 1.774 1.85 1.988 2.14 2.295 2.36 2.485 2.604 2.752 2.849 2.946 3.082 3.215 3.344 3.475 3.608 3.766 3.912 4.05 4.216 4.379 4.531 4.705 4.888 5.071 5.273 5.487 5.707 5.912 6.132 6.372 6.583 6.834 7.123 7.401 7.626 7.793 7.859 7.708 7.231 6.586 5.949 5.388 4.847 4.378 3.862 3.312 2.771 2.282 1.815 1.379 0.963 0.56 0.206 -0.159 -0.516 -0.836 -1.142 -1.437 -1.69 -1.963 -2.236 -2.427 -2.618 -2.844 -3.099 -3.377 -3.564 -3.741 -4.018 -4.218 -4.425 -4.536 -4.762 -5.002 -5.274 -5.406 -5.705 -5.839 -5.997 -6.148 -6.482 -6.692 -6.892 -7.114 -7.415 -7.743 -8.142 -9.102 -9 ,31331 ,KEBNE ,17040222,Thu Dec 23 00:01:45 CET,Thu Dec 23 01:44:08 CET,0.0 0.524 0.743 0.885 0.997 1.125 1.241 1.341 1.524 1.612 1.701 1.692 1.937 2.006 2.154 2.307 2.432 2.489 2.607 2.737 2.904 3.003 3.106 3.256 3.391 3.513 3.638 3.767 3.92 4.053 4.181 4.339 4.501 4.663 4.829 4.999 5.171 5.369 5.563 5.757 5.98 6.208 6.438 6.63 6.797 6.928 7.017 7.051 7.018 6.827 6.148 5.033 3.919 2.836 1.84 0.926 0.145 -0.496 -1.01 -1.529 -1.993 -2.413 -2.797 -3.151 -3.492 -3.808 -4.138 -4.445 -4.711 -4.993 -5.3 -5.563 -5.826 -6.092 -6.299 -6.508 -6.735 -6.982 -7.241 -7.423 -7.61 -7.89 -8.078 -8.286 -8.394 -8.607 -8.822 -9.049 -9.181 -9.494 -9.62 -9.778 -9.943 -10.274 -10.451 -10.642 -10.848 -11.099 -11.452 -11.868 -12.9 -10 ,15516 ,KEBNE ,17040224,Thu Dec 23 00:03:48 CET,Thu Dec 23 01:46:44 CET,0.0 0.371 0.538 0.682 0.809 0.93 1.045 1.165 1.402 1.511 1.606 1.606 1.853 1.928 2.067 2.219 2.374 2.438 2.546 2.655 2.814 2.905 2.993 3.129 3.26 3.386 3.506 3.625 3.786 3.94 4.083 4.244 4.4 4.549 4.7 4.858 5.028 5.215 5.395 5.58 5.766 5.955 6.182 6.419 6.659 6.92 7.19 7.394 7.569 7.642 7.367 6.687 6.019 5.396 4.794 4.257 3.776 3.252 2.752 2.233 1.774 1.376 0.976 0.584 0.222 -0.116 -0.476 -0.808 -1.102 -1.414 -1.738 -1.992 -2.237 -2.497 -2.705 -2.924 -3.166 -3.4 -3.643 -3.818 -3.987 -4.261 -4.471 -4.694 -4.802 -5.039 -5.299 -5.562 -5.686 -5.979 -6.094 -6.24 -6.388 -6.714 -6.895 -7.099 -7.334 -7.602 -7.94 -8.337 -9.124 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 073bef88..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21865 ,KEBNE ,17040225,Thu Dec 23 00:03:49 CET,Thu Dec 23 01:48:32 CET,0.0 0.517 0.702 0.892 1.063 1.213 1.355 1.464 1.675 1.784 1.888 1.904 2.145 2.219 2.358 2.498 2.623 2.686 2.817 2.932 3.086 3.183 3.278 3.419 3.548 3.67 3.786 3.902 4.049 4.17 4.259 4.353 4.45 4.543 4.652 4.769 4.866 4.975 5.073 5.132 5.178 5.197 5.169 5.128 5.038 4.867 4.603 4.178 3.477 2.308 0.106 -2.642 -4.984 -6.948 -8.531 -9.899 -11.076 -12.101 -12.943 -13.778 -14.486 -15.105 -15.671 -16.195 -16.698 -17.157 -17.627 -18.044 -18.401 -18.77 -19.151 -19.456 -19.77 -20.1 -20.359 -20.63 -20.912 -21.199 -21.495 -21.698 -21.908 -22.231 -22.443 -22.669 -22.785 -23.012 -23.258 -23.517 -23.654 -23.976 -24.046 -24.197 -24.358 -24.68 -24.886 -25.116 -25.339 -25.56 -25.817 -26.155 -26.861 -2 ,17131 ,KEBNE ,17040226,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:47:43 CET,0.0 0.991 1.319 1.568 1.769 1.93 2.073 2.222 2.483 2.598 2.718 2.769 3.03 3.112 3.273 3.438 3.594 3.668 3.806 3.932 4.104 4.209 4.307 4.443 4.569 4.688 4.804 4.914 5.033 5.13 5.215 5.31 5.409 5.5 5.589 5.681 5.777 5.875 5.966 6.054 6.117 6.142 6.122 6.108 6.086 5.952 5.669 5.21 4.49 3.286 1.098 -1.595 -3.889 -5.956 -7.736 -9.255 -10.494 -11.526 -12.377 -13.216 -13.92 -14.535 -15.126 -15.695 -16.227 -16.711 -17.202 -17.619 -17.965 -18.326 -18.727 -19.057 -19.387 -19.744 -20.017 -20.292 -20.579 -20.882 -21.192 -21.398 -21.615 -21.946 -22.162 -22.39 -22.506 -22.748 -23.023 -23.297 -23.439 -23.783 -23.914 -24.078 -24.253 -24.654 -24.86 -25.101 -25.369 -25.675 -26.034 -26.431 -27.391 -3 ,25050 ,KEBNE ,17040227,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:51:14 CET,0.0 0.765 1.073 1.291 1.462 1.624 1.781 1.906 2.105 2.201 2.291 2.304 2.563 2.657 2.838 3.0 3.147 3.212 3.323 3.421 3.562 3.66 3.751 3.866 3.98 4.083 4.174 4.257 4.36 4.466 4.556 4.658 4.746 4.816 4.901 4.98 5.04 5.109 5.176 5.233 5.282 5.317 5.31 5.26 5.133 4.911 4.594 4.114 3.361 2.106 -0.078 -2.855 -5.252 -7.179 -8.714 -10.039 -11.191 -12.222 -13.095 -13.968 -14.692 -15.321 -15.938 -16.496 -17.0 -17.469 -17.966 -18.412 -18.781 -19.14 -19.52 -19.844 -20.167 -20.5 -20.761 -21.031 -21.306 -21.593 -21.876 -22.07 -22.279 -22.58 -22.786 -23.014 -23.133 -23.368 -23.623 -23.904 -24.044 -24.374 -24.462 -24.625 -24.788 -25.104 -25.272 -25.453 -25.649 -25.86 -26.112 -26.487 -27.485 -4 ,8244 ,KEBNE ,17040229,Thu Dec 23 00:05:56 CET,Thu Dec 23 01:47:03 CET,0.0 0.642 0.973 1.243 1.475 1.663 1.821 1.983 2.268 2.392 2.51 2.543 2.809 2.9 3.087 3.26 3.407 3.478 3.627 3.774 3.967 4.081 4.198 4.36 4.496 4.627 4.749 4.857 4.996 5.137 5.263 5.392 5.53 5.665 5.806 5.965 6.1 6.214 6.33 6.443 6.538 6.629 6.695 6.7 6.64 6.492 6.244 5.837 5.092 3.853 1.627 -1.146 -3.412 -5.401 -7.171 -8.744 -10.086 -11.265 -12.211 -13.081 -13.793 -14.422 -15.025 -15.591 -16.105 -16.56 -17.038 -17.47 -17.848 -18.261 -18.69 -19.011 -19.337 -19.694 -19.969 -20.244 -20.519 -20.813 -21.127 -21.335 -21.558 -21.914 -22.147 -22.392 -22.521 -22.782 -23.064 -23.355 -23.503 -23.844 -23.95 -24.119 -24.287 -24.67 -24.87 -25.081 -25.333 -25.585 -25.899 -26.273 -26.953 -5 ,26620 ,KEBNE ,17040230,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:55:39 CET,0.0 0.766 1.08 1.347 1.552 1.736 1.88 2.035 2.382 2.517 2.622 2.666 2.935 3.016 3.172 3.319 3.461 3.533 3.667 3.785 3.967 4.08 4.178 4.32 4.443 4.568 4.703 4.827 4.98 5.126 5.252 5.38 5.493 5.604 5.724 5.853 5.972 6.105 6.24 6.354 6.447 6.518 6.581 6.633 6.638 6.568 6.388 5.972 5.184 3.844 1.453 -1.445 -3.781 -5.763 -7.495 -9.027 -10.333 -11.493 -12.48 -13.47 -14.253 -14.875 -15.459 -16.02 -16.546 -17.016 -17.492 -17.909 -18.273 -18.658 -19.04 -19.351 -19.671 -19.989 -20.248 -20.511 -20.768 -21.049 -21.343 -21.548 -21.764 -22.096 -22.326 -22.566 -22.698 -22.977 -23.258 -23.543 -23.688 -24.031 -24.181 -24.367 -24.568 -25.003 -25.231 -25.481 -25.763 -26.061 -26.378 -26.76 -27.794 -6 ,4288 ,KEBNE ,17040232,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:49:58 CET,0.0 0.883 1.253 1.469 1.654 1.83 1.983 2.145 2.442 2.559 2.67 2.712 2.985 3.095 3.293 3.495 3.669 3.742 3.882 4.028 4.249 4.37 4.483 4.654 4.796 4.923 5.045 5.157 5.298 5.432 5.555 5.689 5.813 5.922 6.032 6.152 6.269 6.394 6.503 6.602 6.688 6.75 6.794 6.785 6.714 6.532 6.233 5.81 5.056 3.847 1.748 -0.941 -3.226 -5.195 -6.861 -8.271 -9.413 -10.424 -11.285 -12.154 -12.926 -13.581 -14.173 -14.73 -15.254 -15.735 -16.224 -16.653 -17.011 -17.382 -17.779 -18.105 -18.429 -18.771 -19.047 -19.319 -19.591 -19.875 -20.174 -20.378 -20.586 -20.893 -21.108 -21.34 -21.458 -21.708 -21.982 -22.262 -22.407 -22.752 -22.886 -23.066 -23.249 -23.624 -23.817 -24.051 -24.322 -24.595 -24.939 -25.403 -26.558 -7 ,7015 ,KEBNE ,17040234,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:48:16 CET,0.0 0.741 0.989 1.205 1.407 1.577 1.728 1.859 2.086 2.198 2.304 2.314 2.562 2.648 2.807 2.933 3.073 3.145 3.27 3.394 3.578 3.687 3.794 3.929 4.037 4.15 4.27 4.373 4.479 4.577 4.678 4.8 4.904 4.982 5.06 5.145 5.208 5.269 5.332 5.38 5.41 5.441 5.429 5.369 5.289 5.147 4.866 4.351 3.508 2.188 -0.008 -2.66 -4.874 -6.648 -8.148 -9.489 -10.597 -11.586 -12.442 -13.269 -13.968 -14.594 -15.208 -15.782 -16.286 -16.757 -17.259 -17.697 -18.061 -18.436 -18.825 -19.14 -19.475 -19.807 -20.059 -20.332 -20.62 -20.918 -21.227 -21.444 -21.665 -21.993 -22.231 -22.474 -22.598 -22.853 -23.103 -23.382 -23.538 -23.889 -24.048 -24.224 -24.395 -24.748 -24.937 -25.158 -25.418 -25.708 -26.006 -26.356 -27.522 -8 ,27132 ,KEBNE ,17040235,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:49:02 CET,0.0 0.64 1.01 1.279 1.498 1.69 1.842 1.985 2.26 2.381 2.507 2.578 2.84 2.921 3.082 3.246 3.406 3.477 3.608 3.736 3.912 4.028 4.147 4.324 4.482 4.616 4.749 4.877 5.028 5.168 5.303 5.448 5.559 5.673 5.819 5.976 6.116 6.256 6.39 6.518 6.593 6.61 6.615 6.595 6.521 6.375 6.108 5.664 4.941 3.714 1.495 -1.205 -3.507 -5.503 -7.196 -8.714 -10.019 -11.182 -12.179 -13.178 -14.05 -14.779 -15.392 -15.94 -16.45 -16.896 -17.334 -17.737 -18.107 -18.504 -18.898 -19.217 -19.542 -19.865 -20.125 -20.403 -20.69 -20.988 -21.289 -21.48 -21.678 -22.002 -22.232 -22.46 -22.568 -22.803 -23.06 -23.322 -23.457 -23.782 -23.858 -24.0 -24.151 -24.482 -24.663 -24.852 -25.082 -25.366 -25.69 -26.053 -27.09 -9 ,6770 ,KEBNE ,17040237,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:47:52 CET,0.0 0.712 0.974 1.209 1.372 1.524 1.668 1.802 2.03 2.141 2.26 2.312 2.579 2.667 2.838 2.989 3.121 3.185 3.3 3.407 3.571 3.675 3.772 3.909 4.047 4.179 4.295 4.392 4.507 4.63 4.736 4.847 4.949 5.043 5.155 5.269 5.359 5.451 5.545 5.617 5.662 5.701 5.734 5.715 5.63 5.462 5.176 4.733 3.973 2.738 0.599 -2.235 -4.721 -6.762 -8.478 -10.0 -11.346 -12.444 -13.306 -14.181 -14.918 -15.565 -16.179 -16.759 -17.274 -17.731 -18.217 -18.654 -19.023 -19.396 -19.766 -20.066 -20.404 -20.772 -21.046 -21.332 -21.619 -21.884 -22.159 -22.361 -22.567 -22.884 -23.109 -23.358 -23.481 -23.729 -23.998 -24.268 -24.413 -24.763 -24.893 -25.059 -25.241 -25.63 -25.829 -26.028 -26.255 -26.515 -26.873 -27.403 -28.561 -10 ,2244 ,KEBNE ,17040239,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:49:28 CET,0.0 0.546 0.777 1.001 1.191 1.341 1.466 1.593 1.83 1.93 2.015 2.016 2.252 2.321 2.465 2.594 2.706 2.763 2.875 2.973 3.108 3.198 3.28 3.392 3.499 3.593 3.676 3.758 3.864 3.96 4.044 4.144 4.226 4.3 4.376 4.448 4.54 4.627 4.687 4.752 4.791 4.777 4.743 4.707 4.643 4.497 4.241 3.813 3.129 2.018 0.015 -2.488 -4.575 -6.303 -7.76 -9.074 -10.199 -11.192 -12.037 -12.849 -13.559 -14.215 -14.818 -15.381 -15.891 -16.337 -16.81 -17.232 -17.595 -17.977 -18.372 -18.69 -19.006 -19.328 -19.582 -19.857 -20.142 -20.423 -20.704 -20.898 -21.102 -21.425 -21.654 -21.9 -22.024 -22.273 -22.526 -22.784 -22.925 -23.26 -23.35 -23.496 -23.648 -23.975 -24.148 -24.329 -24.564 -24.802 -25.021 -25.368 -26.486 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt deleted file mode 100644 index 4e5b327b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15659 ,KEBNE ,17040242,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:48:41 CET,0.0 0.695 0.988 1.192 1.39 1.573 1.743 1.907 2.172 2.283 2.391 2.434 2.68 2.754 2.9 3.041 3.18 3.253 3.387 3.503 3.656 3.746 3.831 3.963 4.098 4.223 4.338 4.46 4.621 4.756 4.876 5.023 5.152 5.272 5.393 5.526 5.655 5.776 5.891 5.988 6.079 6.15 6.205 6.255 6.271 6.281 6.209 5.946 5.452 4.572 2.921 0.797 -1.033 -2.735 -4.222 -5.367 -6.25 -7.05 -7.762 -8.45 -9.024 -9.538 -10.032 -10.495 -10.925 -11.322 -11.747 -12.133 -12.456 -12.787 -13.124 -13.407 -13.71 -14.031 -14.285 -14.531 -14.772 -15.034 -15.318 -15.515 -15.711 -16.011 -16.217 -16.433 -16.543 -16.767 -16.997 -17.234 -17.357 -17.673 -17.749 -17.879 -18.025 -18.342 -18.52 -18.709 -18.919 -19.172 -19.435 -19.736 -20.608 -2 ,14961 ,KEBNE ,17040243,Thu Dec 23 00:05:53 CET,Thu Dec 23 01:48:19 CET,0.0 0.541 0.781 0.964 1.141 1.327 1.492 1.636 1.908 2.031 2.137 2.176 2.449 2.543 2.725 2.894 3.049 3.124 3.248 3.368 3.556 3.665 3.769 3.911 4.03 4.155 4.277 4.384 4.524 4.662 4.786 4.924 5.051 5.182 5.337 5.498 5.645 5.787 5.903 6.008 6.109 6.215 6.326 6.379 6.401 6.372 6.28 6.087 5.639 4.787 3.169 1.046 -0.772 -2.42 -3.906 -5.171 -6.292 -7.326 -8.194 -9.047 -9.761 -10.404 -11.049 -11.669 -12.182 -12.595 -13.007 -13.362 -13.677 -14.019 -14.373 -14.654 -14.945 -15.256 -15.497 -15.737 -15.979 -16.241 -16.507 -16.678 -16.852 -17.125 -17.322 -17.525 -17.63 -17.844 -18.072 -18.319 -18.442 -18.749 -18.837 -18.986 -19.142 -19.44 -19.592 -19.758 -19.953 -20.186 -20.447 -20.787 -21.767 -3 ,7554 ,KEBNE ,17040244,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:49:13 CET,0.0 1.003 1.287 1.547 1.792 1.987 2.149 2.29 2.514 2.621 2.728 2.785 3.055 3.148 3.334 3.507 3.681 3.757 3.885 4.009 4.201 4.318 4.426 4.583 4.735 4.875 4.997 5.118 5.265 5.397 5.536 5.704 5.86 5.989 6.117 6.272 6.439 6.615 6.796 6.956 7.066 7.177 7.298 7.394 7.437 7.45 7.359 7.066 6.604 5.775 4.144 2.09 0.244 -1.429 -2.867 -4.092 -5.082 -5.904 -6.602 -7.302 -7.892 -8.44 -8.986 -9.485 -9.932 -10.328 -10.742 -11.124 -11.449 -11.79 -12.145 -12.428 -12.717 -13.018 -13.253 -13.493 -13.734 -13.994 -14.266 -14.445 -14.629 -14.914 -15.113 -15.318 -15.424 -15.646 -15.882 -16.127 -16.251 -16.572 -16.742 -16.933 -17.102 -17.426 -17.584 -17.756 -17.995 -18.261 -18.524 -18.926 -20.103 -4 ,4471 ,KEBNE ,17040245,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:48:56 CET,0.0 0.344 0.523 0.709 0.888 1.043 1.172 1.291 1.498 1.596 1.692 1.724 1.978 2.052 2.198 2.338 2.463 2.529 2.66 2.777 2.94 3.046 3.153 3.306 3.437 3.564 3.689 3.803 3.95 4.095 4.221 4.359 4.486 4.6 4.743 4.897 5.025 5.152 5.281 5.423 5.55 5.637 5.713 5.779 5.828 5.823 5.73 5.571 5.209 4.487 3.156 1.223 -0.491 -1.89 -3.133 -4.236 -5.168 -6.019 -6.745 -7.447 -8.038 -8.589 -9.098 -9.553 -10.004 -10.426 -10.833 -11.191 -11.507 -11.825 -12.16 -12.443 -12.721 -13.021 -13.259 -13.488 -13.732 -13.983 -14.239 -14.417 -14.594 -14.871 -15.074 -15.284 -15.398 -15.637 -15.874 -16.117 -16.242 -16.56 -16.65 -16.801 -16.97 -17.311 -17.476 -17.662 -17.861 -18.073 -18.342 -18.679 -19.547 -5 ,22217 ,KEBNE ,17040246,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:48:26 CET,0.0 0.652 0.948 1.196 1.405 1.585 1.737 1.898 2.171 2.286 2.406 2.468 2.739 2.832 2.998 3.164 3.311 3.381 3.517 3.65 3.857 3.988 4.102 4.253 4.392 4.526 4.666 4.807 4.978 5.142 5.292 5.461 5.629 5.787 5.964 6.152 6.309 6.475 6.661 6.841 6.999 7.119 7.195 7.261 7.312 7.284 7.157 6.905 6.44 5.617 3.945 1.735 -0.08 -1.528 -2.74 -3.859 -4.78 -5.593 -6.284 -6.941 -7.537 -8.085 -8.608 -9.107 -9.556 -9.959 -10.399 -10.805 -11.157 -11.514 -11.871 -12.164 -12.468 -12.789 -13.044 -13.296 -13.547 -13.811 -14.072 -14.239 -14.418 -14.723 -14.926 -15.132 -15.244 -15.472 -15.692 -15.926 -16.045 -16.342 -16.437 -16.589 -16.747 -17.081 -17.251 -17.44 -17.65 -17.894 -18.164 -18.48 -19.175 -6 ,6708 ,KEBNE ,17040247,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:49:07 CET,0.0 0.333 0.526 0.731 0.9 1.04 1.178 1.307 1.504 1.595 1.679 1.679 1.928 2.006 2.154 2.288 2.41 2.475 2.599 2.709 2.877 2.991 3.096 3.252 3.399 3.523 3.642 3.751 3.882 4.019 4.164 4.317 4.443 4.566 4.705 4.853 4.975 5.093 5.209 5.303 5.402 5.513 5.616 5.695 5.733 5.704 5.596 5.387 4.981 4.225 2.8 0.94 -0.697 -2.147 -3.344 -4.362 -5.285 -6.142 -6.855 -7.533 -8.129 -8.669 -9.177 -9.655 -10.086 -10.484 -10.91 -11.302 -11.635 -11.958 -12.277 -12.559 -12.859 -13.157 -13.392 -13.627 -13.865 -14.116 -14.38 -14.566 -14.745 -15.017 -15.223 -15.436 -15.537 -15.742 -15.961 -16.188 -16.306 -16.621 -16.691 -16.829 -16.978 -17.315 -17.503 -17.724 -17.958 -18.207 -18.516 -18.883 -19.653 -7 ,23557 ,KEBNE ,17040248,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:49:10 CET,0.0 0.947 1.249 1.47 1.66 1.823 1.956 2.073 2.313 2.435 2.542 2.56 2.804 2.883 3.04 3.187 3.338 3.408 3.529 3.649 3.818 3.917 4.01 4.142 4.262 4.39 4.523 4.658 4.822 4.972 5.115 5.268 5.414 5.547 5.686 5.828 5.95 6.074 6.207 6.329 6.447 6.565 6.66 6.696 6.67 6.584 6.429 6.166 5.671 4.757 3.076 0.961 -0.887 -2.474 -3.812 -5.054 -6.185 -7.207 -8.079 -8.942 -9.728 -10.434 -11.079 -11.703 -12.3 -12.832 -13.359 -13.835 -14.257 -14.68 -15.117 -15.496 -15.892 -16.258 -16.51 -16.76 -16.996 -17.229 -17.477 -17.648 -17.829 -18.122 -18.33 -18.54 -18.639 -18.837 -19.057 -19.311 -19.445 -19.761 -19.863 -20.016 -20.165 -20.471 -20.623 -20.79 -20.987 -21.21 -21.439 -21.789 -22.747 -8 ,24780 ,KEBNE ,17040249,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:48:52 CET,0.0 0.589 0.804 1.019 1.221 1.399 1.557 1.702 1.969 2.101 2.231 2.283 2.536 2.622 2.784 2.937 3.094 3.175 3.309 3.427 3.607 3.719 3.82 3.958 4.095 4.236 4.371 4.491 4.631 4.763 4.885 5.039 5.184 5.3 5.429 5.578 5.706 5.83 5.954 6.07 6.192 6.311 6.411 6.478 6.512 6.481 6.379 6.196 5.789 4.972 3.329 1.159 -0.655 -2.223 -3.582 -4.837 -5.97 -6.973 -7.818 -8.555 -9.109 -9.628 -10.149 -10.641 -11.09 -11.496 -11.915 -12.279 -12.59 -12.919 -13.259 -13.545 -13.858 -14.18 -14.413 -14.646 -14.886 -15.127 -15.362 -15.532 -15.724 -16.006 -16.205 -16.42 -16.531 -16.753 -16.976 -17.206 -17.322 -17.622 -17.695 -17.828 -17.979 -18.338 -18.51 -18.695 -18.895 -19.129 -19.466 -19.868 -20.818 -9 ,11636 ,KEBNE ,17040250,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:48:29 CET,0.0 0.791 1.11 1.32 1.504 1.674 1.828 1.976 2.238 2.352 2.47 2.509 2.772 2.866 3.028 3.197 3.366 3.439 3.585 3.731 3.925 4.04 4.15 4.324 4.497 4.66 4.806 4.945 5.121 5.285 5.436 5.603 5.774 5.939 6.109 6.284 6.449 6.64 6.839 7.036 7.211 7.359 7.482 7.536 7.565 7.554 7.43 7.172 6.746 5.941 4.304 2.225 0.417 -1.17 -2.543 -3.737 -4.748 -5.69 -6.581 -7.461 -8.123 -8.663 -9.157 -9.613 -10.035 -10.419 -10.812 -11.161 -11.485 -11.816 -12.166 -12.457 -12.752 -13.056 -13.281 -13.514 -13.758 -14.005 -14.247 -14.42 -14.607 -14.897 -15.096 -15.296 -15.396 -15.6 -15.81 -16.058 -16.183 -16.49 -16.554 -16.684 -16.828 -17.172 -17.366 -17.57 -17.771 -18.02 -18.395 -18.788 -19.955 -10 ,10139 ,KEBNE ,17040251,Thu Dec 23 00:05:52 CET,Thu Dec 23 01:48:11 CET,0.0 0.737 0.971 1.17 1.399 1.587 1.725 1.84 2.055 2.154 2.242 2.242 2.495 2.589 2.764 2.922 3.068 3.14 3.269 3.372 3.514 3.617 3.724 3.881 4.049 4.209 4.338 4.448 4.588 4.735 4.88 5.04 5.169 5.291 5.441 5.597 5.731 5.861 5.993 6.124 6.243 6.363 6.467 6.559 6.615 6.558 6.371 6.067 5.606 4.725 3.176 1.148 -0.763 -2.389 -3.747 -4.97 -6.076 -7.099 -7.973 -8.833 -9.577 -10.219 -10.788 -11.283 -11.7 -12.086 -12.507 -12.881 -13.204 -13.537 -13.889 -14.173 -14.453 -14.74 -14.975 -15.222 -15.479 -15.754 -16.044 -16.235 -16.421 -16.742 -16.959 -17.164 -17.267 -17.475 -17.714 -17.966 -18.085 -18.391 -18.478 -18.617 -18.765 -19.095 -19.255 -19.419 -19.607 -19.837 -20.124 -20.444 -21.017 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 7d00612a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24936 ,KEBNE ,17040252,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:55:12 CET,0.0 1.046 1.318 1.537 1.719 1.894 2.079 2.239 2.507 2.645 2.766 2.815 3.1 3.201 3.389 3.577 3.766 3.858 4.02 4.183 4.432 4.592 4.749 4.962 5.145 5.321 5.502 5.681 5.909 6.125 6.324 6.571 6.814 7.039 7.286 7.553 7.808 8.086 8.368 8.672 9.003 9.348 9.732 10.104 10.548 11.015 11.418 11.759 12.071 12.322 12.323 11.827 11.264 10.711 10.146 9.591 9.092 8.625 8.206 7.751 7.319 6.954 6.632 6.318 6.021 5.752 5.463 5.193 4.969 4.735 4.49 4.298 4.092 3.865 3.68 3.46 3.226 2.989 2.715 2.518 2.309 1.965 1.728 1.482 1.351 1.081 0.807 0.533 0.393 0.082 -0.064 -0.232 -0.424 -0.819 -1.037 -1.281 -1.547 -1.853 -2.2 -2.658 -3.843 -2 ,23342 ,KEBNE ,17040253,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:55:52 CET,0.0 0.757 1.024 1.289 1.553 1.738 1.895 2.047 2.313 2.435 2.555 2.611 2.878 2.983 3.179 3.352 3.53 3.619 3.789 3.961 4.221 4.386 4.548 4.769 4.956 5.133 5.31 5.479 5.685 5.879 6.069 6.3 6.53 6.745 6.998 7.286 7.548 7.835 8.146 8.457 8.791 9.2 9.686 10.152 10.61 11.001 11.382 11.737 12.15 12.701 13.203 13.255 12.932 12.443 11.939 11.465 11.038 10.611 10.22 9.805 9.425 9.087 8.778 8.486 8.207 7.95 7.659 7.386 7.16 6.926 6.684 6.48 6.265 6.041 5.867 5.695 5.51 5.313 5.127 4.996 4.853 4.635 4.483 4.317 4.237 4.067 3.872 3.665 3.537 3.22 3.067 2.894 2.709 2.32 2.096 1.845 1.574 1.27 0.907 0.42 -0.799 -3 ,7646 ,KEBNE ,17040254,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:55:03 CET,0.0 0.52 0.781 0.982 1.197 1.41 1.585 1.753 2.025 2.14 2.259 2.316 2.581 2.682 2.872 3.051 3.22 3.298 3.452 3.61 3.839 3.982 4.12 4.311 4.478 4.642 4.808 4.964 5.159 5.359 5.549 5.768 5.986 6.197 6.441 6.719 7.006 7.318 7.632 7.957 8.293 8.649 9.025 9.404 9.817 10.246 10.773 11.301 11.905 12.579 13.089 13.136 12.847 12.506 12.177 11.831 11.471 11.089 10.749 10.379 10.039 9.739 9.437 9.104 8.744 8.407 8.047 7.711 7.437 7.153 6.848 6.596 6.33 6.056 5.844 5.612 5.363 5.106 4.833 4.642 4.444 4.137 3.918 3.686 3.571 3.33 3.069 2.791 2.635 2.313 2.154 1.995 1.838 1.494 1.291 1.064 0.811 0.529 0.221 -0.209 -1.161 -4 ,778 ,KEBNE ,17040255,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:55:59 CET,0.0 1.142 1.527 1.815 2.037 2.221 2.382 2.535 2.836 2.971 3.099 3.183 3.453 3.556 3.743 3.923 4.095 4.169 4.307 4.457 4.671 4.798 4.917 5.089 5.261 5.424 5.581 5.736 5.942 6.151 6.349 6.588 6.82 7.029 7.256 7.52 7.775 8.042 8.315 8.598 8.92 9.293 9.693 10.048 10.391 10.694 10.998 11.303 11.59 11.875 12.049 11.827 11.44 11.019 10.513 9.981 9.506 9.044 8.651 8.276 7.9 7.544 7.231 6.944 6.682 6.427 6.145 5.906 5.709 5.501 5.275 5.074 4.857 4.629 4.445 4.26 4.076 3.863 3.597 3.415 3.24 2.936 2.715 2.499 2.387 2.146 1.905 1.663 1.525 1.206 1.052 0.877 0.702 0.292 0.036 -0.223 -0.49 -0.794 -1.147 -1.626 -2.634 -5 ,22866 ,KEBNE ,17040256,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:54:37 CET,0.0 0.708 0.95 1.172 1.354 1.539 1.711 1.86 2.155 2.294 2.414 2.483 2.759 2.862 3.093 3.379 3.64 3.742 3.934 4.114 4.345 4.492 4.638 4.849 5.046 5.231 5.405 5.576 5.8 6.013 6.233 6.495 6.735 6.968 7.232 7.512 7.798 8.172 8.617 9.086 9.555 10.07 10.672 11.261 11.929 12.596 13.267 13.953 14.646 15.245 15.646 15.662 15.378 15.049 14.711 14.341 14.031 13.686 13.294 12.873 12.537 12.236 11.915 11.606 11.313 11.039 10.755 10.499 10.273 10.041 9.763 9.49 9.21 8.923 8.708 8.503 8.276 8.042 7.806 7.626 7.426 7.119 6.909 6.686 6.564 6.306 6.048 5.793 5.651 5.343 5.239 5.081 4.904 4.536 4.326 4.096 3.846 3.563 3.242 2.842 1.825 -6 ,2724 ,KEBNE ,17040257,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:55:42 CET,0.0 0.58 0.806 0.989 1.169 1.345 1.508 1.65 1.914 2.037 2.151 2.193 2.461 2.553 2.734 2.901 3.056 3.131 3.291 3.446 3.646 3.773 3.891 4.072 4.258 4.437 4.619 4.798 5.011 5.209 5.415 5.661 5.885 6.096 6.351 6.634 6.88 7.149 7.444 7.778 8.12 8.545 9.102 9.631 10.224 10.887 11.573 12.216 12.891 13.558 14.037 13.974 13.622 13.191 12.781 12.394 11.977 11.551 11.175 10.796 10.459 10.131 9.812 9.522 9.247 8.987 8.719 8.48 8.274 8.056 7.831 7.644 7.445 7.225 7.05 6.872 6.685 6.488 6.289 6.142 5.975 5.702 5.513 5.328 5.222 4.987 4.763 4.526 4.392 4.094 3.959 3.809 3.643 3.257 3.061 2.849 2.604 2.334 2.041 1.674 0.968 -7 ,31958 ,KEBNE ,17040258,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:55:35 CET,0.0 0.946 1.251 1.484 1.691 1.88 2.054 2.211 2.514 2.664 2.804 2.88 3.163 3.262 3.454 3.633 3.795 3.877 4.032 4.187 4.401 4.531 4.658 4.85 5.042 5.233 5.429 5.621 5.861 6.075 6.28 6.516 6.726 6.926 7.163 7.449 7.728 8.011 8.298 8.599 8.895 9.225 9.598 9.952 10.317 10.637 10.915 11.186 11.431 11.577 11.586 11.238 10.739 10.173 9.631 9.151 8.704 8.27 7.859 7.457 7.104 6.79 6.512 6.24 5.976 5.704 5.409 5.161 4.961 4.751 4.536 4.358 4.15 3.922 3.743 3.561 3.363 3.164 2.975 2.844 2.704 2.482 2.313 2.099 1.991 1.759 1.481 1.208 1.06 0.738 0.589 0.422 0.242 -0.145 -0.365 -0.599 -0.842 -1.112 -1.436 -1.844 -2.844 -8 ,16433 ,KEBNE ,17040259,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:55:33 CET,0.0 1.054 1.399 1.679 1.92 2.122 2.302 2.462 2.763 2.903 3.036 3.103 3.37 3.469 3.66 3.836 4.012 4.097 4.258 4.411 4.627 4.774 4.913 5.089 5.253 5.423 5.603 5.789 6.007 6.207 6.407 6.64 6.867 7.089 7.346 7.637 7.923 8.231 8.527 8.824 9.158 9.545 9.966 10.351 10.768 11.297 11.98 12.67 13.338 13.985 14.564 14.81 14.709 14.43 14.082 13.721 13.302 12.842 12.415 11.969 11.589 11.247 10.929 10.626 10.347 10.105 9.858 9.629 9.412 9.177 8.93 8.731 8.528 8.302 8.128 7.963 7.774 7.568 7.354 7.21 7.066 6.822 6.652 6.481 6.398 6.229 6.04 5.841 5.73 5.434 5.309 5.137 4.951 4.586 4.38 4.142 3.878 3.567 3.19 2.722 1.755 -9 ,18743 ,KEBNE ,17040260,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:55:31 CET,0.0 0.559 0.924 1.22 1.423 1.599 1.769 1.954 2.275 2.409 2.536 2.617 2.891 2.984 3.189 3.401 3.576 3.655 3.817 3.978 4.196 4.329 4.469 4.667 4.851 5.034 5.212 5.377 5.576 5.773 5.969 6.201 6.415 6.617 6.927 7.335 7.709 8.108 8.517 8.943 9.375 9.824 10.359 10.878 11.436 12.05 12.708 13.381 14.084 14.733 15.204 15.306 15.118 14.768 14.393 13.992 13.583 13.233 12.928 12.594 12.323 12.08 11.82 11.551 11.283 11.034 10.779 10.537 10.329 10.133 9.935 9.771 9.575 9.353 9.185 9.014 8.806 8.536 8.24 8.046 7.845 7.519 7.324 7.146 7.044 6.802 6.53 6.238 6.09 5.77 5.621 5.461 5.303 4.948 4.748 4.544 4.299 4.016 3.688 3.24 2.295 -10 ,7354 ,KEBNE ,17040261,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:54:55 CET,0.0 0.961 1.317 1.543 1.763 1.97 2.125 2.271 2.555 2.681 2.798 2.852 3.117 3.212 3.404 3.594 3.789 3.88 4.031 4.176 4.406 4.564 4.713 4.936 5.15 5.357 5.561 5.759 6.008 6.236 6.453 6.714 6.946 7.183 7.462 7.749 8.034 8.354 8.703 9.046 9.38 9.697 10.08 10.578 11.172 11.808 12.509 13.246 13.953 14.713 15.388 15.469 15.19 14.834 14.41 13.907 13.431 12.994 12.612 12.222 11.859 11.504 11.167 10.876 10.591 10.303 9.993 9.719 9.474 9.189 8.87 8.599 8.337 8.09 7.89 7.669 7.453 7.242 6.998 6.826 6.645 6.345 6.142 5.926 5.805 5.553 5.294 5.007 4.854 4.538 4.405 4.23 4.051 3.677 3.454 3.195 2.918 2.658 2.385 2.009 1.06 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt deleted file mode 100644 index 149701b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18582 ,KEBNE ,17040262,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:54:32 CET,0.0 1.193 1.601 1.906 2.171 2.394 2.569 2.736 3.072 3.239 3.379 3.439 3.707 3.82 4.054 4.252 4.416 4.5 4.669 4.827 5.042 5.179 5.311 5.511 5.695 5.853 6.011 6.167 6.365 6.558 6.733 6.937 7.154 7.361 7.593 7.891 8.194 8.513 8.863 9.222 9.578 9.973 10.41 10.813 11.23 11.659 12.093 12.55 13.001 13.275 13.198 12.629 11.903 11.156 10.463 9.844 9.273 8.731 8.281 7.839 7.441 7.058 6.68 6.333 6.03 5.762 5.475 5.233 5.029 4.793 4.538 4.327 4.101 3.837 3.615 3.39 3.159 2.905 2.633 2.452 2.277 2.008 1.809 1.596 1.488 1.269 1.037 0.776 0.636 0.318 0.211 0.065 -0.089 -0.427 -0.639 -0.865 -1.107 -1.393 -1.734 -2.165 -3.444 -2 ,25545 ,KEBNE ,17040263,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:55:35 CET,0.0 1.098 1.635 1.994 2.241 2.473 2.676 2.851 3.161 3.324 3.479 3.573 3.852 3.959 4.185 4.398 4.6 4.693 4.871 5.047 5.31 5.482 5.647 5.883 6.115 6.332 6.531 6.725 6.975 7.198 7.402 7.647 7.872 8.086 8.34 8.613 8.853 9.112 9.389 9.654 9.917 10.209 10.445 10.615 10.939 11.414 11.909 12.409 12.834 13.037 12.848 12.169 11.46 10.759 9.99 9.189 8.466 7.851 7.381 6.902 6.463 6.092 5.74 5.396 5.08 4.804 4.518 4.228 3.925 3.574 3.201 2.906 2.618 2.316 2.073 1.82 1.543 1.251 0.972 0.781 0.587 0.286 0.06 -0.18 -0.307 -0.571 -0.832 -1.127 -1.291 -1.625 -1.767 -1.943 -2.143 -2.579 -2.808 -3.037 -3.278 -3.54 -3.828 -4.203 -5.261 -3 ,28164 ,KEBNE ,17040264,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:56:32 CET,0.0 1.304 1.663 1.93 2.169 2.38 2.552 2.73 3.073 3.225 3.376 3.484 3.78 3.901 4.125 4.333 4.542 4.655 4.859 5.029 5.258 5.4 5.545 5.753 5.957 6.156 6.343 6.514 6.735 6.997 7.294 7.646 7.974 8.296 8.649 9.033 9.405 9.793 10.192 10.621 11.026 11.42 11.892 12.352 12.828 13.309 13.8 14.237 14.568 14.796 14.75 14.216 13.585 12.965 12.352 11.785 11.303 10.866 10.486 10.054 9.649 9.301 8.955 8.617 8.306 8.02 7.738 7.486 7.264 7.039 6.797 6.581 6.352 6.126 5.949 5.756 5.531 5.242 4.915 4.692 4.46 4.091 3.827 3.554 3.424 3.161 2.867 2.544 2.372 2.028 1.838 1.644 1.461 1.07 0.853 0.622 0.37 0.13 -0.173 -0.637 -1.77 -4 ,7293 ,KEBNE ,17040265,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:54:49 CET,0.0 1.457 1.825 2.117 2.395 2.62 2.825 3.008 3.294 3.44 3.586 3.677 3.96 4.076 4.29 4.492 4.676 4.771 4.956 5.127 5.379 5.533 5.676 5.883 6.083 6.282 6.466 6.639 6.866 7.077 7.267 7.495 7.724 7.938 8.169 8.408 8.638 8.852 9.03 9.216 9.446 9.804 10.253 10.703 11.178 11.612 12.071 12.49 12.834 13.011 12.73 12.093 11.424 10.75 10.113 9.496 8.945 8.437 7.971 7.495 7.08 6.699 6.335 5.999 5.682 5.367 5.028 4.729 4.462 4.201 3.947 3.727 3.495 3.262 3.042 2.78 2.513 2.228 1.931 1.725 1.516 1.198 0.965 0.71 0.594 0.394 0.175 -0.074 -0.219 -0.546 -0.665 -0.821 -0.992 -1.404 -1.637 -1.868 -2.124 -2.417 -2.744 -3.147 -4.294 -5 ,11190 ,KEBNE ,17040266,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:54:52 CET,0.0 1.459 1.893 2.188 2.433 2.659 2.871 3.056 3.388 3.55 3.704 3.83 4.112 4.214 4.41 4.621 4.838 4.931 5.101 5.271 5.515 5.661 5.796 6.008 6.227 6.432 6.622 6.793 6.982 7.169 7.347 7.549 7.75 7.948 8.172 8.404 8.623 8.861 9.102 9.347 9.592 9.846 10.095 10.28 10.46 10.628 10.749 10.832 10.846 10.668 10.023 8.986 7.999 7.088 6.29 5.582 4.963 4.367 3.839 3.309 2.858 2.452 2.039 1.649 1.293 0.969 0.631 0.339 0.09 -0.179 -0.444 -0.65 -0.88 -1.135 -1.338 -1.559 -1.788 -2.023 -2.279 -2.467 -2.678 -3.014 -3.236 -3.469 -3.593 -3.86 -4.149 -4.446 -4.586 -4.897 -5.017 -5.183 -5.369 -5.789 -6.03 -6.275 -6.536 -6.837 -7.189 -7.657 -9.006 -6 ,25315 ,KEBNE ,17040267,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:54:31 CET,0.0 1.331 1.699 1.943 2.14 2.335 2.528 2.706 3.028 3.171 3.293 3.341 3.616 3.722 3.92 4.109 4.287 4.377 4.565 4.753 4.998 5.15 5.296 5.503 5.69 5.873 6.053 6.225 6.451 6.68 6.896 7.144 7.386 7.618 7.882 8.161 8.418 8.694 8.964 9.219 9.467 9.761 10.117 10.457 10.734 10.904 11.037 11.119 11.089 10.809 10.115 9.129 8.227 7.356 6.539 5.797 5.186 4.657 4.175 3.658 3.201 2.812 2.447 2.049 1.676 1.365 1.037 0.732 0.458 0.163 -0.18 -0.472 -0.763 -1.08 -1.331 -1.582 -1.848 -2.137 -2.424 -2.631 -2.847 -3.181 -3.417 -3.659 -3.792 -4.083 -4.398 -4.731 -4.896 -5.247 -5.468 -5.675 -5.864 -6.253 -6.455 -6.678 -6.92 -7.207 -7.562 -7.997 -8.916 -7 ,2879 ,KEBNE ,17040268,Thu Dec 23 00:12:05 CET,Thu Dec 23 01:54:59 CET,0.0 0.965 1.304 1.591 1.833 2.037 2.234 2.422 2.748 2.9 3.045 3.131 3.4 3.51 3.709 3.891 4.082 4.178 4.353 4.509 4.723 4.862 5.009 5.229 5.428 5.613 5.782 5.948 6.173 6.385 6.575 6.783 6.984 7.189 7.42 7.681 7.933 8.191 8.436 8.697 8.982 9.284 9.579 9.798 9.992 10.139 10.294 10.484 10.514 10.343 9.832 8.831 7.901 7.073 6.321 5.634 5.016 4.43 3.892 3.353 2.919 2.519 2.144 1.816 1.496 1.192 0.863 0.571 0.306 -0.025 -0.392 -0.693 -0.99 -1.285 -1.53 -1.796 -2.074 -2.365 -2.679 -2.903 -3.136 -3.484 -3.71 -3.932 -4.054 -4.336 -4.639 -4.937 -5.078 -5.409 -5.582 -5.756 -5.945 -6.381 -6.622 -6.867 -7.118 -7.386 -7.679 -8.05 -8.664 -8 ,15707 ,KEBNE ,17040269,Thu Dec 23 00:12:07 CET,Thu Dec 23 01:53:53 CET,0.0 1.143 1.602 1.873 2.097 2.304 2.478 2.632 2.924 3.055 3.187 3.348 3.678 3.828 4.06 4.237 4.409 4.492 4.66 4.832 5.067 5.2 5.325 5.513 5.706 5.903 6.089 6.261 6.481 6.702 6.911 7.135 7.341 7.553 7.797 8.068 8.334 8.614 8.902 9.192 9.477 9.753 10.048 10.343 10.628 10.9 11.082 11.14 11.256 11.344 11.085 10.437 9.714 9.056 8.425 7.808 7.191 6.59 6.096 5.554 5.04 4.597 4.142 3.687 3.256 2.848 2.41 2.028 1.706 1.376 1.031 0.721 0.39 0.038 -0.241 -0.516 -0.79 -1.08 -1.379 -1.589 -1.808 -2.145 -2.379 -2.621 -2.754 -3.031 -3.297 -3.579 -3.732 -4.067 -4.218 -4.394 -4.59 -5.006 -5.226 -5.464 -5.718 -5.994 -6.286 -6.642 -7.536 -9 ,23327 ,KEBNE ,17040270,Thu Dec 23 00:12:11 CET,Thu Dec 23 01:53:16 CET,0.0 0.985 1.293 1.552 1.764 1.954 2.146 2.316 2.635 2.792 2.941 3.04 3.326 3.446 3.654 3.841 4.019 4.107 4.297 4.485 4.745 4.904 5.048 5.274 5.504 5.719 5.906 6.089 6.325 6.529 6.719 6.928 7.119 7.312 7.556 7.901 8.265 8.648 9.06 9.461 9.852 10.292 10.763 11.206 11.715 12.226 12.716 13.16 13.543 13.742 13.659 13.122 12.39 11.688 11.015 10.363 9.768 9.236 8.779 8.277 7.827 7.428 7.034 6.65 6.302 5.987 5.665 5.392 5.149 4.883 4.586 4.308 4.007 3.694 3.458 3.202 2.917 2.64 2.367 2.167 1.951 1.617 1.4 1.165 1.036 0.765 0.468 0.156 -0.003 -0.329 -0.472 -0.664 -0.858 -1.226 -1.442 -1.68 -1.914 -2.174 -2.491 -2.932 -3.753 -10 ,17720 ,KEBNE ,17040271,Thu Dec 23 00:12:07 CET,Thu Dec 23 01:54:36 CET,0.0 1.179 1.571 1.839 2.047 2.236 2.425 2.628 2.984 3.133 3.275 3.36 3.646 3.752 3.932 4.105 4.29 4.384 4.564 4.736 4.982 5.14 5.287 5.48 5.663 5.838 6.026 6.213 6.414 6.605 6.799 7.029 7.25 7.464 7.744 8.096 8.44 8.811 9.168 9.514 9.893 10.298 10.733 11.13 11.509 11.882 12.284 12.696 13.046 13.216 13.094 12.559 11.923 11.345 10.791 10.215 9.679 9.18 8.736 8.254 7.817 7.414 7.042 6.703 6.35 5.999 5.627 5.293 5.013 4.731 4.437 4.188 3.936 3.691 3.49 3.274 3.048 2.8 2.555 2.4 2.229 1.941 1.733 1.527 1.422 1.184 0.915 0.623 0.482 0.171 0.02 -0.166 -0.348 -0.732 -0.951 -1.188 -1.425 -1.685 -2.021 -2.443 -3.185 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt deleted file mode 100644 index 01b61a85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28688 ,KEBNE ,17040272,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:54:16 CET,0.0 0.694 1.01 1.264 1.495 1.704 1.891 2.073 2.39 2.535 2.684 2.802 3.104 3.236 3.471 3.693 3.911 4.014 4.203 4.389 4.66 4.83 5.0 5.246 5.472 5.683 5.889 6.086 6.312 6.495 6.648 6.831 7.025 7.216 7.432 7.65 7.852 8.091 8.332 8.578 8.838 9.117 9.441 9.762 10.123 10.525 10.93 11.335 11.751 12.15 12.432 12.254 11.819 11.362 10.919 10.477 10.084 9.718 9.346 8.905 8.531 8.234 7.925 7.631 7.361 7.094 6.815 6.581 6.375 6.138 5.887 5.691 5.495 5.284 5.12 4.955 4.787 4.606 4.417 4.294 4.16 3.943 3.787 3.626 3.535 3.323 3.088 2.822 2.671 2.354 2.215 2.065 1.9 1.519 1.309 1.083 0.82 0.538 0.222 -0.226 -1.814 -2 ,16434 ,KEBNE ,17040273,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:53:39 CET,0.0 0.664 0.993 1.252 1.487 1.709 1.903 2.091 2.426 2.574 2.711 2.793 3.076 3.193 3.419 3.632 3.83 3.928 4.114 4.292 4.53 4.656 4.761 4.925 5.089 5.254 5.414 5.562 5.748 5.925 6.084 6.266 6.458 6.638 6.833 7.069 7.294 7.515 7.746 8.005 8.271 8.561 8.899 9.217 9.579 9.958 10.356 10.772 11.147 11.495 11.78 11.68 11.348 11.004 10.67 10.283 9.873 9.477 9.141 8.79 8.477 8.189 7.901 7.624 7.364 7.135 6.899 6.679 6.491 6.294 6.062 5.881 5.703 5.502 5.357 5.207 5.041 4.864 4.693 4.575 4.445 4.235 4.081 3.923 3.84 3.666 3.486 3.309 3.216 2.95 2.897 2.775 2.653 2.368 2.207 2.035 1.839 1.618 1.317 0.943 0.244 -3 ,5971 ,KEBNE ,17040274,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:54:16 CET,0.0 0.894 1.264 1.531 1.749 1.951 2.138 2.307 2.633 2.783 2.918 3.016 3.312 3.44 3.693 3.928 4.114 4.184 4.315 4.431 4.599 4.721 4.834 4.998 5.204 5.423 5.626 5.838 6.12 6.372 6.586 6.798 6.983 7.16 7.362 7.588 7.808 8.05 8.295 8.544 8.821 9.133 9.474 9.804 10.182 10.583 11.036 11.501 11.966 12.361 12.472 12.153 11.726 11.315 10.85 10.393 9.98 9.568 9.224 8.874 8.532 8.207 7.91 7.633 7.369 7.132 6.883 6.662 6.474 6.272 6.057 5.881 5.696 5.504 5.352 5.192 5.02 4.841 4.651 4.522 4.391 4.176 4.008 3.83 3.745 3.565 3.373 3.171 3.061 2.785 2.713 2.596 2.476 2.224 2.085 1.944 1.804 1.627 1.429 1.162 0.466 -4 ,12643 ,KEBNE ,17040275,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:54:39 CET,0.0 0.923 1.304 1.624 1.864 2.07 2.269 2.45 2.817 2.992 3.143 3.247 3.535 3.654 3.89 4.113 4.295 4.367 4.496 4.622 4.819 4.944 5.055 5.212 5.365 5.511 5.664 5.806 5.972 6.137 6.307 6.498 6.669 6.838 7.023 7.235 7.452 7.694 7.955 8.214 8.476 8.782 9.146 9.479 9.848 10.228 10.618 11.012 11.409 11.749 11.868 11.58 11.193 10.825 10.426 10.015 9.603 9.199 8.839 8.481 8.175 7.896 7.604 7.33 7.08 6.843 6.598 6.388 6.223 6.039 5.828 5.647 5.463 5.275 5.124 4.961 4.783 4.6 4.41 4.283 4.162 3.963 3.81 3.649 3.568 3.398 3.213 3.022 2.913 2.631 2.589 2.482 2.374 2.153 2.026 1.913 1.763 1.576 1.393 1.137 0.437 -5 ,5643 ,KEBNE ,17040276,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:55:02 CET,0.0 0.564 0.999 1.28 1.523 1.755 1.98 2.174 2.473 2.609 2.729 2.769 3.029 3.112 3.27 3.423 3.567 3.63 3.757 3.891 4.081 4.201 4.322 4.489 4.643 4.787 4.918 5.052 5.227 5.389 5.537 5.716 5.909 6.101 6.301 6.506 6.718 6.958 7.208 7.476 7.75 8.047 8.393 8.738 9.117 9.489 9.853 10.185 10.532 10.92 11.141 10.972 10.59 10.135 9.703 9.307 8.935 8.571 8.193 7.78 7.466 7.201 6.938 6.692 6.469 6.257 6.017 5.792 5.593 5.394 5.205 5.049 4.858 4.64 4.475 4.324 4.176 4.016 3.853 3.736 3.615 3.417 3.263 3.107 3.029 2.867 2.695 2.518 2.434 2.178 2.135 2.019 1.906 1.648 1.494 1.339 1.189 1.017 0.803 0.541 -0.11 -6 ,12674 ,KEBNE ,17040277,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:54:31 CET,0.0 0.902 1.179 1.349 1.492 1.639 1.763 1.881 2.094 2.183 2.275 2.275 2.515 2.597 2.763 2.913 3.049 3.112 3.228 3.343 3.508 3.613 3.73 3.901 4.054 4.202 4.339 4.464 4.635 4.804 4.947 5.11 5.28 5.448 5.64 5.854 6.048 6.26 6.485 6.73 7.004 7.307 7.627 7.914 8.231 8.539 8.877 9.258 9.602 9.883 10.06 9.879 9.476 8.998 8.478 7.97 7.539 7.154 6.816 6.456 6.121 5.812 5.512 5.227 4.963 4.727 4.48 4.25 4.053 3.844 3.62 3.442 3.241 3.026 2.872 2.697 2.51 2.328 2.134 1.999 1.858 1.651 1.509 1.345 1.261 1.095 0.927 0.743 0.648 0.387 0.33 0.213 0.094 -0.154 -0.28 -0.471 -0.676 -0.823 -1.004 -1.219 -1.665 -7 ,8655 ,KEBNE ,17040278,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:54:32 CET,0.0 0.563 0.868 1.122 1.341 1.551 1.737 1.904 2.206 2.338 2.47 2.571 2.853 2.967 3.198 3.417 3.617 3.715 3.911 4.095 4.352 4.514 4.669 4.9 5.138 5.357 5.558 5.761 6.034 6.313 6.562 6.834 7.113 7.379 7.653 7.901 8.108 8.343 8.587 8.831 9.081 9.358 9.678 9.982 10.33 10.693 11.053 11.45 11.882 12.216 12.351 12.08 11.629 11.187 10.795 10.398 10.028 9.663 9.3 8.917 8.586 8.285 7.982 7.685 7.409 7.152 6.875 6.643 6.441 6.222 5.993 5.804 5.615 5.425 5.269 5.098 4.92 4.727 4.534 4.409 4.272 4.03 3.874 3.723 3.635 3.453 3.282 3.09 2.984 2.719 2.691 2.584 2.474 2.247 2.122 1.992 1.841 1.672 1.492 1.243 0.692 -8 ,30311 ,KEBNE ,17040279,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:53:10 CET,0.0 0.759 1.106 1.408 1.674 1.898 2.09 2.273 2.61 2.756 2.9 3.009 3.303 3.425 3.668 3.907 4.13 4.232 4.426 4.613 4.884 5.061 5.235 5.491 5.721 5.939 6.147 6.338 6.59 6.835 7.057 7.31 7.562 7.807 8.058 8.315 8.545 8.774 9.023 9.289 9.56 9.856 10.189 10.508 10.855 11.208 11.599 12.019 12.43 12.786 12.986 12.794 12.393 11.969 11.564 11.126 10.693 10.317 9.988 9.641 9.346 9.072 8.799 8.546 8.317 8.094 7.852 7.642 7.46 7.259 7.048 6.888 6.723 6.542 6.404 6.257 6.091 5.922 5.753 5.64 5.521 5.316 5.155 4.985 4.906 4.75 4.598 4.436 4.343 4.082 4.047 3.935 3.818 3.572 3.435 3.285 3.111 2.885 2.578 2.146 0.814 -9 ,5938 ,KEBNE ,17040280,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:56:09 CET,0.0 0.823 1.227 1.507 1.735 1.952 2.141 2.311 2.643 2.808 2.964 3.075 3.358 3.471 3.701 3.915 4.114 4.217 4.412 4.601 4.88 5.067 5.252 5.474 5.633 5.781 5.932 6.074 6.258 6.431 6.607 6.812 6.996 7.181 7.383 7.603 7.819 8.057 8.309 8.572 8.861 9.173 9.509 9.857 10.232 10.591 11.008 11.455 11.838 12.162 12.408 12.299 11.97 11.579 11.205 10.795 10.371 9.973 9.642 9.324 9.022 8.735 8.452 8.178 7.931 7.703 7.455 7.221 7.003 6.767 6.538 6.357 6.171 5.975 5.813 5.644 5.479 5.308 5.123 4.993 4.867 4.675 4.53 4.371 4.286 4.106 3.922 3.734 3.633 3.365 3.303 3.194 3.085 2.833 2.681 2.519 2.367 2.192 1.995 1.756 0.828 -10 ,25174 ,KEBNE ,17040281,Thu Dec 23 00:12:07 CET,Thu Dec 23 01:51:23 CET,0.0 0.507 0.809 1.06 1.271 1.466 1.67 1.856 2.189 2.343 2.49 2.612 2.915 3.048 3.29 3.502 3.7 3.803 4.008 4.189 4.423 4.549 4.658 4.817 4.957 5.085 5.23 5.378 5.556 5.711 5.859 6.048 6.222 6.38 6.566 6.784 6.987 7.204 7.448 7.694 7.933 8.199 8.51 8.805 9.121 9.461 9.828 10.205 10.595 10.925 11.055 10.747 10.299 9.871 9.429 8.968 8.557 8.168 7.808 7.416 7.079 6.798 6.531 6.27 6.03 5.795 5.538 5.329 5.141 4.923 4.686 4.493 4.316 4.152 4.01 3.851 3.686 3.517 3.341 3.224 3.102 2.893 2.735 2.57 2.491 2.338 2.172 1.995 1.902 1.637 1.615 1.503 1.385 1.138 0.998 0.836 0.658 0.465 0.257 -0.004 -0.476 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt deleted file mode 100644 index 458d06ea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27743 ,KEBNE ,17040282,Thu Dec 23 00:12:08 CET,Thu Dec 23 01:52:54 CET,0.0 0.379 0.641 0.879 1.074 1.247 1.42 1.585 1.835 1.919 1.997 1.998 2.243 2.314 2.467 2.61 2.741 2.811 2.938 3.062 3.242 3.351 3.461 3.617 3.755 3.888 4.022 4.155 4.328 4.497 4.655 4.843 5.026 5.191 5.375 5.599 5.826 6.046 6.27 6.505 6.729 6.996 7.299 7.589 7.931 8.277 8.596 8.917 9.226 9.445 9.375 8.93 8.442 7.911 7.36 6.777 6.262 5.808 5.39 4.983 4.63 4.293 3.935 3.583 3.284 3.008 2.701 2.409 2.143 1.867 1.577 1.333 1.079 0.803 0.577 0.335 0.099 -0.118 -0.326 -0.48 -0.648 -0.923 -1.12 -1.331 -1.446 -1.674 -1.908 -2.173 -2.315 -2.601 -2.684 -2.824 -2.975 -3.268 -3.439 -3.649 -3.866 -4.124 -4.435 -4.817 -5.508 -2 ,28707 ,KEBNE ,17040283,Thu Dec 23 00:12:07 CET,Thu Dec 23 01:51:32 CET,0.0 0.591 0.975 1.259 1.486 1.692 1.882 2.044 2.352 2.502 2.643 2.727 3.005 3.117 3.339 3.547 3.738 3.833 4.022 4.2 4.435 4.585 4.734 4.952 5.152 5.342 5.531 5.718 5.968 6.202 6.418 6.674 6.913 7.151 7.42 7.714 8.01 8.312 8.581 8.827 9.098 9.403 9.735 10.058 10.398 10.747 11.102 11.441 11.767 11.982 12.012 11.638 11.087 10.557 10.02 9.475 8.959 8.418 7.917 7.435 7.056 6.732 6.396 6.067 5.759 5.45 5.107 4.817 4.579 4.331 4.081 3.853 3.588 3.325 3.119 2.895 2.651 2.38 2.1 1.916 1.739 1.432 1.205 0.991 0.885 0.666 0.415 0.163 0.045 -0.248 -0.366 -0.519 -0.668 -0.992 -1.166 -1.349 -1.558 -1.809 -2.122 -2.511 -3.415 -3 ,16207 ,KEBNE ,17040284,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:54:59 CET,0.0 0.557 0.858 1.07 1.293 1.496 1.67 1.832 2.145 2.287 2.423 2.517 2.795 2.909 3.13 3.343 3.532 3.632 3.826 3.999 4.257 4.424 4.58 4.806 5.027 5.238 5.438 5.629 5.872 6.104 6.317 6.578 6.834 7.07 7.345 7.651 7.922 8.209 8.531 8.845 9.123 9.402 9.744 10.095 10.468 10.861 11.273 11.687 12.103 12.412 12.515 12.289 11.884 11.411 10.935 10.449 9.985 9.58 9.201 8.781 8.424 8.108 7.809 7.51 7.222 6.956 6.665 6.399 6.158 5.907 5.663 5.453 5.219 4.987 4.819 4.637 4.45 4.259 4.061 3.933 3.798 3.607 3.476 3.315 3.229 3.051 2.862 2.661 2.554 2.289 2.246 2.137 2.03 1.792 1.643 1.448 1.249 1.034 0.765 0.476 -0.285 -4 ,14268 ,KEBNE ,17040285,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:54:59 CET,0.0 0.618 0.935 1.225 1.438 1.631 1.803 1.949 2.231 2.362 2.481 2.545 2.814 2.921 3.126 3.3 3.442 3.506 3.614 3.721 3.887 3.997 4.104 4.255 4.41 4.559 4.691 4.815 4.968 5.123 5.284 5.472 5.64 5.801 5.989 6.195 6.383 6.593 6.836 7.096 7.362 7.67 8.005 8.32 8.666 9.029 9.429 9.845 10.237 10.45 10.519 10.259 9.712 9.17 8.666 8.192 7.773 7.363 6.981 6.599 6.228 5.854 5.511 5.178 4.855 4.58 4.31 4.066 3.847 3.602 3.362 3.185 2.994 2.792 2.632 2.455 2.249 2.032 1.809 1.642 1.485 1.269 1.113 0.953 0.864 0.677 0.482 0.253 0.121 -0.178 -0.295 -0.468 -0.655 -1.068 -1.305 -1.569 -1.861 -2.188 -2.585 -3.121 -4.627 -5 ,23991 ,KEBNE ,17040286,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:54:57 CET,0.0 0.834 1.184 1.447 1.675 1.871 2.042 2.201 2.51 2.647 2.771 2.846 3.127 3.239 3.454 3.665 3.864 3.946 4.085 4.233 4.44 4.568 4.698 4.869 5.017 5.159 5.3 5.433 5.599 5.752 5.897 6.08 6.265 6.438 6.627 6.836 7.042 7.276 7.524 7.775 8.025 8.296 8.61 8.879 9.165 9.463 9.764 10.115 10.484 10.781 10.902 10.517 9.931 9.339 8.81 8.303 7.852 7.404 6.998 6.632 6.283 5.943 5.62 5.316 5.042 4.789 4.511 4.237 3.998 3.751 3.49 3.273 3.043 2.815 2.624 2.42 2.207 1.988 1.753 1.594 1.44 1.172 0.988 0.809 0.719 0.542 0.355 0.155 0.041 -0.242 -0.345 -0.493 -0.642 -0.966 -1.13 -1.286 -1.473 -1.711 -2.026 -2.487 -4.619 -6 ,8745 ,KEBNE ,17040287,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:54:19 CET,0.0 0.409 0.713 0.95 1.147 1.325 1.483 1.621 1.878 2.011 2.133 2.14 2.38 2.454 2.601 2.759 2.925 3.007 3.181 3.36 3.612 3.772 3.926 4.155 4.374 4.584 4.78 4.954 5.166 5.363 5.531 5.706 5.878 6.043 6.234 6.451 6.648 6.869 7.112 7.36 7.601 7.858 8.197 8.543 8.916 9.301 9.708 10.1 10.461 10.8 10.98 10.703 10.231 9.765 9.269 8.742 8.242 7.744 7.304 6.879 6.527 6.204 5.886 5.593 5.302 5.023 4.734 4.486 4.253 3.989 3.723 3.51 3.288 3.06 2.884 2.702 2.508 2.301 2.087 1.939 1.793 1.553 1.377 1.208 1.124 0.938 0.745 0.542 0.431 0.149 -0.029 -0.262 -0.494 -0.93 -1.168 -1.422 -1.686 -1.987 -2.377 -2.964 -4.963 -7 ,14458 ,KEBNE ,17040288,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:54:01 CET,0.0 0.378 0.707 0.992 1.208 1.404 1.578 1.737 2.034 2.172 2.302 2.38 2.662 2.767 2.946 3.108 3.254 3.323 3.46 3.583 3.757 3.879 3.992 4.15 4.299 4.441 4.577 4.711 4.878 5.041 5.204 5.4 5.577 5.738 5.922 6.139 6.348 6.549 6.78 7.028 7.279 7.563 7.861 8.141 8.479 8.853 9.246 9.615 10.002 10.36 10.474 10.201 9.758 9.287 8.834 8.367 7.916 7.497 7.105 6.665 6.291 5.985 5.668 5.351 5.065 4.803 4.535 4.281 4.046 3.782 3.502 3.295 3.095 2.877 2.703 2.514 2.3 2.07 1.832 1.662 1.481 1.181 0.97 0.764 0.661 0.465 0.24 -0.013 -0.138 -0.444 -0.58 -0.745 -0.913 -1.263 -1.463 -1.695 -1.959 -2.244 -2.558 -2.987 -3.945 -8 ,7289 ,KEBNE ,17040289,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:56:52 CET,0.0 0.641 0.911 1.099 1.275 1.438 1.597 1.746 2.021 2.161 2.295 2.351 2.62 2.727 2.942 3.148 3.341 3.435 3.588 3.723 3.894 3.988 4.095 4.249 4.391 4.539 4.684 4.825 4.997 5.157 5.307 5.469 5.627 5.791 5.98 6.202 6.419 6.642 6.878 7.136 7.397 7.672 8.009 8.367 8.778 9.173 9.554 9.961 10.348 10.611 10.654 10.38 9.97 9.484 8.951 8.438 8.004 7.633 7.29 6.898 6.559 6.276 5.989 5.685 5.396 5.132 4.823 4.535 4.298 4.049 3.797 3.595 3.376 3.141 2.96 2.781 2.585 2.375 2.177 2.039 1.885 1.646 1.48 1.316 1.239 1.062 0.86 0.675 0.584 0.323 0.273 0.162 0.049 -0.196 -0.333 -0.498 -0.696 -0.942 -1.235 -1.589 -2.319 -9 ,16859 ,KEBNE ,17040290,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:53:54 CET,0.0 0.762 1.07 1.354 1.595 1.784 1.968 2.139 2.45 2.583 2.723 2.847 3.14 3.257 3.459 3.643 3.823 3.916 4.089 4.251 4.498 4.656 4.797 4.998 5.191 5.378 5.56 5.749 5.98 6.186 6.374 6.563 6.724 6.876 7.071 7.297 7.516 7.733 7.951 8.195 8.438 8.695 8.984 9.278 9.628 9.974 10.325 10.719 11.079 11.396 11.567 11.365 10.982 10.485 9.987 9.517 9.074 8.678 8.326 7.951 7.624 7.278 6.881 6.491 6.137 5.817 5.499 5.223 4.986 4.73 4.417 4.138 3.858 3.594 3.404 3.216 3.043 2.854 2.632 2.461 2.264 1.978 1.791 1.564 1.432 1.184 0.934 0.648 0.499 0.173 0.0 -0.183 -0.399 -0.865 -1.087 -1.305 -1.538 -1.833 -2.212 -2.639 -3.438 -10 ,14040 ,KEBNE ,17040292,Thu Dec 23 00:12:05 CET,Thu Dec 23 01:53:58 CET,0.0 0.448 0.703 0.927 1.134 1.304 1.46 1.626 1.957 2.094 2.231 2.341 2.636 2.751 2.964 3.164 3.346 3.432 3.601 3.767 4.005 4.157 4.3 4.51 4.723 4.925 5.114 5.295 5.524 5.713 5.865 6.045 6.212 6.373 6.566 6.769 6.967 7.194 7.423 7.651 7.879 8.138 8.433 8.724 9.071 9.428 9.79 10.15 10.457 10.749 10.957 10.683 10.197 9.718 9.241 8.757 8.287 7.829 7.422 7.005 6.66 6.348 6.002 5.672 5.382 5.107 4.829 4.585 4.357 4.12 3.868 3.638 3.406 3.161 2.957 2.749 2.534 2.307 2.087 1.936 1.769 1.516 1.351 1.173 1.074 0.877 0.688 0.48 0.369 0.081 0.017 -0.11 -0.251 -0.545 -0.698 -0.867 -1.053 -1.277 -1.551 -1.872 -2.727 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt deleted file mode 100644 index f54fe77e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23884 ,KEBNE ,17040295,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:54:21 CET,0.0 0.986 1.392 1.724 2.004 2.255 2.462 2.661 3.016 3.171 3.326 3.456 3.75 3.875 4.082 4.246 4.379 4.439 4.559 4.68 4.86 4.979 5.087 5.234 5.382 5.533 5.677 5.805 5.975 6.159 6.325 6.511 6.69 6.849 7.04 7.264 7.469 7.702 7.956 8.209 8.478 8.761 9.072 9.407 9.779 10.209 10.73 11.196 11.597 11.899 11.91 11.544 11.027 10.483 10.003 9.52 9.037 8.561 8.111 7.637 7.226 6.869 6.518 6.188 5.867 5.566 5.262 4.979 4.725 4.46 4.186 3.948 3.715 3.471 3.273 3.073 2.861 2.64 2.405 2.248 2.094 1.867 1.712 1.545 1.455 1.269 1.078 0.882 0.781 0.497 0.428 0.313 0.181 -0.112 -0.263 -0.428 -0.609 -0.821 -1.052 -1.327 -1.696 -2 ,1092 ,KEBNE ,17040296,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:54:56 CET,0.0 0.379 0.593 0.73 0.869 1.028 1.177 1.305 1.529 1.635 1.737 1.76 2.011 2.088 2.24 2.393 2.535 2.597 2.719 2.845 3.032 3.146 3.254 3.426 3.587 3.726 3.862 4.003 4.191 4.362 4.528 4.734 4.923 5.101 5.294 5.494 5.681 5.898 6.144 6.404 6.66 6.931 7.247 7.564 7.939 8.319 8.711 9.118 9.499 9.778 9.872 9.629 9.118 8.504 7.977 7.477 7.01 6.581 6.206 5.843 5.526 5.226 4.903 4.577 4.286 4.031 3.758 3.516 3.306 3.082 2.841 2.629 2.405 2.186 2.011 1.808 1.59 1.359 1.119 0.961 0.805 0.567 0.387 0.2 0.111 -0.076 -0.261 -0.443 -0.553 -0.844 -0.913 -1.03 -1.152 -1.391 -1.525 -1.689 -1.89 -2.091 -2.295 -2.513 -2.919 -3 ,29559 ,KEBNE ,17040298,Thu Dec 23 00:12:03 CET,Thu Dec 23 01:54:38 CET,0.0 0.418 0.651 0.849 1.001 1.123 1.249 1.361 1.542 1.631 1.719 1.724 1.979 2.072 2.239 2.374 2.506 2.57 2.691 2.795 2.946 3.046 3.149 3.31 3.454 3.597 3.744 3.884 4.058 4.232 4.396 4.58 4.76 4.942 5.148 5.367 5.579 5.804 6.037 6.28 6.529 6.802 7.111 7.426 7.785 8.144 8.515 8.895 9.257 9.588 9.755 9.461 8.973 8.495 8.002 7.495 7.061 6.66 6.28 5.883 5.532 5.219 4.926 4.65 4.391 4.147 3.899 3.667 3.448 3.228 3.004 2.822 2.631 2.417 2.247 2.086 1.915 1.723 1.535 1.398 1.251 1.031 0.878 0.716 0.63 0.455 0.281 0.09 -0.013 -0.287 -0.334 -0.444 -0.558 -0.814 -0.964 -1.124 -1.288 -1.484 -1.738 -2.022 -2.576 -4 ,15451 ,KEBNE ,17040299,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:54:45 CET,0.0 0.604 0.879 1.062 1.206 1.346 1.479 1.614 1.855 1.959 2.052 2.057 2.308 2.39 2.549 2.7 2.857 2.931 3.08 3.221 3.407 3.524 3.633 3.797 3.961 4.118 4.271 4.427 4.618 4.786 4.945 5.149 5.351 5.542 5.76 5.985 6.207 6.45 6.714 6.993 7.264 7.55 7.852 8.142 8.48 8.866 9.268 9.625 9.997 10.319 10.412 10.131 9.703 9.235 8.698 8.151 7.682 7.238 6.845 6.436 6.062 5.716 5.387 5.081 4.799 4.54 4.268 4.021 3.797 3.563 3.324 3.13 2.932 2.724 2.554 2.378 2.201 2.015 1.819 1.677 1.532 1.319 1.159 0.996 0.916 0.73 0.534 0.332 0.228 -0.04 -0.11 -0.243 -0.378 -0.677 -0.862 -1.061 -1.26 -1.474 -1.723 -2.054 -3.114 -5 ,494 ,KEBNE ,17040301,Thu Dec 23 00:12:04 CET,Thu Dec 23 01:54:22 CET,0.0 0.739 1.042 1.23 1.376 1.52 1.662 1.782 2.019 2.134 2.234 2.279 2.54 2.631 2.803 2.947 3.079 3.149 3.29 3.425 3.623 3.743 3.853 4.016 4.174 4.315 4.456 4.599 4.786 4.961 5.127 5.325 5.516 5.698 5.903 6.138 6.357 6.595 6.849 7.096 7.359 7.643 7.961 8.266 8.596 8.945 9.325 9.752 10.115 10.36 10.44 10.127 9.607 9.095 8.545 7.964 7.455 6.965 6.519 6.07 5.665 5.314 5.006 4.704 4.419 4.149 3.868 3.625 3.388 3.119 2.86 2.653 2.425 2.184 1.993 1.788 1.575 1.356 1.122 0.962 0.8 0.54 0.361 0.176 0.078 -0.105 -0.293 -0.505 -0.613 -0.888 -0.939 -1.048 -1.18 -1.469 -1.624 -1.805 -1.984 -2.156 -2.359 -2.652 -3.328 -6 ,12103 ,KEBNE ,17040302,Thu Dec 23 00:13:05 CET,Thu Dec 23 01:57:05 CET,0.0 0.38 0.58 0.746 0.868 0.979 1.093 1.21 1.42 1.509 1.585 1.592 1.849 1.93 2.075 2.208 2.338 2.404 2.534 2.661 2.845 2.968 3.091 3.27 3.429 3.581 3.723 3.849 4.016 4.181 4.336 4.514 4.68 4.854 5.064 5.28 5.477 5.696 5.947 6.204 6.45 6.723 7.038 7.327 7.648 8.01 8.374 8.733 9.129 9.514 9.785 9.618 9.234 8.762 8.269 7.822 7.374 6.975 6.645 6.289 5.977 5.682 5.384 5.102 4.831 4.571 4.287 4.044 3.851 3.639 3.405 3.204 2.99 2.782 2.64 2.493 2.322 2.145 1.959 1.828 1.692 1.477 1.335 1.176 1.093 0.926 0.752 0.578 0.483 0.219 0.204 0.106 -0.009 -0.289 -0.462 -0.658 -0.889 -1.126 -1.394 -1.832 -3.551 -7 ,13398 ,KEBNE ,17040303,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:23 CET,0.0 0.463 0.691 0.93 1.125 1.263 1.388 1.509 1.723 1.822 1.919 1.932 2.183 2.265 2.423 2.563 2.687 2.748 2.87 2.982 3.125 3.223 3.33 3.481 3.625 3.769 3.905 4.044 4.24 4.418 4.582 4.784 4.962 5.127 5.319 5.542 5.759 5.983 6.227 6.492 6.761 7.057 7.392 7.715 8.081 8.455 8.826 9.257 9.725 10.059 10.117 9.771 9.286 8.769 8.291 7.827 7.386 6.974 6.598 6.204 5.861 5.537 5.21 4.891 4.599 4.336 4.067 3.813 3.588 3.366 3.131 2.941 2.734 2.514 2.351 2.178 1.983 1.786 1.585 1.439 1.287 1.047 0.879 0.706 0.616 0.429 0.229 0.018 -0.097 -0.395 -0.524 -0.687 -0.85 -1.161 -1.325 -1.516 -1.733 -1.952 -2.217 -2.586 -3.277 -8 ,30103 ,KEBNE ,17040305,Thu Dec 23 00:15:10 CET,Thu Dec 23 01:57:58 CET,0.0 0.465 0.706 0.889 1.036 1.183 1.314 1.429 1.66 1.764 1.852 1.861 2.1 2.168 2.331 2.491 2.632 2.703 2.835 2.949 3.136 3.265 3.375 3.524 3.672 3.824 3.978 4.122 4.302 4.48 4.636 4.815 5.0 5.175 5.374 5.592 5.791 6.002 6.231 6.485 6.743 7.02 7.337 7.614 7.922 8.302 8.755 9.159 9.513 9.872 10.016 9.766 9.25 8.658 8.132 7.63 7.185 6.772 6.398 6.004 5.636 5.312 5.015 4.737 4.461 4.191 3.919 3.667 3.447 3.233 2.996 2.789 2.578 2.357 2.184 2.006 1.835 1.654 1.451 1.309 1.16 0.936 0.782 0.62 0.541 0.384 0.214 0.031 -0.06 -0.314 -0.338 -0.437 -0.551 -0.8 -0.952 -1.126 -1.301 -1.487 -1.702 -2.002 -2.685 -9 ,22464 ,KEBNE ,17040306,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:05 CET,0.0 0.439 0.695 0.854 0.986 1.123 1.256 1.377 1.587 1.692 1.796 1.807 2.059 2.141 2.309 2.471 2.63 2.704 2.832 2.963 3.148 3.26 3.371 3.533 3.681 3.833 3.99 4.123 4.291 4.459 4.623 4.824 5.008 5.177 5.381 5.623 5.861 6.097 6.331 6.585 6.844 7.137 7.478 7.8 8.161 8.546 8.935 9.33 9.725 10.037 10.11 9.721 9.196 8.623 8.007 7.434 6.956 6.483 6.041 5.591 5.199 4.844 4.516 4.217 3.929 3.666 3.374 3.113 2.905 2.67 2.415 2.212 1.987 1.751 1.58 1.398 1.205 1.006 0.797 0.64 0.481 0.236 0.051 -0.152 -0.246 -0.424 -0.612 -0.811 -0.923 -1.205 -1.282 -1.421 -1.559 -1.834 -1.99 -2.182 -2.382 -2.623 -2.918 -3.274 -3.871 -10 ,440 ,KEBNE ,17040308,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:58:30 CET,0.0 0.319 0.531 0.762 0.95 1.098 1.228 1.355 1.598 1.7 1.797 1.816 2.075 2.16 2.311 2.456 2.593 2.659 2.797 2.919 3.082 3.189 3.296 3.464 3.624 3.783 3.937 4.083 4.266 4.435 4.59 4.776 4.963 5.141 5.357 5.6 5.819 6.054 6.303 6.559 6.813 7.089 7.413 7.725 8.063 8.424 8.788 9.154 9.541 9.899 10.044 9.762 9.311 8.816 8.325 7.826 7.336 6.84 6.394 5.958 5.599 5.299 5.004 4.706 4.42 4.158 3.875 3.62 3.401 3.169 2.941 2.73 2.474 2.223 2.041 1.846 1.645 1.448 1.242 1.102 0.965 0.735 0.566 0.389 0.301 0.135 -0.045 -0.24 -0.349 -0.631 -0.696 -0.819 -0.946 -1.227 -1.369 -1.506 -1.657 -1.835 -2.073 -2.389 -2.814 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 056bd509..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8485 ,KEBNE ,17040309,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:24 CET,0.0 0.357 0.547 0.68 0.803 0.909 0.997 1.087 1.278 1.369 1.46 1.467 1.695 1.76 1.889 2.017 2.139 2.196 2.305 2.414 2.55 2.631 2.714 2.83 2.944 3.055 3.159 3.26 3.387 3.511 3.634 3.783 3.918 4.042 4.186 4.34 4.467 4.592 4.725 4.846 4.955 5.065 5.168 5.226 5.283 5.334 5.305 5.167 4.827 4.179 2.902 1.202 -0.276 -1.636 -2.862 -3.973 -4.976 -5.875 -6.659 -7.48 -8.202 -8.831 -9.445 -10.043 -10.607 -11.125 -11.67 -12.169 -12.6 -13.052 -13.519 -13.899 -14.291 -14.709 -15.042 -15.377 -15.721 -16.091 -16.479 -16.741 -17.016 -17.473 -17.799 -18.158 -18.349 -18.723 -19.113 -19.534 -19.75 -20.138 -20.43 -20.687 -20.979 -21.62 -21.989 -22.405 -22.856 -23.361 -24.008 -24.903 -27.531 -2 ,25373 ,KEBNE ,17040310,Thu Dec 23 00:15:10 CET,Thu Dec 23 01:57:38 CET,0.0 0.531 0.796 0.975 1.127 1.299 1.448 1.55 1.719 1.807 1.896 1.889 2.112 2.182 2.322 2.445 2.566 2.625 2.732 2.828 2.985 3.093 3.196 3.341 3.458 3.57 3.683 3.782 3.914 4.048 4.175 4.331 4.461 4.572 4.704 4.827 4.934 5.066 5.203 5.305 5.385 5.467 5.536 5.595 5.642 5.631 5.551 5.409 5.072 4.398 3.161 1.306 -0.368 -1.779 -3.096 -4.371 -5.506 -6.469 -7.288 -8.033 -8.579 -9.089 -9.576 -9.996 -10.392 -10.772 -11.166 -11.512 -11.831 -12.166 -12.482 -12.755 -13.063 -13.387 -13.634 -13.886 -14.146 -14.424 -14.745 -14.97 -15.209 -15.579 -15.864 -16.202 -16.377 -16.739 -17.115 -17.516 -17.746 -18.158 -18.473 -18.723 -18.982 -19.56 -19.883 -20.252 -20.665 -21.119 -21.649 -22.355 -24.661 -3 ,1463 ,KEBNE ,17040311,Thu Dec 23 00:15:10 CET,Thu Dec 23 01:57:27 CET,0.0 0.287 0.442 0.558 0.657 0.771 0.891 0.994 1.169 1.244 1.32 1.312 1.543 1.611 1.727 1.836 1.951 2.007 2.119 2.217 2.343 2.429 2.508 2.625 2.735 2.834 2.925 3.021 3.147 3.26 3.366 3.49 3.616 3.732 3.863 4.012 4.146 4.299 4.472 4.632 4.769 4.91 5.052 5.197 5.361 5.505 5.606 5.616 5.516 5.174 4.282 2.996 1.813 0.706 -0.233 -1.061 -1.8 -2.457 -3.058 -3.688 -4.226 -4.801 -5.45 -6.083 -6.663 -7.176 -7.712 -8.211 -8.652 -9.089 -9.498 -9.813 -10.136 -10.485 -10.744 -11.009 -11.32 -11.622 -11.903 -12.093 -12.288 -12.606 -12.857 -13.149 -13.306 -13.632 -13.981 -14.372 -14.583 -14.976 -15.252 -15.496 -15.777 -16.383 -16.711 -17.056 -17.453 -17.933 -18.518 -19.318 -22.055 -4 ,6652 ,KEBNE ,17040312,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:58 CET,0.0 0.473 0.713 0.885 1.008 1.132 1.263 1.375 1.566 1.664 1.751 1.737 1.964 2.033 2.189 2.333 2.448 2.499 2.612 2.723 2.878 2.973 3.063 3.183 3.294 3.408 3.518 3.632 3.779 3.914 4.032 4.164 4.29 4.409 4.535 4.667 4.806 4.968 5.137 5.284 5.419 5.575 5.748 5.914 6.077 6.219 6.302 6.305 6.218 5.955 5.308 4.141 2.923 1.887 1.046 0.28 -0.407 -1.048 -1.65 -2.253 -2.769 -3.24 -3.675 -4.096 -4.49 -4.843 -5.228 -5.577 -5.88 -6.263 -6.722 -7.102 -7.489 -7.89 -8.214 -8.553 -8.895 -9.203 -9.487 -9.697 -9.912 -10.232 -10.463 -10.708 -10.823 -11.053 -11.321 -11.628 -11.808 -12.2 -12.538 -12.812 -13.111 -13.735 -14.083 -14.446 -14.836 -15.292 -15.854 -16.647 -19.082 -5 ,22089 ,KEBNE ,17040313,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:21 CET,0.0 0.464 0.626 0.797 0.938 1.055 1.165 1.271 1.465 1.548 1.624 1.62 1.857 1.919 2.03 2.142 2.256 2.312 2.416 2.518 2.661 2.755 2.847 2.971 3.084 3.194 3.303 3.406 3.529 3.647 3.768 3.902 4.02 4.142 4.293 4.465 4.622 4.781 4.95 5.118 5.262 5.402 5.566 5.735 5.912 6.037 6.082 6.053 5.871 5.363 4.26 2.726 1.346 0.028 -1.206 -2.168 -2.903 -3.587 -4.198 -4.814 -5.325 -5.789 -6.246 -6.683 -7.095 -7.483 -7.903 -8.266 -8.594 -8.95 -9.289 -9.551 -9.833 -10.139 -10.379 -10.632 -10.905 -11.194 -11.507 -11.726 -11.944 -12.286 -12.531 -12.775 -12.891 -13.189 -13.52 -13.82 -14.001 -14.391 -14.684 -14.934 -15.218 -15.866 -16.229 -16.597 -16.999 -17.5 -18.057 -18.744 -21.157 -6 ,16719 ,KEBNE ,17040314,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:58:21 CET,0.0 0.304 0.571 0.784 0.961 1.093 1.189 1.291 1.484 1.573 1.664 1.68 1.928 2.005 2.153 2.298 2.43 2.495 2.61 2.713 2.86 2.953 3.051 3.189 3.31 3.425 3.532 3.635 3.767 3.894 4.012 4.147 4.282 4.416 4.565 4.735 4.875 5.009 5.162 5.319 5.466 5.626 5.799 5.944 6.082 6.188 6.239 6.225 5.995 5.323 4.064 2.334 0.777 -0.635 -1.883 -3.022 -4.033 -4.934 -5.738 -6.599 -7.285 -7.785 -8.32 -8.924 -9.483 -9.983 -10.501 -10.969 -11.413 -11.886 -12.351 -12.692 -12.991 -13.296 -13.539 -13.783 -14.051 -14.351 -14.651 -14.846 -15.047 -15.445 -15.771 -16.108 -16.275 -16.599 -16.968 -17.334 -17.506 -17.862 -18.085 -18.303 -18.52 -19.015 -19.301 -19.629 -20.003 -20.448 -20.994 -21.716 -23.899 -7 ,29479 ,KEBNE ,17040315,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:34 CET,0.0 0.528 0.745 0.896 1.041 1.19 1.297 1.402 1.611 1.696 1.772 1.764 1.997 2.061 2.186 2.325 2.451 2.502 2.603 2.692 2.824 2.915 2.999 3.133 3.261 3.37 3.456 3.543 3.68 3.802 3.906 4.021 4.125 4.224 4.327 4.445 4.548 4.636 4.731 4.827 4.916 4.994 5.047 5.077 5.097 5.102 5.043 4.902 4.564 3.888 2.683 0.99 -0.618 -2.084 -3.332 -4.503 -5.592 -6.543 -7.341 -8.187 -8.904 -9.516 -10.126 -10.692 -11.196 -11.669 -12.2 -12.689 -13.097 -13.509 -13.948 -14.307 -14.677 -15.088 -15.427 -15.776 -16.121 -16.478 -16.859 -17.115 -17.386 -17.801 -18.094 -18.413 -18.57 -18.894 -19.24 -19.633 -19.848 -20.242 -20.534 -20.785 -21.051 -21.613 -21.945 -22.319 -22.737 -23.231 -23.817 -24.556 -26.87 -8 ,27965 ,KEBNE ,17040316,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:58:06 CET,0.0 0.498 0.688 0.849 0.978 1.105 1.232 1.326 1.496 1.591 1.684 1.674 1.9 1.957 2.071 2.198 2.321 2.372 2.468 2.567 2.701 2.784 2.864 2.979 3.09 3.195 3.307 3.419 3.559 3.683 3.788 3.915 4.046 4.175 4.316 4.461 4.598 4.731 4.868 5.034 5.189 5.286 5.343 5.382 5.403 5.408 5.361 5.168 4.789 4.125 2.788 0.97 -0.783 -2.457 -3.802 -4.967 -5.979 -6.925 -7.812 -8.577 -9.122 -9.606 -10.028 -10.424 -10.851 -11.229 -11.585 -11.935 -12.25 -12.572 -12.954 -13.326 -13.73 -14.132 -14.464 -14.829 -15.19 -15.566 -15.965 -16.242 -16.534 -16.965 -17.273 -17.615 -17.784 -18.118 -18.471 -18.861 -19.074 -19.473 -19.791 -20.066 -20.363 -21.008 -21.353 -21.743 -22.195 -22.696 -23.273 -24.006 -26.264 -9 ,2724 ,KEBNE ,17040317,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:57 CET,0.0 0.572 0.86 1.076 1.228 1.363 1.485 1.604 1.829 1.927 2.02 2.041 2.289 2.37 2.521 2.673 2.812 2.873 2.986 3.099 3.265 3.355 3.438 3.566 3.69 3.805 3.92 4.035 4.171 4.292 4.418 4.586 4.731 4.853 5.002 5.151 5.276 5.434 5.595 5.738 5.904 6.088 6.269 6.442 6.616 6.754 6.852 6.897 6.767 6.284 5.356 4.093 2.933 1.926 0.996 0.097 -0.709 -1.453 -2.103 -2.737 -3.289 -3.789 -4.233 -4.648 -5.049 -5.402 -5.771 -6.108 -6.418 -6.761 -7.115 -7.41 -7.728 -8.057 -8.309 -8.562 -8.836 -9.116 -9.42 -9.654 -9.912 -10.357 -10.68 -10.983 -11.111 -11.397 -11.747 -12.152 -12.369 -12.767 -13.064 -13.317 -13.578 -14.124 -14.439 -14.777 -15.158 -15.591 -16.097 -16.798 -19.246 -10 ,27778 ,KEBNE ,17040318,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:57 CET,0.0 0.485 0.674 0.821 0.935 1.033 1.128 1.225 1.404 1.489 1.576 1.571 1.803 1.858 1.967 2.082 2.192 2.245 2.347 2.463 2.634 2.723 2.802 2.92 3.036 3.143 3.245 3.339 3.448 3.553 3.657 3.787 3.918 4.04 4.171 4.303 4.424 4.559 4.694 4.824 4.946 5.076 5.229 5.358 5.481 5.594 5.655 5.683 5.584 5.196 4.463 3.493 2.555 1.64 0.792 0.009 -0.698 -1.344 -1.922 -2.509 -3.02 -3.484 -3.91 -4.303 -4.674 -5.026 -5.441 -5.889 -6.327 -6.719 -7.043 -7.307 -7.595 -7.89 -8.124 -8.373 -8.624 -8.896 -9.186 -9.387 -9.656 -10.135 -10.447 -10.783 -10.964 -11.344 -11.735 -12.151 -12.36 -12.743 -13.046 -13.305 -13.588 -14.193 -14.52 -14.86 -15.238 -15.718 -16.29 -17.054 -19.368 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 2b43e883..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27806 ,KEBNE ,17040319,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:52 CET,0.0 0.319 0.573 0.775 0.949 1.093 1.216 1.334 1.546 1.647 1.749 1.788 2.045 2.133 2.302 2.456 2.604 2.684 2.847 2.992 3.189 3.311 3.438 3.624 3.795 3.955 4.1 4.239 4.423 4.607 4.779 4.967 5.149 5.331 5.526 5.744 5.98 6.256 6.528 6.797 7.083 7.367 7.676 7.954 8.187 8.395 8.607 8.831 8.957 8.893 8.499 7.758 6.997 6.243 5.579 4.952 4.392 3.882 3.443 3.006 2.596 2.227 1.883 1.556 1.247 0.949 0.617 0.324 0.08 -0.182 -0.467 -0.713 -0.999 -1.285 -1.474 -1.665 -1.864 -2.086 -2.326 -2.497 -2.697 -3.046 -3.264 -3.453 -3.556 -3.788 -4.075 -4.429 -4.614 -4.966 -5.186 -5.402 -5.634 -6.143 -6.436 -6.759 -7.097 -7.449 -7.85 -8.442 -10.363 -2 ,3921 ,KEBNE ,17040320,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:51 CET,0.0 0.743 0.976 1.152 1.311 1.455 1.584 1.708 1.95 2.057 2.148 2.19 2.449 2.54 2.717 2.882 3.035 3.108 3.251 3.395 3.595 3.721 3.842 4.014 4.169 4.317 4.463 4.603 4.778 4.941 5.109 5.326 5.527 5.707 5.919 6.148 6.355 6.601 6.851 7.101 7.363 7.62 7.899 8.178 8.503 8.766 8.906 9.002 9.072 8.984 8.496 7.616 6.699 5.84 5.068 4.413 3.876 3.34 2.841 2.319 1.882 1.524 1.165 0.813 0.487 0.189 -0.11 -0.39 -0.649 -0.916 -1.19 -1.425 -1.673 -1.987 -2.277 -2.534 -2.75 -2.964 -3.18 -3.336 -3.506 -3.775 -3.976 -4.198 -4.331 -4.647 -5.004 -5.387 -5.571 -5.916 -6.129 -6.345 -6.582 -7.113 -7.411 -7.726 -8.077 -8.495 -8.982 -9.582 -11.201 -3 ,3401 ,KEBNE ,17040321,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:15 CET,0.0 0.63 0.931 1.175 1.361 1.531 1.708 1.857 2.073 2.182 2.292 2.32 2.574 2.666 2.835 3.0 3.163 3.232 3.362 3.495 3.693 3.818 3.927 4.071 4.22 4.38 4.53 4.665 4.831 4.997 5.155 5.343 5.525 5.699 5.882 6.071 6.263 6.47 6.706 6.944 7.174 7.468 7.814 8.121 8.455 8.825 9.196 9.535 9.874 9.988 9.584 8.756 7.868 7.033 6.314 5.67 5.109 4.576 4.1 3.615 3.176 2.77 2.385 2.042 1.726 1.42 1.088 0.786 0.527 0.267 0.002 -0.234 -0.492 -0.761 -0.959 -1.159 -1.385 -1.627 -1.881 -2.092 -2.346 -2.741 -2.975 -3.176 -3.298 -3.619 -3.98 -4.371 -4.574 -4.941 -5.201 -5.426 -5.671 -6.156 -6.387 -6.662 -6.988 -7.356 -7.786 -8.412 -10.159 -4 ,18535 ,KEBNE ,17040322,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:45 CET,0.0 0.655 0.937 1.137 1.303 1.476 1.655 1.822 2.069 2.172 2.281 2.319 2.573 2.66 2.812 2.961 3.106 3.178 3.329 3.476 3.679 3.794 3.904 4.068 4.214 4.358 4.514 4.67 4.859 5.039 5.214 5.422 5.627 5.82 6.031 6.27 6.514 6.762 7.011 7.261 7.51 7.788 8.108 8.378 8.586 8.772 8.961 9.114 9.186 9.104 8.672 7.874 7.065 6.287 5.576 4.908 4.288 3.759 3.312 2.82 2.39 1.907 1.416 1.037 0.699 0.37 0.014 -0.293 -0.553 -0.843 -1.156 -1.411 -1.69 -1.954 -2.145 -2.364 -2.581 -2.861 -3.206 -3.45 -3.709 -4.105 -4.4 -4.696 -4.822 -5.057 -5.291 -5.534 -5.666 -5.97 -6.129 -6.348 -6.562 -6.931 -7.135 -7.365 -7.599 -7.874 -8.229 -8.718 -9.605 -5 ,22592 ,KEBNE ,17040323,Thu Dec 23 00:15:10 CET,Thu Dec 23 01:58:12 CET,0.0 0.839 1.111 1.314 1.467 1.603 1.731 1.851 2.076 2.18 2.279 2.312 2.568 2.665 2.842 3.006 3.148 3.219 3.36 3.493 3.672 3.784 3.893 4.052 4.214 4.379 4.537 4.68 4.866 5.057 5.237 5.445 5.636 5.819 6.045 6.287 6.509 6.742 6.985 7.243 7.512 7.806 8.135 8.455 8.8 9.139 9.414 9.59 9.747 9.794 9.415 8.604 7.795 7.044 6.345 5.663 5.052 4.494 3.991 3.492 3.064 2.678 2.318 1.955 1.59 1.25 0.912 0.624 0.345 0.045 -0.252 -0.489 -0.741 -1.018 -1.226 -1.434 -1.659 -1.887 -2.115 -2.277 -2.446 -2.715 -2.908 -3.124 -3.238 -3.462 -3.687 -3.906 -4.061 -4.431 -4.71 -4.938 -5.179 -5.747 -6.05 -6.356 -6.707 -7.135 -7.608 -8.212 -10.343 -6 ,26030 ,KEBNE ,17040324,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:58 CET,0.0 0.678 1.032 1.248 1.417 1.559 1.693 1.828 2.067 2.174 2.274 2.302 2.556 2.643 2.807 2.945 3.082 3.152 3.281 3.41 3.61 3.746 3.885 4.062 4.213 4.359 4.5 4.637 4.825 5.013 5.193 5.409 5.608 5.793 5.999 6.225 6.439 6.656 6.88 7.122 7.357 7.605 7.89 8.132 8.349 8.573 8.777 8.92 8.979 8.929 8.511 7.722 7.053 6.405 5.737 5.112 4.56 4.039 3.558 3.077 2.654 2.288 1.935 1.571 1.241 0.945 0.643 0.382 0.158 -0.094 -0.372 -0.603 -0.859 -1.13 -1.328 -1.54 -1.765 -1.983 -2.205 -2.363 -2.523 -2.772 -2.939 -3.105 -3.231 -3.558 -3.903 -4.278 -4.458 -4.777 -4.909 -5.085 -5.266 -5.641 -5.853 -6.065 -6.288 -6.549 -6.855 -7.213 -8.074 -7 ,18640 ,KEBNE ,17040325,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:58:09 CET,0.0 0.783 1.018 1.195 1.376 1.526 1.652 1.77 1.976 2.07 2.165 2.186 2.438 2.527 2.685 2.817 2.951 3.021 3.161 3.307 3.512 3.633 3.743 3.901 4.067 4.226 4.372 4.506 4.683 4.862 5.03 5.224 5.407 5.583 5.8 6.043 6.266 6.5 6.758 7.026 7.291 7.574 7.899 8.224 8.593 8.92 9.137 9.306 9.416 9.39 9.038 8.33 7.539 6.716 5.969 5.259 4.596 3.998 3.491 2.989 2.56 2.18 1.799 1.414 1.077 0.778 0.439 0.136 -0.108 -0.369 -0.656 -0.901 -1.171 -1.445 -1.655 -1.868 -2.092 -2.341 -2.599 -2.778 -2.958 -3.218 -3.394 -3.595 -3.703 -3.915 -4.135 -4.416 -4.57 -4.873 -4.988 -5.157 -5.363 -5.846 -6.12 -6.438 -6.798 -7.194 -7.685 -8.303 -10.018 -8 ,29530 ,KEBNE ,17040326,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:58:36 CET,0.0 0.35 0.575 0.782 0.96 1.112 1.258 1.39 1.617 1.718 1.814 1.839 2.097 2.181 2.335 2.479 2.619 2.688 2.822 2.95 3.129 3.248 3.373 3.556 3.729 3.888 4.032 4.168 4.339 4.506 4.67 4.871 5.055 5.226 5.42 5.642 5.861 6.075 6.31 6.585 6.862 7.185 7.597 7.983 8.379 8.771 9.137 9.5 9.776 9.808 9.411 8.419 7.382 6.441 5.588 4.775 3.997 3.293 2.709 2.094 1.535 1.013 0.505 0.006 -0.472 -0.899 -1.366 -1.791 -2.14 -2.511 -2.918 -3.268 -3.625 -3.996 -4.293 -4.603 -4.928 -5.22 -5.476 -5.655 -5.84 -6.125 -6.322 -6.516 -6.615 -6.856 -7.127 -7.383 -7.525 -7.875 -8.143 -8.374 -8.596 -9.076 -9.375 -9.731 -10.106 -10.521 -11.004 -11.611 -13.484 -9 ,20412 ,KEBNE ,17040327,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:57:02 CET,0.0 0.467 0.742 0.956 1.119 1.272 1.442 1.593 1.834 1.95 2.063 2.112 2.37 2.463 2.636 2.804 2.965 3.043 3.201 3.354 3.575 3.711 3.832 4.012 4.187 4.35 4.505 4.658 4.85 5.028 5.2 5.406 5.594 5.766 5.969 6.184 6.385 6.605 6.827 7.054 7.29 7.497 7.683 7.886 8.078 8.27 8.499 8.693 8.803 8.797 8.413 7.567 6.743 5.981 5.282 4.623 4.019 3.501 3.06 2.581 2.165 1.794 1.446 1.116 0.79 0.491 0.183 -0.101 -0.359 -0.639 -0.919 -1.159 -1.424 -1.697 -1.918 -2.19 -2.484 -2.755 -3.036 -3.231 -3.429 -3.744 -3.95 -4.154 -4.264 -4.501 -4.735 -4.976 -5.107 -5.434 -5.67 -5.884 -6.103 -6.627 -6.913 -7.219 -7.545 -7.912 -8.37 -8.956 -10.753 -10 ,29586 ,KEBNE ,17040328,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:58:34 CET,0.0 0.736 0.998 1.226 1.42 1.596 1.75 1.887 2.148 2.272 2.385 2.434 2.708 2.811 2.982 3.15 3.31 3.383 3.522 3.654 3.842 3.96 4.076 4.26 4.437 4.589 4.738 4.888 5.077 5.252 5.415 5.614 5.802 5.971 6.177 6.398 6.598 6.819 7.037 7.29 7.54 7.819 8.198 8.545 8.832 9.076 9.329 9.532 9.634 9.594 9.217 8.404 7.593 6.851 6.17 5.53 4.91 4.337 3.864 3.381 2.94 2.551 2.167 1.779 1.422 1.087 0.726 0.423 0.168 -0.105 -0.397 -0.652 -0.913 -1.185 -1.406 -1.638 -1.877 -2.116 -2.36 -2.538 -2.725 -2.997 -3.219 -3.447 -3.548 -3.766 -4.011 -4.305 -4.484 -4.854 -5.07 -5.273 -5.512 -6.068 -6.378 -6.706 -7.054 -7.426 -7.9 -8.579 -11.231 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt deleted file mode 100644 index 1e6deb73..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29699 ,KEBNE ,17040329,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:59:00 CET,0.0 0.397 0.612 0.858 1.072 1.264 1.434 1.56 1.785 1.896 1.998 2.04 2.311 2.411 2.616 2.818 2.998 3.083 3.242 3.39 3.609 3.739 3.862 4.048 4.225 4.39 4.547 4.711 4.943 5.151 5.329 5.544 5.762 5.965 6.179 6.419 6.66 6.925 7.194 7.48 7.777 8.106 8.514 8.893 9.303 9.742 10.208 10.667 11.155 11.639 11.956 11.698 11.082 10.472 9.966 9.473 9.004 8.532 8.067 7.574 7.134 6.768 6.445 6.12 5.774 5.421 5.046 4.727 4.446 4.132 3.809 3.552 3.287 3.013 2.803 2.583 2.331 2.065 1.806 1.608 1.394 1.088 0.883 0.665 0.555 0.348 0.128 -0.122 -0.251 -0.562 -0.699 -0.857 -1.025 -1.362 -1.563 -1.794 -2.041 -2.336 -2.748 -3.264 -4.456 -2 ,31974 ,KEBNE ,17040330,Thu Dec 23 00:15:10 CET,Thu Dec 23 01:58:11 CET,0.0 1.142 1.452 1.688 1.869 2.038 2.197 2.349 2.593 2.705 2.82 2.847 3.113 3.205 3.373 3.556 3.731 3.812 3.984 4.143 4.356 4.496 4.624 4.806 4.991 5.171 5.332 5.49 5.688 5.862 6.035 6.248 6.468 6.683 6.908 7.15 7.382 7.647 7.937 8.241 8.546 8.888 9.283 9.674 10.151 10.677 11.258 11.873 12.521 13.102 13.501 13.453 13.053 12.603 12.169 11.683 11.161 10.682 10.293 9.882 9.501 9.125 8.758 8.402 8.058 7.746 7.433 7.175 6.942 6.675 6.378 6.126 5.866 5.609 5.412 5.184 4.947 4.719 4.495 4.344 4.167 3.866 3.658 3.417 3.294 3.076 2.838 2.571 2.444 2.156 2.061 1.921 1.756 1.369 1.156 0.945 0.693 0.35 0.001 -0.373 -1.617 -3 ,5509 ,KEBNE ,17040331,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:58:22 CET,0.0 0.978 1.215 1.417 1.617 1.794 1.94 2.072 2.322 2.438 2.545 2.596 2.872 2.979 3.167 3.345 3.514 3.592 3.744 3.878 4.064 4.198 4.343 4.542 4.723 4.891 5.051 5.207 5.404 5.591 5.774 6.005 6.223 6.432 6.672 6.931 7.183 7.456 7.737 8.029 8.332 8.674 9.072 9.454 9.897 10.374 10.899 11.463 12.046 12.579 12.957 12.94 12.671 12.295 11.881 11.445 11.039 10.641 10.241 9.796 9.41 9.079 8.764 8.462 8.159 7.859 7.543 7.259 7.012 6.751 6.489 6.268 6.037 5.796 5.607 5.406 5.183 4.95 4.709 4.534 4.342 4.057 3.853 3.628 3.521 3.313 3.108 2.891 2.764 2.449 2.314 2.162 1.988 1.621 1.394 1.132 0.869 0.547 0.131 -0.392 -1.783 -4 ,5745 ,KEBNE ,17040332,Thu Dec 23 00:15:10 CET,Thu Dec 23 01:58:33 CET,0.0 0.731 1.045 1.282 1.45 1.616 1.775 1.916 2.198 2.319 2.419 2.452 2.706 2.79 2.967 3.154 3.319 3.386 3.518 3.656 3.85 3.988 4.133 4.309 4.464 4.617 4.775 4.918 5.082 5.25 5.418 5.609 5.785 5.96 6.165 6.379 6.576 6.813 7.072 7.33 7.575 7.871 8.241 8.596 8.967 9.327 9.724 10.065 10.428 10.81 10.831 10.319 9.722 9.161 8.566 8.021 7.553 7.061 6.612 6.181 5.806 5.436 5.055 4.689 4.338 4.024 3.664 3.319 3.045 2.759 2.44 2.175 1.912 1.646 1.438 1.222 0.986 0.742 0.497 0.339 0.171 -0.115 -0.318 -0.529 -0.644 -0.895 -1.148 -1.414 -1.546 -1.842 -1.958 -2.114 -2.284 -2.647 -2.847 -3.068 -3.287 -3.522 -3.8 -4.158 -5.02 -5 ,25017 ,KEBNE ,17040333,Thu Dec 23 00:15:10 CET,Thu Dec 23 01:57:48 CET,0.0 0.535 0.777 0.955 1.105 1.255 1.4 1.53 1.746 1.85 1.952 1.98 2.251 2.345 2.538 2.73 2.907 2.989 3.13 3.26 3.474 3.615 3.752 3.943 4.12 4.278 4.424 4.582 4.783 4.971 5.148 5.38 5.615 5.822 6.053 6.315 6.571 6.854 7.162 7.462 7.761 8.093 8.436 8.77 9.14 9.509 9.951 10.483 11.052 11.577 11.979 11.996 11.769 11.449 11.109 10.719 10.288 9.85 9.456 9.074 8.758 8.469 8.173 7.88 7.618 7.38 7.135 6.9 6.694 6.478 6.207 5.956 5.69 5.419 5.216 5.013 4.813 4.619 4.423 4.279 4.12 3.852 3.661 3.458 3.356 3.137 2.883 2.605 2.457 2.142 2.008 1.853 1.687 1.288 1.06 0.838 0.585 0.257 -0.173 -0.728 -2.31 -6 ,22495 ,KEBNE ,17040334,Thu Dec 23 00:15:09 CET,Thu Dec 23 01:58:13 CET,0.0 0.947 1.247 1.449 1.635 1.808 1.953 2.085 2.335 2.453 2.557 2.572 2.84 2.941 3.128 3.299 3.458 3.536 3.687 3.834 4.038 4.165 4.299 4.487 4.657 4.817 4.974 5.134 5.35 5.552 5.742 5.969 6.194 6.405 6.635 6.903 7.163 7.436 7.719 8.018 8.34 8.688 9.062 9.44 9.858 10.286 10.779 11.298 11.811 12.311 12.684 12.728 12.502 12.091 11.707 11.353 10.965 10.593 10.252 9.882 9.555 9.246 8.94 8.648 8.36 8.078 7.778 7.503 7.243 6.96 6.674 6.46 6.241 5.983 5.775 5.564 5.326 5.057 4.783 4.602 4.417 4.124 3.921 3.716 3.61 3.389 3.148 2.883 2.754 2.446 2.279 2.1 1.933 1.597 1.406 1.196 0.946 0.653 0.317 -0.09 -1.02 -7 ,6329 ,KEBNE ,17040335,Thu Dec 23 00:15:10 CET,Thu Dec 23 01:58:32 CET,0.0 1.045 1.285 1.475 1.654 1.809 1.947 2.087 2.351 2.466 2.579 2.634 2.914 3.033 3.232 3.396 3.547 3.622 3.768 3.915 4.138 4.281 4.413 4.605 4.792 4.968 5.126 5.281 5.488 5.682 5.875 6.115 6.356 6.574 6.804 7.06 7.295 7.551 7.837 8.142 8.453 8.794 9.189 9.606 10.087 10.563 11.122 11.728 12.311 12.827 13.162 13.119 12.724 12.299 11.937 11.575 11.164 10.753 10.43 10.098 9.792 9.513 9.224 8.914 8.609 8.316 8.009 7.732 7.486 7.242 6.987 6.753 6.504 6.266 6.082 5.884 5.662 5.425 5.173 4.998 4.828 4.57 4.383 4.167 4.052 3.826 3.594 3.342 3.204 2.895 2.785 2.638 2.478 2.083 1.854 1.6 1.331 0.986 0.58 0.1 -1.811 -8 ,32103 ,KEBNE ,17040336,Thu Dec 23 00:15:10 CET,Thu Dec 23 01:58:00 CET,0.0 0.617 0.837 1.04 1.195 1.332 1.455 1.572 1.802 1.915 2.025 2.056 2.319 2.405 2.561 2.71 2.858 2.934 3.084 3.236 3.442 3.564 3.69 3.869 4.021 4.168 4.319 4.47 4.664 4.844 5.019 5.232 5.445 5.648 5.872 6.135 6.391 6.66 6.965 7.273 7.562 7.871 8.209 8.533 8.897 9.27 9.648 10.089 10.605 11.115 11.554 11.583 11.317 10.936 10.471 9.995 9.583 9.209 8.835 8.419 8.053 7.706 7.379 7.09 6.831 6.576 6.289 6.017 5.782 5.547 5.302 5.102 4.891 4.667 4.482 4.299 4.123 3.924 3.693 3.528 3.367 3.118 2.941 2.764 2.672 2.473 2.278 2.025 1.865 1.558 1.416 1.242 1.086 0.741 0.539 0.33 0.093 -0.203 -0.572 -0.99 -2.354 -9 ,29498 ,KEBNE ,17040337,Thu Dec 23 00:15:10 CET,Thu Dec 23 01:58:39 CET,0.0 0.7 0.969 1.223 1.431 1.592 1.732 1.86 2.074 2.17 2.268 2.292 2.559 2.666 2.876 3.056 3.21 3.282 3.417 3.562 3.775 3.898 4.011 4.17 4.32 4.469 4.631 4.784 4.961 5.128 5.285 5.479 5.683 5.873 6.069 6.288 6.49 6.706 6.945 7.206 7.488 7.789 8.137 8.496 8.918 9.393 9.907 10.431 10.989 11.571 12.029 12.003 11.708 11.305 10.924 10.576 10.226 9.872 9.543 9.184 8.862 8.581 8.302 8.041 7.792 7.535 7.237 6.976 6.769 6.55 6.291 6.069 5.83 5.567 5.363 5.152 4.906 4.632 4.376 4.211 4.04 3.776 3.593 3.399 3.296 3.081 2.845 2.584 2.444 2.136 2.008 1.862 1.708 1.394 1.199 0.981 0.772 0.529 0.219 -0.159 -1.078 -10 ,5538 ,KEBNE ,17040338,Thu Dec 23 00:15:10 CET,Thu Dec 23 01:57:42 CET,0.0 0.737 0.899 1.075 1.26 1.434 1.583 1.717 1.968 2.088 2.207 2.252 2.5 2.58 2.734 2.89 3.066 3.154 3.317 3.465 3.664 3.787 3.905 4.063 4.221 4.404 4.581 4.724 4.901 5.073 5.264 5.516 5.747 5.951 6.157 6.383 6.612 6.872 7.132 7.393 7.668 7.965 8.313 8.655 9.049 9.501 9.969 10.432 10.88 11.312 11.619 11.521 11.174 10.717 10.244 9.786 9.334 8.903 8.544 8.183 7.846 7.521 7.195 6.89 6.624 6.371 6.088 5.823 5.587 5.361 5.128 4.925 4.726 4.495 4.302 4.117 3.933 3.742 3.502 3.321 3.149 2.907 2.726 2.505 2.392 2.157 1.918 1.689 1.56 1.251 1.104 0.922 0.751 0.412 0.2 -0.039 -0.299 -0.597 -0.892 -1.281 -2.471 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 7112bf1a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31776 ,KEBNE ,17040339,Thu Dec 23 00:15:10 CET,Thu Dec 23 01:58:20 CET,0.0 0.6 0.854 1.079 1.273 1.462 1.635 1.787 2.049 2.186 2.326 2.393 2.675 2.783 2.974 3.156 3.328 3.41 3.573 3.734 3.95 4.082 4.215 4.424 4.631 4.817 4.991 5.167 5.397 5.607 5.797 6.03 6.263 6.479 6.725 6.997 7.256 7.54 7.844 8.165 8.499 8.891 9.437 10.044 10.693 11.362 12.095 12.863 13.669 14.452 15.189 15.48 15.382 15.147 14.838 14.426 13.957 13.487 13.105 12.724 12.363 12.024 11.682 11.326 10.991 10.684 10.359 10.081 9.833 9.561 9.28 9.039 8.771 8.507 8.31 8.104 7.891 7.67 7.436 7.251 7.051 6.735 6.516 6.312 6.207 5.998 5.786 5.531 5.398 5.098 4.947 4.777 4.617 4.295 4.117 3.914 3.67 3.413 3.152 2.759 1.922 -2 ,23600 ,KEBNE ,17040340,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:35 CET,0.0 0.858 1.181 1.413 1.601 1.753 1.883 2.006 2.244 2.376 2.507 2.562 2.828 2.925 3.114 3.28 3.451 3.542 3.701 3.854 4.103 4.254 4.388 4.596 4.803 4.993 5.168 5.33 5.548 5.76 5.961 6.201 6.444 6.677 6.933 7.216 7.485 7.779 8.105 8.463 8.868 9.376 9.956 10.487 11.103 11.765 12.438 13.136 13.867 14.606 15.212 15.362 15.183 14.843 14.431 13.996 13.584 13.142 12.728 12.333 11.967 11.613 11.29 10.991 10.664 10.328 9.983 9.684 9.449 9.211 8.934 8.684 8.461 8.216 7.987 7.761 7.518 7.268 7.012 6.827 6.633 6.34 6.147 5.925 5.803 5.568 5.313 5.034 4.896 4.594 4.48 4.322 4.133 3.696 3.454 3.187 2.903 2.614 2.289 1.893 0.854 -3 ,22648 ,KEBNE ,17040341,Thu Dec 23 00:19:15 CET,Thu Dec 23 02:03:55 CET,0.0 0.68 1.06 1.298 1.467 1.638 1.797 1.933 2.165 2.278 2.39 2.439 2.719 2.831 3.021 3.196 3.356 3.434 3.586 3.725 3.927 4.058 4.189 4.373 4.553 4.736 4.913 5.094 5.323 5.532 5.723 5.947 6.161 6.37 6.618 6.89 7.158 7.451 7.765 8.127 8.501 8.87 9.268 9.67 10.12 10.611 11.137 11.738 12.451 13.197 13.868 14.02 13.838 13.466 13.029 12.619 12.211 11.803 11.394 10.952 10.58 10.256 9.95 9.626 9.304 9.01 8.682 8.378 8.106 7.816 7.505 7.25 7.009 6.747 6.547 6.337 6.101 5.861 5.62 5.443 5.243 4.932 4.729 4.52 4.411 4.184 3.938 3.69 3.56 3.246 3.087 2.922 2.736 2.347 2.136 1.862 1.565 1.274 0.901 0.446 -0.877 -4 ,30737 ,KEBNE ,17040342,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:02:22 CET,0.0 0.662 0.893 1.124 1.307 1.465 1.62 1.755 1.998 2.112 2.216 2.259 2.539 2.642 2.836 3.015 3.194 3.278 3.426 3.573 3.786 3.921 4.049 4.229 4.402 4.568 4.731 4.901 5.133 5.334 5.524 5.762 5.981 6.203 6.455 6.733 7.011 7.314 7.607 7.906 8.228 8.601 9.035 9.449 9.953 10.456 10.933 11.44 11.981 12.642 13.322 13.49 13.312 12.984 12.635 12.259 11.883 11.554 11.234 10.847 10.541 10.262 9.915 9.574 9.302 9.069 8.813 8.578 8.361 8.108 7.827 7.591 7.349 7.099 6.913 6.724 6.505 6.243 6.0 5.847 5.679 5.435 5.26 5.062 4.962 4.734 4.493 4.26 4.125 3.809 3.682 3.539 3.371 2.993 2.788 2.559 2.303 2.011 1.69 1.139 -0.88 -5 ,6291 ,KEBNE ,17040343,Thu Dec 23 00:19:15 CET,Thu Dec 23 02:02:37 CET,0.0 0.742 1.004 1.22 1.391 1.527 1.66 1.81 2.07 2.188 2.308 2.354 2.626 2.722 2.919 3.095 3.258 3.346 3.516 3.668 3.88 4.018 4.147 4.33 4.519 4.697 4.857 5.02 5.244 5.452 5.639 5.853 6.063 6.269 6.49 6.751 7.004 7.274 7.592 7.919 8.244 8.619 9.031 9.425 9.879 10.389 10.971 11.581 12.2 12.816 13.381 13.567 13.426 13.182 12.885 12.536 12.188 11.837 11.491 11.102 10.725 10.353 9.991 9.653 9.366 9.101 8.812 8.545 8.29 8.034 7.791 7.584 7.355 7.11 6.925 6.735 6.525 6.31 6.111 5.963 5.803 5.55 5.366 5.18 5.08 4.877 4.664 4.42 4.289 4.005 3.932 3.803 3.657 3.349 3.183 2.995 2.795 2.553 2.179 1.73 1.027 -6 ,22103 ,KEBNE ,17040344,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:21 CET,0.0 0.605 0.916 1.182 1.38 1.541 1.689 1.832 2.112 2.237 2.374 2.473 2.755 2.857 3.047 3.225 3.385 3.469 3.635 3.786 3.999 4.125 4.247 4.433 4.619 4.792 4.955 5.12 5.321 5.512 5.706 5.941 6.157 6.354 6.591 6.854 7.093 7.36 7.648 7.942 8.257 8.612 8.997 9.44 10.038 10.683 11.39 12.154 12.973 13.825 14.631 14.952 14.938 14.757 14.431 14.097 13.806 13.508 13.191 12.852 12.567 12.27 11.978 11.722 11.456 11.173 10.87 10.608 10.384 10.162 9.934 9.743 9.543 9.32 9.138 8.953 8.761 8.556 8.329 8.16 7.997 7.756 7.572 7.376 7.283 7.091 6.875 6.639 6.513 6.216 6.103 5.962 5.825 5.515 5.339 5.163 4.964 4.74 4.479 4.15 2.843 -7 ,6274 ,KEBNE ,17040345,Thu Dec 23 00:19:15 CET,Thu Dec 23 02:03:59 CET,0.0 0.423 0.676 0.887 1.071 1.257 1.435 1.572 1.814 1.93 2.05 2.13 2.405 2.498 2.671 2.847 3.018 3.105 3.288 3.458 3.692 3.837 3.973 4.165 4.345 4.529 4.709 4.887 5.117 5.341 5.549 5.788 6.03 6.258 6.522 6.824 7.105 7.408 7.745 8.108 8.471 8.847 9.271 9.697 10.167 10.669 11.235 11.846 12.493 13.107 13.675 13.819 13.628 13.37 13.004 12.54 12.066 11.648 11.274 10.865 10.518 10.19 9.883 9.621 9.374 9.136 8.878 8.618 8.376 8.126 7.87 7.656 7.44 7.224 7.06 6.882 6.695 6.513 6.334 6.22 6.099 5.898 5.75 5.58 5.486 5.276 5.086 4.895 4.766 4.457 4.334 4.183 4.028 3.694 3.518 3.337 3.124 2.885 2.613 2.297 1.689 -8 ,19498 ,KEBNE ,17040346,Thu Dec 23 00:19:15 CET,Thu Dec 23 02:02:18 CET,0.0 0.57 0.838 1.093 1.308 1.478 1.661 1.821 2.077 2.192 2.301 2.347 2.605 2.7 2.902 3.095 3.279 3.363 3.522 3.682 3.92 4.061 4.193 4.398 4.592 4.789 4.984 5.158 5.37 5.573 5.778 6.017 6.236 6.451 6.709 6.991 7.251 7.537 7.829 8.14 8.481 8.87 9.308 9.73 10.23 10.771 11.333 11.91 12.536 13.198 13.707 13.729 13.538 13.217 12.823 12.429 12.007 11.567 11.221 10.856 10.503 10.192 9.842 9.481 9.155 8.854 8.525 8.232 7.999 7.748 7.456 7.212 6.975 6.728 6.521 6.305 6.085 5.857 5.612 5.439 5.252 4.954 4.776 4.592 4.488 4.262 4.042 3.826 3.704 3.413 3.341 3.218 3.074 2.693 2.453 2.215 1.995 1.738 1.413 0.984 -0.377 -9 ,14986 ,KEBNE ,17040347,Thu Dec 23 00:19:19 CET,Thu Dec 23 01:56:02 CET,0.0 0.911 1.221 1.468 1.657 1.799 1.946 2.101 2.354 2.471 2.583 2.615 2.878 2.98 3.174 3.351 3.506 3.58 3.735 3.898 4.118 4.248 4.384 4.571 4.748 4.924 5.104 5.276 5.478 5.671 5.856 6.07 6.287 6.5 6.724 6.973 7.231 7.538 7.869 8.198 8.524 8.893 9.321 9.685 10.1 10.562 11.001 11.505 12.175 12.961 13.629 13.862 13.798 13.509 13.134 12.779 12.421 12.06 11.778 11.491 11.187 10.859 10.534 10.209 9.879 9.579 9.297 9.028 8.755 8.47 8.191 7.945 7.67 7.41 7.205 6.984 6.766 6.541 6.301 6.138 5.978 5.731 5.526 5.27 5.136 4.883 4.636 4.393 4.266 3.968 3.818 3.647 3.487 3.162 2.966 2.738 2.49 2.172 1.836 1.392 0.053 -10 ,15908 ,KEBNE ,17040348,Thu Dec 23 00:19:15 CET,Thu Dec 23 02:02:15 CET,0.0 0.617 0.955 1.194 1.36 1.507 1.636 1.766 2.004 2.11 2.224 2.283 2.564 2.677 2.883 3.067 3.233 3.313 3.479 3.648 3.891 4.04 4.17 4.375 4.576 4.755 4.931 5.103 5.318 5.521 5.721 5.953 6.171 6.387 6.627 6.885 7.14 7.474 7.887 8.322 8.765 9.254 9.807 10.336 10.917 11.532 12.201 12.862 13.555 14.243 14.801 14.993 14.73 14.286 13.894 13.511 13.125 12.727 12.326 11.892 11.523 11.215 10.918 10.627 10.348 10.073 9.769 9.491 9.257 9.015 8.747 8.501 8.235 7.97 7.766 7.567 7.343 7.084 6.807 6.611 6.417 6.143 5.948 5.739 5.64 5.437 5.202 4.965 4.848 4.548 4.447 4.313 4.17 3.853 3.678 3.46 3.205 2.822 2.272 1.621 -0.123 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt deleted file mode 100644 index 1a0e60ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13101 ,KEBNE ,17040349,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:34 CET,0.0 0.693 1.06 1.352 1.567 1.74 1.906 2.046 2.331 2.479 2.616 2.645 2.959 3.056 3.223 3.398 3.564 3.647 3.833 4.006 4.256 4.417 4.555 4.749 4.946 5.149 5.342 5.522 5.735 5.943 6.152 6.399 6.63 6.855 7.123 7.431 7.732 8.049 8.369 8.706 9.064 9.476 9.948 10.389 10.892 11.463 12.091 12.72 13.352 13.927 14.322 14.332 14.111 13.762 13.402 13.02 12.602 12.215 11.872 11.496 11.155 10.853 10.581 10.31 10.059 9.844 9.617 9.398 9.201 8.991 8.775 8.605 8.431 8.24 8.081 7.914 7.736 7.544 7.343 7.212 7.077 6.873 6.722 6.559 6.481 6.31 6.131 5.945 5.839 5.522 5.473 5.354 5.233 4.993 4.863 4.726 4.584 4.407 4.181 3.902 3.194 -2 ,29501 ,KEBNE ,17040350,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:02:46 CET,0.0 0.868 1.197 1.379 1.539 1.688 1.843 1.996 2.285 2.43 2.563 2.594 2.914 3.013 3.212 3.42 3.615 3.704 3.868 4.041 4.302 4.463 4.605 4.805 5.01 5.204 5.374 5.549 5.793 6.019 6.237 6.489 6.73 6.975 7.258 7.555 7.844 8.164 8.482 8.843 9.242 9.683 10.199 10.694 11.246 11.815 12.394 12.959 13.574 14.225 14.699 14.638 14.32 13.966 13.588 13.168 12.775 12.41 12.07 11.698 11.359 11.043 10.749 10.486 10.238 10.004 9.771 9.561 9.369 9.166 8.943 8.768 8.582 8.385 8.24 8.074 7.886 7.687 7.495 7.371 7.236 6.998 6.835 6.675 6.594 6.425 6.245 6.058 5.959 5.646 5.644 5.534 5.397 5.129 5.008 4.854 4.677 4.506 4.271 3.944 3.085 -3 ,3841 ,KEBNE ,17040351,Thu Dec 23 00:19:15 CET,Thu Dec 23 02:03:50 CET,0.0 0.923 1.268 1.509 1.717 1.896 2.059 2.244 2.562 2.685 2.797 2.805 3.107 3.221 3.45 3.641 3.811 3.899 4.068 4.23 4.479 4.638 4.787 5.007 5.219 5.406 5.577 5.753 5.988 6.206 6.405 6.641 6.874 7.09 7.327 7.607 7.864 8.126 8.415 8.735 9.062 9.416 9.834 10.27 10.773 11.315 11.924 12.562 13.261 13.889 14.319 14.462 14.301 13.954 13.549 13.157 12.792 12.416 12.087 11.752 11.422 11.12 10.834 10.537 10.261 10.018 9.749 9.509 9.298 9.077 8.863 8.685 8.49 8.282 8.114 7.942 7.76 7.565 7.366 7.22 7.066 6.823 6.65 6.48 6.396 6.202 5.986 5.766 5.656 5.339 5.322 5.221 5.104 4.86 4.727 4.577 4.407 4.192 3.942 3.668 2.84 -4 ,18153 ,KEBNE ,17040352,Thu Dec 23 00:19:17 CET,Thu Dec 23 02:03:15 CET,0.0 0.571 0.855 1.137 1.363 1.554 1.741 1.905 2.174 2.296 2.417 2.441 2.757 2.862 3.066 3.259 3.429 3.507 3.671 3.84 4.074 4.221 4.379 4.6 4.795 4.985 5.157 5.328 5.568 5.802 6.034 6.33 6.616 6.888 7.191 7.489 7.768 8.086 8.425 8.766 9.108 9.499 9.931 10.357 10.846 11.368 11.985 12.648 13.385 14.193 14.828 14.986 14.82 14.518 14.171 13.792 13.429 13.074 12.729 12.365 12.089 11.847 11.592 11.365 11.141 10.918 10.669 10.441 10.257 10.068 9.862 9.686 9.506 9.315 9.168 9.009 8.841 8.665 8.473 8.347 8.219 8.008 7.861 7.696 7.612 7.452 7.288 7.105 7.005 6.709 6.711 6.604 6.488 6.256 6.129 5.971 5.794 5.606 5.404 5.169 4.551 -5 ,18475 ,KEBNE ,17040353,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:38 CET,0.0 0.929 1.263 1.499 1.68 1.866 2.066 2.248 2.535 2.661 2.79 2.823 3.145 3.248 3.441 3.628 3.827 3.929 4.12 4.293 4.529 4.677 4.833 5.056 5.261 5.466 5.661 5.855 6.101 6.326 6.532 6.778 7.019 7.24 7.522 7.859 8.16 8.468 8.805 9.168 9.548 9.964 10.454 10.94 11.516 12.175 12.898 13.647 14.432 15.193 15.67 15.638 15.385 15.108 14.84 14.548 14.283 14.018 13.736 13.447 13.21 12.989 12.739 12.498 12.3 12.113 11.894 11.682 11.481 11.284 11.078 10.89 10.708 10.524 10.362 10.184 10.008 9.832 9.647 9.522 9.393 9.186 9.039 8.878 8.794 8.627 8.447 8.254 8.16 7.867 7.862 7.747 7.629 7.394 7.235 7.041 6.832 6.62 6.358 5.99 5.19 -6 ,17960 ,KEBNE ,17040355,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:02:46 CET,0.0 1.015 1.303 1.55 1.769 1.951 2.13 2.29 2.579 2.719 2.85 2.882 3.203 3.317 3.517 3.688 3.849 3.933 4.104 4.274 4.52 4.666 4.809 5.02 5.233 5.445 5.65 5.848 6.102 6.322 6.525 6.787 7.037 7.266 7.517 7.794 8.085 8.403 8.742 9.104 9.456 9.862 10.364 10.862 11.389 11.947 12.578 13.243 13.989 14.795 15.53 15.781 15.59 15.236 14.864 14.472 14.101 13.758 13.456 13.126 12.796 12.506 12.231 11.951 11.691 11.455 11.211 10.994 10.799 10.588 10.372 10.202 10.016 9.823 9.685 9.531 9.364 9.198 9.023 8.888 8.745 8.541 8.4 8.243 8.162 8.009 7.84 7.673 7.595 7.31 7.32 7.215 7.11 6.865 6.716 6.549 6.391 6.229 6.03 5.806 5.114 -7 ,17243 ,KEBNE ,17040356,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:34 CET,0.0 1.222 1.531 1.781 2.009 2.217 2.385 2.508 2.761 2.88 2.991 3.029 3.352 3.456 3.65 3.828 4.022 4.114 4.282 4.452 4.695 4.854 5.005 5.219 5.421 5.63 5.846 6.038 6.277 6.506 6.724 6.99 7.241 7.457 7.686 7.952 8.21 8.507 8.826 9.149 9.48 9.856 10.311 10.742 11.226 11.766 12.366 12.984 13.572 14.17 14.686 14.776 14.577 14.227 13.851 13.482 13.126 12.798 12.499 12.176 11.872 11.591 11.331 11.058 10.81 10.599 10.373 10.176 9.995 9.791 9.581 9.402 9.213 9.016 8.854 8.678 8.499 8.326 8.151 8.026 7.896 7.687 7.54 7.392 7.31 7.142 6.95 6.756 6.668 6.365 6.343 6.226 6.116 5.854 5.691 5.513 5.302 5.054 4.824 4.604 3.711 -8 ,1216 ,KEBNE ,17040358,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:16 CET,0.0 0.64 0.955 1.169 1.385 1.576 1.747 1.921 2.218 2.331 2.449 2.47 2.782 2.886 3.079 3.266 3.451 3.538 3.721 3.905 4.144 4.286 4.419 4.631 4.855 5.072 5.279 5.473 5.714 5.941 6.171 6.431 6.654 6.877 7.146 7.457 7.768 8.102 8.426 8.753 9.125 9.547 10.018 10.466 10.986 11.543 12.119 12.788 13.431 13.957 14.377 14.419 14.22 13.859 13.482 13.127 12.757 12.354 11.993 11.65 11.344 11.077 10.829 10.576 10.335 10.101 9.864 9.656 9.479 9.291 9.068 8.883 8.701 8.521 8.38 8.23 8.061 7.9 7.747 7.631 7.505 7.307 7.166 7.012 6.939 6.788 6.608 6.409 6.308 5.995 5.951 5.848 5.739 5.493 5.354 5.201 5.057 4.909 4.723 4.533 3.966 -9 ,32022 ,KEBNE ,17040359,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:53 CET,0.0 0.773 1.113 1.394 1.615 1.81 1.984 2.137 2.404 2.538 2.677 2.722 3.034 3.128 3.33 3.525 3.706 3.794 3.965 4.124 4.351 4.504 4.65 4.856 5.045 5.234 5.419 5.587 5.797 6.019 6.238 6.497 6.764 7.005 7.266 7.567 7.857 8.16 8.496 8.875 9.282 9.736 10.244 10.738 11.322 11.979 12.68 13.373 14.038 14.668 15.124 15.146 14.953 14.65 14.251 13.851 13.484 13.104 12.748 12.4 12.091 11.806 11.54 11.289 11.052 10.837 10.619 10.41 10.222 10.022 9.783 9.576 9.368 9.154 8.988 8.815 8.649 8.485 8.299 8.165 8.026 7.803 7.641 7.472 7.388 7.218 7.039 6.843 6.746 6.451 6.419 6.297 6.173 5.913 5.783 5.636 5.451 5.252 5.031 4.749 4.13 -10 ,14710 ,KEBNE ,17040361,Thu Dec 23 00:19:15 CET,Thu Dec 23 02:03:30 CET,0.0 0.763 1.07 1.317 1.506 1.636 1.783 1.949 2.242 2.362 2.476 2.504 2.812 2.918 3.136 3.326 3.501 3.59 3.762 3.937 4.195 4.351 4.504 4.727 4.928 5.12 5.301 5.477 5.698 5.902 6.112 6.372 6.622 6.854 7.115 7.418 7.724 8.064 8.413 8.763 9.127 9.524 9.948 10.373 10.875 11.364 11.899 12.548 13.269 13.951 14.571 14.684 14.435 14.116 13.717 13.317 12.962 12.631 12.356 12.076 11.789 11.501 11.225 10.976 10.746 10.513 10.265 10.041 9.83 9.61 9.373 9.163 8.919 8.654 8.465 8.268 8.063 7.84 7.614 7.476 7.337 7.116 6.955 6.786 6.705 6.53 6.341 6.14 6.03 5.72 5.698 5.588 5.469 5.208 5.078 4.933 4.762 4.562 4.332 4.055 3.361 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt deleted file mode 100644 index af894125..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16721 ,KEBNE ,17040363,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:07 CET,0.0 0.524 0.72 0.857 0.992 1.09 1.155 1.219 1.326 1.366 1.404 1.273 1.495 1.506 1.528 1.544 1.55 1.545 1.532 1.531 1.525 1.505 1.481 1.443 1.387 1.313 1.239 1.171 1.077 0.964 0.842 0.673 0.494 0.321 0.106 -0.173 -0.478 -0.814 -1.206 -1.678 -2.19 -2.812 -3.612 -4.508 -5.679 -7.102 -8.927 -11.275 -14.439 -18.819 -25.331 -32.315 -37.521 -41.552 -44.816 -47.573 -49.809 -51.736 -53.329 -54.852 -56.126 -57.225 -58.243 -59.173 -60.007 -60.74 -61.505 -62.176 -62.732 -63.29 -63.874 -64.362 -64.839 -65.323 -65.707 -66.09 -66.469 -66.866 -67.269 -67.539 -67.822 -68.253 -68.536 -68.833 -68.995 -69.328 -69.661 -70.009 -70.195 -70.659 -70.752 -70.951 -71.145 -71.547 -71.777 -72.023 -72.289 -72.57 -72.897 -73.336 -74.338 -2 ,28368 ,KEBNE ,17040364,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:02:46 CET,0.0 0.57 0.694 0.787 0.891 0.991 1.059 1.117 1.206 1.232 1.249 1.066 1.292 1.304 1.318 1.337 1.357 1.36 1.362 1.362 1.346 1.339 1.332 1.289 1.24 1.19 1.123 1.051 0.946 0.83 0.713 0.565 0.4 0.236 0.039 -0.223 -0.494 -0.816 -1.214 -1.66 -2.157 -2.787 -3.589 -4.459 -5.558 -6.905 -8.642 -10.87 -13.885 -18.139 -24.572 -31.357 -36.367 -40.283 -43.457 -46.102 -48.258 -50.089 -51.591 -53.048 -54.25 -55.307 -56.298 -57.201 -58.011 -58.742 -59.503 -60.165 -60.717 -61.259 -61.818 -62.298 -62.799 -63.303 -63.672 -64.038 -64.403 -64.776 -65.161 -65.422 -65.682 -66.097 -66.384 -66.67 -66.822 -67.14 -67.442 -67.739 -67.914 -68.379 -68.47 -68.669 -68.868 -69.271 -69.488 -69.728 -69.982 -70.275 -70.575 -70.896 -71.589 -3 ,24871 ,KEBNE ,17040366,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:47 CET,0.0 0.592 0.742 0.872 0.971 1.053 1.15 1.23 1.323 1.368 1.401 1.217 1.444 1.473 1.51 1.514 1.538 1.555 1.555 1.537 1.514 1.5 1.475 1.43 1.374 1.3 1.21 1.117 1.007 0.898 0.785 0.628 0.46 0.281 0.078 -0.167 -0.463 -0.801 -1.187 -1.642 -2.161 -2.796 -3.602 -4.482 -5.602 -6.966 -8.74 -11.053 -14.211 -18.504 -24.779 -31.452 -36.44 -40.328 -43.445 -46.067 -48.233 -50.093 -51.617 -53.09 -54.313 -55.353 -56.319 -57.222 -58.044 -58.763 -59.477 -60.105 -60.646 -61.186 -61.749 -62.223 -62.699 -63.179 -63.535 -63.899 -64.279 -64.672 -65.077 -65.351 -65.634 -66.054 -66.34 -66.644 -66.794 -67.096 -67.416 -67.737 -67.896 -68.338 -68.4 -68.583 -68.78 -69.229 -69.475 -69.709 -69.925 -70.167 -70.48 -70.851 -71.604 -4 ,14812 ,KEBNE ,17040368,Thu Dec 23 00:19:15 CET,Thu Dec 23 02:03:35 CET,0.0 0.625 0.816 0.959 1.051 1.133 1.214 1.28 1.407 1.457 1.501 1.357 1.601 1.631 1.687 1.721 1.74 1.746 1.75 1.744 1.713 1.685 1.658 1.628 1.588 1.531 1.469 1.401 1.289 1.173 1.065 0.918 0.755 0.585 0.353 0.054 -0.248 -0.58 -0.956 -1.407 -1.902 -2.489 -3.253 -4.124 -5.27 -6.652 -8.401 -10.651 -13.698 -17.914 -24.202 -30.984 -36.09 -40.075 -43.223 -45.878 -48.047 -49.878 -51.432 -52.907 -54.104 -55.145 -56.111 -56.996 -57.821 -58.561 -59.292 -59.93 -60.479 -61.033 -61.598 -62.067 -62.551 -63.034 -63.405 -63.793 -64.174 -64.552 -64.929 -65.19 -65.462 -65.876 -66.165 -66.457 -66.61 -66.92 -67.232 -67.555 -67.725 -68.171 -68.229 -68.418 -68.608 -68.995 -69.201 -69.413 -69.64 -69.902 -70.239 -70.694 -71.476 -5 ,6352 ,KEBNE ,17040369,Thu Dec 23 00:19:15 CET,Thu Dec 23 02:03:01 CET,0.0 0.428 0.622 0.778 0.919 1.024 1.103 1.175 1.311 1.355 1.382 1.231 1.462 1.483 1.518 1.533 1.541 1.538 1.522 1.509 1.486 1.468 1.44 1.399 1.36 1.308 1.244 1.173 1.072 0.96 0.838 0.686 0.537 0.371 0.157 -0.098 -0.367 -0.712 -1.127 -1.596 -2.118 -2.751 -3.564 -4.475 -5.628 -7.038 -8.901 -11.273 -14.417 -18.723 -25.053 -31.789 -36.82 -40.752 -43.864 -46.466 -48.641 -50.5 -52.024 -53.506 -54.739 -55.799 -56.779 -57.693 -58.518 -59.234 -59.982 -60.635 -61.185 -61.739 -62.302 -62.767 -63.234 -63.705 -64.063 -64.428 -64.794 -65.175 -65.575 -65.848 -66.121 -66.531 -66.812 -67.11 -67.267 -67.586 -67.904 -68.222 -68.39 -68.845 -68.916 -69.095 -69.295 -69.7 -69.906 -70.111 -70.313 -70.567 -70.865 -71.21 -71.944 -6 ,20670 ,KEBNE ,17040370,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:38 CET,0.0 0.558 0.737 0.858 0.962 1.054 1.124 1.173 1.233 1.271 1.31 1.139 1.349 1.358 1.38 1.394 1.412 1.416 1.401 1.386 1.365 1.351 1.338 1.297 1.235 1.171 1.114 1.055 0.951 0.831 0.721 0.584 0.419 0.235 -0.001 -0.294 -0.583 -0.931 -1.342 -1.799 -2.316 -2.953 -3.777 -4.669 -5.777 -7.14 -8.921 -11.201 -14.266 -18.558 -25.097 -32.11 -37.235 -41.21 -44.433 -47.139 -49.365 -51.264 -52.838 -54.333 -55.556 -56.635 -57.628 -58.548 -59.402 -60.138 -60.874 -61.515 -62.054 -62.603 -63.168 -63.639 -64.115 -64.58 -64.931 -65.296 -65.662 -66.041 -66.443 -66.711 -66.981 -67.389 -67.668 -67.968 -68.124 -68.445 -68.764 -69.081 -69.263 -69.738 -69.838 -70.034 -70.233 -70.683 -70.925 -71.177 -71.458 -71.744 -72.082 -72.54 -73.533 -7 ,9241 ,KEBNE ,17040371,Thu Dec 23 00:19:17 CET,Thu Dec 23 02:03:42 CET,0.0 0.511 0.652 0.761 0.842 0.908 0.96 1.013 1.099 1.136 1.171 1.013 1.23 1.251 1.281 1.282 1.273 1.272 1.257 1.237 1.218 1.191 1.158 1.105 1.035 0.96 0.89 0.812 0.701 0.586 0.469 0.309 0.141 -0.033 -0.257 -0.531 -0.824 -1.168 -1.565 -2.011 -2.505 -3.152 -3.988 -4.871 -6.025 -7.426 -9.216 -11.496 -14.559 -18.904 -25.415 -32.234 -37.31 -41.35 -44.595 -47.296 -49.501 -51.377 -52.928 -54.445 -55.695 -56.781 -57.787 -58.697 -59.524 -60.254 -61.011 -61.669 -62.233 -62.802 -63.362 -63.819 -64.293 -64.782 -65.146 -65.515 -65.897 -66.285 -66.69 -66.975 -67.267 -67.702 -67.995 -68.298 -68.449 -68.77 -69.088 -69.392 -69.552 -70.006 -70.065 -70.242 -70.434 -70.854 -71.075 -71.301 -71.527 -71.777 -72.067 -72.396 -73.14 -8 ,27857 ,KEBNE ,17040373,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:02:52 CET,0.0 0.737 0.944 1.063 1.182 1.302 1.364 1.423 1.523 1.56 1.592 1.446 1.67 1.688 1.718 1.743 1.752 1.744 1.727 1.712 1.702 1.699 1.676 1.626 1.582 1.528 1.464 1.403 1.32 1.223 1.118 0.963 0.781 0.586 0.351 0.08 -0.205 -0.537 -0.909 -1.356 -1.877 -2.518 -3.357 -4.265 -5.411 -6.841 -8.681 -11.032 -14.138 -18.431 -24.961 -31.85 -36.88 -40.789 -43.904 -46.556 -48.754 -50.625 -52.165 -53.627 -54.837 -55.872 -56.849 -57.77 -58.62 -59.387 -60.175 -60.854 -61.419 -61.991 -62.598 -63.105 -63.6 -64.109 -64.492 -64.879 -65.273 -65.67 -66.102 -66.406 -66.702 -67.155 -67.472 -67.786 -67.949 -68.299 -68.66 -69.02 -69.205 -69.679 -69.792 -69.993 -70.185 -70.608 -70.828 -71.056 -71.314 -71.568 -71.853 -72.195 -73.017 -9 ,26283 ,KEBNE ,17040374,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:54 CET,0.0 0.323 0.465 0.558 0.649 0.752 0.838 0.895 0.968 1.007 1.043 0.887 1.115 1.135 1.174 1.216 1.243 1.246 1.256 1.255 1.23 1.204 1.165 1.108 1.064 0.999 0.92 0.845 0.745 0.646 0.545 0.41 0.251 0.08 -0.13 -0.403 -0.686 -1.027 -1.43 -1.883 -2.401 -3.042 -3.863 -4.752 -5.892 -7.303 -9.142 -11.478 -14.586 -18.873 -25.262 -32.087 -37.163 -41.195 -44.444 -47.153 -49.363 -51.25 -52.829 -54.344 -55.592 -56.677 -57.676 -58.597 -59.434 -60.17 -60.903 -61.537 -62.103 -62.697 -63.279 -63.735 -64.194 -64.658 -65.021 -65.39 -65.764 -66.15 -66.536 -66.796 -67.071 -67.501 -67.779 -68.066 -68.219 -68.513 -68.813 -69.143 -69.312 -69.775 -69.861 -70.054 -70.262 -70.705 -70.917 -71.126 -71.389 -71.663 -71.923 -72.267 -73.281 -10 ,8896 ,KEBNE ,17040375,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:01:50 CET,0.0 0.685 0.86 0.983 1.057 1.113 1.17 1.243 1.368 1.414 1.458 1.312 1.562 1.601 1.624 1.635 1.646 1.649 1.631 1.608 1.594 1.578 1.548 1.506 1.459 1.391 1.34 1.278 1.168 1.059 0.942 0.779 0.609 0.436 0.203 -0.091 -0.384 -0.715 -1.096 -1.542 -2.075 -2.712 -3.501 -4.379 -5.5 -6.887 -8.664 -10.924 -13.966 -18.162 -24.423 -31.119 -36.169 -40.131 -43.285 -45.943 -48.161 -50.065 -51.651 -53.187 -54.436 -55.517 -56.534 -57.478 -58.343 -59.126 -59.927 -60.602 -61.159 -61.73 -62.315 -62.798 -63.284 -63.774 -64.151 -64.526 -64.906 -65.292 -65.712 -66.007 -66.291 -66.701 -66.986 -67.307 -67.471 -67.786 -68.111 -68.458 -68.636 -69.095 -69.174 -69.371 -69.592 -70.036 -70.256 -70.493 -70.772 -71.07 -71.388 -71.821 -72.935 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt deleted file mode 100644 index 9edf0cb6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28456 ,KEBNE ,17040376,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:50 CET,0.0 0.674 0.886 1.052 1.215 1.366 1.488 1.574 1.739 1.812 1.86 1.706 1.936 1.964 2.025 2.09 2.138 2.157 2.2 2.232 2.255 2.264 2.283 2.305 2.322 2.332 2.326 2.308 2.28 2.258 2.226 2.158 2.08 1.989 1.857 1.694 1.516 1.309 1.092 0.812 0.45 -0.004 -0.587 -1.255 -2.139 -3.276 -4.774 -6.732 -9.426 -13.161 -18.822 -24.864 -29.483 -33.198 -36.189 -38.656 -40.68 -42.463 -43.939 -45.341 -46.52 -47.57 -48.544 -49.422 -50.225 -50.93 -51.646 -52.289 -52.821 -53.356 -53.928 -54.395 -54.869 -55.338 -55.685 -56.039 -56.399 -56.777 -57.178 -57.455 -57.74 -58.165 -58.438 -58.71 -58.849 -59.134 -59.434 -59.761 -59.937 -60.372 -60.447 -60.621 -60.811 -61.235 -61.448 -61.696 -61.945 -62.172 -62.43 -62.796 -63.682 -2 ,8303 ,KEBNE ,17040377,Thu Dec 23 00:19:17 CET,Thu Dec 23 02:02:02 CET,0.0 0.685 0.92 1.1 1.222 1.316 1.417 1.505 1.635 1.699 1.77 1.664 1.908 1.947 2.012 2.072 2.134 2.165 2.211 2.248 2.297 2.318 2.333 2.349 2.348 2.344 2.334 2.313 2.275 2.23 2.181 2.107 2.03 1.951 1.837 1.663 1.478 1.255 0.97 0.624 0.237 -0.235 -0.841 -1.529 -2.444 -3.549 -4.966 -6.829 -9.416 -13.049 -18.593 -24.635 -29.156 -32.718 -35.644 -38.132 -40.203 -42.028 -43.539 -44.985 -46.192 -47.227 -48.19 -49.062 -49.845 -50.549 -51.255 -51.868 -52.401 -52.935 -53.457 -53.891 -54.335 -54.789 -55.152 -55.52 -55.893 -56.269 -56.655 -56.92 -57.19 -57.596 -57.869 -58.152 -58.303 -58.619 -58.929 -59.243 -59.401 -59.831 -59.901 -60.078 -60.279 -60.723 -60.952 -61.176 -61.387 -61.601 -61.838 -62.175 -62.854 -3 ,4724 ,KEBNE ,17040378,Thu Dec 23 00:19:15 CET,Thu Dec 23 02:03:53 CET,0.0 0.961 1.195 1.398 1.551 1.672 1.778 1.869 1.996 2.047 2.106 2.018 2.27 2.315 2.383 2.424 2.461 2.484 2.519 2.542 2.558 2.569 2.582 2.583 2.574 2.57 2.558 2.538 2.511 2.486 2.452 2.389 2.304 2.191 2.047 1.897 1.757 1.556 1.291 0.996 0.681 0.27 -0.32 -0.982 -1.805 -2.887 -4.406 -6.355 -8.966 -12.705 -18.47 -24.705 -29.372 -33.007 -35.888 -38.317 -40.354 -42.122 -43.583 -44.989 -46.17 -47.179 -48.087 -48.925 -49.704 -50.404 -51.13 -51.768 -52.303 -52.843 -53.38 -53.811 -54.254 -54.705 -55.053 -55.405 -55.768 -56.144 -56.517 -56.772 -57.035 -57.434 -57.704 -57.981 -58.126 -58.417 -58.719 -59.036 -59.194 -59.622 -59.691 -59.862 -60.042 -60.441 -60.647 -60.862 -61.084 -61.332 -61.618 -62.006 -62.803 -4 ,4010 ,KEBNE ,17040379,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:30 CET,0.0 0.733 0.952 1.126 1.303 1.433 1.528 1.63 1.787 1.845 1.904 1.818 2.076 2.113 2.187 2.246 2.283 2.303 2.335 2.367 2.408 2.439 2.465 2.471 2.465 2.459 2.471 2.477 2.461 2.443 2.413 2.365 2.295 2.219 2.138 2.003 1.824 1.604 1.316 0.974 0.595 0.142 -0.446 -1.127 -2.024 -3.154 -4.563 -6.381 -8.966 -12.657 -18.256 -24.285 -28.804 -32.361 -35.281 -37.765 -39.787 -41.499 -42.912 -44.279 -45.433 -46.426 -47.362 -48.233 -49.005 -49.689 -50.385 -50.985 -51.504 -52.04 -52.563 -52.988 -53.423 -53.877 -54.243 -54.618 -54.983 -55.337 -55.688 -55.928 -56.186 -56.603 -56.876 -57.137 -57.28 -57.569 -57.855 -58.156 -58.307 -58.738 -58.807 -58.978 -59.165 -59.567 -59.769 -59.998 -60.237 -60.48 -60.728 -61.038 -61.884 -5 ,25590 ,KEBNE ,17040380,Thu Dec 23 00:19:17 CET,Thu Dec 23 02:04:07 CET,0.0 0.645 0.916 1.1 1.24 1.354 1.441 1.519 1.657 1.714 1.766 1.655 1.896 1.924 2.009 2.075 2.104 2.121 2.15 2.175 2.205 2.211 2.212 2.228 2.229 2.209 2.198 2.177 2.137 2.087 2.0 1.875 1.754 1.626 1.495 1.352 1.197 1.018 0.799 0.504 0.149 -0.281 -0.875 -1.585 -2.494 -3.626 -5.112 -7.033 -9.641 -13.229 -18.73 -24.751 -29.334 -32.925 -35.806 -38.291 -40.362 -42.079 -43.484 -44.851 -45.987 -46.994 -47.934 -48.795 -49.567 -50.239 -50.93 -51.529 -52.036 -52.567 -53.109 -53.54 -53.983 -54.445 -54.8 -55.162 -55.523 -55.887 -56.257 -56.515 -56.782 -57.177 -57.435 -57.698 -57.836 -58.109 -58.395 -58.724 -58.895 -59.333 -59.439 -59.639 -59.835 -60.217 -60.409 -60.593 -60.815 -61.074 -61.36 -61.768 -62.746 -6 ,16313 ,KEBNE ,17040381,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:39 CET,0.0 0.897 1.247 1.451 1.568 1.67 1.777 1.864 2.011 2.067 2.107 1.98 2.218 2.247 2.303 2.371 2.44 2.463 2.505 2.542 2.567 2.576 2.573 2.555 2.54 2.523 2.505 2.493 2.455 2.385 2.304 2.209 2.107 1.996 1.878 1.718 1.521 1.28 1.027 0.741 0.375 -0.101 -0.73 -1.404 -2.282 -3.38 -4.817 -6.761 -9.354 -12.951 -18.436 -24.345 -28.914 -32.599 -35.554 -38.028 -40.067 -41.822 -43.304 -44.72 -45.881 -46.903 -47.867 -48.753 -49.553 -50.267 -50.98 -51.614 -52.163 -52.713 -53.3 -53.802 -54.311 -54.83 -55.226 -55.616 -56.014 -56.412 -56.826 -57.118 -57.408 -57.835 -58.126 -58.437 -58.601 -58.932 -59.261 -59.611 -59.789 -60.232 -60.343 -60.543 -60.749 -61.195 -61.434 -61.661 -61.885 -62.178 -62.497 -62.829 -63.612 -7 ,14213 ,KEBNE ,17040382,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:50 CET,0.0 0.435 0.669 0.88 1.03 1.149 1.238 1.314 1.442 1.492 1.543 1.445 1.704 1.749 1.839 1.916 1.985 2.017 2.06 2.084 2.118 2.135 2.146 2.164 2.175 2.172 2.16 2.139 2.095 2.048 2.008 1.955 1.888 1.811 1.695 1.53 1.356 1.161 0.933 0.654 0.344 -0.048 -0.581 -1.195 -1.964 -2.88 -4.111 -5.872 -8.454 -12.134 -17.721 -23.764 -28.342 -31.933 -34.788 -37.259 -39.345 -41.124 -42.586 -44.004 -45.182 -46.192 -47.142 -48.01 -48.791 -49.493 -50.223 -50.845 -51.364 -51.892 -52.423 -52.865 -53.308 -53.741 -54.082 -54.433 -54.784 -55.15 -55.537 -55.802 -56.064 -56.441 -56.692 -56.972 -57.12 -57.417 -57.72 -58.03 -58.187 -58.619 -58.69 -58.863 -59.037 -59.437 -59.665 -59.919 -60.178 -60.42 -60.696 -61.1 -62.189 -8 ,16547 ,KEBNE ,17040383,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:03:28 CET,0.0 0.419 0.594 0.736 0.861 0.957 1.044 1.138 1.287 1.341 1.386 1.275 1.524 1.565 1.634 1.698 1.761 1.788 1.835 1.873 1.896 1.903 1.915 1.924 1.934 1.938 1.93 1.919 1.887 1.843 1.792 1.718 1.64 1.558 1.447 1.312 1.177 1.002 0.771 0.488 0.157 -0.262 -0.818 -1.455 -2.266 -3.331 -4.815 -6.736 -9.227 -12.805 -18.386 -24.369 -28.961 -32.618 -35.536 -37.974 -40.041 -41.824 -43.269 -44.676 -45.85 -46.846 -47.769 -48.634 -49.413 -50.09 -50.772 -51.378 -51.89 -52.424 -52.998 -53.457 -53.911 -54.394 -54.762 -55.121 -55.495 -55.875 -56.262 -56.528 -56.804 -57.244 -57.539 -57.819 -57.964 -58.276 -58.59 -58.904 -59.075 -59.516 -59.619 -59.82 -60.029 -60.468 -60.696 -60.933 -61.211 -61.511 -61.831 -62.223 -63.241 -9 ,21505 ,KEBNE ,17040384,Thu Dec 23 00:19:16 CET,Thu Dec 23 02:04:00 CET,0.0 0.694 0.941 1.063 1.18 1.294 1.412 1.525 1.686 1.754 1.829 1.783 2.06 2.106 2.185 2.25 2.29 2.307 2.342 2.375 2.403 2.42 2.447 2.476 2.489 2.493 2.488 2.48 2.459 2.417 2.36 2.286 2.206 2.088 1.938 1.782 1.59 1.349 1.059 0.736 0.359 -0.148 -0.766 -1.435 -2.331 -3.424 -4.854 -6.744 -9.368 -13.112 -18.773 -24.935 -29.594 -33.282 -36.245 -38.739 -40.769 -42.523 -43.985 -45.365 -46.514 -47.497 -48.422 -49.288 -50.082 -50.792 -51.504 -52.119 -52.65 -53.2 -53.755 -54.212 -54.669 -55.118 -55.462 -55.817 -56.183 -56.558 -56.953 -57.226 -57.487 -57.863 -58.12 -58.408 -58.563 -58.869 -59.191 -59.528 -59.691 -60.126 -60.202 -60.381 -60.58 -60.981 -61.184 -61.401 -61.648 -61.912 -62.17 -62.48 -63.187 -10 ,9962 ,KEBNE ,17040385,Thu Dec 23 00:24:23 CET,Thu Dec 23 02:08:11 CET,0.0 0.516 0.735 0.925 1.066 1.198 1.312 1.401 1.529 1.58 1.646 1.568 1.81 1.85 1.941 2.031 2.107 2.135 2.177 2.211 2.257 2.289 2.302 2.299 2.298 2.297 2.299 2.295 2.271 2.246 2.217 2.152 2.061 1.959 1.849 1.716 1.555 1.348 1.103 0.81 0.452 0.011 -0.59 -1.282 -2.198 -3.374 -4.811 -6.618 -9.206 -12.899 -18.44 -24.548 -29.243 -32.913 -35.818 -38.235 -40.247 -41.997 -43.449 -44.908 -46.155 -47.23 -48.234 -49.164 -50.022 -50.792 -51.572 -52.26 -52.834 -53.413 -54.022 -54.517 -55.013 -55.526 -55.912 -56.301 -56.702 -57.113 -57.536 -57.824 -58.112 -58.56 -58.862 -59.151 -59.298 -59.608 -59.934 -60.274 -60.447 -60.89 -61.004 -61.194 -61.38 -61.776 -61.976 -62.181 -62.394 -62.611 -62.911 -63.356 -64.314 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt deleted file mode 100644 index 1b5500e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9880 ,KEBNE ,17040386,Thu Dec 23 00:24:23 CET,Thu Dec 23 02:08:49 CET,0.0 0.717 1.017 1.264 1.486 1.692 1.874 2.051 2.388 2.549 2.691 2.728 3.051 3.169 3.391 3.617 3.846 3.953 4.169 4.383 4.672 4.86 5.048 5.307 5.565 5.827 6.091 6.351 6.685 7.009 7.318 7.716 8.122 8.492 8.909 9.395 9.869 10.399 10.996 11.631 12.271 13.008 13.893 14.793 15.884 17.158 18.646 20.375 22.513 25.061 28.193 30.859 32.44 33.51 34.283 34.827 35.103 35.199 35.219 35.224 35.222 35.182 35.122 35.084 35.046 35.018 35.0 34.954 34.9 34.839 34.761 34.679 34.596 34.512 34.43 34.345 34.254 34.14 34.014 33.925 33.833 33.698 33.595 33.478 33.42 33.303 33.179 33.043 32.97 32.715 32.695 32.596 32.508 32.342 32.229 32.105 31.957 31.762 31.522 31.234 30.461 -2 ,12780 ,KEBNE ,17040387,Thu Dec 23 00:24:24 CET,Thu Dec 23 02:08:12 CET,0.0 0.83 1.102 1.296 1.47 1.624 1.781 1.936 2.208 2.335 2.455 2.514 2.842 2.959 3.189 3.438 3.676 3.787 3.997 4.185 4.463 4.65 4.833 5.096 5.354 5.601 5.841 6.087 6.412 6.717 7.014 7.378 7.733 8.08 8.492 8.974 9.447 9.97 10.539 11.147 11.808 12.568 13.491 14.446 15.539 16.776 18.271 20.007 22.079 24.606 27.777 30.497 32.121 33.184 33.893 34.353 34.638 34.846 34.967 35.017 35.041 35.071 35.074 35.052 35.028 34.978 34.909 34.852 34.787 34.698 34.606 34.54 34.461 34.364 34.293 34.209 34.109 34.0 33.894 33.824 33.75 33.616 33.515 33.42 33.363 33.237 33.11 32.975 32.905 32.658 32.655 32.562 32.476 32.295 32.179 32.031 31.892 31.707 31.438 31.156 30.393 -3 ,22775 ,KEBNE ,17040388,Thu Dec 23 00:24:23 CET,Thu Dec 23 02:08:48 CET,0.0 0.698 1.036 1.255 1.449 1.637 1.831 2.018 2.313 2.451 2.589 2.665 3.01 3.146 3.382 3.592 3.808 3.908 4.109 4.317 4.603 4.786 4.968 5.245 5.513 5.768 6.014 6.262 6.593 6.91 7.223 7.598 7.968 8.32 8.73 9.212 9.688 10.201 10.745 11.34 11.974 12.696 13.541 14.422 15.519 16.789 18.274 19.99 22.093 24.659 27.848 30.633 32.363 33.448 34.119 34.576 34.921 35.181 35.343 35.46 35.516 35.549 35.571 35.568 35.543 35.502 35.448 35.399 35.349 35.292 35.224 35.155 35.08 34.985 34.898 34.809 34.715 34.608 34.493 34.414 34.326 34.183 34.075 33.972 33.917 33.79 33.672 33.547 33.484 33.25 33.238 33.154 33.059 32.833 32.722 32.599 32.466 32.329 32.135 31.838 31.08 -4 ,5963 ,KEBNE ,17040389,Thu Dec 23 00:24:23 CET,Thu Dec 23 02:08:31 CET,0.0 0.647 1.008 1.287 1.519 1.716 1.911 2.084 2.379 2.521 2.654 2.697 3.029 3.163 3.425 3.659 3.88 3.99 4.204 4.396 4.679 4.866 5.051 5.323 5.603 5.874 6.115 6.351 6.662 6.967 7.27 7.635 7.993 8.361 8.789 9.263 9.729 10.256 10.828 11.439 12.112 12.897 13.823 14.783 15.913 17.157 18.6 20.235 22.257 24.895 28.25 31.075 32.826 33.996 34.755 35.305 35.736 36.015 36.149 36.244 36.305 36.329 36.3 36.257 36.227 36.204 36.193 36.158 36.098 36.018 35.934 35.87 35.797 35.711 35.653 35.591 35.512 35.427 35.324 35.238 35.147 35.011 34.913 34.804 34.74 34.594 34.442 34.298 34.223 33.966 33.966 33.86 33.755 33.549 33.409 33.26 33.129 32.994 32.801 32.541 31.922 -5 ,28183 ,KEBNE ,17040390,Thu Dec 23 00:24:24 CET,Thu Dec 23 02:08:27 CET,0.0 0.768 1.129 1.434 1.685 1.88 2.084 2.281 2.608 2.77 2.922 2.991 3.34 3.473 3.707 3.923 4.136 4.249 4.466 4.663 4.966 5.165 5.355 5.642 5.917 6.187 6.448 6.697 7.034 7.365 7.677 8.051 8.433 8.808 9.235 9.727 10.199 10.722 11.305 11.919 12.554 13.272 14.129 15.037 16.097 17.272 18.699 20.403 22.459 24.895 27.924 30.636 32.379 33.435 34.068 34.518 34.799 34.962 35.046 35.075 35.094 35.103 35.073 35.008 34.945 34.893 34.809 34.702 34.6 34.498 34.392 34.303 34.204 34.075 33.968 33.857 33.74 33.606 33.463 33.375 33.285 33.112 32.994 32.888 32.827 32.693 32.55 32.379 32.286 32.028 32.006 31.893 31.78 31.565 31.438 31.299 31.137 30.962 30.794 30.529 29.376 -6 ,10196 ,KEBNE ,17040391,Thu Dec 23 00:24:24 CET,Thu Dec 23 02:08:35 CET,0.0 0.416 0.656 0.901 1.117 1.301 1.463 1.618 1.914 2.041 2.175 2.225 2.543 2.656 2.899 3.15 3.377 3.488 3.7 3.891 4.178 4.364 4.549 4.822 5.079 5.326 5.568 5.804 6.13 6.437 6.731 7.121 7.494 7.842 8.251 8.736 9.217 9.743 10.308 10.91 11.557 12.315 13.217 14.116 15.151 16.309 17.726 19.473 21.726 24.532 27.818 30.531 32.168 33.189 33.911 34.421 34.695 34.872 35.026 35.153 35.213 35.247 35.271 35.269 35.237 35.201 35.171 35.118 35.049 34.976 34.899 34.835 34.767 34.663 34.572 34.476 34.368 34.255 34.131 34.033 33.939 33.808 33.698 33.601 33.565 33.473 33.354 33.219 33.147 32.895 32.864 32.771 32.687 32.49 32.387 32.284 32.146 31.977 31.761 31.478 30.913 -7 ,18666 ,KEBNE ,17040392,Thu Dec 23 00:24:23 CET,Thu Dec 23 02:08:00 CET,0.0 0.707 1.026 1.245 1.431 1.623 1.812 1.98 2.302 2.458 2.605 2.654 2.977 3.094 3.326 3.559 3.79 3.905 4.13 4.336 4.631 4.821 5.007 5.287 5.571 5.848 6.097 6.328 6.638 6.954 7.255 7.612 7.974 8.318 8.714 9.179 9.629 10.135 10.716 11.341 11.998 12.76 13.658 14.583 15.674 16.9 18.343 19.965 21.894 24.305 27.371 30.038 31.742 32.914 33.708 34.248 34.624 34.925 35.119 35.272 35.371 35.43 35.484 35.499 35.491 35.488 35.473 35.456 35.436 35.399 35.341 35.291 35.236 35.17 35.128 35.074 35.006 34.943 34.876 34.825 34.759 34.648 34.576 34.494 34.445 34.338 34.223 34.082 34.008 33.773 33.82 33.749 33.666 33.495 33.381 33.228 33.037 32.841 32.642 32.375 31.719 -8 ,31450 ,KEBNE ,17040393,Thu Dec 23 00:24:23 CET,Thu Dec 23 02:08:10 CET,0.0 0.58 1.004 1.303 1.521 1.728 1.904 2.051 2.356 2.514 2.666 2.73 3.06 3.189 3.437 3.679 3.916 4.027 4.244 4.445 4.729 4.915 5.104 5.392 5.665 5.925 6.198 6.471 6.802 7.1 7.397 7.77 8.136 8.496 8.904 9.366 9.848 10.393 10.956 11.561 12.217 12.973 13.87 14.786 15.859 17.086 18.572 20.251 22.253 24.761 27.86 30.442 31.992 32.983 33.645 34.143 34.495 34.702 34.834 34.948 35.022 35.062 35.068 35.074 35.053 35.009 34.947 34.866 34.789 34.71 34.629 34.556 34.471 34.381 34.303 34.213 34.111 34.01 33.92 33.853 33.757 33.599 33.5 33.395 33.342 33.228 33.086 32.951 32.876 32.619 32.653 32.566 32.457 32.183 32.031 31.887 31.724 31.534 31.283 30.969 30.204 -9 ,28231 ,KEBNE ,17040394,Thu Dec 23 00:24:24 CET,Thu Dec 23 02:08:52 CET,0.0 0.644 1.017 1.308 1.529 1.694 1.869 2.058 2.379 2.518 2.662 2.724 3.054 3.183 3.427 3.655 3.873 3.979 4.19 4.386 4.665 4.86 5.055 5.317 5.579 5.833 6.064 6.304 6.631 6.94 7.238 7.604 7.967 8.317 8.722 9.169 9.607 10.11 10.67 11.27 11.911 12.653 13.531 14.431 15.495 16.688 18.071 19.656 21.615 24.026 27.096 29.719 31.34 32.432 33.127 33.61 33.962 34.203 34.348 34.464 34.534 34.554 34.556 34.553 34.541 34.531 34.515 34.474 34.418 34.366 34.307 34.249 34.182 34.112 34.046 33.968 33.899 33.825 33.736 33.665 33.584 33.452 33.362 33.256 33.192 33.066 32.94 32.804 32.718 32.469 32.482 32.389 32.304 32.084 31.957 31.818 31.671 31.526 31.308 30.995 30.333 -10 ,19263 ,KEBNE ,17040395,Thu Dec 23 00:24:24 CET,Thu Dec 23 02:08:23 CET,0.0 0.526 0.87 1.11 1.306 1.496 1.685 1.87 2.194 2.342 2.484 2.539 2.874 2.994 3.238 3.48 3.71 3.82 4.043 4.24 4.517 4.712 4.906 5.2 5.48 5.745 6.001 6.25 6.578 6.887 7.178 7.546 7.931 8.302 8.706 9.143 9.581 10.104 10.672 11.289 11.958 12.701 13.565 14.437 15.485 16.67 18.032 19.637 21.578 23.944 27.047 29.814 31.486 32.576 33.32 33.827 34.164 34.382 34.475 34.54 34.614 34.678 34.724 34.746 34.751 34.743 34.717 34.676 34.635 34.574 34.464 34.356 34.238 34.094 33.991 33.885 33.76 33.655 33.542 33.458 33.379 33.238 33.139 33.034 32.966 32.823 32.682 32.518 32.434 32.178 32.143 32.035 31.916 31.624 31.473 31.328 31.182 31.011 30.781 30.455 29.699 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index 6ed11cc5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26702 ,KEBNE ,17040396,Thu Dec 23 00:26:26 CET,Thu Dec 23 02:10:46 CET,0.0 0.582 0.886 1.113 1.32 1.507 1.675 1.828 2.097 2.222 2.355 2.408 2.731 2.842 3.058 3.273 3.477 3.575 3.755 3.929 4.187 4.349 4.51 4.749 4.991 5.235 5.465 5.69 5.996 6.294 6.563 6.866 7.157 7.436 7.763 8.128 8.476 8.878 9.323 9.793 10.284 10.86 11.514 12.158 12.954 13.838 14.825 15.897 17.138 18.617 20.408 21.771 22.37 22.654 22.76 22.736 22.685 22.564 22.398 22.209 22.023 21.854 21.685 21.512 21.329 21.151 20.96 20.785 20.633 20.465 20.299 20.171 20.021 19.852 19.723 19.585 19.438 19.298 19.155 19.049 18.934 18.737 18.605 18.465 18.39 18.236 18.076 17.911 17.827 17.546 17.553 17.441 17.307 17.066 16.951 16.821 16.651 16.431 16.183 15.896 15.361 -2 ,17378 ,KEBNE ,17040397,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:10:58 CET,0.0 0.613 0.94 1.2 1.407 1.589 1.755 1.901 2.15 2.273 2.4 2.435 2.754 2.866 3.085 3.297 3.511 3.62 3.822 4.007 4.282 4.463 4.642 4.889 5.119 5.349 5.572 5.779 6.051 6.305 6.548 6.862 7.179 7.489 7.836 8.22 8.602 9.042 9.524 10.025 10.541 11.116 11.805 12.504 13.304 14.157 15.167 16.285 17.567 19.168 20.968 22.257 22.832 23.01 22.998 22.912 22.782 22.606 22.404 22.181 21.965 21.771 21.589 21.404 21.248 21.101 20.93 20.78 20.651 20.485 20.292 20.138 19.965 19.77 19.616 19.463 19.309 19.153 18.988 18.866 18.739 18.547 18.407 18.232 18.147 18.001 17.843 17.665 17.581 17.304 17.29 17.183 17.071 16.831 16.695 16.54 16.33 16.091 15.825 15.529 14.755 -3 ,1799 ,KEBNE ,17040398,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:11:01 CET,0.0 0.498 0.778 1.022 1.218 1.403 1.578 1.752 2.066 2.207 2.354 2.431 2.771 2.894 3.114 3.317 3.533 3.65 3.878 4.088 4.379 4.562 4.739 5.002 5.26 5.5 5.727 5.947 6.23 6.498 6.751 7.067 7.392 7.704 8.052 8.452 8.85 9.279 9.738 10.213 10.71 11.275 11.905 12.596 13.426 14.319 15.307 16.392 17.715 19.275 21.116 22.557 23.291 23.632 23.775 23.762 23.646 23.502 23.336 23.134 22.953 22.784 22.602 22.409 22.215 22.048 21.864 21.669 21.499 21.328 21.132 20.974 20.81 20.628 20.495 20.354 20.211 20.067 19.909 19.797 19.682 19.516 19.39 19.25 19.178 19.044 18.908 18.742 18.647 18.354 18.339 18.228 18.102 17.814 17.639 17.446 17.251 17.016 16.766 16.485 15.836 -4 ,28474 ,KEBNE ,17040399,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:09:18 CET,0.0 0.452 0.744 0.979 1.161 1.354 1.549 1.718 1.998 2.141 2.28 2.333 2.66 2.776 2.996 3.21 3.42 3.518 3.722 3.922 4.197 4.378 4.56 4.822 5.067 5.314 5.561 5.788 6.085 6.373 6.647 6.985 7.296 7.6 7.971 8.379 8.768 9.201 9.676 10.161 10.662 11.235 11.911 12.582 13.365 14.233 15.157 16.187 17.327 18.617 20.171 21.427 22.026 22.289 22.338 22.244 22.157 22.048 21.93 21.796 21.619 21.421 21.219 21.032 20.858 20.693 20.501 20.303 20.128 19.952 19.774 19.626 19.46 19.264 19.102 18.942 18.786 18.615 18.424 18.297 18.172 17.975 17.84 17.69 17.599 17.402 17.206 17.014 16.923 16.639 16.589 16.45 16.33 16.03 15.862 15.705 15.512 15.297 15.045 14.718 14.029 -5 ,27957 ,KEBNE ,17040400,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:09:12 CET,0.0 0.667 0.97 1.204 1.43 1.623 1.786 1.93 2.228 2.379 2.518 2.548 2.857 2.966 3.174 3.376 3.575 3.672 3.852 4.025 4.288 4.443 4.596 4.827 5.053 5.277 5.493 5.703 5.975 6.232 6.489 6.811 7.11 7.398 7.736 8.116 8.489 8.911 9.348 9.78 10.23 10.744 11.388 12.031 12.745 13.548 14.518 15.607 16.762 18.165 19.759 20.774 21.195 21.31 21.272 21.17 20.949 20.656 20.416 20.181 19.979 19.788 19.59 19.391 19.183 18.967 18.753 18.575 18.391 18.19 18.0 17.844 17.681 17.501 17.351 17.188 17.036 16.89 16.731 16.633 16.521 16.304 16.154 16.011 15.935 15.77 15.603 15.435 15.35 15.062 15.025 14.898 14.773 14.525 14.381 14.22 14.049 13.87 13.661 13.31 12.338 -6 ,11069 ,KEBNE ,17040401,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:08:55 CET,0.0 0.49 0.756 0.989 1.231 1.443 1.635 1.797 2.099 2.242 2.385 2.449 2.778 2.902 3.125 3.335 3.542 3.645 3.845 4.04 4.323 4.505 4.664 4.886 5.113 5.336 5.555 5.767 6.04 6.317 6.59 6.902 7.199 7.488 7.83 8.227 8.601 8.983 9.43 9.93 10.441 11.037 11.716 12.368 13.14 13.979 14.995 16.134 17.301 18.639 20.155 21.316 21.899 22.227 22.369 22.33 22.23 22.066 21.889 21.691 21.484 21.299 21.12 20.903 20.689 20.507 20.315 20.145 19.985 19.806 19.621 19.476 19.332 19.17 19.048 18.917 18.776 18.629 18.456 18.335 18.211 17.995 17.845 17.687 17.598 17.427 17.271 17.103 17.0 16.706 16.696 16.58 16.453 16.2 16.072 15.908 15.72 15.51 15.276 15.022 14.332 -7 ,19189 ,KEBNE ,17040402,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:10:43 CET,0.0 0.817 1.161 1.436 1.674 1.853 2.013 2.173 2.47 2.605 2.737 2.786 3.114 3.233 3.457 3.69 3.92 4.028 4.225 4.415 4.681 4.845 5.005 5.237 5.466 5.697 5.92 6.138 6.425 6.704 6.962 7.275 7.589 7.88 8.206 8.581 8.944 9.34 9.763 10.221 10.715 11.276 11.931 12.583 13.335 14.148 15.167 16.344 17.638 19.147 20.838 21.976 22.47 22.737 22.803 22.715 22.587 22.458 22.299 22.092 21.904 21.727 21.542 21.362 21.191 21.012 20.821 20.68 20.544 20.378 20.201 20.052 19.9 19.705 19.549 19.404 19.243 19.061 18.868 18.732 18.595 18.402 18.275 18.137 18.052 17.871 17.695 17.5 17.398 17.115 17.099 16.99 16.875 16.565 16.397 16.253 16.097 15.934 15.733 15.49 14.781 -8 ,24396 ,KEBNE ,17040403,Thu Dec 23 00:26:26 CET,Thu Dec 23 02:08:53 CET,0.0 0.768 1.057 1.27 1.434 1.599 1.772 1.946 2.251 2.385 2.525 2.578 2.896 3.01 3.24 3.457 3.669 3.774 3.974 4.17 4.45 4.632 4.804 5.061 5.326 5.585 5.844 6.086 6.379 6.658 6.936 7.266 7.58 7.887 8.243 8.66 9.057 9.478 9.919 10.388 10.883 11.416 12.026 12.662 13.39 14.194 15.141 16.184 17.343 18.631 20.157 21.267 21.725 21.937 22.044 22.085 21.986 21.803 21.643 21.47 21.309 21.155 20.982 20.805 20.61 20.433 20.259 20.098 19.956 19.782 19.574 19.41 19.263 19.093 18.952 18.815 18.665 18.505 18.332 18.208 18.09 17.9 17.761 17.623 17.555 17.411 17.249 17.086 17.002 16.731 16.737 16.642 16.537 16.271 16.108 15.932 15.735 15.513 15.281 15.009 14.336 -9 ,23176 ,KEBNE ,17040404,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:09:21 CET,0.0 0.46 0.692 0.899 1.112 1.312 1.486 1.664 1.985 2.132 2.266 2.302 2.625 2.732 2.959 3.185 3.403 3.511 3.709 3.882 4.141 4.322 4.509 4.778 5.025 5.264 5.499 5.74 6.062 6.359 6.651 7.005 7.336 7.668 8.046 8.457 8.862 9.308 9.788 10.312 10.865 11.47 12.14 12.794 13.588 14.526 15.613 16.805 18.157 19.749 21.654 23.072 23.721 24.062 24.179 24.099 23.972 23.861 23.725 23.555 23.409 23.269 23.127 22.987 22.83 22.662 22.497 22.362 22.242 22.098 21.935 21.797 21.646 21.505 21.401 21.274 21.133 20.989 20.842 20.742 20.641 20.469 20.338 20.195 20.121 19.978 19.824 19.651 19.56 19.268 19.218 19.095 18.974 18.714 18.576 18.412 18.215 18.013 17.751 17.39 16.59 -10 ,28815 ,KEBNE ,17040405,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:09:50 CET,0.0 0.51 0.775 1.008 1.193 1.377 1.566 1.724 1.999 2.126 2.247 2.286 2.609 2.726 2.954 3.162 3.365 3.466 3.671 3.876 4.168 4.354 4.526 4.77 5.011 5.238 5.451 5.666 5.943 6.199 6.456 6.802 7.131 7.427 7.791 8.226 8.63 9.06 9.53 10.024 10.526 11.075 11.751 12.426 13.219 14.136 15.177 16.315 17.599 19.133 20.995 22.125 22.609 22.863 22.945 22.991 22.954 22.841 22.68 22.473 22.274 22.099 21.935 21.749 21.577 21.435 21.277 21.128 20.974 20.792 20.613 20.47 20.315 20.164 20.045 19.908 19.767 19.618 19.462 19.343 19.215 19.048 18.936 18.787 18.706 18.563 18.408 18.219 18.11 17.81 17.798 17.687 17.562 17.288 17.133 16.983 16.827 16.627 16.392 16.097 15.147 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt deleted file mode 100644 index caa4f4af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19374 ,TETRA ,17976601,Tue Dec 21 04:05:54 CET,Tue Dec 21 06:25:06 CET,0.0 0.71 1.075 1.379 1.612 1.786 1.985 2.176 2.504 2.656 2.794 2.76 3.177 3.296 3.523 3.73 3.947 4.059 4.267 4.454 4.708 4.862 5.019 5.269 5.507 5.73 5.945 6.152 6.416 6.665 6.896 7.193 7.483 7.748 8.057 8.401 8.723 9.098 9.509 9.963 10.448 10.967 11.572 12.163 12.836 13.554 14.328 15.183 16.123 17.11 18.164 18.719 18.654 18.45 18.251 18.068 17.883 17.65 17.415 17.125 16.856 16.6 16.326 16.065 15.812 15.561 15.291 15.052 14.844 14.63 14.403 14.21 13.996 13.763 13.587 13.415 13.243 13.06 12.868 12.736 12.59 12.357 12.207 12.046 11.962 11.807 11.636 11.457 11.372 11.004 11.074 10.961 10.843 10.549 10.383 10.213 10.027 9.822 9.596 9.336 8.527 -2 ,14296 ,TETRA ,17976603,Tue Dec 21 04:53:28 CET,Tue Dec 21 07:14:39 CET,0.0 0.636 0.946 1.166 1.359 1.553 1.741 1.9 2.185 2.323 2.459 2.415 2.818 2.929 3.142 3.346 3.527 3.614 3.805 3.991 4.23 4.376 4.523 4.741 4.958 5.186 5.409 5.611 5.875 6.137 6.384 6.694 6.998 7.283 7.612 7.981 8.33 8.7 9.081 9.463 9.871 10.357 10.923 11.471 12.079 12.761 13.533 14.325 15.196 16.127 16.986 17.338 17.225 16.975 16.686 16.364 16.048 15.749 15.506 15.256 15.004 14.75 14.452 14.145 13.858 13.589 13.304 13.037 12.803 12.56 12.319 12.123 11.924 11.717 11.556 11.387 11.193 11.0 10.807 10.67 10.522 10.285 10.135 9.982 9.892 9.716 9.541 9.364 9.268 8.884 8.976 8.88 8.77 8.548 8.441 8.306 8.135 7.946 7.741 7.477 6.772 -3 ,19464 ,TETRA ,17976605,Tue Dec 21 04:53:30 CET,Tue Dec 21 07:15:57 CET,0.0 0.827 1.192 1.48 1.739 1.965 2.174 2.356 2.668 2.803 2.952 2.933 3.333 3.436 3.655 3.882 4.076 4.165 4.35 4.537 4.802 4.975 5.157 5.425 5.664 5.9 6.124 6.328 6.586 6.834 7.072 7.356 7.635 7.908 8.238 8.607 8.941 9.306 9.708 10.147 10.604 11.126 11.758 12.386 13.103 13.847 14.675 15.602 16.526 17.476 18.436 18.757 18.509 18.066 17.709 17.418 17.131 16.851 16.595 16.314 16.039 15.789 15.556 15.317 15.103 14.893 14.632 14.382 14.157 13.922 13.681 13.497 13.323 13.132 12.972 12.815 12.655 12.48 12.3 12.175 12.044 11.85 11.724 11.584 11.508 11.343 11.182 11.011 10.912 10.527 10.595 10.501 10.394 10.123 9.973 9.796 9.608 9.433 9.222 8.984 8.385 -4 ,12609 ,TETRA ,17976608,Tue Dec 21 04:54:28 CET,Tue Dec 21 07:10:57 CET,0.0 1.052 1.419 1.679 1.905 2.118 2.314 2.481 2.774 2.918 3.059 3.025 3.451 3.57 3.786 4.004 4.233 4.338 4.532 4.713 4.965 5.126 5.29 5.54 5.791 6.023 6.226 6.431 6.704 6.953 7.185 7.48 7.766 8.041 8.367 8.711 9.06 9.435 9.79 10.199 10.653 11.18 11.786 12.374 13.034 13.741 14.548 15.438 16.415 17.362 18.197 18.553 18.555 18.392 18.096 17.769 17.5 17.235 16.976 16.7 16.456 16.215 15.969 15.741 15.512 15.249 14.975 14.762 14.575 14.384 14.175 14.003 13.825 13.641 13.501 13.336 13.157 12.972 12.766 12.622 12.471 12.221 12.057 11.902 11.827 11.673 11.506 11.316 11.213 10.832 10.919 10.806 10.695 10.424 10.257 10.103 9.955 9.793 9.554 9.249 8.467 -5 ,28443 ,TETRA ,17976610,Tue Dec 21 04:54:29 CET,Tue Dec 21 07:13:57 CET,0.0 0.927 1.307 1.578 1.807 2.037 2.235 2.42 2.716 2.845 2.975 2.923 3.336 3.462 3.703 3.91 4.099 4.192 4.361 4.524 4.775 4.939 5.102 5.334 5.56 5.765 5.961 6.154 6.385 6.615 6.843 7.125 7.411 7.689 8.001 8.346 8.679 9.05 9.458 9.888 10.333 10.823 11.392 11.988 12.634 13.321 14.12 14.977 15.875 16.773 17.76 18.242 18.154 17.928 17.724 17.48 17.152 16.816 16.543 16.263 16.027 15.821 15.599 15.361 15.139 14.938 14.718 14.516 14.338 14.135 13.912 13.72 13.499 13.258 13.081 12.915 12.741 12.552 12.359 12.223 12.085 11.868 11.709 11.545 11.464 11.294 11.117 10.917 10.806 10.423 10.489 10.38 10.279 10.053 9.931 9.799 9.623 9.43 9.202 8.888 7.949 -6 ,4104 ,TETRA ,17976613,Tue Dec 21 04:54:29 CET,Tue Dec 21 07:16:39 CET,0.0 0.907 1.219 1.452 1.657 1.849 2.044 2.199 2.479 2.619 2.75 2.711 3.123 3.235 3.444 3.662 3.859 3.95 4.143 4.347 4.659 4.856 5.028 5.274 5.513 5.731 5.941 6.153 6.425 6.683 6.942 7.248 7.528 7.796 8.104 8.452 8.782 9.164 9.597 10.047 10.526 11.056 11.679 12.332 13.079 13.9 14.824 15.742 16.639 17.584 18.528 19.021 19.074 18.968 18.76 18.536 18.319 18.068 17.798 17.509 17.263 17.03 16.811 16.599 16.388 16.206 16.017 15.824 15.67 15.51 15.334 15.188 15.027 14.854 14.709 14.562 14.429 14.294 14.146 14.047 13.947 13.767 13.641 13.507 13.439 13.305 13.161 13.016 12.931 12.559 12.639 12.533 12.412 12.173 12.041 11.903 11.752 11.579 11.403 11.185 10.624 -7 ,24056 ,TETRA ,17976616,Tue Dec 21 04:55:31 CET,Tue Dec 21 07:18:14 CET,0.0 0.864 1.179 1.403 1.63 1.839 2.036 2.216 2.543 2.67 2.784 2.717 3.123 3.243 3.491 3.719 3.936 4.043 4.229 4.4 4.666 4.84 5.004 5.234 5.448 5.651 5.857 6.06 6.328 6.595 6.849 7.159 7.452 7.719 8.027 8.372 8.706 9.054 9.418 9.845 10.287 10.756 11.298 11.842 12.508 13.249 14.011 14.829 15.759 16.69 17.579 17.997 17.967 17.756 17.448 17.096 16.786 16.498 16.221 15.924 15.661 15.416 15.146 14.889 14.657 14.406 14.142 13.914 13.708 13.493 13.28 13.101 12.906 12.688 12.516 12.348 12.175 11.997 11.811 11.671 11.516 11.282 11.132 10.981 10.908 10.749 10.568 10.37 10.264 9.88 9.956 9.84 9.724 9.451 9.297 9.134 8.972 8.786 8.545 8.283 7.6 -8 ,23152 ,TETRA ,17976618,Tue Dec 21 05:01:30 CET,Tue Dec 21 07:19:55 CET,0.0 0.74 1.127 1.488 1.776 2.003 2.203 2.393 2.767 2.937 3.09 3.106 3.543 3.667 3.9 4.112 4.324 4.423 4.621 4.812 5.071 5.24 5.404 5.63 5.843 6.057 6.279 6.488 6.731 6.979 7.215 7.493 7.775 8.043 8.341 8.678 9.005 9.366 9.77 10.223 10.714 11.262 11.899 12.489 13.098 13.81 14.623 15.458 16.483 17.578 18.648 19.308 19.389 19.23 19.064 18.828 18.53 18.266 18.007 17.68 17.364 17.099 16.845 16.568 16.287 16.038 15.803 15.602 15.423 15.237 15.043 14.874 14.694 14.503 14.352 14.179 14.004 13.837 13.652 13.53 13.408 13.211 13.055 12.884 12.806 12.656 12.486 12.302 12.207 11.836 11.912 11.799 11.693 11.467 11.338 11.192 11.012 10.785 10.542 10.321 9.87 -9 ,15699 ,TETRA ,17976621,Tue Dec 21 05:03:29 CET,Tue Dec 21 07:24:55 CET,0.0 0.742 1.105 1.398 1.677 1.895 2.066 2.227 2.535 2.673 2.799 2.757 3.183 3.318 3.569 3.773 3.962 4.059 4.258 4.455 4.741 4.914 5.083 5.325 5.547 5.763 5.987 6.196 6.452 6.717 6.979 7.281 7.572 7.864 8.201 8.577 8.905 9.253 9.627 10.019 10.444 10.932 11.518 12.099 12.757 13.467 14.254 15.094 15.952 16.862 17.694 18.108 18.141 17.968 17.734 17.449 17.11 16.796 16.53 16.237 15.98 15.754 15.501 15.238 15.001 14.766 14.503 14.254 14.032 13.804 13.586 13.419 13.227 13.012 12.846 12.669 12.481 12.29 12.079 11.924 11.768 11.529 11.367 11.204 11.117 10.936 10.746 10.533 10.421 10.021 10.062 9.931 9.787 9.485 9.323 9.163 8.981 8.779 8.531 8.158 7.163 -10 ,25144 ,TETRA ,17976624,Tue Dec 21 03:41:48 CET,Tue Dec 21 05:57:31 CET,0.0 1.132 1.552 1.856 2.065 2.243 2.408 2.543 2.816 2.961 3.101 3.075 3.501 3.623 3.847 4.065 4.289 4.392 4.586 4.78 5.059 5.232 5.406 5.648 5.885 6.127 6.349 6.572 6.859 7.121 7.368 7.65 7.933 8.236 8.593 8.985 9.359 9.73 10.13 10.596 11.05 11.539 12.11 12.661 13.313 14.012 14.796 15.584 16.449 17.482 18.476 18.968 18.979 18.831 18.615 18.327 18.04 17.773 17.484 17.154 16.836 16.518 16.234 15.972 15.733 15.502 15.232 14.977 14.755 14.541 14.334 14.161 13.971 13.763 13.605 13.438 13.274 13.088 12.879 12.751 12.629 12.428 12.28 12.118 12.034 11.876 11.711 11.536 11.439 11.06 11.122 11.017 10.911 10.673 10.543 10.398 10.217 9.967 9.699 9.386 8.454 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt deleted file mode 100644 index cdf48026..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30996 ,KEBNE ,17040406,Thu Dec 23 00:26:30 CET,Thu Dec 23 02:09:12 CET,0.0 0.517 0.828 1.078 1.316 1.553 1.777 1.995 2.413 2.612 2.812 2.919 3.364 3.548 3.888 4.218 4.532 4.691 5.006 5.298 5.728 6.015 6.295 6.708 7.122 7.532 7.935 8.324 8.811 9.273 9.732 10.296 10.829 11.353 11.985 12.705 13.408 14.204 15.09 16.042 17.06 18.26 19.698 21.169 22.948 25.019 27.53 30.542 34.331 39.163 45.654 51.698 55.671 58.528 60.64 62.266 63.533 64.57 65.361 66.061 66.609 67.057 67.453 67.801 68.092 68.325 68.554 68.734 68.858 68.978 69.107 69.205 69.29 69.37 69.422 69.467 69.506 69.534 69.537 69.537 69.548 69.553 69.543 69.523 69.519 69.51 69.483 69.451 69.436 69.216 69.358 69.328 69.28 69.158 69.077 68.993 68.917 68.81 68.67 68.504 67.996 -2 ,30813 ,KEBNE ,17040407,Thu Dec 23 00:26:26 CET,Thu Dec 23 02:10:26 CET,0.0 0.511 0.828 1.095 1.327 1.535 1.735 1.945 2.335 2.519 2.702 2.786 3.22 3.39 3.721 4.036 4.341 4.491 4.78 5.059 5.47 5.748 6.029 6.457 6.888 7.312 7.725 8.119 8.629 9.122 9.589 10.147 10.703 11.26 11.91 12.65 13.367 14.173 15.072 16.045 17.091 18.302 19.757 21.261 23.07 25.163 27.688 30.713 34.477 39.235 45.591 51.606 55.646 58.515 60.61 62.198 63.432 64.462 65.272 66.0 66.543 66.98 67.361 67.696 67.975 68.198 68.401 68.579 68.735 68.873 68.999 69.091 69.169 69.247 69.29 69.325 69.361 69.379 69.397 69.411 69.416 69.411 69.394 69.365 69.34 69.277 69.214 69.144 69.108 68.882 69.02 68.98 68.928 68.805 68.732 68.653 68.557 68.45 68.332 68.141 67.796 -3 ,12526 ,KEBNE ,17040408,Thu Dec 23 00:26:26 CET,Thu Dec 23 02:10:15 CET,0.0 0.484 0.836 1.095 1.319 1.556 1.795 2.011 2.404 2.588 2.77 2.843 3.27 3.43 3.747 4.055 4.344 4.486 4.769 5.05 5.455 5.722 5.988 6.365 6.742 7.12 7.487 7.84 8.309 8.775 9.218 9.753 10.283 10.803 11.428 12.164 12.907 13.731 14.635 15.613 16.661 17.877 19.353 20.891 22.716 24.815 27.378 30.423 34.2 39.018 45.444 51.505 55.551 58.425 60.533 62.173 63.432 64.439 65.219 65.934 66.471 66.899 67.297 67.641 67.918 68.123 68.319 68.494 68.633 68.76 68.878 68.971 69.058 69.128 69.173 69.21 69.241 69.265 69.281 69.281 69.278 69.261 69.224 69.19 69.18 69.152 69.112 69.06 69.033 68.809 68.956 68.918 68.866 68.741 68.674 68.597 68.495 68.385 68.208 67.965 67.497 -4 ,2932 ,KEBNE ,17040409,Thu Dec 23 00:26:26 CET,Thu Dec 23 02:10:08 CET,0.0 0.511 0.823 1.099 1.3 1.501 1.708 1.916 2.306 2.475 2.636 2.706 3.148 3.302 3.589 3.878 4.154 4.29 4.568 4.851 5.264 5.528 5.794 6.194 6.573 6.948 7.32 7.675 8.134 8.577 9.017 9.573 10.114 10.638 11.275 12.01 12.713 13.495 14.351 15.296 16.334 17.522 18.953 20.464 22.323 24.447 26.969 29.988 33.765 38.563 45.029 51.192 55.297 58.204 60.334 61.969 63.204 64.199 64.96 65.631 66.162 66.621 67.037 67.382 67.672 67.924 68.169 68.348 68.495 68.635 68.76 68.855 68.943 69.025 69.08 69.129 69.169 69.211 69.246 69.26 69.271 69.288 69.281 69.259 69.248 69.223 69.176 69.127 69.101 68.872 68.985 68.941 68.896 68.781 68.707 68.614 68.525 68.433 68.253 67.984 67.506 -5 ,29101 ,KEBNE ,17040410,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:11:06 CET,0.0 0.467 0.785 1.063 1.291 1.515 1.726 1.932 2.314 2.494 2.678 2.761 3.199 3.377 3.704 4.007 4.304 4.451 4.738 5.007 5.402 5.666 5.925 6.312 6.698 7.071 7.429 7.78 8.241 8.695 9.147 9.686 10.221 10.762 11.377 12.081 12.792 13.581 14.434 15.371 16.392 17.582 19.03 20.541 22.36 24.452 26.961 30.001 33.829 38.615 44.975 51.018 55.056 57.968 60.113 61.737 62.999 64.057 64.86 65.561 66.123 66.583 66.991 67.352 67.656 67.898 68.125 68.319 68.47 68.615 68.762 68.862 68.951 69.033 69.089 69.146 69.19 69.213 69.231 69.245 69.258 69.27 69.275 69.265 69.252 69.22 69.185 69.165 69.154 68.933 69.077 69.042 68.988 68.852 68.771 68.686 68.615 68.527 68.411 68.307 67.946 -6 ,17744 ,KEBNE ,17040411,Thu Dec 23 00:26:26 CET,Thu Dec 23 02:10:15 CET,0.0 0.891 1.251 1.567 1.864 2.11 2.319 2.544 2.973 3.177 3.369 3.482 3.931 4.109 4.454 4.77 5.077 5.227 5.513 5.793 6.192 6.462 6.738 7.139 7.517 7.884 8.252 8.612 9.069 9.524 9.986 10.562 11.132 11.681 12.305 13.031 13.754 14.562 15.461 16.436 17.474 18.686 20.171 21.73 23.611 25.766 28.35 31.399 35.178 39.989 46.322 52.254 56.238 59.121 61.268 62.936 64.257 65.313 66.103 66.794 67.333 67.785 68.184 68.527 68.829 69.089 69.319 69.504 69.649 69.779 69.885 69.95 70.019 70.085 70.132 70.172 70.202 70.227 70.241 70.247 70.25 70.249 70.228 70.181 70.163 70.139 70.091 70.029 69.993 69.754 69.857 69.808 69.764 69.643 69.577 69.514 69.425 69.282 69.09 68.845 68.291 -7 ,23144 ,KEBNE ,17040412,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:09:31 CET,0.0 0.674 0.975 1.236 1.506 1.741 1.965 2.193 2.621 2.816 3.008 3.115 3.55 3.723 4.055 4.372 4.674 4.825 5.126 5.428 5.868 6.148 6.428 6.835 7.229 7.626 8.018 8.395 8.87 9.352 9.834 10.4 10.955 11.502 12.137 12.857 13.557 14.359 15.265 16.227 17.253 18.461 19.921 21.449 23.278 25.377 27.903 30.901 34.64 39.331 45.555 51.445 55.387 58.185 60.215 61.786 62.998 63.987 64.752 65.452 65.967 66.362 66.733 67.058 67.322 67.537 67.739 67.909 68.043 68.16 68.261 68.33 68.402 68.475 68.508 68.539 68.579 68.606 68.625 68.63 68.64 68.626 68.595 68.575 68.564 68.54 68.5 68.45 68.414 68.176 68.294 68.239 68.182 68.069 68.002 67.939 67.851 67.713 67.592 67.456 66.896 -8 ,24440 ,KEBNE ,17040413,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:10:26 CET,0.0 0.702 1.054 1.337 1.605 1.852 2.086 2.308 2.717 2.911 3.109 3.203 3.633 3.807 4.139 4.455 4.766 4.918 5.227 5.533 5.973 6.253 6.528 6.937 7.334 7.722 8.099 8.452 8.911 9.359 9.8 10.346 10.887 11.415 12.032 12.756 13.475 14.276 15.15 16.099 17.132 18.335 19.789 21.315 23.136 25.231 27.765 30.812 34.61 39.358 45.754 51.742 55.66 58.464 60.555 62.199 63.457 64.448 65.223 65.929 66.468 66.91 67.301 67.63 67.915 68.158 68.382 68.562 68.687 68.793 68.896 68.976 69.056 69.132 69.179 69.221 69.258 69.284 69.309 69.322 69.335 69.352 69.345 69.329 69.322 69.307 69.29 69.264 69.251 69.036 69.174 69.126 69.078 68.988 68.937 68.873 68.786 68.665 68.547 68.42 67.853 -9 ,13390 ,KEBNE ,17040414,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:09:37 CET,0.0 0.832 1.244 1.591 1.872 2.143 2.392 2.612 3.068 3.271 3.463 3.565 4.01 4.183 4.504 4.812 5.113 5.262 5.567 5.868 6.297 6.559 6.807 7.181 7.554 7.922 8.296 8.666 9.142 9.618 10.105 10.698 11.267 11.83 12.484 13.254 14.025 14.869 15.786 16.778 17.83 19.056 20.513 22.026 23.879 26.006 28.539 31.534 35.311 40.151 46.652 52.781 56.831 59.737 61.88 63.527 64.783 65.798 66.589 67.259 67.766 68.219 68.623 68.955 69.232 69.465 69.678 69.851 70.005 70.142 70.257 70.346 70.44 70.524 70.57 70.61 70.643 70.669 70.681 70.678 70.666 70.63 70.603 70.578 70.569 70.531 70.478 70.437 70.411 70.183 70.326 70.285 70.226 70.039 69.944 69.866 69.799 69.714 69.596 69.435 69.159 -10 ,2340 ,KEBNE ,17040415,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:09:41 CET,0.0 1.052 1.372 1.648 1.879 2.106 2.311 2.492 2.842 3.02 3.198 3.274 3.716 3.883 4.202 4.529 4.847 5.003 5.306 5.595 6.012 6.289 6.57 6.989 7.395 7.788 8.168 8.54 9.032 9.519 9.999 10.581 11.152 11.718 12.391 13.173 13.938 14.775 15.706 16.73 17.807 19.047 20.556 22.13 24.027 26.22 28.843 31.963 35.86 40.753 47.177 53.145 57.101 59.983 62.135 63.785 65.046 66.033 66.797 67.502 68.05 68.499 68.894 69.234 69.512 69.73 69.937 70.118 70.263 70.384 70.487 70.567 70.644 70.722 70.78 70.822 70.856 70.873 70.882 70.887 70.878 70.869 70.867 70.86 70.855 70.828 70.786 70.747 70.718 70.495 70.632 70.585 70.547 70.454 70.374 70.289 70.221 70.137 70.025 69.876 69.566 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt deleted file mode 100644 index fc29bef8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19121 ,KEBNE ,17040418,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:09:44 CET,0.0 0.701 1.063 1.352 1.604 1.861 2.112 2.334 2.786 3.003 3.21 3.32 3.769 3.956 4.326 4.675 5.017 5.188 5.52 5.851 6.354 6.692 7.024 7.505 7.983 8.458 8.92 9.38 9.996 10.591 11.16 11.849 12.528 13.221 14.056 15.015 15.959 17.019 18.21 19.509 20.882 22.477 24.398 26.398 28.809 31.608 35.018 39.072 44.145 50.701 59.725 68.294 74.082 78.296 81.467 84.01 86.026 87.671 88.949 90.098 90.995 91.737 92.389 92.972 93.479 93.897 94.31 94.654 94.931 95.187 95.439 95.65 95.839 96.016 96.146 96.274 96.405 96.525 96.635 96.702 96.761 96.838 96.882 96.914 96.924 96.934 96.948 96.956 96.959 96.783 96.919 96.888 96.848 96.756 96.708 96.646 96.573 96.481 96.347 96.171 95.748 -2 ,12923 ,KEBNE ,17040419,Thu Dec 23 00:26:26 CET,Thu Dec 23 02:09:44 CET,0.0 0.579 0.876 1.173 1.462 1.713 1.933 2.162 2.587 2.778 2.978 3.109 3.558 3.737 4.102 4.472 4.833 4.998 5.325 5.655 6.141 6.468 6.791 7.258 7.716 8.172 8.628 9.081 9.684 10.254 10.803 11.481 12.154 12.822 13.615 14.538 15.427 16.405 17.505 18.718 20.034 21.579 23.462 25.451 27.853 30.634 33.999 38.079 43.177 49.713 58.733 67.281 73.068 77.287 80.434 82.955 84.941 86.551 87.805 88.951 89.872 90.633 91.311 91.897 92.392 92.811 93.214 93.566 93.855 94.121 94.372 94.563 94.762 94.95 95.075 95.195 95.3 95.397 95.488 95.534 95.58 95.663 95.705 95.732 95.747 95.773 95.796 95.798 95.801 95.627 95.789 95.778 95.768 95.727 95.695 95.657 95.608 95.551 95.488 95.421 95.124 -3 ,1423 ,KEBNE ,17040421,Thu Dec 23 00:26:26 CET,Thu Dec 23 02:09:54 CET,0.0 0.716 1.106 1.431 1.738 2.011 2.277 2.544 3.044 3.262 3.468 3.595 4.051 4.245 4.61 4.954 5.298 5.466 5.797 6.129 6.612 6.929 7.25 7.726 8.209 8.679 9.122 9.559 10.137 10.719 11.299 12.01 12.7 13.373 14.174 15.12 16.042 17.04 18.135 19.327 20.627 22.16 24.032 25.999 28.373 31.136 34.505 38.554 43.604 50.121 59.1 67.69 73.478 77.673 80.872 83.416 85.4 87.028 88.298 89.46 90.371 91.115 91.772 92.348 92.854 93.288 93.711 94.07 94.366 94.63 94.881 95.083 95.273 95.449 95.567 95.691 95.812 95.908 95.992 96.051 96.102 96.155 96.186 96.221 96.239 96.26 96.28 96.292 96.281 96.085 96.192 96.172 96.147 96.086 96.045 96.007 95.958 95.881 95.783 95.653 95.374 -4 ,29997 ,KEBNE ,17040422,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:09:02 CET,0.0 0.733 1.207 1.585 1.865 2.118 2.355 2.59 3.044 3.255 3.456 3.574 4.028 4.215 4.587 4.95 5.299 5.471 5.822 6.161 6.667 7.003 7.324 7.801 8.277 8.742 9.191 9.635 10.211 10.772 11.334 12.04 12.738 13.424 14.228 15.125 16.001 16.997 18.099 19.35 20.744 22.368 24.307 26.324 28.775 31.614 35.059 39.148 44.272 50.896 59.921 68.484 74.26 78.505 81.679 84.148 86.058 87.618 88.849 89.958 90.847 91.596 92.267 92.86 93.366 93.804 94.23 94.566 94.84 95.11 95.368 95.574 95.778 95.964 96.093 96.216 96.327 96.424 96.507 96.555 96.598 96.669 96.711 96.732 96.731 96.726 96.721 96.694 96.681 96.495 96.613 96.579 96.536 96.438 96.389 96.296 96.166 96.043 95.865 95.56 95.122 -5 ,24946 ,KEBNE ,17040424,Thu Dec 23 00:26:27 CET,Thu Dec 23 02:11:04 CET,0.0 0.716 1.135 1.51 1.815 2.067 2.295 2.499 2.957 3.203 3.425 3.556 4.017 4.209 4.59 4.964 5.337 5.523 5.876 6.219 6.729 7.063 7.383 7.852 8.327 8.803 9.264 9.722 10.328 10.912 11.487 12.214 12.925 13.609 14.428 15.377 16.304 17.346 18.487 19.74 21.112 22.701 24.6 26.559 28.967 31.76 35.139 39.235 44.406 50.995 59.902 68.439 74.195 78.387 81.545 84.064 86.022 87.604 88.86 90.018 90.931 91.672 92.335 92.927 93.431 93.859 94.285 94.61 94.859 95.132 95.39 95.584 95.767 95.943 96.083 96.223 96.354 96.471 96.575 96.633 96.674 96.727 96.781 96.836 96.852 96.866 96.898 96.93 96.927 96.746 96.909 96.903 96.89 96.826 96.78 96.733 96.683 96.61 96.509 96.361 96.071 -6 ,30103 ,KEBNE ,17040425,Thu Dec 23 00:27:30 CET,Thu Dec 23 02:11:16 CET,0.0 0.633 1.028 1.356 1.667 1.942 2.197 2.459 2.919 3.12 3.33 3.457 3.899 4.079 4.451 4.809 5.138 5.298 5.63 5.962 6.436 6.747 7.063 7.514 7.953 8.398 8.824 9.255 9.841 10.412 10.972 11.648 12.309 12.971 13.756 14.653 15.525 16.504 17.595 18.798 20.126 21.693 23.594 25.564 27.922 30.668 34.031 38.112 43.277 49.939 58.969 67.539 73.334 77.575 80.764 83.297 85.269 86.862 88.125 89.273 90.194 90.944 91.61 92.197 92.687 93.106 93.497 93.837 94.13 94.399 94.654 94.847 95.034 95.208 95.323 95.426 95.532 95.628 95.698 95.757 95.809 95.863 95.891 95.916 95.932 95.942 95.94 95.941 95.93 95.748 95.897 95.882 95.853 95.76 95.694 95.62 95.55 95.466 95.363 95.253 94.488 -7 ,16163 ,KEBNE ,17040426,Thu Dec 23 00:27:30 CET,Thu Dec 23 02:10:55 CET,0.0 0.705 1.069 1.352 1.614 1.869 2.097 2.316 2.734 2.935 3.146 3.3 3.763 3.964 4.358 4.739 5.11 5.287 5.64 6.0 6.53 6.875 7.215 7.711 8.203 8.702 9.196 9.674 10.287 10.877 11.451 12.155 12.847 13.509 14.273 15.158 16.065 17.101 18.199 19.402 20.749 22.322 24.197 26.156 28.566 31.361 34.712 38.732 43.771 50.226 59.015 67.471 73.177 77.309 80.443 82.921 84.868 86.414 87.601 88.703 89.559 90.262 90.894 91.435 91.897 92.263 92.609 92.921 93.175 93.42 93.636 93.786 93.936 94.079 94.175 94.275 94.372 94.456 94.522 94.564 94.607 94.638 94.653 94.677 94.687 94.699 94.707 94.715 94.711 94.525 94.655 94.639 94.615 94.517 94.453 94.367 94.275 94.163 93.992 93.747 92.91 -8 ,21589 ,KEBNE ,17040428,Thu Dec 23 00:27:30 CET,Thu Dec 23 02:10:17 CET,0.0 0.501 0.81 1.148 1.455 1.714 1.955 2.196 2.644 2.855 3.07 3.216 3.667 3.847 4.207 4.564 4.909 5.081 5.426 5.767 6.252 6.575 6.901 7.367 7.832 8.307 8.781 9.241 9.838 10.421 10.974 11.653 12.325 12.996 13.819 14.764 15.671 16.713 17.898 19.174 20.526 22.073 23.962 25.938 28.307 31.109 34.526 38.603 43.736 50.36 59.415 68.133 74.029 78.268 81.442 83.918 85.812 87.392 88.656 89.788 90.685 91.436 92.104 92.693 93.192 93.605 93.993 94.319 94.579 94.819 95.05 95.244 95.445 95.618 95.745 95.874 95.996 96.125 96.241 96.305 96.36 96.431 96.454 96.473 96.489 96.512 96.531 96.536 96.535 96.363 96.536 96.522 96.498 96.439 96.411 96.356 96.276 96.167 96.005 95.826 95.374 -9 ,8830 ,KEBNE ,17040429,Thu Dec 23 00:27:30 CET,Thu Dec 23 02:11:07 CET,0.0 0.909 1.319 1.64 1.916 2.186 2.458 2.706 3.177 3.397 3.599 3.715 4.164 4.361 4.775 5.165 5.543 5.726 6.085 6.439 6.945 7.267 7.583 8.059 8.515 8.944 9.373 9.794 10.337 10.885 11.424 12.084 12.741 13.401 14.181 15.067 15.947 16.942 18.038 19.235 20.539 22.072 23.939 25.901 28.252 30.987 34.327 38.34 43.387 49.855 58.653 67.009 72.605 76.657 79.733 82.162 84.037 85.565 86.762 87.859 88.749 89.493 90.15 90.727 91.196 91.583 91.958 92.264 92.526 92.779 93.033 93.237 93.418 93.584 93.696 93.808 93.927 94.031 94.114 94.167 94.213 94.278 94.317 94.341 94.353 94.366 94.375 94.383 94.372 94.182 94.327 94.307 94.287 94.22 94.187 94.156 94.091 94.015 93.922 93.724 93.318 -10 ,30607 ,KEBNE ,17040431,Thu Dec 23 00:27:30 CET,Thu Dec 23 02:13:07 CET,0.0 0.564 0.913 1.21 1.471 1.714 1.962 2.212 2.677 2.893 3.102 3.268 3.741 3.932 4.286 4.648 5.006 5.183 5.528 5.858 6.351 6.672 6.987 7.449 7.898 8.331 8.758 9.182 9.744 10.304 10.853 11.537 12.219 12.905 13.731 14.672 15.587 16.616 17.754 18.973 20.255 21.772 23.648 25.612 27.999 30.773 34.148 38.22 43.298 49.861 58.891 67.577 73.452 77.718 80.934 83.466 85.434 87.041 88.311 89.491 90.418 91.175 91.86 92.464 92.976 93.418 93.857 94.217 94.506 94.778 95.028 95.222 95.411 95.596 95.73 95.856 95.977 96.094 96.195 96.253 96.311 96.377 96.417 96.449 96.465 96.495 96.513 96.533 96.532 96.352 96.527 96.517 96.498 96.449 96.405 96.327 96.237 96.146 96.047 95.93 95.271 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 11d8ee66..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7448 ,KEBNE ,17040433,Thu Dec 23 00:27:30 CET,Thu Dec 23 02:10:40 CET,0.0 0.505 0.709 0.886 1.048 1.204 1.358 1.501 1.772 1.902 2.025 2.084 2.371 2.473 2.67 2.87 3.048 3.127 3.282 3.441 3.657 3.795 3.949 4.166 4.36 4.555 4.752 4.928 5.152 5.38 5.597 5.863 6.112 6.34 6.602 6.894 7.191 7.515 7.865 8.236 8.597 9.003 9.506 10.003 10.568 11.172 11.83 12.559 13.33 14.105 14.923 15.347 15.399 15.325 15.179 14.988 14.763 14.527 14.284 14.001 13.759 13.556 13.353 13.141 12.942 12.759 12.549 12.347 12.179 12.004 11.809 11.643 11.462 11.255 11.094 10.921 10.733 10.549 10.362 10.235 10.096 9.851 9.69 9.529 9.444 9.281 9.106 8.914 8.816 8.549 8.487 8.37 8.248 7.965 7.794 7.613 7.429 7.217 6.941 6.58 5.651 -2 ,4728 ,KEBNE ,17040434,Thu Dec 23 00:27:30 CET,Thu Dec 23 02:11:35 CET,0.0 0.603 0.855 1.101 1.308 1.494 1.682 1.854 2.147 2.276 2.407 2.483 2.772 2.889 3.134 3.368 3.576 3.675 3.859 4.031 4.272 4.421 4.571 4.781 4.988 5.199 5.405 5.604 5.874 6.13 6.36 6.639 6.9 7.146 7.449 7.797 8.104 8.438 8.811 9.172 9.612 10.207 10.868 11.494 12.196 12.983 13.847 14.748 15.798 17.033 18.167 18.603 18.669 18.61 18.427 18.087 17.713 17.365 17.016 16.621 16.291 16.011 15.717 15.425 15.167 14.916 14.64 14.403 14.194 13.963 13.72 13.512 13.289 13.051 12.865 12.677 12.47 12.243 11.999 11.832 11.662 11.402 11.23 11.048 10.953 10.753 10.531 10.279 10.147 9.842 9.703 9.543 9.384 9.036 8.841 8.63 8.41 8.152 7.846 7.442 6.413 -3 ,29138 ,KEBNE ,17040435,Thu Dec 23 00:27:30 CET,Thu Dec 23 02:11:35 CET,0.0 0.593 0.869 1.078 1.295 1.497 1.683 1.833 2.067 2.187 2.319 2.388 2.683 2.802 3.024 3.247 3.465 3.565 3.758 3.951 4.22 4.385 4.547 4.771 4.988 5.216 5.431 5.635 5.896 6.148 6.395 6.69 6.964 7.224 7.515 7.844 8.178 8.555 9.046 9.599 10.127 10.71 11.355 11.981 12.68 13.41 14.217 15.116 16.124 17.146 18.124 18.523 18.417 18.171 17.809 17.359 16.923 16.508 16.129 15.735 15.423 15.157 14.879 14.616 14.371 14.123 13.839 13.563 13.336 13.111 12.852 12.642 12.434 12.209 12.029 11.836 11.638 11.437 11.215 11.057 10.885 10.576 10.362 10.166 10.07 9.873 9.646 9.385 9.255 8.953 8.833 8.687 8.542 8.226 8.045 7.831 7.583 7.332 7.015 6.577 5.459 -4 ,2246 ,KEBNE ,17040436,Thu Dec 23 00:27:30 CET,Thu Dec 23 02:11:53 CET,0.0 0.361 0.611 0.802 0.972 1.135 1.283 1.415 1.66 1.775 1.878 1.912 2.182 2.277 2.468 2.643 2.818 2.903 3.064 3.227 3.469 3.625 3.769 3.969 4.159 4.347 4.52 4.688 4.912 5.119 5.324 5.574 5.818 6.068 6.344 6.645 6.945 7.273 7.621 7.991 8.378 8.795 9.284 9.774 10.313 10.898 11.587 12.347 13.212 14.153 15.059 15.556 15.596 15.414 15.153 14.866 14.603 14.363 14.123 13.845 13.591 13.343 13.107 12.887 12.686 12.494 12.28 12.065 11.864 11.677 11.463 11.286 11.113 10.914 10.752 10.581 10.41 10.236 10.062 9.936 9.797 9.577 9.429 9.277 9.193 9.027 8.849 8.653 8.55 8.273 8.214 8.092 7.964 7.668 7.484 7.299 7.105 6.867 6.58 6.189 5.13 -5 ,22634 ,KEBNE ,17040437,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:11:48 CET,0.0 0.461 0.748 0.998 1.225 1.448 1.642 1.83 2.156 2.297 2.436 2.522 2.815 2.935 3.178 3.404 3.618 3.716 3.902 4.093 4.375 4.543 4.702 4.949 5.188 5.415 5.628 5.827 6.084 6.338 6.59 6.886 7.162 7.432 7.735 8.074 8.411 8.765 9.136 9.551 9.983 10.442 10.976 11.517 12.133 12.799 13.45 14.075 14.811 15.659 16.488 16.942 17.062 16.887 16.522 16.158 15.803 15.427 15.094 14.755 14.476 14.228 13.939 13.651 13.398 13.162 12.924 12.737 12.572 12.371 12.16 11.985 11.802 11.613 11.465 11.305 11.138 10.974 10.79 10.665 10.542 10.332 10.18 10.025 9.944 9.787 9.621 9.416 9.307 9.034 8.98 8.861 8.738 8.442 8.268 8.078 7.895 7.713 7.496 7.264 6.665 -6 ,9374 ,KEBNE ,17040438,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:12:13 CET,0.0 0.584 0.869 1.104 1.308 1.481 1.642 1.806 2.12 2.271 2.406 2.463 2.758 2.874 3.09 3.303 3.513 3.619 3.816 3.998 4.258 4.42 4.578 4.809 5.044 5.268 5.473 5.679 5.956 6.224 6.477 6.779 7.059 7.311 7.609 7.964 8.31 8.7 9.125 9.544 9.979 10.496 11.061 11.582 12.137 12.69 13.275 13.941 14.755 15.655 16.503 16.939 17.053 17.051 16.941 16.769 16.573 16.37 16.18 15.96 15.739 15.485 15.211 14.934 14.664 14.428 14.195 13.989 13.806 13.623 13.429 13.252 13.062 12.854 12.684 12.513 12.333 12.156 11.982 11.839 11.677 11.443 11.279 11.095 11.001 10.807 10.589 10.354 10.232 9.931 9.82 9.668 9.5 9.16 8.979 8.789 8.587 8.33 8.013 7.581 6.491 -7 ,9577 ,KEBNE ,17040439,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:13:36 CET,0.0 0.649 0.947 1.178 1.398 1.589 1.755 1.916 2.228 2.363 2.486 2.562 2.854 2.968 3.176 3.37 3.554 3.647 3.817 3.978 4.224 4.377 4.525 4.727 4.912 5.106 5.304 5.493 5.726 5.952 6.161 6.4 6.63 6.86 7.146 7.477 7.792 8.116 8.455 8.825 9.217 9.659 10.183 10.679 11.213 11.834 12.593 13.442 14.351 15.315 16.266 16.655 16.541 16.263 15.939 15.498 15.152 14.879 14.591 14.263 13.928 13.639 13.372 13.099 12.842 12.611 12.349 12.108 11.905 11.678 11.428 11.226 11.012 10.778 10.61 10.449 10.261 10.046 9.829 9.677 9.514 9.264 9.096 8.925 8.831 8.615 8.391 8.17 8.05 7.752 7.653 7.512 7.362 7.035 6.856 6.684 6.502 6.274 6.006 5.663 4.74 -8 ,26721 ,KEBNE ,17040440,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:12:44 CET,0.0 0.839 1.199 1.442 1.63 1.806 1.966 2.108 2.376 2.503 2.626 2.693 2.97 3.066 3.249 3.428 3.62 3.717 3.889 4.06 4.304 4.452 4.589 4.792 5.003 5.202 5.382 5.549 5.774 6.0 6.224 6.5 6.773 7.033 7.325 7.649 7.947 8.277 8.64 9.0 9.379 9.833 10.404 10.989 11.669 12.42 13.198 14.005 14.904 15.822 16.666 17.048 17.0 16.747 16.303 15.759 15.255 14.76 14.281 13.794 13.418 13.109 12.812 12.525 12.234 11.962 11.673 11.413 11.189 10.947 10.68 10.463 10.261 10.054 9.874 9.684 9.49 9.289 9.081 8.939 8.795 8.572 8.419 8.253 8.164 7.98 7.8 7.594 7.476 7.194 7.116 6.972 6.824 6.519 6.361 6.19 5.981 5.751 5.516 5.188 4.469 -9 ,29385 ,KEBNE ,17040441,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:12:58 CET,0.0 0.641 0.931 1.194 1.414 1.597 1.774 1.941 2.267 2.423 2.567 2.666 2.971 3.092 3.329 3.556 3.767 3.864 4.059 4.25 4.512 4.671 4.831 5.061 5.264 5.456 5.645 5.837 6.077 6.328 6.594 6.902 7.186 7.466 7.795 8.15 8.488 8.859 9.245 9.675 10.146 10.634 11.165 11.735 12.356 12.915 13.487 14.124 14.862 15.684 16.552 17.057 17.095 16.911 16.657 16.349 16.034 15.722 15.457 15.171 14.897 14.626 14.343 14.087 13.861 13.647 13.402 13.174 12.991 12.808 12.602 12.426 12.246 12.053 11.893 11.722 11.553 11.37 11.171 11.04 10.909 10.722 10.587 10.43 10.348 10.17 9.975 9.776 9.677 9.416 9.38 9.258 9.133 8.851 8.707 8.548 8.343 8.127 7.876 7.447 6.536 -10 ,12662 ,KEBNE ,17040442,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:11:33 CET,0.0 0.702 1.005 1.265 1.472 1.654 1.85 2.034 2.356 2.5 2.632 2.696 2.996 3.125 3.357 3.58 3.794 3.896 4.095 4.29 4.574 4.756 4.926 5.165 5.405 5.649 5.875 6.081 6.338 6.589 6.849 7.15 7.42 7.684 8.007 8.378 8.742 9.13 9.509 9.908 10.345 10.811 11.358 11.918 12.485 13.048 13.667 14.331 15.089 15.878 16.671 17.139 17.22 17.139 16.937 16.696 16.497 16.299 16.088 15.842 15.596 15.315 15.011 14.709 14.405 14.129 13.846 13.588 13.35 13.09 12.812 12.606 12.388 12.125 11.92 11.713 11.49 11.257 11.018 10.861 10.702 10.437 10.245 10.034 9.926 9.715 9.492 9.26 9.139 8.842 8.741 8.585 8.41 8.029 7.835 7.602 7.336 7.061 6.709 6.248 5.071 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 7976d844..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7290 ,KEBNE ,17040443,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:12:48 CET,0.0 0.81 1.095 1.323 1.539 1.729 1.902 2.057 2.338 2.467 2.595 2.662 2.932 3.041 3.25 3.452 3.645 3.739 3.913 4.079 4.329 4.477 4.618 4.824 5.011 5.185 5.348 5.507 5.717 5.91 6.108 6.359 6.588 6.799 7.055 7.345 7.622 7.93 8.248 8.563 8.894 9.27 9.69 10.076 10.489 10.956 11.586 12.326 13.104 13.878 14.431 14.466 14.169 13.734 13.201 12.618 12.081 11.607 11.214 10.797 10.395 10.042 9.7 9.374 9.08 8.809 8.512 8.239 8.007 7.754 7.489 7.275 7.047 6.798 6.609 6.416 6.193 5.971 5.75 5.596 5.44 5.191 5.006 4.8 4.699 4.508 4.297 4.062 3.944 3.663 3.575 3.436 3.295 2.993 2.834 2.675 2.481 2.229 1.969 1.658 0.343 -2 ,11007 ,KEBNE ,17040444,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:15:15 CET,0.0 0.885 1.205 1.454 1.659 1.859 2.032 2.194 2.512 2.654 2.792 2.881 3.181 3.304 3.531 3.733 3.899 3.98 4.154 4.325 4.546 4.681 4.816 5.021 5.233 5.418 5.579 5.742 5.965 6.179 6.394 6.649 6.881 7.111 7.365 7.673 8.016 8.401 8.817 9.256 9.706 10.193 10.732 11.272 11.869 12.491 13.172 13.865 14.594 15.195 15.582 15.51 15.115 14.606 14.037 13.458 12.875 12.309 11.785 11.226 10.723 10.268 9.836 9.423 9.043 8.728 8.415 8.128 7.882 7.621 7.337 7.114 6.879 6.616 6.417 6.209 5.982 5.754 5.521 5.355 5.195 4.973 4.807 4.617 4.513 4.277 4.037 3.799 3.676 3.38 3.273 3.132 2.999 2.71 2.535 2.331 2.104 1.877 1.61 1.244 0.178 -3 ,29955 ,KEBNE ,17040445,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:14:43 CET,0.0 0.991 1.336 1.599 1.809 1.992 2.163 2.333 2.671 2.826 2.967 3.052 3.354 3.484 3.716 3.933 4.143 4.244 4.428 4.599 4.838 4.987 5.142 5.383 5.603 5.811 6.013 6.212 6.472 6.732 6.984 7.268 7.521 7.751 8.019 8.333 8.642 8.99 9.361 9.737 10.206 10.81 11.485 12.129 12.867 13.665 14.531 15.424 16.339 17.267 17.83 17.591 17.126 16.554 15.961 15.33 14.718 14.147 13.616 13.068 12.573 12.103 11.674 11.314 11.008 10.717 10.391 10.1 9.837 9.556 9.269 9.033 8.78 8.52 8.33 8.127 7.891 7.636 7.383 7.207 7.023 6.732 6.54 6.346 6.237 5.999 5.751 5.479 5.345 5.061 4.936 4.757 4.571 4.184 3.959 3.716 3.46 3.178 2.866 2.436 1.413 -4 ,14013 ,KEBNE ,17040446,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:13:09 CET,0.0 0.921 1.329 1.588 1.878 2.126 2.318 2.508 2.793 2.918 3.047 3.136 3.432 3.547 3.774 3.999 4.207 4.299 4.483 4.664 4.938 5.126 5.299 5.531 5.751 5.959 6.159 6.366 6.62 6.838 7.057 7.333 7.6 7.858 8.15 8.467 8.78 9.146 9.54 9.944 10.341 10.755 11.269 11.792 12.267 12.676 13.138 13.631 14.178 14.717 15.109 15.115 14.833 14.472 14.117 13.692 13.265 12.888 12.555 12.139 11.706 11.28 10.867 10.48 10.121 9.788 9.428 9.098 8.795 8.487 8.169 7.898 7.626 7.351 7.131 6.904 6.659 6.389 6.095 5.899 5.707 5.406 5.205 4.991 4.871 4.612 4.341 4.069 3.924 3.604 3.452 3.286 3.115 2.729 2.515 2.278 2.018 1.755 1.467 1.048 0.075 -5 ,32229 ,KEBNE ,17040447,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:13:20 CET,0.0 1.151 1.519 1.786 2.024 2.233 2.427 2.626 2.98 3.114 3.234 3.308 3.594 3.706 3.911 4.104 4.283 4.375 4.562 4.735 4.978 5.132 5.281 5.507 5.729 5.938 6.13 6.307 6.543 6.761 6.966 7.213 7.454 7.701 7.982 8.286 8.57 8.869 9.185 9.529 9.911 10.349 10.831 11.344 11.97 12.592 13.257 13.996 14.76 15.485 16.006 15.809 15.3 14.709 14.108 13.51 12.927 12.368 11.846 11.289 10.789 10.332 9.887 9.451 9.052 8.683 8.321 8.023 7.765 7.496 7.202 6.952 6.702 6.446 6.248 6.038 5.808 5.549 5.267 5.086 4.909 4.62 4.412 4.193 4.084 3.847 3.595 3.34 3.201 2.896 2.764 2.61 2.445 2.056 1.848 1.635 1.388 1.114 0.824 0.437 -0.852 -6 ,12377 ,KEBNE ,17040448,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:14:00 CET,0.0 0.657 1.01 1.282 1.503 1.685 1.827 1.967 2.237 2.367 2.494 2.566 2.855 2.972 3.189 3.378 3.562 3.658 3.846 4.019 4.258 4.401 4.545 4.772 4.973 5.159 5.332 5.499 5.725 5.934 6.138 6.376 6.6 6.821 7.071 7.346 7.606 7.894 8.217 8.545 8.866 9.225 9.662 10.088 10.564 11.097 11.669 12.227 12.762 13.249 13.606 13.507 13.113 12.653 12.24 11.815 11.382 10.947 10.536 10.113 9.755 9.422 9.091 8.787 8.499 8.221 7.92 7.66 7.438 7.204 6.956 6.743 6.513 6.271 6.081 5.864 5.634 5.407 5.182 5.037 4.882 4.623 4.435 4.235 4.137 3.941 3.74 3.53 3.419 3.126 3.02 2.868 2.713 2.382 2.203 2.013 1.789 1.537 1.284 0.956 0.286 -7 ,331 ,KEBNE ,17040449,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:13:09 CET,0.0 1.272 1.693 1.984 2.182 2.327 2.465 2.615 2.919 3.052 3.172 3.253 3.538 3.642 3.836 4.016 4.195 4.288 4.479 4.652 4.875 5.022 5.172 5.375 5.556 5.733 5.911 6.084 6.3 6.498 6.7 6.955 7.244 7.573 7.95 8.362 8.752 9.168 9.623 10.091 10.57 11.089 11.662 12.231 12.862 13.526 14.259 14.999 15.723 16.397 16.858 16.864 16.598 16.226 15.812 15.312 14.844 14.43 14.047 13.613 13.23 12.89 12.529 12.162 11.82 11.494 11.139 10.837 10.575 10.3 10.01 9.747 9.473 9.206 9.005 8.795 8.566 8.337 8.098 7.925 7.743 7.451 7.254 7.052 6.942 6.728 6.515 6.262 6.121 5.812 5.704 5.555 5.395 5.055 4.866 4.665 4.424 4.148 3.816 3.418 2.183 -8 ,8272 ,KEBNE ,17040450,Thu Dec 23 00:29:33 CET,Thu Dec 23 02:13:18 CET,0.0 0.631 0.892 1.135 1.356 1.555 1.75 1.935 2.276 2.422 2.554 2.62 2.913 3.039 3.27 3.474 3.66 3.748 3.921 4.091 4.33 4.49 4.643 4.859 5.068 5.263 5.462 5.651 5.871 6.084 6.286 6.524 6.77 6.998 7.251 7.538 7.806 8.105 8.404 8.701 9.024 9.369 9.745 10.132 10.619 11.231 11.908 12.598 13.288 13.892 14.28 14.117 13.619 13.021 12.478 12.004 11.584 11.114 10.626 10.1 9.659 9.273 8.894 8.533 8.189 7.873 7.548 7.255 6.971 6.657 6.333 6.054 5.766 5.467 5.218 4.966 4.703 4.407 4.114 3.915 3.712 3.387 3.159 2.928 2.812 2.574 2.322 2.053 1.916 1.613 1.495 1.332 1.166 0.832 0.64 0.414 0.163 -0.1 -0.411 -0.793 -1.367 -9 ,9519 ,KEBNE ,17040451,Thu Dec 23 00:31:37 CET,Thu Dec 23 02:16:56 CET,0.0 0.513 0.792 1.036 1.24 1.416 1.591 1.749 2.013 2.154 2.31 2.406 2.694 2.813 3.023 3.233 3.447 3.553 3.752 3.945 4.232 4.405 4.562 4.79 5.016 5.234 5.439 5.645 5.919 6.159 6.387 6.67 6.954 7.234 7.544 7.904 8.229 8.55 8.89 9.239 9.612 10.036 10.501 10.959 11.529 12.13 12.644 13.1 13.631 14.181 14.563 14.416 14.013 13.549 13.074 12.601 12.171 11.716 11.26 10.786 10.362 9.957 9.572 9.22 8.881 8.55 8.196 7.871 7.578 7.273 6.943 6.67 6.39 6.109 5.889 5.651 5.395 5.119 4.845 4.657 4.455 4.146 3.919 3.69 3.581 3.357 3.108 2.839 2.697 2.383 2.253 2.084 1.906 1.542 1.334 1.108 0.864 0.56 0.197 -0.211 -1.562 -10 ,28293 ,KEBNE ,17040452,Thu Dec 23 00:31:36 CET,Thu Dec 23 02:15:30 CET,0.0 0.772 1.05 1.28 1.461 1.6 1.759 1.923 2.202 2.343 2.479 2.556 2.848 2.958 3.153 3.33 3.495 3.577 3.734 3.883 4.101 4.243 4.377 4.558 4.736 4.925 5.112 5.284 5.511 5.73 5.947 6.205 6.431 6.641 6.886 7.176 7.447 7.729 8.026 8.333 8.677 9.078 9.525 9.959 10.441 10.921 11.42 11.974 12.545 13.103 13.525 13.435 13.049 12.604 12.149 11.703 11.297 10.888 10.509 10.122 9.776 9.442 9.094 8.752 8.433 8.141 7.836 7.564 7.326 7.079 6.823 6.602 6.379 6.149 5.968 5.773 5.559 5.341 5.114 4.947 4.771 4.504 4.312 4.109 4.01 3.813 3.599 3.352 3.22 2.933 2.838 2.706 2.562 2.239 2.08 1.895 1.671 1.408 1.109 0.717 -0.205 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 112a676f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17911 ,KEBNE ,17040453,Thu Dec 23 00:31:40 CET,Thu Dec 23 02:13:29 CET,0.0 0.666 0.949 1.147 1.307 1.486 1.674 1.828 2.087 2.202 2.306 2.352 2.617 2.712 2.877 3.033 3.198 3.28 3.428 3.564 3.774 3.914 4.044 4.227 4.397 4.575 4.759 4.928 5.132 5.317 5.501 5.719 5.939 6.168 6.415 6.665 6.884 7.11 7.351 7.609 7.885 8.189 8.53 8.848 9.176 9.544 9.89 10.238 10.766 11.28 11.586 11.492 11.076 10.568 10.115 9.69 9.268 8.851 8.467 8.09 7.774 7.473 7.167 6.872 6.589 6.322 6.036 5.78 5.561 5.337 5.108 4.918 4.725 4.52 4.357 4.176 3.991 3.806 3.603 3.472 3.335 3.11 2.946 2.773 2.682 2.478 2.262 2.033 1.915 1.627 1.54 1.413 1.28 0.977 0.8 0.594 0.343 0.055 -0.242 -0.601 -1.39 -2 ,19277 ,KEBNE ,17040454,Thu Dec 23 00:31:37 CET,Thu Dec 23 02:15:16 CET,0.0 0.897 1.23 1.443 1.629 1.816 1.969 2.091 2.343 2.471 2.576 2.611 2.876 2.972 3.153 3.335 3.501 3.579 3.735 3.879 4.086 4.223 4.35 4.526 4.686 4.847 5.016 5.179 5.38 5.564 5.748 5.982 6.192 6.378 6.597 6.848 7.076 7.319 7.588 7.883 8.18 8.493 8.835 9.176 9.581 10.072 10.625 11.194 11.776 12.253 12.524 12.347 11.976 11.541 11.036 10.475 9.987 9.543 9.145 8.716 8.301 7.941 7.601 7.26 6.941 6.644 6.327 6.025 5.753 5.477 5.211 4.996 4.763 4.542 4.377 4.189 3.981 3.773 3.564 3.418 3.267 3.012 2.835 2.641 2.532 2.316 2.109 1.897 1.781 1.498 1.423 1.286 1.123 0.766 0.595 0.381 0.151 -0.061 -0.31 -0.598 -1.236 -3 ,17395 ,KEBNE ,17040455,Thu Dec 23 00:31:37 CET,Thu Dec 23 02:16:23 CET,0.0 0.776 1.064 1.282 1.47 1.624 1.78 1.953 2.282 2.422 2.539 2.583 2.84 2.933 3.121 3.305 3.468 3.548 3.697 3.832 4.032 4.163 4.301 4.55 4.817 5.079 5.334 5.573 5.865 6.144 6.42 6.751 7.071 7.373 7.711 8.072 8.409 8.796 9.192 9.574 9.966 10.409 10.904 11.379 11.911 12.461 13.044 13.615 14.206 14.754 15.014 14.763 14.313 13.753 13.208 12.681 12.165 11.693 11.285 10.817 10.401 10.04 9.691 9.382 9.1 8.841 8.573 8.327 8.107 7.882 7.64 7.439 7.237 7.022 6.848 6.661 6.473 6.276 6.063 5.926 5.784 5.546 5.376 5.201 5.11 4.928 4.73 4.525 4.429 4.16 4.064 3.929 3.803 3.487 3.3 3.111 2.933 2.736 2.491 2.193 1.297 -4 ,16359 ,KEBNE ,17040456,Thu Dec 23 00:31:37 CET,Thu Dec 23 02:14:54 CET,0.0 0.988 1.231 1.438 1.639 1.829 1.995 2.143 2.419 2.539 2.661 2.714 2.97 3.061 3.251 3.431 3.596 3.679 3.837 3.98 4.201 4.341 4.469 4.648 4.818 4.987 5.147 5.3 5.494 5.688 5.877 6.096 6.307 6.511 6.734 6.98 7.223 7.468 7.709 7.959 8.217 8.499 8.864 9.236 9.611 9.987 10.371 10.747 11.075 11.331 11.365 10.938 10.411 9.877 9.351 8.85 8.346 7.887 7.513 7.117 6.781 6.483 6.19 5.911 5.638 5.391 5.132 4.888 4.668 4.444 4.222 4.031 3.818 3.594 3.432 3.264 3.083 2.898 2.696 2.55 2.397 2.15 1.995 1.843 1.761 1.587 1.401 1.186 1.071 0.795 0.721 0.584 0.419 0.059 -0.121 -0.307 -0.506 -0.744 -0.992 -1.275 -2.029 -5 ,2428 ,KEBNE ,17040457,Thu Dec 23 00:31:36 CET,Thu Dec 23 02:16:30 CET,0.0 0.822 1.076 1.303 1.53 1.717 1.85 1.973 2.216 2.334 2.445 2.485 2.745 2.84 3.021 3.183 3.338 3.419 3.578 3.733 3.948 4.089 4.24 4.445 4.616 4.777 4.949 5.122 5.336 5.526 5.697 5.912 6.118 6.31 6.527 6.768 6.993 7.22 7.467 7.736 8.005 8.288 8.587 8.88 9.244 9.601 9.941 10.286 10.646 10.989 11.073 10.785 10.329 9.802 9.295 8.825 8.421 8.032 7.647 7.259 6.933 6.633 6.345 6.071 5.812 5.577 5.334 5.095 4.888 4.686 4.456 4.249 4.032 3.804 3.642 3.486 3.319 3.133 2.94 2.804 2.655 2.427 2.26 2.091 2.007 1.83 1.625 1.402 1.288 0.997 0.92 0.81 0.7 0.469 0.337 0.184 0.034 -0.128 -0.365 -0.686 -1.79 -6 ,4793 ,KEBNE ,17040458,Thu Dec 23 00:31:37 CET,Thu Dec 23 02:16:03 CET,0.0 0.981 1.296 1.535 1.737 1.918 2.084 2.218 2.461 2.584 2.716 2.804 3.084 3.187 3.38 3.564 3.725 3.803 3.958 4.095 4.285 4.414 4.534 4.708 4.883 5.057 5.231 5.395 5.587 5.769 5.947 6.143 6.324 6.508 6.723 6.956 7.173 7.399 7.644 7.913 8.179 8.482 8.891 9.353 9.887 10.441 11.024 11.593 12.119 12.542 12.776 12.625 12.159 11.631 11.14 10.64 10.177 9.761 9.409 9.035 8.645 8.267 7.914 7.568 7.235 6.937 6.641 6.386 6.148 5.873 5.578 5.347 5.113 4.863 4.666 4.461 4.247 4.023 3.799 3.635 3.451 3.166 2.974 2.778 2.673 2.455 2.225 1.975 1.844 1.542 1.427 1.268 1.099 0.754 0.573 0.378 0.146 -0.125 -0.448 -0.849 -1.783 -7 ,14528 ,KEBNE ,17040459,Thu Dec 23 00:31:37 CET,Thu Dec 23 02:15:19 CET,0.0 0.832 1.185 1.44 1.677 1.857 2.009 2.177 2.472 2.603 2.724 2.775 3.04 3.144 3.34 3.528 3.704 3.781 3.936 4.09 4.322 4.471 4.604 4.789 4.962 5.128 5.284 5.438 5.648 5.85 6.055 6.282 6.485 6.67 6.88 7.125 7.346 7.573 7.809 8.06 8.325 8.628 8.957 9.251 9.594 9.948 10.292 10.668 11.02 11.225 11.13 10.697 10.173 9.624 9.064 8.535 8.057 7.594 7.203 6.83 6.5 6.195 5.892 5.605 5.353 5.123 4.854 4.609 4.39 4.155 3.933 3.74 3.533 3.314 3.139 2.961 2.777 2.593 2.401 2.261 2.118 1.896 1.733 1.561 1.473 1.294 1.122 0.933 0.827 0.553 0.482 0.359 0.246 -0.007 -0.166 -0.345 -0.533 -0.726 -0.958 -1.214 -1.83 -8 ,24424 ,KEBNE ,17040460,Thu Dec 23 00:31:36 CET,Thu Dec 23 02:16:03 CET,0.0 0.772 1.046 1.321 1.591 1.783 1.927 2.046 2.265 2.37 2.477 2.534 2.805 2.901 3.075 3.243 3.403 3.477 3.615 3.752 3.946 4.068 4.188 4.36 4.534 4.711 4.874 5.033 5.243 5.432 5.61 5.824 6.019 6.198 6.41 6.657 6.884 7.12 7.387 7.67 7.943 8.229 8.544 8.868 9.243 9.617 10.012 10.489 11.034 11.519 11.796 11.658 11.325 10.891 10.418 9.96 9.55 9.152 8.771 8.372 8.039 7.717 7.39 7.091 6.803 6.514 6.209 5.966 5.758 5.533 5.301 5.108 4.903 4.678 4.507 4.317 4.116 3.92 3.72 3.579 3.434 3.206 3.049 2.894 2.815 2.631 2.408 2.195 2.095 1.818 1.725 1.592 1.469 1.182 1.001 0.787 0.557 0.313 0.057 -0.246 -0.853 -9 ,14573 ,KEBNE ,17040461,Thu Dec 23 00:31:37 CET,Thu Dec 23 02:15:39 CET,0.0 0.84 1.122 1.322 1.518 1.712 1.886 2.032 2.304 2.458 2.611 2.686 2.948 3.04 3.228 3.416 3.591 3.673 3.819 3.956 4.163 4.298 4.434 4.633 4.821 4.999 5.175 5.339 5.527 5.701 5.859 6.041 6.225 6.407 6.603 6.818 7.042 7.289 7.545 7.82 8.088 8.355 8.66 8.965 9.332 9.811 10.407 11.026 11.642 12.142 12.375 12.1 11.635 11.126 10.616 10.103 9.632 9.205 8.811 8.417 8.079 7.754 7.435 7.135 6.851 6.567 6.263 6.0 5.78 5.553 5.304 5.101 4.897 4.669 4.488 4.305 4.102 3.908 3.711 3.56 3.403 3.152 2.971 2.765 2.655 2.446 2.234 2.02 1.908 1.62 1.545 1.419 1.282 0.975 0.792 0.601 0.401 0.146 -0.152 -0.485 -1.309 -10 ,1230 ,KEBNE ,17040462,Thu Dec 23 00:31:37 CET,Thu Dec 23 02:15:41 CET,0.0 0.78 1.103 1.344 1.539 1.712 1.894 2.079 2.359 2.471 2.575 2.614 2.893 3.01 3.215 3.41 3.599 3.683 3.842 3.999 4.226 4.369 4.509 4.709 4.884 5.044 5.204 5.359 5.56 5.751 5.936 6.157 6.361 6.551 6.764 6.997 7.224 7.462 7.706 7.964 8.226 8.513 8.846 9.261 9.796 10.3 10.825 11.382 11.933 12.447 12.774 12.672 12.276 11.78 11.261 10.749 10.29 9.849 9.468 9.078 8.716 8.371 8.043 7.736 7.434 7.154 6.849 6.579 6.356 6.131 5.887 5.682 5.462 5.212 5.008 4.772 4.522 4.27 4.011 3.837 3.673 3.427 3.257 3.087 2.993 2.794 2.59 2.375 2.258 1.964 1.849 1.704 1.561 1.252 1.08 0.874 0.646 0.398 0.114 -0.22 -1.125 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt deleted file mode 100644 index d4fab831..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19115 ,KEBNE ,17040463,Thu Dec 23 00:33:42 CET,Thu Dec 23 02:18:44 CET,0.0 1.006 1.426 1.753 2.036 2.312 2.562 2.787 3.193 3.384 3.579 3.738 4.086 4.237 4.539 4.839 5.114 5.241 5.506 5.769 6.143 6.376 6.597 6.915 7.217 7.5 7.771 8.041 8.396 8.744 9.081 9.48 9.875 10.285 10.753 11.257 11.745 12.287 12.871 13.464 14.058 14.735 15.545 16.385 17.361 18.372 19.472 20.69 21.989 23.46 25.203 26.459 27.057 27.333 27.427 27.385 27.242 27.03 26.816 26.564 26.312 26.072 25.825 25.595 25.373 25.143 24.898 24.682 24.491 24.291 24.067 23.864 23.66 23.457 23.291 23.116 22.933 22.736 22.539 22.406 22.263 22.034 21.87 21.698 21.609 21.419 21.22 21.034 20.934 20.652 20.605 20.471 20.306 19.995 19.835 19.668 19.49 19.278 19.04 18.738 17.986 -2 ,10043 ,KEBNE ,17040464,Thu Dec 23 00:36:49 CET,Thu Dec 23 02:20:33 CET,0.0 0.916 1.303 1.636 1.926 2.192 2.436 2.646 3.012 3.177 3.344 3.53 3.892 4.047 4.35 4.636 4.92 5.059 5.323 5.576 5.935 6.171 6.405 6.737 7.051 7.35 7.647 7.938 8.307 8.67 9.022 9.441 9.853 10.252 10.67 11.136 11.615 12.131 12.687 13.307 13.974 14.712 15.553 16.424 17.396 18.428 19.68 20.951 22.434 24.391 26.374 27.494 27.912 27.986 27.941 27.819 27.651 27.437 27.192 26.934 26.694 26.472 26.26 26.031 25.789 25.566 25.335 25.096 24.87 24.652 24.442 24.27 24.086 23.898 23.746 23.579 23.413 23.251 23.075 22.946 22.808 22.585 22.432 22.278 22.202 22.045 21.881 21.706 21.615 21.347 21.303 21.191 21.072 20.812 20.664 20.504 20.329 20.138 19.915 19.634 19.088 -3 ,28118 ,KEBNE ,17040465,Thu Dec 23 00:33:46 CET,Thu Dec 23 02:27:16 CET,0.0 0.909 1.411 1.774 2.078 2.392 2.682 2.916 3.338 3.544 3.73 3.876 4.24 4.406 4.715 5.01 5.282 5.418 5.692 5.954 6.337 6.577 6.807 7.13 7.444 7.764 8.076 8.392 8.79 9.156 9.522 9.964 10.392 10.799 11.272 11.795 12.285 12.835 13.439 14.085 14.753 15.556 16.506 17.44 18.559 19.785 21.225 22.759 24.404 26.38 28.627 30.189 31.021 31.368 31.424 31.342 31.207 31.065 30.888 30.652 30.401 30.168 29.924 29.678 29.439 29.197 28.932 28.683 28.449 28.2 27.953 27.746 27.525 27.296 27.106 26.912 26.723 26.531 26.332 26.188 26.033 25.784 25.617 25.44 25.347 25.149 24.918 24.692 24.583 24.287 24.166 24.007 23.85 23.5 23.312 23.126 22.914 22.663 22.373 22.019 20.989 -4 ,15722 ,KEBNE ,17040466,Thu Dec 23 00:36:48 CET,Thu Dec 23 02:21:14 CET,0.0 1.062 1.463 1.746 1.986 2.197 2.405 2.605 2.959 3.131 3.294 3.399 3.721 3.86 4.12 4.367 4.607 4.726 4.958 5.174 5.501 5.727 5.937 6.23 6.506 6.782 7.043 7.299 7.636 7.949 8.252 8.62 8.993 9.358 9.763 10.209 10.653 11.144 11.664 12.232 12.839 13.523 14.339 15.141 16.021 16.96 18.037 19.258 20.626 22.114 23.715 24.852 25.36 25.597 25.678 25.623 25.493 25.349 25.179 24.969 24.766 24.55 24.345 24.168 23.986 23.795 23.596 23.405 23.225 23.044 22.842 22.661 22.476 22.289 22.143 21.986 21.812 21.631 21.451 21.321 21.186 20.983 20.833 20.676 20.595 20.432 20.261 20.072 19.961 19.684 19.651 19.535 19.411 19.152 19.009 18.842 18.643 18.423 18.176 17.903 17.163 -5 ,23695 ,KEBNE ,17040467,Thu Dec 23 00:36:48 CET,Thu Dec 23 02:20:45 CET,0.0 1.006 1.293 1.57 1.86 2.095 2.293 2.493 2.883 3.058 3.232 3.401 3.745 3.89 4.174 4.442 4.683 4.805 5.067 5.312 5.646 5.857 6.065 6.365 6.664 6.966 7.258 7.549 7.912 8.236 8.542 8.94 9.322 9.683 10.099 10.57 11.043 11.541 12.067 12.64 13.245 13.932 14.735 15.523 16.411 17.396 18.517 19.731 21.135 22.664 24.313 25.515 26.036 26.242 26.285 26.188 26.008 25.803 25.619 25.416 25.195 24.975 24.763 24.556 24.36 24.165 23.943 23.74 23.556 23.36 23.154 22.976 22.784 22.567 22.399 22.234 22.067 21.891 21.691 21.559 21.42 21.177 21.009 20.834 20.74 20.545 20.349 20.128 20.006 19.723 19.661 19.538 19.41 19.134 18.966 18.774 18.562 18.316 18.022 17.634 16.691 -6 ,20322 ,KEBNE ,17040468,Thu Dec 23 00:36:49 CET,Thu Dec 23 02:19:40 CET,0.0 0.917 1.323 1.642 1.918 2.161 2.384 2.602 2.997 3.181 3.363 3.534 3.881 4.025 4.307 4.586 4.852 4.98 5.226 5.452 5.781 6.002 6.216 6.531 6.828 7.105 7.381 7.654 8.002 8.351 8.703 9.125 9.52 9.887 10.315 10.806 11.251 11.736 12.266 12.837 13.447 14.104 14.886 15.68 16.594 17.62 18.788 20.039 21.445 23.112 24.944 26.04 26.346 26.348 26.199 25.928 25.608 25.266 24.922 24.509 24.121 23.753 23.394 23.051 22.71 22.391 22.107 21.879 21.685 21.485 21.262 21.062 20.848 20.641 20.48 20.302 20.115 19.918 19.692 19.54 19.394 19.16 18.985 18.797 18.702 18.493 18.277 18.064 17.945 17.649 17.579 17.449 17.302 16.989 16.82 16.635 16.432 16.22 15.99 15.7 14.869 -7 ,21285 ,KEBNE ,17040469,Thu Dec 23 00:36:49 CET,Thu Dec 23 02:20:04 CET,0.0 0.872 1.182 1.419 1.656 1.9 2.12 2.315 2.665 2.829 2.98 3.077 3.416 3.566 3.865 4.137 4.396 4.518 4.74 4.962 5.285 5.486 5.685 5.969 6.252 6.539 6.819 7.085 7.421 7.748 8.068 8.465 8.84 9.192 9.605 10.076 10.536 11.035 11.564 12.135 12.732 13.415 14.219 15.027 15.956 16.958 18.132 19.408 20.863 22.483 24.23 25.519 26.058 26.216 26.227 26.116 25.953 25.798 25.628 25.436 25.266 25.086 24.888 24.706 24.519 24.32 24.1 23.905 23.739 23.563 23.361 23.196 23.027 22.844 22.707 22.555 22.388 22.219 22.06 21.947 21.824 21.617 21.464 21.317 21.242 21.08 20.895 20.696 20.6 20.323 20.27 20.149 20.026 19.77 19.629 19.476 19.296 19.087 18.872 18.629 18.078 -8 ,30657 ,KEBNE ,17040470,Thu Dec 23 00:36:53 CET,Thu Dec 23 02:20:44 CET,0.0 0.772 1.185 1.497 1.758 2.011 2.268 2.501 2.89 3.07 3.257 3.43 3.794 3.965 4.299 4.61 4.882 5.017 5.282 5.528 5.889 6.121 6.348 6.671 6.987 7.304 7.608 7.896 8.275 8.644 8.998 9.415 9.801 10.168 10.6 11.105 11.618 12.165 12.724 13.308 13.922 14.646 15.482 16.315 17.337 18.497 19.757 21.115 22.683 24.433 26.324 27.594 28.126 28.226 28.147 28.022 27.892 27.713 27.526 27.287 27.03 26.813 26.605 26.382 26.166 25.961 25.745 25.546 25.371 25.199 24.999 24.828 24.651 24.462 24.316 24.164 24.004 23.818 23.607 23.47 23.33 23.109 22.952 22.78 22.697 22.538 22.36 22.154 22.05 21.778 21.713 21.578 21.431 21.114 20.934 20.755 20.568 20.35 20.123 19.802 19.018 -9 ,31717 ,KEBNE ,17040471,Thu Dec 23 00:36:48 CET,Thu Dec 23 02:20:30 CET,0.0 0.905 1.352 1.684 1.951 2.232 2.483 2.694 3.084 3.268 3.464 3.625 3.957 4.12 4.461 4.763 5.057 5.199 5.473 5.738 6.113 6.35 6.571 6.903 7.224 7.526 7.818 8.101 8.47 8.819 9.155 9.563 9.968 10.371 10.85 11.401 11.919 12.468 13.033 13.631 14.256 14.939 15.743 16.536 17.399 18.321 19.367 20.589 22.029 23.692 25.528 26.78 27.387 27.71 27.795 27.748 27.652 27.516 27.371 27.143 26.875 26.635 26.37 26.071 25.796 25.538 25.264 25.015 24.811 24.612 24.397 24.213 24.017 23.814 23.645 23.46 23.273 23.085 22.894 22.756 22.613 22.39 22.227 22.042 21.938 21.735 21.528 21.308 21.196 20.906 20.825 20.693 20.568 20.32 20.169 20.005 19.822 19.594 19.349 19.015 17.931 -10 ,21405 ,KEBNE ,17040472,Thu Dec 23 00:36:49 CET,Thu Dec 23 02:21:02 CET,0.0 0.573 0.941 1.282 1.6 1.892 2.144 2.366 2.772 2.956 3.138 3.292 3.643 3.798 4.107 4.406 4.689 4.829 5.092 5.334 5.706 5.944 6.158 6.477 6.809 7.14 7.458 7.762 8.144 8.49 8.821 9.237 9.651 10.05 10.516 11.035 11.511 12.029 12.583 13.162 13.792 14.516 15.353 16.181 17.135 18.109 19.152 20.374 21.766 23.211 24.68 25.781 26.405 26.734 26.777 26.725 26.622 26.458 26.25 25.967 25.683 25.401 25.106 24.831 24.553 24.281 24.002 23.732 23.51 23.291 23.043 22.836 22.629 22.403 22.216 22.029 21.84 21.647 21.442 21.284 21.119 20.883 20.718 20.529 20.435 20.231 20.02 19.82 19.719 19.437 19.373 19.252 19.107 18.772 18.597 18.417 18.185 17.917 17.642 17.282 16.617 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 97c99d82..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1453 ,KEBNE ,17040473,Thu Dec 23 00:36:48 CET,Thu Dec 23 02:19:32 CET,0.0 1.08 1.424 1.652 1.84 2.034 2.22 2.403 2.71 2.834 2.964 3.029 3.338 3.442 3.641 3.83 4.006 4.09 4.253 4.408 4.637 4.796 4.951 5.167 5.357 5.533 5.712 5.885 6.094 6.293 6.481 6.705 6.934 7.162 7.421 7.682 7.919 8.189 8.465 8.744 9.005 9.292 9.623 9.929 10.281 10.631 10.886 10.991 11.019 10.852 10.157 8.991 7.861 6.854 6.032 5.274 4.574 3.923 3.35 2.796 2.265 1.734 1.242 0.791 0.375 -0.004 -0.423 -0.808 -1.135 -1.478 -1.836 -2.138 -2.454 -2.766 -3.009 -3.268 -3.529 -3.79 -4.074 -4.279 -4.482 -4.791 -5.004 -5.239 -5.368 -5.641 -5.922 -6.212 -6.355 -6.692 -6.814 -6.99 -7.175 -7.587 -7.818 -8.053 -8.296 -8.536 -8.835 -9.211 -9.97 -2 ,19544 ,KEBNE ,17040474,Thu Dec 23 00:41:59 CET,Thu Dec 23 02:25:34 CET,0.0 0.535 0.793 1.002 1.202 1.393 1.564 1.724 2.014 2.145 2.262 2.28 2.57 2.666 2.847 3.024 3.2 3.291 3.476 3.645 3.866 4.012 4.147 4.335 4.508 4.669 4.834 4.989 5.188 5.391 5.581 5.803 6.022 6.218 6.434 6.677 6.948 7.294 7.664 8.039 8.419 8.827 9.268 9.681 10.13 10.585 11.057 11.436 11.671 11.733 11.252 10.219 9.145 8.118 7.164 6.251 5.406 4.596 3.912 3.229 2.612 2.027 1.454 0.935 0.444 -0.015 -0.482 -0.902 -1.272 -1.669 -2.112 -2.451 -2.777 -3.115 -3.347 -3.568 -3.805 -4.068 -4.34 -4.516 -4.699 -4.99 -5.2 -5.433 -5.553 -5.807 -6.056 -6.328 -6.486 -6.846 -6.951 -7.113 -7.29 -7.672 -7.882 -8.1 -8.308 -8.538 -8.83 -9.186 -9.975 -3 ,15693 ,KEBNE ,17040475,Thu Dec 23 00:42:03 CET,Thu Dec 23 02:34:55 CET,0.0 0.968 1.317 1.561 1.764 1.937 2.102 2.259 2.549 2.681 2.812 2.88 3.19 3.309 3.53 3.741 3.931 4.019 4.203 4.38 4.611 4.769 4.929 5.158 5.377 5.578 5.77 5.952 6.181 6.415 6.642 6.874 7.078 7.306 7.612 7.969 8.284 8.614 9.027 9.486 9.944 10.388 10.797 11.161 11.528 11.899 12.269 12.608 12.82 12.775 12.198 10.998 9.801 8.643 7.584 6.644 5.828 5.079 4.396 3.72 3.136 2.62 2.136 1.677 1.24 0.847 0.457 0.099 -0.208 -0.516 -0.832 -1.099 -1.388 -1.691 -1.926 -2.183 -2.476 -2.774 -3.053 -3.245 -3.456 -3.782 -4.019 -4.279 -4.403 -4.66 -4.939 -5.238 -5.386 -5.72 -5.851 -6.02 -6.2 -6.612 -6.832 -7.073 -7.323 -7.598 -7.912 -8.3 -9.054 -4 ,32177 ,KEBNE ,17040476,Thu Dec 23 00:41:59 CET,Thu Dec 23 02:26:04 CET,0.0 0.954 1.252 1.479 1.671 1.848 2.001 2.126 2.355 2.462 2.565 2.587 2.877 2.976 3.148 3.309 3.468 3.547 3.701 3.849 4.051 4.183 4.32 4.512 4.675 4.828 4.978 5.119 5.298 5.475 5.653 5.861 6.036 6.196 6.386 6.609 6.832 7.062 7.305 7.555 7.803 8.081 8.382 8.707 9.091 9.448 9.789 10.056 10.206 10.153 9.588 8.477 7.317 6.215 5.205 4.235 3.362 2.575 1.883 1.166 0.536 -0.038 -0.575 -1.086 -1.577 -2.011 -2.433 -2.806 -3.129 -3.452 -3.801 -4.116 -4.434 -4.744 -4.993 -5.259 -5.513 -5.76 -6.036 -6.243 -6.452 -6.744 -6.959 -7.19 -7.304 -7.559 -7.842 -8.138 -8.289 -8.641 -8.741 -8.904 -9.08 -9.502 -9.723 -9.936 -10.169 -10.445 -10.768 -11.166 -12.096 -5 ,26457 ,KEBNE ,17040477,Thu Dec 23 00:41:59 CET,Thu Dec 23 02:24:36 CET,0.0 0.549 0.818 1.049 1.233 1.399 1.562 1.713 2.024 2.163 2.289 2.326 2.628 2.742 2.947 3.144 3.332 3.426 3.616 3.795 4.035 4.184 4.339 4.566 4.758 4.93 5.095 5.26 5.48 5.703 5.939 6.209 6.454 6.681 6.929 7.192 7.455 7.794 8.173 8.552 8.943 9.386 9.877 10.361 10.825 11.204 11.586 11.913 12.101 12.08 11.56 10.455 9.271 8.139 7.138 6.215 5.331 4.495 3.742 3.045 2.482 1.949 1.438 0.958 0.52 0.139 -0.262 -0.625 -0.963 -1.343 -1.733 -2.062 -2.411 -2.773 -3.039 -3.297 -3.572 -3.88 -4.195 -4.403 -4.632 -5.03 -5.299 -5.549 -5.677 -5.948 -6.221 -6.515 -6.671 -7.026 -7.148 -7.328 -7.521 -7.926 -8.131 -8.348 -8.588 -8.829 -9.135 -9.504 -10.155 -6 ,4615 ,KEBNE ,17040478,Thu Dec 23 00:41:59 CET,Thu Dec 23 02:24:40 CET,0.0 0.705 0.963 1.184 1.397 1.597 1.768 1.907 2.171 2.301 2.431 2.502 2.806 2.915 3.115 3.302 3.482 3.572 3.761 3.936 4.186 4.357 4.517 4.72 4.908 5.097 5.275 5.445 5.658 5.867 6.073 6.329 6.585 6.828 7.107 7.401 7.678 7.988 8.307 8.629 8.956 9.306 9.688 10.059 10.511 10.984 11.497 12.034 12.538 12.907 12.652 11.876 11.081 10.209 9.367 8.592 7.869 7.185 6.577 5.93 5.349 4.849 4.389 3.953 3.56 3.203 2.819 2.47 2.163 1.838 1.498 1.216 0.925 0.621 0.39 0.154 -0.12 -0.42 -0.718 -0.904 -1.1 -1.418 -1.639 -1.869 -1.989 -2.242 -2.501 -2.775 -2.92 -3.276 -3.437 -3.62 -3.812 -4.207 -4.424 -4.636 -4.849 -5.076 -5.314 -5.639 -6.574 -7 ,1705 ,KEBNE ,17040479,Thu Dec 23 00:41:59 CET,Thu Dec 23 02:25:26 CET,0.0 0.41 0.639 0.831 1.011 1.177 1.319 1.435 1.662 1.771 1.874 1.901 2.189 2.28 2.451 2.611 2.761 2.837 2.986 3.119 3.303 3.429 3.558 3.755 3.929 4.093 4.253 4.406 4.609 4.79 4.959 5.163 5.344 5.517 5.717 5.943 6.145 6.35 6.569 6.791 7.001 7.214 7.456 7.686 7.922 8.152 8.377 8.564 8.637 8.466 7.758 6.54 5.388 4.303 3.371 2.561 1.829 1.147 0.542 -0.05 -0.547 -0.997 -1.434 -1.852 -2.251 -2.612 -2.982 -3.301 -3.58 -3.889 -4.204 -4.467 -4.748 -5.029 -5.244 -5.458 -5.68 -5.921 -6.172 -6.344 -6.52 -6.801 -6.992 -7.194 -7.3 -7.505 -7.708 -7.921 -8.038 -8.347 -8.399 -8.534 -8.67 -8.964 -9.132 -9.312 -9.495 -9.685 -9.893 -10.155 -10.75 -8 ,4478 ,KEBNE ,17040480,Thu Dec 23 00:41:59 CET,Thu Dec 23 02:25:29 CET,0.0 0.901 1.195 1.427 1.637 1.832 2.004 2.165 2.443 2.563 2.682 2.706 2.986 3.081 3.285 3.46 3.618 3.702 3.868 4.008 4.219 4.367 4.497 4.683 4.852 5.001 5.147 5.298 5.483 5.67 5.859 6.067 6.256 6.426 6.625 6.843 7.035 7.261 7.509 7.737 7.968 8.222 8.499 8.737 8.97 9.221 9.468 9.622 9.698 9.708 9.34 8.458 7.42 6.386 5.485 4.681 3.955 3.275 2.679 2.038 1.454 0.968 0.516 0.08 -0.339 -0.728 -1.128 -1.481 -1.785 -2.09 -2.397 -2.652 -2.927 -3.228 -3.461 -3.699 -3.951 -4.223 -4.507 -4.704 -4.894 -5.18 -5.383 -5.598 -5.709 -5.922 -6.144 -6.391 -6.523 -6.85 -6.927 -7.067 -7.21 -7.541 -7.73 -7.928 -8.141 -8.373 -8.641 -8.969 -9.638 -9 ,22089 ,KEBNE ,17040482,Thu Dec 23 00:41:59 CET,Thu Dec 23 02:25:20 CET,0.0 0.51 0.779 1.007 1.185 1.346 1.502 1.662 1.953 2.08 2.205 2.23 2.518 2.619 2.822 3.028 3.208 3.288 3.448 3.605 3.839 3.984 4.114 4.305 4.513 4.706 4.867 5.024 5.24 5.449 5.64 5.84 6.018 6.195 6.394 6.622 6.83 7.04 7.263 7.497 7.764 8.066 8.412 8.706 8.97 9.25 9.534 9.785 9.936 9.863 9.315 8.265 7.124 6.06 5.177 4.381 3.632 2.895 2.263 1.623 1.041 0.521 0.054 -0.381 -0.807 -1.2 -1.607 -1.972 -2.292 -2.633 -2.994 -3.278 -3.58 -3.911 -4.157 -4.406 -4.668 -4.944 -5.222 -5.424 -5.647 -5.991 -6.221 -6.451 -6.565 -6.808 -7.075 -7.356 -7.498 -7.838 -7.933 -8.087 -8.249 -8.584 -8.792 -9.036 -9.283 -9.562 -9.875 -10.219 -10.758 -10 ,21472 ,KEBNE ,17040483,Thu Dec 23 00:41:59 CET,Thu Dec 23 02:25:57 CET,0.0 0.424 0.715 0.946 1.141 1.331 1.481 1.6 1.843 1.953 2.058 2.09 2.393 2.512 2.719 2.914 3.108 3.2 3.368 3.533 3.752 3.894 4.045 4.267 4.485 4.667 4.823 4.988 5.188 5.35 5.513 5.706 5.883 6.075 6.315 6.593 6.836 7.067 7.3 7.523 7.758 8.015 8.249 8.47 8.705 8.92 9.108 9.208 9.274 9.207 8.588 7.35 6.163 5.065 4.002 3.005 2.123 1.331 0.631 -0.06 -0.63 -1.127 -1.573 -1.99 -2.406 -2.81 -3.237 -3.624 -3.965 -4.308 -4.656 -4.943 -5.234 -5.526 -5.759 -6.011 -6.265 -6.515 -6.768 -6.939 -7.105 -7.371 -7.568 -7.778 -7.893 -8.164 -8.463 -8.771 -8.923 -9.269 -9.383 -9.55 -9.74 -10.173 -10.405 -10.649 -10.901 -11.168 -11.475 -11.847 -12.578 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 49af2942..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6414 ,TETRA ,17589505,Sat Nov 27 17:15:35 CET,Sat Nov 27 19:16:20 CET,0.0 0.79 1.134 1.414 1.628 1.806 1.978 2.15 2.457 2.608 2.753 2.788 3.123 3.255 3.498 3.731 3.96 4.066 4.27 4.473 4.761 4.943 5.12 5.377 5.627 5.875 6.155 6.464 6.853 7.212 7.575 8.029 8.458 8.869 9.337 9.857 10.349 10.882 11.447 12.05 12.699 13.425 14.273 15.095 16.014 17.06 18.267 19.565 21.033 22.762 24.701 26.107 26.827 27.131 27.226 27.249 27.219 27.127 27.012 26.894 26.766 26.646 26.527 26.374 26.221 26.074 25.901 25.759 25.638 25.498 25.345 25.219 25.095 24.969 24.866 24.755 24.629 24.49 24.353 24.26 24.156 23.989 23.868 23.741 23.675 23.54 23.404 23.245 23.158 22.871 22.871 22.767 22.656 22.402 22.258 22.08 21.891 21.705 21.491 21.198 20.238 -2 ,14583 ,TETRA ,17589506,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:38:04 CET,0.0 0.687 0.969 1.226 1.462 1.685 1.881 2.052 2.387 2.541 2.676 2.708 3.046 3.165 3.394 3.606 3.816 3.916 4.103 4.292 4.568 4.751 4.943 5.229 5.504 5.757 5.994 6.229 6.515 6.787 7.07 7.41 7.734 8.056 8.435 8.838 9.206 9.61 10.069 10.553 11.046 11.641 12.365 13.034 13.794 14.66 15.628 16.737 18.035 19.527 21.251 22.448 22.983 23.169 23.231 23.251 23.172 22.995 22.811 22.604 22.416 22.263 22.125 21.996 21.869 21.738 21.593 21.464 21.337 21.194 21.051 20.918 20.761 20.605 20.492 20.377 20.247 20.077 19.876 19.745 19.613 19.42 19.295 19.166 19.099 18.951 18.797 18.659 18.575 18.276 18.284 18.189 18.073 17.841 17.701 17.532 17.362 17.158 16.911 16.639 15.606 -3 ,11642 ,TETRA ,17589507,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:36:55 CET,0.0 0.793 1.11 1.354 1.558 1.764 1.978 2.174 2.478 2.624 2.77 2.83 3.178 3.306 3.575 3.822 4.039 4.143 4.348 4.542 4.809 4.989 5.214 5.598 5.952 6.279 6.6 6.909 7.301 7.679 8.036 8.462 8.865 9.254 9.711 10.221 10.699 11.213 11.764 12.35 12.958 13.639 14.448 15.223 16.112 17.149 18.345 19.64 21.057 22.623 24.466 25.917 26.616 26.93 27.033 27.004 26.917 26.807 26.688 26.516 26.328 26.151 25.993 25.856 25.714 25.576 25.431 25.288 25.156 25.01 24.851 24.73 24.605 24.463 24.35 24.231 24.103 23.965 23.815 23.714 23.61 23.447 23.315 23.173 23.106 22.965 22.81 22.628 22.533 22.247 22.259 22.159 22.05 21.812 21.677 21.536 21.369 21.21 21.005 20.672 20.04 -4 ,16071 ,TETRA ,17589508,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:33:19 CET,0.0 1.175 1.494 1.756 2.014 2.217 2.401 2.568 2.867 3.007 3.144 3.207 3.555 3.685 3.945 4.199 4.424 4.53 4.743 4.945 5.221 5.4 5.589 5.874 6.143 6.39 6.624 6.846 7.127 7.402 7.667 7.992 8.304 8.606 8.969 9.379 9.78 10.234 10.699 11.183 11.706 12.3 12.978 13.646 14.448 15.428 16.628 17.952 19.415 21.096 23.093 24.587 25.357 25.769 25.981 26.056 26.076 26.057 25.992 25.908 25.799 25.689 25.564 25.426 25.298 25.157 24.997 24.852 24.706 24.544 24.38 24.24 24.107 23.97 23.85 23.713 23.564 23.422 23.262 23.158 23.058 22.88 22.757 22.619 22.55 22.416 22.273 22.128 22.055 21.786 21.817 21.712 21.608 21.408 21.28 21.15 21.02 20.848 20.607 20.317 19.898 -5 ,17463 ,TETRA ,17589509,Sat Nov 27 17:16:31 CET,Sat Nov 27 19:32:40 CET,0.0 0.785 1.167 1.47 1.674 1.851 2.045 2.245 2.566 2.7 2.839 2.893 3.245 3.371 3.595 3.808 4.038 4.153 4.36 4.548 4.826 5.002 5.172 5.428 5.691 5.946 6.183 6.407 6.686 6.96 7.233 7.557 7.875 8.187 8.527 8.911 9.288 9.695 10.152 10.652 11.173 11.745 12.39 13.055 13.85 14.704 15.694 16.777 18.009 19.456 21.12 22.325 22.826 23.049 23.137 23.149 23.074 22.951 22.831 22.693 22.56 22.41 22.253 22.121 21.981 21.813 21.628 21.474 21.335 21.176 20.995 20.844 20.697 20.536 20.396 20.26 20.139 20.009 19.871 19.766 19.651 19.475 19.352 19.218 19.151 19.007 18.851 18.697 18.617 18.334 18.334 18.231 18.123 17.874 17.743 17.58 17.377 17.177 16.953 16.668 15.711 -6 ,6205 ,TETRA ,17589510,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:29:17 CET,0.0 1.106 1.409 1.669 1.891 2.093 2.271 2.441 2.78 2.928 3.064 3.096 3.434 3.555 3.798 4.027 4.25 4.357 4.551 4.74 5.043 5.242 5.427 5.696 5.946 6.19 6.438 6.679 6.977 7.278 7.565 7.896 8.218 8.52 8.874 9.26 9.623 10.026 10.492 11.0 11.491 12.053 12.71 13.356 14.109 14.918 15.845 16.881 18.087 19.492 21.035 22.169 22.71 22.918 22.988 23.002 22.959 22.803 22.577 22.36 22.192 22.032 21.861 21.691 21.539 21.406 21.271 21.133 21.003 20.873 20.716 20.575 20.438 20.284 20.15 20.018 19.897 19.767 19.617 19.507 19.384 19.194 19.074 18.947 18.87 18.699 18.528 18.346 18.253 17.96 17.931 17.8 17.672 17.413 17.261 17.095 16.901 16.68 16.415 16.076 15.136 -7 ,11889 ,TETRA ,17589511,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:33:54 CET,0.0 1.23 1.614 1.931 2.194 2.427 2.607 2.775 3.104 3.256 3.395 3.428 3.769 3.897 4.131 4.367 4.597 4.703 4.915 5.118 5.427 5.623 5.795 6.055 6.308 6.548 6.785 7.009 7.306 7.592 7.863 8.178 8.479 8.792 9.16 9.555 9.918 10.321 10.738 11.187 11.707 12.287 12.96 13.608 14.356 15.226 16.206 17.33 18.662 20.072 21.561 22.701 23.238 23.447 23.49 23.454 23.382 23.273 23.149 22.966 22.754 22.529 22.328 22.167 22.009 21.879 21.726 21.579 21.453 21.318 21.18 21.038 20.88 20.736 20.627 20.511 20.378 20.225 20.076 19.972 19.872 19.713 19.594 19.463 19.385 19.231 19.07 18.889 18.781 18.475 18.463 18.347 18.222 17.954 17.818 17.671 17.505 17.329 17.143 16.932 16.033 -8 ,3804 ,TETRA ,17589512,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:29:48 CET,0.0 0.861 1.179 1.431 1.657 1.856 2.029 2.19 2.502 2.644 2.788 2.86 3.194 3.312 3.564 3.807 4.028 4.139 4.364 4.578 4.863 5.045 5.23 5.489 5.747 6.003 6.249 6.491 6.807 7.117 7.407 7.765 8.107 8.43 8.813 9.241 9.654 10.092 10.561 11.062 11.641 12.372 13.212 14.044 15.004 16.02 17.221 18.613 20.102 21.724 23.573 24.891 25.604 26.025 26.193 26.261 26.226 26.115 25.998 25.845 25.704 25.557 25.38 25.221 25.045 24.855 24.656 24.447 24.266 24.098 23.943 23.82 23.655 23.47 23.34 23.202 23.04 22.861 22.677 22.559 22.436 22.212 22.063 21.938 21.87 21.7 21.511 21.298 21.188 20.887 20.866 20.756 20.64 20.413 20.283 20.101 19.903 19.7 19.467 19.202 17.964 -9 ,23170 ,TETRA ,17589513,Sat Nov 27 17:16:33 CET,Sat Nov 27 19:32:35 CET,0.0 0.462 0.73 0.943 1.148 1.357 1.541 1.708 2.018 2.154 2.306 2.375 2.715 2.835 3.059 3.274 3.495 3.603 3.811 4.011 4.281 4.448 4.624 4.897 5.151 5.391 5.625 5.851 6.132 6.404 6.675 6.999 7.309 7.61 7.962 8.352 8.721 9.158 9.72 10.369 11.011 11.717 12.542 13.34 14.267 15.327 16.587 17.942 19.457 21.198 23.145 24.533 25.191 25.55 25.697 25.67 25.62 25.563 25.462 25.346 25.233 25.12 24.986 24.823 24.662 24.51 24.337 24.183 24.061 23.933 23.777 23.615 23.441 23.271 23.14 23.006 22.864 22.718 22.564 22.456 22.342 22.156 22.022 21.88 21.814 21.686 21.542 21.372 21.275 20.979 20.98 20.877 20.759 20.492 20.351 20.211 20.075 19.91 19.664 19.347 18.694 -10 ,7441 ,TETRA ,17589514,Sat Nov 27 17:16:33 CET,Sat Nov 27 19:33:50 CET,0.0 0.603 0.865 1.091 1.313 1.522 1.702 1.866 2.167 2.304 2.449 2.5 2.84 2.963 3.188 3.402 3.6 3.705 3.92 4.114 4.382 4.563 4.757 5.06 5.392 5.737 6.072 6.408 6.83 7.208 7.555 7.97 8.372 8.757 9.203 9.701 10.189 10.739 11.321 11.936 12.576 13.308 14.128 14.913 15.867 16.933 18.13 19.398 20.867 22.596 24.545 26.042 26.792 27.231 27.46 27.545 27.531 27.441 27.352 27.2 27.025 26.868 26.72 26.596 26.472 26.337 26.187 26.056 25.932 25.797 25.646 25.505 25.368 25.233 25.121 25.011 24.882 24.735 24.587 24.483 24.372 24.199 24.092 23.98 23.909 23.76 23.612 23.444 23.356 23.068 23.058 22.951 22.853 22.629 22.492 22.365 22.252 22.114 21.954 21.739 21.146 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt deleted file mode 100644 index cf3318d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1794 ,KEBNE ,17040486,Thu Dec 23 00:41:59 CET,Thu Dec 23 02:25:13 CET,0.0 0.488 0.767 0.984 1.175 1.366 1.561 1.746 2.095 2.244 2.391 2.498 2.841 2.978 3.224 3.465 3.699 3.812 4.046 4.287 4.616 4.815 5.019 5.319 5.601 5.879 6.142 6.391 6.722 7.052 7.364 7.754 8.135 8.507 8.968 9.475 9.963 10.501 11.074 11.687 12.325 13.084 13.967 14.809 15.817 16.961 18.316 19.848 21.64 23.801 26.511 28.853 30.252 31.124 31.706 32.116 32.416 32.633 32.743 32.791 32.811 32.829 32.838 32.826 32.8 32.754 32.688 32.613 32.548 32.474 32.393 32.339 32.278 32.191 32.101 32.008 31.934 31.836 31.712 31.642 31.574 31.443 31.352 31.27 31.227 31.121 31.005 30.889 30.825 30.594 30.606 30.518 30.432 30.253 30.136 30.021 29.916 29.775 29.614 29.432 29.055 -2 ,26220 ,KEBNE ,17040487,Thu Dec 23 00:41:59 CET,Thu Dec 23 02:25:34 CET,0.0 0.615 0.963 1.228 1.437 1.626 1.812 2.003 2.325 2.462 2.606 2.684 3.01 3.142 3.401 3.642 3.873 3.992 4.215 4.417 4.717 4.916 5.112 5.409 5.687 5.952 6.224 6.484 6.82 7.159 7.485 7.871 8.257 8.636 9.073 9.559 10.006 10.499 11.041 11.648 12.33 13.085 13.944 14.816 15.844 17.012 18.404 20.026 21.89 24.106 26.887 29.278 30.708 31.584 32.143 32.514 32.737 32.867 32.938 32.991 33.011 32.997 32.96 32.924 32.868 32.786 32.697 32.621 32.543 32.443 32.342 32.26 32.161 32.053 31.97 31.876 31.772 31.668 31.562 31.483 31.396 31.266 31.18 31.086 31.037 30.934 30.822 30.695 30.627 30.401 30.429 30.354 30.272 30.096 30.003 29.889 29.77 29.654 29.494 29.294 28.843 -3 ,18858 ,KEBNE ,17040489,Thu Dec 23 00:44:04 CET,Thu Dec 23 02:26:51 CET,0.0 0.674 0.971 1.216 1.429 1.613 1.779 1.945 2.256 2.408 2.562 2.651 2.98 3.109 3.349 3.592 3.825 3.933 4.155 4.373 4.69 4.892 5.083 5.378 5.659 5.924 6.186 6.451 6.79 7.108 7.409 7.783 8.16 8.529 8.954 9.423 9.882 10.397 10.953 11.55 12.199 12.952 13.831 14.694 15.68 16.803 18.17 19.716 21.521 23.699 26.357 28.607 29.917 30.75 31.331 31.771 32.062 32.233 32.326 32.386 32.396 32.386 32.367 32.316 32.264 32.235 32.184 32.111 32.059 32.002 31.928 31.856 31.777 31.689 31.599 31.506 31.409 31.299 31.183 31.101 31.015 30.856 30.737 30.624 30.576 30.48 30.365 30.234 30.164 29.927 29.92 29.829 29.739 29.53 29.412 29.293 29.167 29.032 28.854 28.6 28.253 -4 ,14090 ,KEBNE ,17040490,Thu Dec 23 00:44:04 CET,Thu Dec 23 02:26:38 CET,0.0 0.801 1.128 1.398 1.664 1.912 2.099 2.275 2.652 2.824 2.98 3.067 3.396 3.532 3.784 4.027 4.261 4.376 4.609 4.825 5.13 5.336 5.538 5.84 6.128 6.395 6.643 6.882 7.203 7.506 7.806 8.183 8.549 8.9 9.294 9.755 10.216 10.734 11.301 11.91 12.571 13.324 14.203 15.083 16.128 17.283 18.623 20.147 21.977 24.209 26.952 29.223 30.605 31.556 32.113 32.497 32.773 32.934 33.001 33.05 33.075 33.047 33.006 32.952 32.897 32.837 32.749 32.667 32.595 32.518 32.429 32.344 32.253 32.162 32.095 32.032 31.956 31.867 31.781 31.713 31.635 31.522 31.438 31.347 31.295 31.189 31.095 30.996 30.941 30.722 30.753 30.682 30.607 30.415 30.299 30.187 30.057 29.894 29.715 29.498 28.892 -5 ,28869 ,KEBNE ,17040492,Thu Dec 23 00:44:04 CET,Thu Dec 23 02:29:32 CET,0.0 0.945 1.241 1.495 1.705 1.893 2.08 2.251 2.557 2.704 2.843 2.898 3.223 3.352 3.604 3.847 4.096 4.22 4.437 4.637 4.945 5.138 5.325 5.604 5.869 6.139 6.406 6.668 7.008 7.321 7.641 8.033 8.392 8.74 9.145 9.615 10.066 10.573 11.131 11.69 12.267 12.961 13.807 14.673 15.7 16.843 18.199 19.739 21.595 23.84 26.578 28.9 30.279 31.169 31.777 32.195 32.431 32.569 32.665 32.744 32.764 32.766 32.742 32.7 32.665 32.605 32.538 32.465 32.371 32.276 32.191 32.116 32.04 31.948 31.872 31.801 31.721 31.636 31.549 31.471 31.381 31.258 31.171 31.075 31.023 30.904 30.77 30.639 30.569 30.33 30.338 30.246 30.155 29.955 29.846 29.739 29.623 29.479 29.29 29.07 28.71 -6 ,30353 ,KEBNE ,17040493,Thu Dec 23 00:51:21 CET,Thu Dec 23 02:34:01 CET,0.0 0.647 0.934 1.197 1.412 1.6 1.783 1.961 2.302 2.459 2.604 2.668 2.99 3.116 3.339 3.574 3.808 3.926 4.159 4.387 4.713 4.908 5.1 5.379 5.654 5.934 6.2 6.451 6.777 7.084 7.384 7.781 8.17 8.533 8.953 9.437 9.903 10.404 10.955 11.54 12.145 12.843 13.68 14.54 15.563 16.737 18.141 19.71 21.577 23.859 26.655 29.026 30.472 31.489 32.139 32.547 32.832 33.03 33.146 33.233 33.274 33.277 33.256 33.216 33.18 33.136 33.073 33.014 32.956 32.868 32.776 32.707 32.616 32.501 32.415 32.338 32.259 32.154 32.021 31.938 31.857 31.744 31.661 31.566 31.521 31.41 31.284 31.159 31.095 30.859 30.864 30.794 30.703 30.499 30.39 30.273 30.163 30.027 29.875 29.681 29.219 -7 ,1255 ,KEBNE ,17040495,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:36:30 CET,0.0 0.492 0.762 1.01 1.226 1.405 1.583 1.769 2.109 2.256 2.405 2.493 2.823 2.96 3.225 3.481 3.736 3.858 4.09 4.315 4.652 4.858 5.047 5.346 5.645 5.925 6.183 6.425 6.757 7.093 7.41 7.794 8.178 8.546 8.969 9.441 9.908 10.438 10.996 11.605 12.267 12.996 13.875 14.762 15.804 16.986 18.307 19.819 21.642 23.881 26.654 28.956 30.367 31.282 31.886 32.253 32.467 32.628 32.739 32.805 32.835 32.845 32.824 32.787 32.716 32.634 32.552 32.466 32.39 32.303 32.189 32.101 32.011 31.89 31.801 31.722 31.634 31.54 31.438 31.359 31.279 31.159 31.065 30.964 30.911 30.792 30.672 30.544 30.478 30.248 30.239 30.152 30.06 29.845 29.73 29.616 29.503 29.37 29.19 28.968 28.308 -8 ,17583 ,KEBNE ,17040496,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:35:11 CET,0.0 0.744 1.125 1.388 1.585 1.787 1.975 2.14 2.474 2.638 2.79 2.885 3.221 3.357 3.613 3.846 4.064 4.177 4.406 4.627 4.953 5.16 5.361 5.646 5.922 6.197 6.469 6.734 7.074 7.403 7.725 8.131 8.523 8.9 9.334 9.832 10.323 10.863 11.459 12.078 12.707 13.435 14.307 15.18 16.214 17.349 18.724 20.346 22.17 24.415 27.23 29.487 30.881 31.82 32.424 32.833 33.085 33.25 33.36 33.424 33.432 33.408 33.365 33.313 33.245 33.159 33.053 32.959 32.875 32.797 32.722 32.639 32.524 32.402 32.319 32.229 32.126 32.017 31.904 31.825 31.739 31.582 31.478 31.382 31.33 31.222 31.113 30.993 30.927 30.695 30.704 30.618 30.529 30.352 30.257 30.159 30.033 29.896 29.741 29.538 29.047 -9 ,15418 ,KEBNE ,17040498,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:34:49 CET,0.0 0.765 1.073 1.357 1.623 1.855 2.077 2.276 2.64 2.812 2.964 3.052 3.388 3.524 3.803 4.063 4.304 4.42 4.643 4.877 5.197 5.387 5.575 5.859 6.138 6.401 6.658 6.903 7.237 7.572 7.877 8.236 8.601 8.953 9.351 9.818 10.274 10.78 11.344 11.944 12.571 13.287 14.102 14.942 15.973 17.131 18.442 19.947 21.768 23.959 26.655 29.022 30.456 31.339 31.89 32.289 32.568 32.749 32.86 32.925 32.959 32.974 32.964 32.95 32.92 32.884 32.836 32.777 32.725 32.651 32.567 32.517 32.463 32.393 32.328 32.254 32.17 32.072 31.971 31.897 31.812 31.677 31.586 31.484 31.431 31.328 31.213 31.095 31.032 30.804 30.81 30.726 30.647 30.45 30.34 30.234 30.109 29.977 29.807 29.609 29.214 -10 ,20912 ,KEBNE ,17040499,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:35:52 CET,0.0 0.534 0.763 0.971 1.179 1.366 1.551 1.744 2.099 2.261 2.42 2.518 2.844 2.965 3.189 3.41 3.629 3.736 3.957 4.165 4.462 4.661 4.857 5.142 5.419 5.689 5.94 6.183 6.512 6.841 7.15 7.52 7.876 8.215 8.636 9.133 9.614 10.144 10.707 11.299 11.927 12.66 13.511 14.375 15.43 16.609 18.026 19.693 21.613 23.884 26.621 28.882 30.183 31.036 31.633 32.045 32.303 32.468 32.558 32.607 32.645 32.661 32.657 32.639 32.616 32.582 32.524 32.449 32.379 32.303 32.199 32.112 32.009 31.909 31.85 31.782 31.7 31.606 31.506 31.438 31.359 31.223 31.138 31.048 30.998 30.888 30.763 30.64 30.579 30.351 30.366 30.289 30.203 30.007 29.906 29.795 29.66 29.491 29.293 29.098 28.715 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index d08c8eed..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9034 ,TETRA ,17976856,Tue Dec 21 05:28:32 CET,Tue Dec 21 07:50:41 CET,0.0 0.588 0.877 1.124 1.313 1.491 1.662 1.821 2.104 2.254 2.412 2.462 2.784 2.895 3.109 3.325 3.542 3.643 3.838 4.029 4.301 4.475 4.638 4.872 5.104 5.322 5.514 5.703 5.956 6.197 6.423 6.686 6.942 7.188 7.474 7.797 8.093 8.406 8.721 9.044 9.381 9.753 10.212 10.711 11.222 11.654 12.071 12.468 12.83 13.144 13.282 13.059 12.702 12.279 11.878 11.484 11.104 10.732 10.399 10.077 9.729 9.347 8.974 8.623 8.286 7.97 7.657 7.404 7.18 6.928 6.66 6.433 6.201 5.949 5.738 5.524 5.296 5.062 4.83 4.669 4.504 4.251 4.069 3.868 3.771 3.581 3.364 3.128 2.996 2.654 2.596 2.458 2.308 1.967 1.781 1.603 1.381 1.138 0.941 0.669 0.172 -2 ,22072 ,TETRA ,17976859,Tue Dec 21 05:28:32 CET,Tue Dec 21 07:50:35 CET,0.0 1.262 1.57 1.846 2.082 2.265 2.432 2.596 2.875 2.992 3.109 3.111 3.416 3.517 3.713 3.884 4.061 4.153 4.324 4.481 4.704 4.853 4.995 5.187 5.367 5.541 5.719 5.888 6.095 6.293 6.477 6.688 6.906 7.129 7.384 7.658 7.933 8.303 8.741 9.183 9.625 10.111 10.65 11.158 11.748 12.368 12.997 13.643 14.303 14.896 15.286 15.207 14.895 14.507 14.048 13.553 13.066 12.607 12.23 11.869 11.543 11.214 10.876 10.56 10.248 9.927 9.584 9.27 8.993 8.724 8.44 8.201 7.959 7.695 7.491 7.294 7.079 6.856 6.631 6.467 6.294 6.028 5.846 5.64 5.537 5.343 5.148 4.943 4.83 4.491 4.419 4.273 4.128 3.824 3.67 3.515 3.344 3.122 2.855 2.531 1.665 -3 ,8242 ,TETRA ,17976861,Tue Dec 21 05:28:32 CET,Tue Dec 21 07:48:24 CET,0.0 0.788 1.111 1.379 1.572 1.743 1.897 2.048 2.316 2.426 2.533 2.536 2.859 2.963 3.141 3.318 3.492 3.581 3.739 3.901 4.138 4.277 4.41 4.605 4.797 4.992 5.168 5.336 5.557 5.76 5.955 6.181 6.401 6.61 6.84 7.116 7.375 7.658 7.954 8.249 8.569 8.919 9.301 9.684 10.119 10.544 10.984 11.448 11.993 12.567 12.991 12.901 12.506 12.052 11.601 11.089 10.624 10.229 9.822 9.341 8.917 8.514 8.117 7.743 7.379 7.055 6.73 6.442 6.199 5.936 5.635 5.395 5.161 4.906 4.709 4.501 4.272 4.032 3.782 3.617 3.452 3.182 2.976 2.767 2.666 2.476 2.266 2.023 1.909 1.593 1.568 1.449 1.327 1.028 0.863 0.692 0.489 0.28 0.086 -0.167 -0.795 -4 ,13957 ,TETRA ,17976864,Tue Dec 21 05:33:31 CET,Tue Dec 21 07:52:31 CET,0.0 0.658 0.942 1.176 1.392 1.596 1.781 1.941 2.209 2.328 2.445 2.461 2.772 2.865 3.052 3.236 3.402 3.482 3.646 3.803 4.048 4.204 4.34 4.534 4.718 4.89 5.067 5.251 5.475 5.673 5.861 6.091 6.317 6.523 6.758 7.083 7.453 7.854 8.264 8.685 9.131 9.601 10.109 10.634 11.208 11.814 12.489 13.16 13.829 14.47 14.911 14.831 14.47 14.055 13.662 13.231 12.781 12.347 11.955 11.529 11.131 10.752 10.374 9.996 9.645 9.343 9.032 8.761 8.531 8.283 8.019 7.801 7.57 7.351 7.19 6.994 6.771 6.532 6.276 6.105 5.938 5.664 5.468 5.274 5.175 4.973 4.757 4.507 4.366 4.017 3.982 3.851 3.703 3.359 3.179 3.006 2.809 2.6 2.339 2.007 1.086 -5 ,10767 ,TETRA ,17976866,Tue Dec 21 05:34:31 CET,Tue Dec 21 07:53:55 CET,0.0 0.94 1.224 1.447 1.626 1.801 1.977 2.15 2.483 2.622 2.746 2.767 3.075 3.175 3.355 3.523 3.692 3.779 3.944 4.099 4.319 4.457 4.59 4.782 4.965 5.135 5.296 5.452 5.654 5.861 6.054 6.276 6.485 6.69 6.921 7.162 7.402 7.662 7.936 8.23 8.538 8.89 9.307 9.701 10.131 10.629 11.241 11.887 12.597 13.278 13.682 13.572 13.238 12.829 12.434 12.019 11.607 11.248 10.919 10.532 10.171 9.84 9.528 9.231 8.96 8.738 8.489 8.236 8.016 7.787 7.543 7.353 7.159 6.944 6.777 6.604 6.423 6.232 6.016 5.866 5.714 5.487 5.334 5.167 5.081 4.895 4.703 4.503 4.392 4.071 4.05 3.933 3.813 3.485 3.304 3.141 2.966 2.784 2.59 2.325 1.788 -6 ,22934 ,TETRA ,17976868,Tue Dec 21 05:40:31 CET,Tue Dec 21 07:59:34 CET,0.0 0.514 0.808 1.042 1.237 1.397 1.545 1.694 1.985 2.12 2.249 2.27 2.593 2.698 2.882 3.064 3.241 3.324 3.484 3.642 3.882 4.03 4.17 4.378 4.575 4.768 4.958 5.174 5.509 5.831 6.128 6.494 6.859 7.205 7.579 7.974 8.352 8.735 9.137 9.586 10.043 10.527 11.073 11.622 12.204 12.772 13.407 14.094 14.751 15.294 15.548 15.355 14.921 14.421 13.911 13.347 12.831 12.402 11.992 11.531 11.158 10.828 10.501 10.177 9.862 9.567 9.265 8.993 8.746 8.499 8.248 8.047 7.842 7.62 7.44 7.254 7.041 6.801 6.559 6.378 6.188 5.911 5.729 5.533 5.43 5.227 5.014 4.789 4.678 4.36 4.336 4.205 4.069 3.761 3.589 3.401 3.177 2.904 2.624 2.274 1.462 -7 ,8031 ,TETRA ,17976870,Tue Dec 21 05:40:34 CET,Tue Dec 21 07:59:55 CET,0.0 0.87 1.186 1.493 1.747 1.951 2.132 2.282 2.544 2.661 2.777 2.798 3.117 3.216 3.399 3.593 3.782 3.867 4.021 4.16 4.37 4.514 4.654 4.861 5.066 5.263 5.451 5.634 5.873 6.099 6.302 6.53 6.755 6.973 7.214 7.479 7.735 8.02 8.309 8.607 8.904 9.231 9.621 10.008 10.454 10.934 11.55 12.237 12.86 13.46 13.899 13.86 13.605 13.233 12.81 12.388 11.98 11.579 11.216 10.839 10.503 10.193 9.875 9.552 9.248 8.977 8.668 8.376 8.12 7.848 7.564 7.33 7.094 6.846 6.641 6.425 6.217 5.994 5.75 5.589 5.437 5.196 5.003 4.807 4.715 4.523 4.313 4.106 3.997 3.661 3.611 3.471 3.321 2.966 2.783 2.586 2.376 2.18 1.962 1.718 0.965 -8 ,21036 ,TETRA ,17976873,Tue Dec 21 05:40:32 CET,Tue Dec 21 08:10:35 CET,0.0 0.73 0.951 1.17 1.37 1.543 1.697 1.837 2.094 2.219 2.34 2.348 2.666 2.77 2.96 3.134 3.312 3.395 3.553 3.703 3.924 4.068 4.202 4.403 4.595 4.776 4.954 5.136 5.367 5.578 5.78 6.013 6.223 6.424 6.667 6.934 7.176 7.45 7.751 8.051 8.347 8.683 9.049 9.398 9.91 10.552 11.208 11.901 12.571 13.118 13.492 13.364 13.004 12.527 12.012 11.514 11.023 10.559 10.166 9.763 9.408 9.108 8.81 8.511 8.246 7.996 7.726 7.483 7.268 7.042 6.804 6.59 6.375 6.163 5.992 5.802 5.599 5.382 5.133 4.961 4.795 4.549 4.383 4.196 4.096 3.894 3.677 3.447 3.321 2.978 2.938 2.803 2.654 2.338 2.162 1.968 1.744 1.452 1.146 0.841 0.164 -9 ,31713 ,TETRA ,17976875,Tue Dec 21 05:44:31 CET,Tue Dec 21 08:05:13 CET,0.0 0.871 1.176 1.4 1.598 1.767 1.922 2.062 2.307 2.425 2.558 2.598 2.912 3.007 3.199 3.384 3.549 3.628 3.783 3.935 4.15 4.285 4.416 4.617 4.815 5.0 5.184 5.354 5.561 5.774 5.976 6.211 6.451 6.687 6.948 7.23 7.488 7.783 8.177 8.637 9.089 9.576 10.113 10.633 11.231 11.833 12.475 13.199 13.948 14.564 14.969 14.875 14.476 13.998 13.575 13.141 12.746 12.359 11.98 11.573 11.223 10.92 10.617 10.322 10.028 9.737 9.426 9.149 8.894 8.633 8.369 8.137 7.884 7.629 7.434 7.223 7.001 6.783 6.575 6.427 6.267 6.003 5.818 5.634 5.536 5.33 5.123 4.91 4.797 4.46 4.427 4.297 4.158 3.85 3.686 3.523 3.327 3.116 2.878 2.551 2.01 -10 ,7120 ,TETRA ,17976877,Tue Dec 21 05:44:31 CET,Tue Dec 21 08:04:53 CET,0.0 0.564 0.843 1.07 1.26 1.43 1.591 1.738 1.997 2.119 2.235 2.241 2.554 2.66 2.861 3.039 3.203 3.288 3.453 3.601 3.82 3.976 4.126 4.326 4.519 4.699 4.874 5.049 5.276 5.489 5.716 6.046 6.388 6.717 7.078 7.476 7.849 8.238 8.665 9.108 9.55 10.047 10.626 11.174 11.798 12.448 13.142 13.866 14.505 15.032 15.376 15.342 15.07 14.706 14.305 13.844 13.394 12.967 12.572 12.176 11.831 11.537 11.239 10.924 10.643 10.384 10.094 9.814 9.567 9.319 9.068 8.851 8.602 8.333 8.127 7.916 7.684 7.447 7.209 7.045 6.871 6.581 6.385 6.19 6.082 5.868 5.655 5.431 5.319 4.988 4.961 4.831 4.695 4.382 4.206 4.043 3.872 3.676 3.451 3.145 2.379 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index ce2dca7d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22332 ,KEBNE ,17040500,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:33:45 CET,0.0 0.647 0.899 1.068 1.21 1.35 1.474 1.594 1.806 1.904 2.01 2.027 2.304 2.387 2.541 2.688 2.82 2.883 3.012 3.131 3.301 3.413 3.52 3.69 3.858 4.015 4.161 4.302 4.486 4.662 4.829 5.022 5.209 5.382 5.583 5.815 6.031 6.25 6.452 6.658 6.859 7.066 7.325 7.548 7.785 8.035 8.295 8.564 8.742 8.698 8.286 7.568 6.799 6.059 5.371 4.697 4.087 3.524 3.045 2.543 2.096 1.706 1.319 0.948 0.598 0.274 -0.054 -0.333 -0.57 -0.821 -1.082 -1.303 -1.548 -1.793 -1.977 -2.186 -2.403 -2.604 -2.797 -2.944 -3.112 -3.372 -3.546 -3.731 -3.826 -4.011 -4.199 -4.391 -4.493 -4.795 -4.839 -4.969 -5.109 -5.389 -5.529 -5.666 -5.821 -6.006 -6.253 -6.554 -7.359 -2 ,2847 ,KEBNE ,17040501,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:34:02 CET,0.0 0.537 0.744 0.906 1.071 1.254 1.413 1.553 1.803 1.913 2.017 2.02 2.284 2.362 2.514 2.679 2.842 2.907 3.036 3.163 3.351 3.473 3.58 3.734 3.878 4.012 4.144 4.282 4.474 4.643 4.805 5.003 5.181 5.345 5.536 5.755 5.948 6.142 6.349 6.566 6.785 7.015 7.28 7.537 7.802 8.048 8.281 8.44 8.522 8.501 8.087 7.224 6.356 5.543 4.844 4.177 3.565 3.006 2.484 1.966 1.538 1.141 0.737 0.366 0.034 -0.273 -0.586 -0.873 -1.12 -1.373 -1.651 -1.891 -2.131 -2.37 -2.55 -2.753 -2.975 -3.191 -3.415 -3.581 -3.746 -3.981 -4.153 -4.33 -4.417 -4.602 -4.795 -4.989 -5.089 -5.374 -5.37 -5.479 -5.602 -5.875 -6.012 -6.169 -6.366 -6.558 -6.777 -7.038 -7.738 -3 ,26114 ,KEBNE ,17040502,Thu Dec 23 00:51:16 CET,Thu Dec 23 02:34:06 CET,0.0 0.453 0.679 0.861 1.024 1.168 1.294 1.405 1.61 1.706 1.795 1.79 2.062 2.143 2.295 2.451 2.604 2.672 2.824 2.982 3.185 3.298 3.404 3.561 3.711 3.855 3.995 4.137 4.314 4.468 4.616 4.806 4.981 5.147 5.345 5.55 5.727 5.915 6.119 6.349 6.587 6.831 7.089 7.323 7.575 7.818 8.071 8.273 8.385 8.348 7.959 7.143 6.286 5.452 4.678 3.965 3.312 2.699 2.172 1.667 1.243 0.852 0.489 0.157 -0.15 -0.431 -0.722 -0.979 -1.207 -1.448 -1.716 -1.948 -2.189 -2.414 -2.596 -2.791 -2.975 -3.174 -3.384 -3.528 -3.673 -3.901 -4.067 -4.239 -4.331 -4.526 -4.717 -4.933 -5.051 -5.352 -5.421 -5.553 -5.677 -5.972 -6.136 -6.297 -6.456 -6.644 -6.883 -7.164 -7.788 -4 ,3872 ,KEBNE ,17040503,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:35:38 CET,0.0 0.787 1.046 1.224 1.381 1.542 1.706 1.85 2.092 2.194 2.29 2.31 2.593 2.678 2.826 2.969 3.116 3.185 3.318 3.448 3.632 3.761 3.883 4.057 4.218 4.359 4.501 4.64 4.81 4.959 5.099 5.277 5.449 5.607 5.778 5.971 6.145 6.33 6.541 6.761 6.977 7.209 7.485 7.73 7.973 8.202 8.392 8.539 8.625 8.563 8.148 7.342 6.538 5.767 5.093 4.479 3.906 3.36 2.876 2.402 1.986 1.61 1.248 0.89 0.562 0.294 -0.002 -0.283 -0.515 -0.755 -1.001 -1.199 -1.411 -1.638 -1.818 -2.011 -2.207 -2.4 -2.598 -2.743 -2.893 -3.12 -3.281 -3.446 -3.532 -3.728 -3.948 -4.166 -4.269 -4.571 -4.633 -4.768 -4.9 -5.167 -5.306 -5.47 -5.671 -5.876 -6.118 -6.423 -7.101 -5 ,29562 ,KEBNE ,17040504,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:35:33 CET,0.0 0.453 0.68 0.88 1.075 1.25 1.381 1.506 1.745 1.856 1.955 1.946 2.227 2.323 2.497 2.65 2.801 2.872 3.004 3.136 3.32 3.435 3.539 3.686 3.824 3.95 4.082 4.216 4.385 4.537 4.686 4.859 5.021 5.17 5.329 5.515 5.689 5.882 6.093 6.315 6.545 6.779 7.034 7.275 7.526 7.781 8.031 8.228 8.344 8.264 7.786 6.898 6.059 5.274 4.539 3.86 3.213 2.635 2.148 1.648 1.223 0.82 0.411 0.051 -0.275 -0.608 -0.949 -1.238 -1.5 -1.778 -2.057 -2.29 -2.537 -2.806 -3.019 -3.228 -3.435 -3.652 -3.878 -4.038 -4.206 -4.473 -4.641 -4.813 -4.909 -5.101 -5.31 -5.523 -5.625 -5.916 -5.949 -6.081 -6.216 -6.506 -6.68 -6.865 -7.044 -7.239 -7.484 -7.819 -8.483 -6 ,9088 ,KEBNE ,17040505,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:34:38 CET,0.0 0.604 0.827 1.016 1.177 1.304 1.457 1.61 1.859 1.977 2.089 2.111 2.4 2.49 2.654 2.808 2.955 3.033 3.178 3.305 3.485 3.593 3.701 3.869 4.04 4.201 4.344 4.487 4.665 4.826 4.982 5.17 5.343 5.517 5.723 5.939 6.139 6.342 6.547 6.77 6.988 7.213 7.49 7.76 8.013 8.248 8.482 8.657 8.78 8.743 8.249 7.376 6.483 5.63 4.872 4.167 3.547 2.97 2.45 1.939 1.512 1.135 0.772 0.436 0.115 -0.189 -0.504 -0.803 -1.075 -1.353 -1.637 -1.861 -2.089 -2.327 -2.509 -2.69 -2.88 -3.078 -3.287 -3.437 -3.591 -3.832 -3.998 -4.162 -4.243 -4.419 -4.614 -4.809 -4.911 -5.216 -5.255 -5.391 -5.534 -5.798 -5.922 -6.057 -6.231 -6.428 -6.662 -6.951 -7.39 -7 ,1219 ,KEBNE ,17040506,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:33:43 CET,0.0 0.5 0.754 0.955 1.106 1.231 1.357 1.474 1.699 1.808 1.908 1.898 2.169 2.248 2.401 2.551 2.695 2.762 2.893 3.011 3.17 3.273 3.384 3.55 3.698 3.832 3.962 4.086 4.247 4.41 4.569 4.753 4.933 5.097 5.27 5.464 5.645 5.835 6.029 6.232 6.438 6.667 6.931 7.163 7.379 7.588 7.825 8.025 8.079 7.964 7.532 6.667 5.799 5.041 4.362 3.724 3.172 2.663 2.184 1.699 1.277 0.895 0.53 0.184 -0.141 -0.443 -0.756 -1.044 -1.299 -1.563 -1.845 -2.07 -2.276 -2.491 -2.68 -2.876 -3.064 -3.255 -3.458 -3.604 -3.763 -4.012 -4.186 -4.364 -4.458 -4.655 -4.858 -5.075 -5.195 -5.496 -5.511 -5.628 -5.762 -6.058 -6.218 -6.37 -6.523 -6.723 -6.957 -7.187 -7.8 -8 ,13920 ,KEBNE ,17040507,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:33:47 CET,0.0 0.624 0.894 1.085 1.275 1.427 1.543 1.661 1.917 2.029 2.129 2.118 2.387 2.466 2.625 2.781 2.927 2.994 3.126 3.252 3.411 3.519 3.636 3.799 3.953 4.107 4.25 4.371 4.519 4.668 4.813 4.973 5.121 5.266 5.426 5.607 5.788 5.987 6.2 6.413 6.638 6.897 7.156 7.403 7.682 7.947 8.221 8.473 8.663 8.744 8.386 7.517 6.641 5.853 5.096 4.355 3.724 3.17 2.687 2.19 1.759 1.367 0.997 0.657 0.33 0.026 -0.296 -0.584 -0.829 -1.076 -1.338 -1.574 -1.821 -2.065 -2.248 -2.444 -2.663 -2.906 -3.144 -3.286 -3.433 -3.675 -3.841 -4.007 -4.096 -4.301 -4.525 -4.746 -4.866 -5.179 -5.223 -5.347 -5.478 -5.756 -5.914 -6.094 -6.265 -6.441 -6.684 -6.998 -7.929 -9 ,20385 ,KEBNE ,17040508,Thu Dec 23 00:51:19 CET,Thu Dec 23 02:34:17 CET,0.0 0.44 0.649 0.819 0.998 1.172 1.318 1.461 1.707 1.806 1.902 1.895 2.163 2.237 2.385 2.539 2.695 2.77 2.908 3.035 3.202 3.305 3.407 3.55 3.683 3.812 3.949 4.083 4.251 4.407 4.552 4.719 4.878 5.036 5.207 5.382 5.542 5.723 5.934 6.149 6.361 6.579 6.822 7.056 7.321 7.584 7.802 7.972 8.083 8.022 7.617 6.827 5.977 5.208 4.499 3.819 3.252 2.727 2.272 1.828 1.426 1.075 0.726 0.384 0.071 -0.225 -0.54 -0.822 -1.061 -1.311 -1.563 -1.77 -1.989 -2.215 -2.384 -2.557 -2.743 -2.939 -3.141 -3.284 -3.441 -3.684 -3.851 -4.022 -4.109 -4.294 -4.493 -4.695 -4.793 -5.084 -5.115 -5.23 -5.34 -5.594 -5.744 -5.896 -6.06 -6.238 -6.417 -6.621 -7.085 -10 ,24136 ,KEBNE ,17040509,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:34:40 CET,0.0 0.423 0.632 0.823 0.972 1.105 1.229 1.348 1.587 1.703 1.799 1.776 2.031 2.094 2.247 2.397 2.524 2.586 2.716 2.836 2.993 3.102 3.21 3.364 3.528 3.682 3.807 3.926 4.069 4.217 4.372 4.55 4.707 4.848 5.02 5.207 5.373 5.545 5.721 5.904 6.096 6.302 6.527 6.76 6.995 7.213 7.454 7.624 7.7 7.573 7.076 6.2 5.334 4.543 3.84 3.17 2.53 1.956 1.458 0.964 0.537 0.157 -0.212 -0.567 -0.892 -1.195 -1.519 -1.817 -2.059 -2.306 -2.568 -2.778 -3.007 -3.237 -3.413 -3.597 -3.795 -4.014 -4.238 -4.389 -4.542 -4.778 -4.943 -5.111 -5.201 -5.384 -5.563 -5.761 -5.87 -6.168 -6.217 -6.339 -6.455 -6.695 -6.824 -6.987 -7.17 -7.365 -7.591 -7.888 -8.46 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt deleted file mode 100644 index 2c6b863f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8514 ,KEBNE ,17040510,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:34:05 CET,0.0 0.327 0.532 0.723 0.886 1.027 1.171 1.304 1.541 1.655 1.768 1.808 2.096 2.183 2.352 2.522 2.678 2.752 2.905 3.055 3.281 3.414 3.534 3.71 3.884 4.059 4.228 4.391 4.606 4.823 5.032 5.28 5.499 5.696 5.927 6.183 6.422 6.693 6.977 7.256 7.546 7.884 8.298 8.716 9.167 9.641 10.175 10.772 11.423 12.054 12.573 12.75 12.598 12.276 11.94 11.607 11.271 10.939 10.62 10.266 9.963 9.699 9.431 9.175 8.934 8.694 8.454 8.244 8.048 7.854 7.672 7.508 7.313 7.118 6.969 6.806 6.642 6.486 6.317 6.188 6.056 5.862 5.717 5.566 5.495 5.346 5.185 4.995 4.885 4.601 4.609 4.503 4.373 4.104 3.973 3.826 3.641 3.434 3.236 3.006 2.282 -2 ,23997 ,KEBNE ,17040511,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:33:58 CET,0.0 0.508 0.769 1.01 1.173 1.314 1.461 1.592 1.823 1.942 2.065 2.102 2.388 2.476 2.644 2.799 2.954 3.038 3.204 3.365 3.578 3.703 3.832 4.02 4.196 4.368 4.542 4.716 4.937 5.134 5.322 5.564 5.788 5.991 6.212 6.476 6.726 6.982 7.262 7.551 7.844 8.18 8.574 8.954 9.43 9.939 10.468 11.027 11.622 12.274 12.839 12.946 12.788 12.462 12.077 11.726 11.388 11.045 10.741 10.427 10.133 9.86 9.594 9.334 9.089 8.857 8.603 8.373 8.165 7.932 7.705 7.52 7.323 7.116 6.947 6.766 6.581 6.4 6.217 6.094 5.955 5.711 5.545 5.368 5.279 5.109 4.922 4.723 4.622 4.337 4.289 4.168 4.052 3.815 3.697 3.55 3.38 3.159 2.899 2.656 2.271 -3 ,18412 ,KEBNE ,17040512,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:35:22 CET,0.0 0.554 0.828 1.046 1.236 1.388 1.523 1.66 1.92 2.032 2.137 2.143 2.433 2.537 2.735 2.914 3.078 3.154 3.302 3.456 3.683 3.821 3.952 4.146 4.334 4.502 4.668 4.836 5.042 5.233 5.414 5.664 5.904 6.103 6.327 6.59 6.842 7.113 7.418 7.746 8.072 8.429 8.869 9.289 9.759 10.285 10.82 11.355 11.951 12.533 12.982 13.072 12.884 12.627 12.306 11.968 11.666 11.354 11.059 10.733 10.438 10.179 9.929 9.69 9.455 9.23 8.986 8.765 8.572 8.375 8.162 7.987 7.807 7.61 7.456 7.3 7.139 6.972 6.798 6.674 6.548 6.346 6.202 6.066 6.0 5.862 5.709 5.535 5.451 5.178 5.152 5.034 4.917 4.667 4.516 4.36 4.219 4.063 3.866 3.586 2.921 -4 ,6467 ,KEBNE ,17040513,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:33:24 CET,0.0 0.484 0.732 0.936 1.108 1.265 1.388 1.515 1.771 1.884 1.994 2.011 2.291 2.379 2.539 2.704 2.86 2.936 3.093 3.245 3.446 3.575 3.711 3.914 4.094 4.259 4.428 4.598 4.821 5.025 5.205 5.414 5.623 5.842 6.089 6.357 6.622 6.902 7.192 7.503 7.829 8.188 8.58 8.972 9.445 9.919 10.42 10.981 11.61 12.271 12.852 13.018 12.894 12.673 12.41 12.074 11.718 11.386 11.067 10.73 10.446 10.204 9.958 9.724 9.516 9.303 9.075 8.864 8.682 8.48 8.261 8.093 7.928 7.752 7.607 7.453 7.297 7.144 6.985 6.875 6.765 6.593 6.458 6.308 6.232 6.083 5.931 5.77 5.683 5.405 5.354 5.226 5.104 4.851 4.715 4.582 4.399 4.19 3.983 3.689 3.057 -5 ,28527 ,KEBNE ,17040514,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:34:15 CET,0.0 0.519 0.86 1.114 1.28 1.422 1.555 1.674 1.907 2.027 2.139 2.172 2.461 2.568 2.778 2.957 3.124 3.213 3.38 3.523 3.714 3.847 3.987 4.181 4.364 4.545 4.727 4.898 5.11 5.325 5.534 5.784 6.023 6.236 6.478 6.764 7.06 7.374 7.692 8.028 8.386 8.787 9.227 9.664 10.15 10.672 11.248 11.812 12.437 13.122 13.725 13.942 13.881 13.623 13.314 13.023 12.708 12.407 12.113 11.801 11.527 11.275 11.028 10.773 10.538 10.321 10.087 9.867 9.681 9.487 9.269 9.099 8.913 8.708 8.558 8.409 8.249 8.077 7.902 7.778 7.644 7.446 7.319 7.186 7.112 6.944 6.77 6.588 6.496 6.226 6.217 6.112 5.997 5.737 5.593 5.438 5.268 5.03 4.758 4.458 3.504 -6 ,11111 ,KEBNE ,17040515,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:34:12 CET,0.0 0.498 0.784 1.023 1.207 1.347 1.482 1.622 1.898 2.025 2.144 2.167 2.447 2.54 2.714 2.89 3.065 3.149 3.305 3.464 3.693 3.832 3.964 4.14 4.305 4.471 4.641 4.797 4.992 5.186 5.374 5.601 5.816 6.035 6.288 6.559 6.837 7.137 7.451 7.786 8.121 8.491 8.921 9.35 9.838 10.371 10.938 11.517 12.13 12.712 13.231 13.47 13.43 13.217 12.929 12.594 12.267 11.972 11.687 11.395 11.124 10.851 10.596 10.363 10.142 9.914 9.663 9.445 9.251 9.028 8.795 8.63 8.461 8.277 8.13 7.98 7.823 7.657 7.487 7.375 7.267 7.08 6.941 6.798 6.717 6.556 6.402 6.231 6.138 5.851 5.79 5.673 5.559 5.318 5.174 5.014 4.837 4.636 4.404 4.048 3.262 -7 ,20312 ,KEBNE ,17040516,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:35:45 CET,0.0 0.541 0.776 0.953 1.125 1.272 1.407 1.541 1.778 1.886 1.995 2.0 2.277 2.37 2.547 2.712 2.869 2.949 3.103 3.253 3.478 3.62 3.757 3.948 4.131 4.318 4.493 4.659 4.878 5.1 5.312 5.541 5.77 6.0 6.255 6.542 6.822 7.102 7.391 7.711 8.033 8.381 8.79 9.205 9.691 10.229 10.82 11.36 11.91 12.502 12.989 13.1 12.913 12.605 12.264 11.937 11.627 11.3 10.977 10.643 10.345 10.068 9.805 9.531 9.272 9.039 8.796 8.579 8.388 8.19 7.983 7.8 7.607 7.414 7.251 7.081 6.919 6.75 6.575 6.457 6.328 6.114 5.958 5.802 5.725 5.567 5.393 5.199 5.099 4.818 4.79 4.684 4.576 4.321 4.165 3.991 3.818 3.608 3.378 3.131 2.634 -8 ,1971 ,KEBNE ,17040517,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:34:11 CET,0.0 0.575 0.81 1.035 1.223 1.384 1.563 1.73 2.0 2.13 2.255 2.272 2.561 2.665 2.865 3.04 3.198 3.275 3.431 3.583 3.797 3.933 4.071 4.267 4.458 4.634 4.798 4.965 5.184 5.383 5.557 5.781 6.013 6.226 6.471 6.747 7.01 7.307 7.628 7.952 8.271 8.626 9.044 9.47 9.937 10.433 10.976 11.549 12.156 12.768 13.238 13.234 13.009 12.693 12.325 11.939 11.565 11.216 10.903 10.568 10.264 9.978 9.721 9.465 9.216 8.991 8.742 8.514 8.32 8.118 7.901 7.712 7.521 7.327 7.176 7.013 6.832 6.646 6.452 6.319 6.191 5.979 5.824 5.668 5.587 5.412 5.234 5.059 4.966 4.687 4.666 4.555 4.44 4.158 4.001 3.861 3.711 3.526 3.294 2.993 2.28 -9 ,30428 ,KEBNE ,17040518,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:35:47 CET,0.0 0.435 0.635 0.822 0.998 1.126 1.246 1.363 1.579 1.678 1.775 1.785 2.068 2.156 2.32 2.485 2.636 2.711 2.868 3.015 3.226 3.363 3.496 3.688 3.872 4.042 4.202 4.35 4.551 4.757 4.958 5.197 5.418 5.62 5.841 6.098 6.352 6.622 6.918 7.222 7.539 7.894 8.29 8.692 9.128 9.614 10.17 10.706 11.268 11.864 12.363 12.52 12.366 12.04 11.7 11.375 11.065 10.733 10.421 10.094 9.783 9.512 9.255 9.005 8.769 8.541 8.3 8.094 7.904 7.691 7.47 7.297 7.125 6.947 6.813 6.658 6.484 6.309 6.108 5.967 5.82 5.604 5.485 5.358 5.283 5.128 4.968 4.794 4.703 4.428 4.407 4.306 4.207 3.979 3.845 3.704 3.554 3.392 3.171 2.892 2.205 -10 ,16940 ,KEBNE ,17040519,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:33:39 CET,0.0 0.536 0.794 1.006 1.198 1.363 1.505 1.637 1.913 2.044 2.158 2.179 2.459 2.552 2.732 2.897 3.06 3.145 3.311 3.476 3.706 3.856 4.008 4.218 4.412 4.591 4.749 4.906 5.115 5.318 5.515 5.757 6.006 6.242 6.488 6.749 7.0 7.28 7.565 7.86 8.179 8.555 9.002 9.434 9.908 10.4 10.954 11.577 12.239 12.821 13.292 13.356 13.143 12.861 12.548 12.201 11.867 11.543 11.228 10.899 10.609 10.329 10.061 9.813 9.564 9.339 9.089 8.855 8.658 8.446 8.228 8.048 7.86 7.67 7.531 7.375 7.202 7.037 6.855 6.726 6.598 6.393 6.245 6.091 6.014 5.855 5.68 5.5 5.408 5.14 5.149 5.051 4.944 4.7 4.553 4.386 4.211 4.014 3.764 3.469 2.839 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index b9b4fe24..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9900 ,KEBNE ,17040520,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:36:21 CET,0.0 0.638 0.883 1.059 1.229 1.391 1.553 1.708 1.974 2.085 2.184 2.196 2.474 2.57 2.741 2.905 3.061 3.138 3.29 3.421 3.61 3.739 3.86 4.015 4.164 4.325 4.478 4.617 4.792 4.959 5.122 5.324 5.513 5.683 5.914 6.235 6.567 6.924 7.29 7.648 7.995 8.355 8.763 9.152 9.552 9.928 10.266 10.582 10.814 10.89 10.571 9.702 8.809 7.933 7.153 6.491 5.834 5.23 4.731 4.207 3.754 3.339 2.941 2.567 2.199 1.853 1.508 1.204 0.932 0.644 0.329 0.063 -0.215 -0.515 -0.737 -0.959 -1.184 -1.428 -1.701 -1.882 -2.064 -2.338 -2.543 -2.755 -2.858 -3.076 -3.301 -3.544 -3.671 -3.992 -4.033 -4.173 -4.33 -4.658 -4.846 -5.047 -5.236 -5.437 -5.686 -5.983 -6.637 -2 ,5740 ,KEBNE ,17040521,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:34:45 CET,0.0 0.922 1.204 1.418 1.62 1.801 1.962 2.115 2.373 2.493 2.624 2.667 2.95 3.047 3.234 3.407 3.577 3.661 3.822 3.964 4.15 4.273 4.392 4.564 4.732 4.883 5.023 5.169 5.374 5.566 5.734 6.005 6.313 6.578 6.881 7.216 7.53 7.878 8.219 8.555 8.913 9.294 9.711 10.112 10.551 10.973 11.391 11.758 12.024 12.109 11.783 11.033 10.223 9.467 8.748 8.068 7.483 6.947 6.441 5.91 5.483 5.111 4.756 4.42 4.1 3.8 3.484 3.194 2.939 2.67 2.396 2.173 1.911 1.63 1.415 1.204 0.994 0.775 0.552 0.39 0.221 -0.038 -0.234 -0.441 -0.55 -0.789 -1.025 -1.257 -1.382 -1.711 -1.784 -1.935 -2.096 -2.432 -2.598 -2.78 -2.968 -3.191 -3.449 -3.707 -4.611 -3 ,31539 ,KEBNE ,17040522,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:34:04 CET,0.0 1.08 1.359 1.584 1.808 1.991 2.135 2.286 2.6 2.727 2.837 2.885 3.179 3.272 3.446 3.62 3.785 3.864 4.017 4.16 4.354 4.48 4.604 4.785 4.963 5.122 5.269 5.41 5.593 5.771 5.936 6.124 6.312 6.502 6.706 6.929 7.197 7.555 7.925 8.289 8.659 9.072 9.533 9.945 10.365 10.758 11.108 11.405 11.628 11.655 11.169 10.251 9.325 8.396 7.574 6.881 6.267 5.705 5.212 4.695 4.254 3.858 3.461 3.083 2.743 2.431 2.121 1.852 1.599 1.339 1.079 0.855 0.62 0.362 0.162 -0.034 -0.23 -0.417 -0.624 -0.788 -0.957 -1.217 -1.395 -1.567 -1.653 -1.838 -2.045 -2.264 -2.38 -2.703 -2.76 -2.902 -3.049 -3.342 -3.504 -3.695 -3.877 -4.086 -4.344 -4.64 -5.505 -4 ,13309 ,KEBNE ,17040523,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:35:34 CET,0.0 0.828 1.138 1.38 1.599 1.769 1.921 2.062 2.302 2.408 2.518 2.552 2.834 2.927 3.111 3.268 3.412 3.48 3.615 3.756 3.955 4.088 4.211 4.379 4.544 4.703 4.869 5.018 5.193 5.365 5.523 5.707 5.878 6.04 6.237 6.453 6.646 6.843 7.05 7.273 7.505 7.766 8.054 8.297 8.537 8.703 8.777 8.944 9.187 9.224 8.847 7.964 7.103 6.339 5.613 4.889 4.274 3.706 3.205 2.708 2.246 1.824 1.436 1.066 0.709 0.397 0.089 -0.178 -0.403 -0.653 -0.925 -1.161 -1.419 -1.672 -1.862 -2.066 -2.283 -2.521 -2.786 -2.973 -3.157 -3.418 -3.593 -3.774 -3.87 -4.074 -4.31 -4.564 -4.691 -5.023 -5.083 -5.218 -5.367 -5.699 -5.881 -6.074 -6.27 -6.473 -6.723 -7.054 -7.623 -5 ,11939 ,KEBNE ,17040524,Thu Dec 23 00:51:19 CET,Thu Dec 23 02:36:33 CET,0.0 0.868 1.25 1.512 1.704 1.875 2.033 2.161 2.377 2.482 2.589 2.602 2.889 2.983 3.158 3.335 3.505 3.582 3.726 3.876 4.075 4.194 4.319 4.495 4.656 4.795 4.936 5.076 5.248 5.418 5.573 5.803 6.073 6.343 6.652 6.977 7.283 7.598 7.932 8.297 8.648 8.991 9.379 9.769 10.197 10.619 10.995 11.362 11.721 11.876 11.595 10.842 9.966 9.079 8.308 7.578 6.934 6.359 5.856 5.377 4.948 4.531 4.126 3.752 3.413 3.115 2.796 2.502 2.246 1.972 1.683 1.438 1.19 0.95 0.763 0.566 0.356 0.135 -0.087 -0.236 -0.395 -0.659 -0.841 -1.02 -1.117 -1.319 -1.511 -1.701 -1.806 -2.113 -2.162 -2.291 -2.425 -2.702 -2.842 -2.991 -3.163 -3.354 -3.59 -3.914 -4.574 -6 ,21113 ,KEBNE ,17040525,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:36:13 CET,0.0 1.009 1.271 1.463 1.616 1.765 1.911 2.054 2.289 2.395 2.51 2.549 2.836 2.925 3.086 3.248 3.416 3.5 3.645 3.779 3.978 4.106 4.236 4.413 4.576 4.734 4.881 5.014 5.184 5.349 5.504 5.698 5.883 6.048 6.237 6.449 6.641 6.833 7.031 7.232 7.421 7.621 7.836 8.002 8.141 8.252 8.311 8.291 8.125 7.702 6.686 5.185 3.922 2.89 1.952 1.063 0.284 -0.395 -0.98 -1.583 -2.097 -2.545 -2.974 -3.374 -3.759 -4.133 -4.515 -4.845 -5.118 -5.406 -5.722 -5.974 -6.225 -6.493 -6.701 -6.914 -7.144 -7.391 -7.643 -7.818 -7.995 -8.273 -8.475 -8.69 -8.801 -9.018 -9.25 -9.487 -9.61 -9.938 -10.014 -10.154 -10.297 -10.618 -10.783 -10.96 -11.171 -11.384 -11.64 -11.994 -12.756 -7 ,32569 ,KEBNE ,17040526,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:35:27 CET,0.0 0.936 1.259 1.474 1.658 1.818 1.972 2.128 2.434 2.572 2.689 2.716 3.004 3.112 3.329 3.521 3.692 3.77 3.914 4.046 4.236 4.362 4.491 4.688 4.891 5.068 5.215 5.365 5.554 5.719 5.881 6.085 6.279 6.457 6.66 6.873 7.074 7.301 7.565 7.916 8.324 8.744 9.212 9.662 10.139 10.62 11.076 11.514 11.909 12.095 11.81 11.028 10.233 9.53 8.876 8.217 7.598 7.01 6.478 5.933 5.459 5.055 4.676 4.307 3.967 3.668 3.347 3.046 2.783 2.509 2.218 1.98 1.737 1.5 1.317 1.115 0.909 0.692 0.449 0.28 0.112 -0.147 -0.337 -0.546 -0.642 -0.83 -1.041 -1.286 -1.412 -1.721 -1.765 -1.894 -2.024 -2.301 -2.47 -2.655 -2.849 -3.063 -3.293 -3.588 -4.442 -8 ,9625 ,KEBNE ,17040527,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:34:59 CET,0.0 0.723 1.026 1.266 1.473 1.646 1.796 1.919 2.135 2.249 2.356 2.373 2.659 2.756 2.948 3.131 3.286 3.356 3.492 3.629 3.807 3.912 4.026 4.19 4.345 4.5 4.643 4.776 4.957 5.122 5.272 5.466 5.647 5.813 6.054 6.383 6.699 7.047 7.399 7.746 8.1 8.476 8.891 9.278 9.667 10.008 10.348 10.7 10.971 11.038 10.701 9.931 9.114 8.292 7.529 6.867 6.272 5.663 5.114 4.552 4.063 3.632 3.215 2.812 2.443 2.108 1.758 1.437 1.168 0.902 0.646 0.434 0.209 -0.018 -0.201 -0.408 -0.621 -0.825 -1.029 -1.169 -1.318 -1.544 -1.688 -1.849 -1.937 -2.112 -2.316 -2.531 -2.632 -2.936 -2.988 -3.126 -3.275 -3.57 -3.75 -3.998 -4.235 -4.454 -4.676 -4.906 -5.415 -9 ,17542 ,KEBNE ,17040528,Thu Dec 23 00:51:19 CET,Thu Dec 23 02:34:21 CET,0.0 0.985 1.319 1.557 1.75 1.911 2.07 2.228 2.479 2.582 2.694 2.739 3.027 3.125 3.311 3.493 3.663 3.741 3.886 4.018 4.205 4.324 4.443 4.614 4.772 4.914 5.056 5.201 5.378 5.557 5.722 5.898 6.059 6.221 6.413 6.617 6.82 7.056 7.291 7.506 7.737 7.977 8.246 8.497 8.743 8.983 9.205 9.4 9.533 9.49 9.018 8.05 7.076 6.147 5.294 4.52 3.892 3.321 2.829 2.325 1.876 1.489 1.097 0.715 0.369 0.052 -0.295 -0.602 -0.853 -1.113 -1.402 -1.641 -1.877 -2.123 -2.309 -2.5 -2.709 -2.923 -3.142 -3.289 -3.44 -3.676 -3.844 -4.025 -4.114 -4.291 -4.465 -4.657 -4.768 -5.068 -5.099 -5.221 -5.361 -5.663 -5.807 -5.967 -6.154 -6.359 -6.609 -6.951 -7.705 -10 ,4815 ,KEBNE ,17040529,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:34:45 CET,0.0 0.893 1.155 1.418 1.641 1.796 1.95 2.116 2.406 2.526 2.631 2.638 2.917 3.008 3.186 3.35 3.51 3.591 3.739 3.88 4.076 4.193 4.315 4.486 4.653 4.817 4.96 5.098 5.27 5.439 5.605 5.807 6.007 6.184 6.382 6.611 6.813 7.027 7.257 7.495 7.732 7.965 8.23 8.485 8.76 9.038 9.263 9.417 9.485 9.317 8.714 7.765 6.836 5.924 5.173 4.496 3.847 3.261 2.761 2.297 1.902 1.516 1.135 0.771 0.435 0.136 -0.168 -0.443 -0.691 -0.941 -1.205 -1.439 -1.679 -1.921 -2.119 -2.328 -2.54 -2.743 -2.957 -3.112 -3.264 -3.51 -3.669 -3.829 -3.917 -4.09 -4.258 -4.447 -4.553 -4.851 -4.874 -5.011 -5.163 -5.451 -5.61 -5.785 -5.963 -6.173 -6.422 -6.72 -7.443 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index ca874cf7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23863 ,KEBNE ,17040530,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:35:32 CET,0.0 0.337 0.545 0.684 0.815 0.976 1.124 1.25 1.482 1.595 1.703 1.703 2.005 2.107 2.3 2.477 2.643 2.723 2.888 3.059 3.29 3.427 3.56 3.759 3.947 4.126 4.296 4.458 4.665 4.866 5.066 5.308 5.534 5.745 5.984 6.25 6.51 6.793 7.083 7.396 7.721 8.082 8.514 8.944 9.419 9.92 10.465 10.969 11.445 11.904 12.057 11.78 11.297 10.706 10.087 9.462 8.855 8.281 7.772 7.245 6.826 6.505 6.215 5.925 5.635 5.381 5.126 4.891 4.666 4.417 4.17 3.986 3.792 3.577 3.399 3.197 3.0 2.806 2.589 2.433 2.274 2.041 1.881 1.719 1.636 1.465 1.29 1.089 0.975 0.672 0.628 0.494 0.358 0.042 -0.145 -0.334 -0.562 -0.81 -1.097 -1.509 -2.65 -2 ,31911 ,KEBNE ,17040531,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:33:43 CET,0.0 0.691 1.01 1.227 1.399 1.559 1.71 1.846 2.105 2.233 2.351 2.366 2.68 2.793 3.003 3.22 3.425 3.52 3.699 3.88 4.141 4.288 4.43 4.633 4.824 5.011 5.204 5.392 5.618 5.836 6.047 6.304 6.549 6.787 7.07 7.374 7.681 8.033 8.381 8.706 9.015 9.393 9.862 10.312 10.791 11.281 11.854 12.432 12.95 13.425 13.763 13.615 13.307 12.977 12.605 12.23 11.851 11.446 11.088 10.72 10.397 10.104 9.806 9.519 9.262 9.036 8.802 8.57 8.35 8.123 7.88 7.673 7.459 7.228 7.05 6.865 6.663 6.45 6.242 6.096 5.944 5.698 5.518 5.333 5.238 5.042 4.827 4.613 4.511 4.205 4.132 3.984 3.847 3.555 3.395 3.216 2.999 2.721 2.387 1.971 0.986 -3 ,28730 ,KEBNE ,17040532,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:34:09 CET,0.0 1.138 1.46 1.769 2.032 2.251 2.442 2.619 2.95 3.107 3.253 3.312 3.625 3.737 3.97 4.198 4.412 4.518 4.72 4.904 5.174 5.352 5.512 5.747 5.979 6.192 6.397 6.599 6.854 7.098 7.332 7.624 7.902 8.149 8.424 8.732 9.03 9.353 9.676 10.021 10.397 10.807 11.27 11.714 12.215 12.776 13.389 13.972 14.541 15.058 15.32 15.076 14.56 13.96 13.375 12.767 12.172 11.603 11.075 10.523 10.038 9.568 9.158 8.867 8.614 8.357 8.07 7.818 7.601 7.36 7.105 6.907 6.697 6.454 6.266 6.079 5.89 5.689 5.467 5.319 5.171 4.928 4.757 4.579 4.489 4.307 4.107 3.883 3.766 3.449 3.394 3.249 3.089 2.742 2.565 2.383 2.139 1.874 1.605 1.16 -0.235 -4 ,28647 ,KEBNE ,17040533,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:36:09 CET,0.0 0.604 0.865 1.095 1.307 1.497 1.681 1.848 2.132 2.25 2.361 2.382 2.693 2.801 2.997 3.175 3.347 3.428 3.587 3.741 3.96 4.105 4.248 4.44 4.616 4.793 4.964 5.141 5.368 5.576 5.778 6.014 6.241 6.447 6.679 6.954 7.222 7.492 7.78 8.088 8.42 8.796 9.194 9.567 9.974 10.403 10.852 11.309 11.764 12.136 12.266 11.843 11.285 10.708 10.116 9.462 8.889 8.454 8.091 7.706 7.364 7.064 6.772 6.496 6.215 5.949 5.676 5.43 5.219 4.991 4.733 4.507 4.288 4.078 3.922 3.752 3.558 3.347 3.124 2.972 2.819 2.579 2.41 2.225 2.126 1.929 1.737 1.547 1.442 1.134 1.093 0.971 0.845 0.576 0.41 0.216 0.022 -0.205 -0.511 -0.836 -1.758 -5 ,1274 ,KEBNE ,17040534,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:35:07 CET,0.0 0.744 1.032 1.267 1.501 1.733 1.93 2.102 2.411 2.536 2.665 2.722 3.035 3.162 3.409 3.625 3.84 3.948 4.15 4.326 4.569 4.721 4.86 5.066 5.279 5.502 5.714 5.901 6.131 6.351 6.57 6.84 7.098 7.341 7.609 7.911 8.206 8.517 8.837 9.181 9.537 9.933 10.394 10.828 11.281 11.741 12.254 12.8 13.358 13.839 14.028 13.706 13.163 12.611 12.086 11.573 11.139 10.735 10.352 9.952 9.609 9.306 8.993 8.686 8.398 8.123 7.84 7.583 7.361 7.138 6.886 6.664 6.444 6.226 6.051 5.862 5.665 5.474 5.282 5.127 4.953 4.698 4.534 4.339 4.239 4.065 3.865 3.628 3.509 3.194 3.145 3.005 2.841 2.466 2.269 2.055 1.825 1.605 1.362 1.02 -0.05 -6 ,21850 ,KEBNE ,17040535,Thu Dec 23 00:51:19 CET,Thu Dec 23 02:34:13 CET,0.0 0.822 1.22 1.547 1.831 2.06 2.251 2.431 2.751 2.91 3.07 3.178 3.509 3.633 3.872 4.105 4.326 4.422 4.601 4.787 5.043 5.203 5.374 5.624 5.842 6.046 6.256 6.468 6.748 7.008 7.232 7.485 7.734 7.987 8.273 8.617 8.943 9.252 9.556 9.863 10.191 10.568 10.99 11.385 11.794 12.227 12.702 13.164 13.564 13.891 14.009 13.619 13.039 12.452 11.855 11.198 10.553 9.977 9.459 8.971 8.613 8.314 8.019 7.734 7.48 7.221 6.955 6.736 6.544 6.347 6.143 5.961 5.756 5.541 5.38 5.219 5.036 4.837 4.639 4.501 4.351 4.112 3.945 3.771 3.681 3.491 3.29 3.08 2.976 2.682 2.659 2.537 2.411 2.124 1.968 1.791 1.609 1.428 1.219 0.875 -0.448 -7 ,349 ,KEBNE ,17040536,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:33:50 CET,0.0 0.752 1.078 1.325 1.571 1.786 1.959 2.121 2.42 2.561 2.706 2.756 3.081 3.196 3.417 3.629 3.804 3.883 4.048 4.213 4.45 4.59 4.726 4.927 5.107 5.275 5.439 5.603 5.827 6.047 6.265 6.529 6.772 6.992 7.238 7.509 7.773 8.07 8.381 8.695 9.013 9.386 9.81 10.2 10.649 11.136 11.625 12.076 12.563 12.987 13.116 12.729 12.267 11.874 11.453 11.039 10.642 10.234 9.854 9.472 9.14 8.834 8.533 8.248 7.982 7.731 7.479 7.24 7.023 6.811 6.594 6.393 6.178 5.952 5.763 5.572 5.383 5.178 4.954 4.8 4.638 4.377 4.183 3.995 3.903 3.7 3.483 3.238 3.116 2.816 2.789 2.666 2.531 2.214 1.999 1.782 1.582 1.286 0.892 0.409 -0.827 -8 ,16198 ,KEBNE ,17040537,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:34:41 CET,0.0 0.553 0.809 1.036 1.269 1.501 1.726 1.912 2.172 2.302 2.429 2.462 2.766 2.872 3.079 3.272 3.452 3.541 3.708 3.861 4.075 4.217 4.353 4.54 4.725 4.904 5.072 5.238 5.46 5.671 5.861 6.081 6.314 6.538 6.798 7.105 7.377 7.66 7.961 8.269 8.605 8.982 9.406 9.808 10.236 10.663 11.104 11.583 12.087 12.507 12.623 12.198 11.568 11.0 10.575 10.149 9.741 9.342 8.971 8.587 8.247 7.938 7.626 7.32 7.03 6.752 6.466 6.224 6.003 5.757 5.503 5.298 5.091 4.871 4.69 4.495 4.303 4.097 3.873 3.714 3.54 3.285 3.105 2.917 2.82 2.607 2.391 2.155 2.038 1.733 1.66 1.522 1.36 1.0 0.82 0.645 0.455 0.202 -0.1 -0.441 -1.263 -9 ,619 ,KEBNE ,17040538,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:34:29 CET,0.0 0.635 0.955 1.223 1.439 1.61 1.785 1.961 2.252 2.384 2.502 2.519 2.81 2.906 3.088 3.281 3.466 3.549 3.712 3.863 4.078 4.218 4.352 4.555 4.755 4.937 5.102 5.268 5.485 5.678 5.876 6.125 6.353 6.583 6.842 7.117 7.384 7.668 7.959 8.267 8.581 8.918 9.297 9.668 10.078 10.508 10.988 11.509 12.047 12.557 12.902 12.904 12.65 12.258 11.83 11.357 10.914 10.518 10.152 9.735 9.365 9.046 8.744 8.477 8.218 7.967 7.719 7.479 7.255 7.029 6.802 6.595 6.362 6.128 5.952 5.763 5.563 5.363 5.164 5.027 4.874 4.63 4.468 4.301 4.214 4.02 3.8 3.575 3.462 3.152 3.092 2.958 2.818 2.493 2.307 2.107 1.89 1.642 1.372 0.971 -0.31 -10 ,143 ,KEBNE ,17040539,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:36:22 CET,0.0 0.793 1.085 1.294 1.507 1.71 1.879 2.028 2.293 2.414 2.539 2.581 2.877 2.986 3.21 3.409 3.59 3.678 3.847 4.014 4.248 4.396 4.545 4.751 4.943 5.125 5.301 5.48 5.715 5.928 6.118 6.337 6.55 6.756 7.014 7.32 7.584 7.855 8.149 8.448 8.746 9.089 9.488 9.891 10.338 10.792 11.297 11.81 12.262 12.604 12.732 12.396 11.864 11.274 10.787 10.383 9.977 9.559 9.176 8.777 8.425 8.138 7.878 7.62 7.366 7.122 6.848 6.596 6.39 6.186 5.949 5.74 5.534 5.329 5.173 5.002 4.822 4.626 4.415 4.277 4.129 3.896 3.731 3.539 3.448 3.28 3.095 2.899 2.79 2.488 2.432 2.301 2.166 1.902 1.766 1.616 1.443 1.248 1.027 0.713 -0.526 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt deleted file mode 100644 index 07d550f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23340 ,KEBNE ,17040540,Thu Dec 23 00:51:17 CET,Thu Dec 23 02:35:17 CET,0.0 1.156 1.487 1.787 2.096 2.395 2.634 2.802 3.095 3.238 3.389 3.493 3.828 3.963 4.214 4.431 4.649 4.755 4.968 5.175 5.464 5.647 5.819 6.078 6.341 6.59 6.828 7.065 7.366 7.652 7.917 8.237 8.566 8.888 9.261 9.674 10.059 10.49 10.969 11.456 11.947 12.488 13.107 13.721 14.428 15.198 16.018 16.904 17.86 18.893 19.984 20.593 20.687 20.536 20.279 20.064 19.88 19.691 19.513 19.29 19.074 18.875 18.672 18.473 18.305 18.154 17.964 17.779 17.614 17.441 17.268 17.119 16.934 16.747 16.62 16.479 16.318 16.144 15.958 15.835 15.711 15.508 15.362 15.207 15.131 14.967 14.785 14.586 14.477 14.188 14.072 13.888 13.731 13.406 13.236 13.079 12.898 12.692 12.435 12.085 11.095 -2 ,24276 ,KEBNE ,17040541,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:34:30 CET,0.0 0.723 1.052 1.349 1.58 1.788 1.976 2.146 2.445 2.581 2.716 2.794 3.103 3.217 3.436 3.642 3.851 3.948 4.129 4.307 4.567 4.742 4.921 5.188 5.434 5.656 5.873 6.079 6.335 6.588 6.833 7.121 7.393 7.659 7.972 8.328 8.656 9.005 9.379 9.785 10.225 10.733 11.306 11.87 12.541 13.261 14.08 14.975 15.983 17.098 18.277 19.027 19.193 19.025 18.73 18.363 17.997 17.66 17.308 16.888 16.552 16.317 16.108 15.897 15.688 15.497 15.297 15.112 14.935 14.747 14.556 14.394 14.221 14.046 13.914 13.771 13.617 13.467 13.323 13.207 13.083 12.903 12.759 12.593 12.509 12.342 12.167 11.985 11.889 11.608 11.548 11.418 11.291 11.015 10.866 10.711 10.569 10.399 10.192 9.907 9.085 -3 ,2392 ,KEBNE ,17040543,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:34:54 CET,0.0 0.76 1.079 1.324 1.516 1.666 1.835 2.002 2.316 2.466 2.613 2.697 3.014 3.123 3.344 3.544 3.728 3.825 4.031 4.228 4.49 4.656 4.814 5.048 5.264 5.47 5.687 5.914 6.217 6.494 6.745 7.035 7.318 7.584 7.882 8.231 8.572 8.947 9.364 9.798 10.242 10.75 11.319 11.869 12.524 13.248 14.104 15.036 16.01 17.089 18.348 19.146 19.326 19.185 18.921 18.575 18.162 17.783 17.472 17.212 17.002 16.789 16.591 16.397 16.192 15.995 15.795 15.624 15.46 15.289 15.12 14.971 14.812 14.656 14.527 14.379 14.234 14.085 13.905 13.771 13.64 13.432 13.278 13.129 13.051 12.884 12.713 12.521 12.423 12.153 12.145 12.033 11.914 11.672 11.534 11.378 11.17 10.947 10.727 10.372 9.164 -4 ,17733 ,KEBNE ,17040544,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:34:14 CET,0.0 0.822 1.119 1.381 1.616 1.842 2.076 2.287 2.627 2.781 2.916 2.966 3.299 3.426 3.645 3.86 4.057 4.148 4.338 4.522 4.784 4.964 5.13 5.349 5.565 5.78 5.987 6.186 6.446 6.691 6.921 7.205 7.489 7.763 8.075 8.422 8.751 9.122 9.524 9.933 10.369 10.876 11.464 12.048 12.724 13.447 14.277 15.184 16.207 17.362 18.424 19.018 19.185 19.09 18.845 18.537 18.225 17.87 17.576 17.369 17.198 17.017 16.836 16.655 16.465 16.277 16.07 15.886 15.741 15.585 15.409 15.25 15.089 14.925 14.782 14.631 14.474 14.304 14.141 14.028 13.906 13.71 13.575 13.439 13.368 13.212 13.041 12.856 12.764 12.483 12.442 12.308 12.167 11.86 11.703 11.515 11.281 11.071 10.833 10.525 9.204 -5 ,25814 ,KEBNE ,17040545,Thu Dec 23 00:51:18 CET,Thu Dec 23 02:34:11 CET,0.0 0.927 1.265 1.56 1.821 2.029 2.219 2.384 2.696 2.851 2.992 3.055 3.372 3.486 3.717 3.94 4.161 4.273 4.491 4.691 4.962 5.14 5.316 5.573 5.825 6.063 6.298 6.527 6.832 7.141 7.426 7.752 8.074 8.381 8.72 9.103 9.486 9.904 10.361 10.843 11.317 11.857 12.524 13.187 13.929 14.771 15.751 16.851 18.095 19.393 20.617 21.278 21.676 21.965 22.042 21.961 21.782 21.592 21.407 21.183 20.966 20.76 20.566 20.381 20.195 20.005 19.796 19.61 19.439 19.25 19.06 18.903 18.736 18.553 18.407 18.238 18.075 17.929 17.772 17.664 17.547 17.332 17.176 17.027 16.944 16.758 16.571 16.391 16.299 16.024 16.035 15.932 15.81 15.529 15.383 15.237 15.057 14.821 14.536 14.198 12.976 -6 ,5106 ,KEBNE ,17040547,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:38:15 CET,0.0 0.527 0.846 1.103 1.34 1.54 1.72 1.906 2.232 2.373 2.514 2.596 2.925 3.051 3.305 3.549 3.779 3.884 4.08 4.274 4.561 4.75 4.943 5.22 5.488 5.759 6.028 6.287 6.62 6.931 7.215 7.556 7.87 8.16 8.501 8.872 9.219 9.61 10.04 10.506 10.955 11.406 11.933 12.478 13.132 13.883 14.702 15.553 16.519 17.554 18.669 19.341 19.396 19.201 18.932 18.624 18.274 17.931 17.679 17.43 17.195 16.998 16.795 16.587 16.392 16.21 16.013 15.833 15.671 15.489 15.309 15.17 15.008 14.822 14.679 14.538 14.382 14.202 14.021 13.898 13.773 13.573 13.436 13.298 13.225 13.067 12.888 12.692 12.583 12.286 12.234 12.098 11.959 11.668 11.5 11.334 11.161 10.963 10.701 10.325 9.146 -7 ,20720 ,KEBNE ,17040548,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:39:23 CET,0.0 0.554 0.839 1.057 1.247 1.42 1.587 1.756 2.037 2.154 2.272 2.296 2.605 2.711 2.896 3.075 3.247 3.329 3.494 3.656 3.894 4.052 4.213 4.439 4.647 4.851 5.056 5.249 5.499 5.742 5.981 6.281 6.562 6.818 7.118 7.462 7.796 8.179 8.579 8.979 9.407 9.887 10.429 10.984 11.622 12.34 13.163 14.069 15.119 16.236 17.337 17.903 18.099 18.218 18.217 18.076 17.907 17.742 17.555 17.341 17.136 16.936 16.736 16.536 16.34 16.148 15.944 15.75 15.583 15.425 15.247 15.089 14.928 14.756 14.614 14.476 14.336 14.177 14.001 13.866 13.731 13.539 13.408 13.265 13.187 13.031 12.863 12.681 12.583 12.301 12.266 12.143 12.01 11.722 11.569 11.394 11.2 10.98 10.734 10.442 9.57 -8 ,14395 ,KEBNE ,17040550,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:37:59 CET,0.0 0.613 0.922 1.169 1.355 1.533 1.698 1.857 2.157 2.298 2.425 2.465 2.781 2.887 3.097 3.299 3.483 3.574 3.746 3.914 4.163 4.315 4.458 4.684 4.9 5.102 5.306 5.511 5.781 6.038 6.287 6.597 6.886 7.156 7.489 7.85 8.186 8.581 9.0 9.409 9.835 10.341 10.92 11.47 12.105 12.818 13.626 14.523 15.496 16.507 17.609 18.232 18.318 18.172 17.882 17.521 17.147 16.775 16.428 16.034 15.645 15.299 14.966 14.635 14.34 14.063 13.735 13.416 13.144 12.911 12.707 12.546 12.391 12.225 12.081 11.937 11.78 11.613 11.453 11.341 11.215 11.02 10.87 10.704 10.624 10.47 10.303 10.11 10.008 9.724 9.702 9.593 9.468 9.186 9.032 8.851 8.672 8.475 8.201 7.832 6.614 -9 ,23664 ,KEBNE ,17040551,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:37:21 CET,0.0 0.597 0.913 1.171 1.388 1.541 1.687 1.825 2.039 2.154 2.264 2.275 2.582 2.683 2.867 3.049 3.224 3.311 3.48 3.646 3.893 4.044 4.189 4.403 4.62 4.833 5.044 5.249 5.514 5.77 6.007 6.284 6.558 6.838 7.165 7.525 7.865 8.255 8.694 9.157 9.631 10.145 10.734 11.322 12.026 12.813 13.712 14.672 15.72 16.959 18.301 19.289 19.751 19.895 19.881 19.802 19.686 19.546 19.392 19.197 18.997 18.792 18.574 18.368 18.184 18.019 17.855 17.688 17.516 17.336 17.137 16.98 16.833 16.67 16.532 16.378 16.231 16.078 15.9 15.773 15.633 15.423 15.292 15.151 15.076 14.926 14.772 14.605 14.503 14.202 14.15 14.03 13.894 13.611 13.464 13.299 13.119 12.926 12.686 12.309 11.253 -10 ,204 ,KEBNE ,17040553,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:39:32 CET,0.0 0.409 0.649 0.868 1.082 1.269 1.45 1.637 1.974 2.133 2.284 2.35 2.665 2.789 3.059 3.3 3.515 3.628 3.852 4.056 4.347 4.539 4.721 4.977 5.236 5.487 5.737 5.985 6.295 6.58 6.859 7.217 7.551 7.857 8.203 8.62 9.035 9.46 9.88 10.318 10.775 11.275 11.835 12.361 13.012 13.782 14.612 15.523 16.541 17.624 18.636 19.188 19.282 19.101 18.785 18.393 18.026 17.749 17.563 17.36 17.155 16.954 16.739 16.535 16.348 16.161 15.984 15.821 15.659 15.49 15.301 15.134 14.957 14.781 14.657 14.521 14.379 14.23 14.058 13.931 13.795 13.583 13.444 13.294 13.219 13.087 12.944 12.776 12.684 12.397 12.349 12.237 12.12 11.837 11.684 11.529 11.347 11.126 10.867 10.58 9.933 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt deleted file mode 100644 index 41935c20..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25336 ,KEBNE ,17040556,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:39:39 CET,0.0 0.583 0.824 1.048 1.259 1.442 1.615 1.793 2.139 2.292 2.43 2.501 2.835 2.965 3.221 3.441 3.636 3.735 3.931 4.111 4.377 4.539 4.684 4.884 5.08 5.291 5.502 5.706 5.95 6.174 6.396 6.663 6.925 7.173 7.437 7.714 8.001 8.334 8.678 9.021 9.366 9.746 10.184 10.628 11.131 11.664 12.208 12.832 13.493 14.068 14.545 14.529 14.257 13.833 13.292 12.739 12.223 11.722 11.275 10.806 10.383 10.053 9.782 9.52 9.259 9.008 8.748 8.519 8.337 8.16 7.968 7.802 7.622 7.411 7.252 7.098 6.927 6.754 6.58 6.459 6.321 6.111 5.98 5.835 5.752 5.591 5.439 5.272 5.177 4.882 4.848 4.717 4.58 4.337 4.188 3.992 3.781 3.554 3.301 2.979 1.785 -2 ,2421 ,KEBNE ,17040557,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:37:43 CET,0.0 0.573 0.878 1.114 1.327 1.495 1.647 1.799 2.079 2.2 2.307 2.336 2.645 2.753 2.961 3.155 3.327 3.406 3.574 3.741 3.965 4.111 4.255 4.466 4.678 4.865 5.03 5.186 5.378 5.574 5.77 5.992 6.216 6.452 6.717 6.992 7.254 7.55 7.889 8.24 8.579 8.972 9.428 9.841 10.285 10.783 11.364 11.953 12.577 13.207 13.687 13.673 13.42 13.053 12.598 12.086 11.558 11.061 10.624 10.155 9.723 9.317 8.914 8.509 8.113 7.735 7.347 7.08 6.894 6.696 6.483 6.297 6.105 5.913 5.751 5.568 5.395 5.229 5.042 4.897 4.733 4.499 4.349 4.179 4.094 3.922 3.746 3.569 3.478 3.184 3.166 3.05 2.924 2.64 2.479 2.304 2.101 1.865 1.623 1.293 0.11 -3 ,19134 ,KEBNE ,17040559,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:38:11 CET,0.0 0.746 1.032 1.259 1.448 1.62 1.808 1.984 2.279 2.407 2.53 2.58 2.903 3.025 3.259 3.473 3.669 3.762 3.932 4.104 4.366 4.53 4.69 4.923 5.144 5.357 5.555 5.741 5.984 6.214 6.427 6.686 6.943 7.193 7.482 7.83 8.168 8.511 8.876 9.247 9.591 10.0 10.527 11.044 11.629 12.261 12.986 13.727 14.49 15.4 16.361 16.855 16.939 16.8 16.49 16.099 15.739 15.389 15.077 14.791 14.522 14.254 14.011 13.762 13.515 13.292 13.052 12.845 12.671 12.482 12.275 12.1 11.907 11.711 11.564 11.411 11.26 11.099 10.915 10.786 10.662 10.465 10.336 10.207 10.134 9.968 9.778 9.572 9.466 9.17 9.147 9.026 8.902 8.665 8.519 8.353 8.175 7.977 7.74 7.446 6.573 -4 ,17442 ,KEBNE ,17040560,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:39:52 CET,0.0 0.61 0.876 1.086 1.239 1.413 1.593 1.736 2.025 2.165 2.29 2.332 2.645 2.751 2.96 3.173 3.376 3.467 3.641 3.809 4.047 4.204 4.348 4.558 4.768 4.96 5.148 5.336 5.576 5.819 6.04 6.279 6.522 6.746 6.996 7.293 7.57 7.868 8.184 8.518 8.891 9.316 9.789 10.231 10.71 11.216 11.759 12.319 12.94 13.496 13.839 13.683 13.155 12.532 11.934 11.35 10.823 10.32 9.833 9.324 8.876 8.465 8.068 7.689 7.319 6.959 6.573 6.234 5.938 5.623 5.29 5.058 4.862 4.655 4.496 4.335 4.177 4.021 3.844 3.704 3.556 3.316 3.143 2.984 2.905 2.726 2.546 2.35 2.248 1.956 1.928 1.796 1.666 1.405 1.25 1.081 0.905 0.714 0.447 0.097 -0.777 -5 ,6459 ,KEBNE ,17040561,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:39:46 CET,0.0 0.528 0.799 1.067 1.308 1.481 1.654 1.848 2.193 2.341 2.474 2.504 2.827 2.952 3.187 3.41 3.622 3.724 3.919 4.109 4.36 4.529 4.691 4.914 5.148 5.375 5.583 5.79 6.056 6.296 6.531 6.823 7.105 7.383 7.694 8.04 8.366 8.685 9.021 9.385 9.75 10.126 10.558 11.016 11.555 12.122 12.713 13.289 13.884 14.466 14.87 14.808 14.488 14.005 13.466 12.935 12.399 11.885 11.481 11.109 10.809 10.557 10.305 10.049 9.797 9.577 9.36 9.139 8.936 8.744 8.546 8.37 8.191 7.99 7.811 7.628 7.444 7.247 7.056 6.927 6.789 6.579 6.433 6.273 6.188 6.018 5.823 5.6 5.49 5.194 5.156 5.026 4.887 4.601 4.44 4.272 4.104 3.908 3.638 3.26 2.298 -6 ,9377 ,KEBNE ,17040562,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:37:58 CET,0.0 0.739 1.122 1.351 1.528 1.706 1.866 2.015 2.299 2.424 2.548 2.59 2.888 2.994 3.192 3.376 3.546 3.622 3.785 3.956 4.207 4.361 4.507 4.712 4.898 5.084 5.264 5.445 5.671 5.883 6.088 6.34 6.597 6.838 7.099 7.38 7.661 7.982 8.326 8.666 9.019 9.421 9.861 10.297 10.783 11.293 11.828 12.374 12.955 13.504 13.918 13.857 13.504 13.062 12.559 12.021 11.511 11.015 10.55 10.044 9.655 9.362 9.096 8.849 8.596 8.358 8.111 7.885 7.686 7.478 7.258 7.065 6.867 6.669 6.518 6.355 6.161 5.952 5.749 5.607 5.459 5.232 5.068 4.898 4.81 4.62 4.424 4.206 4.086 3.765 3.672 3.528 3.394 3.098 2.925 2.726 2.506 2.258 1.934 1.491 -0.062 -7 ,4105 ,KEBNE ,17040563,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:38:28 CET,0.0 0.96 1.312 1.597 1.821 1.991 2.149 2.297 2.567 2.693 2.812 2.838 3.15 3.251 3.448 3.658 3.861 3.955 4.13 4.295 4.533 4.689 4.847 5.07 5.278 5.481 5.676 5.872 6.14 6.383 6.588 6.833 7.081 7.315 7.576 7.885 8.171 8.48 8.851 9.223 9.583 9.994 10.498 10.993 11.528 12.108 12.722 13.348 14.025 14.717 15.288 15.419 15.173 14.81 14.388 13.886 13.39 12.905 12.438 11.945 11.486 11.104 10.802 10.524 10.271 10.031 9.768 9.535 9.344 9.143 8.915 8.724 8.524 8.31 8.146 7.984 7.83 7.656 7.44 7.287 7.142 6.916 6.759 6.597 6.513 6.347 6.181 5.998 5.895 5.598 5.547 5.417 5.29 5.04 4.92 4.77 4.587 4.404 4.197 3.9 2.612 -8 ,23122 ,KEBNE ,17040564,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:39:45 CET,0.0 0.509 0.807 1.012 1.22 1.414 1.561 1.682 1.915 2.035 2.146 2.167 2.472 2.573 2.761 2.935 3.104 3.193 3.371 3.533 3.767 3.921 4.075 4.289 4.476 4.652 4.83 5.016 5.27 5.506 5.714 5.96 6.191 6.421 6.701 6.994 7.263 7.558 7.869 8.214 8.571 8.96 9.421 9.868 10.365 10.893 11.477 12.088 12.685 13.24 13.723 13.684 13.318 12.9 12.424 11.882 11.375 10.895 10.459 10.089 9.806 9.542 9.262 9.001 8.769 8.543 8.31 8.098 7.912 7.712 7.495 7.309 7.111 6.917 6.771 6.617 6.448 6.26 6.071 5.945 5.798 5.561 5.408 5.251 5.165 4.976 4.77 4.545 4.428 4.114 4.055 3.924 3.793 3.526 3.378 3.229 3.056 2.824 2.579 2.232 0.835 -9 ,4100 ,KEBNE ,17040565,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:38:13 CET,0.0 0.565 0.956 1.222 1.457 1.638 1.808 1.976 2.259 2.39 2.522 2.583 2.907 3.031 3.272 3.494 3.702 3.801 4.006 4.19 4.438 4.596 4.758 5.003 5.228 5.439 5.633 5.834 6.095 6.336 6.59 6.887 7.162 7.424 7.717 8.065 8.387 8.725 9.115 9.562 10.039 10.535 11.068 11.58 12.143 12.766 13.436 14.084 14.749 15.34 15.669 15.504 15.095 14.525 13.877 13.268 12.727 12.179 11.687 11.197 10.756 10.352 9.958 9.59 9.241 8.901 8.522 8.18 7.871 7.531 7.187 6.938 6.73 6.526 6.368 6.215 6.055 5.881 5.695 5.571 5.44 5.21 5.051 4.893 4.813 4.639 4.446 4.243 4.139 3.831 3.795 3.679 3.55 3.276 3.12 2.941 2.73 2.491 2.208 1.88 0.797 -10 ,31374 ,KEBNE ,17040566,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:38:13 CET,0.0 0.903 1.221 1.459 1.668 1.852 2.03 2.212 2.53 2.665 2.797 2.859 3.191 3.317 3.563 3.802 4.028 4.125 4.305 4.481 4.735 4.901 5.057 5.275 5.473 5.66 5.835 6.005 6.231 6.448 6.654 6.907 7.148 7.381 7.656 7.943 8.209 8.503 8.823 9.161 9.512 9.927 10.407 10.852 11.345 11.871 12.465 13.036 13.581 14.142 14.509 14.361 13.909 13.343 12.751 12.165 11.629 11.095 10.589 10.04 9.616 9.294 8.988 8.701 8.437 8.196 7.949 7.715 7.498 7.277 7.057 6.884 6.686 6.474 6.312 6.127 5.933 5.758 5.576 5.441 5.291 5.056 4.898 4.718 4.625 4.447 4.264 4.042 3.922 3.613 3.536 3.399 3.261 2.958 2.797 2.629 2.451 2.231 1.96 1.631 0.449 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index d55b9dc7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17068 ,KEBNE ,17040567,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:39:45 CET,0.0 0.294 0.481 0.649 0.805 0.963 1.114 1.253 1.513 1.617 1.716 1.732 2.024 2.118 2.306 2.477 2.623 2.695 2.852 3.015 3.242 3.387 3.527 3.722 3.921 4.11 4.287 4.461 4.678 4.871 5.068 5.305 5.534 5.759 6.013 6.281 6.544 6.84 7.136 7.442 7.76 8.124 8.554 8.992 9.475 9.983 10.593 11.293 12.057 12.767 13.331 13.385 12.959 12.449 12.042 11.723 11.428 11.072 10.73 10.407 10.072 9.717 9.386 9.052 8.706 8.386 8.058 7.765 7.517 7.243 6.948 6.711 6.453 6.177 5.971 5.764 5.551 5.333 5.095 4.94 4.788 4.53 4.352 4.167 4.071 3.88 3.668 3.447 3.335 3.022 2.944 2.797 2.647 2.269 2.06 1.836 1.603 1.362 1.086 0.705 -0.24 -2 ,13683 ,KEBNE ,17040568,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:39:23 CET,0.0 0.484 0.754 0.977 1.176 1.352 1.498 1.637 1.913 2.049 2.184 2.248 2.577 2.708 2.951 3.162 3.364 3.468 3.675 3.873 4.169 4.36 4.545 4.819 5.077 5.321 5.555 5.775 6.03 6.26 6.47 6.717 6.956 7.201 7.498 7.823 8.141 8.488 8.867 9.27 9.662 10.093 10.605 11.135 11.667 12.158 12.693 13.243 13.865 14.473 14.959 15.133 15.097 14.904 14.611 14.295 13.998 13.702 13.357 12.952 12.606 12.277 11.936 11.605 11.282 10.982 10.678 10.4 10.16 9.905 9.64 9.421 9.183 8.947 8.76 8.559 8.354 8.142 7.904 7.739 7.581 7.335 7.159 6.961 6.859 6.656 6.452 6.244 6.131 5.813 5.73 5.582 5.428 5.072 4.861 4.639 4.411 4.167 3.892 3.514 2.323 -3 ,29802 ,KEBNE ,17040569,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:39:53 CET,0.0 0.555 0.833 1.04 1.236 1.428 1.606 1.772 2.083 2.229 2.365 2.424 2.748 2.862 3.085 3.302 3.498 3.59 3.776 3.955 4.203 4.361 4.522 4.758 4.97 5.177 5.372 5.561 5.814 6.057 6.289 6.564 6.828 7.077 7.348 7.657 7.95 8.27 8.616 8.989 9.386 9.78 10.186 10.598 11.057 11.525 12.02 12.572 13.22 13.847 14.245 14.308 14.145 13.894 13.655 13.412 13.155 12.881 12.603 12.287 12.005 11.752 11.518 11.278 11.017 10.728 10.399 10.105 9.841 9.576 9.304 9.071 8.823 8.55 8.337 8.124 7.898 7.656 7.399 7.227 7.058 6.798 6.596 6.382 6.278 6.056 5.801 5.515 5.368 5.027 4.934 4.787 4.631 4.26 4.037 3.8 3.566 3.311 3.002 2.623 1.758 -4 ,17647 ,KEBNE ,17040570,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:39:13 CET,0.0 0.534 0.832 1.057 1.265 1.446 1.603 1.749 2.043 2.187 2.328 2.38 2.684 2.779 2.97 3.156 3.348 3.441 3.617 3.786 4.036 4.199 4.362 4.587 4.784 4.982 5.185 5.377 5.614 5.845 6.098 6.438 6.763 7.074 7.431 7.825 8.2 8.601 9.024 9.457 9.908 10.426 11.018 11.598 12.256 12.946 13.702 14.506 15.331 16.147 16.824 17.002 16.864 16.597 16.224 15.733 15.153 14.593 14.105 13.601 13.167 12.797 12.452 12.12 11.803 11.516 11.233 10.965 10.722 10.461 10.18 9.951 9.715 9.475 9.296 9.088 8.849 8.601 8.329 8.131 7.933 7.637 7.437 7.246 7.143 6.901 6.647 6.39 6.257 5.922 5.825 5.672 5.51 5.163 4.957 4.726 4.474 4.169 3.837 3.437 2.229 -5 ,24838 ,KEBNE ,17040571,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:40:52 CET,0.0 0.477 0.832 1.099 1.315 1.517 1.691 1.855 2.183 2.319 2.44 2.485 2.809 2.929 3.159 3.395 3.609 3.707 3.898 4.08 4.352 4.524 4.689 4.932 5.159 5.377 5.591 5.796 6.056 6.308 6.552 6.852 7.133 7.396 7.698 8.038 8.359 8.713 9.103 9.546 10.044 10.581 11.186 11.771 12.387 13.045 13.769 14.515 15.277 16.026 16.697 16.879 16.621 16.169 15.656 15.097 14.556 14.038 13.577 13.094 12.664 12.332 12.042 11.746 11.443 11.169 10.889 10.626 10.395 10.161 9.9 9.661 9.402 9.136 8.939 8.732 8.522 8.31 8.095 7.937 7.748 7.459 7.267 7.06 6.95 6.713 6.475 6.214 6.079 5.748 5.646 5.503 5.343 4.962 4.783 4.594 4.38 4.136 3.835 3.434 2.366 -6 ,22150 ,KEBNE ,17040572,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:38:34 CET,0.0 0.574 0.901 1.148 1.349 1.515 1.67 1.826 2.114 2.254 2.394 2.439 2.758 2.868 3.086 3.307 3.519 3.62 3.814 3.997 4.26 4.426 4.576 4.797 5.013 5.207 5.393 5.579 5.813 6.042 6.269 6.539 6.797 7.036 7.301 7.608 7.899 8.208 8.523 8.843 9.169 9.533 9.943 10.34 10.777 11.295 11.863 12.342 12.822 13.409 14.043 14.198 14.015 13.644 13.225 12.791 12.346 11.866 11.384 10.837 10.35 9.898 9.428 8.992 8.596 8.223 7.815 7.434 7.137 6.864 6.581 6.355 6.115 5.869 5.675 5.472 5.256 5.031 4.79 4.607 4.422 4.129 3.927 3.723 3.617 3.394 3.152 2.901 2.772 2.44 2.357 2.218 2.075 1.74 1.556 1.362 1.17 0.946 0.682 0.359 -0.549 -7 ,19708 ,KEBNE ,17040573,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:39:27 CET,0.0 0.796 1.056 1.248 1.43 1.607 1.757 1.894 2.137 2.257 2.375 2.391 2.704 2.805 2.992 3.166 3.33 3.41 3.569 3.729 3.958 4.102 4.239 4.453 4.662 4.846 5.021 5.19 5.421 5.649 5.859 6.111 6.357 6.605 6.906 7.264 7.607 7.954 8.319 8.697 9.075 9.492 9.953 10.402 10.865 11.329 11.856 12.383 12.934 13.529 14.133 14.231 13.94 13.602 13.233 12.849 12.485 12.106 11.752 11.385 11.083 10.808 10.521 10.234 9.937 9.65 9.343 9.072 8.856 8.643 8.402 8.187 7.971 7.761 7.609 7.446 7.238 7.007 6.788 6.645 6.497 6.262 6.099 5.921 5.825 5.627 5.421 5.213 5.102 4.778 4.688 4.546 4.409 4.087 3.918 3.745 3.554 3.334 3.073 2.747 1.953 -8 ,28630 ,KEBNE ,17040574,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:40:06 CET,0.0 0.413 0.648 0.83 1.01 1.187 1.345 1.488 1.751 1.884 2.007 2.028 2.341 2.445 2.626 2.804 2.981 3.064 3.216 3.37 3.617 3.776 3.932 4.162 4.383 4.597 4.798 4.989 5.238 5.476 5.696 5.955 6.2 6.436 6.697 6.99 7.286 7.617 7.963 8.303 8.634 8.996 9.438 9.884 10.399 10.977 11.659 12.401 13.151 13.891 14.541 14.652 14.318 13.895 13.489 13.043 12.651 12.277 11.92 11.536 11.194 10.888 10.583 10.289 10.005 9.719 9.399 9.116 8.878 8.62 8.374 8.184 7.969 7.728 7.537 7.35 7.153 6.935 6.709 6.547 6.38 6.109 5.918 5.729 5.631 5.443 5.242 4.994 4.855 4.535 4.464 4.306 4.117 3.719 3.515 3.302 3.049 2.772 2.461 1.953 0.584 -9 ,27461 ,KEBNE ,17040575,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:38:18 CET,0.0 0.478 0.769 1.01 1.209 1.405 1.601 1.774 2.075 2.232 2.389 2.472 2.798 2.915 3.161 3.383 3.589 3.692 3.897 4.103 4.388 4.561 4.72 4.947 5.175 5.396 5.604 5.809 6.067 6.309 6.536 6.825 7.124 7.402 7.753 8.192 8.623 9.076 9.541 10.047 10.606 11.209 11.872 12.494 13.131 13.8 14.55 15.351 16.16 16.938 17.641 17.736 17.46 17.084 16.645 16.174 15.716 15.25 14.792 14.292 13.832 13.397 12.977 12.583 12.217 11.864 11.436 11.051 10.774 10.518 10.243 10.009 9.773 9.535 9.346 9.154 8.964 8.767 8.527 8.344 8.16 7.886 7.707 7.514 7.407 7.187 6.961 6.722 6.595 6.268 6.187 6.039 5.887 5.552 5.364 5.151 4.929 4.72 4.458 4.127 3.161 -10 ,25636 ,KEBNE ,17040576,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:38:49 CET,0.0 0.541 0.872 1.162 1.388 1.574 1.75 1.906 2.168 2.305 2.44 2.48 2.794 2.907 3.126 3.325 3.518 3.61 3.798 3.991 4.261 4.431 4.589 4.813 5.038 5.26 5.471 5.68 5.952 6.225 6.487 6.789 7.087 7.375 7.696 8.038 8.343 8.672 9.018 9.383 9.75 10.163 10.639 11.043 11.472 11.964 12.523 13.067 13.652 14.269 14.869 15.099 15.026 14.816 14.512 14.176 13.87 13.579 13.278 12.929 12.628 12.329 12.001 11.647 11.29 10.984 10.663 10.365 10.102 9.825 9.55 9.302 9.03 8.765 8.568 8.37 8.153 7.908 7.647 7.47 7.291 7.011 6.823 6.623 6.511 6.275 6.022 5.764 5.634 5.305 5.22 5.074 4.922 4.559 4.352 4.118 3.868 3.614 3.266 2.817 1.906 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt deleted file mode 100644 index fdb5fc5b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20639 ,KEBNE ,17040577,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:37:58 CET,0.0 0.432 0.72 0.916 1.054 1.177 1.278 1.384 1.576 1.651 1.719 1.69 1.911 1.974 2.083 2.169 2.242 2.286 2.367 2.434 2.531 2.594 2.642 2.699 2.752 2.788 2.826 2.862 2.896 2.938 2.968 2.998 3.037 3.058 3.061 3.051 3.023 2.963 2.866 2.739 2.589 2.401 2.141 1.832 1.407 0.855 0.123 -0.85 -2.202 -4.226 -7.556 -11.336 -14.275 -16.669 -18.661 -20.299 -21.674 -22.909 -23.927 -24.903 -25.72 -26.452 -27.126 -27.74 -28.305 -28.807 -29.323 -29.793 -30.192 -30.597 -31.02 -31.359 -31.686 -32.022 -32.29 -32.563 -32.857 -33.162 -33.474 -33.693 -33.918 -34.27 -34.506 -34.742 -34.864 -35.12 -35.383 -35.626 -35.748 -36.079 -36.159 -36.311 -36.481 -36.839 -37.029 -37.244 -37.472 -37.691 -37.927 -38.241 -39.057 -2 ,30608 ,KEBNE ,17040578,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:37:20 CET,0.0 0.522 0.733 0.901 1.043 1.144 1.224 1.304 1.466 1.544 1.616 1.572 1.776 1.831 1.927 1.997 2.053 2.086 2.159 2.215 2.296 2.348 2.387 2.446 2.502 2.549 2.585 2.607 2.636 2.665 2.681 2.696 2.71 2.7 2.675 2.648 2.606 2.54 2.448 2.326 2.195 2.033 1.78 1.474 1.055 0.48 -0.251 -1.236 -2.67 -4.748 -8.112 -11.832 -14.716 -17.094 -19.019 -20.636 -22.027 -23.286 -24.343 -25.366 -26.227 -26.975 -27.689 -28.379 -28.989 -29.525 -30.09 -30.572 -30.98 -31.386 -31.794 -32.134 -32.486 -32.85 -33.124 -33.396 -33.678 -33.974 -34.27 -34.467 -34.678 -35.005 -35.234 -35.483 -35.607 -35.847 -36.097 -36.359 -36.505 -36.851 -36.94 -37.087 -37.24 -37.584 -37.771 -37.959 -38.157 -38.37 -38.6 -38.902 -39.42 -3 ,5624 ,KEBNE ,17040579,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:38:22 CET,0.0 0.613 0.82 0.993 1.129 1.226 1.311 1.409 1.611 1.687 1.743 1.691 1.889 1.936 2.02 2.099 2.185 2.225 2.299 2.372 2.462 2.504 2.545 2.607 2.659 2.698 2.724 2.745 2.766 2.782 2.804 2.841 2.864 2.868 2.847 2.822 2.794 2.733 2.661 2.57 2.44 2.259 2.008 1.703 1.291 0.759 0.037 -0.932 -2.326 -4.369 -7.536 -11.132 -13.88 -16.155 -18.056 -19.624 -20.971 -22.154 -23.115 -24.05 -24.841 -25.531 -26.175 -26.769 -27.315 -27.826 -28.36 -28.828 -29.215 -29.604 -29.994 -30.309 -30.638 -30.989 -31.274 -31.568 -31.862 -32.147 -32.443 -32.642 -32.833 -33.14 -33.355 -33.563 -33.671 -33.91 -34.16 -34.421 -34.553 -34.882 -34.996 -35.143 -35.293 -35.622 -35.788 -35.965 -36.177 -36.407 -36.655 -36.968 -37.69 -4 ,27281 ,KEBNE ,17040580,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:36:14 CET,0.0 0.591 0.843 1.027 1.162 1.29 1.41 1.491 1.615 1.671 1.726 1.674 1.892 1.957 2.067 2.156 2.233 2.269 2.339 2.394 2.471 2.525 2.575 2.63 2.676 2.71 2.751 2.795 2.834 2.857 2.88 2.903 2.917 2.923 2.937 2.942 2.916 2.873 2.799 2.703 2.57 2.379 2.119 1.846 1.478 0.975 0.275 -0.685 -2.047 -4.071 -7.216 -10.806 -13.607 -15.82 -17.669 -19.312 -20.735 -21.986 -23.019 -23.991 -24.824 -25.571 -26.283 -26.932 -27.52 -28.049 -28.577 -29.046 -29.437 -29.824 -30.219 -30.552 -30.905 -31.262 -31.536 -31.817 -32.1 -32.387 -32.683 -32.887 -33.115 -33.489 -33.729 -33.969 -34.093 -34.346 -34.595 -34.851 -34.991 -35.323 -35.446 -35.614 -35.782 -36.163 -36.368 -36.576 -36.79 -37.046 -37.366 -37.708 -38.492 -5 ,18352 ,KEBNE ,17040581,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:38:30 CET,0.0 0.784 0.972 1.121 1.264 1.401 1.507 1.588 1.754 1.845 1.931 1.913 2.123 2.171 2.257 2.338 2.422 2.467 2.547 2.609 2.674 2.72 2.77 2.818 2.866 2.918 2.957 2.995 3.026 3.046 3.074 3.105 3.122 3.129 3.127 3.113 3.087 3.027 2.933 2.829 2.699 2.514 2.271 1.993 1.609 1.071 0.306 -0.715 -2.113 -4.069 -7.344 -11.12 -13.931 -16.282 -18.275 -19.979 -21.366 -22.575 -23.606 -24.594 -25.434 -26.196 -26.931 -27.601 -28.181 -28.7 -29.245 -29.726 -30.128 -30.537 -30.958 -31.311 -31.673 -32.039 -32.319 -32.607 -32.891 -33.176 -33.484 -33.698 -33.914 -34.246 -34.477 -34.705 -34.821 -35.071 -35.332 -35.611 -35.758 -36.113 -36.244 -36.413 -36.577 -36.944 -37.152 -37.348 -37.544 -37.77 -38.024 -38.365 -39.387 -6 ,5038 ,KEBNE ,17040582,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:37:19 CET,0.0 0.532 0.728 0.918 1.092 1.234 1.335 1.427 1.596 1.672 1.744 1.71 1.918 1.968 2.068 2.142 2.203 2.244 2.331 2.402 2.5 2.562 2.613 2.67 2.743 2.81 2.861 2.906 2.952 2.986 3.015 3.041 3.059 3.068 3.065 3.048 3.016 2.986 2.935 2.835 2.682 2.487 2.247 1.961 1.585 1.104 0.451 -0.489 -1.912 -3.983 -7.272 -10.889 -13.699 -16.036 -17.975 -19.677 -21.126 -22.356 -23.406 -24.426 -25.267 -26.012 -26.716 -27.378 -27.959 -28.465 -28.979 -29.426 -29.822 -30.247 -30.705 -31.084 -31.451 -31.816 -32.102 -32.404 -32.712 -33.019 -33.341 -33.567 -33.802 -34.173 -34.43 -34.698 -34.833 -35.096 -35.36 -35.644 -35.791 -36.131 -36.249 -36.418 -36.592 -36.947 -37.146 -37.374 -37.588 -37.815 -38.117 -38.497 -39.47 -7 ,14321 ,KEBNE ,17040583,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:37:45 CET,0.0 0.464 0.723 0.884 0.99 1.083 1.177 1.275 1.439 1.5 1.545 1.467 1.667 1.716 1.808 1.897 1.976 2.013 2.095 2.163 2.239 2.283 2.331 2.407 2.452 2.475 2.505 2.534 2.571 2.613 2.641 2.656 2.66 2.657 2.638 2.618 2.596 2.54 2.45 2.357 2.228 2.03 1.774 1.49 1.099 0.567 -0.145 -1.078 -2.398 -4.379 -7.634 -11.292 -14.132 -16.478 -18.405 -20.031 -21.376 -22.587 -23.607 -24.574 -25.394 -26.136 -26.849 -27.513 -28.115 -28.646 -29.198 -29.676 -30.073 -30.488 -30.909 -31.233 -31.567 -31.921 -32.201 -32.488 -32.774 -33.079 -33.393 -33.602 -33.815 -34.158 -34.4 -34.647 -34.77 -35.019 -35.282 -35.553 -35.698 -36.037 -36.136 -36.286 -36.446 -36.824 -37.013 -37.225 -37.463 -37.698 -37.956 -38.262 -38.858 -8 ,22552 ,KEBNE ,17040584,Thu Dec 23 00:54:23 CET,Thu Dec 23 02:38:47 CET,0.0 0.536 0.717 0.863 0.998 1.126 1.238 1.353 1.543 1.624 1.709 1.708 1.94 2.006 2.111 2.204 2.292 2.331 2.396 2.466 2.577 2.641 2.698 2.765 2.823 2.876 2.924 2.972 3.034 3.091 3.127 3.156 3.179 3.198 3.2 3.175 3.155 3.124 3.064 2.972 2.841 2.671 2.434 2.162 1.791 1.277 0.571 -0.402 -1.792 -3.821 -7.047 -10.694 -13.532 -15.871 -17.802 -19.44 -20.794 -21.983 -22.977 -23.943 -24.801 -25.558 -26.254 -26.892 -27.501 -28.052 -28.601 -29.074 -29.455 -29.838 -30.242 -30.587 -30.95 -31.319 -31.605 -31.903 -32.19 -32.482 -32.786 -32.987 -33.198 -33.536 -33.76 -33.991 -34.113 -34.363 -34.61 -34.871 -35.009 -35.341 -35.466 -35.639 -35.799 -36.119 -36.285 -36.46 -36.652 -36.853 -37.081 -37.419 -38.214 -9 ,29540 ,KEBNE ,17040585,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:37:07 CET,0.0 0.563 0.835 1.023 1.164 1.283 1.384 1.475 1.632 1.704 1.784 1.79 2.012 2.07 2.162 2.24 2.313 2.346 2.408 2.47 2.555 2.592 2.631 2.688 2.731 2.771 2.804 2.833 2.88 2.919 2.934 2.945 2.947 2.938 2.918 2.907 2.889 2.829 2.753 2.647 2.497 2.297 2.034 1.728 1.326 0.81 0.083 -0.887 -2.264 -4.306 -7.539 -11.208 -13.985 -16.203 -18.035 -19.604 -20.912 -22.095 -23.126 -24.111 -24.952 -25.693 -26.384 -27.032 -27.622 -28.142 -28.668 -29.126 -29.514 -29.925 -30.342 -30.664 -30.991 -31.333 -31.601 -31.87 -32.146 -32.439 -32.733 -32.921 -33.116 -33.424 -33.632 -33.848 -33.957 -34.172 -34.403 -34.645 -34.771 -35.096 -35.146 -35.287 -35.453 -35.799 -35.971 -36.152 -36.33 -36.541 -36.83 -37.156 -37.877 -10 ,1450 ,KEBNE ,17040586,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:38:14 CET,0.0 0.614 0.866 1.026 1.149 1.273 1.388 1.48 1.641 1.721 1.789 1.753 1.97 2.029 2.123 2.226 2.321 2.361 2.432 2.483 2.555 2.605 2.649 2.715 2.777 2.816 2.84 2.86 2.884 2.913 2.948 2.978 3.01 3.027 3.028 3.01 2.964 2.902 2.82 2.706 2.541 2.332 2.084 1.789 1.382 0.829 0.063 -0.927 -2.284 -4.273 -7.484 -11.114 -13.934 -16.245 -18.156 -19.737 -21.068 -22.268 -23.316 -24.349 -25.21 -25.945 -26.635 -27.281 -27.861 -28.362 -28.878 -29.351 -29.755 -30.171 -30.619 -30.998 -31.384 -31.767 -32.066 -32.371 -32.682 -33.01 -33.337 -33.56 -33.784 -34.128 -34.364 -34.608 -34.735 -34.995 -35.265 -35.543 -35.693 -36.051 -36.186 -36.359 -36.538 -36.927 -37.141 -37.355 -37.588 -37.853 -38.159 -38.498 -39.24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 5f65f1f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28235 ,KEBNE ,17040587,Thu Dec 23 00:54:25 CET,Thu Dec 23 02:37:50 CET,0.0 0.508 0.733 0.92 1.093 1.229 1.364 1.505 1.737 1.847 1.962 2.004 2.261 2.36 2.569 2.777 2.971 3.067 3.259 3.426 3.667 3.819 3.963 4.183 4.383 4.567 4.755 4.941 5.17 5.399 5.616 5.868 6.11 6.333 6.597 6.901 7.181 7.487 7.827 8.171 8.523 8.949 9.442 9.931 10.497 11.114 11.78 12.498 13.327 14.159 14.979 15.381 15.38 15.248 15.047 14.763 14.45 14.132 13.823 13.496 13.194 12.934 12.683 12.421 12.156 11.899 11.638 11.405 11.195 10.974 10.743 10.544 10.333 10.105 9.918 9.733 9.543 9.341 9.13 8.991 8.832 8.56 8.385 8.195 8.093 7.895 7.681 7.46 7.344 7.062 6.94 6.787 6.631 6.271 6.059 5.829 5.594 5.372 5.103 4.745 4.055 -2 ,4653 ,KEBNE ,17040588,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:38:35 CET,0.0 0.522 0.799 1.034 1.203 1.359 1.502 1.634 1.877 1.988 2.091 2.11 2.367 2.469 2.661 2.824 2.981 3.058 3.213 3.366 3.586 3.723 3.854 4.048 4.233 4.412 4.594 4.767 4.986 5.204 5.41 5.653 5.882 6.095 6.333 6.605 6.872 7.163 7.466 7.794 8.157 8.556 9.0 9.437 9.953 10.521 11.139 11.808 12.584 13.425 14.282 14.67 14.662 14.535 14.332 14.081 13.787 13.454 13.123 12.808 12.544 12.302 12.055 11.801 11.543 11.304 11.065 10.849 10.655 10.446 10.233 10.046 9.841 9.621 9.445 9.27 9.089 8.902 8.698 8.546 8.39 8.159 8.008 7.836 7.749 7.585 7.4 7.192 7.08 6.802 6.705 6.559 6.388 6.026 5.816 5.606 5.4 5.129 4.785 4.355 3.389 -3 ,13959 ,KEBNE ,17040589,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:39:45 CET,0.0 0.508 0.735 0.935 1.119 1.292 1.452 1.597 1.862 1.983 2.095 2.125 2.382 2.47 2.642 2.814 2.974 3.058 3.232 3.399 3.619 3.758 3.891 4.07 4.247 4.427 4.606 4.777 5.001 5.215 5.415 5.665 5.914 6.153 6.422 6.716 6.999 7.323 7.658 8.007 8.382 8.78 9.264 9.766 10.306 10.879 11.533 12.226 12.947 13.75 14.534 14.908 14.886 14.71 14.485 14.189 13.902 13.648 13.394 13.083 12.769 12.479 12.208 11.948 11.69 11.444 11.192 10.963 10.763 10.543 10.307 10.106 9.883 9.645 9.454 9.261 9.059 8.857 8.653 8.499 8.333 8.088 7.927 7.754 7.66 7.469 7.271 7.079 6.975 6.684 6.559 6.422 6.288 6.037 5.888 5.719 5.519 5.283 5.012 4.673 3.939 -4 ,12324 ,KEBNE ,17040590,Thu Dec 23 00:54:24 CET,Thu Dec 23 02:39:54 CET,0.0 0.557 0.87 1.099 1.287 1.448 1.589 1.728 1.993 2.118 2.24 2.299 2.562 2.655 2.846 3.032 3.206 3.295 3.466 3.625 3.854 3.997 4.135 4.339 4.532 4.718 4.903 5.077 5.297 5.51 5.711 5.95 6.18 6.4 6.652 6.939 7.211 7.486 7.779 8.118 8.475 8.865 9.329 9.793 10.282 10.799 11.433 12.148 12.939 13.783 14.637 15.076 15.121 14.988 14.767 14.49 14.204 13.928 13.638 13.297 12.986 12.713 12.459 12.207 11.96 11.718 11.431 11.185 10.982 10.759 10.528 10.335 10.139 9.92 9.743 9.575 9.385 9.176 8.974 8.833 8.68 8.421 8.239 8.066 7.976 7.778 7.554 7.312 7.188 6.908 6.819 6.701 6.585 6.313 6.151 5.944 5.709 5.497 5.288 4.999 4.308 -5 ,19376 ,KEBNE ,17040591,Thu Dec 23 00:57:28 CET,Thu Dec 23 02:43:21 CET,0.0 0.505 0.794 1.022 1.219 1.39 1.543 1.682 1.921 2.032 2.141 2.187 2.455 2.557 2.747 2.923 3.094 3.178 3.343 3.499 3.708 3.843 3.977 4.17 4.348 4.516 4.688 4.856 5.075 5.281 5.47 5.702 5.924 6.139 6.392 6.67 6.936 7.233 7.553 7.884 8.224 8.623 9.078 9.547 10.127 10.73 11.37 12.086 12.903 13.758 14.596 15.059 15.078 14.883 14.648 14.369 14.053 13.729 13.426 13.119 12.837 12.58 12.307 12.043 11.811 11.582 11.334 11.103 10.888 10.664 10.444 10.261 10.065 9.844 9.669 9.496 9.324 9.151 8.961 8.828 8.696 8.477 8.318 8.161 8.082 7.915 7.714 7.485 7.373 7.101 7.02 6.894 6.757 6.485 6.35 6.195 6.012 5.805 5.539 5.168 4.379 -6 ,20746 ,KEBNE ,17040592,Thu Dec 23 01:02:41 CET,Thu Dec 23 02:46:06 CET,0.0 0.785 1.018 1.202 1.37 1.554 1.711 1.848 2.131 2.26 2.375 2.413 2.673 2.775 2.972 3.153 3.334 3.419 3.572 3.728 3.955 4.098 4.238 4.43 4.621 4.817 4.997 5.158 5.375 5.592 5.787 6.035 6.278 6.505 6.764 7.066 7.371 7.696 8.034 8.378 8.737 9.132 9.579 10.024 10.528 11.061 11.688 12.414 13.197 14.031 14.953 15.408 15.433 15.287 15.034 14.725 14.378 14.051 13.764 13.446 13.133 12.847 12.59 12.324 12.055 11.798 11.53 11.295 11.093 10.88 10.648 10.456 10.251 10.03 9.854 9.667 9.481 9.282 9.059 8.9 8.737 8.5 8.33 8.155 8.066 7.859 7.639 7.411 7.296 7.015 6.907 6.765 6.599 6.234 6.058 5.856 5.639 5.424 5.133 4.759 4.004 -7 ,30463 ,KEBNE ,17040593,Thu Dec 23 01:02:41 CET,Thu Dec 23 02:45:47 CET,0.0 0.42 0.709 0.946 1.14 1.33 1.512 1.67 1.944 2.057 2.164 2.206 2.474 2.574 2.76 2.947 3.121 3.2 3.362 3.526 3.75 3.891 4.025 4.219 4.412 4.588 4.754 4.922 5.131 5.327 5.518 5.758 5.997 6.232 6.506 6.82 7.117 7.43 7.773 8.124 8.476 8.871 9.322 9.759 10.265 10.836 11.491 12.206 12.989 13.838 14.661 15.014 15.037 14.93 14.717 14.439 14.143 13.82 13.51 13.193 12.922 12.655 12.37 12.092 11.846 11.622 11.362 11.131 10.93 10.707 10.456 10.237 10.015 9.792 9.613 9.423 9.234 9.022 8.799 8.643 8.478 8.211 8.014 7.821 7.728 7.525 7.304 7.077 6.963 6.687 6.545 6.386 6.227 5.842 5.613 5.384 5.145 4.878 4.562 4.184 3.602 -8 ,9390 ,KEBNE ,17040594,Thu Dec 23 01:02:41 CET,Thu Dec 23 02:46:45 CET,0.0 0.443 0.705 0.942 1.135 1.292 1.438 1.589 1.851 1.963 2.076 2.133 2.402 2.515 2.729 2.915 3.107 3.198 3.364 3.53 3.775 3.925 4.068 4.274 4.458 4.643 4.826 4.989 5.196 5.405 5.603 5.829 6.05 6.267 6.524 6.815 7.091 7.407 7.745 8.101 8.476 8.896 9.366 9.818 10.343 10.931 11.583 12.28 13.081 13.938 14.789 15.147 15.097 14.893 14.632 14.345 14.072 13.789 13.472 13.14 12.85 12.558 12.265 12.008 11.746 11.488 11.207 10.952 10.74 10.506 10.259 10.053 9.833 9.597 9.413 9.231 9.041 8.836 8.614 8.456 8.301 8.071 7.9 7.704 7.603 7.391 7.173 6.952 6.837 6.564 6.453 6.317 6.179 5.88 5.722 5.557 5.372 5.126 4.803 4.461 3.594 -9 ,20801 ,KEBNE ,17040595,Thu Dec 23 01:02:41 CET,Thu Dec 23 02:46:59 CET,0.0 0.587 0.873 1.1 1.277 1.447 1.612 1.756 2.015 2.134 2.255 2.308 2.572 2.67 2.858 3.048 3.222 3.3 3.458 3.613 3.838 3.98 4.122 4.335 4.526 4.7 4.886 5.068 5.283 5.491 5.693 5.933 6.16 6.382 6.646 6.938 7.213 7.517 7.842 8.176 8.532 8.927 9.379 9.837 10.385 11.011 11.688 12.373 13.146 13.992 14.806 15.197 15.173 15.035 14.827 14.555 14.262 13.975 13.705 13.378 13.074 12.807 12.552 12.306 12.062 11.831 11.57 11.315 11.099 10.879 10.634 10.424 10.217 10.002 9.821 9.629 9.439 9.242 9.018 8.865 8.721 8.496 8.334 8.179 8.1 7.912 7.697 7.464 7.342 7.054 6.946 6.805 6.662 6.319 6.14 5.955 5.736 5.484 5.189 4.789 3.626 -10 ,29228 ,KEBNE ,17040596,Thu Dec 23 01:02:42 CET,Thu Dec 23 02:46:26 CET,0.0 0.422 0.654 0.869 1.062 1.22 1.376 1.511 1.76 1.889 2.011 2.052 2.311 2.404 2.591 2.745 2.901 2.981 3.131 3.272 3.466 3.604 3.745 3.94 4.132 4.324 4.5 4.662 4.878 5.091 5.282 5.513 5.749 5.981 6.237 6.522 6.797 7.095 7.415 7.759 8.127 8.53 8.999 9.487 10.031 10.589 11.217 11.874 12.571 13.347 14.134 14.478 14.514 14.389 14.117 13.8 13.515 13.222 12.934 12.613 12.308 12.035 11.776 11.537 11.295 11.061 10.813 10.583 10.378 10.167 9.953 9.773 9.581 9.377 9.224 9.059 8.883 8.698 8.5 8.36 8.214 7.98 7.809 7.637 7.55 7.365 7.165 6.957 6.838 6.554 6.463 6.329 6.187 5.879 5.697 5.479 5.242 5.014 4.726 4.342 3.065 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 64ae520b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31902 ,KEBNE ,17040597,Thu Dec 23 01:02:41 CET,Thu Dec 23 02:45:59 CET,0.0 0.98 1.322 1.567 1.767 1.94 2.092 2.239 2.492 2.607 2.723 2.769 3.027 3.125 3.315 3.49 3.657 3.738 3.895 4.059 4.301 4.45 4.585 4.775 4.97 5.163 5.337 5.514 5.744 5.948 6.146 6.396 6.641 6.869 7.129 7.428 7.709 8.002 8.299 8.63 8.997 9.374 9.817 10.284 10.793 11.318 11.932 12.616 13.365 14.132 14.82 15.044 14.957 14.69 14.326 13.962 13.583 13.186 12.83 12.44 12.088 11.786 11.472 11.166 10.885 10.621 10.349 10.087 9.851 9.593 9.324 9.112 8.892 8.664 8.483 8.292 8.085 7.857 7.635 7.487 7.327 7.074 6.899 6.696 6.594 6.395 6.169 5.921 5.784 5.487 5.343 5.187 5.008 4.591 4.396 4.19 3.954 3.7 3.424 3.064 1.46 -2 ,25415 ,KEBNE ,17040598,Thu Dec 23 01:02:41 CET,Thu Dec 23 02:45:47 CET,0.0 0.927 1.158 1.338 1.488 1.63 1.779 1.939 2.245 2.373 2.494 2.547 2.81 2.914 3.101 3.277 3.458 3.543 3.695 3.851 4.096 4.251 4.395 4.601 4.793 4.969 5.144 5.31 5.512 5.711 5.912 6.172 6.412 6.632 6.887 7.169 7.439 7.735 8.03 8.344 8.701 9.093 9.55 9.997 10.492 11.016 11.593 12.267 13.026 13.831 14.623 14.916 14.775 14.493 14.183 13.853 13.501 13.156 12.867 12.605 12.343 12.068 11.807 11.552 11.31 11.079 10.806 10.552 10.315 10.03 9.727 9.5 9.265 9.015 8.832 8.634 8.419 8.189 7.934 7.756 7.556 7.216 7.008 6.817 6.711 6.487 6.258 6.014 5.886 5.587 5.44 5.293 5.118 4.731 4.515 4.274 4.022 3.779 3.506 3.043 1.485 -3 ,25915 ,KEBNE ,17040599,Thu Dec 23 01:02:41 CET,Thu Dec 23 02:46:11 CET,0.0 0.626 0.892 1.102 1.312 1.514 1.683 1.827 2.096 2.219 2.332 2.375 2.641 2.74 2.935 3.12 3.281 3.358 3.511 3.662 3.884 4.022 4.155 4.359 4.563 4.753 4.928 5.1 5.333 5.556 5.767 6.026 6.266 6.479 6.718 6.985 7.253 7.549 7.852 8.189 8.56 8.954 9.39 9.82 10.341 10.923 11.551 12.179 12.86 13.627 14.345 14.637 14.579 14.366 14.139 13.813 13.439 13.087 12.757 12.38 12.032 11.721 11.432 11.169 10.905 10.659 10.383 10.128 9.912 9.685 9.425 9.205 8.994 8.771 8.594 8.404 8.199 7.981 7.746 7.589 7.429 7.171 6.982 6.788 6.691 6.48 6.244 5.992 5.873 5.596 5.434 5.252 5.067 4.648 4.412 4.154 3.84 3.487 3.107 2.653 1.375 -4 ,15252 ,KEBNE ,17040600,Thu Dec 23 01:02:41 CET,Thu Dec 23 02:45:45 CET,0.0 0.763 1.08 1.303 1.506 1.686 1.858 2.02 2.302 2.423 2.548 2.639 2.925 3.04 3.262 3.469 3.661 3.752 3.914 4.064 4.287 4.434 4.589 4.822 5.033 5.229 5.416 5.599 5.846 6.089 6.311 6.58 6.845 7.086 7.362 7.666 7.967 8.313 8.672 9.04 9.407 9.825 10.313 10.771 11.304 11.913 12.629 13.391 14.188 15.028 15.816 16.13 16.045 15.782 15.416 14.984 14.55 14.139 13.788 13.411 13.048 12.686 12.329 11.981 11.649 11.34 11.016 10.717 10.444 10.17 9.871 9.625 9.368 9.081 8.849 8.609 8.38 8.138 7.869 7.684 7.499 7.227 7.031 6.816 6.709 6.483 6.229 5.941 5.784 5.473 5.315 5.148 4.966 4.564 4.334 4.076 3.806 3.517 3.169 2.688 1.269 -5 ,27660 ,KEBNE ,17040601,Thu Dec 23 01:02:41 CET,Thu Dec 23 02:46:36 CET,0.0 0.761 1.145 1.425 1.627 1.829 2.02 2.177 2.46 2.597 2.728 2.807 3.092 3.206 3.424 3.63 3.805 3.89 4.058 4.22 4.451 4.591 4.727 4.928 5.134 5.326 5.504 5.676 5.894 6.12 6.347 6.609 6.871 7.122 7.405 7.73 8.031 8.35 8.699 9.057 9.407 9.798 10.279 10.77 11.286 11.844 12.504 13.235 14.054 14.861 15.625 15.915 15.804 15.56 15.227 14.845 14.444 14.048 13.713 13.347 12.978 12.621 12.297 11.98 11.657 11.355 11.025 10.732 10.484 10.221 9.939 9.705 9.443 9.154 8.952 8.747 8.529 8.309 8.072 7.891 7.703 7.415 7.215 7.005 6.897 6.678 6.441 6.193 6.058 5.754 5.629 5.471 5.296 4.912 4.704 4.494 4.266 4.002 3.696 3.249 1.829 -6 ,25657 ,KEBNE ,17040602,Thu Dec 23 01:02:41 CET,Thu Dec 23 02:46:44 CET,0.0 0.43 0.658 0.844 1.029 1.221 1.391 1.532 1.807 1.943 2.064 2.115 2.39 2.496 2.685 2.852 3.031 3.126 3.3 3.463 3.684 3.822 3.966 4.182 4.383 4.568 4.752 4.939 5.161 5.375 5.588 5.839 6.069 6.278 6.525 6.803 7.074 7.388 7.714 8.052 8.405 8.797 9.235 9.649 10.119 10.644 11.211 11.834 12.578 13.35 14.085 14.398 14.291 14.077 13.835 13.527 13.174 12.78 12.425 12.087 11.782 11.462 11.168 10.896 10.605 10.342 10.08 9.842 9.621 9.377 9.12 8.901 8.673 8.407 8.204 8.024 7.822 7.602 7.364 7.193 7.026 6.742 6.535 6.338 6.244 6.036 5.796 5.538 5.394 5.099 4.945 4.761 4.559 4.106 3.852 3.577 3.248 2.843 2.358 1.665 -0.829 -7 ,1465 ,KEBNE ,17040603,Thu Dec 23 01:02:42 CET,Thu Dec 23 02:46:13 CET,0.0 1.201 1.593 1.845 2.04 2.229 2.426 2.621 2.926 3.051 3.179 3.266 3.534 3.635 3.828 3.998 4.17 4.26 4.425 4.575 4.797 4.945 5.077 5.267 5.453 5.623 5.789 5.952 6.171 6.387 6.593 6.838 7.058 7.264 7.51 7.787 8.039 8.318 8.622 8.925 9.25 9.637 10.089 10.525 11.014 11.551 12.129 12.774 13.516 14.23 14.809 14.987 14.838 14.474 14.072 13.711 13.366 12.984 12.604 12.22 11.899 11.59 11.29 11.012 10.725 10.437 10.139 9.873 9.62 9.356 9.105 8.901 8.68 8.423 8.208 8.005 7.782 7.537 7.288 7.108 6.919 6.642 6.452 6.246 6.134 5.885 5.626 5.352 5.212 4.919 4.741 4.561 4.373 3.972 3.739 3.484 3.205 2.847 2.41 1.847 -0.096 -8 ,32350 ,KEBNE ,17040604,Thu Dec 23 01:02:42 CET,Thu Dec 23 02:46:21 CET,0.0 0.861 1.207 1.46 1.668 1.848 2.016 2.187 2.491 2.621 2.748 2.807 3.075 3.177 3.376 3.582 3.778 3.869 4.055 4.229 4.463 4.601 4.735 4.952 5.168 5.362 5.556 5.746 5.975 6.196 6.411 6.658 6.897 7.136 7.412 7.719 8.001 8.297 8.605 8.944 9.31 9.712 10.154 10.597 11.133 11.697 12.31 12.99 13.724 14.47 15.063 15.234 15.109 14.791 14.382 13.966 13.566 13.14 12.74 12.338 11.979 11.659 11.369 11.059 10.739 10.458 10.146 9.83 9.547 9.283 9.014 8.774 8.515 8.243 8.022 7.799 7.575 7.336 7.067 6.866 6.67 6.386 6.174 5.941 5.826 5.613 5.391 5.134 4.987 4.679 4.506 4.318 4.122 3.676 3.408 3.117 2.82 2.485 2.044 1.384 -1.057 -9 ,10451 ,KEBNE ,17040605,Thu Dec 23 01:02:41 CET,Thu Dec 23 02:44:50 CET,0.0 0.781 1.036 1.229 1.413 1.574 1.716 1.851 2.116 2.241 2.362 2.431 2.695 2.806 3.019 3.206 3.384 3.471 3.632 3.774 3.988 4.133 4.265 4.461 4.664 4.862 5.052 5.231 5.461 5.683 5.89 6.133 6.357 6.578 6.849 7.142 7.426 7.724 8.041 8.391 8.761 9.164 9.618 10.07 10.568 11.106 11.716 12.368 13.04 13.714 14.338 14.622 14.567 14.271 13.938 13.603 13.236 12.856 12.518 12.196 11.89 11.589 11.275 10.973 10.698 10.435 10.175 9.949 9.75 9.526 9.271 9.041 8.803 8.573 8.392 8.196 7.972 7.729 7.456 7.259 7.067 6.749 6.511 6.269 6.142 5.881 5.616 5.347 5.217 4.926 4.758 4.598 4.444 4.081 3.872 3.668 3.425 3.126 2.733 2.07 -0.166 -10 ,13586 ,KEBNE ,17040606,Thu Dec 23 01:02:42 CET,Thu Dec 23 02:46:50 CET,0.0 0.744 1.058 1.302 1.56 1.802 1.998 2.165 2.427 2.55 2.669 2.71 2.982 3.083 3.271 3.466 3.662 3.753 3.917 4.081 4.31 4.465 4.618 4.839 5.047 5.253 5.46 5.647 5.882 6.087 6.281 6.533 6.787 7.035 7.299 7.578 7.845 8.144 8.481 8.845 9.224 9.639 10.132 10.628 11.193 11.824 12.49 13.21 14.039 14.874 15.671 16.072 16.053 15.815 15.475 15.067 14.658 14.268 13.924 13.564 13.225 12.885 12.535 12.209 11.907 11.609 11.267 10.949 10.674 10.38 10.077 9.831 9.586 9.327 9.11 8.883 8.642 8.389 8.132 7.958 7.78 7.502 7.301 7.081 6.958 6.718 6.477 6.194 6.061 5.783 5.639 5.471 5.294 4.875 4.655 4.422 4.142 3.801 3.366 2.82 1.259 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt deleted file mode 100644 index b01af3d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32157 ,KEBNE ,17040610,Thu Dec 23 01:02:42 CET,Thu Dec 23 02:46:26 CET,0.0 1.12 1.515 1.832 2.118 2.392 2.623 2.811 3.149 3.31 3.459 3.581 3.879 4.003 4.246 4.48 4.711 4.826 5.055 5.271 5.582 5.773 5.948 6.202 6.443 6.68 6.903 7.105 7.34 7.565 7.803 8.088 8.355 8.606 8.88 9.203 9.524 9.862 10.219 10.601 11.027 11.505 12.009 12.463 12.97 13.548 14.175 14.772 15.297 15.656 15.662 15.132 14.483 13.819 13.133 12.436 11.787 11.184 10.633 10.063 9.567 9.124 8.696 8.276 7.877 7.525 7.19 6.885 6.614 6.334 6.028 5.781 5.528 5.25 5.027 4.801 4.561 4.311 4.051 3.869 3.694 3.39 3.155 2.92 2.803 2.552 2.282 1.99 1.845 1.544 1.405 1.241 1.073 0.714 0.511 0.302 0.091 -0.175 -0.511 -0.928 -2.203 -2 ,18980 ,KEBNE ,17040611,Thu Dec 23 01:02:41 CET,Thu Dec 23 02:47:05 CET,0.0 0.904 1.325 1.626 1.911 2.136 2.333 2.5 2.812 2.972 3.12 3.264 3.566 3.688 3.931 4.172 4.389 4.48 4.66 4.848 5.127 5.308 5.475 5.706 5.923 6.144 6.364 6.566 6.828 7.062 7.278 7.545 7.807 8.058 8.352 8.683 8.986 9.307 9.651 10.044 10.473 10.936 11.465 11.959 12.464 12.93 13.42 13.946 14.472 14.91 15.018 14.586 13.905 13.16 12.458 11.819 11.244 10.679 10.188 9.689 9.242 8.831 8.412 8.0 7.631 7.309 6.955 6.635 6.362 6.046 5.705 5.446 5.181 4.873 4.623 4.367 4.095 3.832 3.571 3.393 3.205 2.875 2.642 2.39 2.258 1.957 1.653 1.35 1.186 0.86 0.695 0.52 0.327 -0.117 -0.353 -0.622 -0.916 -1.269 -1.689 -2.315 -4.871 -3 ,17456 ,KEBNE ,17040612,Thu Dec 23 01:02:42 CET,Thu Dec 23 02:46:05 CET,0.0 0.868 1.259 1.515 1.75 1.967 2.161 2.34 2.634 2.768 2.914 3.064 3.387 3.528 3.774 3.997 4.198 4.291 4.466 4.637 4.873 5.028 5.191 5.418 5.641 5.866 6.074 6.262 6.491 6.715 6.955 7.258 7.536 7.792 8.083 8.413 8.717 9.024 9.344 9.704 10.106 10.553 11.028 11.475 12.011 12.572 13.112 13.64 14.15 14.622 14.838 14.478 13.922 13.36 12.826 12.282 11.797 11.329 10.861 10.378 9.982 9.62 9.246 8.881 8.545 8.22 7.869 7.566 7.304 7.051 6.798 6.586 6.367 6.121 5.923 5.725 5.53 5.32 5.099 4.94 4.76 4.486 4.301 4.097 3.986 3.747 3.501 3.253 3.115 2.804 2.639 2.464 2.276 1.881 1.672 1.452 1.176 0.827 0.446 0.02 -1.293 -4 ,25743 ,KEBNE ,17040614,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:48:44 CET,0.0 1.166 1.561 1.854 2.105 2.331 2.529 2.708 3.053 3.216 3.364 3.474 3.766 3.891 4.128 4.353 4.568 4.665 4.857 5.036 5.279 5.445 5.614 5.857 6.083 6.292 6.496 6.683 6.928 7.17 7.399 7.683 7.953 8.218 8.512 8.825 9.141 9.493 9.834 10.182 10.545 10.949 11.417 11.854 12.319 12.807 13.326 13.841 14.373 14.761 14.79 14.361 13.717 12.959 12.24 11.623 11.074 10.531 10.06 9.584 9.14 8.718 8.277 7.846 7.438 7.066 6.673 6.304 5.998 5.689 5.372 5.118 4.859 4.579 4.35 4.113 3.875 3.626 3.356 3.169 2.967 2.638 2.408 2.169 2.054 1.825 1.566 1.285 1.136 0.82 0.649 0.463 0.273 -0.189 -0.453 -0.724 -1.055 -1.459 -1.982 -2.647 -4.471 -5 ,30466 ,KEBNE ,17040615,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:48:12 CET,0.0 0.591 0.975 1.245 1.454 1.645 1.821 1.989 2.3 2.445 2.593 2.702 2.991 3.11 3.348 3.572 3.783 3.884 4.091 4.289 4.552 4.716 4.876 5.097 5.314 5.531 5.734 5.921 6.156 6.376 6.581 6.841 7.097 7.337 7.613 7.903 8.178 8.479 8.791 9.115 9.461 9.861 10.311 10.769 11.273 11.778 12.321 12.868 13.417 13.854 14.046 13.765 13.294 12.813 12.273 11.699 11.165 10.654 10.194 9.748 9.353 8.983 8.613 8.261 7.946 7.641 7.303 6.992 6.714 6.426 6.127 5.887 5.629 5.346 5.139 4.931 4.71 4.472 4.212 4.034 3.855 3.568 3.372 3.161 3.052 2.835 2.559 2.234 2.067 1.734 1.549 1.379 1.215 0.828 0.581 0.312 0.039 -0.281 -0.715 -1.269 -3.472 -6 ,9804 ,KEBNE ,17040617,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:47:50 CET,0.0 0.809 1.167 1.437 1.659 1.877 2.063 2.242 2.58 2.731 2.884 3.009 3.307 3.426 3.65 3.867 4.062 4.159 4.336 4.516 4.813 5.002 5.164 5.374 5.578 5.782 5.981 6.168 6.405 6.63 6.868 7.168 7.431 7.681 7.958 8.288 8.617 8.929 9.24 9.567 9.916 10.308 10.75 11.185 11.66 12.162 12.689 13.237 13.799 14.251 14.358 13.914 13.301 12.643 12.009 11.391 10.799 10.228 9.731 9.233 8.806 8.404 8.007 7.631 7.291 6.988 6.648 6.353 6.101 5.814 5.509 5.252 4.989 4.735 4.54 4.327 4.101 3.868 3.634 3.471 3.291 2.993 2.788 2.594 2.494 2.286 2.059 1.811 1.688 1.389 1.25 1.106 0.964 0.632 0.438 0.237 0.018 -0.241 -0.555 -0.968 -2.117 -7 ,13181 ,KEBNE ,17040618,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:48:00 CET,0.0 1.177 1.715 2.062 2.359 2.609 2.838 3.048 3.418 3.596 3.767 3.956 4.285 4.426 4.713 4.971 5.187 5.297 5.516 5.722 6.024 6.215 6.401 6.666 6.898 7.116 7.325 7.529 7.807 8.074 8.307 8.581 8.86 9.13 9.436 9.768 10.078 10.41 10.753 11.117 11.502 11.928 12.394 12.85 13.377 13.899 14.453 15.033 15.596 16.005 15.965 15.308 14.542 13.805 13.128 12.502 11.881 11.253 10.686 10.118 9.636 9.194 8.762 8.358 7.986 7.64 7.28 6.96 6.672 6.371 6.068 5.822 5.56 5.277 5.067 4.855 4.634 4.392 4.136 3.964 3.78 3.48 3.265 3.048 2.936 2.701 2.474 2.232 2.109 1.804 1.63 1.472 1.307 0.928 0.72 0.472 0.205 -0.055 -0.402 -0.872 -2.355 -8 ,23659 ,KEBNE ,17040620,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:48:16 CET,0.0 1.17 1.594 1.903 2.171 2.42 2.642 2.839 3.168 3.32 3.459 3.542 3.833 3.97 4.204 4.42 4.628 4.721 4.901 5.074 5.319 5.478 5.637 5.865 6.084 6.297 6.5 6.704 6.965 7.219 7.469 7.744 7.979 8.217 8.488 8.795 9.106 9.453 9.794 10.093 10.435 10.849 11.313 11.786 12.302 12.806 13.319 13.877 14.502 15.036 15.201 14.672 13.899 13.1 12.366 11.695 11.097 10.497 9.935 9.387 8.938 8.547 8.172 7.8 7.431 7.075 6.711 6.391 6.098 5.798 5.482 5.209 4.921 4.613 4.38 4.142 3.883 3.617 3.336 3.143 2.957 2.659 2.446 2.223 2.11 1.873 1.595 1.295 1.151 0.845 0.725 0.562 0.394 0.066 -0.125 -0.329 -0.54 -0.777 -1.072 -1.431 -2.375 -9 ,25178 ,KEBNE ,17040621,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:48:07 CET,0.0 1.028 1.382 1.637 1.834 2.04 2.241 2.403 2.716 2.867 3.008 3.11 3.404 3.525 3.748 3.972 4.191 4.296 4.494 4.677 4.942 5.111 5.27 5.496 5.719 5.93 6.121 6.314 6.583 6.831 7.077 7.377 7.639 7.884 8.168 8.499 8.826 9.174 9.536 9.916 10.313 10.729 11.179 11.626 12.101 12.563 13.069 13.581 14.039 14.367 14.438 13.99 13.384 12.748 12.161 11.552 10.935 10.384 9.913 9.406 8.972 8.584 8.176 7.786 7.422 7.079 6.731 6.422 6.125 5.801 5.476 5.223 4.967 4.684 4.459 4.239 4.018 3.77 3.497 3.305 3.112 2.814 2.602 2.383 2.267 2.025 1.782 1.505 1.352 1.029 0.864 0.685 0.51 0.139 -0.076 -0.308 -0.576 -0.873 -1.187 -1.62 -2.725 -10 ,29509 ,KEBNE ,17040622,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:47:45 CET,0.0 0.764 1.077 1.378 1.655 1.899 2.095 2.285 2.677 2.853 3.0 3.105 3.405 3.55 3.815 4.051 4.277 4.388 4.604 4.809 5.084 5.257 5.421 5.65 5.894 6.129 6.344 6.544 6.787 7.035 7.274 7.553 7.842 8.118 8.401 8.723 9.016 9.319 9.66 10.017 10.376 10.755 11.178 11.582 12.029 12.543 13.107 13.627 14.119 14.523 14.62 14.259 13.643 12.917 12.252 11.601 10.959 10.339 9.751 9.16 8.663 8.22 7.791 7.369 6.97 6.601 6.214 5.867 5.565 5.244 4.901 4.625 4.353 4.074 3.835 3.581 3.317 3.045 2.763 2.571 2.392 2.108 1.897 1.687 1.58 1.343 1.079 0.783 0.629 0.307 0.152 -0.023 -0.207 -0.57 -0.777 -1.03 -1.294 -1.581 -1.988 -2.497 -4.014 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 91c96bd7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10824 ,KEBNE ,17040624,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:49:56 CET,0.0 0.833 1.139 1.376 1.56 1.708 1.854 1.997 2.278 2.4 2.514 2.571 2.847 2.947 3.141 3.332 3.527 3.619 3.78 3.938 4.165 4.297 4.424 4.61 4.8 4.993 5.176 5.355 5.587 5.806 6.01 6.261 6.507 6.755 7.055 7.39 7.696 8.032 8.405 8.801 9.215 9.671 10.22 10.782 11.416 12.125 12.895 13.697 14.611 15.66 16.83 17.599 17.851 17.826 17.655 17.414 17.164 16.89 16.601 16.285 16.013 15.744 15.451 15.175 14.925 14.683 14.394 14.135 13.926 13.697 13.444 13.243 13.031 12.786 12.6 12.406 12.187 11.962 11.74 11.574 11.388 11.102 10.905 10.704 10.594 10.376 10.137 9.887 9.766 9.485 9.357 9.179 8.962 8.507 8.29 8.075 7.797 7.424 6.986 6.466 4.591 -2 ,1251 ,KEBNE ,17040625,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:49:11 CET,0.0 0.561 0.841 1.06 1.228 1.377 1.511 1.64 1.915 2.047 2.173 2.233 2.517 2.621 2.803 2.97 3.145 3.235 3.401 3.562 3.793 3.937 4.075 4.283 4.5 4.712 4.903 5.078 5.309 5.544 5.756 6.002 6.254 6.497 6.778 7.089 7.381 7.708 8.058 8.429 8.832 9.286 9.81 10.316 10.893 11.545 12.318 13.172 14.098 15.163 16.324 16.963 17.167 17.192 17.025 16.78 16.578 16.358 16.1 15.755 15.401 15.091 14.78 14.473 14.196 13.948 13.695 13.472 13.279 13.072 12.838 12.629 12.392 12.148 11.974 11.787 11.593 11.386 11.159 11.004 10.859 10.597 10.369 10.149 10.05 9.835 9.597 9.355 9.213 8.915 8.816 8.659 8.503 8.143 7.902 7.642 7.375 7.092 6.748 6.301 4.859 -3 ,3246 ,KEBNE ,17040626,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:48:53 CET,0.0 0.516 0.775 1.001 1.196 1.363 1.524 1.687 1.979 2.102 2.224 2.288 2.562 2.671 2.877 3.063 3.234 3.313 3.468 3.625 3.848 3.987 4.127 4.328 4.54 4.754 4.945 5.125 5.349 5.561 5.763 6.011 6.265 6.516 6.787 7.081 7.369 7.706 8.081 8.475 8.877 9.325 9.851 10.377 11.004 11.697 12.463 13.334 14.366 15.456 16.521 17.173 17.392 17.386 17.247 17.01 16.732 16.431 16.147 15.833 15.557 15.303 15.016 14.689 14.397 14.163 13.912 13.664 13.435 13.199 12.965 12.78 12.578 12.346 12.163 11.965 11.742 11.517 11.286 11.116 10.942 10.692 10.507 10.304 10.205 10.007 9.801 9.567 9.439 9.154 9.012 8.848 8.679 8.31 8.071 7.805 7.53 7.203 6.784 6.2 4.643 -4 ,26165 ,KEBNE ,17040627,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:50:02 CET,0.0 0.574 0.855 1.06 1.235 1.402 1.554 1.696 1.972 2.103 2.221 2.251 2.523 2.619 2.794 2.979 3.175 3.266 3.443 3.614 3.854 4.006 4.145 4.356 4.564 4.756 4.94 5.109 5.326 5.552 5.773 6.022 6.267 6.506 6.78 7.098 7.395 7.714 8.07 8.46 8.854 9.293 9.82 10.348 10.962 11.648 12.426 13.263 14.232 15.318 16.517 17.305 17.531 17.49 17.322 17.114 16.887 16.61 16.333 16.032 15.742 15.446 15.171 14.917 14.666 14.441 14.186 13.944 13.731 13.504 13.274 13.071 12.848 12.626 12.439 12.241 12.043 11.835 11.604 11.426 11.252 11.011 10.827 10.623 10.52 10.32 10.065 9.791 9.671 9.391 9.246 9.07 8.894 8.538 8.306 8.026 7.744 7.439 7.086 6.601 4.543 -5 ,12500 ,KEBNE ,17040628,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:50:23 CET,0.0 0.413 0.733 0.999 1.183 1.379 1.56 1.704 2.005 2.143 2.264 2.316 2.58 2.681 2.883 3.067 3.247 3.33 3.49 3.647 3.871 4.022 4.17 4.382 4.58 4.768 4.95 5.126 5.361 5.584 5.792 6.05 6.308 6.561 6.847 7.163 7.482 7.832 8.194 8.564 8.956 9.398 9.913 10.434 11.029 11.698 12.478 13.356 14.38 15.517 16.637 17.296 17.48 17.371 17.166 16.925 16.653 16.375 16.087 15.786 15.507 15.222 14.945 14.67 14.403 14.157 13.897 13.649 13.415 13.165 12.887 12.654 12.422 12.184 12.007 11.817 11.595 11.359 11.139 10.976 10.795 10.525 10.314 10.092 9.983 9.746 9.472 9.181 9.037 8.731 8.594 8.44 8.264 7.917 7.719 7.484 7.164 6.787 6.302 5.677 3.576 -6 ,8130 ,KEBNE ,17040629,Thu Dec 23 01:03:44 CET,Thu Dec 23 02:49:38 CET,0.0 0.349 0.606 0.808 0.962 1.115 1.264 1.403 1.675 1.799 1.918 1.996 2.279 2.377 2.565 2.746 2.909 2.989 3.159 3.322 3.542 3.682 3.818 4.028 4.236 4.428 4.614 4.802 5.042 5.266 5.477 5.739 5.986 6.214 6.489 6.789 7.076 7.415 7.777 8.15 8.555 8.997 9.497 10.037 10.653 11.294 12.051 12.91 13.868 14.92 16.033 16.685 16.848 16.808 16.67 16.454 16.204 15.923 15.636 15.321 15.044 14.782 14.498 14.227 13.956 13.69 13.417 13.165 12.944 12.712 12.45 12.222 11.973 11.702 11.503 11.311 11.121 10.912 10.659 10.481 10.299 10.023 9.837 9.625 9.507 9.257 8.983 8.7 8.567 8.266 8.108 7.942 7.75 7.321 7.105 6.874 6.61 6.34 6.008 5.536 4.336 -7 ,14552 ,KEBNE ,17040630,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:50:54 CET,0.0 0.546 0.806 1.024 1.215 1.365 1.509 1.637 1.856 1.959 2.072 2.124 2.39 2.479 2.663 2.851 3.023 3.108 3.269 3.422 3.648 3.78 3.91 4.102 4.287 4.465 4.644 4.819 5.036 5.252 5.461 5.714 5.956 6.188 6.458 6.766 7.083 7.417 7.764 8.136 8.516 8.948 9.457 9.964 10.549 11.182 11.916 12.764 13.764 14.931 16.246 17.128 17.454 17.524 17.443 17.253 17.011 16.737 16.476 16.195 15.931 15.684 15.424 15.163 14.932 14.728 14.493 14.264 14.07 13.845 13.584 13.372 13.144 12.908 12.726 12.544 12.348 12.126 11.905 11.746 11.575 11.322 11.121 10.858 10.724 10.473 10.212 9.931 9.781 9.473 9.339 9.177 9.003 8.604 8.355 8.098 7.804 7.461 7.032 6.409 4.339 -8 ,28675 ,KEBNE ,17040631,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:50:28 CET,0.0 0.56 0.826 1.014 1.174 1.331 1.466 1.602 1.877 2.0 2.109 2.149 2.433 2.537 2.72 2.897 3.058 3.137 3.294 3.451 3.686 3.832 3.969 4.166 4.366 4.573 4.765 4.942 5.171 5.395 5.614 5.878 6.132 6.371 6.642 6.945 7.245 7.583 7.944 8.333 8.748 9.213 9.746 10.283 10.875 11.557 12.38 13.251 14.266 15.433 16.683 17.464 17.667 17.653 17.517 17.263 16.964 16.647 16.365 16.075 15.795 15.523 15.24 14.957 14.682 14.423 14.159 13.926 13.721 13.505 13.281 13.088 12.872 12.644 12.43 12.173 11.935 11.714 11.487 11.341 11.188 10.941 10.764 10.568 10.462 10.249 10.012 9.751 9.622 9.334 9.203 9.031 8.832 8.406 8.162 7.909 7.609 7.253 6.859 6.284 3.879 -9 ,28703 ,KEBNE ,17040632,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:51:24 CET,0.0 0.561 0.832 1.039 1.213 1.368 1.516 1.663 1.923 2.057 2.184 2.243 2.523 2.633 2.844 3.031 3.206 3.291 3.462 3.633 3.872 4.018 4.158 4.362 4.572 4.787 4.99 5.175 5.415 5.653 5.88 6.154 6.4 6.644 6.935 7.259 7.577 7.916 8.278 8.673 9.093 9.558 10.097 10.655 11.335 12.081 12.909 13.832 14.866 15.961 17.124 17.843 18.146 18.235 18.145 17.99 17.786 17.544 17.272 16.921 16.615 16.349 16.04 15.739 15.483 15.241 14.994 14.776 14.567 14.344 14.114 13.915 13.681 13.431 13.245 13.049 12.837 12.611 12.378 12.213 12.029 11.746 11.546 11.333 11.225 10.997 10.745 10.458 10.312 10.016 9.883 9.705 9.497 9.094 8.896 8.658 8.386 8.071 7.662 7.079 4.634 -10 ,15076 ,KEBNE ,17040633,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:50:03 CET,0.0 0.719 0.953 1.158 1.338 1.507 1.678 1.835 2.115 2.253 2.387 2.463 2.74 2.85 3.039 3.205 3.373 3.458 3.622 3.776 4.006 4.159 4.303 4.517 4.716 4.902 5.097 5.288 5.533 5.768 5.99 6.265 6.518 6.756 7.03 7.336 7.642 7.975 8.328 8.698 9.086 9.532 10.061 10.62 11.27 11.976 12.8 13.7 14.714 15.835 16.973 17.709 17.923 17.874 17.717 17.457 17.171 16.88 16.592 16.29 16.013 15.747 15.475 15.202 14.933 14.661 14.342 14.05 13.793 13.543 13.299 13.102 12.902 12.678 12.496 12.292 12.085 11.883 11.674 11.516 11.346 11.073 10.848 10.626 10.528 10.318 10.09 9.832 9.688 9.371 9.194 9.002 8.798 8.348 8.099 7.827 7.515 7.156 6.749 6.199 4.051 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt deleted file mode 100644 index e1f74a23..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20288 ,KEBNE ,17040634,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:51:39 CET,0.0 0.739 1.1 1.35 1.553 1.739 1.926 2.097 2.394 2.528 2.655 2.733 3.032 3.156 3.375 3.581 3.782 3.879 4.066 4.242 4.508 4.677 4.84 5.078 5.301 5.525 5.742 5.944 6.204 6.443 6.66 6.934 7.203 7.454 7.736 8.037 8.33 8.668 9.017 9.378 9.774 10.23 10.742 11.218 11.759 12.353 12.969 13.608 14.297 14.931 15.488 15.614 15.357 14.94 14.481 13.983 13.515 13.087 12.671 12.227 11.833 11.489 11.163 10.847 10.564 10.296 10.009 9.75 9.522 9.278 8.986 8.74 8.501 8.253 8.041 7.827 7.608 7.362 7.104 6.922 6.74 6.488 6.326 6.141 6.031 5.809 5.592 5.334 5.193 4.898 4.741 4.576 4.411 4.059 3.866 3.65 3.422 3.152 2.8 2.314 0.792 -2 ,15140 ,KEBNE ,17040635,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:52:14 CET,0.0 0.505 0.808 1.016 1.184 1.347 1.521 1.672 1.942 2.08 2.211 2.271 2.555 2.668 2.883 3.089 3.287 3.38 3.554 3.723 3.958 4.109 4.265 4.485 4.697 4.903 5.093 5.276 5.515 5.741 5.959 6.227 6.486 6.731 7.026 7.357 7.64 7.952 8.307 8.673 9.048 9.487 9.98 10.448 11.0 11.627 12.29 12.932 13.619 14.275 14.818 14.924 14.698 14.362 13.96 13.481 12.986 12.518 12.107 11.661 11.278 10.95 10.612 10.269 9.944 9.639 9.31 9.03 8.796 8.539 8.28 8.068 7.841 7.595 7.399 7.213 7.028 6.819 6.579 6.418 6.265 6.035 5.864 5.636 5.521 5.336 5.145 4.938 4.826 4.527 4.396 4.214 4.01 3.572 3.343 3.091 2.856 2.611 2.27 1.813 0.108 -3 ,28082 ,KEBNE ,17040636,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:51:56 CET,0.0 0.822 1.194 1.436 1.627 1.805 1.985 2.162 2.483 2.622 2.759 2.86 3.143 3.248 3.449 3.658 3.862 3.957 4.138 4.311 4.562 4.725 4.886 5.108 5.311 5.512 5.709 5.902 6.151 6.377 6.593 6.857 7.122 7.37 7.642 7.958 8.268 8.615 8.977 9.363 9.767 10.204 10.716 11.224 11.796 12.4 13.035 13.716 14.465 15.227 15.847 15.984 15.814 15.474 15.054 14.638 14.226 13.799 13.422 13.023 12.63 12.267 11.927 11.603 11.317 11.065 10.771 10.496 10.257 10.013 9.77 9.567 9.344 9.086 8.883 8.688 8.473 8.231 7.977 7.792 7.609 7.354 7.163 6.935 6.826 6.61 6.361 6.091 5.946 5.623 5.468 5.289 5.098 4.709 4.473 4.221 3.97 3.698 3.383 2.978 1.794 -4 ,19986 ,KEBNE ,17040637,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:51:15 CET,0.0 0.69 0.989 1.201 1.38 1.556 1.728 1.897 2.204 2.351 2.499 2.592 2.863 2.968 3.172 3.364 3.557 3.648 3.829 4.01 4.253 4.402 4.549 4.768 4.99 5.206 5.413 5.61 5.86 6.099 6.326 6.593 6.842 7.075 7.347 7.661 7.97 8.308 8.673 9.051 9.434 9.869 10.388 10.909 11.477 12.049 12.691 13.429 14.151 14.869 15.551 15.601 15.33 14.943 14.516 14.081 13.664 13.257 12.891 12.539 12.223 11.922 11.613 11.301 11.008 10.736 10.464 10.232 10.024 9.813 9.585 9.362 9.122 8.872 8.666 8.457 8.246 8.022 7.778 7.592 7.401 7.119 6.929 6.749 6.647 6.433 6.207 5.927 5.776 5.464 5.323 5.135 4.947 4.6 4.381 4.124 3.855 3.546 3.132 2.613 0.834 -5 ,18802 ,KEBNE ,17040638,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:52:23 CET,0.0 0.571 0.88 1.124 1.328 1.508 1.673 1.831 2.132 2.272 2.408 2.498 2.786 2.898 3.109 3.316 3.514 3.609 3.787 3.956 4.196 4.352 4.514 4.735 4.932 5.129 5.322 5.516 5.77 6.007 6.224 6.473 6.712 6.957 7.241 7.546 7.845 8.184 8.539 8.907 9.285 9.701 10.174 10.631 11.174 11.766 12.392 13.045 13.75 14.433 14.98 15.029 14.707 14.257 13.78 13.314 12.903 12.479 12.063 11.672 11.338 11.008 10.675 10.352 10.035 9.741 9.435 9.135 8.874 8.624 8.362 8.141 7.905 7.649 7.446 7.247 7.041 6.806 6.558 6.387 6.191 5.9 5.718 5.519 5.407 5.179 4.913 4.634 4.507 4.199 4.072 3.915 3.75 3.359 3.136 2.937 2.715 2.437 2.122 1.69 0.048 -6 ,4087 ,KEBNE ,17040639,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:51:03 CET,0.0 0.753 1.115 1.354 1.547 1.761 1.954 2.118 2.427 2.57 2.705 2.801 3.095 3.203 3.424 3.641 3.851 3.95 4.129 4.31 4.568 4.735 4.896 5.124 5.344 5.55 5.745 5.936 6.193 6.447 6.688 6.966 7.22 7.464 7.761 8.085 8.365 8.679 9.039 9.421 9.808 10.225 10.714 11.214 11.782 12.375 13.012 13.75 14.568 15.339 15.988 16.203 15.996 15.595 15.133 14.654 14.184 13.736 13.344 12.908 12.52 12.174 11.826 11.487 11.16 10.859 10.561 10.281 10.027 9.765 9.49 9.262 9.022 8.779 8.568 8.336 8.117 7.892 7.651 7.472 7.273 6.963 6.748 6.532 6.421 6.195 5.967 5.699 5.548 5.24 5.102 4.92 4.721 4.307 4.087 3.847 3.566 3.263 2.918 2.477 1.056 -7 ,934 ,KEBNE ,17040640,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:51:46 CET,0.0 0.642 0.958 1.183 1.391 1.606 1.78 1.919 2.169 2.288 2.409 2.48 2.765 2.891 3.13 3.355 3.553 3.649 3.841 4.029 4.3 4.473 4.639 4.863 5.08 5.284 5.49 5.692 5.944 6.181 6.409 6.69 6.958 7.226 7.535 7.879 8.209 8.562 8.927 9.303 9.687 10.094 10.571 11.056 11.593 12.18 12.837 13.56 14.348 15.092 15.709 15.857 15.653 15.343 14.956 14.532 14.123 13.719 13.364 12.988 12.648 12.33 12.013 11.728 11.453 11.173 10.884 10.626 10.38 10.128 9.862 9.612 9.35 9.103 8.931 8.737 8.527 8.315 8.1 7.949 7.78 7.5 7.302 7.107 7.015 6.836 6.618 6.347 6.206 5.916 5.82 5.689 5.538 5.16 4.932 4.701 4.466 4.175 3.81 3.308 1.352 -8 ,11034 ,KEBNE ,17040641,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:51:30 CET,0.0 0.634 0.912 1.126 1.293 1.439 1.59 1.747 2.014 2.15 2.282 2.345 2.624 2.727 2.92 3.104 3.286 3.376 3.555 3.737 4.001 4.168 4.325 4.538 4.733 4.93 5.123 5.311 5.556 5.786 6.016 6.299 6.561 6.811 7.087 7.41 7.727 8.065 8.435 8.818 9.209 9.639 10.125 10.621 11.194 11.795 12.444 13.083 13.768 14.486 15.087 15.194 14.951 14.585 14.137 13.663 13.214 12.793 12.419 11.997 11.623 11.3 10.977 10.661 10.369 10.102 9.809 9.536 9.299 9.033 8.736 8.493 8.238 7.967 7.761 7.555 7.349 7.138 6.909 6.757 6.602 6.342 6.137 5.911 5.801 5.57 5.332 5.073 4.932 4.612 4.449 4.271 4.085 3.721 3.5 3.272 3.075 2.838 2.509 2.108 0.912 -9 ,29034 ,KEBNE ,17040642,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:51:18 CET,0.0 0.962 1.325 1.602 1.829 2.029 2.225 2.412 2.738 2.873 3.006 3.119 3.424 3.556 3.796 4.01 4.206 4.296 4.48 4.65 4.884 5.032 5.177 5.39 5.596 5.805 5.999 6.185 6.45 6.703 6.923 7.189 7.455 7.711 7.999 8.316 8.624 8.966 9.309 9.662 10.048 10.485 10.976 11.434 11.955 12.516 13.13 13.804 14.531 15.284 15.965 16.198 16.043 15.713 15.354 14.936 14.496 14.074 13.677 13.258 12.899 12.54 12.178 11.839 11.532 11.26 10.941 10.634 10.396 10.166 9.912 9.702 9.478 9.228 9.01 8.771 8.542 8.332 8.117 7.961 7.799 7.532 7.327 7.13 7.038 6.817 6.552 6.3 6.171 5.867 5.73 5.556 5.367 4.932 4.673 4.405 4.135 3.805 3.419 3.016 1.628 -10 ,1554 ,KEBNE ,17040643,Thu Dec 23 01:04:48 CET,Thu Dec 23 02:52:20 CET,0.0 0.823 1.14 1.335 1.519 1.708 1.874 2.017 2.285 2.412 2.529 2.57 2.844 2.943 3.125 3.312 3.499 3.595 3.778 3.953 4.219 4.374 4.52 4.749 4.98 5.199 5.399 5.59 5.844 6.095 6.342 6.645 6.919 7.171 7.479 7.829 8.148 8.484 8.844 9.211 9.592 10.028 10.524 10.994 11.516 12.098 12.736 13.378 14.077 14.773 15.3 15.389 15.123 14.724 14.295 13.849 13.429 13.019 12.616 12.17 11.775 11.423 11.076 10.746 10.442 10.156 9.85 9.575 9.339 9.094 8.835 8.608 8.362 8.117 7.926 7.715 7.482 7.238 6.994 6.827 6.662 6.392 6.198 5.997 5.887 5.659 5.414 5.158 5.026 4.718 4.55 4.38 4.212 3.859 3.653 3.423 3.216 2.988 2.676 2.223 1.175 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 5c334a5c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21670 ,KEBNE ,17040644,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:47:18 CET,0.0 0.348 0.592 0.833 1.035 1.206 1.357 1.492 1.753 1.872 1.978 1.98 2.259 2.35 2.531 2.711 2.875 2.947 3.091 3.245 3.469 3.614 3.745 3.936 4.132 4.32 4.502 4.676 4.897 5.102 5.288 5.522 5.746 5.948 6.171 6.408 6.648 6.935 7.245 7.537 7.789 8.069 8.414 8.76 9.12 9.446 9.756 10.06 10.371 10.553 10.417 9.967 9.418 8.848 8.279 7.701 7.189 6.759 6.376 5.964 5.581 5.216 4.854 4.511 4.183 3.878 3.557 3.259 3.005 2.732 2.441 2.204 1.959 1.706 1.51 1.299 1.079 0.86 0.615 0.445 0.277 0.024 -0.136 -0.309 -0.405 -0.611 -0.82 -1.048 -1.178 -1.485 -1.525 -1.645 -1.788 -2.111 -2.284 -2.488 -2.705 -2.928 -3.175 -3.601 -5.596 -2 ,10268 ,KEBNE ,17040645,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:47:37 CET,0.0 0.93 1.249 1.476 1.651 1.807 1.962 2.106 2.344 2.46 2.581 2.628 2.916 3.012 3.203 3.399 3.586 3.667 3.817 3.968 4.198 4.34 4.46 4.617 4.776 4.95 5.111 5.25 5.433 5.609 5.781 5.996 6.216 6.421 6.636 6.863 7.09 7.343 7.606 7.867 8.146 8.487 8.86 9.195 9.548 9.875 10.191 10.528 10.837 10.983 10.873 10.332 9.638 8.986 8.354 7.757 7.254 6.76 6.29 5.828 5.424 5.052 4.689 4.364 4.08 3.81 3.521 3.255 3.028 2.786 2.523 2.314 2.089 1.836 1.644 1.416 1.13 0.864 0.63 0.461 0.283 0.006 -0.188 -0.389 -0.487 -0.691 -0.921 -1.182 -1.319 -1.65 -1.774 -1.941 -2.119 -2.528 -2.735 -2.956 -3.257 -3.582 -3.952 -4.55 -6.165 -3 ,6255 ,KEBNE ,17040646,Thu Dec 23 01:04:48 CET,Thu Dec 23 02:47:26 CET,0.0 0.661 0.955 1.162 1.361 1.54 1.686 1.819 2.072 2.193 2.308 2.342 2.634 2.723 2.888 3.028 3.164 3.236 3.383 3.518 3.712 3.843 3.962 4.14 4.317 4.485 4.641 4.788 4.98 5.157 5.312 5.501 5.692 5.876 6.098 6.348 6.572 6.799 7.054 7.34 7.624 7.91 8.233 8.532 8.863 9.196 9.565 9.945 10.266 10.453 10.29 9.853 9.358 8.734 8.144 7.636 7.161 6.687 6.257 5.799 5.413 5.079 4.769 4.497 4.226 3.963 3.678 3.412 3.177 2.924 2.639 2.407 2.155 1.874 1.654 1.406 1.115 0.809 0.512 0.317 0.14 -0.153 -0.395 -0.65 -0.784 -1.032 -1.283 -1.585 -1.756 -2.127 -2.319 -2.516 -2.706 -3.137 -3.397 -3.688 -4.008 -4.344 -4.78 -5.392 -7.224 -4 ,1041 ,KEBNE ,17040647,Thu Dec 23 01:04:47 CET,Thu Dec 23 02:47:39 CET,0.0 0.518 0.761 0.971 1.138 1.292 1.438 1.582 1.836 1.958 2.078 2.118 2.405 2.497 2.688 2.873 3.038 3.114 3.25 3.387 3.596 3.724 3.852 4.026 4.181 4.339 4.498 4.649 4.834 5.022 5.214 5.431 5.621 5.794 6.003 6.238 6.445 6.669 6.917 7.162 7.396 7.65 7.938 8.218 8.532 8.864 9.193 9.48 9.768 9.973 9.832 9.328 8.713 8.03 7.411 6.831 6.27 5.721 5.253 4.795 4.392 4.033 3.677 3.33 2.977 2.64 2.321 2.054 1.794 1.526 1.26 1.007 0.737 0.462 0.235 -0.003 -0.234 -0.499 -0.818 -1.027 -1.237 -1.572 -1.816 -2.088 -2.224 -2.491 -2.777 -3.096 -3.268 -3.624 -3.758 -3.914 -4.061 -4.394 -4.584 -4.818 -5.074 -5.343 -5.705 -6.195 -7.817 -5 ,25601 ,KEBNE ,17040648,Thu Dec 23 01:05:51 CET,Thu Dec 23 02:49:14 CET,0.0 1.192 1.541 1.833 2.074 2.262 2.405 2.547 2.828 2.962 3.086 3.109 3.409 3.516 3.707 3.887 4.06 4.146 4.323 4.492 4.71 4.838 4.961 5.144 5.317 5.481 5.643 5.795 5.987 6.19 6.389 6.615 6.822 7.013 7.237 7.487 7.736 8.007 8.262 8.52 8.806 9.12 9.464 9.805 10.158 10.474 10.798 11.133 11.42 11.597 11.542 11.115 10.552 9.907 9.267 8.685 8.153 7.618 7.138 6.672 6.271 5.909 5.567 5.233 4.904 4.566 4.181 3.832 3.537 3.234 2.893 2.594 2.289 1.965 1.711 1.443 1.15 0.855 0.563 0.346 0.127 -0.152 -0.343 -0.553 -0.665 -0.892 -1.146 -1.42 -1.566 -1.916 -2.066 -2.251 -2.44 -2.865 -3.126 -3.395 -3.678 -3.996 -4.395 -4.952 -6.772 -6 ,9926 ,KEBNE ,17040649,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:58:27 CET,0.0 0.907 1.174 1.417 1.619 1.803 1.963 2.11 2.401 2.535 2.656 2.695 2.986 3.085 3.284 3.478 3.67 3.764 3.941 4.1 4.313 4.442 4.557 4.736 4.924 5.101 5.271 5.424 5.603 5.779 5.954 6.16 6.353 6.53 6.736 6.975 7.205 7.451 7.706 7.98 8.275 8.593 8.95 9.292 9.634 9.976 10.312 10.596 10.822 10.923 10.777 10.226 9.618 9.033 8.467 7.911 7.388 6.875 6.434 6.017 5.648 5.317 4.977 4.653 4.364 4.083 3.77 3.489 3.254 2.988 2.704 2.483 2.238 1.97 1.768 1.56 1.351 1.116 0.842 0.651 0.448 0.135 -0.078 -0.29 -0.39 -0.599 -0.837 -1.111 -1.254 -1.576 -1.651 -1.782 -1.906 -2.215 -2.395 -2.582 -2.77 -3.001 -3.29 -3.74 -5.605 -7 ,3957 ,KEBNE ,17040650,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:58:42 CET,0.0 0.543 0.818 1.052 1.273 1.466 1.614 1.755 2.014 2.126 2.23 2.238 2.517 2.604 2.781 2.934 3.071 3.144 3.302 3.447 3.648 3.774 3.883 4.044 4.214 4.385 4.552 4.719 4.94 5.142 5.328 5.542 5.748 5.944 6.164 6.396 6.597 6.824 7.104 7.392 7.644 7.905 8.219 8.546 8.869 9.193 9.55 9.91 10.209 10.378 10.298 9.839 9.309 8.754 8.217 7.715 7.25 6.785 6.371 5.946 5.56 5.213 4.858 4.501 4.165 3.839 3.498 3.193 2.915 2.631 2.357 2.136 1.903 1.647 1.442 1.218 0.969 0.715 0.475 0.328 0.185 -0.052 -0.244 -0.443 -0.543 -0.761 -0.989 -1.229 -1.355 -1.669 -1.737 -1.889 -2.06 -2.436 -2.652 -2.886 -3.13 -3.396 -3.711 -4.124 -5.805 -8 ,13149 ,KEBNE ,17040651,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:59:46 CET,0.0 0.732 1.037 1.265 1.44 1.595 1.74 1.865 2.117 2.241 2.35 2.366 2.656 2.753 2.93 3.107 3.279 3.356 3.501 3.65 3.878 4.029 4.173 4.368 4.546 4.719 4.883 5.032 5.221 5.411 5.608 5.847 6.049 6.239 6.444 6.686 6.961 7.242 7.522 7.815 8.117 8.461 8.855 9.233 9.647 10.039 10.412 10.795 11.149 11.38 11.33 10.793 10.068 9.276 8.556 7.921 7.354 6.826 6.328 5.793 5.325 4.912 4.534 4.181 3.861 3.57 3.261 2.981 2.734 2.489 2.232 2.009 1.776 1.521 1.314 1.083 0.835 0.589 0.337 0.153 -0.039 -0.355 -0.58 -0.802 -0.909 -1.133 -1.39 -1.663 -1.789 -2.101 -2.18 -2.339 -2.5 -2.824 -3.013 -3.246 -3.544 -3.899 -4.302 -4.812 -6.679 -9 ,14946 ,KEBNE ,17040652,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:57:20 CET,0.0 0.802 1.082 1.286 1.463 1.613 1.76 1.913 2.192 2.321 2.441 2.451 2.724 2.813 2.983 3.134 3.287 3.363 3.512 3.667 3.882 4.013 4.14 4.322 4.495 4.658 4.822 4.971 5.156 5.348 5.53 5.743 5.943 6.139 6.346 6.552 6.763 6.996 7.254 7.533 7.807 8.112 8.439 8.773 9.164 9.527 9.891 10.232 10.516 10.723 10.721 10.372 9.912 9.397 8.898 8.392 7.914 7.474 7.08 6.685 6.363 6.073 5.787 5.514 5.252 5.013 4.757 4.521 4.323 4.101 3.844 3.634 3.419 3.204 3.035 2.86 2.68 2.49 2.301 2.172 2.039 1.828 1.674 1.493 1.4 1.203 0.986 0.766 0.654 0.347 0.284 0.138 -0.015 -0.321 -0.492 -0.712 -0.975 -1.317 -1.774 -2.406 -4.476 -10 ,12604 ,KEBNE ,17040653,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:54 CET,0.0 0.373 0.572 0.756 0.932 1.113 1.283 1.432 1.669 1.787 1.911 1.933 2.208 2.293 2.461 2.63 2.797 2.874 3.013 3.154 3.35 3.472 3.596 3.77 3.935 4.095 4.249 4.398 4.579 4.749 4.925 5.151 5.376 5.586 5.809 6.057 6.292 6.543 6.814 7.077 7.334 7.618 7.961 8.294 8.64 8.982 9.313 9.667 10.009 10.195 10.066 9.511 8.842 8.207 7.641 7.106 6.621 6.156 5.743 5.325 4.953 4.633 4.317 3.971 3.626 3.326 3.019 2.734 2.477 2.224 1.969 1.735 1.478 1.215 1.009 0.801 0.594 0.385 0.13 -0.085 -0.314 -0.661 -0.902 -1.177 -1.319 -1.602 -1.906 -2.209 -2.368 -2.711 -2.797 -2.958 -3.174 -3.648 -3.913 -4.209 -4.536 -4.963 -5.415 -6.027 -7.809 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 8cbacca0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,904 ,KEBNE ,17040654,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:17 CET,0.0 0.812 1.092 1.336 1.562 1.757 1.927 2.083 2.405 2.567 2.714 2.789 3.107 3.23 3.465 3.704 3.941 4.054 4.266 4.474 4.78 4.977 5.18 5.485 5.763 6.019 6.276 6.543 6.897 7.228 7.534 7.916 8.287 8.647 9.068 9.549 10.033 10.574 11.144 11.761 12.455 13.22 14.082 14.991 16.074 17.254 18.64 20.292 22.239 24.667 27.845 30.531 32.102 33.07 33.729 34.18 34.498 34.726 34.877 35.0 35.063 35.077 35.074 35.056 35.023 34.991 34.947 34.896 34.849 34.792 34.725 34.671 34.619 34.556 34.496 34.438 34.368 34.283 34.188 34.111 34.036 33.937 33.861 33.775 33.733 33.643 33.549 33.444 33.385 33.165 33.172 33.088 33.004 32.836 32.735 32.617 32.477 32.333 32.168 31.948 31.378 -2 ,17760 ,KEBNE ,17040655,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:06 CET,0.0 0.512 0.876 1.173 1.423 1.649 1.843 2.028 2.394 2.55 2.695 2.805 3.134 3.267 3.539 3.796 4.033 4.147 4.377 4.6 4.925 5.119 5.302 5.593 5.875 6.134 6.391 6.651 6.989 7.313 7.636 8.032 8.407 8.776 9.213 9.708 10.198 10.728 11.292 11.908 12.567 13.295 14.154 15.086 16.194 17.449 18.92 20.519 22.463 24.858 27.805 30.399 32.027 33.066 33.705 34.132 34.454 34.664 34.78 34.866 34.918 34.952 34.958 34.95 34.934 34.907 34.868 34.831 34.799 34.748 34.682 34.63 34.576 34.508 34.45 34.385 34.298 34.207 34.113 34.045 33.979 33.859 33.762 33.669 33.626 33.537 33.439 33.327 33.252 33.005 33.026 32.963 32.88 32.688 32.589 32.496 32.377 32.241 32.087 31.857 31.43 -3 ,20428 ,KEBNE ,17040656,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:59:15 CET,0.0 0.674 0.97 1.216 1.43 1.615 1.792 1.955 2.266 2.428 2.578 2.65 2.963 3.081 3.31 3.533 3.75 3.861 4.076 4.288 4.593 4.776 4.958 5.247 5.519 5.784 6.065 6.335 6.682 7.004 7.313 7.704 8.081 8.44 8.866 9.349 9.812 10.342 10.918 11.539 12.21 12.981 13.866 14.707 15.686 16.864 18.309 19.991 22.007 24.406 27.343 29.855 31.408 32.388 33.021 33.467 33.77 33.996 34.154 34.279 34.365 34.421 34.45 34.449 34.428 34.406 34.382 34.331 34.27 34.211 34.152 34.113 34.068 34.002 33.941 33.871 33.799 33.713 33.619 33.562 33.498 33.385 33.305 33.211 33.154 33.029 32.902 32.781 32.717 32.498 32.543 32.479 32.399 32.189 32.072 31.937 31.799 31.667 31.52 31.329 30.957 -4 ,4676 ,KEBNE ,17040657,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:59:01 CET,0.0 0.686 1.031 1.295 1.541 1.783 1.994 2.172 2.505 2.656 2.796 2.886 3.212 3.341 3.582 3.826 4.068 4.194 4.446 4.671 4.988 5.202 5.412 5.712 6.007 6.285 6.554 6.821 7.165 7.503 7.83 8.223 8.602 8.965 9.392 9.896 10.387 10.902 11.478 12.121 12.785 13.532 14.415 15.335 16.44 17.652 19.074 20.703 22.673 25.118 28.042 30.488 32.047 33.035 33.651 34.071 34.349 34.54 34.679 34.793 34.854 34.892 34.911 34.917 34.913 34.886 34.849 34.804 34.743 34.674 34.594 34.527 34.455 34.369 34.309 34.244 34.174 34.099 34.011 33.948 33.876 33.757 33.675 33.591 33.548 33.45 33.336 33.227 33.157 32.933 32.975 32.91 32.833 32.663 32.559 32.448 32.333 32.222 32.091 31.918 31.548 -5 ,10375 ,KEBNE ,17040658,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:57:42 CET,0.0 0.627 0.923 1.2 1.435 1.641 1.817 1.991 2.312 2.464 2.606 2.68 2.995 3.119 3.367 3.611 3.829 3.935 4.153 4.356 4.648 4.846 5.044 5.319 5.583 5.861 6.127 6.363 6.686 7.006 7.323 7.716 8.093 8.46 8.889 9.386 9.861 10.387 10.963 11.58 12.228 12.969 13.845 14.763 15.873 17.08 18.496 20.11 22.038 24.411 27.455 30.157 31.746 32.718 33.407 33.92 34.245 34.468 34.623 34.741 34.792 34.814 34.836 34.832 34.8 34.774 34.743 34.715 34.693 34.658 34.601 34.544 34.486 34.419 34.365 34.286 34.195 34.117 34.036 33.969 33.898 33.772 33.687 33.609 33.564 33.467 33.352 33.242 33.183 32.971 32.975 32.9 32.821 32.637 32.542 32.422 32.291 32.157 31.971 31.725 31.349 -6 ,27449 ,KEBNE ,17040659,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:59:16 CET,0.0 0.545 0.849 1.09 1.307 1.508 1.696 1.878 2.207 2.347 2.487 2.576 2.888 3.013 3.26 3.492 3.71 3.818 4.034 4.244 4.555 4.759 4.96 5.245 5.527 5.799 6.051 6.3 6.634 6.956 7.273 7.667 8.038 8.391 8.826 9.31 9.776 10.33 10.928 11.565 12.236 12.993 13.903 14.805 15.862 17.121 18.601 20.292 22.346 24.828 27.866 30.411 31.999 33.029 33.707 34.216 34.559 34.802 34.959 35.079 35.143 35.168 35.19 35.199 35.192 35.18 35.152 35.104 35.05 34.998 34.932 34.868 34.811 34.741 34.676 34.618 34.56 34.497 34.433 34.369 34.291 34.178 34.097 34.014 33.971 33.872 33.767 33.652 33.584 33.363 33.369 33.298 33.221 33.063 32.98 32.883 32.759 32.591 32.383 32.084 31.501 -7 ,25017 ,KEBNE ,17040660,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:59:43 CET,0.0 0.756 1.11 1.377 1.629 1.863 2.068 2.244 2.584 2.744 2.888 2.979 3.301 3.439 3.709 3.956 4.18 4.282 4.491 4.692 4.978 5.173 5.374 5.666 5.938 6.197 6.448 6.698 7.025 7.345 7.674 8.085 8.479 8.856 9.29 9.789 10.275 10.812 11.417 12.073 12.752 13.517 14.409 15.306 16.354 17.549 18.993 20.648 22.644 25.053 27.997 30.475 31.954 32.924 33.584 34.037 34.346 34.562 34.717 34.85 34.928 34.965 34.977 34.969 34.955 34.937 34.892 34.838 34.788 34.735 34.678 34.628 34.556 34.465 34.399 34.323 34.24 34.167 34.09 34.028 33.96 33.857 33.784 33.703 33.659 33.558 33.455 33.355 33.299 33.092 33.118 33.047 32.974 32.83 32.754 32.657 32.514 32.328 32.131 31.919 31.536 -8 ,12720 ,KEBNE ,17040661,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:58:50 CET,0.0 0.669 0.939 1.18 1.416 1.624 1.815 1.992 2.331 2.495 2.643 2.751 3.077 3.203 3.453 3.696 3.924 4.033 4.244 4.448 4.754 4.959 5.162 5.46 5.732 5.987 6.236 6.467 6.775 7.094 7.402 7.781 8.164 8.54 8.974 9.452 9.923 10.442 10.992 11.594 12.239 13.007 13.907 14.816 15.883 17.069 18.521 20.173 22.16 24.595 27.627 30.265 31.835 32.873 33.587 34.086 34.418 34.653 34.824 34.952 35.017 35.05 35.086 35.108 35.09 35.061 35.023 34.976 34.935 34.887 34.822 34.764 34.683 34.591 34.524 34.456 34.383 34.299 34.207 34.147 34.094 34.003 33.924 33.832 33.787 33.687 33.575 33.445 33.38 33.152 33.141 33.059 32.972 32.763 32.631 32.496 32.369 32.235 32.04 31.771 31.188 -9 ,24190 ,KEBNE ,17040662,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:59:37 CET,0.0 0.678 0.925 1.152 1.364 1.558 1.738 1.895 2.187 2.33 2.465 2.521 2.83 2.946 3.165 3.396 3.628 3.732 3.932 4.14 4.46 4.657 4.841 5.108 5.369 5.625 5.874 6.109 6.414 6.711 7.006 7.381 7.753 8.11 8.507 8.96 9.41 9.896 10.399 10.96 11.588 12.315 13.164 14.026 15.099 16.283 17.653 19.327 21.346 23.735 26.672 29.17 30.645 31.601 32.212 32.643 32.972 33.203 33.349 33.448 33.493 33.526 33.548 33.554 33.557 33.54 33.512 33.475 33.419 33.357 33.284 33.219 33.164 33.108 33.049 32.987 32.924 32.839 32.748 32.682 32.614 32.517 32.445 32.363 32.317 32.22 32.128 32.026 31.962 31.733 31.734 31.658 31.579 31.398 31.28 31.156 31.038 30.908 30.738 30.507 30.011 -10 ,4579 ,KEBNE ,17040663,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:59:09 CET,0.0 0.47 0.699 0.911 1.115 1.285 1.45 1.61 1.906 2.055 2.187 2.228 2.544 2.667 2.909 3.139 3.355 3.464 3.681 3.897 4.212 4.408 4.595 4.879 5.149 5.407 5.665 5.915 6.223 6.535 6.848 7.211 7.566 7.921 8.353 8.838 9.309 9.827 10.367 10.96 11.606 12.346 13.219 14.092 15.131 16.374 17.829 19.427 21.368 23.804 26.884 29.435 30.986 31.988 32.647 33.137 33.476 33.722 33.895 34.028 34.095 34.115 34.115 34.106 34.103 34.074 34.011 33.95 33.89 33.827 33.763 33.7 33.621 33.546 33.492 33.427 33.358 33.287 33.217 33.161 33.088 32.962 32.878 32.793 32.745 32.64 32.537 32.424 32.371 32.16 32.196 32.129 32.061 31.91 31.815 31.711 31.6 31.477 31.278 31.033 30.67 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt deleted file mode 100644 index 8e9aa187..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29408 ,KEBNE ,17040664,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:41 CET,0.0 0.725 0.966 1.202 1.369 1.522 1.696 1.865 2.15 2.27 2.378 2.423 2.717 2.818 3.027 3.209 3.357 3.428 3.565 3.697 3.879 3.979 4.074 4.213 4.355 4.502 4.638 4.762 4.913 5.06 5.211 5.399 5.56 5.718 5.889 6.052 6.224 6.425 6.653 6.876 7.098 7.334 7.578 7.808 8.034 8.273 8.501 8.687 8.783 8.535 7.737 6.518 5.439 4.474 3.598 2.812 2.12 1.483 0.911 0.343 -0.131 -0.528 -0.908 -1.275 -1.606 -1.911 -2.24 -2.54 -2.795 -3.058 -3.333 -3.562 -3.799 -4.037 -4.222 -4.41 -4.609 -4.813 -5.017 -5.167 -5.326 -5.56 -5.711 -5.876 -5.973 -6.17 -6.377 -6.59 -6.701 -7.017 -7.053 -7.166 -7.296 -7.576 -7.724 -7.881 -8.058 -8.247 -8.453 -8.708 -9.709 -2 ,11177 ,KEBNE ,17040665,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:58:58 CET,0.0 0.745 1.042 1.263 1.424 1.575 1.722 1.848 2.045 2.137 2.243 2.281 2.577 2.667 2.854 3.031 3.194 3.268 3.397 3.525 3.71 3.837 3.965 4.138 4.296 4.442 4.591 4.747 4.93 5.103 5.27 5.458 5.648 5.828 6.011 6.197 6.39 6.589 6.791 6.999 7.189 7.391 7.607 7.794 8.021 8.297 8.528 8.667 8.71 8.55 7.854 6.67 5.614 4.676 3.821 3.057 2.389 1.746 1.191 0.661 0.215 -0.189 -0.586 -0.958 -1.302 -1.616 -1.937 -2.223 -2.474 -2.73 -2.996 -3.22 -3.447 -3.687 -3.885 -4.08 -4.27 -4.476 -4.709 -4.863 -5.01 -5.232 -5.385 -5.559 -5.648 -5.813 -5.978 -6.171 -6.275 -6.579 -6.596 -6.709 -6.837 -7.144 -7.301 -7.462 -7.639 -7.827 -8.04 -8.284 -8.659 -3 ,30962 ,KEBNE ,17040666,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 03:00:56 CET,0.0 0.815 1.048 1.245 1.418 1.562 1.691 1.82 2.067 2.183 2.292 2.312 2.596 2.7 2.901 3.077 3.245 3.329 3.483 3.614 3.795 3.918 4.029 4.195 4.372 4.551 4.701 4.826 4.993 5.151 5.31 5.502 5.682 5.856 6.047 6.238 6.403 6.592 6.801 7.01 7.213 7.428 7.673 7.894 8.126 8.365 8.571 8.753 8.896 8.814 8.133 6.986 5.876 4.853 3.97 3.162 2.415 1.713 1.129 0.579 0.106 -0.309 -0.682 -1.038 -1.373 -1.685 -2.015 -2.305 -2.56 -2.827 -3.119 -3.356 -3.611 -3.883 -4.073 -4.271 -4.481 -4.705 -4.937 -5.099 -5.272 -5.531 -5.708 -5.903 -6.001 -6.195 -6.393 -6.596 -6.703 -7.014 -7.056 -7.184 -7.332 -7.648 -7.812 -7.984 -8.162 -8.35 -8.568 -8.806 -9.296 -4 ,20864 ,KEBNE ,17040667,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:59:26 CET,0.0 0.481 0.733 0.921 1.108 1.276 1.417 1.538 1.762 1.869 1.983 1.989 2.276 2.368 2.529 2.676 2.826 2.902 3.053 3.198 3.395 3.513 3.636 3.815 3.974 4.118 4.266 4.411 4.603 4.782 4.935 5.109 5.277 5.443 5.62 5.792 5.94 6.098 6.278 6.469 6.666 6.884 7.1 7.285 7.484 7.649 7.785 7.863 7.775 7.459 6.709 5.447 4.284 3.272 2.361 1.516 0.778 0.139 -0.42 -1.005 -1.487 -1.904 -2.325 -2.735 -3.105 -3.454 -3.828 -4.145 -4.427 -4.721 -5.017 -5.253 -5.481 -5.74 -5.955 -6.164 -6.379 -6.597 -6.817 -6.967 -7.116 -7.37 -7.543 -7.707 -7.797 -7.987 -8.169 -8.372 -8.481 -8.79 -8.846 -8.982 -9.115 -9.383 -9.546 -9.729 -9.927 -10.126 -10.324 -10.609 -11.229 -5 ,19724 ,KEBNE ,17040668,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:46 CET,0.0 0.684 0.926 1.124 1.29 1.435 1.588 1.746 2.003 2.11 2.208 2.223 2.504 2.588 2.745 2.896 3.051 3.127 3.258 3.38 3.571 3.688 3.793 3.935 4.062 4.202 4.351 4.493 4.676 4.843 4.985 5.167 5.343 5.481 5.643 5.844 6.021 6.193 6.374 6.59 6.824 7.055 7.319 7.56 7.806 8.055 8.229 8.315 8.305 8.037 7.35 6.316 5.284 4.264 3.387 2.627 1.946 1.253 0.657 0.135 -0.312 -0.735 -1.147 -1.527 -1.884 -2.217 -2.579 -2.92 -3.217 -3.524 -3.854 -4.12 -4.389 -4.674 -4.896 -5.118 -5.338 -5.577 -5.827 -6.006 -6.194 -6.465 -6.657 -6.853 -6.953 -7.178 -7.428 -7.682 -7.801 -8.116 -8.147 -8.264 -8.381 -8.66 -8.819 -8.994 -9.172 -9.347 -9.529 -9.737 -10.269 -6 ,30927 ,KEBNE ,17040669,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:59:40 CET,0.0 0.699 0.995 1.192 1.356 1.511 1.681 1.852 2.13 2.237 2.339 2.351 2.635 2.716 2.855 2.986 3.108 3.164 3.291 3.433 3.636 3.757 3.865 4.028 4.201 4.371 4.534 4.676 4.849 5.014 5.171 5.351 5.503 5.654 5.833 6.043 6.248 6.454 6.672 6.896 7.154 7.434 7.699 7.894 8.07 8.248 8.402 8.523 8.566 8.395 7.631 6.5 5.371 4.338 3.51 2.766 2.081 1.461 0.94 0.388 -0.102 -0.537 -0.933 -1.295 -1.628 -1.935 -2.265 -2.558 -2.805 -3.078 -3.373 -3.607 -3.839 -4.082 -4.273 -4.463 -4.661 -4.86 -5.064 -5.201 -5.344 -5.577 -5.741 -5.916 -6.001 -6.168 -6.348 -6.537 -6.637 -6.939 -6.973 -7.097 -7.228 -7.518 -7.681 -7.85 -8.044 -8.25 -8.476 -8.731 -9.453 -7 ,20266 ,KEBNE ,17040671,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:45 CET,0.0 0.586 0.916 1.138 1.332 1.517 1.662 1.785 2.023 2.124 2.222 2.221 2.492 2.581 2.761 2.925 3.081 3.155 3.294 3.419 3.601 3.718 3.821 3.973 4.128 4.267 4.386 4.507 4.678 4.859 5.036 5.241 5.424 5.583 5.766 5.963 6.157 6.375 6.593 6.791 7.0 7.23 7.478 7.731 7.97 8.143 8.261 8.322 8.281 7.973 7.087 5.884 4.858 3.884 3.025 2.286 1.593 0.944 0.388 -0.165 -0.662 -1.125 -1.546 -1.917 -2.26 -2.559 -2.845 -3.103 -3.34 -3.594 -3.87 -4.128 -4.397 -4.653 -4.839 -5.022 -5.226 -5.459 -5.685 -5.834 -5.991 -6.237 -6.427 -6.622 -6.716 -6.901 -7.105 -7.328 -7.434 -7.73 -7.748 -7.866 -8.001 -8.302 -8.458 -8.627 -8.801 -9.006 -9.247 -9.571 -10.489 -8 ,11919 ,KEBNE ,17040672,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:16 CET,0.0 0.792 1.021 1.219 1.402 1.58 1.754 1.906 2.142 2.26 2.376 2.395 2.702 2.813 2.995 3.147 3.298 3.38 3.539 3.685 3.886 4.011 4.126 4.292 4.454 4.593 4.719 4.844 5.006 5.167 5.318 5.481 5.638 5.8 5.987 6.173 6.358 6.558 6.75 6.953 7.169 7.401 7.634 7.86 8.117 8.351 8.517 8.587 8.558 8.272 7.36 6.085 4.971 3.951 3.064 2.253 1.536 0.862 0.293 -0.246 -0.73 -1.165 -1.579 -1.972 -2.331 -2.639 -2.971 -3.284 -3.546 -3.818 -4.106 -4.335 -4.573 -4.827 -5.017 -5.199 -5.395 -5.606 -5.821 -5.972 -6.135 -6.403 -6.573 -6.741 -6.832 -7.011 -7.208 -7.42 -7.525 -7.828 -7.825 -7.937 -8.06 -8.309 -8.445 -8.611 -8.791 -8.983 -9.187 -9.481 -10.035 -9 ,338 ,KEBNE ,17040674,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:58:24 CET,0.0 0.585 0.791 0.961 1.134 1.256 1.377 1.519 1.782 1.888 1.982 1.959 2.232 2.309 2.451 2.6 2.737 2.801 2.93 3.064 3.25 3.361 3.467 3.613 3.746 3.875 4.005 4.127 4.292 4.462 4.634 4.833 5.005 5.159 5.333 5.526 5.719 5.915 6.116 6.319 6.541 6.801 7.065 7.32 7.57 7.75 7.884 7.942 7.796 7.377 6.401 5.07 3.938 2.925 2.024 1.215 0.527 -0.109 -0.712 -1.3 -1.751 -2.161 -2.563 -2.935 -3.288 -3.604 -3.922 -4.213 -4.469 -4.74 -5.018 -5.238 -5.46 -5.685 -5.853 -6.034 -6.23 -6.433 -6.662 -6.82 -6.976 -7.221 -7.382 -7.552 -7.645 -7.829 -8.021 -8.227 -8.333 -8.633 -8.651 -8.772 -8.9 -9.194 -9.365 -9.527 -9.676 -9.844 -10.068 -10.366 -11.099 -10 ,16078 ,KEBNE ,17040675,Thu Dec 23 01:16:13 CET,Thu Dec 23 02:57:55 CET,0.0 0.879 1.256 1.494 1.682 1.844 1.999 2.144 2.399 2.513 2.618 2.622 2.909 2.995 3.146 3.289 3.423 3.488 3.619 3.746 3.923 4.039 4.148 4.293 4.443 4.596 4.743 4.879 5.051 5.211 5.373 5.572 5.748 5.904 6.065 6.244 6.416 6.613 6.82 7.006 7.211 7.456 7.721 7.949 8.165 8.39 8.618 8.778 8.853 8.746 8.066 6.874 5.797 4.801 3.895 3.085 2.379 1.71 1.124 0.56 0.072 -0.379 -0.788 -1.152 -1.501 -1.829 -2.173 -2.481 -2.751 -3.021 -3.293 -3.521 -3.76 -4.012 -4.208 -4.403 -4.604 -4.825 -5.059 -5.221 -5.381 -5.619 -5.782 -5.949 -6.036 -6.229 -6.432 -6.644 -6.756 -7.067 -7.081 -7.199 -7.332 -7.669 -7.851 -8.038 -8.267 -8.492 -8.722 -9.002 -9.687 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt deleted file mode 100644 index 32894953..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17039 ,KEBNE ,17040678,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:32 CET,0.0 0.631 0.969 1.223 1.464 1.7 1.918 2.122 2.508 2.686 2.85 2.985 3.327 3.477 3.77 4.076 4.377 4.518 4.798 5.084 5.472 5.708 5.946 6.296 6.643 6.982 7.322 7.676 8.141 8.579 9.001 9.516 10.007 10.49 11.064 11.716 12.349 13.068 13.876 14.737 15.656 16.739 18.03 19.349 20.943 22.807 25.03 27.57 30.683 34.578 39.631 44.143 46.866 48.813 50.269 51.34 52.141 52.811 53.297 53.686 53.992 54.235 54.434 54.581 54.702 54.813 54.907 54.966 55.015 55.054 55.077 55.085 55.087 55.063 55.026 54.991 54.965 54.933 54.892 54.855 54.808 54.73 54.657 54.578 54.534 54.441 54.35 54.255 54.199 53.997 54.013 53.945 53.868 53.701 53.595 53.449 53.295 53.131 52.924 52.678 51.787 -2 ,11712 ,KEBNE ,17040679,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:54 CET,0.0 0.829 1.193 1.49 1.741 1.955 2.15 2.348 2.724 2.904 3.08 3.243 3.6 3.76 4.071 4.374 4.661 4.799 5.065 5.321 5.704 5.952 6.19 6.555 6.908 7.24 7.564 7.881 8.3 8.723 9.135 9.636 10.148 10.658 11.255 11.923 12.568 13.283 14.037 14.858 15.764 16.854 18.186 19.517 21.101 22.913 25.057 27.603 30.78 34.763 39.925 44.583 47.671 49.83 51.363 52.569 53.473 54.172 54.718 55.207 55.56 55.838 56.092 56.282 56.439 56.568 56.685 56.776 56.814 56.841 56.875 56.89 56.886 56.868 56.845 56.828 56.815 56.789 56.754 56.74 56.715 56.654 56.602 56.548 56.533 56.5 56.441 56.375 56.333 56.151 56.169 56.091 56.003 55.832 55.734 55.614 55.494 55.348 55.132 54.877 53.881 -3 ,21113 ,KEBNE ,17040681,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:59:22 CET,0.0 0.61 0.969 1.276 1.539 1.8 2.029 2.251 2.677 2.856 3.017 3.152 3.499 3.65 3.95 4.241 4.538 4.682 4.955 5.212 5.581 5.836 6.081 6.433 6.779 7.109 7.431 7.749 8.171 8.586 8.987 9.489 9.989 10.476 11.045 11.711 12.361 13.083 13.861 14.706 15.636 16.706 17.972 19.284 20.869 22.706 24.941 27.537 30.754 34.824 40.043 44.735 47.793 49.878 51.373 52.555 53.452 54.125 54.605 55.014 55.351 55.617 55.811 55.984 56.139 56.263 56.365 56.426 56.472 56.517 56.541 56.546 56.547 56.537 56.523 56.5 56.47 56.425 56.369 56.331 56.294 56.222 56.168 56.108 56.065 55.972 55.887 55.785 55.726 55.527 55.498 55.422 55.347 55.149 55.028 54.924 54.813 54.627 54.402 54.161 53.689 -4 ,31486 ,KEBNE ,17040682,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:58:26 CET,0.0 0.534 0.825 1.056 1.265 1.466 1.67 1.876 2.223 2.368 2.524 2.652 2.991 3.145 3.447 3.739 4.026 4.157 4.405 4.651 5.021 5.263 5.493 5.829 6.158 6.484 6.814 7.143 7.568 7.98 8.392 8.894 9.381 9.861 10.428 11.088 11.736 12.467 13.284 14.138 15.039 16.103 17.409 18.758 20.371 22.238 24.452 26.987 30.124 34.148 39.302 43.948 46.996 49.137 50.634 51.721 52.543 53.221 53.758 54.203 54.525 54.798 55.003 55.162 55.303 55.402 55.486 55.552 55.603 55.636 55.654 55.669 55.664 55.646 55.632 55.614 55.589 55.553 55.512 55.477 55.439 55.365 55.302 55.223 55.179 55.1 55.028 54.946 54.885 54.685 54.688 54.615 54.539 54.369 54.275 54.169 54.032 53.871 53.716 53.535 53.011 -5 ,15978 ,KEBNE ,17040684,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:57:23 CET,0.0 1.065 1.432 1.697 1.943 2.204 2.447 2.66 3.064 3.262 3.44 3.585 3.928 4.085 4.399 4.686 4.965 5.104 5.369 5.633 6.034 6.293 6.548 6.921 7.275 7.615 7.946 8.271 8.686 9.099 9.513 9.999 10.472 10.951 11.503 12.13 12.756 13.463 14.257 15.13 16.039 17.075 18.334 19.62 21.187 22.998 25.131 27.663 30.828 34.832 40.012 44.69 47.726 49.825 51.289 52.385 53.214 53.852 54.347 54.779 55.09 55.347 55.563 55.736 55.881 55.971 56.044 56.079 56.101 56.131 56.154 56.166 56.161 56.141 56.121 56.095 56.057 56.018 55.984 55.949 55.904 55.829 55.76 55.683 55.648 55.556 55.446 55.359 55.31 55.111 55.114 55.042 54.966 54.788 54.684 54.573 54.433 54.271 54.074 53.833 53.067 -6 ,23226 ,KEBNE ,17040685,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:59:03 CET,0.0 0.777 1.063 1.302 1.571 1.846 2.072 2.255 2.607 2.786 2.954 3.091 3.44 3.593 3.893 4.181 4.446 4.575 4.829 5.079 5.463 5.714 5.954 6.303 6.646 6.98 7.307 7.637 8.068 8.476 8.878 9.385 9.88 10.359 10.918 11.566 12.2 12.913 13.719 14.591 15.512 16.561 17.826 19.112 20.658 22.472 24.643 27.177 30.265 34.186 39.388 44.17 47.179 49.264 50.79 51.905 52.76 53.45 53.956 54.408 54.746 55.001 55.217 55.386 55.524 55.635 55.71 55.769 55.804 55.821 55.837 55.849 55.858 55.858 55.846 55.826 55.799 55.761 55.723 55.691 55.653 55.578 55.514 55.445 55.413 55.354 55.282 55.183 55.13 54.941 54.948 54.874 54.786 54.608 54.511 54.397 54.239 54.063 53.895 53.659 53.029 -7 ,12223 ,KEBNE ,17040687,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:03 CET,0.0 0.702 1.083 1.407 1.666 1.893 2.114 2.34 2.768 2.953 3.126 3.278 3.631 3.792 4.101 4.392 4.668 4.801 5.071 5.349 5.737 5.974 6.221 6.59 6.941 7.27 7.59 7.922 8.376 8.821 9.252 9.768 10.265 10.743 11.308 11.973 12.625 13.355 14.178 15.061 15.97 17.045 18.37 19.696 21.261 23.124 25.319 27.855 31.031 35.015 40.235 44.945 47.963 50.039 51.541 52.682 53.524 54.186 54.704 55.155 55.504 55.797 56.046 56.244 56.39 56.498 56.598 56.666 56.698 56.722 56.75 56.773 56.779 56.77 56.773 56.777 56.775 56.744 56.683 56.637 56.586 56.499 56.449 56.403 56.371 56.29 56.2 56.105 56.057 55.869 55.864 55.791 55.717 55.566 55.479 55.359 55.213 55.052 54.85 54.581 53.713 -8 ,13678 ,KEBNE ,17040688,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:57:42 CET,0.0 0.85 1.195 1.499 1.815 2.055 2.254 2.437 2.792 2.969 3.16 3.349 3.705 3.88 4.204 4.496 4.779 4.915 5.181 5.445 5.835 6.082 6.328 6.695 7.045 7.392 7.737 8.068 8.504 8.935 9.364 9.881 10.363 10.842 11.412 12.048 12.67 13.377 14.168 15.049 15.988 17.051 18.314 19.639 21.267 23.085 25.22 27.76 30.88 34.844 40.026 44.713 47.76 49.866 51.382 52.559 53.427 54.057 54.513 54.927 55.257 55.524 55.754 55.947 56.066 56.147 56.243 56.303 56.333 56.359 56.373 56.384 56.394 56.386 56.368 56.342 56.317 56.297 56.268 56.232 56.186 56.099 56.041 55.984 55.946 55.849 55.739 55.635 55.579 55.379 55.365 55.281 55.181 54.986 54.881 54.769 54.665 54.534 54.336 54.08 53.313 -9 ,6542 ,KEBNE ,17040689,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:58:06 CET,0.0 0.486 0.752 1.034 1.289 1.502 1.7 1.883 2.222 2.394 2.563 2.704 3.054 3.21 3.521 3.82 4.106 4.247 4.52 4.783 5.161 5.401 5.647 6.008 6.363 6.721 7.064 7.393 7.812 8.226 8.646 9.144 9.618 10.092 10.663 11.322 11.97 12.693 13.481 14.322 15.229 16.265 17.53 18.851 20.399 22.164 24.271 26.749 29.836 33.674 38.664 43.277 46.268 48.368 49.851 50.941 51.749 52.39 52.884 53.336 53.659 53.884 54.097 54.289 54.43 54.529 54.61 54.665 54.698 54.73 54.747 54.752 54.761 54.759 54.755 54.748 54.729 54.701 54.66 54.623 54.578 54.51 54.461 54.4 54.358 54.258 54.169 54.083 54.038 53.854 53.878 53.808 53.727 53.519 53.401 53.29 53.161 52.99 52.8 52.589 52.117 -10 ,14811 ,KEBNE ,17040690,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:58:41 CET,0.0 0.538 0.873 1.166 1.42 1.659 1.88 2.071 2.434 2.612 2.773 2.885 3.209 3.351 3.657 3.948 4.218 4.353 4.623 4.9 5.291 5.529 5.766 6.121 6.466 6.801 7.128 7.447 7.872 8.298 8.717 9.239 9.742 10.214 10.769 11.411 12.039 12.739 13.517 14.36 15.262 16.329 17.64 18.949 20.499 22.318 24.502 27.152 30.33 34.374 39.749 44.357 47.263 49.299 50.769 51.836 52.617 53.237 53.701 54.121 54.422 54.645 54.849 55.014 55.138 55.219 55.265 55.298 55.318 55.316 55.325 55.334 55.325 55.309 55.29 55.254 55.211 55.175 55.136 55.102 55.061 54.988 54.931 54.865 54.834 54.766 54.67 54.55 54.486 54.29 54.291 54.222 54.151 54.004 53.928 53.826 53.702 53.559 53.358 53.088 51.909 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index cd465a48..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2602 ,KEBNE ,17040691,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:59:23 CET,0.0 0.825 1.177 1.475 1.74 1.958 2.139 2.323 2.681 2.837 2.98 3.057 3.397 3.531 3.786 4.021 4.255 4.38 4.624 4.854 5.177 5.383 5.58 5.876 6.169 6.458 6.741 7.016 7.382 7.738 8.071 8.48 8.895 9.292 9.742 10.267 10.788 11.362 11.989 12.667 13.388 14.228 15.256 16.299 17.537 18.945 20.592 22.554 25.015 28.112 32.178 35.798 38.062 39.584 40.683 41.526 42.122 42.6 42.964 43.26 43.478 43.654 43.809 43.931 44.016 44.077 44.137 44.179 44.199 44.202 44.209 44.214 44.194 44.16 44.137 44.107 44.076 44.041 43.983 43.938 43.895 43.816 43.753 43.687 43.658 43.594 43.515 43.425 43.381 43.186 43.237 43.181 43.125 42.987 42.895 42.788 42.637 42.481 42.336 42.132 41.779 -2 ,5772 ,KEBNE ,17040692,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:16 CET,0.0 0.714 1.027 1.27 1.451 1.631 1.83 2.027 2.389 2.551 2.696 2.774 3.102 3.23 3.49 3.743 3.999 4.123 4.352 4.569 4.888 5.098 5.304 5.599 5.874 6.147 6.428 6.703 7.062 7.416 7.759 8.177 8.585 8.979 9.437 9.96 10.479 11.055 11.681 12.351 13.067 13.892 14.865 15.873 17.106 18.504 20.134 22.034 24.363 27.339 31.259 34.811 37.085 38.651 39.774 40.618 41.26 41.75 42.092 42.375 42.59 42.763 42.865 42.948 43.043 43.114 43.164 43.193 43.205 43.211 43.222 43.234 43.241 43.233 43.213 43.197 43.176 43.147 43.122 43.088 43.043 42.975 42.934 42.897 42.872 42.827 42.775 42.706 42.665 42.458 42.514 42.461 42.386 42.22 42.147 42.058 41.954 41.864 41.745 41.514 40.749 -3 ,22276 ,KEBNE ,17040693,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:59:27 CET,0.0 0.396 0.736 0.966 1.141 1.323 1.489 1.637 1.948 2.1 2.243 2.337 2.674 2.811 3.079 3.337 3.577 3.69 3.907 4.115 4.42 4.625 4.824 5.098 5.364 5.632 5.909 6.188 6.541 6.875 7.204 7.61 8.008 8.405 8.884 9.415 9.919 10.484 11.121 11.821 12.562 13.408 14.402 15.4 16.615 18.041 19.76 21.755 24.161 27.165 31.076 34.647 36.855 38.342 39.408 40.223 40.863 41.367 41.722 42.027 42.258 42.444 42.585 42.699 42.817 42.906 42.975 43.027 43.052 43.068 43.083 43.088 43.093 43.09 43.08 43.063 43.032 42.993 42.955 42.927 42.898 42.828 42.766 42.692 42.653 42.586 42.517 42.435 42.387 42.185 42.243 42.198 42.143 42.01 41.933 41.854 41.768 41.638 41.453 41.217 40.847 -4 ,15587 ,KEBNE ,17040694,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:00 CET,0.0 0.642 0.929 1.167 1.384 1.592 1.783 1.963 2.303 2.461 2.606 2.682 3.013 3.151 3.425 3.676 3.911 4.021 4.24 4.457 4.772 4.972 5.161 5.441 5.726 6.01 6.287 6.56 6.92 7.283 7.637 8.048 8.454 8.847 9.294 9.815 10.327 10.895 11.509 12.171 12.889 13.723 14.725 15.773 17.009 18.379 19.993 21.902 24.312 27.314 31.284 34.891 37.09 38.606 39.706 40.555 41.177 41.616 41.948 42.261 42.47 42.621 42.751 42.856 42.936 42.999 43.063 43.102 43.119 43.116 43.105 43.093 43.062 43.012 42.982 42.944 42.894 42.859 42.827 42.795 42.732 42.617 42.539 42.458 42.418 42.344 42.266 42.163 42.105 41.884 41.894 41.83 41.756 41.569 41.456 41.333 41.209 41.068 40.9 40.636 40.153 -5 ,10601 ,KEBNE ,17040695,Thu Dec 23 01:16:13 CET,Thu Dec 23 02:58:05 CET,0.0 0.68 0.985 1.22 1.437 1.626 1.79 1.942 2.247 2.402 2.553 2.648 2.983 3.117 3.394 3.671 3.906 4.013 4.239 4.467 4.791 5.001 5.201 5.492 5.766 6.033 6.306 6.58 6.938 7.281 7.609 8.015 8.418 8.803 9.255 9.775 10.273 10.833 11.478 12.207 12.98 13.845 14.884 15.936 17.153 18.588 20.358 22.415 24.902 27.959 31.939 35.456 37.679 39.249 40.323 41.075 41.606 42.018 42.337 42.606 42.813 42.97 43.089 43.176 43.239 43.282 43.318 43.354 43.374 43.38 43.377 43.362 43.359 43.353 43.323 43.285 43.249 43.206 43.141 43.096 43.057 42.986 42.917 42.85 42.818 42.743 42.662 42.587 42.548 42.342 42.362 42.297 42.227 42.068 41.984 41.874 41.742 41.617 41.49 41.314 40.827 -6 ,3149 ,KEBNE ,17040696,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:59:05 CET,0.0 0.724 1.034 1.272 1.502 1.722 1.936 2.131 2.484 2.642 2.788 2.88 3.215 3.354 3.609 3.836 4.058 4.17 4.385 4.588 4.907 5.116 5.311 5.609 5.894 6.174 6.456 6.723 7.063 7.391 7.718 8.121 8.525 8.915 9.374 9.895 10.387 10.954 11.586 12.246 12.974 13.819 14.826 15.887 17.121 18.512 20.17 22.078 24.443 27.477 31.377 34.871 37.057 38.6 39.736 40.586 41.199 41.686 42.03 42.301 42.526 42.683 42.794 42.889 42.953 43.004 43.061 43.099 43.126 43.137 43.128 43.111 43.09 43.058 43.03 42.994 42.95 42.905 42.851 42.814 42.783 42.711 42.649 42.591 42.56 42.496 42.419 42.336 42.296 42.095 42.156 42.095 42.026 41.869 41.79 41.708 41.616 41.52 41.389 41.218 40.905 -7 ,15117 ,KEBNE ,17040697,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:58:12 CET,0.0 0.595 0.872 1.109 1.309 1.51 1.708 1.907 2.279 2.443 2.597 2.708 3.054 3.197 3.483 3.749 4.022 4.156 4.413 4.656 4.972 5.179 5.387 5.694 6.001 6.3 6.583 6.87 7.248 7.6 7.958 8.4 8.82 9.232 9.711 10.269 10.817 11.425 12.078 12.762 13.509 14.371 15.385 16.41 17.625 19.042 20.717 22.649 25.045 28.108 32.024 35.431 37.619 39.185 40.282 41.075 41.672 42.123 42.471 42.793 43.006 43.144 43.25 43.336 43.414 43.479 43.527 43.555 43.57 43.56 43.538 43.527 43.514 43.497 43.465 43.417 43.372 43.332 43.284 43.248 43.211 43.137 43.082 43.026 43.0 42.934 42.851 42.768 42.724 42.521 42.555 42.494 42.44 42.316 42.233 42.125 42.014 41.89 41.746 41.559 40.896 -8 ,27999 ,KEBNE ,17040698,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:59:30 CET,0.0 0.842 1.123 1.391 1.637 1.836 2.02 2.199 2.553 2.706 2.855 2.961 3.308 3.453 3.735 4.0 4.251 4.372 4.609 4.844 5.183 5.404 5.62 5.931 6.244 6.556 6.854 7.138 7.512 7.884 8.249 8.7 9.147 9.579 10.069 10.625 11.185 11.79 12.412 13.068 13.792 14.63 15.628 16.669 17.916 19.34 21.02 22.973 25.326 28.337 32.426 36.094 38.369 39.934 41.074 41.925 42.569 43.067 43.421 43.726 43.948 44.11 44.219 44.306 44.39 44.454 44.504 44.53 44.542 44.553 44.553 44.543 44.518 44.479 44.45 44.419 44.39 44.363 44.326 44.294 44.264 44.212 44.166 44.109 44.082 44.036 43.964 43.887 43.855 43.66 43.726 43.672 43.618 43.471 43.39 43.319 43.23 43.101 42.936 42.75 42.517 -9 ,2638 ,KEBNE ,17040699,Thu Dec 23 01:16:13 CET,Thu Dec 23 02:57:55 CET,0.0 0.735 1.016 1.207 1.396 1.582 1.759 1.929 2.245 2.383 2.511 2.564 2.89 3.025 3.288 3.527 3.747 3.855 4.077 4.285 4.584 4.779 4.966 5.255 5.536 5.808 6.087 6.362 6.706 7.047 7.388 7.795 8.189 8.583 9.038 9.537 10.016 10.55 11.157 11.833 12.541 13.361 14.334 15.318 16.531 17.928 19.596 21.546 23.914 26.869 30.684 34.209 36.497 38.056 39.132 39.928 40.498 40.916 41.246 41.555 41.777 41.933 42.043 42.126 42.195 42.245 42.287 42.318 42.331 42.331 42.34 42.344 42.33 42.306 42.279 42.232 42.179 42.131 42.075 42.03 41.984 41.91 41.846 41.787 41.758 41.7 41.634 41.541 41.491 41.294 41.347 41.282 41.217 41.062 40.952 40.828 40.713 40.609 40.487 40.326 40.037 -10 ,13803 ,KEBNE ,17040700,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:59:25 CET,0.0 0.485 0.767 1.005 1.209 1.414 1.614 1.791 2.113 2.271 2.422 2.482 2.815 2.946 3.203 3.459 3.718 3.85 4.107 4.342 4.686 4.915 5.13 5.448 5.773 6.082 6.361 6.623 6.976 7.341 7.685 8.089 8.494 8.89 9.349 9.88 10.405 10.993 11.635 12.315 13.043 13.884 14.896 15.964 17.256 18.725 20.429 22.397 24.786 27.714 31.596 35.125 37.329 38.868 39.992 40.859 41.489 41.975 42.364 42.685 42.91 43.096 43.247 43.363 43.447 43.513 43.569 43.594 43.61 43.636 43.648 43.652 43.658 43.649 43.624 43.583 43.539 43.503 43.452 43.414 43.382 43.332 43.29 43.225 43.194 43.122 43.041 42.972 42.934 42.734 42.82 42.779 42.725 42.594 42.517 42.428 42.337 42.236 42.087 41.873 41.174 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt deleted file mode 100644 index a449196c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2573 ,KEBNE ,17040701,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:01 CET,0.0 0.887 1.155 1.338 1.469 1.578 1.681 1.769 1.887 1.936 1.982 1.923 2.089 2.125 2.199 2.258 2.313 2.333 2.36 2.376 2.377 2.368 2.367 2.384 2.39 2.376 2.36 2.342 2.319 2.271 2.198 2.108 2.006 1.902 1.776 1.613 1.434 1.222 0.971 0.657 0.275 -0.207 -0.836 -1.503 -2.359 -3.498 -4.97 -6.789 -9.29 -12.862 -18.31 -24.156 -28.485 -31.922 -34.704 -37.015 -38.949 -40.658 -42.083 -43.436 -44.563 -45.545 -46.454 -47.318 -48.116 -48.805 -49.484 -50.071 -50.584 -51.112 -51.646 -52.086 -52.531 -52.98 -53.321 -53.657 -54.0 -54.365 -54.748 -55.003 -55.257 -55.646 -55.906 -56.174 -56.311 -56.585 -56.876 -57.178 -57.326 -57.677 -57.822 -57.996 -58.171 -58.563 -58.77 -58.982 -59.199 -59.417 -59.658 -59.977 -61.088 -2 ,19314 ,KEBNE ,17040702,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:57:13 CET,0.0 0.791 1.027 1.174 1.323 1.45 1.552 1.652 1.788 1.836 1.88 1.816 1.986 2.018 2.085 2.145 2.178 2.195 2.232 2.253 2.265 2.268 2.271 2.267 2.27 2.28 2.272 2.247 2.213 2.167 2.115 2.046 1.947 1.837 1.713 1.572 1.408 1.198 0.946 0.65 0.321 -0.114 -0.701 -1.333 -2.147 -3.227 -4.661 -6.461 -8.944 -12.485 -17.809 -23.615 -27.99 -31.441 -34.235 -36.568 -38.487 -40.148 -41.547 -42.904 -44.037 -45.016 -45.909 -46.729 -47.483 -48.17 -48.867 -49.457 -49.949 -50.442 -50.95 -51.363 -51.782 -52.219 -52.55 -52.889 -53.246 -53.611 -53.989 -54.252 -54.509 -54.889 -55.157 -55.443 -55.583 -55.86 -56.17 -56.478 -56.633 -56.996 -57.146 -57.301 -57.452 -57.785 -57.951 -58.134 -58.356 -58.615 -58.897 -59.268 -60.144 -3 ,28445 ,KEBNE ,17040703,Thu Dec 23 01:16:13 CET,Thu Dec 23 02:59:09 CET,0.0 0.546 0.726 0.81 0.893 0.977 1.034 1.083 1.192 1.234 1.27 1.21 1.385 1.417 1.464 1.507 1.535 1.551 1.601 1.643 1.683 1.7 1.707 1.718 1.715 1.704 1.694 1.686 1.667 1.627 1.575 1.489 1.389 1.281 1.144 0.95 0.744 0.499 0.201 -0.144 -0.548 -1.043 -1.681 -2.382 -3.281 -4.411 -5.886 -7.819 -10.474 -14.185 -19.702 -25.554 -29.965 -33.379 -36.082 -38.371 -40.293 -41.969 -43.341 -44.655 -45.733 -46.675 -47.564 -48.369 -49.119 -49.781 -50.442 -51.018 -51.502 -52.009 -52.528 -52.93 -53.343 -53.775 -54.1 -54.44 -54.781 -55.121 -55.475 -55.712 -55.96 -56.349 -56.609 -56.865 -56.996 -57.271 -57.551 -57.832 -57.972 -58.327 -58.47 -58.64 -58.821 -59.171 -59.339 -59.516 -59.704 -59.945 -60.184 -60.5 -61.534 -4 ,32614 ,KEBNE ,17040704,Thu Dec 23 01:16:11 CET,Thu Dec 23 02:57:42 CET,0.0 0.563 0.732 0.845 0.941 1.046 1.159 1.253 1.405 1.457 1.495 1.46 1.636 1.66 1.692 1.719 1.739 1.745 1.76 1.769 1.764 1.761 1.755 1.745 1.746 1.732 1.704 1.676 1.633 1.578 1.504 1.396 1.276 1.156 1.003 0.818 0.643 0.42 0.13 -0.212 -0.607 -1.087 -1.71 -2.419 -3.34 -4.481 -5.953 -7.828 -10.354 -13.906 -19.257 -24.972 -29.383 -32.921 -35.772 -38.149 -40.087 -41.747 -43.126 -44.459 -45.561 -46.521 -47.429 -48.265 -49.017 -49.689 -50.373 -50.977 -51.485 -51.999 -52.518 -52.941 -53.388 -53.845 -54.186 -54.529 -54.879 -55.243 -55.618 -55.87 -56.128 -56.523 -56.787 -57.065 -57.209 -57.493 -57.793 -58.113 -58.277 -58.636 -58.781 -58.959 -59.127 -59.466 -59.644 -59.844 -60.051 -60.274 -60.525 -60.777 -61.505 -5 ,4835 ,KEBNE ,17040705,Thu Dec 23 01:16:12 CET,Thu Dec 23 02:58:38 CET,0.0 0.619 0.838 1.009 1.152 1.254 1.329 1.407 1.555 1.619 1.68 1.687 1.885 1.943 2.056 2.139 2.214 2.24 2.273 2.3 2.329 2.344 2.342 2.322 2.302 2.281 2.255 2.224 2.166 2.098 2.043 1.964 1.859 1.743 1.586 1.389 1.172 0.925 0.642 0.293 -0.12 -0.609 -1.23 -1.934 -2.885 -4.086 -5.61 -7.559 -10.178 -13.857 -19.356 -25.186 -29.506 -32.903 -35.618 -37.911 -39.828 -41.489 -42.877 -44.194 -45.283 -46.242 -47.133 -47.945 -48.669 -49.319 -49.986 -50.571 -51.068 -51.568 -52.078 -52.502 -52.953 -53.416 -53.755 -54.089 -54.422 -54.761 -55.109 -55.349 -55.596 -55.974 -56.226 -56.489 -56.62 -56.881 -57.171 -57.466 -57.611 -57.968 -58.11 -58.282 -58.443 -58.764 -58.953 -59.161 -59.382 -59.613 -59.852 -60.163 -60.741 -6 ,17960 ,KEBNE ,17040706,Thu Dec 23 01:18:13 CET,Thu Dec 23 02:59:47 CET,0.0 0.682 0.997 1.183 1.336 1.468 1.566 1.674 1.853 1.9 1.936 1.886 2.056 2.09 2.162 2.22 2.259 2.278 2.324 2.358 2.382 2.395 2.401 2.409 2.419 2.409 2.388 2.367 2.321 2.277 2.228 2.137 2.043 1.939 1.786 1.591 1.392 1.142 0.835 0.486 0.103 -0.37 -0.989 -1.676 -2.551 -3.645 -5.077 -6.918 -9.509 -13.159 -18.576 -24.359 -28.73 -32.188 -34.936 -37.257 -39.209 -40.885 -42.264 -43.584 -44.679 -45.651 -46.564 -47.396 -48.144 -48.807 -49.475 -50.063 -50.56 -51.057 -51.566 -51.973 -52.399 -52.85 -53.187 -53.527 -53.88 -54.239 -54.597 -54.832 -55.073 -55.451 -55.713 -55.99 -56.132 -56.42 -56.701 -57.003 -57.165 -57.529 -57.68 -57.871 -58.057 -58.43 -58.644 -58.869 -59.099 -59.344 -59.606 -59.959 -60.87 -7 ,11847 ,KEBNE ,17040707,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:03:34 CET,0.0 1.005 1.332 1.509 1.633 1.724 1.803 1.871 1.989 2.037 2.082 2.025 2.203 2.236 2.287 2.331 2.378 2.4 2.432 2.449 2.455 2.462 2.476 2.473 2.448 2.421 2.386 2.339 2.277 2.216 2.141 2.034 1.918 1.796 1.652 1.476 1.271 1.024 0.737 0.389 -0.013 -0.497 -1.113 -1.8 -2.691 -3.847 -5.348 -7.208 -9.79 -13.507 -19.072 -24.948 -29.3 -32.752 -35.543 -37.913 -39.867 -41.544 -42.941 -44.267 -45.364 -46.341 -47.249 -48.047 -48.776 -49.425 -50.082 -50.679 -51.192 -51.705 -52.227 -52.653 -53.09 -53.531 -53.87 -54.216 -54.562 -54.943 -55.339 -55.59 -55.844 -56.247 -56.52 -56.797 -56.933 -57.2 -57.495 -57.806 -57.966 -58.318 -58.423 -58.589 -58.771 -59.151 -59.352 -59.576 -59.831 -60.119 -60.438 -60.828 -62.041 -8 ,7093 ,KEBNE ,17040708,Thu Dec 23 01:18:17 CET,Thu Dec 23 02:58:54 CET,0.0 1.005 1.245 1.425 1.55 1.65 1.71 1.75 1.822 1.862 1.898 1.815 1.974 2.011 2.07 2.086 2.103 2.116 2.144 2.16 2.149 2.138 2.132 2.113 2.1 2.089 2.062 2.019 1.959 1.895 1.817 1.704 1.588 1.469 1.327 1.162 0.985 0.772 0.491 0.148 -0.242 -0.725 -1.354 -2.064 -3.014 -4.158 -5.598 -7.494 -10.076 -13.694 -19.104 -24.889 -29.207 -32.601 -35.356 -37.687 -39.64 -41.332 -42.732 -44.055 -45.12 -46.054 -46.934 -47.749 -48.483 -49.139 -49.8 -50.375 -50.872 -51.361 -51.862 -52.297 -52.751 -53.191 -53.509 -53.839 -54.184 -54.522 -54.875 -55.123 -55.376 -55.749 -55.992 -56.255 -56.394 -56.659 -56.928 -57.198 -57.337 -57.68 -57.778 -57.93 -58.076 -58.425 -58.628 -58.851 -59.086 -59.32 -59.581 -59.903 -60.598 -9 ,17068 ,KEBNE ,17040709,Thu Dec 23 01:18:13 CET,Thu Dec 23 02:59:14 CET,0.0 0.858 1.176 1.345 1.465 1.544 1.616 1.661 1.769 1.821 1.862 1.822 2.011 2.052 2.113 2.175 2.237 2.255 2.281 2.308 2.335 2.342 2.348 2.345 2.329 2.304 2.278 2.25 2.194 2.12 2.04 1.948 1.856 1.759 1.638 1.478 1.288 1.049 0.774 0.454 0.068 -0.396 -1.002 -1.673 -2.527 -3.66 -5.165 -7.067 -9.619 -13.264 -18.74 -24.597 -28.993 -32.489 -35.309 -37.643 -39.568 -41.234 -42.618 -43.987 -45.125 -46.086 -46.981 -47.799 -48.531 -49.18 -49.831 -50.394 -50.87 -51.355 -51.85 -52.265 -52.705 -53.156 -53.494 -53.84 -54.19 -54.535 -54.891 -55.142 -55.398 -55.771 -56.026 -56.292 -56.42 -56.696 -56.992 -57.296 -57.455 -57.81 -57.965 -58.145 -58.328 -58.741 -58.953 -59.165 -59.388 -59.649 -59.968 -60.364 -61.339 -10 ,16898 ,KEBNE ,17040710,Thu Dec 23 01:18:13 CET,Thu Dec 23 02:59:37 CET,0.0 0.668 0.87 1.026 1.153 1.228 1.285 1.33 1.408 1.443 1.474 1.397 1.555 1.573 1.606 1.637 1.651 1.66 1.679 1.678 1.691 1.697 1.697 1.687 1.658 1.628 1.608 1.577 1.511 1.445 1.377 1.286 1.182 1.068 0.926 0.744 0.545 0.333 0.093 -0.197 -0.548 -0.984 -1.527 -2.183 -3.066 -4.175 -5.645 -7.513 -9.998 -13.512 -18.899 -24.722 -29.03 -32.408 -35.174 -37.514 -39.411 -41.024 -42.371 -43.682 -44.777 -45.721 -46.607 -47.431 -48.162 -48.807 -49.465 -50.029 -50.519 -51.017 -51.516 -51.923 -52.335 -52.75 -53.072 -53.41 -53.759 -54.11 -54.458 -54.685 -54.913 -55.281 -55.546 -55.823 -55.961 -56.225 -56.475 -56.746 -56.885 -57.217 -57.326 -57.482 -57.639 -57.999 -58.198 -58.399 -58.603 -58.83 -59.104 -59.435 -60.321 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index a5419fca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29969 ,KEBNE ,17040711,Thu Dec 23 01:18:13 CET,Thu Dec 23 03:02:31 CET,0.0 0.5 0.792 1.013 1.202 1.368 1.499 1.615 1.85 1.954 2.049 2.045 2.329 2.418 2.581 2.739 2.899 2.979 3.118 3.248 3.457 3.591 3.713 3.88 4.043 4.213 4.376 4.525 4.717 4.901 5.079 5.299 5.517 5.732 5.968 6.218 6.451 6.706 6.993 7.289 7.585 7.929 8.322 8.709 9.147 9.59 10.066 10.557 11.092 11.701 12.207 12.293 12.112 11.811 11.449 11.076 10.747 10.444 10.166 9.852 9.561 9.302 9.054 8.808 8.577 8.371 8.152 7.942 7.759 7.577 7.371 7.193 7.014 6.815 6.658 6.493 6.31 6.12 5.922 5.782 5.65 5.458 5.315 5.155 5.075 4.922 4.771 4.597 4.496 4.204 4.17 4.038 3.914 3.671 3.524 3.348 3.168 2.974 2.689 2.373 1.49 -2 ,30124 ,KEBNE ,17040712,Thu Dec 23 01:18:13 CET,Thu Dec 23 03:02:49 CET,0.0 0.676 0.944 1.171 1.374 1.532 1.682 1.827 2.051 2.144 2.228 2.197 2.479 2.57 2.73 2.886 3.045 3.121 3.261 3.395 3.597 3.735 3.866 4.054 4.228 4.394 4.556 4.722 4.926 5.106 5.29 5.504 5.71 5.908 6.147 6.421 6.678 6.946 7.225 7.53 7.84 8.189 8.6 8.996 9.44 9.918 10.436 10.968 11.518 12.096 12.569 12.656 12.46 12.153 11.818 11.44 11.065 10.701 10.372 10.012 9.696 9.442 9.191 8.926 8.67 8.441 8.195 7.984 7.808 7.609 7.394 7.224 7.041 6.833 6.679 6.526 6.346 6.148 5.953 5.826 5.688 5.458 5.297 5.135 5.056 4.888 4.704 4.5 4.398 4.109 4.078 3.94 3.791 3.505 3.355 3.188 2.997 2.781 2.559 2.271 1.535 -3 ,21162 ,KEBNE ,17040713,Thu Dec 23 01:18:14 CET,Thu Dec 23 03:01:51 CET,0.0 0.551 0.814 1.014 1.172 1.316 1.455 1.587 1.824 1.924 2.02 2.019 2.315 2.418 2.602 2.779 2.945 3.024 3.158 3.285 3.481 3.608 3.736 3.922 4.091 4.255 4.411 4.569 4.774 4.977 5.176 5.403 5.62 5.822 6.055 6.322 6.573 6.836 7.114 7.408 7.716 8.047 8.417 8.784 9.232 9.736 10.264 10.791 11.351 11.889 12.321 12.383 12.183 11.883 11.572 11.269 10.936 10.59 10.234 9.859 9.57 9.32 9.065 8.804 8.549 8.315 8.069 7.852 7.671 7.479 7.28 7.114 6.931 6.728 6.564 6.387 6.211 6.04 5.852 5.726 5.597 5.385 5.239 5.092 5.018 4.854 4.668 4.473 4.373 4.083 4.059 3.938 3.81 3.571 3.457 3.317 3.148 2.957 2.702 2.4 1.554 -4 ,29619 ,KEBNE ,17040714,Thu Dec 23 01:18:13 CET,Thu Dec 23 03:02:48 CET,0.0 0.662 0.927 1.12 1.295 1.468 1.618 1.738 1.925 2.02 2.121 2.129 2.407 2.485 2.656 2.822 2.966 3.039 3.178 3.296 3.482 3.613 3.741 3.919 4.103 4.29 4.469 4.633 4.831 5.022 5.21 5.435 5.64 5.833 6.044 6.293 6.532 6.777 7.052 7.339 7.631 7.978 8.384 8.759 9.177 9.629 10.111 10.626 11.167 11.686 12.115 12.117 11.782 11.395 11.04 10.642 10.259 9.902 9.571 9.254 8.968 8.672 8.396 8.136 7.881 7.645 7.39 7.152 6.949 6.735 6.51 6.325 6.133 5.928 5.765 5.589 5.4 5.206 4.998 4.849 4.707 4.508 4.36 4.195 4.103 3.899 3.686 3.477 3.375 3.072 3.01 2.877 2.737 2.425 2.259 2.088 1.889 1.663 1.419 1.146 0.554 -5 ,21592 ,KEBNE ,17040715,Thu Dec 23 01:18:13 CET,Thu Dec 23 03:02:50 CET,0.0 0.5 0.759 0.956 1.153 1.316 1.471 1.625 1.878 1.989 2.094 2.111 2.392 2.474 2.652 2.828 2.989 3.073 3.236 3.371 3.56 3.68 3.798 3.977 4.151 4.328 4.492 4.646 4.857 5.06 5.241 5.457 5.665 5.861 6.079 6.312 6.535 6.78 7.066 7.369 7.668 8.011 8.393 8.754 9.151 9.578 10.03 10.458 10.923 11.445 11.905 11.961 11.715 11.393 11.071 10.739 10.399 10.057 9.741 9.445 9.179 8.896 8.621 8.369 8.13 7.904 7.679 7.492 7.311 7.11 6.916 6.751 6.578 6.401 6.249 6.09 5.927 5.765 5.594 5.459 5.328 5.136 4.988 4.829 4.75 4.594 4.438 4.263 4.159 3.864 3.836 3.7 3.549 3.231 3.076 2.923 2.748 2.536 2.308 1.989 1.267 -6 ,20519 ,KEBNE ,17040716,Thu Dec 23 01:18:14 CET,Thu Dec 23 03:01:18 CET,0.0 0.505 0.732 0.914 1.08 1.23 1.37 1.497 1.729 1.853 1.964 1.955 2.239 2.336 2.533 2.691 2.845 2.925 3.08 3.224 3.432 3.566 3.697 3.887 4.07 4.252 4.413 4.547 4.718 4.893 5.071 5.296 5.511 5.722 5.962 6.216 6.455 6.705 6.963 7.246 7.546 7.874 8.249 8.619 9.048 9.499 9.976 10.489 11.027 11.596 12.106 12.197 11.943 11.585 11.225 10.843 10.479 10.159 9.847 9.511 9.237 8.978 8.712 8.453 8.222 8.011 7.779 7.574 7.384 7.183 6.968 6.793 6.612 6.411 6.256 6.106 5.956 5.788 5.605 5.479 5.358 5.18 5.043 4.889 4.811 4.646 4.471 4.277 4.175 3.882 3.863 3.741 3.62 3.351 3.188 3.025 2.846 2.616 2.389 2.058 1.014 -7 ,13708 ,KEBNE ,17040717,Thu Dec 23 01:18:18 CET,Thu Dec 23 02:58:45 CET,0.0 0.461 0.708 0.953 1.16 1.324 1.483 1.62 1.843 1.953 2.06 2.078 2.367 2.467 2.639 2.81 2.989 3.069 3.218 3.372 3.592 3.728 3.867 4.065 4.238 4.421 4.596 4.754 4.963 5.163 5.353 5.575 5.784 5.995 6.234 6.519 6.797 7.06 7.344 7.66 7.984 8.329 8.684 9.077 9.561 10.066 10.627 11.201 11.802 12.363 12.787 12.857 12.669 12.379 12.056 11.706 11.354 11.049 10.756 10.413 10.101 9.815 9.537 9.268 9.012 8.764 8.502 8.269 8.071 7.871 7.647 7.454 7.268 7.08 6.923 6.753 6.579 6.4 6.221 6.106 5.985 5.781 5.646 5.508 5.436 5.283 5.107 4.92 4.821 4.535 4.528 4.399 4.274 4.015 3.859 3.699 3.51 3.293 3.047 2.716 1.902 -8 ,11969 ,KEBNE ,17040718,Thu Dec 23 01:18:18 CET,Thu Dec 23 02:59:15 CET,0.0 0.352 0.581 0.767 0.943 1.096 1.227 1.355 1.589 1.69 1.796 1.812 2.095 2.189 2.385 2.56 2.721 2.797 2.942 3.074 3.259 3.385 3.513 3.691 3.85 4.007 4.162 4.316 4.515 4.7 4.877 5.096 5.308 5.501 5.726 5.984 6.238 6.512 6.783 7.065 7.382 7.739 8.124 8.494 8.906 9.352 9.857 10.385 10.898 11.384 11.765 11.808 11.618 11.353 11.058 10.715 10.367 10.02 9.703 9.355 9.052 8.792 8.519 8.255 8.019 7.82 7.62 7.426 7.252 7.059 6.849 6.674 6.482 6.28 6.114 5.947 5.788 5.613 5.418 5.293 5.167 4.973 4.838 4.682 4.604 4.462 4.3 4.104 3.998 3.704 3.681 3.577 3.469 3.236 3.087 2.932 2.79 2.613 2.4 2.153 1.57 -9 ,19474 ,KEBNE ,17040719,Thu Dec 23 01:18:18 CET,Thu Dec 23 02:55:52 CET,0.0 0.415 0.619 0.774 0.927 1.083 1.249 1.393 1.613 1.707 1.81 1.836 2.131 2.226 2.406 2.569 2.713 2.785 2.926 3.056 3.25 3.38 3.496 3.667 3.844 4.029 4.198 4.35 4.552 4.746 4.933 5.142 5.342 5.544 5.753 5.984 6.233 6.497 6.763 7.068 7.378 7.692 8.052 8.406 8.837 9.308 9.819 10.308 10.793 11.316 11.757 11.844 11.65 11.359 11.024 10.665 10.326 10.015 9.739 9.454 9.199 8.957 8.733 8.512 8.283 8.078 7.847 7.619 7.434 7.241 7.04 6.876 6.686 6.474 6.312 6.147 5.981 5.817 5.649 5.526 5.402 5.208 5.07 4.927 4.847 4.664 4.477 4.294 4.196 3.911 3.917 3.812 3.692 3.404 3.241 3.074 2.898 2.705 2.496 2.239 1.549 -10 ,12530 ,KEBNE ,17040720,Thu Dec 23 01:18:18 CET,Thu Dec 23 02:59:32 CET,0.0 0.627 0.849 1.037 1.217 1.36 1.487 1.612 1.848 1.964 2.075 2.084 2.385 2.475 2.644 2.823 2.995 3.075 3.218 3.357 3.557 3.685 3.816 4.008 4.185 4.351 4.516 4.67 4.875 5.081 5.262 5.474 5.681 5.889 6.121 6.361 6.605 6.88 7.148 7.423 7.714 8.054 8.433 8.79 9.21 9.672 10.16 10.66 11.208 11.696 12.091 12.192 11.965 11.646 11.296 10.942 10.601 10.256 9.944 9.608 9.3 9.023 8.777 8.538 8.287 8.039 7.768 7.549 7.354 7.141 6.935 6.762 6.576 6.389 6.237 6.075 5.901 5.712 5.518 5.387 5.253 5.038 4.875 4.694 4.608 4.433 4.242 4.055 3.959 3.659 3.615 3.487 3.367 3.122 2.951 2.746 2.542 2.334 2.119 1.842 1.279 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt deleted file mode 100644 index 308e3ffa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11689 ,KEBNE ,17040721,Thu Dec 23 01:18:22 CET,Thu Dec 23 02:59:04 CET,0.0 0.756 1.008 1.188 1.34 1.515 1.676 1.82 2.107 2.236 2.351 2.382 2.69 2.795 3.004 3.22 3.415 3.512 3.704 3.88 4.117 4.27 4.427 4.656 4.88 5.088 5.287 5.488 5.738 5.976 6.189 6.445 6.707 6.975 7.279 7.607 7.924 8.269 8.638 9.041 9.487 9.985 10.581 11.203 11.907 12.635 13.47 14.431 15.53 16.801 18.272 19.287 19.741 19.991 20.054 20.002 19.912 19.778 19.646 19.511 19.366 19.211 19.057 18.904 18.753 18.605 18.435 18.285 18.147 17.993 17.837 17.709 17.585 17.435 17.305 17.17 17.028 16.889 16.73 16.619 16.506 16.321 16.193 16.051 15.974 15.805 15.622 15.426 15.331 15.061 15.026 14.911 14.804 14.585 14.449 14.301 14.15 14.003 13.806 13.481 12.913 -2 ,1030 ,KEBNE ,17040722,Thu Dec 23 01:18:22 CET,Thu Dec 23 02:55:55 CET,0.0 0.699 1.0 1.209 1.389 1.542 1.701 1.849 2.101 2.224 2.342 2.377 2.685 2.788 2.999 3.216 3.421 3.513 3.687 3.867 4.115 4.262 4.405 4.623 4.837 5.047 5.253 5.448 5.698 5.939 6.167 6.435 6.706 6.971 7.27 7.605 7.918 8.256 8.624 9.036 9.484 9.992 10.589 11.186 11.869 12.623 13.498 14.457 15.538 16.738 18.075 18.999 19.326 19.448 19.464 19.377 19.255 19.119 18.971 18.811 18.661 18.492 18.333 18.159 17.984 17.818 17.626 17.468 17.311 17.134 16.974 16.852 16.699 16.509 16.372 16.234 16.094 15.96 15.817 15.711 15.59 15.391 15.247 15.089 15.014 14.872 14.72 14.539 14.436 14.157 14.144 14.046 13.935 13.695 13.562 13.415 13.255 13.068 12.832 12.554 11.875 -3 ,7230 ,KEBNE ,17040723,Thu Dec 23 01:21:20 CET,Thu Dec 23 03:05:46 CET,0.0 0.405 0.647 0.854 1.039 1.197 1.342 1.486 1.75 1.867 1.982 2.041 2.347 2.461 2.649 2.821 2.988 3.072 3.253 3.432 3.692 3.857 4.009 4.23 4.441 4.636 4.827 5.008 5.245 5.475 5.695 5.954 6.201 6.456 6.754 7.096 7.434 7.81 8.195 8.59 9.024 9.501 10.041 10.594 11.26 12.016 12.898 13.857 14.956 16.229 17.595 18.606 19.16 19.446 19.532 19.508 19.447 19.338 19.19 19.008 18.837 18.669 18.503 18.368 18.241 18.097 17.935 17.788 17.647 17.497 17.343 17.211 17.068 16.912 16.788 16.659 16.51 16.352 16.196 16.082 15.97 15.798 15.662 15.523 15.449 15.284 15.128 14.981 14.905 14.643 14.621 14.504 14.385 14.15 14.023 13.885 13.736 13.541 13.321 13.069 12.465 -4 ,20444 ,KEBNE ,17040724,Thu Dec 23 01:21:20 CET,Thu Dec 23 03:06:08 CET,0.0 0.506 0.77 0.972 1.122 1.276 1.425 1.562 1.824 1.938 2.049 2.086 2.38 2.48 2.682 2.868 3.054 3.139 3.293 3.451 3.675 3.823 3.97 4.181 4.387 4.586 4.781 4.968 5.2 5.42 5.636 5.903 6.173 6.437 6.737 7.074 7.383 7.718 8.072 8.456 8.89 9.371 9.904 10.457 11.119 11.851 12.665 13.548 14.573 15.764 17.131 18.103 18.588 18.806 18.828 18.787 18.674 18.538 18.41 18.265 18.119 17.965 17.813 17.655 17.501 17.362 17.208 17.049 16.903 16.755 16.597 16.456 16.306 16.152 16.039 15.925 15.805 15.667 15.518 15.402 15.278 15.108 14.985 14.855 14.786 14.647 14.504 14.341 14.249 13.976 13.95 13.847 13.731 13.46 13.325 13.174 13.012 12.84 12.603 12.324 11.72 -5 ,4695 ,KEBNE ,17040725,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:05:08 CET,0.0 0.535 0.783 1.003 1.193 1.365 1.535 1.702 2.008 2.144 2.271 2.302 2.605 2.715 2.945 3.16 3.338 3.424 3.604 3.777 4.013 4.163 4.307 4.514 4.712 4.913 5.11 5.3 5.553 5.798 6.033 6.325 6.607 6.865 7.157 7.496 7.833 8.202 8.577 8.971 9.389 9.846 10.396 10.965 11.641 12.394 13.218 14.136 15.225 16.452 17.788 18.723 19.076 19.194 19.216 19.175 19.07 18.923 18.75 18.534 18.343 18.179 18.016 17.849 17.677 17.507 17.314 17.13 16.967 16.806 16.634 16.478 16.325 16.16 16.014 15.865 15.722 15.564 15.383 15.26 15.134 14.94 14.807 14.662 14.583 14.417 14.254 14.084 13.987 13.701 13.671 13.571 13.462 13.223 13.092 12.941 12.785 12.6 12.362 12.037 11.037 -6 ,9613 ,KEBNE ,17040726,Thu Dec 23 01:21:20 CET,Thu Dec 23 03:04:57 CET,0.0 0.312 0.496 0.669 0.825 0.971 1.117 1.241 1.462 1.572 1.674 1.68 1.969 2.072 2.269 2.456 2.641 2.728 2.893 3.046 3.257 3.402 3.549 3.752 3.941 4.126 4.319 4.512 4.764 5.004 5.22 5.469 5.713 5.968 6.27 6.598 6.923 7.274 7.645 8.057 8.487 8.974 9.535 10.073 10.706 11.41 12.213 13.096 14.127 15.354 16.685 17.593 18.008 18.177 18.189 18.109 18.003 17.877 17.723 17.54 17.362 17.19 16.987 16.778 16.595 16.409 16.218 16.054 15.914 15.771 15.606 15.452 15.283 15.113 14.984 14.835 14.672 14.51 14.351 14.246 14.136 13.949 13.816 13.682 13.614 13.476 13.321 13.153 13.069 12.799 12.795 12.698 12.59 12.344 12.202 12.046 11.888 11.717 11.5 11.248 10.566 -7 ,21080 ,KEBNE ,17040727,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:06:13 CET,0.0 0.609 0.893 1.12 1.308 1.467 1.612 1.741 1.986 2.101 2.224 2.282 2.572 2.666 2.863 3.059 3.239 3.325 3.489 3.648 3.891 4.047 4.194 4.406 4.61 4.812 5.01 5.19 5.425 5.662 5.886 6.151 6.42 6.692 6.997 7.318 7.605 7.933 8.304 8.715 9.149 9.631 10.199 10.76 11.429 12.167 13.034 14.009 15.093 16.349 17.812 18.922 19.41 19.632 19.705 19.702 19.674 19.581 19.473 19.35 19.208 19.055 18.878 18.7 18.524 18.353 18.186 18.041 17.903 17.742 17.575 17.436 17.283 17.131 17.008 16.879 16.744 16.598 16.45 16.354 16.253 16.085 15.966 15.831 15.757 15.608 15.457 15.276 15.17 14.887 14.86 14.749 14.629 14.401 14.262 14.085 13.896 13.696 13.476 13.205 12.536 -8 ,25635 ,KEBNE ,17040728,Thu Dec 23 01:21:20 CET,Thu Dec 23 03:06:42 CET,0.0 0.424 0.664 0.871 1.053 1.236 1.405 1.555 1.816 1.932 2.032 2.041 2.334 2.427 2.599 2.773 2.954 3.043 3.212 3.372 3.597 3.748 3.899 4.111 4.315 4.506 4.684 4.874 5.118 5.342 5.563 5.828 6.092 6.35 6.642 6.962 7.272 7.634 8.022 8.401 8.802 9.264 9.807 10.376 11.034 11.714 12.476 13.371 14.447 15.64 16.891 17.837 18.363 18.597 18.638 18.58 18.49 18.365 18.225 18.063 17.909 17.772 17.622 17.456 17.305 17.164 16.999 16.848 16.718 16.577 16.426 16.299 16.157 15.999 15.88 15.755 15.617 15.473 15.317 15.202 15.088 14.916 14.778 14.635 14.564 14.409 14.245 14.087 14.005 13.74 13.72 13.613 13.498 13.234 13.082 12.917 12.716 12.491 12.226 11.964 11.146 -9 ,14988 ,KEBNE ,17040729,Thu Dec 23 01:21:19 CET,Thu Dec 23 03:06:17 CET,0.0 0.459 0.721 0.941 1.144 1.325 1.462 1.595 1.84 1.938 2.037 2.062 2.362 2.467 2.66 2.836 3.005 3.094 3.28 3.452 3.679 3.828 3.974 4.186 4.398 4.602 4.794 4.976 5.209 5.445 5.679 5.947 6.207 6.469 6.763 7.081 7.402 7.762 8.149 8.569 9.029 9.556 10.135 10.684 11.32 12.028 12.883 13.873 15.016 16.286 17.749 18.835 19.345 19.56 19.605 19.549 19.47 19.371 19.215 19.011 18.818 18.668 18.53 18.371 18.207 18.043 17.873 17.728 17.59 17.443 17.292 17.173 17.051 16.906 16.787 16.66 16.529 16.386 16.235 16.13 16.008 15.82 15.7 15.579 15.518 15.381 15.233 15.083 15.011 14.761 14.751 14.639 14.531 14.304 14.177 14.043 13.898 13.754 13.554 13.301 12.701 -10 ,1427 ,KEBNE ,17040730,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:06:46 CET,0.0 0.475 0.795 1.081 1.299 1.487 1.671 1.829 2.106 2.233 2.355 2.4 2.71 2.825 3.032 3.229 3.422 3.514 3.691 3.86 4.1 4.252 4.403 4.619 4.834 5.047 5.257 5.46 5.714 5.966 6.21 6.503 6.791 7.064 7.38 7.725 8.057 8.428 8.829 9.26 9.714 10.234 10.833 11.417 12.09 12.838 13.706 14.664 15.754 16.996 18.457 19.519 19.981 20.178 20.226 20.186 20.08 19.959 19.805 19.608 19.433 19.284 19.14 18.981 18.826 18.681 18.512 18.348 18.208 18.061 17.895 17.743 17.584 17.436 17.326 17.215 17.1 16.965 16.812 16.701 16.581 16.397 16.273 16.139 16.068 15.926 15.785 15.633 15.556 15.298 15.31 15.228 15.137 14.928 14.793 14.631 14.484 14.283 14.023 13.713 12.59 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt deleted file mode 100644 index 44908017..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17835 ,KEBNE ,17040732,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:05:35 CET,0.0 0.807 1.065 1.312 1.58 1.794 1.975 2.15 2.474 2.621 2.754 2.797 3.106 3.224 3.439 3.639 3.817 3.901 4.071 4.247 4.491 4.651 4.807 5.011 5.215 5.422 5.621 5.807 6.03 6.254 6.465 6.716 6.953 7.169 7.426 7.71 7.986 8.295 8.63 8.999 9.389 9.826 10.362 10.869 11.41 12.019 12.714 13.471 14.325 15.261 16.263 16.839 16.985 16.961 16.87 16.736 16.575 16.414 16.248 16.037 15.833 15.642 15.466 15.287 15.109 14.935 14.738 14.562 14.407 14.261 14.112 13.981 13.826 13.648 13.518 13.384 13.243 13.093 12.933 12.825 12.714 12.541 12.417 12.279 12.206 12.046 11.883 11.708 11.608 11.335 11.334 11.224 11.096 10.817 10.668 10.513 10.355 10.189 10.0 9.698 9.017 -2 ,22612 ,KEBNE ,17040733,Thu Dec 23 01:21:20 CET,Thu Dec 23 03:06:01 CET,0.0 0.805 1.087 1.308 1.488 1.637 1.768 1.889 2.134 2.253 2.378 2.46 2.764 2.861 3.073 3.299 3.512 3.61 3.783 3.945 4.184 4.333 4.478 4.7 4.922 5.144 5.362 5.568 5.81 6.04 6.263 6.517 6.757 6.989 7.264 7.571 7.876 8.207 8.557 8.954 9.374 9.834 10.371 10.889 11.463 12.087 12.797 13.578 14.463 15.412 16.374 16.994 17.165 17.121 16.963 16.795 16.621 16.411 16.208 15.961 15.726 15.503 15.279 15.083 14.892 14.688 14.467 14.283 14.114 13.923 13.734 13.572 13.387 13.195 13.046 12.885 12.72 12.54 12.362 12.256 12.135 11.921 11.776 11.615 11.527 11.361 11.189 10.985 10.883 10.594 10.547 10.432 10.319 10.051 9.91 9.748 9.555 9.339 9.091 8.775 8.067 -3 ,18791 ,KEBNE ,17040735,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:06:49 CET,0.0 0.683 1.014 1.269 1.474 1.668 1.843 2.009 2.319 2.458 2.591 2.682 3.0 3.105 3.306 3.511 3.698 3.789 3.963 4.129 4.382 4.537 4.696 4.917 5.107 5.313 5.51 5.704 5.951 6.165 6.393 6.682 6.945 7.186 7.451 7.755 8.065 8.39 8.734 9.099 9.488 9.939 10.482 11.018 11.625 12.285 13.001 13.78 14.646 15.617 16.602 17.192 17.316 17.236 17.126 16.979 16.813 16.64 16.466 16.264 16.065 15.882 15.694 15.501 15.318 15.138 14.939 14.758 14.586 14.405 14.235 14.11 13.975 13.812 13.673 13.524 13.378 13.229 13.075 12.971 12.856 12.663 12.527 12.393 12.312 12.149 12.009 11.87 11.792 11.513 11.486 11.391 11.28 11.01 10.859 10.702 10.554 10.406 10.212 9.921 9.02 -4 ,31346 ,KEBNE ,17040736,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:04:36 CET,0.0 0.637 0.91 1.114 1.292 1.47 1.623 1.756 1.995 2.125 2.255 2.282 2.576 2.67 2.868 3.057 3.228 3.307 3.464 3.628 3.844 3.99 4.142 4.365 4.573 4.766 4.95 5.131 5.361 5.579 5.803 6.055 6.302 6.558 6.846 7.149 7.432 7.746 8.09 8.465 8.839 9.261 9.78 10.291 10.872 11.494 12.225 13.042 13.93 14.896 15.847 16.355 16.483 16.404 16.207 16.002 15.81 15.604 15.426 15.226 15.017 14.819 14.64 14.44 14.238 14.067 13.892 13.713 13.539 13.364 13.176 13.024 12.866 12.69 12.544 12.394 12.251 12.106 11.96 11.847 11.719 11.532 11.404 11.276 11.211 11.069 10.921 10.756 10.668 10.391 10.359 10.246 10.147 9.88 9.728 9.603 9.466 9.296 9.088 8.814 7.929 -5 ,32493 ,KEBNE ,17040737,Thu Dec 23 01:21:19 CET,Thu Dec 23 03:06:02 CET,0.0 1.119 1.44 1.672 1.839 1.999 2.162 2.321 2.624 2.761 2.902 2.966 3.266 3.366 3.57 3.76 3.928 4.014 4.192 4.362 4.595 4.749 4.904 5.106 5.31 5.514 5.699 5.879 6.1 6.315 6.533 6.791 7.029 7.26 7.523 7.814 8.108 8.433 8.789 9.168 9.544 9.973 10.485 11.001 11.595 12.227 12.93 13.72 14.62 15.588 16.586 17.19 17.333 17.264 17.158 17.02 16.834 16.641 16.457 16.245 16.063 15.891 15.698 15.516 15.354 15.201 15.014 14.835 14.689 14.544 14.372 14.218 14.069 13.898 13.757 13.625 13.489 13.322 13.136 13.009 12.869 12.64 12.491 12.343 12.263 12.104 11.929 11.736 11.636 11.347 11.284 11.155 11.029 10.773 10.635 10.479 10.321 10.142 9.909 9.611 8.718 -6 ,5180 ,KEBNE ,17040739,Thu Dec 23 01:21:19 CET,Thu Dec 23 03:06:55 CET,0.0 0.88 1.184 1.446 1.651 1.83 1.988 2.133 2.4 2.533 2.668 2.711 3.023 3.132 3.331 3.529 3.706 3.795 3.968 4.129 4.367 4.519 4.665 4.875 5.081 5.279 5.465 5.65 5.886 6.12 6.344 6.6 6.843 7.08 7.371 7.709 8.017 8.348 8.722 9.123 9.52 9.941 10.437 10.94 11.5 12.096 12.805 13.607 14.527 15.561 16.624 17.255 17.455 17.437 17.32 17.189 16.993 16.744 16.526 16.298 16.107 15.914 15.714 15.54 15.35 15.151 14.948 14.775 14.626 14.461 14.275 14.121 13.958 13.791 13.657 13.509 13.36 13.2 13.024 12.901 12.773 12.566 12.414 12.262 12.189 12.023 11.834 11.644 11.542 11.263 11.259 11.153 11.034 10.771 10.623 10.462 10.275 10.09 9.908 9.627 8.27 -7 ,15102 ,KEBNE ,17040740,Thu Dec 23 01:21:20 CET,Thu Dec 23 03:04:42 CET,0.0 1.246 1.569 1.799 2.006 2.189 2.352 2.486 2.719 2.841 2.978 3.038 3.334 3.44 3.661 3.872 4.075 4.167 4.339 4.512 4.757 4.928 5.096 5.314 5.516 5.708 5.887 6.06 6.296 6.521 6.734 7.003 7.285 7.56 7.867 8.214 8.541 8.886 9.249 9.64 10.057 10.523 11.047 11.576 12.182 12.838 13.565 14.374 15.295 16.308 17.329 17.919 18.114 18.1 17.955 17.774 17.603 17.41 17.233 17.022 16.821 16.624 16.412 16.222 16.057 15.901 15.723 15.556 15.412 15.251 15.062 14.913 14.761 14.591 14.46 14.326 14.18 14.039 13.897 13.792 13.675 13.491 13.366 13.234 13.169 13.031 12.877 12.706 12.614 12.341 12.327 12.211 12.101 11.883 11.759 11.613 11.436 11.222 10.983 10.715 9.746 -8 ,25967 ,KEBNE ,17040742,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:06:07 CET,0.0 0.798 1.098 1.335 1.544 1.749 1.936 2.101 2.382 2.509 2.63 2.663 2.96 3.057 3.247 3.455 3.656 3.751 3.933 4.095 4.323 4.466 4.611 4.824 5.017 5.196 5.379 5.553 5.766 5.987 6.198 6.441 6.681 6.909 7.18 7.485 7.779 8.105 8.456 8.845 9.22 9.627 10.138 10.618 11.139 11.737 12.429 13.162 13.996 14.984 16.053 16.69 16.929 16.996 16.928 16.785 16.584 16.374 16.2 16.049 15.879 15.696 15.521 15.35 15.201 15.049 14.874 14.721 14.579 14.433 14.278 14.146 14.011 13.862 13.741 13.601 13.446 13.295 13.144 13.03 12.915 12.742 12.621 12.495 12.429 12.284 12.135 11.973 11.876 11.588 11.566 11.458 11.345 11.11 10.978 10.826 10.664 10.491 10.282 9.991 9.339 -9 ,3956 ,KEBNE ,17040743,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:06:55 CET,0.0 0.762 1.054 1.299 1.517 1.695 1.833 1.974 2.238 2.351 2.469 2.529 2.836 2.947 3.165 3.357 3.533 3.612 3.76 3.91 4.135 4.284 4.427 4.631 4.834 5.022 5.209 5.387 5.618 5.85 6.058 6.3 6.548 6.789 7.069 7.39 7.696 8.031 8.386 8.771 9.199 9.655 10.176 10.682 11.232 11.879 12.607 13.368 14.211 15.085 16.073 16.772 17.031 17.063 16.963 16.765 16.57 16.377 16.177 15.959 15.76 15.566 15.365 15.173 14.981 14.806 14.63 14.45 14.283 14.113 13.944 13.807 13.659 13.493 13.363 13.218 13.062 12.915 12.763 12.647 12.537 12.373 12.251 12.122 12.054 11.905 11.745 11.566 11.473 11.195 11.165 11.064 10.96 10.704 10.575 10.442 10.27 10.056 9.836 9.572 8.905 -10 ,24644 ,KEBNE ,17040744,Thu Dec 23 01:21:19 CET,Thu Dec 23 03:05:59 CET,0.0 0.773 1.089 1.326 1.511 1.693 1.869 2.023 2.319 2.46 2.592 2.652 2.954 3.063 3.282 3.495 3.705 3.802 3.975 4.135 4.377 4.529 4.664 4.865 5.071 5.266 5.454 5.637 5.865 6.086 6.289 6.533 6.765 6.991 7.276 7.598 7.896 8.228 8.592 8.958 9.333 9.765 10.267 10.766 11.354 11.994 12.71 13.493 14.356 15.304 16.296 16.854 17.03 17.05 16.945 16.784 16.602 16.396 16.185 15.958 15.743 15.533 15.342 15.139 14.926 14.728 14.521 14.331 14.15 13.964 13.791 13.632 13.455 13.283 13.152 13.005 12.845 12.676 12.506 12.403 12.286 12.09 11.953 11.808 11.737 11.578 11.403 11.218 11.114 10.829 10.801 10.695 10.581 10.319 10.163 9.996 9.833 9.65 9.424 9.102 8.382 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt deleted file mode 100644 index 8bce4513..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10613 ,KEBNE ,17040747,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:04:33 CET,0.0 0.652 0.874 1.098 1.311 1.511 1.671 1.789 2.045 2.163 2.264 2.275 2.573 2.68 2.893 3.096 3.257 3.327 3.466 3.598 3.788 3.913 4.027 4.189 4.347 4.504 4.669 4.842 5.05 5.234 5.417 5.618 5.816 6.009 6.217 6.451 6.672 6.917 7.158 7.38 7.601 7.853 8.151 8.468 8.818 9.142 9.492 9.804 10.066 10.265 10.134 9.528 8.848 8.19 7.542 6.958 6.444 5.944 5.502 5.056 4.686 4.352 4.035 3.741 3.447 3.169 2.888 2.615 2.367 2.117 1.843 1.609 1.348 1.068 0.873 0.686 0.489 0.284 0.041 -0.153 -0.347 -0.62 -0.806 -0.992 -1.082 -1.297 -1.547 -1.814 -1.951 -2.286 -2.389 -2.558 -2.755 -3.152 -3.362 -3.596 -3.838 -4.163 -4.589 -5.081 -7.217 -2 ,21272 ,KEBNE ,17040749,Thu Dec 23 01:21:20 CET,Thu Dec 23 03:05:20 CET,0.0 1.01 1.354 1.597 1.816 2.008 2.166 2.319 2.6 2.729 2.847 2.89 3.201 3.312 3.512 3.712 3.908 4.0 4.177 4.349 4.592 4.731 4.854 5.048 5.247 5.43 5.602 5.778 5.995 6.19 6.369 6.588 6.798 6.993 7.217 7.463 7.688 7.93 8.194 8.464 8.73 9.032 9.34 9.628 9.97 10.307 10.669 11.025 11.338 11.546 11.416 10.831 10.178 9.465 8.803 8.168 7.561 7.041 6.588 6.099 5.652 5.277 4.939 4.602 4.274 3.982 3.673 3.402 3.183 2.929 2.627 2.36 2.098 1.816 1.58 1.333 1.056 0.757 0.444 0.224 -0.003 -0.338 -0.538 -0.746 -0.865 -1.112 -1.374 -1.645 -1.785 -2.121 -2.253 -2.434 -2.618 -3.004 -3.236 -3.499 -3.777 -4.119 -4.515 -5.017 -6.36 -3 ,31123 ,KEBNE ,17040750,Thu Dec 23 01:21:19 CET,Thu Dec 23 03:05:57 CET,0.0 0.518 0.745 0.945 1.127 1.311 1.519 1.743 2.15 2.311 2.453 2.521 2.815 2.92 3.114 3.303 3.501 3.592 3.761 3.921 4.149 4.293 4.422 4.6 4.773 4.945 5.107 5.259 5.447 5.625 5.807 6.019 6.218 6.413 6.627 6.876 7.119 7.386 7.677 7.952 8.219 8.509 8.835 9.169 9.511 9.826 10.147 10.457 10.696 10.751 10.499 9.767 8.951 8.222 7.569 6.917 6.324 5.774 5.242 4.693 4.249 3.8 3.319 2.894 2.511 2.149 1.752 1.409 1.144 0.893 0.653 0.442 0.19 -0.112 -0.364 -0.617 -0.873 -1.124 -1.362 -1.529 -1.728 -2.065 -2.316 -2.579 -2.703 -2.975 -3.272 -3.552 -3.696 -4.054 -4.197 -4.389 -4.593 -4.995 -5.22 -5.494 -5.807 -6.128 -6.493 -6.987 -8.225 -4 ,29734 ,KEBNE ,17040751,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:05:24 CET,0.0 0.405 0.657 0.879 1.082 1.267 1.417 1.545 1.77 1.88 1.997 2.017 2.307 2.403 2.583 2.756 2.925 3.006 3.166 3.332 3.563 3.694 3.806 3.975 4.169 4.348 4.491 4.627 4.81 4.976 5.136 5.343 5.541 5.734 5.961 6.202 6.41 6.639 6.887 7.131 7.386 7.704 8.074 8.396 8.722 9.044 9.386 9.692 9.963 10.106 9.923 9.364 8.629 7.928 7.295 6.619 5.988 5.43 4.938 4.421 3.961 3.536 3.127 2.764 2.418 2.042 1.656 1.346 1.085 0.832 0.557 0.318 0.077 -0.175 -0.383 -0.593 -0.788 -1.005 -1.257 -1.429 -1.603 -1.877 -2.071 -2.308 -2.439 -2.689 -2.955 -3.236 -3.385 -3.737 -3.905 -4.109 -4.324 -4.794 -5.04 -5.296 -5.573 -5.904 -6.255 -6.718 -8.668 -5 ,4016 ,KEBNE ,17040752,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:05:20 CET,0.0 0.767 1.025 1.222 1.403 1.572 1.743 1.895 2.165 2.287 2.395 2.421 2.703 2.796 2.986 3.159 3.317 3.39 3.536 3.695 3.904 4.035 4.153 4.299 4.457 4.631 4.794 4.934 5.119 5.301 5.475 5.703 5.92 6.128 6.343 6.554 6.785 7.047 7.324 7.602 7.849 8.108 8.418 8.706 9.028 9.357 9.68 9.968 10.162 10.2 9.942 9.243 8.439 7.669 6.925 6.201 5.547 4.957 4.468 3.968 3.508 3.076 2.657 2.276 1.958 1.676 1.376 1.11 0.872 0.608 0.314 0.073 -0.162 -0.414 -0.612 -0.806 -0.999 -1.195 -1.416 -1.576 -1.738 -1.993 -2.183 -2.413 -2.542 -2.792 -3.012 -3.22 -3.343 -3.658 -3.722 -3.864 -4.002 -4.322 -4.498 -4.665 -4.857 -5.112 -5.439 -5.873 -7.672 -6 ,23905 ,KEBNE ,17040753,Thu Dec 23 01:21:20 CET,Thu Dec 23 03:05:00 CET,0.0 0.536 0.802 1.028 1.257 1.438 1.577 1.72 1.986 2.117 2.254 2.31 2.612 2.714 2.902 3.074 3.227 3.304 3.457 3.6 3.8 3.934 4.066 4.262 4.454 4.638 4.808 4.969 5.187 5.393 5.587 5.819 6.023 6.216 6.462 6.738 6.972 7.22 7.505 7.81 8.116 8.432 8.756 9.041 9.396 9.774 10.108 10.41 10.715 10.887 10.733 10.23 9.66 9.059 8.445 7.884 7.377 6.897 6.475 6.062 5.696 5.367 5.035 4.686 4.386 4.13 3.846 3.588 3.378 3.16 2.933 2.748 2.547 2.337 2.172 1.988 1.794 1.585 1.362 1.205 1.041 0.745 0.499 0.242 0.119 -0.119 -0.352 -0.619 -0.783 -1.132 -1.21 -1.364 -1.548 -1.948 -2.182 -2.446 -2.729 -3.073 -3.485 -4.037 -5.778 -7 ,24977 ,KEBNE ,17040754,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:06:07 CET,0.0 0.411 0.701 0.933 1.122 1.294 1.448 1.59 1.835 1.954 2.069 2.074 2.353 2.44 2.628 2.817 2.994 3.074 3.232 3.376 3.563 3.694 3.826 4.014 4.19 4.363 4.528 4.681 4.877 5.076 5.27 5.48 5.689 5.88 6.074 6.295 6.519 6.778 7.043 7.328 7.623 7.922 8.247 8.555 8.884 9.213 9.54 9.855 10.113 10.192 9.912 9.289 8.629 8.005 7.398 6.831 6.311 5.767 5.271 4.749 4.291 3.883 3.479 3.107 2.767 2.452 2.086 1.737 1.466 1.196 0.92 0.697 0.469 0.23 0.033 -0.18 -0.402 -0.636 -0.882 -1.046 -1.215 -1.507 -1.721 -1.942 -2.056 -2.307 -2.588 -2.906 -3.059 -3.408 -3.57 -3.755 -3.943 -4.33 -4.553 -4.818 -5.098 -5.402 -5.768 -6.306 -8.153 -8 ,12170 ,KEBNE ,17040755,Thu Dec 23 01:21:19 CET,Thu Dec 23 03:05:51 CET,0.0 0.752 0.981 1.198 1.427 1.614 1.777 1.925 2.177 2.289 2.407 2.439 2.726 2.813 2.995 3.184 3.36 3.45 3.625 3.772 3.996 4.144 4.283 4.475 4.648 4.817 4.974 5.11 5.295 5.487 5.682 5.915 6.116 6.306 6.532 6.777 7.006 7.247 7.501 7.791 8.062 8.34 8.691 9.028 9.37 9.712 10.074 10.389 10.639 10.827 10.796 10.362 9.756 9.13 8.478 7.832 7.273 6.786 6.371 5.944 5.581 5.258 4.937 4.627 4.342 4.081 3.812 3.55 3.303 3.055 2.785 2.567 2.313 2.0 1.75 1.495 1.244 0.997 0.763 0.613 0.463 0.222 0.001 -0.255 -0.377 -0.635 -0.899 -1.173 -1.325 -1.687 -1.877 -2.084 -2.303 -2.774 -3.028 -3.31 -3.633 -3.906 -4.225 -4.797 -7.09 -9 ,12694 ,KEBNE ,17040756,Thu Dec 23 01:21:20 CET,Thu Dec 23 03:04:42 CET,0.0 0.962 1.291 1.512 1.704 1.883 2.061 2.225 2.521 2.651 2.764 2.784 3.079 3.178 3.366 3.543 3.72 3.81 3.979 4.134 4.356 4.501 4.629 4.808 4.99 5.173 5.342 5.51 5.724 5.928 6.116 6.328 6.525 6.704 6.912 7.141 7.35 7.583 7.827 8.057 8.307 8.605 8.929 9.207 9.483 9.787 10.146 10.524 10.811 10.943 10.771 10.22 9.615 8.984 8.352 7.715 7.161 6.656 6.189 5.683 5.201 4.77 4.361 3.981 3.644 3.344 3.028 2.741 2.493 2.224 1.907 1.636 1.368 1.087 0.856 0.623 0.405 0.166 -0.13 -0.358 -0.594 -0.938 -1.173 -1.442 -1.577 -1.847 -2.168 -2.517 -2.678 -3.033 -3.229 -3.439 -3.638 -4.087 -4.338 -4.605 -4.958 -5.353 -5.816 -6.418 -8.883 -10 ,28259 ,KEBNE ,17040757,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:04:57 CET,0.0 0.922 1.27 1.527 1.704 1.855 1.998 2.13 2.371 2.477 2.581 2.616 2.911 3.015 3.2 3.378 3.548 3.626 3.775 3.919 4.125 4.256 4.385 4.579 4.752 4.913 5.077 5.233 5.439 5.635 5.819 6.043 6.261 6.476 6.706 6.93 7.139 7.369 7.597 7.847 8.09 8.346 8.669 9.003 9.355 9.695 10.056 10.369 10.607 10.725 10.535 9.99 9.389 8.766 8.137 7.519 6.958 6.453 5.993 5.511 5.107 4.764 4.437 4.089 3.734 3.429 3.123 2.854 2.635 2.408 2.158 1.939 1.713 1.451 1.215 0.977 0.762 0.533 0.235 0.014 -0.194 -0.508 -0.737 -0.968 -1.088 -1.345 -1.618 -1.904 -2.059 -2.417 -2.584 -2.782 -2.984 -3.406 -3.604 -3.797 -4.007 -4.235 -4.498 -4.929 -6.302 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index a4610214..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31950 ,KEBNE ,17040758,Thu Dec 23 01:21:20 CET,Thu Dec 23 03:05:30 CET,0.0 1.129 1.425 1.668 1.868 2.034 2.181 2.331 2.605 2.726 2.848 2.879 3.181 3.283 3.478 3.675 3.86 3.941 4.083 4.231 4.448 4.58 4.705 4.897 5.09 5.276 5.454 5.619 5.822 6.007 6.185 6.426 6.682 6.903 7.138 7.401 7.645 7.91 8.193 8.473 8.773 9.114 9.497 9.884 10.303 10.738 11.229 11.713 12.18 12.564 12.822 12.741 12.424 12.02 11.6 11.203 10.835 10.46 10.112 9.779 9.485 9.204 8.906 8.616 8.348 8.087 7.813 7.566 7.349 7.116 6.851 6.628 6.417 6.189 6.009 5.836 5.642 5.421 5.198 5.058 4.913 4.671 4.506 4.331 4.24 4.054 3.863 3.647 3.523 3.21 3.123 2.971 2.825 2.517 2.347 2.165 1.979 1.774 1.511 1.166 0.245 -2 ,1634 ,KEBNE ,17040759,Thu Dec 23 01:21:20 CET,Thu Dec 23 03:05:07 CET,0.0 1.183 1.529 1.817 2.082 2.306 2.479 2.627 2.931 3.061 3.171 3.205 3.506 3.608 3.794 3.974 4.148 4.234 4.402 4.564 4.8 4.941 5.07 5.259 5.449 5.646 5.83 5.996 6.202 6.394 6.585 6.815 7.034 7.241 7.479 7.739 7.982 8.255 8.539 8.838 9.156 9.502 9.892 10.275 10.712 11.166 11.63 12.094 12.597 13.051 13.325 13.159 12.711 12.231 11.742 11.257 10.824 10.421 10.055 9.669 9.349 9.059 8.767 8.497 8.222 7.95 7.656 7.398 7.182 6.949 6.699 6.485 6.267 6.045 5.875 5.696 5.49 5.268 5.049 4.91 4.751 4.482 4.318 4.151 4.053 3.852 3.661 3.478 3.383 3.079 3.036 2.914 2.783 2.477 2.312 2.132 1.921 1.697 1.454 1.141 0.109 -3 ,18317 ,KEBNE ,17040760,Thu Dec 23 01:21:20 CET,Thu Dec 23 03:05:03 CET,0.0 0.799 1.158 1.467 1.686 1.877 2.046 2.204 2.486 2.616 2.75 2.813 3.113 3.205 3.405 3.602 3.778 3.868 4.044 4.206 4.447 4.593 4.729 4.931 5.117 5.294 5.468 5.639 5.855 6.071 6.283 6.521 6.759 6.987 7.23 7.495 7.746 8.017 8.298 8.596 8.895 9.22 9.601 9.993 10.453 10.937 11.416 11.918 12.44 12.915 13.289 13.226 12.945 12.585 12.179 11.779 11.382 10.996 10.65 10.274 9.933 9.613 9.295 9.001 8.74 8.475 8.18 7.934 7.718 7.494 7.277 7.102 6.909 6.688 6.519 6.351 6.181 5.996 5.794 5.654 5.506 5.266 5.1 4.922 4.833 4.657 4.461 4.254 4.148 3.843 3.758 3.615 3.481 3.2 3.019 2.83 2.647 2.427 2.18 1.889 1.148 -4 ,9486 ,KEBNE ,17040761,Thu Dec 23 01:21:21 CET,Thu Dec 23 03:04:54 CET,0.0 0.971 1.258 1.493 1.697 1.886 2.046 2.184 2.441 2.56 2.694 2.764 3.055 3.152 3.338 3.521 3.704 3.792 3.967 4.128 4.347 4.49 4.624 4.827 5.029 5.199 5.357 5.523 5.74 5.953 6.152 6.378 6.61 6.83 7.061 7.322 7.57 7.828 8.117 8.423 8.74 9.08 9.471 9.864 10.299 10.752 11.217 11.697 12.22 12.711 13.093 13.079 12.73 12.325 11.923 11.493 11.035 10.577 10.186 9.791 9.441 9.14 8.848 8.568 8.302 8.026 7.726 7.464 7.24 7.007 6.747 6.522 6.294 6.073 5.904 5.724 5.54 5.341 5.139 5.005 4.852 4.591 4.429 4.282 4.201 4.03 3.849 3.646 3.539 3.239 3.183 3.047 2.887 2.543 2.375 2.191 1.991 1.778 1.524 1.228 0.6 -5 ,20101 ,KEBNE ,17040762,Thu Dec 23 01:21:19 CET,Thu Dec 23 03:05:47 CET,0.0 0.587 0.879 1.093 1.271 1.467 1.648 1.793 2.051 2.176 2.302 2.337 2.643 2.749 2.934 3.105 3.275 3.35 3.504 3.654 3.857 3.991 4.136 4.34 4.519 4.681 4.831 4.981 5.173 5.354 5.533 5.762 5.987 6.198 6.424 6.677 6.924 7.175 7.444 7.733 8.014 8.34 8.743 9.131 9.576 10.072 10.646 11.213 11.733 12.232 12.604 12.573 12.357 12.06 11.718 11.359 11.023 10.714 10.413 10.056 9.707 9.381 9.082 8.793 8.518 8.274 8.004 7.747 7.534 7.325 7.087 6.87 6.66 6.44 6.262 6.08 5.895 5.703 5.501 5.36 5.214 4.97 4.792 4.617 4.53 4.343 4.142 3.935 3.818 3.5 3.453 3.336 3.205 2.866 2.695 2.529 2.33 2.123 1.893 1.582 0.448 -6 ,26644 ,KEBNE ,17040763,Thu Dec 23 01:23:24 CET,Thu Dec 23 03:07:10 CET,0.0 0.941 1.34 1.648 1.867 2.03 2.178 2.332 2.6 2.727 2.851 2.874 3.176 3.281 3.481 3.656 3.825 3.911 4.076 4.232 4.462 4.602 4.738 4.939 5.119 5.295 5.469 5.638 5.851 6.052 6.245 6.47 6.676 6.866 7.087 7.355 7.601 7.855 8.136 8.44 8.761 9.117 9.506 9.865 10.266 10.691 11.115 11.54 12.042 12.55 12.857 12.698 12.268 11.832 11.414 10.949 10.518 10.148 9.845 9.513 9.159 8.836 8.551 8.279 8.027 7.796 7.542 7.302 7.099 6.904 6.706 6.53 6.34 6.143 5.98 5.809 5.648 5.481 5.293 5.145 4.988 4.773 4.62 4.464 4.384 4.207 4.011 3.811 3.707 3.396 3.295 3.153 3.009 2.693 2.52 2.326 2.108 1.886 1.604 1.177 0.028 -7 ,28113 ,KEBNE ,17040764,Thu Dec 23 01:33:46 CET,Thu Dec 23 03:17:25 CET,0.0 1.002 1.255 1.474 1.661 1.822 1.979 2.128 2.396 2.522 2.638 2.661 2.957 3.046 3.219 3.388 3.553 3.638 3.799 3.946 4.156 4.303 4.452 4.657 4.834 5.006 5.177 5.338 5.536 5.728 5.922 6.165 6.4 6.612 6.836 7.102 7.371 7.643 7.933 8.245 8.57 8.91 9.305 9.709 10.136 10.591 11.106 11.639 12.209 12.753 13.118 13.131 12.901 12.541 12.118 11.723 11.392 11.057 10.743 10.414 10.108 9.802 9.499 9.211 8.922 8.641 8.361 8.126 7.922 7.708 7.47 7.265 7.059 6.851 6.675 6.482 6.279 6.061 5.844 5.704 5.56 5.315 5.131 4.948 4.859 4.68 4.502 4.327 4.231 3.938 3.9 3.785 3.664 3.371 3.205 3.052 2.86 2.611 2.355 2.026 1.25 -8 ,19636 ,KEBNE ,17040765,Thu Dec 23 01:40:58 CET,Thu Dec 23 03:24:04 CET,0.0 1.176 1.546 1.769 1.95 2.125 2.302 2.458 2.713 2.829 2.933 2.931 3.229 3.333 3.521 3.693 3.866 3.949 4.11 4.266 4.492 4.632 4.763 4.966 5.165 5.348 5.523 5.69 5.887 6.074 6.273 6.527 6.756 6.965 7.209 7.466 7.707 7.97 8.254 8.583 8.911 9.247 9.615 9.985 10.402 10.858 11.375 11.888 12.386 12.82 13.086 12.911 12.536 12.122 11.684 11.254 10.844 10.437 10.085 9.733 9.4 9.105 8.803 8.509 8.242 7.978 7.717 7.492 7.284 7.067 6.833 6.634 6.418 6.191 6.026 5.869 5.698 5.512 5.335 5.205 5.053 4.831 4.682 4.503 4.407 4.225 4.022 3.779 3.658 3.364 3.334 3.222 3.105 2.817 2.637 2.423 2.205 1.945 1.669 1.358 0.519 -9 ,1825 ,KEBNE ,17040766,Thu Dec 23 01:40:58 CET,Thu Dec 23 03:23:06 CET,0.0 1.089 1.399 1.648 1.852 2.025 2.184 2.324 2.564 2.68 2.802 2.837 3.128 3.224 3.423 3.608 3.776 3.861 4.02 4.166 4.376 4.518 4.661 4.856 5.034 5.214 5.394 5.562 5.77 5.966 6.152 6.382 6.593 6.779 7.009 7.276 7.528 7.806 8.108 8.409 8.707 9.056 9.437 9.772 10.178 10.62 11.098 11.598 12.071 12.53 12.901 12.799 12.442 12.027 11.657 11.313 10.94 10.548 10.178 9.775 9.408 9.079 8.763 8.437 8.131 7.886 7.635 7.386 7.175 6.953 6.693 6.482 6.272 6.048 5.867 5.678 5.493 5.317 5.139 4.998 4.85 4.641 4.487 4.311 4.221 4.013 3.786 3.553 3.44 3.141 3.079 2.947 2.812 2.483 2.301 2.123 1.89 1.615 1.338 1.025 0.2 -10 ,4636 ,KEBNE ,17040767,Thu Dec 23 01:40:58 CET,Thu Dec 23 03:24:02 CET,0.0 0.563 0.92 1.179 1.376 1.553 1.742 1.916 2.191 2.314 2.433 2.457 2.744 2.839 3.026 3.2 3.366 3.454 3.62 3.772 3.986 4.111 4.228 4.415 4.601 4.768 4.934 5.093 5.298 5.49 5.668 5.894 6.135 6.368 6.605 6.847 7.086 7.351 7.623 7.909 8.212 8.549 8.932 9.322 9.778 10.247 10.728 11.242 11.738 12.158 12.362 12.182 11.834 11.395 10.951 10.525 10.148 9.792 9.449 9.08 8.739 8.415 8.107 7.84 7.582 7.337 7.066 6.811 6.592 6.355 6.098 5.902 5.708 5.49 5.316 5.144 4.959 4.745 4.517 4.36 4.201 3.955 3.784 3.609 3.519 3.318 3.094 2.867 2.755 2.444 2.39 2.268 2.128 1.834 1.677 1.503 1.314 1.089 0.81 0.427 -0.72 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt deleted file mode 100644 index 1dcf9746..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32174 ,KEBNE ,17040768,Thu Dec 23 01:40:58 CET,Thu Dec 23 03:23:36 CET,0.0 1.028 1.377 1.611 1.812 1.981 2.14 2.293 2.581 2.693 2.79 2.809 3.094 3.182 3.351 3.512 3.666 3.739 3.884 4.015 4.2 4.331 4.465 4.658 4.837 4.989 5.138 5.295 5.493 5.678 5.853 6.054 6.242 6.432 6.655 6.907 7.154 7.425 7.699 7.953 8.219 8.523 8.866 9.189 9.542 9.94 10.372 10.798 11.238 11.606 11.774 11.599 11.221 10.743 10.245 9.778 9.352 8.945 8.573 8.207 7.887 7.597 7.326 7.064 6.82 6.596 6.354 6.123 5.907 5.69 5.474 5.296 5.104 4.905 4.751 4.583 4.402 4.202 3.994 3.851 3.703 3.495 3.345 3.181 3.094 2.917 2.738 2.543 2.44 2.128 2.064 1.941 1.827 1.581 1.439 1.284 1.102 0.839 0.506 0.183 -0.546 -2 ,31071 ,KEBNE ,17040769,Thu Dec 23 01:40:58 CET,Thu Dec 23 03:24:02 CET,0.0 1.131 1.412 1.641 1.821 1.967 2.094 2.21 2.453 2.568 2.673 2.689 2.987 3.089 3.269 3.435 3.591 3.669 3.819 3.964 4.174 4.3 4.414 4.581 4.75 4.925 5.088 5.239 5.441 5.637 5.818 6.022 6.217 6.414 6.648 6.89 7.101 7.339 7.599 7.863 8.135 8.442 8.788 9.112 9.46 9.817 10.198 10.601 10.996 11.309 11.411 11.198 10.775 10.299 9.828 9.35 8.897 8.448 8.065 7.688 7.355 7.071 6.809 6.542 6.276 6.032 5.786 5.567 5.367 5.167 4.965 4.806 4.634 4.438 4.282 4.127 3.974 3.803 3.622 3.496 3.366 3.173 3.024 2.874 2.797 2.617 2.431 2.246 2.153 1.856 1.796 1.671 1.542 1.262 1.114 0.958 0.781 0.6 0.403 0.063 -0.681 -3 ,6525 ,KEBNE ,17040770,Thu Dec 23 01:40:58 CET,Thu Dec 23 03:24:14 CET,0.0 0.845 1.17 1.452 1.693 1.891 2.056 2.206 2.509 2.643 2.76 2.785 3.08 3.186 3.368 3.544 3.718 3.797 3.952 4.105 4.325 4.455 4.578 4.762 4.939 5.116 5.285 5.449 5.646 5.832 6.018 6.243 6.455 6.654 6.887 7.142 7.373 7.627 7.903 8.178 8.453 8.776 9.13 9.446 9.805 10.202 10.621 11.013 11.36 11.703 11.872 11.619 11.196 10.701 10.207 9.715 9.231 8.782 8.414 8.02 7.65 7.296 6.968 6.664 6.381 6.137 5.883 5.649 5.445 5.243 5.014 4.802 4.587 4.374 4.211 4.044 3.866 3.664 3.468 3.342 3.207 3.004 2.855 2.682 2.597 2.42 2.233 2.044 1.939 1.649 1.632 1.523 1.422 1.169 1.011 0.864 0.705 0.531 0.347 0.14 -0.493 -4 ,24444 ,KEBNE ,17040771,Thu Dec 23 01:40:58 CET,Thu Dec 23 03:23:17 CET,0.0 1.018 1.326 1.618 1.877 2.06 2.218 2.375 2.642 2.761 2.871 2.89 3.194 3.302 3.513 3.707 3.884 3.971 4.138 4.298 4.515 4.647 4.768 4.947 5.128 5.303 5.481 5.655 5.865 6.055 6.236 6.456 6.666 6.857 7.077 7.335 7.584 7.838 8.098 8.391 8.711 9.077 9.468 9.809 10.193 10.626 11.07 11.483 11.862 12.147 12.249 12.004 11.623 11.17 10.694 10.226 9.804 9.409 9.047 8.659 8.316 8.012 7.722 7.429 7.149 6.904 6.667 6.451 6.251 6.039 5.815 5.634 5.446 5.238 5.057 4.865 4.669 4.471 4.264 4.14 4.019 3.814 3.663 3.5 3.412 3.227 3.042 2.842 2.743 2.454 2.418 2.296 2.182 1.931 1.775 1.611 1.452 1.251 1.034 0.702 -0.263 -5 ,28059 ,KEBNE ,17040772,Thu Dec 23 01:43:02 CET,Thu Dec 23 03:27:11 CET,0.0 0.982 1.331 1.547 1.744 1.921 2.07 2.225 2.511 2.634 2.757 2.809 3.11 3.208 3.393 3.571 3.747 3.829 3.975 4.114 4.328 4.475 4.603 4.775 4.952 5.118 5.277 5.434 5.633 5.812 5.987 6.21 6.413 6.595 6.815 7.061 7.288 7.529 7.785 8.057 8.33 8.627 8.974 9.32 9.682 10.059 10.473 10.875 11.248 11.51 11.548 11.271 10.823 10.347 9.831 9.29 8.862 8.466 8.099 7.73 7.373 7.044 6.73 6.435 6.18 5.937 5.668 5.434 5.23 5.021 4.79 4.589 4.39 4.186 4.034 3.875 3.706 3.53 3.351 3.231 3.099 2.899 2.765 2.611 2.521 2.341 2.165 1.95 1.844 1.547 1.525 1.416 1.313 1.064 0.911 0.758 0.602 0.41 0.192 -0.048 -1.101 -6 ,1549 ,KEBNE ,17040773,Thu Dec 23 01:43:02 CET,Thu Dec 23 03:27:39 CET,0.0 0.665 0.928 1.124 1.304 1.462 1.596 1.738 2.004 2.119 2.24 2.284 2.579 2.678 2.837 2.991 3.16 3.238 3.395 3.557 3.779 3.906 4.017 4.191 4.364 4.522 4.681 4.834 5.017 5.191 5.367 5.58 5.777 5.958 6.164 6.397 6.618 6.878 7.147 7.418 7.693 7.959 8.284 8.614 8.958 9.33 9.714 10.057 10.373 10.619 10.657 10.339 9.845 9.363 8.886 8.394 7.958 7.547 7.185 6.798 6.431 6.112 5.825 5.543 5.257 4.998 4.721 4.478 4.28 4.06 3.809 3.604 3.397 3.182 3.008 2.831 2.647 2.446 2.24 2.097 1.956 1.734 1.566 1.383 1.294 1.113 0.904 0.697 0.586 0.277 0.274 0.163 0.021 -0.292 -0.456 -0.611 -0.772 -0.982 -1.203 -1.478 -2.282 -7 ,32748 ,KEBNE ,17040774,Thu Dec 23 01:43:01 CET,Thu Dec 23 03:26:58 CET,0.0 0.603 0.854 1.022 1.18 1.335 1.474 1.613 1.858 1.957 2.052 2.047 2.341 2.437 2.603 2.76 2.907 2.987 3.149 3.293 3.482 3.603 3.726 3.897 4.064 4.226 4.374 4.526 4.72 4.885 5.049 5.251 5.439 5.619 5.845 6.096 6.309 6.552 6.836 7.123 7.393 7.679 8.008 8.345 8.715 9.091 9.519 9.951 10.32 10.649 10.798 10.58 10.182 9.688 9.2 8.747 8.299 7.844 7.459 7.064 6.716 6.415 6.115 5.797 5.498 5.254 5.012 4.78 4.576 4.371 4.155 3.973 3.79 3.597 3.439 3.274 3.096 2.911 2.709 2.567 2.422 2.189 2.029 1.876 1.801 1.638 1.463 1.279 1.188 0.907 0.888 0.769 0.632 0.341 0.198 0.049 -0.108 -0.305 -0.511 -0.74 -1.362 -8 ,16082 ,KEBNE ,17040775,Thu Dec 23 01:43:02 CET,Thu Dec 23 03:27:42 CET,0.0 1.068 1.451 1.693 1.88 2.08 2.283 2.445 2.701 2.819 2.938 2.96 3.249 3.345 3.557 3.761 3.934 4.014 4.175 4.34 4.574 4.713 4.847 5.04 5.206 5.365 5.527 5.691 5.881 6.042 6.221 6.439 6.639 6.834 7.058 7.329 7.587 7.87 8.167 8.449 8.74 9.076 9.456 9.822 10.244 10.668 11.081 11.482 11.888 12.207 12.242 11.88 11.316 10.763 10.288 9.816 9.338 8.878 8.476 8.073 7.717 7.389 7.081 6.789 6.496 6.21 5.938 5.708 5.502 5.282 5.056 4.877 4.679 4.464 4.304 4.142 3.974 3.787 3.588 3.467 3.343 3.125 2.97 2.822 2.745 2.588 2.402 2.194 2.098 1.808 1.801 1.678 1.544 1.258 1.097 0.92 0.735 0.504 0.244 0.009 -0.585 -9 ,4414 ,KEBNE ,17040776,Thu Dec 23 01:43:02 CET,Thu Dec 23 03:26:56 CET,0.0 0.785 1.101 1.323 1.482 1.616 1.754 1.891 2.116 2.215 2.322 2.326 2.602 2.688 2.846 3.003 3.158 3.228 3.369 3.512 3.704 3.828 3.953 4.131 4.301 4.471 4.638 4.784 4.958 5.114 5.259 5.447 5.624 5.803 6.032 6.268 6.469 6.696 6.952 7.22 7.489 7.769 8.077 8.389 8.753 9.139 9.558 9.948 10.258 10.519 10.597 10.314 9.909 9.382 8.905 8.484 8.031 7.576 7.175 6.774 6.436 6.116 5.822 5.561 5.296 5.052 4.794 4.55 4.345 4.136 3.924 3.763 3.593 3.398 3.252 3.111 2.958 2.797 2.625 2.498 2.364 2.158 2.019 1.881 1.807 1.64 1.453 1.251 1.155 0.871 0.849 0.734 0.611 0.324 0.181 0.043 -0.11 -0.269 -0.461 -0.735 -1.39 -10 ,6638 ,KEBNE ,17040777,Thu Dec 23 01:43:02 CET,Thu Dec 23 03:27:38 CET,0.0 0.813 1.115 1.365 1.59 1.785 1.969 2.122 2.402 2.532 2.655 2.711 3.014 3.109 3.307 3.49 3.657 3.739 3.893 4.042 4.244 4.381 4.517 4.696 4.858 5.031 5.22 5.401 5.623 5.824 6.01 6.231 6.443 6.635 6.838 7.085 7.32 7.581 7.862 8.121 8.375 8.654 8.99 9.33 9.714 10.117 10.516 10.888 11.311 11.742 11.901 11.681 11.231 10.705 10.209 9.693 9.204 8.787 8.419 8.014 7.652 7.323 7.019 6.726 6.43 6.169 5.906 5.675 5.476 5.25 5.006 4.803 4.591 4.361 4.185 4.02 3.835 3.633 3.415 3.27 3.135 2.911 2.754 2.596 2.506 2.326 2.131 1.926 1.821 1.516 1.479 1.353 1.227 0.93 0.755 0.571 0.362 0.13 -0.115 -0.395 -1.104 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt deleted file mode 100644 index d61d3dbd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29731 ,KEBNE ,17040778,Thu Dec 23 01:43:02 CET,Thu Dec 23 03:26:29 CET,0.0 0.664 0.759 0.833 0.9 0.955 0.998 1.036 1.099 1.112 1.115 0.933 1.115 1.12 1.121 1.098 1.074 1.059 1.029 0.995 0.922 0.871 0.809 0.692 0.579 0.469 0.371 0.271 0.112 -0.062 -0.25 -0.489 -0.714 -0.961 -1.285 -1.665 -2.075 -2.577 -3.163 -3.803 -4.518 -5.362 -6.425 -7.656 -9.232 -11.145 -13.591 -16.708 -20.873 -26.507 -34.897 -43.749 -50.218 -55.312 -59.399 -62.801 -65.621 -68.03 -69.99 -71.891 -73.469 -74.832 -76.124 -77.327 -78.406 -79.355 -80.325 -81.151 -81.836 -82.535 -83.255 -83.851 -84.455 -85.056 -85.508 -85.96 -86.422 -86.91 -87.397 -87.724 -88.055 -88.551 -88.894 -89.265 -89.46 -89.846 -90.239 -90.65 -90.855 -91.343 -91.491 -91.711 -91.947 -92.442 -92.705 -92.977 -93.253 -93.546 -93.837 -94.227 -95.128 -2 ,26951 ,KEBNE ,17040779,Thu Dec 23 01:43:02 CET,Thu Dec 23 03:25:34 CET,0.0 0.63 0.805 0.953 1.077 1.204 1.296 1.351 1.429 1.469 1.503 1.362 1.561 1.566 1.58 1.577 1.559 1.546 1.509 1.467 1.398 1.342 1.291 1.213 1.123 1.019 0.9 0.776 0.604 0.424 0.232 0.001 -0.241 -0.501 -0.807 -1.179 -1.582 -2.052 -2.573 -3.186 -3.889 -4.731 -5.822 -7.022 -8.56 -10.415 -12.745 -15.782 -19.914 -25.637 -34.065 -42.962 -49.582 -54.73 -58.844 -62.303 -65.172 -67.608 -69.591 -71.526 -73.152 -74.552 -75.82 -76.959 -78.014 -78.945 -79.858 -80.654 -81.334 -82.011 -82.703 -83.278 -83.862 -84.458 -84.915 -85.378 -85.85 -86.336 -86.832 -87.165 -87.5 -88.033 -88.385 -88.725 -88.903 -89.279 -89.659 -90.051 -90.251 -90.746 -90.861 -91.075 -91.305 -91.752 -92.002 -92.281 -92.551 -92.816 -93.1 -93.405 -94.371 -3 ,13528 ,KEBNE ,17040780,Thu Dec 23 01:43:02 CET,Thu Dec 23 03:26:23 CET,0.0 0.645 0.794 0.915 0.985 1.051 1.113 1.142 1.168 1.186 1.206 1.034 1.219 1.22 1.208 1.175 1.14 1.12 1.075 1.033 0.95 0.891 0.842 0.762 0.662 0.549 0.423 0.286 0.099 -0.092 -0.29 -0.54 -0.798 -1.069 -1.407 -1.795 -2.188 -2.674 -3.259 -3.894 -4.611 -5.499 -6.599 -7.804 -9.367 -11.294 -13.727 -16.862 -21.023 -26.743 -35.272 -44.226 -50.835 -55.932 -59.968 -63.334 -66.106 -68.489 -70.444 -72.358 -73.979 -75.386 -76.684 -77.84 -78.888 -79.833 -80.787 -81.61 -82.302 -82.994 -83.695 -84.285 -84.878 -85.469 -85.921 -86.385 -86.867 -87.361 -87.859 -88.193 -88.541 -89.069 -89.414 -89.77 -89.948 -90.314 -90.69 -91.084 -91.289 -91.761 -91.904 -92.133 -92.353 -92.787 -93.011 -93.244 -93.496 -93.786 -94.082 -94.415 -94.993 -4 ,28190 ,KEBNE ,17040781,Thu Dec 23 01:43:02 CET,Thu Dec 23 03:25:52 CET,0.0 0.712 0.913 1.066 1.182 1.265 1.328 1.383 1.481 1.506 1.518 1.362 1.555 1.559 1.566 1.563 1.543 1.521 1.468 1.43 1.377 1.336 1.283 1.183 1.072 0.958 0.839 0.718 0.554 0.382 0.193 -0.049 -0.292 -0.536 -0.84 -1.212 -1.592 -2.04 -2.565 -3.184 -3.882 -4.742 -5.854 -7.066 -8.595 -10.451 -12.864 -15.947 -20.054 -25.796 -34.386 -43.419 -50.071 -55.291 -59.46 -62.932 -65.799 -68.251 -70.298 -72.291 -73.931 -75.323 -76.602 -77.781 -78.851 -79.795 -80.737 -81.548 -82.238 -82.943 -83.66 -84.232 -84.812 -85.417 -85.887 -86.362 -86.833 -87.304 -87.801 -88.144 -88.483 -88.994 -89.34 -89.701 -89.883 -90.247 -90.638 -91.042 -91.235 -91.704 -91.862 -92.089 -92.318 -92.816 -93.107 -93.393 -93.661 -93.952 -94.321 -94.75 -95.622 -5 ,20069 ,KEBNE ,17040782,Thu Dec 23 01:43:02 CET,Thu Dec 23 03:26:36 CET,0.0 0.466 0.608 0.713 0.8 0.858 0.906 0.954 1.024 1.039 1.049 0.869 1.059 1.058 1.032 1.003 0.978 0.965 0.945 0.92 0.87 0.836 0.788 0.706 0.611 0.496 0.381 0.257 0.082 -0.097 -0.284 -0.52 -0.761 -1.014 -1.345 -1.758 -2.179 -2.668 -3.21 -3.833 -4.575 -5.472 -6.585 -7.792 -9.296 -11.185 -13.614 -16.658 -20.782 -26.499 -34.888 -43.779 -50.44 -55.575 -59.628 -63.029 -65.829 -68.232 -70.229 -72.165 -73.751 -75.092 -76.353 -77.502 -78.51 -79.399 -80.315 -81.125 -81.801 -82.499 -83.212 -83.778 -84.359 -84.962 -85.43 -85.907 -86.378 -86.848 -87.342 -87.681 -88.02 -88.526 -88.864 -89.195 -89.364 -89.733 -90.124 -90.516 -90.719 -91.222 -91.37 -91.585 -91.805 -92.305 -92.571 -92.841 -93.13 -93.42 -93.731 -94.13 -94.965 -6 ,21128 ,KEBNE ,17040783,Thu Dec 23 01:45:07 CET,Thu Dec 23 03:27:01 CET,0.0 0.465 0.554 0.609 0.677 0.756 0.801 0.828 0.872 0.899 0.93 0.784 0.962 0.959 0.933 0.91 0.897 0.883 0.846 0.799 0.738 0.702 0.655 0.548 0.418 0.299 0.189 0.076 -0.09 -0.265 -0.443 -0.684 -0.933 -1.186 -1.485 -1.84 -2.231 -2.709 -3.24 -3.837 -4.545 -5.434 -6.531 -7.718 -9.254 -11.134 -13.575 -16.714 -20.955 -26.782 -35.229 -44.006 -50.519 -55.625 -59.686 -63.047 -65.836 -68.264 -70.238 -72.102 -73.661 -75.019 -76.257 -77.354 -78.339 -79.237 -80.147 -80.946 -81.649 -82.396 -83.16 -83.769 -84.382 -85.005 -85.494 -85.986 -86.473 -86.973 -87.477 -87.806 -88.134 -88.635 -88.979 -89.353 -89.544 -89.923 -90.306 -90.692 -90.895 -91.37 -91.511 -91.734 -91.959 -92.408 -92.639 -92.885 -93.154 -93.458 -93.817 -94.194 -95.16 -7 ,13560 ,KEBNE ,17040784,Thu Dec 23 01:45:06 CET,Thu Dec 23 03:27:08 CET,0.0 0.652 0.825 0.927 1.005 1.067 1.118 1.163 1.241 1.268 1.29 1.136 1.309 1.304 1.286 1.266 1.25 1.238 1.221 1.212 1.175 1.137 1.094 1.014 0.921 0.809 0.701 0.597 0.436 0.276 0.112 -0.117 -0.351 -0.588 -0.89 -1.27 -1.676 -2.156 -2.708 -3.343 -4.041 -4.875 -5.947 -7.117 -8.599 -10.469 -12.905 -16.006 -20.129 -25.737 -34.174 -43.205 -49.876 -55.064 -59.157 -62.516 -65.314 -67.752 -69.726 -71.595 -73.143 -74.482 -75.726 -76.863 -77.894 -78.808 -79.734 -80.542 -81.213 -81.888 -82.555 -83.093 -83.662 -84.245 -84.69 -85.141 -85.588 -86.054 -86.555 -86.902 -87.252 -87.798 -88.173 -88.54 -88.728 -89.129 -89.537 -89.936 -90.144 -90.641 -90.794 -91.01 -91.229 -91.691 -91.94 -92.189 -92.439 -92.729 -93.045 -93.417 -94.416 -8 ,27679 ,KEBNE ,17040785,Thu Dec 23 01:45:07 CET,Thu Dec 23 03:26:36 CET,0.0 0.336 0.542 0.68 0.763 0.808 0.834 0.876 0.959 0.972 0.982 0.822 1.003 1.011 1.023 1.022 1.017 1.01 0.983 0.953 0.901 0.856 0.798 0.7 0.606 0.511 0.407 0.288 0.115 -0.051 -0.219 -0.462 -0.704 -0.939 -1.245 -1.634 -2.028 -2.492 -3.038 -3.665 -4.381 -5.227 -6.293 -7.455 -8.967 -10.893 -13.407 -16.504 -20.569 -26.259 -34.7 -43.705 -50.366 -55.559 -59.705 -63.192 -66.097 -68.526 -70.513 -72.466 -74.067 -75.424 -76.684 -77.83 -78.876 -79.831 -80.787 -81.595 -82.281 -82.994 -83.714 -84.29 -84.878 -85.475 -85.937 -86.407 -86.875 -87.345 -87.823 -88.148 -88.478 -88.991 -89.346 -89.699 -89.877 -90.243 -90.636 -91.028 -91.228 -91.723 -91.886 -92.115 -92.352 -92.831 -93.087 -93.338 -93.597 -93.856 -94.115 -94.456 -95.274 -9 ,31664 ,KEBNE ,17040786,Thu Dec 23 01:45:07 CET,Thu Dec 23 03:26:53 CET,0.0 0.531 0.63 0.701 0.778 0.825 0.86 0.9 0.959 0.975 0.983 0.848 1.047 1.058 1.071 1.072 1.071 1.068 1.039 1.002 0.951 0.907 0.855 0.759 0.649 0.536 0.42 0.297 0.107 -0.087 -0.27 -0.501 -0.743 -0.994 -1.296 -1.672 -2.064 -2.526 -3.062 -3.683 -4.402 -5.274 -6.381 -7.618 -9.194 -11.115 -13.583 -16.669 -20.797 -26.541 -35.017 -43.876 -50.481 -55.675 -59.817 -63.289 -66.184 -68.669 -70.697 -72.636 -74.247 -75.65 -76.949 -78.133 -79.182 -80.11 -81.052 -81.884 -82.615 -83.331 -84.02 -84.578 -85.164 -85.774 -86.237 -86.708 -87.193 -87.676 -88.165 -88.498 -88.836 -89.356 -89.703 -90.062 -90.238 -90.59 -90.962 -91.335 -91.522 -91.996 -92.136 -92.343 -92.566 -93.023 -93.268 -93.554 -93.864 -94.203 -94.558 -94.926 -95.834 -10 ,3152 ,KEBNE ,17040787,Thu Dec 23 01:45:07 CET,Thu Dec 23 03:27:56 CET,0.0 0.511 0.704 0.834 0.916 0.999 1.056 1.097 1.178 1.206 1.222 1.06 1.247 1.253 1.258 1.254 1.231 1.213 1.176 1.138 1.068 1.02 0.965 0.867 0.769 0.666 0.56 0.441 0.269 0.091 -0.098 -0.322 -0.549 -0.797 -1.119 -1.516 -1.903 -2.337 -2.848 -3.453 -4.153 -5.004 -6.1 -7.296 -8.803 -10.681 -13.112 -16.16 -20.196 -25.767 -34.076 -42.962 -49.582 -54.716 -58.79 -62.196 -65.061 -67.505 -69.51 -71.445 -73.032 -74.423 -75.707 -76.839 -77.843 -78.759 -79.701 -80.506 -81.182 -81.871 -82.601 -83.202 -83.824 -84.463 -84.933 -85.424 -85.92 -86.407 -86.898 -87.223 -87.551 -88.064 -88.426 -88.794 -88.981 -89.36 -89.749 -90.152 -90.348 -90.827 -90.948 -91.157 -91.384 -91.868 -92.118 -92.378 -92.675 -93.005 -93.381 -93.835 -94.923 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt deleted file mode 100644 index b99f18c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12326 ,KEBNE ,17040788,Thu Dec 23 01:45:07 CET,Thu Dec 23 03:28:01 CET,0.0 0.926 1.209 1.417 1.577 1.737 1.898 2.031 2.291 2.422 2.538 2.56 2.84 2.935 3.111 3.275 3.427 3.503 3.66 3.822 4.058 4.194 4.325 4.529 4.733 4.926 5.113 5.285 5.494 5.705 5.894 6.111 6.328 6.543 6.798 7.081 7.348 7.628 7.917 8.234 8.575 8.923 9.326 9.734 10.198 10.698 11.23 11.826 12.456 12.996 13.455 13.665 13.588 13.352 13.068 12.772 12.447 12.099 11.791 11.475 11.187 10.924 10.667 10.421 10.194 9.988 9.761 9.551 9.378 9.195 8.986 8.817 8.642 8.459 8.317 8.166 8.021 7.872 7.705 7.591 7.474 7.276 7.128 6.965 6.875 6.714 6.572 6.392 6.289 6.007 5.971 5.855 5.742 5.494 5.347 5.186 5.013 4.811 4.542 4.191 3.253 -2 ,6205 ,KEBNE ,17040789,Thu Dec 23 01:45:07 CET,Thu Dec 23 03:28:02 CET,0.0 0.654 0.901 1.107 1.291 1.455 1.615 1.773 2.05 2.176 2.296 2.34 2.627 2.73 2.923 3.1 3.267 3.347 3.494 3.632 3.852 4.0 4.14 4.338 4.526 4.699 4.863 5.036 5.253 5.457 5.653 5.898 6.138 6.358 6.603 6.864 7.12 7.413 7.727 8.041 8.372 8.754 9.173 9.596 10.093 10.607 11.129 11.648 12.206 12.812 13.33 13.434 13.227 12.915 12.553 12.174 11.827 11.48 11.171 10.859 10.596 10.334 10.044 9.774 9.549 9.342 9.101 8.878 8.688 8.487 8.277 8.099 7.899 7.69 7.53 7.366 7.195 7.01 6.804 6.668 6.544 6.343 6.187 6.023 5.939 5.755 5.559 5.365 5.265 4.985 4.964 4.86 4.745 4.463 4.312 4.17 4.001 3.771 3.494 3.178 2.296 -3 ,18594 ,KEBNE ,17040790,Thu Dec 23 01:45:07 CET,Thu Dec 23 03:27:41 CET,0.0 0.99 1.319 1.517 1.69 1.833 1.961 2.109 2.392 2.507 2.621 2.649 2.924 3.018 3.206 3.395 3.566 3.649 3.812 3.959 4.185 4.337 4.471 4.663 4.86 5.037 5.205 5.364 5.549 5.733 5.917 6.128 6.335 6.534 6.756 6.999 7.228 7.488 7.789 8.09 8.382 8.72 9.085 9.455 9.891 10.345 10.821 11.331 11.941 12.561 13.045 13.201 13.119 12.923 12.658 12.398 12.166 11.903 11.625 11.335 11.074 10.824 10.579 10.338 10.095 9.879 9.644 9.415 9.207 8.983 8.767 8.608 8.432 8.239 8.09 7.931 7.766 7.585 7.376 7.242 7.116 6.905 6.769 6.641 6.569 6.423 6.241 6.046 5.948 5.634 5.543 5.416 5.287 5.042 4.872 4.677 4.505 4.317 4.071 3.724 2.812 -4 ,22631 ,KEBNE ,17040791,Thu Dec 23 01:45:07 CET,Thu Dec 23 03:27:23 CET,0.0 0.692 0.955 1.161 1.351 1.524 1.676 1.811 2.03 2.138 2.252 2.283 2.569 2.67 2.857 3.025 3.178 3.256 3.418 3.578 3.799 3.934 4.068 4.269 4.463 4.64 4.814 4.985 5.2 5.406 5.611 5.863 6.086 6.279 6.511 6.788 7.049 7.325 7.629 7.988 8.342 8.685 9.059 9.435 9.871 10.338 10.876 11.438 12.006 12.549 13.071 13.308 13.228 12.99 12.676 12.316 11.986 11.693 11.432 11.136 10.87 10.651 10.433 10.191 9.95 9.752 9.537 9.326 9.142 8.945 8.729 8.545 8.369 8.192 8.046 7.885 7.727 7.569 7.388 7.266 7.144 6.951 6.817 6.669 6.59 6.427 6.255 6.063 5.955 5.675 5.648 5.533 5.397 5.095 4.952 4.811 4.613 4.367 4.116 3.758 2.591 -5 ,28411 ,KEBNE ,17040792,Thu Dec 23 01:45:07 CET,Thu Dec 23 03:27:52 CET,0.0 0.491 0.734 0.941 1.108 1.265 1.431 1.586 1.863 1.98 2.093 2.138 2.422 2.529 2.725 2.885 3.048 3.129 3.275 3.424 3.635 3.771 3.906 4.104 4.294 4.476 4.651 4.826 5.055 5.246 5.432 5.653 5.842 6.027 6.244 6.503 6.743 6.988 7.263 7.567 7.887 8.247 8.656 9.046 9.506 10.009 10.546 11.12 11.699 12.29 12.882 13.108 12.99 12.739 12.462 12.17 11.853 11.55 11.282 10.982 10.726 10.484 10.252 10.034 9.818 9.627 9.424 9.241 9.084 8.916 8.741 8.587 8.414 8.233 8.102 7.961 7.804 7.648 7.483 7.373 7.261 7.074 6.934 6.785 6.712 6.568 6.42 6.261 6.174 5.902 5.857 5.736 5.618 5.374 5.237 5.061 4.879 4.71 4.516 4.2 3.229 -6 ,28656 ,KEBNE ,17040793,Thu Dec 23 01:45:07 CET,Thu Dec 23 03:27:36 CET,0.0 0.474 0.697 0.892 1.05 1.193 1.343 1.499 1.779 1.896 2.011 2.04 2.319 2.422 2.629 2.812 2.981 3.061 3.208 3.356 3.563 3.696 3.823 4.006 4.18 4.338 4.489 4.638 4.843 5.035 5.226 5.451 5.659 5.874 6.12 6.394 6.653 6.92 7.2 7.491 7.802 8.167 8.588 8.993 9.461 9.975 10.522 11.086 11.673 12.264 12.817 13.018 12.946 12.763 12.533 12.271 12.003 11.735 11.468 11.197 10.953 10.724 10.511 10.284 10.062 9.872 9.67 9.471 9.282 9.094 8.909 8.754 8.582 8.385 8.224 8.07 7.914 7.742 7.562 7.434 7.305 7.095 6.952 6.803 6.721 6.548 6.371 6.186 6.087 5.818 5.761 5.625 5.499 5.233 5.09 4.927 4.753 4.583 4.382 4.059 2.745 -7 ,15974 ,KEBNE ,17040795,Thu Dec 23 01:47:11 CET,Thu Dec 23 03:30:26 CET,0.0 0.534 0.852 1.091 1.303 1.481 1.621 1.742 1.989 2.114 2.226 2.243 2.521 2.614 2.797 2.969 3.124 3.202 3.357 3.5 3.697 3.821 3.957 4.161 4.334 4.49 4.646 4.803 5.018 5.216 5.395 5.612 5.824 6.031 6.257 6.498 6.725 6.991 7.287 7.582 7.898 8.269 8.693 9.098 9.537 9.998 10.528 11.108 11.69 12.236 12.702 12.848 12.758 12.558 12.298 11.968 11.598 11.263 10.987 10.684 10.425 10.181 9.94 9.699 9.462 9.245 9.001 8.785 8.612 8.424 8.214 8.044 7.878 7.71 7.572 7.423 7.283 7.136 6.966 6.843 6.718 6.524 6.39 6.25 6.172 6.018 5.854 5.673 5.571 5.286 5.257 5.147 5.024 4.749 4.613 4.48 4.33 4.152 3.957 3.716 2.952 -8 ,24798 ,KEBNE ,17040796,Thu Dec 23 01:47:11 CET,Thu Dec 23 03:30:34 CET,0.0 0.922 1.176 1.4 1.595 1.749 1.897 2.043 2.323 2.445 2.55 2.594 2.886 2.99 3.184 3.37 3.548 3.637 3.806 3.96 4.183 4.335 4.488 4.698 4.895 5.081 5.25 5.418 5.639 5.846 6.033 6.253 6.47 6.684 6.923 7.171 7.421 7.703 8.002 8.308 8.609 8.948 9.345 9.73 10.161 10.65 11.212 11.824 12.476 13.099 13.636 13.885 13.776 13.525 13.273 13.001 12.733 12.478 12.229 11.941 11.688 11.461 11.239 11.018 10.782 10.56 10.336 10.126 9.945 9.76 9.565 9.397 9.223 9.056 8.919 8.777 8.626 8.47 8.306 8.186 8.054 7.829 7.684 7.542 7.465 7.312 7.154 6.989 6.908 6.651 6.629 6.516 6.398 6.177 6.053 5.907 5.742 5.538 5.297 4.953 3.925 -9 ,26396 ,KEBNE ,17040797,Thu Dec 23 01:47:10 CET,Thu Dec 23 03:30:12 CET,0.0 0.794 1.071 1.281 1.483 1.664 1.812 1.956 2.228 2.346 2.455 2.472 2.757 2.856 3.021 3.188 3.355 3.438 3.605 3.766 3.983 4.12 4.261 4.453 4.631 4.806 4.981 5.149 5.357 5.563 5.76 5.998 6.221 6.421 6.648 6.902 7.142 7.415 7.702 8.002 8.329 8.669 9.059 9.442 9.874 10.351 10.866 11.416 11.973 12.497 13.013 13.163 13.025 12.803 12.536 12.235 11.933 11.623 11.326 11.019 10.753 10.509 10.261 10.026 9.808 9.607 9.391 9.204 9.04 8.849 8.653 8.492 8.319 8.13 7.975 7.824 7.679 7.512 7.336 7.212 7.075 6.861 6.711 6.556 6.473 6.319 6.169 5.994 5.898 5.617 5.59 5.487 5.379 5.127 4.982 4.809 4.62 4.441 4.219 3.942 3.282 -10 ,11773 ,KEBNE ,17040799,Thu Dec 23 01:48:15 CET,Thu Dec 23 03:29:55 CET,0.0 1.094 1.446 1.705 1.928 2.125 2.289 2.443 2.723 2.856 2.993 3.049 3.331 3.424 3.616 3.783 3.934 4.01 4.164 4.333 4.589 4.737 4.877 5.086 5.273 5.447 5.628 5.8 6.019 6.227 6.427 6.662 6.882 7.098 7.329 7.574 7.824 8.101 8.405 8.728 9.042 9.4 9.826 10.236 10.702 11.179 11.687 12.188 12.698 13.26 13.798 13.948 13.805 13.509 13.166 12.86 12.556 12.254 11.973 11.665 11.389 11.126 10.862 10.624 10.402 10.199 9.999 9.81 9.629 9.442 9.253 9.083 8.908 8.699 8.526 8.377 8.217 8.048 7.877 7.748 7.614 7.409 7.267 7.115 7.037 6.873 6.691 6.507 6.407 6.113 6.032 5.892 5.756 5.441 5.263 5.069 4.852 4.626 4.37 4.018 2.991 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index b24f3ebc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2959 ,KEBNE ,17040803,Thu Dec 23 01:47:11 CET,Thu Dec 23 03:08:14 CET,0.0 0.841 1.148 1.359 1.515 1.642 1.748 1.843 2.048 2.143 2.22 2.273 2.459 2.533 2.665 2.785 2.901 2.957 3.059 3.16 3.316 3.418 3.51 3.637 3.758 3.875 3.988 4.098 4.231 4.351 4.469 4.617 4.764 4.904 5.053 5.204 5.347 5.508 5.688 5.873 6.048 6.238 6.47 6.694 6.924 7.175 7.42 7.624 7.795 7.846 7.566 6.912 6.234 5.567 4.893 4.266 3.728 3.215 2.745 2.277 1.873 1.506 1.156 0.815 0.495 0.206 -0.077 -0.313 -0.519 -0.739 -0.989 -1.193 -1.4 -1.609 -1.775 -1.963 -2.15 -2.349 -2.559 -2.705 -2.857 -3.092 -3.263 -3.451 -3.544 -3.723 -3.919 -4.133 -4.24 -4.466 -4.62 -4.751 -4.895 -5.188 -5.346 -5.538 -5.763 -6.007 -6.267 -6.62 -7.673 -2 ,11674 ,KEBNE ,17040804,Thu Dec 23 01:47:11 CET,Thu Dec 23 03:08:04 CET,0.0 0.239 0.385 0.495 0.6 0.68 0.758 0.855 1.028 1.086 1.133 1.128 1.28 1.332 1.437 1.527 1.614 1.658 1.746 1.842 1.975 2.05 2.127 2.251 2.368 2.476 2.583 2.685 2.802 2.912 3.029 3.163 3.282 3.4 3.533 3.675 3.811 3.961 4.116 4.285 4.464 4.66 4.884 5.08 5.292 5.5 5.698 5.886 6.015 6.02 5.786 5.232 4.533 3.824 3.208 2.666 2.193 1.746 1.3 0.861 0.507 0.169 -0.183 -0.517 -0.804 -1.06 -1.342 -1.609 -1.842 -2.078 -2.31 -2.505 -2.73 -2.975 -3.154 -3.325 -3.497 -3.694 -3.902 -4.048 -4.196 -4.412 -4.568 -4.733 -4.825 -5.015 -5.211 -5.428 -5.538 -5.754 -5.914 -6.05 -6.179 -6.43 -6.563 -6.741 -6.948 -7.175 -7.451 -7.789 -8.715 -3 ,28638 ,KEBNE ,17040806,Thu Dec 23 01:48:15 CET,Thu Dec 23 03:09:02 CET,0.0 0.699 0.963 1.149 1.295 1.425 1.546 1.659 1.83 1.907 1.984 2.03 2.2 2.264 2.382 2.496 2.612 2.667 2.771 2.872 3.025 3.12 3.205 3.326 3.448 3.567 3.676 3.773 3.896 4.022 4.147 4.292 4.431 4.553 4.686 4.832 4.98 5.15 5.31 5.479 5.657 5.833 6.011 6.182 6.398 6.608 6.817 6.978 7.031 7.053 6.869 6.213 5.493 4.774 4.135 3.555 3.036 2.604 2.233 1.866 1.522 1.178 0.826 0.479 0.164 -0.103 -0.384 -0.655 -0.887 -1.119 -1.364 -1.563 -1.765 -1.971 -2.128 -2.295 -2.475 -2.663 -2.865 -3.014 -3.163 -3.394 -3.565 -3.751 -3.85 -4.041 -4.228 -4.429 -4.527 -4.735 -4.823 -4.924 -5.036 -5.308 -5.466 -5.623 -5.777 -5.952 -6.153 -6.388 -6.911 -4 ,9516 ,KEBNE ,17040807,Thu Dec 23 01:48:19 CET,Thu Dec 23 03:05:49 CET,0.0 0.182 0.293 0.43 0.552 0.634 0.714 0.789 0.903 0.96 1.024 1.027 1.187 1.241 1.36 1.479 1.577 1.623 1.727 1.825 1.964 2.056 2.143 2.266 2.387 2.514 2.633 2.74 2.875 3.009 3.135 3.275 3.406 3.53 3.671 3.835 4.008 4.191 4.367 4.552 4.739 4.939 5.179 5.414 5.64 5.849 6.074 6.31 6.525 6.669 6.525 6.043 5.563 5.044 4.453 3.851 3.319 2.835 2.402 1.955 1.571 1.226 0.882 0.556 0.262 0.007 -0.27 -0.536 -0.757 -0.98 -1.216 -1.415 -1.624 -1.839 -2.0 -2.167 -2.352 -2.533 -2.711 -2.828 -2.953 -3.158 -3.3 -3.454 -3.533 -3.703 -3.878 -4.054 -4.151 -4.364 -4.484 -4.599 -4.713 -4.962 -5.1 -5.245 -5.398 -5.565 -5.77 -6.042 -6.911 -5 ,25636 ,KEBNE ,17040809,Thu Dec 23 01:50:20 CET,Thu Dec 23 03:12:45 CET,0.0 0.276 0.424 0.538 0.627 0.703 0.779 0.838 0.951 1.013 1.076 1.087 1.245 1.299 1.394 1.478 1.565 1.608 1.695 1.776 1.898 1.978 2.051 2.147 2.235 2.328 2.423 2.517 2.64 2.758 2.863 2.995 3.12 3.239 3.379 3.514 3.64 3.783 3.941 4.093 4.243 4.408 4.607 4.786 4.968 5.186 5.396 5.572 5.669 5.63 5.379 4.851 4.198 3.503 2.871 2.264 1.721 1.248 0.842 0.455 0.099 -0.235 -0.556 -0.863 -1.146 -1.415 -1.7 -1.946 -2.15 -2.368 -2.607 -2.817 -3.037 -3.244 -3.401 -3.572 -3.756 -3.953 -4.157 -4.289 -4.428 -4.651 -4.807 -4.982 -5.069 -5.257 -5.46 -5.668 -5.783 -6.01 -6.145 -6.28 -6.417 -6.705 -6.872 -7.054 -7.262 -7.477 -7.677 -7.939 -8.783 -6 ,1267 ,KEBNE ,17040810,Thu Dec 23 01:50:20 CET,Thu Dec 23 03:11:17 CET,0.0 0.436 0.723 0.911 1.089 1.236 1.358 1.471 1.69 1.793 1.882 1.951 2.127 2.194 2.313 2.428 2.548 2.603 2.698 2.792 2.932 3.021 3.108 3.242 3.365 3.48 3.596 3.703 3.838 3.964 4.08 4.236 4.38 4.493 4.622 4.761 4.895 5.047 5.206 5.378 5.554 5.744 5.961 6.155 6.352 6.552 6.768 6.972 7.085 7.08 6.847 6.303 5.679 5.067 4.466 3.967 3.481 2.986 2.586 2.167 1.774 1.438 1.132 0.827 0.533 0.258 -0.042 -0.299 -0.523 -0.768 -1.007 -1.211 -1.424 -1.629 -1.788 -1.957 -2.13 -2.301 -2.488 -2.614 -2.735 -2.951 -3.094 -3.232 -3.313 -3.476 -3.653 -3.845 -3.938 -4.148 -4.267 -4.38 -4.489 -4.739 -4.885 -5.027 -5.178 -5.368 -5.625 -5.972 -7.066 -7 ,25385 ,KEBNE ,17040811,Thu Dec 23 01:50:20 CET,Thu Dec 23 03:11:24 CET,0.0 0.252 0.374 0.467 0.55 0.634 0.723 0.795 0.919 0.986 1.045 1.04 1.2 1.256 1.372 1.493 1.603 1.653 1.752 1.859 2.023 2.123 2.212 2.328 2.45 2.569 2.677 2.785 2.919 3.042 3.159 3.296 3.432 3.563 3.715 3.881 4.031 4.178 4.33 4.487 4.639 4.823 5.05 5.251 5.473 5.683 5.866 6.065 6.205 6.18 5.876 5.251 4.521 3.828 3.228 2.653 2.105 1.616 1.212 0.783 0.395 0.06 -0.248 -0.555 -0.855 -1.122 -1.385 -1.621 -1.832 -2.046 -2.268 -2.456 -2.666 -2.881 -3.047 -3.218 -3.396 -3.591 -3.791 -3.933 -4.095 -4.332 -4.484 -4.66 -4.754 -4.926 -5.098 -5.282 -5.371 -5.573 -5.67 -5.775 -5.883 -6.128 -6.27 -6.412 -6.559 -6.719 -6.91 -7.184 -8.007 -8 ,8500 ,KEBNE ,17040812,Thu Dec 23 01:50:20 CET,Thu Dec 23 03:11:31 CET,0.0 0.536 0.741 0.929 1.106 1.24 1.351 1.455 1.638 1.726 1.814 1.866 2.038 2.114 2.248 2.364 2.484 2.54 2.652 2.761 2.905 2.994 3.084 3.214 3.331 3.44 3.549 3.656 3.783 3.907 4.035 4.184 4.322 4.454 4.601 4.758 4.909 5.072 5.238 5.419 5.615 5.816 6.03 6.234 6.454 6.698 6.938 7.156 7.382 7.51 7.387 6.983 6.527 6.038 5.498 4.981 4.496 3.992 3.546 3.123 2.755 2.428 2.136 1.857 1.582 1.312 1.029 0.76 0.526 0.295 0.047 -0.164 -0.379 -0.592 -0.756 -0.933 -1.136 -1.352 -1.576 -1.73 -1.871 -2.098 -2.261 -2.41 -2.488 -2.671 -2.874 -3.082 -3.194 -3.422 -3.568 -3.693 -3.825 -4.134 -4.312 -4.53 -4.77 -5.013 -5.287 -5.673 -6.664 -9 ,28068 ,KEBNE ,17040813,Thu Dec 23 01:50:20 CET,Thu Dec 23 03:11:36 CET,0.0 0.188 0.33 0.469 0.57 0.65 0.722 0.794 0.922 0.983 1.063 1.138 1.312 1.371 1.489 1.608 1.726 1.784 1.892 1.994 2.143 2.234 2.323 2.45 2.566 2.677 2.776 2.875 3.009 3.136 3.262 3.415 3.549 3.666 3.803 3.959 4.1 4.248 4.42 4.606 4.782 4.964 5.173 5.363 5.557 5.75 5.922 6.079 6.214 6.226 5.952 5.382 4.719 4.091 3.57 3.071 2.639 2.242 1.84 1.443 1.094 0.746 0.419 0.117 -0.157 -0.411 -0.694 -0.956 -1.179 -1.413 -1.65 -1.833 -2.013 -2.198 -2.349 -2.511 -2.669 -2.834 -3.031 -3.166 -3.299 -3.492 -3.626 -3.776 -3.849 -4.01 -4.183 -4.358 -4.449 -4.652 -4.756 -4.867 -4.989 -5.261 -5.403 -5.559 -5.735 -5.925 -6.152 -6.386 -7.133 -10 ,378 ,KEBNE ,17040814,Thu Dec 23 01:50:21 CET,Thu Dec 23 03:11:06 CET,0.0 0.674 0.957 1.142 1.28 1.412 1.554 1.687 1.905 1.996 2.082 2.131 2.304 2.362 2.48 2.607 2.728 2.782 2.884 2.982 3.124 3.218 3.306 3.431 3.552 3.668 3.786 3.89 4.017 4.144 4.27 4.413 4.551 4.68 4.816 4.958 5.084 5.229 5.4 5.593 5.788 5.992 6.216 6.427 6.661 6.879 7.1 7.318 7.412 7.337 7.022 6.365 5.686 5.053 4.466 3.935 3.459 2.991 2.548 2.088 1.71 1.393 1.112 0.822 0.518 0.261 -0.013 -0.272 -0.496 -0.722 -0.949 -1.15 -1.368 -1.586 -1.758 -1.937 -2.123 -2.324 -2.531 -2.671 -2.818 -3.051 -3.211 -3.386 -3.478 -3.66 -3.858 -4.068 -4.175 -4.39 -4.526 -4.661 -4.805 -5.092 -5.251 -5.446 -5.651 -5.878 -6.147 -6.491 -7.498 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 5a1367d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10996 ,KEBNE ,17040815,Thu Dec 23 01:50:20 CET,Thu Dec 23 03:11:49 CET,0.0 0.321 0.439 0.54 0.643 0.737 0.819 0.891 1.013 1.073 1.129 1.15 1.307 1.36 1.458 1.55 1.634 1.674 1.763 1.865 2.001 2.075 2.145 2.258 2.366 2.462 2.554 2.646 2.767 2.884 2.995 3.114 3.208 3.297 3.415 3.563 3.697 3.821 3.928 4.034 4.166 4.303 4.449 4.567 4.658 4.744 4.82 4.837 4.721 4.365 3.631 2.58 1.512 0.561 -0.291 -1.098 -1.801 -2.451 -3.031 -3.607 -4.125 -4.599 -5.04 -5.447 -5.827 -6.173 -6.543 -6.889 -7.173 -7.475 -7.811 -8.088 -8.379 -8.688 -8.924 -9.158 -9.412 -9.685 -9.957 -10.151 -10.354 -10.672 -10.884 -11.105 -11.223 -11.47 -11.738 -12.029 -12.175 -12.419 -12.616 -12.783 -12.954 -13.35 -13.584 -13.828 -14.095 -14.416 -14.8 -15.355 -17.198 -2 ,29014 ,KEBNE ,17040816,Thu Dec 23 01:50:20 CET,Thu Dec 23 03:12:59 CET,0.0 0.514 0.729 0.892 1.025 1.136 1.247 1.352 1.545 1.641 1.722 1.769 1.93 1.995 2.12 2.227 2.327 2.377 2.47 2.557 2.672 2.753 2.834 2.939 3.036 3.129 3.227 3.327 3.444 3.545 3.637 3.753 3.874 3.987 4.115 4.246 4.368 4.501 4.637 4.753 4.877 5.014 5.13 5.241 5.337 5.418 5.454 5.385 5.221 4.829 3.964 2.768 1.678 0.664 -0.216 -1.013 -1.745 -2.411 -2.988 -3.567 -4.073 -4.531 -4.963 -5.387 -5.794 -6.167 -6.554 -6.894 -7.189 -7.5 -7.834 -8.106 -8.386 -8.675 -8.904 -9.151 -9.415 -9.677 -9.935 -10.114 -10.302 -10.604 -10.816 -11.03 -11.146 -11.396 -11.643 -11.883 -12.011 -12.252 -12.414 -12.565 -12.728 -13.067 -13.244 -13.427 -13.665 -13.957 -14.281 -14.698 -15.967 -3 ,7511 ,KEBNE ,17040817,Thu Dec 23 01:50:20 CET,Thu Dec 23 03:13:13 CET,0.0 0.261 0.407 0.505 0.605 0.71 0.809 0.901 1.051 1.124 1.212 1.281 1.451 1.516 1.636 1.751 1.857 1.913 2.016 2.102 2.226 2.309 2.392 2.509 2.609 2.703 2.799 2.892 3.005 3.118 3.228 3.347 3.453 3.552 3.667 3.807 3.93 4.049 4.186 4.308 4.431 4.591 4.744 4.87 5.009 5.141 5.212 5.203 5.081 4.691 3.866 2.701 1.625 0.645 -0.226 -1.007 -1.7 -2.37 -2.968 -3.56 -4.062 -4.5 -4.934 -5.35 -5.758 -6.135 -6.525 -6.883 -7.184 -7.493 -7.814 -8.082 -8.363 -8.656 -8.885 -9.128 -9.373 -9.611 -9.857 -10.032 -10.213 -10.495 -10.693 -10.91 -11.022 -11.244 -11.497 -11.764 -11.891 -12.129 -12.305 -12.465 -12.628 -12.961 -13.137 -13.32 -13.553 -13.854 -14.23 -14.66 -16.319 -4 ,18206 ,KEBNE ,17040818,Thu Dec 23 01:50:20 CET,Thu Dec 23 03:11:48 CET,0.0 0.568 0.81 1.036 1.226 1.376 1.486 1.578 1.746 1.826 1.907 1.953 2.118 2.188 2.311 2.428 2.53 2.577 2.671 2.762 2.901 2.997 3.08 3.186 3.295 3.39 3.476 3.57 3.7 3.806 3.888 3.988 4.093 4.2 4.323 4.449 4.568 4.701 4.833 4.962 5.093 5.237 5.382 5.507 5.632 5.744 5.825 5.785 5.646 5.353 4.524 3.324 2.286 1.343 0.478 -0.338 -1.057 -1.703 -2.251 -2.799 -3.269 -3.689 -4.103 -4.517 -4.913 -5.271 -5.65 -6.001 -6.294 -6.591 -6.9 -7.144 -7.397 -7.651 -7.845 -8.064 -8.297 -8.52 -8.761 -8.94 -9.123 -9.405 -9.599 -9.795 -9.895 -10.104 -10.343 -10.603 -10.729 -10.96 -11.112 -11.255 -11.414 -11.793 -11.992 -12.205 -12.456 -12.756 -13.081 -13.527 -14.648 -5 ,32656 ,KEBNE ,17040819,Thu Dec 23 01:50:20 CET,Thu Dec 23 03:11:25 CET,0.0 0.628 0.867 1.028 1.139 1.241 1.351 1.458 1.646 1.733 1.823 1.879 2.043 2.106 2.225 2.341 2.45 2.506 2.618 2.712 2.849 2.942 3.021 3.119 3.23 3.341 3.432 3.517 3.623 3.721 3.823 3.956 4.068 4.179 4.304 4.444 4.588 4.725 4.86 4.995 5.127 5.262 5.401 5.522 5.651 5.747 5.808 5.835 5.751 5.445 4.717 3.696 2.737 1.868 1.121 0.417 -0.254 -0.892 -1.444 -1.985 -2.472 -2.895 -3.309 -3.728 -4.128 -4.501 -4.877 -5.211 -5.504 -5.807 -6.123 -6.389 -6.681 -6.997 -7.242 -7.491 -7.734 -7.985 -8.246 -8.429 -8.605 -8.858 -9.035 -9.228 -9.326 -9.52 -9.718 -9.938 -10.065 -10.305 -10.496 -10.656 -10.812 -11.165 -11.363 -11.571 -11.825 -12.108 -12.415 -12.837 -14.167 -6 ,29292 ,KEBNE ,17040820,Thu Dec 23 01:50:20 CET,Thu Dec 23 03:11:50 CET,0.0 0.57 0.788 0.954 1.108 1.235 1.342 1.442 1.627 1.722 1.812 1.863 2.031 2.104 2.236 2.355 2.463 2.514 2.609 2.695 2.817 2.901 2.977 3.086 3.193 3.281 3.37 3.463 3.579 3.681 3.784 3.909 4.017 4.123 4.233 4.349 4.469 4.605 4.761 4.905 5.032 5.163 5.32 5.452 5.561 5.669 5.746 5.74 5.613 5.337 4.681 3.589 2.529 1.588 0.726 -0.069 -0.755 -1.414 -2.028 -2.634 -3.125 -3.544 -3.939 -4.337 -4.739 -5.093 -5.46 -5.783 -6.043 -6.319 -6.623 -6.891 -7.178 -7.473 -7.702 -7.941 -8.191 -8.455 -8.724 -8.901 -9.072 -9.324 -9.507 -9.696 -9.792 -10.001 -10.224 -10.458 -10.581 -10.825 -11.007 -11.16 -11.325 -11.689 -11.878 -12.077 -12.327 -12.631 -12.964 -13.385 -14.675 -7 ,28350 ,KEBNE ,17040821,Thu Dec 23 01:50:21 CET,Thu Dec 23 03:11:38 CET,0.0 0.314 0.486 0.614 0.761 0.918 1.034 1.122 1.283 1.359 1.436 1.478 1.642 1.71 1.832 1.94 2.044 2.1 2.202 2.288 2.408 2.492 2.57 2.676 2.782 2.876 2.964 3.056 3.167 3.269 3.365 3.474 3.584 3.675 3.774 3.892 3.997 4.114 4.238 4.36 4.494 4.649 4.79 4.905 5.017 5.137 5.272 5.348 5.273 4.944 4.075 2.868 1.832 0.831 -0.096 -0.951 -1.694 -2.335 -2.903 -3.513 -4.063 -4.541 -4.976 -5.379 -5.767 -6.12 -6.504 -6.849 -7.137 -7.452 -7.795 -8.077 -8.351 -8.631 -8.855 -9.098 -9.336 -9.578 -9.832 -10.001 -10.19 -10.491 -10.697 -10.92 -11.041 -11.297 -11.552 -11.807 -11.947 -12.208 -12.426 -12.598 -12.778 -13.161 -13.377 -13.627 -13.905 -14.228 -14.619 -15.122 -16.437 -8 ,6669 ,KEBNE ,17040822,Thu Dec 23 01:53:27 CET,Thu Dec 23 03:14:39 CET,0.0 0.241 0.395 0.505 0.597 0.698 0.799 0.886 1.056 1.139 1.213 1.251 1.415 1.483 1.598 1.718 1.83 1.878 1.963 2.041 2.162 2.24 2.322 2.441 2.553 2.653 2.746 2.841 2.955 3.063 3.161 3.287 3.41 3.513 3.629 3.752 3.868 3.999 4.138 4.275 4.4 4.519 4.616 4.704 4.805 4.902 4.962 4.972 4.91 4.603 3.816 2.643 1.52 0.505 -0.357 -1.17 -1.892 -2.56 -3.161 -3.752 -4.26 -4.709 -5.136 -5.555 -5.934 -6.275 -6.661 -7.003 -7.298 -7.615 -7.943 -8.205 -8.494 -8.796 -9.018 -9.254 -9.511 -9.788 -10.072 -10.268 -10.464 -10.755 -10.959 -11.172 -11.287 -11.531 -11.773 -12.03 -12.164 -12.398 -12.56 -12.726 -12.912 -13.348 -13.585 -13.825 -14.091 -14.392 -14.71 -15.098 -16.213 -9 ,1846 ,KEBNE ,17040823,Thu Dec 23 01:53:27 CET,Thu Dec 23 03:16:47 CET,0.0 0.415 0.617 0.797 0.965 1.087 1.179 1.28 1.476 1.569 1.663 1.72 1.887 1.956 2.089 2.217 2.339 2.388 2.475 2.575 2.716 2.798 2.877 2.986 3.098 3.197 3.289 3.389 3.498 3.588 3.679 3.79 3.903 4.026 4.149 4.29 4.435 4.568 4.69 4.816 4.952 5.108 5.266 5.382 5.486 5.576 5.611 5.566 5.436 5.145 4.398 3.262 2.23 1.28 0.416 -0.366 -1.043 -1.674 -2.241 -2.815 -3.309 -3.761 -4.192 -4.606 -5.006 -5.373 -5.769 -6.119 -6.437 -6.777 -7.115 -7.383 -7.659 -7.962 -8.2 -8.44 -8.691 -8.95 -9.218 -9.401 -9.595 -9.903 -10.125 -10.365 -10.485 -10.731 -10.986 -11.258 -11.405 -11.653 -11.814 -11.97 -12.132 -12.464 -12.683 -12.932 -13.156 -13.413 -13.763 -14.2 -15.524 -10 ,1422 ,KEBNE ,17040824,Thu Dec 23 01:53:31 CET,Thu Dec 23 03:11:55 CET,0.0 0.214 0.339 0.448 0.541 0.622 0.699 0.778 0.92 0.986 1.05 1.08 1.246 1.315 1.431 1.542 1.647 1.704 1.809 1.896 2.022 2.102 2.172 2.253 2.343 2.444 2.541 2.626 2.728 2.834 2.938 3.069 3.189 3.291 3.404 3.53 3.653 3.777 3.901 4.016 4.12 4.246 4.395 4.535 4.673 4.764 4.792 4.767 4.658 4.328 3.574 2.383 1.245 0.233 -0.645 -1.441 -2.18 -2.836 -3.398 -3.973 -4.482 -4.936 -5.362 -5.776 -6.179 -6.561 -6.947 -7.283 -7.565 -7.866 -8.196 -8.468 -8.745 -9.029 -9.251 -9.483 -9.749 -10.024 -10.272 -10.451 -10.654 -10.958 -11.165 -11.383 -11.496 -11.746 -12.018 -12.317 -12.463 -12.7 -12.852 -12.991 -13.147 -13.509 -13.695 -13.888 -14.086 -14.329 -14.647 -15.05 -16.289 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt deleted file mode 100644 index 53e57bd5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10250 ,KEBNE ,17040825,Thu Dec 23 01:53:31 CET,Thu Dec 23 03:13:35 CET,0.0 0.917 1.152 1.33 1.495 1.662 1.817 1.943 2.138 2.219 2.309 2.401 2.573 2.653 2.809 2.955 3.098 3.162 3.289 3.414 3.59 3.701 3.806 3.951 4.094 4.241 4.374 4.497 4.656 4.805 4.95 5.13 5.301 5.464 5.642 5.84 6.039 6.245 6.456 6.667 6.881 7.104 7.345 7.59 7.86 8.145 8.45 8.716 8.894 8.919 8.625 7.924 7.155 6.412 5.738 5.12 4.582 4.078 3.621 3.166 2.768 2.398 2.052 1.709 1.381 1.089 0.775 0.486 0.234 -0.01 -0.276 -0.506 -0.733 -0.979 -1.176 -1.371 -1.572 -1.783 -2.025 -2.195 -2.362 -2.623 -2.796 -2.98 -3.077 -3.27 -3.457 -3.654 -3.769 -3.992 -4.167 -4.313 -4.455 -4.786 -4.982 -5.181 -5.404 -5.68 -6.003 -6.332 -7.336 -2 ,4842 ,KEBNE ,17040826,Thu Dec 23 01:53:31 CET,Thu Dec 23 03:12:07 CET,0.0 0.564 0.896 1.177 1.384 1.548 1.667 1.773 1.965 2.062 2.165 2.261 2.439 2.516 2.663 2.805 2.947 3.012 3.146 3.278 3.458 3.559 3.659 3.811 3.947 4.081 4.22 4.342 4.489 4.636 4.774 4.939 5.094 5.24 5.411 5.614 5.8 5.983 6.186 6.395 6.608 6.858 7.14 7.415 7.697 7.977 8.275 8.547 8.752 8.768 8.494 7.91 7.207 6.527 5.925 5.335 4.784 4.301 3.875 3.399 2.96 2.555 2.131 1.74 1.391 1.058 0.735 0.469 0.216 -0.081 -0.391 -0.641 -0.89 -1.131 -1.312 -1.519 -1.733 -1.941 -2.155 -2.299 -2.472 -2.767 -2.963 -3.163 -3.268 -3.481 -3.706 -3.938 -4.043 -4.253 -4.388 -4.513 -4.65 -4.934 -5.072 -5.232 -5.414 -5.607 -5.853 -6.208 -7.077 -3 ,4025 ,KEBNE ,17040827,Thu Dec 23 01:54:30 CET,Thu Dec 23 03:16:01 CET,0.0 0.415 0.67 0.882 1.052 1.204 1.343 1.458 1.663 1.764 1.861 1.945 2.128 2.21 2.356 2.482 2.617 2.691 2.821 2.936 3.105 3.214 3.316 3.47 3.618 3.755 3.895 4.023 4.184 4.346 4.481 4.63 4.783 4.942 5.112 5.297 5.485 5.691 5.912 6.144 6.371 6.604 6.855 7.102 7.389 7.688 7.967 8.218 8.387 8.407 8.182 7.532 6.843 6.218 5.627 5.013 4.452 3.953 3.518 3.076 2.662 2.286 1.946 1.633 1.334 1.051 0.752 0.481 0.243 -0.008 -0.27 -0.491 -0.718 -0.946 -1.13 -1.328 -1.532 -1.744 -1.968 -2.124 -2.289 -2.538 -2.71 -2.881 -2.963 -3.131 -3.301 -3.472 -3.559 -3.753 -3.865 -3.986 -4.11 -4.388 -4.54 -4.705 -4.898 -5.12 -5.357 -5.627 -6.351 -4 ,6818 ,KEBNE ,17040828,Thu Dec 23 01:54:30 CET,Thu Dec 23 03:16:07 CET,0.0 0.362 0.585 0.766 0.896 1.004 1.093 1.17 1.315 1.389 1.465 1.504 1.67 1.734 1.847 1.957 2.065 2.118 2.214 2.301 2.437 2.527 2.611 2.742 2.874 3.008 3.14 3.26 3.412 3.553 3.697 3.873 4.038 4.197 4.37 4.574 4.762 4.945 5.153 5.369 5.582 5.804 6.042 6.278 6.531 6.773 6.996 7.209 7.412 7.497 7.304 6.629 5.802 5.023 4.368 3.787 3.224 2.702 2.258 1.799 1.39 1.032 0.681 0.335 0.008 -0.294 -0.615 -0.898 -1.143 -1.405 -1.671 -1.885 -2.117 -2.376 -2.577 -2.779 -2.98 -3.189 -3.408 -3.554 -3.706 -3.982 -4.194 -4.405 -4.503 -4.707 -4.93 -5.167 -5.281 -5.491 -5.644 -5.777 -5.906 -6.163 -6.309 -6.463 -6.621 -6.81 -7.027 -7.316 -7.969 -5 ,20978 ,KEBNE ,17040829,Thu Dec 23 01:54:30 CET,Thu Dec 23 03:16:06 CET,0.0 0.588 0.864 1.056 1.193 1.329 1.469 1.592 1.799 1.901 2.001 2.087 2.263 2.341 2.507 2.665 2.798 2.859 2.987 3.117 3.288 3.387 3.481 3.621 3.761 3.906 4.055 4.193 4.351 4.495 4.647 4.837 5.006 5.174 5.37 5.57 5.754 5.951 6.153 6.361 6.591 6.848 7.119 7.378 7.646 7.901 8.162 8.384 8.564 8.606 8.336 7.707 6.985 6.324 5.68 5.105 4.607 4.113 3.681 3.192 2.719 2.308 1.927 1.594 1.28 0.959 0.63 0.332 0.058 -0.21 -0.46 -0.673 -0.914 -1.181 -1.394 -1.61 -1.805 -1.99 -2.189 -2.323 -2.466 -2.724 -2.916 -3.123 -3.227 -3.434 -3.671 -3.922 -4.05 -4.279 -4.409 -4.535 -4.672 -4.998 -5.176 -5.345 -5.53 -5.765 -6.03 -6.322 -7.219 -6 ,10719 ,KEBNE ,17040830,Thu Dec 23 01:54:34 CET,Thu Dec 23 03:13:01 CET,0.0 0.673 1.006 1.248 1.441 1.617 1.774 1.903 2.136 2.252 2.357 2.436 2.621 2.699 2.854 3.006 3.133 3.195 3.323 3.438 3.605 3.704 3.799 3.947 4.088 4.225 4.357 4.477 4.63 4.775 4.911 5.078 5.244 5.403 5.581 5.752 5.911 6.102 6.303 6.522 6.753 7.007 7.291 7.539 7.775 8.02 8.289 8.547 8.764 8.913 8.754 8.075 7.355 6.659 6.018 5.428 4.877 4.359 3.906 3.446 3.054 2.689 2.318 1.964 1.642 1.35 1.037 0.752 0.507 0.263 0.011 -0.201 -0.42 -0.656 -0.853 -1.067 -1.299 -1.538 -1.772 -1.933 -2.109 -2.377 -2.566 -2.754 -2.838 -3.019 -3.223 -3.456 -3.582 -3.821 -4.004 -4.139 -4.265 -4.527 -4.661 -4.815 -5.006 -5.197 -5.431 -5.764 -6.597 -7 ,21079 ,KEBNE ,17040831,Thu Dec 23 01:54:34 CET,Thu Dec 23 03:12:05 CET,0.0 0.711 1.008 1.197 1.364 1.509 1.637 1.775 2.031 2.135 2.233 2.315 2.491 2.568 2.725 2.889 3.031 3.091 3.211 3.331 3.499 3.6 3.706 3.873 4.018 4.153 4.288 4.423 4.601 4.761 4.91 5.087 5.258 5.414 5.575 5.753 5.934 6.132 6.341 6.563 6.796 7.029 7.283 7.529 7.757 7.982 8.248 8.514 8.737 8.851 8.665 8.062 7.385 6.758 6.135 5.506 4.955 4.464 4.025 3.557 3.141 2.764 2.419 2.084 1.772 1.497 1.19 0.908 0.665 0.406 0.134 -0.102 -0.35 -0.597 -0.784 -0.964 -1.153 -1.362 -1.578 -1.73 -1.896 -2.162 -2.333 -2.5 -2.588 -2.776 -2.984 -3.2 -3.314 -3.534 -3.683 -3.822 -3.967 -4.26 -4.422 -4.613 -4.827 -5.082 -5.394 -5.782 -6.717 -8 ,20646 ,KEBNE ,17040832,Thu Dec 23 01:54:30 CET,Thu Dec 23 03:16:06 CET,0.0 0.889 1.272 1.484 1.623 1.78 1.947 2.077 2.324 2.438 2.533 2.616 2.801 2.886 3.038 3.179 3.314 3.38 3.511 3.636 3.818 3.933 4.041 4.188 4.321 4.454 4.577 4.699 4.862 5.015 5.161 5.342 5.51 5.662 5.841 6.029 6.201 6.384 6.581 6.776 6.981 7.228 7.507 7.748 7.968 8.209 8.449 8.687 8.881 8.946 8.789 8.259 7.617 6.922 6.278 5.674 5.08 4.51 3.985 3.443 3.023 2.631 2.213 1.851 1.549 1.271 0.968 0.685 0.428 0.163 -0.103 -0.328 -0.572 -0.809 -0.987 -1.19 -1.41 -1.605 -1.784 -1.922 -2.078 -2.33 -2.498 -2.669 -2.763 -2.966 -3.177 -3.406 -3.531 -3.759 -3.898 -4.03 -4.17 -4.466 -4.629 -4.784 -4.962 -5.184 -5.422 -5.761 -6.577 -9 ,10308 ,KEBNE ,17040833,Thu Dec 23 01:54:29 CET,Thu Dec 23 03:15:50 CET,0.0 0.661 0.913 1.103 1.243 1.386 1.544 1.682 1.899 1.988 2.082 2.18 2.367 2.45 2.602 2.745 2.878 2.939 3.061 3.182 3.35 3.462 3.577 3.719 3.845 3.977 4.111 4.239 4.408 4.557 4.69 4.859 5.021 5.181 5.355 5.537 5.718 5.926 6.144 6.364 6.578 6.813 7.075 7.314 7.589 7.868 8.128 8.377 8.609 8.681 8.418 7.835 7.204 6.521 5.864 5.29 4.783 4.289 3.844 3.378 2.98 2.63 2.283 1.954 1.657 1.387 1.1 0.848 0.621 0.365 0.08 -0.152 -0.387 -0.637 -0.834 -1.035 -1.243 -1.466 -1.708 -1.875 -2.048 -2.313 -2.5 -2.698 -2.803 -3.026 -3.241 -3.471 -3.6 -3.83 -4.001 -4.158 -4.326 -4.648 -4.805 -4.981 -5.174 -5.393 -5.67 -6.014 -6.76 -10 ,28815 ,KEBNE ,17040834,Thu Dec 23 01:54:30 CET,Thu Dec 23 03:15:51 CET,0.0 0.43 0.656 0.877 1.09 1.253 1.4 1.532 1.759 1.858 1.961 2.059 2.233 2.305 2.455 2.603 2.743 2.812 2.942 3.057 3.231 3.349 3.448 3.588 3.732 3.871 3.989 4.104 4.266 4.411 4.553 4.727 4.886 5.039 5.205 5.385 5.567 5.765 5.97 6.18 6.395 6.615 6.848 7.08 7.337 7.606 7.867 8.089 8.261 8.313 8.043 7.423 6.72 6.023 5.354 4.703 4.134 3.614 3.158 2.687 2.279 1.919 1.577 1.258 0.955 0.665 0.363 0.098 -0.132 -0.377 -0.63 -0.836 -1.051 -1.268 -1.433 -1.611 -1.801 -1.998 -2.201 -2.339 -2.48 -2.701 -2.854 -3.007 -3.084 -3.248 -3.417 -3.6 -3.707 -3.932 -4.083 -4.21 -4.329 -4.586 -4.72 -4.877 -5.061 -5.28 -5.547 -5.888 -6.696 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 4ebc5bbe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4847 ,KEBNE ,17040835,Thu Dec 23 01:54:30 CET,Thu Dec 23 03:15:27 CET,0.0 0.556 0.788 0.982 1.123 1.229 1.341 1.447 1.63 1.723 1.807 1.861 2.028 2.09 2.201 2.296 2.399 2.452 2.543 2.623 2.753 2.841 2.929 3.055 3.17 3.275 3.376 3.476 3.597 3.701 3.81 3.946 4.07 4.193 4.323 4.456 4.575 4.702 4.831 4.973 5.14 5.314 5.474 5.621 5.787 5.926 6.064 6.159 6.142 6.003 5.513 4.579 3.659 2.824 2.052 1.357 0.743 0.185 -0.292 -0.778 -1.213 -1.605 -1.968 -2.327 -2.674 -2.974 -3.281 -3.581 -3.849 -4.125 -4.408 -4.639 -4.883 -5.129 -5.309 -5.488 -5.673 -5.873 -6.09 -6.241 -6.395 -6.629 -6.787 -6.942 -7.03 -7.246 -7.46 -7.663 -7.776 -8.005 -8.136 -8.269 -8.411 -8.683 -8.826 -9.007 -9.215 -9.439 -9.702 -10.061 -10.883 -2 ,20374 ,KEBNE ,17040836,Thu Dec 23 01:54:30 CET,Thu Dec 23 03:15:33 CET,0.0 0.389 0.558 0.707 0.842 0.969 1.08 1.186 1.372 1.448 1.521 1.562 1.737 1.806 1.927 2.038 2.141 2.192 2.287 2.374 2.493 2.571 2.644 2.742 2.843 2.947 3.046 3.131 3.245 3.353 3.458 3.587 3.704 3.811 3.926 4.052 4.177 4.321 4.469 4.609 4.742 4.875 5.02 5.161 5.311 5.442 5.561 5.628 5.554 5.321 4.758 3.849 2.961 2.126 1.382 0.7 0.08 -0.496 -1.006 -1.525 -1.969 -2.358 -2.74 -3.114 -3.443 -3.746 -4.082 -4.377 -4.614 -4.853 -5.111 -5.324 -5.538 -5.767 -5.948 -6.127 -6.304 -6.501 -6.722 -6.873 -7.025 -7.255 -7.428 -7.608 -7.69 -7.867 -8.056 -8.249 -8.357 -8.574 -8.695 -8.823 -8.964 -9.264 -9.425 -9.618 -9.811 -10.01 -10.267 -10.586 -11.201 -3 ,7090 ,KEBNE ,17040837,Thu Dec 23 01:54:30 CET,Thu Dec 23 03:15:27 CET,0.0 0.533 0.738 0.888 1.011 1.124 1.237 1.355 1.556 1.644 1.729 1.768 1.929 1.996 2.131 2.249 2.356 2.409 2.516 2.609 2.728 2.808 2.889 2.999 3.099 3.192 3.292 3.391 3.5 3.599 3.696 3.823 3.944 4.061 4.202 4.355 4.483 4.603 4.728 4.865 5.002 5.145 5.296 5.421 5.524 5.632 5.751 5.817 5.795 5.628 5.092 4.143 3.232 2.396 1.643 0.949 0.364 -0.177 -0.661 -1.156 -1.596 -2.011 -2.412 -2.771 -3.112 -3.431 -3.757 -4.051 -4.308 -4.591 -4.886 -5.125 -5.384 -5.656 -5.868 -6.079 -6.294 -6.525 -6.765 -6.929 -7.101 -7.344 -7.516 -7.718 -7.819 -8.03 -8.265 -8.515 -8.639 -8.885 -9.075 -9.211 -9.347 -9.65 -9.81 -9.966 -10.134 -10.344 -10.594 -10.974 -11.963 -4 ,313 ,KEBNE ,17040838,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:16:38 CET,0.0 0.544 0.843 1.053 1.187 1.298 1.412 1.523 1.724 1.811 1.89 1.932 2.103 2.175 2.306 2.417 2.523 2.575 2.676 2.772 2.898 2.977 3.062 3.188 3.294 3.385 3.477 3.563 3.665 3.765 3.859 3.976 4.09 4.204 4.329 4.461 4.591 4.742 4.912 5.085 5.244 5.41 5.601 5.764 5.919 6.043 6.152 6.234 6.225 6.031 5.461 4.596 3.735 2.921 2.181 1.502 0.908 0.348 -0.148 -0.621 -1.033 -1.442 -1.829 -2.178 -2.526 -2.836 -3.163 -3.462 -3.717 -3.986 -4.264 -4.498 -4.734 -4.967 -5.145 -5.34 -5.544 -5.74 -5.949 -6.091 -6.234 -6.469 -6.638 -6.81 -6.894 -7.072 -7.284 -7.495 -7.594 -7.808 -7.941 -8.074 -8.214 -8.525 -8.695 -8.875 -9.064 -9.27 -9.513 -9.797 -10.536 -5 ,27829 ,KEBNE ,17040839,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:16:24 CET,0.0 0.534 0.758 0.92 1.046 1.184 1.328 1.432 1.581 1.658 1.736 1.778 1.941 2.006 2.116 2.215 2.318 2.369 2.464 2.554 2.695 2.786 2.868 2.976 3.082 3.189 3.296 3.396 3.506 3.615 3.728 3.861 3.983 4.09 4.206 4.342 4.475 4.606 4.74 4.888 5.036 5.174 5.318 5.474 5.64 5.767 5.876 5.961 5.967 5.825 5.303 4.375 3.499 2.713 1.979 1.264 0.621 0.052 -0.444 -0.946 -1.38 -1.785 -2.177 -2.533 -2.854 -3.149 -3.472 -3.768 -4.018 -4.288 -4.583 -4.827 -5.076 -5.335 -5.539 -5.74 -5.943 -6.151 -6.372 -6.537 -6.698 -6.96 -7.134 -7.293 -7.376 -7.552 -7.756 -7.982 -8.091 -8.317 -8.459 -8.59 -8.726 -9.019 -9.186 -9.356 -9.533 -9.738 -9.984 -10.32 -11.09 -6 ,3668 ,KEBNE ,17040840,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:16:18 CET,0.0 0.486 0.696 0.876 1.022 1.154 1.281 1.388 1.566 1.641 1.721 1.799 1.977 2.047 2.176 2.282 2.38 2.431 2.53 2.624 2.748 2.829 2.917 3.045 3.146 3.235 3.326 3.427 3.556 3.663 3.766 3.885 3.997 4.102 4.212 4.335 4.455 4.598 4.749 4.885 5.018 5.156 5.301 5.426 5.555 5.709 5.844 5.935 5.954 5.781 5.223 4.329 3.461 2.652 1.928 1.294 0.693 0.118 -0.369 -0.872 -1.313 -1.701 -2.064 -2.42 -2.769 -3.088 -3.417 -3.705 -3.956 -4.237 -4.532 -4.77 -5.012 -5.259 -5.451 -5.647 -5.851 -6.073 -6.302 -6.455 -6.616 -6.865 -7.037 -7.202 -7.288 -7.486 -7.686 -7.901 -8.013 -8.23 -8.355 -8.47 -8.602 -8.921 -9.097 -9.276 -9.446 -9.666 -9.926 -10.22 -11.09 -7 ,24939 ,KEBNE ,17040841,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:16:51 CET,0.0 0.235 0.379 0.469 0.556 0.637 0.704 0.774 0.905 0.965 1.016 1.008 1.156 1.204 1.297 1.374 1.447 1.485 1.56 1.635 1.75 1.823 1.906 2.031 2.139 2.248 2.355 2.457 2.589 2.717 2.836 2.971 3.09 3.205 3.331 3.454 3.573 3.717 3.861 3.989 4.129 4.292 4.453 4.592 4.731 4.837 4.935 5.015 4.99 4.792 4.196 3.212 2.29 1.45 0.665 -0.052 -0.653 -1.195 -1.676 -2.167 -2.6 -2.989 -3.355 -3.71 -4.042 -4.36 -4.692 -4.983 -5.233 -5.486 -5.759 -5.994 -6.245 -6.501 -6.695 -6.898 -7.115 -7.342 -7.573 -7.734 -7.906 -8.157 -8.325 -8.516 -8.619 -8.84 -9.062 -9.274 -9.387 -9.621 -9.781 -9.93 -10.083 -10.393 -10.557 -10.72 -10.901 -11.103 -11.366 -11.716 -12.479 -8 ,722 ,KEBNE ,17040842,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:16:42 CET,0.0 0.244 0.393 0.532 0.653 0.763 0.866 0.969 1.151 1.227 1.308 1.354 1.509 1.561 1.669 1.782 1.896 1.952 2.053 2.148 2.292 2.381 2.464 2.597 2.715 2.818 2.926 3.023 3.14 3.257 3.365 3.495 3.622 3.734 3.865 4.005 4.13 4.265 4.402 4.562 4.74 4.894 5.034 5.178 5.323 5.44 5.53 5.579 5.557 5.369 4.758 3.726 2.752 1.914 1.194 0.531 -0.051 -0.606 -1.116 -1.63 -2.073 -2.458 -2.827 -3.193 -3.538 -3.845 -4.17 -4.466 -4.716 -4.979 -5.259 -5.491 -5.733 -5.988 -6.186 -6.389 -6.596 -6.799 -7.007 -7.156 -7.307 -7.542 -7.723 -7.903 -7.988 -8.183 -8.383 -8.58 -8.685 -8.907 -9.047 -9.166 -9.291 -9.607 -9.779 -9.964 -10.176 -10.398 -10.643 -10.932 -12.063 -9 ,17676 ,KEBNE ,17040843,Thu Dec 23 01:55:37 CET,Thu Dec 23 03:14:47 CET,0.0 0.766 1.005 1.186 1.338 1.451 1.553 1.661 1.854 1.938 2.008 2.037 2.201 2.264 2.373 2.482 2.592 2.645 2.745 2.836 2.963 3.046 3.127 3.244 3.361 3.47 3.57 3.666 3.796 3.92 4.03 4.147 4.252 4.356 4.48 4.622 4.754 4.888 5.034 5.196 5.351 5.516 5.686 5.832 5.978 6.096 6.184 6.222 6.162 5.955 5.399 4.551 3.674 2.764 1.948 1.248 0.657 0.112 -0.354 -0.837 -1.271 -1.668 -2.053 -2.407 -2.743 -3.069 -3.403 -3.686 -3.923 -4.176 -4.44 -4.667 -4.912 -5.162 -5.368 -5.59 -5.819 -6.06 -6.298 -6.455 -6.624 -6.896 -7.076 -7.272 -7.373 -7.574 -7.791 -8.012 -8.129 -8.366 -8.52 -8.658 -8.804 -9.096 -9.254 -9.408 -9.588 -9.833 -10.114 -10.425 -11.388 -10 ,5834 ,KEBNE ,17040844,Thu Dec 23 01:55:32 CET,Thu Dec 23 03:16:25 CET,0.0 0.409 0.628 0.745 0.849 0.963 1.058 1.151 1.326 1.399 1.467 1.501 1.663 1.723 1.847 1.976 2.084 2.136 2.237 2.333 2.481 2.567 2.65 2.771 2.88 2.988 3.089 3.188 3.313 3.429 3.541 3.672 3.796 3.913 4.046 4.191 4.319 4.452 4.603 4.754 4.88 5.006 5.167 5.325 5.476 5.603 5.685 5.714 5.637 5.39 4.723 3.752 2.862 1.999 1.247 0.592 -0.006 -0.565 -1.059 -1.546 -1.984 -2.378 -2.752 -3.112 -3.441 -3.747 -4.073 -4.355 -4.601 -4.855 -5.118 -5.353 -5.594 -5.833 -6.028 -6.232 -6.441 -6.659 -6.886 -7.042 -7.21 -7.472 -7.648 -7.838 -7.932 -8.11 -8.301 -8.513 -8.623 -8.845 -8.964 -9.08 -9.215 -9.539 -9.703 -9.867 -10.058 -10.284 -10.537 -10.861 -11.72 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 36d36ddf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19286 ,KEBNE ,17040845,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:16:53 CET,0.0 0.823 1.096 1.27 1.414 1.544 1.658 1.768 1.979 2.071 2.153 2.205 2.37 2.434 2.559 2.679 2.792 2.842 2.936 3.024 3.131 3.195 3.261 3.363 3.462 3.548 3.622 3.687 3.775 3.865 3.95 4.057 4.149 4.224 4.296 4.366 4.425 4.482 4.521 4.544 4.567 4.564 4.538 4.474 4.335 4.118 3.773 3.269 2.536 1.359 -0.755 -3.31 -5.418 -7.177 -8.605 -9.871 -11.009 -12.027 -12.892 -13.741 -14.455 -15.086 -15.682 -16.233 -16.739 -17.205 -17.687 -18.104 -18.461 -18.837 -19.234 -19.554 -19.882 -20.232 -20.493 -20.753 -21.025 -21.313 -21.625 -21.834 -22.05 -22.383 -22.606 -22.842 -22.961 -23.209 -23.46 -23.714 -23.851 -24.131 -24.333 -24.496 -24.663 -25.057 -25.284 -25.517 -25.766 -26.066 -26.427 -26.875 -28.046 -2 ,29375 ,KEBNE ,17040846,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:17:08 CET,0.0 0.406 0.573 0.701 0.808 0.92 1.017 1.087 1.219 1.283 1.342 1.354 1.508 1.557 1.65 1.734 1.817 1.86 1.931 1.998 2.108 2.176 2.243 2.34 2.428 2.51 2.589 2.663 2.75 2.843 2.936 3.028 3.104 3.17 3.24 3.316 3.393 3.463 3.504 3.534 3.556 3.564 3.532 3.454 3.344 3.186 2.914 2.47 1.719 0.522 -1.51 -3.98 -6.007 -7.742 -9.271 -10.623 -11.754 -12.76 -13.632 -14.496 -15.226 -15.871 -16.457 -16.988 -17.49 -17.949 -18.411 -18.813 -19.155 -19.505 -19.876 -20.179 -20.469 -20.779 -21.026 -21.277 -21.537 -21.802 -22.079 -22.257 -22.447 -22.755 -22.959 -23.173 -23.287 -23.52 -23.747 -24.019 -24.174 -24.447 -24.64 -24.808 -24.972 -25.344 -25.569 -25.822 -26.084 -26.351 -26.639 -27.006 -28.041 -3 ,21603 ,KEBNE ,17040847,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:17:03 CET,0.0 0.419 0.603 0.764 0.907 1.041 1.174 1.294 1.493 1.592 1.692 1.771 1.955 2.032 2.167 2.288 2.397 2.451 2.565 2.677 2.821 2.903 2.983 3.09 3.174 3.255 3.338 3.419 3.515 3.6 3.68 3.765 3.841 3.918 4.009 4.086 4.131 4.178 4.216 4.247 4.266 4.264 4.25 4.185 4.052 3.861 3.576 3.121 2.371 1.173 -0.922 -3.509 -5.693 -7.494 -8.978 -10.297 -11.439 -12.43 -13.282 -14.127 -14.847 -15.488 -16.077 -16.624 -17.137 -17.593 -18.063 -18.483 -18.839 -19.213 -19.604 -19.913 -20.22 -20.543 -20.807 -21.082 -21.365 -21.659 -21.955 -22.15 -22.351 -22.659 -22.873 -23.097 -23.211 -23.452 -23.693 -23.936 -24.057 -24.314 -24.478 -24.627 -24.778 -25.119 -25.304 -25.498 -25.714 -25.932 -26.169 -26.497 -27.44 -4 ,17765 ,KEBNE ,17040848,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:16:53 CET,0.0 0.5 0.656 0.784 0.899 1.001 1.088 1.167 1.305 1.369 1.433 1.474 1.654 1.723 1.843 1.956 2.077 2.131 2.229 2.33 2.462 2.556 2.64 2.742 2.844 2.942 3.043 3.135 3.23 3.311 3.394 3.491 3.573 3.654 3.741 3.82 3.878 3.928 3.981 4.024 4.044 4.059 4.057 4.018 3.941 3.759 3.452 3.055 2.356 1.062 -1.139 -3.676 -5.758 -7.535 -9.049 -10.407 -11.593 -12.641 -13.521 -14.37 -15.075 -15.696 -16.297 -16.87 -17.385 -17.848 -18.332 -18.759 -19.124 -19.5 -19.88 -20.183 -20.502 -20.848 -21.124 -21.399 -21.677 -21.974 -22.284 -22.488 -22.684 -22.997 -23.228 -23.474 -23.595 -23.841 -24.097 -24.36 -24.49 -24.755 -24.922 -25.074 -25.236 -25.581 -25.762 -25.946 -26.147 -26.381 -26.663 -26.995 -27.806 -5 ,10690 ,KEBNE ,17040849,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:16:48 CET,0.0 0.346 0.562 0.729 0.851 0.945 1.042 1.151 1.362 1.459 1.545 1.604 1.783 1.866 2.013 2.129 2.242 2.295 2.388 2.466 2.572 2.647 2.724 2.833 2.93 3.028 3.128 3.215 3.316 3.409 3.505 3.62 3.702 3.773 3.854 3.919 3.972 4.029 4.081 4.113 4.126 4.133 4.105 4.024 3.889 3.687 3.368 2.899 2.124 0.892 -1.205 -3.735 -5.838 -7.596 -9.094 -10.414 -11.53 -12.526 -13.369 -14.211 -14.926 -15.551 -16.143 -16.689 -17.218 -17.707 -18.198 -18.644 -19.018 -19.388 -19.786 -20.116 -20.443 -20.781 -21.047 -21.312 -21.568 -21.828 -22.095 -22.275 -22.457 -22.741 -22.942 -23.161 -23.272 -23.494 -23.725 -23.979 -24.117 -24.387 -24.55 -24.707 -24.867 -25.192 -25.359 -25.534 -25.748 -26.022 -26.293 -26.651 -27.757 -6 ,18956 ,KEBNE ,17040851,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:17:15 CET,0.0 0.267 0.471 0.648 0.804 0.956 1.076 1.2 1.429 1.535 1.633 1.689 1.862 1.924 2.028 2.126 2.227 2.277 2.379 2.472 2.581 2.658 2.739 2.842 2.938 3.041 3.147 3.243 3.359 3.462 3.561 3.673 3.761 3.823 3.885 3.966 4.052 4.141 4.204 4.229 4.242 4.241 4.196 4.116 3.982 3.777 3.457 2.961 2.18 0.925 -1.251 -3.807 -5.881 -7.637 -9.142 -10.493 -11.689 -12.756 -13.643 -14.514 -15.265 -15.927 -16.554 -17.152 -17.69 -18.159 -18.643 -19.059 -19.405 -19.771 -20.16 -20.471 -20.786 -21.122 -21.386 -21.657 -21.947 -22.239 -22.523 -22.721 -22.926 -23.259 -23.494 -23.74 -23.871 -24.14 -24.409 -24.682 -24.818 -25.085 -25.269 -25.446 -25.62 -25.998 -26.21 -26.423 -26.666 -26.957 -27.315 -27.775 -29.199 -7 ,10110 ,KEBNE ,17040852,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:17:13 CET,0.0 0.407 0.547 0.651 0.772 0.897 1.016 1.127 1.33 1.418 1.502 1.554 1.729 1.793 1.92 2.043 2.151 2.206 2.312 2.406 2.52 2.588 2.66 2.763 2.852 2.939 3.024 3.095 3.183 3.257 3.319 3.397 3.482 3.556 3.626 3.698 3.763 3.833 3.894 3.947 4.001 4.022 3.982 3.907 3.784 3.585 3.304 2.867 2.142 0.932 -1.241 -3.803 -5.907 -7.687 -9.196 -10.512 -11.615 -12.621 -13.504 -14.364 -15.072 -15.696 -16.307 -16.872 -17.382 -17.842 -18.311 -18.747 -19.118 -19.489 -19.877 -20.184 -20.498 -20.84 -21.105 -21.373 -21.649 -21.932 -22.226 -22.432 -22.635 -22.964 -23.194 -23.407 -23.521 -23.777 -24.049 -24.334 -24.486 -24.775 -24.987 -25.167 -25.345 -25.727 -25.927 -26.147 -26.385 -26.626 -26.895 -27.263 -28.235 -8 ,10802 ,KEBNE ,17040854,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:17:04 CET,0.0 0.458 0.641 0.795 0.937 1.053 1.171 1.263 1.391 1.448 1.511 1.537 1.699 1.75 1.845 1.932 2.025 2.073 2.16 2.246 2.344 2.404 2.466 2.55 2.634 2.709 2.772 2.84 2.932 3.018 3.098 3.195 3.275 3.341 3.421 3.517 3.591 3.647 3.691 3.717 3.731 3.721 3.694 3.654 3.583 3.455 3.195 2.748 2.016 0.829 -1.267 -3.774 -5.854 -7.639 -9.109 -10.383 -11.522 -12.542 -13.392 -14.223 -14.931 -15.549 -16.14 -16.714 -17.244 -17.706 -18.177 -18.594 -18.968 -19.353 -19.741 -20.062 -20.388 -20.722 -20.981 -21.238 -21.509 -21.797 -22.095 -22.306 -22.519 -22.839 -23.064 -23.305 -23.423 -23.668 -23.943 -24.224 -24.364 -24.637 -24.831 -24.998 -25.165 -25.535 -25.738 -25.975 -26.227 -26.492 -26.864 -27.386 -28.508 -9 ,5062 ,KEBNE ,17040855,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:16:56 CET,0.0 0.41 0.555 0.719 0.869 1.0 1.114 1.219 1.427 1.515 1.604 1.681 1.849 1.921 2.049 2.155 2.249 2.302 2.407 2.506 2.652 2.73 2.796 2.893 2.99 3.081 3.168 3.261 3.378 3.481 3.58 3.682 3.766 3.853 3.95 4.04 4.107 4.151 4.193 4.242 4.26 4.248 4.211 4.143 4.02 3.843 3.537 3.03 2.276 1.033 -1.125 -3.665 -5.805 -7.663 -9.237 -10.605 -11.76 -12.765 -13.66 -14.545 -15.275 -15.901 -16.482 -17.043 -17.562 -18.025 -18.511 -18.949 -19.323 -19.715 -20.124 -20.45 -20.774 -21.101 -21.353 -21.627 -21.918 -22.206 -22.504 -22.706 -22.909 -23.239 -23.464 -23.703 -23.834 -24.1 -24.371 -24.656 -24.799 -25.071 -25.247 -25.405 -25.555 -25.857 -26.027 -26.222 -26.449 -26.704 -26.971 -27.305 -28.237 -10 ,27781 ,KEBNE ,17040857,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:17:17 CET,0.0 0.416 0.645 0.839 0.987 1.133 1.264 1.377 1.58 1.681 1.772 1.819 1.986 2.049 2.166 2.267 2.36 2.412 2.52 2.622 2.756 2.835 2.92 3.036 3.129 3.221 3.305 3.373 3.457 3.532 3.602 3.686 3.758 3.828 3.898 3.957 4.014 4.072 4.122 4.16 4.173 4.168 4.137 4.077 3.977 3.819 3.548 3.108 2.399 1.195 -0.882 -3.37 -5.486 -7.269 -8.768 -10.076 -11.203 -12.243 -13.14 -14.011 -14.731 -15.351 -15.948 -16.518 -17.037 -17.497 -17.989 -18.434 -18.804 -19.181 -19.572 -19.881 -20.218 -20.564 -20.815 -21.092 -21.376 -21.669 -21.979 -22.186 -22.399 -22.752 -22.993 -23.228 -23.349 -23.614 -23.901 -24.197 -24.35 -24.617 -24.784 -24.949 -25.113 -25.438 -25.601 -25.788 -26.011 -26.245 -26.515 -26.858 -27.789 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt deleted file mode 100644 index 66a7fda9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12318 ,KEBNE ,17040860,Thu Dec 23 01:55:33 CET,Thu Dec 23 03:17:03 CET,0.0 0.875 1.182 1.38 1.585 1.757 1.902 2.048 2.283 2.366 2.445 2.504 2.675 2.747 2.898 3.046 3.175 3.228 3.33 3.433 3.581 3.685 3.776 3.897 4.006 4.106 4.205 4.306 4.445 4.573 4.681 4.8 4.911 5.019 5.142 5.258 5.374 5.498 5.605 5.705 5.8 5.888 5.975 6.045 6.083 6.064 5.999 5.793 5.351 4.597 3.217 1.47 0.004 -1.261 -2.368 -3.343 -4.219 -5.029 -5.718 -6.399 -6.977 -7.501 -7.995 -8.45 -8.861 -9.246 -9.667 -10.034 -10.335 -10.642 -10.963 -11.222 -11.496 -11.782 -11.998 -12.218 -12.449 -12.692 -12.956 -13.142 -13.314 -13.569 -13.756 -13.956 -14.058 -14.261 -14.47 -14.704 -14.827 -15.08 -15.23 -15.368 -15.508 -15.776 -15.932 -16.079 -16.22 -16.379 -16.562 -16.805 -17.323 -2 ,23069 ,KEBNE ,17040861,Thu Dec 23 01:59:42 CET,Thu Dec 23 03:21:20 CET,0.0 0.437 0.613 0.78 0.908 1.015 1.116 1.214 1.387 1.463 1.529 1.556 1.719 1.776 1.888 1.999 2.119 2.175 2.28 2.38 2.501 2.582 2.667 2.783 2.896 3.0 3.098 3.195 3.306 3.398 3.496 3.624 3.732 3.841 3.967 4.087 4.186 4.285 4.401 4.51 4.6 4.688 4.769 4.809 4.796 4.74 4.611 4.396 4.027 3.314 1.95 0.171 -1.367 -2.691 -3.86 -4.875 -5.741 -6.513 -7.165 -7.797 -8.339 -8.833 -9.307 -9.761 -10.188 -10.57 -10.951 -11.291 -11.59 -11.901 -12.231 -12.499 -12.776 -13.064 -13.288 -13.506 -13.717 -13.937 -14.15 -14.289 -14.439 -14.665 -14.824 -15.003 -15.093 -15.275 -15.456 -15.644 -15.748 -15.975 -16.065 -16.175 -16.287 -16.534 -16.67 -16.819 -16.985 -17.173 -17.38 -17.634 -18.272 -3 ,29998 ,KEBNE ,17040863,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:21:29 CET,0.0 0.37 0.581 0.732 0.86 0.98 1.096 1.212 1.426 1.536 1.639 1.72 1.908 1.99 2.145 2.282 2.41 2.468 2.573 2.67 2.809 2.9 2.992 3.128 3.253 3.367 3.469 3.561 3.67 3.759 3.849 3.964 4.074 4.18 4.303 4.429 4.525 4.626 4.724 4.821 4.922 5.012 5.106 5.162 5.211 5.227 5.147 4.966 4.551 3.795 2.426 0.538 -1.056 -2.348 -3.448 -4.454 -5.351 -6.165 -6.838 -7.5 -8.067 -8.586 -9.087 -9.552 -9.987 -10.384 -10.788 -11.139 -11.438 -11.74 -12.053 -12.31 -12.573 -12.85 -13.061 -13.276 -13.499 -13.717 -13.931 -14.081 -14.242 -14.507 -14.696 -14.877 -14.967 -15.158 -15.361 -15.57 -15.677 -15.909 -16.017 -16.146 -16.287 -16.572 -16.705 -16.843 -17.008 -17.197 -17.396 -17.622 -18.246 -4 ,17653 ,KEBNE ,17040864,Thu Dec 23 01:59:42 CET,Thu Dec 23 03:21:13 CET,0.0 0.788 1.158 1.41 1.599 1.736 1.867 2.002 2.22 2.316 2.421 2.522 2.707 2.787 2.938 3.069 3.195 3.259 3.38 3.497 3.651 3.742 3.832 3.965 4.091 4.202 4.312 4.405 4.512 4.632 4.742 4.852 4.956 5.05 5.161 5.295 5.408 5.521 5.624 5.719 5.814 5.912 6.013 6.09 6.127 6.099 5.969 5.717 5.307 4.561 3.09 1.204 -0.35 -1.689 -2.904 -4.009 -4.947 -5.765 -6.45 -7.133 -7.722 -8.246 -8.734 -9.193 -9.615 -9.974 -10.346 -10.694 -10.987 -11.275 -11.574 -11.812 -12.066 -12.342 -12.554 -12.771 -12.988 -13.209 -13.442 -13.598 -13.76 -14.008 -14.162 -14.335 -14.433 -14.633 -14.842 -15.045 -15.147 -15.382 -15.484 -15.596 -15.736 -16.033 -16.173 -16.31 -16.462 -16.635 -16.839 -17.106 -17.98 -5 ,10398 ,KEBNE ,17040866,Thu Dec 23 01:59:44 CET,Thu Dec 23 03:14:58 CET,0.0 0.474 0.654 0.801 0.927 1.054 1.176 1.304 1.518 1.604 1.686 1.753 1.929 1.999 2.13 2.256 2.383 2.441 2.55 2.653 2.804 2.915 3.021 3.156 3.28 3.396 3.508 3.619 3.754 3.868 3.968 4.087 4.19 4.276 4.379 4.501 4.611 4.736 4.867 4.973 5.068 5.168 5.239 5.281 5.298 5.226 5.077 4.844 4.445 3.665 2.19 0.403 -1.19 -2.577 -3.713 -4.717 -5.621 -6.41 -7.076 -7.768 -8.345 -8.844 -9.335 -9.795 -10.204 -10.573 -10.965 -11.319 -11.629 -11.929 -12.238 -12.515 -12.804 -13.093 -13.312 -13.545 -13.789 -14.03 -14.28 -14.465 -14.654 -14.924 -15.106 -15.29 -15.38 -15.566 -15.769 -15.977 -16.087 -16.328 -16.435 -16.552 -16.676 -16.924 -17.052 -17.207 -17.384 -17.556 -17.758 -18.0 -18.415 -6 ,12658 ,KEBNE ,17040867,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:21:09 CET,0.0 0.488 0.67 0.802 0.917 1.036 1.161 1.285 1.516 1.608 1.697 1.766 1.948 2.027 2.164 2.274 2.376 2.425 2.53 2.644 2.813 2.925 3.024 3.146 3.265 3.37 3.468 3.576 3.712 3.841 3.948 4.074 4.2 4.306 4.415 4.541 4.665 4.784 4.902 5.038 5.187 5.307 5.392 5.459 5.502 5.487 5.395 5.174 4.773 4.016 2.52 0.575 -1.054 -2.412 -3.563 -4.581 -5.463 -6.272 -6.962 -7.621 -8.171 -8.658 -9.145 -9.613 -10.034 -10.399 -10.777 -11.122 -11.418 -11.719 -12.032 -12.297 -12.574 -12.861 -13.094 -13.328 -13.561 -13.809 -14.074 -14.253 -14.432 -14.705 -14.893 -15.088 -15.19 -15.412 -15.64 -15.873 -15.996 -16.243 -16.383 -16.504 -16.623 -16.888 -17.028 -17.176 -17.332 -17.521 -17.738 -18.01 -18.369 -7 ,10912 ,KEBNE ,17040868,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:10 CET,0.0 0.374 0.559 0.692 0.796 0.895 0.993 1.076 1.217 1.286 1.354 1.378 1.54 1.596 1.697 1.796 1.897 1.947 2.043 2.131 2.262 2.343 2.423 2.551 2.671 2.78 2.883 2.988 3.116 3.229 3.344 3.472 3.586 3.696 3.805 3.923 4.037 4.142 4.241 4.331 4.402 4.466 4.53 4.555 4.525 4.491 4.42 4.261 3.918 3.264 1.908 0.083 -1.487 -2.83 -3.998 -5.028 -5.907 -6.694 -7.369 -8.034 -8.601 -9.132 -9.634 -10.082 -10.514 -10.901 -11.271 -11.59 -11.879 -12.197 -12.52 -12.778 -13.039 -13.33 -13.559 -13.785 -14.021 -14.258 -14.513 -14.694 -14.865 -15.126 -15.311 -15.507 -15.608 -15.821 -16.046 -16.287 -16.409 -16.655 -16.824 -16.965 -17.103 -17.434 -17.622 -17.802 -18.028 -18.315 -18.603 -18.889 -19.504 -8 ,28946 ,KEBNE ,17040869,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:21:15 CET,0.0 0.444 0.64 0.817 0.988 1.121 1.217 1.311 1.481 1.56 1.624 1.645 1.816 1.881 2.004 2.132 2.243 2.298 2.415 2.527 2.696 2.796 2.872 2.982 3.098 3.209 3.313 3.405 3.518 3.624 3.717 3.827 3.924 4.01 4.109 4.222 4.326 4.437 4.547 4.65 4.759 4.864 4.94 5.002 5.042 5.022 4.915 4.67 4.26 3.507 2.052 0.208 -1.335 -2.667 -3.824 -4.84 -5.695 -6.434 -7.071 -7.711 -8.263 -8.775 -9.269 -9.727 -10.141 -10.498 -10.878 -11.226 -11.511 -11.794 -12.079 -12.311 -12.554 -12.822 -13.041 -13.26 -13.482 -13.694 -13.915 -14.079 -14.244 -14.498 -14.67 -14.844 -14.934 -15.123 -15.313 -15.5 -15.595 -15.822 -15.917 -16.024 -16.133 -16.372 -16.499 -16.647 -16.806 -16.984 -17.191 -17.423 -17.954 -9 ,29896 ,KEBNE ,17040870,Thu Dec 23 01:59:42 CET,Thu Dec 23 03:21:14 CET,0.0 0.358 0.616 0.85 1.055 1.238 1.39 1.523 1.757 1.868 1.971 2.057 2.245 2.326 2.479 2.621 2.756 2.818 2.929 3.035 3.199 3.303 3.391 3.511 3.627 3.737 3.828 3.912 4.025 4.14 4.247 4.366 4.481 4.582 4.695 4.821 4.944 5.053 5.156 5.273 5.37 5.458 5.569 5.674 5.744 5.753 5.71 5.523 5.129 4.379 2.948 1.118 -0.453 -1.819 -2.951 -3.972 -4.876 -5.676 -6.353 -7.032 -7.651 -8.185 -8.674 -9.126 -9.549 -9.935 -10.326 -10.685 -10.983 -11.276 -11.584 -11.842 -12.112 -12.372 -12.566 -12.774 -12.99 -13.212 -13.451 -13.614 -13.768 -14.001 -14.177 -14.358 -14.451 -14.639 -14.82 -15.007 -15.099 -15.319 -15.416 -15.533 -15.644 -15.887 -16.024 -16.162 -16.303 -16.472 -16.693 -16.962 -17.467 -10 ,16587 ,KEBNE ,17040871,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:22:38 CET,0.0 0.292 0.446 0.601 0.712 0.814 0.916 0.998 1.139 1.199 1.26 1.289 1.452 1.511 1.623 1.72 1.811 1.858 1.946 2.023 2.134 2.196 2.254 2.357 2.47 2.579 2.684 2.783 2.904 3.03 3.156 3.296 3.435 3.557 3.665 3.771 3.875 3.982 4.1 4.218 4.312 4.401 4.514 4.605 4.661 4.685 4.639 4.473 4.13 3.389 1.93 0.089 -1.51 -2.853 -3.997 -5.021 -5.924 -6.726 -7.385 -8.037 -8.583 -9.056 -9.544 -10.006 -10.418 -10.802 -11.192 -11.538 -11.836 -12.145 -12.466 -12.728 -12.986 -13.246 -13.464 -13.688 -13.906 -14.126 -14.355 -14.513 -14.665 -14.898 -15.053 -15.213 -15.299 -15.472 -15.659 -15.863 -15.96 -16.186 -16.287 -16.405 -16.525 -16.769 -16.913 -17.068 -17.215 -17.373 -17.568 -17.827 -18.259 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 453c6a80..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15491 ,KEBNE ,17040872,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:16 CET,0.0 0.322 0.491 0.616 0.721 0.813 0.889 0.97 1.129 1.205 1.281 1.325 1.49 1.558 1.686 1.81 1.933 1.99 2.093 2.193 2.347 2.44 2.528 2.671 2.812 2.937 3.062 3.193 3.352 3.506 3.652 3.832 4.024 4.2 4.391 4.617 4.827 5.051 5.325 5.615 5.891 6.197 6.529 6.855 7.24 7.639 8.082 8.535 8.977 9.348 9.543 9.379 9.058 8.671 8.248 7.812 7.39 7.003 6.666 6.309 5.978 5.673 5.391 5.114 4.847 4.594 4.319 4.084 3.879 3.653 3.422 3.235 3.04 2.836 2.675 2.502 2.324 2.141 1.945 1.803 1.667 1.481 1.344 1.186 1.106 0.942 0.759 0.555 0.448 0.239 0.099 -0.034 -0.168 -0.44 -0.599 -0.786 -0.996 -1.229 -1.506 -1.877 -2.622 -2 ,814 ,KEBNE ,17040873,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:22:24 CET,0.0 0.585 0.805 0.989 1.142 1.289 1.434 1.556 1.8 1.911 2.02 2.137 2.334 2.425 2.597 2.769 2.952 3.04 3.193 3.328 3.53 3.661 3.783 3.955 4.121 4.293 4.456 4.61 4.815 5.002 5.179 5.396 5.601 5.784 6.0 6.273 6.527 6.779 7.052 7.331 7.61 7.915 8.273 8.623 8.996 9.386 9.817 10.253 10.679 11.085 11.347 11.233 10.933 10.581 10.205 9.824 9.478 9.15 8.845 8.504 8.185 7.889 7.597 7.316 7.043 6.788 6.53 6.304 6.104 5.885 5.65 5.458 5.262 5.048 4.888 4.733 4.572 4.407 4.222 4.087 3.949 3.732 3.575 3.414 3.336 3.176 3.009 2.818 2.704 2.483 2.345 2.223 2.082 1.795 1.662 1.538 1.418 1.271 1.107 0.893 0.442 -3 ,7780 ,KEBNE ,17040874,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:23:48 CET,0.0 0.355 0.586 0.74 0.879 1.01 1.133 1.245 1.438 1.511 1.581 1.624 1.794 1.857 1.968 2.087 2.21 2.268 2.382 2.495 2.655 2.762 2.876 3.048 3.201 3.343 3.48 3.615 3.784 3.951 4.125 4.322 4.515 4.708 4.924 5.154 5.361 5.565 5.784 6.025 6.286 6.584 6.909 7.229 7.61 7.998 8.356 8.674 8.981 9.247 9.318 9.018 8.606 8.172 7.731 7.249 6.783 6.367 6.017 5.652 5.307 4.993 4.688 4.403 4.137 3.887 3.627 3.402 3.217 3.029 2.825 2.651 2.481 2.296 2.155 2.02 1.87 1.719 1.568 1.46 1.346 1.157 1.023 0.895 0.833 0.703 0.557 0.389 0.293 0.091 -0.013 -0.113 -0.221 -0.477 -0.613 -0.757 -0.891 -1.019 -1.177 -1.382 -1.847 -4 ,4827 ,KEBNE ,17040875,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:21:48 CET,0.0 0.922 1.249 1.485 1.689 1.856 2.014 2.182 2.487 2.619 2.729 2.831 3.039 3.14 3.316 3.49 3.652 3.727 3.882 4.031 4.237 4.369 4.5 4.691 4.862 5.033 5.206 5.369 5.574 5.771 5.967 6.197 6.404 6.604 6.836 7.082 7.309 7.558 7.827 8.105 8.385 8.699 9.059 9.417 9.8 10.213 10.65 11.076 11.531 11.942 12.2 12.098 11.782 11.41 11.024 10.631 10.291 9.978 9.662 9.295 8.979 8.692 8.391 8.113 7.844 7.6 7.35 7.121 6.93 6.734 6.529 6.348 6.152 5.954 5.787 5.618 5.45 5.262 5.057 4.917 4.788 4.591 4.444 4.288 4.21 4.033 3.83 3.637 3.535 3.327 3.177 3.043 2.918 2.654 2.504 2.336 2.147 1.893 1.568 1.106 0.002 -5 ,21613 ,KEBNE ,17040876,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:24 CET,0.0 0.462 0.772 1.022 1.222 1.404 1.564 1.695 1.933 2.054 2.164 2.247 2.429 2.521 2.693 2.847 2.999 3.072 3.209 3.342 3.524 3.636 3.749 3.915 4.075 4.241 4.395 4.528 4.704 4.866 5.007 5.195 5.381 5.556 5.756 5.974 6.185 6.417 6.66 6.906 7.168 7.457 7.764 8.058 8.403 8.771 9.146 9.511 9.86 10.114 10.166 9.829 9.345 8.857 8.344 7.827 7.372 6.979 6.635 6.261 5.935 5.636 5.339 5.048 4.765 4.491 4.211 3.966 3.761 3.556 3.341 3.163 2.973 2.764 2.586 2.396 2.207 2.026 1.842 1.715 1.58 1.344 1.181 1.023 0.94 0.761 0.578 0.381 0.271 0.059 -0.075 -0.201 -0.336 -0.646 -0.825 -1.031 -1.26 -1.494 -1.729 -2.023 -2.633 -6 ,3470 ,KEBNE ,17040877,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:21:43 CET,0.0 0.86 1.141 1.361 1.563 1.732 1.877 2.022 2.276 2.387 2.498 2.61 2.808 2.904 3.086 3.248 3.407 3.49 3.653 3.802 4.006 4.132 4.255 4.45 4.639 4.807 4.96 5.108 5.316 5.507 5.682 5.893 6.089 6.284 6.5 6.746 6.975 7.213 7.483 7.768 8.044 8.362 8.729 9.069 9.468 9.882 10.287 10.719 11.176 11.604 11.884 11.78 11.472 11.067 10.668 10.29 9.903 9.533 9.239 8.92 8.606 8.306 8.002 7.704 7.435 7.192 6.928 6.695 6.49 6.27 6.049 5.867 5.667 5.467 5.311 5.136 4.957 4.783 4.585 4.445 4.312 4.092 3.924 3.752 3.669 3.499 3.323 3.15 3.06 2.869 2.778 2.675 2.574 2.351 2.222 2.092 1.954 1.798 1.611 1.378 0.987 -7 ,2592 ,KEBNE ,17040878,Thu Dec 23 01:59:42 CET,Thu Dec 23 03:22:00 CET,0.0 0.332 0.53 0.699 0.827 0.939 1.035 1.138 1.324 1.402 1.483 1.562 1.747 1.835 2.025 2.204 2.364 2.44 2.586 2.721 2.887 3.003 3.133 3.329 3.501 3.646 3.788 3.928 4.092 4.248 4.408 4.612 4.816 4.996 5.183 5.39 5.593 5.816 6.07 6.332 6.57 6.827 7.123 7.416 7.742 8.08 8.447 8.804 9.143 9.428 9.461 9.127 8.664 8.156 7.656 7.156 6.725 6.338 5.963 5.577 5.235 4.921 4.627 4.335 4.077 3.844 3.584 3.355 3.156 2.941 2.696 2.495 2.297 2.086 1.915 1.734 1.551 1.365 1.17 1.034 0.887 0.64 0.466 0.289 0.203 0.041 -0.114 -0.284 -0.375 -0.57 -0.677 -0.789 -0.908 -1.159 -1.275 -1.398 -1.547 -1.719 -1.913 -2.157 -2.889 -8 ,15086 ,KEBNE ,17040879,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:22:04 CET,0.0 0.928 1.282 1.562 1.787 1.985 2.164 2.309 2.572 2.7 2.813 2.915 3.12 3.218 3.393 3.556 3.714 3.796 3.946 4.093 4.308 4.441 4.568 4.754 4.936 5.105 5.269 5.427 5.629 5.829 6.025 6.241 6.425 6.614 6.838 7.073 7.3 7.55 7.809 8.071 8.351 8.667 9.025 9.364 9.764 10.197 10.624 11.07 11.56 12.006 12.23 12.101 11.742 11.269 10.769 10.286 9.873 9.481 9.106 8.72 8.378 8.074 7.789 7.505 7.244 7.017 6.777 6.566 6.366 6.149 5.947 5.78 5.585 5.359 5.191 5.026 4.849 4.668 4.47 4.332 4.195 3.974 3.813 3.649 3.567 3.392 3.204 3.008 2.913 2.717 2.622 2.515 2.408 2.195 2.073 1.937 1.79 1.617 1.413 1.186 0.732 -9 ,29853 ,KEBNE ,17040880,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:21:50 CET,0.0 0.482 0.784 1.023 1.205 1.383 1.541 1.677 1.915 2.026 2.129 2.229 2.418 2.511 2.69 2.852 3.013 3.081 3.208 3.341 3.542 3.666 3.781 3.953 4.117 4.264 4.4 4.538 4.717 4.895 5.076 5.276 5.458 5.638 5.845 6.076 6.276 6.489 6.727 6.974 7.219 7.484 7.788 8.089 8.445 8.809 9.144 9.443 9.743 9.979 9.982 9.65 9.18 8.671 8.172 7.706 7.278 6.859 6.49 6.12 5.812 5.518 5.218 4.931 4.665 4.422 4.163 3.931 3.712 3.478 3.234 3.036 2.832 2.628 2.477 2.3 2.099 1.904 1.724 1.6 1.469 1.251 1.085 0.918 0.83 0.648 0.453 0.241 0.133 -0.075 -0.205 -0.325 -0.44 -0.676 -0.804 -0.93 -1.075 -1.246 -1.445 -1.752 -2.518 -10 ,20631 ,KEBNE ,17040881,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:21:52 CET,0.0 0.376 0.565 0.713 0.828 0.935 1.04 1.135 1.296 1.376 1.454 1.497 1.668 1.739 1.87 1.994 2.115 2.17 2.282 2.414 2.6 2.705 2.802 2.943 3.075 3.207 3.351 3.482 3.652 3.834 4.013 4.231 4.431 4.607 4.803 5.035 5.252 5.478 5.717 5.955 6.212 6.509 6.826 7.097 7.398 7.771 8.171 8.536 8.873 9.111 9.142 8.832 8.374 7.874 7.375 6.895 6.457 6.045 5.678 5.295 4.947 4.63 4.34 4.069 3.8 3.547 3.291 3.062 2.852 2.623 2.385 2.2 2.024 1.843 1.691 1.529 1.36 1.18 0.995 0.866 0.725 0.514 0.38 0.234 0.153 -0.001 -0.154 -0.299 -0.371 -0.557 -0.638 -0.742 -0.845 -1.085 -1.241 -1.408 -1.563 -1.741 -1.961 -2.197 -2.59 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt deleted file mode 100644 index 3b22d8d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17476 ,KEBNE ,17040882,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:22:17 CET,0.0 0.827 1.093 1.307 1.506 1.682 1.826 1.96 2.192 2.29 2.389 2.484 2.678 2.763 2.921 3.063 3.201 3.27 3.397 3.512 3.683 3.801 3.919 4.081 4.221 4.366 4.514 4.665 4.862 5.045 5.223 5.428 5.623 5.81 6.021 6.231 6.432 6.65 6.869 7.112 7.346 7.588 7.865 8.115 8.389 8.656 8.908 9.168 9.357 9.331 8.902 8.11 7.278 6.473 5.74 5.045 4.441 3.895 3.423 2.959 2.529 2.137 1.774 1.426 1.108 0.823 0.533 0.262 0.012 -0.236 -0.493 -0.701 -0.915 -1.153 -1.334 -1.519 -1.71 -1.914 -2.13 -2.276 -2.422 -2.663 -2.84 -3.007 -3.095 -3.276 -3.463 -3.669 -3.789 -4.025 -4.162 -4.288 -4.419 -4.703 -4.857 -5.028 -5.233 -5.468 -5.788 -6.197 -7.254 -2 ,8969 ,KEBNE ,17040883,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:22:06 CET,0.0 0.549 0.815 1.021 1.203 1.361 1.501 1.632 1.854 1.951 2.047 2.115 2.303 2.385 2.525 2.66 2.793 2.863 2.997 3.115 3.293 3.42 3.546 3.739 3.923 4.077 4.226 4.377 4.575 4.756 4.917 5.112 5.291 5.467 5.664 5.873 6.076 6.29 6.51 6.751 6.982 7.232 7.517 7.753 8.029 8.303 8.568 8.848 9.065 9.074 8.745 8.033 7.222 6.433 5.673 4.957 4.328 3.764 3.274 2.77 2.337 1.953 1.572 1.222 0.906 0.61 0.308 0.043 -0.191 -0.448 -0.719 -0.933 -1.153 -1.397 -1.595 -1.796 -1.982 -2.164 -2.369 -2.513 -2.663 -2.901 -3.068 -3.254 -3.348 -3.527 -3.707 -3.911 -4.022 -4.255 -4.42 -4.552 -4.683 -4.971 -5.132 -5.297 -5.462 -5.636 -5.819 -6.085 -6.639 -3 ,2366 ,KEBNE ,17040884,Thu Dec 23 01:59:42 CET,Thu Dec 23 03:21:59 CET,0.0 1.269 1.654 1.917 2.137 2.346 2.535 2.696 2.973 3.093 3.219 3.36 3.571 3.68 3.882 4.072 4.247 4.327 4.477 4.63 4.852 4.985 5.115 5.309 5.488 5.662 5.841 6.002 6.194 6.376 6.541 6.743 6.954 7.154 7.37 7.601 7.817 8.054 8.292 8.515 8.768 9.051 9.353 9.647 9.956 10.256 10.536 10.775 10.919 10.921 10.626 9.949 9.216 8.481 7.741 7.054 6.461 5.912 5.423 4.93 4.497 4.11 3.755 3.413 3.07 2.759 2.443 2.156 1.916 1.675 1.432 1.227 0.998 0.76 0.577 0.378 0.168 -0.033 -0.223 -0.352 -0.497 -0.724 -0.89 -1.066 -1.154 -1.338 -1.522 -1.726 -1.844 -2.071 -2.202 -2.319 -2.43 -2.693 -2.834 -2.963 -3.116 -3.316 -3.499 -3.693 -4.03 -4 ,18214 ,KEBNE ,17040885,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:21:46 CET,0.0 0.626 0.857 1.028 1.178 1.311 1.436 1.551 1.746 1.841 1.939 2.019 2.202 2.28 2.437 2.6 2.747 2.807 2.93 3.064 3.254 3.372 3.49 3.654 3.798 3.938 4.081 4.223 4.407 4.578 4.738 4.937 5.128 5.287 5.448 5.643 5.839 6.039 6.226 6.399 6.589 6.81 7.025 7.214 7.473 7.77 8.055 8.301 8.486 8.532 8.186 7.381 6.502 5.726 5.075 4.432 3.854 3.3 2.805 2.322 1.887 1.485 1.086 0.718 0.385 0.083 -0.23 -0.505 -0.737 -0.976 -1.229 -1.445 -1.663 -1.893 -2.076 -2.26 -2.455 -2.648 -2.847 -2.984 -3.118 -3.325 -3.477 -3.629 -3.707 -3.885 -4.062 -4.253 -4.359 -4.57 -4.711 -4.849 -4.981 -5.242 -5.373 -5.523 -5.687 -5.864 -6.069 -6.31 -6.865 -5 ,23557 ,KEBNE ,17040886,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:09 CET,0.0 1.166 1.614 1.907 2.122 2.329 2.512 2.68 2.989 3.12 3.255 3.42 3.627 3.731 3.936 4.128 4.314 4.399 4.552 4.704 4.905 5.026 5.153 5.338 5.507 5.667 5.828 5.99 6.193 6.378 6.563 6.781 6.97 7.152 7.365 7.616 7.844 8.067 8.285 8.513 8.76 9.027 9.3 9.548 9.84 10.156 10.447 10.701 10.893 10.922 10.599 9.767 8.842 7.975 7.199 6.505 5.912 5.364 4.876 4.399 3.986 3.603 3.232 2.88 2.559 2.265 1.955 1.684 1.447 1.19 0.92 0.707 0.493 0.264 0.085 -0.103 -0.294 -0.495 -0.723 -0.878 -1.029 -1.266 -1.426 -1.575 -1.652 -1.816 -1.987 -2.182 -2.279 -2.477 -2.549 -2.648 -2.757 -3.0 -3.131 -3.261 -3.396 -3.558 -3.769 -3.998 -4.509 -6 ,25121 ,KEBNE ,17040887,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:22:08 CET,0.0 0.72 0.977 1.19 1.38 1.534 1.664 1.792 2.038 2.149 2.253 2.34 2.541 2.638 2.824 2.999 3.161 3.247 3.408 3.551 3.755 3.882 4.003 4.169 4.329 4.497 4.663 4.82 5.007 5.183 5.348 5.556 5.76 5.94 6.139 6.357 6.564 6.782 7.018 7.253 7.475 7.741 8.022 8.258 8.523 8.795 9.07 9.308 9.503 9.543 9.201 8.485 7.702 6.961 6.295 5.702 5.159 4.638 4.173 3.706 3.291 2.904 2.537 2.202 1.889 1.6 1.284 0.991 0.751 0.508 0.241 0.005 -0.234 -0.479 -0.673 -0.867 -1.069 -1.28 -1.492 -1.637 -1.797 -2.048 -2.214 -2.395 -2.482 -2.651 -2.834 -3.028 -3.141 -3.365 -3.489 -3.615 -3.758 -4.054 -4.207 -4.378 -4.595 -4.832 -5.109 -5.519 -6.255 -7 ,11831 ,KEBNE ,17040888,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:15 CET,0.0 0.638 0.909 1.133 1.32 1.474 1.611 1.737 1.963 2.068 2.163 2.221 2.409 2.494 2.651 2.814 2.964 3.031 3.157 3.295 3.505 3.625 3.744 3.925 4.096 4.265 4.434 4.594 4.78 4.949 5.116 5.316 5.508 5.684 5.885 6.109 6.334 6.579 6.814 7.056 7.298 7.556 7.827 8.081 8.354 8.61 8.85 9.07 9.234 9.194 8.754 7.898 7.09 6.339 5.606 4.94 4.331 3.762 3.276 2.794 2.395 2.034 1.663 1.315 1.007 0.704 0.383 0.106 -0.128 -0.359 -0.611 -0.826 -1.045 -1.291 -1.491 -1.687 -1.881 -2.076 -2.28 -2.423 -2.577 -2.832 -3.008 -3.187 -3.28 -3.469 -3.657 -3.856 -3.96 -4.171 -4.321 -4.46 -4.599 -4.887 -5.05 -5.257 -5.486 -5.707 -5.971 -6.316 -6.974 -8 ,5737 ,KEBNE ,17040889,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:21:54 CET,0.0 0.539 0.786 0.978 1.133 1.292 1.426 1.558 1.805 1.913 2.023 2.105 2.283 2.366 2.519 2.662 2.805 2.869 2.994 3.123 3.311 3.433 3.543 3.704 3.883 4.059 4.215 4.365 4.549 4.717 4.89 5.094 5.287 5.475 5.686 5.908 6.115 6.345 6.595 6.866 7.103 7.337 7.597 7.829 8.094 8.395 8.705 8.945 9.123 9.157 8.873 8.174 7.387 6.642 5.874 5.15 4.538 3.981 3.489 2.982 2.535 2.127 1.768 1.428 1.097 0.799 0.481 0.204 -0.024 -0.266 -0.533 -0.755 -0.982 -1.223 -1.398 -1.579 -1.776 -1.97 -2.177 -2.322 -2.468 -2.683 -2.832 -3.0 -3.088 -3.274 -3.456 -3.638 -3.733 -3.936 -4.034 -4.138 -4.236 -4.459 -4.577 -4.71 -4.854 -5.02 -5.229 -5.491 -6.04 -9 ,25035 ,KEBNE ,17040890,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:05 CET,0.0 0.746 1.053 1.265 1.439 1.615 1.786 1.931 2.18 2.3 2.422 2.533 2.722 2.809 2.959 3.107 3.263 3.335 3.477 3.614 3.814 3.944 4.066 4.242 4.417 4.575 4.731 4.888 5.073 5.255 5.446 5.664 5.847 6.024 6.233 6.469 6.681 6.905 7.171 7.439 7.689 7.977 8.306 8.599 8.907 9.192 9.456 9.693 9.859 9.907 9.593 8.82 8.02 7.275 6.634 6.044 5.449 4.859 4.34 3.832 3.394 2.988 2.595 2.23 1.902 1.587 1.262 0.99 0.754 0.508 0.246 0.024 -0.214 -0.452 -0.635 -0.834 -1.029 -1.217 -1.431 -1.577 -1.716 -1.946 -2.112 -2.294 -2.388 -2.585 -2.788 -2.997 -3.106 -3.328 -3.475 -3.603 -3.737 -4.033 -4.19 -4.336 -4.471 -4.623 -4.808 -5.043 -5.872 -10 ,13366 ,KEBNE ,17040891,Thu Dec 23 01:59:42 CET,Thu Dec 23 03:22:00 CET,0.0 0.577 0.856 1.032 1.189 1.338 1.464 1.59 1.814 1.911 2.002 2.072 2.252 2.338 2.493 2.633 2.787 2.859 2.994 3.134 3.32 3.44 3.573 3.756 3.914 4.069 4.212 4.348 4.522 4.692 4.857 5.057 5.246 5.396 5.559 5.767 5.971 6.181 6.389 6.592 6.8 7.031 7.267 7.505 7.753 7.958 8.144 8.271 8.3 8.164 7.623 6.684 5.774 4.938 4.186 3.491 2.861 2.273 1.754 1.227 0.779 0.379 -0.021 -0.406 -0.746 -1.033 -1.33 -1.61 -1.849 -2.085 -2.337 -2.564 -2.808 -3.054 -3.244 -3.433 -3.621 -3.819 -4.026 -4.172 -4.322 -4.556 -4.726 -4.911 -5.007 -5.194 -5.395 -5.635 -5.765 -5.993 -6.122 -6.245 -6.374 -6.654 -6.811 -6.99 -7.206 -7.438 -7.728 -8.065 -8.497 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt deleted file mode 100644 index a77d11c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12163 ,KEBNE ,17040892,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:30 CET,0.0 0.538 0.773 0.972 1.151 1.303 1.426 1.552 1.781 1.891 2.001 2.105 2.297 2.397 2.585 2.752 2.901 2.975 3.131 3.27 3.47 3.604 3.714 3.855 3.983 4.101 4.221 4.338 4.491 4.634 4.771 4.958 5.155 5.353 5.586 5.806 5.973 6.157 6.355 6.554 6.765 7.006 7.283 7.554 7.865 8.203 8.553 8.933 9.312 9.61 9.722 9.466 9.088 8.644 8.251 7.869 7.474 7.113 6.798 6.473 6.195 5.955 5.711 5.46 5.221 5.014 4.791 4.585 4.415 4.232 4.036 3.877 3.711 3.541 3.409 3.269 3.128 2.978 2.823 2.724 2.622 2.466 2.363 2.263 2.21 2.086 1.957 1.814 1.734 1.56 1.5 1.409 1.312 1.088 0.974 0.862 0.739 0.604 0.451 0.263 -0.035 -2 ,14792 ,KEBNE ,17040893,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:50 CET,0.0 0.286 0.479 0.621 0.739 0.854 0.966 1.077 1.282 1.366 1.449 1.527 1.697 1.768 1.914 2.055 2.193 2.261 2.384 2.502 2.674 2.778 2.881 3.028 3.174 3.329 3.485 3.638 3.831 4.011 4.18 4.396 4.611 4.812 5.04 5.302 5.55 5.807 6.055 6.29 6.511 6.748 7.029 7.313 7.623 7.931 8.272 8.599 8.874 9.111 9.261 9.124 8.779 8.344 7.912 7.514 7.146 6.802 6.497 6.185 5.934 5.707 5.457 5.214 4.993 4.794 4.578 4.393 4.243 4.063 3.866 3.711 3.545 3.368 3.229 3.087 2.935 2.769 2.593 2.48 2.369 2.171 2.036 1.886 1.806 1.647 1.482 1.306 1.202 1.004 0.922 0.827 0.698 0.391 0.235 0.077 -0.073 -0.213 -0.366 -0.561 -1.198 -3 ,23398 ,KEBNE ,17040894,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:52 CET,0.0 0.691 0.998 1.222 1.377 1.512 1.659 1.803 2.049 2.153 2.25 2.349 2.544 2.631 2.793 2.962 3.119 3.193 3.324 3.456 3.656 3.782 3.905 4.081 4.235 4.372 4.504 4.634 4.812 4.972 5.113 5.272 5.436 5.603 5.774 5.953 6.123 6.305 6.504 6.72 6.956 7.211 7.49 7.769 8.084 8.403 8.738 9.09 9.45 9.754 9.887 9.636 9.286 8.903 8.498 8.088 7.704 7.361 7.069 6.754 6.47 6.22 5.969 5.726 5.503 5.307 5.095 4.897 4.727 4.55 4.372 4.229 4.064 3.889 3.754 3.602 3.443 3.292 3.132 3.011 2.882 2.658 2.489 2.322 2.234 2.032 1.812 1.587 1.47 1.257 1.11 0.979 0.842 0.537 0.377 0.217 0.056 -0.161 -0.419 -0.719 -1.496 -4 ,1006 ,KEBNE ,17040895,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:23:15 CET,0.0 0.591 0.859 1.085 1.271 1.427 1.581 1.715 1.94 2.046 2.153 2.256 2.442 2.53 2.693 2.853 3.012 3.088 3.225 3.34 3.492 3.592 3.686 3.841 4.007 4.164 4.299 4.434 4.636 4.823 4.996 5.221 5.437 5.632 5.853 6.087 6.319 6.574 6.835 7.127 7.429 7.752 8.084 8.356 8.649 8.965 9.317 9.648 9.957 10.236 10.348 10.132 9.798 9.41 8.992 8.57 8.173 7.818 7.515 7.19 6.905 6.651 6.389 6.143 5.913 5.698 5.486 5.306 5.145 4.966 4.774 4.61 4.442 4.275 4.146 4.014 3.877 3.736 3.593 3.489 3.382 3.219 3.101 2.978 2.917 2.792 2.666 2.535 2.465 2.289 2.22 2.127 2.037 1.869 1.778 1.67 1.539 1.39 1.239 1.034 0.58 -5 ,4673 ,KEBNE ,17040896,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:23:06 CET,0.0 0.929 1.307 1.553 1.747 1.895 2.026 2.159 2.419 2.53 2.627 2.717 2.905 2.991 3.148 3.303 3.456 3.527 3.659 3.796 4.012 4.144 4.266 4.44 4.604 4.759 4.905 5.031 5.176 5.314 5.448 5.612 5.781 5.938 6.11 6.302 6.492 6.695 6.915 7.135 7.353 7.592 7.868 8.147 8.437 8.752 9.106 9.444 9.761 10.012 10.1 9.903 9.548 9.145 8.749 8.372 8.01 7.664 7.355 7.036 6.762 6.512 6.266 6.015 5.775 5.568 5.361 5.157 4.974 4.789 4.599 4.437 4.254 4.056 3.904 3.756 3.606 3.452 3.287 3.166 3.04 2.841 2.702 2.553 2.479 2.33 2.165 1.982 1.878 1.664 1.506 1.38 1.266 1.034 0.907 0.767 0.617 0.474 0.347 0.191 -0.158 -6 ,14989 ,KEBNE ,17040897,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:40 CET,0.0 0.56 0.834 1.018 1.201 1.357 1.494 1.636 1.914 2.038 2.152 2.253 2.435 2.519 2.687 2.85 3.007 3.087 3.238 3.372 3.559 3.677 3.8 3.98 4.149 4.311 4.464 4.618 4.813 4.986 5.156 5.37 5.574 5.761 5.976 6.226 6.456 6.671 6.91 7.199 7.49 7.807 8.169 8.484 8.78 9.093 9.451 9.812 10.143 10.46 10.632 10.431 10.096 9.721 9.353 8.969 8.602 8.244 7.921 7.598 7.313 7.058 6.821 6.584 6.353 6.148 5.937 5.739 5.553 5.357 5.169 5.01 4.841 4.664 4.528 4.39 4.242 4.086 3.9 3.748 3.592 3.344 3.173 3.001 2.913 2.736 2.543 2.335 2.232 2.033 1.921 1.808 1.688 1.406 1.255 1.102 0.942 0.781 0.598 0.331 -0.272 -7 ,14963 ,KEBNE ,17040898,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:33 CET,0.0 0.33 0.466 0.585 0.712 0.848 0.991 1.136 1.376 1.475 1.577 1.709 1.913 2.013 2.184 2.317 2.437 2.498 2.613 2.722 2.886 2.995 3.092 3.24 3.409 3.58 3.736 3.887 4.061 4.204 4.344 4.503 4.663 4.845 5.071 5.328 5.558 5.79 6.046 6.319 6.575 6.814 7.077 7.362 7.679 7.984 8.311 8.632 8.946 9.219 9.349 9.163 8.782 8.355 7.932 7.518 7.156 6.829 6.528 6.22 5.94 5.672 5.412 5.165 4.935 4.708 4.464 4.244 4.048 3.855 3.662 3.498 3.332 3.149 3.002 2.854 2.699 2.521 2.315 2.19 2.08 1.896 1.762 1.623 1.551 1.415 1.26 1.055 0.935 0.717 0.586 0.489 0.387 0.153 0.04 -0.08 -0.216 -0.35 -0.502 -0.692 -1.011 -8 ,19365 ,KEBNE ,17040899,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:58 CET,0.0 0.632 0.957 1.179 1.364 1.522 1.668 1.801 2.037 2.134 2.225 2.304 2.478 2.567 2.747 2.892 3.02 3.08 3.197 3.326 3.525 3.66 3.787 3.962 4.118 4.249 4.381 4.526 4.716 4.894 5.066 5.283 5.49 5.678 5.903 6.17 6.423 6.651 6.859 7.077 7.297 7.544 7.812 8.085 8.384 8.69 9.036 9.416 9.8 10.081 10.221 10.053 9.729 9.343 8.918 8.535 8.195 7.856 7.541 7.21 6.923 6.659 6.406 6.153 5.911 5.696 5.461 5.223 5.005 4.774 4.529 4.318 4.098 3.862 3.672 3.495 3.313 3.107 2.883 2.745 2.621 2.4 2.242 2.082 2.0 1.841 1.666 1.456 1.34 1.126 0.99 0.865 0.73 0.463 0.32 0.165 -0.001 -0.219 -0.474 -0.827 -1.805 -9 ,7451 ,KEBNE ,17040900,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:43 CET,0.0 0.387 0.619 0.805 0.96 1.099 1.215 1.31 1.47 1.571 1.691 1.807 2.001 2.097 2.27 2.439 2.593 2.663 2.802 2.949 3.158 3.275 3.393 3.566 3.698 3.824 3.947 4.055 4.186 4.308 4.428 4.566 4.704 4.838 4.997 5.184 5.363 5.578 5.846 6.148 6.444 6.759 7.095 7.414 7.802 8.2 8.613 9.045 9.516 9.934 10.121 9.973 9.684 9.294 8.892 8.498 8.102 7.746 7.456 7.126 6.817 6.556 6.302 6.049 5.81 5.592 5.376 5.193 5.021 4.832 4.636 4.468 4.291 4.112 3.977 3.831 3.691 3.554 3.407 3.291 3.162 2.953 2.805 2.664 2.593 2.447 2.299 2.139 2.053 1.857 1.693 1.541 1.396 1.09 0.911 0.74 0.563 0.345 0.048 -0.396 -1.536 -10 ,24280 ,KEBNE ,17040901,Thu Dec 23 01:59:42 CET,Thu Dec 23 03:22:35 CET,0.0 0.662 1.006 1.266 1.462 1.632 1.793 1.931 2.171 2.287 2.394 2.496 2.688 2.775 2.934 3.104 3.272 3.344 3.479 3.616 3.821 3.948 4.049 4.171 4.292 4.43 4.567 4.688 4.837 4.976 5.113 5.283 5.459 5.641 5.857 6.101 6.334 6.577 6.835 7.118 7.396 7.703 8.079 8.435 8.848 9.319 9.803 10.299 10.793 11.153 11.33 11.164 10.798 10.4 9.969 9.559 9.195 8.851 8.556 8.253 7.985 7.74 7.49 7.242 7.007 6.788 6.56 6.353 6.178 6.004 5.813 5.641 5.461 5.272 5.12 4.958 4.809 4.659 4.491 4.375 4.255 4.072 3.931 3.792 3.727 3.592 3.443 3.269 3.179 2.982 2.817 2.669 2.519 2.193 2.018 1.85 1.673 1.44 1.148 0.792 -0.126 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt deleted file mode 100644 index 785e6ace..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3166 ,KEBNE ,17040902,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:23:27 CET,0.0 0.654 0.879 1.062 1.209 1.334 1.449 1.554 1.749 1.838 1.922 1.995 2.176 2.258 2.405 2.545 2.679 2.75 2.903 3.044 3.251 3.382 3.507 3.687 3.86 4.007 4.13 4.261 4.433 4.6 4.767 4.96 5.137 5.3 5.479 5.666 5.85 6.045 6.234 6.45 6.687 6.913 7.125 7.337 7.615 7.932 8.272 8.592 8.89 9.126 9.141 8.851 8.422 7.94 7.46 6.993 6.559 6.15 5.785 5.406 5.082 4.782 4.497 4.229 3.963 3.716 3.45 3.222 3.029 2.81 2.57 2.375 2.184 1.988 1.828 1.659 1.487 1.307 1.113 0.977 0.836 0.615 0.472 0.338 0.267 0.104 -0.068 -0.271 -0.392 -0.621 -0.793 -0.929 -1.089 -1.454 -1.652 -1.862 -2.099 -2.362 -2.668 -3.086 -4.093 -2 ,30341 ,KEBNE ,17040903,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:53 CET,0.0 0.317 0.53 0.716 0.88 1.027 1.155 1.274 1.486 1.586 1.685 1.768 1.942 2.019 2.171 2.319 2.461 2.532 2.673 2.809 2.993 3.098 3.189 3.314 3.436 3.555 3.67 3.785 3.937 4.079 4.208 4.356 4.507 4.66 4.823 4.989 5.152 5.338 5.534 5.753 5.988 6.276 6.592 6.852 7.136 7.439 7.732 8.001 8.241 8.442 8.462 8.165 7.742 7.279 6.832 6.386 5.96 5.526 5.139 4.763 4.431 4.129 3.839 3.568 3.32 3.099 2.848 2.621 2.429 2.215 1.988 1.795 1.591 1.388 1.243 1.085 0.909 0.728 0.543 0.413 0.274 0.047 -0.12 -0.284 -0.361 -0.549 -0.765 -0.968 -1.077 -1.295 -1.433 -1.558 -1.685 -1.968 -2.13 -2.311 -2.556 -2.843 -3.209 -3.73 -4.727 -3 ,12280 ,KEBNE ,17040904,Thu Dec 23 01:59:42 CET,Thu Dec 23 03:23:05 CET,0.0 0.636 0.918 1.139 1.318 1.47 1.611 1.725 1.918 2.007 2.097 2.171 2.35 2.433 2.578 2.726 2.888 2.965 3.1 3.228 3.414 3.515 3.611 3.747 3.865 3.982 4.116 4.263 4.451 4.629 4.793 4.991 5.187 5.373 5.571 5.789 5.996 6.219 6.482 6.737 6.968 7.203 7.461 7.734 8.033 8.32 8.621 8.936 9.252 9.505 9.494 9.076 8.578 8.076 7.591 7.124 6.694 6.302 5.944 5.553 5.225 4.937 4.631 4.336 4.065 3.823 3.567 3.322 3.099 2.855 2.618 2.43 2.243 2.043 1.868 1.7 1.532 1.337 1.126 0.984 0.841 0.594 0.423 0.265 0.192 0.036 -0.143 -0.316 -0.408 -0.602 -0.707 -0.816 -0.926 -1.172 -1.299 -1.428 -1.58 -1.774 -1.997 -2.273 -2.918 -4 ,27684 ,KEBNE ,17040905,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:23:03 CET,0.0 0.642 0.858 1.077 1.28 1.422 1.552 1.682 1.905 2.015 2.12 2.208 2.388 2.472 2.641 2.793 2.94 3.009 3.133 3.254 3.423 3.531 3.643 3.812 3.959 4.09 4.218 4.324 4.466 4.644 4.836 5.05 5.211 5.343 5.499 5.671 5.855 6.06 6.256 6.474 6.705 6.939 7.19 7.451 7.768 8.087 8.398 8.686 8.95 9.169 9.161 8.852 8.467 8.05 7.581 7.086 6.64 6.207 5.83 5.454 5.137 4.859 4.583 4.309 4.054 3.822 3.566 3.347 3.157 2.941 2.699 2.501 2.311 2.122 1.967 1.804 1.635 1.45 1.257 1.128 0.978 0.735 0.575 0.405 0.319 0.133 -0.074 -0.288 -0.399 -0.606 -0.728 -0.847 -0.971 -1.281 -1.454 -1.623 -1.789 -1.974 -2.21 -2.507 -3.576 -5 ,29020 ,KEBNE ,17040906,Thu Dec 23 01:59:40 CET,Thu Dec 23 03:22:48 CET,0.0 0.608 0.908 1.112 1.279 1.447 1.606 1.742 1.956 2.064 2.173 2.28 2.467 2.547 2.709 2.885 3.043 3.11 3.223 3.328 3.49 3.604 3.715 3.881 4.042 4.193 4.342 4.478 4.661 4.824 4.951 5.1 5.258 5.435 5.642 5.868 6.074 6.269 6.461 6.666 6.877 7.103 7.371 7.635 7.93 8.242 8.544 8.847 9.138 9.344 9.393 9.125 8.689 8.199 7.736 7.289 6.858 6.443 6.097 5.762 5.446 5.154 4.861 4.565 4.297 4.051 3.785 3.546 3.338 3.107 2.866 2.669 2.477 2.287 2.128 1.937 1.726 1.503 1.26 1.092 0.919 0.66 0.479 0.285 0.182 -0.031 -0.261 -0.497 -0.617 -0.847 -1.039 -1.179 -1.317 -1.632 -1.806 -1.99 -2.187 -2.445 -2.819 -3.357 -4.733 -6 ,1463 ,KEBNE ,17040907,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:22:53 CET,0.0 0.606 0.828 0.996 1.161 1.305 1.41 1.501 1.662 1.745 1.838 1.923 2.103 2.192 2.352 2.482 2.622 2.698 2.851 2.981 3.136 3.229 3.315 3.439 3.571 3.717 3.874 4.027 4.204 4.374 4.545 4.751 4.955 5.149 5.365 5.617 5.832 6.017 6.203 6.399 6.618 6.861 7.133 7.389 7.653 7.939 8.263 8.562 8.843 9.08 9.173 8.971 8.572 8.086 7.6 7.133 6.691 6.265 5.901 5.541 5.214 4.919 4.619 4.325 4.056 3.816 3.568 3.342 3.147 2.946 2.728 2.548 2.36 2.149 1.953 1.731 1.509 1.292 1.088 0.948 0.808 0.581 0.428 0.289 0.214 0.048 -0.126 -0.297 -0.387 -0.582 -0.671 -0.775 -0.882 -1.105 -1.234 -1.375 -1.533 -1.706 -1.896 -2.166 -2.678 -7 ,668 ,KEBNE ,17040908,Thu Dec 23 01:59:41 CET,Thu Dec 23 03:24:50 CET,0.0 0.452 0.742 0.945 1.107 1.256 1.391 1.516 1.75 1.86 1.961 2.06 2.248 2.329 2.487 2.642 2.78 2.846 2.988 3.126 3.302 3.416 3.535 3.708 3.855 3.977 4.094 4.212 4.366 4.501 4.642 4.825 4.997 5.17 5.375 5.601 5.807 6.051 6.323 6.6 6.847 7.081 7.334 7.591 7.9 8.218 8.525 8.852 9.237 9.504 9.52 9.174 8.681 8.187 7.721 7.256 6.834 6.444 6.067 5.667 5.321 5.036 4.769 4.49 4.205 3.94 3.683 3.464 3.267 3.06 2.84 2.656 2.464 2.254 2.071 1.882 1.704 1.53 1.348 1.209 1.062 0.834 0.681 0.526 0.445 0.28 0.119 -0.052 -0.144 -0.338 -0.441 -0.543 -0.646 -0.886 -1.018 -1.147 -1.279 -1.448 -1.658 -1.943 -2.577 -8 ,19055 ,KEBNE ,17040909,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:28:46 CET,0.0 0.772 1.04 1.24 1.424 1.624 1.781 1.905 2.134 2.232 2.335 2.447 2.627 2.71 2.878 3.041 3.198 3.27 3.411 3.545 3.726 3.845 3.962 4.117 4.255 4.39 4.522 4.654 4.837 5.013 5.17 5.336 5.516 5.71 5.935 6.183 6.411 6.666 6.91 7.128 7.352 7.64 7.971 8.234 8.507 8.805 9.126 9.444 9.749 10.005 10.044 9.725 9.302 8.804 8.313 7.848 7.416 7.018 6.667 6.285 5.946 5.65 5.368 5.097 4.84 4.606 4.351 4.112 3.916 3.704 3.474 3.287 3.091 2.886 2.724 2.551 2.373 2.179 1.972 1.84 1.715 1.525 1.38 1.214 1.124 0.936 0.748 0.546 0.434 0.229 0.112 -0.01 -0.14 -0.409 -0.561 -0.739 -0.936 -1.151 -1.41 -1.813 -3.01 -9 ,11979 ,KEBNE ,17040911,Thu Dec 23 02:03:51 CET,Thu Dec 23 03:28:17 CET,0.0 0.282 0.487 0.666 0.805 0.921 1.022 1.119 1.316 1.401 1.481 1.534 1.698 1.762 1.889 2.029 2.174 2.245 2.37 2.499 2.715 2.847 2.961 3.117 3.267 3.415 3.568 3.716 3.901 4.06 4.198 4.363 4.507 4.64 4.804 4.994 5.176 5.369 5.572 5.776 5.979 6.21 6.47 6.715 6.982 7.273 7.58 7.885 8.173 8.39 8.385 8.063 7.697 7.253 6.788 6.327 5.904 5.519 5.164 4.776 4.433 4.132 3.845 3.548 3.264 3.019 2.762 2.523 2.293 2.065 1.85 1.656 1.458 1.248 1.083 0.918 0.736 0.546 0.353 0.219 0.091 -0.119 -0.27 -0.427 -0.512 -0.684 -0.87 -1.073 -1.172 -1.369 -1.488 -1.622 -1.764 -2.046 -2.185 -2.33 -2.517 -2.782 -3.168 -3.631 -4.917 -10 ,2858 ,KEBNE ,17040912,Thu Dec 23 02:03:51 CET,Thu Dec 23 03:27:27 CET,0.0 0.247 0.396 0.542 0.681 0.797 0.896 0.986 1.148 1.229 1.311 1.36 1.526 1.595 1.731 1.867 2.001 2.068 2.19 2.305 2.49 2.607 2.718 2.873 3.018 3.17 3.316 3.456 3.638 3.804 3.942 4.085 4.226 4.372 4.542 4.727 4.894 5.103 5.331 5.527 5.725 5.945 6.204 6.453 6.714 6.99 7.315 7.668 8.003 8.246 8.22 7.832 7.336 6.828 6.332 5.833 5.378 4.975 4.617 4.239 3.906 3.602 3.312 3.033 2.778 2.553 2.297 2.064 1.866 1.658 1.433 1.231 1.017 0.795 0.622 0.444 0.273 0.107 -0.087 -0.225 -0.362 -0.582 -0.739 -0.901 -0.989 -1.173 -1.348 -1.538 -1.643 -1.857 -2.011 -2.131 -2.246 -2.51 -2.657 -2.806 -2.987 -3.196 -3.441 -3.802 -4.808 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt deleted file mode 100644 index 0fef6740..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6185 ,KEBNE ,17040915,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:28:49 CET,0.0 0.541 0.798 0.964 1.105 1.236 1.355 1.469 1.67 1.762 1.849 1.929 2.105 2.183 2.349 2.521 2.668 2.723 2.833 2.954 3.1 3.186 3.275 3.433 3.587 3.718 3.852 3.971 4.118 4.255 4.391 4.562 4.711 4.856 5.027 5.223 5.413 5.611 5.815 6.038 6.271 6.521 6.8 7.06 7.337 7.633 7.953 8.242 8.488 8.694 8.681 8.255 7.762 7.289 6.836 6.376 5.959 5.601 5.283 4.926 4.602 4.318 4.043 3.765 3.487 3.25 3.009 2.787 2.601 2.43 2.252 2.082 1.906 1.731 1.581 1.419 1.256 1.081 0.907 0.795 0.669 0.475 0.355 0.218 0.143 -0.002 -0.147 -0.306 -0.392 -0.584 -0.693 -0.808 -0.939 -1.189 -1.322 -1.491 -1.685 -1.873 -2.099 -2.396 -2.917 -2 ,25268 ,KEBNE ,17040916,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:27:42 CET,0.0 0.332 0.563 0.767 0.92 1.054 1.169 1.284 1.503 1.596 1.677 1.738 1.907 1.973 2.103 2.239 2.371 2.437 2.568 2.685 2.838 2.935 3.039 3.191 3.339 3.476 3.595 3.704 3.841 3.966 4.09 4.247 4.402 4.556 4.719 4.891 5.057 5.243 5.453 5.667 5.88 6.124 6.409 6.664 6.927 7.219 7.534 7.836 8.142 8.41 8.479 8.172 7.723 7.286 6.838 6.374 5.966 5.595 5.237 4.855 4.549 4.283 4.023 3.776 3.547 3.328 3.095 2.882 2.689 2.5 2.307 2.142 1.975 1.801 1.666 1.527 1.379 1.229 1.068 0.952 0.835 0.65 0.51 0.369 0.3 0.156 0.0 -0.162 -0.242 -0.423 -0.497 -0.583 -0.674 -0.89 -1.011 -1.139 -1.263 -1.391 -1.562 -1.749 -2.061 -3 ,4858 ,KEBNE ,17040918,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:28:50 CET,0.0 0.207 0.323 0.431 0.527 0.631 0.735 0.828 1.013 1.108 1.197 1.255 1.426 1.513 1.7 1.852 1.972 2.035 2.153 2.25 2.389 2.482 2.582 2.733 2.877 3.013 3.138 3.249 3.396 3.542 3.685 3.859 4.019 4.177 4.354 4.546 4.733 4.928 5.136 5.347 5.559 5.808 6.079 6.324 6.605 6.916 7.228 7.512 7.815 8.079 8.06 7.657 7.136 6.616 6.171 5.722 5.323 4.972 4.632 4.274 3.954 3.677 3.414 3.151 2.897 2.665 2.432 2.225 2.048 1.863 1.669 1.509 1.33 1.143 1.002 0.858 0.708 0.554 0.389 0.264 0.134 -0.06 -0.191 -0.325 -0.398 -0.552 -0.695 -0.834 -0.907 -1.078 -1.122 -1.199 -1.28 -1.477 -1.584 -1.696 -1.814 -1.942 -2.085 -2.262 -2.568 -4 ,3590 ,KEBNE ,17040919,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:29:06 CET,0.0 0.323 0.465 0.571 0.668 0.757 0.84 0.914 1.063 1.139 1.214 1.261 1.419 1.472 1.581 1.687 1.785 1.831 1.925 2.032 2.19 2.289 2.387 2.522 2.642 2.765 2.893 3.011 3.162 3.305 3.446 3.612 3.772 3.924 4.091 4.264 4.438 4.644 4.854 5.067 5.287 5.523 5.787 6.055 6.341 6.629 6.943 7.226 7.502 7.742 7.784 7.455 6.985 6.514 6.048 5.585 5.189 4.815 4.473 4.12 3.813 3.546 3.28 3.021 2.789 2.57 2.343 2.148 1.972 1.793 1.599 1.43 1.253 1.072 0.937 0.78 0.608 0.446 0.284 0.167 0.052 -0.107 -0.214 -0.327 -0.389 -0.518 -0.66 -0.799 -0.865 -1.036 -1.086 -1.165 -1.252 -1.448 -1.549 -1.658 -1.777 -1.902 -2.03 -2.176 -2.488 -5 ,7421 ,KEBNE ,17040921,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:27:30 CET,0.0 0.505 0.817 1.004 1.146 1.27 1.388 1.526 1.78 1.892 2.008 2.128 2.324 2.415 2.546 2.701 2.875 2.961 3.112 3.224 3.379 3.487 3.598 3.743 3.869 3.99 4.11 4.219 4.354 4.486 4.633 4.816 4.977 5.127 5.299 5.485 5.663 5.859 6.061 6.269 6.482 6.727 7.007 7.282 7.571 7.855 8.182 8.523 8.826 9.032 9.079 8.769 8.303 7.829 7.396 6.99 6.588 6.211 5.867 5.498 5.188 4.904 4.634 4.381 4.136 3.918 3.687 3.481 3.295 3.092 2.879 2.706 2.523 2.337 2.202 2.05 1.895 1.733 1.556 1.437 1.303 1.084 0.94 0.799 0.728 0.58 0.419 0.244 0.157 -0.024 -0.12 -0.232 -0.347 -0.59 -0.733 -0.917 -1.125 -1.311 -1.508 -1.776 -2.37 -6 ,27837 ,KEBNE ,17040922,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:29:13 CET,0.0 0.466 0.649 0.794 0.941 1.079 1.216 1.326 1.496 1.584 1.67 1.72 1.886 1.952 2.09 2.221 2.343 2.402 2.513 2.621 2.778 2.88 2.973 3.099 3.227 3.348 3.459 3.572 3.731 3.882 4.017 4.184 4.344 4.504 4.702 4.89 5.05 5.237 5.437 5.647 5.869 6.115 6.391 6.65 6.952 7.277 7.59 7.889 8.172 8.411 8.405 8.012 7.564 7.117 6.652 6.182 5.805 5.449 5.106 4.761 4.465 4.198 3.924 3.664 3.44 3.225 2.973 2.755 2.567 2.368 2.173 2.005 1.837 1.673 1.536 1.394 1.245 1.09 0.926 0.808 0.691 0.517 0.387 0.253 0.184 0.027 -0.133 -0.301 -0.39 -0.585 -0.69 -0.791 -0.902 -1.131 -1.251 -1.374 -1.511 -1.643 -1.785 -1.971 -2.247 -7 ,6638 ,KEBNE ,17040924,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:27:29 CET,0.0 0.276 0.4 0.496 0.582 0.665 0.75 0.827 0.951 1.009 1.073 1.102 1.26 1.325 1.45 1.556 1.655 1.704 1.805 1.913 2.06 2.15 2.251 2.385 2.509 2.638 2.753 2.858 3.005 3.157 3.289 3.451 3.622 3.773 3.928 4.103 4.283 4.491 4.71 4.92 5.139 5.37 5.612 5.856 6.129 6.406 6.697 6.986 7.273 7.511 7.538 7.253 6.812 6.345 5.889 5.443 5.048 4.663 4.306 3.944 3.628 3.34 3.08 2.835 2.596 2.373 2.142 1.943 1.771 1.591 1.406 1.243 1.072 0.897 0.749 0.595 0.44 0.275 0.107 -0.004 -0.122 -0.322 -0.455 -0.575 -0.639 -0.787 -0.946 -1.105 -1.189 -1.368 -1.412 -1.481 -1.56 -1.741 -1.845 -1.951 -2.059 -2.195 -2.357 -2.552 -2.92 -8 ,6508 ,KEBNE ,17040925,Thu Dec 23 02:03:51 CET,Thu Dec 23 03:28:54 CET,0.0 0.385 0.591 0.751 0.886 1.021 1.147 1.252 1.436 1.522 1.606 1.672 1.845 1.913 2.037 2.168 2.293 2.35 2.467 2.584 2.738 2.832 2.935 3.082 3.213 3.337 3.467 3.602 3.759 3.908 4.053 4.21 4.352 4.499 4.669 4.852 5.028 5.217 5.418 5.627 5.842 6.081 6.35 6.613 6.904 7.218 7.546 7.862 8.181 8.412 8.474 8.192 7.764 7.309 6.869 6.438 6.022 5.651 5.32 4.962 4.661 4.392 4.131 3.887 3.657 3.442 3.203 2.991 2.804 2.59 2.381 2.22 2.054 1.886 1.748 1.593 1.433 1.275 1.109 0.99 0.875 0.696 0.558 0.413 0.341 0.192 0.035 -0.13 -0.222 -0.415 -0.514 -0.618 -0.729 -0.986 -1.12 -1.255 -1.44 -1.679 -1.902 -2.165 -2.941 -9 ,22813 ,KEBNE ,17040926,Thu Dec 23 02:03:51 CET,Thu Dec 23 03:28:04 CET,0.0 0.632 0.829 1.01 1.185 1.347 1.47 1.575 1.78 1.863 1.947 2.043 2.242 2.331 2.467 2.596 2.72 2.777 2.887 2.996 3.148 3.246 3.347 3.486 3.626 3.757 3.882 4.003 4.146 4.286 4.419 4.576 4.728 4.875 5.049 5.25 5.431 5.615 5.824 6.041 6.254 6.479 6.735 6.997 7.301 7.611 7.917 8.214 8.551 8.846 8.884 8.603 8.158 7.651 7.175 6.751 6.357 5.961 5.613 5.268 4.977 4.711 4.439 4.164 3.908 3.685 3.453 3.246 3.071 2.883 2.686 2.515 2.329 2.148 2.009 1.861 1.703 1.536 1.374 1.256 1.131 0.95 0.823 0.686 0.619 0.478 0.329 0.158 0.067 -0.114 -0.211 -0.328 -0.448 -0.704 -0.865 -1.032 -1.188 -1.379 -1.594 -1.908 -2.776 -10 ,12389 ,KEBNE ,17040928,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:27:40 CET,0.0 0.206 0.326 0.45 0.556 0.638 0.716 0.795 0.963 1.041 1.109 1.137 1.296 1.352 1.455 1.555 1.65 1.695 1.779 1.859 1.975 2.06 2.151 2.273 2.394 2.518 2.638 2.753 2.906 3.06 3.198 3.356 3.505 3.648 3.821 4.019 4.201 4.388 4.598 4.825 5.04 5.271 5.553 5.813 6.082 6.368 6.661 6.969 7.3 7.554 7.541 7.166 6.74 6.29 5.84 5.434 5.025 4.625 4.295 3.956 3.652 3.375 3.107 2.841 2.589 2.363 2.118 1.898 1.713 1.531 1.347 1.186 1.005 0.816 0.672 0.526 0.375 0.2 0.031 -0.082 -0.205 -0.382 -0.508 -0.646 -0.715 -0.868 -1.023 -1.194 -1.296 -1.489 -1.584 -1.686 -1.8 -2.021 -2.139 -2.317 -2.549 -2.775 -3.072 -3.465 -4.21 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 5f748124..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1463 ,KEBNE ,17040929,Thu Dec 23 02:03:51 CET,Thu Dec 23 03:27:08 CET,0.0 0.431 0.632 0.777 0.902 1.022 1.131 1.227 1.405 1.487 1.554 1.577 1.729 1.781 1.879 1.974 2.07 2.112 2.192 2.277 2.399 2.479 2.555 2.664 2.776 2.876 2.955 3.024 3.101 3.176 3.255 3.343 3.417 3.489 3.577 3.678 3.782 3.889 3.988 4.082 4.169 4.251 4.332 4.398 4.481 4.538 4.513 4.401 4.152 3.638 2.525 1.068 -0.236 -1.426 -2.477 -3.391 -4.171 -4.889 -5.552 -6.21 -6.766 -7.266 -7.729 -8.18 -8.599 -8.992 -9.387 -9.728 -10.052 -10.394 -10.735 -11.024 -11.328 -11.631 -11.859 -12.107 -12.371 -12.639 -12.92 -13.119 -13.329 -13.661 -13.9 -14.151 -14.276 -14.53 -14.801 -15.092 -15.236 -15.483 -15.667 -15.827 -16.012 -16.432 -16.66 -16.885 -17.118 -17.391 -17.721 -18.148 -19.72 -2 ,25598 ,KEBNE ,17040930,Thu Dec 23 02:03:51 CET,Thu Dec 23 03:26:47 CET,0.0 0.328 0.549 0.729 0.865 0.976 1.081 1.208 1.444 1.528 1.6 1.645 1.812 1.882 1.997 2.118 2.233 2.281 2.372 2.457 2.56 2.63 2.705 2.803 2.893 2.977 3.049 3.132 3.249 3.344 3.429 3.535 3.629 3.719 3.823 3.914 3.989 4.079 4.183 4.293 4.401 4.506 4.608 4.677 4.73 4.765 4.753 4.649 4.38 3.882 2.878 1.404 0.076 -1.047 -2.038 -2.979 -3.8 -4.523 -5.135 -5.749 -6.298 -6.796 -7.271 -7.741 -8.179 -8.56 -8.938 -9.282 -9.597 -9.923 -10.256 -10.541 -10.856 -11.196 -11.458 -11.708 -11.961 -12.227 -12.486 -12.66 -12.859 -13.175 -13.389 -13.622 -13.74 -13.977 -14.224 -14.476 -14.623 -14.881 -15.089 -15.264 -15.46 -15.864 -16.082 -16.329 -16.582 -16.878 -17.273 -17.814 -19.132 -3 ,30752 ,KEBNE ,17040931,Thu Dec 23 02:03:51 CET,Thu Dec 23 03:26:50 CET,0.0 0.358 0.566 0.724 0.845 0.953 1.053 1.138 1.315 1.393 1.462 1.495 1.646 1.711 1.836 1.945 2.05 2.098 2.19 2.288 2.418 2.498 2.573 2.674 2.773 2.858 2.938 3.022 3.125 3.216 3.3 3.398 3.494 3.597 3.704 3.808 3.903 3.997 4.1 4.197 4.285 4.375 4.442 4.483 4.538 4.58 4.554 4.45 4.178 3.621 2.604 1.154 -0.244 -1.451 -2.485 -3.43 -4.233 -4.944 -5.573 -6.201 -6.76 -7.256 -7.727 -8.189 -8.608 -8.984 -9.377 -9.735 -10.059 -10.395 -10.743 -11.047 -11.357 -11.659 -11.901 -12.15 -12.404 -12.672 -12.945 -13.135 -13.328 -13.63 -13.844 -14.076 -14.202 -14.448 -14.703 -14.963 -15.088 -15.343 -15.55 -15.701 -15.856 -16.202 -16.385 -16.587 -16.837 -17.122 -17.423 -17.799 -18.91 -4 ,32000 ,KEBNE ,17040932,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:26:56 CET,0.0 0.283 0.468 0.62 0.743 0.862 0.964 1.042 1.209 1.289 1.353 1.376 1.528 1.589 1.703 1.813 1.914 1.958 2.04 2.122 2.233 2.299 2.371 2.478 2.563 2.65 2.737 2.816 2.923 3.029 3.122 3.223 3.321 3.411 3.514 3.629 3.737 3.845 3.949 4.056 4.164 4.275 4.361 4.429 4.505 4.52 4.495 4.396 4.145 3.579 2.447 0.95 -0.422 -1.602 -2.619 -3.559 -4.38 -5.105 -5.727 -6.378 -6.977 -7.502 -7.974 -8.405 -8.814 -9.183 -9.579 -9.941 -10.232 -10.538 -10.875 -11.141 -11.401 -11.669 -11.891 -12.132 -12.373 -12.627 -12.9 -13.084 -13.269 -13.569 -13.802 -14.043 -14.159 -14.394 -14.657 -14.944 -15.094 -15.345 -15.542 -15.711 -15.9 -16.314 -16.535 -16.76 -16.998 -17.295 -17.63 -18.033 -19.19 -5 ,4742 ,KEBNE ,17040933,Thu Dec 23 02:03:51 CET,Thu Dec 23 03:25:29 CET,0.0 0.478 0.695 0.879 1.015 1.114 1.196 1.275 1.423 1.485 1.536 1.536 1.686 1.741 1.839 1.941 2.032 2.073 2.159 2.252 2.39 2.474 2.549 2.654 2.753 2.848 2.935 3.02 3.13 3.219 3.302 3.415 3.528 3.623 3.724 3.835 3.925 4.015 4.106 4.206 4.305 4.401 4.498 4.556 4.607 4.628 4.587 4.484 4.231 3.691 2.592 1.068 -0.321 -1.549 -2.546 -3.417 -4.207 -4.966 -5.623 -6.266 -6.831 -7.336 -7.804 -8.236 -8.662 -9.068 -9.47 -9.823 -10.141 -10.466 -10.808 -11.108 -11.413 -11.738 -11.992 -12.231 -12.489 -12.769 -13.05 -13.246 -13.443 -13.744 -13.97 -14.214 -14.34 -14.603 -14.88 -15.167 -15.319 -15.585 -15.761 -15.912 -16.092 -16.523 -16.749 -16.978 -17.239 -17.542 -17.899 -18.328 -19.505 -6 ,20498 ,KEBNE ,17040934,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:25:18 CET,0.0 0.56 0.782 0.928 1.065 1.194 1.314 1.42 1.604 1.701 1.79 1.829 1.986 2.051 2.156 2.243 2.33 2.38 2.476 2.55 2.645 2.709 2.776 2.877 2.973 3.064 3.151 3.228 3.331 3.437 3.525 3.623 3.714 3.799 3.9 4.012 4.124 4.23 4.316 4.398 4.483 4.59 4.715 4.798 4.861 4.905 4.898 4.809 4.552 3.973 2.844 1.365 0.057 -1.097 -2.068 -2.947 -3.76 -4.498 -5.143 -5.784 -6.347 -6.869 -7.358 -7.82 -8.246 -8.63 -9.041 -9.414 -9.728 -10.053 -10.402 -10.692 -10.979 -11.282 -11.521 -11.756 -12.016 -12.301 -12.588 -12.787 -12.989 -13.299 -13.525 -13.759 -13.879 -14.118 -14.362 -14.631 -14.776 -15.036 -15.24 -15.403 -15.588 -16.005 -16.237 -16.484 -16.78 -17.147 -17.586 -18.128 -19.606 -7 ,1657 ,KEBNE ,17040935,Thu Dec 23 02:03:51 CET,Thu Dec 23 03:25:21 CET,0.0 0.662 0.891 1.097 1.277 1.412 1.526 1.638 1.827 1.911 1.984 2.026 2.176 2.227 2.332 2.434 2.533 2.579 2.677 2.77 2.887 2.963 3.037 3.15 3.264 3.369 3.462 3.55 3.661 3.758 3.837 3.934 4.032 4.12 4.216 4.32 4.425 4.538 4.642 4.749 4.856 4.953 5.026 5.072 5.123 5.128 5.069 4.934 4.621 4.004 2.829 1.353 0.067 -1.103 -2.139 -3.075 -3.903 -4.643 -5.244 -5.829 -6.342 -6.816 -7.263 -7.682 -8.089 -8.447 -8.805 -9.131 -9.419 -9.741 -10.104 -10.404 -10.706 -11.026 -11.275 -11.522 -11.758 -12.01 -12.292 -12.488 -12.693 -13.015 -13.24 -13.465 -13.583 -13.834 -14.091 -14.367 -14.514 -14.762 -14.965 -15.142 -15.315 -15.709 -15.953 -16.2 -16.469 -16.787 -17.176 -17.648 -18.76 -8 ,4792 ,KEBNE ,17040936,Thu Dec 23 02:03:51 CET,Thu Dec 23 03:26:57 CET,0.0 0.277 0.469 0.626 0.756 0.863 0.954 1.024 1.185 1.274 1.34 1.362 1.52 1.583 1.692 1.791 1.889 1.934 2.02 2.103 2.206 2.272 2.348 2.463 2.561 2.649 2.726 2.798 2.897 2.991 3.069 3.162 3.257 3.352 3.466 3.577 3.668 3.761 3.859 3.97 4.086 4.202 4.314 4.408 4.507 4.565 4.553 4.489 4.274 3.814 2.782 1.347 0.124 -0.951 -1.921 -2.797 -3.584 -4.331 -4.966 -5.598 -6.136 -6.613 -7.061 -7.492 -7.923 -8.325 -8.736 -9.108 -9.416 -9.711 -10.03 -10.293 -10.566 -10.874 -11.112 -11.342 -11.574 -11.817 -12.061 -12.243 -12.441 -12.733 -12.934 -13.145 -13.252 -13.469 -13.698 -13.965 -14.112 -14.362 -14.542 -14.715 -14.897 -15.271 -15.487 -15.711 -15.967 -16.255 -16.616 -17.14 -18.219 -9 ,14152 ,KEBNE ,17040937,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:27:00 CET,0.0 0.237 0.365 0.47 0.573 0.652 0.711 0.767 0.887 0.945 0.999 1.011 1.155 1.205 1.299 1.383 1.46 1.498 1.566 1.64 1.76 1.831 1.89 1.973 2.054 2.129 2.198 2.272 2.377 2.475 2.574 2.688 2.787 2.872 2.961 3.065 3.157 3.251 3.36 3.483 3.597 3.706 3.825 3.913 3.963 4.0 3.995 3.899 3.679 3.167 2.086 0.668 -0.615 -1.775 -2.776 -3.672 -4.495 -5.254 -5.883 -6.502 -7.037 -7.518 -7.992 -8.462 -8.912 -9.321 -9.731 -10.09 -10.415 -10.758 -11.102 -11.386 -11.685 -12.004 -12.257 -12.518 -12.779 -13.043 -13.309 -13.491 -13.684 -13.994 -14.219 -14.459 -14.575 -14.816 -15.086 -15.369 -15.508 -15.755 -15.983 -16.168 -16.346 -16.716 -16.927 -17.167 -17.455 -17.767 -18.167 -18.74 -20.105 -10 ,30764 ,KEBNE ,17040938,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:25:37 CET,0.0 0.847 1.103 1.271 1.404 1.527 1.644 1.745 1.919 2.006 2.071 2.087 2.243 2.308 2.429 2.539 2.636 2.679 2.766 2.854 2.966 3.032 3.1 3.196 3.284 3.369 3.457 3.539 3.636 3.733 3.815 3.909 4.017 4.116 4.206 4.315 4.422 4.527 4.628 4.719 4.802 4.891 4.997 5.072 5.109 5.123 5.101 5.009 4.798 4.331 3.328 1.881 0.627 -0.486 -1.491 -2.422 -3.244 -3.959 -4.574 -5.22 -5.803 -6.305 -6.785 -7.23 -7.633 -8.014 -8.436 -8.799 -9.112 -9.448 -9.79 -10.081 -10.374 -10.68 -10.928 -11.19 -11.451 -11.728 -12.012 -12.213 -12.437 -12.79 -13.025 -13.259 -13.384 -13.656 -13.948 -14.25 -14.402 -14.674 -14.932 -15.118 -15.315 -15.752 -15.993 -16.255 -16.546 -16.879 -17.264 -17.787 -19.395 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 6b2db1c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21259 ,KEBNE ,17040939,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:27:33 CET,0.0 0.228 0.417 0.602 0.751 0.878 0.985 1.088 1.292 1.395 1.492 1.576 1.75 1.836 2.013 2.163 2.292 2.361 2.496 2.62 2.796 2.908 3.016 3.164 3.305 3.443 3.583 3.726 3.897 4.048 4.198 4.377 4.549 4.715 4.907 5.117 5.307 5.515 5.719 5.911 6.12 6.347 6.613 6.875 7.123 7.364 7.612 7.814 7.934 7.91 7.53 6.792 6.017 5.265 4.604 3.994 3.444 2.927 2.454 1.942 1.514 1.142 0.764 0.419 0.103 -0.184 -0.494 -0.791 -1.038 -1.273 -1.523 -1.741 -1.967 -2.201 -2.385 -2.575 -2.787 -3.01 -3.221 -3.359 -3.504 -3.724 -3.872 -4.039 -4.125 -4.306 -4.511 -4.72 -4.821 -5.025 -5.17 -5.31 -5.455 -5.75 -5.907 -6.071 -6.24 -6.42 -6.643 -6.943 -7.896 -2 ,14106 ,KEBNE ,17040940,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:25:50 CET,0.0 0.485 0.76 1.001 1.207 1.381 1.529 1.669 1.924 2.033 2.142 2.251 2.427 2.516 2.702 2.891 3.057 3.133 3.284 3.41 3.579 3.696 3.808 3.958 4.1 4.237 4.369 4.498 4.665 4.823 4.967 5.132 5.296 5.457 5.64 5.846 6.034 6.231 6.442 6.647 6.852 7.091 7.361 7.628 7.887 8.104 8.353 8.592 8.725 8.67 8.282 7.442 6.614 5.885 5.197 4.557 3.973 3.425 2.962 2.478 2.057 1.67 1.295 0.953 0.637 0.338 0.003 -0.292 -0.535 -0.787 -1.051 -1.267 -1.495 -1.732 -1.919 -2.129 -2.353 -2.583 -2.813 -2.972 -3.129 -3.362 -3.535 -3.72 -3.813 -4.014 -4.231 -4.447 -4.561 -4.786 -4.948 -5.087 -5.239 -5.581 -5.769 -5.978 -6.186 -6.455 -6.744 -7.079 -7.694 -3 ,32436 ,KEBNE ,17040941,Thu Dec 23 02:03:50 CET,Thu Dec 23 03:27:20 CET,0.0 0.685 0.967 1.135 1.302 1.468 1.634 1.797 2.054 2.167 2.268 2.345 2.522 2.607 2.754 2.898 3.044 3.112 3.241 3.369 3.551 3.663 3.778 3.943 4.093 4.234 4.36 4.483 4.651 4.809 4.959 5.139 5.312 5.476 5.667 5.863 6.039 6.237 6.44 6.661 6.898 7.137 7.386 7.63 7.918 8.195 8.436 8.635 8.81 8.85 8.511 7.712 6.904 6.211 5.569 4.938 4.367 3.835 3.373 2.922 2.51 2.12 1.751 1.413 1.086 0.783 0.469 0.179 -0.057 -0.292 -0.545 -0.763 -0.994 -1.237 -1.424 -1.615 -1.819 -2.043 -2.278 -2.439 -2.596 -2.824 -2.99 -3.166 -3.26 -3.457 -3.667 -3.891 -4.003 -4.221 -4.375 -4.501 -4.619 -4.865 -5.001 -5.15 -5.304 -5.492 -5.744 -6.051 -7.018 -4 ,17157 ,KEBNE ,17040942,Thu Dec 23 02:05:54 CET,Thu Dec 23 03:29:29 CET,0.0 0.977 1.308 1.544 1.752 1.934 2.094 2.235 2.45 2.541 2.627 2.694 2.871 2.952 3.109 3.27 3.413 3.475 3.598 3.718 3.886 4.0 4.105 4.248 4.396 4.542 4.682 4.812 4.979 5.139 5.287 5.457 5.624 5.788 5.965 6.158 6.367 6.591 6.795 7.003 7.209 7.446 7.702 7.918 8.173 8.438 8.684 8.878 9.013 8.985 8.578 7.888 7.256 6.623 6.007 5.384 4.805 4.283 3.805 3.316 2.908 2.538 2.175 1.821 1.497 1.21 0.911 0.622 0.373 0.13 -0.13 -0.348 -0.574 -0.8 -0.982 -1.17 -1.349 -1.525 -1.705 -1.832 -1.974 -2.193 -2.334 -2.479 -2.553 -2.712 -2.881 -3.051 -3.141 -3.335 -3.417 -3.512 -3.615 -3.876 -4.031 -4.195 -4.365 -4.559 -4.802 -5.107 -6.066 -5 ,5957 ,KEBNE ,17040943,Thu Dec 23 02:05:53 CET,Thu Dec 23 03:27:57 CET,0.0 0.868 1.142 1.367 1.549 1.707 1.86 1.992 2.222 2.336 2.434 2.532 2.721 2.807 2.963 3.111 3.268 3.339 3.462 3.592 3.776 3.882 3.979 4.135 4.299 4.449 4.591 4.743 4.934 5.093 5.249 5.432 5.598 5.76 5.934 6.126 6.308 6.505 6.72 6.945 7.169 7.397 7.623 7.856 8.129 8.388 8.655 8.915 9.1 9.131 8.752 7.899 7.059 6.315 5.676 5.082 4.519 3.997 3.533 3.06 2.642 2.268 1.914 1.577 1.257 0.947 0.635 0.368 0.133 -0.115 -0.373 -0.592 -0.821 -1.055 -1.238 -1.435 -1.636 -1.843 -2.058 -2.2 -2.344 -2.555 -2.695 -2.841 -2.92 -3.083 -3.241 -3.407 -3.492 -3.687 -3.804 -3.915 -4.023 -4.234 -4.351 -4.486 -4.646 -4.825 -5.02 -5.277 -5.997 -6 ,2582 ,KEBNE ,17040944,Thu Dec 23 02:05:53 CET,Thu Dec 23 03:29:14 CET,0.0 0.556 0.882 1.152 1.374 1.546 1.688 1.832 2.083 2.189 2.298 2.397 2.572 2.662 2.837 2.996 3.139 3.203 3.334 3.465 3.66 3.78 3.886 4.044 4.198 4.35 4.492 4.62 4.777 4.923 5.075 5.266 5.441 5.61 5.793 5.993 6.191 6.404 6.637 6.874 7.094 7.331 7.599 7.839 8.079 8.335 8.607 8.85 9.059 9.084 8.703 7.988 7.271 6.579 5.902 5.262 4.677 4.134 3.657 3.159 2.723 2.343 1.985 1.649 1.323 1.029 0.729 0.441 0.189 -0.075 -0.346 -0.567 -0.797 -1.029 -1.212 -1.419 -1.635 -1.849 -2.071 -2.218 -2.376 -2.644 -2.84 -3.046 -3.146 -3.338 -3.543 -3.77 -3.892 -4.114 -4.267 -4.408 -4.545 -4.807 -4.951 -5.092 -5.234 -5.38 -5.538 -5.764 -6.291 -7 ,30578 ,KEBNE ,17040945,Thu Dec 23 02:05:53 CET,Thu Dec 23 03:29:53 CET,0.0 0.519 0.886 1.114 1.298 1.457 1.591 1.721 1.96 2.071 2.184 2.298 2.481 2.566 2.718 2.861 3.011 3.086 3.227 3.353 3.546 3.671 3.78 3.947 4.107 4.268 4.423 4.554 4.717 4.883 5.035 5.209 5.38 5.545 5.742 5.949 6.12 6.309 6.525 6.742 6.961 7.195 7.46 7.718 7.978 8.249 8.537 8.813 9.021 9.06 8.758 8.114 7.394 6.651 5.986 5.38 4.823 4.302 3.851 3.392 2.982 2.604 2.255 1.923 1.605 1.309 0.99 0.706 0.453 0.195 -0.065 -0.286 -0.517 -0.755 -0.943 -1.134 -1.319 -1.505 -1.704 -1.843 -1.991 -2.217 -2.363 -2.518 -2.601 -2.765 -2.928 -3.119 -3.22 -3.412 -3.497 -3.602 -3.714 -3.945 -4.069 -4.199 -4.353 -4.538 -4.767 -5.045 -5.562 -8 ,15889 ,KEBNE ,17040946,Thu Dec 23 02:05:53 CET,Thu Dec 23 03:29:22 CET,0.0 0.584 0.847 1.036 1.203 1.342 1.471 1.592 1.825 1.942 2.044 2.141 2.328 2.414 2.581 2.749 2.899 2.965 3.092 3.218 3.401 3.512 3.617 3.766 3.907 4.05 4.192 4.326 4.497 4.65 4.793 4.974 5.151 5.324 5.505 5.689 5.87 6.068 6.282 6.501 6.721 6.97 7.245 7.498 7.763 8.03 8.284 8.493 8.659 8.652 8.311 7.586 6.835 6.085 5.372 4.718 4.139 3.589 3.109 2.616 2.187 1.809 1.474 1.176 0.891 0.623 0.325 0.053 -0.174 -0.399 -0.644 -0.854 -1.084 -1.327 -1.515 -1.719 -1.924 -2.128 -2.343 -2.5 -2.666 -2.924 -3.104 -3.284 -3.378 -3.578 -3.786 -3.998 -4.102 -4.305 -4.44 -4.565 -4.698 -5.017 -5.194 -5.379 -5.582 -5.812 -6.052 -6.327 -6.934 -9 ,187 ,KEBNE ,17040947,Thu Dec 23 02:05:53 CET,Thu Dec 23 03:29:28 CET,0.0 0.735 1.014 1.227 1.419 1.597 1.745 1.893 2.165 2.284 2.401 2.498 2.666 2.739 2.878 2.996 3.101 3.15 3.243 3.336 3.461 3.546 3.645 3.805 3.95 4.092 4.237 4.377 4.556 4.714 4.867 5.056 5.233 5.4 5.588 5.799 5.996 6.201 6.419 6.647 6.871 7.102 7.351 7.574 7.826 8.082 8.32 8.533 8.676 8.669 8.365 7.714 7.036 6.337 5.64 5.009 4.435 3.878 3.384 2.872 2.434 2.089 1.779 1.462 1.144 0.853 0.57 0.323 0.106 -0.121 -0.357 -0.563 -0.794 -1.031 -1.212 -1.388 -1.568 -1.763 -1.946 -2.067 -2.205 -2.429 -2.582 -2.739 -2.822 -3.008 -3.207 -3.416 -3.528 -3.738 -3.867 -3.99 -4.116 -4.439 -4.615 -4.784 -4.991 -5.206 -5.427 -5.689 -6.283 -10 ,23569 ,KEBNE ,17040948,Thu Dec 23 02:05:54 CET,Thu Dec 23 03:29:44 CET,0.0 0.374 0.525 0.701 0.874 1.034 1.185 1.307 1.544 1.652 1.757 1.876 2.054 2.133 2.289 2.454 2.61 2.676 2.801 2.918 3.082 3.189 3.297 3.456 3.609 3.753 3.887 4.028 4.209 4.367 4.518 4.698 4.867 5.017 5.188 5.387 5.578 5.765 5.968 6.194 6.418 6.664 6.929 7.183 7.487 7.805 8.109 8.363 8.512 8.495 8.156 7.485 6.753 5.982 5.3 4.675 4.082 3.539 3.078 2.624 2.253 1.918 1.58 1.266 0.977 0.703 0.404 0.134 -0.101 -0.344 -0.583 -0.777 -0.99 -1.216 -1.388 -1.571 -1.755 -1.936 -2.135 -2.284 -2.435 -2.664 -2.82 -2.99 -3.08 -3.253 -3.438 -3.646 -3.758 -3.972 -4.135 -4.27 -4.422 -4.78 -4.963 -5.133 -5.298 -5.468 -5.65 -5.894 -6.533 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt deleted file mode 100644 index 104727d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24170 ,KEBNE ,17040949,Thu Dec 23 02:05:54 CET,Thu Dec 23 03:29:24 CET,0.0 0.404 0.622 0.818 0.982 1.105 1.219 1.314 1.485 1.575 1.671 1.766 1.967 2.067 2.244 2.39 2.534 2.613 2.764 2.904 3.109 3.24 3.359 3.525 3.682 3.828 3.97 4.108 4.279 4.442 4.602 4.803 4.99 5.176 5.406 5.666 5.915 6.167 6.413 6.674 6.957 7.23 7.502 7.794 8.162 8.564 8.979 9.398 9.82 10.192 10.409 10.293 9.895 9.4 8.944 8.509 8.13 7.792 7.468 7.102 6.783 6.512 6.263 6.023 5.788 5.548 5.283 5.032 4.806 4.585 4.367 4.175 3.956 3.737 3.568 3.385 3.2 3.001 2.781 2.636 2.507 2.303 2.159 2.012 1.933 1.759 1.57 1.376 1.282 1.084 0.978 0.858 0.734 0.494 0.337 0.156 -0.021 -0.222 -0.48 -0.924 -3.628 -2 ,15701 ,KEBNE ,17040950,Thu Dec 23 02:05:54 CET,Thu Dec 23 03:29:42 CET,0.0 0.739 1.019 1.234 1.41 1.594 1.779 1.932 2.203 2.313 2.415 2.52 2.706 2.795 2.967 3.123 3.271 3.348 3.489 3.602 3.769 3.876 3.977 4.131 4.278 4.419 4.549 4.675 4.866 5.053 5.23 5.423 5.586 5.736 5.912 6.124 6.342 6.573 6.796 7.038 7.295 7.559 7.844 8.136 8.485 8.86 9.231 9.593 9.957 10.308 10.577 10.443 10.123 9.775 9.373 8.967 8.585 8.213 7.888 7.529 7.208 6.923 6.655 6.403 6.159 5.935 5.697 5.488 5.308 5.124 4.926 4.747 4.559 4.372 4.224 4.066 3.898 3.709 3.506 3.373 3.225 2.97 2.787 2.588 2.492 2.299 2.109 1.883 1.756 1.54 1.404 1.271 1.124 0.762 0.564 0.363 0.129 -0.151 -0.483 -0.883 -1.924 -3 ,10929 ,KEBNE ,17040951,Thu Dec 23 02:05:54 CET,Thu Dec 23 03:29:20 CET,0.0 0.686 0.923 1.09 1.253 1.408 1.553 1.679 1.92 2.035 2.139 2.217 2.395 2.475 2.655 2.835 2.99 3.057 3.183 3.309 3.484 3.605 3.723 3.876 4.028 4.171 4.307 4.445 4.617 4.777 4.923 5.113 5.3 5.468 5.667 5.88 6.095 6.329 6.568 6.824 7.09 7.375 7.676 7.978 8.317 8.661 9.032 9.395 9.766 10.14 10.328 10.194 9.912 9.503 9.067 8.65 8.272 7.948 7.644 7.3 7.004 6.722 6.434 6.168 5.933 5.706 5.454 5.227 5.013 4.803 4.6 4.424 4.24 4.038 3.874 3.706 3.528 3.34 3.147 3.011 2.864 2.631 2.469 2.297 2.208 2.016 1.814 1.612 1.488 1.255 1.108 0.976 0.835 0.499 0.319 0.15 -0.055 -0.319 -0.63 -1.045 -2.547 -4 ,14948 ,KEBNE ,17040952,Thu Dec 23 02:05:54 CET,Thu Dec 23 03:29:50 CET,0.0 0.418 0.557 0.682 0.799 0.908 1.025 1.145 1.336 1.411 1.488 1.536 1.713 1.793 1.945 2.09 2.24 2.316 2.459 2.589 2.778 2.898 3.019 3.197 3.365 3.528 3.686 3.829 3.993 4.15 4.304 4.494 4.684 4.863 5.072 5.314 5.547 5.794 6.046 6.297 6.554 6.86 7.196 7.496 7.843 8.234 8.658 9.097 9.559 9.968 10.16 10.006 9.714 9.306 8.883 8.463 8.05 7.684 7.377 7.054 6.766 6.497 6.2 5.923 5.678 5.446 5.21 4.983 4.78 4.562 4.315 4.102 3.883 3.662 3.491 3.299 3.092 2.883 2.648 2.497 2.344 2.094 1.907 1.714 1.626 1.432 1.209 0.974 0.854 0.637 0.502 0.367 0.22 -0.089 -0.271 -0.496 -0.729 -0.992 -1.305 -1.648 -2.316 -5 ,23729 ,KEBNE ,17040953,Thu Dec 23 02:09:02 CET,Thu Dec 23 03:32:04 CET,0.0 0.23 0.377 0.521 0.655 0.759 0.843 0.929 1.095 1.178 1.258 1.289 1.457 1.521 1.66 1.807 1.948 2.017 2.16 2.295 2.48 2.602 2.716 2.878 3.032 3.179 3.331 3.475 3.656 3.826 3.976 4.177 4.365 4.52 4.711 4.952 5.177 5.413 5.682 5.946 6.202 6.499 6.842 7.182 7.56 7.953 8.383 8.787 9.193 9.608 9.852 9.702 9.336 8.92 8.55 8.15 7.753 7.379 7.037 6.696 6.402 6.137 5.864 5.594 5.342 5.116 4.882 4.675 4.489 4.302 4.106 3.942 3.783 3.61 3.468 3.321 3.172 3.025 2.855 2.737 2.625 2.442 2.314 2.181 2.105 1.939 1.753 1.545 1.45 1.258 1.149 1.041 0.925 0.673 0.538 0.381 0.202 -0.032 -0.296 -0.615 -1.348 -6 ,5207 ,KEBNE ,17040954,Thu Dec 23 02:09:02 CET,Thu Dec 23 03:32:48 CET,0.0 0.389 0.593 0.752 0.911 1.058 1.173 1.281 1.5 1.6 1.692 1.757 1.937 2.014 2.166 2.302 2.431 2.499 2.629 2.746 2.931 3.056 3.165 3.306 3.451 3.59 3.704 3.816 3.982 4.118 4.228 4.401 4.606 4.794 4.998 5.233 5.452 5.678 5.912 6.156 6.409 6.683 7.003 7.326 7.652 7.972 8.298 8.597 8.915 9.228 9.354 9.113 8.738 8.302 7.895 7.48 7.091 6.72 6.348 5.935 5.577 5.274 4.977 4.676 4.405 4.172 3.929 3.7 3.488 3.268 3.047 2.854 2.657 2.458 2.291 2.11 1.925 1.743 1.543 1.399 1.257 1.024 0.854 0.695 0.615 0.453 0.309 0.141 0.052 -0.14 -0.257 -0.369 -0.478 -0.718 -0.85 -1.016 -1.208 -1.427 -1.674 -1.989 -2.818 -7 ,22830 ,KEBNE ,17040955,Thu Dec 23 02:09:02 CET,Thu Dec 23 03:32:17 CET,0.0 0.485 0.744 0.939 1.093 1.245 1.384 1.5 1.725 1.836 1.936 2.031 2.237 2.334 2.511 2.665 2.805 2.875 3.011 3.137 3.323 3.446 3.564 3.73 3.881 4.03 4.173 4.301 4.468 4.637 4.802 5.005 5.202 5.389 5.602 5.839 6.053 6.285 6.552 6.827 7.095 7.388 7.725 8.054 8.416 8.797 9.176 9.547 9.877 10.13 10.222 9.984 9.61 9.226 8.752 8.293 7.923 7.587 7.259 6.896 6.597 6.305 5.994 5.686 5.414 5.185 4.932 4.69 4.471 4.25 4.019 3.805 3.57 3.337 3.157 2.964 2.768 2.576 2.382 2.252 2.112 1.88 1.719 1.54 1.447 1.266 1.074 0.859 0.752 0.551 0.396 0.252 0.114 -0.22 -0.409 -0.601 -0.785 -0.998 -1.296 -1.73 -2.968 -8 ,1398 ,KEBNE ,17040956,Thu Dec 23 02:09:02 CET,Thu Dec 23 03:32:15 CET,0.0 0.493 0.753 0.941 1.102 1.233 1.342 1.441 1.605 1.692 1.784 1.839 2.021 2.094 2.233 2.389 2.537 2.607 2.744 2.868 3.046 3.158 3.256 3.406 3.556 3.701 3.856 4.003 4.176 4.341 4.501 4.692 4.87 5.049 5.252 5.468 5.675 5.906 6.149 6.395 6.655 6.941 7.266 7.585 7.937 8.308 8.698 9.101 9.514 9.867 10.042 9.941 9.668 9.33 8.944 8.536 8.166 7.779 7.439 7.112 6.816 6.566 6.31 6.036 5.765 5.501 5.215 4.967 4.773 4.574 4.338 4.131 3.918 3.686 3.506 3.331 3.145 2.951 2.74 2.594 2.455 2.226 2.067 1.908 1.818 1.62 1.414 1.202 1.077 0.847 0.703 0.57 0.428 0.118 -0.049 -0.245 -0.454 -0.656 -0.928 -1.284 -2.897 -9 ,29316 ,KEBNE ,17040957,Thu Dec 23 02:09:02 CET,Thu Dec 23 03:30:45 CET,0.0 0.326 0.459 0.593 0.744 0.895 1.047 1.193 1.454 1.573 1.68 1.755 1.935 2.015 2.167 2.311 2.454 2.524 2.664 2.807 3.002 3.119 3.232 3.396 3.561 3.719 3.862 3.994 4.163 4.327 4.492 4.688 4.865 5.048 5.261 5.491 5.704 5.935 6.178 6.413 6.67 6.963 7.276 7.603 8.007 8.406 8.8 9.221 9.648 10.077 10.347 10.211 9.909 9.559 9.136 8.696 8.32 7.957 7.615 7.26 6.939 6.652 6.386 6.132 5.888 5.643 5.366 5.134 4.936 4.716 4.49 4.303 4.107 3.906 3.748 3.57 3.39 3.2 2.981 2.836 2.688 2.428 2.24 2.061 1.969 1.767 1.568 1.367 1.267 1.069 0.966 0.849 0.722 0.447 0.295 0.136 -0.054 -0.277 -0.538 -0.835 -1.711 -10 ,1903 ,KEBNE ,17040958,Thu Dec 23 02:09:03 CET,Thu Dec 23 03:30:37 CET,0.0 0.245 0.422 0.559 0.676 0.789 0.899 1.002 1.215 1.323 1.428 1.528 1.716 1.795 1.947 2.083 2.219 2.292 2.431 2.561 2.745 2.856 2.965 3.118 3.266 3.416 3.563 3.71 3.887 4.055 4.227 4.428 4.614 4.801 5.021 5.263 5.498 5.732 5.959 6.212 6.477 6.767 7.101 7.426 7.782 8.192 8.642 9.045 9.436 9.813 10.062 10.024 9.692 9.199 8.786 8.434 8.059 7.679 7.311 6.91 6.569 6.277 5.999 5.724 5.47 5.229 4.972 4.741 4.529 4.293 4.066 3.884 3.679 3.468 3.308 3.133 2.942 2.725 2.498 2.369 2.256 2.048 1.889 1.742 1.659 1.48 1.293 1.105 0.996 0.779 0.688 0.576 0.456 0.208 0.046 -0.136 -0.332 -0.547 -0.79 -1.074 -1.762 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index f426837a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23886 ,KEBNE ,17040959,Thu Dec 23 02:09:02 CET,Thu Dec 23 03:32:40 CET,0.0 0.326 0.511 0.656 0.772 0.887 0.996 1.086 1.264 1.352 1.433 1.495 1.685 1.769 1.921 2.073 2.238 2.322 2.472 2.607 2.8 2.93 3.058 3.241 3.419 3.587 3.744 3.902 4.111 4.31 4.502 4.72 4.917 5.102 5.323 5.58 5.817 6.079 6.376 6.68 6.979 7.307 7.694 8.1 8.532 8.971 9.46 9.992 10.589 11.197 11.758 11.938 11.795 11.564 11.31 11.007 10.701 10.432 10.187 9.902 9.631 9.39 9.162 8.93 8.709 8.486 8.249 8.048 7.874 7.704 7.511 7.334 7.153 6.973 6.823 6.662 6.494 6.305 6.117 5.994 5.861 5.642 5.475 5.301 5.222 5.069 4.9 4.7 4.592 4.382 4.231 4.1 3.959 3.646 3.481 3.275 3.045 2.8 2.542 2.187 1.209 -2 ,17015 ,KEBNE ,17040960,Thu Dec 23 02:09:02 CET,Thu Dec 23 03:32:21 CET,0.0 0.782 1.182 1.489 1.755 1.964 2.139 2.272 2.506 2.622 2.735 2.86 3.06 3.149 3.339 3.524 3.698 3.779 3.937 4.082 4.292 4.435 4.571 4.762 4.94 5.105 5.261 5.409 5.594 5.78 5.962 6.182 6.403 6.61 6.842 7.096 7.336 7.603 7.885 8.187 8.507 8.855 9.255 9.638 10.054 10.497 11.016 11.545 12.06 12.589 12.972 12.991 12.817 12.546 12.239 11.912 11.536 11.188 10.894 10.57 10.289 10.038 9.808 9.581 9.341 9.109 8.882 8.689 8.509 8.31 8.088 7.907 7.729 7.544 7.401 7.251 7.1 6.94 6.77 6.653 6.531 6.35 6.218 6.075 6.005 5.847 5.678 5.506 5.411 5.205 5.082 4.963 4.853 4.649 4.517 4.352 4.182 3.983 3.712 3.296 1.9 -3 ,13633 ,KEBNE ,17040961,Thu Dec 23 02:09:02 CET,Thu Dec 23 03:32:50 CET,0.0 0.37 0.573 0.721 0.847 0.971 1.087 1.199 1.409 1.51 1.613 1.727 1.932 2.027 2.211 2.386 2.542 2.618 2.762 2.911 3.128 3.255 3.375 3.559 3.734 3.895 4.056 4.212 4.405 4.585 4.764 4.987 5.198 5.404 5.637 5.889 6.128 6.384 6.665 6.952 7.244 7.589 7.976 8.346 8.774 9.245 9.768 10.337 10.929 11.453 11.913 11.943 11.702 11.403 11.062 10.714 10.409 10.117 9.836 9.514 9.239 9.0 8.749 8.505 8.265 8.04 7.811 7.597 7.418 7.225 7.013 6.844 6.662 6.461 6.298 6.139 5.982 5.811 5.618 5.486 5.357 5.136 4.989 4.838 4.756 4.591 4.423 4.232 4.125 3.918 3.774 3.635 3.494 3.176 3.003 2.811 2.604 2.381 2.104 1.725 0.793 -4 ,23031 ,KEBNE ,17040962,Thu Dec 23 02:09:02 CET,Thu Dec 23 03:32:24 CET,0.0 0.706 1.035 1.268 1.48 1.665 1.825 1.97 2.239 2.364 2.488 2.627 2.84 2.947 3.137 3.318 3.488 3.569 3.723 3.865 4.071 4.218 4.363 4.565 4.765 4.95 5.124 5.306 5.553 5.773 5.972 6.214 6.441 6.653 6.89 7.16 7.423 7.693 7.994 8.322 8.656 9.003 9.411 9.836 10.3 10.792 11.348 11.965 12.585 13.162 13.551 13.534 13.349 13.069 12.76 12.429 12.082 11.742 11.437 11.117 10.822 10.548 10.293 10.066 9.849 9.644 9.411 9.202 9.034 8.848 8.662 8.501 8.322 8.143 8.006 7.855 7.689 7.513 7.335 7.213 7.079 6.87 6.717 6.553 6.472 6.303 6.117 5.92 5.81 5.595 5.485 5.371 5.23 4.924 4.771 4.591 4.393 4.185 3.913 3.532 2.616 -5 ,17534 ,KEBNE ,17040963,Thu Dec 23 02:09:02 CET,Thu Dec 23 03:32:35 CET,0.0 0.402 0.622 0.822 1.006 1.184 1.351 1.499 1.761 1.889 2.018 2.156 2.366 2.475 2.687 2.887 3.063 3.146 3.304 3.448 3.675 3.823 3.963 4.156 4.34 4.515 4.689 4.856 5.051 5.241 5.439 5.671 5.88 6.079 6.304 6.56 6.805 7.065 7.353 7.651 7.969 8.333 8.736 9.127 9.578 10.05 10.526 11.037 11.62 12.205 12.662 12.709 12.562 12.342 12.005 11.631 11.291 10.961 10.665 10.365 10.083 9.816 9.561 9.309 9.076 8.866 8.631 8.417 8.24 8.032 7.813 7.652 7.479 7.287 7.129 6.965 6.798 6.621 6.429 6.292 6.155 5.962 5.822 5.658 5.577 5.426 5.286 5.129 5.041 4.843 4.747 4.641 4.521 4.262 4.128 3.973 3.794 3.608 3.419 3.198 2.506 -6 ,23283 ,KEBNE ,17040964,Thu Dec 23 02:09:03 CET,Thu Dec 23 03:31:23 CET,0.0 0.509 0.79 1.029 1.244 1.428 1.59 1.73 1.948 2.055 2.168 2.277 2.483 2.579 2.749 2.901 3.045 3.12 3.272 3.419 3.639 3.774 3.896 4.082 4.263 4.434 4.591 4.739 4.928 5.114 5.298 5.519 5.72 5.903 6.134 6.398 6.643 6.906 7.199 7.508 7.816 8.156 8.56 8.966 9.395 9.858 10.364 10.885 11.434 11.961 12.422 12.535 12.356 12.092 11.791 11.441 11.096 10.768 10.475 10.16 9.871 9.614 9.363 9.116 8.883 8.677 8.455 8.244 8.064 7.875 7.67 7.497 7.313 7.126 6.987 6.829 6.649 6.464 6.28 6.162 6.045 5.868 5.731 5.581 5.513 5.366 5.208 5.044 4.96 4.761 4.649 4.549 4.438 4.181 4.045 3.912 3.765 3.582 3.369 3.091 2.453 -7 ,11793 ,KEBNE ,17040965,Thu Dec 23 02:09:03 CET,Thu Dec 23 03:32:24 CET,0.0 0.353 0.526 0.668 0.799 0.931 1.042 1.132 1.3 1.384 1.463 1.503 1.679 1.748 1.891 2.03 2.164 2.233 2.352 2.461 2.638 2.762 2.877 3.041 3.199 3.339 3.473 3.619 3.805 3.968 4.126 4.327 4.52 4.705 4.922 5.163 5.411 5.686 5.968 6.276 6.592 6.931 7.346 7.736 8.12 8.542 9.042 9.569 10.151 10.769 11.276 11.339 11.138 10.857 10.525 10.168 9.831 9.495 9.173 8.86 8.588 8.335 8.085 7.836 7.606 7.385 7.132 6.912 6.729 6.538 6.357 6.199 6.007 5.808 5.652 5.486 5.318 5.14 4.943 4.798 4.654 4.448 4.298 4.133 4.047 3.871 3.702 3.528 3.437 3.248 3.154 3.042 2.928 2.671 2.532 2.376 2.197 1.996 1.693 1.331 0.488 -8 ,23872 ,KEBNE ,17040966,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:35:57 CET,0.0 0.933 1.281 1.486 1.658 1.827 1.972 2.107 2.378 2.49 2.589 2.692 2.893 2.995 3.197 3.377 3.538 3.615 3.762 3.904 4.103 4.227 4.359 4.542 4.716 4.901 5.086 5.251 5.458 5.666 5.859 6.078 6.292 6.498 6.717 6.969 7.215 7.48 7.773 8.073 8.363 8.687 9.081 9.446 9.864 10.356 10.872 11.404 11.982 12.508 12.921 12.984 12.848 12.64 12.393 12.071 11.714 11.392 11.079 10.744 10.46 10.188 9.927 9.675 9.426 9.208 8.975 8.77 8.583 8.382 8.183 8.009 7.831 7.642 7.491 7.341 7.188 7.009 6.807 6.676 6.538 6.31 6.157 5.998 5.912 5.74 5.556 5.354 5.256 5.054 4.918 4.796 4.675 4.393 4.23 4.068 3.901 3.714 3.489 3.197 2.351 -9 ,7108 ,KEBNE ,17040967,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:33:56 CET,0.0 0.337 0.525 0.714 0.885 1.009 1.117 1.222 1.426 1.53 1.622 1.682 1.865 1.943 2.09 2.229 2.354 2.412 2.534 2.666 2.854 2.978 3.109 3.308 3.492 3.668 3.849 4.02 4.234 4.441 4.629 4.837 5.042 5.249 5.489 5.761 6.005 6.271 6.571 6.874 7.187 7.53 7.927 8.316 8.728 9.165 9.695 10.253 10.816 11.358 11.749 11.794 11.541 11.189 10.846 10.479 10.152 9.837 9.528 9.222 8.955 8.718 8.49 8.268 8.051 7.82 7.554 7.325 7.133 6.928 6.714 6.553 6.389 6.196 6.043 5.892 5.734 5.554 5.364 5.237 5.099 4.882 4.726 4.562 4.477 4.295 4.097 3.896 3.797 3.598 3.508 3.399 3.267 2.993 2.853 2.705 2.554 2.376 2.136 1.879 1.23 -10 ,25757 ,KEBNE ,17040968,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:34:26 CET,0.0 0.243 0.439 0.591 0.729 0.856 0.963 1.067 1.27 1.372 1.462 1.532 1.724 1.804 1.955 2.103 2.249 2.313 2.43 2.55 2.736 2.85 2.955 3.105 3.252 3.386 3.519 3.67 3.858 4.018 4.176 4.379 4.592 4.814 5.056 5.306 5.56 5.833 6.126 6.433 6.734 7.057 7.439 7.822 8.237 8.719 9.278 9.817 10.363 10.924 11.419 11.481 11.296 11.013 10.689 10.342 9.998 9.692 9.412 9.099 8.821 8.555 8.293 8.059 7.823 7.605 7.381 7.17 6.989 6.791 6.572 6.4 6.222 6.022 5.864 5.695 5.524 5.355 5.164 5.043 4.923 4.722 4.582 4.43 4.349 4.186 3.999 3.774 3.66 3.449 3.307 3.193 3.066 2.788 2.632 2.446 2.264 2.097 1.905 1.507 -0.018 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt deleted file mode 100644 index 50b7e669..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19204 ,KEBNE ,17040969,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:35:46 CET,0.0 0.487 0.737 0.913 1.084 1.232 1.367 1.508 1.761 1.865 1.969 2.038 2.277 2.37 2.541 2.71 2.878 2.954 3.111 3.272 3.487 3.629 3.773 3.991 4.211 4.414 4.611 4.8 5.045 5.275 5.497 5.771 6.037 6.288 6.57 6.897 7.21 7.554 7.918 8.303 8.702 9.134 9.652 10.159 10.705 11.286 11.944 12.678 13.382 14.104 14.895 15.171 15.007 14.728 14.42 14.073 13.73 13.392 13.081 12.765 12.47 12.198 11.95 11.705 11.465 11.246 11.012 10.79 10.601 10.411 10.206 10.026 9.84 9.643 9.486 9.331 9.175 9.015 8.853 8.745 8.627 8.413 8.249 8.086 8.009 7.86 7.711 7.543 7.449 7.219 7.127 7.012 6.898 6.666 6.526 6.357 6.18 5.98 5.713 5.373 4.687 -2 ,28325 ,KEBNE ,17040971,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:34:10 CET,0.0 0.672 0.925 1.13 1.302 1.458 1.596 1.73 1.98 2.079 2.181 2.254 2.496 2.582 2.759 2.93 3.08 3.154 3.304 3.44 3.638 3.781 3.918 4.108 4.288 4.454 4.614 4.785 5.004 5.21 5.415 5.664 5.917 6.163 6.443 6.758 7.066 7.398 7.741 8.112 8.511 8.931 9.384 9.849 10.422 10.999 11.582 12.29 13.07 13.866 14.551 14.697 14.568 14.279 13.901 13.499 13.125 12.789 12.471 12.142 11.856 11.572 11.286 11.012 10.766 10.555 10.335 10.133 9.957 9.776 9.574 9.395 9.206 9.008 8.859 8.712 8.568 8.422 8.281 8.188 8.091 7.926 7.807 7.686 7.621 7.484 7.331 7.165 7.073 6.84 6.786 6.7 6.618 6.442 6.347 6.219 6.079 5.949 5.787 5.571 5.068 -3 ,996 ,KEBNE ,17040973,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:34:13 CET,0.0 0.408 0.65 0.853 1.028 1.216 1.382 1.525 1.826 1.948 2.056 2.143 2.395 2.507 2.726 2.937 3.143 3.235 3.41 3.585 3.825 3.97 4.131 4.37 4.588 4.792 4.978 5.163 5.414 5.647 5.853 6.113 6.363 6.601 6.892 7.216 7.523 7.853 8.216 8.606 9.005 9.451 9.946 10.443 11.03 11.665 12.367 13.147 13.929 14.57 14.992 14.957 14.611 14.207 13.826 13.434 13.059 12.695 12.385 12.062 11.752 11.466 11.19 10.933 10.694 10.463 10.224 10.025 9.856 9.666 9.453 9.289 9.121 8.925 8.775 8.623 8.467 8.302 8.122 8.011 7.903 7.714 7.582 7.453 7.387 7.246 7.09 6.924 6.841 6.626 6.568 6.477 6.389 6.169 6.05 5.936 5.803 5.643 5.467 5.271 5.008 -4 ,32406 ,KEBNE ,17040974,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:33:54 CET,0.0 0.68 0.961 1.171 1.356 1.542 1.714 1.871 2.177 2.319 2.446 2.549 2.807 2.913 3.12 3.324 3.516 3.607 3.777 3.941 4.188 4.351 4.503 4.708 4.912 5.109 5.298 5.483 5.722 5.95 6.162 6.422 6.683 6.938 7.231 7.557 7.876 8.219 8.573 8.956 9.363 9.792 10.279 10.762 11.302 11.918 12.627 13.373 14.099 14.85 15.52 15.693 15.53 15.265 14.966 14.582 14.203 13.866 13.563 13.238 12.944 12.672 12.4 12.137 11.886 11.649 11.38 11.138 10.936 10.733 10.518 10.334 10.152 9.96 9.804 9.639 9.476 9.327 9.187 9.078 8.968 8.815 8.697 8.578 8.512 8.373 8.241 8.103 8.03 7.82 7.782 7.69 7.597 7.42 7.318 7.203 7.075 6.935 6.763 6.548 6.096 -5 ,9452 ,KEBNE ,17040976,Thu Dec 23 02:12:12 CET,Thu Dec 23 03:31:04 CET,0.0 0.548 0.815 1.017 1.189 1.338 1.472 1.592 1.82 1.916 2.009 2.062 2.302 2.394 2.578 2.756 2.934 3.016 3.158 3.291 3.497 3.635 3.765 3.951 4.123 4.297 4.476 4.663 4.908 5.122 5.326 5.589 5.843 6.09 6.4 6.751 7.062 7.397 7.752 8.137 8.561 9.014 9.522 10.02 10.556 11.119 11.727 12.373 13.082 13.818 14.469 14.635 14.504 14.245 13.892 13.531 13.208 12.866 12.551 12.233 11.944 11.675 11.404 11.137 10.887 10.657 10.41 10.197 10.012 9.802 9.584 9.42 9.247 9.062 8.915 8.766 8.598 8.422 8.254 8.138 8.009 7.799 7.669 7.539 7.47 7.325 7.166 7.0 6.912 6.689 6.617 6.5 6.383 6.133 5.991 5.851 5.689 5.454 5.196 4.918 4.009 -6 ,14519 ,KEBNE ,17040978,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:34:17 CET,0.0 0.91 1.221 1.427 1.605 1.782 1.946 2.087 2.351 2.463 2.563 2.622 2.866 2.966 3.14 3.302 3.483 3.572 3.742 3.913 4.139 4.275 4.417 4.648 4.872 5.078 5.264 5.438 5.671 5.898 6.12 6.395 6.658 6.902 7.171 7.468 7.76 8.096 8.446 8.798 9.181 9.607 10.111 10.602 11.137 11.734 12.384 13.068 13.775 14.417 15.008 15.196 15.023 14.781 14.506 14.211 13.912 13.556 13.218 12.887 12.608 12.35 12.063 11.769 11.505 11.277 11.038 10.824 10.64 10.443 10.243 10.068 9.88 9.686 9.529 9.361 9.196 9.026 8.842 8.711 8.574 8.356 8.203 8.054 7.983 7.84 7.682 7.521 7.446 7.241 7.211 7.115 7.019 6.847 6.746 6.626 6.494 6.345 6.167 5.933 5.512 -7 ,3147 ,KEBNE ,17040979,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:35:38 CET,0.0 0.382 0.571 0.741 0.883 1.016 1.154 1.295 1.564 1.701 1.832 1.924 2.186 2.305 2.521 2.718 2.91 3.003 3.166 3.313 3.542 3.69 3.833 4.038 4.247 4.447 4.626 4.799 5.033 5.268 5.484 5.74 5.995 6.24 6.527 6.859 7.179 7.527 7.905 8.29 8.648 9.018 9.454 9.878 10.34 10.86 11.447 12.076 12.727 13.319 13.77 13.745 13.433 13.017 12.602 12.2 11.829 11.463 11.096 10.7 10.366 10.079 9.814 9.561 9.32 9.088 8.835 8.617 8.429 8.231 8.023 7.841 7.651 7.445 7.283 7.124 6.949 6.764 6.588 6.462 6.321 6.109 5.97 5.819 5.739 5.593 5.445 5.28 5.203 4.993 4.954 4.861 4.771 4.587 4.489 4.384 4.266 4.12 3.965 3.773 3.23 -8 ,16245 ,KEBNE ,17040981,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:34:10 CET,0.0 0.478 0.77 0.982 1.157 1.317 1.451 1.573 1.8 1.907 2.012 2.073 2.317 2.411 2.59 2.764 2.937 3.021 3.193 3.377 3.636 3.793 3.938 4.152 4.356 4.548 4.74 4.929 5.174 5.399 5.616 5.884 6.132 6.369 6.647 6.945 7.235 7.575 7.929 8.302 8.689 9.117 9.621 10.097 10.642 11.275 11.953 12.603 13.347 14.175 14.839 14.978 14.816 14.543 14.207 13.848 13.502 13.171 12.878 12.572 12.304 12.059 11.831 11.605 11.352 11.109 10.864 10.641 10.451 10.253 10.051 9.878 9.693 9.505 9.353 9.184 9.009 8.834 8.663 8.546 8.413 8.198 8.06 7.911 7.834 7.696 7.55 7.407 7.335 7.123 7.101 7.014 6.923 6.732 6.613 6.482 6.351 6.216 6.031 5.818 5.537 -9 ,23647 ,KEBNE ,17040982,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:34:02 CET,0.0 0.492 0.709 0.91 1.089 1.272 1.423 1.539 1.764 1.869 1.973 2.028 2.27 2.363 2.541 2.71 2.87 2.947 3.092 3.235 3.441 3.573 3.708 3.925 4.134 4.325 4.514 4.699 4.93 5.155 5.373 5.627 5.876 6.125 6.411 6.715 7.008 7.339 7.689 8.068 8.456 8.891 9.377 9.842 10.387 10.983 11.655 12.364 13.066 13.776 14.4 14.565 14.41 14.171 13.865 13.521 13.166 12.805 12.504 12.161 11.84 11.571 11.304 11.015 10.747 10.536 10.303 10.079 9.885 9.678 9.469 9.307 9.132 8.945 8.798 8.641 8.487 8.328 8.154 8.033 7.904 7.686 7.53 7.372 7.292 7.132 6.965 6.788 6.689 6.461 6.4 6.293 6.189 5.957 5.815 5.673 5.493 5.271 4.995 4.693 3.754 -10 ,9458 ,KEBNE ,17040984,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:35:58 CET,0.0 0.385 0.597 0.761 0.931 1.062 1.191 1.337 1.594 1.709 1.816 1.873 2.115 2.211 2.398 2.593 2.78 2.866 3.038 3.204 3.44 3.597 3.749 3.959 4.149 4.327 4.511 4.693 4.913 5.129 5.352 5.636 5.913 6.174 6.466 6.799 7.095 7.401 7.745 8.129 8.526 8.962 9.472 10.008 10.612 11.254 12.003 12.788 13.657 14.59 15.498 15.925 15.93 15.806 15.587 15.227 14.808 14.429 14.084 13.757 13.491 13.228 12.97 12.715 12.463 12.212 11.945 11.721 11.524 11.322 11.131 10.979 10.809 10.609 10.445 10.283 10.106 9.924 9.761 9.655 9.546 9.371 9.249 9.125 9.062 8.936 8.802 8.658 8.579 8.364 8.314 8.209 8.093 7.85 7.737 7.623 7.514 7.388 7.215 6.993 6.548 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt deleted file mode 100644 index 1465b87f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20031 ,KEBNE ,17040986,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:34:09 CET,0.0 0.476 0.671 0.819 0.912 0.975 1.027 1.061 1.106 1.132 1.152 1.023 1.18 1.185 1.193 1.202 1.201 1.195 1.184 1.173 1.146 1.119 1.082 1.023 0.953 0.879 0.802 0.72 0.603 0.485 0.36 0.179 -0.002 -0.166 -0.374 -0.645 -0.931 -1.261 -1.645 -2.088 -2.586 -3.172 -3.9 -4.732 -5.802 -7.105 -8.758 -10.901 -13.873 -17.968 -24.045 -30.581 -35.49 -39.389 -42.551 -45.239 -47.456 -49.363 -50.958 -52.474 -53.715 -54.777 -55.769 -56.694 -57.549 -58.313 -59.072 -59.738 -60.311 -60.885 -61.467 -61.941 -62.423 -62.924 -63.3 -63.683 -64.088 -64.498 -64.923 -65.204 -65.482 -65.936 -66.24 -66.527 -66.677 -66.99 -67.308 -67.662 -67.843 -68.244 -68.412 -68.604 -68.805 -69.257 -69.491 -69.729 -69.997 -70.291 -70.628 -71.024 -71.861 -2 ,24695 ,KEBNE ,17040987,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:34:34 CET,0.0 0.37 0.539 0.649 0.734 0.808 0.86 0.906 0.97 0.994 1.007 0.9 1.063 1.071 1.073 1.083 1.08 1.077 1.076 1.055 1.009 0.977 0.95 0.914 0.851 0.793 0.739 0.674 0.594 0.5 0.397 0.277 0.145 0.007 -0.166 -0.402 -0.662 -0.965 -1.303 -1.692 -2.165 -2.76 -3.515 -4.361 -5.425 -6.712 -8.372 -10.529 -13.464 -17.529 -23.668 -30.204 -35.104 -39.018 -42.163 -44.781 -46.935 -48.777 -50.304 -51.781 -53.01 -54.086 -55.092 -56.007 -56.827 -57.562 -58.312 -58.97 -59.536 -60.108 -60.69 -61.153 -61.632 -62.134 -62.512 -62.898 -63.286 -63.678 -64.081 -64.358 -64.64 -65.071 -65.371 -65.669 -65.82 -66.139 -66.485 -66.849 -67.024 -67.408 -67.527 -67.691 -67.857 -68.215 -68.409 -68.618 -68.85 -69.11 -69.399 -69.715 -70.282 -3 ,31011 ,KEBNE ,17040988,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:34:14 CET,0.0 0.478 0.711 0.862 0.996 1.102 1.175 1.244 1.354 1.408 1.455 1.374 1.539 1.566 1.639 1.683 1.697 1.707 1.722 1.713 1.699 1.69 1.673 1.659 1.647 1.609 1.552 1.487 1.393 1.312 1.224 1.095 0.957 0.813 0.644 0.426 0.184 -0.098 -0.437 -0.845 -1.313 -1.897 -2.65 -3.483 -4.546 -5.868 -7.545 -9.7 -12.656 -16.707 -22.806 -29.336 -34.181 -38.005 -41.129 -43.729 -45.911 -47.798 -49.343 -50.851 -52.125 -53.218 -54.219 -55.13 -55.966 -56.705 -57.447 -58.114 -58.691 -59.266 -59.842 -60.316 -60.807 -61.3 -61.667 -62.051 -62.437 -62.824 -63.227 -63.503 -63.79 -64.24 -64.547 -64.866 -65.024 -65.324 -65.633 -65.952 -66.104 -66.475 -66.579 -66.747 -66.918 -67.298 -67.523 -67.758 -67.994 -68.229 -68.474 -68.765 -69.398 -4 ,18939 ,KEBNE ,17040989,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:34:12 CET,0.0 0.54 0.646 0.713 0.78 0.85 0.899 0.928 0.967 0.98 0.994 0.878 1.04 1.045 1.04 1.042 1.036 1.029 1.017 1.009 1.009 1.005 0.987 0.961 0.936 0.887 0.826 0.766 0.69 0.611 0.521 0.395 0.256 0.11 -0.064 -0.292 -0.54 -0.835 -1.183 -1.581 -2.037 -2.607 -3.386 -4.245 -5.321 -6.682 -8.396 -10.508 -13.377 -17.429 -23.6 -30.172 -35.009 -38.825 -41.922 -44.532 -46.694 -48.58 -50.168 -51.71 -52.985 -54.077 -55.096 -56.048 -56.895 -57.635 -58.382 -59.028 -59.593 -60.179 -60.767 -61.236 -61.713 -62.216 -62.604 -62.987 -63.368 -63.761 -64.179 -64.46 -64.741 -65.188 -65.498 -65.81 -65.964 -66.29 -66.632 -66.954 -67.115 -67.496 -67.614 -67.789 -67.972 -68.336 -68.516 -68.724 -68.952 -69.205 -69.466 -69.796 -70.427 -5 ,11476 ,KEBNE ,17040990,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:34:13 CET,0.0 0.312 0.42 0.515 0.618 0.705 0.807 0.901 1.006 1.04 1.074 0.991 1.158 1.172 1.208 1.234 1.246 1.254 1.262 1.28 1.307 1.308 1.3 1.265 1.224 1.18 1.127 1.069 0.991 0.911 0.813 0.681 0.536 0.379 0.197 -0.032 -0.282 -0.59 -0.955 -1.383 -1.86 -2.446 -3.215 -4.056 -5.117 -6.417 -8.117 -10.315 -13.272 -17.32 -23.42 -29.957 -34.843 -38.717 -41.809 -44.4 -46.575 -48.466 -50.029 -51.528 -52.793 -53.893 -54.909 -55.812 -56.606 -57.328 -58.07 -58.729 -59.298 -59.872 -60.451 -60.921 -61.398 -61.891 -62.277 -62.67 -63.056 -63.454 -63.865 -64.137 -64.415 -64.84 -65.13 -65.438 -65.599 -65.924 -66.241 -66.57 -66.738 -67.125 -67.26 -67.445 -67.641 -68.089 -68.324 -68.547 -68.809 -69.105 -69.427 -69.869 -70.975 -6 ,6984 ,KEBNE ,17040991,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:34:15 CET,0.0 0.672 0.933 1.15 1.337 1.461 1.546 1.617 1.762 1.818 1.85 1.748 1.908 1.927 1.978 2.023 2.059 2.068 2.065 2.071 2.087 2.086 2.079 2.071 2.046 2.001 1.955 1.9 1.809 1.713 1.613 1.487 1.358 1.214 1.019 0.777 0.521 0.222 -0.12 -0.534 -1.013 -1.584 -2.309 -3.13 -4.192 -5.526 -7.26 -9.436 -12.316 -16.361 -22.514 -29.191 -34.133 -37.923 -40.93 -43.473 -45.631 -47.567 -49.193 -50.75 -52.044 -53.137 -54.141 -55.077 -55.941 -56.701 -57.463 -58.135 -58.696 -59.258 -59.838 -60.311 -60.779 -61.247 -61.61 -61.998 -62.404 -62.803 -63.203 -63.479 -63.761 -64.201 -64.5 -64.809 -64.969 -65.295 -65.622 -65.951 -66.115 -66.497 -66.651 -66.843 -67.035 -67.408 -67.598 -67.801 -68.012 -68.244 -68.512 -68.851 -69.406 -7 ,23397 ,KEBNE ,17040992,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:34:10 CET,0.0 0.523 0.791 0.986 1.14 1.261 1.349 1.43 1.572 1.626 1.67 1.598 1.774 1.801 1.843 1.866 1.895 1.905 1.908 1.921 1.929 1.915 1.894 1.854 1.81 1.769 1.719 1.655 1.57 1.49 1.397 1.258 1.111 0.96 0.763 0.514 0.251 -0.053 -0.402 -0.808 -1.274 -1.848 -2.59 -3.427 -4.505 -5.831 -7.547 -9.774 -12.731 -16.761 -22.821 -29.307 -34.178 -38.025 -41.109 -43.699 -45.855 -47.697 -49.237 -50.733 -51.98 -53.056 -54.047 -54.971 -55.821 -56.571 -57.318 -57.974 -58.533 -59.104 -59.684 -60.155 -60.645 -61.143 -61.52 -61.897 -62.275 -62.671 -63.064 -63.328 -63.61 -64.039 -64.339 -64.662 -64.825 -65.146 -65.473 -65.82 -66.006 -66.412 -66.583 -66.783 -66.986 -67.411 -67.637 -67.884 -68.148 -68.418 -68.746 -69.119 -69.81 -8 ,5659 ,KEBNE ,17040993,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:34:09 CET,0.0 0.666 0.96 1.172 1.331 1.424 1.502 1.574 1.707 1.761 1.805 1.755 1.933 1.958 2.006 2.027 2.031 2.036 2.046 2.053 2.054 2.038 2.023 1.988 1.941 1.903 1.864 1.813 1.715 1.614 1.517 1.389 1.249 1.101 0.914 0.675 0.435 0.159 -0.177 -0.577 -1.041 -1.624 -2.376 -3.2 -4.248 -5.548 -7.247 -9.417 -12.343 -16.403 -22.521 -28.986 -33.88 -37.837 -40.967 -43.572 -45.716 -47.576 -49.147 -50.638 -51.89 -52.981 -53.98 -54.898 -55.739 -56.491 -57.259 -57.926 -58.485 -59.059 -59.633 -60.087 -60.555 -61.052 -61.44 -61.821 -62.206 -62.6 -63.011 -63.296 -63.578 -64.019 -64.32 -64.621 -64.776 -65.099 -65.445 -65.789 -65.958 -66.354 -66.503 -66.692 -66.883 -67.287 -67.507 -67.748 -68.006 -68.252 -68.481 -68.734 -69.162 -9 ,21453 ,KEBNE ,17040994,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:34:22 CET,0.0 0.352 0.49 0.63 0.736 0.793 0.834 0.881 0.964 1.002 1.041 0.972 1.149 1.172 1.208 1.247 1.281 1.289 1.296 1.304 1.306 1.301 1.292 1.271 1.248 1.218 1.175 1.119 1.035 0.942 0.84 0.705 0.563 0.412 0.216 -0.022 -0.276 -0.584 -0.941 -1.35 -1.811 -2.383 -3.127 -3.945 -4.992 -6.308 -8.008 -10.191 -13.125 -17.214 -23.373 -29.966 -34.874 -38.697 -41.796 -44.408 -46.576 -48.458 -50.005 -51.5 -52.751 -53.825 -54.818 -55.733 -56.568 -57.305 -58.056 -58.704 -59.25 -59.823 -60.412 -60.89 -61.375 -61.88 -62.273 -62.659 -63.049 -63.458 -63.866 -64.139 -64.417 -64.862 -65.159 -65.447 -65.606 -65.938 -66.272 -66.615 -66.785 -67.192 -67.358 -67.545 -67.75 -68.179 -68.394 -68.618 -68.869 -69.145 -69.477 -69.904 -70.551 -10 ,11150 ,KEBNE ,17040995,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:34:03 CET,0.0 0.569 0.803 0.98 1.097 1.175 1.267 1.354 1.49 1.54 1.572 1.474 1.644 1.666 1.7 1.732 1.759 1.77 1.785 1.794 1.791 1.775 1.766 1.753 1.72 1.684 1.647 1.594 1.517 1.426 1.322 1.177 1.025 0.863 0.67 0.446 0.196 -0.104 -0.463 -0.883 -1.35 -1.928 -2.678 -3.511 -4.58 -5.875 -7.56 -9.718 -12.616 -16.708 -22.886 -29.445 -34.298 -38.169 -41.293 -43.896 -46.076 -47.993 -49.598 -51.131 -52.388 -53.473 -54.512 -55.468 -56.32 -57.086 -57.864 -58.537 -59.114 -59.711 -60.309 -60.78 -61.256 -61.751 -62.128 -62.519 -62.923 -63.326 -63.735 -64.006 -64.278 -64.708 -65.013 -65.323 -65.471 -65.778 -66.103 -66.442 -66.616 -67.008 -67.161 -67.344 -67.527 -67.931 -68.128 -68.321 -68.529 -68.759 -69.038 -69.417 -70.19 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt deleted file mode 100644 index d6f47b12..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27422 ,KEBNE ,17040996,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:33:59 CET,0.0 0.424 0.579 0.694 0.804 0.899 0.991 1.078 1.25 1.319 1.367 1.301 1.489 1.532 1.601 1.66 1.7 1.722 1.766 1.799 1.833 1.84 1.843 1.853 1.856 1.863 1.862 1.855 1.838 1.802 1.772 1.737 1.684 1.594 1.456 1.279 1.109 0.901 0.655 0.386 0.046 -0.388 -0.947 -1.563 -2.382 -3.444 -4.847 -6.693 -9.201 -12.745 -18.175 -24.189 -28.805 -32.428 -35.376 -37.87 -39.896 -41.665 -43.167 -44.598 -45.794 -46.821 -47.765 -48.634 -49.428 -50.129 -50.854 -51.508 -52.048 -52.602 -53.17 -53.62 -54.084 -54.575 -54.946 -55.32 -55.72 -56.134 -56.534 -56.797 -57.07 -57.487 -57.779 -58.072 -58.218 -58.518 -58.827 -59.14 -59.307 -59.684 -59.834 -60.005 -60.172 -60.52 -60.693 -60.893 -61.108 -61.322 -61.603 -61.982 -62.534 -2 ,11303 ,KEBNE ,17040997,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:35:56 CET,0.0 1.118 1.37 1.495 1.596 1.67 1.734 1.8 1.902 1.941 1.981 1.92 2.097 2.12 2.169 2.21 2.247 2.26 2.285 2.307 2.328 2.335 2.33 2.319 2.314 2.298 2.287 2.28 2.257 2.227 2.175 2.098 2.022 1.93 1.816 1.685 1.524 1.315 1.067 0.787 0.458 0.033 -0.532 -1.192 -2.052 -3.098 -4.471 -6.286 -8.848 -12.563 -18.175 -24.204 -28.73 -32.34 -35.295 -37.801 -39.887 -41.696 -43.196 -44.596 -45.751 -46.765 -47.72 -48.604 -49.396 -50.114 -50.86 -51.512 -52.063 -52.617 -53.192 -53.655 -54.119 -54.586 -54.943 -55.317 -55.697 -56.088 -56.487 -56.753 -57.03 -57.461 -57.749 -58.048 -58.205 -58.533 -58.869 -59.208 -59.372 -59.74 -59.903 -60.085 -60.284 -60.723 -60.931 -61.141 -61.375 -61.653 -61.985 -62.365 -63.155 -3 ,24802 ,KEBNE ,17040998,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:34:14 CET,0.0 0.383 0.533 0.64 0.722 0.789 0.85 0.907 1.013 1.054 1.1 1.05 1.234 1.264 1.33 1.401 1.448 1.467 1.503 1.521 1.53 1.536 1.539 1.55 1.554 1.542 1.534 1.533 1.523 1.492 1.442 1.357 1.261 1.169 1.047 0.875 0.695 0.477 0.223 -0.061 -0.402 -0.834 -1.416 -2.073 -2.922 -3.971 -5.359 -7.197 -9.723 -13.297 -18.758 -24.788 -29.396 -32.987 -35.884 -38.38 -40.473 -42.259 -43.762 -45.217 -46.403 -47.429 -48.375 -49.243 -50.035 -50.764 -51.493 -52.11 -52.647 -53.202 -53.767 -54.218 -54.686 -55.162 -55.519 -55.889 -56.266 -56.646 -57.028 -57.29 -57.564 -58.0 -58.295 -58.583 -58.727 -59.015 -59.316 -59.631 -59.79 -60.147 -60.268 -60.44 -60.599 -60.956 -61.145 -61.346 -61.564 -61.781 -62.02 -62.329 -63.132 -4 ,25419 ,KEBNE ,17040999,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:36:04 CET,0.0 0.345 0.497 0.615 0.69 0.77 0.853 0.914 1.019 1.084 1.148 1.096 1.276 1.31 1.368 1.417 1.447 1.461 1.492 1.511 1.52 1.522 1.534 1.547 1.539 1.535 1.523 1.502 1.475 1.432 1.364 1.261 1.147 1.039 0.903 0.723 0.561 0.37 0.133 -0.17 -0.553 -0.996 -1.536 -2.158 -3.01 -4.089 -5.517 -7.369 -9.876 -13.471 -19.011 -25.003 -29.51 -33.101 -36.06 -38.53 -40.563 -42.333 -43.817 -45.285 -46.523 -47.575 -48.539 -49.445 -50.266 -50.979 -51.693 -52.315 -52.845 -53.387 -53.947 -54.403 -54.872 -55.341 -55.692 -56.056 -56.427 -56.812 -57.218 -57.494 -57.779 -58.221 -58.518 -58.812 -58.959 -59.278 -59.605 -59.921 -60.087 -60.458 -60.608 -60.795 -60.987 -61.406 -61.628 -61.853 -62.101 -62.359 -62.637 -62.988 -63.695 -5 ,25812 ,KEBNE ,17041000,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:35:46 CET,0.0 0.332 0.467 0.558 0.639 0.703 0.781 0.843 0.933 0.985 1.035 0.967 1.141 1.162 1.213 1.256 1.281 1.293 1.312 1.335 1.385 1.413 1.436 1.461 1.468 1.472 1.471 1.461 1.449 1.419 1.367 1.299 1.23 1.154 1.038 0.876 0.696 0.481 0.235 -0.041 -0.384 -0.845 -1.443 -2.105 -2.932 -3.963 -5.354 -7.181 -9.714 -13.34 -18.904 -25.05 -29.697 -33.345 -36.309 -38.794 -40.892 -42.731 -44.234 -45.701 -46.937 -48.007 -48.987 -49.874 -50.667 -51.375 -52.095 -52.725 -53.255 -53.791 -54.358 -54.822 -55.3 -55.796 -56.165 -56.53 -56.9 -57.292 -57.697 -57.96 -58.232 -58.645 -58.93 -59.229 -59.381 -59.688 -59.995 -60.322 -60.49 -60.864 -61.034 -61.226 -61.425 -61.863 -62.094 -62.314 -62.553 -62.841 -63.137 -63.423 -63.82 -6 ,29802 ,KEBNE ,17041001,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:36:04 CET,0.0 0.556 0.743 0.9 1.046 1.165 1.255 1.339 1.505 1.571 1.626 1.559 1.74 1.785 1.864 1.92 1.958 1.976 2.013 2.051 2.107 2.131 2.144 2.159 2.16 2.148 2.135 2.122 2.098 2.064 2.014 1.948 1.868 1.761 1.622 1.474 1.307 1.092 0.823 0.49 0.129 -0.299 -0.868 -1.521 -2.362 -3.416 -4.777 -6.563 -9.127 -12.763 -18.262 -24.441 -29.24 -32.983 -35.983 -38.513 -40.631 -42.449 -43.944 -45.377 -46.568 -47.59 -48.54 -49.407 -50.183 -50.89 -51.615 -52.243 -52.773 -53.332 -53.899 -54.349 -54.821 -55.295 -55.647 -56.019 -56.406 -56.804 -57.213 -57.48 -57.743 -58.155 -58.443 -58.732 -58.88 -59.177 -59.473 -59.783 -59.933 -60.278 -60.39 -60.56 -60.734 -61.123 -61.328 -61.528 -61.739 -61.974 -62.247 -62.557 -63.113 -7 ,20263 ,KEBNE ,17041002,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:34:33 CET,0.0 0.37 0.473 0.581 0.682 0.768 0.853 0.925 1.054 1.118 1.181 1.153 1.344 1.386 1.461 1.524 1.57 1.588 1.64 1.693 1.739 1.758 1.772 1.796 1.827 1.851 1.847 1.823 1.788 1.754 1.714 1.652 1.571 1.485 1.381 1.23 1.066 0.883 0.644 0.338 -0.033 -0.488 -1.068 -1.717 -2.55 -3.655 -5.109 -6.978 -9.527 -13.091 -18.614 -24.674 -29.231 -32.798 -35.816 -38.427 -40.509 -42.283 -43.775 -45.21 -46.38 -47.395 -48.343 -49.214 -50.017 -50.722 -51.429 -52.064 -52.62 -53.185 -53.748 -54.207 -54.686 -55.177 -55.553 -55.949 -56.338 -56.713 -57.112 -57.381 -57.644 -58.044 -58.327 -58.63 -58.783 -59.098 -59.421 -59.74 -59.904 -60.285 -60.454 -60.65 -60.856 -61.274 -61.493 -61.731 -61.991 -62.283 -62.635 -63.096 -64.024 -8 ,20752 ,KEBNE ,17041003,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:33:58 CET,0.0 0.819 1.036 1.225 1.391 1.519 1.631 1.729 1.889 1.953 2.01 1.99 2.184 2.216 2.274 2.328 2.367 2.391 2.43 2.448 2.46 2.465 2.471 2.488 2.514 2.521 2.513 2.495 2.454 2.396 2.333 2.27 2.209 2.147 2.055 1.936 1.791 1.591 1.37 1.101 0.738 0.273 -0.314 -0.965 -1.836 -2.955 -4.377 -6.22 -8.734 -12.347 -17.827 -23.692 -28.165 -31.802 -34.752 -37.235 -39.3 -41.065 -42.526 -43.962 -45.151 -46.175 -47.142 -48.038 -48.854 -49.598 -50.343 -50.97 -51.508 -52.077 -52.665 -53.134 -53.607 -54.088 -54.457 -54.838 -55.221 -55.606 -56.003 -56.275 -56.544 -56.937 -57.209 -57.489 -57.631 -57.92 -58.215 -58.52 -58.672 -59.025 -59.104 -59.249 -59.414 -59.775 -59.961 -60.165 -60.404 -60.656 -60.924 -61.224 -61.681 -9 ,24056 ,KEBNE ,17041004,Thu Dec 23 02:12:08 CET,Thu Dec 23 03:34:22 CET,0.0 0.438 0.724 0.911 1.055 1.183 1.284 1.369 1.515 1.58 1.643 1.609 1.791 1.824 1.891 1.941 1.984 2.009 2.048 2.069 2.105 2.126 2.143 2.151 2.154 2.157 2.152 2.147 2.129 2.088 2.043 1.993 1.925 1.84 1.738 1.604 1.439 1.231 0.998 0.709 0.35 -0.1 -0.693 -1.357 -2.223 -3.284 -4.693 -6.545 -9.054 -12.556 -17.982 -23.89 -28.37 -31.958 -34.894 -37.448 -39.612 -41.458 -42.928 -44.341 -45.554 -46.599 -47.541 -48.423 -49.23 -49.954 -50.696 -51.33 -51.874 -52.425 -52.982 -53.434 -53.893 -54.381 -54.763 -55.148 -55.532 -55.92 -56.314 -56.581 -56.852 -57.281 -57.583 -57.889 -58.049 -58.38 -58.7 -59.024 -59.198 -59.585 -59.754 -59.938 -60.122 -60.496 -60.698 -60.9 -61.116 -61.358 -61.603 -61.905 -62.541 -10 ,21852 ,KEBNE ,17041005,Thu Dec 23 02:12:09 CET,Thu Dec 23 03:34:24 CET,0.0 0.639 0.758 0.833 0.922 0.986 1.04 1.1 1.196 1.243 1.282 1.182 1.35 1.388 1.472 1.539 1.588 1.61 1.649 1.675 1.691 1.701 1.706 1.717 1.739 1.739 1.726 1.714 1.685 1.643 1.597 1.545 1.49 1.416 1.311 1.167 0.996 0.786 0.529 0.215 -0.138 -0.585 -1.165 -1.788 -2.62 -3.704 -5.108 -6.923 -9.466 -13.125 -18.764 -24.946 -29.567 -33.173 -36.091 -38.567 -40.662 -42.491 -44.007 -45.446 -46.619 -47.645 -48.607 -49.483 -50.288 -51.006 -51.727 -52.349 -52.879 -53.427 -53.989 -54.452 -54.919 -55.398 -55.768 -56.139 -56.508 -56.894 -57.292 -57.554 -57.82 -58.248 -58.548 -58.852 -59.004 -59.309 -59.635 -59.972 -60.15 -60.532 -60.69 -60.874 -61.059 -61.495 -61.742 -61.986 -62.254 -62.539 -62.801 -63.105 -64.013 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt deleted file mode 100644 index 42e587e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25678 ,KEBNE ,17041006,Thu Dec 23 02:14:15 CET,Thu Dec 23 03:37:57 CET,0.0 0.449 0.702 0.897 1.072 1.219 1.351 1.48 1.74 1.875 2.005 2.092 2.348 2.455 2.662 2.862 3.063 3.167 3.367 3.559 3.832 4.007 4.187 4.449 4.707 4.959 5.193 5.433 5.752 6.061 6.37 6.75 7.126 7.476 7.889 8.369 8.846 9.363 9.905 10.531 11.221 11.975 12.847 13.739 14.817 16.087 17.556 19.23 21.237 23.613 26.621 29.209 30.766 31.677 32.285 32.729 33.032 33.236 33.367 33.464 33.526 33.551 33.543 33.528 33.493 33.451 33.411 33.365 33.308 33.244 33.176 33.116 33.051 32.97 32.909 32.849 32.794 32.735 32.662 32.614 32.559 32.466 32.409 32.338 32.3 32.234 32.16 32.073 32.029 31.872 31.883 31.828 31.77 31.645 31.569 31.478 31.355 31.218 31.054 30.777 30.265 -2 ,22938 ,KEBNE ,17041007,Thu Dec 23 02:13:11 CET,Thu Dec 23 03:34:41 CET,0.0 0.4 0.657 0.898 1.091 1.268 1.427 1.585 1.867 1.998 2.126 2.236 2.505 2.618 2.825 3.025 3.226 3.322 3.505 3.688 3.946 4.115 4.282 4.511 4.736 4.978 5.221 5.462 5.78 6.1 6.414 6.786 7.152 7.522 7.959 8.452 8.94 9.466 10.021 10.618 11.258 12.012 12.944 13.892 14.961 16.156 17.548 19.159 21.135 23.49 26.426 28.979 30.498 31.486 32.127 32.542 32.845 33.082 33.243 33.354 33.407 33.419 33.402 33.389 33.377 33.333 33.269 33.212 33.161 33.113 33.047 32.969 32.89 32.817 32.742 32.649 32.548 32.452 32.349 32.276 32.2 32.067 31.974 31.893 31.856 31.778 31.691 31.606 31.561 31.397 31.368 31.298 31.236 31.081 30.987 30.889 30.797 30.668 30.49 30.31 29.757 -3 ,2164 ,KEBNE ,17041008,Thu Dec 23 02:13:11 CET,Thu Dec 23 03:34:56 CET,0.0 0.726 1.079 1.36 1.58 1.787 1.983 2.164 2.508 2.667 2.82 2.972 3.247 3.377 3.639 3.877 4.097 4.209 4.433 4.641 4.944 5.145 5.341 5.617 5.879 6.143 6.395 6.64 6.971 7.282 7.586 7.975 8.35 8.709 9.135 9.621 10.074 10.571 11.129 11.747 12.404 13.149 14.032 14.899 15.9 17.043 18.444 20.124 22.2 24.681 27.615 30.043 31.509 32.486 33.135 33.592 33.903 34.117 34.244 34.343 34.387 34.389 34.393 34.369 34.306 34.242 34.175 34.113 34.051 33.979 33.905 33.827 33.738 33.651 33.586 33.517 33.435 33.344 33.233 33.143 33.059 32.939 32.847 32.752 32.7 32.585 32.47 32.348 32.285 32.1 32.034 31.941 31.834 31.601 31.482 31.363 31.235 31.077 30.89 30.613 29.985 -4 ,18731 ,KEBNE ,17041009,Thu Dec 23 02:13:11 CET,Thu Dec 23 03:34:50 CET,0.0 0.483 0.734 0.933 1.11 1.277 1.437 1.6 1.951 2.118 2.272 2.405 2.68 2.811 3.057 3.301 3.538 3.655 3.888 4.111 4.424 4.614 4.801 5.084 5.361 5.619 5.87 6.124 6.454 6.783 7.095 7.489 7.889 8.26 8.687 9.16 9.604 10.109 10.686 11.297 11.944 12.676 13.514 14.381 15.431 16.678 18.187 19.941 21.963 24.277 26.982 29.206 30.74 31.798 32.432 32.84 33.131 33.336 33.443 33.518 33.557 33.561 33.541 33.529 33.517 33.491 33.437 33.374 33.325 33.268 33.203 33.151 33.087 33.002 32.922 32.831 32.735 32.628 32.52 32.449 32.375 32.235 32.124 32.018 31.967 31.86 31.75 31.618 31.544 31.365 31.315 31.231 31.134 30.896 30.753 30.599 30.437 30.262 30.049 29.752 28.981 -5 ,14791 ,KEBNE ,17041010,Thu Dec 23 02:13:11 CET,Thu Dec 23 03:34:45 CET,0.0 0.992 1.432 1.729 1.964 2.173 2.364 2.536 2.868 3.023 3.175 3.326 3.602 3.726 3.951 4.163 4.381 4.493 4.697 4.891 5.196 5.398 5.59 5.856 6.113 6.372 6.63 6.876 7.197 7.518 7.826 8.202 8.575 8.937 9.339 9.793 10.242 10.756 11.323 11.93 12.6 13.379 14.301 15.203 16.232 17.431 18.886 20.593 22.728 25.287 28.3 30.818 32.314 33.291 33.906 34.328 34.643 34.864 34.988 35.076 35.152 35.194 35.211 35.204 35.167 35.129 35.07 35.012 34.956 34.883 34.804 34.73 34.646 34.539 34.457 34.381 34.302 34.226 34.132 34.064 33.991 33.86 33.758 33.654 33.604 33.494 33.376 33.246 33.175 32.991 32.928 32.835 32.748 32.593 32.503 32.417 32.319 32.17 32.009 31.836 31.108 -6 ,18780 ,KEBNE ,17041011,Thu Dec 23 02:14:15 CET,Thu Dec 23 03:38:18 CET,0.0 0.613 0.929 1.148 1.361 1.564 1.75 1.927 2.253 2.408 2.561 2.711 3.009 3.156 3.415 3.641 3.859 3.964 4.183 4.399 4.696 4.886 5.07 5.353 5.623 5.882 6.146 6.404 6.737 7.071 7.392 7.764 8.131 8.503 8.94 9.42 9.859 10.357 10.925 11.531 12.171 12.907 13.811 14.723 15.772 16.957 18.362 19.989 21.934 24.301 27.21 29.583 30.927 31.794 32.385 32.753 32.999 33.199 33.314 33.375 33.39 33.394 33.379 33.353 33.308 33.242 33.17 33.095 33.016 32.925 32.829 32.757 32.679 32.574 32.495 32.418 32.321 32.223 32.118 32.04 31.951 31.81 31.715 31.603 31.544 31.427 31.304 31.149 31.069 30.89 30.843 30.754 30.671 30.471 30.33 30.191 30.042 29.852 29.593 29.295 28.608 -7 ,4114 ,KEBNE ,17041012,Thu Dec 23 02:14:15 CET,Thu Dec 23 03:37:11 CET,0.0 0.956 1.281 1.538 1.78 1.998 2.191 2.372 2.718 2.863 2.997 3.108 3.369 3.488 3.748 3.992 4.219 4.333 4.547 4.756 5.051 5.239 5.426 5.7 5.978 6.244 6.494 6.747 7.074 7.388 7.697 8.07 8.437 8.801 9.216 9.672 10.12 10.62 11.153 11.736 12.385 13.132 14.013 14.912 15.963 17.184 18.614 20.267 22.212 24.565 27.669 30.357 31.909 32.889 33.548 33.987 34.243 34.42 34.549 34.631 34.668 34.682 34.671 34.642 34.607 34.56 34.498 34.431 34.369 34.29 34.184 34.105 34.033 33.945 33.872 33.796 33.708 33.619 33.519 33.435 33.341 33.201 33.108 33.008 32.953 32.831 32.703 32.562 32.48 32.29 32.207 32.11 32.032 31.891 31.803 31.712 31.618 31.493 31.318 31.128 30.567 -8 ,20171 ,KEBNE ,17041013,Thu Dec 23 02:14:14 CET,Thu Dec 23 03:37:53 CET,0.0 0.663 1.009 1.263 1.472 1.669 1.866 2.053 2.395 2.549 2.685 2.803 3.074 3.198 3.449 3.695 3.924 4.035 4.255 4.462 4.764 4.97 5.162 5.428 5.696 5.961 6.219 6.471 6.802 7.12 7.43 7.811 8.199 8.577 9.01 9.515 9.992 10.528 11.121 11.745 12.411 13.188 14.091 14.971 16.055 17.328 18.794 20.42 22.36 24.718 27.689 30.273 31.814 32.775 33.388 33.802 34.086 34.286 34.408 34.494 34.553 34.579 34.573 34.546 34.511 34.469 34.415 34.363 34.308 34.256 34.177 34.099 34.028 33.936 33.865 33.79 33.711 33.63 33.528 33.458 33.389 33.268 33.177 33.067 33.009 32.903 32.803 32.7 32.649 32.495 32.497 32.438 32.375 32.203 32.109 32.029 31.942 31.831 31.667 31.465 30.978 -9 ,752 ,KEBNE ,17041014,Thu Dec 23 02:14:19 CET,Thu Dec 23 03:32:40 CET,0.0 0.408 0.637 0.845 1.031 1.19 1.327 1.453 1.709 1.835 1.958 2.045 2.303 2.423 2.666 2.897 3.12 3.227 3.436 3.66 3.973 4.162 4.348 4.628 4.903 5.16 5.411 5.665 6.0 6.316 6.618 6.997 7.363 7.721 8.153 8.643 9.104 9.618 10.202 10.823 11.464 12.19 13.059 13.961 15.042 16.258 17.68 19.291 21.223 23.575 26.524 29.094 30.631 31.588 32.225 32.687 33.008 33.199 33.316 33.403 33.446 33.446 33.414 33.383 33.338 33.285 33.221 33.149 33.084 33.002 32.9 32.82 32.744 32.656 32.586 32.512 32.445 32.381 32.313 32.269 32.211 32.096 32.023 31.96 31.92 31.816 31.72 31.624 31.575 31.414 31.402 31.334 31.26 31.104 31.004 30.885 30.76 30.618 30.455 30.251 29.664 -10 ,5416 ,KEBNE ,17041015,Thu Dec 23 02:14:15 CET,Thu Dec 23 03:35:45 CET,0.0 0.593 0.887 1.163 1.41 1.618 1.803 1.982 2.308 2.459 2.611 2.75 3.022 3.148 3.403 3.657 3.908 4.032 4.258 4.47 4.794 5.003 5.198 5.469 5.731 5.993 6.252 6.499 6.808 7.118 7.434 7.815 8.186 8.544 8.962 9.443 9.922 10.446 11.012 11.642 12.294 13.027 13.911 14.806 15.829 16.983 18.368 19.998 22.046 24.621 27.602 30.004 31.529 32.494 33.153 33.632 33.961 34.166 34.275 34.37 34.409 34.416 34.435 34.439 34.415 34.363 34.271 34.179 34.105 34.021 33.93 33.862 33.787 33.696 33.619 33.541 33.46 33.367 33.261 33.194 33.118 32.99 32.904 32.802 32.74 32.617 32.504 32.381 32.311 32.125 32.051 31.973 31.903 31.75 31.675 31.591 31.486 31.344 31.177 31.0 30.653 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index cc5c14d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2018 ,KEBNE ,17041016,Thu Dec 23 02:14:15 CET,Thu Dec 23 03:36:19 CET,0.0 0.701 1.034 1.289 1.491 1.692 1.881 2.054 2.375 2.516 2.645 2.767 3.036 3.155 3.374 3.582 3.789 3.88 4.059 4.24 4.503 4.676 4.852 5.1 5.329 5.56 5.791 6.014 6.29 6.553 6.808 7.126 7.443 7.758 8.127 8.542 8.942 9.384 9.852 10.363 10.916 11.535 12.274 13.008 13.86 14.825 15.944 17.251 18.777 20.518 22.547 23.989 24.625 24.922 25.004 24.928 24.774 24.567 24.364 24.187 24.016 23.815 23.632 23.465 23.288 23.118 22.941 22.768 22.614 22.459 22.29 22.129 21.958 21.793 21.661 21.526 21.39 21.242 21.08 20.966 20.848 20.65 20.508 20.362 20.285 20.112 19.932 19.744 19.646 19.43 19.337 19.222 19.117 18.856 18.701 18.528 18.345 18.156 17.926 17.615 17.048 -2 ,25593 ,KEBNE ,17041017,Thu Dec 23 02:14:15 CET,Thu Dec 23 03:36:06 CET,0.0 0.465 0.686 0.873 1.036 1.165 1.277 1.397 1.666 1.794 1.911 1.989 2.239 2.335 2.521 2.704 2.887 2.977 3.147 3.315 3.555 3.707 3.85 4.067 4.29 4.51 4.729 4.942 5.22 5.496 5.75 6.075 6.404 6.717 7.088 7.491 7.876 8.314 8.785 9.284 9.82 10.439 11.152 11.849 12.682 13.645 14.736 15.971 17.412 19.053 20.935 22.323 23.005 23.338 23.434 23.438 23.408 23.34 23.215 23.021 22.829 22.653 22.48 22.293 22.123 21.963 21.778 21.618 21.482 21.325 21.142 20.986 20.824 20.653 20.523 20.393 20.253 20.1 19.927 19.811 19.702 19.513 19.377 19.234 19.158 19.012 18.857 18.688 18.599 18.377 18.276 18.166 18.051 17.79 17.64 17.466 17.285 17.081 16.811 16.455 15.205 -3 ,32480 ,KEBNE ,17041018,Thu Dec 23 02:14:15 CET,Thu Dec 23 03:36:02 CET,0.0 0.604 0.877 1.074 1.242 1.401 1.548 1.676 1.914 2.039 2.161 2.255 2.516 2.626 2.826 3.012 3.194 3.283 3.458 3.635 3.909 4.079 4.244 4.497 4.745 4.994 5.221 5.44 5.727 6.005 6.271 6.584 6.893 7.207 7.571 7.972 8.362 8.805 9.282 9.782 10.307 10.893 11.612 12.346 13.188 14.133 15.2 16.429 17.888 19.589 21.576 23.121 23.869 24.191 24.316 24.315 24.258 24.154 24.026 23.859 23.679 23.51 23.323 23.113 22.911 22.741 22.552 22.355 22.188 22.027 21.859 21.722 21.571 21.41 21.29 21.16 21.025 20.89 20.753 20.652 20.534 20.339 20.218 20.093 20.02 19.876 19.731 19.569 19.481 19.261 19.176 19.064 18.953 18.682 18.522 18.36 18.192 18.023 17.809 17.516 16.713 -4 ,28242 ,KEBNE ,17041019,Thu Dec 23 02:14:14 CET,Thu Dec 23 03:36:27 CET,0.0 0.345 0.521 0.679 0.835 1.003 1.178 1.347 1.671 1.815 1.951 2.063 2.34 2.47 2.705 2.918 3.123 3.226 3.433 3.624 3.891 4.062 4.22 4.457 4.705 4.957 5.187 5.418 5.732 6.011 6.278 6.613 6.932 7.237 7.594 8.0 8.384 8.82 9.313 9.816 10.347 10.967 11.666 12.374 13.224 14.177 15.268 16.501 17.924 19.581 21.442 22.737 23.346 23.682 23.817 23.791 23.721 23.627 23.502 23.333 23.158 22.994 22.815 22.62 22.429 22.265 22.09 21.917 21.764 21.597 21.426 21.281 21.128 20.968 20.838 20.707 20.567 20.413 20.252 20.14 20.028 19.846 19.71 19.567 19.494 19.336 19.171 18.989 18.89 18.667 18.628 18.537 18.428 18.208 18.092 17.958 17.791 17.612 17.426 17.11 16.035 -5 ,26967 ,KEBNE ,17041020,Thu Dec 23 02:15:17 CET,Thu Dec 23 03:39:10 CET,0.0 0.315 0.522 0.703 0.867 1.021 1.174 1.319 1.62 1.763 1.886 1.985 2.244 2.358 2.596 2.82 3.035 3.141 3.336 3.525 3.807 3.986 4.157 4.406 4.631 4.85 5.07 5.284 5.572 5.847 6.11 6.435 6.756 7.072 7.426 7.816 8.206 8.645 9.112 9.621 10.154 10.75 11.471 12.185 13.019 13.989 15.125 16.379 17.842 19.543 21.404 22.702 23.372 23.737 23.877 23.892 23.8 23.671 23.546 23.389 23.239 23.092 22.923 22.753 22.589 22.411 22.223 22.057 21.913 21.765 21.597 21.443 21.275 21.116 20.991 20.848 20.704 20.557 20.393 20.259 20.122 19.932 19.803 19.669 19.601 19.464 19.319 19.165 19.086 18.863 18.784 18.685 18.581 18.344 18.198 18.049 17.897 17.725 17.544 17.271 16.083 -6 ,29671 ,KEBNE ,17041021,Thu Dec 23 02:15:16 CET,Thu Dec 23 03:38:30 CET,0.0 0.32 0.534 0.705 0.879 1.052 1.214 1.378 1.685 1.819 1.951 2.07 2.339 2.453 2.659 2.865 3.065 3.158 3.339 3.521 3.788 3.966 4.143 4.401 4.643 4.885 5.113 5.322 5.619 5.903 6.17 6.5 6.827 7.147 7.51 7.921 8.314 8.75 9.214 9.726 10.28 10.884 11.598 12.311 13.154 14.127 15.239 16.52 18.006 19.698 21.575 22.876 23.553 23.893 24.016 23.983 23.893 23.776 23.647 23.49 23.329 23.166 22.99 22.819 22.668 22.513 22.331 22.151 21.996 21.849 21.673 21.526 21.386 21.229 21.111 20.991 20.85 20.699 20.551 20.45 20.346 20.184 20.062 19.929 19.864 19.728 19.564 19.405 19.333 19.126 19.065 18.961 18.856 18.634 18.502 18.351 18.168 17.987 17.772 17.458 16.405 -7 ,3090 ,KEBNE ,17041022,Thu Dec 23 02:16:21 CET,Thu Dec 23 03:39:29 CET,0.0 0.792 1.111 1.359 1.568 1.768 1.957 2.121 2.41 2.543 2.667 2.76 3.033 3.166 3.404 3.622 3.849 3.956 4.149 4.325 4.587 4.759 4.923 5.179 5.441 5.693 5.923 6.145 6.431 6.71 6.972 7.293 7.627 7.943 8.292 8.683 9.062 9.474 9.925 10.426 10.959 11.563 12.283 13.007 13.842 14.774 15.874 17.148 18.592 20.254 22.245 23.738 24.509 24.884 25.044 25.043 24.967 24.884 24.79 24.636 24.462 24.298 24.125 23.944 23.775 23.615 23.428 23.247 23.091 22.938 22.77 22.619 22.468 22.318 22.192 22.058 21.922 21.778 21.626 21.507 21.38 21.177 21.031 20.889 20.817 20.651 20.48 20.324 20.241 20.032 19.985 19.896 19.81 19.596 19.469 19.329 19.188 19.024 18.82 18.543 17.775 -8 ,25289 ,KEBNE ,17041024,Thu Dec 23 02:16:21 CET,Thu Dec 23 03:40:09 CET,0.0 0.231 0.413 0.589 0.749 0.894 1.032 1.164 1.399 1.505 1.611 1.67 1.912 2.012 2.215 2.418 2.605 2.688 2.858 3.025 3.263 3.422 3.586 3.841 4.085 4.308 4.53 4.767 5.063 5.329 5.588 5.922 6.258 6.573 6.941 7.363 7.759 8.202 8.689 9.197 9.736 10.325 11.001 11.717 12.556 13.476 14.576 15.826 17.285 19.025 21.063 22.542 23.277 23.587 23.675 23.699 23.657 23.541 23.403 23.244 23.089 22.915 22.709 22.505 22.306 22.118 21.913 21.724 21.563 21.388 21.195 21.03 20.85 20.659 20.52 20.382 20.233 20.079 19.917 19.791 19.664 19.483 19.341 19.177 19.086 18.905 18.726 18.535 18.438 18.212 18.116 17.996 17.856 17.543 17.357 17.158 16.961 16.728 16.463 16.123 15.306 -9 ,28582 ,KEBNE ,17041025,Thu Dec 23 02:16:21 CET,Thu Dec 23 03:40:10 CET,0.0 0.447 0.671 0.825 0.979 1.121 1.251 1.376 1.613 1.731 1.846 1.902 2.136 2.232 2.427 2.611 2.785 2.869 3.037 3.198 3.436 3.597 3.756 3.994 4.229 4.462 4.694 4.92 5.189 5.444 5.712 6.036 6.347 6.664 7.034 7.445 7.839 8.282 8.769 9.298 9.838 10.444 11.158 11.856 12.678 13.637 14.747 15.964 17.392 19.06 20.844 21.962 22.461 22.696 22.76 22.715 22.612 22.468 22.3 22.069 21.869 21.688 21.47 21.275 21.098 20.911 20.714 20.546 20.385 20.204 20.033 19.892 19.736 19.571 19.432 19.28 19.135 18.987 18.828 18.727 18.625 18.43 18.282 18.134 18.059 17.913 17.769 17.604 17.512 17.283 17.175 17.059 16.938 16.684 16.548 16.39 16.215 16.019 15.814 15.548 14.728 -10 ,13881 ,KEBNE ,17041027,Thu Dec 23 02:16:21 CET,Thu Dec 23 03:39:54 CET,0.0 0.355 0.537 0.692 0.85 1.001 1.132 1.251 1.482 1.59 1.698 1.77 2.024 2.131 2.334 2.522 2.699 2.789 2.979 3.175 3.453 3.631 3.803 4.047 4.286 4.525 4.755 4.971 5.249 5.523 5.797 6.12 6.426 6.725 7.082 7.5 7.898 8.319 8.788 9.314 9.848 10.423 11.107 11.831 12.679 13.613 14.723 15.975 17.383 19.003 20.953 22.43 23.122 23.418 23.53 23.54 23.465 23.358 23.225 23.047 22.883 22.717 22.544 22.358 22.173 22.009 21.835 21.674 21.529 21.375 21.219 21.077 20.92 20.767 20.642 20.49 20.327 20.171 20.001 19.882 19.761 19.579 19.45 19.308 19.236 19.074 18.896 18.72 18.625 18.399 18.305 18.193 18.076 17.797 17.619 17.418 17.208 16.975 16.669 16.234 15.118 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt deleted file mode 100644 index 498a6920..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5594 ,TETRA ,17977674,Tue Dec 21 07:34:33 CET,Tue Dec 21 09:08:55 CET,0.0 0.677 0.949 1.132 1.307 1.483 1.656 1.812 2.08 2.197 2.318 2.346 2.683 2.798 3.019 3.231 3.433 3.529 3.717 3.903 4.168 4.336 4.493 4.719 4.946 5.168 5.379 5.588 5.847 6.093 6.344 6.648 6.946 7.234 7.574 7.962 8.307 8.684 9.11 9.571 10.044 10.546 11.135 11.722 12.401 13.185 14.027 14.914 15.852 16.762 17.606 17.888 17.729 17.436 17.057 16.649 16.25 15.859 15.495 15.143 14.85 14.566 14.284 13.992 13.701 13.429 13.16 12.911 12.682 12.454 12.23 12.048 11.863 11.668 11.503 11.332 11.163 10.99 10.804 10.669 10.54 10.356 10.216 10.054 9.974 9.8 9.603 9.411 9.306 8.98 8.936 8.823 8.705 8.446 8.307 8.159 7.995 7.811 7.579 7.237 6.591 -2 ,3965 ,TETRA ,17977675,Tue Dec 21 07:35:24 CET,Tue Dec 21 09:14:45 CET,0.0 0.442 0.681 0.892 1.062 1.223 1.373 1.5 1.746 1.861 1.972 1.985 2.31 2.409 2.602 2.789 2.966 3.049 3.215 3.38 3.625 3.78 3.936 4.164 4.388 4.615 4.833 5.058 5.358 5.637 5.905 6.228 6.532 6.823 7.173 7.563 7.941 8.353 8.774 9.197 9.643 10.182 10.784 11.362 12.013 12.706 13.502 14.369 15.269 16.16 16.946 17.181 17.035 16.74 16.378 16.019 15.639 15.248 14.913 14.556 14.231 13.932 13.634 13.361 13.093 12.86 12.624 12.393 12.188 11.972 11.737 11.544 11.353 11.151 10.991 10.821 10.649 10.476 10.295 10.165 10.029 9.819 9.683 9.544 9.464 9.296 9.121 8.921 8.821 8.527 8.547 8.441 8.329 8.119 7.996 7.854 7.711 7.563 7.395 7.203 6.828 -3 ,2615 ,TETRA ,17977676,Tue Dec 21 07:35:24 CET,Tue Dec 21 09:15:30 CET,0.0 0.447 0.724 0.967 1.159 1.313 1.445 1.576 1.84 1.976 2.112 2.158 2.497 2.612 2.825 3.029 3.235 3.337 3.516 3.684 3.95 4.127 4.293 4.535 4.775 4.998 5.21 5.424 5.705 5.978 6.249 6.569 6.858 7.135 7.463 7.821 8.177 8.567 8.98 9.444 9.925 10.441 11.039 11.64 12.309 12.986 13.776 14.617 15.463 16.354 17.158 17.443 17.306 17.014 16.634 16.225 15.876 15.517 15.152 14.781 14.473 14.2 13.904 13.6 13.336 13.098 12.832 12.587 12.38 12.165 11.933 11.745 11.543 11.327 11.18 11.034 10.877 10.725 10.579 10.476 10.363 10.169 10.028 9.882 9.806 9.66 9.514 9.348 9.258 8.962 8.975 8.87 8.755 8.527 8.41 8.291 8.162 8.012 7.839 7.634 7.132 -4 ,801 ,TETRA ,17977677,Tue Dec 21 07:36:19 CET,Tue Dec 21 09:12:02 CET,0.0 0.528 0.855 1.091 1.319 1.518 1.689 1.847 2.136 2.276 2.424 2.509 2.858 2.976 3.204 3.408 3.599 3.697 3.899 4.085 4.342 4.511 4.679 4.929 5.172 5.402 5.625 5.841 6.112 6.375 6.631 6.931 7.226 7.505 7.819 8.189 8.552 8.934 9.338 9.791 10.272 10.801 11.4 11.964 12.623 13.334 14.13 14.973 15.858 16.797 17.701 17.954 17.812 17.535 17.187 16.827 16.457 16.105 15.768 15.393 15.061 14.764 14.479 14.211 13.957 13.701 13.441 13.217 13.016 12.807 12.592 12.421 12.228 12.017 11.86 11.698 11.53 11.349 11.161 11.02 10.877 10.682 10.542 10.392 10.318 10.182 10.035 9.887 9.816 9.537 9.578 9.487 9.395 9.169 9.033 8.895 8.757 8.611 8.459 8.272 7.906 -5 ,7867 ,TETRA ,17977678,Tue Dec 21 07:36:21 CET,Tue Dec 21 09:12:46 CET,0.0 0.396 0.64 0.849 1.042 1.213 1.351 1.493 1.754 1.871 1.991 1.996 2.318 2.425 2.627 2.808 2.987 3.074 3.249 3.432 3.695 3.864 4.048 4.326 4.59 4.821 5.028 5.237 5.52 5.784 6.035 6.354 6.653 6.937 7.259 7.613 7.962 8.339 8.738 9.161 9.62 10.184 10.821 11.4 12.048 12.761 13.544 14.387 15.34 16.292 17.146 17.564 17.511 17.222 16.861 16.462 16.048 15.653 15.307 14.962 14.679 14.401 14.117 13.869 13.625 13.387 13.155 12.951 12.769 12.573 12.371 12.196 12.0 11.793 11.634 11.473 11.298 11.111 10.932 10.805 10.665 10.436 10.269 10.098 10.014 9.848 9.672 9.491 9.393 9.081 9.055 8.946 8.842 8.638 8.526 8.392 8.248 8.1 7.933 7.67 7.103 -6 ,27216 ,TETRA ,17977679,Tue Dec 21 07:36:23 CET,Tue Dec 21 09:12:37 CET,0.0 0.486 0.722 0.931 1.124 1.287 1.428 1.556 1.816 1.948 2.072 2.1 2.432 2.545 2.771 2.977 3.167 3.262 3.455 3.648 3.92 4.098 4.276 4.522 4.749 4.954 5.152 5.36 5.643 5.903 6.146 6.455 6.759 7.035 7.358 7.726 8.066 8.441 8.86 9.324 9.834 10.383 10.978 11.541 12.175 12.894 13.697 14.602 15.625 16.641 17.461 17.695 17.597 17.343 16.945 16.485 16.076 15.708 15.363 15.017 14.719 14.435 14.165 13.895 13.623 13.38 13.132 12.913 12.713 12.501 12.286 12.109 11.916 11.709 11.543 11.373 11.207 11.024 10.825 10.691 10.55 10.338 10.204 10.06 9.98 9.81 9.629 9.454 9.376 9.092 9.115 9.021 8.924 8.702 8.581 8.448 8.287 8.107 7.911 7.686 7.045 -7 ,24685 ,TETRA ,17977680,Tue Dec 21 07:36:25 CET,Tue Dec 21 09:11:17 CET,0.0 0.652 0.954 1.2 1.426 1.607 1.765 1.92 2.191 2.315 2.448 2.49 2.833 2.951 3.17 3.382 3.588 3.693 3.896 4.097 4.387 4.567 4.745 4.989 5.222 5.457 5.68 5.899 6.166 6.415 6.663 6.968 7.271 7.562 7.9 8.29 8.652 9.056 9.48 9.916 10.399 10.93 11.523 12.093 12.743 13.47 14.329 15.269 16.229 17.113 17.912 18.213 18.09 17.812 17.446 17.037 16.641 16.258 15.914 15.559 15.217 14.918 14.637 14.353 14.094 13.861 13.599 13.37 13.186 12.978 12.763 12.592 12.41 12.215 12.062 11.897 11.725 11.551 11.369 11.239 11.094 10.875 10.739 10.598 10.517 10.345 10.184 10.018 9.933 9.651 9.671 9.564 9.447 9.214 9.101 8.978 8.831 8.65 8.445 8.192 7.634 -8 ,10328 ,TETRA ,17977681,Tue Dec 21 07:36:21 CET,Tue Dec 21 09:12:03 CET,0.0 0.431 0.664 0.837 0.987 1.145 1.302 1.458 1.751 1.888 2.027 2.079 2.421 2.543 2.772 2.977 3.187 3.282 3.467 3.65 3.911 4.091 4.278 4.545 4.788 5.024 5.259 5.483 5.756 6.007 6.244 6.53 6.819 7.101 7.412 7.778 8.136 8.543 8.962 9.376 9.815 10.3 10.886 11.482 12.134 12.863 13.7 14.525 15.417 16.337 17.139 17.392 17.15 16.834 16.511 16.138 15.774 15.393 15.028 14.676 14.364 14.078 13.806 13.547 13.3 13.06 12.796 12.548 12.328 12.115 11.888 11.69 11.498 11.299 11.137 10.965 10.78 10.598 10.408 10.272 10.144 9.94 9.797 9.644 9.56 9.388 9.222 9.033 8.932 8.638 8.621 8.495 8.378 8.128 7.973 7.804 7.614 7.399 7.116 6.746 5.933 -9 ,31893 ,TETRA ,17977682,Tue Dec 21 07:36:25 CET,Tue Dec 21 09:12:15 CET,0.0 1.058 1.484 1.755 1.971 2.18 2.359 2.504 2.797 2.934 3.062 3.098 3.433 3.546 3.791 4.026 4.246 4.353 4.553 4.743 5.017 5.191 5.367 5.62 5.851 6.08 6.297 6.509 6.786 7.055 7.315 7.641 7.969 8.272 8.589 8.935 9.302 9.702 10.104 10.523 10.975 11.498 12.082 12.635 13.267 14.0 14.839 15.724 16.678 17.662 18.487 18.735 18.578 18.243 17.878 17.483 17.084 16.698 16.345 15.977 15.652 15.363 15.081 14.811 14.563 14.328 14.069 13.845 13.655 13.455 13.247 13.07 12.883 12.688 12.527 12.352 12.18 12.008 11.826 11.701 11.566 11.347 11.19 11.037 10.964 10.807 10.655 10.508 10.429 10.128 10.129 10.032 9.931 9.733 9.621 9.49 9.341 9.182 9.002 8.778 8.34 -10 ,29793 ,TETRA ,17977683,Tue Dec 21 07:36:24 CET,Tue Dec 21 09:12:48 CET,0.0 0.543 0.817 1.038 1.201 1.351 1.485 1.612 1.874 1.997 2.118 2.119 2.444 2.551 2.761 2.957 3.145 3.239 3.406 3.558 3.778 3.925 4.082 4.311 4.53 4.752 4.971 5.181 5.442 5.698 5.967 6.286 6.584 6.877 7.206 7.574 7.938 8.329 8.756 9.197 9.639 10.165 10.787 11.385 12.07 12.826 13.629 14.414 15.262 16.128 16.868 17.102 16.926 16.633 16.274 15.85 15.476 15.123 14.776 14.399 14.096 13.816 13.524 13.243 12.972 12.721 12.464 12.231 12.02 11.81 11.599 11.423 11.245 11.058 10.9 10.732 10.563 10.399 10.229 10.114 9.997 9.813 9.687 9.565 9.501 9.354 9.203 9.062 8.987 8.693 8.699 8.603 8.513 8.295 8.174 8.07 7.951 7.785 7.608 7.37 6.815 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt deleted file mode 100644 index ad75a25f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19156 ,KEBNE ,17041030,Thu Dec 23 02:16:21 CET,Thu Dec 23 03:39:43 CET,0.0 0.347 0.585 0.816 1.057 1.271 1.466 1.647 1.981 2.144 2.301 2.395 2.746 2.894 3.184 3.465 3.74 3.875 4.133 4.391 4.775 5.027 5.284 5.659 6.016 6.361 6.7 7.032 7.469 7.901 8.338 8.892 9.433 9.967 10.608 11.326 12.028 12.833 13.727 14.701 15.761 17.0 18.527 20.126 22.034 24.24 26.87 29.975 33.796 38.595 44.943 50.898 54.937 57.825 59.949 61.654 62.989 64.032 64.843 65.583 66.159 66.626 67.021 67.343 67.626 67.877 68.105 68.298 68.455 68.598 68.738 68.85 68.949 69.034 69.089 69.135 69.176 69.209 69.237 69.262 69.291 69.308 69.297 69.28 69.276 69.26 69.222 69.18 69.158 68.995 69.041 68.992 68.944 68.841 68.77 68.682 68.578 68.477 68.367 68.218 67.746 -2 ,17404 ,KEBNE ,17041031,Thu Dec 23 02:16:21 CET,Thu Dec 23 03:39:40 CET,0.0 1.026 1.486 1.814 2.069 2.294 2.498 2.703 3.088 3.257 3.425 3.571 3.941 4.1 4.421 4.727 5.031 5.186 5.479 5.755 6.168 6.441 6.711 7.111 7.5 7.887 8.259 8.623 9.104 9.581 10.048 10.606 11.153 11.697 12.357 13.094 13.813 14.626 15.529 16.521 17.578 18.821 20.342 21.922 23.82 26.02 28.657 31.796 35.734 40.738 47.364 53.581 57.716 60.657 62.847 64.52 65.784 66.809 67.599 68.317 68.874 69.324 69.724 70.076 70.378 70.624 70.851 71.038 71.182 71.305 71.424 71.526 71.617 71.696 71.755 71.808 71.863 71.909 71.938 71.96 71.979 71.993 71.992 71.987 71.987 71.983 71.96 71.925 71.909 71.753 71.843 71.824 71.791 71.691 71.625 71.541 71.442 71.345 71.251 71.138 70.788 -3 ,20097 ,KEBNE ,17041033,Thu Dec 23 02:16:21 CET,Thu Dec 23 03:39:35 CET,0.0 0.619 0.971 1.288 1.563 1.804 2.039 2.245 2.615 2.796 2.968 3.1 3.469 3.632 3.963 4.286 4.582 4.728 5.015 5.295 5.712 5.984 6.247 6.629 7.013 7.395 7.762 8.12 8.599 9.069 9.525 10.081 10.631 11.175 11.812 12.537 13.26 14.077 14.975 15.956 17.008 18.22 19.652 21.137 22.942 25.028 27.574 30.607 34.367 39.189 45.632 51.619 55.562 58.4 60.522 62.188 63.464 64.468 65.264 65.991 66.559 67.036 67.449 67.796 68.08 68.31 68.544 68.749 68.908 69.052 69.191 69.301 69.393 69.468 69.534 69.599 69.643 69.672 69.697 69.72 69.744 69.776 69.802 69.821 69.828 69.838 69.844 69.854 69.856 69.72 69.848 69.834 69.811 69.775 69.754 69.72 69.663 69.591 69.512 69.423 69.267 -4 ,15519 ,KEBNE ,17041035,Thu Dec 23 02:16:21 CET,Thu Dec 23 03:39:44 CET,0.0 0.576 0.863 1.112 1.349 1.567 1.754 1.94 2.298 2.459 2.617 2.738 3.099 3.243 3.518 3.793 4.059 4.191 4.459 4.725 5.109 5.366 5.62 5.988 6.346 6.7 7.052 7.395 7.855 8.306 8.762 9.345 9.905 10.444 11.083 11.823 12.555 13.369 14.257 15.237 16.284 17.489 18.958 20.492 22.332 24.442 26.997 30.038 33.883 38.85 45.475 51.716 55.907 58.857 60.991 62.657 63.923 64.946 65.759 66.479 67.035 67.484 67.875 68.224 68.507 68.735 68.974 69.171 69.311 69.442 69.569 69.673 69.77 69.848 69.901 69.946 69.979 70.018 70.057 70.076 70.081 70.076 70.077 70.081 70.079 70.058 70.026 69.999 69.981 69.827 69.905 69.87 69.831 69.76 69.721 69.674 69.624 69.574 69.501 69.39 69.22 -5 ,16800 ,KEBNE ,17041036,Thu Dec 23 02:18:24 CET,Thu Dec 23 03:42:07 CET,0.0 0.633 0.919 1.153 1.355 1.55 1.724 1.893 2.229 2.385 2.533 2.642 3.008 3.151 3.423 3.7 3.985 4.13 4.405 4.671 5.059 5.309 5.558 5.919 6.276 6.634 6.988 7.341 7.813 8.275 8.73 9.308 9.867 10.402 11.034 11.755 12.476 13.286 14.172 15.153 16.21 17.435 18.916 20.443 22.263 24.346 26.886 29.922 33.669 38.562 45.29 51.687 55.878 58.793 60.991 62.75 64.055 65.062 65.851 66.577 67.153 67.601 67.977 68.321 68.621 68.874 69.114 69.308 69.458 69.593 69.715 69.809 69.892 69.973 70.026 70.064 70.107 70.149 70.179 70.198 70.201 70.197 70.204 70.206 70.2 70.19 70.18 70.149 70.131 69.988 70.087 70.061 70.042 70.014 69.983 69.94 69.897 69.845 69.791 69.731 69.636 -6 ,19831 ,KEBNE ,17041038,Thu Dec 23 02:18:25 CET,Thu Dec 23 03:41:59 CET,0.0 0.658 0.947 1.186 1.386 1.558 1.748 1.942 2.28 2.444 2.604 2.717 3.072 3.211 3.476 3.76 4.049 4.183 4.446 4.709 5.087 5.325 5.56 5.92 6.279 6.627 6.971 7.318 7.772 8.215 8.652 9.198 9.731 10.251 10.888 11.622 12.328 13.125 14.014 14.998 16.054 17.257 18.713 20.216 22.065 24.271 26.892 29.949 33.747 38.619 45.238 51.362 55.387 58.285 60.428 62.069 63.331 64.342 65.141 65.873 66.413 66.846 67.254 67.624 67.92 68.165 68.416 68.611 68.755 68.894 69.034 69.144 69.245 69.34 69.407 69.469 69.514 69.555 69.595 69.609 69.617 69.608 69.601 69.589 69.58 69.558 69.528 69.488 69.459 69.299 69.37 69.339 69.314 69.24 69.182 69.125 69.028 68.875 68.698 68.472 68.058 -7 ,1506 ,KEBNE ,17041039,Thu Dec 23 02:18:24 CET,Thu Dec 23 03:41:34 CET,0.0 0.787 1.139 1.469 1.79 2.051 2.271 2.476 2.89 3.082 3.264 3.413 3.786 3.96 4.289 4.611 4.918 5.072 5.371 5.646 6.052 6.324 6.585 6.977 7.366 7.736 8.109 8.481 8.955 9.429 9.901 10.47 11.036 11.602 12.263 13.008 13.747 14.577 15.499 16.503 17.554 18.761 20.242 21.791 23.671 25.847 28.484 31.64 35.478 40.293 46.721 52.665 56.653 59.534 61.644 63.282 64.555 65.584 66.377 67.083 67.64 68.093 68.493 68.852 69.15 69.372 69.598 69.795 69.942 70.073 70.187 70.291 70.393 70.476 70.526 70.567 70.612 70.654 70.679 70.696 70.704 70.702 70.708 70.713 70.713 70.712 70.705 70.664 70.631 70.463 70.518 70.485 70.449 70.357 70.305 70.245 70.172 70.096 70.034 69.948 69.701 -8 ,1086 ,KEBNE ,17041040,Thu Dec 23 02:19:28 CET,Thu Dec 23 03:43:06 CET,0.0 0.539 0.815 1.016 1.191 1.366 1.54 1.708 2.035 2.191 2.341 2.446 2.802 2.949 3.223 3.498 3.778 3.911 4.165 4.409 4.788 5.045 5.284 5.637 6.003 6.373 6.73 7.078 7.558 8.036 8.501 9.079 9.644 10.189 10.832 11.568 12.286 13.091 13.962 14.906 15.934 17.137 18.613 20.176 22.04 24.138 26.666 29.725 33.507 38.302 44.718 50.727 54.685 57.494 59.62 61.3 62.65 63.741 64.559 65.304 65.879 66.36 66.771 67.099 67.379 67.622 67.848 68.035 68.199 68.358 68.504 68.615 68.726 68.843 68.927 68.994 69.054 69.107 69.141 69.168 69.198 69.251 69.293 69.318 69.327 69.347 69.358 69.361 69.359 69.22 69.319 69.302 69.292 69.277 69.257 69.232 69.186 69.117 69.058 69.001 68.849 -9 ,12907 ,KEBNE ,17041041,Thu Dec 23 02:20:32 CET,Thu Dec 23 03:42:12 CET,0.0 0.607 0.962 1.258 1.516 1.74 1.95 2.155 2.541 2.72 2.9 3.057 3.432 3.6 3.916 4.226 4.527 4.677 4.977 5.264 5.673 5.938 6.194 6.576 6.946 7.301 7.662 8.024 8.5 8.958 9.415 9.983 10.532 11.072 11.712 12.445 13.176 14.007 14.9 15.877 16.943 18.159 19.627 21.147 22.978 25.099 27.645 30.657 34.456 39.283 45.677 51.683 55.655 58.467 60.553 62.196 63.465 64.49 65.292 66.025 66.597 67.061 67.464 67.8 68.081 68.32 68.544 68.727 68.867 68.995 69.124 69.226 69.32 69.411 69.475 69.519 69.554 69.589 69.62 69.646 69.673 69.712 69.739 69.767 69.774 69.775 69.782 69.789 69.789 69.648 69.768 69.758 69.741 69.691 69.67 69.653 69.626 69.569 69.493 69.389 69.154 -10 ,2328 ,KEBNE ,17041042,Thu Dec 23 02:20:32 CET,Thu Dec 23 03:42:04 CET,0.0 0.422 0.704 0.949 1.163 1.358 1.55 1.731 2.082 2.253 2.422 2.559 2.916 3.068 3.343 3.608 3.881 4.024 4.306 4.57 4.961 5.223 5.484 5.864 6.246 6.624 6.991 7.359 7.824 8.28 8.749 9.327 9.878 10.419 11.081 11.838 12.58 13.415 14.331 15.323 16.39 17.625 19.105 20.65 22.477 24.591 27.153 30.175 33.955 38.744 45.164 51.214 55.198 58.049 60.166 61.817 63.105 64.124 64.909 65.612 66.153 66.607 67.009 67.352 67.641 67.885 68.119 68.297 68.435 68.579 68.719 68.819 68.905 68.997 69.06 69.113 69.172 69.223 69.25 69.261 69.272 69.283 69.281 69.279 69.28 69.257 69.221 69.186 69.161 69.0 69.066 69.033 69.001 68.929 68.889 68.845 68.78 68.7 68.615 68.544 68.311 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt deleted file mode 100644 index c573efef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25562 ,KEBNE ,17041043,Thu Dec 23 02:20:32 CET,Thu Dec 23 03:41:55 CET,0.0 0.405 0.65 0.878 1.087 1.289 1.495 1.693 2.063 2.237 2.405 2.537 2.899 3.062 3.42 3.781 4.126 4.292 4.603 4.903 5.357 5.659 5.961 6.42 6.878 7.326 7.766 8.213 8.791 9.344 9.896 10.585 11.262 11.933 12.725 13.638 14.529 15.517 16.622 17.835 19.171 20.747 22.657 24.636 26.982 29.714 33.064 37.046 42.063 48.555 57.214 65.548 71.256 75.328 78.37 80.812 82.737 84.294 85.518 86.642 87.534 88.287 88.943 89.501 89.985 90.398 90.807 91.155 91.428 91.686 91.944 92.135 92.315 92.493 92.617 92.737 92.847 92.94 93.045 93.12 93.177 93.253 93.294 93.324 93.339 93.357 93.371 93.382 93.386 93.28 93.37 93.35 93.331 93.257 93.199 93.146 93.075 92.967 92.807 92.572 91.932 -2 ,2166 ,KEBNE ,17041044,Thu Dec 23 02:22:37 CET,Thu Dec 23 03:44:07 CET,0.0 0.594 0.939 1.239 1.529 1.775 2.0 2.222 2.635 2.817 2.992 3.128 3.499 3.666 3.992 4.316 4.64 4.797 5.101 5.4 5.858 6.158 6.452 6.884 7.308 7.729 8.14 8.551 9.101 9.651 10.191 10.86 11.544 12.217 13.006 13.922 14.811 15.818 16.953 18.196 19.563 21.143 23.027 25.007 27.435 30.26 33.711 37.904 43.146 49.853 58.692 66.892 72.454 76.519 79.609 82.059 83.965 85.503 86.73 87.872 88.766 89.495 90.148 90.716 91.179 91.575 91.982 92.321 92.585 92.854 93.117 93.301 93.485 93.674 93.806 93.933 94.057 94.165 94.259 94.312 94.37 94.442 94.476 94.515 94.536 94.567 94.569 94.566 94.568 94.455 94.535 94.524 94.506 94.44 94.386 94.325 94.267 94.187 94.056 93.849 93.216 -3 ,9010 ,KEBNE ,17041045,Thu Dec 23 02:22:37 CET,Thu Dec 23 03:44:25 CET,0.0 0.481 0.75 0.985 1.21 1.419 1.628 1.826 2.183 2.354 2.526 2.676 3.046 3.206 3.525 3.86 4.201 4.368 4.712 5.052 5.545 5.877 6.197 6.659 7.107 7.547 7.988 8.427 9.004 9.573 10.145 10.862 11.547 12.211 12.999 13.902 14.799 15.794 16.9 18.127 19.449 20.967 22.797 24.707 27.013 29.72 32.999 36.905 41.865 48.263 56.921 65.222 70.826 74.907 77.988 80.408 82.291 83.84 85.082 86.239 87.136 87.854 88.497 89.065 89.547 89.965 90.365 90.695 90.977 91.24 91.488 91.681 91.869 92.032 92.133 92.242 92.356 92.472 92.581 92.651 92.72 92.802 92.845 92.894 92.914 92.958 93.004 93.043 93.065 92.967 93.076 93.084 93.091 93.084 93.077 93.07 93.067 93.054 93.001 92.895 92.508 -4 ,20633 ,KEBNE ,17041046,Thu Dec 23 02:22:37 CET,Thu Dec 23 03:44:08 CET,0.0 0.386 0.631 0.862 1.081 1.293 1.499 1.69 2.042 2.217 2.403 2.548 2.92 3.091 3.438 3.786 4.119 4.277 4.577 4.878 5.335 5.63 5.924 6.367 6.809 7.249 7.678 8.1 8.663 9.226 9.782 10.473 11.157 11.834 12.636 13.542 14.432 15.432 16.525 17.728 19.059 20.613 22.455 24.387 26.789 29.572 32.878 36.818 41.887 48.385 57.048 65.379 71.018 75.124 78.199 80.621 82.537 84.121 85.362 86.49 87.375 88.091 88.729 89.303 89.802 90.227 90.646 90.998 91.279 91.546 91.811 92.021 92.221 92.407 92.54 92.652 92.767 92.889 92.986 93.052 93.123 93.204 93.248 93.282 93.288 93.305 93.327 93.34 93.341 93.239 93.351 93.343 93.331 93.298 93.245 93.171 93.1 93.003 92.857 92.677 91.946 -5 ,12490 ,KEBNE ,17041047,Thu Dec 23 02:22:41 CET,Thu Dec 23 03:43:12 CET,0.0 0.547 0.86 1.164 1.416 1.623 1.838 2.056 2.477 2.692 2.909 3.133 3.531 3.714 4.071 4.426 4.763 4.929 5.264 5.583 6.044 6.352 6.66 7.111 7.565 8.014 8.436 8.858 9.432 9.998 10.556 11.253 11.925 12.589 13.389 14.309 15.229 16.254 17.38 18.615 19.945 21.465 23.264 25.154 27.479 30.202 33.548 37.593 42.6 48.993 57.813 66.199 71.808 75.904 78.961 81.384 83.277 84.801 86.012 87.119 87.982 88.705 89.349 89.903 90.391 90.799 91.187 91.524 91.809 92.069 92.313 92.509 92.7 92.889 93.014 93.125 93.238 93.358 93.481 93.549 93.594 93.663 93.712 93.754 93.773 93.805 93.825 93.844 93.852 93.743 93.835 93.827 93.802 93.712 93.656 93.584 93.52 93.44 93.275 93.035 92.5 -6 ,15080 ,KEBNE ,17041048,Thu Dec 23 02:22:37 CET,Thu Dec 23 03:44:17 CET,0.0 0.524 0.843 1.132 1.36 1.569 1.772 1.98 2.4 2.59 2.763 2.888 3.262 3.434 3.753 4.067 4.398 4.559 4.866 5.183 5.668 5.983 6.297 6.767 7.221 7.662 8.096 8.518 9.08 9.634 10.166 10.829 11.491 12.143 12.928 13.831 14.705 15.69 16.785 17.987 19.307 20.844 22.694 24.627 26.961 29.703 33.076 37.068 42.042 48.4 57.228 65.936 71.718 75.773 78.806 81.205 83.084 84.646 85.888 87.017 87.916 88.656 89.313 89.891 90.39 90.813 91.229 91.576 91.859 92.138 92.399 92.593 92.776 92.957 93.095 93.224 93.348 93.469 93.579 93.643 93.694 93.745 93.768 93.8 93.817 93.831 93.843 93.861 93.856 93.737 93.824 93.811 93.783 93.721 93.676 93.624 93.564 93.436 93.259 93.06 92.559 -7 ,20810 ,KEBNE ,17041049,Thu Dec 23 02:22:37 CET,Thu Dec 23 03:44:11 CET,0.0 0.453 0.748 0.995 1.205 1.408 1.615 1.824 2.239 2.437 2.636 2.805 3.192 3.38 3.725 4.037 4.344 4.497 4.804 5.121 5.598 5.905 6.208 6.676 7.139 7.581 8.023 8.461 9.017 9.57 10.128 10.825 11.504 12.157 12.926 13.827 14.725 15.728 16.839 18.057 19.365 20.877 22.715 24.664 27.041 29.808 33.17 37.191 42.183 48.532 57.25 65.602 71.202 75.27 78.357 80.802 82.697 84.237 85.451 86.585 87.493 88.235 88.884 89.441 89.935 90.362 90.778 91.126 91.398 91.658 91.913 92.117 92.314 92.495 92.611 92.722 92.84 92.946 93.042 93.101 93.156 93.223 93.263 93.305 93.322 93.349 93.365 93.362 93.357 93.251 93.362 93.343 93.307 93.225 93.187 93.141 93.064 92.985 92.874 92.671 92.111 -8 ,7552 ,KEBNE ,17041050,Thu Dec 23 02:27:48 CET,Thu Dec 23 03:49:17 CET,0.0 0.508 0.809 1.069 1.295 1.504 1.724 1.956 2.401 2.612 2.833 3.056 3.453 3.648 4.025 4.384 4.737 4.909 5.241 5.563 6.044 6.363 6.673 7.125 7.575 8.01 8.422 8.848 9.421 9.973 10.523 11.2 11.866 12.533 13.31 14.188 15.068 16.067 17.188 18.427 19.752 21.299 23.19 25.149 27.487 30.231 33.582 37.551 42.507 48.941 57.693 66.04 71.728 75.863 78.959 81.399 83.317 84.867 86.062 87.162 88.048 88.773 89.416 89.99 90.482 90.897 91.318 91.672 91.951 92.213 92.463 92.656 92.845 93.033 93.161 93.274 93.39 93.502 93.603 93.67 93.738 93.815 93.848 93.873 93.89 93.92 93.948 93.969 93.971 93.86 93.959 93.964 93.967 93.953 93.931 93.898 93.872 93.838 93.769 93.704 93.557 -9 ,3842 ,KEBNE ,17041051,Thu Dec 23 02:27:48 CET,Thu Dec 23 03:49:18 CET,0.0 0.475 0.742 0.983 1.21 1.434 1.635 1.822 2.185 2.366 2.543 2.705 3.097 3.283 3.669 4.036 4.38 4.547 4.88 5.215 5.697 6.016 6.339 6.815 7.277 7.716 8.143 8.569 9.135 9.698 10.258 10.956 11.629 12.277 13.052 13.943 14.822 15.833 16.962 18.177 19.487 21.002 22.82 24.728 27.055 29.758 33.052 37.025 41.985 48.383 57.124 65.476 71.113 75.201 78.257 80.682 82.591 84.128 85.348 86.497 87.396 88.134 88.802 89.386 89.883 90.296 90.693 91.019 91.288 91.556 91.812 92.014 92.211 92.403 92.539 92.661 92.773 92.871 92.955 93.003 93.043 93.112 93.157 93.194 93.213 93.255 93.295 93.307 93.294 93.168 93.246 93.236 93.214 93.147 93.111 93.064 92.999 92.901 92.772 92.638 92.319 -10 ,30697 ,KEBNE ,17041052,Thu Dec 23 02:27:48 CET,Thu Dec 23 03:49:17 CET,0.0 0.664 0.953 1.204 1.431 1.651 1.86 2.083 2.534 2.739 2.941 3.131 3.521 3.709 4.085 4.446 4.8 4.978 5.326 5.661 6.162 6.489 6.801 7.273 7.727 8.162 8.595 9.025 9.591 10.158 10.725 11.409 12.068 12.717 13.489 14.376 15.259 16.284 17.423 18.663 20.003 21.55 23.409 25.357 27.717 30.445 33.782 37.766 42.723 49.156 58.024 66.433 72.065 76.156 79.223 81.671 83.592 85.149 86.381 87.507 88.399 89.131 89.765 90.341 90.843 91.261 91.679 92.012 92.266 92.517 92.769 92.963 93.139 93.318 93.442 93.565 93.7 93.82 93.932 94.003 94.07 94.161 94.211 94.268 94.306 94.374 94.42 94.455 94.477 94.38 94.497 94.506 94.507 94.484 94.475 94.462 94.426 94.382 94.314 94.231 94.025 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 2e395a51..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28427 ,KEBNE ,17041053,Thu Dec 23 02:27:52 CET,Thu Dec 23 03:54:36 CET,0.0 0.312 0.486 0.616 0.732 0.85 0.948 1.048 1.248 1.341 1.435 1.52 1.73 1.835 2.023 2.188 2.351 2.431 2.577 2.709 2.9 3.031 3.161 3.346 3.523 3.698 3.879 4.058 4.278 4.478 4.673 4.922 5.154 5.37 5.621 5.902 6.169 6.47 6.795 7.131 7.472 7.843 8.28 8.72 9.222 9.76 10.403 11.124 11.86 12.607 13.322 13.7 13.756 13.603 13.378 13.131 12.858 12.567 12.304 12.024 11.768 11.535 11.313 11.092 10.878 10.681 10.481 10.301 10.136 9.949 9.747 9.587 9.424 9.255 9.127 8.988 8.832 8.666 8.483 8.35 8.219 8.02 7.878 7.723 7.642 7.492 7.333 7.13 7.017 6.81 6.677 6.551 6.422 6.168 6.022 5.843 5.625 5.393 5.149 4.747 3.701 -2 ,12200 ,KEBNE ,17041054,Thu Dec 23 02:27:48 CET,Thu Dec 23 03:49:04 CET,0.0 0.592 0.935 1.205 1.402 1.542 1.683 1.84 2.128 2.244 2.355 2.472 2.681 2.782 2.985 3.166 3.327 3.404 3.555 3.698 3.903 4.042 4.173 4.356 4.54 4.713 4.874 5.03 5.243 5.447 5.643 5.886 6.111 6.323 6.575 6.852 7.122 7.416 7.712 8.016 8.332 8.705 9.145 9.587 10.1 10.646 11.274 11.933 12.649 13.4 14.069 14.467 14.537 14.44 14.258 14.009 13.762 13.513 13.265 12.996 12.745 12.518 12.296 12.077 11.855 11.647 11.447 11.266 11.085 10.889 10.699 10.535 10.36 10.181 10.038 9.883 9.736 9.594 9.43 9.306 9.175 8.959 8.81 8.656 8.579 8.423 8.255 8.085 7.997 7.796 7.666 7.544 7.406 7.098 6.933 6.759 6.583 6.391 6.124 5.776 5.094 -3 ,27731 ,KEBNE ,17041055,Thu Dec 23 02:27:48 CET,Thu Dec 23 03:49:07 CET,0.0 0.612 0.878 1.084 1.248 1.408 1.566 1.705 1.967 2.1 2.221 2.305 2.5 2.592 2.768 2.96 3.151 3.237 3.398 3.55 3.772 3.92 4.056 4.247 4.423 4.591 4.761 4.92 5.115 5.308 5.489 5.715 5.93 6.126 6.375 6.647 6.892 7.174 7.483 7.798 8.133 8.519 8.957 9.391 9.902 10.463 11.076 11.764 12.537 13.336 14.105 14.507 14.533 14.447 14.281 14.013 13.737 13.466 13.2 12.927 12.688 12.45 12.215 11.994 11.784 11.59 11.378 11.186 11.025 10.853 10.657 10.494 10.333 10.171 10.043 9.895 9.736 9.577 9.415 9.303 9.178 8.968 8.834 8.695 8.615 8.45 8.282 8.103 8.01 7.813 7.698 7.58 7.458 7.197 7.045 6.882 6.698 6.494 6.271 5.936 5.093 -4 ,15160 ,KEBNE ,17041056,Thu Dec 23 02:27:48 CET,Thu Dec 23 03:49:05 CET,0.0 0.313 0.505 0.68 0.831 0.97 1.076 1.163 1.338 1.421 1.497 1.536 1.718 1.793 1.942 2.071 2.191 2.254 2.374 2.487 2.667 2.785 2.897 3.057 3.208 3.355 3.498 3.636 3.811 3.977 4.142 4.343 4.539 4.726 4.939 5.2 5.463 5.744 6.043 6.381 6.74 7.122 7.576 8.025 8.538 9.082 9.656 10.288 10.999 11.769 12.542 12.908 12.931 12.833 12.634 12.37 12.111 11.848 11.603 11.354 11.124 10.896 10.66 10.442 10.241 10.044 9.825 9.623 9.455 9.274 9.061 8.883 8.702 8.512 8.351 8.192 8.038 7.875 7.706 7.586 7.461 7.269 7.142 7.01 6.937 6.774 6.595 6.421 6.338 6.15 6.055 5.95 5.854 5.658 5.542 5.394 5.24 5.083 4.896 4.645 4.113 -5 ,25658 ,KEBNE ,17041057,Thu Dec 23 02:27:48 CET,Thu Dec 23 03:49:19 CET,0.0 0.347 0.521 0.662 0.797 0.918 1.033 1.134 1.321 1.42 1.514 1.566 1.751 1.835 1.997 2.152 2.303 2.374 2.522 2.671 2.869 2.999 3.129 3.323 3.507 3.676 3.842 3.998 4.212 4.429 4.636 4.882 5.106 5.322 5.576 5.861 6.143 6.449 6.769 7.103 7.455 7.853 8.305 8.725 9.204 9.784 10.445 11.151 11.915 12.634 13.367 13.875 13.957 13.833 13.627 13.378 13.131 12.863 12.604 12.342 12.116 11.903 11.699 11.503 11.316 11.134 10.911 10.713 10.552 10.368 10.176 10.026 9.867 9.698 9.557 9.396 9.23 9.055 8.873 8.755 8.627 8.426 8.284 8.13 8.047 7.879 7.712 7.53 7.437 7.246 7.151 7.064 6.98 6.77 6.655 6.528 6.374 6.201 5.984 5.671 4.912 -6 ,9271 ,KEBNE ,17041058,Thu Dec 23 02:27:48 CET,Thu Dec 23 03:49:28 CET,0.0 0.648 0.956 1.202 1.412 1.577 1.718 1.86 2.121 2.243 2.355 2.457 2.672 2.782 2.969 3.126 3.284 3.363 3.513 3.658 3.857 3.989 4.12 4.302 4.48 4.646 4.808 4.97 5.178 5.38 5.58 5.82 6.044 6.259 6.504 6.784 7.049 7.318 7.608 7.938 8.284 8.652 9.082 9.538 10.046 10.586 11.192 11.856 12.601 13.369 14.069 14.424 14.486 14.38 14.172 13.917 13.666 13.404 13.136 12.853 12.6 12.358 12.131 11.913 11.7 11.506 11.299 11.112 10.954 10.787 10.604 10.436 10.26 10.092 9.958 9.813 9.66 9.5 9.328 9.211 9.093 8.89 8.742 8.59 8.514 8.357 8.183 7.977 7.869 7.671 7.561 7.45 7.336 7.066 6.903 6.726 6.532 6.32 6.016 5.589 4.464 -7 ,15692 ,KEBNE ,17041059,Thu Dec 23 02:27:48 CET,Thu Dec 23 03:49:21 CET,0.0 0.398 0.628 0.817 1.001 1.169 1.338 1.496 1.757 1.875 1.994 2.138 2.358 2.457 2.629 2.786 2.937 3.012 3.161 3.304 3.524 3.659 3.786 3.967 4.135 4.302 4.463 4.631 4.845 5.035 5.222 5.458 5.687 5.909 6.159 6.441 6.715 7.009 7.305 7.609 7.942 8.303 8.723 9.155 9.658 10.212 10.806 11.432 12.136 12.915 13.684 14.053 14.082 13.951 13.765 13.553 13.326 13.085 12.837 12.566 12.311 12.077 11.842 11.606 11.406 11.226 11.016 10.814 10.634 10.451 10.267 10.102 9.933 9.761 9.622 9.457 9.291 9.136 8.959 8.836 8.716 8.524 8.379 8.209 8.124 7.954 7.784 7.614 7.514 7.31 7.189 7.072 6.945 6.666 6.504 6.322 6.131 5.906 5.617 5.281 4.34 -8 ,29570 ,KEBNE ,17041060,Thu Dec 23 02:27:48 CET,Thu Dec 23 03:49:28 CET,0.0 0.539 0.728 0.884 1.016 1.144 1.271 1.387 1.575 1.666 1.765 1.841 2.03 2.103 2.253 2.409 2.582 2.666 2.811 2.954 3.159 3.29 3.423 3.616 3.8 3.968 4.126 4.288 4.508 4.712 4.898 5.117 5.34 5.553 5.793 6.056 6.3 6.593 6.914 7.237 7.58 7.947 8.354 8.774 9.265 9.785 10.375 11.011 11.697 12.501 13.296 13.665 13.663 13.491 13.271 13.023 12.759 12.477 12.218 11.954 11.711 11.481 11.248 11.029 10.824 10.635 10.425 10.228 10.056 9.872 9.672 9.51 9.345 9.163 9.023 8.879 8.731 8.572 8.393 8.264 8.134 7.93 7.78 7.623 7.553 7.418 7.27 7.113 7.028 6.844 6.771 6.673 6.567 6.346 6.234 6.118 5.983 5.827 5.658 5.462 5.102 -9 ,10429 ,KEBNE ,17041061,Thu Dec 23 02:27:48 CET,Thu Dec 23 03:49:14 CET,0.0 0.345 0.523 0.665 0.79 0.906 1.01 1.106 1.299 1.398 1.491 1.553 1.746 1.822 1.961 2.104 2.246 2.312 2.438 2.562 2.734 2.843 2.947 3.099 3.25 3.397 3.546 3.691 3.887 4.082 4.261 4.481 4.692 4.902 5.159 5.443 5.712 6.007 6.329 6.668 7.013 7.396 7.833 8.268 8.77 9.34 9.975 10.622 11.309 12.064 12.836 13.197 13.267 13.127 12.924 12.743 12.512 12.241 11.994 11.737 11.508 11.275 11.039 10.801 10.569 10.368 10.169 9.996 9.843 9.678 9.488 9.327 9.162 8.983 8.835 8.684 8.53 8.358 8.181 8.061 7.933 7.74 7.591 7.421 7.337 7.172 7.012 6.844 6.751 6.539 6.408 6.305 6.187 5.897 5.743 5.571 5.385 5.171 4.912 4.636 3.973 -10 ,28754 ,KEBNE ,17041062,Thu Dec 23 02:27:48 CET,Thu Dec 23 03:49:09 CET,0.0 0.315 0.472 0.621 0.75 0.874 1.008 1.14 1.388 1.489 1.572 1.632 1.826 1.922 2.111 2.286 2.456 2.535 2.681 2.819 3.011 3.139 3.273 3.46 3.632 3.804 3.973 4.127 4.329 4.528 4.716 4.951 5.178 5.392 5.637 5.901 6.148 6.425 6.712 7.022 7.366 7.762 8.202 8.632 9.145 9.684 10.244 10.867 11.609 12.357 13.047 13.384 13.383 13.234 13.023 12.799 12.539 12.259 12.003 11.733 11.495 11.288 11.079 10.86 10.652 10.461 10.248 10.057 9.896 9.717 9.527 9.37 9.203 9.028 8.893 8.754 8.601 8.433 8.264 8.142 8.017 7.831 7.694 7.546 7.465 7.3 7.126 6.934 6.835 6.634 6.527 6.418 6.302 6.077 5.957 5.826 5.692 5.527 5.314 5.089 4.727 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 969f2794..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23331 ,KEBNE ,17041063,Thu Dec 23 02:29:52 CET,Thu Dec 23 03:53:40 CET,0.0 0.462 0.688 0.87 1.02 1.159 1.291 1.414 1.66 1.769 1.867 1.942 2.132 2.217 2.37 2.51 2.646 2.714 2.849 2.973 3.153 3.28 3.411 3.605 3.789 3.956 4.114 4.264 4.45 4.639 4.823 5.038 5.243 5.441 5.673 5.925 6.164 6.433 6.717 7.001 7.275 7.59 7.997 8.386 8.802 9.24 9.686 10.139 10.625 11.046 11.233 10.967 10.492 9.998 9.479 8.939 8.445 7.971 7.532 7.076 6.664 6.299 5.958 5.629 5.31 5.01 4.697 4.409 4.169 3.923 3.649 3.415 3.171 2.908 2.702 2.497 2.294 2.082 1.856 1.699 1.539 1.289 1.102 0.897 0.789 0.584 0.374 0.142 0.019 -0.205 -0.387 -0.535 -0.682 -1.014 -1.19 -1.361 -1.542 -1.741 -1.961 -2.239 -2.931 -2 ,29696 ,KEBNE ,17041064,Thu Dec 23 02:34:01 CET,Thu Dec 23 03:55:59 CET,0.0 0.69 0.961 1.204 1.418 1.6 1.769 1.931 2.218 2.343 2.457 2.564 2.762 2.859 3.054 3.228 3.394 3.481 3.651 3.798 4.007 4.149 4.28 4.47 4.659 4.839 5.002 5.16 5.378 5.585 5.768 5.981 6.194 6.4 6.623 6.856 7.086 7.348 7.624 7.919 8.206 8.514 8.922 9.34 9.779 10.259 10.77 11.261 11.774 12.256 12.496 12.172 11.646 11.078 10.544 10.018 9.513 9.036 8.611 8.169 7.787 7.449 7.127 6.807 6.492 6.203 5.896 5.617 5.372 5.123 4.857 4.632 4.404 4.171 3.978 3.784 3.593 3.373 3.137 2.971 2.8 2.536 2.357 2.171 2.066 1.853 1.633 1.396 1.272 1.052 0.905 0.778 0.657 0.391 0.234 0.063 -0.12 -0.307 -0.5 -0.782 -1.642 -3 ,5311 ,KEBNE ,17041065,Thu Dec 23 02:34:01 CET,Thu Dec 23 03:56:19 CET,0.0 1.028 1.354 1.554 1.726 1.874 2.004 2.133 2.358 2.468 2.573 2.668 2.865 2.963 3.151 3.326 3.502 3.586 3.753 3.913 4.133 4.287 4.434 4.616 4.79 4.956 5.113 5.265 5.464 5.649 5.815 6.023 6.22 6.414 6.644 6.892 7.123 7.37 7.628 7.901 8.198 8.523 8.902 9.287 9.706 10.141 10.585 11.023 11.439 11.77 11.901 11.66 11.211 10.682 10.132 9.625 9.16 8.67 8.211 7.748 7.366 7.022 6.684 6.36 6.047 5.76 5.464 5.179 4.933 4.681 4.416 4.197 3.97 3.723 3.524 3.318 3.108 2.896 2.667 2.51 2.349 2.085 1.891 1.698 1.602 1.397 1.174 0.934 0.809 0.582 0.435 0.302 0.151 -0.18 -0.366 -0.589 -0.837 -1.108 -1.418 -1.852 -2.975 -4 ,14438 ,KEBNE ,17041066,Thu Dec 23 02:34:01 CET,Thu Dec 23 03:55:44 CET,0.0 0.827 1.243 1.512 1.708 1.874 2.026 2.17 2.424 2.549 2.66 2.761 2.969 3.073 3.268 3.447 3.608 3.684 3.846 3.998 4.201 4.33 4.453 4.635 4.804 4.964 5.123 5.28 5.48 5.661 5.847 6.072 6.281 6.486 6.715 6.968 7.206 7.466 7.746 8.04 8.335 8.662 9.042 9.42 9.836 10.238 10.662 11.121 11.593 12.039 12.28 12.003 11.524 10.982 10.433 9.891 9.396 8.931 8.509 8.075 7.695 7.35 7.009 6.689 6.37 6.058 5.737 5.456 5.217 4.969 4.712 4.497 4.261 4.009 3.811 3.606 3.399 3.184 2.957 2.8 2.627 2.36 2.181 2.004 1.919 1.746 1.564 1.364 1.256 1.054 0.929 0.804 0.685 0.433 0.283 0.113 -0.066 -0.259 -0.487 -0.789 -1.734 -5 ,28329 ,KEBNE ,17041067,Thu Dec 23 02:34:00 CET,Thu Dec 23 03:55:56 CET,0.0 0.941 1.269 1.541 1.772 1.97 2.161 2.335 2.655 2.793 2.896 2.993 3.192 3.29 3.473 3.645 3.81 3.891 4.045 4.203 4.434 4.569 4.694 4.878 5.055 5.213 5.368 5.525 5.732 5.928 6.113 6.332 6.538 6.728 6.952 7.227 7.485 7.764 8.052 8.336 8.619 8.933 9.294 9.637 10.023 10.454 10.926 11.375 11.846 12.249 12.362 12.066 11.635 11.156 10.655 10.177 9.721 9.259 8.837 8.413 8.039 7.689 7.341 7.017 6.715 6.433 6.131 5.858 5.617 5.365 5.089 4.854 4.61 4.364 4.17 3.965 3.768 3.557 3.33 3.171 3.007 2.769 2.605 2.426 2.335 2.164 1.992 1.807 1.707 1.498 1.389 1.279 1.154 0.893 0.76 0.609 0.452 0.294 0.091 -0.221 -1.223 -6 ,22478 ,KEBNE ,17041068,Thu Dec 23 02:34:00 CET,Thu Dec 23 03:55:50 CET,0.0 0.414 0.614 0.811 0.967 1.115 1.264 1.378 1.57 1.682 1.795 1.907 2.115 2.216 2.386 2.539 2.704 2.786 2.948 3.105 3.321 3.451 3.573 3.756 3.949 4.136 4.308 4.473 4.679 4.871 5.046 5.274 5.499 5.697 5.914 6.153 6.388 6.635 6.893 7.16 7.439 7.745 8.1 8.471 8.882 9.294 9.715 10.14 10.593 11.016 11.195 10.872 10.395 9.863 9.345 8.84 8.353 7.892 7.489 7.079 6.71 6.377 6.061 5.741 5.437 5.168 4.857 4.565 4.328 4.079 3.817 3.592 3.356 3.118 2.922 2.724 2.531 2.315 2.073 1.907 1.73 1.436 1.249 1.065 0.959 0.728 0.485 0.243 0.115 -0.119 -0.291 -0.444 -0.599 -0.915 -1.097 -1.307 -1.543 -1.817 -2.143 -2.572 -3.573 -7 ,22869 ,KEBNE ,17041069,Thu Dec 23 02:34:01 CET,Thu Dec 23 03:55:40 CET,0.0 0.464 0.708 0.934 1.117 1.287 1.439 1.566 1.802 1.93 2.059 2.172 2.382 2.489 2.675 2.84 2.993 3.07 3.234 3.391 3.616 3.751 3.882 4.085 4.262 4.419 4.578 4.737 4.934 5.124 5.311 5.531 5.735 5.931 6.159 6.411 6.639 6.871 7.126 7.414 7.72 8.075 8.46 8.808 9.225 9.658 10.117 10.609 11.097 11.488 11.624 11.35 10.906 10.399 9.89 9.385 8.894 8.422 8.015 7.591 7.224 6.888 6.545 6.215 5.903 5.614 5.321 5.056 4.82 4.568 4.312 4.099 3.876 3.655 3.469 3.272 3.071 2.85 2.621 2.467 2.319 2.077 1.887 1.7 1.604 1.38 1.14 0.888 0.758 0.525 0.347 0.188 0.016 -0.351 -0.541 -0.742 -0.982 -1.238 -1.556 -2.006 -3.398 -8 ,1908 ,KEBNE ,17041070,Thu Dec 23 02:34:01 CET,Thu Dec 23 03:55:50 CET,0.0 0.373 0.607 0.792 0.92 1.056 1.196 1.301 1.503 1.615 1.708 1.765 1.947 2.023 2.17 2.313 2.447 2.514 2.645 2.777 2.962 3.075 3.189 3.361 3.519 3.671 3.818 3.959 4.145 4.321 4.489 4.692 4.9 5.104 5.333 5.582 5.816 6.068 6.342 6.64 6.956 7.292 7.656 8.023 8.452 8.863 9.291 9.746 10.192 10.579 10.718 10.393 9.893 9.398 8.906 8.385 7.878 7.416 7.013 6.59 6.213 5.861 5.523 5.202 4.894 4.62 4.328 4.046 3.797 3.542 3.283 3.07 2.845 2.598 2.404 2.212 2.017 1.805 1.584 1.419 1.238 0.961 0.77 0.57 0.468 0.259 0.041 -0.184 -0.305 -0.526 -0.686 -0.822 -0.95 -1.232 -1.386 -1.548 -1.741 -1.958 -2.197 -2.513 -3.113 -9 ,7216 ,KEBNE ,17041071,Thu Dec 23 02:35:03 CET,Thu Dec 23 03:56:58 CET,0.0 0.338 0.555 0.761 0.946 1.125 1.292 1.44 1.698 1.809 1.932 2.069 2.278 2.381 2.572 2.766 2.946 3.031 3.188 3.328 3.544 3.683 3.807 3.985 4.166 4.346 4.523 4.68 4.885 5.09 5.289 5.515 5.717 5.919 6.161 6.451 6.702 6.956 7.234 7.515 7.799 8.137 8.515 8.858 9.266 9.703 10.154 10.611 11.087 11.481 11.676 11.437 10.979 10.415 9.836 9.333 8.856 8.384 7.977 7.559 7.181 6.839 6.495 6.155 5.842 5.549 5.242 4.992 4.768 4.513 4.256 4.043 3.808 3.569 3.385 3.185 2.976 2.753 2.524 2.366 2.207 1.959 1.784 1.586 1.479 1.26 1.041 0.833 0.723 0.517 0.378 0.245 0.108 -0.187 -0.346 -0.505 -0.678 -0.872 -1.09 -1.375 -1.944 -10 ,25867 ,KEBNE ,17041072,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:56:58 CET,0.0 0.849 1.11 1.291 1.461 1.587 1.707 1.826 2.02 2.102 2.187 2.251 2.434 2.51 2.66 2.796 2.941 3.016 3.164 3.309 3.508 3.625 3.733 3.89 4.033 4.181 4.33 4.471 4.66 4.845 5.018 5.233 5.448 5.646 5.886 6.144 6.377 6.653 6.948 7.238 7.532 7.843 8.196 8.537 8.912 9.323 9.791 10.268 10.713 11.112 11.309 11.089 10.604 10.066 9.556 9.012 8.518 8.053 7.621 7.198 6.822 6.472 6.123 5.78 5.467 5.169 4.861 4.586 4.336 4.071 3.79 3.542 3.274 3.009 2.805 2.599 2.385 2.148 1.901 1.733 1.567 1.321 1.152 0.983 0.906 0.75 0.574 0.384 0.282 0.076 -0.045 -0.157 -0.282 -0.552 -0.688 -0.842 -1.007 -1.177 -1.4 -1.691 -2.65 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 15ade1e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18674 ,KEBNE ,17041073,Thu Dec 23 02:35:03 CET,Thu Dec 23 03:56:51 CET,0.0 0.813 1.118 1.335 1.511 1.676 1.827 1.988 2.273 2.396 2.509 2.629 2.842 2.938 3.118 3.314 3.49 3.565 3.714 3.855 4.054 4.181 4.305 4.484 4.655 4.818 4.974 5.131 5.331 5.523 5.696 5.886 6.074 6.265 6.497 6.744 6.967 7.217 7.481 7.75 8.036 8.353 8.704 9.058 9.432 9.805 10.204 10.6 10.979 11.278 11.332 11.019 10.54 10.054 9.614 9.189 8.772 8.351 7.971 7.6 7.281 6.996 6.72 6.438 6.161 5.905 5.644 5.415 5.207 4.987 4.762 4.577 4.382 4.181 4.027 3.872 3.705 3.527 3.347 3.215 3.067 2.84 2.692 2.538 2.458 2.295 2.125 1.944 1.85 1.645 1.518 1.407 1.289 1.039 0.9 0.76 0.613 0.444 0.25 0.013 -0.459 -2 ,31594 ,KEBNE ,17041074,Thu Dec 23 02:35:08 CET,Thu Dec 23 03:54:14 CET,0.0 0.723 0.926 1.094 1.241 1.38 1.545 1.694 1.922 2.028 2.128 2.232 2.421 2.492 2.622 2.746 2.885 2.953 3.074 3.194 3.37 3.48 3.588 3.769 3.949 4.11 4.261 4.41 4.612 4.803 4.986 5.199 5.393 5.591 5.813 6.041 6.257 6.502 6.783 7.06 7.325 7.619 7.953 8.27 8.606 8.973 9.357 9.752 10.155 10.473 10.575 10.294 9.834 9.319 8.826 8.376 7.959 7.559 7.21 6.831 6.494 6.216 5.953 5.686 5.425 5.172 4.91 4.688 4.493 4.285 4.066 3.883 3.704 3.513 3.354 3.188 3.023 2.845 2.652 2.518 2.378 2.155 1.994 1.832 1.747 1.579 1.421 1.233 1.131 0.926 0.793 0.673 0.552 0.311 0.163 -0.045 -0.268 -0.489 -0.747 -1.043 -1.783 -3 ,20007 ,KEBNE ,17041075,Thu Dec 23 02:37:09 CET,Thu Dec 23 04:00:16 CET,0.0 0.513 0.709 0.882 1.006 1.121 1.241 1.349 1.558 1.67 1.782 1.881 2.082 2.178 2.347 2.507 2.669 2.747 2.893 3.034 3.25 3.394 3.522 3.687 3.859 4.03 4.179 4.328 4.525 4.71 4.893 5.106 5.29 5.476 5.682 5.912 6.139 6.382 6.647 6.911 7.181 7.49 7.827 8.162 8.547 8.912 9.284 9.679 10.066 10.416 10.55 10.186 9.601 9.072 8.608 8.127 7.694 7.304 6.944 6.556 6.225 5.938 5.648 5.344 5.067 4.812 4.535 4.304 4.102 3.895 3.679 3.493 3.299 3.088 2.917 2.739 2.55 2.352 2.165 2.038 1.903 1.687 1.52 1.357 1.284 1.12 0.944 0.78 0.695 0.499 0.365 0.242 0.117 -0.16 -0.318 -0.481 -0.647 -0.84 -1.075 -1.378 -2.062 -4 ,27175 ,KEBNE ,17041076,Thu Dec 23 02:35:03 CET,Thu Dec 23 03:56:52 CET,0.0 0.891 1.207 1.447 1.647 1.806 1.979 2.143 2.407 2.528 2.647 2.767 2.972 3.069 3.253 3.433 3.597 3.672 3.818 3.96 4.175 4.311 4.421 4.576 4.738 4.906 5.075 5.231 5.424 5.606 5.782 5.995 6.198 6.394 6.616 6.861 7.092 7.334 7.579 7.847 8.143 8.459 8.805 9.119 9.466 9.862 10.278 10.69 11.068 11.371 11.448 11.041 10.524 10.024 9.511 9.023 8.594 8.186 7.832 7.478 7.171 6.867 6.555 6.258 5.976 5.711 5.441 5.203 4.981 4.768 4.559 4.378 4.199 4.009 3.842 3.668 3.499 3.316 3.127 2.99 2.847 2.642 2.5 2.353 2.274 2.108 1.925 1.728 1.631 1.442 1.352 1.241 1.122 0.867 0.714 0.536 0.317 0.079 -0.159 -0.471 -1.326 -5 ,5178 ,KEBNE ,17041077,Thu Dec 23 02:35:03 CET,Thu Dec 23 03:56:36 CET,0.0 1.075 1.493 1.765 1.971 2.145 2.3 2.453 2.723 2.861 2.993 3.117 3.316 3.407 3.584 3.762 3.928 4.0 4.147 4.29 4.498 4.638 4.767 4.967 5.15 5.318 5.484 5.633 5.823 6.004 6.181 6.395 6.601 6.801 7.028 7.273 7.496 7.724 7.966 8.228 8.496 8.777 9.076 9.392 9.74 10.1 10.496 10.878 11.247 11.553 11.649 11.339 10.871 10.42 10.012 9.584 9.175 8.801 8.45 8.102 7.781 7.47 7.179 6.908 6.652 6.412 6.169 5.941 5.731 5.502 5.252 5.066 4.872 4.653 4.491 4.33 4.158 3.97 3.784 3.666 3.536 3.321 3.169 3.008 2.928 2.765 2.583 2.384 2.281 2.079 1.97 1.856 1.733 1.492 1.35 1.197 1.07 0.936 0.778 0.552 -0.221 -6 ,14197 ,KEBNE ,17041078,Thu Dec 23 02:35:03 CET,Thu Dec 23 03:56:39 CET,0.0 1.152 1.495 1.742 1.96 2.143 2.297 2.434 2.672 2.793 2.914 3.032 3.237 3.324 3.49 3.655 3.807 3.88 4.026 4.162 4.364 4.497 4.613 4.786 4.951 5.101 5.246 5.388 5.576 5.758 5.929 6.145 6.345 6.518 6.723 6.967 7.193 7.428 7.68 7.952 8.22 8.515 8.855 9.173 9.535 9.896 10.273 10.659 11.028 11.289 11.319 11.03 10.586 10.093 9.575 9.072 8.604 8.154 7.752 7.347 7.007 6.699 6.385 6.088 5.822 5.579 5.331 5.108 4.917 4.699 4.458 4.267 4.072 3.872 3.718 3.56 3.397 3.222 3.036 2.903 2.764 2.551 2.403 2.246 2.162 1.997 1.828 1.634 1.527 1.313 1.171 1.04 0.913 0.651 0.52 0.389 0.246 0.088 -0.086 -0.329 -1.038 -7 ,26755 ,KEBNE ,17041079,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:56:46 CET,0.0 0.484 0.646 0.801 0.934 1.052 1.167 1.28 1.473 1.561 1.658 1.729 1.906 1.982 2.131 2.273 2.4 2.468 2.612 2.752 2.953 3.087 3.215 3.386 3.572 3.767 3.934 4.09 4.297 4.485 4.67 4.893 5.086 5.269 5.478 5.719 5.938 6.174 6.432 6.7 6.98 7.267 7.589 7.908 8.255 8.615 9.0 9.391 9.8 10.161 10.266 9.966 9.567 9.102 8.606 8.141 7.706 7.268 6.879 6.484 6.122 5.797 5.487 5.207 4.939 4.671 4.404 4.185 3.986 3.758 3.527 3.344 3.151 2.946 2.79 2.634 2.469 2.296 2.123 2.001 1.871 1.672 1.527 1.368 1.289 1.113 0.92 0.732 0.632 0.419 0.272 0.154 0.044 -0.215 -0.357 -0.505 -0.662 -0.826 -1.018 -1.235 -1.776 -8 ,13475 ,KEBNE ,17041080,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:56:50 CET,0.0 0.802 1.181 1.414 1.604 1.771 1.926 2.079 2.359 2.489 2.601 2.705 2.905 2.998 3.162 3.315 3.465 3.539 3.682 3.831 4.041 4.168 4.29 4.47 4.647 4.812 4.971 5.115 5.292 5.47 5.643 5.843 6.043 6.237 6.451 6.683 6.914 7.167 7.413 7.665 7.934 8.237 8.565 8.878 9.229 9.585 9.986 10.387 10.747 11.047 11.113 10.739 10.272 9.819 9.354 8.867 8.431 8.045 7.689 7.31 6.988 6.698 6.408 6.136 5.873 5.636 5.394 5.168 4.963 4.744 4.516 4.331 4.138 3.93 3.772 3.604 3.411 3.207 3.011 2.872 2.724 2.521 2.386 2.245 2.172 2.008 1.848 1.679 1.586 1.387 1.282 1.187 1.084 0.851 0.726 0.583 0.435 0.269 0.053 -0.271 -1.107 -9 ,31107 ,KEBNE ,17041081,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:56:43 CET,0.0 0.443 0.659 0.825 0.985 1.124 1.258 1.385 1.604 1.706 1.801 1.897 2.104 2.202 2.374 2.545 2.711 2.786 2.929 3.073 3.275 3.41 3.538 3.707 3.88 4.044 4.198 4.351 4.542 4.73 4.898 5.103 5.303 5.484 5.686 5.915 6.142 6.381 6.647 6.923 7.193 7.501 7.868 8.221 8.579 8.932 9.322 9.715 10.096 10.423 10.574 10.33 9.901 9.424 8.935 8.443 7.997 7.572 7.182 6.786 6.447 6.133 5.831 5.557 5.299 5.056 4.805 4.586 4.395 4.19 3.973 3.789 3.596 3.408 3.268 3.116 2.959 2.789 2.599 2.472 2.347 2.155 2.009 1.847 1.769 1.602 1.431 1.25 1.145 0.94 0.804 0.684 0.575 0.303 0.156 0.022 -0.127 -0.281 -0.485 -0.724 -1.338 -10 ,17 ,KEBNE ,17041082,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:56:44 CET,0.0 0.921 1.277 1.534 1.749 1.957 2.148 2.315 2.593 2.723 2.851 2.979 3.182 3.283 3.47 3.654 3.822 3.9 4.055 4.21 4.448 4.604 4.751 4.951 5.133 5.3 5.457 5.609 5.806 5.989 6.162 6.368 6.559 6.745 6.971 7.224 7.468 7.725 7.986 8.258 8.537 8.831 9.15 9.497 9.895 10.275 10.679 11.083 11.454 11.762 11.833 11.458 10.942 10.444 9.951 9.419 8.958 8.527 8.12 7.716 7.38 7.072 6.787 6.524 6.264 6.013 5.74 5.5 5.296 5.079 4.854 4.661 4.46 4.254 4.086 3.924 3.756 3.574 3.385 3.25 3.117 2.918 2.764 2.603 2.524 2.354 2.171 1.986 1.892 1.7 1.598 1.482 1.348 1.073 0.921 0.745 0.543 0.32 0.048 -0.323 -1.141 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt deleted file mode 100644 index 8f9622e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14987 ,KEBNE ,17041085,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:29 CET,0.0 0.377 0.643 0.873 1.084 1.27 1.472 1.664 1.998 2.164 2.324 2.488 2.742 2.872 3.126 3.382 3.627 3.74 3.954 4.165 4.478 4.68 4.88 5.157 5.411 5.669 5.932 6.176 6.465 6.753 7.057 7.416 7.753 8.079 8.451 8.863 9.269 9.727 10.225 10.745 11.296 11.942 12.685 13.395 14.242 15.237 16.367 17.539 18.877 20.449 22.198 23.455 24.024 24.292 24.361 24.317 24.22 24.11 23.989 23.801 23.62 23.464 23.289 23.105 22.924 22.757 22.56 22.363 22.195 22.034 21.864 21.722 21.575 21.396 21.251 21.097 20.936 20.766 20.582 20.458 20.335 20.148 20.002 19.854 19.783 19.635 19.477 19.299 19.213 19.025 18.938 18.846 18.758 18.572 18.478 18.374 18.258 18.143 18.022 17.852 17.468 -2 ,1385 ,KEBNE ,17041086,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:05 CET,0.0 1.095 1.487 1.81 2.096 2.365 2.598 2.798 3.154 3.317 3.471 3.635 3.888 4.01 4.222 4.422 4.614 4.71 4.918 5.124 5.408 5.601 5.799 6.085 6.356 6.617 6.878 7.127 7.45 7.76 8.049 8.401 8.737 9.066 9.459 9.896 10.294 10.728 11.21 11.74 12.311 12.932 13.657 14.396 15.231 16.159 17.219 18.387 19.712 21.175 22.862 24.119 24.67 24.914 24.978 24.917 24.813 24.678 24.517 24.337 24.172 24.012 23.823 23.628 23.45 23.29 23.105 22.919 22.763 22.582 22.378 22.224 22.068 21.903 21.776 21.639 21.498 21.348 21.178 21.057 20.926 20.717 20.567 20.416 20.342 20.182 20.001 19.812 19.709 19.494 19.346 19.219 19.087 18.8 18.661 18.52 18.361 18.204 18.042 17.841 17.516 -3 ,14824 ,KEBNE ,17041088,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:27 CET,0.0 0.695 1.046 1.331 1.583 1.83 2.074 2.289 2.647 2.808 2.953 3.11 3.364 3.501 3.776 4.033 4.284 4.397 4.606 4.791 5.055 5.234 5.401 5.656 5.907 6.132 6.357 6.59 6.903 7.209 7.506 7.863 8.202 8.526 8.917 9.36 9.778 10.235 10.74 11.279 11.823 12.443 13.184 13.915 14.758 15.698 16.762 17.926 19.258 20.766 22.415 23.62 24.237 24.508 24.568 24.525 24.422 24.272 24.118 23.944 23.779 23.603 23.406 23.215 23.037 22.87 22.682 22.5 22.34 22.188 22.025 21.88 21.729 21.567 21.436 21.304 21.172 21.037 20.901 20.807 20.713 20.569 20.471 20.368 20.309 20.189 20.048 19.893 19.82 19.644 19.586 19.502 19.416 19.245 19.149 19.045 18.928 18.793 18.636 18.421 17.928 -4 ,3776 ,KEBNE ,17041089,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:22 CET,0.0 0.942 1.357 1.656 1.877 2.096 2.312 2.506 2.843 2.996 3.145 3.309 3.574 3.723 3.982 4.212 4.44 4.552 4.777 4.994 5.297 5.49 5.681 5.964 6.244 6.512 6.761 6.994 7.305 7.614 7.916 8.284 8.633 8.972 9.383 9.83 10.249 10.713 11.206 11.746 12.323 12.962 13.703 14.439 15.275 16.177 17.22 18.433 19.802 21.321 23.08 24.311 24.797 24.984 25.038 24.974 24.859 24.719 24.556 24.383 24.218 24.051 23.868 23.682 23.512 23.346 23.149 22.962 22.795 22.62 22.428 22.276 22.135 21.968 21.828 21.69 21.544 21.395 21.241 21.119 20.991 20.798 20.665 20.525 20.45 20.302 20.144 19.956 19.857 19.664 19.551 19.431 19.313 19.064 18.921 18.76 18.572 18.346 18.117 17.891 17.515 -5 ,8711 ,KEBNE ,17041091,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:31 CET,0.0 0.471 0.724 0.952 1.144 1.305 1.461 1.603 1.89 2.025 2.147 2.247 2.494 2.637 2.92 3.19 3.441 3.555 3.767 3.983 4.292 4.476 4.659 4.929 5.192 5.441 5.678 5.924 6.243 6.536 6.828 7.186 7.53 7.862 8.244 8.662 9.067 9.533 10.035 10.564 11.132 11.784 12.546 13.295 14.163 15.097 16.142 17.351 18.69 20.192 21.851 22.997 23.508 23.681 23.709 23.65 23.53 23.393 23.241 23.045 22.856 22.682 22.501 22.315 22.144 21.978 21.789 21.626 21.481 21.324 21.16 21.017 20.861 20.686 20.538 20.393 20.26 20.118 19.961 19.839 19.715 19.532 19.392 19.243 19.159 18.998 18.85 18.673 18.579 18.385 18.27 18.152 18.037 17.767 17.618 17.44 17.242 17.047 16.821 16.527 15.791 -6 ,22230 ,KEBNE ,17041092,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:29 CET,0.0 0.507 0.75 0.961 1.142 1.324 1.487 1.634 1.916 2.047 2.172 2.302 2.547 2.667 2.895 3.115 3.329 3.437 3.652 3.855 4.157 4.351 4.534 4.803 5.069 5.331 5.589 5.835 6.145 6.444 6.724 7.066 7.411 7.741 8.126 8.558 8.978 9.444 9.923 10.432 10.981 11.597 12.326 13.061 13.912 14.862 15.951 17.149 18.462 19.99 21.734 22.947 23.516 23.708 23.739 23.665 23.54 23.4 23.251 23.063 22.877 22.713 22.53 22.347 22.182 22.023 21.845 21.678 21.534 21.387 21.224 21.086 20.937 20.764 20.634 20.5 20.355 20.206 20.038 19.915 19.785 19.576 19.439 19.305 19.235 19.101 18.965 18.827 18.755 18.58 18.527 18.437 18.351 18.163 18.049 17.936 17.809 17.664 17.52 17.33 16.714 -7 ,24521 ,KEBNE ,17041094,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:15 CET,0.0 0.842 1.19 1.534 1.851 2.116 2.361 2.597 2.985 3.141 3.294 3.48 3.748 3.884 4.147 4.392 4.628 4.738 4.947 5.156 5.473 5.676 5.864 6.145 6.421 6.676 6.926 7.171 7.48 7.783 8.082 8.447 8.791 9.118 9.494 9.919 10.347 10.806 11.309 11.841 12.367 12.969 13.684 14.397 15.236 16.177 17.254 18.453 19.821 21.416 23.146 24.314 24.863 25.099 25.147 25.075 24.967 24.815 24.64 24.46 24.288 24.116 23.947 23.775 23.61 23.45 23.259 23.081 22.92 22.756 22.592 22.44 22.27 22.106 21.97 21.815 21.653 21.494 21.34 21.214 21.074 20.877 20.749 20.613 20.539 20.386 20.23 20.06 19.971 19.783 19.695 19.587 19.466 19.177 19.009 18.818 18.62 18.424 18.177 17.881 17.278 -8 ,8929 ,KEBNE ,17041096,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:02 CET,0.0 1.023 1.434 1.709 1.926 2.142 2.347 2.526 2.853 3.014 3.172 3.36 3.628 3.767 4.039 4.312 4.566 4.677 4.892 5.105 5.407 5.609 5.807 6.076 6.344 6.614 6.87 7.113 7.424 7.717 8.004 8.364 8.691 9.012 9.405 9.84 10.254 10.702 11.198 11.731 12.274 12.904 13.651 14.386 15.215 16.122 17.18 18.365 19.698 21.207 22.948 24.212 24.768 25.027 25.108 25.081 24.991 24.819 24.641 24.459 24.291 24.129 23.943 23.751 23.572 23.411 23.245 23.083 22.925 22.764 22.601 22.47 22.337 22.207 22.114 22.015 21.905 21.779 21.643 21.54 21.437 21.294 21.188 21.082 21.027 20.905 20.785 20.657 20.585 20.416 20.372 20.286 20.205 20.043 19.959 19.86 19.724 19.565 19.391 19.175 18.788 -9 ,30955 ,KEBNE ,17041097,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:17 CET,0.0 0.994 1.429 1.755 2.011 2.245 2.465 2.674 3.031 3.192 3.354 3.545 3.806 3.944 4.219 4.476 4.71 4.819 5.032 5.243 5.551 5.751 5.947 6.224 6.481 6.733 6.987 7.232 7.543 7.845 8.14 8.505 8.86 9.191 9.558 9.965 10.368 10.81 11.286 11.796 12.342 12.959 13.659 14.356 15.191 16.155 17.247 18.425 19.744 21.275 23.003 24.219 24.789 25.041 25.102 25.063 24.954 24.816 24.68 24.511 24.345 24.172 23.991 23.803 23.623 23.46 23.279 23.119 22.971 22.803 22.614 22.461 22.303 22.135 22.01 21.865 21.709 21.554 21.386 21.264 21.15 20.967 20.834 20.703 20.629 20.475 20.301 20.103 20.004 19.806 19.681 19.559 19.432 19.165 19.014 18.833 18.639 18.415 18.148 17.852 17.132 -10 ,2099 ,KEBNE ,17041099,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:23 CET,0.0 0.437 0.677 0.87 1.039 1.187 1.329 1.467 1.719 1.842 1.962 2.088 2.335 2.453 2.673 2.88 3.074 3.173 3.375 3.557 3.811 3.981 4.16 4.443 4.73 5.013 5.275 5.523 5.857 6.173 6.467 6.832 7.181 7.519 7.919 8.357 8.776 9.225 9.707 10.228 10.783 11.419 12.163 12.925 13.804 14.748 15.809 16.986 18.308 19.769 21.466 22.71 23.237 23.425 23.47 23.44 23.352 23.214 23.06 22.875 22.699 22.532 22.353 22.161 21.976 21.812 21.637 21.474 21.328 21.177 21.02 20.871 20.709 20.554 20.424 20.274 20.115 19.956 19.77 19.635 19.503 19.301 19.157 19.004 18.932 18.791 18.632 18.448 18.349 18.145 18.026 17.899 17.77 17.52 17.383 17.222 17.029 16.82 16.577 16.22 15.302 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 00b1a735..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8008 ,KEBNE ,17041100,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:14 CET,0.0 0.646 0.921 1.17 1.381 1.517 1.621 1.728 1.918 1.99 2.07 2.107 2.297 2.376 2.533 2.677 2.819 2.885 3.003 3.118 3.299 3.415 3.516 3.656 3.78 3.897 4.017 4.142 4.3 4.436 4.555 4.706 4.854 4.998 5.168 5.352 5.52 5.676 5.834 6.0 6.182 6.381 6.591 6.797 6.982 7.153 7.302 7.376 7.334 7.011 6.101 4.815 3.669 2.584 1.624 0.75 0.001 -0.687 -1.293 -1.9 -2.425 -2.891 -3.343 -3.765 -4.15 -4.513 -4.895 -5.223 -5.513 -5.815 -6.112 -6.361 -6.626 -6.9 -7.12 -7.359 -7.587 -7.814 -8.068 -8.252 -8.44 -8.716 -8.911 -9.12 -9.221 -9.423 -9.635 -9.853 -9.964 -10.207 -10.309 -10.426 -10.539 -10.779 -10.922 -11.074 -11.234 -11.419 -11.622 -11.834 -12.212 -2 ,8967 ,KEBNE ,17041101,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:03 CET,0.0 0.335 0.512 0.634 0.761 0.867 0.953 1.041 1.213 1.288 1.359 1.386 1.578 1.639 1.765 1.884 1.999 2.063 2.18 2.284 2.443 2.56 2.669 2.808 2.942 3.072 3.196 3.325 3.495 3.641 3.773 3.925 4.076 4.223 4.393 4.577 4.727 4.871 5.03 5.206 5.38 5.55 5.734 5.908 6.073 6.198 6.296 6.34 6.224 5.869 5.0 3.671 2.495 1.427 0.459 -0.412 -1.187 -1.894 -2.505 -3.122 -3.657 -4.117 -4.564 -5.001 -5.398 -5.766 -6.15 -6.491 -6.786 -7.089 -7.383 -7.627 -7.899 -8.169 -8.38 -8.605 -8.835 -9.074 -9.326 -9.507 -9.692 -9.97 -10.163 -10.374 -10.484 -10.703 -10.917 -11.133 -11.244 -11.49 -11.58 -11.689 -11.807 -12.074 -12.234 -12.412 -12.596 -12.77 -12.956 -13.184 -13.68 -3 ,3148 ,KEBNE ,17041102,Thu Dec 23 02:35:04 CET,Thu Dec 23 03:57:05 CET,0.0 0.368 0.532 0.67 0.78 0.891 0.996 1.077 1.216 1.295 1.377 1.435 1.654 1.746 1.901 2.045 2.187 2.254 2.376 2.5 2.674 2.767 2.855 2.994 3.128 3.252 3.37 3.488 3.636 3.773 3.905 4.064 4.218 4.367 4.53 4.702 4.869 5.047 5.217 5.381 5.575 5.798 6.019 6.215 6.44 6.63 6.752 6.819 6.749 6.447 5.598 4.314 3.158 2.099 1.1 0.212 -0.548 -1.256 -1.85 -2.449 -2.975 -3.42 -3.847 -4.263 -4.643 -4.999 -5.371 -5.7 -5.987 -6.282 -6.594 -6.849 -7.112 -7.39 -7.608 -7.832 -8.065 -8.318 -8.579 -8.754 -8.939 -9.214 -9.398 -9.613 -9.723 -9.936 -10.173 -10.408 -10.515 -10.745 -10.828 -10.939 -11.054 -11.309 -11.448 -11.582 -11.735 -11.921 -12.127 -12.4 -13.032 -4 ,14306 ,KEBNE ,17041103,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 03:58:58 CET,0.0 0.243 0.396 0.538 0.671 0.781 0.87 0.959 1.128 1.213 1.297 1.334 1.53 1.6 1.733 1.857 1.977 2.036 2.153 2.279 2.459 2.566 2.669 2.816 2.954 3.071 3.183 3.291 3.434 3.575 3.708 3.867 4.014 4.159 4.33 4.52 4.692 4.873 5.046 5.232 5.435 5.631 5.836 6.018 6.193 6.329 6.422 6.449 6.332 5.994 5.126 3.774 2.573 1.487 0.512 -0.374 -1.166 -1.904 -2.531 -3.161 -3.701 -4.181 -4.645 -5.078 -5.475 -5.827 -6.217 -6.564 -6.846 -7.14 -7.44 -7.703 -7.978 -8.252 -8.471 -8.687 -8.907 -9.152 -9.395 -9.561 -9.738 -10.022 -10.217 -10.411 -10.513 -10.733 -10.967 -11.221 -11.356 -11.614 -11.762 -11.911 -12.057 -12.398 -12.581 -12.769 -12.982 -13.229 -13.479 -13.749 -14.244 -5 ,27259 ,KEBNE ,17041104,Thu Dec 23 02:37:09 CET,Thu Dec 23 04:00:43 CET,0.0 0.613 0.883 1.085 1.27 1.46 1.634 1.775 2.038 2.152 2.244 2.315 2.526 2.599 2.73 2.867 2.997 3.056 3.17 3.282 3.446 3.547 3.644 3.791 3.932 4.064 4.193 4.308 4.454 4.599 4.733 4.889 5.04 5.183 5.336 5.502 5.672 5.855 6.037 6.217 6.407 6.609 6.813 6.996 7.176 7.349 7.449 7.454 7.377 7.044 6.144 4.804 3.562 2.46 1.52 0.675 -0.116 -0.827 -1.427 -2.032 -2.565 -3.033 -3.483 -3.922 -4.32 -4.686 -5.064 -5.397 -5.694 -6.013 -6.332 -6.588 -6.859 -7.132 -7.344 -7.571 -7.802 -8.043 -8.305 -8.486 -8.661 -8.932 -9.129 -9.333 -9.439 -9.657 -9.876 -10.12 -10.251 -10.512 -10.662 -10.804 -10.951 -11.267 -11.448 -11.65 -11.873 -12.125 -12.424 -12.84 -13.753 -6 ,15124 ,KEBNE ,17041105,Thu Dec 23 02:37:09 CET,Thu Dec 23 04:00:40 CET,0.0 0.463 0.639 0.792 0.908 1.018 1.123 1.205 1.353 1.422 1.496 1.514 1.704 1.767 1.887 1.998 2.103 2.149 2.238 2.339 2.471 2.559 2.652 2.779 2.898 3.002 3.106 3.218 3.37 3.515 3.661 3.829 3.975 4.115 4.275 4.456 4.634 4.816 4.989 5.174 5.365 5.561 5.752 5.93 6.125 6.262 6.327 6.34 6.238 5.882 4.974 3.63 2.429 1.344 0.4 -0.448 -1.206 -1.896 -2.494 -3.097 -3.635 -4.133 -4.594 -5.017 -5.42 -5.791 -6.175 -6.509 -6.799 -7.118 -7.454 -7.707 -7.973 -8.266 -8.489 -8.71 -8.927 -9.154 -9.383 -9.539 -9.703 -9.959 -10.131 -10.3 -10.388 -10.575 -10.77 -10.968 -11.067 -11.303 -11.425 -11.549 -11.666 -11.939 -12.1 -12.261 -12.422 -12.601 -12.847 -13.165 -13.722 -7 ,13622 ,KEBNE ,17041106,Thu Dec 23 02:37:13 CET,Thu Dec 23 04:03:11 CET,0.0 0.431 0.587 0.724 0.843 0.952 1.047 1.139 1.306 1.386 1.471 1.488 1.672 1.734 1.851 1.961 2.07 2.127 2.238 2.338 2.483 2.574 2.658 2.776 2.881 2.974 3.076 3.176 3.298 3.42 3.529 3.651 3.77 3.894 4.039 4.184 4.334 4.515 4.699 4.87 5.039 5.243 5.462 5.644 5.826 5.985 6.106 6.152 6.03 5.677 4.808 3.478 2.295 1.26 0.311 -0.571 -1.36 -2.069 -2.677 -3.293 -3.834 -4.319 -4.776 -5.197 -5.574 -5.928 -6.302 -6.632 -6.919 -7.218 -7.536 -7.801 -8.074 -8.359 -8.58 -8.814 -9.053 -9.29 -9.537 -9.712 -9.889 -10.163 -10.353 -10.565 -10.683 -10.904 -11.102 -11.297 -11.4 -11.637 -11.719 -11.841 -11.981 -12.263 -12.398 -12.522 -12.645 -12.798 -12.986 -13.228 -13.746 -8 ,733 ,KEBNE ,17041107,Thu Dec 23 02:37:09 CET,Thu Dec 23 04:00:47 CET,0.0 0.364 0.557 0.705 0.829 0.949 1.065 1.164 1.333 1.416 1.488 1.495 1.685 1.75 1.874 1.998 2.133 2.197 2.319 2.45 2.633 2.739 2.846 2.99 3.124 3.259 3.389 3.51 3.667 3.81 3.928 4.072 4.212 4.343 4.483 4.621 4.758 4.926 5.109 5.286 5.448 5.621 5.804 5.945 6.103 6.256 6.382 6.444 6.332 5.929 4.986 3.632 2.361 1.229 0.231 -0.671 -1.453 -2.17 -2.795 -3.416 -3.936 -4.4 -4.855 -5.276 -5.66 -6.021 -6.399 -6.742 -7.035 -7.327 -7.638 -7.899 -8.161 -8.429 -8.653 -8.889 -9.118 -9.366 -9.614 -9.779 -9.95 -10.234 -10.446 -10.656 -10.759 -10.975 -11.212 -11.451 -11.572 -11.825 -11.985 -12.138 -12.285 -12.614 -12.798 -12.993 -13.221 -13.48 -13.713 -13.96 -14.628 -9 ,5300 ,KEBNE ,17041108,Thu Dec 23 02:37:09 CET,Thu Dec 23 04:00:41 CET,0.0 0.394 0.591 0.738 0.856 0.968 1.076 1.188 1.41 1.513 1.603 1.659 1.864 1.944 2.103 2.248 2.375 2.442 2.572 2.697 2.877 2.979 3.075 3.207 3.337 3.475 3.616 3.745 3.892 4.036 4.169 4.322 4.478 4.622 4.79 4.976 5.133 5.294 5.471 5.648 5.821 6.006 6.185 6.339 6.484 6.621 6.747 6.812 6.756 6.456 5.601 4.222 2.939 1.844 0.901 0.009 -0.774 -1.458 -2.048 -2.646 -3.185 -3.67 -4.109 -4.526 -4.921 -5.272 -5.649 -5.998 -6.292 -6.591 -6.901 -7.16 -7.423 -7.694 -7.906 -8.121 -8.356 -8.601 -8.841 -9.013 -9.196 -9.477 -9.667 -9.872 -9.977 -10.187 -10.405 -10.636 -10.758 -11.015 -11.154 -11.299 -11.456 -11.807 -11.984 -12.162 -12.373 -12.602 -12.828 -13.05 -13.429 -10 ,25922 ,KEBNE ,17041109,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 04:00:38 CET,0.0 0.441 0.595 0.734 0.849 0.952 1.063 1.173 1.373 1.462 1.544 1.562 1.751 1.825 1.978 2.122 2.242 2.296 2.404 2.514 2.691 2.812 2.924 3.074 3.21 3.337 3.469 3.595 3.745 3.873 3.994 4.147 4.291 4.425 4.58 4.745 4.912 5.089 5.249 5.42 5.589 5.756 5.942 6.115 6.288 6.431 6.513 6.557 6.508 6.184 5.357 4.084 2.839 1.724 0.759 -0.126 -0.914 -1.603 -2.196 -2.815 -3.353 -3.825 -4.273 -4.684 -5.076 -5.438 -5.816 -6.161 -6.449 -6.744 -7.051 -7.311 -7.583 -7.858 -8.074 -8.308 -8.551 -8.802 -9.052 -9.231 -9.415 -9.69 -9.881 -10.074 -10.169 -10.357 -10.541 -10.741 -10.849 -11.08 -11.186 -11.308 -11.426 -11.688 -11.817 -11.949 -12.092 -12.265 -12.471 -12.718 -13.243 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 6a0499dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22893 ,TETRA ,17590046,Sat Nov 27 19:30:45 CET,Sat Nov 27 21:20:39 CET,0.0 0.571 0.794 1.008 1.203 1.361 1.504 1.651 1.923 2.053 2.18 2.263 2.502 2.602 2.799 2.985 3.17 3.263 3.442 3.606 3.825 3.972 4.121 4.341 4.555 4.764 4.972 5.175 5.433 5.672 5.907 6.191 6.471 6.756 7.075 7.435 7.793 8.184 8.603 9.071 9.584 10.162 10.829 11.48 12.239 13.094 14.077 15.16 16.427 17.863 19.508 20.706 21.267 21.562 21.648 21.642 21.602 21.506 21.391 21.257 21.107 20.946 20.793 20.649 20.505 20.372 20.217 20.069 19.941 19.801 19.644 19.511 19.375 19.237 19.132 19.012 18.883 18.753 18.601 18.499 18.398 18.209 18.071 17.924 17.843 17.685 17.517 17.342 17.25 17.037 16.956 16.854 16.745 16.507 16.375 16.231 16.082 15.917 15.699 15.365 14.424 -2 ,13618 ,TETRA ,17590047,Sat Nov 27 19:30:42 CET,Sat Nov 27 21:20:00 CET,0.0 0.561 0.801 1.011 1.2 1.36 1.527 1.687 1.957 2.076 2.184 2.262 2.52 2.633 2.832 3.008 3.185 3.275 3.446 3.624 3.896 4.061 4.211 4.421 4.63 4.833 5.041 5.252 5.506 5.751 5.998 6.281 6.56 6.831 7.139 7.509 7.874 8.264 8.686 9.125 9.572 10.094 10.745 11.434 12.246 13.116 14.068 15.15 16.406 17.762 19.312 20.45 21.032 21.356 21.462 21.41 21.326 21.25 21.149 21.008 20.856 20.698 20.54 20.391 20.243 20.1 19.946 19.794 19.651 19.498 19.33 19.2 19.076 18.942 18.837 18.733 18.628 18.511 18.389 18.31 18.225 18.09 17.999 17.905 17.859 17.757 17.64 17.517 17.445 17.25 17.227 17.158 17.084 16.921 16.834 16.742 16.616 16.461 16.314 16.113 15.742 -3 ,32580 ,TETRA ,17590048,Sat Nov 27 19:30:44 CET,Sat Nov 27 21:20:17 CET,0.0 0.583 0.794 0.98 1.148 1.304 1.465 1.619 1.906 2.034 2.148 2.214 2.442 2.539 2.756 2.971 3.162 3.246 3.404 3.556 3.78 3.936 4.094 4.32 4.533 4.736 4.945 5.153 5.4 5.643 5.887 6.171 6.432 6.688 7.004 7.37 7.739 8.154 8.592 9.062 9.558 10.106 10.762 11.449 12.254 13.171 14.23 15.391 16.691 18.166 19.819 20.913 21.41 21.6 21.616 21.599 21.54 21.427 21.314 21.186 21.06 20.944 20.816 20.667 20.529 20.408 20.275 20.151 20.03 19.903 19.776 19.674 19.578 19.468 19.366 19.263 19.164 19.062 18.958 18.882 18.801 18.677 18.591 18.494 18.441 18.336 18.224 18.086 18.013 17.82 17.782 17.704 17.614 17.412 17.325 17.229 17.119 16.966 16.758 16.536 15.964 -4 ,31904 ,TETRA ,17590049,Sat Nov 27 19:30:44 CET,Sat Nov 27 21:20:01 CET,0.0 1.004 1.273 1.475 1.675 1.848 2.001 2.135 2.377 2.491 2.604 2.685 2.929 3.038 3.246 3.434 3.612 3.707 3.894 4.064 4.321 4.495 4.668 4.916 5.153 5.379 5.603 5.819 6.086 6.34 6.596 6.913 7.232 7.542 7.887 8.269 8.636 9.03 9.457 9.926 10.422 10.985 11.652 12.323 13.119 14.004 14.959 15.991 17.215 18.651 20.287 21.481 22.032 22.301 22.382 22.334 22.276 22.192 22.048 21.867 21.705 21.545 21.403 21.273 21.142 21.023 20.874 20.728 20.615 20.495 20.365 20.244 20.106 19.96 19.857 19.747 19.63 19.502 19.329 19.21 19.106 18.948 18.84 18.726 18.664 18.539 18.42 18.29 18.22 18.032 17.988 17.908 17.823 17.626 17.532 17.434 17.326 17.208 17.049 16.842 16.462 -5 ,14537 ,TETRA ,17590050,Sat Nov 27 19:30:44 CET,Sat Nov 27 21:20:02 CET,0.0 1.07 1.493 1.795 2.046 2.282 2.497 2.678 3.024 3.173 3.302 3.419 3.678 3.807 4.053 4.271 4.476 4.582 4.792 4.984 5.259 5.439 5.612 5.858 6.11 6.349 6.57 6.792 7.077 7.342 7.589 7.901 8.214 8.521 8.878 9.268 9.63 10.027 10.482 10.968 11.463 12.04 12.699 13.355 14.118 14.934 15.878 16.956 18.249 19.718 21.302 22.44 23.063 23.326 23.375 23.384 23.342 23.259 23.14 22.981 22.84 22.718 22.575 22.407 22.259 22.116 21.956 21.814 21.686 21.544 21.379 21.258 21.146 21.015 20.92 20.811 20.693 20.592 20.472 20.39 20.318 20.188 20.094 19.998 19.953 19.86 19.755 19.636 19.56 19.365 19.346 19.276 19.202 19.015 18.912 18.791 18.661 18.534 18.403 18.231 17.511 -6 ,3831 ,TETRA ,17590051,Sat Nov 27 19:30:43 CET,Sat Nov 27 21:24:14 CET,0.0 0.576 0.839 1.058 1.243 1.398 1.544 1.682 1.955 2.089 2.21 2.288 2.529 2.63 2.816 3.001 3.193 3.287 3.468 3.637 3.873 4.03 4.194 4.429 4.645 4.853 5.045 5.23 5.485 5.733 5.977 6.283 6.59 6.876 7.206 7.599 7.978 8.388 8.833 9.304 9.8 10.377 11.055 11.76 12.56 13.384 14.366 15.469 16.709 18.167 19.784 20.906 21.451 21.731 21.845 21.815 21.701 21.568 21.412 21.261 21.138 21.003 20.866 20.742 20.61 20.47 20.33 20.213 20.116 20.01 19.897 19.798 19.685 19.573 19.492 19.4 19.294 19.182 19.054 18.958 18.862 18.724 18.629 18.535 18.484 18.378 18.28 18.173 18.109 17.917 17.877 17.803 17.728 17.566 17.482 17.357 17.214 17.083 16.923 16.725 16.333 -7 ,18254 ,TETRA ,17590052,Sat Nov 27 19:30:44 CET,Sat Nov 27 21:20:09 CET,0.0 0.782 1.16 1.453 1.718 1.957 2.171 2.364 2.698 2.853 2.996 3.126 3.395 3.517 3.753 3.986 4.22 4.332 4.53 4.717 4.979 5.145 5.306 5.546 5.78 6.008 6.238 6.456 6.732 6.999 7.26 7.58 7.878 8.151 8.471 8.856 9.228 9.62 10.06 10.525 10.992 11.532 12.183 12.845 13.661 14.561 15.538 16.617 17.846 19.259 20.843 21.97 22.503 22.733 22.803 22.802 22.72 22.605 22.506 22.373 22.235 22.095 21.94 21.784 21.618 21.46 21.323 21.206 21.1 21.002 20.891 20.785 20.672 20.541 20.441 20.348 20.253 20.155 20.046 19.972 19.91 19.803 19.716 19.623 19.575 19.471 19.366 19.271 19.215 19.031 19.0 18.913 18.833 18.652 18.548 18.442 18.319 18.185 18.038 17.85 17.276 -8 ,1041 ,TETRA ,17590053,Sat Nov 27 19:30:44 CET,Sat Nov 27 21:22:33 CET,0.0 0.55 0.763 0.945 1.099 1.238 1.358 1.477 1.718 1.838 1.959 2.033 2.28 2.386 2.583 2.781 2.973 3.064 3.237 3.409 3.663 3.822 3.981 4.215 4.435 4.665 4.9 5.125 5.409 5.68 5.953 6.277 6.577 6.867 7.213 7.596 7.953 8.357 8.802 9.281 9.785 10.354 11.012 11.666 12.429 13.305 14.323 15.432 16.677 18.069 19.66 20.826 21.4 21.69 21.797 21.804 21.731 21.624 21.504 21.361 21.235 21.109 20.963 20.811 20.66 20.513 20.352 20.192 20.049 19.899 19.748 19.637 19.519 19.4 19.316 19.231 19.136 19.02 18.885 18.79 18.701 18.576 18.483 18.382 18.331 18.233 18.127 18.007 17.948 17.762 17.747 17.677 17.593 17.406 17.305 17.199 17.082 16.96 16.83 16.652 16.081 -9 ,20335 ,TETRA ,17590054,Sat Nov 27 19:30:44 CET,Sat Nov 27 21:23:39 CET,0.0 0.512 0.753 0.958 1.155 1.344 1.514 1.657 1.917 2.041 2.161 2.246 2.484 2.582 2.781 2.961 3.145 3.231 3.386 3.541 3.778 3.925 4.066 4.293 4.511 4.719 4.934 5.132 5.377 5.628 5.878 6.17 6.446 6.72 7.054 7.429 7.795 8.208 8.658 9.135 9.637 10.198 10.846 11.525 12.318 13.179 14.207 15.369 16.662 18.056 19.617 20.762 21.272 21.47 21.54 21.527 21.461 21.357 21.244 21.098 20.939 20.814 20.677 20.523 20.377 20.217 20.046 19.91 19.795 19.663 19.519 19.392 19.248 19.109 19.015 18.907 18.781 18.653 18.5 18.402 18.308 18.141 18.026 17.903 17.84 17.707 17.543 17.363 17.274 17.064 16.981 16.864 16.751 16.548 16.427 16.289 16.157 15.993 15.778 15.546 15.076 -10 ,11902 ,TETRA ,17590055,Sat Nov 27 19:30:45 CET,Sat Nov 27 21:23:29 CET,0.0 0.803 1.111 1.328 1.494 1.666 1.814 1.944 2.208 2.332 2.448 2.542 2.792 2.902 3.107 3.3 3.493 3.591 3.778 3.969 4.256 4.43 4.604 4.872 5.13 5.367 5.599 5.823 6.107 6.383 6.641 6.955 7.269 7.567 7.914 8.308 8.677 9.088 9.548 10.034 10.54 11.111 11.753 12.432 13.264 14.142 15.117 16.236 17.551 19.047 20.701 21.888 22.458 22.69 22.775 22.772 22.736 22.658 22.55 22.422 22.288 22.146 22.0 21.852 21.705 21.567 21.411 21.27 21.142 21.003 20.835 20.682 20.542 20.414 20.305 20.177 20.045 19.913 19.773 19.68 19.591 19.431 19.312 19.189 19.124 18.989 18.836 18.663 18.574 18.373 18.332 18.234 18.127 17.919 17.782 17.635 17.466 17.26 17.037 16.698 15.655 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt deleted file mode 100644 index caae9f21..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2132 ,KEBNE ,17041110,Thu Dec 23 02:37:09 CET,Thu Dec 23 04:00:16 CET,0.0 0.343 0.615 0.832 1.008 1.162 1.321 1.469 1.745 1.89 2.02 2.127 2.386 2.499 2.713 2.917 3.13 3.239 3.449 3.647 3.94 4.145 4.34 4.619 4.904 5.173 5.429 5.677 5.992 6.294 6.604 6.993 7.355 7.699 8.115 8.582 9.007 9.474 10.0 10.569 11.165 11.867 12.724 13.575 14.557 15.692 17.04 18.588 20.458 22.687 25.403 27.719 29.127 30.062 30.664 31.076 31.354 31.541 31.681 31.775 31.811 31.811 31.792 31.756 31.711 31.673 31.638 31.595 31.54 31.478 31.405 31.35 31.287 31.201 31.139 31.084 31.021 30.929 30.815 30.745 30.683 30.593 30.53 30.458 30.421 30.342 30.254 30.163 30.124 29.982 29.976 29.921 29.864 29.749 29.676 29.6 29.516 29.422 29.305 29.116 28.896 -2 ,2076 ,KEBNE ,17041111,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 03:59:11 CET,0.0 0.812 1.141 1.405 1.651 1.867 2.046 2.196 2.51 2.671 2.832 3.007 3.271 3.392 3.622 3.858 4.101 4.209 4.414 4.623 4.916 5.109 5.299 5.58 5.858 6.118 6.363 6.61 6.939 7.245 7.547 7.922 8.289 8.64 9.034 9.482 9.921 10.421 10.967 11.56 12.184 12.882 13.715 14.563 15.562 16.695 18.039 19.54 21.324 23.523 26.182 28.472 29.843 30.702 31.289 31.729 32.022 32.207 32.32 32.385 32.419 32.436 32.421 32.403 32.39 32.362 32.312 32.251 32.195 32.137 32.07 32.007 31.941 31.871 31.812 31.754 31.688 31.596 31.489 31.417 31.338 31.224 31.14 31.044 30.997 30.899 30.786 30.665 30.606 30.444 30.402 30.32 30.229 30.041 29.942 29.833 29.703 29.55 29.353 29.09 28.435 -3 ,33 ,KEBNE ,17041112,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 04:00:30 CET,0.0 0.349 0.577 0.765 0.929 1.083 1.231 1.367 1.615 1.731 1.844 1.936 2.192 2.312 2.548 2.781 3.006 3.112 3.333 3.55 3.847 4.035 4.216 4.492 4.757 5.01 5.254 5.494 5.814 6.122 6.424 6.8 7.165 7.505 7.902 8.35 8.785 9.267 9.807 10.411 11.029 11.725 12.552 13.403 14.415 15.579 16.939 18.476 20.305 22.56 25.345 27.698 29.155 30.077 30.676 31.097 31.381 31.582 31.704 31.774 31.808 31.809 31.784 31.759 31.739 31.711 31.67 31.634 31.6 31.55 31.475 31.411 31.342 31.261 31.2 31.128 31.05 30.98 30.898 30.834 30.774 30.679 30.61 30.53 30.484 30.382 30.267 30.139 30.065 29.888 29.831 29.748 29.661 29.451 29.32 29.173 29.026 28.85 28.65 28.401 27.947 -4 ,26447 ,KEBNE ,17041113,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 04:01:07 CET,0.0 0.368 0.602 0.8 0.96 1.111 1.248 1.376 1.633 1.761 1.877 1.955 2.202 2.322 2.551 2.754 2.945 3.042 3.233 3.408 3.665 3.847 4.032 4.308 4.57 4.832 5.095 5.338 5.651 5.958 6.258 6.618 6.966 7.311 7.724 8.195 8.64 9.136 9.682 10.256 10.866 11.568 12.414 13.271 14.253 15.374 16.673 18.159 19.953 22.108 24.754 27.044 28.394 29.279 29.915 30.347 30.657 30.88 31.002 31.07 31.125 31.166 31.174 31.15 31.124 31.097 31.038 30.986 30.938 30.877 30.812 30.75 30.694 30.62 30.542 30.467 30.397 30.317 30.225 30.161 30.092 29.98 29.902 29.819 29.771 29.669 29.569 29.456 29.381 29.21 29.171 29.086 29.001 28.819 28.705 28.573 28.417 28.251 28.081 27.875 27.484 -5 ,21337 ,KEBNE ,17041114,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 04:00:35 CET,0.0 0.361 0.575 0.766 0.94 1.098 1.248 1.389 1.637 1.749 1.86 1.957 2.209 2.324 2.544 2.756 2.966 3.063 3.257 3.436 3.692 3.863 4.024 4.261 4.498 4.74 4.973 5.205 5.51 5.809 6.108 6.484 6.851 7.195 7.608 8.075 8.515 9.011 9.545 10.112 10.714 11.391 12.206 13.06 14.069 15.216 16.598 18.186 20.033 22.269 25.076 27.43 28.804 29.673 30.255 30.681 30.963 31.147 31.278 31.355 31.392 31.405 31.387 31.357 31.313 31.262 31.207 31.153 31.094 31.032 30.968 30.906 30.842 30.773 30.71 30.636 30.558 30.477 30.384 30.316 30.252 30.164 30.106 30.041 30.002 29.914 29.827 29.748 29.71 29.569 29.579 29.519 29.452 29.332 29.278 29.208 29.129 29.031 28.903 28.72 28.283 -6 ,31448 ,KEBNE ,17041115,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 04:00:29 CET,0.0 0.637 0.921 1.132 1.302 1.459 1.605 1.74 1.993 2.115 2.233 2.347 2.613 2.74 2.993 3.238 3.475 3.587 3.806 4.014 4.3 4.5 4.7 4.978 5.239 5.494 5.74 5.981 6.307 6.62 6.919 7.281 7.639 7.997 8.417 8.888 9.344 9.831 10.369 10.946 11.54 12.249 13.092 13.957 15.003 16.153 17.473 19.051 20.944 23.203 26.04 28.396 29.803 30.722 31.308 31.696 31.984 32.183 32.299 32.385 32.425 32.433 32.433 32.429 32.415 32.375 32.324 32.28 32.237 32.186 32.131 32.078 32.015 31.949 31.905 31.864 31.813 31.756 31.689 31.64 31.598 31.529 31.467 31.404 31.371 31.294 31.186 31.083 31.043 30.902 30.922 30.872 30.824 30.718 30.653 30.578 30.493 30.401 30.31 30.212 29.986 -7 ,16440 ,KEBNE ,17041116,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 04:00:25 CET,0.0 1.02 1.417 1.704 1.938 2.156 2.35 2.52 2.827 2.968 3.113 3.248 3.508 3.642 3.893 4.114 4.339 4.454 4.663 4.868 5.178 5.364 5.554 5.84 6.101 6.354 6.603 6.841 7.154 7.471 7.777 8.14 8.49 8.832 9.244 9.704 10.145 10.646 11.189 11.78 12.415 13.143 14.013 14.875 15.901 17.06 18.378 19.881 21.708 23.93 26.649 28.955 30.312 31.182 31.772 32.184 32.478 32.688 32.818 32.9 32.943 32.96 32.961 32.945 32.91 32.869 32.825 32.783 32.738 32.677 32.61 32.549 32.473 32.398 32.346 32.28 32.193 32.103 32.014 31.952 31.889 31.798 31.735 31.658 31.619 31.54 31.45 31.373 31.332 31.176 31.176 31.126 31.072 30.924 30.841 30.767 30.695 30.614 30.503 30.357 30.204 -8 ,1437 ,KEBNE ,17041117,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 04:00:21 CET,0.0 0.375 0.597 0.788 0.963 1.124 1.268 1.408 1.68 1.807 1.93 2.028 2.284 2.407 2.654 2.894 3.11 3.21 3.413 3.62 3.915 4.104 4.289 4.568 4.839 5.097 5.342 5.571 5.876 6.189 6.492 6.857 7.211 7.543 7.923 8.372 8.819 9.311 9.837 10.409 11.043 11.77 12.622 13.476 14.485 15.634 16.94 18.447 20.258 22.419 25.135 27.44 28.757 29.613 30.24 30.652 30.881 31.04 31.168 31.259 31.307 31.329 31.327 31.307 31.284 31.256 31.211 31.163 31.109 31.043 30.97 30.901 30.829 30.759 30.693 30.61 30.521 30.427 30.338 30.273 30.205 30.093 30.005 29.918 29.874 29.783 29.679 29.56 29.484 29.298 29.247 29.164 29.069 28.868 28.759 28.631 28.479 28.314 28.105 27.785 27.2 -9 ,12910 ,KEBNE ,17041118,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 03:58:56 CET,0.0 0.418 0.644 0.843 1.016 1.177 1.332 1.465 1.703 1.827 1.95 2.051 2.302 2.423 2.677 2.913 3.14 3.25 3.466 3.672 3.967 4.158 4.348 4.619 4.88 5.135 5.383 5.631 5.946 6.26 6.574 6.952 7.312 7.646 8.042 8.502 8.937 9.427 9.975 10.56 11.178 11.87 12.678 13.488 14.456 15.579 16.924 18.487 20.343 22.528 25.195 27.45 28.817 29.751 30.388 30.827 31.127 31.326 31.425 31.486 31.531 31.567 31.573 31.546 31.507 31.457 31.401 31.351 31.313 31.262 31.201 31.149 31.087 31.016 30.943 30.863 30.788 30.694 30.593 30.528 30.46 30.349 30.263 30.165 30.114 29.998 29.878 29.759 29.697 29.534 29.496 29.417 29.333 29.174 29.094 29.018 28.93 28.831 28.73 28.592 28.28 -10 ,22476 ,KEBNE ,17041119,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 04:00:58 CET,0.0 0.554 0.795 1.013 1.173 1.318 1.466 1.618 1.936 2.08 2.221 2.34 2.578 2.678 2.888 3.089 3.282 3.373 3.55 3.737 4.013 4.185 4.353 4.596 4.835 5.069 5.304 5.541 5.836 6.126 6.42 6.788 7.142 7.482 7.881 8.331 8.775 9.258 9.787 10.377 10.998 11.7 12.517 13.33 14.301 15.43 16.75 18.27 20.121 22.335 25.026 27.369 28.757 29.629 30.204 30.606 30.928 31.14 31.233 31.298 31.36 31.406 31.433 31.431 31.407 31.362 31.299 31.252 31.21 31.155 31.081 30.999 30.913 30.842 30.787 30.73 30.677 30.615 30.547 30.498 30.441 30.347 30.288 30.229 30.198 30.137 30.074 29.989 29.943 29.803 29.833 29.791 29.73 29.603 29.542 29.481 29.415 29.323 29.227 29.1 28.785 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 86f078cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23282 ,TETRA ,17977764,Tue Dec 21 07:42:41 CET,Tue Dec 21 09:19:28 CET,0.0 0.38 0.557 0.686 0.809 0.933 1.045 1.145 1.376 1.488 1.572 1.596 1.811 1.894 2.049 2.203 2.354 2.426 2.564 2.696 2.886 3.003 3.114 3.271 3.436 3.601 3.744 3.871 4.041 4.215 4.387 4.583 4.776 4.975 5.206 5.456 5.672 5.895 6.152 6.428 6.704 7.021 7.401 7.767 8.204 8.665 9.119 9.579 10.111 10.614 10.839 10.582 10.073 9.557 9.072 8.595 8.16 7.731 7.349 6.97 6.624 6.279 5.928 5.602 5.303 5.029 4.747 4.495 4.267 4.029 3.783 3.585 3.371 3.133 2.955 2.785 2.62 2.443 2.24 2.103 1.971 1.737 1.572 1.421 1.347 1.186 1.015 0.835 0.73 0.498 0.418 0.286 0.142 -0.161 -0.321 -0.496 -0.706 -0.953 -1.236 -1.585 -2.529 -2 ,20651 ,TETRA ,17977765,Tue Dec 21 07:42:43 CET,Tue Dec 21 09:19:14 CET,0.0 0.534 0.732 0.919 1.07 1.206 1.319 1.422 1.601 1.678 1.751 1.752 1.964 2.041 2.183 2.318 2.459 2.528 2.664 2.8 2.987 3.117 3.25 3.45 3.644 3.823 3.992 4.149 4.356 4.562 4.755 4.981 5.192 5.39 5.622 5.894 6.158 6.437 6.737 7.038 7.336 7.68 8.078 8.474 8.909 9.363 9.862 10.36 10.883 11.35 11.523 11.222 10.749 10.27 9.799 9.324 8.876 8.443 8.048 7.648 7.305 6.993 6.689 6.401 6.134 5.889 5.632 5.404 5.191 4.968 4.73 4.517 4.303 4.088 3.926 3.759 3.583 3.394 3.195 3.053 2.892 2.636 2.473 2.319 2.24 2.076 1.886 1.694 1.604 1.386 1.334 1.232 1.133 0.913 0.791 0.651 0.491 0.309 0.118 -0.117 -0.715 -3 ,10052 ,TETRA ,17977766,Tue Dec 21 07:42:39 CET,Tue Dec 21 09:17:58 CET,0.0 0.577 0.799 0.95 1.072 1.18 1.294 1.404 1.595 1.684 1.776 1.815 2.028 2.101 2.257 2.408 2.542 2.609 2.738 2.86 3.05 3.17 3.281 3.447 3.61 3.759 3.888 4.025 4.216 4.388 4.551 4.756 4.956 5.136 5.343 5.575 5.789 6.025 6.291 6.588 6.894 7.199 7.547 7.904 8.303 8.739 9.232 9.744 10.214 10.624 10.885 10.653 10.188 9.709 9.237 8.735 8.255 7.817 7.413 6.988 6.601 6.225 5.876 5.566 5.268 5.001 4.726 4.476 4.258 4.029 3.803 3.612 3.405 3.2 3.045 2.866 2.67 2.473 2.269 2.129 1.99 1.771 1.608 1.447 1.37 1.203 1.008 0.817 0.721 0.487 0.392 0.273 0.16 -0.086 -0.244 -0.413 -0.588 -0.819 -1.122 -1.472 -2.118 -4 ,12961 ,TETRA ,17977767,Tue Dec 21 07:44:35 CET,Tue Dec 21 09:22:55 CET,0.0 0.359 0.618 0.82 0.971 1.109 1.232 1.35 1.583 1.686 1.772 1.803 2.021 2.097 2.25 2.404 2.548 2.61 2.723 2.835 3.012 3.138 3.264 3.44 3.596 3.747 3.902 4.046 4.234 4.407 4.575 4.792 5.01 5.217 5.454 5.732 5.994 6.268 6.558 6.86 7.181 7.538 7.925 8.297 8.718 9.176 9.684 10.17 10.651 11.124 11.359 11.137 10.713 10.229 9.762 9.289 8.818 8.372 7.971 7.568 7.218 6.9 6.597 6.304 6.022 5.765 5.495 5.261 5.064 4.836 4.585 4.384 4.171 3.947 3.772 3.594 3.413 3.238 3.074 2.958 2.84 2.673 2.551 2.419 2.346 2.197 2.046 1.881 1.8 1.588 1.56 1.47 1.366 1.149 1.022 0.881 0.719 0.518 0.296 0.01 -0.63 -5 ,29307 ,TETRA ,17977768,Tue Dec 21 07:44:29 CET,Tue Dec 21 09:23:00 CET,0.0 0.856 1.075 1.229 1.356 1.498 1.647 1.804 2.086 2.204 2.319 2.406 2.641 2.738 2.927 3.1 3.251 3.331 3.49 3.635 3.843 3.982 4.119 4.314 4.488 4.647 4.815 4.981 5.174 5.362 5.549 5.777 6.003 6.229 6.467 6.725 6.986 7.257 7.542 7.842 8.161 8.503 8.872 9.247 9.675 10.134 10.602 11.079 11.596 12.063 12.304 12.046 11.586 11.095 10.629 10.174 9.741 9.341 8.989 8.623 8.266 7.926 7.623 7.347 7.086 6.836 6.57 6.329 6.109 5.873 5.63 5.428 5.217 4.998 4.824 4.645 4.474 4.315 4.137 4.006 3.881 3.689 3.55 3.394 3.312 3.149 2.995 2.838 2.749 2.519 2.434 2.313 2.19 1.952 1.844 1.723 1.578 1.401 1.199 0.96 0.545 -6 ,26135 ,TETRA ,17977769,Tue Dec 21 07:44:31 CET,Tue Dec 21 09:21:13 CET,0.0 0.697 0.956 1.111 1.263 1.417 1.549 1.662 1.844 1.924 2.005 2.02 2.237 2.32 2.468 2.607 2.753 2.828 2.959 3.079 3.27 3.395 3.503 3.654 3.805 3.95 4.089 4.223 4.391 4.56 4.74 4.965 5.18 5.382 5.617 5.878 6.131 6.413 6.701 6.988 7.298 7.643 8.025 8.424 8.855 9.292 9.819 10.374 10.855 11.214 11.325 11.154 10.772 10.313 9.847 9.33 8.851 8.439 8.045 7.632 7.288 6.97 6.64 6.323 6.05 5.806 5.549 5.314 5.11 4.895 4.667 4.477 4.277 4.072 3.91 3.732 3.552 3.377 3.204 3.084 2.944 2.728 2.589 2.449 2.373 2.194 2.003 1.811 1.714 1.488 1.417 1.307 1.199 0.983 0.863 0.733 0.601 0.44 0.252 0.027 -0.459 -7 ,24205 ,TETRA ,17977770,Tue Dec 21 07:44:33 CET,Tue Dec 21 09:21:12 CET,0.0 0.718 0.962 1.152 1.296 1.406 1.511 1.604 1.801 1.897 1.99 2.042 2.265 2.347 2.491 2.615 2.744 2.809 2.936 3.068 3.259 3.38 3.49 3.645 3.799 3.948 4.091 4.228 4.389 4.547 4.716 4.914 5.105 5.287 5.499 5.763 6.016 6.291 6.584 6.898 7.215 7.568 7.98 8.371 8.838 9.324 9.798 10.302 10.842 11.257 11.451 11.289 10.862 10.324 9.819 9.335 8.868 8.422 8.028 7.62 7.265 6.956 6.641 6.303 5.986 5.707 5.399 5.125 4.896 4.673 4.446 4.252 4.051 3.828 3.653 3.48 3.297 3.101 2.893 2.747 2.603 2.373 2.203 2.033 1.947 1.772 1.597 1.4 1.293 1.062 0.963 0.83 0.686 0.393 0.25 0.091 -0.118 -0.343 -0.574 -0.908 -1.926 -8 ,5673 ,TETRA ,17977771,Tue Dec 21 07:44:30 CET,Tue Dec 21 09:20:26 CET,0.0 0.54 0.724 0.887 1.028 1.173 1.294 1.407 1.608 1.693 1.78 1.81 2.03 2.114 2.262 2.406 2.543 2.613 2.765 2.914 3.136 3.279 3.411 3.609 3.794 3.976 4.145 4.296 4.497 4.684 4.868 5.093 5.307 5.541 5.807 6.085 6.35 6.634 6.935 7.239 7.545 7.875 8.251 8.64 9.079 9.508 9.997 10.517 10.989 11.39 11.585 11.354 10.888 10.341 9.828 9.344 8.91 8.508 8.132 7.754 7.409 7.088 6.791 6.529 6.278 6.038 5.781 5.538 5.323 5.106 4.886 4.692 4.494 4.295 4.138 3.973 3.793 3.609 3.421 3.29 3.154 2.94 2.785 2.62 2.537 2.372 2.187 1.995 1.907 1.68 1.591 1.476 1.369 1.14 1.002 0.833 0.647 0.451 0.211 -0.207 -1.534 -9 ,29612 ,TETRA ,17977772,Tue Dec 21 07:44:34 CET,Tue Dec 21 09:20:59 CET,0.0 0.451 0.654 0.817 0.964 1.094 1.209 1.309 1.498 1.605 1.705 1.742 1.961 2.038 2.189 2.351 2.499 2.562 2.681 2.814 3.017 3.128 3.235 3.394 3.557 3.72 3.864 4.013 4.206 4.377 4.54 4.743 4.939 5.121 5.334 5.572 5.802 6.059 6.345 6.642 6.942 7.256 7.622 8.015 8.451 8.92 9.421 9.93 10.422 10.842 11.066 10.857 10.409 9.921 9.455 8.98 8.533 8.113 7.736 7.355 7.027 6.712 6.376 6.072 5.805 5.553 5.285 5.037 4.823 4.619 4.415 4.232 4.039 3.84 3.684 3.518 3.339 3.14 2.94 2.809 2.663 2.448 2.302 2.128 2.046 1.897 1.739 1.585 1.508 1.295 1.253 1.165 1.072 0.852 0.73 0.617 0.497 0.338 0.166 -0.053 -0.62 -10 ,4551 ,TETRA ,17977773,Tue Dec 21 07:44:36 CET,Tue Dec 21 09:21:37 CET,0.0 0.586 0.78 0.921 1.058 1.183 1.301 1.413 1.634 1.741 1.833 1.881 2.101 2.179 2.314 2.435 2.551 2.612 2.736 2.856 3.032 3.144 3.252 3.419 3.574 3.714 3.857 3.994 4.168 4.334 4.497 4.694 4.881 5.072 5.308 5.565 5.798 6.051 6.324 6.63 6.937 7.276 7.691 8.098 8.523 8.948 9.411 9.871 10.337 10.802 11.063 10.815 10.363 9.885 9.403 8.905 8.431 7.997 7.624 7.232 6.892 6.576 6.262 5.971 5.691 5.436 5.181 4.948 4.736 4.512 4.273 4.073 3.862 3.628 3.441 3.258 3.088 2.921 2.748 2.622 2.497 2.309 2.174 2.041 1.977 1.845 1.716 1.579 1.5 1.286 1.222 1.117 1.018 0.786 0.645 0.516 0.382 0.229 0.068 -0.125 -0.58 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 72f916de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1631 ,KEBNE ,17041120,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 04:00:16 CET,0.0 0.43 0.688 0.894 1.088 1.261 1.395 1.516 1.744 1.841 1.931 1.973 2.165 2.241 2.383 2.519 2.654 2.715 2.824 2.937 3.111 3.221 3.331 3.486 3.633 3.77 3.902 4.023 4.181 4.33 4.457 4.616 4.773 4.912 5.076 5.277 5.459 5.639 5.825 6.02 6.203 6.404 6.645 6.858 7.054 7.24 7.443 7.603 7.647 7.504 6.983 6.064 5.193 4.389 3.669 2.991 2.342 1.748 1.244 0.745 0.317 -0.076 -0.45 -0.786 -1.109 -1.423 -1.747 -2.03 -2.284 -2.552 -2.809 -3.025 -3.262 -3.51 -3.707 -3.903 -4.088 -4.281 -4.495 -4.64 -4.776 -4.989 -5.148 -5.318 -5.401 -5.559 -5.718 -5.892 -5.989 -6.211 -6.279 -6.384 -6.498 -6.745 -6.882 -7.027 -7.208 -7.405 -7.579 -7.821 -8.473 -2 ,25267 ,KEBNE ,17041121,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 03:59:55 CET,0.0 0.505 0.728 0.931 1.114 1.283 1.425 1.554 1.784 1.891 1.997 2.059 2.254 2.33 2.472 2.617 2.76 2.825 2.95 3.073 3.236 3.336 3.437 3.578 3.706 3.835 3.958 4.087 4.264 4.42 4.561 4.726 4.88 5.029 5.196 5.374 5.529 5.692 5.87 6.055 6.247 6.457 6.676 6.879 7.091 7.291 7.469 7.629 7.688 7.531 6.966 6.054 5.141 4.211 3.395 2.669 2.05 1.482 0.974 0.476 0.04 -0.351 -0.735 -1.105 -1.441 -1.743 -2.062 -2.35 -2.595 -2.85 -3.124 -3.359 -3.589 -3.824 -4.016 -4.209 -4.402 -4.605 -4.803 -4.937 -5.089 -5.332 -5.497 -5.674 -5.76 -5.936 -6.15 -6.385 -6.5 -6.746 -6.878 -7.015 -7.161 -7.51 -7.69 -7.872 -8.067 -8.257 -8.545 -8.945 -9.836 -3 ,9176 ,KEBNE ,17041122,Thu Dec 23 02:37:10 CET,Thu Dec 23 03:58:39 CET,0.0 0.685 1.003 1.213 1.382 1.524 1.661 1.793 2.018 2.115 2.215 2.269 2.467 2.549 2.695 2.838 2.983 3.054 3.192 3.315 3.476 3.579 3.682 3.831 3.969 4.105 4.233 4.348 4.5 4.656 4.8 4.964 5.121 5.273 5.451 5.642 5.813 5.997 6.191 6.396 6.595 6.802 7.027 7.227 7.435 7.606 7.738 7.83 7.82 7.63 7.048 6.08 5.095 4.213 3.448 2.753 2.131 1.523 0.982 0.468 0.039 -0.338 -0.697 -1.054 -1.393 -1.7 -2.026 -2.331 -2.589 -2.854 -3.126 -3.346 -3.592 -3.844 -4.03 -4.228 -4.442 -4.663 -4.886 -5.044 -5.2 -5.438 -5.605 -5.783 -5.877 -6.073 -6.27 -6.479 -6.595 -6.845 -6.979 -7.108 -7.243 -7.565 -7.758 -7.972 -8.234 -8.542 -8.889 -9.372 -10.634 -4 ,24817 ,KEBNE ,17041123,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:01:44 CET,0.0 0.324 0.561 0.751 0.924 1.074 1.21 1.348 1.604 1.703 1.801 1.848 2.048 2.136 2.323 2.492 2.628 2.692 2.813 2.93 3.129 3.257 3.363 3.505 3.638 3.771 3.9 4.023 4.174 4.317 4.459 4.622 4.758 4.881 5.025 5.2 5.367 5.53 5.716 5.924 6.128 6.347 6.584 6.792 7.015 7.232 7.39 7.502 7.543 7.419 6.98 6.115 5.175 4.317 3.579 2.898 2.281 1.714 1.227 0.717 0.246 -0.168 -0.554 -0.918 -1.256 -1.586 -1.918 -2.203 -2.457 -2.718 -2.981 -3.19 -3.407 -3.64 -3.831 -4.027 -4.228 -4.44 -4.66 -4.811 -4.963 -5.202 -5.372 -5.548 -5.641 -5.843 -6.05 -6.249 -6.36 -6.614 -6.742 -6.876 -7.006 -7.287 -7.455 -7.65 -7.874 -8.152 -8.443 -8.766 -9.633 -5 ,22760 ,KEBNE ,17041124,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:03:11 CET,0.0 0.417 0.623 0.747 0.857 0.957 1.049 1.128 1.295 1.375 1.444 1.447 1.635 1.701 1.81 1.91 2.009 2.057 2.155 2.243 2.366 2.448 2.531 2.663 2.792 2.921 3.047 3.17 3.321 3.452 3.594 3.768 3.921 4.068 4.235 4.404 4.568 4.763 4.969 5.178 5.385 5.606 5.853 6.076 6.307 6.546 6.756 6.886 6.918 6.686 5.978 4.972 4.061 3.241 2.522 1.834 1.184 0.601 0.107 -0.37 -0.775 -1.164 -1.548 -1.92 -2.258 -2.556 -2.866 -3.143 -3.389 -3.654 -3.925 -4.138 -4.366 -4.599 -4.776 -4.967 -5.165 -5.372 -5.59 -5.743 -5.898 -6.139 -6.304 -6.487 -6.583 -6.765 -6.953 -7.153 -7.264 -7.506 -7.624 -7.76 -7.903 -8.231 -8.424 -8.637 -8.849 -9.097 -9.424 -9.874 -10.942 -6 ,7071 ,KEBNE ,17041125,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:01:53 CET,0.0 0.664 0.996 1.253 1.469 1.616 1.761 1.894 2.112 2.22 2.332 2.396 2.594 2.677 2.84 2.987 3.127 3.198 3.336 3.463 3.622 3.727 3.828 3.966 4.096 4.226 4.36 4.48 4.623 4.767 4.905 5.066 5.218 5.361 5.523 5.7 5.872 6.066 6.267 6.466 6.658 6.838 7.036 7.236 7.453 7.65 7.82 7.971 8.03 7.845 7.261 6.289 5.348 4.515 3.743 2.984 2.312 1.728 1.216 0.701 0.254 -0.163 -0.551 -0.903 -1.227 -1.516 -1.829 -2.133 -2.398 -2.658 -2.933 -3.164 -3.383 -3.609 -3.792 -3.981 -4.171 -4.376 -4.601 -4.753 -4.906 -5.144 -5.309 -5.484 -5.575 -5.773 -5.972 -6.177 -6.296 -6.55 -6.691 -6.836 -6.976 -7.274 -7.47 -7.662 -7.839 -8.028 -8.239 -8.499 -9.079 -7 ,9704 ,KEBNE ,17041126,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:01:52 CET,0.0 0.483 0.727 0.925 1.099 1.261 1.398 1.532 1.799 1.933 2.049 2.115 2.322 2.404 2.562 2.71 2.852 2.919 3.039 3.167 3.352 3.457 3.559 3.718 3.874 4.017 4.153 4.279 4.444 4.611 4.766 4.953 5.127 5.267 5.44 5.641 5.805 5.985 6.179 6.388 6.59 6.794 7.036 7.246 7.452 7.65 7.808 7.929 7.978 7.852 7.331 6.35 5.386 4.487 3.682 2.977 2.345 1.773 1.287 0.79 0.346 -0.056 -0.415 -0.762 -1.11 -1.433 -1.762 -2.045 -2.283 -2.533 -2.804 -3.029 -3.269 -3.527 -3.72 -3.91 -4.101 -4.302 -4.512 -4.647 -4.799 -5.053 -5.217 -5.403 -5.505 -5.704 -5.899 -6.11 -6.221 -6.464 -6.608 -6.755 -6.902 -7.219 -7.399 -7.6 -7.83 -8.063 -8.307 -8.681 -9.737 -8 ,16851 ,KEBNE ,17041127,Thu Dec 23 02:40:17 CET,Thu Dec 23 04:03:59 CET,0.0 0.79 1.08 1.282 1.476 1.651 1.777 1.888 2.106 2.206 2.306 2.391 2.61 2.695 2.84 2.98 3.111 3.175 3.302 3.431 3.611 3.708 3.797 3.941 4.082 4.212 4.333 4.458 4.619 4.769 4.917 5.093 5.25 5.401 5.592 5.787 5.946 6.115 6.28 6.456 6.646 6.844 7.058 7.259 7.471 7.656 7.81 7.908 7.907 7.742 7.188 6.229 5.258 4.366 3.618 2.944 2.335 1.767 1.266 0.771 0.345 -0.046 -0.435 -0.804 -1.144 -1.458 -1.781 -2.064 -2.306 -2.562 -2.843 -3.067 -3.29 -3.523 -3.704 -3.896 -4.09 -4.3 -4.521 -4.667 -4.825 -5.076 -5.251 -5.441 -5.534 -5.721 -5.928 -6.155 -6.269 -6.509 -6.574 -6.672 -6.785 -7.04 -7.173 -7.324 -7.504 -7.704 -7.903 -8.113 -8.647 -9 ,22872 ,KEBNE ,17041128,Thu Dec 23 02:40:17 CET,Thu Dec 23 04:01:41 CET,0.0 0.385 0.56 0.676 0.767 0.861 0.942 1.011 1.14 1.216 1.303 1.349 1.548 1.626 1.782 1.919 2.055 2.124 2.255 2.368 2.522 2.624 2.718 2.856 2.994 3.128 3.257 3.378 3.529 3.666 3.791 3.948 4.103 4.249 4.427 4.625 4.799 4.993 5.208 5.417 5.621 5.827 6.063 6.275 6.471 6.678 6.87 7.007 7.06 6.909 6.333 5.371 4.42 3.539 2.817 2.15 1.527 0.947 0.41 -0.126 -0.571 -0.965 -1.352 -1.722 -2.062 -2.369 -2.698 -2.994 -3.245 -3.498 -3.753 -3.965 -4.186 -4.427 -4.616 -4.812 -5.017 -5.227 -5.449 -5.604 -5.761 -6.009 -6.194 -6.391 -6.48 -6.659 -6.843 -7.05 -7.168 -7.416 -7.537 -7.666 -7.818 -8.144 -8.307 -8.507 -8.726 -8.965 -9.263 -9.62 -10.508 -10 ,30386 ,KEBNE ,17041129,Thu Dec 23 02:40:17 CET,Thu Dec 23 04:01:25 CET,0.0 0.219 0.364 0.474 0.575 0.683 0.798 0.901 1.082 1.185 1.283 1.308 1.508 1.594 1.749 1.896 2.04 2.109 2.244 2.377 2.544 2.642 2.742 2.897 3.036 3.156 3.278 3.399 3.551 3.688 3.816 3.986 4.153 4.313 4.492 4.675 4.841 5.019 5.21 5.407 5.603 5.808 6.029 6.227 6.436 6.629 6.804 6.937 6.978 6.856 6.316 5.383 4.494 3.65 2.887 2.171 1.509 0.922 0.423 -0.094 -0.536 -0.918 -1.303 -1.671 -1.99 -2.269 -2.583 -2.877 -3.132 -3.405 -3.684 -3.907 -4.13 -4.372 -4.562 -4.758 -4.955 -5.159 -5.392 -5.549 -5.705 -5.959 -6.142 -6.319 -6.408 -6.6 -6.818 -7.059 -7.189 -7.445 -7.577 -7.707 -7.837 -8.128 -8.3 -8.501 -8.731 -9.021 -9.368 -9.804 -10.929 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt deleted file mode 100644 index b2faa9ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30735 ,KEBNE ,17041132,Thu Dec 23 02:40:17 CET,Thu Dec 23 04:01:33 CET,0.0 0.371 0.546 0.69 0.81 0.93 1.055 1.17 1.37 1.457 1.528 1.537 1.732 1.8 1.928 2.057 2.187 2.248 2.37 2.498 2.688 2.815 2.948 3.149 3.333 3.5 3.656 3.805 3.992 4.173 4.353 4.566 4.77 4.972 5.213 5.474 5.712 5.971 6.255 6.553 6.855 7.199 7.598 7.998 8.446 8.895 9.386 9.901 10.422 10.935 11.331 11.313 11.078 10.737 10.379 10.013 9.652 9.313 8.988 8.649 8.339 8.048 7.784 7.54 7.296 7.057 6.822 6.628 6.45 6.279 6.097 5.936 5.778 5.608 5.479 5.345 5.205 5.08 4.935 4.817 4.702 4.532 4.418 4.301 4.235 4.098 3.963 3.809 3.731 3.534 3.473 3.373 3.276 3.082 2.975 2.858 2.72 2.564 2.372 2.125 1.348 -2 ,29828 ,KEBNE ,17041133,Thu Dec 23 02:40:17 CET,Thu Dec 23 04:03:22 CET,0.0 0.553 0.862 1.091 1.292 1.491 1.659 1.817 2.096 2.214 2.321 2.408 2.625 2.719 2.901 3.075 3.263 3.354 3.51 3.65 3.862 4.01 4.136 4.306 4.468 4.615 4.768 4.921 5.118 5.304 5.479 5.702 5.92 6.127 6.367 6.623 6.855 7.11 7.386 7.685 7.987 8.31 8.682 9.041 9.462 9.929 10.431 10.963 11.546 12.133 12.566 12.599 12.398 12.127 11.784 11.41 11.051 10.722 10.418 10.096 9.837 9.594 9.354 9.117 8.884 8.669 8.445 8.24 8.056 7.859 7.654 7.484 7.301 7.112 6.96 6.8 6.626 6.448 6.268 6.138 6.006 5.804 5.669 5.545 5.479 5.327 5.19 5.051 4.975 4.78 4.732 4.639 4.556 4.368 4.261 4.144 4.005 3.835 3.668 3.452 3.002 -3 ,30805 ,KEBNE ,17041134,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:03:03 CET,0.0 0.446 0.654 0.859 1.04 1.193 1.34 1.481 1.743 1.86 1.97 2.069 2.288 2.384 2.567 2.725 2.867 2.941 3.085 3.218 3.407 3.52 3.635 3.808 3.974 4.13 4.281 4.431 4.631 4.824 5.006 5.222 5.417 5.609 5.843 6.103 6.35 6.618 6.889 7.183 7.489 7.819 8.201 8.575 8.994 9.437 9.918 10.4 10.916 11.436 11.826 11.824 11.552 11.188 10.831 10.478 10.119 9.78 9.483 9.187 8.912 8.661 8.418 8.173 7.93 7.701 7.471 7.254 7.055 6.843 6.629 6.461 6.279 6.084 5.927 5.769 5.611 5.447 5.27 5.149 5.023 4.827 4.686 4.533 4.45 4.269 4.1 3.92 3.816 3.595 3.507 3.393 3.278 3.037 2.889 2.702 2.48 2.251 1.966 1.548 0.633 -4 ,11950 ,KEBNE ,17041135,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:01:56 CET,0.0 0.597 0.896 1.14 1.323 1.472 1.625 1.774 2.035 2.155 2.263 2.342 2.549 2.633 2.799 2.958 3.112 3.185 3.335 3.488 3.694 3.82 3.944 4.116 4.282 4.449 4.612 4.764 4.966 5.156 5.338 5.565 5.773 5.981 6.216 6.466 6.709 6.97 7.255 7.563 7.879 8.225 8.618 9.008 9.471 9.959 10.487 11.029 11.572 12.148 12.608 12.635 12.394 12.069 11.73 11.35 10.971 10.633 10.326 9.987 9.681 9.413 9.159 8.923 8.693 8.465 8.216 7.989 7.804 7.621 7.426 7.262 7.087 6.897 6.751 6.614 6.469 6.303 6.126 6.0 5.874 5.68 5.536 5.386 5.313 5.166 5.004 4.816 4.711 4.483 4.384 4.271 4.147 3.882 3.723 3.539 3.339 3.122 2.876 2.497 1.559 -5 ,14266 ,KEBNE ,17041136,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:01:49 CET,0.0 0.358 0.579 0.737 0.859 0.97 1.068 1.161 1.33 1.414 1.494 1.523 1.725 1.803 1.95 2.093 2.23 2.293 2.412 2.541 2.741 2.858 2.981 3.163 3.344 3.518 3.665 3.812 4.004 4.178 4.358 4.584 4.795 4.993 5.217 5.474 5.726 5.99 6.261 6.536 6.82 7.147 7.535 7.923 8.353 8.803 9.309 9.819 10.357 10.915 11.342 11.377 11.146 10.8 10.424 10.038 9.679 9.354 9.066 8.768 8.487 8.213 7.943 7.679 7.434 7.21 6.976 6.769 6.585 6.388 6.175 5.999 5.809 5.618 5.472 5.309 5.142 4.978 4.809 4.684 4.551 4.36 4.23 4.074 3.986 3.82 3.665 3.504 3.422 3.229 3.193 3.106 3.014 2.798 2.678 2.553 2.426 2.278 2.112 1.9 1.39 -6 ,18404 ,KEBNE ,17041137,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:03:08 CET,0.0 0.421 0.6 0.756 0.875 0.984 1.09 1.19 1.371 1.454 1.532 1.549 1.744 1.816 1.963 2.118 2.263 2.331 2.471 2.612 2.803 2.928 3.053 3.21 3.369 3.54 3.7 3.855 4.052 4.235 4.41 4.617 4.808 4.994 5.218 5.473 5.717 5.976 6.242 6.525 6.824 7.16 7.544 7.925 8.366 8.823 9.327 9.848 10.394 10.933 11.343 11.357 11.129 10.834 10.486 10.136 9.815 9.474 9.145 8.8 8.515 8.268 8.02 7.775 7.546 7.333 7.101 6.895 6.71 6.506 6.3 6.13 5.961 5.788 5.656 5.519 5.363 5.202 5.039 4.928 4.816 4.639 4.512 4.385 4.322 4.181 4.031 3.878 3.797 3.595 3.537 3.442 3.343 3.135 3.035 2.919 2.774 2.62 2.474 2.295 1.932 -7 ,9663 ,KEBNE ,17041138,Thu Dec 23 02:40:17 CET,Thu Dec 23 04:01:43 CET,0.0 0.631 0.906 1.1 1.276 1.441 1.599 1.744 1.993 2.1 2.205 2.29 2.499 2.579 2.744 2.909 3.066 3.147 3.309 3.453 3.649 3.778 3.904 4.085 4.26 4.424 4.587 4.739 4.928 5.109 5.288 5.51 5.722 5.927 6.157 6.405 6.642 6.905 7.178 7.471 7.789 8.129 8.497 8.869 9.289 9.722 10.225 10.778 11.359 11.905 12.305 12.304 12.056 11.727 11.359 10.978 10.63 10.276 9.955 9.632 9.342 9.077 8.821 8.578 8.348 8.134 7.901 7.697 7.515 7.316 7.117 6.948 6.761 6.569 6.414 6.251 6.085 5.908 5.719 5.591 5.466 5.276 5.141 4.994 4.917 4.757 4.585 4.393 4.291 4.072 3.976 3.868 3.754 3.437 3.255 3.069 2.878 2.695 2.464 2.106 1.155 -8 ,11336 ,KEBNE ,17041139,Thu Dec 23 02:40:17 CET,Thu Dec 23 04:01:46 CET,0.0 0.509 0.724 0.948 1.135 1.31 1.464 1.602 1.869 1.99 2.099 2.17 2.385 2.473 2.651 2.828 2.999 3.077 3.228 3.39 3.613 3.747 3.885 4.089 4.272 4.436 4.603 4.775 4.984 5.186 5.382 5.599 5.815 6.017 6.242 6.515 6.773 7.046 7.323 7.602 7.907 8.243 8.628 9.004 9.436 9.911 10.415 10.945 11.511 12.067 12.535 12.583 12.372 12.083 11.726 11.344 10.993 10.66 10.343 10.001 9.699 9.438 9.176 8.915 8.685 8.473 8.251 8.051 7.873 7.683 7.478 7.303 7.126 6.94 6.789 6.634 6.486 6.338 6.174 6.061 5.948 5.789 5.677 5.543 5.471 5.328 5.181 5.021 4.943 4.744 4.703 4.61 4.508 4.309 4.206 4.094 3.944 3.738 3.515 3.239 2.655 -9 ,8960 ,KEBNE ,17041140,Thu Dec 23 02:40:17 CET,Thu Dec 23 04:03:32 CET,0.0 0.531 0.785 1.029 1.243 1.415 1.57 1.702 1.954 2.077 2.186 2.271 2.485 2.571 2.731 2.877 3.036 3.115 3.269 3.412 3.607 3.734 3.856 4.039 4.217 4.382 4.539 4.689 4.876 5.055 5.236 5.455 5.661 5.87 6.124 6.391 6.637 6.913 7.196 7.486 7.796 8.14 8.522 8.907 9.346 9.8 10.269 10.801 11.394 11.957 12.429 12.506 12.32 12.076 11.781 11.447 11.096 10.736 10.427 10.099 9.798 9.546 9.302 9.05 8.82 8.614 8.38 8.166 7.981 7.789 7.585 7.404 7.223 7.031 6.883 6.739 6.581 6.42 6.254 6.126 5.978 5.751 5.614 5.468 5.387 5.231 5.057 4.863 4.766 4.545 4.414 4.277 4.146 3.88 3.718 3.531 3.348 3.135 2.863 2.534 1.835 -10 ,30902 ,KEBNE ,17041142,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:01:44 CET,0.0 0.767 1.154 1.395 1.585 1.759 1.908 2.043 2.271 2.374 2.484 2.575 2.794 2.885 3.055 3.216 3.369 3.441 3.575 3.71 3.916 4.046 4.168 4.329 4.488 4.649 4.802 4.955 5.155 5.356 5.54 5.744 5.949 6.155 6.388 6.643 6.888 7.155 7.438 7.744 8.069 8.421 8.806 9.182 9.605 10.025 10.495 10.997 11.552 12.133 12.547 12.618 12.478 12.184 11.845 11.519 11.219 10.91 10.596 10.27 9.986 9.712 9.442 9.203 8.986 8.78 8.55 8.343 8.168 7.973 7.763 7.583 7.392 7.203 7.053 6.888 6.724 6.559 6.381 6.257 6.139 5.958 5.831 5.702 5.641 5.516 5.363 5.196 5.111 4.904 4.855 4.769 4.674 4.443 4.309 4.182 4.049 3.887 3.691 3.446 2.831 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index fb607ea0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13707 ,KEBNE ,17041143,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:03:32 CET,0.0 0.716 0.97 1.128 1.302 1.465 1.593 1.708 1.891 1.965 2.047 2.094 2.295 2.376 2.517 2.641 2.758 2.812 2.913 3.016 3.176 3.273 3.368 3.508 3.645 3.783 3.906 4.027 4.185 4.335 4.475 4.631 4.8 4.96 5.134 5.324 5.502 5.709 5.929 6.154 6.384 6.61 6.838 7.063 7.292 7.472 7.604 7.708 7.727 7.522 6.868 5.827 4.841 3.929 3.115 2.397 1.762 1.17 0.66 0.147 -0.302 -0.7 -1.068 -1.418 -1.755 -2.067 -2.391 -2.678 -2.92 -3.181 -3.456 -3.685 -3.932 -4.191 -4.397 -4.595 -4.789 -4.999 -5.207 -5.345 -5.491 -5.721 -5.886 -6.052 -6.133 -6.309 -6.487 -6.667 -6.772 -7.005 -7.097 -7.225 -7.36 -7.644 -7.804 -7.977 -8.157 -8.366 -8.633 -9.007 -9.916 -2 ,18068 ,KEBNE ,17041145,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:02:00 CET,0.0 1.009 1.223 1.362 1.51 1.655 1.767 1.866 2.06 2.146 2.236 2.289 2.494 2.567 2.7 2.825 2.951 3.009 3.117 3.234 3.413 3.528 3.638 3.792 3.935 4.07 4.2 4.328 4.5 4.655 4.793 4.978 5.164 5.324 5.492 5.671 5.845 6.026 6.198 6.39 6.599 6.811 7.017 7.208 7.416 7.614 7.804 7.957 8.0 7.832 7.151 6.053 5.039 4.121 3.298 2.548 1.932 1.36 0.853 0.357 -0.07 -0.46 -0.835 -1.175 -1.502 -1.802 -2.113 -2.397 -2.635 -2.87 -3.13 -3.357 -3.583 -3.818 -3.999 -4.182 -4.377 -4.582 -4.776 -4.907 -5.049 -5.293 -5.46 -5.611 -5.689 -5.858 -6.044 -6.237 -6.334 -6.562 -6.67 -6.791 -6.912 -7.197 -7.369 -7.553 -7.758 -8.01 -8.321 -8.678 -9.379 -3 ,5397 ,KEBNE ,17041147,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:02:13 CET,0.0 0.361 0.564 0.742 0.888 1.019 1.14 1.261 1.492 1.607 1.721 1.799 2.018 2.108 2.261 2.405 2.55 2.618 2.746 2.875 3.062 3.18 3.299 3.469 3.623 3.763 3.903 4.04 4.217 4.383 4.535 4.715 4.878 5.037 5.227 5.437 5.613 5.804 6.031 6.258 6.472 6.682 6.914 7.122 7.346 7.583 7.777 7.897 7.927 7.763 7.075 5.869 4.781 3.869 3.06 2.314 1.659 1.073 0.557 0.04 -0.398 -0.782 -1.143 -1.477 -1.785 -2.067 -2.369 -2.646 -2.876 -3.109 -3.36 -3.58 -3.799 -4.016 -4.185 -4.378 -4.586 -4.782 -4.984 -5.131 -5.286 -5.515 -5.673 -5.849 -5.941 -6.124 -6.324 -6.551 -6.658 -6.887 -6.962 -7.064 -7.165 -7.385 -7.518 -7.653 -7.784 -7.946 -8.139 -8.387 -8.793 -4 ,3470 ,KEBNE ,17041152,Thu Dec 23 02:40:15 CET,Thu Dec 23 04:03:18 CET,0.0 0.567 0.85 1.075 1.256 1.419 1.568 1.703 1.957 2.08 2.198 2.278 2.503 2.604 2.779 2.942 3.099 3.17 3.3 3.424 3.59 3.689 3.781 3.911 4.047 4.179 4.297 4.418 4.575 4.726 4.882 5.072 5.245 5.402 5.575 5.773 5.972 6.166 6.348 6.541 6.737 6.948 7.162 7.375 7.632 7.851 8.049 8.197 8.211 8.009 7.377 6.276 5.276 4.354 3.525 2.804 2.15 1.559 1.053 0.547 0.108 -0.288 -0.657 -1.011 -1.349 -1.656 -1.968 -2.245 -2.482 -2.72 -2.971 -3.176 -3.389 -3.621 -3.804 -3.987 -4.187 -4.4 -4.612 -4.761 -4.917 -5.167 -5.348 -5.542 -5.639 -5.819 -6.007 -6.202 -6.304 -6.549 -6.656 -6.786 -6.916 -7.218 -7.4 -7.588 -7.773 -7.975 -8.188 -8.427 -8.833 -5 ,5013 ,KEBNE ,17041153,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:03:34 CET,0.0 1.26 1.704 2.004 2.223 2.416 2.561 2.68 2.918 3.045 3.174 3.268 3.481 3.574 3.742 3.896 4.046 4.113 4.238 4.358 4.527 4.635 4.741 4.914 5.079 5.226 5.366 5.503 5.679 5.821 5.959 6.141 6.309 6.468 6.652 6.843 7.008 7.187 7.374 7.566 7.779 7.998 8.243 8.474 8.705 8.937 9.122 9.225 9.243 9.021 8.344 7.339 6.33 5.402 4.622 3.93 3.301 2.701 2.176 1.66 1.222 0.823 0.439 0.089 -0.224 -0.501 -0.795 -1.075 -1.319 -1.564 -1.819 -2.043 -2.27 -2.488 -2.664 -2.842 -3.023 -3.219 -3.421 -3.559 -3.714 -3.966 -4.127 -4.293 -4.377 -4.548 -4.742 -4.939 -5.043 -5.29 -5.406 -5.538 -5.672 -5.966 -6.143 -6.326 -6.521 -6.732 -6.992 -7.324 -8.215 -6 ,23741 ,KEBNE ,17041155,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:02:35 CET,0.0 0.457 0.626 0.772 0.925 1.065 1.186 1.295 1.493 1.591 1.683 1.722 1.922 2.0 2.131 2.251 2.364 2.424 2.541 2.648 2.803 2.905 3.007 3.138 3.262 3.389 3.503 3.61 3.754 3.896 4.039 4.227 4.403 4.563 4.736 4.932 5.121 5.311 5.512 5.721 5.935 6.156 6.383 6.589 6.813 7.031 7.204 7.299 7.3 7.133 6.489 5.398 4.323 3.34 2.483 1.677 0.995 0.407 -0.098 -0.591 -1.029 -1.428 -1.794 -2.134 -2.455 -2.76 -3.074 -3.355 -3.599 -3.846 -4.095 -4.294 -4.517 -4.757 -4.939 -5.121 -5.312 -5.516 -5.728 -5.882 -6.043 -6.283 -6.443 -6.613 -6.704 -6.892 -7.09 -7.304 -7.417 -7.663 -7.784 -7.916 -8.054 -8.309 -8.424 -8.541 -8.685 -8.837 -8.987 -9.188 -9.624 -7 ,6393 ,KEBNE ,17041157,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:02:11 CET,0.0 0.858 1.208 1.477 1.677 1.841 1.999 2.149 2.396 2.492 2.586 2.658 2.867 2.95 3.102 3.227 3.353 3.42 3.54 3.658 3.82 3.913 4.001 4.12 4.236 4.355 4.471 4.578 4.706 4.829 4.951 5.108 5.28 5.442 5.619 5.816 5.997 6.172 6.36 6.562 6.752 6.968 7.205 7.399 7.583 7.771 7.961 8.066 8.033 7.83 7.217 6.168 5.138 4.235 3.457 2.728 2.079 1.482 0.953 0.409 -0.027 -0.383 -0.748 -1.103 -1.44 -1.737 -2.044 -2.32 -2.549 -2.799 -3.054 -3.266 -3.495 -3.72 -3.885 -4.066 -4.264 -4.461 -4.674 -4.825 -4.979 -5.219 -5.383 -5.56 -5.651 -5.83 -6.018 -6.233 -6.34 -6.576 -6.662 -6.765 -6.872 -7.11 -7.231 -7.363 -7.513 -7.675 -7.845 -8.062 -8.586 -8 ,26676 ,KEBNE ,17041158,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:03:31 CET,0.0 0.507 0.694 0.865 1.033 1.165 1.284 1.403 1.615 1.703 1.784 1.819 2.02 2.09 2.228 2.363 2.505 2.572 2.694 2.816 2.994 3.119 3.246 3.417 3.57 3.712 3.849 3.972 4.133 4.285 4.434 4.614 4.769 4.919 5.103 5.307 5.481 5.662 5.878 6.093 6.286 6.485 6.688 6.891 7.098 7.274 7.431 7.579 7.621 7.403 6.759 5.696 4.671 3.749 2.913 2.111 1.391 0.764 0.232 -0.287 -0.741 -1.165 -1.572 -1.966 -2.329 -2.662 -3.007 -3.299 -3.548 -3.818 -4.096 -4.324 -4.564 -4.823 -5.027 -5.233 -5.441 -5.643 -5.854 -6.007 -6.165 -6.406 -6.576 -6.751 -6.835 -7.003 -7.168 -7.346 -7.449 -7.685 -7.75 -7.851 -7.952 -8.17 -8.298 -8.433 -8.573 -8.729 -8.921 -9.163 -9.647 -9 ,2815 ,KEBNE ,17041160,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:02:14 CET,0.0 0.931 1.293 1.521 1.73 1.893 2.047 2.194 2.444 2.558 2.661 2.746 2.975 3.078 3.267 3.436 3.57 3.632 3.751 3.858 4.011 4.116 4.217 4.355 4.5 4.652 4.786 4.903 5.068 5.232 5.38 5.556 5.722 5.881 6.065 6.265 6.444 6.621 6.805 6.999 7.197 7.402 7.617 7.826 8.053 8.268 8.43 8.537 8.574 8.396 7.816 6.835 5.839 4.897 4.082 3.367 2.684 2.066 1.552 1.005 0.534 0.129 -0.284 -0.665 -0.987 -1.293 -1.612 -1.886 -2.119 -2.375 -2.665 -2.909 -3.142 -3.377 -3.573 -3.773 -3.975 -4.198 -4.433 -4.584 -4.738 -4.977 -5.139 -5.319 -5.417 -5.609 -5.792 -5.968 -6.055 -6.276 -6.326 -6.429 -6.54 -6.772 -6.897 -7.021 -7.164 -7.327 -7.484 -7.72 -8.462 -10 ,31102 ,KEBNE ,17041161,Thu Dec 23 02:40:17 CET,Thu Dec 23 04:03:30 CET,0.0 0.914 1.168 1.341 1.505 1.65 1.774 1.892 2.101 2.188 2.267 2.307 2.522 2.615 2.81 2.993 3.157 3.226 3.354 3.481 3.654 3.76 3.867 4.031 4.195 4.343 4.477 4.609 4.765 4.907 5.049 5.212 5.367 5.528 5.714 5.904 6.066 6.245 6.443 6.642 6.846 7.066 7.289 7.492 7.714 7.927 8.114 8.224 8.224 8.077 7.527 6.528 5.559 4.674 3.839 3.077 2.416 1.813 1.29 0.764 0.318 -0.075 -0.452 -0.82 -1.158 -1.457 -1.763 -2.035 -2.281 -2.547 -2.802 -3.008 -3.252 -3.513 -3.719 -3.924 -4.116 -4.315 -4.526 -4.673 -4.827 -5.081 -5.258 -5.429 -5.513 -5.687 -5.871 -6.078 -6.189 -6.432 -6.524 -6.64 -6.764 -7.045 -7.209 -7.395 -7.606 -7.839 -8.103 -8.47 -9.495 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index c6880120..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11380 ,KEBNE ,17041163,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:03:37 CET,0.0 0.433 0.652 0.819 0.965 1.08 1.179 1.275 1.463 1.569 1.68 1.754 1.977 2.072 2.246 2.411 2.576 2.654 2.798 2.946 3.167 3.309 3.443 3.638 3.831 3.997 4.151 4.302 4.492 4.68 4.857 5.075 5.294 5.499 5.718 5.957 6.208 6.495 6.793 7.102 7.429 7.798 8.185 8.56 9.009 9.457 9.902 10.37 10.86 11.325 11.647 11.52 11.164 10.786 10.405 9.963 9.531 9.138 8.805 8.424 8.066 7.761 7.483 7.2 6.911 6.651 6.393 6.161 5.959 5.749 5.527 5.338 5.134 4.92 4.753 4.586 4.424 4.239 4.038 3.902 3.755 3.53 3.377 3.218 3.133 2.954 2.76 2.551 2.444 2.205 2.085 1.944 1.793 1.506 1.356 1.199 1.026 0.842 0.62 0.312 -0.685 -2 ,19761 ,KEBNE ,17041164,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:02:03 CET,0.0 0.351 0.599 0.794 0.95 1.088 1.205 1.311 1.509 1.604 1.692 1.715 1.925 1.994 2.127 2.278 2.418 2.479 2.611 2.751 2.947 3.073 3.198 3.385 3.565 3.732 3.892 4.053 4.253 4.434 4.609 4.829 5.047 5.243 5.461 5.706 5.933 6.186 6.47 6.763 7.049 7.364 7.725 8.078 8.453 8.841 9.323 9.857 10.358 10.795 11.1 11.028 10.745 10.364 9.938 9.514 9.129 8.758 8.41 8.06 7.751 7.452 7.14 6.842 6.578 6.325 6.048 5.803 5.592 5.373 5.128 4.927 4.733 4.525 4.359 4.176 3.985 3.778 3.548 3.394 3.237 3.001 2.831 2.666 2.58 2.398 2.216 1.992 1.87 1.622 1.499 1.37 1.227 0.895 0.721 0.534 0.318 0.061 -0.224 -0.605 -1.587 -3 ,1243 ,KEBNE ,17041167,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:01:53 CET,0.0 0.356 0.537 0.686 0.816 0.939 1.06 1.177 1.389 1.485 1.59 1.668 1.893 1.978 2.15 2.307 2.444 2.511 2.658 2.801 2.992 3.112 3.224 3.39 3.557 3.715 3.87 4.027 4.222 4.409 4.596 4.808 5.007 5.206 5.43 5.68 5.919 6.181 6.447 6.728 7.024 7.354 7.729 8.08 8.452 8.855 9.32 9.793 10.262 10.693 10.914 10.756 10.39 9.923 9.457 9.021 8.634 8.272 7.931 7.577 7.243 6.932 6.648 6.382 6.122 5.871 5.61 5.384 5.18 4.962 4.743 4.55 4.351 4.134 3.955 3.77 3.575 3.382 3.177 3.02 2.865 2.636 2.484 2.32 2.225 2.04 1.856 1.635 1.517 1.266 1.128 0.99 0.856 0.576 0.411 0.226 0.006 -0.251 -0.524 -0.843 -2.057 -4 ,19221 ,KEBNE ,17041168,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:03:24 CET,0.0 0.443 0.686 0.878 1.075 1.258 1.426 1.579 1.841 1.957 2.061 2.138 2.374 2.47 2.652 2.83 2.997 3.074 3.23 3.369 3.554 3.68 3.811 4.001 4.163 4.318 4.473 4.618 4.809 4.999 5.196 5.426 5.638 5.839 6.071 6.342 6.602 6.875 7.168 7.472 7.763 8.066 8.433 8.804 9.223 9.649 10.101 10.595 11.088 11.549 11.856 11.781 11.383 10.921 10.525 10.132 9.738 9.369 9.043 8.695 8.378 8.087 7.798 7.504 7.222 6.98 6.737 6.507 6.299 6.095 5.885 5.703 5.509 5.298 5.126 4.949 4.77 4.575 4.368 4.236 4.089 3.84 3.678 3.518 3.435 3.261 3.076 2.874 2.762 2.516 2.358 2.203 2.055 1.749 1.591 1.379 1.135 0.865 0.53 0.06 -1.136 -5 ,8717 ,KEBNE ,17041169,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:02:05 CET,0.0 0.595 0.853 1.074 1.301 1.517 1.699 1.852 2.11 2.231 2.354 2.463 2.703 2.803 2.974 3.131 3.288 3.367 3.528 3.686 3.923 4.069 4.199 4.392 4.592 4.775 4.924 5.063 5.254 5.447 5.625 5.83 6.037 6.242 6.49 6.763 7.009 7.271 7.556 7.838 8.12 8.448 8.827 9.19 9.599 10.041 10.502 10.959 11.446 11.915 12.22 12.175 11.853 11.402 10.93 10.483 10.067 9.664 9.311 8.958 8.624 8.316 8.034 7.758 7.496 7.254 6.999 6.75 6.533 6.316 6.076 5.886 5.687 5.462 5.293 5.122 4.939 4.743 4.538 4.4 4.255 4.035 3.882 3.716 3.624 3.421 3.22 3.006 2.904 2.666 2.554 2.433 2.299 2.028 1.895 1.739 1.563 1.371 1.133 0.824 0.081 -6 ,30082 ,KEBNE ,17041170,Thu Dec 23 02:40:17 CET,Thu Dec 23 04:02:09 CET,0.0 0.794 1.09 1.301 1.496 1.678 1.827 1.961 2.205 2.32 2.437 2.529 2.758 2.848 3.019 3.186 3.34 3.418 3.564 3.692 3.887 4.02 4.146 4.325 4.504 4.677 4.84 4.999 5.205 5.399 5.588 5.812 6.024 6.234 6.474 6.745 7.005 7.291 7.589 7.882 8.184 8.533 8.924 9.267 9.639 10.061 10.533 11.012 11.467 11.883 12.16 11.983 11.568 11.142 10.701 10.252 9.869 9.505 9.155 8.801 8.497 8.209 7.912 7.643 7.394 7.15 6.891 6.649 6.437 6.22 6.001 5.804 5.579 5.362 5.2 5.019 4.831 4.642 4.443 4.315 4.178 3.937 3.78 3.614 3.531 3.371 3.194 2.998 2.888 2.637 2.517 2.408 2.301 2.057 1.928 1.792 1.62 1.42 1.206 0.894 -0.107 -7 ,687 ,KEBNE ,17041172,Thu Dec 23 02:40:17 CET,Thu Dec 23 04:01:47 CET,0.0 0.661 0.959 1.172 1.355 1.53 1.686 1.834 2.131 2.265 2.388 2.483 2.721 2.822 3.007 3.18 3.35 3.43 3.582 3.734 3.937 4.054 4.167 4.345 4.522 4.685 4.841 5.002 5.214 5.405 5.582 5.799 6.002 6.197 6.424 6.674 6.912 7.168 7.436 7.713 8.012 8.333 8.688 9.062 9.482 9.92 10.413 10.944 11.486 11.993 12.371 12.369 12.114 11.774 11.4 11.024 10.627 10.236 9.891 9.511 9.185 8.889 8.59 8.298 8.029 7.785 7.51 7.273 7.089 6.891 6.662 6.46 6.257 6.045 5.873 5.699 5.514 5.318 5.119 4.986 4.856 4.66 4.517 4.377 4.308 4.155 3.98 3.786 3.685 3.458 3.383 3.268 3.155 2.895 2.749 2.593 2.412 2.206 1.976 1.666 0.759 -8 ,11493 ,KEBNE ,17041173,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:02:10 CET,0.0 0.613 0.967 1.206 1.418 1.613 1.787 1.943 2.205 2.332 2.448 2.512 2.738 2.828 2.999 3.166 3.324 3.4 3.559 3.71 3.914 4.049 4.181 4.364 4.535 4.715 4.886 5.038 5.255 5.466 5.645 5.851 6.041 6.232 6.462 6.713 6.953 7.219 7.505 7.808 8.108 8.419 8.793 9.185 9.627 10.078 10.587 11.155 11.716 12.158 12.35 12.207 11.914 11.519 11.11 10.695 10.302 9.921 9.565 9.191 8.855 8.553 8.276 8.0 7.714 7.449 7.176 6.942 6.739 6.519 6.278 6.082 5.889 5.68 5.517 5.35 5.185 5.022 4.854 4.74 4.623 4.438 4.3 4.16 4.086 3.927 3.759 3.582 3.491 3.263 3.166 3.044 2.924 2.647 2.498 2.359 2.206 2.029 1.826 1.497 0.443 -9 ,28847 ,KEBNE ,17041174,Thu Dec 23 02:40:17 CET,Thu Dec 23 04:03:25 CET,0.0 0.437 0.635 0.794 0.936 1.06 1.168 1.266 1.453 1.54 1.617 1.63 1.838 1.914 2.061 2.205 2.344 2.415 2.565 2.706 2.902 3.026 3.148 3.326 3.484 3.639 3.797 3.944 4.141 4.339 4.519 4.734 4.934 5.115 5.326 5.572 5.803 6.052 6.322 6.609 6.895 7.206 7.589 7.976 8.395 8.838 9.305 9.754 10.202 10.619 10.84 10.685 10.354 9.978 9.563 9.137 8.712 8.295 7.956 7.6 7.286 7.013 6.737 6.478 6.229 5.981 5.711 5.476 5.274 5.059 4.825 4.62 4.417 4.21 4.047 3.878 3.706 3.529 3.333 3.189 3.044 2.815 2.649 2.48 2.393 2.22 2.043 1.834 1.725 1.48 1.355 1.226 1.086 0.767 0.589 0.398 0.189 -0.071 -0.365 -0.719 -1.584 -10 ,881 ,KEBNE ,17041175,Thu Dec 23 02:40:16 CET,Thu Dec 23 04:03:33 CET,0.0 0.53 0.728 0.899 1.051 1.177 1.296 1.413 1.606 1.685 1.767 1.817 2.041 2.121 2.275 2.422 2.568 2.637 2.756 2.878 3.062 3.166 3.261 3.398 3.537 3.686 3.832 3.971 4.147 4.315 4.486 4.697 4.902 5.103 5.314 5.546 5.772 6.011 6.275 6.546 6.823 7.148 7.522 7.866 8.261 8.698 9.169 9.672 10.191 10.678 11.003 10.892 10.544 10.144 9.765 9.364 8.962 8.589 8.256 7.912 7.603 7.321 7.023 6.729 6.453 6.204 5.937 5.7 5.495 5.273 5.049 4.86 4.655 4.437 4.258 4.081 3.905 3.698 3.487 3.35 3.195 2.958 2.799 2.623 2.531 2.349 2.161 1.969 1.87 1.636 1.531 1.41 1.276 0.983 0.812 0.62 0.406 0.142 -0.174 -0.544 -1.327 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt deleted file mode 100644 index 5dd57a9a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5590 ,KEBNE ,17041176,Thu Dec 23 02:44:23 CET,Thu Dec 23 04:07:38 CET,0.0 0.406 0.602 0.785 0.934 1.052 1.166 1.291 1.542 1.646 1.739 1.812 2.06 2.173 2.393 2.602 2.792 2.885 3.065 3.233 3.49 3.653 3.803 4.031 4.239 4.431 4.621 4.806 5.047 5.278 5.501 5.782 6.058 6.307 6.588 6.927 7.266 7.625 8.007 8.421 8.847 9.32 9.875 10.439 11.091 11.802 12.626 13.574 14.694 15.956 17.299 18.197 18.574 18.717 18.733 18.624 18.45 18.266 18.069 17.85 17.656 17.47 17.287 17.111 16.945 16.784 16.595 16.423 16.27 16.099 15.916 15.765 15.619 15.469 15.339 15.209 15.065 14.905 14.735 14.613 14.494 14.304 14.154 14.003 13.929 13.767 13.594 13.396 13.291 13.076 12.998 12.898 12.805 12.594 12.466 12.326 12.179 12.003 11.805 11.541 10.881 -2 ,20966 ,KEBNE ,17041177,Thu Dec 23 02:44:23 CET,Thu Dec 23 04:07:46 CET,0.0 0.907 1.228 1.478 1.697 1.888 2.045 2.194 2.47 2.597 2.726 2.863 3.112 3.223 3.439 3.647 3.835 3.924 4.108 4.282 4.528 4.689 4.838 5.062 5.292 5.5 5.698 5.889 6.133 6.371 6.602 6.889 7.158 7.425 7.747 8.105 8.432 8.768 9.134 9.536 9.951 10.423 10.967 11.505 12.154 12.894 13.756 14.716 15.798 16.979 18.252 19.114 19.492 19.624 19.6 19.509 19.383 19.204 18.987 18.75 18.542 18.361 18.188 18.004 17.812 17.63 17.44 17.267 17.099 16.918 16.739 16.572 16.397 16.223 16.082 15.938 15.796 15.642 15.479 15.366 15.242 15.037 14.895 14.754 14.679 14.502 14.313 14.134 14.034 13.798 13.69 13.579 13.452 13.17 12.999 12.781 12.544 12.313 12.026 11.695 10.753 -3 ,31133 ,KEBNE ,17041178,Thu Dec 23 02:45:27 CET,Thu Dec 23 04:06:47 CET,0.0 0.329 0.579 0.793 0.993 1.188 1.365 1.529 1.813 1.942 2.072 2.194 2.437 2.541 2.736 2.919 3.102 3.187 3.344 3.501 3.731 3.882 4.032 4.245 4.455 4.655 4.843 5.014 5.235 5.463 5.698 5.976 6.24 6.503 6.798 7.131 7.451 7.802 8.182 8.587 9.019 9.491 10.034 10.592 11.252 11.982 12.8 13.723 14.799 16.017 17.358 18.236 18.611 18.76 18.781 18.674 18.496 18.311 18.117 17.915 17.728 17.53 17.339 17.157 16.967 16.78 16.584 16.401 16.246 16.088 15.912 15.761 15.605 15.446 15.315 15.171 15.026 14.886 14.725 14.604 14.488 14.304 14.163 14.018 13.95 13.807 13.647 13.468 13.374 13.158 13.083 12.982 12.872 12.643 12.494 12.317 12.124 11.871 11.575 11.208 10.179 -4 ,28514 ,KEBNE ,17041179,Thu Dec 23 02:46:30 CET,Thu Dec 23 04:08:14 CET,0.0 0.582 0.931 1.201 1.42 1.597 1.758 1.911 2.201 2.344 2.481 2.59 2.841 2.954 3.159 3.346 3.523 3.61 3.785 3.954 4.195 4.351 4.504 4.731 4.934 5.122 5.306 5.479 5.71 5.936 6.168 6.446 6.713 6.972 7.249 7.551 7.864 8.226 8.611 9.026 9.444 9.917 10.485 11.041 11.676 12.382 13.179 14.081 15.166 16.372 17.641 18.56 18.912 19.034 19.044 18.923 18.748 18.574 18.378 18.158 17.955 17.744 17.551 17.363 17.165 16.973 16.774 16.6 16.437 16.257 16.083 15.926 15.759 15.594 15.452 15.309 15.164 15.0 14.835 14.719 14.585 14.391 14.259 14.106 14.02 13.848 13.667 13.466 13.366 13.154 13.058 12.935 12.799 12.501 12.35 12.179 11.967 11.711 11.373 10.979 9.972 -5 ,6213 ,KEBNE ,17041180,Thu Dec 23 02:46:30 CET,Thu Dec 23 04:07:55 CET,0.0 0.984 1.316 1.573 1.832 2.061 2.265 2.439 2.722 2.854 2.996 3.132 3.378 3.479 3.653 3.832 4.013 4.103 4.281 4.451 4.689 4.84 4.989 5.196 5.394 5.597 5.794 5.981 6.23 6.479 6.717 7.003 7.28 7.544 7.842 8.184 8.51 8.862 9.246 9.65 10.075 10.554 11.135 11.725 12.404 13.164 14.049 15.043 16.071 17.168 18.486 19.377 19.705 19.793 19.763 19.666 19.52 19.352 19.182 18.982 18.81 18.647 18.472 18.304 18.137 17.972 17.79 17.618 17.459 17.294 17.117 16.953 16.786 16.607 16.459 16.312 16.165 16.025 15.869 15.748 15.618 15.429 15.303 15.156 15.081 14.921 14.749 14.573 14.477 14.259 14.16 14.041 13.909 13.617 13.446 13.252 13.048 12.807 12.482 12.072 10.646 -6 ,5292 ,KEBNE ,17041181,Thu Dec 23 02:46:30 CET,Thu Dec 23 04:07:57 CET,0.0 0.679 1.014 1.262 1.453 1.63 1.806 1.964 2.239 2.374 2.499 2.582 2.807 2.907 3.101 3.286 3.475 3.569 3.759 3.947 4.191 4.338 4.489 4.703 4.908 5.104 5.288 5.478 5.724 5.962 6.184 6.447 6.71 6.971 7.28 7.624 7.947 8.312 8.709 9.129 9.559 10.045 10.639 11.25 11.957 12.738 13.633 14.581 15.63 16.791 18.056 18.934 19.328 19.451 19.382 19.267 19.111 18.902 18.712 18.518 18.321 18.133 17.954 17.764 17.574 17.397 17.199 17.027 16.881 16.708 16.518 16.371 16.225 16.063 15.929 15.785 15.635 15.482 15.331 15.221 15.094 14.892 14.757 14.617 14.543 14.403 14.244 14.043 13.938 13.719 13.667 13.582 13.489 13.262 13.131 12.992 12.839 12.688 12.518 12.229 11.487 -7 ,4510 ,KEBNE ,17041182,Thu Dec 23 02:46:29 CET,Thu Dec 23 04:08:26 CET,0.0 0.773 1.147 1.423 1.657 1.848 1.999 2.141 2.442 2.578 2.692 2.78 3.019 3.123 3.327 3.519 3.706 3.796 3.958 4.12 4.362 4.522 4.681 4.89 5.093 5.307 5.509 5.708 5.973 6.211 6.443 6.726 6.993 7.24 7.544 7.892 8.226 8.596 8.974 9.373 9.801 10.286 10.85 11.405 12.054 12.751 13.545 14.469 15.532 16.714 17.979 18.789 19.17 19.287 19.236 19.097 18.908 18.706 18.529 18.32 18.116 17.935 17.744 17.551 17.355 17.171 16.966 16.772 16.616 16.456 16.279 16.131 15.983 15.819 15.673 15.516 15.359 15.2 15.036 14.921 14.804 14.628 14.495 14.337 14.258 14.104 13.943 13.756 13.648 13.428 13.339 13.228 13.093 12.784 12.622 12.417 12.174 11.934 11.654 11.238 9.954 -8 ,20348 ,KEBNE ,17041183,Thu Dec 23 02:46:30 CET,Thu Dec 23 04:07:58 CET,0.0 0.341 0.524 0.678 0.791 0.901 1.018 1.124 1.316 1.407 1.49 1.52 1.739 1.826 1.99 2.155 2.316 2.391 2.541 2.698 2.94 3.092 3.236 3.449 3.659 3.861 4.055 4.245 4.479 4.699 4.922 5.204 5.46 5.69 5.966 6.289 6.607 6.968 7.359 7.772 8.203 8.671 9.217 9.755 10.394 11.124 11.962 12.893 13.955 15.168 16.441 17.253 17.614 17.727 17.696 17.573 17.393 17.206 17.019 16.804 16.587 16.388 16.219 16.052 15.86 15.675 15.477 15.301 15.158 15.003 14.841 14.715 14.583 14.427 14.301 14.182 14.054 13.922 13.781 13.682 13.582 13.417 13.303 13.189 13.127 13.002 12.876 12.724 12.637 12.43 12.366 12.248 12.132 11.91 11.789 11.661 11.506 11.332 11.148 10.895 9.922 -9 ,28391 ,KEBNE ,17041184,Thu Dec 23 02:46:29 CET,Thu Dec 23 04:08:18 CET,0.0 0.393 0.614 0.79 0.941 1.092 1.238 1.358 1.585 1.71 1.824 1.882 2.106 2.198 2.378 2.557 2.724 2.801 2.964 3.133 3.375 3.537 3.696 3.925 4.154 4.374 4.575 4.767 5.018 5.249 5.462 5.713 5.959 6.201 6.484 6.8 7.1 7.442 7.822 8.233 8.676 9.185 9.784 10.366 11.031 11.788 12.651 13.609 14.691 15.866 17.148 18.094 18.495 18.576 18.555 18.459 18.304 18.138 17.975 17.791 17.594 17.401 17.223 17.052 16.883 16.725 16.538 16.347 16.191 16.043 15.888 15.764 15.637 15.496 15.374 15.241 15.105 14.97 14.827 14.727 14.631 14.469 14.351 14.226 14.161 14.036 13.903 13.756 13.672 13.467 13.422 13.317 13.206 12.98 12.856 12.727 12.596 12.438 12.223 11.935 11.125 -10 ,23831 ,KEBNE ,17041185,Thu Dec 23 02:46:29 CET,Thu Dec 23 04:07:57 CET,0.0 0.354 0.526 0.677 0.817 0.947 1.057 1.155 1.349 1.443 1.526 1.555 1.769 1.85 2.023 2.189 2.354 2.437 2.61 2.778 3.015 3.17 3.311 3.525 3.732 3.936 4.144 4.343 4.596 4.849 5.086 5.354 5.606 5.848 6.135 6.453 6.749 7.083 7.462 7.865 8.273 8.744 9.308 9.869 10.514 11.224 12.067 13.038 14.1 15.259 16.558 17.438 17.789 17.942 17.947 17.846 17.704 17.524 17.325 17.124 16.95 16.771 16.585 16.397 16.21 16.047 15.866 15.696 15.549 15.373 15.18 15.017 14.847 14.686 14.555 14.414 14.278 14.13 13.966 13.849 13.727 13.537 13.405 13.267 13.188 13.021 12.851 12.682 12.594 12.377 12.296 12.181 12.062 11.821 11.698 11.567 11.422 11.256 11.037 10.742 10.146 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt deleted file mode 100644 index e51893f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19519 ,KEBNE ,17041186,Thu Dec 23 02:46:29 CET,Thu Dec 23 04:08:29 CET,0.0 0.792 1.104 1.314 1.494 1.663 1.812 1.94 2.18 2.289 2.387 2.455 2.676 2.778 2.989 3.17 3.322 3.398 3.556 3.696 3.894 4.024 4.148 4.329 4.498 4.653 4.807 4.962 5.18 5.376 5.539 5.752 5.961 6.162 6.388 6.629 6.869 7.125 7.414 7.748 8.06 8.361 8.712 9.077 9.503 9.947 10.408 10.904 11.436 11.946 12.3 12.179 11.815 11.43 11.003 10.546 10.131 9.714 9.348 8.968 8.627 8.325 8.018 7.714 7.42 7.142 6.855 6.59 6.357 6.117 5.842 5.624 5.409 5.186 5.009 4.813 4.617 4.415 4.205 4.057 3.9 3.648 3.481 3.301 3.205 3.015 2.821 2.591 2.471 2.228 2.091 1.951 1.81 1.479 1.298 1.118 0.925 0.711 0.446 0.08 -1.432 -2 ,30966 ,KEBNE ,17041187,Thu Dec 23 02:46:29 CET,Thu Dec 23 04:08:20 CET,0.0 0.935 1.334 1.59 1.799 1.981 2.142 2.305 2.574 2.702 2.832 2.94 3.185 3.291 3.471 3.636 3.803 3.881 4.032 4.178 4.398 4.536 4.666 4.851 5.035 5.228 5.4 5.56 5.766 5.967 6.161 6.387 6.608 6.819 7.052 7.307 7.548 7.822 8.121 8.437 8.757 9.094 9.484 9.855 10.251 10.667 11.151 11.676 12.202 12.675 12.994 12.917 12.559 12.12 11.709 11.248 10.81 10.399 10.038 9.689 9.371 9.07 8.771 8.488 8.234 7.991 7.715 7.475 7.271 7.052 6.813 6.616 6.404 6.177 6.003 5.825 5.634 5.424 5.203 5.051 4.89 4.64 4.461 4.275 4.178 3.967 3.746 3.49 3.362 3.102 2.93 2.783 2.636 2.279 2.079 1.867 1.638 1.399 1.129 0.786 -0.712 -3 ,16209 ,KEBNE ,17041189,Thu Dec 23 02:47:34 CET,Thu Dec 23 04:10:57 CET,0.0 0.869 1.229 1.472 1.665 1.839 1.993 2.135 2.387 2.501 2.621 2.742 2.982 3.086 3.275 3.457 3.638 3.723 3.885 4.039 4.271 4.415 4.548 4.745 4.932 5.101 5.264 5.431 5.649 5.842 6.033 6.273 6.496 6.707 6.958 7.238 7.486 7.755 8.045 8.334 8.636 8.989 9.387 9.782 10.22 10.664 11.185 11.752 12.31 12.809 13.132 13.034 12.664 12.23 11.808 11.384 10.968 10.566 10.205 9.821 9.473 9.152 8.833 8.537 8.259 7.995 7.719 7.466 7.249 7.03 6.792 6.583 6.359 6.122 5.938 5.75 5.553 5.34 5.117 4.964 4.804 4.542 4.361 4.175 4.078 3.872 3.65 3.421 3.293 3.018 2.845 2.695 2.542 2.191 1.995 1.771 1.51 1.239 0.905 0.474 -1.391 -4 ,29371 ,KEBNE ,17041190,Thu Dec 23 02:47:34 CET,Thu Dec 23 04:09:37 CET,0.0 0.55 0.824 1.042 1.215 1.398 1.584 1.742 2.021 2.147 2.258 2.352 2.592 2.69 2.88 3.071 3.237 3.313 3.478 3.623 3.819 3.954 4.071 4.249 4.434 4.603 4.76 4.91 5.102 5.289 5.466 5.677 5.878 6.065 6.285 6.544 6.783 7.042 7.307 7.583 7.887 8.213 8.583 8.929 9.332 9.796 10.294 10.827 11.377 11.879 12.264 12.213 11.906 11.508 11.113 10.717 10.32 9.929 9.55 9.157 8.826 8.525 8.24 7.952 7.669 7.404 7.114 6.858 6.64 6.429 6.223 6.037 5.848 5.663 5.501 5.328 5.157 4.985 4.799 4.659 4.52 4.311 4.16 4.001 3.918 3.753 3.578 3.371 3.258 3.019 2.937 2.827 2.703 2.426 2.279 2.121 1.943 1.732 1.487 1.16 0.171 -5 ,26517 ,KEBNE ,17041192,Thu Dec 23 02:47:34 CET,Thu Dec 23 04:09:35 CET,0.0 0.568 0.878 1.137 1.317 1.473 1.648 1.804 2.07 2.191 2.299 2.387 2.616 2.714 2.897 3.061 3.233 3.315 3.472 3.624 3.822 3.949 4.068 4.233 4.402 4.567 4.727 4.883 5.075 5.255 5.437 5.657 5.86 6.049 6.269 6.518 6.751 7.003 7.285 7.582 7.883 8.226 8.604 8.959 9.347 9.781 10.268 10.753 11.259 11.769 12.179 12.149 11.804 11.35 10.92 10.494 10.097 9.735 9.395 9.02 8.681 8.361 8.054 7.76 7.473 7.221 6.966 6.722 6.487 6.247 6.003 5.788 5.57 5.344 5.168 4.984 4.795 4.589 4.345 4.185 4.024 3.766 3.609 3.44 3.352 3.177 2.991 2.781 2.668 2.411 2.299 2.179 2.054 1.75 1.584 1.418 1.228 1.014 0.745 0.402 -0.815 -6 ,18242 ,KEBNE ,17041193,Thu Dec 23 02:47:34 CET,Thu Dec 23 04:09:37 CET,0.0 0.328 0.523 0.656 0.8 0.946 1.076 1.183 1.38 1.487 1.588 1.635 1.859 1.947 2.114 2.263 2.406 2.474 2.61 2.745 2.93 3.05 3.164 3.323 3.471 3.609 3.746 3.888 4.084 4.273 4.448 4.656 4.86 5.058 5.3 5.585 5.842 6.1 6.372 6.665 6.967 7.302 7.684 8.045 8.472 8.947 9.434 9.909 10.389 10.8 11.038 10.895 10.521 10.077 9.639 9.205 8.757 8.335 7.97 7.585 7.258 6.954 6.649 6.357 6.077 5.816 5.548 5.313 5.104 4.894 4.666 4.462 4.241 4.015 3.838 3.638 3.446 3.252 3.033 2.869 2.704 2.479 2.306 2.112 2.025 1.851 1.655 1.444 1.327 1.073 0.973 0.85 0.717 0.41 0.241 0.057 -0.161 -0.411 -0.715 -1.118 -2.569 -7 ,19006 ,KEBNE ,17041195,Thu Dec 23 02:47:34 CET,Thu Dec 23 04:09:17 CET,0.0 0.431 0.601 0.74 0.875 0.982 1.079 1.18 1.367 1.446 1.536 1.574 1.773 1.846 1.986 2.111 2.24 2.3 2.409 2.515 2.67 2.772 2.883 3.051 3.21 3.362 3.499 3.633 3.812 3.98 4.151 4.363 4.57 4.773 5.0 5.253 5.499 5.758 6.038 6.344 6.657 7.023 7.455 7.863 8.314 8.794 9.337 9.888 10.435 10.943 11.25 11.147 10.797 10.385 9.963 9.517 9.091 8.671 8.291 7.89 7.498 7.166 6.868 6.577 6.299 6.021 5.74 5.495 5.275 5.046 4.796 4.589 4.389 4.167 3.971 3.77 3.563 3.341 3.101 2.938 2.784 2.541 2.375 2.219 2.142 1.976 1.794 1.597 1.481 1.224 1.122 1.004 0.871 0.563 0.405 0.239 0.055 -0.164 -0.432 -0.829 -2.057 -8 ,8025 ,KEBNE ,17041197,Thu Dec 23 02:47:34 CET,Thu Dec 23 04:10:57 CET,0.0 0.864 1.217 1.46 1.662 1.84 1.991 2.137 2.444 2.582 2.687 2.749 2.975 3.073 3.255 3.426 3.598 3.679 3.829 3.972 4.172 4.294 4.42 4.613 4.794 4.968 5.129 5.272 5.462 5.656 5.833 6.049 6.257 6.447 6.665 6.909 7.138 7.384 7.653 7.944 8.241 8.574 8.967 9.373 9.832 10.315 10.821 11.342 11.886 12.377 12.716 12.648 12.339 11.919 11.465 11.017 10.609 10.2 9.803 9.41 9.079 8.785 8.492 8.206 7.926 7.664 7.399 7.155 6.944 6.724 6.49 6.285 6.078 5.864 5.686 5.506 5.315 5.119 4.917 4.766 4.609 4.371 4.199 4.011 3.915 3.717 3.5 3.273 3.155 2.899 2.768 2.623 2.471 2.125 1.915 1.698 1.484 1.213 0.884 0.477 -1.355 -9 ,9525 ,KEBNE ,17041198,Thu Dec 23 02:47:34 CET,Thu Dec 23 04:09:34 CET,0.0 0.742 1.067 1.318 1.561 1.788 1.984 2.132 2.378 2.493 2.605 2.703 2.941 3.038 3.221 3.401 3.569 3.649 3.798 3.94 4.136 4.265 4.393 4.569 4.743 4.912 5.078 5.234 5.436 5.626 5.801 6.026 6.253 6.468 6.714 6.984 7.237 7.516 7.801 8.114 8.463 8.846 9.276 9.676 10.107 10.569 11.1 11.614 12.121 12.601 12.913 12.847 12.516 12.126 11.702 11.208 10.723 10.291 9.926 9.561 9.22 8.903 8.584 8.297 8.043 7.79 7.513 7.246 7.008 6.775 6.543 6.339 6.12 5.905 5.723 5.526 5.333 5.126 4.913 4.765 4.609 4.365 4.199 4.022 3.931 3.753 3.562 3.346 3.232 2.985 2.893 2.767 2.647 2.357 2.188 2.022 1.811 1.578 1.328 0.979 -0.122 -10 ,25988 ,KEBNE ,17041200,Thu Dec 23 02:47:34 CET,Thu Dec 23 04:09:30 CET,0.0 0.464 0.688 0.866 1.013 1.146 1.277 1.398 1.597 1.691 1.79 1.851 2.071 2.154 2.332 2.518 2.685 2.759 2.904 3.047 3.256 3.39 3.532 3.743 3.935 4.116 4.286 4.442 4.634 4.816 4.993 5.212 5.43 5.631 5.855 6.119 6.372 6.629 6.919 7.246 7.56 7.892 8.281 8.666 9.097 9.543 10.019 10.475 10.95 11.427 11.724 11.623 11.237 10.737 10.265 9.852 9.455 9.053 8.698 8.316 7.974 7.67 7.372 7.076 6.788 6.519 6.223 5.947 5.711 5.478 5.234 5.012 4.789 4.582 4.416 4.235 4.041 3.84 3.626 3.462 3.292 3.034 2.846 2.651 2.557 2.373 2.163 1.925 1.794 1.526 1.401 1.27 1.113 0.722 0.499 0.267 0.031 -0.254 -0.623 -1.117 -2.863 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 840afea7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26552 ,KEBNE ,17041202,Thu Dec 23 02:47:34 CET,Thu Dec 23 04:09:34 CET,0.0 0.285 0.478 0.632 0.739 0.823 0.904 0.989 1.148 1.219 1.285 1.277 1.478 1.547 1.696 1.828 1.939 1.992 2.097 2.197 2.345 2.446 2.556 2.718 2.854 2.983 3.114 3.238 3.385 3.536 3.681 3.852 4.01 4.158 4.346 4.548 4.73 4.92 5.142 5.386 5.63 5.896 6.201 6.498 6.827 7.193 7.609 8.061 8.501 8.863 9.116 9.067 8.812 8.46 8.059 7.646 7.246 6.864 6.516 6.181 5.856 5.547 5.261 4.985 4.718 4.455 4.181 3.946 3.742 3.517 3.287 3.096 2.892 2.68 2.514 2.346 2.174 1.983 1.792 1.669 1.527 1.304 1.154 0.987 0.9 0.729 0.548 0.351 0.249 0.013 -0.108 -0.25 -0.374 -0.614 -0.756 -0.889 -1.034 -1.237 -1.519 -1.931 -3.463 -2 ,16944 ,KEBNE ,17041204,Thu Dec 23 02:47:34 CET,Thu Dec 23 04:09:42 CET,0.0 0.262 0.434 0.583 0.694 0.82 0.931 1.021 1.181 1.252 1.326 1.336 1.539 1.612 1.752 1.871 1.978 2.034 2.144 2.253 2.419 2.525 2.625 2.759 2.89 3.019 3.147 3.267 3.419 3.561 3.696 3.866 4.04 4.202 4.376 4.569 4.751 4.955 5.184 5.446 5.723 6.018 6.36 6.711 7.085 7.491 7.971 8.445 8.911 9.306 9.5 9.335 8.962 8.516 8.079 7.658 7.251 6.866 6.544 6.196 5.875 5.59 5.306 5.042 4.788 4.555 4.296 4.036 3.816 3.588 3.346 3.149 2.93 2.699 2.542 2.38 2.196 2.006 1.81 1.671 1.529 1.327 1.188 1.024 0.942 0.78 0.602 0.413 0.313 0.085 0.017 -0.097 -0.215 -0.464 -0.613 -0.784 -0.975 -1.194 -1.466 -1.825 -3.225 -3 ,26229 ,KEBNE ,17041205,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:14:29 CET,0.0 0.296 0.466 0.604 0.713 0.808 0.909 1.01 1.19 1.275 1.351 1.359 1.56 1.628 1.756 1.871 1.976 2.027 2.137 2.252 2.407 2.506 2.61 2.754 2.883 3.021 3.156 3.272 3.419 3.561 3.691 3.846 4.009 4.173 4.363 4.6 4.828 5.074 5.348 5.621 5.899 6.202 6.539 6.862 7.224 7.625 8.075 8.547 9.001 9.358 9.541 9.357 9.017 8.648 8.232 7.814 7.449 7.101 6.787 6.451 6.157 5.892 5.624 5.346 5.074 4.829 4.573 4.343 4.143 3.931 3.705 3.52 3.325 3.122 2.966 2.802 2.635 2.467 2.29 2.16 2.021 1.807 1.664 1.528 1.455 1.273 1.082 0.917 0.838 0.615 0.521 0.397 0.257 -0.041 -0.173 -0.299 -0.466 -0.688 -0.957 -1.291 -2.932 -4 ,5901 ,KEBNE ,17041206,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:14:32 CET,0.0 0.548 0.732 0.844 0.968 1.083 1.174 1.257 1.402 1.48 1.557 1.565 1.769 1.835 1.952 2.066 2.176 2.229 2.339 2.453 2.61 2.702 2.801 2.953 3.091 3.217 3.338 3.457 3.612 3.757 3.903 4.082 4.248 4.415 4.619 4.864 5.108 5.368 5.633 5.898 6.173 6.484 6.849 7.211 7.617 8.045 8.493 8.963 9.46 9.885 10.133 10.032 9.708 9.275 8.829 8.419 8.056 7.712 7.365 6.977 6.658 6.372 6.073 5.759 5.475 5.244 5.006 4.789 4.588 4.369 4.133 3.936 3.742 3.532 3.36 3.18 3.0 2.821 2.629 2.484 2.333 2.113 1.959 1.798 1.722 1.557 1.361 1.151 1.046 0.806 0.692 0.559 0.416 0.084 -0.11 -0.333 -0.587 -0.853 -1.175 -1.635 -3.576 -5 ,12783 ,KEBNE ,17041207,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:14:16 CET,0.0 0.259 0.408 0.516 0.631 0.743 0.842 0.935 1.09 1.155 1.222 1.213 1.405 1.469 1.61 1.756 1.894 1.963 2.115 2.256 2.443 2.563 2.671 2.835 2.999 3.148 3.296 3.45 3.645 3.82 3.992 4.205 4.4 4.574 4.767 4.994 5.214 5.45 5.704 5.978 6.263 6.562 6.894 7.241 7.629 8.03 8.48 8.931 9.357 9.736 9.955 9.757 9.41 9.015 8.587 8.179 7.767 7.383 7.047 6.682 6.365 6.09 5.807 5.521 5.243 4.979 4.723 4.503 4.299 4.09 3.875 3.695 3.501 3.293 3.14 2.983 2.801 2.613 2.42 2.279 2.13 1.892 1.732 1.573 1.487 1.309 1.134 0.949 0.855 0.625 0.537 0.424 0.304 0.043 -0.11 -0.277 -0.461 -0.694 -0.981 -1.413 -2.736 -6 ,19511 ,KEBNE ,17041208,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:15:05 CET,0.0 0.181 0.317 0.454 0.58 0.705 0.825 0.925 1.095 1.171 1.245 1.26 1.465 1.533 1.655 1.773 1.89 1.946 2.044 2.136 2.289 2.396 2.498 2.648 2.8 2.949 3.072 3.187 3.349 3.503 3.653 3.848 4.036 4.22 4.441 4.681 4.901 5.149 5.427 5.702 6.003 6.353 6.696 7.028 7.417 7.837 8.287 8.724 9.163 9.539 9.696 9.507 9.136 8.728 8.314 7.895 7.486 7.087 6.742 6.401 6.104 5.833 5.563 5.283 5.018 4.782 4.533 4.295 4.087 3.871 3.635 3.44 3.234 3.021 2.856 2.686 2.507 2.317 2.123 1.987 1.843 1.612 1.442 1.277 1.193 1.006 0.819 0.614 0.511 0.278 0.172 0.06 -0.047 -0.306 -0.452 -0.611 -0.787 -0.99 -1.253 -1.649 -2.902 -7 ,262 ,KEBNE ,17041209,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:13:01 CET,0.0 0.238 0.38 0.516 0.634 0.748 0.873 0.987 1.186 1.281 1.378 1.415 1.626 1.702 1.852 1.987 2.102 2.159 2.272 2.385 2.548 2.651 2.75 2.892 3.038 3.185 3.323 3.466 3.662 3.84 4.003 4.199 4.388 4.578 4.806 5.051 5.261 5.496 5.762 6.042 6.322 6.622 6.971 7.323 7.716 8.099 8.515 8.971 9.442 9.897 10.214 10.118 9.789 9.389 8.998 8.602 8.22 7.857 7.518 7.156 6.841 6.551 6.267 5.99 5.719 5.465 5.197 4.953 4.74 4.509 4.273 4.092 3.905 3.703 3.534 3.364 3.191 2.999 2.801 2.67 2.536 2.323 2.178 2.024 1.939 1.757 1.562 1.358 1.251 1.013 0.922 0.81 0.698 0.47 0.332 0.167 -0.022 -0.247 -0.502 -0.866 -2.559 -8 ,28436 ,KEBNE ,17041210,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:12:55 CET,0.0 0.404 0.584 0.73 0.865 0.977 1.082 1.171 1.328 1.411 1.492 1.504 1.7 1.768 1.909 2.036 2.159 2.225 2.356 2.472 2.636 2.742 2.847 2.994 3.134 3.27 3.405 3.536 3.699 3.857 4.012 4.184 4.35 4.53 4.727 4.941 5.155 5.383 5.629 5.906 6.194 6.507 6.873 7.209 7.581 7.986 8.434 8.89 9.321 9.684 9.953 9.903 9.596 9.187 8.771 8.327 7.911 7.541 7.213 6.874 6.571 6.267 5.962 5.681 5.429 5.196 4.942 4.708 4.497 4.281 4.062 3.888 3.701 3.494 3.335 3.162 2.977 2.792 2.608 2.473 2.334 2.12 1.96 1.8 1.726 1.567 1.403 1.241 1.149 0.91 0.815 0.705 0.593 0.347 0.207 0.058 -0.121 -0.314 -0.503 -0.801 -2.153 -9 ,2830 ,KEBNE ,17041211,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:12:52 CET,0.0 0.289 0.465 0.62 0.764 0.892 0.999 1.098 1.275 1.353 1.427 1.435 1.636 1.705 1.835 1.972 2.108 2.171 2.29 2.404 2.562 2.67 2.77 2.908 3.046 3.175 3.302 3.426 3.577 3.721 3.869 4.054 4.23 4.391 4.58 4.801 5.008 5.232 5.473 5.72 5.964 6.232 6.535 6.855 7.217 7.565 7.915 8.282 8.714 9.109 9.32 9.188 8.82 8.348 7.945 7.547 7.144 6.769 6.425 6.065 5.746 5.436 5.133 4.846 4.568 4.307 4.049 3.826 3.619 3.39 3.157 2.967 2.768 2.558 2.387 2.219 2.056 1.882 1.69 1.545 1.405 1.203 1.058 0.896 0.807 0.615 0.42 0.203 0.088 -0.138 -0.242 -0.383 -0.52 -0.85 -1.042 -1.264 -1.512 -1.766 -2.063 -2.491 -4.326 -10 ,3255 ,KEBNE ,17041212,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:14:09 CET,0.0 0.488 0.648 0.774 0.89 1.013 1.12 1.205 1.349 1.418 1.483 1.49 1.696 1.767 1.894 2.017 2.142 2.199 2.309 2.432 2.607 2.706 2.799 2.938 3.08 3.219 3.353 3.485 3.654 3.822 3.971 4.138 4.308 4.48 4.667 4.866 5.073 5.298 5.539 5.79 6.04 6.332 6.691 7.043 7.422 7.817 8.247 8.71 9.189 9.629 9.893 9.819 9.566 9.214 8.838 8.418 8.02 7.664 7.331 6.982 6.67 6.396 6.121 5.837 5.571 5.332 5.091 4.862 4.643 4.42 4.193 3.997 3.796 3.581 3.413 3.239 3.054 2.871 2.694 2.566 2.431 2.223 2.082 1.939 1.864 1.714 1.535 1.352 1.264 1.037 0.973 0.875 0.752 0.481 0.344 0.2 0.012 -0.235 -0.508 -0.833 -1.834 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt deleted file mode 100644 index d4ebe2d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12542 ,KEBNE ,17041213,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:13:07 CET,0.0 0.355 0.526 0.652 0.762 0.863 0.945 1.023 1.182 1.26 1.327 1.346 1.491 1.55 1.645 1.722 1.783 1.815 1.885 1.94 2.023 2.078 2.115 2.163 2.208 2.255 2.292 2.318 2.358 2.382 2.391 2.391 2.384 2.382 2.374 2.349 2.32 2.286 2.214 2.09 1.945 1.773 1.517 1.21 0.8 0.249 -0.501 -1.473 -2.853 -4.914 -8.173 -11.87 -14.699 -16.946 -18.86 -20.53 -21.911 -23.111 -24.104 -25.072 -25.885 -26.597 -27.258 -27.872 -28.45 -28.96 -29.477 -29.932 -30.314 -30.71 -31.116 -31.451 -31.793 -32.148 -32.418 -32.702 -32.999 -33.288 -33.585 -33.791 -33.995 -34.308 -34.533 -34.76 -34.876 -35.118 -35.361 -35.612 -35.741 -35.995 -36.156 -36.315 -36.474 -36.822 -37.03 -37.253 -37.486 -37.726 -38.001 -38.396 -39.266 -2 ,29349 ,KEBNE ,17041214,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:14:30 CET,0.0 0.421 0.619 0.78 0.893 0.993 1.088 1.183 1.348 1.412 1.471 1.495 1.64 1.691 1.8 1.909 1.984 2.016 2.081 2.137 2.223 2.269 2.306 2.362 2.405 2.448 2.495 2.53 2.554 2.569 2.594 2.623 2.625 2.617 2.598 2.551 2.499 2.429 2.34 2.237 2.097 1.894 1.623 1.342 0.958 0.41 -0.359 -1.363 -2.739 -4.797 -8.118 -11.75 -14.557 -16.894 -18.836 -20.481 -21.856 -23.078 -24.11 -25.112 -25.948 -26.665 -27.343 -27.965 -28.531 -29.051 -29.59 -30.058 -30.457 -30.861 -31.264 -31.593 -31.953 -32.322 -32.588 -32.866 -33.15 -33.425 -33.716 -33.926 -34.138 -34.46 -34.677 -34.894 -35.008 -35.245 -35.495 -35.767 -35.909 -36.188 -36.374 -36.522 -36.666 -36.986 -37.16 -37.369 -37.622 -37.88 -38.146 -38.523 -39.723 -3 ,24139 ,KEBNE ,17041215,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:12:54 CET,0.0 0.502 0.708 0.885 1.052 1.172 1.284 1.385 1.544 1.622 1.706 1.778 1.933 1.984 2.082 2.173 2.244 2.282 2.365 2.442 2.534 2.576 2.612 2.663 2.703 2.744 2.787 2.816 2.834 2.864 2.895 2.908 2.909 2.897 2.882 2.841 2.789 2.728 2.643 2.535 2.381 2.178 1.921 1.614 1.195 0.672 -0.087 -1.153 -2.626 -4.716 -7.98 -11.68 -14.543 -16.84 -18.703 -20.325 -21.712 -22.918 -23.949 -24.953 -25.767 -26.482 -27.155 -27.775 -28.345 -28.858 -29.381 -29.847 -30.243 -30.642 -31.05 -31.391 -31.741 -32.093 -32.373 -32.656 -32.944 -33.253 -33.558 -33.753 -33.957 -34.273 -34.485 -34.7 -34.813 -35.045 -35.291 -35.557 -35.689 -35.949 -36.104 -36.248 -36.41 -36.775 -36.955 -37.126 -37.298 -37.503 -37.764 -38.122 -39.103 -4 ,11075 ,KEBNE ,17041216,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:13:14 CET,0.0 0.306 0.482 0.611 0.712 0.805 0.879 0.949 1.078 1.147 1.228 1.276 1.433 1.496 1.606 1.7 1.789 1.832 1.892 1.942 2.01 2.05 2.098 2.168 2.202 2.225 2.249 2.272 2.3 2.319 2.329 2.334 2.333 2.326 2.305 2.263 2.21 2.136 2.04 1.913 1.743 1.522 1.251 0.943 0.515 -0.016 -0.723 -1.714 -3.109 -5.148 -8.356 -11.952 -14.795 -17.133 -19.049 -20.654 -22.021 -23.212 -24.221 -25.21 -26.049 -26.803 -27.49 -28.105 -28.682 -29.194 -29.705 -30.148 -30.525 -30.925 -31.338 -31.679 -32.03 -32.387 -32.666 -32.95 -33.228 -33.511 -33.8 -33.998 -34.204 -34.528 -34.753 -34.981 -35.094 -35.321 -35.56 -35.809 -35.943 -36.216 -36.393 -36.56 -36.734 -37.085 -37.278 -37.497 -37.706 -37.918 -38.182 -38.519 -39.329 -5 ,24872 ,KEBNE ,17041217,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:14:19 CET,0.0 0.538 0.678 0.801 0.914 0.999 1.081 1.169 1.291 1.328 1.364 1.352 1.482 1.52 1.601 1.671 1.728 1.758 1.825 1.893 1.991 2.036 2.07 2.114 2.155 2.189 2.212 2.236 2.268 2.291 2.306 2.313 2.32 2.323 2.313 2.295 2.268 2.202 2.106 2.017 1.898 1.719 1.472 1.158 0.738 0.185 -0.55 -1.518 -2.902 -4.96 -8.268 -11.92 -14.788 -17.15 -19.052 -20.678 -22.104 -23.367 -24.39 -25.37 -26.214 -26.938 -27.606 -28.238 -28.821 -29.345 -29.877 -30.343 -30.739 -31.131 -31.519 -31.843 -32.176 -32.519 -32.791 -33.069 -33.354 -33.648 -33.956 -34.163 -34.372 -34.7 -34.917 -35.136 -35.245 -35.476 -35.728 -35.993 -36.124 -36.39 -36.562 -36.72 -36.882 -37.234 -37.417 -37.592 -37.812 -38.061 -38.331 -38.702 -39.401 -6 ,5488 ,KEBNE ,17041218,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:13:16 CET,0.0 0.468 0.655 0.814 0.923 0.98 1.048 1.126 1.247 1.303 1.358 1.374 1.515 1.569 1.658 1.734 1.797 1.832 1.902 1.962 2.043 2.086 2.126 2.185 2.233 2.272 2.31 2.342 2.391 2.425 2.428 2.439 2.452 2.458 2.434 2.399 2.369 2.306 2.215 2.099 1.947 1.756 1.494 1.192 0.795 0.266 -0.464 -1.451 -2.859 -4.93 -8.243 -12.001 -14.878 -17.188 -19.082 -20.697 -22.085 -23.332 -24.359 -25.351 -26.199 -26.934 -27.602 -28.211 -28.777 -29.285 -29.817 -30.291 -30.687 -31.107 -31.535 -31.874 -32.227 -32.582 -32.85 -33.134 -33.437 -33.741 -34.045 -34.245 -34.452 -34.765 -34.971 -35.186 -35.301 -35.555 -35.814 -36.063 -36.19 -36.459 -36.624 -36.778 -36.935 -37.242 -37.404 -37.598 -37.821 -38.047 -38.286 -38.588 -39.196 -7 ,29902 ,KEBNE ,17041219,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:13:34 CET,0.0 0.492 0.703 0.902 1.055 1.175 1.271 1.364 1.538 1.612 1.679 1.709 1.86 1.905 1.972 2.036 2.1 2.133 2.191 2.24 2.312 2.356 2.396 2.455 2.503 2.543 2.578 2.604 2.63 2.652 2.665 2.669 2.673 2.666 2.637 2.597 2.548 2.475 2.383 2.285 2.161 1.994 1.762 1.466 1.063 0.535 -0.19 -1.156 -2.507 -4.485 -7.769 -11.51 -14.373 -16.659 -18.567 -20.198 -21.567 -22.776 -23.781 -24.761 -25.576 -26.276 -26.941 -27.582 -28.159 -28.671 -29.195 -29.649 -30.055 -30.475 -30.884 -31.221 -31.577 -31.925 -32.183 -32.464 -32.745 -33.03 -33.326 -33.52 -33.719 -34.025 -34.221 -34.417 -34.524 -34.739 -34.948 -35.164 -35.278 -35.541 -35.676 -35.814 -35.958 -36.275 -36.44 -36.598 -36.764 -36.941 -37.156 -37.432 -37.957 -8 ,10000 ,KEBNE ,17041220,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:14:52 CET,0.0 0.918 1.155 1.331 1.492 1.625 1.737 1.846 2.045 2.125 2.209 2.255 2.39 2.425 2.503 2.591 2.672 2.716 2.795 2.85 2.924 2.972 3.021 3.095 3.154 3.192 3.216 3.238 3.267 3.298 3.312 3.311 3.314 3.306 3.284 3.243 3.189 3.126 3.048 2.948 2.803 2.613 2.363 2.069 1.675 1.143 0.394 -0.653 -2.141 -4.26 -7.563 -11.321 -14.25 -16.601 -18.539 -20.203 -21.611 -22.855 -23.892 -24.882 -25.715 -26.437 -27.097 -27.726 -28.294 -28.802 -29.326 -29.776 -30.159 -30.553 -30.965 -31.297 -31.649 -32.031 -32.319 -32.599 -32.88 -33.166 -33.472 -33.68 -33.888 -34.222 -34.44 -34.659 -34.771 -34.988 -35.21 -35.459 -35.592 -35.855 -36.006 -36.158 -36.319 -36.653 -36.833 -37.03 -37.255 -37.538 -37.883 -38.297 -39.532 -9 ,5194 ,KEBNE ,17041221,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:14:37 CET,0.0 0.827 1.185 1.389 1.526 1.637 1.76 1.881 2.054 2.126 2.208 2.248 2.395 2.453 2.556 2.647 2.72 2.752 2.819 2.874 2.949 3.002 3.048 3.108 3.155 3.194 3.231 3.261 3.304 3.353 3.377 3.366 3.346 3.338 3.342 3.319 3.267 3.203 3.103 2.967 2.806 2.603 2.343 2.029 1.582 1.029 0.304 -0.672 -2.042 -4.104 -7.397 -11.022 -13.895 -16.257 -18.184 -19.836 -21.229 -22.437 -23.464 -24.474 -25.316 -26.059 -26.745 -27.376 -27.953 -28.47 -29.008 -29.481 -29.88 -30.295 -30.718 -31.07 -31.439 -31.807 -32.095 -32.385 -32.675 -32.976 -33.284 -33.493 -33.701 -34.022 -34.241 -34.45 -34.556 -34.774 -34.99 -35.202 -35.308 -35.556 -35.685 -35.816 -35.943 -36.217 -36.396 -36.581 -36.75 -36.938 -37.131 -37.359 -37.911 -10 ,11446 ,KEBNE ,17041222,Thu Dec 23 02:50:41 CET,Thu Dec 23 04:14:45 CET,0.0 0.524 0.727 0.897 1.033 1.169 1.291 1.387 1.588 1.672 1.744 1.774 1.92 1.975 2.073 2.157 2.242 2.283 2.347 2.399 2.482 2.527 2.564 2.625 2.68 2.728 2.771 2.801 2.829 2.849 2.857 2.854 2.854 2.852 2.834 2.796 2.751 2.677 2.574 2.457 2.291 2.064 1.794 1.504 1.077 0.516 -0.232 -1.213 -2.59 -4.679 -8.01 -11.8 -14.756 -17.119 -19.001 -20.608 -21.987 -23.212 -24.26 -25.271 -26.114 -26.839 -27.517 -28.152 -28.727 -29.241 -29.761 -30.209 -30.597 -30.997 -31.403 -31.736 -32.067 -32.406 -32.673 -32.936 -33.207 -33.511 -33.821 -34.016 -34.218 -34.547 -34.769 -34.989 -35.102 -35.329 -35.558 -35.831 -35.972 -36.236 -36.401 -36.554 -36.72 -37.07 -37.255 -37.458 -37.713 -37.983 -38.238 -38.546 -39.163 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index b9b3105e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13634 ,KEBNE ,17041223,Thu Dec 23 02:55:51 CET,Thu Dec 23 04:20:03 CET,0.0 0.749 1.028 1.25 1.427 1.565 1.689 1.815 2.066 2.175 2.276 2.378 2.565 2.662 2.839 3.0 3.148 3.22 3.368 3.512 3.713 3.845 3.974 4.151 4.32 4.479 4.641 4.802 4.996 5.174 5.348 5.576 5.807 6.027 6.267 6.544 6.817 7.102 7.394 7.715 8.044 8.391 8.8 9.21 9.676 10.187 10.738 11.349 12.041 12.667 13.185 13.311 13.108 12.741 12.327 11.931 11.528 11.126 10.772 10.42 10.096 9.775 9.457 9.153 8.872 8.604 8.323 8.083 7.861 7.634 7.403 7.193 6.962 6.717 6.526 6.334 6.131 5.918 5.701 5.542 5.378 5.141 4.97 4.78 4.688 4.503 4.307 4.11 4.0 3.794 3.655 3.524 3.386 3.087 2.915 2.729 2.522 2.265 1.972 1.572 0.354 -2 ,22547 ,KEBNE ,17041224,Thu Dec 23 02:55:51 CET,Thu Dec 23 04:19:39 CET,0.0 0.398 0.596 0.704 0.809 0.914 1.014 1.118 1.319 1.421 1.509 1.569 1.755 1.833 1.966 2.108 2.245 2.306 2.433 2.555 2.734 2.853 2.972 3.146 3.309 3.467 3.63 3.79 3.985 4.168 4.352 4.576 4.795 5.006 5.253 5.516 5.764 6.043 6.353 6.673 6.984 7.342 7.773 8.18 8.651 9.197 9.791 10.404 11.077 11.734 12.27 12.382 12.154 11.79 11.387 10.988 10.624 10.259 9.907 9.545 9.206 8.883 8.579 8.279 8.003 7.749 7.466 7.227 7.028 6.807 6.573 6.37 6.168 5.956 5.782 5.599 5.403 5.198 4.977 4.823 4.664 4.417 4.232 4.034 3.939 3.731 3.515 3.287 3.161 2.945 2.761 2.608 2.467 2.163 1.979 1.798 1.605 1.377 1.137 0.813 -0.331 -3 ,13152 ,KEBNE ,17041225,Thu Dec 23 02:55:51 CET,Thu Dec 23 04:20:25 CET,0.0 0.317 0.496 0.639 0.751 0.856 0.959 1.062 1.258 1.356 1.457 1.561 1.756 1.856 2.054 2.229 2.388 2.463 2.602 2.734 2.942 3.071 3.188 3.36 3.527 3.689 3.849 4.007 4.214 4.409 4.601 4.835 5.041 5.236 5.474 5.747 6.004 6.275 6.563 6.861 7.181 7.561 7.995 8.42 8.9 9.399 9.944 10.537 11.184 11.794 12.276 12.347 12.122 11.789 11.433 11.046 10.67 10.284 9.931 9.566 9.23 8.905 8.573 8.273 8.009 7.766 7.494 7.246 7.03 6.802 6.553 6.342 6.124 5.894 5.711 5.516 5.311 5.092 4.865 4.713 4.557 4.302 4.128 3.947 3.852 3.652 3.419 3.179 3.059 2.843 2.651 2.508 2.357 1.976 1.776 1.586 1.375 1.159 0.907 0.535 -0.46 -4 ,18492 ,KEBNE ,17041226,Thu Dec 23 02:55:51 CET,Thu Dec 23 04:19:48 CET,0.0 0.554 0.83 1.054 1.245 1.432 1.596 1.732 1.979 2.097 2.208 2.308 2.493 2.584 2.769 2.929 3.068 3.135 3.269 3.405 3.602 3.722 3.841 4.022 4.198 4.365 4.528 4.677 4.869 5.071 5.259 5.477 5.688 5.891 6.124 6.391 6.661 6.956 7.269 7.597 7.941 8.33 8.76 9.18 9.653 10.149 10.721 11.309 11.958 12.616 13.081 13.116 12.885 12.563 12.202 11.833 11.471 11.097 10.748 10.363 10.027 9.731 9.439 9.143 8.847 8.58 8.29 8.025 7.81 7.592 7.345 7.131 6.909 6.686 6.512 6.323 6.125 5.91 5.678 5.525 5.374 5.119 4.924 4.728 4.634 4.438 4.219 3.981 3.86 3.649 3.467 3.309 3.144 2.819 2.658 2.48 2.265 2.016 1.716 1.303 0.405 -5 ,3681 ,KEBNE ,17041227,Thu Dec 23 02:55:51 CET,Thu Dec 23 04:21:03 CET,0.0 0.297 0.495 0.663 0.815 0.948 1.066 1.169 1.334 1.419 1.514 1.578 1.75 1.824 1.981 2.135 2.278 2.349 2.493 2.632 2.836 2.967 3.09 3.272 3.452 3.611 3.769 3.925 4.123 4.315 4.489 4.709 4.926 5.128 5.354 5.598 5.83 6.099 6.401 6.721 7.045 7.407 7.825 8.223 8.69 9.195 9.71 10.249 10.832 11.43 11.963 12.046 11.838 11.528 11.153 10.736 10.331 9.948 9.619 9.262 8.926 8.611 8.29 7.985 7.7 7.433 7.157 6.91 6.693 6.465 6.219 6.016 5.799 5.559 5.372 5.175 4.973 4.768 4.55 4.397 4.243 3.995 3.82 3.634 3.533 3.334 3.128 2.904 2.794 2.573 2.376 2.234 2.089 1.755 1.561 1.371 1.164 0.871 0.467 -0.024 -1.632 -6 ,17652 ,KEBNE ,17041228,Thu Dec 23 02:55:51 CET,Thu Dec 23 04:19:58 CET,0.0 0.416 0.574 0.7 0.818 0.915 1.0 1.104 1.312 1.405 1.498 1.568 1.745 1.824 1.977 2.12 2.254 2.324 2.45 2.569 2.746 2.858 2.967 3.135 3.314 3.477 3.632 3.786 3.984 4.178 4.362 4.591 4.814 5.022 5.26 5.526 5.791 6.08 6.364 6.675 7.022 7.373 7.771 8.198 8.683 9.189 9.741 10.329 10.985 11.699 12.287 12.353 12.115 11.786 11.4 10.994 10.592 10.204 9.85 9.456 9.112 8.798 8.482 8.174 7.885 7.62 7.336 7.075 6.848 6.605 6.356 6.149 5.927 5.706 5.54 5.374 5.211 5.032 4.839 4.715 4.585 4.34 4.162 3.989 3.899 3.727 3.556 3.365 3.259 3.057 2.915 2.792 2.664 2.37 2.211 2.045 1.862 1.632 1.33 0.947 -0.287 -7 ,16862 ,KEBNE ,17041229,Thu Dec 23 02:55:51 CET,Thu Dec 23 04:20:13 CET,0.0 1.061 1.432 1.641 1.816 1.987 2.147 2.293 2.554 2.672 2.785 2.922 3.125 3.214 3.389 3.56 3.724 3.807 3.966 4.122 4.339 4.467 4.584 4.756 4.924 5.079 5.23 5.385 5.592 5.788 5.97 6.196 6.409 6.611 6.852 7.119 7.359 7.614 7.899 8.218 8.56 8.936 9.343 9.742 10.198 10.657 11.171 11.762 12.426 13.088 13.606 13.701 13.498 13.18 12.802 12.392 12.009 11.645 11.299 10.921 10.581 10.265 9.964 9.692 9.431 9.167 8.883 8.63 8.391 8.135 7.878 7.668 7.451 7.223 7.046 6.862 6.658 6.434 6.215 6.063 5.899 5.63 5.451 5.281 5.185 4.96 4.731 4.508 4.398 4.192 4.03 3.9 3.764 3.446 3.28 3.097 2.896 2.681 2.417 2.06 0.591 -8 ,27471 ,KEBNE ,17041230,Thu Dec 23 02:55:51 CET,Thu Dec 23 04:20:15 CET,0.0 0.814 1.056 1.264 1.453 1.633 1.779 1.895 2.113 2.215 2.314 2.408 2.6 2.688 2.866 3.049 3.219 3.297 3.445 3.593 3.8 3.927 4.06 4.248 4.418 4.58 4.742 4.9 5.098 5.295 5.475 5.695 5.919 6.126 6.358 6.61 6.853 7.123 7.419 7.741 8.059 8.436 8.898 9.336 9.822 10.346 10.896 11.466 12.149 12.857 13.355 13.383 13.153 12.794 12.402 11.977 11.569 11.194 10.848 10.482 10.158 9.863 9.572 9.284 9.002 8.739 8.449 8.184 7.962 7.73 7.493 7.304 7.097 6.875 6.715 6.539 6.346 6.158 5.969 5.837 5.71 5.516 5.358 5.189 5.099 4.906 4.717 4.517 4.418 4.222 4.056 3.932 3.811 3.504 3.339 3.145 2.924 2.68 2.396 2.027 0.792 -9 ,30203 ,KEBNE ,17041231,Thu Dec 23 02:55:51 CET,Thu Dec 23 04:20:33 CET,0.0 0.363 0.556 0.693 0.817 0.93 1.04 1.136 1.292 1.369 1.454 1.515 1.691 1.773 1.929 2.078 2.228 2.296 2.427 2.568 2.791 2.932 3.056 3.229 3.393 3.557 3.727 3.886 4.08 4.273 4.464 4.699 4.915 5.118 5.35 5.602 5.851 6.131 6.423 6.728 7.055 7.409 7.816 8.24 8.707 9.209 9.786 10.414 11.066 11.679 12.237 12.344 12.082 11.703 11.307 10.905 10.484 10.091 9.727 9.347 9.014 8.708 8.398 8.092 7.811 7.542 7.252 7.01 6.802 6.577 6.34 6.128 5.899 5.671 5.49 5.303 5.107 4.895 4.674 4.52 4.366 4.104 3.919 3.74 3.643 3.419 3.182 2.947 2.824 2.611 2.415 2.264 2.114 1.773 1.599 1.407 1.157 0.865 0.527 0.054 -1.881 -10 ,11816 ,KEBNE ,17041232,Thu Dec 23 02:55:51 CET,Thu Dec 23 04:19:52 CET,0.0 0.293 0.486 0.654 0.813 0.972 1.14 1.286 1.532 1.643 1.753 1.867 2.053 2.146 2.318 2.478 2.635 2.714 2.873 3.026 3.243 3.368 3.484 3.651 3.82 3.986 4.137 4.284 4.486 4.683 4.874 5.103 5.318 5.53 5.775 6.042 6.299 6.581 6.865 7.168 7.482 7.815 8.222 8.641 9.11 9.635 10.203 10.778 11.412 12.048 12.624 12.804 12.643 12.301 11.89 11.48 11.077 10.692 10.344 9.985 9.651 9.341 9.041 8.737 8.461 8.214 7.946 7.703 7.49 7.265 7.02 6.807 6.583 6.337 6.145 5.944 5.731 5.519 5.308 5.162 4.994 4.733 4.556 4.37 4.27 4.047 3.815 3.586 3.463 3.24 3.06 2.907 2.742 2.381 2.185 1.976 1.729 1.422 1.097 0.706 -0.727 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 75af2e61..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1347 ,KEBNE ,17041233,Thu Dec 23 02:55:51 CET,Thu Dec 23 04:19:52 CET,0.0 0.408 0.61 0.742 0.875 1.016 1.139 1.249 1.458 1.548 1.633 1.69 1.866 1.94 2.09 2.231 2.376 2.445 2.58 2.726 2.937 3.066 3.199 3.394 3.57 3.751 3.927 4.094 4.31 4.517 4.717 4.958 5.18 5.389 5.627 5.905 6.193 6.503 6.816 7.137 7.487 7.874 8.329 8.793 9.291 9.837 10.469 11.151 11.861 12.585 13.225 13.452 13.357 13.083 12.767 12.404 12.012 11.658 11.344 10.993 10.663 10.366 10.084 9.812 9.547 9.293 9.023 8.783 8.574 8.346 8.105 7.9 7.675 7.443 7.267 7.082 6.894 6.702 6.492 6.347 6.194 5.936 5.771 5.596 5.5 5.291 5.065 4.833 4.717 4.505 4.317 4.173 4.032 3.7 3.514 3.287 3.03 2.74 2.351 1.794 0.134 -2 ,6493 ,KEBNE ,17041234,Thu Dec 23 02:55:51 CET,Thu Dec 23 04:19:48 CET,0.0 0.632 0.945 1.165 1.343 1.525 1.694 1.848 2.127 2.243 2.35 2.461 2.669 2.772 2.965 3.137 3.289 3.366 3.515 3.646 3.856 3.999 4.128 4.316 4.506 4.683 4.849 5.012 5.228 5.435 5.638 5.889 6.121 6.33 6.573 6.866 7.139 7.429 7.753 8.106 8.473 8.858 9.271 9.689 10.186 10.747 11.368 12.016 12.724 13.444 14.08 14.259 14.131 13.898 13.563 13.175 12.803 12.425 12.075 11.727 11.418 11.115 10.811 10.518 10.237 9.993 9.729 9.491 9.279 9.047 8.803 8.591 8.368 8.133 7.946 7.751 7.554 7.346 7.125 6.975 6.819 6.562 6.383 6.187 6.081 5.867 5.642 5.41 5.286 5.064 4.89 4.756 4.618 4.284 4.075 3.851 3.612 3.37 3.087 2.643 1.211 -3 ,29650 ,KEBNE ,17041235,Thu Dec 23 02:56:57 CET,Thu Dec 23 04:12:47 CET,0.0 0.384 0.612 0.787 0.936 1.058 1.172 1.291 1.511 1.609 1.697 1.758 1.931 2.0 2.142 2.291 2.449 2.527 2.684 2.831 3.028 3.15 3.27 3.457 3.633 3.799 3.971 4.14 4.353 4.562 4.758 4.99 5.222 5.447 5.702 5.997 6.268 6.557 6.877 7.214 7.575 7.972 8.413 8.847 9.365 9.963 10.628 11.316 12.053 12.818 13.5 13.695 13.548 13.27 12.96 12.653 12.323 11.962 11.633 11.306 10.992 10.697 10.405 10.116 9.828 9.56 9.284 9.054 8.859 8.643 8.402 8.19 7.967 7.737 7.562 7.372 7.171 6.965 6.751 6.601 6.432 6.174 6.001 5.813 5.71 5.497 5.282 5.053 4.925 4.704 4.541 4.413 4.275 3.939 3.763 3.577 3.362 3.149 2.87 2.509 1.372 -4 ,10230 ,KEBNE ,17041236,Thu Dec 23 02:56:57 CET,Thu Dec 23 04:12:49 CET,0.0 0.692 0.97 1.172 1.358 1.524 1.678 1.822 2.075 2.185 2.301 2.428 2.632 2.737 2.937 3.13 3.298 3.371 3.512 3.659 3.876 4.005 4.136 4.336 4.532 4.71 4.874 5.033 5.249 5.456 5.663 5.909 6.127 6.339 6.592 6.88 7.155 7.448 7.737 8.042 8.374 8.755 9.202 9.639 10.113 10.636 11.274 11.947 12.67 13.413 14.031 14.21 14.075 13.788 13.433 13.075 12.716 12.351 12.012 11.669 11.355 11.063 10.792 10.503 10.215 9.953 9.675 9.425 9.203 8.968 8.718 8.514 8.299 8.073 7.887 7.702 7.511 7.298 7.081 6.916 6.743 6.501 6.329 6.13 6.028 5.824 5.61 5.393 5.271 5.049 4.866 4.736 4.595 4.269 4.088 3.905 3.705 3.453 3.174 2.833 1.592 -5 ,10660 ,KEBNE ,17041237,Thu Dec 23 02:57:56 CET,Thu Dec 23 04:20:37 CET,0.0 0.753 1.016 1.22 1.427 1.619 1.762 1.883 2.093 2.2 2.307 2.401 2.596 2.689 2.86 3.021 3.18 3.259 3.415 3.571 3.795 3.934 4.063 4.247 4.416 4.592 4.775 4.943 5.14 5.338 5.532 5.768 6.001 6.215 6.457 6.727 6.998 7.303 7.621 7.947 8.277 8.653 9.103 9.558 10.072 10.608 11.212 11.88 12.602 13.316 13.995 14.231 14.101 13.877 13.603 13.268 12.926 12.605 12.279 11.914 11.601 11.301 10.997 10.69 10.391 10.133 9.861 9.603 9.381 9.154 8.914 8.711 8.493 8.261 8.079 7.875 7.661 7.452 7.251 7.119 6.972 6.735 6.582 6.43 6.348 6.177 6.004 5.804 5.694 5.481 5.311 5.179 5.033 4.715 4.528 4.311 4.095 3.859 3.597 3.219 1.699 -6 ,26464 ,KEBNE ,17041238,Thu Dec 23 02:57:56 CET,Thu Dec 23 04:20:33 CET,0.0 0.777 1.059 1.283 1.453 1.594 1.752 1.893 2.14 2.264 2.38 2.509 2.705 2.799 2.987 3.16 3.32 3.401 3.563 3.705 3.902 4.03 4.163 4.356 4.533 4.705 4.885 5.059 5.266 5.458 5.651 5.891 6.123 6.348 6.621 6.915 7.181 7.476 7.791 8.116 8.451 8.821 9.226 9.636 10.142 10.709 11.329 12.025 12.778 13.491 14.165 14.452 14.386 14.173 13.851 13.486 13.131 12.757 12.411 12.057 11.747 11.459 11.161 10.874 10.607 10.351 10.08 9.836 9.612 9.381 9.147 8.947 8.731 8.499 8.32 8.123 7.911 7.695 7.471 7.308 7.132 6.862 6.678 6.486 6.389 6.182 5.942 5.695 5.572 5.357 5.169 5.011 4.843 4.485 4.288 4.08 3.857 3.583 3.231 2.772 1.381 -7 ,3114 ,KEBNE ,17041239,Thu Dec 23 02:57:56 CET,Thu Dec 23 04:20:19 CET,0.0 0.477 0.708 0.875 1.015 1.153 1.284 1.408 1.609 1.709 1.812 1.878 2.058 2.137 2.287 2.435 2.565 2.628 2.764 2.901 3.086 3.2 3.315 3.485 3.653 3.817 3.971 4.12 4.318 4.512 4.696 4.913 5.138 5.372 5.64 5.939 6.227 6.536 6.859 7.192 7.546 7.956 8.415 8.862 9.385 9.937 10.534 11.193 11.926 12.668 13.389 13.722 13.648 13.412 13.1 12.75 12.382 12.004 11.678 11.314 10.976 10.681 10.39 10.104 9.843 9.592 9.306 9.039 8.814 8.59 8.343 8.134 7.924 7.703 7.519 7.322 7.128 6.923 6.706 6.564 6.422 6.205 6.045 5.869 5.777 5.59 5.405 5.207 5.1 4.901 4.744 4.61 4.471 4.156 3.998 3.825 3.636 3.437 3.2 2.834 1.455 -8 ,30961 ,KEBNE ,17041240,Thu Dec 23 02:57:56 CET,Thu Dec 23 04:20:13 CET,0.0 0.601 0.807 0.963 1.113 1.244 1.362 1.485 1.692 1.779 1.867 1.951 2.142 2.227 2.382 2.532 2.679 2.753 2.903 3.054 3.275 3.412 3.54 3.74 3.936 4.107 4.271 4.429 4.634 4.84 5.039 5.284 5.522 5.744 5.991 6.27 6.53 6.807 7.122 7.476 7.832 8.203 8.642 9.085 9.608 10.194 10.835 11.497 12.208 13.011 13.798 14.113 14.026 13.774 13.446 13.091 12.708 12.315 11.986 11.633 11.303 11.009 10.721 10.434 10.168 9.925 9.651 9.384 9.153 8.924 8.687 8.495 8.292 8.07 7.898 7.716 7.517 7.308 7.089 6.936 6.782 6.545 6.371 6.182 6.09 5.898 5.679 5.455 5.345 5.14 4.993 4.865 4.722 4.415 4.248 4.093 3.912 3.658 3.363 2.958 1.762 -9 ,31166 ,KEBNE ,17041241,Thu Dec 23 02:57:56 CET,Thu Dec 23 04:20:22 CET,0.0 0.903 1.133 1.34 1.525 1.703 1.858 1.99 2.238 2.37 2.496 2.615 2.815 2.91 3.077 3.231 3.39 3.472 3.621 3.762 3.981 4.129 4.28 4.487 4.669 4.838 5.003 5.165 5.387 5.605 5.808 6.039 6.265 6.495 6.756 7.043 7.323 7.632 7.953 8.28 8.608 8.968 9.404 9.85 10.353 10.914 11.546 12.202 12.94 13.737 14.432 14.696 14.558 14.258 13.937 13.597 13.244 12.874 12.53 12.206 11.912 11.622 11.347 11.082 10.81 10.543 10.27 10.019 9.797 9.57 9.319 9.097 8.868 8.629 8.45 8.264 8.062 7.847 7.622 7.472 7.309 7.055 6.881 6.687 6.583 6.378 6.171 5.946 5.822 5.604 5.427 5.28 5.13 4.793 4.597 4.389 4.194 3.999 3.742 3.271 1.194 -10 ,13731 ,KEBNE ,17041242,Thu Dec 23 02:57:57 CET,Thu Dec 23 04:20:32 CET,0.0 0.721 0.997 1.222 1.416 1.598 1.758 1.898 2.156 2.273 2.398 2.52 2.705 2.798 2.994 3.179 3.35 3.427 3.577 3.731 3.943 4.077 4.215 4.416 4.597 4.77 4.94 5.108 5.321 5.52 5.709 5.942 6.176 6.395 6.641 6.916 7.182 7.475 7.79 8.123 8.48 8.886 9.351 9.803 10.303 10.859 11.483 12.18 12.933 13.65 14.318 14.582 14.446 14.161 13.849 13.494 13.137 12.773 12.434 12.073 11.747 11.437 11.127 10.835 10.551 10.294 10.013 9.758 9.546 9.324 9.091 8.874 8.651 8.415 8.227 8.042 7.855 7.656 7.431 7.275 7.116 6.85 6.663 6.485 6.387 6.174 5.966 5.755 5.628 5.396 5.212 5.057 4.897 4.522 4.306 4.082 3.821 3.544 3.257 2.892 1.539 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt deleted file mode 100644 index d7e6eec9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5606 ,KEBNE ,17041243,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:24:26 CET,0.0 0.715 1.012 1.255 1.473 1.657 1.802 1.933 2.186 2.312 2.435 2.566 2.77 2.875 3.079 3.272 3.463 3.55 3.712 3.872 4.116 4.265 4.403 4.607 4.805 5.003 5.191 5.36 5.584 5.815 6.036 6.321 6.6 6.854 7.154 7.51 7.825 8.145 8.51 8.881 9.242 9.645 10.108 10.563 11.076 11.639 12.283 12.91 13.542 14.166 14.576 14.471 14.086 13.617 13.099 12.54 12.026 11.539 11.103 10.664 10.29 9.923 9.54 9.19 8.868 8.57 8.244 7.97 7.74 7.485 7.216 6.994 6.762 6.512 6.32 6.118 5.902 5.687 5.464 5.303 5.139 4.889 4.716 4.528 4.425 4.214 3.997 3.781 3.67 3.465 3.322 3.175 3.016 2.686 2.502 2.299 2.105 1.891 1.609 1.315 0.714 -2 ,5092 ,KEBNE ,17041244,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:24:22 CET,0.0 0.589 0.869 1.121 1.343 1.505 1.659 1.801 2.028 2.143 2.27 2.391 2.586 2.685 2.879 3.065 3.236 3.322 3.495 3.663 3.919 4.088 4.258 4.502 4.733 4.958 5.174 5.393 5.661 5.891 6.115 6.392 6.659 6.919 7.213 7.544 7.867 8.21 8.569 8.941 9.313 9.727 10.228 10.715 11.224 11.763 12.363 12.984 13.67 14.317 14.651 14.519 14.12 13.612 13.104 12.563 12.053 11.586 11.167 10.729 10.344 9.991 9.638 9.306 8.984 8.69 8.389 8.098 7.843 7.585 7.322 7.102 6.868 6.62 6.424 6.225 6.016 5.805 5.598 5.445 5.288 5.042 4.847 4.644 4.543 4.338 4.105 3.856 3.73 3.504 3.333 3.183 3.03 2.696 2.491 2.285 2.035 1.734 1.427 1.024 -0.582 -3 ,11184 ,KEBNE ,17041245,Thu Dec 23 03:00:02 CET,Thu Dec 23 04:24:33 CET,0.0 0.852 1.22 1.511 1.767 1.982 2.163 2.338 2.648 2.783 2.911 3.033 3.237 3.349 3.578 3.794 3.988 4.082 4.269 4.455 4.717 4.884 5.049 5.283 5.511 5.723 5.927 6.134 6.39 6.631 6.878 7.186 7.478 7.741 8.036 8.364 8.68 9.036 9.403 9.798 10.229 10.685 11.178 11.654 12.179 12.709 13.312 13.945 14.57 15.11 15.382 15.191 14.868 14.415 13.867 13.322 12.845 12.408 12.0 11.556 11.159 10.822 10.493 10.164 9.838 9.533 9.224 8.934 8.685 8.442 8.171 7.922 7.669 7.421 7.232 7.036 6.814 6.586 6.345 6.171 5.994 5.716 5.532 5.352 5.257 5.054 4.83 4.573 4.438 4.21 4.007 3.834 3.653 3.264 3.045 2.805 2.562 2.303 2.006 1.606 0.247 -4 ,26918 ,KEBNE ,17041246,Thu Dec 23 03:00:06 CET,Thu Dec 23 04:21:18 CET,0.0 0.898 1.167 1.373 1.552 1.728 1.902 2.048 2.305 2.435 2.56 2.665 2.871 2.979 3.166 3.342 3.512 3.603 3.774 3.933 4.159 4.311 4.458 4.655 4.845 5.035 5.224 5.411 5.653 5.889 6.135 6.425 6.689 6.947 7.243 7.565 7.88 8.234 8.61 8.981 9.348 9.757 10.234 10.717 11.277 11.835 12.437 13.059 13.665 14.298 14.745 14.631 14.257 13.776 13.253 12.749 12.262 11.777 11.335 10.868 10.48 10.134 9.78 9.424 9.112 8.836 8.529 8.253 8.009 7.753 7.492 7.276 7.048 6.796 6.593 6.385 6.17 5.958 5.732 5.564 5.377 5.093 4.896 4.685 4.579 4.355 4.119 3.855 3.712 3.481 3.299 3.148 2.982 2.624 2.429 2.218 1.975 1.659 1.318 0.956 -0.187 -5 ,19003 ,KEBNE ,17041247,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:24:56 CET,0.0 0.673 0.966 1.239 1.48 1.691 1.871 2.019 2.291 2.442 2.592 2.744 2.963 3.087 3.329 3.561 3.789 3.899 4.097 4.276 4.53 4.696 4.862 5.108 5.331 5.54 5.74 5.945 6.213 6.466 6.71 6.985 7.246 7.52 7.844 8.175 8.477 8.812 9.178 9.563 9.944 10.364 10.833 11.305 11.857 12.435 13.033 13.648 14.287 14.857 15.259 15.018 14.505 14.011 13.488 12.934 12.417 11.939 11.503 11.05 10.666 10.315 9.969 9.633 9.309 9.002 8.682 8.402 8.153 7.872 7.592 7.37 7.127 6.881 6.692 6.493 6.276 6.043 5.791 5.614 5.442 5.175 4.981 4.787 4.687 4.474 4.254 4.009 3.878 3.65 3.47 3.326 3.179 2.815 2.603 2.379 2.129 1.842 1.526 1.117 -0.27 -6 ,21280 ,KEBNE ,17041248,Thu Dec 23 03:00:02 CET,Thu Dec 23 04:23:03 CET,0.0 1.048 1.477 1.768 2.026 2.248 2.425 2.597 2.948 3.116 3.273 3.463 3.695 3.818 4.047 4.267 4.474 4.578 4.777 4.955 5.212 5.38 5.541 5.773 6.0 6.216 6.425 6.63 6.886 7.11 7.321 7.602 7.882 8.149 8.452 8.784 9.089 9.411 9.76 10.139 10.525 10.955 11.452 11.948 12.511 13.091 13.718 14.347 15.008 15.615 15.99 15.842 15.418 14.923 14.387 13.852 13.357 12.888 12.475 12.029 11.624 11.246 10.878 10.532 10.199 9.906 9.6 9.318 9.057 8.78 8.51 8.286 8.054 7.821 7.635 7.431 7.227 7.023 6.817 6.684 6.536 6.304 6.158 6.002 5.922 5.757 5.583 5.399 5.303 5.108 5.001 4.894 4.776 4.49 4.327 4.172 4.004 3.78 3.534 3.245 2.615 -7 ,26774 ,KEBNE ,17041249,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:25:05 CET,0.0 0.873 1.178 1.401 1.579 1.751 1.91 2.067 2.369 2.514 2.664 2.844 3.063 3.172 3.39 3.598 3.797 3.898 4.096 4.288 4.562 4.735 4.907 5.147 5.38 5.607 5.821 6.021 6.277 6.536 6.773 7.049 7.33 7.605 7.91 8.236 8.548 8.882 9.247 9.625 10.026 10.491 10.982 11.427 11.941 12.515 13.141 13.793 14.462 15.072 15.49 15.341 14.916 14.439 13.889 13.332 12.837 12.376 11.951 11.506 11.112 10.76 10.424 10.083 9.766 9.477 9.16 8.878 8.637 8.389 8.131 7.909 7.672 7.441 7.256 7.051 6.833 6.608 6.373 6.214 6.047 5.779 5.593 5.393 5.287 5.08 4.879 4.665 4.552 4.336 4.173 4.035 3.889 3.562 3.398 3.235 3.045 2.837 2.62 2.356 1.527 -8 ,4629 ,KEBNE ,17041250,Thu Dec 23 03:00:02 CET,Thu Dec 23 04:25:06 CET,0.0 1.477 1.905 2.209 2.487 2.727 2.947 3.152 3.524 3.692 3.84 4.026 4.265 4.393 4.628 4.844 5.049 5.145 5.325 5.501 5.763 5.932 6.098 6.336 6.568 6.785 6.979 7.173 7.434 7.682 7.915 8.197 8.468 8.725 9.016 9.333 9.645 9.994 10.349 10.728 11.116 11.539 12.038 12.512 13.019 13.564 14.186 14.86 15.539 16.159 16.544 16.404 16.017 15.538 14.986 14.406 13.897 13.438 13.027 12.608 12.231 11.888 11.545 11.189 10.849 10.561 10.267 9.983 9.724 9.453 9.186 8.966 8.726 8.464 8.26 8.055 7.839 7.603 7.357 7.201 7.042 6.775 6.58 6.393 6.302 6.105 5.901 5.666 5.541 5.329 5.163 5.013 4.868 4.584 4.435 4.286 4.129 3.949 3.752 3.492 2.681 -9 ,30796 ,KEBNE ,17041252,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:23:16 CET,0.0 0.825 1.079 1.325 1.569 1.79 1.998 2.183 2.506 2.651 2.78 2.911 3.121 3.238 3.459 3.68 3.898 4.001 4.205 4.4 4.674 4.839 4.989 5.214 5.441 5.66 5.874 6.081 6.33 6.558 6.794 7.083 7.365 7.623 7.91 8.24 8.549 8.88 9.248 9.621 10.0 10.437 10.933 11.411 11.958 12.539 13.128 13.702 14.283 14.859 15.22 15.029 14.584 14.098 13.579 13.034 12.542 12.077 11.663 11.249 10.873 10.519 10.17 9.838 9.523 9.229 8.92 8.643 8.411 8.159 7.887 7.666 7.435 7.196 7.014 6.829 6.635 6.424 6.193 6.036 5.867 5.601 5.41 5.206 5.105 4.895 4.677 4.438 4.319 4.1 3.916 3.76 3.611 3.301 3.132 2.958 2.753 2.496 2.186 1.792 0.815 -10 ,31545 ,KEBNE ,17041253,Thu Dec 23 03:00:04 CET,Thu Dec 23 04:23:29 CET,0.0 0.786 1.052 1.279 1.471 1.627 1.791 1.956 2.239 2.354 2.478 2.635 2.842 2.944 3.137 3.305 3.468 3.55 3.714 3.872 4.102 4.254 4.395 4.592 4.79 4.984 5.173 5.356 5.586 5.812 6.045 6.328 6.598 6.879 7.218 7.573 7.89 8.229 8.59 8.976 9.371 9.817 10.33 10.809 11.341 11.923 12.551 13.203 13.862 14.501 14.964 14.815 14.348 13.816 13.292 12.784 12.315 11.836 11.408 10.986 10.591 10.231 9.888 9.569 9.269 8.978 8.676 8.397 8.153 7.913 7.657 7.448 7.23 6.98 6.781 6.586 6.377 6.143 5.908 5.75 5.577 5.313 5.135 4.958 4.865 4.655 4.43 4.195 4.082 3.862 3.67 3.513 3.349 3.001 2.838 2.656 2.443 2.187 1.86 1.516 0.916 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index c9577ea4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30019 ,KEBNE ,17041256,Thu Dec 23 03:00:02 CET,Thu Dec 23 04:25:09 CET,0.0 0.285 0.446 0.572 0.687 0.821 0.943 1.047 1.258 1.36 1.462 1.54 1.726 1.805 1.961 2.1 2.232 2.304 2.448 2.587 2.791 2.915 3.029 3.207 3.377 3.539 3.706 3.863 4.065 4.262 4.458 4.681 4.895 5.12 5.377 5.663 5.939 6.255 6.62 7.005 7.382 7.796 8.269 8.728 9.286 9.875 10.503 11.213 12.021 12.912 13.772 14.194 14.25 14.091 13.776 13.414 13.069 12.7 12.355 11.998 11.661 11.348 11.038 10.723 10.413 10.111 9.791 9.517 9.266 8.999 8.732 8.502 8.251 7.997 7.799 7.581 7.357 7.116 6.86 6.687 6.506 6.213 5.995 5.772 5.66 5.415 5.136 4.828 4.68 4.438 4.211 4.043 3.863 3.451 3.187 2.903 2.61 2.262 1.905 1.379 -0.44 -2 ,19587 ,KEBNE ,17041257,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:23:07 CET,0.0 0.664 0.946 1.125 1.293 1.471 1.635 1.784 2.04 2.156 2.268 2.397 2.594 2.682 2.861 3.035 3.203 3.281 3.434 3.592 3.813 3.949 4.077 4.259 4.435 4.611 4.779 4.938 5.136 5.324 5.516 5.756 5.991 6.214 6.463 6.754 7.043 7.35 7.69 8.052 8.43 8.872 9.381 9.882 10.443 11.051 11.769 12.562 13.406 14.262 15.11 15.533 15.519 15.339 15.071 14.726 14.327 13.944 13.652 13.339 13.024 12.726 12.421 12.126 11.842 11.566 11.27 10.998 10.776 10.535 10.252 10.024 9.796 9.551 9.346 9.128 8.907 8.672 8.418 8.241 8.065 7.779 7.578 7.359 7.243 7.022 6.769 6.471 6.315 6.081 5.865 5.703 5.528 5.134 4.934 4.692 4.417 4.132 3.752 3.22 0.6 -3 ,369 ,KEBNE ,17041258,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:24:17 CET,0.0 0.842 1.101 1.337 1.556 1.722 1.881 2.029 2.27 2.391 2.505 2.593 2.782 2.885 3.066 3.223 3.378 3.46 3.628 3.776 3.975 4.107 4.237 4.425 4.607 4.776 4.942 5.108 5.323 5.539 5.753 6.0 6.234 6.465 6.732 7.026 7.294 7.59 7.911 8.244 8.598 9.004 9.481 9.95 10.474 11.047 11.72 12.47 13.274 14.062 14.818 15.253 15.251 14.994 14.647 14.281 13.896 13.491 13.134 12.764 12.42 12.111 11.802 11.496 11.208 10.937 10.644 10.362 10.109 9.87 9.627 9.41 9.173 8.902 8.688 8.475 8.251 8.029 7.786 7.613 7.441 7.161 6.957 6.736 6.625 6.43 6.232 5.989 5.86 5.652 5.508 5.359 5.181 4.816 4.619 4.369 4.093 3.776 3.39 2.789 0.49 -4 ,19054 ,KEBNE ,17041260,Thu Dec 23 03:00:02 CET,Thu Dec 23 04:23:13 CET,0.0 0.376 0.691 0.92 1.083 1.218 1.349 1.472 1.728 1.86 1.981 2.106 2.311 2.411 2.601 2.783 2.945 3.021 3.167 3.305 3.521 3.66 3.789 3.984 4.166 4.334 4.502 4.67 4.877 5.081 5.293 5.541 5.769 5.994 6.259 6.547 6.825 7.128 7.439 7.771 8.137 8.55 9.033 9.511 10.039 10.619 11.28 11.995 12.76 13.557 14.317 14.657 14.61 14.383 14.068 13.712 13.366 13.042 12.733 12.369 12.043 11.725 11.397 11.106 10.823 10.553 10.268 9.994 9.733 9.465 9.186 8.941 8.687 8.426 8.226 8.023 7.789 7.536 7.286 7.109 6.921 6.66 6.496 6.284 6.165 5.936 5.685 5.387 5.237 5.011 4.81 4.635 4.419 3.963 3.723 3.45 3.163 2.825 2.39 1.784 -0.997 -5 ,29597 ,KEBNE ,17041262,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:23:08 CET,0.0 0.266 0.417 0.586 0.747 0.883 0.994 1.104 1.31 1.41 1.507 1.577 1.762 1.844 1.999 2.148 2.299 2.377 2.533 2.687 2.904 3.036 3.164 3.349 3.525 3.702 3.892 4.071 4.285 4.49 4.686 4.922 5.15 5.365 5.619 5.912 6.198 6.52 6.86 7.206 7.566 7.978 8.448 8.9 9.434 10.023 10.651 11.344 12.087 12.915 13.767 14.188 14.207 13.997 13.746 13.413 13.026 12.643 12.288 11.909 11.566 11.26 10.95 10.646 10.351 10.066 9.772 9.502 9.252 8.988 8.707 8.469 8.231 7.966 7.754 7.545 7.334 7.109 6.867 6.697 6.518 6.246 6.053 5.838 5.725 5.492 5.241 4.98 4.841 4.595 4.377 4.223 4.047 3.647 3.431 3.19 2.926 2.649 2.295 1.717 -0.57 -6 ,11695 ,KEBNE ,17041264,Thu Dec 23 03:00:02 CET,Thu Dec 23 04:24:40 CET,0.0 0.736 1.018 1.252 1.458 1.62 1.759 1.903 2.163 2.269 2.369 2.465 2.65 2.738 2.917 3.089 3.249 3.324 3.483 3.635 3.851 3.99 4.122 4.317 4.501 4.676 4.841 5.004 5.224 5.43 5.624 5.858 6.078 6.293 6.551 6.833 7.095 7.404 7.753 8.091 8.434 8.833 9.302 9.758 10.272 10.867 11.553 12.278 13.073 13.926 14.73 15.112 15.108 14.95 14.721 14.422 14.085 13.745 13.404 13.03 12.712 12.406 12.105 11.821 11.543 11.296 11.032 10.777 10.549 10.302 10.034 9.809 9.579 9.325 9.113 8.889 8.641 8.392 8.137 7.962 7.791 7.534 7.355 7.142 7.03 6.801 6.557 6.317 6.185 5.951 5.745 5.583 5.405 5.028 4.845 4.633 4.385 4.112 3.82 3.383 1.489 -7 ,3414 ,KEBNE ,17041265,Thu Dec 23 03:00:02 CET,Thu Dec 23 04:23:11 CET,0.0 0.269 0.557 0.779 0.953 1.127 1.274 1.403 1.655 1.761 1.856 1.959 2.158 2.25 2.424 2.588 2.744 2.82 2.971 3.126 3.354 3.494 3.623 3.806 3.974 4.139 4.303 4.467 4.686 4.895 5.102 5.348 5.578 5.807 6.089 6.412 6.71 7.03 7.367 7.72 8.085 8.495 8.955 9.414 9.963 10.532 11.16 11.871 12.663 13.515 14.323 14.642 14.592 14.368 14.078 13.772 13.433 13.09 12.794 12.456 12.111 11.787 11.472 11.169 10.863 10.567 10.261 9.987 9.744 9.483 9.22 9.006 8.766 8.498 8.291 8.086 7.865 7.623 7.365 7.175 6.995 6.748 6.567 6.369 6.263 6.05 5.82 5.572 5.439 5.191 4.952 4.78 4.59 4.153 3.903 3.633 3.328 2.955 2.541 2.003 -0.138 -8 ,21908 ,KEBNE ,17041267,Thu Dec 23 03:00:02 CET,Thu Dec 23 04:23:09 CET,0.0 0.31 0.471 0.586 0.709 0.832 0.947 1.059 1.265 1.349 1.43 1.482 1.664 1.747 1.909 2.053 2.194 2.265 2.397 2.519 2.693 2.811 2.943 3.138 3.313 3.474 3.633 3.792 4.01 4.219 4.412 4.654 4.896 5.119 5.383 5.694 5.984 6.283 6.601 6.951 7.332 7.743 8.218 8.701 9.231 9.814 10.467 11.202 12.041 12.881 13.696 14.055 13.992 13.769 13.451 13.076 12.683 12.309 11.968 11.596 11.262 10.949 10.65 10.37 10.11 9.861 9.584 9.32 9.087 8.849 8.58 8.35 8.123 7.873 7.655 7.434 7.219 6.982 6.73 6.567 6.402 6.123 5.923 5.709 5.593 5.374 5.166 4.91 4.763 4.523 4.294 4.115 3.92 3.502 3.285 3.068 2.832 2.531 2.125 1.574 -0.134 -9 ,31283 ,KEBNE ,17041268,Thu Dec 23 03:00:02 CET,Thu Dec 23 04:24:21 CET,0.0 0.933 1.237 1.452 1.642 1.812 1.957 2.09 2.329 2.441 2.546 2.643 2.843 2.938 3.121 3.303 3.467 3.541 3.698 3.863 4.086 4.224 4.356 4.547 4.746 4.936 5.119 5.303 5.524 5.726 5.931 6.171 6.404 6.634 6.898 7.192 7.465 7.773 8.104 8.45 8.818 9.204 9.634 10.106 10.67 11.253 11.902 12.631 13.44 14.263 15.013 15.35 15.329 15.121 14.834 14.558 14.246 13.918 13.608 13.26 12.966 12.683 12.398 12.112 11.828 11.549 11.254 10.968 10.702 10.431 10.127 9.871 9.636 9.39 9.197 9.019 8.82 8.598 8.361 8.191 8.024 7.734 7.521 7.31 7.207 6.983 6.716 6.427 6.278 6.048 5.852 5.668 5.465 5.052 4.818 4.546 4.232 3.888 3.525 2.948 0.578 -10 ,10681 ,KEBNE ,17041269,Thu Dec 23 03:00:04 CET,Thu Dec 23 04:24:28 CET,0.0 0.355 0.539 0.716 0.848 0.965 1.082 1.184 1.371 1.461 1.543 1.584 1.762 1.843 2.001 2.144 2.274 2.338 2.471 2.595 2.779 2.909 3.029 3.192 3.35 3.5 3.654 3.806 3.981 4.154 4.338 4.569 4.798 5.026 5.283 5.56 5.827 6.12 6.443 6.797 7.163 7.548 8.006 8.488 9.023 9.616 10.283 11.016 11.846 12.675 13.413 13.803 13.828 13.565 13.197 12.812 12.422 12.05 11.713 11.341 10.999 10.691 10.409 10.132 9.836 9.552 9.254 8.988 8.761 8.511 8.24 8.031 7.816 7.596 7.415 7.201 6.987 6.768 6.519 6.343 6.164 5.879 5.679 5.454 5.341 5.117 4.872 4.613 4.463 4.224 4.001 3.829 3.665 3.265 3.016 2.758 2.472 2.167 1.779 1.231 -0.77 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt deleted file mode 100644 index 7aaef898..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11930 ,KEBNE ,17041270,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:25:10 CET,0.0 0.463 0.73 0.972 1.193 1.363 1.534 1.706 1.997 2.123 2.244 2.383 2.591 2.702 2.91 3.103 3.305 3.401 3.58 3.744 3.973 4.116 4.259 4.47 4.665 4.847 5.03 5.22 5.459 5.677 5.893 6.158 6.395 6.616 6.869 7.159 7.445 7.747 8.067 8.395 8.738 9.116 9.535 9.951 10.428 10.951 11.528 12.122 12.743 13.346 13.766 13.767 13.517 13.157 12.735 12.264 11.817 11.432 11.075 10.684 10.339 10.016 9.704 9.393 9.094 8.812 8.513 8.245 8.006 7.75 7.473 7.24 7.006 6.766 6.576 6.378 6.169 5.953 5.722 5.559 5.401 5.146 4.955 4.762 4.667 4.463 4.237 3.992 3.865 3.649 3.464 3.303 3.131 2.779 2.576 2.338 2.087 1.808 1.488 1.017 -0.206 -2 ,12912 ,KEBNE ,17041271,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:23:18 CET,0.0 0.393 0.63 0.812 0.985 1.139 1.251 1.349 1.558 1.661 1.756 1.826 2.002 2.084 2.265 2.425 2.563 2.63 2.762 2.9 3.116 3.252 3.384 3.585 3.78 3.965 4.141 4.306 4.534 4.76 4.968 5.22 5.459 5.686 5.947 6.249 6.542 6.848 7.168 7.512 7.881 8.286 8.737 9.181 9.675 10.204 10.806 11.442 12.119 12.793 13.278 13.295 13.029 12.666 12.258 11.816 11.417 11.038 10.661 10.255 9.899 9.587 9.28 8.977 8.677 8.379 8.063 7.799 7.579 7.344 7.096 6.871 6.626 6.388 6.21 6.02 5.817 5.6 5.386 5.23 5.057 4.79 4.598 4.399 4.3 4.101 3.89 3.657 3.529 3.297 3.113 2.958 2.794 2.491 2.318 2.102 1.871 1.64 1.379 1.077 0.277 -3 ,1057 ,KEBNE ,17041272,Thu Dec 23 03:00:04 CET,Thu Dec 23 04:23:31 CET,0.0 0.68 1.028 1.318 1.561 1.779 1.965 2.124 2.406 2.538 2.665 2.805 3.012 3.116 3.32 3.518 3.707 3.799 3.978 4.144 4.371 4.521 4.671 4.895 5.101 5.278 5.46 5.644 5.873 6.098 6.313 6.57 6.822 7.061 7.326 7.618 7.906 8.237 8.584 8.924 9.262 9.644 10.095 10.544 11.058 11.606 12.196 12.784 13.404 14.019 14.501 14.533 14.272 13.89 13.456 13.001 12.584 12.168 11.764 11.348 10.979 10.633 10.291 9.972 9.671 9.388 9.093 8.837 8.62 8.38 8.137 7.943 7.728 7.497 7.314 7.116 6.918 6.73 6.537 6.401 6.258 6.02 5.854 5.692 5.603 5.405 5.21 5.003 4.888 4.672 4.522 4.397 4.261 3.953 3.788 3.6 3.394 3.168 2.904 2.591 1.626 -4 ,8847 ,KEBNE ,17041273,Thu Dec 23 03:00:04 CET,Thu Dec 23 04:24:53 CET,0.0 0.54 0.79 1.011 1.233 1.44 1.614 1.779 2.095 2.23 2.351 2.491 2.7 2.807 3.015 3.205 3.384 3.473 3.659 3.838 4.084 4.236 4.386 4.607 4.805 4.995 5.188 5.37 5.602 5.821 6.026 6.28 6.524 6.751 7.021 7.334 7.63 7.95 8.279 8.626 8.992 9.383 9.81 10.232 10.727 11.285 11.878 12.495 13.153 13.762 14.147 14.065 13.738 13.339 12.923 12.487 12.075 11.673 11.294 10.881 10.525 10.221 9.927 9.645 9.375 9.114 8.824 8.562 8.334 8.097 7.842 7.631 7.405 7.168 6.981 6.792 6.595 6.377 6.153 5.989 5.814 5.547 5.368 5.177 5.078 4.873 4.649 4.421 4.313 4.107 3.968 3.839 3.704 3.407 3.234 3.05 2.861 2.638 2.372 2.065 1.255 -5 ,648 ,KEBNE ,17041274,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:25:17 CET,0.0 0.343 0.561 0.745 0.896 1.022 1.14 1.263 1.503 1.612 1.711 1.79 1.976 2.062 2.23 2.381 2.531 2.611 2.751 2.875 3.082 3.228 3.373 3.585 3.779 3.964 4.15 4.33 4.558 4.771 4.979 5.232 5.477 5.703 5.955 6.249 6.525 6.833 7.177 7.529 7.876 8.249 8.677 9.102 9.59 10.121 10.696 11.303 11.965 12.559 12.962 12.958 12.642 12.226 11.804 11.336 10.855 10.387 10.005 9.621 9.29 8.992 8.686 8.399 8.121 7.862 7.582 7.305 7.065 6.823 6.569 6.358 6.133 5.889 5.695 5.501 5.309 5.114 4.929 4.801 4.656 4.429 4.262 4.09 4.001 3.815 3.619 3.408 3.305 3.104 2.975 2.85 2.709 2.405 2.252 2.085 1.895 1.67 1.397 1.078 0.355 -6 ,18823 ,KEBNE ,17041275,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:23:21 CET,0.0 0.594 0.909 1.156 1.364 1.554 1.734 1.91 2.242 2.398 2.546 2.713 2.933 3.048 3.251 3.447 3.644 3.735 3.903 4.063 4.294 4.442 4.589 4.808 4.999 5.174 5.353 5.53 5.759 5.972 6.172 6.416 6.656 6.888 7.149 7.446 7.734 8.049 8.38 8.715 9.071 9.455 9.888 10.314 10.799 11.319 11.884 12.498 13.143 13.753 14.25 14.29 14.01 13.595 13.169 12.753 12.338 11.952 11.571 11.181 10.87 10.577 10.264 9.945 9.647 9.377 9.082 8.813 8.564 8.284 8.001 7.769 7.527 7.27 7.065 6.86 6.648 6.43 6.195 6.029 5.862 5.586 5.395 5.198 5.09 4.876 4.644 4.388 4.264 4.04 3.888 3.76 3.619 3.294 3.12 2.945 2.763 2.528 2.182 1.75 0.87 -7 ,22425 ,KEBNE ,17041276,Thu Dec 23 03:00:04 CET,Thu Dec 23 04:24:52 CET,0.0 0.817 1.217 1.537 1.778 1.955 2.129 2.314 2.652 2.801 2.938 3.076 3.288 3.394 3.608 3.808 3.994 4.083 4.246 4.402 4.635 4.783 4.924 5.13 5.318 5.502 5.689 5.865 6.093 6.306 6.505 6.742 6.99 7.234 7.499 7.787 8.057 8.35 8.658 8.99 9.359 9.777 10.216 10.62 11.08 11.566 12.112 12.717 13.36 13.99 14.4 14.312 14.056 13.7 13.315 12.869 12.442 12.046 11.657 11.25 10.88 10.544 10.234 9.945 9.681 9.43 9.148 8.873 8.622 8.384 8.138 7.914 7.671 7.411 7.214 7.016 6.817 6.615 6.4 6.241 6.072 5.813 5.625 5.425 5.325 5.119 4.897 4.648 4.523 4.303 4.132 3.988 3.838 3.502 3.321 3.113 2.857 2.563 2.217 1.766 0.472 -8 ,27539 ,KEBNE ,17041277,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:24:51 CET,0.0 1.03 1.404 1.696 1.945 2.175 2.365 2.539 2.887 3.039 3.174 3.34 3.569 3.687 3.916 4.134 4.332 4.422 4.589 4.748 4.981 5.135 5.292 5.507 5.709 5.901 6.079 6.252 6.465 6.687 6.903 7.145 7.382 7.619 7.902 8.2 8.482 8.79 9.109 9.453 9.808 10.188 10.604 11.031 11.51 11.987 12.524 13.113 13.742 14.361 14.795 14.743 14.381 13.943 13.514 13.054 12.603 12.182 11.799 11.392 11.039 10.708 10.363 10.012 9.699 9.415 9.095 8.806 8.559 8.309 8.069 7.856 7.613 7.371 7.183 6.997 6.819 6.621 6.419 6.274 6.115 5.876 5.71 5.55 5.472 5.298 5.115 4.909 4.792 4.574 4.415 4.281 4.144 3.855 3.701 3.517 3.311 3.092 2.824 2.43 1.261 -9 ,24643 ,KEBNE ,17041278,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:23:46 CET,0.0 0.432 0.735 0.986 1.223 1.425 1.588 1.741 2.025 2.165 2.3 2.435 2.646 2.761 2.973 3.167 3.348 3.434 3.598 3.756 3.976 4.11 4.249 4.465 4.671 4.866 5.05 5.226 5.462 5.683 5.875 6.104 6.325 6.544 6.808 7.124 7.43 7.752 8.098 8.458 8.831 9.254 9.746 10.237 10.762 11.305 11.908 12.536 13.192 13.841 14.37 14.451 14.178 13.752 13.321 12.919 12.537 12.149 11.772 11.388 11.062 10.753 10.43 10.112 9.808 9.518 9.206 8.93 8.701 8.467 8.221 8.025 7.819 7.602 7.44 7.266 7.09 6.909 6.715 6.571 6.418 6.188 6.027 5.856 5.764 5.577 5.367 5.15 5.051 4.844 4.698 4.577 4.459 4.198 4.034 3.83 3.616 3.402 3.154 2.859 2.059 -10 ,5214 ,KEBNE ,17041279,Thu Dec 23 03:00:07 CET,Thu Dec 23 04:18:53 CET,0.0 0.866 1.323 1.637 1.863 2.062 2.247 2.427 2.749 2.874 2.987 3.118 3.325 3.43 3.63 3.815 4.003 4.099 4.282 4.446 4.673 4.819 4.954 5.154 5.346 5.532 5.711 5.884 6.102 6.314 6.523 6.778 7.018 7.24 7.504 7.805 8.079 8.382 8.72 9.081 9.449 9.858 10.318 10.764 11.27 11.791 12.369 13.002 13.668 14.268 14.689 14.668 14.395 14.037 13.628 13.169 12.705 12.263 11.872 11.47 11.104 10.779 10.452 10.13 9.85 9.589 9.291 9.033 8.807 8.568 8.318 8.103 7.882 7.639 7.444 7.246 7.044 6.832 6.59 6.419 6.252 5.987 5.795 5.613 5.52 5.313 5.095 4.862 4.73 4.501 4.331 4.18 4.027 3.705 3.515 3.29 3.048 2.782 2.435 2.018 0.473 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 33c3d592..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11139 ,KEBNE ,17041280,Thu Dec 23 03:00:06 CET,Thu Dec 23 04:17:39 CET,0.0 0.507 0.686 0.823 0.951 1.084 1.21 1.323 1.519 1.614 1.71 1.749 1.951 2.031 2.187 2.323 2.456 2.521 2.662 2.8 2.988 3.103 3.209 3.367 3.529 3.692 3.844 3.987 4.176 4.357 4.519 4.713 4.898 5.061 5.239 5.448 5.664 5.901 6.141 6.377 6.602 6.839 7.109 7.366 7.648 7.911 8.127 8.294 8.416 8.397 7.982 7.146 6.288 5.506 4.785 4.093 3.46 2.859 2.331 1.795 1.322 0.914 0.51 0.115 -0.243 -0.568 -0.907 -1.208 -1.465 -1.734 -2.007 -2.228 -2.458 -2.707 -2.902 -3.101 -3.302 -3.517 -3.748 -3.912 -4.093 -4.369 -4.558 -4.765 -4.866 -5.07 -5.298 -5.542 -5.667 -5.923 -6.067 -6.207 -6.341 -6.632 -6.801 -7.0 -7.236 -7.486 -7.795 -8.194 -9.389 -2 ,8082 ,KEBNE ,17041281,Thu Dec 23 03:00:07 CET,Thu Dec 23 04:17:41 CET,0.0 0.529 0.868 1.087 1.267 1.421 1.562 1.698 1.926 2.03 2.129 2.198 2.415 2.507 2.689 2.857 3.012 3.081 3.207 3.339 3.552 3.681 3.797 3.959 4.114 4.273 4.419 4.551 4.729 4.901 5.056 5.241 5.432 5.599 5.786 5.994 6.187 6.397 6.618 6.846 7.078 7.347 7.638 7.897 8.191 8.47 8.743 9.028 9.237 9.225 8.793 7.925 7.006 6.147 5.376 4.646 4.026 3.484 2.984 2.467 2.016 1.616 1.23 0.853 0.515 0.217 -0.1 -0.394 -0.649 -0.911 -1.193 -1.422 -1.654 -1.914 -2.125 -2.332 -2.538 -2.77 -3.017 -3.175 -3.333 -3.585 -3.76 -3.949 -4.047 -4.243 -4.456 -4.698 -4.833 -5.101 -5.257 -5.41 -5.575 -5.938 -6.141 -6.372 -6.621 -6.913 -7.237 -7.639 -9.196 -3 ,6223 ,KEBNE ,17041282,Thu Dec 23 03:00:06 CET,Thu Dec 23 04:17:19 CET,0.0 0.448 0.684 0.866 0.999 1.137 1.265 1.377 1.588 1.684 1.78 1.827 2.041 2.121 2.256 2.389 2.523 2.585 2.705 2.827 3.0 3.108 3.224 3.394 3.548 3.699 3.839 3.982 4.186 4.374 4.53 4.709 4.896 5.07 5.256 5.458 5.649 5.871 6.108 6.343 6.582 6.808 7.044 7.281 7.541 7.814 8.098 8.353 8.505 8.448 8.002 7.206 6.376 5.54 4.777 4.094 3.469 2.899 2.42 1.926 1.477 1.062 0.661 0.285 -0.065 -0.386 -0.708 -0.999 -1.255 -1.523 -1.8 -2.025 -2.265 -2.521 -2.718 -2.914 -3.117 -3.326 -3.55 -3.722 -3.89 -4.138 -4.311 -4.492 -4.59 -4.796 -5.003 -5.216 -5.334 -5.582 -5.676 -5.801 -5.947 -6.285 -6.475 -6.662 -6.861 -7.092 -7.347 -7.694 -9.04 -4 ,10208 ,KEBNE ,17041283,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:23:37 CET,0.0 0.345 0.524 0.706 0.874 1.004 1.112 1.219 1.411 1.499 1.586 1.63 1.845 1.937 2.117 2.282 2.438 2.517 2.663 2.796 2.996 3.124 3.246 3.425 3.589 3.739 3.876 4.011 4.202 4.39 4.561 4.74 4.905 5.085 5.295 5.532 5.755 5.961 6.176 6.418 6.646 6.886 7.187 7.453 7.716 7.99 8.238 8.483 8.655 8.587 8.105 7.214 6.336 5.515 4.777 4.127 3.563 3.007 2.496 1.997 1.558 1.163 0.785 0.417 0.084 -0.231 -0.574 -0.884 -1.155 -1.426 -1.71 -1.946 -2.188 -2.444 -2.64 -2.85 -3.066 -3.29 -3.529 -3.688 -3.853 -4.127 -4.311 -4.497 -4.596 -4.801 -5.028 -5.266 -5.383 -5.637 -5.748 -5.875 -6.014 -6.313 -6.465 -6.643 -6.848 -7.073 -7.374 -7.766 -8.765 -5 ,31033 ,KEBNE ,17041284,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:22:20 CET,0.0 0.702 0.92 1.084 1.208 1.323 1.439 1.545 1.732 1.815 1.903 1.943 2.152 2.241 2.413 2.576 2.735 2.809 2.951 3.084 3.278 3.4 3.517 3.687 3.85 4.007 4.153 4.304 4.501 4.677 4.843 5.036 5.209 5.378 5.572 5.791 6.003 6.211 6.43 6.647 6.853 7.091 7.349 7.587 7.833 8.089 8.375 8.608 8.722 8.655 8.237 7.357 6.46 5.668 4.936 4.243 3.603 3.025 2.546 2.06 1.632 1.257 0.895 0.531 0.181 -0.129 -0.433 -0.719 -0.975 -1.24 -1.518 -1.729 -1.947 -2.189 -2.39 -2.604 -2.817 -3.033 -3.265 -3.427 -3.591 -3.842 -4.027 -4.208 -4.3 -4.502 -4.702 -4.924 -5.038 -5.28 -5.416 -5.554 -5.691 -5.985 -6.153 -6.33 -6.532 -6.782 -7.091 -7.502 -8.483 -6 ,27919 ,KEBNE ,17041285,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:21:51 CET,0.0 0.711 1.032 1.262 1.424 1.572 1.724 1.861 2.088 2.195 2.302 2.387 2.608 2.7 2.864 3.017 3.166 3.243 3.392 3.522 3.694 3.803 3.911 4.078 4.247 4.405 4.542 4.675 4.855 5.022 5.18 5.372 5.553 5.728 5.935 6.157 6.369 6.598 6.818 7.058 7.332 7.601 7.894 8.182 8.471 8.761 9.063 9.347 9.52 9.485 9.116 8.29 7.363 6.524 5.79 5.073 4.405 3.806 3.295 2.786 2.341 1.928 1.534 1.17 0.83 0.501 0.152 -0.152 -0.415 -0.687 -0.963 -1.199 -1.45 -1.707 -1.905 -2.109 -2.323 -2.541 -2.764 -2.919 -3.085 -3.356 -3.554 -3.77 -3.882 -4.102 -4.332 -4.585 -4.699 -4.937 -5.05 -5.174 -5.309 -5.581 -5.733 -5.913 -6.114 -6.342 -6.623 -6.966 -8.114 -7 ,32703 ,KEBNE ,17041286,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:23:30 CET,0.0 0.503 0.749 0.926 1.097 1.259 1.402 1.532 1.783 1.91 2.034 2.131 2.35 2.439 2.606 2.756 2.897 2.973 3.125 3.263 3.441 3.557 3.678 3.853 4.012 4.156 4.305 4.445 4.621 4.797 4.969 5.167 5.344 5.51 5.71 5.937 6.143 6.348 6.563 6.804 7.057 7.325 7.63 7.93 8.254 8.564 8.84 9.078 9.221 9.108 8.572 7.689 6.771 5.913 5.175 4.474 3.777 3.147 2.644 2.116 1.634 1.219 0.83 0.464 0.133 -0.183 -0.529 -0.844 -1.099 -1.358 -1.63 -1.844 -2.082 -2.324 -2.508 -2.709 -2.903 -3.097 -3.312 -3.467 -3.619 -3.862 -4.03 -4.203 -4.299 -4.496 -4.699 -4.917 -5.028 -5.276 -5.379 -5.497 -5.636 -5.931 -6.074 -6.227 -6.399 -6.592 -6.846 -7.24 -8.694 -8 ,19167 ,KEBNE ,17041287,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:21:44 CET,0.0 0.725 1.006 1.231 1.429 1.586 1.729 1.863 2.097 2.217 2.341 2.437 2.659 2.751 2.93 3.09 3.245 3.32 3.455 3.581 3.761 3.873 3.983 4.154 4.321 4.477 4.62 4.748 4.923 5.106 5.279 5.488 5.685 5.866 6.063 6.286 6.511 6.726 6.93 7.166 7.401 7.649 7.931 8.172 8.426 8.682 8.925 9.139 9.279 9.245 8.786 7.865 6.934 6.057 5.24 4.499 3.866 3.265 2.755 2.246 1.794 1.397 1.019 0.662 0.315 -0.003 -0.326 -0.614 -0.861 -1.121 -1.406 -1.647 -1.893 -2.141 -2.333 -2.527 -2.731 -2.957 -3.183 -3.343 -3.511 -3.76 -3.939 -4.131 -4.236 -4.456 -4.688 -4.938 -5.063 -5.318 -5.47 -5.62 -5.779 -6.142 -6.342 -6.557 -6.799 -7.077 -7.398 -7.799 -9.519 -9 ,29114 ,KEBNE ,17041288,Thu Dec 23 03:00:02 CET,Thu Dec 23 04:23:13 CET,0.0 0.795 1.061 1.279 1.495 1.69 1.854 1.997 2.268 2.391 2.494 2.563 2.79 2.893 3.082 3.249 3.403 3.477 3.625 3.766 3.965 4.099 4.228 4.388 4.543 4.704 4.855 4.991 5.164 5.328 5.472 5.649 5.832 5.996 6.179 6.4 6.62 6.854 7.112 7.381 7.619 7.851 8.135 8.408 8.672 8.936 9.161 9.321 9.411 9.409 9.014 8.025 7.096 6.252 5.449 4.7 4.064 3.496 3.004 2.483 2.028 1.649 1.288 0.93 0.592 0.28 -0.055 -0.37 -0.637 -0.898 -1.175 -1.41 -1.663 -1.922 -2.114 -2.323 -2.544 -2.756 -2.967 -3.121 -3.292 -3.573 -3.761 -3.947 -4.044 -4.247 -4.467 -4.7 -4.822 -5.076 -5.227 -5.387 -5.553 -5.925 -6.14 -6.364 -6.598 -6.868 -7.208 -7.624 -9.213 -10 ,30713 ,KEBNE ,17041289,Thu Dec 23 03:00:04 CET,Thu Dec 23 04:21:48 CET,0.0 0.538 0.806 1.038 1.249 1.428 1.593 1.74 1.992 2.112 2.218 2.265 2.471 2.556 2.729 2.897 3.043 3.111 3.261 3.402 3.592 3.715 3.836 3.997 4.157 4.315 4.469 4.619 4.798 4.961 5.119 5.301 5.469 5.635 5.828 6.033 6.244 6.474 6.692 6.915 7.156 7.418 7.7 7.965 8.255 8.539 8.82 9.063 9.206 9.132 8.696 7.876 6.995 6.168 5.426 4.742 4.127 3.57 3.074 2.584 2.16 1.754 1.358 0.984 0.65 0.361 0.024 -0.3 -0.558 -0.826 -1.1 -1.326 -1.561 -1.805 -1.995 -2.188 -2.413 -2.649 -2.881 -3.047 -3.22 -3.49 -3.686 -3.894 -4.002 -4.228 -4.459 -4.696 -4.824 -5.089 -5.249 -5.391 -5.533 -5.827 -6.002 -6.205 -6.411 -6.669 -6.989 -7.361 -8.521 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 0475d497..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16996 ,KEBNE ,17041290,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:23:51 CET,0.0 0.25 0.462 0.651 0.819 0.98 1.121 1.254 1.498 1.616 1.733 1.821 2.055 2.16 2.376 2.58 2.765 2.866 3.072 3.272 3.563 3.743 3.925 4.208 4.486 4.746 5.006 5.27 5.599 5.905 6.195 6.555 6.914 7.256 7.673 8.143 8.588 9.101 9.663 10.26 10.893 11.623 12.485 13.376 14.442 15.646 17.052 18.669 20.634 23.015 25.887 28.31 29.822 30.824 31.489 31.954 32.267 32.483 32.631 32.756 32.832 32.879 32.908 32.922 32.926 32.9 32.868 32.835 32.791 32.736 32.676 32.624 32.564 32.5 32.44 32.374 32.322 32.244 32.135 32.07 32.003 31.9 31.829 31.752 31.71 31.622 31.54 31.457 31.41 31.274 31.264 31.199 31.135 31.023 30.958 30.885 30.793 30.67 30.543 30.398 30.148 -2 ,24243 ,KEBNE ,17041291,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:22:26 CET,0.0 0.434 0.659 0.839 1.001 1.172 1.336 1.47 1.711 1.838 1.959 2.042 2.28 2.389 2.596 2.81 3.017 3.117 3.317 3.52 3.816 4.009 4.195 4.465 4.733 4.995 5.249 5.495 5.805 6.1 6.386 6.752 7.123 7.482 7.901 8.388 8.852 9.355 9.904 10.514 11.172 11.902 12.764 13.634 14.64 15.788 17.146 18.754 20.706 23.031 25.961 28.46 29.936 30.89 31.516 31.933 32.223 32.464 32.643 32.779 32.867 32.916 32.93 32.917 32.897 32.883 32.875 32.849 32.797 32.739 32.688 32.641 32.585 32.521 32.465 32.401 32.338 32.273 32.192 32.137 32.079 31.976 31.9 31.818 31.781 31.693 31.594 31.484 31.426 31.283 31.266 31.206 31.149 31.029 30.953 30.884 30.823 30.753 30.661 30.539 30.306 -3 ,12006 ,KEBNE ,17041292,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:24:15 CET,0.0 0.961 1.246 1.475 1.696 1.899 2.089 2.257 2.56 2.7 2.831 2.958 3.199 3.327 3.579 3.808 4.031 4.138 4.352 4.564 4.863 5.052 5.244 5.517 5.775 6.039 6.295 6.545 6.875 7.194 7.499 7.867 8.23 8.579 8.983 9.45 9.911 10.417 10.966 11.583 12.246 12.974 13.807 14.654 15.691 16.92 18.341 19.968 21.901 24.2 27.122 29.634 31.158 32.127 32.747 33.204 33.553 33.796 33.946 34.059 34.129 34.177 34.197 34.2 34.195 34.185 34.175 34.146 34.113 34.07 34.011 33.953 33.892 33.836 33.786 33.718 33.65 33.577 33.502 33.451 33.397 33.322 33.273 33.219 33.191 33.131 33.058 32.981 32.944 32.806 32.784 32.724 32.675 32.575 32.509 32.436 32.358 32.251 32.144 31.998 31.53 -4 ,11552 ,KEBNE ,17041293,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:23:45 CET,0.0 0.415 0.663 0.898 1.104 1.298 1.505 1.687 1.991 2.133 2.277 2.443 2.705 2.829 3.065 3.293 3.514 3.621 3.83 4.031 4.326 4.517 4.698 4.979 5.26 5.524 5.779 6.032 6.363 6.674 6.965 7.33 7.698 8.055 8.474 8.945 9.404 9.916 10.454 11.028 11.664 12.417 13.306 14.192 15.222 16.398 17.781 19.361 21.283 23.623 26.56 29.061 30.513 31.445 32.102 32.576 32.886 33.106 33.234 33.339 33.426 33.477 33.493 33.494 33.496 33.485 33.447 33.398 33.355 33.307 33.242 33.178 33.118 33.059 33.008 32.952 32.884 32.817 32.753 32.697 32.631 32.547 32.488 32.412 32.369 32.275 32.17 32.057 32.001 31.854 31.799 31.724 31.65 31.46 31.34 31.196 31.046 30.889 30.698 30.459 29.83 -5 ,14138 ,KEBNE ,17041294,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:23:45 CET,0.0 0.324 0.599 0.82 1.017 1.217 1.424 1.614 1.931 2.074 2.211 2.343 2.599 2.727 2.964 3.189 3.414 3.527 3.757 3.967 4.254 4.443 4.631 4.907 5.174 5.433 5.682 5.929 6.255 6.575 6.889 7.271 7.631 7.984 8.408 8.883 9.336 9.831 10.371 10.968 11.622 12.372 13.237 14.116 15.161 16.347 17.724 19.326 21.289 23.637 26.543 29.03 30.519 31.522 32.179 32.632 32.962 33.191 33.339 33.448 33.531 33.585 33.607 33.613 33.602 33.588 33.559 33.529 33.504 33.455 33.395 33.341 33.276 33.216 33.162 33.097 33.029 32.954 32.876 32.823 32.761 32.662 32.594 32.512 32.468 32.382 32.291 32.18 32.119 31.968 31.926 31.853 31.769 31.577 31.481 31.371 31.239 31.104 30.908 30.63 30.243 -6 ,24402 ,KEBNE ,17041295,Thu Dec 23 03:00:04 CET,Thu Dec 23 04:24:29 CET,0.0 0.74 1.045 1.307 1.512 1.715 1.908 2.071 2.388 2.54 2.681 2.829 3.092 3.229 3.469 3.7 3.934 4.048 4.268 4.48 4.777 4.961 5.152 5.444 5.715 5.981 6.234 6.476 6.795 7.102 7.398 7.764 8.127 8.481 8.883 9.34 9.808 10.321 10.878 11.487 12.13 12.861 13.715 14.561 15.558 16.72 18.111 19.694 21.586 23.958 26.986 29.57 31.098 32.054 32.697 33.186 33.512 33.739 33.865 33.951 34.033 34.091 34.12 34.117 34.11 34.106 34.078 34.028 33.973 33.918 33.854 33.796 33.744 33.684 33.626 33.562 33.495 33.425 33.344 33.281 33.209 33.084 32.997 32.921 32.879 32.784 32.683 32.567 32.504 32.351 32.309 32.244 32.176 32.013 31.903 31.776 31.651 31.459 31.2 30.857 29.748 -7 ,10814 ,KEBNE ,17041296,Thu Dec 23 03:00:04 CET,Thu Dec 23 04:22:35 CET,0.0 0.668 1.022 1.269 1.483 1.682 1.869 2.045 2.387 2.537 2.673 2.816 3.066 3.181 3.409 3.635 3.858 3.963 4.165 4.36 4.637 4.824 5.021 5.305 5.572 5.831 6.08 6.33 6.661 6.985 7.3 7.671 8.032 8.38 8.787 9.25 9.692 10.201 10.76 11.339 11.966 12.704 13.567 14.446 15.499 16.698 18.113 19.757 21.69 24.007 26.9 29.432 30.962 31.946 32.59 32.994 33.27 33.484 33.64 33.74 33.787 33.822 33.839 33.849 33.847 33.835 33.798 33.748 33.71 33.663 33.592 33.529 33.466 33.397 33.342 33.283 33.216 33.142 33.054 32.996 32.943 32.857 32.805 32.748 32.716 32.647 32.582 32.516 32.479 32.346 32.344 32.296 32.246 32.115 32.05 31.99 31.912 31.813 31.689 31.539 31.234 -8 ,5161 ,KEBNE ,17041297,Thu Dec 23 03:00:04 CET,Thu Dec 23 04:22:51 CET,0.0 0.748 0.992 1.182 1.347 1.498 1.635 1.77 2.053 2.184 2.311 2.463 2.728 2.857 3.088 3.308 3.543 3.664 3.897 4.111 4.402 4.582 4.767 5.043 5.3 5.562 5.825 6.073 6.391 6.696 6.998 7.377 7.74 8.093 8.507 8.969 9.415 9.914 10.465 11.056 11.679 12.389 13.227 14.095 15.138 16.336 17.775 19.451 21.376 23.689 26.693 29.312 30.855 31.829 32.531 32.996 33.287 33.514 33.665 33.762 33.819 33.84 33.851 33.856 33.848 33.836 33.79 33.735 33.691 33.638 33.584 33.531 33.461 33.386 33.338 33.29 33.238 33.18 33.125 33.097 33.051 32.973 32.929 32.873 32.846 32.795 32.723 32.639 32.595 32.452 32.449 32.4 32.343 32.214 32.143 32.074 32.006 31.911 31.789 31.633 31.233 -9 ,13953 ,KEBNE ,17041299,Thu Dec 23 03:00:03 CET,Thu Dec 23 04:22:37 CET,0.0 0.455 0.73 0.974 1.197 1.409 1.601 1.773 2.07 2.219 2.362 2.507 2.759 2.883 3.135 3.371 3.586 3.69 3.9 4.104 4.411 4.605 4.781 5.043 5.312 5.578 5.827 6.065 6.382 6.694 6.998 7.373 7.735 8.076 8.478 8.96 9.432 9.948 10.509 11.121 11.757 12.467 13.316 14.225 15.293 16.48 17.892 19.483 21.403 23.695 26.581 29.114 30.613 31.593 32.247 32.704 33.031 33.263 33.41 33.535 33.611 33.647 33.67 33.668 33.654 33.622 33.572 33.526 33.482 33.436 33.394 33.349 33.283 33.21 33.151 33.081 33.01 32.936 32.862 32.811 32.755 32.662 32.596 32.513 32.47 32.389 32.305 32.203 32.134 31.973 31.928 31.856 31.774 31.574 31.468 31.36 31.214 31.036 30.834 30.566 29.851 -10 ,1602 ,KEBNE ,17041300,Thu Dec 23 03:00:02 CET,Thu Dec 23 04:22:14 CET,0.0 0.446 0.662 0.835 0.998 1.152 1.299 1.437 1.696 1.82 1.942 2.045 2.276 2.387 2.607 2.824 3.043 3.149 3.356 3.556 3.855 4.055 4.245 4.52 4.778 5.027 5.265 5.498 5.797 6.089 6.387 6.75 7.109 7.462 7.873 8.332 8.795 9.319 9.874 10.47 11.095 11.811 12.67 13.542 14.564 15.739 17.154 18.788 20.73 23.074 25.968 28.433 29.968 30.975 31.631 32.096 32.421 32.65 32.789 32.883 32.943 32.988 33.027 33.041 33.024 33.004 32.983 32.958 32.928 32.885 32.839 32.792 32.739 32.684 32.631 32.567 32.496 32.419 32.337 32.287 32.239 32.154 32.1 32.051 32.022 31.943 31.855 31.782 31.747 31.615 31.617 31.568 31.519 31.411 31.345 31.276 31.198 31.112 31.02 30.885 30.582 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt deleted file mode 100644 index bee146bf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32215 ,KEBNE ,17041301,Thu Dec 23 03:03:07 CET,Thu Dec 23 04:25:08 CET,0.0 0.317 0.516 0.672 0.811 0.927 1.03 1.132 1.304 1.374 1.445 1.454 1.641 1.707 1.842 1.981 2.12 2.187 2.317 2.442 2.616 2.727 2.831 2.978 3.122 3.26 3.386 3.508 3.657 3.795 3.94 4.113 4.275 4.429 4.594 4.765 4.933 5.118 5.304 5.494 5.681 5.879 6.099 6.293 6.469 6.62 6.761 6.803 6.706 6.382 5.517 4.23 2.984 1.843 0.829 -0.102 -0.898 -1.61 -2.23 -2.871 -3.431 -3.895 -4.334 -4.765 -5.147 -5.487 -5.851 -6.179 -6.465 -6.76 -7.058 -7.304 -7.567 -7.83 -8.031 -8.233 -8.439 -8.663 -8.885 -9.046 -9.218 -9.471 -9.647 -9.828 -9.923 -10.115 -10.31 -10.53 -10.642 -10.892 -11.011 -11.14 -11.268 -11.575 -11.774 -11.971 -12.147 -12.325 -12.528 -12.787 -13.208 -2 ,1539 ,KEBNE ,17041302,Thu Dec 23 03:03:08 CET,Thu Dec 23 04:27:22 CET,0.0 0.389 0.628 0.798 0.951 1.098 1.235 1.357 1.576 1.673 1.765 1.809 2.016 2.096 2.25 2.405 2.556 2.626 2.757 2.881 3.066 3.179 3.276 3.417 3.551 3.68 3.817 3.953 4.118 4.256 4.394 4.574 4.724 4.855 5.008 5.2 5.382 5.565 5.753 5.943 6.134 6.357 6.595 6.783 6.974 7.142 7.257 7.288 7.185 6.795 5.752 4.197 2.875 1.752 0.795 -0.078 -0.869 -1.604 -2.24 -2.863 -3.412 -3.888 -4.325 -4.746 -5.121 -5.459 -5.823 -6.153 -6.43 -6.708 -6.996 -7.237 -7.497 -7.779 -7.997 -8.216 -8.447 -8.673 -8.893 -9.051 -9.221 -9.474 -9.647 -9.836 -9.934 -10.128 -10.33 -10.556 -10.679 -10.947 -11.044 -11.169 -11.304 -11.557 -11.692 -11.838 -11.985 -12.149 -12.365 -12.59 -12.963 -3 ,15476 ,KEBNE ,17041303,Thu Dec 23 03:03:08 CET,Thu Dec 23 04:25:18 CET,0.0 0.86 1.189 1.417 1.611 1.781 1.913 2.033 2.266 2.377 2.484 2.556 2.774 2.863 3.023 3.166 3.297 3.362 3.49 3.615 3.808 3.925 4.027 4.175 4.324 4.476 4.611 4.727 4.877 5.022 5.162 5.328 5.485 5.632 5.796 5.984 6.175 6.377 6.561 6.734 6.916 7.114 7.32 7.498 7.662 7.81 7.943 7.99 7.897 7.529 6.627 5.349 4.149 3.002 1.983 1.105 0.328 -0.405 -1.027 -1.637 -2.183 -2.672 -3.103 -3.507 -3.886 -4.239 -4.612 -4.932 -5.201 -5.482 -5.782 -6.029 -6.277 -6.532 -6.734 -6.946 -7.168 -7.392 -7.626 -7.786 -7.947 -8.195 -8.368 -8.545 -8.635 -8.822 -9.023 -9.239 -9.35 -9.602 -9.707 -9.834 -9.959 -10.215 -10.359 -10.535 -10.74 -10.956 -11.202 -11.466 -12.156 -4 ,25764 ,KEBNE ,17041304,Thu Dec 23 03:03:08 CET,Thu Dec 23 04:25:13 CET,0.0 0.403 0.615 0.761 0.875 0.975 1.068 1.178 1.384 1.458 1.531 1.57 1.769 1.835 1.972 2.108 2.247 2.315 2.443 2.565 2.74 2.845 2.948 3.092 3.227 3.362 3.492 3.607 3.758 3.917 4.066 4.248 4.417 4.562 4.721 4.905 5.071 5.237 5.411 5.592 5.787 5.986 6.189 6.389 6.595 6.776 6.929 6.962 6.853 6.491 5.543 4.136 2.849 1.69 0.699 -0.204 -1.019 -1.757 -2.379 -2.986 -3.518 -3.981 -4.421 -4.836 -5.23 -5.597 -5.956 -6.271 -6.548 -6.829 -7.121 -7.377 -7.643 -7.908 -8.117 -8.324 -8.527 -8.743 -8.979 -9.145 -9.315 -9.578 -9.763 -9.96 -10.057 -10.246 -10.444 -10.652 -10.764 -11.025 -11.151 -11.285 -11.41 -11.653 -11.792 -11.954 -12.135 -12.339 -12.579 -12.899 -13.984 -5 ,1286 ,KEBNE ,17041305,Thu Dec 23 03:03:08 CET,Thu Dec 23 04:25:03 CET,0.0 0.401 0.588 0.741 0.879 1.012 1.14 1.251 1.449 1.545 1.641 1.682 1.892 1.984 2.142 2.29 2.43 2.494 2.616 2.73 2.894 3.001 3.105 3.256 3.399 3.535 3.663 3.78 3.937 4.1 4.258 4.437 4.596 4.744 4.898 5.056 5.217 5.395 5.582 5.784 5.986 6.202 6.423 6.622 6.816 6.975 7.116 7.162 7.047 6.711 5.808 4.44 3.224 2.063 1.021 0.124 -0.675 -1.387 -1.992 -2.631 -3.196 -3.675 -4.121 -4.531 -4.907 -5.247 -5.595 -5.919 -6.199 -6.484 -6.783 -7.029 -7.276 -7.528 -7.724 -7.932 -8.156 -8.378 -8.59 -8.737 -8.894 -9.148 -9.323 -9.508 -9.604 -9.787 -9.967 -10.184 -10.305 -10.559 -10.648 -10.762 -10.889 -11.171 -11.318 -11.465 -11.617 -11.79 -11.968 -12.168 -12.66 -6 ,11424 ,KEBNE ,17041306,Thu Dec 23 03:03:07 CET,Thu Dec 23 04:25:20 CET,0.0 0.604 0.897 1.133 1.307 1.47 1.619 1.761 2.032 2.147 2.249 2.302 2.524 2.615 2.785 2.948 3.082 3.145 3.28 3.421 3.613 3.722 3.833 3.995 4.143 4.281 4.408 4.531 4.697 4.858 5.008 5.188 5.338 5.474 5.647 5.832 6.008 6.208 6.408 6.592 6.78 6.99 7.222 7.422 7.618 7.777 7.87 7.896 7.787 7.447 6.579 5.251 4.011 2.893 1.87 0.963 0.196 -0.508 -1.115 -1.727 -2.267 -2.754 -3.208 -3.62 -3.992 -4.319 -4.66 -4.979 -5.256 -5.54 -5.81 -6.039 -6.291 -6.555 -6.766 -6.983 -7.199 -7.415 -7.644 -7.808 -7.977 -8.237 -8.411 -8.591 -8.689 -8.886 -9.087 -9.299 -9.402 -9.653 -9.755 -9.868 -9.993 -10.286 -10.436 -10.59 -10.77 -10.999 -11.333 -11.773 -12.716 -7 ,28993 ,KEBNE ,17041307,Thu Dec 23 03:03:08 CET,Thu Dec 23 04:25:09 CET,0.0 0.608 0.804 0.955 1.079 1.186 1.284 1.372 1.54 1.618 1.691 1.713 1.911 1.983 2.129 2.258 2.389 2.457 2.581 2.708 2.878 2.978 3.083 3.238 3.38 3.511 3.631 3.742 3.894 4.038 4.175 4.344 4.509 4.669 4.845 5.025 5.191 5.366 5.552 5.736 5.901 6.083 6.31 6.539 6.712 6.856 7.027 7.13 7.094 6.81 5.999 4.645 3.301 2.123 1.086 0.167 -0.613 -1.341 -1.968 -2.584 -3.109 -3.587 -4.045 -4.482 -4.87 -5.212 -5.565 -5.868 -6.12 -6.38 -6.66 -6.899 -7.15 -7.403 -7.6 -7.802 -8.009 -8.235 -8.459 -8.608 -8.765 -9.037 -9.225 -9.407 -9.504 -9.711 -9.911 -10.114 -10.221 -10.466 -10.581 -10.721 -10.858 -11.147 -11.294 -11.432 -11.575 -11.727 -11.908 -12.148 -12.701 -8 ,11515 ,KEBNE ,17041308,Thu Dec 23 03:03:08 CET,Thu Dec 23 04:25:12 CET,0.0 0.554 0.813 1.025 1.202 1.361 1.512 1.64 1.848 1.951 2.064 2.143 2.356 2.442 2.597 2.741 2.887 2.956 3.073 3.183 3.35 3.454 3.559 3.714 3.856 3.993 4.125 4.249 4.406 4.559 4.712 4.893 5.05 5.2 5.372 5.556 5.732 5.916 6.105 6.311 6.518 6.74 6.949 7.116 7.283 7.447 7.586 7.626 7.574 7.281 6.333 4.907 3.611 2.457 1.459 0.55 -0.237 -0.937 -1.555 -2.17 -2.688 -3.151 -3.591 -3.988 -4.36 -4.711 -5.073 -5.387 -5.65 -5.926 -6.217 -6.464 -6.731 -6.996 -7.193 -7.392 -7.6 -7.807 -8.01 -8.15 -8.296 -8.532 -8.695 -8.853 -8.929 -9.084 -9.248 -9.42 -9.509 -9.736 -9.79 -9.898 -10.009 -10.236 -10.35 -10.478 -10.629 -10.789 -10.964 -11.158 -11.581 -9 ,1260 ,KEBNE ,17041309,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:31:27 CET,0.0 0.68 0.96 1.186 1.361 1.525 1.671 1.805 2.065 2.193 2.297 2.336 2.542 2.635 2.808 2.961 3.105 3.174 3.303 3.422 3.581 3.685 3.788 3.936 4.084 4.219 4.341 4.466 4.617 4.754 4.898 5.076 5.249 5.4 5.563 5.768 5.96 6.14 6.322 6.5 6.682 6.896 7.137 7.313 7.489 7.672 7.843 7.955 7.885 7.545 6.652 5.305 4.037 2.886 1.883 0.987 0.179 -0.537 -1.15 -1.754 -2.26 -2.73 -3.18 -3.604 -3.995 -4.343 -4.698 -5.009 -5.283 -5.567 -5.862 -6.108 -6.361 -6.621 -6.816 -7.021 -7.248 -7.47 -7.684 -7.828 -7.974 -8.191 -8.334 -8.494 -8.582 -8.77 -8.958 -9.148 -9.238 -9.466 -9.54 -9.651 -9.77 -10.032 -10.165 -10.294 -10.418 -10.557 -10.724 -10.908 -11.293 -10 ,25087 ,KEBNE ,17041310,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:32:57 CET,0.0 0.589 0.796 0.929 1.055 1.175 1.284 1.374 1.541 1.635 1.727 1.749 1.94 2.002 2.123 2.247 2.367 2.418 2.526 2.64 2.813 2.923 3.024 3.175 3.324 3.459 3.596 3.728 3.885 4.043 4.197 4.367 4.523 4.674 4.845 5.027 5.21 5.396 5.574 5.767 5.954 6.157 6.375 6.545 6.72 6.913 7.071 7.136 7.077 6.763 5.888 4.502 3.258 2.147 1.129 0.218 -0.564 -1.252 -1.833 -2.45 -2.988 -3.463 -3.904 -4.313 -4.706 -5.065 -5.421 -5.745 -6.028 -6.303 -6.597 -6.838 -7.093 -7.373 -7.59 -7.807 -8.031 -8.256 -8.486 -8.65 -8.811 -9.059 -9.234 -9.418 -9.511 -9.7 -9.897 -10.104 -10.218 -10.466 -10.552 -10.676 -10.801 -11.083 -11.253 -11.423 -11.587 -11.776 -11.978 -12.206 -12.672 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt deleted file mode 100644 index e72358f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28202 ,KEBNE ,17041313,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:32:03 CET,0.0 0.421 0.659 0.878 1.076 1.252 1.415 1.573 1.878 2.013 2.142 2.291 2.549 2.676 2.924 3.154 3.374 3.489 3.731 3.963 4.302 4.527 4.749 5.083 5.408 5.736 6.065 6.38 6.792 7.2 7.596 8.067 8.534 9.015 9.584 10.218 10.849 11.557 12.328 13.159 14.05 15.084 16.328 17.63 19.206 21.016 23.203 25.793 28.907 32.82 37.913 42.458 45.489 47.644 49.134 50.24 51.081 51.74 52.24 52.668 52.966 53.224 53.473 53.665 53.826 53.948 54.032 54.104 54.161 54.203 54.242 54.265 54.264 54.255 54.253 54.242 54.218 54.188 54.163 54.148 54.13 54.073 54.021 53.979 53.953 53.889 53.82 53.736 53.697 53.588 53.54 53.467 53.382 53.193 53.078 52.939 52.811 52.677 52.518 52.226 51.383 -2 ,27978 ,KEBNE ,17041314,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:31:07 CET,0.0 0.628 0.886 1.072 1.264 1.451 1.625 1.793 2.106 2.258 2.402 2.576 2.858 3.009 3.3 3.581 3.858 3.995 4.271 4.531 4.896 5.139 5.375 5.73 6.071 6.398 6.712 7.014 7.41 7.805 8.2 8.683 9.159 9.629 10.182 10.813 11.426 12.122 12.888 13.715 14.619 15.667 16.923 18.217 19.779 21.595 23.764 26.328 29.507 33.5 38.664 43.243 46.124 48.133 49.624 50.788 51.682 52.385 52.893 53.315 53.636 53.891 54.118 54.292 54.424 54.546 54.655 54.731 54.788 54.834 54.867 54.899 54.925 54.925 54.919 54.909 54.898 54.887 54.858 54.822 54.776 54.715 54.674 54.609 54.575 54.518 54.451 54.38 54.344 54.235 54.202 54.137 54.064 53.917 53.823 53.705 53.576 53.421 53.239 53.006 52.443 -3 ,32492 ,KEBNE ,17041316,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:33:05 CET,0.0 0.771 1.134 1.446 1.702 1.928 2.133 2.306 2.64 2.805 2.955 3.125 3.396 3.546 3.854 4.142 4.403 4.533 4.806 5.071 5.437 5.674 5.904 6.245 6.573 6.886 7.2 7.504 7.9 8.302 8.702 9.193 9.668 10.129 10.682 11.322 11.946 12.635 13.375 14.187 15.08 16.139 17.417 18.693 20.185 21.897 23.969 26.432 29.55 33.478 38.551 43.158 46.146 48.22 49.667 50.758 51.594 52.235 52.718 53.133 53.432 53.684 53.914 54.106 54.244 54.345 54.438 54.507 54.56 54.605 54.646 54.67 54.685 54.697 54.693 54.68 54.672 54.662 54.624 54.584 54.555 54.525 54.499 54.456 54.437 54.403 54.344 54.288 54.262 54.157 54.147 54.103 54.059 53.957 53.895 53.811 53.72 53.63 53.527 53.337 53.01 -4 ,24735 ,KEBNE ,17041317,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:31:42 CET,0.0 0.504 0.777 0.992 1.201 1.404 1.585 1.765 2.107 2.274 2.439 2.623 2.9 3.048 3.335 3.608 3.876 4.011 4.267 4.511 4.868 5.108 5.343 5.676 5.995 6.315 6.63 6.943 7.356 7.765 8.165 8.648 9.116 9.58 10.14 10.761 11.375 12.083 12.881 13.761 14.689 15.743 16.999 18.318 19.912 21.746 23.931 26.461 29.572 33.561 38.752 43.429 46.389 48.365 49.802 50.911 51.757 52.427 52.925 53.349 53.674 53.93 54.141 54.321 54.469 54.568 54.657 54.726 54.766 54.803 54.83 54.843 54.849 54.844 54.837 54.825 54.81 54.786 54.757 54.731 54.697 54.636 54.583 54.53 54.502 54.439 54.352 54.24 54.193 54.078 54.039 53.971 53.9 53.747 53.653 53.555 53.449 53.342 53.178 52.828 51.862 -5 ,450 ,KEBNE ,17041318,Thu Dec 23 03:09:24 CET,Thu Dec 23 04:27:43 CET,0.0 0.692 1.075 1.364 1.59 1.81 2.014 2.203 2.549 2.717 2.9 3.114 3.388 3.529 3.813 4.08 4.33 4.455 4.698 4.94 5.297 5.524 5.752 6.094 6.43 6.76 7.098 7.421 7.825 8.221 8.62 9.135 9.631 10.116 10.674 11.316 11.961 12.671 13.459 14.323 15.23 16.281 17.536 18.797 20.316 22.112 24.255 26.768 29.896 33.756 38.837 43.619 46.71 48.847 50.354 51.476 52.321 53.001 53.505 53.929 54.241 54.457 54.645 54.809 54.933 55.022 55.093 55.167 55.228 55.273 55.308 55.32 55.325 55.317 55.305 55.298 55.294 55.297 55.302 55.295 55.274 55.241 55.224 55.208 55.197 55.166 55.127 55.065 55.03 54.929 54.94 54.893 54.841 54.727 54.656 54.585 54.513 54.419 54.311 54.147 53.709 -6 ,18433 ,KEBNE ,17041320,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:31:22 CET,0.0 0.776 1.155 1.42 1.678 1.904 2.101 2.281 2.617 2.779 2.934 3.125 3.402 3.543 3.816 4.072 4.319 4.446 4.712 4.971 5.336 5.574 5.815 6.168 6.511 6.836 7.152 7.46 7.866 8.278 8.677 9.157 9.63 10.092 10.628 11.255 11.861 12.541 13.309 14.123 15.011 16.043 17.253 18.493 19.983 21.716 23.806 26.337 29.507 33.487 38.599 43.158 46.106 48.125 49.549 50.661 51.511 52.153 52.643 53.056 53.376 53.639 53.841 54.009 54.155 54.278 54.386 54.477 54.542 54.583 54.604 54.608 54.618 54.625 54.617 54.608 54.591 54.558 54.518 54.485 54.442 54.382 54.345 54.295 54.265 54.181 54.072 53.981 53.936 53.806 53.743 53.674 53.594 53.382 53.271 53.154 53.009 52.877 52.703 52.434 51.656 -7 ,6450 ,KEBNE ,17041322,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:31:21 CET,0.0 0.528 0.789 0.967 1.149 1.333 1.502 1.654 1.932 2.069 2.21 2.362 2.62 2.746 2.989 3.239 3.491 3.617 3.877 4.136 4.504 4.728 4.946 5.281 5.62 5.957 6.285 6.604 7.021 7.428 7.822 8.297 8.78 9.263 9.836 10.492 11.116 11.815 12.605 13.462 14.38 15.436 16.694 17.979 19.497 21.256 23.385 25.902 29.035 33.016 38.18 42.798 45.768 47.824 49.326 50.489 51.359 52.015 52.507 52.966 53.321 53.593 53.81 53.978 54.09 54.179 54.279 54.357 54.417 54.448 54.456 54.461 54.453 54.443 54.425 54.415 54.415 54.384 54.337 54.303 54.26 54.184 54.131 54.078 54.06 54.024 53.968 53.913 53.89 53.789 53.777 53.739 53.702 53.589 53.519 53.435 53.345 53.282 53.2 53.093 52.714 -8 ,31865 ,KEBNE ,17041323,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:31:43 CET,0.0 0.325 0.556 0.782 0.974 1.133 1.291 1.442 1.72 1.85 1.979 2.111 2.363 2.488 2.72 2.961 3.207 3.328 3.565 3.795 4.138 4.363 4.586 4.898 5.192 5.487 5.778 6.07 6.454 6.839 7.219 7.681 8.144 8.605 9.162 9.801 10.414 11.106 11.876 12.718 13.639 14.704 15.97 17.297 18.906 20.747 22.951 25.524 28.646 32.538 37.671 42.295 45.268 47.352 48.833 49.948 50.772 51.418 51.916 52.353 52.676 52.915 53.112 53.275 53.413 53.517 53.585 53.635 53.674 53.699 53.726 53.737 53.731 53.722 53.716 53.702 53.667 53.63 53.593 53.559 53.524 53.463 53.421 53.386 53.368 53.322 53.263 53.204 53.169 53.064 53.057 53.009 52.954 52.822 52.764 52.697 52.623 52.511 52.353 52.153 51.7 -9 ,10431 ,KEBNE ,17041325,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:33:07 CET,0.0 0.393 0.633 0.849 1.049 1.233 1.413 1.574 1.869 2.017 2.162 2.306 2.554 2.684 2.951 3.214 3.482 3.62 3.881 4.125 4.494 4.734 4.966 5.298 5.62 5.937 6.255 6.571 6.976 7.385 7.787 8.266 8.732 9.186 9.74 10.392 11.008 11.696 12.455 13.281 14.177 15.194 16.418 17.717 19.283 21.079 23.239 25.798 28.921 32.791 37.864 42.477 45.45 47.478 48.95 50.084 50.946 51.604 52.124 52.616 52.966 53.221 53.439 53.614 53.767 53.894 53.983 54.058 54.113 54.152 54.19 54.213 54.221 54.226 54.229 54.225 54.206 54.179 54.146 54.111 54.075 54.023 53.984 53.944 53.915 53.847 53.78 53.717 53.679 53.566 53.522 53.468 53.431 53.352 53.294 53.226 53.139 53.039 52.939 52.81 52.509 -10 ,13796 ,KEBNE ,17041326,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:32:53 CET,0.0 0.446 0.676 0.893 1.094 1.277 1.46 1.635 1.943 2.091 2.235 2.4 2.672 2.802 3.049 3.302 3.543 3.658 3.91 4.155 4.501 4.737 4.975 5.33 5.673 5.998 6.317 6.631 7.043 7.457 7.856 8.341 8.828 9.307 9.86 10.495 11.124 11.811 12.572 13.416 14.318 15.351 16.604 17.876 19.371 21.115 23.241 25.769 28.874 32.832 38.02 42.708 45.749 47.885 49.421 50.606 51.492 52.183 52.721 53.185 53.538 53.808 53.999 54.146 54.276 54.382 54.471 54.535 54.585 54.621 54.653 54.685 54.724 54.751 54.753 54.741 54.727 54.715 54.702 54.695 54.677 54.64 54.619 54.59 54.568 54.514 54.452 54.404 54.379 54.277 54.281 54.232 54.175 54.045 53.969 53.872 53.777 53.698 53.578 53.38 53.001 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index a84392dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22811 ,KEBNE ,17041328,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:33:20 CET,0.0 0.666 0.921 1.137 1.317 1.468 1.615 1.772 2.076 2.207 2.341 2.454 2.711 2.841 3.098 3.325 3.534 3.641 3.848 4.054 4.369 4.572 4.772 5.064 5.345 5.629 5.914 6.188 6.531 6.873 7.217 7.628 8.035 8.43 8.892 9.433 9.974 10.579 11.234 11.938 12.69 13.576 14.656 15.742 17.005 18.455 20.216 22.268 24.753 27.812 31.782 35.393 37.712 39.33 40.508 41.41 42.054 42.517 42.877 43.197 43.426 43.583 43.694 43.784 43.859 43.924 43.979 44.017 44.039 44.044 44.035 44.026 44.001 43.96 43.921 43.883 43.861 43.836 43.795 43.759 43.723 43.67 43.632 43.605 43.593 43.563 43.529 43.472 43.441 43.317 43.352 43.315 43.275 43.186 43.135 43.086 43.014 42.929 42.85 42.734 42.419 -2 ,15332 ,KEBNE ,17041329,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:33:13 CET,0.0 0.437 0.646 0.832 1.012 1.176 1.35 1.516 1.81 1.952 2.089 2.21 2.475 2.601 2.844 3.074 3.303 3.413 3.629 3.844 4.157 4.357 4.558 4.861 5.159 5.451 5.728 5.997 6.348 6.683 7.024 7.46 7.869 8.267 8.742 9.284 9.823 10.434 11.104 11.828 12.604 13.484 14.532 15.607 16.899 18.395 20.2 22.318 24.876 28.011 32.038 35.665 37.982 39.581 40.732 41.585 42.203 42.692 43.052 43.363 43.578 43.743 43.892 44.001 44.094 44.172 44.234 44.274 44.305 44.346 44.384 44.404 44.407 44.4 44.395 44.39 44.379 44.352 44.316 44.289 44.268 44.246 44.218 44.175 44.157 44.128 44.082 44.015 43.982 43.862 43.886 43.845 43.789 43.669 43.618 43.548 43.449 43.355 43.231 43.054 42.732 -3 ,2920 ,KEBNE ,17041330,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:33:04 CET,0.0 0.553 0.84 1.071 1.254 1.441 1.631 1.813 2.166 2.329 2.493 2.697 2.99 3.135 3.413 3.681 3.939 4.062 4.304 4.534 4.855 5.065 5.28 5.599 5.9 6.194 6.49 6.777 7.141 7.501 7.853 8.274 8.692 9.101 9.584 10.151 10.702 11.32 12.003 12.716 13.467 14.381 15.476 16.565 17.86 19.338 21.108 23.184 25.747 28.904 32.944 36.647 38.974 40.572 41.73 42.615 43.266 43.758 44.11 44.413 44.656 44.847 44.984 45.09 45.191 45.276 45.341 45.374 45.391 45.402 45.407 45.407 45.403 45.398 45.378 45.341 45.311 45.279 45.244 45.219 45.186 45.137 45.102 45.047 45.014 44.958 44.888 44.798 44.755 44.618 44.606 44.54 44.457 44.289 44.218 44.143 44.069 43.977 43.844 43.696 43.377 -4 ,8748 ,KEBNE ,17041331,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:33:33 CET,0.0 0.445 0.669 0.872 1.078 1.269 1.46 1.661 2.033 2.206 2.368 2.528 2.81 2.956 3.219 3.48 3.737 3.858 4.093 4.324 4.67 4.893 5.098 5.393 5.699 6.004 6.298 6.575 6.946 7.313 7.668 8.104 8.525 8.947 9.441 9.977 10.506 11.115 11.782 12.508 13.304 14.226 15.316 16.414 17.717 19.218 20.984 23.055 25.597 28.749 32.83 36.475 38.79 40.336 41.447 42.315 42.95 43.436 43.814 44.139 44.35 44.509 44.655 44.768 44.855 44.93 44.991 45.037 45.071 45.094 45.115 45.114 45.093 45.07 45.044 45.011 44.986 44.967 44.939 44.908 44.875 44.812 44.754 44.688 44.652 44.584 44.523 44.451 44.41 44.278 44.264 44.202 44.132 43.94 43.832 43.73 43.61 43.447 43.231 42.935 42.127 -5 ,2805 ,KEBNE ,17041332,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:33:15 CET,0.0 0.365 0.627 0.848 1.021 1.192 1.379 1.547 1.835 1.978 2.117 2.249 2.517 2.639 2.883 3.111 3.329 3.436 3.646 3.853 4.172 4.389 4.602 4.906 5.205 5.507 5.804 6.103 6.495 6.864 7.212 7.636 8.054 8.471 8.955 9.49 10.011 10.603 11.277 11.999 12.762 13.654 14.69 15.744 17.02 18.482 20.242 22.336 24.865 27.998 32.065 35.666 37.988 39.609 40.757 41.61 42.242 42.733 43.1 43.424 43.666 43.837 43.981 44.113 44.198 44.255 44.304 44.345 44.376 44.391 44.386 44.375 44.358 44.344 44.333 44.315 44.292 44.249 44.186 44.144 44.107 44.027 43.974 43.937 43.913 43.853 43.778 43.692 43.645 43.516 43.516 43.455 43.389 43.252 43.173 43.08 42.954 42.808 42.614 42.351 41.421 -6 ,6841 ,KEBNE ,17041333,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:31:34 CET,0.0 0.271 0.493 0.696 0.874 1.047 1.212 1.366 1.705 1.877 2.032 2.195 2.485 2.64 2.918 3.18 3.444 3.562 3.788 4.02 4.359 4.581 4.795 5.112 5.429 5.742 6.046 6.334 6.708 7.068 7.428 7.873 8.297 8.712 9.197 9.762 10.303 10.906 11.576 12.292 13.069 13.944 14.988 16.095 17.411 18.899 20.636 22.666 25.136 28.231 32.278 35.873 38.184 39.786 40.939 41.803 42.423 42.89 43.243 43.56 43.802 43.992 44.147 44.273 44.371 44.452 44.523 44.569 44.594 44.608 44.622 44.627 44.609 44.577 44.551 44.527 44.498 44.461 44.423 44.399 44.382 44.363 44.343 44.305 44.283 44.246 44.194 44.141 44.118 44.0 44.027 43.991 43.949 43.833 43.769 43.69 43.555 43.4 43.242 42.977 42.463 -7 ,5131 ,KEBNE ,17041334,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:31:58 CET,0.0 0.359 0.582 0.78 0.948 1.109 1.27 1.42 1.691 1.826 1.961 2.093 2.364 2.49 2.725 2.951 3.172 3.282 3.499 3.709 4.026 4.237 4.439 4.738 5.05 5.347 5.623 5.897 6.267 6.649 7.016 7.454 7.883 8.305 8.794 9.35 9.907 10.513 11.175 11.898 12.675 13.564 14.605 15.677 16.947 18.393 20.13 22.203 24.684 27.763 31.845 35.455 37.755 39.338 40.444 41.292 41.958 42.47 42.842 43.164 43.408 43.581 43.716 43.83 43.918 43.994 44.06 44.1 44.123 44.144 44.159 44.151 44.123 44.093 44.074 44.053 44.032 44.001 43.959 43.929 43.896 43.84 43.788 43.72 43.686 43.617 43.533 43.444 43.394 43.248 43.231 43.175 43.115 42.969 42.892 42.809 42.716 42.628 42.55 42.461 42.227 -8 ,9361 ,KEBNE ,17041335,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:33:09 CET,0.0 0.841 1.221 1.51 1.736 1.941 2.14 2.324 2.678 2.85 3.017 3.202 3.487 3.632 3.904 4.158 4.393 4.509 4.747 4.991 5.346 5.561 5.765 6.06 6.351 6.642 6.921 7.201 7.571 7.931 8.281 8.716 9.146 9.56 10.046 10.608 11.158 11.762 12.435 13.168 13.923 14.8 15.862 16.975 18.301 19.772 21.579 23.71 26.23 29.345 33.41 37.018 39.328 40.934 42.071 42.924 43.558 44.076 44.442 44.758 45.002 45.167 45.304 45.428 45.528 45.591 45.629 45.648 45.655 45.662 45.68 45.679 45.668 45.655 45.628 45.589 45.553 45.516 45.482 45.456 45.419 45.349 45.297 45.243 45.209 45.132 45.05 44.956 44.904 44.761 44.751 44.702 44.638 44.45 44.34 44.221 44.086 43.945 43.789 43.571 42.813 -9 ,22101 ,KEBNE ,17041336,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:31:39 CET,0.0 0.269 0.458 0.629 0.784 0.954 1.14 1.302 1.585 1.714 1.844 1.973 2.243 2.371 2.627 2.88 3.121 3.236 3.464 3.686 4.0 4.216 4.435 4.752 5.069 5.375 5.662 5.938 6.298 6.668 7.037 7.475 7.906 8.325 8.807 9.361 9.914 10.525 11.194 11.922 12.691 13.579 14.627 15.701 16.993 18.486 20.281 22.368 24.88 27.984 32.022 35.689 38.022 39.608 40.714 41.523 42.113 42.58 42.936 43.238 43.471 43.649 43.786 43.902 43.996 44.063 44.119 44.156 44.187 44.198 44.182 44.173 44.173 44.183 44.191 44.193 44.179 44.152 44.133 44.12 44.106 44.082 44.062 44.04 44.026 43.989 43.926 43.86 43.822 43.684 43.693 43.657 43.623 43.529 43.477 43.421 43.347 43.248 43.136 43.01 42.717 -10 ,29398 ,KEBNE ,17041337,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:33:24 CET,0.0 0.634 0.854 1.039 1.228 1.411 1.575 1.733 2.03 2.163 2.298 2.452 2.735 2.881 3.168 3.432 3.688 3.812 4.045 4.272 4.6 4.806 5.009 5.313 5.618 5.92 6.207 6.474 6.844 7.215 7.572 8.008 8.436 8.869 9.361 9.886 10.41 11.016 11.665 12.369 13.152 14.053 15.103 16.192 17.508 18.998 20.755 22.813 25.347 28.437 32.424 36.05 38.342 39.911 41.017 41.863 42.499 42.995 43.368 43.69 43.928 44.101 44.245 44.367 44.465 44.538 44.603 44.641 44.659 44.677 44.676 44.663 44.657 44.646 44.628 44.604 44.573 44.54 44.495 44.455 44.42 44.362 44.311 44.254 44.223 44.161 44.088 44.002 43.952 43.806 43.761 43.694 43.626 43.477 43.403 43.313 43.203 43.089 42.97 42.829 42.586 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt deleted file mode 100644 index b0a86b1b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,773 ,KEBNE ,17041338,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:33:12 CET,0.0 0.583 0.782 0.911 0.999 1.081 1.157 1.23 1.336 1.384 1.434 1.435 1.539 1.568 1.613 1.636 1.635 1.632 1.625 1.616 1.603 1.598 1.59 1.565 1.539 1.503 1.461 1.421 1.354 1.276 1.199 1.091 0.971 0.847 0.683 0.492 0.302 0.077 -0.188 -0.516 -0.912 -1.393 -2.011 -2.72 -3.647 -4.802 -6.278 -8.164 -10.748 -14.373 -19.833 -25.676 -30.05 -33.512 -36.339 -38.711 -40.664 -42.37 -43.79 -45.144 -46.251 -47.212 -48.097 -48.902 -49.653 -50.314 -50.97 -51.559 -52.061 -52.56 -53.071 -53.473 -53.891 -54.33 -54.652 -54.976 -55.314 -55.662 -56.016 -56.254 -56.496 -56.87 -57.124 -57.379 -57.512 -57.794 -58.094 -58.384 -58.532 -58.818 -59.006 -59.17 -59.33 -59.707 -59.92 -60.145 -60.38 -60.661 -60.966 -61.226 -61.74 -2 ,11804 ,KEBNE ,17041339,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:33:24 CET,0.0 0.376 0.482 0.583 0.724 0.853 0.955 1.048 1.195 1.252 1.311 1.346 1.449 1.483 1.553 1.598 1.627 1.637 1.648 1.662 1.674 1.673 1.669 1.662 1.653 1.643 1.626 1.595 1.552 1.506 1.449 1.354 1.258 1.147 0.996 0.821 0.641 0.419 0.146 -0.177 -0.545 -1.025 -1.656 -2.33 -3.215 -4.346 -5.819 -7.706 -10.262 -13.909 -19.341 -25.11 -29.457 -32.91 -35.693 -38.034 -39.991 -41.679 -43.061 -44.392 -45.522 -46.512 -47.406 -48.204 -48.934 -49.594 -50.262 -50.857 -51.36 -51.862 -52.376 -52.8 -53.231 -53.665 -53.999 -54.334 -54.667 -55.002 -55.337 -55.56 -55.79 -56.15 -56.401 -56.652 -56.775 -57.016 -57.254 -57.514 -57.656 -57.927 -58.057 -58.203 -58.374 -58.714 -58.878 -59.067 -59.276 -59.487 -59.688 -59.917 -60.671 -3 ,23709 ,KEBNE ,17041340,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:31:32 CET,0.0 0.559 0.709 0.848 0.952 1.012 1.06 1.122 1.239 1.293 1.354 1.398 1.515 1.555 1.625 1.686 1.736 1.755 1.771 1.78 1.783 1.785 1.792 1.777 1.761 1.751 1.724 1.686 1.649 1.6 1.539 1.454 1.354 1.247 1.096 0.893 0.69 0.463 0.178 -0.158 -0.536 -0.997 -1.593 -2.268 -3.172 -4.344 -5.837 -7.693 -10.271 -13.877 -19.296 -25.17 -29.576 -33.061 -35.866 -38.238 -40.203 -41.859 -43.224 -44.554 -45.645 -46.592 -47.471 -48.272 -49.019 -49.684 -50.35 -50.95 -51.46 -51.968 -52.463 -52.862 -53.294 -53.727 -54.046 -54.378 -54.719 -55.072 -55.432 -55.675 -55.908 -56.268 -56.531 -56.806 -56.942 -57.193 -57.459 -57.748 -57.899 -58.191 -58.388 -58.559 -58.743 -59.09 -59.256 -59.441 -59.638 -59.835 -60.041 -60.265 -60.718 -4 ,32533 ,KEBNE ,17041341,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:31:22 CET,0.0 0.828 1.184 1.389 1.542 1.675 1.788 1.873 2.005 2.064 2.119 2.151 2.255 2.291 2.354 2.402 2.443 2.456 2.472 2.492 2.518 2.526 2.532 2.536 2.527 2.502 2.479 2.457 2.409 2.332 2.244 2.137 2.033 1.943 1.82 1.648 1.461 1.228 0.94 0.602 0.221 -0.268 -0.904 -1.6 -2.489 -3.603 -5.064 -6.971 -9.57 -13.214 -18.682 -24.542 -28.963 -32.458 -35.254 -37.616 -39.6 -41.306 -42.736 -44.092 -45.202 -46.163 -47.049 -47.857 -48.595 -49.267 -49.943 -50.518 -51.004 -51.509 -52.036 -52.468 -52.892 -53.313 -53.647 -53.996 -54.347 -54.699 -55.058 -55.303 -55.54 -55.902 -56.159 -56.429 -56.575 -56.863 -57.147 -57.448 -57.599 -57.884 -58.062 -58.218 -58.388 -58.75 -58.925 -59.12 -59.337 -59.547 -59.776 -60.027 -60.407 -5 ,15839 ,KEBNE ,17041342,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:32:48 CET,0.0 0.808 1.063 1.24 1.382 1.511 1.608 1.692 1.831 1.888 1.937 1.95 2.049 2.077 2.118 2.154 2.202 2.218 2.225 2.241 2.277 2.278 2.265 2.254 2.239 2.208 2.18 2.155 2.105 2.043 1.971 1.857 1.746 1.628 1.464 1.285 1.104 0.865 0.582 0.266 -0.109 -0.604 -1.241 -1.946 -2.839 -3.945 -5.406 -7.287 -9.851 -13.411 -18.84 -24.735 -29.125 -32.582 -35.381 -37.738 -39.691 -41.373 -42.787 -44.15 -45.244 -46.194 -47.09 -47.899 -48.632 -49.286 -49.947 -50.54 -51.042 -51.549 -52.079 -52.509 -52.931 -53.349 -53.669 -53.999 -54.339 -54.688 -55.038 -55.277 -55.52 -55.876 -56.125 -56.389 -56.531 -56.819 -57.108 -57.412 -57.571 -57.862 -58.05 -58.222 -58.407 -58.787 -58.985 -59.196 -59.438 -59.711 -60.01 -60.437 -61.193 -6 ,17239 ,KEBNE ,17041343,Thu Dec 23 03:09:19 CET,Thu Dec 23 04:33:07 CET,0.0 0.845 1.143 1.321 1.465 1.612 1.744 1.845 2.0 2.068 2.122 2.134 2.234 2.274 2.35 2.408 2.47 2.49 2.514 2.547 2.604 2.632 2.639 2.638 2.615 2.581 2.554 2.52 2.46 2.402 2.341 2.238 2.12 1.997 1.853 1.679 1.487 1.243 0.96 0.635 0.253 -0.223 -0.863 -1.576 -2.478 -3.614 -5.099 -6.984 -9.542 -13.147 -18.651 -24.541 -28.952 -32.458 -35.277 -37.622 -39.546 -41.222 -42.61 -43.957 -45.079 -46.036 -46.918 -47.737 -48.489 -49.152 -49.82 -50.403 -50.897 -51.401 -51.927 -52.352 -52.775 -53.209 -53.538 -53.868 -54.198 -54.525 -54.881 -55.121 -55.356 -55.734 -55.985 -56.245 -56.38 -56.647 -56.92 -57.216 -57.373 -57.663 -57.856 -58.025 -58.196 -58.556 -58.741 -58.91 -59.078 -59.263 -59.461 -59.707 -60.425 -7 ,7699 ,KEBNE ,17041344,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:33:06 CET,0.0 0.664 0.931 1.113 1.234 1.321 1.386 1.442 1.538 1.571 1.597 1.573 1.666 1.69 1.737 1.776 1.817 1.835 1.859 1.882 1.913 1.919 1.91 1.899 1.882 1.849 1.822 1.785 1.717 1.654 1.591 1.515 1.424 1.304 1.157 0.973 0.771 0.533 0.256 -0.083 -0.49 -0.995 -1.616 -2.312 -3.237 -4.384 -5.898 -7.82 -10.388 -14.038 -19.587 -25.503 -29.886 -33.358 -36.164 -38.509 -40.453 -42.114 -43.494 -44.826 -45.92 -46.866 -47.733 -48.514 -49.23 -49.884 -50.555 -51.142 -51.635 -52.127 -52.622 -53.035 -53.463 -53.893 -54.222 -54.554 -54.881 -55.224 -55.58 -55.812 -56.05 -56.426 -56.686 -56.944 -57.071 -57.341 -57.624 -57.92 -58.076 -58.363 -58.561 -58.733 -58.919 -59.304 -59.489 -59.667 -59.87 -60.122 -60.441 -60.852 -61.728 -8 ,11802 ,KEBNE ,17041345,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:31:31 CET,0.0 0.62 0.8 0.918 1.016 1.095 1.162 1.22 1.31 1.352 1.384 1.367 1.467 1.498 1.573 1.624 1.659 1.673 1.694 1.699 1.69 1.688 1.686 1.681 1.666 1.648 1.628 1.6 1.548 1.484 1.413 1.312 1.209 1.099 0.958 0.776 0.579 0.353 0.095 -0.218 -0.593 -1.055 -1.672 -2.368 -3.253 -4.359 -5.798 -7.659 -10.2 -13.739 -19.2 -25.166 -29.615 -33.099 -35.947 -38.336 -40.286 -41.989 -43.421 -44.772 -45.875 -46.826 -47.698 -48.501 -49.227 -49.87 -50.524 -51.087 -51.57 -52.071 -52.587 -53.011 -53.438 -53.872 -54.209 -54.548 -54.893 -55.25 -55.622 -55.862 -56.106 -56.488 -56.744 -57.024 -57.17 -57.453 -57.744 -58.062 -58.215 -58.49 -58.68 -58.85 -59.024 -59.42 -59.631 -59.848 -60.113 -60.416 -60.729 -61.124 -61.93 -9 ,14067 ,KEBNE ,17041346,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:32:52 CET,0.0 0.479 0.579 0.656 0.746 0.819 0.87 0.925 1.041 1.093 1.135 1.139 1.251 1.302 1.382 1.424 1.448 1.456 1.464 1.473 1.495 1.509 1.514 1.502 1.472 1.446 1.415 1.373 1.313 1.254 1.188 1.083 0.964 0.851 0.698 0.488 0.272 0.019 -0.272 -0.604 -0.998 -1.478 -2.088 -2.779 -3.66 -4.776 -6.178 -7.979 -10.521 -14.127 -19.663 -25.657 -30.134 -33.609 -36.382 -38.736 -40.684 -42.338 -43.717 -45.048 -46.166 -47.153 -48.055 -48.885 -49.641 -50.295 -50.969 -51.562 -52.048 -52.533 -53.031 -53.445 -53.869 -54.311 -54.644 -54.976 -55.318 -55.665 -56.021 -56.264 -56.516 -56.923 -57.206 -57.494 -57.637 -57.916 -58.199 -58.488 -58.635 -58.924 -59.145 -59.326 -59.506 -59.876 -60.073 -60.29 -60.514 -60.762 -61.026 -61.322 -61.862 -10 ,17739 ,KEBNE ,17041347,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:33:25 CET,0.0 0.452 0.598 0.707 0.812 0.89 0.958 1.016 1.079 1.107 1.13 1.098 1.195 1.219 1.261 1.297 1.339 1.36 1.385 1.414 1.451 1.459 1.457 1.45 1.434 1.41 1.378 1.329 1.268 1.215 1.152 1.044 0.921 0.801 0.649 0.463 0.265 0.028 -0.247 -0.579 -0.96 -1.439 -2.046 -2.737 -3.645 -4.749 -6.202 -8.127 -10.696 -14.268 -19.787 -25.69 -30.058 -33.487 -36.279 -38.631 -40.559 -42.208 -43.578 -44.919 -46.039 -47.003 -47.888 -48.703 -49.439 -50.092 -50.764 -51.351 -51.837 -52.323 -52.821 -53.227 -53.65 -54.073 -54.391 -54.735 -55.09 -55.439 -55.795 -56.036 -56.278 -56.66 -56.911 -57.159 -57.291 -57.555 -57.829 -58.121 -58.267 -58.542 -58.716 -58.882 -59.057 -59.407 -59.597 -59.807 -60.03 -60.27 -60.557 -60.856 -61.487 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index 10cd383b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24021 ,KEBNE ,17041348,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:33:24 CET,0.0 0.805 1.117 1.318 1.475 1.638 1.79 1.921 2.176 2.288 2.384 2.428 2.638 2.73 2.911 3.078 3.233 3.304 3.433 3.555 3.726 3.837 3.949 4.121 4.284 4.421 4.559 4.707 4.885 5.058 5.233 5.435 5.624 5.8 6.004 6.231 6.456 6.699 6.947 7.218 7.508 7.839 8.218 8.578 8.991 9.424 9.886 10.358 10.83 11.319 11.648 11.541 11.208 10.818 10.432 10.012 9.608 9.247 8.945 8.635 8.347 8.066 7.784 7.527 7.277 7.05 6.838 6.637 6.447 6.242 6.027 5.843 5.647 5.447 5.289 5.128 4.964 4.8 4.626 4.495 4.361 4.155 4.003 3.851 3.772 3.595 3.409 3.208 3.103 2.885 2.826 2.725 2.619 2.372 2.232 2.075 1.892 1.709 1.498 1.231 0.569 -2 ,22010 ,KEBNE ,17041349,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:33:33 CET,0.0 0.674 1.002 1.245 1.414 1.564 1.716 1.865 2.126 2.24 2.336 2.39 2.601 2.686 2.849 2.997 3.128 3.189 3.32 3.452 3.641 3.765 3.888 4.061 4.217 4.36 4.506 4.645 4.82 4.992 5.155 5.342 5.52 5.705 5.914 6.138 6.36 6.615 6.882 7.159 7.446 7.758 8.124 8.472 8.845 9.255 9.724 10.214 10.68 11.063 11.333 11.207 10.853 10.497 10.151 9.774 9.397 9.019 8.679 8.345 8.05 7.783 7.518 7.262 7.022 6.792 6.545 6.318 6.114 5.906 5.695 5.52 5.334 5.138 4.985 4.822 4.648 4.473 4.303 4.183 4.056 3.858 3.715 3.566 3.493 3.359 3.231 3.084 3.004 2.786 2.707 2.61 2.508 2.282 2.156 2.022 1.881 1.7 1.463 1.181 0.23 -3 ,12930 ,KEBNE ,17041350,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:33:41 CET,0.0 0.313 0.489 0.61 0.718 0.814 0.899 0.981 1.175 1.278 1.385 1.467 1.688 1.782 1.944 2.092 2.24 2.31 2.447 2.589 2.771 2.878 2.982 3.139 3.297 3.445 3.59 3.736 3.924 4.109 4.278 4.469 4.645 4.815 5.021 5.248 5.474 5.713 5.966 6.245 6.536 6.847 7.191 7.538 7.941 8.353 8.809 9.291 9.76 10.22 10.523 10.438 10.121 9.765 9.407 9.018 8.633 8.258 7.923 7.597 7.31 7.023 6.753 6.494 6.257 6.043 5.822 5.625 5.431 5.215 4.99 4.817 4.638 4.439 4.293 4.153 4.001 3.842 3.688 3.583 3.464 3.262 3.123 2.979 2.898 2.754 2.618 2.458 2.378 2.172 2.133 2.035 1.926 1.701 1.581 1.45 1.297 1.133 0.934 0.677 -0.017 -4 ,28906 ,KEBNE ,17041351,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:33:27 CET,0.0 0.289 0.472 0.625 0.753 0.87 0.978 1.066 1.244 1.326 1.399 1.415 1.615 1.685 1.819 1.95 2.067 2.123 2.244 2.36 2.505 2.603 2.715 2.891 3.054 3.208 3.349 3.484 3.663 3.843 4.012 4.223 4.426 4.608 4.812 5.045 5.268 5.515 5.777 6.041 6.309 6.603 6.96 7.306 7.678 8.11 8.596 9.042 9.5 9.954 10.287 10.218 9.888 9.532 9.202 8.851 8.503 8.131 7.777 7.428 7.114 6.82 6.54 6.276 6.031 5.813 5.574 5.349 5.161 4.96 4.749 4.581 4.408 4.227 4.083 3.938 3.794 3.646 3.487 3.383 3.279 3.086 2.945 2.801 2.732 2.595 2.439 2.276 2.186 1.974 1.925 1.837 1.749 1.553 1.438 1.295 1.126 0.952 0.736 0.432 -0.225 -5 ,1036 ,KEBNE ,17041352,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:33:15 CET,0.0 0.847 1.235 1.506 1.699 1.842 1.985 2.119 2.352 2.463 2.564 2.623 2.838 2.923 3.08 3.239 3.39 3.461 3.609 3.744 3.929 4.048 4.16 4.324 4.484 4.634 4.77 4.904 5.082 5.263 5.44 5.654 5.856 6.047 6.274 6.522 6.751 7.001 7.256 7.524 7.822 8.13 8.474 8.827 9.231 9.651 10.096 10.567 11.05 11.523 11.875 11.82 11.489 11.071 10.671 10.284 9.914 9.552 9.228 8.884 8.573 8.285 8.005 7.759 7.529 7.311 7.08 6.867 6.67 6.452 6.235 6.061 5.88 5.701 5.564 5.426 5.281 5.119 4.95 4.838 4.725 4.546 4.423 4.29 4.221 4.079 3.919 3.754 3.671 3.454 3.395 3.287 3.169 2.944 2.825 2.684 2.527 2.351 2.155 1.928 1.031 -6 ,15868 ,KEBNE ,17041353,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:32:17 CET,0.0 0.236 0.389 0.524 0.653 0.757 0.844 0.935 1.112 1.198 1.283 1.307 1.497 1.562 1.69 1.819 1.948 2.008 2.128 2.244 2.397 2.493 2.596 2.749 2.898 3.054 3.209 3.356 3.542 3.721 3.898 4.102 4.296 4.488 4.706 4.943 5.172 5.42 5.668 5.936 6.218 6.513 6.84 7.172 7.557 7.977 8.456 8.95 9.424 9.871 10.276 10.324 10.074 9.665 9.235 8.814 8.408 8.034 7.714 7.384 7.094 6.825 6.542 6.27 6.034 5.808 5.551 5.316 5.121 4.922 4.703 4.519 4.342 4.147 3.994 3.838 3.657 3.47 3.284 3.157 3.013 2.789 2.645 2.481 2.389 2.211 2.03 1.831 1.727 1.5 1.396 1.272 1.138 0.834 0.689 0.545 0.382 0.208 0.006 -0.255 -1.098 -7 ,20171 ,KEBNE ,17041354,Thu Dec 23 03:09:20 CET,Thu Dec 23 04:33:38 CET,0.0 0.241 0.407 0.566 0.736 0.897 1.04 1.184 1.425 1.526 1.632 1.698 1.904 1.981 2.132 2.285 2.435 2.504 2.635 2.766 2.959 3.076 3.187 3.346 3.501 3.655 3.799 3.932 4.096 4.255 4.417 4.604 4.793 4.987 5.204 5.445 5.681 5.932 6.193 6.468 6.761 7.08 7.414 7.743 8.127 8.536 8.981 9.45 9.946 10.377 10.608 10.538 10.243 9.815 9.376 8.983 8.601 8.219 7.895 7.565 7.258 6.98 6.715 6.461 6.197 5.948 5.707 5.494 5.302 5.092 4.885 4.716 4.541 4.358 4.212 4.062 3.901 3.738 3.58 3.465 3.339 3.161 3.036 2.904 2.837 2.692 2.551 2.386 2.286 2.061 2.0 1.901 1.796 1.574 1.454 1.341 1.196 1.031 0.86 0.621 -0.022 -8 ,8209 ,KEBNE ,17041355,Thu Dec 23 03:12:26 CET,Thu Dec 23 04:34:47 CET,0.0 0.905 1.235 1.426 1.593 1.751 1.897 2.038 2.292 2.405 2.51 2.576 2.798 2.886 3.039 3.186 3.334 3.406 3.545 3.682 3.875 3.995 4.11 4.277 4.437 4.6 4.752 4.901 5.099 5.273 5.433 5.622 5.814 6.013 6.237 6.483 6.715 6.941 7.187 7.469 7.77 8.092 8.442 8.784 9.169 9.586 10.015 10.447 10.918 11.378 11.706 11.646 11.334 10.948 10.56 10.163 9.795 9.437 9.112 8.793 8.511 8.25 7.975 7.703 7.45 7.207 6.951 6.727 6.527 6.326 6.12 5.942 5.754 5.554 5.404 5.253 5.09 4.918 4.75 4.637 4.512 4.308 4.162 3.998 3.916 3.733 3.542 3.363 3.273 3.048 2.934 2.812 2.684 2.416 2.263 2.084 1.893 1.69 1.421 1.025 -0.544 -9 ,30670 ,KEBNE ,17041356,Thu Dec 23 03:12:26 CET,Thu Dec 23 04:34:52 CET,0.0 0.355 0.517 0.649 0.771 0.877 0.976 1.072 1.246 1.326 1.41 1.44 1.631 1.692 1.82 1.943 2.051 2.103 2.215 2.329 2.494 2.599 2.7 2.836 2.966 3.097 3.227 3.361 3.541 3.719 3.886 4.09 4.292 4.482 4.68 4.897 5.118 5.369 5.641 5.916 6.2 6.511 6.871 7.232 7.633 8.051 8.501 8.956 9.424 9.906 10.228 10.113 9.792 9.437 9.054 8.656 8.295 7.967 7.649 7.308 7.011 6.721 6.448 6.183 5.919 5.677 5.428 5.198 4.997 4.793 4.584 4.412 4.233 4.044 3.896 3.737 3.569 3.389 3.208 3.086 2.956 2.753 2.615 2.471 2.392 2.233 2.068 1.898 1.814 1.602 1.538 1.43 1.32 1.092 0.975 0.855 0.704 0.508 0.319 0.088 -0.829 -10 ,336 ,KEBNE ,17041357,Thu Dec 23 03:12:30 CET,Thu Dec 23 04:30:51 CET,0.0 0.6 0.919 1.177 1.375 1.548 1.697 1.829 2.084 2.185 2.277 2.333 2.544 2.63 2.786 2.941 3.095 3.169 3.313 3.443 3.615 3.73 3.843 4.009 4.166 4.309 4.453 4.597 4.795 4.974 5.133 5.329 5.522 5.706 5.898 6.107 6.326 6.568 6.812 7.081 7.363 7.658 8.0 8.345 8.732 9.147 9.595 10.058 10.518 10.951 11.273 11.203 10.904 10.517 10.117 9.693 9.285 8.924 8.588 8.218 7.912 7.623 7.351 7.098 6.85 6.627 6.384 6.161 5.971 5.761 5.541 5.358 5.162 4.97 4.823 4.665 4.489 4.306 4.128 4.003 3.871 3.654 3.494 3.328 3.245 3.075 2.894 2.694 2.588 2.357 2.252 2.117 1.984 1.696 1.52 1.352 1.205 1.071 0.907 0.64 -0.198 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt deleted file mode 100644 index 7d0250af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26346 ,KEBNE ,17041358,Thu Dec 23 03:12:26 CET,Thu Dec 23 04:35:03 CET,0.0 0.458 0.618 0.741 0.868 0.993 1.105 1.214 1.426 1.525 1.617 1.678 1.896 1.98 2.142 2.306 2.47 2.546 2.682 2.808 2.99 3.116 3.246 3.446 3.636 3.811 3.981 4.148 4.375 4.6 4.816 5.066 5.317 5.566 5.848 6.17 6.474 6.807 7.166 7.561 7.985 8.462 9.02 9.582 10.237 10.976 11.824 12.727 13.742 14.871 16.107 16.967 17.361 17.472 17.433 17.323 17.167 16.981 16.824 16.665 16.507 16.353 16.181 16.022 15.856 15.673 15.48 15.316 15.183 15.035 14.87 14.736 14.587 14.421 14.297 14.164 14.026 13.892 13.746 13.634 13.52 13.341 13.213 13.086 13.016 12.859 12.687 12.519 12.439 12.23 12.134 12.026 11.906 11.618 11.458 11.321 11.187 11.04 10.864 10.625 9.93 -2 ,9791 ,KEBNE ,17041359,Thu Dec 23 03:12:26 CET,Thu Dec 23 04:34:51 CET,0.0 0.429 0.633 0.8 0.924 1.035 1.161 1.279 1.475 1.568 1.658 1.687 1.89 1.973 2.13 2.276 2.418 2.486 2.626 2.77 2.969 3.095 3.224 3.407 3.577 3.749 3.923 4.094 4.303 4.503 4.696 4.934 5.173 5.398 5.673 5.991 6.28 6.605 6.973 7.362 7.783 8.265 8.82 9.364 9.973 10.666 11.49 12.412 13.47 14.664 15.942 16.789 17.215 17.439 17.482 17.399 17.288 17.144 16.999 16.829 16.65 16.488 16.324 16.159 15.996 15.849 15.693 15.531 15.378 15.213 15.049 14.915 14.763 14.606 14.484 14.351 14.218 14.072 13.913 13.802 13.689 13.512 13.39 13.264 13.192 13.037 12.858 12.665 12.572 12.361 12.273 12.16 12.036 11.782 11.642 11.482 11.29 11.065 10.814 10.543 9.966 -3 ,12840 ,KEBNE ,17041360,Thu Dec 23 03:12:26 CET,Thu Dec 23 04:35:04 CET,0.0 0.265 0.456 0.613 0.732 0.855 0.972 1.082 1.287 1.381 1.478 1.54 1.745 1.827 1.988 2.142 2.304 2.381 2.539 2.71 2.945 3.095 3.24 3.442 3.647 3.847 4.031 4.208 4.434 4.65 4.866 5.123 5.365 5.612 5.904 6.216 6.521 6.873 7.255 7.659 8.082 8.539 9.091 9.645 10.266 10.982 11.789 12.673 13.729 14.924 16.241 17.166 17.549 17.651 17.642 17.577 17.456 17.283 17.12 16.951 16.786 16.614 16.422 16.243 16.07 15.898 15.699 15.53 15.394 15.254 15.099 14.957 14.812 14.653 14.527 14.393 14.247 14.108 13.961 13.855 13.739 13.549 13.428 13.296 13.22 13.056 12.895 12.725 12.63 12.422 12.319 12.202 12.089 11.833 11.69 11.556 11.389 11.192 10.994 10.675 9.567 -4 ,12313 ,KEBNE ,17041361,Thu Dec 23 03:12:27 CET,Thu Dec 23 04:34:55 CET,0.0 0.311 0.471 0.613 0.738 0.877 1.008 1.113 1.32 1.419 1.511 1.563 1.77 1.849 2.012 2.176 2.326 2.401 2.551 2.702 2.917 3.062 3.208 3.406 3.601 3.789 3.972 4.157 4.394 4.628 4.851 5.116 5.377 5.625 5.91 6.233 6.563 6.927 7.301 7.691 8.116 8.629 9.207 9.731 10.365 11.091 11.905 12.846 13.896 15.038 16.277 17.12 17.526 17.679 17.657 17.54 17.384 17.211 17.04 16.858 16.706 16.553 16.373 16.198 16.046 15.907 15.746 15.58 15.427 15.262 15.085 14.94 14.791 14.628 14.494 14.349 14.203 14.065 13.909 13.796 13.678 13.468 13.321 13.183 13.111 12.957 12.788 12.611 12.523 12.323 12.24 12.132 12.03 11.807 11.68 11.557 11.431 11.303 11.158 10.935 10.266 -5 ,3006 ,KEBNE ,17041362,Thu Dec 23 03:12:30 CET,Thu Dec 23 04:31:39 CET,0.0 0.437 0.76 1.003 1.2 1.38 1.537 1.681 1.949 2.068 2.185 2.29 2.521 2.621 2.796 2.969 3.148 3.236 3.412 3.582 3.809 3.952 4.092 4.294 4.491 4.679 4.868 5.048 5.277 5.496 5.694 5.947 6.213 6.473 6.768 7.092 7.407 7.761 8.141 8.53 8.937 9.398 9.939 10.494 11.137 11.863 12.665 13.558 14.612 15.756 17.011 17.922 18.302 18.42 18.43 18.363 18.259 18.107 17.94 17.745 17.554 17.356 17.153 16.987 16.828 16.673 16.528 16.407 16.281 16.123 15.968 15.843 15.713 15.576 15.455 15.328 15.19 15.033 14.878 14.772 14.652 14.474 14.351 14.214 14.145 13.998 13.834 13.653 13.562 13.356 13.27 13.159 13.039 12.786 12.642 12.483 12.292 12.04 11.736 11.335 10.46 -6 ,12641 ,KEBNE ,17041363,Thu Dec 23 03:12:30 CET,Thu Dec 23 04:31:19 CET,0.0 0.227 0.368 0.5 0.627 0.743 0.851 0.955 1.153 1.25 1.335 1.367 1.58 1.658 1.818 1.967 2.108 2.182 2.331 2.47 2.657 2.776 2.894 3.075 3.258 3.429 3.585 3.737 3.954 4.18 4.392 4.64 4.881 5.118 5.4 5.729 6.04 6.38 6.762 7.175 7.609 8.081 8.624 9.16 9.794 10.503 11.289 12.197 13.298 14.526 15.924 16.921 17.286 17.383 17.37 17.257 17.088 16.884 16.688 16.486 16.309 16.148 15.961 15.768 15.593 15.426 15.224 15.042 14.892 14.728 14.566 14.431 14.278 14.114 13.984 13.848 13.707 13.557 13.403 13.292 13.178 12.996 12.868 12.743 12.681 12.557 12.434 12.304 12.231 12.036 11.982 11.893 11.803 11.616 11.511 11.393 11.248 11.085 10.916 10.724 10.225 -7 ,28347 ,KEBNE ,17041364,Thu Dec 23 03:12:26 CET,Thu Dec 23 04:34:56 CET,0.0 0.318 0.487 0.631 0.765 0.889 1.014 1.133 1.336 1.427 1.521 1.577 1.792 1.893 2.076 2.229 2.387 2.463 2.601 2.748 2.964 3.097 3.237 3.445 3.656 3.87 4.059 4.224 4.441 4.657 4.88 5.147 5.394 5.638 5.915 6.234 6.537 6.879 7.262 7.648 8.052 8.516 9.08 9.636 10.26 10.958 11.735 12.623 13.677 14.816 16.024 16.896 17.296 17.436 17.408 17.305 17.187 17.043 16.865 16.675 16.511 16.343 16.154 15.963 15.788 15.63 15.459 15.295 15.147 14.991 14.839 14.708 14.563 14.401 14.274 14.149 14.017 13.873 13.718 13.618 13.506 13.327 13.202 13.068 13.003 12.856 12.686 12.512 12.418 12.205 12.124 12.013 11.896 11.64 11.504 11.354 11.186 11.0 10.76 10.445 9.098 -8 ,24358 ,KEBNE ,17041365,Thu Dec 23 03:12:26 CET,Thu Dec 23 04:34:32 CET,0.0 0.289 0.466 0.633 0.792 0.937 1.057 1.167 1.376 1.481 1.577 1.617 1.822 1.902 2.071 2.239 2.398 2.474 2.636 2.801 3.037 3.187 3.328 3.536 3.737 3.94 4.132 4.305 4.534 4.758 4.972 5.233 5.488 5.741 6.034 6.362 6.677 7.018 7.384 7.792 8.226 8.685 9.208 9.769 10.426 11.124 11.933 12.858 13.893 15.044 16.396 17.333 17.72 17.859 17.858 17.74 17.569 17.4 17.217 17.029 16.85 16.659 16.471 16.271 16.084 15.928 15.766 15.612 15.463 15.302 15.131 14.99 14.848 14.714 14.608 14.481 14.345 14.221 14.09 13.998 13.908 13.752 13.642 13.532 13.477 13.365 13.246 13.117 13.051 12.863 12.822 12.737 12.652 12.461 12.343 12.208 12.067 11.922 11.754 11.548 10.946 -9 ,23091 ,KEBNE ,17041367,Thu Dec 23 03:12:26 CET,Thu Dec 23 04:34:45 CET,0.0 0.271 0.452 0.589 0.707 0.831 0.948 1.047 1.219 1.302 1.396 1.463 1.675 1.761 1.928 2.09 2.252 2.334 2.509 2.684 2.918 3.063 3.214 3.439 3.641 3.835 4.021 4.196 4.424 4.644 4.859 5.13 5.386 5.63 5.918 6.238 6.547 6.885 7.245 7.651 8.085 8.542 9.08 9.651 10.304 11.019 11.825 12.754 13.818 14.993 16.285 17.159 17.491 17.591 17.588 17.496 17.365 17.209 17.054 16.884 16.709 16.527 16.328 16.141 15.969 15.803 15.639 15.49 15.348 15.196 15.032 14.887 14.733 14.578 14.461 14.332 14.2 14.049 13.894 13.801 13.694 13.5 13.371 13.244 13.171 13.008 12.849 12.681 12.592 12.383 12.301 12.202 12.081 11.792 11.636 11.486 11.312 11.107 10.862 10.55 9.921 -10 ,4802 ,KEBNE ,17041369,Thu Dec 23 03:12:26 CET,Thu Dec 23 04:34:33 CET,0.0 0.286 0.418 0.55 0.674 0.802 0.923 1.026 1.214 1.309 1.406 1.462 1.683 1.784 1.998 2.198 2.386 2.475 2.636 2.792 3.015 3.16 3.302 3.515 3.716 3.908 4.104 4.296 4.532 4.765 4.993 5.259 5.528 5.783 6.077 6.414 6.739 7.088 7.451 7.854 8.277 8.716 9.227 9.772 10.41 11.108 11.907 12.794 13.839 15.032 16.348 17.216 17.567 17.687 17.675 17.588 17.47 17.314 17.13 16.924 16.739 16.558 16.373 16.204 16.026 15.855 15.679 15.511 15.369 15.219 15.056 14.919 14.774 14.619 14.489 14.357 14.221 14.076 13.935 13.846 13.758 13.618 13.523 13.416 13.359 13.249 13.125 12.988 12.918 12.72 12.679 12.604 12.521 12.311 12.193 12.066 11.93 11.777 11.6 11.386 10.707 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt deleted file mode 100644 index 8704d801..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11905 ,KEBNE ,17041372,Thu Dec 23 03:17:35 CET,Thu Dec 23 04:41:35 CET,0.0 0.609 0.855 1.042 1.193 1.332 1.469 1.605 1.858 1.964 2.062 2.138 2.358 2.449 2.634 2.816 2.989 3.075 3.241 3.394 3.603 3.736 3.867 4.057 4.237 4.413 4.586 4.751 4.964 5.168 5.358 5.592 5.834 6.075 6.367 6.679 6.964 7.293 7.647 8.015 8.41 8.855 9.359 9.87 10.475 11.117 11.836 12.657 13.613 14.694 15.776 16.387 16.584 16.57 16.461 16.3 16.119 15.903 15.677 15.46 15.266 15.077 14.892 14.717 14.535 14.35 14.158 13.995 13.846 13.681 13.51 13.375 13.244 13.104 12.992 12.867 12.741 12.62 12.494 12.411 12.316 12.158 12.058 11.949 11.892 11.78 11.654 11.513 11.44 11.245 11.194 11.108 11.018 10.849 10.749 10.64 10.517 10.377 10.21 9.923 9.066 -2 ,25380 ,KEBNE ,17041374,Thu Dec 23 03:17:35 CET,Thu Dec 23 04:40:02 CET,0.0 0.531 0.758 0.945 1.09 1.213 1.347 1.473 1.675 1.769 1.883 1.96 2.173 2.264 2.425 2.58 2.735 2.812 2.961 3.094 3.291 3.42 3.552 3.739 3.913 4.084 4.263 4.452 4.687 4.905 5.115 5.372 5.626 5.864 6.146 6.466 6.763 7.102 7.462 7.822 8.195 8.613 9.091 9.584 10.178 10.81 11.513 12.322 13.262 14.331 15.408 15.973 16.13 16.149 16.063 15.893 15.706 15.529 15.348 15.12 14.893 14.681 14.485 14.298 14.12 13.942 13.75 13.582 13.429 13.261 13.098 12.965 12.801 12.625 12.504 12.378 12.243 12.108 11.969 11.857 11.741 11.571 11.44 11.295 11.219 11.074 10.935 10.781 10.692 10.475 10.378 10.269 10.154 9.875 9.718 9.558 9.383 9.173 8.914 8.593 7.679 -3 ,5322 ,KEBNE ,17041375,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:50 CET,0.0 0.607 0.873 1.081 1.318 1.547 1.731 1.892 2.213 2.359 2.494 2.611 2.844 2.95 3.155 3.373 3.573 3.665 3.84 4.007 4.254 4.405 4.543 4.761 4.973 5.16 5.343 5.524 5.765 5.99 6.199 6.451 6.703 6.944 7.217 7.525 7.822 8.162 8.527 8.893 9.276 9.708 10.211 10.712 11.29 11.944 12.687 13.487 14.408 15.448 16.547 17.179 17.397 17.437 17.326 17.17 17.001 16.813 16.642 16.454 16.26 16.074 15.89 15.707 15.533 15.373 15.188 15.017 14.868 14.714 14.558 14.418 14.272 14.123 14.002 13.87 13.734 13.594 13.442 13.331 13.22 13.041 12.904 12.772 12.702 12.552 12.401 12.224 12.124 11.893 11.777 11.672 11.559 11.299 11.174 11.035 10.875 10.71 10.523 10.285 9.63 -4 ,22692 ,KEBNE ,17041377,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:41:52 CET,0.0 0.843 1.076 1.284 1.472 1.626 1.749 1.866 2.087 2.191 2.297 2.363 2.576 2.669 2.853 3.031 3.205 3.291 3.455 3.611 3.858 4.016 4.177 4.421 4.625 4.819 5.013 5.196 5.423 5.645 5.865 6.132 6.382 6.613 6.902 7.242 7.552 7.869 8.196 8.565 8.966 9.408 9.926 10.438 11.027 11.675 12.399 13.22 14.131 15.077 16.102 16.788 16.996 16.994 16.91 16.747 16.577 16.393 16.189 15.959 15.768 15.607 15.425 15.232 15.044 14.872 14.682 14.508 14.359 14.21 14.045 13.899 13.748 13.582 13.449 13.316 13.17 13.011 12.841 12.724 12.615 12.444 12.32 12.191 12.119 11.966 11.807 11.645 11.564 11.363 11.286 11.179 11.072 10.828 10.668 10.514 10.382 10.231 10.075 9.844 8.689 -5 ,17940 ,KEBNE ,17041378,Thu Dec 23 03:17:37 CET,Thu Dec 23 04:39:55 CET,0.0 0.307 0.508 0.669 0.812 0.96 1.106 1.239 1.474 1.597 1.711 1.763 1.977 2.066 2.243 2.425 2.61 2.702 2.872 3.035 3.266 3.415 3.562 3.776 3.979 4.178 4.375 4.571 4.819 5.055 5.275 5.529 5.782 6.029 6.316 6.629 6.921 7.233 7.579 7.955 8.337 8.781 9.284 9.755 10.334 10.998 11.753 12.585 13.493 14.486 15.527 16.14 16.338 16.357 16.28 16.147 15.952 15.715 15.505 15.274 15.046 14.847 14.66 14.469 14.281 14.099 13.899 13.725 13.573 13.394 13.216 13.07 12.905 12.733 12.603 12.471 12.336 12.194 12.039 11.935 11.82 11.626 11.5 11.359 11.278 11.126 10.979 10.82 10.736 10.525 10.416 10.3 10.174 9.901 9.772 9.636 9.474 9.266 9.01 8.687 7.994 -6 ,31076 ,KEBNE ,17041380,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:51 CET,0.0 0.586 0.824 1.018 1.199 1.361 1.514 1.664 1.961 2.108 2.233 2.324 2.549 2.64 2.83 3.036 3.241 3.335 3.506 3.664 3.893 4.046 4.195 4.404 4.599 4.807 5.005 5.175 5.393 5.613 5.829 6.099 6.363 6.606 6.885 7.219 7.549 7.897 8.257 8.633 9.036 9.487 10.037 10.556 11.12 11.752 12.471 13.272 14.162 15.165 16.255 16.907 17.121 17.116 16.989 16.8 16.583 16.355 16.15 15.952 15.769 15.6 15.422 15.238 15.069 14.905 14.729 14.575 14.441 14.287 14.099 13.947 13.795 13.633 13.518 13.394 13.263 13.117 12.955 12.844 12.718 12.521 12.386 12.244 12.168 12.009 11.831 11.637 11.55 11.351 11.265 11.156 11.036 10.757 10.608 10.438 10.24 10.026 9.776 9.48 8.784 -7 ,10499 ,KEBNE ,17041382,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:40:10 CET,0.0 0.93 1.297 1.551 1.772 1.981 2.197 2.383 2.656 2.778 2.912 3.057 3.298 3.397 3.609 3.81 3.996 4.086 4.242 4.392 4.639 4.8 4.942 5.143 5.34 5.525 5.713 5.903 6.137 6.357 6.571 6.821 7.06 7.294 7.566 7.884 8.191 8.534 8.902 9.269 9.65 10.088 10.595 11.095 11.669 12.308 13.033 13.808 14.706 15.699 16.729 17.382 17.542 17.561 17.52 17.391 17.188 16.96 16.77 16.584 16.398 16.215 16.053 15.895 15.734 15.583 15.422 15.269 15.128 14.986 14.834 14.709 14.582 14.448 14.335 14.215 14.1 13.97 13.832 13.74 13.64 13.484 13.378 13.277 13.225 13.11 12.972 12.821 12.747 12.555 12.52 12.434 12.344 12.154 12.049 11.933 11.797 11.645 11.484 11.238 10.182 -8 ,18891 ,KEBNE ,17041383,Thu Dec 23 03:17:37 CET,Thu Dec 23 04:40:04 CET,0.0 0.501 0.724 0.915 1.097 1.247 1.386 1.534 1.823 1.949 2.073 2.204 2.444 2.553 2.778 2.972 3.15 3.241 3.418 3.592 3.854 4.014 4.162 4.37 4.577 4.787 4.983 5.161 5.393 5.623 5.84 6.091 6.326 6.571 6.868 7.192 7.492 7.827 8.203 8.581 8.97 9.417 9.922 10.415 10.97 11.567 12.269 13.11 14.047 15.086 16.214 16.836 17.017 17.031 16.92 16.725 16.508 16.284 16.07 15.87 15.688 15.492 15.295 15.087 14.882 14.7 14.509 14.336 14.184 14.015 13.831 13.685 13.532 13.355 13.219 13.089 12.95 12.802 12.64 12.52 12.398 12.218 12.099 11.963 11.888 11.734 11.577 11.418 11.331 11.118 11.028 10.917 10.809 10.582 10.467 10.338 10.192 10.018 9.792 9.493 8.794 -9 ,16739 ,KEBNE ,17041384,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:40:03 CET,0.0 0.971 1.262 1.488 1.68 1.873 2.047 2.211 2.512 2.638 2.768 2.908 3.142 3.244 3.437 3.617 3.8 3.894 4.07 4.232 4.486 4.65 4.796 5.012 5.209 5.389 5.583 5.768 5.996 6.227 6.451 6.706 6.947 7.198 7.486 7.801 8.103 8.435 8.797 9.179 9.581 10.012 10.518 11.028 11.595 12.234 12.994 13.818 14.753 15.783 16.856 17.543 17.759 17.746 17.617 17.455 17.254 17.004 16.785 16.556 16.357 16.188 16.012 15.834 15.651 15.481 15.308 15.147 15.002 14.833 14.652 14.503 14.342 14.184 14.059 13.91 13.755 13.587 13.417 13.311 13.194 13.004 12.87 12.74 12.671 12.532 12.39 12.23 12.151 11.958 11.925 11.843 11.754 11.553 11.448 11.336 11.187 11.019 10.875 10.672 9.808 -10 ,11672 ,KEBNE ,17041385,Thu Dec 23 03:17:35 CET,Thu Dec 23 04:40:14 CET,0.0 0.705 0.943 1.144 1.314 1.478 1.648 1.781 2.004 2.114 2.215 2.302 2.525 2.611 2.779 2.951 3.127 3.213 3.38 3.545 3.778 3.917 4.047 4.26 4.471 4.66 4.854 5.043 5.277 5.496 5.707 5.965 6.221 6.477 6.756 7.069 7.366 7.676 8.013 8.382 8.77 9.211 9.734 10.246 10.821 11.465 12.199 13.013 13.921 14.876 15.917 16.528 16.65 16.594 16.485 16.312 16.103 15.875 15.673 15.47 15.282 15.084 14.874 14.685 14.516 14.36 14.186 14.019 13.878 13.735 13.586 13.466 13.339 13.205 13.099 12.978 12.848 12.717 12.582 12.492 12.399 12.241 12.123 12.0 11.937 11.813 11.682 11.547 11.483 11.285 11.234 11.147 11.054 10.864 10.761 10.628 10.469 10.3 10.14 9.955 8.986 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt deleted file mode 100644 index 72b5861c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4901 ,KEBNE ,17041386,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:42 CET,0.0 0.526 0.832 1.042 1.211 1.366 1.525 1.683 1.944 2.055 2.172 2.271 2.501 2.602 2.798 2.973 3.14 3.211 3.355 3.507 3.7 3.819 3.941 4.118 4.289 4.44 4.579 4.721 4.905 5.077 5.239 5.431 5.614 5.789 5.978 6.196 6.415 6.638 6.859 7.092 7.329 7.582 7.853 8.092 8.367 8.686 8.98 9.225 9.379 9.305 8.88 7.998 7.068 6.207 5.468 4.792 4.187 3.645 3.145 2.651 2.223 1.82 1.446 1.084 0.731 0.399 0.07 -0.225 -0.5 -0.781 -1.059 -1.289 -1.525 -1.767 -1.968 -2.182 -2.4 -2.632 -2.871 -3.036 -3.212 -3.48 -3.664 -3.851 -3.95 -4.155 -4.371 -4.61 -4.741 -5.003 -5.14 -5.293 -5.448 -5.811 -6.016 -6.228 -6.47 -6.744 -7.044 -7.446 -8.952 -2 ,10002 ,KEBNE ,17041387,Thu Dec 23 03:17:40 CET,Thu Dec 23 04:36:23 CET,0.0 0.696 1.0 1.253 1.465 1.656 1.823 1.964 2.221 2.341 2.453 2.549 2.788 2.889 3.061 3.219 3.367 3.441 3.598 3.75 3.949 4.069 4.192 4.363 4.523 4.683 4.829 4.965 5.136 5.308 5.475 5.669 5.851 6.014 6.207 6.41 6.589 6.801 7.049 7.306 7.539 7.795 8.075 8.308 8.577 8.889 9.149 9.326 9.43 9.372 8.985 8.128 7.197 6.372 5.609 4.913 4.296 3.724 3.222 2.682 2.224 1.827 1.437 1.066 0.718 0.398 0.079 -0.201 -0.462 -0.755 -1.044 -1.287 -1.552 -1.815 -2.017 -2.225 -2.438 -2.657 -2.89 -3.054 -3.222 -3.506 -3.704 -3.889 -3.99 -4.217 -4.451 -4.697 -4.828 -5.097 -5.258 -5.426 -5.606 -5.968 -6.163 -6.36 -6.579 -6.841 -7.183 -7.675 -9.112 -3 ,6424 ,KEBNE ,17041388,Thu Dec 23 03:17:40 CET,Thu Dec 23 04:37:41 CET,0.0 0.317 0.507 0.647 0.76 0.871 0.971 1.072 1.292 1.383 1.461 1.477 1.681 1.757 1.917 2.084 2.243 2.318 2.466 2.612 2.799 2.906 3.015 3.178 3.347 3.514 3.656 3.795 3.974 4.134 4.286 4.466 4.643 4.821 5.018 5.227 5.419 5.64 5.881 6.115 6.352 6.583 6.825 7.063 7.318 7.595 7.847 8.024 8.129 8.089 7.705 6.796 5.855 5.072 4.358 3.662 3.016 2.406 1.876 1.368 0.933 0.551 0.187 -0.164 -0.507 -0.836 -1.18 -1.489 -1.758 -2.025 -2.291 -2.524 -2.769 -3.011 -3.21 -3.413 -3.616 -3.836 -4.079 -4.249 -4.423 -4.709 -4.897 -5.092 -5.201 -5.416 -5.619 -5.854 -5.979 -6.222 -6.324 -6.467 -6.605 -6.893 -7.053 -7.216 -7.387 -7.582 -7.847 -8.227 -9.552 -4 ,27739 ,KEBNE ,17041389,Thu Dec 23 03:17:40 CET,Thu Dec 23 04:33:54 CET,0.0 0.825 1.171 1.406 1.595 1.769 1.945 2.095 2.34 2.459 2.572 2.636 2.856 2.945 3.118 3.295 3.463 3.543 3.689 3.827 4.026 4.149 4.264 4.423 4.578 4.731 4.876 5.011 5.199 5.387 5.566 5.769 5.944 6.12 6.325 6.55 6.774 6.997 7.222 7.467 7.71 7.974 8.266 8.539 8.806 9.087 9.365 9.574 9.726 9.77 9.404 8.569 7.747 6.901 6.114 5.416 4.798 4.222 3.703 3.17 2.708 2.308 1.94 1.576 1.244 0.934 0.597 0.297 0.036 -0.245 -0.541 -0.781 -1.026 -1.292 -1.502 -1.719 -1.944 -2.167 -2.392 -2.557 -2.74 -3.021 -3.213 -3.41 -3.509 -3.726 -3.968 -4.207 -4.32 -4.568 -4.679 -4.81 -4.954 -5.259 -5.436 -5.64 -5.846 -6.087 -6.383 -6.749 -7.75 -5 ,29779 ,KEBNE ,17041390,Thu Dec 23 03:17:40 CET,Thu Dec 23 04:37:30 CET,0.0 0.759 1.11 1.362 1.577 1.767 1.928 2.076 2.348 2.476 2.595 2.682 2.906 2.995 3.175 3.348 3.498 3.572 3.717 3.861 4.057 4.178 4.31 4.501 4.667 4.816 4.95 5.078 5.26 5.44 5.603 5.8 5.988 6.158 6.35 6.564 6.754 6.953 7.166 7.395 7.611 7.823 8.083 8.352 8.625 8.872 9.109 9.286 9.393 9.396 9.009 8.196 7.34 6.467 5.726 5.082 4.485 3.955 3.495 2.995 2.54 2.158 1.807 1.47 1.147 0.837 0.491 0.19 -0.063 -0.339 -0.626 -0.857 -1.103 -1.374 -1.584 -1.801 -2.029 -2.256 -2.493 -2.661 -2.831 -3.096 -3.293 -3.498 -3.601 -3.818 -4.038 -4.265 -4.397 -4.675 -4.844 -4.999 -5.158 -5.529 -5.714 -5.904 -6.145 -6.394 -6.683 -7.133 -8.541 -6 ,17184 ,KEBNE ,17041391,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:38 CET,0.0 0.73 1.073 1.335 1.544 1.734 1.906 2.059 2.323 2.437 2.543 2.596 2.82 2.918 3.092 3.252 3.409 3.489 3.636 3.768 3.971 4.105 4.222 4.388 4.548 4.703 4.861 5.015 5.212 5.394 5.556 5.744 5.923 6.085 6.268 6.469 6.666 6.891 7.129 7.364 7.586 7.821 8.077 8.319 8.599 8.899 9.186 9.399 9.512 9.519 9.192 8.415 7.549 6.715 5.987 5.308 4.68 4.109 3.634 3.154 2.72 2.315 1.934 1.58 1.244 0.935 0.6 0.296 0.034 -0.245 -0.529 -0.764 -1.01 -1.261 -1.454 -1.66 -1.886 -2.123 -2.367 -2.534 -2.703 -2.977 -3.169 -3.361 -3.461 -3.671 -3.901 -4.145 -4.271 -4.537 -4.69 -4.859 -5.03 -5.375 -5.569 -5.783 -6.007 -6.261 -6.584 -7.053 -8.55 -7 ,7518 ,KEBNE ,17041392,Thu Dec 23 03:17:35 CET,Thu Dec 23 04:39:17 CET,0.0 0.311 0.523 0.69 0.822 0.949 1.062 1.167 1.362 1.447 1.532 1.575 1.782 1.853 1.994 2.123 2.247 2.309 2.425 2.543 2.727 2.851 2.974 3.15 3.314 3.468 3.616 3.757 3.94 4.114 4.271 4.459 4.641 4.817 5.016 5.229 5.431 5.646 5.864 6.084 6.322 6.592 6.874 7.131 7.407 7.667 7.921 8.146 8.299 8.237 7.75 6.82 5.931 5.097 4.322 3.617 2.968 2.342 1.824 1.306 0.851 0.442 0.054 -0.304 -0.658 -1.0 -1.347 -1.658 -1.926 -2.184 -2.459 -2.686 -2.926 -3.199 -3.4 -3.607 -3.84 -4.083 -4.318 -4.472 -4.648 -4.934 -5.123 -5.314 -5.408 -5.619 -5.864 -6.117 -6.249 -6.527 -6.701 -6.854 -7.021 -7.433 -7.659 -7.877 -8.108 -8.372 -8.692 -9.151 -10.6 -8 ,5833 ,KEBNE ,17041393,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:39 CET,0.0 0.345 0.587 0.76 0.916 1.057 1.18 1.305 1.513 1.601 1.695 1.769 2.001 2.098 2.277 2.451 2.608 2.682 2.821 2.954 3.152 3.288 3.42 3.59 3.764 3.925 4.066 4.209 4.383 4.55 4.725 4.941 5.144 5.335 5.547 5.77 5.966 6.176 6.421 6.688 6.96 7.225 7.473 7.736 8.051 8.322 8.573 8.833 9.05 9.051 8.646 7.733 6.757 5.878 5.078 4.357 3.706 3.108 2.629 2.145 1.708 1.316 0.937 0.583 0.242 -0.071 -0.386 -0.667 -0.91 -1.17 -1.432 -1.649 -1.893 -2.155 -2.347 -2.541 -2.747 -2.958 -3.179 -3.345 -3.516 -3.772 -3.954 -4.144 -4.241 -4.448 -4.666 -4.901 -5.027 -5.279 -5.405 -5.546 -5.706 -6.069 -6.251 -6.455 -6.698 -7.001 -7.384 -7.825 -8.977 -9 ,29220 ,KEBNE ,17041394,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:34 CET,0.0 0.481 0.651 0.819 0.971 1.1 1.217 1.319 1.517 1.605 1.693 1.752 1.97 2.061 2.235 2.399 2.551 2.623 2.771 2.916 3.115 3.237 3.351 3.521 3.695 3.857 4.007 4.144 4.32 4.49 4.656 4.849 5.025 5.19 5.391 5.619 5.833 6.053 6.273 6.523 6.784 7.055 7.33 7.559 7.825 8.081 8.305 8.505 8.647 8.623 8.284 7.609 6.797 6.01 5.316 4.634 4.007 3.448 2.952 2.455 2.051 1.673 1.305 0.947 0.599 0.283 -0.068 -0.379 -0.635 -0.902 -1.183 -1.407 -1.635 -1.875 -2.071 -2.27 -2.472 -2.711 -2.976 -3.147 -3.315 -3.596 -3.802 -4.0 -4.096 -4.299 -4.519 -4.747 -4.875 -5.15 -5.301 -5.455 -5.621 -5.98 -6.193 -6.425 -6.659 -6.948 -7.307 -7.838 -9.858 -10 ,25740 ,KEBNE ,17041395,Thu Dec 23 03:17:37 CET,Thu Dec 23 04:39:58 CET,0.0 0.836 1.165 1.407 1.61 1.778 1.932 2.074 2.324 2.451 2.565 2.643 2.873 2.968 3.136 3.296 3.475 3.559 3.716 3.869 4.069 4.188 4.31 4.496 4.669 4.84 5.003 5.163 5.363 5.538 5.706 5.909 6.095 6.268 6.46 6.674 6.878 7.098 7.358 7.631 7.885 8.151 8.443 8.723 9.033 9.319 9.566 9.786 9.889 9.807 9.426 8.621 7.772 6.918 6.135 5.437 4.827 4.273 3.765 3.24 2.779 2.374 2.0 1.651 1.315 1.012 0.698 0.404 0.149 -0.111 -0.375 -0.589 -0.823 -1.08 -1.277 -1.481 -1.682 -1.894 -2.126 -2.285 -2.451 -2.73 -2.927 -3.125 -3.221 -3.421 -3.635 -3.869 -3.999 -4.265 -4.415 -4.563 -4.706 -5.004 -5.179 -5.376 -5.596 -5.822 -6.091 -6.492 -7.695 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index 35a70595..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30460 ,KEBNE ,17041396,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:50 CET,0.0 0.677 0.87 1.027 1.186 1.332 1.47 1.592 1.838 1.973 2.097 2.189 2.42 2.517 2.696 2.861 3.036 3.118 3.262 3.413 3.638 3.778 3.902 4.084 4.271 4.447 4.617 4.791 5.013 5.199 5.374 5.609 5.837 6.049 6.297 6.577 6.829 7.09 7.371 7.669 7.979 8.331 8.731 9.1 9.501 9.957 10.469 11.005 11.55 12.038 12.349 12.223 11.802 11.308 10.853 10.403 9.952 9.528 9.149 8.748 8.38 8.047 7.726 7.408 7.094 6.817 6.53 6.263 6.041 5.822 5.593 5.398 5.2 4.997 4.842 4.683 4.524 4.347 4.155 4.022 3.871 3.632 3.48 3.323 3.242 3.075 2.89 2.702 2.598 2.364 2.266 2.134 2.001 1.698 1.509 1.299 1.086 0.868 0.619 0.281 -0.707 -2 ,24758 ,KEBNE ,17041397,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:30 CET,0.0 0.49 0.647 0.811 0.966 1.089 1.2 1.312 1.544 1.654 1.756 1.803 2.019 2.11 2.294 2.469 2.626 2.704 2.863 3.017 3.228 3.357 3.479 3.662 3.846 4.029 4.2 4.359 4.568 4.774 4.969 5.198 5.426 5.647 5.894 6.168 6.421 6.692 6.971 7.277 7.621 7.983 8.382 8.8 9.29 9.8 10.338 10.896 11.459 11.966 12.24 12.003 11.666 11.251 10.75 10.253 9.777 9.301 8.911 8.514 8.156 7.863 7.574 7.291 7.022 6.764 6.489 6.249 6.03 5.79 5.547 5.349 5.141 4.916 4.742 4.55 4.355 4.162 3.952 3.813 3.654 3.398 3.239 3.076 2.987 2.791 2.584 2.364 2.242 1.989 1.839 1.693 1.538 1.201 1.028 0.838 0.601 0.324 0.006 -0.455 -1.866 -3 ,28643 ,KEBNE ,17041398,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:50 CET,0.0 0.684 0.865 1.035 1.182 1.309 1.443 1.551 1.743 1.834 1.924 1.981 2.194 2.275 2.441 2.62 2.803 2.884 3.033 3.18 3.387 3.514 3.635 3.801 3.962 4.127 4.292 4.45 4.645 4.834 5.015 5.242 5.477 5.697 5.937 6.199 6.446 6.714 7.012 7.342 7.683 8.049 8.466 8.885 9.352 9.837 10.353 10.941 11.607 12.19 12.519 12.321 11.931 11.457 10.967 10.516 10.094 9.686 9.315 8.939 8.611 8.303 7.981 7.68 7.411 7.151 6.88 6.638 6.421 6.203 5.975 5.772 5.554 5.33 5.157 4.978 4.793 4.594 4.391 4.259 4.127 3.922 3.765 3.599 3.516 3.338 3.149 2.966 2.869 2.644 2.558 2.427 2.293 2.043 1.892 1.722 1.527 1.291 1.036 0.73 -0.48 -4 ,11148 ,KEBNE ,17041399,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:30 CET,0.0 0.504 0.806 1.015 1.173 1.307 1.425 1.528 1.722 1.818 1.905 1.939 2.155 2.246 2.416 2.572 2.714 2.782 2.912 3.041 3.23 3.346 3.461 3.621 3.765 3.91 4.058 4.201 4.378 4.553 4.729 4.944 5.147 5.339 5.566 5.823 6.065 6.339 6.629 6.925 7.233 7.572 7.955 8.32 8.761 9.249 9.755 10.273 10.854 11.418 11.733 11.61 11.256 10.786 10.295 9.814 9.348 8.883 8.473 8.06 7.697 7.386 7.095 6.809 6.532 6.271 6.014 5.782 5.565 5.341 5.109 4.908 4.69 4.465 4.292 4.105 3.906 3.693 3.47 3.325 3.175 2.945 2.799 2.653 2.575 2.4 2.204 2.012 1.912 1.669 1.552 1.438 1.309 0.997 0.802 0.575 0.334 0.099 -0.175 -0.629 -2.277 -5 ,20726 ,KEBNE ,17041400,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:37 CET,0.0 0.286 0.478 0.657 0.837 0.989 1.112 1.23 1.481 1.607 1.726 1.806 2.032 2.124 2.313 2.5 2.663 2.74 2.896 3.045 3.251 3.382 3.511 3.692 3.867 4.035 4.206 4.376 4.586 4.794 4.995 5.233 5.457 5.666 5.905 6.164 6.42 6.705 7.006 7.337 7.655 7.989 8.402 8.82 9.288 9.793 10.338 10.854 11.373 11.848 12.103 11.941 11.61 11.173 10.689 10.253 9.844 9.41 9.034 8.641 8.275 7.953 7.639 7.349 7.078 6.823 6.548 6.298 6.081 5.849 5.606 5.398 5.17 4.947 4.776 4.589 4.39 4.183 3.965 3.806 3.651 3.419 3.237 3.046 2.949 2.752 2.57 2.37 2.255 2.015 1.895 1.762 1.628 1.348 1.189 1.017 0.84 0.653 0.4 0.025 -1.059 -6 ,28076 ,KEBNE ,17041401,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:42 CET,0.0 0.467 0.721 0.906 1.072 1.205 1.323 1.439 1.685 1.802 1.902 1.947 2.164 2.249 2.41 2.559 2.702 2.769 2.907 3.05 3.26 3.389 3.511 3.693 3.874 4.056 4.226 4.385 4.591 4.786 4.974 5.203 5.419 5.637 5.881 6.134 6.385 6.663 6.954 7.279 7.628 8.003 8.397 8.772 9.229 9.71 10.228 10.745 11.273 11.817 12.187 12.039 11.675 11.268 10.8 10.312 9.865 9.419 9.021 8.625 8.275 7.974 7.66 7.343 7.041 6.753 6.457 6.197 5.972 5.736 5.502 5.305 5.088 4.871 4.696 4.512 4.322 4.124 3.911 3.764 3.611 3.377 3.218 3.031 2.93 2.717 2.495 2.278 2.169 1.93 1.837 1.725 1.588 1.286 1.135 0.964 0.769 0.544 0.241 -0.157 -1.602 -7 ,19344 ,KEBNE ,17041402,Thu Dec 23 03:17:37 CET,Thu Dec 23 04:39:41 CET,0.0 1.108 1.447 1.71 1.918 2.092 2.258 2.405 2.665 2.796 2.912 3.0 3.224 3.321 3.514 3.686 3.839 3.913 4.065 4.211 4.423 4.564 4.701 4.897 5.081 5.252 5.417 5.58 5.781 5.982 6.169 6.386 6.6 6.807 7.047 7.297 7.544 7.827 8.12 8.427 8.744 9.105 9.51 9.871 10.301 10.777 11.257 11.778 12.322 12.799 13.098 13.009 12.598 12.102 11.613 11.129 10.72 10.339 9.965 9.55 9.173 8.841 8.521 8.205 7.913 7.649 7.373 7.126 6.904 6.661 6.398 6.172 5.952 5.729 5.549 5.364 5.162 4.94 4.717 4.564 4.399 4.138 3.96 3.792 3.709 3.524 3.331 3.125 3.015 2.776 2.657 2.528 2.381 2.054 1.87 1.67 1.445 1.181 0.874 0.458 -1.001 -8 ,29323 ,KEBNE ,17041403,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:39:33 CET,0.0 0.511 0.822 1.07 1.268 1.435 1.595 1.749 2.041 2.174 2.292 2.366 2.587 2.686 2.883 3.053 3.213 3.289 3.444 3.606 3.83 3.96 4.082 4.257 4.43 4.598 4.755 4.903 5.095 5.281 5.48 5.716 5.928 6.134 6.367 6.641 6.908 7.189 7.481 7.786 8.102 8.446 8.857 9.269 9.739 10.238 10.758 11.288 11.854 12.352 12.653 12.586 12.281 11.872 11.437 11.025 10.626 10.212 9.836 9.444 9.089 8.765 8.438 8.121 7.832 7.564 7.287 7.037 6.824 6.605 6.359 6.158 5.948 5.716 5.531 5.347 5.165 4.974 4.782 4.654 4.513 4.284 4.119 3.948 3.861 3.68 3.489 3.288 3.177 2.937 2.854 2.738 2.618 2.367 2.213 2.05 1.861 1.625 1.337 0.979 -0.157 -9 ,4584 ,KEBNE ,17041404,Thu Dec 23 03:17:37 CET,Thu Dec 23 04:39:31 CET,0.0 0.967 1.331 1.592 1.781 1.932 2.077 2.203 2.44 2.55 2.661 2.748 2.978 3.082 3.27 3.451 3.64 3.726 3.876 4.026 4.231 4.352 4.469 4.651 4.837 5.02 5.191 5.361 5.575 5.766 5.963 6.206 6.431 6.641 6.883 7.171 7.444 7.725 8.028 8.346 8.678 9.041 9.453 9.858 10.316 10.801 11.318 11.828 12.348 12.862 13.164 13.008 12.592 12.11 11.617 11.126 10.678 10.252 9.867 9.471 9.124 8.819 8.507 8.196 7.91 7.643 7.347 7.075 6.848 6.625 6.394 6.209 6.02 5.801 5.62 5.432 5.23 5.008 4.78 4.631 4.481 4.24 4.066 3.882 3.782 3.579 3.364 3.14 3.029 2.791 2.649 2.497 2.351 2.034 1.85 1.658 1.427 1.16 0.826 0.353 -0.922 -10 ,4162 ,KEBNE ,17041405,Thu Dec 23 03:17:35 CET,Thu Dec 23 04:41:49 CET,0.0 0.7 0.942 1.152 1.334 1.495 1.646 1.799 2.089 2.205 2.311 2.388 2.606 2.699 2.891 3.061 3.22 3.3 3.456 3.609 3.824 3.961 4.091 4.274 4.452 4.616 4.78 4.952 5.167 5.365 5.563 5.789 6.003 6.224 6.471 6.729 6.977 7.256 7.545 7.84 8.157 8.521 8.946 9.352 9.776 10.237 10.741 11.267 11.854 12.378 12.693 12.529 12.106 11.623 11.129 10.627 10.146 9.699 9.308 8.906 8.543 8.231 7.928 7.621 7.342 7.098 6.824 6.55 6.32 6.098 5.851 5.639 5.423 5.195 5.026 4.851 4.66 4.454 4.236 4.085 3.916 3.649 3.471 3.277 3.176 2.982 2.77 2.542 2.425 2.186 2.045 1.881 1.717 1.389 1.207 1.013 0.785 0.509 0.146 -0.372 -1.705 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt deleted file mode 100644 index d1eb7a9d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11269 ,KEBNE ,17041406,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:40:43 CET,0.0 0.584 0.797 0.975 1.13 1.253 1.368 1.486 1.718 1.821 1.914 1.974 2.194 2.275 2.422 2.559 2.695 2.762 2.883 2.998 3.159 3.261 3.363 3.512 3.658 3.798 3.937 4.075 4.25 4.418 4.581 4.79 4.981 5.16 5.366 5.589 5.826 6.09 6.368 6.656 6.953 7.293 7.661 8.019 8.425 8.865 9.366 9.853 10.332 10.746 10.966 10.721 10.264 9.775 9.29 8.808 8.353 7.932 7.547 7.153 6.805 6.493 6.205 5.917 5.631 5.382 5.129 4.875 4.654 4.437 4.222 4.041 3.851 3.655 3.495 3.322 3.134 2.938 2.739 2.606 2.466 2.249 2.097 1.947 1.869 1.701 1.512 1.312 1.217 0.993 0.904 0.786 0.664 0.367 0.201 0.039 -0.145 -0.365 -0.62 -0.93 -1.9 -2 ,7210 ,KEBNE ,17041407,Thu Dec 23 03:17:36 CET,Thu Dec 23 04:40:23 CET,0.0 0.712 0.977 1.125 1.25 1.37 1.48 1.585 1.793 1.897 1.994 2.022 2.225 2.299 2.46 2.613 2.747 2.818 2.954 3.07 3.256 3.388 3.519 3.71 3.883 4.054 4.229 4.393 4.596 4.777 4.947 5.167 5.389 5.588 5.805 6.048 6.296 6.588 6.88 7.169 7.468 7.803 8.177 8.539 8.966 9.399 9.869 10.379 10.913 11.414 11.664 11.375 10.88 10.326 9.811 9.31 8.825 8.385 8.0 7.584 7.219 6.891 6.56 6.269 6.01 5.757 5.496 5.254 5.038 4.826 4.603 4.408 4.192 3.962 3.791 3.614 3.434 3.247 3.047 2.913 2.777 2.564 2.409 2.249 2.159 1.981 1.816 1.637 1.543 1.307 1.175 1.041 0.915 0.658 0.504 0.321 0.118 -0.105 -0.392 -0.78 -1.372 -3 ,28477 ,KEBNE ,17041408,Thu Dec 23 03:17:35 CET,Thu Dec 23 04:41:30 CET,0.0 0.433 0.607 0.773 0.942 1.101 1.225 1.359 1.596 1.685 1.782 1.841 2.061 2.152 2.321 2.486 2.658 2.742 2.892 3.051 3.282 3.417 3.546 3.72 3.896 4.064 4.219 4.368 4.56 4.753 4.945 5.177 5.401 5.614 5.852 6.116 6.358 6.614 6.899 7.225 7.574 7.929 8.308 8.683 9.111 9.551 10.028 10.533 11.003 11.366 11.524 11.286 10.78 10.243 9.79 9.293 8.801 8.373 8.002 7.587 7.217 6.894 6.587 6.29 5.996 5.728 5.458 5.214 4.995 4.782 4.556 4.354 4.149 3.938 3.772 3.597 3.421 3.234 3.04 2.903 2.758 2.535 2.377 2.212 2.13 1.956 1.759 1.549 1.444 1.214 1.12 0.99 0.847 0.553 0.406 0.247 0.062 -0.144 -0.378 -0.669 -1.352 -4 ,15169 ,KEBNE ,17041409,Thu Dec 23 03:17:35 CET,Thu Dec 23 04:40:12 CET,0.0 0.609 0.89 1.099 1.294 1.479 1.651 1.796 2.006 2.102 2.203 2.286 2.513 2.614 2.805 2.973 3.146 3.233 3.384 3.52 3.729 3.874 4.006 4.194 4.372 4.538 4.703 4.865 5.077 5.272 5.448 5.67 5.894 6.117 6.374 6.647 6.897 7.167 7.461 7.768 8.068 8.398 8.792 9.145 9.532 9.97 10.436 10.925 11.415 11.826 12.034 11.776 11.305 10.809 10.316 9.817 9.346 8.9 8.512 8.108 7.757 7.446 7.125 6.827 6.559 6.309 6.052 5.832 5.634 5.417 5.188 5.001 4.805 4.602 4.437 4.269 4.102 3.927 3.743 3.618 3.48 3.252 3.101 2.936 2.85 2.672 2.487 2.299 2.204 1.987 1.893 1.771 1.647 1.345 1.171 0.988 0.796 0.58 0.36 0.048 -0.672 -5 ,9469 ,KEBNE ,17041410,Thu Dec 23 03:17:35 CET,Thu Dec 23 04:41:34 CET,0.0 0.83 1.058 1.2 1.356 1.519 1.68 1.831 2.076 2.195 2.309 2.4 2.631 2.729 2.92 3.085 3.245 3.327 3.48 3.627 3.842 3.984 4.12 4.297 4.459 4.622 4.791 4.956 5.153 5.339 5.521 5.746 5.967 6.172 6.393 6.65 6.905 7.17 7.454 7.746 8.052 8.394 8.769 9.12 9.546 10.035 10.524 11.007 11.497 11.93 12.161 11.968 11.558 11.069 10.585 10.098 9.624 9.168 8.78 8.404 8.082 7.785 7.478 7.167 6.875 6.622 6.348 6.093 5.876 5.662 5.442 5.253 5.06 4.858 4.696 4.538 4.378 4.209 4.037 3.911 3.77 3.549 3.41 3.274 3.204 3.055 2.898 2.74 2.651 2.435 2.38 2.276 2.173 1.97 1.84 1.691 1.542 1.372 1.161 0.893 0.465 -6 ,11406 ,KEBNE ,17041411,Thu Dec 23 03:17:37 CET,Thu Dec 23 04:39:58 CET,0.0 0.6 0.845 1.031 1.184 1.334 1.467 1.566 1.771 1.873 1.955 1.956 2.159 2.236 2.379 2.528 2.687 2.764 2.921 3.071 3.269 3.402 3.538 3.722 3.91 4.099 4.263 4.408 4.606 4.8 4.98 5.205 5.419 5.631 5.88 6.139 6.376 6.624 6.895 7.182 7.481 7.824 8.22 8.612 9.042 9.475 9.945 10.426 10.914 11.371 11.548 11.251 10.855 10.407 9.932 9.451 8.981 8.55 8.187 7.801 7.454 7.128 6.806 6.509 6.236 5.983 5.715 5.475 5.263 5.05 4.82 4.623 4.428 4.226 4.065 3.897 3.727 3.537 3.336 3.202 3.061 2.83 2.664 2.49 2.403 2.233 2.053 1.858 1.752 1.51 1.391 1.271 1.136 0.824 0.649 0.455 0.241 0.021 -0.213 -0.497 -1.282 -7 ,27179 ,KEBNE ,17041412,Thu Dec 23 03:21:44 CET,Thu Dec 23 04:44:22 CET,0.0 0.677 0.894 1.058 1.222 1.364 1.504 1.626 1.829 1.928 2.03 2.112 2.331 2.41 2.56 2.697 2.84 2.911 3.049 3.173 3.343 3.462 3.575 3.732 3.889 4.041 4.19 4.345 4.545 4.729 4.904 5.132 5.348 5.544 5.779 6.045 6.295 6.555 6.82 7.129 7.466 7.824 8.225 8.608 9.029 9.493 9.987 10.503 11.023 11.422 11.607 11.316 10.869 10.416 9.938 9.423 8.936 8.494 8.093 7.691 7.351 7.031 6.728 6.441 6.163 5.912 5.636 5.389 5.164 4.934 4.714 4.528 4.327 4.11 3.954 3.783 3.592 3.391 3.183 3.043 2.904 2.695 2.55 2.401 2.318 2.136 1.955 1.756 1.637 1.399 1.291 1.16 1.032 0.767 0.612 0.45 0.258 0.029 -0.242 -0.633 -1.438 -8 ,729 ,KEBNE ,17041413,Thu Dec 23 03:21:44 CET,Thu Dec 23 04:44:11 CET,0.0 0.887 1.218 1.471 1.68 1.875 2.046 2.203 2.482 2.601 2.716 2.792 3.015 3.109 3.271 3.445 3.624 3.706 3.86 4.01 4.234 4.371 4.501 4.686 4.859 5.027 5.186 5.345 5.551 5.733 5.907 6.122 6.333 6.538 6.761 7.002 7.246 7.502 7.77 8.071 8.385 8.724 9.096 9.473 9.912 10.354 10.834 11.345 11.892 12.451 12.807 12.633 12.203 11.718 11.232 10.764 10.314 9.867 9.46 9.066 8.724 8.4 8.086 7.807 7.531 7.263 7.005 6.769 6.549 6.315 6.081 5.888 5.683 5.481 5.321 5.145 4.977 4.799 4.596 4.459 4.316 4.087 3.933 3.777 3.697 3.534 3.366 3.181 3.082 2.849 2.724 2.591 2.456 2.138 1.952 1.762 1.566 1.356 1.088 0.706 -0.251 -9 ,6489 ,KEBNE ,17041414,Thu Dec 23 03:21:44 CET,Thu Dec 23 04:44:26 CET,0.0 0.603 0.881 1.108 1.303 1.451 1.587 1.708 1.918 2.025 2.13 2.183 2.398 2.483 2.641 2.794 2.93 2.998 3.133 3.269 3.466 3.58 3.683 3.837 3.998 4.167 4.345 4.511 4.703 4.902 5.105 5.33 5.548 5.762 6.0 6.264 6.521 6.795 7.073 7.352 7.663 8.03 8.422 8.79 9.186 9.603 10.066 10.541 11.019 11.411 11.614 11.386 10.91 10.414 9.911 9.409 8.946 8.482 8.087 7.696 7.335 7.011 6.697 6.398 6.13 5.882 5.608 5.368 5.164 4.95 4.73 4.547 4.346 4.133 3.971 3.796 3.609 3.41 3.211 3.087 2.955 2.73 2.572 2.415 2.331 2.142 1.953 1.756 1.65 1.42 1.33 1.206 1.075 0.827 0.685 0.521 0.361 0.198 0.03 -0.188 -0.679 -10 ,32417 ,KEBNE ,17041415,Thu Dec 23 03:21:44 CET,Thu Dec 23 04:44:08 CET,0.0 0.526 0.732 0.921 1.085 1.215 1.341 1.469 1.696 1.799 1.901 1.97 2.194 2.286 2.458 2.63 2.797 2.869 3.016 3.17 3.37 3.503 3.639 3.823 3.99 4.152 4.315 4.478 4.684 4.876 5.063 5.305 5.533 5.741 5.981 6.25 6.521 6.808 7.083 7.376 7.683 8.016 8.411 8.786 9.191 9.624 10.117 10.64 11.138 11.602 11.853 11.652 11.279 10.839 10.388 9.888 9.413 8.983 8.593 8.212 7.877 7.561 7.238 6.929 6.639 6.385 6.119 5.856 5.627 5.393 5.151 4.956 4.756 4.541 4.372 4.211 4.043 3.848 3.647 3.519 3.393 3.183 3.026 2.851 2.761 2.584 2.4 2.218 2.122 1.885 1.776 1.656 1.527 1.257 1.09 0.893 0.695 0.495 0.242 -0.096 -0.63 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt deleted file mode 100644 index 3ff2f54b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30836 ,KEBNE ,17041416,Thu Dec 23 03:21:44 CET,Thu Dec 23 04:43:41 CET,0.0 0.805 1.05 1.224 1.358 1.425 1.497 1.556 1.619 1.65 1.671 1.579 1.705 1.709 1.702 1.696 1.681 1.668 1.635 1.594 1.534 1.482 1.421 1.332 1.238 1.14 1.023 0.903 0.745 0.574 0.389 0.142 -0.12 -0.386 -0.707 -1.093 -1.498 -1.972 -2.523 -3.155 -3.866 -4.743 -5.842 -7.021 -8.518 -10.376 -12.762 -15.814 -19.942 -25.581 -34.03 -43.005 -49.588 -54.766 -58.941 -62.43 -65.295 -67.781 -69.859 -71.842 -73.456 -74.843 -76.134 -77.324 -78.412 -79.371 -80.332 -81.157 -81.847 -82.552 -83.295 -83.908 -84.528 -85.159 -85.639 -86.132 -86.632 -87.13 -87.616 -87.937 -88.281 -88.826 -89.187 -89.558 -89.755 -90.144 -90.537 -90.94 -91.143 -91.579 -91.833 -92.07 -92.315 -92.842 -93.108 -93.366 -93.658 -93.981 -94.307 -94.711 -95.794 -2 ,32576 ,KEBNE ,17041417,Thu Dec 23 03:21:44 CET,Thu Dec 23 04:43:53 CET,0.0 0.52 0.655 0.751 0.807 0.835 0.85 0.871 0.905 0.905 0.903 0.774 0.884 0.872 0.831 0.781 0.735 0.708 0.652 0.587 0.489 0.43 0.361 0.246 0.124 -0.003 -0.136 -0.275 -0.461 -0.653 -0.852 -1.122 -1.398 -1.673 -2.009 -2.397 -2.776 -3.228 -3.778 -4.414 -5.122 -5.969 -7.072 -8.281 -9.763 -11.603 -14.041 -17.124 -21.213 -26.889 -35.398 -44.318 -50.993 -56.262 -60.44 -63.943 -66.841 -69.34 -71.406 -73.394 -75.054 -76.484 -77.787 -78.99 -80.098 -81.086 -82.07 -82.905 -83.628 -84.369 -85.109 -85.705 -86.32 -86.944 -87.416 -87.896 -88.38 -88.865 -89.356 -89.691 -90.04 -90.583 -90.941 -91.31 -91.498 -91.878 -92.281 -92.695 -92.905 -93.339 -93.567 -93.781 -94.005 -94.497 -94.758 -95.035 -95.323 -95.631 -95.943 -96.247 -96.702 -3 ,27357 ,KEBNE ,17041419,Thu Dec 23 03:22:49 CET,Thu Dec 23 04:45:35 CET,0.0 0.248 0.332 0.381 0.424 0.451 0.476 0.496 0.516 0.516 0.514 0.399 0.518 0.506 0.472 0.436 0.386 0.361 0.311 0.251 0.166 0.109 0.045 -0.071 -0.187 -0.304 -0.435 -0.555 -0.705 -0.869 -1.047 -1.293 -1.549 -1.803 -2.112 -2.498 -2.911 -3.382 -3.915 -4.511 -5.193 -6.045 -7.132 -8.315 -9.798 -11.649 -14.045 -17.103 -21.188 -26.822 -35.295 -44.306 -51.012 -56.218 -60.408 -63.961 -66.863 -69.349 -71.437 -73.446 -75.097 -76.519 -77.822 -79.009 -80.096 -81.07 -82.049 -82.89 -83.61 -84.353 -85.096 -85.683 -86.263 -86.854 -87.307 -87.749 -88.192 -88.667 -89.146 -89.466 -89.806 -90.307 -90.647 -90.996 -91.175 -91.546 -91.922 -92.296 -92.478 -92.889 -93.076 -93.282 -93.49 -93.922 -94.149 -94.393 -94.651 -94.915 -95.188 -95.493 -96.05 -4 ,29844 ,KEBNE ,17041420,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:44:37 CET,0.0 0.395 0.541 0.662 0.742 0.776 0.792 0.804 0.821 0.824 0.828 0.699 0.81 0.805 0.776 0.734 0.685 0.663 0.616 0.552 0.452 0.391 0.321 0.2 0.082 -0.038 -0.177 -0.311 -0.471 -0.651 -0.843 -1.083 -1.326 -1.576 -1.887 -2.275 -2.68 -3.162 -3.71 -4.328 -5.029 -5.874 -6.986 -8.222 -9.77 -11.688 -14.141 -17.17 -21.218 -26.938 -35.472 -44.531 -51.252 -56.541 -60.799 -64.325 -67.251 -69.775 -71.869 -73.9 -75.569 -76.987 -78.299 -79.49 -80.564 -81.528 -82.516 -83.367 -84.071 -84.794 -85.541 -86.149 -86.757 -87.373 -87.848 -88.328 -88.813 -89.309 -89.818 -90.161 -90.508 -91.042 -91.397 -91.752 -91.933 -92.31 -92.707 -93.108 -93.309 -93.735 -93.955 -94.188 -94.435 -94.97 -95.268 -95.568 -95.881 -96.223 -96.629 -97.185 -98.572 -5 ,8007 ,KEBNE ,17041422,Thu Dec 23 03:22:47 CET,Thu Dec 23 04:45:05 CET,0.0 0.404 0.512 0.6 0.678 0.736 0.762 0.779 0.798 0.802 0.81 0.701 0.81 0.8 0.779 0.759 0.729 0.71 0.669 0.622 0.548 0.483 0.407 0.3 0.194 0.084 -0.037 -0.172 -0.351 -0.534 -0.717 -0.959 -1.212 -1.473 -1.796 -2.172 -2.558 -3.022 -3.591 -4.236 -4.924 -5.759 -6.853 -8.076 -9.627 -11.505 -13.914 -17.011 -21.195 -26.929 -35.412 -44.469 -51.205 -56.43 -60.658 -64.229 -67.144 -69.654 -71.703 -73.668 -75.307 -76.706 -78.021 -79.245 -80.337 -81.293 -82.274 -83.129 -83.857 -84.622 -85.376 -85.961 -86.575 -87.207 -87.678 -88.145 -88.619 -89.104 -89.595 -89.923 -90.246 -90.739 -91.067 -91.41 -91.589 -91.943 -92.32 -92.697 -92.875 -93.279 -93.452 -93.655 -93.855 -94.273 -94.512 -94.758 -95.018 -95.3 -95.6 -95.956 -96.511 -6 ,19786 ,KEBNE ,17041423,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:46:09 CET,0.0 0.462 0.595 0.739 0.863 0.944 1.012 1.074 1.154 1.184 1.215 1.155 1.285 1.288 1.291 1.281 1.262 1.247 1.204 1.168 1.112 1.062 1.008 0.917 0.814 0.708 0.595 0.468 0.298 0.129 -0.052 -0.29 -0.532 -0.78 -1.092 -1.465 -1.868 -2.358 -2.901 -3.501 -4.203 -5.083 -6.165 -7.372 -8.92 -10.81 -13.253 -16.346 -20.486 -26.175 -34.701 -43.766 -50.367 -55.546 -59.811 -63.436 -66.387 -68.863 -70.897 -72.873 -74.515 -75.911 -77.207 -78.4 -79.48 -80.441 -81.399 -82.234 -82.944 -83.668 -84.401 -84.985 -85.579 -86.205 -86.695 -87.171 -87.647 -88.136 -88.627 -88.968 -89.312 -89.85 -90.221 -90.587 -90.773 -91.164 -91.576 -91.99 -92.195 -92.619 -92.854 -93.1 -93.338 -93.836 -94.105 -94.366 -94.64 -94.946 -95.302 -95.751 -96.577 -7 ,25419 ,KEBNE ,17041424,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:45:11 CET,0.0 0.858 1.101 1.255 1.385 1.505 1.593 1.665 1.751 1.77 1.793 1.695 1.815 1.813 1.79 1.781 1.757 1.739 1.701 1.67 1.62 1.575 1.524 1.427 1.335 1.244 1.136 1.022 0.868 0.713 0.547 0.332 0.104 -0.155 -0.469 -0.831 -1.222 -1.694 -2.235 -2.841 -3.526 -4.392 -5.508 -6.714 -8.229 -10.094 -12.521 -15.628 -19.752 -25.496 -34.108 -43.219 -49.972 -55.222 -59.373 -62.877 -65.827 -68.328 -70.365 -72.332 -73.963 -75.376 -76.694 -77.892 -78.98 -79.941 -80.915 -81.755 -82.469 -83.2 -83.937 -84.54 -85.156 -85.776 -86.248 -86.731 -87.22 -87.709 -88.208 -88.551 -88.899 -89.43 -89.8 -90.18 -90.373 -90.772 -91.177 -91.575 -91.78 -92.203 -92.406 -92.649 -92.9 -93.371 -93.614 -93.878 -94.174 -94.527 -94.913 -95.372 -96.277 -8 ,7510 ,KEBNE ,17041426,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:44:51 CET,0.0 0.63 0.889 1.091 1.225 1.321 1.388 1.437 1.515 1.548 1.583 1.512 1.635 1.644 1.642 1.621 1.589 1.572 1.55 1.529 1.478 1.433 1.376 1.267 1.149 1.033 0.919 0.805 0.649 0.484 0.306 0.073 -0.162 -0.401 -0.703 -1.095 -1.5 -1.976 -2.52 -3.142 -3.848 -4.697 -5.788 -6.976 -8.491 -10.369 -12.801 -15.898 -20.022 -25.779 -34.359 -43.437 -50.174 -55.418 -59.612 -63.111 -66.0 -68.513 -70.604 -72.593 -74.206 -75.582 -76.875 -78.075 -79.156 -80.113 -81.089 -81.948 -82.668 -83.382 -84.104 -84.691 -85.29 -85.9 -86.363 -86.835 -87.32 -87.81 -88.294 -88.63 -88.984 -89.525 -89.898 -90.274 -90.46 -90.838 -91.234 -91.643 -91.851 -92.283 -92.503 -92.728 -92.959 -93.42 -93.659 -93.934 -94.246 -94.595 -94.947 -95.367 -96.362 -9 ,22667 ,KEBNE ,17041428,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:44:50 CET,0.0 0.165 0.289 0.38 0.416 0.44 0.475 0.508 0.546 0.553 0.556 0.45 0.575 0.582 0.579 0.565 0.548 0.541 0.521 0.481 0.421 0.388 0.342 0.249 0.152 0.063 -0.033 -0.147 -0.311 -0.479 -0.651 -0.882 -1.128 -1.382 -1.706 -2.08 -2.465 -2.925 -3.453 -4.065 -4.767 -5.652 -6.789 -8.012 -9.562 -11.479 -13.939 -17.063 -21.189 -26.919 -35.414 -44.273 -50.921 -56.151 -60.326 -63.847 -66.759 -69.269 -71.327 -73.281 -74.9 -76.293 -77.597 -78.813 -79.881 -80.812 -81.783 -82.635 -83.345 -84.068 -84.822 -85.433 -86.051 -86.681 -87.151 -87.628 -88.116 -88.607 -89.117 -89.468 -89.816 -90.337 -90.707 -91.078 -91.263 -91.633 -92.013 -92.41 -92.615 -93.049 -93.29 -93.528 -93.774 -94.281 -94.549 -94.825 -95.101 -95.397 -95.717 -96.074 -96.674 -10 ,7696 ,KEBNE ,17041430,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:45:04 CET,0.0 0.521 0.725 0.885 0.999 1.097 1.182 1.251 1.326 1.342 1.359 1.278 1.396 1.392 1.387 1.38 1.348 1.324 1.282 1.245 1.184 1.137 1.09 1.014 0.928 0.832 0.72 0.596 0.433 0.263 0.086 -0.152 -0.41 -0.661 -0.966 -1.35 -1.75 -2.22 -2.757 -3.356 -4.028 -4.851 -5.921 -7.118 -8.643 -10.503 -12.9 -15.951 -20.016 -25.677 -34.147 -43.106 -49.8 -55.099 -59.317 -62.788 -65.69 -68.199 -70.275 -72.3 -73.964 -75.39 -76.699 -77.891 -78.977 -79.947 -80.915 -81.756 -82.48 -83.206 -83.947 -84.549 -85.155 -85.785 -86.273 -86.754 -87.237 -87.743 -88.261 -88.599 -88.933 -89.462 -89.835 -90.213 -90.397 -90.76 -91.126 -91.503 -91.699 -92.109 -92.273 -92.473 -92.678 -93.12 -93.355 -93.595 -93.855 -94.133 -94.443 -94.798 -95.436 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt deleted file mode 100644 index d971dce3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26672 ,KEBNE ,17041432,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:45:01 CET,0.0 0.54 0.751 0.915 1.059 1.197 1.323 1.437 1.641 1.732 1.819 1.863 2.053 2.132 2.284 2.433 2.582 2.65 2.797 2.931 3.114 3.235 3.365 3.556 3.727 3.891 4.046 4.206 4.411 4.606 4.793 5.004 5.202 5.391 5.614 5.871 6.12 6.397 6.697 7.009 7.335 7.699 8.105 8.502 8.943 9.409 9.939 10.482 11.055 11.619 12.022 12.057 11.884 11.649 11.375 11.036 10.68 10.338 10.028 9.722 9.459 9.191 8.922 8.668 8.436 8.221 7.989 7.776 7.595 7.405 7.194 7.013 6.82 6.623 6.466 6.3 6.129 5.939 5.742 5.614 5.483 5.267 5.117 4.964 4.883 4.725 4.565 4.387 4.288 4.064 3.985 3.887 3.77 3.512 3.382 3.225 3.051 2.859 2.633 2.369 1.546 -2 ,5350 ,KEBNE ,17041434,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:44:56 CET,0.0 0.476 0.7 0.872 1.004 1.122 1.221 1.316 1.507 1.6 1.691 1.752 1.958 2.044 2.207 2.376 2.543 2.624 2.768 2.898 3.114 3.247 3.368 3.554 3.736 3.908 4.072 4.232 4.441 4.637 4.82 5.033 5.233 5.426 5.656 5.913 6.154 6.42 6.705 7.004 7.329 7.699 8.106 8.503 8.953 9.42 9.939 10.479 11.042 11.582 11.981 11.973 11.716 11.388 11.035 10.668 10.329 10.018 9.733 9.433 9.144 8.86 8.597 8.361 8.118 7.878 7.651 7.453 7.271 7.082 6.893 6.73 6.554 6.37 6.219 6.068 5.905 5.724 5.535 5.41 5.286 5.084 4.943 4.789 4.703 4.523 4.338 4.146 4.05 3.837 3.731 3.609 3.477 3.161 2.974 2.789 2.585 2.364 2.101 1.699 0.475 -3 ,2932 ,KEBNE ,17041435,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:45:03 CET,0.0 0.422 0.673 0.849 1.02 1.162 1.29 1.404 1.598 1.681 1.766 1.839 2.045 2.12 2.258 2.396 2.536 2.606 2.741 2.877 3.076 3.194 3.317 3.508 3.681 3.853 4.015 4.17 4.374 4.562 4.743 4.957 5.161 5.359 5.596 5.859 6.097 6.35 6.618 6.914 7.218 7.541 7.919 8.277 8.694 9.157 9.663 10.15 10.646 11.201 11.664 11.726 11.472 11.148 10.803 10.44 10.136 9.809 9.488 9.155 8.86 8.601 8.339 8.08 7.848 7.619 7.371 7.168 6.996 6.815 6.61 6.43 6.234 6.032 5.884 5.727 5.555 5.376 5.194 5.074 4.942 4.719 4.568 4.414 4.338 4.175 3.986 3.778 3.67 3.441 3.315 3.191 3.08 2.862 2.732 2.579 2.403 2.195 1.945 1.683 1.081 -4 ,16083 ,KEBNE ,17041436,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:44:34 CET,0.0 0.623 0.944 1.17 1.361 1.528 1.682 1.826 2.084 2.215 2.336 2.417 2.626 2.732 2.959 3.151 3.31 3.389 3.539 3.682 3.886 4.011 4.135 4.319 4.494 4.668 4.83 4.995 5.226 5.448 5.644 5.864 6.067 6.259 6.495 6.759 7.01 7.279 7.556 7.843 8.133 8.462 8.844 9.225 9.638 10.1 10.62 11.159 11.742 12.302 12.734 12.738 12.502 12.208 11.864 11.485 11.116 10.766 10.45 10.135 9.86 9.602 9.334 9.067 8.818 8.591 8.358 8.154 7.971 7.761 7.53 7.348 7.169 6.98 6.824 6.665 6.504 6.335 6.156 6.029 5.901 5.688 5.54 5.392 5.317 5.169 5.012 4.854 4.776 4.574 4.497 4.395 4.286 4.061 3.931 3.783 3.628 3.449 3.22 2.954 2.352 -5 ,20471 ,KEBNE ,17041437,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:44:50 CET,0.0 0.593 0.849 1.082 1.31 1.513 1.678 1.828 2.098 2.214 2.323 2.4 2.61 2.713 2.91 3.077 3.234 3.312 3.465 3.607 3.803 3.936 4.065 4.242 4.415 4.585 4.747 4.898 5.082 5.258 5.443 5.675 5.888 6.095 6.337 6.598 6.846 7.109 7.377 7.656 7.955 8.278 8.645 9.016 9.44 9.889 10.38 10.92 11.478 12.035 12.532 12.58 12.29 11.933 11.583 11.221 10.878 10.58 10.309 10.008 9.729 9.472 9.192 8.914 8.675 8.445 8.195 7.979 7.796 7.597 7.378 7.197 7.013 6.814 6.658 6.499 6.333 6.162 5.988 5.857 5.711 5.494 5.352 5.197 5.111 4.938 4.763 4.573 4.472 4.249 4.12 4.003 3.887 3.64 3.487 3.305 3.128 2.975 2.798 2.523 1.482 -6 ,21105 ,KEBNE ,17041438,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:45:00 CET,0.0 0.585 0.772 0.879 1.008 1.148 1.286 1.408 1.606 1.695 1.787 1.851 2.056 2.143 2.301 2.467 2.63 2.709 2.862 3.011 3.225 3.359 3.485 3.669 3.845 4.012 4.175 4.334 4.555 4.763 4.932 5.127 5.314 5.507 5.738 5.991 6.243 6.514 6.786 7.078 7.396 7.737 8.121 8.518 8.941 9.368 9.856 10.366 10.941 11.524 11.941 11.962 11.721 11.411 11.085 10.707 10.356 10.022 9.678 9.316 9.009 8.746 8.477 8.196 7.938 7.702 7.458 7.237 7.04 6.84 6.629 6.444 6.252 6.051 5.896 5.738 5.582 5.417 5.225 5.086 4.936 4.706 4.557 4.401 4.321 4.153 3.984 3.789 3.678 3.457 3.325 3.197 3.06 2.772 2.613 2.45 2.298 2.134 1.938 1.602 0.855 -7 ,4777 ,KEBNE ,17041439,Thu Dec 23 03:22:49 CET,Thu Dec 23 04:44:38 CET,0.0 0.556 0.777 0.96 1.104 1.222 1.326 1.433 1.625 1.713 1.795 1.842 2.044 2.122 2.276 2.428 2.571 2.638 2.771 2.896 3.068 3.181 3.287 3.444 3.609 3.775 3.938 4.092 4.302 4.508 4.687 4.893 5.102 5.302 5.53 5.791 6.035 6.297 6.584 6.885 7.182 7.511 7.883 8.246 8.669 9.098 9.568 10.109 10.698 11.215 11.629 11.726 11.543 11.241 10.923 10.601 10.264 9.924 9.623 9.282 8.972 8.696 8.42 8.163 7.921 7.688 7.46 7.256 7.061 6.857 6.641 6.457 6.262 6.079 5.949 5.796 5.628 5.46 5.274 5.147 5.017 4.778 4.618 4.47 4.394 4.227 4.05 3.863 3.769 3.55 3.427 3.3 3.189 2.974 2.834 2.685 2.526 2.33 2.111 1.834 1.191 -8 ,17823 ,KEBNE ,17041440,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:44:42 CET,0.0 0.831 1.103 1.356 1.567 1.748 1.91 2.07 2.336 2.452 2.556 2.631 2.845 2.937 3.111 3.279 3.456 3.54 3.69 3.842 4.06 4.188 4.305 4.476 4.652 4.808 4.96 5.125 5.329 5.518 5.7 5.922 6.129 6.321 6.551 6.806 7.05 7.32 7.6 7.894 8.193 8.502 8.886 9.269 9.693 10.183 10.72 11.279 11.881 12.471 12.94 12.977 12.739 12.411 12.062 11.727 11.395 11.067 10.761 10.446 10.155 9.865 9.578 9.31 9.06 8.832 8.612 8.42 8.237 8.042 7.838 7.652 7.451 7.249 7.107 6.958 6.8 6.659 6.502 6.382 6.266 6.086 5.967 5.839 5.775 5.645 5.5 5.332 5.24 5.033 4.966 4.867 4.757 4.512 4.372 4.223 4.065 3.898 3.713 3.462 2.919 -9 ,1697 ,KEBNE ,17041441,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:44:49 CET,0.0 0.558 0.839 1.06 1.247 1.417 1.57 1.699 1.951 2.076 2.189 2.265 2.475 2.576 2.765 2.932 3.105 3.191 3.343 3.488 3.696 3.826 3.955 4.142 4.334 4.523 4.698 4.861 5.061 5.258 5.445 5.66 5.869 6.068 6.281 6.519 6.759 7.033 7.324 7.602 7.888 8.22 8.603 8.995 9.439 9.921 10.483 11.048 11.582 12.125 12.612 12.675 12.484 12.197 11.858 11.521 11.186 10.859 10.571 10.234 9.933 9.677 9.435 9.189 8.926 8.695 8.461 8.247 8.055 7.846 7.624 7.427 7.232 7.027 6.868 6.724 6.571 6.399 6.215 6.085 5.944 5.729 5.582 5.419 5.336 5.16 4.971 4.788 4.695 4.469 4.304 4.161 4.027 3.754 3.608 3.429 3.204 2.953 2.683 2.342 1.524 -10 ,20721 ,KEBNE ,17041442,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 04:44:59 CET,0.0 0.498 0.684 0.828 0.967 1.113 1.256 1.401 1.687 1.805 1.905 1.995 2.22 2.317 2.494 2.673 2.837 2.916 3.073 3.224 3.444 3.58 3.712 3.893 4.068 4.246 4.409 4.563 4.765 4.957 5.14 5.375 5.6 5.806 6.045 6.301 6.538 6.805 7.084 7.384 7.68 8.005 8.412 8.812 9.263 9.726 10.205 10.701 11.225 11.731 12.084 12.098 11.883 11.585 11.234 10.88 10.554 10.218 9.894 9.551 9.257 8.988 8.707 8.44 8.185 7.957 7.718 7.489 7.29 7.095 6.898 6.731 6.555 6.366 6.224 6.07 5.903 5.727 5.533 5.403 5.276 5.079 4.944 4.793 4.71 4.532 4.337 4.152 4.057 3.833 3.711 3.588 3.466 3.167 2.986 2.813 2.635 2.427 2.184 1.911 1.261 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_17_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_17_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 7ff5055b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_17_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26573 ,KEBNE ,17018466,Tue Dec 21 23:36:14 CET,Wed Dec 22 01:57:15 CET,0.0 0.36 0.487 0.591 0.701 0.822 0.929 1.011 1.16 1.229 1.294 1.377 1.486 1.556 1.683 1.8 1.913 1.969 2.085 2.19 2.343 2.437 2.523 2.646 2.773 2.896 3.014 3.126 3.271 3.424 3.561 3.715 3.864 4.009 4.171 4.344 4.517 4.708 4.918 5.141 5.367 5.619 5.92 6.218 6.53 6.87 7.255 7.662 8.093 8.511 8.805 8.769 8.544 8.263 7.977 7.698 7.409 7.066 6.741 6.427 6.155 5.883 5.601 5.342 5.106 4.885 4.663 4.489 4.34 4.16 3.979 3.836 3.667 3.469 3.303 3.129 2.962 2.828 2.683 2.565 2.446 2.272 2.151 2.027 1.96 1.807 1.641 1.44 1.339 1.201 1.025 0.917 0.799 0.498 0.326 0.148 -0.026 -0.211 -0.447 -0.75 -1.891 -2 ,5035 ,KEBNE ,17018467,Tue Dec 21 23:36:14 CET,Wed Dec 22 01:56:36 CET,0.0 0.259 0.441 0.604 0.747 0.874 0.985 1.08 1.255 1.336 1.409 1.51 1.631 1.713 1.86 1.987 2.103 2.159 2.265 2.375 2.543 2.635 2.713 2.827 2.953 3.085 3.205 3.319 3.469 3.612 3.743 3.897 4.051 4.206 4.386 4.595 4.791 4.986 5.202 5.437 5.665 5.906 6.188 6.465 6.767 7.109 7.504 7.906 8.334 8.788 9.151 9.184 8.969 8.658 8.319 7.974 7.675 7.43 7.201 6.916 6.653 6.408 6.163 5.956 5.777 5.602 5.413 5.235 5.082 4.931 4.773 4.636 4.48 4.304 4.167 4.027 3.877 3.71 3.531 3.41 3.283 3.085 2.946 2.781 2.691 2.503 2.324 2.134 2.03 1.897 1.759 1.654 1.526 1.201 1.026 0.846 0.633 0.403 0.122 -0.196 -1.351 -3 ,4572 ,KEBNE ,17018468,Tue Dec 21 23:37:17 CET,Wed Dec 22 01:57:56 CET,0.0 0.34 0.516 0.659 0.785 0.893 0.997 1.098 1.291 1.374 1.444 1.53 1.638 1.7 1.823 1.941 2.051 2.108 2.217 2.309 2.44 2.526 2.608 2.718 2.831 2.941 3.047 3.152 3.293 3.429 3.545 3.687 3.825 3.957 4.11 4.288 4.469 4.661 4.866 5.071 5.28 5.514 5.764 6.014 6.323 6.65 6.973 7.306 7.661 8.001 8.272 8.31 8.108 7.856 7.561 7.231 6.945 6.67 6.413 6.159 5.941 5.742 5.524 5.316 5.143 4.973 4.781 4.608 4.468 4.329 4.159 4.013 3.869 3.712 3.59 3.453 3.28 3.083 2.893 2.772 2.645 2.438 2.301 2.166 2.094 1.933 1.761 1.599 1.507 1.336 1.089 0.984 0.895 0.682 0.542 0.395 0.234 0.032 -0.186 -0.536 -2.33 -4 ,12286 ,KEBNE ,17018469,Tue Dec 21 23:37:17 CET,Wed Dec 22 01:58:33 CET,0.0 0.243 0.371 0.483 0.58 0.693 0.806 0.915 1.138 1.228 1.302 1.411 1.529 1.597 1.735 1.864 1.982 2.039 2.145 2.255 2.415 2.506 2.592 2.724 2.855 2.986 3.114 3.229 3.367 3.505 3.648 3.811 3.954 4.106 4.284 4.471 4.653 4.862 5.08 5.298 5.525 5.779 6.047 6.339 6.669 6.969 7.288 7.618 7.933 8.178 8.26 8.044 7.709 7.38 7.017 6.594 6.193 5.842 5.572 5.284 4.977 4.689 4.447 4.221 4.016 3.824 3.615 3.427 3.232 3.009 2.787 2.595 2.397 2.215 2.061 1.888 1.705 1.521 1.351 1.228 1.096 0.894 0.736 0.563 0.479 0.313 0.141 -0.039 -0.138 -0.282 -0.483 -0.615 -0.739 -0.99 -1.133 -1.31 -1.532 -1.74 -1.981 -2.349 -3.219 -5 ,30792 ,KEBNE ,17018470,Tue Dec 21 23:37:18 CET,Wed Dec 22 01:57:08 CET,0.0 0.299 0.439 0.583 0.714 0.821 0.906 0.987 1.149 1.233 1.315 1.415 1.517 1.577 1.703 1.821 1.937 1.993 2.088 2.19 2.345 2.437 2.531 2.671 2.807 2.926 3.044 3.167 3.328 3.479 3.606 3.754 3.904 4.059 4.243 4.446 4.629 4.82 5.021 5.229 5.452 5.701 5.964 6.224 6.524 6.836 7.195 7.581 7.957 8.287 8.562 8.618 8.473 8.224 7.964 7.71 7.44 7.176 6.936 6.662 6.422 6.2 5.993 5.799 5.598 5.401 5.195 5.012 4.846 4.682 4.496 4.335 4.186 4.013 3.867 3.729 3.586 3.43 3.269 3.151 3.028 2.849 2.714 2.564 2.49 2.355 2.209 2.049 1.962 1.824 1.653 1.539 1.433 1.194 1.061 0.923 0.752 0.576 0.409 0.148 -0.763 -6 ,2406 ,KEBNE ,17018471,Tue Dec 21 23:37:18 CET,Wed Dec 22 01:58:19 CET,0.0 0.565 0.731 0.852 0.97 1.074 1.173 1.281 1.459 1.53 1.603 1.694 1.802 1.867 1.997 2.123 2.239 2.292 2.395 2.496 2.647 2.748 2.85 2.995 3.116 3.235 3.355 3.465 3.599 3.732 3.856 3.999 4.144 4.281 4.436 4.629 4.801 4.975 5.177 5.401 5.645 5.907 6.202 6.48 6.78 7.109 7.476 7.867 8.289 8.716 8.975 8.916 8.747 8.523 8.237 7.896 7.551 7.234 6.956 6.648 6.376 6.151 5.933 5.719 5.506 5.307 5.093 4.906 4.738 4.553 4.354 4.181 4.013 3.845 3.701 3.543 3.375 3.192 3.018 2.906 2.787 2.592 2.448 2.307 2.234 2.068 1.893 1.695 1.587 1.44 1.278 1.173 1.057 0.73 0.558 0.381 0.184 -0.044 -0.317 -0.604 -1.769 -7 ,2341 ,KEBNE ,17018472,Tue Dec 21 23:37:21 CET,Wed Dec 22 01:54:43 CET,0.0 0.276 0.459 0.599 0.711 0.818 0.916 1.011 1.195 1.283 1.372 1.495 1.604 1.668 1.799 1.929 2.052 2.119 2.247 2.344 2.485 2.586 2.692 2.839 2.97 3.107 3.24 3.358 3.502 3.645 3.78 3.948 4.114 4.272 4.451 4.639 4.826 5.023 5.231 5.459 5.687 5.938 6.234 6.521 6.826 7.154 7.514 7.865 8.236 8.545 8.657 8.431 8.005 7.577 7.201 6.836 6.506 6.172 5.862 5.562 5.278 4.998 4.73 4.457 4.197 3.955 3.687 3.459 3.27 3.068 2.852 2.668 2.48 2.29 2.134 1.974 1.795 1.596 1.393 1.253 1.111 0.883 0.713 0.544 0.454 0.264 0.084 -0.111 -0.215 -0.36 -0.544 -0.658 -0.764 -1.009 -1.16 -1.327 -1.505 -1.708 -1.919 -2.191 -2.832 -8 ,24119 ,KEBNE ,17018473,Tue Dec 21 23:37:17 CET,Wed Dec 22 01:57:11 CET,0.0 0.337 0.512 0.665 0.798 0.888 0.983 1.075 1.25 1.336 1.409 1.511 1.62 1.689 1.821 1.939 2.056 2.112 2.226 2.334 2.478 2.571 2.661 2.803 2.943 3.074 3.205 3.333 3.495 3.627 3.748 3.91 4.066 4.209 4.376 4.563 4.739 4.941 5.152 5.368 5.587 5.832 6.112 6.398 6.747 7.124 7.553 8.009 8.471 8.881 9.232 9.4 9.363 9.127 8.831 8.557 8.251 7.954 7.702 7.434 7.183 6.944 6.72 6.498 6.267 6.054 5.861 5.693 5.527 5.333 5.137 4.991 4.831 4.654 4.524 4.398 4.259 4.104 3.947 3.826 3.691 3.503 3.377 3.232 3.148 2.967 2.782 2.596 2.498 2.352 2.175 2.048 1.913 1.612 1.447 1.285 1.103 0.906 0.675 0.392 -0.504 -9 ,13300 ,KEBNE ,17018474,Tue Dec 21 23:37:17 CET,Wed Dec 22 01:57:18 CET,0.0 0.352 0.531 0.647 0.757 0.857 0.952 1.044 1.213 1.289 1.366 1.487 1.601 1.669 1.802 1.932 2.058 2.115 2.221 2.318 2.454 2.543 2.632 2.763 2.892 3.026 3.157 3.277 3.413 3.54 3.675 3.84 4.001 4.164 4.332 4.507 4.673 4.859 5.067 5.283 5.505 5.739 6.007 6.288 6.596 6.871 7.144 7.44 7.721 7.963 8.037 7.807 7.448 7.077 6.72 6.374 6.061 5.773 5.504 5.195 4.922 4.667 4.418 4.197 3.992 3.819 3.658 3.505 3.358 3.18 2.983 2.824 2.664 2.482 2.334 2.191 2.045 1.901 1.75 1.639 1.516 1.334 1.213 1.093 1.024 0.872 0.716 0.546 0.451 0.314 0.202 0.124 0.033 -0.178 -0.322 -0.469 -0.606 -0.74 -0.869 -1.054 -1.42 -10 ,31397 ,KEBNE ,17018475,Tue Dec 21 23:37:21 CET,Wed Dec 22 01:54:52 CET,0.0 0.213 0.362 0.511 0.641 0.754 0.85 0.94 1.129 1.217 1.299 1.395 1.505 1.575 1.7 1.819 1.934 1.986 2.085 2.183 2.323 2.417 2.512 2.644 2.775 2.908 3.032 3.146 3.289 3.429 3.569 3.733 3.897 4.058 4.227 4.411 4.594 4.789 4.998 5.214 5.442 5.694 5.961 6.241 6.569 6.891 7.243 7.611 7.952 8.298 8.62 8.644 8.409 8.096 7.815 7.54 7.234 6.923 6.652 6.367 6.117 5.888 5.657 5.441 5.244 5.072 4.893 4.715 4.552 4.377 4.189 4.034 3.864 3.677 3.546 3.423 3.298 3.155 2.998 2.904 2.806 2.625 2.5 2.371 2.3 2.149 1.988 1.802 1.698 1.554 1.393 1.281 1.163 0.906 0.779 0.646 0.477 0.283 0.048 -0.208 -0.593 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_17.txt deleted file mode 100644 index 5430ef76..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26558 ,KEBNE ,17018476,Tue Dec 21 23:37:21 CET,Wed Dec 22 01:55:29 CET,0.0 0.631 0.826 0.977 1.091 1.203 1.31 1.406 1.593 1.688 1.779 1.888 1.995 2.067 2.207 2.325 2.439 2.494 2.611 2.73 2.891 2.982 3.059 3.178 3.294 3.402 3.515 3.63 3.767 3.895 4.02 4.168 4.303 4.426 4.564 4.724 4.877 5.04 5.213 5.393 5.587 5.792 6.037 6.288 6.564 6.843 7.109 7.377 7.656 7.875 7.941 7.781 7.514 7.197 6.875 6.564 6.27 5.992 5.754 5.5 5.262 5.035 4.808 4.599 4.414 4.24 4.056 3.884 3.734 3.593 3.445 3.308 3.167 3.027 2.92 2.802 2.661 2.525 2.396 2.302 2.204 2.047 1.94 1.837 1.786 1.674 1.554 1.426 1.355 1.242 1.124 1.043 0.963 0.801 0.689 0.554 0.431 0.287 0.11 -0.075 -0.556 -2 ,25418 ,KEBNE ,17018477,Tue Dec 21 23:38:19 CET,Wed Dec 22 02:00:11 CET,0.0 0.32 0.53 0.724 0.873 0.979 1.085 1.18 1.327 1.403 1.484 1.595 1.704 1.773 1.907 2.039 2.16 2.216 2.323 2.426 2.575 2.658 2.739 2.867 2.986 3.105 3.219 3.327 3.462 3.583 3.699 3.841 3.975 4.108 4.259 4.426 4.588 4.761 4.942 5.125 5.32 5.55 5.811 6.05 6.296 6.539 6.803 7.055 7.288 7.511 7.547 7.363 7.105 6.77 6.444 6.128 5.828 5.548 5.286 5.03 4.819 4.625 4.429 4.225 4.032 3.859 3.673 3.504 3.366 3.23 3.087 2.957 2.809 2.66 2.552 2.441 2.327 2.201 2.067 1.976 1.884 1.742 1.646 1.56 1.507 1.383 1.254 1.123 1.061 0.952 0.856 0.79 0.711 0.523 0.429 0.332 0.233 0.122 -0.003 -0.189 -0.469 -3 ,8982 ,KEBNE ,17018478,Tue Dec 21 23:38:19 CET,Wed Dec 22 01:59:07 CET,0.0 0.293 0.51 0.675 0.804 0.931 1.035 1.125 1.313 1.4 1.477 1.574 1.687 1.759 1.89 2.012 2.128 2.189 2.303 2.416 2.577 2.673 2.774 2.911 3.035 3.151 3.26 3.365 3.5 3.628 3.752 3.891 4.031 4.173 4.332 4.506 4.666 4.835 5.006 5.19 5.399 5.627 5.857 6.08 6.347 6.607 6.852 7.088 7.319 7.511 7.482 7.169 6.84 6.514 6.233 5.971 5.699 5.424 5.166 4.906 4.684 4.478 4.269 4.073 3.894 3.732 3.56 3.392 3.243 3.097 2.945 2.821 2.689 2.552 2.446 2.339 2.22 2.092 1.955 1.86 1.769 1.614 1.504 1.398 1.347 1.235 1.113 0.982 0.909 0.795 0.698 0.62 0.538 0.363 0.258 0.148 0.037 -0.07 -0.179 -0.292 -0.475 -4 ,12280 ,KEBNE ,17018479,Tue Dec 21 23:39:21 CET,Wed Dec 22 01:59:12 CET,0.0 0.517 0.722 0.869 0.988 1.09 1.188 1.297 1.486 1.565 1.634 1.72 1.826 1.884 2.006 2.134 2.257 2.316 2.421 2.518 2.663 2.757 2.845 2.962 3.077 3.196 3.313 3.423 3.559 3.684 3.805 3.953 4.108 4.249 4.386 4.544 4.696 4.867 5.06 5.259 5.443 5.649 5.891 6.107 6.363 6.651 6.937 7.214 7.484 7.646 7.625 7.407 7.134 6.816 6.493 6.173 5.864 5.578 5.298 5.012 4.779 4.563 4.355 4.147 3.946 3.766 3.578 3.402 3.246 3.095 2.941 2.807 2.675 2.535 2.422 2.301 2.181 2.062 1.936 1.852 1.762 1.605 1.502 1.403 1.353 1.243 1.124 0.984 0.913 0.8 0.687 0.611 0.533 0.355 0.255 0.152 0.03 -0.082 -0.189 -0.364 -0.554 -5 ,5473 ,KEBNE ,17018480,Tue Dec 21 23:39:21 CET,Wed Dec 22 01:58:28 CET,0.0 0.3 0.501 0.636 0.744 0.85 0.951 1.048 1.22 1.316 1.402 1.501 1.612 1.677 1.815 1.947 2.058 2.111 2.21 2.315 2.457 2.535 2.613 2.739 2.866 2.981 3.087 3.19 3.325 3.453 3.579 3.724 3.859 3.993 4.143 4.318 4.486 4.665 4.843 5.024 5.225 5.445 5.692 5.935 6.199 6.495 6.8 7.072 7.31 7.484 7.562 7.399 7.098 6.748 6.384 6.027 5.708 5.39 5.105 4.822 4.573 4.354 4.153 3.967 3.782 3.601 3.414 3.253 3.112 2.964 2.808 2.671 2.523 2.365 2.241 2.116 1.986 1.848 1.7 1.6 1.508 1.374 1.267 1.153 1.093 0.963 0.816 0.662 0.586 0.47 0.361 0.272 0.188 0.021 -0.065 -0.156 -0.256 -0.384 -0.521 -0.644 -0.898 -6 ,25133 ,KEBNE ,17018481,Tue Dec 21 23:39:21 CET,Wed Dec 22 02:01:22 CET,0.0 0.34 0.511 0.696 0.86 0.987 1.086 1.188 1.384 1.471 1.549 1.648 1.755 1.825 1.962 2.082 2.193 2.244 2.347 2.448 2.596 2.705 2.812 2.953 3.073 3.184 3.299 3.409 3.54 3.664 3.791 3.949 4.083 4.197 4.352 4.531 4.696 4.883 5.066 5.243 5.438 5.654 5.896 6.124 6.373 6.639 6.918 7.21 7.486 7.689 7.764 7.569 7.269 6.942 6.617 6.288 5.973 5.693 5.446 5.178 4.939 4.733 4.542 4.353 4.164 3.995 3.816 3.649 3.512 3.362 3.2 3.07 2.938 2.808 2.708 2.603 2.488 2.365 2.236 2.148 2.063 1.922 1.812 1.701 1.645 1.519 1.386 1.261 1.195 1.079 0.979 0.908 0.83 0.633 0.531 0.433 0.312 0.177 0.038 -0.115 -0.46 -7 ,15031 ,KEBNE ,17018482,Tue Dec 21 23:41:23 CET,Wed Dec 22 02:02:09 CET,0.0 0.402 0.561 0.73 0.866 0.967 1.052 1.125 1.273 1.356 1.434 1.547 1.658 1.715 1.814 1.907 1.994 2.04 2.133 2.219 2.351 2.438 2.523 2.648 2.763 2.88 3.001 3.115 3.263 3.391 3.512 3.672 3.83 3.97 4.117 4.266 4.403 4.57 4.744 4.914 5.087 5.285 5.517 5.73 5.957 6.194 6.432 6.645 6.84 6.992 7.033 6.855 6.561 6.22 5.882 5.567 5.28 5.012 4.78 4.536 4.314 4.106 3.902 3.701 3.511 3.35 3.188 3.029 2.885 2.741 2.604 2.494 2.358 2.216 2.117 2.005 1.887 1.767 1.646 1.564 1.479 1.345 1.247 1.147 1.094 0.98 0.861 0.746 0.689 0.586 0.491 0.413 0.332 0.153 0.057 -0.033 -0.14 -0.265 -0.398 -0.545 -0.757 -8 ,24685 ,KEBNE ,17018483,Tue Dec 21 23:41:23 CET,Wed Dec 22 02:00:38 CET,0.0 0.251 0.402 0.566 0.728 0.868 0.988 1.086 1.269 1.347 1.417 1.519 1.631 1.694 1.815 1.942 2.055 2.109 2.216 2.317 2.471 2.571 2.672 2.805 2.922 3.041 3.159 3.281 3.432 3.567 3.699 3.858 4.0 4.131 4.285 4.452 4.599 4.757 4.932 5.111 5.303 5.517 5.756 5.989 6.249 6.53 6.812 7.093 7.358 7.571 7.629 7.383 7.043 6.677 6.329 5.989 5.685 5.4 5.143 4.895 4.669 4.449 4.25 4.073 3.905 3.752 3.58 3.413 3.27 3.116 2.953 2.82 2.668 2.518 2.414 2.3 2.192 2.081 1.947 1.851 1.76 1.615 1.511 1.412 1.361 1.25 1.13 0.998 0.934 0.828 0.727 0.651 0.558 0.364 0.284 0.183 0.044 -0.08 -0.198 -0.363 -0.624 -9 ,11285 ,KEBNE ,17018484,Tue Dec 21 23:41:23 CET,Wed Dec 22 02:01:05 CET,0.0 0.307 0.537 0.68 0.789 0.893 1.004 1.113 1.291 1.36 1.436 1.56 1.673 1.742 1.884 2.004 2.105 2.156 2.259 2.365 2.526 2.623 2.714 2.838 2.966 3.093 3.201 3.311 3.458 3.583 3.701 3.848 4.003 4.16 4.324 4.497 4.654 4.832 5.035 5.236 5.429 5.639 5.879 6.114 6.391 6.676 6.971 7.269 7.562 7.777 7.781 7.448 7.037 6.656 6.321 6.009 5.706 5.414 5.164 4.918 4.728 4.554 4.375 4.192 3.999 3.827 3.655 3.494 3.344 3.189 3.039 2.916 2.784 2.643 2.523 2.395 2.277 2.159 2.028 1.934 1.83 1.67 1.57 1.474 1.426 1.322 1.196 1.054 0.986 0.863 0.732 0.65 0.561 0.37 0.263 0.139 0.007 -0.136 -0.286 -0.472 -0.752 -10 ,24905 ,KEBNE ,17018485,Tue Dec 21 23:41:23 CET,Wed Dec 22 02:00:26 CET,0.0 0.566 0.737 0.862 0.979 1.081 1.162 1.238 1.404 1.485 1.556 1.657 1.773 1.843 1.965 2.075 2.185 2.238 2.339 2.444 2.579 2.659 2.744 2.866 2.992 3.116 3.222 3.33 3.476 3.609 3.727 3.864 3.996 4.129 4.29 4.471 4.639 4.817 4.997 5.185 5.389 5.598 5.819 6.021 6.25 6.505 6.779 7.052 7.301 7.512 7.581 7.357 7.012 6.611 6.252 5.932 5.632 5.356 5.085 4.789 4.55 4.338 4.117 3.905 3.699 3.506 3.322 3.156 3.007 2.859 2.718 2.6 2.468 2.332 2.228 2.126 2.015 1.9 1.783 1.7 1.617 1.479 1.374 1.261 1.205 1.086 0.949 0.803 0.731 0.615 0.516 0.442 0.362 0.193 0.106 0.027 -0.063 -0.191 -0.316 -0.444 -0.76 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 786c7941..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16407 ,KEBNE ,17018486,Tue Dec 21 23:44:28 CET,Wed Dec 22 02:04:24 CET,0.0 0.355 0.518 0.666 0.796 0.917 1.02 1.113 1.32 1.412 1.489 1.605 1.726 1.795 1.917 2.031 2.141 2.194 2.304 2.412 2.567 2.668 2.764 2.89 3.014 3.137 3.248 3.353 3.485 3.611 3.736 3.883 4.023 4.159 4.315 4.497 4.676 4.85 5.034 5.234 5.439 5.677 5.951 6.211 6.511 6.832 7.184 7.538 7.796 7.935 7.896 7.564 7.167 6.737 6.297 5.882 5.478 5.105 4.794 4.466 4.18 3.901 3.621 3.385 3.161 2.928 2.68 2.457 2.259 2.052 1.836 1.65 1.45 1.246 1.094 0.943 0.788 0.62 0.435 0.311 0.191 -0.002 -0.143 -0.3 -0.379 -0.539 -0.714 -0.897 -0.991 -1.133 -1.313 -1.433 -1.557 -1.804 -1.95 -2.115 -2.299 -2.532 -2.794 -3.117 -3.838 -2 ,21596 ,KEBNE ,17018487,Tue Dec 21 23:44:28 CET,Wed Dec 22 02:03:04 CET,0.0 0.198 0.33 0.467 0.589 0.69 0.788 0.873 1.042 1.128 1.215 1.345 1.459 1.523 1.654 1.775 1.884 1.935 2.039 2.136 2.273 2.361 2.453 2.593 2.713 2.837 2.968 3.09 3.234 3.368 3.5 3.664 3.81 3.95 4.12 4.307 4.49 4.692 4.9 5.113 5.341 5.576 5.807 6.026 6.311 6.654 7.013 7.373 7.732 8.047 8.229 8.147 7.863 7.5 7.167 6.841 6.53 6.231 5.945 5.656 5.414 5.187 4.945 4.708 4.478 4.255 4.02 3.818 3.654 3.487 3.295 3.134 2.977 2.814 2.685 2.547 2.393 2.245 2.098 1.991 1.881 1.704 1.582 1.457 1.391 1.254 1.105 0.933 0.836 0.704 0.57 0.482 0.391 0.157 0.022 -0.112 -0.248 -0.431 -0.638 -0.868 -1.461 -3 ,11430 ,KEBNE ,17018488,Tue Dec 21 23:44:28 CET,Wed Dec 22 02:03:07 CET,0.0 0.357 0.558 0.687 0.807 0.938 1.063 1.157 1.319 1.399 1.47 1.563 1.676 1.736 1.857 1.994 2.118 2.17 2.268 2.366 2.512 2.605 2.696 2.834 2.965 3.087 3.212 3.336 3.487 3.62 3.747 3.903 4.051 4.188 4.346 4.51 4.671 4.861 5.046 5.246 5.464 5.701 5.953 6.205 6.501 6.792 7.084 7.409 7.761 8.03 8.097 7.888 7.57 7.222 6.866 6.485 6.128 5.792 5.481 5.176 4.93 4.686 4.441 4.207 3.972 3.749 3.5 3.271 3.087 2.894 2.676 2.486 2.303 2.109 1.953 1.798 1.633 1.465 1.3 1.184 1.065 0.898 0.769 0.606 0.523 0.362 0.193 0.02 -0.07 -0.204 -0.358 -0.46 -0.572 -0.841 -0.985 -1.141 -1.321 -1.512 -1.708 -1.942 -2.71 -4 ,6391 ,KEBNE ,17018489,Tue Dec 21 23:45:31 CET,Wed Dec 22 02:04:21 CET,0.0 0.293 0.484 0.655 0.801 0.932 1.063 1.175 1.358 1.438 1.519 1.624 1.728 1.793 1.921 2.04 2.157 2.212 2.316 2.434 2.638 2.76 2.86 2.996 3.121 3.237 3.346 3.454 3.586 3.707 3.826 3.985 4.139 4.276 4.442 4.624 4.789 4.964 5.151 5.354 5.578 5.82 6.084 6.361 6.669 6.973 7.309 7.671 8.05 8.391 8.519 8.35 8.126 7.867 7.523 7.194 6.923 6.641 6.375 6.072 5.799 5.552 5.31 5.076 4.852 4.648 4.44 4.245 4.074 3.894 3.689 3.512 3.34 3.149 2.981 2.813 2.644 2.47 2.296 2.174 2.041 1.823 1.677 1.535 1.456 1.289 1.131 0.96 0.858 0.705 0.541 0.435 0.317 0.023 -0.137 -0.296 -0.477 -0.668 -0.874 -1.138 -1.941 -5 ,17367 ,KEBNE ,17018490,Tue Dec 21 23:45:31 CET,Wed Dec 22 02:05:09 CET,0.0 0.261 0.427 0.612 0.798 0.93 1.045 1.144 1.323 1.402 1.471 1.558 1.676 1.749 1.872 1.987 2.112 2.172 2.277 2.379 2.527 2.617 2.708 2.846 2.965 3.069 3.174 3.292 3.435 3.561 3.686 3.833 3.976 4.114 4.274 4.449 4.6 4.765 4.952 5.168 5.388 5.622 5.891 6.135 6.399 6.656 6.919 7.205 7.506 7.698 7.734 7.56 7.232 6.855 6.467 6.068 5.686 5.28 4.919 4.602 4.321 4.047 3.78 3.529 3.284 3.061 2.833 2.63 2.44 2.243 2.046 1.859 1.645 1.452 1.321 1.186 1.026 0.867 0.715 0.6 0.475 0.27 0.121 -0.046 -0.136 -0.301 -0.461 -0.643 -0.733 -0.869 -1.055 -1.171 -1.28 -1.524 -1.657 -1.796 -1.948 -2.125 -2.373 -2.658 -3.356 -6 ,25357 ,KEBNE ,17018491,Tue Dec 21 23:45:31 CET,Wed Dec 22 02:06:52 CET,0.0 0.293 0.494 0.639 0.761 0.872 0.981 1.079 1.232 1.303 1.372 1.464 1.578 1.65 1.773 1.884 1.998 2.055 2.165 2.269 2.405 2.488 2.573 2.694 2.804 2.916 3.024 3.123 3.256 3.38 3.5 3.653 3.799 3.933 4.094 4.276 4.435 4.608 4.789 4.985 5.192 5.416 5.674 5.925 6.215 6.551 6.916 7.271 7.582 7.791 7.862 7.714 7.4 6.974 6.52 6.064 5.644 5.253 4.928 4.613 4.312 4.039 3.772 3.519 3.287 3.055 2.804 2.596 2.424 2.237 2.034 1.867 1.696 1.525 1.39 1.245 1.097 0.938 0.763 0.623 0.48 0.279 0.136 -0.016 -0.089 -0.247 -0.41 -0.574 -0.667 -0.807 -0.985 -1.106 -1.224 -1.483 -1.644 -1.829 -2.009 -2.214 -2.463 -2.74 -3.782 -7 ,29474 ,KEBNE ,17018492,Tue Dec 21 23:45:31 CET,Wed Dec 22 02:04:18 CET,0.0 0.19 0.368 0.505 0.613 0.703 0.804 0.898 1.058 1.131 1.192 1.27 1.373 1.433 1.552 1.653 1.759 1.815 1.928 2.034 2.193 2.294 2.382 2.519 2.647 2.758 2.864 2.969 3.12 3.273 3.407 3.555 3.694 3.839 4.001 4.163 4.328 4.504 4.702 4.918 5.136 5.377 5.633 5.883 6.176 6.454 6.705 6.938 7.153 7.331 7.336 7.104 6.745 6.276 5.809 5.375 4.97 4.583 4.255 3.911 3.577 3.28 2.997 2.736 2.511 2.297 2.071 1.863 1.677 1.486 1.284 1.108 0.924 0.759 0.631 0.485 0.329 0.178 0.026 -0.093 -0.21 -0.393 -0.546 -0.703 -0.774 -0.919 -1.076 -1.242 -1.326 -1.457 -1.62 -1.727 -1.835 -2.079 -2.219 -2.405 -2.626 -2.824 -3.045 -3.375 -4.626 -8 ,29459 ,KEBNE ,17018493,Tue Dec 21 23:45:31 CET,Wed Dec 22 02:04:02 CET,0.0 0.328 0.521 0.661 0.791 0.906 1.007 1.097 1.265 1.343 1.425 1.542 1.662 1.745 1.902 2.034 2.148 2.199 2.299 2.407 2.559 2.646 2.741 2.885 3.024 3.155 3.263 3.37 3.517 3.656 3.78 3.932 4.084 4.218 4.361 4.509 4.658 4.836 5.03 5.221 5.422 5.661 5.919 6.167 6.447 6.742 7.068 7.389 7.665 7.822 7.809 7.543 7.123 6.664 6.232 5.872 5.536 5.216 4.948 4.677 4.436 4.223 4.007 3.779 3.57 3.386 3.197 3.028 2.87 2.673 2.467 2.309 2.148 1.985 1.862 1.739 1.612 1.473 1.321 1.215 1.096 0.92 0.801 0.671 0.607 0.48 0.33 0.152 0.066 -0.057 -0.182 -0.274 -0.373 -0.623 -0.799 -0.976 -1.145 -1.334 -1.539 -1.734 -2.013 -9 ,21030 ,KEBNE ,17018494,Tue Dec 21 23:45:35 CET,Wed Dec 22 02:04:28 CET,0.0 0.169 0.292 0.417 0.54 0.657 0.76 0.861 1.034 1.112 1.195 1.308 1.421 1.478 1.591 1.715 1.827 1.879 1.977 2.067 2.22 2.317 2.406 2.531 2.64 2.758 2.871 2.969 3.1 3.22 3.343 3.491 3.61 3.729 3.869 4.024 4.178 4.343 4.52 4.702 4.887 5.101 5.361 5.609 5.878 6.16 6.452 6.741 7.045 7.374 7.501 7.112 6.706 6.327 5.927 5.542 5.183 4.84 4.518 4.143 3.809 3.523 3.251 2.971 2.698 2.473 2.256 2.06 1.881 1.699 1.499 1.327 1.161 0.972 0.821 0.664 0.502 0.342 0.171 0.05 -0.07 -0.241 -0.36 -0.495 -0.565 -0.713 -0.879 -1.062 -1.164 -1.308 -1.452 -1.546 -1.656 -1.913 -2.069 -2.228 -2.388 -2.561 -2.758 -3.032 -3.507 -10 ,10100 ,KEBNE ,17018495,Tue Dec 21 23:45:31 CET,Wed Dec 22 02:06:16 CET,0.0 0.371 0.569 0.735 0.862 0.963 1.06 1.155 1.331 1.41 1.477 1.562 1.674 1.737 1.855 1.986 2.111 2.164 2.268 2.375 2.522 2.617 2.704 2.836 2.959 3.063 3.175 3.292 3.441 3.579 3.705 3.858 4.005 4.131 4.273 4.435 4.598 4.792 4.996 5.201 5.413 5.651 5.914 6.168 6.45 6.738 7.052 7.382 7.723 7.957 7.99 7.772 7.452 7.09 6.729 6.377 6.065 5.796 5.536 5.272 5.027 4.798 4.571 4.334 4.12 3.909 3.673 3.477 3.316 3.14 2.966 2.823 2.661 2.479 2.337 2.209 2.078 1.931 1.759 1.646 1.535 1.345 1.216 1.094 1.023 0.869 0.726 0.585 0.512 0.39 0.258 0.15 0.041 -0.164 -0.302 -0.468 -0.625 -0.83 -1.074 -1.294 -1.784 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt deleted file mode 100644 index 7e57e3fc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1778 ,KEBNE ,17018496,Tue Dec 21 23:46:32 CET,Wed Dec 22 02:04:48 CET,0.0 1.034 1.427 1.672 1.875 2.059 2.22 2.373 2.654 2.786 2.902 3.049 3.212 3.312 3.512 3.708 3.887 3.971 4.128 4.272 4.47 4.597 4.731 4.922 5.098 5.267 5.431 5.588 5.79 5.982 6.142 6.312 6.483 6.659 6.857 7.074 7.297 7.538 7.81 8.073 8.311 8.575 8.864 9.189 9.564 9.927 10.314 10.696 11.035 11.162 10.968 10.467 9.97 9.537 9.102 8.667 8.242 7.834 7.481 7.099 6.743 6.444 6.201 5.967 5.717 5.483 5.221 4.974 4.763 4.521 4.275 4.088 3.898 3.705 3.558 3.403 3.231 3.04 2.813 2.657 2.516 2.311 2.16 1.988 1.895 1.713 1.519 1.298 1.189 1.008 0.804 0.647 0.463 0.073 -0.128 -0.373 -0.637 -0.952 -1.361 -1.926 -3.82 -2 ,14948 ,KEBNE ,17018497,Tue Dec 21 23:46:32 CET,Wed Dec 22 02:05:16 CET,0.0 1.201 1.605 1.935 2.205 2.437 2.665 2.859 3.167 3.3 3.41 3.552 3.716 3.817 4.013 4.177 4.337 4.419 4.574 4.714 4.897 5.02 5.152 5.325 5.474 5.655 5.863 6.048 6.251 6.44 6.616 6.8 6.971 7.128 7.295 7.493 7.71 7.934 8.147 8.373 8.609 8.864 9.149 9.42 9.726 10.074 10.393 10.628 10.857 11.07 11.117 10.808 10.38 9.917 9.454 9.014 8.594 8.179 7.813 7.444 7.104 6.785 6.475 6.172 5.878 5.602 5.293 4.993 4.742 4.508 4.257 4.044 3.825 3.598 3.429 3.261 3.087 2.89 2.661 2.493 2.325 2.081 1.898 1.703 1.606 1.408 1.177 0.932 0.823 0.63 0.445 0.305 0.139 -0.201 -0.375 -0.566 -0.808 -1.122 -1.54 -2.094 -4.009 -3 ,11136 ,KEBNE ,17018498,Tue Dec 21 23:46:32 CET,Wed Dec 22 02:05:38 CET,0.0 1.339 1.678 1.919 2.135 2.32 2.478 2.636 2.905 3.028 3.149 3.308 3.484 3.585 3.77 3.955 4.128 4.203 4.351 4.49 4.696 4.838 4.97 5.138 5.294 5.456 5.604 5.743 5.943 6.134 6.309 6.524 6.724 6.913 7.136 7.361 7.54 7.718 7.912 8.115 8.31 8.512 8.736 8.952 9.238 9.588 9.958 10.285 10.517 10.673 10.643 10.198 9.677 9.226 8.777 8.282 7.831 7.421 7.072 6.735 6.444 6.17 5.897 5.64 5.404 5.191 4.962 4.763 4.588 4.374 4.149 3.985 3.819 3.627 3.471 3.323 3.169 2.991 2.818 2.702 2.563 2.332 2.166 1.991 1.9 1.7 1.487 1.258 1.131 0.934 0.734 0.591 0.437 0.09 -0.102 -0.318 -0.572 -0.845 -1.153 -1.618 -3.032 -4 ,21419 ,KEBNE ,17018499,Tue Dec 21 23:46:32 CET,Wed Dec 22 02:06:32 CET,0.0 1.256 1.588 1.799 1.994 2.183 2.338 2.476 2.738 2.862 2.969 3.09 3.248 3.337 3.496 3.641 3.791 3.866 4.016 4.176 4.401 4.541 4.677 4.868 5.051 5.232 5.383 5.515 5.685 5.846 6.003 6.188 6.362 6.549 6.764 6.981 7.195 7.448 7.721 7.992 8.261 8.546 8.879 9.218 9.579 9.957 10.364 10.763 11.145 11.407 11.446 11.176 10.719 10.168 9.621 9.107 8.664 8.289 7.958 7.587 7.259 6.975 6.709 6.461 6.211 5.974 5.732 5.515 5.33 5.125 4.882 4.676 4.461 4.217 4.016 3.81 3.628 3.44 3.228 3.089 2.929 2.679 2.524 2.357 2.265 2.072 1.87 1.654 1.54 1.348 1.137 0.982 0.817 0.478 0.294 0.096 -0.138 -0.469 -0.914 -1.536 -3.953 -5 ,12631 ,KEBNE ,17018500,Tue Dec 21 23:46:32 CET,Wed Dec 22 02:04:38 CET,0.0 1.181 1.474 1.716 1.932 2.097 2.251 2.394 2.649 2.767 2.875 3.017 3.195 3.307 3.513 3.703 3.865 3.941 4.1 4.252 4.451 4.572 4.696 4.875 5.041 5.208 5.36 5.502 5.68 5.846 6.012 6.202 6.386 6.594 6.84 7.076 7.278 7.492 7.719 7.952 8.186 8.456 8.743 9.012 9.309 9.592 9.916 10.22 10.479 10.67 10.51 9.966 9.354 8.727 8.154 7.646 7.185 6.738 6.332 5.926 5.586 5.279 4.972 4.683 4.417 4.141 3.826 3.564 3.353 3.123 2.86 2.64 2.422 2.201 2.034 1.856 1.665 1.469 1.269 1.121 0.946 0.691 0.534 0.342 0.232 0.013 -0.204 -0.428 -0.55 -0.735 -0.92 -1.07 -1.221 -1.576 -1.782 -1.982 -2.203 -2.46 -2.832 -3.34 -5.296 -6 ,16305 ,KEBNE ,17018501,Tue Dec 21 23:46:32 CET,Wed Dec 22 02:05:24 CET,0.0 0.993 1.364 1.642 1.866 2.068 2.255 2.42 2.745 2.903 3.031 3.197 3.375 3.473 3.654 3.842 4.01 4.084 4.236 4.383 4.597 4.744 4.893 5.104 5.288 5.452 5.619 5.781 5.968 6.141 6.305 6.497 6.705 6.888 7.078 7.304 7.525 7.754 7.988 8.246 8.516 8.821 9.163 9.469 9.782 10.114 10.471 10.833 11.19 11.429 11.317 10.872 10.3 9.753 9.249 8.756 8.313 7.893 7.511 7.127 6.801 6.474 6.151 5.853 5.591 5.363 5.109 4.881 4.678 4.442 4.182 3.98 3.791 3.591 3.431 3.269 3.094 2.897 2.699 2.561 2.413 2.181 2.011 1.834 1.745 1.556 1.339 1.113 1.004 0.817 0.622 0.5 0.374 0.064 -0.115 -0.34 -0.638 -0.964 -1.305 -1.715 -2.996 -7 ,14066 ,KEBNE ,17018502,Tue Dec 21 23:46:32 CET,Wed Dec 22 02:05:04 CET,0.0 1.521 1.973 2.276 2.518 2.718 2.889 3.037 3.323 3.454 3.575 3.727 3.89 3.997 4.192 4.353 4.514 4.606 4.783 4.964 5.239 5.415 5.564 5.739 5.925 6.099 6.248 6.387 6.557 6.708 6.868 7.068 7.255 7.439 7.645 7.848 8.061 8.293 8.509 8.731 8.967 9.23 9.542 9.853 10.199 10.56 10.902 11.224 11.564 11.796 11.609 11.176 10.739 10.232 9.767 9.308 8.853 8.441 8.054 7.649 7.287 6.944 6.628 6.334 6.047 5.789 5.539 5.313 5.108 4.883 4.636 4.411 4.169 3.946 3.789 3.621 3.435 3.241 3.026 2.876 2.742 2.533 2.377 2.218 2.14 1.975 1.776 1.569 1.474 1.305 1.145 1.021 0.878 0.5 0.289 0.062 -0.193 -0.447 -0.759 -1.233 -2.987 -8 ,22865 ,KEBNE ,17018503,Tue Dec 21 23:46:32 CET,Wed Dec 22 02:06:39 CET,0.0 1.052 1.402 1.648 1.857 2.02 2.173 2.314 2.565 2.696 2.822 3.005 3.184 3.291 3.489 3.66 3.823 3.909 4.067 4.216 4.442 4.58 4.709 4.893 5.061 5.224 5.383 5.545 5.762 5.962 6.134 6.335 6.527 6.704 6.912 7.144 7.359 7.602 7.872 8.158 8.429 8.729 9.082 9.394 9.728 10.047 10.36 10.72 11.041 11.194 11.082 10.592 10.077 9.55 9.01 8.503 8.024 7.561 7.146 6.698 6.31 5.972 5.639 5.328 5.047 4.784 4.519 4.273 4.048 3.826 3.594 3.389 3.165 2.932 2.762 2.584 2.387 2.187 1.977 1.808 1.643 1.421 1.253 1.068 0.978 0.799 0.609 0.392 0.282 0.103 -0.09 -0.218 -0.353 -0.687 -0.861 -1.064 -1.334 -1.633 -1.995 -2.453 -3.867 -9 ,8694 ,KEBNE ,17018504,Tue Dec 21 23:46:36 CET,Wed Dec 22 02:05:30 CET,0.0 0.973 1.41 1.713 1.958 2.167 2.339 2.506 2.811 2.938 3.061 3.216 3.379 3.473 3.654 3.842 4.052 4.147 4.308 4.471 4.687 4.826 4.961 5.136 5.301 5.475 5.629 5.762 5.943 6.142 6.332 6.538 6.735 6.935 7.152 7.37 7.583 7.807 8.025 8.264 8.524 8.812 9.146 9.465 9.803 10.169 10.59 11.009 11.388 11.678 11.68 11.254 10.74 10.284 9.815 9.358 8.977 8.596 8.239 7.88 7.576 7.305 7.051 6.79 6.529 6.299 6.064 5.847 5.636 5.409 5.169 4.969 4.778 4.588 4.453 4.308 4.136 3.968 3.815 3.699 3.564 3.35 3.193 3.022 2.936 2.757 2.561 2.346 2.233 2.047 1.846 1.703 1.561 1.268 1.082 0.853 0.58 0.279 -0.054 -0.576 -3.155 -10 ,12816 ,KEBNE ,17018505,Tue Dec 21 23:47:34 CET,Wed Dec 22 02:06:42 CET,0.0 0.976 1.265 1.487 1.692 1.87 2.028 2.155 2.405 2.525 2.617 2.729 2.87 2.954 3.14 3.296 3.424 3.499 3.649 3.781 3.978 4.099 4.229 4.409 4.566 4.71 4.845 4.966 5.118 5.273 5.436 5.638 5.807 5.968 6.167 6.391 6.604 6.825 7.069 7.335 7.575 7.806 8.071 8.334 8.66 8.994 9.323 9.636 9.944 10.203 10.114 9.696 9.238 8.707 8.147 7.598 7.11 6.67 6.279 5.86 5.504 5.195 4.894 4.602 4.315 4.045 3.796 3.593 3.399 3.198 2.996 2.837 2.675 2.476 2.299 2.109 1.917 1.725 1.527 1.39 1.25 1.035 0.881 0.722 0.641 0.466 0.283 0.063 -0.064 -0.245 -0.391 -0.512 -0.652 -0.971 -1.172 -1.409 -1.685 -1.988 -2.31 -2.856 -4.685 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt deleted file mode 100644 index 14213193..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5626 ,KEBNE ,17018506,Tue Dec 21 23:47:35 CET,Wed Dec 22 02:06:20 CET,0.0 0.421 0.693 0.92 1.116 1.282 1.416 1.538 1.756 1.857 1.959 2.089 2.239 2.317 2.477 2.636 2.791 2.86 2.992 3.12 3.306 3.431 3.549 3.713 3.874 4.023 4.162 4.301 4.474 4.64 4.81 5.007 5.19 5.376 5.595 5.839 6.092 6.366 6.65 6.959 7.268 7.625 8.041 8.437 8.895 9.434 10.051 10.717 11.455 12.228 13.006 13.496 13.647 13.631 13.554 13.43 13.271 13.071 12.877 12.665 12.466 12.281 12.101 11.94 11.783 11.632 11.469 11.32 11.191 11.05 10.895 10.761 10.622 10.49 10.385 10.267 10.129 9.985 9.843 9.746 9.646 9.473 9.344 9.216 9.154 9.012 8.854 8.688 8.603 8.456 8.341 8.254 8.15 7.908 7.78 7.642 7.505 7.359 7.178 6.907 5.875 -2 ,25669 ,KEBNE ,17018507,Tue Dec 21 23:47:35 CET,Wed Dec 22 02:07:31 CET,0.0 0.579 0.767 0.902 1.044 1.169 1.287 1.407 1.625 1.719 1.816 1.937 2.084 2.177 2.349 2.479 2.602 2.668 2.798 2.914 3.102 3.227 3.346 3.516 3.674 3.837 3.987 4.129 4.321 4.5 4.67 4.878 5.079 5.265 5.481 5.736 5.99 6.25 6.517 6.811 7.111 7.429 7.822 8.242 8.707 9.195 9.755 10.383 11.111 11.937 12.734 13.148 13.195 13.105 12.963 12.774 12.581 12.393 12.213 11.996 11.794 11.608 11.412 11.229 11.071 10.936 10.761 10.58 10.416 10.24 10.06 9.91 9.761 9.614 9.5 9.377 9.246 9.11 8.952 8.841 8.732 8.561 8.449 8.318 8.242 8.078 7.894 7.718 7.635 7.498 7.352 7.242 7.131 6.892 6.772 6.66 6.537 6.355 6.13 5.862 5.02 -3 ,1812 ,KEBNE ,17018508,Tue Dec 21 23:47:34 CET,Wed Dec 22 02:05:40 CET,0.0 0.314 0.556 0.765 0.929 1.096 1.247 1.381 1.636 1.746 1.846 1.977 2.131 2.22 2.395 2.547 2.701 2.781 2.929 3.054 3.229 3.344 3.46 3.63 3.79 3.944 4.086 4.222 4.404 4.593 4.788 5.017 5.212 5.395 5.635 5.896 6.136 6.403 6.691 7.0 7.328 7.717 8.162 8.58 9.05 9.546 10.119 10.8 11.584 12.441 13.27 13.755 13.914 13.946 13.852 13.689 13.521 13.341 13.168 12.963 12.79 12.622 12.434 12.231 12.042 11.9 11.738 11.57 11.434 11.293 11.14 11.006 10.862 10.714 10.604 10.498 10.381 10.256 10.12 10.014 9.895 9.718 9.596 9.463 9.398 9.255 9.09 8.918 8.835 8.693 8.555 8.45 8.336 8.089 7.96 7.818 7.655 7.486 7.263 6.877 6.114 -4 ,17046 ,KEBNE ,17018509,Tue Dec 21 23:47:38 CET,Wed Dec 22 02:04:40 CET,0.0 0.531 0.779 0.966 1.108 1.252 1.386 1.507 1.729 1.824 1.915 2.029 2.181 2.265 2.439 2.619 2.79 2.866 3.018 3.172 3.382 3.512 3.647 3.846 4.047 4.226 4.384 4.541 4.738 4.927 5.107 5.323 5.532 5.733 5.962 6.213 6.452 6.704 6.975 7.268 7.592 7.942 8.346 8.754 9.216 9.736 10.313 10.977 11.756 12.567 13.4 13.923 14.081 14.084 13.967 13.786 13.597 13.394 13.217 13.042 12.859 12.685 12.517 12.338 12.159 11.993 11.81 11.623 11.465 11.315 11.16 11.027 10.885 10.727 10.597 10.471 10.346 10.223 10.082 9.961 9.825 9.633 9.516 9.396 9.324 9.174 9.03 8.879 8.799 8.648 8.499 8.392 8.295 8.05 7.906 7.752 7.587 7.413 7.188 6.858 6.175 -5 ,24964 ,KEBNE ,17018510,Tue Dec 21 23:48:36 CET,Wed Dec 22 02:07:55 CET,0.0 0.347 0.571 0.759 0.923 1.092 1.235 1.354 1.573 1.674 1.769 1.889 2.047 2.139 2.322 2.493 2.643 2.708 2.839 2.959 3.127 3.24 3.353 3.522 3.683 3.834 3.981 4.121 4.297 4.477 4.646 4.839 5.036 5.235 5.468 5.722 5.962 6.21 6.474 6.772 7.078 7.422 7.826 8.208 8.628 9.09 9.641 10.252 10.953 11.693 12.476 13.006 13.171 13.192 13.136 13.036 12.937 12.797 12.633 12.467 12.306 12.13 11.974 11.814 11.643 11.481 11.309 11.16 11.026 10.886 10.731 10.597 10.46 10.308 10.185 10.055 9.92 9.788 9.653 9.557 9.46 9.303 9.185 9.055 8.979 8.827 8.688 8.547 8.467 8.316 8.201 8.116 8.016 7.758 7.618 7.479 7.308 7.099 6.871 6.576 5.469 -6 ,5103 ,KEBNE ,17018511,Tue Dec 21 23:51:42 CET,Wed Dec 22 02:08:53 CET,0.0 0.38 0.581 0.774 0.942 1.073 1.203 1.339 1.581 1.682 1.794 1.968 2.136 2.228 2.417 2.584 2.726 2.8 2.955 3.096 3.291 3.419 3.538 3.719 3.895 4.06 4.22 4.374 4.566 4.753 4.939 5.158 5.364 5.566 5.807 6.076 6.329 6.617 6.932 7.245 7.578 7.953 8.376 8.81 9.314 9.857 10.429 11.061 11.803 12.639 13.577 14.176 14.341 14.34 14.254 14.11 13.95 13.776 13.613 13.428 13.239 13.068 12.92 12.78 12.621 12.457 12.281 12.133 12.003 11.858 11.712 11.604 11.476 11.322 11.209 11.09 10.962 10.842 10.706 10.602 10.502 10.354 10.257 10.155 10.098 9.978 9.846 9.693 9.614 9.483 9.366 9.262 9.153 8.951 8.834 8.697 8.553 8.378 8.182 7.924 7.575 -7 ,23046 ,KEBNE ,17018512,Tue Dec 21 23:51:42 CET,Wed Dec 22 02:08:51 CET,0.0 0.429 0.625 0.773 0.908 1.023 1.126 1.229 1.443 1.55 1.645 1.749 1.904 1.992 2.163 2.322 2.467 2.531 2.652 2.766 2.931 3.043 3.158 3.337 3.507 3.661 3.814 3.965 4.147 4.314 4.472 4.669 4.868 5.051 5.26 5.518 5.767 6.022 6.295 6.589 6.9 7.248 7.657 8.078 8.573 9.104 9.737 10.434 11.106 11.773 12.529 13.061 13.253 13.257 13.175 13.071 12.933 12.779 12.593 12.371 12.176 12.003 11.839 11.674 11.503 11.342 11.176 11.019 10.875 10.724 10.567 10.425 10.284 10.146 10.029 9.904 9.777 9.648 9.515 9.416 9.316 9.175 9.073 8.936 8.862 8.721 8.557 8.403 8.329 8.188 8.059 7.953 7.841 7.581 7.423 7.252 7.084 6.897 6.687 6.443 5.927 -8 ,25954 ,KEBNE ,17018513,Tue Dec 21 23:51:41 CET,Wed Dec 22 02:10:18 CET,0.0 0.632 0.866 1.059 1.199 1.333 1.465 1.583 1.802 1.915 2.02 2.139 2.299 2.391 2.55 2.699 2.84 2.908 3.043 3.175 3.362 3.475 3.581 3.736 3.888 4.038 4.184 4.324 4.512 4.7 4.89 5.114 5.321 5.516 5.75 6.019 6.273 6.545 6.83 7.134 7.461 7.82 8.226 8.643 9.114 9.617 10.188 10.819 11.5 12.254 13.153 13.705 13.832 13.805 13.672 13.492 13.303 13.105 12.938 12.758 12.582 12.409 12.23 12.064 11.896 11.728 11.555 11.398 11.264 11.121 10.957 10.823 10.697 10.566 10.458 10.343 10.206 10.063 9.92 9.819 9.721 9.565 9.453 9.329 9.257 9.119 8.994 8.856 8.779 8.64 8.529 8.436 8.318 8.072 7.951 7.82 7.67 7.485 7.27 7.031 6.367 -9 ,11553 ,KEBNE ,17018514,Tue Dec 21 23:51:41 CET,Wed Dec 22 02:09:13 CET,0.0 0.361 0.554 0.731 0.894 1.047 1.182 1.3 1.51 1.604 1.715 1.864 2.026 2.115 2.267 2.422 2.568 2.636 2.775 2.913 3.109 3.241 3.368 3.542 3.694 3.842 3.998 4.148 4.331 4.505 4.674 4.879 5.079 5.258 5.465 5.735 6.002 6.278 6.557 6.841 7.164 7.528 7.919 8.318 8.782 9.282 9.868 10.523 11.273 12.032 12.777 13.268 13.418 13.392 13.276 13.138 12.985 12.823 12.65 12.453 12.272 12.099 11.916 11.747 11.6 11.448 11.294 11.163 11.042 10.915 10.772 10.638 10.491 10.336 10.214 10.079 9.943 9.817 9.674 9.573 9.477 9.302 9.181 9.068 9.005 8.865 8.718 8.555 8.461 8.318 8.185 8.063 7.946 7.7 7.563 7.423 7.272 7.088 6.849 6.546 5.692 -10 ,3372 ,KEBNE ,17018515,Tue Dec 21 23:52:48 CET,Wed Dec 22 02:03:10 CET,0.0 0.454 0.666 0.87 1.04 1.185 1.311 1.413 1.59 1.679 1.775 1.885 2.036 2.117 2.279 2.44 2.58 2.648 2.784 2.914 3.101 3.215 3.319 3.476 3.647 3.815 3.973 4.125 4.319 4.506 4.681 4.886 5.079 5.285 5.54 5.799 6.04 6.312 6.598 6.898 7.206 7.55 7.948 8.354 8.852 9.383 9.978 10.607 11.284 12.039 12.953 13.618 13.835 13.822 13.726 13.551 13.335 13.129 12.906 12.687 12.494 12.309 12.144 11.976 11.801 11.641 11.47 11.291 11.14 10.987 10.813 10.68 10.542 10.384 10.249 10.099 9.954 9.815 9.67 9.553 9.419 9.221 9.085 8.951 8.886 8.748 8.587 8.411 8.327 8.182 8.029 7.908 7.782 7.521 7.381 7.238 7.084 6.89 6.69 6.438 5.719 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_30.txt deleted file mode 100644 index 7a1322e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3002 ,KEBNE ,17018516,Tue Dec 21 23:53:47 CET,Wed Dec 22 02:14:30 CET,0.0 0.378 0.556 0.727 0.898 1.051 1.182 1.305 1.521 1.613 1.696 1.807 1.964 2.05 2.218 2.369 2.493 2.554 2.678 2.802 2.989 3.113 3.226 3.377 3.519 3.653 3.784 3.917 4.087 4.246 4.393 4.571 4.741 4.903 5.119 5.357 5.557 5.765 5.983 6.226 6.484 6.756 7.064 7.375 7.737 8.127 8.557 8.998 9.529 10.106 10.623 10.957 10.987 10.861 10.694 10.518 10.35 10.171 10.002 9.829 9.643 9.471 9.322 9.163 9.009 8.866 8.712 8.579 8.453 8.323 8.181 8.052 7.922 7.79 7.69 7.578 7.45 7.317 7.184 7.091 7.004 6.869 6.752 6.642 6.594 6.487 6.384 6.265 6.199 6.074 6.006 5.937 5.854 5.652 5.551 5.434 5.288 5.14 4.999 4.811 4.41 -2 ,5538 ,KEBNE ,17018517,Tue Dec 21 23:53:47 CET,Wed Dec 22 02:11:12 CET,0.0 0.52 0.776 0.95 1.102 1.236 1.36 1.482 1.7 1.799 1.891 1.987 2.124 2.212 2.38 2.514 2.654 2.724 2.846 2.957 3.11 3.212 3.317 3.468 3.61 3.752 3.883 4.002 4.173 4.34 4.493 4.669 4.849 5.034 5.235 5.446 5.647 5.856 6.076 6.323 6.581 6.86 7.172 7.498 7.876 8.267 8.713 9.195 9.71 10.246 10.729 10.918 10.896 10.752 10.561 10.362 10.181 10.009 9.832 9.627 9.444 9.28 9.122 8.97 8.809 8.648 8.479 8.341 8.232 8.12 7.997 7.881 7.751 7.618 7.517 7.42 7.323 7.204 7.076 6.995 6.908 6.766 6.666 6.571 6.517 6.396 6.275 6.139 6.073 5.945 5.846 5.765 5.678 5.491 5.399 5.297 5.18 5.013 4.823 4.613 4.292 -3 ,7350 ,KEBNE ,17018518,Tue Dec 21 23:54:53 CET,Wed Dec 22 02:05:57 CET,0.0 0.559 0.809 1.025 1.196 1.342 1.481 1.605 1.853 1.977 2.075 2.17 2.313 2.394 2.546 2.689 2.836 2.903 3.02 3.144 3.314 3.424 3.535 3.684 3.822 3.952 4.088 4.22 4.386 4.538 4.675 4.849 5.026 5.198 5.398 5.621 5.84 6.078 6.312 6.557 6.809 7.092 7.43 7.748 8.104 8.47 8.851 9.301 9.795 10.251 10.706 10.883 10.838 10.721 10.564 10.38 10.167 9.972 9.8 9.617 9.444 9.282 9.121 8.955 8.806 8.676 8.529 8.39 8.276 8.158 8.027 7.913 7.792 7.658 7.552 7.44 7.324 7.2 7.073 6.993 6.916 6.782 6.678 6.576 6.529 6.415 6.289 6.164 6.098 5.97 5.882 5.804 5.704 5.462 5.355 5.25 5.14 5.024 4.879 4.714 4.408 -4 ,8909 ,KEBNE ,17018519,Tue Dec 21 23:54:53 CET,Wed Dec 22 02:05:21 CET,0.0 0.493 0.711 0.877 1.033 1.183 1.329 1.454 1.653 1.748 1.828 1.914 2.053 2.132 2.295 2.457 2.602 2.667 2.797 2.916 3.088 3.202 3.318 3.48 3.634 3.794 3.932 4.055 4.216 4.373 4.523 4.702 4.875 5.048 5.247 5.459 5.669 5.89 6.124 6.386 6.655 6.936 7.262 7.606 7.996 8.388 8.822 9.333 9.866 10.372 10.852 11.031 10.992 10.868 10.686 10.473 10.257 10.034 9.816 9.593 9.402 9.224 9.044 8.874 8.716 8.583 8.43 8.285 8.166 8.031 7.882 7.76 7.635 7.49 7.37 7.252 7.135 7.006 6.88 6.795 6.706 6.565 6.463 6.36 6.304 6.183 6.056 5.906 5.828 5.688 5.56 5.458 5.356 5.148 5.04 4.92 4.776 4.612 4.455 4.202 3.566 -5 ,5790 ,KEBNE ,17018520,Tue Dec 21 23:54:48 CET,Wed Dec 22 02:13:03 CET,0.0 0.43 0.635 0.813 0.982 1.131 1.27 1.403 1.636 1.734 1.831 1.962 2.111 2.183 2.332 2.469 2.6 2.668 2.799 2.921 3.089 3.191 3.29 3.434 3.567 3.695 3.814 3.931 4.081 4.239 4.402 4.589 4.758 4.931 5.142 5.352 5.535 5.746 5.985 6.233 6.506 6.801 7.114 7.438 7.808 8.192 8.598 9.053 9.57 10.08 10.569 10.797 10.792 10.709 10.574 10.389 10.192 10.005 9.832 9.637 9.476 9.333 9.185 9.041 8.899 8.77 8.631 8.5 8.39 8.276 8.157 8.048 7.934 7.821 7.725 7.625 7.531 7.432 7.318 7.24 7.159 7.018 6.92 6.825 6.78 6.687 6.583 6.468 6.412 6.295 6.223 6.145 6.064 5.913 5.806 5.684 5.567 5.424 5.255 5.026 4.619 -6 ,2026 ,KEBNE ,17018521,Tue Dec 21 23:54:48 CET,Wed Dec 22 02:13:17 CET,0.0 0.317 0.56 0.752 0.891 1.015 1.134 1.236 1.436 1.546 1.66 1.823 1.98 2.059 2.205 2.33 2.459 2.524 2.654 2.781 2.958 3.069 3.168 3.314 3.455 3.577 3.706 3.837 3.998 4.161 4.315 4.499 4.68 4.843 5.03 5.239 5.435 5.653 5.886 6.129 6.39 6.67 6.992 7.321 7.673 8.038 8.453 8.911 9.404 9.962 10.532 10.771 10.749 10.605 10.42 10.22 10.013 9.804 9.628 9.435 9.253 9.097 8.94 8.78 8.623 8.475 8.317 8.17 8.049 7.923 7.785 7.678 7.565 7.436 7.336 7.231 7.122 7.012 6.89 6.791 6.686 6.554 6.461 6.353 6.298 6.191 6.071 5.946 5.879 5.748 5.66 5.582 5.498 5.295 5.181 5.058 4.939 4.821 4.656 4.415 4.054 -7 ,11522 ,KEBNE ,17018522,Tue Dec 21 23:55:50 CET,Wed Dec 22 02:14:47 CET,0.0 0.504 0.794 1.025 1.2 1.368 1.503 1.631 1.885 1.993 2.085 2.189 2.339 2.423 2.58 2.723 2.862 2.937 3.085 3.223 3.402 3.511 3.625 3.803 3.964 4.103 4.236 4.366 4.547 4.734 4.926 5.14 5.32 5.492 5.708 5.961 6.181 6.415 6.659 6.913 7.188 7.493 7.841 8.171 8.546 8.953 9.4 9.894 10.45 10.987 11.46 11.692 11.708 11.585 11.391 11.178 10.937 10.705 10.509 10.306 10.123 9.955 9.784 9.632 9.49 9.354 9.213 9.079 8.952 8.815 8.665 8.536 8.415 8.293 8.196 8.096 7.979 7.848 7.724 7.637 7.546 7.397 7.276 7.161 7.102 6.98 6.856 6.719 6.643 6.5 6.389 6.302 6.217 6.031 5.927 5.821 5.719 5.601 5.462 5.319 4.826 -8 ,8415 ,KEBNE ,17018523,Tue Dec 21 23:55:50 CET,Wed Dec 22 02:13:16 CET,0.0 0.737 0.996 1.208 1.41 1.577 1.708 1.824 2.026 2.122 2.217 2.333 2.484 2.569 2.731 2.879 3.027 3.098 3.241 3.367 3.539 3.657 3.768 3.938 4.104 4.25 4.391 4.531 4.714 4.882 5.048 5.255 5.433 5.602 5.797 6.01 6.216 6.449 6.694 6.942 7.205 7.494 7.822 8.153 8.536 8.941 9.366 9.814 10.309 10.844 11.389 11.638 11.633 11.517 11.325 11.114 10.931 10.746 10.554 10.362 10.186 10.015 9.839 9.674 9.515 9.366 9.213 9.082 8.96 8.823 8.68 8.561 8.43 8.3 8.204 8.101 7.997 7.892 7.775 7.686 7.596 7.463 7.365 7.259 7.204 7.083 6.956 6.833 6.778 6.659 6.577 6.494 6.414 6.257 6.161 6.063 5.96 5.837 5.681 5.481 5.137 -9 ,25087 ,KEBNE ,17018524,Tue Dec 21 23:55:50 CET,Wed Dec 22 02:14:47 CET,0.0 0.497 0.721 0.881 1.029 1.178 1.295 1.407 1.624 1.72 1.808 1.913 2.061 2.132 2.257 2.399 2.54 2.608 2.754 2.893 3.061 3.169 3.277 3.423 3.566 3.71 3.843 3.961 4.119 4.282 4.436 4.608 4.773 4.94 5.126 5.334 5.529 5.736 5.966 6.197 6.432 6.709 7.045 7.38 7.76 8.193 8.668 9.123 9.585 10.032 10.429 10.595 10.575 10.46 10.292 10.097 9.874 9.662 9.489 9.309 9.155 8.998 8.823 8.661 8.514 8.378 8.236 8.104 7.993 7.874 7.74 7.631 7.52 7.397 7.297 7.193 7.084 6.967 6.842 6.755 6.665 6.524 6.429 6.337 6.285 6.177 6.063 5.947 5.89 5.766 5.69 5.618 5.542 5.362 5.271 5.179 5.07 4.947 4.823 4.653 4.451 -10 ,29430 ,KEBNE ,17018525,Tue Dec 21 23:55:50 CET,Wed Dec 22 02:13:43 CET,0.0 0.381 0.608 0.802 0.941 1.067 1.191 1.3 1.492 1.585 1.671 1.773 1.919 2.002 2.173 2.331 2.487 2.555 2.667 2.782 2.953 3.054 3.157 3.319 3.469 3.609 3.741 3.862 4.014 4.167 4.321 4.506 4.691 4.868 5.069 5.292 5.494 5.731 5.987 6.256 6.53 6.819 7.15 7.479 7.86 8.266 8.701 9.17 9.707 10.242 10.723 10.922 10.886 10.787 10.639 10.469 10.275 10.059 9.855 9.638 9.476 9.32 9.146 8.99 8.845 8.708 8.549 8.397 8.262 8.132 7.998 7.883 7.77 7.645 7.546 7.445 7.33 7.207 7.08 6.99 6.899 6.761 6.664 6.555 6.5 6.396 6.298 6.186 6.119 5.981 5.88 5.801 5.718 5.537 5.444 5.332 5.19 5.021 4.834 4.585 3.975 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt deleted file mode 100644 index a5421eca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18829 ,KEBNE ,17018526,Tue Dec 21 23:56:52 CET,Wed Dec 22 02:16:14 CET,0.0 0.372 0.638 0.806 0.94 1.073 1.21 1.337 1.581 1.7 1.802 1.926 2.07 2.162 2.333 2.488 2.645 2.718 2.857 3.011 3.237 3.362 3.48 3.651 3.82 3.994 4.154 4.306 4.519 4.714 4.898 5.118 5.329 5.546 5.793 6.083 6.354 6.643 6.961 7.297 7.656 8.061 8.512 8.973 9.525 10.162 10.937 11.775 12.656 13.617 14.87 15.838 16.26 16.472 16.544 16.506 16.429 16.355 16.271 16.166 16.054 15.929 15.793 15.662 15.546 15.439 15.319 15.208 15.115 15.007 14.889 14.789 14.688 14.588 14.495 14.391 14.291 14.185 14.056 13.969 13.882 13.748 13.66 13.57 13.521 13.411 13.278 13.148 13.093 12.991 12.881 12.797 12.7 12.496 12.391 12.281 12.157 11.974 11.776 11.581 11.223 -2 ,16620 ,KEBNE ,17018527,Tue Dec 21 23:57:54 CET,Wed Dec 22 02:16:00 CET,0.0 0.254 0.449 0.62 0.753 0.868 0.979 1.08 1.277 1.37 1.456 1.569 1.712 1.794 1.943 2.087 2.239 2.308 2.447 2.586 2.781 2.909 3.026 3.206 3.372 3.521 3.684 3.85 4.052 4.26 4.461 4.692 4.918 5.129 5.364 5.628 5.881 6.159 6.455 6.772 7.112 7.504 8.0 8.493 9.026 9.603 10.297 11.119 12.058 13.102 14.29 15.306 15.883 16.178 16.306 16.339 16.308 16.232 16.151 16.044 15.937 15.837 15.725 15.607 15.478 15.357 15.242 15.14 15.034 14.908 14.78 14.661 14.536 14.412 14.317 14.217 14.109 13.99 13.859 13.767 13.674 13.526 13.426 13.328 13.28 13.171 13.054 12.932 12.864 12.748 12.637 12.558 12.469 12.27 12.165 12.049 11.925 11.785 11.63 11.415 10.911 -3 ,8393 ,KEBNE ,17018528,Tue Dec 21 23:57:54 CET,Wed Dec 22 02:15:32 CET,0.0 0.19 0.381 0.528 0.675 0.82 0.946 1.064 1.295 1.399 1.504 1.648 1.797 1.88 2.04 2.19 2.346 2.431 2.584 2.719 2.914 3.044 3.176 3.358 3.529 3.702 3.863 4.013 4.215 4.414 4.603 4.828 5.05 5.266 5.503 5.77 6.033 6.317 6.63 6.972 7.351 7.772 8.246 8.714 9.285 9.925 10.589 11.327 12.271 13.445 14.744 15.677 16.078 16.289 16.439 16.481 16.457 16.426 16.385 16.307 16.21 16.104 16.01 15.925 15.821 15.708 15.589 15.484 15.38 15.259 15.13 15.024 14.921 14.819 14.731 14.639 14.549 14.445 14.333 14.258 14.173 14.03 13.939 13.843 13.79 13.671 13.538 13.406 13.341 13.222 13.105 13.029 12.948 12.745 12.633 12.525 12.398 12.244 12.096 11.936 11.544 -4 ,22663 ,KEBNE ,17018529,Tue Dec 21 23:57:53 CET,Wed Dec 22 02:18:11 CET,0.0 0.352 0.546 0.728 0.896 1.032 1.159 1.281 1.492 1.594 1.693 1.833 1.979 2.062 2.228 2.393 2.557 2.631 2.767 2.908 3.11 3.234 3.354 3.526 3.691 3.861 4.028 4.18 4.377 4.572 4.76 4.991 5.22 5.45 5.723 6.027 6.309 6.621 6.975 7.358 7.745 8.173 8.671 9.15 9.72 10.376 11.082 11.86 12.782 13.769 14.911 15.71 16.088 16.294 16.362 16.388 16.375 16.33 16.247 16.13 16.019 15.91 15.81 15.713 15.617 15.522 15.408 15.287 15.168 15.05 14.934 14.833 14.734 14.629 14.539 14.434 14.32 14.201 14.086 14.013 13.926 13.788 13.695 13.591 13.539 13.429 13.32 13.203 13.131 13.022 12.948 12.876 12.783 12.606 12.519 12.411 12.303 12.178 12.025 11.847 11.554 -5 ,6280 ,KEBNE ,17018530,Tue Dec 21 23:57:54 CET,Wed Dec 22 02:13:58 CET,0.0 0.465 0.682 0.875 1.022 1.137 1.252 1.368 1.585 1.682 1.777 1.909 2.06 2.147 2.31 2.463 2.607 2.677 2.818 2.953 3.143 3.268 3.392 3.573 3.75 3.915 4.067 4.216 4.413 4.604 4.795 5.027 5.24 5.45 5.702 5.978 6.267 6.591 6.92 7.265 7.629 8.043 8.532 9.049 9.651 10.292 11.062 11.919 12.871 14.004 15.28 16.183 16.662 16.9 16.973 16.961 16.893 16.809 16.743 16.645 16.514 16.372 16.224 16.101 15.996 15.889 15.779 15.677 15.584 15.479 15.371 15.29 15.19 15.083 15.006 14.926 14.843 14.744 14.634 14.553 14.47 14.351 14.265 14.173 14.124 14.022 13.915 13.786 13.717 13.608 13.499 13.412 13.326 13.183 13.106 13.001 12.872 12.733 12.563 12.314 11.916 -6 ,9814 ,KEBNE ,17018531,Tue Dec 21 23:57:57 CET,Wed Dec 22 02:13:35 CET,0.0 0.38 0.56 0.705 0.84 0.982 1.116 1.243 1.468 1.561 1.653 1.764 1.91 2.004 2.164 2.304 2.436 2.506 2.655 2.795 3.004 3.134 3.248 3.423 3.6 3.759 3.914 4.076 4.283 4.469 4.647 4.866 5.076 5.28 5.526 5.822 6.104 6.408 6.739 7.097 7.457 7.854 8.326 8.792 9.344 9.974 10.705 11.487 12.442 13.616 14.816 15.571 15.973 16.193 16.264 16.27 16.241 16.171 16.082 15.964 15.863 15.779 15.681 15.561 15.443 15.344 15.243 15.156 15.075 14.99 14.89 14.794 14.687 14.569 14.477 14.389 14.308 14.218 14.098 14.009 13.927 13.801 13.709 13.606 13.554 13.459 13.354 13.221 13.15 13.04 12.951 12.871 12.791 12.602 12.484 12.346 12.208 12.062 11.841 11.602 11.093 -7 ,23931 ,KEBNE ,17018532,Wed Dec 22 00:00:01 CET,Wed Dec 22 02:18:51 CET,0.0 0.329 0.535 0.685 0.809 0.928 1.052 1.169 1.371 1.469 1.57 1.714 1.866 1.961 2.146 2.308 2.459 2.531 2.67 2.811 3.018 3.153 3.278 3.451 3.618 3.78 3.939 4.097 4.299 4.494 4.694 4.935 5.16 5.382 5.646 5.942 6.224 6.522 6.835 7.189 7.58 8.003 8.476 8.952 9.53 10.167 10.904 11.753 12.749 13.884 15.167 16.123 16.558 16.766 16.849 16.845 16.791 16.721 16.632 16.527 16.427 16.315 16.202 16.077 15.952 15.852 15.737 15.633 15.533 15.412 15.285 15.179 15.068 14.947 14.859 14.77 14.668 14.566 14.454 14.378 14.302 14.17 14.076 13.976 13.926 13.82 13.697 13.572 13.505 13.385 13.266 13.179 13.09 12.911 12.827 12.727 12.591 12.445 12.271 12.017 11.369 -8 ,23701 ,KEBNE ,17018533,Tue Dec 21 23:59:57 CET,Wed Dec 22 02:19:01 CET,0.0 0.336 0.542 0.713 0.871 1.001 1.121 1.234 1.437 1.526 1.618 1.739 1.881 1.962 2.125 2.281 2.415 2.477 2.62 2.767 2.955 3.071 3.191 3.372 3.544 3.707 3.855 3.998 4.19 4.375 4.548 4.759 4.963 5.16 5.401 5.685 5.94 6.208 6.508 6.831 7.175 7.574 8.062 8.548 9.08 9.643 10.316 11.078 11.963 13.027 14.218 15.13 15.538 15.726 15.835 15.871 15.877 15.82 15.717 15.622 15.54 15.441 15.33 15.211 15.094 14.966 14.824 14.715 14.612 14.497 14.379 14.27 14.147 14.023 13.937 13.84 13.724 13.612 13.496 13.413 13.329 13.192 13.094 12.996 12.948 12.844 12.727 12.61 12.552 12.443 12.328 12.244 12.148 11.953 11.866 11.775 11.653 11.513 11.368 11.179 10.844 -9 ,6062 ,KEBNE ,17018534,Tue Dec 21 23:59:57 CET,Wed Dec 22 02:19:29 CET,0.0 0.42 0.645 0.815 0.955 1.081 1.189 1.287 1.493 1.601 1.698 1.8 1.938 2.033 2.217 2.361 2.494 2.562 2.699 2.837 3.024 3.136 3.25 3.424 3.598 3.761 3.915 4.062 4.262 4.467 4.65 4.863 5.064 5.262 5.509 5.811 6.103 6.406 6.728 7.071 7.432 7.839 8.321 8.797 9.35 9.935 10.617 11.417 12.305 13.302 14.482 15.38 15.829 16.083 16.169 16.146 16.096 16.021 15.938 15.836 15.724 15.625 15.526 15.409 15.291 15.189 15.07 14.966 14.88 14.785 14.672 14.574 14.481 14.384 14.306 14.231 14.141 14.036 13.93 13.856 13.777 13.638 13.534 13.431 13.38 13.274 13.146 13.0 12.928 12.817 12.708 12.62 12.52 12.314 12.214 12.097 11.975 11.827 11.638 11.385 10.981 -10 ,8872 ,KEBNE ,17018535,Tue Dec 21 23:59:57 CET,Wed Dec 22 02:19:10 CET,0.0 0.345 0.525 0.672 0.816 0.941 1.063 1.18 1.401 1.509 1.602 1.729 1.882 1.966 2.122 2.27 2.421 2.499 2.638 2.767 2.965 3.089 3.209 3.397 3.59 3.767 3.926 4.082 4.294 4.5 4.703 4.947 5.179 5.402 5.657 5.94 6.202 6.51 6.86 7.216 7.588 8.043 8.565 9.051 9.625 10.25 10.965 11.752 12.675 13.813 15.189 16.154 16.614 16.832 16.901 16.912 16.86 16.76 16.659 16.55 16.446 16.353 16.247 16.117 15.984 15.87 15.751 15.638 15.538 15.422 15.301 15.196 15.075 14.963 14.869 14.758 14.654 14.555 14.451 14.375 14.294 14.168 14.072 13.969 13.921 13.809 13.692 13.575 13.509 13.398 13.284 13.187 13.095 12.9 12.794 12.69 12.562 12.414 12.275 12.068 11.652 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 5d342c07..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22100 ,KEBNE ,17018536,Wed Dec 22 00:01:00 CET,Wed Dec 22 02:19:23 CET,0.0 0.935 1.309 1.56 1.78 1.975 2.153 2.324 2.618 2.745 2.885 3.11 3.309 3.431 3.646 3.827 4.004 4.098 4.291 4.469 4.73 4.896 5.05 5.276 5.502 5.732 5.943 6.132 6.387 6.635 6.881 7.195 7.51 7.835 8.196 8.565 8.943 9.372 9.819 10.284 10.777 11.365 12.04 12.69 13.468 14.397 15.49 16.696 18.161 19.95 22.303 24.328 25.365 26.023 26.414 26.6 26.756 26.856 26.891 26.903 26.898 26.856 26.777 26.681 26.598 26.518 26.415 26.323 26.211 26.083 25.961 25.867 25.783 25.693 25.598 25.483 25.361 25.226 25.099 25.021 24.926 24.747 24.607 24.45 24.368 24.225 24.061 23.838 23.724 23.58 23.411 23.302 23.18 22.896 22.745 22.558 22.355 22.149 21.871 21.374 19.926 -2 ,31060 ,KEBNE ,17018537,Wed Dec 22 00:01:00 CET,Wed Dec 22 02:17:27 CET,0.0 0.67 1.076 1.358 1.593 1.811 1.994 2.161 2.474 2.618 2.735 2.879 3.054 3.174 3.4 3.602 3.79 3.883 4.051 4.22 4.497 4.664 4.825 5.063 5.306 5.545 5.761 5.966 6.235 6.48 6.74 7.083 7.394 7.693 8.064 8.487 8.873 9.284 9.72 10.184 10.693 11.289 11.971 12.64 13.445 14.365 15.48 16.772 18.25 20.053 22.315 24.315 25.606 26.357 26.827 27.151 27.315 27.404 27.445 27.455 27.456 27.407 27.327 27.261 27.195 27.115 27.017 26.937 26.848 26.747 26.655 26.572 26.464 26.341 26.243 26.136 26.035 25.918 25.789 25.704 25.61 25.455 25.35 25.242 25.171 25.021 24.893 24.712 24.598 24.452 24.279 24.164 24.043 23.791 23.636 23.433 23.181 22.91 22.617 22.191 20.166 -3 ,12042 ,KEBNE ,17018538,Wed Dec 22 00:01:00 CET,Wed Dec 22 02:17:49 CET,0.0 0.755 1.068 1.284 1.477 1.652 1.822 1.992 2.308 2.444 2.572 2.766 2.941 3.047 3.269 3.487 3.684 3.775 3.965 4.145 4.404 4.567 4.726 4.974 5.209 5.423 5.64 5.85 6.114 6.382 6.636 6.943 7.258 7.573 7.933 8.349 8.752 9.192 9.69 10.25 10.829 11.475 12.245 13.023 13.946 14.96 16.13 17.496 19.104 21.01 23.272 25.132 26.225 26.885 27.317 27.587 27.744 27.847 27.909 27.935 27.92 27.875 27.826 27.779 27.71 27.629 27.534 27.45 27.377 27.265 27.131 27.019 26.901 26.805 26.722 26.628 26.54 26.446 26.337 26.251 26.167 26.025 25.916 25.785 25.724 25.619 25.446 25.222 25.115 24.978 24.837 24.728 24.593 24.321 24.19 24.041 23.844 23.598 23.309 22.95 21.166 -4 ,26354 ,KEBNE ,17018539,Wed Dec 22 00:01:00 CET,Wed Dec 22 02:15:46 CET,0.0 0.752 1.046 1.291 1.499 1.692 1.862 2.032 2.378 2.531 2.668 2.853 3.04 3.158 3.392 3.651 3.906 4.015 4.23 4.44 4.734 4.911 5.078 5.317 5.551 5.781 6.01 6.231 6.511 6.788 7.064 7.396 7.715 8.017 8.361 8.749 9.122 9.553 10.025 10.515 11.042 11.658 12.39 13.116 13.976 14.961 16.119 17.415 18.95 20.801 23.064 25.002 26.069 26.719 27.18 27.48 27.635 27.715 27.777 27.815 27.809 27.779 27.712 27.619 27.546 27.486 27.396 27.286 27.173 27.047 26.933 26.833 26.724 26.629 26.544 26.439 26.328 26.222 26.106 26.011 25.904 25.753 25.672 25.565 25.497 25.359 25.203 25.029 24.937 24.794 24.651 24.546 24.406 24.103 23.947 23.723 23.459 23.201 22.918 22.497 20.728 -5 ,1640 ,KEBNE ,17018540,Wed Dec 22 00:01:04 CET,Wed Dec 22 02:14:40 CET,0.0 0.746 1.014 1.221 1.404 1.568 1.724 1.887 2.188 2.326 2.452 2.622 2.807 2.915 3.111 3.326 3.546 3.651 3.849 4.032 4.296 4.463 4.628 4.872 5.113 5.342 5.565 5.792 6.081 6.356 6.636 6.988 7.315 7.628 7.992 8.392 8.768 9.18 9.603 10.031 10.517 11.089 11.746 12.424 13.232 14.139 15.24 16.554 18.1 19.849 22.052 23.987 25.061 25.708 26.083 26.305 26.456 26.575 26.619 26.614 26.584 26.527 26.457 26.387 26.302 26.218 26.117 26.015 25.929 25.821 25.707 25.616 25.528 25.436 25.35 25.238 25.114 24.978 24.839 24.755 24.661 24.523 24.396 24.254 24.196 24.059 23.851 23.612 23.509 23.355 23.125 22.989 22.868 22.635 22.481 22.23 21.928 21.656 21.287 20.716 18.484 -6 ,21976 ,KEBNE ,17018541,Wed Dec 22 00:02:02 CET,Wed Dec 22 02:20:31 CET,0.0 0.39 0.622 0.836 1.028 1.196 1.332 1.48 1.756 1.884 2.01 2.172 2.348 2.463 2.673 2.85 3.029 3.124 3.302 3.465 3.709 3.869 4.038 4.299 4.561 4.816 5.05 5.274 5.553 5.81 6.059 6.349 6.637 6.934 7.286 7.679 8.042 8.456 8.911 9.38 9.889 10.462 11.143 11.866 12.721 13.674 14.763 15.95 17.385 19.159 21.493 23.57 24.751 25.438 25.874 26.173 26.366 26.468 26.494 26.475 26.457 26.429 26.364 26.268 26.169 26.08 25.99 25.893 25.792 25.691 25.582 25.494 25.406 25.296 25.201 25.095 24.961 24.811 24.662 24.574 24.474 24.31 24.215 24.113 24.057 23.947 23.839 23.704 23.618 23.489 23.358 23.257 23.138 22.848 22.698 22.544 22.354 22.131 21.879 21.534 20.212 -7 ,27529 ,KEBNE ,17018542,Wed Dec 22 00:02:02 CET,Wed Dec 22 02:17:54 CET,0.0 0.308 0.515 0.731 0.929 1.113 1.262 1.4 1.661 1.785 1.898 2.051 2.232 2.336 2.531 2.714 2.9 2.99 3.155 3.324 3.582 3.744 3.895 4.117 4.34 4.548 4.747 4.945 5.195 5.459 5.723 6.044 6.347 6.613 6.933 7.306 7.659 8.065 8.532 9.033 9.55 10.138 10.836 11.54 12.355 13.318 14.497 15.855 17.437 19.371 21.782 23.738 24.868 25.547 25.952 26.193 26.341 26.425 26.488 26.536 26.55 26.508 26.443 26.398 26.344 26.266 26.177 26.116 26.048 25.959 25.835 25.72 25.604 25.464 25.356 25.254 25.148 25.035 24.923 24.838 24.741 24.602 24.501 24.384 24.324 24.191 24.032 23.862 23.776 23.645 23.491 23.38 23.261 22.992 22.837 22.633 22.35 22.071 21.764 21.222 19.716 -8 ,27699 ,KEBNE ,17018543,Wed Dec 22 00:02:02 CET,Wed Dec 22 02:18:52 CET,0.0 0.823 1.151 1.38 1.595 1.774 1.934 2.096 2.386 2.51 2.638 2.829 3.014 3.139 3.4 3.641 3.845 3.938 4.111 4.275 4.532 4.703 4.857 5.061 5.265 5.469 5.658 5.84 6.078 6.311 6.539 6.819 7.1 7.372 7.681 8.023 8.362 8.748 9.157 9.6 10.091 10.642 11.276 11.95 12.761 13.671 14.761 16.006 17.503 19.386 21.691 23.581 24.69 25.462 25.976 26.321 26.577 26.739 26.853 26.926 26.945 26.938 26.888 26.822 26.76 26.693 26.612 26.532 26.456 26.358 26.258 26.173 26.058 25.952 25.876 25.765 25.638 25.506 25.364 25.267 25.167 24.996 24.887 24.78 24.714 24.571 24.428 24.276 24.188 24.042 23.875 23.757 23.632 23.392 23.244 23.046 22.841 22.592 22.244 21.827 20.327 -9 ,18750 ,KEBNE ,17018544,Wed Dec 22 00:02:02 CET,Wed Dec 22 02:19:32 CET,0.0 0.529 0.795 1.013 1.24 1.448 1.616 1.772 2.07 2.194 2.304 2.456 2.624 2.731 2.952 3.145 3.332 3.427 3.605 3.785 4.056 4.226 4.389 4.628 4.857 5.079 5.301 5.515 5.798 6.074 6.351 6.703 7.042 7.35 7.7 8.093 8.473 8.902 9.391 9.921 10.458 11.037 11.718 12.442 13.286 14.228 15.365 16.72 18.355 20.382 22.975 25.144 26.338 27.072 27.572 27.948 28.206 28.34 28.38 28.383 28.392 28.395 28.375 28.327 28.259 28.188 28.104 28.015 27.923 27.814 27.696 27.606 27.503 27.382 27.288 27.174 27.049 26.912 26.772 26.682 26.591 26.446 26.337 26.224 26.163 26.005 25.826 25.635 25.539 25.402 25.224 25.1 24.98 24.687 24.495 24.288 24.034 23.756 23.451 22.972 21.332 -10 ,11536 ,KEBNE ,17018545,Wed Dec 22 00:02:02 CET,Wed Dec 22 02:17:33 CET,0.0 1.484 1.858 2.153 2.358 2.573 2.766 2.908 3.197 3.345 3.484 3.672 3.862 3.989 4.226 4.426 4.612 4.696 4.864 5.051 5.335 5.511 5.693 5.968 6.209 6.43 6.648 6.862 7.131 7.398 7.67 7.983 8.272 8.557 8.895 9.289 9.689 10.142 10.619 11.103 11.613 12.189 12.881 13.577 14.415 15.378 16.503 17.81 19.319 21.104 23.411 25.406 26.578 27.333 27.804 28.122 28.297 28.38 28.423 28.429 28.402 28.341 28.272 28.195 28.117 28.05 27.955 27.855 27.763 27.644 27.499 27.371 27.244 27.117 27.016 26.893 26.763 26.639 26.501 26.4 26.303 26.138 26.016 25.9 25.826 25.633 25.432 25.223 25.103 24.938 24.741 24.62 24.488 24.184 24.027 23.853 23.634 23.371 23.054 22.585 20.701 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt deleted file mode 100644 index 3b3c1068..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1966 ,KEBNE ,17018546,Wed Dec 22 00:02:02 CET,Wed Dec 22 02:20:13 CET,0.0 0.263 0.464 0.629 0.788 0.928 1.05 1.152 1.36 1.453 1.54 1.639 1.772 1.85 1.984 2.106 2.224 2.287 2.414 2.524 2.664 2.758 2.854 2.988 3.123 3.271 3.415 3.54 3.699 3.847 3.988 4.163 4.32 4.464 4.632 4.817 4.992 5.191 5.402 5.618 5.853 6.12 6.412 6.703 7.046 7.416 7.788 8.142 8.533 8.867 9.04 8.851 8.485 8.097 7.684 7.303 6.961 6.591 6.228 5.852 5.501 5.178 4.877 4.602 4.358 4.116 3.851 3.608 3.39 3.171 2.95 2.752 2.534 2.309 2.134 1.95 1.754 1.545 1.333 1.181 1.02 0.778 0.619 0.445 0.353 0.178 -0.015 -0.244 -0.368 -0.551 -0.749 -0.874 -1.007 -1.328 -1.525 -1.725 -1.95 -2.196 -2.506 -2.979 -4.565 -2 ,18143 ,KEBNE ,17018547,Wed Dec 22 00:03:04 CET,Wed Dec 22 02:20:02 CET,0.0 0.44 0.638 0.803 0.95 1.071 1.182 1.284 1.471 1.559 1.648 1.752 1.89 1.965 2.104 2.244 2.374 2.435 2.552 2.665 2.822 2.923 3.023 3.163 3.296 3.43 3.561 3.685 3.847 3.995 4.137 4.311 4.478 4.649 4.85 5.057 5.242 5.433 5.634 5.851 6.091 6.351 6.646 6.966 7.314 7.651 8.004 8.39 8.82 9.23 9.538 9.59 9.459 9.25 9.003 8.729 8.479 8.226 7.983 7.726 7.481 7.238 6.993 6.757 6.536 6.327 6.128 5.954 5.779 5.585 5.393 5.229 5.048 4.865 4.701 4.533 4.365 4.182 3.992 3.853 3.699 3.449 3.285 3.108 3.019 2.844 2.638 2.404 2.291 2.121 1.904 1.767 1.641 1.354 1.179 0.97 0.731 0.465 0.139 -0.25 -1.575 -3 ,14608 ,KEBNE ,17018548,Wed Dec 22 00:04:05 CET,Wed Dec 22 02:22:26 CET,0.0 0.591 0.839 1.001 1.171 1.324 1.42 1.512 1.707 1.8 1.899 2.039 2.174 2.243 2.373 2.499 2.618 2.675 2.795 2.916 3.085 3.194 3.298 3.431 3.56 3.692 3.813 3.929 4.088 4.234 4.381 4.56 4.725 4.871 5.033 5.223 5.391 5.571 5.775 5.984 6.19 6.437 6.722 7.005 7.348 7.708 8.078 8.496 9.046 9.616 10.036 10.134 9.971 9.652 9.346 9.023 8.681 8.363 8.09 7.792 7.525 7.265 6.98 6.709 6.472 6.272 6.043 5.818 5.633 5.438 5.235 5.068 4.886 4.699 4.536 4.354 4.167 3.97 3.778 3.647 3.516 3.293 3.131 2.961 2.869 2.675 2.456 2.238 2.123 1.946 1.749 1.605 1.438 1.095 0.932 0.72 0.463 0.201 -0.087 -0.541 -1.9 -4 ,26605 ,KEBNE ,17018549,Wed Dec 22 00:04:06 CET,Wed Dec 22 02:20:58 CET,0.0 0.448 0.659 0.823 0.951 1.059 1.167 1.26 1.453 1.543 1.623 1.705 1.835 1.911 2.041 2.165 2.296 2.357 2.468 2.573 2.721 2.814 2.906 3.034 3.16 3.283 3.399 3.515 3.668 3.805 3.936 4.104 4.262 4.405 4.576 4.769 4.941 5.12 5.323 5.543 5.761 6.005 6.28 6.557 6.878 7.23 7.613 8.035 8.505 8.876 9.094 9.015 8.758 8.463 8.18 7.864 7.546 7.244 6.96 6.654 6.35 6.076 5.813 5.54 5.276 5.038 4.793 4.565 4.365 4.141 3.896 3.71 3.513 3.3 3.124 2.931 2.745 2.55 2.333 2.186 2.038 1.809 1.643 1.442 1.34 1.173 0.999 0.787 0.67 0.477 0.222 0.06 -0.099 -0.479 -0.678 -0.893 -1.149 -1.434 -1.733 -2.141 -4.003 -5 ,4528 ,KEBNE ,17018550,Wed Dec 22 00:04:05 CET,Wed Dec 22 02:22:12 CET,0.0 0.556 0.771 0.981 1.152 1.266 1.38 1.484 1.69 1.789 1.873 1.975 2.11 2.185 2.316 2.439 2.556 2.609 2.721 2.833 2.99 3.093 3.191 3.334 3.481 3.618 3.739 3.863 4.019 4.159 4.303 4.487 4.652 4.8 4.975 5.16 5.353 5.583 5.799 6.02 6.244 6.486 6.768 7.029 7.342 7.699 8.066 8.465 8.886 9.287 9.603 9.535 9.189 8.802 8.385 7.96 7.611 7.274 6.943 6.595 6.304 6.041 5.768 5.491 5.243 5.019 4.737 4.464 4.252 4.044 3.82 3.621 3.418 3.226 3.078 2.912 2.73 2.532 2.316 2.169 2.025 1.798 1.636 1.46 1.37 1.181 0.984 0.756 0.627 0.446 0.255 0.123 -0.021 -0.36 -0.529 -0.697 -0.918 -1.181 -1.483 -1.891 -3.26 -6 ,3891 ,KEBNE ,17018551,Wed Dec 22 00:04:06 CET,Wed Dec 22 02:21:06 CET,0.0 0.446 0.652 0.818 0.951 1.067 1.179 1.282 1.462 1.556 1.65 1.745 1.876 1.947 2.076 2.193 2.303 2.361 2.483 2.6 2.757 2.859 2.954 3.079 3.208 3.345 3.479 3.598 3.731 3.857 3.986 4.145 4.303 4.455 4.642 4.86 5.061 5.255 5.441 5.643 5.863 6.11 6.391 6.647 6.94 7.301 7.711 8.118 8.524 8.969 9.311 9.298 9.063 8.739 8.422 8.082 7.746 7.391 7.023 6.642 6.304 6.0 5.703 5.41 5.139 4.885 4.636 4.415 4.22 4.013 3.785 3.584 3.378 3.167 3.008 2.856 2.696 2.522 2.336 2.207 2.062 1.825 1.644 1.454 1.361 1.157 0.942 0.72 0.613 0.438 0.208 0.058 -0.087 -0.413 -0.598 -0.775 -0.977 -1.255 -1.571 -1.935 -2.894 -7 ,8531 ,KEBNE ,17018552,Wed Dec 22 00:04:05 CET,Wed Dec 22 02:22:30 CET,0.0 0.418 0.629 0.805 0.958 1.088 1.194 1.305 1.537 1.63 1.716 1.822 1.953 2.021 2.169 2.318 2.449 2.509 2.618 2.722 2.883 3.001 3.11 3.261 3.409 3.542 3.667 3.792 3.951 4.094 4.243 4.421 4.579 4.73 4.908 5.102 5.295 5.498 5.708 5.957 6.221 6.479 6.765 7.06 7.389 7.754 8.153 8.544 8.945 9.363 9.66 9.617 9.434 9.16 8.854 8.506 8.115 7.732 7.442 7.158 6.884 6.598 6.304 6.018 5.754 5.535 5.314 5.105 4.914 4.728 4.539 4.377 4.178 3.952 3.797 3.649 3.487 3.314 3.128 2.989 2.841 2.592 2.416 2.23 2.132 1.923 1.705 1.474 1.348 1.159 0.94 0.795 0.642 0.324 0.153 -0.063 -0.282 -0.472 -0.719 -1.105 -2.957 -8 ,1932 ,KEBNE ,17018553,Wed Dec 22 00:04:06 CET,Wed Dec 22 02:21:03 CET,0.0 0.313 0.527 0.68 0.855 1.012 1.13 1.229 1.406 1.497 1.577 1.671 1.804 1.888 2.045 2.18 2.325 2.395 2.521 2.649 2.833 2.935 3.033 3.179 3.33 3.474 3.608 3.736 3.894 4.057 4.207 4.378 4.553 4.722 4.918 5.13 5.334 5.554 5.779 6.018 6.268 6.525 6.816 7.11 7.46 7.843 8.277 8.765 9.263 9.774 10.264 10.448 10.302 10.022 9.691 9.353 9.034 8.73 8.432 8.101 7.807 7.547 7.278 6.996 6.75 6.545 6.336 6.135 5.956 5.765 5.538 5.338 5.137 4.946 4.805 4.631 4.441 4.26 4.057 3.904 3.744 3.505 3.347 3.172 3.087 2.913 2.703 2.475 2.351 2.163 1.951 1.805 1.64 1.297 1.13 0.942 0.735 0.509 0.191 -0.249 -2.086 -9 ,14638 ,KEBNE ,17018554,Wed Dec 22 00:04:05 CET,Wed Dec 22 02:21:05 CET,0.0 0.291 0.487 0.652 0.783 0.907 1.027 1.136 1.327 1.417 1.505 1.601 1.738 1.819 1.97 2.109 2.229 2.29 2.41 2.534 2.715 2.827 2.937 3.088 3.234 3.379 3.511 3.633 3.79 3.948 4.103 4.288 4.456 4.607 4.786 4.978 5.154 5.351 5.57 5.795 6.03 6.301 6.592 6.916 7.323 7.717 8.133 8.581 9.043 9.496 9.864 9.898 9.649 9.32 8.994 8.65 8.267 7.895 7.56 7.218 6.937 6.681 6.437 6.202 5.95 5.682 5.376 5.11 4.905 4.705 4.49 4.303 4.126 3.947 3.795 3.648 3.496 3.31 3.095 2.938 2.78 2.561 2.419 2.26 2.179 2.017 1.811 1.583 1.466 1.28 1.075 0.915 0.737 0.363 0.158 -0.055 -0.306 -0.611 -0.98 -1.54 -3.323 -10 ,9483 ,KEBNE ,17018555,Wed Dec 22 00:04:06 CET,Wed Dec 22 02:21:24 CET,0.0 0.38 0.563 0.707 0.831 0.94 1.053 1.167 1.371 1.457 1.548 1.696 1.828 1.896 2.039 2.161 2.274 2.33 2.436 2.542 2.708 2.806 2.901 3.04 3.174 3.3 3.414 3.527 3.671 3.807 3.933 4.097 4.262 4.408 4.577 4.772 4.967 5.173 5.372 5.581 5.802 6.034 6.317 6.605 6.918 7.289 7.702 8.121 8.526 8.915 9.268 9.165 8.816 8.404 8.019 7.676 7.272 6.867 6.538 6.211 5.923 5.648 5.373 5.115 4.86 4.616 4.363 4.134 3.935 3.727 3.497 3.305 3.123 2.932 2.782 2.63 2.441 2.216 1.977 1.827 1.69 1.483 1.325 1.13 1.034 0.846 0.664 0.47 0.351 0.168 -0.044 -0.205 -0.375 -0.698 -0.876 -1.075 -1.318 -1.607 -1.953 -2.433 -3.747 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_20_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_20_17.txt deleted file mode 100644 index 2bf3c60b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_20_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17018 ,KEBNE ,17018556,Wed Dec 22 00:05:08 CET,Wed Dec 22 02:23:45 CET,0.0 0.664 1.005 1.274 1.49 1.689 1.853 2.006 2.32 2.472 2.599 2.786 2.972 3.096 3.336 3.567 3.781 3.878 4.051 4.208 4.427 4.585 4.75 4.992 5.225 5.426 5.61 5.788 6.013 6.221 6.429 6.699 6.949 7.192 7.478 7.787 8.1 8.452 8.814 9.155 9.489 9.848 10.241 10.628 11.087 11.551 12.016 12.525 13.009 13.399 13.657 13.586 13.33 12.942 12.523 12.109 11.72 11.39 11.11 10.812 10.542 10.306 10.069 9.816 9.57 9.335 9.099 8.912 8.75 8.575 8.38 8.214 8.047 7.865 7.714 7.559 7.394 7.228 7.076 6.974 6.866 6.704 6.588 6.455 6.381 6.221 6.052 5.882 5.795 5.659 5.486 5.368 5.261 5.046 4.921 4.784 4.622 4.42 4.211 3.981 3.418 -2 ,23606 ,KEBNE ,17018557,Wed Dec 22 00:05:07 CET,Wed Dec 22 02:23:48 CET,0.0 1.537 1.983 2.304 2.53 2.72 2.884 3.038 3.318 3.432 3.548 3.738 3.905 4.013 4.209 4.378 4.549 4.638 4.81 4.998 5.264 5.423 5.571 5.781 5.989 6.186 6.376 6.558 6.783 7.001 7.209 7.475 7.731 7.946 8.203 8.489 8.754 9.055 9.35 9.635 9.936 10.288 10.706 11.105 11.567 12.052 12.571 13.16 13.788 14.434 14.893 14.954 14.703 14.35 14.029 13.694 13.366 13.022 12.71 12.402 12.126 11.866 11.609 11.358 11.127 10.915 10.678 10.468 10.295 10.116 9.911 9.734 9.563 9.379 9.238 9.095 8.947 8.8 8.642 8.525 8.395 8.195 8.068 7.932 7.859 7.699 7.528 7.349 7.248 7.104 6.934 6.831 6.736 6.531 6.411 6.268 6.098 5.895 5.707 5.486 4.553 -3 ,3978 ,KEBNE ,17018558,Wed Dec 22 00:06:09 CET,Wed Dec 22 02:22:16 CET,0.0 1.313 1.749 2.045 2.275 2.466 2.663 2.853 3.171 3.308 3.43 3.572 3.708 3.797 3.975 4.175 4.373 4.466 4.652 4.808 5.005 5.131 5.263 5.491 5.709 5.896 6.082 6.262 6.47 6.647 6.825 7.036 7.226 7.431 7.67 7.909 8.139 8.411 8.727 9.061 9.367 9.698 10.118 10.546 11.014 11.46 11.959 12.504 13.065 13.788 14.61 14.902 14.815 14.622 14.326 14.009 13.699 13.397 13.13 12.844 12.584 12.343 12.088 11.854 11.644 11.448 11.252 11.075 10.916 10.736 10.533 10.372 10.203 10.023 9.892 9.75 9.596 9.426 9.25 9.139 9.027 8.847 8.708 8.565 8.491 8.332 8.167 7.995 7.908 7.761 7.583 7.458 7.323 7.062 6.927 6.782 6.616 6.404 6.17 5.876 5.095 -4 ,25890 ,KEBNE ,17018559,Wed Dec 22 00:07:12 CET,Wed Dec 22 02:25:00 CET,0.0 0.937 1.193 1.384 1.572 1.741 1.886 2.038 2.32 2.451 2.583 2.775 2.942 3.056 3.281 3.486 3.672 3.757 3.923 4.092 4.337 4.498 4.66 4.89 5.105 5.311 5.512 5.715 5.973 6.192 6.404 6.687 6.963 7.196 7.431 7.682 7.925 8.212 8.531 8.844 9.161 9.564 10.036 10.511 11.052 11.614 12.181 12.706 13.195 13.703 14.147 14.072 13.815 13.462 13.075 12.709 12.391 12.105 11.825 11.51 11.256 11.045 10.824 10.584 10.37 10.195 9.992 9.803 9.647 9.478 9.289 9.116 8.922 8.72 8.563 8.397 8.232 8.052 7.87 7.75 7.605 7.38 7.23 7.065 6.984 6.828 6.658 6.469 6.366 6.203 6.011 5.894 5.761 5.469 5.307 5.137 4.943 4.725 4.447 4.075 2.962 -5 ,7185 ,KEBNE ,17018560,Wed Dec 22 00:07:12 CET,Wed Dec 22 02:24:26 CET,0.0 0.996 1.378 1.684 1.945 2.166 2.342 2.511 2.853 3.008 3.155 3.382 3.566 3.693 3.946 4.17 4.367 4.462 4.66 4.85 5.095 5.238 5.385 5.605 5.808 6.008 6.198 6.38 6.617 6.833 7.026 7.243 7.462 7.675 7.904 8.183 8.439 8.719 9.06 9.428 9.797 10.158 10.528 10.902 11.348 11.865 12.48 13.099 13.663 14.176 14.646 14.793 14.615 14.348 14.049 13.721 13.408 13.106 12.824 12.504 12.233 12.014 11.798 11.589 11.381 11.184 10.983 10.805 10.636 10.441 10.249 10.1 9.948 9.786 9.656 9.523 9.397 9.256 9.09 8.977 8.862 8.683 8.541 8.403 8.341 8.2 8.027 7.832 7.741 7.613 7.457 7.348 7.23 6.97 6.83 6.673 6.501 6.312 6.081 5.773 4.903 -6 ,25233 ,KEBNE ,17018561,Wed Dec 22 00:07:12 CET,Wed Dec 22 02:24:09 CET,0.0 1.782 2.208 2.497 2.756 2.976 3.206 3.443 3.841 4.004 4.149 4.333 4.513 4.64 4.876 5.101 5.317 5.421 5.62 5.795 6.039 6.209 6.383 6.619 6.849 7.089 7.302 7.492 7.736 7.96 8.176 8.437 8.682 8.92 9.196 9.512 9.808 10.119 10.466 10.845 11.212 11.613 12.043 12.457 13.017 13.683 14.383 15.051 15.744 16.43 16.963 16.954 16.646 16.277 15.947 15.603 15.278 14.98 14.703 14.409 14.139 13.901 13.659 13.412 13.197 13.014 12.823 12.636 12.464 12.298 12.132 11.994 11.859 11.711 11.588 11.451 11.293 11.128 10.961 10.842 10.717 10.52 10.391 10.254 10.178 10.022 9.859 9.684 9.595 9.457 9.289 9.17 9.051 8.817 8.68 8.518 8.319 8.098 7.846 7.487 6.427 -7 ,5662 ,KEBNE ,17018562,Wed Dec 22 00:07:12 CET,Wed Dec 22 02:22:57 CET,0.0 0.802 1.092 1.313 1.514 1.718 1.918 2.125 2.496 2.637 2.777 3.0 3.178 3.31 3.559 3.772 3.982 4.078 4.25 4.415 4.664 4.826 4.994 5.24 5.443 5.628 5.81 5.998 6.234 6.458 6.68 6.94 7.18 7.407 7.669 7.973 8.282 8.621 8.954 9.25 9.553 9.913 10.323 10.728 11.222 11.768 12.36 12.946 13.565 14.242 14.847 14.972 14.862 14.702 14.42 14.067 13.736 13.433 13.12 12.752 12.441 12.169 11.93 11.724 11.515 11.315 11.107 10.918 10.751 10.57 10.373 10.202 10.03 9.856 9.713 9.576 9.435 9.281 9.124 9.013 8.895 8.704 8.558 8.398 8.319 8.17 8.006 7.82 7.725 7.591 7.449 7.34 7.233 7.006 6.867 6.716 6.549 6.354 6.126 5.864 5.286 -8 ,25868 ,KEBNE ,17018563,Wed Dec 22 00:07:11 CET,Wed Dec 22 02:24:20 CET,0.0 0.783 1.063 1.308 1.529 1.728 1.909 2.057 2.284 2.403 2.528 2.695 2.844 2.94 3.125 3.312 3.511 3.615 3.809 3.985 4.245 4.398 4.54 4.743 4.948 5.156 5.351 5.533 5.773 6.0 6.189 6.417 6.652 6.886 7.162 7.458 7.759 8.096 8.447 8.839 9.218 9.6 10.074 10.555 11.083 11.655 12.253 12.835 13.513 14.313 15.149 15.555 15.458 15.135 14.756 14.408 14.081 13.768 13.481 13.184 12.907 12.638 12.386 12.132 11.894 11.702 11.504 11.322 11.139 10.943 10.769 10.622 10.473 10.316 10.18 10.024 9.863 9.693 9.528 9.422 9.293 9.073 8.935 8.806 8.739 8.582 8.418 8.265 8.174 8.03 7.866 7.751 7.621 7.337 7.205 7.065 6.901 6.708 6.457 6.149 5.371 -9 ,6230 ,KEBNE ,17018564,Wed Dec 22 00:07:16 CET,Wed Dec 22 02:21:25 CET,0.0 0.596 1.05 1.371 1.578 1.804 2.026 2.229 2.579 2.722 2.851 3.015 3.178 3.298 3.512 3.709 3.908 4.007 4.191 4.36 4.6 4.751 4.898 5.101 5.282 5.461 5.633 5.807 6.025 6.219 6.411 6.649 6.889 7.108 7.333 7.576 7.822 8.123 8.439 8.76 9.09 9.454 9.861 10.238 10.686 11.204 11.793 12.415 13.029 13.511 13.778 13.779 13.566 13.268 12.94 12.593 12.266 11.898 11.537 11.205 10.921 10.639 10.364 10.087 9.818 9.577 9.317 9.087 8.883 8.666 8.444 8.269 8.092 7.888 7.726 7.567 7.401 7.206 6.984 6.835 6.697 6.499 6.361 6.221 6.148 5.986 5.818 5.646 5.556 5.423 5.283 5.18 5.063 4.806 4.672 4.523 4.354 4.186 4.005 3.74 2.757 -10 ,23665 ,KEBNE ,17018565,Wed Dec 22 00:08:14 CET,Wed Dec 22 02:24:24 CET,0.0 0.543 0.825 1.049 1.254 1.447 1.626 1.795 2.112 2.252 2.371 2.554 2.714 2.825 3.008 3.174 3.356 3.438 3.586 3.732 3.961 4.111 4.255 4.449 4.631 4.812 4.977 5.121 5.322 5.526 5.709 5.916 6.127 6.352 6.597 6.866 7.136 7.427 7.72 8.015 8.327 8.69 9.123 9.546 9.992 10.484 11.068 11.638 12.219 12.812 13.304 13.344 13.108 12.734 12.352 11.981 11.625 11.296 11.001 10.709 10.433 10.178 9.941 9.716 9.503 9.297 9.088 8.911 8.761 8.607 8.427 8.277 8.119 7.955 7.82 7.666 7.512 7.356 7.194 7.075 6.954 6.767 6.62 6.469 6.388 6.215 6.037 5.856 5.761 5.609 5.428 5.308 5.176 4.903 4.743 4.549 4.322 4.076 3.807 3.457 2.52 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_20_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_20_1h1r.txt deleted file mode 100644 index fc3aa90e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_20_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4312 ,KEBNE ,17018566,Wed Dec 22 00:08:14 CET,Wed Dec 22 02:24:27 CET,0.0 0.563 0.841 1.036 1.209 1.352 1.469 1.603 1.863 1.968 2.073 2.239 2.377 2.465 2.655 2.833 3.002 3.077 3.214 3.349 3.556 3.684 3.809 3.99 4.168 4.346 4.508 4.662 4.859 5.054 5.247 5.47 5.673 5.891 6.147 6.419 6.671 6.935 7.223 7.527 7.85 8.196 8.555 8.91 9.342 9.814 10.324 10.926 11.546 12.066 12.615 12.898 12.81 12.556 12.308 12.03 11.715 11.422 11.148 10.849 10.581 10.323 10.088 9.878 9.654 9.442 9.245 9.064 8.893 8.724 8.559 8.417 8.266 8.098 7.972 7.848 7.704 7.558 7.408 7.299 7.188 7.008 6.883 6.758 6.697 6.576 6.428 6.274 6.194 6.058 5.898 5.804 5.713 5.475 5.334 5.191 5.034 4.851 4.573 4.221 3.055 -2 ,24670 ,KEBNE ,17018567,Wed Dec 22 00:08:14 CET,Wed Dec 22 02:23:59 CET,0.0 0.737 1.051 1.333 1.562 1.741 1.908 2.057 2.31 2.431 2.548 2.704 2.845 2.932 3.099 3.262 3.442 3.528 3.684 3.829 4.028 4.166 4.302 4.485 4.666 4.852 5.044 5.222 5.445 5.656 5.86 6.124 6.368 6.577 6.815 7.097 7.37 7.671 7.992 8.298 8.602 8.974 9.432 9.869 10.336 10.816 11.325 11.88 12.454 13.046 13.524 13.609 13.51 13.291 13.004 12.731 12.46 12.168 11.881 11.554 11.274 11.027 10.783 10.558 10.34 10.136 9.919 9.728 9.557 9.357 9.157 8.987 8.797 8.614 8.475 8.336 8.202 8.055 7.889 7.774 7.654 7.442 7.297 7.157 7.087 6.938 6.791 6.638 6.548 6.411 6.242 6.128 6.018 5.767 5.627 5.47 5.296 5.104 4.879 4.637 4.05 -3 ,10638 ,KEBNE ,17018568,Wed Dec 22 00:08:14 CET,Wed Dec 22 02:25:07 CET,0.0 0.653 0.893 1.115 1.282 1.413 1.54 1.675 1.925 2.029 2.135 2.313 2.467 2.56 2.742 2.913 3.083 3.167 3.329 3.492 3.712 3.835 3.948 4.123 4.301 4.467 4.618 4.762 4.96 5.156 5.352 5.621 5.878 6.097 6.339 6.608 6.864 7.147 7.472 7.85 8.225 8.599 9.042 9.485 10.007 10.612 11.276 11.91 12.552 13.24 13.849 14.053 13.918 13.683 13.449 13.169 12.881 12.599 12.328 12.041 11.786 11.542 11.311 11.098 10.901 10.72 10.499 10.29 10.125 9.963 9.776 9.618 9.466 9.278 9.124 8.986 8.848 8.685 8.512 8.391 8.262 8.078 7.942 7.785 7.704 7.546 7.404 7.266 7.186 7.063 6.942 6.854 6.762 6.556 6.431 6.284 6.125 5.924 5.693 5.406 4.976 -4 ,13739 ,KEBNE ,17018569,Wed Dec 22 00:08:14 CET,Wed Dec 22 02:24:30 CET,0.0 1.105 1.427 1.677 1.922 2.135 2.33 2.519 2.839 2.98 3.111 3.304 3.468 3.576 3.785 3.982 4.174 4.264 4.426 4.582 4.818 4.976 5.123 5.338 5.559 5.766 5.965 6.152 6.367 6.578 6.791 7.069 7.347 7.6 7.886 8.212 8.524 8.865 9.213 9.583 9.972 10.39 10.873 11.343 11.882 12.47 13.121 13.806 14.543 15.256 15.923 16.207 16.087 15.863 15.599 15.296 14.984 14.707 14.473 14.229 14.004 13.774 13.533 13.302 13.084 12.885 12.668 12.473 12.308 12.127 11.924 11.762 11.602 11.433 11.3 11.156 11.001 10.833 10.653 10.537 10.421 10.25 10.135 10.01 9.943 9.796 9.634 9.441 9.351 9.219 9.048 8.939 8.829 8.556 8.407 8.251 8.084 7.899 7.662 7.381 6.634 -5 ,17563 ,KEBNE ,17018570,Wed Dec 22 00:08:14 CET,Wed Dec 22 02:24:41 CET,0.0 0.831 1.144 1.457 1.713 1.922 2.107 2.271 2.555 2.703 2.842 3.031 3.192 3.293 3.519 3.732 3.913 3.998 4.165 4.336 4.561 4.698 4.841 5.05 5.249 5.441 5.636 5.823 6.044 6.251 6.449 6.703 6.954 7.187 7.457 7.765 8.056 8.372 8.7 9.052 9.415 9.796 10.225 10.669 11.197 11.751 12.374 13.049 13.713 14.337 14.885 15.051 14.95 14.772 14.548 14.273 13.959 13.639 13.377 13.136 12.912 12.697 12.49 12.286 12.087 11.912 11.718 11.528 11.365 11.194 11.011 10.865 10.707 10.536 10.412 10.279 10.135 9.966 9.777 9.65 9.517 9.316 9.175 9.028 8.955 8.8 8.617 8.435 8.348 8.211 8.066 7.964 7.843 7.58 7.44 7.271 7.11 6.945 6.728 6.448 5.845 -6 ,21547 ,KEBNE ,17018571,Wed Dec 22 00:08:18 CET,Wed Dec 22 02:22:16 CET,0.0 0.86 1.171 1.421 1.67 1.865 2.035 2.199 2.489 2.617 2.739 2.919 3.086 3.192 3.397 3.584 3.761 3.847 4.017 4.171 4.39 4.546 4.707 4.937 5.145 5.34 5.518 5.685 5.91 6.13 6.335 6.58 6.826 7.062 7.33 7.609 7.849 8.135 8.457 8.802 9.164 9.578 10.063 10.493 10.968 11.525 12.197 12.958 13.766 14.584 15.254 15.514 15.547 15.422 15.194 14.868 14.537 14.234 13.97 13.686 13.431 13.215 13.008 12.773 12.537 12.327 12.098 11.904 11.731 11.542 11.347 11.192 11.051 10.902 10.774 10.64 10.497 10.35 10.197 10.085 9.964 9.78 9.659 9.524 9.456 9.306 9.14 8.97 8.885 8.748 8.589 8.483 8.36 8.118 7.991 7.839 7.68 7.496 7.287 7.059 6.397 -7 ,6991 ,KEBNE ,17018572,Wed Dec 22 00:09:15 CET,Wed Dec 22 02:28:20 CET,0.0 0.614 0.92 1.184 1.409 1.598 1.769 1.937 2.228 2.349 2.472 2.645 2.794 2.887 3.083 3.292 3.483 3.567 3.733 3.884 4.114 4.27 4.416 4.63 4.839 5.05 5.235 5.407 5.651 5.883 6.101 6.36 6.615 6.861 7.135 7.432 7.706 8.006 8.318 8.647 9.015 9.427 9.891 10.38 10.921 11.518 12.17 12.852 13.621 14.382 15.086 15.381 15.321 15.079 14.77 14.475 14.213 13.937 13.67 13.385 13.163 12.974 12.778 12.584 12.393 12.194 11.986 11.806 11.647 11.478 11.294 11.146 10.994 10.824 10.689 10.549 10.396 10.246 10.103 9.993 9.873 9.696 9.567 9.418 9.336 9.167 9.003 8.826 8.736 8.612 8.465 8.361 8.254 7.988 7.829 7.672 7.51 7.335 7.122 6.79 6.084 -8 ,13209 ,KEBNE ,17018573,Wed Dec 22 00:09:15 CET,Wed Dec 22 02:27:31 CET,0.0 0.487 0.721 0.933 1.123 1.298 1.452 1.588 1.859 1.986 2.106 2.294 2.452 2.556 2.744 2.923 3.078 3.149 3.298 3.439 3.647 3.775 3.887 4.06 4.229 4.387 4.539 4.686 4.88 5.07 5.248 5.458 5.651 5.835 6.063 6.35 6.609 6.876 7.173 7.498 7.852 8.218 8.648 9.09 9.601 10.137 10.707 11.33 11.98 12.597 13.135 13.387 13.301 13.034 12.679 12.334 12.053 11.787 11.545 11.285 11.04 10.812 10.572 10.324 10.106 9.917 9.722 9.562 9.407 9.231 9.04 8.881 8.727 8.56 8.428 8.289 8.137 7.976 7.805 7.688 7.574 7.395 7.272 7.136 7.063 6.908 6.734 6.547 6.458 6.33 6.191 6.088 5.963 5.667 5.504 5.348 5.201 5.024 4.831 4.598 3.938 -9 ,11118 ,KEBNE ,17018574,Wed Dec 22 00:09:15 CET,Wed Dec 22 02:26:48 CET,0.0 1.162 1.534 1.777 2.009 2.201 2.373 2.538 2.854 2.993 3.125 3.316 3.476 3.584 3.788 3.974 4.141 4.23 4.413 4.578 4.824 4.981 5.118 5.323 5.543 5.77 5.985 6.18 6.411 6.645 6.875 7.151 7.428 7.699 8.017 8.379 8.705 9.008 9.313 9.636 9.983 10.389 10.875 11.357 11.891 12.472 13.1 13.786 14.484 15.127 15.719 15.956 15.896 15.728 15.506 15.255 15.005 14.716 14.434 14.155 13.908 13.682 13.463 13.239 13.016 12.819 12.624 12.442 12.28 12.12 11.942 11.781 11.613 11.42 11.271 11.118 10.952 10.783 10.611 10.491 10.362 10.156 10.007 9.865 9.796 9.653 9.491 9.308 9.217 9.09 8.956 8.86 8.756 8.515 8.386 8.246 8.068 7.865 7.617 7.349 6.86 -10 ,3573 ,KEBNE ,17018575,Wed Dec 22 00:09:15 CET,Wed Dec 22 02:24:58 CET,0.0 0.945 1.308 1.573 1.785 1.958 2.126 2.295 2.605 2.757 2.901 3.113 3.292 3.4 3.585 3.769 3.964 4.06 4.242 4.439 4.731 4.906 5.068 5.309 5.546 5.772 5.989 6.194 6.451 6.7 6.929 7.192 7.456 7.691 7.948 8.244 8.518 8.844 9.193 9.567 9.967 10.386 10.835 11.269 11.782 12.324 12.922 13.559 14.23 14.861 15.406 15.598 15.485 15.242 14.957 14.65 14.329 14.018 13.736 13.453 13.203 12.961 12.723 12.492 12.279 12.086 11.877 11.686 11.528 11.362 11.191 11.058 10.915 10.766 10.646 10.509 10.377 10.234 10.071 9.96 9.843 9.651 9.528 9.405 9.344 9.221 9.088 8.929 8.837 8.708 8.56 8.456 8.355 8.119 7.975 7.826 7.68 7.524 7.325 7.059 6.368 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_21_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_21_1h1r.txt deleted file mode 100644 index e186fb6b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_21_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12757 ,KEBNE ,17018577,Wed Dec 22 00:09:15 CET,Wed Dec 22 02:27:36 CET,0.0 0.434 0.593 0.713 0.828 0.933 1.024 1.111 1.272 1.35 1.428 1.527 1.635 1.7 1.846 1.99 2.123 2.191 2.311 2.417 2.568 2.67 2.77 2.911 3.045 3.18 3.312 3.436 3.59 3.734 3.885 4.066 4.249 4.427 4.625 4.843 5.044 5.262 5.497 5.746 6.002 6.268 6.582 6.905 7.275 7.654 8.031 8.405 8.76 9.148 9.471 9.362 8.958 8.492 8.047 7.605 7.199 6.82 6.459 6.108 5.808 5.522 5.251 4.995 4.757 4.522 4.265 4.035 3.834 3.624 3.402 3.216 3.017 2.805 2.64 2.469 2.291 2.107 1.914 1.781 1.645 1.435 1.287 1.121 1.032 0.854 0.676 0.488 0.393 0.256 0.077 -0.033 -0.156 -0.438 -0.598 -0.8 -0.998 -1.189 -1.43 -1.725 -2.649 -2 ,19086 ,KEBNE ,17018578,Wed Dec 22 00:09:15 CET,Wed Dec 22 02:26:56 CET,0.0 0.329 0.49 0.611 0.736 0.873 1.009 1.116 1.281 1.353 1.424 1.525 1.654 1.729 1.855 1.978 2.103 2.164 2.276 2.383 2.532 2.636 2.742 2.896 3.044 3.174 3.303 3.434 3.603 3.765 3.924 4.106 4.259 4.42 4.62 4.811 4.986 5.191 5.409 5.635 5.867 6.115 6.401 6.684 7.021 7.377 7.743 8.128 8.472 8.692 8.617 8.215 7.739 7.225 6.754 6.321 5.913 5.5 5.091 4.671 4.304 3.977 3.67 3.369 3.08 2.822 2.57 2.336 2.129 1.919 1.694 1.502 1.301 1.094 0.93 0.743 0.547 0.364 0.167 0.017 -0.135 -0.378 -0.547 -0.703 -0.784 -0.985 -1.2 -1.41 -1.52 -1.679 -1.858 -1.973 -2.106 -2.407 -2.565 -2.741 -2.934 -3.186 -3.509 -3.883 -5.062 -3 ,31847 ,KEBNE ,17018579,Wed Dec 22 00:09:15 CET,Wed Dec 22 02:28:21 CET,0.0 1.215 1.595 1.817 1.933 2.029 2.126 2.214 2.377 2.46 2.537 2.631 2.743 2.81 2.942 3.06 3.188 3.252 3.37 3.474 3.613 3.701 3.793 3.93 4.064 4.19 4.31 4.426 4.559 4.691 4.83 4.996 5.148 5.298 5.483 5.687 5.874 6.074 6.278 6.488 6.711 6.977 7.287 7.58 7.906 8.261 8.662 9.016 9.38 9.733 9.867 9.692 9.356 8.944 8.48 8.03 7.619 7.243 6.927 6.586 6.271 5.991 5.716 5.454 5.219 5.004 4.782 4.586 4.406 4.216 4.02 3.853 3.676 3.495 3.354 3.215 3.083 2.939 2.774 2.662 2.547 2.349 2.214 2.075 2.005 1.876 1.739 1.587 1.501 1.365 1.213 1.109 1.0 0.759 0.61 0.46 0.314 0.163 0.005 -0.193 -0.863 -4 ,32717 ,KEBNE ,17018580,Wed Dec 22 00:09:15 CET,Wed Dec 22 02:27:48 CET,0.0 0.207 0.33 0.466 0.586 0.702 0.821 0.916 1.083 1.161 1.231 1.322 1.432 1.491 1.615 1.752 1.881 1.938 2.039 2.134 2.277 2.381 2.486 2.62 2.744 2.858 2.961 3.065 3.197 3.331 3.469 3.635 3.802 3.968 4.155 4.361 4.563 4.798 5.027 5.248 5.496 5.786 6.133 6.464 6.844 7.238 7.657 8.054 8.414 8.745 8.829 8.42 7.923 7.483 7.036 6.558 6.123 5.728 5.374 4.992 4.658 4.381 4.123 3.874 3.635 3.42 3.198 2.999 2.814 2.618 2.432 2.271 2.094 1.895 1.73 1.577 1.431 1.277 1.122 1.016 0.905 0.722 0.592 0.455 0.377 0.221 0.067 -0.103 -0.199 -0.344 -0.495 -0.596 -0.706 -0.968 -1.098 -1.21 -1.362 -1.541 -1.745 -2.013 -2.715 -5 ,1072 ,KEBNE ,17018581,Wed Dec 22 00:09:15 CET,Wed Dec 22 02:27:22 CET,0.0 0.453 0.66 0.788 0.9 1.008 1.102 1.191 1.361 1.449 1.538 1.645 1.763 1.84 1.989 2.13 2.255 2.315 2.431 2.543 2.709 2.81 2.902 3.044 3.174 3.285 3.394 3.516 3.676 3.825 3.968 4.13 4.282 4.437 4.628 4.838 5.029 5.24 5.469 5.724 5.978 6.249 6.568 6.875 7.227 7.626 8.095 8.582 9.053 9.472 9.682 9.481 9.124 8.677 8.22 7.786 7.37 6.981 6.618 6.215 5.854 5.534 5.217 4.931 4.669 4.417 4.146 3.895 3.687 3.465 3.216 3.016 2.815 2.603 2.433 2.256 2.082 1.916 1.746 1.617 1.479 1.277 1.126 0.953 0.867 0.689 0.502 0.316 0.21 0.058 -0.106 -0.216 -0.339 -0.637 -0.796 -0.946 -1.136 -1.36 -1.579 -1.89 -2.963 -6 ,12730 ,KEBNE ,17018582,Wed Dec 22 00:09:15 CET,Wed Dec 22 02:27:43 CET,0.0 0.261 0.455 0.611 0.753 0.882 0.994 1.093 1.293 1.386 1.474 1.596 1.714 1.78 1.915 2.04 2.174 2.242 2.368 2.479 2.632 2.726 2.814 2.962 3.102 3.238 3.366 3.487 3.651 3.797 3.929 4.103 4.276 4.442 4.641 4.863 5.062 5.278 5.514 5.77 6.045 6.332 6.66 6.97 7.335 7.751 8.172 8.604 9.06 9.528 9.865 9.836 9.608 9.265 8.83 8.301 7.817 7.4 7.024 6.614 6.239 5.912 5.595 5.28 4.972 4.697 4.429 4.19 3.97 3.735 3.481 3.264 3.042 2.815 2.642 2.459 2.264 2.066 1.865 1.726 1.572 1.314 1.144 0.981 0.896 0.725 0.545 0.353 0.26 0.115 -0.077 -0.197 -0.326 -0.61 -0.769 -0.925 -1.088 -1.299 -1.535 -1.81 -2.381 -7 ,32397 ,KEBNE ,17018583,Wed Dec 22 00:10:17 CET,Wed Dec 22 02:28:07 CET,0.0 0.29 0.457 0.597 0.728 0.865 0.986 1.082 1.245 1.321 1.403 1.507 1.624 1.689 1.811 1.943 2.075 2.131 2.232 2.332 2.483 2.578 2.665 2.791 2.916 3.045 3.173 3.296 3.446 3.588 3.724 3.876 4.028 4.172 4.338 4.536 4.724 4.941 5.188 5.454 5.72 6.003 6.337 6.669 7.054 7.457 7.878 8.308 8.745 9.174 9.441 9.368 8.971 8.479 8.035 7.569 7.138 6.757 6.418 6.059 5.741 5.469 5.209 4.946 4.706 4.491 4.259 4.053 3.874 3.679 3.479 3.315 3.147 2.977 2.84 2.695 2.549 2.403 2.248 2.141 2.032 1.848 1.723 1.6 1.531 1.381 1.198 1.013 0.927 0.79 0.642 0.547 0.455 0.262 0.142 -0.013 -0.178 -0.359 -0.557 -0.809 -1.593 -8 ,10317 ,KEBNE ,17018584,Wed Dec 22 00:10:17 CET,Wed Dec 22 02:27:53 CET,0.0 0.232 0.384 0.498 0.62 0.735 0.846 0.949 1.121 1.201 1.275 1.364 1.475 1.543 1.689 1.82 1.934 1.989 2.107 2.216 2.37 2.475 2.571 2.701 2.83 2.954 3.083 3.213 3.378 3.538 3.69 3.87 4.035 4.194 4.38 4.585 4.797 5.019 5.214 5.409 5.624 5.85 6.112 6.392 6.701 7.014 7.358 7.73 8.086 8.422 8.653 8.525 8.168 7.712 7.281 6.901 6.539 6.165 5.815 5.489 5.204 4.926 4.654 4.392 4.149 3.932 3.706 3.493 3.306 3.111 2.896 2.714 2.539 2.363 2.224 2.071 1.914 1.746 1.57 1.447 1.317 1.131 1.005 0.869 0.795 0.633 0.465 0.27 0.169 0.029 -0.142 -0.248 -0.365 -0.63 -0.762 -0.915 -1.097 -1.29 -1.51 -1.788 -2.502 -9 ,8796 ,KEBNE ,17018585,Wed Dec 22 00:10:17 CET,Wed Dec 22 02:31:26 CET,0.0 0.376 0.574 0.731 0.859 0.974 1.082 1.185 1.372 1.457 1.537 1.638 1.754 1.823 1.955 2.087 2.218 2.276 2.394 2.52 2.686 2.78 2.883 3.042 3.189 3.331 3.467 3.593 3.759 3.914 4.055 4.229 4.389 4.566 4.771 4.977 5.186 5.403 5.621 5.865 6.137 6.44 6.791 7.124 7.52 7.97 8.42 8.824 9.222 9.619 9.868 9.713 9.382 9.002 8.595 8.171 7.783 7.415 7.076 6.683 6.333 6.046 5.789 5.527 5.255 5.014 4.777 4.556 4.354 4.133 3.892 3.691 3.491 3.303 3.156 2.997 2.815 2.615 2.425 2.298 2.163 1.939 1.779 1.62 1.543 1.38 1.206 1.034 0.941 0.801 0.604 0.461 0.317 0.051 -0.086 -0.272 -0.475 -0.695 -0.941 -1.251 -2.316 -10 ,27335 ,KEBNE ,17018586,Wed Dec 22 00:10:17 CET,Wed Dec 22 02:29:40 CET,0.0 0.364 0.587 0.7 0.802 0.902 1.006 1.12 1.321 1.396 1.467 1.571 1.703 1.792 1.936 2.06 2.188 2.25 2.355 2.461 2.618 2.718 2.823 2.967 3.103 3.236 3.353 3.472 3.641 3.803 3.955 4.13 4.3 4.464 4.661 4.9 5.11 5.323 5.552 5.777 6.021 6.289 6.573 6.873 7.242 7.65 8.086 8.554 9.065 9.501 9.803 9.686 9.37 8.997 8.571 8.136 7.749 7.386 7.05 6.703 6.394 6.11 5.819 5.537 5.281 5.038 4.763 4.511 4.314 4.094 3.852 3.662 3.465 3.273 3.123 2.961 2.788 2.591 2.4 2.282 2.152 1.927 1.782 1.631 1.547 1.37 1.191 1.005 0.906 0.763 0.603 0.494 0.381 0.13 -0.022 -0.187 -0.36 -0.545 -0.788 -1.103 -1.865 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_21_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_21_22.txt deleted file mode 100644 index bb466b6e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_21_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,584 ,KEBNE ,17018587,Wed Dec 22 00:10:17 CET,Wed Dec 22 02:29:38 CET,0.0 0.785 1.116 1.302 1.483 1.649 1.799 1.945 2.222 2.342 2.439 2.601 2.748 2.836 2.998 3.146 3.279 3.342 3.475 3.61 3.826 3.96 4.081 4.261 4.431 4.605 4.765 4.892 5.052 5.23 5.398 5.583 5.739 5.885 6.068 6.273 6.461 6.641 6.846 7.086 7.328 7.586 7.883 8.191 8.498 8.763 8.994 9.16 9.247 9.232 8.895 8.164 7.45 6.754 6.097 5.486 4.938 4.424 3.977 3.53 3.14 2.78 2.419 2.085 1.787 1.525 1.251 0.993 0.762 0.526 0.279 0.073 -0.138 -0.356 -0.531 -0.725 -0.928 -1.125 -1.322 -1.456 -1.6 -1.825 -1.973 -2.122 -2.206 -2.403 -2.591 -2.788 -2.899 -3.06 -3.264 -3.404 -3.54 -3.807 -3.95 -4.101 -4.262 -4.455 -4.667 -4.887 -5.222 -2 ,1064 ,KEBNE ,17018588,Wed Dec 22 00:11:19 CET,Wed Dec 22 02:30:07 CET,0.0 1.027 1.317 1.518 1.676 1.827 1.955 2.07 2.287 2.38 2.478 2.625 2.757 2.836 2.996 3.147 3.29 3.359 3.478 3.593 3.746 3.835 3.932 4.077 4.212 4.34 4.465 4.587 4.746 4.899 5.052 5.245 5.44 5.624 5.82 6.03 6.22 6.418 6.601 6.763 6.933 7.166 7.477 7.779 8.081 8.37 8.686 8.979 9.139 9.071 8.763 8.178 7.459 6.787 6.157 5.557 5.032 4.552 4.139 3.7 3.305 2.975 2.672 2.39 2.114 1.862 1.6 1.346 1.129 0.907 0.677 0.487 0.287 0.08 -0.079 -0.237 -0.403 -0.57 -0.737 -0.859 -0.979 -1.159 -1.291 -1.431 -1.503 -1.652 -1.832 -2.029 -2.118 -2.257 -2.406 -2.502 -2.622 -2.887 -2.999 -3.124 -3.275 -3.428 -3.599 -3.9 -4.459 -3 ,21402 ,KEBNE ,17018589,Wed Dec 22 00:11:19 CET,Wed Dec 22 02:30:31 CET,0.0 1.095 1.461 1.692 1.892 2.073 2.232 2.402 2.703 2.825 2.936 3.096 3.238 3.337 3.542 3.709 3.845 3.907 4.02 4.132 4.3 4.413 4.525 4.688 4.844 4.989 5.138 5.283 5.473 5.648 5.801 5.978 6.145 6.306 6.486 6.705 6.931 7.16 7.377 7.596 7.822 8.077 8.343 8.554 8.747 8.956 9.252 9.578 9.801 9.823 9.46 8.695 7.969 7.309 6.679 6.096 5.616 5.197 4.803 4.381 4.037 3.73 3.43 3.154 2.895 2.65 2.393 2.161 1.957 1.746 1.532 1.355 1.168 0.974 0.821 0.655 0.477 0.298 0.119 0.0 -0.125 -0.321 -0.461 -0.606 -0.679 -0.837 -1.0 -1.162 -1.251 -1.385 -1.512 -1.611 -1.716 -1.945 -2.069 -2.215 -2.38 -2.534 -2.724 -3.026 -3.651 -4 ,23602 ,KEBNE ,17018590,Wed Dec 22 00:11:18 CET,Wed Dec 22 02:29:41 CET,0.0 0.984 1.247 1.468 1.655 1.805 1.949 2.089 2.328 2.445 2.558 2.707 2.851 2.966 3.163 3.309 3.45 3.524 3.672 3.797 3.969 4.076 4.18 4.324 4.456 4.589 4.72 4.842 4.986 5.123 5.253 5.413 5.583 5.737 5.922 6.125 6.301 6.506 6.722 6.949 7.193 7.476 7.746 7.991 8.287 8.555 8.799 9.001 9.156 9.164 8.816 8.141 7.354 6.619 6.012 5.454 4.929 4.44 4.017 3.585 3.223 2.903 2.59 2.28 1.985 1.727 1.462 1.227 1.036 0.826 0.589 0.405 0.224 0.032 -0.12 -0.291 -0.47 -0.649 -0.837 -0.962 -1.094 -1.302 -1.435 -1.571 -1.641 -1.794 -1.963 -2.129 -2.217 -2.357 -2.496 -2.595 -2.697 -2.911 -3.022 -3.156 -3.331 -3.509 -3.669 -3.88 -4.4 -5 ,31669 ,KEBNE ,17018591,Wed Dec 22 00:11:19 CET,Wed Dec 22 02:31:47 CET,0.0 1.222 1.662 1.967 2.171 2.337 2.491 2.626 2.878 2.992 3.118 3.325 3.478 3.582 3.794 3.995 4.154 4.223 4.358 4.495 4.706 4.835 4.949 5.107 5.26 5.42 5.567 5.701 5.879 6.048 6.2 6.363 6.504 6.648 6.833 7.031 7.212 7.42 7.68 7.92 8.123 8.358 8.633 8.887 9.161 9.439 9.729 10.03 10.242 10.28 10.055 9.395 8.639 7.982 7.372 6.766 6.222 5.731 5.311 4.902 4.541 4.207 3.871 3.553 3.276 3.02 2.747 2.5 2.28 2.066 1.848 1.662 1.463 1.258 1.101 0.943 0.776 0.588 0.393 0.264 0.14 -0.058 -0.202 -0.348 -0.425 -0.588 -0.761 -0.933 -1.015 -1.15 -1.287 -1.38 -1.473 -1.681 -1.808 -1.96 -2.117 -2.259 -2.445 -2.71 -3.585 -6 ,10897 ,KEBNE ,17018592,Wed Dec 22 00:11:18 CET,Wed Dec 22 02:29:36 CET,0.0 0.748 0.982 1.166 1.331 1.484 1.62 1.757 2.011 2.113 2.219 2.369 2.513 2.606 2.766 2.914 3.057 3.129 3.276 3.413 3.592 3.703 3.805 3.961 4.119 4.257 4.382 4.519 4.685 4.827 4.973 5.156 5.335 5.493 5.667 5.853 6.02 6.198 6.394 6.597 6.793 7.006 7.234 7.47 7.728 7.955 8.186 8.412 8.59 8.549 7.992 7.074 6.269 5.506 4.775 4.117 3.556 3.057 2.634 2.201 1.834 1.502 1.175 0.883 0.605 0.341 0.071 -0.169 -0.363 -0.558 -0.781 -0.967 -1.157 -1.346 -1.487 -1.639 -1.797 -1.96 -2.12 -2.228 -2.341 -2.515 -2.635 -2.777 -2.862 -3.028 -3.18 -3.339 -3.424 -3.556 -3.697 -3.806 -3.915 -4.145 -4.27 -4.402 -4.548 -4.698 -4.891 -5.186 -5.853 -7 ,14313 ,KEBNE ,17018593,Wed Dec 22 00:11:19 CET,Wed Dec 22 02:30:09 CET,0.0 0.643 0.891 1.07 1.221 1.363 1.491 1.614 1.86 1.98 2.099 2.266 2.397 2.483 2.645 2.791 2.934 3.001 3.134 3.265 3.463 3.602 3.734 3.903 4.045 4.18 4.312 4.426 4.57 4.734 4.892 5.055 5.206 5.341 5.492 5.66 5.818 5.991 6.178 6.381 6.59 6.8 7.027 7.215 7.423 7.672 7.907 8.064 8.145 8.063 7.597 6.794 5.978 5.233 4.564 3.96 3.441 2.951 2.522 2.106 1.751 1.418 1.087 0.791 0.517 0.274 0.037 -0.182 -0.382 -0.594 -0.809 -0.986 -1.168 -1.359 -1.514 -1.674 -1.834 -1.995 -2.164 -2.284 -2.406 -2.595 -2.727 -2.871 -2.941 -3.086 -3.235 -3.398 -3.494 -3.634 -3.782 -3.884 -3.982 -4.205 -4.33 -4.456 -4.587 -4.772 -5.009 -5.256 -5.723 -8 ,18908 ,KEBNE ,17018594,Wed Dec 22 00:12:21 CET,Wed Dec 22 02:33:12 CET,0.0 0.875 1.198 1.426 1.592 1.757 1.937 2.114 2.405 2.555 2.685 2.827 2.974 3.056 3.196 3.344 3.495 3.57 3.716 3.853 4.04 4.155 4.272 4.435 4.583 4.727 4.857 4.983 5.15 5.312 5.459 5.636 5.8 5.959 6.167 6.383 6.569 6.761 6.965 7.185 7.399 7.629 7.882 8.156 8.48 8.75 8.988 9.205 9.352 9.32 8.921 8.196 7.456 6.69 6.011 5.412 4.876 4.391 3.984 3.602 3.253 2.907 2.583 2.279 1.994 1.737 1.484 1.258 1.049 0.825 0.585 0.38 0.172 -0.028 -0.182 -0.35 -0.528 -0.701 -0.873 -0.992 -1.118 -1.322 -1.464 -1.606 -1.681 -1.842 -2.024 -2.224 -2.323 -2.477 -2.654 -2.758 -2.861 -3.095 -3.209 -3.321 -3.449 -3.609 -3.814 -4.044 -4.54 -9 ,18013 ,KEBNE ,17018595,Wed Dec 22 00:12:21 CET,Wed Dec 22 02:34:45 CET,0.0 0.974 1.221 1.41 1.637 1.841 1.996 2.183 2.535 2.664 2.766 2.907 3.043 3.129 3.296 3.458 3.609 3.674 3.806 3.944 4.146 4.28 4.418 4.62 4.795 4.951 5.099 5.231 5.4 5.571 5.736 5.928 6.119 6.303 6.504 6.728 6.93 7.121 7.329 7.543 7.763 8.014 8.284 8.547 8.835 9.121 9.383 9.622 9.766 9.661 9.168 8.32 7.472 6.695 6.006 5.369 4.801 4.262 3.811 3.382 3.003 2.653 2.31 1.992 1.693 1.423 1.144 0.889 0.658 0.419 0.184 -0.005 -0.195 -0.397 -0.558 -0.721 -0.902 -1.086 -1.273 -1.407 -1.541 -1.756 -1.903 -2.049 -2.126 -2.288 -2.453 -2.614 -2.709 -2.853 -2.972 -3.072 -3.182 -3.399 -3.518 -3.654 -3.818 -3.974 -4.148 -4.418 -4.875 -10 ,20676 ,KEBNE ,17018596,Wed Dec 22 00:12:21 CET,Wed Dec 22 02:33:27 CET,0.0 0.894 1.238 1.491 1.693 1.872 2.034 2.167 2.424 2.553 2.669 2.812 2.95 3.042 3.215 3.362 3.515 3.591 3.723 3.853 4.042 4.16 4.273 4.431 4.582 4.729 4.86 4.985 5.169 5.345 5.496 5.675 5.848 6.005 6.187 6.408 6.63 6.847 7.037 7.233 7.435 7.644 7.88 8.094 8.332 8.57 8.806 9.013 9.161 9.195 8.921 8.224 7.497 6.759 6.091 5.504 4.954 4.459 4.056 3.644 3.287 2.952 2.627 2.33 2.067 1.823 1.553 1.32 1.101 0.862 0.641 0.474 0.291 0.087 -0.071 -0.232 -0.394 -0.56 -0.742 -0.874 -1.002 -1.196 -1.339 -1.476 -1.541 -1.692 -1.864 -2.042 -2.134 -2.281 -2.449 -2.56 -2.663 -2.904 -3.037 -3.178 -3.348 -3.537 -3.732 -3.991 -4.643 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_22_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_22_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 2313eef3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_22_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27982 ,KEBNE ,17018597,Wed Dec 22 00:12:22 CET,Wed Dec 22 02:30:13 CET,0.0 0.327 0.452 0.55 0.646 0.752 0.849 0.929 1.097 1.176 1.246 1.331 1.448 1.514 1.631 1.743 1.865 1.928 2.045 2.149 2.295 2.394 2.5 2.646 2.776 2.903 3.03 3.157 3.32 3.479 3.632 3.818 3.992 4.153 4.335 4.537 4.735 4.966 5.217 5.469 5.731 6.024 6.365 6.693 7.068 7.481 7.932 8.442 9.064 9.757 10.427 10.763 10.826 10.739 10.606 10.435 10.264 10.107 9.949 9.772 9.577 9.386 9.195 9.003 8.826 8.646 8.442 8.269 8.114 7.935 7.762 7.636 7.511 7.367 7.241 7.102 6.954 6.801 6.641 6.534 6.428 6.247 6.112 5.97 5.898 5.753 5.577 5.372 5.265 5.123 4.989 4.882 4.766 4.516 4.373 4.222 4.042 3.838 3.568 3.213 1.816 -2 ,1173 ,KEBNE ,17018598,Wed Dec 22 00:13:24 CET,Wed Dec 22 02:32:14 CET,0.0 0.474 0.673 0.835 1.005 1.153 1.281 1.403 1.607 1.693 1.776 1.889 2.017 2.093 2.233 2.345 2.461 2.518 2.636 2.751 2.913 3.012 3.105 3.261 3.413 3.557 3.699 3.823 3.989 4.148 4.287 4.462 4.636 4.804 5.005 5.222 5.421 5.641 5.88 6.131 6.398 6.686 7.019 7.378 7.799 8.237 8.706 9.228 9.855 10.526 11.148 11.491 11.533 11.445 11.303 11.08 10.816 10.563 10.313 10.056 9.842 9.636 9.431 9.226 9.036 8.852 8.663 8.513 8.363 8.183 7.982 7.81 7.632 7.452 7.313 7.152 6.984 6.819 6.638 6.514 6.398 6.198 6.028 5.841 5.749 5.573 5.387 5.178 5.064 4.9 4.69 4.552 4.404 4.101 3.946 3.763 3.54 3.278 2.938 2.516 1.298 -3 ,5883 ,KEBNE ,17018599,Wed Dec 22 00:13:25 CET,Wed Dec 22 02:31:42 CET,0.0 0.827 1.083 1.314 1.482 1.596 1.701 1.808 2.013 2.109 2.209 2.367 2.515 2.597 2.749 2.902 3.043 3.105 3.217 3.332 3.497 3.603 3.708 3.866 4.02 4.162 4.298 4.426 4.591 4.752 4.909 5.103 5.288 5.46 5.652 5.865 6.076 6.3 6.536 6.796 7.063 7.369 7.731 8.092 8.49 8.928 9.424 9.974 10.607 11.305 12.003 12.342 12.4 12.343 12.217 12.023 11.791 11.573 11.384 11.175 10.97 10.771 10.589 10.397 10.194 10.0 9.805 9.647 9.51 9.345 9.149 9.01 8.866 8.683 8.535 8.393 8.255 8.108 7.928 7.796 7.668 7.471 7.337 7.188 7.112 6.935 6.746 6.551 6.436 6.268 6.05 5.917 5.782 5.527 5.383 5.215 5.014 4.805 4.528 4.113 3.484 -4 ,9500 ,KEBNE ,17018600,Wed Dec 22 00:13:24 CET,Wed Dec 22 02:31:17 CET,0.0 0.235 0.389 0.521 0.633 0.739 0.836 0.941 1.152 1.241 1.322 1.415 1.532 1.598 1.732 1.866 1.986 2.04 2.149 2.26 2.432 2.548 2.656 2.805 2.943 3.073 3.211 3.331 3.482 3.631 3.774 3.953 4.126 4.29 4.495 4.735 4.96 5.193 5.418 5.658 5.922 6.211 6.562 6.946 7.374 7.811 8.29 8.826 9.391 9.966 10.561 10.911 11.002 10.948 10.832 10.709 10.523 10.27 10.04 9.82 9.639 9.448 9.246 9.058 8.875 8.702 8.523 8.342 8.166 8.001 7.827 7.673 7.522 7.356 7.218 7.08 6.948 6.813 6.666 6.561 6.447 6.243 6.078 5.91 5.82 5.632 5.452 5.243 5.125 4.959 4.751 4.614 4.482 4.193 4.024 3.842 3.646 3.443 3.191 2.844 1.931 -5 ,30100 ,KEBNE ,17018601,Wed Dec 22 00:13:24 CET,Wed Dec 22 02:32:55 CET,0.0 0.41 0.546 0.663 0.777 0.887 0.994 1.097 1.26 1.336 1.418 1.535 1.657 1.734 1.873 2.0 2.133 2.194 2.303 2.416 2.578 2.67 2.762 2.91 3.053 3.188 3.319 3.441 3.604 3.77 3.927 4.106 4.275 4.443 4.64 4.859 5.076 5.313 5.569 5.834 6.113 6.426 6.772 7.119 7.515 7.936 8.395 8.915 9.528 10.176 10.852 11.235 11.306 11.23 11.089 10.931 10.729 10.529 10.361 10.153 9.947 9.743 9.533 9.341 9.151 8.959 8.751 8.552 8.384 8.198 7.986 7.82 7.639 7.44 7.294 7.149 7.003 6.859 6.682 6.557 6.441 6.245 6.102 5.951 5.874 5.692 5.486 5.281 5.17 5.019 4.839 4.713 4.589 4.351 4.199 4.021 3.824 3.603 3.372 3.02 1.796 -6 ,14141 ,KEBNE ,17018602,Wed Dec 22 00:13:24 CET,Wed Dec 22 02:33:48 CET,0.0 0.333 0.521 0.705 0.836 0.958 1.064 1.156 1.332 1.407 1.472 1.561 1.68 1.746 1.872 1.991 2.103 2.161 2.273 2.379 2.541 2.647 2.751 2.906 3.048 3.185 3.32 3.445 3.618 3.782 3.945 4.145 4.309 4.471 4.667 4.888 5.1 5.329 5.571 5.845 6.136 6.453 6.823 7.183 7.609 8.056 8.514 9.014 9.582 10.179 10.735 11.011 11.045 10.97 10.861 10.655 10.42 10.195 9.968 9.721 9.497 9.284 9.076 8.873 8.666 8.467 8.255 8.082 7.949 7.796 7.612 7.462 7.318 7.16 7.022 6.872 6.714 6.542 6.363 6.237 6.1 5.898 5.765 5.624 5.547 5.37 5.177 4.974 4.865 4.706 4.536 4.422 4.303 4.026 3.859 3.677 3.471 3.213 2.886 2.44 0.596 -7 ,19799 ,KEBNE ,17018603,Wed Dec 22 00:13:25 CET,Wed Dec 22 02:33:19 CET,0.0 0.356 0.563 0.79 0.982 1.116 1.239 1.355 1.549 1.636 1.719 1.835 1.956 2.023 2.16 2.297 2.42 2.479 2.608 2.726 2.887 2.994 3.105 3.258 3.397 3.537 3.666 3.783 3.935 4.079 4.218 4.401 4.583 4.754 4.953 5.17 5.382 5.611 5.861 6.128 6.409 6.726 7.1 7.481 7.921 8.376 8.823 9.317 9.889 10.514 11.162 11.515 11.628 11.579 11.425 11.275 11.085 10.862 10.675 10.457 10.229 10.043 9.89 9.72 9.533 9.347 9.15 8.985 8.861 8.726 8.585 8.472 8.318 8.156 8.047 7.938 7.828 7.706 7.534 7.397 7.269 7.065 6.938 6.808 6.726 6.549 6.342 6.112 5.993 5.823 5.59 5.431 5.263 4.944 4.761 4.562 4.351 4.088 3.725 3.188 1.408 -8 ,5120 ,KEBNE ,17018604,Wed Dec 22 00:14:28 CET,Wed Dec 22 02:34:31 CET,0.0 0.302 0.472 0.645 0.77 0.87 0.953 1.042 1.233 1.324 1.404 1.493 1.614 1.682 1.811 1.946 2.08 2.14 2.245 2.342 2.483 2.584 2.681 2.81 2.936 3.065 3.194 3.322 3.488 3.639 3.785 3.959 4.128 4.295 4.485 4.707 4.928 5.157 5.395 5.635 5.882 6.169 6.522 6.874 7.278 7.714 8.186 8.714 9.281 9.906 10.579 11.001 11.15 11.152 11.071 10.942 10.798 10.627 10.474 10.31 10.12 9.953 9.809 9.67 9.521 9.357 9.182 9.026 8.889 8.746 8.591 8.468 8.317 8.148 8.031 7.897 7.749 7.597 7.441 7.329 7.198 6.987 6.836 6.669 6.59 6.417 6.238 6.073 5.985 5.846 5.677 5.549 5.407 5.098 4.931 4.76 4.557 4.251 3.861 3.466 1.776 -9 ,10188 ,KEBNE ,17018605,Wed Dec 22 00:14:28 CET,Wed Dec 22 02:35:41 CET,0.0 0.294 0.5 0.662 0.785 0.894 1.001 1.107 1.31 1.397 1.481 1.618 1.76 1.845 1.998 2.131 2.271 2.34 2.469 2.595 2.778 2.896 3.01 3.173 3.32 3.469 3.613 3.744 3.911 4.071 4.225 4.404 4.581 4.747 4.93 5.154 5.365 5.584 5.835 6.112 6.398 6.714 7.061 7.389 7.777 8.212 8.718 9.287 9.924 10.662 11.443 11.812 11.837 11.752 11.611 11.415 11.209 10.998 10.799 10.577 10.351 10.143 9.947 9.763 9.611 9.469 9.3 9.15 9.012 8.86 8.711 8.588 8.444 8.308 8.209 8.087 7.948 7.801 7.642 7.531 7.418 7.233 7.101 6.948 6.864 6.703 6.538 6.344 6.238 6.089 5.912 5.8 5.672 5.391 5.228 5.028 4.813 4.588 4.339 4.049 3.278 -10 ,18934 ,KEBNE ,17018606,Wed Dec 22 00:15:33 CET,Wed Dec 22 02:30:24 CET,0.0 0.276 0.485 0.644 0.773 0.883 1.0 1.109 1.293 1.38 1.468 1.585 1.712 1.788 1.929 2.062 2.186 2.247 2.364 2.475 2.64 2.743 2.839 2.97 3.094 3.222 3.348 3.472 3.634 3.795 3.951 4.134 4.31 4.477 4.668 4.891 5.113 5.353 5.598 5.867 6.155 6.439 6.778 7.152 7.579 8.035 8.546 9.091 9.708 10.409 11.151 11.603 11.702 11.638 11.547 11.405 11.203 11.005 10.828 10.639 10.463 10.291 10.133 9.977 9.805 9.636 9.447 9.279 9.127 8.96 8.789 8.643 8.486 8.326 8.199 8.04 7.87 7.703 7.522 7.399 7.267 7.066 6.929 6.768 6.684 6.519 6.353 6.178 6.087 5.941 5.757 5.632 5.488 5.183 5.025 4.863 4.673 4.452 4.189 3.845 2.584 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 98db2d78..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7789 ,KEBNE ,17018607,Wed Dec 22 00:16:37 CET,Wed Dec 22 02:32:52 CET,0.0 0.327 0.523 0.666 0.79 0.913 1.036 1.16 1.384 1.478 1.563 1.683 1.833 1.922 2.099 2.272 2.434 2.513 2.665 2.807 3.017 3.146 3.269 3.456 3.641 3.807 3.962 4.117 4.309 4.503 4.702 4.944 5.186 5.424 5.688 5.981 6.269 6.593 6.957 7.345 7.726 8.129 8.585 9.051 9.65 10.312 11.025 11.839 12.801 13.898 14.928 15.488 15.64 15.592 15.483 15.282 15.033 14.817 14.596 14.323 14.074 13.839 13.633 13.443 13.22 13.005 12.802 12.614 12.432 12.232 12.012 11.828 11.632 11.424 11.269 11.103 10.912 10.713 10.524 10.386 10.227 9.974 9.805 9.636 9.555 9.387 9.199 9.003 8.911 8.764 8.538 8.403 8.285 8.022 7.861 7.684 7.479 7.238 6.951 6.636 5.645 -2 ,24469 ,KEBNE ,17018608,Wed Dec 22 00:17:39 CET,Wed Dec 22 02:33:13 CET,0.0 0.29 0.476 0.609 0.765 0.92 1.043 1.165 1.382 1.481 1.577 1.708 1.853 1.927 2.069 2.222 2.364 2.432 2.573 2.71 2.896 3.011 3.126 3.298 3.46 3.609 3.754 3.896 4.091 4.288 4.477 4.704 4.914 5.12 5.367 5.629 5.888 6.189 6.512 6.861 7.22 7.614 8.071 8.553 9.122 9.751 10.486 11.259 12.14 13.11 13.97 14.402 14.529 14.474 14.313 14.11 13.903 13.69 13.475 13.242 13.013 12.802 12.603 12.391 12.174 11.957 11.718 11.504 11.315 11.121 10.909 10.725 10.526 10.319 10.158 9.973 9.784 9.611 9.422 9.283 9.138 8.923 8.782 8.611 8.522 8.355 8.174 7.983 7.875 7.723 7.574 7.459 7.322 7.023 6.853 6.679 6.5 6.244 5.883 5.327 3.5 -3 ,1766 ,KEBNE ,17018609,Wed Dec 22 00:17:43 CET,Wed Dec 22 02:34:12 CET,0.0 0.235 0.412 0.572 0.719 0.849 0.97 1.083 1.292 1.391 1.492 1.619 1.76 1.839 1.985 2.128 2.274 2.344 2.487 2.633 2.836 2.967 3.099 3.282 3.451 3.613 3.771 3.933 4.141 4.332 4.514 4.744 4.962 5.174 5.416 5.684 5.954 6.245 6.566 6.92 7.289 7.703 8.19 8.688 9.281 9.943 10.689 11.488 12.385 13.363 14.379 15.017 15.172 15.129 14.968 14.735 14.509 14.303 14.114 13.878 13.629 13.409 13.181 12.949 12.72 12.486 12.253 12.044 11.854 11.663 11.457 11.273 11.091 10.911 10.752 10.567 10.381 10.189 9.974 9.823 9.666 9.42 9.255 9.103 9.019 8.818 8.593 8.354 8.24 8.088 7.885 7.748 7.613 7.332 7.163 6.972 6.758 6.491 6.157 5.663 4.384 -4 ,20659 ,KEBNE ,17018610,Wed Dec 22 00:17:43 CET,Wed Dec 22 02:28:26 CET,0.0 0.571 0.823 1.014 1.185 1.332 1.472 1.61 1.875 1.993 2.091 2.224 2.381 2.476 2.67 2.852 3.012 3.088 3.238 3.37 3.55 3.674 3.799 3.975 4.139 4.288 4.441 4.604 4.808 4.99 5.17 5.386 5.577 5.771 6.019 6.309 6.586 6.878 7.189 7.515 7.847 8.231 8.675 9.131 9.695 10.307 10.988 11.807 12.789 13.828 14.788 15.304 15.427 15.399 15.275 15.046 14.798 14.553 14.346 14.134 13.916 13.7 13.474 13.27 13.077 12.872 12.648 12.434 12.239 12.037 11.824 11.649 11.465 11.267 11.102 10.934 10.765 10.585 10.393 10.263 10.132 9.909 9.752 9.586 9.491 9.302 9.118 8.917 8.806 8.633 8.359 8.201 8.053 7.721 7.535 7.321 7.077 6.825 6.535 6.184 4.006 -5 ,20066 ,KEBNE ,17018611,Wed Dec 22 00:18:37 CET,Wed Dec 22 02:38:22 CET,0.0 0.298 0.536 0.735 0.903 1.038 1.154 1.281 1.511 1.615 1.716 1.826 1.978 2.067 2.226 2.366 2.506 2.585 2.736 2.885 3.112 3.252 3.375 3.547 3.72 3.894 4.062 4.216 4.418 4.614 4.802 5.04 5.252 5.453 5.692 5.96 6.225 6.519 6.844 7.186 7.536 7.949 8.458 8.982 9.565 10.169 10.875 11.7 12.683 13.779 14.949 15.679 15.859 15.806 15.639 15.388 15.084 14.815 14.622 14.41 14.184 13.961 13.754 13.542 13.305 13.084 12.856 12.645 12.445 12.223 12.011 11.834 11.64 11.441 11.265 11.081 10.919 10.737 10.518 10.375 10.228 9.975 9.806 9.618 9.521 9.327 9.114 8.892 8.766 8.59 8.347 8.192 8.035 7.673 7.439 7.16 6.865 6.563 6.179 5.599 3.845 -6 ,9720 ,KEBNE ,17018612,Wed Dec 22 00:20:42 CET,Wed Dec 22 02:38:39 CET,0.0 0.25 0.407 0.553 0.689 0.81 0.929 1.056 1.298 1.406 1.505 1.618 1.756 1.835 1.977 2.117 2.264 2.339 2.479 2.605 2.794 2.918 3.035 3.198 3.353 3.503 3.647 3.79 3.989 4.183 4.352 4.554 4.769 4.976 5.217 5.499 5.761 6.03 6.325 6.641 6.966 7.361 7.846 8.324 8.866 9.451 10.105 10.815 11.603 12.466 13.452 14.034 14.197 14.225 14.105 13.916 13.704 13.462 13.227 12.998 12.793 12.576 12.369 12.172 11.972 11.796 11.607 11.419 11.249 11.072 10.875 10.71 10.543 10.368 10.211 10.037 9.872 9.709 9.532 9.4 9.27 9.04 8.863 8.691 8.593 8.381 8.184 7.965 7.845 7.681 7.463 7.329 7.196 6.88 6.672 6.442 6.185 5.867 5.51 5.043 3.598 -7 ,16817 ,KEBNE ,17018613,Wed Dec 22 00:20:43 CET,Wed Dec 22 02:38:13 CET,0.0 0.427 0.631 0.818 0.973 1.104 1.242 1.382 1.634 1.739 1.829 1.939 2.076 2.154 2.312 2.459 2.601 2.671 2.81 2.949 3.148 3.281 3.411 3.587 3.758 3.924 4.084 4.24 4.443 4.63 4.812 5.051 5.276 5.482 5.721 5.98 6.228 6.502 6.813 7.15 7.506 7.919 8.404 8.88 9.42 10.072 10.871 11.708 12.573 13.55 14.629 15.24 15.403 15.411 15.334 15.238 15.083 14.846 14.593 14.32 14.095 13.884 13.644 13.407 13.194 12.998 12.78 12.566 12.379 12.185 11.99 11.83 11.644 11.444 11.286 11.122 10.946 10.772 10.596 10.462 10.325 10.092 9.917 9.739 9.647 9.467 9.272 9.059 8.95 8.802 8.617 8.491 8.363 8.08 7.908 7.692 7.417 7.122 6.841 6.494 5.494 -8 ,5803 ,KEBNE ,17018614,Wed Dec 22 00:20:42 CET,Wed Dec 22 02:39:17 CET,0.0 0.258 0.486 0.679 0.851 1.007 1.142 1.281 1.533 1.643 1.74 1.877 2.036 2.122 2.289 2.448 2.598 2.674 2.819 2.951 3.142 3.263 3.383 3.564 3.74 3.909 4.069 4.221 4.422 4.614 4.807 5.047 5.264 5.468 5.717 6.016 6.304 6.623 6.956 7.296 7.675 8.124 8.621 9.083 9.607 10.231 10.989 11.83 12.763 13.759 14.811 15.378 15.528 15.596 15.556 15.385 15.147 14.896 14.694 14.473 14.263 14.08 13.879 13.655 13.434 13.238 13.034 12.855 12.691 12.521 12.355 12.208 12.033 11.834 11.675 11.519 11.376 11.224 11.053 10.927 10.795 10.598 10.451 10.275 10.174 9.964 9.765 9.556 9.435 9.264 9.036 8.885 8.736 8.412 8.205 7.965 7.719 7.434 7.046 6.571 5.206 -9 ,27279 ,KEBNE ,17018615,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:41:08 CET,0.0 0.466 0.688 0.854 1.001 1.129 1.242 1.365 1.599 1.709 1.817 1.96 2.108 2.191 2.364 2.53 2.681 2.75 2.889 3.03 3.236 3.359 3.47 3.632 3.8 3.967 4.125 4.276 4.473 4.687 4.893 5.117 5.34 5.565 5.82 6.103 6.375 6.658 6.976 7.344 7.731 8.132 8.57 9.033 9.603 10.218 10.873 11.608 12.489 13.476 14.482 15.068 15.258 15.211 15.04 14.859 14.644 14.378 14.126 13.865 13.616 13.371 13.149 12.936 12.717 12.525 12.331 12.153 12.004 11.849 11.649 11.465 11.285 11.117 10.966 10.791 10.635 10.482 10.3 10.157 10.011 9.801 9.643 9.469 9.385 9.203 8.989 8.741 8.61 8.444 8.243 8.11 7.963 7.63 7.444 7.253 7.034 6.784 6.514 6.151 4.297 -10 ,5899 ,KEBNE ,17018616,Wed Dec 22 00:20:42 CET,Wed Dec 22 02:39:25 CET,0.0 0.359 0.57 0.723 0.862 1.006 1.152 1.28 1.481 1.577 1.678 1.807 1.954 2.038 2.198 2.36 2.519 2.593 2.737 2.877 3.072 3.194 3.307 3.47 3.638 3.795 3.94 4.086 4.28 4.468 4.646 4.877 5.104 5.312 5.55 5.825 6.091 6.384 6.706 7.04 7.406 7.834 8.322 8.81 9.357 9.966 10.681 11.492 12.43 13.456 14.583 15.3 15.579 15.624 15.498 15.319 15.147 14.952 14.731 14.486 14.249 13.997 13.755 13.526 13.294 13.083 12.86 12.656 12.495 12.331 12.157 12.012 11.842 11.648 11.491 11.332 11.169 10.994 10.807 10.678 10.549 10.35 10.217 10.066 9.983 9.808 9.629 9.437 9.328 9.173 8.981 8.853 8.715 8.421 8.247 8.052 7.847 7.598 7.306 6.9 5.348 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1oi9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1oi9.txt deleted file mode 100644 index 0efbe57c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1oi9.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21941 ,KEBNE ,17018617,Wed Dec 22 00:20:42 CET,Wed Dec 22 02:38:12 CET,0.0 0.206 0.32 0.449 0.57 0.656 0.743 0.829 0.992 1.077 1.143 1.204 1.322 1.38 1.493 1.589 1.688 1.738 1.832 1.92 2.052 2.146 2.239 2.362 2.478 2.584 2.688 2.788 2.914 3.042 3.163 3.325 3.471 3.603 3.759 3.926 4.077 4.242 4.423 4.618 4.82 5.019 5.251 5.485 5.737 6.014 6.31 6.583 6.849 7.034 6.991 6.618 6.161 5.696 5.224 4.774 4.376 3.986 3.595 3.211 2.886 2.557 2.243 1.924 1.605 1.33 1.053 0.806 0.595 0.397 0.207 0.029 -0.178 -0.379 -0.542 -0.744 -0.95 -1.145 -1.366 -1.523 -1.68 -1.938 -2.124 -2.315 -2.412 -2.604 -2.794 -3.018 -3.151 -3.338 -3.553 -3.693 -3.831 -4.144 -4.318 -4.504 -4.721 -4.987 -5.293 -5.68 -7.063 -2 ,31669 ,KEBNE ,17018618,Wed Dec 22 00:20:43 CET,Wed Dec 22 02:39:50 CET,0.0 0.307 0.49 0.643 0.789 0.925 1.055 1.161 1.362 1.451 1.523 1.616 1.751 1.823 1.949 2.083 2.206 2.262 2.377 2.487 2.644 2.742 2.836 2.97 3.097 3.214 3.325 3.426 3.556 3.694 3.82 3.967 4.106 4.231 4.379 4.549 4.699 4.858 5.03 5.208 5.385 5.572 5.792 6.017 6.253 6.491 6.767 7.062 7.332 7.503 7.461 7.069 6.563 6.09 5.683 5.256 4.845 4.469 4.135 3.793 3.481 3.184 2.88 2.588 2.298 2.046 1.802 1.564 1.339 1.08 0.821 0.63 0.433 0.224 0.054 -0.124 -0.315 -0.51 -0.7 -0.835 -0.983 -1.219 -1.382 -1.558 -1.652 -1.845 -2.037 -2.243 -2.372 -2.575 -2.794 -2.938 -3.088 -3.438 -3.626 -3.827 -4.051 -4.302 -4.65 -5.104 -6.281 -3 ,3636 ,KEBNE ,17018619,Wed Dec 22 00:20:43 CET,Wed Dec 22 02:38:49 CET,0.0 0.435 0.591 0.72 0.852 0.961 1.063 1.164 1.358 1.445 1.523 1.615 1.749 1.82 1.941 2.063 2.199 2.259 2.365 2.474 2.63 2.738 2.838 2.967 3.087 3.205 3.325 3.444 3.599 3.739 3.878 4.047 4.215 4.371 4.532 4.716 4.877 5.039 5.227 5.437 5.658 5.925 6.23 6.492 6.769 7.085 7.458 7.834 8.197 8.494 8.576 8.246 7.756 7.254 6.792 6.376 5.975 5.559 5.137 4.695 4.308 3.951 3.614 3.292 2.997 2.734 2.464 2.22 1.987 1.721 1.445 1.222 1.008 0.795 0.612 0.436 0.265 0.057 -0.187 -0.358 -0.536 -0.813 -1.013 -1.215 -1.318 -1.53 -1.735 -1.95 -2.066 -2.241 -2.426 -2.564 -2.736 -3.129 -3.339 -3.549 -3.75 -3.97 -4.266 -4.695 -6.273 -4 ,11531 ,KEBNE ,17018620,Wed Dec 22 00:20:43 CET,Wed Dec 22 02:39:31 CET,0.0 0.379 0.553 0.686 0.81 0.936 1.071 1.187 1.387 1.48 1.563 1.68 1.819 1.892 2.02 2.144 2.27 2.33 2.441 2.556 2.736 2.837 2.926 3.062 3.2 3.324 3.428 3.534 3.684 3.825 3.963 4.138 4.307 4.456 4.607 4.781 4.956 5.13 5.299 5.471 5.668 5.887 6.118 6.35 6.598 6.851 7.117 7.388 7.652 7.872 7.863 7.514 7.122 6.622 6.114 5.654 5.207 4.766 4.386 4.021 3.681 3.349 3.025 2.727 2.458 2.206 1.929 1.668 1.44 1.216 0.985 0.779 0.556 0.314 0.124 -0.052 -0.233 -0.432 -0.645 -0.793 -0.951 -1.203 -1.384 -1.564 -1.651 -1.851 -2.05 -2.237 -2.332 -2.497 -2.709 -2.866 -3.033 -3.367 -3.552 -3.771 -4.002 -4.265 -4.552 -4.928 -5.796 -5 ,3259 ,KEBNE ,17018621,Wed Dec 22 00:20:42 CET,Wed Dec 22 02:39:39 CET,0.0 0.271 0.46 0.635 0.782 0.897 0.993 1.089 1.265 1.347 1.429 1.521 1.648 1.722 1.879 2.017 2.137 2.196 2.305 2.404 2.545 2.644 2.75 2.891 3.017 3.129 3.236 3.34 3.468 3.589 3.708 3.856 3.997 4.13 4.286 4.48 4.656 4.825 5.018 5.221 5.431 5.663 5.912 6.136 6.379 6.64 6.931 7.272 7.56 7.689 7.613 7.244 6.741 6.206 5.727 5.282 4.879 4.428 3.997 3.584 3.234 2.922 2.598 2.282 1.994 1.708 1.368 1.052 0.811 0.579 0.328 0.098 -0.152 -0.392 -0.588 -0.798 -1.035 -1.28 -1.513 -1.672 -1.849 -2.157 -2.359 -2.544 -2.646 -2.87 -3.102 -3.366 -3.5 -3.687 -3.93 -4.097 -4.262 -4.643 -4.872 -5.087 -5.31 -5.586 -5.932 -6.41 -7.608 -6 ,31993 ,KEBNE ,17018622,Wed Dec 22 00:20:43 CET,Wed Dec 22 02:38:28 CET,0.0 0.353 0.525 0.697 0.867 1.018 1.146 1.258 1.452 1.546 1.629 1.732 1.879 1.964 2.123 2.27 2.402 2.465 2.588 2.7 2.864 2.971 3.078 3.239 3.393 3.543 3.69 3.829 3.988 4.13 4.278 4.465 4.627 4.769 4.928 5.106 5.284 5.475 5.679 5.883 6.079 6.292 6.539 6.777 7.059 7.369 7.686 7.993 8.295 8.609 8.761 8.49 8.076 7.626 7.223 6.788 6.345 5.926 5.523 5.138 4.825 4.541 4.274 3.99 3.71 3.458 3.189 2.954 2.732 2.501 2.268 2.07 1.852 1.632 1.467 1.297 1.11 0.911 0.701 0.544 0.388 0.146 -0.037 -0.246 -0.347 -0.553 -0.772 -0.999 -1.137 -1.343 -1.559 -1.701 -1.863 -2.251 -2.482 -2.749 -3.047 -3.345 -3.691 -4.113 -5.901 -7 ,24059 ,KEBNE ,17018623,Wed Dec 22 00:20:47 CET,Wed Dec 22 02:36:41 CET,0.0 0.428 0.581 0.724 0.856 0.98 1.093 1.192 1.363 1.444 1.531 1.619 1.748 1.818 1.94 2.059 2.178 2.233 2.333 2.429 2.565 2.654 2.747 2.877 2.994 3.116 3.233 3.34 3.475 3.614 3.743 3.888 4.028 4.177 4.341 4.505 4.659 4.83 5.013 5.188 5.377 5.601 5.846 6.068 6.338 6.621 6.901 7.148 7.365 7.572 7.6 7.332 6.915 6.48 6.035 5.568 5.147 4.782 4.457 4.094 3.754 3.449 3.164 2.901 2.638 2.375 2.081 1.779 1.516 1.26 1.016 0.833 0.623 0.394 0.223 0.044 -0.13 -0.296 -0.485 -0.626 -0.773 -1.01 -1.164 -1.328 -1.419 -1.607 -1.81 -2.027 -2.146 -2.335 -2.556 -2.706 -2.86 -3.162 -3.356 -3.602 -3.835 -4.065 -4.366 -4.762 -5.812 -8 ,20465 ,KEBNE ,17018624,Wed Dec 22 00:20:45 CET,Wed Dec 22 02:39:08 CET,0.0 0.294 0.447 0.6 0.761 0.888 0.988 1.079 1.266 1.362 1.456 1.54 1.666 1.741 1.891 2.019 2.139 2.194 2.295 2.385 2.512 2.609 2.706 2.841 2.972 3.092 3.207 3.316 3.449 3.575 3.71 3.882 4.036 4.175 4.363 4.588 4.777 4.963 5.153 5.353 5.546 5.749 5.982 6.197 6.444 6.725 6.996 7.275 7.533 7.713 7.749 7.469 7.065 6.623 6.184 5.74 5.286 4.866 4.511 4.124 3.78 3.471 3.19 2.936 2.678 2.426 2.129 1.84 1.585 1.338 1.083 0.858 0.615 0.35 0.142 -0.066 -0.275 -0.501 -0.744 -0.928 -1.13 -1.462 -1.686 -1.892 -1.996 -2.196 -2.402 -2.64 -2.769 -2.961 -3.19 -3.339 -3.488 -3.808 -3.982 -4.162 -4.362 -4.608 -4.931 -5.374 -6.75 -9 ,23923 ,KEBNE ,17018625,Wed Dec 22 00:20:42 CET,Wed Dec 22 02:39:39 CET,0.0 0.363 0.588 0.774 0.925 1.058 1.169 1.269 1.455 1.559 1.655 1.759 1.899 1.978 2.131 2.293 2.449 2.517 2.65 2.775 2.961 3.082 3.19 3.349 3.511 3.661 3.795 3.919 4.076 4.22 4.356 4.525 4.683 4.825 4.979 5.146 5.306 5.474 5.656 5.841 6.027 6.248 6.494 6.731 6.992 7.255 7.53 7.828 8.108 8.222 8.064 7.569 7.071 6.591 6.038 5.492 5.008 4.56 4.182 3.803 3.484 3.184 2.873 2.577 2.291 2.023 1.721 1.441 1.19 0.914 0.643 0.423 0.186 -0.056 -0.237 -0.419 -0.622 -0.841 -1.083 -1.261 -1.435 -1.7 -1.892 -2.103 -2.211 -2.423 -2.657 -2.924 -3.069 -3.282 -3.568 -3.754 -3.946 -4.327 -4.533 -4.756 -4.98 -5.266 -5.644 -6.117 -7.265 -10 ,28003 ,KEBNE ,17018626,Wed Dec 22 00:20:42 CET,Wed Dec 22 02:39:02 CET,0.0 0.252 0.424 0.544 0.656 0.758 0.84 0.928 1.126 1.208 1.277 1.357 1.484 1.549 1.674 1.789 1.887 1.941 2.055 2.157 2.301 2.394 2.482 2.601 2.724 2.84 2.942 3.043 3.184 3.317 3.446 3.6 3.738 3.868 4.028 4.199 4.354 4.537 4.731 4.928 5.151 5.425 5.755 6.084 6.473 6.87 7.221 7.52 7.768 7.94 7.989 7.691 7.232 6.797 6.357 5.866 5.352 4.865 4.447 3.994 3.604 3.248 2.883 2.503 2.121 1.791 1.466 1.17 0.887 0.601 0.327 0.093 -0.154 -0.412 -0.621 -0.836 -1.056 -1.281 -1.516 -1.693 -1.864 -2.113 -2.295 -2.511 -2.624 -2.862 -3.114 -3.368 -3.506 -3.69 -3.855 -3.979 -4.134 -4.498 -4.7 -4.924 -5.165 -5.421 -5.732 -6.146 -7.053 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_26_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_26_21.txt deleted file mode 100644 index b8246424..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_26_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10765 ,TETRA ,17590494,Sat Nov 27 21:06:43 CET,Sun Nov 28 00:07:41 CET,0.0 0.978 1.392 1.719 1.999 2.229 2.44 2.648 2.982 3.13 3.283 3.246 3.697 3.813 4.035 4.241 4.429 4.525 4.7 4.85 5.065 5.203 5.335 5.521 5.709 5.887 6.044 6.187 6.365 6.538 6.706 6.913 7.109 7.287 7.472 7.671 7.861 8.06 8.254 8.43 8.6 8.778 8.958 9.102 9.205 9.278 9.283 9.141 8.799 8.121 6.767 4.899 3.258 1.853 0.632 -0.438 -1.396 -2.269 -3.004 -3.735 -4.366 -4.932 -5.475 -6.003 -6.476 -6.889 -7.323 -7.719 -8.061 -8.422 -8.8 -9.098 -9.393 -9.703 -9.943 -10.194 -10.448 -10.711 -11.003 -11.213 -11.43 -11.747 -11.968 -12.207 -12.323 -12.566 -12.844 -13.126 -13.265 -13.749 -13.73 -13.914 -14.103 -14.483 -14.7 -14.933 -15.173 -15.456 -15.791 -16.172 -16.843 -2 ,17731 ,TETRA ,17590495,Sat Nov 27 21:06:43 CET,Sun Nov 28 00:07:32 CET,0.0 0.803 1.301 1.682 1.961 2.201 2.427 2.638 3.073 3.274 3.448 3.45 3.911 4.035 4.272 4.523 4.761 4.86 5.046 5.224 5.473 5.63 5.769 5.966 6.16 6.354 6.545 6.739 6.985 7.198 7.397 7.616 7.804 8.0 8.239 8.468 8.659 8.859 9.059 9.254 9.429 9.611 9.821 9.997 10.144 10.217 10.188 10.057 9.74 9.076 7.728 5.841 4.226 2.863 1.664 0.575 -0.401 -1.305 -2.053 -2.756 -3.367 -3.926 -4.434 -4.893 -5.346 -5.764 -6.171 -6.539 -6.883 -7.224 -7.561 -7.852 -8.152 -8.458 -8.698 -8.95 -9.205 -9.457 -9.729 -9.929 -10.138 -10.477 -10.714 -10.951 -11.078 -11.342 -11.61 -11.886 -12.029 -12.52 -12.478 -12.637 -12.814 -13.232 -13.464 -13.718 -13.987 -14.277 -14.611 -15.016 -15.982 -3 ,21511 ,TETRA ,17590496,Sat Nov 27 21:06:42 CET,Sun Nov 28 00:07:10 CET,0.0 1.24 1.738 2.155 2.544 2.885 3.109 3.286 3.604 3.75 3.889 3.831 4.268 4.382 4.61 4.82 5.015 5.104 5.276 5.454 5.705 5.847 5.987 6.187 6.362 6.542 6.706 6.845 7.031 7.217 7.389 7.587 7.766 7.924 8.097 8.291 8.494 8.714 8.938 9.15 9.338 9.524 9.69 9.806 9.923 10.002 10.049 9.96 9.623 8.93 7.417 5.41 3.678 2.203 0.94 -0.143 -1.108 -2.067 -2.903 -3.68 -4.308 -4.849 -5.365 -5.864 -6.34 -6.77 -7.214 -7.619 -7.971 -8.336 -8.703 -9.021 -9.355 -9.68 -9.926 -10.185 -10.458 -10.737 -11.025 -11.227 -11.428 -11.739 -11.967 -12.214 -12.338 -12.581 -12.852 -13.181 -13.346 -13.844 -13.821 -13.981 -14.156 -14.567 -14.793 -15.023 -15.28 -15.553 -15.869 -16.335 -17.228 -4 ,6668 ,TETRA ,17590497,Sat Nov 27 21:06:43 CET,Sun Nov 28 00:01:21 CET,0.0 1.553 2.172 2.653 3.013 3.29 3.586 3.864 4.281 4.447 4.608 4.575 5.028 5.153 5.414 5.663 5.878 5.976 6.174 6.382 6.65 6.799 6.958 7.182 7.38 7.588 7.794 7.989 8.224 8.428 8.629 8.85 9.048 9.249 9.491 9.752 9.985 10.211 10.431 10.657 10.892 11.139 11.367 11.543 11.7 11.809 11.898 11.903 11.67 11.042 9.701 7.896 6.385 5.013 3.74 2.626 1.647 0.756 0.04 -0.676 -1.337 -1.943 -2.519 -3.036 -3.514 -3.969 -4.453 -4.887 -5.246 -5.607 -5.975 -6.27 -6.589 -6.931 -7.202 -7.493 -7.791 -8.094 -8.405 -8.621 -8.843 -9.166 -9.404 -9.664 -9.788 -10.043 -10.332 -10.642 -10.8 -11.305 -11.319 -11.512 -11.708 -12.127 -12.341 -12.56 -12.819 -13.156 -13.626 -14.149 -15.192 -5 ,2049 ,TETRA ,17590498,Sat Nov 27 21:06:43 CET,Sun Nov 28 00:15:39 CET,0.0 2.08 2.67 3.06 3.378 3.683 3.942 4.167 4.552 4.72 4.876 4.833 5.293 5.424 5.669 5.912 6.116 6.205 6.392 6.583 6.85 7.018 7.174 7.385 7.583 7.771 7.951 8.116 8.317 8.506 8.686 8.898 9.089 9.268 9.454 9.664 9.875 10.098 10.321 10.526 10.724 10.918 11.099 11.278 11.491 11.684 11.766 11.717 11.519 10.982 9.693 7.853 6.252 4.922 3.728 2.651 1.744 0.917 0.169 -0.577 -1.198 -1.753 -2.267 -2.747 -3.188 -3.586 -4.017 -4.409 -4.738 -5.076 -5.421 -5.699 -5.994 -6.303 -6.552 -6.814 -7.081 -7.363 -7.668 -7.871 -8.072 -8.384 -8.601 -8.835 -8.957 -9.216 -9.489 -9.777 -9.933 -10.429 -10.412 -10.591 -10.778 -11.165 -11.377 -11.606 -11.858 -12.148 -12.497 -12.964 -13.824 -6 ,2420 ,TETRA ,17590499,Sat Nov 27 21:06:43 CET,Sun Nov 28 00:04:55 CET,0.0 2.128 2.634 2.988 3.274 3.552 3.848 4.114 4.611 4.847 5.038 5.054 5.54 5.683 5.92 6.153 6.372 6.477 6.684 6.875 7.137 7.296 7.442 7.64 7.839 8.032 8.198 8.341 8.541 8.735 8.913 9.133 9.345 9.55 9.777 10.003 10.209 10.465 10.706 10.919 11.123 11.315 11.515 11.674 11.833 11.942 11.938 11.798 11.447 10.669 9.107 7.108 5.464 4.039 2.819 1.697 0.705 -0.153 -0.888 -1.618 -2.262 -2.829 -3.366 -3.873 -4.329 -4.753 -5.197 -5.593 -5.922 -6.254 -6.613 -6.909 -7.235 -7.592 -7.871 -8.142 -8.402 -8.663 -8.94 -9.136 -9.321 -9.611 -9.833 -10.07 -10.192 -10.451 -10.723 -11.01 -11.163 -11.66 -11.655 -11.845 -12.035 -12.431 -12.654 -12.901 -13.188 -13.48 -13.803 -14.253 -15.315 -7 ,22842 ,TETRA ,17590500,Sat Nov 27 21:07:42 CET,Sun Nov 28 00:10:48 CET,0.0 1.538 2.044 2.42 2.772 3.062 3.283 3.505 3.901 4.082 4.272 4.316 4.792 4.935 5.218 5.475 5.698 5.801 5.998 6.186 6.455 6.624 6.781 7.006 7.219 7.43 7.617 7.795 8.02 8.205 8.389 8.608 8.799 8.989 9.208 9.444 9.661 9.896 10.134 10.383 10.639 10.883 11.152 11.395 11.595 11.754 11.829 11.716 11.34 10.544 9.036 7.147 5.518 4.158 2.997 1.965 1.003 0.101 -0.65 -1.394 -2.025 -2.575 -3.095 -3.584 -4.028 -4.444 -4.89 -5.299 -5.645 -6.002 -6.376 -6.681 -6.987 -7.298 -7.548 -7.801 -8.052 -8.311 -8.577 -8.771 -8.983 -9.305 -9.524 -9.744 -9.859 -10.104 -10.361 -10.633 -10.768 -11.249 -11.2 -11.358 -11.538 -11.927 -12.136 -12.367 -12.628 -12.926 -13.277 -13.723 -14.668 -8 ,27036 ,TETRA ,17590501,Sat Nov 27 21:07:42 CET,Sun Nov 28 00:10:15 CET,0.0 2.13 2.658 3.031 3.344 3.625 3.875 4.109 4.527 4.721 4.918 4.94 5.425 5.582 5.862 6.14 6.416 6.538 6.751 6.944 7.209 7.373 7.529 7.761 7.974 8.154 8.327 8.496 8.713 8.918 9.107 9.337 9.557 9.761 9.988 10.225 10.422 10.637 10.883 11.123 11.361 11.589 11.808 12.016 12.228 12.344 12.305 12.166 11.85 11.15 9.659 7.665 5.957 4.503 3.257 2.165 1.148 0.181 -0.579 -1.302 -1.969 -2.558 -3.098 -3.596 -4.051 -4.472 -4.908 -5.288 -5.617 -5.988 -6.372 -6.671 -6.983 -7.316 -7.569 -7.837 -8.121 -8.39 -8.66 -8.862 -9.08 -9.404 -9.632 -9.875 -9.994 -10.23 -10.481 -10.754 -10.908 -11.414 -11.412 -11.592 -11.78 -12.221 -12.475 -12.745 -13.015 -13.336 -13.736 -14.283 -15.295 -9 ,18850 ,TETRA ,17590502,Sat Nov 27 21:07:42 CET,Sun Nov 28 00:07:41 CET,0.0 1.975 2.557 2.972 3.309 3.592 3.832 4.042 4.39 4.563 4.748 4.784 5.263 5.397 5.639 5.877 6.102 6.196 6.373 6.557 6.827 6.994 7.156 7.372 7.568 7.749 7.921 8.082 8.272 8.456 8.634 8.847 9.046 9.223 9.428 9.654 9.855 10.071 10.314 10.55 10.779 11.025 11.271 11.46 11.617 11.743 11.821 11.783 11.544 11.02 9.913 8.094 6.396 4.926 3.631 2.481 1.492 0.605 -0.163 -0.909 -1.535 -2.098 -2.634 -3.134 -3.581 -3.988 -4.417 -4.806 -5.137 -5.478 -5.841 -6.14 -6.439 -6.749 -7.006 -7.277 -7.539 -7.799 -8.057 -8.242 -8.445 -8.759 -8.977 -9.199 -9.318 -9.572 -9.845 -10.137 -10.284 -10.773 -10.769 -10.951 -11.14 -11.548 -11.782 -12.04 -12.314 -12.598 -12.951 -13.405 -14.13 -10 ,21439 ,TETRA ,17590503,Sat Nov 27 21:07:42 CET,Sun Nov 28 00:09:59 CET,0.0 1.586 2.11 2.484 2.805 3.064 3.303 3.524 3.905 4.081 4.24 4.201 4.665 4.799 5.063 5.298 5.508 5.627 5.858 6.049 6.304 6.462 6.596 6.769 6.929 7.093 7.27 7.44 7.647 7.834 8.011 8.24 8.469 8.674 8.909 9.152 9.35 9.56 9.772 9.99 10.224 10.469 10.719 10.914 11.092 11.218 11.235 11.08 10.673 9.929 8.468 6.489 4.804 3.366 2.084 0.91 -0.072 -0.921 -1.679 -2.452 -3.114 -3.706 -4.266 -4.785 -5.26 -5.698 -6.139 -6.527 -6.869 -7.224 -7.602 -7.919 -8.239 -8.565 -8.813 -9.068 -9.341 -9.626 -9.928 -10.136 -10.35 -10.691 -10.924 -11.171 -11.304 -11.571 -11.843 -12.138 -12.291 -12.791 -12.811 -13.012 -13.214 -13.616 -13.846 -14.101 -14.361 -14.645 -14.98 -15.35 -16.316 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_28_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_28_1h1s.txt deleted file mode 100644 index 98cb4844..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_28_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6927 ,KEBNE ,17018627,Wed Dec 22 00:20:42 CET,Wed Dec 22 02:38:36 CET,0.0 0.202 0.353 0.474 0.587 0.687 0.779 0.868 1.015 1.084 1.159 1.238 1.366 1.439 1.563 1.659 1.749 1.794 1.882 1.964 2.087 2.166 2.252 2.378 2.484 2.584 2.689 2.791 2.912 3.023 3.121 3.241 3.349 3.449 3.572 3.706 3.831 3.949 4.068 4.207 4.36 4.528 4.712 4.864 4.986 5.094 5.192 5.233 5.192 5.032 4.541 3.76 2.99 2.29 1.669 1.064 0.537 0.073 -0.329 -0.733 -1.101 -1.42 -1.712 -2.005 -2.267 -2.496 -2.736 -2.954 -3.142 -3.343 -3.564 -3.752 -3.948 -4.15 -4.318 -4.496 -4.676 -4.862 -5.054 -5.183 -5.317 -5.551 -5.71 -5.871 -5.955 -6.117 -6.287 -6.486 -6.592 -6.776 -6.998 -7.148 -7.293 -7.585 -7.744 -7.917 -8.097 -8.297 -8.565 -8.916 -10.41 -2 ,4345 ,KEBNE ,17018628,Wed Dec 22 00:20:42 CET,Wed Dec 22 02:39:47 CET,0.0 0.446 0.648 0.81 0.929 1.04 1.166 1.271 1.432 1.507 1.589 1.677 1.796 1.862 1.997 2.112 2.226 2.281 2.392 2.505 2.659 2.747 2.821 2.924 3.024 3.122 3.221 3.318 3.441 3.56 3.678 3.812 3.925 4.028 4.144 4.282 4.418 4.55 4.682 4.824 4.982 5.135 5.3 5.467 5.633 5.779 5.872 5.909 5.856 5.705 5.307 4.407 3.444 2.646 2.022 1.479 0.948 0.444 0.021 -0.402 -0.768 -1.106 -1.427 -1.722 -1.985 -2.212 -2.444 -2.672 -2.878 -3.115 -3.392 -3.613 -3.837 -4.077 -4.254 -4.434 -4.62 -4.808 -5.004 -5.134 -5.264 -5.475 -5.637 -5.817 -5.902 -6.07 -6.269 -6.481 -6.584 -6.756 -6.92 -7.042 -7.18 -7.532 -7.735 -7.95 -8.178 -8.422 -8.698 -9.033 -10.102 -3 ,20473 ,KEBNE ,17018629,Wed Dec 22 00:20:42 CET,Wed Dec 22 02:38:41 CET,0.0 0.247 0.44 0.589 0.701 0.803 0.905 1.01 1.191 1.267 1.341 1.413 1.533 1.589 1.683 1.778 1.884 1.933 2.02 2.109 2.224 2.293 2.366 2.473 2.57 2.663 2.759 2.858 2.973 3.069 3.171 3.292 3.401 3.516 3.649 3.791 3.921 4.039 4.161 4.286 4.402 4.514 4.655 4.787 4.909 5.028 5.132 5.23 5.261 5.154 4.711 3.916 3.132 2.41 1.783 1.217 0.708 0.232 -0.171 -0.579 -0.932 -1.251 -1.558 -1.851 -2.127 -2.372 -2.662 -2.945 -3.193 -3.448 -3.713 -3.94 -4.163 -4.397 -4.592 -4.781 -4.958 -5.139 -5.336 -5.471 -5.602 -5.8 -5.941 -6.103 -6.192 -6.378 -6.562 -6.734 -6.829 -7.003 -7.167 -7.29 -7.419 -7.688 -7.829 -7.974 -8.156 -8.378 -8.625 -9.004 -10.334 -4 ,6561 ,KEBNE ,17018630,Wed Dec 22 00:20:43 CET,Wed Dec 22 02:38:26 CET,0.0 0.382 0.589 0.761 0.916 1.025 1.13 1.247 1.439 1.533 1.636 1.745 1.874 1.942 2.059 2.175 2.287 2.34 2.449 2.549 2.69 2.781 2.866 2.987 3.097 3.197 3.305 3.401 3.513 3.626 3.737 3.864 3.982 4.09 4.208 4.353 4.5 4.661 4.83 4.991 5.145 5.325 5.502 5.65 5.815 5.958 6.087 6.173 6.209 6.104 5.575 4.75 3.942 3.203 2.583 1.972 1.426 0.972 0.588 0.185 -0.169 -0.491 -0.792 -1.082 -1.368 -1.631 -1.918 -2.173 -2.379 -2.592 -2.817 -3.016 -3.213 -3.412 -3.584 -3.758 -3.926 -4.103 -4.289 -4.425 -4.559 -4.785 -4.964 -5.158 -5.259 -5.465 -5.7 -5.957 -6.096 -6.3 -6.485 -6.618 -6.755 -7.054 -7.219 -7.39 -7.579 -7.775 -8.014 -8.35 -9.35 -5 ,29946 ,KEBNE ,17018631,Wed Dec 22 00:20:43 CET,Wed Dec 22 02:37:08 CET,0.0 0.346 0.544 0.678 0.821 0.968 1.087 1.168 1.309 1.383 1.457 1.523 1.64 1.71 1.844 1.959 2.061 2.115 2.231 2.341 2.48 2.562 2.648 2.78 2.913 3.028 3.123 3.218 3.345 3.467 3.579 3.692 3.794 3.913 4.059 4.213 4.353 4.504 4.653 4.806 4.969 5.131 5.296 5.433 5.558 5.68 5.826 5.897 5.862 5.738 5.265 4.437 3.633 2.924 2.311 1.734 1.198 0.697 0.27 -0.185 -0.59 -0.943 -1.3 -1.644 -1.95 -2.23 -2.53 -2.813 -3.066 -3.321 -3.584 -3.787 -4.0 -4.223 -4.388 -4.564 -4.734 -4.92 -5.131 -5.278 -5.436 -5.681 -5.848 -6.012 -6.099 -6.278 -6.475 -6.684 -6.789 -6.965 -7.134 -7.249 -7.381 -7.723 -7.915 -8.086 -8.255 -8.455 -8.737 -9.077 -10.266 -6 ,8912 ,KEBNE ,17018632,Wed Dec 22 00:20:43 CET,Wed Dec 22 02:37:06 CET,0.0 0.195 0.35 0.484 0.61 0.722 0.822 0.919 1.105 1.192 1.269 1.351 1.469 1.529 1.649 1.763 1.888 1.946 2.036 2.129 2.268 2.349 2.433 2.547 2.64 2.74 2.834 2.928 3.062 3.186 3.299 3.434 3.565 3.678 3.8 3.934 4.057 4.198 4.356 4.503 4.63 4.765 4.932 5.08 5.222 5.364 5.494 5.577 5.586 5.44 4.905 4.077 3.305 2.566 1.923 1.335 0.812 0.339 -0.078 -0.486 -0.839 -1.181 -1.516 -1.825 -2.127 -2.415 -2.704 -2.951 -3.157 -3.381 -3.624 -3.821 -4.028 -4.234 -4.395 -4.572 -4.757 -4.947 -5.134 -5.255 -5.393 -5.614 -5.773 -5.944 -6.03 -6.216 -6.389 -6.569 -6.681 -6.865 -7.046 -7.184 -7.326 -7.637 -7.816 -7.986 -8.184 -8.395 -8.622 -8.977 -10.246 -7 ,335 ,KEBNE ,17018633,Wed Dec 22 00:20:42 CET,Wed Dec 22 02:38:27 CET,0.0 0.537 0.737 0.926 1.057 1.164 1.253 1.348 1.53 1.61 1.685 1.748 1.877 1.955 2.088 2.204 2.305 2.357 2.466 2.566 2.692 2.769 2.852 2.981 3.111 3.223 3.311 3.401 3.522 3.634 3.749 3.882 4.006 4.12 4.246 4.381 4.508 4.651 4.789 4.937 5.111 5.297 5.47 5.603 5.748 5.899 6.035 6.115 6.099 5.923 5.38 4.532 3.747 3.018 2.37 1.823 1.35 0.883 0.47 0.06 -0.317 -0.642 -0.942 -1.223 -1.508 -1.779 -2.025 -2.261 -2.477 -2.67 -2.871 -3.056 -3.257 -3.465 -3.622 -3.796 -3.974 -4.147 -4.338 -4.476 -4.614 -4.831 -4.986 -5.146 -5.228 -5.407 -5.598 -5.807 -5.916 -6.094 -6.271 -6.398 -6.532 -6.829 -6.983 -7.136 -7.319 -7.514 -7.748 -8.063 -8.867 -8 ,5918 ,KEBNE ,17018634,Wed Dec 22 00:20:42 CET,Wed Dec 22 02:37:19 CET,0.0 0.347 0.521 0.683 0.814 0.93 1.033 1.122 1.292 1.382 1.46 1.531 1.658 1.726 1.851 1.975 2.086 2.14 2.255 2.358 2.502 2.592 2.673 2.794 2.907 3.017 3.124 3.215 3.323 3.424 3.528 3.674 3.818 3.939 4.065 4.206 4.341 4.493 4.65 4.801 4.946 5.095 5.276 5.452 5.624 5.769 5.894 6.014 6.085 5.97 5.487 4.711 3.962 3.264 2.68 2.131 1.626 1.172 0.787 0.402 0.03 -0.311 -0.626 -0.926 -1.206 -1.464 -1.734 -1.962 -2.167 -2.378 -2.587 -2.78 -2.993 -3.198 -3.349 -3.536 -3.751 -3.952 -4.137 -4.263 -4.404 -4.637 -4.794 -4.944 -5.022 -5.21 -5.413 -5.606 -5.71 -5.89 -6.055 -6.178 -6.314 -6.613 -6.762 -6.91 -7.08 -7.271 -7.522 -7.902 -9.037 -9 ,21435 ,KEBNE ,17018635,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:39:04 CET,0.0 0.29 0.45 0.603 0.753 0.867 0.952 1.031 1.189 1.267 1.343 1.439 1.565 1.628 1.752 1.858 1.958 2.007 2.101 2.195 2.328 2.412 2.491 2.607 2.724 2.843 2.946 3.047 3.188 3.317 3.426 3.556 3.683 3.801 3.938 4.084 4.213 4.341 4.47 4.596 4.736 4.906 5.076 5.228 5.387 5.522 5.596 5.632 5.632 5.442 4.857 4.071 3.382 2.731 2.113 1.539 0.997 0.496 0.077 -0.334 -0.707 -1.051 -1.379 -1.7 -1.997 -2.263 -2.523 -2.762 -2.982 -3.226 -3.498 -3.727 -3.96 -4.175 -4.331 -4.512 -4.721 -4.915 -5.106 -5.243 -5.381 -5.614 -5.771 -5.93 -6.02 -6.204 -6.388 -6.588 -6.718 -6.909 -7.056 -7.171 -7.311 -7.627 -7.789 -7.992 -8.208 -8.428 -8.692 -8.976 -9.829 -10 ,6988 ,KEBNE ,17018636,Wed Dec 22 00:22:50 CET,Wed Dec 22 02:32:47 CET,0.0 0.197 0.377 0.531 0.684 0.811 0.906 0.997 1.183 1.271 1.36 1.453 1.575 1.645 1.79 1.918 2.019 2.072 2.185 2.287 2.42 2.5 2.585 2.703 2.799 2.901 3.001 3.088 3.2 3.306 3.401 3.506 3.613 3.732 3.875 4.023 4.143 4.276 4.431 4.588 4.745 4.917 5.099 5.263 5.429 5.578 5.702 5.78 5.805 5.671 5.161 4.421 3.744 3.097 2.492 1.921 1.376 0.878 0.442 -0.012 -0.392 -0.712 -1.042 -1.367 -1.655 -1.908 -2.181 -2.445 -2.683 -2.896 -3.102 -3.292 -3.491 -3.692 -3.862 -4.059 -4.262 -4.482 -4.696 -4.824 -4.959 -5.196 -5.37 -5.554 -5.649 -5.823 -6.022 -6.241 -6.347 -6.536 -6.736 -6.873 -7.026 -7.353 -7.512 -7.689 -7.897 -8.112 -8.383 -8.721 -9.943 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_28_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_28_30.txt deleted file mode 100644 index 2e820386..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_28_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24900 ,KEBNE ,17018637,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:41:14 CET,0.0 0.373 0.602 0.775 0.912 1.034 1.141 1.244 1.441 1.532 1.625 1.748 1.887 1.963 2.102 2.224 2.34 2.395 2.495 2.591 2.742 2.836 2.912 3.018 3.146 3.272 3.384 3.498 3.647 3.781 3.901 4.039 4.169 4.305 4.463 4.615 4.751 4.895 5.07 5.261 5.453 5.659 5.881 6.092 6.293 6.486 6.676 6.884 7.094 7.178 7.019 6.507 5.923 5.427 4.96 4.494 4.093 3.719 3.392 3.078 2.788 2.523 2.274 2.03 1.792 1.569 1.348 1.155 0.984 0.8 0.601 0.439 0.271 0.103 -0.03 -0.177 -0.325 -0.482 -0.657 -0.779 -0.902 -1.09 -1.22 -1.354 -1.422 -1.567 -1.72 -1.877 -1.957 -2.098 -2.214 -2.313 -2.422 -2.671 -2.804 -2.95 -3.11 -3.269 -3.453 -3.716 -4.714 -2 ,17997 ,KEBNE ,17018638,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:42:05 CET,0.0 0.538 0.757 0.943 1.096 1.208 1.295 1.385 1.548 1.632 1.717 1.802 1.932 1.995 2.118 2.246 2.366 2.425 2.541 2.637 2.77 2.861 2.954 3.09 3.214 3.33 3.441 3.54 3.653 3.766 3.883 4.024 4.156 4.285 4.427 4.589 4.749 4.927 5.111 5.292 5.492 5.708 5.916 6.134 6.389 6.604 6.818 7.04 7.199 7.253 7.115 6.709 6.261 5.804 5.369 4.94 4.558 4.206 3.887 3.572 3.284 3.027 2.788 2.533 2.287 2.075 1.855 1.648 1.464 1.288 1.109 0.952 0.786 0.609 0.472 0.329 0.184 0.043 -0.11 -0.225 -0.354 -0.545 -0.687 -0.846 -0.919 -1.063 -1.226 -1.407 -1.502 -1.661 -1.816 -1.94 -2.063 -2.312 -2.437 -2.576 -2.75 -2.956 -3.2 -3.474 -4.362 -3 ,13957 ,KEBNE ,17018639,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:39:12 CET,0.0 0.436 0.62 0.783 0.911 1.02 1.121 1.233 1.434 1.517 1.605 1.731 1.875 1.95 2.105 2.252 2.38 2.439 2.553 2.657 2.797 2.889 2.981 3.123 3.254 3.37 3.484 3.597 3.733 3.864 3.982 4.116 4.242 4.358 4.498 4.663 4.812 4.967 5.132 5.291 5.452 5.659 5.894 6.095 6.295 6.494 6.702 6.899 7.051 7.077 6.829 6.306 5.834 5.414 4.995 4.59 4.208 3.836 3.506 3.171 2.892 2.651 2.425 2.203 1.983 1.775 1.549 1.349 1.167 0.972 0.775 0.613 0.444 0.259 0.111 -0.037 -0.186 -0.347 -0.526 -0.64 -0.756 -0.937 -1.07 -1.216 -1.287 -1.432 -1.593 -1.761 -1.843 -1.994 -2.135 -2.242 -2.356 -2.606 -2.744 -2.885 -3.03 -3.204 -3.441 -3.756 -4.592 -4 ,25865 ,KEBNE ,17018640,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:41:28 CET,0.0 0.457 0.664 0.839 0.982 1.112 1.229 1.327 1.519 1.613 1.702 1.8 1.934 2.011 2.161 2.292 2.405 2.461 2.569 2.667 2.813 2.903 2.987 3.125 3.253 3.367 3.478 3.585 3.726 3.86 3.992 4.143 4.285 4.416 4.567 4.738 4.9 5.082 5.274 5.475 5.656 5.867 6.124 6.355 6.595 6.813 7.016 7.217 7.411 7.535 7.412 6.952 6.413 5.863 5.371 4.918 4.52 4.147 3.778 3.416 3.132 2.872 2.609 2.339 2.078 1.839 1.597 1.374 1.179 0.984 0.787 0.629 0.461 0.272 0.128 -0.027 -0.192 -0.351 -0.527 -0.652 -0.778 -0.99 -1.139 -1.288 -1.362 -1.512 -1.697 -1.891 -1.991 -2.153 -2.28 -2.389 -2.524 -2.803 -2.937 -3.093 -3.26 -3.428 -3.612 -3.889 -4.896 -5 ,11768 ,KEBNE ,17018641,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:40:25 CET,0.0 0.361 0.633 0.833 0.988 1.127 1.258 1.361 1.527 1.611 1.683 1.777 1.917 1.993 2.121 2.229 2.349 2.412 2.524 2.63 2.792 2.894 2.99 3.132 3.27 3.4 3.518 3.635 3.792 3.929 4.052 4.202 4.344 4.486 4.649 4.815 4.967 5.124 5.28 5.443 5.626 5.832 6.057 6.265 6.482 6.703 6.934 7.143 7.328 7.436 7.308 6.919 6.374 5.815 5.302 4.829 4.433 4.071 3.745 3.415 3.132 2.876 2.626 2.383 2.148 1.92 1.687 1.482 1.295 1.098 0.898 0.724 0.544 0.361 0.222 0.074 -0.086 -0.245 -0.416 -0.551 -0.684 -0.885 -1.037 -1.194 -1.27 -1.42 -1.583 -1.75 -1.836 -1.984 -2.127 -2.248 -2.372 -2.642 -2.777 -2.921 -3.076 -3.244 -3.476 -3.798 -4.89 -6 ,16176 ,KEBNE ,17018642,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:41:08 CET,0.0 0.422 0.619 0.801 0.95 1.109 1.248 1.363 1.574 1.661 1.743 1.834 1.967 2.04 2.19 2.328 2.455 2.52 2.631 2.731 2.874 2.96 3.055 3.2 3.332 3.459 3.582 3.697 3.836 3.966 4.085 4.235 4.386 4.539 4.703 4.871 5.05 5.235 5.421 5.617 5.812 6.028 6.241 6.406 6.605 6.846 7.095 7.316 7.514 7.599 7.481 7.112 6.636 6.124 5.636 5.206 4.828 4.486 4.177 3.838 3.529 3.259 3.023 2.795 2.568 2.349 2.112 1.917 1.751 1.561 1.351 1.174 0.999 0.828 0.694 0.553 0.4 0.244 0.074 -0.058 -0.18 -0.371 -0.531 -0.689 -0.762 -0.922 -1.092 -1.247 -1.336 -1.509 -1.677 -1.789 -1.907 -2.16 -2.295 -2.443 -2.623 -2.832 -3.066 -3.331 -4.379 -7 ,22882 ,KEBNE ,17018643,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:39:57 CET,0.0 0.41 0.655 0.808 0.941 1.061 1.178 1.275 1.438 1.517 1.6 1.697 1.821 1.882 1.999 2.111 2.221 2.274 2.38 2.485 2.627 2.721 2.813 2.95 3.075 3.187 3.294 3.393 3.534 3.669 3.793 3.937 4.065 4.195 4.365 4.547 4.7 4.86 5.028 5.204 5.377 5.575 5.786 5.958 6.138 6.338 6.571 6.789 7.013 7.145 6.985 6.533 6.048 5.564 5.122 4.709 4.338 3.963 3.609 3.273 2.988 2.733 2.481 2.234 2.008 1.791 1.554 1.351 1.181 1.004 0.826 0.669 0.491 0.305 0.163 0.015 -0.139 -0.306 -0.486 -0.605 -0.727 -0.917 -1.039 -1.174 -1.253 -1.415 -1.588 -1.781 -1.879 -2.051 -2.237 -2.357 -2.482 -2.755 -2.888 -3.041 -3.208 -3.408 -3.676 -3.996 -4.926 -8 ,24379 ,KEBNE ,17018644,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:41:08 CET,0.0 0.459 0.653 0.819 0.963 1.091 1.224 1.349 1.538 1.62 1.698 1.788 1.919 1.987 2.117 2.235 2.358 2.42 2.527 2.63 2.797 2.897 2.976 3.097 3.23 3.353 3.457 3.561 3.692 3.815 3.925 4.056 4.201 4.339 4.492 4.651 4.805 4.988 5.156 5.319 5.49 5.684 5.927 6.149 6.372 6.583 6.786 6.984 7.132 7.187 6.972 6.462 5.968 5.542 5.13 4.703 4.298 3.919 3.597 3.256 2.949 2.691 2.407 2.095 1.815 1.562 1.313 1.125 0.968 0.793 0.605 0.451 0.281 0.085 -0.068 -0.218 -0.371 -0.522 -0.684 -0.801 -0.922 -1.118 -1.253 -1.393 -1.461 -1.605 -1.764 -1.925 -2.017 -2.177 -2.299 -2.411 -2.545 -2.811 -2.939 -3.087 -3.27 -3.465 -3.676 -4.067 -5.924 -9 ,22240 ,KEBNE ,17018645,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:39:59 CET,0.0 0.313 0.514 0.686 0.84 0.973 1.074 1.176 1.372 1.448 1.51 1.573 1.694 1.756 1.878 2.0 2.122 2.178 2.275 2.372 2.51 2.592 2.675 2.798 2.9 2.999 3.111 3.219 3.357 3.493 3.615 3.753 3.892 4.029 4.19 4.359 4.509 4.67 4.836 5.016 5.183 5.351 5.54 5.735 5.989 6.252 6.505 6.716 6.914 7.05 6.916 6.457 5.953 5.497 5.05 4.626 4.26 3.894 3.552 3.206 2.927 2.674 2.408 2.15 1.921 1.702 1.476 1.29 1.115 0.929 0.741 0.561 0.354 0.145 -0.015 -0.172 -0.33 -0.502 -0.683 -0.807 -0.927 -1.121 -1.254 -1.382 -1.45 -1.594 -1.754 -1.925 -2.013 -2.164 -2.293 -2.394 -2.505 -2.725 -2.869 -3.036 -3.197 -3.378 -3.627 -3.971 -4.88 -10 ,4683 ,KEBNE ,17018646,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:41:30 CET,0.0 0.444 0.683 0.886 1.045 1.199 1.317 1.415 1.621 1.717 1.809 1.907 2.035 2.121 2.296 2.423 2.54 2.603 2.713 2.829 2.996 3.083 3.16 3.277 3.405 3.525 3.63 3.724 3.844 3.962 4.077 4.212 4.357 4.492 4.625 4.78 4.922 5.069 5.221 5.393 5.583 5.78 5.982 6.175 6.371 6.56 6.768 6.975 7.122 7.177 6.987 6.456 5.905 5.395 4.916 4.464 4.061 3.69 3.388 3.091 2.799 2.521 2.246 1.979 1.744 1.524 1.278 1.07 0.902 0.713 0.511 0.342 0.157 -0.026 -0.165 -0.312 -0.465 -0.628 -0.792 -0.904 -1.022 -1.212 -1.342 -1.477 -1.556 -1.725 -1.894 -2.079 -2.181 -2.341 -2.489 -2.598 -2.713 -2.974 -3.108 -3.262 -3.456 -3.654 -3.872 -4.148 -4.748 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_29_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_29_28.txt deleted file mode 100644 index 2fe4fc93..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_29_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2019 ,KEBNE ,17018647,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:38:45 CET,0.0 0.347 0.508 0.622 0.729 0.849 0.962 1.045 1.189 1.267 1.339 1.419 1.539 1.6 1.747 1.886 1.999 2.052 2.152 2.246 2.385 2.471 2.556 2.684 2.807 2.922 3.028 3.127 3.253 3.375 3.494 3.636 3.758 3.872 4.005 4.156 4.302 4.455 4.628 4.797 4.955 5.15 5.37 5.557 5.74 5.926 6.138 6.352 6.521 6.575 6.363 5.81 5.211 4.639 4.094 3.584 3.131 2.721 2.371 1.99 1.663 1.376 1.089 0.805 0.52 0.257 -0.022 -0.269 -0.48 -0.694 -0.903 -1.089 -1.284 -1.474 -1.615 -1.771 -1.95 -2.125 -2.298 -2.422 -2.555 -2.768 -2.919 -3.071 -3.15 -3.338 -3.536 -3.721 -3.814 -3.97 -4.119 -4.242 -4.39 -4.694 -4.85 -5.029 -5.227 -5.429 -5.686 -6.003 -6.643 -2 ,32760 ,KEBNE ,17018648,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:38:34 CET,0.0 0.363 0.59 0.792 0.955 1.076 1.179 1.278 1.456 1.543 1.635 1.738 1.863 1.934 2.083 2.219 2.334 2.387 2.49 2.595 2.751 2.858 2.972 3.12 3.254 3.378 3.48 3.577 3.705 3.829 3.939 4.08 4.221 4.349 4.502 4.662 4.802 4.971 5.156 5.342 5.524 5.712 5.933 6.151 6.368 6.574 6.791 6.958 7.051 7.047 6.798 6.238 5.659 5.127 4.58 4.024 3.556 3.145 2.777 2.382 2.035 1.743 1.473 1.204 0.945 0.7 0.427 0.179 -0.031 -0.264 -0.511 -0.702 -0.892 -1.109 -1.285 -1.447 -1.62 -1.802 -1.983 -2.116 -2.254 -2.466 -2.619 -2.778 -2.863 -3.046 -3.246 -3.46 -3.57 -3.749 -3.948 -4.083 -4.226 -4.51 -4.659 -4.823 -5.003 -5.224 -5.479 -5.777 -6.676 -3 ,10206 ,KEBNE ,17018649,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:41:37 CET,0.0 0.478 0.663 0.804 0.938 1.058 1.179 1.3 1.512 1.602 1.695 1.827 1.968 2.03 2.157 2.275 2.389 2.447 2.564 2.678 2.824 2.916 3.006 3.14 3.264 3.369 3.475 3.585 3.708 3.826 3.951 4.11 4.265 4.393 4.534 4.705 4.863 5.031 5.194 5.351 5.514 5.7 5.914 6.099 6.316 6.571 6.816 7.028 7.26 7.356 7.129 6.62 6.042 5.503 5.022 4.516 4.056 3.647 3.274 2.906 2.601 2.332 2.059 1.795 1.555 1.334 1.092 0.872 0.666 0.443 0.21 0.003 -0.205 -0.409 -0.557 -0.711 -0.883 -1.061 -1.235 -1.351 -1.477 -1.685 -1.828 -1.965 -2.039 -2.203 -2.366 -2.522 -2.605 -2.764 -2.91 -3.013 -3.122 -3.349 -3.483 -3.66 -3.853 -4.071 -4.3 -4.612 -5.243 -4 ,22240 ,KEBNE ,17018650,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:41:01 CET,0.0 0.309 0.481 0.607 0.737 0.866 0.986 1.094 1.279 1.364 1.442 1.537 1.668 1.749 1.899 2.034 2.156 2.214 2.329 2.441 2.604 2.698 2.784 2.911 3.033 3.151 3.27 3.391 3.55 3.688 3.812 3.967 4.124 4.273 4.43 4.599 4.756 4.924 5.101 5.283 5.457 5.636 5.839 6.035 6.257 6.479 6.723 6.95 7.094 7.125 6.885 6.363 5.793 5.203 4.676 4.19 3.742 3.352 3.016 2.646 2.31 2.013 1.723 1.423 1.136 0.885 0.62 0.373 0.171 -0.026 -0.243 -0.425 -0.613 -0.81 -0.961 -1.117 -1.283 -1.455 -1.631 -1.755 -1.887 -2.112 -2.276 -2.423 -2.497 -2.665 -2.837 -3.036 -3.148 -3.319 -3.491 -3.613 -3.739 -4.019 -4.169 -4.329 -4.511 -4.729 -5.012 -5.332 -6.017 -5 ,29364 ,KEBNE ,17018651,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:40:15 CET,0.0 0.479 0.724 0.899 1.06 1.211 1.337 1.449 1.647 1.742 1.832 1.937 2.07 2.142 2.272 2.394 2.509 2.567 2.684 2.789 2.934 3.031 3.127 3.261 3.378 3.487 3.581 3.681 3.831 3.965 4.081 4.214 4.336 4.453 4.595 4.757 4.903 5.059 5.215 5.362 5.524 5.717 5.935 6.144 6.347 6.532 6.733 6.929 7.087 7.19 7.12 6.671 6.142 5.614 5.112 4.638 4.212 3.843 3.515 3.168 2.86 2.576 2.303 2.044 1.798 1.561 1.31 1.107 0.926 0.721 0.515 0.346 0.159 -0.035 -0.181 -0.336 -0.509 -0.699 -0.888 -1.021 -1.161 -1.386 -1.529 -1.664 -1.743 -1.907 -2.079 -2.272 -2.373 -2.544 -2.757 -2.902 -3.039 -3.339 -3.491 -3.639 -3.827 -4.052 -4.328 -4.684 -5.409 -6 ,23859 ,KEBNE ,17018652,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:38:14 CET,0.0 0.449 0.646 0.814 0.955 1.087 1.2 1.287 1.45 1.531 1.621 1.751 1.885 1.953 2.08 2.206 2.331 2.388 2.494 2.601 2.771 2.869 2.96 3.085 3.199 3.306 3.407 3.51 3.643 3.77 3.891 4.032 4.176 4.315 4.47 4.626 4.765 4.922 5.093 5.267 5.437 5.624 5.845 6.051 6.259 6.486 6.7 6.892 7.062 7.127 6.896 6.414 5.917 5.391 4.921 4.475 4.055 3.641 3.281 2.93 2.603 2.292 2.007 1.741 1.486 1.251 1.008 0.782 0.572 0.35 0.133 -0.042 -0.223 -0.4 -0.541 -0.691 -0.852 -1.033 -1.221 -1.35 -1.481 -1.687 -1.83 -1.976 -2.057 -2.22 -2.393 -2.582 -2.677 -2.835 -2.983 -3.092 -3.209 -3.467 -3.629 -3.8 -3.986 -4.223 -4.479 -4.785 -5.46 -7 ,10675 ,KEBNE ,17018653,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:40:08 CET,0.0 0.32 0.479 0.631 0.773 0.894 1.008 1.116 1.301 1.391 1.473 1.59 1.73 1.812 1.961 2.088 2.199 2.251 2.367 2.483 2.634 2.734 2.831 2.966 3.095 3.209 3.322 3.43 3.56 3.688 3.823 3.99 4.142 4.281 4.425 4.568 4.704 4.868 5.042 5.213 5.372 5.549 5.752 5.941 6.153 6.37 6.581 6.763 6.899 6.93 6.753 6.199 5.56 4.985 4.467 3.994 3.572 3.177 2.814 2.451 2.134 1.831 1.531 1.253 1.002 0.756 0.487 0.25 0.057 -0.137 -0.352 -0.539 -0.73 -0.929 -1.085 -1.241 -1.397 -1.553 -1.725 -1.853 -1.989 -2.207 -2.358 -2.517 -2.601 -2.786 -2.976 -3.161 -3.261 -3.441 -3.646 -3.764 -3.879 -4.112 -4.241 -4.437 -4.655 -4.863 -5.154 -5.501 -6.225 -8 ,17539 ,KEBNE ,17018654,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:41:39 CET,0.0 0.296 0.499 0.698 0.828 0.953 1.079 1.188 1.397 1.496 1.585 1.684 1.809 1.878 2.006 2.125 2.241 2.302 2.409 2.498 2.631 2.731 2.832 2.96 3.088 3.21 3.318 3.418 3.55 3.683 3.798 3.935 4.079 4.217 4.368 4.531 4.692 4.854 5.022 5.212 5.385 5.559 5.769 5.969 6.177 6.403 6.629 6.796 6.887 6.891 6.7 6.218 5.656 5.129 4.596 4.069 3.588 3.135 2.739 2.332 1.965 1.628 1.307 1.003 0.723 0.477 0.223 -0.019 -0.236 -0.46 -0.688 -0.874 -1.066 -1.261 -1.412 -1.577 -1.75 -1.925 -2.125 -2.276 -2.427 -2.664 -2.833 -3.006 -3.096 -3.281 -3.482 -3.695 -3.794 -3.966 -4.158 -4.28 -4.41 -4.696 -4.858 -5.054 -5.247 -5.437 -5.68 -6.015 -6.699 -9 ,32723 ,KEBNE ,17018655,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:41:28 CET,0.0 0.54 0.766 0.93 1.071 1.205 1.339 1.452 1.645 1.732 1.813 1.9 2.025 2.096 2.229 2.346 2.459 2.513 2.615 2.712 2.849 2.938 3.021 3.155 3.29 3.409 3.526 3.639 3.785 3.929 4.056 4.193 4.33 4.47 4.625 4.769 4.906 5.074 5.26 5.446 5.623 5.818 6.03 6.231 6.453 6.685 6.908 7.098 7.269 7.314 7.097 6.627 6.157 5.695 5.204 4.722 4.314 3.938 3.601 3.272 2.987 2.727 2.46 2.191 1.935 1.685 1.406 1.17 0.965 0.753 0.537 0.355 0.162 -0.044 -0.204 -0.366 -0.541 -0.729 -0.913 -1.035 -1.158 -1.361 -1.504 -1.671 -1.764 -1.943 -2.12 -2.289 -2.376 -2.536 -2.709 -2.835 -2.949 -3.191 -3.348 -3.504 -3.651 -3.822 -4.062 -4.391 -4.993 -10 ,11256 ,KEBNE ,17018656,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:38:40 CET,0.0 0.321 0.562 0.755 0.933 1.09 1.197 1.302 1.523 1.63 1.728 1.848 1.991 2.073 2.222 2.354 2.487 2.56 2.69 2.802 2.966 3.062 3.154 3.295 3.415 3.522 3.624 3.715 3.823 3.929 4.038 4.166 4.296 4.42 4.547 4.678 4.822 4.998 5.184 5.372 5.547 5.736 5.932 6.097 6.284 6.475 6.677 6.87 7.028 7.098 6.958 6.482 5.956 5.469 4.998 4.522 4.081 3.669 3.3 2.929 2.627 2.362 2.095 1.828 1.583 1.37 1.134 0.909 0.715 0.504 0.281 0.104 -0.084 -0.267 -0.41 -0.564 -0.716 -0.881 -1.06 -1.176 -1.298 -1.512 -1.665 -1.82 -1.894 -2.042 -2.202 -2.405 -2.525 -2.688 -2.799 -2.895 -3.013 -3.291 -3.432 -3.574 -3.744 -3.938 -4.166 -4.465 -5.247 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_29_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_29_30.txt deleted file mode 100644 index c496c13d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_29_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30242 ,KEBNE ,17018657,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:38:34 CET,0.0 0.317 0.461 0.595 0.73 0.854 0.956 1.053 1.222 1.305 1.378 1.463 1.588 1.652 1.786 1.919 2.037 2.088 2.18 2.262 2.388 2.472 2.55 2.656 2.764 2.87 2.964 3.049 3.156 3.262 3.356 3.471 3.584 3.687 3.815 3.949 4.076 4.219 4.369 4.512 4.658 4.806 4.953 5.116 5.276 5.395 5.535 5.633 5.588 5.359 4.823 4.003 3.199 2.479 1.845 1.257 0.703 0.183 -0.251 -0.701 -1.11 -1.449 -1.762 -2.07 -2.369 -2.637 -2.905 -3.143 -3.358 -3.598 -3.854 -4.068 -4.279 -4.498 -4.672 -4.849 -5.037 -5.242 -5.454 -5.595 -5.75 -5.992 -6.152 -6.324 -6.415 -6.6 -6.773 -6.96 -7.072 -7.25 -7.439 -7.579 -7.723 -8.021 -8.19 -8.37 -8.581 -8.812 -9.054 -9.396 -10.686 -2 ,3555 ,KEBNE ,17018658,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:39:33 CET,0.0 0.253 0.414 0.543 0.643 0.743 0.848 0.94 1.109 1.189 1.259 1.328 1.445 1.5 1.606 1.71 1.803 1.845 1.929 2.019 2.147 2.223 2.295 2.398 2.504 2.611 2.71 2.802 2.918 3.034 3.147 3.282 3.408 3.526 3.65 3.78 3.901 4.02 4.145 4.276 4.42 4.583 4.745 4.874 4.986 5.095 5.2 5.243 5.249 5.143 4.701 3.946 3.22 2.57 1.971 1.406 0.883 0.399 -0.031 -0.481 -0.859 -1.183 -1.498 -1.815 -2.129 -2.409 -2.701 -2.962 -3.185 -3.425 -3.682 -3.891 -4.099 -4.306 -4.467 -4.641 -4.83 -5.026 -5.221 -5.352 -5.499 -5.742 -5.908 -6.085 -6.179 -6.366 -6.555 -6.763 -6.871 -7.039 -7.225 -7.352 -7.491 -7.826 -7.991 -8.177 -8.399 -8.641 -8.911 -9.234 -10.51 -3 ,17099 ,KEBNE ,17018659,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:39:40 CET,0.0 0.335 0.535 0.674 0.793 0.9 0.999 1.095 1.275 1.361 1.44 1.525 1.649 1.718 1.849 1.969 2.081 2.13 2.228 2.326 2.47 2.558 2.645 2.765 2.87 2.968 3.049 3.133 3.259 3.369 3.464 3.582 3.696 3.803 3.924 4.053 4.168 4.285 4.408 4.543 4.68 4.83 4.989 5.124 5.272 5.416 5.525 5.602 5.625 5.492 5.053 4.301 3.485 2.679 2.008 1.422 0.881 0.384 -0.05 -0.499 -0.898 -1.237 -1.556 -1.859 -2.156 -2.441 -2.732 -2.988 -3.22 -3.466 -3.704 -3.893 -4.099 -4.322 -4.489 -4.667 -4.859 -5.056 -5.253 -5.398 -5.549 -5.78 -5.939 -6.103 -6.193 -6.371 -6.556 -6.755 -6.858 -7.023 -7.189 -7.315 -7.462 -7.807 -7.987 -8.168 -8.38 -8.615 -8.869 -9.225 -10.977 -4 ,23826 ,KEBNE ,17018660,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:39:00 CET,0.0 0.344 0.589 0.761 0.885 0.986 1.074 1.161 1.346 1.431 1.505 1.586 1.705 1.765 1.881 1.988 2.084 2.128 2.219 2.324 2.474 2.556 2.633 2.755 2.862 2.952 3.043 3.136 3.256 3.366 3.464 3.574 3.67 3.761 3.872 3.994 4.11 4.238 4.365 4.494 4.629 4.784 4.954 5.092 5.239 5.393 5.505 5.511 5.443 5.272 4.756 3.933 3.177 2.466 1.839 1.235 0.689 0.204 -0.207 -0.611 -0.98 -1.301 -1.605 -1.916 -2.22 -2.517 -2.825 -3.081 -3.294 -3.523 -3.759 -3.959 -4.179 -4.394 -4.563 -4.748 -4.942 -5.133 -5.329 -5.475 -5.627 -5.868 -6.026 -6.178 -6.259 -6.439 -6.636 -6.837 -6.942 -7.132 -7.349 -7.498 -7.662 -7.996 -8.166 -8.371 -8.582 -8.792 -9.055 -9.405 -10.519 -5 ,21514 ,KEBNE ,17018661,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:38:16 CET,0.0 0.345 0.513 0.645 0.782 0.913 1.028 1.12 1.271 1.354 1.434 1.526 1.646 1.702 1.821 1.925 2.017 2.068 2.161 2.251 2.393 2.473 2.547 2.657 2.771 2.885 2.985 3.063 3.171 3.295 3.408 3.537 3.651 3.748 3.87 4.008 4.119 4.248 4.396 4.525 4.654 4.786 4.919 5.062 5.202 5.318 5.396 5.42 5.375 5.175 4.608 3.748 2.993 2.275 1.624 1.047 0.505 0.003 -0.417 -0.842 -1.216 -1.554 -1.904 -2.248 -2.577 -2.866 -3.15 -3.402 -3.609 -3.828 -4.063 -4.268 -4.488 -4.714 -4.893 -5.061 -5.227 -5.416 -5.619 -5.756 -5.9 -6.139 -6.31 -6.476 -6.556 -6.742 -6.958 -7.169 -7.281 -7.458 -7.632 -7.765 -7.904 -8.177 -8.318 -8.494 -8.704 -8.934 -9.203 -9.585 -10.846 -6 ,30388 ,KEBNE ,17018662,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:38:52 CET,0.0 0.228 0.349 0.447 0.548 0.658 0.762 0.84 0.972 1.037 1.099 1.161 1.267 1.319 1.426 1.53 1.624 1.664 1.744 1.821 1.924 2.0 2.076 2.179 2.275 2.368 2.445 2.512 2.61 2.707 2.796 2.904 3.016 3.123 3.242 3.376 3.496 3.618 3.748 3.874 3.998 4.147 4.305 4.436 4.58 4.691 4.754 4.797 4.757 4.517 3.924 3.0 2.115 1.328 0.592 -0.101 -0.661 -1.131 -1.562 -2.019 -2.392 -2.739 -3.079 -3.396 -3.703 -3.972 -4.244 -4.508 -4.749 -4.997 -5.251 -5.459 -5.682 -5.916 -6.09 -6.272 -6.458 -6.648 -6.853 -6.99 -7.14 -7.387 -7.561 -7.754 -7.853 -8.046 -8.251 -8.455 -8.572 -8.754 -8.941 -9.081 -9.211 -9.482 -9.639 -9.808 -9.993 -10.204 -10.489 -10.874 -12.149 -7 ,30702 ,KEBNE ,17018663,Wed Dec 22 00:22:46 CET,Wed Dec 22 02:38:09 CET,0.0 0.175 0.308 0.445 0.542 0.629 0.734 0.827 0.985 1.064 1.146 1.217 1.329 1.382 1.493 1.607 1.714 1.759 1.841 1.922 2.046 2.13 2.204 2.308 2.415 2.529 2.631 2.728 2.844 2.952 3.063 3.178 3.287 3.397 3.519 3.651 3.769 3.891 4.019 4.162 4.302 4.443 4.595 4.742 4.896 5.039 5.15 5.199 5.163 4.971 4.467 3.636 2.843 2.171 1.577 1.046 0.57 0.114 -0.289 -0.701 -1.063 -1.391 -1.718 -2.026 -2.308 -2.565 -2.814 -3.045 -3.264 -3.495 -3.744 -3.959 -4.187 -4.419 -4.602 -4.793 -4.984 -5.17 -5.371 -5.513 -5.658 -5.918 -6.108 -6.283 -6.372 -6.568 -6.762 -6.967 -7.084 -7.267 -7.434 -7.56 -7.691 -7.985 -8.178 -8.405 -8.659 -8.928 -9.27 -9.734 -11.391 -8 ,32165 ,KEBNE ,17018664,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:37:58 CET,0.0 0.209 0.343 0.455 0.561 0.655 0.746 0.831 0.982 1.05 1.111 1.176 1.289 1.342 1.443 1.545 1.64 1.685 1.764 1.846 1.975 2.053 2.135 2.255 2.358 2.454 2.543 2.625 2.736 2.837 2.932 3.061 3.188 3.314 3.452 3.581 3.709 3.838 3.96 4.105 4.261 4.406 4.552 4.676 4.793 4.903 5.006 5.066 5.023 4.786 4.248 3.433 2.628 1.935 1.292 0.68 0.145 -0.348 -0.806 -1.267 -1.64 -1.957 -2.255 -2.535 -2.798 -3.047 -3.32 -3.58 -3.802 -4.035 -4.282 -4.482 -4.696 -4.921 -5.096 -5.277 -5.455 -5.655 -5.884 -6.051 -6.226 -6.475 -6.641 -6.819 -6.906 -7.095 -7.299 -7.496 -7.608 -7.784 -7.971 -8.115 -8.257 -8.569 -8.75 -8.953 -9.164 -9.386 -9.684 -10.108 -11.669 -9 ,30510 ,KEBNE ,17018665,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:39:04 CET,0.0 0.214 0.342 0.459 0.556 0.626 0.696 0.774 0.933 1.011 1.082 1.154 1.268 1.325 1.429 1.521 1.604 1.655 1.761 1.847 1.975 2.054 2.124 2.229 2.34 2.447 2.535 2.62 2.738 2.86 2.974 3.09 3.201 3.31 3.431 3.562 3.683 3.81 3.945 4.077 4.224 4.381 4.532 4.685 4.838 4.99 5.107 5.15 5.144 5.01 4.619 3.885 3.033 2.227 1.547 0.943 0.384 -0.153 -0.634 -1.105 -1.503 -1.852 -2.188 -2.505 -2.798 -3.072 -3.352 -3.603 -3.84 -4.083 -4.322 -4.525 -4.725 -4.924 -5.078 -5.246 -5.438 -5.644 -5.849 -5.989 -6.147 -6.398 -6.56 -6.726 -6.811 -6.995 -7.199 -7.432 -7.56 -7.739 -7.923 -8.064 -8.208 -8.529 -8.697 -8.871 -9.079 -9.327 -9.581 -9.964 -11.047 -10 ,16982 ,KEBNE ,17018666,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:38:17 CET,0.0 0.287 0.447 0.594 0.727 0.855 0.985 1.102 1.286 1.356 1.41 1.468 1.577 1.629 1.735 1.831 1.915 1.956 2.034 2.113 2.224 2.295 2.364 2.458 2.549 2.635 2.721 2.795 2.879 2.966 3.063 3.173 3.26 3.347 3.451 3.565 3.67 3.791 3.924 4.067 4.197 4.302 4.429 4.571 4.707 4.819 4.909 4.953 4.92 4.722 4.153 3.322 2.559 1.862 1.229 0.66 0.152 -0.331 -0.732 -1.128 -1.476 -1.775 -2.079 -2.389 -2.678 -2.932 -3.207 -3.465 -3.69 -3.925 -4.167 -4.374 -4.598 -4.819 -4.986 -5.173 -5.372 -5.564 -5.757 -5.898 -6.048 -6.298 -6.466 -6.621 -6.7 -6.866 -7.056 -7.267 -7.371 -7.552 -7.759 -7.899 -8.041 -8.337 -8.507 -8.673 -8.851 -9.056 -9.301 -9.651 -10.882 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_30_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_30_1h1s.txt deleted file mode 100644 index f0c971d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_30_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29356 ,TETRA ,17590545,Sat Nov 27 21:10:44 CET,Sun Nov 28 00:12:36 CET,0.0 0.424 0.7 0.887 1.023 1.129 1.222 1.292 1.414 1.478 1.528 1.152 1.588 1.602 1.636 1.67 1.688 1.69 1.681 1.658 1.611 1.575 1.531 1.458 1.381 1.294 1.196 1.091 0.929 0.757 0.587 0.368 0.128 -0.137 -0.45 -0.819 -1.205 -1.657 -2.183 -2.777 -3.445 -4.267 -5.319 -6.473 -7.93 -9.732 -12.082 -15.094 -19.141 -24.851 -33.474 -42.534 -49.307 -54.632 -58.929 -62.561 -65.587 -68.211 -70.353 -72.419 -74.157 -75.642 -77.014 -78.274 -79.419 -80.431 -81.442 -82.333 -83.104 -83.885 -84.665 -85.304 -85.965 -86.642 -87.158 -87.678 -88.206 -88.751 -89.309 -89.694 -90.086 -90.687 -91.11 -91.575 -91.828 -92.349 -92.877 -93.415 -93.693 -94.5 -94.557 -94.873 -95.198 -95.885 -96.253 -96.629 -97.046 -97.521 -98.049 -98.711 -100.161 -2 ,19742 ,TETRA ,17590546,Sat Nov 27 21:10:44 CET,Sun Nov 28 00:06:28 CET,0.0 0.47 0.73 0.922 1.074 1.2 1.303 1.384 1.58 1.658 1.717 1.406 1.854 1.87 1.903 1.926 1.925 1.924 1.919 1.902 1.853 1.807 1.763 1.693 1.631 1.555 1.462 1.358 1.19 1.011 0.821 0.587 0.357 0.105 -0.214 -0.576 -0.946 -1.401 -1.93 -2.54 -3.201 -4.018 -5.105 -6.322 -7.862 -9.698 -12.036 -15.095 -19.199 -24.86 -33.345 -42.403 -49.205 -54.561 -58.804 -62.389 -65.365 -67.885 -69.994 -72.068 -73.805 -75.293 -76.656 -77.906 -79.06 -80.116 -81.203 -82.146 -82.95 -83.77 -84.61 -85.303 -85.998 -86.689 -87.207 -87.735 -88.285 -88.846 -89.413 -89.8 -90.193 -90.81 -91.243 -91.685 -91.915 -92.377 -92.826 -93.293 -93.541 -94.326 -94.307 -94.567 -94.846 -95.41 -95.711 -96.032 -96.406 -96.802 -97.214 -97.745 -98.664 -3 ,7116 ,TETRA ,17590547,Sat Nov 27 21:11:41 CET,Sun Nov 28 00:12:30 CET,0.0 0.466 0.686 0.868 1.015 1.108 1.206 1.283 1.374 1.421 1.474 1.133 1.577 1.606 1.646 1.667 1.665 1.654 1.641 1.633 1.599 1.561 1.514 1.441 1.365 1.283 1.183 1.088 0.955 0.779 0.607 0.393 0.157 -0.084 -0.39 -0.759 -1.127 -1.552 -2.052 -2.619 -3.268 -4.096 -5.179 -6.397 -7.923 -9.748 -12.114 -15.159 -19.276 -25.015 -33.516 -42.409 -49.013 -54.304 -58.584 -62.141 -65.141 -67.774 -69.911 -71.995 -73.748 -75.268 -76.68 -77.926 -79.044 -80.076 -81.129 -82.037 -82.816 -83.599 -84.398 -85.069 -85.749 -86.43 -86.945 -87.456 -87.984 -88.537 -89.109 -89.502 -89.895 -90.491 -90.912 -91.351 -91.577 -92.025 -92.472 -92.943 -93.189 -93.967 -93.947 -94.221 -94.505 -95.121 -95.439 -95.764 -96.137 -96.517 -96.923 -97.479 -98.466 -4 ,4742 ,TETRA ,17590548,Sat Nov 27 21:11:41 CET,Sun Nov 28 00:14:42 CET,0.0 0.642 0.902 1.1 1.245 1.369 1.48 1.572 1.726 1.782 1.822 1.48 1.935 1.973 2.05 2.107 2.147 2.162 2.187 2.205 2.211 2.198 2.174 2.114 2.036 1.963 1.881 1.777 1.615 1.445 1.277 1.061 0.83 0.584 0.279 -0.082 -0.468 -0.942 -1.495 -2.125 -2.818 -3.653 -4.743 -5.927 -7.416 -9.246 -11.628 -14.696 -18.776 -24.448 -32.917 -41.974 -48.674 -53.963 -58.33 -62.041 -65.081 -67.678 -69.812 -71.86 -73.603 -75.117 -76.517 -77.794 -78.944 -79.981 -81.047 -81.968 -82.727 -83.518 -84.343 -85.015 -85.712 -86.419 -86.962 -87.521 -88.101 -88.709 -89.354 -89.801 -90.221 -90.819 -91.237 -91.672 -91.888 -92.317 -92.755 -93.226 -93.471 -94.246 -94.244 -94.516 -94.789 -95.366 -95.672 -95.991 -96.344 -96.738 -97.168 -97.706 -99.159 -5 ,7262 ,TETRA ,17590549,Sat Nov 27 21:11:41 CET,Sun Nov 28 00:09:47 CET,0.0 0.51 0.71 0.864 0.995 1.101 1.195 1.269 1.386 1.422 1.455 1.085 1.521 1.541 1.573 1.585 1.574 1.565 1.542 1.503 1.438 1.398 1.354 1.278 1.182 1.073 0.97 0.87 0.729 0.578 0.418 0.188 -0.059 -0.317 -0.627 -0.992 -1.387 -1.86 -2.405 -3.023 -3.711 -4.563 -5.679 -6.896 -8.424 -10.287 -12.673 -15.723 -19.85 -25.614 -34.09 -43.157 -49.989 -55.302 -59.612 -63.222 -66.267 -68.929 -71.1 -73.18 -74.936 -76.452 -77.841 -79.152 -80.332 -81.366 -82.444 -83.377 -84.161 -84.963 -85.788 -86.454 -87.118 -87.797 -88.323 -88.874 -89.442 -90.016 -90.605 -91.002 -91.406 -92.009 -92.413 -92.828 -93.033 -93.457 -93.923 -94.418 -94.659 -95.434 -95.4 -95.664 -95.934 -96.507 -96.816 -97.129 -97.465 -97.845 -98.281 -98.818 -99.608 -6 ,16269 ,TETRA ,17590550,Sat Nov 27 21:11:43 CET,Sun Nov 28 00:11:09 CET,0.0 0.425 0.631 0.776 0.893 0.984 1.061 1.133 1.225 1.259 1.297 0.937 1.385 1.414 1.452 1.478 1.481 1.478 1.47 1.456 1.415 1.387 1.351 1.27 1.187 1.109 1.012 0.896 0.749 0.605 0.437 0.202 -0.037 -0.287 -0.611 -0.999 -1.387 -1.833 -2.369 -3.005 -3.711 -4.573 -5.667 -6.876 -8.433 -10.311 -12.677 -15.687 -19.701 -25.304 -33.83 -42.865 -49.528 -54.738 -58.916 -62.559 -65.715 -68.419 -70.622 -72.779 -74.598 -76.176 -77.617 -78.929 -80.107 -81.151 -82.262 -83.222 -84.008 -84.819 -85.66 -86.346 -87.035 -87.731 -88.254 -88.78 -89.339 -89.929 -90.511 -90.895 -91.275 -91.855 -92.264 -92.692 -92.915 -93.374 -93.829 -94.298 -94.537 -95.308 -95.276 -95.54 -95.832 -96.451 -96.768 -97.115 -97.491 -97.884 -98.331 -98.822 -100.103 -7 ,23062 ,TETRA ,17590551,Sat Nov 27 21:11:43 CET,Sun Nov 28 00:15:12 CET,0.0 0.727 1.03 1.232 1.4 1.561 1.683 1.773 1.906 1.976 2.049 1.719 2.177 2.212 2.26 2.299 2.325 2.337 2.353 2.357 2.363 2.366 2.353 2.308 2.258 2.21 2.15 2.083 1.994 1.878 1.736 1.555 1.369 1.164 0.903 0.579 0.221 -0.203 -0.687 -1.282 -1.999 -2.874 -3.98 -5.208 -6.779 -8.68 -11.076 -14.072 -18.112 -23.734 -32.118 -41.053 -47.786 -53.116 -57.408 -61.029 -64.121 -66.86 -69.142 -71.373 -73.289 -74.927 -76.399 -77.746 -78.977 -80.055 -81.106 -82.015 -82.792 -83.587 -84.398 -85.069 -85.748 -86.426 -86.947 -87.478 -88.008 -88.546 -89.105 -89.481 -89.861 -90.469 -90.881 -91.286 -91.493 -91.923 -92.388 -92.878 -93.123 -93.901 -93.9 -94.18 -94.458 -95.073 -95.426 -95.78 -96.152 -96.592 -97.088 -97.722 -99.256 -8 ,922 ,TETRA ,17590552,Sat Nov 27 21:11:43 CET,Sun Nov 28 00:18:44 CET,0.0 0.608 0.92 1.147 1.33 1.49 1.628 1.753 1.941 2.02 2.089 1.782 2.26 2.316 2.396 2.445 2.466 2.478 2.495 2.514 2.53 2.521 2.51 2.487 2.452 2.398 2.319 2.23 2.12 2.006 1.881 1.71 1.524 1.319 1.059 0.741 0.405 0.016 -0.445 -1.008 -1.685 -2.518 -3.59 -4.784 -6.287 -8.157 -10.587 -13.729 -17.987 -23.778 -32.281 -41.206 -47.791 -53.077 -57.398 -61.003 -64.062 -66.695 -68.855 -70.906 -72.6 -74.122 -75.515 -76.786 -77.97 -79.047 -80.154 -81.088 -81.873 -82.666 -83.46 -84.114 -84.795 -85.479 -85.996 -86.537 -87.098 -87.655 -88.207 -88.599 -88.99 -89.56 -89.955 -90.367 -90.582 -91.019 -91.482 -91.962 -92.202 -92.98 -92.982 -93.244 -93.507 -94.068 -94.368 -94.706 -95.049 -95.419 -95.859 -96.407 -97.404 -9 ,6177 ,TETRA ,17590553,Sat Nov 27 21:11:43 CET,Sun Nov 28 00:17:01 CET,0.0 0.606 0.879 1.052 1.15 1.242 1.333 1.414 1.539 1.591 1.635 1.277 1.717 1.735 1.757 1.776 1.776 1.771 1.772 1.779 1.771 1.771 1.785 1.809 1.817 1.806 1.786 1.761 1.68 1.543 1.386 1.169 0.953 0.735 0.447 0.087 -0.299 -0.761 -1.291 -1.891 -2.581 -3.436 -4.516 -5.69 -7.178 -9.033 -11.414 -14.463 -18.597 -24.313 -32.756 -41.767 -48.521 -53.855 -58.19 -61.842 -64.868 -67.474 -69.613 -71.684 -73.436 -74.954 -76.381 -77.668 -78.815 -79.843 -80.903 -81.826 -82.589 -83.365 -84.155 -84.795 -85.453 -86.123 -86.634 -87.158 -87.698 -88.247 -88.821 -89.225 -89.616 -90.213 -90.625 -91.128 -91.423 -92.012 -92.614 -93.229 -93.545 -94.436 -94.51 -94.852 -95.186 -95.887 -96.269 -96.652 -97.055 -97.522 -98.019 -98.634 -100.108 -10 ,24023 ,TETRA ,17590554,Sat Nov 27 21:11:43 CET,Sun Nov 28 00:25:35 CET,0.0 0.697 0.969 1.164 1.323 1.461 1.571 1.677 1.821 1.866 1.915 1.586 2.031 2.055 2.092 2.152 2.233 2.268 2.303 2.314 2.321 2.314 2.3 2.259 2.196 2.121 2.043 1.967 1.861 1.753 1.634 1.46 1.266 1.052 0.777 0.417 0.041 -0.401 -0.923 -1.531 -2.212 -3.023 -4.078 -5.253 -6.751 -8.613 -10.993 -14.017 -18.056 -23.639 -32.031 -40.996 -47.862 -53.286 -57.596 -61.261 -64.306 -66.914 -69.085 -71.187 -72.928 -74.423 -75.809 -77.076 -78.244 -79.301 -80.351 -81.253 -82.025 -82.804 -83.599 -84.256 -84.923 -85.606 -86.123 -86.652 -87.198 -87.745 -88.299 -88.682 -89.076 -89.686 -90.116 -90.567 -90.801 -91.285 -91.78 -92.3 -92.569 -93.368 -93.408 -93.707 -94.014 -94.683 -95.03 -95.392 -95.798 -96.25 -96.763 -97.368 -98.581 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_30_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_30_26.txt deleted file mode 100644 index ff388452..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_30_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1975 ,KEBNE ,17069211,Thu Dec 23 20:37:10 CET,Thu Dec 23 22:54:33 CET,0.0 0.712 0.937 1.136 1.317 1.483 1.629 1.773 2.044 2.167 2.285 2.451 2.621 2.725 2.903 3.061 3.219 3.298 3.457 3.612 3.832 3.973 4.114 4.326 4.525 4.714 4.901 5.068 5.284 5.493 5.701 5.967 6.221 6.455 6.726 7.015 7.285 7.588 7.907 8.253 8.617 9.007 9.459 9.937 10.494 11.094 11.78 12.559 13.391 14.252 15.192 15.688 15.805 15.758 15.654 15.504 15.298 15.062 14.834 14.623 14.425 14.209 14.0 13.808 13.617 13.428 13.212 13.015 12.848 12.681 12.509 12.358 12.198 12.008 11.861 11.728 11.588 11.432 11.267 11.161 11.049 10.851 10.708 10.55 10.466 10.29 10.092 9.883 9.772 9.587 9.373 9.234 9.103 8.824 8.651 8.408 8.139 7.869 7.515 6.997 5.032 -2 ,21844 ,KEBNE ,17069212,Thu Dec 23 20:37:08 CET,Thu Dec 23 22:57:07 CET,0.0 0.676 0.954 1.14 1.33 1.498 1.638 1.777 2.041 2.158 2.278 2.443 2.603 2.704 2.903 3.096 3.28 3.364 3.523 3.674 3.903 4.051 4.187 4.386 4.581 4.764 4.944 5.11 5.328 5.556 5.78 6.035 6.272 6.508 6.768 7.058 7.351 7.668 7.987 8.328 8.68 9.073 9.55 10.023 10.532 11.056 11.666 12.328 13.042 13.863 14.751 15.266 15.405 15.431 15.325 15.118 14.906 14.679 14.458 14.208 14.003 13.836 13.646 13.433 13.241 13.075 12.889 12.702 12.533 12.362 12.176 12.018 11.861 11.68 11.527 11.373 11.195 10.983 10.771 10.629 10.477 10.217 10.03 9.829 9.735 9.544 9.317 9.087 8.966 8.79 8.594 8.437 8.285 7.983 7.805 7.619 7.4 7.132 6.85 6.416 5.123 -3 ,22986 ,KEBNE ,17069213,Thu Dec 23 20:37:10 CET,Thu Dec 23 22:55:27 CET,0.0 0.482 0.718 0.925 1.088 1.239 1.387 1.526 1.756 1.871 1.984 2.14 2.298 2.382 2.544 2.698 2.854 2.931 3.078 3.228 3.443 3.576 3.704 3.896 4.083 4.259 4.435 4.608 4.825 5.028 5.231 5.474 5.707 5.941 6.201 6.481 6.752 7.046 7.361 7.707 8.075 8.496 8.983 9.451 9.989 10.561 11.236 12.047 12.953 13.884 14.758 15.232 15.368 15.386 15.315 15.152 14.94 14.742 14.542 14.317 14.121 13.915 13.702 13.5 13.29 13.084 12.894 12.7 12.513 12.325 12.13 11.978 11.799 11.591 11.425 11.257 11.092 10.92 10.757 10.644 10.508 10.298 10.155 10.007 9.934 9.766 9.589 9.403 9.3 9.122 8.894 8.752 8.606 8.242 8.017 7.801 7.603 7.371 7.052 6.662 5.835 -4 ,31766 ,KEBNE ,17069214,Thu Dec 23 20:37:10 CET,Thu Dec 23 22:55:28 CET,0.0 1.037 1.393 1.643 1.826 1.992 2.159 2.321 2.62 2.753 2.871 3.031 3.204 3.31 3.494 3.667 3.823 3.899 4.054 4.207 4.426 4.554 4.672 4.848 5.034 5.215 5.378 5.538 5.751 5.958 6.149 6.375 6.595 6.799 7.032 7.297 7.556 7.843 8.166 8.511 8.867 9.267 9.718 10.182 10.736 11.314 11.976 12.712 13.492 14.349 15.203 15.589 15.64 15.559 15.426 15.245 15.042 14.838 14.58 14.293 14.079 13.885 13.666 13.415 13.136 12.898 12.681 12.478 12.297 12.108 11.926 11.75 11.557 11.364 11.203 11.039 10.853 10.653 10.467 10.327 10.18 9.941 9.749 9.565 9.473 9.267 9.058 8.839 8.729 8.551 8.349 8.216 8.07 7.719 7.523 7.309 7.071 6.795 6.498 6.16 5.055 -5 ,17762 ,KEBNE ,17069215,Thu Dec 23 20:37:11 CET,Thu Dec 23 22:54:28 CET,0.0 0.917 1.208 1.437 1.644 1.835 1.998 2.121 2.377 2.506 2.615 2.765 2.928 3.019 3.205 3.385 3.55 3.63 3.796 3.955 4.177 4.319 4.449 4.635 4.816 4.987 5.159 5.327 5.527 5.721 5.906 6.132 6.357 6.576 6.829 7.11 7.375 7.679 8.019 8.361 8.714 9.115 9.595 10.045 10.527 11.075 11.687 12.359 13.162 14.004 14.854 15.428 15.622 15.541 15.373 15.204 15.002 14.753 14.51 14.268 14.015 13.801 13.612 13.391 13.151 12.932 12.726 12.552 12.402 12.235 12.053 11.888 11.7 11.493 11.332 11.153 10.949 10.752 10.543 10.393 10.242 10.029 9.876 9.702 9.613 9.417 9.194 8.975 8.872 8.696 8.489 8.351 8.198 7.847 7.66 7.459 7.217 6.929 6.613 6.163 4.641 -6 ,18530 ,KEBNE ,17069216,Thu Dec 23 20:37:09 CET,Thu Dec 23 22:55:26 CET,0.0 0.499 0.759 0.979 1.178 1.352 1.499 1.62 1.849 1.967 2.096 2.287 2.458 2.569 2.789 2.977 3.142 3.224 3.39 3.538 3.731 3.864 3.998 4.185 4.369 4.553 4.728 4.898 5.11 5.315 5.52 5.767 5.987 6.189 6.434 6.718 6.997 7.295 7.598 7.927 8.294 8.703 9.154 9.582 10.061 10.609 11.246 11.962 12.825 13.771 14.742 15.309 15.434 15.389 15.303 15.178 15.004 14.82 14.634 14.401 14.136 13.9 13.693 13.473 13.243 13.05 12.869 12.701 12.562 12.408 12.232 12.071 11.905 11.72 11.567 11.418 11.25 11.066 10.876 10.75 10.624 10.419 10.261 10.09 10.019 9.886 9.726 9.548 9.441 9.272 9.114 8.984 8.851 8.559 8.374 8.175 7.941 7.679 7.388 6.98 5.43 -7 ,21486 ,KEBNE ,17069217,Thu Dec 23 20:37:11 CET,Thu Dec 23 22:54:11 CET,0.0 0.858 1.155 1.375 1.586 1.755 1.904 2.058 2.333 2.46 2.582 2.742 2.903 3.002 3.197 3.384 3.553 3.635 3.794 3.943 4.161 4.299 4.433 4.627 4.819 5.003 5.17 5.331 5.539 5.75 5.955 6.196 6.427 6.648 6.91 7.198 7.479 7.775 8.079 8.412 8.766 9.155 9.606 10.071 10.593 11.142 11.753 12.43 13.167 13.964 14.793 15.352 15.628 15.653 15.561 15.422 15.223 14.996 14.795 14.586 14.378 14.154 13.908 13.673 13.452 13.249 13.041 12.857 12.683 12.489 12.282 12.098 11.908 11.699 11.518 11.328 11.121 10.912 10.702 10.559 10.415 10.14 9.934 9.725 9.617 9.409 9.184 8.951 8.823 8.624 8.42 8.287 8.135 7.754 7.538 7.327 7.084 6.789 6.44 5.979 4.387 -8 ,2022 ,KEBNE ,17069218,Thu Dec 23 20:37:11 CET,Thu Dec 23 22:55:55 CET,0.0 0.442 0.694 0.912 1.075 1.225 1.363 1.48 1.69 1.798 1.903 2.043 2.191 2.275 2.433 2.588 2.737 2.815 2.971 3.112 3.304 3.43 3.558 3.745 3.934 4.115 4.289 4.45 4.646 4.835 5.012 5.235 5.465 5.676 5.914 6.18 6.426 6.717 7.051 7.404 7.759 8.148 8.604 9.039 9.528 10.085 10.713 11.414 12.22 13.041 13.978 14.598 14.734 14.719 14.603 14.384 14.127 13.891 13.67 13.439 13.216 12.981 12.769 12.577 12.374 12.185 11.972 11.77 11.604 11.433 11.25 11.087 10.91 10.715 10.561 10.403 10.224 10.043 9.879 9.757 9.621 9.415 9.264 9.095 9.013 8.842 8.658 8.486 8.392 8.232 8.057 7.932 7.797 7.506 7.319 7.097 6.875 6.616 6.303 5.907 4.356 -9 ,24018 ,KEBNE ,17069219,Thu Dec 23 20:37:09 CET,Thu Dec 23 22:54:10 CET,0.0 0.798 1.144 1.366 1.542 1.698 1.86 2.027 2.301 2.416 2.529 2.687 2.848 2.94 3.125 3.301 3.46 3.542 3.707 3.873 4.1 4.244 4.389 4.6 4.796 4.973 5.142 5.307 5.513 5.717 5.923 6.166 6.397 6.627 6.895 7.193 7.472 7.77 8.086 8.415 8.764 9.15 9.594 10.041 10.543 11.096 11.736 12.441 13.174 13.938 14.789 15.382 15.666 15.688 15.544 15.359 15.165 14.918 14.67 14.422 14.174 13.941 13.706 13.449 13.197 12.995 12.791 12.597 12.429 12.224 11.985 11.808 11.645 11.445 11.271 11.109 10.912 10.683 10.475 10.339 10.191 9.947 9.778 9.597 9.498 9.287 9.082 8.862 8.738 8.551 8.334 8.196 8.048 7.706 7.525 7.327 7.098 6.845 6.592 6.311 5.466 -10 ,15069 ,KEBNE ,17069220,Thu Dec 23 20:37:08 CET,Thu Dec 23 22:55:59 CET,0.0 0.401 0.692 0.935 1.14 1.29 1.41 1.525 1.735 1.835 1.942 2.085 2.242 2.336 2.524 2.707 2.871 2.947 3.098 3.244 3.45 3.582 3.721 3.931 4.11 4.277 4.442 4.608 4.831 5.05 5.253 5.491 5.724 5.941 6.19 6.483 6.76 7.057 7.375 7.706 8.048 8.433 8.876 9.32 9.843 10.408 11.062 11.786 12.608 13.579 14.585 15.174 15.347 15.348 15.291 15.121 14.884 14.673 14.502 14.311 14.098 13.896 13.706 13.51 13.324 13.15 12.961 12.764 12.57 12.375 12.187 12.021 11.822 11.609 11.45 11.308 11.164 11.007 10.829 10.694 10.555 10.343 10.2 10.052 9.972 9.812 9.657 9.486 9.395 9.23 9.044 8.925 8.797 8.532 8.366 8.181 8.01 7.803 7.505 7.15 5.986 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_30_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_30_31.txt deleted file mode 100644 index 25d0ddd0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_30_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18815 ,KEBNE ,17018667,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:40:20 CET,0.0 0.326 0.556 0.73 0.852 0.964 1.073 1.169 1.354 1.447 1.532 1.62 1.757 1.832 1.964 2.097 2.226 2.287 2.411 2.523 2.68 2.779 2.873 3.014 3.146 3.268 3.38 3.487 3.627 3.76 3.902 4.094 4.269 4.416 4.579 4.757 4.93 5.13 5.334 5.531 5.743 5.976 6.235 6.489 6.776 7.091 7.459 7.825 8.166 8.504 8.681 8.515 8.23 7.94 7.642 7.358 7.072 6.775 6.507 6.245 6.008 5.774 5.549 5.336 5.127 4.94 4.756 4.584 4.417 4.236 4.055 3.909 3.749 3.578 3.448 3.31 3.154 3.001 2.851 2.737 2.617 2.443 2.331 2.202 2.13 1.988 1.848 1.712 1.642 1.506 1.393 1.298 1.198 0.99 0.875 0.733 0.574 0.387 0.186 -0.062 -0.69 -2 ,24681 ,KEBNE ,17018668,Wed Dec 22 00:22:47 CET,Wed Dec 22 02:40:42 CET,0.0 0.433 0.624 0.812 0.943 1.045 1.153 1.27 1.474 1.565 1.653 1.758 1.904 1.983 2.123 2.255 2.383 2.445 2.564 2.671 2.817 2.917 3.019 3.153 3.278 3.408 3.539 3.664 3.818 3.97 4.119 4.288 4.445 4.603 4.794 5.01 5.214 5.414 5.616 5.832 6.051 6.287 6.554 6.799 7.082 7.419 7.769 8.11 8.47 8.828 9.025 8.884 8.628 8.311 8.007 7.75 7.474 7.199 6.961 6.716 6.491 6.278 6.085 5.904 5.723 5.549 5.358 5.183 5.029 4.859 4.669 4.515 4.355 4.193 4.078 3.956 3.819 3.668 3.511 3.404 3.297 3.126 3.0 2.869 2.807 2.677 2.52 2.344 2.26 2.113 1.98 1.873 1.756 1.496 1.35 1.201 1.059 0.911 0.725 0.478 0.029 -3 ,19942 ,KEBNE ,17018669,Wed Dec 22 00:23:49 CET,Wed Dec 22 02:40:09 CET,0.0 0.572 0.784 0.995 1.16 1.288 1.421 1.535 1.708 1.791 1.874 1.97 2.108 2.193 2.348 2.48 2.61 2.677 2.796 2.903 3.062 3.173 3.283 3.452 3.617 3.771 3.912 4.034 4.208 4.371 4.519 4.694 4.864 5.034 5.216 5.411 5.598 5.8 6.004 6.22 6.466 6.743 7.043 7.352 7.693 8.039 8.41 8.776 9.142 9.475 9.759 9.701 9.451 9.159 8.853 8.543 8.241 7.925 7.619 7.299 7.023 6.766 6.528 6.311 6.099 5.894 5.676 5.491 5.333 5.175 5.019 4.881 4.726 4.557 4.427 4.298 4.162 4.022 3.876 3.765 3.656 3.466 3.317 3.181 3.114 2.975 2.829 2.663 2.576 2.428 2.288 2.172 2.061 1.834 1.71 1.574 1.399 1.203 1.012 0.752 0.34 -4 ,11795 ,KEBNE ,17018670,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:40:33 CET,0.0 0.461 0.685 0.842 0.971 1.118 1.235 1.332 1.538 1.639 1.734 1.845 1.984 2.056 2.2 2.33 2.458 2.522 2.646 2.764 2.924 3.033 3.138 3.269 3.4 3.534 3.658 3.775 3.917 4.065 4.217 4.399 4.561 4.706 4.864 5.042 5.222 5.438 5.672 5.899 6.127 6.362 6.626 6.871 7.14 7.436 7.784 8.156 8.506 8.824 9.024 8.999 8.843 8.591 8.315 8.05 7.811 7.559 7.313 7.061 6.826 6.605 6.395 6.188 5.987 5.79 5.583 5.407 5.246 5.073 4.895 4.747 4.607 4.466 4.351 4.224 4.084 3.945 3.808 3.712 3.609 3.439 3.323 3.194 3.124 2.998 2.865 2.722 2.644 2.51 2.411 2.322 2.231 1.99 1.851 1.713 1.584 1.432 1.226 0.99 0.557 -5 ,28452 ,KEBNE ,17018671,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:41:16 CET,0.0 0.612 0.826 1.003 1.175 1.329 1.456 1.573 1.772 1.865 1.959 2.077 2.211 2.27 2.389 2.509 2.63 2.693 2.818 2.943 3.111 3.205 3.298 3.441 3.575 3.709 3.84 3.959 4.103 4.252 4.395 4.558 4.717 4.859 5.019 5.198 5.369 5.558 5.774 6.004 6.244 6.505 6.786 7.065 7.378 7.701 8.077 8.467 8.866 9.203 9.416 9.314 8.999 8.698 8.359 7.968 7.624 7.35 7.112 6.84 6.592 6.355 6.111 5.884 5.657 5.455 5.261 5.091 4.946 4.781 4.6 4.454 4.307 4.144 4.013 3.885 3.751 3.605 3.459 3.351 3.239 3.058 2.934 2.806 2.734 2.593 2.451 2.299 2.225 2.085 1.958 1.864 1.77 1.556 1.415 1.263 1.116 0.962 0.777 0.498 -0.091 -6 ,32520 ,KEBNE ,17018672,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:41:21 CET,0.0 0.498 0.732 0.879 0.997 1.109 1.225 1.336 1.543 1.641 1.722 1.81 1.947 2.021 2.149 2.259 2.367 2.419 2.517 2.614 2.748 2.834 2.919 3.037 3.153 3.272 3.387 3.492 3.625 3.759 3.888 4.04 4.19 4.345 4.53 4.733 4.922 5.121 5.324 5.527 5.749 5.99 6.26 6.536 6.823 7.109 7.414 7.77 8.171 8.472 8.578 8.449 8.229 7.951 7.649 7.348 7.052 6.757 6.478 6.211 5.98 5.756 5.545 5.35 5.152 4.971 4.781 4.605 4.451 4.287 4.12 3.975 3.824 3.665 3.539 3.417 3.29 3.16 3.024 2.922 2.807 2.62 2.486 2.35 2.287 2.147 1.984 1.819 1.73 1.575 1.452 1.358 1.263 1.046 0.922 0.796 0.657 0.473 0.259 0.015 -0.524 -7 ,21635 ,KEBNE ,17018673,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:40:28 CET,0.0 0.603 0.864 1.048 1.202 1.332 1.431 1.521 1.702 1.788 1.866 1.97 2.114 2.184 2.323 2.456 2.576 2.635 2.759 2.873 3.019 3.117 3.209 3.341 3.484 3.612 3.73 3.857 4.018 4.176 4.325 4.493 4.66 4.813 4.97 5.142 5.308 5.509 5.752 5.986 6.21 6.474 6.76 7.033 7.364 7.719 8.088 8.455 8.834 9.154 9.329 9.22 8.924 8.591 8.284 7.98 7.661 7.371 7.114 6.837 6.588 6.368 6.161 5.973 5.812 5.656 5.485 5.334 5.193 5.034 4.876 4.751 4.619 4.481 4.369 4.243 4.112 3.977 3.842 3.747 3.641 3.486 3.374 3.254 3.193 3.067 2.929 2.775 2.696 2.56 2.441 2.331 2.222 2.008 1.889 1.751 1.597 1.435 1.251 0.959 0.346 -8 ,13850 ,KEBNE ,17018674,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:42:00 CET,0.0 0.321 0.509 0.689 0.824 0.944 1.063 1.166 1.364 1.452 1.537 1.644 1.779 1.849 1.992 2.128 2.255 2.315 2.429 2.538 2.701 2.81 2.905 3.025 3.146 3.272 3.39 3.497 3.636 3.774 3.908 4.057 4.203 4.354 4.519 4.7 4.876 5.063 5.263 5.479 5.699 5.939 6.205 6.454 6.724 7.005 7.33 7.693 8.063 8.407 8.637 8.537 8.315 8.066 7.824 7.551 7.246 6.958 6.696 6.389 6.132 5.917 5.706 5.498 5.292 5.091 4.893 4.737 4.592 4.425 4.241 4.084 3.919 3.757 3.636 3.509 3.385 3.258 3.119 3.03 2.941 2.799 2.695 2.587 2.528 2.397 2.268 2.133 2.06 1.926 1.818 1.729 1.631 1.419 1.299 1.165 1.022 0.865 0.688 0.441 -0.157 -9 ,5613 ,KEBNE ,17018675,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:39:44 CET,0.0 0.466 0.715 0.904 1.053 1.197 1.331 1.448 1.659 1.761 1.86 1.994 2.135 2.207 2.354 2.498 2.641 2.708 2.83 2.944 3.12 3.233 3.329 3.46 3.589 3.72 3.843 3.961 4.121 4.265 4.391 4.558 4.725 4.877 5.048 5.24 5.428 5.617 5.823 6.058 6.296 6.543 6.831 7.101 7.401 7.748 8.096 8.437 8.817 9.213 9.492 9.502 9.334 9.08 8.789 8.473 8.162 7.85 7.582 7.338 7.11 6.897 6.704 6.502 6.311 6.133 5.935 5.769 5.617 5.446 5.264 5.11 4.959 4.802 4.684 4.567 4.441 4.3 4.152 4.058 3.959 3.788 3.675 3.551 3.486 3.363 3.219 3.058 2.973 2.819 2.694 2.611 2.521 2.306 2.192 2.056 1.885 1.704 1.526 1.299 0.955 -10 ,8722 ,KEBNE ,17018676,Wed Dec 22 00:23:49 CET,Wed Dec 22 02:40:27 CET,0.0 0.436 0.665 0.839 0.983 1.113 1.238 1.353 1.555 1.637 1.724 1.835 1.981 2.055 2.191 2.324 2.448 2.512 2.635 2.74 2.898 3.003 3.109 3.258 3.387 3.511 3.63 3.755 3.915 4.058 4.205 4.381 4.55 4.704 4.857 5.025 5.192 5.385 5.598 5.809 6.015 6.24 6.522 6.823 7.15 7.482 7.81 8.14 8.463 8.782 9.041 9.03 8.845 8.574 8.323 8.085 7.847 7.6 7.369 7.133 6.911 6.693 6.495 6.304 6.124 5.962 5.789 5.631 5.48 5.314 5.136 4.994 4.846 4.672 4.535 4.396 4.26 4.133 4.007 3.91 3.803 3.632 3.508 3.382 3.319 3.171 3.014 2.861 2.773 2.616 2.475 2.369 2.262 2.018 1.881 1.735 1.577 1.398 1.174 0.88 0.425 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_31_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_31_26.txt deleted file mode 100644 index 8fa2d34a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_31_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27863 ,KEBNE ,17018677,Wed Dec 22 00:23:49 CET,Wed Dec 22 02:41:50 CET,0.0 0.459 0.711 0.89 1.041 1.202 1.352 1.486 1.75 1.865 1.958 2.1 2.259 2.35 2.535 2.717 2.885 2.966 3.123 3.268 3.482 3.622 3.754 3.943 4.14 4.341 4.522 4.689 4.899 5.102 5.297 5.549 5.795 6.025 6.287 6.573 6.85 7.172 7.531 7.915 8.312 8.716 9.158 9.633 10.166 10.707 11.361 12.093 12.886 13.825 14.627 15.088 15.263 15.094 14.824 14.604 14.381 14.139 13.889 13.582 13.322 13.06 12.794 12.548 12.296 12.073 11.862 11.657 11.467 11.277 11.085 10.922 10.746 10.571 10.436 10.275 10.101 9.932 9.756 9.628 9.492 9.287 9.135 8.971 8.886 8.711 8.514 8.29 8.172 8.003 7.83 7.689 7.548 7.236 7.044 6.837 6.611 6.367 6.111 5.779 5.009 -2 ,440 ,KEBNE ,17018678,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:41:50 CET,0.0 0.347 0.64 0.881 1.09 1.265 1.412 1.554 1.808 1.922 2.038 2.204 2.37 2.475 2.676 2.852 3.022 3.104 3.254 3.412 3.635 3.772 3.91 4.107 4.296 4.484 4.667 4.831 5.027 5.221 5.415 5.646 5.864 6.078 6.336 6.619 6.889 7.193 7.517 7.845 8.167 8.528 8.975 9.421 9.909 10.409 10.984 11.61 12.282 13.03 13.731 14.002 13.929 13.725 13.515 13.257 13.007 12.769 12.522 12.26 12.042 11.843 11.611 11.389 11.201 11.01 10.802 10.601 10.402 10.187 9.98 9.825 9.655 9.48 9.34 9.176 9.011 8.823 8.599 8.452 8.31 8.081 7.916 7.745 7.657 7.483 7.287 7.062 6.938 6.745 6.525 6.385 6.239 5.894 5.708 5.496 5.265 5.033 4.802 4.453 3.662 -3 ,11518 ,KEBNE ,17018679,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:41:03 CET,0.0 0.656 0.948 1.177 1.375 1.558 1.72 1.862 2.084 2.185 2.301 2.466 2.619 2.709 2.871 3.033 3.195 3.269 3.418 3.564 3.769 3.906 4.046 4.245 4.422 4.581 4.741 4.904 5.101 5.289 5.481 5.704 5.905 6.107 6.345 6.609 6.871 7.167 7.506 7.866 8.246 8.699 9.226 9.735 10.287 10.86 11.542 12.277 13.028 13.786 14.574 14.992 15.008 14.904 14.73 14.5 14.237 13.934 13.63 13.337 13.066 12.804 12.543 12.29 12.053 11.82 11.556 11.322 11.114 10.91 10.723 10.559 10.381 10.208 10.069 9.915 9.749 9.576 9.39 9.257 9.112 8.879 8.727 8.56 8.467 8.278 8.087 7.885 7.784 7.619 7.398 7.259 7.126 6.801 6.626 6.431 6.222 5.991 5.725 5.379 4.691 -4 ,27069 ,KEBNE ,17018680,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:43:50 CET,0.0 0.531 0.799 1.011 1.198 1.353 1.498 1.642 1.913 2.034 2.139 2.285 2.449 2.548 2.72 2.889 3.053 3.127 3.269 3.403 3.607 3.746 3.881 4.072 4.256 4.43 4.589 4.737 4.939 5.148 5.352 5.588 5.814 6.024 6.264 6.535 6.785 7.077 7.391 7.712 8.048 8.428 8.873 9.304 9.79 10.322 10.912 11.549 12.282 13.081 13.851 14.096 13.992 13.792 13.516 13.267 13.067 12.821 12.551 12.266 12.03 11.794 11.552 11.343 11.127 10.917 10.71 10.514 10.328 10.146 9.961 9.793 9.626 9.461 9.319 9.167 9.007 8.851 8.695 8.588 8.469 8.26 8.106 7.946 7.862 7.674 7.478 7.268 7.163 7.004 6.841 6.727 6.613 6.363 6.211 6.036 5.835 5.608 5.313 4.918 3.73 -5 ,4930 ,KEBNE ,17018681,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:43:55 CET,0.0 0.444 0.662 0.811 0.954 1.1 1.23 1.352 1.591 1.701 1.809 1.955 2.121 2.221 2.4 2.566 2.729 2.806 2.955 3.111 3.334 3.47 3.601 3.791 3.97 4.132 4.285 4.44 4.653 4.863 5.068 5.303 5.538 5.772 6.025 6.311 6.583 6.879 7.201 7.529 7.871 8.274 8.744 9.215 9.773 10.333 10.921 11.565 12.236 12.951 13.765 14.101 14.103 14.035 13.867 13.627 13.403 13.205 12.949 12.594 12.276 11.998 11.724 11.459 11.25 11.061 10.821 10.63 10.471 10.274 10.069 9.891 9.7 9.506 9.347 9.177 8.996 8.802 8.608 8.492 8.367 8.133 7.955 7.779 7.695 7.508 7.292 7.078 6.981 6.817 6.654 6.532 6.39 6.066 5.878 5.67 5.45 5.195 4.894 4.491 3.538 -6 ,17518 ,KEBNE ,17018682,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:41:51 CET,0.0 0.42 0.629 0.829 1.012 1.174 1.334 1.474 1.727 1.849 1.965 2.128 2.289 2.382 2.546 2.725 2.911 2.991 3.149 3.309 3.532 3.669 3.809 4.021 4.214 4.396 4.57 4.745 4.98 5.195 5.399 5.651 5.897 6.13 6.39 6.675 6.957 7.269 7.596 7.941 8.285 8.673 9.143 9.622 10.142 10.684 11.307 12.01 12.842 13.773 14.564 14.952 15.011 14.799 14.514 14.209 13.946 13.694 13.403 13.029 12.692 12.397 12.122 11.861 11.593 11.361 11.129 10.927 10.732 10.496 10.239 10.029 9.817 9.599 9.446 9.297 9.143 8.977 8.784 8.64 8.497 8.285 8.131 7.975 7.902 7.752 7.581 7.387 7.282 7.118 6.954 6.823 6.682 6.397 6.246 6.066 5.854 5.626 5.342 5.004 3.918 -7 ,4984 ,KEBNE ,17018683,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:40:18 CET,0.0 0.47 0.694 0.889 1.048 1.192 1.329 1.472 1.744 1.853 1.95 2.065 2.208 2.295 2.46 2.623 2.786 2.858 3.0 3.147 3.357 3.493 3.633 3.842 4.036 4.218 4.397 4.569 4.791 5.005 5.213 5.466 5.699 5.919 6.182 6.484 6.773 7.08 7.421 7.791 8.188 8.635 9.132 9.606 10.132 10.726 11.427 12.234 13.099 13.95 14.854 15.483 15.67 15.521 15.221 14.92 14.621 14.301 13.964 13.641 13.374 13.12 12.872 12.633 12.416 12.221 12.005 11.798 11.626 11.439 11.225 11.046 10.851 10.638 10.49 10.339 10.163 9.98 9.801 9.674 9.528 9.307 9.16 8.992 8.901 8.718 8.542 8.34 8.223 8.046 7.875 7.751 7.623 7.345 7.155 6.936 6.714 6.462 6.179 5.835 4.838 -8 ,12561 ,KEBNE ,17018684,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:41:41 CET,0.0 0.447 0.683 0.852 1.015 1.191 1.358 1.517 1.766 1.87 1.978 2.119 2.281 2.382 2.571 2.74 2.898 2.983 3.156 3.314 3.539 3.68 3.816 4.027 4.224 4.402 4.577 4.755 4.996 5.225 5.438 5.695 5.94 6.179 6.444 6.727 7.008 7.306 7.624 7.957 8.307 8.707 9.153 9.601 10.118 10.674 11.289 12.007 12.756 13.482 14.15 14.401 14.342 14.2 13.973 13.68 13.413 13.131 12.847 12.539 12.285 12.04 11.795 11.561 11.343 11.15 10.906 10.684 10.493 10.3 10.112 9.935 9.741 9.549 9.387 9.222 9.069 8.903 8.728 8.602 8.474 8.281 8.129 7.957 7.866 7.679 7.484 7.257 7.148 6.994 6.822 6.697 6.574 6.302 6.134 5.967 5.774 5.506 5.171 4.716 3.695 -9 ,7718 ,KEBNE ,17018685,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:41:01 CET,0.0 0.4 0.627 0.828 0.99 1.141 1.279 1.399 1.64 1.759 1.87 2.01 2.165 2.26 2.443 2.626 2.798 2.878 3.029 3.179 3.411 3.562 3.705 3.908 4.098 4.281 4.464 4.636 4.846 5.06 5.268 5.529 5.791 6.027 6.292 6.596 6.888 7.204 7.545 7.908 8.286 8.694 9.154 9.612 10.155 10.747 11.407 12.136 12.946 13.876 14.781 15.13 15.124 14.977 14.721 14.419 14.127 13.824 13.519 13.182 12.904 12.675 12.462 12.243 12.004 11.784 11.539 11.299 11.105 10.904 10.702 10.538 10.349 10.151 9.987 9.802 9.618 9.427 9.235 9.103 8.953 8.724 8.556 8.384 8.299 8.119 7.935 7.737 7.625 7.451 7.282 7.176 7.049 6.716 6.535 6.35 6.142 5.893 5.641 5.327 4.606 -10 ,16588 ,KEBNE ,17018686,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:40:25 CET,0.0 0.769 1.068 1.251 1.425 1.587 1.734 1.882 2.155 2.287 2.412 2.568 2.723 2.82 3.012 3.184 3.348 3.432 3.591 3.744 3.959 4.089 4.215 4.403 4.599 4.784 4.965 5.139 5.362 5.581 5.779 6.015 6.235 6.446 6.716 7.022 7.309 7.637 7.986 8.346 8.722 9.149 9.642 10.147 10.699 11.236 11.813 12.462 13.178 13.922 14.659 15.002 15.04 14.917 14.704 14.47 14.143 13.784 13.488 13.218 12.975 12.7 12.395 12.09 11.804 11.541 11.265 11.012 10.798 10.584 10.35 10.147 9.965 9.784 9.625 9.449 9.252 9.034 8.817 8.678 8.536 8.307 8.148 7.984 7.898 7.718 7.53 7.337 7.228 7.062 6.88 6.732 6.602 6.329 6.147 5.956 5.746 5.528 5.286 4.987 4.336 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1h1s.txt deleted file mode 100644 index 5bea39b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28452 ,KEBNE ,17018687,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:42:27 CET,0.0 0.385 0.62 0.781 0.928 1.057 1.167 1.278 1.461 1.529 1.596 1.68 1.804 1.871 1.993 2.103 2.213 2.264 2.35 2.435 2.562 2.647 2.732 2.861 2.982 3.086 3.182 3.279 3.405 3.509 3.607 3.73 3.842 3.958 4.094 4.212 4.317 4.436 4.542 4.644 4.754 4.869 4.972 5.051 5.108 5.149 5.128 4.939 4.506 3.749 2.307 0.424 -1.187 -2.606 -3.867 -5.01 -5.984 -6.877 -7.656 -8.463 -9.145 -9.714 -10.236 -10.748 -11.257 -11.711 -12.165 -12.56 -12.891 -13.227 -13.59 -13.905 -14.219 -14.533 -14.777 -15.039 -15.322 -15.598 -15.877 -16.082 -16.297 -16.662 -16.911 -17.142 -17.269 -17.541 -17.807 -18.079 -18.226 -18.439 -18.709 -18.889 -19.073 -19.485 -19.709 -19.937 -20.198 -20.498 -20.839 -21.286 -22.372 -2 ,11177 ,KEBNE ,17018688,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:41:14 CET,0.0 0.213 0.371 0.497 0.603 0.708 0.822 0.923 1.097 1.173 1.245 1.32 1.433 1.487 1.596 1.701 1.805 1.858 1.953 2.043 2.182 2.271 2.349 2.455 2.566 2.67 2.755 2.833 2.928 3.023 3.121 3.222 3.32 3.434 3.561 3.685 3.791 3.906 4.016 4.13 4.254 4.353 4.421 4.429 4.383 4.374 4.374 4.176 3.689 2.836 1.338 -0.502 -2.063 -3.382 -4.489 -5.497 -6.376 -7.18 -7.876 -8.548 -9.119 -9.601 -10.062 -10.535 -11.004 -11.411 -11.781 -12.135 -12.494 -12.86 -13.202 -13.476 -13.772 -14.097 -14.347 -14.593 -14.856 -15.127 -15.389 -15.574 -15.773 -16.074 -16.281 -16.518 -16.649 -16.891 -17.123 -17.389 -17.521 -17.719 -17.94 -18.088 -18.257 -18.604 -18.812 -19.053 -19.3 -19.597 -19.939 -20.356 -22.717 -3 ,5445 ,KEBNE ,17018689,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:42:38 CET,0.0 0.196 0.361 0.482 0.587 0.699 0.818 0.929 1.136 1.229 1.307 1.397 1.524 1.596 1.72 1.828 1.924 1.966 2.054 2.148 2.275 2.344 2.419 2.536 2.649 2.751 2.845 2.945 3.061 3.163 3.268 3.396 3.516 3.621 3.735 3.866 3.995 4.126 4.23 4.341 4.468 4.587 4.729 4.839 4.915 4.977 4.961 4.877 4.78 4.464 3.433 1.853 0.469 -0.809 -1.924 -2.985 -3.945 -4.752 -5.461 -6.211 -6.815 -7.324 -7.801 -8.244 -8.657 -9.032 -9.442 -9.802 -10.108 -10.464 -10.847 -11.139 -11.444 -11.77 -12.023 -12.288 -12.579 -12.882 -13.194 -13.417 -13.629 -13.942 -14.181 -14.442 -14.569 -14.826 -15.101 -15.403 -15.558 -15.77 -16.011 -16.176 -16.345 -16.716 -16.917 -17.131 -17.358 -17.602 -17.885 -18.303 -19.535 -4 ,1186 ,KEBNE ,17018690,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:41:44 CET,0.0 0.351 0.529 0.678 0.826 0.963 1.079 1.185 1.369 1.439 1.501 1.569 1.693 1.763 1.885 1.993 2.098 2.147 2.234 2.317 2.448 2.54 2.629 2.74 2.835 2.931 3.033 3.122 3.221 3.321 3.423 3.539 3.644 3.744 3.865 4.01 4.14 4.259 4.37 4.479 4.577 4.668 4.766 4.865 4.939 4.976 4.985 4.895 4.701 4.27 3.157 1.618 0.328 -0.832 -1.85 -2.733 -3.548 -4.293 -4.895 -5.504 -6.058 -6.564 -7.026 -7.448 -7.848 -8.21 -8.574 -8.89 -9.17 -9.469 -9.784 -10.04 -10.296 -10.592 -10.845 -11.123 -11.429 -11.749 -12.085 -12.324 -12.564 -12.965 -13.266 -13.585 -13.748 -14.064 -14.393 -14.765 -14.972 -15.252 -15.642 -15.888 -16.137 -16.643 -16.926 -17.25 -17.579 -17.929 -18.381 -18.983 -20.9 -6 ,32608 ,KEBNE ,17018692,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:43:13 CET,0.0 0.237 0.386 0.514 0.623 0.706 0.791 0.882 1.045 1.118 1.194 1.273 1.392 1.46 1.581 1.693 1.801 1.854 1.957 2.039 2.154 2.235 2.317 2.436 2.541 2.642 2.738 2.828 2.946 3.062 3.166 3.289 3.401 3.49 3.596 3.717 3.825 3.946 4.069 4.178 4.267 4.376 4.497 4.604 4.71 4.782 4.802 4.752 4.567 4.013 2.91 1.433 0.118 -1.017 -2.016 -2.921 -3.725 -4.461 -5.119 -5.767 -6.331 -6.836 -7.293 -7.744 -8.169 -8.568 -8.973 -9.322 -9.637 -9.963 -10.304 -10.575 -10.858 -11.16 -11.388 -11.618 -11.851 -12.08 -12.324 -12.5 -12.677 -12.956 -13.17 -13.414 -13.54 -13.803 -14.076 -14.376 -14.541 -14.77 -15.063 -15.251 -15.457 -15.878 -16.09 -16.324 -16.662 -17.155 -17.727 -18.343 -19.441 -7 ,14949 ,KEBNE ,17018693,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:44:17 CET,0.0 0.319 0.463 0.6 0.71 0.807 0.904 0.996 1.137 1.211 1.294 1.412 1.548 1.622 1.753 1.877 2.0 2.053 2.146 2.247 2.384 2.465 2.554 2.674 2.796 2.916 3.022 3.123 3.241 3.348 3.45 3.576 3.696 3.818 3.96 4.125 4.282 4.418 4.544 4.662 4.786 4.933 5.084 5.228 5.416 5.573 5.601 5.523 5.259 4.643 3.439 1.764 0.23 -1.08 -2.209 -3.268 -4.212 -5.048 -5.788 -6.502 -7.111 -7.703 -8.257 -8.762 -9.23 -9.645 -10.082 -10.475 -10.842 -11.224 -11.599 -11.904 -12.211 -12.537 -12.8 -13.075 -13.354 -13.637 -13.927 -14.129 -14.339 -14.675 -14.919 -15.159 -15.274 -15.515 -15.764 -16.027 -16.163 -16.374 -16.62 -16.778 -16.964 -17.389 -17.626 -17.874 -18.134 -18.436 -18.785 -19.354 -21.113 -8 ,2735 ,KEBNE ,17018694,Wed Dec 22 00:23:49 CET,Wed Dec 22 02:42:47 CET,0.0 0.516 0.686 0.817 0.912 1.007 1.1 1.188 1.364 1.44 1.524 1.643 1.772 1.831 1.939 2.049 2.146 2.192 2.282 2.37 2.496 2.572 2.651 2.763 2.863 2.968 3.064 3.147 3.256 3.36 3.456 3.579 3.703 3.816 3.943 4.091 4.226 4.35 4.481 4.61 4.725 4.855 4.999 5.105 5.197 5.276 5.241 5.0 4.534 3.72 2.277 0.45 -1.109 -2.454 -3.67 -4.729 -5.63 -6.42 -7.079 -7.718 -8.273 -8.787 -9.279 -9.742 -10.164 -10.56 -10.966 -11.306 -11.603 -11.922 -12.247 -12.566 -12.927 -13.279 -13.526 -13.768 -14.024 -14.295 -14.637 -14.903 -15.17 -15.572 -15.845 -16.112 -16.248 -16.589 -16.993 -17.388 -17.586 -17.86 -18.213 -18.437 -18.645 -19.084 -19.323 -19.578 -19.854 -20.168 -20.532 -21.041 -23.463 -9 ,12189 ,KEBNE ,17018695,Wed Dec 22 00:23:49 CET,Wed Dec 22 02:41:24 CET,0.0 0.376 0.539 0.668 0.777 0.871 0.96 1.037 1.187 1.257 1.321 1.397 1.515 1.573 1.685 1.789 1.887 1.934 2.025 2.108 2.233 2.307 2.369 2.459 2.556 2.656 2.743 2.816 2.904 2.99 3.065 3.152 3.232 3.302 3.385 3.48 3.566 3.654 3.741 3.825 3.901 3.986 4.076 4.148 4.247 4.345 4.276 4.066 3.71 2.986 1.652 -0.123 -1.691 -3.026 -4.145 -5.14 -6.037 -6.852 -7.524 -8.188 -8.756 -9.223 -9.666 -10.097 -10.498 -10.891 -11.321 -11.68 -11.979 -12.314 -12.682 -12.989 -13.298 -13.608 -13.853 -14.124 -14.41 -14.701 -15.008 -15.216 -15.441 -15.805 -16.048 -16.291 -16.421 -16.703 -16.979 -17.249 -17.387 -17.594 -17.865 -18.059 -18.263 -18.68 -18.921 -19.202 -19.49 -19.788 -20.132 -20.65 -22.413 -10 ,1622 ,KEBNE ,17018696,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:41:37 CET,0.0 0.353 0.521 0.639 0.759 0.864 0.97 1.058 1.203 1.276 1.346 1.421 1.545 1.613 1.735 1.848 1.956 2.006 2.1 2.193 2.341 2.425 2.496 2.607 2.71 2.81 2.91 2.999 3.106 3.206 3.303 3.427 3.538 3.635 3.741 3.863 3.987 4.113 4.246 4.377 4.504 4.625 4.716 4.772 4.79 4.759 4.695 4.55 4.211 3.558 2.33 0.554 -1.062 -2.46 -3.65 -4.661 -5.555 -6.376 -7.041 -7.713 -8.284 -8.772 -9.239 -9.7 -10.15 -10.532 -10.918 -11.29 -11.642 -11.993 -12.34 -12.641 -12.938 -13.249 -13.484 -13.737 -14.006 -14.269 -14.546 -14.731 -14.918 -15.225 -15.446 -15.675 -15.8 -16.077 -16.368 -16.642 -16.769 -16.969 -17.187 -17.331 -17.476 -17.807 -17.999 -18.195 -18.398 -18.659 -18.992 -19.464 -21.02 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1oiu.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1oiu.txt deleted file mode 100644 index 8e42a4a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1oiu.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19740 ,TETRA ,17590585,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:01:28 CET,0.0 1.464 2.157 2.761 3.306 3.786 4.221 4.641 5.426 5.798 6.173 6.25 7.208 7.533 8.132 8.648 9.131 9.376 9.863 10.35 11.074 11.534 11.972 12.618 13.247 13.856 14.462 15.08 15.916 16.717 17.469 18.391 19.301 20.202 21.276 22.487 23.697 25.053 26.506 28.129 29.871 31.852 34.212 36.64 39.607 43.05 47.17 52.052 57.988 65.392 75.003 83.606 89.026 92.579 95.021 96.629 97.681 98.547 99.218 99.784 100.204 100.525 100.721 100.839 100.97 101.068 101.139 101.191 101.197 101.172 101.146 101.111 101.04 100.952 100.874 100.77 100.633 100.459 100.268 100.12 99.968 99.728 99.553 99.346 99.222 98.963 98.683 98.356 98.187 97.526 97.658 97.472 97.276 96.878 96.599 96.245 95.822 95.331 94.746 93.894 89.803 -2 ,630 ,TETRA ,17590586,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:18:35 CET,0.0 1.343 1.957 2.483 2.964 3.373 3.751 4.13 4.846 5.211 5.582 5.651 6.548 6.824 7.353 7.894 8.428 8.685 9.189 9.691 10.413 10.87 11.321 11.978 12.624 13.262 13.87 14.465 15.303 16.101 16.833 17.768 18.69 19.579 20.611 21.784 22.933 24.227 25.684 27.331 29.071 30.983 33.267 35.671 38.548 41.858 45.819 50.458 56.247 63.7 73.24 81.591 86.926 90.463 92.978 94.843 96.17 97.185 97.91 98.474 98.86 99.122 99.321 99.5 99.64 99.737 99.82 99.833 99.801 99.776 99.761 99.747 99.706 99.631 99.569 99.497 99.377 99.205 99.03 98.946 98.851 98.67 98.543 98.401 98.327 98.126 97.896 97.681 97.538 96.897 97.085 96.908 96.699 96.144 95.785 95.384 94.958 94.508 93.886 92.925 88.283 -3 ,16995 ,TETRA ,17590587,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:13:28 CET,0.0 1.169 1.817 2.313 2.74 3.136 3.502 3.854 4.523 4.819 5.104 5.083 5.954 6.239 6.777 7.286 7.778 8.019 8.512 9.008 9.709 10.149 10.577 11.216 11.856 12.486 13.104 13.712 14.514 15.305 16.061 16.977 17.9 18.807 19.855 21.059 22.243 23.587 25.092 26.716 28.484 30.551 33.02 35.545 38.549 42.037 46.175 51.047 57.194 64.514 73.242 80.766 85.531 88.669 90.82 92.394 93.525 94.375 94.97 95.505 95.882 96.139 96.293 96.354 96.33 96.307 96.314 96.308 96.269 96.163 96.048 95.983 95.894 95.771 95.668 95.524 95.357 95.182 94.998 94.868 94.731 94.507 94.321 94.112 94.014 93.818 93.568 93.256 93.095 92.433 92.556 92.364 92.157 91.669 91.406 91.127 90.773 90.323 89.71 88.829 86.125 -4 ,16346 ,TETRA ,17590588,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:15:57 CET,0.0 1.891 2.528 3.076 3.544 3.974 4.363 4.715 5.391 5.714 6.009 5.971 6.83 7.101 7.646 8.169 8.667 8.928 9.438 9.91 10.621 11.088 11.543 12.197 12.81 13.402 14.002 14.619 15.436 16.205 16.938 17.84 18.71 19.566 20.604 21.797 22.984 24.36 25.884 27.569 29.364 31.373 33.801 36.252 39.074 42.343 46.268 50.926 56.868 64.263 73.679 82.018 87.187 90.826 93.372 95.268 96.702 97.75 98.499 99.149 99.626 99.978 100.248 100.478 100.659 100.768 100.885 100.969 100.994 101.005 101.0 100.968 100.923 100.867 100.791 100.685 100.586 100.473 100.357 100.286 100.2 100.032 99.888 99.727 99.634 99.435 99.231 98.979 98.846 98.241 98.454 98.29 98.119 97.686 97.416 97.123 96.82 96.471 95.96 95.114 91.908 -5 ,8679 ,TETRA ,17590589,Sat Nov 27 21:13:43 CET,Sun Nov 28 00:17:34 CET,0.0 1.77 2.418 2.907 3.368 3.786 4.168 4.526 5.189 5.499 5.803 5.812 6.687 6.963 7.464 7.939 8.42 8.669 9.17 9.643 10.306 10.737 11.176 11.826 12.46 13.078 13.681 14.284 15.079 15.855 16.61 17.527 18.405 19.265 20.292 21.521 22.745 24.065 25.526 27.142 28.863 30.895 33.309 35.664 38.527 41.915 45.933 50.591 56.245 63.349 72.544 80.665 85.804 89.244 91.592 93.298 94.544 95.513 96.251 96.864 97.298 97.596 97.833 98.016 98.142 98.256 98.358 98.42 98.437 98.42 98.371 98.292 98.173 98.039 97.93 97.807 97.665 97.527 97.388 97.272 97.126 96.878 96.706 96.535 96.441 96.233 96.02 95.769 95.637 95.022 95.226 95.063 94.883 94.438 94.166 93.885 93.554 93.127 92.569 91.731 87.652 -6 ,5720 ,TETRA ,17590590,Sat Nov 27 21:13:45 CET,Sun Nov 28 00:16:03 CET,0.0 1.465 2.037 2.511 2.972 3.385 3.751 4.092 4.79 5.126 5.445 5.461 6.337 6.634 7.199 7.723 8.226 8.475 8.966 9.441 10.136 10.582 11.014 11.652 12.284 12.911 13.528 14.134 14.927 15.704 16.477 17.444 18.389 19.304 20.366 21.607 22.834 24.208 25.736 27.366 29.097 31.065 33.424 35.932 38.923 42.302 46.354 51.111 56.9 64.205 73.898 82.595 87.879 91.515 94.122 96.061 97.491 98.523 99.29 99.934 100.363 100.688 100.936 101.089 101.205 101.284 101.355 101.409 101.382 101.306 101.242 101.183 101.107 101.013 100.914 100.817 100.733 100.609 100.453 100.342 100.212 99.997 99.85 99.674 99.574 99.378 99.162 98.878 98.712 98.056 98.213 98.033 97.834 97.396 97.13 96.819 96.461 96.021 95.486 94.741 91.558 -7 ,19604 ,TETRA ,17590592,Sat Nov 27 21:13:43 CET,Sun Nov 28 00:15:44 CET,0.0 1.739 2.369 2.902 3.372 3.785 4.19 4.575 5.25 5.568 5.898 5.937 6.834 7.132 7.685 8.22 8.735 8.98 9.478 9.966 10.684 11.178 11.658 12.333 12.964 13.574 14.179 14.767 15.53 16.279 17.017 17.917 18.824 19.731 20.781 21.951 23.095 24.39 25.819 27.405 29.146 31.12 33.498 36.031 39.058 42.467 46.516 51.218 56.948 64.194 73.66 81.976 87.061 90.531 93.076 94.964 96.274 97.244 97.961 98.613 99.086 99.422 99.663 99.831 99.963 100.043 100.1 100.083 100.064 100.071 100.026 99.934 99.804 99.677 99.57 99.432 99.276 99.1 98.918 98.791 98.644 98.381 98.178 97.966 97.86 97.654 97.383 97.014 96.821 96.142 96.236 96.049 95.852 95.409 95.139 94.809 94.437 94.004 93.427 92.569 89.422 -8 ,5716 ,TETRA ,17590593,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:15:49 CET,0.0 1.022 1.589 2.05 2.457 2.813 3.157 3.489 4.133 4.451 4.761 4.75 5.62 5.886 6.4 6.897 7.374 7.615 8.099 8.565 9.246 9.697 10.135 10.774 11.401 12.019 12.619 13.218 14.029 14.813 15.56 16.493 17.409 18.308 19.351 20.521 21.691 22.984 24.442 26.082 27.87 29.924 32.403 35.003 38.083 41.603 45.819 50.807 56.79 63.809 72.824 81.087 86.296 89.76 92.127 93.969 95.366 96.41 97.18 97.817 98.254 98.61 98.873 99.031 99.173 99.278 99.36 99.429 99.472 99.481 99.425 99.342 99.265 99.207 99.153 99.07 98.969 98.83 98.649 98.534 98.437 98.253 98.1 97.916 97.814 97.623 97.416 97.18 97.047 96.425 96.602 96.413 96.219 95.746 95.473 95.177 94.835 94.443 93.909 93.033 89.653 -9 ,1966 ,TETRA ,17590594,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:23:27 CET,0.0 1.016 1.61 2.116 2.545 2.939 3.287 3.636 4.298 4.596 4.892 4.883 5.749 6.017 6.535 7.042 7.54 7.791 8.295 8.79 9.496 9.946 10.398 11.069 11.711 12.324 12.932 13.552 14.359 15.143 15.919 16.868 17.817 18.761 19.848 21.104 22.317 23.648 25.185 26.884 28.713 30.789 33.184 35.648 38.641 42.048 46.019 50.641 56.133 62.925 71.576 78.837 83.287 86.267 88.341 89.884 90.988 91.845 92.446 92.935 93.3 93.552 93.746 93.859 93.876 93.855 93.825 93.796 93.757 93.703 93.639 93.561 93.445 93.282 93.156 93.038 92.925 92.795 92.549 92.339 92.121 91.75 91.493 91.221 91.071 90.758 90.446 90.1 89.893 89.14 89.256 89.024 88.756 88.172 87.83 87.424 87.0 86.505 85.845 84.897 81.802 -10 ,7160 ,TETRA ,17590595,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:13:57 CET,0.0 1.939 2.556 3.062 3.509 3.927 4.297 4.659 5.35 5.656 5.951 5.943 6.806 7.074 7.618 8.143 8.647 8.89 9.366 9.837 10.533 10.984 11.425 12.11 12.793 13.439 14.053 14.645 15.443 16.245 17.027 18.001 18.973 19.942 21.087 22.357 23.588 24.979 26.497 28.163 29.967 32.043 34.581 37.155 40.145 43.558 47.63 52.409 58.346 65.707 74.751 82.666 87.653 91.008 93.297 94.977 96.242 97.173 97.832 98.36 98.69 98.934 99.125 99.24 99.279 99.281 99.246 99.181 99.122 99.03 98.889 98.788 98.68 98.504 98.373 98.266 98.11 97.931 97.747 97.601 97.467 97.245 97.06 96.857 96.74 96.451 96.141 95.856 95.706 95.05 95.138 94.906 94.674 94.094 93.718 93.31 92.886 92.389 91.776 90.917 85.376 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_32_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_32_30.txt deleted file mode 100644 index 733a0531..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/protein/Summary_FEP_32_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21563 ,KEBNE ,17018697,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:42:03 CET,0.0 0.601 0.829 0.992 1.133 1.271 1.384 1.495 1.699 1.788 1.866 1.96 2.094 2.167 2.303 2.427 2.554 2.617 2.743 2.866 3.037 3.146 3.25 3.406 3.549 3.673 3.788 3.891 4.013 4.135 4.269 4.447 4.606 4.739 4.872 5.011 5.127 5.254 5.381 5.509 5.651 5.789 5.944 6.085 6.214 6.35 6.459 6.45 6.337 6.091 5.491 4.547 3.638 2.756 1.898 1.141 0.463 -0.169 -0.689 -1.215 -1.686 -2.09 -2.483 -2.88 -3.253 -3.585 -3.945 -4.3 -4.583 -4.854 -5.143 -5.38 -5.635 -5.897 -6.086 -6.292 -6.536 -6.785 -7.036 -7.211 -7.391 -7.679 -7.874 -8.072 -8.18 -8.417 -8.668 -8.906 -9.017 -9.204 -9.418 -9.558 -9.718 -10.096 -10.302 -10.521 -10.8 -11.154 -11.585 -12.157 -14.122 -2 ,28941 ,KEBNE ,17018698,Wed Dec 22 00:23:49 CET,Wed Dec 22 02:41:57 CET,0.0 0.645 0.912 1.123 1.3 1.461 1.591 1.694 1.915 2.034 2.143 2.278 2.411 2.479 2.602 2.72 2.827 2.875 2.996 3.129 3.291 3.393 3.49 3.631 3.774 3.921 4.061 4.18 4.321 4.446 4.584 4.739 4.869 4.985 5.102 5.239 5.365 5.497 5.629 5.762 5.933 6.106 6.304 6.466 6.545 6.598 6.603 6.543 6.414 6.014 5.068 3.746 2.428 1.306 0.346 -0.521 -1.292 -1.986 -2.622 -3.281 -3.842 -4.365 -4.842 -5.252 -5.638 -6.018 -6.445 -6.828 -7.135 -7.457 -7.795 -8.058 -8.346 -8.65 -8.874 -9.091 -9.317 -9.574 -9.843 -10.027 -10.225 -10.544 -10.767 -11.0 -11.121 -11.377 -11.628 -11.881 -12.035 -12.264 -12.508 -12.668 -12.845 -13.199 -13.392 -13.614 -13.857 -14.158 -14.522 -14.985 -16.614 -3 ,32072 ,KEBNE ,17018699,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:42:31 CET,0.0 0.752 1.069 1.312 1.521 1.701 1.862 2.005 2.264 2.385 2.493 2.642 2.796 2.884 3.044 3.19 3.34 3.41 3.548 3.686 3.884 4.016 4.146 4.34 4.519 4.681 4.824 4.955 5.126 5.299 5.47 5.675 5.865 6.035 6.208 6.38 6.54 6.705 6.865 7.023 7.159 7.298 7.408 7.498 7.594 7.68 7.727 7.631 7.407 6.952 5.892 4.478 3.237 2.06 1.043 0.143 -0.612 -1.31 -1.983 -2.641 -3.174 -3.652 -4.101 -4.53 -4.928 -5.282 -5.671 -6.025 -6.321 -6.626 -6.933 -7.198 -7.495 -7.8 -8.04 -8.279 -8.514 -8.762 -9.011 -9.198 -9.4 -9.713 -9.932 -10.142 -10.254 -10.492 -10.731 -10.986 -11.12 -11.328 -11.605 -11.772 -11.934 -12.291 -12.482 -12.679 -12.899 -13.128 -13.396 -13.858 -15.499 -4 ,8528 ,KEBNE ,17018700,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:43:20 CET,0.0 0.499 0.746 0.938 1.105 1.261 1.414 1.559 1.812 1.922 2.003 2.093 2.225 2.31 2.473 2.629 2.779 2.845 2.97 3.087 3.261 3.389 3.503 3.649 3.788 3.926 4.054 4.174 4.328 4.48 4.608 4.734 4.876 5.013 5.153 5.306 5.431 5.571 5.716 5.839 5.954 6.081 6.249 6.415 6.556 6.674 6.782 6.811 6.6 6.076 5.058 3.633 2.375 1.292 0.35 -0.485 -1.247 -2.025 -2.674 -3.278 -3.847 -4.363 -4.826 -5.26 -5.661 -6.016 -6.386 -6.712 -7.006 -7.321 -7.649 -7.922 -8.224 -8.525 -8.74 -8.979 -9.237 -9.498 -9.775 -9.982 -10.212 -10.554 -10.783 -11.04 -11.172 -11.429 -11.688 -11.957 -12.099 -12.321 -12.597 -12.775 -12.962 -13.389 -13.661 -13.94 -14.195 -14.434 -14.697 -15.065 -16.828 -5 ,31963 ,KEBNE ,17018701,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:44:35 CET,0.0 1.337 1.688 1.936 2.145 2.317 2.466 2.605 2.868 2.988 3.095 3.262 3.417 3.502 3.667 3.817 3.954 4.025 4.158 4.276 4.459 4.572 4.671 4.803 4.932 5.067 5.188 5.295 5.432 5.546 5.653 5.801 5.943 6.074 6.223 6.394 6.549 6.706 6.852 6.984 7.119 7.28 7.468 7.617 7.729 7.824 7.882 7.873 7.803 7.469 6.535 5.246 4.104 3.098 2.242 1.461 0.774 0.127 -0.463 -1.033 -1.515 -1.938 -2.328 -2.7 -3.057 -3.402 -3.782 -4.104 -4.371 -4.671 -5.004 -5.288 -5.566 -5.831 -6.05 -6.286 -6.526 -6.774 -7.035 -7.199 -7.355 -7.628 -7.818 -8.032 -8.148 -8.369 -8.577 -8.78 -8.897 -9.081 -9.264 -9.398 -9.542 -9.866 -10.046 -10.244 -10.473 -10.696 -10.961 -11.334 -13.28 -6 ,8519 ,KEBNE ,17018702,Wed Dec 22 00:23:49 CET,Wed Dec 22 02:42:35 CET,0.0 0.956 1.263 1.477 1.656 1.806 1.953 2.102 2.366 2.492 2.604 2.719 2.849 2.923 3.061 3.189 3.308 3.364 3.477 3.586 3.75 3.869 3.987 4.159 4.316 4.464 4.609 4.753 4.932 5.097 5.243 5.383 5.51 5.648 5.795 5.923 6.046 6.179 6.327 6.488 6.632 6.767 6.916 7.071 7.225 7.369 7.484 7.496 7.43 7.187 6.323 4.889 3.655 2.563 1.568 0.666 -0.156 -0.9 -1.509 -2.104 -2.631 -3.109 -3.588 -4.048 -4.453 -4.81 -5.194 -5.542 -5.812 -6.088 -6.372 -6.6 -6.85 -7.126 -7.356 -7.586 -7.802 -8.033 -8.28 -8.445 -8.62 -8.924 -9.137 -9.356 -9.471 -9.7 -9.952 -10.228 -10.377 -10.589 -10.805 -10.96 -11.134 -11.54 -11.776 -12.056 -12.345 -12.638 -12.978 -13.387 -14.718 -7 ,18017 ,KEBNE ,17018703,Wed Dec 22 00:23:49 CET,Wed Dec 22 02:41:19 CET,0.0 0.357 0.617 0.877 1.075 1.223 1.333 1.457 1.704 1.805 1.9 1.99 2.108 2.191 2.351 2.492 2.631 2.693 2.804 2.899 3.059 3.181 3.288 3.433 3.573 3.701 3.816 3.927 4.078 4.221 4.357 4.518 4.67 4.82 4.986 5.138 5.297 5.477 5.63 5.761 5.863 5.961 6.061 6.146 6.235 6.292 6.294 6.207 6.0 5.51 4.537 3.203 2.019 0.965 0.052 -0.775 -1.557 -2.314 -2.98 -3.625 -4.155 -4.625 -5.074 -5.474 -5.847 -6.224 -6.637 -7.004 -7.328 -7.646 -7.946 -8.198 -8.449 -8.704 -8.922 -9.174 -9.443 -9.715 -9.989 -10.165 -10.33 -10.625 -10.875 -11.129 -11.256 -11.528 -11.822 -12.141 -12.301 -12.528 -12.822 -13.002 -13.174 -13.481 -13.645 -13.852 -14.18 -14.647 -15.147 -15.676 -17.328 -8 ,21210 ,KEBNE ,17018704,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:43:45 CET,0.0 0.971 1.349 1.63 1.859 2.004 2.139 2.278 2.533 2.638 2.724 2.819 2.933 2.993 3.124 3.286 3.46 3.536 3.688 3.831 4.005 4.101 4.201 4.346 4.469 4.59 4.712 4.83 4.987 5.137 5.283 5.44 5.584 5.724 5.863 6.03 6.201 6.359 6.528 6.714 6.904 7.095 7.28 7.452 7.616 7.754 7.827 7.776 7.593 7.139 6.101 4.729 3.42 2.196 1.11 0.175 -0.572 -1.257 -1.891 -2.509 -3.06 -3.587 -4.05 -4.494 -4.929 -5.316 -5.731 -6.104 -6.425 -6.765 -7.12 -7.405 -7.697 -8.037 -8.322 -8.589 -8.846 -9.137 -9.445 -9.643 -9.849 -10.182 -10.434 -10.683 -10.806 -11.055 -11.315 -11.606 -11.747 -11.944 -12.182 -12.34 -12.495 -12.816 -13.001 -13.206 -13.429 -13.685 -13.977 -14.361 -16.001 -9 ,25585 ,KEBNE ,17018705,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:42:10 CET,0.0 0.391 0.592 0.755 0.903 1.044 1.181 1.3 1.481 1.572 1.658 1.774 1.917 2.0 2.164 2.308 2.44 2.51 2.657 2.787 2.961 3.077 3.192 3.37 3.539 3.675 3.783 3.886 4.028 4.163 4.305 4.492 4.648 4.766 4.901 5.053 5.197 5.342 5.482 5.654 5.854 6.064 6.261 6.397 6.493 6.583 6.679 6.679 6.56 6.242 5.403 4.043 2.73 1.575 0.586 -0.312 -1.119 -1.839 -2.476 -3.118 -3.659 -4.141 -4.612 -5.073 -5.49 -5.852 -6.218 -6.54 -6.825 -7.117 -7.414 -7.666 -7.928 -8.2 -8.409 -8.627 -8.867 -9.122 -9.38 -9.542 -9.709 -9.976 -10.174 -10.399 -10.515 -10.756 -11.011 -11.273 -11.413 -11.627 -11.862 -12.018 -12.175 -12.523 -12.738 -12.965 -13.175 -13.378 -13.652 -14.018 -14.965 -10 ,13735 ,KEBNE ,17018706,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 02:41:17 CET,0.0 0.478 0.716 0.907 1.049 1.159 1.265 1.375 1.615 1.729 1.83 1.947 2.071 2.139 2.259 2.37 2.48 2.532 2.638 2.749 2.901 3.007 3.123 3.268 3.393 3.527 3.65 3.76 3.895 4.015 4.117 4.239 4.364 4.481 4.602 4.713 4.817 4.971 5.151 5.332 5.496 5.642 5.835 5.986 6.054 6.123 6.125 6.023 5.848 5.421 4.375 3.04 1.804 0.516 -0.619 -1.54 -2.36 -3.13 -3.777 -4.403 -4.931 -5.401 -5.884 -6.35 -6.754 -7.131 -7.53 -7.891 -8.217 -8.542 -8.876 -9.157 -9.45 -9.738 -9.967 -10.219 -10.464 -10.703 -10.95 -11.132 -11.335 -11.628 -11.811 -12.01 -12.114 -12.341 -12.584 -12.853 -13.002 -13.207 -13.493 -13.68 -13.852 -14.201 -14.381 -14.596 -14.838 -15.126 -15.435 -15.835 -16.906 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_17_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_17_1h1q.txt deleted file mode 100644 index f91b6952..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_17_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1593 ,KEBNE ,17018707,Wed Dec 22 00:23:48 CET,Wed Dec 22 01:51:02 CET,0.0 0.568 0.83 1.051 1.225 1.371 1.492 1.607 1.818 1.912 2.001 2.134 2.233 2.312 2.45 2.571 2.693 2.747 2.858 2.975 3.141 3.243 3.347 3.493 3.62 3.748 3.867 3.987 4.153 4.303 4.436 4.597 4.747 4.891 5.057 5.237 5.404 5.576 5.767 5.975 6.186 6.414 6.674 6.924 7.196 7.498 7.84 8.221 8.624 8.984 9.263 9.316 9.168 8.934 8.702 8.434 8.173 7.951 7.742 7.519 7.319 7.126 6.937 6.745 6.545 6.36 6.184 6.019 5.881 5.746 5.598 5.481 5.357 5.22 5.101 4.968 4.837 4.713 4.584 4.488 4.387 4.219 4.084 3.949 3.883 3.737 3.585 3.434 3.351 3.237 3.089 2.994 2.888 2.665 2.529 2.353 2.143 1.908 1.623 1.217 -0.111 -2 ,30083 ,KEBNE ,17018708,Wed Dec 22 00:24:50 CET,Wed Dec 22 01:54:04 CET,0.0 0.377 0.612 0.8 0.984 1.159 1.306 1.429 1.66 1.771 1.876 2.031 2.13 2.198 2.331 2.461 2.584 2.639 2.754 2.884 3.073 3.189 3.288 3.418 3.542 3.658 3.775 3.887 4.015 4.133 4.259 4.419 4.571 4.71 4.871 5.055 5.229 5.406 5.59 5.794 5.993 6.206 6.471 6.722 6.994 7.306 7.655 8.014 8.349 8.695 9.032 9.084 8.946 8.746 8.494 8.215 7.972 7.725 7.469 7.189 6.952 6.747 6.54 6.343 6.156 5.982 5.788 5.614 5.467 5.306 5.147 5.005 4.848 4.683 4.564 4.448 4.306 4.138 3.97 3.864 3.75 3.567 3.45 3.332 3.258 3.104 2.957 2.784 2.684 2.55 2.33 2.212 2.094 1.824 1.677 1.503 1.289 1.062 0.816 0.457 -0.4 -3 ,24938 ,KEBNE ,17018709,Wed Dec 22 00:24:50 CET,Wed Dec 22 01:52:04 CET,0.0 0.389 0.622 0.808 0.982 1.142 1.291 1.403 1.56 1.638 1.71 1.814 1.902 1.958 2.066 2.177 2.288 2.345 2.445 2.529 2.659 2.75 2.844 2.977 3.096 3.199 3.298 3.404 3.532 3.654 3.777 3.922 4.057 4.188 4.346 4.521 4.684 4.848 5.034 5.257 5.476 5.723 6.001 6.273 6.586 6.899 7.244 7.612 8.004 8.38 8.679 8.688 8.539 8.353 8.144 7.902 7.651 7.413 7.171 6.894 6.659 6.442 6.225 6.013 5.819 5.648 5.461 5.284 5.122 4.961 4.797 4.651 4.503 4.35 4.226 4.095 3.949 3.797 3.648 3.545 3.435 3.262 3.141 3.001 2.923 2.759 2.589 2.409 2.314 2.188 1.986 1.86 1.733 1.477 1.333 1.173 1.005 0.797 0.56 0.275 -0.713 -4 ,23297 ,KEBNE ,17018710,Wed Dec 22 00:24:50 CET,Wed Dec 22 01:52:08 CET,0.0 0.3 0.519 0.72 0.893 1.044 1.167 1.264 1.446 1.527 1.605 1.722 1.807 1.878 2.048 2.204 2.343 2.407 2.508 2.604 2.759 2.858 2.944 3.056 3.172 3.284 3.385 3.485 3.629 3.766 3.891 4.04 4.175 4.304 4.452 4.618 4.782 4.955 5.145 5.346 5.541 5.771 6.042 6.3 6.592 6.906 7.253 7.593 7.942 8.345 8.713 8.744 8.613 8.423 8.188 7.916 7.64 7.386 7.171 6.947 6.739 6.552 6.362 6.182 6.009 5.841 5.65 5.473 5.337 5.189 5.029 4.903 4.763 4.623 4.513 4.39 4.264 4.135 3.989 3.885 3.784 3.613 3.489 3.378 3.317 3.182 3.039 2.872 2.781 2.658 2.451 2.329 2.199 1.897 1.717 1.535 1.346 1.112 0.825 0.427 -0.647 -5 ,9567 ,KEBNE ,17018711,Wed Dec 22 00:24:50 CET,Wed Dec 22 01:54:11 CET,0.0 0.535 0.764 0.967 1.142 1.299 1.454 1.58 1.758 1.837 1.912 2.047 2.143 2.206 2.318 2.434 2.548 2.599 2.708 2.81 2.947 3.029 3.108 3.229 3.349 3.461 3.583 3.701 3.826 3.947 4.072 4.22 4.358 4.492 4.638 4.8 4.961 5.147 5.343 5.536 5.739 5.968 6.228 6.49 6.802 7.125 7.462 7.819 8.201 8.571 8.868 8.86 8.674 8.442 8.187 7.919 7.66 7.414 7.172 6.914 6.709 6.528 6.352 6.177 6.007 5.852 5.685 5.53 5.393 5.242 5.074 4.935 4.797 4.652 4.539 4.429 4.3 4.151 4.015 3.912 3.785 3.594 3.472 3.341 3.273 3.134 2.994 2.855 2.777 2.669 2.515 2.414 2.3 2.063 1.924 1.752 1.579 1.386 1.159 0.889 -0.436 -6 ,14016 ,KEBNE ,17018712,Wed Dec 22 00:24:50 CET,Wed Dec 22 01:52:08 CET,0.0 0.403 0.622 0.794 0.951 1.101 1.215 1.301 1.473 1.551 1.619 1.726 1.811 1.867 1.983 2.102 2.236 2.311 2.453 2.578 2.754 2.867 2.97 3.107 3.227 3.338 3.451 3.562 3.701 3.855 4.013 4.18 4.318 4.443 4.599 4.785 4.955 5.129 5.315 5.508 5.709 5.924 6.18 6.434 6.702 6.998 7.339 7.686 8.032 8.36 8.591 8.568 8.418 8.227 7.976 7.716 7.485 7.266 7.05 6.812 6.605 6.429 6.275 6.116 5.952 5.781 5.606 5.445 5.298 5.153 4.988 4.846 4.711 4.559 4.445 4.333 4.207 4.068 3.929 3.834 3.735 3.584 3.471 3.351 3.285 3.151 3.021 2.863 2.776 2.66 2.466 2.349 2.229 1.994 1.866 1.704 1.528 1.357 1.14 0.847 -0.173 -7 ,3516 ,KEBNE ,17018713,Wed Dec 22 00:24:50 CET,Wed Dec 22 01:54:12 CET,0.0 0.637 0.919 1.119 1.306 1.466 1.598 1.718 1.926 2.02 2.108 2.259 2.369 2.441 2.576 2.708 2.834 2.894 3.006 3.111 3.263 3.366 3.462 3.589 3.703 3.807 3.907 4.008 4.135 4.255 4.37 4.506 4.643 4.778 4.932 5.104 5.272 5.446 5.626 5.824 6.032 6.263 6.529 6.775 7.051 7.345 7.655 7.987 8.352 8.708 8.965 8.987 8.878 8.663 8.396 8.12 7.852 7.618 7.405 7.155 6.933 6.748 6.569 6.397 6.225 6.074 5.909 5.741 5.599 5.446 5.296 5.179 5.051 4.92 4.816 4.695 4.57 4.438 4.297 4.195 4.082 3.893 3.759 3.624 3.548 3.383 3.22 3.042 2.936 2.808 2.609 2.489 2.358 2.072 1.942 1.8 1.59 1.353 1.109 0.755 -0.338 -8 ,14685 ,KEBNE ,17018714,Wed Dec 22 00:24:50 CET,Wed Dec 22 01:53:47 CET,0.0 0.5 0.736 0.941 1.131 1.304 1.442 1.57 1.796 1.897 1.998 2.144 2.244 2.317 2.451 2.569 2.689 2.747 2.862 2.979 3.16 3.268 3.372 3.523 3.662 3.798 3.915 4.026 4.166 4.301 4.439 4.596 4.741 4.881 5.034 5.201 5.36 5.542 5.739 5.939 6.144 6.367 6.624 6.88 7.165 7.473 7.82 8.169 8.512 8.853 9.133 9.179 9.035 8.828 8.574 8.302 8.065 7.834 7.616 7.39 7.185 6.981 6.772 6.579 6.412 6.261 6.081 5.91 5.767 5.612 5.444 5.302 5.158 5.019 4.906 4.771 4.615 4.452 4.302 4.198 4.079 3.885 3.749 3.612 3.542 3.396 3.233 3.069 2.989 2.874 2.708 2.611 2.51 2.288 2.134 1.953 1.784 1.57 1.253 0.819 -0.361 -9 ,31461 ,KEBNE ,17018715,Wed Dec 22 00:24:54 CET,Wed Dec 22 01:45:02 CET,0.0 0.521 0.752 0.91 1.067 1.226 1.365 1.487 1.693 1.788 1.871 1.985 2.082 2.157 2.297 2.429 2.563 2.623 2.734 2.847 3.006 3.103 3.201 3.349 3.484 3.61 3.733 3.851 3.994 4.129 4.269 4.432 4.584 4.724 4.888 5.069 5.227 5.396 5.575 5.762 5.966 6.202 6.465 6.731 7.041 7.355 7.696 8.048 8.405 8.761 9.042 9.08 8.895 8.636 8.405 8.183 7.96 7.716 7.496 7.265 7.067 6.882 6.687 6.498 6.316 6.143 5.968 5.8 5.636 5.464 5.295 5.151 5.002 4.849 4.72 4.585 4.452 4.297 4.123 4.007 3.881 3.67 3.529 3.386 3.313 3.168 3.02 2.864 2.78 2.66 2.452 2.326 2.208 1.965 1.841 1.671 1.469 1.274 0.997 0.567 -0.628 -10 ,26124 ,KEBNE ,17018716,Wed Dec 22 00:24:50 CET,Wed Dec 22 01:51:58 CET,0.0 0.451 0.71 0.899 1.053 1.183 1.283 1.384 1.563 1.639 1.709 1.817 1.912 1.97 2.087 2.223 2.355 2.414 2.528 2.639 2.786 2.878 2.971 3.104 3.24 3.381 3.509 3.629 3.787 3.932 4.058 4.21 4.366 4.517 4.687 4.868 5.039 5.224 5.42 5.632 5.85 6.097 6.371 6.614 6.897 7.204 7.52 7.874 8.262 8.64 8.941 8.959 8.786 8.57 8.353 8.118 7.873 7.634 7.402 7.142 6.915 6.7 6.489 6.285 6.094 5.924 5.743 5.573 5.42 5.267 5.095 4.94 4.782 4.627 4.503 4.367 4.22 4.069 3.926 3.829 3.716 3.535 3.407 3.259 3.181 3.014 2.843 2.677 2.595 2.48 2.291 2.172 2.05 1.761 1.601 1.433 1.251 1.049 0.776 0.393 -0.602 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_17.txt deleted file mode 100644 index 6d53749f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29532 ,KEBNE ,17018717,Wed Dec 22 00:24:50 CET,Wed Dec 22 01:52:02 CET,0.0 0.611 0.911 1.133 1.331 1.491 1.62 1.762 2.024 2.13 2.225 2.388 2.496 2.573 2.723 2.854 2.976 3.033 3.142 3.255 3.403 3.483 3.565 3.686 3.8 3.908 4.013 4.115 4.239 4.362 4.482 4.623 4.759 4.889 5.028 5.177 5.314 5.464 5.631 5.785 5.933 6.116 6.325 6.525 6.748 6.972 7.199 7.428 7.671 7.869 7.939 7.778 7.501 7.179 6.852 6.551 6.291 6.048 5.823 5.58 5.366 5.175 4.983 4.798 4.629 4.469 4.295 4.142 4.007 3.871 3.729 3.609 3.481 3.341 3.239 3.134 3.014 2.897 2.781 2.694 2.606 2.466 2.362 2.262 2.218 2.121 2.009 1.891 1.828 1.739 1.625 1.55 1.469 1.283 1.179 1.074 0.972 0.865 0.738 0.574 0.005 -2 ,13054 ,KEBNE ,17018718,Wed Dec 22 00:24:54 CET,Wed Dec 22 01:47:10 CET,0.0 0.77 1.028 1.241 1.385 1.497 1.611 1.728 1.95 2.04 2.121 2.247 2.333 2.393 2.519 2.64 2.756 2.813 2.92 3.021 3.17 3.257 3.338 3.453 3.562 3.677 3.784 3.885 4.03 4.161 4.272 4.41 4.548 4.672 4.814 4.977 5.131 5.295 5.461 5.636 5.817 6.019 6.235 6.443 6.68 6.911 7.158 7.398 7.609 7.745 7.732 7.536 7.227 6.866 6.529 6.216 5.938 5.675 5.436 5.201 5.007 4.821 4.631 4.448 4.275 4.114 3.938 3.785 3.655 3.515 3.375 3.256 3.125 2.987 2.876 2.758 2.641 2.518 2.387 2.299 2.215 2.083 1.988 1.887 1.834 1.717 1.578 1.419 1.339 1.238 1.096 1.009 0.917 0.698 0.563 0.404 0.253 0.094 -0.084 -0.35 -1.037 -3 ,31607 ,KEBNE ,17018719,Wed Dec 22 00:24:54 CET,Wed Dec 22 01:49:00 CET,0.0 0.777 1.099 1.331 1.53 1.705 1.835 1.94 2.131 2.225 2.307 2.438 2.533 2.591 2.712 2.835 2.947 3.009 3.119 3.207 3.341 3.426 3.512 3.644 3.764 3.876 3.992 4.099 4.226 4.341 4.45 4.606 4.761 4.892 5.032 5.185 5.327 5.476 5.639 5.803 5.98 6.174 6.394 6.603 6.838 7.099 7.37 7.642 7.883 8.066 8.117 7.9 7.585 7.267 6.945 6.633 6.354 6.089 5.851 5.609 5.403 5.213 5.025 4.85 4.678 4.511 4.333 4.167 4.02 3.869 3.699 3.564 3.429 3.293 3.198 3.095 2.985 2.87 2.734 2.639 2.541 2.375 2.263 2.153 2.096 1.97 1.834 1.685 1.605 1.502 1.373 1.28 1.178 0.964 0.838 0.689 0.546 0.385 0.152 -0.171 -0.753 -4 ,14608 ,KEBNE ,17018720,Wed Dec 22 00:25:53 CET,Wed Dec 22 01:53:16 CET,0.0 0.833 1.128 1.357 1.54 1.693 1.828 1.937 2.133 2.237 2.337 2.486 2.594 2.674 2.823 2.964 3.081 3.137 3.245 3.338 3.465 3.548 3.632 3.76 3.88 3.993 4.111 4.219 4.348 4.477 4.602 4.744 4.875 5.0 5.133 5.271 5.417 5.581 5.736 5.903 6.084 6.282 6.497 6.688 6.896 7.126 7.385 7.649 7.897 8.093 8.137 7.928 7.615 7.307 7.024 6.745 6.476 6.205 5.956 5.711 5.514 5.334 5.142 4.948 4.776 4.624 4.46 4.308 4.177 4.035 3.874 3.752 3.638 3.514 3.411 3.299 3.182 3.062 2.939 2.852 2.761 2.623 2.524 2.421 2.361 2.24 2.119 1.968 1.882 1.776 1.621 1.523 1.428 1.234 1.13 1.013 0.879 0.711 0.507 0.234 -0.446 -5 ,7794 ,KEBNE ,17018721,Wed Dec 22 00:25:52 CET,Wed Dec 22 01:53:15 CET,0.0 0.87 1.23 1.509 1.709 1.871 1.999 2.118 2.34 2.439 2.534 2.668 2.772 2.855 2.999 3.136 3.274 3.341 3.474 3.603 3.778 3.88 3.979 4.121 4.251 4.367 4.468 4.569 4.71 4.848 4.967 5.106 5.239 5.357 5.497 5.647 5.78 5.931 6.095 6.257 6.428 6.617 6.832 7.041 7.263 7.506 7.774 8.022 8.268 8.482 8.566 8.392 8.081 7.758 7.445 7.138 6.878 6.626 6.391 6.142 5.931 5.745 5.554 5.37 5.21 5.063 4.887 4.726 4.601 4.472 4.329 4.198 4.046 3.882 3.743 3.597 3.454 3.322 3.193 3.103 3.015 2.882 2.784 2.684 2.635 2.528 2.414 2.302 2.233 2.129 2.003 1.92 1.833 1.652 1.555 1.443 1.317 1.156 0.956 0.76 0.308 -6 ,21195 ,KEBNE ,17018722,Wed Dec 22 00:25:53 CET,Wed Dec 22 01:55:47 CET,0.0 0.624 0.841 1.015 1.184 1.313 1.422 1.536 1.784 1.901 2.002 2.166 2.288 2.379 2.527 2.651 2.774 2.84 2.985 3.115 3.28 3.377 3.461 3.585 3.711 3.834 3.954 4.064 4.191 4.32 4.447 4.61 4.768 4.911 5.079 5.267 5.444 5.627 5.8 5.984 6.181 6.378 6.588 6.809 7.061 7.301 7.544 7.777 8.007 8.204 8.236 8.016 7.723 7.393 7.083 6.797 6.519 6.245 5.998 5.751 5.535 5.335 5.141 4.954 4.769 4.604 4.436 4.279 4.142 3.997 3.837 3.703 3.571 3.423 3.3 3.172 3.041 2.907 2.766 2.671 2.575 2.421 2.305 2.185 2.115 1.954 1.788 1.619 1.542 1.442 1.286 1.181 1.081 0.875 0.764 0.648 0.508 0.333 0.122 -0.158 -0.83 -7 ,21884 ,KEBNE ,17018723,Wed Dec 22 00:25:52 CET,Wed Dec 22 01:53:21 CET,0.0 0.557 0.799 0.989 1.124 1.249 1.358 1.455 1.63 1.713 1.793 1.928 2.029 2.105 2.257 2.396 2.524 2.582 2.683 2.774 2.896 2.981 3.068 3.185 3.298 3.41 3.52 3.631 3.77 3.902 4.02 4.156 4.297 4.431 4.575 4.728 4.872 5.035 5.206 5.38 5.564 5.767 5.988 6.197 6.441 6.683 6.909 7.177 7.457 7.661 7.729 7.54 7.219 6.889 6.585 6.275 6.001 5.739 5.484 5.22 5.009 4.832 4.647 4.452 4.27 4.112 3.948 3.809 3.685 3.557 3.426 3.31 3.184 3.046 2.94 2.836 2.725 2.603 2.482 2.4 2.311 2.173 2.074 1.966 1.909 1.793 1.684 1.566 1.498 1.406 1.291 1.209 1.121 0.917 0.79 0.666 0.528 0.389 0.258 0.048 -0.328 -8 ,13943 ,KEBNE ,17018724,Wed Dec 22 00:25:53 CET,Wed Dec 22 01:54:44 CET,0.0 0.722 0.998 1.207 1.389 1.564 1.7 1.818 2.037 2.136 2.24 2.411 2.511 2.577 2.715 2.852 2.977 3.035 3.144 3.242 3.374 3.459 3.544 3.669 3.785 3.896 3.996 4.083 4.201 4.321 4.438 4.579 4.713 4.838 4.985 5.149 5.313 5.5 5.701 5.899 6.072 6.272 6.508 6.708 6.943 7.176 7.421 7.701 7.94 8.075 8.102 7.888 7.58 7.269 6.973 6.687 6.426 6.165 5.93 5.698 5.485 5.29 5.111 4.954 4.801 4.649 4.483 4.328 4.197 4.057 3.917 3.801 3.677 3.551 3.446 3.333 3.222 3.103 2.975 2.885 2.794 2.663 2.566 2.463 2.411 2.297 2.169 2.038 1.973 1.877 1.769 1.698 1.617 1.453 1.352 1.237 1.12 0.993 0.85 0.647 0.109 -9 ,5056 ,KEBNE ,17018725,Wed Dec 22 00:25:52 CET,Wed Dec 22 01:53:10 CET,0.0 0.678 0.967 1.183 1.357 1.518 1.667 1.804 2.019 2.119 2.214 2.367 2.488 2.58 2.732 2.866 2.979 3.038 3.161 3.27 3.428 3.525 3.61 3.738 3.867 3.987 4.093 4.192 4.316 4.433 4.549 4.693 4.828 4.943 5.081 5.249 5.398 5.556 5.724 5.881 6.043 6.244 6.47 6.665 6.868 7.092 7.339 7.565 7.82 8.04 8.072 7.819 7.524 7.243 6.929 6.636 6.373 6.108 5.891 5.669 5.461 5.269 5.084 4.905 4.738 4.575 4.405 4.26 4.131 4.0 3.867 3.755 3.638 3.509 3.401 3.289 3.176 3.05 2.919 2.826 2.728 2.579 2.483 2.383 2.328 2.219 2.109 1.992 1.926 1.832 1.721 1.644 1.56 1.375 1.277 1.188 1.078 0.95 0.809 0.628 0.056 -10 ,16759 ,KEBNE ,17018726,Wed Dec 22 00:25:56 CET,Wed Dec 22 01:48:42 CET,0.0 0.758 1.052 1.294 1.499 1.668 1.808 1.938 2.165 2.26 2.353 2.503 2.608 2.691 2.855 3.007 3.143 3.208 3.334 3.452 3.604 3.705 3.804 3.931 4.042 4.153 4.267 4.383 4.534 4.661 4.772 4.901 5.022 5.148 5.294 5.446 5.585 5.733 5.891 6.055 6.217 6.394 6.608 6.812 7.031 7.27 7.515 7.737 7.956 8.132 8.144 7.934 7.637 7.334 7.037 6.746 6.493 6.25 6.007 5.744 5.531 5.351 5.173 4.999 4.839 4.698 4.549 4.406 4.274 4.138 4.002 3.885 3.756 3.622 3.516 3.407 3.292 3.173 3.05 2.963 2.867 2.715 2.606 2.491 2.439 2.333 2.216 2.091 2.023 1.92 1.757 1.647 1.547 1.377 1.271 1.152 1.025 0.858 0.66 0.429 -0.325 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 7e11946b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13570 ,KEBNE ,17018727,Wed Dec 22 00:25:52 CET,Wed Dec 22 01:53:01 CET,0.0 0.439 0.684 0.901 1.085 1.244 1.364 1.467 1.659 1.741 1.816 1.936 2.028 2.103 2.252 2.403 2.558 2.625 2.741 2.839 2.972 3.055 3.148 3.287 3.402 3.51 3.616 3.722 3.857 3.986 4.125 4.29 4.434 4.567 4.72 4.896 5.061 5.245 5.433 5.623 5.815 6.018 6.256 6.507 6.793 7.096 7.421 7.731 8.053 8.351 8.509 8.422 8.246 8.037 7.775 7.497 7.228 6.969 6.744 6.511 6.3 6.095 5.892 5.702 5.528 5.366 5.195 5.042 4.911 4.766 4.604 4.471 4.343 4.207 4.092 3.973 3.851 3.725 3.59 3.491 3.388 3.237 3.123 3.009 2.952 2.802 2.624 2.437 2.343 2.227 2.03 1.915 1.803 1.539 1.399 1.246 1.054 0.793 0.459 0.095 -1.042 -2 ,13761 ,KEBNE ,17018728,Wed Dec 22 00:25:52 CET,Wed Dec 22 01:53:07 CET,0.0 0.529 0.774 0.948 1.122 1.26 1.363 1.462 1.659 1.756 1.846 1.993 2.099 2.179 2.32 2.454 2.596 2.664 2.798 2.924 3.099 3.218 3.341 3.512 3.67 3.82 3.953 4.057 4.179 4.3 4.416 4.555 4.686 4.818 4.969 5.14 5.3 5.464 5.638 5.831 6.034 6.24 6.474 6.717 6.987 7.261 7.549 7.854 8.164 8.456 8.662 8.586 8.372 8.12 7.854 7.578 7.321 7.071 6.836 6.589 6.375 6.177 5.985 5.793 5.604 5.44 5.257 5.073 4.909 4.745 4.573 4.419 4.264 4.112 3.973 3.811 3.659 3.526 3.39 3.289 3.181 3.0 2.872 2.749 2.686 2.549 2.4 2.241 2.158 2.039 1.843 1.73 1.625 1.416 1.298 1.148 0.997 0.861 0.649 0.278 -0.512 -3 ,15791 ,KEBNE ,17018729,Wed Dec 22 00:25:53 CET,Wed Dec 22 01:52:59 CET,0.0 0.698 1.001 1.199 1.374 1.523 1.629 1.707 1.881 1.98 2.092 2.26 2.352 2.414 2.537 2.649 2.769 2.829 2.941 3.046 3.195 3.281 3.361 3.483 3.595 3.705 3.817 3.92 4.049 4.178 4.308 4.463 4.611 4.744 4.883 5.049 5.211 5.392 5.58 5.777 5.989 6.218 6.474 6.719 6.994 7.288 7.605 7.928 8.249 8.538 8.776 8.787 8.614 8.331 8.045 7.774 7.505 7.25 7.003 6.743 6.525 6.33 6.142 5.957 5.776 5.617 5.458 5.304 5.162 5.017 4.862 4.727 4.596 4.451 4.336 4.22 4.1 3.975 3.837 3.737 3.622 3.445 3.332 3.217 3.156 3.027 2.889 2.729 2.639 2.525 2.354 2.241 2.13 1.911 1.782 1.648 1.495 1.316 1.137 0.912 -0.121 -4 ,4448 ,KEBNE ,17018730,Wed Dec 22 00:25:52 CET,Wed Dec 22 01:53:15 CET,0.0 0.391 0.57 0.728 0.856 0.958 1.05 1.143 1.306 1.385 1.462 1.578 1.675 1.749 1.88 1.999 2.112 2.164 2.267 2.366 2.497 2.578 2.661 2.779 2.899 3.014 3.118 3.225 3.359 3.491 3.618 3.772 3.919 4.054 4.208 4.369 4.519 4.692 4.886 5.087 5.288 5.491 5.724 5.975 6.245 6.518 6.822 7.125 7.447 7.785 8.015 7.991 7.809 7.562 7.277 6.991 6.726 6.451 6.215 5.963 5.748 5.559 5.367 5.197 5.033 4.872 4.698 4.542 4.409 4.268 4.111 3.971 3.827 3.684 3.57 3.446 3.318 3.184 3.049 2.963 2.871 2.717 2.6 2.471 2.395 2.245 2.112 1.977 1.906 1.808 1.66 1.565 1.464 1.217 1.086 0.929 0.75 0.56 0.341 0.035 -0.729 -5 ,27325 ,KEBNE ,17018731,Wed Dec 22 00:25:52 CET,Wed Dec 22 01:53:11 CET,0.0 0.727 1.008 1.186 1.352 1.504 1.642 1.753 1.914 1.985 2.058 2.172 2.259 2.321 2.442 2.549 2.66 2.717 2.813 2.904 3.037 3.119 3.208 3.338 3.449 3.559 3.667 3.771 3.904 4.027 4.15 4.323 4.486 4.618 4.769 4.93 5.08 5.243 5.432 5.649 5.86 6.076 6.31 6.527 6.779 7.042 7.323 7.658 7.999 8.272 8.433 8.315 8.115 7.858 7.588 7.333 7.084 6.843 6.63 6.41 6.202 6.021 5.839 5.653 5.483 5.33 5.16 5.002 4.852 4.701 4.563 4.445 4.307 4.161 4.044 3.92 3.804 3.685 3.548 3.446 3.343 3.186 3.076 2.963 2.9 2.762 2.609 2.447 2.369 2.266 2.115 2.013 1.916 1.698 1.58 1.439 1.263 1.074 0.863 0.567 -0.453 -6 ,29139 ,KEBNE ,17018732,Wed Dec 22 00:25:52 CET,Wed Dec 22 01:52:56 CET,0.0 0.372 0.576 0.784 0.949 1.096 1.223 1.336 1.558 1.658 1.742 1.875 1.976 2.052 2.211 2.366 2.496 2.555 2.673 2.788 2.939 3.038 3.143 3.292 3.428 3.548 3.665 3.781 3.927 4.065 4.183 4.315 4.451 4.58 4.72 4.886 5.041 5.202 5.382 5.571 5.768 5.979 6.224 6.486 6.799 7.139 7.499 7.843 8.176 8.47 8.677 8.662 8.435 8.137 7.857 7.596 7.327 7.061 6.828 6.586 6.367 6.163 5.966 5.789 5.615 5.444 5.268 5.108 4.957 4.791 4.624 4.497 4.365 4.217 4.094 3.966 3.83 3.682 3.527 3.416 3.292 3.103 2.97 2.836 2.772 2.637 2.492 2.333 2.248 2.129 1.942 1.832 1.718 1.434 1.253 1.073 0.909 0.709 0.44 0.054 -1.108 -7 ,24994 ,KEBNE ,17018733,Wed Dec 22 00:25:52 CET,Wed Dec 22 01:52:49 CET,0.0 0.529 0.839 1.087 1.263 1.39 1.501 1.619 1.851 1.95 2.043 2.215 2.327 2.402 2.557 2.71 2.846 2.906 3.015 3.12 3.286 3.384 3.465 3.572 3.671 3.774 3.881 3.987 4.124 4.251 4.371 4.517 4.656 4.781 4.926 5.094 5.25 5.412 5.584 5.761 5.948 6.169 6.416 6.654 6.919 7.192 7.511 7.863 8.202 8.487 8.699 8.694 8.51 8.249 7.97 7.694 7.435 7.185 6.945 6.706 6.51 6.308 6.089 5.883 5.697 5.53 5.345 5.179 5.038 4.883 4.709 4.553 4.4 4.242 4.119 3.992 3.832 3.664 3.509 3.398 3.283 3.106 2.978 2.847 2.777 2.629 2.479 2.317 2.229 2.113 1.939 1.829 1.715 1.455 1.312 1.167 0.992 0.8 0.569 0.239 -0.658 -8 ,10070 ,KEBNE ,17018734,Wed Dec 22 00:25:52 CET,Wed Dec 22 01:53:06 CET,0.0 0.541 0.832 1.038 1.195 1.334 1.467 1.592 1.819 1.91 1.995 2.145 2.247 2.319 2.461 2.591 2.715 2.778 2.904 3.03 3.204 3.314 3.414 3.546 3.685 3.822 3.948 4.071 4.218 4.351 4.477 4.631 4.776 4.901 5.038 5.194 5.344 5.514 5.693 5.871 6.073 6.311 6.555 6.783 7.044 7.34 7.673 7.972 8.26 8.548 8.774 8.743 8.521 8.268 7.981 7.671 7.394 7.127 6.881 6.611 6.381 6.194 6.004 5.811 5.626 5.45 5.265 5.103 4.96 4.808 4.656 4.532 4.405 4.272 4.158 4.033 3.905 3.763 3.613 3.51 3.412 3.264 3.136 2.995 2.929 2.802 2.67 2.523 2.448 2.337 2.164 2.058 1.951 1.763 1.643 1.5 1.343 1.153 0.897 0.534 -0.351 -9 ,23005 ,KEBNE ,17018735,Wed Dec 22 00:25:52 CET,Wed Dec 22 01:53:07 CET,0.0 0.482 0.787 0.994 1.159 1.305 1.432 1.552 1.769 1.862 1.945 2.077 2.182 2.262 2.403 2.534 2.656 2.718 2.839 2.943 3.096 3.195 3.286 3.412 3.537 3.655 3.769 3.882 4.033 4.175 4.303 4.455 4.6 4.752 4.929 5.1 5.254 5.418 5.593 5.781 5.965 6.17 6.42 6.654 6.91 7.194 7.511 7.816 8.134 8.416 8.571 8.514 8.308 8.038 7.775 7.5 7.213 6.958 6.727 6.491 6.28 6.071 5.87 5.678 5.498 5.335 5.168 5.014 4.864 4.701 4.534 4.398 4.255 4.088 3.951 3.819 3.688 3.556 3.409 3.295 3.177 2.996 2.871 2.724 2.641 2.487 2.331 2.166 2.072 1.945 1.754 1.641 1.526 1.262 1.106 0.941 0.767 0.548 0.251 -0.09 -0.925 -10 ,3926 ,KEBNE ,17018736,Wed Dec 22 00:25:53 CET,Wed Dec 22 01:53:00 CET,0.0 0.408 0.631 0.778 0.899 1.0 1.104 1.211 1.392 1.474 1.547 1.668 1.767 1.835 1.958 2.073 2.181 2.229 2.317 2.398 2.517 2.607 2.697 2.818 2.929 3.033 3.146 3.258 3.391 3.51 3.625 3.776 3.919 4.042 4.196 4.366 4.51 4.678 4.862 5.04 5.221 5.438 5.696 5.951 6.232 6.516 6.821 7.141 7.464 7.767 7.984 7.934 7.715 7.457 7.201 6.915 6.64 6.389 6.165 5.925 5.71 5.512 5.325 5.159 4.994 4.819 4.634 4.475 4.345 4.188 4.017 3.89 3.761 3.623 3.511 3.396 3.275 3.148 3.026 2.94 2.839 2.667 2.551 2.432 2.368 2.219 2.056 1.891 1.799 1.679 1.497 1.391 1.276 0.999 0.837 0.663 0.459 0.229 -0.006 -0.268 -0.79 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt deleted file mode 100644 index bc8267ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6718 ,KEBNE ,17018737,Wed Dec 22 00:25:53 CET,Wed Dec 22 01:54:45 CET,0.0 2.096 2.569 2.898 3.144 3.333 3.5 3.651 3.936 4.075 4.206 4.395 4.545 4.65 4.85 5.028 5.201 5.286 5.442 5.589 5.797 5.925 6.049 6.238 6.414 6.573 6.726 6.88 7.07 7.244 7.414 7.611 7.798 7.973 8.173 8.39 8.59 8.805 9.043 9.292 9.524 9.781 10.076 10.324 10.59 10.9 11.219 11.526 11.8 11.989 11.946 11.567 11.079 10.581 10.133 9.68 9.257 8.866 8.491 8.119 7.821 7.547 7.282 7.037 6.808 6.58 6.336 6.127 5.937 5.739 5.538 5.37 5.192 5.007 4.869 4.72 4.56 4.389 4.211 4.078 3.943 3.731 3.568 3.394 3.31 3.154 2.956 2.727 2.623 2.477 2.272 2.139 2.01 1.731 1.566 1.341 1.083 0.802 0.477 0.022 -1.328 -2 ,3021 ,KEBNE ,17018738,Wed Dec 22 00:25:53 CET,Wed Dec 22 01:54:52 CET,0.0 1.309 1.661 1.909 2.112 2.293 2.473 2.648 2.904 3.022 3.149 3.319 3.469 3.571 3.737 3.885 4.039 4.117 4.259 4.395 4.585 4.7 4.819 5.001 5.174 5.325 5.458 5.599 5.781 5.945 6.102 6.285 6.455 6.622 6.802 6.997 7.193 7.404 7.619 7.853 8.096 8.354 8.643 8.913 9.227 9.528 9.817 10.123 10.393 10.582 10.566 10.197 9.763 9.3 8.828 8.359 7.928 7.545 7.219 6.868 6.552 6.265 5.984 5.721 5.476 5.249 4.992 4.763 4.569 4.365 4.157 3.985 3.808 3.627 3.482 3.32 3.152 2.972 2.78 2.655 2.53 2.33 2.184 2.013 1.915 1.723 1.532 1.32 1.199 1.016 0.792 0.664 0.519 0.167 -0.03 -0.23 -0.439 -0.696 -1.065 -1.558 -3.019 -3 ,790 ,KEBNE ,17018739,Wed Dec 22 00:25:53 CET,Wed Dec 22 01:56:17 CET,0.0 1.361 1.757 2.069 2.291 2.46 2.629 2.785 3.042 3.146 3.252 3.443 3.593 3.685 3.864 4.022 4.167 4.25 4.417 4.56 4.757 4.878 4.988 5.158 5.326 5.476 5.619 5.763 5.938 6.097 6.258 6.455 6.628 6.781 6.948 7.131 7.327 7.552 7.783 8.013 8.255 8.544 8.874 9.178 9.465 9.762 10.097 10.39 10.644 10.808 10.798 10.44 9.978 9.507 9.021 8.588 8.209 7.853 7.535 7.202 6.912 6.635 6.362 6.108 5.879 5.666 5.431 5.217 5.03 4.835 4.63 4.468 4.303 4.129 3.989 3.833 3.661 3.476 3.276 3.14 2.998 2.777 2.627 2.471 2.395 2.241 2.08 1.899 1.792 1.638 1.432 1.284 1.151 0.881 0.716 0.532 0.323 0.089 -0.173 -0.576 -2.706 -4 ,18988 ,KEBNE ,17018740,Wed Dec 22 00:25:53 CET,Wed Dec 22 01:54:51 CET,0.0 1.197 1.574 1.848 2.06 2.252 2.458 2.626 2.897 3.032 3.151 3.329 3.475 3.573 3.749 3.921 4.089 4.172 4.325 4.464 4.677 4.805 4.928 5.113 5.277 5.434 5.59 5.748 5.944 6.113 6.284 6.495 6.692 6.877 7.076 7.277 7.473 7.707 7.952 8.189 8.419 8.684 9.006 9.301 9.569 9.844 10.158 10.463 10.705 10.883 10.881 10.5 9.997 9.477 9.001 8.567 8.139 7.713 7.33 6.928 6.587 6.288 5.994 5.691 5.412 5.183 4.933 4.693 4.481 4.259 4.025 3.841 3.65 3.436 3.274 3.105 2.911 2.707 2.517 2.395 2.257 2.032 1.88 1.714 1.623 1.433 1.24 1.042 0.937 0.777 0.564 0.439 0.306 0.018 -0.152 -0.362 -0.59 -0.847 -1.167 -1.633 -2.556 -5 ,25177 ,KEBNE ,17018741,Wed Dec 22 00:25:52 CET,Wed Dec 22 01:56:39 CET,0.0 1.177 1.588 1.91 2.155 2.352 2.521 2.69 2.988 3.122 3.261 3.48 3.62 3.713 3.885 4.033 4.17 4.244 4.405 4.572 4.802 4.932 5.048 5.217 5.384 5.548 5.694 5.832 6.008 6.174 6.333 6.514 6.699 6.867 7.047 7.236 7.421 7.622 7.812 8.012 8.23 8.484 8.765 9.018 9.289 9.569 9.86 10.144 10.4 10.6 10.639 10.252 9.737 9.25 8.788 8.328 7.892 7.493 7.152 6.82 6.525 6.259 6.003 5.737 5.471 5.243 5.004 4.782 4.586 4.383 4.182 4.02 3.831 3.639 3.504 3.348 3.178 3.013 2.843 2.725 2.588 2.358 2.213 2.066 1.986 1.81 1.628 1.427 1.32 1.172 0.987 0.861 0.733 0.404 0.21 0.017 -0.185 -0.396 -0.673 -1.109 -2.544 -6 ,3132 ,KEBNE ,17018742,Wed Dec 22 00:25:53 CET,Wed Dec 22 01:56:38 CET,0.0 1.035 1.471 1.795 2.036 2.247 2.432 2.6 2.884 3.005 3.126 3.327 3.473 3.568 3.753 3.923 4.093 4.179 4.343 4.487 4.664 4.776 4.893 5.067 5.236 5.398 5.561 5.712 5.886 6.053 6.211 6.401 6.583 6.753 6.935 7.137 7.335 7.557 7.794 8.01 8.242 8.521 8.786 9.05 9.365 9.687 10.027 10.335 10.628 10.83 10.798 10.423 9.976 9.512 9.053 8.62 8.218 7.837 7.488 7.138 6.835 6.551 6.288 6.044 5.807 5.591 5.369 5.168 4.989 4.79 4.579 4.408 4.227 4.03 3.877 3.725 3.568 3.404 3.227 3.103 2.974 2.768 2.625 2.477 2.397 2.227 2.048 1.849 1.744 1.589 1.398 1.269 1.139 0.867 0.697 0.506 0.308 0.068 -0.243 -0.739 -2.603 -7 ,18214 ,KEBNE ,17018743,Wed Dec 22 00:25:53 CET,Wed Dec 22 01:56:30 CET,0.0 1.227 1.523 1.767 1.976 2.152 2.304 2.444 2.708 2.831 2.943 3.122 3.272 3.372 3.557 3.721 3.88 3.951 4.082 4.21 4.396 4.52 4.639 4.811 4.977 5.121 5.259 5.403 5.583 5.762 5.931 6.125 6.31 6.485 6.683 6.91 7.136 7.377 7.608 7.836 8.076 8.344 8.652 8.922 9.202 9.51 9.833 10.12 10.385 10.583 10.52 10.174 9.729 9.241 8.787 8.346 7.942 7.553 7.199 6.844 6.534 6.254 5.978 5.703 5.448 5.213 4.977 4.78 4.602 4.414 4.218 4.059 3.89 3.694 3.537 3.376 3.193 2.997 2.795 2.659 2.519 2.298 2.151 1.984 1.885 1.689 1.497 1.298 1.201 1.053 0.863 0.741 0.618 0.336 0.175 -0.003 -0.206 -0.425 -0.677 -1.084 -2.394 -8 ,7496 ,KEBNE ,17018744,Wed Dec 22 00:25:53 CET,Wed Dec 22 01:54:40 CET,0.0 1.453 1.88 2.2 2.448 2.63 2.803 2.971 3.257 3.389 3.516 3.682 3.826 3.929 4.102 4.27 4.434 4.508 4.651 4.788 4.993 5.121 5.241 5.409 5.561 5.72 5.879 6.021 6.178 6.323 6.472 6.658 6.826 6.987 7.188 7.413 7.605 7.809 8.043 8.268 8.491 8.75 9.033 9.283 9.572 9.882 10.172 10.461 10.782 11.027 10.983 10.581 10.115 9.615 9.09 8.616 8.212 7.846 7.506 7.162 6.896 6.634 6.346 6.089 5.849 5.626 5.386 5.167 4.982 4.782 4.566 4.399 4.227 4.026 3.862 3.697 3.53 3.36 3.177 3.041 2.906 2.703 2.558 2.403 2.323 2.151 1.97 1.791 1.684 1.52 1.34 1.214 1.074 0.794 0.628 0.426 0.194 -0.085 -0.408 -0.829 -2.187 -9 ,185 ,KEBNE ,17018745,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:55:42 CET,0.0 1.418 1.809 2.095 2.335 2.566 2.776 2.948 3.261 3.4 3.529 3.718 3.865 3.962 4.151 4.341 4.509 4.586 4.731 4.867 5.083 5.224 5.349 5.509 5.672 5.84 6.002 6.145 6.313 6.486 6.656 6.85 7.03 7.199 7.391 7.604 7.813 8.033 8.257 8.49 8.713 8.954 9.233 9.502 9.799 10.108 10.432 10.742 11.058 11.269 11.211 10.889 10.477 10.029 9.562 9.11 8.712 8.33 7.997 7.661 7.36 7.096 6.844 6.588 6.331 6.095 5.868 5.66 5.475 5.294 5.094 4.919 4.741 4.556 4.41 4.248 4.074 3.897 3.711 3.58 3.44 3.216 3.061 2.903 2.822 2.651 2.469 2.28 2.173 2.012 1.824 1.692 1.563 1.289 1.124 0.943 0.747 0.512 0.223 -0.167 -1.869 -10 ,12011 ,KEBNE ,17018746,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:55:29 CET,0.0 1.231 1.605 1.856 2.058 2.223 2.376 2.523 2.797 2.934 3.062 3.254 3.399 3.485 3.655 3.813 3.962 4.036 4.181 4.314 4.486 4.606 4.729 4.897 5.052 5.214 5.379 5.531 5.701 5.842 5.982 6.164 6.337 6.498 6.683 6.897 7.104 7.323 7.542 7.764 7.997 8.245 8.531 8.809 9.091 9.346 9.639 9.949 10.225 10.405 10.318 9.967 9.484 8.978 8.483 8.007 7.596 7.212 6.88 6.531 6.213 5.923 5.658 5.412 5.171 4.944 4.702 4.49 4.297 4.102 3.904 3.721 3.523 3.31 3.142 2.973 2.795 2.601 2.388 2.249 2.11 1.886 1.717 1.535 1.441 1.262 1.082 0.867 0.755 0.599 0.397 0.24 0.064 -0.274 -0.443 -0.634 -0.884 -1.192 -1.558 -2.096 -4.315 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt deleted file mode 100644 index 0e2cb2f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28210 ,KEBNE ,17018747,Wed Dec 22 00:26:55 CET,Wed Dec 22 01:55:36 CET,0.0 0.586 0.847 1.053 1.234 1.403 1.55 1.676 1.893 1.987 2.083 2.223 2.357 2.444 2.602 2.761 2.91 2.98 3.125 3.258 3.442 3.566 3.692 3.86 4.016 4.168 4.305 4.434 4.627 4.818 4.988 5.189 5.369 5.543 5.749 5.982 6.207 6.453 6.729 7.015 7.301 7.644 8.051 8.449 8.923 9.467 10.095 10.766 11.517 12.338 13.213 13.746 13.904 13.888 13.766 13.636 13.502 13.357 13.223 13.075 12.936 12.791 12.637 12.486 12.346 12.206 12.051 11.919 11.795 11.651 11.506 11.377 11.234 11.093 10.98 10.863 10.74 10.612 10.476 10.386 10.294 10.149 10.049 9.931 9.872 9.771 9.653 9.52 9.444 9.325 9.181 9.085 8.978 8.733 8.59 8.43 8.25 8.062 7.855 7.608 7.084 -2 ,23275 ,KEBNE ,17018748,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:55:38 CET,0.0 0.34 0.552 0.743 0.898 1.035 1.162 1.285 1.509 1.601 1.693 1.828 1.951 2.033 2.185 2.328 2.464 2.53 2.665 2.796 2.999 3.121 3.218 3.367 3.519 3.668 3.812 3.947 4.116 4.272 4.416 4.598 4.773 4.94 5.137 5.374 5.607 5.849 6.108 6.393 6.697 7.025 7.432 7.833 8.264 8.739 9.297 9.936 10.627 11.38 12.212 12.663 12.776 12.785 12.709 12.594 12.462 12.316 12.165 11.995 11.843 11.692 11.535 11.389 11.248 11.115 10.967 10.829 10.72 10.605 10.467 10.342 10.214 10.086 9.982 9.86 9.729 9.6 9.474 9.387 9.29 9.141 9.038 8.926 8.862 8.72 8.574 8.434 8.362 8.247 8.105 8.006 7.894 7.665 7.55 7.409 7.26 7.096 6.909 6.714 6.147 -3 ,6455 ,KEBNE ,17018749,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:57:52 CET,0.0 0.46 0.723 0.938 1.115 1.267 1.402 1.527 1.754 1.859 1.958 2.114 2.252 2.338 2.5 2.653 2.789 2.856 2.986 3.116 3.313 3.444 3.564 3.72 3.866 4.002 4.133 4.261 4.432 4.598 4.754 4.939 5.127 5.31 5.51 5.726 5.945 6.193 6.457 6.737 7.036 7.373 7.763 8.162 8.634 9.125 9.668 10.304 11.021 11.809 12.67 13.256 13.437 13.464 13.426 13.323 13.191 13.043 12.885 12.702 12.54 12.396 12.246 12.088 11.954 11.837 11.687 11.547 11.433 11.298 11.153 11.034 10.906 10.76 10.654 10.545 10.426 10.305 10.165 10.065 9.962 9.796 9.686 9.566 9.502 9.385 9.254 9.111 9.04 8.932 8.798 8.702 8.607 8.4 8.29 8.162 8.014 7.857 7.682 7.453 6.814 -4 ,395 ,KEBNE ,17018750,Wed Dec 22 00:26:55 CET,Wed Dec 22 01:57:32 CET,0.0 0.435 0.67 0.837 0.996 1.148 1.29 1.421 1.646 1.742 1.842 1.984 2.101 2.177 2.315 2.447 2.583 2.65 2.773 2.882 3.03 3.13 3.24 3.398 3.535 3.661 3.801 3.937 4.098 4.267 4.427 4.608 4.791 4.967 5.178 5.418 5.632 5.871 6.146 6.433 6.709 7.024 7.393 7.743 8.168 8.646 9.199 9.823 10.532 11.301 12.083 12.56 12.71 12.738 12.682 12.574 12.437 12.287 12.15 11.986 11.82 11.663 11.5 11.342 11.185 11.036 10.882 10.747 10.628 10.503 10.366 10.229 10.09 9.955 9.846 9.726 9.597 9.461 9.318 9.212 9.086 8.898 8.78 8.65 8.578 8.427 8.27 8.096 7.997 7.869 7.705 7.604 7.5 7.224 7.068 6.909 6.752 6.566 6.322 5.921 4.802 -5 ,18665 ,KEBNE ,17018751,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:55:59 CET,0.0 0.542 0.754 0.887 1.024 1.16 1.277 1.388 1.596 1.679 1.766 1.906 2.043 2.137 2.312 2.475 2.627 2.71 2.874 3.026 3.239 3.371 3.498 3.674 3.832 3.983 4.119 4.25 4.419 4.593 4.763 4.959 5.151 5.334 5.537 5.771 5.999 6.248 6.518 6.811 7.114 7.429 7.789 8.162 8.612 9.09 9.636 10.286 10.988 11.76 12.634 13.184 13.359 13.365 13.254 13.086 12.934 12.773 12.61 12.428 12.259 12.105 11.948 11.797 11.652 11.518 11.371 11.233 11.112 10.968 10.806 10.675 10.535 10.372 10.249 10.127 10.001 9.873 9.724 9.619 9.51 9.338 9.209 9.08 9.018 8.871 8.716 8.565 8.483 8.363 8.216 8.112 8.001 7.732 7.563 7.371 7.173 6.966 6.714 6.4 5.575 -6 ,26363 ,KEBNE ,17018752,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:55:38 CET,0.0 0.642 0.824 0.979 1.134 1.282 1.404 1.524 1.763 1.88 1.992 2.147 2.277 2.354 2.504 2.645 2.788 2.855 2.982 3.116 3.296 3.401 3.51 3.664 3.808 3.945 4.085 4.227 4.395 4.56 4.728 4.918 5.105 5.286 5.488 5.715 5.932 6.173 6.441 6.717 7.011 7.345 7.709 8.071 8.501 8.961 9.497 10.114 10.779 11.542 12.339 12.807 13.018 13.055 13.005 12.894 12.728 12.562 12.396 12.2 12.034 11.883 11.742 11.601 11.453 11.319 11.183 11.038 10.912 10.785 10.622 10.488 10.352 10.182 10.06 9.953 9.841 9.725 9.59 9.495 9.403 9.262 9.15 9.03 8.968 8.838 8.719 8.586 8.51 8.394 8.247 8.144 8.038 7.818 7.686 7.537 7.375 7.208 7.018 6.764 6.116 -7 ,19766 ,KEBNE ,17018753,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:57:36 CET,0.0 0.804 1.09 1.282 1.443 1.562 1.679 1.812 2.053 2.154 2.239 2.36 2.489 2.57 2.726 2.876 3.013 3.08 3.207 3.326 3.495 3.6 3.701 3.849 4.001 4.151 4.286 4.418 4.596 4.766 4.923 5.109 5.286 5.462 5.666 5.895 6.131 6.379 6.639 6.916 7.193 7.51 7.896 8.266 8.702 9.198 9.769 10.379 11.059 11.84 12.671 13.204 13.417 13.445 13.371 13.25 13.116 12.956 12.802 12.643 12.486 12.329 12.168 12.014 11.856 11.707 11.565 11.441 11.323 11.188 11.049 10.932 10.795 10.639 10.522 10.412 10.297 10.163 10.008 9.898 9.784 9.62 9.501 9.374 9.307 9.162 9.015 8.867 8.782 8.65 8.464 8.353 8.245 8.002 7.875 7.726 7.552 7.357 7.125 6.838 5.969 -8 ,28616 ,KEBNE ,17018754,Wed Dec 22 00:26:55 CET,Wed Dec 22 01:57:29 CET,0.0 0.618 0.885 1.059 1.188 1.306 1.446 1.59 1.841 1.951 2.046 2.157 2.27 2.347 2.509 2.667 2.806 2.867 2.983 3.104 3.285 3.393 3.498 3.652 3.795 3.941 4.089 4.23 4.418 4.595 4.76 4.965 5.166 5.346 5.546 5.771 5.996 6.239 6.507 6.793 7.077 7.401 7.784 8.18 8.651 9.17 9.758 10.388 11.056 11.778 12.582 13.141 13.323 13.3 13.187 13.052 12.892 12.714 12.561 12.39 12.207 12.045 11.894 11.731 11.557 11.393 11.224 11.067 10.929 10.785 10.633 10.509 10.37 10.219 10.105 9.986 9.863 9.729 9.575 9.472 9.366 9.182 9.061 8.94 8.871 8.736 8.598 8.443 8.353 8.224 8.069 7.97 7.871 7.65 7.528 7.395 7.223 7.018 6.796 6.548 5.856 -9 ,27169 ,KEBNE ,17018755,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:56:00 CET,0.0 0.754 1.036 1.251 1.448 1.624 1.793 1.952 2.218 2.336 2.443 2.583 2.713 2.798 2.957 3.094 3.221 3.287 3.418 3.539 3.713 3.836 3.962 4.143 4.301 4.439 4.579 4.712 4.886 5.054 5.214 5.407 5.593 5.776 5.991 6.234 6.458 6.692 6.943 7.225 7.534 7.86 8.251 8.668 9.143 9.641 10.193 10.809 11.503 12.294 13.153 13.692 13.87 13.876 13.812 13.712 13.588 13.459 13.324 13.176 13.034 12.882 12.728 12.573 12.418 12.281 12.139 12.0 11.88 11.754 11.613 11.489 11.367 11.252 11.157 11.054 10.947 10.839 10.722 10.629 10.533 10.386 10.28 10.16 10.094 9.949 9.788 9.611 9.517 9.39 9.238 9.14 9.032 8.8 8.667 8.519 8.35 8.12 7.82 7.439 6.723 -10 ,21984 ,KEBNE ,17018756,Wed Dec 22 00:27:00 CET,Wed Dec 22 01:55:43 CET,0.0 0.548 0.762 0.932 1.066 1.186 1.295 1.414 1.646 1.749 1.851 1.983 2.095 2.162 2.299 2.441 2.574 2.638 2.764 2.887 3.069 3.186 3.296 3.451 3.595 3.735 3.882 4.025 4.201 4.379 4.54 4.728 4.924 5.109 5.313 5.531 5.746 5.997 6.256 6.535 6.839 7.174 7.572 7.96 8.395 8.889 9.436 10.032 10.701 11.455 12.277 12.809 13.033 13.074 13.02 12.914 12.768 12.607 12.468 12.301 12.139 11.984 11.833 11.691 11.542 11.401 11.259 11.124 11.002 10.878 10.739 10.618 10.493 10.361 10.255 10.143 10.031 9.91 9.785 9.694 9.599 9.438 9.32 9.203 9.141 9.02 8.891 8.738 8.648 8.508 8.342 8.245 8.136 7.917 7.805 7.68 7.533 7.353 7.138 6.823 6.083 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_30.txt deleted file mode 100644 index 6ade8461..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11323 ,KEBNE ,17018757,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:56:25 CET,0.0 0.394 0.657 0.832 1.014 1.166 1.291 1.415 1.654 1.759 1.862 2.017 2.143 2.224 2.38 2.525 2.674 2.743 2.867 2.988 3.161 3.269 3.374 3.521 3.662 3.803 3.933 4.062 4.227 4.393 4.559 4.742 4.909 5.077 5.278 5.503 5.718 5.947 6.186 6.426 6.679 6.972 7.33 7.673 8.05 8.441 8.862 9.326 9.818 10.33 10.833 11.05 11.017 10.891 10.725 10.527 10.322 10.125 9.937 9.741 9.568 9.398 9.227 9.061 8.89 8.737 8.58 8.429 8.292 8.146 8.002 7.891 7.768 7.636 7.533 7.422 7.302 7.175 7.046 6.956 6.854 6.7 6.594 6.476 6.411 6.28 6.15 6.006 5.929 5.819 5.695 5.599 5.499 5.296 5.17 5.028 4.89 4.745 4.585 4.353 3.75 -2 ,14955 ,KEBNE ,17018758,Wed Dec 22 00:26:55 CET,Wed Dec 22 01:56:15 CET,0.0 0.523 0.743 0.921 1.082 1.22 1.357 1.503 1.787 1.906 2.014 2.171 2.303 2.39 2.563 2.733 2.896 2.976 3.128 3.269 3.456 3.573 3.694 3.872 4.037 4.192 4.339 4.481 4.661 4.833 4.999 5.195 5.375 5.549 5.759 5.981 6.185 6.411 6.664 6.934 7.214 7.54 7.904 8.235 8.605 9.011 9.45 9.891 10.385 10.915 11.399 11.611 11.565 11.437 11.266 11.063 10.871 10.682 10.51 10.334 10.171 10.022 9.865 9.711 9.575 9.445 9.3 9.17 9.05 8.928 8.803 8.69 8.553 8.409 8.309 8.207 8.099 7.98 7.857 7.778 7.698 7.554 7.439 7.322 7.266 7.158 7.029 6.884 6.819 6.716 6.612 6.545 6.479 6.306 6.164 6.013 5.876 5.718 5.54 5.332 4.957 -3 ,21155 ,KEBNE ,17018759,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:56:09 CET,0.0 0.525 0.808 1.021 1.18 1.324 1.465 1.59 1.812 1.91 1.999 2.127 2.251 2.328 2.472 2.613 2.755 2.822 2.957 3.083 3.249 3.355 3.455 3.594 3.731 3.864 4.0 4.134 4.302 4.472 4.63 4.813 4.989 5.15 5.343 5.563 5.768 5.984 6.232 6.494 6.744 7.033 7.368 7.697 8.074 8.462 8.873 9.314 9.805 10.33 10.827 11.033 11.003 10.886 10.737 10.575 10.404 10.217 10.028 9.842 9.691 9.549 9.401 9.241 9.088 8.957 8.824 8.709 8.601 8.477 8.343 8.219 8.091 7.961 7.859 7.752 7.639 7.527 7.414 7.33 7.242 7.084 6.966 6.848 6.791 6.688 6.579 6.459 6.396 6.294 6.191 6.11 6.007 5.762 5.625 5.479 5.338 5.182 5.007 4.796 4.355 -4 ,25821 ,KEBNE ,17018760,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:56:18 CET,0.0 0.58 0.837 1.032 1.173 1.311 1.449 1.568 1.784 1.882 1.978 2.137 2.281 2.375 2.529 2.668 2.812 2.884 3.007 3.121 3.297 3.407 3.513 3.669 3.821 3.959 4.087 4.222 4.394 4.548 4.695 4.876 5.055 5.225 5.416 5.625 5.828 6.052 6.301 6.569 6.851 7.147 7.461 7.764 8.134 8.551 9.011 9.486 9.968 10.507 11.034 11.257 11.258 11.143 10.998 10.83 10.641 10.449 10.267 10.075 9.903 9.747 9.608 9.468 9.328 9.203 9.062 8.925 8.812 8.696 8.566 8.443 8.299 8.15 8.036 7.916 7.797 7.681 7.573 7.499 7.413 7.276 7.188 7.098 7.048 6.943 6.838 6.718 6.657 6.551 6.438 6.356 6.275 6.101 5.999 5.894 5.781 5.644 5.454 5.233 4.728 -5 ,26204 ,KEBNE ,17018761,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:57:04 CET,0.0 0.68 0.989 1.25 1.465 1.645 1.809 1.946 2.161 2.264 2.353 2.468 2.598 2.679 2.823 2.962 3.103 3.171 3.3 3.423 3.599 3.705 3.8 3.95 4.097 4.233 4.37 4.5 4.652 4.802 4.955 5.143 5.327 5.496 5.677 5.886 6.087 6.299 6.528 6.773 7.022 7.292 7.627 7.964 8.34 8.753 9.215 9.69 10.197 10.704 11.146 11.338 11.297 11.163 10.991 10.806 10.612 10.407 10.213 10.017 9.841 9.685 9.533 9.382 9.232 9.09 8.941 8.806 8.689 8.554 8.41 8.3 8.185 8.059 7.96 7.855 7.747 7.63 7.504 7.417 7.327 7.187 7.087 6.985 6.931 6.816 6.695 6.566 6.492 6.376 6.264 6.181 6.094 5.903 5.792 5.683 5.573 5.449 5.318 5.126 4.869 -6 ,1578 ,KEBNE ,17018762,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:56:16 CET,0.0 0.551 0.802 1.022 1.19 1.341 1.489 1.629 1.887 1.999 2.104 2.264 2.401 2.497 2.674 2.831 2.975 3.042 3.181 3.32 3.504 3.623 3.746 3.921 4.07 4.206 4.342 4.471 4.641 4.8 4.947 5.127 5.297 5.456 5.642 5.861 6.06 6.262 6.488 6.738 7.004 7.295 7.637 7.969 8.316 8.695 9.125 9.554 9.984 10.463 10.957 11.148 11.132 11.014 10.82 10.606 10.425 10.25 10.069 9.859 9.664 9.498 9.336 9.174 9.026 8.894 8.75 8.617 8.501 8.376 8.239 8.124 8.013 7.899 7.813 7.726 7.626 7.514 7.396 7.314 7.222 7.08 6.988 6.876 6.815 6.691 6.568 6.439 6.372 6.268 6.165 6.086 6.007 5.849 5.762 5.663 5.557 5.43 5.261 5.053 4.639 -7 ,24396 ,KEBNE ,17018763,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:57:54 CET,0.0 0.575 0.873 1.055 1.209 1.356 1.482 1.612 1.867 1.979 2.087 2.258 2.396 2.489 2.663 2.823 2.972 3.044 3.179 3.307 3.489 3.609 3.728 3.905 4.067 4.238 4.411 4.557 4.727 4.887 5.038 5.231 5.422 5.599 5.806 6.044 6.27 6.491 6.722 6.973 7.227 7.503 7.829 8.159 8.518 8.918 9.348 9.782 10.281 10.808 11.276 11.458 11.434 11.341 11.206 11.028 10.847 10.673 10.505 10.313 10.139 9.975 9.822 9.685 9.543 9.406 9.277 9.16 9.051 8.931 8.797 8.688 8.577 8.458 8.363 8.26 8.149 8.031 7.907 7.819 7.729 7.595 7.501 7.401 7.347 7.237 7.128 7.01 6.954 6.857 6.747 6.665 6.573 6.369 6.264 6.134 5.986 5.834 5.651 5.441 4.897 -8 ,21339 ,KEBNE ,17018764,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:58:00 CET,0.0 0.515 0.732 0.912 1.067 1.193 1.313 1.434 1.662 1.77 1.871 2.028 2.169 2.257 2.421 2.583 2.731 2.797 2.937 3.079 3.284 3.425 3.553 3.723 3.876 4.022 4.17 4.311 4.489 4.671 4.845 5.035 5.21 5.374 5.562 5.775 5.986 6.218 6.461 6.721 6.992 7.276 7.605 7.94 8.297 8.687 9.126 9.566 10.057 10.576 11.068 11.338 11.361 11.247 11.083 10.913 10.742 10.558 10.384 10.203 10.035 9.869 9.699 9.536 9.387 9.257 9.118 8.99 8.874 8.748 8.611 8.483 8.36 8.245 8.148 8.045 7.937 7.827 7.712 7.626 7.538 7.398 7.299 7.198 7.145 7.038 6.928 6.809 6.748 6.649 6.553 6.479 6.398 6.213 6.108 5.987 5.848 5.694 5.513 5.24 4.688 -9 ,4039 ,KEBNE ,17018765,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:56:03 CET,0.0 0.775 1.019 1.179 1.336 1.486 1.621 1.752 1.99 2.099 2.211 2.37 2.495 2.583 2.766 2.946 3.122 3.196 3.322 3.444 3.621 3.738 3.844 3.985 4.133 4.291 4.446 4.581 4.748 4.902 5.042 5.219 5.389 5.554 5.751 5.955 6.149 6.369 6.612 6.874 7.144 7.432 7.76 8.08 8.45 8.85 9.293 9.757 10.221 10.744 11.231 11.418 11.44 11.368 11.212 11.009 10.803 10.601 10.434 10.257 10.089 9.947 9.792 9.627 9.483 9.345 9.196 9.071 8.961 8.836 8.701 8.592 8.48 8.356 8.267 8.178 8.078 7.974 7.869 7.787 7.697 7.578 7.497 7.402 7.352 7.257 7.168 7.043 6.97 6.867 6.748 6.671 6.605 6.42 6.315 6.209 6.063 5.88 5.663 5.343 4.665 -10 ,3708 ,KEBNE ,17018766,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:57:53 CET,0.0 0.695 0.998 1.227 1.414 1.585 1.742 1.891 2.166 2.283 2.391 2.541 2.665 2.754 2.938 3.107 3.268 3.348 3.492 3.622 3.793 3.896 4.001 4.159 4.316 4.457 4.589 4.718 4.879 5.042 5.209 5.407 5.586 5.751 5.937 6.143 6.337 6.542 6.765 7.006 7.263 7.555 7.894 8.224 8.587 8.97 9.391 9.857 10.366 10.899 11.415 11.65 11.674 11.583 11.433 11.243 11.029 10.838 10.67 10.489 10.329 10.178 10.019 9.86 9.722 9.587 9.434 9.298 9.176 9.058 8.939 8.833 8.71 8.574 8.467 8.36 8.249 8.128 8.008 7.931 7.843 7.694 7.593 7.486 7.425 7.297 7.161 7.025 6.953 6.828 6.686 6.593 6.489 6.257 6.134 5.994 5.837 5.659 5.447 5.225 4.671 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 791477c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6996 ,KEBNE ,17018767,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:54:05 CET,0.0 0.725 1.092 1.342 1.507 1.645 1.778 1.909 2.14 2.246 2.354 2.528 2.67 2.773 2.951 3.093 3.222 3.29 3.433 3.581 3.785 3.912 4.036 4.202 4.358 4.516 4.666 4.808 4.991 5.171 5.345 5.549 5.742 5.937 6.166 6.406 6.633 6.89 7.176 7.49 7.814 8.178 8.618 9.064 9.583 10.158 10.819 11.532 12.302 13.241 14.393 15.17 15.507 15.646 15.671 15.63 15.573 15.478 15.366 15.251 15.154 15.058 14.947 14.844 14.739 14.623 14.489 14.366 14.264 14.156 14.037 13.94 13.833 13.72 13.638 13.538 13.427 13.326 13.224 13.141 13.051 12.903 12.796 12.687 12.633 12.505 12.349 12.193 12.116 12.008 11.84 11.732 11.609 11.351 11.229 11.093 10.923 10.732 10.496 10.19 9.475 -2 ,17475 ,KEBNE ,17018768,Wed Dec 22 00:26:55 CET,Wed Dec 22 01:53:57 CET,0.0 0.639 0.977 1.251 1.468 1.624 1.774 1.924 2.164 2.269 2.371 2.5 2.62 2.706 2.868 3.006 3.132 3.196 3.323 3.439 3.611 3.729 3.845 4.019 4.175 4.316 4.473 4.635 4.828 5.011 5.193 5.402 5.601 5.792 6.011 6.265 6.504 6.758 7.031 7.314 7.618 7.972 8.388 8.825 9.341 9.917 10.522 11.178 11.979 12.864 13.889 14.633 14.966 15.117 15.169 15.147 15.07 14.955 14.839 14.706 14.565 14.438 14.322 14.205 14.084 13.967 13.837 13.705 13.591 13.484 13.361 13.249 13.13 13.012 12.922 12.825 12.726 12.625 12.509 12.41 12.307 12.161 12.059 11.961 11.906 11.78 11.645 11.487 11.409 11.312 11.163 11.068 10.956 10.697 10.543 10.394 10.251 10.076 9.808 9.468 8.763 -3 ,11636 ,KEBNE ,17018769,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:55:54 CET,0.0 0.969 1.285 1.471 1.623 1.756 1.88 1.999 2.198 2.298 2.388 2.526 2.656 2.737 2.896 3.052 3.196 3.263 3.385 3.508 3.691 3.803 3.91 4.063 4.205 4.339 4.478 4.623 4.803 4.979 5.155 5.363 5.561 5.751 5.967 6.208 6.446 6.705 6.983 7.283 7.618 7.984 8.393 8.806 9.28 9.833 10.491 11.234 12.109 13.089 14.219 15.017 15.33 15.455 15.464 15.443 15.387 15.293 15.212 15.12 15.02 14.913 14.788 14.665 14.553 14.452 14.336 14.23 14.142 14.049 13.943 13.849 13.742 13.622 13.529 13.436 13.337 13.235 13.133 13.06 12.962 12.8 12.703 12.599 12.544 12.428 12.307 12.175 12.101 11.997 11.842 11.747 11.644 11.415 11.289 11.147 10.992 10.818 10.564 10.19 9.09 -4 ,6274 ,KEBNE ,17018770,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:54:31 CET,0.0 0.69 1.024 1.259 1.429 1.597 1.76 1.917 2.19 2.302 2.418 2.618 2.759 2.847 2.999 3.153 3.298 3.365 3.503 3.623 3.787 3.901 4.022 4.186 4.343 4.504 4.657 4.798 4.985 5.155 5.32 5.534 5.729 5.908 6.124 6.378 6.615 6.874 7.156 7.457 7.778 8.121 8.521 8.947 9.46 10.009 10.633 11.377 12.259 13.275 14.411 15.18 15.547 15.723 15.775 15.747 15.684 15.611 15.541 15.445 15.337 15.231 15.131 15.035 14.938 14.844 14.738 14.639 14.553 14.457 14.343 14.249 14.154 14.053 13.968 13.876 13.787 13.691 13.582 13.504 13.42 13.299 13.219 13.128 13.08 12.985 12.881 12.763 12.703 12.618 12.502 12.422 12.335 12.141 12.023 11.88 11.722 11.556 11.388 11.195 10.734 -5 ,23173 ,KEBNE ,17018771,Wed Dec 22 00:26:56 CET,Wed Dec 22 01:54:12 CET,0.0 0.59 0.913 1.16 1.371 1.561 1.738 1.902 2.181 2.309 2.426 2.595 2.717 2.793 2.944 3.087 3.241 3.32 3.457 3.589 3.772 3.888 4.011 4.188 4.339 4.482 4.623 4.762 4.938 5.105 5.275 5.479 5.676 5.872 6.093 6.341 6.58 6.835 7.115 7.416 7.741 8.115 8.538 8.944 9.425 9.976 10.595 11.28 12.093 13.056 14.094 14.82 15.203 15.38 15.462 15.462 15.406 15.335 15.249 15.131 15.02 14.93 14.844 14.747 14.64 14.532 14.416 14.311 14.217 14.119 14.006 13.902 13.799 13.693 13.615 13.531 13.428 13.315 13.202 13.124 13.036 12.913 12.832 12.738 12.69 12.592 12.479 12.362 12.301 12.207 12.077 11.994 11.906 11.731 11.644 11.532 11.396 11.232 11.003 10.652 10.144 -6 ,15695 ,KEBNE ,17018772,Wed Dec 22 00:26:55 CET,Wed Dec 22 01:54:11 CET,0.0 0.882 1.214 1.454 1.631 1.776 1.907 2.019 2.251 2.357 2.447 2.584 2.705 2.78 2.918 3.052 3.182 3.248 3.371 3.498 3.691 3.812 3.927 4.101 4.273 4.427 4.573 4.713 4.899 5.077 5.243 5.454 5.671 5.874 6.097 6.36 6.619 6.897 7.183 7.496 7.83 8.184 8.591 9.018 9.539 10.106 10.724 11.429 12.298 13.256 14.279 15.06 15.428 15.579 15.629 15.618 15.578 15.505 15.391 15.268 15.164 15.058 14.948 14.834 14.721 14.616 14.512 14.423 14.338 14.239 14.13 14.041 13.938 13.833 13.755 13.669 13.583 13.487 13.38 13.301 13.215 13.086 12.976 12.851 12.798 12.694 12.56 12.418 12.351 12.262 12.156 12.084 11.999 11.803 11.693 11.582 11.461 11.293 11.073 10.732 9.875 -7 ,32115 ,KEBNE ,17018773,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:56:27 CET,0.0 0.695 1.036 1.301 1.509 1.693 1.845 1.967 2.187 2.294 2.407 2.605 2.753 2.85 3.039 3.211 3.363 3.434 3.565 3.692 3.874 3.994 4.11 4.267 4.42 4.571 4.721 4.868 5.053 5.224 5.391 5.603 5.817 6.026 6.287 6.587 6.848 7.112 7.396 7.705 8.033 8.405 8.825 9.23 9.724 10.28 10.896 11.609 12.459 13.422 14.494 15.249 15.624 15.805 15.886 15.905 15.859 15.772 15.675 15.563 15.448 15.335 15.221 15.108 15.014 14.923 14.822 14.736 14.644 14.544 14.44 14.345 14.247 14.142 14.053 13.954 13.861 13.761 13.645 13.569 13.496 13.386 13.305 13.207 13.155 13.054 12.942 12.821 12.751 12.649 12.507 12.418 12.33 12.13 12.019 11.896 11.767 11.618 11.422 11.115 10.281 -8 ,16928 ,KEBNE ,17018774,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:56:33 CET,0.0 0.825 1.185 1.43 1.625 1.797 1.936 2.055 2.26 2.358 2.457 2.601 2.719 2.798 2.949 3.08 3.204 3.271 3.407 3.539 3.728 3.851 3.965 4.131 4.293 4.443 4.588 4.732 4.911 5.078 5.243 5.446 5.64 5.826 6.047 6.289 6.534 6.823 7.11 7.398 7.716 8.079 8.501 8.923 9.403 9.956 10.597 11.3 12.128 13.061 14.072 14.799 15.107 15.235 15.282 15.269 15.219 15.13 15.02 14.884 14.763 14.668 14.564 14.435 14.312 14.202 14.073 13.963 13.874 13.778 13.682 13.601 13.502 13.383 13.3 13.216 13.125 13.029 12.906 12.807 12.716 12.574 12.465 12.352 12.297 12.191 12.078 11.947 11.873 11.768 11.625 11.535 11.44 11.243 11.135 11.005 10.874 10.715 10.515 10.277 9.583 -9 ,5760 ,KEBNE ,17018775,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:56:43 CET,0.0 0.769 1.047 1.277 1.446 1.621 1.777 1.898 2.116 2.22 2.311 2.44 2.566 2.65 2.809 2.956 3.091 3.166 3.318 3.455 3.645 3.768 3.882 4.045 4.202 4.352 4.501 4.648 4.83 5.002 5.17 5.372 5.565 5.761 6.003 6.265 6.506 6.771 7.071 7.392 7.703 8.056 8.47 8.875 9.357 9.908 10.531 11.216 12.019 12.937 13.992 14.773 15.092 15.229 15.275 15.246 15.181 15.11 15.038 14.924 14.805 14.703 14.597 14.489 14.382 14.269 14.15 14.046 13.951 13.839 13.726 13.637 13.532 13.422 13.329 13.216 13.106 12.996 12.884 12.803 12.715 12.576 12.471 12.357 12.299 12.176 12.04 11.872 11.785 11.679 11.532 11.445 11.36 11.165 11.054 10.935 10.823 10.703 10.538 10.292 9.555 -10 ,22013 ,KEBNE ,17018776,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:57:03 CET,0.0 0.742 1.071 1.277 1.412 1.54 1.674 1.802 2.029 2.137 2.237 2.376 2.503 2.597 2.78 2.944 3.092 3.162 3.309 3.457 3.646 3.764 3.884 4.048 4.2 4.346 4.498 4.644 4.818 4.99 5.163 5.368 5.561 5.744 5.965 6.227 6.473 6.74 7.026 7.322 7.634 8.003 8.44 8.873 9.375 9.937 10.579 11.266 12.054 12.984 13.996 14.757 15.141 15.308 15.371 15.36 15.31 15.227 15.132 15.039 14.934 14.831 14.731 14.619 14.507 14.407 14.293 14.181 14.09 13.989 13.875 13.781 13.689 13.588 13.507 13.414 13.314 13.213 13.099 13.022 12.946 12.826 12.744 12.654 12.604 12.494 12.382 12.271 12.208 12.117 11.99 11.915 11.846 11.649 11.52 11.398 11.278 11.125 10.923 10.666 10.073 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt deleted file mode 100644 index bee750a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28442 ,KEBNE ,17018777,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:56:19 CET,0.0 0.816 1.103 1.357 1.571 1.75 1.912 2.059 2.327 2.457 2.579 2.77 2.935 3.053 3.273 3.473 3.646 3.725 3.887 4.046 4.273 4.419 4.556 4.752 4.953 5.151 5.339 5.53 5.766 5.989 6.214 6.487 6.749 6.995 7.281 7.615 7.938 8.286 8.664 9.077 9.512 10.006 10.595 11.196 11.902 12.704 13.645 14.691 15.965 17.508 19.402 21.046 21.974 22.544 22.906 23.139 23.252 23.294 23.33 23.346 23.322 23.261 23.19 23.13 23.069 22.993 22.904 22.804 22.701 22.604 22.506 22.421 22.327 22.223 22.137 22.047 21.952 21.846 21.724 21.636 21.547 21.393 21.271 21.148 21.086 20.955 20.801 20.633 20.545 20.427 20.255 20.142 20.015 19.753 19.619 19.482 19.322 19.11 18.797 18.35 16.548 -2 ,4081 ,KEBNE ,17018778,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:58:08 CET,0.0 0.667 0.968 1.194 1.393 1.595 1.772 1.919 2.22 2.36 2.479 2.656 2.807 2.91 3.127 3.338 3.521 3.601 3.75 3.91 4.155 4.302 4.435 4.632 4.824 5.015 5.193 5.366 5.605 5.833 6.046 6.301 6.55 6.797 7.085 7.415 7.735 8.1 8.499 8.912 9.342 9.828 10.409 11.001 11.705 12.497 13.421 14.483 15.739 17.285 19.186 20.763 21.725 22.33 22.697 22.897 22.987 23.037 23.07 23.091 23.057 22.99 22.932 22.873 22.8 22.707 22.608 22.508 22.409 22.304 22.191 22.094 21.997 21.903 21.824 21.738 21.632 21.5 21.373 21.281 21.183 21.03 20.904 20.76 20.687 20.554 20.415 20.25 20.158 20.029 19.844 19.728 19.601 19.361 19.196 18.968 18.707 18.421 18.113 17.677 16.217 -3 ,3155 ,KEBNE ,17018779,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:57:42 CET,0.0 0.643 0.925 1.137 1.318 1.494 1.655 1.804 2.1 2.242 2.366 2.543 2.691 2.796 3.009 3.213 3.403 3.493 3.676 3.841 4.077 4.234 4.391 4.606 4.791 4.979 5.163 5.345 5.588 5.811 6.024 6.287 6.531 6.769 7.06 7.39 7.7 8.042 8.423 8.839 9.283 9.805 10.402 11.004 11.742 12.557 13.516 14.603 15.919 17.522 19.418 20.957 21.79 22.304 22.642 22.855 22.97 23.038 23.068 23.074 23.069 23.051 23.011 22.942 22.877 22.823 22.742 22.656 22.574 22.477 22.375 22.289 22.197 22.086 21.993 21.889 21.786 21.685 21.561 21.457 21.327 21.134 21.01 20.877 20.807 20.659 20.507 20.332 20.235 20.115 19.937 19.821 19.7 19.423 19.254 19.068 18.844 18.556 18.217 17.727 16.01 -4 ,18678 ,KEBNE ,17018780,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:56:03 CET,0.0 0.848 1.159 1.378 1.526 1.691 1.864 2.01 2.25 2.358 2.469 2.638 2.788 2.886 3.061 3.237 3.423 3.51 3.668 3.817 4.02 4.159 4.297 4.492 4.683 4.878 5.081 5.283 5.551 5.797 6.009 6.268 6.518 6.763 7.06 7.385 7.697 8.04 8.418 8.832 9.267 9.763 10.35 10.951 11.65 12.431 13.364 14.447 15.704 17.208 19.148 20.82 21.734 22.302 22.683 22.882 23.0 23.097 23.146 23.146 23.114 23.063 22.987 22.89 22.792 22.707 22.604 22.507 22.432 22.348 22.241 22.137 22.032 21.91 21.794 21.674 21.552 21.436 21.297 21.179 21.066 20.907 20.787 20.662 20.599 20.447 20.276 20.1 20.005 19.881 19.671 19.536 19.4 19.105 18.931 18.729 18.511 18.235 17.884 17.312 15.3 -5 ,19534 ,KEBNE ,17018781,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:56:27 CET,0.0 0.652 0.943 1.185 1.378 1.554 1.712 1.865 2.16 2.286 2.401 2.567 2.711 2.813 3.002 3.179 3.35 3.436 3.599 3.757 3.995 4.146 4.284 4.49 4.685 4.875 5.067 5.251 5.486 5.703 5.918 6.187 6.439 6.676 6.972 7.309 7.618 7.954 8.322 8.726 9.161 9.654 10.236 10.84 11.537 12.327 13.27 14.366 15.665 17.199 19.115 20.701 21.607 22.173 22.547 22.773 22.905 22.983 23.025 23.037 23.011 22.965 22.9 22.822 22.747 22.673 22.577 22.495 22.409 22.303 22.195 22.102 21.987 21.858 21.757 21.643 21.516 21.397 21.28 21.187 21.085 20.933 20.829 20.708 20.643 20.498 20.343 20.181 20.095 19.976 19.79 19.674 19.539 19.234 19.069 18.882 18.69 18.469 18.167 17.738 15.825 -6 ,24214 ,KEBNE ,17018782,Wed Dec 22 00:28:00 CET,Wed Dec 22 01:53:10 CET,0.0 0.812 1.114 1.34 1.531 1.724 1.893 2.063 2.387 2.517 2.624 2.759 2.904 3.001 3.197 3.405 3.609 3.704 3.872 4.041 4.287 4.438 4.581 4.794 4.999 5.19 5.375 5.55 5.774 5.99 6.21 6.496 6.763 7.024 7.329 7.668 7.994 8.345 8.714 9.111 9.536 10.026 10.619 11.223 11.938 12.735 13.679 14.774 16.071 17.606 19.451 20.946 21.821 22.387 22.735 22.929 23.024 23.079 23.103 23.095 23.067 23.017 22.953 22.865 22.771 22.69 22.599 22.518 22.434 22.337 22.227 22.129 22.032 21.92 21.829 21.731 21.627 21.518 21.391 21.3 21.203 21.047 20.939 20.82 20.752 20.599 20.448 20.28 20.189 20.076 19.916 19.811 19.696 19.401 19.221 19.031 18.849 18.622 18.298 17.879 15.818 -7 ,8802 ,KEBNE ,17018783,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:55:59 CET,0.0 0.666 0.909 1.11 1.305 1.476 1.622 1.749 2.003 2.143 2.27 2.429 2.575 2.671 2.856 3.048 3.233 3.321 3.493 3.65 3.861 3.993 4.121 4.317 4.5 4.678 4.862 5.038 5.275 5.512 5.739 6.004 6.256 6.5 6.792 7.125 7.446 7.794 8.169 8.579 9.019 9.52 10.101 10.689 11.385 12.167 13.097 14.157 15.408 16.956 18.882 20.496 21.432 21.971 22.295 22.516 22.651 22.719 22.774 22.8 22.78 22.718 22.621 22.509 22.398 22.297 22.183 22.085 22.004 21.924 21.847 21.772 21.667 21.545 21.447 21.345 21.23 21.099 20.963 20.871 20.777 20.611 20.491 20.372 20.312 20.172 20.011 19.841 19.747 19.622 19.427 19.324 19.215 18.933 18.776 18.62 18.433 18.228 17.978 17.491 15.898 -8 ,25903 ,KEBNE ,17018784,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:56:17 CET,0.0 0.655 0.896 1.109 1.309 1.48 1.635 1.778 2.053 2.174 2.279 2.439 2.588 2.69 2.889 3.076 3.243 3.327 3.491 3.657 3.892 4.04 4.197 4.438 4.672 4.894 5.103 5.303 5.561 5.815 6.055 6.323 6.574 6.823 7.118 7.444 7.761 8.11 8.497 8.931 9.379 9.865 10.453 11.047 11.729 12.518 13.457 14.537 15.82 17.364 19.317 20.946 21.861 22.448 22.818 23.033 23.176 23.268 23.299 23.277 23.243 23.217 23.179 23.134 23.078 23.001 22.912 22.815 22.727 22.638 22.526 22.434 22.333 22.2 22.09 22.0 21.903 21.8 21.695 21.605 21.508 21.354 21.246 21.141 21.083 20.959 20.807 20.6 20.495 20.38 20.21 20.104 19.989 19.698 19.542 19.373 19.175 18.927 18.6 18.195 16.937 -9 ,14678 ,KEBNE ,17018785,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:57:35 CET,0.0 0.801 1.127 1.349 1.532 1.692 1.838 1.986 2.247 2.362 2.469 2.63 2.782 2.877 3.064 3.249 3.424 3.508 3.673 3.828 4.034 4.169 4.306 4.501 4.686 4.871 5.053 5.233 5.461 5.679 5.902 6.184 6.459 6.716 7.012 7.345 7.658 8.004 8.388 8.802 9.24 9.732 10.312 10.905 11.594 12.372 13.302 14.362 15.613 17.165 19.067 20.619 21.521 22.067 22.421 22.643 22.757 22.799 22.783 22.75 22.709 22.646 22.572 22.483 22.384 22.291 22.197 22.112 22.019 21.92 21.824 21.731 21.628 21.511 21.419 21.327 21.221 21.103 20.966 20.871 20.778 20.628 20.52 20.394 20.324 20.181 20.012 19.824 19.735 19.629 19.456 19.331 19.196 18.902 18.735 18.567 18.353 18.074 17.676 17.095 14.563 -10 ,15268 ,KEBNE ,17018786,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:50 CET,0.0 0.763 1.065 1.307 1.52 1.722 1.906 2.056 2.31 2.438 2.562 2.743 2.899 3.008 3.209 3.403 3.594 3.687 3.86 4.027 4.276 4.434 4.585 4.804 5.01 5.206 5.397 5.58 5.824 6.053 6.264 6.516 6.762 7.014 7.303 7.626 7.951 8.314 8.701 9.105 9.539 10.034 10.616 11.22 11.929 12.727 13.673 14.74 15.977 17.463 19.347 20.989 21.916 22.484 22.827 23.029 23.152 23.188 23.192 23.192 23.17 23.121 23.054 22.991 22.917 22.844 22.754 22.652 22.561 22.466 22.354 22.273 22.192 22.104 22.031 21.932 21.829 21.72 21.594 21.509 21.412 21.246 21.136 21.014 20.946 20.8 20.645 20.482 20.393 20.289 20.154 20.052 19.933 19.673 19.498 19.305 19.11 18.877 18.556 18.095 16.864 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt deleted file mode 100644 index 324c14f9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10474 ,KEBNE ,17018787,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:34 CET,0.0 0.474 0.692 0.869 1.055 1.224 1.359 1.487 1.724 1.821 1.908 2.042 2.165 2.251 2.394 2.528 2.655 2.714 2.832 2.951 3.126 3.238 3.345 3.494 3.633 3.765 3.892 4.008 4.15 4.291 4.418 4.564 4.703 4.833 4.993 5.184 5.357 5.531 5.718 5.917 6.112 6.328 6.59 6.844 7.142 7.468 7.793 8.124 8.473 8.78 8.941 8.857 8.603 8.293 7.966 7.611 7.283 6.972 6.676 6.362 6.074 5.815 5.564 5.316 5.087 4.877 4.653 4.448 4.267 4.077 3.867 3.693 3.521 3.347 3.202 3.038 2.861 2.679 2.511 2.395 2.262 2.032 1.868 1.71 1.633 1.465 1.282 1.089 0.983 0.83 0.629 0.522 0.394 0.085 -0.084 -0.273 -0.467 -0.686 -0.946 -1.342 -2.756 -2 ,16218 ,KEBNE ,17018788,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:47 CET,0.0 0.387 0.591 0.753 0.887 1.0 1.115 1.231 1.418 1.504 1.591 1.707 1.809 1.871 1.99 2.097 2.205 2.258 2.366 2.47 2.614 2.71 2.805 2.947 3.081 3.207 3.324 3.434 3.588 3.734 3.869 4.029 4.188 4.336 4.494 4.672 4.832 5.008 5.199 5.392 5.595 5.816 6.081 6.36 6.672 7.001 7.361 7.722 8.115 8.484 8.684 8.588 8.344 8.041 7.693 7.351 7.048 6.751 6.474 6.178 5.884 5.617 5.38 5.155 4.937 4.714 4.459 4.246 4.061 3.854 3.649 3.48 3.3 3.122 2.979 2.823 2.663 2.489 2.3 2.16 2.016 1.806 1.646 1.48 1.4 1.222 1.04 0.861 0.762 0.621 0.465 0.356 0.217 -0.097 -0.274 -0.457 -0.68 -0.948 -1.23 -1.553 -2.991 -3 ,2729 ,KEBNE ,17018789,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:57:56 CET,0.0 0.518 0.801 0.99 1.147 1.29 1.406 1.503 1.69 1.779 1.861 1.995 2.109 2.183 2.316 2.444 2.568 2.628 2.751 2.859 3.009 3.11 3.212 3.354 3.479 3.596 3.712 3.823 3.962 4.097 4.22 4.366 4.507 4.65 4.811 4.991 5.19 5.414 5.637 5.863 6.094 6.354 6.644 6.914 7.229 7.589 7.936 8.253 8.57 8.875 9.105 8.987 8.677 8.361 8.05 7.706 7.362 7.024 6.716 6.39 6.078 5.791 5.545 5.307 5.064 4.853 4.629 4.418 4.233 4.04 3.83 3.656 3.483 3.302 3.164 3.008 2.836 2.666 2.495 2.366 2.232 2.027 1.876 1.719 1.641 1.473 1.285 1.072 0.95 0.79 0.574 0.436 0.28 -0.049 -0.221 -0.435 -0.653 -0.912 -1.239 -1.664 -3.099 -4 ,12665 ,KEBNE ,17018790,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:22 CET,0.0 0.511 0.73 0.931 1.113 1.245 1.367 1.497 1.727 1.829 1.922 2.042 2.146 2.21 2.333 2.459 2.584 2.643 2.765 2.87 3.009 3.1 3.185 3.304 3.424 3.542 3.655 3.76 3.894 4.016 4.129 4.27 4.404 4.536 4.69 4.868 5.042 5.23 5.429 5.623 5.817 6.037 6.3 6.56 6.837 7.123 7.436 7.77 8.118 8.43 8.609 8.542 8.284 7.928 7.581 7.272 6.982 6.687 6.403 6.107 5.848 5.614 5.377 5.154 4.952 4.752 4.535 4.341 4.156 3.96 3.761 3.596 3.424 3.236 3.094 2.951 2.79 2.612 2.437 2.319 2.187 1.97 1.821 1.668 1.596 1.452 1.271 1.06 0.957 0.817 0.623 0.503 0.38 0.11 -0.045 -0.222 -0.433 -0.635 -0.892 -1.275 -2.069 -5 ,23416 ,KEBNE ,17018791,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:58:05 CET,0.0 0.536 0.733 0.873 1.011 1.118 1.232 1.349 1.542 1.622 1.696 1.807 1.906 1.969 2.097 2.216 2.324 2.379 2.488 2.6 2.762 2.873 2.982 3.121 3.254 3.386 3.512 3.637 3.799 3.942 4.073 4.231 4.387 4.544 4.708 4.875 5.04 5.223 5.401 5.605 5.827 6.068 6.334 6.585 6.874 7.18 7.504 7.855 8.201 8.497 8.712 8.559 8.257 7.925 7.579 7.192 6.841 6.536 6.252 5.969 5.709 5.428 5.159 4.922 4.697 4.48 4.243 4.035 3.856 3.657 3.439 3.251 3.057 2.87 2.725 2.572 2.414 2.241 2.06 1.937 1.807 1.608 1.463 1.305 1.226 1.068 0.895 0.694 0.586 0.437 0.219 0.079 -0.075 -0.416 -0.599 -0.788 -0.988 -1.223 -1.531 -2.033 -3.414 -6 ,30639 ,KEBNE ,17018792,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:56:07 CET,0.0 0.364 0.592 0.759 0.892 1.02 1.145 1.264 1.471 1.558 1.644 1.768 1.87 1.932 2.045 2.149 2.25 2.3 2.397 2.49 2.633 2.727 2.812 2.94 3.068 3.178 3.282 3.394 3.559 3.731 3.892 4.07 4.232 4.381 4.553 4.736 4.907 5.093 5.287 5.501 5.731 5.975 6.235 6.478 6.75 7.045 7.38 7.724 8.036 8.335 8.549 8.467 8.168 7.756 7.365 6.989 6.626 6.295 6.023 5.723 5.439 5.182 4.929 4.69 4.448 4.214 3.986 3.787 3.605 3.407 3.199 3.034 2.861 2.668 2.514 2.355 2.196 2.021 1.833 1.712 1.585 1.372 1.221 1.061 0.978 0.793 0.612 0.441 0.346 0.196 0.005 -0.11 -0.234 -0.487 -0.642 -0.818 -1.019 -1.253 -1.533 -1.866 -2.599 -7 ,28895 ,KEBNE ,17018793,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:58:02 CET,0.0 0.306 0.494 0.64 0.768 0.894 1.014 1.121 1.299 1.381 1.456 1.566 1.675 1.744 1.882 2.01 2.126 2.183 2.294 2.408 2.556 2.641 2.734 2.874 2.999 3.124 3.247 3.357 3.5 3.643 3.79 3.953 4.103 4.253 4.41 4.581 4.746 4.934 5.149 5.369 5.584 5.822 6.096 6.367 6.673 6.97 7.303 7.626 7.938 8.234 8.416 8.293 8.02 7.666 7.262 6.868 6.515 6.205 5.914 5.619 5.374 5.128 4.883 4.638 4.404 4.203 3.989 3.772 3.584 3.393 3.172 2.993 2.812 2.607 2.442 2.267 2.091 1.896 1.689 1.555 1.412 1.175 1.01 0.849 0.768 0.595 0.397 0.165 0.045 -0.102 -0.311 -0.455 -0.591 -0.873 -1.041 -1.219 -1.435 -1.706 -2.011 -2.42 -3.505 -8 ,21169 ,KEBNE ,17018794,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:57:51 CET,0.0 0.393 0.55 0.686 0.812 0.923 1.038 1.16 1.375 1.467 1.551 1.673 1.781 1.849 1.977 2.109 2.242 2.301 2.411 2.528 2.685 2.78 2.876 3.009 3.133 3.253 3.363 3.47 3.612 3.747 3.875 4.051 4.22 4.363 4.531 4.719 4.886 5.058 5.253 5.461 5.658 5.866 6.107 6.336 6.593 6.881 7.183 7.484 7.788 8.074 8.304 8.248 7.96 7.613 7.281 6.92 6.586 6.287 5.997 5.683 5.399 5.15 4.93 4.706 4.477 4.282 4.072 3.884 3.716 3.529 3.314 3.131 2.95 2.752 2.591 2.431 2.278 2.114 1.936 1.816 1.694 1.489 1.341 1.188 1.107 0.931 0.757 0.58 0.482 0.342 0.155 0.036 -0.091 -0.365 -0.516 -0.698 -0.908 -1.123 -1.375 -1.76 -2.853 -9 ,9024 ,KEBNE ,17018795,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:28 CET,0.0 0.415 0.7 0.901 1.045 1.184 1.325 1.444 1.64 1.733 1.834 1.984 2.098 2.164 2.287 2.421 2.541 2.597 2.699 2.788 2.923 3.012 3.11 3.272 3.426 3.565 3.683 3.796 3.945 4.075 4.206 4.387 4.547 4.679 4.837 5.008 5.166 5.342 5.553 5.791 6.027 6.28 6.566 6.844 7.135 7.431 7.75 8.097 8.458 8.753 8.897 8.761 8.454 8.06 7.683 7.33 6.984 6.642 6.34 6.044 5.745 5.453 5.177 4.907 4.664 4.455 4.229 4.032 3.851 3.654 3.456 3.286 3.104 2.921 2.785 2.637 2.478 2.318 2.15 2.016 1.879 1.665 1.503 1.343 1.265 1.105 0.925 0.725 0.622 0.478 0.273 0.129 -0.003 -0.274 -0.425 -0.585 -0.781 -0.995 -1.279 -1.646 -2.773 -10 ,4830 ,KEBNE ,17018796,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:57:40 CET,0.0 0.317 0.482 0.616 0.738 0.862 0.982 1.09 1.286 1.374 1.458 1.578 1.691 1.767 1.906 2.031 2.156 2.222 2.34 2.447 2.593 2.685 2.78 2.911 3.032 3.149 3.257 3.37 3.524 3.664 3.787 3.937 4.086 4.224 4.38 4.568 4.75 4.934 5.12 5.322 5.53 5.76 6.022 6.251 6.52 6.827 7.143 7.471 7.822 8.157 8.322 8.177 7.898 7.569 7.223 6.882 6.567 6.247 5.936 5.59 5.303 5.06 4.82 4.565 4.319 4.109 3.891 3.694 3.522 3.337 3.137 2.964 2.776 2.579 2.427 2.267 2.111 1.955 1.788 1.653 1.506 1.293 1.149 0.994 0.913 0.757 0.593 0.409 0.305 0.162 -0.028 -0.154 -0.297 -0.62 -0.787 -0.969 -1.171 -1.389 -1.665 -2.012 -2.82 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_20_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_20_17.txt deleted file mode 100644 index 32c645af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_20_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14087 ,KEBNE ,17018797,Wed Dec 22 00:28:03 CET,Wed Dec 22 01:56:01 CET,0.0 0.644 0.979 1.223 1.409 1.568 1.73 1.876 2.141 2.262 2.375 2.543 2.662 2.747 2.906 3.053 3.197 3.271 3.422 3.552 3.731 3.848 3.958 4.111 4.269 4.443 4.6 4.74 4.927 5.109 5.273 5.468 5.661 5.853 6.063 6.286 6.485 6.695 6.933 7.187 7.445 7.743 8.078 8.384 8.747 9.129 9.524 9.937 10.385 10.802 11.112 11.092 10.839 10.459 10.048 9.695 9.37 9.062 8.794 8.504 8.251 8.02 7.783 7.561 7.345 7.138 6.924 6.726 6.563 6.401 6.227 6.079 5.924 5.756 5.627 5.488 5.327 5.169 5.012 4.901 4.774 4.586 4.463 4.332 4.263 4.108 3.956 3.808 3.715 3.588 3.424 3.328 3.223 2.972 2.833 2.676 2.494 2.321 2.132 1.83 1.01 -2 ,18253 ,KEBNE ,17018798,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:22 CET,0.0 1.058 1.421 1.71 1.969 2.165 2.327 2.487 2.777 2.907 3.025 3.205 3.336 3.429 3.604 3.764 3.917 3.989 4.133 4.284 4.499 4.633 4.759 4.926 5.083 5.238 5.397 5.556 5.75 5.927 6.095 6.297 6.493 6.676 6.877 7.092 7.31 7.562 7.813 8.073 8.34 8.614 8.945 9.295 9.683 10.079 10.505 10.932 11.36 11.751 12.03 11.981 11.699 11.356 11.018 10.681 10.363 10.085 9.852 9.595 9.349 9.125 8.913 8.696 8.484 8.303 8.104 7.907 7.744 7.578 7.39 7.234 7.062 6.877 6.736 6.588 6.442 6.286 6.11 5.988 5.866 5.672 5.539 5.402 5.324 5.154 4.987 4.797 4.688 4.555 4.353 4.233 4.111 3.847 3.698 3.532 3.33 3.102 2.856 2.509 1.287 -3 ,10907 ,KEBNE ,17018799,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:55:51 CET,0.0 1.363 1.747 1.981 2.206 2.418 2.609 2.772 3.044 3.165 3.279 3.456 3.575 3.667 3.848 4.01 4.18 4.262 4.413 4.556 4.746 4.866 4.982 5.157 5.331 5.498 5.653 5.8 5.983 6.157 6.329 6.536 6.725 6.904 7.113 7.353 7.583 7.81 8.047 8.299 8.56 8.841 9.146 9.452 9.838 10.262 10.706 11.146 11.551 11.909 12.164 12.146 11.896 11.534 11.19 10.833 10.493 10.175 9.899 9.603 9.319 9.065 8.836 8.629 8.416 8.205 7.99 7.805 7.643 7.479 7.296 7.138 6.98 6.813 6.687 6.551 6.407 6.272 6.133 6.021 5.898 5.712 5.583 5.45 5.379 5.23 5.074 4.896 4.808 4.693 4.51 4.398 4.295 4.075 3.938 3.774 3.595 3.378 3.1 2.73 1.547 -4 ,3631 ,KEBNE ,17018800,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:55:50 CET,0.0 1.077 1.478 1.764 1.998 2.188 2.342 2.487 2.775 2.9 3.01 3.2 3.342 3.446 3.645 3.83 3.992 4.067 4.208 4.338 4.525 4.644 4.764 4.936 5.097 5.255 5.407 5.553 5.748 5.93 6.096 6.295 6.481 6.658 6.872 7.099 7.292 7.534 7.792 8.032 8.291 8.579 8.913 9.23 9.56 9.932 10.363 10.812 11.281 11.716 12.019 11.99 11.746 11.422 11.086 10.731 10.386 10.068 9.774 9.47 9.206 8.974 8.753 8.536 8.336 8.143 7.928 7.749 7.593 7.421 7.235 7.08 6.929 6.774 6.639 6.48 6.3 6.084 5.867 5.737 5.605 5.411 5.286 5.154 5.083 4.926 4.768 4.611 4.527 4.42 4.261 4.152 4.029 3.766 3.632 3.489 3.327 3.152 2.939 2.639 1.908 -5 ,29928 ,KEBNE ,17018801,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:56:01 CET,0.0 0.778 1.161 1.447 1.674 1.878 2.055 2.212 2.501 2.628 2.748 2.929 3.059 3.161 3.358 3.541 3.72 3.809 3.965 4.091 4.26 4.374 4.484 4.643 4.807 4.957 5.1 5.252 5.449 5.623 5.78 5.965 6.132 6.288 6.482 6.698 6.901 7.125 7.37 7.621 7.882 8.18 8.512 8.836 9.185 9.548 9.936 10.344 10.796 11.203 11.497 11.353 11.009 10.687 10.339 9.983 9.64 9.264 8.928 8.613 8.354 8.121 7.877 7.656 7.458 7.272 7.075 6.885 6.715 6.53 6.335 6.183 6.013 5.831 5.698 5.548 5.386 5.229 5.06 4.939 4.823 4.631 4.478 4.318 4.24 4.085 3.923 3.742 3.648 3.523 3.334 3.213 3.072 2.782 2.621 2.454 2.283 2.068 1.786 1.415 0.638 -6 ,15068 ,KEBNE ,17018803,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:55:26 CET,0.0 0.987 1.35 1.577 1.749 1.908 2.061 2.203 2.461 2.57 2.666 2.824 2.946 3.04 3.241 3.418 3.567 3.635 3.769 3.897 4.077 4.187 4.3 4.472 4.632 4.793 4.951 5.097 5.27 5.429 5.586 5.777 5.956 6.127 6.325 6.539 6.746 6.968 7.195 7.447 7.709 7.984 8.308 8.618 8.961 9.337 9.73 10.155 10.638 11.095 11.343 11.212 10.903 10.569 10.239 9.892 9.563 9.252 8.974 8.682 8.419 8.196 7.969 7.727 7.504 7.3 7.083 6.889 6.718 6.539 6.356 6.197 6.027 5.847 5.698 5.543 5.387 5.226 5.063 4.946 4.817 4.626 4.494 4.349 4.273 4.106 3.943 3.777 3.687 3.57 3.402 3.304 3.191 2.887 2.709 2.524 2.336 2.146 1.9 1.513 0.268 -7 ,7427 ,KEBNE ,17018804,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:19 CET,0.0 1.384 1.698 1.919 2.095 2.254 2.408 2.531 2.744 2.844 2.944 3.092 3.201 3.29 3.473 3.626 3.764 3.836 3.967 4.077 4.259 4.393 4.515 4.673 4.83 4.98 5.116 5.239 5.411 5.587 5.746 5.931 6.112 6.281 6.472 6.692 6.908 7.145 7.386 7.64 7.915 8.238 8.586 8.909 9.279 9.643 10.035 10.473 10.946 11.414 11.759 11.683 11.375 11.038 10.735 10.438 10.138 9.832 9.552 9.28 9.031 8.79 8.567 8.355 8.155 7.966 7.765 7.586 7.41 7.233 7.063 6.911 6.74 6.556 6.418 6.285 6.144 5.998 5.836 5.714 5.579 5.35 5.193 5.055 4.989 4.832 4.672 4.53 4.45 4.331 4.171 4.077 3.972 3.734 3.587 3.427 3.254 3.039 2.832 2.564 1.633 -8 ,5876 ,KEBNE ,17018805,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:57:29 CET,0.0 0.91 1.281 1.574 1.821 2.015 2.18 2.336 2.642 2.787 2.915 3.085 3.213 3.324 3.527 3.696 3.841 3.904 4.024 4.143 4.314 4.419 4.522 4.677 4.83 4.975 5.114 5.25 5.419 5.576 5.727 5.905 6.065 6.227 6.42 6.634 6.841 7.061 7.307 7.565 7.83 8.113 8.41 8.697 9.035 9.393 9.765 10.173 10.617 11.018 11.272 11.2 10.887 10.532 10.202 9.887 9.585 9.246 8.955 8.654 8.358 8.099 7.857 7.613 7.376 7.167 6.955 6.767 6.598 6.414 6.219 6.062 5.884 5.692 5.551 5.407 5.252 5.095 4.941 4.829 4.709 4.519 4.375 4.234 4.167 4.019 3.852 3.677 3.587 3.471 3.295 3.185 3.084 2.873 2.733 2.579 2.421 2.233 2.004 1.708 1.127 -9 ,4232 ,KEBNE ,17018806,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:55:35 CET,0.0 1.186 1.567 1.829 2.037 2.23 2.423 2.601 2.909 3.046 3.177 3.395 3.524 3.61 3.805 3.993 4.153 4.23 4.363 4.496 4.714 4.851 4.984 5.166 5.325 5.489 5.643 5.787 5.971 6.148 6.321 6.52 6.69 6.849 7.046 7.263 7.454 7.656 7.888 8.147 8.409 8.69 9.015 9.327 9.67 10.011 10.379 10.785 11.215 11.615 11.818 11.74 11.507 11.186 10.871 10.573 10.25 9.908 9.616 9.325 9.063 8.81 8.574 8.356 8.15 7.962 7.763 7.587 7.434 7.267 7.09 6.951 6.797 6.631 6.499 6.354 6.204 6.049 5.89 5.786 5.678 5.493 5.355 5.209 5.14 4.987 4.824 4.663 4.572 4.442 4.237 4.123 4.007 3.737 3.582 3.408 3.197 2.96 2.684 2.274 0.909 -10 ,27750 ,KEBNE ,17018807,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:55:52 CET,0.0 0.763 1.034 1.237 1.423 1.606 1.775 1.913 2.145 2.26 2.373 2.54 2.662 2.753 2.932 3.104 3.261 3.326 3.442 3.555 3.729 3.842 3.956 4.124 4.279 4.423 4.571 4.72 4.9 5.056 5.201 5.38 5.555 5.732 5.938 6.159 6.367 6.606 6.867 7.124 7.375 7.647 7.979 8.303 8.653 9.034 9.432 9.868 10.337 10.729 10.926 10.818 10.576 10.271 9.94 9.633 9.329 9.013 8.741 8.453 8.193 7.967 7.755 7.535 7.324 7.135 6.928 6.741 6.584 6.425 6.251 6.103 5.954 5.789 5.655 5.516 5.365 5.22 5.079 4.977 4.849 4.636 4.496 4.344 4.272 4.112 3.93 3.738 3.634 3.505 3.303 3.188 3.073 2.806 2.651 2.499 2.336 2.133 1.879 1.575 0.297 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_20_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_20_1h1r.txt deleted file mode 100644 index f5d1d226..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_20_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17713 ,KEBNE ,17018808,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:55:48 CET,0.0 1.079 1.434 1.663 1.872 2.086 2.278 2.442 2.704 2.827 2.955 3.149 3.272 3.35 3.506 3.653 3.8 3.882 4.037 4.176 4.385 4.526 4.651 4.809 4.961 5.106 5.242 5.372 5.544 5.719 5.886 6.084 6.27 6.443 6.639 6.855 7.074 7.325 7.586 7.846 8.112 8.415 8.762 9.082 9.434 9.815 10.228 10.673 11.144 11.619 11.954 11.883 11.691 11.434 11.134 10.855 10.567 10.271 10.017 9.743 9.486 9.253 9.041 8.838 8.638 8.453 8.255 8.069 7.91 7.75 7.581 7.439 7.278 7.108 6.985 6.853 6.707 6.554 6.377 6.254 6.141 5.956 5.824 5.689 5.617 5.471 5.32 5.151 5.059 4.936 4.768 4.666 4.546 4.3 4.176 4.016 3.829 3.604 3.333 2.986 1.865 -2 ,23874 ,KEBNE ,17018809,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:22 CET,0.0 0.822 1.147 1.404 1.621 1.792 1.938 2.06 2.322 2.459 2.578 2.76 2.889 2.992 3.196 3.363 3.511 3.578 3.705 3.837 4.025 4.144 4.256 4.407 4.551 4.692 4.834 4.976 5.162 5.34 5.506 5.71 5.901 6.086 6.298 6.522 6.736 6.97 7.216 7.473 7.752 8.049 8.366 8.685 9.061 9.475 9.908 10.344 10.846 11.368 11.827 11.904 11.702 11.393 11.077 10.747 10.44 10.168 9.906 9.628 9.391 9.173 8.958 8.743 8.543 8.355 8.151 7.961 7.791 7.616 7.418 7.249 7.078 6.907 6.769 6.625 6.478 6.321 6.162 6.038 5.904 5.713 5.569 5.42 5.349 5.198 5.029 4.849 4.756 4.636 4.446 4.331 4.203 3.927 3.791 3.651 3.48 3.277 3.031 2.646 1.318 -3 ,23993 ,KEBNE ,17018810,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:57:29 CET,0.0 0.8 1.143 1.386 1.601 1.79 1.949 2.104 2.378 2.488 2.582 2.763 2.895 2.979 3.134 3.284 3.424 3.49 3.62 3.748 3.934 4.05 4.158 4.315 4.462 4.603 4.745 4.886 5.052 5.195 5.343 5.531 5.705 5.866 6.065 6.295 6.503 6.722 6.967 7.222 7.481 7.774 8.095 8.408 8.771 9.176 9.624 10.093 10.556 10.974 11.316 11.291 11.071 10.807 10.495 10.176 9.887 9.604 9.338 9.06 8.816 8.586 8.369 8.159 7.956 7.773 7.581 7.407 7.244 7.076 6.899 6.752 6.6 6.439 6.319 6.191 6.056 5.909 5.753 5.642 5.524 5.341 5.219 5.092 5.023 4.87 4.717 4.548 4.453 4.333 4.133 4.008 3.878 3.628 3.488 3.322 3.135 2.919 2.625 2.185 1.0 -4 ,27458 ,KEBNE ,17018811,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:55:31 CET,0.0 0.834 1.166 1.406 1.62 1.835 2.02 2.162 2.407 2.525 2.636 2.8 2.924 3.023 3.199 3.361 3.519 3.599 3.746 3.872 4.06 4.192 4.318 4.492 4.665 4.825 4.959 5.093 5.28 5.458 5.625 5.832 6.03 6.219 6.433 6.658 6.886 7.146 7.415 7.687 7.977 8.3 8.657 8.99 9.349 9.719 10.132 10.605 11.077 11.496 11.848 11.823 11.605 11.339 11.026 10.679 10.343 10.035 9.76 9.456 9.186 8.939 8.714 8.489 8.251 8.046 7.831 7.625 7.454 7.283 7.09 6.918 6.743 6.568 6.424 6.27 6.119 5.962 5.788 5.659 5.532 5.356 5.234 5.092 5.009 4.831 4.644 4.457 4.367 4.256 4.096 3.979 3.851 3.562 3.402 3.246 3.073 2.884 2.629 2.241 1.475 -5 ,20261 ,KEBNE ,17018812,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:19 CET,0.0 0.612 0.851 1.053 1.235 1.399 1.562 1.722 2.004 2.137 2.249 2.427 2.567 2.666 2.849 3.017 3.173 3.252 3.402 3.542 3.736 3.855 3.978 4.15 4.315 4.473 4.621 4.773 4.973 5.149 5.308 5.499 5.684 5.868 6.075 6.295 6.509 6.765 7.032 7.292 7.561 7.845 8.161 8.484 8.859 9.247 9.673 10.122 10.574 10.982 11.258 11.278 11.094 10.817 10.537 10.262 9.977 9.712 9.456 9.157 8.91 8.682 8.453 8.239 8.027 7.833 7.641 7.462 7.304 7.13 6.934 6.772 6.621 6.466 6.323 6.178 6.036 5.889 5.726 5.608 5.488 5.286 5.149 5.01 4.938 4.801 4.65 4.494 4.416 4.305 4.143 4.041 3.928 3.687 3.563 3.418 3.26 3.085 2.897 2.646 1.986 -6 ,653 ,KEBNE ,17018813,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:57:39 CET,0.0 0.635 0.901 1.099 1.262 1.419 1.564 1.69 1.928 2.037 2.136 2.286 2.405 2.486 2.627 2.756 2.893 2.96 3.086 3.208 3.385 3.506 3.624 3.78 3.919 4.06 4.208 4.353 4.529 4.69 4.848 5.042 5.229 5.398 5.581 5.8 6.01 6.228 6.472 6.731 7.002 7.293 7.62 7.951 8.334 8.72 9.135 9.569 10.028 10.531 10.879 10.887 10.681 10.383 10.068 9.744 9.442 9.152 8.869 8.569 8.323 8.094 7.864 7.641 7.44 7.237 7.007 6.815 6.648 6.479 6.313 6.168 6.006 5.841 5.712 5.566 5.415 5.259 5.091 4.971 4.841 4.652 4.518 4.377 4.306 4.142 3.977 3.802 3.71 3.593 3.397 3.267 3.133 2.865 2.716 2.558 2.368 2.164 1.971 1.694 0.52 -7 ,19740 ,KEBNE ,17018814,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:50 CET,0.0 0.833 1.087 1.309 1.513 1.679 1.816 1.951 2.178 2.288 2.39 2.532 2.638 2.711 2.852 2.987 3.129 3.194 3.334 3.47 3.636 3.746 3.853 4.005 4.154 4.307 4.452 4.581 4.754 4.924 5.082 5.271 5.452 5.627 5.834 6.065 6.274 6.493 6.743 7.005 7.298 7.615 7.942 8.273 8.635 9.041 9.491 9.958 10.471 10.974 11.427 11.537 11.341 11.051 10.742 10.419 10.109 9.814 9.552 9.275 9.026 8.788 8.56 8.347 8.12 7.909 7.698 7.487 7.301 7.126 6.943 6.78 6.601 6.421 6.282 6.124 5.965 5.802 5.626 5.506 5.384 5.193 5.047 4.898 4.825 4.663 4.489 4.309 4.213 4.088 3.896 3.779 3.671 3.43 3.285 3.118 2.939 2.719 2.447 2.12 1.313 -8 ,27548 ,KEBNE ,17018815,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:31 CET,0.0 0.688 0.987 1.179 1.32 1.461 1.6 1.733 1.966 2.07 2.169 2.317 2.43 2.517 2.691 2.841 2.988 3.06 3.188 3.312 3.5 3.618 3.731 3.895 4.053 4.195 4.338 4.485 4.665 4.824 4.978 5.165 5.343 5.513 5.7 5.935 6.155 6.373 6.621 6.895 7.175 7.474 7.796 8.11 8.509 8.927 9.368 9.866 10.38 10.831 11.255 11.357 11.117 10.785 10.458 10.14 9.849 9.578 9.335 9.04 8.773 8.548 8.312 8.079 7.862 7.666 7.459 7.275 7.117 6.951 6.777 6.621 6.454 6.285 6.152 6.014 5.873 5.713 5.555 5.45 5.34 5.166 5.031 4.893 4.823 4.665 4.495 4.319 4.231 4.115 3.944 3.849 3.741 3.487 3.36 3.236 3.097 2.908 2.628 2.285 1.205 -9 ,7425 ,KEBNE ,17018816,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:44 CET,0.0 1.053 1.397 1.663 1.888 2.082 2.249 2.394 2.64 2.732 2.819 2.956 3.071 3.168 3.353 3.519 3.666 3.734 3.871 4.006 4.189 4.311 4.427 4.574 4.719 4.857 4.989 5.122 5.293 5.454 5.62 5.824 6.012 6.186 6.387 6.611 6.818 7.041 7.264 7.515 7.789 8.091 8.424 8.735 9.109 9.499 9.908 10.34 10.809 11.29 11.708 11.753 11.55 11.3 11.034 10.77 10.479 10.181 9.925 9.663 9.42 9.193 8.957 8.736 8.536 8.341 8.144 7.965 7.804 7.637 7.461 7.306 7.132 6.954 6.82 6.675 6.517 6.36 6.192 6.067 5.942 5.759 5.629 5.486 5.412 5.249 5.07 4.879 4.784 4.657 4.469 4.361 4.24 3.984 3.841 3.667 3.449 3.22 2.965 2.575 1.618 -10 ,12631 ,KEBNE ,17018817,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:57:08 CET,0.0 0.716 0.937 1.111 1.296 1.468 1.612 1.74 1.952 2.052 2.155 2.32 2.443 2.531 2.682 2.819 2.963 3.03 3.16 3.293 3.467 3.577 3.698 3.868 4.009 4.147 4.291 4.428 4.6 4.767 4.922 5.105 5.281 5.446 5.638 5.856 6.057 6.268 6.497 6.749 7.019 7.311 7.66 7.998 8.376 8.794 9.219 9.683 10.196 10.642 10.948 10.899 10.59 10.235 9.897 9.592 9.305 9.03 8.767 8.494 8.26 8.03 7.805 7.589 7.382 7.195 6.994 6.817 6.666 6.495 6.304 6.148 5.993 5.827 5.689 5.549 5.414 5.261 5.105 4.999 4.889 4.731 4.612 4.485 4.419 4.268 4.116 3.934 3.825 3.699 3.502 3.38 3.251 2.998 2.856 2.689 2.464 2.177 1.914 1.624 0.485 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_21_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_21_1h1r.txt deleted file mode 100644 index f01b4ac1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_21_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16051 ,KEBNE ,17018818,Wed Dec 22 00:27:59 CET,Wed Dec 22 01:55:57 CET,0.0 0.821 1.075 1.268 1.433 1.569 1.687 1.81 2.031 2.13 2.218 2.353 2.456 2.519 2.661 2.807 2.941 2.998 3.111 3.23 3.4 3.511 3.613 3.739 3.856 3.978 4.099 4.215 4.367 4.509 4.637 4.792 4.946 5.092 5.257 5.443 5.615 5.81 6.036 6.262 6.48 6.739 7.031 7.294 7.602 7.918 8.213 8.515 8.827 9.085 9.131 8.89 8.485 8.033 7.62 7.226 6.868 6.527 6.218 5.907 5.619 5.327 5.043 4.774 4.525 4.306 4.087 3.891 3.708 3.513 3.32 3.156 2.972 2.778 2.629 2.482 2.329 2.169 2.005 1.881 1.745 1.531 1.38 1.218 1.135 0.964 0.784 0.596 0.49 0.353 0.137 0.019 -0.101 -0.388 -0.56 -0.754 -0.972 -1.233 -1.535 -1.974 -3.478 -2 ,28516 ,KEBNE ,17018819,Wed Dec 22 00:27:58 CET,Wed Dec 22 01:57:20 CET,0.0 0.603 0.839 1.022 1.175 1.31 1.425 1.54 1.808 1.928 2.033 2.222 2.351 2.434 2.576 2.715 2.841 2.898 3.015 3.132 3.3 3.408 3.51 3.648 3.783 3.91 4.03 4.153 4.315 4.463 4.605 4.777 4.93 5.079 5.26 5.455 5.627 5.82 6.03 6.239 6.452 6.696 6.985 7.26 7.571 7.898 8.249 8.632 9.033 9.39 9.54 9.318 8.893 8.453 8.06 7.664 7.277 6.887 6.539 6.172 5.833 5.541 5.264 4.981 4.709 4.462 4.208 3.966 3.751 3.536 3.312 3.117 2.915 2.714 2.564 2.396 2.215 2.034 1.842 1.708 1.571 1.351 1.2 1.044 0.956 0.771 0.582 0.379 0.271 0.138 -0.074 -0.201 -0.339 -0.637 -0.799 -0.983 -1.189 -1.432 -1.73 -2.147 -3.667 -3 ,32015 ,KEBNE ,17018820,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:57:39 CET,0.0 0.67 1.023 1.235 1.403 1.564 1.699 1.819 2.013 2.106 2.203 2.355 2.462 2.539 2.705 2.849 2.974 3.042 3.185 3.319 3.497 3.605 3.709 3.862 3.999 4.133 4.268 4.393 4.553 4.708 4.864 5.058 5.23 5.391 5.573 5.771 5.975 6.197 6.406 6.618 6.859 7.12 7.403 7.689 8.005 8.318 8.658 8.982 9.271 9.566 9.699 9.474 9.106 8.666 8.199 7.768 7.399 7.019 6.669 6.332 6.021 5.723 5.432 5.165 4.918 4.689 4.447 4.216 4.021 3.807 3.581 3.403 3.21 3.003 2.837 2.669 2.498 2.319 2.128 1.99 1.846 1.627 1.47 1.293 1.204 1.032 0.851 0.658 0.559 0.428 0.221 0.097 -0.035 -0.315 -0.47 -0.635 -0.822 -1.057 -1.316 -1.662 -2.654 -4 ,20882 ,KEBNE ,17018821,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:32 CET,0.0 0.818 1.065 1.25 1.395 1.526 1.649 1.755 1.944 2.03 2.131 2.301 2.412 2.498 2.671 2.832 2.988 3.065 3.21 3.342 3.509 3.61 3.711 3.857 4.001 4.136 4.269 4.407 4.572 4.72 4.859 5.018 5.177 5.332 5.498 5.685 5.868 6.056 6.263 6.496 6.731 6.986 7.269 7.535 7.825 8.113 8.435 8.81 9.173 9.434 9.548 9.354 8.958 8.5 8.084 7.679 7.281 6.913 6.583 6.259 5.982 5.731 5.491 5.253 5.026 4.824 4.609 4.402 4.219 4.028 3.823 3.65 3.47 3.286 3.147 3.009 2.86 2.706 2.545 2.421 2.284 2.064 1.909 1.744 1.662 1.498 1.321 1.126 1.022 0.883 0.663 0.537 0.398 0.094 -0.065 -0.231 -0.439 -0.713 -1.026 -1.439 -3.076 -5 ,24945 ,KEBNE ,17018822,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:40 CET,0.0 0.916 1.167 1.363 1.536 1.685 1.813 1.927 2.122 2.215 2.306 2.443 2.543 2.615 2.763 2.908 3.042 3.101 3.208 3.325 3.494 3.594 3.693 3.836 3.97 4.09 4.203 4.32 4.469 4.614 4.756 4.933 5.085 5.234 5.411 5.59 5.769 5.95 6.134 6.346 6.562 6.799 7.086 7.377 7.692 7.997 8.324 8.69 9.048 9.343 9.428 9.15 8.718 8.254 7.8 7.361 6.966 6.597 6.268 5.936 5.657 5.396 5.127 4.881 4.661 4.446 4.21 4.003 3.81 3.592 3.368 3.187 3.009 2.822 2.667 2.502 2.326 2.14 1.955 1.833 1.703 1.495 1.35 1.196 1.111 0.939 0.766 0.586 0.494 0.371 0.197 0.094 -0.023 -0.27 -0.405 -0.558 -0.726 -0.924 -1.142 -1.416 -2.305 -6 ,14826 ,KEBNE ,17018823,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:57:52 CET,0.0 0.65 0.896 1.117 1.308 1.476 1.611 1.718 1.903 1.984 2.064 2.195 2.301 2.378 2.522 2.653 2.777 2.836 2.95 3.064 3.233 3.34 3.439 3.582 3.717 3.842 3.957 4.065 4.213 4.363 4.496 4.646 4.801 4.955 5.124 5.303 5.49 5.701 5.912 6.129 6.354 6.605 6.887 7.144 7.426 7.732 8.043 8.369 8.693 8.9 8.925 8.725 8.365 7.961 7.538 7.11 6.724 6.345 6.006 5.652 5.327 5.025 4.733 4.458 4.213 3.992 3.754 3.543 3.345 3.137 2.926 2.757 2.578 2.38 2.23 2.069 1.894 1.713 1.52 1.384 1.241 1.019 0.865 0.692 0.605 0.438 0.262 0.078 -0.031 -0.178 -0.408 -0.546 -0.688 -0.985 -1.134 -1.308 -1.518 -1.73 -1.993 -2.364 -3.28 -7 ,6549 ,KEBNE ,17018824,Wed Dec 22 00:30:06 CET,Wed Dec 22 01:59:40 CET,0.0 0.712 1.001 1.2 1.396 1.568 1.717 1.852 2.071 2.171 2.267 2.403 2.508 2.585 2.72 2.837 2.951 3.008 3.114 3.214 3.37 3.468 3.559 3.695 3.827 3.954 4.074 4.186 4.323 4.458 4.595 4.776 4.947 5.096 5.267 5.457 5.642 5.844 6.054 6.271 6.501 6.753 7.026 7.285 7.57 7.844 8.144 8.456 8.738 8.995 9.107 8.86 8.444 7.946 7.469 7.057 6.676 6.331 6.009 5.66 5.366 5.103 4.843 4.589 4.355 4.147 3.933 3.731 3.549 3.349 3.124 2.94 2.75 2.543 2.376 2.191 2.006 1.833 1.648 1.516 1.37 1.142 0.99 0.83 0.738 0.542 0.356 0.167 0.072 -0.052 -0.258 -0.381 -0.508 -0.802 -0.985 -1.193 -1.406 -1.642 -1.914 -2.242 -3.27 -8 ,11120 ,KEBNE ,17018825,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:22 CET,0.0 0.761 1.07 1.278 1.469 1.621 1.751 1.866 2.065 2.159 2.25 2.387 2.502 2.594 2.755 2.895 3.021 3.079 3.189 3.301 3.464 3.568 3.673 3.818 3.95 4.077 4.192 4.31 4.463 4.607 4.737 4.885 5.045 5.204 5.373 5.567 5.743 5.924 6.127 6.346 6.567 6.804 7.08 7.344 7.634 7.935 8.262 8.594 8.922 9.232 9.344 9.085 8.658 8.158 7.701 7.283 6.885 6.483 6.114 5.746 5.423 5.141 4.861 4.569 4.316 4.091 3.837 3.614 3.418 3.225 3.015 2.827 2.639 2.448 2.295 2.136 1.975 1.8 1.608 1.47 1.321 1.096 0.942 0.783 0.698 0.523 0.349 0.148 0.04 -0.094 -0.318 -0.449 -0.569 -0.869 -1.046 -1.22 -1.414 -1.636 -1.917 -2.306 -3.443 -9 ,21896 ,KEBNE ,17018826,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:10 CET,0.0 0.66 0.871 1.027 1.194 1.339 1.466 1.582 1.777 1.875 1.97 2.114 2.221 2.302 2.452 2.583 2.708 2.769 2.889 3.001 3.148 3.238 3.337 3.479 3.606 3.73 3.858 3.995 4.156 4.299 4.441 4.605 4.762 4.917 5.091 5.268 5.438 5.636 5.844 6.073 6.324 6.597 6.887 7.132 7.382 7.682 8.015 8.316 8.606 8.888 9.053 8.782 8.337 7.896 7.47 7.037 6.634 6.279 5.964 5.653 5.376 5.119 4.858 4.588 4.337 4.113 3.888 3.686 3.513 3.332 3.133 2.97 2.8 2.614 2.473 2.335 2.186 2.027 1.859 1.74 1.618 1.438 1.315 1.177 1.102 0.949 0.784 0.607 0.513 0.388 0.217 0.107 -0.019 -0.299 -0.453 -0.623 -0.808 -1.02 -1.259 -1.568 -2.505 -10 ,23067 ,KEBNE ,17018827,Wed Dec 22 00:30:01 CET,Wed Dec 22 01:59:08 CET,0.0 0.54 0.777 0.944 1.105 1.243 1.368 1.493 1.71 1.805 1.9 2.04 2.151 2.234 2.39 2.529 2.657 2.718 2.835 2.947 3.113 3.21 3.301 3.446 3.581 3.717 3.852 3.974 4.127 4.279 4.429 4.596 4.759 4.915 5.085 5.282 5.467 5.661 5.873 6.094 6.316 6.556 6.839 7.111 7.407 7.734 8.075 8.413 8.737 9.053 9.196 8.844 8.393 7.983 7.552 7.104 6.711 6.35 6.032 5.709 5.405 5.122 4.868 4.629 4.396 4.19 3.972 3.767 3.588 3.392 3.184 3.02 2.852 2.667 2.521 2.371 2.217 2.056 1.885 1.763 1.635 1.441 1.303 1.152 1.078 0.935 0.778 0.611 0.517 0.384 0.191 0.068 -0.052 -0.299 -0.445 -0.601 -0.777 -0.992 -1.275 -1.612 -2.48 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_21_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_21_22.txt deleted file mode 100644 index f92a5547..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_21_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20416 ,KEBNE ,17018828,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 02:00:25 CET,0.0 0.894 1.203 1.456 1.693 1.909 2.057 2.185 2.438 2.544 2.634 2.776 2.89 2.975 3.14 3.284 3.419 3.485 3.615 3.748 3.954 4.083 4.207 4.384 4.529 4.665 4.799 4.923 5.071 5.202 5.341 5.501 5.642 5.783 5.941 6.105 6.253 6.422 6.608 6.796 6.971 7.154 7.361 7.561 7.766 7.94 8.105 8.247 8.328 8.291 7.848 6.991 6.203 5.498 4.879 4.313 3.809 3.352 2.955 2.554 2.2 1.888 1.589 1.304 1.042 0.811 0.565 0.332 0.132 -0.067 -0.275 -0.451 -0.632 -0.822 -0.973 -1.127 -1.283 -1.436 -1.596 -1.709 -1.824 -2.016 -2.152 -2.289 -2.358 -2.504 -2.66 -2.816 -2.899 -3.021 -3.185 -3.295 -3.427 -3.725 -3.885 -4.037 -4.193 -4.374 -4.583 -4.876 -5.779 -2 ,8082 ,KEBNE ,17018829,Wed Dec 22 00:30:01 CET,Wed Dec 22 02:00:26 CET,0.0 0.723 1.086 1.37 1.608 1.788 1.963 2.124 2.382 2.501 2.626 2.831 2.962 3.061 3.256 3.439 3.588 3.659 3.798 3.932 4.124 4.253 4.367 4.522 4.673 4.812 4.946 5.077 5.237 5.399 5.564 5.752 5.925 6.085 6.272 6.475 6.648 6.833 7.051 7.27 7.475 7.692 7.923 8.119 8.309 8.499 8.658 8.739 8.762 8.668 8.207 7.408 6.621 5.922 5.313 4.747 4.238 3.78 3.386 2.983 2.627 2.311 2.03 1.76 1.487 1.241 0.993 0.763 0.561 0.354 0.14 -0.023 -0.191 -0.368 -0.502 -0.648 -0.805 -0.964 -1.126 -1.241 -1.363 -1.557 -1.685 -1.83 -1.905 -2.04 -2.198 -2.376 -2.465 -2.584 -2.739 -2.837 -2.944 -3.184 -3.307 -3.442 -3.595 -3.779 -3.999 -4.32 -4.993 -3 ,2554 ,KEBNE ,17018830,Wed Dec 22 00:30:01 CET,Wed Dec 22 01:58:32 CET,0.0 0.649 0.94 1.199 1.429 1.624 1.776 1.922 2.202 2.315 2.414 2.555 2.673 2.761 2.921 3.061 3.178 3.239 3.364 3.477 3.643 3.754 3.86 4.001 4.135 4.265 4.387 4.514 4.684 4.834 4.972 5.133 5.28 5.427 5.594 5.769 5.947 6.138 6.32 6.512 6.71 6.922 7.133 7.29 7.456 7.658 7.851 7.983 8.031 7.973 7.597 6.775 6.012 5.327 4.707 4.119 3.595 3.147 2.757 2.346 1.985 1.66 1.361 1.087 0.827 0.599 0.358 0.128 -0.068 -0.276 -0.483 -0.646 -0.815 -0.998 -1.156 -1.319 -1.501 -1.686 -1.852 -1.965 -2.083 -2.274 -2.412 -2.554 -2.623 -2.766 -2.926 -3.097 -3.182 -3.299 -3.477 -3.582 -3.685 -3.931 -4.059 -4.2 -4.356 -4.528 -4.773 -5.076 -5.89 -4 ,26022 ,KEBNE ,17018831,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:58:25 CET,0.0 0.925 1.261 1.533 1.745 1.902 2.053 2.216 2.549 2.69 2.817 3.023 3.155 3.248 3.411 3.564 3.696 3.753 3.874 4.018 4.231 4.352 4.456 4.591 4.73 4.868 4.988 5.108 5.254 5.38 5.515 5.696 5.856 6.001 6.172 6.349 6.519 6.708 6.882 7.063 7.268 7.468 7.667 7.886 8.124 8.321 8.49 8.606 8.664 8.571 8.116 7.33 6.576 5.871 5.274 4.729 4.227 3.761 3.35 2.936 2.578 2.26 1.944 1.664 1.416 1.185 0.935 0.709 0.507 0.297 0.086 -0.084 -0.251 -0.444 -0.606 -0.767 -0.92 -1.081 -1.249 -1.361 -1.485 -1.677 -1.807 -1.95 -2.027 -2.178 -2.329 -2.484 -2.57 -2.685 -2.827 -2.93 -3.045 -3.3 -3.439 -3.582 -3.739 -3.932 -4.171 -4.499 -5.345 -5 ,24100 ,KEBNE ,17018832,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:49 CET,0.0 0.778 1.131 1.387 1.615 1.81 1.97 2.102 2.323 2.431 2.544 2.715 2.836 2.927 3.088 3.246 3.388 3.45 3.583 3.713 3.887 3.996 4.102 4.239 4.367 4.49 4.613 4.738 4.893 5.022 5.141 5.286 5.431 5.573 5.732 5.896 6.053 6.242 6.437 6.625 6.833 7.042 7.23 7.411 7.598 7.751 7.898 8.036 8.107 7.969 7.475 6.678 5.869 5.119 4.432 3.819 3.306 2.846 2.444 2.043 1.691 1.379 1.097 0.832 0.573 0.329 0.075 -0.154 -0.361 -0.564 -0.771 -0.944 -1.123 -1.318 -1.47 -1.631 -1.798 -1.967 -2.146 -2.273 -2.397 -2.582 -2.708 -2.839 -2.911 -3.07 -3.238 -3.405 -3.49 -3.614 -3.79 -3.894 -3.997 -4.231 -4.375 -4.535 -4.687 -4.852 -5.053 -5.298 -5.982 -6 ,1904 ,KEBNE ,17018833,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:54 CET,0.0 0.906 1.331 1.636 1.877 2.071 2.24 2.39 2.663 2.785 2.894 3.06 3.187 3.29 3.482 3.646 3.795 3.868 4.017 4.158 4.341 4.459 4.58 4.738 4.89 5.041 5.182 5.311 5.466 5.613 5.748 5.905 6.057 6.197 6.35 6.524 6.686 6.84 7.019 7.218 7.401 7.605 7.846 8.041 8.207 8.368 8.543 8.67 8.719 8.616 8.133 7.312 6.542 5.835 5.187 4.61 4.093 3.598 3.188 2.794 2.446 2.135 1.835 1.546 1.285 1.048 0.798 0.57 0.371 0.169 -0.04 -0.218 -0.396 -0.57 -0.716 -0.876 -1.035 -1.192 -1.377 -1.515 -1.662 -1.898 -2.062 -2.237 -2.327 -2.517 -2.704 -2.898 -3.002 -3.134 -3.295 -3.4 -3.513 -3.778 -3.944 -4.121 -4.281 -4.452 -4.647 -4.926 -5.759 -7 ,17032 ,KEBNE ,17018834,Wed Dec 22 00:30:01 CET,Wed Dec 22 02:00:14 CET,0.0 0.766 1.026 1.219 1.382 1.538 1.674 1.799 2.022 2.117 2.21 2.371 2.481 2.552 2.687 2.819 2.959 3.023 3.159 3.297 3.466 3.584 3.704 3.856 3.993 4.121 4.241 4.364 4.53 4.671 4.797 4.953 5.097 5.242 5.418 5.607 5.776 5.939 6.094 6.268 6.457 6.642 6.845 7.041 7.242 7.444 7.652 7.8 7.802 7.631 7.158 6.349 5.587 4.887 4.252 3.68 3.163 2.69 2.295 1.907 1.577 1.281 0.999 0.724 0.46 0.215 -0.045 -0.273 -0.467 -0.666 -0.882 -1.07 -1.262 -1.456 -1.603 -1.759 -1.921 -2.079 -2.241 -2.36 -2.483 -2.664 -2.792 -2.941 -3.021 -3.185 -3.341 -3.494 -3.578 -3.702 -3.887 -3.998 -4.101 -4.318 -4.441 -4.579 -4.757 -4.94 -5.121 -5.385 -6.006 -8 ,4214 ,KEBNE ,17018835,Wed Dec 22 00:30:01 CET,Wed Dec 22 01:58:14 CET,0.0 1.052 1.472 1.748 1.985 2.188 2.36 2.513 2.77 2.894 3.015 3.206 3.331 3.422 3.628 3.833 4.009 4.092 4.238 4.363 4.545 4.666 4.778 4.929 5.062 5.187 5.313 5.434 5.593 5.746 5.878 6.031 6.183 6.328 6.489 6.688 6.884 7.066 7.241 7.429 7.634 7.843 8.064 8.283 8.508 8.716 8.91 9.055 9.132 9.076 8.663 7.866 7.064 6.36 5.754 5.187 4.673 4.208 3.823 3.427 3.08 2.774 2.478 2.191 1.932 1.709 1.47 1.244 1.047 0.841 0.631 0.457 0.275 0.091 -0.052 -0.201 -0.355 -0.522 -0.693 -0.81 -0.926 -1.106 -1.236 -1.37 -1.441 -1.584 -1.727 -1.888 -1.986 -2.119 -2.305 -2.419 -2.542 -2.809 -2.957 -3.122 -3.31 -3.499 -3.757 -4.086 -4.671 -9 ,25351 ,KEBNE ,17018836,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:58:36 CET,0.0 1.045 1.393 1.652 1.874 2.07 2.253 2.42 2.709 2.838 2.95 3.12 3.24 3.327 3.485 3.623 3.756 3.829 3.981 4.117 4.293 4.405 4.508 4.664 4.803 4.926 5.051 5.174 5.332 5.473 5.602 5.762 5.925 6.077 6.244 6.429 6.597 6.77 6.951 7.127 7.3 7.493 7.728 7.947 8.158 8.358 8.567 8.723 8.783 8.691 8.193 7.355 6.559 5.83 5.181 4.584 4.046 3.565 3.17 2.779 2.424 2.101 1.803 1.532 1.271 1.019 0.749 0.517 0.315 0.09 -0.14 -0.325 -0.512 -0.705 -0.862 -1.027 -1.206 -1.387 -1.566 -1.692 -1.824 -2.029 -2.175 -2.337 -2.418 -2.58 -2.776 -2.985 -3.084 -3.213 -3.396 -3.508 -3.635 -3.929 -4.086 -4.255 -4.436 -4.63 -4.853 -5.123 -6.16 -10 ,26417 ,KEBNE ,17018837,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:40 CET,0.0 0.67 0.995 1.233 1.435 1.614 1.758 1.895 2.128 2.237 2.336 2.497 2.624 2.719 2.9 3.061 3.195 3.27 3.411 3.519 3.678 3.783 3.889 4.053 4.218 4.374 4.523 4.661 4.817 4.958 5.09 5.256 5.415 5.565 5.739 5.927 6.1 6.28 6.464 6.656 6.85 7.045 7.254 7.439 7.635 7.842 8.055 8.231 8.258 8.153 7.742 6.953 6.186 5.465 4.831 4.232 3.699 3.228 2.817 2.39 2.033 1.729 1.441 1.173 0.915 0.68 0.434 0.207 0.011 -0.192 -0.398 -0.57 -0.749 -0.928 -1.073 -1.223 -1.371 -1.53 -1.707 -1.827 -1.946 -2.149 -2.295 -2.443 -2.517 -2.669 -2.819 -2.977 -3.059 -3.178 -3.368 -3.483 -3.594 -3.826 -3.955 -4.096 -4.254 -4.423 -4.621 -4.919 -5.62 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_22_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_22_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 76a5280f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_22_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30126 ,KEBNE ,17018838,Wed Dec 22 00:30:04 CET,Wed Dec 22 01:54:18 CET,0.0 0.38 0.61 0.81 0.966 1.088 1.19 1.274 1.456 1.549 1.631 1.742 1.84 1.908 2.035 2.167 2.292 2.355 2.477 2.591 2.762 2.867 2.963 3.098 3.231 3.367 3.5 3.616 3.762 3.902 4.032 4.206 4.377 4.538 4.707 4.887 5.066 5.264 5.479 5.724 5.988 6.261 6.555 6.856 7.224 7.634 8.104 8.605 9.134 9.74 10.407 10.771 10.83 10.772 10.65 10.509 10.365 10.212 10.067 9.904 9.75 9.608 9.455 9.301 9.154 9.012 8.865 8.739 8.625 8.506 8.381 8.268 8.154 8.041 7.952 7.851 7.73 7.599 7.471 7.37 7.26 7.103 6.989 6.855 6.788 6.658 6.519 6.367 6.291 6.172 5.969 5.863 5.75 5.507 5.364 5.189 4.992 4.795 4.532 4.134 2.962 -2 ,7721 ,KEBNE ,17018839,Wed Dec 22 00:30:06 CET,Wed Dec 22 01:55:58 CET,0.0 0.319 0.491 0.618 0.754 0.896 1.02 1.119 1.284 1.356 1.427 1.534 1.637 1.711 1.842 1.972 2.091 2.144 2.247 2.347 2.499 2.602 2.701 2.842 2.976 3.105 3.23 3.346 3.487 3.625 3.76 3.925 4.078 4.224 4.391 4.593 4.793 4.995 5.213 5.442 5.686 5.969 6.292 6.607 6.974 7.379 7.796 8.254 8.776 9.331 9.903 10.197 10.257 10.209 10.067 9.912 9.75 9.553 9.367 9.158 8.951 8.74 8.548 8.39 8.248 8.102 7.937 7.78 7.642 7.502 7.354 7.227 7.091 6.964 6.866 6.758 6.649 6.511 6.345 6.242 6.141 5.975 5.844 5.709 5.639 5.5 5.345 5.153 5.059 4.945 4.765 4.652 4.537 4.271 4.127 3.984 3.823 3.624 3.397 3.081 1.727 -3 ,19773 ,KEBNE ,17018840,Wed Dec 22 00:30:06 CET,Wed Dec 22 01:59:32 CET,0.0 0.448 0.687 0.838 0.969 1.091 1.212 1.326 1.507 1.594 1.676 1.798 1.897 1.969 2.098 2.21 2.323 2.381 2.494 2.597 2.747 2.844 2.935 3.069 3.218 3.353 3.463 3.581 3.737 3.882 4.028 4.199 4.368 4.531 4.703 4.891 5.081 5.293 5.52 5.749 5.985 6.244 6.556 6.879 7.235 7.634 8.095 8.59 9.144 9.753 10.315 10.542 10.537 10.468 10.37 10.209 10.037 9.869 9.698 9.517 9.354 9.181 9.018 8.888 8.74 8.578 8.403 8.229 8.074 7.909 7.729 7.584 7.444 7.308 7.191 7.051 6.899 6.754 6.603 6.487 6.366 6.186 6.052 5.92 5.862 5.738 5.601 5.449 5.368 5.254 5.079 4.967 4.854 4.629 4.502 4.371 4.203 3.992 3.757 3.454 2.504 -4 ,25395 ,KEBNE ,17018841,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:14 CET,0.0 0.736 0.991 1.156 1.302 1.428 1.536 1.635 1.809 1.882 1.959 2.104 2.228 2.315 2.452 2.575 2.699 2.757 2.871 2.984 3.132 3.23 3.333 3.477 3.613 3.756 3.893 4.021 4.195 4.363 4.517 4.703 4.875 5.039 5.234 5.454 5.666 5.888 6.124 6.386 6.651 6.932 7.268 7.598 7.945 8.32 8.76 9.229 9.734 10.274 10.836 11.201 11.311 11.273 11.14 10.935 10.72 10.526 10.349 10.141 9.946 9.769 9.588 9.423 9.286 9.148 8.978 8.823 8.697 8.566 8.418 8.292 8.154 8.02 7.925 7.82 7.695 7.56 7.425 7.325 7.211 7.038 6.924 6.8 6.727 6.579 6.428 6.264 6.176 6.051 5.83 5.689 5.543 5.238 5.061 4.889 4.697 4.434 4.143 3.719 2.1 -5 ,10110 ,KEBNE ,17018842,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:10 CET,0.0 0.592 0.813 0.989 1.131 1.279 1.42 1.546 1.772 1.865 1.954 2.117 2.242 2.325 2.476 2.614 2.739 2.805 2.933 3.049 3.212 3.315 3.414 3.551 3.681 3.8 3.917 4.035 4.18 4.32 4.465 4.643 4.805 4.948 5.11 5.294 5.483 5.699 5.931 6.172 6.418 6.689 6.998 7.302 7.662 8.054 8.488 8.96 9.491 10.093 10.74 11.077 11.136 11.06 10.945 10.798 10.611 10.424 10.241 10.047 9.854 9.677 9.527 9.378 9.234 9.091 8.925 8.782 8.657 8.514 8.347 8.205 8.068 7.927 7.814 7.691 7.561 7.428 7.276 7.173 7.073 6.907 6.794 6.677 6.611 6.474 6.322 6.129 6.018 5.884 5.706 5.605 5.496 5.235 5.081 4.923 4.736 4.528 4.3 4.009 3.075 -6 ,24706 ,KEBNE ,17018843,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:22 CET,0.0 0.736 0.973 1.178 1.388 1.558 1.685 1.795 1.995 2.091 2.18 2.322 2.432 2.511 2.671 2.824 2.963 3.035 3.169 3.284 3.444 3.551 3.653 3.803 3.95 4.085 4.218 4.351 4.516 4.665 4.809 4.982 5.158 5.319 5.492 5.698 5.901 6.114 6.344 6.591 6.839 7.113 7.429 7.733 8.085 8.497 8.945 9.411 9.963 10.56 11.142 11.462 11.545 11.504 11.366 11.165 10.951 10.735 10.53 10.327 10.141 9.954 9.764 9.592 9.43 9.274 9.116 8.978 8.849 8.702 8.549 8.423 8.29 8.156 8.042 7.916 7.786 7.635 7.474 7.372 7.275 7.124 7.009 6.874 6.804 6.668 6.524 6.37 6.296 6.193 6.028 5.932 5.826 5.581 5.442 5.277 5.079 4.844 4.578 4.166 2.299 -7 ,4616 ,KEBNE ,17018844,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:22 CET,0.0 0.402 0.619 0.778 0.921 1.052 1.155 1.247 1.409 1.483 1.561 1.68 1.78 1.849 1.994 2.134 2.274 2.343 2.468 2.578 2.715 2.805 2.898 3.027 3.155 3.284 3.401 3.517 3.667 3.8 3.933 4.094 4.248 4.403 4.578 4.763 4.951 5.165 5.388 5.617 5.858 6.143 6.477 6.792 7.167 7.591 8.052 8.547 9.062 9.604 10.151 10.431 10.462 10.376 10.236 10.068 9.906 9.74 9.574 9.391 9.21 9.04 8.871 8.703 8.532 8.362 8.186 8.028 7.883 7.724 7.554 7.408 7.247 7.078 6.948 6.809 6.668 6.522 6.367 6.253 6.127 5.938 5.801 5.655 5.587 5.457 5.324 5.172 5.09 4.981 4.802 4.688 4.575 4.355 4.233 4.094 3.931 3.744 3.535 3.249 2.502 -8 ,6741 ,KEBNE ,17018845,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:34 CET,0.0 0.558 0.837 1.066 1.246 1.397 1.516 1.621 1.844 1.943 2.042 2.194 2.295 2.368 2.51 2.636 2.755 2.813 2.926 3.046 3.218 3.321 3.42 3.545 3.665 3.786 3.901 4.016 4.175 4.329 4.466 4.626 4.778 4.923 5.096 5.294 5.485 5.698 5.919 6.155 6.401 6.662 6.994 7.336 7.707 8.091 8.52 9.007 9.56 10.132 10.697 11.008 11.036 10.964 10.823 10.637 10.46 10.29 10.13 9.968 9.826 9.67 9.5 9.343 9.187 9.044 8.901 8.759 8.631 8.5 8.359 8.241 8.103 7.942 7.821 7.705 7.554 7.381 7.217 7.117 7.013 6.839 6.727 6.606 6.539 6.403 6.256 6.097 6.01 5.901 5.756 5.656 5.543 5.286 5.142 4.995 4.846 4.659 4.394 4.075 3.038 -9 ,29816 ,KEBNE ,17018846,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:38 CET,0.0 0.58 0.844 1.045 1.221 1.389 1.537 1.667 1.881 1.975 2.07 2.226 2.349 2.436 2.599 2.748 2.887 2.952 3.076 3.205 3.379 3.482 3.593 3.751 3.894 4.034 4.169 4.301 4.466 4.628 4.776 4.949 5.122 5.288 5.478 5.687 5.891 6.11 6.335 6.566 6.82 7.112 7.454 7.78 8.136 8.533 8.993 9.503 10.015 10.56 11.148 11.392 11.36 11.201 10.996 10.793 10.58 10.382 10.184 9.955 9.759 9.57 9.376 9.181 8.998 8.834 8.661 8.508 8.373 8.228 8.062 7.915 7.762 7.602 7.47 7.33 7.186 7.038 6.899 6.797 6.678 6.481 6.348 6.197 6.116 5.97 5.836 5.695 5.615 5.511 5.357 5.252 5.141 4.901 4.766 4.613 4.443 4.249 4.049 3.798 3.197 -10 ,9094 ,KEBNE ,17018847,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:13 CET,0.0 0.455 0.666 0.837 0.988 1.112 1.214 1.302 1.448 1.523 1.607 1.745 1.856 1.928 2.052 2.172 2.281 2.337 2.464 2.585 2.74 2.834 2.922 3.053 3.186 3.309 3.425 3.537 3.684 3.832 3.979 4.14 4.293 4.448 4.634 4.841 5.033 5.244 5.47 5.715 5.969 6.252 6.571 6.887 7.248 7.641 8.081 8.563 9.113 9.72 10.376 10.735 10.8 10.722 10.576 10.414 10.255 10.078 9.898 9.703 9.516 9.339 9.158 8.978 8.791 8.604 8.407 8.236 8.093 7.937 7.772 7.649 7.524 7.378 7.269 7.153 7.024 6.899 6.766 6.672 6.568 6.4 6.288 6.165 6.097 5.955 5.811 5.661 5.582 5.472 5.305 5.205 5.106 4.9 4.756 4.568 4.393 4.207 3.944 3.552 2.342 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_26_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_26_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 5cf9797a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_26_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9197 ,KEBNE ,17018848,Wed Dec 22 00:30:01 CET,Wed Dec 22 01:59:29 CET,0.0 0.566 0.826 0.998 1.161 1.283 1.393 1.498 1.698 1.795 1.886 2.026 2.15 2.231 2.404 2.566 2.698 2.76 2.883 3.005 3.185 3.299 3.421 3.603 3.787 3.968 4.135 4.286 4.459 4.623 4.782 4.982 5.172 5.359 5.581 5.821 6.048 6.3 6.582 6.882 7.196 7.556 7.979 8.387 8.864 9.404 10.009 10.67 11.41 12.2 13.05 13.567 13.61 13.487 13.337 13.147 12.947 12.725 12.499 12.267 12.057 11.855 11.636 11.431 11.251 11.052 10.827 10.642 10.481 10.312 10.137 9.97 9.785 9.602 9.468 9.334 9.186 9.029 8.865 8.743 8.611 8.402 8.255 8.101 8.01 7.815 7.612 7.402 7.298 7.164 6.909 6.758 6.614 6.289 6.093 5.897 5.702 5.459 5.16 4.734 3.593 -2 ,29584 ,KEBNE ,17018849,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:13 CET,0.0 0.616 0.805 0.959 1.129 1.287 1.425 1.532 1.71 1.798 1.894 2.048 2.166 2.244 2.403 2.548 2.677 2.744 2.886 3.027 3.225 3.345 3.463 3.637 3.792 3.944 4.094 4.235 4.417 4.59 4.762 4.968 5.167 5.365 5.594 5.842 6.084 6.363 6.654 6.954 7.295 7.673 8.086 8.496 8.978 9.525 10.136 10.806 11.543 12.353 13.262 13.797 13.931 13.866 13.682 13.497 13.324 13.141 12.958 12.741 12.536 12.339 12.127 11.917 11.727 11.548 11.364 11.201 11.049 10.882 10.712 10.57 10.405 10.235 10.104 9.961 9.811 9.646 9.477 9.361 9.237 9.052 8.908 8.754 8.678 8.516 8.336 8.123 8.019 7.885 7.645 7.514 7.378 7.077 6.928 6.75 6.528 6.272 5.956 5.515 3.868 -3 ,32603 ,KEBNE ,17018850,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:57:34 CET,0.0 0.411 0.679 0.902 1.103 1.272 1.418 1.545 1.76 1.861 1.952 2.075 2.194 2.274 2.432 2.584 2.715 2.776 2.903 3.029 3.207 3.323 3.439 3.61 3.77 3.925 4.07 4.216 4.398 4.566 4.729 4.925 5.119 5.312 5.535 5.792 6.036 6.307 6.588 6.888 7.222 7.587 8.001 8.415 8.916 9.478 10.127 10.872 11.678 12.475 13.252 13.657 13.725 13.65 13.503 13.326 13.116 12.914 12.719 12.48 12.256 12.045 11.821 11.609 11.418 11.235 11.037 10.856 10.697 10.525 10.341 10.189 10.023 9.835 9.682 9.534 9.378 9.22 9.057 8.941 8.817 8.602 8.457 8.309 8.224 8.055 7.89 7.701 7.591 7.451 7.245 7.121 6.968 6.619 6.429 6.253 6.072 5.851 5.573 5.141 3.691 -4 ,6842 ,KEBNE ,17018851,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:57:37 CET,0.0 0.775 1.021 1.22 1.412 1.584 1.744 1.892 2.179 2.308 2.421 2.619 2.755 2.835 2.998 3.159 3.299 3.361 3.491 3.622 3.809 3.922 4.032 4.196 4.348 4.493 4.635 4.771 4.943 5.115 5.288 5.488 5.669 5.853 6.079 6.321 6.548 6.812 7.101 7.389 7.698 8.065 8.484 8.887 9.366 9.924 10.539 11.193 11.91 12.702 13.541 13.972 14.095 14.038 13.849 13.644 13.418 13.191 12.979 12.726 12.484 12.264 12.048 11.835 11.639 11.456 11.262 11.093 10.941 10.772 10.59 10.431 10.264 10.092 9.955 9.808 9.645 9.475 9.312 9.209 9.092 8.888 8.749 8.604 8.527 8.365 8.192 8.015 7.92 7.791 7.576 7.453 7.319 7.045 6.899 6.737 6.564 6.333 6.014 5.626 4.293 -5 ,7959 ,KEBNE ,17018852,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:57:35 CET,0.0 0.435 0.694 0.897 1.055 1.189 1.314 1.422 1.612 1.698 1.792 1.946 2.065 2.139 2.293 2.445 2.578 2.642 2.776 2.902 3.076 3.191 3.307 3.483 3.646 3.797 3.941 4.084 4.263 4.438 4.611 4.815 5.002 5.183 5.411 5.665 5.895 6.161 6.476 6.798 7.129 7.517 7.956 8.399 8.907 9.456 10.079 10.77 11.555 12.405 13.232 13.727 13.809 13.742 13.607 13.377 13.131 12.898 12.698 12.48 12.274 12.079 11.89 11.711 11.522 11.334 11.13 10.937 10.759 10.566 10.367 10.199 10.029 9.862 9.717 9.558 9.396 9.212 9.017 8.892 8.76 8.544 8.4 8.239 8.153 7.988 7.823 7.652 7.56 7.428 7.208 7.086 6.956 6.643 6.472 6.276 6.044 5.794 5.494 5.108 4.044 -6 ,20970 ,KEBNE ,17018853,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:07 CET,0.0 0.68 0.98 1.215 1.406 1.571 1.72 1.843 2.032 2.12 2.219 2.386 2.511 2.586 2.735 2.881 3.012 3.076 3.21 3.342 3.516 3.621 3.726 3.883 4.041 4.203 4.358 4.5 4.675 4.849 5.022 5.236 5.448 5.657 5.9 6.162 6.405 6.676 6.968 7.275 7.602 7.97 8.4 8.833 9.366 9.974 10.626 11.291 12.047 12.902 13.759 14.193 14.295 14.253 14.124 13.915 13.696 13.467 13.238 13.018 12.803 12.578 12.367 12.164 11.954 11.761 11.55 11.344 11.168 10.988 10.803 10.642 10.453 10.264 10.128 9.982 9.825 9.656 9.476 9.363 9.247 9.043 8.898 8.74 8.655 8.481 8.31 8.129 8.026 7.891 7.683 7.562 7.434 7.151 6.975 6.787 6.574 6.299 5.97 5.505 4.234 -7 ,18493 ,KEBNE ,17018854,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:11 CET,0.0 0.6 0.867 1.051 1.214 1.352 1.475 1.578 1.767 1.862 1.954 2.087 2.214 2.308 2.474 2.633 2.807 2.888 3.029 3.167 3.355 3.475 3.596 3.775 3.948 4.12 4.279 4.425 4.616 4.797 4.97 5.176 5.377 5.577 5.811 6.062 6.295 6.569 6.872 7.192 7.517 7.862 8.267 8.682 9.185 9.737 10.332 10.99 11.778 12.645 13.559 14.102 14.218 14.168 14.031 13.847 13.634 13.409 13.179 12.932 12.717 12.499 12.281 12.073 11.887 11.7 11.499 11.319 11.156 10.986 10.816 10.67 10.496 10.311 10.174 10.029 9.863 9.695 9.52 9.397 9.265 9.053 8.899 8.742 8.66 8.478 8.308 8.137 8.04 7.901 7.66 7.487 7.307 6.966 6.778 6.574 6.342 6.083 5.753 5.236 3.423 -8 ,8601 ,KEBNE ,17018855,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:59:07 CET,0.0 0.583 0.815 1.001 1.166 1.299 1.42 1.554 1.795 1.901 2.007 2.148 2.261 2.344 2.496 2.634 2.766 2.833 2.97 3.091 3.271 3.391 3.507 3.674 3.827 3.978 4.127 4.267 4.441 4.613 4.792 5.01 5.202 5.378 5.596 5.849 6.088 6.346 6.625 6.924 7.251 7.617 8.027 8.457 8.978 9.542 10.169 10.869 11.662 12.537 13.464 13.962 14.064 13.997 13.85 13.657 13.442 13.222 13.012 12.783 12.568 12.364 12.147 11.935 11.737 11.532 11.317 11.128 10.953 10.754 10.552 10.398 10.227 10.027 9.872 9.715 9.548 9.373 9.196 9.066 8.931 8.721 8.561 8.399 8.313 8.133 7.956 7.761 7.656 7.517 7.309 7.169 7.016 6.732 6.586 6.419 6.236 6.022 5.759 5.383 4.312 -9 ,9646 ,KEBNE ,17018856,Wed Dec 22 00:30:02 CET,Wed Dec 22 01:57:41 CET,0.0 0.582 0.85 1.066 1.276 1.488 1.661 1.79 2.029 2.146 2.257 2.428 2.56 2.649 2.803 2.948 3.089 3.156 3.285 3.411 3.592 3.707 3.82 3.976 4.122 4.27 4.412 4.553 4.743 4.923 5.086 5.279 5.48 5.672 5.889 6.136 6.374 6.631 6.905 7.206 7.536 7.926 8.395 8.864 9.37 9.923 10.592 11.346 12.109 12.871 13.647 14.039 14.077 13.984 13.832 13.621 13.404 13.174 12.932 12.667 12.438 12.239 12.036 11.834 11.654 11.474 11.269 11.092 10.945 10.789 10.614 10.47 10.314 10.138 9.983 9.794 9.607 9.437 9.256 9.125 8.985 8.76 8.609 8.445 8.363 8.199 8.014 7.826 7.721 7.585 7.397 7.27 7.122 6.811 6.651 6.48 6.256 5.963 5.628 5.231 3.946 -10 ,11755 ,KEBNE ,17018857,Wed Dec 22 00:31:04 CET,Wed Dec 22 02:00:40 CET,0.0 0.639 0.89 1.056 1.188 1.308 1.421 1.534 1.734 1.823 1.908 2.044 2.168 2.251 2.408 2.556 2.697 2.774 2.92 3.053 3.242 3.358 3.472 3.63 3.781 3.925 4.07 4.218 4.403 4.573 4.734 4.932 5.125 5.317 5.538 5.794 6.039 6.304 6.58 6.89 7.228 7.576 7.979 8.411 8.93 9.496 10.122 10.816 11.623 12.477 13.278 13.787 13.881 13.8 13.697 13.549 13.356 13.133 12.924 12.686 12.448 12.23 12.023 11.819 11.621 11.432 11.216 11.015 10.844 10.664 10.477 10.326 10.171 9.995 9.858 9.723 9.563 9.401 9.246 9.125 9.0 8.812 8.659 8.495 8.414 8.238 8.062 7.885 7.787 7.656 7.426 7.287 7.134 6.78 6.598 6.419 6.247 6.039 5.758 5.329 4.033 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_26_1oi9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_26_1oi9.txt deleted file mode 100644 index f644db8d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_26_1oi9.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13553 ,KEBNE ,17018858,Wed Dec 22 00:31:04 CET,Wed Dec 22 02:00:34 CET,0.0 0.441 0.71 0.958 1.171 1.331 1.457 1.569 1.805 1.899 1.981 2.095 2.204 2.279 2.43 2.567 2.693 2.751 2.857 2.956 3.091 3.188 3.291 3.444 3.584 3.714 3.848 3.982 4.145 4.288 4.417 4.565 4.713 4.861 5.038 5.242 5.441 5.67 5.916 6.149 6.37 6.61 6.86 7.108 7.388 7.638 7.9 8.186 8.462 8.665 8.702 8.368 7.9 7.44 7.016 6.546 6.097 5.704 5.345 4.969 4.635 4.323 4.033 3.768 3.504 3.246 2.97 2.724 2.53 2.327 2.102 1.911 1.714 1.518 1.36 1.19 1.01 0.814 0.602 0.459 0.323 0.109 -0.046 -0.206 -0.293 -0.473 -0.657 -0.862 -0.985 -1.159 -1.408 -1.564 -1.727 -2.078 -2.25 -2.446 -2.695 -3.0 -3.358 -3.758 -5.034 -2 ,6989 ,KEBNE ,17018859,Wed Dec 22 00:31:05 CET,Wed Dec 22 01:58:45 CET,0.0 0.742 1.061 1.255 1.424 1.59 1.737 1.874 2.102 2.194 2.29 2.45 2.571 2.643 2.774 2.9 3.023 3.091 3.217 3.328 3.484 3.57 3.65 3.774 3.882 3.992 4.123 4.241 4.373 4.499 4.617 4.76 4.901 5.032 5.186 5.356 5.503 5.665 5.849 6.034 6.213 6.415 6.656 6.878 7.112 7.37 7.634 7.882 8.12 8.272 8.21 7.843 7.367 6.858 6.334 5.817 5.383 5.001 4.641 4.284 3.984 3.699 3.398 3.099 2.817 2.554 2.286 2.07 1.882 1.664 1.422 1.219 1.004 0.791 0.625 0.444 0.259 0.078 -0.117 -0.263 -0.413 -0.665 -0.862 -1.072 -1.178 -1.393 -1.622 -1.851 -1.964 -2.119 -2.334 -2.483 -2.644 -2.981 -3.154 -3.337 -3.562 -3.808 -4.062 -4.447 -5.958 -3 ,23997 ,KEBNE ,17018860,Wed Dec 22 00:31:09 CET,Wed Dec 22 01:52:09 CET,0.0 0.961 1.355 1.603 1.788 1.951 2.109 2.265 2.522 2.626 2.722 2.874 3.001 3.087 3.245 3.379 3.497 3.559 3.674 3.775 3.914 4.01 4.109 4.245 4.367 4.493 4.615 4.728 4.867 4.993 5.109 5.259 5.415 5.557 5.707 5.865 6.013 6.179 6.355 6.539 6.735 6.954 7.189 7.401 7.655 7.918 8.168 8.434 8.715 8.919 8.886 8.563 8.177 7.74 7.265 6.818 6.414 6.033 5.703 5.369 5.075 4.799 4.534 4.265 3.978 3.722 3.474 3.232 3.017 2.796 2.564 2.384 2.199 1.991 1.834 1.677 1.514 1.325 1.102 0.952 0.806 0.578 0.414 0.24 0.151 -0.03 -0.241 -0.476 -0.586 -0.736 -0.95 -1.09 -1.24 -1.553 -1.72 -1.91 -2.123 -2.368 -2.656 -3.062 -4.518 -4 ,1650 ,KEBNE ,17018861,Wed Dec 22 00:31:05 CET,Wed Dec 22 01:58:54 CET,0.0 0.755 1.081 1.327 1.536 1.703 1.821 1.932 2.132 2.223 2.304 2.403 2.503 2.566 2.699 2.832 2.972 3.044 3.168 3.273 3.414 3.508 3.598 3.738 3.892 4.042 4.177 4.302 4.452 4.579 4.699 4.839 4.982 5.122 5.269 5.431 5.606 5.814 6.026 6.245 6.481 6.721 6.951 7.169 7.415 7.68 7.946 8.194 8.43 8.584 8.54 8.124 7.61 7.091 6.608 6.142 5.705 5.302 4.918 4.485 4.11 3.807 3.529 3.243 2.97 2.73 2.475 2.238 2.027 1.808 1.575 1.374 1.179 0.979 0.824 0.664 0.482 0.264 0.048 -0.092 -0.234 -0.458 -0.635 -0.826 -0.923 -1.133 -1.349 -1.565 -1.686 -1.861 -2.117 -2.275 -2.432 -2.786 -3.003 -3.221 -3.45 -3.705 -4.015 -4.407 -5.461 -5 ,5912 ,KEBNE ,17018862,Wed Dec 22 00:31:05 CET,Wed Dec 22 02:00:28 CET,0.0 0.658 0.948 1.167 1.339 1.475 1.585 1.696 1.894 1.984 2.071 2.187 2.302 2.388 2.536 2.676 2.823 2.89 3.013 3.136 3.303 3.394 3.49 3.641 3.771 3.889 4.002 4.105 4.233 4.358 4.485 4.638 4.782 4.912 5.059 5.211 5.35 5.52 5.721 5.928 6.118 6.315 6.543 6.796 7.117 7.429 7.715 7.976 8.223 8.397 8.361 8.001 7.557 7.114 6.69 6.279 5.884 5.488 5.133 4.79 4.485 4.198 3.901 3.596 3.307 3.049 2.788 2.541 2.311 2.082 1.857 1.656 1.441 1.229 1.056 0.875 0.7 0.516 0.311 0.172 0.032 -0.187 -0.332 -0.481 -0.565 -0.766 -0.98 -1.181 -1.285 -1.444 -1.659 -1.776 -1.917 -2.262 -2.447 -2.637 -2.816 -3.026 -3.287 -3.664 -5.013 -6 ,10880 ,KEBNE ,17018863,Wed Dec 22 00:31:05 CET,Wed Dec 22 01:58:34 CET,0.0 0.515 0.808 1.051 1.248 1.426 1.587 1.732 1.985 2.093 2.191 2.325 2.437 2.511 2.654 2.788 2.926 2.996 3.123 3.244 3.414 3.521 3.634 3.803 3.953 4.081 4.215 4.355 4.529 4.691 4.844 5.033 5.209 5.373 5.575 5.795 6.0 6.225 6.466 6.691 6.898 7.111 7.334 7.571 7.855 8.14 8.442 8.732 8.999 9.18 9.119 8.76 8.299 7.837 7.406 6.956 6.506 6.087 5.717 5.355 5.048 4.744 4.421 4.11 3.837 3.59 3.315 3.061 2.842 2.616 2.362 2.134 1.909 1.687 1.514 1.332 1.144 0.959 0.756 0.607 0.453 0.205 0.032 -0.148 -0.246 -0.464 -0.693 -0.923 -1.039 -1.202 -1.455 -1.598 -1.738 -2.083 -2.286 -2.51 -2.76 -3.055 -3.405 -3.942 -5.576 -7 ,21459 ,KEBNE ,17018864,Wed Dec 22 00:31:04 CET,Wed Dec 22 01:58:58 CET,0.0 0.403 0.641 0.842 0.997 1.121 1.232 1.342 1.558 1.651 1.736 1.863 1.971 2.042 2.18 2.306 2.418 2.471 2.584 2.695 2.855 2.952 3.042 3.188 3.345 3.494 3.627 3.747 3.897 4.041 4.172 4.321 4.454 4.576 4.728 4.894 5.055 5.223 5.393 5.595 5.818 6.045 6.278 6.494 6.748 7.011 7.279 7.54 7.79 7.972 7.919 7.544 7.076 6.568 6.077 5.613 5.163 4.755 4.378 3.979 3.654 3.363 3.073 2.781 2.49 2.22 1.961 1.741 1.546 1.336 1.103 0.904 0.698 0.473 0.289 0.095 -0.09 -0.271 -0.461 -0.603 -0.763 -1.005 -1.173 -1.349 -1.439 -1.635 -1.858 -2.08 -2.191 -2.36 -2.587 -2.714 -2.844 -3.13 -3.314 -3.518 -3.736 -3.992 -4.307 -4.729 -6.031 -8 ,1323 ,KEBNE ,17018865,Wed Dec 22 00:32:07 CET,Wed Dec 22 01:59:59 CET,0.0 0.812 1.116 1.313 1.476 1.62 1.74 1.846 2.034 2.119 2.206 2.342 2.454 2.523 2.641 2.758 2.878 2.938 3.052 3.152 3.313 3.437 3.56 3.734 3.897 4.03 4.144 4.264 4.43 4.592 4.747 4.913 5.057 5.194 5.347 5.517 5.684 5.875 6.065 6.243 6.424 6.621 6.844 7.061 7.318 7.595 7.862 8.096 8.337 8.537 8.548 8.227 7.744 7.253 6.784 6.324 5.894 5.488 5.141 4.777 4.449 4.168 3.89 3.61 3.351 3.11 2.846 2.61 2.403 2.186 1.952 1.765 1.581 1.367 1.191 1.009 0.822 0.635 0.446 0.307 0.15 -0.087 -0.248 -0.423 -0.513 -0.708 -0.916 -1.128 -1.238 -1.394 -1.628 -1.771 -1.918 -2.25 -2.441 -2.647 -2.879 -3.159 -3.558 -4.067 -5.261 -9 ,23938 ,KEBNE ,17018866,Wed Dec 22 00:32:07 CET,Wed Dec 22 02:00:18 CET,0.0 0.664 0.957 1.181 1.361 1.493 1.611 1.714 1.896 1.982 2.07 2.21 2.328 2.407 2.551 2.699 2.843 2.907 3.017 3.117 3.277 3.374 3.46 3.579 3.687 3.797 3.909 4.026 4.187 4.34 4.488 4.684 4.873 5.019 5.174 5.363 5.551 5.729 5.902 6.107 6.344 6.6 6.903 7.168 7.409 7.673 7.945 8.191 8.397 8.487 8.397 8.084 7.641 7.155 6.68 6.235 5.824 5.421 5.073 4.729 4.41 4.08 3.755 3.469 3.198 2.927 2.643 2.403 2.2 1.996 1.768 1.563 1.356 1.148 0.984 0.803 0.612 0.407 0.203 0.068 -0.079 -0.296 -0.447 -0.63 -0.721 -0.907 -1.119 -1.335 -1.451 -1.61 -1.825 -1.975 -2.139 -2.458 -2.651 -2.872 -3.113 -3.372 -3.707 -4.154 -5.25 -10 ,23896 ,KEBNE ,17018867,Wed Dec 22 00:32:07 CET,Wed Dec 22 01:59:53 CET,0.0 0.785 1.044 1.216 1.366 1.516 1.652 1.765 1.954 2.039 2.124 2.242 2.347 2.419 2.561 2.683 2.792 2.846 2.96 3.074 3.251 3.374 3.501 3.679 3.829 3.969 4.096 4.203 4.337 4.462 4.578 4.74 4.903 5.039 5.183 5.357 5.522 5.689 5.862 6.036 6.213 6.41 6.635 6.844 7.063 7.327 7.611 7.852 8.065 8.215 8.205 7.839 7.38 6.892 6.436 6.015 5.558 5.087 4.654 4.212 3.863 3.55 3.229 2.918 2.616 2.331 2.067 1.847 1.635 1.391 1.138 0.932 0.724 0.528 0.376 0.208 0.029 -0.157 -0.346 -0.477 -0.616 -0.84 -0.998 -1.174 -1.266 -1.459 -1.675 -1.913 -2.038 -2.209 -2.478 -2.618 -2.764 -3.081 -3.244 -3.446 -3.674 -3.914 -4.201 -4.607 -5.828 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_26_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_26_21.txt deleted file mode 100644 index f8f190e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_26_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22307 ,TETRA ,17590727,Sat Nov 27 21:20:13 CET,Sat Nov 27 23:12:12 CET,0.0 2.448 2.97 3.329 3.641 3.896 4.107 4.314 4.702 4.887 5.051 4.994 5.422 5.538 5.763 5.974 6.16 6.244 6.404 6.551 6.773 6.921 7.059 7.249 7.423 7.582 7.746 7.902 8.065 8.216 8.375 8.57 8.765 8.943 9.133 9.318 9.49 9.692 9.885 10.052 10.189 10.332 10.483 10.599 10.681 10.69 10.617 10.448 10.058 9.27 7.716 5.729 4.006 2.486 1.185 0.049 -0.95 -1.868 -2.65 -3.428 -4.097 -4.687 -5.249 -5.769 -6.249 -6.7 -7.165 -7.571 -7.923 -8.288 -8.672 -8.997 -9.333 -9.67 -9.934 -10.206 -10.48 -10.752 -11.05 -11.275 -11.498 -11.831 -12.068 -12.316 -12.443 -12.702 -12.981 -13.289 -13.445 -13.929 -13.945 -14.126 -14.311 -14.73 -14.986 -15.328 -15.713 -16.133 -16.636 -17.25 -18.7 -2 ,1117 ,TETRA ,17590728,Sat Nov 27 21:20:13 CET,Sat Nov 27 23:20:34 CET,0.0 1.742 2.249 2.597 2.87 3.118 3.35 3.567 3.951 4.12 4.285 4.281 4.732 4.855 5.072 5.287 5.49 5.576 5.758 5.93 6.156 6.302 6.439 6.623 6.792 6.959 7.131 7.293 7.479 7.649 7.808 7.987 8.153 8.315 8.493 8.67 8.826 8.996 9.168 9.331 9.495 9.662 9.816 9.911 9.975 10.023 9.99 9.787 9.383 8.609 7.027 4.964 3.186 1.636 0.337 -0.804 -1.789 -2.698 -3.49 -4.249 -4.896 -5.466 -6.004 -6.523 -7.013 -7.466 -7.953 -8.38 -8.743 -9.124 -9.519 -9.841 -10.166 -10.505 -10.781 -11.077 -11.374 -11.694 -12.021 -12.242 -12.478 -12.838 -13.088 -13.36 -13.505 -13.798 -14.107 -14.451 -14.629 -15.123 -15.159 -15.363 -15.566 -16.024 -16.272 -16.535 -16.866 -17.229 -17.645 -18.156 -19.257 -3 ,15329 ,TETRA ,17590729,Sat Nov 27 21:20:12 CET,Sat Nov 27 23:08:40 CET,0.0 1.806 2.398 2.8 3.107 3.392 3.633 3.848 4.226 4.404 4.573 4.581 5.043 5.177 5.407 5.61 5.798 5.889 6.07 6.242 6.467 6.598 6.726 6.907 7.075 7.243 7.405 7.547 7.719 7.889 8.054 8.243 8.408 8.567 8.745 8.936 9.101 9.272 9.461 9.629 9.777 9.923 10.058 10.166 10.248 10.287 10.218 10.024 9.625 8.835 7.314 5.28 3.513 1.982 0.665 -0.498 -1.505 -2.407 -3.186 -3.978 -4.655 -5.25 -5.815 -6.34 -6.815 -7.26 -7.737 -8.16 -8.524 -8.898 -9.287 -9.621 -9.978 -10.346 -10.624 -10.906 -11.194 -11.493 -11.801 -12.014 -12.238 -12.583 -12.82 -13.064 -13.194 -13.474 -13.767 -14.095 -14.272 -14.768 -14.788 -14.979 -15.178 -15.634 -15.9 -16.201 -16.524 -16.876 -17.264 -17.762 -18.636 -4 ,31010 ,TETRA ,17590730,Sat Nov 27 21:20:13 CET,Sat Nov 27 23:15:54 CET,0.0 1.796 2.371 2.765 3.083 3.383 3.63 3.827 4.169 4.322 4.468 4.428 4.864 4.986 5.211 5.424 5.636 5.736 5.916 6.08 6.307 6.453 6.593 6.784 6.957 7.125 7.29 7.443 7.621 7.795 7.965 8.165 8.354 8.531 8.733 8.942 9.128 9.307 9.481 9.654 9.795 9.922 10.081 10.225 10.331 10.38 10.321 10.123 9.73 8.994 7.481 5.419 3.638 2.079 0.716 -0.506 -1.571 -2.528 -3.34 -4.13 -4.824 -5.442 -6.021 -6.557 -7.058 -7.518 -8.002 -8.436 -8.807 -9.183 -9.572 -9.912 -10.267 -10.619 -10.887 -11.167 -11.451 -11.742 -12.054 -12.271 -12.492 -12.832 -13.068 -13.327 -13.463 -13.746 -14.058 -14.406 -14.573 -15.054 -15.042 -15.216 -15.399 -15.808 -16.057 -16.335 -16.637 -16.986 -17.427 -17.978 -19.259 -5 ,16983 ,TETRA ,17590731,Sat Nov 27 21:20:13 CET,Sat Nov 27 23:11:31 CET,0.0 1.874 2.412 2.79 3.078 3.316 3.529 3.709 4.063 4.224 4.362 4.33 4.774 4.887 5.108 5.333 5.526 5.616 5.794 5.949 6.168 6.312 6.458 6.669 6.866 7.045 7.197 7.346 7.531 7.689 7.853 8.056 8.234 8.393 8.565 8.733 8.903 9.1 9.279 9.424 9.549 9.69 9.834 9.953 10.064 10.116 10.075 9.932 9.572 8.783 7.279 5.304 3.536 2.031 0.728 -0.458 -1.502 -2.451 -3.266 -4.068 -4.745 -5.334 -5.886 -6.412 -6.917 -7.383 -7.854 -8.257 -8.605 -8.966 -9.345 -9.669 -10.0 -10.342 -10.609 -10.89 -11.195 -11.504 -11.809 -12.029 -12.257 -12.623 -12.888 -13.158 -13.289 -13.554 -13.838 -14.145 -14.306 -14.799 -14.844 -15.042 -15.245 -15.715 -15.983 -16.276 -16.599 -16.956 -17.394 -17.924 -19.328 -6 ,19030 ,TETRA ,17590732,Sat Nov 27 21:36:12 CET,Sat Nov 27 23:31:14 CET,0.0 1.461 2.0 2.418 2.747 3.03 3.26 3.468 3.846 4.021 4.192 4.182 4.627 4.759 4.991 5.192 5.385 5.48 5.671 5.854 6.111 6.27 6.428 6.646 6.831 7.005 7.167 7.323 7.516 7.684 7.837 8.039 8.231 8.394 8.571 8.756 8.937 9.117 9.303 9.502 9.677 9.829 9.97 10.08 10.158 10.189 10.147 9.995 9.646 8.886 7.358 5.341 3.567 2.009 0.664 -0.531 -1.595 -2.528 -3.305 -4.084 -4.738 -5.316 -5.874 -6.397 -6.897 -7.348 -7.804 -8.223 -8.589 -8.966 -9.356 -9.694 -10.053 -10.397 -10.656 -10.938 -11.24 -11.55 -11.871 -12.089 -12.316 -12.68 -12.94 -13.21 -13.351 -13.644 -13.953 -14.28 -14.451 -14.956 -14.977 -15.17 -15.376 -15.81 -16.053 -16.326 -16.621 -16.956 -17.338 -17.808 -18.935 -7 ,32301 ,TETRA ,17590733,Sat Nov 27 21:36:12 CET,Sat Nov 27 23:29:34 CET,0.0 1.394 1.928 2.311 2.652 2.968 3.218 3.432 3.788 3.948 4.095 4.063 4.507 4.633 4.898 5.129 5.327 5.42 5.582 5.735 5.954 6.105 6.255 6.458 6.656 6.842 7.014 7.174 7.379 7.574 7.739 7.926 8.11 8.277 8.457 8.652 8.824 9.0 9.178 9.337 9.482 9.622 9.754 9.848 9.919 9.939 9.877 9.703 9.304 8.512 6.997 4.99 3.216 1.645 0.315 -0.831 -1.836 -2.736 -3.542 -4.347 -5.014 -5.612 -6.188 -6.723 -7.215 -7.667 -8.137 -8.567 -8.936 -9.309 -9.702 -10.024 -10.362 -10.715 -10.986 -11.276 -11.579 -11.888 -12.202 -12.419 -12.657 -13.042 -13.293 -13.548 -13.683 -13.96 -14.252 -14.563 -14.729 -15.226 -15.262 -15.46 -15.661 -16.106 -16.364 -16.643 -16.955 -17.333 -17.789 -18.381 -19.945 -8 ,10713 ,TETRA ,17590734,Sat Nov 27 21:36:12 CET,Sat Nov 27 23:27:47 CET,0.0 1.427 1.958 2.394 2.69 2.941 3.171 3.37 3.738 3.912 4.082 4.07 4.503 4.622 4.845 5.062 5.256 5.341 5.515 5.681 5.919 6.057 6.188 6.404 6.605 6.785 6.947 7.1 7.298 7.475 7.626 7.795 7.972 8.137 8.316 8.52 8.691 8.862 9.049 9.23 9.408 9.586 9.751 9.869 9.956 10.011 9.99 9.808 9.389 8.608 7.095 5.065 3.283 1.757 0.442 -0.745 -1.753 -2.671 -3.484 -4.292 -4.987 -5.584 -6.137 -6.668 -7.172 -7.649 -8.133 -8.549 -8.906 -9.266 -9.636 -9.94 -10.276 -10.633 -10.903 -11.181 -11.477 -11.793 -12.116 -12.347 -12.578 -12.924 -13.172 -13.437 -13.578 -13.873 -14.19 -14.544 -14.734 -15.25 -15.288 -15.492 -15.707 -16.153 -16.388 -16.659 -16.977 -17.321 -17.724 -18.311 -19.795 -9 ,3730 ,TETRA ,17590735,Sat Nov 27 21:36:13 CET,Sat Nov 27 23:28:59 CET,0.0 2.008 2.585 2.942 3.234 3.498 3.728 3.932 4.327 4.502 4.66 4.643 5.085 5.203 5.412 5.614 5.813 5.914 6.098 6.266 6.51 6.661 6.796 6.975 7.147 7.317 7.474 7.63 7.82 7.975 8.126 8.305 8.473 8.641 8.832 9.019 9.175 9.34 9.507 9.664 9.821 9.979 10.133 10.246 10.317 10.341 10.292 10.126 9.723 8.922 7.368 5.307 3.524 1.963 0.597 -0.593 -1.617 -2.533 -3.307 -4.067 -4.706 -5.276 -5.823 -6.335 -6.807 -7.238 -7.694 -8.108 -8.47 -8.844 -9.224 -9.545 -9.879 -10.222 -10.486 -10.765 -11.063 -11.369 -11.694 -11.928 -12.163 -12.513 -12.754 -13.009 -13.141 -13.412 -13.708 -14.019 -14.176 -14.658 -14.656 -14.84 -15.038 -15.491 -15.745 -16.018 -16.338 -16.707 -17.129 -17.682 -19.251 -10 ,14944 ,TETRA ,17590736,Sat Nov 27 21:36:13 CET,Sat Nov 27 23:27:45 CET,0.0 1.567 2.069 2.448 2.774 3.061 3.309 3.523 3.896 4.074 4.238 4.216 4.654 4.773 4.996 5.208 5.402 5.498 5.701 5.897 6.15 6.297 6.437 6.631 6.804 6.973 7.13 7.276 7.459 7.629 7.787 7.964 8.13 8.282 8.458 8.653 8.821 8.996 9.184 9.352 9.503 9.65 9.795 9.94 10.064 10.111 10.054 9.872 9.487 8.717 7.186 5.143 3.389 1.892 0.571 -0.644 -1.69 -2.609 -3.398 -4.19 -4.861 -5.441 -6.0 -6.527 -7.018 -7.481 -7.962 -8.378 -8.73 -9.099 -9.475 -9.785 -10.133 -10.496 -10.77 -11.057 -11.35 -11.644 -11.946 -12.15 -12.359 -12.692 -12.931 -13.185 -13.314 -13.576 -13.852 -14.153 -14.318 -14.813 -14.839 -15.023 -15.21 -15.65 -15.895 -16.142 -16.408 -16.717 -17.1 -17.553 -18.394 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_28_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_28_1h1s.txt deleted file mode 100644 index 8d4d3790..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_28_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31395 ,KEBNE ,17018868,Wed Dec 22 00:32:07 CET,Wed Dec 22 02:01:12 CET,0.0 0.383 0.556 0.689 0.809 0.91 1.012 1.115 1.307 1.389 1.472 1.596 1.705 1.774 1.891 1.996 2.1 2.152 2.242 2.326 2.455 2.544 2.625 2.741 2.848 2.938 3.025 3.111 3.22 3.339 3.473 3.619 3.735 3.847 3.971 4.098 4.212 4.333 4.461 4.586 4.705 4.822 4.949 5.055 5.148 5.238 5.313 5.339 5.248 4.958 4.398 3.561 2.756 2.066 1.448 0.865 0.385 -0.058 -0.461 -0.868 -1.213 -1.52 -1.828 -2.121 -2.382 -2.62 -2.884 -3.125 -3.336 -3.553 -3.777 -3.963 -4.155 -4.35 -4.496 -4.643 -4.801 -4.968 -5.145 -5.277 -5.412 -5.645 -5.805 -5.957 -6.041 -6.223 -6.409 -6.593 -6.686 -6.825 -6.986 -7.104 -7.23 -7.519 -7.677 -7.856 -8.065 -8.309 -8.599 -9.031 -10.194 -2 ,343 ,KEBNE ,17018869,Wed Dec 22 00:32:07 CET,Wed Dec 22 02:01:28 CET,0.0 0.486 0.762 0.958 1.091 1.215 1.337 1.438 1.607 1.687 1.768 1.879 1.972 2.029 2.147 2.259 2.36 2.406 2.493 2.584 2.719 2.801 2.88 2.995 3.101 3.193 3.281 3.37 3.482 3.578 3.671 3.792 3.909 4.017 4.135 4.258 4.357 4.456 4.569 4.689 4.808 4.933 5.079 5.211 5.328 5.426 5.508 5.536 5.471 5.263 4.769 3.984 3.211 2.504 1.884 1.355 0.878 0.402 -0.007 -0.404 -0.751 -1.07 -1.368 -1.643 -1.917 -2.165 -2.418 -2.637 -2.833 -3.052 -3.29 -3.51 -3.734 -3.962 -4.134 -4.299 -4.463 -4.628 -4.814 -4.948 -5.084 -5.295 -5.44 -5.597 -5.675 -5.844 -6.033 -6.233 -6.336 -6.486 -6.672 -6.805 -6.95 -7.236 -7.41 -7.606 -7.84 -8.101 -8.366 -8.739 -9.953 -3 ,12949 ,KEBNE ,17018870,Wed Dec 22 00:32:07 CET,Wed Dec 22 02:03:13 CET,0.0 0.601 0.84 0.996 1.132 1.26 1.37 1.469 1.659 1.741 1.816 1.934 2.034 2.092 2.221 2.329 2.432 2.489 2.591 2.676 2.789 2.864 2.945 3.069 3.176 3.268 3.351 3.442 3.563 3.675 3.787 3.917 4.031 4.129 4.237 4.371 4.511 4.667 4.813 4.942 5.073 5.219 5.372 5.504 5.65 5.794 5.888 5.908 5.867 5.666 5.108 4.253 3.449 2.74 2.15 1.609 1.116 0.66 0.253 -0.146 -0.498 -0.831 -1.159 -1.461 -1.751 -2.018 -2.294 -2.536 -2.734 -2.944 -3.174 -3.369 -3.566 -3.778 -3.943 -4.115 -4.3 -4.483 -4.674 -4.82 -4.966 -5.184 -5.34 -5.504 -5.593 -5.777 -5.959 -6.157 -6.269 -6.424 -6.624 -6.749 -6.883 -7.177 -7.337 -7.518 -7.732 -7.962 -8.247 -8.603 -9.946 -4 ,26357 ,KEBNE ,17018871,Wed Dec 22 00:32:07 CET,Wed Dec 22 02:02:58 CET,0.0 0.297 0.515 0.688 0.822 0.95 1.073 1.188 1.364 1.435 1.503 1.595 1.697 1.76 1.872 1.983 2.088 2.135 2.231 2.328 2.461 2.543 2.622 2.733 2.836 2.937 3.031 3.109 3.215 3.311 3.4 3.508 3.603 3.705 3.825 3.958 4.086 4.215 4.348 4.472 4.583 4.704 4.837 4.949 5.052 5.146 5.212 5.207 5.112 4.856 4.262 3.432 2.671 1.993 1.372 0.804 0.294 -0.19 -0.587 -0.976 -1.349 -1.675 -1.978 -2.277 -2.559 -2.805 -3.06 -3.291 -3.487 -3.692 -3.906 -4.088 -4.267 -4.454 -4.615 -4.781 -4.958 -5.155 -5.352 -5.48 -5.611 -5.815 -5.957 -6.124 -6.215 -6.391 -6.566 -6.754 -6.855 -7.001 -7.183 -7.308 -7.451 -7.761 -7.927 -8.107 -8.296 -8.513 -8.793 -9.201 -10.158 -5 ,27196 ,KEBNE ,17018872,Wed Dec 22 00:33:09 CET,Wed Dec 22 02:04:27 CET,0.0 0.335 0.48 0.604 0.723 0.835 0.948 1.071 1.305 1.387 1.448 1.535 1.634 1.693 1.805 1.934 2.063 2.123 2.236 2.332 2.459 2.532 2.608 2.718 2.807 2.895 2.987 3.072 3.181 3.287 3.393 3.507 3.605 3.714 3.838 3.951 4.052 4.166 4.279 4.389 4.504 4.628 4.759 4.868 4.977 5.073 5.15 5.186 5.127 4.926 4.364 3.559 2.823 2.104 1.478 0.914 0.419 -0.031 -0.426 -0.826 -1.176 -1.503 -1.805 -2.084 -2.356 -2.614 -2.888 -3.111 -3.296 -3.483 -3.686 -3.87 -4.075 -4.289 -4.447 -4.612 -4.786 -4.975 -5.167 -5.292 -5.432 -5.651 -5.807 -5.979 -6.068 -6.246 -6.429 -6.628 -6.73 -6.874 -7.048 -7.161 -7.281 -7.582 -7.77 -7.952 -8.129 -8.316 -8.535 -8.904 -10.067 -6 ,1036 ,KEBNE ,17018873,Wed Dec 22 00:33:09 CET,Wed Dec 22 02:03:52 CET,0.0 0.344 0.514 0.669 0.818 0.939 1.032 1.124 1.3 1.375 1.442 1.533 1.633 1.702 1.816 1.916 2.016 2.065 2.159 2.248 2.368 2.445 2.519 2.622 2.722 2.821 2.913 2.998 3.108 3.208 3.295 3.402 3.502 3.592 3.7 3.822 3.93 4.049 4.17 4.291 4.416 4.541 4.67 4.789 4.897 4.993 5.06 5.08 5.044 4.842 4.285 3.404 2.56 1.803 1.145 0.569 0.08 -0.385 -0.792 -1.198 -1.565 -1.879 -2.17 -2.45 -2.725 -2.977 -3.234 -3.477 -3.685 -3.89 -4.107 -4.293 -4.489 -4.692 -4.842 -4.995 -5.155 -5.324 -5.503 -5.634 -5.769 -5.971 -6.129 -6.295 -6.377 -6.549 -6.732 -6.93 -7.03 -7.171 -7.351 -7.477 -7.622 -7.938 -8.111 -8.309 -8.533 -8.777 -9.09 -9.511 -10.411 -7 ,4394 ,KEBNE ,17018874,Wed Dec 22 00:33:09 CET,Wed Dec 22 02:04:15 CET,0.0 0.337 0.52 0.674 0.818 0.942 1.046 1.157 1.334 1.406 1.473 1.56 1.655 1.716 1.837 1.943 2.046 2.096 2.194 2.289 2.411 2.488 2.563 2.678 2.785 2.878 2.963 3.042 3.144 3.236 3.32 3.434 3.546 3.65 3.768 3.894 4.004 4.115 4.232 4.345 4.448 4.555 4.678 4.793 4.905 5.0 5.077 5.091 5.034 4.887 4.375 3.559 2.799 2.048 1.389 0.826 0.32 -0.14 -0.532 -0.922 -1.254 -1.557 -1.851 -2.128 -2.386 -2.634 -2.9 -3.126 -3.313 -3.509 -3.73 -3.917 -4.107 -4.306 -4.467 -4.646 -4.836 -5.038 -5.264 -5.413 -5.562 -5.798 -5.975 -6.156 -6.24 -6.405 -6.586 -6.779 -6.886 -7.045 -7.224 -7.332 -7.458 -7.747 -7.895 -8.035 -8.188 -8.391 -8.679 -9.055 -10.28 -8 ,17273 ,KEBNE ,17018875,Wed Dec 22 00:33:09 CET,Wed Dec 22 02:03:39 CET,0.0 0.373 0.583 0.739 0.884 1.02 1.139 1.249 1.437 1.522 1.615 1.755 1.865 1.938 2.069 2.183 2.291 2.343 2.446 2.556 2.718 2.808 2.886 3.003 3.116 3.216 3.318 3.42 3.54 3.662 3.79 3.935 4.059 4.171 4.303 4.445 4.559 4.678 4.815 4.959 5.11 5.262 5.418 5.574 5.737 5.867 5.977 6.039 5.984 5.77 5.248 4.41 3.666 3.03 2.42 1.836 1.322 0.852 0.459 0.067 -0.275 -0.584 -0.883 -1.169 -1.446 -1.693 -1.933 -2.146 -2.361 -2.585 -2.813 -3.0 -3.181 -3.371 -3.515 -3.667 -3.829 -4.0 -4.179 -4.303 -4.432 -4.624 -4.766 -4.923 -5.003 -5.168 -5.343 -5.537 -5.648 -5.809 -6.01 -6.138 -6.273 -6.577 -6.744 -6.927 -7.124 -7.345 -7.61 -7.96 -9.017 -9 ,14892 ,KEBNE ,17018876,Wed Dec 22 00:33:13 CET,Wed Dec 22 01:58:43 CET,0.0 0.32 0.497 0.662 0.798 0.907 1.004 1.099 1.269 1.34 1.416 1.531 1.626 1.685 1.808 1.924 2.034 2.088 2.187 2.278 2.404 2.483 2.553 2.657 2.766 2.865 2.953 3.034 3.141 3.245 3.353 3.486 3.596 3.688 3.786 3.894 3.997 4.116 4.232 4.347 4.47 4.596 4.717 4.817 4.924 5.016 5.07 5.082 5.021 4.838 4.367 3.548 2.782 2.071 1.417 0.84 0.346 -0.124 -0.532 -0.932 -1.291 -1.612 -1.927 -2.212 -2.47 -2.725 -2.989 -3.225 -3.426 -3.63 -3.852 -4.04 -4.241 -4.445 -4.592 -4.735 -4.891 -5.06 -5.227 -5.345 -5.475 -5.696 -5.843 -6.004 -6.097 -6.283 -6.485 -6.715 -6.837 -6.991 -7.16 -7.28 -7.41 -7.68 -7.824 -7.984 -8.16 -8.377 -8.639 -8.945 -10.09 -10 ,21084 ,KEBNE ,17018877,Wed Dec 22 00:34:12 CET,Wed Dec 22 02:05:22 CET,0.0 0.309 0.447 0.57 0.713 0.859 0.986 1.085 1.25 1.329 1.408 1.512 1.605 1.666 1.785 1.892 1.99 2.037 2.13 2.215 2.321 2.392 2.462 2.555 2.647 2.743 2.832 2.914 3.019 3.113 3.209 3.329 3.422 3.51 3.621 3.753 3.893 4.043 4.176 4.287 4.396 4.53 4.672 4.773 4.872 4.978 5.065 5.087 5.009 4.756 4.147 3.285 2.517 1.811 1.154 0.555 0.043 -0.404 -0.783 -1.201 -1.575 -1.891 -2.194 -2.493 -2.771 -3.021 -3.3 -3.551 -3.752 -3.959 -4.173 -4.35 -4.531 -4.719 -4.873 -5.034 -5.195 -5.354 -5.529 -5.661 -5.8 -6.016 -6.158 -6.315 -6.405 -6.589 -6.778 -6.978 -7.071 -7.204 -7.357 -7.46 -7.58 -7.881 -8.063 -8.276 -8.498 -8.733 -9.022 -9.355 -10.252 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_28_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_28_30.txt deleted file mode 100644 index 05cf6744..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_28_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3816 ,KEBNE ,17018878,Wed Dec 22 00:34:16 CET,Wed Dec 22 01:59:48 CET,0.0 0.321 0.513 0.666 0.796 0.9 0.991 1.086 1.271 1.357 1.44 1.558 1.666 1.733 1.863 1.978 2.078 2.128 2.226 2.319 2.455 2.541 2.622 2.74 2.858 2.971 3.075 3.176 3.305 3.428 3.548 3.693 3.822 3.941 4.085 4.243 4.383 4.535 4.699 4.873 5.054 5.24 5.421 5.584 5.767 5.959 6.161 6.343 6.483 6.527 6.328 5.852 5.38 4.878 4.393 3.947 3.554 3.201 2.892 2.579 2.306 2.053 1.797 1.552 1.312 1.094 0.867 0.652 0.459 0.261 0.053 -0.119 -0.309 -0.508 -0.647 -0.787 -0.94 -1.102 -1.275 -1.392 -1.514 -1.708 -1.849 -2.0 -2.071 -2.217 -2.386 -2.565 -2.657 -2.797 -2.984 -3.095 -3.218 -3.499 -3.665 -3.848 -4.022 -4.207 -4.458 -4.852 -6.011 -2 ,4152 ,KEBNE ,17018879,Wed Dec 22 00:35:15 CET,Wed Dec 22 02:04:50 CET,0.0 0.205 0.338 0.469 0.586 0.685 0.768 0.842 0.974 1.035 1.097 1.177 1.275 1.34 1.454 1.549 1.637 1.681 1.77 1.865 1.992 2.06 2.13 2.239 2.354 2.464 2.563 2.658 2.783 2.909 3.029 3.162 3.281 3.405 3.556 3.716 3.851 3.997 4.156 4.321 4.487 4.658 4.85 5.026 5.195 5.355 5.515 5.667 5.793 5.834 5.577 5.043 4.535 4.042 3.573 3.138 2.763 2.416 2.092 1.764 1.494 1.247 1.01 0.779 0.557 0.351 0.134 -0.056 -0.225 -0.404 -0.581 -0.736 -0.91 -1.082 -1.221 -1.378 -1.55 -1.737 -1.929 -2.057 -2.179 -2.351 -2.478 -2.608 -2.671 -2.813 -2.971 -3.135 -3.217 -3.345 -3.497 -3.599 -3.724 -3.985 -4.116 -4.24 -4.371 -4.524 -4.75 -5.079 -6.082 -3 ,27971 ,KEBNE ,17018880,Wed Dec 22 00:35:15 CET,Wed Dec 22 02:06:23 CET,0.0 0.376 0.564 0.711 0.836 0.957 1.074 1.182 1.389 1.483 1.563 1.673 1.782 1.853 1.979 2.097 2.214 2.27 2.372 2.466 2.599 2.686 2.771 2.886 2.993 3.094 3.192 3.288 3.417 3.539 3.653 3.787 3.907 4.016 4.139 4.289 4.437 4.59 4.75 4.904 5.068 5.247 5.447 5.639 5.842 6.033 6.199 6.349 6.438 6.453 6.279 5.783 5.235 4.709 4.215 3.788 3.413 3.034 2.716 2.409 2.13 1.874 1.627 1.389 1.16 0.942 0.712 0.509 0.33 0.153 -0.032 -0.192 -0.352 -0.528 -0.668 -0.808 -0.943 -1.086 -1.238 -1.345 -1.461 -1.647 -1.779 -1.911 -1.982 -2.141 -2.304 -2.479 -2.577 -2.714 -2.889 -3.001 -3.113 -3.354 -3.491 -3.644 -3.828 -4.03 -4.246 -4.569 -5.429 -4 ,26896 ,KEBNE ,17018881,Wed Dec 22 00:35:16 CET,Wed Dec 22 02:06:18 CET,0.0 0.211 0.371 0.487 0.586 0.699 0.817 0.917 1.075 1.138 1.194 1.273 1.368 1.421 1.523 1.618 1.714 1.76 1.844 1.929 2.063 2.144 2.216 2.323 2.433 2.541 2.641 2.73 2.839 2.939 3.034 3.155 3.272 3.388 3.538 3.701 3.839 3.986 4.141 4.305 4.473 4.658 4.857 5.038 5.236 5.424 5.598 5.748 5.876 5.935 5.743 5.272 4.771 4.266 3.809 3.361 2.954 2.604 2.288 1.956 1.671 1.413 1.156 0.913 0.694 0.496 0.272 0.058 -0.122 -0.303 -0.491 -0.645 -0.812 -0.988 -1.127 -1.275 -1.425 -1.585 -1.755 -1.87 -1.998 -2.188 -2.312 -2.451 -2.521 -2.656 -2.794 -2.955 -3.045 -3.176 -3.377 -3.507 -3.63 -3.898 -4.046 -4.208 -4.381 -4.569 -4.805 -5.128 -5.898 -5 ,22748 ,KEBNE ,17018882,Wed Dec 22 00:35:15 CET,Wed Dec 22 02:06:56 CET,0.0 0.393 0.616 0.779 0.939 1.075 1.207 1.348 1.594 1.693 1.776 1.895 2.009 2.083 2.221 2.357 2.486 2.546 2.666 2.781 2.943 3.047 3.138 3.266 3.394 3.514 3.621 3.724 3.865 3.994 4.122 4.272 4.408 4.543 4.706 4.874 5.006 5.149 5.294 5.437 5.594 5.757 5.939 6.134 6.346 6.559 6.776 6.959 7.091 7.143 6.992 6.525 6.0 5.498 5.026 4.6 4.211 3.84 3.511 3.175 2.884 2.622 2.377 2.143 1.927 1.731 1.527 1.341 1.156 0.955 0.758 0.6 0.426 0.247 0.111 -0.025 -0.16 -0.308 -0.466 -0.575 -0.686 -0.861 -0.987 -1.129 -1.202 -1.345 -1.498 -1.669 -1.75 -1.865 -1.993 -2.08 -2.173 -2.392 -2.511 -2.642 -2.806 -2.982 -3.172 -3.425 -4.341 -6 ,4643 ,KEBNE ,17018883,Wed Dec 22 00:35:16 CET,Wed Dec 22 02:06:36 CET,0.0 0.599 0.844 1.037 1.234 1.416 1.555 1.665 1.879 1.965 2.039 2.167 2.276 2.346 2.49 2.63 2.758 2.814 2.924 3.031 3.183 3.287 3.384 3.521 3.656 3.784 3.903 4.018 4.165 4.29 4.39 4.525 4.659 4.774 4.908 5.054 5.202 5.355 5.516 5.689 5.846 6.01 6.188 6.341 6.515 6.718 6.908 7.051 7.168 7.182 6.992 6.516 5.928 5.386 4.904 4.451 4.041 3.651 3.306 2.958 2.658 2.401 2.152 1.903 1.684 1.487 1.278 1.095 0.926 0.737 0.547 0.399 0.237 0.056 -0.088 -0.24 -0.393 -0.554 -0.718 -0.826 -0.943 -1.114 -1.23 -1.36 -1.43 -1.571 -1.723 -1.883 -1.972 -2.104 -2.252 -2.358 -2.482 -2.761 -2.899 -3.029 -3.188 -3.365 -3.573 -3.858 -4.763 -7 ,25811 ,KEBNE ,17018884,Wed Dec 22 00:35:15 CET,Wed Dec 22 02:06:31 CET,0.0 0.295 0.458 0.594 0.721 0.817 0.913 1.016 1.205 1.29 1.369 1.48 1.58 1.64 1.759 1.88 1.996 2.05 2.165 2.283 2.449 2.55 2.647 2.783 2.912 3.046 3.171 3.279 3.412 3.54 3.655 3.786 3.918 4.045 4.182 4.332 4.471 4.61 4.761 4.929 5.102 5.285 5.487 5.684 5.887 6.088 6.284 6.432 6.553 6.636 6.489 5.989 5.454 4.961 4.474 3.992 3.574 3.187 2.847 2.523 2.239 1.976 1.734 1.491 1.25 1.034 0.816 0.618 0.434 0.245 0.049 -0.12 -0.286 -0.451 -0.59 -0.744 -0.902 -1.065 -1.244 -1.369 -1.493 -1.688 -1.827 -1.978 -2.06 -2.211 -2.355 -2.519 -2.611 -2.747 -2.922 -3.043 -3.165 -3.415 -3.563 -3.732 -3.924 -4.142 -4.396 -4.663 -5.657 -8 ,26325 ,KEBNE ,17018885,Wed Dec 22 00:36:19 CET,Wed Dec 22 02:05:50 CET,0.0 0.393 0.594 0.725 0.869 1.01 1.129 1.222 1.38 1.466 1.542 1.634 1.74 1.812 1.938 2.055 2.166 2.216 2.307 2.397 2.543 2.644 2.738 2.858 2.965 3.078 3.204 3.324 3.482 3.637 3.766 3.908 4.051 4.183 4.329 4.48 4.62 4.78 4.934 5.087 5.249 5.443 5.668 5.848 6.027 6.213 6.399 6.536 6.636 6.72 6.557 6.038 5.49 4.996 4.572 4.177 3.799 3.437 3.109 2.774 2.481 2.22 1.972 1.734 1.511 1.296 1.076 0.888 0.718 0.547 0.369 0.21 0.048 -0.127 -0.266 -0.408 -0.561 -0.713 -0.866 -0.98 -1.093 -1.256 -1.382 -1.513 -1.583 -1.732 -1.868 -2.022 -2.109 -2.232 -2.384 -2.495 -2.618 -2.896 -3.05 -3.193 -3.345 -3.535 -3.769 -4.091 -4.908 -9 ,14613 ,KEBNE ,17018886,Wed Dec 22 00:36:18 CET,Wed Dec 22 02:05:56 CET,0.0 0.497 0.717 0.923 1.096 1.252 1.384 1.514 1.756 1.856 1.948 2.082 2.195 2.272 2.414 2.551 2.677 2.736 2.852 2.962 3.108 3.198 3.289 3.418 3.542 3.668 3.785 3.892 4.031 4.162 4.277 4.418 4.548 4.681 4.834 4.98 5.119 5.262 5.416 5.579 5.746 5.918 6.104 6.295 6.495 6.679 6.852 7.029 7.163 7.175 6.946 6.46 5.934 5.431 4.978 4.54 4.145 3.771 3.414 3.052 2.754 2.491 2.245 2.005 1.772 1.558 1.318 1.101 0.923 0.738 0.543 0.387 0.235 0.088 -0.038 -0.18 -0.325 -0.475 -0.622 -0.716 -0.817 -0.994 -1.113 -1.237 -1.315 -1.476 -1.633 -1.799 -1.882 -2.005 -2.147 -2.242 -2.355 -2.605 -2.738 -2.872 -3.017 -3.176 -3.377 -3.633 -4.101 -10 ,25783 ,KEBNE ,17018887,Wed Dec 22 00:36:17 CET,Wed Dec 22 02:07:15 CET,0.0 0.304 0.455 0.577 0.692 0.804 0.904 0.989 1.151 1.233 1.305 1.39 1.479 1.532 1.637 1.739 1.833 1.872 1.949 2.024 2.13 2.2 2.27 2.376 2.469 2.557 2.647 2.733 2.84 2.944 3.042 3.153 3.259 3.368 3.5 3.644 3.777 3.933 4.096 4.263 4.424 4.594 4.791 4.993 5.213 5.39 5.566 5.752 5.891 5.959 5.803 5.273 4.716 4.226 3.768 3.311 2.897 2.533 2.214 1.867 1.566 1.311 1.069 0.835 0.625 0.428 0.191 -0.022 -0.192 -0.375 -0.585 -0.765 -0.946 -1.12 -1.248 -1.382 -1.538 -1.694 -1.851 -1.966 -2.076 -2.248 -2.374 -2.517 -2.593 -2.735 -2.886 -3.053 -3.138 -3.266 -3.421 -3.536 -3.677 -3.939 -4.058 -4.202 -4.362 -4.556 -4.81 -5.147 -6.322 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_29_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_29_28.txt deleted file mode 100644 index 24187b46..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_29_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21029 ,KEBNE ,17018888,Wed Dec 22 00:36:17 CET,Wed Dec 22 02:08:31 CET,0.0 0.433 0.689 0.883 1.043 1.184 1.323 1.457 1.68 1.774 1.859 1.979 2.08 2.155 2.3 2.446 2.586 2.649 2.761 2.868 3.023 3.124 3.223 3.36 3.489 3.604 3.704 3.81 3.955 4.086 4.199 4.328 4.453 4.577 4.73 4.89 5.037 5.206 5.39 5.576 5.754 5.972 6.238 6.469 6.712 6.923 7.107 7.275 7.383 7.396 7.106 6.507 5.921 5.378 4.909 4.463 4.026 3.587 3.204 2.846 2.547 2.284 2.02 1.76 1.517 1.294 1.056 0.845 0.664 0.482 0.291 0.108 -0.096 -0.314 -0.476 -0.628 -0.782 -0.949 -1.122 -1.241 -1.367 -1.575 -1.722 -1.87 -1.947 -2.116 -2.3 -2.483 -2.573 -2.698 -2.859 -2.981 -3.121 -3.407 -3.555 -3.716 -3.9 -4.131 -4.374 -4.678 -5.526 -2 ,16918 ,KEBNE ,17018889,Wed Dec 22 00:36:17 CET,Wed Dec 22 02:06:59 CET,0.0 0.336 0.531 0.695 0.836 0.962 1.066 1.169 1.357 1.448 1.554 1.735 1.853 1.929 2.071 2.193 2.297 2.348 2.454 2.55 2.678 2.762 2.85 2.982 3.098 3.197 3.301 3.414 3.568 3.714 3.859 4.024 4.168 4.315 4.47 4.605 4.736 4.885 5.038 5.2 5.357 5.525 5.693 5.832 5.977 6.135 6.319 6.48 6.547 6.465 6.155 5.577 5.011 4.479 3.966 3.471 3.035 2.634 2.28 1.912 1.594 1.314 1.027 0.758 0.521 0.304 0.066 -0.166 -0.373 -0.576 -0.78 -0.953 -1.135 -1.329 -1.478 -1.617 -1.788 -1.977 -2.159 -2.283 -2.412 -2.611 -2.749 -2.9 -2.979 -3.144 -3.314 -3.499 -3.605 -3.748 -3.94 -4.065 -4.189 -4.445 -4.594 -4.777 -4.996 -5.259 -5.551 -5.931 -6.963 -3 ,30462 ,KEBNE ,17018890,Wed Dec 22 00:36:19 CET,Wed Dec 22 02:06:38 CET,0.0 0.433 0.673 0.816 0.921 1.021 1.105 1.2 1.398 1.483 1.561 1.687 1.794 1.864 1.997 2.113 2.213 2.262 2.359 2.448 2.576 2.657 2.738 2.864 2.989 3.095 3.192 3.289 3.41 3.525 3.638 3.782 3.926 4.054 4.188 4.336 4.462 4.597 4.754 4.899 5.041 5.206 5.402 5.578 5.749 5.939 6.134 6.28 6.378 6.338 6.054 5.525 4.91 4.342 3.839 3.364 2.945 2.571 2.257 1.929 1.62 1.333 1.055 0.791 0.543 0.315 0.078 -0.131 -0.32 -0.52 -0.737 -0.915 -1.089 -1.275 -1.422 -1.587 -1.752 -1.914 -2.086 -2.199 -2.323 -2.534 -2.672 -2.812 -2.884 -3.038 -3.196 -3.361 -3.446 -3.573 -3.761 -3.875 -3.985 -4.245 -4.411 -4.595 -4.789 -5.0 -5.272 -5.632 -6.449 -4 ,27539 ,KEBNE ,17018891,Wed Dec 22 00:37:22 CET,Wed Dec 22 02:09:23 CET,0.0 0.392 0.615 0.823 0.978 1.09 1.197 1.296 1.474 1.548 1.62 1.737 1.84 1.909 2.035 2.163 2.289 2.343 2.438 2.53 2.658 2.737 2.815 2.933 3.045 3.152 3.256 3.359 3.489 3.597 3.699 3.831 3.963 4.083 4.236 4.425 4.582 4.723 4.88 5.055 5.226 5.393 5.581 5.749 5.929 6.153 6.353 6.49 6.56 6.534 6.269 5.724 5.18 4.62 4.109 3.639 3.213 2.812 2.428 2.052 1.732 1.447 1.182 0.917 0.67 0.446 0.199 -0.022 -0.217 -0.426 -0.639 -0.823 -1.009 -1.198 -1.349 -1.493 -1.656 -1.834 -2.007 -2.128 -2.253 -2.467 -2.611 -2.753 -2.828 -2.988 -3.165 -3.354 -3.463 -3.611 -3.787 -3.905 -4.037 -4.317 -4.46 -4.609 -4.804 -5.027 -5.289 -5.648 -6.543 -5 ,20465 ,KEBNE ,17018892,Wed Dec 22 00:37:21 CET,Wed Dec 22 02:07:49 CET,0.0 0.752 1.044 1.261 1.448 1.596 1.714 1.812 1.981 2.062 2.144 2.26 2.352 2.417 2.545 2.655 2.755 2.806 2.902 2.995 3.138 3.232 3.318 3.432 3.543 3.647 3.74 3.833 3.965 4.094 4.204 4.328 4.454 4.574 4.705 4.85 4.983 5.118 5.252 5.394 5.551 5.721 5.914 6.103 6.294 6.466 6.652 6.807 6.88 6.885 6.663 6.143 5.612 5.091 4.569 4.078 3.648 3.25 2.909 2.559 2.262 1.998 1.724 1.461 1.215 0.977 0.726 0.51 0.325 0.128 -0.081 -0.253 -0.436 -0.632 -0.775 -0.919 -1.069 -1.224 -1.393 -1.514 -1.635 -1.842 -1.992 -2.133 -2.213 -2.377 -2.531 -2.703 -2.798 -2.944 -3.176 -3.317 -3.447 -3.726 -3.893 -4.086 -4.309 -4.565 -4.837 -5.162 -5.98 -6 ,22635 ,KEBNE ,17018893,Wed Dec 22 00:37:21 CET,Wed Dec 22 02:08:11 CET,0.0 0.415 0.633 0.826 0.999 1.148 1.278 1.399 1.625 1.722 1.822 1.979 2.093 2.171 2.303 2.42 2.528 2.578 2.685 2.789 2.928 3.011 3.087 3.199 3.309 3.418 3.523 3.622 3.746 3.863 3.975 4.115 4.243 4.353 4.478 4.619 4.753 4.9 5.056 5.221 5.385 5.568 5.79 5.991 6.183 6.359 6.54 6.676 6.746 6.718 6.41 5.823 5.222 4.667 4.174 3.703 3.267 2.88 2.533 2.18 1.878 1.583 1.29 1.027 0.795 0.586 0.367 0.161 -0.025 -0.218 -0.42 -0.583 -0.75 -0.932 -1.07 -1.214 -1.373 -1.542 -1.722 -1.85 -1.98 -2.171 -2.303 -2.45 -2.531 -2.697 -2.872 -3.059 -3.154 -3.283 -3.461 -3.578 -3.714 -4.017 -4.179 -4.365 -4.563 -4.816 -5.135 -5.514 -6.789 -7 ,5291 ,KEBNE ,17018894,Wed Dec 22 00:37:21 CET,Wed Dec 22 02:07:59 CET,0.0 0.443 0.671 0.873 1.036 1.189 1.306 1.418 1.625 1.716 1.805 1.941 2.04 2.107 2.243 2.371 2.483 2.538 2.644 2.745 2.887 2.978 3.082 3.239 3.362 3.465 3.567 3.67 3.798 3.914 4.028 4.172 4.306 4.432 4.577 4.733 4.887 5.043 5.195 5.349 5.507 5.684 5.884 6.05 6.213 6.392 6.564 6.705 6.801 6.78 6.538 6.016 5.404 4.818 4.301 3.821 3.383 2.958 2.597 2.259 1.959 1.674 1.4 1.132 0.876 0.63 0.354 0.126 -0.059 -0.263 -0.488 -0.664 -0.846 -1.05 -1.208 -1.37 -1.536 -1.697 -1.872 -1.997 -2.126 -2.336 -2.487 -2.638 -2.713 -2.873 -3.042 -3.218 -3.315 -3.448 -3.616 -3.729 -3.851 -4.15 -4.343 -4.538 -4.723 -4.937 -5.223 -5.602 -6.673 -8 ,5057 ,KEBNE ,17018895,Wed Dec 22 00:37:22 CET,Wed Dec 22 02:09:51 CET,0.0 0.471 0.674 0.846 0.991 1.147 1.293 1.413 1.642 1.735 1.827 1.997 2.113 2.19 2.346 2.463 2.57 2.626 2.726 2.815 2.936 3.02 3.1 3.208 3.32 3.432 3.538 3.631 3.754 3.882 3.996 4.116 4.235 4.349 4.477 4.632 4.776 4.918 5.066 5.238 5.407 5.579 5.782 5.97 6.164 6.352 6.553 6.732 6.836 6.838 6.587 5.991 5.398 4.844 4.344 3.891 3.46 3.042 2.679 2.321 2.02 1.738 1.465 1.217 0.971 0.749 0.504 0.268 0.075 -0.116 -0.327 -0.515 -0.7 -0.901 -1.074 -1.256 -1.437 -1.616 -1.801 -1.921 -2.046 -2.259 -2.405 -2.563 -2.643 -2.798 -2.975 -3.15 -3.238 -3.366 -3.563 -3.682 -3.797 -4.062 -4.203 -4.341 -4.493 -4.685 -4.928 -5.216 -6.407 -9 ,19817 ,KEBNE ,17018896,Wed Dec 22 00:37:21 CET,Wed Dec 22 02:07:52 CET,0.0 0.413 0.63 0.781 0.881 0.984 1.087 1.18 1.359 1.443 1.527 1.645 1.738 1.801 1.906 2.006 2.109 2.16 2.253 2.349 2.486 2.564 2.639 2.748 2.852 2.956 3.06 3.156 3.273 3.386 3.497 3.628 3.75 3.867 4.004 4.166 4.317 4.477 4.652 4.815 4.962 5.125 5.322 5.491 5.676 5.895 6.079 6.234 6.363 6.384 6.109 5.553 5.009 4.454 3.926 3.423 2.986 2.613 2.283 1.933 1.625 1.341 1.062 0.802 0.556 0.328 0.101 -0.099 -0.281 -0.475 -0.69 -0.867 -1.03 -1.202 -1.349 -1.502 -1.659 -1.822 -1.995 -2.119 -2.244 -2.428 -2.553 -2.693 -2.772 -2.932 -3.096 -3.284 -3.378 -3.503 -3.665 -3.767 -3.874 -4.109 -4.246 -4.417 -4.622 -4.84 -5.108 -5.502 -6.679 -10 ,23421 ,KEBNE ,17018897,Wed Dec 22 00:37:21 CET,Wed Dec 22 02:08:01 CET,0.0 0.533 0.783 0.942 1.088 1.219 1.342 1.463 1.66 1.737 1.809 1.914 2.008 2.07 2.204 2.349 2.49 2.56 2.697 2.823 2.999 3.113 3.211 3.327 3.439 3.555 3.664 3.764 3.883 3.996 4.12 4.283 4.424 4.545 4.668 4.812 4.962 5.112 5.27 5.439 5.602 5.767 5.923 6.052 6.201 6.376 6.563 6.709 6.788 6.798 6.557 6.035 5.49 4.966 4.476 4.002 3.581 3.173 2.823 2.469 2.132 1.844 1.583 1.33 1.089 0.863 0.626 0.417 0.237 0.055 -0.136 -0.303 -0.484 -0.666 -0.808 -0.964 -1.116 -1.273 -1.441 -1.556 -1.678 -1.862 -1.998 -2.148 -2.232 -2.405 -2.574 -2.761 -2.863 -3.0 -3.171 -3.287 -3.414 -3.684 -3.837 -4.005 -4.186 -4.381 -4.618 -4.956 -6.02 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_29_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_29_30.txt deleted file mode 100644 index 3744f1de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_29_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22527 ,KEBNE ,17018898,Wed Dec 22 00:38:23 CET,Wed Dec 22 02:10:07 CET,0.0 0.248 0.38 0.49 0.579 0.666 0.738 0.8 0.917 0.973 1.029 1.093 1.171 1.22 1.306 1.386 1.475 1.519 1.589 1.656 1.756 1.82 1.889 1.991 2.085 2.18 2.277 2.369 2.482 2.587 2.674 2.774 2.881 2.978 3.097 3.241 3.361 3.472 3.588 3.7 3.806 3.916 4.042 4.147 4.233 4.308 4.348 4.329 4.213 3.932 3.295 2.344 1.489 0.701 0.033 -0.569 -1.115 -1.611 -2.045 -2.462 -2.809 -3.153 -3.491 -3.799 -4.092 -4.347 -4.617 -4.875 -5.093 -5.318 -5.56 -5.764 -5.972 -6.171 -6.322 -6.488 -6.663 -6.851 -7.048 -7.184 -7.328 -7.556 -7.714 -7.872 -7.954 -8.131 -8.322 -8.529 -8.65 -8.814 -9.028 -9.156 -9.289 -9.621 -9.816 -10.011 -10.211 -10.469 -10.826 -11.227 -12.151 -2 ,396 ,KEBNE ,17018899,Wed Dec 22 00:42:30 CET,Wed Dec 22 02:05:33 CET,0.0 0.267 0.423 0.565 0.692 0.804 0.905 0.996 1.146 1.216 1.287 1.379 1.461 1.512 1.624 1.753 1.865 1.908 1.991 2.074 2.191 2.262 2.33 2.43 2.526 2.623 2.718 2.805 2.915 3.011 3.092 3.189 3.283 3.385 3.509 3.629 3.723 3.824 3.945 4.069 4.185 4.309 4.437 4.545 4.65 4.739 4.796 4.783 4.686 4.416 3.775 2.889 2.084 1.331 0.637 0.024 -0.52 -1.024 -1.453 -1.88 -2.257 -2.595 -2.916 -3.222 -3.499 -3.743 -4.005 -4.245 -4.46 -4.695 -4.93 -5.113 -5.303 -5.51 -5.684 -5.862 -6.043 -6.238 -6.44 -6.583 -6.744 -6.993 -7.158 -7.318 -7.397 -7.579 -7.769 -7.971 -8.077 -8.221 -8.424 -8.547 -8.672 -8.969 -9.153 -9.353 -9.564 -9.836 -10.17 -10.612 -12.128 -3 ,15968 ,KEBNE ,17018900,Wed Dec 22 00:43:32 CET,Wed Dec 22 02:14:02 CET,0.0 0.369 0.603 0.788 0.943 1.067 1.177 1.279 1.472 1.558 1.639 1.771 1.878 1.948 2.085 2.21 2.313 2.36 2.447 2.52 2.631 2.707 2.779 2.892 3.005 3.101 3.185 3.27 3.389 3.492 3.581 3.69 3.793 3.891 4.004 4.139 4.251 4.355 4.463 4.576 4.697 4.816 4.94 5.053 5.151 5.219 5.262 5.246 5.134 4.872 4.208 3.231 2.37 1.586 0.902 0.305 -0.226 -0.711 -1.131 -1.561 -1.935 -2.264 -2.578 -2.879 -3.165 -3.421 -3.699 -3.96 -4.175 -4.397 -4.627 -4.813 -5.0 -5.209 -5.386 -5.566 -5.752 -5.94 -6.137 -6.276 -6.415 -6.636 -6.802 -6.97 -7.051 -7.228 -7.415 -7.622 -7.734 -7.882 -8.065 -8.187 -8.325 -8.612 -8.769 -8.953 -9.155 -9.389 -9.665 -10.05 -11.043 -4 ,5343 ,KEBNE ,17018901,Wed Dec 22 00:46:38 CET,Wed Dec 22 02:16:42 CET,0.0 0.234 0.425 0.586 0.704 0.8 0.878 0.954 1.096 1.161 1.226 1.329 1.423 1.482 1.596 1.707 1.81 1.853 1.932 2.017 2.146 2.22 2.291 2.391 2.482 2.569 2.655 2.741 2.849 2.946 3.035 3.14 3.23 3.319 3.427 3.54 3.645 3.754 3.874 3.991 4.097 4.213 4.324 4.411 4.502 4.582 4.628 4.609 4.506 4.235 3.588 2.688 1.858 1.112 0.454 -0.163 -0.715 -1.196 -1.608 -2.023 -2.391 -2.73 -3.047 -3.354 -3.636 -3.901 -4.189 -4.436 -4.647 -4.867 -5.109 -5.31 -5.503 -5.698 -5.855 -6.03 -6.218 -6.422 -6.636 -6.774 -6.911 -7.141 -7.319 -7.488 -7.571 -7.745 -7.933 -8.138 -8.237 -8.381 -8.587 -8.712 -8.831 -9.087 -9.243 -9.424 -9.643 -9.942 -10.297 -10.666 -11.84 -5 ,31898 ,KEBNE ,17018902,Wed Dec 22 00:46:38 CET,Wed Dec 22 02:18:31 CET,0.0 0.169 0.29 0.389 0.467 0.556 0.636 0.704 0.838 0.894 0.949 1.028 1.104 1.151 1.241 1.335 1.44 1.486 1.569 1.65 1.761 1.841 1.935 2.075 2.19 2.282 2.369 2.453 2.559 2.663 2.767 2.873 2.972 3.079 3.2 3.312 3.416 3.529 3.627 3.742 3.862 3.971 4.075 4.164 4.249 4.316 4.36 4.343 4.243 3.981 3.382 2.46 1.643 0.93 0.279 -0.328 -0.869 -1.382 -1.819 -2.228 -2.596 -2.938 -3.271 -3.581 -3.866 -4.134 -4.419 -4.674 -4.897 -5.125 -5.353 -5.546 -5.759 -5.977 -6.14 -6.325 -6.525 -6.708 -6.892 -7.032 -7.176 -7.393 -7.538 -7.681 -7.763 -7.942 -8.141 -8.355 -8.469 -8.63 -8.845 -8.969 -9.097 -9.352 -9.504 -9.697 -9.9 -10.135 -10.422 -10.831 -12.171 -6 ,26905 ,KEBNE ,17018903,Wed Dec 22 00:46:39 CET,Wed Dec 22 02:13:04 CET,0.0 0.375 0.575 0.744 0.876 0.982 1.084 1.186 1.382 1.477 1.563 1.667 1.758 1.816 1.915 2.009 2.099 2.137 2.216 2.299 2.425 2.509 2.586 2.69 2.778 2.857 2.943 3.024 3.119 3.211 3.3 3.403 3.501 3.597 3.707 3.821 3.932 4.041 4.134 4.236 4.339 4.441 4.549 4.629 4.719 4.801 4.821 4.794 4.686 4.385 3.736 2.829 1.994 1.228 0.563 -0.022 -0.566 -1.07 -1.512 -1.951 -2.329 -2.669 -2.981 -3.271 -3.544 -3.798 -4.069 -4.333 -4.566 -4.786 -5.0 -5.184 -5.386 -5.601 -5.767 -5.942 -6.122 -6.297 -6.487 -6.625 -6.772 -7.007 -7.172 -7.349 -7.438 -7.618 -7.81 -8.002 -8.104 -8.259 -8.461 -8.581 -8.707 -8.997 -9.168 -9.347 -9.543 -9.786 -10.079 -10.44 -11.591 -7 ,10670 ,KEBNE ,17018904,Wed Dec 22 00:47:40 CET,Wed Dec 22 02:17:31 CET,0.0 0.253 0.428 0.577 0.699 0.798 0.882 0.963 1.107 1.176 1.248 1.341 1.423 1.475 1.575 1.668 1.757 1.801 1.891 1.984 2.107 2.181 2.257 2.353 2.444 2.534 2.619 2.693 2.783 2.872 2.958 3.064 3.16 3.252 3.356 3.465 3.564 3.668 3.786 3.891 3.984 4.066 4.172 4.276 4.353 4.417 4.475 4.478 4.354 4.088 3.456 2.486 1.615 0.862 0.185 -0.457 -1.013 -1.515 -1.96 -2.409 -2.802 -3.154 -3.488 -3.815 -4.121 -4.392 -4.676 -4.929 -5.144 -5.375 -5.614 -5.818 -6.035 -6.252 -6.423 -6.603 -6.796 -7.003 -7.217 -7.363 -7.522 -7.768 -7.934 -8.11 -8.2 -8.406 -8.611 -8.804 -8.915 -9.069 -9.279 -9.414 -9.553 -9.837 -10.005 -10.204 -10.407 -10.65 -10.97 -11.374 -12.576 -8 ,26580 ,KEBNE ,17018905,Wed Dec 22 00:48:45 CET,Wed Dec 22 02:12:09 CET,0.0 0.178 0.295 0.407 0.5 0.589 0.69 0.788 0.97 1.069 1.154 1.244 1.327 1.387 1.504 1.606 1.698 1.738 1.81 1.884 1.988 2.054 2.123 2.229 2.324 2.407 2.483 2.56 2.665 2.752 2.833 2.947 3.061 3.152 3.247 3.358 3.451 3.553 3.674 3.79 3.897 4.023 4.146 4.24 4.36 4.447 4.5 4.522 4.422 4.119 3.438 2.531 1.751 0.988 0.28 -0.339 -0.877 -1.368 -1.784 -2.19 -2.565 -2.91 -3.236 -3.553 -3.843 -4.099 -4.381 -4.633 -4.842 -5.059 -5.285 -5.476 -5.681 -5.903 -6.076 -6.259 -6.452 -6.637 -6.826 -6.954 -7.085 -7.282 -7.416 -7.57 -7.659 -7.839 -8.026 -8.23 -8.338 -8.489 -8.682 -8.811 -8.942 -9.217 -9.372 -9.541 -9.753 -10.015 -10.285 -10.563 -11.647 -9 ,12999 ,KEBNE ,17018906,Wed Dec 22 00:48:42 CET,Wed Dec 22 02:15:45 CET,0.0 0.328 0.468 0.589 0.698 0.794 0.88 0.96 1.101 1.169 1.24 1.342 1.429 1.479 1.609 1.757 1.873 1.925 2.019 2.098 2.218 2.294 2.372 2.503 2.628 2.749 2.866 2.974 3.098 3.2 3.299 3.409 3.511 3.615 3.728 3.844 3.946 4.048 4.148 4.256 4.376 4.506 4.631 4.737 4.831 4.903 4.959 4.968 4.879 4.59 3.907 2.973 2.19 1.455 0.742 0.107 -0.45 -0.961 -1.388 -1.807 -2.177 -2.508 -2.821 -3.124 -3.415 -3.694 -3.978 -4.227 -4.449 -4.688 -4.931 -5.122 -5.328 -5.545 -5.72 -5.905 -6.099 -6.308 -6.516 -6.66 -6.813 -7.036 -7.186 -7.343 -7.424 -7.602 -7.792 -8.001 -8.114 -8.267 -8.475 -8.613 -8.76 -9.084 -9.26 -9.463 -9.667 -9.869 -10.126 -10.509 -11.437 -10 ,30350 ,KEBNE ,17018907,Wed Dec 22 00:51:47 CET,Wed Dec 22 02:21:59 CET,0.0 0.293 0.492 0.649 0.758 0.864 0.961 1.04 1.183 1.246 1.302 1.397 1.488 1.538 1.628 1.725 1.823 1.87 1.965 2.043 2.148 2.216 2.281 2.375 2.458 2.536 2.621 2.708 2.831 2.957 3.054 3.159 3.254 3.336 3.441 3.553 3.66 3.778 3.888 3.985 4.084 4.195 4.312 4.41 4.524 4.631 4.684 4.688 4.589 4.319 3.67 2.698 1.848 1.127 0.487 -0.137 -0.723 -1.235 -1.66 -2.102 -2.497 -2.842 -3.16 -3.464 -3.746 -3.987 -4.253 -4.527 -4.759 -4.978 -5.204 -5.4 -5.608 -5.811 -5.975 -6.151 -6.322 -6.491 -6.684 -6.828 -6.972 -7.204 -7.359 -7.516 -7.604 -7.788 -7.997 -8.212 -8.31 -8.453 -8.63 -8.747 -8.866 -9.108 -9.269 -9.44 -9.623 -9.849 -10.127 -10.55 -12.27 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_30_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_30_1h1s.txt deleted file mode 100644 index 18b34734..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_30_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30586 ,TETRA ,17590778,Sat Nov 27 21:39:11 CET,Sat Nov 27 23:34:49 CET,0.0 0.762 1.063 1.287 1.478 1.6 1.696 1.786 1.927 1.981 2.016 1.666 2.097 2.118 2.14 2.149 2.162 2.166 2.153 2.127 2.084 2.051 2.015 1.956 1.892 1.821 1.748 1.666 1.527 1.367 1.2 0.988 0.759 0.517 0.217 -0.163 -0.557 -1.009 -1.539 -2.15 -2.849 -3.705 -4.782 -5.954 -7.458 -9.318 -11.663 -14.643 -18.718 -24.413 -32.89 -41.844 -48.531 -53.831 -58.124 -61.761 -64.782 -67.389 -69.555 -71.631 -73.333 -74.825 -76.207 -77.465 -78.617 -79.647 -80.709 -81.633 -82.416 -83.227 -84.051 -84.71 -85.385 -86.08 -86.607 -87.135 -87.674 -88.24 -88.814 -89.193 -89.576 -90.157 -90.563 -90.984 -91.197 -91.636 -92.086 -92.55 -92.788 -93.548 -93.546 -93.814 -94.092 -94.666 -94.963 -95.271 -95.668 -96.161 -96.653 -97.298 -98.626 -2 ,20351 ,TETRA ,17590779,Sat Nov 27 21:40:13 CET,Sat Nov 27 23:34:18 CET,0.0 0.88 1.192 1.413 1.568 1.692 1.8 1.892 2.053 2.114 2.154 1.827 2.274 2.307 2.371 2.42 2.448 2.462 2.478 2.469 2.437 2.412 2.386 2.336 2.265 2.177 2.083 1.994 1.873 1.728 1.566 1.367 1.163 0.935 0.646 0.307 -0.044 -0.471 -0.992 -1.614 -2.315 -3.157 -4.228 -5.41 -6.929 -8.786 -11.174 -14.237 -18.352 -24.041 -32.46 -41.438 -48.199 -53.519 -57.77 -61.373 -64.39 -67.006 -69.139 -71.172 -72.951 -74.517 -75.928 -77.209 -78.386 -79.437 -80.506 -81.445 -82.236 -83.038 -83.865 -84.541 -85.222 -85.924 -86.468 -87.006 -87.548 -88.118 -88.7 -89.094 -89.501 -90.109 -90.514 -90.932 -91.146 -91.576 -92.023 -92.499 -92.742 -93.509 -93.51 -93.767 -94.043 -94.655 -94.97 -95.309 -95.704 -96.138 -96.593 -97.171 -98.376 -3 ,1564 ,TETRA ,17590780,Sat Nov 27 21:40:14 CET,Sat Nov 27 23:34:50 CET,0.0 0.712 1.021 1.22 1.384 1.512 1.624 1.727 1.874 1.941 2.003 1.687 2.129 2.153 2.198 2.238 2.245 2.249 2.265 2.269 2.25 2.219 2.185 2.141 2.077 2.003 1.919 1.817 1.692 1.564 1.421 1.231 1.025 0.799 0.516 0.168 -0.193 -0.622 -1.137 -1.738 -2.401 -3.195 -4.229 -5.401 -6.891 -8.707 -11.036 -14.013 -18.003 -23.559 -31.95 -40.881 -47.646 -53.046 -57.371 -61.012 -64.046 -66.709 -68.959 -71.092 -72.871 -74.403 -75.809 -77.096 -78.239 -79.269 -80.339 -81.271 -82.066 -82.874 -83.694 -84.38 -85.082 -85.793 -86.335 -86.884 -87.443 -87.996 -88.565 -88.976 -89.391 -89.999 -90.415 -90.856 -91.083 -91.545 -92.024 -92.505 -92.761 -93.547 -93.6 -93.939 -94.317 -95.121 -95.548 -95.964 -96.402 -96.904 -97.477 -98.203 -99.571 -4 ,30933 ,TETRA ,17590781,Sat Nov 27 21:40:14 CET,Sat Nov 27 23:34:24 CET,0.0 0.722 1.06 1.314 1.521 1.658 1.778 1.885 2.033 2.092 2.148 1.823 2.265 2.301 2.34 2.356 2.367 2.374 2.389 2.392 2.367 2.337 2.295 2.229 2.166 2.094 2.011 1.925 1.794 1.649 1.498 1.281 1.032 0.785 0.489 0.128 -0.223 -0.655 -1.172 -1.756 -2.429 -3.262 -4.332 -5.506 -7.0 -8.836 -11.21 -14.245 -18.321 -23.935 -32.351 -41.33 -48.06 -53.411 -57.729 -61.348 -64.336 -66.957 -69.136 -71.213 -72.948 -74.435 -75.808 -77.06 -78.197 -79.21 -80.234 -81.131 -81.898 -82.689 -83.495 -84.148 -84.818 -85.517 -86.065 -86.612 -87.155 -87.722 -88.298 -88.685 -89.076 -89.663 -90.058 -90.469 -90.685 -91.144 -91.602 -92.065 -92.315 -93.081 -93.087 -93.353 -93.625 -94.22 -94.546 -94.896 -95.269 -95.657 -96.073 -96.651 -98.082 -5 ,2400 ,TETRA ,17590782,Sat Nov 27 21:40:14 CET,Sat Nov 27 23:32:16 CET,0.0 0.741 1.024 1.204 1.364 1.498 1.622 1.742 1.916 1.981 2.036 1.713 2.142 2.147 2.164 2.176 2.172 2.186 2.208 2.19 2.173 2.153 2.112 2.042 1.959 1.88 1.793 1.695 1.553 1.399 1.246 1.031 0.809 0.577 0.285 -0.077 -0.467 -0.915 -1.433 -2.032 -2.707 -3.515 -4.567 -5.749 -7.268 -9.126 -11.477 -14.473 -18.563 -24.255 -32.709 -41.74 -48.6 -53.968 -58.226 -61.799 -64.771 -67.343 -69.503 -71.593 -73.314 -74.825 -76.237 -77.501 -78.64 -79.665 -80.712 -81.639 -82.432 -83.226 -84.04 -84.707 -85.369 -86.045 -86.569 -87.102 -87.644 -88.203 -88.768 -89.185 -89.69 -90.519 -91.089 -91.663 -91.944 -92.528 -93.118 -93.713 -94.028 -94.916 -95.022 -95.37 -95.717 -96.451 -96.841 -97.267 -97.718 -98.254 -98.91 -99.734 -101.508 -6 ,25094 ,TETRA ,17590783,Sat Nov 27 21:41:12 CET,Sat Nov 27 23:34:22 CET,0.0 0.574 0.865 1.028 1.171 1.314 1.429 1.523 1.671 1.725 1.777 1.454 1.885 1.909 1.952 1.963 1.95 1.95 1.955 1.952 1.944 1.923 1.883 1.813 1.72 1.621 1.527 1.43 1.282 1.116 0.952 0.74 0.514 0.273 -0.032 -0.392 -0.762 -1.21 -1.746 -2.362 -3.055 -3.885 -4.922 -6.063 -7.584 -9.481 -11.877 -14.934 -19.039 -24.744 -33.246 -42.228 -48.948 -54.174 -58.381 -62.02 -65.068 -67.706 -69.899 -72.026 -73.807 -75.37 -76.834 -78.156 -79.337 -80.381 -81.458 -82.392 -83.177 -83.975 -84.77 -85.428 -86.224 -87.162 -87.891 -88.642 -89.42 -90.198 -90.973 -91.492 -92.023 -92.836 -93.383 -93.951 -94.239 -94.826 -95.438 -96.077 -96.408 -97.303 -97.422 -97.779 -98.153 -98.954 -99.416 -99.895 -100.336 -100.814 -101.381 -102.068 -103.121 -7 ,26101 ,TETRA ,17590784,Sat Nov 27 21:41:14 CET,Sat Nov 27 23:34:48 CET,0.0 1.002 1.381 1.649 1.839 1.966 2.063 2.155 2.301 2.344 2.378 2.055 2.493 2.509 2.529 2.546 2.551 2.551 2.545 2.534 2.528 2.513 2.479 2.417 2.372 2.326 2.257 2.168 2.037 1.908 1.761 1.551 1.349 1.125 0.828 0.46 0.071 -0.37 -0.893 -1.512 -2.211 -3.062 -4.167 -5.391 -6.918 -8.786 -11.204 -14.251 -18.281 -23.904 -32.365 -41.431 -48.182 -53.472 -57.73 -61.374 -64.414 -66.987 -69.143 -71.246 -72.99 -74.474 -75.833 -77.095 -78.249 -79.293 -80.369 -81.309 -82.088 -82.853 -83.644 -84.31 -85.004 -85.715 -86.254 -86.801 -87.345 -87.889 -88.449 -88.838 -89.229 -89.82 -90.244 -90.681 -90.902 -91.354 -91.811 -92.293 -92.537 -93.305 -93.307 -93.567 -93.843 -94.427 -94.742 -95.092 -95.477 -95.853 -96.249 -96.744 -97.814 -8 ,2692 ,TETRA ,17590785,Sat Nov 27 21:41:12 CET,Sat Nov 27 23:35:02 CET,0.0 0.815 1.145 1.358 1.502 1.62 1.724 1.822 1.978 2.033 2.073 1.736 2.167 2.188 2.248 2.306 2.34 2.355 2.371 2.381 2.369 2.34 2.309 2.235 2.157 2.079 1.974 1.862 1.723 1.568 1.388 1.169 0.948 0.725 0.46 0.106 -0.291 -0.755 -1.289 -1.899 -2.592 -3.439 -4.504 -5.686 -7.183 -9.031 -11.428 -14.487 -18.594 -24.244 -32.741 -41.792 -48.518 -53.875 -58.199 -61.799 -64.76 -67.303 -69.462 -71.562 -73.278 -74.749 -76.115 -77.386 -78.538 -79.567 -80.623 -81.541 -82.301 -83.068 -83.856 -84.501 -85.18 -85.88 -86.412 -86.948 -87.494 -88.055 -88.62 -89.036 -89.481 -90.163 -90.643 -91.134 -91.384 -91.901 -92.421 -92.968 -93.253 -94.049 -94.118 -94.421 -94.725 -95.44 -95.886 -96.399 -96.934 -97.507 -98.184 -99.036 -101.111 -9 ,10017 ,TETRA ,17590786,Sat Nov 27 21:41:11 CET,Sat Nov 27 23:34:23 CET,0.0 0.762 1.078 1.289 1.422 1.554 1.698 1.815 1.994 2.059 2.115 1.814 2.261 2.292 2.309 2.322 2.345 2.352 2.344 2.321 2.284 2.25 2.211 2.139 2.053 1.973 1.895 1.802 1.654 1.511 1.357 1.135 0.918 0.689 0.383 0.014 -0.331 -0.692 -1.157 -1.763 -2.459 -3.3 -4.372 -5.557 -7.069 -8.945 -11.37 -14.402 -18.453 -24.073 -32.494 -41.484 -48.196 -53.503 -57.814 -61.488 -64.527 -67.112 -69.247 -71.291 -73.024 -74.525 -75.901 -77.166 -78.3 -79.314 -80.368 -81.294 -82.07 -82.854 -83.65 -84.297 -84.953 -85.628 -86.147 -86.674 -87.206 -87.759 -88.324 -88.695 -89.081 -89.684 -90.104 -90.535 -90.749 -91.173 -91.616 -92.085 -92.33 -93.102 -93.112 -93.418 -93.76 -94.539 -94.987 -95.466 -95.986 -96.577 -97.235 -98.025 -99.483 -10 ,12009 ,TETRA ,17590787,Sat Nov 27 21:41:14 CET,Sat Nov 27 23:34:43 CET,0.0 0.678 0.997 1.214 1.367 1.494 1.612 1.715 1.856 1.918 1.973 1.663 2.115 2.144 2.157 2.164 2.169 2.165 2.149 2.133 2.102 2.08 2.049 1.984 1.924 1.85 1.752 1.67 1.569 1.432 1.266 1.046 0.824 0.585 0.283 -0.07 -0.445 -0.89 -1.409 -2.015 -2.716 -3.565 -4.648 -5.852 -7.346 -9.201 -11.59 -14.609 -18.729 -24.425 -32.839 -41.827 -48.567 -53.858 -58.161 -61.765 -64.695 -67.233 -69.409 -71.539 -73.288 -74.773 -76.165 -77.452 -78.598 -79.621 -80.664 -81.591 -82.397 -83.203 -84.015 -84.682 -85.353 -86.06 -86.613 -87.171 -87.745 -88.319 -88.888 -89.261 -89.648 -90.26 -90.676 -91.099 -91.31 -91.759 -92.223 -92.683 -92.922 -93.693 -93.744 -94.037 -94.331 -94.969 -95.287 -95.629 -96.02 -96.46 -96.975 -97.589 -98.878 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_30_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_30_26.txt deleted file mode 100644 index c35f54de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_30_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28424 ,KEBNE ,17069221,Thu Dec 23 20:37:08 CET,Thu Dec 23 22:06:32 CET,0.0 0.607 0.851 1.07 1.281 1.463 1.621 1.761 2.011 2.125 2.234 2.406 2.541 2.63 2.806 2.978 3.151 3.241 3.417 3.59 3.847 4.005 4.151 4.346 4.53 4.707 4.878 5.041 5.24 5.438 5.63 5.874 6.131 6.37 6.636 6.932 7.214 7.517 7.834 8.148 8.475 8.846 9.263 9.692 10.202 10.769 11.403 12.082 12.843 13.645 14.471 14.943 15.005 14.916 14.745 14.523 14.315 14.123 13.931 13.703 13.469 13.25 13.047 12.833 12.624 12.44 12.252 12.053 11.854 11.651 11.434 11.263 11.083 10.875 10.696 10.501 10.321 10.154 9.976 9.853 9.719 9.502 9.345 9.179 9.096 8.913 8.71 8.503 8.397 8.247 8.035 7.895 7.749 7.44 7.252 7.058 6.844 6.591 6.28 5.824 4.057 -2 ,31418 ,KEBNE ,17069222,Thu Dec 23 20:37:10 CET,Thu Dec 23 22:08:13 CET,0.0 0.515 0.759 0.941 1.11 1.278 1.439 1.589 1.881 2.018 2.139 2.323 2.467 2.565 2.752 2.939 3.126 3.215 3.38 3.537 3.761 3.9 4.029 4.224 4.418 4.6 4.772 4.938 5.158 5.374 5.581 5.827 6.068 6.295 6.55 6.841 7.121 7.42 7.731 8.073 8.442 8.835 9.261 9.683 10.173 10.702 11.308 12.009 12.803 13.664 14.537 15.078 15.241 15.2 15.113 14.973 14.747 14.494 14.285 14.053 13.834 13.613 13.369 13.143 12.934 12.735 12.524 12.333 12.162 11.979 11.778 11.602 11.416 11.235 11.088 10.925 10.762 10.595 10.419 10.297 10.163 9.953 9.801 9.638 9.554 9.371 9.168 8.954 8.838 8.684 8.495 8.37 8.225 7.879 7.681 7.476 7.245 6.96 6.59 6.135 4.758 -3 ,8727 ,KEBNE ,17069223,Thu Dec 23 20:37:10 CET,Thu Dec 23 22:06:38 CET,0.0 0.841 1.159 1.391 1.587 1.78 1.94 2.063 2.303 2.419 2.527 2.697 2.835 2.933 3.119 3.306 3.508 3.608 3.787 3.949 4.191 4.34 4.469 4.654 4.835 5.006 5.166 5.328 5.533 5.721 5.911 6.138 6.352 6.564 6.824 7.112 7.367 7.641 7.929 8.234 8.568 8.945 9.362 9.758 10.231 10.752 11.338 12.028 12.798 13.602 14.489 14.992 15.101 15.047 14.887 14.699 14.479 14.247 14.05 13.848 13.671 13.493 13.299 13.094 12.876 12.683 12.483 12.291 12.122 11.94 11.735 11.553 11.364 11.169 11.017 10.866 10.719 10.563 10.392 10.271 10.141 9.938 9.779 9.607 9.523 9.355 9.172 8.977 8.864 8.7 8.469 8.327 8.193 7.91 7.75 7.574 7.368 7.139 6.885 6.541 4.704 -4 ,2701 ,KEBNE ,17069224,Thu Dec 23 20:37:09 CET,Thu Dec 23 22:08:22 CET,0.0 0.674 0.962 1.199 1.4 1.57 1.722 1.858 2.103 2.223 2.342 2.53 2.671 2.77 2.96 3.147 3.328 3.415 3.582 3.738 3.953 4.086 4.225 4.426 4.604 4.778 4.947 5.111 5.325 5.534 5.737 5.979 6.205 6.425 6.668 6.939 7.221 7.528 7.846 8.17 8.504 8.886 9.326 9.758 10.239 10.785 11.436 12.135 12.908 13.766 14.585 15.051 15.207 15.131 14.924 14.7 14.472 14.22 13.996 13.785 13.595 13.391 13.179 12.969 12.761 12.57 12.361 12.168 11.994 11.805 11.605 11.431 11.253 11.08 10.957 10.827 10.671 10.49 10.306 10.189 10.049 9.8 9.639 9.476 9.393 9.212 9.01 8.817 8.724 8.584 8.365 8.219 8.065 7.716 7.535 7.317 7.071 6.827 6.549 6.185 5.016 -5 ,19173 ,KEBNE ,17069225,Thu Dec 23 20:37:08 CET,Thu Dec 23 22:05:51 CET,0.0 0.829 1.176 1.414 1.615 1.795 1.955 2.111 2.39 2.509 2.615 2.776 2.911 3.005 3.188 3.365 3.53 3.606 3.755 3.898 4.105 4.236 4.357 4.538 4.708 4.864 5.026 5.202 5.414 5.598 5.784 6.02 6.245 6.453 6.695 6.962 7.206 7.481 7.783 8.091 8.407 8.774 9.215 9.641 10.121 10.653 11.244 11.895 12.591 13.313 14.043 14.442 14.593 14.569 14.442 14.287 14.084 13.846 13.592 13.299 13.049 12.807 12.568 12.331 12.099 11.884 11.649 11.438 11.245 11.037 10.826 10.653 10.457 10.234 10.074 9.928 9.773 9.6 9.409 9.269 9.128 8.9 8.741 8.592 8.516 8.34 8.159 7.976 7.87 7.709 7.475 7.35 7.227 6.93 6.758 6.554 6.315 6.025 5.698 5.273 3.688 -6 ,25637 ,KEBNE ,17069226,Thu Dec 23 20:37:10 CET,Thu Dec 23 22:07:49 CET,0.0 0.529 0.813 1.069 1.302 1.493 1.642 1.774 2.009 2.133 2.246 2.397 2.528 2.618 2.79 2.96 3.121 3.192 3.332 3.474 3.685 3.834 3.971 4.153 4.333 4.517 4.711 4.883 5.089 5.291 5.48 5.714 5.954 6.196 6.475 6.785 7.084 7.397 7.729 8.066 8.392 8.772 9.215 9.639 10.119 10.661 11.296 11.962 12.66 13.421 14.239 14.681 14.798 14.783 14.635 14.418 14.19 13.932 13.661 13.367 13.11 12.872 12.638 12.421 12.221 12.024 11.815 11.617 11.428 11.227 11.026 10.863 10.689 10.523 10.379 10.213 10.045 9.866 9.693 9.569 9.438 9.235 9.083 8.927 8.848 8.681 8.49 8.265 8.144 7.988 7.798 7.689 7.561 7.263 7.115 6.941 6.726 6.497 6.233 5.871 4.219 -7 ,16180 ,KEBNE ,17069227,Thu Dec 23 20:37:09 CET,Thu Dec 23 22:06:08 CET,0.0 0.62 0.864 1.057 1.237 1.402 1.553 1.698 1.964 2.086 2.208 2.393 2.532 2.63 2.823 3.007 3.192 3.282 3.447 3.594 3.804 3.945 4.075 4.264 4.45 4.637 4.815 4.986 5.207 5.416 5.624 5.857 6.085 6.316 6.564 6.832 7.089 7.377 7.687 8.01 8.349 8.719 9.146 9.565 10.046 10.589 11.206 11.845 12.563 13.413 14.247 14.759 14.942 14.881 14.697 14.458 14.257 14.037 13.791 13.509 13.252 13.06 12.873 12.673 12.474 12.28 12.081 11.899 11.739 11.568 11.374 11.196 10.994 10.799 10.657 10.507 10.354 10.2 10.04 9.933 9.806 9.586 9.439 9.284 9.199 9.009 8.811 8.603 8.506 8.364 8.156 8.035 7.915 7.67 7.513 7.327 7.136 6.923 6.6 6.121 4.455 -8 ,2414 ,KEBNE ,17069228,Thu Dec 23 20:37:10 CET,Thu Dec 23 22:07:50 CET,0.0 0.486 0.714 0.933 1.137 1.322 1.474 1.629 1.909 2.031 2.156 2.355 2.502 2.606 2.78 2.94 3.105 3.188 3.349 3.5 3.715 3.852 3.987 4.194 4.39 4.571 4.739 4.904 5.121 5.319 5.508 5.746 5.978 6.188 6.426 6.696 6.952 7.231 7.526 7.856 8.214 8.599 9.016 9.431 9.93 10.471 11.087 11.767 12.524 13.356 14.186 14.703 14.88 14.856 14.693 14.4 14.103 13.86 13.656 13.44 13.201 12.965 12.754 12.56 12.371 12.183 11.96 11.741 11.567 11.399 11.216 11.06 10.892 10.717 10.591 10.447 10.293 10.152 9.998 9.873 9.731 9.505 9.341 9.169 9.083 8.894 8.701 8.499 8.383 8.233 8.053 7.928 7.789 7.482 7.305 7.095 6.864 6.611 6.274 5.849 4.565 -9 ,23147 ,KEBNE ,17069229,Thu Dec 23 20:37:08 CET,Thu Dec 23 22:05:55 CET,0.0 0.546 0.833 1.005 1.174 1.344 1.501 1.636 1.865 1.972 2.079 2.241 2.372 2.46 2.633 2.808 2.974 3.054 3.208 3.357 3.561 3.693 3.824 4.011 4.184 4.347 4.514 4.679 4.879 5.069 5.252 5.473 5.696 5.907 6.153 6.434 6.698 6.996 7.297 7.602 7.94 8.316 8.722 9.124 9.657 10.241 10.856 11.534 12.26 13.065 13.813 14.119 14.169 14.12 13.981 13.744 13.468 13.195 12.927 12.655 12.39 12.129 11.92 11.74 11.535 11.333 11.125 10.919 10.736 10.559 10.374 10.21 10.031 9.841 9.697 9.547 9.394 9.235 9.063 8.938 8.8 8.579 8.417 8.236 8.139 7.943 7.731 7.496 7.376 7.223 7.003 6.863 6.715 6.398 6.241 6.051 5.803 5.525 5.222 4.747 2.721 -10 ,19650 ,KEBNE ,17069230,Thu Dec 23 20:37:08 CET,Thu Dec 23 22:07:30 CET,0.0 0.715 1.015 1.255 1.465 1.647 1.804 1.945 2.223 2.345 2.447 2.616 2.754 2.854 3.055 3.227 3.386 3.469 3.627 3.766 3.965 4.101 4.238 4.448 4.648 4.824 4.993 5.158 5.366 5.565 5.763 6.001 6.224 6.434 6.673 6.939 7.196 7.488 7.801 8.131 8.47 8.837 9.257 9.694 10.197 10.732 11.342 11.998 12.738 13.527 14.325 14.725 14.783 14.716 14.519 14.299 14.067 13.814 13.578 13.325 13.107 12.902 12.692 12.502 12.305 12.116 11.927 11.756 11.596 11.402 11.192 11.022 10.849 10.67 10.512 10.35 10.193 10.017 9.84 9.712 9.571 9.348 9.199 9.046 8.963 8.781 8.574 8.35 8.234 8.077 7.857 7.718 7.569 7.252 7.067 6.866 6.656 6.414 6.101 5.668 3.994 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_30_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_30_31.txt deleted file mode 100644 index bc6a010a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_30_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31690 ,KEBNE ,17018908,Wed Dec 22 00:51:47 CET,Wed Dec 22 02:20:51 CET,0.0 0.836 1.197 1.44 1.627 1.783 1.933 2.076 2.321 2.431 2.528 2.682 2.82 2.911 3.084 3.247 3.397 3.467 3.595 3.714 3.911 4.041 4.157 4.32 4.469 4.614 4.748 4.885 5.072 5.24 5.392 5.575 5.746 5.905 6.081 6.277 6.472 6.67 6.876 7.081 7.296 7.548 7.832 8.11 8.418 8.766 9.134 9.52 9.915 10.229 10.444 10.346 10.12 9.889 9.646 9.371 9.105 8.845 8.589 8.325 8.107 7.905 7.69 7.481 7.292 7.127 6.937 6.747 6.589 6.435 6.271 6.137 6.014 5.883 5.775 5.663 5.54 5.406 5.257 5.147 5.032 4.842 4.713 4.584 4.514 4.365 4.199 4.015 3.92 3.787 3.612 3.501 3.383 3.113 2.967 2.802 2.607 2.374 2.098 1.734 0.421 -2 ,11723 ,KEBNE ,17018909,Wed Dec 22 00:51:47 CET,Wed Dec 22 02:20:51 CET,0.0 0.557 0.81 1.002 1.162 1.299 1.43 1.549 1.765 1.862 1.95 2.085 2.205 2.28 2.416 2.546 2.684 2.747 2.869 2.989 3.149 3.259 3.364 3.509 3.657 3.804 3.944 4.069 4.226 4.38 4.528 4.698 4.854 5.001 5.172 5.388 5.594 5.804 6.03 6.253 6.476 6.716 6.98 7.261 7.576 7.888 8.241 8.584 8.921 9.259 9.498 9.478 9.301 9.039 8.769 8.497 8.241 7.981 7.725 7.47 7.258 7.05 6.83 6.617 6.429 6.263 6.081 5.911 5.746 5.572 5.4 5.255 5.095 4.925 4.792 4.655 4.519 4.38 4.227 4.127 4.026 3.854 3.736 3.616 3.553 3.416 3.26 3.107 3.026 2.901 2.763 2.661 2.546 2.328 2.215 2.086 1.931 1.755 1.543 1.265 0.305 -3 ,6848 ,KEBNE ,17018910,Wed Dec 22 00:51:51 CET,Wed Dec 22 02:17:28 CET,0.0 0.672 0.993 1.221 1.421 1.597 1.755 1.884 2.116 2.236 2.352 2.518 2.64 2.725 2.903 3.073 3.227 3.298 3.441 3.579 3.758 3.87 3.984 4.149 4.303 4.442 4.58 4.712 4.885 5.061 5.224 5.414 5.599 5.775 5.963 6.17 6.374 6.59 6.821 7.071 7.312 7.575 7.884 8.177 8.526 8.922 9.329 9.701 10.062 10.433 10.745 10.72 10.507 10.235 9.932 9.632 9.365 9.118 8.885 8.647 8.426 8.208 8.003 7.8 7.602 7.436 7.27 7.105 6.962 6.812 6.651 6.512 6.364 6.217 6.095 5.968 5.839 5.696 5.545 5.442 5.338 5.177 5.058 4.933 4.871 4.751 4.606 4.437 4.343 4.216 4.065 3.962 3.857 3.614 3.486 3.35 3.196 3.007 2.785 2.463 1.58 -4 ,17698 ,KEBNE ,17018911,Wed Dec 22 00:52:51 CET,Wed Dec 22 02:22:02 CET,0.0 0.912 1.272 1.504 1.67 1.816 1.961 2.107 2.343 2.454 2.566 2.718 2.844 2.93 3.1 3.272 3.429 3.502 3.64 3.775 3.977 4.103 4.221 4.387 4.541 4.698 4.856 5.005 5.189 5.357 5.519 5.703 5.882 6.057 6.258 6.47 6.655 6.86 7.073 7.286 7.505 7.745 7.99 8.252 8.585 8.894 9.176 9.493 9.859 10.255 10.611 10.609 10.427 10.182 9.916 9.614 9.292 8.992 8.733 8.473 8.251 8.047 7.839 7.64 7.454 7.284 7.107 6.95 6.818 6.663 6.502 6.366 6.221 6.072 5.94 5.803 5.677 5.543 5.393 5.289 5.188 5.045 4.932 4.814 4.753 4.62 4.491 4.339 4.257 4.144 4.01 3.917 3.827 3.623 3.505 3.383 3.233 3.061 2.853 2.539 1.95 -5 ,4205 ,KEBNE ,17018912,Wed Dec 22 00:52:51 CET,Wed Dec 22 02:21:57 CET,0.0 0.518 0.772 0.954 1.102 1.237 1.348 1.447 1.647 1.746 1.839 1.974 2.092 2.172 2.323 2.468 2.613 2.681 2.817 2.958 3.145 3.267 3.394 3.574 3.73 3.87 3.997 4.116 4.266 4.41 4.558 4.73 4.892 5.05 5.226 5.419 5.603 5.804 6.018 6.245 6.475 6.727 7.017 7.286 7.558 7.845 8.195 8.571 8.98 9.403 9.653 9.578 9.371 9.092 8.781 8.489 8.219 7.944 7.672 7.402 7.174 6.954 6.732 6.534 6.351 6.174 5.983 5.808 5.654 5.49 5.308 5.158 5.008 4.848 4.728 4.596 4.46 4.323 4.176 4.071 3.96 3.772 3.63 3.485 3.415 3.273 3.126 2.967 2.882 2.761 2.619 2.517 2.408 2.181 2.054 1.91 1.76 1.605 1.425 1.192 0.607 -6 ,9231 ,KEBNE ,17018913,Wed Dec 22 00:52:51 CET,Wed Dec 22 02:21:46 CET,0.0 0.905 1.151 1.339 1.505 1.641 1.764 1.884 2.097 2.189 2.278 2.413 2.539 2.629 2.792 2.925 3.047 3.107 3.236 3.364 3.542 3.651 3.744 3.884 4.023 4.149 4.27 4.394 4.558 4.707 4.853 5.032 5.201 5.353 5.522 5.717 5.902 6.106 6.32 6.535 6.772 7.022 7.259 7.508 7.839 8.223 8.59 8.887 9.243 9.604 9.843 9.848 9.649 9.381 9.076 8.749 8.444 8.153 7.912 7.657 7.43 7.232 7.033 6.839 6.64 6.454 6.262 6.086 5.933 5.771 5.603 5.459 5.307 5.146 5.022 4.892 4.734 4.571 4.419 4.301 4.172 3.993 3.876 3.747 3.68 3.541 3.387 3.22 3.135 3.008 2.868 2.779 2.687 2.482 2.333 2.144 1.957 1.757 1.497 1.114 -0.141 -7 ,14226 ,KEBNE ,17018914,Wed Dec 22 00:52:51 CET,Wed Dec 22 02:23:24 CET,0.0 0.43 0.697 0.9 1.063 1.218 1.364 1.493 1.697 1.793 1.891 2.025 2.144 2.228 2.388 2.537 2.68 2.743 2.857 2.97 3.13 3.23 3.332 3.482 3.621 3.749 3.875 4.002 4.164 4.321 4.474 4.653 4.802 4.939 5.122 5.332 5.519 5.726 5.946 6.183 6.428 6.677 6.966 7.265 7.595 7.942 8.347 8.743 9.13 9.557 9.838 9.782 9.563 9.291 8.976 8.648 8.371 8.109 7.856 7.599 7.355 7.125 6.909 6.694 6.494 6.315 6.115 5.931 5.775 5.61 5.427 5.276 5.124 4.966 4.836 4.697 4.552 4.4 4.247 4.136 4.019 3.84 3.712 3.588 3.524 3.378 3.225 3.055 2.962 2.826 2.64 2.529 2.4 2.111 1.966 1.815 1.652 1.467 1.221 0.912 0.283 -8 ,15789 ,KEBNE ,17018915,Wed Dec 22 00:53:54 CET,Wed Dec 22 02:22:41 CET,0.0 0.608 0.931 1.164 1.366 1.523 1.671 1.811 2.063 2.176 2.269 2.415 2.544 2.625 2.783 2.945 3.089 3.155 3.282 3.401 3.572 3.673 3.772 3.92 4.061 4.191 4.315 4.439 4.605 4.772 4.918 5.078 5.24 5.402 5.594 5.803 5.995 6.195 6.407 6.637 6.882 7.17 7.494 7.797 8.15 8.507 8.886 9.319 9.772 10.207 10.543 10.577 10.405 10.152 9.886 9.618 9.37 9.127 8.89 8.633 8.395 8.177 7.965 7.761 7.573 7.401 7.218 7.05 6.9 6.756 6.598 6.455 6.311 6.155 6.026 5.885 5.724 5.55 5.384 5.272 5.159 4.971 4.828 4.699 4.636 4.491 4.319 4.098 3.969 3.804 3.565 3.403 3.227 2.848 2.638 2.406 2.156 1.908 1.603 1.163 0.467 -9 ,20950 ,KEBNE ,17018916,Wed Dec 22 00:53:53 CET,Wed Dec 22 02:24:23 CET,0.0 0.675 0.936 1.132 1.318 1.482 1.608 1.723 1.933 2.036 2.133 2.278 2.405 2.487 2.642 2.795 2.937 3.002 3.122 3.232 3.407 3.526 3.631 3.772 3.927 4.08 4.215 4.344 4.515 4.681 4.831 4.992 5.146 5.316 5.515 5.716 5.89 6.095 6.326 6.568 6.804 7.046 7.312 7.591 7.934 8.307 8.735 9.166 9.561 9.85 10.012 9.882 9.611 9.303 8.997 8.694 8.414 8.143 7.87 7.584 7.348 7.144 6.954 6.758 6.552 6.372 6.188 6.015 5.858 5.688 5.508 5.356 5.202 5.054 4.934 4.812 4.689 4.556 4.402 4.296 4.185 3.998 3.873 3.742 3.673 3.54 3.402 3.255 3.176 3.048 2.898 2.805 2.711 2.515 2.399 2.261 2.101 1.932 1.739 1.407 -0.043 -10 ,25905 ,KEBNE ,17018917,Wed Dec 22 00:53:54 CET,Wed Dec 22 02:24:02 CET,0.0 0.807 1.118 1.371 1.581 1.751 1.903 2.037 2.262 2.364 2.472 2.64 2.772 2.861 3.033 3.193 3.34 3.408 3.532 3.659 3.86 3.983 4.099 4.278 4.439 4.583 4.72 4.85 5.016 5.172 5.321 5.505 5.684 5.842 6.017 6.231 6.431 6.634 6.844 7.074 7.319 7.579 7.882 8.162 8.469 8.809 9.184 9.599 10.042 10.48 10.733 10.634 10.413 10.115 9.8 9.511 9.247 8.972 8.722 8.467 8.235 8.032 7.825 7.62 7.441 7.285 7.125 6.969 6.822 6.669 6.517 6.386 6.25 6.114 6.007 5.889 5.749 5.612 5.476 5.369 5.253 5.069 4.938 4.799 4.723 4.566 4.411 4.243 4.152 4.021 3.848 3.732 3.609 3.328 3.176 3.022 2.85 2.664 2.429 2.097 0.838 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_31_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_31_26.txt deleted file mode 100644 index 5b1a2b44..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_31_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17781 ,KEBNE ,17018918,Wed Dec 22 00:53:54 CET,Wed Dec 22 02:23:55 CET,0.0 0.727 1.057 1.286 1.459 1.591 1.723 1.853 2.095 2.216 2.331 2.498 2.63 2.724 2.894 3.047 3.202 3.278 3.424 3.572 3.786 3.917 4.032 4.21 4.39 4.547 4.7 4.859 5.061 5.254 5.439 5.665 5.891 6.111 6.366 6.647 6.902 7.185 7.495 7.817 8.144 8.484 8.861 9.238 9.699 10.194 10.731 11.331 11.965 12.649 13.412 13.8 13.806 13.693 13.483 13.202 12.922 12.629 12.332 12.014 11.735 11.466 11.208 10.955 10.71 10.511 10.287 10.084 9.915 9.73 9.538 9.356 9.168 8.989 8.838 8.669 8.496 8.323 8.128 7.989 7.852 7.641 7.489 7.328 7.243 7.064 6.872 6.666 6.561 6.419 6.207 6.061 5.915 5.614 5.455 5.285 5.077 4.826 4.546 4.22 3.358 -2 ,8818 ,KEBNE ,17018919,Wed Dec 22 00:54:56 CET,Wed Dec 22 02:23:11 CET,0.0 0.553 0.842 1.063 1.23 1.392 1.565 1.741 2.038 2.169 2.301 2.491 2.618 2.701 2.861 3.02 3.174 3.251 3.409 3.549 3.736 3.86 3.981 4.161 4.338 4.495 4.653 4.805 4.997 5.193 5.375 5.582 5.795 6.007 6.23 6.466 6.701 6.977 7.279 7.588 7.906 8.267 8.683 9.085 9.519 9.976 10.491 11.054 11.667 12.272 12.828 13.054 12.963 12.738 12.453 12.137 11.823 11.531 11.255 10.925 10.639 10.374 10.127 9.91 9.701 9.503 9.301 9.125 8.956 8.772 8.572 8.403 8.231 8.05 7.907 7.763 7.606 7.434 7.251 7.118 6.985 6.778 6.615 6.449 6.376 6.223 6.03 5.807 5.697 5.547 5.362 5.242 5.114 4.831 4.651 4.444 4.223 3.962 3.635 3.19 1.908 -3 ,26179 ,KEBNE ,17018920,Wed Dec 22 00:54:56 CET,Wed Dec 22 02:23:27 CET,0.0 0.609 0.865 1.067 1.26 1.451 1.6 1.72 1.949 2.062 2.177 2.35 2.481 2.573 2.75 2.914 3.067 3.143 3.286 3.426 3.618 3.731 3.85 4.026 4.189 4.352 4.508 4.661 4.873 5.08 5.269 5.492 5.706 5.901 6.123 6.393 6.656 6.944 7.26 7.583 7.91 8.279 8.696 9.127 9.615 10.116 10.662 11.253 11.916 12.591 13.263 13.572 13.532 13.372 13.134 12.881 12.648 12.38 12.116 11.854 11.621 11.405 11.163 10.925 10.711 10.483 10.22 10.008 9.831 9.638 9.419 9.251 9.094 8.912 8.764 8.608 8.452 8.287 8.102 7.981 7.856 7.655 7.516 7.366 7.284 7.115 6.943 6.758 6.66 6.511 6.315 6.192 6.048 5.75 5.592 5.4 5.183 4.96 4.7 4.367 3.353 -4 ,11911 ,KEBNE ,17018921,Wed Dec 22 00:54:56 CET,Wed Dec 22 02:23:11 CET,0.0 0.704 0.98 1.173 1.333 1.485 1.621 1.747 2.007 2.15 2.294 2.5 2.635 2.726 2.902 3.078 3.242 3.32 3.474 3.615 3.811 3.937 4.059 4.233 4.396 4.564 4.728 4.887 5.088 5.267 5.436 5.653 5.869 6.081 6.323 6.583 6.834 7.12 7.421 7.729 8.038 8.375 8.785 9.206 9.692 10.193 10.75 11.378 12.038 12.69 13.293 13.488 13.402 13.275 13.052 12.768 12.466 12.158 11.895 11.617 11.344 11.079 10.847 10.625 10.39 10.188 9.975 9.778 9.603 9.411 9.221 9.059 8.87 8.671 8.518 8.358 8.199 8.026 7.833 7.693 7.557 7.36 7.22 7.072 6.989 6.811 6.624 6.433 6.337 6.198 6.012 5.892 5.768 5.509 5.368 5.207 5.01 4.767 4.439 3.983 2.735 -5 ,8214 ,KEBNE ,17018922,Wed Dec 22 00:54:55 CET,Wed Dec 22 02:23:27 CET,0.0 0.596 0.924 1.185 1.412 1.577 1.718 1.84 2.061 2.17 2.276 2.429 2.549 2.632 2.798 2.956 3.113 3.187 3.314 3.442 3.632 3.756 3.878 4.06 4.24 4.407 4.568 4.728 4.948 5.154 5.345 5.57 5.776 5.987 6.249 6.527 6.784 7.076 7.394 7.73 8.079 8.468 8.889 9.293 9.765 10.275 10.857 11.483 12.156 12.845 13.505 13.813 13.72 13.544 13.355 13.147 12.909 12.624 12.356 12.073 11.824 11.599 11.346 11.094 10.868 10.644 10.407 10.213 10.026 9.828 9.646 9.479 9.289 9.095 8.935 8.761 8.59 8.421 8.255 8.132 7.992 7.791 7.65 7.49 7.41 7.245 7.069 6.879 6.777 6.612 6.357 6.216 6.07 5.761 5.595 5.412 5.196 4.952 4.662 4.264 3.14 -6 ,20106 ,KEBNE ,17018923,Wed Dec 22 00:54:56 CET,Wed Dec 22 02:23:59 CET,0.0 0.473 0.721 0.948 1.146 1.303 1.448 1.582 1.824 1.943 2.054 2.217 2.348 2.439 2.607 2.765 2.923 3.001 3.15 3.288 3.488 3.618 3.746 3.931 4.098 4.26 4.425 4.583 4.787 4.981 5.159 5.37 5.584 5.797 6.031 6.29 6.542 6.81 7.082 7.366 7.67 8.025 8.437 8.861 9.355 9.855 10.378 10.928 11.507 12.081 12.639 12.971 12.968 12.797 12.517 12.201 11.924 11.66 11.412 11.125 10.861 10.603 10.345 10.121 9.905 9.685 9.446 9.231 9.048 8.859 8.668 8.508 8.335 8.152 8.009 7.857 7.696 7.534 7.351 7.219 7.09 6.891 6.742 6.564 6.467 6.286 6.086 5.862 5.755 5.609 5.383 5.245 5.107 4.784 4.596 4.402 4.16 3.869 3.529 3.057 1.764 -7 ,17740 ,KEBNE ,17018924,Wed Dec 22 00:54:56 CET,Wed Dec 22 02:23:33 CET,0.0 0.569 0.82 1.031 1.216 1.377 1.536 1.694 1.966 2.094 2.217 2.406 2.549 2.651 2.852 3.036 3.198 3.274 3.429 3.581 3.793 3.932 4.071 4.289 4.499 4.691 4.866 5.028 5.23 5.419 5.589 5.797 6.007 6.209 6.45 6.731 6.994 7.268 7.553 7.846 8.16 8.516 8.912 9.296 9.746 10.231 10.788 11.39 12.04 12.757 13.437 13.701 13.603 13.438 13.256 12.991 12.723 12.44 12.148 11.869 11.62 11.372 11.122 10.889 10.671 10.468 10.262 10.068 9.883 9.684 9.479 9.317 9.143 8.956 8.81 8.65 8.475 8.298 8.114 7.988 7.875 7.687 7.55 7.402 7.319 7.155 6.979 6.773 6.657 6.501 6.314 6.201 6.08 5.8 5.62 5.443 5.263 5.038 4.753 4.346 3.028 -8 ,12262 ,KEBNE ,17018925,Wed Dec 22 00:55:57 CET,Wed Dec 22 02:25:58 CET,0.0 0.749 1.069 1.303 1.476 1.631 1.796 1.968 2.26 2.383 2.501 2.684 2.819 2.907 3.082 3.252 3.417 3.498 3.652 3.794 3.998 4.138 4.276 4.466 4.639 4.808 4.974 5.135 5.346 5.547 5.732 5.949 6.155 6.361 6.613 6.887 7.146 7.428 7.72 8.033 8.369 8.742 9.162 9.583 10.069 10.579 11.15 11.757 12.418 13.135 13.855 14.154 14.033 13.83 13.659 13.453 13.167 12.87 12.621 12.376 12.146 11.92 11.671 11.417 11.177 10.969 10.754 10.545 10.36 10.152 9.931 9.749 9.55 9.347 9.187 9.024 8.846 8.655 8.466 8.334 8.199 7.985 7.838 7.686 7.603 7.419 7.227 7.03 6.93 6.787 6.591 6.46 6.309 5.997 5.815 5.578 5.329 5.087 4.779 4.363 3.421 -9 ,1818 ,KEBNE ,17018926,Wed Dec 22 00:55:57 CET,Wed Dec 22 02:26:22 CET,0.0 0.693 1.014 1.266 1.463 1.635 1.798 1.949 2.222 2.335 2.445 2.642 2.792 2.899 3.09 3.26 3.43 3.512 3.671 3.821 4.029 4.166 4.296 4.474 4.655 4.846 5.016 5.168 5.367 5.566 5.763 5.993 6.197 6.391 6.621 6.883 7.138 7.421 7.721 8.029 8.349 8.716 9.124 9.52 9.999 10.524 11.107 11.739 12.416 13.115 13.742 13.978 13.895 13.712 13.462 13.196 12.907 12.583 12.307 12.02 11.734 11.49 11.264 11.041 10.835 10.618 10.351 10.126 9.944 9.761 9.574 9.412 9.23 9.037 8.891 8.731 8.568 8.397 8.219 8.096 7.963 7.747 7.602 7.45 7.374 7.214 7.029 6.832 6.741 6.603 6.385 6.248 6.099 5.759 5.577 5.392 5.181 4.936 4.67 4.329 3.199 -10 ,11962 ,KEBNE ,17018927,Wed Dec 22 00:55:57 CET,Wed Dec 22 02:26:13 CET,0.0 0.542 0.802 0.992 1.162 1.318 1.445 1.567 1.802 1.913 2.022 2.183 2.319 2.409 2.576 2.745 2.907 2.985 3.145 3.287 3.48 3.61 3.736 3.918 4.098 4.28 4.458 4.628 4.837 5.027 5.212 5.438 5.651 5.858 6.106 6.374 6.622 6.897 7.2 7.531 7.865 8.245 8.69 9.106 9.58 10.1 10.672 11.26 11.847 12.467 13.071 13.322 13.339 13.185 12.974 12.767 12.525 12.291 12.086 11.831 11.606 11.409 11.188 10.973 10.776 10.576 10.354 10.151 9.974 9.775 9.55 9.372 9.177 8.96 8.79 8.621 8.455 8.282 8.107 7.989 7.863 7.663 7.52 7.365 7.289 7.126 6.956 6.766 6.663 6.524 6.321 6.195 6.067 5.78 5.614 5.435 5.249 5.024 4.738 4.35 2.973 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_32_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_32_1h1s.txt deleted file mode 100644 index 8ebdb50f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_32_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4392 ,KEBNE ,17018928,Wed Dec 22 00:55:57 CET,Wed Dec 22 02:26:38 CET,0.0 0.334 0.563 0.769 0.924 1.055 1.149 1.238 1.423 1.501 1.57 1.673 1.763 1.822 1.931 2.027 2.121 2.169 2.267 2.354 2.466 2.534 2.605 2.713 2.808 2.903 2.989 3.063 3.156 3.248 3.335 3.432 3.528 3.62 3.713 3.803 3.892 3.996 4.099 4.211 4.302 4.393 4.512 4.605 4.648 4.65 4.637 4.537 4.269 3.662 2.427 0.834 -0.553 -1.727 -2.728 -3.631 -4.416 -5.151 -5.776 -6.387 -6.935 -7.404 -7.837 -8.268 -8.679 -9.035 -9.396 -9.724 -10.028 -10.354 -10.677 -10.953 -11.233 -11.514 -11.74 -11.972 -12.219 -12.471 -12.732 -12.928 -13.121 -13.4 -13.599 -13.814 -13.924 -14.155 -14.415 -14.711 -14.861 -15.039 -15.286 -15.441 -15.608 -15.99 -16.203 -16.432 -16.679 -16.96 -17.326 -17.796 -19.807 -2 ,10269 ,KEBNE ,17018929,Wed Dec 22 00:55:57 CET,Wed Dec 22 02:27:20 CET,0.0 0.338 0.562 0.742 0.896 1.006 1.101 1.194 1.36 1.434 1.505 1.618 1.72 1.779 1.889 1.997 2.106 2.159 2.254 2.334 2.441 2.508 2.571 2.667 2.773 2.879 2.971 3.055 3.161 3.254 3.336 3.448 3.557 3.651 3.755 3.866 3.981 4.102 4.205 4.299 4.398 4.489 4.569 4.622 4.638 4.626 4.58 4.462 4.192 3.606 2.331 0.65 -0.814 -2.049 -3.052 -3.989 -4.842 -5.581 -6.203 -6.842 -7.377 -7.844 -8.316 -8.738 -9.117 -9.471 -9.834 -10.156 -10.44 -10.743 -11.057 -11.307 -11.571 -11.851 -12.063 -12.289 -12.533 -12.775 -13.004 -13.162 -13.329 -13.585 -13.765 -13.957 -14.056 -14.259 -14.465 -14.688 -14.815 -14.992 -15.251 -15.406 -15.561 -15.894 -16.087 -16.3 -16.536 -16.793 -17.078 -17.459 -18.364 -3 ,8239 ,KEBNE ,17018930,Wed Dec 22 00:57:00 CET,Wed Dec 22 02:27:14 CET,0.0 0.516 0.742 0.925 1.072 1.196 1.308 1.439 1.694 1.792 1.873 1.997 2.108 2.184 2.32 2.434 2.53 2.575 2.671 2.762 2.889 2.965 3.031 3.126 3.223 3.316 3.398 3.478 3.577 3.662 3.743 3.843 3.944 4.041 4.148 4.267 4.364 4.453 4.544 4.608 4.677 4.767 4.836 4.893 4.892 4.857 4.8 4.613 4.229 3.521 2.254 0.686 -0.671 -1.843 -2.869 -3.811 -4.622 -5.347 -5.986 -6.616 -7.159 -7.644 -8.109 -8.549 -8.931 -9.259 -9.611 -9.936 -10.232 -10.536 -10.845 -11.108 -11.37 -11.632 -11.841 -12.061 -12.279 -12.513 -12.77 -12.953 -13.134 -13.408 -13.598 -13.819 -13.942 -14.173 -14.41 -14.692 -14.839 -15.036 -15.332 -15.503 -15.689 -16.091 -16.298 -16.525 -16.778 -17.096 -17.477 -17.947 -20.88 -4 ,7291 ,KEBNE ,17018931,Wed Dec 22 00:57:00 CET,Wed Dec 22 02:26:58 CET,0.0 0.432 0.628 0.784 0.919 1.048 1.163 1.245 1.401 1.482 1.552 1.631 1.721 1.784 1.912 2.015 2.096 2.14 2.221 2.295 2.413 2.495 2.576 2.687 2.781 2.871 2.953 3.036 3.15 3.253 3.35 3.454 3.561 3.678 3.797 3.91 4.004 4.106 4.215 4.313 4.4 4.483 4.551 4.601 4.643 4.654 4.615 4.408 3.967 3.299 2.111 0.515 -0.921 -2.179 -3.241 -4.191 -5.013 -5.741 -6.373 -7.011 -7.557 -8.029 -8.466 -8.892 -9.308 -9.67 -10.03 -10.361 -10.652 -10.945 -11.252 -11.51 -11.769 -12.04 -12.263 -12.492 -12.717 -12.943 -13.168 -13.326 -13.488 -13.751 -13.936 -14.132 -14.238 -14.453 -14.672 -14.914 -15.044 -15.214 -15.45 -15.585 -15.723 -16.058 -16.252 -16.464 -16.701 -16.968 -17.289 -17.771 -19.317 -5 ,25097 ,KEBNE ,17018932,Wed Dec 22 00:57:00 CET,Wed Dec 22 02:27:45 CET,0.0 0.506 0.754 0.938 1.092 1.211 1.315 1.418 1.608 1.696 1.776 1.883 1.983 2.062 2.2 2.313 2.424 2.477 2.575 2.671 2.807 2.881 2.942 3.033 3.13 3.229 3.317 3.397 3.507 3.607 3.702 3.833 3.942 4.026 4.119 4.22 4.304 4.386 4.469 4.54 4.627 4.754 4.88 4.944 4.967 4.951 4.901 4.766 4.449 3.775 2.516 0.92 -0.489 -1.71 -2.743 -3.67 -4.509 -5.262 -5.879 -6.475 -7.0 -7.473 -7.913 -8.339 -8.734 -9.073 -9.425 -9.744 -10.025 -10.317 -10.63 -10.896 -11.164 -11.43 -11.639 -11.862 -12.096 -12.321 -12.55 -12.718 -12.876 -13.127 -13.327 -13.527 -13.629 -13.841 -14.055 -14.273 -14.389 -14.561 -14.799 -14.953 -15.126 -15.476 -15.665 -15.873 -16.126 -16.45 -16.808 -17.226 -18.533 -6 ,29060 ,KEBNE ,17018933,Wed Dec 22 00:57:00 CET,Wed Dec 22 02:28:38 CET,0.0 0.54 0.754 0.921 1.064 1.207 1.34 1.445 1.637 1.728 1.805 1.938 2.057 2.124 2.242 2.362 2.482 2.538 2.638 2.74 2.894 2.982 3.066 3.186 3.288 3.392 3.5 3.595 3.704 3.82 3.942 4.061 4.164 4.273 4.395 4.515 4.616 4.726 4.83 4.923 5.014 5.104 5.194 5.262 5.316 5.362 5.322 5.132 4.802 4.184 2.874 1.163 -0.234 -1.413 -2.449 -3.38 -4.188 -4.895 -5.499 -6.105 -6.617 -7.082 -7.526 -7.958 -8.356 -8.705 -9.07 -9.401 -9.713 -10.041 -10.365 -10.635 -10.91 -11.206 -11.446 -11.674 -11.906 -12.154 -12.395 -12.56 -12.736 -13.019 -13.218 -13.422 -13.524 -13.739 -13.981 -14.253 -14.388 -14.559 -14.784 -14.931 -15.092 -15.478 -15.707 -15.922 -16.119 -16.36 -16.638 -16.989 -18.514 -7 ,4177 ,KEBNE ,17018934,Wed Dec 22 00:57:01 CET,Wed Dec 22 02:27:07 CET,0.0 0.324 0.51 0.645 0.751 0.847 0.94 1.043 1.23 1.304 1.372 1.459 1.544 1.601 1.72 1.822 1.92 1.966 2.048 2.129 2.256 2.336 2.409 2.501 2.582 2.669 2.764 2.855 2.966 3.071 3.174 3.287 3.383 3.473 3.579 3.692 3.807 3.925 4.024 4.112 4.195 4.282 4.362 4.436 4.511 4.538 4.497 4.355 3.998 3.347 2.148 0.554 -0.83 -2.032 -3.077 -4.009 -4.816 -5.545 -6.158 -6.778 -7.315 -7.779 -8.234 -8.678 -9.09 -9.454 -9.82 -10.157 -10.452 -10.756 -11.062 -11.312 -11.565 -11.822 -12.027 -12.243 -12.461 -12.696 -12.954 -13.123 -13.296 -13.585 -13.786 -13.989 -14.098 -14.319 -14.558 -14.823 -14.958 -15.137 -15.387 -15.536 -15.699 -16.047 -16.223 -16.409 -16.64 -16.918 -17.259 -17.681 -18.581 -8 ,10269 ,KEBNE ,17018935,Wed Dec 22 00:57:00 CET,Wed Dec 22 02:28:09 CET,0.0 0.338 0.562 0.742 0.896 1.006 1.101 1.194 1.36 1.434 1.505 1.618 1.72 1.779 1.889 1.997 2.106 2.159 2.254 2.334 2.441 2.508 2.571 2.667 2.773 2.879 2.971 3.055 3.161 3.254 3.336 3.448 3.557 3.651 3.755 3.866 3.981 4.102 4.205 4.299 4.398 4.489 4.569 4.622 4.638 4.626 4.58 4.462 4.192 3.606 2.331 0.65 -0.814 -2.049 -3.052 -3.989 -4.842 -5.581 -6.203 -6.842 -7.377 -7.844 -8.316 -8.738 -9.117 -9.471 -9.834 -10.156 -10.44 -10.743 -11.057 -11.307 -11.571 -11.851 -12.063 -12.289 -12.533 -12.775 -13.004 -13.162 -13.329 -13.585 -13.765 -13.957 -14.056 -14.259 -14.465 -14.688 -14.815 -14.992 -15.251 -15.406 -15.561 -15.894 -16.087 -16.3 -16.536 -16.793 -17.078 -17.459 -18.364 -9 ,11465 ,KEBNE ,17018936,Wed Dec 22 00:57:00 CET,Wed Dec 22 02:26:52 CET,0.0 0.235 0.363 0.476 0.592 0.715 0.827 0.923 1.082 1.155 1.229 1.328 1.423 1.477 1.567 1.651 1.751 1.805 1.902 1.995 2.121 2.19 2.258 2.359 2.461 2.56 2.651 2.726 2.819 2.916 3.016 3.133 3.238 3.33 3.428 3.535 3.628 3.724 3.819 3.909 3.993 4.067 4.129 4.187 4.255 4.261 4.155 3.957 3.597 2.929 1.668 -0.007 -1.418 -2.593 -3.596 -4.482 -5.278 -6.014 -6.621 -7.223 -7.749 -8.195 -8.62 -9.047 -9.43 -9.774 -10.147 -10.476 -10.759 -11.045 -11.332 -11.57 -11.821 -12.08 -12.288 -12.511 -12.75 -12.996 -13.241 -13.405 -13.583 -13.862 -14.051 -14.249 -14.351 -14.568 -14.794 -15.054 -15.185 -15.357 -15.597 -15.746 -15.915 -16.328 -16.548 -16.773 -17.023 -17.31 -17.633 -18.024 -19.227 -10 ,1390 ,KEBNE ,17018937,Wed Dec 22 00:58:03 CET,Wed Dec 22 02:29:10 CET,0.0 0.222 0.401 0.553 0.677 0.786 0.875 0.95 1.103 1.182 1.257 1.348 1.446 1.508 1.622 1.742 1.847 1.89 1.969 2.045 2.16 2.224 2.286 2.386 2.482 2.568 2.656 2.746 2.847 2.941 3.029 3.133 3.223 3.306 3.404 3.509 3.607 3.706 3.796 3.88 3.975 4.08 4.181 4.285 4.344 4.291 4.169 3.999 3.697 3.109 1.862 0.232 -1.13 -2.352 -3.439 -4.374 -5.147 -5.849 -6.471 -7.121 -7.667 -8.129 -8.58 -9.007 -9.399 -9.753 -10.132 -10.476 -10.756 -11.031 -11.325 -11.581 -11.851 -12.128 -12.341 -12.558 -12.777 -13.009 -13.259 -13.431 -13.604 -13.858 -14.037 -14.23 -14.33 -14.529 -14.738 -14.985 -15.111 -15.267 -15.497 -15.668 -15.837 -16.174 -16.362 -16.567 -16.808 -17.073 -17.422 -17.982 -19.709 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_32_1oiu.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_32_1oiu.txt deleted file mode 100644 index 782d60fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_32_1oiu.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20822 ,TETRA ,17590818,Sat Nov 27 21:21:13 CET,Sat Nov 27 23:13:41 CET,0.0 2.059 2.762 3.371 3.899 4.375 4.82 5.237 6.01 6.37 6.73 6.822 7.786 8.124 8.796 9.448 10.072 10.379 10.987 11.595 12.523 13.12 13.684 14.527 15.38 16.129 16.774 17.408 18.226 19.003 19.764 20.709 21.619 22.501 23.543 24.723 25.899 27.251 28.699 30.281 32.007 33.989 36.401 38.889 41.914 45.379 49.522 54.381 60.303 67.766 77.244 85.395 90.528 94.149 96.763 98.586 99.804 100.779 101.518 102.115 102.555 102.913 103.217 103.434 103.595 103.726 103.783 103.791 103.81 103.81 103.787 103.743 103.668 103.597 103.548 103.491 103.4 103.275 103.156 103.079 102.985 102.8 102.662 102.502 102.404 102.205 101.987 101.73 101.6 100.992 101.179 101.011 100.801 100.345 100.049 99.675 99.249 98.705 98.084 97.264 93.322 -2 ,12050 ,TETRA ,17590819,Sat Nov 27 21:21:14 CET,Sat Nov 27 23:16:54 CET,0.0 2.29 3.123 3.743 4.27 4.772 5.229 5.648 6.419 6.797 7.177 7.291 8.267 8.605 9.239 9.849 10.447 10.744 11.333 11.919 12.793 13.381 13.95 14.752 15.531 16.303 17.063 17.802 18.769 19.735 20.69 21.838 22.959 24.094 25.468 27.052 28.58 30.258 31.899 33.442 35.105 37.073 39.464 41.928 44.898 48.355 52.489 57.329 63.181 70.399 79.848 88.275 93.538 97.039 99.5 101.333 102.668 103.684 104.435 105.074 105.537 105.881 106.172 106.399 106.53 106.612 106.686 106.717 106.733 106.755 106.747 106.708 106.639 106.549 106.481 106.405 106.303 106.151 105.915 105.716 105.499 105.128 104.859 104.557 104.395 104.082 103.759 103.402 103.198 102.467 102.55 102.322 102.085 101.544 101.236 100.874 100.465 100.004 99.442 98.564 94.474 -3 ,10375 ,TETRA ,17590820,Sat Nov 27 21:21:15 CET,Sat Nov 27 23:15:06 CET,0.0 2.25 3.012 3.651 4.189 4.628 5.047 5.432 6.105 6.417 6.719 6.724 7.576 7.851 8.362 8.867 9.379 9.63 10.127 10.614 11.311 11.754 12.19 12.846 13.482 14.098 14.719 15.323 16.075 16.85 17.632 18.564 19.464 20.338 21.379 22.573 23.743 25.066 26.533 28.134 29.864 31.863 34.25 36.702 39.663 43.098 47.181 51.978 57.914 65.258 74.822 83.281 88.473 92.085 94.644 96.452 97.742 98.74 99.457 100.066 100.54 100.903 101.173 101.353 101.476 101.576 101.65 101.665 101.623 101.576 101.528 101.453 101.363 101.269 101.196 101.117 101.028 100.918 100.792 100.681 100.556 100.381 100.227 100.038 99.947 99.746 99.537 99.318 99.169 98.456 98.535 98.302 98.052 97.477 97.175 96.849 96.428 95.933 95.338 94.456 91.563 -4 ,23725 ,TETRA ,17590821,Sat Nov 27 21:21:15 CET,Sat Nov 27 23:14:24 CET,0.0 1.941 2.725 3.343 3.868 4.363 4.806 5.226 6.028 6.404 6.769 6.817 7.763 8.096 8.759 9.391 10.011 10.315 10.896 11.475 12.318 12.877 13.434 14.229 15.019 15.789 16.55 17.307 18.303 19.298 20.289 21.468 22.491 23.405 24.5 25.765 26.983 28.33 29.807 31.422 33.161 35.206 37.655 40.123 43.075 46.508 50.63 55.468 61.393 68.737 78.262 86.619 91.833 95.408 97.841 99.619 100.947 101.966 102.71 103.287 103.68 103.997 104.26 104.427 104.549 104.658 104.73 104.766 104.776 104.755 104.728 104.709 104.679 104.578 104.471 104.373 104.254 104.116 103.967 103.87 103.703 103.34 103.061 102.754 102.608 102.301 101.968 101.631 101.448 100.714 100.77 100.538 100.295 99.736 99.393 98.99 98.554 98.054 97.426 96.549 87.776 -5 ,16342 ,TETRA ,17590822,Sat Nov 27 21:21:15 CET,Sat Nov 27 23:19:35 CET,0.0 2.231 2.949 3.553 4.065 4.551 5.007 5.432 6.248 6.629 7.005 7.082 8.042 8.365 8.956 9.493 10.003 10.252 10.752 11.237 11.925 12.378 12.823 13.451 14.064 14.67 15.258 15.837 16.597 17.351 18.092 18.995 19.88 20.76 21.831 23.091 24.287 25.598 27.058 28.664 30.422 32.429 34.767 37.164 40.052 43.422 47.534 52.373 58.26 65.622 75.322 83.957 89.235 92.781 95.313 97.1 98.376 99.392 100.164 100.799 101.238 101.613 101.904 102.118 102.273 102.373 102.447 102.474 102.472 102.459 102.41 102.252 101.976 101.672 101.434 101.198 100.959 100.687 100.397 100.192 99.974 99.645 99.415 99.149 99.001 98.685 98.357 98.007 97.821 97.1 97.186 96.937 96.68 96.145 95.843 95.514 95.128 94.671 94.085 93.231 88.91 -6 ,12632 ,TETRA ,17590823,Sat Nov 27 21:22:11 CET,Sat Nov 27 23:18:49 CET,0.0 1.872 2.657 3.276 3.784 4.26 4.687 5.06 5.716 6.035 6.341 6.336 7.179 7.451 7.974 8.481 8.98 9.218 9.7 10.172 10.86 11.314 11.743 12.38 13.016 13.628 14.229 14.824 15.609 16.373 17.102 18.004 18.903 19.781 20.837 22.047 23.212 24.527 25.992 27.601 29.346 31.369 33.793 36.34 39.42 42.959 47.164 52.038 57.947 65.254 74.594 82.876 88.067 91.593 94.087 95.92 97.252 98.288 99.066 99.629 100.006 100.34 100.609 100.824 101.008 101.123 101.201 101.232 101.244 101.25 101.242 101.215 101.137 101.048 100.984 100.908 100.825 100.708 100.558 100.444 100.313 100.128 99.988 99.817 99.729 99.539 99.315 99.069 98.941 98.323 98.478 98.328 98.165 97.744 97.511 97.232 96.886 96.448 95.856 95.057 92.14 -7 ,32596 ,TETRA ,17590824,Sat Nov 27 21:22:11 CET,Sat Nov 27 23:16:03 CET,0.0 1.794 2.534 3.151 3.674 4.138 4.566 4.974 5.735 6.104 6.474 6.557 7.526 7.858 8.51 9.161 9.806 10.118 10.698 11.191 11.849 12.298 12.749 13.406 14.032 14.652 15.294 15.926 16.725 17.492 18.249 19.182 20.091 21.008 22.07 23.25 24.392 25.688 27.146 28.723 30.433 32.455 34.905 37.386 40.298 43.733 47.913 52.756 58.693 66.029 75.458 83.747 89.054 92.663 95.149 97.001 98.346 99.395 100.18 100.828 101.295 101.384 101.179 100.942 100.708 100.486 100.224 99.958 99.705 99.427 99.122 98.872 98.603 98.296 98.067 97.83 97.567 97.299 97.028 96.835 96.618 96.277 96.027 95.743 95.595 95.274 94.914 94.531 94.346 93.638 93.737 93.498 93.256 92.696 92.319 91.89 91.411 90.884 90.274 89.344 85.139 -8 ,24441 ,TETRA ,17590825,Sat Nov 27 21:22:12 CET,Sat Nov 27 23:17:16 CET,0.0 1.791 2.532 3.121 3.626 4.12 4.589 5.013 5.796 6.168 6.52 6.579 7.538 7.858 8.451 8.989 9.494 9.737 10.207 10.665 11.331 11.772 12.212 12.869 13.517 14.131 14.745 15.358 16.138 16.913 17.68 18.605 19.509 20.417 21.5 22.711 23.926 25.293 26.752 28.334 30.065 32.086 34.476 36.948 39.96 43.447 47.604 52.498 58.471 65.897 75.532 84.154 89.52 93.181 95.8 97.643 98.912 99.884 100.631 101.27 101.734 102.11 102.393 102.556 102.659 102.742 102.783 102.774 102.755 102.7 102.624 102.545 102.445 102.338 102.238 102.127 102.016 101.883 101.718 101.596 101.46 101.258 101.115 100.944 100.857 100.682 100.46 100.192 100.052 99.436 99.592 99.395 99.202 98.779 98.498 98.132 97.685 97.212 96.657 95.824 92.213 -9 ,23659 ,TETRA ,17590826,Sat Nov 27 21:22:12 CET,Sat Nov 27 23:15:38 CET,0.0 2.054 2.77 3.379 3.891 4.365 4.834 5.284 6.094 6.433 6.734 6.752 7.613 7.892 8.421 8.913 9.396 9.637 10.124 10.604 11.304 11.75 12.183 12.812 13.427 14.047 14.667 15.261 16.031 16.799 17.544 18.466 19.393 20.297 21.343 22.518 23.696 25.034 26.493 28.068 29.759 31.734 34.131 36.619 39.607 43.038 47.154 51.979 57.884 65.305 74.823 83.404 88.825 92.421 94.929 96.829 98.235 99.244 99.996 100.66 101.133 101.488 101.764 101.927 101.997 102.034 102.095 102.157 102.16 102.144 102.107 102.04 101.947 101.847 101.778 101.686 101.561 101.366 101.091 100.887 100.682 100.359 100.115 99.848 99.701 99.415 99.123 98.802 98.633 97.924 98.017 97.774 97.507 96.894 96.541 96.179 95.76 95.254 94.699 93.958 91.158 -10 ,5552 ,TETRA ,17590827,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:16:16 CET,0.0 1.786 2.439 3.012 3.536 4.012 4.465 4.887 5.706 6.102 6.477 6.562 7.523 7.849 8.475 9.1 9.725 10.027 10.632 11.224 12.072 12.62 13.171 13.994 14.766 15.53 16.302 17.061 18.015 18.853 19.602 20.521 21.41 22.309 23.393 24.607 25.773 27.078 28.529 30.097 31.801 33.797 36.153 38.586 41.527 44.896 48.949 53.786 59.688 67.001 76.478 84.889 90.225 93.806 96.283 98.163 99.537 100.576 101.354 102.017 102.494 102.832 103.093 103.29 103.415 103.462 103.435 103.409 103.401 103.379 103.345 103.306 103.255 103.169 103.072 102.954 102.82 102.675 102.528 102.424 102.303 102.081 101.922 101.754 101.664 101.493 101.286 101.022 100.869 100.24 100.402 100.213 99.994 99.511 99.256 98.98 98.638 98.191 97.639 96.945 94.153 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_32_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_32_30.txt deleted file mode 100644 index 099843cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/CDK2/water/Summary_FEP_32_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2645 ,KEBNE ,17018938,Wed Dec 22 00:58:03 CET,Wed Dec 22 02:29:30 CET,0.0 0.581 0.908 1.157 1.367 1.555 1.709 1.833 2.058 2.161 2.254 2.387 2.498 2.575 2.724 2.867 2.999 3.067 3.205 3.33 3.503 3.614 3.713 3.861 4.005 4.134 4.25 4.361 4.512 4.659 4.784 4.918 5.05 5.165 5.293 5.431 5.55 5.685 5.816 5.945 6.078 6.218 6.363 6.481 6.577 6.688 6.763 6.752 6.698 6.38 5.559 4.334 3.165 2.133 1.264 0.504 -0.18 -0.848 -1.448 -2.019 -2.496 -2.931 -3.334 -3.714 -4.072 -4.386 -4.722 -5.026 -5.29 -5.571 -5.86 -6.09 -6.327 -6.584 -6.783 -6.989 -7.203 -7.425 -7.657 -7.827 -7.999 -8.259 -8.437 -8.63 -8.744 -8.973 -9.191 -9.424 -9.55 -9.722 -9.989 -10.146 -10.306 -10.664 -10.851 -11.066 -11.321 -11.605 -11.984 -12.481 -14.013 -2 ,6375 ,KEBNE ,17018939,Wed Dec 22 00:58:03 CET,Wed Dec 22 02:28:51 CET,0.0 0.49 0.752 0.963 1.102 1.216 1.339 1.451 1.636 1.724 1.809 1.93 2.026 2.088 2.225 2.361 2.47 2.518 2.619 2.717 2.861 2.954 3.042 3.182 3.311 3.421 3.527 3.636 3.769 3.869 3.962 4.083 4.22 4.349 4.474 4.627 4.759 4.909 5.067 5.21 5.359 5.504 5.64 5.743 5.837 5.911 5.951 5.94 5.785 5.33 4.398 3.082 1.899 0.855 -0.049 -0.862 -1.593 -2.266 -2.86 -3.419 -3.884 -4.308 -4.718 -5.121 -5.499 -5.822 -6.157 -6.465 -6.734 -7.008 -7.281 -7.516 -7.773 -8.03 -8.225 -8.428 -8.643 -8.88 -9.124 -9.286 -9.463 -9.738 -9.935 -10.134 -10.231 -10.438 -10.672 -10.919 -11.031 -11.178 -11.384 -11.516 -11.656 -11.984 -12.16 -12.362 -12.594 -12.87 -13.184 -13.577 -14.736 -3 ,17637 ,KEBNE ,17018940,Wed Dec 22 00:59:06 CET,Wed Dec 22 02:30:55 CET,0.0 0.607 0.879 1.089 1.242 1.361 1.472 1.575 1.758 1.849 1.95 2.088 2.194 2.271 2.419 2.56 2.684 2.743 2.868 2.99 3.142 3.233 3.315 3.436 3.561 3.673 3.776 3.877 4.006 4.127 4.254 4.41 4.539 4.661 4.793 4.918 5.042 5.184 5.35 5.517 5.649 5.784 5.914 6.026 6.122 6.183 6.228 6.218 6.071 5.633 4.688 3.404 2.292 1.282 0.379 -0.433 -1.17 -1.816 -2.38 -2.973 -3.462 -3.885 -4.29 -4.657 -4.991 -5.298 -5.64 -5.94 -6.191 -6.47 -6.755 -6.988 -7.227 -7.473 -7.672 -7.876 -8.087 -8.31 -8.543 -8.706 -8.879 -9.149 -9.327 -9.502 -9.597 -9.793 -10.005 -10.254 -10.38 -10.541 -10.767 -10.908 -11.049 -11.365 -11.538 -11.717 -11.932 -12.174 -12.494 -12.933 -14.553 -4 ,20315 ,KEBNE ,17018941,Wed Dec 22 00:59:06 CET,Wed Dec 22 02:30:11 CET,0.0 0.534 0.797 1.021 1.205 1.359 1.489 1.604 1.82 1.909 1.999 2.162 2.273 2.349 2.509 2.669 2.815 2.883 3.018 3.15 3.323 3.427 3.528 3.661 3.796 3.924 4.034 4.145 4.27 4.378 4.487 4.623 4.758 4.878 5.001 5.133 5.263 5.409 5.553 5.692 5.819 5.944 6.082 6.187 6.283 6.382 6.482 6.479 6.354 6.019 5.08 3.687 2.482 1.487 0.601 -0.227 -0.976 -1.635 -2.168 -2.713 -3.195 -3.615 -4.013 -4.396 -4.76 -5.083 -5.413 -5.704 -5.956 -6.218 -6.501 -6.758 -7.025 -7.29 -7.484 -7.678 -7.887 -8.109 -8.332 -8.492 -8.665 -8.933 -9.125 -9.327 -9.429 -9.625 -9.841 -10.071 -10.191 -10.365 -10.595 -10.731 -10.883 -11.202 -11.392 -11.603 -11.824 -12.057 -12.342 -12.836 -15.035 -5 ,10205 ,KEBNE ,17018942,Wed Dec 22 01:02:12 CET,Wed Dec 22 02:31:52 CET,0.0 0.516 0.786 1.008 1.186 1.33 1.459 1.596 1.811 1.893 1.967 2.077 2.18 2.256 2.398 2.528 2.655 2.714 2.817 2.914 3.055 3.142 3.227 3.348 3.459 3.563 3.656 3.749 3.874 3.999 4.117 4.255 4.389 4.506 4.637 4.804 4.962 5.103 5.234 5.367 5.519 5.685 5.836 5.975 6.087 6.168 6.266 6.304 6.199 5.812 4.85 3.5 2.355 1.339 0.439 -0.363 -1.063 -1.709 -2.287 -2.841 -3.299 -3.696 -4.091 -4.478 -4.831 -5.145 -5.475 -5.772 -6.057 -6.356 -6.645 -6.892 -7.143 -7.397 -7.596 -7.803 -8.022 -8.24 -8.455 -8.605 -8.755 -8.985 -9.148 -9.327 -9.425 -9.62 -9.813 -10.042 -10.164 -10.324 -10.545 -10.672 -10.808 -11.111 -11.344 -11.604 -11.857 -12.181 -12.566 -13.077 -14.942 -6 ,13181 ,KEBNE ,17018943,Wed Dec 22 01:17:45 CET,Wed Dec 22 02:47:38 CET,0.0 0.487 0.756 0.967 1.132 1.28 1.402 1.513 1.691 1.776 1.865 1.98 2.092 2.183 2.32 2.442 2.56 2.62 2.733 2.834 2.986 3.086 3.179 3.302 3.424 3.55 3.669 3.767 3.886 3.997 4.113 4.251 4.363 4.467 4.598 4.751 4.894 5.037 5.179 5.32 5.448 5.57 5.7 5.821 5.955 6.069 6.132 6.149 6.038 5.68 4.742 3.415 2.328 1.365 0.51 -0.272 -1.003 -1.668 -2.203 -2.725 -3.193 -3.612 -4.012 -4.391 -4.744 -5.069 -5.404 -5.699 -5.964 -6.235 -6.512 -6.748 -6.994 -7.258 -7.471 -7.686 -7.897 -8.126 -8.365 -8.523 -8.683 -8.937 -9.113 -9.298 -9.402 -9.622 -9.843 -10.07 -10.18 -10.334 -10.562 -10.703 -10.851 -11.189 -11.379 -11.565 -11.785 -12.033 -12.303 -12.677 -13.789 -7 ,28992 ,KEBNE ,17018944,Wed Dec 22 01:42:46 CET,Wed Dec 22 03:12:52 CET,0.0 0.623 0.883 1.055 1.195 1.313 1.43 1.541 1.736 1.834 1.929 2.052 2.15 2.221 2.352 2.467 2.579 2.635 2.752 2.856 2.99 3.074 3.163 3.297 3.42 3.538 3.639 3.736 3.873 4.003 4.131 4.271 4.395 4.509 4.635 4.77 4.887 5.037 5.208 5.355 5.495 5.667 5.83 5.959 6.102 6.201 6.255 6.245 6.066 5.71 4.888 3.525 2.306 1.245 0.34 -0.453 -1.16 -1.802 -2.359 -2.904 -3.377 -3.801 -4.212 -4.598 -4.946 -5.255 -5.578 -5.881 -6.139 -6.403 -6.678 -6.902 -7.136 -7.392 -7.594 -7.799 -8.019 -8.238 -8.453 -8.613 -8.779 -9.041 -9.225 -9.43 -9.535 -9.747 -9.977 -10.212 -10.329 -10.48 -10.697 -10.844 -11.011 -11.381 -11.586 -11.792 -12.028 -12.31 -12.801 -13.73 -17.335 -8 ,23409 ,KEBNE ,17018945,Wed Dec 22 01:42:46 CET,Wed Dec 22 03:13:45 CET,0.0 0.665 0.872 1.03 1.174 1.315 1.439 1.562 1.77 1.845 1.916 2.034 2.144 2.221 2.361 2.474 2.583 2.644 2.763 2.875 3.024 3.113 3.207 3.351 3.485 3.61 3.72 3.815 3.932 4.055 4.182 4.316 4.446 4.583 4.727 4.887 5.029 5.161 5.293 5.423 5.55 5.666 5.794 5.906 6.006 6.079 6.098 6.056 5.922 5.498 4.477 3.115 1.93 0.936 0.079 -0.71 -1.392 -2.029 -2.59 -3.146 -3.654 -4.125 -4.572 -4.984 -5.349 -5.681 -6.034 -6.34 -6.599 -6.874 -7.169 -7.409 -7.648 -7.907 -8.104 -8.306 -8.521 -8.753 -8.992 -9.157 -9.324 -9.569 -9.743 -9.923 -10.013 -10.215 -10.447 -10.686 -10.805 -10.958 -11.167 -11.312 -11.471 -11.793 -11.962 -12.158 -12.377 -12.642 -12.949 -13.308 -15.062 -9 ,27752 ,KEBNE ,17018946,Wed Dec 22 01:42:46 CET,Wed Dec 22 03:12:27 CET,0.0 0.374 0.581 0.804 1.028 1.191 1.327 1.462 1.718 1.831 1.927 2.077 2.192 2.264 2.405 2.537 2.656 2.709 2.812 2.915 3.046 3.132 3.222 3.335 3.442 3.554 3.663 3.77 3.893 4.009 4.122 4.243 4.358 4.468 4.607 4.765 4.895 5.035 5.168 5.287 5.411 5.537 5.679 5.809 5.926 6.019 6.095 6.09 5.927 5.509 4.612 3.332 2.173 1.206 0.361 -0.454 -1.167 -1.809 -2.366 -2.942 -3.436 -3.84 -4.222 -4.589 -4.931 -5.261 -5.605 -5.914 -6.2 -6.484 -6.754 -6.988 -7.232 -7.486 -7.686 -7.885 -8.097 -8.309 -8.53 -8.697 -8.868 -9.129 -9.308 -9.493 -9.585 -9.776 -9.983 -10.2 -10.318 -10.48 -10.692 -10.833 -10.986 -11.324 -11.521 -11.728 -11.951 -12.234 -12.566 -12.951 -14.398 -10 ,17584 ,KEBNE ,17018947,Wed Dec 22 01:45:14 CET,Wed Dec 22 03:08:13 CET,0.0 0.72 1.008 1.188 1.331 1.467 1.609 1.739 1.963 2.071 2.169 2.306 2.418 2.503 2.637 2.76 2.89 2.947 3.054 3.15 3.283 3.379 3.476 3.611 3.733 3.848 3.954 4.054 4.177 4.303 4.431 4.575 4.701 4.816 4.947 5.086 5.208 5.343 5.488 5.644 5.806 5.966 6.12 6.25 6.395 6.519 6.578 6.586 6.48 6.058 5.078 3.727 2.565 1.559 0.68 -0.122 -0.844 -1.475 -2.001 -2.54 -3.013 -3.434 -3.829 -4.208 -4.578 -4.91 -5.247 -5.545 -5.803 -6.072 -6.365 -6.607 -6.852 -7.106 -7.301 -7.506 -7.724 -7.95 -8.171 -8.326 -8.493 -8.757 -8.937 -9.12 -9.221 -9.453 -9.696 -9.93 -10.041 -10.191 -10.399 -10.543 -10.721 -11.116 -11.322 -11.552 -11.817 -12.123 -12.495 -12.976 -15.105 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index b2e5211a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4595 ,TETRA ,17590850,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:35:14 CET,0.0 1.367 1.867 2.234 2.575 2.888 3.147 3.381 3.811 4.003 4.185 4.166 4.711 4.86 5.147 5.434 5.715 5.84 6.071 6.297 6.616 6.816 7.0 7.264 7.526 7.785 8.038 8.282 8.59 8.872 9.135 9.436 9.722 10.009 10.348 10.718 11.06 11.424 11.811 12.216 12.625 13.066 13.581 14.062 14.575 15.141 15.716 16.261 16.822 17.262 17.334 16.855 16.117 15.297 14.551 13.865 13.225 12.606 12.039 11.481 10.994 10.508 10.027 9.551 9.087 8.675 8.247 7.876 7.566 7.229 6.855 6.535 6.2 5.846 5.572 5.279 4.966 4.663 4.355 4.118 3.862 3.475 3.197 2.88 2.715 2.401 2.073 1.711 1.522 0.944 0.903 0.662 0.415 -0.109 -0.405 -0.737 -1.104 -1.496 -1.967 -2.735 -4.599 -2 ,1406 ,TETRA ,17590851,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:36:13 CET,0.0 1.452 1.986 2.375 2.712 3.039 3.344 3.613 4.096 4.314 4.519 4.539 5.099 5.27 5.592 5.861 6.111 6.235 6.466 6.68 6.974 7.159 7.344 7.622 7.894 8.151 8.4 8.633 8.925 9.208 9.476 9.795 10.114 10.416 10.734 11.101 11.453 11.825 12.234 12.641 13.05 13.509 14.026 14.519 15.073 15.64 16.22 16.785 17.343 17.825 17.906 17.457 16.837 16.105 15.4 14.701 14.031 13.366 12.766 12.158 11.611 11.112 10.63 10.172 9.737 9.302 8.837 8.44 8.094 7.73 7.355 7.061 6.741 6.374 6.079 5.777 5.476 5.167 4.83 4.581 4.316 3.906 3.607 3.286 3.138 2.821 2.469 2.106 1.926 1.359 1.289 1.048 0.799 0.267 -0.017 -0.363 -0.746 -1.154 -1.667 -2.352 -4.132 -3 ,21326 ,TETRA ,17590852,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:44:18 CET,0.0 1.506 2.007 2.406 2.717 3.017 3.289 3.508 3.95 4.172 4.373 4.35 4.89 5.032 5.344 5.632 5.904 6.035 6.267 6.497 6.836 7.05 7.274 7.588 7.866 8.125 8.38 8.647 8.973 9.272 9.558 9.89 10.194 10.484 10.843 11.249 11.624 12.005 12.397 12.806 13.226 13.691 14.19 14.657 15.187 15.72 16.274 16.846 17.39 17.814 17.92 17.437 16.703 15.982 15.281 14.508 13.762 13.114 12.534 11.906 11.387 10.918 10.429 9.954 9.514 9.116 8.728 8.371 8.022 7.668 7.309 7.004 6.69 6.352 6.074 5.792 5.512 5.206 4.855 4.616 4.375 3.987 3.708 3.422 3.269 2.944 2.628 2.305 2.128 1.557 1.521 1.295 1.062 0.539 0.256 -0.056 -0.397 -0.766 -1.224 -1.859 -3.428 -4 ,8181 ,TETRA ,17590853,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:34:32 CET,0.0 1.412 1.956 2.356 2.678 2.949 3.2 3.435 3.843 4.036 4.217 4.154 4.698 4.851 5.125 5.389 5.64 5.755 5.972 6.188 6.492 6.687 6.886 7.168 7.429 7.68 7.925 8.153 8.451 8.734 8.983 9.268 9.549 9.837 10.164 10.514 10.838 11.186 11.562 11.956 12.351 12.777 13.257 13.727 14.24 14.781 15.375 15.942 16.495 16.884 16.928 16.45 15.713 14.931 14.185 13.417 12.686 12.025 11.421 10.779 10.241 9.758 9.285 8.822 8.368 7.964 7.535 7.132 6.804 6.466 6.101 5.797 5.449 5.08 4.811 4.532 4.226 3.859 3.479 3.234 2.973 2.552 2.266 1.991 1.839 1.492 1.131 0.763 0.564 -0.028 -0.08 -0.326 -0.584 -1.153 -1.475 -1.806 -2.192 -2.603 -3.122 -3.863 -5.411 -5 ,28695 ,TETRA ,17590854,Sat Nov 27 21:22:14 CET,Sat Nov 27 23:36:26 CET,0.0 1.332 1.861 2.257 2.628 2.914 3.151 3.376 3.805 4.004 4.188 4.149 4.696 4.855 5.146 5.415 5.674 5.796 6.039 6.26 6.558 6.751 6.937 7.217 7.486 7.738 7.978 8.213 8.507 8.775 9.043 9.38 9.693 9.989 10.323 10.675 11.008 11.371 11.77 12.191 12.614 13.048 13.535 14.036 14.553 15.095 15.686 16.223 16.736 17.146 17.252 16.832 16.078 15.296 14.579 13.859 13.173 12.532 11.981 11.411 10.89 10.405 9.942 9.475 9.023 8.614 8.183 7.779 7.424 7.084 6.743 6.452 6.148 5.828 5.543 5.248 4.944 4.632 4.328 4.099 3.845 3.44 3.143 2.847 2.699 2.368 1.998 1.585 1.377 0.784 0.737 0.507 0.265 -0.244 -0.551 -0.901 -1.302 -1.768 -2.265 -2.974 -4.828 -6 ,20849 ,TETRA ,17590855,Sat Nov 27 21:22:14 CET,Sat Nov 27 23:36:40 CET,0.0 1.165 1.621 1.995 2.307 2.567 2.815 3.053 3.456 3.634 3.82 3.788 4.339 4.494 4.774 5.022 5.258 5.378 5.605 5.813 6.09 6.277 6.476 6.765 7.031 7.281 7.526 7.757 8.05 8.343 8.619 8.935 9.229 9.521 9.874 10.243 10.577 10.934 11.299 11.682 12.079 12.51 12.985 13.446 13.969 14.511 15.119 15.735 16.303 16.76 16.898 16.477 15.843 15.145 14.412 13.695 13.06 12.439 11.858 11.273 10.743 10.244 9.766 9.326 8.92 8.533 8.132 7.77 7.436 7.093 6.72 6.407 6.086 5.737 5.459 5.169 4.862 4.544 4.232 4.008 3.748 3.315 3.017 2.696 2.528 2.215 1.906 1.56 1.374 0.812 0.778 0.52 0.241 -0.363 -0.719 -1.103 -1.494 -1.905 -2.418 -3.106 -4.66 -7 ,5979 ,TETRA ,17590856,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:37:38 CET,0.0 1.448 2.049 2.509 2.914 3.257 3.536 3.795 4.225 4.423 4.621 4.598 5.154 5.311 5.591 5.867 6.141 6.277 6.516 6.717 7.006 7.204 7.4 7.683 7.945 8.194 8.44 8.668 8.94 9.208 9.478 9.798 10.079 10.341 10.647 10.982 11.307 11.664 12.045 12.438 12.841 13.286 13.779 14.248 14.757 15.27 15.839 16.432 16.926 17.276 17.389 16.99 16.342 15.63 14.905 14.192 13.547 12.972 12.445 11.851 11.313 10.815 10.348 9.909 9.469 9.073 8.68 8.334 8.024 7.682 7.325 7.027 6.715 6.38 6.106 5.836 5.556 5.242 4.915 4.684 4.445 4.08 3.808 3.52 3.374 3.065 2.751 2.423 2.245 1.675 1.679 1.467 1.238 0.728 0.426 0.104 -0.258 -0.682 -1.251 -2.212 -5.375 -8 ,14656 ,TETRA ,17590857,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:38:56 CET,0.0 0.981 1.438 1.82 2.158 2.432 2.689 2.931 3.351 3.543 3.715 3.635 4.17 4.322 4.622 4.905 5.159 5.284 5.53 5.753 6.078 6.296 6.505 6.792 7.064 7.336 7.593 7.825 8.111 8.389 8.661 8.991 9.308 9.611 9.955 10.322 10.677 11.056 11.44 11.85 12.291 12.764 13.287 13.808 14.382 14.955 15.53 16.094 16.646 17.105 17.259 16.803 16.093 15.3 14.527 13.812 13.158 12.5 11.905 11.299 10.74 10.219 9.716 9.232 8.781 8.362 7.882 7.453 7.1 6.728 6.346 6.043 5.718 5.361 5.077 4.78 4.483 4.168 3.82 3.576 3.33 2.947 2.681 2.39 2.236 1.928 1.597 1.215 1.017 0.436 0.393 0.156 -0.1 -0.659 -0.975 -1.328 -1.709 -2.138 -2.621 -3.325 -5.28 -9 ,27304 ,TETRA ,17590858,Sat Nov 27 21:22:14 CET,Sat Nov 27 23:35:52 CET,0.0 1.31 1.871 2.308 2.64 2.93 3.187 3.433 3.873 4.061 4.229 4.17 4.711 4.864 5.162 5.438 5.693 5.807 6.026 6.246 6.566 6.777 6.988 7.293 7.598 7.895 8.16 8.405 8.707 8.993 9.27 9.58 9.864 10.146 10.47 10.815 11.151 11.51 11.887 12.29 12.706 13.173 13.687 14.159 14.704 15.293 15.921 16.518 17.052 17.501 17.689 17.31 16.606 15.834 15.101 14.408 13.759 13.107 12.525 11.93 11.392 10.893 10.404 9.922 9.462 9.037 8.596 8.209 7.865 7.505 7.143 6.843 6.511 6.152 5.878 5.598 5.296 4.967 4.631 4.407 4.172 3.789 3.517 3.225 3.076 2.736 2.367 1.972 1.761 1.173 1.136 0.888 0.614 0.057 -0.247 -0.577 -0.951 -1.374 -1.896 -2.587 -4.346 -10 ,25314 ,TETRA ,17590859,Sat Nov 27 21:22:14 CET,Sat Nov 27 23:39:23 CET,0.0 1.235 1.732 2.126 2.436 2.709 2.957 3.198 3.676 3.898 4.097 4.063 4.609 4.768 5.065 5.329 5.571 5.695 5.933 6.149 6.457 6.653 6.851 7.143 7.419 7.682 7.922 8.151 8.449 8.731 9.002 9.344 9.674 9.987 10.361 10.746 11.091 11.458 11.833 12.23 12.643 13.114 13.614 14.082 14.626 15.157 15.69 16.248 16.809 17.283 17.451 17.011 16.325 15.555 14.759 13.964 13.28 12.648 12.093 11.53 11.026 10.576 10.144 9.733 9.329 8.932 8.512 8.149 7.821 7.482 7.132 6.793 6.42 6.054 5.781 5.502 5.202 4.884 4.552 4.318 4.083 3.729 3.474 3.204 3.065 2.784 2.503 2.175 1.985 1.409 1.389 1.174 0.961 0.47 0.184 -0.13 -0.501 -0.964 -1.471 -2.15 -3.984 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt deleted file mode 100644 index fae729e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13865 ,TETRA ,17590860,Sat Nov 27 21:22:16 CET,Sat Nov 27 23:38:23 CET,0.0 1.472 2.079 2.557 2.903 3.234 3.534 3.775 4.197 4.396 4.599 4.612 5.169 5.348 5.708 6.027 6.318 6.469 6.757 7.034 7.444 7.693 7.933 8.286 8.637 8.976 9.301 9.62 10.019 10.406 10.775 11.228 11.694 12.139 12.654 13.232 13.765 14.332 14.958 15.642 16.336 17.111 18.008 18.925 20.049 21.293 22.677 24.21 26.026 28.12 30.397 32.074 32.809 33.0 32.972 32.898 32.707 32.431 32.18 31.879 31.583 31.291 30.97 30.661 30.366 30.046 29.694 29.379 29.09 28.788 28.46 28.181 27.873 27.531 27.273 27.011 26.73 26.425 26.121 25.904 25.682 25.307 25.01 24.714 24.575 24.29 23.953 23.585 23.388 22.827 22.722 22.479 22.232 21.683 21.384 21.029 20.606 20.128 19.603 18.852 15.843 -2 ,26709 ,TETRA ,17590861,Sat Nov 27 21:22:15 CET,Sat Nov 27 23:36:56 CET,0.0 1.93 2.63 3.157 3.584 3.967 4.295 4.602 5.15 5.386 5.605 5.631 6.215 6.407 6.765 7.125 7.464 7.629 7.939 8.231 8.664 8.926 9.176 9.539 9.89 10.228 10.549 10.86 11.274 11.665 12.04 12.529 12.996 13.426 13.937 14.501 15.042 15.655 16.311 16.997 17.713 18.517 19.474 20.436 21.552 22.778 24.119 25.612 27.404 29.464 31.706 33.224 33.887 34.198 34.268 34.217 34.055 33.791 33.536 33.269 33.011 32.757 32.488 32.194 31.877 31.58 31.269 30.981 30.721 30.43 30.132 29.882 29.579 29.263 29.016 28.733 28.434 28.121 27.771 27.521 27.277 26.881 26.6 26.313 26.166 25.882 25.582 25.249 25.066 24.509 24.377 24.113 23.834 23.214 22.889 22.533 22.109 21.559 20.891 20.032 16.382 -3 ,13663 ,TETRA ,17590862,Sat Nov 27 21:23:12 CET,Sat Nov 27 23:36:39 CET,0.0 1.589 2.103 2.461 2.816 3.166 3.474 3.753 4.277 4.511 4.718 4.725 5.306 5.498 5.854 6.187 6.51 6.668 6.953 7.223 7.623 7.881 8.12 8.46 8.79 9.112 9.434 9.767 10.181 10.545 10.911 11.343 11.752 12.145 12.597 13.132 13.658 14.23 14.849 15.493 16.163 16.939 17.843 18.778 19.864 20.999 22.292 23.767 25.485 27.48 29.846 31.509 32.171 32.375 32.385 32.274 32.081 31.85 31.606 31.309 31.04 30.796 30.523 30.234 29.952 29.695 29.418 29.135 28.875 28.614 28.317 28.055 27.784 27.498 27.261 27.003 26.74 26.463 26.145 25.922 25.7 25.353 25.105 24.844 24.701 24.388 24.068 23.732 23.538 22.973 22.898 22.675 22.417 21.832 21.513 21.161 20.771 20.285 19.669 18.797 15.861 -4 ,26899 ,TETRA ,17590863,Sat Nov 27 21:23:12 CET,Sat Nov 27 23:38:52 CET,0.0 2.154 2.756 3.191 3.569 3.897 4.199 4.478 4.987 5.236 5.465 5.463 6.019 6.199 6.535 6.857 7.186 7.345 7.638 7.926 8.344 8.602 8.851 9.217 9.56 9.904 10.265 10.608 11.037 11.448 11.841 12.322 12.779 13.229 13.741 14.296 14.81 15.37 15.999 16.666 17.353 18.138 19.041 19.935 21.043 22.348 23.776 25.338 27.136 29.17 31.518 33.17 33.868 34.09 34.11 34.051 33.895 33.698 33.479 33.181 32.913 32.649 32.358 32.061 31.774 31.47 31.113 30.792 30.489 30.169 29.844 29.559 29.257 28.933 28.686 28.457 28.217 27.938 27.607 27.354 27.085 26.671 26.403 26.13 25.988 25.693 25.356 24.995 24.809 24.256 24.141 23.879 23.625 23.049 22.707 22.36 21.924 21.375 20.709 19.763 16.906 -5 ,13612 ,TETRA ,17590864,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:37:37 CET,0.0 1.209 1.789 2.221 2.561 2.874 3.158 3.439 3.952 4.183 4.391 4.393 4.97 5.154 5.507 5.856 6.173 6.333 6.65 6.942 7.357 7.628 7.884 8.254 8.623 8.975 9.299 9.624 10.069 10.486 10.865 11.312 11.749 12.162 12.634 13.177 13.703 14.3 14.971 15.664 16.375 17.17 18.094 19.018 20.078 21.276 22.637 24.095 25.743 27.66 29.938 31.709 32.518 32.809 32.774 32.579 32.337 32.083 31.803 31.481 31.166 30.818 30.501 30.21 29.894 29.591 29.265 28.946 28.661 28.362 28.04 27.778 27.494 27.185 26.953 26.702 26.417 26.129 25.82 25.585 25.343 24.959 24.682 24.394 24.245 23.943 23.63 23.282 23.086 22.541 22.478 22.232 21.972 21.435 21.127 20.772 20.36 19.86 19.227 18.484 16.371 -6 ,28834 ,TETRA ,17590865,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:36:06 CET,0.0 1.558 2.069 2.522 2.923 3.253 3.552 3.803 4.256 4.489 4.704 4.727 5.289 5.467 5.838 6.18 6.499 6.657 6.975 7.289 7.75 8.033 8.294 8.683 9.048 9.401 9.747 10.074 10.478 10.884 11.274 11.728 12.2 12.663 13.174 13.735 14.286 14.897 15.54 16.201 16.89 17.684 18.639 19.594 20.677 21.913 23.326 24.925 26.782 28.832 31.217 32.933 33.561 33.781 33.829 33.675 33.444 33.199 32.887 32.533 32.189 31.832 31.482 31.139 30.798 30.508 30.211 29.91 29.612 29.281 28.972 28.715 28.421 28.109 27.861 27.582 27.256 26.92 26.605 26.393 26.152 25.741 25.452 25.146 24.991 24.662 24.301 23.886 23.665 23.087 22.966 22.714 22.455 21.865 21.506 21.106 20.665 20.184 19.627 18.847 16.075 -7 ,26958 ,TETRA ,17590866,Sat Nov 27 21:23:12 CET,Sat Nov 27 23:34:36 CET,0.0 2.006 2.711 3.194 3.582 3.95 4.286 4.558 5.061 5.293 5.508 5.545 6.123 6.315 6.684 7.04 7.381 7.535 7.816 8.106 8.528 8.789 9.052 9.437 9.806 10.165 10.501 10.818 11.208 11.579 11.956 12.416 12.853 13.283 13.806 14.382 14.925 15.511 16.141 16.831 17.579 18.392 19.319 20.294 21.428 22.641 23.987 25.519 27.304 29.37 31.693 33.295 34.026 34.307 34.338 34.233 34.035 33.791 33.542 33.233 32.919 32.602 32.284 32.01 31.732 31.436 31.09 30.76 30.469 30.15 29.837 29.576 29.292 29.001 28.764 28.494 28.196 27.893 27.564 27.341 27.116 26.729 26.442 26.15 26.0 25.688 25.377 25.039 24.855 24.303 24.221 23.977 23.72 23.136 22.8 22.447 22.049 21.562 20.985 20.151 17.611 -8 ,5061 ,TETRA ,17590867,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:34:53 CET,0.0 1.521 2.083 2.505 2.867 3.201 3.5 3.775 4.272 4.489 4.687 4.697 5.263 5.445 5.807 6.148 6.451 6.596 6.908 7.199 7.596 7.851 8.094 8.45 8.805 9.143 9.468 9.785 10.182 10.562 10.92 11.339 11.749 12.162 12.654 13.196 13.704 14.306 14.978 15.666 16.382 17.186 18.133 19.072 20.173 21.401 22.779 24.364 26.229 28.339 30.771 32.556 33.34 33.632 33.686 33.616 33.457 33.199 32.928 32.617 32.288 31.986 31.7 31.405 31.106 30.817 30.499 30.2 29.946 29.672 29.373 29.136 28.877 28.578 28.344 28.095 27.834 27.563 27.261 27.041 26.803 26.407 26.115 25.808 25.649 25.291 24.892 24.494 24.288 23.727 23.666 23.428 23.165 22.586 22.266 21.918 21.509 21.008 20.447 19.645 16.899 -9 ,9302 ,TETRA ,17590868,Sat Nov 27 21:23:12 CET,Sat Nov 27 23:38:55 CET,0.0 2.11 2.637 3.102 3.505 3.854 4.154 4.434 4.995 5.244 5.476 5.527 6.111 6.311 6.692 7.053 7.401 7.571 7.885 8.164 8.578 8.857 9.11 9.458 9.816 10.165 10.474 10.772 11.187 11.576 11.926 12.349 12.767 13.188 13.677 14.221 14.74 15.308 15.941 16.64 17.374 18.191 19.12 20.034 21.118 22.311 23.695 25.254 27.07 29.198 31.628 33.404 34.108 34.343 34.429 34.444 34.387 34.211 33.989 33.719 33.403 33.073 32.741 32.423 32.124 31.836 31.534 31.227 30.943 30.636 30.276 29.964 29.642 29.329 29.08 28.812 28.539 28.25 27.93 27.695 27.434 27.023 26.743 26.471 26.335 26.018 25.672 25.299 25.091 24.514 24.415 24.173 23.93 23.366 23.037 22.688 22.289 21.785 21.127 20.231 17.56 -10 ,1267 ,TETRA ,17590869,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:35:48 CET,0.0 1.686 2.299 2.785 3.19 3.537 3.862 4.164 4.716 4.954 5.174 5.223 5.815 6.024 6.437 6.81 7.156 7.328 7.651 7.955 8.409 8.687 8.96 9.397 9.811 10.181 10.538 10.877 11.319 11.742 12.122 12.577 13.019 13.444 13.921 14.451 14.986 15.592 16.251 16.921 17.601 18.397 19.325 20.242 21.29 22.47 23.849 25.402 27.252 29.378 31.749 33.507 34.265 34.549 34.606 34.551 34.427 34.24 33.986 33.647 33.358 33.086 32.792 32.462 32.098 31.768 31.44 31.128 30.831 30.524 30.204 29.916 29.634 29.36 29.142 28.895 28.612 28.318 28.016 27.805 27.594 27.261 27.007 26.739 26.594 26.27 25.943 25.601 25.416 24.848 24.728 24.468 24.204 23.636 23.312 22.968 22.556 22.047 21.443 20.606 17.909 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index f4ee675f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23778 ,TETRA ,17590870,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:36:32 CET,0.0 0.661 0.97 1.225 1.469 1.668 1.825 1.997 2.318 2.448 2.569 2.454 2.918 3.022 3.242 3.441 3.623 3.714 3.891 4.051 4.283 4.426 4.557 4.76 4.955 5.135 5.314 5.482 5.689 5.883 6.081 6.333 6.565 6.776 7.014 7.281 7.549 7.852 8.174 8.501 8.823 9.213 9.674 10.094 10.584 11.137 11.729 12.321 12.957 13.596 14.164 14.367 14.277 14.049 13.742 13.407 13.071 12.741 12.427 12.114 11.861 11.608 11.323 11.052 10.811 10.573 10.314 10.069 9.857 9.654 9.439 9.24 9.019 8.773 8.583 8.397 8.205 7.995 7.759 7.605 7.445 7.187 7.015 6.835 6.746 6.561 6.345 6.115 5.997 5.517 5.592 5.445 5.304 4.971 4.772 4.555 4.291 3.979 3.627 3.181 2.111 -2 ,19488 ,TETRA ,17590871,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:33:29 CET,0.0 1.28 1.635 1.96 2.19 2.391 2.571 2.727 3.035 3.163 3.282 3.184 3.673 3.796 4.037 4.247 4.454 4.552 4.725 4.906 5.179 5.34 5.5 5.736 5.948 6.137 6.318 6.503 6.736 6.951 7.156 7.404 7.641 7.876 8.148 8.438 8.702 8.994 9.325 9.665 9.998 10.345 10.754 11.176 11.669 12.198 12.777 13.379 13.98 14.594 15.141 15.283 15.129 14.864 14.573 14.269 13.944 13.628 13.366 13.081 12.785 12.511 12.248 11.983 11.712 11.445 11.175 10.953 10.757 10.544 10.316 10.121 9.912 9.689 9.512 9.332 9.143 8.946 8.743 8.601 8.432 8.144 7.954 7.776 7.687 7.489 7.284 7.067 6.954 6.479 6.56 6.412 6.249 5.903 5.726 5.543 5.348 5.092 4.781 4.421 3.557 -3 ,21405 ,TETRA ,17590872,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:33:12 CET,0.0 0.736 1.04 1.295 1.523 1.735 1.94 2.127 2.466 2.615 2.74 2.623 3.103 3.219 3.416 3.603 3.793 3.879 4.035 4.189 4.409 4.549 4.688 4.881 5.061 5.235 5.41 5.586 5.809 6.025 6.224 6.464 6.698 6.917 7.169 7.452 7.738 8.046 8.355 8.684 9.025 9.403 9.82 10.219 10.696 11.229 11.799 12.376 13.033 13.734 14.322 14.49 14.42 14.177 13.869 13.573 13.28 12.965 12.658 12.368 12.127 11.873 11.606 11.374 11.145 10.925 10.669 10.428 10.229 10.023 9.796 9.61 9.42 9.201 9.048 8.897 8.716 8.531 8.332 8.187 8.027 7.755 7.581 7.408 7.312 7.105 6.898 6.705 6.596 6.125 6.233 6.089 5.936 5.616 5.44 5.243 5.022 4.782 4.491 4.126 2.971 -4 ,20710 ,TETRA ,17590873,Sat Nov 27 21:23:14 CET,Sat Nov 27 23:32:50 CET,0.0 0.481 0.762 0.985 1.193 1.386 1.562 1.718 1.993 2.124 2.256 2.146 2.614 2.729 2.941 3.138 3.325 3.415 3.595 3.764 4.01 4.151 4.282 4.474 4.66 4.852 5.043 5.232 5.472 5.7 5.915 6.152 6.374 6.609 6.883 7.168 7.446 7.761 8.092 8.427 8.763 9.138 9.582 10.025 10.515 11.006 11.539 12.12 12.732 13.413 14.043 14.235 14.157 13.944 13.667 13.359 13.016 12.684 12.397 12.051 11.727 11.455 11.208 10.974 10.737 10.51 10.263 10.038 9.851 9.661 9.451 9.266 9.069 8.855 8.691 8.522 8.345 8.17 7.962 7.805 7.654 7.416 7.24 7.062 6.975 6.787 6.576 6.337 6.213 5.743 5.854 5.708 5.549 5.219 5.034 4.841 4.64 4.399 4.106 3.716 2.761 -5 ,14580 ,TETRA ,17590874,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:33:43 CET,0.0 0.836 1.219 1.448 1.63 1.804 1.975 2.135 2.405 2.535 2.673 2.566 3.047 3.17 3.389 3.594 3.789 3.888 4.07 4.23 4.459 4.609 4.763 4.969 5.152 5.333 5.508 5.674 5.896 6.12 6.331 6.578 6.813 7.051 7.331 7.623 7.893 8.205 8.529 8.869 9.25 9.675 10.151 10.606 11.116 11.665 12.254 12.895 13.594 14.251 14.784 15.006 14.945 14.7 14.399 14.091 13.791 13.513 13.248 12.911 12.594 12.31 12.029 11.763 11.517 11.287 11.048 10.836 10.628 10.405 10.179 9.995 9.797 9.576 9.38 9.18 8.992 8.775 8.526 8.36 8.195 7.905 7.706 7.512 7.407 7.179 6.949 6.718 6.593 6.104 6.169 6.018 5.866 5.525 5.326 5.123 4.907 4.658 4.35 3.893 2.95 -6 ,12602 ,TETRA ,17590875,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:34:29 CET,0.0 0.491 0.794 1.054 1.271 1.455 1.625 1.779 2.074 2.212 2.341 2.23 2.704 2.81 3.018 3.215 3.386 3.464 3.635 3.804 4.043 4.195 4.338 4.534 4.737 4.935 5.118 5.295 5.512 5.729 5.94 6.185 6.428 6.656 6.917 7.213 7.47 7.762 8.085 8.409 8.741 9.09 9.494 9.924 10.417 10.938 11.478 12.042 12.691 13.375 14.017 14.25 14.158 13.935 13.688 13.432 13.147 12.84 12.551 12.244 11.982 11.747 11.507 11.253 11.013 10.786 10.534 10.321 10.123 9.897 9.668 9.478 9.28 9.072 8.915 8.747 8.555 8.362 8.152 7.999 7.84 7.608 7.447 7.262 7.163 6.967 6.765 6.552 6.432 5.956 6.067 5.928 5.777 5.46 5.278 5.096 4.907 4.655 4.367 3.979 3.15 -7 ,11871 ,TETRA ,17590876,Sat Nov 27 21:23:12 CET,Sat Nov 27 23:33:16 CET,0.0 0.88 1.218 1.511 1.743 1.931 2.095 2.243 2.523 2.658 2.784 2.651 3.117 3.222 3.414 3.594 3.771 3.861 4.045 4.223 4.459 4.603 4.745 4.951 5.145 5.317 5.487 5.655 5.864 6.064 6.266 6.516 6.742 6.958 7.211 7.483 7.745 8.036 8.336 8.655 8.998 9.365 9.774 10.179 10.634 11.133 11.694 12.297 12.971 13.629 14.212 14.455 14.385 14.176 13.894 13.626 13.358 13.084 12.82 12.514 12.248 12.02 11.785 11.547 11.321 11.126 10.91 10.696 10.515 10.32 10.114 9.93 9.728 9.522 9.358 9.185 8.999 8.809 8.615 8.478 8.334 8.098 7.934 7.76 7.667 7.488 7.304 7.117 7.004 6.524 6.648 6.518 6.358 6.0 5.808 5.597 5.383 5.139 4.844 4.475 3.674 -8 ,25256 ,TETRA ,17590877,Sat Nov 27 21:24:13 CET,Sat Nov 27 23:35:51 CET,0.0 0.649 0.911 1.134 1.322 1.498 1.687 1.866 2.174 2.308 2.424 2.271 2.728 2.829 3.032 3.242 3.422 3.505 3.682 3.856 4.083 4.226 4.361 4.55 4.728 4.897 5.065 5.229 5.439 5.646 5.847 6.084 6.304 6.516 6.764 7.025 7.268 7.545 7.847 8.178 8.516 8.886 9.304 9.726 10.233 10.754 11.295 11.888 12.557 13.242 13.85 14.068 13.979 13.801 13.598 13.337 13.053 12.764 12.5 12.226 11.955 11.708 11.462 11.216 10.965 10.726 10.486 10.255 10.037 9.819 9.598 9.409 9.22 9.019 8.87 8.713 8.543 8.366 8.178 8.041 7.887 7.644 7.481 7.312 7.221 7.026 6.825 6.608 6.493 6.031 6.162 6.027 5.872 5.525 5.352 5.171 4.969 4.748 4.452 4.107 3.434 -9 ,32002 ,TETRA ,17590878,Sat Nov 27 21:24:13 CET,Sat Nov 27 23:34:50 CET,0.0 0.896 1.232 1.493 1.703 1.887 2.042 2.196 2.482 2.608 2.74 2.637 3.111 3.217 3.415 3.614 3.814 3.906 4.074 4.241 4.49 4.651 4.806 5.027 5.243 5.447 5.635 5.806 6.022 6.24 6.454 6.692 6.904 7.127 7.399 7.685 7.941 8.227 8.548 8.874 9.197 9.569 9.989 10.403 10.882 11.393 11.959 12.544 13.186 13.85 14.516 14.803 14.705 14.487 14.222 13.939 13.662 13.388 13.107 12.788 12.499 12.225 11.955 11.713 11.5 11.302 11.064 10.824 10.616 10.407 10.2 10.028 9.837 9.638 9.494 9.346 9.181 9.004 8.807 8.667 8.521 8.301 8.138 7.967 7.88 7.689 7.479 7.257 7.137 6.655 6.777 6.655 6.514 6.216 6.042 5.835 5.601 5.325 5.009 4.622 3.245 -10 ,19920 ,TETRA ,17590879,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:34:43 CET,0.0 1.138 1.555 1.891 2.153 2.399 2.613 2.816 3.185 3.346 3.498 3.397 3.873 3.981 4.19 4.393 4.578 4.667 4.85 5.028 5.29 5.45 5.593 5.799 6.0 6.191 6.389 6.593 6.839 7.058 7.263 7.503 7.724 7.937 8.181 8.465 8.747 9.069 9.404 9.74 10.085 10.452 10.866 11.288 11.763 12.245 12.832 13.482 14.11 14.74 15.297 15.444 15.327 15.085 14.791 14.484 14.161 13.83 13.543 13.232 12.939 12.694 12.466 12.224 11.994 11.776 11.53 11.319 11.128 10.935 10.737 10.542 10.331 10.148 10.008 9.844 9.666 9.473 9.272 9.138 8.989 8.744 8.582 8.413 8.327 8.151 7.962 7.745 7.631 7.158 7.262 7.132 6.996 6.688 6.507 6.303 6.078 5.828 5.545 5.134 4.046 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index d276ba54..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4061 ,TETRA ,17590880,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:36:03 CET,0.0 1.347 1.74 2.085 2.379 2.582 2.781 2.993 3.337 3.479 3.632 3.598 4.092 4.208 4.429 4.643 4.827 4.915 5.1 5.288 5.541 5.698 5.849 6.059 6.26 6.445 6.631 6.81 7.027 7.236 7.439 7.684 7.909 8.126 8.364 8.621 8.878 9.16 9.477 9.785 10.074 10.398 10.765 11.106 11.502 11.931 12.383 12.816 13.214 13.574 13.696 13.393 12.974 12.509 12.017 11.515 11.052 10.6 10.174 9.742 9.377 9.032 8.696 8.385 8.081 7.81 7.536 7.283 7.068 6.833 6.584 6.375 6.149 5.921 5.733 5.52 5.301 5.06 4.803 4.642 4.474 4.184 3.976 3.767 3.663 3.447 3.217 2.97 2.834 2.333 2.396 2.232 2.057 1.657 1.428 1.176 0.871 0.504 0.116 -0.37 -1.746 -2 ,10037 ,TETRA ,17590881,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:37:55 CET,0.0 1.058 1.501 1.823 2.1 2.313 2.506 2.698 3.04 3.199 3.363 3.314 3.801 3.926 4.177 4.387 4.579 4.676 4.851 5.007 5.249 5.415 5.573 5.799 6.009 6.212 6.411 6.603 6.855 7.099 7.328 7.579 7.806 8.024 8.257 8.524 8.785 9.071 9.37 9.666 9.969 10.296 10.65 11.006 11.4 11.817 12.272 12.696 13.09 13.358 13.397 13.056 12.548 12.029 11.49 10.937 10.424 9.947 9.524 9.086 8.696 8.341 7.996 7.666 7.348 7.059 6.764 6.494 6.243 5.979 5.728 5.519 5.296 5.06 4.878 4.701 4.506 4.298 4.086 3.934 3.775 3.503 3.301 3.098 2.996 2.785 2.562 2.318 2.196 1.715 1.781 1.609 1.438 1.097 0.919 0.699 0.452 0.2 -0.117 -0.616 -1.824 -3 ,14463 ,TETRA ,17590882,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:34:53 CET,0.0 1.561 2.025 2.367 2.653 2.901 3.148 3.379 3.753 3.94 4.115 4.039 4.535 4.674 4.944 5.177 5.395 5.504 5.7 5.887 6.151 6.325 6.484 6.704 6.923 7.133 7.329 7.519 7.772 8.027 8.27 8.56 8.843 9.101 9.38 9.674 9.937 10.215 10.497 10.796 11.13 11.479 11.815 12.145 12.519 12.937 13.374 13.761 14.119 14.423 14.569 14.274 13.768 13.239 12.729 12.198 11.663 11.19 10.798 10.344 9.929 9.587 9.262 8.942 8.631 8.344 8.049 7.802 7.578 7.326 7.073 6.86 6.627 6.387 6.194 5.972 5.745 5.507 5.249 5.079 4.916 4.659 4.472 4.282 4.19 3.983 3.743 3.474 3.332 2.83 2.889 2.74 2.578 2.216 2.014 1.776 1.478 1.167 0.852 0.392 -0.858 -4 ,19539 ,TETRA ,17590883,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:35:02 CET,0.0 1.889 2.357 2.703 2.946 3.162 3.369 3.559 3.905 4.058 4.206 4.129 4.625 4.762 5.027 5.267 5.477 5.574 5.748 5.899 6.134 6.292 6.44 6.64 6.834 7.033 7.224 7.41 7.644 7.858 8.047 8.261 8.478 8.685 8.917 9.179 9.441 9.712 9.997 10.293 10.566 10.878 11.258 11.631 12.04 12.424 12.819 13.209 13.564 13.9 14.047 13.82 13.393 12.884 12.366 11.869 11.402 10.951 10.565 10.157 9.771 9.431 9.112 8.79 8.495 8.219 7.922 7.661 7.436 7.184 6.894 6.659 6.43 6.189 6.004 5.804 5.581 5.355 5.124 4.961 4.785 4.51 4.32 4.126 4.029 3.831 3.602 3.356 3.242 2.752 2.816 2.667 2.502 2.144 1.953 1.757 1.55 1.268 0.904 0.428 -0.787 -5 ,29384 ,TETRA ,17590884,Sat Nov 27 21:23:17 CET,Sat Nov 27 23:34:34 CET,0.0 1.582 2.015 2.352 2.614 2.844 3.062 3.27 3.638 3.794 3.936 3.837 4.317 4.438 4.698 4.934 5.145 5.255 5.456 5.639 5.895 6.05 6.218 6.457 6.674 6.874 7.062 7.226 7.434 7.659 7.871 8.115 8.345 8.562 8.799 9.065 9.328 9.629 9.945 10.237 10.528 10.865 11.254 11.626 12.018 12.409 12.851 13.292 13.692 14.061 14.227 13.939 13.502 12.995 12.477 11.948 11.471 11.031 10.637 10.24 9.877 9.534 9.212 8.902 8.586 8.305 8.017 7.747 7.503 7.245 6.978 6.755 6.52 6.286 6.107 5.916 5.699 5.463 5.225 5.066 4.907 4.641 4.453 4.255 4.147 3.913 3.671 3.435 3.295 2.794 2.854 2.691 2.529 2.184 1.977 1.746 1.512 1.234 0.904 0.485 -0.721 -6 ,18056 ,TETRA ,17590885,Sat Nov 27 21:24:13 CET,Sat Nov 27 23:33:31 CET,0.0 1.529 2.038 2.413 2.714 2.954 3.164 3.358 3.708 3.876 4.046 3.987 4.471 4.591 4.812 5.014 5.2 5.292 5.466 5.634 5.884 6.038 6.195 6.439 6.663 6.864 7.054 7.25 7.51 7.74 7.944 8.183 8.403 8.616 8.877 9.184 9.477 9.768 10.066 10.4 10.748 11.12 11.519 11.9 12.269 12.649 13.075 13.487 13.918 14.323 14.492 14.116 13.537 12.93 12.398 11.881 11.395 10.923 10.494 10.064 9.689 9.331 8.977 8.651 8.344 8.056 7.756 7.481 7.225 6.956 6.676 6.457 6.222 5.942 5.715 5.481 5.24 4.996 4.74 4.559 4.388 4.13 3.945 3.756 3.658 3.435 3.188 2.925 2.784 2.277 2.326 2.152 1.969 1.567 1.345 1.119 0.851 0.548 0.226 -0.2 -1.495 -7 ,398 ,TETRA ,17590886,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:35:30 CET,0.0 1.391 1.858 2.149 2.403 2.654 2.849 3.039 3.405 3.581 3.741 3.661 4.15 4.267 4.469 4.668 4.847 4.937 5.131 5.32 5.574 5.722 5.873 6.1 6.306 6.503 6.692 6.879 7.107 7.312 7.51 7.759 8.005 8.248 8.515 8.798 9.059 9.333 9.614 9.909 10.219 10.545 10.908 11.269 11.666 12.087 12.524 12.951 13.407 13.732 13.826 13.612 13.131 12.584 12.047 11.556 11.102 10.647 10.253 9.835 9.442 9.116 8.814 8.504 8.212 7.946 7.648 7.387 7.158 6.919 6.675 6.472 6.24 5.986 5.811 5.624 5.413 5.207 4.985 4.82 4.661 4.411 4.229 4.036 3.936 3.726 3.503 3.261 3.129 2.646 2.737 2.581 2.417 2.068 1.866 1.66 1.426 1.142 0.85 0.474 -0.55 -8 ,25676 ,TETRA ,17590887,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:35:33 CET,0.0 1.704 2.177 2.543 2.874 3.147 3.393 3.625 4.03 4.222 4.396 4.32 4.817 4.959 5.223 5.425 5.629 5.738 5.945 6.144 6.425 6.592 6.762 7.003 7.228 7.436 7.616 7.793 8.023 8.247 8.464 8.734 8.983 9.221 9.496 9.774 10.033 10.32 10.63 10.965 11.298 11.665 12.069 12.439 12.858 13.301 13.76 14.195 14.584 14.904 14.97 14.642 14.155 13.577 13.006 12.49 12.01 11.558 11.163 10.738 10.352 10.002 9.666 9.349 9.049 8.779 8.508 8.253 8.031 7.775 7.49 7.269 7.047 6.815 6.629 6.426 6.218 5.999 5.753 5.595 5.44 5.178 4.993 4.807 4.711 4.496 4.256 4.016 3.891 3.392 3.448 3.295 3.137 2.75 2.531 2.327 2.107 1.849 1.546 1.094 -0.204 -9 ,26916 ,TETRA ,17590888,Sat Nov 27 21:24:13 CET,Sat Nov 27 23:34:17 CET,0.0 1.476 1.874 2.192 2.434 2.662 2.864 3.05 3.345 3.488 3.635 3.537 4.02 4.139 4.354 4.551 4.748 4.839 4.998 5.168 5.435 5.585 5.718 5.919 6.13 6.322 6.499 6.681 6.905 7.131 7.361 7.62 7.847 8.058 8.316 8.589 8.837 9.102 9.381 9.681 9.986 10.321 10.708 11.101 11.524 11.891 12.274 12.688 13.088 13.435 13.535 13.264 12.808 12.24 11.714 11.245 10.818 10.371 9.949 9.515 9.155 8.851 8.548 8.259 7.986 7.697 7.367 7.08 6.847 6.614 6.336 6.094 5.867 5.647 5.461 5.249 5.03 4.808 4.573 4.411 4.256 4.017 3.83 3.619 3.517 3.308 3.067 2.805 2.673 2.187 2.287 2.148 2.0 1.633 1.417 1.183 0.93 0.639 0.276 -0.218 -1.245 -10 ,18647 ,TETRA ,17590889,Sat Nov 27 21:24:13 CET,Sat Nov 27 23:39:45 CET,0.0 1.079 1.502 1.845 2.122 2.412 2.68 2.871 3.201 3.351 3.497 3.424 3.902 4.023 4.258 4.474 4.675 4.772 4.95 5.12 5.367 5.517 5.657 5.859 6.046 6.24 6.431 6.602 6.817 7.015 7.207 7.431 7.628 7.832 8.068 8.326 8.572 8.832 9.113 9.387 9.687 10.023 10.374 10.729 11.135 11.574 12.049 12.459 12.862 13.212 13.225 12.82 12.326 11.825 11.323 10.825 10.361 9.931 9.584 9.211 8.87 8.57 8.266 7.944 7.637 7.368 7.085 6.808 6.565 6.327 6.067 5.839 5.596 5.344 5.151 4.952 4.743 4.534 4.315 4.162 4.001 3.748 3.581 3.404 3.309 3.115 2.909 2.667 2.536 2.049 2.15 2.004 1.854 1.526 1.327 1.108 0.861 0.559 0.215 -0.228 -1.18 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt deleted file mode 100644 index f65c1a19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20682 ,TETRA ,17590890,Sat Nov 27 21:24:13 CET,Sat Nov 27 23:37:48 CET,0.0 0.889 1.315 1.648 1.891 2.107 2.313 2.504 2.885 3.058 3.208 3.103 3.579 3.706 3.949 4.164 4.372 4.478 4.68 4.859 5.129 5.311 5.464 5.671 5.874 6.074 6.271 6.476 6.738 6.962 7.158 7.382 7.593 7.787 8.008 8.255 8.491 8.779 9.087 9.378 9.657 10.001 10.421 10.774 11.161 11.58 11.983 12.402 12.832 13.059 12.929 12.42 11.798 11.172 10.587 10.032 9.539 9.052 8.596 8.143 7.748 7.37 7.003 6.67 6.35 6.046 5.712 5.419 5.153 4.866 4.561 4.299 4.049 3.779 3.546 3.321 3.106 2.865 2.598 2.421 2.238 1.924 1.694 1.46 1.343 1.109 0.845 0.556 0.407 -0.113 -0.073 -0.246 -0.432 -0.83 -1.057 -1.299 -1.556 -1.863 -2.261 -2.824 -4.754 -2 ,18623 ,TETRA ,17590891,Sat Nov 27 21:24:15 CET,Sat Nov 27 23:36:02 CET,0.0 1.267 1.735 2.034 2.279 2.53 2.75 2.937 3.325 3.508 3.656 3.567 4.044 4.159 4.404 4.635 4.824 4.919 5.099 5.269 5.508 5.657 5.806 6.021 6.236 6.451 6.658 6.844 7.073 7.302 7.522 7.77 8.011 8.259 8.534 8.829 9.126 9.443 9.752 10.05 10.358 10.699 11.093 11.491 11.928 12.373 12.824 13.249 13.658 13.995 13.96 13.361 12.716 12.077 11.437 10.818 10.247 9.703 9.209 8.709 8.282 7.907 7.567 7.24 6.918 6.621 6.297 6.003 5.746 5.467 5.186 4.943 4.694 4.437 4.218 3.98 3.737 3.486 3.228 3.049 2.857 2.558 2.35 2.125 2.011 1.785 1.517 1.215 1.071 0.579 0.653 0.483 0.291 -0.136 -0.371 -0.615 -0.877 -1.175 -1.58 -2.128 -3.78 -3 ,8923 ,TETRA ,17590892,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:35:34 CET,0.0 0.955 1.423 1.829 2.178 2.463 2.681 2.873 3.242 3.416 3.581 3.505 3.986 4.112 4.365 4.58 4.783 4.898 5.105 5.277 5.523 5.689 5.847 6.075 6.293 6.497 6.684 6.856 7.089 7.305 7.513 7.768 7.999 8.221 8.475 8.738 8.988 9.264 9.547 9.849 10.157 10.496 10.88 11.23 11.616 12.006 12.389 12.765 13.086 13.267 13.222 12.772 12.122 11.438 10.816 10.186 9.607 9.103 8.655 8.175 7.76 7.397 7.035 6.68 6.341 6.032 5.704 5.389 5.112 4.828 4.533 4.309 4.074 3.801 3.578 3.358 3.138 2.897 2.634 2.452 2.278 1.994 1.783 1.563 1.449 1.233 1.0 0.736 0.601 0.102 0.155 0.003 -0.148 -0.52 -0.744 -0.981 -1.243 -1.576 -1.971 -2.466 -4.004 -4 ,32635 ,TETRA ,17590893,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:40:12 CET,0.0 1.368 1.802 2.157 2.489 2.76 2.999 3.212 3.544 3.688 3.821 3.713 4.201 4.332 4.57 4.765 4.957 5.056 5.235 5.407 5.668 5.826 5.975 6.185 6.39 6.587 6.765 6.943 7.191 7.417 7.621 7.869 8.093 8.292 8.52 8.778 9.033 9.312 9.59 9.884 10.21 10.55 10.897 11.208 11.565 11.988 12.432 12.839 13.224 13.515 13.511 13.037 12.468 11.866 11.211 10.569 9.994 9.475 9.037 8.606 8.207 7.827 7.451 7.094 6.776 6.463 6.103 5.793 5.532 5.243 4.942 4.715 4.489 4.234 4.031 3.811 3.574 3.343 3.093 2.907 2.718 2.42 2.209 1.991 1.881 1.662 1.437 1.188 1.045 0.527 0.538 0.367 0.19 -0.225 -0.469 -0.722 -1.03 -1.375 -1.738 -2.266 -4.989 -5 ,9322 ,TETRA ,17590894,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:37:59 CET,0.0 1.285 1.649 1.908 2.142 2.385 2.604 2.812 3.168 3.319 3.464 3.386 3.878 4.01 4.237 4.451 4.676 4.784 4.986 5.179 5.447 5.61 5.771 5.992 6.189 6.388 6.595 6.775 6.97 7.163 7.362 7.609 7.839 8.05 8.294 8.558 8.818 9.102 9.402 9.715 10.017 10.344 10.729 11.078 11.423 11.795 12.216 12.624 13.061 13.412 13.38 12.916 12.294 11.671 11.071 10.501 9.974 9.455 8.985 8.521 8.099 7.709 7.356 7.01 6.663 6.349 6.033 5.749 5.501 5.243 4.972 4.75 4.519 4.252 4.033 3.813 3.597 3.366 3.113 2.941 2.76 2.472 2.276 2.072 1.964 1.745 1.514 1.255 1.113 0.605 0.64 0.489 0.333 -0.027 -0.229 -0.453 -0.71 -1.021 -1.373 -1.87 -3.277 -6 ,1255 ,TETRA ,17590895,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:36:38 CET,0.0 1.723 2.2 2.54 2.835 3.091 3.336 3.564 3.92 4.088 4.247 4.143 4.617 4.726 4.95 5.166 5.361 5.452 5.632 5.812 6.054 6.209 6.367 6.584 6.785 6.979 7.16 7.329 7.552 7.772 7.973 8.213 8.45 8.663 8.888 9.148 9.399 9.656 9.921 10.199 10.505 10.863 11.242 11.581 11.98 12.385 12.782 13.175 13.517 13.797 13.875 13.404 12.664 11.913 11.203 10.537 9.965 9.443 8.987 8.5 8.045 7.651 7.287 6.935 6.594 6.263 5.931 5.642 5.375 5.092 4.808 4.58 4.336 4.068 3.851 3.623 3.401 3.172 2.921 2.737 2.542 2.227 1.994 1.75 1.621 1.369 1.106 0.822 0.678 0.176 0.217 0.033 -0.157 -0.544 -0.766 -1.034 -1.34 -1.664 -2.022 -2.531 -4.558 -7 ,24394 ,TETRA ,17590896,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:38:06 CET,0.0 1.472 2.033 2.416 2.73 2.985 3.22 3.42 3.77 3.928 4.081 4.009 4.502 4.635 4.88 5.102 5.31 5.409 5.61 5.804 6.07 6.24 6.389 6.619 6.856 7.06 7.253 7.446 7.693 7.921 8.131 8.385 8.632 8.858 9.112 9.402 9.659 9.92 10.203 10.493 10.793 11.12 11.485 11.836 12.208 12.589 12.992 13.409 13.802 14.044 13.968 13.469 12.85 12.213 11.601 11.009 10.492 10.013 9.561 9.092 8.682 8.289 7.904 7.556 7.235 6.944 6.649 6.378 6.136 5.868 5.56 5.3 5.048 4.787 4.574 4.368 4.157 3.917 3.655 3.483 3.309 3.01 2.796 2.582 2.476 2.252 2.008 1.755 1.62 1.118 1.157 0.986 0.806 0.431 0.232 0.001 -0.246 -0.522 -0.838 -1.334 -3.006 -8 ,17754 ,TETRA ,17590897,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:35:21 CET,0.0 1.222 1.704 2.018 2.305 2.577 2.785 2.997 3.393 3.56 3.706 3.634 4.109 4.221 4.427 4.625 4.826 4.921 5.097 5.258 5.489 5.647 5.807 6.03 6.222 6.401 6.588 6.776 7.002 7.201 7.394 7.625 7.83 8.022 8.248 8.517 8.788 9.062 9.329 9.61 9.917 10.249 10.618 10.981 11.356 11.749 12.162 12.595 12.996 13.276 13.307 12.889 12.356 11.769 11.17 10.591 10.056 9.546 9.086 8.622 8.212 7.822 7.456 7.119 6.784 6.474 6.142 5.834 5.576 5.305 5.02 4.795 4.557 4.305 4.106 3.894 3.671 3.438 3.185 2.996 2.797 2.492 2.295 2.091 1.977 1.751 1.52 1.264 1.126 0.626 0.685 0.513 0.333 -0.023 -0.233 -0.483 -0.752 -1.044 -1.382 -1.885 -4.068 -9 ,9267 ,TETRA ,17590898,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:35:41 CET,0.0 1.203 1.673 2.046 2.347 2.599 2.85 3.057 3.403 3.586 3.756 3.691 4.176 4.286 4.487 4.689 4.885 4.982 5.178 5.341 5.554 5.703 5.856 6.077 6.287 6.481 6.666 6.842 7.076 7.303 7.515 7.751 7.958 8.17 8.421 8.672 8.908 9.166 9.42 9.704 10.022 10.344 10.699 11.06 11.447 11.819 12.172 12.499 12.784 13.026 13.065 12.581 11.94 11.311 10.705 10.107 9.566 9.073 8.65 8.207 7.804 7.432 7.073 6.736 6.415 6.118 5.804 5.518 5.266 5.01 4.743 4.506 4.258 4.003 3.815 3.601 3.358 3.115 2.865 2.69 2.505 2.203 1.993 1.773 1.658 1.436 1.202 0.943 0.802 0.296 0.351 0.194 0.021 -0.374 -0.598 -0.865 -1.15 -1.47 -1.86 -2.369 -3.982 -10 ,13305 ,TETRA ,17590899,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:39:02 CET,0.0 1.282 1.684 1.986 2.272 2.529 2.744 2.95 3.338 3.517 3.687 3.607 4.094 4.214 4.415 4.613 4.811 4.91 5.11 5.306 5.57 5.725 5.867 6.085 6.29 6.48 6.674 6.856 7.08 7.292 7.493 7.737 7.967 8.184 8.422 8.664 8.903 9.162 9.44 9.742 10.053 10.384 10.754 11.129 11.521 11.919 12.367 12.782 13.141 13.385 13.342 12.786 12.111 11.418 10.75 10.164 9.634 9.129 8.67 8.178 7.722 7.28 6.86 6.484 6.16 5.857 5.522 5.219 4.957 4.685 4.386 4.13 3.86 3.583 3.375 3.158 2.927 2.69 2.441 2.275 2.103 1.823 1.632 1.437 1.332 1.114 0.889 0.634 0.499 0.003 0.06 -0.12 -0.307 -0.696 -0.91 -1.153 -1.429 -1.722 -2.121 -2.609 -4.368 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index a23ffe81..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14395 ,TETRA ,17590900,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:42:56 CET,0.0 0.706 1.058 1.373 1.662 1.893 2.065 2.244 2.557 2.691 2.829 2.734 3.211 3.324 3.535 3.735 3.928 4.015 4.182 4.35 4.597 4.754 4.897 5.11 5.318 5.524 5.724 5.91 6.149 6.38 6.59 6.853 7.106 7.341 7.623 7.911 8.187 8.513 8.858 9.211 9.573 9.968 10.427 10.88 11.418 12.012 12.663 13.357 14.104 14.931 15.781 16.208 16.298 16.226 16.043 15.818 15.585 15.337 15.087 14.802 14.537 14.277 14.029 13.821 13.614 13.416 13.201 12.999 12.818 12.617 12.4 12.218 12.026 11.808 11.646 11.481 11.295 11.107 10.912 10.773 10.623 10.37 10.201 10.039 9.951 9.759 9.556 9.337 9.22 8.746 8.844 8.712 8.571 8.241 8.046 7.838 7.621 7.372 7.055 6.645 5.299 -2 ,19857 ,TETRA ,17590901,Sat Nov 27 21:24:17 CET,Sat Nov 27 23:41:56 CET,0.0 0.886 1.274 1.543 1.756 1.961 2.142 2.312 2.635 2.774 2.919 2.822 3.297 3.409 3.625 3.832 4.026 4.115 4.279 4.45 4.71 4.873 5.026 5.247 5.447 5.639 5.824 6.009 6.251 6.478 6.693 6.939 7.171 7.398 7.672 7.977 8.256 8.553 8.879 9.242 9.624 10.045 10.52 10.972 11.479 12.041 12.691 13.415 14.196 15.012 15.826 16.275 16.404 16.357 16.228 16.043 15.808 15.567 15.343 15.066 14.817 14.618 14.398 14.152 13.929 13.72 13.48 13.268 13.091 12.896 12.687 12.508 12.302 12.096 11.947 11.793 11.635 11.462 11.266 11.129 10.988 10.759 10.582 10.383 10.281 10.092 9.889 9.643 9.517 9.037 9.117 8.967 8.808 8.47 8.285 8.075 7.822 7.529 7.202 6.832 5.86 -3 ,32221 ,TETRA ,17590902,Sat Nov 27 21:24:15 CET,Sat Nov 27 23:36:10 CET,0.0 0.676 0.999 1.282 1.506 1.689 1.846 1.985 2.261 2.397 2.522 2.389 2.85 2.962 3.173 3.36 3.529 3.612 3.776 3.925 4.15 4.301 4.442 4.645 4.845 5.028 5.217 5.408 5.653 5.884 6.097 6.377 6.64 6.876 7.148 7.459 7.763 8.077 8.411 8.791 9.176 9.588 10.062 10.514 11.026 11.594 12.273 13.053 13.862 14.682 15.589 16.168 16.264 16.157 15.977 15.742 15.494 15.213 14.943 14.66 14.409 14.173 13.938 13.724 13.513 13.288 13.031 12.798 12.603 12.409 12.209 12.033 11.837 11.626 11.472 11.317 11.127 10.932 10.74 10.607 10.468 10.249 10.094 9.928 9.84 9.661 9.468 9.261 9.149 8.676 8.769 8.622 8.46 8.114 7.919 7.708 7.485 7.24 6.893 6.45 5.188 -4 ,15758 ,TETRA ,17590903,Sat Nov 27 21:24:18 CET,Sat Nov 27 23:36:09 CET,0.0 0.551 0.837 1.071 1.268 1.456 1.628 1.776 2.043 2.176 2.31 2.195 2.664 2.785 3.018 3.227 3.419 3.512 3.698 3.859 4.094 4.255 4.402 4.608 4.805 4.996 5.191 5.375 5.613 5.839 6.051 6.299 6.533 6.762 7.019 7.309 7.588 7.888 8.23 8.593 8.967 9.376 9.842 10.308 10.836 11.433 12.118 12.852 13.653 14.539 15.416 15.873 15.949 15.9 15.756 15.527 15.3 15.071 14.845 14.577 14.312 14.071 13.834 13.611 13.39 13.196 13.003 12.811 12.639 12.448 12.24 12.067 11.877 11.679 11.527 11.372 11.204 11.018 10.827 10.692 10.545 10.306 10.128 9.933 9.832 9.643 9.454 9.239 9.12 8.642 8.731 8.579 8.414 8.047 7.86 7.658 7.405 7.125 6.843 6.404 4.809 -5 ,6786 ,TETRA ,17590904,Sat Nov 27 21:24:16 CET,Sat Nov 27 23:36:30 CET,0.0 0.812 1.082 1.321 1.524 1.687 1.845 2.021 2.353 2.488 2.617 2.493 2.966 3.073 3.273 3.484 3.698 3.792 3.965 4.129 4.363 4.514 4.654 4.857 5.062 5.258 5.436 5.604 5.82 6.023 6.232 6.49 6.721 6.955 7.226 7.517 7.795 8.097 8.437 8.789 9.134 9.511 9.944 10.372 10.884 11.443 12.086 12.792 13.549 14.375 15.216 15.723 15.872 15.836 15.722 15.55 15.333 15.086 14.858 14.613 14.374 14.151 13.934 13.713 13.493 13.298 13.101 12.912 12.756 12.582 12.387 12.227 12.04 11.847 11.691 11.519 11.363 11.211 11.03 10.893 10.75 10.534 10.381 10.217 10.14 9.982 9.786 9.572 9.467 9.008 9.133 8.999 8.862 8.554 8.379 8.192 7.975 7.735 7.411 6.962 5.918 -6 ,20617 ,TETRA ,17590905,Sat Nov 27 21:24:15 CET,Sat Nov 27 23:41:47 CET,0.0 0.773 1.089 1.326 1.534 1.716 1.882 2.043 2.336 2.471 2.597 2.479 2.958 3.064 3.28 3.502 3.703 3.799 3.988 4.17 4.419 4.571 4.73 4.95 5.151 5.342 5.53 5.706 5.931 6.156 6.382 6.649 6.898 7.139 7.413 7.72 8.007 8.323 8.651 8.999 9.37 9.78 10.237 10.677 11.197 11.766 12.401 13.079 13.859 14.711 15.521 15.979 16.022 15.879 15.695 15.444 15.194 14.941 14.673 14.404 14.153 13.92 13.712 13.504 13.281 13.073 12.872 12.679 12.497 12.303 12.084 11.894 11.695 11.486 11.333 11.18 11.014 10.828 10.624 10.478 10.332 10.086 9.907 9.732 9.643 9.446 9.248 9.048 8.936 8.473 8.561 8.403 8.247 7.924 7.729 7.505 7.292 7.058 6.774 6.404 5.347 -7 ,23766 ,TETRA ,17590906,Sat Nov 27 21:24:16 CET,Sat Nov 27 23:35:38 CET,0.0 1.079 1.378 1.601 1.791 1.986 2.195 2.38 2.682 2.816 2.934 2.804 3.28 3.39 3.584 3.775 3.957 4.049 4.223 4.38 4.608 4.758 4.899 5.111 5.316 5.505 5.694 5.87 6.081 6.29 6.495 6.731 6.96 7.188 7.447 7.737 8.021 8.355 8.706 9.052 9.411 9.811 10.282 10.742 11.238 11.783 12.429 13.143 13.917 14.713 15.488 15.918 16.038 15.976 15.775 15.523 15.253 14.971 14.683 14.372 14.097 13.842 13.587 13.332 13.07 12.825 12.584 12.359 12.153 11.934 11.702 11.503 11.291 11.075 10.897 10.724 10.553 10.361 10.18 10.05 9.899 9.667 9.504 9.328 9.239 9.048 8.839 8.626 8.517 8.056 8.136 7.984 7.846 7.531 7.331 7.112 6.892 6.65 6.368 5.899 4.453 -8 ,14342 ,TETRA ,17590907,Sat Nov 27 21:25:12 CET,Sat Nov 27 23:38:30 CET,0.0 1.297 1.697 1.973 2.211 2.409 2.571 2.741 3.065 3.212 3.353 3.23 3.707 3.824 4.035 4.238 4.438 4.536 4.721 4.901 5.161 5.321 5.468 5.68 5.894 6.098 6.279 6.444 6.671 6.906 7.14 7.421 7.701 7.979 8.258 8.54 8.804 9.089 9.415 9.759 10.104 10.494 10.951 11.406 11.924 12.502 13.143 13.835 14.627 15.482 16.377 16.925 17.068 17.038 16.887 16.643 16.369 16.096 15.84 15.591 15.379 15.153 14.915 14.683 14.463 14.249 14.013 13.804 13.619 13.42 13.216 13.046 12.851 12.621 12.456 12.295 12.113 11.924 11.739 11.616 11.478 11.243 11.07 10.889 10.799 10.609 10.409 10.192 10.082 9.607 9.673 9.523 9.377 9.068 8.879 8.665 8.459 8.214 7.893 7.457 6.186 -9 ,27119 ,TETRA ,17590908,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:38:11 CET,0.0 0.676 1.048 1.306 1.52 1.735 1.939 2.123 2.459 2.601 2.724 2.613 3.099 3.214 3.433 3.629 3.824 3.926 4.109 4.286 4.554 4.722 4.881 5.102 5.309 5.515 5.717 5.905 6.147 6.395 6.649 6.93 7.167 7.401 7.681 7.992 8.277 8.588 8.918 9.276 9.66 10.073 10.543 10.993 11.499 12.061 12.683 13.371 14.15 15.018 15.907 16.371 16.433 16.309 16.147 15.933 15.686 15.452 15.218 14.956 14.693 14.435 14.182 13.948 13.729 13.508 13.275 13.065 12.877 12.671 12.446 12.254 12.057 11.852 11.684 11.509 11.319 11.12 10.918 10.762 10.599 10.349 10.167 9.975 9.877 9.677 9.463 9.233 9.108 8.62 8.678 8.508 8.338 7.979 7.772 7.557 7.336 7.07 6.698 6.228 4.729 -10 ,967 ,TETRA ,17590909,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:40:09 CET,0.0 0.607 0.954 1.217 1.449 1.674 1.862 2.023 2.334 2.472 2.61 2.508 2.995 3.12 3.354 3.555 3.734 3.829 4.015 4.184 4.411 4.561 4.706 4.921 5.127 5.321 5.509 5.694 5.947 6.181 6.39 6.634 6.87 7.11 7.384 7.682 7.968 8.276 8.6 8.93 9.302 9.713 10.177 10.644 11.171 11.759 12.413 13.122 13.924 14.813 15.682 16.217 16.371 16.334 16.175 15.939 15.733 15.528 15.263 14.972 14.752 14.544 14.324 14.101 13.893 13.706 13.51 13.298 13.105 12.917 12.72 12.564 12.381 12.169 12.009 11.851 11.694 11.52 11.33 11.19 11.038 10.802 10.635 10.463 10.376 10.187 9.978 9.777 9.674 9.21 9.316 9.181 9.037 8.712 8.528 8.327 8.083 7.807 7.513 7.137 5.67 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index a5fab52a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2225 ,TETRA ,17590910,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:38:46 CET,0.0 1.549 2.112 2.553 2.867 3.137 3.376 3.583 3.988 4.185 4.359 4.308 4.815 4.947 5.2 5.454 5.69 5.796 5.988 6.169 6.43 6.599 6.761 6.988 7.197 7.405 7.61 7.796 8.034 8.264 8.47 8.709 8.932 9.142 9.401 9.687 9.936 10.204 10.494 10.784 11.066 11.4 11.8 12.178 12.586 13.046 13.573 14.107 14.663 15.171 15.457 15.376 15.068 14.664 14.255 13.813 13.378 12.965 12.592 12.214 11.877 11.569 11.283 10.997 10.715 10.444 10.15 9.887 9.659 9.422 9.179 8.975 8.749 8.507 8.326 8.124 7.9 7.667 7.441 7.286 7.119 6.873 6.69 6.494 6.396 6.197 5.996 5.773 5.647 5.164 5.232 5.071 4.911 4.576 4.402 4.193 3.935 3.668 3.351 2.87 1.095 -2 ,22331 ,TETRA ,17590911,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:38:54 CET,0.0 0.871 1.325 1.695 1.992 2.244 2.474 2.664 2.987 3.138 3.285 3.183 3.669 3.804 4.053 4.289 4.496 4.595 4.802 4.988 5.228 5.384 5.536 5.766 5.995 6.192 6.386 6.574 6.809 7.039 7.257 7.52 7.775 8.021 8.312 8.655 8.966 9.279 9.604 9.94 10.29 10.674 11.126 11.586 12.099 12.602 13.122 13.668 14.201 14.686 15.028 14.975 14.679 14.298 13.883 13.436 13.03 12.655 12.309 11.933 11.583 11.261 10.944 10.643 10.376 10.121 9.837 9.577 9.348 9.131 8.902 8.697 8.482 8.253 8.068 7.871 7.681 7.479 7.261 7.111 6.95 6.658 6.463 6.277 6.173 5.969 5.755 5.53 5.404 4.905 4.982 4.813 4.643 4.301 4.105 3.881 3.626 3.339 2.977 2.46 1.105 -3 ,27975 ,TETRA ,17590912,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:36:51 CET,0.0 1.276 1.669 1.985 2.278 2.535 2.774 2.978 3.325 3.493 3.653 3.593 4.088 4.215 4.457 4.686 4.901 5.002 5.197 5.375 5.616 5.772 5.929 6.162 6.379 6.575 6.77 6.965 7.206 7.43 7.636 7.884 8.129 8.365 8.648 8.958 9.236 9.545 9.873 10.22 10.574 10.956 11.389 11.797 12.251 12.73 13.249 13.802 14.356 14.901 15.269 15.234 14.979 14.61 14.225 13.811 13.397 13.028 12.687 12.325 12.009 11.685 11.366 11.064 10.767 10.519 10.256 10.001 9.771 9.512 9.251 9.044 8.811 8.578 8.409 8.21 7.991 7.785 7.575 7.417 7.237 6.95 6.761 6.57 6.467 6.246 6.009 5.769 5.647 5.156 5.216 5.057 4.894 4.518 4.293 4.041 3.745 3.403 3.037 2.54 0.449 -4 ,28524 ,TETRA ,17590913,Sat Nov 27 21:25:15 CET,Sat Nov 27 23:37:37 CET,0.0 1.309 1.783 2.116 2.365 2.549 2.744 2.948 3.324 3.481 3.627 3.554 4.046 4.17 4.394 4.61 4.811 4.909 5.092 5.264 5.516 5.669 5.818 6.048 6.248 6.425 6.602 6.767 6.976 7.188 7.396 7.633 7.857 8.075 8.337 8.617 8.86 9.125 9.422 9.743 10.06 10.409 10.803 11.2 11.65 12.103 12.585 13.071 13.603 14.118 14.442 14.362 14.068 13.725 13.347 12.964 12.617 12.244 11.901 11.563 11.268 10.999 10.724 10.437 10.168 9.928 9.673 9.432 9.209 8.988 8.755 8.551 8.334 8.099 7.924 7.747 7.555 7.341 7.115 6.969 6.805 6.532 6.345 6.16 6.067 5.854 5.614 5.382 5.258 4.768 4.844 4.692 4.515 4.116 3.901 3.644 3.375 3.076 2.686 2.195 0.184 -5 ,17463 ,TETRA ,17590914,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:41:02 CET,0.0 1.259 1.717 2.042 2.308 2.535 2.762 2.968 3.302 3.451 3.599 3.524 4.005 4.118 4.336 4.561 4.784 4.88 5.066 5.246 5.504 5.677 5.844 6.088 6.315 6.52 6.717 6.905 7.135 7.358 7.576 7.838 8.078 8.306 8.568 8.847 9.12 9.411 9.714 10.041 10.377 10.757 11.207 11.635 12.108 12.598 13.129 13.668 14.179 14.671 15.015 15.016 14.767 14.383 13.997 13.618 13.242 12.864 12.518 12.154 11.809 11.475 11.151 10.849 10.563 10.302 10.033 9.778 9.547 9.304 9.057 8.853 8.639 8.405 8.218 8.036 7.841 7.634 7.428 7.281 7.114 6.836 6.639 6.44 6.338 6.117 5.876 5.619 5.493 4.999 5.022 4.838 4.655 4.304 4.11 3.883 3.607 3.299 2.942 2.437 0.672 -6 ,4356 ,TETRA ,17590915,Sat Nov 27 21:25:15 CET,Sat Nov 27 23:42:53 CET,0.0 1.456 1.893 2.258 2.551 2.794 3.01 3.205 3.569 3.747 3.906 3.833 4.325 4.453 4.703 4.904 5.094 5.193 5.382 5.555 5.825 6.016 6.189 6.42 6.639 6.855 7.066 7.26 7.51 7.747 7.971 8.229 8.471 8.704 8.982 9.295 9.596 9.93 10.273 10.636 10.983 11.362 11.818 12.237 12.674 13.112 13.561 14.051 14.634 15.119 15.382 15.3 14.995 14.61 14.175 13.72 13.295 12.891 12.525 12.12 11.751 11.421 11.109 10.805 10.518 10.269 9.991 9.722 9.498 9.276 9.039 8.831 8.605 8.382 8.208 8.014 7.804 7.591 7.383 7.24 7.086 6.826 6.636 6.45 6.358 6.144 5.905 5.66 5.524 5.026 5.088 4.928 4.763 4.37 4.148 3.897 3.603 3.263 2.914 2.405 0.497 -7 ,15002 ,TETRA ,17590916,Sat Nov 27 21:25:14 CET,Sat Nov 27 23:44:32 CET,0.0 1.537 1.994 2.342 2.621 2.868 3.088 3.296 3.642 3.799 3.947 3.853 4.35 4.489 4.743 4.976 5.188 5.284 5.467 5.644 5.908 6.083 6.239 6.443 6.64 6.853 7.056 7.234 7.45 7.652 7.854 8.104 8.346 8.576 8.826 9.099 9.359 9.635 9.925 10.23 10.575 10.975 11.406 11.797 12.221 12.688 13.189 13.7 14.262 14.78 15.048 14.917 14.645 14.319 13.942 13.539 13.154 12.794 12.478 12.146 11.847 11.56 11.24 10.92 10.662 10.423 10.135 9.859 9.645 9.446 9.23 9.053 8.852 8.638 8.47 8.267 8.055 7.849 7.644 7.501 7.324 7.027 6.828 6.63 6.53 6.32 6.081 5.81 5.672 5.163 5.215 5.058 4.898 4.511 4.263 3.997 3.702 3.376 3.012 2.537 0.418 -8 ,10493 ,TETRA ,17590917,Sat Nov 27 21:48:16 CET,Sun Nov 28 00:04:07 CET,0.0 2.133 2.652 3.014 3.321 3.574 3.794 3.996 4.372 4.55 4.709 4.625 5.115 5.248 5.495 5.721 5.926 6.028 6.24 6.44 6.708 6.879 7.038 7.281 7.522 7.746 7.974 8.193 8.477 8.776 9.046 9.323 9.586 9.837 10.11 10.402 10.668 10.964 11.307 11.659 12.007 12.376 12.775 13.175 13.651 14.169 14.709 15.271 15.862 16.403 16.751 16.745 16.468 16.087 15.707 15.275 14.85 14.467 14.109 13.712 13.34 13.007 12.691 12.395 12.132 11.897 11.645 11.391 11.152 10.902 10.646 10.432 10.196 9.95 9.757 9.552 9.327 9.079 8.825 8.65 8.47 8.191 8.002 7.805 7.703 7.495 7.269 7.011 6.865 6.368 6.441 6.285 6.097 5.673 5.432 5.177 4.904 4.586 4.193 3.682 1.75 -9 ,18205 ,TETRA ,17590918,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:40:59 CET,0.0 1.373 1.97 2.391 2.705 2.928 3.126 3.335 3.744 3.918 4.081 4.012 4.503 4.63 4.848 5.043 5.242 5.344 5.549 5.74 6.012 6.188 6.356 6.578 6.777 6.981 7.17 7.346 7.576 7.787 7.994 8.242 8.462 8.68 8.973 9.3 9.588 9.901 10.221 10.551 10.906 11.297 11.71 12.111 12.552 13.009 13.511 14.017 14.531 15.052 15.436 15.344 15.005 14.619 14.243 13.814 13.399 13.028 12.683 12.323 12.014 11.726 11.436 11.146 10.881 10.646 10.379 10.141 9.921 9.678 9.43 9.21 8.986 8.761 8.576 8.391 8.202 7.997 7.788 7.635 7.471 7.19 6.99 6.794 6.695 6.493 6.264 6.021 5.888 5.393 5.453 5.284 5.109 4.709 4.487 4.264 4.025 3.729 3.382 2.852 1.192 -10 ,26315 ,TETRA ,17590919,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:37:53 CET,0.0 1.241 1.712 2.071 2.362 2.607 2.836 3.065 3.486 3.661 3.822 3.743 4.233 4.364 4.616 4.852 5.073 5.179 5.376 5.559 5.81 5.967 6.13 6.369 6.583 6.782 6.97 7.159 7.401 7.618 7.812 8.051 8.297 8.527 8.797 9.091 9.357 9.651 9.962 10.28 10.608 10.97 11.406 11.827 12.266 12.749 13.275 13.765 14.265 14.828 15.281 15.239 14.931 14.531 14.121 13.702 13.3 12.904 12.548 12.179 11.844 11.542 11.25 10.985 10.744 10.522 10.262 9.998 9.769 9.551 9.319 9.109 8.89 8.662 8.48 8.3 8.123 7.926 7.699 7.54 7.387 7.138 6.936 6.73 6.629 6.414 6.185 5.932 5.797 5.298 5.364 5.205 5.036 4.682 4.48 4.244 4.0 3.715 3.319 2.769 0.975 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index cb8ab825..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8425 ,TETRA ,17590920,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:25:46 CET,0.0 0.992 1.328 1.668 1.948 2.159 2.339 2.508 2.807 2.934 3.041 2.877 3.347 3.457 3.664 3.867 4.048 4.132 4.292 4.457 4.704 4.851 4.989 5.186 5.368 5.557 5.75 5.926 6.14 6.352 6.561 6.81 7.045 7.265 7.527 7.82 8.095 8.393 8.73 9.074 9.402 9.779 10.247 10.705 11.198 11.74 12.358 13.021 13.746 14.523 15.274 15.653 15.666 15.502 15.268 15.027 14.773 14.465 14.191 13.936 13.696 13.476 13.255 13.026 12.798 12.579 12.345 12.124 11.936 11.743 11.543 11.371 11.176 10.963 10.786 10.613 10.454 10.266 10.047 9.901 9.749 9.523 9.365 9.193 9.103 8.915 8.715 8.487 8.364 7.886 7.97 7.826 7.68 7.369 7.204 7.021 6.826 6.62 6.363 5.972 5.034 -2 ,31088 ,TETRA ,17590921,Sat Nov 27 21:25:14 CET,Sat Nov 27 23:37:17 CET,0.0 0.7 1.066 1.332 1.562 1.761 1.926 2.088 2.411 2.559 2.693 2.558 3.019 3.132 3.348 3.531 3.693 3.772 3.925 4.081 4.315 4.465 4.609 4.805 4.988 5.167 5.333 5.501 5.727 5.939 6.138 6.388 6.648 6.889 7.157 7.451 7.719 8.016 8.352 8.71 9.09 9.497 9.953 10.413 10.923 11.479 12.077 12.741 13.466 14.183 14.912 15.303 15.32 15.169 14.971 14.734 14.476 14.206 13.965 13.711 13.482 13.251 13.016 12.795 12.574 12.371 12.151 11.954 11.776 11.581 11.384 11.208 11.019 10.818 10.651 10.475 10.306 10.129 9.911 9.76 9.607 9.355 9.183 9.02 8.934 8.751 8.562 8.366 8.264 7.801 7.866 7.692 7.531 7.218 7.041 6.846 6.613 6.377 6.107 5.681 4.843 -3 ,26300 ,TETRA ,17590922,Sat Nov 27 21:25:15 CET,Sat Nov 27 23:36:15 CET,0.0 0.667 0.997 1.266 1.487 1.685 1.889 2.068 2.373 2.507 2.639 2.534 3.004 3.11 3.339 3.554 3.75 3.845 4.022 4.182 4.431 4.596 4.751 4.983 5.21 5.426 5.638 5.843 6.105 6.353 6.581 6.856 7.123 7.373 7.649 7.944 8.234 8.559 8.91 9.253 9.582 9.977 10.461 10.925 11.432 11.999 12.622 13.263 13.971 14.702 15.438 15.77 15.726 15.575 15.342 15.078 14.826 14.592 14.354 14.059 13.783 13.516 13.244 13.001 12.772 12.549 12.318 12.081 11.862 11.648 11.433 11.259 11.058 10.841 10.666 10.49 10.315 10.118 9.917 9.776 9.626 9.389 9.224 9.055 8.958 8.742 8.508 8.262 8.132 7.638 7.707 7.565 7.405 7.022 6.815 6.605 6.412 6.19 5.89 5.525 4.57 -4 ,3764 ,TETRA ,17590923,Sat Nov 27 21:25:15 CET,Sat Nov 27 23:37:26 CET,0.0 0.717 1.167 1.509 1.747 1.948 2.114 2.282 2.606 2.748 2.875 2.755 3.227 3.336 3.536 3.735 3.929 4.013 4.168 4.325 4.568 4.726 4.874 5.078 5.272 5.465 5.647 5.818 6.036 6.241 6.457 6.721 6.958 7.194 7.474 7.775 8.045 8.327 8.647 9.0 9.35 9.745 10.219 10.69 11.198 11.725 12.321 12.952 13.631 14.37 15.119 15.509 15.551 15.422 15.2 14.927 14.63 14.349 14.093 13.807 13.548 13.31 13.091 12.886 12.668 12.434 12.193 11.989 11.803 11.604 11.389 11.204 11.007 10.796 10.632 10.462 10.287 10.113 9.927 9.792 9.651 9.438 9.294 9.141 9.057 8.876 8.677 8.461 8.354 7.9 8.037 7.914 7.776 7.488 7.315 7.108 6.899 6.674 6.357 5.95 5.047 -5 ,8419 ,TETRA ,17590924,Sat Nov 27 21:25:15 CET,Sat Nov 27 23:37:53 CET,0.0 0.752 1.106 1.408 1.649 1.863 2.057 2.241 2.579 2.721 2.859 2.761 3.23 3.343 3.577 3.795 4.006 4.111 4.318 4.516 4.788 4.959 5.119 5.339 5.552 5.747 5.939 6.117 6.332 6.55 6.765 7.026 7.278 7.509 7.782 8.107 8.436 8.8 9.157 9.512 9.87 10.248 10.675 11.104 11.627 12.197 12.821 13.557 14.339 15.09 15.794 16.198 16.221 16.053 15.814 15.548 15.296 15.029 14.74 14.415 14.15 13.895 13.641 13.409 13.201 12.995 12.743 12.492 12.273 12.073 11.879 11.717 11.537 11.328 11.153 10.956 10.763 10.567 10.361 10.225 10.08 9.841 9.669 9.498 9.41 9.229 9.03 8.813 8.688 8.203 8.274 8.117 7.955 7.604 7.421 7.238 7.055 6.809 6.431 5.907 4.699 -6 ,8806 ,TETRA ,17590925,Sat Nov 27 21:25:16 CET,Sat Nov 27 23:36:46 CET,0.0 0.562 0.895 1.201 1.426 1.608 1.781 1.942 2.224 2.357 2.492 2.37 2.831 2.936 3.138 3.34 3.548 3.644 3.808 3.968 4.201 4.348 4.502 4.734 4.94 5.138 5.33 5.499 5.716 5.941 6.163 6.414 6.638 6.844 7.096 7.401 7.704 8.023 8.355 8.709 9.077 9.487 9.945 10.388 10.916 11.503 12.137 12.793 13.516 14.34 15.141 15.583 15.643 15.497 15.276 14.999 14.726 14.459 14.209 13.955 13.692 13.433 13.19 12.955 12.725 12.509 12.272 12.049 11.854 11.654 11.457 11.285 11.078 10.845 10.668 10.507 10.349 10.158 9.936 9.778 9.622 9.395 9.232 9.074 8.993 8.816 8.608 8.375 8.253 7.782 7.888 7.739 7.58 7.233 7.023 6.796 6.552 6.284 5.97 5.543 4.548 -7 ,17438 ,TETRA ,17590926,Sat Nov 27 21:25:18 CET,Sat Nov 27 23:36:46 CET,0.0 1.135 1.576 1.893 2.13 2.328 2.503 2.666 2.962 3.102 3.234 3.124 3.585 3.693 3.913 4.106 4.279 4.369 4.549 4.721 4.975 5.138 5.302 5.533 5.745 5.948 6.14 6.323 6.561 6.796 7.02 7.266 7.513 7.773 8.069 8.389 8.677 8.975 9.296 9.639 9.999 10.399 10.87 11.324 11.836 12.412 13.06 13.755 14.499 15.279 16.014 16.42 16.449 16.255 16.025 15.783 15.508 15.217 14.935 14.648 14.395 14.162 13.926 13.679 13.447 13.249 13.034 12.813 12.603 12.369 12.136 11.961 11.778 11.568 11.416 11.275 11.12 10.944 10.743 10.603 10.461 10.237 10.059 9.874 9.788 9.611 9.403 9.173 9.054 8.576 8.659 8.503 8.335 7.991 7.783 7.568 7.357 7.068 6.736 6.371 5.653 -8 ,17443 ,TETRA ,17590927,Sat Nov 27 21:25:15 CET,Sat Nov 27 23:38:19 CET,0.0 0.805 1.134 1.392 1.663 1.931 2.143 2.335 2.677 2.837 2.987 2.887 3.368 3.482 3.691 3.898 4.093 4.184 4.351 4.52 4.774 4.921 5.061 5.271 5.465 5.645 5.825 6.007 6.248 6.475 6.7 6.973 7.227 7.469 7.736 8.024 8.293 8.593 8.922 9.271 9.639 10.047 10.518 10.996 11.528 12.086 12.708 13.367 14.077 14.847 15.5 15.783 15.809 15.711 15.525 15.275 15.01 14.731 14.451 14.157 13.901 13.676 13.454 13.231 13.012 12.789 12.551 12.328 12.113 11.895 11.694 11.514 11.308 11.089 10.917 10.748 10.567 10.368 10.159 10.009 9.85 9.614 9.441 9.256 9.163 8.958 8.755 8.55 8.435 7.967 8.054 7.912 7.765 7.441 7.251 7.042 6.817 6.568 6.284 5.845 4.845 -9 ,9066 ,TETRA ,17590928,Sat Nov 27 21:48:17 CET,Sun Nov 28 00:04:33 CET,0.0 0.74 1.056 1.252 1.427 1.628 1.83 2.01 2.326 2.456 2.571 2.425 2.904 3.012 3.208 3.39 3.563 3.644 3.811 3.98 4.199 4.336 4.47 4.662 4.85 5.028 5.205 5.379 5.599 5.83 6.047 6.287 6.527 6.757 7.007 7.281 7.564 7.883 8.209 8.568 8.954 9.371 9.834 10.269 10.752 11.297 11.938 12.636 13.424 14.243 15.06 15.44 15.414 15.245 15.009 14.741 14.468 14.215 13.995 13.725 13.442 13.197 12.963 12.737 12.513 12.285 12.049 11.838 11.652 11.444 11.215 11.026 10.824 10.606 10.438 10.274 10.104 9.921 9.725 9.589 9.451 9.225 9.054 8.882 8.793 8.597 8.397 8.195 8.084 7.607 7.669 7.513 7.362 7.035 6.842 6.617 6.38 6.133 5.843 5.44 4.188 -10 ,1619 ,TETRA ,17590929,Sat Nov 27 21:49:13 CET,Sat Nov 27 23:46:51 CET,0.0 0.589 0.897 1.148 1.339 1.526 1.695 1.849 2.141 2.285 2.435 2.341 2.81 2.923 3.158 3.362 3.543 3.632 3.792 3.959 4.207 4.352 4.498 4.718 4.916 5.11 5.304 5.487 5.711 5.919 6.13 6.4 6.649 6.877 7.137 7.431 7.722 8.05 8.394 8.721 9.064 9.449 9.896 10.344 10.878 11.453 12.094 12.802 13.555 14.318 15.019 15.339 15.287 15.128 14.933 14.689 14.408 14.1 13.814 13.512 13.233 12.95 12.677 12.433 12.194 11.967 11.737 11.509 11.293 11.081 10.866 10.693 10.494 10.277 10.118 9.951 9.783 9.607 9.388 9.238 9.098 8.859 8.698 8.53 8.438 8.232 8.02 7.821 7.716 7.252 7.381 7.25 7.111 6.801 6.604 6.404 6.191 5.895 5.55 5.142 4.075 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt deleted file mode 100644 index 7d81a822..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18700 ,TETRA ,17590930,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:21:09 CET,0.0 0.631 0.984 1.281 1.517 1.732 1.923 2.108 2.437 2.586 2.733 2.636 3.118 3.237 3.46 3.659 3.854 3.953 4.139 4.312 4.559 4.719 4.874 5.089 5.304 5.521 5.708 5.877 6.096 6.313 6.518 6.748 6.978 7.205 7.451 7.723 7.985 8.268 8.566 8.863 9.155 9.48 9.866 10.243 10.638 11.068 11.568 12.099 12.635 13.152 13.524 13.457 13.156 12.772 12.393 12.028 11.688 11.342 11.02 10.667 10.356 10.092 9.827 9.559 9.298 9.055 8.794 8.572 8.388 8.188 7.987 7.813 7.611 7.386 7.219 7.053 6.879 6.698 6.495 6.352 6.204 5.97 5.799 5.626 5.541 5.358 5.144 4.902 4.777 4.292 4.421 4.296 4.151 3.818 3.647 3.463 3.238 3.012 2.744 2.338 0.985 -2 ,16707 ,TETRA ,17590931,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:01:47 CET,0.0 0.665 1.014 1.277 1.514 1.707 1.861 1.991 2.243 2.375 2.509 2.384 2.854 2.962 3.153 3.332 3.517 3.607 3.781 3.937 4.162 4.302 4.435 4.635 4.825 5.007 5.188 5.359 5.567 5.789 5.998 6.229 6.465 6.686 6.924 7.202 7.476 7.75 8.031 8.341 8.654 8.969 9.316 9.675 10.085 10.512 11.001 11.567 12.151 12.658 12.991 12.929 12.674 12.342 11.964 11.571 11.19 10.838 10.51 10.155 9.829 9.534 9.248 8.957 8.711 8.5 8.27 8.065 7.881 7.688 7.473 7.288 7.097 6.901 6.758 6.606 6.438 6.266 6.091 5.97 5.844 5.625 5.459 5.291 5.206 5.032 4.849 4.639 4.53 4.065 4.187 4.052 3.904 3.592 3.411 3.222 3.024 2.808 2.593 2.31 1.514 -3 ,27765 ,TETRA ,17590932,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:01:06 CET,0.0 0.719 1.05 1.314 1.546 1.753 1.927 2.09 2.378 2.501 2.625 2.507 2.976 3.089 3.309 3.499 3.675 3.763 3.939 4.114 4.353 4.493 4.635 4.839 5.02 5.196 5.37 5.54 5.761 5.971 6.168 6.392 6.603 6.811 7.058 7.326 7.587 7.867 8.144 8.453 8.793 9.156 9.555 9.947 10.384 10.842 11.343 11.869 12.43 12.904 13.225 13.199 12.891 12.492 12.056 11.62 11.184 10.782 10.44 10.083 9.772 9.506 9.26 9.027 8.796 8.563 8.307 8.075 7.873 7.657 7.426 7.229 7.034 6.832 6.674 6.514 6.336 6.145 5.947 5.809 5.672 5.445 5.273 5.096 4.999 4.787 4.582 4.362 4.233 3.753 3.874 3.748 3.616 3.328 3.166 2.983 2.782 2.54 2.23 1.861 1.226 -4 ,18176 ,TETRA ,17590933,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:00:51 CET,0.0 0.934 1.273 1.559 1.793 1.996 2.186 2.357 2.662 2.812 2.963 2.846 3.308 3.411 3.621 3.819 3.998 4.09 4.274 4.449 4.692 4.849 4.986 5.168 5.344 5.512 5.682 5.848 6.07 6.287 6.483 6.715 6.945 7.168 7.408 7.675 7.945 8.238 8.534 8.827 9.145 9.494 9.873 10.245 10.675 11.157 11.64 12.113 12.619 13.104 13.486 13.497 13.247 12.899 12.483 12.044 11.644 11.25 10.886 10.48 10.098 9.768 9.461 9.175 8.91 8.648 8.356 8.099 7.895 7.688 7.455 7.247 7.035 6.819 6.655 6.489 6.323 6.151 5.961 5.826 5.679 5.438 5.258 5.072 4.981 4.792 4.582 4.348 4.232 3.759 3.87 3.732 3.58 3.264 3.105 2.938 2.759 2.534 2.282 1.98 1.01 -5 ,6955 ,TETRA ,17590934,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:00:36 CET,0.0 0.964 1.301 1.572 1.804 2.033 2.247 2.427 2.751 2.909 3.052 2.937 3.413 3.537 3.767 3.974 4.166 4.257 4.436 4.597 4.813 4.955 5.094 5.291 5.48 5.666 5.84 6.005 6.218 6.428 6.64 6.885 7.107 7.316 7.559 7.833 8.079 8.339 8.628 8.938 9.244 9.581 9.973 10.36 10.814 11.273 11.738 12.214 12.691 13.119 13.426 13.37 13.111 12.783 12.432 12.06 11.696 11.344 11.024 10.704 10.415 10.132 9.864 9.624 9.402 9.198 8.971 8.758 8.572 8.361 8.132 7.943 7.757 7.543 7.366 7.207 7.039 6.85 6.657 6.533 6.402 6.186 6.031 5.865 5.78 5.602 5.406 5.181 5.062 4.596 4.71 4.577 4.442 4.139 3.975 3.791 3.586 3.369 3.114 2.722 1.824 -6 ,31443 ,TETRA ,17590935,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:01:50 CET,0.0 0.521 0.81 1.054 1.278 1.482 1.67 1.84 2.117 2.25 2.39 2.289 2.772 2.902 3.139 3.338 3.525 3.616 3.803 3.981 4.22 4.367 4.513 4.729 4.931 5.121 5.31 5.488 5.702 5.905 6.111 6.371 6.611 6.824 7.072 7.355 7.615 7.868 8.143 8.437 8.739 9.07 9.454 9.835 10.251 10.708 11.207 11.732 12.289 12.807 13.199 13.26 13.01 12.645 12.302 11.938 11.596 11.259 10.916 10.561 10.243 9.954 9.692 9.438 9.195 8.963 8.716 8.504 8.31 8.088 7.846 7.651 7.454 7.243 7.076 6.887 6.692 6.506 6.301 6.143 5.99 5.754 5.565 5.37 5.27 5.065 4.861 4.645 4.525 4.05 4.143 4.002 3.863 3.558 3.379 3.188 2.993 2.768 2.497 2.099 0.858 -7 ,30687 ,TETRA ,17590936,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:03:19 CET,0.0 0.949 1.297 1.582 1.796 1.985 2.175 2.341 2.651 2.803 2.952 2.851 3.324 3.436 3.651 3.854 4.048 4.138 4.316 4.491 4.739 4.902 5.05 5.261 5.465 5.646 5.809 5.973 6.182 6.383 6.577 6.798 7.017 7.239 7.483 7.743 7.998 8.281 8.583 8.878 9.185 9.538 9.915 10.275 10.674 11.099 11.577 12.083 12.621 13.101 13.411 13.367 13.098 12.709 12.294 11.909 11.559 11.247 10.962 10.661 10.376 10.101 9.821 9.552 9.319 9.098 8.857 8.629 8.425 8.217 7.99 7.799 7.593 7.368 7.202 7.03 6.853 6.661 6.446 6.304 6.157 5.911 5.75 5.577 5.484 5.295 5.083 4.856 4.74 4.267 4.39 4.265 4.129 3.829 3.665 3.487 3.278 3.037 2.746 2.344 1.487 -8 ,10119 ,TETRA ,17590937,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sat Nov 27 23:58:02 CET,0.0 0.457 0.778 1.03 1.245 1.421 1.572 1.727 2.012 2.141 2.264 2.141 2.621 2.752 2.987 3.202 3.42 3.522 3.704 3.856 4.076 4.226 4.365 4.581 4.794 4.978 5.148 5.311 5.536 5.747 5.952 6.217 6.467 6.684 6.923 7.179 7.414 7.681 7.967 8.281 8.585 8.908 9.291 9.67 10.128 10.621 11.106 11.588 12.121 12.606 12.919 12.887 12.639 12.323 11.972 11.589 11.192 10.805 10.464 10.081 9.739 9.444 9.171 8.921 8.69 8.473 8.218 7.98 7.781 7.566 7.323 7.12 6.939 6.759 6.601 6.421 6.228 6.036 5.839 5.7 5.562 5.362 5.2 5.035 4.953 4.763 4.568 4.346 4.23 3.759 3.859 3.721 3.586 3.32 3.158 2.972 2.763 2.522 2.223 1.793 1.044 -9 ,28363 ,TETRA ,17590938,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sat Nov 27 23:57:58 CET,0.0 0.738 1.08 1.374 1.645 1.859 2.027 2.19 2.498 2.64 2.781 2.692 3.165 3.276 3.482 3.664 3.847 3.942 4.125 4.305 4.554 4.712 4.87 5.076 5.255 5.43 5.613 5.797 6.02 6.243 6.45 6.681 6.913 7.145 7.412 7.707 7.974 8.243 8.541 8.86 9.192 9.546 9.919 10.281 10.696 11.123 11.574 12.108 12.667 13.166 13.576 13.617 13.369 13.028 12.627 12.19 11.794 11.413 11.033 10.623 10.286 9.993 9.708 9.427 9.169 8.945 8.683 8.43 8.223 8.011 7.77 7.554 7.337 7.116 6.94 6.759 6.576 6.374 6.167 6.027 5.871 5.649 5.49 5.306 5.207 5.01 4.811 4.575 4.445 3.976 4.096 3.959 3.822 3.536 3.369 3.152 2.924 2.696 2.419 2.024 0.982 -10 ,20042 ,TETRA ,17590939,Sat Nov 27 22:00:40 CET,Sun Nov 28 00:12:13 CET,0.0 0.831 1.184 1.433 1.638 1.803 1.965 2.12 2.415 2.569 2.718 2.621 3.112 3.241 3.457 3.657 3.845 3.931 4.097 4.257 4.489 4.644 4.786 4.987 5.185 5.369 5.556 5.75 6.0 6.22 6.424 6.676 6.898 7.112 7.371 7.66 7.937 8.233 8.546 8.868 9.212 9.586 10.001 10.401 10.826 11.268 11.741 12.229 12.716 13.171 13.454 13.346 13.053 12.708 12.33 11.914 11.523 11.146 10.8 10.441 10.114 9.812 9.527 9.25 8.982 8.744 8.498 8.258 8.048 7.843 7.616 7.405 7.189 6.991 6.84 6.668 6.486 6.293 6.09 5.951 5.794 5.559 5.401 5.229 5.136 4.939 4.74 4.524 4.407 3.935 4.051 3.921 3.795 3.534 3.385 3.202 2.999 2.769 2.513 2.222 1.291 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt deleted file mode 100644 index c2450a98..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25618 ,TETRA ,17590940,Sat Nov 27 22:00:40 CET,Sun Nov 28 00:15:49 CET,0.0 1.073 1.484 1.856 2.174 2.443 2.679 2.887 3.238 3.403 3.573 3.517 4.026 4.175 4.453 4.701 4.931 5.05 5.281 5.496 5.817 6.021 6.199 6.457 6.711 6.947 7.183 7.412 7.699 7.963 8.219 8.528 8.822 9.091 9.401 9.773 10.125 10.495 10.884 11.298 11.731 12.211 12.761 13.292 13.912 14.614 15.376 16.17 17.049 17.957 18.79 19.097 19.027 18.828 18.574 18.284 17.926 17.546 17.209 16.822 16.474 16.139 15.798 15.481 15.171 14.881 14.584 14.311 14.06 13.792 13.497 13.246 12.983 12.693 12.473 12.256 12.025 11.785 11.531 11.352 11.167 10.871 10.659 10.419 10.283 10.006 9.717 9.403 9.243 8.72 8.712 8.524 8.32 7.86 7.587 7.284 6.928 6.551 6.116 5.427 1.87 -2 ,19932 ,TETRA ,17590941,Sat Nov 27 22:00:40 CET,Sun Nov 28 00:12:36 CET,0.0 1.223 1.645 1.946 2.198 2.442 2.656 2.843 3.181 3.332 3.475 3.377 3.873 4.002 4.235 4.456 4.666 4.767 4.957 5.142 5.422 5.595 5.763 6.01 6.259 6.499 6.717 6.933 7.206 7.476 7.742 8.047 8.346 8.628 8.938 9.281 9.611 9.979 10.358 10.751 11.193 11.692 12.234 12.768 13.395 14.088 14.848 15.649 16.509 17.389 18.173 18.541 18.552 18.37 18.117 17.816 17.494 17.152 16.802 16.444 16.143 15.873 15.607 15.325 15.045 14.788 14.51 14.249 14.013 13.755 13.484 13.261 13.034 12.801 12.607 12.401 12.201 11.986 11.746 11.574 11.392 11.1 10.887 10.651 10.526 10.267 9.99 9.692 9.535 9.014 9.026 8.832 8.621 8.154 7.899 7.616 7.308 6.934 6.444 5.816 3.147 -3 ,5798 ,TETRA ,17590942,Sat Nov 27 22:00:40 CET,Sun Nov 28 00:15:24 CET,0.0 1.133 1.472 1.72 1.987 2.244 2.467 2.642 2.98 3.156 3.311 3.207 3.705 3.854 4.125 4.365 4.606 4.712 4.902 5.091 5.372 5.555 5.733 5.991 6.232 6.467 6.709 6.937 7.216 7.494 7.776 8.116 8.414 8.678 8.985 9.339 9.689 10.062 10.456 10.877 11.306 11.795 12.357 12.904 13.527 14.181 14.923 15.763 16.697 17.695 18.682 19.112 19.129 18.978 18.702 18.371 18.031 17.666 17.317 16.913 16.55 16.222 15.866 15.542 15.252 14.97 14.659 14.38 14.142 13.885 13.608 13.375 13.131 12.88 12.668 12.439 12.212 11.972 11.725 11.55 11.36 11.055 10.836 10.609 10.497 10.274 10.028 9.762 9.62 9.114 9.16 8.987 8.797 8.356 8.117 7.861 7.543 7.161 6.658 5.911 3.649 -4 ,22129 ,TETRA ,17590943,Sat Nov 27 22:00:40 CET,Sun Nov 28 00:14:35 CET,0.0 1.418 1.961 2.373 2.668 2.941 3.183 3.377 3.744 3.922 4.097 4.093 4.611 4.747 5.027 5.307 5.563 5.68 5.902 6.1 6.387 6.583 6.775 7.046 7.294 7.524 7.747 7.967 8.246 8.514 8.769 9.089 9.394 9.664 9.957 10.31 10.662 11.021 11.407 11.83 12.246 12.717 13.3 13.872 14.495 15.172 15.919 16.643 17.446 18.373 19.309 19.687 19.569 19.267 18.877 18.442 18.022 17.629 17.236 16.827 16.474 16.125 15.772 15.447 15.139 14.83 14.499 14.215 13.97 13.698 13.397 13.138 12.869 12.588 12.367 12.137 11.892 11.626 11.34 11.146 10.933 10.589 10.358 10.114 9.982 9.706 9.416 9.11 8.942 8.409 8.414 8.223 8.01 7.539 7.289 7.012 6.7 6.352 5.863 5.135 2.837 -5 ,26181 ,TETRA ,17590944,Sat Nov 27 22:00:42 CET,Sun Nov 28 00:12:37 CET,0.0 0.871 1.211 1.502 1.763 2.0 2.197 2.378 2.738 2.901 3.056 2.997 3.498 3.633 3.879 4.107 4.347 4.462 4.671 4.868 5.141 5.323 5.505 5.765 6.016 6.249 6.459 6.668 6.959 7.222 7.453 7.743 8.02 8.288 8.597 8.934 9.266 9.623 10.024 10.46 10.882 11.375 11.974 12.553 13.213 13.869 14.566 15.335 16.156 17.042 17.94 18.387 18.416 18.232 17.941 17.607 17.282 16.938 16.603 16.246 15.925 15.644 15.368 15.072 14.786 14.523 14.228 13.964 13.734 13.467 13.188 12.958 12.715 12.449 12.23 12.003 11.763 11.5 11.207 11.023 10.816 10.463 10.23 9.968 9.836 9.567 9.263 8.947 8.785 8.259 8.24 8.011 7.777 7.27 6.97 6.627 6.239 5.816 5.266 4.475 0.967 -6 ,1696 ,TETRA ,17590945,Sat Nov 27 22:00:45 CET,Sun Nov 28 00:13:23 CET,0.0 0.973 1.358 1.684 1.98 2.237 2.448 2.646 3.023 3.192 3.351 3.258 3.75 3.89 4.154 4.39 4.616 4.72 4.905 5.088 5.362 5.541 5.715 5.963 6.188 6.402 6.624 6.834 7.105 7.361 7.597 7.902 8.205 8.482 8.791 9.142 9.489 9.879 10.284 10.705 11.132 11.597 12.14 12.66 13.273 13.987 14.764 15.577 16.464 17.421 18.3 18.643 18.561 18.314 17.99 17.633 17.32 16.983 16.661 16.346 16.042 15.721 15.388 15.08 14.793 14.517 14.204 13.911 13.66 13.39 13.087 12.838 12.581 12.309 12.101 11.868 11.625 11.381 11.101 10.899 10.684 10.347 10.123 9.879 9.747 9.455 9.149 8.83 8.669 8.146 8.138 7.936 7.721 7.276 7.014 6.714 6.361 5.921 5.359 4.487 1.337 -7 ,18448 ,TETRA ,17590946,Sat Nov 27 22:01:40 CET,Sun Nov 28 00:06:42 CET,0.0 1.584 2.152 2.544 2.807 3.039 3.263 3.459 3.816 3.97 4.128 4.074 4.57 4.697 4.93 5.148 5.362 5.461 5.651 5.837 6.106 6.289 6.465 6.704 6.932 7.161 7.378 7.592 7.871 8.117 8.353 8.651 8.93 9.199 9.51 9.851 10.173 10.542 10.933 11.318 11.741 12.247 12.813 13.341 13.935 14.589 15.322 16.136 17.02 17.916 18.745 19.126 19.154 19.014 18.782 18.49 18.166 17.818 17.49 17.14 16.821 16.517 16.204 15.893 15.59 15.313 15.009 14.733 14.47 14.171 13.86 13.605 13.34 13.047 12.817 12.578 12.337 12.093 11.828 11.641 11.446 11.112 10.87 10.612 10.476 10.21 9.948 9.667 9.505 8.974 8.951 8.757 8.572 8.121 7.851 7.54 7.173 6.746 6.204 5.465 2.995 -8 ,11094 ,TETRA ,17590947,Sat Nov 27 22:02:40 CET,Sun Nov 28 00:14:30 CET,0.0 1.22 1.626 1.931 2.203 2.443 2.668 2.863 3.22 3.398 3.57 3.501 4.0 4.129 4.349 4.552 4.759 4.87 5.096 5.31 5.595 5.769 5.936 6.166 6.38 6.598 6.823 7.042 7.31 7.573 7.829 8.126 8.424 8.705 9.011 9.355 9.679 10.059 10.487 10.893 11.297 11.773 12.338 12.897 13.522 14.147 14.832 15.596 16.403 17.204 17.955 18.213 18.057 17.76 17.396 17.015 16.66 16.323 16.003 15.651 15.336 15.051 14.751 14.42 14.099 13.801 13.494 13.246 13.036 12.816 12.561 12.337 12.112 11.869 11.669 11.441 11.202 10.972 10.735 10.563 10.377 10.091 9.882 9.662 9.548 9.29 9.023 8.765 8.63 8.137 8.2 8.038 7.865 7.474 7.25 6.995 6.724 6.441 6.113 5.693 4.16 -9 ,30804 ,TETRA ,17590948,Sat Nov 27 22:02:40 CET,Sun Nov 28 00:14:34 CET,0.0 1.393 1.804 2.134 2.432 2.71 2.952 3.144 3.494 3.665 3.823 3.774 4.29 4.429 4.699 4.953 5.183 5.295 5.503 5.692 5.975 6.165 6.35 6.609 6.848 7.086 7.332 7.553 7.812 8.077 8.347 8.66 8.945 9.216 9.532 9.896 10.241 10.59 10.956 11.353 11.783 12.239 12.728 13.22 13.797 14.432 15.163 15.953 16.843 17.845 18.768 19.217 19.201 18.962 18.706 18.405 18.063 17.718 17.405 17.065 16.76 16.461 16.147 15.848 15.583 15.342 15.08 14.84 14.615 14.366 14.1 13.87 13.63 13.376 13.171 12.962 12.743 12.501 12.251 12.081 11.897 11.615 11.407 11.181 11.07 10.84 10.588 10.316 10.168 9.651 9.69 9.52 9.338 8.975 8.781 8.542 8.238 7.914 7.544 7.063 5.929 -10 ,19431 ,TETRA ,17590949,Sat Nov 27 22:03:38 CET,Sun Nov 28 00:17:14 CET,0.0 0.824 1.203 1.526 1.809 2.088 2.351 2.574 2.967 3.14 3.313 3.304 3.821 3.962 4.238 4.481 4.709 4.823 5.048 5.276 5.592 5.784 5.959 6.216 6.479 6.728 6.97 7.209 7.494 7.76 8.026 8.341 8.645 8.953 9.328 9.73 10.102 10.52 10.965 11.424 11.91 12.456 13.055 13.631 14.28 14.97 15.717 16.518 17.409 18.3 19.125 19.425 19.25 18.971 18.66 18.335 17.999 17.64 17.292 16.947 16.639 16.344 16.064 15.757 15.449 15.184 14.909 14.657 14.44 14.208 13.957 13.746 13.521 13.283 13.083 12.868 12.634 12.386 12.147 11.988 11.817 11.525 11.325 11.112 10.995 10.756 10.516 10.25 10.11 9.618 9.658 9.488 9.309 8.945 8.729 8.48 8.201 7.872 7.507 7.025 4.853 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index a3e096ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1680 ,TETRA ,17590950,Sat Nov 27 22:04:39 CET,Sun Nov 28 00:16:52 CET,0.0 1.107 1.53 1.874 2.168 2.434 2.661 2.867 3.236 3.413 3.593 3.547 4.056 4.193 4.462 4.725 4.962 5.077 5.31 5.522 5.815 6.008 6.202 6.496 6.767 7.003 7.229 7.454 7.752 8.026 8.286 8.607 8.913 9.205 9.543 9.927 10.283 10.67 11.106 11.558 12.018 12.539 13.138 13.718 14.378 15.103 15.914 16.76 17.674 18.658 19.696 20.227 20.252 20.099 19.821 19.465 19.106 18.747 18.397 18.009 17.649 17.319 17.008 16.708 16.416 16.157 15.884 15.629 15.403 15.163 14.898 14.671 14.453 14.224 14.039 13.836 13.608 13.366 13.106 12.933 12.76 12.481 12.279 12.058 11.945 11.709 11.47 11.243 11.108 10.599 10.661 10.494 10.324 9.956 9.75 9.516 9.218 8.88 8.513 7.967 6.566 -2 ,12156 ,TETRA ,17590951,Sat Nov 27 22:04:41 CET,Sun Nov 28 00:18:16 CET,0.0 0.85 1.198 1.494 1.778 2.046 2.282 2.489 2.852 3.026 3.186 3.119 3.625 3.764 4.033 4.291 4.536 4.654 4.874 5.087 5.399 5.593 5.78 6.041 6.288 6.548 6.791 7.021 7.316 7.579 7.841 8.163 8.458 8.742 9.075 9.433 9.767 10.145 10.545 10.953 11.39 11.863 12.379 12.922 13.58 14.307 15.093 15.965 16.999 18.068 19.035 19.526 19.589 19.489 19.318 19.077 18.804 18.506 18.217 17.902 17.573 17.236 16.908 16.595 16.321 16.065 15.749 15.466 15.229 14.97 14.697 14.464 14.227 13.996 13.814 13.607 13.377 13.139 12.896 12.728 12.56 12.311 12.12 11.906 11.788 11.519 11.243 10.968 10.823 10.326 10.407 10.254 10.087 9.734 9.535 9.297 9.035 8.75 8.412 7.992 6.885 -3 ,536 ,TETRA ,17590952,Sat Nov 27 22:04:42 CET,Sun Nov 28 00:17:48 CET,0.0 1.489 1.992 2.313 2.573 2.798 3.009 3.199 3.555 3.73 3.887 3.812 4.327 4.46 4.725 4.983 5.228 5.342 5.544 5.749 6.045 6.222 6.401 6.673 6.924 7.157 7.385 7.601 7.886 8.166 8.425 8.736 9.034 9.333 9.675 10.04 10.392 10.769 11.18 11.618 12.057 12.554 13.119 13.659 14.269 14.958 15.726 16.569 17.564 18.592 19.586 20.082 20.121 19.956 19.685 19.375 19.039 18.693 18.323 17.878 17.498 17.175 16.854 16.533 16.217 15.925 15.589 15.274 15.019 14.744 14.454 14.212 13.958 13.696 13.49 13.263 13.019 12.763 12.487 12.297 12.102 11.794 11.599 11.4 11.289 11.064 10.842 10.605 10.465 9.949 9.966 9.796 9.62 9.25 9.057 8.818 8.511 8.139 7.746 7.304 5.356 -4 ,32692 ,TETRA ,17590953,Sat Nov 27 22:04:44 CET,Sun Nov 28 00:16:59 CET,0.0 0.84 1.226 1.561 1.854 2.124 2.366 2.582 2.961 3.128 3.303 3.272 3.789 3.935 4.209 4.466 4.712 4.829 5.045 5.255 5.574 5.781 5.967 6.239 6.495 6.73 6.965 7.192 7.477 7.744 8.0 8.308 8.602 8.889 9.227 9.621 10.009 10.423 10.845 11.277 11.727 12.235 12.82 13.402 14.074 14.77 15.564 16.416 17.341 18.34 19.323 19.864 19.919 19.732 19.426 19.01 18.621 18.277 17.937 17.579 17.257 16.938 16.619 16.334 16.059 15.805 15.537 15.275 15.035 14.799 14.549 14.327 14.107 13.861 13.658 13.453 13.225 12.971 12.697 12.508 12.314 12.028 11.826 11.603 11.487 11.229 10.955 10.676 10.54 10.052 10.112 9.947 9.77 9.409 9.219 8.983 8.719 8.411 8.006 7.537 5.972 -5 ,24698 ,TETRA ,17590954,Sat Nov 27 22:05:39 CET,Sun Nov 28 00:20:35 CET,0.0 1.575 2.046 2.382 2.66 2.914 3.157 3.405 3.843 4.037 4.231 4.207 4.72 4.873 5.157 5.421 5.684 5.809 6.029 6.238 6.55 6.75 6.941 7.196 7.431 7.665 7.899 8.12 8.404 8.684 8.941 9.269 9.595 9.891 10.231 10.596 10.937 11.319 11.726 12.144 12.578 13.078 13.682 14.29 15.0 15.783 16.632 17.553 18.557 19.611 20.747 21.404 21.496 21.368 21.171 20.905 20.599 20.31 20.017 19.675 19.386 19.096 18.787 18.504 18.213 17.953 17.695 17.436 17.188 16.922 16.648 16.435 16.215 15.959 15.76 15.555 15.333 15.107 14.869 14.704 14.524 14.234 14.038 13.822 13.712 13.486 13.256 13.013 12.872 12.359 12.386 12.208 12.01 11.567 11.334 11.095 10.824 10.508 10.16 9.71 8.388 -6 ,18453 ,TETRA ,17590955,Sat Nov 27 22:05:40 CET,Sun Nov 28 00:21:53 CET,0.0 1.421 1.928 2.333 2.686 2.98 3.233 3.463 3.883 4.064 4.235 4.211 4.742 4.899 5.181 5.455 5.714 5.834 6.061 6.268 6.576 6.793 6.989 7.259 7.515 7.739 7.961 8.188 8.497 8.791 9.071 9.398 9.706 9.998 10.338 10.728 11.103 11.514 11.942 12.393 12.868 13.381 13.949 14.521 15.183 15.912 16.701 17.498 18.423 19.472 20.498 21.065 21.155 21.045 20.837 20.573 20.229 19.834 19.471 19.052 18.644 18.274 17.927 17.597 17.282 16.986 16.683 16.403 16.157 15.893 15.587 15.332 15.068 14.8 14.597 14.379 14.15 13.91 13.651 13.464 13.285 13.022 12.833 12.62 12.509 12.28 12.033 11.772 11.639 11.146 11.197 11.029 10.842 10.438 10.219 9.966 9.686 9.365 8.952 8.408 6.751 -7 ,19695 ,TETRA ,17590956,Sat Nov 27 22:05:42 CET,Sun Nov 28 00:20:42 CET,0.0 1.089 1.47 1.782 2.021 2.233 2.439 2.624 2.96 3.128 3.288 3.225 3.74 3.876 4.143 4.395 4.617 4.727 4.955 5.185 5.496 5.674 5.86 6.138 6.399 6.643 6.855 7.056 7.313 7.571 7.825 8.114 8.384 8.648 8.953 9.29 9.627 9.995 10.38 10.794 11.216 11.662 12.202 12.751 13.383 14.057 14.781 15.578 16.492 17.431 18.283 18.633 18.601 18.422 18.168 17.915 17.618 17.298 17.008 16.68 16.376 16.065 15.768 15.508 15.256 15.026 14.771 14.514 14.275 14.039 13.793 13.589 13.364 13.117 12.914 12.694 12.474 12.229 11.971 11.796 11.625 11.366 11.187 10.994 10.879 10.641 10.418 10.164 10.013 9.5 9.55 9.389 9.217 8.801 8.559 8.326 8.069 7.769 7.407 6.902 5.25 -8 ,21495 ,TETRA ,17590957,Sat Nov 27 22:05:45 CET,Sun Nov 28 00:20:46 CET,0.0 0.753 1.173 1.53 1.81 2.041 2.26 2.465 2.839 3.008 3.16 3.095 3.586 3.709 3.971 4.237 4.477 4.592 4.828 5.063 5.377 5.566 5.751 6.014 6.262 6.497 6.734 6.971 7.254 7.504 7.749 8.05 8.359 8.637 8.944 9.297 9.642 10.047 10.459 10.882 11.315 11.788 12.36 12.925 13.568 14.231 14.939 15.729 16.632 17.575 18.559 19.033 19.079 18.946 18.657 18.295 17.932 17.607 17.33 17.013 16.711 16.4 16.08 15.776 15.476 15.203 14.923 14.663 14.414 14.154 13.891 13.662 13.416 13.176 13.0 12.806 12.601 12.381 12.137 11.971 11.799 11.516 11.312 11.109 11.008 10.795 10.549 10.272 10.139 9.647 9.689 9.532 9.375 9.008 8.784 8.548 8.303 8.013 7.667 7.199 5.269 -9 ,5811 ,TETRA ,17590958,Sat Nov 27 22:05:40 CET,Sun Nov 28 00:19:57 CET,0.0 1.294 1.793 2.221 2.543 2.799 3.025 3.198 3.514 3.68 3.842 3.788 4.299 4.438 4.702 4.97 5.223 5.339 5.555 5.761 6.07 6.267 6.453 6.715 6.953 7.176 7.391 7.608 7.882 8.148 8.41 8.713 8.994 9.275 9.614 9.982 10.333 10.713 11.108 11.517 11.97 12.494 13.072 13.651 14.299 14.998 15.802 16.62 17.478 18.443 19.426 19.976 20.079 20.007 19.789 19.421 19.029 18.66 18.318 17.954 17.617 17.286 16.962 16.651 16.345 16.061 15.751 15.476 15.249 15.013 14.739 14.497 14.264 14.021 13.823 13.605 13.382 13.161 12.925 12.755 12.567 12.287 12.093 11.875 11.768 11.547 11.312 11.078 10.949 10.436 10.463 10.299 10.097 9.637 9.395 9.145 8.887 8.592 8.245 7.777 6.078 -10 ,21805 ,TETRA ,17590959,Sat Nov 27 22:05:40 CET,Sun Nov 28 00:19:56 CET,0.0 1.343 1.763 2.106 2.395 2.671 2.922 3.148 3.559 3.739 3.904 3.873 4.388 4.536 4.836 5.123 5.391 5.514 5.738 5.953 6.27 6.469 6.667 6.962 7.23 7.481 7.721 7.943 8.23 8.512 8.787 9.115 9.425 9.73 10.083 10.46 10.811 11.207 11.648 12.121 12.58 13.069 13.654 14.228 14.878 15.597 16.392 17.229 18.176 19.235 20.292 20.858 20.928 20.789 20.573 20.283 19.925 19.594 19.337 19.03 18.736 18.447 18.138 17.832 17.538 17.276 16.989 16.721 16.499 16.277 16.02 15.803 15.588 15.361 15.194 15.007 14.788 14.563 14.319 14.13 13.943 13.656 13.449 13.245 13.145 12.931 12.674 12.389 12.25 11.769 11.838 11.672 11.492 11.089 10.886 10.676 10.435 10.16 9.833 9.346 7.581 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt deleted file mode 100644 index f6d7b481..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19107 ,TETRA ,17590960,Sat Nov 27 22:06:39 CET,Sun Nov 28 00:17:28 CET,0.0 1.187 1.625 1.941 2.227 2.508 2.767 2.977 3.362 3.552 3.733 3.678 4.192 4.332 4.6 4.85 5.072 5.177 5.374 5.565 5.855 6.046 6.232 6.501 6.757 6.994 7.201 7.398 7.665 7.927 8.182 8.471 8.751 9.024 9.342 9.718 10.063 10.417 10.8 11.188 11.594 12.079 12.605 13.076 13.639 14.284 14.971 15.67 16.423 17.278 18.119 18.413 18.375 18.181 17.855 17.509 17.179 16.838 16.526 16.164 15.839 15.566 15.285 14.989 14.692 14.416 14.126 13.855 13.62 13.374 13.091 12.863 12.654 12.437 12.244 12.03 11.812 11.593 11.363 11.194 11.006 10.705 10.505 10.282 10.163 9.933 9.701 9.439 9.286 8.769 8.794 8.6 8.401 7.959 7.69 7.393 7.075 6.76 6.353 5.661 3.266 -2 ,29958 ,TETRA ,17590961,Sat Nov 27 22:06:41 CET,Sun Nov 28 00:16:40 CET,0.0 1.675 2.21 2.588 2.89 3.152 3.391 3.604 3.97 4.139 4.305 4.218 4.714 4.853 5.127 5.375 5.617 5.724 5.929 6.127 6.39 6.564 6.736 6.963 7.2 7.44 7.653 7.854 8.103 8.345 8.601 8.92 9.22 9.509 9.819 10.153 10.465 10.826 11.241 11.675 12.108 12.589 13.145 13.65 14.207 14.837 15.535 16.258 17.003 17.785 18.539 18.824 18.757 18.526 18.237 17.903 17.578 17.236 16.914 16.577 16.245 15.907 15.557 15.249 14.971 14.7 14.404 14.112 13.859 13.598 13.312 13.066 12.795 12.514 12.3 12.084 11.861 11.623 11.364 11.19 11.028 10.746 10.525 10.296 10.18 9.949 9.708 9.432 9.274 8.742 8.744 8.551 8.341 7.87 7.611 7.336 7.054 6.745 6.343 5.788 3.501 -3 ,5195 ,TETRA ,17590962,Sat Nov 27 22:06:39 CET,Sun Nov 28 00:16:23 CET,0.0 1.527 2.073 2.432 2.731 2.974 3.205 3.436 3.871 4.04 4.188 4.132 4.65 4.79 5.054 5.302 5.537 5.647 5.846 6.049 6.357 6.54 6.712 6.968 7.204 7.421 7.638 7.862 8.149 8.403 8.65 8.966 9.256 9.526 9.836 10.178 10.501 10.844 11.22 11.619 12.031 12.486 12.999 13.514 14.118 14.757 15.425 16.15 16.997 17.893 18.719 19.185 19.23 19.024 18.712 18.339 17.983 17.623 17.25 16.84 16.462 16.121 15.798 15.482 15.178 14.888 14.577 14.307 14.057 13.777 13.492 13.261 13.017 12.753 12.546 12.34 12.129 11.889 11.637 11.465 11.278 10.975 10.759 10.534 10.411 10.164 9.92 9.644 9.505 9.007 9.044 8.872 8.687 8.242 7.993 7.738 7.429 7.098 6.704 6.145 3.513 -4 ,23338 ,TETRA ,17590963,Sat Nov 27 22:06:38 CET,Sun Nov 28 00:19:36 CET,0.0 1.367 1.866 2.204 2.497 2.756 2.985 3.196 3.583 3.764 3.917 3.812 4.321 4.466 4.717 4.935 5.142 5.251 5.464 5.662 5.949 6.131 6.32 6.581 6.813 7.048 7.287 7.499 7.759 8.019 8.276 8.579 8.838 9.079 9.357 9.67 9.979 10.321 10.712 11.126 11.53 11.946 12.437 12.953 13.53 14.198 14.96 15.748 16.598 17.471 18.339 18.71 18.691 18.502 18.222 17.873 17.538 17.21 16.872 16.491 16.139 15.815 15.504 15.228 14.966 14.706 14.438 14.183 13.944 13.68 13.382 13.143 12.911 12.672 12.484 12.279 12.053 11.812 11.56 11.397 11.223 10.925 10.718 10.491 10.373 10.121 9.838 9.558 9.408 8.888 8.909 8.721 8.525 8.123 7.892 7.62 7.336 7.022 6.633 6.066 3.622 -5 ,19601 ,TETRA ,17590964,Sat Nov 27 22:07:41 CET,Sun Nov 28 00:18:30 CET,0.0 1.425 1.866 2.19 2.482 2.769 3.035 3.26 3.659 3.84 4.003 3.957 4.469 4.601 4.85 5.099 5.346 5.459 5.663 5.856 6.128 6.303 6.484 6.745 6.987 7.235 7.475 7.697 7.957 8.205 8.472 8.784 9.062 9.322 9.627 9.974 10.319 10.692 11.085 11.529 11.976 12.468 13.052 13.593 14.155 14.783 15.506 16.271 17.114 18.049 19.014 19.459 19.464 19.228 18.895 18.534 18.17 17.806 17.471 17.133 16.794 16.488 16.225 15.947 15.658 15.39 15.109 14.84 14.595 14.339 14.077 13.847 13.588 13.325 13.133 12.935 12.718 12.48 12.218 12.037 11.86 11.572 11.361 11.159 11.055 10.815 10.559 10.286 10.128 9.6 9.634 9.448 9.261 8.823 8.571 8.317 8.049 7.739 7.354 6.811 5.119 -6 ,31582 ,TETRA ,17590965,Sat Nov 27 22:07:41 CET,Sun Nov 28 00:17:34 CET,0.0 1.919 2.322 2.668 2.987 3.245 3.459 3.646 3.978 4.139 4.305 4.244 4.756 4.892 5.13 5.358 5.584 5.69 5.897 6.094 6.367 6.536 6.699 6.942 7.175 7.4 7.618 7.826 8.105 8.355 8.583 8.88 9.179 9.462 9.769 10.098 10.433 10.804 11.183 11.583 11.986 12.434 12.97 13.465 14.041 14.701 15.441 16.199 16.948 17.786 18.613 18.923 18.87 18.641 18.326 18.007 17.68 17.296 16.94 16.56 16.193 15.868 15.57 15.283 15.007 14.756 14.46 14.17 13.905 13.632 13.358 13.127 12.881 12.616 12.415 12.215 11.997 11.746 11.49 11.315 11.136 10.863 10.659 10.435 10.314 10.067 9.788 9.485 9.33 8.802 8.831 8.662 8.482 8.012 7.739 7.441 7.096 6.712 6.308 5.714 3.905 -7 ,26887 ,TETRA ,17590966,Sat Nov 27 22:07:41 CET,Sun Nov 28 00:18:03 CET,0.0 1.624 2.126 2.49 2.818 3.085 3.302 3.494 3.859 4.052 4.217 4.132 4.644 4.779 5.038 5.3 5.55 5.663 5.878 6.082 6.357 6.519 6.684 6.951 7.208 7.436 7.66 7.87 8.13 8.371 8.619 8.944 9.228 9.485 9.791 10.125 10.45 10.823 11.202 11.627 12.077 12.553 13.084 13.573 14.121 14.747 15.464 16.222 17.011 17.825 18.595 18.933 18.89 18.662 18.377 18.03 17.682 17.349 17.01 16.654 16.338 16.011 15.671 15.376 15.108 14.837 14.521 14.224 13.961 13.687 13.4 13.163 12.932 12.685 12.478 12.242 11.992 11.743 11.482 11.305 11.125 10.84 10.637 10.415 10.305 10.081 9.823 9.555 9.413 8.9 8.941 8.752 8.531 8.068 7.819 7.555 7.297 6.994 6.566 5.97 3.448 -8 ,19366 ,TETRA ,17590967,Sat Nov 27 22:07:41 CET,Sun Nov 28 00:17:00 CET,0.0 1.589 2.043 2.463 2.797 3.075 3.314 3.531 3.924 4.099 4.282 4.251 4.765 4.904 5.161 5.396 5.624 5.745 5.99 6.188 6.445 6.628 6.814 7.077 7.313 7.529 7.742 7.953 8.234 8.51 8.795 9.12 9.391 9.632 9.926 10.267 10.575 10.911 11.284 11.675 12.081 12.57 13.134 13.666 14.22 14.83 15.549 16.304 17.117 17.968 18.701 18.878 18.781 18.593 18.306 17.966 17.595 17.207 16.847 16.479 16.175 15.888 15.594 15.304 15.019 14.757 14.456 14.189 13.968 13.725 13.476 13.25 13.001 12.749 12.547 12.324 12.092 11.863 11.611 11.445 11.283 10.993 10.778 10.556 10.439 10.185 9.91 9.612 9.46 8.941 8.96 8.778 8.597 8.212 7.982 7.718 7.406 7.033 6.611 6.09 4.408 -9 ,27909 ,TETRA ,17590968,Sat Nov 27 22:07:43 CET,Sun Nov 28 00:18:01 CET,0.0 2.05 2.599 3.03 3.372 3.64 3.877 4.09 4.476 4.646 4.808 4.756 5.272 5.404 5.657 5.888 6.12 6.238 6.463 6.682 7.002 7.211 7.409 7.674 7.933 8.18 8.394 8.594 8.865 9.119 9.342 9.614 9.894 10.164 10.473 10.828 11.169 11.516 11.882 12.281 12.687 13.159 13.695 14.213 14.797 15.427 16.138 16.933 17.801 18.671 19.421 19.719 19.643 19.365 18.997 18.592 18.213 17.811 17.434 17.081 16.752 16.433 16.115 15.794 15.488 15.22 14.943 14.677 14.437 14.18 13.908 13.689 13.458 13.21 12.996 12.758 12.52 12.275 12.017 11.824 11.63 11.351 11.158 10.96 10.839 10.589 10.339 10.064 9.916 9.4 9.433 9.271 9.121 8.753 8.51 8.209 7.852 7.452 6.993 6.37 4.554 -10 ,22376 ,TETRA ,17590969,Sat Nov 27 22:08:39 CET,Sun Nov 28 00:18:49 CET,0.0 1.454 1.919 2.269 2.568 2.858 3.115 3.336 3.723 3.898 4.062 3.979 4.49 4.625 4.88 5.137 5.372 5.48 5.68 5.863 6.14 6.325 6.492 6.732 6.969 7.189 7.41 7.619 7.867 8.126 8.383 8.692 8.991 9.246 9.552 9.912 10.238 10.601 10.976 11.353 11.76 12.243 12.8 13.34 13.923 14.52 15.187 15.877 16.642 17.497 18.328 18.69 18.686 18.536 18.254 17.91 17.565 17.233 16.908 16.524 16.199 15.891 15.569 15.248 14.94 14.681 14.4 14.124 13.882 13.615 13.326 13.09 12.842 12.583 12.391 12.174 11.919 11.666 11.409 11.221 11.038 10.773 10.587 10.379 10.264 10.019 9.766 9.479 9.32 8.797 8.827 8.653 8.45 7.978 7.734 7.488 7.202 6.868 6.454 5.828 3.466 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt deleted file mode 100644 index b7824879..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29995 ,TETRA ,17590970,Sat Nov 27 22:08:40 CET,Sun Nov 28 00:15:48 CET,0.0 0.73 1.079 1.33 1.561 1.752 1.95 2.129 2.417 2.547 2.671 2.569 3.041 3.149 3.369 3.567 3.753 3.844 4.02 4.182 4.416 4.568 4.704 4.895 5.088 5.281 5.468 5.644 5.876 6.099 6.304 6.541 6.776 7.018 7.292 7.579 7.839 8.123 8.414 8.714 9.039 9.384 9.77 10.134 10.51 10.943 11.426 11.865 12.256 12.537 12.621 12.241 11.609 10.963 10.396 9.866 9.313 8.751 8.285 7.838 7.449 7.085 6.722 6.374 6.05 5.741 5.395 5.078 4.807 4.526 4.233 3.992 3.738 3.466 3.251 3.027 2.787 2.54 2.293 2.12 1.936 1.648 1.45 1.227 1.11 0.881 0.624 0.344 0.209 -0.292 -0.242 -0.419 -0.608 -1.022 -1.237 -1.47 -1.725 -1.995 -2.318 -2.757 -3.829 -2 ,18351 ,TETRA ,17590971,Sat Nov 27 22:08:40 CET,Sun Nov 28 00:20:26 CET,0.0 0.935 1.248 1.531 1.808 2.028 2.197 2.346 2.609 2.741 2.863 2.73 3.204 3.312 3.519 3.701 3.874 3.965 4.14 4.306 4.56 4.705 4.833 5.031 5.21 5.38 5.549 5.714 5.922 6.134 6.349 6.596 6.817 7.013 7.258 7.53 7.767 8.025 8.283 8.55 8.844 9.165 9.527 9.885 10.273 10.664 11.134 11.668 12.13 12.479 12.594 12.276 11.749 11.173 10.609 10.041 9.497 8.972 8.524 8.051 7.619 7.245 6.897 6.563 6.233 5.931 5.612 5.311 5.056 4.799 4.513 4.271 4.029 3.769 3.557 3.344 3.126 2.889 2.639 2.46 2.277 2.018 1.833 1.613 1.492 1.262 1.01 0.739 0.605 0.107 0.186 0.031 -0.14 -0.56 -0.804 -1.044 -1.296 -1.605 -1.963 -2.389 -3.316 -3 ,20626 ,TETRA ,17590972,Sat Nov 27 22:08:39 CET,Sun Nov 28 00:15:24 CET,0.0 0.988 1.302 1.583 1.81 1.997 2.192 2.366 2.646 2.782 2.908 2.778 3.252 3.363 3.563 3.757 3.952 4.05 4.24 4.41 4.649 4.8 4.936 5.147 5.359 5.541 5.699 5.863 6.078 6.256 6.426 6.639 6.842 7.037 7.252 7.502 7.756 8.033 8.336 8.637 8.932 9.266 9.645 10.008 10.416 10.842 11.29 11.729 12.108 12.441 12.563 12.2 11.623 11.003 10.415 9.839 9.311 8.812 8.38 7.923 7.513 7.158 6.811 6.479 6.154 5.849 5.541 5.26 5.001 4.718 4.439 4.209 3.957 3.698 3.495 3.278 3.05 2.819 2.584 2.412 2.221 1.91 1.698 1.492 1.382 1.147 0.896 0.626 0.491 -0.01 0.049 -0.116 -0.292 -0.691 -0.909 -1.169 -1.493 -1.825 -2.229 -2.815 -4.214 -4 ,14229 ,TETRA ,17590973,Sat Nov 27 22:09:38 CET,Sun Nov 28 00:29:19 CET,0.0 1.354 1.702 1.949 2.158 2.364 2.566 2.757 3.107 3.272 3.434 3.373 3.87 3.995 4.216 4.422 4.623 4.714 4.896 5.065 5.306 5.468 5.629 5.835 6.023 6.215 6.395 6.553 6.749 6.945 7.137 7.371 7.598 7.817 8.062 8.352 8.616 8.87 9.15 9.456 9.764 10.069 10.414 10.771 11.173 11.575 12.008 12.474 12.927 13.26 13.233 12.702 12.064 11.41 10.739 10.077 9.514 9.03 8.604 8.139 7.706 7.325 6.963 6.608 6.281 5.979 5.654 5.363 5.104 4.83 4.542 4.302 4.056 3.788 3.562 3.327 3.087 2.829 2.574 2.399 2.218 1.929 1.718 1.492 1.377 1.135 0.88 0.614 0.468 -0.048 -0.03 -0.199 -0.368 -0.785 -1.019 -1.268 -1.55 -1.845 -2.172 -2.6 -3.566 -5 ,641 ,TETRA ,17590974,Sat Nov 27 22:09:38 CET,Sun Nov 28 00:27:38 CET,0.0 1.027 1.429 1.729 1.981 2.209 2.41 2.577 2.855 2.987 3.117 2.986 3.458 3.57 3.78 3.986 4.197 4.296 4.484 4.662 4.892 5.031 5.166 5.348 5.527 5.707 5.887 6.063 6.272 6.479 6.676 6.926 7.163 7.371 7.623 7.912 8.164 8.43 8.714 9.016 9.315 9.639 10.025 10.376 10.767 11.179 11.607 12.069 12.523 12.892 13.052 12.739 12.213 11.652 11.048 10.467 9.962 9.488 9.053 8.556 8.11 7.723 7.35 6.997 6.664 6.356 6.02 5.708 5.44 5.167 4.881 4.633 4.38 4.129 3.93 3.72 3.495 3.237 2.972 2.8 2.623 2.335 2.129 1.92 1.804 1.557 1.299 1.028 0.889 0.392 0.462 0.297 0.127 -0.252 -0.477 -0.722 -0.99 -1.272 -1.619 -2.079 -3.364 -6 ,3533 ,TETRA ,17590975,Sat Nov 27 22:09:41 CET,Sun Nov 28 00:29:32 CET,0.0 0.801 1.159 1.387 1.615 1.841 2.026 2.186 2.471 2.598 2.72 2.588 3.059 3.173 3.38 3.574 3.763 3.85 4.007 4.16 4.388 4.527 4.661 4.88 5.092 5.276 5.447 5.623 5.854 6.063 6.261 6.517 6.765 6.98 7.219 7.495 7.743 7.999 8.291 8.62 8.936 9.264 9.64 9.988 10.394 10.842 11.268 11.655 12.04 12.346 12.327 11.88 11.365 10.836 10.297 9.73 9.176 8.656 8.179 7.68 7.214 6.79 6.401 6.04 5.709 5.4 5.071 4.777 4.523 4.262 3.986 3.743 3.477 3.204 2.986 2.752 2.513 2.268 2.019 1.837 1.643 1.33 1.119 0.902 0.778 0.531 0.278 0.015 -0.122 -0.624 -0.563 -0.724 -0.909 -1.305 -1.509 -1.727 -1.975 -2.275 -2.61 -3.042 -4.265 -7 ,11495 ,TETRA ,17590976,Sat Nov 27 22:09:38 CET,Sun Nov 28 00:21:51 CET,0.0 0.757 1.066 1.313 1.51 1.688 1.853 2.009 2.304 2.446 2.574 2.435 2.9 3.008 3.205 3.403 3.595 3.687 3.87 4.047 4.29 4.429 4.56 4.761 4.951 5.124 5.295 5.463 5.666 5.861 6.054 6.291 6.518 6.727 6.961 7.207 7.449 7.726 8.025 8.335 8.636 8.957 9.314 9.649 10.024 10.41 10.83 11.26 11.668 12.045 12.167 11.743 11.132 10.523 9.923 9.342 8.811 8.305 7.858 7.378 6.957 6.603 6.243 5.881 5.566 5.276 4.939 4.634 4.371 4.096 3.811 3.565 3.305 3.031 2.813 2.583 2.344 2.114 1.867 1.684 1.497 1.195 0.99 0.776 0.665 0.436 0.167 -0.113 -0.246 -0.741 -0.675 -0.835 -1.01 -1.384 -1.597 -1.836 -2.085 -2.362 -2.758 -3.311 -4.723 -8 ,12223 ,TETRA ,17590977,Sat Nov 27 22:09:38 CET,Sun Nov 28 00:24:08 CET,0.0 1.075 1.457 1.706 1.957 2.189 2.36 2.51 2.8 2.94 3.084 2.991 3.471 3.587 3.808 4.023 4.227 4.319 4.499 4.665 4.898 5.053 5.198 5.403 5.583 5.755 5.939 6.112 6.331 6.544 6.745 6.985 7.216 7.448 7.713 7.994 8.254 8.53 8.817 9.102 9.394 9.724 10.077 10.436 10.867 11.282 11.753 12.264 12.707 13.061 13.11 12.692 12.139 11.528 10.932 10.391 9.915 9.462 9.047 8.611 8.223 7.854 7.483 7.136 6.791 6.478 6.165 5.883 5.632 5.364 5.088 4.839 4.566 4.296 4.085 3.864 3.644 3.411 3.159 2.979 2.789 2.494 2.285 2.074 1.964 1.729 1.488 1.231 1.102 0.605 0.679 0.529 0.373 0.01 -0.2 -0.438 -0.671 -0.945 -1.316 -1.83 -2.979 -9 ,17068 ,TETRA ,17590978,Sat Nov 27 22:10:38 CET,Sun Nov 28 00:21:57 CET,0.0 0.736 1.071 1.316 1.534 1.762 1.981 2.172 2.51 2.652 2.787 2.673 3.143 3.248 3.444 3.636 3.821 3.907 4.079 4.241 4.473 4.618 4.772 5.01 5.221 5.416 5.596 5.777 6.013 6.228 6.43 6.66 6.882 7.092 7.318 7.581 7.822 8.074 8.358 8.65 8.93 9.239 9.608 9.97 10.379 10.8 11.214 11.631 12.041 12.372 12.426 12.075 11.552 10.932 10.306 9.69 9.134 8.641 8.176 7.681 7.265 6.896 6.539 6.201 5.869 5.56 5.235 4.928 4.663 4.395 4.112 3.883 3.641 3.37 3.148 2.919 2.674 2.413 2.146 1.956 1.769 1.491 1.299 1.096 0.982 0.74 0.486 0.213 0.067 -0.444 -0.388 -0.546 -0.72 -1.113 -1.323 -1.541 -1.787 -2.068 -2.416 -2.916 -4.118 -10 ,20907 ,TETRA ,17590979,Sat Nov 27 22:10:39 CET,Sun Nov 28 00:23:24 CET,0.0 0.666 0.994 1.286 1.554 1.787 2.007 2.207 2.516 2.652 2.791 2.685 3.161 3.271 3.491 3.716 3.925 4.022 4.198 4.365 4.62 4.788 4.938 5.136 5.339 5.537 5.704 5.869 6.074 6.273 6.478 6.732 6.968 7.184 7.444 7.728 7.986 8.253 8.544 8.846 9.148 9.457 9.803 10.157 10.557 10.991 11.406 11.766 12.132 12.438 12.473 12.097 11.55 10.976 10.383 9.811 9.264 8.732 8.263 7.765 7.315 6.933 6.587 6.252 5.926 5.612 5.274 4.977 4.722 4.449 4.161 3.913 3.666 3.408 3.202 2.975 2.728 2.481 2.226 2.04 1.852 1.552 1.344 1.142 1.034 0.803 0.551 0.272 0.129 -0.374 -0.335 -0.506 -0.691 -1.108 -1.338 -1.595 -1.886 -2.217 -2.615 -3.133 -4.638 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt deleted file mode 100644 index b0cf7f2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32379 ,TETRA ,17590980,Sat Nov 27 22:10:41 CET,Sun Nov 28 00:23:49 CET,0.0 1.933 2.501 2.912 3.273 3.595 3.878 4.119 4.539 4.728 4.899 4.864 5.362 5.503 5.749 5.994 6.245 6.354 6.569 6.773 7.067 7.257 7.437 7.688 7.931 8.172 8.377 8.558 8.8 9.052 9.297 9.584 9.869 10.129 10.4 10.691 10.97 11.267 11.571 11.878 12.175 12.5 12.84 13.138 13.468 13.801 14.138 14.415 14.589 14.532 14.043 13.005 11.91 10.915 10.0 9.123 8.319 7.567 6.933 6.29 5.715 5.214 4.739 4.27 3.827 3.429 3.019 2.646 2.321 1.989 1.643 1.36 1.062 0.738 0.48 0.212 -0.048 -0.313 -0.603 -0.806 -1.014 -1.344 -1.582 -1.828 -1.956 -2.222 -2.504 -2.782 -2.928 -3.447 -3.418 -3.61 -3.818 -4.267 -4.528 -4.804 -5.103 -5.46 -5.89 -6.454 -7.956 -2 ,9566 ,TETRA ,17590981,Sat Nov 27 22:10:43 CET,Sun Nov 28 00:23:03 CET,0.0 2.116 2.605 2.975 3.308 3.586 3.829 4.06 4.456 4.64 4.812 4.762 5.273 5.412 5.678 5.931 6.177 6.291 6.492 6.694 6.996 7.162 7.312 7.562 7.806 8.031 8.244 8.452 8.719 8.949 9.157 9.431 9.699 9.942 10.224 10.534 10.808 11.106 11.437 11.751 12.049 12.39 12.742 13.067 13.439 13.778 14.113 14.39 14.557 14.51 13.887 12.785 11.686 10.621 9.641 8.766 7.996 7.292 6.685 6.054 5.527 5.068 4.607 4.141 3.707 3.332 2.954 2.618 2.311 1.977 1.631 1.342 1.047 0.745 0.506 0.238 -0.055 -0.359 -0.677 -0.879 -1.083 -1.429 -1.668 -1.909 -2.033 -2.291 -2.565 -2.839 -2.989 -3.526 -3.504 -3.684 -3.879 -4.353 -4.633 -4.928 -5.257 -5.683 -6.15 -6.728 -8.775 -3 ,24153 ,TETRA ,17590982,Sat Nov 27 22:10:45 CET,Sun Nov 28 00:22:18 CET,0.0 1.565 2.113 2.47 2.759 3.041 3.304 3.538 3.946 4.121 4.295 4.266 4.769 4.899 5.146 5.39 5.626 5.739 5.958 6.163 6.431 6.598 6.755 6.979 7.206 7.433 7.632 7.817 8.069 8.314 8.553 8.819 9.054 9.277 9.543 9.841 10.121 10.44 10.749 11.052 11.359 11.68 12.011 12.335 12.711 13.058 13.396 13.709 13.903 13.815 13.187 12.026 10.861 9.805 8.879 8.029 7.257 6.53 5.848 5.178 4.644 4.144 3.64 3.188 2.786 2.408 1.984 1.593 1.26 0.903 0.515 0.19 -0.149 -0.497 -0.755 -1.012 -1.295 -1.609 -1.941 -2.171 -2.408 -2.78 -3.034 -3.303 -3.444 -3.728 -4.008 -4.297 -4.459 -5.002 -4.981 -5.174 -5.377 -5.816 -6.081 -6.35 -6.654 -7.021 -7.488 -8.168 -9.987 -4 ,28850 ,TETRA ,17590983,Sat Nov 27 22:10:39 CET,Sun Nov 28 00:24:01 CET,0.0 2.111 2.691 3.062 3.384 3.657 3.9 4.146 4.608 4.796 4.979 4.958 5.474 5.625 5.893 6.16 6.425 6.544 6.755 6.963 7.259 7.438 7.607 7.844 8.064 8.29 8.509 8.71 8.968 9.211 9.448 9.753 10.033 10.277 10.564 10.864 11.127 11.416 11.71 12.024 12.356 12.711 13.081 13.392 13.722 14.075 14.397 14.654 14.826 14.731 14.157 13.1 11.981 10.94 10.066 9.281 8.518 7.773 7.127 6.491 5.958 5.492 5.032 4.583 4.166 3.794 3.401 3.029 2.703 2.372 2.03 1.742 1.438 1.134 0.892 0.62 0.335 0.048 -0.253 -0.462 -0.67 -0.998 -1.236 -1.475 -1.598 -1.871 -2.167 -2.49 -2.651 -3.179 -3.168 -3.368 -3.577 -4.011 -4.264 -4.559 -4.875 -5.244 -5.677 -6.218 -7.827 -5 ,6400 ,TETRA ,17590984,Sat Nov 27 22:10:41 CET,Sun Nov 28 00:24:47 CET,0.0 2.422 2.961 3.349 3.638 3.884 4.146 4.398 4.806 4.974 5.137 5.126 5.657 5.816 6.087 6.323 6.556 6.67 6.883 7.09 7.39 7.566 7.721 7.956 8.182 8.391 8.592 8.785 9.033 9.266 9.5 9.784 10.033 10.255 10.522 10.822 11.095 11.389 11.693 11.993 12.294 12.616 12.964 13.297 13.669 14.013 14.315 14.616 14.845 14.77 14.155 13.102 12.026 10.966 10.002 9.119 8.328 7.601 6.965 6.294 5.719 5.204 4.724 4.282 3.863 3.478 3.043 2.652 2.325 1.984 1.621 1.295 0.953 0.608 0.34 0.058 -0.245 -0.558 -0.855 -1.061 -1.286 -1.651 -1.912 -2.161 -2.281 -2.543 -2.842 -3.155 -3.32 -3.872 -3.866 -4.057 -4.264 -4.714 -4.973 -5.258 -5.548 -5.853 -6.255 -6.813 -8.881 -6 ,963 ,TETRA ,17590985,Sat Nov 27 21:26:17 CET,Sat Nov 27 23:35:52 CET,0.0 2.774 3.37 3.801 4.136 4.39 4.631 4.867 5.297 5.5 5.675 5.63 6.14 6.283 6.531 6.768 7.004 7.125 7.36 7.576 7.865 8.036 8.215 8.485 8.73 8.964 9.196 9.409 9.659 9.911 10.166 10.452 10.689 10.92 11.211 11.531 11.826 12.14 12.46 12.775 13.083 13.4 13.761 14.107 14.461 14.814 15.153 15.401 15.548 15.537 15.067 13.957 12.828 11.859 10.987 10.128 9.32 8.561 7.901 7.264 6.739 6.264 5.79 5.343 4.914 4.521 4.116 3.752 3.448 3.115 2.749 2.439 2.134 1.822 1.566 1.298 1.012 0.693 0.337 0.106 -0.112 -0.458 -0.695 -0.939 -1.069 -1.346 -1.632 -1.904 -2.063 -2.618 -2.639 -2.84 -3.043 -3.473 -3.701 -3.98 -4.298 -4.678 -5.168 -5.716 -7.224 -7 ,16088 ,TETRA ,17590986,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:38:43 CET,0.0 1.868 2.469 2.909 3.26 3.557 3.797 4.005 4.406 4.599 4.777 4.702 5.2 5.343 5.624 5.907 6.159 6.275 6.504 6.717 7.007 7.191 7.356 7.571 7.784 7.992 8.195 8.386 8.627 8.867 9.106 9.385 9.639 9.887 10.153 10.434 10.705 10.994 11.325 11.65 11.958 12.28 12.628 12.985 13.383 13.755 14.111 14.443 14.664 14.662 14.182 13.091 11.951 10.928 10.002 9.097 8.289 7.558 6.918 6.273 5.721 5.215 4.74 4.292 3.854 3.446 3.007 2.634 2.324 1.985 1.635 1.351 1.039 0.699 0.426 0.151 -0.135 -0.463 -0.779 -0.977 -1.19 -1.53 -1.764 -2.012 -2.147 -2.421 -2.708 -3.016 -3.191 -3.753 -3.793 -4.013 -4.224 -4.695 -4.981 -5.304 -5.667 -6.051 -6.432 -7.051 -8.95 -8 ,23710 ,TETRA ,17590987,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:41:30 CET,0.0 1.886 2.456 2.877 3.214 3.498 3.73 3.961 4.4 4.568 4.718 4.654 5.154 5.293 5.552 5.787 5.994 6.095 6.297 6.48 6.742 6.914 7.083 7.333 7.579 7.808 8.02 8.232 8.503 8.729 8.947 9.22 9.469 9.697 9.959 10.276 10.567 10.841 11.121 11.432 11.747 12.063 12.432 12.764 13.126 13.489 13.792 14.043 14.188 14.125 13.583 12.495 11.337 10.259 9.354 8.524 7.781 7.05 6.423 5.812 5.258 4.758 4.28 3.843 3.438 3.07 2.685 2.324 2.003 1.674 1.346 1.06 0.769 0.467 0.22 -0.038 -0.313 -0.582 -0.866 -1.07 -1.279 -1.616 -1.855 -2.099 -2.231 -2.498 -2.783 -3.105 -3.28 -3.83 -3.836 -4.025 -4.214 -4.595 -4.82 -5.077 -5.369 -5.716 -6.151 -6.759 -8.431 -9 ,1125 ,TETRA ,17590988,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:37:41 CET,0.0 2.681 3.26 3.68 4.037 4.351 4.618 4.837 5.263 5.448 5.619 5.605 6.1 6.247 6.559 6.842 7.079 7.191 7.411 7.609 7.884 8.062 8.237 8.488 8.727 8.96 9.177 9.386 9.648 9.898 10.14 10.413 10.668 10.904 11.162 11.443 11.708 11.988 12.282 12.6 12.939 13.303 13.67 14.014 14.376 14.7 15.044 15.332 15.482 15.397 14.939 14.037 13.019 12.035 11.15 10.348 9.605 8.904 8.322 7.741 7.23 6.752 6.26 5.809 5.389 5.004 4.62 4.272 3.96 3.637 3.29 2.995 2.689 2.357 2.098 1.843 1.571 1.277 0.966 0.748 0.534 0.195 -0.052 -0.315 -0.449 -0.711 -0.987 -1.275 -1.426 -1.975 -2.009 -2.207 -2.423 -2.897 -3.136 -3.391 -3.675 -3.964 -4.381 -4.953 -6.421 -10 ,893 ,TETRA ,17590989,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:38:16 CET,0.0 1.662 2.142 2.524 2.812 3.071 3.301 3.507 3.897 4.09 4.276 4.261 4.781 4.925 5.188 5.446 5.68 5.795 6.029 6.238 6.514 6.687 6.876 7.169 7.433 7.67 7.887 8.092 8.349 8.587 8.806 9.068 9.325 9.559 9.821 10.126 10.41 10.704 11.018 11.344 11.667 12.021 12.435 12.81 13.191 13.544 13.903 14.219 14.368 14.265 13.645 12.531 11.44 10.4 9.395 8.435 7.545 6.729 6.052 5.393 4.826 4.303 3.789 3.33 2.894 2.465 2.026 1.641 1.308 0.955 0.605 0.331 0.041 -0.27 -0.519 -0.775 -1.044 -1.339 -1.647 -1.861 -2.081 -2.409 -2.641 -2.884 -3.004 -3.262 -3.548 -3.841 -4.001 -4.533 -4.493 -4.664 -4.849 -5.287 -5.55 -5.814 -6.082 -6.391 -6.86 -7.497 -10.057 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt deleted file mode 100644 index 7bf14e80..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14622 ,TETRA ,17590990,Sat Nov 27 21:26:13 CET,Sat Nov 27 23:37:28 CET,0.0 0.958 1.412 1.78 2.091 2.354 2.598 2.851 3.324 3.519 3.692 3.648 4.183 4.332 4.628 4.921 5.192 5.315 5.571 5.812 6.136 6.338 6.543 6.847 7.136 7.416 7.7 7.981 8.336 8.669 8.987 9.369 9.731 10.078 10.479 10.912 11.319 11.76 12.228 12.734 13.268 13.86 14.565 15.292 16.155 17.097 18.15 19.327 20.65 22.144 23.807 24.941 25.395 25.506 25.441 25.255 24.999 24.709 24.435 24.161 23.885 23.588 23.303 23.039 22.781 22.519 22.213 21.92 21.662 21.401 21.126 20.893 20.644 20.379 20.158 19.922 19.682 19.42 19.144 18.955 18.736 18.409 18.192 17.963 17.851 17.584 17.259 16.899 16.714 16.168 16.153 15.955 15.743 15.241 14.962 14.669 14.348 13.968 13.478 12.8 10.973 -2 ,26802 ,TETRA ,17590991,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:42:59 CET,0.0 1.277 1.794 2.18 2.512 2.818 3.1 3.351 3.819 4.029 4.208 4.152 4.697 4.853 5.168 5.473 5.766 5.903 6.153 6.403 6.762 6.992 7.218 7.532 7.819 8.104 8.386 8.673 9.047 9.392 9.726 10.112 10.481 10.844 11.263 11.711 12.124 12.607 13.156 13.717 14.272 14.898 15.617 16.314 17.127 18.041 19.074 20.254 21.622 23.126 24.777 25.913 26.338 26.437 26.363 26.156 25.864 25.531 25.214 24.882 24.564 24.243 23.921 23.608 23.326 23.069 22.77 22.469 22.189 21.906 21.626 21.384 21.126 20.853 20.644 20.428 20.198 19.959 19.708 19.513 19.301 18.977 18.76 18.527 18.401 18.124 17.801 17.455 17.28 16.73 16.707 16.491 16.264 15.774 15.486 15.178 14.843 14.421 13.915 13.235 11.556 -3 ,24217 ,TETRA ,17590992,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:37:45 CET,0.0 1.018 1.414 1.754 2.061 2.319 2.543 2.744 3.119 3.314 3.5 3.459 4.0 4.152 4.441 4.695 4.947 5.07 5.3 5.517 5.835 6.041 6.25 6.555 6.842 7.108 7.354 7.597 7.927 8.252 8.573 8.963 9.326 9.645 9.998 10.414 10.805 11.235 11.707 12.212 12.759 13.384 14.111 14.835 15.668 16.559 17.552 18.685 19.943 21.397 23.093 24.305 24.828 24.966 24.884 24.736 24.539 24.314 24.105 23.851 23.597 23.336 23.048 22.748 22.457 22.199 21.911 21.632 21.402 21.176 20.932 20.709 20.47 20.212 20.009 19.79 19.561 19.33 19.08 18.903 18.721 18.421 18.204 17.983 17.862 17.609 17.339 17.054 16.907 16.394 16.404 16.206 15.992 15.554 15.324 15.067 14.763 14.396 13.959 13.351 10.874 -4 ,8854 ,TETRA ,17590993,Sat Nov 27 21:26:15 CET,Sat Nov 27 23:37:57 CET,0.0 0.825 1.255 1.587 1.885 2.184 2.455 2.699 3.117 3.309 3.497 3.433 3.957 4.099 4.386 4.648 4.893 5.016 5.26 5.473 5.769 5.97 6.168 6.46 6.748 7.026 7.28 7.527 7.867 8.207 8.531 8.912 9.278 9.634 10.04 10.489 10.922 11.395 11.905 12.453 13.023 13.675 14.447 15.208 16.094 17.108 18.232 19.427 20.85 22.474 24.242 25.515 26.037 26.166 26.09 25.91 25.672 25.417 25.165 24.861 24.591 24.356 24.106 23.849 23.611 23.344 23.042 22.767 22.531 22.3 22.036 21.811 21.578 21.32 21.12 20.914 20.699 20.471 20.219 20.044 19.852 19.541 19.331 19.12 19.004 18.753 18.484 18.19 18.037 17.517 17.546 17.362 17.164 16.726 16.48 16.203 15.897 15.521 15.019 14.425 12.595 -5 ,12914 ,TETRA ,17590994,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:37:51 CET,0.0 1.073 1.497 1.803 2.06 2.288 2.508 2.72 3.106 3.285 3.456 3.399 3.927 4.069 4.356 4.636 4.889 5.014 5.257 5.486 5.83 6.046 6.248 6.549 6.826 7.084 7.33 7.569 7.897 8.204 8.483 8.816 9.152 9.482 9.877 10.332 10.76 11.206 11.656 12.154 12.701 13.335 14.094 14.826 15.672 16.599 17.628 18.796 20.157 21.702 23.371 24.518 25.003 25.196 25.229 25.076 24.85 24.63 24.414 24.139 23.872 23.623 23.359 23.093 22.844 22.595 22.327 22.059 21.817 21.561 21.286 21.073 20.833 20.573 20.374 20.159 19.936 19.696 19.436 19.257 19.072 18.791 18.582 18.343 18.218 17.968 17.692 17.394 17.237 16.709 16.726 16.542 16.363 15.963 15.73 15.463 15.163 14.799 14.343 13.723 12.078 -6 ,20446 ,TETRA ,17590995,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:37:50 CET,0.0 0.807 1.269 1.619 1.901 2.156 2.389 2.606 2.989 3.162 3.327 3.255 3.788 3.948 4.24 4.5 4.743 4.863 5.104 5.335 5.655 5.85 6.042 6.329 6.608 6.876 7.133 7.381 7.704 8.023 8.333 8.698 9.046 9.384 9.789 10.247 10.67 11.123 11.64 12.187 12.723 13.334 14.073 14.827 15.693 16.611 17.6 18.699 19.996 21.438 23.046 24.168 24.637 24.763 24.683 24.517 24.325 24.119 23.908 23.65 23.37 23.088 22.812 22.539 22.26 21.988 21.701 21.461 21.251 21.011 20.749 20.523 20.288 20.068 19.887 19.687 19.478 19.236 18.97 18.794 18.604 18.291 18.073 17.851 17.737 17.487 17.231 16.96 16.821 16.311 16.317 16.116 15.926 15.49 15.233 14.969 14.652 14.257 13.763 13.166 11.529 -7 ,16745 ,TETRA ,17590996,Sat Nov 27 21:26:13 CET,Sat Nov 27 23:38:38 CET,0.0 1.158 1.612 1.943 2.208 2.426 2.645 2.856 3.242 3.419 3.583 3.507 4.036 4.174 4.46 4.748 5.018 5.143 5.367 5.596 5.939 6.143 6.344 6.64 6.917 7.18 7.439 7.69 8.026 8.35 8.654 9.026 9.385 9.727 10.13 10.577 11.002 11.469 11.962 12.495 13.062 13.686 14.409 15.128 15.95 16.881 17.993 19.207 20.541 22.04 23.579 24.632 25.116 25.245 25.141 24.972 24.797 24.576 24.312 24.02 23.756 23.458 23.168 22.895 22.621 22.376 22.107 21.838 21.592 21.348 21.073 20.817 20.546 20.285 20.083 19.867 19.637 19.382 19.097 18.9 18.715 18.441 18.228 17.997 17.88 17.632 17.363 17.074 16.923 16.402 16.443 16.256 16.052 15.577 15.302 15.013 14.683 14.308 13.865 13.2 11.427 -8 ,26724 ,TETRA ,17590997,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:37:46 CET,0.0 1.227 1.678 2.021 2.309 2.568 2.806 3.039 3.433 3.596 3.751 3.686 4.22 4.36 4.633 4.89 5.128 5.246 5.483 5.712 6.027 6.241 6.454 6.742 7.024 7.304 7.563 7.795 8.094 8.391 8.687 9.05 9.4 9.72 10.104 10.55 10.978 11.45 11.948 12.473 13.017 13.638 14.347 15.043 15.868 16.769 17.782 18.935 20.283 21.808 23.431 24.491 24.978 25.122 25.015 24.842 24.672 24.464 24.237 23.982 23.728 23.467 23.204 22.936 22.66 22.405 22.133 21.878 21.649 21.409 21.16 20.949 20.707 20.43 20.221 19.991 19.748 19.521 19.283 19.103 18.897 18.554 18.329 18.117 18.007 17.754 17.49 17.211 17.05 16.499 16.44 16.218 16.013 15.583 15.321 15.032 14.705 14.324 13.832 13.159 10.971 -9 ,20012 ,TETRA ,17590998,Sat Nov 27 21:26:13 CET,Sat Nov 27 23:30:27 CET,0.0 1.04 1.436 1.742 1.995 2.226 2.446 2.652 3.017 3.178 3.339 3.273 3.797 3.938 4.211 4.461 4.701 4.817 5.041 5.265 5.6 5.814 6.018 6.319 6.61 6.878 7.13 7.367 7.672 7.995 8.332 8.711 9.041 9.364 9.743 10.173 10.587 11.04 11.526 12.04 12.588 13.196 13.928 14.678 15.536 16.491 17.575 18.737 20.041 21.551 23.216 24.415 24.9 25.023 25.026 24.899 24.699 24.472 24.223 23.944 23.677 23.407 23.142 22.87 22.59 22.321 22.031 21.755 21.513 21.258 20.969 20.732 20.5 20.243 20.035 19.806 19.567 19.336 19.083 18.891 18.689 18.359 18.132 17.907 17.786 17.514 17.24 16.956 16.808 16.294 16.32 16.128 15.921 15.428 15.138 14.846 14.535 14.139 13.651 13.013 11.289 -10 ,22404 ,TETRA ,17590999,Sat Nov 27 21:26:14 CET,Sat Nov 27 23:37:59 CET,0.0 0.926 1.363 1.717 2.027 2.299 2.524 2.723 3.085 3.253 3.424 3.384 3.92 4.067 4.35 4.625 4.885 5.008 5.254 5.501 5.842 6.05 6.256 6.545 6.814 7.069 7.308 7.559 7.896 8.207 8.518 8.883 9.225 9.576 9.977 10.41 10.81 11.261 11.765 12.29 12.833 13.434 14.142 14.847 15.648 16.521 17.516 18.639 19.942 21.477 23.201 24.383 24.883 25.048 25.017 24.867 24.656 24.432 24.194 23.909 23.619 23.331 23.066 22.794 22.508 22.239 21.968 21.723 21.51 21.27 21.016 20.79 20.527 20.247 20.042 19.839 19.617 19.364 19.079 18.883 18.698 18.38 18.134 17.887 17.762 17.493 17.207 16.893 16.71 16.147 16.107 15.903 15.681 15.19 14.927 14.638 14.287 13.889 13.439 12.812 10.271 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt deleted file mode 100644 index d0bbcc6c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7864 ,TETRA ,17591000,Sat Nov 27 21:26:14 CET,Sat Nov 27 23:38:40 CET,0.0 2.027 2.579 3.018 3.393 3.714 4.022 4.307 4.784 5.022 5.248 5.256 5.831 6.009 6.353 6.68 6.992 7.13 7.387 7.65 8.031 8.28 8.529 8.885 9.214 9.528 9.837 10.134 10.518 10.879 11.214 11.624 12.021 12.402 12.868 13.391 13.904 14.498 15.137 15.784 16.454 17.251 18.185 19.125 20.203 21.391 22.736 24.232 25.994 28.072 30.462 32.156 32.901 33.19 33.278 33.241 33.097 32.843 32.6 32.367 32.11 31.83 31.543 31.226 30.891 30.616 30.351 30.1 29.869 29.622 29.336 29.073 28.788 28.485 28.242 27.991 27.729 27.468 27.195 26.989 26.752 26.34 26.047 25.744 25.594 25.303 24.994 24.63 24.431 23.876 23.754 23.478 23.206 22.61 22.264 21.841 21.344 20.766 20.072 19.134 15.585 -2 ,16684 ,TETRA ,17591001,Sat Nov 27 21:26:13 CET,Sat Nov 27 23:38:01 CET,0.0 2.285 2.886 3.35 3.759 4.117 4.455 4.755 5.291 5.533 5.733 5.734 6.307 6.492 6.826 7.138 7.456 7.613 7.907 8.18 8.57 8.83 9.079 9.437 9.776 10.086 10.402 10.722 11.125 11.505 11.866 12.306 12.728 13.129 13.603 14.143 14.663 15.216 15.809 16.458 17.151 17.941 18.832 19.729 20.845 22.106 23.506 25.065 26.858 28.837 31.187 33.014 33.884 34.371 34.637 34.729 34.694 34.544 34.366 34.204 34.027 33.79 33.508 33.219 32.953 32.691 32.385 32.107 31.867 31.606 31.338 31.11 30.829 30.52 30.287 30.041 29.757 29.431 29.102 28.896 28.673 28.303 28.06 27.802 27.658 27.339 27.001 26.622 26.405 25.836 25.764 25.506 25.241 24.616 24.235 23.83 23.424 22.96 22.381 21.559 14.257 -3 ,11853 ,TETRA ,17591002,Sat Nov 27 21:26:14 CET,Sat Nov 27 23:38:41 CET,0.0 2.116 2.798 3.324 3.762 4.152 4.478 4.785 5.327 5.573 5.798 5.833 6.412 6.596 6.942 7.28 7.588 7.733 8.019 8.302 8.725 8.99 9.243 9.61 9.951 10.284 10.596 10.885 11.272 11.635 11.983 12.416 12.825 13.223 13.72 14.3 14.836 15.414 16.048 16.702 17.37 18.161 19.111 20.043 21.116 22.345 23.73 25.257 27.048 29.087 31.472 33.292 34.168 34.487 34.559 34.547 34.472 34.297 34.022 33.676 33.35 33.048 32.752 32.445 32.136 31.837 31.508 31.171 30.884 30.627 30.334 30.072 29.814 29.546 29.316 29.068 28.813 28.54 28.234 27.997 27.762 27.407 27.164 26.903 26.754 26.431 26.078 25.695 25.511 24.966 24.922 24.7 24.449 23.867 23.529 23.19 22.807 22.324 21.694 20.806 18.677 -4 ,1087 ,TETRA ,17591003,Sat Nov 27 21:26:14 CET,Sat Nov 27 23:35:56 CET,0.0 2.042 2.654 3.138 3.514 3.81 4.107 4.432 5.074 5.345 5.589 5.646 6.227 6.421 6.769 7.105 7.445 7.616 7.953 8.25 8.64 8.896 9.146 9.537 9.91 10.24 10.567 10.889 11.292 11.671 12.052 12.532 12.982 13.4 13.891 14.458 14.996 15.579 16.207 16.88 17.577 18.356 19.29 20.203 21.256 22.469 23.896 25.518 27.406 29.594 32.081 33.981 34.865 35.293 35.462 35.437 35.273 35.062 34.849 34.579 34.327 34.079 33.809 33.521 33.23 32.949 32.615 32.294 32.032 31.749 31.429 31.163 30.869 30.535 30.29 30.038 29.77 29.448 29.068 28.821 28.585 28.227 27.971 27.694 27.55 27.24 26.892 26.506 26.3 25.745 25.695 25.451 25.185 24.595 24.265 23.903 23.476 23.033 22.548 21.818 18.405 -5 ,27139 ,TETRA ,17591004,Sat Nov 27 21:26:14 CET,Sat Nov 27 23:38:38 CET,0.0 2.559 3.124 3.558 3.911 4.209 4.47 4.736 5.222 5.432 5.643 5.652 6.222 6.419 6.812 7.143 7.442 7.589 7.872 8.146 8.548 8.8 9.05 9.443 9.811 10.136 10.441 10.749 11.175 11.573 11.948 12.379 12.767 13.146 13.582 14.082 14.584 15.15 15.752 16.394 17.074 17.831 18.704 19.583 20.623 21.798 23.168 24.697 26.412 28.401 30.801 32.538 33.335 33.666 33.747 33.723 33.608 33.438 33.24 32.978 32.73 32.488 32.214 31.946 31.68 31.404 31.104 30.825 30.587 30.321 30.019 29.766 29.512 29.248 29.03 28.793 28.527 28.251 27.963 27.762 27.561 27.24 26.988 26.707 26.567 26.287 25.998 25.682 25.503 24.949 24.869 24.635 24.362 23.792 23.502 23.164 22.785 22.361 21.827 20.952 13.753 -6 ,19694 ,TETRA ,17591005,Sat Nov 27 21:27:13 CET,Sat Nov 27 23:40:36 CET,0.0 2.267 2.806 3.305 3.729 4.088 4.42 4.716 5.195 5.405 5.605 5.63 6.22 6.416 6.809 7.151 7.449 7.601 7.906 8.185 8.577 8.826 9.062 9.408 9.738 10.044 10.348 10.651 11.035 11.417 11.79 12.259 12.713 13.126 13.6 14.134 14.656 15.237 15.857 16.504 17.206 18.007 18.93 19.884 20.972 22.17 23.528 25.031 26.843 29.025 31.475 33.246 34.14 34.612 34.809 34.798 34.724 34.538 34.301 34.059 33.79 33.51 33.228 32.982 32.747 32.494 32.204 31.943 31.711 31.46 31.172 30.904 30.624 30.344 30.149 29.925 29.648 29.36 29.053 28.837 28.619 28.275 28.018 27.746 27.586 27.226 26.906 26.595 26.424 25.875 25.781 25.535 25.265 24.665 24.355 24.022 23.599 23.072 22.412 21.592 19.029 -7 ,12936 ,TETRA ,17591006,Sat Nov 27 21:27:13 CET,Sat Nov 27 23:46:28 CET,0.0 2.233 2.785 3.176 3.533 3.874 4.171 4.449 4.958 5.179 5.389 5.417 5.989 6.175 6.525 6.875 7.206 7.36 7.668 7.939 8.309 8.549 8.786 9.149 9.495 9.819 10.129 10.421 10.802 11.163 11.51 11.961 12.397 12.802 13.25 13.764 14.269 14.806 15.393 16.025 16.685 17.434 18.315 19.225 20.287 21.446 22.787 24.262 25.958 27.962 30.312 32.036 32.843 33.231 33.398 33.361 33.239 33.072 32.884 32.627 32.361 32.105 31.858 31.611 31.32 31.023 30.709 30.435 30.181 29.902 29.634 29.428 29.202 28.932 28.717 28.466 28.201 27.94 27.662 27.446 27.214 26.854 26.577 26.296 26.163 25.879 25.572 25.219 25.02 24.453 24.391 24.155 23.913 23.393 23.05 22.649 22.198 21.679 21.068 20.231 16.077 -8 ,24986 ,TETRA ,17591007,Sat Nov 27 21:27:13 CET,Sat Nov 27 23:38:53 CET,0.0 1.758 2.413 2.901 3.287 3.594 3.873 4.165 4.716 4.965 5.196 5.212 5.792 5.982 6.346 6.689 7.025 7.173 7.443 7.728 8.145 8.41 8.672 9.038 9.394 9.752 10.091 10.414 10.819 11.202 11.577 12.037 12.487 12.916 13.406 13.942 14.471 15.055 15.658 16.315 16.997 17.764 18.671 19.588 20.678 21.895 23.3 24.864 26.65 28.797 31.239 33.022 33.953 34.311 34.411 34.368 34.226 34.07 33.873 33.598 33.324 33.053 32.79 32.501 32.203 31.933 31.64 31.346 31.106 30.876 30.609 30.369 30.102 29.812 29.582 29.348 29.099 28.834 28.533 28.306 28.079 27.704 27.425 27.128 26.982 26.67 26.312 25.932 25.739 25.187 25.114 24.875 24.62 24.061 23.725 23.357 22.985 22.56 21.948 21.128 17.545 -9 ,23197 ,TETRA ,17591008,Sat Nov 27 21:27:13 CET,Sat Nov 27 23:36:08 CET,0.0 1.831 2.369 2.812 3.206 3.55 3.85 4.115 4.593 4.816 5.021 5.034 5.615 5.817 6.201 6.554 6.885 7.042 7.328 7.605 8.007 8.253 8.501 8.872 9.228 9.586 9.921 10.235 10.654 11.056 11.433 11.877 12.303 12.719 13.206 13.77 14.308 14.863 15.466 16.123 16.803 17.542 18.402 19.28 20.312 21.486 22.848 24.373 26.061 28.014 30.285 31.943 32.687 32.949 32.971 32.916 32.847 32.697 32.492 32.227 31.981 31.783 31.576 31.327 31.035 30.767 30.494 30.185 29.881 29.588 29.306 29.06 28.799 28.529 28.286 28.022 27.737 27.448 27.17 26.959 26.746 26.413 26.149 25.863 25.716 25.439 25.132 24.766 24.573 24.009 23.934 23.717 23.478 22.905 22.528 22.109 21.673 21.153 20.56 19.764 15.871 -10 ,4878 ,TETRA ,17591009,Sat Nov 27 21:27:13 CET,Sat Nov 27 23:39:53 CET,0.0 2.212 2.799 3.236 3.612 3.949 4.231 4.483 4.946 5.159 5.37 5.4 5.976 6.166 6.545 6.914 7.248 7.392 7.665 7.925 8.291 8.526 8.757 9.12 9.479 9.811 10.106 10.382 10.76 11.145 11.532 11.977 12.396 12.814 13.296 13.811 14.313 14.886 15.518 16.199 16.907 17.679 18.585 19.499 20.545 21.741 23.132 24.697 26.572 28.628 30.731 32.248 33.05 33.412 33.447 33.284 33.092 32.874 32.628 32.382 32.154 31.887 31.578 31.243 30.913 30.605 30.256 29.944 29.662 29.368 29.066 28.803 28.523 28.228 27.995 27.766 27.528 27.26 26.94 26.699 26.465 26.12 25.871 25.603 25.459 25.146 24.804 24.422 24.226 23.644 23.514 23.261 23.004 22.403 22.048 21.658 21.229 20.722 20.097 19.222 16.008 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index 63b5aacd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13836 ,TETRA ,17591010,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:38:08 CET,0.0 1.729 2.255 2.619 2.939 3.213 3.457 3.68 4.064 4.249 4.429 4.364 4.871 5.019 5.306 5.563 5.804 5.924 6.148 6.36 6.655 6.837 7.024 7.287 7.535 7.774 8.011 8.245 8.525 8.795 9.066 9.383 9.671 9.959 10.281 10.644 10.999 11.371 11.769 12.184 12.626 13.129 13.68 14.22 14.844 15.502 16.211 16.99 17.843 18.723 19.485 19.682 19.561 19.312 19.005 18.652 18.292 17.926 17.571 17.205 16.872 16.563 16.265 15.969 15.663 15.384 15.097 14.83 14.59 14.326 14.054 13.847 13.63 13.374 13.185 13.002 12.796 12.587 12.37 12.206 12.037 11.76 11.553 11.341 11.229 11.002 10.758 10.487 10.354 9.871 9.933 9.77 9.596 9.226 8.992 8.722 8.451 8.155 7.755 7.212 5.293 -2 ,16344 ,TETRA ,17591011,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:37:31 CET,0.0 1.102 1.542 1.921 2.246 2.502 2.726 2.961 3.411 3.596 3.764 3.734 4.234 4.361 4.606 4.837 5.049 5.156 5.379 5.593 5.873 6.053 6.24 6.512 6.776 7.016 7.24 7.465 7.756 8.03 8.286 8.579 8.863 9.149 9.469 9.807 10.123 10.481 10.852 11.219 11.597 12.017 12.514 13.001 13.548 14.143 14.76 15.423 16.167 16.944 17.649 17.913 17.865 17.665 17.43 17.143 16.827 16.514 16.235 15.917 15.635 15.373 15.114 14.872 14.634 14.415 14.169 13.942 13.742 13.529 13.293 13.091 12.871 12.635 12.45 12.252 12.046 11.82 11.575 11.417 11.247 10.979 10.812 10.643 10.554 10.37 10.154 9.906 9.778 9.293 9.362 9.21 9.027 8.631 8.423 8.189 7.939 7.645 7.285 6.854 5.259 -3 ,6198 ,TETRA ,17591012,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:40:49 CET,0.0 1.445 1.958 2.316 2.603 2.877 3.147 3.38 3.75 3.914 4.058 3.968 4.465 4.591 4.827 5.064 5.301 5.408 5.622 5.822 6.097 6.28 6.45 6.692 6.941 7.176 7.391 7.604 7.866 8.125 8.379 8.672 8.949 9.2 9.487 9.817 10.141 10.484 10.835 11.209 11.626 12.079 12.579 13.101 13.69 14.338 15.062 15.841 16.668 17.511 18.3 18.602 18.539 18.292 17.967 17.61 17.254 16.922 16.601 16.24 15.915 15.619 15.325 15.031 14.747 14.49 14.203 13.941 13.724 13.481 13.219 12.991 12.727 12.464 12.282 12.081 11.871 11.643 11.393 11.224 11.045 10.734 10.519 10.304 10.187 9.956 9.699 9.414 9.27 8.774 8.848 8.693 8.53 8.152 7.925 7.679 7.404 7.068 6.638 6.06 4.351 -4 ,11777 ,TETRA ,17591013,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:42:19 CET,0.0 1.515 2.025 2.371 2.672 2.923 3.162 3.383 3.783 3.979 4.16 4.12 4.637 4.785 5.076 5.361 5.626 5.749 5.969 6.178 6.477 6.673 6.872 7.134 7.378 7.623 7.867 8.106 8.396 8.677 8.96 9.3 9.617 9.913 10.249 10.629 10.988 11.366 11.753 12.144 12.549 13.021 13.576 14.12 14.753 15.433 16.187 16.984 17.843 18.77 19.65 20.047 20.022 19.834 19.587 19.24 18.853 18.476 18.085 17.685 17.35 17.032 16.734 16.451 16.166 15.907 15.632 15.383 15.177 14.943 14.686 14.456 14.209 13.968 13.778 13.57 13.346 13.113 12.899 12.756 12.588 12.294 12.093 11.884 11.772 11.546 11.304 11.045 10.91 10.416 10.467 10.296 10.116 9.702 9.47 9.225 8.93 8.585 8.168 7.609 6.097 -5 ,16747 ,TETRA ,17591014,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:38:28 CET,0.0 1.429 1.97 2.367 2.69 2.98 3.228 3.455 3.841 4.013 4.181 4.138 4.628 4.761 5.027 5.275 5.518 5.634 5.857 6.064 6.345 6.536 6.725 6.999 7.247 7.477 7.691 7.884 8.13 8.374 8.61 8.89 9.153 9.409 9.723 10.084 10.415 10.767 11.137 11.511 11.912 12.367 12.867 13.348 13.883 14.467 15.093 15.798 16.557 17.319 18.105 18.446 18.366 18.154 17.881 17.513 17.142 16.77 16.436 16.065 15.714 15.426 15.137 14.823 14.529 14.27 13.992 13.725 13.497 13.269 13.026 12.822 12.603 12.364 12.173 11.978 11.781 11.573 11.344 11.181 11.015 10.755 10.572 10.387 10.29 10.079 9.856 9.607 9.472 8.977 9.035 8.865 8.678 8.3 8.098 7.87 7.602 7.258 6.825 6.221 4.327 -6 ,23233 ,TETRA ,17591015,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:38:32 CET,0.0 1.913 2.478 2.904 3.236 3.528 3.776 4.002 4.427 4.615 4.783 4.762 5.291 5.44 5.718 5.975 6.223 6.342 6.571 6.81 7.152 7.35 7.544 7.834 8.103 8.357 8.605 8.839 9.124 9.397 9.658 9.961 10.262 10.544 10.854 11.198 11.534 11.882 12.222 12.579 12.979 13.458 14.002 14.528 15.12 15.739 16.402 17.132 17.908 18.727 19.56 19.881 19.792 19.577 19.286 18.951 18.596 18.223 17.884 17.522 17.189 16.889 16.606 16.318 16.027 15.76 15.462 15.175 14.931 14.682 14.414 14.181 13.936 13.687 13.489 13.298 13.09 12.84 12.576 12.406 12.248 11.999 11.813 11.612 11.502 11.27 11.023 10.755 10.613 10.111 10.157 9.978 9.796 9.428 9.205 8.938 8.644 8.314 7.882 7.209 4.748 -7 ,24239 ,TETRA ,17591016,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:39:25 CET,0.0 1.243 1.735 2.08 2.371 2.629 2.849 3.066 3.467 3.656 3.84 3.784 4.292 4.427 4.686 4.943 5.182 5.297 5.52 5.731 6.022 6.21 6.384 6.634 6.892 7.126 7.35 7.586 7.878 8.15 8.403 8.681 8.955 9.224 9.542 9.902 10.236 10.619 11.025 11.436 11.863 12.331 12.873 13.413 14.022 14.683 15.416 16.167 16.996 17.872 18.691 19.077 19.043 18.82 18.494 18.137 17.776 17.425 17.128 16.794 16.453 16.137 15.848 15.566 15.305 15.068 14.802 14.538 14.299 14.049 13.794 13.593 13.377 13.135 12.941 12.738 12.537 12.32 12.07 11.894 11.726 11.459 11.252 11.036 10.931 10.7 10.439 10.164 10.02 9.514 9.544 9.372 9.18 8.764 8.558 8.301 8.011 7.694 7.291 6.726 4.46 -8 ,20739 ,TETRA ,17591017,Sat Nov 27 21:27:15 CET,Sat Nov 27 23:41:55 CET,0.0 1.047 1.462 1.788 2.069 2.319 2.573 2.825 3.259 3.455 3.636 3.592 4.101 4.24 4.501 4.745 4.989 5.105 5.319 5.543 5.853 6.026 6.19 6.439 6.693 6.934 7.153 7.357 7.629 7.917 8.195 8.495 8.772 9.05 9.372 9.733 10.095 10.466 10.838 11.241 11.662 12.112 12.604 13.098 13.651 14.235 14.906 15.636 16.433 17.268 18.037 18.421 18.438 18.259 17.981 17.651 17.3 16.945 16.607 16.238 15.919 15.623 15.298 14.978 14.701 14.458 14.195 13.929 13.693 13.462 13.229 13.01 12.746 12.48 12.295 12.085 11.833 11.546 11.24 11.028 10.81 10.447 10.18 9.93 9.808 9.533 9.234 8.93 8.782 8.279 8.286 8.096 7.91 7.499 7.25 6.968 6.642 6.277 5.872 5.3 3.133 -9 ,18098 ,TETRA ,17591018,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:37:29 CET,0.0 1.43 1.899 2.269 2.585 2.876 3.131 3.362 3.776 3.961 4.122 4.056 4.552 4.691 4.957 5.196 5.43 5.54 5.739 5.925 6.196 6.374 6.544 6.786 7.024 7.249 7.456 7.656 7.911 8.155 8.389 8.683 8.978 9.25 9.549 9.889 10.205 10.55 10.913 11.298 11.706 12.142 12.653 13.172 13.754 14.396 15.134 15.884 16.64 17.44 18.181 18.472 18.412 18.197 17.893 17.511 17.137 16.778 16.448 16.086 15.734 15.399 15.091 14.811 14.53 14.252 13.968 13.707 13.466 13.221 12.963 12.742 12.5 12.245 12.044 11.826 11.608 11.385 11.151 10.99 10.826 10.571 10.37 10.14 10.022 9.779 9.525 9.269 9.124 8.616 8.664 8.501 8.317 7.92 7.702 7.445 7.147 6.812 6.411 5.835 3.776 -10 ,10626 ,TETRA ,17591019,Sat Nov 27 21:27:17 CET,Sat Nov 27 23:39:24 CET,0.0 1.426 1.873 2.227 2.572 2.877 3.102 3.29 3.659 3.847 4.019 3.957 4.46 4.592 4.84 5.087 5.315 5.434 5.669 5.885 6.175 6.347 6.512 6.768 7.017 7.256 7.486 7.699 7.961 8.217 8.471 8.765 9.051 9.343 9.679 10.055 10.408 10.786 11.204 11.625 12.032 12.501 13.042 13.539 14.1 14.739 15.443 16.198 17.043 17.914 18.684 18.937 18.814 18.577 18.26 17.949 17.616 17.243 16.898 16.511 16.147 15.816 15.488 15.152 14.831 14.54 14.252 14.001 13.779 13.536 13.274 13.055 12.809 12.539 12.334 12.128 11.922 11.697 11.458 11.295 11.106 10.799 10.594 10.381 10.267 10.047 9.801 9.517 9.368 8.855 8.874 8.693 8.511 8.121 7.893 7.627 7.335 7.002 6.588 6.034 4.267 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt deleted file mode 100644 index 25d689c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19207 ,TETRA ,17591020,Sat Nov 27 21:27:15 CET,Sat Nov 27 23:39:55 CET,0.0 1.466 1.894 2.24 2.524 2.762 2.997 3.231 3.638 3.819 3.982 3.933 4.438 4.558 4.805 5.04 5.271 5.376 5.577 5.794 6.101 6.271 6.445 6.705 6.915 7.116 7.324 7.517 7.773 8.022 8.245 8.501 8.751 9.013 9.312 9.651 9.987 10.327 10.674 11.034 11.438 11.911 12.417 12.882 13.419 13.972 14.597 15.327 16.107 16.869 17.458 17.565 17.326 16.992 16.571 16.095 15.673 15.266 14.885 14.477 14.1 13.745 13.409 13.096 12.798 12.51 12.191 11.901 11.659 11.389 11.09 10.855 10.611 10.345 10.135 9.928 9.723 9.504 9.26 9.084 8.904 8.608 8.394 8.184 8.081 7.863 7.622 7.36 7.216 6.713 6.783 6.607 6.406 5.98 5.737 5.466 5.167 4.786 4.3 3.78 2.267 -2 ,3895 ,TETRA ,17591021,Sat Nov 27 21:27:15 CET,Sat Nov 27 23:37:45 CET,0.0 1.481 1.899 2.2 2.482 2.74 2.966 3.176 3.562 3.726 3.878 3.8 4.297 4.428 4.68 4.902 5.108 5.209 5.402 5.573 5.824 6.007 6.189 6.441 6.676 6.882 7.077 7.288 7.551 7.783 7.995 8.25 8.494 8.729 9.006 9.323 9.623 9.945 10.275 10.619 10.98 11.379 11.839 12.279 12.79 13.365 13.979 14.642 15.355 16.054 16.749 16.92 16.673 16.293 15.864 15.412 14.988 14.586 14.23 13.831 13.462 13.13 12.763 12.427 12.147 11.863 11.542 11.261 11.019 10.763 10.477 10.234 9.993 9.75 9.56 9.346 9.11 8.871 8.621 8.444 8.272 8.009 7.818 7.612 7.499 7.254 6.991 6.694 6.537 6.033 6.083 5.889 5.679 5.251 4.973 4.59 4.145 3.663 3.069 2.358 -0.663 -3 ,3011 ,TETRA ,17591022,Sat Nov 27 21:27:15 CET,Sat Nov 27 23:39:31 CET,0.0 0.972 1.386 1.687 1.968 2.212 2.418 2.607 2.985 3.145 3.291 3.197 3.678 3.805 4.052 4.266 4.471 4.568 4.757 4.939 5.174 5.33 5.486 5.694 5.909 6.127 6.33 6.526 6.778 7.022 7.254 7.51 7.773 8.021 8.284 8.579 8.861 9.181 9.523 9.879 10.235 10.623 11.079 11.522 12.027 12.568 13.174 13.822 14.488 15.164 15.714 15.759 15.507 15.157 14.791 14.429 14.058 13.649 13.27 12.862 12.501 12.174 11.858 11.561 11.252 10.954 10.648 10.374 10.134 9.856 9.541 9.297 9.062 8.804 8.579 8.342 8.111 7.871 7.591 7.388 7.17 6.821 6.574 6.305 6.162 5.868 5.565 5.211 5.017 4.47 4.458 4.273 4.066 3.542 3.225 2.834 2.388 1.953 1.311 0.326 -2.937 -4 ,17147 ,TETRA ,17591023,Sat Nov 27 21:27:15 CET,Sat Nov 27 23:38:01 CET,0.0 1.236 1.69 2.011 2.262 2.483 2.684 2.877 3.241 3.407 3.57 3.512 4.002 4.122 4.373 4.62 4.856 4.969 5.175 5.355 5.606 5.771 5.922 6.143 6.377 6.607 6.82 7.005 7.235 7.467 7.707 7.996 8.258 8.512 8.806 9.126 9.438 9.772 10.111 10.476 10.865 11.288 11.742 12.183 12.702 13.256 13.875 14.547 15.242 15.895 16.485 16.662 16.454 16.109 15.708 15.275 14.892 14.515 14.15 13.759 13.43 13.126 12.784 12.446 12.142 11.848 11.527 11.254 11.022 10.769 10.513 10.294 10.035 9.769 9.569 9.355 9.126 8.874 8.611 8.432 8.238 7.931 7.727 7.516 7.401 7.162 6.907 6.621 6.461 5.931 5.956 5.786 5.588 5.114 4.86 4.589 4.297 3.979 3.617 3.108 0.864 -5 ,12017 ,TETRA ,17591024,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:42:39 CET,0.0 1.317 1.775 2.147 2.465 2.741 2.971 3.195 3.599 3.785 3.954 3.898 4.405 4.533 4.774 5.01 5.219 5.321 5.519 5.705 5.98 6.168 6.342 6.571 6.802 7.035 7.271 7.509 7.811 8.09 8.351 8.64 8.906 9.161 9.457 9.781 10.083 10.401 10.752 11.114 11.487 11.919 12.417 12.922 13.464 14.034 14.639 15.255 15.945 16.672 17.27 17.387 17.195 16.863 16.468 16.072 15.678 15.232 14.826 14.424 14.056 13.708 13.372 13.047 12.732 12.457 12.18 11.924 11.685 11.423 11.132 10.876 10.623 10.367 10.161 9.937 9.692 9.445 9.192 9.018 8.832 8.537 8.34 8.126 8.009 7.76 7.505 7.242 7.108 6.609 6.647 6.474 6.282 5.838 5.586 5.317 5.017 4.694 4.344 3.789 1.071 -6 ,1490 ,TETRA ,17591025,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:41:08 CET,0.0 0.893 1.264 1.611 1.889 2.139 2.371 2.569 2.915 3.077 3.241 3.171 3.658 3.775 3.996 4.211 4.433 4.543 4.766 4.986 5.271 5.445 5.622 5.874 6.109 6.328 6.54 6.75 7.014 7.256 7.494 7.795 8.063 8.297 8.592 8.941 9.254 9.581 9.924 10.292 10.678 11.119 11.629 12.098 12.614 13.182 13.81 14.458 15.145 15.808 16.316 16.443 16.212 15.863 15.472 15.04 14.643 14.269 13.915 13.548 13.226 12.894 12.558 12.24 11.949 11.676 11.365 11.089 10.827 10.554 10.289 10.067 9.818 9.552 9.359 9.162 8.954 8.733 8.506 8.338 8.15 7.835 7.597 7.367 7.252 7.01 6.75 6.459 6.294 5.762 5.783 5.592 5.383 4.961 4.729 4.471 4.199 3.876 3.409 2.732 1.089 -7 ,28962 ,TETRA ,17591026,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:46:34 CET,0.0 1.023 1.43 1.766 2.037 2.274 2.493 2.694 3.037 3.195 3.345 3.263 3.769 3.91 4.146 4.346 4.553 4.658 4.875 5.08 5.361 5.553 5.735 5.981 6.21 6.429 6.643 6.857 7.118 7.374 7.623 7.907 8.17 8.41 8.702 9.029 9.334 9.666 10.002 10.367 10.741 11.145 11.598 12.044 12.556 13.105 13.703 14.314 14.998 15.682 16.157 16.252 16.058 15.733 15.4 15.016 14.623 14.273 13.948 13.584 13.248 12.944 12.64 12.323 12.016 11.739 11.455 11.194 10.943 10.654 10.359 10.12 9.876 9.62 9.411 9.187 8.951 8.707 8.469 8.317 8.136 7.826 7.624 7.422 7.317 7.079 6.792 6.493 6.354 5.86 5.896 5.718 5.526 4.984 4.658 4.348 4.044 3.738 3.321 2.752 1.549 -8 ,23155 ,TETRA ,17591027,Sat Nov 27 21:29:12 CET,Sat Nov 27 23:39:22 CET,0.0 0.995 1.452 1.759 2.032 2.305 2.528 2.725 3.108 3.275 3.41 3.291 3.775 3.907 4.162 4.405 4.62 4.721 4.921 5.116 5.407 5.589 5.768 6.052 6.323 6.567 6.796 7.008 7.266 7.519 7.774 8.074 8.343 8.591 8.894 9.236 9.542 9.862 10.205 10.582 10.984 11.44 11.954 12.428 12.936 13.448 14.016 14.614 15.259 15.894 16.401 16.488 16.276 15.944 15.588 15.161 14.694 14.245 13.863 13.484 13.146 12.799 12.426 12.086 11.769 11.472 11.151 10.858 10.599 10.313 10.014 9.772 9.514 9.241 9.022 8.788 8.545 8.289 8.025 7.847 7.656 7.368 7.173 6.948 6.834 6.586 6.303 5.998 5.844 5.334 5.356 5.168 4.977 4.528 4.269 4.03 3.751 3.392 2.969 2.323 -0.819 -9 ,17216 ,TETRA ,17591028,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:39:57 CET,0.0 1.265 1.698 2.083 2.376 2.615 2.855 3.059 3.398 3.546 3.686 3.616 4.116 4.247 4.476 4.704 4.945 5.052 5.251 5.445 5.719 5.899 6.074 6.316 6.534 6.731 6.919 7.114 7.374 7.613 7.831 8.1 8.362 8.615 8.916 9.23 9.534 9.865 10.227 10.616 10.987 11.361 11.786 12.224 12.75 13.314 13.904 14.534 15.242 15.913 16.417 16.504 16.297 16.004 15.674 15.311 14.915 14.51 14.143 13.759 13.428 13.11 12.788 12.455 12.134 11.848 11.525 11.224 10.981 10.746 10.492 10.274 10.034 9.788 9.605 9.388 9.148 8.908 8.661 8.49 8.311 8.023 7.816 7.597 7.482 7.254 7.002 6.702 6.545 6.038 6.082 5.894 5.694 5.266 5.03 4.771 4.494 4.156 3.752 3.165 1.106 -10 ,23169 ,TETRA ,17591029,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:38:57 CET,0.0 0.963 1.399 1.74 2.022 2.257 2.468 2.667 3.045 3.206 3.353 3.267 3.76 3.876 4.095 4.305 4.505 4.611 4.81 4.982 5.23 5.383 5.528 5.744 5.95 6.158 6.374 6.587 6.851 7.103 7.33 7.588 7.847 8.09 8.371 8.687 8.97 9.266 9.594 9.947 10.299 10.683 11.125 11.572 12.085 12.622 13.233 13.871 14.485 15.153 15.758 15.795 15.466 15.072 14.659 14.236 13.826 13.406 13.022 12.604 12.245 11.914 11.584 11.268 10.964 10.692 10.398 10.132 9.91 9.676 9.417 9.189 8.944 8.7 8.517 8.312 8.084 7.839 7.586 7.416 7.236 6.942 6.737 6.525 6.411 6.171 5.904 5.613 5.472 4.97 5.024 4.854 4.66 4.203 3.956 3.712 3.435 3.106 2.689 2.125 0.42 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index 3aceed4e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18376 ,TETRA ,17591030,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:38:26 CET,0.0 1.95 2.399 2.746 3.063 3.347 3.606 3.822 4.21 4.389 4.581 4.589 5.098 5.238 5.504 5.755 5.992 6.11 6.339 6.56 6.865 7.049 7.229 7.504 7.757 7.992 8.232 8.457 8.734 8.989 9.231 9.525 9.802 10.058 10.365 10.716 11.031 11.361 11.713 12.083 12.456 12.872 13.338 13.814 14.366 14.935 15.553 16.197 16.867 17.442 17.698 17.408 16.964 16.484 15.983 15.442 14.88 14.352 13.904 13.465 13.054 12.622 12.182 11.784 11.438 11.119 10.756 10.43 10.147 9.835 9.49 9.209 8.909 8.573 8.315 8.065 7.796 7.503 7.187 6.954 6.728 6.391 6.132 5.864 5.739 5.465 5.138 4.804 4.634 4.099 4.086 3.879 3.649 3.183 2.931 2.649 2.334 1.957 1.403 0.646 -2.295 -2 ,23837 ,TETRA ,17591031,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:41:31 CET,0.0 2.185 2.726 3.099 3.419 3.724 3.978 4.205 4.651 4.856 5.044 5.012 5.512 5.655 5.928 6.19 6.44 6.558 6.788 7.002 7.304 7.488 7.663 7.904 8.122 8.345 8.563 8.76 9.002 9.239 9.471 9.758 10.03 10.276 10.559 10.856 11.128 11.45 11.777 12.088 12.407 12.753 13.16 13.553 14.002 14.484 14.975 15.506 16.068 16.608 16.854 16.627 16.198 15.643 15.073 14.539 14.006 13.466 13.015 12.535 12.068 11.644 11.259 10.889 10.532 10.194 9.832 9.522 9.251 8.953 8.608 8.325 8.04 7.716 7.479 7.241 6.98 6.717 6.454 6.26 6.06 5.742 5.514 5.269 5.143 4.884 4.586 4.292 4.13 3.612 3.629 3.417 3.199 2.754 2.478 2.161 1.825 1.401 0.953 0.337 -2.572 -3 ,7148 ,TETRA ,17591032,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:41:32 CET,0.0 1.738 2.186 2.501 2.799 3.046 3.236 3.442 3.817 3.966 4.105 4.013 4.493 4.61 4.861 5.103 5.323 5.429 5.619 5.794 6.051 6.205 6.352 6.593 6.83 7.044 7.245 7.441 7.704 7.944 8.166 8.445 8.713 8.974 9.274 9.592 9.886 10.191 10.53 10.898 11.238 11.629 12.097 12.531 13.006 13.521 14.112 14.747 15.409 16.026 16.35 16.175 15.798 15.242 14.661 14.081 13.492 12.957 12.515 12.027 11.582 11.191 10.813 10.452 10.09 9.742 9.349 8.987 8.68 8.332 7.965 7.671 7.386 7.083 6.83 6.577 6.32 6.046 5.771 5.572 5.358 5.064 4.857 4.619 4.5 4.237 3.946 3.655 3.486 2.935 2.917 2.724 2.517 2.057 1.799 1.534 1.235 0.85 0.398 -0.219 -2.391 -4 ,10796 ,TETRA ,17591033,Sat Nov 27 21:28:15 CET,Sat Nov 27 23:40:58 CET,0.0 1.894 2.414 2.739 3.006 3.271 3.51 3.72 4.091 4.265 4.447 4.416 4.908 5.036 5.304 5.551 5.764 5.871 6.089 6.318 6.657 6.858 7.049 7.327 7.592 7.839 8.075 8.303 8.562 8.782 9.011 9.306 9.573 9.833 10.145 10.473 10.781 11.101 11.448 11.811 12.155 12.546 13.008 13.453 13.917 14.414 14.996 15.597 16.168 16.745 17.13 16.891 16.44 15.889 15.299 14.73 14.167 13.621 13.141 12.643 12.215 11.813 11.418 11.019 10.633 10.288 9.912 9.58 9.278 8.939 8.604 8.336 8.053 7.745 7.502 7.26 7.0 6.727 6.458 6.264 6.05 5.721 5.502 5.27 5.138 4.878 4.614 4.31 4.148 3.605 3.556 3.357 3.139 2.671 2.428 2.164 1.867 1.502 1.022 0.307 -1.934 -5 ,9676 ,TETRA ,17591034,Sat Nov 27 21:28:15 CET,Sat Nov 27 23:42:15 CET,0.0 1.357 1.858 2.23 2.58 2.887 3.128 3.372 3.824 4.007 4.168 4.099 4.598 4.75 5.026 5.269 5.498 5.607 5.805 6.002 6.293 6.477 6.645 6.877 7.102 7.323 7.553 7.769 8.029 8.285 8.519 8.8 9.071 9.315 9.608 9.922 10.206 10.525 10.855 11.192 11.543 11.944 12.422 12.866 13.361 13.914 14.517 15.109 15.692 16.268 16.639 16.519 16.126 15.619 15.094 14.556 14.027 13.509 13.012 12.501 12.074 11.693 11.317 10.918 10.554 10.237 9.918 9.62 9.351 9.075 8.779 8.52 8.236 7.947 7.716 7.466 7.213 6.969 6.692 6.498 6.302 5.971 5.742 5.51 5.39 5.126 4.822 4.504 4.342 3.81 3.824 3.65 3.44 2.908 2.609 2.303 1.983 1.625 1.257 0.662 -1.317 -6 ,2233 ,TETRA ,17591035,Sat Nov 27 21:29:12 CET,Sat Nov 27 23:39:13 CET,0.0 1.798 2.288 2.638 2.922 3.176 3.424 3.635 4.007 4.182 4.336 4.283 4.782 4.924 5.205 5.477 5.715 5.828 6.055 6.268 6.556 6.734 6.914 7.164 7.394 7.611 7.819 8.033 8.301 8.552 8.801 9.09 9.357 9.605 9.885 10.199 10.5 10.845 11.214 11.587 11.957 12.357 12.806 13.224 13.709 14.225 14.783 15.374 15.974 16.484 16.71 16.374 15.819 15.235 14.592 13.94 13.333 12.754 12.249 11.714 11.253 10.84 10.427 10.025 9.65 9.298 8.918 8.587 8.305 7.972 7.602 7.309 7.012 6.69 6.436 6.181 5.91 5.62 5.332 5.136 4.909 4.553 4.304 4.047 3.911 3.628 3.34 3.027 2.876 2.357 2.307 2.099 1.889 1.398 1.117 0.823 0.505 0.13 -0.379 -1.104 -3.53 -7 ,6949 ,TETRA ,17591036,Sat Nov 27 21:28:15 CET,Sat Nov 27 23:39:42 CET,0.0 1.348 1.818 2.162 2.467 2.764 3.046 3.29 3.696 3.872 4.041 3.994 4.493 4.626 4.882 5.136 5.368 5.481 5.704 5.9 6.181 6.36 6.524 6.761 6.994 7.23 7.457 7.668 7.946 8.219 8.481 8.785 9.065 9.331 9.643 9.998 10.334 10.682 11.038 11.397 11.768 12.197 12.687 13.133 13.631 14.191 14.761 15.293 15.888 16.483 16.822 16.597 16.071 15.454 14.805 14.171 13.601 13.07 12.57 12.03 11.558 11.13 10.712 10.319 9.958 9.612 9.229 8.892 8.608 8.293 7.963 7.683 7.388 7.099 6.86 6.591 6.319 6.041 5.751 5.554 5.347 5.015 4.779 4.53 4.399 4.136 3.847 3.513 3.344 2.832 2.866 2.674 2.46 1.975 1.681 1.37 1.049 0.61 -0.005 -0.679 -2.798 -8 ,19287 ,TETRA ,17591037,Sat Nov 27 21:28:15 CET,Sat Nov 27 23:40:23 CET,0.0 1.62 2.087 2.434 2.696 2.946 3.202 3.435 3.845 4.018 4.173 4.102 4.59 4.728 5.008 5.274 5.523 5.638 5.849 6.065 6.373 6.556 6.738 7.001 7.253 7.5 7.731 7.96 8.267 8.539 8.786 9.08 9.356 9.627 9.943 10.285 10.609 10.952 11.316 11.727 12.138 12.555 13.022 13.49 14.012 14.562 15.158 15.735 16.346 16.918 17.23 16.955 16.388 15.782 15.182 14.557 13.955 13.385 12.847 12.265 11.723 11.228 10.77 10.317 9.889 9.527 9.129 8.756 8.426 8.072 7.672 7.341 7.037 6.725 6.454 6.173 5.895 5.608 5.308 5.089 4.845 4.476 4.233 3.974 3.833 3.539 3.255 2.917 2.721 2.169 2.118 1.904 1.694 1.207 0.919 0.622 0.284 -0.16 -0.713 -1.497 -4.527 -9 ,25447 ,TETRA ,17591038,Sat Nov 27 21:28:17 CET,Sat Nov 27 23:41:36 CET,0.0 1.385 1.882 2.265 2.572 2.837 3.067 3.27 3.655 3.837 3.998 3.935 4.436 4.58 4.839 5.059 5.269 5.375 5.592 5.792 6.055 6.219 6.375 6.608 6.831 7.032 7.229 7.428 7.681 7.906 8.121 8.404 8.674 8.934 9.235 9.566 9.88 10.21 10.566 10.934 11.302 11.701 12.152 12.607 13.111 13.596 14.071 14.564 15.105 15.59 15.739 15.349 14.819 14.22 13.61 12.986 12.378 11.82 11.326 10.811 10.356 9.94 9.535 9.138 8.74 8.372 8.02 7.698 7.407 7.094 6.746 6.455 6.165 5.872 5.631 5.372 5.105 4.841 4.567 4.361 4.137 3.782 3.553 3.307 3.172 2.897 2.585 2.255 2.086 1.545 1.497 1.302 1.104 0.674 0.439 0.184 -0.092 -0.46 -1.014 -1.717 -4.168 -10 ,23411 ,TETRA ,17591039,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:40:43 CET,0.0 1.638 2.156 2.575 2.895 3.158 3.386 3.595 3.975 4.149 4.322 4.304 4.8 4.941 5.21 5.455 5.693 5.799 6.005 6.213 6.497 6.674 6.844 7.093 7.327 7.556 7.778 7.974 8.237 8.486 8.722 9.023 9.311 9.583 9.889 10.234 10.547 10.867 11.211 11.566 11.956 12.383 12.83 13.267 13.736 14.193 14.69 15.232 15.774 16.282 16.601 16.395 15.926 15.338 14.711 14.087 13.517 12.979 12.462 11.925 11.482 11.063 10.632 10.231 9.842 9.459 9.074 8.733 8.441 8.125 7.791 7.517 7.218 6.901 6.64 6.366 6.081 5.798 5.516 5.306 5.08 4.719 4.466 4.223 4.097 3.83 3.567 3.263 3.09 2.554 2.543 2.34 2.117 1.622 1.351 1.063 0.732 0.313 -0.232 -1.078 -3.327 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index e79555b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30610 ,TETRA ,17591040,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:40:36 CET,0.0 1.204 1.806 2.26 2.66 3.036 3.383 3.678 4.215 4.483 4.728 4.721 5.413 5.652 6.111 6.545 6.966 7.174 7.565 7.945 8.503 8.863 9.207 9.716 10.21 10.681 11.136 11.577 12.164 12.748 13.335 14.041 14.72 15.398 16.178 17.058 17.919 18.866 19.922 21.074 22.29 23.695 25.373 27.033 29.002 31.305 34.062 37.316 41.175 45.917 52.128 57.492 60.787 62.93 64.367 65.402 66.105 66.592 66.911 67.15 67.275 67.342 67.373 67.38 67.37 67.336 67.286 67.214 67.115 66.986 66.837 66.699 66.563 66.396 66.24 66.082 65.899 65.705 65.508 65.354 65.183 64.892 64.686 64.455 64.324 64.072 63.806 63.509 63.36 62.807 62.8 62.596 62.379 61.873 61.596 61.295 60.937 60.504 59.989 59.262 56.92 -2 ,541 ,TETRA ,17591041,Sat Nov 27 21:28:16 CET,Sat Nov 27 23:42:26 CET,0.0 1.275 1.831 2.288 2.711 3.088 3.45 3.795 4.428 4.709 4.969 5.033 5.745 5.989 6.454 6.887 7.32 7.535 7.938 8.321 8.878 9.255 9.615 10.113 10.605 11.102 11.594 12.086 12.724 13.331 13.925 14.647 15.368 16.052 16.824 17.699 18.564 19.527 20.564 21.719 22.965 24.365 26.04 27.783 29.822 32.121 34.848 38.04 41.933 46.667 52.615 57.905 61.17 63.202 64.542 65.526 66.265 66.783 67.124 67.398 67.557 67.622 67.638 67.649 67.614 67.543 67.462 67.386 67.293 67.166 67.017 66.869 66.696 66.528 66.398 66.243 66.072 65.882 65.676 65.533 65.377 65.104 64.895 64.682 64.566 64.316 64.05 63.751 63.593 63.043 63.031 62.818 62.611 62.137 61.849 61.51 61.126 60.67 60.089 59.379 57.739 -3 ,1981 ,TETRA ,17591042,Sat Nov 27 21:28:16 CET,Sat Nov 27 23:40:21 CET,0.0 1.469 2.055 2.555 2.987 3.357 3.703 4.038 4.622 4.894 5.167 5.222 5.903 6.128 6.583 7.032 7.463 7.666 8.084 8.506 9.102 9.476 9.835 10.355 10.859 11.361 11.844 12.301 12.897 13.497 14.085 14.785 15.459 16.121 16.903 17.779 18.639 19.608 20.666 21.787 22.994 24.411 26.102 27.856 29.934 32.275 35.087 38.345 42.227 47.021 53.043 58.365 61.642 63.664 65.018 66.058 66.799 67.285 67.613 67.856 67.994 68.071 68.099 68.095 68.037 67.942 67.819 67.707 67.615 67.481 67.305 67.159 67.01 66.838 66.696 66.551 66.382 66.179 65.96 65.81 65.647 65.354 65.13 64.906 64.792 64.543 64.254 63.934 63.765 63.195 63.18 62.954 62.714 62.212 61.925 61.598 61.209 60.765 60.238 59.542 57.789 -4 ,23092 ,TETRA ,17591043,Sat Nov 27 21:28:17 CET,Sat Nov 27 23:40:36 CET,0.0 1.418 2.016 2.452 2.8 3.119 3.461 3.8 4.373 4.636 4.89 4.915 5.602 5.832 6.272 6.699 7.104 7.295 7.682 8.066 8.63 8.995 9.337 9.837 10.34 10.821 11.294 11.769 12.382 12.971 13.534 14.215 14.879 15.537 16.31 17.194 18.058 19.017 20.079 21.199 22.394 23.783 25.417 27.09 29.112 31.439 34.152 37.284 41.178 45.973 52.135 57.531 60.812 62.985 64.495 65.562 66.277 66.791 67.131 67.374 67.537 67.661 67.738 67.773 67.77 67.706 67.6 67.504 67.416 67.326 67.204 67.073 66.923 66.752 66.607 66.442 66.251 66.044 65.829 65.673 65.491 65.179 64.959 64.757 64.659 64.411 64.131 63.828 63.67 63.118 63.105 62.886 62.635 62.088 61.798 61.486 61.123 60.649 60.09 59.336 56.92 -5 ,29536 ,TETRA ,17591044,Sat Nov 27 21:28:16 CET,Sat Nov 27 23:40:37 CET,0.0 1.216 1.859 2.354 2.778 3.184 3.542 3.849 4.468 4.763 5.029 5.073 5.762 5.997 6.453 6.875 7.285 7.479 7.857 8.232 8.777 9.132 9.485 9.998 10.498 10.984 11.439 11.884 12.494 13.104 13.706 14.415 15.087 15.75 16.508 17.379 18.248 19.192 20.214 21.333 22.564 23.962 25.601 27.276 29.233 31.502 34.254 37.42 41.245 45.999 51.954 57.097 60.35 62.515 63.967 64.99 65.678 66.172 66.508 66.772 66.97 67.105 67.173 67.188 67.18 67.133 67.048 66.95 66.834 66.711 66.606 66.506 66.358 66.181 66.018 65.844 65.672 65.48 65.267 65.11 64.942 64.67 64.459 64.234 64.118 63.868 63.599 63.317 63.168 62.632 62.674 62.469 62.257 61.774 61.461 61.12 60.781 60.39 59.872 59.143 57.099 -6 ,21161 ,TETRA ,17591045,Sat Nov 27 21:28:18 CET,Sat Nov 27 23:39:39 CET,0.0 1.298 1.953 2.469 2.883 3.256 3.608 3.958 4.559 4.819 5.076 5.098 5.772 5.989 6.422 6.852 7.265 7.465 7.84 8.204 8.743 9.096 9.442 9.95 10.457 10.949 11.426 11.895 12.49 13.071 13.647 14.363 15.064 15.738 16.519 17.395 18.234 19.193 20.275 21.418 22.62 23.989 25.626 27.317 29.327 31.665 34.423 37.604 41.461 46.144 52.132 57.449 60.723 62.864 64.316 65.363 66.069 66.547 66.899 67.185 67.341 67.418 67.445 67.44 67.4 67.338 67.261 67.171 67.063 66.939 66.788 66.626 66.456 66.277 66.131 65.965 65.762 65.554 65.357 65.221 65.056 64.763 64.564 64.366 64.257 64.024 63.76 63.465 63.312 62.766 62.779 62.578 62.36 61.84 61.554 61.249 60.902 60.494 59.966 59.258 57.233 -7 ,6580 ,TETRA ,17591046,Sat Nov 27 21:28:16 CET,Sat Nov 27 23:40:27 CET,0.0 1.12 1.733 2.255 2.713 3.074 3.388 3.692 4.266 4.54 4.802 4.867 5.561 5.787 6.216 6.644 7.05 7.251 7.651 8.027 8.571 8.922 9.266 9.773 10.254 10.72 11.185 11.652 12.275 12.878 13.448 14.15 14.834 15.489 16.268 17.169 18.039 19.006 20.069 21.19 22.38 23.734 25.374 27.07 29.069 31.384 34.148 37.4 41.342 46.132 52.209 57.58 60.869 62.986 64.436 65.466 66.185 66.69 67.036 67.314 67.504 67.617 67.667 67.693 67.666 67.592 67.493 67.391 67.291 67.171 67.002 66.857 66.722 66.57 66.43 66.263 66.077 65.861 65.617 65.443 65.245 64.939 64.745 64.54 64.431 64.188 63.916 63.612 63.449 62.914 62.947 62.726 62.501 62.025 61.737 61.429 61.062 60.622 60.086 59.391 57.543 -8 ,29128 ,TETRA ,17591047,Sat Nov 27 21:28:16 CET,Sat Nov 27 23:40:29 CET,0.0 1.424 2.06 2.511 2.892 3.244 3.57 3.891 4.463 4.726 5.0 5.07 5.773 6.003 6.455 6.899 7.319 7.525 7.922 8.298 8.857 9.235 9.606 10.132 10.612 11.072 11.546 12.026 12.654 13.25 13.818 14.509 15.212 15.898 16.673 17.575 18.466 19.429 20.45 21.577 22.801 24.237 25.953 27.682 29.746 32.059 34.764 37.887 41.681 46.423 52.481 57.666 60.848 62.999 64.446 65.479 66.197 66.712 67.068 67.316 67.456 67.543 67.584 67.561 67.49 67.401 67.302 67.218 67.132 67.029 66.899 66.772 66.608 66.408 66.266 66.126 65.964 65.769 65.544 65.387 65.228 64.946 64.736 64.511 64.379 64.09 63.787 63.448 63.27 62.704 62.701 62.497 62.264 61.716 61.418 61.103 60.734 60.272 59.688 58.98 57.263 -9 ,30433 ,TETRA ,17591048,Sat Nov 27 21:28:17 CET,Sat Nov 27 23:41:42 CET,0.0 1.151 1.706 2.204 2.634 2.981 3.298 3.608 4.161 4.415 4.668 4.706 5.402 5.632 6.08 6.522 6.967 7.184 7.581 7.984 8.568 8.935 9.305 9.833 10.326 10.822 11.311 11.765 12.357 12.939 13.49 14.184 14.885 15.55 16.313 17.18 18.059 19.047 20.092 21.218 22.442 23.848 25.513 27.239 29.311 31.649 34.404 37.614 41.458 46.168 52.192 57.502 60.765 62.873 64.277 65.336 66.1 66.618 66.967 67.222 67.402 67.523 67.581 67.607 67.583 67.532 67.439 67.337 67.248 67.133 66.998 66.857 66.705 66.542 66.403 66.247 66.062 65.857 65.64 65.481 65.313 65.057 64.857 64.612 64.487 64.237 63.953 63.626 63.458 62.907 62.913 62.697 62.47 61.971 61.685 61.36 61.002 60.598 60.068 59.395 57.724 -10 ,29687 ,TETRA ,17591049,Sat Nov 27 21:29:11 CET,Sat Nov 27 23:43:29 CET,0.0 1.584 2.222 2.673 3.086 3.503 3.877 4.22 4.832 5.102 5.364 5.43 6.123 6.348 6.806 7.255 7.679 7.884 8.278 8.665 9.232 9.604 9.981 10.522 11.032 11.5 11.961 12.433 13.045 13.628 14.194 14.897 15.582 16.253 17.038 17.924 18.786 19.75 20.811 21.946 23.154 24.533 26.176 27.866 29.865 32.188 35.005 38.255 42.113 46.802 52.803 58.189 61.453 63.656 65.153 66.159 66.893 67.423 67.765 68.018 68.166 68.254 68.315 68.346 68.308 68.234 68.128 68.023 67.939 67.828 67.663 67.508 67.348 67.18 67.039 66.877 66.704 66.495 66.245 66.082 65.925 65.655 65.458 65.252 65.14 64.91 64.656 64.366 64.21 63.653 63.641 63.451 63.25 62.774 62.49 62.163 61.805 61.404 60.934 60.309 58.35 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt deleted file mode 100644 index 7a7c1ce3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3005 ,TETRA ,17591050,Sat Nov 27 21:29:11 CET,Sat Nov 27 23:47:33 CET,0.0 1.837 2.569 3.112 3.522 3.868 4.201 4.5 5.047 5.308 5.544 5.493 6.137 6.339 6.708 7.04 7.345 7.492 7.785 8.061 8.408 8.624 8.828 9.129 9.44 9.712 9.963 10.215 10.545 10.856 11.127 11.444 11.754 12.053 12.38 12.712 12.998 13.31 13.658 14.008 14.31 14.602 14.926 15.162 15.395 15.636 15.77 15.683 15.293 14.324 12.249 9.328 6.656 4.345 2.292 0.406 -1.221 -2.677 -3.922 -5.157 -6.224 -7.18 -8.093 -8.946 -9.747 -10.479 -11.227 -11.89 -12.468 -13.081 -13.728 -14.248 -14.771 -15.329 -15.75 -16.185 -16.665 -17.179 -17.711 -18.07 -18.432 -18.991 -19.394 -19.825 -20.048 -20.51 -20.994 -21.485 -21.737 -22.493 -22.573 -22.868 -23.201 -23.96 -24.356 -24.755 -25.217 -25.792 -26.501 -27.316 -29.336 -2 ,13293 ,TETRA ,17591051,Sat Nov 27 21:29:13 CET,Sat Nov 27 23:43:19 CET,0.0 1.883 2.59 3.171 3.663 4.064 4.374 4.645 5.191 5.447 5.691 5.709 6.373 6.57 6.952 7.283 7.597 7.753 8.026 8.272 8.616 8.832 9.042 9.338 9.627 9.899 10.165 10.425 10.738 11.043 11.356 11.718 12.018 12.272 12.55 12.898 13.246 13.58 13.874 14.169 14.503 14.85 15.155 15.439 15.729 15.889 15.951 15.874 15.49 14.601 12.444 9.354 6.806 4.605 2.664 0.965 -0.608 -2.064 -3.301 -4.541 -5.61 -6.601 -7.524 -8.366 -9.156 -9.87 -10.597 -11.264 -11.846 -12.451 -13.093 -13.621 -14.156 -14.715 -15.168 -15.63 -16.1 -16.586 -17.089 -17.436 -17.797 -18.369 -18.778 -19.207 -19.419 -19.887 -20.383 -20.882 -21.151 -21.909 -22.024 -22.341 -22.665 -23.345 -23.724 -24.141 -24.572 -25.059 -25.701 -26.563 -28.425 -3 ,16440 ,TETRA ,17591052,Sat Nov 27 21:29:13 CET,Sat Nov 27 23:44:36 CET,0.0 2.209 2.952 3.481 3.912 4.324 4.67 4.983 5.559 5.821 6.054 6.009 6.652 6.832 7.193 7.512 7.796 7.941 8.208 8.458 8.824 9.043 9.255 9.566 9.88 10.164 10.422 10.692 11.032 11.35 11.633 11.974 12.313 12.612 12.931 13.249 13.545 13.875 14.224 14.593 14.929 15.233 15.523 15.77 16.038 16.254 16.362 16.251 15.859 15.078 13.179 10.331 7.695 5.39 3.431 1.677 0.101 -1.337 -2.567 -3.806 -4.866 -5.802 -6.714 -7.59 -8.39 -9.106 -9.876 -10.578 -11.179 -11.792 -12.424 -12.951 -13.498 -14.059 -14.495 -14.949 -15.407 -15.884 -16.389 -16.739 -17.096 -17.659 -18.054 -18.444 -18.653 -19.12 -19.608 -20.101 -20.353 -21.119 -21.226 -21.535 -21.884 -22.623 -23.003 -23.428 -23.909 -24.439 -25.05 -25.872 -28.237 -4 ,4966 ,TETRA ,17591053,Sat Nov 27 21:29:13 CET,Sat Nov 27 23:44:40 CET,0.0 1.781 2.491 3.011 3.451 3.855 4.208 4.509 5.048 5.278 5.474 5.389 6.024 6.203 6.546 6.872 7.167 7.311 7.594 7.849 8.191 8.423 8.66 8.976 9.27 9.554 9.818 10.053 10.34 10.64 10.94 11.269 11.565 11.823 12.094 12.402 12.703 13.021 13.333 13.654 13.964 14.282 14.646 14.938 15.141 15.26 15.334 15.237 14.774 13.81 11.87 9.36 7.007 4.751 2.764 0.985 -0.604 -2.035 -3.254 -4.487 -5.566 -6.559 -7.488 -8.349 -9.169 -9.915 -10.692 -11.39 -11.975 -12.549 -13.15 -13.669 -14.207 -14.772 -15.224 -15.691 -16.164 -16.653 -17.152 -17.505 -17.872 -18.425 -18.816 -19.22 -19.433 -19.883 -20.343 -20.832 -21.097 -21.847 -21.96 -22.287 -22.625 -23.317 -23.691 -24.099 -24.544 -25.038 -25.645 -26.426 -28.204 -5 ,10333 ,TETRA ,17591054,Sat Nov 27 21:29:13 CET,Sat Nov 27 23:45:21 CET,0.0 2.214 2.922 3.463 3.91 4.314 4.673 4.969 5.478 5.725 5.958 5.926 6.555 6.728 7.076 7.404 7.713 7.868 8.151 8.407 8.796 9.045 9.272 9.605 9.915 10.201 10.48 10.74 11.073 11.394 11.693 12.018 12.323 12.641 12.983 13.313 13.641 14.001 14.339 14.672 15.037 15.421 15.768 16.028 16.238 16.392 16.458 16.428 16.068 15.077 12.919 9.854 7.127 4.767 2.748 0.942 -0.604 -2.006 -3.236 -4.467 -5.541 -6.53 -7.459 -8.297 -9.091 -9.829 -10.593 -11.275 -11.867 -12.496 -13.158 -13.697 -14.26 -14.846 -15.306 -15.776 -16.252 -16.746 -17.255 -17.612 -17.981 -18.562 -18.966 -19.394 -19.615 -20.068 -20.526 -21.001 -21.252 -21.997 -22.133 -22.48 -22.8 -23.454 -23.836 -24.246 -24.674 -25.162 -25.768 -26.579 -28.858 -6 ,3511 ,TETRA ,17591055,Sat Nov 27 21:29:13 CET,Sat Nov 27 23:44:41 CET,0.0 2.503 3.324 3.89 4.329 4.709 5.025 5.298 5.813 6.061 6.289 6.265 6.928 7.121 7.461 7.779 8.099 8.257 8.552 8.806 9.176 9.408 9.613 9.92 10.217 10.501 10.778 11.036 11.344 11.638 11.912 12.223 12.525 12.829 13.156 13.476 13.765 14.087 14.413 14.713 15.014 15.343 15.685 15.97 16.236 16.438 16.539 16.479 16.188 15.488 13.585 10.508 7.834 5.562 3.528 1.616 -0.02 -1.425 -2.64 -3.865 -4.91 -5.856 -6.79 -7.673 -8.499 -9.254 -10.022 -10.695 -11.271 -11.856 -12.463 -12.99 -13.555 -14.149 -14.611 -15.09 -15.569 -16.055 -16.555 -16.909 -17.292 -17.875 -18.262 -18.676 -18.897 -19.343 -19.811 -20.282 -20.526 -21.27 -21.33 -21.636 -21.965 -22.663 -23.045 -23.451 -23.919 -24.433 -25.032 -25.874 -28.068 -7 ,16621 ,TETRA ,17591056,Sat Nov 27 21:29:13 CET,Sat Nov 27 23:42:58 CET,0.0 1.98 2.789 3.325 3.765 4.143 4.461 4.765 5.35 5.614 5.856 5.845 6.495 6.683 7.037 7.367 7.672 7.817 8.116 8.421 8.831 9.073 9.298 9.644 9.963 10.234 10.481 10.716 11.018 11.315 11.613 11.98 12.313 12.621 12.977 13.313 13.612 13.926 14.217 14.538 14.858 15.123 15.358 15.572 15.789 16.004 16.15 16.072 15.674 14.644 12.42 9.404 6.618 4.206 2.153 0.273 -1.332 -2.732 -3.945 -5.169 -6.218 -7.16 -8.077 -8.946 -9.761 -10.501 -11.254 -11.898 -12.454 -13.075 -13.709 -14.228 -14.78 -15.363 -15.819 -16.27 -16.725 -17.2 -17.708 -18.088 -18.479 -19.054 -19.457 -19.886 -20.109 -20.55 -21.01 -21.494 -21.744 -22.506 -22.638 -22.946 -23.275 -23.986 -24.353 -24.778 -25.266 -25.796 -26.454 -27.315 -29.426 -8 ,15838 ,TETRA ,17591057,Sat Nov 27 21:30:12 CET,Sat Nov 27 23:43:51 CET,0.0 1.67 2.373 2.881 3.292 3.696 4.055 4.369 4.937 5.214 5.468 5.431 6.077 6.251 6.591 6.921 7.224 7.373 7.651 7.93 8.355 8.615 8.859 9.188 9.481 9.784 10.102 10.403 10.767 11.106 11.425 11.766 12.049 12.325 12.639 12.976 13.289 13.589 13.902 14.236 14.537 14.855 15.188 15.425 15.622 15.788 15.857 15.787 15.464 14.456 12.069 8.754 6.04 3.805 1.823 0.039 -1.572 -3.061 -4.314 -5.574 -6.666 -7.612 -8.526 -9.399 -10.201 -10.955 -11.74 -12.42 -13.0 -13.638 -14.302 -14.821 -15.348 -15.914 -16.373 -16.837 -17.318 -17.845 -18.395 -18.76 -19.124 -19.682 -20.089 -20.525 -20.742 -21.19 -21.643 -22.14 -22.415 -23.173 -23.253 -23.555 -23.88 -24.577 -24.929 -25.312 -25.79 -26.368 -27.004 -27.829 -29.667 -9 ,2319 ,TETRA ,17591058,Sat Nov 27 21:30:12 CET,Sat Nov 27 23:40:52 CET,0.0 1.86 2.5 3.001 3.459 3.831 4.153 4.468 5.056 5.299 5.516 5.478 6.13 6.327 6.693 7.018 7.322 7.47 7.755 8.027 8.376 8.599 8.845 9.183 9.467 9.743 10.014 10.274 10.617 10.935 11.196 11.502 11.789 12.059 12.384 12.724 13.03 13.357 13.681 14.028 14.365 14.651 14.919 15.13 15.33 15.501 15.588 15.468 14.988 13.921 11.87 9.046 6.491 4.255 2.262 0.425 -1.162 -2.638 -3.914 -5.128 -6.2 -7.164 -8.066 -8.914 -9.712 -10.449 -11.201 -11.868 -12.461 -13.056 -13.687 -14.232 -14.769 -15.311 -15.739 -16.183 -16.644 -17.143 -17.662 -18.017 -18.404 -19.017 -19.428 -19.835 -20.045 -20.489 -20.939 -21.409 -21.664 -22.421 -22.539 -22.849 -23.152 -23.852 -24.246 -24.666 -25.139 -25.691 -26.324 -27.135 -29.098 -10 ,8873 ,TETRA ,17591059,Sat Nov 27 21:30:11 CET,Sat Nov 27 23:48:16 CET,0.0 2.019 2.662 3.183 3.639 4.051 4.436 4.755 5.241 5.473 5.714 5.701 6.368 6.578 6.962 7.294 7.628 7.796 8.109 8.406 8.804 9.046 9.28 9.605 9.903 10.189 10.463 10.717 11.018 11.3 11.583 11.924 12.242 12.533 12.835 13.145 13.435 13.756 14.093 14.422 14.747 15.066 15.359 15.628 15.916 16.152 16.262 16.139 15.709 14.855 12.742 9.687 7.129 4.901 2.912 1.111 -0.468 -1.909 -3.167 -4.427 -5.566 -6.58 -7.49 -8.35 -9.177 -9.917 -10.67 -11.344 -11.939 -12.574 -13.233 -13.761 -14.297 -14.859 -15.295 -15.755 -16.223 -16.71 -17.228 -17.604 -18.0 -18.572 -18.949 -19.329 -19.537 -19.994 -20.473 -20.975 -21.231 -21.979 -22.086 -22.402 -22.716 -23.434 -23.841 -24.264 -24.739 -25.27 -25.881 -26.763 -28.788 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt deleted file mode 100644 index 18d847ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13494 ,TETRA ,17591060,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:44:40 CET,0.0 1.64 2.308 2.873 3.318 3.737 4.12 4.472 5.14 5.448 5.744 5.843 6.554 6.799 7.276 7.751 8.216 8.445 8.896 9.324 9.93 10.333 10.732 11.309 11.864 12.402 12.922 13.43 14.092 14.735 15.379 16.156 16.903 17.648 18.515 19.489 20.445 21.51 22.656 23.911 25.262 26.812 28.667 30.522 32.71 35.207 38.175 41.709 45.975 51.209 57.947 63.705 67.177 69.481 71.057 72.162 72.942 73.505 73.873 74.177 74.35 74.448 74.515 74.538 74.501 74.43 74.345 74.252 74.145 74.012 73.861 73.721 73.567 73.38 73.223 73.057 72.873 72.68 72.473 72.317 72.149 71.91 71.736 71.537 71.433 71.201 70.927 70.615 70.442 69.889 69.875 69.656 69.413 68.859 68.56 68.219 67.815 67.318 66.692 65.841 63.354 -2 ,30697 ,TETRA ,17591061,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:44:16 CET,0.0 1.858 2.573 3.128 3.586 4.015 4.414 4.793 5.478 5.803 6.109 6.214 6.952 7.22 7.72 8.212 8.704 8.942 9.384 9.804 10.417 10.839 11.249 11.816 12.369 12.912 13.435 13.935 14.592 15.249 15.902 16.706 17.502 18.266 19.153 20.157 21.125 22.22 23.409 24.682 26.02 27.55 29.376 31.257 33.527 36.136 39.265 42.932 47.37 52.698 59.39 65.221 68.806 71.204 72.821 73.988 74.812 75.437 75.866 76.171 76.364 76.465 76.516 76.511 76.46 76.405 76.324 76.216 76.1 75.974 75.832 75.695 75.54 75.366 75.214 75.032 74.832 74.635 74.42 74.239 74.031 73.717 73.504 73.271 73.141 72.864 72.567 72.249 72.071 71.497 71.444 71.189 70.93 70.367 70.059 69.713 69.287 68.767 68.171 67.418 64.507 -3 ,30598 ,TETRA ,17591062,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:46:00 CET,0.0 2.261 3.019 3.591 4.067 4.493 4.885 5.234 5.887 6.202 6.512 6.642 7.359 7.626 8.167 8.686 9.164 9.39 9.845 10.29 10.921 11.331 11.734 12.326 12.896 13.452 13.983 14.501 15.186 15.84 16.464 17.236 18.021 18.793 19.685 20.737 21.766 22.851 24.0 25.259 26.641 28.194 30.021 31.923 34.211 36.814 39.857 43.403 47.673 53.021 59.93 65.88 69.546 71.993 73.679 74.864 75.664 76.249 76.662 76.957 77.108 77.232 77.323 77.34 77.315 77.258 77.174 77.084 76.98 76.829 76.643 76.485 76.307 76.12 75.964 75.797 75.623 75.408 75.181 75.019 74.833 74.554 74.353 74.103 73.963 73.686 73.392 73.062 72.887 72.316 72.275 72.028 71.75 71.137 70.8 70.431 70.023 69.529 68.855 67.954 65.125 -4 ,2822 ,TETRA ,17591063,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:43:02 CET,0.0 1.767 2.405 2.919 3.381 3.811 4.204 4.557 5.216 5.532 5.833 5.944 6.653 6.903 7.405 7.887 8.349 8.569 8.999 9.41 10.006 10.405 10.777 11.304 11.837 12.378 12.896 13.39 14.045 14.68 15.301 16.054 16.783 17.524 18.41 19.407 20.391 21.48 22.644 23.896 25.234 26.762 28.571 30.466 32.734 35.324 38.412 41.977 46.281 51.646 58.484 64.426 68.06 70.443 72.096 73.305 74.163 74.774 75.181 75.49 75.673 75.757 75.812 75.819 75.75 75.672 75.579 75.467 75.358 75.234 75.085 74.947 74.798 74.63 74.473 74.297 74.112 73.915 73.705 73.56 73.404 73.136 72.926 72.69 72.566 72.307 72.03 71.734 71.571 71.005 70.962 70.735 70.511 70.008 69.706 69.36 68.946 68.476 67.945 67.143 64.583 -5 ,15958 ,TETRA ,17591064,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:42:57 CET,0.0 2.419 3.197 3.757 4.263 4.709 5.09 5.444 6.09 6.387 6.688 6.8 7.516 7.771 8.249 8.707 9.156 9.382 9.816 10.234 10.848 11.249 11.649 12.217 12.764 13.304 13.826 14.336 15.018 15.681 16.313 17.061 17.783 18.507 19.36 20.324 21.279 22.367 23.542 24.8 26.152 27.686 29.498 31.349 33.541 36.107 39.206 42.773 47.087 52.3 59.031 65.046 68.643 71.071 72.755 73.849 74.593 75.151 75.521 75.81 75.985 76.097 76.191 76.205 76.155 76.112 76.027 75.91 75.794 75.64 75.467 75.324 75.16 74.978 74.817 74.64 74.448 74.241 74.01 73.846 73.681 73.402 73.188 72.917 72.787 72.537 72.217 71.86 71.689 71.148 71.191 70.978 70.727 70.138 69.821 69.498 69.119 68.676 68.104 67.189 63.485 -6 ,17229 ,TETRA ,17591065,Sat Nov 27 21:30:14 CET,Sat Nov 27 23:42:58 CET,0.0 1.636 2.38 2.955 3.463 3.894 4.27 4.611 5.263 5.562 5.834 5.949 6.681 6.953 7.467 7.943 8.395 8.613 9.053 9.487 10.092 10.483 10.873 11.453 12.025 12.584 13.13 13.648 14.303 14.944 15.576 16.366 17.151 17.903 18.755 19.725 20.715 21.824 23.005 24.264 25.593 27.134 28.976 30.827 33.032 35.62 38.71 42.236 46.47 51.808 58.732 64.686 68.251 70.549 72.127 73.279 74.105 74.693 75.085 75.399 75.592 75.714 75.766 75.75 75.696 75.618 75.523 75.415 75.307 75.182 75.034 74.894 74.723 74.535 74.38 74.208 74.028 73.833 73.618 73.461 73.284 72.996 72.786 72.558 72.445 72.2 71.906 71.592 71.426 70.866 70.855 70.633 70.378 69.802 69.496 69.185 68.827 68.336 67.687 66.855 64.119 -7 ,7951 ,TETRA ,17591066,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:45:34 CET,0.0 1.921 2.678 3.236 3.712 4.157 4.588 4.968 5.581 5.872 6.164 6.256 6.975 7.242 7.762 8.253 8.734 8.969 9.416 9.846 10.484 10.888 11.29 11.891 12.46 13.002 13.537 14.076 14.759 15.413 16.061 16.849 17.617 18.38 19.286 20.288 21.25 22.322 23.492 24.771 26.132 27.692 29.554 31.454 33.676 36.159 39.116 42.6 46.847 52.197 59.016 64.887 68.535 70.909 72.493 73.61 74.382 74.953 75.317 75.586 75.769 75.865 75.894 75.889 75.829 75.76 75.678 75.554 75.434 75.298 75.136 74.99 74.845 74.682 74.535 74.387 74.213 74.013 73.82 73.682 73.525 73.24 73.025 72.804 72.683 72.425 72.135 71.809 71.639 71.075 71.004 70.753 70.489 69.881 69.527 69.137 68.701 68.203 67.593 66.749 63.796 -8 ,30206 ,TETRA ,17591067,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:44:14 CET,0.0 1.751 2.498 3.049 3.491 3.896 4.28 4.629 5.274 5.581 5.871 5.983 6.692 6.943 7.462 7.97 8.444 8.673 9.118 9.549 10.17 10.561 10.941 11.515 12.076 12.615 13.141 13.666 14.35 15.002 15.65 16.436 17.189 17.932 18.825 19.842 20.806 21.863 22.998 24.237 25.627 27.243 29.114 31.021 33.323 35.972 39.11 42.714 47.057 52.403 59.147 65.067 68.695 71.026 72.579 73.697 74.503 75.113 75.542 75.833 75.992 76.088 76.149 76.18 76.17 76.139 76.073 75.989 75.907 75.803 75.674 75.531 75.378 75.202 75.026 74.852 74.673 74.473 74.243 74.074 73.892 73.589 73.371 73.157 73.037 72.733 72.429 72.138 71.975 71.416 71.373 71.149 70.924 70.343 70.015 69.674 69.261 68.781 68.241 67.42 65.06 -9 ,11399 ,TETRA ,17591068,Sat Nov 27 21:30:14 CET,Sat Nov 27 23:43:32 CET,0.0 1.692 2.415 2.99 3.467 3.893 4.277 4.633 5.282 5.583 5.872 5.981 6.702 6.964 7.454 7.918 8.358 8.574 9.008 9.423 10.039 10.421 10.792 11.372 11.947 12.503 13.029 13.536 14.189 14.825 15.457 16.238 17.007 17.766 18.644 19.615 20.535 21.579 22.751 24.027 25.401 26.946 28.791 30.709 33.025 35.631 38.662 42.263 46.596 51.848 58.512 64.311 67.828 70.179 71.766 72.868 73.645 74.174 74.56 74.885 75.067 75.19 75.258 75.259 75.223 75.157 75.051 74.95 74.847 74.694 74.527 74.401 74.262 74.103 73.968 73.789 73.589 73.388 73.159 72.983 72.8 72.494 72.272 72.037 71.905 71.643 71.361 71.019 70.836 70.266 70.201 69.97 69.74 69.195 68.86 68.488 68.087 67.648 67.092 66.261 63.925 -10 ,31862 ,TETRA ,17591069,Sat Nov 27 21:30:14 CET,Sat Nov 27 23:42:29 CET,0.0 1.708 2.439 3.051 3.527 3.934 4.33 4.688 5.324 5.62 5.916 6.034 6.746 6.994 7.486 7.973 8.437 8.663 9.114 9.553 10.169 10.563 10.953 11.532 12.093 12.643 13.176 13.688 14.36 15.019 15.668 16.447 17.214 17.979 18.874 19.898 20.903 22.012 23.225 24.503 25.867 27.45 29.315 31.179 33.367 35.914 38.938 42.5 46.876 52.235 58.994 64.783 68.24 70.484 72.043 73.174 73.968 74.527 74.912 75.226 75.397 75.484 75.529 75.519 75.471 75.381 75.227 75.083 74.956 74.787 74.591 74.432 74.253 74.033 73.862 73.685 73.481 73.238 72.96 72.783 72.603 72.27 72.033 71.819 71.697 71.404 71.102 70.771 70.593 70.042 70.024 69.8 69.546 69.003 68.697 68.333 67.933 67.472 66.83 65.847 63.043 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index 015390f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16930 ,TETRA ,17591070,Sat Nov 27 21:30:14 CET,Sat Nov 27 23:42:20 CET,0.0 1.259 1.869 2.355 2.776 3.171 3.535 3.888 4.568 4.876 5.161 5.224 5.966 6.219 6.71 7.188 7.655 7.88 8.322 8.75 9.36 9.762 10.164 10.763 11.352 11.922 12.468 13.002 13.707 14.392 15.061 15.889 16.698 17.48 18.397 19.481 20.535 21.702 22.995 24.371 25.841 27.544 29.601 31.755 34.308 37.27 40.877 45.132 50.326 56.892 65.518 73.245 78.178 81.627 84.145 86.048 87.462 88.581 89.413 90.135 90.706 91.129 91.455 91.732 91.937 92.091 92.23 92.319 92.366 92.395 92.434 92.453 92.426 92.378 92.334 92.285 92.238 92.176 92.085 92.011 91.934 91.792 91.688 91.571 91.506 91.356 91.183 90.987 90.884 90.405 90.549 90.417 90.285 89.908 89.673 89.426 89.165 88.845 88.456 87.835 85.623 -2 ,17396 ,TETRA ,17591071,Sat Nov 27 21:30:16 CET,Sat Nov 27 23:42:43 CET,0.0 1.535 2.218 2.677 3.1 3.483 3.827 4.136 4.709 4.993 5.278 5.327 6.07 6.324 6.812 7.303 7.779 8.009 8.446 8.869 9.499 9.898 10.282 10.848 11.404 11.95 12.495 13.049 13.757 14.425 15.088 15.906 16.703 17.483 18.423 19.49 20.512 21.673 22.938 24.3 25.793 27.523 29.587 31.75 34.333 37.291 40.875 45.109 50.333 56.859 65.398 73.149 78.023 81.457 83.98 85.899 87.305 88.392 89.206 89.883 90.407 90.826 91.172 91.462 91.716 91.929 92.097 92.219 92.31 92.358 92.377 92.391 92.401 92.383 92.354 92.312 92.247 92.174 92.086 92.03 91.985 91.888 91.8 91.695 91.638 91.516 91.368 91.193 91.093 90.604 90.759 90.639 90.495 90.143 89.949 89.723 89.456 89.161 88.779 88.282 86.312 -3 ,24202 ,TETRA ,17591072,Sat Nov 27 21:30:14 CET,Sat Nov 27 23:43:11 CET,0.0 1.257 1.876 2.369 2.792 3.188 3.56 3.91 4.558 4.866 5.162 5.235 5.97 6.232 6.743 7.22 7.692 7.916 8.343 8.772 9.397 9.801 10.202 10.79 11.365 11.909 12.442 12.988 13.703 14.388 15.07 15.918 16.729 17.517 18.453 19.52 20.569 21.771 23.094 24.483 25.957 27.688 29.766 31.899 34.484 37.479 41.091 45.41 50.728 57.219 65.685 73.512 78.539 82.0 84.515 86.458 87.863 88.977 89.84 90.585 91.118 91.507 91.827 92.104 92.313 92.464 92.612 92.709 92.751 92.763 92.756 92.75 92.736 92.684 92.63 92.551 92.448 92.351 92.237 92.15 92.059 91.894 91.77 91.64 91.564 91.399 91.232 91.031 90.918 90.422 90.513 90.362 90.189 89.752 89.518 89.264 88.991 88.674 88.246 87.595 85.262 -4 ,31824 ,TETRA ,17591073,Sat Nov 27 21:30:16 CET,Sat Nov 27 23:42:58 CET,0.0 1.21 1.796 2.303 2.764 3.144 3.494 3.82 4.423 4.706 4.97 5.012 5.747 5.998 6.494 6.969 7.427 7.653 8.096 8.521 9.14 9.549 9.944 10.516 11.071 11.606 12.139 12.674 13.364 14.036 14.681 15.478 16.272 17.044 17.96 19.006 20.026 21.163 22.407 23.794 25.318 27.052 29.099 31.211 33.767 36.716 40.252 44.453 49.592 55.998 64.465 72.19 77.152 80.639 83.15 85.05 86.449 87.524 88.378 89.151 89.703 90.11 90.453 90.73 90.94 91.086 91.204 91.286 91.336 91.363 91.359 91.338 91.313 91.275 91.252 91.226 91.174 91.097 91.011 90.941 90.849 90.699 90.573 90.43 90.365 90.219 90.026 89.812 89.703 89.199 89.278 89.113 88.931 88.483 88.259 88.014 87.738 87.4 86.974 86.445 84.165 -5 ,4484 ,TETRA ,17591074,Sat Nov 27 21:30:14 CET,Sat Nov 27 23:42:22 CET,0.0 1.519 2.214 2.744 3.242 3.686 4.056 4.392 5.026 5.313 5.586 5.617 6.357 6.619 7.125 7.611 8.083 8.308 8.761 9.205 9.83 10.226 10.619 11.217 11.806 12.375 12.916 13.462 14.172 14.831 15.481 16.278 17.049 17.821 18.744 19.8 20.833 21.97 23.208 24.561 26.078 27.854 29.932 32.072 34.641 37.595 41.146 45.347 50.419 56.775 65.244 72.993 78.008 81.517 84.109 86.041 87.371 88.405 89.247 90.013 90.586 91.018 91.356 91.631 91.872 92.043 92.17 92.257 92.316 92.375 92.422 92.426 92.37 92.3 92.275 92.228 92.151 92.066 91.956 91.872 91.786 91.655 91.545 91.407 91.327 91.136 90.917 90.676 90.548 90.037 90.143 89.991 89.823 89.394 89.156 88.895 88.598 88.233 87.778 87.243 85.73 -6 ,4157 ,TETRA ,17591075,Sat Nov 27 22:10:40 CET,Sun Nov 28 00:23:23 CET,0.0 1.048 1.623 2.083 2.505 2.894 3.237 3.588 4.242 4.528 4.799 4.836 5.571 5.822 6.302 6.762 7.224 7.449 7.87 8.279 8.892 9.3 9.697 10.284 10.855 11.39 11.906 12.416 13.099 13.79 14.468 15.292 16.102 16.898 17.82 18.881 19.945 21.133 22.455 23.879 25.392 27.167 29.275 31.421 34.036 37.059 40.65 44.925 50.146 56.671 65.361 73.165 78.152 81.557 84.035 85.914 87.276 88.382 89.222 89.934 90.466 90.888 91.223 91.484 91.717 91.897 92.034 92.141 92.214 92.253 92.287 92.294 92.247 92.19 92.165 92.139 92.094 92.022 91.91 91.833 91.759 91.607 91.485 91.344 91.272 91.128 90.953 90.744 90.626 90.119 90.222 90.086 89.951 89.627 89.428 89.199 88.961 88.67 88.313 87.774 86.289 -7 ,24712 ,TETRA ,17591076,Sat Nov 27 22:10:41 CET,Sun Nov 28 00:23:58 CET,0.0 1.329 1.977 2.496 2.942 3.347 3.724 4.079 4.693 5.002 5.305 5.367 6.114 6.378 6.891 7.378 7.844 8.07 8.513 8.943 9.568 9.978 10.384 10.983 11.554 12.111 12.666 13.201 13.889 14.565 15.235 16.055 16.868 17.667 18.588 19.628 20.658 21.819 23.115 24.527 26.024 27.77 29.837 31.959 34.556 37.537 41.097 45.324 50.555 57.098 65.645 73.469 78.516 82.014 84.452 86.292 87.72 88.828 89.641 90.366 90.942 91.405 91.75 92.008 92.224 92.378 92.497 92.587 92.644 92.674 92.666 92.652 92.643 92.613 92.574 92.525 92.479 92.429 92.343 92.262 92.172 92.011 91.875 91.734 91.661 91.501 91.339 91.156 91.048 90.561 90.709 90.562 90.402 90.01 89.782 89.558 89.323 89.02 88.586 87.978 86.315 -8 ,5259 ,TETRA ,17591077,Sat Nov 27 22:10:43 CET,Sun Nov 28 00:23:36 CET,0.0 1.361 2.002 2.508 2.934 3.328 3.712 4.056 4.677 4.984 5.28 5.366 6.131 6.411 6.926 7.396 7.848 8.072 8.509 8.94 9.561 9.966 10.372 10.953 11.529 12.094 12.634 13.169 13.87 14.541 15.202 16.036 16.859 17.652 18.58 19.64 20.677 21.83 23.085 24.475 25.984 27.704 29.747 31.888 34.512 37.53 41.172 45.499 50.741 57.22 65.787 73.572 78.531 82.002 84.558 86.495 87.961 89.111 89.941 90.663 91.203 91.595 91.913 92.163 92.348 92.501 92.636 92.737 92.802 92.846 92.882 92.9 92.891 92.862 92.835 92.795 92.732 92.662 92.573 92.493 92.405 92.267 92.147 91.996 91.918 91.762 91.593 91.391 91.276 90.769 90.861 90.685 90.511 90.153 89.955 89.717 89.427 89.048 88.591 87.978 86.426 -9 ,834 ,TETRA ,17591078,Sat Nov 27 22:10:45 CET,Sun Nov 28 00:23:45 CET,0.0 1.262 1.902 2.41 2.838 3.227 3.586 3.921 4.528 4.806 5.082 5.14 5.875 6.127 6.62 7.072 7.511 7.735 8.176 8.602 9.22 9.619 10.015 10.592 11.168 11.729 12.267 12.814 13.542 14.223 14.885 15.711 16.516 17.303 18.225 19.287 20.305 21.418 22.662 24.04 25.53 27.239 29.28 31.404 33.984 36.973 40.543 44.743 49.94 56.5 65.111 72.957 78.029 81.497 83.951 85.794 87.169 88.255 89.079 89.802 90.352 90.76 91.096 91.394 91.629 91.805 91.979 92.097 92.152 92.197 92.238 92.25 92.235 92.216 92.199 92.159 92.084 92.007 91.925 91.864 91.794 91.646 91.531 91.413 91.358 91.242 91.083 90.905 90.806 90.31 90.424 90.287 90.137 89.751 89.532 89.275 88.97 88.633 88.218 87.702 86.189 -10 ,3648 ,TETRA ,17591079,Sat Nov 27 22:10:41 CET,Sun Nov 28 00:15:58 CET,0.0 1.282 1.876 2.35 2.762 3.176 3.545 3.869 4.48 4.759 5.028 5.056 5.789 6.041 6.553 7.044 7.503 7.72 8.142 8.558 9.163 9.56 9.957 10.538 11.107 11.66 12.198 12.725 13.421 14.094 14.741 15.536 16.321 17.097 18.01 19.057 20.091 21.26 22.537 23.914 25.404 27.134 29.21 31.349 33.912 36.913 40.499 44.701 49.938 56.464 64.938 72.524 77.523 81.054 83.515 85.319 86.653 87.748 88.564 89.221 89.729 90.156 90.51 90.785 91.014 91.204 91.352 91.45 91.517 91.556 91.542 91.528 91.524 91.485 91.442 91.405 91.35 91.272 91.162 91.078 91.017 90.922 90.827 90.692 90.616 90.459 90.29 90.108 89.997 89.498 89.644 89.503 89.343 88.988 88.801 88.576 88.296 87.988 87.609 87.068 85.471 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index e3ad037c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17260 ,TETRA ,17591080,Sat Nov 27 22:11:39 CET,Sun Nov 28 00:29:05 CET,0.0 0.894 1.365 1.793 2.158 2.455 2.701 2.931 3.383 3.574 3.761 3.766 4.322 4.476 4.755 5.02 5.289 5.425 5.659 5.877 6.183 6.373 6.57 6.855 7.117 7.375 7.625 7.868 8.181 8.468 8.733 9.073 9.398 9.679 9.999 10.378 10.728 11.096 11.494 11.906 12.338 12.802 13.3 13.767 14.288 14.835 15.349 15.831 16.28 16.527 16.293 15.407 14.411 13.405 12.424 11.508 10.661 9.863 9.167 8.497 7.918 7.381 6.858 6.371 5.914 5.46 4.981 4.574 4.223 3.842 3.435 3.088 2.738 2.369 2.068 1.755 1.436 1.118 0.767 0.514 0.267 -0.115 -0.378 -0.663 -0.82 -1.118 -1.44 -1.796 -1.973 -2.55 -2.598 -2.827 -3.072 -3.607 -3.884 -4.157 -4.467 -4.854 -5.358 -6.03 -8.116 -2 ,4350 ,TETRA ,17591081,Sat Nov 27 22:11:41 CET,Sun Nov 28 00:28:00 CET,0.0 1.532 2.074 2.5 2.881 3.215 3.501 3.764 4.228 4.44 4.625 4.583 5.142 5.318 5.644 5.937 6.209 6.344 6.602 6.834 7.171 7.385 7.592 7.898 8.177 8.449 8.717 8.952 9.231 9.5 9.766 10.081 10.377 10.659 11.0 11.386 11.724 12.088 12.485 12.884 13.29 13.74 14.237 14.69 15.203 15.736 16.241 16.74 17.161 17.388 17.212 16.365 15.307 14.243 13.263 12.307 11.424 10.643 9.961 9.245 8.593 8.028 7.52 6.993 6.478 6.026 5.552 5.12 4.748 4.356 3.948 3.628 3.289 2.916 2.631 2.336 2.025 1.71 1.391 1.174 0.939 0.55 0.268 -0.015 -0.158 -0.461 -0.79 -1.14 -1.311 -1.862 -1.856 -2.066 -2.293 -2.746 -2.99 -3.263 -3.578 -4.015 -4.558 -5.177 -7.064 -3 ,548 ,TETRA ,17591082,Sat Nov 27 22:11:43 CET,Sun Nov 28 00:26:23 CET,0.0 1.655 2.241 2.688 3.06 3.37 3.645 3.91 4.381 4.6 4.808 4.829 5.392 5.564 5.892 6.219 6.517 6.662 6.944 7.212 7.588 7.812 8.031 8.335 8.615 8.888 9.143 9.376 9.655 9.945 10.25 10.596 10.917 11.216 11.553 11.967 12.35 12.709 13.085 13.487 13.904 14.342 14.817 15.298 15.828 16.361 16.888 17.383 17.837 18.056 17.801 16.916 15.887 14.835 13.815 12.873 12.003 11.19 10.484 9.772 9.157 8.583 8.012 7.442 6.917 6.426 5.912 5.476 5.089 4.687 4.266 3.908 3.544 3.179 2.883 2.556 2.226 1.896 1.525 1.273 1.026 0.627 0.344 0.052 -0.105 -0.444 -0.809 -1.182 -1.375 -1.965 -2.003 -2.214 -2.438 -2.939 -3.226 -3.548 -3.912 -4.352 -4.869 -5.55 -7.163 -4 ,17911 ,TETRA ,17591083,Sat Nov 27 22:11:44 CET,Sun Nov 28 00:26:16 CET,0.0 1.81 2.34 2.715 3.022 3.323 3.588 3.825 4.285 4.509 4.714 4.713 5.266 5.412 5.704 6.002 6.28 6.408 6.633 6.855 7.205 7.425 7.633 7.917 8.19 8.454 8.693 8.927 9.239 9.539 9.823 10.162 10.464 10.732 11.062 11.443 11.796 12.193 12.629 13.054 13.485 13.961 14.473 14.976 15.515 16.07 16.647 17.173 17.609 17.856 17.668 16.841 15.809 14.802 13.829 12.822 11.902 11.081 10.386 9.69 9.049 8.445 7.867 7.313 6.793 6.336 5.851 5.396 5.007 4.622 4.223 3.886 3.529 3.145 2.847 2.544 2.231 1.912 1.574 1.331 1.086 0.705 0.435 0.15 -0.003 -0.33 -0.697 -1.08 -1.264 -1.835 -1.886 -2.123 -2.36 -2.872 -3.142 -3.432 -3.771 -4.148 -4.578 -5.159 -6.792 -5 ,26532 ,TETRA ,17591084,Sat Nov 27 22:11:40 CET,Sun Nov 28 00:29:22 CET,0.0 1.223 1.802 2.251 2.626 2.974 3.276 3.544 4.043 4.278 4.497 4.501 5.05 5.21 5.523 5.831 6.118 6.249 6.499 6.754 7.115 7.342 7.561 7.858 8.143 8.414 8.679 8.935 9.247 9.547 9.842 10.201 10.533 10.829 11.157 11.536 11.889 12.247 12.613 13.02 13.447 13.869 14.343 14.827 15.347 15.867 16.412 16.917 17.287 17.443 17.139 16.243 15.183 14.127 13.173 12.275 11.443 10.664 9.971 9.275 8.674 8.112 7.568 7.07 6.591 6.145 5.673 5.248 4.886 4.508 4.104 3.754 3.396 3.029 2.727 2.423 2.116 1.79 1.455 1.214 0.958 0.544 0.263 -0.022 -0.175 -0.486 -0.814 -1.168 -1.345 -1.897 -1.902 -2.134 -2.361 -2.837 -3.115 -3.432 -3.77 -4.124 -4.595 -5.282 -6.943 -6 ,29978 ,TETRA ,17591085,Sat Nov 27 22:11:43 CET,Sun Nov 28 00:29:14 CET,0.0 1.853 2.5 2.96 3.379 3.759 4.067 4.312 4.77 4.98 5.177 5.172 5.733 5.892 6.18 6.466 6.746 6.882 7.143 7.378 7.681 7.894 8.113 8.41 8.681 8.944 9.206 9.461 9.782 10.083 10.369 10.697 11.003 11.3 11.629 11.983 12.335 12.731 13.128 13.499 13.865 14.278 14.748 15.202 15.693 16.176 16.672 17.185 17.623 17.88 17.705 16.795 15.678 14.581 13.602 12.726 11.935 11.179 10.499 9.814 9.221 8.653 8.097 7.589 7.115 6.682 6.214 5.771 5.383 4.994 4.593 4.257 3.891 3.496 3.204 2.911 2.598 2.257 1.901 1.655 1.392 0.959 0.662 0.375 0.228 -0.079 -0.404 -0.75 -0.933 -1.508 -1.521 -1.723 -1.938 -2.435 -2.715 -3.037 -3.396 -3.763 -4.189 -4.758 -6.734 -7 ,30859 ,TETRA ,17591086,Sat Nov 27 22:11:45 CET,Sun Nov 28 00:25:12 CET,0.0 1.591 2.161 2.584 2.931 3.264 3.568 3.818 4.244 4.429 4.61 4.587 5.134 5.293 5.599 5.875 6.152 6.289 6.548 6.799 7.168 7.401 7.612 7.895 8.167 8.446 8.728 8.99 9.322 9.631 9.896 10.215 10.525 10.828 11.173 11.524 11.871 12.267 12.671 13.075 13.482 13.904 14.379 14.861 15.402 15.944 16.471 16.979 17.412 17.604 17.351 16.439 15.342 14.301 13.323 12.38 11.555 10.801 10.099 9.363 8.713 8.125 7.578 7.065 6.587 6.14 5.664 5.244 4.88 4.495 4.089 3.751 3.399 3.033 2.754 2.456 2.148 1.823 1.465 1.208 0.943 0.544 0.267 -0.019 -0.164 -0.476 -0.803 -1.141 -1.307 -1.867 -1.881 -2.084 -2.302 -2.816 -3.109 -3.409 -3.745 -4.128 -4.609 -5.235 -7.3 -8 ,22065 ,TETRA ,17591087,Sat Nov 27 22:11:41 CET,Sun Nov 28 00:24:53 CET,0.0 1.643 2.219 2.716 3.118 3.459 3.761 4.04 4.537 4.758 4.969 4.965 5.515 5.672 5.977 6.258 6.519 6.644 6.887 7.113 7.436 7.651 7.858 8.152 8.432 8.7 8.947 9.195 9.516 9.815 10.104 10.462 10.783 11.073 11.42 11.806 12.141 12.489 12.871 13.251 13.634 14.088 14.612 15.095 15.613 16.137 16.675 17.187 17.618 17.838 17.633 16.815 15.799 14.72 13.673 12.725 11.884 11.115 10.434 9.727 9.123 8.579 8.03 7.508 7.033 6.581 6.096 5.681 5.318 4.939 4.551 4.213 3.848 3.474 3.196 2.894 2.58 2.249 1.885 1.642 1.399 1.01 0.731 0.441 0.285 -0.034 -0.37 -0.742 -0.95 -1.544 -1.566 -1.781 -1.998 -2.474 -2.75 -3.066 -3.443 -3.862 -4.313 -4.917 -6.488 -9 ,15229 ,TETRA ,17591088,Sat Nov 27 22:11:41 CET,Sun Nov 28 00:23:33 CET,0.0 1.735 2.391 2.854 3.238 3.559 3.802 4.032 4.494 4.703 4.919 4.95 5.509 5.678 5.996 6.292 6.57 6.71 6.976 7.21 7.533 7.735 7.936 8.239 8.519 8.776 9.023 9.263 9.569 9.86 10.143 10.491 10.82 11.124 11.459 11.843 12.219 12.607 13.009 13.4 13.796 14.26 14.769 15.253 15.771 16.291 16.838 17.348 17.788 18.068 17.904 17.016 15.978 14.978 13.985 13.047 12.207 11.379 10.652 9.945 9.345 8.807 8.28 7.763 7.285 6.841 6.339 5.897 5.524 5.142 4.748 4.402 4.048 3.69 3.407 3.111 2.805 2.509 2.201 1.978 1.745 1.358 1.068 0.778 0.639 0.341 0.004 -0.349 -0.528 -1.092 -1.12 -1.331 -1.542 -2.033 -2.327 -2.636 -2.999 -3.395 -3.804 -4.386 -5.796 -10 ,10817 ,TETRA ,17591089,Sat Nov 27 22:11:41 CET,Sun Nov 28 00:27:48 CET,0.0 2.039 2.569 2.959 3.298 3.646 3.975 4.251 4.741 4.94 5.121 5.106 5.655 5.823 6.125 6.411 6.685 6.814 7.057 7.288 7.635 7.847 8.043 8.318 8.578 8.843 9.091 9.329 9.639 9.936 10.203 10.505 10.802 11.085 11.416 11.79 12.146 12.513 12.877 13.262 13.658 14.092 14.61 15.075 15.572 16.098 16.585 17.024 17.432 17.666 17.418 16.514 15.483 14.452 13.453 12.498 11.63 10.831 10.129 9.413 8.769 8.182 7.605 7.065 6.586 6.137 5.655 5.234 4.871 4.47 4.046 3.706 3.349 2.982 2.685 2.378 2.071 1.744 1.411 1.175 0.919 0.528 0.252 -0.049 -0.202 -0.523 -0.861 -1.212 -1.393 -1.96 -1.97 -2.183 -2.408 -2.901 -3.178 -3.479 -3.8 -4.18 -4.633 -5.24 -6.849 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index bc13957a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18746 ,TETRA ,17591090,Sat Nov 27 22:12:42 CET,Sun Nov 28 00:26:26 CET,0.0 1.399 2.023 2.523 2.958 3.371 3.78 4.141 4.791 5.091 5.377 5.439 6.185 6.443 6.944 7.422 7.875 8.107 8.557 8.977 9.593 9.994 10.404 11.012 11.585 12.149 12.717 13.281 14.006 14.719 15.434 16.302 17.154 18.004 19.009 20.139 21.24 22.473 23.83 25.295 26.872 28.72 30.943 33.227 35.978 39.197 43.071 47.737 53.507 60.687 70.17 78.738 84.304 88.14 90.859 92.914 94.448 95.669 96.599 97.415 98.025 98.498 98.902 99.241 99.493 99.684 99.836 99.941 100.008 100.038 100.055 100.066 100.066 100.057 100.035 99.978 99.919 99.853 99.738 99.648 99.548 99.383 99.258 99.104 99.016 98.828 98.631 98.407 98.286 97.765 97.853 97.699 97.497 97.011 96.755 96.477 96.145 95.734 95.203 94.457 91.652 -2 ,12628 ,TETRA ,17591091,Sat Nov 27 22:12:43 CET,Sun Nov 28 00:29:05 CET,0.0 1.76 2.469 3.006 3.438 3.811 4.175 4.533 5.199 5.508 5.804 5.862 6.625 6.895 7.384 7.854 8.324 8.55 8.996 9.444 10.091 10.509 10.917 11.512 12.112 12.715 13.297 13.871 14.636 15.374 16.092 16.963 17.786 18.592 19.549 20.636 21.703 22.897 24.222 25.682 27.238 29.03 31.198 33.461 36.214 39.399 43.193 47.645 53.175 60.136 69.242 77.432 82.701 86.413 89.118 91.131 92.497 93.483 94.228 94.841 95.279 95.593 95.814 95.969 96.085 96.171 96.208 96.201 96.168 96.1 95.978 95.874 95.775 95.674 95.611 95.538 95.459 95.351 95.195 95.086 94.965 94.756 94.618 94.48 94.406 94.246 94.048 93.811 93.691 93.183 93.251 93.071 92.859 92.316 92.03 91.761 91.452 91.093 90.62 89.769 87.47 -3 ,24345 ,TETRA ,17591092,Sat Nov 27 22:12:42 CET,Sun Nov 28 00:25:59 CET,0.0 1.653 2.32 2.851 3.389 3.867 4.25 4.597 5.238 5.531 5.814 5.876 6.623 6.885 7.4 7.895 8.371 8.606 9.067 9.514 10.156 10.587 11.014 11.618 12.206 12.78 13.346 13.907 14.63 15.338 16.036 16.9 17.749 18.574 19.55 20.672 21.776 22.997 24.328 25.788 27.378 29.186 31.359 33.628 36.331 39.498 43.31 47.747 53.224 60.133 69.157 77.282 82.476 86.15 88.763 90.704 92.152 93.267 94.065 94.749 95.281 95.666 95.924 96.118 96.295 96.45 96.579 96.656 96.731 96.773 96.762 96.747 96.729 96.683 96.627 96.572 96.491 96.399 96.283 96.196 96.119 95.968 95.833 95.677 95.598 95.445 95.249 94.968 94.82 94.302 94.374 94.183 93.969 93.517 93.287 93.021 92.676 92.29 91.822 91.113 88.414 -4 ,23952 ,TETRA ,17591093,Sat Nov 27 22:12:42 CET,Sun Nov 28 00:24:00 CET,0.0 1.623 2.229 2.736 3.167 3.562 3.937 4.279 4.893 5.185 5.475 5.546 6.307 6.568 7.079 7.585 8.062 8.295 8.745 9.18 9.828 10.248 10.644 11.226 11.823 12.415 12.99 13.556 14.29 15.004 15.706 16.558 17.383 18.202 19.182 20.318 21.429 22.657 24.008 25.479 27.075 28.943 31.164 33.443 36.176 39.325 43.099 47.518 53.027 60.004 69.16 77.581 82.868 86.462 89.068 91.038 92.46 93.537 94.356 95.049 95.531 95.901 96.208 96.449 96.656 96.824 96.951 97.021 97.074 97.114 97.135 97.145 97.14 97.114 97.068 97.016 96.962 96.882 96.761 96.669 96.567 96.366 96.223 96.041 95.935 95.732 95.513 95.283 95.167 94.656 94.708 94.517 94.318 93.895 93.634 93.358 93.025 92.594 92.102 91.303 88.343 -5 ,27812 ,TETRA ,17591094,Sat Nov 27 22:12:42 CET,Sun Nov 28 00:27:24 CET,0.0 1.946 2.612 3.092 3.517 3.917 4.308 4.686 5.361 5.659 5.958 6.053 6.824 7.111 7.653 8.151 8.621 8.844 9.273 9.698 10.345 10.772 11.191 11.811 12.408 12.991 13.57 14.133 14.86 15.586 16.304 17.176 18.027 18.874 19.878 20.98 22.015 23.199 24.538 26.045 27.703 29.582 31.853 34.2 36.967 40.116 43.966 48.594 54.316 61.449 70.8 79.291 84.726 88.487 91.211 93.319 94.876 96.114 97.055 97.895 98.511 98.955 99.314 99.601 99.813 99.968 100.133 100.248 100.314 100.349 100.351 100.345 100.322 100.302 100.29 100.261 100.214 100.162 100.085 100.01 99.922 99.774 99.661 99.506 99.424 99.269 99.084 98.855 98.732 98.23 98.292 98.122 97.957 97.544 97.281 96.972 96.621 96.199 95.599 94.781 92.506 -6 ,9697 ,TETRA ,17591095,Sat Nov 27 22:12:42 CET,Sun Nov 28 00:29:51 CET,0.0 1.762 2.405 2.897 3.343 3.746 4.135 4.495 5.111 5.404 5.695 5.776 6.529 6.78 7.287 7.787 8.262 8.493 8.948 9.395 10.041 10.459 10.868 11.462 12.046 12.622 13.18 13.722 14.441 15.157 15.856 16.704 17.545 18.369 19.338 20.471 21.591 22.832 24.204 25.719 27.344 29.213 31.479 33.804 36.573 39.771 43.613 48.177 53.776 60.745 69.903 78.261 83.633 87.315 89.954 91.94 93.421 94.589 95.503 96.317 96.87 97.276 97.635 97.94 98.169 98.341 98.497 98.614 98.673 98.697 98.706 98.69 98.653 98.608 98.565 98.504 98.418 98.303 98.172 98.084 97.992 97.824 97.691 97.532 97.439 97.243 97.027 96.781 96.652 96.135 96.193 96.027 95.851 95.425 95.182 94.885 94.51 94.077 93.532 92.787 90.607 -7 ,13591 ,TETRA ,17591096,Sat Nov 27 22:12:42 CET,Sun Nov 28 00:19:00 CET,0.0 1.423 2.037 2.51 2.937 3.336 3.674 4.004 4.674 4.992 5.292 5.364 6.134 6.395 6.912 7.423 7.919 8.164 8.641 9.096 9.758 10.18 10.588 11.216 11.827 12.413 13.001 13.575 14.323 15.046 15.747 16.622 17.486 18.32 19.299 20.43 21.536 22.77 24.144 25.648 27.278 29.158 31.391 33.693 36.444 39.657 43.549 48.145 53.854 61.041 70.354 78.909 84.478 88.324 91.148 93.312 94.952 96.265 97.243 98.093 98.735 99.219 99.607 99.923 100.185 100.395 100.568 100.699 100.785 100.833 100.852 100.856 100.839 100.788 100.746 100.688 100.616 100.545 100.448 100.368 100.27 100.1 99.967 99.808 99.726 99.562 99.385 99.179 99.06 98.563 98.713 98.563 98.382 97.978 97.756 97.519 97.221 96.867 96.395 95.671 93.242 -8 ,19677 ,TETRA ,17591097,Sat Nov 27 22:13:39 CET,Sun Nov 28 00:27:23 CET,0.0 1.834 2.52 3.029 3.465 3.855 4.234 4.605 5.307 5.624 5.916 6.002 6.762 7.024 7.534 8.014 8.471 8.702 9.16 9.606 10.259 10.685 11.102 11.713 12.311 12.905 13.499 14.079 14.845 15.588 16.304 17.181 18.038 18.889 19.893 21.045 22.158 23.38 24.753 26.257 27.855 29.699 31.939 34.26 37.013 40.216 44.081 48.633 54.24 61.314 70.639 79.198 84.706 88.442 91.077 93.081 94.563 95.658 96.459 97.131 97.586 97.888 98.13 98.313 98.458 98.596 98.727 98.802 98.806 98.782 98.743 98.681 98.628 98.575 98.502 98.404 98.271 98.136 97.98 97.838 97.691 97.465 97.273 97.067 96.968 96.765 96.555 96.308 96.181 95.679 95.776 95.618 95.418 94.975 94.718 94.436 94.132 93.744 93.236 92.484 90.226 -9 ,12278 ,TETRA ,17591098,Sat Nov 27 22:13:38 CET,Sun Nov 28 00:27:22 CET,0.0 1.769 2.361 2.862 3.34 3.775 4.153 4.503 5.131 5.417 5.695 5.777 6.542 6.805 7.319 7.824 8.292 8.511 8.945 9.384 10.045 10.474 10.884 11.486 12.076 12.645 13.201 13.752 14.478 15.2 15.897 16.745 17.585 18.405 19.373 20.482 21.582 22.823 24.188 25.667 27.262 29.141 31.37 33.653 36.42 39.627 43.457 47.938 53.458 60.338 69.402 77.853 83.258 87.011 89.69 91.65 93.075 94.176 94.977 95.662 96.157 96.524 96.846 97.138 97.379 97.554 97.72 97.842 97.916 97.98 98.025 98.033 98.033 98.028 98.0 97.939 97.843 97.733 97.628 97.547 97.447 97.27 97.151 96.999 96.909 96.732 96.532 96.283 96.146 95.638 95.707 95.526 95.337 94.913 94.663 94.359 93.961 93.548 93.078 92.373 89.974 -10 ,8795 ,TETRA ,17591099,Sat Nov 27 22:14:39 CET,Sun Nov 28 00:31:03 CET,0.0 1.633 2.253 2.76 3.211 3.621 4.008 4.358 4.999 5.307 5.593 5.649 6.41 6.683 7.227 7.737 8.219 8.449 8.893 9.332 9.987 10.411 10.821 11.436 12.044 12.633 13.222 13.797 14.536 15.261 15.977 16.858 17.729 18.578 19.564 20.691 21.802 23.055 24.419 25.916 27.539 29.371 31.573 33.892 36.657 39.81 43.619 48.161 53.789 60.878 70.236 78.719 84.059 87.753 90.392 92.355 93.803 94.902 95.666 96.322 96.802 97.197 97.576 97.886 98.093 98.264 98.447 98.556 98.618 98.657 98.687 98.702 98.694 98.654 98.6 98.546 98.477 98.374 98.252 98.157 98.038 97.833 97.681 97.518 97.431 97.244 97.037 96.807 96.681 96.165 96.218 96.018 95.824 95.341 95.021 94.684 94.339 93.915 93.37 92.657 90.291 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt deleted file mode 100644 index 1be3c543..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16158 ,TETRA ,17591100,Sat Nov 27 22:14:40 CET,Sun Nov 28 00:29:19 CET,0.0 1.308 1.904 2.354 2.688 2.975 3.252 3.521 3.967 4.161 4.356 4.23 4.895 5.071 5.386 5.672 5.942 6.084 6.361 6.624 6.997 7.229 7.455 7.784 8.092 8.38 8.67 8.95 9.315 9.67 10.011 10.423 10.807 11.165 11.591 12.077 12.516 12.98 13.479 14.009 14.554 15.156 15.851 16.521 17.293 18.123 19.005 19.956 20.988 22.011 22.803 22.984 22.792 22.36 21.846 21.277 20.667 20.073 19.526 18.922 18.368 17.862 17.377 16.907 16.443 16.007 15.519 15.063 14.658 14.225 13.793 13.417 13.009 12.592 12.277 11.974 11.677 11.378 11.071 10.854 10.615 10.208 9.914 9.58 9.39 8.999 8.598 8.162 7.939 7.225 7.205 6.95 6.677 6.101 5.799 5.468 5.109 4.698 4.208 3.571 1.686 -2 ,15817 ,TETRA ,17591101,Sat Nov 27 22:14:40 CET,Sun Nov 28 00:30:59 CET,0.0 1.605 2.137 2.551 2.913 3.231 3.508 3.767 4.245 4.463 4.663 4.567 5.236 5.405 5.726 6.029 6.319 6.456 6.72 6.981 7.357 7.595 7.817 8.136 8.453 8.762 9.057 9.334 9.688 10.036 10.359 10.746 11.126 11.479 11.893 12.35 12.763 13.216 13.709 14.21 14.727 15.329 16.02 16.685 17.424 18.213 19.103 20.046 21.051 22.012 22.834 23.022 22.588 21.984 21.412 20.754 20.059 19.408 18.82 18.206 17.681 17.185 16.728 16.339 15.961 15.596 15.213 14.858 14.547 14.217 13.836 13.501 13.15 12.805 12.536 12.244 11.926 11.597 11.268 11.042 10.816 10.443 10.181 9.922 9.776 9.458 9.137 8.787 8.601 7.922 8.001 7.771 7.513 6.944 6.644 6.314 5.946 5.578 5.145 4.521 2.769 -3 ,23460 ,TETRA ,17591102,Sat Nov 27 22:14:40 CET,Sun Nov 28 00:29:49 CET,0.0 1.654 2.237 2.65 2.99 3.27 3.548 3.825 4.279 4.469 4.655 4.552 5.221 5.395 5.724 6.03 6.327 6.468 6.751 7.034 7.407 7.647 7.888 8.224 8.545 8.857 9.146 9.411 9.752 10.07 10.379 10.771 11.146 11.5 11.9 12.35 12.785 13.259 13.772 14.306 14.836 15.417 16.099 16.747 17.461 18.235 19.099 20.058 21.092 22.1 23.022 23.374 23.21 22.845 22.379 21.893 21.394 20.873 20.412 19.939 19.516 19.127 18.744 18.356 17.975 17.607 17.21 16.866 16.57 16.249 15.897 15.592 15.281 14.962 14.704 14.439 14.157 13.862 13.55 13.325 13.101 12.757 12.506 12.242 12.102 11.806 11.48 11.122 10.926 10.248 10.327 10.117 9.895 9.41 9.145 8.862 8.56 8.219 7.789 7.206 5.23 -4 ,28544 ,TETRA ,17591103,Sat Nov 27 22:14:40 CET,Sun Nov 28 00:29:13 CET,0.0 1.443 1.937 2.334 2.703 3.062 3.387 3.679 4.16 4.386 4.6 4.479 5.143 5.309 5.628 5.925 6.225 6.368 6.618 6.873 7.259 7.499 7.733 8.053 8.346 8.637 8.92 9.187 9.526 9.857 10.177 10.56 10.93 11.287 11.686 12.116 12.533 12.993 13.502 14.047 14.598 15.194 15.875 16.542 17.269 18.062 18.963 19.922 20.981 22.076 22.939 23.106 22.76 22.264 21.75 21.189 20.637 20.065 19.541 18.989 18.48 17.99 17.503 17.049 16.601 16.188 15.76 15.361 15.003 14.626 14.223 13.867 13.477 13.061 12.754 12.442 12.104 11.743 11.351 11.076 10.792 10.352 10.051 9.736 9.57 9.223 8.861 8.466 8.258 7.561 7.56 7.304 7.043 6.468 6.144 5.78 5.362 4.89 4.397 3.716 1.697 -5 ,20533 ,TETRA ,17591104,Sat Nov 27 22:15:21 CET,Sun Nov 28 00:31:11 CET,0.0 1.667 2.274 2.711 3.098 3.451 3.759 4.034 4.528 4.745 4.957 4.894 5.594 5.8 6.169 6.509 6.826 6.969 7.233 7.496 7.896 8.152 8.389 8.74 9.086 9.407 9.698 9.977 10.355 10.719 11.054 11.464 11.869 12.245 12.663 13.12 13.573 14.079 14.61 15.163 15.725 16.33 17.049 17.763 18.533 19.358 20.295 21.272 22.343 23.488 24.435 24.668 24.451 23.946 23.315 22.691 22.061 21.435 20.919 20.385 19.875 19.385 18.893 18.404 17.927 17.465 16.975 16.552 16.187 15.798 15.376 15.014 14.626 14.218 13.89 13.553 13.206 12.852 12.489 12.236 11.963 11.506 11.198 10.884 10.709 10.317 9.919 9.503 9.284 8.585 8.604 8.347 8.064 7.382 7.004 6.599 6.166 5.714 5.175 4.345 2.047 -6 ,14999 ,TETRA ,17591105,Sat Nov 27 22:15:21 CET,Sun Nov 28 00:33:26 CET,0.0 1.548 2.096 2.553 2.953 3.301 3.608 3.881 4.375 4.604 4.821 4.747 5.424 5.596 5.932 6.253 6.562 6.708 6.982 7.243 7.626 7.877 8.108 8.437 8.751 9.042 9.331 9.604 9.94 10.273 10.614 11.025 11.399 11.756 12.18 12.651 13.109 13.603 14.109 14.647 15.2 15.823 16.572 17.295 18.09 18.975 19.966 21.036 22.209 23.389 24.515 25.063 25.02 24.756 24.395 23.97 23.506 23.04 22.627 22.165 21.752 21.37 20.974 20.604 20.244 19.898 19.52 19.16 18.843 18.503 18.147 17.859 17.544 17.202 16.92 16.61 16.293 15.983 15.68 15.47 15.235 14.861 14.61 14.349 14.213 13.925 13.624 13.295 13.105 12.423 12.493 12.289 12.066 11.545 11.26 10.951 10.597 10.193 9.719 9.122 7.511 -7 ,11774 ,TETRA ,17591106,Sat Nov 27 22:14:41 CET,Sun Nov 28 00:30:12 CET,0.0 1.298 1.903 2.351 2.702 3.029 3.335 3.596 4.081 4.314 4.535 4.445 5.123 5.316 5.691 6.024 6.321 6.461 6.738 7.006 7.384 7.62 7.842 8.162 8.475 8.782 9.076 9.366 9.744 10.095 10.422 10.818 11.195 11.542 11.94 12.377 12.795 13.276 13.798 14.341 14.889 15.48 16.158 16.85 17.617 18.456 19.403 20.374 21.383 22.413 23.318 23.47 23.114 22.529 21.86 21.201 20.537 19.858 19.233 18.619 18.14 17.698 17.225 16.787 16.372 15.976 15.564 15.172 14.815 14.453 14.082 13.753 13.419 13.083 12.825 12.556 12.262 11.935 11.573 11.328 11.079 10.68 10.416 10.149 9.999 9.671 9.333 8.966 8.766 8.07 8.121 7.9 7.667 7.109 6.755 6.344 5.909 5.416 4.809 4.036 1.957 -8 ,21165 ,TETRA ,17591107,Sat Nov 27 22:14:43 CET,Sun Nov 28 00:30:45 CET,0.0 1.953 2.549 2.975 3.341 3.692 3.987 4.241 4.712 4.922 5.117 5.024 5.702 5.876 6.224 6.556 6.856 6.996 7.258 7.526 7.924 8.169 8.392 8.698 8.995 9.277 9.548 9.822 10.18 10.511 10.848 11.26 11.644 12.005 12.412 12.874 13.309 13.809 14.341 14.889 15.478 16.121 16.865 17.593 18.416 19.312 20.327 21.41 22.532 23.664 24.807 25.363 25.312 25.02 24.602 24.148 23.618 23.064 22.59 22.097 21.653 21.212 20.769 20.343 19.938 19.555 19.133 18.753 18.423 18.089 17.734 17.42 17.082 16.714 16.424 16.133 15.834 15.509 15.139 14.881 14.628 14.227 13.93 13.614 13.452 13.119 12.774 12.415 12.22 11.527 11.585 11.351 11.117 10.63 10.344 10.025 9.658 9.243 8.73 7.829 5.158 -9 ,8930 ,TETRA ,17591108,Sat Nov 27 22:14:47 CET,Sun Nov 28 00:31:08 CET,0.0 1.463 2.001 2.429 2.764 3.067 3.359 3.633 4.132 4.361 4.572 4.461 5.135 5.309 5.634 5.941 6.225 6.36 6.631 6.895 7.285 7.535 7.774 8.13 8.449 8.743 9.032 9.298 9.634 9.962 10.287 10.681 11.049 11.391 11.796 12.267 12.71 13.165 13.666 14.217 14.762 15.352 16.047 16.739 17.522 18.358 19.267 20.273 21.351 22.412 23.323 23.619 23.444 23.052 22.5 21.822 21.163 20.487 19.857 19.204 18.667 18.23 17.827 17.455 17.078 16.719 16.322 15.961 15.662 15.329 14.965 14.659 14.341 14.01 13.746 13.471 13.194 12.907 12.583 12.355 12.125 11.762 11.509 11.238 11.086 10.761 10.439 10.097 9.903 9.214 9.237 9.007 8.749 8.14 7.823 7.503 7.155 6.723 6.191 5.477 3.164 -10 ,26183 ,TETRA ,17591109,Sat Nov 27 22:14:42 CET,Sun Nov 28 00:31:33 CET,0.0 1.335 1.87 2.292 2.646 2.959 3.253 3.519 3.99 4.212 4.424 4.33 4.996 5.168 5.51 5.844 6.162 6.3 6.554 6.806 7.175 7.416 7.654 8.001 8.315 8.61 8.9 9.184 9.55 9.892 10.22 10.613 10.992 11.353 11.758 12.211 12.638 13.119 13.639 14.172 14.717 15.315 16.008 16.683 17.444 18.292 19.217 20.182 21.209 22.223 23.117 23.273 22.881 22.378 21.853 21.274 20.708 20.137 19.594 19.002 18.411 17.822 17.241 16.666 16.126 15.667 15.188 14.752 14.37 13.966 13.533 13.161 12.776 12.394 12.098 11.771 11.43 11.071 10.682 10.411 10.124 9.668 9.352 9.027 8.849 8.45 8.041 7.627 7.398 6.667 6.63 6.356 6.071 5.447 5.086 4.669 4.203 3.658 2.946 2.04 -0.911 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index f4965d2a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17361 ,TETRA ,17591110,Sat Nov 27 22:14:42 CET,Sun Nov 28 00:30:00 CET,0.0 2.267 2.948 3.422 3.809 4.162 4.478 4.767 5.296 5.528 5.744 5.759 6.323 6.487 6.822 7.152 7.445 7.59 7.852 8.084 8.431 8.656 8.878 9.194 9.481 9.762 10.033 10.296 10.634 10.949 11.223 11.52 11.808 12.081 12.386 12.752 13.105 13.465 13.838 14.224 14.616 15.039 15.55 16.053 16.584 17.073 17.546 18.035 18.501 18.796 18.552 17.585 16.514 15.461 14.45 13.525 12.702 11.939 11.299 10.654 10.061 9.543 9.077 8.633 8.226 7.855 7.451 7.069 6.709 6.324 5.936 5.601 5.265 4.938 4.664 4.363 4.041 3.712 3.374 3.127 2.865 2.464 2.181 1.883 1.729 1.421 1.121 0.804 0.615 0.033 0.03 -0.177 -0.404 -0.859 -1.117 -1.412 -1.732 -2.134 -2.626 -3.281 -5.137 -2 ,9968 ,TETRA ,17591111,Sat Nov 27 22:14:44 CET,Sun Nov 28 00:29:21 CET,0.0 1.64 2.202 2.612 2.94 3.221 3.492 3.753 4.244 4.465 4.656 4.634 5.199 5.376 5.676 5.939 6.192 6.305 6.514 6.732 7.044 7.24 7.439 7.724 8.0 8.254 8.483 8.708 8.998 9.281 9.547 9.863 10.173 10.458 10.761 11.1 11.418 11.744 12.1 12.506 12.936 13.395 13.877 14.311 14.775 15.244 15.764 16.287 16.705 16.915 16.657 15.739 14.809 13.894 12.941 12.039 11.214 10.433 9.76 9.099 8.508 7.932 7.367 6.834 6.354 5.941 5.493 5.065 4.682 4.292 3.906 3.577 3.225 2.857 2.562 2.249 1.931 1.604 1.262 1.021 0.776 0.408 0.136 -0.165 -0.311 -0.595 -0.918 -1.278 -1.46 -2.028 -2.038 -2.261 -2.503 -3.047 -3.334 -3.623 -3.957 -4.339 -4.785 -5.477 -7.747 -3 ,11052 ,TETRA ,17591112,Sat Nov 27 22:14:47 CET,Sun Nov 28 00:25:24 CET,0.0 2.24 2.867 3.307 3.695 4.048 4.358 4.633 5.127 5.346 5.547 5.541 6.118 6.305 6.646 6.947 7.245 7.403 7.691 7.943 8.277 8.473 8.662 8.95 9.252 9.553 9.822 10.063 10.363 10.644 10.91 11.232 11.536 11.815 12.134 12.489 12.825 13.182 13.553 13.95 14.391 14.855 15.317 15.784 16.335 16.858 17.291 17.662 17.975 18.149 17.839 16.89 15.776 14.709 13.795 12.959 12.179 11.426 10.796 10.163 9.591 9.095 8.622 8.159 7.716 7.291 6.841 6.45 6.11 5.767 5.4 5.082 4.757 4.422 4.159 3.89 3.607 3.312 2.997 2.776 2.557 2.21 1.964 1.7 1.564 1.271 0.935 0.584 0.399 -0.201 -0.268 -0.495 -0.72 -1.179 -1.426 -1.679 -1.96 -2.301 -2.728 -3.319 -4.633 -4 ,29986 ,TETRA ,17591113,Sat Nov 27 21:51:12 CET,Sun Nov 28 00:03:44 CET,0.0 1.484 2.047 2.494 2.864 3.181 3.438 3.678 4.14 4.344 4.532 4.492 5.037 5.205 5.528 5.822 6.1 6.23 6.482 6.732 7.079 7.29 7.49 7.77 8.047 8.334 8.601 8.858 9.181 9.491 9.8 10.168 10.509 10.824 11.185 11.581 11.951 12.362 12.817 13.296 13.743 14.193 14.72 15.256 15.865 16.465 17.083 17.672 18.185 18.577 18.574 17.913 16.993 15.995 15.071 14.205 13.422 12.676 11.995 11.303 10.721 10.19 9.654 9.142 8.68 8.267 7.803 7.37 6.997 6.621 6.231 5.89 5.526 5.149 4.874 4.598 4.293 3.951 3.593 3.362 3.128 2.739 2.465 2.186 2.039 1.737 1.421 1.085 0.895 0.316 0.293 0.084 -0.135 -0.619 -0.896 -1.209 -1.544 -1.915 -2.361 -2.956 -5.412 -5 ,23333 ,TETRA ,17591114,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sat Nov 27 23:44:46 CET,0.0 1.62 2.216 2.65 3.015 3.334 3.628 3.888 4.358 4.59 4.803 4.798 5.348 5.495 5.775 6.053 6.327 6.456 6.715 6.972 7.321 7.535 7.746 8.059 8.36 8.637 8.883 9.126 9.445 9.744 10.038 10.416 10.763 11.084 11.455 11.827 12.169 12.549 12.931 13.32 13.738 14.225 14.807 15.346 15.884 16.439 17.03 17.599 18.083 18.392 18.364 17.792 17.0 16.119 15.249 14.428 13.661 12.9 12.244 11.614 11.039 10.501 9.995 9.511 9.062 8.649 8.209 7.826 7.499 7.145 6.779 6.492 6.184 5.828 5.542 5.255 4.949 4.627 4.303 4.078 3.837 3.474 3.216 2.935 2.796 2.522 2.23 1.884 1.707 1.162 1.199 1.005 0.78 0.302 0.052 -0.233 -0.539 -0.882 -1.321 -1.898 -3.573 -6 ,1614 ,TETRA ,17591115,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:04:23 CET,0.0 1.869 2.44 2.852 3.179 3.478 3.773 4.041 4.503 4.718 4.916 4.882 5.44 5.602 5.894 6.155 6.414 6.545 6.784 6.997 7.324 7.556 7.771 8.068 8.357 8.631 8.876 9.117 9.445 9.75 10.03 10.369 10.704 11.009 11.33 11.69 12.04 12.407 12.782 13.173 13.615 14.122 14.655 15.141 15.683 16.195 16.689 17.212 17.653 17.847 17.572 16.894 16.012 15.091 14.254 13.427 12.672 11.949 11.306 10.676 10.108 9.575 9.06 8.566 8.099 7.679 7.219 6.783 6.422 6.066 5.707 5.409 5.072 4.696 4.404 4.109 3.784 3.45 3.13 2.899 2.644 2.255 1.997 1.738 1.608 1.322 1.017 0.697 0.533 -0.012 0.011 -0.19 -0.418 -0.9 -1.153 -1.439 -1.749 -2.089 -2.535 -3.219 -5.623 -7 ,21170 ,TETRA ,17591116,Sat Nov 27 21:51:12 CET,Sat Nov 27 23:50:25 CET,0.0 1.42 2.126 2.582 2.88 3.156 3.413 3.642 4.067 4.266 4.455 4.445 4.997 5.161 5.464 5.761 6.028 6.149 6.405 6.658 7.016 7.236 7.439 7.733 8.006 8.267 8.509 8.728 9.024 9.315 9.604 9.976 10.317 10.619 10.966 11.337 11.68 12.06 12.452 12.867 13.293 13.714 14.202 14.722 15.304 15.924 16.5 17.012 17.491 17.745 17.379 16.349 15.311 14.314 13.359 12.452 11.643 10.878 10.195 9.523 8.952 8.427 7.935 7.491 7.067 6.653 6.201 5.793 5.434 5.042 4.639 4.316 3.982 3.628 3.338 3.049 2.762 2.437 2.084 1.855 1.62 1.236 0.956 0.657 0.497 0.159 -0.174 -0.508 -0.678 -1.239 -1.246 -1.444 -1.665 -2.177 -2.45 -2.742 -3.058 -3.416 -3.877 -4.491 -6.094 -8 ,19495 ,TETRA ,17591117,Sat Nov 27 21:51:12 CET,Sun Nov 28 00:04:21 CET,0.0 2.01 2.633 3.198 3.658 3.998 4.297 4.568 5.028 5.245 5.455 5.477 6.054 6.216 6.519 6.788 7.039 7.166 7.411 7.652 8.003 8.225 8.452 8.783 9.088 9.378 9.644 9.884 10.19 10.469 10.758 11.127 11.45 11.742 12.054 12.405 12.755 13.134 13.518 13.889 14.287 14.727 15.193 15.642 16.148 16.661 17.222 17.768 18.256 18.587 18.437 17.616 16.65 15.711 14.847 14.015 13.236 12.522 11.894 11.268 10.71 10.196 9.674 9.156 8.675 8.223 7.756 7.321 6.92 6.503 6.083 5.74 5.394 5.048 4.778 4.496 4.206 3.913 3.585 3.348 3.114 2.77 2.521 2.259 2.12 1.81 1.482 1.142 0.961 0.395 0.378 0.165 -0.058 -0.567 -0.844 -1.136 -1.462 -1.85 -2.348 -2.933 -5.251 -9 ,11913 ,TETRA ,17591118,Sat Nov 27 21:51:14 CET,Sun Nov 28 00:04:56 CET,0.0 1.928 2.525 2.975 3.312 3.605 3.894 4.145 4.585 4.79 4.983 4.975 5.535 5.703 6.021 6.302 6.553 6.681 6.924 7.146 7.48 7.703 7.911 8.207 8.494 8.767 9.039 9.304 9.626 9.913 10.17 10.469 10.77 11.074 11.418 11.768 12.114 12.51 12.922 13.356 13.796 14.245 14.716 15.138 15.584 16.044 16.542 17.141 17.759 18.06 17.731 16.799 15.733 14.65 13.649 12.732 11.909 11.143 10.459 9.77 9.169 8.636 8.128 7.635 7.19 6.783 6.344 5.951 5.616 5.262 4.881 4.566 4.24 3.91 3.65 3.372 3.074 2.764 2.456 2.235 2.007 1.661 1.409 1.148 1.01 0.723 0.426 0.092 -0.084 -0.65 -0.659 -0.869 -1.078 -1.504 -1.762 -2.065 -2.378 -2.745 -3.167 -3.732 -5.879 -10 ,990 ,TETRA ,17591119,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:04:02 CET,0.0 1.456 2.007 2.441 2.859 3.214 3.507 3.774 4.267 4.49 4.687 4.65 5.199 5.36 5.679 5.99 6.274 6.401 6.64 6.88 7.244 7.465 7.676 7.979 8.255 8.524 8.777 9.001 9.294 9.587 9.865 10.191 10.499 10.784 11.108 11.457 11.782 12.142 12.518 12.925 13.329 13.763 14.263 14.755 15.291 15.767 16.189 16.568 16.852 16.897 16.491 15.544 14.469 13.46 12.565 11.704 10.896 10.132 9.416 8.705 8.112 7.586 7.064 6.526 6.035 5.604 5.144 4.73 4.387 4.018 3.624 3.3 2.962 2.619 2.35 2.06 1.742 1.42 1.09 0.857 0.607 0.215 -0.048 -0.327 -0.47 -0.768 -1.095 -1.451 -1.646 -2.23 -2.245 -2.456 -2.676 -3.166 -3.445 -3.741 -4.06 -4.422 -4.898 -5.619 -7.281 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt deleted file mode 100644 index 90f58ab4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12470 ,TETRA ,17591120,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:08:48 CET,0.0 1.785 2.392 2.848 3.195 3.479 3.758 4.018 4.464 4.676 4.879 4.864 5.399 5.556 5.867 6.137 6.394 6.525 6.767 6.986 7.307 7.527 7.743 8.048 8.339 8.614 8.863 9.101 9.409 9.716 10.01 10.346 10.674 10.973 11.297 11.664 12.017 12.406 12.823 13.276 13.752 14.252 14.802 15.34 15.955 16.6 17.264 17.931 18.591 19.129 19.337 18.875 18.18 17.418 16.567 15.679 14.89 14.156 13.465 12.753 12.115 11.513 10.933 10.372 9.819 9.298 8.773 8.332 7.965 7.563 7.116 6.749 6.37 5.972 5.66 5.322 4.964 4.595 4.234 3.988 3.712 3.24 2.905 2.564 2.391 2.034 1.664 1.286 1.084 0.471 0.389 0.13 -0.141 -0.703 -1.008 -1.352 -1.747 -2.197 -2.76 -3.528 -5.969 -2 ,807 ,TETRA ,17591121,Sat Nov 27 21:51:16 CET,Sun Nov 28 00:07:32 CET,0.0 1.785 2.372 2.794 3.129 3.421 3.717 4.019 4.551 4.779 4.988 4.986 5.542 5.709 6.018 6.305 6.583 6.727 6.985 7.228 7.577 7.806 8.041 8.364 8.673 8.966 9.244 9.537 9.903 10.229 10.557 10.94 11.286 11.62 12.014 12.473 12.881 13.282 13.706 14.149 14.616 15.125 15.673 16.192 16.82 17.514 18.206 18.877 19.583 20.209 20.528 20.087 19.325 18.561 17.813 17.05 16.198 15.3 14.525 13.753 13.089 12.524 11.999 11.463 10.96 10.503 10.014 9.559 9.156 8.754 8.324 7.944 7.549 7.126 6.796 6.46 6.11 5.768 5.382 5.087 4.804 4.389 4.093 3.772 3.596 3.242 2.89 2.506 2.298 1.703 1.615 1.372 1.115 0.54 0.219 -0.136 -0.532 -0.982 -1.51 -2.251 -4.85 -3 ,28934 ,TETRA ,17591122,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:07:57 CET,0.0 1.794 2.308 2.724 3.078 3.387 3.661 3.928 4.423 4.627 4.814 4.797 5.349 5.509 5.815 6.102 6.39 6.536 6.813 7.062 7.399 7.623 7.83 8.14 8.45 8.732 8.991 9.239 9.559 9.874 10.185 10.54 10.866 11.194 11.566 11.962 12.331 12.743 13.183 13.638 14.117 14.65 15.25 15.832 16.429 17.07 17.797 18.491 19.159 19.759 20.067 19.706 18.985 18.039 17.066 16.181 15.305 14.375 13.528 12.759 12.114 11.527 10.972 10.439 9.887 9.337 8.788 8.287 7.852 7.416 6.969 6.591 6.174 5.72 5.373 5.0 4.602 4.202 3.806 3.534 3.254 2.821 2.497 2.152 1.969 1.585 1.191 0.776 0.563 -0.035 -0.089 -0.327 -0.589 -1.188 -1.527 -1.887 -2.296 -2.756 -3.308 -4.019 -7.272 -4 ,27048 ,TETRA ,17591123,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:02:51 CET,0.0 2.635 3.285 3.696 4.08 4.456 4.771 5.03 5.521 5.772 6.012 6.066 6.627 6.805 7.158 7.514 7.824 7.954 8.208 8.461 8.838 9.084 9.306 9.618 9.914 10.193 10.465 10.727 11.067 11.373 11.642 11.99 12.34 12.668 13.021 13.402 13.78 14.189 14.603 15.034 15.486 15.972 16.522 17.061 17.661 18.231 18.816 19.476 20.114 20.556 20.64 20.156 19.481 18.734 17.924 17.087 16.28 15.521 14.845 14.169 13.558 12.971 12.402 11.888 11.428 11.002 10.535 10.114 9.767 9.397 9.005 8.671 8.314 7.91 7.589 7.289 6.981 6.638 6.271 6.009 5.743 5.352 5.07 4.759 4.592 4.256 3.92 3.546 3.347 2.76 2.708 2.479 2.235 1.632 1.266 0.904 0.537 0.077 -0.545 -1.269 -2.927 -5 ,22585 ,TETRA ,17591124,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:08:22 CET,0.0 1.753 2.299 2.669 3.0 3.32 3.605 3.856 4.312 4.514 4.709 4.684 5.216 5.371 5.669 5.952 6.225 6.355 6.602 6.838 7.169 7.389 7.608 7.903 8.178 8.466 8.75 9.023 9.366 9.676 9.959 10.281 10.596 10.904 11.246 11.619 11.985 12.384 12.793 13.206 13.631 14.088 14.617 15.178 15.776 16.356 16.972 17.6 18.176 18.569 18.574 17.943 17.095 16.193 15.319 14.537 13.858 13.182 12.521 11.784 11.094 10.495 9.952 9.418 8.897 8.416 7.922 7.489 7.102 6.691 6.253 5.885 5.492 5.09 4.807 4.502 4.173 3.819 3.437 3.177 2.915 2.514 2.218 1.904 1.743 1.406 1.049 0.679 0.48 -0.114 -0.191 -0.44 -0.7 -1.259 -1.603 -1.985 -2.391 -2.866 -3.411 -4.087 -6.912 -6 ,25460 ,TETRA ,17591125,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:04:52 CET,0.0 1.829 2.443 2.921 3.313 3.636 3.95 4.241 4.759 4.996 5.221 5.237 5.789 5.942 6.217 6.487 6.754 6.888 7.14 7.383 7.727 7.938 8.149 8.454 8.745 9.031 9.298 9.56 9.904 10.214 10.482 10.779 11.087 11.419 11.781 12.163 12.518 12.886 13.284 13.706 14.123 14.576 15.101 15.613 16.192 16.802 17.448 18.091 18.743 19.325 19.574 19.258 18.588 17.793 17.007 16.262 15.594 14.961 14.394 13.816 13.246 12.684 12.149 11.633 11.129 10.674 10.218 9.797 9.426 9.042 8.638 8.294 7.942 7.569 7.268 6.948 6.614 6.266 5.882 5.613 5.339 4.914 4.627 4.327 4.163 3.812 3.454 3.084 2.885 2.259 2.098 1.817 1.537 0.973 0.666 0.32 -0.081 -0.555 -1.125 -1.928 -6.005 -7 ,2102 ,TETRA ,17591126,Sat Nov 27 21:51:56 CET,Sun Nov 28 00:07:51 CET,0.0 1.592 2.062 2.422 2.714 2.985 3.253 3.496 3.926 4.129 4.334 4.371 4.938 5.12 5.474 5.785 6.07 6.209 6.477 6.735 7.099 7.331 7.559 7.868 8.136 8.399 8.666 8.923 9.262 9.605 9.929 10.303 10.658 10.968 11.3 11.668 11.996 12.347 12.736 13.158 13.612 14.107 14.649 15.153 15.695 16.293 16.917 17.5 18.089 18.545 18.505 17.754 16.802 15.804 14.805 13.884 13.092 12.358 11.695 10.988 10.333 9.724 9.113 8.517 7.961 7.457 6.93 6.431 5.995 5.557 5.115 4.752 4.378 3.986 3.655 3.328 3.001 2.639 2.249 1.975 1.696 1.27 0.962 0.627 0.458 0.117 -0.244 -0.63 -0.833 -1.433 -1.526 -1.787 -2.063 -2.663 -2.986 -3.307 -3.685 -4.149 -4.674 -5.389 -7.977 -8 ,19205 ,TETRA ,17591127,Sat Nov 27 21:51:58 CET,Sun Nov 28 00:11:16 CET,0.0 1.422 2.031 2.482 2.859 3.186 3.466 3.759 4.346 4.611 4.846 4.865 5.42 5.583 5.886 6.191 6.478 6.609 6.876 7.138 7.516 7.777 8.021 8.362 8.714 9.053 9.372 9.671 10.034 10.361 10.665 11.02 11.351 11.67 12.031 12.421 12.807 13.25 13.703 14.152 14.653 15.215 15.81 16.378 16.989 17.626 18.303 18.936 19.534 20.056 20.2 19.776 19.103 18.305 17.509 16.735 15.951 15.125 14.364 13.602 12.937 12.285 11.639 11.026 10.446 9.932 9.388 8.883 8.444 7.962 7.44 7.014 6.6 6.185 5.859 5.513 5.141 4.761 4.348 4.052 3.778 3.353 3.018 2.659 2.487 2.146 1.781 1.36 1.131 0.535 0.445 0.171 -0.133 -0.733 -1.025 -1.366 -1.778 -2.289 -2.898 -3.588 -5.604 -9 ,4948 ,TETRA ,17591128,Sat Nov 27 21:51:56 CET,Sun Nov 28 00:11:48 CET,0.0 1.708 2.263 2.697 3.101 3.474 3.807 4.125 4.665 4.88 5.091 5.125 5.684 5.856 6.191 6.512 6.811 6.954 7.238 7.497 7.823 8.032 8.257 8.607 8.943 9.264 9.566 9.835 10.173 10.511 10.834 11.221 11.603 11.952 12.332 12.768 13.192 13.657 14.109 14.549 15.026 15.55 16.157 16.758 17.451 18.199 18.968 19.676 20.372 21.05 21.436 21.054 20.368 19.66 18.892 18.121 17.388 16.675 16.01 15.323 14.741 14.216 13.702 13.156 12.615 12.131 11.612 11.162 10.785 10.377 9.939 9.558 9.136 8.694 8.35 7.988 7.623 7.263 6.881 6.601 6.306 5.854 5.528 5.174 4.998 4.66 4.29 3.874 3.656 3.064 2.982 2.731 2.477 1.909 1.568 1.168 0.728 0.227 -0.359 -1.177 -4.559 -10 ,3819 ,TETRA ,17591129,Sat Nov 27 21:51:56 CET,Sun Nov 28 00:11:56 CET,0.0 1.945 2.473 2.865 3.194 3.495 3.76 4.016 4.511 4.729 4.921 4.901 5.44 5.605 5.916 6.224 6.526 6.662 6.913 7.144 7.476 7.692 7.902 8.216 8.515 8.785 9.027 9.26 9.563 9.876 10.186 10.535 10.862 11.186 11.56 11.96 12.341 12.739 13.144 13.57 14.016 14.504 15.042 15.56 16.153 16.811 17.479 18.11 18.758 19.356 19.662 19.328 18.682 17.949 17.186 16.454 15.764 15.117 14.55 13.968 13.413 12.886 12.355 11.812 11.312 10.868 10.419 10.016 9.659 9.291 8.903 8.579 8.232 7.85 7.542 7.219 6.889 6.558 6.205 5.953 5.696 5.298 5.011 4.697 4.526 4.16 3.742 3.312 3.104 2.493 2.383 2.144 1.894 1.344 1.038 0.702 0.314 -0.075 -0.526 -1.241 -4.284 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index bb95ff32..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11998 ,TETRA ,17591130,Sat Nov 27 21:51:56 CET,Sun Nov 28 00:05:16 CET,0.0 2.24 2.985 3.547 4.062 4.528 4.934 5.313 6.011 6.346 6.679 6.817 7.651 7.952 8.529 9.085 9.635 9.906 10.431 10.942 11.684 12.164 12.627 13.314 14.023 14.719 15.389 16.052 16.913 17.772 18.618 19.638 20.627 21.603 22.757 24.07 25.359 26.816 28.427 30.171 32.057 34.279 36.946 39.677 42.958 46.779 51.409 57.003 63.946 72.648 84.402 95.311 102.521 107.653 111.42 114.376 116.583 118.314 119.668 120.867 121.808 122.611 123.296 123.843 124.305 124.686 125.03 125.311 125.536 125.699 125.796 125.832 125.84 125.844 125.829 125.79 125.712 125.634 125.59 125.554 125.513 125.425 125.328 125.224 125.17 125.019 124.847 124.649 124.531 124.033 124.158 124.006 123.825 123.368 123.084 122.781 122.448 121.991 121.37 120.536 117.295 -2 ,30647 ,TETRA ,17591131,Sat Nov 27 21:51:56 CET,Sun Nov 28 00:11:12 CET,0.0 2.215 3.075 3.724 4.219 4.643 5.035 5.392 6.084 6.441 6.784 6.911 7.727 8.029 8.602 9.143 9.677 9.936 10.437 10.927 11.674 12.172 12.654 13.345 14.04 14.731 15.4 16.067 16.93 17.748 18.549 19.546 20.528 21.485 22.618 23.917 25.193 26.652 28.284 30.064 31.961 34.164 36.807 39.547 42.858 46.7 51.368 56.848 63.677 72.447 84.163 94.99 102.083 107.124 110.875 113.873 116.138 117.862 119.215 120.404 121.303 122.037 122.661 123.168 123.583 123.944 124.311 124.604 124.81 125.001 125.172 125.288 125.392 125.482 125.506 125.484 125.462 125.438 125.394 125.341 125.286 125.165 125.036 124.874 124.777 124.595 124.44 124.239 124.113 123.598 123.669 123.485 123.271 122.795 122.511 122.186 121.864 121.533 121.111 120.44 113.14 -3 ,18775 ,TETRA ,17591132,Sat Nov 27 21:51:56 CET,Sun Nov 28 00:07:11 CET,0.0 1.734 2.377 2.92 3.378 3.782 4.198 4.601 5.326 5.678 6.022 6.151 6.975 7.275 7.839 8.377 8.908 9.171 9.702 10.218 10.961 11.449 11.921 12.612 13.292 13.954 14.604 15.24 16.069 16.902 17.729 18.733 19.715 20.684 21.823 23.114 24.391 25.832 27.422 29.151 31.011 33.176 35.801 38.528 41.859 45.76 50.424 55.89 62.727 71.536 83.197 93.981 101.031 106.05 109.748 112.587 114.741 116.443 117.804 119.037 119.962 120.734 121.394 121.944 122.404 122.761 123.089 123.333 123.512 123.662 123.791 123.869 123.932 123.979 123.974 123.967 123.967 123.942 123.87 123.81 123.746 123.619 123.519 123.396 123.328 123.207 123.068 122.878 122.77 122.264 122.381 122.204 121.99 121.567 121.295 120.951 120.591 120.176 119.54 118.643 112.425 -4 ,17435 ,TETRA ,17591133,Sat Nov 27 21:52:47 CET,Sun Nov 28 00:14:30 CET,0.0 1.835 2.536 3.091 3.588 4.038 4.442 4.843 5.627 5.986 6.325 6.466 7.31 7.622 8.217 8.808 9.39 9.678 10.245 10.797 11.586 12.097 12.609 13.355 14.052 14.73 15.41 16.066 16.909 17.727 18.53 19.524 20.48 21.416 22.536 23.816 25.086 26.529 28.116 29.84 31.684 33.821 36.42 39.166 42.488 46.286 50.88 56.26 62.878 71.389 82.84 93.636 100.868 106.003 109.707 112.52 114.676 116.459 117.872 119.153 120.099 120.841 121.508 122.09 122.565 122.938 123.281 123.529 123.721 123.901 124.056 124.172 124.258 124.311 124.345 124.376 124.388 124.369 124.308 124.265 124.21 124.06 123.957 123.864 123.811 123.691 123.567 123.416 123.307 122.797 122.902 122.757 122.619 122.238 121.996 121.723 121.363 120.907 120.332 119.536 116.379 -5 ,7325 ,TETRA ,17591134,Sat Nov 27 21:52:48 CET,Sun Nov 28 00:15:08 CET,0.0 1.829 2.621 3.191 3.7 4.15 4.553 4.939 5.675 6.005 6.323 6.416 7.239 7.538 8.094 8.637 9.157 9.409 9.921 10.42 11.113 11.567 12.037 12.733 13.424 14.094 14.734 15.361 16.185 17.016 17.854 18.885 19.88 20.844 21.987 23.284 24.539 25.958 27.514 29.216 31.073 33.218 35.796 38.477 41.709 45.434 49.887 55.282 62.073 70.628 82.1 92.883 100.076 105.237 109.044 112.023 114.282 116.064 117.429 118.649 119.579 120.296 120.899 121.411 121.82 122.146 122.458 122.695 122.893 123.108 123.302 123.405 123.478 123.529 123.556 123.573 123.562 123.531 123.503 123.484 123.41 123.281 123.198 123.07 122.998 122.85 122.674 122.451 122.32 121.819 121.924 121.748 121.578 121.145 120.875 120.585 120.249 119.844 119.288 118.385 114.91 -7 ,15846 ,TETRA ,17591136,Sat Nov 27 21:52:48 CET,Sun Nov 28 00:13:57 CET,0.0 2.023 2.77 3.362 3.902 4.353 4.75 5.161 5.925 6.278 6.606 6.726 7.547 7.84 8.425 8.982 9.524 9.791 10.308 10.806 11.548 12.041 12.52 13.21 13.883 14.546 15.211 15.861 16.695 17.503 18.302 19.31 20.302 21.253 22.374 23.689 24.981 26.423 28.028 29.783 31.658 33.823 36.454 39.183 42.454 46.303 50.936 56.443 63.325 72.123 83.998 95.087 102.411 107.651 111.505 114.448 116.665 118.403 119.715 120.909 121.839 122.583 123.207 123.686 124.099 124.474 124.814 125.064 125.231 125.387 125.539 125.649 125.735 125.764 125.762 125.762 125.755 125.724 125.641 125.556 125.465 125.301 125.177 125.037 124.957 124.793 124.623 124.441 124.331 123.826 123.893 123.713 123.537 123.106 122.819 122.492 122.144 121.797 121.405 120.841 113.084 -8 ,19225 ,TETRA ,17591137,Sat Nov 27 21:53:32 CET,Sun Nov 28 00:31:39 CET,0.0 1.694 2.41 2.999 3.481 3.895 4.282 4.647 5.343 5.677 6.005 6.114 6.908 7.185 7.73 8.265 8.791 9.041 9.53 10.038 10.792 11.279 11.757 12.454 13.132 13.8 14.471 15.123 15.958 16.793 17.629 18.628 19.617 20.607 21.774 23.126 24.46 25.943 27.55 29.288 31.159 33.334 35.955 38.671 41.988 45.861 50.493 56.026 62.865 71.567 83.327 94.282 101.465 106.542 110.32 113.324 115.582 117.369 118.771 120.024 120.975 121.736 122.365 122.897 123.359 123.736 124.088 124.375 124.606 124.789 124.917 125.008 125.079 125.147 125.182 125.185 125.18 125.167 125.114 125.058 125.003 124.911 124.829 124.683 124.605 124.465 124.284 124.082 123.978 123.488 123.613 123.467 123.305 122.905 122.66 122.36 122.01 121.611 121.077 120.408 118.033 -9 ,25240 ,TETRA ,17591138,Sat Nov 27 21:53:33 CET,Sun Nov 28 00:11:58 CET,0.0 1.682 2.387 2.937 3.439 3.918 4.359 4.788 5.593 5.942 6.263 6.364 7.176 7.471 8.047 8.574 9.089 9.353 9.886 10.395 11.125 11.606 12.087 12.796 13.487 14.158 14.811 15.461 16.316 17.143 17.947 18.943 19.915 20.872 22.024 23.347 24.634 26.088 27.699 29.455 31.325 33.475 36.091 38.812 42.065 45.854 50.472 55.987 62.861 71.633 83.351 94.277 101.494 106.664 110.484 113.417 115.646 117.393 118.711 119.871 120.76 121.477 122.089 122.596 122.992 123.32 123.642 123.876 124.016 124.13 124.248 124.311 124.349 124.377 124.376 124.36 124.345 124.332 124.282 124.201 124.112 123.963 123.857 123.752 123.688 123.52 123.297 123.055 122.934 122.432 122.556 122.405 122.227 121.82 121.571 121.254 120.893 120.511 120.037 119.372 114.509 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt deleted file mode 100644 index ea905884..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14589 ,TETRA ,17591140,Sat Nov 27 21:54:17 CET,Sun Nov 28 00:19:09 CET,0.0 1.994 2.605 3.08 3.505 3.93 4.332 4.715 5.425 5.747 6.071 6.214 7.047 7.358 7.946 8.5 9.032 9.288 9.787 10.282 11.025 11.52 12.002 12.694 13.379 14.069 14.76 15.429 16.274 17.109 17.944 18.962 19.955 20.942 22.109 23.469 24.793 26.246 27.864 29.654 31.64 33.912 36.604 39.439 42.899 46.978 51.851 57.601 64.756 73.872 86.288 97.989 105.69 111.069 114.992 118.08 120.484 122.409 123.879 125.17 126.152 126.959 127.653 128.232 128.729 129.132 129.498 129.778 129.977 130.157 130.3 130.392 130.459 130.471 130.455 130.432 130.418 130.392 130.323 130.279 130.241 130.127 130.021 129.879 129.788 129.585 129.348 129.067 128.916 128.404 128.498 128.325 128.118 127.655 127.38 127.056 126.68 126.258 125.731 124.93 121.378 -2 ,12339 ,TETRA ,17591141,Sat Nov 27 21:54:17 CET,Sun Nov 28 00:16:01 CET,0.0 1.776 2.525 3.138 3.646 4.106 4.527 4.902 5.596 5.939 6.284 6.426 7.256 7.565 8.144 8.703 9.278 9.565 10.102 10.599 11.321 11.803 12.284 12.995 13.701 14.401 15.084 15.749 16.605 17.46 18.333 19.419 20.462 21.474 22.668 24.043 25.408 26.94 28.64 30.485 32.458 34.735 37.523 40.439 43.901 47.878 52.679 58.385 65.465 74.612 86.936 98.518 106.251 111.652 115.598 118.689 121.069 122.975 124.419 125.635 126.518 127.228 127.843 128.367 128.788 129.117 129.419 129.67 129.858 130.006 130.127 130.219 130.304 130.343 130.327 130.298 130.282 130.264 130.24 130.186 130.091 129.948 129.841 129.686 129.595 129.421 129.221 128.97 128.825 128.293 128.326 128.128 127.937 127.501 127.213 126.883 126.532 126.1 125.569 124.759 121.26 -3 ,7521 ,TETRA ,17591142,Sat Nov 27 21:55:04 CET,Sun Nov 28 00:13:50 CET,0.0 1.696 2.459 3.036 3.508 3.957 4.397 4.792 5.521 5.879 6.206 6.299 7.122 7.432 8.029 8.579 9.112 9.375 9.891 10.402 11.139 11.624 12.109 12.804 13.476 14.139 14.798 15.455 16.319 17.183 18.043 19.085 20.104 21.112 22.3 23.671 25.033 26.535 28.154 29.917 31.848 34.095 36.768 39.569 42.991 46.938 51.714 57.421 64.597 73.681 85.679 96.885 104.419 109.85 113.823 116.879 119.237 121.15 122.592 123.87 124.883 125.673 126.325 126.851 127.249 127.573 127.868 128.076 128.213 128.319 128.424 128.494 128.537 128.568 128.561 128.537 128.499 128.409 128.228 128.082 127.944 127.689 127.476 127.259 127.149 126.906 126.623 126.29 126.115 125.584 125.687 125.548 125.394 124.977 124.702 124.389 124.029 123.56 122.991 122.17 116.898 -4 ,21946 ,TETRA ,17591143,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:50:59 CET,0.0 1.947 2.724 3.27 3.737 4.171 4.598 5.014 5.777 6.118 6.435 6.546 7.374 7.679 8.269 8.832 9.371 9.642 10.175 10.688 11.44 11.936 12.417 13.125 13.825 14.507 15.186 15.839 16.691 17.535 18.361 19.396 20.423 21.427 22.622 23.991 25.334 26.891 28.611 30.436 32.385 34.637 37.358 40.166 43.548 47.518 52.355 58.097 65.29 74.495 86.873 98.545 106.211 111.548 115.371 118.292 120.493 122.236 123.595 124.766 125.65 126.384 127.01 127.513 127.916 128.239 128.535 128.756 128.902 129.033 129.162 129.241 129.288 129.299 129.289 129.286 129.263 129.217 129.156 129.095 129.032 128.941 128.858 128.752 128.697 128.555 128.346 128.113 127.98 127.448 127.536 127.387 127.247 126.859 126.595 126.301 125.972 125.583 125.093 124.446 121.725 -5 ,24964 ,TETRA ,17591144,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:50:50 CET,0.0 1.825 2.588 3.193 3.688 4.124 4.544 4.945 5.677 6.021 6.355 6.482 7.3 7.592 8.188 8.766 9.309 9.575 10.097 10.615 11.391 11.898 12.403 13.144 13.854 14.549 15.237 15.903 16.769 17.62 18.455 19.482 20.494 21.483 22.653 23.995 25.309 26.813 28.49 30.294 32.256 34.542 37.271 40.106 43.55 47.568 52.433 58.255 65.54 74.776 87.011 98.273 105.784 111.29 115.331 118.354 120.618 122.438 123.8 124.997 125.941 126.667 127.272 127.798 128.23 128.579 128.896 129.153 129.353 129.5 129.6 129.664 129.681 129.648 129.625 129.607 129.575 129.515 129.423 129.344 129.245 129.048 128.904 128.734 128.645 128.479 128.268 128.005 127.87 127.342 127.379 127.21 127.015 126.511 126.225 125.899 125.503 125.065 124.507 123.641 118.578 -6 ,28925 ,TETRA ,17591145,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:54:33 CET,0.0 1.764 2.487 3.064 3.55 3.988 4.43 4.843 5.571 5.914 6.238 6.323 7.131 7.419 7.947 8.499 9.081 9.351 9.868 10.356 11.079 11.572 12.057 12.75 13.418 14.094 14.752 15.385 16.211 17.047 17.886 18.894 19.887 20.883 22.051 23.389 24.705 26.18 27.836 29.667 31.663 33.97 36.74 39.564 42.948 46.934 51.789 57.55 64.703 73.862 86.166 97.658 105.325 110.821 114.874 118.049 120.499 122.472 123.988 125.317 126.329 127.114 127.78 128.328 128.767 129.137 129.468 129.709 129.903 130.087 130.215 130.293 130.353 130.384 130.391 130.376 130.32 130.23 130.119 130.044 129.964 129.791 129.666 129.529 129.446 129.286 129.111 128.883 128.746 128.215 128.225 128.025 127.834 127.319 127.018 126.691 126.298 125.834 125.273 124.428 115.818 -7 ,26191 ,TETRA ,17591146,Sat Nov 27 21:31:13 CET,Sat Nov 27 23:59:18 CET,0.0 1.799 2.53 3.121 3.635 4.076 4.462 4.85 5.647 6.027 6.385 6.54 7.38 7.687 8.314 8.917 9.486 9.769 10.329 10.867 11.635 12.137 12.637 13.374 14.102 14.807 15.473 16.133 17.015 17.888 18.726 19.745 20.78 21.82 23.036 24.393 25.706 27.208 28.879 30.707 32.72 35.047 37.827 40.702 44.124 48.117 52.957 58.751 66.04 75.381 88.017 99.854 107.541 113.049 117.044 120.08 122.396 124.221 125.63 126.905 127.913 128.728 129.407 129.955 130.384 130.742 131.121 131.428 131.663 131.868 132.046 132.165 132.273 132.371 132.416 132.453 132.47 132.422 132.343 132.311 132.272 132.166 132.083 131.964 131.895 131.766 131.604 131.408 131.307 130.817 130.965 130.818 130.664 130.325 130.082 129.78 129.447 129.003 128.441 127.772 120.16 -8 ,28829 ,TETRA ,17591147,Sat Nov 27 21:31:13 CET,Sat Nov 27 23:50:26 CET,0.0 1.687 2.328 2.847 3.314 3.764 4.19 4.603 5.35 5.69 6.021 6.165 6.982 7.272 7.856 8.416 8.956 9.227 9.754 10.252 10.975 11.456 11.942 12.643 13.329 14.019 14.693 15.34 16.189 17.037 17.867 18.875 19.899 20.927 22.118 23.455 24.758 26.238 27.903 29.718 31.666 33.906 36.594 39.413 42.846 46.862 51.761 57.576 64.789 73.995 86.305 97.874 105.606 111.161 115.252 118.353 120.707 122.589 124.022 125.263 126.203 126.978 127.655 128.239 128.73 129.106 129.457 129.747 129.951 130.114 130.247 130.328 130.402 130.478 130.525 130.557 130.563 130.551 130.519 130.492 130.445 130.338 130.254 130.139 130.077 129.953 129.822 129.63 129.504 128.989 129.039 128.851 128.64 128.139 127.886 127.631 127.325 126.936 126.435 125.722 123.083 -9 ,18730 ,TETRA ,17591148,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:57:12 CET,0.0 1.868 2.66 3.25 3.709 4.118 4.504 4.899 5.67 6.027 6.366 6.483 7.314 7.625 8.229 8.797 9.336 9.602 10.133 10.653 11.423 11.934 12.428 13.148 13.861 14.555 15.232 15.903 16.812 17.679 18.485 19.497 20.508 21.512 22.697 24.044 25.367 26.854 28.504 30.3 32.245 34.506 37.254 40.138 43.624 47.713 52.646 58.467 65.737 75.067 87.709 99.498 107.316 112.89 117.02 120.256 122.673 124.529 125.937 127.221 128.231 129.004 129.62 130.15 130.624 131.019 131.341 131.551 131.736 131.909 132.0 132.049 132.103 132.167 132.181 132.142 132.104 132.067 132.001 131.934 131.859 131.729 131.629 131.493 131.419 131.284 131.124 130.942 130.838 130.346 130.434 130.245 130.042 129.587 129.314 129.01 128.637 128.14 127.585 126.904 122.196 -10 ,26386 ,TETRA ,17591149,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:53:29 CET,0.0 1.649 2.37 2.956 3.461 3.882 4.311 4.749 5.538 5.893 6.218 6.323 7.149 7.463 8.083 8.657 9.191 9.456 10.005 10.553 11.312 11.792 12.282 13.001 13.686 14.37 15.063 15.742 16.604 17.45 18.309 19.37 20.394 21.397 22.587 23.94 25.262 26.748 28.44 30.323 32.353 34.691 37.459 40.29 43.693 47.668 52.458 58.182 65.377 74.586 86.907 98.386 106.076 111.645 115.777 119.006 121.504 123.469 124.996 126.366 127.362 128.142 128.849 129.45 129.907 130.298 130.684 130.99 131.206 131.369 131.513 131.62 131.703 131.743 131.752 131.733 131.693 131.641 131.552 131.471 131.384 131.234 131.121 130.99 130.907 130.738 130.569 130.377 130.247 129.724 129.836 129.655 129.446 129.012 128.751 128.475 128.178 127.816 127.28 126.512 120.813 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt deleted file mode 100644 index 122a19b7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19043 ,TETRA ,17591150,Sat Nov 27 21:31:13 CET,Sat Nov 27 23:53:59 CET,0.0 1.823 2.554 3.152 3.678 4.149 4.583 5.006 5.828 6.202 6.55 6.692 7.533 7.846 8.447 9.039 9.613 9.905 10.488 11.045 11.864 12.402 12.937 13.72 14.482 15.213 15.94 16.652 17.548 18.435 19.321 20.408 21.465 22.508 23.762 25.183 26.551 28.077 29.789 31.661 33.644 35.97 38.786 41.676 45.171 49.222 54.17 60.072 67.336 76.485 88.787 100.401 108.083 113.566 117.603 120.724 123.129 125.064 126.542 127.843 128.836 129.662 130.374 130.984 131.494 131.879 132.244 132.558 132.785 132.977 133.14 133.247 133.343 133.416 133.464 133.512 133.54 133.552 133.555 133.534 133.497 133.437 133.385 133.311 133.25 133.112 132.997 132.874 132.798 132.331 132.473 132.342 132.201 131.891 131.706 131.495 131.24 130.905 130.441 129.808 124.961 -2 ,28876 ,TETRA ,17591151,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:55:24 CET,0.0 2.29 3.046 3.632 4.119 4.578 5.008 5.414 6.149 6.495 6.835 6.97 7.805 8.123 8.729 9.311 9.918 10.215 10.754 11.281 12.059 12.576 13.088 13.829 14.546 15.248 15.927 16.588 17.481 18.35 19.206 20.287 21.326 22.347 23.572 24.954 26.314 27.863 29.569 31.417 33.404 35.727 38.502 41.362 44.83 48.872 53.728 59.491 66.715 75.964 88.499 100.244 108.096 113.71 117.81 120.976 123.461 125.504 127.035 128.379 129.442 130.297 131.051 131.691 132.184 132.547 132.885 133.18 133.412 133.612 133.776 133.896 134.024 134.133 134.186 134.222 134.257 134.257 134.226 134.203 134.162 134.077 134.001 133.928 133.885 133.764 133.622 133.473 133.374 132.88 133.01 132.864 132.693 132.304 132.107 131.904 131.651 131.335 130.908 130.19 126.733 -3 ,17157 ,TETRA ,17591152,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:49:57 CET,0.0 2.7 3.452 4.1 4.683 5.243 5.733 6.168 7.014 7.378 7.721 7.894 8.746 9.077 9.71 10.297 10.867 11.145 11.686 12.234 13.044 13.558 14.061 14.803 15.514 16.225 16.925 17.612 18.506 19.379 20.236 21.289 22.316 23.344 24.571 25.954 27.298 28.805 30.48 32.298 34.281 36.576 39.338 42.231 45.691 49.711 54.59 60.36 67.53 76.723 89.138 100.817 108.523 113.919 117.882 121.009 123.455 125.407 126.897 128.229 129.228 130.045 130.79 131.425 131.934 132.331 132.698 132.995 133.235 133.465 133.68 133.831 133.962 134.085 134.176 134.252 134.311 134.334 134.304 134.278 134.259 134.225 134.195 134.124 134.068 133.955 133.848 133.714 133.632 133.168 133.32 133.188 133.031 132.665 132.452 132.166 131.842 131.473 131.036 130.434 128.012 -4 ,652 ,TETRA ,17591153,Sat Nov 27 21:31:14 CET,Sat Nov 27 23:49:33 CET,0.0 1.869 2.549 3.083 3.576 4.037 4.499 4.929 5.706 6.083 6.434 6.595 7.449 7.769 8.386 8.986 9.58 9.869 10.434 10.983 11.765 12.268 12.782 13.556 14.296 15.006 15.715 16.424 17.362 18.282 19.154 20.2 21.245 22.285 23.509 24.905 26.266 27.803 29.502 31.345 33.317 35.575 38.323 41.192 44.62 48.567 53.329 59.017 66.072 75.041 87.058 98.402 106.066 111.59 115.675 118.835 121.245 123.17 124.678 126.056 127.101 127.922 128.638 129.225 129.699 130.096 130.459 130.736 130.938 131.127 131.289 131.383 131.485 131.59 131.65 131.697 131.71 131.699 131.675 131.667 131.67 131.66 131.635 131.601 131.571 131.468 131.32 131.13 131.022 130.538 130.702 130.58 130.44 130.058 129.818 129.55 129.251 128.901 128.487 127.878 125.367 -5 ,25217 ,TETRA ,17591154,Sat Nov 27 21:31:13 CET,Sat Nov 27 23:50:52 CET,0.0 2.387 3.216 3.885 4.473 4.985 5.442 5.862 6.607 6.956 7.305 7.48 8.335 8.657 9.293 9.907 10.515 10.82 11.413 11.995 12.846 13.38 13.878 14.608 15.353 16.101 16.824 17.519 18.415 19.285 20.14 21.201 22.263 23.303 24.516 25.904 27.268 28.838 30.579 32.452 34.479 36.818 39.654 42.633 46.255 50.413 55.361 61.218 68.565 77.935 90.412 102.076 109.824 115.32 119.357 122.518 124.998 127.009 128.558 129.92 130.949 131.789 132.538 133.168 133.679 134.11 134.498 134.797 135.02 135.229 135.419 135.532 135.621 135.69 135.717 135.724 135.737 135.725 135.673 135.636 135.586 135.489 135.411 135.303 135.235 135.077 134.93 134.785 134.702 134.238 134.372 134.238 134.115 133.783 133.57 133.328 133.019 132.609 132.043 131.23 127.688 -6 ,10378 ,TETRA ,17591155,Sat Nov 27 21:31:14 CET,Sat Nov 27 23:49:37 CET,0.0 2.456 3.317 3.979 4.586 5.107 5.548 5.946 6.678 7.02 7.367 7.516 8.348 8.655 9.245 9.82 10.385 10.666 11.208 11.722 12.477 12.982 13.482 14.217 14.932 15.634 16.333 17.018 17.901 18.778 19.644 20.686 21.691 22.684 23.873 25.246 26.616 28.144 29.806 31.633 33.609 35.879 38.659 41.537 44.942 48.895 53.728 59.542 66.847 76.191 88.665 100.374 108.176 113.673 117.711 120.851 123.287 125.284 126.798 128.16 129.252 130.133 130.915 131.553 132.059 132.491 132.901 133.237 133.514 133.768 133.995 134.156 134.307 134.443 134.521 134.59 134.632 134.644 134.666 134.686 134.687 134.651 134.597 134.516 134.471 134.38 134.283 134.171 134.103 133.653 133.861 133.738 133.598 133.317 133.145 132.935 132.703 132.398 131.93 131.263 128.039 -7 ,23453 ,TETRA ,17591156,Sat Nov 27 21:32:14 CET,Sat Nov 27 23:54:21 CET,0.0 1.963 2.688 3.337 3.914 4.408 4.868 5.281 5.992 6.336 6.685 6.872 7.725 8.039 8.659 9.269 9.865 10.167 10.744 11.284 12.072 12.595 13.115 13.869 14.602 15.321 16.035 16.741 17.696 18.625 19.503 20.569 21.604 22.626 23.849 25.238 26.584 28.114 29.841 31.738 33.784 36.176 39.041 41.99 45.574 49.727 54.691 60.574 67.899 77.224 89.762 101.516 109.372 115.023 119.228 122.523 125.042 127.048 128.619 130.041 131.122 131.992 132.73 133.341 133.849 134.268 134.639 134.936 135.186 135.423 135.632 135.779 135.906 136.03 136.109 136.167 136.213 136.226 136.229 136.206 136.163 136.103 136.058 135.988 135.938 135.835 135.681 135.489 135.4 134.94 135.112 134.992 134.867 134.564 134.347 134.099 133.837 133.552 133.156 132.447 129.968 -8 ,1525 ,TETRA ,17591157,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:54:12 CET,0.0 3.071 3.804 4.361 4.84 5.286 5.722 6.106 6.812 7.154 7.48 7.595 8.417 8.728 9.328 9.886 10.43 10.7 11.225 11.743 12.498 12.999 13.502 14.228 14.929 15.612 16.276 16.936 17.82 18.691 19.544 20.585 21.618 22.639 23.845 25.233 26.598 28.13 29.808 31.62 33.557 35.811 38.549 41.407 44.855 48.881 53.755 59.544 66.794 76.102 88.657 100.447 108.392 114.133 118.363 121.609 124.08 126.078 127.645 129.05 130.12 130.998 131.777 132.431 132.964 133.398 133.779 134.066 134.272 134.452 134.593 134.695 134.821 134.943 135.002 135.038 135.085 135.126 135.136 135.132 135.105 135.034 134.978 134.9 134.859 134.756 134.61 134.432 134.333 133.859 133.985 133.828 133.672 133.264 133.031 132.78 132.502 132.186 131.71 131.04 127.371 -9 ,27618 ,TETRA ,17591158,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:51:04 CET,0.0 2.223 2.968 3.562 4.08 4.556 5.008 5.437 6.238 6.615 6.974 7.128 7.97 8.289 8.907 9.493 10.052 10.327 10.878 11.414 12.191 12.702 13.224 13.999 14.743 15.45 16.138 16.838 17.755 18.649 19.522 20.586 21.62 22.622 23.825 25.219 26.59 28.145 29.851 31.696 33.697 36.031 38.843 41.756 45.253 49.304 54.217 60.095 67.426 76.742 89.296 101.163 109.077 114.671 118.75 121.942 124.399 126.351 127.854 129.192 130.249 131.128 131.898 132.561 133.109 133.574 133.991 134.289 134.544 134.792 135.002 135.159 135.3 135.42 135.482 135.51 135.539 135.567 135.549 135.522 135.497 135.426 135.367 135.302 135.257 135.158 135.021 134.823 134.718 134.236 134.399 134.251 134.054 133.589 133.302 132.992 132.622 132.168 131.634 130.952 127.097 -10 ,31149 ,TETRA ,17591159,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:54:42 CET,0.0 2.824 3.454 3.994 4.439 4.857 5.271 5.668 6.385 6.731 7.071 7.208 8.04 8.353 8.962 9.543 10.102 10.385 10.94 11.464 12.215 12.702 13.199 13.933 14.645 15.346 16.024 16.691 17.563 18.416 19.258 20.29 21.308 22.325 23.525 24.894 26.237 27.765 29.472 31.34 33.368 35.72 38.544 41.445 44.907 48.901 53.766 59.608 66.898 76.166 88.54 100.084 107.733 113.258 117.289 120.353 122.744 124.689 126.185 127.541 128.6 129.453 130.2 130.847 131.368 131.787 132.202 132.54 132.803 133.064 133.324 133.502 133.641 133.746 133.796 133.826 133.846 133.863 133.878 133.864 133.82 133.725 133.658 133.587 133.537 133.428 133.287 133.104 133.01 132.534 132.66 132.509 132.343 131.954 131.725 131.464 131.16 130.805 130.35 129.611 127.663 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index c51a57ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,436 ,TETRA ,17591160,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:24:42 CET,0.0 1.331 1.881 2.311 2.675 2.98 3.267 3.522 3.953 4.153 4.358 4.374 4.925 5.102 5.419 5.722 6.007 6.138 6.39 6.645 7.005 7.217 7.428 7.747 8.043 8.306 8.563 8.82 9.144 9.442 9.722 10.052 10.369 10.673 11.033 11.44 11.807 12.186 12.597 13.023 13.43 13.895 14.455 14.988 15.557 16.17 16.817 17.417 18.051 18.552 18.683 18.203 17.44 16.639 15.874 15.092 14.346 13.676 13.04 12.351 11.766 11.244 10.721 10.204 9.725 9.3 8.829 8.393 8.02 7.627 7.212 6.87 6.512 6.125 5.824 5.514 5.183 4.83 4.464 4.209 3.951 3.551 3.26 2.948 2.79 2.46 2.105 1.717 1.499 0.91 0.831 0.586 0.33 -0.27 -0.612 -0.966 -1.375 -1.855 -2.469 -3.248 -4.977 -2 ,15597 ,TETRA ,17591161,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:22:41 CET,0.0 1.405 1.991 2.432 2.785 3.093 3.379 3.641 4.118 4.33 4.54 4.552 5.101 5.28 5.612 5.921 6.215 6.355 6.616 6.871 7.225 7.441 7.655 7.958 8.243 8.522 8.793 9.055 9.396 9.708 9.995 10.348 10.695 11.013 11.36 11.746 12.116 12.525 12.954 13.406 13.879 14.398 14.971 15.514 16.097 16.684 17.297 17.92 18.556 19.057 19.153 18.607 17.855 17.053 16.254 15.469 14.748 14.069 13.44 12.761 12.16 11.627 11.102 10.586 10.1 9.636 9.118 8.682 8.305 7.913 7.499 7.129 6.756 6.384 6.088 5.758 5.405 5.064 4.706 4.444 4.164 3.713 3.404 3.072 2.891 2.522 2.14 1.728 1.517 0.93 0.823 0.577 0.332 -0.249 -0.575 -0.918 -1.34 -1.819 -2.375 -3.131 -4.984 -3 ,13766 ,TETRA ,17591162,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:22:01 CET,0.0 1.438 2.017 2.459 2.83 3.152 3.434 3.68 4.125 4.347 4.565 4.597 5.143 5.311 5.634 5.926 6.204 6.345 6.625 6.88 7.231 7.461 7.687 8.006 8.298 8.576 8.855 9.122 9.449 9.75 10.043 10.395 10.732 11.067 11.437 11.835 12.231 12.653 13.07 13.515 13.965 14.434 14.96 15.479 16.063 16.638 17.241 17.87 18.487 18.977 19.139 18.681 17.987 17.199 16.396 15.633 14.891 14.191 13.557 12.888 12.323 11.813 11.305 10.797 10.322 9.876 9.377 8.95 8.6 8.205 7.784 7.453 7.1 6.716 6.405 6.089 5.777 5.452 5.084 4.823 4.559 4.14 3.842 3.53 3.364 2.993 2.615 2.233 2.023 1.443 1.329 1.066 0.806 0.211 -0.123 -0.476 -0.844 -1.279 -1.849 -2.632 -4.345 -4 ,14794 ,TETRA ,17591163,Sat Nov 27 21:33:12 CET,Sat Nov 27 23:23:09 CET,0.0 1.3 1.872 2.295 2.66 2.971 3.247 3.512 4.003 4.227 4.434 4.462 5.016 5.187 5.513 5.82 6.106 6.246 6.499 6.73 7.073 7.298 7.508 7.791 8.058 8.327 8.583 8.827 9.152 9.473 9.767 10.104 10.436 10.753 11.111 11.5 11.861 12.259 12.67 13.088 13.559 14.096 14.691 15.286 15.924 16.56 17.211 17.838 18.448 18.932 19.026 18.477 17.704 16.83 15.951 15.157 14.431 13.741 13.114 12.423 11.812 11.269 10.767 10.293 9.831 9.4 8.934 8.497 8.109 7.723 7.332 7.003 6.662 6.302 6.015 5.709 5.391 5.047 4.659 4.399 4.12 3.658 3.363 3.072 2.926 2.619 2.272 1.893 1.694 1.116 1.005 0.715 0.393 -0.319 -0.708 -1.13 -1.635 -2.236 -2.956 -3.982 -6.875 -5 ,6151 ,TETRA ,17591164,Sat Nov 27 21:33:16 CET,Sat Nov 27 23:23:10 CET,0.0 1.059 1.643 2.07 2.434 2.755 3.053 3.325 3.821 4.057 4.279 4.304 4.848 5.023 5.342 5.62 5.893 6.029 6.287 6.532 6.873 7.098 7.326 7.651 7.945 8.228 8.52 8.795 9.135 9.451 9.75 10.114 10.447 10.758 11.135 11.554 11.931 12.33 12.766 13.197 13.643 14.158 14.671 15.136 15.699 16.303 16.932 17.543 18.074 18.511 18.635 18.132 17.36 16.531 15.767 14.998 14.268 13.589 12.961 12.313 11.747 11.239 10.756 10.273 9.814 9.375 8.89 8.477 8.116 7.713 7.295 6.967 6.622 6.236 5.938 5.636 5.322 4.99 4.623 4.362 4.106 3.708 3.427 3.139 2.989 2.654 2.277 1.848 1.611 0.993 0.866 0.614 0.354 -0.221 -0.551 -0.919 -1.337 -1.839 -2.406 -3.148 -5.231 -6 ,15420 ,TETRA ,17591165,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:23:28 CET,0.0 1.23 1.798 2.258 2.645 2.98 3.286 3.563 4.052 4.277 4.488 4.512 5.069 5.246 5.578 5.876 6.157 6.299 6.572 6.817 7.165 7.396 7.613 7.926 8.232 8.526 8.806 9.065 9.394 9.716 10.034 10.392 10.724 11.031 11.368 11.752 12.122 12.535 12.952 13.362 13.785 14.254 14.809 15.351 15.956 16.568 17.249 17.968 18.602 19.063 19.138 18.608 17.842 17.062 16.313 15.551 14.813 14.12 13.502 12.858 12.263 11.72 11.205 10.677 10.181 9.73 9.248 8.804 8.408 8.013 7.613 7.288 6.963 6.606 6.315 6.009 5.674 5.331 4.974 4.714 4.453 4.056 3.771 3.466 3.306 2.974 2.622 2.23 2.021 1.44 1.359 1.113 0.859 0.321 0.004 -0.348 -0.718 -1.167 -1.726 -2.458 -4.538 -7 ,14479 ,TETRA ,17591166,Sat Nov 27 21:33:13 CET,Sat Nov 27 23:23:17 CET,0.0 1.46 2.061 2.518 2.911 3.26 3.547 3.81 4.302 4.525 4.738 4.752 5.305 5.487 5.813 6.116 6.399 6.531 6.785 7.04 7.396 7.621 7.842 8.156 8.455 8.734 8.999 9.261 9.6 9.923 10.243 10.63 10.983 11.317 11.708 12.125 12.519 12.962 13.444 13.933 14.423 14.936 15.497 16.022 16.577 17.192 17.87 18.518 19.077 19.512 19.624 19.057 18.299 17.494 16.698 15.905 15.141 14.422 13.772 13.099 12.527 11.999 11.474 10.962 10.493 10.085 9.621 9.199 8.827 8.418 7.999 7.645 7.294 6.931 6.639 6.342 6.028 5.69 5.337 5.085 4.823 4.414 4.123 3.819 3.669 3.36 3.019 2.65 2.461 1.882 1.785 1.539 1.276 0.658 0.31 -0.057 -0.45 -0.92 -1.468 -2.209 -4.1 -8 ,17724 ,TETRA ,17591167,Sat Nov 27 21:33:13 CET,Sat Nov 27 23:24:02 CET,0.0 1.05 1.606 2.033 2.391 2.708 3.006 3.279 3.768 3.995 4.204 4.206 4.758 4.936 5.25 5.545 5.831 5.972 6.258 6.523 6.878 7.108 7.332 7.665 7.982 8.271 8.536 8.787 9.125 9.442 9.739 10.084 10.402 10.702 11.058 11.442 11.788 12.169 12.57 12.996 13.44 13.909 14.428 14.93 15.521 16.113 16.711 17.344 17.962 18.451 18.529 18.003 17.19 16.338 15.515 14.708 13.977 13.283 12.638 11.972 11.372 10.815 10.271 9.761 9.283 8.835 8.364 7.937 7.556 7.163 6.758 6.412 6.046 5.654 5.334 5.011 4.675 4.322 3.97 3.717 3.456 3.054 2.757 2.445 2.282 1.928 1.558 1.181 0.982 0.397 0.3 0.061 -0.196 -0.752 -1.057 -1.409 -1.825 -2.287 -2.852 -3.621 -5.857 -9 ,8931 ,TETRA ,17591168,Sat Nov 27 21:33:15 CET,Sat Nov 27 23:24:07 CET,0.0 2.079 2.68 3.102 3.47 3.799 4.1 4.385 4.857 5.058 5.239 5.231 5.776 5.947 6.265 6.548 6.82 6.967 7.24 7.476 7.812 8.029 8.24 8.542 8.83 9.112 9.385 9.637 9.952 10.258 10.552 10.897 11.224 11.531 11.877 12.27 12.641 13.036 13.476 13.908 14.349 14.866 15.409 15.921 16.49 17.06 17.689 18.304 18.851 19.331 19.504 19.034 18.264 17.451 16.678 15.924 15.19 14.512 13.905 13.261 12.682 12.153 11.644 11.158 10.695 10.259 9.795 9.387 9.029 8.65 8.254 7.92 7.572 7.192 6.887 6.565 6.229 5.897 5.557 5.31 5.058 4.667 4.379 4.08 3.922 3.578 3.211 2.801 2.588 1.995 1.904 1.659 1.396 0.836 0.519 0.161 -0.311 -0.937 -1.705 -2.694 -5.342 -10 ,1865 ,TETRA ,17591169,Sat Nov 27 21:33:16 CET,Sat Nov 27 23:23:37 CET,0.0 1.443 1.974 2.397 2.734 3.052 3.343 3.6 4.061 4.272 4.477 4.497 5.043 5.211 5.539 5.859 6.149 6.282 6.54 6.79 7.143 7.374 7.601 7.914 8.2 8.48 8.761 9.028 9.353 9.66 9.97 10.337 10.677 11.001 11.37 11.784 12.172 12.571 12.972 13.406 13.881 14.398 14.971 15.492 16.059 16.645 17.258 17.886 18.491 18.988 19.098 18.59 17.848 17.038 16.212 15.375 14.618 13.909 13.26 12.56 11.958 11.411 10.873 10.381 9.923 9.508 9.066 8.648 8.248 7.816 7.384 7.026 6.66 6.276 5.989 5.685 5.357 5.018 4.655 4.396 4.125 3.711 3.424 3.119 2.954 2.604 2.229 1.843 1.64 1.059 0.995 0.759 0.497 -0.096 -0.42 -0.788 -1.197 -1.611 -2.147 -2.922 -5.009 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt deleted file mode 100644 index 20401c39..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15979 ,TETRA ,17591170,Sat Nov 27 21:33:19 CET,Sat Nov 27 23:21:43 CET,0.0 2.241 2.834 3.285 3.676 4.044 4.345 4.617 5.104 5.327 5.542 5.581 6.147 6.341 6.699 7.032 7.34 7.484 7.769 8.034 8.414 8.669 8.917 9.275 9.615 9.951 10.27 10.578 10.974 11.328 11.676 12.101 12.492 12.876 13.344 13.859 14.357 14.915 15.514 16.123 16.748 17.46 18.285 19.119 20.115 21.245 22.498 23.909 25.48 27.121 28.828 29.898 30.203 30.148 29.904 29.554 29.202 28.832 28.462 28.072 27.712 27.339 26.949 26.578 26.194 25.831 25.465 25.129 24.829 24.517 24.178 23.881 23.576 23.243 22.969 22.681 22.386 22.087 21.778 21.557 21.316 20.933 20.663 20.373 20.221 19.904 19.54 19.147 18.948 18.403 18.292 18.038 17.785 17.227 16.899 16.526 16.123 15.651 15.045 14.195 11.666 -2 ,23930 ,TETRA ,17591171,Sat Nov 27 21:33:13 CET,Sat Nov 27 23:26:26 CET,0.0 1.724 2.314 2.816 3.243 3.579 3.856 4.119 4.612 4.852 5.079 5.109 5.666 5.852 6.199 6.529 6.843 6.99 7.263 7.528 7.936 8.195 8.448 8.807 9.149 9.489 9.803 10.102 10.502 10.866 11.223 11.679 12.109 12.509 12.955 13.486 13.998 14.555 15.159 15.802 16.472 17.182 18.024 18.896 19.88 20.985 22.29 23.671 25.205 26.976 28.916 30.031 30.296 30.289 30.146 29.895 29.557 29.136 28.735 28.289 27.866 27.477 27.09 26.694 26.306 25.963 25.595 25.245 24.95 24.637 24.304 24.023 23.714 23.381 23.113 22.829 22.542 22.231 21.874 21.622 21.368 20.955 20.649 20.311 20.143 19.817 19.463 19.084 18.886 18.342 18.239 17.993 17.75 17.187 16.845 16.476 16.05 15.56 14.984 14.213 10.855 -3 ,4518 ,TETRA ,17591172,Sat Nov 27 21:33:12 CET,Sat Nov 27 23:21:50 CET,0.0 2.041 2.692 3.185 3.559 3.855 4.142 4.427 4.942 5.175 5.394 5.407 5.947 6.12 6.454 6.778 7.069 7.214 7.509 7.779 8.166 8.415 8.659 9.032 9.4 9.749 10.074 10.38 10.776 11.164 11.526 11.967 12.37 12.741 13.198 13.738 14.242 14.777 15.361 15.989 16.651 17.394 18.234 19.043 19.988 21.045 22.269 23.659 25.22 26.902 28.63 29.739 30.077 29.995 29.779 29.501 29.113 28.668 28.225 27.763 27.345 26.967 26.6 26.228 25.851 25.488 25.117 24.769 24.462 24.129 23.779 23.509 23.188 22.825 22.555 22.268 21.963 21.656 21.336 21.103 20.849 20.444 20.158 19.862 19.718 19.418 19.078 18.713 18.518 17.981 17.91 17.667 17.407 16.793 16.443 16.084 15.674 15.193 14.576 13.716 10.523 -4 ,8041 ,TETRA ,17591173,Sat Nov 27 21:33:13 CET,Sat Nov 27 23:21:51 CET,0.0 1.514 2.186 2.652 3.032 3.382 3.668 3.929 4.436 4.67 4.881 4.921 5.491 5.672 6.01 6.338 6.648 6.794 7.076 7.349 7.726 7.967 8.215 8.57 8.897 9.234 9.561 9.863 10.253 10.619 10.982 11.417 11.828 12.229 12.695 13.235 13.752 14.299 14.886 15.514 16.171 16.907 17.75 18.529 19.433 20.474 21.652 22.99 24.484 26.125 27.961 29.143 29.525 29.505 29.342 29.106 28.781 28.424 28.048 27.59 27.181 26.814 26.442 26.072 25.701 25.349 24.971 24.625 24.328 24.018 23.664 23.369 23.059 22.712 22.446 22.191 21.934 21.652 21.351 21.131 20.895 20.529 20.267 19.958 19.793 19.475 19.123 18.739 18.544 17.998 17.906 17.68 17.424 16.835 16.515 16.103 15.558 14.895 14.094 13.008 8.988 -5 ,10018 ,TETRA ,17591174,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:21:37 CET,0.0 2.223 2.863 3.32 3.722 4.053 4.359 4.618 5.099 5.324 5.543 5.62 6.186 6.365 6.704 7.03 7.342 7.484 7.755 8.038 8.462 8.722 8.967 9.32 9.658 9.985 10.299 10.59 10.968 11.336 11.698 12.133 12.53 12.92 13.382 13.901 14.399 14.931 15.492 16.114 16.784 17.541 18.415 19.243 20.199 21.241 22.429 23.778 25.301 26.979 28.707 29.712 30.038 29.979 29.712 29.335 28.952 28.574 28.197 27.763 27.356 26.974 26.586 26.203 25.835 25.491 25.127 24.801 24.503 24.177 23.821 23.512 23.188 22.838 22.566 22.298 22.024 21.716 21.385 21.155 20.904 20.51 20.238 19.951 19.791 19.454 19.126 18.768 18.559 17.993 17.879 17.642 17.39 16.782 16.431 16.044 15.615 15.125 14.502 13.646 10.527 -6 ,24141 ,TETRA ,17591175,Sat Nov 27 21:33:15 CET,Sat Nov 27 23:22:16 CET,0.0 1.602 2.218 2.646 3.012 3.333 3.63 3.923 4.454 4.68 4.89 4.946 5.529 5.715 6.043 6.365 6.663 6.809 7.092 7.367 7.754 7.996 8.236 8.586 8.933 9.26 9.568 9.869 10.263 10.647 11.02 11.467 11.915 12.341 12.807 13.344 13.877 14.439 15.015 15.619 16.285 17.043 17.885 18.701 19.666 20.737 21.939 23.303 24.884 26.657 28.505 29.667 30.002 29.915 29.689 29.364 29.015 28.633 28.226 27.787 27.396 27.042 26.683 26.314 25.954 25.634 25.286 24.945 24.646 24.318 23.973 23.685 23.364 23.016 22.732 22.44 22.148 21.846 21.532 21.31 21.073 20.688 20.408 20.102 19.946 19.611 19.253 18.888 18.688 18.137 18.039 17.794 17.536 16.951 16.612 16.249 15.835 15.327 14.73 13.915 11.787 -7 ,24826 ,TETRA ,17591176,Sat Nov 27 21:33:18 CET,Sat Nov 27 23:22:06 CET,0.0 1.563 2.154 2.594 2.992 3.345 3.654 3.942 4.477 4.725 4.937 4.964 5.528 5.716 6.067 6.382 6.674 6.825 7.117 7.396 7.786 8.029 8.267 8.61 8.942 9.255 9.572 9.877 10.277 10.671 11.043 11.486 11.906 12.318 12.804 13.333 13.832 14.392 14.995 15.63 16.277 17.004 17.868 18.708 19.689 20.788 22.035 23.332 24.746 26.351 28.115 29.222 29.423 29.273 29.05 28.731 28.334 27.928 27.544 27.121 26.735 26.366 25.989 25.602 25.243 24.918 24.575 24.248 23.959 23.651 23.304 23.007 22.698 22.357 22.089 21.84 21.557 21.227 20.895 20.651 20.386 19.976 19.699 19.41 19.257 18.935 18.577 18.142 17.903 17.338 17.218 16.968 16.713 16.143 15.809 15.417 14.98 14.444 13.799 13.033 11.193 -8 ,1613 ,TETRA ,17591177,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:22:16 CET,0.0 1.411 1.998 2.451 2.831 3.185 3.496 3.78 4.31 4.564 4.794 4.824 5.393 5.581 5.926 6.255 6.582 6.73 7.012 7.295 7.694 7.948 8.196 8.559 8.9 9.213 9.516 9.816 10.194 10.571 10.933 11.364 11.778 12.167 12.634 13.175 13.695 14.25 14.852 15.51 16.161 16.859 17.68 18.496 19.432 20.447 21.6 22.9 24.319 25.884 27.602 28.607 28.907 28.892 28.717 28.47 28.17 27.835 27.504 27.105 26.723 26.362 25.971 25.577 25.213 24.878 24.489 24.111 23.789 23.458 23.121 22.836 22.528 22.199 21.942 21.67 21.379 21.08 20.759 20.527 20.286 19.909 19.638 19.357 19.212 18.866 18.482 18.109 17.92 17.369 17.288 17.056 16.787 16.201 15.879 15.524 15.131 14.645 14.018 13.211 11.022 -9 ,20559 ,TETRA ,17591178,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:25:00 CET,0.0 1.516 2.068 2.532 2.961 3.339 3.631 3.903 4.408 4.642 4.873 4.93 5.489 5.66 6.007 6.347 6.664 6.811 7.087 7.367 7.785 8.042 8.294 8.65 8.99 9.314 9.616 9.908 10.29 10.666 11.018 11.442 11.837 12.222 12.689 13.198 13.709 14.29 14.884 15.496 16.14 16.875 17.736 18.588 19.58 20.678 21.933 23.303 24.793 26.396 28.122 29.216 29.599 29.659 29.502 29.252 28.949 28.568 28.18 27.738 27.351 27.0 26.624 26.245 25.873 25.514 25.137 24.804 24.513 24.203 23.868 23.578 23.275 22.951 22.698 22.437 22.154 21.836 21.496 21.266 21.022 20.629 20.347 20.055 19.899 19.558 19.202 18.845 18.646 18.087 17.961 17.697 17.432 16.862 16.531 16.174 15.771 15.322 14.773 13.988 11.744 -10 ,24856 ,TETRA ,17591179,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:23:00 CET,0.0 1.904 2.521 2.998 3.38 3.725 4.033 4.297 4.786 5.015 5.225 5.258 5.822 6.012 6.365 6.701 7.017 7.171 7.471 7.754 8.15 8.397 8.642 8.988 9.3 9.616 9.925 10.231 10.629 11.008 11.372 11.814 12.234 12.619 13.082 13.615 14.123 14.695 15.342 15.992 16.641 17.391 18.241 19.077 20.043 21.115 22.356 23.704 25.134 26.668 28.286 29.293 29.584 29.546 29.309 28.951 28.606 28.241 27.867 27.454 27.071 26.696 26.309 25.949 25.611 25.264 24.873 24.526 24.223 23.901 23.561 23.27 22.963 22.631 22.363 22.074 21.77 21.464 21.136 20.905 20.665 20.271 20.002 19.7 19.536 19.215 18.868 18.493 18.299 17.746 17.642 17.413 17.179 16.633 16.294 15.922 15.532 15.064 14.486 13.686 10.997 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 5305ef6e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12643 ,TETRA ,17591180,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:21:19 CET,0.0 1.014 1.442 1.742 2.01 2.264 2.489 2.692 3.046 3.195 3.336 3.26 3.728 3.847 4.082 4.3 4.499 4.597 4.787 4.967 5.228 5.395 5.557 5.799 6.028 6.24 6.449 6.653 6.907 7.142 7.352 7.61 7.884 8.148 8.438 8.755 9.062 9.392 9.729 10.088 10.478 10.89 11.327 11.777 12.281 12.807 13.405 14.039 14.73 15.461 16.133 16.305 16.156 15.898 15.553 15.188 14.825 14.464 14.138 13.76 13.427 13.128 12.83 12.547 12.272 12.02 11.744 11.483 11.271 11.042 10.794 10.595 10.384 10.145 9.95 9.762 9.562 9.328 9.084 8.929 8.767 8.503 8.32 8.124 8.019 7.803 7.569 7.316 7.185 6.701 6.735 6.577 6.404 6.003 5.79 5.57 5.329 5.059 4.712 4.283 2.948 -2 ,14451 ,TETRA ,17591181,Sat Nov 27 21:34:13 CET,Sat Nov 27 23:24:27 CET,0.0 1.099 1.498 1.775 2.019 2.26 2.48 2.677 3.028 3.182 3.325 3.279 3.764 3.893 4.139 4.352 4.556 4.658 4.843 5.014 5.261 5.432 5.593 5.822 6.044 6.241 6.438 6.637 6.873 7.102 7.326 7.593 7.851 8.106 8.397 8.7 8.996 9.321 9.654 9.991 10.337 10.742 11.197 11.644 12.173 12.746 13.379 14.042 14.733 15.435 16.044 16.17 15.969 15.676 15.338 14.95 14.568 14.185 13.839 13.472 13.136 12.847 12.565 12.282 12.026 11.785 11.509 11.248 11.02 10.79 10.544 10.322 10.094 9.868 9.68 9.48 9.272 9.047 8.805 8.643 8.48 8.223 8.035 7.828 7.725 7.506 7.254 7.009 6.881 6.388 6.416 6.254 6.096 5.705 5.491 5.274 4.996 4.674 4.328 3.874 2.573 -3 ,6978 ,TETRA ,17591182,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:23:46 CET,0.0 1.215 1.65 1.983 2.257 2.485 2.673 2.843 3.167 3.324 3.473 3.411 3.875 3.991 4.229 4.452 4.647 4.743 4.935 5.118 5.378 5.555 5.721 5.936 6.139 6.334 6.528 6.718 6.962 7.201 7.434 7.717 7.99 8.238 8.513 8.825 9.117 9.425 9.753 10.106 10.478 10.876 11.333 11.78 12.28 12.821 13.407 14.022 14.72 15.431 16.004 16.104 15.927 15.688 15.411 15.109 14.743 14.369 14.057 13.713 13.373 13.049 12.738 12.451 12.192 11.956 11.686 11.433 11.205 10.962 10.707 10.486 10.256 10.015 9.832 9.631 9.413 9.205 8.982 8.819 8.649 8.372 8.178 7.982 7.88 7.665 7.436 7.21 7.094 6.609 6.631 6.461 6.285 5.895 5.67 5.442 5.199 4.907 4.515 4.003 3.027 -4 ,14290 ,TETRA ,17591183,Sat Nov 27 21:34:13 CET,Sat Nov 27 23:22:21 CET,0.0 2.042 2.676 3.094 3.39 3.606 3.811 4.006 4.33 4.469 4.598 4.492 4.958 5.089 5.324 5.527 5.729 5.828 6.021 6.206 6.483 6.655 6.808 7.029 7.255 7.482 7.692 7.88 8.123 8.365 8.592 8.863 9.122 9.357 9.617 9.918 10.218 10.544 10.87 11.202 11.566 12.003 12.49 12.939 13.437 13.971 14.581 15.218 15.884 16.566 17.136 17.301 17.169 16.926 16.624 16.248 15.883 15.545 15.246 14.91 14.602 14.323 14.049 13.776 13.502 13.253 12.981 12.733 12.513 12.273 12.026 11.813 11.575 11.33 11.148 10.963 10.763 10.555 10.331 10.168 10.003 9.759 9.58 9.381 9.279 9.068 8.841 8.581 8.446 7.967 8.013 7.857 7.697 7.327 7.115 6.885 6.626 6.307 5.909 5.329 3.518 -5 ,1770 ,TETRA ,17591184,Sat Nov 27 21:34:13 CET,Sat Nov 27 23:25:30 CET,0.0 1.104 1.575 1.905 2.157 2.39 2.597 2.796 3.147 3.292 3.437 3.378 3.857 3.982 4.222 4.435 4.634 4.736 4.934 5.123 5.395 5.566 5.729 5.957 6.171 6.398 6.621 6.816 7.059 7.291 7.505 7.756 7.993 8.234 8.505 8.814 9.125 9.437 9.765 10.113 10.467 10.853 11.313 11.782 12.308 12.848 13.423 14.05 14.734 15.403 15.974 16.139 15.997 15.732 15.424 15.064 14.681 14.316 13.97 13.578 13.25 12.969 12.655 12.347 12.069 11.796 11.517 11.282 11.072 10.836 10.581 10.378 10.157 9.903 9.713 9.522 9.313 9.092 8.872 8.724 8.57 8.329 8.151 7.96 7.86 7.651 7.424 7.177 7.04 6.553 6.61 6.447 6.273 5.896 5.676 5.446 5.201 4.931 4.592 4.054 2.134 -6 ,27201 ,TETRA ,17591185,Sat Nov 27 21:35:12 CET,Sat Nov 27 23:22:34 CET,0.0 1.035 1.486 1.845 2.116 2.34 2.549 2.754 3.12 3.275 3.414 3.341 3.809 3.923 4.148 4.366 4.581 4.683 4.869 5.042 5.302 5.469 5.624 5.853 6.079 6.283 6.475 6.671 6.917 7.144 7.362 7.632 7.897 8.141 8.411 8.71 8.996 9.31 9.644 9.989 10.348 10.749 11.221 11.689 12.207 12.732 13.287 13.925 14.638 15.297 15.856 16.039 15.933 15.651 15.298 14.939 14.598 14.244 13.903 13.548 13.227 12.94 12.65 12.35 12.077 11.828 11.539 11.274 11.045 10.795 10.538 10.344 10.127 9.88 9.7 9.52 9.321 9.105 8.896 8.745 8.571 8.303 8.117 7.918 7.809 7.584 7.36 7.118 6.984 6.501 6.535 6.382 6.208 5.816 5.611 5.378 5.123 4.848 4.498 3.991 2.845 -7 ,24241 ,TETRA ,17591186,Sat Nov 27 21:34:14 CET,Sat Nov 27 23:23:15 CET,0.0 1.164 1.633 1.987 2.26 2.487 2.706 2.905 3.251 3.422 3.578 3.5 3.973 4.101 4.338 4.558 4.764 4.861 5.058 5.242 5.49 5.653 5.808 6.014 6.216 6.425 6.626 6.818 7.07 7.309 7.532 7.808 8.056 8.283 8.546 8.846 9.15 9.487 9.841 10.195 10.553 10.971 11.443 11.896 12.415 12.959 13.559 14.227 14.954 15.653 16.202 16.279 16.044 15.694 15.318 14.969 14.622 14.246 13.895 13.536 13.199 12.893 12.606 12.328 12.043 11.762 11.475 11.226 10.992 10.747 10.499 10.28 10.051 9.803 9.608 9.418 9.22 9.012 8.783 8.62 8.457 8.197 8.014 7.807 7.698 7.484 7.273 7.049 6.924 6.454 6.516 6.35 6.172 5.793 5.565 5.324 5.082 4.778 4.38 3.855 2.43 -8 ,18773 ,TETRA ,17591187,Sat Nov 27 21:34:13 CET,Sat Nov 27 23:23:15 CET,0.0 1.104 1.477 1.756 2.008 2.231 2.43 2.612 2.971 3.135 3.293 3.232 3.707 3.835 4.071 4.282 4.49 4.593 4.798 4.991 5.241 5.407 5.57 5.793 6.001 6.206 6.403 6.6 6.864 7.112 7.341 7.619 7.893 8.151 8.439 8.751 9.038 9.36 9.69 10.024 10.373 10.783 11.274 11.737 12.242 12.789 13.38 14.003 14.688 15.383 15.95 16.072 15.906 15.591 15.191 14.806 14.471 14.131 13.804 13.442 13.117 12.84 12.561 12.269 11.983 11.727 11.461 11.208 10.988 10.749 10.481 10.28 10.063 9.818 9.631 9.422 9.208 8.987 8.753 8.6 8.429 8.151 7.965 7.768 7.667 7.47 7.257 7.018 6.889 6.416 6.454 6.284 6.112 5.769 5.568 5.338 5.064 4.738 4.362 3.871 2.509 -9 ,5733 ,TETRA ,17591188,Sat Nov 27 21:34:14 CET,Sat Nov 27 23:23:03 CET,0.0 0.942 1.393 1.73 1.987 2.202 2.409 2.602 2.943 3.104 3.253 3.18 3.653 3.769 3.994 4.214 4.418 4.517 4.707 4.887 5.146 5.312 5.469 5.689 5.911 6.127 6.313 6.487 6.718 6.944 7.169 7.444 7.688 7.922 8.196 8.502 8.8 9.115 9.45 9.801 10.169 10.578 11.042 11.478 11.946 12.462 13.076 13.722 14.381 15.055 15.669 15.856 15.703 15.45 15.16 14.821 14.485 14.134 13.805 13.476 13.152 12.829 12.535 12.275 12.029 11.784 11.497 11.228 10.996 10.757 10.503 10.292 10.07 9.834 9.654 9.46 9.255 9.052 8.83 8.669 8.513 8.278 8.104 7.911 7.808 7.595 7.376 7.124 6.986 6.507 6.548 6.391 6.22 5.838 5.625 5.382 5.128 4.845 4.472 3.874 2.294 -10 ,4078 ,TETRA ,17591189,Sat Nov 27 21:34:14 CET,Sat Nov 27 23:22:39 CET,0.0 1.023 1.437 1.735 1.967 2.172 2.36 2.532 2.863 3.019 3.167 3.1 3.575 3.699 3.944 4.171 4.378 4.474 4.659 4.843 5.099 5.26 5.415 5.631 5.832 6.04 6.236 6.422 6.673 6.922 7.159 7.428 7.705 7.974 8.279 8.606 8.904 9.237 9.593 9.954 10.307 10.696 11.168 11.64 12.147 12.66 13.239 13.896 14.603 15.321 15.937 16.094 15.921 15.618 15.305 14.968 14.589 14.183 13.811 13.435 13.12 12.824 12.514 12.231 11.957 11.696 11.421 11.177 10.962 10.718 10.457 10.245 10.021 9.782 9.598 9.404 9.192 8.986 8.769 8.611 8.445 8.167 7.967 7.765 7.658 7.427 7.199 6.965 6.842 6.36 6.41 6.264 6.086 5.679 5.471 5.249 4.98 4.655 4.295 3.806 2.516 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index 5f341a25..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10312 ,TETRA ,17591190,Sat Nov 27 21:34:15 CET,Sat Nov 27 23:21:11 CET,0.0 1.457 1.935 2.313 2.617 2.881 3.136 3.362 3.77 3.946 4.109 4.054 4.534 4.672 4.939 5.173 5.405 5.519 5.731 5.925 6.207 6.392 6.554 6.79 7.03 7.256 7.465 7.651 7.888 8.121 8.352 8.625 8.884 9.13 9.405 9.701 9.986 10.305 10.637 10.977 11.325 11.713 12.155 12.591 13.054 13.528 14.024 14.504 14.987 15.393 15.499 15.097 14.565 13.999 13.411 12.854 12.346 11.846 11.4 10.957 10.554 10.181 9.826 9.488 9.171 8.874 8.562 8.265 7.994 7.726 7.458 7.239 6.993 6.731 6.528 6.318 6.095 5.855 5.598 5.413 5.221 4.918 4.705 4.481 4.361 4.121 3.87 3.614 3.486 2.995 3.032 2.873 2.703 2.322 2.104 1.848 1.542 1.199 0.839 0.381 -0.892 -2 ,29969 ,TETRA ,17591191,Sat Nov 27 21:34:15 CET,Sat Nov 27 23:24:45 CET,0.0 1.557 2.12 2.529 2.82 3.091 3.362 3.585 3.954 4.128 4.289 4.238 4.721 4.86 5.11 5.338 5.556 5.667 5.883 6.079 6.358 6.524 6.685 6.923 7.158 7.375 7.577 7.774 8.033 8.284 8.512 8.774 9.02 9.277 9.571 9.868 10.145 10.45 10.772 11.11 11.447 11.813 12.225 12.596 13.011 13.485 13.995 14.513 14.99 15.415 15.631 15.326 14.805 14.267 13.702 13.123 12.631 12.163 11.72 11.259 10.845 10.494 10.175 9.857 9.552 9.254 8.929 8.638 8.39 8.133 7.856 7.62 7.371 7.117 6.908 6.688 6.473 6.24 5.992 5.822 5.643 5.349 5.141 4.936 4.83 4.601 4.361 4.105 3.967 3.484 3.536 3.369 3.173 2.76 2.559 2.329 2.062 1.765 1.395 0.876 -0.852 -3 ,9316 ,TETRA ,17591192,Sat Nov 27 21:34:15 CET,Sat Nov 27 23:21:14 CET,0.0 2.179 2.724 3.08 3.419 3.698 3.941 4.173 4.582 4.761 4.924 4.89 5.385 5.516 5.778 6.024 6.258 6.37 6.566 6.751 7.028 7.203 7.376 7.629 7.871 8.112 8.321 8.519 8.77 8.989 9.206 9.474 9.728 9.975 10.265 10.567 10.838 11.129 11.444 11.771 12.09 12.437 12.815 13.2 13.655 14.114 14.596 15.062 15.511 15.877 15.959 15.598 15.071 14.514 13.966 13.409 12.908 12.445 12.016 11.562 11.162 10.795 10.445 10.108 9.792 9.497 9.169 8.882 8.628 8.364 8.085 7.844 7.605 7.35 7.149 6.946 6.723 6.48 6.221 6.042 5.869 5.61 5.423 5.217 5.106 4.864 4.601 4.324 4.176 3.676 3.694 3.526 3.341 2.9 2.656 2.381 2.08 1.729 1.288 0.772 -0.245 -4 ,30793 ,TETRA ,17591193,Sat Nov 27 21:34:15 CET,Sat Nov 27 23:21:18 CET,0.0 1.433 1.936 2.304 2.6 2.874 3.145 3.381 3.796 3.999 4.19 4.187 4.67 4.802 5.062 5.305 5.524 5.626 5.836 6.037 6.32 6.497 6.662 6.894 7.118 7.335 7.546 7.745 7.982 8.212 8.457 8.743 8.991 9.223 9.506 9.827 10.11 10.419 10.749 11.083 11.412 11.775 12.199 12.62 13.055 13.473 13.95 14.452 14.941 15.344 15.407 15.096 14.639 14.056 13.472 12.947 12.477 12.005 11.556 11.093 10.706 10.346 9.989 9.661 9.331 9.024 8.712 8.425 8.171 7.902 7.621 7.385 7.134 6.873 6.654 6.423 6.2 5.969 5.72 5.538 5.351 5.046 4.84 4.646 4.532 4.275 4.013 3.74 3.596 3.107 3.165 2.997 2.801 2.405 2.202 1.969 1.693 1.373 0.995 0.492 -0.889 -5 ,19019 ,TETRA ,17591194,Sat Nov 27 21:34:16 CET,Sat Nov 27 23:21:44 CET,0.0 1.5 1.925 2.303 2.629 2.885 3.142 3.428 3.932 4.131 4.297 4.264 4.753 4.89 5.169 5.443 5.676 5.775 5.961 6.138 6.393 6.564 6.739 6.993 7.231 7.453 7.655 7.85 8.098 8.327 8.543 8.811 9.086 9.355 9.649 9.964 10.26 10.568 10.883 11.211 11.554 11.927 12.355 12.776 13.215 13.661 14.158 14.66 15.099 15.416 15.527 15.225 14.741 14.21 13.662 13.102 12.578 12.084 11.667 11.225 10.799 10.406 10.045 9.718 9.39 9.064 8.734 8.44 8.193 7.942 7.659 7.415 7.152 6.883 6.692 6.475 6.21 5.944 5.693 5.521 5.347 5.07 4.875 4.661 4.546 4.305 4.064 3.826 3.685 3.182 3.223 3.055 2.882 2.534 2.311 2.062 1.831 1.549 1.187 0.596 -1.385 -6 ,3008 ,TETRA ,17591195,Sat Nov 27 21:34:18 CET,Sat Nov 27 23:21:32 CET,0.0 1.334 1.832 2.188 2.507 2.784 3.029 3.237 3.608 3.783 3.952 3.918 4.407 4.548 4.827 5.077 5.304 5.417 5.631 5.828 6.092 6.264 6.44 6.699 6.933 7.143 7.346 7.544 7.812 8.064 8.299 8.551 8.793 9.04 9.295 9.581 9.863 10.172 10.509 10.857 11.182 11.538 11.974 12.379 12.82 13.288 13.78 14.267 14.729 15.112 15.24 14.932 14.456 13.928 13.403 12.899 12.409 11.945 11.519 11.065 10.668 10.305 9.963 9.637 9.319 9.019 8.712 8.451 8.205 7.934 7.649 7.412 7.154 6.874 6.659 6.433 6.199 5.959 5.714 5.543 5.354 5.068 4.876 4.65 4.527 4.284 4.025 3.747 3.606 3.122 3.179 3.01 2.833 2.492 2.283 2.041 1.78 1.463 1.052 0.528 -1.125 -7 ,4566 ,TETRA ,17591196,Sat Nov 27 21:34:16 CET,Sat Nov 27 23:22:15 CET,0.0 1.722 2.204 2.58 2.877 3.14 3.386 3.611 3.983 4.17 4.347 4.298 4.776 4.908 5.164 5.392 5.608 5.715 5.924 6.115 6.38 6.546 6.701 6.931 7.162 7.384 7.587 7.781 8.03 8.261 8.484 8.751 9.008 9.248 9.514 9.799 10.075 10.383 10.698 11.038 11.382 11.753 12.174 12.569 13.022 13.486 13.959 14.416 14.886 15.333 15.47 15.162 14.667 14.109 13.566 13.015 12.484 11.979 11.535 11.086 10.701 10.352 10.0 9.648 9.292 8.961 8.634 8.341 8.075 7.798 7.504 7.266 7.018 6.738 6.521 6.295 6.056 5.802 5.533 5.358 5.179 4.889 4.686 4.476 4.366 4.138 3.907 3.65 3.506 3.005 3.021 2.841 2.659 2.26 2.018 1.756 1.444 1.095 0.688 0.171 -1.301 -8 ,14068 ,TETRA ,17591197,Sat Nov 27 21:34:15 CET,Sat Nov 27 23:21:48 CET,0.0 1.801 2.329 2.732 3.046 3.308 3.545 3.78 4.179 4.342 4.492 4.454 4.945 5.073 5.335 5.57 5.785 5.896 6.1 6.29 6.563 6.738 6.908 7.156 7.387 7.595 7.8 8.001 8.255 8.493 8.725 9.008 9.267 9.503 9.771 10.063 10.34 10.65 10.976 11.33 11.691 12.045 12.447 12.84 13.264 13.727 14.225 14.703 15.186 15.609 15.77 15.423 14.926 14.411 13.858 13.332 12.872 12.454 12.051 11.605 11.227 10.847 10.464 10.116 9.779 9.484 9.183 8.89 8.641 8.382 8.087 7.84 7.596 7.342 7.139 6.925 6.713 6.495 6.252 6.083 5.915 5.648 5.445 5.231 5.115 4.866 4.616 4.361 4.225 3.738 3.796 3.621 3.438 3.063 2.836 2.584 2.329 2.046 1.574 0.776 -1.421 -9 ,30263 ,TETRA ,17591198,Sat Nov 27 21:34:18 CET,Sat Nov 27 23:21:15 CET,0.0 2.3 3.053 3.498 3.781 4.029 4.26 4.483 4.882 5.056 5.22 5.201 5.707 5.839 6.093 6.327 6.531 6.637 6.853 7.064 7.341 7.511 7.681 7.918 8.161 8.391 8.592 8.79 9.052 9.295 9.524 9.786 10.026 10.264 10.538 10.831 11.112 11.434 11.778 12.118 12.464 12.851 13.265 13.665 14.128 14.582 15.055 15.537 16.032 16.435 16.519 16.172 15.687 15.137 14.581 14.034 13.512 13.02 12.592 12.145 11.741 11.378 11.02 10.683 10.369 10.07 9.753 9.464 9.221 8.958 8.672 8.439 8.195 7.943 7.73 7.513 7.302 7.071 6.832 6.672 6.5 6.218 6.008 5.793 5.683 5.438 5.179 4.896 4.742 4.237 4.247 4.078 3.92 3.553 3.322 3.069 2.79 2.479 2.094 1.559 0.146 -10 ,31538 ,TETRA ,17591199,Sat Nov 27 21:34:16 CET,Sat Nov 27 23:22:39 CET,0.0 1.879 2.46 2.811 3.138 3.423 3.656 3.865 4.227 4.395 4.554 4.505 4.997 5.14 5.424 5.674 5.884 5.99 6.207 6.403 6.674 6.857 7.032 7.283 7.507 7.715 7.921 8.116 8.376 8.613 8.831 9.097 9.355 9.591 9.861 10.165 10.437 10.734 11.052 11.39 11.719 12.067 12.476 12.86 13.292 13.746 14.202 14.658 15.107 15.451 15.543 15.219 14.736 14.159 13.582 13.035 12.53 12.055 11.622 11.197 10.832 10.487 10.145 9.823 9.515 9.207 8.872 8.572 8.308 8.027 7.742 7.51 7.249 6.978 6.774 6.569 6.361 6.138 5.905 5.737 5.549 5.259 5.048 4.816 4.704 4.469 4.217 3.949 3.808 3.292 3.274 3.104 2.938 2.575 2.369 2.13 1.862 1.556 1.096 0.422 -1.962 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt deleted file mode 100644 index 13e261a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9600 ,TETRA ,17591200,Sat Nov 27 21:34:16 CET,Sat Nov 27 23:21:44 CET,0.0 1.429 2.038 2.52 2.878 3.163 3.419 3.669 4.105 4.297 4.473 4.428 4.911 5.046 5.3 5.541 5.778 5.888 6.103 6.303 6.577 6.757 6.93 7.182 7.427 7.656 7.866 8.062 8.306 8.537 8.762 9.04 9.3 9.544 9.813 10.103 10.368 10.654 10.98 11.302 11.616 11.976 12.388 12.772 13.182 13.581 13.983 14.366 14.711 14.984 14.938 14.455 13.818 13.108 12.417 11.789 11.241 10.719 10.264 9.768 9.3 8.867 8.469 8.105 7.749 7.422 7.07 6.749 6.479 6.184 5.88 5.635 5.376 5.096 4.872 4.65 4.418 4.167 3.901 3.718 3.531 3.23 3.014 2.8 2.686 2.428 2.164 1.891 1.747 1.245 1.261 1.079 0.88 0.447 0.225 -0.033 -0.346 -0.681 -1.094 -1.653 -3.484 -2 ,14310 ,TETRA ,17591201,Sat Nov 27 21:34:16 CET,Sat Nov 27 23:21:22 CET,0.0 1.582 2.127 2.5 2.806 3.052 3.31 3.566 3.96 4.124 4.284 4.251 4.754 4.903 5.166 5.412 5.648 5.756 5.955 6.148 6.421 6.597 6.769 7.005 7.234 7.468 7.685 7.885 8.144 8.391 8.62 8.87 9.087 9.309 9.572 9.853 10.127 10.435 10.76 11.076 11.398 11.763 12.162 12.533 12.954 13.375 13.817 14.236 14.6 14.874 14.839 14.311 13.667 13.011 12.384 11.767 11.177 10.611 10.099 9.604 9.169 8.765 8.369 7.975 7.6 7.251 6.873 6.55 6.275 5.978 5.663 5.401 5.14 4.869 4.646 4.404 4.159 3.906 3.64 3.452 3.254 2.96 2.752 2.514 2.389 2.134 1.851 1.561 1.421 0.927 0.934 0.755 0.572 0.171 -0.068 -0.338 -0.629 -0.961 -1.387 -1.966 -3.5 -3 ,8825 ,TETRA ,17591202,Sat Nov 27 21:35:12 CET,Sat Nov 27 23:22:52 CET,0.0 1.635 2.12 2.539 2.878 3.154 3.401 3.611 3.982 4.147 4.312 4.28 4.763 4.907 5.176 5.415 5.646 5.757 5.968 6.179 6.454 6.629 6.804 7.048 7.293 7.517 7.719 7.928 8.182 8.425 8.661 8.929 9.175 9.394 9.641 9.925 10.185 10.478 10.807 11.116 11.423 11.783 12.184 12.578 13.025 13.449 13.896 14.336 14.713 14.954 14.885 14.367 13.666 12.945 12.243 11.588 10.999 10.444 9.968 9.459 8.998 8.586 8.189 7.809 7.45 7.106 6.75 6.442 6.166 5.879 5.57 5.311 5.05 4.776 4.563 4.34 4.097 3.843 3.579 3.394 3.204 2.899 2.691 2.487 2.376 2.129 1.887 1.617 1.466 0.963 0.981 0.805 0.608 0.153 -0.085 -0.321 -0.586 -0.903 -1.303 -1.877 -3.669 -4 ,27116 ,TETRA ,17591203,Sat Nov 27 21:35:12 CET,Sat Nov 27 23:25:04 CET,0.0 1.759 2.288 2.703 3.054 3.356 3.635 3.895 4.341 4.523 4.68 4.623 5.122 5.273 5.524 5.743 5.953 6.055 6.252 6.456 6.738 6.905 7.075 7.324 7.563 7.79 7.999 8.202 8.462 8.707 8.946 9.224 9.465 9.686 9.952 10.252 10.525 10.808 11.114 11.428 11.759 12.124 12.509 12.893 13.343 13.796 14.243 14.67 15.098 15.384 15.285 14.764 14.132 13.487 12.856 12.244 11.66 11.11 10.618 10.117 9.667 9.247 8.835 8.434 8.056 7.717 7.371 7.065 6.798 6.512 6.202 5.937 5.672 5.403 5.174 4.927 4.676 4.42 4.162 3.981 3.786 3.483 3.27 3.051 2.937 2.686 2.423 2.145 1.998 1.497 1.516 1.342 1.159 0.758 0.527 0.282 0.007 -0.324 -0.727 -1.222 -2.733 -5 ,11505 ,TETRA ,17591204,Sat Nov 27 21:35:13 CET,Sat Nov 27 23:23:12 CET,0.0 2.074 2.594 2.981 3.322 3.631 3.872 4.079 4.463 4.638 4.805 4.762 5.253 5.387 5.646 5.889 6.115 6.221 6.42 6.625 6.925 7.106 7.276 7.519 7.745 7.951 8.146 8.335 8.574 8.796 9.018 9.293 9.557 9.815 10.104 10.404 10.68 10.955 11.26 11.595 11.927 12.291 12.664 13.027 13.452 13.895 14.365 14.813 15.238 15.572 15.56 15.069 14.403 13.74 13.121 12.534 11.98 11.448 10.961 10.439 9.985 9.586 9.198 8.812 8.444 8.113 7.762 7.439 7.166 6.877 6.563 6.313 6.07 5.799 5.579 5.355 5.118 4.87 4.623 4.454 4.262 3.958 3.75 3.516 3.39 3.14 2.88 2.608 2.462 1.955 1.992 1.841 1.678 1.269 1.035 0.791 0.499 0.165 -0.231 -0.79 -2.264 -6 ,27729 ,TETRA ,17591205,Sat Nov 27 21:35:13 CET,Sat Nov 27 23:22:49 CET,0.0 2.299 2.905 3.289 3.622 3.907 4.164 4.404 4.771 4.932 5.107 5.102 5.589 5.726 5.978 6.206 6.404 6.499 6.706 6.903 7.178 7.361 7.53 7.757 7.983 8.207 8.417 8.612 8.85 9.08 9.294 9.543 9.798 10.047 10.334 10.645 10.929 11.242 11.563 11.886 12.204 12.54 12.932 13.326 13.751 14.177 14.632 15.084 15.474 15.735 15.722 15.241 14.602 13.935 13.265 12.617 12.046 11.532 11.047 10.558 10.12 9.712 9.348 8.997 8.646 8.319 7.982 7.681 7.413 7.125 6.822 6.558 6.282 5.987 5.751 5.514 5.27 5.012 4.744 4.555 4.357 4.052 3.832 3.606 3.495 3.265 3.015 2.744 2.598 2.093 2.104 1.914 1.722 1.337 1.109 0.86 0.586 0.25 -0.18 -0.744 -2.194 -7 ,684 ,TETRA ,17591206,Sat Nov 27 21:35:13 CET,Sat Nov 27 23:23:43 CET,0.0 1.612 2.152 2.544 2.881 3.185 3.44 3.653 4.029 4.207 4.366 4.324 4.812 4.943 5.215 5.47 5.702 5.811 6.011 6.194 6.466 6.644 6.817 7.071 7.297 7.509 7.721 7.913 8.15 8.386 8.613 8.887 9.141 9.373 9.643 9.95 10.234 10.535 10.845 11.172 11.515 11.879 12.287 12.69 13.119 13.54 13.981 14.399 14.774 15.054 15.022 14.538 13.865 13.166 12.497 11.817 11.208 10.657 10.157 9.665 9.247 8.852 8.458 8.066 7.695 7.379 7.044 6.721 6.443 6.144 5.818 5.554 5.292 5.012 4.783 4.55 4.314 4.052 3.777 3.592 3.396 3.079 2.864 2.647 2.534 2.275 1.985 1.688 1.534 1.03 1.047 0.865 0.67 0.257 0.034 -0.219 -0.508 -0.839 -1.236 -1.788 -3.037 -8 ,23486 ,TETRA ,17591207,Sat Nov 27 21:35:13 CET,Sat Nov 27 23:22:42 CET,0.0 1.832 2.332 2.718 3.023 3.273 3.505 3.731 4.128 4.309 4.476 4.429 4.923 5.063 5.308 5.525 5.748 5.848 6.027 6.221 6.51 6.683 6.843 7.085 7.325 7.555 7.763 7.953 8.194 8.431 8.668 8.948 9.208 9.457 9.75 10.064 10.36 10.664 10.962 11.285 11.631 12.003 12.43 12.86 13.298 13.695 14.104 14.522 14.911 15.198 15.237 14.785 14.114 13.433 12.754 12.119 11.527 10.963 10.486 9.991 9.545 9.141 8.745 8.361 8.01 7.696 7.345 7.032 6.76 6.461 6.16 5.905 5.637 5.35 5.117 4.873 4.626 4.378 4.107 3.915 3.724 3.405 3.184 2.961 2.846 2.609 2.337 2.054 1.91 1.401 1.4 1.22 1.041 0.648 0.419 0.171 -0.1 -0.422 -0.803 -1.32 -2.873 -9 ,16616 ,TETRA ,17591208,Sat Nov 27 21:35:13 CET,Sat Nov 27 23:24:04 CET,0.0 1.448 1.951 2.344 2.707 2.997 3.241 3.47 3.839 4.002 4.167 4.124 4.609 4.741 4.978 5.204 5.419 5.521 5.721 5.919 6.23 6.426 6.593 6.817 7.047 7.275 7.492 7.694 7.946 8.186 8.412 8.682 8.932 9.156 9.405 9.7 9.989 10.285 10.596 10.928 11.273 11.642 12.041 12.434 12.855 13.26 13.684 14.098 14.444 14.633 14.502 13.946 13.295 12.64 11.98 11.359 10.767 10.19 9.699 9.22 8.771 8.333 7.938 7.583 7.235 6.901 6.542 6.221 5.936 5.649 5.358 5.105 4.824 4.531 4.321 4.101 3.87 3.634 3.376 3.188 2.995 2.67 2.417 2.172 2.049 1.774 1.5 1.228 1.087 0.589 0.598 0.416 0.234 -0.166 -0.408 -0.672 -0.956 -1.293 -1.686 -2.206 -3.588 -10 ,2328 ,TETRA ,17591209,Sat Nov 27 21:35:13 CET,Sat Nov 27 23:23:02 CET,0.0 1.205 1.702 2.119 2.442 2.687 2.927 3.151 3.536 3.729 3.903 3.861 4.356 4.497 4.765 5.008 5.224 5.332 5.54 5.731 6.012 6.194 6.365 6.605 6.836 7.063 7.272 7.468 7.714 7.948 8.17 8.428 8.669 8.9 9.177 9.476 9.734 10.026 10.359 10.696 11.035 11.401 11.809 12.194 12.592 13.01 13.457 13.873 14.207 14.44 14.382 13.82 13.14 12.42 11.725 11.105 10.538 9.993 9.5 9.002 8.561 8.157 7.783 7.415 7.049 6.701 6.339 6.037 5.777 5.484 5.149 4.868 4.592 4.315 4.102 3.874 3.629 3.374 3.112 2.926 2.736 2.437 2.223 2.008 1.893 1.644 1.401 1.132 0.988 0.489 0.528 0.364 0.174 -0.261 -0.494 -0.741 -1.017 -1.356 -1.73 -2.246 -3.906 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 632afad2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28 ,TETRA ,17591210,Sat Nov 27 21:35:14 CET,Sat Nov 27 23:23:35 CET,0.0 1.054 1.479 1.794 2.062 2.263 2.437 2.609 2.903 3.049 3.199 3.12 3.599 3.729 3.976 4.203 4.417 4.509 4.672 4.844 5.117 5.293 5.463 5.705 5.926 6.138 6.347 6.553 6.828 7.08 7.305 7.572 7.83 8.082 8.376 8.7 9.002 9.33 9.694 10.095 10.497 10.924 11.427 11.918 12.461 13.046 13.702 14.427 15.233 16.072 16.878 17.268 17.277 17.127 16.902 16.634 16.35 16.068 15.782 15.446 15.158 14.91 14.657 14.39 14.129 13.903 13.659 13.425 13.227 13.014 12.78 12.581 12.367 12.143 11.969 11.793 11.61 11.389 11.144 10.978 10.817 10.573 10.396 10.204 10.107 9.899 9.676 9.44 9.311 8.836 8.867 8.707 8.542 8.167 7.962 7.726 7.449 7.153 6.836 6.383 5.133 -2 ,4977 ,TETRA ,17591211,Sat Nov 27 21:35:15 CET,Sat Nov 27 23:24:03 CET,0.0 1.281 1.698 1.996 2.228 2.443 2.643 2.818 3.142 3.296 3.457 3.393 3.859 3.986 4.236 4.453 4.659 4.763 4.96 5.157 5.433 5.596 5.757 5.985 6.198 6.412 6.624 6.819 7.059 7.295 7.524 7.799 8.061 8.299 8.581 8.914 9.217 9.563 9.93 10.299 10.699 11.145 11.652 12.135 12.658 13.212 13.849 14.579 15.363 16.158 16.988 17.375 17.345 17.197 16.985 16.706 16.397 16.092 15.799 15.476 15.192 14.929 14.669 14.408 14.162 13.942 13.709 13.479 13.262 13.029 12.785 12.588 12.381 12.176 12.017 11.845 11.662 11.452 11.238 11.091 10.931 10.663 10.484 10.308 10.213 10.012 9.794 9.544 9.413 8.939 8.982 8.819 8.645 8.282 8.091 7.873 7.598 7.298 6.946 6.459 5.052 -3 ,18173 ,TETRA ,17591212,Sat Nov 27 21:35:17 CET,Sat Nov 27 23:23:44 CET,0.0 1.278 1.869 2.313 2.589 2.804 2.994 3.203 3.573 3.724 3.876 3.799 4.279 4.408 4.643 4.872 5.086 5.186 5.385 5.568 5.839 6.013 6.158 6.384 6.614 6.821 7.014 7.208 7.46 7.699 7.925 8.185 8.435 8.683 8.972 9.288 9.59 9.918 10.271 10.649 11.059 11.525 12.043 12.556 13.163 13.785 14.464 15.191 15.989 16.846 17.646 18.04 18.011 17.812 17.532 17.205 16.903 16.603 16.314 16.023 15.737 15.454 15.189 14.924 14.679 14.454 14.214 14.001 13.812 13.608 13.391 13.204 12.997 12.761 12.581 12.405 12.21 11.983 11.743 11.593 11.434 11.172 10.981 10.785 10.689 10.5 10.3 10.066 9.942 9.468 9.522 9.383 9.232 8.878 8.678 8.462 8.216 7.923 7.545 7.006 5.743 -4 ,2984 ,TETRA ,17591213,Sat Nov 27 21:35:14 CET,Sat Nov 27 23:22:49 CET,0.0 1.4 1.817 2.124 2.408 2.651 2.857 3.042 3.355 3.513 3.672 3.621 4.101 4.222 4.456 4.667 4.868 4.965 5.16 5.354 5.622 5.784 5.945 6.181 6.401 6.616 6.822 7.026 7.281 7.528 7.768 8.04 8.309 8.569 8.85 9.156 9.451 9.773 10.136 10.523 10.903 11.33 11.821 12.298 12.843 13.419 14.075 14.806 15.593 16.427 17.226 17.555 17.493 17.303 17.072 16.8 16.506 16.201 15.928 15.64 15.371 15.11 14.852 14.586 14.334 14.106 13.852 13.619 13.409 13.182 12.953 12.766 12.567 12.347 12.169 11.99 11.803 11.595 11.368 11.205 11.039 10.786 10.601 10.41 10.315 10.108 9.897 9.675 9.555 9.085 9.139 8.985 8.824 8.454 8.245 8.025 7.773 7.474 7.107 6.601 5.137 -5 ,3922 ,TETRA ,17591214,Sat Nov 27 21:35:14 CET,Sat Nov 27 23:23:14 CET,0.0 1.197 1.685 2.031 2.3 2.526 2.729 2.919 3.276 3.441 3.593 3.522 4.009 4.148 4.38 4.583 4.779 4.879 5.072 5.247 5.501 5.671 5.831 6.05 6.271 6.493 6.699 6.899 7.154 7.386 7.609 7.86 8.105 8.353 8.63 8.951 9.259 9.577 9.929 10.31 10.702 11.128 11.59 12.042 12.58 13.174 13.819 14.501 15.268 16.058 16.811 17.193 17.159 16.924 16.643 16.34 16.044 15.758 15.474 15.151 14.863 14.604 14.355 14.104 13.841 13.602 13.361 13.14 12.942 12.736 12.523 12.331 12.126 11.918 11.75 11.55 11.328 11.127 10.912 10.744 10.574 10.314 10.134 9.954 9.852 9.65 9.44 9.2 9.081 8.61 8.664 8.51 8.35 8.009 7.811 7.581 7.32 7.04 6.661 6.103 4.945 -6 ,31598 ,TETRA ,17591215,Sat Nov 27 22:14:48 CET,Sun Nov 28 00:03:13 CET,0.0 1.113 1.536 1.867 2.136 2.383 2.615 2.827 3.195 3.352 3.498 3.418 3.894 4.022 4.269 4.513 4.746 4.851 5.051 5.248 5.525 5.694 5.855 6.081 6.302 6.523 6.734 6.933 7.188 7.433 7.663 7.939 8.224 8.488 8.775 9.096 9.391 9.716 10.074 10.459 10.838 11.271 11.774 12.272 12.835 13.404 14.045 14.773 15.551 16.361 17.126 17.508 17.558 17.384 17.112 16.859 16.599 16.304 16.013 15.707 15.44 15.216 14.982 14.711 14.443 14.202 13.952 13.713 13.502 13.274 13.042 12.848 12.635 12.414 12.233 12.047 11.862 11.668 11.455 11.3 11.138 10.878 10.691 10.506 10.413 10.192 9.948 9.704 9.577 9.1 9.149 8.982 8.813 8.452 8.232 7.993 7.74 7.448 7.09 6.604 5.234 -7 ,15913 ,TETRA ,17591216,Sat Nov 27 21:35:14 CET,Sat Nov 27 23:23:54 CET,0.0 1.111 1.597 1.964 2.245 2.484 2.683 2.86 3.193 3.334 3.476 3.407 3.88 3.993 4.208 4.415 4.631 4.734 4.92 5.109 5.372 5.533 5.696 5.927 6.146 6.36 6.57 6.768 7.025 7.279 7.517 7.799 8.07 8.324 8.603 8.923 9.232 9.554 9.899 10.259 10.643 11.08 11.592 12.106 12.679 13.254 13.864 14.54 15.285 16.064 16.823 17.215 17.257 17.141 16.93 16.653 16.379 16.085 15.799 15.493 15.204 14.936 14.685 14.443 14.196 13.965 13.718 13.483 13.271 13.048 12.802 12.59 12.373 12.148 11.97 11.781 11.583 11.379 11.171 11.018 10.857 10.603 10.427 10.245 10.146 9.927 9.693 9.455 9.33 8.868 8.95 8.798 8.628 8.251 8.03 7.8 7.563 7.281 6.926 6.436 5.243 -8 ,23735 ,TETRA ,17591217,Sat Nov 27 22:14:42 CET,Sun Nov 28 00:04:00 CET,0.0 1.216 1.631 1.975 2.258 2.5 2.736 2.955 3.329 3.487 3.637 3.581 4.055 4.181 4.433 4.661 4.88 4.987 5.176 5.352 5.608 5.779 5.951 6.194 6.423 6.631 6.822 7.015 7.289 7.54 7.766 8.044 8.312 8.564 8.858 9.196 9.507 9.836 10.201 10.574 10.962 11.409 11.916 12.418 12.951 13.535 14.216 14.924 15.74 16.673 17.551 18.014 18.066 17.903 17.64 17.338 17.058 16.75 16.453 16.14 15.84 15.556 15.291 15.038 14.789 14.566 14.309 14.069 13.863 13.645 13.414 13.215 13.005 12.784 12.609 12.432 12.248 12.049 11.834 11.688 11.529 11.265 11.066 10.853 10.743 10.516 10.276 10.002 9.862 9.383 9.424 9.262 9.091 8.717 8.52 8.294 8.028 7.693 7.24 6.526 4.412 -9 ,28713 ,TETRA ,17591218,Sat Nov 27 22:14:47 CET,Sun Nov 28 00:03:12 CET,0.0 1.272 1.713 2.043 2.297 2.503 2.696 2.872 3.187 3.345 3.496 3.431 3.916 4.041 4.274 4.497 4.713 4.812 4.998 5.176 5.426 5.593 5.76 5.996 6.228 6.445 6.648 6.841 7.087 7.325 7.565 7.862 8.143 8.411 8.709 9.043 9.354 9.686 10.047 10.423 10.802 11.23 11.728 12.214 12.773 13.406 14.111 14.82 15.554 16.282 17.012 17.378 17.391 17.283 17.061 16.771 16.45 16.15 15.887 15.578 15.288 15.039 14.788 14.52 14.274 14.045 13.797 13.577 13.376 13.148 12.911 12.71 12.495 12.271 12.091 11.901 11.707 11.51 11.293 11.14 10.982 10.732 10.56 10.376 10.278 10.072 9.846 9.599 9.474 9.001 9.058 8.9 8.729 8.352 8.128 7.883 7.605 7.298 6.924 6.445 4.703 -10 ,18023 ,TETRA ,17591219,Sat Nov 27 22:14:43 CET,Sun Nov 28 00:04:02 CET,0.0 1.326 1.765 2.1 2.362 2.612 2.847 3.051 3.38 3.54 3.704 3.649 4.124 4.241 4.488 4.728 4.954 5.065 5.266 5.451 5.723 5.89 6.049 6.274 6.497 6.72 6.928 7.113 7.36 7.604 7.833 8.114 8.376 8.623 8.907 9.236 9.548 9.872 10.226 10.599 10.976 11.387 11.857 12.345 12.919 13.543 14.201 14.87 15.635 16.456 17.267 17.697 17.681 17.515 17.273 16.974 16.708 16.446 16.18 15.87 15.584 15.331 15.078 14.822 14.573 14.341 14.066 13.816 13.601 13.374 13.147 12.954 12.746 12.515 12.348 12.178 12.001 11.808 11.58 11.426 11.274 11.012 10.82 10.638 10.546 10.337 10.112 9.87 9.739 9.265 9.305 9.148 8.988 8.605 8.397 8.179 7.942 7.672 7.327 6.868 5.174 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index 026451f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10609 ,TETRA ,17591220,Sat Nov 27 22:14:44 CET,Sun Nov 28 00:03:12 CET,0.0 1.922 2.392 2.758 3.087 3.375 3.612 3.837 4.232 4.41 4.59 4.552 5.044 5.181 5.434 5.684 5.914 6.019 6.228 6.44 6.745 6.919 7.084 7.33 7.571 7.804 8.023 8.239 8.51 8.751 8.969 9.241 9.519 9.777 10.058 10.363 10.661 10.991 11.342 11.693 12.048 12.432 12.882 13.341 13.811 14.295 14.811 15.325 15.883 16.436 16.837 16.793 16.475 16.092 15.683 15.217 14.742 14.3 13.92 13.517 13.145 12.796 12.465 12.154 11.869 11.588 11.287 11.041 10.819 10.583 10.334 10.112 9.867 9.602 9.397 9.195 8.98 8.755 8.523 8.353 8.174 7.899 7.719 7.531 7.436 7.238 7.002 6.752 6.622 6.136 6.175 6.006 5.832 5.421 5.191 4.953 4.67 4.356 3.981 3.444 2.055 -2 ,20063 ,TETRA ,17591221,Sat Nov 27 22:16:21 CET,Sun Nov 28 00:06:33 CET,0.0 1.524 2.033 2.452 2.806 3.078 3.307 3.538 3.979 4.159 4.332 4.297 4.789 4.925 5.176 5.422 5.664 5.776 5.996 6.211 6.505 6.691 6.869 7.127 7.368 7.596 7.815 8.026 8.283 8.528 8.769 9.049 9.309 9.56 9.852 10.164 10.464 10.785 11.129 11.488 11.85 12.247 12.69 13.12 13.594 14.094 14.656 15.224 15.79 16.337 16.677 16.54 16.204 15.814 15.35 14.881 14.484 14.089 13.698 13.298 12.95 12.643 12.331 12.021 11.723 11.445 11.142 10.861 10.624 10.382 10.124 9.899 9.666 9.433 9.247 9.04 8.812 8.584 8.364 8.203 8.021 7.752 7.568 7.36 7.252 7.019 6.773 6.51 6.372 5.879 5.926 5.771 5.607 5.223 4.997 4.769 4.504 4.186 3.816 3.249 1.257 -3 ,16739 ,TETRA ,17591222,Sat Nov 27 22:15:20 CET,Sun Nov 28 00:03:49 CET,0.0 1.315 1.79 2.181 2.512 2.765 2.981 3.207 3.625 3.805 3.984 3.963 4.458 4.598 4.854 5.088 5.317 5.431 5.664 5.883 6.174 6.358 6.524 6.775 7.037 7.276 7.492 7.687 7.931 8.164 8.395 8.684 8.952 9.202 9.486 9.798 10.107 10.454 10.812 11.17 11.545 11.962 12.411 12.843 13.349 13.879 14.424 14.979 15.565 16.133 16.539 16.473 16.179 15.765 15.28 14.798 14.362 13.965 13.591 13.189 12.833 12.504 12.181 11.879 11.589 11.304 11.006 10.738 10.493 10.23 9.955 9.729 9.504 9.261 9.061 8.865 8.654 8.426 8.198 8.026 7.842 7.563 7.365 7.149 7.037 6.806 6.55 6.277 6.143 5.649 5.668 5.495 5.313 4.937 4.71 4.447 4.158 3.844 3.443 2.91 1.458 -4 ,20292 ,TETRA ,17591223,Sat Nov 27 22:15:21 CET,Sun Nov 28 00:02:09 CET,0.0 1.829 2.338 2.721 3.082 3.384 3.642 3.881 4.293 4.474 4.649 4.627 5.119 5.262 5.544 5.799 6.033 6.147 6.358 6.566 6.88 7.067 7.236 7.472 7.695 7.893 8.084 8.282 8.544 8.798 9.039 9.322 9.58 9.822 10.088 10.394 10.706 11.041 11.39 11.767 12.141 12.527 12.963 13.389 13.871 14.402 14.989 15.55 16.105 16.665 17.04 16.953 16.633 16.223 15.79 15.33 14.895 14.489 14.092 13.678 13.314 12.985 12.661 12.342 12.032 11.747 11.473 11.219 10.986 10.739 10.48 10.256 10.027 9.798 9.598 9.381 9.163 8.941 8.711 8.537 8.345 8.059 7.862 7.646 7.533 7.3 7.064 6.808 6.679 6.196 6.227 6.059 5.88 5.509 5.304 5.06 4.791 4.478 4.057 3.503 1.658 -5 ,11366 ,TETRA ,17591224,Sat Nov 27 22:15:21 CET,Sun Nov 28 00:03:10 CET,0.0 1.751 2.275 2.726 3.057 3.324 3.554 3.769 4.199 4.398 4.571 4.558 5.07 5.214 5.474 5.705 5.923 6.032 6.241 6.442 6.73 6.904 7.078 7.339 7.574 7.792 8.002 8.206 8.473 8.736 8.984 9.288 9.576 9.827 10.099 10.404 10.697 11.004 11.326 11.678 12.062 12.477 12.922 13.35 13.839 14.34 14.892 15.479 16.078 16.647 17.016 16.971 16.666 16.268 15.845 15.383 14.945 14.512 14.098 13.691 13.356 13.018 12.664 12.348 12.051 11.775 11.492 11.234 10.996 10.748 10.487 10.271 10.05 9.815 9.631 9.433 9.228 9.011 8.775 8.612 8.434 8.16 7.982 7.79 7.686 7.454 7.203 6.937 6.797 6.314 6.347 6.163 5.963 5.536 5.321 5.057 4.735 4.389 3.997 3.481 1.5 -6 ,22372 ,TETRA ,17591225,Sat Nov 27 22:15:21 CET,Sun Nov 28 00:02:49 CET,0.0 1.539 2.04 2.39 2.686 2.978 3.254 3.496 3.906 4.089 4.26 4.223 4.711 4.853 5.132 5.377 5.592 5.699 5.906 6.098 6.376 6.555 6.732 6.991 7.226 7.446 7.656 7.864 8.142 8.387 8.618 8.897 9.156 9.409 9.705 10.049 10.378 10.701 11.019 11.361 11.716 12.096 12.519 12.93 13.409 13.923 14.456 15.029 15.623 16.125 16.436 16.316 15.951 15.523 15.079 14.628 14.212 13.826 13.469 13.069 12.698 12.366 12.041 11.723 11.434 11.162 10.87 10.632 10.41 10.157 9.9 9.665 9.401 9.137 8.94 8.733 8.521 8.312 8.093 7.925 7.752 7.49 7.3 7.098 6.993 6.774 6.542 6.283 6.149 5.675 5.724 5.554 5.376 4.963 4.742 4.52 4.259 3.933 3.562 3.062 1.683 -7 ,20572 ,TETRA ,17591226,Sat Nov 27 22:15:23 CET,Sun Nov 28 00:03:09 CET,0.0 1.629 2.085 2.442 2.767 3.06 3.296 3.506 3.906 4.079 4.252 4.248 4.744 4.875 5.161 5.422 5.655 5.77 5.995 6.204 6.493 6.679 6.854 7.099 7.333 7.557 7.765 7.968 8.227 8.46 8.681 8.949 9.201 9.467 9.768 10.073 10.369 10.697 11.043 11.383 11.714 12.08 12.517 12.943 13.404 13.891 14.458 15.035 15.593 16.118 16.464 16.41 16.088 15.645 15.193 14.75 14.324 13.915 13.556 13.166 12.826 12.517 12.204 11.889 11.593 11.314 11.003 10.727 10.488 10.235 9.965 9.754 9.55 9.315 9.13 8.937 8.721 8.498 8.255 8.082 7.905 7.63 7.43 7.227 7.122 6.892 6.637 6.348 6.202 5.713 5.752 5.594 5.428 5.063 4.844 4.595 4.333 4.023 3.641 3.144 1.099 -8 ,3523 ,TETRA ,17591227,Sat Nov 27 22:15:21 CET,Sun Nov 28 00:06:42 CET,0.0 1.918 2.486 2.872 3.168 3.436 3.685 3.917 4.299 4.476 4.65 4.62 5.12 5.27 5.556 5.806 6.037 6.152 6.383 6.604 6.898 7.072 7.234 7.482 7.718 7.937 8.159 8.371 8.628 8.879 9.121 9.411 9.687 9.951 10.262 10.589 10.89 11.229 11.582 11.932 12.298 12.694 13.145 13.603 14.115 14.663 15.25 15.857 16.45 16.955 17.31 17.243 16.864 16.418 16.005 15.536 15.075 14.651 14.244 13.826 13.459 13.117 12.788 12.466 12.161 11.878 11.581 11.299 11.048 10.808 10.553 10.338 10.11 9.855 9.658 9.454 9.237 8.996 8.743 8.57 8.395 8.122 7.934 7.741 7.635 7.402 7.157 6.892 6.753 6.264 6.321 6.166 5.999 5.641 5.436 5.193 4.906 4.589 4.207 3.7 1.948 -9 ,17050 ,TETRA ,17591228,Sat Nov 27 22:16:21 CET,Sun Nov 28 00:04:10 CET,0.0 1.596 2.138 2.555 2.882 3.126 3.356 3.604 4.048 4.232 4.405 4.386 4.888 5.027 5.287 5.53 5.751 5.858 6.07 6.271 6.563 6.744 6.912 7.169 7.425 7.661 7.87 8.076 8.356 8.622 8.859 9.128 9.395 9.65 9.941 10.256 10.55 10.877 11.205 11.525 11.865 12.266 12.739 13.172 13.623 14.13 14.689 15.25 15.857 16.414 16.765 16.763 16.48 16.038 15.6 15.141 14.674 14.224 13.836 13.466 13.139 12.828 12.529 12.223 11.922 11.651 11.378 11.127 10.887 10.638 10.368 10.138 9.916 9.671 9.471 9.278 9.072 8.845 8.598 8.423 8.248 7.985 7.804 7.612 7.513 7.295 7.057 6.812 6.678 6.191 6.245 6.089 5.922 5.548 5.335 5.094 4.838 4.554 4.175 3.571 1.283 -10 ,31238 ,TETRA ,17591229,Sat Nov 27 22:16:23 CET,Sun Nov 28 00:05:10 CET,0.0 1.838 2.369 2.777 3.086 3.337 3.567 3.772 4.15 4.332 4.503 4.489 4.994 5.142 5.412 5.652 5.871 5.984 6.205 6.405 6.689 6.87 7.035 7.258 7.482 7.71 7.923 8.119 8.376 8.622 8.846 9.123 9.391 9.643 9.929 10.236 10.523 10.843 11.19 11.538 11.902 12.306 12.76 13.202 13.701 14.211 14.762 15.337 15.898 16.416 16.773 16.727 16.411 15.959 15.481 15.003 14.567 14.139 13.731 13.324 12.977 12.638 12.308 11.997 11.691 11.407 11.112 10.833 10.596 10.36 10.095 9.874 9.644 9.406 9.216 9.003 8.79 8.569 8.328 8.164 7.991 7.719 7.529 7.323 7.213 6.98 6.74 6.486 6.345 5.863 5.917 5.76 5.587 5.189 4.977 4.753 4.502 4.198 3.722 3.005 1.261 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 30f9acd9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14953 ,TETRA ,17591230,Sat Nov 27 22:16:25 CET,Sun Nov 28 00:02:52 CET,0.0 1.081 1.478 1.778 2.03 2.246 2.448 2.658 3.037 3.197 3.348 3.269 3.743 3.862 4.089 4.297 4.49 4.59 4.793 4.988 5.257 5.434 5.606 5.831 6.044 6.262 6.46 6.643 6.901 7.15 7.379 7.656 7.912 8.149 8.432 8.762 9.078 9.398 9.735 10.114 10.504 10.923 11.4 11.9 12.497 13.09 13.694 14.356 15.092 15.827 16.516 16.791 16.716 16.549 16.28 15.959 15.665 15.35 15.062 14.767 14.481 14.222 13.961 13.698 13.453 13.222 12.981 12.744 12.533 12.317 12.069 11.856 11.642 11.407 11.213 11.027 10.844 10.642 10.422 10.261 10.103 9.854 9.676 9.487 9.385 9.171 8.934 8.688 8.56 8.089 8.153 7.975 7.784 7.424 7.22 6.979 6.723 6.413 6.021 5.526 4.264 -2 ,25559 ,TETRA ,17591231,Sat Nov 27 22:17:21 CET,Sun Nov 28 00:06:43 CET,0.0 1.302 1.726 2.049 2.329 2.567 2.776 2.961 3.279 3.42 3.545 3.459 3.938 4.063 4.31 4.526 4.735 4.834 5.025 5.211 5.464 5.63 5.792 6.02 6.243 6.454 6.655 6.847 7.103 7.354 7.587 7.852 8.106 8.362 8.64 8.953 9.257 9.566 9.908 10.28 10.65 11.062 11.539 12.0 12.543 13.139 13.794 14.477 15.203 15.968 16.689 17.036 17.037 16.861 16.596 16.297 15.989 15.677 15.397 15.111 14.832 14.575 14.322 14.066 13.812 13.565 13.295 13.058 12.853 12.627 12.384 12.172 11.95 11.732 11.557 11.372 11.189 10.98 10.757 10.613 10.463 10.208 10.022 9.828 9.723 9.513 9.297 9.072 8.952 8.474 8.513 8.346 8.171 7.818 7.615 7.363 7.098 6.828 6.469 5.952 4.433 -3 ,9138 ,TETRA ,17591232,Sat Nov 27 22:16:21 CET,Sun Nov 28 00:05:32 CET,0.0 1.067 1.476 1.753 1.994 2.234 2.443 2.623 2.987 3.161 3.309 3.222 3.701 3.835 4.074 4.302 4.512 4.612 4.807 4.99 5.266 5.449 5.624 5.859 6.073 6.28 6.474 6.663 6.908 7.142 7.372 7.653 7.918 8.163 8.448 8.761 9.053 9.377 9.73 10.094 10.46 10.882 11.368 11.855 12.42 13.014 13.654 14.339 15.106 15.903 16.709 17.076 17.069 16.903 16.653 16.34 16.039 15.743 15.449 15.132 14.825 14.536 14.267 14.02 13.768 13.51 13.229 12.982 12.776 12.568 12.34 12.128 11.909 11.682 11.483 11.271 11.065 10.868 10.648 10.474 10.303 10.043 9.858 9.666 9.568 9.37 9.143 8.875 8.742 8.267 8.345 8.201 8.032 7.675 7.475 7.252 6.981 6.658 6.281 5.735 4.222 -4 ,32069 ,TETRA ,17591233,Sat Nov 27 22:16:21 CET,Sun Nov 28 00:05:37 CET,0.0 2.267 2.91 3.395 3.732 3.947 4.155 4.361 4.719 4.873 5.022 4.957 5.428 5.554 5.817 6.06 6.271 6.369 6.554 6.733 6.997 7.174 7.33 7.553 7.768 7.958 8.149 8.347 8.6 8.833 9.059 9.334 9.595 9.829 10.087 10.378 10.653 10.954 11.28 11.628 12.001 12.41 12.869 13.339 13.857 14.4 15.038 15.734 16.469 17.229 17.971 18.271 18.216 18.016 17.746 17.449 17.135 16.803 16.497 16.19 15.924 15.675 15.421 15.16 14.882 14.63 14.378 14.148 13.928 13.697 13.472 13.274 13.061 12.823 12.62 12.418 12.216 11.996 11.767 11.605 11.442 11.176 10.986 10.803 10.708 10.508 10.293 10.053 9.924 9.449 9.513 9.362 9.195 8.832 8.649 8.443 8.181 7.889 7.544 6.999 5.626 -5 ,32482 ,TETRA ,17591234,Sat Nov 27 22:16:21 CET,Sun Nov 28 00:03:43 CET,0.0 1.098 1.56 1.89 2.207 2.46 2.669 2.859 3.19 3.355 3.522 3.464 3.955 4.089 4.32 4.539 4.748 4.848 5.05 5.243 5.501 5.66 5.808 6.018 6.232 6.442 6.646 6.846 7.092 7.323 7.551 7.835 8.102 8.351 8.641 8.944 9.224 9.539 9.886 10.242 10.603 11.019 11.517 12.008 12.542 13.114 13.734 14.4 15.142 15.928 16.683 17.014 16.963 16.754 16.479 16.187 15.88 15.591 15.325 15.01 14.736 14.485 14.217 13.954 13.702 13.459 13.205 12.97 12.767 12.55 12.309 12.108 11.886 11.661 11.484 11.285 11.072 10.856 10.646 10.491 10.325 10.072 9.896 9.706 9.601 9.385 9.173 8.942 8.808 8.316 8.343 8.185 8.025 7.685 7.482 7.242 6.969 6.67 6.304 5.82 4.131 -6 ,32744 ,TETRA ,17591235,Sat Nov 27 22:16:22 CET,Sun Nov 28 00:04:21 CET,0.0 1.026 1.425 1.759 2.031 2.281 2.516 2.705 3.015 3.166 3.312 3.249 3.738 3.87 4.112 4.336 4.552 4.652 4.829 5.002 5.269 5.443 5.611 5.85 6.078 6.295 6.502 6.7 6.954 7.202 7.42 7.662 7.914 8.175 8.46 8.756 9.055 9.379 9.699 10.05 10.434 10.851 11.333 11.798 12.318 12.892 13.537 14.212 14.928 15.673 16.334 16.604 16.553 16.371 16.121 15.798 15.485 15.191 14.883 14.559 14.274 13.995 13.716 13.448 13.193 12.954 12.698 12.463 12.259 12.04 11.81 11.613 11.409 11.177 10.983 10.788 10.597 10.39 10.16 10.006 9.847 9.599 9.426 9.238 9.141 8.934 8.699 8.443 8.309 7.828 7.878 7.728 7.566 7.206 7.0 6.788 6.546 6.248 5.847 5.307 3.801 -7 ,28095 ,TETRA ,17591236,Sat Nov 27 22:17:21 CET,Sun Nov 28 00:05:50 CET,0.0 1.221 1.652 1.968 2.22 2.435 2.635 2.816 3.15 3.308 3.449 3.365 3.839 3.956 4.184 4.4 4.604 4.707 4.904 5.085 5.34 5.501 5.664 5.903 6.122 6.323 6.519 6.712 6.962 7.202 7.428 7.701 7.954 8.192 8.479 8.807 9.106 9.424 9.78 10.148 10.534 10.967 11.465 11.948 12.465 13.057 13.732 14.42 15.161 15.908 16.65 17.007 16.994 16.826 16.572 16.259 15.901 15.537 15.213 14.89 14.603 14.323 14.029 13.761 13.517 13.269 13.0 12.757 12.548 12.32 12.074 11.873 11.655 11.424 11.244 11.052 10.856 10.656 10.433 10.278 10.115 9.854 9.672 9.478 9.377 9.161 8.931 8.704 8.585 8.106 8.151 7.991 7.82 7.454 7.248 7.004 6.733 6.423 6.055 5.537 3.908 -8 ,17098 ,TETRA ,17591237,Sat Nov 27 22:17:20 CET,Sun Nov 28 00:06:53 CET,0.0 1.118 1.471 1.802 2.12 2.423 2.676 2.885 3.226 3.386 3.542 3.469 3.948 4.078 4.329 4.547 4.737 4.835 5.038 5.242 5.533 5.713 5.878 6.111 6.337 6.557 6.761 6.952 7.192 7.426 7.654 7.921 8.18 8.428 8.708 9.013 9.3 9.615 9.962 10.339 10.726 11.125 11.579 12.058 12.595 13.163 13.793 14.443 15.139 15.88 16.568 16.856 16.763 16.52 16.242 15.945 15.66 15.354 15.058 14.731 14.433 14.145 13.853 13.585 13.33 13.095 12.854 12.618 12.404 12.176 11.933 11.723 11.484 11.229 11.04 10.861 10.667 10.453 10.227 10.069 9.902 9.63 9.441 9.25 9.149 8.937 8.716 8.478 8.342 7.864 7.923 7.763 7.594 7.244 7.036 6.799 6.535 6.239 5.892 5.471 4.376 -9 ,17578 ,TETRA ,17591238,Sat Nov 27 22:17:20 CET,Sun Nov 28 00:05:11 CET,0.0 1.247 1.674 2.012 2.31 2.58 2.803 2.992 3.305 3.462 3.611 3.538 4.023 4.149 4.372 4.577 4.779 4.879 5.081 5.269 5.523 5.686 5.842 6.074 6.291 6.478 6.666 6.862 7.125 7.379 7.612 7.887 8.147 8.393 8.682 9.003 9.309 9.638 9.978 10.33 10.69 11.104 11.581 12.07 12.65 13.246 13.878 14.57 15.343 16.154 16.863 17.136 17.064 16.826 16.541 16.205 15.863 15.547 15.244 14.907 14.59 14.316 14.052 13.779 13.506 13.248 12.963 12.708 12.491 12.27 12.048 11.845 11.619 11.394 11.22 11.032 10.84 10.639 10.436 10.287 10.121 9.862 9.683 9.492 9.386 9.176 8.959 8.72 8.597 8.124 8.179 8.022 7.843 7.463 7.263 7.035 6.775 6.47 6.095 5.604 4.057 -10 ,15209 ,TETRA ,17591239,Sat Nov 27 22:23:22 CET,Sun Nov 28 00:12:35 CET,0.0 1.112 1.529 1.831 2.105 2.337 2.543 2.728 3.037 3.192 3.352 3.295 3.772 3.898 4.131 4.35 4.56 4.668 4.871 5.048 5.305 5.471 5.634 5.87 6.1 6.32 6.522 6.716 6.968 7.216 7.449 7.722 7.987 8.24 8.527 8.842 9.141 9.451 9.792 10.157 10.529 10.939 11.398 11.881 12.461 13.056 13.703 14.416 15.163 15.923 16.665 17.004 16.945 16.723 16.434 16.101 15.801 15.505 15.212 14.887 14.592 14.333 14.08 13.825 13.581 13.343 13.08 12.838 12.627 12.412 12.189 11.997 11.776 11.552 11.388 11.192 10.972 10.763 10.536 10.368 10.202 9.952 9.765 9.552 9.446 9.229 9.003 8.767 8.639 8.173 8.255 8.086 7.902 7.504 7.288 7.055 6.803 6.528 6.194 5.748 4.562 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt deleted file mode 100644 index 4f68bccd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,267 ,TETRA ,17591240,Sat Nov 27 22:23:24 CET,Sun Nov 28 00:14:17 CET,0.0 1.134 1.628 1.955 2.251 2.548 2.782 2.975 3.348 3.517 3.66 3.607 4.096 4.22 4.447 4.655 4.856 4.958 5.153 5.336 5.596 5.759 5.92 6.146 6.362 6.579 6.778 6.967 7.208 7.444 7.669 7.912 8.135 8.362 8.637 8.935 9.212 9.52 9.847 10.198 10.55 10.925 11.374 11.806 12.249 12.733 13.264 13.779 14.343 14.869 15.206 15.126 14.828 14.427 13.978 13.535 13.103 12.686 12.302 11.919 11.591 11.287 10.989 10.711 10.453 10.209 9.951 9.714 9.51 9.285 9.044 8.851 8.643 8.427 8.255 8.069 7.88 7.685 7.477 7.327 7.16 6.893 6.711 6.523 6.43 6.22 6.006 5.787 5.663 5.192 5.274 5.122 4.96 4.61 4.411 4.206 3.993 3.737 3.404 2.912 1.518 -2 ,32476 ,TETRA ,17591241,Sat Nov 27 22:23:26 CET,Sun Nov 28 00:12:33 CET,0.0 0.919 1.358 1.719 2.034 2.274 2.493 2.714 3.087 3.238 3.382 3.321 3.796 3.92 4.147 4.361 4.573 4.674 4.861 5.051 5.325 5.492 5.652 5.882 6.101 6.316 6.519 6.706 6.945 7.17 7.377 7.621 7.86 8.106 8.39 8.697 8.998 9.344 9.708 10.053 10.391 10.756 11.184 11.591 12.043 12.524 13.028 13.563 14.114 14.615 14.947 14.856 14.569 14.182 13.768 13.383 13.005 12.623 12.281 11.918 11.593 11.304 11.006 10.71 10.43 10.175 9.906 9.643 9.418 9.196 8.949 8.736 8.513 8.286 8.111 7.92 7.719 7.516 7.299 7.146 6.987 6.726 6.543 6.354 6.257 6.058 5.845 5.619 5.496 5.018 5.088 4.938 4.788 4.446 4.25 4.044 3.801 3.52 3.196 2.753 1.688 -3 ,27490 ,TETRA ,17591242,Sat Nov 27 22:24:23 CET,Sun Nov 28 00:12:23 CET,0.0 1.226 1.685 2.0 2.28 2.538 2.777 2.99 3.347 3.504 3.65 3.567 4.039 4.161 4.397 4.617 4.818 4.915 5.113 5.3 5.543 5.699 5.856 6.082 6.297 6.494 6.687 6.884 7.127 7.355 7.58 7.846 8.081 8.297 8.558 8.856 9.138 9.436 9.76 10.095 10.439 10.831 11.263 11.68 12.172 12.697 13.241 13.796 14.352 14.894 15.266 15.15 14.841 14.444 13.989 13.567 13.168 12.768 12.421 12.053 11.718 11.411 11.072 10.75 10.476 10.221 9.948 9.701 9.481 9.25 8.996 8.793 8.593 8.351 8.158 7.967 7.782 7.595 7.374 7.217 7.057 6.813 6.656 6.471 6.368 6.158 5.921 5.69 5.573 5.092 5.163 5.029 4.889 4.557 4.36 4.131 3.877 3.571 3.186 2.719 1.475 -4 ,4102 ,TETRA ,17591243,Sat Nov 27 22:24:25 CET,Sun Nov 28 00:12:17 CET,0.0 1.215 1.691 2.04 2.316 2.55 2.769 2.967 3.293 3.436 3.589 3.529 4.005 4.129 4.364 4.591 4.805 4.905 5.103 5.289 5.533 5.693 5.853 6.073 6.276 6.48 6.677 6.869 7.118 7.341 7.553 7.827 8.081 8.308 8.574 8.892 9.19 9.501 9.839 10.19 10.553 10.938 11.361 11.768 12.219 12.709 13.238 13.801 14.367 14.846 15.189 15.086 14.729 14.266 13.815 13.376 12.969 12.573 12.201 11.848 11.538 11.226 10.909 10.615 10.327 10.038 9.751 9.51 9.296 9.063 8.812 8.602 8.393 8.169 7.988 7.796 7.58 7.357 7.138 6.988 6.834 6.594 6.426 6.248 6.153 5.959 5.758 5.531 5.411 4.938 5.002 4.856 4.703 4.37 4.149 3.91 3.669 3.36 3.002 2.568 0.999 -5 ,31228 ,TETRA ,17591244,Sat Nov 27 22:24:28 CET,Sun Nov 28 00:13:11 CET,0.0 1.604 1.984 2.268 2.519 2.74 2.943 3.124 3.48 3.659 3.828 3.762 4.236 4.366 4.623 4.864 5.072 5.173 5.368 5.547 5.8 5.96 6.121 6.363 6.591 6.808 7.006 7.194 7.441 7.668 7.881 8.149 8.402 8.639 8.907 9.191 9.466 9.782 10.126 10.474 10.813 11.171 11.593 12.016 12.486 12.961 13.494 14.095 14.708 15.284 15.684 15.566 15.214 14.813 14.415 14.0 13.582 13.188 12.84 12.484 12.161 11.842 11.526 11.222 10.93 10.671 10.404 10.155 9.944 9.731 9.502 9.294 9.075 8.851 8.67 8.483 8.296 8.099 7.875 7.713 7.551 7.297 7.12 6.935 6.84 6.642 6.427 6.201 6.078 5.609 5.691 5.552 5.399 5.057 4.861 4.642 4.398 4.109 3.744 3.273 2.138 -6 ,17695 ,TETRA ,17591245,Sat Nov 27 22:24:27 CET,Sun Nov 28 00:12:34 CET,0.0 1.374 1.876 2.205 2.472 2.723 2.943 3.131 3.482 3.652 3.808 3.73 4.203 4.328 4.583 4.81 5.01 5.108 5.304 5.493 5.749 5.92 6.081 6.299 6.515 6.728 6.918 7.088 7.303 7.506 7.709 7.963 8.199 8.427 8.698 8.993 9.289 9.613 9.946 10.297 10.657 11.033 11.451 11.873 12.325 12.823 13.38 13.937 14.516 15.086 15.421 15.308 14.981 14.567 14.141 13.69 13.274 12.879 12.503 12.153 11.868 11.583 11.264 10.971 10.704 10.443 10.176 9.927 9.701 9.471 9.233 9.022 8.798 8.574 8.399 8.207 8.006 7.803 7.591 7.443 7.284 7.034 6.851 6.653 6.551 6.338 6.119 5.884 5.761 5.281 5.349 5.213 5.072 4.731 4.548 4.354 4.101 3.823 3.491 3.063 1.94 -7 ,11284 ,TETRA ,17591246,Sat Nov 27 22:24:24 CET,Sun Nov 28 00:12:40 CET,0.0 0.987 1.463 1.812 2.093 2.328 2.556 2.774 3.162 3.329 3.472 3.399 3.884 4.003 4.23 4.457 4.672 4.778 4.97 5.144 5.401 5.555 5.698 5.924 6.149 6.356 6.551 6.738 6.989 7.226 7.438 7.701 7.952 8.193 8.472 8.76 9.04 9.353 9.648 9.967 10.316 10.694 11.102 11.484 11.942 12.451 13.027 13.593 14.174 14.724 15.06 14.963 14.658 14.289 13.889 13.446 13.047 12.682 12.326 11.957 11.608 11.288 10.998 10.707 10.433 10.178 9.906 9.666 9.452 9.209 8.957 8.753 8.54 8.329 8.154 7.965 7.772 7.566 7.336 7.173 7.017 6.779 6.603 6.407 6.31 6.114 5.896 5.665 5.545 5.065 5.136 4.993 4.828 4.465 4.243 4.01 3.755 3.455 3.101 2.572 1.41 -8 ,8856 ,TETRA ,17591247,Sat Nov 27 22:24:27 CET,Sun Nov 28 00:12:47 CET,0.0 1.345 1.866 2.22 2.473 2.711 2.919 3.089 3.434 3.601 3.749 3.685 4.174 4.293 4.507 4.714 4.929 5.037 5.238 5.415 5.654 5.802 5.955 6.196 6.422 6.637 6.833 7.017 7.247 7.468 7.691 7.951 8.192 8.413 8.673 8.985 9.288 9.61 9.944 10.278 10.621 11.021 11.47 11.887 12.346 12.847 13.388 13.933 14.493 14.994 15.353 15.37 15.091 14.697 14.28 13.835 13.408 13.022 12.689 12.314 11.953 11.621 11.303 11.002 10.712 10.436 10.159 9.912 9.684 9.443 9.182 8.972 8.774 8.575 8.403 8.205 8.005 7.812 7.613 7.462 7.3 7.034 6.85 6.663 6.561 6.367 6.179 5.941 5.804 5.317 5.382 5.242 5.092 4.731 4.526 4.326 4.04 3.667 3.291 2.864 1.793 -9 ,13082 ,TETRA ,17591248,Sat Nov 27 22:24:28 CET,Sun Nov 28 00:12:33 CET,0.0 1.32 1.833 2.163 2.435 2.72 2.963 3.155 3.514 3.682 3.844 3.786 4.268 4.393 4.629 4.846 5.05 5.155 5.35 5.533 5.801 5.975 6.138 6.359 6.574 6.776 6.974 7.164 7.402 7.636 7.85 8.107 8.357 8.6 8.881 9.17 9.44 9.756 10.093 10.438 10.774 11.121 11.532 11.949 12.411 12.897 13.452 14.02 14.577 15.082 15.439 15.392 15.084 14.708 14.302 13.863 13.427 13.018 12.66 12.304 11.991 11.681 11.374 11.094 10.829 10.563 10.272 10.02 9.793 9.548 9.288 9.072 8.858 8.64 8.47 8.289 8.103 7.91 7.704 7.558 7.408 7.181 7.006 6.821 6.73 6.543 6.336 6.109 5.991 5.518 5.585 5.423 5.256 4.901 4.714 4.516 4.298 4.029 3.69 3.254 2.249 -10 ,12213 ,TETRA ,17591249,Sat Nov 27 22:24:30 CET,Sun Nov 28 00:12:33 CET,0.0 1.111 1.523 1.875 2.155 2.378 2.588 2.777 3.144 3.296 3.431 3.353 3.833 3.953 4.185 4.42 4.635 4.73 4.915 5.1 5.36 5.523 5.678 5.887 6.091 6.302 6.513 6.715 6.966 7.197 7.402 7.64 7.879 8.114 8.381 8.694 9.001 9.304 9.634 9.986 10.321 10.694 11.102 11.508 11.995 12.5 13.039 13.61 14.212 14.786 15.156 15.125 14.865 14.511 14.098 13.661 13.222 12.796 12.436 12.062 11.729 11.424 11.115 10.819 10.54 10.277 10.003 9.758 9.537 9.295 9.034 8.819 8.595 8.363 8.184 7.985 7.775 7.579 7.38 7.223 7.052 6.803 6.637 6.462 6.367 6.173 5.96 5.729 5.613 5.138 5.199 5.055 4.903 4.548 4.343 4.105 3.859 3.608 3.285 2.812 1.706 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt deleted file mode 100644 index 0a9f62cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7634 ,TETRA ,17591250,Sat Nov 27 22:26:22 CET,Sun Nov 28 00:16:35 CET,0.0 1.418 1.942 2.28 2.562 2.819 3.067 3.298 3.671 3.837 4.003 3.971 4.472 4.613 4.874 5.108 5.334 5.446 5.68 5.901 6.197 6.385 6.563 6.826 7.065 7.278 7.492 7.712 7.989 8.241 8.485 8.797 9.095 9.352 9.643 9.991 10.339 10.701 11.074 11.479 11.877 12.319 12.846 13.355 13.899 14.474 15.112 15.78 16.484 17.172 17.657 17.557 17.163 16.639 16.073 15.547 15.065 14.6 14.147 13.667 13.25 12.848 12.45 12.063 11.701 11.372 11.029 10.703 10.418 10.119 9.793 9.535 9.269 8.987 8.763 8.522 8.266 7.993 7.704 7.499 7.297 6.988 6.753 6.506 6.38 6.121 5.851 5.555 5.399 4.882 4.871 4.679 4.477 4.049 3.808 3.53 3.22 2.839 2.337 1.655 -0.396 -2 ,22781 ,TETRA ,17591251,Sat Nov 27 22:29:25 CET,Sun Nov 28 00:19:02 CET,0.0 1.384 1.909 2.27 2.577 2.838 3.064 3.293 3.711 3.886 4.057 4.03 4.522 4.656 4.924 5.173 5.396 5.514 5.741 5.937 6.225 6.42 6.597 6.842 7.082 7.321 7.558 7.78 8.048 8.301 8.544 8.837 9.133 9.418 9.727 10.055 10.381 10.731 11.089 11.463 11.829 12.233 12.712 13.184 13.691 14.234 14.902 15.602 16.277 16.923 17.396 17.373 17.036 16.554 16.038 15.49 14.96 14.466 14.016 13.543 13.113 12.713 12.339 11.968 11.604 11.276 10.935 10.628 10.362 10.071 9.75 9.482 9.201 8.896 8.657 8.419 8.161 7.88 7.595 7.404 7.208 6.894 6.674 6.424 6.285 6.004 5.71 5.407 5.256 4.743 4.727 4.538 4.328 3.872 3.619 3.318 2.975 2.597 2.135 1.52 -0.793 -3 ,13308 ,TETRA ,17591252,Sat Nov 27 22:29:27 CET,Sun Nov 28 00:19:09 CET,0.0 1.253 1.755 2.139 2.449 2.727 2.962 3.179 3.569 3.736 3.91 3.906 4.415 4.568 4.84 5.101 5.351 5.473 5.704 5.913 6.211 6.403 6.588 6.849 7.085 7.297 7.521 7.754 8.045 8.314 8.566 8.856 9.137 9.403 9.697 10.038 10.366 10.724 11.116 11.511 11.911 12.379 12.924 13.456 14.038 14.606 15.197 15.848 16.595 17.307 17.78 17.746 17.385 16.91 16.413 15.92 15.408 14.894 14.424 13.909 13.447 13.051 12.672 12.3 11.944 11.611 11.266 10.939 10.642 10.342 10.034 9.781 9.517 9.227 9.002 8.778 8.54 8.269 7.984 7.794 7.593 7.283 7.063 6.818 6.689 6.427 6.159 5.879 5.725 5.213 5.208 5.013 4.81 4.324 4.063 3.801 3.481 3.131 2.731 2.117 -0.565 -4 ,1637 ,TETRA ,17591253,Sat Nov 27 22:29:29 CET,Sun Nov 28 00:19:07 CET,0.0 1.309 1.803 2.17 2.482 2.766 3.0 3.214 3.609 3.772 3.922 3.856 4.353 4.488 4.757 5.005 5.235 5.346 5.558 5.759 6.04 6.224 6.409 6.673 6.916 7.154 7.378 7.598 7.873 8.138 8.412 8.722 9.004 9.281 9.583 9.928 10.27 10.621 10.987 11.378 11.782 12.221 12.737 13.243 13.804 14.395 15.009 15.643 16.346 16.986 17.383 17.266 16.89 16.41 15.898 15.375 14.829 14.293 13.827 13.348 12.92 12.519 12.133 11.775 11.421 11.076 10.712 10.391 10.108 9.8 9.479 9.224 8.956 8.666 8.45 8.216 7.946 7.678 7.402 7.21 7.015 6.699 6.475 6.232 6.107 5.854 5.58 5.291 5.137 4.617 4.573 4.377 4.19 3.746 3.496 3.207 2.86 2.497 2.066 1.457 -0.79 -5 ,9900 ,TETRA ,17591254,Sat Nov 27 22:29:30 CET,Sun Nov 28 00:18:58 CET,0.0 1.267 1.846 2.371 2.736 2.987 3.223 3.454 3.87 4.056 4.235 4.217 4.719 4.859 5.12 5.352 5.568 5.676 5.907 6.129 6.43 6.626 6.808 7.056 7.298 7.53 7.751 7.961 8.218 8.461 8.71 9.021 9.301 9.56 9.866 10.206 10.536 10.905 11.281 11.687 12.127 12.598 13.121 13.618 14.177 14.776 15.426 16.099 16.753 17.346 17.743 17.689 17.29 16.783 16.259 15.724 15.229 14.775 14.368 13.907 13.47 13.069 12.682 12.308 11.956 11.633 11.284 10.963 10.69 10.407 10.098 9.83 9.551 9.252 9.013 8.767 8.506 8.235 7.949 7.741 7.532 7.223 7.0 6.756 6.632 6.365 6.085 5.795 5.634 5.123 5.135 4.947 4.744 4.314 4.066 3.793 3.473 3.097 2.654 2.072 0.277 -6 ,16767 ,TETRA ,17591255,Sat Nov 27 22:33:24 CET,Sun Nov 28 00:21:18 CET,0.0 1.816 2.267 2.636 2.974 3.271 3.521 3.745 4.139 4.306 4.472 4.451 4.951 5.096 5.361 5.597 5.823 5.937 6.158 6.371 6.678 6.87 7.043 7.291 7.544 7.78 8.003 8.224 8.514 8.781 9.039 9.347 9.628 9.902 10.204 10.527 10.842 11.186 11.552 11.963 12.371 12.787 13.267 13.742 14.292 14.889 15.549 16.242 16.991 17.678 18.19 18.234 17.888 17.371 16.788 16.234 15.724 15.216 14.757 14.261 13.795 13.395 13.022 12.676 12.34 12.009 11.657 11.328 11.024 10.714 10.394 10.121 9.837 9.541 9.318 9.091 8.843 8.587 8.331 8.137 7.925 7.594 7.356 7.104 6.975 6.711 6.444 6.158 5.997 5.483 5.505 5.316 5.108 4.694 4.436 4.125 3.787 3.39 2.955 2.34 0.591 -7 ,3960 ,TETRA ,17591256,Sat Nov 27 22:33:25 CET,Sun Nov 28 00:21:29 CET,0.0 1.296 1.813 2.174 2.493 2.768 2.989 3.193 3.588 3.764 3.932 3.91 4.417 4.562 4.843 5.098 5.325 5.435 5.653 5.856 6.157 6.358 6.549 6.817 7.07 7.315 7.546 7.758 8.031 8.309 8.565 8.86 9.133 9.398 9.702 10.048 10.385 10.734 11.113 11.507 11.914 12.383 12.918 13.41 13.945 14.539 15.203 15.894 16.612 17.273 17.753 17.717 17.35 16.874 16.334 15.743 15.171 14.637 14.166 13.685 13.262 12.889 12.515 12.131 11.775 11.462 11.115 10.791 10.521 10.233 9.927 9.682 9.429 9.152 8.919 8.671 8.407 8.134 7.853 7.642 7.427 7.121 6.899 6.648 6.521 6.267 5.998 5.69 5.522 5.009 5.029 4.862 4.675 4.224 3.967 3.678 3.368 3.037 2.552 1.857 -0.202 -8 ,32508 ,TETRA ,17591257,Sat Nov 27 22:33:28 CET,Sun Nov 28 00:21:27 CET,0.0 1.827 2.541 3.057 3.465 3.795 4.062 4.282 4.673 4.849 5.006 4.941 5.436 5.574 5.828 6.077 6.317 6.43 6.647 6.85 7.141 7.327 7.497 7.734 7.967 8.197 8.419 8.633 8.901 9.161 9.417 9.708 9.986 10.251 10.545 10.878 11.191 11.547 11.936 12.342 12.772 13.229 13.724 14.198 14.725 15.311 15.955 16.6 17.305 17.981 18.452 18.426 18.064 17.544 16.988 16.437 15.898 15.363 14.906 14.445 14.007 13.618 13.264 12.918 12.573 12.25 11.895 11.578 11.312 11.021 10.719 10.466 10.195 9.918 9.704 9.477 9.237 8.981 8.71 8.523 8.325 7.984 7.743 7.502 7.37 7.093 6.813 6.519 6.355 5.831 5.832 5.653 5.459 5.013 4.771 4.497 4.163 3.792 3.361 2.764 1.119 -9 ,29994 ,TETRA ,17591258,Sat Nov 27 22:33:30 CET,Sun Nov 28 00:21:14 CET,0.0 1.347 1.861 2.238 2.555 2.829 3.07 3.272 3.62 3.792 3.959 3.895 4.389 4.526 4.779 5.032 5.272 5.39 5.619 5.835 6.131 6.314 6.5 6.762 7.014 7.25 7.471 7.697 7.971 8.229 8.498 8.832 9.14 9.418 9.727 10.087 10.429 10.788 11.176 11.562 11.979 12.437 12.931 13.409 13.937 14.519 15.147 15.785 16.401 17.004 17.505 17.499 17.21 16.808 16.365 15.849 15.311 14.796 14.319 13.822 13.364 12.952 12.576 12.198 11.851 11.543 11.2 10.88 10.594 10.282 9.951 9.675 9.399 9.128 8.903 8.664 8.415 8.157 7.879 7.679 7.471 7.137 6.901 6.65 6.524 6.27 6.003 5.707 5.542 5.031 5.026 4.83 4.622 4.18 3.925 3.628 3.289 2.903 2.473 1.925 0.358 -10 ,12303 ,TETRA ,17591259,Sat Nov 27 22:34:23 CET,Sun Nov 28 00:23:54 CET,0.0 1.303 1.813 2.213 2.543 2.798 3.019 3.223 3.618 3.802 3.968 3.918 4.415 4.554 4.811 5.068 5.296 5.4 5.608 5.81 6.11 6.308 6.493 6.748 6.983 7.2 7.419 7.632 7.9 8.153 8.404 8.707 8.993 9.266 9.554 9.886 10.211 10.543 10.903 11.28 11.651 12.057 12.553 13.043 13.54 14.054 14.626 15.201 15.766 16.277 16.575 16.384 15.983 15.528 15.062 14.545 14.001 13.489 13.049 12.592 12.164 11.763 11.376 11.009 10.677 10.356 9.979 9.634 9.352 9.066 8.772 8.527 8.258 7.968 7.727 7.468 7.198 6.919 6.637 6.439 6.229 5.907 5.687 5.45 5.325 5.058 4.771 4.466 4.304 3.795 3.818 3.631 3.431 2.982 2.726 2.468 2.169 1.802 1.351 0.736 -1.376 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index 02166e8d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7223 ,TETRA ,17591260,Sat Nov 27 22:34:27 CET,Sun Nov 28 00:24:32 CET,0.0 1.21 1.634 1.978 2.303 2.594 2.841 3.075 3.475 3.629 3.787 3.774 4.279 4.419 4.7 4.97 5.223 5.342 5.566 5.787 6.117 6.325 6.511 6.771 7.031 7.281 7.512 7.742 8.047 8.324 8.583 8.899 9.192 9.477 9.812 10.175 10.512 10.893 11.307 11.747 12.197 12.649 13.182 13.751 14.395 15.057 15.773 16.525 17.318 18.088 18.713 18.852 18.719 18.393 17.952 17.503 17.045 16.603 16.202 15.772 15.373 15.0 14.643 14.306 13.972 13.649 13.308 12.992 12.71 12.419 12.123 11.868 11.599 11.31 11.081 10.851 10.609 10.352 10.094 9.915 9.724 9.405 9.186 8.958 8.835 8.574 8.309 8.041 7.906 7.412 7.422 7.239 7.064 6.675 6.448 6.182 5.878 5.54 5.142 4.574 3.066 -2 ,23191 ,TETRA ,17591261,Sat Nov 27 22:34:24 CET,Sun Nov 28 00:23:10 CET,0.0 1.432 1.929 2.308 2.633 2.909 3.163 3.381 3.767 3.965 4.147 4.116 4.613 4.755 5.04 5.302 5.557 5.68 5.908 6.131 6.446 6.646 6.828 7.084 7.349 7.605 7.845 8.067 8.34 8.616 8.887 9.214 9.528 9.836 10.196 10.575 10.931 11.318 11.728 12.16 12.582 13.034 13.563 14.095 14.714 15.377 16.08 16.806 17.636 18.503 19.153 19.268 19.092 18.746 18.33 17.881 17.415 16.975 16.582 16.142 15.747 15.382 15.018 14.672 14.347 14.043 13.717 13.407 13.111 12.811 12.518 12.274 12.013 11.743 11.528 11.301 11.063 10.813 10.544 10.357 10.166 9.864 9.65 9.421 9.307 9.057 8.767 8.456 8.302 7.798 7.825 7.646 7.441 7.0 6.759 6.493 6.194 5.835 5.416 4.877 3.516 -3 ,14242 ,TETRA ,17591262,Sat Nov 27 22:34:25 CET,Sun Nov 28 00:22:59 CET,0.0 1.376 1.748 2.094 2.412 2.664 2.897 3.122 3.521 3.722 3.919 3.905 4.41 4.56 4.843 5.097 5.327 5.44 5.67 5.887 6.193 6.384 6.581 6.878 7.141 7.385 7.621 7.847 8.135 8.413 8.678 8.997 9.307 9.581 9.916 10.306 10.646 11.002 11.393 11.814 12.266 12.784 13.35 13.872 14.464 15.119 15.822 16.542 17.341 18.158 18.831 18.99 18.798 18.45 18.02 17.53 17.029 16.565 16.152 15.721 15.331 14.98 14.637 14.298 13.974 13.66 13.326 13.028 12.772 12.503 12.213 11.965 11.7 11.423 11.206 10.976 10.74 10.491 10.218 10.027 9.83 9.532 9.33 9.1 8.978 8.741 8.473 8.18 8.026 7.52 7.527 7.342 7.158 6.732 6.485 6.209 5.899 5.521 5.08 4.397 1.66 -4 ,23629 ,TETRA ,17591263,Sat Nov 27 22:34:24 CET,Sun Nov 28 00:24:48 CET,0.0 1.168 1.646 1.999 2.27 2.523 2.776 3.021 3.435 3.61 3.781 3.747 4.252 4.398 4.679 4.943 5.184 5.3 5.515 5.718 6.031 6.229 6.411 6.67 6.929 7.173 7.402 7.632 7.93 8.222 8.508 8.835 9.13 9.425 9.776 10.147 10.503 10.871 11.252 11.669 12.098 12.581 13.125 13.663 14.279 14.938 15.624 16.328 17.096 17.88 18.596 18.746 18.466 18.058 17.579 17.054 16.576 16.135 15.714 15.276 14.883 14.516 14.158 13.809 13.471 13.138 12.79 12.499 12.25 11.957 11.632 11.377 11.113 10.818 10.591 10.356 10.106 9.848 9.582 9.398 9.201 8.881 8.664 8.441 8.327 8.077 7.803 7.516 7.359 6.853 6.854 6.668 6.48 6.033 5.769 5.507 5.232 4.892 4.448 3.883 2.287 -5 ,19000 ,TETRA ,17591264,Sat Nov 27 22:34:25 CET,Sun Nov 28 00:24:50 CET,0.0 1.701 2.197 2.611 2.911 3.162 3.396 3.612 4.014 4.208 4.379 4.35 4.859 5.0 5.273 5.518 5.75 5.866 6.083 6.299 6.605 6.799 6.981 7.238 7.51 7.759 7.987 8.221 8.529 8.806 9.067 9.385 9.69 9.963 10.281 10.67 11.029 11.402 11.81 12.251 12.707 13.216 13.764 14.272 14.875 15.535 16.248 16.99 17.777 18.562 19.189 19.309 19.007 18.536 18.083 17.636 17.168 16.696 16.28 15.851 15.442 15.076 14.717 14.37 14.039 13.721 13.394 13.101 12.836 12.547 12.25 12.006 11.747 11.466 11.235 11.003 10.778 10.539 10.277 10.09 9.899 9.613 9.404 9.179 9.063 8.808 8.548 8.279 8.131 7.622 7.63 7.461 7.275 6.862 6.628 6.355 6.059 5.74 5.368 4.835 3.126 -6 ,30598 ,TETRA ,17591265,Sat Nov 27 22:34:28 CET,Sun Nov 28 00:23:01 CET,0.0 1.434 1.932 2.322 2.667 2.97 3.241 3.473 3.855 4.034 4.21 4.184 4.698 4.849 5.13 5.386 5.637 5.761 5.973 6.172 6.488 6.683 6.868 7.152 7.421 7.676 7.923 8.151 8.441 8.723 8.988 9.308 9.616 9.917 10.266 10.629 10.972 11.362 11.794 12.247 12.694 13.162 13.71 14.272 14.874 15.493 16.19 16.953 17.761 18.516 19.179 19.4 19.168 18.796 18.399 17.937 17.494 17.079 16.658 16.209 15.841 15.49 15.117 14.757 14.431 14.132 13.804 13.508 13.242 12.941 12.637 12.384 12.101 11.802 11.586 11.368 11.13 10.877 10.603 10.411 10.226 9.94 9.729 9.517 9.403 9.149 8.878 8.591 8.437 7.928 7.91 7.712 7.509 7.079 6.836 6.567 6.271 5.94 5.558 4.914 1.52 -7 ,14481 ,TETRA ,17591266,Sat Nov 27 22:34:29 CET,Sun Nov 28 00:22:30 CET,0.0 1.298 1.808 2.182 2.492 2.759 3.002 3.213 3.602 3.79 3.971 3.949 4.446 4.584 4.851 5.111 5.353 5.47 5.689 5.908 6.219 6.407 6.599 6.879 7.139 7.377 7.611 7.841 8.138 8.414 8.669 8.988 9.293 9.588 9.911 10.271 10.638 11.023 11.42 11.834 12.278 12.764 13.308 13.852 14.467 15.125 15.846 16.583 17.381 18.215 18.894 19.069 18.791 18.376 17.929 17.429 16.956 16.514 16.13 15.712 15.319 14.952 14.613 14.282 13.95 13.638 13.292 12.975 12.695 12.411 12.13 11.897 11.655 11.388 11.176 10.952 10.708 10.464 10.218 10.039 9.845 9.539 9.322 9.09 8.968 8.71 8.428 8.121 7.947 7.424 7.422 7.234 7.04 6.617 6.383 6.126 5.814 5.471 5.082 4.513 2.502 -8 ,11786 ,TETRA ,17591267,Sat Nov 27 22:34:24 CET,Sun Nov 28 00:22:55 CET,0.0 1.404 1.853 2.168 2.455 2.728 2.997 3.232 3.636 3.821 3.99 3.967 4.462 4.601 4.892 5.16 5.392 5.505 5.718 5.922 6.227 6.42 6.613 6.904 7.17 7.414 7.647 7.884 8.2 8.505 8.792 9.119 9.42 9.701 10.045 10.421 10.759 11.135 11.533 11.935 12.34 12.784 13.302 13.843 14.455 15.101 15.812 16.545 17.283 17.998 18.548 18.61 18.309 17.885 17.455 17.01 16.572 16.146 15.745 15.307 14.907 14.523 14.142 13.79 13.463 13.16 12.831 12.541 12.304 12.041 11.727 11.47 11.211 10.936 10.731 10.52 10.288 10.023 9.742 9.553 9.352 9.036 8.832 8.616 8.496 8.246 7.976 7.67 7.511 7.003 7.032 6.87 6.685 6.254 6.014 5.758 5.471 5.153 4.749 4.233 3.099 -9 ,17550 ,TETRA ,17591268,Sat Nov 27 22:34:28 CET,Sun Nov 28 00:23:00 CET,0.0 1.769 2.333 2.753 3.062 3.319 3.549 3.763 4.164 4.341 4.503 4.454 4.953 5.095 5.379 5.65 5.895 6.012 6.232 6.437 6.737 6.932 7.12 7.386 7.629 7.882 8.126 8.346 8.635 8.92 9.188 9.502 9.804 10.106 10.45 10.811 11.135 11.489 11.876 12.288 12.739 13.252 13.836 14.382 15.004 15.677 16.385 17.15 17.951 18.721 19.383 19.548 19.259 18.852 18.397 17.941 17.521 17.074 16.644 16.191 15.768 15.391 15.034 14.682 14.344 14.022 13.682 13.383 13.119 12.825 12.505 12.252 12.004 11.729 11.502 11.267 11.023 10.773 10.51 10.321 10.131 9.829 9.602 9.366 9.25 8.994 8.711 8.421 8.268 7.767 7.794 7.616 7.417 6.971 6.734 6.486 6.168 5.789 5.355 4.742 2.345 -10 ,17483 ,TETRA ,17591269,Sat Nov 27 22:34:25 CET,Sun Nov 28 00:23:56 CET,0.0 1.743 2.342 2.707 3.018 3.274 3.503 3.75 4.198 4.387 4.56 4.51 5.015 5.166 5.436 5.688 5.928 6.039 6.247 6.458 6.77 6.969 7.157 7.422 7.677 7.919 8.146 8.371 8.675 8.959 9.23 9.548 9.853 10.152 10.484 10.849 11.198 11.563 11.96 12.396 12.84 13.32 13.87 14.409 14.996 15.617 16.313 17.084 17.908 18.746 19.43 19.58 19.372 18.967 18.513 18.052 17.591 17.16 16.775 16.332 15.931 15.58 15.22 14.852 14.501 14.193 13.865 13.545 13.273 12.988 12.689 12.445 12.181 11.913 11.702 11.476 11.237 10.983 10.704 10.511 10.32 10.02 9.801 9.564 9.436 9.171 8.9 8.61 8.461 7.965 7.983 7.807 7.603 7.17 6.948 6.685 6.395 6.056 5.645 5.097 2.956 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt deleted file mode 100644 index c6dcfee6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16332 ,TETRA ,17591270,Sat Nov 27 22:34:25 CET,Sun Nov 28 00:24:05 CET,0.0 1.662 2.171 2.573 2.919 3.222 3.483 3.71 4.121 4.312 4.494 4.478 4.997 5.158 5.453 5.711 5.96 6.078 6.302 6.524 6.846 7.043 7.228 7.499 7.751 7.991 8.225 8.444 8.739 9.032 9.304 9.624 9.935 10.235 10.566 10.935 11.295 11.692 12.114 12.538 12.976 13.477 14.071 14.635 15.246 15.953 16.749 17.605 18.498 19.393 20.3 20.629 20.493 20.21 19.847 19.454 19.058 18.673 18.305 17.913 17.531 17.173 16.85 16.518 16.18 15.876 15.565 15.261 14.988 14.712 14.425 14.167 13.886 13.593 13.384 13.164 12.924 12.668 12.385 12.195 11.985 11.639 11.408 11.158 11.035 10.791 10.508 10.208 10.05 9.527 9.509 9.31 9.092 8.618 8.347 8.036 7.702 7.285 6.772 6.082 3.605 -2 ,22205 ,TETRA ,17591271,Sat Nov 27 22:34:26 CET,Sun Nov 28 00:23:52 CET,0.0 1.792 2.345 2.769 3.089 3.365 3.593 3.802 4.227 4.42 4.593 4.56 5.072 5.226 5.516 5.772 6.022 6.144 6.375 6.593 6.899 7.085 7.267 7.542 7.796 8.041 8.27 8.485 8.762 9.034 9.306 9.636 9.956 10.255 10.59 10.965 11.332 11.739 12.165 12.594 13.058 13.578 14.156 14.708 15.342 16.036 16.781 17.562 18.402 19.285 20.117 20.455 20.339 20.034 19.681 19.293 18.861 18.411 18.017 17.617 17.235 16.883 16.552 16.237 15.926 15.62 15.287 14.988 14.731 14.453 14.155 13.907 13.648 13.36 13.131 12.899 12.656 12.412 12.145 11.956 11.76 11.443 11.223 10.964 10.828 10.563 10.276 9.957 9.798 9.292 9.29 9.09 8.873 8.433 8.191 7.9 7.573 7.182 6.685 5.861 2.503 -3 ,20913 ,TETRA ,17591272,Sat Nov 27 22:34:28 CET,Sun Nov 28 00:23:52 CET,0.0 1.66 2.26 2.704 3.043 3.328 3.578 3.812 4.226 4.415 4.594 4.564 5.086 5.247 5.538 5.791 6.03 6.149 6.37 6.582 6.896 7.084 7.262 7.522 7.77 8.003 8.222 8.434 8.708 8.976 9.243 9.567 9.881 10.171 10.491 10.853 11.208 11.592 11.996 12.423 12.88 13.378 13.944 14.53 15.172 15.875 16.657 17.443 18.347 19.298 20.117 20.436 20.318 20.018 19.656 19.293 18.894 18.441 18.029 17.635 17.275 16.919 16.54 16.183 15.869 15.553 15.215 14.901 14.622 14.352 14.079 13.835 13.57 13.301 13.082 12.853 12.619 12.363 12.096 11.906 11.702 11.39 11.168 10.937 10.822 10.573 10.286 9.989 9.837 9.326 9.334 9.151 8.943 8.479 8.229 7.954 7.618 7.202 6.717 6.082 3.512 -4 ,20491 ,TETRA ,17591273,Sat Nov 27 22:34:30 CET,Sun Nov 28 00:24:38 CET,0.0 1.547 2.048 2.434 2.76 3.038 3.285 3.527 3.945 4.138 4.323 4.294 4.797 4.934 5.197 5.468 5.726 5.847 6.086 6.308 6.619 6.814 6.997 7.247 7.491 7.738 7.977 8.221 8.543 8.812 9.057 9.374 9.677 9.96 10.293 10.67 11.029 11.413 11.816 12.242 12.686 13.177 13.736 14.283 14.927 15.625 16.411 17.228 18.061 18.936 19.798 20.173 20.052 19.74 19.318 18.89 18.503 18.111 17.733 17.339 16.99 16.656 16.327 16.017 15.709 15.406 15.077 14.77 14.493 14.211 13.931 13.68 13.411 13.131 12.92 12.7 12.461 12.212 11.945 11.749 11.545 11.226 11.008 10.783 10.659 10.404 10.13 9.828 9.666 9.142 9.113 8.91 8.711 8.285 8.046 7.773 7.439 7.059 6.615 5.988 4.078 -5 ,23732 ,TETRA ,17591274,Sat Nov 27 22:34:32 CET,Sun Nov 28 00:23:39 CET,0.0 2.017 2.578 2.966 3.293 3.567 3.821 4.05 4.448 4.64 4.819 4.776 5.282 5.428 5.7 5.964 6.222 6.344 6.573 6.792 7.101 7.297 7.492 7.773 8.035 8.271 8.497 8.723 9.022 9.305 9.561 9.877 10.179 10.468 10.823 11.227 11.604 11.989 12.402 12.843 13.283 13.779 14.36 14.924 15.556 16.233 16.982 17.791 18.628 19.495 20.284 20.518 20.452 20.228 19.875 19.48 19.073 18.664 18.293 17.892 17.522 17.185 16.871 16.546 16.222 15.931 15.615 15.321 15.074 14.808 14.525 14.287 14.029 13.757 13.532 13.302 13.061 12.798 12.524 12.334 12.142 11.812 11.564 11.311 11.185 10.927 10.654 10.359 10.201 9.686 9.67 9.482 9.292 8.847 8.594 8.339 8.031 7.644 7.14 6.439 3.996 -6 ,24492 ,TETRA ,17591275,Sat Nov 27 22:34:26 CET,Sun Nov 28 00:24:36 CET,0.0 1.652 2.159 2.584 2.937 3.217 3.453 3.656 4.022 4.202 4.38 4.333 4.843 4.983 5.242 5.513 5.771 5.887 6.109 6.33 6.632 6.824 7.02 7.293 7.535 7.763 7.992 8.211 8.487 8.74 8.991 9.315 9.63 9.919 10.232 10.603 10.963 11.335 11.73 12.162 12.624 13.142 13.723 14.268 14.883 15.555 16.315 17.118 18.006 18.956 19.798 20.13 20.013 19.713 19.342 18.952 18.575 18.174 17.783 17.378 17.022 16.704 16.377 16.041 15.735 15.438 15.086 14.779 14.523 14.235 13.942 13.703 13.453 13.19 12.973 12.738 12.488 12.23 11.945 11.759 11.574 11.271 11.04 10.789 10.663 10.404 10.117 9.789 9.618 9.094 9.076 8.875 8.667 8.186 7.906 7.605 7.279 6.897 6.406 5.729 3.531 -7 ,22528 ,TETRA ,17591276,Sat Nov 27 22:34:27 CET,Sun Nov 28 00:23:50 CET,0.0 1.591 2.226 2.683 3.022 3.323 3.595 3.826 4.225 4.409 4.575 4.531 5.034 5.175 5.444 5.708 5.962 6.073 6.29 6.512 6.816 7.01 7.197 7.455 7.708 7.959 8.183 8.386 8.662 8.934 9.196 9.506 9.798 10.089 10.444 10.831 11.166 11.524 11.918 12.351 12.807 13.312 13.905 14.481 15.099 15.756 16.5 17.334 18.25 19.16 19.967 20.325 20.256 19.995 19.636 19.217 18.815 18.43 18.058 17.668 17.334 17.013 16.677 16.332 15.989 15.675 15.359 15.072 14.814 14.531 14.245 14.021 13.758 13.477 13.267 13.034 12.796 12.539 12.267 12.087 11.888 11.581 11.374 11.141 11.014 10.753 10.472 10.155 9.981 9.453 9.457 9.271 9.071 8.619 8.362 8.081 7.76 7.375 6.897 6.22 4.365 -8 ,5538 ,TETRA ,17591277,Sat Nov 27 22:34:28 CET,Sun Nov 28 00:23:50 CET,0.0 1.717 2.308 2.718 3.055 3.359 3.641 3.894 4.323 4.508 4.674 4.631 5.14 5.296 5.592 5.85 6.095 6.214 6.442 6.658 6.961 7.168 7.37 7.648 7.902 8.146 8.393 8.625 8.921 9.201 9.469 9.789 10.07 10.339 10.685 11.081 11.463 11.87 12.294 12.753 13.214 13.713 14.271 14.821 15.452 16.129 16.88 17.659 18.511 19.476 20.438 20.844 20.781 20.529 20.151 19.735 19.339 18.941 18.595 18.212 17.821 17.452 17.104 16.764 16.428 16.117 15.798 15.514 15.262 14.98 14.684 14.43 14.151 13.869 13.656 13.426 13.184 12.939 12.674 12.49 12.285 11.934 11.696 11.467 11.35 11.099 10.831 10.546 10.391 9.872 9.882 9.702 9.498 9.03 8.772 8.503 8.186 7.824 7.286 6.339 3.083 -9 ,15233 ,TETRA ,17591278,Sat Nov 27 22:34:30 CET,Sun Nov 28 00:24:34 CET,0.0 1.424 1.984 2.439 2.806 3.083 3.318 3.541 3.946 4.139 4.329 4.314 4.825 4.974 5.241 5.491 5.72 5.828 6.051 6.269 6.586 6.783 6.974 7.254 7.514 7.758 7.987 8.206 8.498 8.787 9.06 9.383 9.698 10.003 10.35 10.731 11.09 11.482 11.905 12.354 12.808 13.316 13.92 14.511 15.171 15.836 16.563 17.377 18.238 19.107 19.933 20.309 20.195 19.901 19.561 19.183 18.819 18.419 17.995 17.56 17.184 16.843 16.505 16.163 15.841 15.529 15.209 14.918 14.63 14.329 14.032 13.787 13.522 13.242 13.027 12.803 12.562 12.3 12.02 11.822 11.604 11.246 11.009 10.778 10.66 10.408 10.122 9.812 9.652 9.137 9.136 8.942 8.739 8.308 8.056 7.778 7.468 7.086 6.584 5.916 3.361 -10 ,11946 ,TETRA ,17591279,Sat Nov 27 22:34:27 CET,Sun Nov 28 00:24:57 CET,0.0 1.594 2.078 2.471 2.819 3.126 3.39 3.616 4.022 4.207 4.374 4.335 4.835 4.965 5.226 5.477 5.704 5.819 6.046 6.267 6.577 6.769 6.961 7.228 7.485 7.737 7.969 8.198 8.494 8.774 9.027 9.337 9.659 9.962 10.294 10.666 11.027 11.423 11.831 12.257 12.711 13.22 13.799 14.351 14.961 15.641 16.421 17.247 18.131 19.059 19.98 20.306 20.167 19.869 19.484 19.083 18.688 18.3 17.951 17.55 17.185 16.865 16.547 16.233 15.928 15.627 15.305 14.998 14.725 14.454 14.148 13.879 13.612 13.348 13.142 12.917 12.683 12.431 12.162 11.973 11.766 11.442 11.225 10.988 10.861 10.6 10.313 10.013 9.862 9.346 9.317 9.117 8.906 8.46 8.207 7.909 7.59 7.24 6.786 6.093 3.694 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt deleted file mode 100644 index eded0738..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1375 ,TETRA ,17591280,Sat Nov 27 22:34:28 CET,Sun Nov 28 00:25:02 CET,0.0 0.896 1.358 1.665 1.926 2.16 2.343 2.507 2.888 3.068 3.223 3.169 3.641 3.763 4.003 4.222 4.424 4.528 4.72 4.893 5.154 5.321 5.483 5.721 5.948 6.159 6.346 6.521 6.754 6.983 7.208 7.469 7.701 7.914 8.163 8.462 8.745 9.039 9.354 9.667 9.98 10.326 10.697 11.06 11.48 11.913 12.356 12.806 13.258 13.588 13.612 13.153 12.501 11.835 11.205 10.595 10.012 9.46 8.984 8.487 8.039 7.646 7.261 6.882 6.515 6.185 5.845 5.52 5.235 4.927 4.589 4.323 4.042 3.746 3.517 3.274 3.014 2.739 2.456 2.268 2.074 1.75 1.52 1.29 1.175 0.943 0.673 0.368 0.215 -0.293 -0.287 -0.469 -0.668 -1.116 -1.35 -1.598 -1.881 -2.202 -2.6 -3.129 -4.461 -2 ,24122 ,TETRA ,17591281,Sat Nov 27 22:34:30 CET,Sun Nov 28 00:25:04 CET,0.0 1.134 1.497 1.769 2.019 2.256 2.458 2.651 3.023 3.192 3.349 3.311 3.797 3.922 4.155 4.379 4.583 4.675 4.855 5.039 5.308 5.474 5.633 5.866 6.077 6.276 6.47 6.655 6.896 7.123 7.335 7.594 7.847 8.097 8.37 8.663 8.954 9.258 9.572 9.896 10.223 10.577 10.972 11.36 11.769 12.2 12.671 13.118 13.563 13.932 13.981 13.55 12.934 12.261 11.668 11.077 10.469 9.92 9.461 8.981 8.532 8.13 7.749 7.371 7.011 6.665 6.287 5.96 5.673 5.371 5.054 4.793 4.528 4.241 4.004 3.761 3.519 3.258 2.985 2.799 2.598 2.285 2.07 1.838 1.718 1.477 1.222 0.938 0.79 0.292 0.306 0.121 -0.079 -0.472 -0.7 -0.967 -1.256 -1.575 -1.934 -2.443 -4.188 -3 ,670 ,TETRA ,17591282,Sat Nov 27 22:34:33 CET,Sun Nov 28 00:24:47 CET,0.0 1.291 1.791 2.137 2.426 2.669 2.879 3.059 3.367 3.519 3.67 3.587 4.066 4.208 4.45 4.669 4.881 4.98 5.169 5.353 5.612 5.78 5.942 6.16 6.371 6.579 6.777 6.959 7.196 7.43 7.646 7.899 8.133 8.354 8.617 8.919 9.191 9.479 9.792 10.126 10.455 10.798 11.188 11.58 12.022 12.472 12.974 13.495 13.965 14.33 14.453 14.042 13.419 12.754 12.121 11.512 10.94 10.401 9.917 9.433 9.01 8.611 8.197 7.787 7.402 7.051 6.698 6.379 6.092 5.809 5.515 5.262 4.986 4.698 4.48 4.252 4.008 3.742 3.464 3.278 3.078 2.75 2.519 2.284 2.16 1.902 1.656 1.381 1.231 0.729 0.75 0.579 0.398 -0.003 -0.241 -0.505 -0.791 -1.11 -1.524 -2.076 -3.415 -4 ,22435 ,TETRA ,17591283,Sat Nov 27 22:34:27 CET,Sun Nov 28 00:24:48 CET,0.0 0.906 1.298 1.602 1.887 2.128 2.349 2.549 2.919 3.095 3.25 3.178 3.659 3.787 4.013 4.219 4.414 4.513 4.71 4.885 5.125 5.288 5.445 5.656 5.858 6.065 6.266 6.448 6.672 6.886 7.1 7.362 7.603 7.833 8.101 8.39 8.657 8.955 9.27 9.579 9.892 10.227 10.614 10.98 11.381 11.832 12.307 12.761 13.214 13.578 13.673 13.265 12.671 12.06 11.432 10.812 10.255 9.736 9.254 8.756 8.298 7.875 7.472 7.074 6.711 6.379 6.022 5.689 5.404 5.123 4.817 4.563 4.292 3.983 3.743 3.502 3.249 2.988 2.707 2.509 2.302 1.964 1.727 1.503 1.386 1.139 0.881 0.587 0.426 -0.092 -0.099 -0.284 -0.471 -0.869 -1.091 -1.361 -1.66 -2.028 -2.493 -3.061 -4.604 -5 ,18833 ,TETRA ,17591284,Sat Nov 27 22:34:27 CET,Sun Nov 28 00:24:48 CET,0.0 1.238 1.678 1.989 2.236 2.469 2.674 2.845 3.188 3.356 3.51 3.438 3.916 4.035 4.261 4.481 4.674 4.764 4.956 5.144 5.399 5.567 5.719 5.918 6.126 6.342 6.556 6.759 6.99 7.215 7.433 7.676 7.923 8.156 8.422 8.716 8.986 9.277 9.584 9.912 10.257 10.63 11.031 11.425 11.856 12.302 12.786 13.269 13.726 14.085 14.113 13.689 13.086 12.437 11.857 11.269 10.661 10.107 9.632 9.13 8.664 8.229 7.814 7.429 7.079 6.759 6.411 6.09 5.819 5.527 5.214 4.953 4.659 4.329 4.082 3.85 3.612 3.357 3.073 2.866 2.67 2.375 2.152 1.914 1.787 1.531 1.263 0.976 0.826 0.311 0.289 0.093 -0.115 -0.549 -0.787 -1.066 -1.387 -1.738 -2.144 -2.689 -3.929 -6 ,17397 ,TETRA ,17591285,Sat Nov 27 22:34:30 CET,Sun Nov 28 00:23:42 CET,0.0 1.362 1.895 2.22 2.472 2.705 2.905 3.094 3.454 3.615 3.767 3.706 4.182 4.305 4.528 4.748 4.976 5.078 5.262 5.438 5.704 5.874 6.03 6.251 6.462 6.66 6.846 7.033 7.281 7.509 7.708 7.955 8.202 8.43 8.691 8.982 9.25 9.536 9.871 10.219 10.568 10.951 11.367 11.763 12.19 12.632 13.1 13.574 14.05 14.446 14.547 14.142 13.568 12.916 12.257 11.598 10.979 10.407 9.899 9.389 8.95 8.549 8.14 7.754 7.404 7.087 6.736 6.404 6.125 5.821 5.484 5.219 4.959 4.672 4.441 4.209 3.976 3.737 3.479 3.292 3.095 2.796 2.586 2.354 2.229 1.973 1.71 1.424 1.269 0.764 0.802 0.635 0.451 0.034 -0.192 -0.442 -0.729 -1.061 -1.464 -2.025 -3.674 -7 ,21449 ,TETRA ,17591286,Sat Nov 27 22:34:31 CET,Sun Nov 28 00:23:44 CET,0.0 0.963 1.382 1.749 2.053 2.295 2.513 2.724 3.099 3.261 3.412 3.327 3.793 3.911 4.139 4.35 4.562 4.661 4.853 5.035 5.278 5.44 5.598 5.819 6.038 6.239 6.428 6.611 6.836 7.058 7.272 7.528 7.772 8.005 8.278 8.577 8.849 9.138 9.437 9.759 10.091 10.447 10.872 11.282 11.702 12.099 12.536 13.015 13.487 13.867 13.954 13.545 12.973 12.37 11.776 11.192 10.631 10.071 9.572 9.063 8.602 8.192 7.8 7.418 7.076 6.761 6.424 6.105 5.828 5.543 5.235 4.978 4.711 4.427 4.201 3.966 3.723 3.46 3.182 2.997 2.799 2.474 2.24 1.991 1.865 1.616 1.346 1.043 0.887 0.377 0.381 0.187 -0.008 -0.447 -0.704 -0.988 -1.288 -1.632 -2.067 -2.672 -3.914 -8 ,12277 ,TETRA ,17591287,Sat Nov 27 22:34:28 CET,Sun Nov 28 00:23:42 CET,0.0 1.367 1.78 2.093 2.364 2.592 2.816 3.014 3.341 3.49 3.634 3.544 4.013 4.134 4.358 4.563 4.752 4.852 5.06 5.253 5.513 5.672 5.834 6.065 6.268 6.475 6.681 6.864 7.09 7.313 7.52 7.772 8.023 8.253 8.512 8.792 9.065 9.379 9.693 9.991 10.313 10.689 11.08 11.459 11.9 12.352 12.831 13.295 13.727 14.09 14.204 13.806 13.186 12.543 11.936 11.325 10.741 10.194 9.728 9.244 8.786 8.36 7.954 7.578 7.219 6.874 6.487 6.15 5.876 5.589 5.286 5.017 4.745 4.451 4.206 3.959 3.706 3.456 3.18 2.981 2.78 2.459 2.232 1.994 1.868 1.595 1.303 1.024 0.881 0.365 0.353 0.151 -0.054 -0.465 -0.699 -0.983 -1.303 -1.663 -2.049 -2.593 -4.298 -9 ,23195 ,TETRA ,17591288,Sat Nov 27 22:34:30 CET,Sun Nov 28 00:23:27 CET,0.0 1.149 1.629 1.964 2.231 2.48 2.711 2.922 3.282 3.446 3.607 3.56 4.046 4.169 4.414 4.657 4.872 4.971 5.156 5.331 5.574 5.72 5.867 6.099 6.318 6.517 6.711 6.89 7.107 7.323 7.538 7.787 8.021 8.243 8.502 8.796 9.071 9.365 9.677 10.011 10.363 10.728 11.12 11.532 11.997 12.445 12.906 13.352 13.779 14.147 14.221 13.783 13.124 12.454 11.839 11.217 10.608 10.062 9.575 9.045 8.572 8.155 7.755 7.354 6.983 6.649 6.295 5.978 5.71 5.425 5.114 4.852 4.575 4.285 4.054 3.8 3.552 3.304 3.031 2.835 2.633 2.326 2.11 1.882 1.765 1.511 1.237 0.943 0.789 0.275 0.277 0.1 -0.092 -0.519 -0.751 -1.0 -1.298 -1.63 -2.053 -2.619 -4.055 -10 ,30053 ,TETRA ,17591289,Sat Nov 27 22:34:32 CET,Sun Nov 28 00:23:32 CET,0.0 1.151 1.59 1.953 2.242 2.496 2.704 2.889 3.22 3.372 3.517 3.441 3.916 4.039 4.27 4.488 4.679 4.772 4.959 5.138 5.394 5.554 5.714 5.949 6.166 6.372 6.564 6.752 6.994 7.22 7.438 7.701 7.952 8.2 8.468 8.741 9.006 9.3 9.624 9.959 10.291 10.656 11.076 11.474 11.897 12.321 12.776 13.222 13.629 13.965 14.018 13.584 12.981 12.362 11.77 11.176 10.595 10.048 9.561 9.049 8.585 8.177 7.771 7.379 7.022 6.689 6.35 6.041 5.767 5.468 5.141 4.87 4.585 4.294 4.071 3.833 3.586 3.309 3.014 2.82 2.625 2.322 2.108 1.899 1.781 1.511 1.242 0.967 0.812 0.298 0.292 0.107 -0.089 -0.526 -0.757 -1.006 -1.273 -1.573 -1.953 -2.489 -4.029 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt deleted file mode 100644 index b6d553bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28744 ,TETRA ,17591290,Sat Nov 27 22:34:32 CET,Sun Nov 28 00:23:25 CET,0.0 1.545 2.144 2.596 2.963 3.285 3.579 3.83 4.268 4.467 4.644 4.622 5.131 5.292 5.579 5.838 6.08 6.195 6.416 6.635 6.941 7.132 7.318 7.583 7.834 8.074 8.296 8.498 8.759 9.004 9.25 9.538 9.795 10.049 10.338 10.627 10.895 11.197 11.517 11.86 12.215 12.57 12.93 13.256 13.634 14.029 14.337 14.572 14.728 14.626 14.014 12.955 11.862 10.803 9.836 8.937 8.131 7.389 6.718 6.029 5.443 4.91 4.409 3.961 3.546 3.155 2.727 2.326 1.968 1.594 1.218 0.916 0.589 0.231 -0.035 -0.31 -0.606 -0.91 -1.222 -1.431 -1.652 -2.018 -2.28 -2.566 -2.709 -2.976 -3.261 -3.582 -3.743 -4.266 -4.267 -4.457 -4.663 -5.131 -5.398 -5.695 -6.023 -6.386 -6.807 -7.413 -9.799 -2 ,8 ,TETRA ,17591291,Sat Nov 27 22:35:00 CET,Sun Nov 28 00:23:32 CET,0.0 1.971 2.656 3.134 3.48 3.787 4.05 4.293 4.739 4.94 5.133 5.155 5.671 5.822 6.104 6.372 6.63 6.748 6.955 7.157 7.45 7.637 7.817 8.061 8.307 8.553 8.783 8.993 9.259 9.517 9.759 10.03 10.294 10.536 10.801 11.106 11.388 11.703 12.038 12.389 12.75 13.111 13.5 13.87 14.259 14.618 14.963 15.275 15.498 15.524 15.024 13.944 12.832 11.771 10.748 9.792 8.977 8.222 7.541 6.873 6.292 5.767 5.28 4.812 4.364 3.951 3.51 3.11 2.771 2.42 2.048 1.738 1.416 1.073 0.811 0.549 0.248 -0.089 -0.42 -0.634 -0.862 -1.225 -1.472 -1.735 -1.875 -2.172 -2.47 -2.778 -2.953 -3.491 -3.523 -3.74 -3.976 -4.512 -4.803 -5.097 -5.428 -5.829 -6.299 -6.912 -8.81 -3 ,3722 ,TETRA ,17591292,Sat Nov 27 22:34:55 CET,Sun Nov 28 00:23:25 CET,0.0 2.126 2.759 3.214 3.554 3.859 4.127 4.374 4.822 5.025 5.208 5.188 5.69 5.841 6.129 6.388 6.614 6.726 6.951 7.175 7.483 7.676 7.868 8.146 8.409 8.65 8.875 9.089 9.364 9.62 9.865 10.16 10.434 10.696 10.993 11.305 11.587 11.882 12.203 12.532 12.842 13.184 13.597 13.951 14.301 14.699 15.12 15.435 15.643 15.648 15.129 14.064 12.948 11.88 10.924 10.029 9.214 8.461 7.781 7.104 6.535 6.018 5.516 5.041 4.598 4.197 3.764 3.361 3.006 2.634 2.265 1.965 1.651 1.321 1.056 0.767 0.467 0.132 -0.216 -0.437 -0.662 -1.008 -1.261 -1.538 -1.674 -1.947 -2.28 -2.627 -2.793 -3.322 -3.352 -3.565 -3.794 -4.306 -4.588 -4.896 -5.241 -5.646 -6.122 -6.787 -8.918 -4 ,19950 ,TETRA ,17591293,Sat Nov 27 22:34:56 CET,Sun Nov 28 00:23:38 CET,0.0 2.416 3.111 3.617 3.989 4.294 4.564 4.809 5.269 5.469 5.653 5.649 6.147 6.294 6.578 6.823 7.063 7.182 7.398 7.609 7.921 8.121 8.301 8.554 8.79 9.005 9.223 9.444 9.72 9.97 10.207 10.497 10.755 10.998 11.288 11.602 11.886 12.2 12.544 12.887 13.224 13.576 13.961 14.337 14.719 15.086 15.459 15.797 16.057 16.11 15.683 14.609 13.487 12.481 11.524 10.618 9.832 9.111 8.477 7.825 7.246 6.719 6.216 5.74 5.292 4.878 4.435 4.044 3.704 3.353 2.985 2.659 2.32 1.98 1.715 1.438 1.149 0.847 0.538 0.325 0.104 -0.225 -0.465 -0.721 -0.856 -1.143 -1.445 -1.776 -1.953 -2.495 -2.537 -2.737 -2.952 -3.446 -3.715 -3.997 -4.304 -4.653 -5.1 -5.72 -7.712 -5 ,16318 ,TETRA ,17591294,Sat Nov 27 22:34:59 CET,Sun Nov 28 00:23:29 CET,0.0 1.753 2.341 2.801 3.185 3.524 3.805 4.057 4.523 4.724 4.905 4.905 5.411 5.557 5.84 6.096 6.34 6.465 6.698 6.903 7.184 7.371 7.549 7.812 8.062 8.289 8.501 8.698 8.95 9.194 9.42 9.681 9.933 10.179 10.458 10.788 11.095 11.411 11.742 12.062 12.393 12.737 13.101 13.461 13.847 14.198 14.52 14.857 15.111 15.105 14.602 13.48 12.359 11.321 10.345 9.444 8.663 7.942 7.3 6.655 6.082 5.553 5.026 4.538 4.103 3.704 3.289 2.913 2.573 2.216 1.845 1.536 1.208 0.871 0.611 0.346 0.068 -0.233 -0.556 -0.776 -1.0 -1.363 -1.627 -1.894 -2.022 -2.309 -2.623 -2.937 -3.098 -3.626 -3.677 -3.902 -4.128 -4.613 -4.885 -5.18 -5.505 -5.86 -6.331 -7.04 -9.268 -6 ,8558 ,TETRA ,17591295,Sat Nov 27 22:34:56 CET,Sun Nov 28 00:23:27 CET,0.0 1.833 2.416 2.865 3.263 3.589 3.869 4.126 4.557 4.753 4.953 4.967 5.478 5.63 5.895 6.13 6.363 6.481 6.704 6.914 7.225 7.424 7.612 7.874 8.125 8.36 8.583 8.793 9.051 9.299 9.538 9.819 10.078 10.33 10.621 10.939 11.256 11.571 11.881 12.218 12.565 12.94 13.326 13.686 14.048 14.419 14.78 15.052 15.254 15.245 14.697 13.577 12.487 11.432 10.476 9.595 8.793 8.049 7.384 6.706 6.119 5.571 5.041 4.571 4.139 3.732 3.294 2.906 2.578 2.236 1.858 1.551 1.247 0.903 0.62 0.34 0.052 -0.243 -0.541 -0.758 -0.984 -1.345 -1.606 -1.897 -2.047 -2.334 -2.636 -2.97 -3.145 -3.677 -3.684 -3.889 -4.107 -4.589 -4.888 -5.206 -5.551 -5.986 -6.468 -7.088 -9.521 -7 ,28769 ,TETRA ,17591296,Sat Nov 27 22:34:58 CET,Sun Nov 28 00:23:31 CET,0.0 1.991 2.611 3.063 3.469 3.797 4.071 4.341 4.824 5.033 5.232 5.243 5.746 5.897 6.182 6.453 6.702 6.812 7.017 7.22 7.518 7.721 7.908 8.16 8.389 8.606 8.831 9.046 9.312 9.571 9.821 10.105 10.363 10.596 10.868 11.195 11.498 11.795 12.097 12.4 12.699 13.054 13.45 13.759 14.08 14.426 14.779 15.111 15.34 15.342 14.847 13.728 12.612 11.568 10.625 9.736 8.913 8.169 7.54 6.875 6.294 5.804 5.326 4.853 4.402 3.98 3.528 3.133 2.809 2.474 2.106 1.787 1.449 1.091 0.805 0.513 0.216 -0.091 -0.409 -0.643 -0.888 -1.26 -1.523 -1.799 -1.938 -2.233 -2.544 -2.875 -3.057 -3.607 -3.63 -3.833 -4.048 -4.515 -4.786 -5.1 -5.476 -5.873 -6.319 -6.934 -8.465 -8 ,16382 ,TETRA ,17591297,Sat Nov 27 22:35:00 CET,Sun Nov 28 00:23:43 CET,0.0 1.73 2.361 2.842 3.219 3.539 3.82 4.076 4.516 4.71 4.899 4.902 5.414 5.562 5.846 6.129 6.381 6.498 6.725 6.934 7.233 7.435 7.623 7.878 8.131 8.364 8.582 8.804 9.081 9.341 9.597 9.893 10.171 10.43 10.728 11.065 11.367 11.687 12.026 12.366 12.68 13.027 13.398 13.74 14.135 14.504 14.876 15.236 15.505 15.549 15.073 13.969 12.805 11.711 10.698 9.778 8.976 8.24 7.606 6.96 6.401 5.889 5.386 4.889 4.447 4.056 3.635 3.246 2.893 2.534 2.169 1.863 1.54 1.18 0.898 0.626 0.343 0.049 -0.262 -0.476 -0.696 -1.071 -1.336 -1.607 -1.748 -2.035 -2.329 -2.643 -2.801 -3.329 -3.36 -3.554 -3.758 -4.243 -4.52 -4.803 -5.134 -5.515 -5.973 -6.619 -8.156 -9 ,8318 ,TETRA ,17591298,Sat Nov 27 22:35:01 CET,Sun Nov 28 00:23:21 CET,0.0 1.469 2.111 2.552 2.913 3.253 3.543 3.776 4.185 4.379 4.552 4.527 5.032 5.18 5.467 5.748 6.004 6.13 6.36 6.567 6.885 7.082 7.27 7.533 7.775 8.007 8.222 8.43 8.707 8.961 9.188 9.446 9.696 9.955 10.253 10.553 10.838 11.152 11.491 11.864 12.227 12.605 13.028 13.394 13.765 14.137 14.487 14.767 14.986 15.02 14.508 13.395 12.236 11.163 10.171 9.265 8.472 7.734 7.085 6.426 5.833 5.303 4.814 4.35 3.9 3.477 3.035 2.647 2.307 1.956 1.6 1.3 0.969 0.627 0.366 0.093 -0.187 -0.479 -0.779 -0.988 -1.21 -1.576 -1.823 -2.087 -2.232 -2.515 -2.82 -3.15 -3.325 -3.861 -3.891 -4.104 -4.323 -4.799 -5.093 -5.43 -5.787 -6.148 -6.614 -7.285 -9.376 -10 ,13286 ,TETRA ,17591299,Sat Nov 27 22:34:56 CET,Sun Nov 28 00:23:43 CET,0.0 2.341 3.007 3.463 3.855 4.201 4.506 4.783 5.253 5.456 5.644 5.626 6.136 6.293 6.603 6.899 7.152 7.266 7.492 7.712 8.023 8.219 8.401 8.655 8.903 9.155 9.393 9.607 9.87 10.126 10.368 10.637 10.878 11.125 11.42 11.734 12.041 12.359 12.683 13.037 13.414 13.769 14.101 14.437 14.806 15.168 15.508 15.812 16.02 16.0 15.455 14.376 13.3 12.268 11.258 10.315 9.486 8.728 8.087 7.434 6.84 6.311 5.81 5.319 4.846 4.42 3.987 3.608 3.258 2.887 2.519 2.21 1.901 1.575 1.302 1.016 0.727 0.438 0.13 -0.093 -0.314 -0.682 -0.934 -1.185 -1.322 -1.622 -1.952 -2.31 -2.496 -3.03 -3.047 -3.246 -3.454 -3.961 -4.247 -4.537 -4.887 -5.319 -5.802 -6.473 -8.334 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt deleted file mode 100644 index 44529be1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2658 ,TETRA ,17591300,Sat Nov 27 22:34:56 CET,Sun Nov 28 00:24:02 CET,0.0 1.21 1.746 2.087 2.419 2.745 3.014 3.251 3.67 3.863 4.046 4.025 4.564 4.721 5.02 5.31 5.583 5.725 6.004 6.262 6.611 6.825 7.039 7.358 7.663 7.951 8.234 8.516 8.864 9.199 9.53 9.924 10.293 10.641 11.062 11.542 11.992 12.475 12.974 13.519 14.12 14.771 15.507 16.245 17.084 18.016 19.112 20.313 21.668 23.179 24.781 25.792 26.137 26.18 26.071 25.871 25.605 25.293 24.975 24.646 24.337 24.008 23.666 23.328 23.016 22.733 22.42 22.121 21.843 21.554 21.26 21.006 20.726 20.421 20.179 19.94 19.703 19.423 19.12 18.909 18.675 18.329 18.093 17.828 17.688 17.39 17.069 16.733 16.558 16.035 16.014 15.795 15.568 15.076 14.807 14.49 14.107 13.665 13.042 12.116 9.964 -2 ,10781 ,TETRA ,17591301,Sat Nov 27 22:34:58 CET,Sun Nov 28 00:26:54 CET,0.0 2.558 3.258 3.658 3.97 4.25 4.5 4.733 5.165 5.363 5.555 5.539 6.082 6.244 6.557 6.862 7.152 7.289 7.545 7.787 8.128 8.338 8.544 8.857 9.171 9.474 9.763 10.048 10.41 10.739 11.066 11.46 11.836 12.212 12.632 13.096 13.549 14.027 14.532 15.075 15.652 16.319 17.077 17.809 18.675 19.652 20.705 21.834 23.127 24.609 26.268 27.294 27.598 27.623 27.498 27.291 27.042 26.762 26.451 26.101 25.809 25.515 25.189 24.852 24.514 24.203 23.883 23.591 23.329 23.056 22.77 22.528 22.262 21.977 21.755 21.521 21.254 20.962 20.677 20.478 20.272 19.933 19.703 19.458 19.325 19.052 18.754 18.417 18.231 17.688 17.618 17.391 17.169 16.663 16.366 16.052 15.691 15.292 14.804 14.123 12.219 -3 ,19868 ,TETRA ,17591302,Sat Nov 27 22:35:00 CET,Sun Nov 28 00:25:55 CET,0.0 1.159 1.7 2.118 2.47 2.768 3.034 3.284 3.718 3.906 4.086 4.072 4.614 4.774 5.09 5.399 5.675 5.807 6.07 6.309 6.651 6.879 7.107 7.424 7.707 7.981 8.264 8.54 8.883 9.221 9.554 9.944 10.322 10.692 11.119 11.589 12.031 12.523 13.056 13.625 14.224 14.879 15.626 16.375 17.236 18.174 19.264 20.49 21.864 23.327 24.866 25.888 26.282 26.357 26.212 25.912 25.592 25.308 25.005 24.636 24.29 23.977 23.668 23.351 23.048 22.767 22.443 22.13 21.88 21.617 21.318 21.063 20.794 20.509 20.289 20.054 19.785 19.508 19.218 19.01 18.797 18.449 18.192 17.914 17.776 17.494 17.194 16.881 16.716 16.197 16.197 15.983 15.739 15.218 14.932 14.6 14.248 13.844 13.348 12.677 10.792 -4 ,28774 ,TETRA ,17591303,Sat Nov 27 22:34:57 CET,Sun Nov 28 00:27:09 CET,0.0 1.201 1.725 2.117 2.43 2.697 2.934 3.168 3.593 3.792 3.979 3.935 4.462 4.615 4.913 5.208 5.49 5.623 5.884 6.137 6.504 6.733 6.941 7.247 7.544 7.837 8.123 8.391 8.726 9.052 9.371 9.76 10.145 10.508 10.92 11.376 11.807 12.304 12.833 13.379 13.965 14.615 15.368 16.102 16.955 17.923 18.998 20.167 21.502 22.978 24.561 25.609 25.971 25.981 25.804 25.548 25.25 24.924 24.596 24.224 23.879 23.536 23.195 22.87 22.555 22.246 21.89 21.568 21.313 21.047 20.75 20.497 20.227 19.934 19.687 19.434 19.177 18.9 18.613 18.42 18.217 17.886 17.658 17.409 17.278 17.001 16.697 16.377 16.204 15.679 15.668 15.46 15.243 14.746 14.45 14.136 13.799 13.409 12.9 12.216 10.353 -5 ,24747 ,TETRA ,17591304,Sat Nov 27 22:34:59 CET,Sun Nov 28 00:26:55 CET,0.0 1.406 1.896 2.289 2.608 2.913 3.18 3.427 3.886 4.087 4.278 4.248 4.797 4.969 5.268 5.552 5.821 5.949 6.202 6.439 6.775 6.994 7.201 7.505 7.806 8.096 8.374 8.636 8.976 9.31 9.632 10.002 10.357 10.726 11.153 11.627 12.102 12.617 13.155 13.715 14.283 14.919 15.673 16.431 17.312 18.298 19.391 20.547 21.852 23.333 24.927 25.984 26.353 26.376 26.256 26.018 25.687 25.325 24.985 24.649 24.319 23.961 23.622 23.32 23.026 22.736 22.411 22.106 21.833 21.543 21.234 20.964 20.694 20.419 20.193 19.942 19.677 19.403 19.113 18.922 18.719 18.382 18.138 17.883 17.76 17.477 17.157 16.84 16.67 16.143 16.106 15.892 15.673 15.157 14.871 14.58 14.245 13.833 13.333 12.641 10.586 -6 ,4838 ,TETRA ,17591305,Sat Nov 27 22:35:01 CET,Sun Nov 28 00:25:17 CET,0.0 0.885 1.415 1.817 2.159 2.448 2.699 2.932 3.35 3.537 3.724 3.72 4.26 4.423 4.726 5.007 5.284 5.419 5.685 5.943 6.285 6.503 6.72 7.027 7.336 7.64 7.923 8.195 8.535 8.863 9.179 9.555 9.912 10.263 10.677 11.132 11.557 12.026 12.556 13.124 13.713 14.382 15.163 15.922 16.778 17.697 18.748 19.95 21.335 22.838 24.391 25.394 25.755 25.772 25.577 25.327 25.069 24.762 24.449 24.076 23.728 23.399 23.053 22.727 22.44 22.161 21.841 21.552 21.302 21.03 20.718 20.451 20.182 19.901 19.688 19.455 19.196 18.936 18.675 18.484 18.259 17.895 17.647 17.393 17.258 16.964 16.651 16.305 16.121 15.591 15.567 15.346 15.114 14.625 14.346 14.052 13.743 13.352 12.866 12.189 10.179 -7 ,5187 ,TETRA ,17591306,Sat Nov 27 22:34:58 CET,Sun Nov 28 00:24:57 CET,0.0 1.406 1.93 2.318 2.639 2.95 3.23 3.476 3.912 4.101 4.289 4.289 4.84 5.015 5.335 5.624 5.901 6.033 6.296 6.549 6.888 7.104 7.327 7.649 7.944 8.218 8.479 8.746 9.112 9.451 9.769 10.161 10.538 10.885 11.278 11.721 12.151 12.647 13.176 13.713 14.283 14.946 15.697 16.438 17.305 18.254 19.355 20.598 21.981 23.518 25.18 26.241 26.652 26.7 26.55 26.305 26.051 25.766 25.468 25.131 24.77 24.44 24.131 23.817 23.506 23.197 22.872 22.586 22.32 22.032 21.726 21.467 21.209 20.938 20.71 20.467 20.218 19.942 19.629 19.406 19.185 18.85 18.61 18.359 18.232 17.961 17.665 17.336 17.158 16.627 16.623 16.429 16.216 15.735 15.461 15.159 14.807 14.389 13.894 13.255 11.399 -8 ,18267 ,TETRA ,17591307,Sat Nov 27 21:59:39 CET,Sat Nov 27 23:44:50 CET,0.0 1.23 1.706 2.06 2.383 2.676 2.931 3.171 3.618 3.822 4.02 4.019 4.562 4.732 5.052 5.349 5.633 5.769 6.024 6.264 6.607 6.829 7.04 7.342 7.64 7.929 8.215 8.486 8.827 9.151 9.471 9.861 10.232 10.583 10.99 11.458 11.894 12.373 12.891 13.436 14.008 14.657 15.421 16.183 17.065 18.007 19.036 20.193 21.52 22.989 24.584 25.667 26.085 26.171 26.069 25.844 25.552 25.252 24.963 24.606 24.271 23.964 23.616 23.26 22.938 22.641 22.323 22.01 21.728 21.431 21.119 20.861 20.596 20.317 20.086 19.84 19.574 19.291 19.017 18.83 18.616 18.273 18.049 17.822 17.693 17.41 17.111 16.776 16.593 16.056 16.018 15.801 15.572 15.066 14.777 14.468 14.125 13.692 13.122 12.429 9.692 -9 ,1726 ,TETRA ,17591308,Sat Nov 27 21:59:39 CET,Sat Nov 27 23:55:08 CET,0.0 1.021 1.564 1.973 2.312 2.594 2.839 3.077 3.508 3.694 3.879 3.881 4.423 4.585 4.905 5.201 5.465 5.59 5.837 6.082 6.449 6.684 6.914 7.241 7.539 7.823 8.093 8.359 8.712 9.037 9.347 9.737 10.112 10.463 10.899 11.415 11.879 12.374 12.932 13.502 14.07 14.718 15.451 16.185 17.057 18.015 19.114 20.333 21.709 23.259 24.933 25.99 26.347 26.399 26.295 26.076 25.787 25.495 25.213 24.897 24.574 24.255 23.94 23.621 23.305 23.02 22.729 22.432 22.154 21.865 21.578 21.334 21.066 20.785 20.553 20.307 20.055 19.796 19.514 19.311 19.102 18.769 18.53 18.285 18.156 17.874 17.566 17.227 17.049 16.52 16.504 16.289 16.06 15.585 15.325 15.027 14.677 14.229 13.679 13.03 11.222 -10 ,17373 ,TETRA ,17591309,Sat Nov 27 22:34:58 CET,Sun Nov 28 00:24:35 CET,0.0 1.588 2.174 2.571 2.898 3.18 3.431 3.661 4.107 4.315 4.498 4.459 4.995 5.15 5.446 5.739 6.016 6.145 6.398 6.651 6.993 7.211 7.431 7.743 8.054 8.352 8.622 8.893 9.245 9.57 9.89 10.268 10.644 11.015 11.43 11.899 12.347 12.844 13.412 14.015 14.6 15.243 16.012 16.789 17.649 18.598 19.715 20.904 22.234 23.752 25.401 26.456 26.81 26.869 26.768 26.557 26.268 25.933 25.62 25.285 24.969 24.656 24.332 24.012 23.688 23.367 23.042 22.746 22.469 22.202 21.921 21.66 21.375 21.057 20.805 20.561 20.325 20.06 19.775 19.581 19.374 19.026 18.767 18.505 18.379 18.103 17.801 17.491 17.33 16.801 16.763 16.559 16.333 15.831 15.545 15.244 14.905 14.492 13.958 13.216 11.354 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt deleted file mode 100644 index e3a365ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2443 ,TETRA ,17591310,Sat Nov 27 22:34:59 CET,Sun Nov 28 00:24:20 CET,0.0 2.09 2.737 3.248 3.611 3.943 4.277 4.576 5.06 5.279 5.499 5.549 6.104 6.282 6.638 6.973 7.274 7.419 7.694 7.962 8.352 8.608 8.858 9.202 9.54 9.874 10.189 10.505 10.924 11.327 11.717 12.175 12.605 13.013 13.479 14.006 14.519 15.094 15.709 16.341 17.0 17.743 18.632 19.51 20.503 21.644 22.96 24.369 25.945 27.758 29.728 31.061 31.586 31.669 31.506 31.247 30.95 30.65 30.342 29.976 29.637 29.294 28.931 28.579 28.246 27.918 27.569 27.267 27.006 26.705 26.36 26.084 25.795 25.494 25.252 24.986 24.72 24.43 24.126 23.919 23.701 23.355 23.099 22.835 22.699 22.403 22.086 21.728 21.538 20.993 20.889 20.655 20.394 19.76 19.41 19.04 18.632 18.165 17.582 16.774 14.029 -2 ,22541 ,TETRA ,17591311,Sat Nov 27 22:35:01 CET,Sun Nov 28 00:24:32 CET,0.0 1.767 2.396 2.916 3.327 3.69 4.01 4.305 4.843 5.086 5.325 5.407 5.971 6.157 6.528 6.871 7.188 7.337 7.632 7.92 8.322 8.57 8.811 9.185 9.554 9.904 10.233 10.552 10.978 11.379 11.766 12.241 12.67 13.057 13.512 14.045 14.568 15.167 15.824 16.491 17.159 17.914 18.809 19.688 20.713 21.862 23.166 24.593 26.171 27.903 29.816 31.155 31.706 31.81 31.671 31.469 31.191 30.863 30.542 30.181 29.846 29.522 29.176 28.837 28.508 28.193 27.857 27.538 27.257 26.955 26.611 26.332 26.054 25.748 25.504 25.237 24.963 24.682 24.388 24.173 23.934 23.542 23.262 22.97 22.828 22.545 22.213 21.858 21.673 21.128 21.052 20.835 20.601 20.066 19.748 19.381 18.994 18.565 17.976 17.183 14.425 -3 ,19648 ,TETRA ,17591312,Sat Nov 27 22:35:04 CET,Sun Nov 28 00:24:22 CET,0.0 2.146 2.775 3.181 3.521 3.837 4.155 4.465 4.977 5.199 5.428 5.504 6.064 6.247 6.611 6.957 7.301 7.464 7.772 8.074 8.498 8.766 9.023 9.369 9.703 10.038 10.351 10.666 11.076 11.459 11.836 12.293 12.715 13.121 13.6 14.139 14.648 15.205 15.817 16.452 17.11 17.876 18.77 19.678 20.753 21.9 23.18 24.626 26.229 27.983 30.001 31.352 31.808 31.915 31.814 31.594 31.357 31.063 30.728 30.351 30.0 29.683 29.34 28.971 28.624 28.3 27.949 27.62 27.331 27.026 26.686 26.411 26.133 25.823 25.568 25.299 25.026 24.74 24.431 24.215 23.98 23.594 23.327 23.037 22.886 22.584 22.274 21.945 21.762 21.226 21.159 20.918 20.663 20.13 19.803 19.404 18.984 18.474 17.833 16.954 13.313 -4 ,2810 ,TETRA ,17591313,Sat Nov 27 22:34:58 CET,Sun Nov 28 00:24:44 CET,0.0 1.881 2.538 3.064 3.47 3.799 4.108 4.389 4.918 5.173 5.415 5.483 6.044 6.221 6.562 6.883 7.182 7.333 7.647 7.946 8.346 8.586 8.819 9.182 9.545 9.899 10.241 10.557 10.945 11.316 11.677 12.134 12.567 12.955 13.411 13.946 14.45 14.989 15.593 16.263 16.966 17.736 18.589 19.465 20.514 21.677 22.995 24.451 26.126 27.96 29.894 31.17 31.714 31.849 31.746 31.489 31.14 30.767 30.422 30.062 29.741 29.422 29.084 28.743 28.418 28.105 27.769 27.455 27.177 26.902 26.598 26.315 26.007 25.699 25.453 25.183 24.899 24.602 24.284 24.063 23.836 23.48 23.221 22.935 22.783 22.463 22.12 21.756 21.571 21.041 20.982 20.755 20.527 19.999 19.678 19.311 18.905 18.451 17.817 16.993 14.049 -5 ,28523 ,TETRA ,17591314,Sat Nov 27 22:35:02 CET,Sun Nov 28 00:25:11 CET,0.0 1.768 2.456 2.955 3.341 3.675 3.967 4.243 4.754 4.978 5.189 5.249 5.829 6.029 6.411 6.757 7.079 7.232 7.522 7.815 8.246 8.512 8.758 9.107 9.451 9.792 10.119 10.43 10.831 11.201 11.557 12.015 12.465 12.888 13.388 13.963 14.498 15.065 15.674 16.348 17.064 17.835 18.704 19.578 20.576 21.683 22.985 24.426 26.024 27.834 29.848 31.099 31.537 31.649 31.564 31.309 30.976 30.646 30.34 30.007 29.687 29.371 29.047 28.72 28.409 28.115 27.806 27.514 27.238 26.945 26.62 26.341 26.039 25.713 25.47 25.203 24.916 24.605 24.27 24.042 23.803 23.415 23.131 22.84 22.684 22.359 22.03 21.687 21.504 20.96 20.865 20.627 20.385 19.817 19.487 19.118 18.709 18.246 17.675 16.919 13.285 -6 ,6461 ,TETRA ,17591315,Sat Nov 27 22:34:59 CET,Sun Nov 28 00:24:19 CET,0.0 1.892 2.48 2.943 3.31 3.61 3.88 4.148 4.646 4.885 5.103 5.124 5.69 5.881 6.235 6.559 6.859 7.001 7.286 7.576 8.006 8.279 8.538 8.903 9.246 9.572 9.886 10.203 10.618 11.019 11.405 11.844 12.259 12.672 13.159 13.705 14.223 14.804 15.445 16.118 16.794 17.55 18.448 19.346 20.37 21.555 22.937 24.399 26.046 27.928 29.981 31.329 31.865 31.961 31.838 31.61 31.286 30.914 30.547 30.168 29.83 29.482 29.135 28.805 28.485 28.182 27.848 27.529 27.236 26.92 26.589 26.332 26.056 25.759 25.521 25.243 24.952 24.661 24.34 24.114 23.883 23.52 23.245 22.952 22.812 22.52 22.188 21.817 21.607 21.039 20.95 20.722 20.464 19.894 19.59 19.231 18.835 18.412 17.875 17.075 14.227 -7 ,23144 ,TETRA ,17591316,Sat Nov 27 22:35:00 CET,Sun Nov 28 00:23:56 CET,0.0 2.234 2.881 3.357 3.743 4.08 4.385 4.674 5.174 5.392 5.612 5.646 6.212 6.396 6.737 7.084 7.413 7.557 7.845 8.128 8.532 8.792 9.04 9.407 9.748 10.071 10.385 10.686 11.077 11.465 11.85 12.293 12.721 13.144 13.616 14.141 14.674 15.28 15.917 16.574 17.26 18.02 18.866 19.719 20.731 21.854 23.106 24.496 26.126 27.984 30.04 31.362 31.827 31.899 31.765 31.518 31.222 30.883 30.547 30.164 29.803 29.475 29.143 28.812 28.494 28.174 27.823 27.519 27.221 26.883 26.532 26.238 25.936 25.615 25.364 25.1 24.811 24.51 24.204 23.983 23.756 23.408 23.145 22.861 22.722 22.441 22.113 21.745 21.555 21.016 20.945 20.703 20.448 19.906 19.571 19.206 18.84 18.399 17.783 16.851 13.39 -8 ,28414 ,TETRA ,17591317,Sat Nov 27 22:34:59 CET,Sun Nov 28 00:24:12 CET,0.0 2.233 2.933 3.472 3.859 4.185 4.481 4.767 5.323 5.586 5.812 5.84 6.404 6.604 6.967 7.295 7.62 7.777 8.071 8.349 8.75 9.008 9.256 9.621 9.987 10.337 10.673 11.003 11.426 11.831 12.212 12.658 13.088 13.505 13.993 14.552 15.069 15.625 16.239 16.892 17.567 18.338 19.245 20.15 21.178 22.273 23.584 25.045 26.617 28.361 30.375 31.649 32.147 32.285 32.189 31.976 31.687 31.329 30.965 30.624 30.315 29.982 29.643 29.301 28.959 28.642 28.304 27.995 27.717 27.415 27.093 26.828 26.546 26.24 25.999 25.748 25.467 25.158 24.849 24.635 24.418 24.079 23.824 23.543 23.394 23.069 22.709 22.33 22.131 21.573 21.486 21.256 21.014 20.469 20.156 19.796 19.368 18.881 18.235 17.319 14.597 -9 ,9116 ,TETRA ,17591318,Sat Nov 27 22:35:00 CET,Sun Nov 28 00:24:20 CET,0.0 2.54 3.242 3.74 4.163 4.536 4.849 5.135 5.695 5.941 6.162 6.224 6.799 6.99 7.352 7.692 8.009 8.171 8.486 8.777 9.189 9.443 9.69 10.062 10.421 10.767 11.104 11.417 11.818 12.227 12.622 13.068 13.479 13.903 14.421 14.992 15.526 16.073 16.661 17.305 17.985 18.762 19.664 20.531 21.532 22.654 23.901 25.32 26.985 28.846 30.87 32.226 32.762 32.866 32.734 32.482 32.192 31.868 31.538 31.183 30.846 30.501 30.158 29.843 29.521 29.19 28.839 28.54 28.275 27.97 27.646 27.379 27.1 26.795 26.545 26.281 25.997 25.704 25.395 25.179 24.963 24.619 24.363 24.065 23.909 23.595 23.231 22.843 22.647 22.097 22.013 21.772 21.514 20.964 20.628 20.261 19.877 19.41 18.815 17.979 15.041 -10 ,21406 ,TETRA ,17591319,Sat Nov 27 22:35:02 CET,Sun Nov 28 00:24:18 CET,0.0 2.075 2.743 3.216 3.598 3.975 4.302 4.583 5.115 5.366 5.604 5.676 6.252 6.447 6.806 7.148 7.471 7.629 7.94 8.226 8.626 8.886 9.127 9.474 9.813 10.148 10.47 10.784 11.17 11.54 11.912 12.341 12.761 13.179 13.663 14.19 14.695 15.262 15.861 16.498 17.161 17.929 18.83 19.702 20.697 21.794 23.097 24.561 26.179 28.051 30.175 31.521 32.062 32.219 32.16 32.013 31.797 31.473 31.105 30.71 30.351 30.02 29.69 29.349 29.014 28.715 28.38 28.054 27.777 27.481 27.17 26.919 26.643 26.337 26.097 25.844 25.577 25.293 24.995 24.78 24.555 24.206 23.957 23.677 23.525 23.228 22.912 22.553 22.365 21.834 21.777 21.539 21.289 20.741 20.434 20.095 19.685 19.169 18.563 17.787 14.624 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index b7df5ef6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20064 ,TETRA ,17591320,Sat Nov 27 22:35:04 CET,Sun Nov 28 00:23:57 CET,0.0 1.042 1.456 1.8 2.078 2.342 2.581 2.786 3.172 3.349 3.51 3.46 3.954 4.094 4.355 4.597 4.828 4.939 5.154 5.36 5.649 5.831 6.017 6.28 6.53 6.773 6.982 7.194 7.488 7.759 8.02 8.323 8.6 8.877 9.196 9.547 9.889 10.259 10.635 11.023 11.452 11.947 12.473 12.974 13.568 14.233 14.967 15.69 16.455 17.255 18.001 18.294 18.177 17.876 17.484 17.059 16.648 16.236 15.871 15.478 15.123 14.818 14.485 14.163 13.879 13.599 13.296 13.026 12.785 12.513 12.216 11.981 11.745 11.498 11.302 11.086 10.847 10.601 10.354 10.171 9.984 9.691 9.481 9.26 9.149 8.91 8.642 8.358 8.203 7.691 7.693 7.521 7.339 6.916 6.69 6.449 6.184 5.861 5.444 4.858 3.101 -2 ,30109 ,TETRA ,17591321,Sat Nov 27 22:34:59 CET,Sun Nov 28 00:23:46 CET,0.0 1.104 1.553 1.871 2.135 2.401 2.648 2.865 3.241 3.42 3.595 3.571 4.077 4.216 4.486 4.751 4.995 5.107 5.327 5.534 5.814 6.0 6.182 6.425 6.661 6.894 7.121 7.338 7.621 7.897 8.15 8.458 8.744 9.003 9.301 9.636 9.968 10.332 10.71 11.102 11.512 11.957 12.478 13.015 13.587 14.185 14.892 15.641 16.45 17.3 18.086 18.387 18.298 18.093 17.764 17.373 16.993 16.613 16.275 15.899 15.54 15.209 14.906 14.598 14.276 13.972 13.642 13.347 13.101 12.859 12.595 12.359 12.1 11.813 11.594 11.383 11.166 10.939 10.696 10.531 10.359 10.076 9.875 9.664 9.556 9.323 9.073 8.81 8.665 8.168 8.197 8.025 7.844 7.447 7.224 6.976 6.71 6.389 5.976 5.41 3.688 -3 ,8022 ,TETRA ,17591322,Sat Nov 27 22:35:04 CET,Sun Nov 28 00:24:13 CET,0.0 1.052 1.473 1.788 2.074 2.367 2.614 2.825 3.222 3.402 3.571 3.519 4.012 4.152 4.423 4.683 4.918 5.03 5.243 5.447 5.751 5.94 6.124 6.396 6.646 6.879 7.111 7.328 7.597 7.852 8.096 8.399 8.695 8.97 9.285 9.662 10.046 10.435 10.816 11.201 11.612 12.076 12.59 13.121 13.723 14.351 15.036 15.755 16.532 17.352 18.081 18.295 18.166 17.876 17.511 17.11 16.721 16.348 16.002 15.602 15.225 14.894 14.578 14.268 13.983 13.722 13.434 13.179 12.947 12.679 12.407 12.181 11.931 11.677 11.471 11.248 11.013 10.772 10.531 10.357 10.169 9.877 9.662 9.432 9.313 9.069 8.82 8.55 8.403 7.899 7.905 7.727 7.543 7.124 6.897 6.657 6.39 6.073 5.697 5.117 3.235 -4 ,408 ,TETRA ,17591323,Sat Nov 27 22:35:00 CET,Sun Nov 28 00:26:12 CET,0.0 1.375 1.803 2.122 2.412 2.675 2.902 3.107 3.483 3.662 3.826 3.786 4.292 4.431 4.674 4.912 5.147 5.261 5.467 5.672 5.981 6.169 6.35 6.605 6.84 7.062 7.284 7.509 7.798 8.064 8.325 8.64 8.922 9.189 9.502 9.86 10.225 10.609 10.986 11.399 11.836 12.315 12.851 13.371 13.969 14.589 15.247 15.962 16.731 17.503 18.214 18.447 18.325 18.045 17.664 17.29 16.91 16.513 16.153 15.766 15.421 15.1 14.783 14.474 14.178 13.894 13.591 13.315 13.065 12.807 12.537 12.308 12.053 11.776 11.56 11.347 11.126 10.883 10.622 10.446 10.261 9.947 9.725 9.507 9.396 9.174 8.932 8.64 8.485 7.985 7.991 7.813 7.629 7.224 6.989 6.731 6.417 6.066 5.703 5.203 3.765 -5 ,18905 ,TETRA ,17591324,Sat Nov 27 22:35:02 CET,Sun Nov 28 00:26:00 CET,0.0 1.407 1.929 2.302 2.598 2.854 3.084 3.299 3.708 3.88 4.04 3.991 4.496 4.653 4.915 5.156 5.387 5.506 5.738 5.956 6.257 6.436 6.612 6.868 7.107 7.339 7.568 7.797 8.093 8.364 8.628 8.948 9.243 9.53 9.859 10.206 10.535 10.885 11.268 11.669 12.077 12.532 13.034 13.542 14.134 14.768 15.451 16.162 16.955 17.768 18.455 18.704 18.591 18.345 18.04 17.669 17.294 16.916 16.565 16.189 15.836 15.505 15.171 14.86 14.552 14.263 13.975 13.707 13.475 13.232 12.963 12.735 12.46 12.169 11.961 11.74 11.511 11.283 11.048 10.876 10.689 10.384 10.171 9.956 9.841 9.604 9.355 9.072 8.918 8.41 8.421 8.244 8.06 7.665 7.433 7.176 6.895 6.582 6.208 5.693 4.079 -6 ,27273 ,TETRA ,17591325,Sat Nov 27 22:35:27 CET,Sun Nov 28 00:24:35 CET,0.0 1.158 1.636 2.003 2.308 2.585 2.824 3.042 3.443 3.62 3.782 3.75 4.25 4.391 4.669 4.916 5.134 5.242 5.46 5.67 5.974 6.158 6.328 6.585 6.835 7.067 7.283 7.496 7.764 8.018 8.274 8.567 8.851 9.132 9.448 9.8 10.14 10.51 10.901 11.321 11.755 12.213 12.709 13.201 13.793 14.419 15.079 15.797 16.583 17.41 18.138 18.337 18.185 17.877 17.471 17.065 16.696 16.316 15.969 15.609 15.264 14.927 14.61 14.3 13.988 13.704 13.411 13.146 12.905 12.651 12.387 12.165 11.924 11.669 11.471 11.259 11.033 10.791 10.538 10.353 10.171 9.893 9.699 9.494 9.382 9.147 8.902 8.636 8.489 7.979 7.975 7.791 7.592 7.176 6.958 6.702 6.414 6.097 5.707 5.175 3.512 -7 ,7421 ,TETRA ,17591326,Sat Nov 27 22:35:29 CET,Sun Nov 28 00:24:26 CET,0.0 1.753 2.254 2.611 2.913 3.201 3.441 3.643 4.03 4.219 4.394 4.367 4.876 5.029 5.317 5.578 5.829 5.945 6.161 6.375 6.684 6.873 7.05 7.307 7.554 7.789 8.006 8.225 8.513 8.775 9.027 9.337 9.626 9.907 10.241 10.595 10.918 11.27 11.655 12.053 12.486 12.967 13.479 13.983 14.582 15.217 15.919 16.691 17.456 18.191 18.886 19.153 19.003 18.655 18.26 17.864 17.485 17.077 16.705 16.332 15.991 15.67 15.345 15.023 14.705 14.419 14.135 13.861 13.62 13.363 13.085 12.847 12.593 12.333 12.125 11.899 11.672 11.447 11.202 11.028 10.843 10.552 10.344 10.124 10.016 9.781 9.528 9.259 9.108 8.615 8.648 8.476 8.29 7.846 7.607 7.323 7.019 6.694 6.291 5.729 3.748 -8 ,1827 ,TETRA ,17591327,Sat Nov 27 22:35:30 CET,Sun Nov 28 00:24:45 CET,0.0 1.672 2.176 2.562 2.87 3.142 3.381 3.602 4.012 4.185 4.347 4.313 4.819 4.968 5.246 5.495 5.727 5.839 6.055 6.276 6.586 6.774 6.964 7.232 7.478 7.722 7.955 8.171 8.441 8.694 8.942 9.244 9.545 9.842 10.179 10.536 10.877 11.246 11.631 12.032 12.454 12.942 13.489 14.017 14.611 15.25 15.915 16.607 17.38 18.154 18.85 19.071 18.944 18.63 18.237 17.801 17.371 16.953 16.595 16.197 15.822 15.504 15.193 14.871 14.555 14.263 13.95 13.681 13.442 13.175 12.882 12.647 12.395 12.114 11.909 11.704 11.486 11.259 11.016 10.839 10.643 10.326 10.116 9.895 9.778 9.551 9.313 9.053 8.912 8.417 8.434 8.254 8.072 7.665 7.445 7.204 6.887 6.527 6.125 5.488 3.809 -9 ,25781 ,TETRA ,17591328,Sat Nov 27 22:35:33 CET,Sun Nov 28 00:24:28 CET,0.0 1.501 2.004 2.347 2.621 2.862 3.101 3.326 3.703 3.875 4.049 4.025 4.522 4.655 4.932 5.209 5.461 5.577 5.804 6.017 6.304 6.491 6.673 6.924 7.178 7.421 7.644 7.862 8.14 8.416 8.686 8.991 9.287 9.566 9.878 10.229 10.555 10.916 11.297 11.7 12.121 12.589 13.128 13.636 14.219 14.86 15.544 16.234 16.992 17.821 18.539 18.765 18.612 18.34 18.013 17.632 17.259 16.882 16.505 16.109 15.748 15.418 15.113 14.828 14.558 14.291 13.986 13.705 13.462 13.21 12.929 12.687 12.432 12.164 11.954 11.741 11.527 11.3 11.061 10.889 10.708 10.42 10.228 10.023 9.909 9.682 9.431 9.152 9.008 8.514 8.531 8.357 8.161 7.733 7.494 7.224 6.912 6.558 6.133 5.535 4.109 -10 ,8266 ,TETRA ,17591329,Sat Nov 27 22:35:27 CET,Sun Nov 28 00:24:31 CET,0.0 1.431 1.889 2.217 2.512 2.797 3.059 3.295 3.709 3.899 4.078 4.056 4.552 4.694 4.967 5.206 5.432 5.547 5.762 5.968 6.267 6.458 6.634 6.889 7.144 7.376 7.599 7.822 8.106 8.385 8.646 8.943 9.23 9.508 9.831 10.169 10.474 10.828 11.21 11.61 12.04 12.506 13.02 13.535 14.115 14.742 15.453 16.188 16.96 17.751 18.491 18.792 18.696 18.432 18.088 17.714 17.347 16.981 16.64 16.294 15.969 15.637 15.323 15.019 14.708 14.413 14.08 13.788 13.55 13.293 13.016 12.775 12.522 12.26 12.048 11.835 11.611 11.373 11.125 10.953 10.769 10.452 10.234 10.011 9.892 9.661 9.416 9.139 8.994 8.503 8.529 8.353 8.163 7.722 7.455 7.166 6.843 6.469 6.077 5.535 3.841 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt deleted file mode 100644 index 10753a32..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14972 ,TETRA ,17591330,Sat Nov 27 22:35:30 CET,Sun Nov 28 00:25:37 CET,0.0 1.503 2.011 2.385 2.699 2.949 3.151 3.348 3.736 3.914 4.078 4.033 4.525 4.667 4.922 5.149 5.382 5.494 5.697 5.899 6.188 6.362 6.531 6.78 7.017 7.232 7.429 7.62 7.887 8.146 8.395 8.698 8.97 9.219 9.52 9.865 10.192 10.54 10.897 11.269 11.641 12.051 12.54 13.036 13.587 14.159 14.792 15.439 16.124 16.838 17.389 17.498 17.276 16.902 16.469 16.011 15.594 15.19 14.8 14.378 13.984 13.631 13.313 13.0 12.694 12.411 12.108 11.834 11.588 11.342 11.088 10.863 10.62 10.361 10.144 9.89 9.623 9.362 9.095 8.909 8.72 8.422 8.208 7.978 7.861 7.618 7.352 7.073 6.922 6.416 6.413 6.222 6.025 5.623 5.388 5.111 4.798 4.446 4.08 3.534 1.37 -2 ,25098 ,TETRA ,17591331,Sat Nov 27 22:35:28 CET,Sun Nov 28 00:24:01 CET,0.0 1.253 1.737 2.082 2.351 2.604 2.829 3.031 3.41 3.583 3.746 3.688 4.178 4.325 4.587 4.808 5.023 5.137 5.36 5.564 5.849 6.035 6.207 6.445 6.689 6.927 7.15 7.354 7.618 7.874 8.116 8.404 8.67 8.935 9.238 9.573 9.9 10.245 10.6 10.981 11.382 11.798 12.261 12.733 13.266 13.841 14.474 15.11 15.784 16.467 16.997 17.076 16.828 16.424 15.977 15.505 15.046 14.604 14.182 13.722 13.308 12.942 12.591 12.258 11.958 11.69 11.403 11.152 10.919 10.652 10.362 10.113 9.872 9.617 9.402 9.171 8.926 8.656 8.379 8.199 8.012 7.719 7.513 7.296 7.182 6.938 6.664 6.379 6.24 5.74 5.733 5.544 5.337 4.906 4.675 4.412 4.138 3.794 3.388 2.889 0.95 -3 ,1011 ,TETRA ,17591332,Sat Nov 27 22:35:28 CET,Sun Nov 28 00:27:20 CET,0.0 1.191 1.707 2.102 2.405 2.67 2.898 3.098 3.453 3.613 3.766 3.703 4.192 4.33 4.587 4.826 5.058 5.17 5.382 5.582 5.872 6.056 6.234 6.49 6.734 6.966 7.186 7.386 7.64 7.884 8.121 8.423 8.693 8.944 9.255 9.594 9.911 10.258 10.623 11.004 11.376 11.782 12.261 12.727 13.24 13.775 14.359 14.966 15.578 16.243 16.799 16.719 16.43 16.09 15.698 15.272 14.836 14.399 13.984 13.529 13.129 12.779 12.437 12.108 11.79 11.495 11.184 10.89 10.613 10.315 10.008 9.735 9.462 9.211 9.017 8.8 8.564 8.288 7.995 7.807 7.618 7.321 7.114 6.895 6.769 6.501 6.235 5.943 5.785 5.272 5.254 5.067 4.872 4.403 4.132 3.839 3.547 3.228 2.825 2.289 -0.094 -4 ,15549 ,TETRA ,17591333,Sat Nov 27 22:35:30 CET,Sun Nov 28 00:27:44 CET,0.0 1.271 1.762 2.139 2.456 2.718 2.961 3.171 3.537 3.709 3.875 3.826 4.308 4.439 4.689 4.927 5.146 5.253 5.462 5.666 5.965 6.143 6.306 6.546 6.775 6.997 7.206 7.412 7.693 7.959 8.212 8.503 8.773 9.032 9.316 9.62 9.911 10.246 10.605 10.987 11.391 11.813 12.291 12.757 13.264 13.801 14.365 14.953 15.605 16.262 16.795 16.842 16.595 16.257 15.837 15.367 14.894 14.425 14.025 13.619 13.257 12.913 12.578 12.238 11.915 11.636 11.339 11.051 10.785 10.504 10.217 9.981 9.719 9.444 9.231 9.001 8.77 8.528 8.263 8.072 7.874 7.559 7.337 7.113 6.991 6.722 6.451 6.174 6.023 5.5 5.472 5.28 5.073 4.556 4.274 3.999 3.676 3.296 2.866 2.301 0.204 -5 ,15974 ,TETRA ,17591334,Sat Nov 27 22:35:32 CET,Sun Nov 28 00:24:26 CET,0.0 1.3 2.027 2.526 2.851 3.118 3.343 3.561 3.983 4.161 4.321 4.276 4.757 4.883 5.137 5.381 5.605 5.709 5.909 6.104 6.374 6.551 6.726 6.969 7.195 7.417 7.633 7.838 8.093 8.328 8.557 8.847 9.129 9.389 9.669 9.985 10.298 10.638 11.008 11.391 11.783 12.201 12.686 13.169 13.693 14.265 14.943 15.66 16.355 17.005 17.515 17.561 17.302 16.876 16.404 15.93 15.473 15.058 14.674 14.239 13.855 13.512 13.171 12.848 12.544 12.243 11.925 11.646 11.4 11.137 10.855 10.618 10.368 10.1 9.881 9.652 9.428 9.196 8.929 8.741 8.552 8.25 8.041 7.816 7.705 7.476 7.204 6.902 6.751 6.253 6.253 6.066 5.879 5.463 5.198 4.883 4.553 4.173 3.719 3.126 1.193 -6 ,25891 ,TETRA ,17591335,Sat Nov 27 22:35:33 CET,Sun Nov 28 00:24:13 CET,0.0 1.097 1.517 1.879 2.187 2.445 2.677 2.898 3.284 3.455 3.623 3.577 4.071 4.208 4.459 4.699 4.925 5.031 5.237 5.429 5.707 5.89 6.066 6.315 6.559 6.792 7.012 7.236 7.508 7.754 7.998 8.279 8.554 8.824 9.119 9.452 9.765 10.102 10.46 10.81 11.187 11.64 12.134 12.607 13.144 13.726 14.367 14.982 15.626 16.284 16.776 16.804 16.549 16.135 15.69 15.276 14.851 14.412 14.022 13.609 13.217 12.854 12.507 12.174 11.867 11.577 11.268 11.009 10.769 10.493 10.197 9.961 9.716 9.437 9.218 8.994 8.768 8.514 8.232 8.038 7.838 7.548 7.342 7.1 6.977 6.735 6.479 6.208 6.064 5.563 5.561 5.357 5.144 4.681 4.436 4.173 3.877 3.519 3.074 2.493 0.643 -7 ,28267 ,TETRA ,17591336,Sat Nov 27 22:35:29 CET,Sun Nov 28 00:24:12 CET,0.0 1.315 1.779 2.139 2.451 2.718 2.937 3.144 3.541 3.699 3.841 3.764 4.256 4.396 4.654 4.889 5.098 5.196 5.396 5.597 5.874 6.047 6.214 6.449 6.678 6.895 7.115 7.327 7.574 7.815 8.048 8.317 8.562 8.802 9.088 9.417 9.727 10.057 10.398 10.736 11.114 11.555 12.042 12.515 13.042 13.615 14.228 14.864 15.565 16.268 16.823 16.843 16.561 16.15 15.676 15.22 14.777 14.306 13.871 13.434 13.055 12.706 12.363 12.016 11.702 11.419 11.115 10.847 10.592 10.307 10.023 9.789 9.545 9.273 9.046 8.814 8.579 8.329 8.059 7.873 7.684 7.391 7.187 6.98 6.866 6.602 6.334 6.042 5.888 5.379 5.367 5.184 4.992 4.554 4.299 4.007 3.683 3.34 2.933 2.404 0.297 -8 ,28979 ,TETRA ,17591337,Sat Nov 27 22:35:30 CET,Sun Nov 28 00:24:14 CET,0.0 1.6 2.152 2.527 2.83 3.111 3.349 3.573 3.974 4.142 4.301 4.257 4.746 4.873 5.118 5.349 5.57 5.674 5.868 6.068 6.352 6.527 6.696 6.941 7.182 7.408 7.619 7.827 8.088 8.32 8.552 8.837 9.103 9.362 9.668 10.005 10.319 10.672 11.041 11.419 11.816 12.252 12.733 13.209 13.753 14.318 14.937 15.599 16.276 16.912 17.414 17.438 17.129 16.756 16.358 15.911 15.437 14.974 14.581 14.179 13.816 13.468 13.131 12.813 12.515 12.231 11.909 11.619 11.375 11.125 10.841 10.589 10.331 10.053 9.847 9.63 9.38 9.125 8.859 8.673 8.475 8.169 7.956 7.723 7.606 7.376 7.123 6.833 6.684 6.186 6.182 5.983 5.775 5.32 5.081 4.831 4.552 4.23 3.845 3.249 0.701 -9 ,23030 ,TETRA ,17591338,Sat Nov 27 22:35:33 CET,Sun Nov 28 00:24:20 CET,0.0 1.227 1.658 2.02 2.307 2.551 2.782 2.995 3.374 3.55 3.717 3.665 4.159 4.293 4.537 4.78 5.012 5.124 5.349 5.555 5.83 6.007 6.183 6.431 6.671 6.892 7.1 7.309 7.584 7.847 8.096 8.404 8.685 8.941 9.24 9.568 9.868 10.198 10.563 10.954 11.343 11.748 12.222 12.69 13.233 13.807 14.411 15.027 15.646 16.284 16.808 16.853 16.553 16.123 15.671 15.206 14.755 14.3 13.884 13.438 13.044 12.7 12.357 12.009 11.688 11.401 11.085 10.813 10.558 10.283 10.0 9.737 9.448 9.167 8.961 8.737 8.499 8.252 7.995 7.822 7.645 7.355 7.142 6.921 6.8 6.546 6.291 6.002 5.841 5.318 5.302 5.116 4.913 4.483 4.238 3.968 3.688 3.363 2.913 2.256 0.17 -10 ,30955 ,TETRA ,17591339,Sat Nov 27 22:35:29 CET,Sun Nov 28 00:24:06 CET,0.0 1.317 1.793 2.152 2.465 2.744 2.985 3.206 3.582 3.74 3.892 3.84 4.335 4.468 4.731 4.976 5.196 5.302 5.517 5.727 6.014 6.189 6.356 6.604 6.846 7.078 7.298 7.513 7.787 8.048 8.302 8.609 8.882 9.137 9.44 9.783 10.115 10.46 10.824 11.193 11.553 11.958 12.463 12.977 13.53 14.088 14.696 15.3 15.93 16.575 17.064 17.121 16.85 16.465 16.022 15.562 15.156 14.751 14.355 13.925 13.55 13.217 12.869 12.521 12.19 11.885 11.574 11.29 11.039 10.781 10.489 10.232 9.975 9.703 9.489 9.272 9.052 8.82 8.549 8.355 8.16 7.862 7.647 7.412 7.288 7.047 6.814 6.555 6.411 5.908 5.911 5.714 5.512 5.108 4.867 4.592 4.296 3.951 3.494 2.852 0.579 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index 6163e297..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22693 ,TETRA ,17591340,Sat Nov 27 22:35:29 CET,Sun Nov 28 00:25:31 CET,0.0 1.349 1.779 2.144 2.467 2.732 2.945 3.145 3.515 3.689 3.854 3.8 4.284 4.424 4.692 4.931 5.159 5.272 5.492 5.691 5.969 6.151 6.325 6.577 6.813 7.035 7.252 7.463 7.738 7.992 8.223 8.506 8.776 9.03 9.335 9.678 9.987 10.302 10.635 11.005 11.394 11.818 12.315 12.792 13.298 13.838 14.401 14.996 15.61 16.103 16.372 16.083 15.568 15.014 14.466 13.878 13.303 12.769 12.247 11.708 11.244 10.818 10.406 10.023 9.659 9.31 8.938 8.597 8.293 7.964 7.628 7.342 7.031 6.721 6.483 6.226 5.968 5.71 5.421 5.213 5.007 4.659 4.398 4.126 3.993 3.705 3.388 3.064 2.896 2.365 2.305 2.093 1.855 1.336 1.069 0.757 0.41 0.018 -0.442 -1.118 -3.751 -2 ,29853 ,TETRA ,17591341,Sat Nov 27 22:35:30 CET,Sun Nov 28 00:25:31 CET,0.0 2.139 2.733 3.083 3.375 3.647 3.889 4.1 4.483 4.671 4.847 4.805 5.28 5.41 5.66 5.892 6.1 6.207 6.432 6.645 6.94 7.126 7.307 7.562 7.805 8.041 8.262 8.468 8.739 9.008 9.244 9.512 9.777 10.04 10.348 10.685 11.011 11.356 11.717 12.092 12.454 12.849 13.343 13.817 14.29 14.78 15.33 15.92 16.555 17.126 17.421 17.144 16.633 16.038 15.385 14.759 14.188 13.639 13.147 12.648 12.218 11.815 11.408 11.022 10.635 10.265 9.893 9.565 9.255 8.936 8.611 8.323 8.036 7.743 7.497 7.25 6.994 6.7 6.394 6.186 5.97 5.625 5.386 5.109 4.959 4.668 4.368 4.066 3.908 3.391 3.324 3.101 2.883 2.408 2.125 1.805 1.468 1.073 0.573 -0.07 -2.523 -3 ,23623 ,TETRA ,17591342,Sat Nov 27 22:35:33 CET,Sun Nov 28 00:25:28 CET,0.0 1.291 1.78 2.103 2.413 2.741 3.005 3.208 3.57 3.746 3.92 3.877 4.363 4.499 4.752 5.003 5.242 5.35 5.556 5.763 6.067 6.249 6.415 6.664 6.911 7.147 7.373 7.586 7.847 8.104 8.352 8.629 8.9 9.173 9.477 9.806 10.108 10.437 10.812 11.194 11.573 11.998 12.483 12.945 13.454 14.001 14.593 15.181 15.75 16.269 16.625 16.457 16.024 15.512 14.949 14.408 13.881 13.358 12.876 12.387 11.981 11.62 11.23 10.815 10.418 10.068 9.703 9.362 9.071 8.773 8.453 8.175 7.886 7.595 7.358 7.095 6.812 6.521 6.211 5.99 5.771 5.419 5.167 4.92 4.796 4.53 4.244 3.913 3.729 3.203 3.175 2.975 2.751 2.245 2.004 1.719 1.36 0.939 0.411 -0.285 -2.858 -4 ,17611 ,TETRA ,17591343,Sat Nov 27 22:35:35 CET,Sun Nov 28 00:24:34 CET,0.0 1.123 1.682 2.088 2.402 2.657 2.891 3.105 3.509 3.701 3.863 3.82 4.3 4.425 4.685 4.931 5.161 5.268 5.466 5.667 5.966 6.145 6.313 6.567 6.804 7.039 7.264 7.465 7.718 7.977 8.224 8.518 8.813 9.077 9.373 9.712 10.038 10.381 10.735 11.107 11.487 11.921 12.414 12.878 13.403 13.991 14.619 15.24 15.872 16.441 16.783 16.598 16.17 15.613 15.059 14.48 13.879 13.359 12.941 12.456 11.988 11.554 11.112 10.7 10.322 9.961 9.589 9.247 8.955 8.657 8.319 8.039 7.744 7.434 7.204 6.967 6.703 6.428 6.149 5.934 5.702 5.339 5.079 4.814 4.686 4.436 4.121 3.787 3.616 3.098 3.082 2.866 2.632 2.124 1.846 1.559 1.238 0.837 0.314 -0.418 -3.157 -5 ,14516 ,TETRA ,17591344,Sat Nov 27 22:36:26 CET,Sun Nov 28 00:24:08 CET,0.0 2.408 3.021 3.384 3.697 3.958 4.188 4.397 4.776 4.952 5.122 5.079 5.564 5.701 5.952 6.193 6.431 6.543 6.74 6.931 7.208 7.379 7.544 7.786 8.017 8.244 8.464 8.675 8.951 9.21 9.459 9.759 10.032 10.281 10.559 10.877 11.184 11.514 11.883 12.276 12.635 13.046 13.551 14.023 14.526 15.047 15.63 16.237 16.863 17.401 17.643 17.4 16.896 16.287 15.669 15.069 14.513 13.972 13.471 12.959 12.498 12.077 11.681 11.289 10.883 10.498 10.109 9.759 9.455 9.147 8.828 8.553 8.262 7.954 7.699 7.421 7.131 6.846 6.547 6.339 6.116 5.76 5.529 5.285 5.149 4.865 4.563 4.238 4.075 3.565 3.565 3.368 3.144 2.636 2.355 2.055 1.687 1.255 0.816 0.194 -2.206 -6 ,17700 ,TETRA ,17591345,Sat Nov 27 22:36:28 CET,Sun Nov 28 00:24:38 CET,0.0 1.473 1.97 2.327 2.647 2.922 3.169 3.379 3.743 3.924 4.103 4.089 4.59 4.737 4.997 5.244 5.469 5.581 5.789 5.975 6.246 6.422 6.608 6.87 7.106 7.343 7.571 7.782 8.053 8.3 8.531 8.821 9.102 9.378 9.673 9.98 10.298 10.652 11.02 11.408 11.802 12.211 12.689 13.153 13.665 14.207 14.787 15.389 16.004 16.534 16.846 16.651 16.176 15.599 14.999 14.403 13.847 13.334 12.861 12.355 11.904 11.487 11.077 10.67 10.284 9.928 9.55 9.214 8.914 8.59 8.245 7.946 7.636 7.335 7.079 6.811 6.541 6.249 5.966 5.773 5.558 5.224 4.991 4.735 4.604 4.336 4.047 3.737 3.568 3.016 2.892 2.67 2.452 1.951 1.647 1.31 0.938 0.47 -0.092 -0.753 -3.508 -7 ,539 ,TETRA ,17591346,Sat Nov 27 22:36:30 CET,Sun Nov 28 00:24:22 CET,0.0 1.407 1.878 2.254 2.563 2.813 3.022 3.23 3.597 3.759 3.916 3.863 4.358 4.507 4.778 5.041 5.281 5.392 5.602 5.803 6.114 6.304 6.48 6.735 6.982 7.224 7.436 7.633 7.896 8.155 8.396 8.687 8.955 9.209 9.519 9.857 10.168 10.523 10.885 11.256 11.646 12.059 12.531 12.979 13.461 13.977 14.595 15.219 15.806 16.361 16.685 16.414 15.87 15.259 14.643 14.04 13.48 12.948 12.472 11.946 11.455 11.009 10.584 10.194 9.839 9.511 9.13 8.739 8.394 8.041 7.678 7.389 7.096 6.791 6.54 6.271 5.999 5.71 5.4 5.188 4.978 4.628 4.378 4.12 3.98 3.702 3.391 3.033 2.856 2.335 2.315 2.122 1.916 1.43 1.158 0.867 0.513 0.097 -0.365 -1.062 -3.427 -8 ,5888 ,TETRA ,17591347,Sat Nov 27 22:36:31 CET,Sun Nov 28 00:23:53 CET,0.0 2.095 2.638 2.995 3.283 3.514 3.711 3.915 4.301 4.477 4.645 4.613 5.105 5.243 5.51 5.747 5.957 6.067 6.285 6.49 6.779 6.955 7.121 7.373 7.617 7.838 8.044 8.251 8.522 8.782 9.02 9.299 9.577 9.844 10.14 10.472 10.797 11.145 11.503 11.864 12.232 12.632 13.088 13.545 14.035 14.562 15.157 15.715 16.298 16.829 17.069 16.815 16.248 15.617 14.984 14.353 13.761 13.198 12.716 12.223 11.76 11.342 10.937 10.542 10.176 9.847 9.485 9.141 8.858 8.573 8.246 7.961 7.665 7.346 7.105 6.845 6.573 6.313 6.029 5.821 5.605 5.244 4.987 4.736 4.6 4.296 4.002 3.692 3.518 2.989 2.942 2.73 2.504 2.021 1.747 1.433 1.081 0.654 0.174 -0.446 -2.139 -9 ,11177 ,TETRA ,17591348,Sat Nov 27 22:37:26 CET,Sun Nov 28 00:26:41 CET,0.0 1.3 1.742 2.089 2.372 2.6 2.801 3.009 3.393 3.568 3.737 3.702 4.19 4.331 4.601 4.854 5.094 5.205 5.42 5.627 5.928 6.128 6.309 6.562 6.797 7.023 7.238 7.437 7.705 7.963 8.212 8.519 8.787 9.045 9.359 9.702 10.01 10.337 10.683 11.04 11.422 11.857 12.345 12.803 13.328 13.89 14.484 15.06 15.639 16.189 16.593 16.552 16.172 15.626 15.056 14.476 13.926 13.404 12.914 12.404 11.947 11.534 11.123 10.716 10.336 9.97 9.583 9.255 8.951 8.61 8.251 7.96 7.658 7.344 7.104 6.846 6.569 6.287 5.99 5.788 5.574 5.216 4.976 4.722 4.583 4.273 3.95 3.621 3.455 2.935 2.896 2.695 2.471 2.008 1.752 1.431 1.071 0.7 0.211 -0.44 -2.881 -10 ,27413 ,TETRA ,17591349,Sat Nov 27 22:36:26 CET,Sun Nov 28 00:23:51 CET,0.0 1.548 2.032 2.364 2.636 2.89 3.116 3.347 3.746 3.913 4.077 4.031 4.504 4.635 4.9 5.148 5.387 5.501 5.708 5.92 6.22 6.398 6.57 6.825 7.069 7.3 7.528 7.742 8.009 8.255 8.494 8.799 9.085 9.343 9.645 9.981 10.296 10.653 11.039 11.429 11.83 12.264 12.747 13.207 13.709 14.237 14.826 15.451 16.105 16.716 17.13 16.999 16.523 15.988 15.455 14.892 14.351 13.821 13.341 12.823 12.361 11.937 11.526 11.131 10.744 10.412 10.066 9.719 9.421 9.108 8.769 8.517 8.253 7.944 7.701 7.468 7.227 6.953 6.655 6.458 6.255 5.9 5.656 5.401 5.268 4.999 4.698 4.373 4.202 3.675 3.606 3.384 3.151 2.673 2.392 2.061 1.702 1.307 0.853 0.199 -2.443 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index d928e10f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27710 ,TETRA ,17591350,Sat Nov 27 22:36:29 CET,Sun Nov 28 00:28:39 CET,0.0 1.517 2.252 2.891 3.386 3.816 4.187 4.527 5.143 5.428 5.702 5.794 6.496 6.739 7.226 7.688 8.132 8.348 8.755 9.155 9.763 10.156 10.536 11.092 11.622 12.13 12.635 13.123 13.756 14.375 14.964 15.723 16.484 17.192 18.012 18.948 19.829 20.788 21.883 23.075 24.323 25.777 27.519 29.301 31.386 33.708 36.485 39.748 43.658 48.361 54.356 59.579 62.683 64.633 65.96 66.921 67.593 68.067 68.364 68.56 68.665 68.716 68.707 68.642 68.555 68.455 68.335 68.207 68.067 67.906 67.736 67.574 67.384 67.173 67.005 66.821 66.631 66.433 66.208 66.038 65.853 65.552 65.331 65.102 64.978 64.705 64.416 64.101 63.928 63.375 63.328 63.106 62.884 62.402 62.112 61.764 61.36 60.89 60.321 59.576 57.58 -2 ,7946 ,TETRA ,17591351,Sat Nov 27 22:36:27 CET,Sun Nov 28 00:27:33 CET,0.0 1.629 2.331 2.865 3.323 3.749 4.139 4.504 5.166 5.463 5.752 5.863 6.561 6.812 7.295 7.766 8.233 8.455 8.876 9.293 9.895 10.279 10.651 11.189 11.71 12.224 12.719 13.204 13.835 14.437 15.026 15.756 16.455 17.14 17.956 18.872 19.775 20.778 21.869 23.045 24.304 25.738 27.432 29.154 31.182 33.532 36.37 39.625 43.426 48.168 54.253 59.467 62.665 64.775 66.188 67.166 67.851 68.317 68.598 68.803 68.904 68.94 68.954 68.933 68.86 68.776 68.676 68.559 68.416 68.233 68.029 67.866 67.689 67.488 67.324 67.148 66.953 66.731 66.494 66.329 66.151 65.866 65.65 65.42 65.298 65.017 64.692 64.338 64.16 63.6 63.558 63.337 63.109 62.604 62.291 61.939 61.568 61.112 60.501 59.659 57.632 -3 ,19163 ,TETRA ,17591352,Sat Nov 27 22:36:27 CET,Sun Nov 28 00:29:13 CET,0.0 1.341 2.02 2.559 3.023 3.422 3.796 4.15 4.808 5.111 5.391 5.472 6.171 6.417 6.882 7.345 7.804 8.026 8.447 8.846 9.44 9.829 10.195 10.736 11.279 11.799 12.298 12.786 13.422 14.047 14.644 15.371 16.098 16.807 17.627 18.534 19.425 20.414 21.481 22.64 23.889 25.333 27.04 28.774 30.845 33.236 36.059 39.286 43.146 47.888 53.994 59.24 62.381 64.419 65.81 66.8 67.472 67.919 68.207 68.407 68.488 68.521 68.546 68.521 68.446 68.364 68.261 68.137 68.004 67.853 67.68 67.519 67.353 67.167 66.999 66.821 66.634 66.419 66.194 66.035 65.859 65.563 65.324 65.039 64.884 64.555 64.202 63.872 63.704 63.149 63.107 62.881 62.649 62.127 61.83 61.492 61.101 60.654 60.118 59.386 57.803 -4 ,8788 ,TETRA ,17591353,Sat Nov 27 22:36:29 CET,Sun Nov 28 00:29:06 CET,0.0 1.426 2.072 2.613 3.074 3.491 3.881 4.239 4.91 5.212 5.486 5.581 6.28 6.533 7.01 7.465 7.919 8.141 8.56 8.967 9.574 9.965 10.34 10.882 11.408 11.929 12.43 12.911 13.525 14.117 14.709 15.46 16.204 16.905 17.716 18.638 19.538 20.535 21.616 22.784 24.037 25.497 27.22 28.957 31.009 33.381 36.235 39.54 43.508 48.257 54.241 59.476 62.685 64.794 66.204 67.138 67.735 68.159 68.41 68.587 68.68 68.708 68.715 68.688 68.613 68.517 68.377 68.222 68.085 67.9 67.682 67.515 67.337 67.133 66.96 66.765 66.557 66.337 66.101 65.94 65.757 65.431 65.195 64.948 64.825 64.576 64.298 63.979 63.804 63.246 63.171 62.917 62.666 62.134 61.827 61.474 61.072 60.641 60.116 59.363 57.06 -5 ,31181 ,TETRA ,17591354,Sat Nov 27 22:36:31 CET,Sun Nov 28 00:29:16 CET,0.0 1.503 2.142 2.667 3.126 3.536 3.91 4.277 4.938 5.245 5.538 5.636 6.338 6.596 7.104 7.588 8.031 8.249 8.679 9.081 9.662 10.039 10.403 10.929 11.443 11.947 12.438 12.917 13.546 14.157 14.748 15.467 16.184 16.885 17.697 18.625 19.515 20.511 21.62 22.805 24.044 25.473 27.192 28.944 31.011 33.339 36.096 39.322 43.194 47.965 53.958 59.094 62.244 64.313 65.696 66.673 67.34 67.777 68.055 68.263 68.388 68.442 68.443 68.403 68.352 68.28 68.147 68.003 67.885 67.747 67.573 67.432 67.261 67.047 66.872 66.684 66.483 66.274 66.046 65.875 65.7 65.406 65.18 64.942 64.817 64.569 64.293 63.974 63.806 63.258 63.214 62.987 62.761 62.255 61.963 61.633 61.242 60.782 60.207 59.408 56.925 -6 ,8933 ,TETRA ,17591355,Sat Nov 27 22:36:32 CET,Sun Nov 28 00:29:08 CET,0.0 1.387 2.101 2.671 3.201 3.673 4.073 4.435 5.112 5.425 5.716 5.822 6.529 6.775 7.244 7.704 8.141 8.358 8.776 9.172 9.765 10.153 10.528 11.077 11.604 12.119 12.623 13.104 13.731 14.355 14.959 15.675 16.358 17.038 17.848 18.772 19.679 20.686 21.778 22.966 24.236 25.686 27.4 29.098 31.13 33.485 36.241 39.471 43.401 48.234 54.265 59.379 62.512 64.611 66.027 67.035 67.697 68.124 68.419 68.623 68.717 68.759 68.773 68.738 68.663 68.584 68.488 68.368 68.234 68.067 67.883 67.733 67.55 67.338 67.179 67.016 66.828 66.611 66.376 66.205 66.026 65.737 65.521 65.266 65.135 64.884 64.601 64.297 64.139 63.592 63.54 63.314 63.087 62.545 62.222 61.873 61.484 61.022 60.462 59.615 57.608 -7 ,11445 ,TETRA ,17591356,Sat Nov 27 22:37:27 CET,Sun Nov 28 00:30:00 CET,0.0 1.323 1.969 2.483 2.93 3.343 3.721 4.071 4.724 5.026 5.311 5.424 6.127 6.384 6.88 7.34 7.775 7.992 8.418 8.821 9.409 9.786 10.159 10.706 11.221 11.725 12.23 12.726 13.362 13.984 14.603 15.346 16.049 16.727 17.542 18.48 19.389 20.389 21.487 22.708 23.995 25.447 27.174 28.935 31.05 33.458 36.259 39.493 43.432 48.303 54.428 59.635 62.798 64.845 66.2 67.139 67.754 68.168 68.424 68.617 68.745 68.807 68.816 68.769 68.677 68.573 68.444 68.318 68.207 68.068 67.895 67.734 67.564 67.38 67.23 67.071 66.886 66.656 66.389 66.214 66.034 65.728 65.518 65.291 65.167 64.89 64.58 64.257 64.084 63.526 63.437 63.175 62.918 62.368 62.043 61.701 61.342 60.901 60.336 59.592 57.605 -8 ,9945 ,TETRA ,17591357,Sat Nov 27 22:37:28 CET,Sun Nov 28 00:29:08 CET,0.0 1.977 2.674 3.235 3.702 4.118 4.489 4.85 5.532 5.838 6.126 6.213 6.907 7.152 7.616 8.083 8.552 8.777 9.198 9.611 10.223 10.601 10.971 11.518 12.04 12.553 13.054 13.531 14.149 14.765 15.371 16.101 16.814 17.517 18.352 19.293 20.193 21.195 22.293 23.477 24.712 26.112 27.771 29.48 31.531 33.893 36.716 39.971 43.886 48.692 54.758 59.929 63.004 65.012 66.401 67.415 68.085 68.521 68.793 68.97 69.043 69.078 69.08 69.054 68.99 68.878 68.754 68.627 68.499 68.348 68.165 68.019 67.856 67.651 67.479 67.277 67.064 66.86 66.63 66.461 66.267 65.952 65.74 65.513 65.399 65.149 64.853 64.534 64.375 63.838 63.813 63.587 63.347 62.794 62.474 62.128 61.746 61.307 60.772 60.091 58.17 -9 ,17564 ,TETRA ,17591358,Sat Nov 27 22:37:30 CET,Sun Nov 28 00:28:51 CET,0.0 1.238 1.911 2.499 3.015 3.46 3.844 4.192 4.847 5.151 5.445 5.551 6.244 6.502 7.008 7.478 7.929 8.146 8.568 8.971 9.539 9.913 10.286 10.829 11.356 11.871 12.377 12.872 13.517 14.14 14.74 15.48 16.209 16.914 17.746 18.687 19.595 20.617 21.712 22.862 24.076 25.452 27.127 28.858 30.877 33.185 35.976 39.253 43.188 47.967 53.949 59.127 62.382 64.547 65.916 66.817 67.446 67.911 68.232 68.45 68.58 68.639 68.626 68.574 68.504 68.419 68.295 68.151 68.038 67.926 67.76 67.603 67.437 67.245 67.078 66.895 66.701 66.488 66.261 66.086 65.901 65.622 65.407 65.159 65.029 64.765 64.489 64.177 64.003 63.446 63.401 63.182 62.944 62.394 62.086 61.745 61.344 60.836 60.197 59.379 56.956 -10 ,15678 ,TETRA ,17591359,Sat Nov 27 22:37:27 CET,Sun Nov 28 00:29:59 CET,0.0 1.604 2.321 2.865 3.333 3.745 4.128 4.493 5.185 5.499 5.774 5.848 6.543 6.792 7.268 7.712 8.135 8.349 8.778 9.174 9.755 10.144 10.516 11.049 11.554 12.051 12.544 13.032 13.676 14.279 14.86 15.583 16.279 16.963 17.791 18.725 19.609 20.586 21.683 22.875 24.152 25.615 27.298 29.013 31.136 33.568 36.371 39.602 43.458 48.263 54.404 59.58 62.673 64.739 66.108 67.041 67.682 68.179 68.527 68.736 68.848 68.902 68.887 68.822 68.757 68.688 68.565 68.43 68.319 68.183 67.999 67.831 67.656 67.459 67.292 67.101 66.899 66.707 66.499 66.345 66.171 65.871 65.661 65.441 65.319 65.059 64.758 64.389 64.176 63.583 63.535 63.326 63.086 62.535 62.225 61.889 61.482 60.988 60.424 59.651 56.976 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt deleted file mode 100644 index 3776d967..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31307 ,TETRA ,17591360,Sat Nov 27 22:37:29 CET,Sun Nov 28 00:31:26 CET,0.0 2.167 2.915 3.43 3.869 4.277 4.64 4.949 5.513 5.773 6.004 5.99 6.632 6.844 7.267 7.635 7.959 8.113 8.409 8.686 9.099 9.373 9.629 9.967 10.28 10.586 10.881 11.174 11.544 11.879 12.184 12.513 12.816 13.127 13.489 13.861 14.19 14.545 14.93 15.304 15.651 16.025 16.416 16.744 17.081 17.35 17.547 17.632 17.373 16.486 14.456 11.566 8.95 6.646 4.664 2.853 1.193 -0.326 -1.607 -2.892 -4.001 -5.01 -5.995 -6.906 -7.745 -8.486 -9.244 -9.938 -10.539 -11.167 -11.822 -12.361 -12.918 -13.483 -13.923 -14.408 -14.913 -15.414 -15.939 -16.294 -16.655 -17.236 -17.642 -18.065 -18.285 -18.744 -19.227 -19.753 -20.033 -20.795 -20.948 -21.266 -21.603 -22.363 -22.776 -23.213 -23.677 -24.222 -24.868 -25.722 -28.145 -2 ,23178 ,TETRA ,17591361,Sat Nov 27 22:37:31 CET,Sun Nov 28 00:30:22 CET,0.0 2.286 3.035 3.611 4.089 4.493 4.869 5.191 5.738 5.987 6.23 6.244 6.888 7.088 7.467 7.83 8.164 8.319 8.623 8.895 9.292 9.553 9.785 10.101 10.42 10.739 11.024 11.292 11.622 11.936 12.234 12.594 12.951 13.267 13.62 14.013 14.367 14.733 15.083 15.411 15.744 16.13 16.528 16.889 17.281 17.593 17.791 17.841 17.595 16.812 14.902 12.106 9.578 7.299 5.264 3.357 1.671 0.215 -1.07 -2.36 -3.435 -4.409 -5.364 -6.275 -7.105 -7.846 -8.632 -9.361 -9.982 -10.618 -11.282 -11.836 -12.405 -13.009 -13.497 -13.989 -14.491 -14.999 -15.521 -15.893 -16.274 -16.875 -17.297 -17.725 -17.945 -18.397 -18.87 -19.372 -19.631 -20.37 -20.493 -20.821 -21.174 -21.927 -22.335 -22.781 -23.26 -23.806 -24.457 -25.287 -27.201 -3 ,28172 ,TETRA ,17591362,Sat Nov 27 22:37:33 CET,Sun Nov 28 00:30:39 CET,0.0 3.099 4.06 4.651 5.081 5.474 5.815 6.12 6.641 6.888 7.131 7.133 7.782 7.99 8.36 8.714 9.048 9.206 9.509 9.796 10.194 10.444 10.686 11.018 11.334 11.642 11.923 12.177 12.517 12.841 13.149 13.518 13.844 14.155 14.499 14.894 15.299 15.68 16.047 16.442 16.826 17.199 17.584 17.908 18.184 18.437 18.597 18.548 18.234 17.444 15.381 12.32 9.646 7.24 5.166 3.286 1.624 0.17 -1.098 -2.414 -3.532 -4.527 -5.48 -6.342 -7.149 -7.911 -8.701 -9.394 -10.016 -10.675 -11.356 -11.901 -12.452 -13.051 -13.514 -13.986 -14.484 -14.996 -15.507 -15.857 -16.234 -16.84 -17.258 -17.688 -17.912 -18.382 -18.874 -19.394 -19.669 -20.412 -20.522 -20.837 -21.17 -21.875 -22.279 -22.738 -23.202 -23.713 -24.362 -25.231 -27.395 -4 ,1805 ,TETRA ,17591363,Sat Nov 27 22:37:27 CET,Sun Nov 28 00:31:45 CET,0.0 2.146 2.868 3.4 3.874 4.28 4.628 4.949 5.531 5.796 6.039 6.059 6.727 6.942 7.325 7.675 7.997 8.15 8.438 8.715 9.119 9.367 9.596 9.957 10.304 10.609 10.906 11.183 11.527 11.848 12.148 12.5 12.838 13.154 13.495 13.868 14.228 14.632 15.049 15.466 15.857 16.242 16.639 16.951 17.249 17.545 17.788 17.84 17.591 16.756 14.717 11.859 9.269 6.949 4.889 3.05 1.425 -0.067 -1.369 -2.659 -3.758 -4.765 -5.726 -6.618 -7.445 -8.202 -8.992 -9.701 -10.306 -10.937 -11.597 -12.136 -12.709 -13.3 -13.756 -14.225 -14.705 -15.216 -15.758 -16.145 -16.533 -17.114 -17.53 -17.979 -18.206 -18.674 -19.179 -19.702 -19.969 -20.713 -20.834 -21.149 -21.47 -22.168 -22.57 -23.016 -23.509 -24.068 -24.729 -25.628 -27.729 -5 ,8772 ,TETRA ,17591364,Sat Nov 27 22:37:28 CET,Sun Nov 28 00:31:38 CET,0.0 1.937 2.725 3.3 3.764 4.162 4.497 4.813 5.384 5.655 5.898 5.885 6.542 6.754 7.127 7.476 7.811 7.966 8.265 8.555 8.975 9.23 9.47 9.814 10.142 10.463 10.773 11.081 11.464 11.792 12.085 12.425 12.758 13.08 13.428 13.786 14.105 14.451 14.82 15.177 15.547 15.95 16.365 16.7 17.003 17.269 17.476 17.467 17.154 16.29 14.213 11.326 8.644 6.239 4.176 2.35 0.701 -0.793 -2.047 -3.336 -4.467 -5.475 -6.427 -7.302 -8.128 -8.903 -9.71 -10.419 -11.024 -11.679 -12.378 -12.94 -13.503 -14.074 -14.517 -14.986 -15.471 -15.972 -16.503 -16.874 -17.26 -17.858 -18.273 -18.708 -18.934 -19.392 -19.864 -20.404 -20.707 -21.488 -21.63 -21.945 -22.3 -23.067 -23.483 -23.929 -24.407 -24.946 -25.626 -26.519 -29.023 -6 ,28686 ,TETRA ,17591365,Sat Nov 27 22:37:29 CET,Sun Nov 28 00:31:44 CET,0.0 2.161 2.962 3.593 4.061 4.42 4.743 5.04 5.607 5.858 6.084 6.063 6.695 6.892 7.265 7.622 7.969 8.129 8.433 8.715 9.111 9.355 9.589 9.942 10.284 10.591 10.888 11.185 11.547 11.885 12.219 12.586 12.907 13.203 13.535 13.917 14.259 14.629 15.01 15.384 15.772 16.149 16.554 16.91 17.209 17.44 17.583 17.519 17.128 16.241 14.2 11.217 8.535 6.184 4.132 2.258 0.596 -0.88 -2.157 -3.461 -4.594 -5.6 -6.559 -7.474 -8.333 -9.122 -9.925 -10.608 -11.215 -11.852 -12.507 -13.066 -13.639 -14.226 -14.677 -15.141 -15.624 -16.14 -16.677 -17.041 -17.417 -18.003 -18.412 -18.849 -19.074 -19.529 -20.023 -20.557 -20.837 -21.592 -21.718 -22.039 -22.375 -23.068 -23.463 -23.927 -24.443 -25.022 -25.656 -26.501 -28.463 -7 ,8855 ,TETRA ,17591366,Sat Nov 27 22:37:31 CET,Sun Nov 28 00:31:34 CET,0.0 2.079 2.874 3.453 3.913 4.318 4.676 4.993 5.576 5.833 6.074 6.084 6.735 6.926 7.285 7.642 7.971 8.123 8.412 8.695 9.094 9.344 9.581 9.908 10.226 10.536 10.833 11.104 11.419 11.745 12.101 12.494 12.847 13.17 13.524 13.91 14.267 14.644 15.012 15.394 15.774 16.17 16.582 16.914 17.207 17.481 17.717 17.723 17.394 16.498 14.469 11.577 8.905 6.535 4.426 2.51 0.811 -0.725 -2.045 -3.353 -4.436 -5.392 -6.358 -7.291 -8.148 -8.919 -9.724 -10.451 -11.077 -11.727 -12.405 -12.954 -13.517 -14.103 -14.564 -15.044 -15.537 -16.037 -16.537 -16.903 -17.299 -17.891 -18.291 -18.721 -18.946 -19.417 -19.906 -20.403 -20.673 -21.425 -21.559 -21.876 -22.215 -22.949 -23.353 -23.833 -24.402 -25.049 -25.804 -26.747 -29.381 -8 ,23127 ,TETRA ,17591367,Sat Nov 27 22:38:27 CET,Sun Nov 28 00:33:44 CET,0.0 2.026 2.782 3.36 3.856 4.27 4.619 4.923 5.474 5.731 5.96 5.954 6.599 6.802 7.199 7.537 7.838 7.984 8.283 8.579 8.978 9.213 9.447 9.801 10.13 10.434 10.72 10.992 11.329 11.654 11.961 12.307 12.662 13.011 13.384 13.763 14.123 14.533 14.936 15.333 15.717 16.113 16.519 16.849 17.172 17.443 17.582 17.553 17.298 16.457 14.392 11.37 8.637 6.28 4.168 2.255 0.6 -0.882 -2.138 -3.406 -4.496 -5.496 -6.463 -7.362 -8.201 -8.965 -9.765 -10.468 -11.065 -11.687 -12.366 -12.924 -13.478 -14.065 -14.522 -14.998 -15.498 -16.011 -16.543 -16.91 -17.292 -17.912 -18.341 -18.773 -19.0 -19.471 -19.952 -20.481 -20.762 -21.501 -21.599 -21.905 -22.229 -22.941 -23.338 -23.774 -24.243 -24.762 -25.379 -26.227 -28.218 -9 ,9098 ,TETRA ,17591368,Sat Nov 27 22:38:27 CET,Sun Nov 28 00:31:14 CET,0.0 2.079 2.827 3.405 3.892 4.296 4.64 4.957 5.554 5.821 6.064 6.076 6.724 6.922 7.284 7.607 7.898 8.043 8.354 8.645 9.035 9.29 9.531 9.846 10.151 10.459 10.747 10.993 11.299 11.588 11.873 12.223 12.548 12.872 13.228 13.596 13.942 14.28 14.641 15.021 15.368 15.744 16.145 16.503 16.823 17.037 17.177 17.196 16.911 16.021 14.036 11.171 8.519 6.136 4.029 2.115 0.456 -1.044 -2.368 -3.661 -4.775 -5.77 -6.707 -7.606 -8.459 -9.229 -10.025 -10.729 -11.336 -11.972 -12.635 -13.183 -13.758 -14.36 -14.826 -15.299 -15.796 -16.325 -16.869 -17.227 -17.586 -18.171 -18.608 -19.07 -19.3 -19.77 -20.25 -20.738 -21.003 -21.762 -21.957 -22.311 -22.682 -23.527 -24.004 -24.484 -24.929 -25.463 -26.14 -26.934 -28.761 -10 ,19387 ,TETRA ,17591369,Sat Nov 27 22:38:28 CET,Sun Nov 28 00:32:28 CET,0.0 1.988 2.742 3.302 3.724 4.108 4.465 4.793 5.409 5.675 5.922 5.923 6.551 6.727 7.072 7.418 7.761 7.928 8.239 8.526 8.952 9.211 9.436 9.755 10.068 10.366 10.647 10.94 11.301 11.615 11.911 12.268 12.606 12.923 13.302 13.672 13.997 14.383 14.776 15.148 15.502 15.864 16.231 16.555 16.918 17.194 17.342 17.316 17.043 16.295 14.453 11.669 9.0 6.642 4.585 2.746 1.134 -0.357 -1.65 -2.913 -3.996 -4.972 -5.908 -6.797 -7.642 -8.417 -9.204 -9.898 -10.51 -11.154 -11.813 -12.347 -12.907 -13.52 -13.99 -14.453 -14.931 -15.424 -15.941 -16.306 -16.692 -17.292 -17.704 -18.138 -18.359 -18.803 -19.293 -19.8 -20.057 -20.809 -20.948 -21.26 -21.577 -22.288 -22.699 -23.149 -23.651 -24.204 -24.862 -25.69 -27.775 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt deleted file mode 100644 index ba6cdb40..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25475 ,TETRA ,17591370,Sat Nov 27 22:38:31 CET,Sun Nov 28 00:30:04 CET,0.0 1.5 2.298 2.993 3.644 4.191 4.631 5.014 5.712 6.037 6.338 6.489 7.232 7.515 8.048 8.559 9.037 9.272 9.747 10.2 10.849 11.272 11.686 12.285 12.851 13.408 13.969 14.509 15.211 15.898 16.566 17.384 18.181 18.954 19.846 20.848 21.826 22.943 24.154 25.451 26.846 28.431 30.32 32.267 34.577 37.218 40.339 43.947 48.278 53.55 60.169 65.938 69.441 71.69 73.206 74.275 75.047 75.574 75.899 76.126 76.242 76.296 76.287 76.231 76.151 76.071 75.979 75.871 75.761 75.625 75.463 75.317 75.165 74.975 74.786 74.584 74.377 74.142 73.89 73.72 73.53 73.21 72.995 72.769 72.645 72.362 72.032 71.679 71.49 70.931 70.91 70.685 70.431 69.887 69.576 69.205 68.78 68.255 67.584 66.725 63.912 -2 ,22751 ,TETRA ,17591371,Sat Nov 27 22:38:27 CET,Sun Nov 28 00:30:29 CET,0.0 1.446 2.179 2.786 3.284 3.702 4.089 4.472 5.192 5.521 5.844 6.029 6.748 7.024 7.557 8.059 8.552 8.79 9.239 9.673 10.312 10.731 11.157 11.766 12.346 12.933 13.491 14.024 14.721 15.402 16.072 16.874 17.637 18.395 19.311 20.357 21.362 22.457 23.645 24.935 26.32 27.904 29.774 31.703 33.988 36.616 39.764 43.416 47.78 53.109 59.87 65.549 68.952 71.231 72.827 73.902 74.575 75.058 75.365 75.593 75.733 75.797 75.816 75.784 75.715 75.63 75.515 75.395 75.271 75.114 74.927 74.743 74.535 74.331 74.162 73.974 73.769 73.549 73.318 73.131 72.925 72.621 72.407 72.148 72.009 71.731 71.421 71.073 70.884 70.317 70.233 69.985 69.734 69.168 68.834 68.451 68.027 67.543 66.944 66.201 63.807 -3 ,10391 ,TETRA ,17591372,Sat Nov 27 22:38:28 CET,Sun Nov 28 00:30:21 CET,0.0 2.033 2.781 3.381 3.88 4.342 4.763 5.129 5.834 6.174 6.494 6.66 7.386 7.667 8.214 8.704 9.177 9.412 9.87 10.321 10.967 11.383 11.798 12.404 12.984 13.55 14.109 14.655 15.372 16.047 16.706 17.524 18.333 19.124 20.009 21.01 22.004 23.12 24.347 25.689 27.141 28.756 30.632 32.553 34.819 37.446 40.563 44.144 48.457 53.717 60.379 66.152 69.646 71.91 73.419 74.454 75.153 75.639 75.935 76.132 76.266 76.351 76.376 76.346 76.302 76.232 76.111 75.999 75.888 75.726 75.524 75.354 75.173 74.964 74.801 74.627 74.408 74.173 73.936 73.762 73.577 73.271 73.05 72.788 72.637 72.319 72.006 71.664 71.477 70.919 70.88 70.655 70.406 69.769 69.385 69.02 68.602 68.077 67.502 66.698 64.218 -4 ,18494 ,TETRA ,17591373,Sat Nov 27 22:38:28 CET,Sun Nov 28 00:30:30 CET,0.0 1.856 2.617 3.207 3.708 4.149 4.565 4.952 5.64 5.966 6.287 6.443 7.166 7.429 7.932 8.432 8.935 9.178 9.641 10.091 10.764 11.195 11.596 12.187 12.771 13.33 13.872 14.39 15.062 15.737 16.397 17.203 17.987 18.745 19.643 20.667 21.664 22.773 23.993 25.315 26.698 28.263 30.122 32.075 34.369 36.972 40.137 43.792 48.136 53.437 60.094 65.782 69.281 71.559 73.092 74.213 74.953 75.465 75.842 76.09 76.223 76.306 76.337 76.317 76.256 76.177 76.075 75.934 75.794 75.657 75.47 75.287 75.081 74.856 74.68 74.492 74.287 74.06 73.8 73.611 73.408 73.04 72.787 72.55 72.411 72.108 71.797 71.439 71.238 70.663 70.611 70.383 70.138 69.586 69.262 68.908 68.5 67.992 67.372 66.509 63.731 -5 ,9775 ,TETRA ,17591374,Sat Nov 27 22:38:31 CET,Sun Nov 28 00:30:07 CET,0.0 2.07 2.825 3.416 3.923 4.368 4.766 5.132 5.819 6.142 6.453 6.607 7.334 7.618 8.16 8.665 9.139 9.368 9.827 10.281 10.934 11.354 11.764 12.354 12.949 13.54 14.105 14.642 15.333 16.003 16.668 17.469 18.239 19.011 19.928 20.961 21.953 23.05 24.231 25.537 26.952 28.556 30.484 32.446 34.741 37.391 40.531 44.099 48.364 53.607 60.268 66.124 69.753 72.099 73.655 74.723 75.436 75.95 76.303 76.527 76.623 76.678 76.706 76.706 76.654 76.563 76.444 76.326 76.201 76.05 75.891 75.733 75.549 75.33 75.152 74.974 74.765 74.529 74.278 74.114 73.931 73.616 73.374 73.098 72.954 72.642 72.304 71.926 71.73 71.167 71.103 70.872 70.625 70.068 69.731 69.318 68.812 68.215 67.541 66.586 63.409 -6 ,25145 ,TETRA ,17591375,Sat Nov 27 22:38:28 CET,Sun Nov 28 00:31:52 CET,0.0 1.663 2.394 2.95 3.46 3.904 4.306 4.688 5.421 5.745 6.047 6.213 6.947 7.214 7.744 8.252 8.737 8.98 9.447 9.887 10.525 10.948 11.364 11.945 12.502 13.061 13.61 14.155 14.865 15.546 16.209 17.021 17.824 18.601 19.502 20.538 21.544 22.653 23.868 25.173 26.546 28.15 30.074 32.033 34.393 37.08 40.282 44.004 48.396 53.693 60.432 66.151 69.598 71.886 73.422 74.486 75.214 75.683 75.975 76.199 76.326 76.377 76.367 76.313 76.235 76.137 76.03 75.903 75.768 75.62 75.432 75.264 75.066 74.832 74.66 74.481 74.27 74.021 73.735 73.538 73.341 73.033 72.814 72.571 72.438 72.131 71.81 71.485 71.304 70.744 70.67 70.433 70.174 69.53 69.148 68.724 68.226 67.674 67.025 66.155 62.922 -7 ,31872 ,TETRA ,17591376,Sat Nov 27 22:38:30 CET,Sun Nov 28 00:31:13 CET,0.0 1.771 2.528 3.185 3.703 4.147 4.542 4.923 5.64 5.965 6.269 6.412 7.144 7.43 7.949 8.441 8.914 9.147 9.6 10.033 10.682 11.104 11.514 12.108 12.692 13.275 13.839 14.375 15.072 15.754 16.41 17.206 17.973 18.725 19.622 20.66 21.665 22.761 23.959 25.258 26.655 28.237 30.112 32.069 34.382 36.949 39.994 43.57 47.891 53.218 59.953 65.69 69.11 71.35 72.867 73.914 74.624 75.094 75.392 75.599 75.726 75.809 75.816 75.779 75.717 75.648 75.548 75.403 75.264 75.12 74.956 74.813 74.661 74.469 74.306 74.133 73.944 73.736 73.493 73.305 73.102 72.802 72.575 72.327 72.202 71.923 71.617 71.262 71.072 70.509 70.451 70.215 69.948 69.367 69.038 68.661 68.228 67.736 67.152 66.352 63.932 -8 ,22222 ,TETRA ,17591377,Sat Nov 27 22:38:32 CET,Sun Nov 28 00:33:17 CET,0.0 2.437 3.25 3.868 4.379 4.834 5.241 5.622 6.357 6.693 7.008 7.162 7.889 8.162 8.679 9.19 9.68 9.915 10.376 10.825 11.467 11.889 12.312 12.922 13.51 14.082 14.636 15.188 15.903 16.588 17.269 18.101 18.887 19.662 20.562 21.561 22.547 23.639 24.822 26.117 27.514 29.086 30.974 32.928 35.224 37.829 40.938 44.561 48.869 54.172 60.88 66.66 70.217 72.504 74.066 75.121 75.821 76.348 76.702 76.941 77.082 77.16 77.169 77.129 77.066 77.0 76.896 76.748 76.586 76.425 76.253 76.094 75.901 75.686 75.514 75.318 75.112 74.887 74.646 74.48 74.291 73.958 73.712 73.457 73.32 73.023 72.695 72.317 72.116 71.539 71.46 71.218 70.956 70.385 70.054 69.674 69.225 68.697 68.102 67.242 64.256 -9 ,11568 ,TETRA ,17591378,Sat Nov 27 22:38:33 CET,Sun Nov 28 00:32:18 CET,0.0 1.972 2.74 3.334 3.847 4.319 4.742 5.104 5.791 6.11 6.419 6.578 7.304 7.574 8.096 8.596 9.096 9.342 9.802 10.244 10.887 11.307 11.724 12.333 12.932 13.496 14.033 14.564 15.268 15.946 16.607 17.422 18.196 18.957 19.857 20.895 21.918 23.016 24.21 25.526 26.915 28.49 30.347 32.253 34.567 37.242 40.369 43.98 48.316 53.617 60.339 66.129 69.599 71.788 73.293 74.338 75.012 75.47 75.772 76.003 76.154 76.235 76.243 76.202 76.167 76.111 75.987 75.847 75.714 75.576 75.414 75.258 75.083 74.881 74.709 74.515 74.298 74.081 73.856 73.683 73.489 73.165 72.944 72.701 72.562 72.287 71.974 71.612 71.426 70.862 70.803 70.57 70.31 69.736 69.414 69.035 68.603 68.106 67.486 66.644 63.905 -10 ,10612 ,TETRA ,17591379,Sat Nov 27 22:38:28 CET,Sun Nov 28 00:30:33 CET,0.0 1.84 2.527 3.087 3.585 4.03 4.453 4.838 5.556 5.886 6.199 6.358 7.066 7.333 7.891 8.421 8.899 9.132 9.586 10.022 10.668 11.086 11.492 12.084 12.657 13.233 13.792 14.328 15.019 15.682 16.328 17.128 17.909 18.672 19.557 20.556 21.535 22.637 23.868 25.209 26.624 28.21 30.098 32.044 34.323 36.915 40.011 43.569 47.84 53.16 59.927 65.652 69.092 71.332 72.86 73.918 74.648 75.168 75.483 75.687 75.803 75.853 75.865 75.845 75.775 75.687 75.587 75.465 75.328 75.165 74.972 74.802 74.619 74.421 74.254 74.047 73.812 73.58 73.335 73.139 72.929 72.601 72.359 72.067 71.911 71.604 71.289 70.961 70.778 70.219 70.168 69.944 69.684 69.102 68.774 68.382 67.931 67.379 66.605 65.591 62.222 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index b5f1a8b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19487 ,TETRA ,17591380,Sat Nov 27 22:38:29 CET,Sun Nov 28 00:30:04 CET,0.0 1.841 2.601 3.144 3.623 4.032 4.396 4.76 5.458 5.78 6.088 6.201 6.959 7.241 7.767 8.267 8.747 8.981 9.444 9.896 10.539 10.963 11.385 11.997 12.6 13.18 13.742 14.301 15.03 15.755 16.462 17.318 18.161 18.977 19.944 21.054 22.125 23.326 24.635 26.038 27.553 29.316 31.438 33.625 36.225 39.204 42.824 47.11 52.29 58.813 67.433 75.133 80.07 83.515 85.974 87.786 89.107 90.159 90.947 91.581 92.045 92.414 92.701 92.915 93.064 93.164 93.248 93.295 93.315 93.327 93.307 93.274 93.248 93.22 93.169 93.102 93.043 92.963 92.86 92.774 92.673 92.509 92.392 92.258 92.178 91.988 91.779 91.573 91.465 90.964 91.044 90.891 90.71 90.322 90.087 89.817 89.523 89.164 88.748 88.139 86.696 -2 ,21873 ,TETRA ,17591381,Sat Nov 27 22:38:31 CET,Sun Nov 28 00:30:26 CET,0.0 1.365 2.062 2.575 3.026 3.439 3.816 4.162 4.802 5.118 5.41 5.49 6.237 6.501 7.025 7.533 8.031 8.276 8.731 9.159 9.789 10.202 10.617 11.235 11.835 12.417 12.982 13.542 14.285 15.018 15.713 16.544 17.356 18.153 19.104 20.18 21.238 22.439 23.763 25.208 26.75 28.504 30.58 32.734 35.355 38.422 42.078 46.279 51.427 57.893 66.362 74.134 79.124 82.59 85.056 86.867 88.23 89.318 90.117 90.8 91.324 91.724 92.045 92.296 92.47 92.574 92.665 92.73 92.763 92.791 92.801 92.771 92.709 92.638 92.581 92.516 92.44 92.328 92.217 92.153 92.067 91.908 91.779 91.636 91.561 91.392 91.198 90.966 90.839 90.342 90.444 90.291 90.122 89.722 89.492 89.238 88.924 88.53 88.061 87.445 85.755 -3 ,22269 ,TETRA ,17591382,Sat Nov 27 22:38:33 CET,Sun Nov 28 00:30:05 CET,0.0 1.577 2.483 3.204 3.832 4.319 4.71 5.069 5.749 6.066 6.361 6.453 7.197 7.467 7.995 8.5 8.985 9.221 9.69 10.148 10.797 11.223 11.641 12.246 12.839 13.42 13.984 14.524 15.235 15.957 16.665 17.51 18.334 19.146 20.109 21.209 22.282 23.477 24.788 26.209 27.76 29.573 31.721 33.907 36.522 39.534 43.146 47.437 52.698 59.265 67.853 75.552 80.458 83.836 86.266 88.11 89.468 90.512 91.284 91.895 92.333 92.679 92.986 93.254 93.462 93.599 93.693 93.749 93.765 93.769 93.746 93.711 93.68 93.636 93.569 93.479 93.382 93.283 93.177 93.088 92.986 92.833 92.717 92.567 92.484 92.314 92.132 91.916 91.797 91.309 91.401 91.239 91.066 90.689 90.475 90.23 89.936 89.602 89.236 88.736 87.369 -4 ,2462 ,TETRA ,17591383,Sat Nov 27 22:39:25 CET,Sun Nov 28 00:31:07 CET,0.0 1.317 1.938 2.441 2.912 3.345 3.736 4.097 4.79 5.108 5.393 5.463 6.202 6.475 6.986 7.475 7.946 8.18 8.661 9.126 9.782 10.191 10.595 11.201 11.803 12.393 12.961 13.518 14.233 14.928 15.621 16.471 17.316 18.14 19.096 20.183 21.242 22.419 23.72 25.158 26.709 28.488 30.615 32.814 35.45 38.485 42.14 46.426 51.618 58.085 66.592 74.305 79.303 82.767 85.186 86.963 88.318 89.37 90.11 90.734 91.203 91.576 91.889 92.144 92.334 92.458 92.567 92.656 92.697 92.706 92.693 92.661 92.625 92.572 92.516 92.449 92.362 92.259 92.141 92.05 91.951 91.78 91.636 91.475 91.393 91.219 91.018 90.806 90.695 90.196 90.247 90.061 89.871 89.44 89.18 88.896 88.599 88.268 87.802 87.14 85.637 -5 ,21644 ,TETRA ,17591384,Sat Nov 27 22:41:25 CET,Sun Nov 28 00:33:21 CET,0.0 1.172 1.834 2.395 2.884 3.308 3.705 4.074 4.741 5.064 5.374 5.479 6.217 6.483 7.01 7.505 7.995 8.236 8.693 9.147 9.81 10.231 10.65 11.276 11.888 12.467 13.029 13.588 14.314 15.029 15.72 16.548 17.367 18.184 19.149 20.246 21.309 22.505 23.837 25.267 26.795 28.604 30.791 33.014 35.642 38.666 42.313 46.606 51.867 58.422 66.959 74.61 79.487 82.878 85.332 87.185 88.567 89.636 90.399 91.058 91.562 91.95 92.262 92.499 92.665 92.775 92.877 92.943 92.959 92.961 92.94 92.906 92.863 92.821 92.783 92.716 92.626 92.514 92.367 92.255 92.142 91.964 91.84 91.708 91.636 91.479 91.283 91.048 90.919 90.413 90.474 90.311 90.158 89.788 89.563 89.302 89.005 88.652 88.198 87.625 85.915 -6 ,21353 ,TETRA ,17591385,Sat Nov 27 22:40:26 CET,Sun Nov 28 00:33:52 CET,0.0 1.49 2.142 2.634 3.11 3.539 3.932 4.306 4.957 5.261 5.558 5.66 6.4 6.667 7.201 7.702 8.188 8.431 8.897 9.345 10.009 10.433 10.841 11.436 12.021 12.606 13.17 13.729 14.47 15.182 15.873 16.707 17.521 18.331 19.282 20.383 21.461 22.656 23.982 25.422 26.963 28.739 30.832 32.99 35.574 38.559 42.181 46.442 51.651 58.149 66.497 74.065 78.987 82.397 84.855 86.641 87.95 88.952 89.683 90.317 90.763 91.097 91.385 91.61 91.781 91.911 92.004 92.062 92.105 92.13 92.132 92.111 92.059 91.987 91.929 91.861 91.77 91.654 91.52 91.415 91.294 91.117 90.999 90.852 90.767 90.587 90.402 90.179 90.05 89.55 89.641 89.481 89.293 88.884 88.658 88.401 88.1 87.761 87.338 86.717 84.866 -7 ,19362 ,TETRA ,17591386,Sat Nov 27 22:40:27 CET,Sun Nov 28 00:38:44 CET,0.0 1.139 1.797 2.357 2.819 3.229 3.612 3.978 4.638 4.951 5.261 5.39 6.151 6.425 6.934 7.43 7.919 8.16 8.622 9.064 9.712 10.139 10.561 11.177 11.78 12.365 12.933 13.504 14.251 14.962 15.655 16.517 17.367 18.191 19.158 20.25 21.332 22.565 23.902 25.324 26.861 28.638 30.748 32.93 35.566 38.617 42.272 46.543 51.72 58.212 66.826 74.654 79.634 83.073 85.48 87.281 88.635 89.694 90.486 91.143 91.611 91.977 92.269 92.487 92.644 92.768 92.892 92.97 92.995 92.994 92.965 92.933 92.887 92.833 92.791 92.726 92.642 92.545 92.421 92.324 92.221 92.057 91.929 91.791 91.716 91.548 91.365 91.155 91.035 90.542 90.645 90.501 90.332 89.926 89.694 89.434 89.134 88.785 88.391 87.849 86.283 -8 ,20540 ,TETRA ,17591387,Sat Nov 27 22:40:29 CET,Sun Nov 28 00:31:36 CET,0.0 1.458 2.173 2.71 3.167 3.618 4.062 4.435 5.09 5.4 5.699 5.809 6.543 6.794 7.291 7.779 8.268 8.512 8.981 9.435 10.112 10.554 10.977 11.589 12.18 12.749 13.313 13.875 14.611 15.323 16.02 16.885 17.742 18.558 19.497 20.572 21.621 22.823 24.154 25.584 27.117 28.887 31.012 33.188 35.792 38.815 42.421 46.682 52.003 58.689 67.363 75.189 80.164 83.574 85.973 87.734 89.072 90.119 90.853 91.484 91.978 92.34 92.634 92.88 93.06 93.184 93.272 93.325 93.363 93.376 93.372 93.358 93.314 93.253 93.203 93.153 93.092 93.0 92.89 92.807 92.708 92.525 92.381 92.227 92.142 91.948 91.741 91.533 91.418 90.913 90.993 90.835 90.672 90.284 90.034 89.756 89.456 89.101 88.642 88.025 86.332 -9 ,29386 ,TETRA ,17591388,Sat Nov 27 22:40:27 CET,Sun Nov 28 00:32:43 CET,0.0 1.538 2.194 2.737 3.241 3.686 4.085 4.446 5.113 5.436 5.735 5.822 6.569 6.835 7.332 7.82 8.304 8.544 9.009 9.459 10.11 10.54 10.966 11.583 12.17 12.744 13.313 13.862 14.579 15.299 16.001 16.841 17.672 18.488 19.431 20.499 21.549 22.728 24.041 25.457 26.975 28.765 30.898 33.079 35.702 38.735 42.36 46.637 51.91 58.487 67.052 74.795 79.693 83.036 85.47 87.319 88.648 89.697 90.476 91.109 91.588 91.962 92.248 92.474 92.667 92.825 92.947 93.018 93.055 93.066 93.041 93.004 92.952 92.883 92.818 92.745 92.661 92.557 92.437 92.342 92.243 92.076 91.956 91.828 91.756 91.597 91.414 91.201 91.073 90.565 90.643 90.491 90.339 89.982 89.776 89.544 89.261 88.932 88.524 87.988 86.528 -10 ,8980 ,TETRA ,17591389,Sat Nov 27 22:40:28 CET,Sun Nov 28 00:32:49 CET,0.0 1.326 1.953 2.501 2.964 3.378 3.767 4.134 4.813 5.12 5.414 5.533 6.289 6.561 7.084 7.59 8.067 8.305 8.784 9.234 9.872 10.299 10.728 11.348 11.949 12.547 13.135 13.708 14.439 15.139 15.825 16.673 17.501 18.317 19.279 20.359 21.428 22.63 23.927 25.328 26.862 28.655 30.797 33.027 35.661 38.678 42.377 46.732 51.968 58.49 67.067 74.867 79.823 83.161 85.472 87.22 88.547 89.594 90.362 90.987 91.442 91.791 92.116 92.397 92.565 92.675 92.78 92.854 92.9 92.916 92.893 92.858 92.809 92.749 92.694 92.62 92.533 92.428 92.301 92.211 92.12 91.964 91.845 91.701 91.62 91.456 91.277 91.062 90.94 90.452 90.545 90.392 90.213 89.792 89.576 89.337 89.058 88.706 88.277 87.689 86.022 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index c00417eb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25668 ,TETRA ,17591390,Sat Nov 27 22:40:30 CET,Sun Nov 28 00:32:18 CET,0.0 2.165 2.875 3.394 3.805 4.126 4.444 4.749 5.276 5.537 5.777 5.826 6.391 6.58 6.926 7.253 7.579 7.729 7.996 8.247 8.619 8.865 9.081 9.388 9.701 10.016 10.306 10.564 10.899 11.227 11.549 11.942 12.31 12.637 13.001 13.397 13.76 14.144 14.538 14.973 15.424 15.906 16.476 17.033 17.618 18.199 18.8 19.412 19.998 20.398 20.313 19.525 18.526 17.472 16.435 15.432 14.545 13.736 13.009 12.258 11.595 10.995 10.392 9.835 9.323 8.85 8.365 7.922 7.526 7.109 6.684 6.333 5.965 5.566 5.245 4.918 4.577 4.227 3.874 3.616 3.347 2.926 2.628 2.315 2.147 1.805 1.456 1.074 0.878 0.309 0.24 0.006 -0.234 -0.755 -1.057 -1.388 -1.766 -2.215 -2.758 -3.415 -4.923 -2 ,29697 ,TETRA ,17591391,Sat Nov 27 22:40:32 CET,Sun Nov 28 00:31:56 CET,0.0 1.639 2.309 2.781 3.191 3.55 3.831 4.108 4.628 4.85 5.06 5.096 5.652 5.835 6.176 6.494 6.808 6.953 7.225 7.481 7.837 8.066 8.284 8.589 8.886 9.178 9.457 9.731 10.07 10.373 10.668 11.039 11.411 11.763 12.141 12.562 12.963 13.385 13.841 14.303 14.763 15.264 15.818 16.345 16.935 17.587 18.259 18.836 19.338 19.705 19.601 18.742 17.719 16.656 15.6 14.621 13.755 12.94 12.209 11.476 10.817 10.216 9.646 9.125 8.622 8.144 7.639 7.178 6.788 6.386 5.969 5.62 5.233 4.825 4.519 4.203 3.872 3.534 3.17 2.919 2.655 2.224 1.93 1.623 1.466 1.143 0.798 0.417 0.217 -0.35 -0.401 -0.622 -0.855 -1.379 -1.671 -1.996 -2.372 -2.771 -3.253 -3.878 -5.4 -3 ,15709 ,TETRA ,17591392,Sat Nov 27 22:41:25 CET,Sun Nov 28 00:31:32 CET,0.0 1.495 2.146 2.678 3.228 3.691 4.054 4.352 4.868 5.102 5.323 5.354 5.902 6.085 6.433 6.756 7.071 7.224 7.518 7.789 8.169 8.403 8.628 8.96 9.274 9.564 9.838 10.098 10.443 10.777 11.081 11.434 11.774 12.102 12.476 12.884 13.255 13.663 14.108 14.569 15.032 15.53 16.1 16.622 17.177 17.775 18.381 18.963 19.519 19.905 19.763 18.902 17.805 16.671 15.639 14.678 13.785 12.928 12.162 11.403 10.742 10.125 9.542 8.982 8.439 7.945 7.433 6.986 6.598 6.18 5.741 5.378 5.001 4.604 4.29 3.974 3.651 3.312 2.967 2.717 2.443 2.027 1.74 1.423 1.254 0.916 0.586 0.217 0.015 -0.552 -0.602 -0.838 -1.088 -1.615 -1.9 -2.214 -2.557 -2.979 -3.487 -4.133 -5.806 -4 ,631 ,TETRA ,17591393,Sat Nov 27 22:41:28 CET,Sun Nov 28 00:31:47 CET,0.0 1.24 1.805 2.243 2.623 2.966 3.283 3.589 4.147 4.385 4.597 4.617 5.175 5.362 5.693 6.004 6.304 6.446 6.717 6.974 7.356 7.593 7.81 8.134 8.437 8.727 9.01 9.276 9.621 9.949 10.26 10.637 10.993 11.327 11.701 12.122 12.521 12.939 13.393 13.873 14.366 14.907 15.512 16.077 16.672 17.266 17.885 18.482 18.96 19.209 19.008 18.134 17.039 15.972 14.917 13.89 12.981 12.116 11.367 10.618 9.943 9.33 8.754 8.208 7.704 7.24 6.752 6.307 5.912 5.513 5.101 4.737 4.345 3.93 3.616 3.305 2.973 2.618 2.249 2.002 1.748 1.335 1.034 0.714 0.552 0.228 -0.119 -0.491 -0.68 -1.249 -1.301 -1.523 -1.753 -2.302 -2.642 -3.016 -3.404 -3.831 -4.34 -4.984 -6.62 -5 ,30527 ,TETRA ,17591394,Sat Nov 27 22:41:30 CET,Sun Nov 28 00:31:34 CET,0.0 2.676 3.687 4.394 4.88 5.25 5.544 5.798 6.284 6.51 6.728 6.775 7.338 7.519 7.859 8.176 8.466 8.613 8.904 9.164 9.518 9.752 9.982 10.299 10.59 10.874 11.154 11.413 11.738 12.052 12.359 12.739 13.106 13.441 13.799 14.179 14.539 14.932 15.359 15.81 16.268 16.774 17.343 17.852 18.388 18.944 19.552 20.152 20.664 20.986 20.802 19.954 18.92 17.849 16.829 15.858 14.971 14.156 13.439 12.69 12.029 11.437 10.862 10.295 9.762 9.283 8.782 8.334 7.942 7.528 7.088 6.722 6.346 5.962 5.66 5.334 4.988 4.631 4.261 4.01 3.751 3.34 3.047 2.741 2.578 2.239 1.892 1.525 1.334 0.765 0.712 0.475 0.226 -0.298 -0.589 -0.918 -1.29 -1.707 -2.192 -2.84 -4.584 -6 ,14813 ,TETRA ,17591395,Sat Nov 27 22:41:31 CET,Sun Nov 28 00:31:44 CET,0.0 1.845 2.524 2.989 3.427 3.788 4.091 4.365 4.866 5.11 5.34 5.39 5.953 6.133 6.484 6.818 7.128 7.279 7.558 7.823 8.19 8.424 8.655 8.965 9.275 9.571 9.843 10.109 10.451 10.765 11.046 11.384 11.726 12.06 12.413 12.806 13.181 13.598 14.046 14.486 14.944 15.448 15.997 16.529 17.129 17.708 18.274 18.835 19.339 19.658 19.449 18.551 17.472 16.428 15.449 14.487 13.594 12.751 12.002 11.212 10.522 9.915 9.312 8.725 8.213 7.744 7.238 6.795 6.413 6.015 5.587 5.219 4.843 4.45 4.138 3.819 3.48 3.132 2.788 2.544 2.278 1.848 1.552 1.263 1.112 0.778 0.447 0.105 -0.09 -0.66 -0.711 -0.942 -1.181 -1.683 -1.965 -2.274 -2.618 -3.016 -3.494 -4.138 -6.009 -7 ,10870 ,TETRA ,17591396,Sat Nov 27 22:43:26 CET,Sun Nov 28 00:40:08 CET,0.0 1.892 2.594 3.1 3.51 3.871 4.186 4.458 4.963 5.186 5.383 5.403 5.952 6.124 6.469 6.792 7.096 7.25 7.526 7.775 8.133 8.363 8.598 8.935 9.242 9.526 9.801 10.071 10.403 10.732 11.047 11.412 11.766 12.099 12.481 12.914 13.296 13.698 14.143 14.607 15.069 15.563 16.102 16.589 17.143 17.727 18.294 18.835 19.353 19.697 19.585 18.858 17.841 16.731 15.692 14.717 13.822 12.98 12.254 11.508 10.852 10.272 9.699 9.143 8.629 8.158 7.642 7.171 6.764 6.333 5.887 5.515 5.129 4.739 4.438 4.116 3.779 3.435 3.07 2.804 2.521 2.078 1.78 1.472 1.308 0.982 0.643 0.258 0.058 -0.512 -0.589 -0.822 -1.067 -1.628 -1.937 -2.281 -2.649 -3.069 -3.579 -4.211 -5.895 -8 ,12843 ,TETRA ,17591397,Sat Nov 27 22:43:29 CET,Sun Nov 28 00:33:45 CET,0.0 1.544 2.186 2.649 3.057 3.41 3.713 3.992 4.476 4.7 4.921 4.965 5.523 5.704 6.034 6.365 6.689 6.835 7.113 7.384 7.771 8.006 8.226 8.54 8.852 9.16 9.43 9.679 10.009 10.321 10.619 10.971 11.313 11.638 12.026 12.453 12.842 13.263 13.692 14.144 14.616 15.107 15.65 16.175 16.752 17.336 17.932 18.516 19.022 19.345 19.248 18.475 17.425 16.261 15.177 14.215 13.348 12.501 11.731 10.947 10.285 9.707 9.134 8.59 8.078 7.582 7.064 6.609 6.215 5.795 5.346 4.975 4.589 4.185 3.866 3.533 3.188 2.832 2.461 2.21 1.956 1.556 1.263 0.947 0.789 0.451 0.098 -0.268 -0.462 -1.033 -1.104 -1.329 -1.57 -2.122 -2.417 -2.732 -3.089 -3.482 -3.988 -4.656 -6.444 -9 ,1005 ,TETRA ,17591398,Sat Nov 27 22:43:27 CET,Sun Nov 28 00:33:59 CET,0.0 2.345 3.057 3.584 4.026 4.388 4.679 4.954 5.469 5.701 5.904 5.888 6.43 6.617 6.982 7.304 7.588 7.719 7.993 8.259 8.619 8.859 9.089 9.411 9.721 10.014 10.295 10.565 10.906 11.225 11.536 11.899 12.244 12.588 12.968 13.375 13.767 14.16 14.549 14.982 15.457 15.974 16.523 17.027 17.601 18.22 18.821 19.38 19.906 20.281 20.172 19.345 18.28 17.216 16.247 15.261 14.353 13.567 12.872 12.145 11.495 10.893 10.336 9.792 9.274 8.808 8.297 7.832 7.433 7.009 6.565 6.196 5.811 5.392 5.059 4.725 4.371 4.024 3.674 3.429 3.169 2.757 2.471 2.165 2.009 1.676 1.322 0.961 0.774 0.213 0.147 -0.077 -0.305 -0.874 -1.192 -1.516 -1.869 -2.273 -2.775 -3.425 -5.005 -10 ,13617 ,TETRA ,17591399,Sat Nov 27 22:43:27 CET,Sun Nov 28 00:34:04 CET,0.0 1.533 2.14 2.609 2.984 3.301 3.601 3.88 4.372 4.6 4.819 4.858 5.418 5.598 5.929 6.231 6.526 6.669 6.948 7.207 7.561 7.789 8.007 8.324 8.634 8.92 9.189 9.457 9.794 10.114 10.414 10.767 11.116 11.454 11.836 12.255 12.652 13.081 13.53 13.987 14.443 14.922 15.449 15.957 16.536 17.13 17.734 18.334 18.869 19.179 18.976 18.145 17.125 16.082 15.039 14.029 13.115 12.275 11.544 10.783 10.094 9.48 8.898 8.344 7.834 7.365 6.873 6.427 6.03 5.623 5.189 4.822 4.455 4.061 3.739 3.407 3.07 2.71 2.316 2.051 1.798 1.405 1.124 0.825 0.67 0.347 0.017 -0.346 -0.542 -1.112 -1.15 -1.365 -1.592 -2.092 -2.394 -2.758 -3.135 -3.548 -4.061 -4.743 -6.372 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index e06a6ec1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17402 ,TETRA ,17591400,Sat Nov 27 22:43:28 CET,Sun Nov 28 00:35:52 CET,0.0 1.845 2.515 3.076 3.568 4.008 4.411 4.791 5.485 5.805 6.113 6.244 7.024 7.305 7.838 8.356 8.861 9.1 9.576 10.053 10.736 11.186 11.622 12.245 12.867 13.486 14.088 14.666 15.421 16.163 16.888 17.768 18.641 19.502 20.528 21.711 22.864 24.146 25.54 27.064 28.691 30.547 32.808 35.152 37.988 41.281 45.176 49.737 55.379 62.47 71.672 80.149 85.675 89.445 92.12 94.118 95.62 96.73 97.501 98.173 98.657 99.006 99.275 99.486 99.637 99.715 99.76 99.786 99.793 99.774 99.71 99.638 99.56 99.458 99.357 99.248 99.144 99.038 98.908 98.815 98.708 98.52 98.382 98.202 98.103 97.91 97.697 97.447 97.308 96.789 96.821 96.649 96.451 96.029 95.807 95.55 95.246 94.861 94.405 93.778 91.874 -2 ,19736 ,TETRA ,17591401,Sat Nov 27 22:43:30 CET,Sun Nov 28 00:35:40 CET,0.0 2.681 3.657 4.299 4.782 5.202 5.602 6.006 6.767 7.099 7.41 7.532 8.301 8.583 9.122 9.648 10.139 10.375 10.855 11.339 12.016 12.445 12.879 13.516 14.143 14.756 15.343 15.927 16.687 17.428 18.169 19.08 19.958 20.81 21.813 22.958 24.084 25.342 26.733 28.251 29.905 31.812 34.083 36.449 39.297 42.575 46.48 51.105 56.799 63.845 73.08 81.553 86.974 90.706 93.381 95.405 96.904 98.052 98.894 99.588 100.088 100.496 100.819 101.059 101.248 101.395 101.532 101.621 101.65 101.638 101.597 101.557 101.509 101.43 101.357 101.285 101.207 101.093 100.954 100.852 100.725 100.494 100.34 100.187 100.101 99.891 99.652 99.397 99.25 98.712 98.733 98.547 98.342 97.927 97.691 97.379 97.032 96.641 96.109 95.297 91.698 -3 ,25529 ,TETRA ,17591402,Sat Nov 27 22:46:28 CET,Sun Nov 28 00:39:24 CET,0.0 1.405 2.103 2.625 3.091 3.52 3.919 4.306 5.03 5.372 5.692 5.802 6.57 6.853 7.389 7.92 8.437 8.685 9.168 9.636 10.329 10.767 11.192 11.83 12.464 13.094 13.702 14.278 15.041 15.792 16.518 17.427 18.315 19.167 20.169 21.336 22.496 23.775 25.16 26.679 28.314 30.188 32.445 34.804 37.636 40.911 44.804 49.359 54.977 62.058 71.377 79.84 85.198 88.887 91.539 93.526 95.022 96.228 97.11 97.832 98.377 98.792 99.116 99.388 99.617 99.774 99.902 99.997 100.036 100.038 100.014 99.97 99.923 99.866 99.812 99.743 99.657 99.553 99.424 99.329 99.224 99.039 98.893 98.727 98.643 98.466 98.255 97.984 97.829 97.308 97.37 97.216 97.041 96.588 96.276 95.925 95.555 95.09 94.526 93.818 91.535 -4 ,17006 ,TETRA ,17591403,Sat Nov 27 22:46:29 CET,Sun Nov 28 00:39:38 CET,0.0 1.647 2.373 2.93 3.404 3.826 4.223 4.602 5.298 5.625 5.942 6.075 6.844 7.127 7.679 8.204 8.714 8.965 9.441 9.901 10.581 11.024 11.456 12.092 12.706 13.291 13.881 14.478 15.241 15.989 16.731 17.641 18.543 19.426 20.441 21.619 22.768 24.024 25.426 26.975 28.63 30.538 32.831 35.184 38.004 41.225 45.092 49.692 55.371 62.5 71.706 80.01 85.267 88.893 91.503 93.467 94.945 96.086 96.945 97.676 98.214 98.637 98.952 99.195 99.382 99.512 99.609 99.655 99.67 99.668 99.658 99.633 99.596 99.54 99.482 99.408 99.312 99.211 99.078 98.965 98.852 98.678 98.54 98.38 98.287 98.098 97.895 97.658 97.534 97.03 97.087 96.908 96.71 96.215 95.944 95.626 95.205 94.77 94.323 93.668 90.969 -5 ,1967 ,TETRA ,17591404,Sat Nov 27 22:46:31 CET,Sun Nov 28 00:39:06 CET,0.0 1.392 2.186 2.754 3.227 3.659 4.065 4.458 5.149 5.453 5.751 5.864 6.628 6.9 7.447 7.977 8.472 8.716 9.19 9.644 10.326 10.789 11.233 11.865 12.499 13.112 13.689 14.262 15.012 15.739 16.463 17.381 18.286 19.149 20.142 21.295 22.436 23.706 25.118 26.641 28.282 30.211 32.511 34.855 37.663 40.935 44.868 49.425 55.039 62.164 71.49 79.909 85.305 89.016 91.641 93.592 95.047 96.194 97.05 97.759 98.276 98.679 98.988 99.235 99.439 99.591 99.716 99.788 99.818 99.814 99.801 99.779 99.737 99.687 99.625 99.532 99.423 99.311 99.176 99.073 98.954 98.748 98.613 98.466 98.384 98.194 97.965 97.703 97.558 97.047 97.096 96.916 96.719 96.27 96.012 95.72 95.392 94.988 94.433 93.658 91.227 -6 ,2043 ,TETRA ,17591405,Sat Nov 27 22:46:33 CET,Sun Nov 28 00:38:48 CET,0.0 1.647 2.375 2.958 3.467 3.94 4.352 4.708 5.361 5.69 6.001 6.098 6.856 7.134 7.677 8.183 8.665 8.902 9.379 9.852 10.544 10.996 11.439 12.081 12.7 13.31 13.912 14.493 15.243 15.981 16.71 17.626 18.524 19.39 20.405 21.572 22.721 24.003 25.417 26.915 28.513 30.368 32.613 34.955 37.741 40.981 44.898 49.468 55.094 62.181 71.48 79.976 85.416 89.15 91.77 93.767 95.272 96.443 97.312 98.066 98.63 99.035 99.367 99.649 99.845 99.985 100.102 100.19 100.253 100.27 100.248 100.214 100.165 100.102 100.037 99.962 99.88 99.775 99.631 99.537 99.442 99.237 99.081 98.927 98.842 98.656 98.46 98.205 98.056 97.536 97.579 97.4 97.203 96.773 96.53 96.241 95.894 95.487 94.939 94.177 91.782 -7 ,8284 ,TETRA ,17591406,Sat Nov 27 22:49:28 CET,Sun Nov 28 00:41:14 CET,0.0 1.555 2.327 2.884 3.349 3.819 4.257 4.612 5.271 5.592 5.912 6.07 6.845 7.124 7.651 8.174 8.687 8.933 9.411 9.871 10.536 10.969 11.391 12.022 12.641 13.252 13.853 14.44 15.219 15.979 16.703 17.572 18.441 19.31 20.327 21.485 22.614 23.881 25.288 26.805 28.429 30.31 32.541 34.855 37.653 40.872 44.731 49.272 54.856 61.918 71.302 79.851 85.365 89.136 91.801 93.804 95.305 96.463 97.33 98.057 98.576 98.971 99.29 99.576 99.812 99.986 100.118 100.194 100.234 100.263 100.253 100.231 100.215 100.183 100.127 100.039 99.934 99.819 99.644 99.5 99.35 99.083 98.885 98.684 98.573 98.326 98.043 97.737 97.573 97.011 96.943 96.709 96.477 96.012 95.743 95.451 95.11 94.604 93.911 93.131 91.021 -8 ,9679 ,TETRA ,17591407,Sat Nov 27 22:49:30 CET,Sun Nov 28 00:41:28 CET,0.0 1.651 2.376 2.904 3.369 3.778 4.157 4.544 5.262 5.598 5.935 6.095 6.873 7.165 7.721 8.24 8.735 8.981 9.458 9.92 10.602 11.044 11.47 12.096 12.726 13.346 13.95 14.537 15.294 16.037 16.767 17.661 18.54 19.408 20.441 21.618 22.76 24.02 25.409 26.916 28.548 30.459 32.718 35.044 37.86 41.107 44.981 49.545 55.205 62.278 71.428 79.802 85.234 88.958 91.611 93.617 95.105 96.273 97.153 97.907 98.481 98.897 99.224 99.494 99.678 99.803 99.905 99.966 100.002 100.036 100.052 100.028 99.983 99.927 99.879 99.825 99.761 99.673 99.557 99.462 99.353 99.176 99.042 98.882 98.794 98.586 98.359 98.132 98.008 97.497 97.544 97.371 97.179 96.73 96.458 96.16 95.825 95.363 94.794 93.945 90.88 -9 ,12163 ,TETRA ,17591408,Sat Nov 27 22:49:31 CET,Sun Nov 28 00:42:41 CET,0.0 2.097 2.986 3.538 4.029 4.465 4.851 5.241 6.013 6.354 6.664 6.784 7.557 7.838 8.387 8.905 9.387 9.631 10.124 10.603 11.293 11.746 12.188 12.822 13.448 14.057 14.644 15.223 15.995 16.752 17.502 18.417 19.297 20.156 21.17 22.315 23.417 24.671 26.06 27.575 29.21 31.116 33.385 35.705 38.522 41.798 45.714 50.304 55.949 63.003 72.408 80.992 86.386 90.107 92.669 94.602 96.123 97.261 98.093 98.839 99.388 99.804 100.143 100.413 100.61 100.752 100.87 100.947 100.984 100.993 100.985 100.976 100.95 100.9 100.852 100.781 100.676 100.545 100.406 100.306 100.189 99.994 99.854 99.696 99.611 99.442 99.245 99.013 98.88 98.362 98.402 98.217 98.031 97.611 97.321 96.995 96.655 96.233 95.721 95.02 93.165 -10 ,23229 ,TETRA ,17591409,Sat Nov 27 22:49:33 CET,Sun Nov 28 00:42:16 CET,0.0 2.166 2.839 3.381 3.854 4.278 4.674 5.054 5.76 6.091 6.403 6.535 7.301 7.573 8.116 8.646 9.158 9.409 9.895 10.351 11.011 11.441 11.865 12.494 13.107 13.718 14.333 14.931 15.704 16.462 17.192 18.085 18.964 19.823 20.834 22.002 23.141 24.406 25.806 27.341 28.992 30.885 33.146 35.495 38.346 41.614 45.496 50.081 55.705 62.736 72.086 80.611 86.042 89.731 92.32 94.297 95.795 96.949 97.783 98.499 99.04 99.425 99.763 100.056 100.276 100.419 100.508 100.572 100.618 100.648 100.65 100.648 100.625 100.558 100.504 100.441 100.352 100.239 100.092 99.981 99.852 99.643 99.502 99.345 99.255 99.062 98.853 98.611 98.488 97.985 98.032 97.852 97.664 97.211 96.923 96.619 96.286 95.857 95.291 94.533 92.028 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt deleted file mode 100644 index 8e8ba7aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29313 ,TETRA ,17591410,Sat Nov 27 22:50:27 CET,Sun Nov 28 00:43:53 CET,0.0 1.257 1.772 2.176 2.528 2.857 3.163 3.419 3.869 4.08 4.279 4.192 4.861 5.025 5.333 5.637 5.925 6.071 6.368 6.655 7.062 7.314 7.562 7.917 8.259 8.592 8.907 9.212 9.608 9.982 10.336 10.758 11.155 11.538 11.975 12.477 12.952 13.465 14.017 14.588 15.189 15.866 16.611 17.307 18.12 19.012 19.99 21.049 22.17 23.303 24.375 24.755 24.621 24.253 23.761 23.256 22.749 22.175 21.673 21.185 20.702 20.246 19.809 19.391 18.988 18.602 18.199 17.846 17.549 17.242 16.916 16.634 16.341 16.032 15.783 15.511 15.213 14.898 14.569 14.36 14.149 13.799 13.56 13.293 13.15 12.873 12.576 12.226 12.023 11.339 11.375 11.137 10.87 10.233 9.889 9.543 9.126 8.604 8.001 7.351 6.06 -2 ,7892 ,TETRA ,17591411,Sat Nov 27 22:50:27 CET,Sun Nov 28 00:43:44 CET,0.0 1.487 2.021 2.433 2.786 3.1 3.368 3.612 4.07 4.27 4.458 4.334 4.986 5.158 5.494 5.784 6.058 6.203 6.48 6.743 7.102 7.324 7.544 7.862 8.182 8.492 8.778 9.061 9.432 9.805 10.169 10.602 11.012 11.383 11.832 12.343 12.793 13.304 13.867 14.434 15.037 15.696 16.444 17.212 18.081 18.999 19.996 21.064 22.233 23.456 24.614 25.007 24.826 24.463 23.974 23.439 22.922 22.39 21.877 21.333 20.871 20.448 20.012 19.589 19.172 18.767 18.339 17.964 17.63 17.262 16.882 16.572 16.239 15.882 15.615 15.345 15.076 14.803 14.493 14.263 14.016 13.643 13.393 13.12 12.978 12.697 12.392 12.068 11.895 11.24 11.323 11.104 10.882 10.392 10.108 9.788 9.441 9.079 8.647 7.981 5.785 -3 ,24623 ,TETRA ,17591412,Sat Nov 27 22:50:29 CET,Sun Nov 28 00:44:34 CET,0.0 1.172 1.703 2.116 2.488 2.8 3.056 3.298 3.748 3.949 4.148 4.024 4.669 4.837 5.151 5.438 5.711 5.844 6.101 6.351 6.718 6.95 7.172 7.506 7.825 8.125 8.405 8.675 9.034 9.372 9.682 10.044 10.408 10.768 11.188 11.67 12.137 12.646 13.184 13.744 14.335 15.003 15.747 16.472 17.308 18.191 19.185 20.272 21.432 22.632 23.687 24.058 23.925 23.556 23.088 22.557 22.034 21.522 21.039 20.509 20.022 19.565 19.118 18.694 18.285 17.889 17.465 17.094 16.77 16.44 16.086 15.776 15.454 15.114 14.85 14.576 14.28 13.963 13.659 13.446 13.209 12.84 12.579 12.293 12.146 11.864 11.572 11.245 11.073 10.423 10.505 10.303 10.088 9.585 9.313 9.013 8.629 8.141 7.625 6.998 5.168 -4 ,17792 ,TETRA ,17591413,Sat Nov 27 22:50:31 CET,Sun Nov 28 00:44:25 CET,0.0 1.209 1.685 2.084 2.443 2.748 3.005 3.234 3.64 3.83 4.024 3.924 4.592 4.771 5.087 5.374 5.661 5.806 6.076 6.335 6.715 6.967 7.212 7.532 7.824 8.115 8.393 8.661 9.037 9.416 9.773 10.186 10.558 10.911 11.327 11.784 12.206 12.667 13.154 13.693 14.322 15.022 15.788 16.536 17.388 18.3 19.265 20.334 21.564 22.816 23.911 24.358 24.3 23.979 23.54 23.077 22.619 22.142 21.704 21.203 20.737 20.327 19.936 19.557 19.182 18.846 18.477 18.127 17.822 17.503 17.158 16.862 16.568 16.279 16.04 15.776 15.501 15.215 14.918 14.717 14.515 14.189 13.947 13.678 13.54 13.228 12.861 12.476 12.273 11.584 11.577 11.319 11.052 10.451 10.118 9.778 9.375 8.898 8.381 7.772 6.309 -5 ,21315 ,TETRA ,17591414,Sat Nov 27 22:51:27 CET,Sun Nov 28 00:30:43 CET,0.0 1.237 1.742 2.14 2.472 2.766 3.041 3.293 3.724 3.929 4.131 4.036 4.697 4.887 5.251 5.58 5.891 6.047 6.35 6.633 7.022 7.268 7.515 7.859 8.183 8.5 8.807 9.115 9.511 9.889 10.25 10.665 11.06 11.437 11.87 12.349 12.806 13.298 13.827 14.39 14.961 15.581 16.279 16.996 17.856 18.796 19.824 20.908 22.071 23.212 24.224 24.574 24.431 24.042 23.526 22.962 22.422 21.882 21.367 20.832 20.343 19.895 19.455 19.025 18.599 18.198 17.812 17.455 17.124 16.796 16.464 16.184 15.886 15.558 15.31 15.053 14.77 14.49 14.19 13.972 13.753 13.394 13.141 12.875 12.721 12.402 12.099 11.778 11.603 10.947 11.038 10.837 10.615 10.128 9.847 9.527 9.187 8.828 8.385 7.763 5.94 -6 ,3229 ,TETRA ,17591415,Sat Nov 27 22:52:28 CET,Sun Nov 28 00:30:42 CET,0.0 1.486 2.033 2.457 2.809 3.113 3.388 3.63 4.073 4.291 4.496 4.39 5.051 5.224 5.57 5.891 6.171 6.305 6.578 6.844 7.209 7.432 7.654 7.978 8.287 8.586 8.874 9.158 9.509 9.847 10.176 10.567 10.932 11.267 11.667 12.12 12.548 13.026 13.553 14.071 14.596 15.221 15.949 16.702 17.559 18.459 19.492 20.608 21.805 22.996 24.083 24.489 24.29 23.878 23.4 22.903 22.423 21.905 21.403 20.871 20.396 19.972 19.515 19.04 18.614 18.231 17.809 17.415 17.089 16.749 16.398 16.101 15.782 15.465 15.234 14.979 14.693 14.393 14.072 13.843 13.605 13.246 12.999 12.74 12.603 12.319 12.021 11.68 11.489 10.824 10.908 10.701 10.482 10.002 9.735 9.439 9.106 8.746 8.314 7.55 5.813 -7 ,29965 ,TETRA ,17591416,Sat Nov 27 22:57:28 CET,Sun Nov 28 00:48:48 CET,0.0 1.447 1.976 2.361 2.696 2.983 3.249 3.491 3.932 4.133 4.332 4.226 4.878 5.036 5.342 5.642 5.932 6.074 6.34 6.597 6.971 7.195 7.415 7.738 8.056 8.385 8.705 9.011 9.402 9.78 10.138 10.561 10.969 11.359 11.812 12.31 12.784 13.3 13.85 14.42 14.991 15.639 16.38 17.096 17.943 18.845 19.791 20.836 22.01 23.179 24.286 24.754 24.592 24.195 23.755 23.261 22.764 22.266 21.787 21.282 20.852 20.455 20.059 19.671 19.285 18.924 18.531 18.17 17.853 17.528 17.19 16.9 16.604 16.302 16.055 15.785 15.496 15.198 14.898 14.686 14.46 14.098 13.848 13.59 13.452 13.163 12.854 12.519 12.345 11.708 11.823 11.611 11.392 10.895 10.616 10.32 9.979 9.597 9.155 8.518 6.804 -8 ,28627 ,TETRA ,17591417,Sat Nov 27 22:57:28 CET,Sun Nov 28 00:51:05 CET,0.0 1.13 1.592 1.967 2.302 2.593 2.841 3.081 3.527 3.731 3.927 3.82 4.466 4.629 4.95 5.266 5.591 5.74 5.997 6.243 6.614 6.86 7.095 7.436 7.773 8.108 8.42 8.712 9.1 9.468 9.819 10.252 10.659 11.045 11.5 11.999 12.463 12.98 13.539 14.126 14.729 15.412 16.199 16.922 17.748 18.639 19.591 20.615 21.679 22.805 23.858 24.228 24.083 23.713 23.238 22.681 22.166 21.655 21.154 20.632 20.164 19.73 19.297 18.868 18.458 18.089 17.712 17.37 17.063 16.739 16.388 16.081 15.764 15.444 15.19 14.924 14.644 14.361 14.069 13.862 13.644 13.293 13.046 12.79 12.659 12.385 12.087 11.775 11.613 10.966 11.06 10.861 10.651 10.168 9.9 9.616 9.288 8.928 8.503 7.943 6.043 -9 ,14898 ,TETRA ,17591418,Sat Nov 27 22:57:30 CET,Sun Nov 28 00:51:07 CET,0.0 1.499 2.088 2.476 2.807 3.113 3.385 3.627 4.061 4.255 4.449 4.347 5.005 5.178 5.5 5.786 6.053 6.187 6.456 6.701 7.035 7.26 7.488 7.812 8.11 8.407 8.697 8.972 9.326 9.651 9.973 10.395 10.778 11.127 11.564 12.089 12.593 13.121 13.682 14.269 14.876 15.56 16.337 17.082 17.916 18.831 19.874 20.958 22.083 23.251 24.279 24.675 24.522 24.126 23.652 23.13 22.594 22.056 21.57 21.05 20.577 20.144 19.707 19.279 18.883 18.485 18.079 17.736 17.412 17.062 16.688 16.378 16.046 15.687 15.421 15.142 14.836 14.513 14.161 13.917 13.66 13.245 12.955 12.645 12.493 12.212 11.902 11.549 11.371 10.714 10.813 10.614 10.397 9.911 9.626 9.328 9.015 8.581 8.049 7.425 5.712 -10 ,8516 ,TETRA ,17591419,Sat Nov 27 22:57:34 CET,Sun Nov 28 00:50:23 CET,0.0 1.374 1.889 2.299 2.637 2.92 3.179 3.425 3.862 4.068 4.27 4.166 4.822 4.992 5.339 5.67 5.979 6.122 6.389 6.643 7.0 7.225 7.443 7.759 8.07 8.377 8.668 8.951 9.313 9.657 9.978 10.338 10.682 11.029 11.433 11.893 12.346 12.834 13.361 13.929 14.512 15.161 15.903 16.635 17.448 18.294 19.229 20.241 21.372 22.561 23.612 24.029 23.878 23.468 22.997 22.486 21.971 21.457 20.967 20.441 19.938 19.476 19.053 18.623 18.193 17.806 17.399 17.014 16.685 16.342 15.965 15.654 15.315 14.944 14.663 14.369 14.06 13.729 13.397 13.174 12.925 12.538 12.262 11.969 11.824 11.521 11.187 10.785 10.564 9.875 9.916 9.686 9.444 8.984 8.731 8.432 8.106 7.734 7.299 6.729 4.92 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index 5532fe93..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29076 ,TETRA ,17591420,Sat Nov 27 22:57:34 CET,Sun Nov 28 00:47:42 CET,0.0 1.53 2.183 2.666 3.076 3.432 3.731 3.995 4.467 4.69 4.902 4.935 5.502 5.677 6.003 6.337 6.636 6.77 7.039 7.3 7.661 7.893 8.123 8.439 8.735 9.027 9.318 9.609 9.962 10.283 10.591 10.95 11.291 11.61 11.975 12.39 12.78 13.181 13.585 14.039 14.528 15.039 15.63 16.203 16.833 17.479 18.115 18.748 19.343 19.683 19.525 18.736 17.72 16.683 15.663 14.698 13.856 13.035 12.297 11.569 10.93 10.333 9.769 9.252 8.759 8.287 7.785 7.331 6.933 6.523 6.095 5.732 5.358 4.989 4.715 4.421 4.093 3.748 3.381 3.131 2.881 2.45 2.153 1.873 1.724 1.394 1.041 0.672 0.475 -0.102 -0.154 -0.384 -0.624 -1.138 -1.433 -1.764 -2.144 -2.573 -3.13 -3.873 -5.855 -2 ,10532 ,TETRA ,17591421,Sat Nov 27 22:58:07 CET,Sun Nov 28 00:49:07 CET,0.0 2.868 3.586 4.101 4.529 4.886 5.2 5.482 5.986 6.222 6.44 6.455 6.993 7.168 7.515 7.824 8.118 8.264 8.544 8.802 9.16 9.387 9.608 9.915 10.203 10.491 10.763 11.033 11.37 11.676 11.969 12.32 12.658 12.982 13.351 13.754 14.127 14.513 14.924 15.357 15.792 16.295 16.877 17.401 17.996 18.628 19.194 19.707 20.204 20.474 20.285 19.481 18.478 17.404 16.415 15.502 14.666 13.884 13.161 12.398 11.747 11.176 10.615 10.073 9.559 9.084 8.586 8.138 7.763 7.369 6.935 6.571 6.198 5.812 5.519 5.228 4.92 4.591 4.251 4.013 3.761 3.363 3.096 2.822 2.667 2.339 2.018 1.675 1.489 0.918 0.866 0.641 0.392 -0.158 -0.467 -0.803 -1.162 -1.594 -2.104 -2.731 -5.219 -3 ,31097 ,TETRA ,17591422,Sat Nov 27 22:58:08 CET,Sun Nov 28 00:49:06 CET,0.0 3.414 4.301 4.835 5.255 5.602 5.919 6.21 6.706 6.936 7.152 7.162 7.714 7.883 8.209 8.533 8.833 8.979 9.257 9.512 9.887 10.133 10.359 10.682 10.997 11.284 11.552 11.805 12.143 12.469 12.785 13.161 13.501 13.82 14.187 14.595 14.992 15.429 15.888 16.372 16.845 17.371 17.961 18.495 19.061 19.633 20.267 20.906 21.451 21.855 21.791 20.961 19.925 18.877 17.884 16.936 16.102 15.311 14.592 13.86 13.235 12.652 12.07 11.528 11.018 10.552 10.043 9.594 9.211 8.802 8.372 8.015 7.648 7.255 6.949 6.641 6.311 5.951 5.588 5.339 5.091 4.697 4.409 4.12 3.971 3.65 3.308 2.937 2.74 2.17 2.108 1.865 1.605 1.034 0.719 0.376 -0.011 -0.442 -0.948 -1.641 -3.639 -4 ,6332 ,TETRA ,17591423,Sat Nov 27 22:58:10 CET,Sun Nov 28 00:48:35 CET,0.0 1.695 2.397 2.868 3.229 3.575 3.892 4.168 4.671 4.9 5.112 5.141 5.702 5.888 6.237 6.559 6.871 7.019 7.304 7.577 7.957 8.196 8.421 8.741 9.051 9.356 9.64 9.915 10.254 10.561 10.853 11.221 11.579 11.913 12.289 12.702 13.104 13.517 13.936 14.391 14.865 15.374 15.944 16.473 17.044 17.628 18.238 18.845 19.35 19.681 19.58 18.752 17.713 16.693 15.726 14.778 13.905 13.099 12.404 11.678 11.034 10.469 9.925 9.383 8.857 8.376 7.874 7.434 7.057 6.653 6.23 5.88 5.49 5.078 4.777 4.469 4.142 3.782 3.403 3.15 2.888 2.477 2.193 1.886 1.72 1.405 1.075 0.705 0.517 -0.056 -0.11 -0.338 -0.576 -1.087 -1.378 -1.721 -2.094 -2.526 -3.074 -3.751 -5.253 -5 ,15314 ,TETRA ,17591424,Sat Nov 27 22:58:12 CET,Sun Nov 28 00:48:31 CET,0.0 2.353 3.004 3.462 3.863 4.216 4.529 4.802 5.281 5.492 5.711 5.757 6.305 6.472 6.79 7.088 7.371 7.514 7.795 8.064 8.448 8.684 8.912 9.244 9.548 9.843 10.135 10.415 10.75 11.058 11.357 11.711 12.055 12.374 12.728 13.136 13.533 13.94 14.367 14.818 15.278 15.817 16.411 16.968 17.594 18.21 18.863 19.52 20.082 20.426 20.266 19.41 18.354 17.313 16.345 15.419 14.585 13.796 13.08 12.346 11.701 11.135 10.599 10.07 9.557 9.097 8.625 8.185 7.8 7.402 6.983 6.638 6.262 5.866 5.573 5.258 4.929 4.584 4.206 3.949 3.707 3.336 3.065 2.783 2.641 2.317 1.944 1.578 1.396 0.835 0.798 0.569 0.321 -0.214 -0.509 -0.84 -1.199 -1.596 -2.158 -2.864 -4.782 -6 ,28547 ,TETRA ,17591425,Sat Nov 27 23:00:07 CET,Sun Nov 28 00:50:47 CET,0.0 2.124 2.864 3.38 3.78 4.144 4.44 4.705 5.214 5.444 5.651 5.673 6.237 6.407 6.727 7.036 7.335 7.475 7.732 7.983 8.346 8.584 8.819 9.159 9.473 9.771 10.052 10.321 10.673 10.991 11.287 11.644 12.003 12.363 12.742 13.152 13.575 14.035 14.503 14.984 15.439 15.9 16.458 17.029 17.654 18.306 18.972 19.565 20.014 20.199 19.954 19.073 18.017 17.009 16.053 15.103 14.234 13.45 12.743 11.987 11.326 10.719 10.116 9.578 9.092 8.631 8.147 7.719 7.35 6.967 6.572 6.23 5.853 5.451 5.142 4.822 4.496 4.166 3.823 3.579 3.314 2.892 2.599 2.296 2.138 1.816 1.481 1.108 0.922 0.362 0.325 0.11 -0.12 -0.637 -0.95 -1.29 -1.657 -2.139 -2.721 -3.551 -6.794 -7 ,11655 ,TETRA ,17591426,Sat Nov 27 23:00:08 CET,Sun Nov 28 00:50:46 CET,0.0 1.837 2.519 3.02 3.446 3.816 4.133 4.405 4.888 5.11 5.321 5.335 5.885 6.063 6.389 6.688 6.972 7.112 7.407 7.683 8.059 8.302 8.528 8.857 9.173 9.46 9.739 10.022 10.376 10.695 11.012 11.396 11.744 12.07 12.441 12.856 13.257 13.702 14.163 14.62 15.077 15.567 16.134 16.693 17.277 17.846 18.434 18.991 19.487 19.821 19.717 18.904 17.814 16.7 15.703 14.771 13.894 13.067 12.325 11.584 10.939 10.357 9.794 9.255 8.761 8.31 7.84 7.408 7.02 6.611 6.186 5.831 5.453 5.053 4.745 4.437 4.133 3.807 3.444 3.187 2.923 2.518 2.239 1.955 1.809 1.493 1.144 0.765 0.575 0.01 -0.053 -0.284 -0.528 -1.05 -1.35 -1.666 -2.009 -2.425 -2.935 -3.607 -5.282 -8 ,1426 ,TETRA ,17591427,Sat Nov 27 23:00:11 CET,Sun Nov 28 00:51:37 CET,0.0 1.502 2.141 2.637 3.035 3.364 3.656 3.948 4.442 4.657 4.866 4.897 5.458 5.649 6.009 6.343 6.655 6.798 7.066 7.323 7.694 7.928 8.148 8.451 8.747 9.041 9.313 9.578 9.929 10.252 10.554 10.912 11.251 11.572 11.956 12.396 12.8 13.225 13.665 14.132 14.613 15.139 15.726 16.294 16.886 17.477 18.112 18.688 19.19 19.595 19.565 18.806 17.774 16.693 15.716 14.831 13.975 13.154 12.448 11.711 11.061 10.483 9.937 9.416 8.925 8.468 7.99 7.553 7.177 6.807 6.415 6.078 5.739 5.383 5.076 4.755 4.435 4.094 3.742 3.498 3.231 2.793 2.487 2.191 2.042 1.712 1.364 0.996 0.806 0.246 0.206 -0.025 -0.274 -0.798 -1.089 -1.434 -1.829 -2.278 -2.808 -3.56 -5.724 -9 ,2088 ,TETRA ,17591428,Sat Nov 27 23:00:12 CET,Sun Nov 28 00:51:16 CET,0.0 1.643 2.468 3.178 3.65 3.988 4.314 4.634 5.166 5.39 5.597 5.614 6.167 6.359 6.714 7.024 7.335 7.484 7.762 8.036 8.397 8.625 8.857 9.169 9.446 9.715 9.989 10.264 10.61 10.924 11.232 11.616 11.97 12.3 12.681 13.109 13.506 13.932 14.388 14.855 15.324 15.823 16.391 16.932 17.539 18.221 18.92 19.517 20.041 20.403 20.277 19.451 18.441 17.406 16.405 15.447 14.616 13.844 13.145 12.388 11.734 11.187 10.635 10.101 9.599 9.125 8.648 8.217 7.812 7.391 6.971 6.617 6.245 5.864 5.547 5.224 4.915 4.594 4.262 4.029 3.782 3.388 3.099 2.798 2.649 2.329 1.99 1.632 1.443 0.877 0.835 0.603 0.307 -0.315 -0.617 -0.969 -1.357 -1.825 -2.421 -3.161 -4.83 -10 ,23968 ,TETRA ,17591429,Sat Nov 27 23:00:07 CET,Sun Nov 28 00:51:27 CET,0.0 1.796 2.442 2.936 3.349 3.728 4.053 4.346 4.887 5.126 5.333 5.335 5.886 6.076 6.433 6.757 7.066 7.213 7.482 7.737 8.117 8.359 8.594 8.918 9.232 9.537 9.831 10.12 10.482 10.823 11.141 11.514 11.877 12.211 12.583 12.987 13.368 13.784 14.235 14.697 15.132 15.603 16.146 16.658 17.203 17.775 18.4 19.014 19.539 19.854 19.686 18.781 17.677 16.611 15.637 14.691 13.797 12.98 12.275 11.532 10.883 10.321 9.756 9.213 8.709 8.234 7.729 7.296 6.933 6.54 6.121 5.772 5.41 5.036 4.748 4.444 4.129 3.809 3.464 3.206 2.943 2.535 2.253 1.96 1.798 1.46 1.113 0.747 0.557 -0.019 -0.104 -0.336 -0.563 -1.101 -1.397 -1.724 -2.121 -2.555 -3.03 -3.67 -5.657 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt deleted file mode 100644 index 45f7fae0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22925 ,TETRA ,17591430,Sat Nov 27 23:00:12 CET,Sun Nov 28 00:52:30 CET,0.0 2.521 3.201 3.682 4.086 4.431 4.741 5.028 5.558 5.785 5.992 6.02 6.564 6.736 7.089 7.441 7.757 7.905 8.191 8.453 8.829 9.08 9.322 9.652 9.968 10.273 10.57 10.852 11.196 11.533 11.842 12.207 12.577 12.919 13.303 13.745 14.171 14.629 15.096 15.568 16.045 16.576 17.174 17.736 18.382 19.065 19.768 20.438 21.09 21.625 21.718 21.072 20.209 19.29 18.384 17.452 16.567 15.698 14.928 14.175 13.508 12.887 12.272 11.704 11.165 10.646 10.094 9.612 9.205 8.771 8.291 7.893 7.495 7.074 6.746 6.405 6.042 5.656 5.262 4.998 4.713 4.246 3.92 3.576 3.398 3.014 2.599 2.176 1.95 1.344 1.231 0.969 0.703 0.111 -0.21 -0.567 -0.978 -1.453 -2.035 -2.794 -5.493 -2 ,10855 ,TETRA ,17591431,Sat Nov 27 23:00:09 CET,Sun Nov 28 00:54:25 CET,0.0 1.808 2.425 2.908 3.316 3.658 3.964 4.257 4.805 5.045 5.272 5.33 5.896 6.086 6.437 6.773 7.083 7.224 7.501 7.781 8.165 8.397 8.63 8.968 9.29 9.614 9.928 10.216 10.557 10.891 11.224 11.627 12.015 12.385 12.788 13.222 13.649 14.09 14.521 14.995 15.499 16.047 16.657 17.221 17.87 18.565 19.301 20.025 20.672 21.147 21.316 20.851 20.011 19.059 18.097 17.168 16.372 15.629 14.923 14.159 13.46 12.853 12.279 11.731 11.204 10.703 10.172 9.684 9.261 8.833 8.385 7.993 7.59 7.165 6.82 6.458 6.076 5.695 5.296 5.021 4.747 4.288 3.962 3.63 3.458 3.076 2.682 2.287 2.072 1.479 1.371 1.118 0.847 0.215 -0.128 -0.513 -0.939 -1.391 -1.987 -2.79 -5.434 -3 ,23849 ,TETRA ,17591432,Sat Nov 27 23:00:11 CET,Sun Nov 28 00:54:14 CET,0.0 1.828 2.456 2.92 3.292 3.633 3.963 4.253 4.755 4.99 5.215 5.248 5.8 5.995 6.369 6.709 7.021 7.163 7.439 7.725 8.142 8.384 8.6 8.929 9.251 9.534 9.808 10.08 10.429 10.755 11.067 11.457 11.806 12.132 12.536 12.977 13.374 13.803 14.276 14.772 15.25 15.748 16.306 16.834 17.447 18.115 18.764 19.409 20.02 20.473 20.58 19.994 19.11 18.157 17.213 16.277 15.438 14.671 13.961 13.198 12.533 11.946 11.349 10.743 10.154 9.614 9.092 8.621 8.201 7.763 7.293 6.914 6.514 6.068 5.73 5.395 5.046 4.67 4.277 4.012 3.735 3.295 2.993 2.67 2.497 2.122 1.72 1.308 1.097 0.51 0.411 0.159 -0.122 -0.756 -1.12 -1.515 -1.932 -2.438 -3.055 -3.812 -5.566 -4 ,7275 ,TETRA ,17591433,Sat Nov 27 23:01:08 CET,Sun Nov 28 00:52:33 CET,0.0 2.032 2.666 3.102 3.492 3.824 4.106 4.373 4.867 5.098 5.313 5.33 5.873 6.047 6.408 6.745 7.046 7.192 7.467 7.733 8.108 8.347 8.586 8.912 9.222 9.506 9.776 10.066 10.452 10.81 11.146 11.542 11.892 12.226 12.627 13.05 13.448 13.862 14.299 14.793 15.333 15.916 16.53 17.128 17.825 18.497 19.154 19.812 20.447 20.925 20.995 20.38 19.551 18.663 17.65 16.691 15.839 15.003 14.254 13.464 12.774 12.168 11.621 11.086 10.55 10.067 9.57 9.099 8.671 8.234 7.785 7.419 7.024 6.619 6.314 5.981 5.608 5.209 4.807 4.533 4.24 3.791 3.483 3.147 2.967 2.608 2.251 1.876 1.676 1.093 0.975 0.696 0.397 -0.228 -0.576 -0.95 -1.373 -1.866 -2.44 -3.206 -6.278 -5 ,17187 ,TETRA ,17591434,Sat Nov 27 23:01:11 CET,Sun Nov 28 00:52:26 CET,0.0 1.74 2.416 2.863 3.224 3.568 3.889 4.178 4.741 4.999 5.222 5.277 5.843 6.039 6.39 6.708 7.015 7.162 7.432 7.684 8.055 8.289 8.511 8.85 9.184 9.507 9.805 10.1 10.481 10.805 11.118 11.519 11.891 12.236 12.628 13.045 13.436 13.875 14.35 14.835 15.343 15.922 16.538 17.114 17.76 18.452 19.209 19.973 20.692 21.238 21.431 20.872 20.041 19.173 18.288 17.376 16.542 15.774 15.054 14.284 13.615 13.007 12.423 11.89 11.383 10.91 10.393 9.894 9.474 9.049 8.606 8.231 7.825 7.402 7.072 6.733 6.363 5.958 5.549 5.263 4.964 4.499 4.168 3.824 3.651 3.28 2.887 2.481 2.276 1.685 1.557 1.307 1.049 0.464 0.102 -0.357 -0.888 -1.402 -1.994 -2.816 -5.532 -6 ,31631 ,TETRA ,17591435,Sat Nov 27 23:01:13 CET,Sun Nov 28 00:52:32 CET,0.0 1.679 2.349 2.831 3.204 3.51 3.81 4.093 4.59 4.826 5.049 5.097 5.665 5.856 6.187 6.51 6.832 6.982 7.25 7.489 7.856 8.092 8.317 8.644 8.95 9.238 9.513 9.789 10.139 10.457 10.758 11.148 11.518 11.855 12.249 12.672 13.051 13.461 13.899 14.355 14.822 15.323 15.895 16.453 17.049 17.66 18.297 18.922 19.538 20.051 20.136 19.455 18.478 17.446 16.486 15.582 14.705 13.856 13.103 12.351 11.717 11.133 10.561 10.014 9.493 9.005 8.473 8.006 7.62 7.205 6.741 6.336 5.915 5.488 5.154 4.803 4.44 4.056 3.653 3.37 3.076 2.635 2.325 1.984 1.811 1.467 1.082 0.662 0.441 -0.155 -0.253 -0.505 -0.761 -1.371 -1.721 -2.094 -2.512 -2.999 -3.575 -4.311 -6.727 -7 ,12369 ,TETRA ,17591436,Sat Nov 27 23:01:08 CET,Sun Nov 28 00:52:23 CET,0.0 2.314 2.973 3.465 3.888 4.261 4.605 4.894 5.36 5.581 5.801 5.838 6.386 6.576 6.929 7.26 7.573 7.725 8.012 8.291 8.684 8.919 9.145 9.468 9.778 10.086 10.375 10.639 10.986 11.319 11.635 12.018 12.398 12.758 13.159 13.579 13.942 14.36 14.831 15.285 15.752 16.291 16.916 17.502 18.158 18.836 19.514 20.249 20.929 21.454 21.553 20.917 20.044 19.061 18.082 17.143 16.294 15.455 14.691 13.926 13.247 12.612 12.018 11.467 10.928 10.446 9.916 9.426 9.004 8.567 8.12 7.745 7.359 6.941 6.607 6.268 5.905 5.52 5.119 4.83 4.535 4.076 3.745 3.389 3.214 2.87 2.507 2.124 1.909 1.305 1.177 0.909 0.642 0.052 -0.305 -0.724 -1.168 -1.65 -2.208 -2.989 -5.578 -8 ,19295 ,TETRA ,17591437,Sat Nov 27 23:02:05 CET,Sun Nov 28 00:43:42 CET,0.0 1.488 2.127 2.635 3.061 3.424 3.753 4.042 4.551 4.79 5.018 5.061 5.619 5.804 6.157 6.482 6.779 6.918 7.198 7.476 7.866 8.111 8.354 8.712 9.048 9.354 9.643 9.916 10.266 10.602 10.921 11.309 11.664 12.001 12.392 12.804 13.197 13.635 14.084 14.543 15.037 15.595 16.214 16.831 17.519 18.213 18.895 19.529 20.155 20.641 20.733 20.193 19.344 18.493 17.609 16.69 15.839 14.981 14.209 13.462 12.819 12.226 11.612 11.029 10.494 9.98 9.451 8.98 8.56 8.105 7.635 7.267 6.861 6.424 6.09 5.731 5.36 4.986 4.599 4.318 4.012 3.531 3.207 2.874 2.7 2.361 2.006 1.598 1.384 0.785 0.663 0.376 0.089 -0.497 -0.864 -1.269 -1.698 -2.204 -2.802 -3.591 -6.352 -9 ,16670 ,TETRA ,17591438,Sat Nov 27 23:03:06 CET,Sun Nov 28 00:42:09 CET,0.0 1.988 2.715 3.208 3.611 4.015 4.343 4.6 5.076 5.301 5.515 5.55 6.121 6.306 6.631 6.948 7.26 7.403 7.675 7.942 8.321 8.548 8.77 9.098 9.405 9.716 10.014 10.297 10.668 11.016 11.326 11.69 12.05 12.386 12.768 13.197 13.6 14.035 14.499 15.007 15.535 16.103 16.722 17.303 17.954 18.635 19.375 20.137 20.837 21.355 21.443 20.888 19.992 19.009 18.086 17.188 16.398 15.692 15.006 14.243 13.613 13.052 12.48 11.937 11.404 10.894 10.356 9.861 9.451 9.027 8.562 8.19 7.798 7.38 7.066 6.727 6.373 6.013 5.639 5.376 5.092 4.645 4.329 3.998 3.823 3.457 3.07 2.657 2.433 1.829 1.729 1.48 1.21 0.569 0.2 -0.183 -0.599 -1.072 -1.642 -2.468 -5.666 -10 ,15735 ,TETRA ,17591439,Sat Nov 27 23:05:06 CET,Sun Nov 28 00:57:17 CET,0.0 3.294 3.98 4.453 4.868 5.243 5.558 5.865 6.445 6.681 6.884 6.92 7.482 7.662 8.005 8.332 8.641 8.792 9.079 9.357 9.751 9.99 10.228 10.561 10.873 11.167 11.447 11.739 12.117 12.456 12.765 13.134 13.476 13.809 14.203 14.614 14.992 15.415 15.881 16.393 16.935 17.503 18.139 18.763 19.419 20.083 20.787 21.483 22.115 22.605 22.71 22.041 21.056 19.994 18.975 17.982 17.076 16.265 15.584 14.854 14.188 13.564 12.959 12.408 11.902 11.408 10.868 10.408 10.014 9.587 9.136 8.76 8.366 7.96 7.635 7.305 6.937 6.542 6.153 5.88 5.59 5.137 4.822 4.506 4.347 3.996 3.609 3.192 2.967 2.359 2.237 1.979 1.715 1.117 0.795 0.455 0.054 -0.437 -1.084 -1.896 -4.311 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index 21eab860..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6626 ,TETRA ,17591440,Sat Nov 27 23:04:08 CET,Sun Nov 28 00:55:22 CET,0.0 2.079 2.958 3.616 4.132 4.603 5.045 5.447 6.192 6.548 6.906 7.075 7.895 8.208 8.797 9.364 9.913 10.183 10.715 11.238 12.018 12.515 12.989 13.689 14.396 15.088 15.749 16.4 17.26 18.109 18.954 20.011 21.04 22.034 23.193 24.535 25.869 27.348 28.966 30.745 32.658 34.865 37.558 40.354 43.701 47.592 52.284 57.867 64.792 73.49 85.08 95.734 102.665 107.632 111.285 114.077 116.236 117.939 119.209 120.309 121.165 121.894 122.496 122.977 123.362 123.665 123.911 124.114 124.303 124.448 124.539 124.586 124.634 124.683 124.695 124.689 124.663 124.624 124.571 124.514 124.451 124.333 124.228 124.124 124.071 123.925 123.738 123.509 123.388 122.883 122.932 122.759 122.577 122.146 121.878 121.565 121.191 120.725 120.201 119.402 116.426 -2 ,16745 ,TETRA ,17591441,Sat Nov 27 23:04:08 CET,Sun Nov 28 00:54:49 CET,0.0 1.729 2.492 3.093 3.623 4.089 4.508 4.923 5.695 6.049 6.402 6.56 7.374 7.682 8.285 8.87 9.441 9.71 10.23 10.751 11.527 12.038 12.53 13.251 13.959 14.641 15.298 15.955 16.848 17.713 18.544 19.562 20.568 21.558 22.719 24.059 25.394 26.891 28.551 30.345 32.28 34.539 37.241 40.049 43.44 47.343 52.098 57.751 64.708 73.445 85.005 95.83 102.881 107.842 111.466 114.265 116.407 118.052 119.29 120.428 121.305 121.999 122.595 123.086 123.482 123.807 124.117 124.373 124.543 124.694 124.849 124.951 125.033 125.083 125.093 125.086 125.063 125.029 124.968 124.909 124.85 124.746 124.66 124.556 124.503 124.375 124.196 123.981 123.873 123.383 123.476 123.314 123.115 122.641 122.38 122.122 121.814 121.428 120.89 120.02 116.563 -4 ,31513 ,TETRA ,17591443,Sat Nov 27 23:04:08 CET,Sun Nov 28 00:54:59 CET,0.0 1.79 2.534 3.123 3.633 4.102 4.549 4.977 5.765 6.113 6.442 6.595 7.419 7.725 8.309 8.877 9.45 9.731 10.268 10.787 11.54 12.035 12.523 13.241 13.943 14.642 15.321 15.974 16.856 17.731 18.579 19.622 20.651 21.652 22.808 24.136 25.456 26.965 28.636 30.44 32.387 34.629 37.323 40.113 43.463 47.363 52.063 57.622 64.462 73.075 84.55 95.217 102.264 107.262 110.87 113.608 115.734 117.458 118.756 119.888 120.769 121.471 122.066 122.581 122.992 123.33 123.655 123.904 124.086 124.255 124.389 124.453 124.504 124.556 124.581 124.579 124.544 124.466 124.383 124.325 124.25 124.126 124.038 123.92 123.85 123.708 123.537 123.309 123.178 122.675 122.75 122.583 122.397 121.98 121.72 121.408 121.05 120.629 120.127 119.412 114.165 -5 ,16406 ,TETRA ,17591444,Sat Nov 27 23:04:08 CET,Sun Nov 28 00:54:58 CET,0.0 1.997 2.797 3.371 3.878 4.353 4.783 5.176 5.939 6.304 6.653 6.818 7.653 7.963 8.556 9.134 9.701 9.98 10.53 11.065 11.838 12.341 12.83 13.55 14.275 14.982 15.664 16.35 17.25 18.115 18.941 19.951 20.977 21.987 23.163 24.508 25.819 27.293 28.922 30.711 32.642 34.887 37.61 40.425 43.807 47.738 52.472 58.072 65.028 73.89 85.765 96.668 103.688 108.636 112.255 115.07 117.245 118.933 120.193 121.329 122.202 122.879 123.43 123.871 124.254 124.593 124.893 125.124 125.305 125.447 125.554 125.626 125.667 125.678 125.679 125.677 125.661 125.626 125.573 125.53 125.476 125.35 125.228 125.089 125.014 124.857 124.697 124.5 124.38 123.886 123.964 123.794 123.611 123.175 122.93 122.637 122.271 121.808 121.233 120.399 112.498 -6 ,30282 ,TETRA ,17591445,Sat Nov 27 23:04:08 CET,Sun Nov 28 00:55:21 CET,0.0 2.078 2.895 3.528 4.027 4.494 4.941 5.347 6.096 6.443 6.785 6.945 7.773 8.093 8.736 9.34 9.893 10.168 10.723 11.27 12.039 12.532 13.023 13.741 14.448 15.149 15.842 16.516 17.381 18.225 19.059 20.087 21.087 22.085 23.283 24.644 25.994 27.524 29.186 30.992 32.939 35.181 37.913 40.743 44.117 48.012 52.666 58.186 65.057 73.853 85.445 95.928 102.74 107.47 110.931 113.636 115.715 117.415 118.704 119.805 120.653 121.355 121.978 122.502 122.9 123.211 123.499 123.713 123.877 124.003 124.11 124.189 124.201 124.194 124.201 124.2 124.191 124.145 124.051 123.983 123.908 123.77 123.653 123.502 123.428 123.279 123.096 122.889 122.783 122.297 122.381 122.225 122.04 121.57 121.301 121.014 120.685 120.268 119.734 118.889 115.703 -7 ,15358 ,TETRA ,17591446,Sat Nov 27 23:04:09 CET,Sun Nov 28 00:55:21 CET,0.0 1.86 2.6 3.181 3.688 4.151 4.595 5.052 5.918 6.289 6.631 6.777 7.597 7.908 8.549 9.17 9.753 10.035 10.59 11.13 11.912 12.415 12.909 13.64 14.361 15.072 15.762 16.428 17.3 18.174 19.024 20.075 21.109 22.132 23.329 24.664 25.979 27.462 29.107 30.891 32.817 35.058 37.726 40.481 43.84 47.734 52.422 58.06 65.048 73.806 85.509 96.34 103.38 108.38 112.038 114.861 116.994 118.667 119.934 121.037 121.909 122.608 123.207 123.717 124.123 124.428 124.708 124.959 125.155 125.298 125.407 125.483 125.552 125.598 125.613 125.626 125.62 125.589 125.552 125.526 125.48 125.36 125.261 125.142 125.072 124.918 124.739 124.542 124.434 123.926 123.971 123.789 123.597 123.144 122.891 122.621 122.246 121.75 121.187 120.403 117.377 -8 ,8265 ,TETRA ,17591447,Sat Nov 27 23:05:06 CET,Sun Nov 28 00:50:06 CET,0.0 1.506 2.203 2.732 3.262 3.749 4.202 4.615 5.357 5.707 6.045 6.186 7.002 7.303 7.895 8.477 9.031 9.299 9.847 10.383 11.138 11.634 12.125 12.848 13.561 14.246 14.923 15.603 16.481 17.338 18.195 19.237 20.231 21.2 22.368 23.729 25.042 26.509 28.143 29.923 31.844 34.073 36.733 39.51 42.904 46.826 51.533 57.086 63.95 72.674 84.226 94.956 102.024 106.982 110.593 113.356 115.473 117.163 118.437 119.585 120.48 121.173 121.748 122.231 122.638 122.971 123.267 123.502 123.678 123.825 123.947 124.013 124.071 124.1 124.075 124.058 124.039 123.98 123.921 123.875 123.82 123.692 123.582 123.476 123.414 123.281 123.117 122.904 122.781 122.284 122.384 122.225 122.046 121.603 121.357 121.049 120.634 120.153 119.565 118.746 115.825 -9 ,26729 ,TETRA ,17591448,Sat Nov 27 23:06:05 CET,Sun Nov 28 00:58:15 CET,0.0 1.666 2.357 2.981 3.52 4.022 4.506 4.914 5.645 6.002 6.342 6.477 7.3 7.608 8.208 8.776 9.325 9.604 10.144 10.653 11.391 11.891 12.4 13.139 13.859 14.571 15.256 15.919 16.792 17.652 18.506 19.547 20.574 21.582 22.772 24.141 25.468 26.944 28.566 30.336 32.272 34.52 37.189 39.969 43.332 47.214 51.916 57.483 64.43 73.323 85.107 95.983 103.041 108.063 111.815 114.65 116.788 118.494 119.805 120.992 121.91 122.657 123.272 123.745 124.138 124.473 124.774 125.014 125.212 125.373 125.487 125.563 125.636 125.677 125.674 125.669 125.658 125.625 125.571 125.527 125.464 125.34 125.234 125.121 125.065 124.924 124.733 124.509 124.391 123.899 123.992 123.828 123.646 123.262 123.045 122.757 122.408 121.991 121.45 120.732 118.534 -10 ,17901 ,TETRA ,17591449,Sat Nov 27 23:05:07 CET,Sun Nov 28 00:53:07 CET,0.0 1.664 2.398 3.04 3.56 4.02 4.466 4.881 5.655 6.016 6.341 6.455 7.27 7.575 8.177 8.766 9.328 9.604 10.155 10.699 11.476 11.966 12.453 13.172 13.863 14.561 15.25 15.919 16.795 17.65 18.504 19.555 20.581 21.583 22.748 24.08 25.386 26.851 28.489 30.291 32.236 34.504 37.212 40.024 43.422 47.396 52.192 57.795 64.707 73.443 84.997 95.748 102.818 107.846 111.494 114.229 116.307 117.967 119.251 120.38 121.265 121.97 122.524 123.002 123.403 123.732 124.043 124.269 124.437 124.6 124.725 124.798 124.85 124.883 124.904 124.915 124.916 124.896 124.857 124.809 124.721 124.571 124.476 124.365 124.302 124.163 123.999 123.82 123.723 123.233 123.318 123.153 122.969 122.534 122.279 121.987 121.63 121.198 120.666 119.955 117.092 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt deleted file mode 100644 index 5831b13c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30779 ,TETRA ,17591450,Sat Nov 27 23:05:06 CET,Sun Nov 28 00:56:56 CET,0.0 1.935 2.726 3.357 3.907 4.374 4.815 5.242 6.022 6.394 6.753 6.913 7.741 8.067 8.69 9.284 9.861 10.15 10.718 11.257 12.024 12.53 13.038 13.793 14.526 15.23 15.911 16.575 17.466 18.344 19.212 20.283 21.333 22.38 23.615 25.03 26.404 27.948 29.651 31.482 33.479 35.824 38.603 41.458 44.898 48.926 53.844 59.653 66.865 75.981 88.175 99.559 107.049 112.338 116.202 119.153 121.35 123.066 124.343 125.554 126.567 127.344 127.98 128.512 128.959 129.313 129.614 129.862 130.04 130.185 130.309 130.396 130.47 130.493 130.497 130.499 130.486 130.462 130.426 130.374 130.294 130.134 130.01 129.876 129.805 129.655 129.476 129.272 129.16 128.661 128.732 128.543 128.344 127.88 127.587 127.254 126.888 126.462 125.883 125.141 121.65 -2 ,1540 ,TETRA ,17591451,Sat Nov 27 23:05:08 CET,Sun Nov 28 00:57:46 CET,0.0 1.689 2.409 3.011 3.515 3.98 4.42 4.845 5.661 6.03 6.387 6.567 7.414 7.757 8.401 9.015 9.603 9.889 10.455 11.012 11.813 12.331 12.836 13.588 14.316 15.036 15.765 16.469 17.396 18.299 19.167 20.237 21.307 22.366 23.611 25.023 26.398 27.941 29.626 31.471 33.464 35.772 38.611 41.562 45.085 49.17 54.087 59.877 67.019 76.179 88.451 99.799 107.307 112.589 116.511 119.538 121.862 123.729 125.136 126.42 127.4 128.199 128.9 129.451 129.896 130.25 130.565 130.793 130.956 131.101 131.213 131.279 131.331 131.364 131.359 131.337 131.299 131.234 131.141 131.084 131.014 130.882 130.788 130.645 130.56 130.399 130.221 130.003 129.873 129.347 129.344 129.157 128.985 128.574 128.309 127.983 127.614 127.163 126.588 125.649 122.535 -3 ,24662 ,TETRA ,17591452,Sat Nov 27 23:05:07 CET,Sun Nov 28 00:56:36 CET,0.0 1.35 2.108 2.708 3.224 3.683 4.116 4.519 5.269 5.62 5.944 6.081 6.911 7.228 7.835 8.441 9.04 9.319 9.859 10.391 11.197 11.722 12.22 12.958 13.676 14.359 15.027 15.699 16.581 17.451 18.32 19.389 20.448 21.493 22.71 24.101 25.476 27.011 28.672 30.499 32.502 34.831 37.633 40.54 44.098 48.222 53.184 59.08 66.346 75.544 87.814 99.309 106.928 112.274 116.074 118.905 121.051 122.846 124.265 125.504 126.457 127.187 127.795 128.308 128.723 129.067 129.392 129.646 129.814 129.924 130.022 130.089 130.099 130.1 130.102 130.089 130.058 129.996 129.914 129.858 129.793 129.655 129.537 129.415 129.344 129.183 129.002 128.761 128.613 128.064 128.031 127.84 127.659 127.261 127.023 126.768 126.423 125.95 125.36 124.508 120.545 -4 ,797 ,TETRA ,17591453,Sat Nov 27 23:05:08 CET,Sun Nov 28 00:50:47 CET,0.0 1.785 2.489 3.073 3.609 4.116 4.581 4.992 5.757 6.117 6.466 6.658 7.503 7.831 8.474 9.088 9.689 9.977 10.523 11.074 11.881 12.392 12.89 13.637 14.379 15.112 15.827 16.524 17.43 18.318 19.197 20.275 21.326 22.364 23.592 24.984 26.344 27.887 29.608 31.438 33.394 35.704 38.502 41.399 44.874 48.908 53.776 59.58 66.836 75.997 88.173 99.498 106.933 112.199 116.038 119.011 121.291 123.118 124.532 125.759 126.688 127.426 128.052 128.604 129.054 129.402 129.725 129.978 130.146 130.285 130.404 130.496 130.558 130.58 130.59 130.581 130.545 130.511 130.485 130.455 130.413 130.297 130.191 130.082 130.025 129.909 129.742 129.496 129.363 128.874 128.955 128.775 128.596 128.146 127.87 127.556 127.187 126.786 126.311 125.511 122.097 -5 ,12191 ,TETRA ,17591454,Sat Nov 27 23:05:09 CET,Sun Nov 28 00:47:31 CET,0.0 3.565 4.6 5.237 5.759 6.248 6.715 7.148 7.922 8.28 8.615 8.762 9.585 9.916 10.565 11.153 11.721 12.006 12.568 13.115 13.919 14.441 14.947 15.684 16.414 17.151 17.871 18.577 19.509 20.428 21.323 22.395 23.433 24.469 25.694 27.089 28.474 30.028 31.725 33.586 35.596 37.904 40.677 43.559 47.039 51.078 55.969 61.768 68.926 78.01 90.162 101.492 108.944 114.265 118.233 121.29 123.63 125.529 126.984 128.223 129.155 129.881 130.483 130.998 131.427 131.798 132.122 132.342 132.516 132.677 132.815 132.911 132.988 133.037 133.046 133.038 133.026 132.975 132.883 132.808 132.74 132.618 132.502 132.37 132.285 132.095 131.92 131.713 131.592 131.088 131.138 130.976 130.789 130.314 130.013 129.672 129.322 128.896 128.305 127.473 124.391 -6 ,15605 ,TETRA ,17591455,Sat Nov 27 23:05:07 CET,Sun Nov 28 00:55:55 CET,0.0 1.681 2.488 3.104 3.627 4.094 4.541 4.957 5.72 6.088 6.444 6.62 7.439 7.748 8.371 8.967 9.544 9.83 10.378 10.91 11.696 12.211 12.725 13.477 14.213 14.935 15.64 16.337 17.248 18.145 19.031 20.114 21.167 22.188 23.412 24.826 26.182 27.68 29.346 31.168 33.144 35.474 38.286 41.2 44.752 48.875 53.811 59.607 66.782 76.014 88.364 99.858 107.534 112.924 116.807 119.769 122.002 123.808 125.181 126.342 127.198 127.887 128.498 128.988 129.397 129.749 130.045 130.295 130.503 130.68 130.832 130.929 130.977 131.011 131.026 131.032 131.032 130.994 130.938 130.903 130.835 130.685 130.598 130.489 130.419 130.273 130.107 129.889 129.757 129.247 129.32 129.153 128.977 128.54 128.273 127.972 127.619 127.189 126.592 125.685 121.476 -7 ,4441 ,TETRA ,17591456,Sat Nov 27 23:05:08 CET,Sun Nov 28 00:51:02 CET,0.0 1.885 2.651 3.252 3.771 4.229 4.649 5.044 5.813 6.191 6.552 6.738 7.573 7.881 8.467 9.04 9.609 9.89 10.457 11.025 11.837 12.359 12.873 13.632 14.375 15.079 15.765 16.46 17.375 18.27 19.158 20.234 21.292 22.343 23.539 24.91 26.267 27.792 29.48 31.342 33.367 35.673 38.481 41.45 45.012 49.068 53.889 59.661 66.957 76.27 88.653 100.204 107.778 113.048 116.854 119.851 122.152 123.922 125.246 126.374 127.241 127.937 128.516 129.001 129.386 129.714 130.019 130.249 130.409 130.556 130.701 130.799 130.882 130.921 130.916 130.909 130.891 130.846 130.787 130.723 130.63 130.475 130.344 130.189 130.11 129.929 129.73 129.496 129.356 128.839 128.912 128.738 128.54 128.052 127.755 127.443 127.082 126.669 126.122 125.338 122.356 -8 ,29416 ,TETRA ,17591457,Sat Nov 27 23:06:06 CET,Sun Nov 28 00:57:00 CET,0.0 1.859 2.573 3.16 3.704 4.178 4.608 5.031 5.792 6.158 6.501 6.645 7.47 7.783 8.391 8.969 9.536 9.824 10.377 10.913 11.711 12.247 12.78 13.546 14.274 14.984 15.697 16.395 17.295 18.189 19.059 20.11 21.154 22.2 23.439 24.852 26.248 27.801 29.492 31.344 33.34 35.629 38.417 41.334 44.868 48.931 53.818 59.691 66.934 76.136 88.45 99.689 106.921 112.054 115.903 118.935 121.165 122.877 124.186 125.347 126.231 126.94 127.551 128.06 128.475 128.812 129.129 129.385 129.569 129.728 129.875 129.94 129.98 130.044 130.088 130.095 130.082 130.073 130.026 129.963 129.885 129.755 129.642 129.52 129.447 129.274 129.088 128.86 128.728 128.233 128.341 128.164 127.967 127.532 127.27 126.979 126.621 126.141 125.571 124.788 121.095 -9 ,351 ,TETRA ,17591458,Sat Nov 27 23:07:05 CET,Sun Nov 28 00:58:55 CET,0.0 1.577 2.296 2.839 3.35 3.826 4.258 4.659 5.406 5.766 6.12 6.289 7.121 7.438 8.053 8.646 9.224 9.513 10.076 10.618 11.407 11.913 12.421 13.175 13.91 14.614 15.296 15.978 16.886 17.798 18.697 19.764 20.816 21.866 23.072 24.446 25.812 27.349 29.048 30.922 32.939 35.238 37.992 40.879 44.352 48.384 53.269 59.024 66.221 75.508 87.93 99.39 106.884 112.18 116.123 119.241 121.575 123.335 124.684 125.887 126.813 127.532 128.136 128.646 129.052 129.386 129.679 129.904 130.091 130.245 130.366 130.448 130.52 130.575 130.585 130.568 130.537 130.468 130.371 130.298 130.213 130.072 129.956 129.827 129.75 129.583 129.432 129.242 129.11 128.594 128.625 128.417 128.199 127.754 127.505 127.207 126.86 126.429 125.826 124.998 119.692 -10 ,24603 ,TETRA ,17591459,Sat Nov 27 23:06:05 CET,Sun Nov 28 00:55:43 CET,0.0 2.342 3.152 3.764 4.316 4.797 5.215 5.613 6.379 6.753 7.105 7.277 8.121 8.437 9.044 9.64 10.215 10.502 11.07 11.623 12.419 12.934 13.437 14.186 14.919 15.631 16.336 17.026 17.926 18.822 19.718 20.79 21.83 22.867 24.067 25.434 26.775 28.289 29.985 31.818 33.783 36.105 38.92 41.801 45.309 49.397 54.336 60.176 67.345 76.54 88.847 100.345 108.053 113.477 117.288 120.19 122.51 124.406 125.791 126.939 127.801 128.509 129.115 129.644 130.098 130.461 130.813 131.043 131.197 131.355 131.504 131.59 131.643 131.68 131.699 131.704 131.683 131.639 131.578 131.519 131.451 131.372 131.295 131.19 131.129 130.981 130.812 130.597 130.463 129.961 130.026 129.851 129.666 129.242 128.995 128.699 128.333 127.908 127.349 126.528 123.037 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt deleted file mode 100644 index 685ca0ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13240 ,TETRA ,17591460,Sat Nov 27 23:06:05 CET,Sun Nov 28 01:00:29 CET,0.0 3.081 3.899 4.533 5.103 5.619 6.083 6.508 7.304 7.685 8.059 8.263 9.095 9.42 10.058 10.68 11.278 11.563 12.126 12.688 13.501 14.017 14.522 15.286 16.034 16.755 17.453 18.141 19.069 19.956 20.813 21.89 22.946 23.976 25.189 26.561 27.919 29.488 31.21 33.066 35.109 37.459 40.271 43.211 46.779 50.92 55.915 61.809 69.059 78.316 90.802 102.485 110.232 115.762 119.861 123.1 125.567 127.496 128.982 130.308 131.327 132.163 132.899 133.518 134.021 134.433 134.821 135.149 135.399 135.606 135.791 135.937 136.065 136.181 136.275 136.339 136.35 136.346 136.353 136.348 136.319 136.237 136.169 136.104 136.063 135.97 135.837 135.662 135.552 135.063 135.189 135.031 134.854 134.503 134.279 134.0 133.649 133.248 132.632 131.5 126.031 -2 ,23017 ,TETRA ,17591461,Sat Nov 27 23:06:06 CET,Sun Nov 28 00:52:29 CET,0.0 2.279 3.068 3.74 4.322 4.843 5.347 5.833 6.664 7.046 7.423 7.626 8.471 8.802 9.431 10.058 10.65 10.934 11.505 12.081 12.915 13.443 13.962 14.729 15.468 16.197 16.919 17.616 18.533 19.427 20.317 21.431 22.506 23.548 24.792 26.217 27.619 29.223 30.99 32.89 34.938 37.304 40.154 43.098 46.627 50.721 55.684 61.616 69.006 78.4 91.007 102.794 110.563 116.092 120.203 123.374 125.782 127.703 129.142 130.436 131.469 132.301 133.021 133.642 134.171 134.569 134.902 135.179 135.408 135.612 135.788 135.927 136.064 136.181 136.257 136.305 136.309 136.318 136.335 136.313 136.253 136.167 136.111 136.013 135.957 135.85 135.712 135.547 135.445 134.966 135.087 134.943 134.767 134.351 134.138 133.887 133.572 133.222 132.733 131.997 127.735 -3 ,11068 ,TETRA ,17591462,Sat Nov 27 23:06:06 CET,Sun Nov 28 00:58:03 CET,0.0 4.016 4.846 5.461 6.006 6.523 7.013 7.463 8.29 8.681 9.043 9.211 10.038 10.362 11.014 11.622 12.226 12.53 13.102 13.654 14.453 14.965 15.463 16.191 16.924 17.661 18.397 19.136 20.083 20.973 21.84 22.926 24.001 25.044 26.259 27.635 28.992 30.537 32.232 34.096 36.145 38.502 41.324 44.253 47.806 51.915 56.9 62.929 70.358 79.704 92.223 103.825 111.536 117.046 121.079 124.229 126.629 128.526 130.006 131.354 132.415 133.274 134.028 134.646 135.115 135.492 135.874 136.182 136.405 136.602 136.803 136.944 137.048 137.126 137.181 137.223 137.233 137.239 137.245 137.22 137.168 137.076 136.999 136.913 136.864 136.74 136.574 136.358 136.25 135.78 135.904 135.783 135.656 135.341 135.137 134.887 134.586 134.216 133.72 132.958 128.947 -4 ,12450 ,TETRA ,17591463,Sat Nov 27 23:06:07 CET,Sun Nov 28 00:57:52 CET,0.0 2.419 3.196 3.824 4.357 4.828 5.281 5.717 6.548 6.942 7.31 7.534 8.403 8.741 9.42 10.059 10.643 10.939 11.514 12.064 12.875 13.411 13.944 14.731 15.497 16.244 16.967 17.683 18.634 19.549 20.422 21.509 22.595 23.661 24.907 26.333 27.75 29.318 31.021 32.911 34.995 37.428 40.317 43.286 46.858 50.977 55.957 61.89 69.302 78.76 91.412 103.107 110.817 116.34 120.435 123.623 125.99 127.87 129.344 130.644 131.616 132.413 133.148 133.769 134.251 134.632 134.997 135.301 135.55 135.778 135.97 136.111 136.235 136.321 136.368 136.412 136.455 136.475 136.47 136.456 136.424 136.368 136.315 136.226 136.172 136.068 135.947 135.774 135.674 135.213 135.338 135.188 135.019 134.582 134.344 134.076 133.763 133.397 132.916 132.148 128.299 -6 ,18303 ,TETRA ,17591465,Sat Nov 27 23:06:06 CET,Sun Nov 28 00:53:23 CET,0.0 2.49 3.252 3.877 4.408 4.906 5.395 5.841 6.673 7.072 7.436 7.626 8.47 8.799 9.431 10.034 10.626 10.917 11.483 12.033 12.824 13.331 13.834 14.588 15.314 16.033 16.746 17.438 18.358 19.257 20.139 21.218 22.263 23.291 24.549 26.008 27.393 28.939 30.657 32.515 34.492 36.786 39.595 42.523 46.027 50.154 55.148 61.09 68.549 77.998 90.606 102.35 110.102 115.56 119.595 122.762 125.175 127.12 128.643 129.999 131.056 131.927 132.67 133.265 133.736 134.126 134.513 134.81 135.032 135.241 135.399 135.507 135.612 135.698 135.744 135.78 135.812 135.847 135.857 135.834 135.789 135.695 135.633 135.553 135.49 135.336 135.196 135.033 134.93 134.452 134.557 134.399 134.228 133.855 133.645 133.377 133.065 132.705 132.186 131.4 127.062 -7 ,1618 ,TETRA ,17591466,Sat Nov 27 23:06:06 CET,Sun Nov 28 00:58:45 CET,0.0 2.271 3.123 3.769 4.329 4.852 5.323 5.76 6.532 6.908 7.286 7.486 8.326 8.65 9.278 9.893 10.487 10.789 11.391 11.957 12.783 13.337 13.875 14.646 15.376 16.102 16.837 17.548 18.476 19.406 20.322 21.436 22.508 23.546 24.782 26.212 27.62 29.182 30.911 32.836 34.947 37.358 40.186 43.124 46.697 50.845 55.843 61.756 69.094 78.452 91.025 102.826 110.586 116.198 120.36 123.551 125.961 127.889 129.382 130.704 131.732 132.587 133.317 133.912 134.42 134.854 135.258 135.58 135.811 136.014 136.203 136.317 136.416 136.499 136.551 136.592 136.609 136.613 136.606 136.585 136.556 136.504 136.454 136.374 136.316 136.193 136.044 135.859 135.77 135.313 135.449 135.303 135.155 134.838 134.628 134.353 134.026 133.661 133.156 132.381 129.768 -8 ,17418 ,TETRA ,17591467,Sat Nov 27 23:06:06 CET,Sun Nov 28 00:58:05 CET,0.0 2.315 3.199 3.835 4.395 4.903 5.374 5.824 6.662 7.042 7.404 7.602 8.436 8.756 9.382 9.986 10.581 10.874 11.435 11.971 12.748 13.253 13.759 14.522 15.268 15.996 16.709 17.415 18.318 19.182 20.045 21.112 22.159 23.182 24.376 25.754 27.128 28.658 30.369 32.254 34.283 36.624 39.447 42.398 45.941 50.065 55.069 61.024 68.393 77.769 90.21 101.797 109.575 115.16 119.241 122.409 124.84 126.739 128.239 129.584 130.572 131.333 131.985 132.563 133.075 133.508 133.88 134.172 134.413 134.641 134.852 135.019 135.155 135.247 135.293 135.344 135.402 135.414 135.378 135.336 135.287 135.198 135.105 135.0 134.954 134.843 134.718 134.568 134.468 134.008 134.159 134.021 133.846 133.43 133.176 132.889 132.588 132.235 131.767 131.058 127.779 -9 ,6230 ,TETRA ,17591468,Sat Nov 27 23:06:08 CET,Sun Nov 28 00:58:19 CET,0.0 1.622 2.329 2.942 3.474 3.982 4.474 4.902 5.674 6.044 6.405 6.59 7.437 7.787 8.432 9.046 9.654 9.946 10.511 11.059 11.852 12.364 12.879 13.641 14.382 15.126 15.847 16.55 17.493 18.411 19.291 20.372 21.455 22.521 23.767 25.192 26.6 28.183 29.908 31.798 33.85 36.225 39.076 42.002 45.514 49.664 54.676 60.559 67.941 77.412 90.01 101.619 109.282 114.807 118.879 122.049 124.503 126.442 127.877 129.135 130.124 130.947 131.687 132.328 132.852 133.273 133.679 133.993 134.217 134.427 134.627 134.769 134.885 134.972 135.031 135.086 135.12 135.122 135.097 135.076 135.058 134.987 134.918 134.843 134.795 134.673 134.52 134.345 134.249 133.78 133.898 133.762 133.623 133.284 133.059 132.799 132.502 132.126 131.662 131.04 128.582 -10 ,26536 ,TETRA ,17591469,Sat Nov 27 23:07:05 CET,Sun Nov 28 00:59:26 CET,0.0 2.264 3.046 3.678 4.214 4.719 5.208 5.636 6.418 6.793 7.15 7.331 8.167 8.486 9.113 9.74 10.359 10.655 11.22 11.778 12.603 13.145 13.683 14.467 15.227 15.963 16.67 17.374 18.301 19.19 20.054 21.127 22.202 23.269 24.535 25.975 27.37 28.939 30.688 32.605 34.642 36.996 39.842 42.766 46.312 50.463 55.414 61.27 68.59 77.847 90.213 101.786 109.453 114.9 118.854 121.941 124.353 126.258 127.718 129.063 130.093 130.915 131.627 132.242 132.729 133.114 133.493 133.784 133.995 134.183 134.349 134.456 134.55 134.637 134.684 134.7 134.715 134.735 134.735 134.719 134.681 134.604 134.535 134.464 134.42 134.308 134.178 134.021 133.93 133.457 133.551 133.388 133.229 132.879 132.654 132.381 132.07 131.729 131.299 130.609 124.245 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_23_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_23_62.txt deleted file mode 100644 index e6cbc8d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_23_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2718 ,KEBNE ,17022007,Wed Dec 22 05:10:05 CET,Wed Dec 22 06:36:15 CET,0.0 1.311 1.663 1.956 2.217 2.426 2.611 2.786 3.13 3.304 3.471 3.538 3.887 4.025 4.291 4.568 4.849 4.982 5.235 5.473 5.801 5.987 6.177 6.455 6.735 7.03 7.313 7.584 7.914 8.227 8.529 8.88 9.218 9.539 9.897 10.298 10.729 11.218 11.696 12.184 12.718 13.326 14.011 14.684 15.474 16.313 17.214 18.237 19.405 20.713 22.148 23.196 23.724 23.944 23.982 23.92 23.816 23.687 23.539 23.353 23.183 23.041 22.91 22.761 22.591 22.417 22.208 22.006 21.836 21.671 21.511 21.378 21.239 21.092 20.967 20.832 20.679 20.527 20.373 20.278 20.166 19.966 19.828 19.675 19.598 19.437 19.259 19.074 18.995 18.712 18.74 18.617 18.472 18.168 17.996 17.797 17.572 17.301 17.002 16.636 15.58 -2 ,28455 ,KEBNE ,17022008,Wed Dec 22 05:10:05 CET,Wed Dec 22 06:36:24 CET,0.0 0.987 1.355 1.654 1.947 2.221 2.452 2.649 3.018 3.182 3.324 3.366 3.728 3.872 4.151 4.409 4.652 4.77 4.993 5.202 5.527 5.736 5.923 6.191 6.448 6.694 6.933 7.171 7.472 7.749 8.032 8.408 8.761 9.083 9.474 9.889 10.269 10.695 11.143 11.628 12.129 12.69 13.355 13.988 14.686 15.448 16.354 17.406 18.559 19.809 21.172 22.113 22.526 22.706 22.792 22.759 22.621 22.483 22.346 22.179 22.022 21.871 21.711 21.538 21.385 21.248 21.092 20.937 20.795 20.621 20.395 20.201 20.022 19.851 19.718 19.587 19.46 19.31 19.139 19.017 18.885 18.671 18.511 18.366 18.304 18.157 17.986 17.809 17.72 17.408 17.417 17.324 17.229 16.998 16.855 16.709 16.561 16.383 16.179 15.916 15.315 -3 ,31432 ,KEBNE ,17022009,Wed Dec 22 05:10:05 CET,Wed Dec 22 06:36:57 CET,0.0 0.794 1.146 1.4 1.64 1.862 2.059 2.247 2.588 2.762 2.939 3.016 3.373 3.509 3.757 4.006 4.25 4.37 4.616 4.844 5.165 5.361 5.541 5.815 6.104 6.367 6.607 6.845 7.149 7.45 7.754 8.127 8.483 8.823 9.208 9.641 10.058 10.465 10.879 11.333 11.803 12.355 13.019 13.663 14.398 15.198 16.139 17.191 18.387 19.799 21.367 22.426 22.936 23.16 23.257 23.263 23.19 23.075 22.932 22.766 22.591 22.412 22.241 22.069 21.896 21.742 21.562 21.357 21.174 20.992 20.8 20.625 20.436 20.251 20.118 19.985 19.824 19.659 19.501 19.391 19.267 19.091 18.973 18.822 18.737 18.567 18.387 18.19 18.083 17.769 17.789 17.686 17.575 17.314 17.172 17.006 16.8 16.563 16.261 15.86 14.899 -4 ,26112 ,KEBNE ,17022010,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:37:15 CET,0.0 1.381 2.061 2.497 2.821 3.091 3.327 3.563 3.989 4.162 4.304 4.351 4.731 4.878 5.158 5.431 5.682 5.794 6.014 6.245 6.58 6.801 7.016 7.324 7.623 7.914 8.204 8.489 8.849 9.195 9.533 9.94 10.322 10.685 11.095 11.557 12.022 12.524 13.045 13.593 14.186 14.832 15.501 16.139 16.903 17.773 18.735 19.862 21.175 22.5 24.043 25.189 25.706 25.916 25.961 25.939 25.895 25.816 25.684 25.498 25.308 25.125 24.964 24.821 24.682 24.542 24.394 24.275 24.161 24.004 23.84 23.711 23.562 23.413 23.297 23.172 23.05 22.915 22.765 22.649 22.52 22.336 22.21 22.06 21.977 21.817 21.644 21.465 21.383 21.081 21.1 20.999 20.895 20.651 20.499 20.345 20.184 19.982 19.66 19.301 18.372 -5 ,20890 ,KEBNE ,17022011,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:37:30 CET,0.0 1.332 1.645 1.905 2.137 2.331 2.515 2.699 3.054 3.217 3.371 3.423 3.774 3.904 4.148 4.37 4.575 4.678 4.887 5.091 5.386 5.573 5.757 6.032 6.297 6.552 6.799 7.03 7.311 7.572 7.844 8.177 8.488 8.804 9.179 9.588 9.968 10.392 10.848 11.332 11.848 12.489 13.207 13.816 14.509 15.302 16.221 17.261 18.441 19.752 21.24 22.291 22.747 22.917 22.931 22.835 22.736 22.634 22.495 22.296 22.111 21.953 21.773 21.574 21.401 21.245 21.08 20.93 20.783 20.629 20.475 20.332 20.174 20.007 19.874 19.745 19.602 19.437 19.265 19.147 19.026 18.843 18.721 18.582 18.505 18.34 18.156 17.975 17.878 17.556 17.543 17.433 17.303 17.021 16.898 16.763 16.575 16.368 16.155 15.823 14.737 -6 ,27820 ,KEBNE ,17022012,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:38:03 CET,0.0 1.293 1.819 2.197 2.493 2.73 2.946 3.165 3.548 3.716 3.869 3.931 4.295 4.424 4.681 4.955 5.22 5.347 5.593 5.828 6.146 6.35 6.54 6.799 7.054 7.301 7.534 7.753 8.037 8.312 8.595 8.949 9.29 9.614 9.972 10.369 10.754 11.16 11.588 12.056 12.546 13.127 13.8 14.439 15.185 16.019 16.958 17.958 19.071 20.368 21.893 22.963 23.397 23.574 23.603 23.531 23.396 23.249 23.08 22.871 22.675 22.491 22.306 22.12 21.937 21.771 21.571 21.379 21.228 21.051 20.849 20.695 20.532 20.36 20.229 20.096 19.965 19.824 19.665 19.54 19.412 19.233 19.102 18.949 18.869 18.707 18.55 18.392 18.297 17.988 18.01 17.91 17.797 17.523 17.349 17.169 16.976 16.736 16.428 16.025 14.118 -7 ,8635 ,KEBNE ,17022013,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:37:44 CET,0.0 0.712 1.062 1.325 1.558 1.779 1.986 2.171 2.489 2.632 2.776 2.835 3.202 3.344 3.601 3.842 4.067 4.185 4.418 4.627 4.931 5.119 5.301 5.571 5.832 6.099 6.353 6.594 6.913 7.216 7.505 7.866 8.228 8.553 8.906 9.296 9.661 10.079 10.533 11.024 11.534 12.101 12.785 13.443 14.157 14.956 15.874 16.888 18.057 19.349 20.801 21.896 22.412 22.655 22.738 22.725 22.64 22.489 22.318 22.122 21.946 21.791 21.578 21.32 21.103 20.919 20.703 20.506 20.337 20.14 19.942 19.802 19.66 19.513 19.39 19.246 19.093 18.923 18.736 18.609 18.495 18.332 18.189 18.024 17.945 17.78 17.61 17.434 17.338 17.025 17.018 16.91 16.786 16.474 16.291 16.11 15.934 15.706 15.376 14.882 13.649 -8 ,22728 ,KEBNE ,17022014,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:37:54 CET,0.0 1.338 1.717 2.031 2.311 2.551 2.768 2.969 3.337 3.501 3.649 3.702 4.072 4.209 4.489 4.751 5.001 5.122 5.36 5.575 5.878 6.086 6.284 6.573 6.839 7.087 7.326 7.553 7.833 8.109 8.379 8.698 9.008 9.315 9.68 10.073 10.472 10.927 11.384 11.858 12.369 12.949 13.596 14.233 14.964 15.775 16.711 17.72 18.904 20.219 21.645 22.73 23.283 23.581 23.717 23.72 23.645 23.548 23.46 23.318 23.155 22.997 22.814 22.624 22.441 22.273 22.098 21.953 21.833 21.705 21.541 21.391 21.261 21.117 20.981 20.844 20.705 20.538 20.366 20.264 20.157 19.968 19.824 19.681 19.619 19.477 19.306 19.125 19.018 18.691 18.674 18.545 18.422 18.199 18.069 17.903 17.71 17.468 17.172 16.712 15.331 -9 ,20309 ,KEBNE ,17022015,Wed Dec 22 05:11:06 CET,Wed Dec 22 06:37:09 CET,0.0 1.165 1.613 1.945 2.226 2.472 2.706 2.924 3.309 3.487 3.67 3.787 4.166 4.317 4.613 4.889 5.163 5.302 5.566 5.805 6.157 6.391 6.615 6.918 7.202 7.49 7.777 8.064 8.432 8.754 9.071 9.482 9.856 10.209 10.629 11.105 11.547 12.015 12.524 13.078 13.682 14.347 15.064 15.73 16.501 17.358 18.318 19.399 20.68 22.131 23.695 24.8 25.305 25.499 25.575 25.562 25.465 25.357 25.268 25.138 24.975 24.801 24.625 24.455 24.306 24.164 23.985 23.815 23.675 23.537 23.364 23.195 23.024 22.87 22.737 22.559 22.386 22.224 22.051 21.937 21.825 21.64 21.503 21.366 21.295 21.136 20.952 20.736 20.632 20.317 20.309 20.186 20.049 19.741 19.566 19.396 19.205 18.962 18.646 18.252 17.028 -10 ,24638 ,KEBNE ,17022016,Wed Dec 22 05:11:06 CET,Wed Dec 22 06:35:54 CET,0.0 1.586 1.971 2.29 2.552 2.79 2.995 3.171 3.501 3.67 3.844 3.96 4.333 4.458 4.711 4.959 5.188 5.299 5.519 5.729 6.06 6.284 6.491 6.791 7.081 7.345 7.594 7.844 8.181 8.514 8.845 9.225 9.553 9.874 10.257 10.668 11.043 11.461 11.934 12.423 12.918 13.47 14.111 14.749 15.483 16.288 17.197 18.241 19.467 20.897 22.422 23.445 23.95 24.181 24.223 24.167 24.05 23.885 23.742 23.597 23.421 23.246 23.08 22.921 22.782 22.648 22.496 22.343 22.19 22.032 21.861 21.706 21.545 21.385 21.254 21.116 20.991 20.851 20.666 20.53 20.403 20.198 20.053 19.898 19.82 19.66 19.487 19.303 19.207 18.886 18.862 18.745 18.617 18.343 18.213 18.067 17.868 17.614 17.32 16.95 15.633 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_23_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_23_64.txt deleted file mode 100644 index 2577d068..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_23_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20518 ,KEBNE ,17022017,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:37:27 CET,0.0 0.902 1.176 1.439 1.674 1.897 2.109 2.299 2.632 2.774 2.896 2.919 3.257 3.35 3.517 3.686 3.844 3.918 4.061 4.194 4.403 4.531 4.642 4.799 4.962 5.132 5.31 5.479 5.685 5.863 6.017 6.213 6.402 6.575 6.769 7.001 7.237 7.52 7.812 8.075 8.311 8.533 8.77 8.981 9.192 9.411 9.639 9.76 9.763 9.641 9.207 8.41 7.551 6.747 6.039 5.365 4.754 4.219 3.776 3.308 2.883 2.511 2.162 1.837 1.545 1.306 1.044 0.768 0.529 0.294 0.061 -0.12 -0.305 -0.499 -0.646 -0.808 -0.972 -1.134 -1.323 -1.461 -1.609 -1.852 -2.011 -2.154 -2.229 -2.392 -2.584 -2.791 -2.888 -3.221 -3.215 -3.332 -3.456 -3.742 -3.886 -4.029 -4.192 -4.364 -4.534 -4.77 -5.547 -2 ,5932 ,KEBNE ,17022018,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:37:57 CET,0.0 1.071 1.517 1.85 2.131 2.408 2.66 2.863 3.172 3.307 3.438 3.474 3.82 3.94 4.133 4.297 4.472 4.56 4.735 4.914 5.161 5.295 5.414 5.6 5.784 5.956 6.124 6.281 6.493 6.683 6.831 7.017 7.209 7.387 7.578 7.783 7.974 8.194 8.44 8.686 8.968 9.257 9.504 9.753 10.017 10.271 10.494 10.61 10.56 10.271 9.61 8.62 7.698 6.84 6.137 5.555 5.028 4.534 4.093 3.642 3.264 2.95 2.643 2.353 2.081 1.81 1.532 1.284 1.066 0.84 0.619 0.441 0.251 0.055 -0.099 -0.258 -0.425 -0.595 -0.783 -0.914 -1.042 -1.251 -1.4 -1.552 -1.633 -1.795 -1.969 -2.168 -2.266 -2.594 -2.589 -2.696 -2.804 -3.036 -3.157 -3.296 -3.477 -3.68 -3.931 -4.278 -5.137 -3 ,12925 ,KEBNE ,17022019,Wed Dec 22 05:11:15 CET,Wed Dec 22 06:34:45 CET,0.0 0.788 1.259 1.573 1.774 1.936 2.101 2.263 2.521 2.635 2.744 2.748 3.081 3.179 3.372 3.552 3.727 3.819 3.98 4.102 4.272 4.382 4.501 4.687 4.848 4.993 5.134 5.267 5.454 5.625 5.781 5.98 6.159 6.311 6.492 6.694 6.874 7.075 7.279 7.484 7.702 7.944 8.194 8.41 8.615 8.794 8.952 9.094 9.162 9.026 8.505 7.579 6.61 5.751 5.012 4.315 3.69 3.122 2.608 2.089 1.661 1.273 0.882 0.519 0.19 -0.109 -0.423 -0.705 -0.949 -1.212 -1.492 -1.71 -1.914 -2.117 -2.286 -2.471 -2.661 -2.843 -3.033 -3.176 -3.323 -3.55 -3.709 -3.866 -3.943 -4.114 -4.292 -4.468 -4.565 -4.899 -4.902 -5.011 -5.112 -5.367 -5.516 -5.669 -5.82 -5.976 -6.156 -6.404 -7.073 -4 ,31253 ,KEBNE ,17022020,Wed Dec 22 05:11:15 CET,Wed Dec 22 06:34:48 CET,0.0 0.776 1.123 1.397 1.64 1.83 2.008 2.155 2.415 2.542 2.673 2.689 3.022 3.124 3.32 3.507 3.696 3.788 3.969 4.15 4.413 4.578 4.722 4.922 5.116 5.279 5.417 5.559 5.745 5.908 6.078 6.297 6.484 6.649 6.842 7.052 7.25 7.449 7.635 7.845 8.088 8.374 8.688 8.973 9.26 9.537 9.825 10.052 10.156 10.047 9.572 8.732 7.879 7.034 6.28 5.645 5.098 4.552 4.066 3.595 3.174 2.783 2.402 2.046 1.722 1.43 1.132 0.87 0.648 0.428 0.188 -0.02 -0.241 -0.472 -0.649 -0.816 -0.983 -1.166 -1.338 -1.465 -1.6 -1.823 -1.991 -2.154 -2.239 -2.415 -2.592 -2.775 -2.868 -3.185 -3.155 -3.257 -3.359 -3.57 -3.686 -3.819 -3.977 -4.159 -4.354 -4.607 -5.723 -5 ,32125 ,KEBNE ,17022021,Wed Dec 22 05:11:11 CET,Wed Dec 22 06:37:48 CET,0.0 1.096 1.563 1.922 2.182 2.383 2.563 2.739 3.066 3.213 3.351 3.417 3.777 3.895 4.115 4.306 4.491 4.583 4.75 4.937 5.227 5.396 5.541 5.734 5.93 6.139 6.335 6.519 6.754 6.97 7.163 7.38 7.605 7.8 7.987 8.201 8.396 8.575 8.758 8.952 9.146 9.349 9.543 9.725 9.916 10.099 10.266 10.363 10.354 10.182 9.62 8.717 7.871 7.064 6.36 5.739 5.211 4.741 4.289 3.82 3.425 3.065 2.725 2.411 2.112 1.829 1.535 1.274 1.048 0.805 0.553 0.355 0.15 -0.064 -0.238 -0.428 -0.617 -0.804 -1.005 -1.151 -1.299 -1.517 -1.67 -1.831 -1.903 -2.064 -2.252 -2.444 -2.533 -2.851 -2.821 -2.919 -3.027 -3.264 -3.381 -3.505 -3.636 -3.793 -4.021 -4.283 -4.749 -6 ,24461 ,KEBNE ,17022022,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:37:34 CET,0.0 1.152 1.418 1.64 1.864 2.086 2.289 2.458 2.754 2.894 3.033 3.05 3.384 3.489 3.686 3.888 4.056 4.128 4.281 4.43 4.64 4.763 4.883 5.06 5.231 5.41 5.579 5.744 5.954 6.139 6.329 6.583 6.823 7.041 7.284 7.546 7.772 8.017 8.286 8.537 8.747 8.985 9.324 9.645 9.927 10.143 10.342 10.552 10.699 10.605 10.038 9.029 8.097 7.281 6.57 5.914 5.352 4.86 4.439 4.014 3.64 3.307 2.978 2.657 2.377 2.129 1.858 1.614 1.405 1.173 0.904 0.679 0.459 0.232 0.048 -0.132 -0.307 -0.498 -0.689 -0.812 -0.944 -1.155 -1.303 -1.466 -1.546 -1.706 -1.874 -2.042 -2.131 -2.456 -2.451 -2.569 -2.694 -2.948 -3.073 -3.205 -3.358 -3.538 -3.746 -4.013 -4.851 -7 ,269 ,KEBNE ,17022023,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:37:24 CET,0.0 1.567 2.106 2.488 2.78 3.032 3.271 3.499 3.895 4.066 4.222 4.308 4.675 4.803 5.039 5.255 5.468 5.566 5.741 5.901 6.131 6.293 6.453 6.657 6.85 7.052 7.25 7.42 7.616 7.826 8.01 8.215 8.419 8.61 8.848 9.11 9.337 9.594 9.854 10.107 10.349 10.585 10.831 11.015 11.213 11.443 11.665 11.834 11.875 11.702 11.144 10.242 9.366 8.599 7.911 7.259 6.683 6.164 5.725 5.279 4.881 4.504 4.149 3.842 3.563 3.311 3.044 2.812 2.623 2.419 2.195 2.01 1.832 1.635 1.473 1.303 1.12 0.952 0.787 0.652 0.512 0.311 0.181 0.041 -0.033 -0.185 -0.344 -0.506 -0.59 -0.908 -0.867 -0.963 -1.064 -1.261 -1.376 -1.523 -1.683 -1.848 -2.012 -2.219 -3.329 -8 ,13727 ,KEBNE ,17022024,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:36:32 CET,0.0 0.825 1.191 1.512 1.782 1.989 2.169 2.32 2.564 2.68 2.802 2.826 3.163 3.259 3.442 3.626 3.805 3.898 4.1 4.302 4.585 4.748 4.901 5.121 5.318 5.506 5.687 5.873 6.12 6.343 6.539 6.757 6.965 7.179 7.444 7.728 7.964 8.214 8.506 8.796 9.078 9.393 9.692 9.956 10.216 10.438 10.662 10.798 10.843 10.709 10.138 9.236 8.328 7.474 6.742 6.111 5.566 5.043 4.581 4.096 3.663 3.285 2.941 2.626 2.335 2.079 1.802 1.531 1.307 1.091 0.857 0.655 0.452 0.25 0.097 -0.056 -0.218 -0.396 -0.574 -0.691 -0.818 -1.035 -1.183 -1.34 -1.422 -1.595 -1.781 -1.972 -2.073 -2.401 -2.375 -2.481 -2.587 -2.811 -2.932 -3.079 -3.246 -3.44 -3.663 -3.957 -4.598 -9 ,10852 ,KEBNE ,17022025,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:37:23 CET,0.0 1.427 1.937 2.252 2.527 2.76 2.955 3.157 3.502 3.637 3.774 3.819 4.182 4.306 4.505 4.69 4.882 4.979 5.165 5.336 5.573 5.719 5.845 6.013 6.174 6.323 6.475 6.634 6.825 6.997 7.174 7.383 7.574 7.77 8.005 8.258 8.494 8.696 8.857 9.035 9.243 9.477 9.725 9.942 10.156 10.377 10.568 10.72 10.822 10.667 10.11 9.228 8.325 7.504 6.795 6.133 5.561 5.035 4.557 4.088 3.684 3.327 2.973 2.643 2.362 2.101 1.821 1.575 1.366 1.148 0.914 0.713 0.516 0.325 0.171 0.006 -0.199 -0.41 -0.612 -0.754 -0.9 -1.142 -1.308 -1.471 -1.56 -1.73 -1.885 -2.067 -2.16 -2.491 -2.482 -2.589 -2.689 -2.892 -3.004 -3.133 -3.268 -3.444 -3.631 -3.849 -4.525 -10 ,271 ,KEBNE ,17022026,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:36:13 CET,0.0 0.754 1.092 1.338 1.56 1.742 1.896 2.038 2.3 2.415 2.53 2.53 2.847 2.937 3.143 3.341 3.51 3.592 3.734 3.867 4.088 4.231 4.352 4.51 4.679 4.847 4.981 5.106 5.269 5.449 5.638 5.82 5.975 6.131 6.302 6.499 6.699 6.913 7.124 7.356 7.61 7.874 8.145 8.382 8.637 8.843 9.008 9.152 9.205 9.054 8.489 7.58 6.75 5.933 5.15 4.446 3.831 3.281 2.78 2.277 1.878 1.536 1.203 0.856 0.54 0.269 -0.022 -0.271 -0.482 -0.722 -0.984 -1.204 -1.433 -1.65 -1.814 -1.998 -2.177 -2.358 -2.563 -2.711 -2.864 -3.092 -3.239 -3.376 -3.443 -3.597 -3.748 -3.907 -4.01 -4.342 -4.324 -4.429 -4.536 -4.787 -4.924 -5.074 -5.23 -5.425 -5.661 -5.904 -6.521 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_23_66.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_23_66.txt deleted file mode 100644 index 29e2d06b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_23_66.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4054 ,KEBNE ,17022027,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:37:44 CET,0.0 0.605 0.915 1.172 1.377 1.558 1.72 1.867 2.132 2.25 2.356 2.316 2.633 2.736 2.919 3.063 3.22 3.305 3.448 3.582 3.786 3.908 4.03 4.212 4.376 4.531 4.677 4.82 5.008 5.183 5.339 5.526 5.721 5.901 6.092 6.296 6.491 6.706 6.917 7.121 7.345 7.615 7.898 8.158 8.446 8.741 9.051 9.335 9.614 9.801 9.687 9.163 8.541 7.93 7.334 6.777 6.297 5.846 5.437 5.044 4.705 4.368 4.046 3.771 3.516 3.285 3.049 2.837 2.646 2.445 2.244 2.067 1.885 1.711 1.574 1.431 1.279 1.111 0.935 0.813 0.679 0.486 0.373 0.256 0.189 0.045 -0.096 -0.244 -0.323 -0.636 -0.592 -0.69 -0.791 -1.001 -1.112 -1.233 -1.365 -1.518 -1.725 -1.964 -2.511 -2 ,9524 ,KEBNE ,17022028,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:36:57 CET,0.0 0.895 1.202 1.464 1.659 1.818 1.982 2.131 2.388 2.511 2.633 2.638 2.975 3.085 3.277 3.446 3.605 3.69 3.851 3.993 4.201 4.348 4.481 4.651 4.821 5.004 5.175 5.327 5.525 5.721 5.908 6.121 6.328 6.525 6.736 6.952 7.167 7.395 7.6 7.842 8.098 8.347 8.652 8.946 9.255 9.566 9.851 10.106 10.301 10.362 10.225 9.683 9.031 8.427 7.88 7.365 6.87 6.432 6.061 5.677 5.332 5.002 4.695 4.423 4.168 3.93 3.687 3.469 3.281 3.08 2.866 2.693 2.519 2.336 2.194 2.061 1.928 1.776 1.606 1.49 1.374 1.2 1.08 0.948 0.874 0.719 0.562 0.406 0.326 0.017 0.072 -0.026 -0.129 -0.351 -0.471 -0.599 -0.738 -0.891 -1.083 -1.371 -1.844 -3 ,2578 ,KEBNE ,17022029,Wed Dec 22 05:11:07 CET,Wed Dec 22 06:37:32 CET,0.0 0.414 0.677 0.916 1.134 1.313 1.472 1.623 1.885 2.006 2.129 2.139 2.465 2.56 2.751 2.947 3.116 3.191 3.336 3.472 3.688 3.82 3.939 4.122 4.306 4.469 4.626 4.783 4.99 5.206 5.399 5.612 5.825 6.028 6.238 6.468 6.7 6.945 7.213 7.474 7.726 8.036 8.372 8.668 8.997 9.321 9.657 9.97 10.232 10.42 10.346 9.908 9.292 8.641 8.036 7.449 6.917 6.445 6.045 5.639 5.282 4.961 4.675 4.412 4.158 3.919 3.66 3.422 3.21 3.005 2.806 2.615 2.411 2.211 2.047 1.885 1.715 1.535 1.366 1.256 1.141 0.96 0.821 0.665 0.591 0.442 0.288 0.128 0.042 -0.273 -0.221 -0.318 -0.437 -0.669 -0.791 -0.938 -1.087 -1.254 -1.46 -1.696 -2.372 -4 ,13553 ,KEBNE ,17022030,Wed Dec 22 05:11:11 CET,Wed Dec 22 06:33:48 CET,0.0 0.629 0.993 1.24 1.431 1.601 1.762 1.906 2.171 2.298 2.417 2.424 2.764 2.868 3.08 3.285 3.479 3.58 3.768 3.933 4.158 4.312 4.465 4.695 4.91 5.105 5.3 5.491 5.731 5.958 6.182 6.453 6.713 6.967 7.247 7.543 7.811 8.113 8.446 8.726 8.972 9.266 9.61 9.93 10.312 10.728 11.134 11.496 11.772 11.928 11.837 11.338 10.693 10.067 9.516 8.975 8.48 8.05 7.671 7.283 6.909 6.58 6.281 5.983 5.708 5.454 5.178 4.941 4.73 4.489 4.238 4.025 3.799 3.566 3.388 3.215 3.046 2.867 2.675 2.549 2.419 2.209 2.066 1.926 1.856 1.697 1.513 1.325 1.236 0.911 0.93 0.827 0.711 0.454 0.307 0.143 -0.017 -0.186 -0.398 -0.636 -1.138 -5 ,16969 ,KEBNE ,17022031,Wed Dec 22 05:11:11 CET,Wed Dec 22 06:33:38 CET,0.0 0.959 1.29 1.593 1.854 2.051 2.224 2.378 2.661 2.803 2.957 3.013 3.352 3.45 3.65 3.845 4.026 4.112 4.276 4.436 4.655 4.786 4.905 5.064 5.224 5.374 5.518 5.659 5.826 5.992 6.16 6.355 6.531 6.692 6.87 7.067 7.273 7.495 7.717 7.951 8.199 8.468 8.759 9.024 9.299 9.621 9.988 10.321 10.62 10.779 10.576 10.015 9.387 8.791 8.247 7.707 7.182 6.679 6.233 5.798 5.433 5.097 4.784 4.518 4.27 4.039 3.805 3.581 3.372 3.158 2.948 2.758 2.561 2.375 2.233 2.084 1.929 1.774 1.602 1.473 1.352 1.18 1.062 0.927 0.854 0.713 0.581 0.446 0.367 0.059 0.093 -0.003 -0.1 -0.29 -0.404 -0.55 -0.699 -0.881 -1.098 -1.374 -2.049 -6 ,25649 ,KEBNE ,17022032,Wed Dec 22 05:11:11 CET,Wed Dec 22 06:31:04 CET,0.0 0.818 1.071 1.284 1.491 1.662 1.8 1.951 2.256 2.389 2.506 2.495 2.826 2.926 3.103 3.278 3.448 3.527 3.694 3.856 4.073 4.211 4.337 4.513 4.682 4.839 4.991 5.139 5.323 5.489 5.645 5.846 6.041 6.223 6.447 6.703 6.929 7.167 7.409 7.659 7.908 8.193 8.528 8.823 9.14 9.45 9.751 10.049 10.345 10.556 10.462 9.961 9.364 8.757 8.17 7.598 7.073 6.602 6.199 5.753 5.36 5.03 4.701 4.382 4.082 3.773 3.453 3.198 2.983 2.752 2.505 2.301 2.087 1.86 1.682 1.501 1.316 1.141 0.975 0.863 0.733 0.509 0.357 0.213 0.144 -0.011 -0.172 -0.339 -0.434 -0.759 -0.732 -0.838 -0.952 -1.213 -1.34 -1.463 -1.629 -1.821 -2.025 -2.273 -2.757 -7 ,32508 ,KEBNE ,17022033,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:38:41 CET,0.0 0.557 0.9 1.126 1.338 1.534 1.696 1.854 2.137 2.259 2.375 2.37 2.704 2.812 3.019 3.196 3.364 3.444 3.588 3.728 3.937 4.073 4.199 4.38 4.56 4.726 4.893 5.058 5.254 5.442 5.621 5.8 5.978 6.164 6.376 6.631 6.877 7.138 7.408 7.69 7.977 8.297 8.665 8.98 9.287 9.611 9.965 10.261 10.502 10.622 10.464 9.93 9.285 8.675 8.12 7.596 7.142 6.74 6.352 5.939 5.582 5.249 4.93 4.64 4.379 4.141 3.896 3.648 3.42 3.208 2.993 2.805 2.613 2.419 2.264 2.104 1.939 1.763 1.566 1.431 1.292 1.08 0.938 0.776 0.689 0.513 0.335 0.164 0.075 -0.246 -0.189 -0.292 -0.404 -0.667 -0.805 -0.934 -1.071 -1.224 -1.41 -1.628 -2.086 -8 ,32760 ,KEBNE ,17022034,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:37:13 CET,0.0 0.876 1.229 1.523 1.765 1.979 2.19 2.402 2.751 2.889 3.029 3.067 3.415 3.532 3.756 3.983 4.218 4.325 4.509 4.681 4.954 5.145 5.317 5.563 5.806 6.024 6.216 6.412 6.67 6.916 7.163 7.45 7.706 7.935 8.162 8.381 8.621 8.891 9.148 9.416 9.67 9.94 10.26 10.546 10.863 11.193 11.532 11.854 12.132 12.266 12.13 11.595 10.981 10.417 9.833 9.245 8.742 8.282 7.861 7.422 7.063 6.743 6.43 6.131 5.841 5.567 5.271 5.014 4.785 4.529 4.267 4.066 3.854 3.63 3.462 3.288 3.095 2.897 2.698 2.563 2.436 2.224 2.059 1.902 1.82 1.646 1.478 1.289 1.182 0.844 0.838 0.711 0.584 0.315 0.156 0.003 -0.158 -0.362 -0.573 -0.83 -1.559 -9 ,17099 ,KEBNE ,17022035,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:37:52 CET,0.0 0.524 0.779 0.954 1.13 1.286 1.401 1.514 1.759 1.861 1.954 1.911 2.217 2.303 2.488 2.659 2.802 2.875 3.022 3.155 3.37 3.507 3.614 3.773 3.934 4.095 4.255 4.411 4.596 4.777 4.959 5.163 5.361 5.542 5.753 6.006 6.235 6.466 6.692 6.922 7.155 7.415 7.723 7.987 8.264 8.56 8.855 9.139 9.392 9.546 9.438 8.903 8.308 7.721 7.125 6.524 5.969 5.455 5.019 4.602 4.238 3.896 3.557 3.252 2.965 2.687 2.394 2.138 1.927 1.715 1.476 1.268 1.05 0.837 0.677 0.511 0.341 0.146 -0.059 -0.19 -0.326 -0.545 -0.691 -0.848 -0.935 -1.099 -1.276 -1.465 -1.566 -1.914 -1.878 -1.962 -2.058 -2.302 -2.435 -2.562 -2.703 -2.868 -3.05 -3.255 -3.653 -10 ,22226 ,KEBNE ,17022036,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:38:32 CET,0.0 0.658 0.953 1.175 1.37 1.537 1.676 1.808 2.057 2.168 2.283 2.293 2.632 2.721 2.894 3.061 3.222 3.304 3.457 3.605 3.824 3.962 4.098 4.289 4.472 4.663 4.836 4.987 5.168 5.339 5.527 5.749 5.951 6.141 6.357 6.61 6.833 7.065 7.316 7.584 7.866 8.153 8.474 8.795 9.111 9.376 9.641 9.912 10.143 10.323 10.227 9.658 9.061 8.491 7.916 7.358 6.865 6.407 5.985 5.566 5.203 4.883 4.614 4.325 4.023 3.747 3.459 3.2 2.975 2.746 2.5 2.284 2.056 1.828 1.647 1.46 1.267 1.072 0.886 0.753 0.616 0.419 0.283 0.137 0.055 -0.102 -0.254 -0.435 -0.529 -0.847 -0.821 -0.928 -1.046 -1.277 -1.394 -1.526 -1.663 -1.8 -1.967 -2.209 -2.621 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_26_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_26_23.txt deleted file mode 100644 index 46ed2764..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_26_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25663 ,KEBNE ,17022037,Wed Dec 22 05:12:12 CET,Wed Dec 22 06:35:43 CET,0.0 0.862 1.261 1.541 1.751 1.913 2.059 2.184 2.404 2.509 2.609 2.579 2.865 2.953 3.127 3.296 3.457 3.528 3.657 3.775 3.95 4.055 4.148 4.29 4.43 4.575 4.711 4.828 4.979 5.143 5.295 5.439 5.559 5.665 5.793 5.924 6.032 6.156 6.289 6.39 6.468 6.534 6.591 6.637 6.662 6.609 6.406 6.071 5.48 4.439 2.662 0.483 -1.291 -2.748 -4.008 -5.155 -6.16 -7.06 -7.844 -8.634 -9.328 -9.945 -10.522 -11.102 -11.65 -12.118 -12.601 -13.023 -13.393 -13.785 -14.205 -14.546 -14.884 -15.239 -15.514 -15.79 -16.073 -16.385 -16.722 -16.952 -17.182 -17.542 -17.778 -18.007 -18.124 -18.378 -18.65 -18.939 -19.097 -19.486 -19.622 -19.814 -20.0 -20.4 -20.627 -20.861 -21.108 -21.399 -21.79 -22.355 -23.98 -2 ,7783 ,KEBNE ,17022038,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:39:52 CET,0.0 0.88 1.236 1.519 1.757 1.981 2.167 2.34 2.599 2.705 2.839 2.938 3.268 3.385 3.577 3.75 3.925 3.999 4.137 4.263 4.422 4.531 4.621 4.739 4.874 5.005 5.132 5.239 5.373 5.511 5.635 5.776 5.898 6.008 6.109 6.214 6.326 6.43 6.528 6.639 6.738 6.834 6.908 6.952 6.976 6.919 6.781 6.515 6.013 5.102 3.45 1.425 -0.221 -1.598 -2.793 -3.831 -4.711 -5.489 -6.161 -6.829 -7.399 -7.92 -8.41 -8.874 -9.312 -9.704 -10.13 -10.508 -10.841 -11.209 -11.582 -11.883 -12.189 -12.501 -12.74 -13.001 -13.279 -13.554 -13.825 -14.012 -14.205 -14.497 -14.724 -14.981 -15.104 -15.367 -15.646 -15.919 -16.058 -16.419 -16.506 -16.677 -16.876 -17.269 -17.463 -17.665 -17.869 -18.125 -18.447 -18.882 -20.206 -3 ,6375 ,KEBNE ,17022039,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:39:37 CET,0.0 1.223 1.553 1.81 2.053 2.246 2.391 2.523 2.762 2.862 2.953 2.917 3.202 3.297 3.467 3.62 3.759 3.819 3.933 4.045 4.212 4.321 4.427 4.576 4.709 4.825 4.942 5.059 5.189 5.311 5.434 5.561 5.672 5.78 5.894 6.017 6.14 6.257 6.376 6.509 6.601 6.685 6.79 6.836 6.802 6.722 6.601 6.316 5.746 4.827 3.191 1.159 -0.514 -1.927 -3.113 -4.217 -5.217 -6.103 -6.854 -7.606 -8.244 -8.801 -9.329 -9.822 -10.292 -10.715 -11.162 -11.553 -11.887 -12.242 -12.597 -12.889 -13.188 -13.499 -13.735 -13.962 -14.207 -14.473 -14.732 -14.905 -15.084 -15.38 -15.595 -15.805 -15.91 -16.123 -16.338 -16.558 -16.674 -17.027 -17.083 -17.239 -17.39 -17.677 -17.844 -18.027 -18.215 -18.464 -18.773 -19.115 -19.871 -4 ,29792 ,KEBNE ,17022040,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:39:08 CET,0.0 1.15 1.5 1.725 1.884 2.053 2.21 2.34 2.588 2.696 2.798 2.798 3.084 3.166 3.324 3.467 3.612 3.681 3.8 3.913 4.074 4.185 4.286 4.421 4.569 4.701 4.801 4.9 5.008 5.1 5.191 5.312 5.421 5.509 5.633 5.771 5.872 5.967 6.084 6.196 6.294 6.402 6.476 6.507 6.507 6.446 6.305 6.067 5.584 4.698 3.116 1.167 -0.45 -1.83 -3.061 -4.245 -5.262 -6.106 -6.832 -7.572 -8.184 -8.728 -9.273 -9.767 -10.219 -10.647 -11.076 -11.442 -11.755 -12.102 -12.46 -12.756 -13.073 -13.394 -13.634 -13.875 -14.129 -14.385 -14.65 -14.842 -15.059 -15.422 -15.674 -15.934 -16.064 -16.332 -16.611 -16.908 -17.066 -17.444 -17.545 -17.697 -17.863 -18.228 -18.411 -18.6 -18.826 -19.095 -19.422 -19.85 -21.014 -5 ,5960 ,KEBNE ,17022041,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:38:19 CET,0.0 1.028 1.471 1.747 1.958 2.174 2.371 2.525 2.792 2.921 3.047 3.044 3.327 3.412 3.565 3.7 3.814 3.866 3.98 4.099 4.267 4.367 4.461 4.605 4.738 4.864 4.973 5.076 5.21 5.335 5.457 5.594 5.713 5.83 5.945 6.069 6.196 6.315 6.439 6.58 6.702 6.779 6.838 6.873 6.842 6.771 6.595 6.258 5.714 4.793 3.111 1.042 -0.649 -2.06 -3.259 -4.327 -5.243 -6.072 -6.786 -7.51 -8.145 -8.714 -9.227 -9.713 -10.166 -10.56 -10.991 -11.397 -11.731 -12.057 -12.404 -12.684 -12.968 -13.262 -13.5 -13.756 -14.022 -14.288 -14.555 -14.743 -14.938 -15.26 -15.512 -15.783 -15.915 -16.176 -16.435 -16.709 -16.867 -17.253 -17.344 -17.515 -17.697 -18.091 -18.292 -18.517 -18.773 -19.007 -19.269 -19.622 -20.935 -6 ,31461 ,KEBNE ,17022042,Wed Dec 22 05:12:12 CET,Wed Dec 22 06:33:50 CET,0.0 0.919 1.304 1.579 1.757 1.905 2.057 2.213 2.478 2.599 2.716 2.718 3.013 3.097 3.259 3.403 3.551 3.615 3.725 3.841 4.02 4.122 4.206 4.332 4.461 4.574 4.666 4.757 4.877 4.994 5.098 5.212 5.324 5.432 5.53 5.633 5.746 5.854 5.958 6.035 6.081 6.114 6.142 6.148 6.077 5.918 5.688 5.356 4.809 3.892 2.252 0.185 -1.516 -2.935 -4.129 -5.168 -6.066 -6.938 -7.767 -8.576 -9.197 -9.736 -10.298 -10.854 -11.355 -11.806 -12.277 -12.689 -13.031 -13.379 -13.763 -14.109 -14.466 -14.815 -15.077 -15.348 -15.614 -15.88 -16.169 -16.377 -16.588 -16.912 -17.137 -17.374 -17.49 -17.728 -18.003 -18.295 -18.442 -18.831 -18.976 -19.156 -19.338 -19.734 -19.94 -20.157 -20.436 -20.796 -21.203 -21.68 -23.243 -7 ,29246 ,KEBNE ,17022043,Wed Dec 22 05:12:12 CET,Wed Dec 22 06:35:55 CET,0.0 0.82 1.132 1.392 1.589 1.747 1.908 2.038 2.23 2.34 2.454 2.435 2.719 2.803 2.952 3.086 3.227 3.294 3.407 3.518 3.692 3.793 3.885 4.018 4.15 4.285 4.396 4.49 4.623 4.758 4.884 5.028 5.15 5.262 5.377 5.488 5.605 5.745 5.875 5.975 6.08 6.187 6.262 6.303 6.315 6.257 6.087 5.774 5.225 4.241 2.524 0.543 -1.093 -2.522 -3.751 -4.887 -5.915 -6.805 -7.562 -8.341 -8.995 -9.574 -10.118 -10.637 -11.124 -11.545 -11.985 -12.375 -12.707 -13.059 -13.414 -13.701 -14.006 -14.324 -14.572 -14.821 -15.061 -15.305 -15.571 -15.756 -15.935 -16.204 -16.389 -16.581 -16.69 -16.913 -17.12 -17.345 -17.467 -17.817 -17.851 -18.0 -18.164 -18.528 -18.74 -18.949 -19.179 -19.439 -19.688 -19.99 -20.722 -8 ,14818 ,KEBNE ,17022044,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:37:51 CET,0.0 0.961 1.338 1.613 1.792 1.947 2.078 2.202 2.447 2.557 2.663 2.658 2.941 3.02 3.175 3.326 3.475 3.539 3.653 3.754 3.888 3.978 4.073 4.2 4.312 4.425 4.534 4.631 4.753 4.863 4.97 5.095 5.194 5.298 5.415 5.545 5.663 5.782 5.915 6.039 6.134 6.217 6.3 6.345 6.347 6.298 6.204 5.952 5.425 4.493 2.776 0.758 -0.931 -2.382 -3.599 -4.631 -5.54 -6.391 -7.098 -7.827 -8.467 -9.046 -9.611 -10.15 -10.655 -11.113 -11.593 -12.041 -12.42 -12.786 -13.182 -13.505 -13.822 -14.158 -14.429 -14.723 -15.023 -15.328 -15.648 -15.871 -16.106 -16.454 -16.694 -16.954 -17.089 -17.352 -17.617 -17.886 -18.023 -18.406 -18.501 -18.655 -18.829 -19.209 -19.412 -19.641 -19.925 -20.233 -20.579 -21.032 -22.591 -9 ,7308 ,KEBNE ,17022045,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:37:34 CET,0.0 1.293 1.694 1.978 2.19 2.36 2.529 2.673 2.899 2.993 3.082 3.05 3.341 3.43 3.594 3.754 3.888 3.952 4.065 4.169 4.317 4.41 4.498 4.624 4.741 4.849 4.958 5.064 5.197 5.326 5.456 5.602 5.717 5.813 5.935 6.081 6.204 6.314 6.433 6.555 6.666 6.763 6.834 6.887 6.913 6.861 6.68 6.374 5.904 5.069 3.432 1.407 -0.162 -1.509 -2.7 -3.744 -4.646 -5.461 -6.133 -6.81 -7.42 -7.948 -8.467 -8.973 -9.42 -9.819 -10.247 -10.624 -10.951 -11.297 -11.66 -11.948 -12.234 -12.529 -12.764 -13.025 -13.298 -13.591 -13.903 -14.104 -14.297 -14.602 -14.803 -15.021 -15.148 -15.409 -15.682 -15.957 -16.098 -16.476 -16.553 -16.724 -16.908 -17.306 -17.51 -17.717 -17.949 -18.228 -18.573 -19.003 -20.456 -10 ,28643 ,KEBNE ,17022046,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:39:15 CET,0.0 1.088 1.435 1.723 1.962 2.136 2.302 2.439 2.665 2.771 2.859 2.82 3.103 3.175 3.311 3.45 3.573 3.627 3.738 3.839 3.968 4.066 4.16 4.295 4.421 4.532 4.635 4.722 4.828 4.934 5.032 5.135 5.229 5.317 5.41 5.499 5.581 5.676 5.774 5.865 5.927 5.99 6.051 6.084 6.085 6.021 5.854 5.519 4.941 4.015 2.385 0.395 -1.199 -2.577 -3.818 -4.915 -5.849 -6.714 -7.45 -8.152 -8.734 -9.258 -9.767 -10.222 -10.648 -11.068 -11.527 -11.942 -12.277 -12.614 -12.972 -13.255 -13.542 -13.854 -14.111 -14.363 -14.612 -14.891 -15.174 -15.36 -15.551 -15.851 -16.072 -16.292 -16.401 -16.655 -16.921 -17.187 -17.324 -17.685 -17.753 -17.917 -18.089 -18.449 -18.65 -18.885 -19.151 -19.453 -19.815 -20.251 -21.896 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_26_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_26_57.txt deleted file mode 100644 index 2c3e036a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_26_57.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6910 ,KEBNE ,17022047,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:38:38 CET,0.0 1.66 2.216 2.654 3.042 3.361 3.604 3.808 4.196 4.385 4.558 4.662 4.993 5.132 5.389 5.609 5.814 5.922 6.128 6.313 6.559 6.712 6.878 7.12 7.337 7.544 7.752 7.96 8.225 8.452 8.657 8.906 9.143 9.367 9.635 9.946 10.24 10.549 10.87 11.185 11.495 11.812 12.158 12.497 12.836 13.193 13.503 13.65 13.708 13.564 12.879 11.717 10.655 9.631 8.672 7.849 7.117 6.486 5.955 5.347 4.801 4.293 3.798 3.345 2.937 2.58 2.23 1.912 1.627 1.34 1.058 0.825 0.568 0.314 0.129 -0.063 -0.273 -0.486 -0.703 -0.867 -1.043 -1.324 -1.527 -1.733 -1.841 -2.062 -2.282 -2.528 -2.677 -3.029 -3.086 -3.232 -3.393 -3.739 -3.951 -4.181 -4.421 -4.707 -5.024 -5.404 -6.482 -2 ,32629 ,KEBNE ,17022048,Wed Dec 22 05:12:08 CET,Wed Dec 22 06:37:30 CET,0.0 1.682 2.171 2.528 2.868 3.194 3.485 3.727 4.122 4.29 4.449 4.573 4.91 5.028 5.285 5.55 5.78 5.887 6.089 6.287 6.578 6.749 6.909 7.147 7.378 7.588 7.776 7.963 8.18 8.4 8.615 8.834 9.049 9.266 9.514 9.797 10.057 10.317 10.605 10.908 11.226 11.561 11.906 12.213 12.511 12.794 13.014 13.138 13.147 12.927 12.167 10.893 9.676 8.608 7.68 6.825 6.087 5.346 4.669 4.029 3.485 3.006 2.537 2.092 1.664 1.267 0.883 0.548 0.241 -0.095 -0.442 -0.718 -0.998 -1.292 -1.517 -1.747 -1.978 -2.214 -2.476 -2.656 -2.837 -3.117 -3.31 -3.508 -3.612 -3.817 -4.02 -4.236 -4.338 -4.661 -4.702 -4.826 -4.959 -5.253 -5.41 -5.561 -5.729 -5.91 -6.102 -6.4 -7.238 -3 ,27265 ,KEBNE ,17022049,Wed Dec 22 05:14:11 CET,Wed Dec 22 06:39:59 CET,0.0 1.613 2.117 2.487 2.788 3.027 3.238 3.419 3.783 3.968 4.133 4.231 4.581 4.721 4.977 5.231 5.468 5.576 5.791 5.996 6.255 6.404 6.56 6.788 6.997 7.206 7.411 7.601 7.833 8.035 8.231 8.466 8.675 8.87 9.121 9.411 9.659 9.927 10.21 10.465 10.698 10.951 11.241 11.542 11.847 12.119 12.376 12.544 12.549 12.285 11.498 10.241 9.115 8.16 7.299 6.511 5.816 5.181 4.628 4.052 3.544 3.117 2.728 2.333 1.942 1.555 1.177 0.832 0.482 0.107 -0.283 -0.607 -0.946 -1.306 -1.581 -1.863 -2.15 -2.441 -2.752 -2.964 -3.18 -3.518 -3.753 -3.999 -4.124 -4.371 -4.623 -4.895 -5.038 -5.391 -5.458 -5.589 -5.729 -6.054 -6.246 -6.459 -6.666 -6.903 -7.264 -7.728 -8.727 -4 ,9601 ,KEBNE ,17022050,Wed Dec 22 05:14:11 CET,Wed Dec 22 06:42:03 CET,0.0 1.504 1.967 2.299 2.626 2.922 3.168 3.382 3.795 3.984 4.153 4.288 4.641 4.795 5.069 5.309 5.549 5.658 5.875 6.099 6.41 6.591 6.745 6.976 7.221 7.439 7.617 7.796 8.049 8.282 8.492 8.759 8.998 9.189 9.424 9.71 9.958 10.201 10.454 10.733 11.026 11.352 11.706 12.009 12.346 12.675 12.945 13.129 13.196 13.018 12.31 11.197 10.236 9.326 8.459 7.644 6.9 6.261 5.733 5.172 4.667 4.21 3.793 3.41 3.048 2.713 2.357 2.032 1.754 1.48 1.195 0.933 0.664 0.388 0.19 0.013 -0.18 -0.386 -0.604 -0.767 -0.948 -1.2 -1.368 -1.556 -1.653 -1.853 -2.061 -2.271 -2.381 -2.699 -2.751 -2.896 -3.036 -3.335 -3.506 -3.702 -3.936 -4.186 -4.447 -4.847 -5.616 -5 ,12008 ,KEBNE ,17022051,Wed Dec 22 05:14:15 CET,Wed Dec 22 06:40:30 CET,0.0 1.21 1.806 2.218 2.534 2.817 3.057 3.278 3.692 3.871 4.036 4.143 4.479 4.607 4.854 5.086 5.308 5.416 5.625 5.818 6.103 6.291 6.446 6.643 6.827 7.011 7.197 7.369 7.597 7.832 8.064 8.325 8.552 8.76 9.002 9.263 9.5 9.736 9.973 10.226 10.497 10.805 11.144 11.414 11.689 11.992 12.264 12.414 12.37 12.031 11.15 9.842 8.652 7.565 6.59 5.769 4.994 4.227 3.586 2.951 2.369 1.823 1.313 0.839 0.4 0.019 -0.375 -0.729 -1.05 -1.388 -1.737 -2.045 -2.383 -2.723 -2.986 -3.258 -3.525 -3.801 -4.066 -4.24 -4.429 -4.732 -4.939 -5.17 -5.291 -5.519 -5.742 -5.986 -6.118 -6.463 -6.527 -6.686 -6.856 -7.221 -7.429 -7.647 -7.865 -8.131 -8.462 -8.855 -10.014 -6 ,17840 ,KEBNE ,17022052,Wed Dec 22 05:14:11 CET,Wed Dec 22 06:40:04 CET,0.0 1.276 1.732 2.085 2.384 2.623 2.844 3.034 3.381 3.541 3.682 3.736 4.059 4.187 4.434 4.653 4.864 4.965 5.136 5.302 5.552 5.717 5.881 6.136 6.364 6.571 6.765 6.932 7.151 7.369 7.584 7.839 8.071 8.281 8.525 8.793 9.049 9.334 9.611 9.912 10.219 10.509 10.836 11.136 11.431 11.692 11.895 12.045 12.102 11.955 11.303 10.222 9.246 8.347 7.534 6.715 5.919 5.214 4.566 3.873 3.289 2.771 2.265 1.803 1.39 0.998 0.573 0.202 -0.129 -0.48 -0.832 -1.12 -1.418 -1.721 -1.946 -2.177 -2.434 -2.717 -2.994 -3.182 -3.385 -3.69 -3.898 -4.118 -4.236 -4.477 -4.719 -4.979 -5.114 -5.452 -5.541 -5.716 -5.901 -6.284 -6.486 -6.694 -6.907 -7.145 -7.422 -7.753 -8.538 -8 ,5142 ,KEBNE ,17022054,Wed Dec 22 05:14:11 CET,Wed Dec 22 06:41:37 CET,0.0 1.846 2.385 2.817 3.154 3.416 3.642 3.844 4.231 4.396 4.535 4.605 4.939 5.069 5.322 5.549 5.772 5.897 6.112 6.283 6.532 6.705 6.877 7.116 7.348 7.567 7.779 7.989 8.253 8.51 8.732 8.974 9.229 9.476 9.732 10.034 10.319 10.602 10.899 11.194 11.46 11.766 12.126 12.481 12.853 13.181 13.463 13.64 13.726 13.583 12.939 11.889 10.892 9.936 9.061 8.277 7.573 6.875 6.22 5.589 5.064 4.589 4.144 3.745 3.37 2.992 2.559 2.173 1.826 1.458 1.109 0.823 0.515 0.231 0.021 -0.224 -0.478 -0.732 -0.985 -1.156 -1.335 -1.626 -1.82 -2.005 -2.111 -2.356 -2.625 -2.874 -2.987 -3.328 -3.419 -3.582 -3.761 -4.126 -4.302 -4.498 -4.692 -4.897 -5.196 -5.556 -6.604 -9 ,12748 ,KEBNE ,17022055,Wed Dec 22 05:14:11 CET,Wed Dec 22 06:42:15 CET,0.0 1.769 2.286 2.665 2.983 3.258 3.49 3.714 4.111 4.293 4.46 4.542 4.886 5.027 5.272 5.499 5.72 5.828 6.018 6.188 6.444 6.606 6.758 6.989 7.195 7.387 7.575 7.769 8.017 8.23 8.446 8.706 8.93 9.128 9.373 9.664 9.916 10.168 10.443 10.721 11.004 11.315 11.64 11.927 12.202 12.458 12.71 12.917 12.929 12.659 11.932 10.811 9.796 8.867 8.007 7.24 6.595 5.996 5.454 4.931 4.493 4.065 3.654 3.279 2.924 2.609 2.27 1.972 1.716 1.443 1.149 0.881 0.617 0.351 0.137 -0.076 -0.306 -0.556 -0.821 -1.0 -1.172 -1.439 -1.634 -1.87 -2.001 -2.275 -2.559 -2.852 -2.995 -3.345 -3.418 -3.568 -3.735 -4.09 -4.274 -4.486 -4.724 -4.955 -5.218 -5.61 -6.666 -10 ,32013 ,KEBNE ,17022056,Wed Dec 22 05:14:11 CET,Wed Dec 22 06:42:54 CET,0.0 1.311 1.772 2.133 2.427 2.688 2.912 3.12 3.47 3.63 3.808 3.912 4.236 4.366 4.634 4.875 5.079 5.176 5.371 5.561 5.825 5.99 6.147 6.38 6.59 6.778 6.975 7.172 7.425 7.658 7.872 8.13 8.365 8.573 8.802 9.058 9.301 9.566 9.877 10.173 10.448 10.757 11.082 11.355 11.626 11.924 12.207 12.378 12.413 12.204 11.467 10.333 9.271 8.321 7.482 6.707 6.026 5.409 4.88 4.351 3.897 3.487 3.098 2.711 2.335 2.001 1.609 1.218 0.888 0.565 0.219 -0.086 -0.387 -0.69 -0.935 -1.18 -1.418 -1.675 -1.952 -2.142 -2.332 -2.632 -2.853 -3.081 -3.194 -3.431 -3.672 -3.917 -4.049 -4.393 -4.471 -4.641 -4.812 -5.191 -5.415 -5.662 -5.929 -6.23 -6.533 -6.936 -7.997 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_26_68.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_26_68.txt deleted file mode 100644 index cc99246d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_26_68.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24710 ,KEBNE ,17022057,Wed Dec 22 05:14:11 CET,Wed Dec 22 06:42:51 CET,0.0 1.531 1.975 2.342 2.657 2.873 3.058 3.271 3.675 3.839 4.002 4.127 4.479 4.615 4.864 5.096 5.322 5.427 5.626 5.836 6.127 6.298 6.445 6.622 6.793 6.958 7.109 7.262 7.479 7.701 7.906 8.128 8.319 8.499 8.719 8.931 9.131 9.382 9.678 9.969 10.213 10.453 10.711 10.975 11.241 11.447 11.607 11.714 11.694 11.475 10.788 9.772 8.857 8.001 7.233 6.528 5.899 5.32 4.825 4.314 3.855 3.449 3.068 2.705 2.348 2.033 1.702 1.385 1.117 0.838 0.521 0.247 -0.029 -0.321 -0.541 -0.76 -0.981 -1.189 -1.406 -1.57 -1.748 -2.018 -2.212 -2.416 -2.524 -2.759 -2.995 -3.232 -3.361 -3.708 -3.82 -3.995 -4.172 -4.562 -4.772 -4.976 -5.183 -5.434 -5.784 -6.261 -7.71 -2 ,32548 ,KEBNE ,17022058,Wed Dec 22 05:14:11 CET,Wed Dec 22 06:39:53 CET,0.0 1.573 2.055 2.378 2.634 2.857 3.068 3.256 3.602 3.754 3.883 3.955 4.28 4.396 4.626 4.846 5.056 5.16 5.368 5.548 5.787 5.948 6.118 6.363 6.571 6.756 6.918 7.081 7.319 7.544 7.766 8.001 8.19 8.398 8.644 8.886 9.113 9.355 9.586 9.836 10.108 10.39 10.661 10.888 11.154 11.449 11.684 11.824 11.894 11.703 11.0 9.99 9.149 8.413 7.693 6.981 6.346 5.761 5.255 4.756 4.288 3.854 3.458 3.069 2.7 2.366 2.022 1.712 1.431 1.148 0.867 0.601 0.31 0.035 -0.156 -0.344 -0.54 -0.735 -0.937 -1.08 -1.23 -1.474 -1.639 -1.806 -1.899 -2.096 -2.299 -2.511 -2.62 -2.948 -3.001 -3.142 -3.281 -3.593 -3.8 -4.063 -4.369 -4.675 -5.015 -5.522 -7.826 -3 ,8163 ,KEBNE ,17022059,Wed Dec 22 05:14:11 CET,Wed Dec 22 06:40:36 CET,0.0 1.628 2.079 2.37 2.637 2.863 3.035 3.191 3.481 3.608 3.729 3.76 4.082 4.205 4.441 4.644 4.822 4.911 5.066 5.216 5.447 5.608 5.766 5.979 6.171 6.345 6.51 6.67 6.863 7.054 7.257 7.484 7.688 7.869 8.069 8.31 8.533 8.764 9.001 9.226 9.477 9.769 10.059 10.315 10.552 10.72 10.862 10.977 10.998 10.817 10.197 9.219 8.317 7.484 6.719 6.026 5.433 4.885 4.369 3.813 3.308 2.835 2.365 1.924 1.524 1.168 0.791 0.44 0.136 -0.172 -0.487 -0.736 -0.999 -1.283 -1.498 -1.724 -1.956 -2.173 -2.381 -2.544 -2.717 -2.955 -3.109 -3.273 -3.354 -3.521 -3.707 -3.896 -4.002 -4.335 -4.388 -4.512 -4.649 -4.941 -5.106 -5.303 -5.511 -5.741 -6.008 -6.327 -7.035 -4 ,12503 ,KEBNE ,17022060,Wed Dec 22 05:14:11 CET,Wed Dec 22 06:40:30 CET,0.0 1.453 1.84 2.166 2.432 2.641 2.849 3.046 3.38 3.52 3.649 3.69 4.006 4.13 4.36 4.566 4.761 4.851 5.028 5.203 5.436 5.574 5.703 5.894 6.074 6.265 6.455 6.617 6.831 7.043 7.241 7.454 7.64 7.817 8.018 8.241 8.451 8.674 8.906 9.162 9.41 9.633 9.868 10.083 10.315 10.527 10.749 10.935 10.994 10.828 10.178 9.082 8.102 7.17 6.304 5.54 4.856 4.234 3.715 3.199 2.765 2.38 2.006 1.673 1.361 1.059 0.738 0.458 0.229 -0.011 -0.279 -0.505 -0.734 -0.967 -1.171 -1.411 -1.66 -1.913 -2.185 -2.369 -2.558 -2.864 -3.076 -3.298 -3.418 -3.649 -3.872 -4.103 -4.228 -4.578 -4.65 -4.798 -4.953 -5.298 -5.489 -5.686 -5.917 -6.172 -6.476 -6.864 -8.177 -5 ,23892 ,KEBNE ,17022061,Wed Dec 22 05:14:11 CET,Wed Dec 22 06:41:11 CET,0.0 1.203 1.626 1.834 2.053 2.27 2.454 2.64 3.012 3.174 3.315 3.378 3.713 3.824 4.026 4.223 4.414 4.507 4.672 4.825 5.066 5.228 5.387 5.605 5.798 5.976 6.154 6.325 6.536 6.737 6.915 7.111 7.279 7.443 7.641 7.863 8.066 8.269 8.472 8.694 8.933 9.192 9.453 9.705 9.979 10.195 10.398 10.554 10.625 10.54 9.989 9.043 8.21 7.455 6.766 6.126 5.571 5.086 4.655 4.201 3.798 3.453 3.137 2.845 2.572 2.308 2.026 1.777 1.566 1.341 1.08 0.851 0.623 0.397 0.219 0.038 -0.136 -0.332 -0.547 -0.679 -0.816 -1.054 -1.22 -1.381 -1.465 -1.633 -1.802 -1.992 -2.098 -2.419 -2.43 -2.55 -2.694 -3.05 -3.242 -3.429 -3.647 -3.906 -4.222 -4.586 -5.822 -6 ,26462 ,KEBNE ,17022062,Wed Dec 22 05:14:11 CET,Wed Dec 22 06:41:39 CET,0.0 0.971 1.429 1.776 2.046 2.266 2.458 2.633 2.958 3.129 3.307 3.417 3.758 3.897 4.15 4.357 4.531 4.615 4.776 4.937 5.17 5.311 5.448 5.658 5.85 6.016 6.181 6.353 6.59 6.824 7.018 7.212 7.403 7.587 7.806 8.061 8.295 8.544 8.783 9.009 9.227 9.438 9.672 9.893 10.105 10.308 10.49 10.589 10.534 10.27 9.602 8.498 7.456 6.532 5.725 4.948 4.267 3.684 3.153 2.578 2.044 1.577 1.177 0.808 0.45 0.113 -0.241 -0.551 -0.818 -1.113 -1.417 -1.657 -1.9 -2.147 -2.345 -2.549 -2.754 -2.97 -3.211 -3.391 -3.582 -3.87 -4.059 -4.259 -4.368 -4.59 -4.803 -5.025 -5.145 -5.471 -5.521 -5.661 -5.817 -6.157 -6.357 -6.572 -6.799 -7.043 -7.31 -7.723 -9.155 -7 ,13619 ,KEBNE ,17022063,Wed Dec 22 05:15:12 CET,Wed Dec 22 06:41:04 CET,0.0 1.315 1.741 2.044 2.367 2.625 2.803 2.991 3.318 3.44 3.566 3.57 3.873 3.975 4.185 4.39 4.584 4.67 4.838 5.01 5.254 5.411 5.548 5.728 5.918 6.095 6.257 6.432 6.646 6.846 7.032 7.249 7.467 7.645 7.852 8.103 8.323 8.573 8.84 9.076 9.323 9.598 9.846 10.073 10.358 10.639 10.876 11.039 11.03 10.786 10.005 8.736 7.6 6.608 5.764 5.013 4.332 3.713 3.165 2.602 2.116 1.688 1.32 1.0 0.674 0.362 0.052 -0.223 -0.454 -0.695 -0.944 -1.168 -1.418 -1.649 -1.813 -1.99 -2.178 -2.365 -2.548 -2.678 -2.816 -3.041 -3.209 -3.395 -3.492 -3.68 -3.88 -4.096 -4.207 -4.53 -4.568 -4.693 -4.819 -5.093 -5.242 -5.411 -5.611 -5.813 -6.03 -6.342 -7.331 -8 ,29212 ,KEBNE ,17022064,Wed Dec 22 05:15:12 CET,Wed Dec 22 06:42:51 CET,0.0 1.155 1.616 1.947 2.179 2.391 2.613 2.811 3.161 3.333 3.484 3.56 3.908 4.032 4.268 4.467 4.637 4.739 4.932 5.088 5.299 5.441 5.593 5.813 6.016 6.209 6.396 6.572 6.779 6.967 7.148 7.367 7.562 7.741 7.959 8.221 8.471 8.727 8.972 9.218 9.501 9.791 10.094 10.37 10.632 10.886 11.118 11.297 11.395 11.278 10.723 9.726 8.738 7.843 7.044 6.289 5.627 5.049 4.535 3.988 3.51 3.091 2.695 2.31 1.938 1.584 1.19 0.842 0.552 0.263 -0.039 -0.294 -0.558 -0.815 -1.0 -1.191 -1.389 -1.615 -1.87 -2.043 -2.22 -2.5 -2.701 -2.897 -2.989 -3.196 -3.428 -3.679 -3.815 -4.162 -4.253 -4.415 -4.586 -4.94 -5.137 -5.359 -5.6 -5.868 -6.136 -6.439 -7.254 -9 ,15386 ,KEBNE ,17022065,Wed Dec 22 05:15:12 CET,Wed Dec 22 06:43:12 CET,0.0 1.462 1.97 2.345 2.632 2.908 3.179 3.395 3.734 3.91 4.059 4.098 4.413 4.53 4.761 4.963 5.139 5.226 5.408 5.578 5.81 5.957 6.097 6.292 6.474 6.636 6.794 6.971 7.187 7.372 7.55 7.766 7.96 8.156 8.384 8.604 8.814 9.057 9.3 9.51 9.736 10.0 10.244 10.443 10.643 10.829 11.026 11.159 11.197 11.017 10.321 9.343 8.437 7.565 6.798 6.089 5.458 4.901 4.413 3.906 3.46 3.044 2.628 2.252 1.907 1.596 1.277 0.965 0.699 0.43 0.14 -0.103 -0.363 -0.617 -0.809 -1.001 -1.189 -1.386 -1.595 -1.743 -1.903 -2.147 -2.321 -2.501 -2.588 -2.776 -2.987 -3.229 -3.36 -3.699 -3.741 -3.887 -4.048 -4.387 -4.564 -4.747 -4.967 -5.205 -5.484 -5.819 -6.691 -10 ,23838 ,KEBNE ,17022066,Wed Dec 22 05:15:12 CET,Wed Dec 22 06:41:55 CET,0.0 1.59 2.15 2.528 2.783 3.016 3.247 3.45 3.824 3.989 4.131 4.198 4.516 4.615 4.81 5.011 5.19 5.271 5.418 5.56 5.789 5.94 6.09 6.318 6.533 6.719 6.885 7.042 7.261 7.467 7.651 7.863 8.051 8.236 8.435 8.631 8.846 9.114 9.4 9.686 9.934 10.203 10.508 10.78 11.057 11.318 11.569 11.728 11.727 11.563 11.07 10.196 9.327 8.512 7.794 7.124 6.527 5.949 5.445 4.916 4.452 4.03 3.613 3.23 2.877 2.559 2.222 1.931 1.694 1.449 1.17 0.93 0.687 0.415 0.188 -0.057 -0.313 -0.565 -0.795 -0.942 -1.094 -1.324 -1.48 -1.636 -1.718 -1.887 -2.068 -2.286 -2.404 -2.721 -2.732 -2.856 -2.997 -3.286 -3.451 -3.65 -3.868 -4.078 -4.318 -4.652 -5.32 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_28.txt deleted file mode 100644 index dedf2f9a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5658 ,KEBNE ,17022067,Wed Dec 22 05:15:16 CET,Wed Dec 22 06:37:01 CET,0.0 3.002 3.407 3.646 3.866 4.101 4.299 4.444 4.71 4.841 5.001 5.106 5.493 5.621 5.853 6.066 6.256 6.347 6.529 6.708 6.953 7.086 7.213 7.395 7.579 7.773 7.968 8.161 8.419 8.655 8.848 9.072 9.298 9.513 9.757 10.014 10.25 10.509 10.781 11.1 11.445 11.793 12.136 12.447 12.792 13.135 13.458 13.732 13.944 14.062 13.931 13.457 12.933 12.398 11.86 11.343 10.861 10.427 10.053 9.686 9.365 9.063 8.794 8.547 8.292 8.039 7.765 7.52 7.302 7.069 6.844 6.662 6.466 6.259 6.104 5.938 5.757 5.567 5.366 5.228 5.093 4.908 4.781 4.635 4.557 4.404 4.247 4.086 4.006 3.675 3.717 3.615 3.487 3.197 3.047 2.863 2.67 2.465 2.177 1.78 1.063 -2 ,18940 ,KEBNE ,17022068,Wed Dec 22 05:15:12 CET,Wed Dec 22 06:39:55 CET,0.0 2.606 3.081 3.457 3.806 4.103 4.349 4.553 4.872 5.025 5.192 5.246 5.625 5.772 5.997 6.173 6.346 6.432 6.61 6.8 7.081 7.233 7.378 7.606 7.82 8.021 8.197 8.355 8.557 8.744 8.933 9.17 9.382 9.574 9.784 10.028 10.268 10.519 10.8 11.091 11.347 11.616 11.912 12.191 12.508 12.856 13.205 13.48 13.723 13.86 13.731 13.198 12.583 11.974 11.4 10.903 10.441 9.998 9.609 9.206 8.866 8.581 8.314 8.047 7.787 7.539 7.266 7.033 6.838 6.62 6.383 6.181 5.971 5.763 5.609 5.454 5.281 5.097 4.893 4.747 4.618 4.418 4.284 4.155 4.081 3.94 3.803 3.65 3.56 3.211 3.246 3.138 3.026 2.808 2.677 2.536 2.385 2.199 1.994 1.699 0.424 -3 ,14983 ,KEBNE ,17022069,Wed Dec 22 05:15:12 CET,Wed Dec 22 06:39:10 CET,0.0 1.526 2.044 2.435 2.732 2.997 3.239 3.475 3.921 4.11 4.284 4.355 4.751 4.916 5.226 5.516 5.755 5.854 6.042 6.234 6.506 6.687 6.876 7.116 7.322 7.505 7.678 7.857 8.097 8.324 8.535 8.771 8.993 9.196 9.421 9.673 9.929 10.207 10.486 10.8 11.102 11.399 11.723 12.009 12.32 12.649 12.978 13.265 13.477 13.578 13.441 12.961 12.385 11.801 11.276 10.784 10.309 9.873 9.488 9.085 8.736 8.422 8.125 7.844 7.57 7.323 7.071 6.839 6.641 6.425 6.183 5.991 5.809 5.622 5.486 5.352 5.218 5.07 4.911 4.811 4.704 4.513 4.369 4.222 4.148 3.98 3.817 3.642 3.537 3.183 3.234 3.129 3.022 2.762 2.613 2.472 2.317 2.145 1.932 1.578 0.601 -4 ,29219 ,KEBNE ,17022070,Wed Dec 22 05:15:13 CET,Wed Dec 22 06:39:11 CET,0.0 1.555 1.817 2.084 2.294 2.459 2.627 2.795 3.13 3.267 3.39 3.368 3.713 3.815 4.006 4.181 4.345 4.424 4.568 4.707 4.899 5.016 5.133 5.305 5.467 5.626 5.786 5.922 6.085 6.257 6.427 6.635 6.861 7.078 7.317 7.598 7.841 8.085 8.348 8.617 8.88 9.172 9.497 9.778 10.069 10.359 10.665 10.939 11.15 11.261 11.122 10.557 9.902 9.266 8.656 8.103 7.615 7.151 6.749 6.33 5.975 5.664 5.339 5.021 4.75 4.515 4.252 4.026 3.837 3.63 3.416 3.234 3.029 2.826 2.687 2.547 2.396 2.233 2.064 1.941 1.809 1.612 1.469 1.31 1.233 1.079 0.921 0.753 0.67 0.342 0.4 0.295 0.178 -0.068 -0.195 -0.332 -0.5 -0.729 -0.984 -1.266 -3.022 -5 ,3213 ,KEBNE ,17022071,Wed Dec 22 05:15:12 CET,Wed Dec 22 06:39:12 CET,0.0 1.631 2.073 2.425 2.725 2.982 3.185 3.361 3.674 3.831 3.985 4.033 4.407 4.518 4.731 4.939 5.138 5.237 5.41 5.576 5.84 6.015 6.181 6.39 6.568 6.744 6.909 7.057 7.256 7.463 7.662 7.877 8.081 8.276 8.495 8.751 8.988 9.24 9.512 9.789 10.069 10.375 10.723 11.04 11.358 11.691 12.028 12.352 12.635 12.76 12.659 12.248 11.695 11.106 10.542 9.991 9.454 8.961 8.544 8.145 7.799 7.485 7.182 6.881 6.597 6.333 6.043 5.778 5.539 5.292 5.058 4.866 4.663 4.446 4.274 4.103 3.918 3.718 3.516 3.374 3.226 2.992 2.816 2.642 2.56 2.392 2.217 2.023 1.924 1.578 1.614 1.496 1.365 1.083 0.928 0.756 0.582 0.398 0.155 -0.173 -1.497 -6 ,29707 ,KEBNE ,17022072,Wed Dec 22 05:15:16 CET,Wed Dec 22 06:37:15 CET,0.0 1.778 2.211 2.553 2.838 3.057 3.247 3.459 3.891 4.075 4.234 4.254 4.608 4.729 4.965 5.178 5.391 5.488 5.66 5.828 6.074 6.232 6.388 6.611 6.816 7.003 7.181 7.35 7.566 7.778 7.985 8.219 8.431 8.637 8.89 9.182 9.454 9.697 9.926 10.196 10.47 10.756 11.096 11.43 11.8 12.139 12.436 12.74 13.011 13.177 13.047 12.51 11.94 11.386 10.848 10.295 9.796 9.351 8.934 8.483 8.097 7.733 7.365 7.013 6.692 6.406 6.104 5.841 5.623 5.4 5.16 4.973 4.778 4.564 4.401 4.228 4.062 3.886 3.675 3.54 3.41 3.213 3.063 2.889 2.803 2.619 2.44 2.274 2.175 1.816 1.845 1.736 1.624 1.392 1.255 1.098 0.92 0.715 0.475 0.099 -1.692 -7 ,18612 ,KEBNE ,17022073,Wed Dec 22 05:15:16 CET,Wed Dec 22 06:34:11 CET,0.0 3.011 3.468 3.779 4.066 4.293 4.505 4.698 5.039 5.203 5.348 5.366 5.732 5.851 6.061 6.25 6.424 6.513 6.687 6.845 7.076 7.22 7.36 7.572 7.762 7.931 8.098 8.264 8.471 8.665 8.862 9.09 9.296 9.496 9.73 9.972 10.186 10.417 10.653 10.901 11.156 11.446 11.779 12.087 12.426 12.782 13.131 13.431 13.691 13.8 13.58 12.993 12.355 11.746 11.161 10.619 10.157 9.691 9.278 8.894 8.558 8.24 7.938 7.65 7.374 7.13 6.859 6.622 6.427 6.22 6.006 5.833 5.644 5.438 5.275 5.107 4.945 4.788 4.628 4.508 4.384 4.199 4.075 3.953 3.889 3.741 3.583 3.418 3.328 2.988 3.05 2.952 2.842 2.59 2.425 2.255 2.089 1.904 1.651 1.263 -0.835 -8 ,27224 ,KEBNE ,17022074,Wed Dec 22 05:16:15 CET,Wed Dec 22 06:40:18 CET,0.0 2.035 2.503 2.911 3.254 3.525 3.74 3.954 4.365 4.536 4.685 4.719 5.088 5.212 5.444 5.657 5.853 5.942 6.124 6.323 6.593 6.751 6.913 7.138 7.337 7.532 7.719 7.892 8.121 8.342 8.537 8.754 8.961 9.161 9.399 9.677 9.928 10.18 10.435 10.702 10.989 11.284 11.595 11.894 12.22 12.546 12.891 13.212 13.49 13.65 13.522 12.982 12.368 11.765 11.204 10.68 10.184 9.741 9.326 8.876 8.511 8.198 7.887 7.582 7.319 7.078 6.803 6.568 6.38 6.174 5.944 5.754 5.547 5.327 5.156 4.976 4.798 4.621 4.444 4.304 4.154 3.942 3.798 3.649 3.571 3.394 3.211 3.015 2.916 2.58 2.619 2.509 2.394 2.126 1.982 1.809 1.616 1.441 1.246 0.975 0.185 -9 ,15745 ,KEBNE ,17022075,Wed Dec 22 05:16:15 CET,Wed Dec 22 06:40:30 CET,0.0 1.489 1.914 2.197 2.394 2.586 2.793 2.975 3.271 3.41 3.563 3.63 4.015 4.142 4.347 4.547 4.77 4.882 5.074 5.251 5.518 5.683 5.876 6.144 6.347 6.541 6.73 6.923 7.179 7.406 7.589 7.792 7.979 8.182 8.42 8.665 8.906 9.155 9.41 9.674 9.968 10.282 10.618 10.949 11.319 11.701 12.06 12.356 12.623 12.762 12.558 12.009 11.407 10.834 10.303 9.809 9.368 8.943 8.569 8.191 7.874 7.6 7.343 7.108 6.868 6.636 6.402 6.174 5.964 5.747 5.522 5.347 5.175 4.985 4.836 4.694 4.554 4.418 4.271 4.149 4.02 3.845 3.716 3.569 3.498 3.35 3.178 2.98 2.885 2.554 2.617 2.506 2.387 2.147 2.016 1.871 1.682 1.48 1.235 0.832 -0.427 -10 ,7046 ,KEBNE ,17022076,Wed Dec 22 05:16:15 CET,Wed Dec 22 06:40:37 CET,0.0 1.131 1.526 1.803 2.044 2.247 2.446 2.64 2.977 3.123 3.254 3.265 3.617 3.733 3.979 4.204 4.418 4.525 4.73 4.928 5.211 5.383 5.526 5.718 5.892 6.064 6.247 6.433 6.659 6.866 7.08 7.325 7.536 7.75 7.999 8.252 8.487 8.737 8.988 9.244 9.49 9.764 10.081 10.391 10.728 11.052 11.37 11.655 11.882 11.907 11.602 11.048 10.478 9.896 9.339 8.815 8.352 7.93 7.564 7.198 6.871 6.562 6.273 6.005 5.731 5.476 5.218 4.988 4.8 4.605 4.395 4.204 3.983 3.762 3.599 3.438 3.267 3.07 2.878 2.751 2.618 2.406 2.249 2.098 2.022 1.852 1.66 1.446 1.341 1.003 1.039 0.93 0.835 0.617 0.482 0.325 0.147 -0.061 -0.268 -0.573 -2.229 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_30.txt deleted file mode 100644 index 5f0c1d6f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_30.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3683 ,KEBNE ,17022077,Wed Dec 22 05:16:15 CET,Wed Dec 22 06:39:43 CET,0.0 0.563 0.894 1.135 1.334 1.513 1.695 1.858 2.083 2.183 2.298 2.267 2.594 2.681 2.857 3.008 3.137 3.2 3.32 3.438 3.614 3.721 3.826 3.984 4.13 4.277 4.417 4.543 4.708 4.862 4.999 5.162 5.327 5.487 5.677 5.898 6.104 6.329 6.577 6.806 7.01 7.244 7.507 7.782 8.08 8.355 8.648 8.941 9.189 9.331 9.242 8.809 8.319 7.867 7.45 7.056 6.687 6.326 6.0 5.676 5.394 5.139 4.895 4.666 4.449 4.251 4.048 3.853 3.676 3.483 3.287 3.134 2.972 2.801 2.655 2.513 2.384 2.232 2.071 1.978 1.885 1.73 1.622 1.511 1.448 1.317 1.184 1.033 0.954 0.626 0.703 0.621 0.543 0.362 0.252 0.14 0.03 -0.083 -0.192 -0.344 -0.579 -2 ,4470 ,KEBNE ,17022078,Wed Dec 22 05:16:15 CET,Wed Dec 22 06:41:39 CET,0.0 1.236 1.576 1.793 1.987 2.142 2.293 2.445 2.724 2.832 2.927 2.874 3.202 3.291 3.451 3.606 3.751 3.815 3.939 4.07 4.268 4.389 4.503 4.674 4.843 4.995 5.128 5.265 5.452 5.622 5.769 5.947 6.13 6.305 6.491 6.671 6.832 7.022 7.235 7.464 7.685 7.908 8.139 8.346 8.6 8.885 9.145 9.358 9.57 9.708 9.582 9.133 8.624 8.144 7.681 7.256 6.899 6.56 6.243 5.925 5.64 5.375 5.125 4.88 4.655 4.456 4.251 4.064 3.902 3.726 3.533 3.38 3.222 3.056 2.925 2.795 2.662 2.507 2.347 2.249 2.14 1.96 1.838 1.71 1.646 1.503 1.352 1.199 1.118 0.792 0.876 0.793 0.693 0.495 0.39 0.271 0.154 0.048 -0.082 -0.287 -0.689 -3 ,6951 ,KEBNE ,17022079,Wed Dec 22 05:16:15 CET,Wed Dec 22 06:40:53 CET,0.0 1.321 1.735 2.022 2.197 2.32 2.443 2.576 2.815 2.91 2.996 2.943 3.267 3.345 3.51 3.675 3.809 3.873 3.999 4.111 4.268 4.38 4.492 4.633 4.768 4.905 5.04 5.178 5.355 5.517 5.666 5.849 6.024 6.185 6.364 6.555 6.74 6.944 7.154 7.359 7.557 7.789 8.07 8.332 8.608 8.895 9.206 9.473 9.673 9.777 9.646 9.202 8.706 8.258 7.828 7.381 6.977 6.606 6.268 5.92 5.598 5.316 5.07 4.839 4.611 4.398 4.174 3.963 3.767 3.574 3.386 3.229 3.073 2.899 2.76 2.618 2.476 2.326 2.175 2.068 1.95 1.773 1.653 1.525 1.457 1.325 1.191 1.052 0.975 0.637 0.701 0.613 0.529 0.337 0.22 0.088 -0.049 -0.191 -0.346 -0.555 -0.846 -5 ,15306 ,KEBNE ,17022081,Wed Dec 22 05:16:15 CET,Wed Dec 22 06:41:52 CET,0.0 0.75 1.024 1.263 1.463 1.626 1.78 1.921 2.173 2.286 2.39 2.343 2.68 2.77 2.932 3.097 3.257 3.33 3.479 3.632 3.833 3.957 4.081 4.251 4.409 4.558 4.693 4.817 4.98 5.149 5.313 5.511 5.699 5.866 6.056 6.26 6.451 6.662 6.892 7.137 7.382 7.633 7.92 8.207 8.529 8.851 9.157 9.414 9.591 9.694 9.629 9.246 8.78 8.304 7.849 7.421 7.033 6.68 6.37 6.062 5.776 5.501 5.249 4.998 4.751 4.531 4.306 4.111 3.949 3.777 3.581 3.423 3.272 3.098 2.963 2.831 2.695 2.556 2.393 2.28 2.17 1.987 1.858 1.731 1.666 1.536 1.4 1.242 1.157 0.832 0.916 0.818 0.73 0.553 0.447 0.335 0.21 0.08 -0.087 -0.327 -0.647 -6 ,24941 ,KEBNE ,17022082,Wed Dec 22 05:16:15 CET,Wed Dec 22 06:40:27 CET,0.0 1.045 1.321 1.537 1.709 1.879 2.022 2.128 2.325 2.418 2.508 2.439 2.768 2.856 3.019 3.167 3.304 3.367 3.498 3.638 3.817 3.922 4.035 4.211 4.383 4.537 4.671 4.807 4.985 5.15 5.312 5.513 5.705 5.884 6.074 6.277 6.477 6.69 6.902 7.132 7.374 7.633 7.905 8.16 8.464 8.762 9.044 9.334 9.607 9.794 9.736 9.298 8.759 8.214 7.703 7.209 6.775 6.377 6.033 5.686 5.363 5.082 4.83 4.588 4.366 4.168 3.959 3.773 3.605 3.435 3.259 3.099 2.945 2.795 2.677 2.554 2.411 2.256 2.106 2.004 1.9 1.728 1.608 1.48 1.409 1.278 1.142 0.998 0.928 0.616 0.718 0.635 0.535 0.308 0.198 0.092 -0.024 -0.149 -0.287 -0.469 -0.872 -7 ,24635 ,KEBNE ,17022083,Wed Dec 22 05:16:15 CET,Wed Dec 22 06:42:34 CET,0.0 0.846 1.122 1.326 1.493 1.664 1.807 1.927 2.159 2.278 2.395 2.363 2.685 2.771 2.936 3.083 3.23 3.3 3.445 3.579 3.754 3.865 3.972 4.128 4.272 4.411 4.534 4.65 4.815 4.977 5.142 5.339 5.508 5.655 5.821 6.019 6.202 6.406 6.627 6.833 7.034 7.249 7.5 7.748 8.001 8.265 8.547 8.803 9.06 9.27 9.202 8.763 8.258 7.746 7.267 6.819 6.411 6.031 5.705 5.384 5.098 4.845 4.596 4.361 4.154 3.961 3.758 3.565 3.394 3.226 3.058 2.921 2.774 2.601 2.468 2.344 2.217 2.084 1.942 1.841 1.736 1.583 1.472 1.342 1.277 1.153 1.016 0.868 0.797 0.485 0.568 0.482 0.391 0.212 0.122 -0.002 -0.14 -0.271 -0.435 -0.646 -1.129 -8 ,7575 ,KEBNE ,17022084,Wed Dec 22 05:16:15 CET,Wed Dec 22 06:40:54 CET,0.0 1.346 1.687 1.922 2.104 2.257 2.385 2.507 2.748 2.866 2.967 2.912 3.256 3.349 3.51 3.668 3.83 3.913 4.05 4.169 4.355 4.475 4.585 4.746 4.89 5.013 5.152 5.295 5.466 5.641 5.806 6.005 6.2 6.366 6.56 6.787 6.995 7.228 7.476 7.743 8.01 8.272 8.561 8.837 9.149 9.464 9.765 10.051 10.297 10.476 10.416 10.005 9.518 9.004 8.506 8.033 7.613 7.238 6.911 6.598 6.317 6.033 5.756 5.514 5.287 5.065 4.833 4.625 4.452 4.27 4.07 3.898 3.714 3.517 3.367 3.228 3.09 2.944 2.798 2.709 2.612 2.431 2.291 2.153 2.092 1.957 1.796 1.637 1.566 1.254 1.353 1.266 1.183 1.008 0.904 0.804 0.695 0.544 0.375 0.219 -0.622 -9 ,252 ,KEBNE ,17022085,Wed Dec 22 05:16:15 CET,Wed Dec 22 06:41:30 CET,0.0 1.029 1.273 1.464 1.639 1.803 1.943 2.067 2.293 2.389 2.479 2.424 2.745 2.828 2.983 3.117 3.243 3.309 3.439 3.552 3.711 3.832 3.958 4.131 4.297 4.457 4.609 4.744 4.91 5.073 5.236 5.439 5.626 5.802 5.994 6.204 6.432 6.678 6.913 7.138 7.35 7.586 7.866 8.153 8.491 8.814 9.093 9.332 9.531 9.637 9.467 8.991 8.456 7.936 7.437 6.955 6.552 6.185 5.844 5.486 5.177 4.916 4.682 4.438 4.206 4.001 3.779 3.585 3.407 3.212 3.01 2.846 2.673 2.495 2.355 2.204 2.047 1.884 1.733 1.631 1.52 1.347 1.228 1.1 1.033 0.895 0.751 0.605 0.527 0.205 0.279 0.196 0.114 -0.088 -0.186 -0.28 -0.405 -0.554 -0.711 -0.898 -1.248 -10 ,24782 ,KEBNE ,17022086,Wed Dec 22 05:16:15 CET,Wed Dec 22 06:40:48 CET,0.0 1.367 1.633 1.821 1.999 2.157 2.312 2.462 2.704 2.814 2.912 2.849 3.178 3.265 3.427 3.576 3.728 3.802 3.941 4.076 4.257 4.37 4.485 4.649 4.809 4.967 5.118 5.257 5.432 5.599 5.765 5.978 6.182 6.37 6.586 6.814 7.015 7.232 7.445 7.658 7.883 8.137 8.417 8.696 8.99 9.266 9.572 9.864 10.114 10.251 10.128 9.66 9.143 8.657 8.184 7.73 7.329 6.944 6.597 6.242 5.937 5.654 5.366 5.104 4.856 4.621 4.387 4.179 4.005 3.82 3.614 3.445 3.281 3.107 2.955 2.806 2.66 2.502 2.346 2.238 2.124 1.952 1.837 1.71 1.643 1.509 1.361 1.221 1.145 0.816 0.902 0.819 0.724 0.502 0.377 0.244 0.119 0.002 -0.134 -0.354 -0.726 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_32.txt deleted file mode 100644 index 7a0c8bce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4402 ,KEBNE ,17022087,Wed Dec 22 05:17:17 CET,Wed Dec 22 06:42:21 CET,0.0 0.555 0.879 1.14 1.326 1.493 1.639 1.76 2.005 2.127 2.242 2.203 2.536 2.637 2.83 3.008 3.17 3.249 3.403 3.554 3.77 3.905 4.031 4.21 4.372 4.512 4.641 4.769 4.927 5.07 5.21 5.368 5.526 5.681 5.844 6.036 6.245 6.466 6.666 6.857 7.056 7.273 7.497 7.707 7.939 8.179 8.413 8.592 8.77 8.877 8.646 8.049 7.413 6.828 6.309 5.822 5.379 4.968 4.613 4.253 3.948 3.687 3.435 3.181 2.947 2.745 2.514 2.291 2.106 1.922 1.725 1.56 1.394 1.234 1.11 0.965 0.813 0.649 0.47 0.359 0.249 0.064 -0.066 -0.195 -0.261 -0.398 -0.548 -0.702 -0.773 -1.091 -1.012 -1.113 -1.218 -1.434 -1.538 -1.649 -1.786 -1.928 -2.086 -2.288 -2.698 -2 ,97 ,KEBNE ,17022088,Wed Dec 22 05:17:17 CET,Wed Dec 22 06:41:09 CET,0.0 0.599 0.943 1.174 1.349 1.511 1.652 1.788 2.039 2.156 2.262 2.228 2.572 2.676 2.857 3.014 3.184 3.265 3.416 3.559 3.743 3.868 3.999 4.195 4.374 4.542 4.694 4.827 4.999 5.161 5.311 5.5 5.684 5.845 6.032 6.242 6.422 6.597 6.79 6.997 7.201 7.412 7.627 7.843 8.108 8.373 8.641 8.872 9.033 9.081 8.838 8.28 7.673 7.095 6.558 6.041 5.576 5.166 4.812 4.459 4.156 3.889 3.638 3.385 3.15 2.948 2.729 2.519 2.334 2.146 1.945 1.777 1.602 1.423 1.285 1.15 1.014 0.868 0.72 0.614 0.498 0.318 0.2 0.08 0.015 -0.12 -0.25 -0.39 -0.462 -0.786 -0.716 -0.794 -0.866 -1.018 -1.121 -1.247 -1.368 -1.501 -1.631 -1.794 -2.063 -3 ,9556 ,KEBNE ,17022089,Wed Dec 22 05:17:19 CET,Wed Dec 22 06:39:08 CET,0.0 0.624 0.858 1.036 1.195 1.321 1.442 1.563 1.801 1.917 2.023 1.97 2.284 2.375 2.553 2.699 2.845 2.916 3.053 3.184 3.368 3.477 3.579 3.744 3.902 4.041 4.169 4.295 4.446 4.59 4.731 4.896 5.051 5.215 5.411 5.594 5.755 5.944 6.146 6.347 6.544 6.764 7.014 7.233 7.473 7.702 7.912 8.092 8.208 8.223 8.007 7.464 6.879 6.301 5.781 5.299 4.872 4.482 4.129 3.759 3.434 3.157 2.886 2.621 2.382 2.155 1.927 1.727 1.542 1.358 1.178 1.014 0.844 0.675 0.544 0.402 0.25 0.098 -0.06 -0.17 -0.279 -0.44 -0.555 -0.67 -0.726 -0.848 -0.984 -1.134 -1.202 -1.517 -1.434 -1.519 -1.603 -1.781 -1.883 -1.998 -2.111 -2.234 -2.375 -2.547 -2.881 -4 ,9230 ,KEBNE ,17022090,Wed Dec 22 05:17:17 CET,Wed Dec 22 06:40:10 CET,0.0 1.046 1.344 1.547 1.702 1.852 2.0 2.139 2.363 2.47 2.578 2.524 2.85 2.937 3.092 3.222 3.351 3.412 3.525 3.624 3.772 3.882 3.993 4.152 4.305 4.454 4.604 4.739 4.885 5.03 5.194 5.402 5.583 5.73 5.917 6.156 6.344 6.525 6.738 6.958 7.199 7.467 7.742 7.996 8.24 8.444 8.62 8.783 8.897 8.873 8.58 7.987 7.372 6.792 6.27 5.787 5.348 4.923 4.533 4.137 3.805 3.515 3.225 2.955 2.72 2.497 2.265 2.068 1.886 1.688 1.469 1.304 1.154 1.0 0.876 0.745 0.621 0.489 0.329 0.211 0.101 -0.06 -0.175 -0.29 -0.355 -0.498 -0.642 -0.783 -0.861 -1.195 -1.123 -1.218 -1.319 -1.527 -1.638 -1.742 -1.858 -2.003 -2.178 -2.43 -2.792 -5 ,24118 ,KEBNE ,17022091,Wed Dec 22 05:17:16 CET,Wed Dec 22 06:41:18 CET,0.0 0.565 0.835 1.028 1.206 1.349 1.488 1.633 1.871 1.978 2.072 2.01 2.344 2.441 2.612 2.767 2.9 2.967 3.103 3.223 3.409 3.528 3.629 3.776 3.93 4.086 4.231 4.363 4.541 4.72 4.88 5.048 5.221 5.406 5.597 5.793 5.995 6.222 6.433 6.614 6.794 7.009 7.241 7.475 7.744 7.98 8.231 8.489 8.712 8.815 8.606 8.075 7.543 7.029 6.525 6.037 5.592 5.193 4.839 4.468 4.154 3.88 3.6 3.325 3.076 2.858 2.624 2.408 2.223 2.031 1.827 1.665 1.504 1.331 1.203 1.065 0.913 0.761 0.602 0.49 0.373 0.183 0.06 -0.053 -0.113 -0.249 -0.389 -0.539 -0.614 -0.923 -0.861 -0.958 -1.043 -1.233 -1.338 -1.46 -1.608 -1.762 -1.918 -2.095 -2.642 -6 ,3042 ,KEBNE ,17022092,Wed Dec 22 05:17:17 CET,Wed Dec 22 06:41:32 CET,0.0 0.983 1.285 1.502 1.678 1.856 2.036 2.187 2.481 2.619 2.725 2.679 3.0 3.085 3.239 3.382 3.515 3.58 3.701 3.811 3.996 4.124 4.239 4.392 4.531 4.663 4.787 4.913 5.085 5.244 5.395 5.575 5.75 5.911 6.082 6.268 6.443 6.637 6.841 7.036 7.243 7.464 7.672 7.87 8.104 8.329 8.572 8.799 8.946 8.967 8.698 8.109 7.531 6.997 6.481 5.967 5.517 5.116 4.766 4.417 4.115 3.853 3.583 3.32 3.073 2.845 2.617 2.399 2.199 1.992 1.768 1.595 1.435 1.262 1.133 0.996 0.837 0.679 0.534 0.434 0.32 0.147 0.032 -0.095 -0.163 -0.306 -0.441 -0.584 -0.664 -0.988 -0.906 -0.992 -1.074 -1.242 -1.35 -1.473 -1.612 -1.773 -1.93 -2.121 -2.499 -7 ,24198 ,KEBNE ,17022093,Wed Dec 22 05:17:17 CET,Wed Dec 22 06:41:27 CET,0.0 0.883 1.217 1.437 1.604 1.738 1.863 1.993 2.24 2.358 2.455 2.383 2.703 2.784 2.951 3.102 3.232 3.294 3.41 3.533 3.716 3.823 3.927 4.091 4.247 4.394 4.527 4.649 4.817 4.974 5.109 5.281 5.45 5.596 5.758 5.943 6.111 6.303 6.504 6.697 6.885 7.087 7.346 7.593 7.84 8.085 8.324 8.543 8.698 8.752 8.577 8.025 7.402 6.819 6.271 5.755 5.295 4.864 4.488 4.091 3.745 3.43 3.134 2.871 2.63 2.411 2.164 1.939 1.746 1.548 1.347 1.169 0.993 0.835 0.713 0.583 0.443 0.299 0.149 0.045 -0.066 -0.246 -0.361 -0.473 -0.535 -0.66 -0.783 -0.904 -0.973 -1.303 -1.229 -1.32 -1.415 -1.63 -1.745 -1.843 -1.988 -2.178 -2.352 -2.557 -2.874 -8 ,7204 ,KEBNE ,17022094,Wed Dec 22 05:17:17 CET,Wed Dec 22 06:41:22 CET,0.0 0.944 1.313 1.534 1.705 1.877 2.041 2.194 2.468 2.592 2.694 2.662 3.009 3.108 3.296 3.47 3.645 3.724 3.891 4.06 4.285 4.429 4.561 4.751 4.931 5.079 5.216 5.355 5.53 5.681 5.842 6.024 6.167 6.316 6.493 6.691 6.889 7.094 7.283 7.475 7.674 7.89 8.147 8.384 8.62 8.863 9.116 9.373 9.626 9.698 9.514 9.076 8.504 7.915 7.404 6.943 6.552 6.212 5.878 5.537 5.244 4.972 4.713 4.452 4.197 3.969 3.729 3.5 3.311 3.135 2.958 2.818 2.671 2.499 2.363 2.224 2.086 1.954 1.813 1.708 1.598 1.424 1.303 1.179 1.118 0.987 0.848 0.7 0.624 0.307 0.387 0.292 0.187 -0.003 -0.101 -0.222 -0.363 -0.516 -0.671 -0.867 -1.157 -9 ,28049 ,KEBNE ,17022095,Wed Dec 22 05:17:17 CET,Wed Dec 22 06:41:26 CET,0.0 0.386 0.625 0.849 1.036 1.204 1.347 1.459 1.664 1.749 1.83 1.771 2.118 2.216 2.381 2.538 2.686 2.748 2.87 2.989 3.16 3.272 3.378 3.531 3.681 3.836 3.986 4.119 4.301 4.485 4.675 4.903 5.092 5.269 5.468 5.679 5.88 6.117 6.388 6.638 6.874 7.133 7.424 7.685 7.941 8.176 8.445 8.75 8.973 9.045 8.835 8.304 7.716 7.128 6.574 6.028 5.555 5.129 4.769 4.407 4.083 3.795 3.519 3.249 2.993 2.756 2.505 2.276 2.09 1.9 1.69 1.514 1.337 1.155 1.02 0.886 0.744 0.584 0.419 0.312 0.201 0.022 -0.101 -0.223 -0.283 -0.41 -0.563 -0.714 -0.781 -1.097 -1.007 -1.098 -1.203 -1.409 -1.51 -1.611 -1.715 -1.863 -2.043 -2.258 -2.706 -10 ,8348 ,KEBNE ,17022096,Wed Dec 22 05:18:19 CET,Wed Dec 22 06:42:03 CET,0.0 0.959 1.294 1.575 1.787 1.964 2.118 2.258 2.515 2.627 2.726 2.691 3.033 3.126 3.304 3.499 3.686 3.761 3.902 4.036 4.228 4.353 4.462 4.628 4.792 4.928 5.062 5.189 5.352 5.512 5.668 5.858 6.02 6.17 6.355 6.549 6.705 6.879 7.088 7.307 7.515 7.722 7.937 8.15 8.385 8.608 8.827 9.018 9.132 9.129 8.867 8.291 7.704 7.127 6.6 6.093 5.625 5.218 4.86 4.494 4.179 3.892 3.615 3.354 3.099 2.874 2.636 2.418 2.236 2.05 1.864 1.705 1.542 1.362 1.217 1.081 0.947 0.798 0.647 0.549 0.454 0.303 0.184 0.058 -0.004 -0.118 -0.253 -0.4 -0.475 -0.795 -0.709 -0.79 -0.879 -1.084 -1.188 -1.294 -1.407 -1.556 -1.743 -1.918 -2.255 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_33.txt deleted file mode 100644 index bf8de252..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29656 ,KEBNE ,17022097,Wed Dec 22 05:18:18 CET,Wed Dec 22 06:42:48 CET,0.0 0.617 0.892 1.125 1.306 1.457 1.582 1.692 1.914 2.008 2.102 2.033 2.346 2.428 2.605 2.764 2.916 2.985 3.108 3.233 3.426 3.54 3.629 3.752 3.885 4.015 4.136 4.263 4.446 4.62 4.779 4.949 5.099 5.244 5.409 5.606 5.793 5.988 6.208 6.443 6.678 6.919 7.169 7.396 7.617 7.827 8.014 8.199 8.312 8.24 7.871 7.16 6.457 5.807 5.231 4.694 4.175 3.694 3.3 2.915 2.572 2.263 1.969 1.686 1.42 1.183 0.946 0.736 0.538 0.328 0.124 -0.043 -0.21 -0.384 -0.53 -0.673 -0.815 -0.972 -1.132 -1.244 -1.369 -1.553 -1.669 -1.794 -1.86 -1.997 -2.15 -2.302 -2.378 -2.708 -2.625 -2.709 -2.8 -3.007 -3.12 -3.239 -3.379 -3.513 -3.654 -3.853 -4.328 -2 ,11813 ,KEBNE ,17022098,Wed Dec 22 05:18:18 CET,Wed Dec 22 06:41:58 CET,0.0 0.748 1.013 1.261 1.419 1.568 1.725 1.848 2.075 2.198 2.3 2.24 2.556 2.639 2.796 2.948 3.105 3.175 3.297 3.416 3.589 3.701 3.805 3.94 4.068 4.204 4.337 4.464 4.622 4.764 4.908 5.081 5.245 5.406 5.585 5.78 5.964 6.154 6.342 6.529 6.729 6.944 7.157 7.354 7.576 7.792 7.954 8.054 8.066 7.926 7.503 6.787 6.038 5.349 4.75 4.167 3.649 3.204 2.807 2.409 2.061 1.746 1.434 1.126 0.863 0.626 0.376 0.159 -0.027 -0.212 -0.415 -0.593 -0.767 -0.945 -1.084 -1.222 -1.372 -1.524 -1.679 -1.793 -1.918 -2.107 -2.238 -2.382 -2.453 -2.587 -2.714 -2.873 -2.96 -3.289 -3.224 -3.317 -3.404 -3.607 -3.73 -3.872 -4.024 -4.149 -4.27 -4.457 -4.801 -3 ,2334 ,KEBNE ,17022099,Wed Dec 22 05:18:18 CET,Wed Dec 22 06:41:59 CET,0.0 0.569 0.87 1.1 1.278 1.444 1.59 1.716 1.928 2.029 2.139 2.118 2.447 2.525 2.674 2.804 2.928 2.993 3.111 3.219 3.377 3.489 3.603 3.767 3.923 4.058 4.178 4.295 4.44 4.583 4.731 4.902 5.053 5.205 5.38 5.567 5.748 5.935 6.135 6.358 6.584 6.833 7.091 7.309 7.541 7.78 7.979 8.118 8.182 8.076 7.6 6.802 6.022 5.31 4.696 4.131 3.646 3.163 2.727 2.31 1.931 1.6 1.319 1.066 0.813 0.575 0.34 0.126 -0.074 -0.29 -0.512 -0.683 -0.858 -1.047 -1.191 -1.343 -1.505 -1.673 -1.837 -1.942 -2.055 -2.247 -2.374 -2.512 -2.588 -2.744 -2.92 -3.087 -3.164 -3.485 -3.419 -3.515 -3.612 -3.817 -3.92 -4.027 -4.149 -4.304 -4.476 -4.648 -4.946 -4 ,18853 ,KEBNE ,17022100,Wed Dec 22 05:18:19 CET,Wed Dec 22 06:39:22 CET,0.0 0.633 0.908 1.142 1.336 1.493 1.611 1.716 1.964 2.078 2.181 2.158 2.5 2.578 2.732 2.894 3.034 3.097 3.216 3.321 3.496 3.605 3.701 3.85 3.992 4.132 4.275 4.413 4.58 4.753 4.915 5.071 5.217 5.351 5.492 5.639 5.782 5.933 6.104 6.31 6.499 6.683 6.871 7.031 7.204 7.37 7.508 7.593 7.585 7.392 6.89 6.074 5.278 4.595 3.993 3.445 2.951 2.49 2.099 1.712 1.379 1.095 0.821 0.545 0.287 0.051 -0.207 -0.433 -0.62 -0.814 -1.014 -1.182 -1.357 -1.542 -1.687 -1.829 -1.968 -2.121 -2.299 -2.424 -2.55 -2.739 -2.869 -3.004 -3.074 -3.224 -3.384 -3.553 -3.637 -3.958 -3.868 -3.959 -4.063 -4.279 -4.397 -4.53 -4.663 -4.796 -4.956 -5.161 -5.619 -5 ,6749 ,KEBNE ,17022101,Wed Dec 22 05:18:23 CET,Wed Dec 22 06:39:49 CET,0.0 0.576 0.842 1.067 1.277 1.437 1.576 1.719 1.957 2.056 2.156 2.101 2.423 2.508 2.665 2.808 2.928 3.001 3.159 3.285 3.443 3.547 3.662 3.836 3.988 4.127 4.268 4.411 4.594 4.763 4.919 5.089 5.237 5.387 5.577 5.773 5.941 6.132 6.322 6.52 6.707 6.888 7.095 7.289 7.49 7.683 7.85 7.96 8.004 7.898 7.419 6.642 5.914 5.24 4.632 4.081 3.593 3.139 2.74 2.314 1.955 1.642 1.331 1.043 0.781 0.54 0.288 0.06 -0.139 -0.345 -0.555 -0.728 -0.905 -1.091 -1.236 -1.378 -1.532 -1.696 -1.877 -1.997 -2.109 -2.286 -2.412 -2.545 -2.611 -2.743 -2.881 -3.015 -3.085 -3.41 -3.314 -3.391 -3.471 -3.662 -3.773 -3.884 -4.013 -4.159 -4.313 -4.522 -4.948 -6 ,31229 ,KEBNE ,17022102,Wed Dec 22 05:19:20 CET,Wed Dec 22 06:43:40 CET,0.0 0.643 0.933 1.204 1.408 1.572 1.71 1.843 2.116 2.248 2.364 2.32 2.667 2.764 2.935 3.094 3.244 3.325 3.492 3.637 3.827 3.954 4.082 4.277 4.455 4.615 4.763 4.906 5.07 5.206 5.335 5.495 5.675 5.838 5.991 6.163 6.341 6.524 6.703 6.876 7.039 7.203 7.363 7.495 7.621 7.738 7.837 7.899 7.867 7.702 7.22 6.43 5.688 5.011 4.427 3.894 3.389 2.922 2.505 2.088 1.757 1.463 1.184 0.911 0.65 0.419 0.168 -0.06 -0.254 -0.454 -0.658 -0.833 -1.025 -1.221 -1.372 -1.525 -1.68 -1.832 -1.988 -2.1 -2.216 -2.385 -2.503 -2.63 -2.694 -2.856 -3.048 -3.251 -3.362 -3.72 -3.724 -3.834 -3.929 -4.123 -4.228 -4.328 -4.441 -4.567 -4.713 -4.868 -5.095 -7 ,6749 ,KEBNE ,17022103,Wed Dec 22 05:19:20 CET,Wed Dec 22 06:42:47 CET,0.0 0.576 0.842 1.067 1.277 1.437 1.576 1.719 1.957 2.056 2.156 2.101 2.423 2.508 2.665 2.808 2.928 3.001 3.159 3.285 3.443 3.547 3.662 3.836 3.988 4.127 4.268 4.411 4.594 4.763 4.919 5.089 5.237 5.387 5.577 5.773 5.941 6.132 6.322 6.52 6.707 6.888 7.095 7.289 7.49 7.683 7.85 7.96 8.004 7.898 7.419 6.642 5.914 5.24 4.632 4.081 3.593 3.139 2.74 2.314 1.955 1.642 1.331 1.043 0.781 0.54 0.288 0.06 -0.139 -0.345 -0.555 -0.728 -0.905 -1.091 -1.236 -1.378 -1.532 -1.696 -1.877 -1.997 -2.109 -2.286 -2.412 -2.545 -2.611 -2.743 -2.881 -3.015 -3.085 -3.41 -3.314 -3.391 -3.471 -3.662 -3.773 -3.884 -4.013 -4.159 -4.313 -4.522 -4.948 -8 ,3640 ,KEBNE ,17022104,Wed Dec 22 05:19:20 CET,Wed Dec 22 06:42:19 CET,0.0 0.478 0.752 0.939 1.091 1.234 1.38 1.501 1.691 1.794 1.903 1.864 2.181 2.254 2.393 2.528 2.653 2.716 2.84 2.938 3.09 3.201 3.309 3.471 3.622 3.768 3.903 4.027 4.194 4.355 4.522 4.742 4.936 5.095 5.265 5.464 5.643 5.823 5.998 6.171 6.376 6.604 6.827 7.027 7.254 7.45 7.583 7.647 7.616 7.435 6.956 6.174 5.417 4.75 4.139 3.581 3.098 2.641 2.236 1.846 1.486 1.149 0.836 0.554 0.297 0.062 -0.173 -0.385 -0.569 -0.769 -0.971 -1.131 -1.293 -1.45 -1.58 -1.72 -1.868 -2.022 -2.193 -2.32 -2.445 -2.628 -2.756 -2.899 -2.971 -3.123 -3.279 -3.437 -3.522 -3.851 -3.769 -3.855 -3.945 -4.141 -4.242 -4.355 -4.481 -4.617 -4.779 -5.007 -5.83 -9 ,32567 ,KEBNE ,17022105,Wed Dec 22 05:19:20 CET,Wed Dec 22 06:44:06 CET,0.0 0.382 0.587 0.757 0.891 0.999 1.096 1.186 1.345 1.414 1.491 1.417 1.73 1.803 1.937 2.061 2.178 2.23 2.332 2.424 2.555 2.638 2.721 2.845 2.953 3.049 3.157 3.264 3.385 3.496 3.603 3.741 3.869 3.981 4.122 4.28 4.43 4.587 4.738 4.886 5.047 5.217 5.383 5.532 5.681 5.82 5.974 6.087 6.084 5.936 5.414 4.576 3.793 3.089 2.46 1.893 1.382 0.887 0.449 0.036 -0.316 -0.641 -0.95 -1.22 -1.474 -1.717 -1.968 -2.21 -2.416 -2.621 -2.849 -3.039 -3.231 -3.42 -3.553 -3.684 -3.826 -3.984 -4.141 -4.248 -4.358 -4.536 -4.667 -4.795 -4.855 -4.98 -5.134 -5.3 -5.374 -5.695 -5.609 -5.683 -5.766 -5.946 -6.034 -6.151 -6.288 -6.409 -6.559 -6.76 -7.206 -10 ,28951 ,KEBNE ,17022106,Wed Dec 22 05:19:20 CET,Wed Dec 22 06:44:08 CET,0.0 0.693 0.965 1.179 1.323 1.458 1.592 1.7 1.912 2.009 2.086 1.998 2.322 2.404 2.543 2.67 2.791 2.849 2.965 3.09 3.267 3.361 3.464 3.617 3.755 3.893 4.026 4.15 4.306 4.456 4.593 4.769 4.956 5.113 5.286 5.487 5.654 5.831 6.017 6.206 6.403 6.59 6.812 7.038 7.269 7.526 7.772 7.961 8.117 8.094 7.679 6.864 6.047 5.303 4.665 4.099 3.592 3.096 2.689 2.315 1.98 1.679 1.387 1.117 0.871 0.634 0.382 0.161 -0.038 -0.247 -0.453 -0.621 -0.81 -1.006 -1.144 -1.283 -1.433 -1.593 -1.762 -1.878 -1.986 -2.161 -2.284 -2.411 -2.481 -2.618 -2.766 -2.946 -3.045 -3.389 -3.335 -3.428 -3.538 -3.782 -3.924 -4.099 -4.283 -4.494 -4.736 -5.056 -5.826 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_34.txt deleted file mode 100644 index d09dd76f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_34.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6842 ,KEBNE ,17022107,Wed Dec 22 05:19:24 CET,Wed Dec 22 06:40:48 CET,0.0 0.946 1.296 1.621 1.882 2.1 2.286 2.43 2.656 2.772 2.901 2.877 3.218 3.314 3.49 3.674 3.853 3.933 4.073 4.209 4.417 4.55 4.677 4.866 5.053 5.237 5.404 5.558 5.747 5.91 6.073 6.28 6.487 6.697 6.945 7.197 7.412 7.66 7.924 8.197 8.473 8.769 9.106 9.424 9.775 10.144 10.57 11.058 11.596 12.076 12.355 12.262 11.967 11.661 11.357 11.02 10.691 10.355 10.034 9.714 9.433 9.181 8.954 8.736 8.51 8.271 8.027 7.822 7.64 7.448 7.25 7.093 6.923 6.751 6.624 6.494 6.365 6.222 6.064 5.952 5.833 5.654 5.531 5.398 5.325 5.178 5.031 4.876 4.8 4.485 4.547 4.455 4.348 4.141 4.035 3.913 3.78 3.65 3.496 3.264 2.748 -2 ,6312 ,KEBNE ,17022108,Wed Dec 22 05:19:20 CET,Wed Dec 22 06:43:28 CET,0.0 1.758 2.309 2.688 2.986 3.229 3.436 3.642 4.032 4.212 4.382 4.453 4.832 4.977 5.258 5.499 5.737 5.851 6.063 6.258 6.52 6.688 6.858 7.098 7.324 7.553 7.768 7.979 8.259 8.501 8.732 9.021 9.296 9.542 9.803 10.078 10.334 10.633 10.964 11.306 11.642 11.984 12.361 12.723 13.122 13.555 14.003 14.456 14.956 15.444 15.8 15.747 15.403 14.972 14.585 14.21 13.855 13.5 13.171 12.841 12.569 12.326 12.081 11.856 11.643 11.434 11.233 11.065 10.915 10.737 10.535 10.367 10.189 10.008 9.866 9.714 9.548 9.368 9.181 9.052 8.918 8.69 8.543 8.402 8.322 8.154 7.98 7.796 7.705 7.369 7.393 7.279 7.161 6.883 6.731 6.58 6.395 6.186 5.972 5.713 5.175 -3 ,11177 ,KEBNE ,17022109,Wed Dec 22 05:19:20 CET,Wed Dec 22 06:45:05 CET,0.0 1.271 1.835 2.348 2.761 3.125 3.41 3.636 4.038 4.209 4.359 4.402 4.765 4.88 5.115 5.362 5.588 5.695 5.897 6.083 6.377 6.566 6.747 7.02 7.256 7.457 7.66 7.86 8.129 8.389 8.636 8.936 9.208 9.469 9.752 10.05 10.354 10.685 11.034 11.409 11.781 12.15 12.543 12.934 13.372 13.834 14.38 14.93 15.465 15.936 16.165 16.043 15.768 15.462 15.129 14.76 14.428 14.13 13.869 13.608 13.367 13.147 12.925 12.687 12.469 12.285 12.09 11.906 11.745 11.578 11.393 11.239 11.081 10.922 10.8 10.675 10.551 10.419 10.273 10.166 10.058 9.894 9.762 9.621 9.553 9.41 9.267 9.114 9.034 8.72 8.798 8.699 8.598 8.369 8.248 8.116 7.968 7.818 7.624 7.385 6.823 -4 ,21881 ,KEBNE ,17022110,Wed Dec 22 05:19:20 CET,Wed Dec 22 06:44:07 CET,0.0 1.543 2.007 2.303 2.586 2.849 3.058 3.251 3.628 3.803 3.965 4.033 4.416 4.545 4.772 4.981 5.198 5.307 5.495 5.658 5.886 6.038 6.179 6.392 6.606 6.82 7.026 7.221 7.488 7.715 7.937 8.232 8.498 8.738 9.014 9.334 9.628 9.939 10.284 10.648 10.985 11.355 11.797 12.186 12.567 12.986 13.522 14.06 14.565 15.034 15.24 15.038 14.714 14.337 13.958 13.6 13.278 12.961 12.678 12.397 12.14 11.903 11.677 11.465 11.265 11.078 10.875 10.69 10.519 10.343 10.171 10.02 9.858 9.682 9.545 9.403 9.26 9.119 8.961 8.853 8.742 8.554 8.427 8.3 8.233 8.091 7.947 7.788 7.703 7.376 7.418 7.321 7.219 7.027 6.905 6.765 6.621 6.457 6.258 6.014 5.478 -5 ,11689 ,KEBNE ,17022111,Wed Dec 22 05:19:20 CET,Wed Dec 22 06:43:09 CET,0.0 1.499 1.994 2.418 2.747 2.977 3.178 3.378 3.779 3.984 4.183 4.321 4.748 4.921 5.205 5.433 5.649 5.764 5.984 6.179 6.497 6.694 6.855 7.077 7.297 7.527 7.738 7.939 8.205 8.461 8.704 9.008 9.277 9.5 9.762 10.052 10.322 10.631 10.967 11.332 11.702 12.069 12.482 12.881 13.316 13.773 14.282 14.813 15.363 15.929 16.399 16.499 16.304 15.969 15.643 15.341 15.043 14.748 14.485 14.197 13.932 13.697 13.463 13.243 13.039 12.853 12.662 12.492 12.341 12.173 12.004 11.861 11.706 11.542 11.407 11.268 11.134 10.979 10.81 10.698 10.579 10.388 10.247 10.1 10.026 9.873 9.714 9.552 9.463 9.12 9.15 9.055 8.964 8.783 8.656 8.522 8.403 8.238 8.042 7.812 7.419 -6 ,29579 ,KEBNE ,17022112,Wed Dec 22 05:19:20 CET,Wed Dec 22 06:44:20 CET,0.0 1.361 1.771 2.022 2.243 2.452 2.626 2.792 3.116 3.274 3.429 3.463 3.85 3.985 4.216 4.424 4.626 4.728 4.926 5.108 5.369 5.541 5.693 5.893 6.115 6.356 6.608 6.849 7.133 7.391 7.621 7.882 8.129 8.36 8.61 8.892 9.166 9.469 9.793 10.161 10.542 10.925 11.374 11.773 12.214 12.696 13.198 13.677 14.13 14.585 14.98 14.981 14.682 14.373 14.062 13.708 13.366 13.054 12.799 12.534 12.273 12.025 11.785 11.557 11.344 11.154 10.965 10.795 10.643 10.47 10.282 10.125 9.968 9.803 9.674 9.549 9.414 9.27 9.122 9.013 8.902 8.734 8.623 8.516 8.455 8.319 8.18 8.032 7.941 7.604 7.654 7.552 7.454 7.249 7.129 6.998 6.844 6.675 6.494 6.233 5.82 -7 ,5535 ,KEBNE ,17022113,Wed Dec 22 05:19:20 CET,Wed Dec 22 06:43:28 CET,0.0 1.732 2.246 2.661 3.011 3.287 3.53 3.745 4.113 4.296 4.455 4.503 4.885 5.026 5.297 5.547 5.783 5.889 6.098 6.301 6.587 6.769 6.938 7.18 7.405 7.616 7.817 8.016 8.282 8.525 8.75 9.034 9.299 9.54 9.828 10.142 10.435 10.743 11.052 11.382 11.754 12.212 12.688 13.071 13.508 13.983 14.479 14.996 15.506 15.908 16.082 15.874 15.556 15.205 14.837 14.48 14.125 13.781 13.501 13.216 12.957 12.718 12.475 12.234 12.009 11.807 11.583 11.375 11.191 11.006 10.826 10.676 10.506 10.33 10.196 10.056 9.919 9.783 9.643 9.548 9.445 9.254 9.121 8.996 8.925 8.768 8.612 8.444 8.355 8.027 8.083 7.987 7.882 7.611 7.47 7.324 7.162 6.993 6.787 6.519 5.967 -9 ,7004 ,KEBNE ,17022115,Wed Dec 22 05:19:24 CET,Wed Dec 22 06:40:53 CET,0.0 1.649 2.208 2.617 2.942 3.222 3.471 3.71 4.135 4.325 4.509 4.602 4.983 5.114 5.363 5.579 5.799 5.92 6.144 6.324 6.576 6.733 6.886 7.123 7.347 7.561 7.78 7.997 8.257 8.495 8.73 9.013 9.282 9.538 9.832 10.17 10.486 10.814 11.145 11.482 11.838 12.23 12.64 13.043 13.51 13.975 14.442 14.91 15.368 15.769 16.088 16.076 15.853 15.547 15.199 14.856 14.539 14.228 13.924 13.605 13.351 13.12 12.876 12.641 12.431 12.234 12.008 11.812 11.648 11.466 11.281 11.133 10.977 10.797 10.649 10.497 10.34 10.171 9.992 9.869 9.744 9.561 9.435 9.302 9.237 9.108 8.97 8.821 8.737 8.406 8.438 8.334 8.219 7.972 7.849 7.707 7.558 7.384 7.175 6.934 6.284 -10 ,20912 ,KEBNE ,17022116,Wed Dec 22 05:19:24 CET,Wed Dec 22 06:39:53 CET,0.0 1.427 1.812 2.093 2.328 2.545 2.765 2.969 3.396 3.624 3.826 3.911 4.284 4.415 4.653 4.88 5.125 5.246 5.463 5.67 5.956 6.127 6.284 6.508 6.719 6.917 7.118 7.304 7.525 7.744 7.957 8.217 8.467 8.702 8.959 9.241 9.517 9.813 10.131 10.462 10.81 11.192 11.607 11.993 12.369 12.746 13.189 13.684 14.172 14.57 14.77 14.667 14.417 14.084 13.721 13.351 13.034 12.737 12.463 12.184 11.928 11.69 11.466 11.24 11.023 10.823 10.602 10.4 10.23 10.064 9.896 9.748 9.593 9.428 9.297 9.164 9.021 8.878 8.73 8.618 8.507 8.335 8.214 8.096 8.038 7.895 7.736 7.586 7.503 7.169 7.246 7.16 7.07 6.877 6.774 6.655 6.499 6.305 6.09 5.871 5.553 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_37.txt deleted file mode 100644 index 5513a151..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24064 ,TETRA ,17524092,Wed Nov 24 20:42:52 CET,Wed Nov 24 22:27:25 CET,0.0 2.657 3.275 3.719 4.083 4.401 4.691 4.977 5.512 5.736 5.941 6.064 6.452 6.608 6.88 7.117 7.342 7.454 7.683 7.893 8.182 8.37 8.565 8.849 9.108 9.337 9.543 9.754 10.02 10.248 10.47 10.767 11.069 11.358 11.67 11.996 12.318 12.65 12.968 13.327 13.697 14.043 14.397 14.736 15.119 15.482 15.784 16.004 16.198 16.226 15.78 14.869 13.951 13.112 12.347 11.645 11.05 10.543 10.104 9.669 9.297 8.962 8.628 8.3 8.008 7.749 7.476 7.229 7.02 6.806 6.57 6.383 6.199 6.005 5.857 5.699 5.524 5.345 5.165 5.039 4.915 4.724 4.588 4.449 4.383 4.244 4.086 3.928 3.848 3.507 3.578 3.48 3.376 3.158 3.046 2.934 2.814 2.656 2.459 2.2 1.599 -2 ,28525 ,TETRA ,17524095,Wed Nov 24 20:45:27 CET,Wed Nov 24 22:30:00 CET,0.0 1.621 2.128 2.565 2.912 3.196 3.461 3.697 4.13 4.338 4.523 4.64 5.043 5.204 5.499 5.752 5.986 6.097 6.308 6.512 6.824 7.022 7.215 7.477 7.715 7.956 8.181 8.399 8.691 8.958 9.207 9.507 9.787 10.022 10.256 10.508 10.755 11.045 11.34 11.61 11.864 12.139 12.448 12.725 13.015 13.301 13.563 13.768 13.867 13.811 13.359 12.437 11.556 10.748 10.021 9.36 8.79 8.283 7.824 7.354 6.947 6.562 6.205 5.883 5.578 5.3 5.016 4.778 4.58 4.371 4.158 3.98 3.794 3.602 3.457 3.308 3.143 2.962 2.778 2.658 2.543 2.365 2.232 2.089 2.013 1.854 1.691 1.517 1.434 1.099 1.159 1.063 0.967 0.762 0.638 0.508 0.366 0.133 -0.171 -0.531 -1.369 -3 ,11573 ,TETRA ,17524098,Wed Nov 24 20:47:20 CET,Wed Nov 24 22:36:03 CET,0.0 2.173 2.813 3.303 3.633 3.878 4.113 4.32 4.67 4.827 4.971 4.972 5.346 5.49 5.773 6.041 6.268 6.373 6.6 6.81 7.107 7.296 7.475 7.728 7.972 8.2 8.402 8.598 8.847 9.071 9.298 9.563 9.78 9.986 10.234 10.519 10.769 11.019 11.318 11.62 11.904 12.247 12.596 12.871 13.155 13.424 13.687 13.909 14.007 13.883 13.265 12.283 11.351 10.539 9.843 9.186 8.582 8.039 7.571 7.124 6.734 6.39 6.082 5.777 5.496 5.239 4.979 4.747 4.534 4.312 4.079 3.882 3.679 3.468 3.307 3.154 3.0 2.83 2.638 2.509 2.397 2.224 2.089 1.94 1.859 1.696 1.527 1.354 1.266 0.932 1.021 0.928 0.827 0.595 0.476 0.355 0.208 0.062 -0.104 -0.341 -1.277 -4 ,13436 ,TETRA ,17524101,Wed Nov 24 20:48:18 CET,Wed Nov 24 22:34:27 CET,0.0 2.042 2.518 2.915 3.271 3.526 3.714 3.897 4.231 4.389 4.531 4.567 4.931 5.054 5.289 5.526 5.742 5.845 6.054 6.264 6.555 6.741 6.914 7.145 7.358 7.555 7.746 7.934 8.172 8.386 8.587 8.826 9.053 9.268 9.513 9.777 10.022 10.269 10.525 10.796 11.035 11.297 11.584 11.829 12.07 12.274 12.431 12.522 12.56 12.389 11.767 10.808 9.932 9.147 8.437 7.794 7.221 6.708 6.273 5.78 5.337 4.972 4.614 4.261 3.935 3.642 3.344 3.089 2.875 2.629 2.359 2.145 1.943 1.731 1.546 1.343 1.131 0.918 0.699 0.554 0.415 0.207 0.076 -0.055 -0.129 -0.287 -0.452 -0.642 -0.74 -1.086 -1.051 -1.163 -1.282 -1.531 -1.666 -1.818 -1.999 -2.211 -2.44 -2.727 -3.155 -5 ,30785 ,TETRA ,17524103,Wed Nov 24 20:49:12 CET,Wed Nov 24 22:37:08 CET,0.0 1.499 2.003 2.321 2.598 2.863 3.121 3.36 3.76 3.937 4.113 4.214 4.605 4.773 5.1 5.384 5.642 5.751 5.975 6.183 6.434 6.584 6.735 6.957 7.157 7.364 7.562 7.75 8.003 8.235 8.438 8.669 8.867 9.055 9.29 9.55 9.785 10.019 10.265 10.527 10.812 11.124 11.416 11.683 11.991 12.278 12.538 12.737 12.791 12.656 12.098 11.116 10.255 9.464 8.745 8.09 7.499 6.963 6.505 6.073 5.703 5.358 5.025 4.718 4.427 4.15 3.847 3.586 3.374 3.147 2.904 2.704 2.503 2.287 2.115 1.935 1.747 1.579 1.398 1.27 1.137 0.908 0.76 0.602 0.52 0.35 0.176 -0.007 -0.101 -0.444 -0.381 -0.481 -0.584 -0.832 -0.975 -1.118 -1.251 -1.407 -1.605 -1.798 -2.171 -6 ,18167 ,TETRA ,17524105,Wed Nov 24 20:49:13 CET,Wed Nov 24 22:36:03 CET,0.0 1.778 2.285 2.672 3.017 3.284 3.502 3.706 4.057 4.204 4.346 4.397 4.748 4.878 5.121 5.344 5.559 5.662 5.867 6.063 6.318 6.484 6.651 6.873 7.07 7.262 7.449 7.617 7.826 8.021 8.216 8.458 8.692 8.919 9.153 9.392 9.616 9.872 10.152 10.428 10.707 11.025 11.354 11.628 11.898 12.13 12.317 12.464 12.505 12.269 11.598 10.589 9.69 8.89 8.177 7.569 7.026 6.51 6.069 5.625 5.235 4.902 4.595 4.308 4.036 3.778 3.503 3.267 3.065 2.856 2.64 2.461 2.275 2.087 1.945 1.794 1.633 1.465 1.28 1.15 1.026 0.823 0.679 0.525 0.449 0.295 0.131 -0.037 -0.129 -0.468 -0.432 -0.545 -0.667 -0.89 -0.997 -1.113 -1.258 -1.43 -1.612 -1.799 -2.38 -7 ,30418 ,TETRA ,17524107,Wed Nov 24 20:50:51 CET,Wed Nov 24 22:36:15 CET,0.0 2.054 2.719 3.25 3.663 4.016 4.329 4.623 5.15 5.374 5.582 5.717 6.12 6.27 6.552 6.828 7.09 7.208 7.445 7.681 8.012 8.223 8.426 8.737 9.037 9.313 9.565 9.794 10.088 10.352 10.603 10.914 11.194 11.453 11.72 12.002 12.269 12.532 12.808 13.092 13.362 13.651 13.965 14.265 14.61 14.957 15.277 15.506 15.661 15.592 15.128 14.35 13.58 12.842 12.183 11.599 11.083 10.613 10.199 9.766 9.38 9.036 8.71 8.41 8.136 7.881 7.59 7.324 7.11 6.885 6.639 6.441 6.236 6.027 5.868 5.687 5.499 5.314 5.112 4.967 4.832 4.636 4.49 4.336 4.257 4.101 3.924 3.727 3.635 3.291 3.298 3.177 3.047 2.767 2.619 2.477 2.345 2.21 2.048 1.844 1.398 -8 ,6498 ,TETRA ,17524109,Wed Nov 24 20:52:26 CET,Wed Nov 24 22:39:04 CET,0.0 2.736 3.359 3.766 4.086 4.356 4.629 4.916 5.383 5.584 5.783 5.911 6.314 6.449 6.698 6.94 7.188 7.316 7.549 7.761 8.059 8.231 8.397 8.65 8.879 9.102 9.321 9.531 9.794 10.015 10.242 10.571 10.865 11.131 11.448 11.775 12.046 12.327 12.645 12.995 13.333 13.668 14.025 14.346 14.647 14.996 15.348 15.559 15.657 15.517 14.909 13.902 12.973 12.161 11.449 10.81 10.257 9.748 9.311 8.871 8.493 8.134 7.78 7.466 7.169 6.887 6.601 6.35 6.151 5.944 5.698 5.498 5.297 5.083 4.923 4.764 4.597 4.41 4.213 4.095 3.983 3.799 3.665 3.516 3.436 3.274 3.114 2.946 2.862 2.534 2.582 2.475 2.368 2.145 2.036 1.919 1.787 1.621 1.412 1.076 0.395 -9 ,14076 ,TETRA ,17524110,Wed Nov 24 20:52:27 CET,Wed Nov 24 22:38:52 CET,0.0 1.688 2.197 2.569 2.86 3.114 3.373 3.632 4.047 4.212 4.357 4.387 4.737 4.861 5.098 5.338 5.6 5.712 5.909 6.105 6.383 6.553 6.711 6.921 7.116 7.31 7.491 7.666 7.91 8.137 8.336 8.587 8.817 9.03 9.275 9.522 9.749 9.992 10.239 10.471 10.693 10.943 11.203 11.416 11.639 11.877 12.095 12.224 12.242 12.061 11.431 10.476 9.582 8.735 7.963 7.304 6.76 6.264 5.825 5.381 5.0 4.665 4.352 4.055 3.773 3.526 3.28 3.048 2.848 2.641 2.412 2.23 2.051 1.856 1.702 1.55 1.389 1.224 1.06 0.946 0.828 0.632 0.49 0.345 0.277 0.128 -0.042 -0.199 -0.281 -0.62 -0.563 -0.66 -0.757 -0.979 -1.099 -1.248 -1.427 -1.594 -1.778 -1.998 -2.401 -10 ,21608 ,TETRA ,17524111,Wed Nov 24 20:52:30 CET,Wed Nov 24 22:38:55 CET,0.0 1.489 1.916 2.284 2.62 2.918 3.188 3.417 3.796 3.983 4.171 4.243 4.609 4.744 4.986 5.202 5.416 5.523 5.722 5.914 6.2 6.39 6.574 6.818 7.039 7.237 7.428 7.625 7.869 8.092 8.302 8.545 8.776 8.984 9.21 9.46 9.684 9.903 10.15 10.43 10.682 10.949 11.244 11.501 11.783 12.073 12.304 12.407 12.383 12.178 11.597 10.665 9.747 8.936 8.251 7.619 7.015 6.445 5.984 5.56 5.195 4.866 4.553 4.249 3.94 3.664 3.398 3.167 2.972 2.776 2.581 2.413 2.229 2.042 1.887 1.724 1.567 1.408 1.232 1.099 0.964 0.773 0.642 0.506 0.424 0.228 0.034 -0.148 -0.237 -0.579 -0.536 -0.628 -0.727 -0.959 -1.085 -1.228 -1.41 -1.611 -1.841 -2.155 -2.73 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_38.txt deleted file mode 100644 index 69c5c594..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_38.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9734 ,KEBNE ,17022117,Wed Dec 22 05:19:29 CET,Wed Dec 22 06:41:39 CET,0.0 6.804 7.502 7.979 8.346 8.658 8.906 9.12 9.488 9.649 9.81 9.907 10.304 10.445 10.72 10.992 11.243 11.369 11.609 11.827 12.131 12.313 12.477 12.723 12.973 13.194 13.405 13.609 13.86 14.109 14.337 14.605 14.862 15.114 15.406 15.736 16.04 16.338 16.649 16.985 17.309 17.639 18.008 18.366 18.731 19.101 19.47 19.764 20.036 20.178 19.965 19.3 18.554 17.852 17.25 16.701 16.189 15.72 15.302 14.877 14.504 14.149 13.816 13.497 13.191 12.913 12.594 12.29 12.03 11.784 11.535 11.32 11.099 10.894 10.739 10.559 10.369 10.187 9.992 9.856 9.726 9.52 9.371 9.212 9.13 8.945 8.728 8.503 8.392 8.034 8.015 7.865 7.707 7.329 7.138 6.956 6.754 6.489 6.134 5.6 3.849 -2 ,26324 ,KEBNE ,17022118,Wed Dec 22 05:19:25 CET,Wed Dec 22 06:44:26 CET,0.0 2.034 2.547 2.928 3.273 3.585 3.861 4.084 4.485 4.653 4.809 4.846 5.204 5.331 5.592 5.839 6.062 6.163 6.357 6.545 6.787 6.946 7.11 7.333 7.559 7.794 8.01 8.206 8.453 8.682 8.902 9.163 9.417 9.668 9.939 10.22 10.482 10.76 11.037 11.311 11.58 11.871 12.196 12.505 12.841 13.166 13.495 13.794 14.069 14.225 14.013 13.395 12.699 12.052 11.458 10.886 10.367 9.882 9.489 9.083 8.705 8.369 8.034 7.723 7.443 7.165 6.885 6.645 6.424 6.196 5.968 5.781 5.578 5.36 5.194 5.027 4.842 4.645 4.456 4.335 4.208 4.011 3.882 3.745 3.668 3.509 3.355 3.18 3.084 2.737 2.745 2.583 2.406 2.064 1.88 1.675 1.449 1.186 0.899 0.524 -1.346 -3 ,26437 ,KEBNE ,17022119,Wed Dec 22 05:19:25 CET,Wed Dec 22 06:45:43 CET,0.0 2.703 3.144 3.489 3.764 4.01 4.243 4.459 4.805 4.947 5.105 5.171 5.534 5.652 5.882 6.12 6.342 6.435 6.605 6.783 7.049 7.217 7.382 7.612 7.833 8.047 8.241 8.433 8.691 8.92 9.139 9.422 9.7 9.936 10.183 10.452 10.716 11.032 11.369 11.684 11.979 12.319 12.685 13.013 13.359 13.697 14.053 14.395 14.719 14.93 14.779 14.193 13.629 13.084 12.487 11.845 11.272 10.766 10.304 9.846 9.468 9.112 8.753 8.424 8.129 7.855 7.586 7.345 7.125 6.908 6.677 6.484 6.305 6.127 5.971 5.801 5.636 5.467 5.285 5.15 5.002 4.778 4.632 4.486 4.41 4.205 3.946 3.693 3.573 3.198 3.176 3.041 2.925 2.649 2.47 2.251 2.014 1.766 1.445 0.997 -0.776 -4 ,98 ,KEBNE ,17022120,Wed Dec 22 05:19:25 CET,Wed Dec 22 06:43:48 CET,0.0 3.521 4.127 4.547 4.882 5.142 5.396 5.635 6.013 6.176 6.322 6.336 6.692 6.816 7.051 7.294 7.53 7.641 7.852 8.036 8.294 8.465 8.633 8.899 9.14 9.332 9.522 9.715 9.954 10.204 10.459 10.74 11.008 11.246 11.493 11.758 12.022 12.314 12.592 12.885 13.217 13.591 14.022 14.414 14.792 15.15 15.531 15.866 16.134 16.271 16.017 15.269 14.534 13.937 13.368 12.812 12.312 11.827 11.4 10.996 10.635 10.306 9.997 9.699 9.418 9.145 8.854 8.601 8.38 8.159 7.935 7.748 7.553 7.332 7.165 7.006 6.847 6.687 6.516 6.399 6.284 6.084 5.939 5.797 5.721 5.55 5.384 5.22 5.123 4.768 4.798 4.67 4.549 4.248 4.044 3.82 3.559 3.271 2.976 2.699 1.775 -5 ,6694 ,KEBNE ,17022121,Wed Dec 22 05:19:33 CET,Wed Dec 22 06:45:59 CET,0.0 2.998 3.433 3.777 4.086 4.367 4.611 4.827 5.224 5.4 5.553 5.611 5.985 6.133 6.413 6.669 6.912 7.021 7.221 7.409 7.672 7.832 7.995 8.248 8.488 8.711 8.93 9.146 9.43 9.708 10.01 10.402 10.733 11.032 11.373 11.725 12.04 12.38 12.724 13.055 13.393 13.751 14.108 14.401 14.729 15.094 15.48 15.835 16.083 16.207 15.971 15.234 14.475 13.775 13.126 12.466 11.89 11.411 10.993 10.532 10.114 9.751 9.395 9.065 8.772 8.508 8.249 8.004 7.778 7.554 7.312 7.107 6.917 6.714 6.552 6.379 6.2 6.023 5.83 5.699 5.559 5.339 5.199 5.063 4.99 4.818 4.648 4.477 4.375 4.017 4.05 3.943 3.834 3.58 3.432 3.231 2.969 2.671 2.31 1.882 0.101 -6 ,23897 ,KEBNE ,17022122,Wed Dec 22 05:19:39 CET,Wed Dec 22 06:45:31 CET,0.0 4.531 5.116 5.512 5.815 6.097 6.35 6.568 6.988 7.17 7.337 7.443 7.834 7.976 8.251 8.511 8.747 8.851 9.058 9.278 9.581 9.759 9.926 10.146 10.348 10.561 10.771 10.967 11.218 11.463 11.697 11.969 12.221 12.464 12.727 13.002 13.28 13.598 13.954 14.301 14.611 14.941 15.326 15.677 16.018 16.357 16.726 17.084 17.406 17.639 17.603 17.14 16.519 15.846 15.218 14.65 14.12 13.622 13.179 12.716 12.326 12.0 11.688 11.37 11.057 10.778 10.494 10.231 9.988 9.742 9.51 9.323 9.127 8.918 8.754 8.582 8.406 8.243 8.061 7.918 7.774 7.546 7.396 7.245 7.167 7.001 6.823 6.639 6.546 6.202 6.24 6.118 6.003 5.784 5.652 5.496 5.299 5.077 4.809 4.387 2.941 -7 ,18336 ,KEBNE ,17022123,Wed Dec 22 05:19:41 CET,Wed Dec 22 06:44:11 CET,0.0 4.802 5.872 6.422 6.869 7.263 7.616 7.905 8.402 8.653 8.891 9.067 9.491 9.683 10.086 10.439 10.736 10.88 11.161 11.421 11.769 11.995 12.195 12.438 12.644 12.859 13.076 13.264 13.519 13.762 13.99 14.273 14.536 14.784 15.069 15.408 15.744 16.086 16.411 16.735 17.085 17.451 17.822 18.176 18.602 19.029 19.44 19.82 20.078 20.187 19.997 19.402 18.757 18.106 17.437 16.771 16.211 15.689 15.225 14.768 14.363 14.026 13.711 13.415 13.143 12.885 12.598 12.34 12.12 11.881 11.621 11.399 11.188 10.982 10.815 10.651 10.483 10.29 10.084 9.947 9.795 9.548 9.373 9.189 9.095 8.91 8.706 8.478 8.368 8.012 8.047 7.932 7.805 7.522 7.368 7.208 7.048 6.853 6.63 6.414 5.556 -8 ,26411 ,KEBNE ,17022124,Wed Dec 22 05:19:43 CET,Wed Dec 22 06:44:41 CET,0.0 4.969 5.555 5.916 6.19 6.421 6.631 6.813 7.177 7.354 7.518 7.62 8.013 8.149 8.412 8.677 8.925 9.038 9.258 9.452 9.706 9.857 10.014 10.237 10.433 10.643 10.849 11.06 11.328 11.551 11.76 12.0 12.233 12.447 12.674 12.933 13.182 13.46 13.757 14.044 14.338 14.691 15.077 15.396 15.733 16.082 16.431 16.754 16.971 17.014 16.747 16.031 15.269 14.627 14.055 13.515 12.997 12.517 12.108 11.69 11.31 10.959 10.633 10.325 10.057 9.826 9.58 9.357 9.157 8.957 8.764 8.6 8.431 8.259 8.12 7.962 7.802 7.634 7.457 7.332 7.198 7.008 6.881 6.748 6.678 6.528 6.376 6.223 6.137 5.795 5.836 5.733 5.622 5.362 5.239 5.116 4.956 4.786 4.531 4.059 3.145 -9 ,12489 ,KEBNE ,17022125,Wed Dec 22 05:19:43 CET,Wed Dec 22 06:44:56 CET,0.0 6.551 7.034 7.394 7.71 7.988 8.232 8.468 8.866 9.035 9.216 9.311 9.674 9.803 10.08 10.343 10.58 10.694 10.904 11.07 11.298 11.457 11.607 11.836 12.07 12.3 12.511 12.714 12.982 13.232 13.464 13.712 13.931 14.146 14.42 14.756 15.037 15.303 15.59 15.86 16.135 16.468 16.849 17.21 17.578 17.969 18.364 18.672 18.935 19.188 19.186 18.713 18.1 17.44 16.838 16.249 15.698 15.19 14.738 14.277 13.871 13.504 13.165 12.859 12.58 12.317 12.05 11.822 11.621 11.397 11.162 10.968 10.77 10.568 10.406 10.23 10.05 9.871 9.672 9.537 9.405 9.208 9.071 8.925 8.847 8.683 8.525 8.354 8.265 7.934 8.007 7.916 7.813 7.502 7.299 7.064 6.777 6.446 6.033 5.508 3.574 -10 ,8146 ,KEBNE ,17022126,Wed Dec 22 05:19:43 CET,Wed Dec 22 06:46:19 CET,0.0 3.175 3.679 4.067 4.444 4.742 4.984 5.219 5.664 5.843 6.006 6.064 6.441 6.568 6.814 7.074 7.33 7.448 7.649 7.823 8.075 8.232 8.387 8.624 8.873 9.111 9.326 9.534 9.807 10.077 10.322 10.584 10.827 11.077 11.374 11.695 11.974 12.266 12.572 12.896 13.22 13.578 13.959 14.291 14.636 14.962 15.277 15.567 15.846 16.031 15.824 15.248 14.702 14.145 13.59 13.092 12.631 12.122 11.647 11.181 10.793 10.441 10.096 9.775 9.477 9.184 8.864 8.58 8.336 8.088 7.843 7.64 7.432 7.229 7.06 6.867 6.659 6.454 6.239 6.087 5.932 5.697 5.523 5.335 5.246 5.064 4.871 4.665 4.56 4.197 4.182 4.053 3.918 3.639 3.484 3.298 3.086 2.808 2.487 2.101 0.658 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_39.txt deleted file mode 100644 index 2026c28f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_39.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28395 ,KEBNE ,17022127,Wed Dec 22 05:19:43 CET,Wed Dec 22 06:44:01 CET,0.0 3.707 4.355 4.766 5.126 5.481 5.795 6.041 6.472 6.664 6.845 6.955 7.355 7.509 7.809 8.096 8.361 8.483 8.733 8.973 9.302 9.509 9.698 9.982 10.247 10.496 10.735 10.952 11.208 11.463 11.722 12.044 12.364 12.647 12.944 13.271 13.555 13.867 14.214 14.557 14.919 15.319 15.731 16.102 16.546 17.018 17.464 17.87 18.195 18.33 18.127 17.638 16.995 16.378 15.819 15.28 14.775 14.272 13.821 13.365 12.964 12.599 12.244 11.902 11.593 11.311 10.999 10.709 10.471 10.22 9.947 9.725 9.487 9.224 9.027 8.841 8.643 8.433 8.224 8.091 7.949 7.712 7.547 7.391 7.307 7.108 6.916 6.705 6.593 6.224 6.23 6.108 5.977 5.691 5.551 5.38 5.164 4.935 4.66 4.301 3.338 -2 ,26791 ,KEBNE ,17022128,Wed Dec 22 05:19:44 CET,Wed Dec 22 06:44:04 CET,0.0 1.95 2.475 2.875 3.235 3.553 3.822 4.052 4.496 4.725 4.93 5.024 5.429 5.585 5.884 6.183 6.441 6.556 6.777 7.008 7.339 7.531 7.714 7.969 8.222 8.469 8.706 8.951 9.278 9.58 9.852 10.172 10.466 10.727 10.995 11.263 11.506 11.776 12.057 12.331 12.645 13.006 13.397 13.762 14.134 14.524 14.923 15.315 15.636 15.688 15.282 14.455 13.654 12.915 12.231 11.599 11.037 10.542 10.093 9.619 9.236 8.919 8.612 8.307 8.012 7.73 7.453 7.229 7.03 6.805 6.586 6.406 6.203 5.989 5.827 5.662 5.464 5.259 5.073 4.921 4.735 4.482 4.315 4.12 4.022 3.823 3.61 3.384 3.27 2.902 2.896 2.761 2.622 2.333 2.155 1.955 1.769 1.563 1.31 0.981 -0.092 -3 ,11537 ,KEBNE ,17022129,Wed Dec 22 05:19:51 CET,Wed Dec 22 06:41:37 CET,0.0 4.676 5.538 6.176 6.66 7.071 7.416 7.705 8.208 8.455 8.701 8.886 9.325 9.516 9.911 10.296 10.657 10.823 11.113 11.406 11.843 12.109 12.35 12.653 12.924 13.195 13.454 13.698 14.023 14.32 14.57 14.863 15.148 15.408 15.698 16.044 16.377 16.747 17.136 17.527 17.907 18.309 18.76 19.195 19.661 20.089 20.517 20.963 21.422 21.772 21.793 21.302 20.621 19.875 19.183 18.61 18.13 17.674 17.265 16.861 16.508 16.173 15.845 15.55 15.261 14.979 14.697 14.449 14.236 14.018 13.772 13.569 13.353 13.12 12.945 12.772 12.596 12.408 12.221 12.088 11.94 11.705 11.521 11.329 11.236 11.031 10.799 10.555 10.437 10.07 10.031 9.874 9.723 9.423 9.245 9.044 8.848 8.649 8.398 8.01 7.05 -4 ,16245 ,KEBNE ,17022130,Wed Dec 22 05:19:47 CET,Wed Dec 22 06:46:36 CET,0.0 4.044 4.748 5.229 5.595 5.896 6.133 6.369 6.827 7.027 7.22 7.311 7.721 7.89 8.19 8.472 8.759 8.897 9.151 9.402 9.754 9.982 10.204 10.504 10.785 11.047 11.282 11.496 11.769 12.032 12.292 12.611 12.922 13.207 13.528 13.896 14.228 14.558 14.89 15.26 15.63 15.979 16.38 16.821 17.277 17.67 18.042 18.342 18.535 18.579 18.266 17.532 16.751 16.012 15.339 14.729 14.192 13.687 13.248 12.82 12.444 12.093 11.747 11.445 11.167 10.906 10.643 10.392 10.183 9.975 9.75 9.552 9.343 9.122 8.946 8.76 8.57 8.373 8.166 8.029 7.866 7.619 7.444 7.246 7.151 6.945 6.736 6.523 6.404 6.033 6.031 5.898 5.75 5.403 5.195 4.96 4.729 4.478 4.155 3.687 1.85 -5 ,18182 ,KEBNE ,17022131,Wed Dec 22 05:19:54 CET,Wed Dec 22 06:44:10 CET,0.0 3.536 4.096 4.595 4.993 5.308 5.546 5.754 6.139 6.325 6.512 6.606 7.022 7.207 7.53 7.834 8.111 8.245 8.486 8.684 8.974 9.162 9.346 9.63 9.887 10.123 10.365 10.597 10.883 11.15 11.394 11.68 11.956 12.219 12.537 12.881 13.207 13.535 13.877 14.272 14.676 15.095 15.527 15.93 16.388 16.833 17.267 17.663 17.994 18.184 18.025 17.414 16.682 15.987 15.379 14.814 14.28 13.77 13.334 12.899 12.493 12.14 11.798 11.425 11.078 10.789 10.491 10.195 9.955 9.718 9.445 9.206 8.956 8.699 8.491 8.275 8.066 7.856 7.644 7.501 7.352 7.098 6.908 6.722 6.627 6.415 6.205 5.992 5.878 5.53 5.555 5.43 5.294 4.994 4.831 4.646 4.429 4.174 3.861 3.501 2.183 -7 ,29672 ,KEBNE ,17022133,Wed Dec 22 05:19:54 CET,Wed Dec 22 06:44:09 CET,0.0 3.612 4.501 5.144 5.642 6.077 6.431 6.767 7.347 7.584 7.799 7.942 8.353 8.517 8.857 9.182 9.463 9.602 9.854 10.073 10.412 10.637 10.823 11.071 11.317 11.558 11.784 11.992 12.263 12.521 12.759 13.053 13.327 13.584 13.877 14.183 14.493 14.836 15.158 15.469 15.789 16.117 16.483 16.862 17.284 17.713 18.122 18.48 18.755 18.891 18.744 18.063 17.306 16.654 16.033 15.407 14.855 14.35 13.899 13.475 13.096 12.727 12.369 12.03 11.724 11.449 11.163 10.909 10.688 10.451 10.199 9.989 9.786 9.573 9.402 9.226 9.031 8.828 8.621 8.468 8.297 8.049 7.881 7.702 7.619 7.452 7.259 7.036 6.921 6.555 6.57 6.43 6.291 6.012 5.867 5.685 5.49 5.278 5.012 4.732 3.982 -8 ,20479 ,KEBNE ,17022134,Wed Dec 22 05:19:54 CET,Wed Dec 22 06:45:59 CET,0.0 2.181 2.846 3.303 3.621 3.936 4.234 4.491 4.911 5.107 5.319 5.478 5.879 6.019 6.283 6.522 6.725 6.825 7.022 7.218 7.52 7.708 7.883 8.142 8.398 8.618 8.823 9.031 9.284 9.501 9.712 9.969 10.218 10.473 10.775 11.087 11.361 11.663 11.989 12.3 12.604 12.917 13.258 13.597 13.966 14.316 14.607 14.809 14.93 14.993 14.685 13.955 13.249 12.55 11.948 11.419 10.892 10.388 9.944 9.481 9.07 8.693 8.344 8.027 7.744 7.494 7.226 6.983 6.776 6.552 6.313 6.114 5.912 5.708 5.56 5.391 5.19 4.997 4.806 4.686 4.564 4.353 4.211 4.066 3.987 3.817 3.641 3.45 3.353 3.013 3.071 2.965 2.854 2.625 2.497 2.326 2.122 1.879 1.567 1.208 0.407 -9 ,3846 ,KEBNE ,17022135,Wed Dec 22 05:19:54 CET,Wed Dec 22 06:44:02 CET,0.0 2.771 3.447 3.941 4.35 4.685 4.952 5.188 5.67 5.887 6.096 6.262 6.674 6.826 7.128 7.437 7.739 7.876 8.128 8.37 8.698 8.898 9.081 9.35 9.614 9.859 10.093 10.315 10.593 10.839 11.072 11.36 11.644 11.916 12.207 12.542 12.874 13.224 13.592 13.981 14.373 14.797 15.297 15.78 16.297 16.814 17.333 17.797 18.163 18.358 18.247 17.611 16.864 16.168 15.543 14.981 14.456 13.969 13.564 13.154 12.809 12.493 12.198 11.92 11.635 11.377 11.109 10.844 10.588 10.332 10.079 9.871 9.648 9.394 9.2 9.011 8.799 8.562 8.327 8.172 8.016 7.785 7.623 7.444 7.346 7.136 6.902 6.642 6.514 6.127 6.112 5.972 5.818 5.487 5.323 5.166 4.991 4.776 4.53 4.228 3.466 -10 ,13442 ,KEBNE ,17022136,Wed Dec 22 05:19:55 CET,Wed Dec 22 06:44:50 CET,0.0 2.69 3.39 3.822 4.182 4.49 4.76 5.028 5.48 5.673 5.855 5.941 6.352 6.514 6.797 7.053 7.276 7.379 7.582 7.783 8.075 8.266 8.453 8.736 8.998 9.225 9.428 9.635 9.924 10.195 10.443 10.752 11.056 11.331 11.643 11.994 12.309 12.646 12.997 13.329 13.658 14.062 14.47 14.739 14.994 15.225 15.443 15.643 15.707 15.627 15.511 15.11 14.492 13.85 13.23 12.623 12.06 11.561 11.145 10.714 10.331 9.98 9.641 9.327 9.031 8.758 8.483 8.231 8.014 7.802 7.56 7.345 7.125 6.907 6.752 6.585 6.41 6.232 6.034 5.888 5.731 5.5 5.353 5.199 5.114 4.942 4.761 4.532 4.414 4.046 4.047 3.914 3.766 3.461 3.287 3.096 2.904 2.679 2.38 2.026 1.395 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_40.txt deleted file mode 100644 index cfb143e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_40.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,21789 ,KEBNE ,17022138,Wed Dec 22 05:19:55 CET,Wed Dec 22 06:44:09 CET,0.0 6.376 7.213 7.834 8.25 8.574 8.873 9.13 9.616 9.842 10.059 10.241 10.648 10.798 11.103 11.385 11.621 11.744 12.01 12.269 12.624 12.826 13.005 13.265 13.501 13.707 13.918 14.122 14.362 14.6 14.831 15.087 15.316 15.536 15.785 16.041 16.279 16.544 16.815 17.113 17.421 17.734 18.077 18.402 18.761 19.044 19.306 19.573 19.709 19.672 19.221 18.169 17.154 16.187 15.317 14.632 14.052 13.512 13.049 12.576 12.153 11.771 11.407 11.067 10.753 10.462 10.134 9.841 9.598 9.341 9.081 8.865 8.646 8.406 8.206 8.012 7.818 7.616 7.409 7.258 7.105 6.864 6.686 6.503 6.397 6.152 5.902 5.65 5.514 5.124 5.106 4.981 4.845 4.527 4.348 4.138 3.928 3.704 3.354 2.853 1.144 -4 ,14626 ,KEBNE ,17022140,Wed Dec 22 05:19:55 CET,Wed Dec 22 06:43:57 CET,0.0 5.511 6.551 7.354 8.041 8.68 9.242 9.733 10.573 10.922 11.237 11.571 12.083 12.365 12.871 13.311 13.699 13.864 14.194 14.515 15.017 15.348 15.653 16.083 16.45 16.775 17.085 17.372 17.753 18.132 18.465 18.829 19.172 19.488 19.803 20.143 20.517 20.929 21.341 21.763 22.215 22.689 23.122 23.46 23.795 24.105 24.419 24.714 24.89 24.841 24.352 23.441 22.505 21.694 21.0 20.33 19.759 19.216 18.723 18.258 17.872 17.518 17.174 16.843 16.54 16.26 15.945 15.681 15.465 15.229 14.986 14.792 14.58 14.337 14.15 13.962 13.765 13.566 13.352 13.195 13.026 12.748 12.554 12.368 12.269 12.068 11.864 11.627 11.507 11.148 11.121 10.969 10.822 10.494 10.306 10.109 9.908 9.698 9.446 9.126 7.489 -6 ,3140 ,KEBNE ,17022142,Wed Dec 22 05:19:57 CET,Wed Dec 22 06:45:57 CET,0.0 5.936 6.832 7.487 8.067 8.625 9.191 9.651 10.282 10.535 10.767 10.975 11.44 11.648 12.009 12.347 12.673 12.825 13.095 13.324 13.633 13.836 14.025 14.283 14.52 14.74 14.937 15.137 15.412 15.69 15.965 16.254 16.491 16.728 17.011 17.317 17.61 17.9 18.17 18.415 18.633 18.852 19.112 19.36 19.626 19.915 20.117 20.202 20.164 19.921 19.217 18.134 17.137 16.245 15.484 14.792 14.186 13.642 13.143 12.633 12.222 11.861 11.484 11.122 10.783 10.471 10.142 9.854 9.613 9.36 9.093 8.828 8.519 8.21 7.959 7.689 7.421 7.142 6.834 6.622 6.412 6.083 5.85 5.613 5.493 5.237 4.973 4.671 4.499 4.082 4.011 3.84 3.662 3.275 3.048 2.776 2.496 2.2 1.855 1.255 -1.409 -7 ,18270 ,KEBNE ,17022143,Wed Dec 22 05:19:57 CET,Wed Dec 22 06:44:34 CET,0.0 4.107 4.829 5.347 5.794 6.172 6.496 6.783 7.31 7.555 7.78 7.974 8.406 8.596 8.955 9.263 9.552 9.683 9.934 10.197 10.612 10.876 11.103 11.425 11.767 12.09 12.371 12.627 12.921 13.198 13.467 13.807 14.12 14.384 14.684 14.999 15.269 15.52 15.774 16.016 16.234 16.495 16.826 17.096 17.35 17.609 17.786 17.872 17.868 17.67 16.986 15.876 14.906 14.003 13.182 12.411 11.731 11.14 10.64 10.135 9.667 9.226 8.818 8.454 8.126 7.823 7.5 7.213 6.96 6.707 6.449 6.222 5.96 5.675 5.459 5.25 5.053 4.85 4.644 4.502 4.349 4.121 3.959 3.778 3.681 3.471 3.258 3.039 2.929 2.555 2.538 2.407 2.257 1.912 1.735 1.559 1.353 1.068 0.72 0.199 -1.941 -8 ,15506 ,KEBNE ,17022144,Wed Dec 22 05:19:57 CET,Wed Dec 22 06:46:30 CET,0.0 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan -9 ,19003 ,KEBNE ,17022145,Wed Dec 22 05:19:57 CET,Wed Dec 22 06:44:53 CET,0.0 3.935 4.852 5.502 5.988 6.399 6.748 7.06 7.618 7.863 8.095 8.288 8.746 8.944 9.294 9.629 9.942 10.093 10.404 10.712 11.116 11.383 11.644 11.98 12.289 12.587 12.861 13.129 13.48 13.81 14.129 14.487 14.821 15.112 15.411 15.768 16.072 16.373 16.701 17.038 17.363 17.685 18.033 18.438 18.893 19.27 19.588 19.907 20.233 20.286 19.855 18.989 18.147 17.3 16.494 15.783 15.171 14.607 14.094 13.603 13.207 12.844 12.493 12.165 11.846 11.556 11.281 11.036 10.803 10.551 10.292 10.069 9.827 9.581 9.393 9.205 8.985 8.706 8.395 8.174 7.959 7.644 7.432 7.218 7.108 6.898 6.682 6.455 6.34 5.968 5.949 5.805 5.666 5.369 5.198 5.007 4.793 4.554 4.274 3.839 2.517 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_41.txt deleted file mode 100644 index 00400977..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_41.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24832 ,KEBNE ,17022147,Wed Dec 22 05:19:58 CET,Wed Dec 22 06:44:35 CET,0.0 3.376 4.019 4.476 4.837 5.14 5.443 5.729 6.17 6.384 6.612 6.784 7.228 7.414 7.7 7.959 8.224 8.345 8.575 8.826 9.181 9.388 9.603 9.92 10.199 10.451 10.685 10.912 11.194 11.473 11.768 12.094 12.388 12.657 12.912 13.202 13.469 13.731 14.013 14.346 14.677 15.009 15.439 15.849 16.266 16.595 16.849 17.036 17.098 16.98 16.38 15.339 14.368 13.484 12.722 12.021 11.4 10.859 10.409 9.964 9.567 9.185 8.773 8.393 8.05 7.722 7.384 7.079 6.794 6.491 6.196 5.944 5.671 5.395 5.177 4.932 4.66 4.362 4.084 3.911 3.726 3.442 3.259 3.073 2.968 2.754 2.532 2.303 2.19 1.811 1.812 1.68 1.535 1.238 1.067 0.87 0.672 0.451 0.201 -0.085 -0.958 -4 ,1817 ,KEBNE ,17022150,Wed Dec 22 05:20:03 CET,Wed Dec 22 06:45:34 CET,0.0 4.776 5.509 6.022 6.422 6.748 7.046 7.343 7.852 8.074 8.274 8.404 8.807 8.946 9.207 9.479 9.732 9.847 10.052 10.24 10.5 10.66 10.799 10.995 11.224 11.45 11.658 11.849 12.087 12.343 12.589 12.884 13.172 13.439 13.746 14.075 14.355 14.642 14.976 15.325 15.658 16.038 16.485 16.891 17.287 17.632 17.919 18.099 18.166 18.042 17.536 16.652 15.798 14.996 14.238 13.514 12.874 12.283 11.745 11.182 10.706 10.282 9.871 9.501 9.138 8.793 8.459 8.173 7.907 7.624 7.352 7.12 6.874 6.617 6.411 6.19 5.965 5.733 5.484 5.32 5.149 4.883 4.713 4.544 4.453 4.259 4.051 3.836 3.727 3.368 3.379 3.249 3.109 2.808 2.613 2.38 2.148 1.877 1.563 1.141 -0.19 -5 ,18539 ,KEBNE ,17022151,Wed Dec 22 05:20:03 CET,Wed Dec 22 06:46:32 CET,0.0 2.932 3.666 4.195 4.62 4.94 5.248 5.537 6.014 6.232 6.436 6.556 6.973 7.16 7.521 7.826 8.105 8.238 8.489 8.729 9.052 9.259 9.451 9.691 9.907 10.13 10.361 10.574 10.851 11.128 11.356 11.603 11.855 12.101 12.371 12.655 12.922 13.199 13.5 13.824 14.126 14.433 14.765 15.056 15.34 15.609 15.858 16.079 16.221 16.115 15.51 14.576 13.733 12.927 12.161 11.438 10.772 10.188 9.702 9.202 8.738 8.315 7.933 7.567 7.204 6.861 6.504 6.181 5.893 5.6 5.322 5.107 4.886 4.65 4.469 4.29 4.086 3.867 3.66 3.521 3.37 3.121 2.945 2.768 2.682 2.501 2.304 2.107 2.004 1.638 1.632 1.5 1.378 1.11 0.942 0.778 0.591 0.342 0.065 -0.306 -1.088 -6 ,32558 ,KEBNE ,17022152,Wed Dec 22 05:20:05 CET,Wed Dec 22 06:46:20 CET,0.0 6.862 7.44 7.84 8.179 8.486 8.744 8.968 9.385 9.566 9.739 9.874 10.289 10.448 10.75 11.031 11.295 11.411 11.608 11.799 12.13 12.347 12.537 12.787 13.04 13.301 13.541 13.754 14.006 14.243 14.474 14.75 15.031 15.296 15.563 15.878 16.185 16.493 16.812 17.123 17.418 17.718 18.021 18.287 18.587 18.903 19.133 19.307 19.425 19.243 18.603 17.616 16.663 15.643 14.638 13.732 12.967 12.269 11.664 11.076 10.591 10.157 9.729 9.313 8.943 8.611 8.248 7.941 7.677 7.405 7.138 6.907 6.648 6.345 6.099 5.859 5.625 5.407 5.173 5.003 4.842 4.601 4.418 4.237 4.151 3.959 3.748 3.537 3.431 3.068 3.059 2.918 2.779 2.495 2.335 2.161 1.973 1.764 1.525 1.242 0.49 -7 ,19427 ,KEBNE ,17022153,Wed Dec 22 05:20:08 CET,Wed Dec 22 06:45:53 CET,0.0 4.766 5.44 5.97 6.401 6.804 7.15 7.459 8.016 8.255 8.471 8.61 9.021 9.183 9.508 9.81 10.079 10.217 10.488 10.728 11.05 11.269 11.49 11.808 12.107 12.369 12.589 12.781 13.035 13.298 13.555 13.854 14.138 14.397 14.681 14.996 15.271 15.555 15.822 16.092 16.379 16.672 16.984 17.248 17.532 17.81 18.014 18.19 18.296 18.088 17.275 15.882 14.689 13.738 12.927 12.197 11.549 10.879 10.278 9.661 9.128 8.688 8.255 7.833 7.453 7.12 6.777 6.472 6.211 5.948 5.668 5.426 5.177 4.915 4.713 4.506 4.283 4.052 3.818 3.659 3.5 3.254 3.082 2.889 2.786 2.586 2.374 2.141 2.031 1.666 1.633 1.477 1.328 1.02 0.855 0.679 0.465 0.216 -0.103 -0.473 -1.795 -10 ,4663 ,KEBNE ,17022156,Wed Dec 22 05:20:22 CET,Wed Dec 22 06:46:09 CET,0.0 7.506 8.528 9.087 9.501 9.847 10.155 10.442 10.945 11.165 11.38 11.52 11.927 12.1 12.417 12.715 13.027 13.173 13.444 13.7 14.059 14.279 14.48 14.753 15.009 15.264 15.516 15.749 16.033 16.286 16.519 16.816 17.084 17.325 17.611 17.902 18.161 18.479 18.806 19.11 19.417 19.702 20.02 20.351 20.612 20.838 21.062 21.21 21.279 21.086 20.515 19.573 18.723 17.976 17.292 16.638 15.992 15.39 14.866 14.36 13.908 13.469 13.054 12.664 12.296 11.96 11.605 11.29 11.028 10.758 10.458 10.207 9.95 9.677 9.451 9.2 8.95 8.714 8.456 8.275 8.103 7.835 7.644 7.44 7.338 7.129 6.908 6.67 6.543 6.17 6.167 6.041 5.91 5.592 5.397 5.196 4.984 4.741 4.414 3.964 2.861 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_42.txt deleted file mode 100644 index 78163378..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10987 ,TETRA ,17524160,Wed Nov 24 21:43:27 CET,Wed Nov 24 23:29:40 CET,0.0 2.414 2.904 3.31 3.726 4.094 4.416 4.695 5.2 5.433 5.61 5.644 6.037 6.176 6.43 6.656 6.87 6.973 7.162 7.336 7.586 7.743 7.893 8.122 8.334 8.531 8.751 8.963 9.203 9.43 9.648 9.885 10.104 10.314 10.542 10.806 11.069 11.362 11.679 11.993 12.328 12.739 13.153 13.511 13.949 14.413 14.834 15.253 15.648 15.955 16.204 16.132 15.83 15.503 15.185 14.856 14.553 14.26 13.984 13.695 13.431 13.184 12.952 12.735 12.532 12.336 12.135 11.962 11.803 11.637 11.468 11.324 11.159 10.991 10.873 10.758 10.638 10.501 10.345 10.228 10.108 9.923 9.798 9.673 9.608 9.476 9.343 9.193 9.098 8.737 8.662 8.503 8.328 7.952 7.773 7.567 7.296 7.01 6.7 6.252 4.079 -2 ,28168 ,TETRA ,17524161,Wed Nov 24 21:44:22 CET,Wed Nov 24 23:31:50 CET,0.0 6.18 6.613 6.962 7.311 7.608 7.828 8.062 8.482 8.652 8.809 8.853 9.237 9.373 9.625 9.866 10.08 10.167 10.336 10.499 10.717 10.867 11.022 11.232 11.427 11.613 11.782 11.95 12.183 12.411 12.632 12.9 13.167 13.438 13.732 14.028 14.305 14.596 14.897 15.209 15.512 15.844 16.241 16.652 17.113 17.582 18.074 18.545 19.025 19.504 19.91 19.955 19.715 19.438 19.133 18.817 18.546 18.249 17.974 17.701 17.452 17.22 16.989 16.786 16.576 16.372 16.171 15.97 15.802 15.645 15.477 15.334 15.19 15.031 14.898 14.762 14.615 14.467 14.311 14.195 14.082 13.903 13.775 13.661 13.601 13.46 13.306 13.149 13.062 12.726 12.774 12.681 12.58 12.34 12.221 12.097 11.952 11.821 11.598 11.178 9.147 -3 ,5818 ,TETRA ,17524162,Wed Nov 24 21:44:23 CET,Wed Nov 24 23:31:13 CET,0.0 1.106 1.651 2.075 2.418 2.693 2.966 3.196 3.569 3.752 3.902 3.95 4.322 4.442 4.676 4.875 5.074 5.184 5.4 5.606 5.911 6.101 6.276 6.526 6.752 6.97 7.177 7.379 7.623 7.841 8.049 8.283 8.511 8.735 8.99 9.286 9.583 9.867 10.139 10.416 10.71 11.055 11.464 11.825 12.204 12.627 13.096 13.572 13.988 14.284 14.456 14.33 14.027 13.677 13.321 12.96 12.617 12.301 12.004 11.671 11.382 11.14 10.899 10.669 10.47 10.279 10.064 9.864 9.689 9.504 9.328 9.189 9.04 8.883 8.75 8.609 8.472 8.321 8.142 8.0 7.843 7.605 7.458 7.322 7.252 7.103 6.948 6.795 6.716 6.382 6.386 6.258 6.114 5.812 5.654 5.445 5.211 4.98 4.697 4.267 0.461 -4 ,8974 ,TETRA ,17524165,Wed Nov 24 21:47:22 CET,Wed Nov 24 23:34:41 CET,0.0 2.369 2.888 3.273 3.575 3.82 3.992 4.153 4.476 4.63 4.778 4.858 5.248 5.385 5.643 5.892 6.124 6.217 6.376 6.538 6.775 6.914 7.037 7.229 7.417 7.588 7.76 7.933 8.164 8.388 8.59 8.836 9.066 9.272 9.514 9.798 10.065 10.352 10.668 10.987 11.321 11.699 12.129 12.546 12.993 13.45 13.952 14.519 15.104 15.619 15.989 16.072 15.927 15.692 15.413 15.112 14.847 14.578 14.311 14.052 13.83 13.632 13.442 13.238 13.021 12.83 12.634 12.458 12.307 12.156 12.0 11.864 11.721 11.566 11.451 11.309 11.148 10.998 10.84 10.73 10.62 10.445 10.332 10.21 10.143 10.014 9.88 9.725 9.648 9.333 9.419 9.309 9.153 8.784 8.575 8.356 8.084 7.763 7.405 6.943 4.359 -5 ,777 ,TETRA ,17524168,Wed Nov 24 21:48:27 CET,Wed Nov 24 23:34:32 CET,0.0 1.551 2.026 2.34 2.618 2.883 3.091 3.257 3.569 3.717 3.856 3.884 4.246 4.36 4.574 4.791 4.984 5.079 5.283 5.472 5.743 5.921 6.081 6.297 6.489 6.679 6.868 7.05 7.298 7.546 7.786 8.059 8.321 8.572 8.855 9.177 9.461 9.768 10.125 10.476 10.806 11.174 11.595 12.01 12.427 12.795 13.207 13.652 14.135 14.635 14.973 14.963 14.753 14.482 14.15 13.748 13.356 13.032 12.758 12.473 12.233 11.999 11.744 11.502 11.292 11.103 10.894 10.717 10.571 10.397 10.203 10.047 9.875 9.709 9.596 9.467 9.328 9.171 9.007 8.906 8.796 8.615 8.494 8.372 8.304 8.158 8.016 7.866 7.774 7.437 7.456 7.333 7.173 6.794 6.591 6.35 6.056 5.669 5.206 4.725 2.091 -6 ,17578 ,TETRA ,17524169,Wed Nov 24 21:48:28 CET,Wed Nov 24 23:34:17 CET,0.0 11.377 12.023 12.491 12.876 13.201 13.435 13.661 14.08 14.26 14.427 14.501 14.882 15.011 15.287 15.559 15.806 15.92 16.122 16.304 16.561 16.729 16.893 17.119 17.327 17.533 17.727 17.906 18.134 18.358 18.571 18.847 19.108 19.324 19.583 19.895 20.194 20.523 20.861 21.209 21.585 22.006 22.442 22.827 23.21 23.599 24.071 24.599 25.161 25.624 25.867 25.734 25.458 25.198 24.883 24.53 24.204 23.875 23.562 23.242 22.966 22.7 22.445 22.207 21.978 21.763 21.525 21.314 21.132 20.95 20.76 20.588 20.412 20.234 20.097 19.943 19.776 19.605 19.426 19.303 19.171 18.959 18.824 18.699 18.63 18.476 18.289 18.075 17.969 17.627 17.65 17.53 17.391 17.082 16.928 16.744 16.54 16.291 15.981 15.589 13.559 -7 ,19986 ,TETRA ,17524171,Wed Nov 24 21:48:25 CET,Wed Nov 24 23:34:15 CET,0.0 1.988 2.535 2.882 3.166 3.414 3.645 3.899 4.338 4.519 4.69 4.762 5.149 5.305 5.602 5.847 6.04 6.134 6.321 6.488 6.716 6.872 7.03 7.248 7.429 7.608 7.798 7.975 8.194 8.401 8.608 8.856 9.082 9.324 9.603 9.892 10.143 10.393 10.672 10.957 11.239 11.543 11.872 12.179 12.531 12.934 13.374 13.791 14.161 14.471 14.695 14.604 14.295 13.905 13.517 13.174 12.858 12.572 12.319 12.044 11.794 11.57 11.349 11.124 10.912 10.726 10.53 10.341 10.162 9.977 9.792 9.643 9.496 9.338 9.215 9.084 8.935 8.786 8.642 8.549 8.452 8.298 8.191 8.067 7.998 7.848 7.655 7.465 7.376 7.033 7.064 6.972 6.876 6.668 6.558 6.391 6.146 5.913 5.634 5.155 3.272 -8 ,31878 ,TETRA ,17524173,Wed Nov 24 21:48:27 CET,Wed Nov 24 23:35:39 CET,0.0 1.693 2.126 2.43 2.708 2.939 3.145 3.335 3.678 3.835 3.999 4.055 4.416 4.534 4.766 4.976 5.187 5.286 5.452 5.601 5.836 5.993 6.13 6.339 6.55 6.745 6.926 7.095 7.316 7.544 7.766 8.02 8.262 8.497 8.759 9.045 9.313 9.608 9.924 10.246 10.615 11.034 11.461 11.84 12.227 12.641 13.112 13.608 14.125 14.585 14.957 14.946 14.73 14.474 14.159 13.824 13.516 13.212 12.932 12.634 12.379 12.166 11.945 11.72 11.491 11.274 11.059 10.856 10.68 10.509 10.329 10.163 9.984 9.807 9.673 9.542 9.4 9.25 9.103 9.0 8.897 8.736 8.618 8.486 8.412 8.259 8.089 7.902 7.813 7.48 7.515 7.413 7.302 7.052 6.926 6.786 6.604 6.38 6.01 5.445 3.538 -9 ,10420 ,TETRA ,17524174,Wed Nov 24 21:48:27 CET,Wed Nov 24 23:34:03 CET,0.0 2.11 2.559 2.882 3.167 3.416 3.638 3.825 4.136 4.282 4.415 4.453 4.822 4.938 5.157 5.368 5.567 5.666 5.865 6.041 6.295 6.463 6.611 6.82 7.04 7.259 7.456 7.627 7.841 8.053 8.26 8.494 8.714 8.942 9.212 9.497 9.752 10.033 10.341 10.654 10.964 11.291 11.653 12.015 12.412 12.842 13.301 13.748 14.229 14.696 14.977 14.873 14.581 14.198 13.811 13.439 13.093 12.754 12.463 12.187 11.924 11.675 11.441 11.193 10.949 10.754 10.561 10.38 10.221 10.047 9.847 9.687 9.525 9.353 9.221 9.08 8.945 8.804 8.647 8.546 8.44 8.262 8.136 8.006 7.937 7.797 7.658 7.499 7.415 7.095 7.156 7.048 6.925 6.688 6.576 6.434 6.286 6.13 5.935 5.712 4.982 -10 ,3571 ,TETRA ,17524176,Wed Nov 24 21:48:27 CET,Wed Nov 24 23:33:20 CET,0.0 1.855 2.471 2.958 3.328 3.638 3.874 4.059 4.422 4.581 4.711 4.729 5.09 5.219 5.477 5.715 5.939 6.04 6.221 6.396 6.622 6.765 6.906 7.131 7.342 7.533 7.731 7.917 8.163 8.408 8.627 8.9 9.174 9.418 9.678 9.952 10.21 10.483 10.76 11.037 11.335 11.682 12.051 12.434 12.886 13.297 13.737 14.236 14.728 15.127 15.39 15.365 15.133 14.795 14.427 14.067 13.699 13.358 13.071 12.769 12.517 12.299 12.079 11.873 11.672 11.478 11.288 11.122 10.963 10.786 10.601 10.451 10.301 10.145 10.025 9.901 9.763 9.62 9.474 9.371 9.254 9.064 8.94 8.812 8.746 8.611 8.469 8.314 8.232 7.91 7.954 7.855 7.756 7.537 7.398 7.244 7.094 6.887 6.662 6.429 5.35 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_43.txt deleted file mode 100644 index 3ca46917..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11501 ,TETRA ,17524178,Wed Nov 24 21:48:24 CET,Wed Nov 24 23:33:47 CET,0.0 1.717 2.039 2.309 2.547 2.754 2.971 3.179 3.503 3.639 3.777 3.807 4.184 4.314 4.544 4.77 4.997 5.092 5.265 5.427 5.655 5.792 5.922 6.093 6.245 6.396 6.541 6.678 6.832 6.966 7.101 7.289 7.518 7.724 7.933 8.163 8.37 8.59 8.793 9.007 9.234 9.46 9.697 9.92 10.182 10.444 10.686 10.891 11.02 11.075 10.833 10.207 9.606 9.015 8.45 7.934 7.495 7.117 6.787 6.434 6.128 5.853 5.56 5.267 5.01 4.794 4.57 4.362 4.181 4.0 3.811 3.648 3.482 3.311 3.168 3.018 2.873 2.724 2.575 2.479 2.371 2.188 2.071 1.94 1.864 1.696 1.507 1.306 1.202 0.85 0.875 0.764 0.633 0.319 0.143 -0.058 -0.248 -0.441 -0.713 -1.095 -1.874 -2 ,32564 ,TETRA ,17524181,Wed Nov 24 21:48:30 CET,Wed Nov 24 23:34:32 CET,0.0 1.459 1.804 2.09 2.304 2.512 2.716 2.881 3.157 3.28 3.4 3.42 3.781 3.88 4.061 4.235 4.392 4.462 4.603 4.757 4.998 5.131 5.246 5.415 5.575 5.733 5.878 6.014 6.202 6.382 6.543 6.729 6.916 7.121 7.349 7.57 7.771 7.961 8.145 8.334 8.53 8.738 8.969 9.178 9.385 9.605 9.821 10.022 10.155 10.151 9.833 9.25 8.702 8.128 7.596 7.115 6.665 6.257 5.899 5.537 5.252 5.001 4.726 4.443 4.196 3.992 3.778 3.585 3.425 3.259 3.078 2.923 2.769 2.603 2.471 2.342 2.197 2.051 1.908 1.804 1.701 1.534 1.401 1.269 1.204 1.076 0.936 0.786 0.715 0.397 0.482 0.402 0.32 0.132 0.012 -0.114 -0.27 -0.442 -0.615 -0.802 -1.277 -3 ,23168 ,TETRA ,17524183,Wed Nov 24 21:49:23 CET,Wed Nov 24 23:34:49 CET,0.0 1.653 2.089 2.389 2.628 2.841 3.053 3.251 3.617 3.781 3.921 3.901 4.231 4.333 4.526 4.704 4.87 4.949 5.108 5.274 5.499 5.632 5.767 5.97 6.158 6.338 6.515 6.695 6.927 7.142 7.356 7.62 7.89 8.117 8.352 8.616 8.866 9.141 9.405 9.658 9.912 10.175 10.449 10.696 10.955 11.265 11.644 11.972 12.174 12.229 11.987 11.411 10.764 10.165 9.636 9.148 8.723 8.338 8.0 7.639 7.327 7.064 6.814 6.575 6.359 6.166 5.954 5.762 5.597 5.422 5.244 5.1 4.943 4.787 4.667 4.544 4.414 4.279 4.136 4.026 3.91 3.719 3.589 3.466 3.4 3.261 3.124 2.993 2.925 2.603 2.674 2.578 2.482 2.28 2.166 2.052 1.924 1.756 1.554 1.347 1.114 -4 ,32624 ,TETRA ,17524185,Wed Nov 24 21:49:27 CET,Wed Nov 24 23:35:14 CET,0.0 1.1 1.454 1.727 1.942 2.15 2.337 2.509 2.797 2.901 2.999 2.954 3.292 3.396 3.6 3.791 3.97 4.058 4.225 4.379 4.603 4.745 4.876 5.054 5.225 5.404 5.59 5.757 5.937 6.121 6.309 6.509 6.713 6.907 7.101 7.301 7.488 7.707 7.929 8.16 8.402 8.63 8.862 9.1 9.376 9.679 9.98 10.243 10.456 10.512 10.347 9.837 9.211 8.674 8.17 7.671 7.244 6.865 6.542 6.195 5.877 5.591 5.313 5.054 4.813 4.597 4.381 4.187 4.011 3.81 3.583 3.394 3.22 3.058 2.936 2.814 2.68 2.531 2.369 2.264 2.16 1.99 1.874 1.759 1.698 1.574 1.446 1.313 1.249 0.936 1.021 0.944 0.856 0.63 0.512 0.381 0.244 0.091 -0.067 -0.23 -0.477 -5 ,3499 ,TETRA ,17524188,Wed Nov 24 21:49:27 CET,Wed Nov 24 23:35:40 CET,0.0 1.536 2.021 2.338 2.589 2.807 2.993 3.129 3.365 3.484 3.603 3.614 3.966 4.091 4.323 4.491 4.631 4.701 4.839 4.963 5.147 5.269 5.379 5.545 5.73 5.912 6.063 6.208 6.4 6.564 6.729 6.936 7.138 7.31 7.481 7.694 7.905 8.107 8.307 8.539 8.788 9.082 9.425 9.738 10.116 10.481 10.799 11.086 11.32 11.415 11.142 10.576 10.006 9.391 8.844 8.352 7.893 7.492 7.16 6.818 6.514 6.241 5.972 5.726 5.496 5.282 5.061 4.867 4.703 4.528 4.345 4.186 4.021 3.854 3.728 3.596 3.462 3.332 3.183 3.08 2.974 2.801 2.679 2.551 2.482 2.331 2.191 2.06 1.991 1.678 1.763 1.67 1.58 1.408 1.304 1.188 1.075 0.951 0.802 0.644 0.395 -6 ,32037 ,TETRA ,17524189,Wed Nov 24 21:49:27 CET,Wed Nov 24 23:35:21 CET,0.0 1.131 1.651 2.067 2.351 2.577 2.774 2.962 3.314 3.482 3.643 3.684 4.049 4.173 4.414 4.611 4.749 4.809 4.929 5.04 5.198 5.308 5.413 5.564 5.707 5.845 5.976 6.105 6.291 6.46 6.607 6.791 6.974 7.144 7.323 7.513 7.719 7.957 8.207 8.459 8.692 8.924 9.191 9.444 9.732 10.048 10.329 10.564 10.749 10.814 10.63 10.101 9.547 9.023 8.536 8.088 7.661 7.265 6.913 6.545 6.229 5.933 5.641 5.373 5.13 4.923 4.717 4.525 4.355 4.177 3.986 3.825 3.666 3.498 3.35 3.198 3.055 2.91 2.748 2.636 2.534 2.378 2.266 2.15 2.088 1.94 1.791 1.654 1.576 1.256 1.348 1.265 1.175 0.99 0.892 0.769 0.634 0.497 0.344 0.141 -0.384 -7 ,6347 ,TETRA ,17524190,Wed Nov 24 21:49:22 CET,Wed Nov 24 23:35:37 CET,0.0 1.487 1.919 2.222 2.47 2.708 2.937 3.149 3.501 3.651 3.792 3.83 4.218 4.354 4.573 4.792 4.99 5.075 5.247 5.399 5.618 5.768 5.908 6.104 6.291 6.478 6.65 6.814 7.032 7.239 7.449 7.721 7.949 8.152 8.386 8.63 8.884 9.146 9.396 9.659 9.923 10.221 10.561 10.883 11.217 11.507 11.786 12.022 12.189 12.269 12.078 11.535 10.958 10.392 9.876 9.422 9.008 8.616 8.271 7.921 7.609 7.328 7.075 6.82 6.555 6.325 6.092 5.883 5.707 5.531 5.344 5.19 5.04 4.883 4.763 4.63 4.487 4.332 4.159 4.05 3.949 3.795 3.685 3.575 3.515 3.378 3.241 3.102 3.03 2.698 2.728 2.637 2.553 2.354 2.248 2.148 2.019 1.847 1.671 1.503 1.17 -8 ,13653 ,TETRA ,17524192,Wed Nov 24 21:49:27 CET,Wed Nov 24 23:35:41 CET,0.0 1.892 2.345 2.683 2.977 3.195 3.394 3.589 3.877 4.007 4.146 4.152 4.511 4.627 4.817 4.988 5.147 5.214 5.339 5.491 5.728 5.864 5.984 6.141 6.303 6.466 6.617 6.77 6.979 7.169 7.336 7.54 7.735 7.909 8.12 8.37 8.58 8.807 9.064 9.33 9.609 9.884 10.178 10.43 10.65 10.897 11.16 11.399 11.609 11.704 11.501 10.965 10.344 9.773 9.279 8.809 8.394 8.025 7.681 7.325 7.019 6.73 6.438 6.167 5.926 5.693 5.441 5.233 5.053 4.859 4.674 4.522 4.349 4.163 4.021 3.883 3.747 3.604 3.455 3.346 3.234 3.069 2.958 2.825 2.752 2.62 2.49 2.352 2.281 1.97 2.067 1.99 1.897 1.704 1.606 1.478 1.319 1.159 1.015 0.847 0.498 -9 ,26971 ,TETRA ,17524195,Wed Nov 24 21:49:27 CET,Wed Nov 24 23:36:14 CET,0.0 0.907 1.214 1.459 1.711 1.944 2.158 2.347 2.662 2.807 2.953 2.982 3.352 3.468 3.682 3.883 4.047 4.135 4.315 4.482 4.736 4.912 5.074 5.28 5.464 5.64 5.816 5.974 6.183 6.378 6.54 6.727 6.898 7.056 7.245 7.452 7.629 7.808 7.976 8.158 8.363 8.572 8.804 9.036 9.271 9.488 9.69 9.834 9.889 9.802 9.437 8.795 8.155 7.557 7.004 6.492 6.029 5.596 5.212 4.818 4.493 4.216 3.941 3.68 3.441 3.233 3.018 2.803 2.621 2.443 2.255 2.098 1.927 1.742 1.586 1.428 1.283 1.14 0.978 0.862 0.749 0.575 0.452 0.335 0.272 0.134 -0.02 -0.18 -0.251 -0.576 -0.52 -0.628 -0.729 -0.9 -0.989 -1.088 -1.212 -1.366 -1.53 -1.704 -2.193 -10 ,2929 ,TETRA ,17524196,Wed Nov 24 21:49:27 CET,Wed Nov 24 23:36:22 CET,0.0 1.355 1.773 2.072 2.314 2.519 2.73 2.923 3.235 3.367 3.502 3.544 3.915 4.035 4.269 4.493 4.686 4.779 4.976 5.153 5.393 5.541 5.683 5.897 6.097 6.29 6.47 6.625 6.82 7.021 7.203 7.405 7.62 7.826 8.026 8.245 8.473 8.722 8.999 9.291 9.579 9.873 10.172 10.42 10.677 10.95 11.214 11.476 11.674 11.779 11.561 10.982 10.452 9.925 9.398 8.936 8.54 8.137 7.794 7.489 7.225 6.958 6.701 6.454 6.214 6.008 5.802 5.62 5.466 5.308 5.128 4.969 4.803 4.632 4.498 4.361 4.228 4.085 3.933 3.836 3.733 3.557 3.432 3.305 3.232 3.081 2.944 2.803 2.729 2.403 2.474 2.389 2.29 2.07 1.963 1.847 1.729 1.611 1.467 1.285 0.889 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_46.txt deleted file mode 100644 index d415889c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21919 ,TETRA ,17524200,Wed Nov 24 21:49:26 CET,Wed Nov 24 23:35:19 CET,0.0 0.892 1.333 1.61 1.823 2.013 2.194 2.377 2.695 2.838 2.973 2.984 3.35 3.472 3.704 3.893 4.043 4.109 4.24 4.379 4.578 4.71 4.839 5.005 5.149 5.279 5.404 5.538 5.709 5.857 5.999 6.145 6.275 6.407 6.551 6.718 6.882 7.041 7.202 7.372 7.524 7.658 7.794 7.917 8.033 8.106 8.132 8.121 8.004 7.634 6.738 5.504 4.461 3.564 2.778 2.045 1.408 0.862 0.38 -0.103 -0.507 -0.863 -1.196 -1.495 -1.787 -2.059 -2.32 -2.551 -2.759 -2.971 -3.191 -3.376 -3.57 -3.77 -3.927 -4.091 -4.262 -4.433 -4.6 -4.714 -4.832 -5.01 -5.144 -5.281 -5.343 -5.476 -5.614 -5.76 -5.838 -6.17 -6.088 -6.183 -6.281 -6.499 -6.617 -6.732 -6.862 -7.006 -7.16 -7.307 -7.651 -2 ,11481 ,TETRA ,17524202,Wed Nov 24 21:49:24 CET,Wed Nov 24 23:35:49 CET,0.0 1.755 2.25 2.638 2.965 3.249 3.47 3.666 4.05 4.228 4.386 4.423 4.799 4.925 5.131 5.296 5.462 5.555 5.737 5.909 6.155 6.318 6.479 6.681 6.86 7.039 7.227 7.398 7.584 7.739 7.888 8.062 8.23 8.398 8.564 8.751 8.938 9.119 9.307 9.497 9.677 9.893 10.137 10.331 10.507 10.635 10.653 10.568 10.362 9.933 9.047 7.805 6.735 5.833 5.035 4.308 3.713 3.188 2.728 2.265 1.853 1.504 1.188 0.892 0.599 0.326 0.045 -0.206 -0.42 -0.654 -0.881 -1.06 -1.249 -1.437 -1.587 -1.746 -1.916 -2.095 -2.273 -2.386 -2.496 -2.669 -2.801 -2.946 -3.017 -3.161 -3.307 -3.468 -3.554 -3.894 -3.819 -3.911 -3.997 -4.187 -4.302 -4.419 -4.545 -4.711 -4.936 -5.178 -5.704 -3 ,13813 ,TETRA ,17524203,Wed Nov 24 21:49:26 CET,Wed Nov 24 23:34:39 CET,0.0 2.439 3.044 3.481 3.775 4.025 4.269 4.449 4.656 4.754 4.862 4.841 5.179 5.274 5.454 5.633 5.788 5.856 5.992 6.13 6.324 6.44 6.552 6.714 6.875 7.024 7.161 7.295 7.471 7.641 7.798 7.966 8.115 8.246 8.402 8.583 8.731 8.871 9.03 9.195 9.36 9.538 9.714 9.868 10.019 10.162 10.263 10.255 10.139 9.815 8.962 7.751 6.685 5.733 4.913 4.181 3.56 3.018 2.545 2.071 1.668 1.313 0.981 0.672 0.378 0.114 -0.155 -0.402 -0.621 -0.844 -1.058 -1.234 -1.426 -1.63 -1.789 -1.957 -2.133 -2.293 -2.453 -2.578 -2.708 -2.898 -3.031 -3.168 -3.235 -3.373 -3.523 -3.684 -3.761 -4.092 -4.009 -4.1 -4.199 -4.411 -4.515 -4.629 -4.772 -4.938 -5.093 -5.218 -5.52 -4 ,24257 ,TETRA ,17524205,Wed Nov 24 21:49:31 CET,Wed Nov 24 23:35:25 CET,0.0 1.431 1.844 2.154 2.412 2.632 2.841 3.021 3.32 3.473 3.626 3.671 4.044 4.158 4.367 4.57 4.765 4.868 5.06 5.225 5.45 5.602 5.747 5.934 6.132 6.334 6.52 6.677 6.874 7.056 7.202 7.376 7.531 7.645 7.759 7.912 8.075 8.239 8.39 8.542 8.698 8.868 9.032 9.148 9.263 9.368 9.45 9.446 9.334 9.003 8.155 6.963 5.905 4.967 4.148 3.424 2.8 2.248 1.762 1.261 0.857 0.515 0.192 -0.11 -0.393 -0.638 -0.888 -1.122 -1.339 -1.565 -1.784 -1.966 -2.156 -2.353 -2.513 -2.683 -2.854 -3.027 -3.204 -3.317 -3.437 -3.633 -3.76 -3.898 -3.969 -4.117 -4.282 -4.46 -4.548 -4.893 -4.836 -4.952 -5.065 -5.289 -5.414 -5.536 -5.65 -5.772 -5.93 -6.167 -6.52 -5 ,28728 ,TETRA ,17524207,Wed Nov 24 21:49:26 CET,Wed Nov 24 23:35:16 CET,0.0 1.519 1.941 2.258 2.497 2.697 2.88 3.05 3.351 3.485 3.613 3.607 3.944 4.041 4.228 4.392 4.54 4.616 4.758 4.888 5.073 5.185 5.289 5.453 5.612 5.757 5.897 6.029 6.188 6.326 6.453 6.623 6.779 6.915 7.085 7.288 7.472 7.647 7.818 7.988 8.175 8.394 8.623 8.799 8.948 9.063 9.142 9.099 8.864 8.4 7.482 6.221 5.117 4.187 3.403 2.72 2.113 1.566 1.102 0.629 0.22 -0.154 -0.513 -0.831 -1.133 -1.429 -1.729 -1.979 -2.182 -2.392 -2.624 -2.824 -3.024 -3.228 -3.38 -3.537 -3.711 -3.875 -4.033 -4.15 -4.282 -4.484 -4.625 -4.77 -4.843 -4.986 -5.132 -5.308 -5.392 -5.731 -5.678 -5.775 -5.867 -6.079 -6.2 -6.315 -6.438 -6.586 -6.77 -7.012 -7.572 -6 ,6894 ,TETRA ,17524209,Wed Nov 24 21:49:27 CET,Wed Nov 24 23:35:08 CET,0.0 1.639 2.027 2.333 2.62 2.878 3.084 3.28 3.642 3.791 3.926 3.919 4.266 4.373 4.576 4.746 4.899 4.983 5.147 5.297 5.497 5.614 5.72 5.873 6.018 6.157 6.288 6.407 6.549 6.686 6.816 6.975 7.136 7.278 7.42 7.583 7.757 7.933 8.095 8.278 8.474 8.656 8.813 8.98 9.133 9.208 9.234 9.185 9.033 8.701 7.961 6.828 5.807 4.936 4.174 3.493 2.906 2.379 1.912 1.437 1.035 0.685 0.356 0.057 -0.219 -0.478 -0.742 -0.969 -1.175 -1.398 -1.62 -1.81 -2.016 -2.227 -2.38 -2.533 -2.696 -2.869 -3.042 -3.155 -3.274 -3.457 -3.583 -3.717 -3.784 -3.923 -4.064 -4.203 -4.281 -4.618 -4.539 -4.628 -4.723 -4.937 -5.05 -5.165 -5.294 -5.43 -5.595 -5.813 -6.449 -7 ,29661 ,TETRA ,17524212,Wed Nov 24 21:49:53 CET,Wed Nov 24 23:36:05 CET,0.0 1.368 1.74 2.038 2.297 2.532 2.761 2.957 3.293 3.447 3.599 3.596 3.943 4.05 4.271 4.493 4.704 4.795 4.967 5.133 5.367 5.506 5.643 5.867 6.069 6.246 6.415 6.584 6.795 6.989 7.176 7.397 7.593 7.774 7.96 8.166 8.367 8.547 8.719 8.889 9.047 9.196 9.334 9.451 9.586 9.691 9.757 9.77 9.61 9.206 8.321 7.11 6.083 5.19 4.416 3.732 3.158 2.652 2.179 1.702 1.315 0.943 0.577 0.251 -0.05 -0.332 -0.632 -0.881 -1.084 -1.304 -1.528 -1.717 -1.916 -2.111 -2.266 -2.433 -2.599 -2.758 -2.923 -3.039 -3.163 -3.368 -3.509 -3.649 -3.721 -3.862 -4.008 -4.169 -4.257 -4.616 -4.567 -4.668 -4.772 -4.972 -5.076 -5.195 -5.341 -5.501 -5.668 -5.886 -6.22 -8 ,11485 ,TETRA ,17524214,Wed Nov 24 21:49:56 CET,Wed Nov 24 23:35:52 CET,0.0 1.278 1.673 2.015 2.269 2.468 2.633 2.791 3.107 3.259 3.41 3.447 3.819 3.928 4.131 4.305 4.487 4.59 4.785 4.955 5.161 5.292 5.438 5.674 5.898 6.085 6.252 6.41 6.615 6.811 6.981 7.158 7.322 7.491 7.697 7.899 8.053 8.196 8.356 8.525 8.672 8.836 9.022 9.14 9.216 9.27 9.277 9.273 9.182 8.752 7.789 6.56 5.534 4.619 3.81 3.068 2.413 1.862 1.387 0.903 0.502 0.148 -0.182 -0.489 -0.777 -1.04 -1.305 -1.531 -1.732 -1.942 -2.181 -2.382 -2.574 -2.775 -2.926 -3.082 -3.25 -3.429 -3.622 -3.746 -3.867 -4.07 -4.205 -4.345 -4.419 -4.563 -4.709 -4.845 -4.923 -5.265 -5.186 -5.272 -5.369 -5.601 -5.729 -5.862 -6.004 -6.15 -6.322 -6.57 -6.876 -9 ,31938 ,TETRA ,17524216,Wed Nov 24 21:49:53 CET,Wed Nov 24 23:36:03 CET,0.0 1.123 1.496 1.793 2.036 2.233 2.415 2.59 2.869 2.994 3.111 3.094 3.439 3.541 3.721 3.884 4.043 4.119 4.249 4.368 4.541 4.653 4.76 4.913 5.071 5.216 5.345 5.468 5.626 5.776 5.925 6.097 6.244 6.374 6.536 6.707 6.85 7.006 7.159 7.293 7.417 7.578 7.763 7.9 8.012 8.07 8.084 8.033 7.838 7.389 6.503 5.384 4.359 3.44 2.656 1.947 1.327 0.801 0.354 -0.103 -0.501 -0.869 -1.201 -1.505 -1.783 -2.031 -2.307 -2.545 -2.74 -2.938 -3.148 -3.333 -3.522 -3.707 -3.848 -3.993 -4.149 -4.312 -4.474 -4.59 -4.715 -4.909 -5.037 -5.166 -5.234 -5.372 -5.515 -5.673 -5.763 -6.107 -6.043 -6.127 -6.207 -6.396 -6.516 -6.642 -6.787 -6.947 -7.141 -7.399 -7.766 -10 ,21370 ,TETRA ,17524218,Wed Nov 24 21:49:54 CET,Wed Nov 24 23:36:23 CET,0.0 1.379 1.789 2.06 2.266 2.45 2.611 2.784 3.077 3.195 3.312 3.31 3.663 3.76 3.943 4.104 4.24 4.307 4.449 4.611 4.815 4.917 5.029 5.182 5.316 5.433 5.544 5.665 5.829 5.985 6.136 6.321 6.518 6.701 6.898 7.1 7.259 7.42 7.609 7.774 7.898 8.048 8.199 8.293 8.393 8.478 8.511 8.459 8.316 7.937 7.002 5.699 4.613 3.685 2.87 2.162 1.557 1.02 0.554 0.087 -0.31 -0.647 -0.979 -1.295 -1.572 -1.839 -2.12 -2.363 -2.569 -2.785 -3.016 -3.204 -3.396 -3.597 -3.745 -3.889 -4.046 -4.22 -4.396 -4.512 -4.631 -4.807 -4.925 -5.064 -5.133 -5.276 -5.435 -5.588 -5.664 -6.005 -5.938 -6.035 -6.138 -6.369 -6.514 -6.65 -6.778 -6.914 -7.051 -7.277 -7.592 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_47.txt deleted file mode 100644 index 48680ace..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_27_47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4626 ,TETRA ,17524223,Wed Nov 24 21:49:59 CET,Wed Nov 24 23:35:40 CET,0.0 1.711 2.226 2.571 2.837 3.068 3.291 3.475 3.779 3.923 4.055 4.061 4.424 4.531 4.723 4.935 5.145 5.249 5.47 5.661 5.917 6.085 6.226 6.394 6.523 6.651 6.775 6.877 6.992 7.076 7.147 7.226 7.292 7.34 7.388 7.436 7.451 7.446 7.431 7.398 7.339 7.217 6.993 6.728 6.377 5.88 5.194 4.268 2.9 0.801 -2.647 -6.548 -9.515 -11.918 -13.88 -15.507 -16.879 -18.08 -19.056 -19.959 -20.73 -21.419 -22.034 -22.587 -23.119 -23.613 -24.116 -24.561 -24.931 -25.321 -25.731 -26.06 -26.392 -26.725 -26.987 -27.248 -27.503 -27.764 -28.027 -28.215 -28.422 -28.742 -28.955 -29.174 -29.286 -29.511 -29.75 -29.998 -30.125 -30.544 -30.55 -30.692 -30.839 -31.146 -31.311 -31.491 -31.682 -31.892 -32.133 -32.414 -33.096 -2 ,15309 ,TETRA ,17524224,Wed Nov 24 21:49:56 CET,Wed Nov 24 23:35:42 CET,0.0 1.493 1.974 2.308 2.565 2.782 2.975 3.159 3.48 3.618 3.735 3.717 4.058 4.169 4.351 4.505 4.66 4.743 4.903 5.034 5.22 5.347 5.491 5.675 5.816 5.958 6.069 6.166 6.297 6.412 6.496 6.597 6.683 6.756 6.832 6.909 6.967 6.99 6.998 6.957 6.872 6.739 6.525 6.272 5.913 5.391 4.623 3.583 2.149 -0.003 -3.469 -7.268 -10.156 -12.513 -14.418 -16.016 -17.368 -18.553 -19.528 -20.49 -21.323 -22.03 -22.69 -23.298 -23.854 -24.355 -24.854 -25.288 -25.661 -26.058 -26.458 -26.774 -27.101 -27.44 -27.704 -27.977 -28.258 -28.533 -28.809 -29.003 -29.2 -29.489 -29.679 -29.874 -29.978 -30.192 -30.404 -30.625 -30.746 -31.153 -31.126 -31.27 -31.418 -31.726 -31.892 -32.06 -32.225 -32.4 -32.599 -32.866 -33.423 -3 ,16399 ,TETRA ,17524225,Wed Nov 24 21:49:57 CET,Wed Nov 24 23:35:16 CET,0.0 1.917 2.537 3.025 3.402 3.723 4.024 4.344 4.899 5.082 5.228 5.31 5.703 5.826 6.06 6.284 6.482 6.575 6.759 6.923 7.16 7.32 7.464 7.632 7.77 7.908 8.047 8.175 8.324 8.468 8.591 8.71 8.825 8.93 9.029 9.115 9.18 9.206 9.199 9.202 9.173 9.09 8.952 8.716 8.335 7.862 7.19 6.179 4.707 2.573 -0.791 -4.463 -7.309 -9.636 -11.542 -13.186 -14.548 -15.702 -16.667 -17.616 -18.407 -19.106 -19.777 -20.387 -20.921 -21.393 -21.879 -22.31 -22.68 -23.052 -23.438 -23.759 -24.086 -24.424 -24.68 -24.94 -25.207 -25.472 -25.74 -25.931 -26.125 -26.409 -26.604 -26.807 -26.906 -27.109 -27.341 -27.593 -27.715 -28.114 -28.095 -28.225 -28.365 -28.709 -28.891 -29.075 -29.28 -29.489 -29.707 -29.963 -30.653 -4 ,26755 ,TETRA ,17524231,Wed Nov 24 21:49:57 CET,Wed Nov 24 23:36:52 CET,0.0 1.623 2.041 2.327 2.586 2.828 3.028 3.206 3.525 3.682 3.843 3.863 4.214 4.319 4.516 4.689 4.842 4.913 5.045 5.168 5.33 5.417 5.498 5.625 5.751 5.861 5.948 6.03 6.137 6.223 6.293 6.371 6.436 6.492 6.544 6.575 6.588 6.587 6.574 6.539 6.461 6.345 6.151 5.88 5.473 4.937 4.234 3.218 1.757 -0.341 -3.668 -7.362 -10.251 -12.608 -14.534 -16.162 -17.492 -18.643 -19.605 -20.539 -21.328 -22.015 -22.647 -23.241 -23.785 -24.266 -24.758 -25.197 -25.565 -25.935 -26.311 -26.618 -26.935 -27.263 -27.523 -27.789 -28.05 -28.306 -28.578 -28.771 -28.968 -29.265 -29.467 -29.682 -29.793 -30.023 -30.265 -30.515 -30.638 -31.033 -31.007 -31.153 -31.298 -31.593 -31.751 -31.909 -32.072 -32.257 -32.483 -32.849 -33.796 -5 ,8794 ,TETRA ,17524233,Wed Nov 24 21:50:00 CET,Wed Nov 24 23:36:57 CET,0.0 2.262 2.75 3.098 3.443 3.792 4.112 4.374 4.749 4.893 5.026 5.026 5.381 5.495 5.693 5.863 6.011 6.079 6.239 6.395 6.593 6.717 6.826 6.97 7.096 7.206 7.298 7.378 7.469 7.554 7.625 7.685 7.745 7.806 7.854 7.881 7.897 7.897 7.868 7.809 7.728 7.608 7.413 7.144 6.777 6.302 5.608 4.638 3.241 1.157 -2.131 -5.761 -8.618 -10.971 -12.88 -14.471 -15.786 -16.946 -17.916 -18.865 -19.68 -20.379 -21.018 -21.602 -22.121 -22.585 -23.064 -23.493 -23.863 -24.241 -24.619 -24.932 -25.261 -25.591 -25.835 -26.082 -26.334 -26.592 -26.857 -27.037 -27.226 -27.524 -27.721 -27.919 -28.02 -28.22 -28.44 -28.68 -28.803 -29.195 -29.167 -29.298 -29.428 -29.706 -29.842 -29.977 -30.131 -30.324 -30.565 -30.886 -31.55 -6 ,21174 ,TETRA ,17524236,Wed Nov 24 21:50:53 CET,Wed Nov 24 23:36:46 CET,0.0 1.98 2.515 2.93 3.24 3.483 3.696 3.893 4.213 4.353 4.49 4.49 4.847 4.981 5.24 5.465 5.693 5.803 5.973 6.105 6.293 6.409 6.519 6.672 6.803 6.917 7.025 7.126 7.245 7.356 7.457 7.556 7.625 7.683 7.765 7.834 7.872 7.905 7.919 7.911 7.88 7.795 7.63 7.412 7.099 6.626 5.889 4.872 3.465 1.402 -1.942 -5.722 -8.666 -11.065 -12.991 -14.632 -16.037 -17.228 -18.21 -19.193 -20.005 -20.698 -21.354 -21.96 -22.506 -23.009 -23.529 -23.967 -24.324 -24.687 -25.075 -25.401 -25.74 -26.082 -26.334 -26.598 -26.882 -27.175 -27.481 -27.69 -27.89 -28.186 -28.398 -28.621 -28.727 -28.955 -29.191 -29.433 -29.562 -29.972 -29.974 -30.121 -30.274 -30.581 -30.734 -30.907 -31.104 -31.31 -31.525 -31.771 -32.267 -7 ,17580 ,TETRA ,17524238,Wed Nov 24 21:50:53 CET,Wed Nov 24 23:37:21 CET,0.0 2.46 3.12 3.502 3.807 4.071 4.282 4.492 4.875 5.032 5.175 5.203 5.562 5.692 5.95 6.142 6.316 6.397 6.547 6.691 6.883 7.009 7.115 7.237 7.355 7.463 7.551 7.638 7.759 7.866 7.948 8.029 8.101 8.145 8.171 8.194 8.21 8.208 8.178 8.109 8.011 7.877 7.689 7.456 7.092 6.573 5.816 4.76 3.254 1.125 -2.198 -5.962 -8.845 -11.192 -13.086 -14.693 -16.039 -17.194 -18.172 -19.121 -19.913 -20.612 -21.26 -21.859 -22.401 -22.871 -23.352 -23.779 -24.143 -24.515 -24.902 -25.212 -25.527 -25.86 -26.12 -26.389 -26.672 -26.945 -27.213 -27.406 -27.598 -27.886 -28.077 -28.279 -28.39 -28.611 -28.827 -29.055 -29.189 -29.612 -29.636 -29.796 -29.962 -30.319 -30.513 -30.708 -30.894 -31.083 -31.299 -31.567 -32.071 -8 ,2321 ,TETRA ,17524239,Wed Nov 24 21:50:54 CET,Wed Nov 24 23:37:57 CET,0.0 2.069 2.646 3.05 3.386 3.653 3.889 4.059 4.363 4.528 4.681 4.721 5.089 5.188 5.353 5.521 5.685 5.77 5.954 6.15 6.394 6.51 6.606 6.721 6.826 6.944 7.054 7.138 7.225 7.304 7.383 7.46 7.505 7.537 7.583 7.618 7.636 7.626 7.575 7.508 7.423 7.284 7.041 6.74 6.319 5.772 5.029 4.01 2.536 0.357 -3.066 -6.83 -9.711 -12.036 -13.967 -15.612 -16.967 -18.143 -19.106 -20.021 -20.803 -21.494 -22.127 -22.707 -23.25 -23.734 -24.207 -24.622 -24.98 -25.34 -25.718 -26.033 -26.351 -26.682 -26.942 -27.207 -27.479 -27.749 -28.022 -28.204 -28.392 -28.701 -28.926 -29.156 -29.272 -29.512 -29.76 -30.004 -30.121 -30.52 -30.492 -30.624 -30.77 -31.115 -31.302 -31.483 -31.667 -31.872 -32.117 -32.436 -33.019 -9 ,15130 ,TETRA ,17524241,Wed Nov 24 21:50:58 CET,Wed Nov 24 23:39:23 CET,0.0 2.392 2.903 3.299 3.606 3.839 4.053 4.246 4.593 4.755 4.903 4.921 5.279 5.39 5.599 5.783 5.929 5.983 6.078 6.179 6.331 6.437 6.537 6.672 6.793 6.891 6.971 7.036 7.113 7.204 7.288 7.357 7.396 7.419 7.432 7.41 7.365 7.324 7.271 7.189 7.054 6.87 6.629 6.311 5.858 5.283 4.491 3.381 1.782 -0.494 -3.93 -7.692 -10.561 -12.835 -14.709 -16.337 -17.695 -18.854 -19.821 -20.763 -21.558 -22.247 -22.89 -23.488 -24.014 -24.473 -24.958 -25.39 -25.761 -26.14 -26.523 -26.835 -27.16 -27.491 -27.743 -28.007 -28.267 -28.529 -28.804 -28.982 -29.167 -29.467 -29.671 -29.87 -29.974 -30.188 -30.404 -30.654 -30.783 -31.192 -31.152 -31.288 -31.426 -31.714 -31.867 -32.021 -32.192 -32.38 -32.572 -32.82 -33.401 -10 ,503 ,TETRA ,17524244,Wed Nov 24 21:50:58 CET,Wed Nov 24 23:36:02 CET,0.0 2.578 3.101 3.44 3.699 3.919 4.089 4.24 4.515 4.655 4.801 4.817 5.185 5.318 5.577 5.813 5.996 6.073 6.204 6.346 6.541 6.64 6.729 6.864 6.99 7.083 7.169 7.265 7.377 7.456 7.519 7.585 7.658 7.729 7.783 7.816 7.838 7.85 7.831 7.767 7.676 7.553 7.359 7.093 6.685 6.144 5.398 4.399 3.007 0.897 -2.529 -6.334 -9.254 -11.606 -13.509 -15.104 -16.461 -17.644 -18.595 -19.531 -20.331 -21.003 -21.626 -22.21 -22.755 -23.249 -23.757 -24.192 -24.55 -24.914 -25.3 -25.628 -25.947 -26.273 -26.533 -26.789 -27.051 -27.32 -27.592 -27.801 -28.037 -28.395 -28.63 -28.859 -28.971 -29.195 -29.423 -29.659 -29.78 -30.176 -30.166 -30.308 -30.455 -30.784 -30.954 -31.122 -31.32 -31.523 -31.787 -32.114 -32.868 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_29.txt deleted file mode 100644 index 4b5b7499..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26446 ,KEBNE ,17022157,Wed Dec 22 05:20:22 CET,Wed Dec 22 06:46:41 CET,0.0 1.757 2.212 2.533 2.848 3.123 3.373 3.641 4.113 4.32 4.509 4.603 5.011 5.175 5.462 5.724 5.976 6.092 6.312 6.535 6.852 7.057 7.259 7.538 7.8 8.065 8.333 8.591 8.911 9.216 9.515 9.873 10.215 10.552 10.957 11.423 11.871 12.363 12.894 13.437 14.007 14.662 15.433 16.177 17.043 18.059 19.228 20.546 22.121 23.966 26.256 28.166 29.246 29.829 30.142 30.356 30.453 30.45 30.403 30.345 30.268 30.199 30.127 30.033 29.948 29.851 29.723 29.604 29.495 29.381 29.261 29.164 29.055 28.924 28.817 28.705 28.571 28.421 28.267 28.166 28.062 27.871 27.737 27.613 27.555 27.433 27.289 27.126 27.043 26.74 26.776 26.673 26.566 26.308 26.151 25.976 25.776 25.544 25.229 24.774 23.399 -2 ,25188 ,KEBNE ,17022158,Wed Dec 22 05:20:22 CET,Wed Dec 22 06:45:29 CET,0.0 1.416 1.825 2.117 2.392 2.624 2.813 2.988 3.341 3.509 3.66 3.708 4.084 4.208 4.447 4.665 4.87 4.974 5.183 5.397 5.697 5.89 6.083 6.342 6.592 6.844 7.086 7.323 7.623 7.906 8.179 8.509 8.823 9.135 9.505 9.905 10.283 10.713 11.192 11.705 12.248 12.863 13.582 14.33 15.203 16.137 17.159 18.342 19.779 21.453 23.405 24.97 25.932 26.477 26.742 26.868 26.856 26.79 26.728 26.618 26.482 26.343 26.203 26.05 25.896 25.755 25.606 25.442 25.302 25.186 25.049 24.932 24.811 24.668 24.556 24.427 24.283 24.132 23.962 23.834 23.699 23.491 23.351 23.204 23.125 22.967 22.806 22.619 22.519 22.198 22.214 22.103 21.975 21.659 21.479 21.295 21.085 20.835 20.529 20.164 18.5 -3 ,25527 ,KEBNE ,17022159,Wed Dec 22 05:20:22 CET,Wed Dec 22 06:44:45 CET,0.0 1.406 1.844 2.186 2.468 2.69 2.893 3.088 3.464 3.648 3.818 3.88 4.261 4.407 4.694 4.969 5.21 5.316 5.522 5.72 6.014 6.217 6.405 6.661 6.924 7.189 7.445 7.693 8.031 8.373 8.68 9.035 9.364 9.683 10.072 10.503 10.906 11.361 11.87 12.407 12.962 13.574 14.261 14.917 15.659 16.484 17.426 18.52 19.81 21.311 23.07 24.493 25.298 25.742 26.012 26.174 26.204 26.182 26.15 26.054 25.952 25.868 25.792 25.704 25.61 25.513 25.391 25.278 25.183 25.059 24.91 24.797 24.667 24.518 24.398 24.268 24.136 24.006 23.857 23.741 23.638 23.488 23.374 23.251 23.191 23.057 22.893 22.727 22.643 22.33 22.371 22.269 22.152 21.914 21.776 21.614 21.432 21.255 21.033 20.687 19.63 -4 ,887 ,KEBNE ,17022160,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:46:40 CET,0.0 2.153 2.671 3.016 3.32 3.618 3.89 4.094 4.449 4.633 4.793 4.886 5.281 5.423 5.695 5.942 6.192 6.314 6.548 6.776 7.091 7.285 7.47 7.753 8.039 8.308 8.567 8.821 9.157 9.498 9.815 10.167 10.52 10.869 11.27 11.723 12.16 12.624 13.134 13.681 14.227 14.837 15.544 16.251 17.08 18.005 19.054 20.246 21.708 23.531 25.762 27.495 28.43 28.941 29.206 29.347 29.423 29.442 29.413 29.341 29.248 29.153 29.039 28.919 28.804 28.689 28.547 28.434 28.348 28.24 28.11 27.995 27.871 27.743 27.638 27.51 27.38 27.249 27.105 26.998 26.877 26.698 26.58 26.455 26.388 26.245 26.09 25.926 25.842 25.522 25.543 25.434 25.303 25.0 24.843 24.673 24.505 24.292 23.933 23.49 22.034 -5 ,25291 ,KEBNE ,17022161,Wed Dec 22 05:20:23 CET,Wed Dec 22 06:42:40 CET,0.0 2.404 3.133 3.687 4.028 4.287 4.536 4.8 5.287 5.485 5.646 5.704 6.092 6.226 6.483 6.74 7.007 7.15 7.41 7.632 7.941 8.143 8.343 8.644 8.945 9.232 9.513 9.774 10.109 10.432 10.734 11.1 11.453 11.785 12.176 12.628 13.066 13.541 14.053 14.608 15.184 15.818 16.573 17.35 18.212 19.141 20.234 21.543 23.117 24.946 27.104 28.856 29.88 30.448 30.759 30.922 30.993 31.004 30.972 30.906 30.82 30.716 30.609 30.509 30.386 30.258 30.115 29.962 29.835 29.715 29.597 29.495 29.364 29.191 29.049 28.908 28.76 28.607 28.439 28.315 28.181 27.975 27.832 27.689 27.618 27.462 27.271 27.068 26.975 26.65 26.602 26.434 26.265 25.91 25.722 25.507 25.256 24.98 24.67 24.129 20.642 -6 ,3593 ,KEBNE ,17022162,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:46:43 CET,0.0 3.436 3.92 4.285 4.597 4.849 5.058 5.268 5.643 5.818 5.969 5.992 6.366 6.486 6.715 6.952 7.18 7.29 7.516 7.723 8.0 8.178 8.358 8.63 8.904 9.152 9.385 9.625 9.929 10.218 10.504 10.848 11.175 11.494 11.889 12.363 12.797 13.23 13.691 14.183 14.716 15.336 16.039 16.738 17.562 18.485 19.482 20.549 21.798 23.238 24.916 26.151 26.729 27.058 27.235 27.295 27.286 27.244 27.213 27.17 27.116 27.045 26.946 26.834 26.714 26.598 26.449 26.3 26.177 26.048 25.916 25.795 25.664 25.515 25.397 25.286 25.159 25.036 24.919 24.83 24.739 24.589 24.471 24.34 24.272 24.118 23.938 23.743 23.635 23.295 23.274 23.148 23.017 22.723 22.553 22.361 22.135 21.853 21.491 21.081 19.695 -7 ,1423 ,KEBNE ,17022163,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:46:43 CET,0.0 1.778 2.261 2.542 2.793 3.035 3.251 3.437 3.78 3.935 4.084 4.133 4.509 4.641 4.885 5.106 5.323 5.435 5.658 5.872 6.18 6.374 6.561 6.838 7.113 7.374 7.625 7.866 8.157 8.428 8.697 9.025 9.34 9.655 10.023 10.433 10.838 11.284 11.737 12.222 12.775 13.388 14.079 14.763 15.56 16.469 17.522 18.726 20.156 21.788 23.662 25.162 25.958 26.502 26.882 27.107 27.229 27.251 27.196 27.117 27.026 26.914 26.812 26.702 26.56 26.43 26.295 26.161 26.033 25.875 25.708 25.586 25.444 25.284 25.164 25.037 24.904 24.771 24.643 24.556 24.456 24.288 24.167 24.047 23.982 23.83 23.676 23.513 23.415 23.089 23.086 22.971 22.861 22.608 22.462 22.299 22.123 21.939 21.711 21.371 20.012 -8 ,21368 ,KEBNE ,17022164,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:45:41 CET,0.0 2.116 2.59 2.923 3.164 3.367 3.577 3.773 4.096 4.246 4.395 4.437 4.825 4.971 5.251 5.53 5.786 5.902 6.12 6.328 6.626 6.803 6.972 7.234 7.491 7.741 7.989 8.226 8.516 8.79 9.082 9.447 9.775 10.087 10.465 10.879 11.272 11.708 12.189 12.695 13.231 13.857 14.609 15.422 16.374 17.402 18.571 19.911 21.526 23.376 25.518 27.259 28.187 28.747 29.117 29.289 29.33 29.359 29.34 29.256 29.157 29.041 28.923 28.827 28.723 28.618 28.499 28.379 28.257 28.123 28.0 27.891 27.761 27.613 27.508 27.416 27.303 27.165 27.031 26.937 26.828 26.646 26.528 26.406 26.336 26.189 26.027 25.83 25.726 25.406 25.399 25.266 25.133 24.838 24.669 24.48 24.279 24.052 23.771 23.433 22.482 -9 ,12046 ,KEBNE ,17022165,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:47:44 CET,0.0 1.851 2.373 2.761 3.052 3.285 3.509 3.74 4.144 4.326 4.509 4.591 4.985 5.143 5.444 5.709 5.944 6.065 6.314 6.556 6.878 7.07 7.251 7.527 7.802 8.057 8.301 8.53 8.818 9.11 9.399 9.736 10.051 10.374 10.782 11.248 11.681 12.155 12.66 13.176 13.714 14.353 15.124 15.891 16.759 17.719 18.883 20.209 21.75 23.577 25.698 27.407 28.391 28.938 29.19 29.317 29.391 29.405 29.415 29.419 29.387 29.313 29.206 29.09 28.965 28.843 28.717 28.605 28.498 28.367 28.217 28.106 27.994 27.865 27.765 27.657 27.532 27.397 27.258 27.164 27.063 26.897 26.778 26.655 26.593 26.466 26.329 26.167 26.075 25.761 25.792 25.676 25.545 25.284 25.139 24.962 24.744 24.495 24.142 23.619 22.111 -10 ,20020 ,KEBNE ,17022166,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:47:50 CET,0.0 2.797 3.379 3.726 4.038 4.313 4.552 4.803 5.254 5.445 5.632 5.738 6.142 6.289 6.557 6.808 7.059 7.183 7.414 7.643 7.968 8.163 8.354 8.644 8.933 9.216 9.491 9.762 10.118 10.441 10.738 11.094 11.436 11.768 12.158 12.596 13.021 13.477 13.955 14.465 15.008 15.622 16.319 17.017 17.84 18.787 19.887 21.132 22.627 24.353 26.311 27.833 28.732 29.283 29.603 29.801 29.947 30.034 29.981 29.867 29.765 29.638 29.501 29.386 29.275 29.155 29.017 28.876 28.747 28.612 28.465 28.336 28.202 28.062 27.943 27.805 27.677 27.555 27.405 27.287 27.157 26.967 26.853 26.727 26.651 26.502 26.356 26.197 26.12 25.831 25.881 25.78 25.68 25.44 25.304 25.164 24.973 24.729 24.479 24.141 19.978 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_42.txt deleted file mode 100644 index f738166f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27323 ,KEBNE ,17022167,Wed Dec 22 05:21:25 CET,Wed Dec 22 06:44:45 CET,0.0 1.226 1.65 1.995 2.325 2.583 2.822 3.025 3.378 3.543 3.704 3.753 4.129 4.258 4.502 4.734 4.96 5.07 5.293 5.525 5.82 5.979 6.121 6.307 6.511 6.73 6.934 7.12 7.339 7.541 7.747 7.986 8.234 8.483 8.736 9.028 9.329 9.649 9.961 10.294 10.66 11.078 11.569 12.007 12.463 12.986 13.595 14.257 14.937 15.587 16.194 16.434 16.367 16.173 15.938 15.709 15.439 15.145 14.899 14.636 14.399 14.195 14.009 13.808 13.597 13.409 13.213 13.036 12.873 12.697 12.512 12.367 12.224 12.071 11.94 11.808 11.669 11.51 11.343 11.222 11.1 10.919 10.803 10.682 10.611 10.465 10.325 10.185 10.104 9.788 9.851 9.753 9.661 9.443 9.312 9.179 9.028 8.845 8.596 8.25 7.461 -2 ,19011 ,KEBNE ,17022168,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:46:19 CET,0.0 0.715 1.084 1.336 1.56 1.776 1.976 2.142 2.407 2.529 2.651 2.626 2.966 3.077 3.282 3.455 3.633 3.719 3.876 4.05 4.309 4.458 4.597 4.799 4.987 5.179 5.366 5.53 5.728 5.912 6.101 6.32 6.53 6.751 6.981 7.232 7.491 7.77 8.064 8.385 8.712 9.063 9.469 9.867 10.313 10.8 11.344 11.952 12.645 13.34 13.957 14.125 13.993 13.787 13.55 13.277 13.014 12.722 12.431 12.142 11.888 11.649 11.41 11.177 10.959 10.753 10.543 10.351 10.167 9.977 9.785 9.614 9.419 9.218 9.069 8.919 8.756 8.583 8.402 8.271 8.142 7.945 7.805 7.65 7.571 7.425 7.26 7.066 6.964 6.624 6.646 6.542 6.43 6.166 6.016 5.859 5.679 5.479 5.225 4.9 4.133 -3 ,8900 ,KEBNE ,17022169,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:45:59 CET,0.0 1.147 1.468 1.685 1.893 2.106 2.297 2.453 2.721 2.846 2.953 2.932 3.282 3.379 3.561 3.725 3.879 3.951 4.087 4.223 4.411 4.538 4.665 4.849 5.028 5.192 5.346 5.51 5.741 5.954 6.149 6.37 6.577 6.793 7.052 7.317 7.559 7.831 8.123 8.411 8.704 9.052 9.441 9.789 10.22 10.719 11.252 11.801 12.42 13.079 13.642 13.857 13.813 13.645 13.426 13.174 12.879 12.574 12.329 12.103 11.887 11.673 11.464 11.256 11.047 10.85 10.633 10.428 10.251 10.076 9.905 9.761 9.602 9.43 9.294 9.15 8.993 8.826 8.658 8.549 8.433 8.223 8.072 7.926 7.853 7.689 7.512 7.331 7.237 6.903 6.928 6.824 6.721 6.519 6.412 6.28 6.12 5.952 5.758 5.54 5.104 -4 ,5913 ,KEBNE ,17022170,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:45:25 CET,0.0 0.527 0.858 1.108 1.285 1.447 1.596 1.74 2.03 2.165 2.289 2.289 2.636 2.744 2.948 3.143 3.324 3.413 3.582 3.735 3.967 4.12 4.273 4.503 4.704 4.896 5.089 5.271 5.504 5.716 5.916 6.158 6.4 6.644 6.913 7.201 7.468 7.762 8.078 8.4 8.753 9.125 9.519 9.93 10.443 11.011 11.642 12.281 12.863 13.431 13.995 14.207 14.106 13.909 13.649 13.343 13.038 12.762 12.512 12.231 11.932 11.653 11.42 11.192 10.955 10.736 10.508 10.293 10.102 9.9 9.688 9.515 9.343 9.176 9.051 8.919 8.771 8.619 8.471 8.364 8.252 8.074 7.939 7.783 7.702 7.557 7.417 7.269 7.192 6.869 6.888 6.767 6.637 6.353 6.194 6.018 5.816 5.588 5.357 5.118 4.516 -5 ,6146 ,KEBNE ,17022171,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:46:05 CET,0.0 0.387 0.608 0.82 1.005 1.211 1.407 1.556 1.814 1.946 2.085 2.104 2.456 2.567 2.776 2.951 3.113 3.184 3.328 3.478 3.682 3.817 3.955 4.149 4.334 4.513 4.683 4.845 5.055 5.252 5.433 5.661 5.907 6.151 6.43 6.742 7.026 7.315 7.619 7.93 8.249 8.596 9.0 9.419 9.907 10.425 10.977 11.557 12.214 12.932 13.61 13.876 13.826 13.647 13.394 13.124 12.846 12.548 12.267 11.981 11.74 11.523 11.289 11.046 10.807 10.567 10.332 10.144 9.975 9.79 9.584 9.393 9.197 8.997 8.837 8.688 8.536 8.364 8.185 8.066 7.943 7.749 7.612 7.472 7.4 7.252 7.102 6.929 6.825 6.487 6.489 6.366 6.237 5.938 5.779 5.636 5.496 5.346 5.131 4.807 3.965 -6 ,25367 ,KEBNE ,17022172,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:47:05 CET,0.0 0.799 1.049 1.262 1.44 1.611 1.773 1.918 2.187 2.306 2.419 2.405 2.744 2.836 3.028 3.213 3.382 3.459 3.609 3.749 3.933 4.057 4.19 4.384 4.569 4.746 4.924 5.092 5.295 5.483 5.659 5.877 6.095 6.317 6.582 6.872 7.139 7.433 7.744 8.066 8.397 8.752 9.145 9.577 10.09 10.64 11.25 11.881 12.558 13.228 13.836 14.088 14.045 13.875 13.645 13.402 13.142 12.87 12.622 12.365 12.125 11.892 11.671 11.431 11.189 10.988 10.773 10.559 10.384 10.224 10.04 9.872 9.71 9.536 9.399 9.244 9.078 8.928 8.746 8.615 8.489 8.276 8.114 7.941 7.853 7.665 7.502 7.367 7.283 6.966 7.008 6.899 6.787 6.563 6.45 6.333 6.205 6.079 5.945 5.762 5.383 -7 ,11103 ,KEBNE ,17022173,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:46:15 CET,0.0 1.227 1.521 1.795 2.035 2.244 2.42 2.611 2.988 3.144 3.28 3.293 3.644 3.74 3.919 4.087 4.265 4.353 4.528 4.706 4.947 5.106 5.258 5.464 5.657 5.847 6.036 6.229 6.48 6.721 6.96 7.243 7.512 7.758 8.021 8.294 8.553 8.836 9.145 9.476 9.813 10.196 10.647 11.064 11.509 11.977 12.486 13.056 13.656 14.251 14.829 15.087 15.066 14.932 14.713 14.429 14.157 13.871 13.606 13.339 13.096 12.867 12.639 12.421 12.214 12.015 11.783 11.584 11.433 11.261 11.08 10.935 10.781 10.608 10.477 10.345 10.208 10.065 9.91 9.8 9.687 9.498 9.365 9.231 9.161 9.011 8.844 8.67 8.574 8.24 8.261 8.142 8.016 7.761 7.619 7.471 7.306 7.105 6.886 6.606 6.041 -8 ,16059 ,KEBNE ,17022174,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:45:32 CET,0.0 1.258 1.595 1.843 2.059 2.267 2.454 2.611 2.889 3.018 3.152 3.183 3.55 3.653 3.86 4.068 4.263 4.356 4.547 4.733 4.979 5.131 5.284 5.49 5.671 5.846 6.025 6.203 6.43 6.655 6.859 7.099 7.325 7.53 7.76 8.009 8.25 8.516 8.819 9.154 9.493 9.863 10.271 10.663 11.116 11.6 12.13 12.683 13.269 13.918 14.521 14.727 14.618 14.431 14.204 13.892 13.532 13.217 12.96 12.688 12.453 12.229 12.001 11.773 11.536 11.304 11.065 10.853 10.674 10.478 10.264 10.093 9.911 9.734 9.599 9.443 9.282 9.133 8.978 8.862 8.745 8.537 8.377 8.227 8.15 7.989 7.825 7.649 7.552 7.218 7.242 7.127 7.009 6.771 6.649 6.514 6.364 6.175 5.938 5.673 5.007 -9 ,4475 ,KEBNE ,17022175,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:45:41 CET,0.0 0.956 1.379 1.662 1.923 2.138 2.337 2.535 2.863 3.013 3.146 3.14 3.504 3.617 3.814 3.991 4.147 4.221 4.367 4.505 4.735 4.889 5.026 5.23 5.411 5.566 5.715 5.86 6.062 6.266 6.455 6.672 6.89 7.105 7.345 7.625 7.923 8.221 8.486 8.769 9.076 9.417 9.817 10.214 10.658 11.147 11.699 12.313 12.942 13.559 14.224 14.571 14.523 14.307 14.043 13.756 13.463 13.199 12.951 12.669 12.435 12.223 12.006 11.804 11.611 11.429 11.239 11.061 10.904 10.727 10.536 10.374 10.21 10.028 9.886 9.752 9.616 9.477 9.329 9.218 9.1 8.929 8.8 8.663 8.593 8.448 8.302 8.135 8.049 7.734 7.779 7.67 7.566 7.343 7.206 7.078 6.954 6.788 6.529 6.148 5.494 -10 ,15751 ,KEBNE ,17022176,Wed Dec 22 05:21:24 CET,Wed Dec 22 06:45:43 CET,0.0 0.855 1.216 1.535 1.783 1.975 2.141 2.273 2.529 2.653 2.776 2.768 3.122 3.236 3.435 3.626 3.798 3.872 4.014 4.157 4.385 4.528 4.652 4.838 5.028 5.213 5.387 5.546 5.756 5.954 6.157 6.406 6.642 6.892 7.201 7.531 7.819 8.131 8.444 8.764 9.123 9.549 10.026 10.487 11.053 11.66 12.33 13.026 13.696 14.33 14.917 15.166 15.142 14.983 14.738 14.486 14.204 13.869 13.583 13.324 13.086 12.862 12.645 12.443 12.22 12.003 11.812 11.646 11.497 11.332 11.153 11.008 10.861 10.708 10.601 10.493 10.375 10.251 10.108 9.999 9.876 9.698 9.585 9.457 9.392 9.268 9.128 8.961 8.874 8.557 8.608 8.509 8.403 8.154 8.012 7.861 7.704 7.526 7.305 7.046 6.483 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_44.txt deleted file mode 100644 index 54bcbd39..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23172 ,KEBNE ,17022177,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:47:21 CET,0.0 1.215 1.618 1.957 2.226 2.438 2.619 2.814 3.176 3.321 3.46 3.488 3.842 3.952 4.169 4.388 4.586 4.683 4.861 5.02 5.253 5.396 5.533 5.739 5.949 6.134 6.291 6.456 6.686 6.93 7.163 7.416 7.647 7.874 8.135 8.41 8.68 8.973 9.257 9.573 9.919 10.301 10.737 11.144 11.611 12.102 12.617 13.141 13.646 14.156 14.572 14.584 14.353 13.978 13.556 13.122 12.713 12.331 11.961 11.573 11.243 10.947 10.65 10.359 10.109 9.905 9.693 9.494 9.321 9.147 8.973 8.828 8.666 8.501 8.382 8.256 8.125 7.995 7.846 7.732 7.612 7.413 7.271 7.129 7.059 6.921 6.782 6.643 6.575 6.268 6.328 6.236 6.148 5.923 5.795 5.67 5.532 5.35 5.105 4.776 2.901 -2 ,5968 ,KEBNE ,17022178,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:46:08 CET,0.0 2.259 2.738 3.072 3.362 3.611 3.81 4.012 4.409 4.583 4.751 4.833 5.232 5.363 5.602 5.826 6.046 6.159 6.373 6.573 6.837 6.999 7.152 7.363 7.566 7.797 8.039 8.258 8.518 8.757 8.988 9.274 9.561 9.822 10.109 10.422 10.715 11.023 11.342 11.686 12.023 12.391 12.832 13.261 13.731 14.228 14.822 15.483 16.16 16.758 17.221 17.333 17.132 16.78 16.452 16.163 15.835 15.495 15.209 14.893 14.572 14.24 13.93 13.673 13.419 13.155 12.892 12.67 12.475 12.278 12.072 11.891 11.696 11.497 11.342 11.184 11.02 10.848 10.679 10.564 10.431 10.218 10.072 9.915 9.826 9.633 9.436 9.246 9.144 8.804 8.831 8.71 8.577 8.283 8.126 7.968 7.795 7.61 7.413 7.169 6.617 -3 ,6273 ,KEBNE ,17022179,Wed Dec 22 05:21:27 CET,Wed Dec 22 06:43:18 CET,0.0 1.345 1.723 2.024 2.293 2.512 2.713 2.901 3.234 3.386 3.531 3.553 3.905 4.007 4.226 4.447 4.642 4.737 4.933 5.109 5.368 5.551 5.715 5.928 6.145 6.358 6.566 6.772 7.028 7.259 7.496 7.8 8.071 8.319 8.619 8.933 9.213 9.519 9.857 10.221 10.602 11.017 11.469 11.892 12.356 12.919 13.528 14.068 14.645 15.182 15.536 15.595 15.435 15.167 14.841 14.472 14.119 13.773 13.446 13.117 12.808 12.524 12.271 12.024 11.788 11.583 11.372 11.174 11.007 10.832 10.623 10.44 10.266 10.098 9.963 9.798 9.61 9.416 9.208 9.063 8.944 8.787 8.669 8.554 8.492 8.356 8.209 8.046 7.965 7.653 7.726 7.628 7.519 7.274 7.137 6.973 6.756 6.511 6.259 5.942 5.261 -4 ,17477 ,KEBNE ,17022180,Wed Dec 22 05:21:27 CET,Wed Dec 22 06:43:12 CET,0.0 1.041 1.393 1.683 1.895 2.077 2.263 2.429 2.728 2.868 3.011 3.048 3.413 3.53 3.767 3.988 4.178 4.269 4.455 4.614 4.83 4.991 5.157 5.385 5.598 5.811 6.033 6.244 6.501 6.754 6.986 7.25 7.478 7.692 7.958 8.247 8.504 8.783 9.099 9.431 9.76 10.114 10.567 11.039 11.51 11.976 12.493 13.018 13.612 14.214 14.643 14.656 14.425 14.126 13.759 13.365 13.057 12.757 12.437 12.105 11.808 11.52 11.225 10.94 10.693 10.471 10.243 10.016 9.806 9.597 9.393 9.233 9.053 8.854 8.697 8.53 8.351 8.165 7.977 7.846 7.719 7.527 7.388 7.249 7.174 7.012 6.854 6.698 6.605 6.258 6.243 6.106 5.972 5.688 5.524 5.345 5.134 4.872 4.568 4.197 3.267 -5 ,5624 ,KEBNE ,17022181,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:45:52 CET,0.0 1.539 1.974 2.356 2.685 2.943 3.154 3.37 3.741 3.912 4.077 4.13 4.504 4.623 4.872 5.117 5.335 5.446 5.682 5.904 6.185 6.341 6.492 6.714 6.908 7.111 7.324 7.522 7.76 7.989 8.214 8.496 8.768 9.005 9.286 9.621 9.92 10.231 10.586 10.972 11.332 11.723 12.202 12.692 13.257 13.902 14.562 15.21 15.894 16.442 16.853 16.949 16.789 16.512 16.204 15.875 15.552 15.194 14.85 14.504 14.189 13.901 13.637 13.368 13.101 12.862 12.601 12.356 12.144 11.938 11.706 11.502 11.288 11.055 10.876 10.689 10.505 10.309 10.106 9.973 9.827 9.586 9.411 9.234 9.14 8.922 8.695 8.472 8.349 7.995 8.021 7.904 7.776 7.496 7.335 7.158 6.975 6.77 6.502 6.122 5.129 -6 ,260 ,KEBNE ,17022182,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:46:26 CET,0.0 1.702 2.223 2.563 2.853 3.073 3.253 3.426 3.733 3.873 3.995 3.995 4.355 4.487 4.724 4.933 5.136 5.226 5.386 5.541 5.783 5.954 6.122 6.343 6.549 6.777 6.997 7.182 7.385 7.564 7.73 7.939 8.138 8.33 8.556 8.8 9.057 9.356 9.668 9.998 10.321 10.654 11.007 11.332 11.74 12.248 12.77 13.251 13.77 14.267 14.575 14.476 14.202 13.807 13.368 12.945 12.563 12.172 11.792 11.403 11.078 10.79 10.506 10.242 10.006 9.786 9.537 9.294 9.096 8.888 8.664 8.493 8.307 8.095 7.923 7.754 7.586 7.397 7.201 7.079 6.952 6.755 6.627 6.483 6.396 6.196 6.003 5.803 5.683 5.321 5.304 5.167 5.028 4.725 4.545 4.36 4.161 3.916 3.636 3.272 2.173 -7 ,815 ,KEBNE ,17022183,Wed Dec 22 05:21:23 CET,Wed Dec 22 06:45:42 CET,0.0 1.637 2.05 2.338 2.57 2.793 2.994 3.184 3.544 3.693 3.833 3.851 4.201 4.323 4.564 4.793 5.024 5.142 5.354 5.542 5.804 5.97 6.131 6.371 6.591 6.797 7.001 7.202 7.472 7.724 7.956 8.231 8.495 8.752 9.052 9.366 9.639 9.953 10.3 10.645 11.045 11.508 12.01 12.484 12.996 13.569 14.24 14.944 15.632 16.367 17.093 17.381 17.274 17.041 16.765 16.46 16.158 15.853 15.575 15.276 15.003 14.772 14.55 14.314 14.058 13.822 13.587 13.355 13.132 12.896 12.664 12.482 12.296 12.103 11.95 11.785 11.613 11.436 11.255 11.13 11.001 10.806 10.664 10.507 10.427 10.272 10.11 9.936 9.84 9.499 9.519 9.404 9.271 8.944 8.772 8.611 8.436 8.242 7.988 7.643 6.761 -8 ,2209 ,KEBNE ,17022184,Wed Dec 22 05:21:24 CET,Wed Dec 22 06:45:38 CET,0.0 1.424 1.843 2.173 2.476 2.717 2.941 3.154 3.519 3.683 3.841 3.861 4.233 4.366 4.598 4.799 5.012 5.118 5.317 5.519 5.809 5.989 6.154 6.395 6.641 6.865 7.068 7.256 7.507 7.763 8.01 8.303 8.586 8.829 9.095 9.392 9.674 9.986 10.313 10.677 11.086 11.557 12.101 12.631 13.178 13.748 14.34 14.935 15.584 16.163 16.607 16.721 16.534 16.238 15.905 15.557 15.239 14.889 14.563 14.242 13.961 13.709 13.458 13.212 12.968 12.745 12.506 12.275 12.076 11.873 11.674 11.511 11.334 11.153 11.004 10.854 10.711 10.56 10.397 10.278 10.153 9.939 9.79 9.65 9.576 9.41 9.224 9.008 8.892 8.539 8.541 8.424 8.3 8.001 7.83 7.651 7.489 7.344 7.166 6.968 6.477 -9 ,31823 ,KEBNE ,17022185,Wed Dec 22 05:21:24 CET,Wed Dec 22 06:47:18 CET,0.0 0.475 0.764 1.009 1.202 1.409 1.623 1.797 2.1 2.246 2.379 2.393 2.749 2.855 3.068 3.265 3.435 3.528 3.734 3.948 4.245 4.401 4.539 4.734 4.916 5.092 5.272 5.457 5.704 5.941 6.156 6.401 6.636 6.864 7.128 7.417 7.698 8.012 8.35 8.71 9.09 9.515 9.965 10.375 10.862 11.356 11.845 12.36 12.926 13.452 13.787 13.829 13.662 13.337 12.974 12.606 12.226 11.876 11.596 11.276 10.966 10.697 10.44 10.189 9.916 9.63 9.341 9.123 8.962 8.789 8.602 8.435 8.25 8.063 7.914 7.764 7.62 7.455 7.265 7.12 6.982 6.793 6.661 6.52 6.441 6.275 6.098 5.909 5.815 5.487 5.549 5.445 5.322 5.047 4.896 4.743 4.581 4.401 4.164 3.791 2.898 -10 ,5831 ,KEBNE ,17022186,Wed Dec 22 05:21:24 CET,Wed Dec 22 06:46:02 CET,0.0 1.368 1.781 2.117 2.417 2.678 2.922 3.145 3.527 3.71 3.898 3.984 4.374 4.516 4.763 4.965 5.186 5.295 5.47 5.639 5.883 6.046 6.204 6.434 6.665 6.885 7.097 7.3 7.595 7.883 8.16 8.507 8.825 9.128 9.448 9.762 10.071 10.418 10.785 11.164 11.531 11.921 12.393 12.894 13.469 14.03 14.638 15.275 15.888 16.458 16.813 16.812 16.653 16.387 16.096 15.796 15.509 15.221 14.913 14.591 14.319 14.061 13.802 13.552 13.321 13.125 12.915 12.704 12.511 12.299 12.085 11.917 11.735 11.538 11.391 11.234 11.06 10.864 10.634 10.472 10.308 10.076 9.928 9.762 9.68 9.512 9.324 9.136 9.039 8.698 8.718 8.611 8.492 8.238 8.096 7.949 7.792 7.602 7.348 6.997 6.191 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_45.txt deleted file mode 100644 index fc56c759..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_45.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27800 ,KEBNE ,17022187,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:31 CET,0.0 2.481 3.028 3.385 3.716 4.017 4.271 4.509 4.922 5.107 5.272 5.292 5.661 5.794 6.044 6.273 6.484 6.587 6.789 6.975 7.212 7.346 7.486 7.692 7.877 8.059 8.257 8.437 8.641 8.837 9.022 9.253 9.464 9.647 9.863 10.107 10.317 10.532 10.78 11.057 11.357 11.683 12.022 12.31 12.606 12.94 13.308 13.583 13.74 13.811 13.6 12.978 12.326 11.742 11.216 10.708 10.206 9.718 9.299 8.874 8.49 8.158 7.842 7.543 7.282 7.03 6.755 6.517 6.323 6.115 5.88 5.694 5.511 5.315 5.147 4.976 4.811 4.642 4.464 4.335 4.185 3.917 3.734 3.562 3.469 3.283 3.116 2.938 2.849 2.508 2.533 2.416 2.289 2.0 1.841 1.687 1.532 1.293 0.963 0.488 -0.752 -2 ,16833 ,KEBNE ,17022188,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:51:03 CET,0.0 1.01 1.416 1.794 2.084 2.272 2.457 2.632 2.89 3.01 3.127 3.103 3.456 3.561 3.742 3.929 4.108 4.186 4.328 4.467 4.667 4.789 4.913 5.093 5.268 5.421 5.553 5.684 5.868 6.052 6.233 6.449 6.657 6.862 7.079 7.301 7.523 7.771 8.015 8.241 8.484 8.774 9.08 9.363 9.684 10.026 10.363 10.67 10.966 11.138 10.976 10.452 9.847 9.233 8.677 8.171 7.69 7.221 6.795 6.375 6.029 5.702 5.367 5.062 4.794 4.53 4.255 4.021 3.815 3.6 3.37 3.169 2.948 2.727 2.554 2.365 2.175 1.969 1.739 1.58 1.412 1.152 0.992 0.841 0.764 0.604 0.438 0.259 0.168 -0.174 -0.128 -0.242 -0.368 -0.663 -0.823 -0.983 -1.163 -1.368 -1.573 -1.835 -2.446 -3 ,2799 ,KEBNE ,17022189,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:52:26 CET,0.0 1.393 1.854 2.228 2.527 2.754 2.942 3.115 3.434 3.576 3.734 3.786 4.149 4.275 4.493 4.69 4.872 4.967 5.164 5.332 5.557 5.718 5.884 6.106 6.32 6.533 6.721 6.88 7.07 7.268 7.458 7.663 7.868 8.072 8.291 8.528 8.756 9.002 9.265 9.541 9.798 10.06 10.353 10.641 10.979 11.314 11.638 11.953 12.264 12.477 12.324 11.751 11.154 10.584 10.026 9.476 9.003 8.58 8.209 7.842 7.503 7.187 6.88 6.589 6.32 6.093 5.854 5.62 5.409 5.202 5.002 4.833 4.651 4.451 4.291 4.12 3.94 3.755 3.569 3.446 3.322 3.119 2.982 2.851 2.779 2.608 2.426 2.241 2.138 1.788 1.799 1.692 1.591 1.345 1.205 1.061 0.907 0.741 0.547 0.291 -0.436 -4 ,27167 ,KEBNE ,17022190,Wed Dec 22 05:26:37 CET,Wed Dec 22 06:51:50 CET,0.0 1.936 2.372 2.707 2.994 3.28 3.496 3.656 3.936 4.074 4.204 4.198 4.56 4.673 4.865 5.04 5.227 5.312 5.455 5.612 5.841 5.981 6.11 6.293 6.468 6.619 6.762 6.914 7.112 7.291 7.465 7.68 7.891 8.088 8.309 8.553 8.76 8.987 9.24 9.483 9.697 9.933 10.21 10.484 10.794 11.106 11.411 11.683 11.916 11.963 11.69 11.079 10.447 9.864 9.289 8.727 8.207 7.696 7.244 6.762 6.316 5.914 5.52 5.133 4.784 4.469 4.139 3.887 3.693 3.489 3.269 3.084 2.901 2.708 2.558 2.415 2.276 2.114 1.938 1.825 1.712 1.522 1.388 1.26 1.196 1.066 0.927 0.776 0.697 0.371 0.424 0.328 0.235 0.024 -0.091 -0.233 -0.372 -0.522 -0.703 -0.919 -1.36 -5 ,32460 ,KEBNE ,17022191,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:52 CET,0.0 2.061 2.481 2.758 3.047 3.335 3.59 3.802 4.164 4.33 4.473 4.484 4.835 4.953 5.191 5.4 5.603 5.71 5.907 6.071 6.293 6.438 6.576 6.754 6.926 7.094 7.257 7.411 7.599 7.8 8.026 8.305 8.562 8.799 9.053 9.31 9.538 9.779 10.031 10.294 10.562 10.834 11.128 11.403 11.672 11.932 12.183 12.403 12.594 12.63 12.356 11.852 11.332 10.798 10.282 9.764 9.237 8.728 8.279 7.813 7.39 6.978 6.565 6.2 5.881 5.578 5.25 4.948 4.689 4.425 4.154 3.936 3.707 3.485 3.318 3.128 2.917 2.697 2.482 2.341 2.192 1.961 1.795 1.605 1.508 1.311 1.107 0.901 0.788 0.413 0.394 0.254 0.103 -0.24 -0.426 -0.617 -0.839 -1.116 -1.432 -1.724 -2.394 -6 ,14477 ,KEBNE ,17022192,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:07 CET,0.0 1.917 2.294 2.608 2.832 3.052 3.269 3.447 3.727 3.853 3.97 3.979 4.333 4.445 4.664 4.883 5.067 5.141 5.293 5.439 5.667 5.826 5.978 6.186 6.392 6.601 6.798 6.982 7.204 7.404 7.595 7.835 8.07 8.293 8.545 8.806 9.042 9.302 9.586 9.891 10.18 10.478 10.805 11.112 11.411 11.659 11.953 12.299 12.586 12.762 12.68 12.187 11.569 10.99 10.456 9.903 9.424 9.009 8.615 8.213 7.885 7.581 7.282 6.993 6.729 6.493 6.247 6.024 5.835 5.64 5.429 5.253 5.071 4.856 4.681 4.514 4.338 4.153 3.968 3.843 3.709 3.478 3.301 3.125 3.044 2.873 2.688 2.501 2.402 2.049 2.067 1.955 1.833 1.537 1.371 1.188 0.976 0.727 0.448 0.098 -1.172 -7 ,17543 ,KEBNE ,17022193,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:37 CET,0.0 1.751 2.218 2.571 2.826 3.036 3.23 3.408 3.739 3.876 4.001 3.999 4.342 4.457 4.699 4.916 5.101 5.18 5.352 5.547 5.797 5.944 6.094 6.31 6.51 6.696 6.875 7.055 7.268 7.451 7.624 7.823 8.02 8.22 8.451 8.708 8.952 9.216 9.504 9.831 10.196 10.587 10.984 11.291 11.571 11.859 12.136 12.415 12.665 12.837 12.707 12.133 11.481 10.823 10.243 9.732 9.267 8.813 8.412 8.019 7.662 7.321 6.995 6.686 6.393 6.135 5.869 5.626 5.427 5.228 5.018 4.837 4.638 4.432 4.26 4.07 3.894 3.72 3.529 3.397 3.267 3.053 2.902 2.735 2.641 2.451 2.258 2.066 1.962 1.593 1.579 1.45 1.298 0.918 0.717 0.512 0.283 0.031 -0.212 -0.514 -1.198 -8 ,9125 ,KEBNE ,17022194,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:18 CET,0.0 1.424 1.874 2.194 2.47 2.719 2.954 3.162 3.494 3.644 3.796 3.853 4.245 4.382 4.637 4.866 5.071 5.166 5.346 5.524 5.787 5.956 6.119 6.344 6.531 6.707 6.892 7.076 7.313 7.521 7.706 7.924 8.136 8.329 8.538 8.77 8.993 9.247 9.515 9.778 10.031 10.281 10.565 10.863 11.202 11.569 11.978 12.337 12.554 12.584 12.35 11.8 11.173 10.552 9.981 9.413 8.923 8.515 8.162 7.791 7.46 7.144 6.833 6.535 6.258 6.0 5.729 5.495 5.287 5.07 4.858 4.682 4.479 4.248 4.074 3.901 3.718 3.53 3.334 3.198 3.06 2.852 2.702 2.549 2.469 2.264 2.037 1.807 1.685 1.325 1.351 1.248 1.132 0.862 0.713 0.552 0.38 0.186 -0.052 -0.365 -1.18 -9 ,21451 ,KEBNE ,17022195,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:52:15 CET,0.0 1.337 1.861 2.233 2.518 2.768 2.998 3.199 3.535 3.664 3.79 3.777 4.105 4.208 4.435 4.648 4.835 4.925 5.094 5.258 5.498 5.647 5.794 6.001 6.175 6.349 6.526 6.686 6.881 7.052 7.223 7.437 7.635 7.835 8.073 8.32 8.555 8.817 9.092 9.377 9.666 9.982 10.339 10.675 11.042 11.418 11.765 12.063 12.363 12.593 12.501 12.065 11.564 10.998 10.447 9.933 9.469 9.046 8.675 8.284 7.936 7.602 7.296 7.022 6.753 6.485 6.174 5.877 5.627 5.389 5.147 4.941 4.723 4.502 4.33 4.132 3.925 3.715 3.5 3.361 3.22 2.985 2.806 2.614 2.518 2.315 2.109 1.893 1.769 1.392 1.378 1.257 1.118 0.799 0.633 0.449 0.265 0.083 -0.131 -0.427 -1.153 -10 ,7310 ,KEBNE ,17022196,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:51:03 CET,0.0 1.456 1.909 2.228 2.503 2.719 2.902 3.075 3.42 3.58 3.723 3.744 4.091 4.198 4.417 4.635 4.824 4.907 5.069 5.226 5.441 5.578 5.715 5.903 6.084 6.255 6.428 6.606 6.832 7.056 7.268 7.488 7.663 7.82 8.047 8.309 8.566 8.884 9.168 9.44 9.728 10.013 10.304 10.573 10.851 11.149 11.516 11.883 12.176 12.317 12.114 11.554 10.913 10.274 9.729 9.229 8.747 8.28 7.874 7.488 7.168 6.881 6.604 6.339 6.089 5.857 5.621 5.398 5.196 4.974 4.737 4.544 4.344 4.137 3.965 3.773 3.559 3.342 3.132 2.982 2.831 2.607 2.436 2.255 2.162 1.956 1.736 1.519 1.414 1.059 1.04 0.904 0.763 0.453 0.281 0.087 -0.113 -0.338 -0.638 -0.996 -1.817 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_48.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_48.txt deleted file mode 100644 index ca95a4b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_28_48.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16021 ,KEBNE ,17022197,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:08 CET,0.0 1.631 2.05 2.377 2.651 2.896 3.102 3.278 3.596 3.761 3.914 3.959 4.344 4.472 4.707 4.923 5.136 5.234 5.422 5.611 5.868 6.023 6.173 6.39 6.602 6.819 7.03 7.239 7.501 7.735 7.963 8.235 8.48 8.712 8.973 9.244 9.513 9.81 10.113 10.429 10.753 11.129 11.59 12.018 12.46 12.915 13.45 14.026 14.664 15.32 15.884 16.072 15.932 15.669 15.355 14.964 14.587 14.263 13.979 13.63 13.305 13.02 12.734 12.468 12.215 11.978 11.716 11.47 11.256 11.041 10.819 10.626 10.424 10.229 10.084 9.918 9.74 9.561 9.384 9.258 9.119 8.907 8.757 8.589 8.51 8.353 8.184 8.003 7.907 7.568 7.577 7.451 7.323 7.052 6.883 6.69 6.51 6.299 6.001 5.674 4.818 -2 ,3724 ,KEBNE ,17022198,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:09 CET,0.0 2.347 2.836 3.233 3.525 3.77 3.995 4.218 4.629 4.79 4.934 4.96 5.333 5.467 5.702 5.915 6.128 6.226 6.413 6.603 6.869 7.032 7.197 7.444 7.671 7.881 8.081 8.264 8.503 8.735 8.947 9.202 9.442 9.669 9.921 10.212 10.513 10.824 11.143 11.468 11.812 12.206 12.636 13.051 13.527 14.064 14.675 15.291 15.946 16.659 17.32 17.613 17.571 17.386 17.158 16.909 16.651 16.391 16.134 15.883 15.662 15.424 15.183 14.959 14.75 14.556 14.341 14.147 13.978 13.789 13.593 13.435 13.27 13.098 12.956 12.805 12.654 12.497 12.325 12.208 12.087 11.894 11.763 11.625 11.556 11.406 11.228 11.023 10.915 10.581 10.603 10.476 10.343 10.055 9.891 9.711 9.533 9.312 9.001 8.619 7.593 -3 ,9915 ,KEBNE ,17022199,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:26 CET,0.0 1.486 2.021 2.345 2.623 2.867 3.086 3.265 3.567 3.714 3.852 3.865 4.216 4.321 4.534 4.744 4.934 5.023 5.193 5.372 5.655 5.83 5.995 6.209 6.415 6.625 6.822 7.011 7.251 7.476 7.7 7.968 8.214 8.447 8.71 9.013 9.314 9.628 9.957 10.309 10.655 11.031 11.468 11.881 12.322 12.805 13.365 13.923 14.469 15.027 15.597 15.763 15.604 15.361 15.038 14.645 14.227 13.868 13.611 13.349 13.11 12.898 12.689 12.48 12.256 12.013 11.743 11.524 11.349 11.137 10.899 10.691 10.468 10.24 10.064 9.889 9.707 9.519 9.328 9.203 9.067 8.839 8.674 8.495 8.409 8.231 8.01 7.777 7.665 7.302 7.271 7.129 6.979 6.669 6.488 6.263 6.047 5.836 5.566 5.221 4.39 -4 ,26566 ,KEBNE ,17022200,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:19 CET,0.0 1.55 1.97 2.263 2.492 2.693 2.897 3.087 3.394 3.528 3.668 3.709 4.085 4.21 4.451 4.685 4.894 4.992 5.184 5.359 5.595 5.761 5.939 6.196 6.429 6.636 6.835 7.038 7.301 7.547 7.784 8.053 8.302 8.547 8.832 9.136 9.428 9.765 10.126 10.491 10.861 11.26 11.71 12.193 12.754 13.332 13.959 14.604 15.279 16.036 16.808 17.007 16.753 16.505 16.255 15.982 15.705 15.426 15.167 14.892 14.646 14.413 14.178 13.949 13.731 13.512 13.268 13.038 12.844 12.656 12.448 12.27 12.089 11.892 11.727 11.548 11.359 11.158 10.943 10.794 10.644 10.395 10.215 10.02 9.917 9.712 9.492 9.242 9.114 8.741 8.707 8.558 8.395 8.026 7.814 7.594 7.343 7.045 6.691 6.218 4.389 -5 ,21893 ,KEBNE ,17022201,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:52:16 CET,0.0 1.882 2.35 2.675 2.917 3.127 3.341 3.559 3.938 4.088 4.236 4.261 4.63 4.751 4.968 5.184 5.392 5.49 5.682 5.857 6.083 6.232 6.38 6.594 6.805 7.014 7.217 7.408 7.65 7.88 8.093 8.353 8.618 8.872 9.156 9.463 9.751 10.069 10.411 10.771 11.136 11.535 11.983 12.421 12.911 13.447 14.064 14.727 15.468 16.212 16.834 17.066 16.986 16.823 16.531 16.124 15.789 15.466 15.133 14.82 14.547 14.272 14.003 13.754 13.516 13.279 13.013 12.777 12.569 12.344 12.115 11.921 11.701 11.469 11.293 11.13 10.967 10.788 10.574 10.425 10.278 10.031 9.862 9.696 9.613 9.438 9.242 9.02 8.907 8.555 8.561 8.442 8.326 8.09 7.958 7.811 7.644 7.447 7.221 6.923 5.711 -6 ,28487 ,KEBNE ,17022202,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:51:09 CET,0.0 2.941 3.449 3.792 4.091 4.347 4.557 4.748 5.095 5.255 5.411 5.47 5.863 6.011 6.273 6.518 6.755 6.868 7.088 7.294 7.577 7.741 7.898 8.15 8.396 8.624 8.844 9.056 9.327 9.584 9.83 10.111 10.371 10.629 10.929 11.261 11.577 11.928 12.288 12.638 13.007 13.419 13.88 14.342 14.848 15.391 15.987 16.573 17.206 17.85 18.275 18.298 18.142 17.86 17.534 17.169 16.791 16.438 16.141 15.819 15.488 15.191 14.936 14.694 14.47 14.26 14.005 13.763 13.569 13.373 13.155 12.963 12.771 12.577 12.402 12.209 12.036 11.864 11.681 11.554 11.41 11.171 11.01 10.854 10.775 10.614 10.432 10.226 10.118 9.768 9.761 9.633 9.499 9.196 9.025 8.857 8.649 8.37 8.065 7.683 5.927 -7 ,4921 ,KEBNE ,17022203,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:49:27 CET,0.0 1.403 1.899 2.263 2.572 2.828 3.042 3.243 3.599 3.777 3.941 3.98 4.367 4.493 4.726 4.946 5.164 5.277 5.503 5.713 6.011 6.192 6.369 6.644 6.893 7.12 7.347 7.568 7.835 8.077 8.305 8.577 8.844 9.089 9.38 9.729 10.042 10.364 10.72 11.1 11.479 11.903 12.39 12.867 13.393 13.92 14.493 15.132 15.831 16.536 17.214 17.498 17.406 17.159 16.885 16.546 16.193 15.844 15.515 15.169 14.853 14.581 14.286 13.953 13.631 13.335 13.013 12.727 12.502 12.289 12.068 11.873 11.667 11.459 11.299 11.139 10.967 10.787 10.602 10.463 10.32 10.113 9.958 9.781 9.691 9.492 9.287 9.088 8.979 8.616 8.595 8.468 8.351 8.109 7.959 7.768 7.558 7.318 7.044 6.681 5.487 -8 ,23248 ,KEBNE ,17022204,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:17 CET,0.0 1.537 1.987 2.333 2.619 2.858 3.094 3.299 3.647 3.816 3.975 4.007 4.374 4.502 4.747 4.991 5.25 5.37 5.583 5.784 6.067 6.254 6.431 6.675 6.897 7.101 7.306 7.509 7.754 7.99 8.219 8.479 8.729 8.976 9.256 9.563 9.849 10.169 10.517 10.867 11.236 11.677 12.186 12.667 13.207 13.772 14.371 14.996 15.674 16.332 16.879 17.089 17.017 16.807 16.545 16.251 15.932 15.607 15.314 14.962 14.635 14.352 14.065 13.775 13.499 13.24 12.962 12.709 12.493 12.26 12.007 11.786 11.554 11.313 11.12 10.93 10.738 10.535 10.336 10.213 10.085 9.873 9.722 9.556 9.469 9.291 9.107 8.925 8.831 8.493 8.496 8.367 8.243 7.971 7.815 7.663 7.505 7.321 7.109 6.804 5.969 -9 ,12459 ,KEBNE ,17022205,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:50:17 CET,0.0 1.262 1.669 1.991 2.261 2.5 2.72 2.907 3.258 3.434 3.599 3.64 4.008 4.132 4.392 4.635 4.861 4.965 5.159 5.338 5.588 5.752 5.909 6.138 6.366 6.6 6.82 7.013 7.264 7.505 7.728 8.005 8.266 8.518 8.835 9.185 9.513 9.878 10.251 10.633 11.037 11.48 11.967 12.434 12.969 13.553 14.171 14.787 15.433 16.086 16.62 16.822 16.774 16.581 16.288 15.922 15.545 15.183 14.865 14.563 14.279 13.994 13.738 13.487 13.244 13.028 12.79 12.571 12.387 12.192 11.978 11.789 11.588 11.375 11.203 11.021 10.828 10.625 10.414 10.269 10.129 9.931 9.788 9.634 9.546 9.354 9.153 8.938 8.822 8.459 8.482 8.357 8.226 7.957 7.811 7.641 7.425 7.181 6.917 6.613 5.583 -10 ,10875 ,KEBNE ,17022206,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:51:14 CET,0.0 1.204 1.621 1.938 2.22 2.465 2.673 2.849 3.172 3.32 3.471 3.512 3.888 4.011 4.246 4.471 4.685 4.786 4.981 5.17 5.445 5.621 5.785 6.021 6.246 6.468 6.689 6.903 7.171 7.431 7.67 7.944 8.197 8.433 8.707 9.024 9.323 9.64 9.996 10.369 10.749 11.166 11.64 12.106 12.595 13.086 13.637 14.21 14.822 15.4 15.88 16.035 15.83 15.495 15.128 14.736 14.395 14.061 13.742 13.428 13.173 12.94 12.695 12.472 12.259 12.038 11.79 11.555 11.343 11.138 10.921 10.728 10.521 10.312 10.175 10.04 9.903 9.771 9.633 9.534 9.437 9.271 9.139 9.007 8.935 8.782 8.619 8.439 8.348 8.019 8.071 7.962 7.847 7.599 7.47 7.307 7.126 6.948 6.744 6.474 5.486 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_29_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_29_42.txt deleted file mode 100644 index 8e9d8e45..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_29_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31609 ,KEBNE ,17022207,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:50:56 CET,0.0 2.08 2.479 2.794 3.024 3.211 3.375 3.516 3.774 3.896 4.009 3.986 4.287 4.369 4.542 4.701 4.835 4.902 5.035 5.155 5.316 5.421 5.533 5.695 5.842 5.968 6.068 6.15 6.25 6.359 6.469 6.597 6.727 6.852 6.978 7.112 7.256 7.4 7.545 7.719 7.868 7.957 8.043 8.147 8.216 8.186 8.065 7.878 7.538 6.767 5.226 3.349 1.739 0.333 -0.928 -2.078 -3.077 -3.94 -4.647 -5.336 -5.911 -6.442 -6.942 -7.406 -7.841 -8.215 -8.623 -9.004 -9.341 -9.707 -10.099 -10.419 -10.742 -11.071 -11.319 -11.586 -11.858 -12.143 -12.464 -12.679 -12.888 -13.209 -13.431 -13.67 -13.801 -14.067 -14.34 -14.625 -14.781 -15.19 -15.323 -15.51 -15.698 -16.077 -16.303 -16.547 -16.81 -17.117 -17.479 -18.052 -20.555 -2 ,16140 ,KEBNE ,17022208,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:50:25 CET,0.0 1.143 1.523 1.838 2.135 2.384 2.594 2.777 3.09 3.22 3.341 3.351 3.683 3.79 3.986 4.166 4.322 4.399 4.547 4.67 4.848 4.972 5.097 5.267 5.424 5.578 5.717 5.843 6.002 6.165 6.328 6.519 6.691 6.834 6.992 7.152 7.298 7.466 7.635 7.796 7.955 8.128 8.315 8.449 8.561 8.667 8.717 8.713 8.589 8.154 7.162 5.797 4.533 3.359 2.356 1.513 0.729 -0.037 -0.692 -1.328 -1.862 -2.345 -2.806 -3.233 -3.646 -4.031 -4.429 -4.797 -5.114 -5.429 -5.749 -6.013 -6.287 -6.568 -6.782 -7.011 -7.257 -7.497 -7.749 -7.929 -8.108 -8.383 -8.584 -8.786 -8.89 -9.117 -9.359 -9.615 -9.741 -10.105 -10.134 -10.276 -10.437 -10.842 -11.061 -11.266 -11.488 -11.734 -12.076 -12.699 -14.676 -3 ,18246 ,KEBNE ,17022209,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:28 CET,0.0 1.577 1.925 2.192 2.408 2.599 2.773 2.942 3.257 3.37 3.463 3.424 3.724 3.805 3.962 4.087 4.197 4.256 4.372 4.471 4.613 4.711 4.802 4.925 5.032 5.136 5.25 5.358 5.486 5.605 5.724 5.859 5.988 6.114 6.239 6.371 6.497 6.625 6.758 6.884 7.002 7.118 7.218 7.298 7.396 7.453 7.444 7.296 6.957 6.396 5.375 4.064 2.855 1.773 0.84 -0.023 -0.8 -1.512 -2.103 -2.689 -3.198 -3.653 -4.101 -4.536 -4.941 -5.317 -5.724 -6.1 -6.435 -6.779 -7.113 -7.382 -7.657 -7.946 -8.174 -8.4 -8.629 -8.874 -9.133 -9.316 -9.508 -9.804 -10.008 -10.223 -10.335 -10.559 -10.78 -11.048 -11.222 -11.649 -11.786 -11.969 -12.142 -12.468 -12.646 -12.867 -13.117 -13.385 -13.728 -14.291 -16.923 -4 ,6903 ,KEBNE ,17022210,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:50:11 CET,0.0 1.356 1.707 2.02 2.273 2.48 2.658 2.818 3.14 3.294 3.454 3.523 3.868 3.974 4.181 4.355 4.526 4.607 4.761 4.931 5.165 5.288 5.396 5.563 5.737 5.897 6.046 6.2 6.407 6.596 6.769 6.979 7.2 7.392 7.584 7.797 7.997 8.188 8.356 8.512 8.606 8.673 8.765 8.846 8.929 8.979 8.945 8.857 8.616 8.098 7.11 5.725 4.47 3.378 2.431 1.588 0.854 0.161 -0.452 -1.063 -1.622 -2.132 -2.594 -3.025 -3.429 -3.793 -4.181 -4.532 -4.827 -5.144 -5.501 -5.795 -6.077 -6.39 -6.638 -6.879 -7.124 -7.395 -7.7 -7.911 -8.124 -8.442 -8.673 -8.93 -9.071 -9.385 -9.718 -10.049 -10.217 -10.638 -10.784 -10.987 -11.205 -11.697 -11.977 -12.298 -12.682 -13.151 -13.731 -14.603 -19.394 -5 ,18292 ,KEBNE ,17022211,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:50:08 CET,0.0 1.359 1.631 1.845 2.062 2.278 2.465 2.631 2.95 3.104 3.241 3.263 3.598 3.702 3.894 4.068 4.231 4.302 4.438 4.573 4.775 4.902 5.014 5.191 5.364 5.521 5.671 5.791 5.945 6.107 6.244 6.406 6.568 6.71 6.868 7.035 7.188 7.338 7.486 7.646 7.798 7.937 8.059 8.151 8.209 8.189 8.108 7.916 7.597 7.103 6.029 4.417 2.93 1.59 0.379 -0.727 -1.66 -2.446 -3.109 -3.789 -4.368 -4.864 -5.337 -5.8 -6.246 -6.652 -7.07 -7.462 -7.796 -8.125 -8.475 -8.759 -9.045 -9.34 -9.579 -9.832 -10.076 -10.326 -10.59 -10.788 -10.995 -11.307 -11.519 -11.727 -11.833 -12.06 -12.291 -12.536 -12.665 -13.029 -13.073 -13.228 -13.391 -13.73 -13.911 -14.128 -14.385 -14.695 -15.045 -15.431 -17.04 -6 ,22654 ,KEBNE ,17022212,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:17 CET,0.0 1.47 1.906 2.193 2.432 2.64 2.816 2.991 3.363 3.525 3.671 3.732 4.076 4.183 4.377 4.566 4.743 4.829 5.001 5.138 5.289 5.382 5.476 5.608 5.732 5.854 5.967 6.074 6.219 6.35 6.463 6.597 6.719 6.839 6.99 7.148 7.286 7.436 7.591 7.74 7.869 8.008 8.157 8.258 8.331 8.361 8.309 8.209 7.975 7.457 6.509 5.25 4.081 3.035 2.093 1.145 0.256 -0.527 -1.163 -1.754 -2.265 -2.725 -3.177 -3.598 -3.966 -4.312 -4.706 -5.062 -5.354 -5.646 -5.94 -6.187 -6.458 -6.743 -6.961 -7.185 -7.417 -7.656 -7.924 -8.123 -8.322 -8.645 -8.874 -9.103 -9.217 -9.446 -9.679 -9.911 -10.032 -10.391 -10.42 -10.562 -10.704 -11.017 -11.183 -11.348 -11.54 -11.769 -12.026 -12.361 -13.935 -7 ,9338 ,KEBNE ,17022213,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:50:32 CET,0.0 1.137 1.564 1.898 2.162 2.385 2.571 2.733 3.025 3.16 3.292 3.316 3.652 3.772 3.985 4.176 4.339 4.415 4.574 4.721 4.926 5.064 5.196 5.392 5.572 5.735 5.887 6.029 6.214 6.386 6.542 6.725 6.906 7.095 7.295 7.472 7.636 7.829 8.021 8.205 8.358 8.49 8.638 8.769 8.904 9.009 9.043 9.04 8.882 8.365 7.318 5.839 4.394 3.105 2.016 1.028 0.157 -0.652 -1.342 -2.008 -2.57 -3.082 -3.558 -4.017 -4.472 -4.861 -5.244 -5.592 -5.879 -6.169 -6.484 -6.748 -7.028 -7.32 -7.535 -7.749 -7.972 -8.213 -8.469 -8.666 -8.877 -9.171 -9.373 -9.587 -9.693 -9.917 -10.155 -10.397 -10.517 -10.87 -10.921 -11.085 -11.264 -11.603 -11.766 -11.963 -12.193 -12.453 -12.75 -13.1 -14.279 -8 ,10762 ,KEBNE ,17022214,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:51:03 CET,0.0 1.648 2.184 2.637 2.988 3.216 3.41 3.585 3.908 4.061 4.192 4.157 4.477 4.564 4.726 4.878 5.01 5.077 5.215 5.343 5.521 5.653 5.788 5.954 6.108 6.258 6.396 6.527 6.713 6.894 7.042 7.206 7.362 7.508 7.67 7.853 8.018 8.185 8.361 8.527 8.7 8.929 9.202 9.402 9.543 9.63 9.694 9.71 9.562 9.159 8.168 6.705 5.469 4.361 3.36 2.383 1.495 0.727 0.035 -0.662 -1.238 -1.774 -2.291 -2.757 -3.171 -3.552 -3.967 -4.331 -4.656 -4.997 -5.346 -5.64 -5.935 -6.247 -6.494 -6.761 -7.04 -7.312 -7.593 -7.796 -8.016 -8.344 -8.567 -8.816 -8.951 -9.212 -9.48 -9.786 -9.947 -10.337 -10.392 -10.543 -10.704 -11.102 -11.319 -11.552 -11.799 -12.068 -12.465 -13.175 -18.344 -9 ,4590 ,KEBNE ,17022215,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:51:35 CET,0.0 1.327 1.707 2.025 2.277 2.48 2.656 2.801 3.042 3.168 3.302 3.351 3.688 3.798 4.003 4.181 4.337 4.418 4.576 4.71 4.912 5.034 5.155 5.347 5.502 5.637 5.771 5.894 6.049 6.197 6.343 6.513 6.661 6.791 6.919 7.06 7.21 7.346 7.458 7.602 7.783 7.96 8.102 8.214 8.324 8.387 8.425 8.318 8.029 7.543 6.443 4.81 3.3 2.023 0.89 -0.095 -0.924 -1.662 -2.321 -3.008 -3.565 -4.04 -4.5 -4.937 -5.37 -5.781 -6.205 -6.594 -6.941 -7.296 -7.648 -7.943 -8.262 -8.578 -8.815 -9.069 -9.333 -9.607 -9.897 -10.094 -10.302 -10.619 -10.832 -11.072 -11.201 -11.444 -11.675 -11.938 -12.095 -12.499 -12.594 -12.753 -12.924 -13.296 -13.475 -13.674 -13.907 -14.172 -14.473 -14.854 -16.14 -10 ,2992 ,KEBNE ,17022216,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:51:40 CET,0.0 1.216 1.564 1.802 1.994 2.159 2.338 2.511 2.814 2.946 3.061 3.064 3.394 3.497 3.693 3.872 4.026 4.107 4.269 4.423 4.616 4.719 4.817 4.954 5.074 5.183 5.305 5.439 5.593 5.727 5.854 6.007 6.124 6.219 6.343 6.484 6.63 6.799 6.973 7.173 7.379 7.568 7.724 7.845 7.958 8.001 7.986 7.868 7.588 6.986 5.756 4.138 2.716 1.494 0.461 -0.502 -1.354 -2.089 -2.729 -3.363 -3.9 -4.38 -4.848 -5.31 -5.746 -6.142 -6.554 -6.911 -7.233 -7.565 -7.907 -8.201 -8.5 -8.804 -9.042 -9.283 -9.527 -9.782 -10.027 -10.195 -10.374 -10.674 -10.887 -11.101 -11.213 -11.436 -11.652 -11.891 -12.017 -12.377 -12.415 -12.552 -12.706 -13.067 -13.278 -13.503 -13.728 -13.983 -14.28 -14.631 -15.768 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_30_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_30_31.txt deleted file mode 100644 index f869a615..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_30_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7685 ,KEBNE ,17022217,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:50:54 CET,0.0 0.359 0.607 0.8 0.945 1.087 1.217 1.333 1.559 1.669 1.779 1.736 2.063 2.15 2.34 2.513 2.685 2.772 2.928 3.076 3.276 3.396 3.514 3.688 3.866 4.035 4.189 4.329 4.515 4.696 4.856 5.061 5.278 5.486 5.698 5.934 6.174 6.422 6.687 6.974 7.283 7.646 8.057 8.46 8.911 9.369 9.865 10.383 10.949 11.492 11.934 12.01 11.824 11.594 11.345 11.105 10.88 10.646 10.431 10.186 9.951 9.734 9.522 9.327 9.147 8.973 8.783 8.6 8.441 8.289 8.137 8.009 7.855 7.697 7.586 7.468 7.339 7.196 7.046 6.949 6.853 6.695 6.58 6.457 6.391 6.266 6.139 6.004 5.935 5.615 5.705 5.623 5.531 5.326 5.217 5.102 4.97 4.828 4.675 4.516 4.058 -2 ,26976 ,KEBNE ,17022218,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:50:54 CET,0.0 0.581 0.841 1.027 1.177 1.299 1.422 1.542 1.754 1.865 1.966 1.905 2.248 2.35 2.524 2.676 2.827 2.9 3.059 3.207 3.399 3.523 3.646 3.826 3.977 4.109 4.249 4.394 4.583 4.758 4.93 5.146 5.347 5.536 5.753 6.0 6.244 6.505 6.776 7.053 7.339 7.664 8.004 8.322 8.711 9.119 9.544 10.006 10.455 10.903 11.3 11.348 11.163 10.914 10.643 10.359 10.1 9.84 9.578 9.309 9.069 8.839 8.606 8.394 8.212 8.042 7.861 7.695 7.555 7.399 7.224 7.085 6.938 6.792 6.693 6.583 6.459 6.333 6.198 6.103 6.009 5.869 5.765 5.662 5.615 5.51 5.386 5.233 5.158 4.855 4.958 4.884 4.806 4.63 4.527 4.406 4.256 4.089 3.914 3.736 3.441 -3 ,27210 ,KEBNE ,17022219,Wed Dec 22 05:25:34 CET,Wed Dec 22 06:47:53 CET,0.0 0.358 0.587 0.778 0.933 1.075 1.213 1.339 1.555 1.645 1.727 1.657 1.991 2.076 2.236 2.379 2.511 2.578 2.71 2.838 3.041 3.165 3.27 3.433 3.601 3.757 3.914 4.068 4.277 4.476 4.642 4.825 5.0 5.18 5.404 5.653 5.885 6.144 6.415 6.69 6.968 7.28 7.665 8.032 8.412 8.834 9.282 9.734 10.246 10.748 11.163 11.271 11.102 10.844 10.536 10.221 9.936 9.664 9.418 9.162 8.911 8.676 8.461 8.246 8.062 7.895 7.701 7.517 7.341 7.162 6.991 6.846 6.693 6.533 6.41 6.284 6.155 6.026 5.886 5.787 5.687 5.52 5.406 5.3 5.238 5.102 4.984 4.86 4.776 4.449 4.509 4.42 4.32 4.113 4.016 3.895 3.769 3.636 3.46 3.268 2.971 -4 ,24091 ,KEBNE ,17022220,Wed Dec 22 05:25:34 CET,Wed Dec 22 06:49:50 CET,0.0 0.595 0.811 0.997 1.174 1.354 1.511 1.65 1.889 2.007 2.117 2.05 2.383 2.47 2.64 2.796 2.959 3.048 3.218 3.375 3.588 3.719 3.845 4.024 4.19 4.35 4.517 4.68 4.878 5.051 5.221 5.434 5.626 5.801 5.996 6.216 6.426 6.638 6.867 7.122 7.402 7.714 8.05 8.389 8.774 9.202 9.687 10.221 10.777 11.285 11.691 11.729 11.53 11.25 10.909 10.556 10.234 9.922 9.643 9.366 9.146 8.941 8.719 8.501 8.299 8.115 7.929 7.775 7.641 7.499 7.341 7.203 7.061 6.91 6.792 6.669 6.544 6.408 6.255 6.156 6.057 5.904 5.796 5.685 5.629 5.51 5.376 5.23 5.152 4.834 4.913 4.827 4.739 4.553 4.459 4.354 4.233 4.105 3.958 3.779 3.454 -5 ,707 ,KEBNE ,17022221,Wed Dec 22 05:25:33 CET,Wed Dec 22 06:49:28 CET,0.0 0.536 0.754 0.945 1.114 1.254 1.389 1.519 1.754 1.858 1.956 1.896 2.238 2.335 2.525 2.703 2.853 2.917 3.045 3.182 3.372 3.486 3.605 3.786 3.952 4.112 4.267 4.404 4.596 4.787 4.973 5.199 5.394 5.583 5.801 6.038 6.267 6.517 6.779 7.059 7.347 7.677 8.053 8.388 8.759 9.155 9.59 10.042 10.522 11.01 11.381 11.378 11.212 10.959 10.633 10.287 9.995 9.746 9.5 9.231 8.986 8.755 8.532 8.335 8.149 7.966 7.791 7.623 7.464 7.31 7.15 7.008 6.861 6.718 6.603 6.465 6.312 6.167 6.029 5.932 5.832 5.672 5.56 5.448 5.389 5.278 5.161 5.035 4.968 4.655 4.755 4.681 4.603 4.426 4.314 4.203 4.098 3.972 3.827 3.614 3.182 -6 ,24909 ,KEBNE ,17022222,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:49:35 CET,0.0 0.892 1.154 1.349 1.509 1.672 1.825 1.96 2.212 2.318 2.429 2.411 2.75 2.847 3.011 3.156 3.302 3.373 3.519 3.656 3.849 3.974 4.093 4.266 4.434 4.596 4.738 4.868 5.042 5.219 5.402 5.628 5.833 6.023 6.238 6.474 6.699 6.966 7.258 7.555 7.857 8.18 8.553 8.92 9.335 9.781 10.254 10.728 11.207 11.657 12.016 12.051 11.888 11.621 11.286 10.944 10.635 10.366 10.104 9.825 9.572 9.316 9.073 8.839 8.625 8.432 8.226 8.037 7.866 7.699 7.541 7.393 7.233 7.086 6.969 6.848 6.728 6.602 6.467 6.368 6.27 6.134 6.031 5.918 5.866 5.763 5.656 5.531 5.453 5.133 5.203 5.128 5.053 4.848 4.75 4.666 4.562 4.45 4.328 4.134 3.726 -7 ,8201 ,KEBNE ,17022223,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:49:57 CET,0.0 0.6 0.865 1.089 1.278 1.446 1.607 1.747 1.98 2.092 2.21 2.192 2.536 2.629 2.812 2.98 3.135 3.214 3.356 3.484 3.682 3.806 3.935 4.124 4.296 4.453 4.598 4.746 4.941 5.135 5.321 5.547 5.768 5.966 6.189 6.444 6.674 6.926 7.202 7.479 7.757 8.049 8.405 8.768 9.172 9.602 10.062 10.539 11.01 11.472 11.839 11.842 11.639 11.399 11.103 10.799 10.53 10.26 9.985 9.682 9.43 9.211 8.995 8.792 8.605 8.425 8.23 8.068 7.935 7.791 7.63 7.492 7.361 7.226 7.111 6.987 6.859 6.731 6.596 6.499 6.404 6.257 6.138 6.012 5.957 5.844 5.715 5.585 5.521 5.212 5.302 5.222 5.134 4.945 4.845 4.735 4.62 4.492 4.302 4.091 3.763 -8 ,23226 ,KEBNE ,17022224,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:26 CET,0.0 0.552 0.851 1.065 1.22 1.339 1.437 1.548 1.776 1.88 1.979 1.926 2.257 2.341 2.495 2.643 2.8 2.879 3.024 3.165 3.37 3.498 3.615 3.785 3.959 4.115 4.255 4.394 4.569 4.737 4.912 5.125 5.327 5.521 5.74 5.972 6.187 6.429 6.697 6.986 7.279 7.598 7.961 8.321 8.703 9.085 9.522 10.012 10.511 10.955 11.311 11.337 11.154 10.938 10.669 10.381 10.112 9.84 9.571 9.276 9.024 8.803 8.559 8.341 8.155 7.973 7.774 7.592 7.437 7.277 7.115 6.984 6.843 6.688 6.571 6.446 6.308 6.161 6.011 5.902 5.777 5.595 5.479 5.35 5.285 5.161 5.026 4.872 4.789 4.47 4.552 4.474 4.385 4.184 4.082 3.967 3.848 3.73 3.596 3.407 3.093 -9 ,9458 ,KEBNE ,17022225,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:27 CET,0.0 0.899 1.099 1.281 1.451 1.579 1.703 1.807 1.989 2.079 2.174 2.13 2.47 2.561 2.732 2.893 3.04 3.112 3.254 3.372 3.528 3.635 3.746 3.912 4.076 4.226 4.371 4.511 4.691 4.855 5.011 5.215 5.413 5.591 5.811 6.055 6.278 6.517 6.768 7.03 7.287 7.581 7.938 8.277 8.647 9.043 9.45 9.911 10.414 10.889 11.244 11.244 11.047 10.78 10.524 10.258 9.974 9.706 9.459 9.188 8.941 8.722 8.505 8.298 8.106 7.924 7.735 7.566 7.415 7.248 7.074 6.924 6.781 6.639 6.518 6.384 6.255 6.13 5.981 5.874 5.759 5.591 5.496 5.386 5.325 5.2 5.056 4.901 4.824 4.509 4.6 4.52 4.44 4.27 4.158 4.037 3.907 3.772 3.617 3.439 2.844 -10 ,12092 ,KEBNE ,17022226,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:50:44 CET,0.0 0.453 0.66 0.835 1.012 1.161 1.29 1.414 1.648 1.752 1.847 1.799 2.135 2.227 2.401 2.565 2.717 2.79 2.931 3.072 3.281 3.418 3.547 3.725 3.906 4.084 4.247 4.393 4.584 4.777 4.962 5.184 5.398 5.59 5.81 6.061 6.304 6.546 6.794 7.072 7.37 7.703 8.08 8.42 8.797 9.246 9.736 10.227 10.718 11.263 11.759 11.816 11.606 11.299 10.969 10.648 10.317 9.988 9.717 9.435 9.166 8.935 8.723 8.514 8.319 8.142 7.955 7.776 7.622 7.464 7.296 7.148 6.987 6.835 6.718 6.589 6.449 6.311 6.176 6.089 6.002 5.848 5.734 5.619 5.567 5.451 5.314 5.165 5.092 4.784 4.86 4.773 4.687 4.505 4.412 4.328 4.234 4.114 3.984 3.847 3.602 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_30_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_30_32.txt deleted file mode 100644 index d6c5c321..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_30_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,267 ,KEBNE ,17022227,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:50:02 CET,0.0 0.532 0.795 0.993 1.158 1.316 1.475 1.613 1.841 1.946 2.046 1.998 2.341 2.433 2.599 2.771 2.938 3.014 3.161 3.302 3.509 3.64 3.759 3.933 4.097 4.238 4.386 4.533 4.712 4.892 5.065 5.254 5.444 5.639 5.842 6.049 6.256 6.477 6.707 6.972 7.237 7.51 7.8 8.048 8.347 8.692 9.059 9.427 9.773 10.046 10.112 9.846 9.441 9.003 8.576 8.169 7.775 7.396 7.085 6.757 6.461 6.195 5.942 5.708 5.477 5.257 5.018 4.8 4.622 4.443 4.242 4.065 3.894 3.731 3.607 3.479 3.334 3.165 2.983 2.86 2.724 2.522 2.394 2.244 2.17 2.02 1.85 1.69 1.609 1.28 1.315 1.207 1.102 0.885 0.764 0.631 0.476 0.277 0.017 -0.266 -0.756 -2 ,4187 ,KEBNE ,17022228,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:49:35 CET,0.0 0.814 1.112 1.32 1.483 1.633 1.773 1.888 2.096 2.195 2.283 2.214 2.539 2.618 2.754 2.879 3.006 3.066 3.183 3.301 3.468 3.562 3.647 3.79 3.947 4.096 4.237 4.385 4.572 4.742 4.911 5.099 5.267 5.43 5.613 5.814 6.01 6.215 6.44 6.684 6.915 7.17 7.489 7.805 8.115 8.411 8.74 9.06 9.318 9.486 9.522 9.266 8.828 8.365 7.916 7.481 7.114 6.779 6.462 6.121 5.815 5.534 5.254 4.986 4.739 4.519 4.294 4.096 3.921 3.74 3.552 3.384 3.207 3.023 2.875 2.721 2.554 2.386 2.217 2.101 1.975 1.774 1.64 1.498 1.423 1.279 1.105 0.924 0.85 0.513 0.555 0.454 0.347 0.133 -0.011 -0.197 -0.406 -0.598 -0.79 -1.102 -2.334 -3 ,13450 ,KEBNE ,17022229,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:51:47 CET,0.0 0.633 0.92 1.132 1.309 1.459 1.599 1.727 1.963 2.071 2.184 2.16 2.503 2.588 2.745 2.914 3.074 3.143 3.272 3.397 3.563 3.669 3.782 3.939 4.085 4.23 4.367 4.503 4.675 4.817 4.955 5.132 5.31 5.483 5.658 5.869 6.088 6.306 6.528 6.749 6.979 7.227 7.497 7.759 8.056 8.358 8.674 9.009 9.326 9.539 9.516 9.211 8.805 8.355 7.928 7.504 7.123 6.785 6.47 6.136 5.828 5.555 5.295 5.039 4.784 4.536 4.278 4.054 3.859 3.646 3.41 3.209 3.027 2.853 2.713 2.56 2.389 2.211 2.027 1.899 1.771 1.578 1.434 1.267 1.181 1.011 0.847 0.675 0.583 0.243 0.274 0.147 0.017 -0.245 -0.382 -0.532 -0.708 -0.919 -1.179 -1.498 -2.451 -4 ,15222 ,KEBNE ,17022230,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:03 CET,0.0 0.854 1.121 1.328 1.479 1.595 1.701 1.812 2.034 2.14 2.248 2.216 2.551 2.635 2.796 2.939 3.075 3.143 3.269 3.393 3.593 3.719 3.826 3.976 4.116 4.259 4.413 4.56 4.74 4.897 5.037 5.204 5.381 5.581 5.809 6.031 6.229 6.436 6.65 6.893 7.162 7.441 7.747 8.053 8.401 8.775 9.198 9.607 9.968 10.267 10.373 10.12 9.736 9.289 8.829 8.413 8.039 7.672 7.355 7.026 6.716 6.452 6.21 5.96 5.714 5.492 5.261 5.059 4.884 4.694 4.491 4.325 4.143 3.947 3.798 3.648 3.484 3.302 3.116 2.988 2.859 2.658 2.511 2.359 2.278 2.094 1.914 1.735 1.636 1.299 1.358 1.251 1.135 0.894 0.761 0.617 0.443 0.223 -0.054 -0.404 -1.045 -5 ,7881 ,KEBNE ,17022231,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:52:36 CET,0.0 0.852 1.142 1.384 1.6 1.779 1.93 2.084 2.351 2.472 2.586 2.553 2.899 2.991 3.177 3.358 3.52 3.6 3.738 3.853 4.021 4.128 4.235 4.405 4.575 4.732 4.873 5.006 5.174 5.334 5.488 5.676 5.858 6.03 6.222 6.436 6.646 6.877 7.121 7.354 7.582 7.823 8.102 8.414 8.776 9.122 9.453 9.752 10.033 10.31 10.457 10.253 9.844 9.381 8.953 8.554 8.206 7.875 7.547 7.18 6.854 6.573 6.314 6.048 5.794 5.577 5.342 5.113 4.906 4.694 4.489 4.321 4.141 3.962 3.817 3.649 3.477 3.303 3.131 3.014 2.89 2.682 2.532 2.37 2.282 2.117 1.946 1.77 1.679 1.338 1.366 1.243 1.116 0.852 0.71 0.55 0.355 0.131 -0.094 -0.379 -1.799 -6 ,7766 ,KEBNE ,17022232,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:49:42 CET,0.0 1.197 1.546 1.817 2.019 2.203 2.401 2.595 2.929 3.066 3.189 3.181 3.524 3.612 3.776 3.933 4.084 4.155 4.302 4.443 4.638 4.756 4.861 5.02 5.191 5.362 5.527 5.684 5.865 6.031 6.187 6.379 6.567 6.729 6.91 7.132 7.337 7.532 7.739 7.966 8.187 8.422 8.696 8.964 9.285 9.609 9.917 10.213 10.521 10.79 10.837 10.572 10.173 9.712 9.266 8.815 8.395 8.022 7.698 7.361 7.052 6.772 6.515 6.267 6.029 5.802 5.563 5.353 5.169 4.984 4.777 4.61 4.445 4.266 4.126 3.983 3.833 3.667 3.483 3.357 3.223 2.999 2.848 2.694 2.614 2.444 2.261 2.069 1.973 1.627 1.659 1.556 1.446 1.185 1.052 0.913 0.739 0.541 0.314 0.056 -0.829 -7 ,27264 ,KEBNE ,17022233,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:49:56 CET,0.0 0.412 0.697 0.916 1.11 1.281 1.438 1.607 1.923 2.046 2.143 2.072 2.394 2.463 2.583 2.703 2.828 2.888 3.008 3.136 3.324 3.443 3.55 3.702 3.869 4.026 4.155 4.29 4.474 4.632 4.788 4.982 5.163 5.329 5.504 5.687 5.861 6.058 6.274 6.494 6.73 7.017 7.335 7.618 7.901 8.179 8.496 8.805 9.102 9.331 9.383 9.162 8.823 8.408 7.943 7.513 7.138 6.795 6.482 6.141 5.861 5.596 5.337 5.104 4.884 4.688 4.48 4.286 4.109 3.912 3.715 3.56 3.389 3.2 3.056 2.919 2.778 2.623 2.456 2.337 2.221 2.039 1.899 1.762 1.7 1.569 1.42 1.25 1.166 0.831 0.891 0.789 0.692 0.496 0.374 0.233 0.079 -0.097 -0.297 -0.57 -1.089 -8 ,22158 ,KEBNE ,17022234,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:49:47 CET,0.0 0.707 0.952 1.184 1.371 1.522 1.674 1.824 2.089 2.206 2.318 2.27 2.605 2.688 2.848 3.012 3.164 3.231 3.362 3.492 3.685 3.802 3.914 4.064 4.202 4.349 4.485 4.619 4.789 4.938 5.096 5.29 5.462 5.62 5.804 6.013 6.213 6.425 6.635 6.851 7.091 7.359 7.636 7.91 8.229 8.541 8.843 9.104 9.356 9.626 9.656 9.264 8.79 8.276 7.769 7.322 6.936 6.598 6.307 5.975 5.669 5.396 5.122 4.849 4.598 4.358 4.102 3.902 3.728 3.535 3.331 3.158 2.981 2.806 2.674 2.528 2.366 2.207 2.042 1.913 1.767 1.534 1.374 1.211 1.127 0.958 0.789 0.61 0.515 0.173 0.202 0.087 -0.043 -0.323 -0.472 -0.635 -0.82 -1.035 -1.285 -1.587 -2.5 -9 ,21853 ,KEBNE ,17022235,Wed Dec 22 05:25:31 CET,Wed Dec 22 06:51:02 CET,0.0 0.901 1.135 1.314 1.493 1.66 1.816 1.955 2.199 2.316 2.425 2.383 2.712 2.791 2.965 3.156 3.326 3.4 3.54 3.67 3.874 4.003 4.117 4.292 4.462 4.622 4.778 4.925 5.104 5.291 5.47 5.672 5.869 6.053 6.253 6.47 6.688 6.929 7.172 7.409 7.634 7.885 8.184 8.475 8.785 9.093 9.409 9.707 10.0 10.28 10.46 10.283 9.938 9.531 9.147 8.778 8.374 7.984 7.676 7.369 7.094 6.841 6.583 6.335 6.095 5.866 5.635 5.415 5.215 5.023 4.825 4.666 4.498 4.311 4.165 4.015 3.857 3.689 3.501 3.369 3.246 3.043 2.886 2.732 2.66 2.514 2.355 2.173 2.075 1.731 1.767 1.658 1.548 1.292 1.15 1.019 0.86 0.655 0.406 0.084 -1.056 -10 ,14738 ,KEBNE ,17022236,Wed Dec 22 05:25:30 CET,Wed Dec 22 06:50:19 CET,0.0 0.873 1.115 1.294 1.468 1.604 1.733 1.862 2.058 2.152 2.254 2.194 2.532 2.625 2.795 2.943 3.092 3.166 3.3 3.421 3.612 3.747 3.87 4.03 4.172 4.309 4.442 4.577 4.745 4.9 5.055 5.233 5.401 5.559 5.732 5.931 6.136 6.361 6.585 6.823 7.056 7.288 7.558 7.816 8.115 8.459 8.821 9.146 9.453 9.711 9.753 9.436 9.038 8.622 8.193 7.737 7.327 6.953 6.61 6.241 5.932 5.679 5.424 5.146 4.896 4.701 4.486 4.277 4.094 3.907 3.697 3.511 3.318 3.116 2.954 2.79 2.622 2.437 2.248 2.129 2.013 1.823 1.672 1.512 1.431 1.248 1.06 0.865 0.756 0.386 0.403 0.269 0.13 -0.165 -0.326 -0.519 -0.742 -0.963 -1.189 -1.439 -2.215 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_30_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_30_38.txt deleted file mode 100644 index 58930d4b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_30_38.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17349 ,TETRA ,17524390,Wed Nov 24 22:11:56 CET,Thu Nov 25 00:01:02 CET,0.0 2.22 2.748 3.11 3.439 3.717 3.988 4.239 4.678 4.865 5.029 5.075 5.447 5.585 5.834 6.068 6.302 6.409 6.601 6.8 7.098 7.258 7.412 7.638 7.85 8.047 8.234 8.412 8.63 8.842 9.04 9.288 9.518 9.732 10.004 10.293 10.546 10.823 11.108 11.413 11.738 12.068 12.439 12.814 13.199 13.604 14.053 14.511 14.996 15.334 15.451 15.164 14.716 14.322 13.877 13.36 12.905 12.511 12.172 11.81 11.475 11.168 10.868 10.594 10.334 10.096 9.855 9.643 9.448 9.238 9.01 8.811 8.623 8.456 8.324 8.176 8.022 7.843 7.641 7.514 7.39 7.182 7.051 6.929 6.855 6.685 6.51 6.334 6.243 5.893 5.904 5.789 5.678 5.419 5.276 5.133 4.974 4.769 4.523 4.198 2.68 -2 ,12144 ,TETRA ,17524392,Wed Nov 24 22:11:57 CET,Thu Nov 25 00:00:12 CET,0.0 2.397 2.993 3.46 3.833 4.165 4.473 4.746 5.256 5.466 5.621 5.671 6.057 6.195 6.456 6.704 6.937 7.052 7.28 7.505 7.854 8.084 8.291 8.557 8.788 8.992 9.201 9.407 9.658 9.898 10.134 10.408 10.672 10.92 11.213 11.544 11.848 12.193 12.545 12.901 13.262 13.652 14.121 14.567 15.022 15.462 15.933 16.447 16.904 17.205 17.38 17.16 16.749 16.298 15.838 15.405 14.98 14.555 14.186 13.763 13.38 13.066 12.754 12.461 12.21 11.969 11.696 11.456 11.235 11.003 10.776 10.595 10.398 10.18 10.022 9.859 9.689 9.514 9.324 9.197 9.064 8.862 8.726 8.565 8.477 8.294 8.098 7.906 7.807 7.456 7.464 7.337 7.202 6.89 6.7 6.508 6.319 6.093 5.82 5.503 3.668 -3 ,4361 ,TETRA ,17524393,Wed Nov 24 22:11:57 CET,Thu Nov 25 00:05:26 CET,0.0 4.836 5.397 5.801 6.14 6.449 6.731 6.993 7.389 7.552 7.711 7.761 8.137 8.269 8.524 8.76 8.973 9.078 9.281 9.465 9.735 9.911 10.081 10.309 10.529 10.742 10.94 11.154 11.449 11.73 11.991 12.303 12.59 12.864 13.209 13.593 13.93 14.291 14.675 15.05 15.45 15.915 16.419 16.841 17.281 17.746 18.237 18.764 19.273 19.687 19.853 19.581 19.062 18.519 18.072 17.625 17.194 16.766 16.387 16.012 15.692 15.402 15.109 14.828 14.569 14.328 14.058 13.813 13.606 13.377 13.12 12.901 12.677 12.456 12.281 12.081 11.876 11.664 11.45 11.312 11.16 10.896 10.707 10.526 10.431 10.233 10.034 9.813 9.688 9.313 9.283 9.137 8.977 8.655 8.488 8.312 8.118 7.891 7.612 7.266 5.781 -4 ,6795 ,TETRA ,17524395,Wed Nov 24 22:12:02 CET,Wed Nov 24 23:58:03 CET,0.0 3.987 4.624 5.074 5.451 5.796 6.097 6.359 6.804 6.98 7.143 7.209 7.596 7.733 7.984 8.198 8.391 8.496 8.709 8.916 9.216 9.401 9.578 9.824 10.051 10.265 10.451 10.628 10.876 11.118 11.344 11.606 11.858 12.094 12.346 12.653 12.946 13.247 13.577 13.931 14.296 14.673 15.09 15.501 15.959 16.439 16.932 17.408 17.866 18.251 18.409 18.175 17.782 17.271 16.734 16.213 15.759 15.298 14.845 14.378 13.989 13.656 13.324 13.013 12.712 12.411 12.11 11.856 11.621 11.381 11.116 10.886 10.67 10.452 10.28 10.098 9.915 9.723 9.509 9.363 9.222 9.011 8.864 8.709 8.626 8.448 8.252 8.044 7.937 7.577 7.566 7.428 7.286 6.965 6.784 6.598 6.41 6.201 5.932 5.598 4.417 -5 ,2649 ,TETRA ,17524398,Wed Nov 24 22:12:56 CET,Thu Nov 25 00:01:22 CET,0.0 2.885 3.288 3.589 3.863 4.089 4.289 4.482 4.852 5.038 5.211 5.23 5.605 5.739 5.999 6.25 6.477 6.573 6.762 6.94 7.217 7.399 7.564 7.8 8.011 8.203 8.388 8.571 8.804 9.033 9.243 9.476 9.705 9.924 10.184 10.473 10.721 10.975 11.243 11.545 11.865 12.204 12.584 12.933 13.314 13.712 14.158 14.594 14.941 15.161 15.04 14.376 13.631 12.936 12.276 11.656 11.132 10.658 10.222 9.777 9.396 9.042 8.694 8.356 8.046 7.769 7.492 7.238 7.004 6.764 6.518 6.321 6.119 5.901 5.734 5.563 5.377 5.184 4.981 4.842 4.699 4.469 4.293 4.093 3.986 3.777 3.545 3.286 3.159 2.773 2.75 2.609 2.462 2.142 1.951 1.746 1.538 1.31 1.033 0.583 -1.412 -6 ,6343 ,TETRA ,17524400,Wed Nov 24 22:11:58 CET,Wed Nov 24 23:59:29 CET,0.0 3.235 3.731 4.109 4.441 4.785 5.071 5.282 5.685 5.868 6.03 6.082 6.464 6.6 6.867 7.129 7.369 7.483 7.722 7.95 8.244 8.448 8.662 8.972 9.261 9.512 9.759 10.004 10.318 10.616 10.872 11.163 11.437 11.686 11.962 12.259 12.546 12.869 13.247 13.679 14.109 14.556 15.029 15.457 15.904 16.368 16.914 17.484 18.044 18.577 18.855 18.598 18.194 17.754 17.302 16.841 16.386 15.972 15.61 15.244 14.92 14.628 14.355 14.063 13.768 13.495 13.204 12.952 12.743 12.531 12.326 12.158 11.969 11.764 11.614 11.459 11.289 11.095 10.896 10.766 10.63 10.414 10.241 10.072 9.997 9.818 9.618 9.398 9.28 8.922 8.936 8.793 8.623 8.255 8.072 7.878 7.64 7.377 7.061 6.609 5.175 -7 ,21244 ,TETRA ,17524402,Wed Nov 24 22:12:01 CET,Wed Nov 24 23:59:00 CET,0.0 3.037 3.504 3.854 4.143 4.413 4.669 4.899 5.286 5.473 5.65 5.731 6.107 6.224 6.466 6.7 6.913 7.025 7.241 7.443 7.71 7.874 8.031 8.235 8.456 8.689 8.918 9.153 9.425 9.657 9.884 10.135 10.364 10.595 10.861 11.15 11.431 11.725 12.013 12.311 12.632 12.987 13.394 13.792 14.21 14.658 15.182 15.732 16.299 16.749 16.911 16.636 16.177 15.712 15.227 14.741 14.307 13.907 13.561 13.215 12.912 12.605 12.291 11.994 11.716 11.47 11.228 10.997 10.795 10.589 10.354 10.168 9.971 9.765 9.609 9.448 9.281 9.105 8.929 8.799 8.664 8.454 8.29 8.127 8.051 7.896 7.735 7.55 7.447 7.086 7.034 6.892 6.748 6.428 6.258 6.074 5.869 5.617 5.316 4.869 3.819 -8 ,2585 ,TETRA ,17524405,Wed Nov 24 22:11:57 CET,Wed Nov 24 23:58:09 CET,0.0 7.334 8.044 8.56 8.972 9.275 9.525 9.737 10.074 10.245 10.413 10.472 10.864 11.008 11.253 11.467 11.683 11.786 11.985 12.18 12.457 12.633 12.799 13.036 13.26 13.495 13.727 13.95 14.249 14.524 14.772 15.064 15.341 15.592 15.858 16.163 16.457 16.768 17.085 17.409 17.754 18.152 18.584 18.986 19.452 19.927 20.448 20.959 21.448 21.791 21.858 21.59 21.083 20.525 19.965 19.414 18.918 18.477 18.111 17.75 17.444 17.17 16.885 16.583 16.28 16.022 15.77 15.508 15.285 15.075 14.843 14.663 14.465 14.249 14.089 13.931 13.77 13.588 13.398 13.257 13.106 12.895 12.747 12.573 12.482 12.294 12.092 11.86 11.741 11.391 11.403 11.28 11.143 10.843 10.679 10.492 10.291 10.063 9.746 9.294 8.143 -9 ,32320 ,TETRA ,17524408,Wed Nov 24 22:12:00 CET,Wed Nov 24 23:59:34 CET,0.0 5.03 5.76 6.318 6.725 7.036 7.327 7.572 7.967 8.148 8.325 8.426 8.814 8.955 9.235 9.509 9.781 9.913 10.161 10.387 10.697 10.882 11.067 11.345 11.591 11.823 12.065 12.291 12.573 12.862 13.145 13.471 13.769 14.046 14.344 14.658 14.952 15.289 15.647 16.017 16.388 16.799 17.322 17.791 18.279 18.833 19.401 19.95 20.468 20.864 20.996 20.685 20.172 19.565 18.985 18.481 18.034 17.61 17.229 16.834 16.476 16.14 15.819 15.512 15.198 14.911 14.629 14.372 14.142 13.913 13.68 13.501 13.32 13.127 12.974 12.807 12.643 12.489 12.33 12.2 12.052 11.806 11.639 11.472 11.385 11.216 11.043 10.856 10.769 10.426 10.422 10.307 10.186 9.881 9.702 9.521 9.332 9.069 8.734 8.31 5.994 -10 ,17046 ,TETRA ,17524409,Wed Nov 24 22:12:00 CET,Wed Nov 24 23:59:28 CET,0.0 3.563 4.448 5.025 5.433 5.781 6.111 6.418 6.958 7.167 7.371 7.538 7.969 8.128 8.408 8.663 8.905 9.02 9.228 9.422 9.687 9.859 10.025 10.244 10.447 10.655 10.861 11.053 11.311 11.561 11.782 12.05 12.315 12.566 12.848 13.161 13.477 13.821 14.173 14.538 14.903 15.285 15.713 16.144 16.622 17.116 17.633 18.17 18.648 19.0 19.137 18.778 18.284 17.773 17.229 16.731 16.317 15.945 15.589 15.186 14.8 14.453 14.158 13.877 13.576 13.276 12.955 12.683 12.454 12.207 11.939 11.703 11.469 11.235 11.055 10.873 10.684 10.505 10.318 10.183 10.045 9.82 9.66 9.483 9.385 9.194 8.999 8.777 8.657 8.289 8.274 8.133 7.989 7.662 7.468 7.267 7.056 6.851 6.577 6.155 4.685 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_31_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_31_34.txt deleted file mode 100644 index 0a5055fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_31_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4951 ,KEBNE ,17022237,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:52:38 CET,0.0 1.344 1.803 2.155 2.426 2.641 2.834 3.02 3.364 3.505 3.629 3.629 3.99 4.113 4.344 4.552 4.742 4.827 4.984 5.142 5.382 5.539 5.685 5.9 6.109 6.315 6.514 6.691 6.915 7.122 7.322 7.585 7.836 8.062 8.319 8.61 8.87 9.164 9.485 9.796 10.109 10.446 10.84 11.23 11.688 12.206 12.737 13.239 13.73 14.17 14.469 14.387 14.079 13.684 13.28 12.873 12.508 12.175 11.888 11.6 11.328 11.083 10.847 10.618 10.394 10.169 9.921 9.706 9.524 9.329 9.127 8.965 8.784 8.579 8.412 8.239 8.056 7.865 7.667 7.525 7.383 7.16 7.02 6.89 6.819 6.675 6.517 6.344 6.258 5.934 5.968 5.857 5.747 5.503 5.368 5.207 5.023 4.809 4.516 4.099 3.092 -2 ,23345 ,KEBNE ,17022238,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:52:27 CET,0.0 0.964 1.296 1.575 1.791 1.966 2.13 2.318 2.694 2.845 2.995 3.037 3.396 3.518 3.748 3.955 4.152 4.25 4.434 4.601 4.875 5.063 5.229 5.469 5.687 5.892 6.097 6.284 6.515 6.73 6.938 7.188 7.433 7.661 7.933 8.227 8.492 8.787 9.105 9.436 9.777 10.146 10.548 10.937 11.374 11.831 12.296 12.775 13.334 13.872 14.207 14.15 13.899 13.566 13.198 12.83 12.47 12.108 11.79 11.49 11.228 10.984 10.741 10.485 10.247 10.038 9.803 9.565 9.37 9.187 9.0 8.847 8.691 8.524 8.38 8.217 8.055 7.889 7.71 7.588 7.445 7.21 7.054 6.885 6.79 6.584 6.352 6.122 6.003 5.627 5.555 5.4 5.23 4.828 4.614 4.387 4.149 3.884 3.589 3.247 1.912 -3 ,355 ,KEBNE ,17022239,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:51:53 CET,0.0 1.538 1.958 2.217 2.44 2.629 2.81 2.986 3.35 3.526 3.676 3.711 4.078 4.198 4.454 4.688 4.894 4.991 5.161 5.314 5.535 5.673 5.806 6.02 6.23 6.428 6.617 6.802 7.052 7.271 7.483 7.763 8.023 8.25 8.507 8.789 9.031 9.299 9.614 9.958 10.309 10.677 11.075 11.466 11.896 12.353 12.841 13.348 13.89 14.394 14.804 14.88 14.684 14.349 13.975 13.599 13.245 12.922 12.612 12.281 12.0 11.745 11.51 11.289 11.073 10.869 10.667 10.471 10.286 10.09 9.869 9.693 9.522 9.353 9.211 9.046 8.887 8.736 8.582 8.471 8.338 8.131 7.999 7.854 7.776 7.601 7.431 7.279 7.191 6.853 6.842 6.717 6.605 6.323 6.157 5.971 5.755 5.533 5.271 4.9 4.078 -4 ,5523 ,KEBNE ,17022240,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:51:54 CET,0.0 1.035 1.453 1.775 2.041 2.294 2.53 2.745 3.122 3.283 3.421 3.456 3.823 3.954 4.183 4.392 4.603 4.702 4.876 5.033 5.276 5.432 5.581 5.802 6.021 6.23 6.421 6.593 6.801 7.0 7.199 7.443 7.679 7.9 8.143 8.423 8.686 8.948 9.22 9.524 9.847 10.179 10.539 10.911 11.346 11.804 12.303 12.818 13.345 13.792 14.078 13.99 13.659 13.27 12.877 12.477 12.105 11.764 11.471 11.151 10.858 10.592 10.328 10.081 9.845 9.623 9.395 9.169 8.969 8.772 8.556 8.374 8.199 8.021 7.871 7.708 7.544 7.381 7.228 7.123 7.004 6.803 6.661 6.523 6.452 6.308 6.154 5.984 5.895 5.577 5.655 5.558 5.428 5.127 4.971 4.816 4.657 4.487 4.279 3.962 2.878 -5 ,14420 ,KEBNE ,17022241,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:51:51 CET,0.0 1.004 1.369 1.671 1.956 2.219 2.44 2.619 2.908 3.05 3.18 3.164 3.513 3.625 3.848 4.056 4.251 4.337 4.489 4.643 4.89 5.044 5.183 5.387 5.592 5.791 5.989 6.183 6.415 6.616 6.811 7.039 7.265 7.484 7.724 8.004 8.287 8.582 8.869 9.189 9.526 9.886 10.308 10.712 11.13 11.558 12.048 12.545 13.044 13.549 13.969 13.977 13.762 13.504 13.222 12.914 12.618 12.328 12.055 11.761 11.486 11.235 10.998 10.775 10.56 10.378 10.193 10.008 9.842 9.676 9.491 9.324 9.155 8.979 8.841 8.695 8.54 8.39 8.239 8.129 8.013 7.83 7.704 7.582 7.518 7.376 7.202 7.026 6.948 6.626 6.658 6.545 6.41 6.112 5.961 5.806 5.64 5.461 5.217 4.823 3.579 -6 ,2041 ,KEBNE ,17022242,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:52:46 CET,0.0 1.274 1.732 2.039 2.284 2.535 2.767 2.962 3.3 3.458 3.601 3.642 4.014 4.139 4.372 4.605 4.819 4.909 5.082 5.257 5.508 5.668 5.814 6.018 6.216 6.411 6.594 6.767 7.002 7.23 7.455 7.718 7.968 8.2 8.437 8.699 8.969 9.241 9.514 9.823 10.137 10.475 10.856 11.217 11.65 12.125 12.598 13.056 13.522 14.021 14.393 14.347 14.1 13.789 13.447 13.086 12.726 12.397 12.1 11.797 11.53 11.281 11.036 10.801 10.581 10.366 10.145 9.947 9.78 9.621 9.439 9.27 9.097 8.923 8.779 8.623 8.454 8.287 8.125 8.006 7.882 7.678 7.541 7.398 7.319 7.15 6.972 6.782 6.682 6.339 6.383 6.272 6.146 5.886 5.748 5.593 5.421 5.24 5.013 4.719 3.949 -7 ,15696 ,KEBNE ,17022244,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:51:55 CET,0.0 1.377 1.761 2.051 2.304 2.547 2.754 2.925 3.271 3.433 3.575 3.566 3.897 4.008 4.247 4.455 4.643 4.736 4.915 5.09 5.342 5.496 5.65 5.88 6.116 6.352 6.547 6.726 6.988 7.243 7.474 7.726 7.956 8.187 8.434 8.691 8.94 9.226 9.529 9.822 10.133 10.477 10.865 11.249 11.669 12.099 12.536 12.978 13.483 13.965 14.308 14.31 14.082 13.792 13.458 13.054 12.656 12.307 11.994 11.679 11.412 11.161 10.901 10.628 10.385 10.173 9.931 9.702 9.498 9.283 9.06 8.892 8.702 8.483 8.325 8.164 8.0 7.835 7.661 7.528 7.386 7.165 7.014 6.873 6.8 6.646 6.487 6.292 6.185 5.843 5.839 5.716 5.589 5.289 5.112 4.922 4.735 4.53 4.242 3.828 2.1 -8 ,24150 ,KEBNE ,17022245,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:51:51 CET,0.0 1.142 1.523 1.842 2.127 2.383 2.608 2.793 3.128 3.288 3.451 3.525 3.903 4.026 4.262 4.492 4.719 4.833 5.04 5.248 5.546 5.719 5.881 6.1 6.301 6.489 6.684 6.87 7.096 7.314 7.518 7.766 7.997 8.21 8.461 8.742 9.011 9.291 9.58 9.879 10.177 10.526 10.938 11.3 11.675 12.061 12.462 12.921 13.392 13.731 13.906 13.776 13.47 13.086 12.718 12.354 11.958 11.618 11.351 11.047 10.771 10.494 10.204 9.932 9.677 9.449 9.206 8.998 8.818 8.615 8.4 8.222 8.031 7.842 7.693 7.529 7.368 7.183 6.977 6.83 6.689 6.485 6.341 6.199 6.124 5.959 5.787 5.613 5.523 5.191 5.209 5.097 4.981 4.694 4.541 4.399 4.258 4.095 3.87 3.593 2.321 -9 ,24243 ,KEBNE ,17022246,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:52:58 CET,0.0 1.026 1.381 1.649 1.885 2.093 2.272 2.419 2.674 2.809 2.937 2.921 3.279 3.396 3.613 3.816 4.031 4.137 4.345 4.551 4.813 4.967 5.108 5.32 5.532 5.722 5.9 6.079 6.309 6.536 6.76 7.008 7.239 7.454 7.687 7.944 8.203 8.499 8.816 9.14 9.462 9.812 10.213 10.606 11.031 11.506 12.046 12.555 13.12 13.726 14.123 14.061 13.798 13.495 13.176 12.824 12.505 12.202 11.899 11.562 11.257 10.981 10.718 10.472 10.235 10.0 9.725 9.477 9.26 9.028 8.79 8.593 8.391 8.191 8.05 7.89 7.719 7.551 7.362 7.231 7.1 6.886 6.737 6.588 6.509 6.341 6.166 5.972 5.86 5.492 5.447 5.311 5.176 4.892 4.74 4.541 4.293 4.018 3.642 3.211 2.077 -10 ,11615 ,KEBNE ,17022247,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:51:52 CET,0.0 1.374 1.76 2.085 2.396 2.647 2.853 3.033 3.34 3.467 3.587 3.578 3.93 4.04 4.271 4.514 4.754 4.868 5.099 5.309 5.565 5.725 5.876 6.084 6.277 6.46 6.631 6.802 7.041 7.282 7.504 7.749 7.979 8.19 8.422 8.715 8.998 9.279 9.577 9.879 10.202 10.56 10.956 11.358 11.783 12.207 12.698 13.246 13.807 14.334 14.791 14.783 14.506 14.133 13.704 13.291 12.943 12.626 12.32 11.997 11.731 11.488 11.231 10.957 10.686 10.429 10.151 9.903 9.703 9.518 9.334 9.186 9.039 8.87 8.734 8.595 8.455 8.308 8.141 8.027 7.914 7.727 7.582 7.434 7.363 7.221 7.077 6.934 6.852 6.519 6.571 6.477 6.373 6.127 5.987 5.83 5.662 5.49 5.221 4.845 3.845 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_32_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_32_43.txt deleted file mode 100644 index 109db0ea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_32_43.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4340 ,KEBNE ,17022248,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:52:46 CET,0.0 1.058 1.331 1.536 1.733 1.904 2.06 2.214 2.551 2.712 2.848 2.821 3.167 3.269 3.449 3.609 3.764 3.846 3.998 4.143 4.358 4.494 4.619 4.803 4.993 5.168 5.335 5.489 5.674 5.846 6.006 6.202 6.391 6.573 6.783 7.026 7.26 7.496 7.732 7.988 8.275 8.58 8.917 9.248 9.619 9.975 10.346 10.769 11.177 11.545 11.722 11.519 11.194 10.843 10.493 10.152 9.818 9.499 9.197 8.878 8.623 8.401 8.192 7.989 7.799 7.629 7.446 7.274 7.116 6.95 6.765 6.619 6.477 6.328 6.214 6.103 5.987 5.849 5.705 5.611 5.518 5.376 5.277 5.169 5.114 4.977 4.825 4.684 4.618 4.305 4.372 4.28 4.194 4.006 3.885 3.745 3.611 3.478 3.336 3.154 2.745 -2 ,9168 ,KEBNE ,17022249,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:52:47 CET,0.0 0.809 1.099 1.324 1.531 1.724 1.892 2.036 2.285 2.387 2.498 2.474 2.816 2.906 3.1 3.3 3.483 3.572 3.743 3.899 4.106 4.231 4.353 4.532 4.695 4.844 4.994 5.14 5.338 5.535 5.715 5.921 6.124 6.322 6.543 6.774 7.004 7.256 7.521 7.82 8.125 8.437 8.776 9.123 9.513 9.887 10.249 10.611 10.996 11.32 11.423 11.187 10.835 10.483 10.158 9.825 9.501 9.197 8.936 8.669 8.413 8.18 7.963 7.758 7.56 7.366 7.159 6.979 6.829 6.673 6.503 6.356 6.204 6.046 5.923 5.794 5.662 5.524 5.383 5.286 5.186 5.008 4.879 4.761 4.698 4.562 4.421 4.271 4.195 3.869 3.959 3.886 3.807 3.633 3.525 3.407 3.284 3.131 2.955 2.779 2.391 -3 ,8985 ,KEBNE ,17022250,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:53:22 CET,0.0 1.111 1.432 1.703 1.906 2.075 2.266 2.442 2.723 2.851 2.974 2.974 3.323 3.419 3.621 3.83 4.035 4.132 4.299 4.447 4.653 4.8 4.946 5.14 5.317 5.489 5.655 5.807 5.992 6.179 6.354 6.569 6.798 7.001 7.215 7.463 7.708 7.966 8.215 8.464 8.73 9.03 9.37 9.7 10.061 10.452 10.874 11.286 11.684 12.016 12.202 12.009 11.678 11.322 10.972 10.633 10.309 9.988 9.695 9.404 9.135 8.902 8.684 8.461 8.251 8.045 7.833 7.645 7.483 7.327 7.161 7.012 6.848 6.674 6.539 6.403 6.275 6.147 6.007 5.901 5.78 5.593 5.475 5.357 5.294 5.159 5.016 4.869 4.786 4.447 4.484 4.394 4.304 4.111 4.012 3.913 3.789 3.628 3.458 3.269 3.05 -4 ,1013 ,KEBNE ,17022251,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:52:34 CET,0.0 1.211 1.622 1.895 2.124 2.34 2.511 2.641 2.904 3.037 3.163 3.145 3.504 3.611 3.786 3.95 4.118 4.197 4.343 4.483 4.684 4.817 4.949 5.135 5.317 5.494 5.667 5.835 6.037 6.222 6.394 6.589 6.772 6.96 7.185 7.424 7.628 7.843 8.076 8.308 8.542 8.79 9.082 9.408 9.77 10.137 10.562 10.988 11.362 11.662 11.845 11.721 11.447 11.087 10.724 10.404 10.086 9.771 9.493 9.197 8.94 8.719 8.506 8.293 8.1 7.93 7.745 7.568 7.42 7.261 7.079 6.936 6.795 6.631 6.494 6.365 6.231 6.087 5.947 5.853 5.756 5.602 5.489 5.364 5.302 5.18 5.049 4.899 4.827 4.515 4.62 4.54 4.46 4.28 4.181 4.084 3.958 3.824 3.703 3.546 3.231 -5 ,7396 ,KEBNE ,17022252,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:53:32 CET,0.0 1.052 1.415 1.71 1.914 2.097 2.281 2.447 2.72 2.842 2.958 2.922 3.258 3.351 3.516 3.658 3.806 3.883 4.016 4.143 4.343 4.466 4.576 4.748 4.92 5.081 5.239 5.391 5.588 5.778 5.941 6.118 6.291 6.457 6.652 6.889 7.121 7.373 7.632 7.894 8.177 8.485 8.811 9.122 9.47 9.824 10.188 10.535 10.894 11.196 11.349 11.224 10.907 10.54 10.175 9.798 9.456 9.129 8.84 8.571 8.335 8.101 7.866 7.644 7.447 7.264 7.074 6.905 6.756 6.589 6.413 6.279 6.14 5.992 5.869 5.729 5.583 5.453 5.327 5.232 5.136 4.987 4.875 4.757 4.697 4.57 4.435 4.303 4.234 3.911 4.011 3.939 3.856 3.683 3.596 3.502 3.39 3.264 3.118 2.887 2.436 -6 ,12703 ,KEBNE ,17022253,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:52:46 CET,0.0 0.801 1.118 1.35 1.561 1.755 1.923 2.07 2.332 2.455 2.567 2.52 2.864 2.96 3.152 3.348 3.528 3.608 3.771 3.928 4.123 4.241 4.357 4.522 4.688 4.854 5.014 5.172 5.365 5.533 5.706 5.911 6.094 6.275 6.488 6.709 6.911 7.136 7.385 7.639 7.888 8.162 8.476 8.808 9.182 9.548 9.915 10.297 10.686 11.035 11.267 11.181 10.888 10.537 10.179 9.84 9.537 9.243 8.971 8.692 8.449 8.239 8.041 7.846 7.653 7.464 7.258 7.073 6.913 6.75 6.571 6.411 6.247 6.087 5.96 5.83 5.699 5.56 5.405 5.298 5.189 5.016 4.892 4.761 4.699 4.572 4.436 4.295 4.227 3.917 4.023 3.952 3.88 3.703 3.589 3.477 3.364 3.244 3.112 2.906 2.647 -7 ,30867 ,KEBNE ,17022254,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:52:44 CET,0.0 0.955 1.27 1.525 1.722 1.891 2.055 2.204 2.488 2.62 2.757 2.779 3.144 3.254 3.464 3.654 3.83 3.912 4.074 4.235 4.465 4.602 4.725 4.909 5.09 5.256 5.427 5.597 5.804 6.004 6.192 6.43 6.659 6.87 7.099 7.349 7.577 7.804 8.048 8.295 8.535 8.816 9.144 9.445 9.792 10.197 10.636 11.045 11.442 11.821 12.008 11.842 11.516 11.168 10.832 10.489 10.188 9.904 9.627 9.328 9.082 8.865 8.634 8.405 8.197 8.016 7.824 7.654 7.512 7.356 7.186 7.049 6.903 6.728 6.595 6.466 6.332 6.203 6.065 5.966 5.864 5.692 5.577 5.451 5.383 5.246 5.094 4.93 4.854 4.539 4.615 4.53 4.437 4.213 4.096 3.984 3.872 3.727 3.545 3.279 2.646 -8 ,9818 ,KEBNE ,17022255,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:50:58 CET,0.0 0.961 1.237 1.452 1.629 1.775 1.92 2.063 2.31 2.426 2.538 2.492 2.843 2.946 3.12 3.279 3.424 3.496 3.638 3.757 3.926 4.051 4.172 4.35 4.526 4.686 4.838 4.995 5.193 5.38 5.566 5.785 5.991 6.185 6.414 6.664 6.882 7.122 7.362 7.608 7.878 8.182 8.518 8.822 9.163 9.565 9.99 10.41 10.839 11.171 11.351 11.15 10.761 10.382 10.011 9.628 9.268 8.935 8.644 8.329 8.064 7.838 7.613 7.394 7.198 7.013 6.801 6.616 6.451 6.279 6.109 5.971 5.829 5.681 5.561 5.436 5.309 5.18 5.041 4.942 4.842 4.678 4.566 4.444 4.379 4.244 4.107 3.977 3.911 3.597 3.655 3.559 3.472 3.289 3.19 3.089 2.981 2.864 2.706 2.51 2.34 -9 ,28576 ,KEBNE ,17022256,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:54:23 CET,0.0 0.812 1.111 1.353 1.562 1.739 1.893 2.031 2.26 2.384 2.498 2.44 2.786 2.884 3.072 3.252 3.408 3.489 3.649 3.788 4.005 4.151 4.278 4.467 4.654 4.813 4.968 5.121 5.328 5.522 5.71 5.935 6.144 6.338 6.542 6.772 6.981 7.206 7.455 7.712 7.982 8.287 8.623 8.957 9.333 9.734 10.188 10.625 11.034 11.453 11.759 11.649 11.365 11.001 10.623 10.262 9.928 9.604 9.317 9.028 8.765 8.536 8.315 8.089 7.877 7.687 7.486 7.316 7.159 6.987 6.813 6.664 6.521 6.384 6.273 6.153 6.023 5.887 5.746 5.649 5.55 5.397 5.289 5.183 5.126 5.001 4.877 4.74 4.672 4.357 4.452 4.36 4.258 4.052 3.946 3.832 3.705 3.534 3.336 3.118 2.672 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_32_46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_32_46.txt deleted file mode 100644 index f5080639..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_32_46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31959 ,KEBNE ,17022258,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:52:50 CET,0.0 1.198 1.565 1.823 2.026 2.242 2.433 2.58 2.844 2.958 3.061 3.011 3.364 3.472 3.659 3.831 3.999 4.083 4.238 4.364 4.535 4.657 4.767 4.915 5.068 5.221 5.374 5.519 5.687 5.839 5.982 6.148 6.308 6.463 6.628 6.791 6.938 7.104 7.296 7.505 7.707 7.911 8.132 8.338 8.534 8.707 8.899 9.046 9.082 8.974 8.537 7.776 7.052 6.395 5.831 5.312 4.833 4.374 3.972 3.573 3.219 2.903 2.608 2.321 2.056 1.823 1.59 1.376 1.185 0.988 0.792 0.622 0.444 0.26 0.108 -0.048 -0.213 -0.391 -0.585 -0.731 -0.887 -1.112 -1.242 -1.367 -1.432 -1.571 -1.722 -1.88 -1.961 -2.293 -2.178 -2.266 -2.377 -2.626 -2.738 -2.873 -3.034 -3.167 -3.32 -3.541 -3.87 -2 ,18463 ,KEBNE ,17022259,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:52:56 CET,0.0 1.025 1.298 1.548 1.75 1.926 2.07 2.204 2.462 2.576 2.686 2.654 3.002 3.088 3.257 3.427 3.584 3.66 3.809 3.948 4.14 4.269 4.384 4.55 4.711 4.868 5.026 5.183 5.383 5.545 5.694 5.888 6.071 6.222 6.384 6.602 6.8 6.994 7.206 7.418 7.619 7.822 8.048 8.227 8.427 8.645 8.825 8.974 9.056 8.954 8.518 7.731 6.995 6.365 5.759 5.181 4.685 4.247 3.877 3.495 3.168 2.891 2.616 2.336 2.081 1.849 1.599 1.377 1.191 1.002 0.797 0.634 0.463 0.285 0.146 -0.01 -0.166 -0.327 -0.508 -0.627 -0.742 -0.931 -1.062 -1.199 -1.272 -1.428 -1.579 -1.717 -1.786 -2.108 -1.997 -2.075 -2.157 -2.363 -2.478 -2.606 -2.752 -2.886 -3.096 -3.36 -3.833 -3 ,914 ,KEBNE ,17022260,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:53:17 CET,0.0 0.864 1.198 1.462 1.671 1.876 2.058 2.188 2.398 2.522 2.635 2.559 2.893 2.983 3.14 3.289 3.424 3.494 3.642 3.776 3.961 4.084 4.198 4.353 4.518 4.682 4.833 4.979 5.142 5.286 5.419 5.575 5.732 5.876 6.046 6.248 6.433 6.616 6.822 7.034 7.248 7.487 7.735 7.97 8.224 8.447 8.669 8.868 8.97 8.918 8.482 7.67 6.903 6.228 5.637 5.073 4.568 4.09 3.677 3.299 2.958 2.651 2.366 2.081 1.824 1.595 1.346 1.128 0.941 0.739 0.533 0.37 0.197 0.012 -0.134 -0.291 -0.453 -0.606 -0.763 -0.878 -0.999 -1.186 -1.321 -1.455 -1.522 -1.663 -1.8 -1.937 -2.018 -2.355 -2.258 -2.348 -2.459 -2.696 -2.809 -2.926 -3.037 -3.162 -3.318 -3.494 -3.749 -4 ,18664 ,KEBNE ,17022261,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:52:39 CET,0.0 0.909 1.24 1.514 1.745 1.927 2.086 2.221 2.476 2.601 2.723 2.699 3.05 3.151 3.35 3.522 3.684 3.763 3.917 4.067 4.274 4.398 4.507 4.664 4.836 4.998 5.142 5.279 5.446 5.604 5.747 5.916 6.085 6.262 6.467 6.69 6.882 7.067 7.278 7.504 7.717 7.929 8.156 8.377 8.61 8.826 9.041 9.221 9.329 9.299 8.89 8.099 7.333 6.631 6.031 5.484 4.953 4.481 4.089 3.682 3.323 3.011 2.708 2.406 2.146 1.93 1.699 1.491 1.304 1.119 0.936 0.775 0.604 0.431 0.302 0.163 0.008 -0.15 -0.305 -0.416 -0.527 -0.699 -0.816 -0.933 -0.994 -1.117 -1.246 -1.392 -1.478 -1.834 -1.761 -1.86 -1.962 -2.174 -2.277 -2.375 -2.491 -2.623 -2.759 -2.937 -3.232 -5 ,1115 ,KEBNE ,17022262,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:53:05 CET,0.0 1.055 1.39 1.671 1.913 2.114 2.272 2.406 2.656 2.784 2.9 2.854 3.194 3.29 3.485 3.657 3.801 3.865 3.977 4.093 4.265 4.38 4.494 4.656 4.805 4.938 5.059 5.187 5.359 5.517 5.662 5.832 6.011 6.176 6.352 6.551 6.733 6.918 7.106 7.3 7.496 7.694 7.915 8.114 8.319 8.536 8.74 8.881 8.936 8.867 8.45 7.701 6.978 6.307 5.664 5.081 4.583 4.126 3.742 3.347 3.009 2.693 2.382 2.109 1.847 1.605 1.366 1.143 0.951 0.765 0.563 0.397 0.228 0.057 -0.075 -0.224 -0.372 -0.516 -0.675 -0.785 -0.895 -1.067 -1.181 -1.299 -1.364 -1.506 -1.648 -1.813 -1.907 -2.249 -2.177 -2.264 -2.349 -2.531 -2.633 -2.76 -2.917 -3.071 -3.225 -3.439 -4.172 -6 ,13274 ,KEBNE ,17022263,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:52:38 CET,0.0 1.651 1.937 2.141 2.321 2.5 2.668 2.805 3.069 3.195 3.311 3.281 3.635 3.746 3.942 4.109 4.254 4.323 4.464 4.601 4.785 4.902 5.02 5.205 5.388 5.564 5.726 5.873 6.058 6.229 6.398 6.596 6.773 6.94 7.124 7.311 7.484 7.678 7.885 8.089 8.314 8.557 8.796 9.014 9.231 9.415 9.549 9.678 9.775 9.751 9.385 8.61 7.867 7.166 6.55 5.996 5.483 5.014 4.619 4.227 3.892 3.577 3.25 2.951 2.69 2.454 2.2 1.968 1.773 1.577 1.379 1.213 1.038 0.854 0.711 0.564 0.405 0.244 0.08 -0.033 -0.15 -0.328 -0.451 -0.581 -0.645 -0.786 -0.943 -1.1 -1.182 -1.516 -1.432 -1.53 -1.635 -1.85 -1.966 -2.084 -2.212 -2.365 -2.553 -2.758 -3.064 -7 ,3022 ,KEBNE ,17022264,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:54:53 CET,0.0 2.596 2.989 3.238 3.428 3.582 3.728 3.871 4.156 4.281 4.385 4.327 4.677 4.773 4.95 5.118 5.271 5.343 5.488 5.619 5.805 5.925 6.035 6.197 6.347 6.488 6.616 6.737 6.895 7.05 7.2 7.371 7.525 7.688 7.876 8.067 8.242 8.416 8.609 8.83 9.061 9.319 9.59 9.847 10.131 10.36 10.558 10.74 10.831 10.768 10.35 9.625 8.922 8.244 7.62 7.059 6.572 6.109 5.691 5.286 4.956 4.667 4.386 4.108 3.851 3.616 3.37 3.151 2.951 2.733 2.504 2.315 2.113 1.921 1.784 1.644 1.491 1.324 1.149 1.037 0.924 0.739 0.609 0.47 0.398 0.256 0.116 -0.039 -0.121 -0.45 -0.351 -0.425 -0.508 -0.712 -0.831 -0.963 -1.102 -1.248 -1.413 -1.635 -1.953 -8 ,10446 ,KEBNE ,17022265,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:54:46 CET,0.0 0.945 1.287 1.514 1.717 1.892 2.054 2.197 2.459 2.591 2.712 2.68 3.023 3.116 3.308 3.496 3.65 3.717 3.845 3.975 4.174 4.301 4.416 4.565 4.707 4.835 4.962 5.094 5.276 5.459 5.62 5.798 5.972 6.138 6.31 6.499 6.686 6.885 7.077 7.255 7.429 7.627 7.866 8.089 8.296 8.462 8.611 8.75 8.813 8.656 8.158 7.396 6.663 5.965 5.345 4.78 4.268 3.809 3.429 3.048 2.701 2.389 2.09 1.811 1.558 1.323 1.082 0.86 0.669 0.474 0.263 0.089 -0.09 -0.285 -0.437 -0.585 -0.731 -0.873 -1.024 -1.134 -1.255 -1.447 -1.57 -1.695 -1.761 -1.889 -2.02 -2.161 -2.241 -2.584 -2.487 -2.569 -2.666 -2.861 -2.981 -3.119 -3.255 -3.408 -3.59 -3.798 -4.447 -9 ,27637 ,KEBNE ,17022266,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:53:31 CET,0.0 0.865 1.252 1.533 1.745 1.928 2.089 2.239 2.539 2.677 2.8 2.773 3.112 3.205 3.407 3.597 3.751 3.828 3.982 4.125 4.33 4.462 4.584 4.756 4.916 5.058 5.204 5.358 5.546 5.713 5.873 6.05 6.213 6.375 6.552 6.747 6.94 7.142 7.347 7.55 7.763 7.973 8.195 8.413 8.641 8.871 9.089 9.24 9.322 9.302 8.926 8.205 7.497 6.818 6.236 5.722 5.253 4.812 4.408 3.991 3.658 3.374 3.084 2.797 2.525 2.287 2.048 1.828 1.63 1.426 1.215 1.043 0.855 0.66 0.519 0.377 0.226 0.05 -0.117 -0.217 -0.324 -0.486 -0.592 -0.702 -0.761 -0.891 -1.036 -1.182 -1.248 -1.564 -1.462 -1.558 -1.654 -1.848 -1.95 -2.06 -2.18 -2.307 -2.466 -2.692 -3.15 -10 ,23690 ,KEBNE ,17022267,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:53:52 CET,0.0 0.926 1.323 1.57 1.737 1.893 2.056 2.182 2.412 2.518 2.619 2.583 2.935 3.037 3.214 3.357 3.5 3.573 3.714 3.844 4.038 4.167 4.293 4.482 4.656 4.811 4.953 5.092 5.268 5.426 5.582 5.763 5.945 6.115 6.294 6.492 6.663 6.839 7.033 7.216 7.407 7.649 7.913 8.157 8.414 8.638 8.837 9.026 9.148 9.095 8.719 7.962 7.185 6.483 5.882 5.347 4.873 4.457 4.085 3.704 3.377 3.078 2.78 2.508 2.26 2.039 1.817 1.6 1.412 1.222 1.024 0.867 0.688 0.491 0.343 0.197 0.049 -0.102 -0.276 -0.404 -0.52 -0.684 -0.812 -0.948 -1.019 -1.167 -1.316 -1.475 -1.553 -1.885 -1.804 -1.903 -2.011 -2.233 -2.347 -2.453 -2.56 -2.676 -2.809 -2.971 -3.2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_32_47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_32_47.txt deleted file mode 100644 index 3e5e08a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_32_47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7744 ,KEBNE ,17022268,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:51:43 CET,0.0 1.452 1.887 2.239 2.544 2.797 2.999 3.174 3.457 3.567 3.663 3.607 3.934 4.014 4.177 4.323 4.47 4.548 4.702 4.839 5.006 5.1 5.187 5.306 5.41 5.508 5.595 5.662 5.753 5.851 5.936 6.03 6.103 6.149 6.199 6.259 6.293 6.299 6.302 6.296 6.268 6.205 6.071 5.866 5.548 5.145 4.595 3.793 2.614 0.783 -2.232 -5.676 -8.356 -10.484 -12.201 -13.67 -14.939 -16.067 -16.987 -17.855 -18.585 -19.219 -19.796 -20.346 -20.858 -21.304 -21.749 -22.146 -22.502 -22.861 -23.215 -23.507 -23.807 -24.126 -24.378 -24.637 -24.894 -25.151 -25.425 -25.612 -25.796 -26.087 -26.294 -26.501 -26.602 -26.804 -27.007 -27.219 -27.337 -27.741 -27.714 -27.843 -27.99 -28.27 -28.407 -28.556 -28.745 -28.959 -29.235 -29.574 -30.129 -2 ,7281 ,KEBNE ,17022269,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:52:10 CET,0.0 1.236 1.629 1.903 2.117 2.296 2.474 2.618 2.87 2.987 3.093 3.063 3.399 3.473 3.616 3.741 3.849 3.901 4.02 4.158 4.327 4.405 4.482 4.588 4.678 4.77 4.854 4.918 4.995 5.067 5.135 5.208 5.27 5.332 5.383 5.416 5.451 5.459 5.443 5.431 5.396 5.316 5.172 4.982 4.689 4.262 3.653 2.793 1.568 -0.233 -3.206 -6.587 -9.171 -11.245 -12.969 -14.481 -15.776 -16.867 -17.784 -18.707 -19.472 -20.142 -20.766 -21.328 -21.859 -22.329 -22.787 -23.191 -23.531 -23.89 -24.263 -24.569 -24.882 -25.186 -25.431 -25.687 -25.946 -26.213 -26.472 -26.65 -26.838 -27.122 -27.32 -27.54 -27.656 -27.887 -28.137 -28.397 -28.529 -28.957 -28.95 -29.106 -29.257 -29.546 -29.697 -29.884 -30.104 -30.319 -30.529 -30.794 -31.382 -3 ,4559 ,KEBNE ,17022270,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:53:32 CET,0.0 0.914 1.296 1.602 1.812 1.981 2.143 2.326 2.643 2.775 2.906 2.875 3.215 3.306 3.471 3.617 3.746 3.814 3.935 4.049 4.233 4.342 4.437 4.544 4.635 4.735 4.829 4.917 5.028 5.119 5.202 5.275 5.336 5.41 5.484 5.538 5.568 5.603 5.627 5.602 5.545 5.455 5.3 5.108 4.833 4.451 3.916 3.128 1.923 0.111 -2.886 -6.223 -8.8 -10.901 -12.627 -14.087 -15.331 -16.421 -17.311 -18.189 -18.922 -19.564 -20.172 -20.734 -21.253 -21.706 -22.169 -22.582 -22.933 -23.288 -23.659 -23.958 -24.261 -24.577 -24.82 -25.07 -25.327 -25.592 -25.845 -26.02 -26.21 -26.498 -26.701 -26.91 -27.011 -27.218 -27.442 -27.671 -27.795 -28.205 -28.169 -28.292 -28.412 -28.648 -28.774 -28.904 -29.052 -29.225 -29.43 -29.646 -30.511 -4 ,17770 ,KEBNE ,17022271,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:52:28 CET,0.0 1.407 1.77 2.058 2.304 2.53 2.715 2.85 3.068 3.178 3.304 3.32 3.67 3.761 3.923 4.057 4.193 4.264 4.414 4.563 4.744 4.839 4.927 5.047 5.159 5.268 5.369 5.458 5.565 5.667 5.745 5.831 5.905 5.973 6.048 6.102 6.124 6.123 6.107 6.086 6.06 5.996 5.854 5.647 5.349 4.982 4.479 3.715 2.54 0.787 -2.047 -5.329 -7.921 -9.98 -11.63 -13.067 -14.283 -15.339 -16.228 -17.091 -17.847 -18.512 -19.103 -19.633 -20.113 -20.556 -21.003 -21.396 -21.761 -22.155 -22.545 -22.851 -23.162 -23.478 -23.711 -23.942 -24.192 -24.443 -24.706 -24.896 -25.078 -25.352 -25.557 -25.773 -25.877 -26.1 -26.335 -26.58 -26.703 -27.102 -27.116 -27.271 -27.419 -27.695 -27.837 -28.003 -28.193 -28.386 -28.634 -28.982 -29.876 -5 ,23090 ,KEBNE ,17022272,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:52:46 CET,0.0 1.265 1.641 1.921 2.152 2.381 2.572 2.707 2.943 3.065 3.183 3.155 3.481 3.565 3.72 3.863 3.997 4.058 4.179 4.287 4.454 4.571 4.684 4.847 5.001 5.133 5.246 5.338 5.437 5.525 5.605 5.697 5.775 5.853 5.933 6.0 6.044 6.069 6.085 6.083 6.068 6.033 5.923 5.759 5.502 5.113 4.551 3.738 2.511 0.688 -2.214 -5.485 -7.962 -9.979 -11.668 -13.132 -14.376 -15.482 -16.408 -17.302 -18.06 -18.735 -19.345 -19.908 -20.427 -20.874 -21.33 -21.746 -22.101 -22.455 -22.824 -23.132 -23.45 -23.786 -24.049 -24.313 -24.578 -24.856 -25.139 -25.331 -25.528 -25.832 -26.041 -26.268 -26.388 -26.646 -26.94 -27.236 -27.383 -27.792 -27.776 -27.913 -28.055 -28.349 -28.526 -28.731 -28.938 -29.153 -29.386 -29.651 -30.226 -6 ,24229 ,KEBNE ,17022273,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:52:56 CET,0.0 1.613 2.018 2.31 2.545 2.738 2.921 3.094 3.372 3.481 3.598 3.602 3.94 4.032 4.209 4.379 4.533 4.606 4.729 4.839 4.986 5.08 5.172 5.299 5.41 5.51 5.616 5.705 5.804 5.907 5.997 6.088 6.169 6.234 6.288 6.338 6.365 6.387 6.408 6.407 6.397 6.347 6.214 6.019 5.724 5.299 4.674 3.836 2.619 0.775 -2.151 -5.481 -8.111 -10.226 -11.916 -13.336 -14.551 -15.594 -16.432 -17.254 -17.959 -18.591 -19.188 -19.728 -20.214 -20.66 -21.113 -21.496 -21.826 -22.164 -22.511 -22.801 -23.09 -23.376 -23.602 -23.833 -24.062 -24.304 -24.559 -24.739 -24.93 -25.219 -25.438 -25.684 -25.802 -26.037 -26.271 -26.504 -26.629 -27.031 -27.059 -27.22 -27.388 -27.725 -27.914 -28.134 -28.351 -28.564 -28.815 -29.149 -30.103 -7 ,22245 ,KEBNE ,17022274,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:53:19 CET,0.0 1.538 2.026 2.358 2.607 2.797 2.969 3.149 3.452 3.578 3.701 3.69 4.033 4.116 4.265 4.412 4.564 4.645 4.788 4.913 5.091 5.194 5.284 5.428 5.589 5.739 5.85 5.953 6.08 6.165 6.24 6.336 6.417 6.485 6.535 6.565 6.595 6.607 6.584 6.526 6.44 6.318 6.145 5.944 5.638 5.181 4.563 3.684 2.389 0.533 -2.415 -5.75 -8.365 -10.517 -12.281 -13.736 -14.951 -16.033 -16.94 -17.824 -18.558 -19.213 -19.835 -20.373 -20.853 -21.302 -21.785 -22.201 -22.542 -22.905 -23.284 -23.597 -23.914 -24.232 -24.482 -24.745 -25.012 -25.291 -25.57 -25.754 -25.957 -26.285 -26.498 -26.704 -26.806 -27.024 -27.255 -27.488 -27.615 -28.028 -28.002 -28.136 -28.273 -28.589 -28.77 -28.968 -29.18 -29.422 -29.673 -30.001 -31.166 -8 ,15200 ,KEBNE ,17022275,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:53:48 CET,0.0 1.641 2.117 2.455 2.713 2.959 3.176 3.353 3.678 3.839 3.999 4.026 4.41 4.556 4.818 5.04 5.204 5.276 5.416 5.536 5.701 5.8 5.893 6.016 6.134 6.24 6.336 6.436 6.554 6.653 6.729 6.805 6.86 6.91 6.974 7.014 7.03 7.046 7.039 6.985 6.895 6.76 6.568 6.34 6.028 5.614 5.007 4.164 2.906 0.998 -1.989 -5.313 -7.863 -9.938 -11.653 -13.133 -14.365 -15.455 -16.385 -17.28 -18.037 -18.702 -19.329 -19.896 -20.415 -20.869 -21.315 -21.714 -22.06 -22.427 -22.813 -23.119 -23.416 -23.724 -23.973 -24.239 -24.504 -24.759 -25.025 -25.219 -25.422 -25.736 -25.938 -26.145 -26.257 -26.486 -26.717 -26.956 -27.075 -27.477 -27.485 -27.639 -27.781 -28.107 -28.273 -28.452 -28.651 -28.882 -29.127 -29.37 -29.893 -9 ,32041 ,KEBNE ,17022276,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:52:41 CET,0.0 2.982 3.473 3.783 4.037 4.242 4.422 4.576 4.834 4.945 5.055 5.033 5.373 5.452 5.605 5.756 5.892 5.948 6.048 6.145 6.279 6.364 6.44 6.534 6.629 6.721 6.808 6.891 6.979 7.068 7.152 7.237 7.316 7.392 7.463 7.503 7.519 7.553 7.602 7.617 7.577 7.481 7.327 7.133 6.849 6.45 5.841 4.985 3.747 1.915 -1.049 -4.415 -7.069 -9.193 -10.874 -12.336 -13.585 -14.667 -15.565 -16.431 -17.15 -17.784 -18.392 -18.969 -19.507 -19.986 -20.482 -20.917 -21.293 -21.679 -22.062 -22.388 -22.732 -23.096 -23.363 -23.627 -23.905 -24.193 -24.475 -24.667 -24.866 -25.153 -25.36 -25.582 -25.691 -25.907 -26.14 -26.428 -26.58 -26.998 -26.991 -27.127 -27.261 -27.561 -27.734 -27.933 -28.164 -28.387 -28.589 -28.863 -29.541 -10 ,25113 ,KEBNE ,17022277,Wed Dec 22 05:26:33 CET,Wed Dec 22 06:51:35 CET,0.0 1.28 1.883 2.352 2.675 2.906 3.109 3.297 3.653 3.799 3.908 3.86 4.214 4.322 4.495 4.643 4.778 4.843 4.981 5.107 5.273 5.379 5.484 5.628 5.739 5.844 5.953 6.044 6.144 6.228 6.318 6.426 6.506 6.566 6.625 6.664 6.689 6.716 6.73 6.704 6.645 6.563 6.421 6.211 5.906 5.492 4.897 4.058 2.785 0.922 -2.076 -5.4 -7.983 -10.114 -11.865 -13.373 -14.627 -15.742 -16.691 -17.593 -18.349 -19.01 -19.629 -20.196 -20.711 -21.188 -21.678 -22.088 -22.418 -22.748 -23.099 -23.402 -23.715 -24.027 -24.273 -24.541 -24.811 -25.089 -25.373 -25.556 -25.747 -26.053 -26.263 -26.48 -26.588 -26.799 -27.019 -27.252 -27.365 -27.76 -27.716 -27.85 -27.994 -28.284 -28.44 -28.609 -28.793 -28.989 -29.249 -29.644 -30.359 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_32.txt deleted file mode 100644 index cac42b44..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3404 ,TETRA ,17524434,Wed Nov 24 22:14:58 CET,Thu Nov 25 00:00:01 CET,0.0 0.817 1.054 1.255 1.436 1.583 1.722 1.847 2.042 2.137 2.232 2.145 2.474 2.561 2.736 2.904 3.059 3.135 3.275 3.404 3.588 3.7 3.81 3.976 4.132 4.287 4.436 4.576 4.765 4.95 5.127 5.334 5.526 5.706 5.924 6.164 6.383 6.607 6.84 7.087 7.35 7.644 7.994 8.373 8.785 9.186 9.628 10.103 10.591 11.061 11.466 11.535 11.335 11.067 10.776 10.5 10.23 9.952 9.685 9.42 9.179 8.95 8.735 8.529 8.316 8.12 7.92 7.738 7.574 7.401 7.222 7.061 6.89 6.724 6.605 6.483 6.352 6.208 6.066 5.973 5.868 5.691 5.579 5.477 5.422 5.296 5.157 5.006 4.929 4.597 4.671 4.577 4.475 4.278 4.155 4.005 3.867 3.677 3.388 3.006 1.375 -2 ,14801 ,TETRA ,17524437,Wed Nov 24 22:15:02 CET,Thu Nov 25 00:01:49 CET,0.0 0.483 0.755 0.939 1.08 1.211 1.348 1.479 1.708 1.813 1.907 1.862 2.179 2.257 2.414 2.565 2.712 2.785 2.924 3.055 3.224 3.33 3.442 3.601 3.747 3.883 4.014 4.15 4.319 4.474 4.639 4.844 5.034 5.214 5.411 5.634 5.865 6.116 6.368 6.619 6.885 7.192 7.528 7.841 8.185 8.559 8.971 9.397 9.86 10.36 10.79 10.95 10.862 10.636 10.389 10.152 9.88 9.565 9.301 9.058 8.843 8.633 8.423 8.23 8.039 7.855 7.663 7.482 7.329 7.15 6.94 6.772 6.608 6.448 6.316 6.176 6.036 5.891 5.755 5.662 5.562 5.395 5.27 5.147 5.076 4.898 4.711 4.532 4.442 4.095 4.133 4.01 3.868 3.603 3.444 3.241 3.029 2.797 2.542 2.186 0.795 -3 ,5616 ,TETRA ,17524439,Wed Nov 24 22:15:01 CET,Thu Nov 25 00:00:23 CET,0.0 0.525 0.851 1.114 1.311 1.447 1.585 1.716 1.948 2.048 2.149 2.089 2.429 2.517 2.685 2.844 3.005 3.075 3.206 3.336 3.522 3.635 3.757 3.948 4.109 4.267 4.431 4.59 4.78 4.946 5.112 5.31 5.49 5.67 5.882 6.112 6.322 6.542 6.774 7.042 7.335 7.657 8.016 8.344 8.717 9.151 9.617 10.068 10.564 11.074 11.493 11.573 11.416 11.172 10.895 10.632 10.38 10.111 9.847 9.584 9.366 9.173 8.985 8.799 8.629 8.46 8.262 8.085 7.937 7.779 7.617 7.481 7.339 7.191 7.082 6.965 6.829 6.683 6.537 6.442 6.333 6.157 6.049 5.937 5.873 5.738 5.6 5.45 5.376 5.058 5.137 5.051 4.965 4.795 4.687 4.566 4.43 4.265 4.077 3.88 3.412 -4 ,31119 ,TETRA ,17524441,Wed Nov 24 22:14:58 CET,Thu Nov 25 00:00:24 CET,0.0 0.605 0.827 1.005 1.168 1.335 1.463 1.579 1.78 1.876 1.964 1.856 2.186 2.268 2.404 2.545 2.686 2.756 2.894 3.025 3.206 3.326 3.443 3.594 3.744 3.895 4.043 4.185 4.379 4.571 4.742 4.937 5.13 5.326 5.547 5.782 5.998 6.23 6.477 6.741 7.024 7.34 7.693 8.028 8.406 8.811 9.271 9.758 10.273 10.724 11.014 11.046 10.869 10.623 10.359 10.079 9.801 9.535 9.291 9.016 8.774 8.554 8.342 8.147 7.95 7.756 7.56 7.394 7.244 7.079 6.903 6.756 6.612 6.441 6.303 6.167 6.027 5.884 5.739 5.644 5.538 5.379 5.27 5.152 5.084 4.937 4.785 4.635 4.561 4.238 4.317 4.227 4.145 3.955 3.85 3.743 3.625 3.452 3.236 2.989 2.587 -5 ,28086 ,TETRA ,17524443,Wed Nov 24 22:15:01 CET,Thu Nov 25 00:00:01 CET,0.0 0.675 0.929 1.136 1.313 1.456 1.596 1.736 1.973 2.073 2.163 2.102 2.43 2.508 2.676 2.844 2.988 3.058 3.201 3.339 3.542 3.672 3.792 3.956 4.112 4.267 4.422 4.581 4.768 4.931 5.081 5.266 5.449 5.626 5.821 6.035 6.239 6.453 6.696 6.959 7.244 7.56 7.898 8.223 8.589 8.979 9.392 9.846 10.316 10.771 11.24 11.375 11.234 11.029 10.794 10.553 10.286 10.011 9.751 9.496 9.289 9.086 8.876 8.671 8.48 8.3 8.1 7.918 7.764 7.595 7.416 7.272 7.115 6.945 6.814 6.697 6.589 6.469 6.329 6.231 6.128 5.961 5.853 5.736 5.672 5.551 5.413 5.266 5.203 4.887 4.976 4.89 4.792 4.604 4.505 4.387 4.26 4.117 3.952 3.734 3.348 -6 ,8562 ,TETRA ,17524445,Wed Nov 24 22:15:04 CET,Thu Nov 25 00:00:22 CET,0.0 1.002 1.248 1.45 1.624 1.789 1.942 2.082 2.314 2.415 2.516 2.443 2.766 2.846 3.0 3.145 3.301 3.377 3.511 3.636 3.807 3.92 4.03 4.191 4.359 4.526 4.695 4.859 5.056 5.26 5.457 5.661 5.833 5.997 6.196 6.419 6.643 6.892 7.14 7.414 7.698 7.994 8.339 8.699 9.086 9.44 9.807 10.249 10.775 11.254 11.616 11.683 11.541 11.312 11.058 10.801 10.546 10.267 10.005 9.757 9.533 9.306 9.086 8.878 8.685 8.501 8.294 8.114 7.957 7.778 7.604 7.474 7.344 7.211 7.094 6.967 6.829 6.691 6.564 6.453 6.33 6.159 6.041 5.925 5.866 5.739 5.613 5.482 5.418 5.108 5.195 5.112 5.024 4.823 4.714 4.598 4.484 4.344 4.169 3.99 3.664 -7 ,14281 ,TETRA ,17524446,Wed Nov 24 22:14:59 CET,Thu Nov 25 00:01:22 CET,0.0 0.569 0.804 0.987 1.156 1.312 1.435 1.555 1.792 1.895 1.992 1.932 2.281 2.374 2.545 2.697 2.83 2.895 3.02 3.133 3.316 3.443 3.558 3.712 3.867 4.017 4.163 4.299 4.466 4.628 4.785 4.98 5.171 5.348 5.556 5.787 6.002 6.251 6.527 6.796 7.053 7.358 7.725 8.071 8.472 8.903 9.364 9.84 10.296 10.756 11.157 11.275 11.192 10.96 10.691 10.432 10.173 9.913 9.669 9.431 9.215 8.998 8.791 8.592 8.404 8.219 8.025 7.855 7.698 7.541 7.383 7.247 7.108 6.956 6.829 6.7 6.562 6.416 6.267 6.164 6.055 5.875 5.752 5.633 5.575 5.448 5.286 5.118 5.046 4.725 4.821 4.734 4.641 4.465 4.372 4.247 4.108 3.973 3.797 3.6 3.172 -8 ,8204 ,TETRA ,17524448,Wed Nov 24 22:15:02 CET,Thu Nov 25 00:00:01 CET,0.0 0.983 1.273 1.529 1.741 1.918 2.064 2.2 2.446 2.563 2.676 2.639 2.987 3.08 3.253 3.422 3.565 3.635 3.785 3.923 4.122 4.254 4.361 4.509 4.666 4.815 4.964 5.107 5.275 5.435 5.599 5.811 6.009 6.189 6.397 6.629 6.849 7.098 7.374 7.644 7.918 8.221 8.568 8.917 9.296 9.695 10.141 10.605 11.066 11.511 11.949 12.088 11.971 11.76 11.531 11.29 11.039 10.779 10.544 10.321 10.111 9.909 9.706 9.497 9.306 9.116 8.914 8.745 8.596 8.437 8.266 8.129 7.999 7.871 7.765 7.648 7.513 7.378 7.252 7.16 7.06 6.909 6.8 6.689 6.628 6.496 6.366 6.22 6.148 5.828 5.888 5.801 5.72 5.508 5.39 5.28 5.163 4.973 4.746 4.499 4.035 -9 ,27100 ,TETRA ,17524450,Wed Nov 24 22:15:02 CET,Wed Nov 24 23:58:58 CET,0.0 0.419 0.595 0.769 0.927 1.06 1.17 1.283 1.522 1.637 1.749 1.697 2.02 2.09 2.262 2.433 2.588 2.662 2.795 2.928 3.123 3.248 3.374 3.545 3.706 3.864 4.008 4.151 4.326 4.496 4.659 4.843 5.023 5.215 5.435 5.66 5.859 6.083 6.328 6.588 6.865 7.169 7.493 7.801 8.152 8.508 8.909 9.342 9.79 10.24 10.619 10.639 10.476 10.253 9.994 9.732 9.462 9.194 8.962 8.712 8.484 8.278 8.077 7.885 7.711 7.54 7.349 7.169 7.009 6.866 6.714 6.571 6.437 6.303 6.19 6.062 5.93 5.799 5.668 5.57 5.469 5.329 5.242 5.142 5.089 4.979 4.855 4.728 4.656 4.33 4.396 4.318 4.232 4.034 3.928 3.828 3.703 3.509 3.297 3.091 2.51 -10 ,18607 ,TETRA ,17524452,Wed Nov 24 22:15:27 CET,Thu Nov 25 00:03:48 CET,0.0 0.783 1.108 1.311 1.489 1.639 1.778 1.915 2.129 2.232 2.344 2.323 2.671 2.752 2.901 3.044 3.175 3.243 3.393 3.548 3.766 3.895 4.008 4.173 4.329 4.471 4.611 4.75 4.93 5.102 5.274 5.485 5.682 5.869 6.076 6.312 6.541 6.793 7.062 7.326 7.608 7.929 8.27 8.606 8.978 9.37 9.82 10.294 10.779 11.273 11.736 11.865 11.689 11.435 11.148 10.859 10.614 10.379 10.145 9.877 9.635 9.422 9.217 9.008 8.811 8.634 8.434 8.251 8.113 7.977 7.809 7.666 7.524 7.37 7.253 7.134 7.009 6.875 6.74 6.64 6.534 6.385 6.277 6.159 6.099 5.979 5.848 5.699 5.618 5.281 5.355 5.263 5.166 4.957 4.843 4.731 4.61 4.473 4.323 3.98 3.381 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_35.txt deleted file mode 100644 index 51b6f375..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_35.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14811 ,KEBNE ,17022278,Wed Dec 22 05:26:32 CET,Wed Dec 22 06:51:39 CET,0.0 0.653 0.842 1.025 1.22 1.401 1.562 1.691 1.913 2.016 2.104 2.043 2.382 2.47 2.63 2.763 2.881 2.943 3.071 3.21 3.396 3.509 3.622 3.782 3.946 4.095 4.235 4.376 4.563 4.732 4.887 5.074 5.262 5.44 5.637 5.858 6.046 6.241 6.473 6.724 6.959 7.227 7.54 7.829 8.149 8.467 8.799 9.108 9.383 9.594 9.602 9.248 8.841 8.483 8.097 7.669 7.282 6.935 6.639 6.336 6.052 5.796 5.539 5.31 5.103 4.894 4.692 4.522 4.365 4.199 4.02 3.87 3.716 3.536 3.39 3.241 3.086 2.936 2.776 2.663 2.556 2.379 2.245 2.112 2.047 1.922 1.79 1.638 1.559 1.238 1.32 1.231 1.133 0.926 0.817 0.7 0.569 0.422 0.255 0.044 -0.306 -2 ,17034 ,KEBNE ,17022279,Wed Dec 22 05:27:34 CET,Wed Dec 22 06:54:25 CET,0.0 1.064 1.378 1.626 1.817 1.971 2.117 2.253 2.505 2.631 2.757 2.731 3.084 3.183 3.361 3.545 3.726 3.808 3.951 4.079 4.263 4.375 4.485 4.659 4.823 4.972 5.112 5.244 5.415 5.58 5.744 5.947 6.151 6.337 6.55 6.789 7.007 7.242 7.465 7.684 7.926 8.203 8.496 8.773 9.094 9.422 9.792 10.145 10.457 10.703 10.705 10.379 9.941 9.488 9.068 8.687 8.33 7.985 7.679 7.342 7.043 6.785 6.538 6.303 6.074 5.856 5.637 5.442 5.273 5.108 4.93 4.778 4.621 4.47 4.355 4.222 4.082 3.941 3.78 3.673 3.581 3.436 3.323 3.199 3.134 3.007 2.865 2.709 2.638 2.321 2.418 2.341 2.252 2.06 1.964 1.857 1.727 1.585 1.423 1.2 0.716 -3 ,27433 ,KEBNE ,17022280,Wed Dec 22 05:27:34 CET,Wed Dec 22 06:53:32 CET,0.0 0.812 1.11 1.354 1.581 1.778 1.93 2.068 2.356 2.481 2.587 2.544 2.883 2.972 3.136 3.307 3.469 3.551 3.717 3.861 4.08 4.218 4.339 4.499 4.657 4.81 4.96 5.1 5.262 5.411 5.564 5.762 5.957 6.142 6.338 6.559 6.78 7.018 7.272 7.526 7.772 8.064 8.398 8.707 9.049 9.427 9.829 10.184 10.493 10.753 10.826 10.523 10.137 9.77 9.354 8.921 8.537 8.193 7.876 7.551 7.26 6.995 6.77 6.562 6.356 6.152 5.935 5.746 5.586 5.43 5.264 5.131 4.984 4.817 4.688 4.556 4.433 4.306 4.165 4.073 3.983 3.838 3.731 3.621 3.561 3.42 3.28 3.139 3.069 2.742 2.832 2.759 2.682 2.528 2.432 2.321 2.206 2.081 1.941 1.766 1.375 -4 ,342 ,KEBNE ,17022281,Wed Dec 22 05:27:34 CET,Wed Dec 22 06:53:09 CET,0.0 0.807 1.176 1.387 1.568 1.737 1.896 2.042 2.276 2.394 2.517 2.475 2.826 2.926 3.112 3.27 3.419 3.504 3.675 3.822 4.032 4.155 4.277 4.462 4.634 4.797 4.954 5.093 5.273 5.471 5.657 5.867 6.059 6.237 6.444 6.67 6.883 7.108 7.344 7.596 7.835 8.083 8.366 8.636 8.967 9.344 9.678 9.991 10.317 10.528 10.504 10.184 9.811 9.416 9.022 8.653 8.297 7.929 7.607 7.291 7.027 6.792 6.566 6.357 6.156 5.96 5.757 5.576 5.417 5.255 5.081 4.937 4.789 4.624 4.489 4.364 4.237 4.093 3.944 3.847 3.744 3.567 3.437 3.302 3.236 3.101 2.951 2.786 2.706 2.381 2.441 2.344 2.259 2.073 1.962 1.833 1.706 1.581 1.448 1.275 0.865 -5 ,11060 ,KEBNE ,17022282,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:53:22 CET,0.0 0.824 1.15 1.385 1.582 1.741 1.894 2.05 2.334 2.456 2.571 2.532 2.866 2.959 3.143 3.314 3.474 3.55 3.691 3.825 4.015 4.138 4.257 4.43 4.596 4.748 4.898 5.042 5.218 5.383 5.543 5.73 5.91 6.089 6.291 6.519 6.739 6.965 7.207 7.456 7.716 8.005 8.332 8.652 8.98 9.303 9.63 9.937 10.199 10.369 10.354 10.063 9.685 9.289 8.899 8.505 8.138 7.795 7.483 7.158 6.872 6.62 6.381 6.148 5.92 5.712 5.517 5.341 5.177 5.0 4.813 4.657 4.492 4.316 4.183 4.059 3.931 3.792 3.65 3.545 3.437 3.276 3.166 3.058 3.0 2.89 2.764 2.618 2.546 2.217 2.292 2.208 2.129 1.961 1.867 1.762 1.638 1.46 1.231 1.011 0.264 -7 ,21172 ,KEBNE ,17022284,Wed Dec 22 05:27:34 CET,Wed Dec 22 06:53:33 CET,0.0 0.904 1.255 1.474 1.688 1.891 2.064 2.212 2.473 2.584 2.685 2.628 2.968 3.065 3.248 3.412 3.567 3.645 3.797 3.951 4.177 4.307 4.427 4.609 4.767 4.92 5.083 5.232 5.407 5.584 5.76 5.963 6.165 6.354 6.553 6.763 6.96 7.185 7.444 7.717 7.983 8.258 8.54 8.807 9.11 9.434 9.771 10.116 10.483 10.736 10.712 10.39 9.996 9.563 9.143 8.742 8.352 7.996 7.702 7.391 7.107 6.861 6.627 6.407 6.2 6.013 5.822 5.625 5.453 5.296 5.139 5.005 4.867 4.717 4.598 4.483 4.349 4.205 4.062 3.959 3.853 3.682 3.563 3.444 3.382 3.263 3.141 3.012 2.947 2.636 2.692 2.601 2.525 2.349 2.258 2.16 2.057 1.931 1.779 1.565 1.221 -8 ,8341 ,KEBNE ,17022285,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:53:01 CET,0.0 0.836 1.113 1.363 1.563 1.726 1.869 2.007 2.27 2.385 2.502 2.484 2.833 2.927 3.093 3.249 3.401 3.476 3.621 3.761 3.955 4.081 4.205 4.38 4.557 4.717 4.856 4.998 5.188 5.367 5.531 5.741 5.949 6.135 6.336 6.553 6.764 7.001 7.252 7.517 7.794 8.081 8.378 8.686 9.008 9.312 9.654 10.022 10.358 10.565 10.574 10.335 9.973 9.569 9.178 8.774 8.409 8.087 7.785 7.449 7.171 6.93 6.689 6.451 6.224 6.014 5.795 5.598 5.428 5.243 5.067 4.932 4.778 4.613 4.484 4.358 4.225 4.081 3.94 3.848 3.752 3.592 3.473 3.354 3.297 3.166 3.027 2.874 2.79 2.462 2.552 2.463 2.371 2.207 2.124 2.009 1.877 1.746 1.575 1.345 0.763 -9 ,28556 ,KEBNE ,17022286,Wed Dec 22 05:27:34 CET,Wed Dec 22 06:53:30 CET,0.0 0.834 1.146 1.4 1.62 1.814 1.988 2.141 2.41 2.541 2.668 2.637 2.987 3.087 3.271 3.433 3.587 3.66 3.8 3.941 4.136 4.252 4.368 4.539 4.703 4.852 5.0 5.151 5.332 5.502 5.668 5.863 6.054 6.237 6.434 6.637 6.829 7.036 7.256 7.486 7.71 7.951 8.225 8.472 8.743 9.039 9.358 9.675 9.995 10.243 10.273 10.018 9.658 9.269 8.847 8.423 8.043 7.675 7.346 7.038 6.763 6.499 6.26 6.034 5.827 5.638 5.419 5.207 5.018 4.829 4.634 4.474 4.313 4.146 4.008 3.861 3.715 3.573 3.432 3.331 3.226 3.043 2.92 2.8 2.736 2.614 2.483 2.34 2.264 1.935 2.028 1.942 1.849 1.658 1.559 1.45 1.332 1.201 1.04 0.843 0.474 -10 ,1933 ,KEBNE ,17022287,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:53:14 CET,0.0 0.759 1.005 1.178 1.338 1.481 1.62 1.773 2.041 2.161 2.274 2.238 2.608 2.718 2.906 3.077 3.24 3.314 3.447 3.573 3.754 3.871 3.989 4.165 4.325 4.475 4.614 4.742 4.919 5.091 5.248 5.435 5.615 5.787 5.982 6.209 6.434 6.674 6.92 7.176 7.441 7.705 7.997 8.289 8.61 8.948 9.288 9.601 9.889 10.148 10.244 10.015 9.637 9.219 8.783 8.37 8.002 7.646 7.353 7.077 6.827 6.588 6.338 6.099 5.884 5.699 5.5 5.31 5.14 4.947 4.76 4.611 4.456 4.301 4.171 4.033 3.892 3.741 3.583 3.477 3.376 3.229 3.123 3.001 2.941 2.821 2.685 2.537 2.463 2.14 2.197 2.082 1.977 1.76 1.654 1.541 1.406 1.26 1.046 0.718 -0.024 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_36.txt deleted file mode 100644 index aadf4f4b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_36.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11392 ,KEBNE ,17022288,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:51:59 CET,0.0 2.171 2.656 2.996 3.271 3.496 3.706 3.906 4.259 4.414 4.553 4.575 4.939 5.041 5.243 5.44 5.622 5.7 5.856 6.031 6.28 6.429 6.573 6.796 6.996 7.159 7.309 7.456 7.653 7.826 7.981 8.175 8.366 8.553 8.754 9.003 9.228 9.44 9.664 9.909 10.172 10.463 10.782 11.067 11.371 11.677 11.994 12.271 12.501 12.654 12.551 12.097 11.58 11.054 10.577 10.126 9.698 9.327 8.991 8.637 8.338 8.081 7.841 7.612 7.391 7.189 6.982 6.779 6.599 6.423 6.257 6.116 5.955 5.792 5.672 5.544 5.41 5.276 5.136 5.03 4.92 4.762 4.654 4.539 4.482 4.365 4.231 4.099 4.036 3.717 3.804 3.72 3.625 3.425 3.322 3.208 3.079 2.925 2.748 2.54 2.021 -2 ,3936 ,KEBNE ,17022289,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:52:55 CET,0.0 2.164 2.703 3.052 3.281 3.454 3.628 3.785 4.06 4.204 4.342 4.328 4.676 4.787 5.009 5.201 5.401 5.5 5.662 5.809 6.024 6.164 6.296 6.501 6.693 6.874 7.047 7.209 7.419 7.628 7.818 8.033 8.238 8.431 8.658 8.922 9.179 9.447 9.725 10.02 10.323 10.649 11.01 11.33 11.673 12.027 12.371 12.713 13.064 13.307 13.261 12.909 12.449 11.991 11.548 11.109 10.725 10.367 10.046 9.71 9.426 9.182 8.934 8.67 8.423 8.211 8.001 7.805 7.623 7.441 7.261 7.109 6.949 6.794 6.679 6.556 6.42 6.288 6.158 6.058 5.944 5.761 5.633 5.511 5.452 5.324 5.199 5.061 4.978 4.651 4.743 4.65 4.541 4.305 4.199 4.085 3.945 3.8 3.671 3.503 3.266 -3 ,15889 ,KEBNE ,17022290,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:52:03 CET,0.0 2.333 2.976 3.405 3.751 4.046 4.27 4.474 4.832 4.98 5.132 5.154 5.513 5.628 5.857 6.067 6.257 6.345 6.505 6.666 6.912 7.058 7.186 7.368 7.555 7.757 7.959 8.154 8.383 8.595 8.8 9.043 9.268 9.479 9.709 9.951 10.191 10.448 10.703 10.974 11.249 11.533 11.87 12.197 12.557 12.923 13.282 13.588 13.855 14.054 14.01 13.658 13.199 12.707 12.247 11.804 11.392 11.018 10.697 10.371 10.05 9.755 9.501 9.277 9.063 8.843 8.608 8.408 8.238 8.061 7.87 7.712 7.546 7.366 7.225 7.078 6.927 6.77 6.606 6.494 6.385 6.205 6.082 5.967 5.903 5.763 5.614 5.456 5.378 5.057 5.152 5.065 4.973 4.766 4.638 4.493 4.355 4.212 4.033 3.8 3.335 -4 ,6056 ,KEBNE ,17022291,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:54:29 CET,0.0 1.893 2.362 2.677 2.927 3.139 3.333 3.492 3.77 3.902 4.036 4.032 4.378 4.478 4.693 4.906 5.114 5.213 5.397 5.569 5.825 5.978 6.118 6.334 6.521 6.68 6.849 7.024 7.248 7.458 7.652 7.881 8.096 8.275 8.466 8.693 8.906 9.129 9.381 9.648 9.909 10.196 10.516 10.814 11.13 11.441 11.756 12.069 12.353 12.479 12.345 11.913 11.387 10.84 10.317 9.819 9.381 8.983 8.624 8.238 7.907 7.63 7.378 7.145 6.914 6.697 6.487 6.303 6.136 5.954 5.765 5.598 5.431 5.268 5.139 5.005 4.87 4.732 4.581 4.473 4.36 4.181 4.059 3.922 3.853 3.725 3.581 3.421 3.338 3.006 3.101 3.025 2.941 2.735 2.639 2.539 2.413 2.269 2.104 1.889 1.574 -5 ,22458 ,KEBNE ,17022292,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:53:05 CET,0.0 1.7 2.166 2.471 2.706 2.911 3.111 3.306 3.639 3.78 3.914 3.918 4.28 4.38 4.581 4.788 4.99 5.082 5.257 5.425 5.65 5.782 5.924 6.138 6.331 6.502 6.644 6.789 6.992 7.177 7.347 7.551 7.735 7.932 8.172 8.407 8.636 8.877 9.114 9.389 9.65 9.916 10.246 10.552 10.865 11.165 11.47 11.753 12.005 12.155 12.078 11.711 11.211 10.701 10.241 9.794 9.377 9.008 8.688 8.349 8.045 7.77 7.519 7.298 7.094 6.898 6.68 6.489 6.325 6.15 5.962 5.807 5.638 5.467 5.333 5.174 5.025 4.883 4.728 4.623 4.514 4.345 4.231 4.105 4.04 3.908 3.764 3.597 3.512 3.18 3.257 3.165 3.071 2.829 2.697 2.579 2.467 2.339 2.173 1.913 1.524 -6 ,2707 ,KEBNE ,17022293,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:54:33 CET,0.0 1.693 2.135 2.451 2.676 2.895 3.081 3.234 3.538 3.682 3.822 3.842 4.212 4.324 4.557 4.77 4.954 5.043 5.207 5.373 5.614 5.76 5.904 6.101 6.292 6.472 6.642 6.818 7.056 7.265 7.438 7.654 7.864 8.048 8.263 8.49 8.718 8.965 9.212 9.495 9.778 10.078 10.389 10.652 10.945 11.26 11.574 11.896 12.18 12.33 12.267 11.85 11.339 10.864 10.421 9.972 9.577 9.221 8.862 8.502 8.209 7.941 7.656 7.386 7.164 6.95 6.729 6.537 6.363 6.182 5.999 5.838 5.669 5.505 5.377 5.244 5.099 4.949 4.805 4.709 4.611 4.455 4.34 4.209 4.142 4.009 3.869 3.721 3.641 3.313 3.405 3.31 3.216 3.03 2.923 2.812 2.711 2.59 2.414 2.181 1.908 -7 ,12904 ,KEBNE ,17022294,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:53:10 CET,0.0 1.944 2.467 2.789 3.052 3.283 3.468 3.653 3.998 4.142 4.254 4.212 4.579 4.695 4.881 5.059 5.235 5.327 5.509 5.68 5.901 6.033 6.167 6.357 6.537 6.708 6.868 7.036 7.258 7.457 7.639 7.856 8.068 8.263 8.492 8.77 9.025 9.272 9.526 9.798 10.066 10.357 10.669 10.968 11.296 11.613 11.945 12.231 12.446 12.603 12.567 12.135 11.626 11.12 10.625 10.162 9.733 9.346 9.016 8.672 8.37 8.111 7.863 7.633 7.419 7.222 7.018 6.831 6.662 6.487 6.309 6.156 5.991 5.826 5.705 5.577 5.442 5.306 5.157 5.052 4.945 4.771 4.654 4.537 4.472 4.343 4.201 4.047 3.967 3.625 3.656 3.532 3.4 3.121 2.969 2.805 2.624 2.433 2.202 1.917 1.194 -8 ,16823 ,KEBNE ,17022295,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:52:35 CET,0.0 1.685 2.127 2.472 2.715 2.929 3.121 3.296 3.622 3.77 3.917 3.94 4.302 4.407 4.61 4.827 5.015 5.101 5.297 5.476 5.71 5.87 6.016 6.184 6.369 6.581 6.763 6.92 7.131 7.331 7.518 7.737 7.945 8.148 8.366 8.61 8.842 9.089 9.353 9.628 9.908 10.217 10.567 10.925 11.319 11.698 12.108 12.515 12.874 13.116 13.116 12.739 12.279 11.81 11.364 10.938 10.525 10.157 9.847 9.517 9.205 8.939 8.693 8.426 8.184 7.979 7.742 7.534 7.374 7.202 7.03 6.881 6.72 6.555 6.421 6.28 6.14 5.996 5.843 5.743 5.639 5.477 5.373 5.263 5.198 5.06 4.916 4.755 4.679 4.367 4.437 4.329 4.223 4.015 3.899 3.778 3.64 3.495 3.327 3.14 2.866 -9 ,18688 ,KEBNE ,17022296,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:52:41 CET,0.0 1.592 1.946 2.25 2.527 2.769 2.978 3.176 3.52 3.654 3.776 3.777 4.141 4.253 4.477 4.691 4.887 4.987 5.186 5.367 5.614 5.765 5.891 6.048 6.218 6.394 6.563 6.74 6.966 7.18 7.376 7.6 7.823 8.028 8.262 8.53 8.775 9.026 9.273 9.528 9.812 10.125 10.49 10.832 11.181 11.53 11.857 12.182 12.495 12.69 12.639 12.257 11.798 11.326 10.887 10.47 10.062 9.701 9.399 9.075 8.773 8.489 8.219 7.972 7.73 7.504 7.29 7.111 6.952 6.782 6.598 6.443 6.287 6.115 5.973 5.838 5.699 5.552 5.394 5.288 5.189 5.024 4.91 4.791 4.722 4.59 4.453 4.304 4.232 3.903 3.941 3.822 3.697 3.404 3.219 3.012 2.785 2.546 2.274 1.988 1.157 -10 ,24337 ,KEBNE ,17022297,Wed Dec 22 05:27:35 CET,Wed Dec 22 06:54:02 CET,0.0 1.407 1.863 2.228 2.473 2.689 2.889 3.062 3.373 3.509 3.643 3.661 4.037 4.153 4.359 4.553 4.732 4.82 4.999 5.169 5.387 5.524 5.669 5.869 6.053 6.24 6.407 6.551 6.737 6.918 7.106 7.349 7.582 7.807 8.057 8.336 8.585 8.837 9.119 9.411 9.688 9.987 10.328 10.62 10.922 11.221 11.512 11.8 12.03 12.143 11.998 11.521 11.018 10.497 10.007 9.57 9.184 8.807 8.464 8.141 7.871 7.613 7.368 7.138 6.919 6.719 6.51 6.316 6.14 5.962 5.78 5.637 5.484 5.322 5.202 5.078 4.949 4.806 4.648 4.545 4.439 4.254 4.125 4.0 3.933 3.807 3.69 3.553 3.476 3.15 3.226 3.136 3.052 2.867 2.76 2.636 2.513 2.394 2.26 2.12 1.684 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_37.txt deleted file mode 100644 index e8122e3a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15779 ,KEBNE ,17022298,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:53:04 CET,0.0 1.564 2.046 2.447 2.748 3.01 3.242 3.451 3.851 4.045 4.225 4.315 4.719 4.87 5.116 5.337 5.574 5.693 5.917 6.15 6.485 6.669 6.846 7.106 7.349 7.584 7.798 8.005 8.269 8.496 8.707 8.974 9.238 9.505 9.776 10.062 10.331 10.608 10.905 11.204 11.516 11.851 12.236 12.608 13.008 13.428 13.844 14.198 14.488 14.746 14.825 14.541 14.128 13.643 13.173 12.737 12.349 12.002 11.675 11.306 10.998 10.74 10.467 10.208 9.988 9.778 9.562 9.36 9.176 8.979 8.78 8.632 8.468 8.284 8.142 7.992 7.84 7.688 7.527 7.416 7.295 7.108 6.993 6.872 6.807 6.68 6.541 6.383 6.297 5.963 6.032 5.929 5.828 5.592 5.448 5.316 5.189 5.061 4.891 4.661 3.319 -2 ,23576 ,KEBNE ,17022299,Wed Dec 22 05:28:36 CET,Wed Dec 22 06:54:31 CET,0.0 2.317 3.071 3.53 3.861 4.166 4.424 4.651 5.053 5.22 5.369 5.405 5.778 5.908 6.147 6.37 6.595 6.702 6.907 7.092 7.337 7.489 7.637 7.849 8.058 8.27 8.463 8.653 8.893 9.109 9.319 9.574 9.81 10.017 10.258 10.552 10.841 11.152 11.478 11.812 12.153 12.542 12.983 13.389 13.842 14.27 14.657 15.046 15.405 15.625 15.641 15.344 14.908 14.418 13.931 13.464 13.015 12.612 12.273 11.924 11.609 11.34 11.083 10.829 10.594 10.375 10.156 9.951 9.763 9.567 9.351 9.177 9.0 8.819 8.682 8.533 8.379 8.221 8.063 7.957 7.84 7.649 7.506 7.355 7.288 7.141 6.978 6.82 6.736 6.396 6.452 6.358 6.258 6.013 5.888 5.745 5.589 5.417 5.242 5.035 3.669 -3 ,16487 ,KEBNE ,17022300,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:53:16 CET,0.0 2.089 2.719 3.121 3.427 3.686 3.931 4.165 4.562 4.743 4.909 4.997 5.412 5.551 5.783 6.022 6.236 6.338 6.549 6.743 7.021 7.199 7.368 7.596 7.805 7.999 8.187 8.375 8.607 8.839 9.07 9.32 9.543 9.764 10.032 10.328 10.601 10.887 11.188 11.503 11.82 12.172 12.552 12.884 13.251 13.643 14.028 14.386 14.714 14.939 14.956 14.619 14.153 13.686 13.207 12.712 12.266 11.879 11.563 11.259 10.995 10.752 10.517 10.286 10.074 9.885 9.671 9.456 9.268 9.08 8.889 8.73 8.569 8.403 8.266 8.128 7.994 7.847 7.689 7.58 7.464 7.297 7.176 7.046 6.983 6.842 6.701 6.566 6.485 6.15 6.217 6.11 6.004 5.77 5.638 5.508 5.359 5.178 5.006 4.838 4.047 -4 ,2082 ,KEBNE ,17022301,Wed Dec 22 05:28:36 CET,Wed Dec 22 06:54:19 CET,0.0 1.88 2.428 2.804 3.078 3.314 3.525 3.69 3.971 4.112 4.239 4.258 4.646 4.783 5.038 5.283 5.506 5.61 5.809 6.008 6.298 6.472 6.628 6.844 7.068 7.292 7.505 7.695 7.931 8.18 8.423 8.685 8.921 9.16 9.448 9.782 10.099 10.411 10.714 11.023 11.326 11.639 12.004 12.359 12.729 13.085 13.483 13.915 14.326 14.651 14.767 14.473 14.013 13.542 13.077 12.647 12.278 11.957 11.669 11.352 11.058 10.784 10.544 10.313 10.088 9.876 9.641 9.444 9.282 9.097 8.889 8.721 8.538 8.345 8.197 8.047 7.899 7.755 7.608 7.505 7.401 7.24 7.134 7.016 6.947 6.794 6.635 6.487 6.412 6.1 6.176 6.073 5.974 5.773 5.649 5.508 5.359 5.204 5.004 4.735 4.116 -5 ,1434 ,KEBNE ,17022302,Wed Dec 22 05:28:36 CET,Wed Dec 22 06:54:36 CET,0.0 1.467 1.987 2.332 2.601 2.838 3.047 3.229 3.538 3.671 3.792 3.783 4.139 4.264 4.533 4.782 5.042 5.178 5.417 5.638 5.935 6.085 6.226 6.443 6.636 6.827 7.029 7.217 7.448 7.664 7.88 8.142 8.369 8.567 8.81 9.091 9.339 9.629 9.951 10.264 10.579 10.913 11.258 11.594 11.961 12.35 12.802 13.227 13.577 13.792 13.751 13.409 12.933 12.409 11.93 11.454 10.986 10.561 10.223 9.899 9.585 9.279 8.996 8.739 8.502 8.291 8.074 7.87 7.683 7.481 7.272 7.111 6.948 6.761 6.609 6.466 6.322 6.169 5.979 5.826 5.67 5.438 5.288 5.143 5.07 4.916 4.769 4.608 4.509 4.157 4.151 4.02 3.88 3.547 3.369 3.197 3.028 2.835 2.58 2.228 1.145 -6 ,30169 ,KEBNE ,17022303,Wed Dec 22 05:28:41 CET,Wed Dec 22 06:48:14 CET,0.0 1.351 1.761 2.121 2.402 2.638 2.867 3.071 3.447 3.612 3.764 3.825 4.202 4.331 4.567 4.766 4.967 5.079 5.32 5.521 5.765 5.934 6.109 6.362 6.597 6.821 7.031 7.227 7.475 7.716 7.947 8.203 8.458 8.716 8.994 9.277 9.521 9.75 9.993 10.266 10.544 10.861 11.226 11.556 11.909 12.272 12.638 12.979 13.271 13.453 13.312 12.786 12.273 11.755 11.26 10.85 10.469 10.081 9.732 9.376 9.077 8.82 8.563 8.317 8.091 7.893 7.685 7.49 7.326 7.158 6.986 6.843 6.683 6.516 6.387 6.245 6.091 5.923 5.756 5.646 5.52 5.323 5.191 5.053 4.981 4.846 4.706 4.541 4.456 4.116 4.153 4.051 3.941 3.72 3.573 3.384 3.18 2.982 2.794 2.558 1.981 -7 ,30233 ,KEBNE ,17022304,Wed Dec 22 05:28:40 CET,Wed Dec 22 06:53:53 CET,0.0 1.534 1.992 2.348 2.654 2.934 3.191 3.407 3.77 3.928 4.084 4.143 4.525 4.657 4.891 5.121 5.365 5.477 5.686 5.897 6.211 6.398 6.577 6.825 7.062 7.297 7.517 7.716 7.955 8.192 8.425 8.725 9.003 9.247 9.528 9.85 10.171 10.515 10.864 11.227 11.579 11.951 12.36 12.744 13.206 13.634 14.028 14.41 14.719 14.939 14.956 14.598 14.108 13.605 13.142 12.71 12.325 11.96 11.624 11.263 10.93 10.634 10.363 10.107 9.855 9.612 9.364 9.146 8.96 8.765 8.551 8.371 8.181 7.996 7.849 7.683 7.532 7.396 7.247 7.131 7.004 6.815 6.688 6.549 6.472 6.317 6.171 6.024 5.944 5.615 5.689 5.593 5.483 5.231 5.094 4.952 4.808 4.662 4.48 4.086 2.15 -8 ,27889 ,KEBNE ,17022305,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:54:22 CET,0.0 2.681 3.207 3.566 3.879 4.132 4.349 4.548 4.907 5.099 5.304 5.404 5.798 5.927 6.175 6.428 6.687 6.808 7.032 7.239 7.508 7.681 7.85 8.093 8.327 8.539 8.739 8.937 9.186 9.409 9.612 9.865 10.106 10.335 10.605 10.883 11.142 11.406 11.656 11.927 12.231 12.586 12.967 13.327 13.739 14.169 14.615 14.987 15.326 15.679 15.797 15.591 15.219 14.739 14.254 13.805 13.414 13.012 12.622 12.248 11.946 11.693 11.416 11.145 10.921 10.722 10.514 10.315 10.135 9.944 9.748 9.591 9.426 9.246 9.11 8.97 8.825 8.68 8.515 8.388 8.26 8.071 7.938 7.808 7.737 7.583 7.437 7.279 7.196 6.855 6.915 6.819 6.725 6.519 6.408 6.314 6.188 6.022 5.854 5.671 4.876 -9 ,3177 ,KEBNE ,17022306,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:53:28 CET,0.0 2.886 3.462 3.785 4.045 4.319 4.59 4.828 5.184 5.332 5.469 5.483 5.857 5.98 6.212 6.424 6.625 6.729 6.925 7.104 7.376 7.551 7.711 7.931 8.148 8.358 8.548 8.723 8.944 9.161 9.372 9.617 9.841 10.07 10.339 10.636 10.912 11.209 11.526 11.824 12.119 12.433 12.768 13.097 13.468 13.857 14.273 14.649 14.997 15.25 15.246 14.904 14.425 13.949 13.489 13.069 12.684 12.321 12.002 11.69 11.425 11.175 10.925 10.675 10.437 10.223 9.991 9.764 9.569 9.373 9.166 9.0 8.821 8.627 8.477 8.328 8.174 8.002 7.828 7.704 7.566 7.376 7.253 7.126 7.062 6.912 6.747 6.591 6.505 6.165 6.234 6.139 6.047 5.813 5.668 5.522 5.374 5.181 4.974 4.741 3.966 -10 ,2281 ,KEBNE ,17022307,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:54:27 CET,0.0 1.918 2.382 2.728 3.016 3.256 3.473 3.694 4.096 4.266 4.424 4.503 4.893 5.029 5.29 5.521 5.724 5.842 6.093 6.305 6.578 6.745 6.911 7.151 7.377 7.601 7.82 8.026 8.264 8.482 8.715 8.997 9.249 9.489 9.763 10.049 10.322 10.623 10.935 11.262 11.595 11.943 12.31 12.638 12.986 13.328 13.669 13.996 14.272 14.457 14.428 14.049 13.568 13.067 12.595 12.162 11.728 11.339 11.003 10.642 10.339 10.076 9.825 9.579 9.357 9.15 8.921 8.728 8.555 8.359 8.15 7.971 7.775 7.588 7.466 7.352 7.218 7.067 6.907 6.788 6.654 6.463 6.342 6.219 6.156 6.02 5.866 5.7 5.618 5.298 5.363 5.277 5.189 4.983 4.858 4.697 4.493 4.253 3.992 3.665 2.73 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_54.txt deleted file mode 100644 index e3e02c96..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_54.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25409 ,KEBNE ,17022308,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:54:56 CET,0.0 5.706 6.243 6.655 6.988 7.25 7.478 7.684 8.058 8.252 8.429 8.493 8.883 9.022 9.294 9.532 9.753 9.86 10.075 10.289 10.59 10.781 10.972 11.238 11.485 11.722 11.935 12.151 12.442 12.713 12.97 13.282 13.601 13.91 14.232 14.535 14.795 15.062 15.331 15.627 15.928 16.219 16.562 16.904 17.266 17.69 18.154 18.65 19.136 19.446 19.505 19.184 18.728 18.251 17.819 17.425 17.055 16.7 16.383 16.072 15.804 15.544 15.296 15.076 14.864 14.656 14.446 14.245 14.066 13.892 13.72 13.568 13.404 13.238 13.105 12.956 12.799 12.649 12.503 12.404 12.291 12.1 11.979 11.858 11.793 11.656 11.497 11.321 11.239 10.922 10.994 10.895 10.785 10.545 10.422 10.29 10.134 9.983 9.83 9.525 8.827 -2 ,29851 ,KEBNE ,17022309,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:54:49 CET,0.0 3.489 3.96 4.368 4.727 5.045 5.311 5.521 5.86 6.023 6.169 6.166 6.54 6.659 6.882 7.09 7.276 7.366 7.537 7.704 7.934 8.07 8.209 8.419 8.605 8.78 8.942 9.102 9.326 9.552 9.769 10.012 10.235 10.431 10.658 10.932 11.181 11.457 11.749 12.051 12.386 12.785 13.288 13.744 14.234 14.737 15.174 15.569 15.933 16.305 16.483 16.215 15.779 15.317 14.907 14.522 14.16 13.802 13.488 13.171 12.888 12.636 12.378 12.128 11.904 11.705 11.501 11.305 11.126 10.945 10.759 10.585 10.403 10.228 10.08 9.932 9.78 9.613 9.45 9.337 9.221 9.035 8.892 8.733 8.664 8.545 8.407 8.255 8.17 7.844 7.901 7.804 7.701 7.479 7.36 7.178 6.963 6.746 6.522 6.289 4.231 -4 ,4407 ,KEBNE ,17022311,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:54:36 CET,0.0 2.982 3.562 3.917 4.202 4.418 4.627 4.802 5.086 5.223 5.367 5.385 5.739 5.855 6.075 6.271 6.454 6.543 6.717 6.878 7.107 7.252 7.393 7.616 7.846 8.055 8.246 8.433 8.663 8.881 9.094 9.36 9.647 9.919 10.182 10.452 10.712 10.983 11.266 11.574 11.899 12.243 12.609 12.988 13.417 13.821 14.294 14.772 15.167 15.503 15.662 15.429 15.037 14.613 14.178 13.762 13.383 12.997 12.655 12.308 12.003 11.744 11.493 11.244 11.012 10.799 10.58 10.395 10.228 10.051 9.861 9.693 9.525 9.325 9.174 9.036 8.883 8.724 8.556 8.448 8.341 8.158 8.03 7.905 7.838 7.691 7.534 7.374 7.293 6.962 7.034 6.947 6.852 6.648 6.531 6.39 6.25 6.107 5.926 5.677 4.664 -5 ,18093 ,KEBNE ,17022312,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:55:29 CET,0.0 1.389 1.84 2.16 2.388 2.622 2.825 3.01 3.402 3.566 3.708 3.732 4.093 4.198 4.387 4.564 4.762 4.867 5.061 5.231 5.476 5.64 5.797 6.022 6.225 6.424 6.64 6.85 7.121 7.387 7.636 7.944 8.247 8.517 8.806 9.105 9.346 9.579 9.842 10.132 10.426 10.749 11.119 11.472 11.859 12.254 12.64 13.052 13.453 13.762 13.95 13.799 13.484 13.138 12.788 12.39 12.023 11.689 11.381 11.066 10.776 10.516 10.275 10.046 9.827 9.618 9.389 9.194 9.04 8.879 8.707 8.555 8.397 8.229 8.1 7.966 7.815 7.65 7.48 7.375 7.269 7.084 6.953 6.809 6.732 6.595 6.451 6.287 6.204 5.887 5.972 5.89 5.796 5.57 5.445 5.318 5.164 4.97 4.707 4.381 3.143 -6 ,15238 ,KEBNE ,17022313,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:54:02 CET,0.0 2.85 3.381 3.798 4.123 4.391 4.632 4.848 5.199 5.363 5.526 5.585 5.976 6.115 6.361 6.594 6.818 6.932 7.138 7.314 7.555 7.699 7.845 8.051 8.232 8.432 8.639 8.823 9.041 9.249 9.454 9.688 9.912 10.124 10.36 10.63 10.882 11.168 11.48 11.788 12.094 12.412 12.763 13.126 13.555 13.967 14.357 14.773 15.257 15.745 16.061 16.021 15.68 15.255 14.891 14.562 14.215 13.859 13.543 13.226 12.952 12.69 12.433 12.199 11.987 11.783 11.574 11.391 11.226 11.05 10.865 10.712 10.555 10.385 10.248 10.104 9.966 9.829 9.674 9.566 9.47 9.324 9.207 9.081 9.019 8.886 8.737 8.58 8.495 8.173 8.245 8.14 8.039 7.834 7.718 7.603 7.448 7.266 7.023 6.712 5.601 -7 ,23546 ,KEBNE ,17022314,Wed Dec 22 05:28:36 CET,Wed Dec 22 06:53:53 CET,0.0 2.384 2.826 3.181 3.462 3.703 3.914 4.11 4.524 4.696 4.851 4.944 5.364 5.497 5.756 6.022 6.264 6.374 6.584 6.799 7.086 7.271 7.454 7.698 7.915 8.12 8.327 8.528 8.799 9.068 9.306 9.592 9.895 10.15 10.404 10.676 10.923 11.177 11.421 11.669 11.92 12.205 12.526 12.86 13.278 13.746 14.32 14.887 15.36 15.738 15.93 15.773 15.364 14.904 14.487 14.035 13.622 13.244 12.889 12.515 12.21 11.942 11.675 11.417 11.165 10.931 10.694 10.472 10.275 10.086 9.899 9.747 9.595 9.432 9.303 9.173 9.044 8.916 8.768 8.664 8.556 8.401 8.295 8.164 8.098 7.968 7.833 7.7 7.627 7.297 7.35 7.26 7.17 6.969 6.846 6.724 6.615 6.468 6.256 5.984 3.845 -8 ,29559 ,KEBNE ,17022315,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:53:38 CET,0.0 2.792 3.288 3.705 4.084 4.348 4.564 4.766 5.116 5.267 5.422 5.489 5.891 6.034 6.286 6.529 6.759 6.867 7.078 7.267 7.525 7.698 7.863 8.096 8.314 8.529 8.726 8.899 9.115 9.326 9.525 9.753 9.981 10.207 10.443 10.684 10.909 11.159 11.411 11.665 11.928 12.205 12.525 12.806 13.107 13.482 13.892 14.258 14.568 14.84 14.912 14.597 14.212 13.858 13.511 13.178 12.847 12.5 12.186 11.852 11.554 11.286 11.044 10.803 10.567 10.366 10.147 9.94 9.75 9.566 9.382 9.214 9.055 8.899 8.773 8.644 8.508 8.363 8.206 8.097 7.991 7.828 7.714 7.591 7.524 7.401 7.269 7.105 7.012 6.67 6.725 6.628 6.538 6.333 6.213 6.084 5.939 5.782 5.611 5.299 2.344 -9 ,27935 ,KEBNE ,17022316,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:53:14 CET,0.0 1.811 2.183 2.485 2.768 3.006 3.205 3.371 3.724 3.905 4.056 4.065 4.443 4.559 4.791 5.034 5.227 5.31 5.497 5.683 5.95 6.105 6.255 6.483 6.7 6.907 7.096 7.279 7.511 7.723 7.932 8.189 8.425 8.662 8.971 9.293 9.576 9.869 10.168 10.477 10.779 11.082 11.379 11.697 12.097 12.493 12.911 13.362 13.892 14.412 14.56 14.308 13.949 13.57 13.17 12.721 12.332 11.986 11.666 11.349 11.073 10.807 10.544 10.299 10.079 9.887 9.662 9.446 9.272 9.087 8.903 8.761 8.609 8.461 8.347 8.217 8.081 7.946 7.802 7.699 7.594 7.424 7.31 7.197 7.138 7.011 6.869 6.726 6.644 6.321 6.381 6.293 6.198 5.962 5.826 5.689 5.567 5.443 5.269 4.965 1.626 -10 ,18299 ,KEBNE ,17022317,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:54:26 CET,0.0 2.336 2.888 3.243 3.55 3.815 4.047 4.268 4.657 4.83 4.998 5.047 5.422 5.548 5.78 6.005 6.244 6.355 6.54 6.698 6.915 7.062 7.207 7.417 7.63 7.83 8.017 8.192 8.399 8.607 8.805 9.031 9.258 9.482 9.727 9.974 10.211 10.481 10.748 11.019 11.294 11.619 12.012 12.38 12.778 13.204 13.634 14.008 14.368 14.648 14.72 14.439 14.009 13.56 13.098 12.64 12.242 11.869 11.524 11.172 10.849 10.559 10.303 10.061 9.832 9.623 9.409 9.222 9.06 8.888 8.714 8.569 8.402 8.227 8.092 7.951 7.809 7.655 7.486 7.372 7.252 7.075 6.947 6.809 6.74 6.601 6.466 6.328 6.263 5.94 6.006 5.92 5.821 5.597 5.483 5.339 5.174 5.016 4.832 4.52 2.752 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_64.txt deleted file mode 100644 index 2c34405c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_33_64.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,32122 ,KEBNE ,17022319,Wed Dec 22 05:28:37 CET,Wed Dec 22 06:53:04 CET,0.0 1.753 2.391 2.983 3.496 3.883 4.215 4.521 5.056 5.263 5.447 5.54 5.925 6.074 6.384 6.685 6.958 7.087 7.336 7.585 7.947 8.188 8.426 8.764 9.086 9.391 9.691 9.99 10.37 10.702 10.982 11.309 11.648 11.971 12.337 12.76 13.149 13.582 14.086 14.647 15.272 15.948 16.645 17.333 18.146 19.055 20.101 21.316 22.718 24.313 26.203 27.617 28.231 28.494 28.638 28.735 28.788 28.732 28.608 28.426 28.231 28.08 27.925 27.759 27.601 27.456 27.298 27.152 27.023 26.888 26.737 26.593 26.433 26.267 26.142 26.013 25.886 25.749 25.603 25.503 25.402 25.245 25.122 24.998 24.931 24.793 24.645 24.486 24.415 24.118 24.208 24.135 24.05 23.856 23.755 23.645 23.507 23.329 23.086 22.741 21.326 -3 ,17244 ,KEBNE ,17022320,Wed Dec 22 05:29:42 CET,Wed Dec 22 06:54:25 CET,0.0 3.463 3.984 4.402 4.766 5.064 5.324 5.577 6.029 6.221 6.398 6.489 6.896 7.062 7.366 7.657 7.934 8.063 8.33 8.603 9.012 9.267 9.512 9.863 10.18 10.502 10.817 11.106 11.482 11.851 12.201 12.591 12.962 13.307 13.71 14.202 14.645 15.108 15.596 16.101 16.652 17.282 18.006 18.73 19.543 20.427 21.445 22.572 23.921 25.482 27.273 28.553 29.118 29.352 29.368 29.241 29.106 29.017 28.919 28.777 28.635 28.494 28.346 28.204 28.076 27.968 27.854 27.731 27.605 27.479 27.343 27.221 27.108 27.005 26.925 26.83 26.73 26.642 26.551 26.477 26.392 26.236 26.124 26.01 25.951 25.809 25.64 25.473 25.381 25.036 25.05 24.938 24.833 24.603 24.451 24.286 24.109 23.901 23.641 23.28 21.563 -4 ,5234 ,KEBNE ,17022321,Wed Dec 22 05:29:38 CET,Wed Dec 22 06:54:20 CET,0.0 3.847 4.475 4.867 5.241 5.554 5.816 6.084 6.57 6.794 6.995 7.14 7.574 7.739 8.03 8.312 8.567 8.692 8.951 9.194 9.509 9.707 9.915 10.228 10.51 10.77 11.011 11.253 11.591 11.92 12.228 12.6 12.966 13.315 13.714 14.171 14.588 15.031 15.519 16.064 16.64 17.261 17.976 18.656 19.459 20.359 21.426 22.577 23.74 25.161 26.856 27.953 28.477 28.837 29.002 29.035 29.025 28.971 28.9 28.816 28.722 28.615 28.486 28.352 28.21 28.066 27.919 27.787 27.663 27.522 27.387 27.286 27.168 27.042 26.945 26.839 26.732 26.622 26.514 26.449 26.374 26.215 26.097 25.993 25.934 25.813 25.697 25.561 25.494 25.206 25.289 25.215 25.124 24.937 24.846 24.741 24.629 24.496 24.314 24.029 22.07 -5 ,3073 ,KEBNE ,17022322,Wed Dec 22 05:29:38 CET,Wed Dec 22 06:55:55 CET,0.0 2.2 2.736 3.083 3.388 3.665 3.897 4.112 4.493 4.671 4.862 5.001 5.435 5.616 5.932 6.224 6.5 6.628 6.858 7.083 7.413 7.617 7.808 8.094 8.379 8.669 8.959 9.218 9.532 9.827 10.115 10.47 10.801 11.117 11.501 11.925 12.302 12.694 13.129 13.635 14.176 14.764 15.432 16.103 16.891 17.721 18.664 19.759 21.088 22.659 24.412 25.682 26.332 26.671 26.837 26.903 26.887 26.819 26.722 26.586 26.446 26.318 26.193 26.069 25.941 25.835 25.727 25.613 25.506 25.395 25.266 25.14 25.009 24.878 24.77 24.647 24.521 24.388 24.243 24.147 24.045 23.877 23.764 23.651 23.596 23.481 23.348 23.21 23.141 22.84 22.912 22.825 22.742 22.521 22.402 22.297 22.148 21.956 21.754 21.507 20.563 -6 ,7104 ,KEBNE ,17022323,Wed Dec 22 05:29:38 CET,Wed Dec 22 06:54:36 CET,0.0 4.199 4.927 5.377 5.76 6.103 6.389 6.673 7.193 7.415 7.607 7.746 8.188 8.378 8.712 9.025 9.329 9.484 9.775 10.04 10.43 10.666 10.889 11.205 11.506 11.804 12.092 12.373 12.716 13.046 13.367 13.745 14.108 14.461 14.855 15.29 15.725 16.207 16.718 17.27 17.834 18.438 19.142 19.846 20.64 21.552 22.637 23.787 25.1 26.596 28.257 29.484 30.054 30.33 30.47 30.483 30.412 30.304 30.187 30.039 29.897 29.745 29.602 29.485 29.354 29.219 29.069 28.949 28.866 28.775 28.653 28.543 28.432 28.317 28.223 28.108 27.989 27.868 27.732 27.634 27.532 27.372 27.249 27.127 27.072 26.955 26.829 26.683 26.6 26.272 26.297 26.212 26.122 25.917 25.803 25.672 25.508 25.312 25.107 24.903 24.156 -7 ,3542 ,KEBNE ,17022324,Wed Dec 22 05:29:38 CET,Wed Dec 22 06:55:40 CET,0.0 7.115 7.747 8.21 8.608 8.963 9.278 9.568 10.153 10.429 10.659 10.833 11.275 11.466 11.848 12.223 12.586 12.752 13.049 13.321 13.715 13.969 14.205 14.542 14.86 15.154 15.443 15.722 16.064 16.381 16.692 17.082 17.444 17.797 18.231 18.7 19.133 19.581 20.043 20.537 21.065 21.648 22.291 22.959 23.792 24.73 25.795 26.968 28.282 29.837 31.56 32.768 33.403 33.795 34.007 34.141 34.191 34.113 33.966 33.788 33.601 33.427 33.279 33.144 32.991 32.834 32.671 32.516 32.363 32.202 32.055 31.928 31.797 31.67 31.574 31.472 31.359 31.242 31.123 31.035 30.946 30.813 30.723 30.632 30.573 30.441 30.321 30.2 30.129 29.828 29.938 29.859 29.767 29.58 29.464 29.334 29.206 29.057 28.79 28.403 26.489 -8 ,9795 ,KEBNE ,17022325,Wed Dec 22 05:29:38 CET,Wed Dec 22 06:55:13 CET,0.0 4.823 5.449 5.937 6.302 6.605 6.898 7.154 7.567 7.755 7.934 8.047 8.464 8.625 8.936 9.229 9.498 9.63 9.892 10.135 10.504 10.743 10.96 11.27 11.553 11.811 12.065 12.324 12.64 12.954 13.262 13.633 14.005 14.357 14.773 15.226 15.636 16.083 16.574 17.11 17.689 18.358 19.108 19.839 20.692 21.577 22.57 23.671 24.928 26.417 28.091 29.373 30.073 30.474 30.702 30.809 30.792 30.717 30.637 30.528 30.407 30.289 30.158 29.999 29.851 29.717 29.546 29.367 29.221 29.088 28.968 28.879 28.785 28.677 28.585 28.489 28.387 28.271 28.151 28.073 27.989 27.855 27.75 27.631 27.566 27.43 27.3 27.135 27.05 26.748 26.802 26.714 26.6 26.32 26.184 26.029 25.828 25.64 25.414 25.026 23.643 -9 ,32667 ,KEBNE ,17022326,Wed Dec 22 05:29:38 CET,Wed Dec 22 06:56:13 CET,0.0 3.0 3.662 4.101 4.433 4.739 5.0 5.235 5.651 5.843 6.033 6.154 6.583 6.751 7.03 7.289 7.562 7.698 7.959 8.19 8.498 8.712 8.923 9.21 9.473 9.734 9.997 10.255 10.581 10.9 11.211 11.602 11.987 12.342 12.752 13.202 13.617 14.077 14.604 15.167 15.752 16.408 17.146 17.921 18.817 19.746 20.818 22.011 23.335 24.814 26.492 27.769 28.413 28.71 28.859 28.951 28.986 28.976 28.931 28.88 28.82 28.74 28.651 28.558 28.465 28.371 28.257 28.157 28.071 27.979 27.872 27.774 27.672 27.563 27.481 27.388 27.283 27.168 27.048 26.962 26.872 26.737 26.638 26.534 26.485 26.381 26.262 26.134 26.067 25.771 25.855 25.778 25.693 25.492 25.383 25.273 25.134 24.958 24.752 24.458 23.043 -10 ,14339 ,KEBNE ,17022327,Wed Dec 22 05:29:38 CET,Wed Dec 22 06:55:20 CET,0.0 2.945 3.578 4.013 4.384 4.719 4.997 5.238 5.647 5.844 6.044 6.144 6.54 6.703 7.024 7.33 7.62 7.756 8.039 8.335 8.766 9.036 9.293 9.656 9.99 10.315 10.621 10.89 11.23 11.539 11.823 12.164 12.493 12.809 13.188 13.683 14.175 14.673 15.213 15.808 16.39 16.991 17.664 18.314 19.063 19.881 20.83 21.896 23.139 24.604 26.298 27.576 28.134 28.308 28.366 28.356 28.315 28.242 28.106 27.896 27.7 27.558 27.441 27.349 27.261 27.153 27.038 26.936 26.846 26.747 26.629 26.523 26.421 26.321 26.228 26.123 26.01 25.903 25.798 25.719 25.637 25.484 25.363 25.244 25.184 25.049 24.907 24.757 24.682 24.379 24.446 24.365 24.267 24.045 23.933 23.819 23.685 23.486 23.19 22.885 21.407 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_35_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_35_36.txt deleted file mode 100644 index 46d5f3a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_35_36.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5542 ,KEBNE ,17022328,Wed Dec 22 05:30:40 CET,Wed Dec 22 06:57:16 CET,0.0 0.898 1.174 1.388 1.602 1.808 1.993 2.158 2.437 2.577 2.719 2.705 3.058 3.161 3.325 3.492 3.662 3.738 3.879 4.018 4.217 4.332 4.446 4.63 4.811 4.986 5.147 5.287 5.472 5.644 5.814 6.019 6.206 6.401 6.606 6.824 7.061 7.304 7.55 7.81 8.082 8.387 8.755 9.118 9.487 9.837 10.211 10.607 10.985 11.26 11.343 11.111 10.718 10.306 9.923 9.527 9.137 8.779 8.461 8.136 7.842 7.58 7.337 7.095 6.87 6.652 6.424 6.226 6.052 5.873 5.684 5.526 5.362 5.202 5.065 4.913 4.767 4.619 4.452 4.334 4.221 4.048 3.925 3.795 3.73 3.592 3.424 3.258 3.188 2.87 2.977 2.906 2.821 2.609 2.481 2.361 2.227 2.081 1.926 1.723 1.406 -2 ,18232 ,KEBNE ,17022329,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:57:41 CET,0.0 1.375 1.723 1.99 2.209 2.395 2.551 2.703 2.997 3.112 3.208 3.142 3.49 3.6 3.806 4.001 4.197 4.281 4.418 4.555 4.77 4.917 5.058 5.232 5.392 5.549 5.701 5.85 6.052 6.246 6.419 6.619 6.83 7.039 7.261 7.48 7.681 7.911 8.147 8.395 8.653 8.938 9.268 9.569 9.876 10.205 10.575 10.911 11.189 11.423 11.479 11.179 10.774 10.327 9.901 9.528 9.176 8.83 8.522 8.199 7.899 7.637 7.398 7.16 6.931 6.731 6.532 6.347 6.188 6.029 5.843 5.681 5.514 5.342 5.207 5.067 4.927 4.776 4.628 4.533 4.426 4.268 4.164 4.035 3.965 3.82 3.669 3.515 3.435 3.113 3.203 3.11 3.02 2.832 2.702 2.559 2.412 2.237 2.033 1.762 0.873 -3 ,14850 ,KEBNE ,17022330,Wed Dec 22 05:30:41 CET,Wed Dec 22 06:55:41 CET,0.0 0.789 1.127 1.397 1.647 1.858 2.044 2.231 2.502 2.621 2.746 2.723 3.074 3.179 3.376 3.564 3.74 3.827 3.987 4.134 4.344 4.477 4.598 4.779 4.965 5.145 5.313 5.471 5.671 5.859 6.045 6.269 6.485 6.691 6.899 7.113 7.348 7.604 7.843 8.109 8.383 8.667 8.997 9.346 9.766 10.17 10.541 10.887 11.236 11.493 11.544 11.323 10.939 10.525 10.119 9.734 9.358 8.985 8.667 8.332 8.025 7.764 7.511 7.255 7.022 6.825 6.614 6.404 6.223 6.042 5.857 5.706 5.548 5.385 5.259 5.125 4.988 4.856 4.714 4.599 4.489 4.329 4.206 4.074 4.007 3.868 3.734 3.599 3.527 3.19 3.231 3.122 3.024 2.807 2.677 2.546 2.429 2.303 2.131 1.878 1.479 -4 ,28551 ,KEBNE ,17022331,Wed Dec 22 05:30:40 CET,Wed Dec 22 06:56:47 CET,0.0 1.682 2.02 2.264 2.492 2.686 2.871 3.039 3.323 3.459 3.581 3.571 3.934 4.045 4.246 4.432 4.596 4.68 4.859 5.017 5.215 5.338 5.468 5.661 5.828 5.991 6.159 6.316 6.507 6.695 6.878 7.091 7.283 7.471 7.691 7.914 8.119 8.346 8.584 8.823 9.097 9.423 9.764 10.085 10.449 10.841 11.256 11.663 12.07 12.383 12.434 12.184 11.836 11.433 11.05 10.692 10.343 9.962 9.607 9.247 8.92 8.647 8.406 8.181 7.962 7.748 7.53 7.333 7.16 6.98 6.798 6.647 6.483 6.302 6.149 5.993 5.847 5.711 5.553 5.442 5.341 5.174 5.047 4.929 4.871 4.734 4.582 4.407 4.309 3.961 3.981 3.857 3.719 3.425 3.267 3.095 2.918 2.699 2.416 2.069 1.261 -5 ,12651 ,KEBNE ,17022332,Wed Dec 22 05:30:42 CET,Wed Dec 22 06:53:59 CET,0.0 0.988 1.334 1.649 1.882 2.089 2.293 2.463 2.777 2.914 3.033 3.018 3.371 3.471 3.655 3.828 4.005 4.085 4.239 4.397 4.618 4.764 4.91 5.103 5.292 5.471 5.641 5.805 6.027 6.233 6.412 6.636 6.848 7.047 7.274 7.524 7.752 7.989 8.246 8.539 8.84 9.129 9.453 9.759 10.095 10.431 10.747 11.077 11.423 11.691 11.69 11.389 10.981 10.561 10.139 9.731 9.355 9.018 8.728 8.407 8.113 7.853 7.589 7.33 7.092 6.874 6.659 6.476 6.312 6.132 5.944 5.792 5.652 5.494 5.353 5.208 5.061 4.915 4.768 4.671 4.572 4.398 4.267 4.133 4.073 3.964 3.833 3.683 3.609 3.283 3.362 3.279 3.202 3.032 2.923 2.804 2.679 2.53 2.347 2.181 1.767 -6 ,28087 ,KEBNE ,17022333,Wed Dec 22 05:30:40 CET,Wed Dec 22 06:55:38 CET,0.0 0.914 1.325 1.561 1.767 1.963 2.132 2.279 2.536 2.665 2.783 2.76 3.111 3.217 3.423 3.608 3.771 3.847 4.001 4.153 4.37 4.507 4.643 4.83 5.005 5.185 5.339 5.48 5.678 5.865 6.056 6.274 6.462 6.645 6.856 7.096 7.325 7.582 7.855 8.105 8.357 8.655 9.0 9.321 9.661 10.014 10.355 10.681 10.992 11.222 11.309 11.075 10.723 10.33 9.939 9.565 9.183 8.814 8.5 8.177 7.891 7.628 7.37 7.125 6.907 6.707 6.483 6.294 6.129 5.952 5.775 5.627 5.465 5.296 5.163 5.03 4.9 4.753 4.602 4.497 4.373 4.174 4.044 3.911 3.837 3.688 3.536 3.38 3.304 2.979 3.041 2.941 2.838 2.622 2.509 2.375 2.245 2.09 1.923 1.72 1.237 -7 ,30370 ,KEBNE ,17022334,Wed Dec 22 05:30:40 CET,Wed Dec 22 06:55:21 CET,0.0 0.974 1.308 1.576 1.826 2.056 2.238 2.385 2.663 2.789 2.916 2.897 3.244 3.34 3.534 3.72 3.9 3.988 4.159 4.322 4.538 4.658 4.785 4.99 5.187 5.353 5.507 5.67 5.876 6.068 6.262 6.493 6.702 6.895 7.105 7.336 7.551 7.781 8.04 8.308 8.581 8.886 9.228 9.552 9.9 10.259 10.59 10.918 11.282 11.583 11.656 11.364 10.932 10.464 10.0 9.551 9.156 8.788 8.468 8.144 7.846 7.558 7.293 7.043 6.795 6.575 6.359 6.165 5.99 5.811 5.628 5.465 5.291 5.106 4.974 4.836 4.678 4.518 4.363 4.263 4.15 3.959 3.828 3.69 3.621 3.483 3.342 3.199 3.127 2.809 2.874 2.771 2.674 2.441 2.306 2.172 2.036 1.877 1.607 1.273 0.175 -8 ,2139 ,KEBNE ,17022335,Wed Dec 22 05:30:41 CET,Wed Dec 22 06:55:41 CET,0.0 0.972 1.278 1.49 1.7 1.878 2.03 2.173 2.437 2.551 2.657 2.614 2.959 3.059 3.264 3.438 3.597 3.677 3.824 3.967 4.168 4.298 4.421 4.592 4.753 4.909 5.065 5.205 5.388 5.572 5.744 5.943 6.135 6.32 6.534 6.771 7.001 7.252 7.497 7.746 7.996 8.276 8.607 8.907 9.224 9.547 9.886 10.247 10.594 10.861 10.964 10.721 10.368 9.97 9.54 9.135 8.778 8.436 8.12 7.802 7.532 7.28 7.029 6.809 6.602 6.408 6.203 6.003 5.83 5.662 5.488 5.34 5.195 5.048 4.924 4.797 4.659 4.507 4.356 4.247 4.128 3.941 3.815 3.697 3.642 3.524 3.389 3.246 3.171 2.849 2.942 2.856 2.773 2.575 2.458 2.334 2.2 2.053 1.875 1.668 1.133 -9 ,12289 ,KEBNE ,17022336,Wed Dec 22 05:30:41 CET,Wed Dec 22 06:55:19 CET,0.0 1.012 1.459 1.729 1.95 2.181 2.367 2.541 2.883 3.027 3.158 3.176 3.535 3.641 3.837 4.026 4.214 4.299 4.453 4.594 4.812 4.959 5.104 5.315 5.512 5.692 5.868 6.039 6.25 6.438 6.61 6.83 7.034 7.219 7.435 7.672 7.884 8.119 8.388 8.67 8.96 9.29 9.597 9.88 10.265 10.659 11.084 11.547 11.975 12.301 12.357 12.028 11.642 11.191 10.714 10.256 9.853 9.467 9.138 8.826 8.531 8.246 7.97 7.709 7.472 7.263 7.051 6.864 6.695 6.511 6.321 6.173 6.022 5.847 5.697 5.543 5.399 5.265 5.124 5.02 4.916 4.759 4.642 4.515 4.452 4.32 4.185 4.049 3.972 3.647 3.755 3.689 3.612 3.417 3.305 3.188 3.061 2.903 2.735 2.544 1.893 -10 ,2652 ,KEBNE ,17022337,Wed Dec 22 05:30:40 CET,Wed Dec 22 06:56:41 CET,0.0 0.981 1.447 1.801 2.075 2.312 2.492 2.646 2.92 3.032 3.148 3.127 3.483 3.591 3.78 3.959 4.132 4.203 4.349 4.503 4.682 4.798 4.919 5.083 5.239 5.382 5.51 5.647 5.85 6.021 6.182 6.382 6.567 6.752 6.953 7.176 7.397 7.64 7.893 8.155 8.406 8.664 8.989 9.31 9.641 9.989 10.336 10.643 10.925 11.143 11.157 10.83 10.388 9.942 9.518 9.109 8.714 8.325 7.991 7.654 7.359 7.098 6.848 6.615 6.392 6.192 5.993 5.809 5.649 5.486 5.312 5.165 4.995 4.809 4.676 4.536 4.387 4.231 4.075 3.967 3.852 3.687 3.572 3.447 3.385 3.255 3.117 2.979 2.904 2.573 2.652 2.56 2.465 2.276 2.179 2.073 1.954 1.814 1.667 1.506 1.26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_35_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_35_37.txt deleted file mode 100644 index 3dca21ad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_35_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16922 ,KEBNE ,17022338,Wed Dec 22 05:30:40 CET,Wed Dec 22 06:56:44 CET,0.0 1.71 2.152 2.463 2.74 3.005 3.243 3.452 3.819 3.982 4.124 4.138 4.519 4.649 4.914 5.158 5.386 5.5 5.714 5.904 6.185 6.37 6.543 6.775 6.975 7.173 7.366 7.544 7.766 7.988 8.207 8.46 8.705 8.941 9.203 9.494 9.774 10.064 10.375 10.723 11.061 11.399 11.771 12.116 12.473 12.857 13.273 13.676 14.105 14.505 14.705 14.589 14.297 13.916 13.521 13.117 12.736 12.371 12.024 11.647 11.32 11.043 10.793 10.551 10.326 10.125 9.911 9.729 9.572 9.391 9.198 9.044 8.882 8.713 8.573 8.422 8.27 8.11 7.94 7.823 7.7 7.511 7.385 7.256 7.192 7.049 6.895 6.716 6.615 6.269 6.347 6.252 6.147 5.937 5.822 5.68 5.532 5.377 5.201 4.938 3.915 -2 ,22623 ,KEBNE ,17022339,Wed Dec 22 05:30:40 CET,Wed Dec 22 06:56:41 CET,0.0 0.955 1.304 1.574 1.824 2.066 2.281 2.466 2.774 2.923 3.076 3.104 3.486 3.627 3.886 4.1 4.29 4.388 4.582 4.759 5.002 5.156 5.313 5.545 5.763 5.96 6.15 6.331 6.549 6.767 6.98 7.231 7.476 7.705 7.961 8.26 8.55 8.853 9.164 9.48 9.808 10.193 10.611 10.998 11.424 11.87 12.341 12.803 13.281 13.695 13.876 13.68 13.337 12.946 12.554 12.143 11.733 11.352 11.024 10.715 10.463 10.221 9.987 9.758 9.545 9.338 9.104 8.889 8.695 8.51 8.325 8.148 7.96 7.763 7.602 7.44 7.272 7.105 6.945 6.83 6.717 6.545 6.427 6.302 6.235 6.099 5.946 5.778 5.693 5.367 5.431 5.329 5.224 5.037 4.946 4.844 4.724 4.574 4.358 4.082 2.343 -3 ,624 ,KEBNE ,17022340,Wed Dec 22 05:30:41 CET,Wed Dec 22 06:55:26 CET,0.0 1.909 2.232 2.496 2.735 2.939 3.122 3.298 3.619 3.763 3.904 3.948 4.321 4.432 4.658 4.871 5.066 5.156 5.315 5.486 5.752 5.912 6.066 6.289 6.499 6.697 6.878 7.043 7.268 7.499 7.713 7.968 8.216 8.439 8.683 8.978 9.265 9.555 9.869 10.199 10.512 10.828 11.183 11.544 11.965 12.381 12.77 13.189 13.624 14.003 14.238 14.077 13.687 13.228 12.768 12.356 11.983 11.615 11.302 10.984 10.697 10.438 10.178 9.925 9.694 9.487 9.268 9.071 8.903 8.732 8.54 8.356 8.15 7.941 7.785 7.613 7.447 7.289 7.117 6.987 6.855 6.659 6.524 6.39 6.326 6.186 6.025 5.848 5.747 5.393 5.441 5.341 5.221 4.972 4.846 4.708 4.564 4.388 4.196 4.014 3.8 -4 ,297 ,KEBNE ,17022341,Wed Dec 22 05:30:41 CET,Wed Dec 22 06:55:20 CET,0.0 1.38 1.792 2.187 2.536 2.813 3.067 3.301 3.715 3.899 4.065 4.138 4.544 4.692 4.976 5.222 5.448 5.561 5.773 5.963 6.238 6.423 6.592 6.822 7.055 7.281 7.494 7.71 7.993 8.26 8.509 8.809 9.099 9.365 9.656 10.0 10.334 10.68 11.033 11.392 11.765 12.17 12.605 13.059 13.584 14.123 14.729 15.298 15.793 16.214 16.489 16.403 16.124 15.762 15.342 14.907 14.519 14.185 13.882 13.55 13.249 12.966 12.695 12.458 12.226 12.006 11.786 11.59 11.398 11.189 10.992 10.829 10.641 10.446 10.297 10.147 9.982 9.8 9.629 9.515 9.393 9.208 9.078 8.932 8.859 8.715 8.53 8.32 8.222 7.884 7.954 7.864 7.768 7.525 7.392 7.252 7.104 6.927 6.731 6.484 5.554 -5 ,24700 ,KEBNE ,17022342,Wed Dec 22 05:30:40 CET,Wed Dec 22 06:56:45 CET,0.0 1.113 1.514 1.833 2.092 2.313 2.501 2.663 2.971 3.133 3.305 3.378 3.755 3.88 4.111 4.322 4.535 4.637 4.82 4.991 5.233 5.381 5.515 5.71 5.912 6.11 6.306 6.496 6.714 6.92 7.131 7.369 7.601 7.826 8.084 8.368 8.643 8.942 9.243 9.548 9.876 10.251 10.629 10.969 11.376 11.837 12.349 12.863 13.336 13.732 13.887 13.652 13.325 12.936 12.511 12.079 11.7 11.351 11.015 10.678 10.383 10.109 9.854 9.614 9.384 9.181 8.973 8.782 8.611 8.425 8.236 8.083 7.917 7.752 7.62 7.483 7.344 7.206 7.062 6.955 6.847 6.68 6.556 6.422 6.353 6.207 6.054 5.901 5.824 5.498 5.548 5.45 5.347 5.141 5.034 4.917 4.785 4.63 4.434 4.194 3.802 -6 ,8009 ,KEBNE ,17022343,Wed Dec 22 05:30:40 CET,Wed Dec 22 06:56:36 CET,0.0 0.987 1.349 1.641 1.892 2.118 2.341 2.557 2.934 3.099 3.251 3.292 3.676 3.803 4.04 4.249 4.431 4.529 4.73 4.912 5.153 5.307 5.453 5.67 5.891 6.08 6.245 6.429 6.67 6.899 7.126 7.37 7.607 7.845 8.109 8.407 8.674 8.954 9.262 9.6 9.938 10.292 10.694 11.077 11.511 11.98 12.457 12.944 13.444 13.916 14.175 13.993 13.653 13.292 12.884 12.445 12.058 11.7 11.373 11.051 10.756 10.455 10.152 9.856 9.6 9.386 9.154 8.943 8.772 8.589 8.384 8.219 8.038 7.843 7.695 7.527 7.349 7.16 6.971 6.847 6.724 6.535 6.398 6.241 6.16 5.999 5.831 5.662 5.564 5.21 5.249 5.136 5.012 4.76 4.638 4.492 4.332 4.167 3.961 3.728 2.927 -7 ,19808 ,KEBNE ,17022344,Wed Dec 22 05:30:41 CET,Wed Dec 22 06:57:04 CET,0.0 1.689 2.077 2.379 2.654 2.872 3.071 3.273 3.614 3.752 3.882 3.896 4.266 4.385 4.607 4.818 5.028 5.135 5.33 5.506 5.755 5.919 6.077 6.305 6.532 6.743 6.942 7.145 7.405 7.628 7.828 8.079 8.333 8.581 8.875 9.192 9.482 9.787 10.098 10.434 10.792 11.168 11.578 11.988 12.466 12.969 13.509 14.025 14.484 14.871 15.035 14.748 14.343 13.976 13.587 13.164 12.776 12.431 12.136 11.815 11.52 11.27 11.028 10.795 10.568 10.348 10.127 9.94 9.772 9.59 9.407 9.262 9.107 8.94 8.814 8.683 8.545 8.392 8.23 8.123 8.008 7.822 7.696 7.57 7.507 7.35 7.173 7.004 6.896 6.532 6.58 6.481 6.351 6.045 5.892 5.743 5.599 5.443 5.237 5.014 4.652 -8 ,17396 ,KEBNE ,17022345,Wed Dec 22 05:30:40 CET,Wed Dec 22 06:56:23 CET,0.0 1.645 2.036 2.334 2.614 2.841 3.032 3.212 3.558 3.715 3.866 3.912 4.286 4.397 4.616 4.828 5.017 5.111 5.305 5.494 5.778 5.97 6.146 6.382 6.61 6.822 7.014 7.188 7.42 7.652 7.858 8.1 8.339 8.572 8.844 9.155 9.43 9.725 10.057 10.408 10.753 11.097 11.472 11.839 12.231 12.628 13.083 13.566 13.986 14.333 14.521 14.343 13.978 13.587 13.201 12.799 12.414 12.041 11.69 11.329 11.025 10.764 10.498 10.226 9.982 9.759 9.521 9.317 9.142 8.958 8.772 8.609 8.443 8.271 8.138 8.007 7.851 7.686 7.527 7.424 7.31 7.122 7.006 6.887 6.816 6.664 6.51 6.352 6.268 5.939 6.034 5.942 5.837 5.643 5.551 5.428 5.272 5.104 4.926 4.718 3.906 -9 ,7127 ,KEBNE ,17022346,Wed Dec 22 05:30:41 CET,Wed Dec 22 06:57:16 CET,0.0 0.855 1.318 1.624 1.884 2.129 2.347 2.527 2.824 2.946 3.078 3.106 3.483 3.621 3.864 4.069 4.249 4.333 4.499 4.648 4.85 4.981 5.108 5.306 5.506 5.706 5.906 6.091 6.326 6.55 6.759 7.008 7.236 7.438 7.68 7.944 8.179 8.438 8.716 9.003 9.309 9.666 10.067 10.458 10.912 11.384 11.853 12.344 12.794 13.114 13.252 13.016 12.586 12.098 11.668 11.249 10.848 10.468 10.126 9.784 9.497 9.231 8.966 8.727 8.504 8.298 8.089 7.884 7.691 7.497 7.288 7.108 6.931 6.753 6.618 6.473 6.331 6.182 6.016 5.901 5.779 5.605 5.484 5.356 5.287 5.138 4.973 4.797 4.704 4.357 4.403 4.304 4.189 3.911 3.765 3.614 3.445 3.242 3.015 2.744 2.152 -10 ,32509 ,KEBNE ,17022347,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:58:01 CET,0.0 1.292 1.745 2.138 2.442 2.648 2.862 3.091 3.463 3.633 3.805 3.871 4.262 4.394 4.626 4.837 5.034 5.12 5.289 5.461 5.709 5.868 6.013 6.212 6.403 6.584 6.771 6.96 7.166 7.354 7.551 7.806 8.059 8.3 8.565 8.86 9.133 9.41 9.708 10.041 10.382 10.763 11.175 11.534 11.923 12.314 12.728 13.155 13.559 13.911 14.108 13.955 13.6 13.118 12.678 12.293 11.896 11.524 11.196 10.846 10.535 10.261 10.004 9.74 9.49 9.272 9.042 8.828 8.652 8.468 8.262 8.075 7.879 7.692 7.551 7.402 7.237 7.055 6.883 6.773 6.645 6.436 6.294 6.146 6.069 5.917 5.767 5.613 5.531 5.191 5.245 5.144 5.03 4.789 4.658 4.507 4.358 4.204 4.039 3.849 3.538 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_35_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_35_49.txt deleted file mode 100644 index 7b7b673a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_35_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22091 ,KEBNE ,17022348,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:57:19 CET,0.0 1.177 1.598 1.866 2.105 2.332 2.526 2.697 2.98 3.116 3.254 3.259 3.628 3.76 4.013 4.248 4.472 4.579 4.797 5.019 5.326 5.521 5.706 5.961 6.206 6.441 6.659 6.884 7.18 7.441 7.689 7.997 8.296 8.574 8.884 9.231 9.58 9.975 10.397 10.829 11.244 11.687 12.216 12.751 13.384 14.075 14.781 15.531 16.396 17.32 18.254 18.751 18.865 18.815 18.689 18.513 18.305 18.121 17.951 17.746 17.568 17.4 17.2 17.002 16.827 16.657 16.47 16.308 16.163 15.998 15.816 15.658 15.5 15.355 15.246 15.121 14.984 14.83 14.671 14.57 14.466 14.31 14.2 14.072 14.005 13.875 13.738 13.612 13.551 13.245 13.316 13.217 13.108 12.897 12.772 12.615 12.439 12.272 12.02 11.628 10.504 -2 ,30605 ,KEBNE ,17022349,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:58:17 CET,0.0 1.209 1.635 1.957 2.254 2.515 2.692 2.85 3.158 3.305 3.449 3.465 3.831 3.951 4.196 4.441 4.665 4.769 4.957 5.146 5.425 5.593 5.754 6.0 6.252 6.484 6.697 6.892 7.151 7.406 7.632 7.904 8.183 8.456 8.747 9.062 9.371 9.726 10.11 10.507 10.924 11.384 11.9 12.412 13.012 13.657 14.377 15.16 15.983 16.821 17.644 18.095 18.173 18.083 17.932 17.757 17.57 17.351 17.13 16.903 16.696 16.515 16.332 16.143 15.963 15.815 15.671 15.523 15.385 15.226 15.043 14.906 14.774 14.624 14.501 14.379 14.25 14.114 13.978 13.881 13.781 13.621 13.499 13.371 13.315 13.189 13.035 12.887 12.82 12.517 12.575 12.479 12.388 12.175 12.046 11.921 11.803 11.657 11.471 11.192 10.323 -3 ,12103 ,KEBNE ,17022350,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:57:16 CET,0.0 0.909 1.294 1.589 1.831 2.047 2.244 2.409 2.714 2.858 2.989 2.995 3.36 3.474 3.719 3.947 4.157 4.253 4.434 4.605 4.846 5.02 5.195 5.43 5.649 5.859 6.065 6.268 6.525 6.777 7.009 7.271 7.525 7.776 8.074 8.412 8.72 9.052 9.422 9.803 10.188 10.617 11.105 11.586 12.169 12.815 13.513 14.255 15.057 15.922 16.826 17.311 17.411 17.363 17.253 17.095 16.89 16.695 16.544 16.355 16.154 15.977 15.832 15.685 15.52 15.369 15.206 15.057 14.914 14.748 14.575 14.435 14.291 14.14 14.031 13.921 13.791 13.639 13.488 13.389 13.28 13.118 12.998 12.864 12.801 12.687 12.554 12.399 12.315 11.98 12.028 11.922 11.812 11.599 11.477 11.346 11.204 11.032 10.828 10.53 9.643 -4 ,14047 ,KEBNE ,17022351,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:58:38 CET,0.0 1.361 1.691 1.948 2.183 2.411 2.602 2.778 3.14 3.292 3.427 3.472 3.867 3.993 4.22 4.458 4.679 4.773 4.966 5.161 5.426 5.593 5.777 6.051 6.294 6.526 6.758 6.982 7.263 7.527 7.778 8.083 8.366 8.623 8.928 9.274 9.605 9.958 10.335 10.755 11.168 11.624 12.147 12.661 13.257 13.873 14.555 15.299 16.093 16.976 17.923 18.473 18.63 18.613 18.499 18.317 18.103 17.866 17.634 17.374 17.112 16.861 16.619 16.401 16.216 16.052 15.863 15.684 15.521 15.358 15.222 15.092 14.935 14.783 14.658 14.519 14.376 14.227 14.07 13.971 13.871 13.712 13.606 13.499 13.445 13.32 13.171 13.005 12.919 12.606 12.665 12.564 12.452 12.192 12.038 11.874 11.677 11.44 11.179 10.813 9.381 -5 ,566 ,KEBNE ,17022352,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:58:52 CET,0.0 0.985 1.274 1.508 1.721 1.916 2.121 2.312 2.634 2.793 2.937 2.952 3.328 3.449 3.669 3.87 4.059 4.154 4.335 4.505 4.743 4.907 5.068 5.279 5.481 5.683 5.884 6.074 6.306 6.525 6.752 7.026 7.288 7.566 7.88 8.192 8.502 8.862 9.229 9.614 10.01 10.427 10.928 11.457 12.06 12.689 13.353 14.048 14.849 15.686 16.528 17.046 17.165 17.091 16.921 16.723 16.536 16.319 16.096 15.861 15.641 15.446 15.257 15.065 14.874 14.682 14.472 14.284 14.115 13.942 13.772 13.637 13.5 13.348 13.226 13.096 12.967 12.837 12.692 12.59 12.483 12.318 12.197 12.062 11.994 11.868 11.744 11.606 11.533 11.206 11.263 11.15 11.004 10.644 10.453 10.279 10.084 9.846 9.584 9.303 8.581 -6 ,25039 ,KEBNE ,17022353,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:58:27 CET,0.0 1.055 1.488 1.754 1.973 2.183 2.395 2.6 2.973 3.132 3.287 3.334 3.712 3.831 4.057 4.269 4.479 4.582 4.773 4.967 5.258 5.44 5.616 5.876 6.115 6.348 6.569 6.766 7.018 7.272 7.529 7.834 8.117 8.375 8.665 8.991 9.314 9.667 10.033 10.43 10.829 11.276 11.802 12.348 12.992 13.63 14.276 14.966 15.746 16.621 17.594 18.144 18.253 18.169 18.003 17.794 17.562 17.328 17.117 16.891 16.692 16.499 16.306 16.12 15.935 15.751 15.556 15.386 15.246 15.11 14.951 14.823 14.7 14.563 14.454 14.332 14.197 14.057 13.91 13.805 13.7 13.543 13.435 13.325 13.264 13.142 13.018 12.876 12.794 12.466 12.529 12.43 12.332 12.129 11.999 11.838 11.676 11.522 11.332 11.055 10.202 -7 ,6299 ,KEBNE ,17022354,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:57:25 CET,0.0 0.877 1.302 1.653 1.908 2.133 2.325 2.499 2.809 2.958 3.113 3.131 3.494 3.608 3.821 4.041 4.256 4.355 4.55 4.732 4.999 5.176 5.351 5.609 5.841 6.05 6.255 6.447 6.69 6.94 7.183 7.459 7.706 7.947 8.226 8.533 8.829 9.156 9.513 9.881 10.253 10.69 11.192 11.668 12.226 12.828 13.484 14.218 15.047 15.964 16.895 17.436 17.598 17.559 17.431 17.28 17.117 16.927 16.724 16.497 16.287 16.082 15.87 15.655 15.451 15.265 15.083 14.934 14.807 14.681 14.544 14.426 14.307 14.173 14.06 13.942 13.816 13.675 13.521 13.421 13.325 13.166 13.042 12.91 12.846 12.711 12.569 12.42 12.338 12.02 12.086 12.003 11.911 11.718 11.619 11.472 11.293 11.125 10.949 10.753 10.278 -8 ,1875 ,KEBNE ,17022355,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:58:07 CET,0.0 0.629 0.994 1.28 1.521 1.762 1.972 2.175 2.542 2.699 2.839 2.862 3.241 3.371 3.628 3.857 4.075 4.19 4.404 4.598 4.872 5.041 5.198 5.418 5.648 5.868 6.066 6.258 6.523 6.796 7.056 7.349 7.619 7.878 8.166 8.486 8.797 9.149 9.544 9.943 10.337 10.79 11.344 11.895 12.513 13.15 13.837 14.602 15.423 16.269 17.008 17.413 17.523 17.461 17.298 17.058 16.8 16.586 16.407 16.209 16.024 15.856 15.69 15.506 15.328 15.167 15.003 14.86 14.719 14.57 14.412 14.265 14.118 13.97 13.857 13.742 13.608 13.455 13.306 13.212 13.115 12.961 12.853 12.732 12.667 12.548 12.416 12.263 12.18 11.859 11.941 11.85 11.742 11.51 11.39 11.268 11.135 10.973 10.769 10.5 9.763 -9 ,15645 ,KEBNE ,17022356,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:57:45 CET,0.0 0.744 1.046 1.327 1.563 1.752 1.929 2.093 2.397 2.55 2.695 2.717 3.097 3.224 3.453 3.659 3.846 3.936 4.119 4.303 4.556 4.726 4.901 5.163 5.4 5.618 5.84 6.052 6.32 6.561 6.793 7.082 7.35 7.62 7.933 8.263 8.583 8.92 9.284 9.682 10.104 10.583 11.101 11.603 12.176 12.815 13.534 14.259 15.044 15.911 16.81 17.319 17.446 17.411 17.324 17.201 17.034 16.855 16.661 16.445 16.258 16.078 15.895 15.706 15.514 15.336 15.163 15.017 14.892 14.747 14.581 14.447 14.312 14.171 14.067 13.941 13.802 13.673 13.531 13.434 13.329 13.166 13.055 12.929 12.862 12.715 12.547 12.38 12.299 11.978 12.054 11.966 11.88 11.706 11.608 11.495 11.371 11.217 11.032 10.771 10.099 -10 ,17930 ,KEBNE ,17022357,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:57:12 CET,0.0 1.071 1.399 1.701 1.934 2.123 2.307 2.482 2.828 3.001 3.158 3.178 3.555 3.678 3.919 4.134 4.336 4.437 4.635 4.833 5.127 5.299 5.452 5.686 5.925 6.143 6.336 6.522 6.766 6.996 7.258 7.575 7.834 8.102 8.408 8.753 9.098 9.465 9.857 10.268 10.692 11.166 11.712 12.213 12.8 13.462 14.18 14.948 15.804 16.768 17.697 18.161 18.25 18.201 18.079 17.872 17.666 17.49 17.29 17.053 16.851 16.665 16.475 16.296 16.118 15.948 15.762 15.582 15.435 15.278 15.093 14.929 14.772 14.608 14.475 14.337 14.182 14.013 13.83 13.708 13.585 13.411 13.294 13.153 13.083 12.941 12.793 12.65 12.569 12.245 12.274 12.166 12.056 11.822 11.689 11.547 11.404 11.239 11.04 10.809 10.197 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_35_52.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_35_52.txt deleted file mode 100644 index 532245e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_35_52.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32641 ,KEBNE ,17022358,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:58:29 CET,0.0 1.181 1.641 2.001 2.291 2.58 2.842 3.056 3.394 3.542 3.715 3.844 4.265 4.414 4.668 4.898 5.107 5.206 5.412 5.629 5.969 6.177 6.354 6.575 6.774 6.96 7.129 7.301 7.531 7.761 7.986 8.242 8.454 8.636 8.877 9.162 9.403 9.645 9.888 10.142 10.429 10.717 10.997 11.299 11.644 11.973 12.284 12.517 12.65 12.657 12.255 11.467 10.715 9.997 9.338 8.676 8.088 7.566 7.112 6.667 6.286 5.94 5.595 5.281 4.983 4.696 4.411 4.168 3.947 3.714 3.483 3.276 3.052 2.842 2.69 2.529 2.356 2.182 1.993 1.864 1.739 1.544 1.405 1.254 1.175 1.006 0.836 0.655 0.566 0.237 0.289 0.19 0.093 -0.164 -0.313 -0.46 -0.598 -0.752 -0.976 -1.31 -2.678 -2 ,5931 ,KEBNE ,17022359,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:58:29 CET,0.0 1.246 1.672 2.002 2.246 2.447 2.638 2.847 3.272 3.463 3.646 3.748 4.151 4.292 4.546 4.78 4.996 5.098 5.29 5.471 5.716 5.861 6.013 6.249 6.455 6.655 6.863 7.064 7.296 7.501 7.688 7.92 8.152 8.359 8.593 8.858 9.104 9.376 9.649 9.911 10.18 10.453 10.77 11.063 11.353 11.615 11.856 12.091 12.234 12.167 11.674 10.773 9.901 9.086 8.342 7.639 7.015 6.449 5.983 5.542 5.125 4.718 4.314 3.945 3.625 3.325 3.003 2.726 2.493 2.239 1.965 1.744 1.514 1.271 1.097 0.917 0.718 0.514 0.298 0.154 0.004 -0.227 -0.383 -0.569 -0.659 -0.825 -1.001 -1.183 -1.282 -1.639 -1.61 -1.721 -1.84 -2.105 -2.26 -2.428 -2.604 -2.803 -3.038 -3.306 -4.291 -3 ,17417 ,KEBNE ,17022360,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:59:00 CET,0.0 2.137 2.738 3.186 3.529 3.825 4.07 4.291 4.723 4.929 5.113 5.176 5.573 5.724 6.002 6.258 6.501 6.613 6.805 6.99 7.276 7.463 7.643 7.89 8.127 8.359 8.57 8.747 8.953 9.144 9.348 9.602 9.857 10.109 10.363 10.629 10.892 11.178 11.446 11.699 11.976 12.271 12.58 12.873 13.189 13.506 13.819 14.088 14.309 14.314 13.944 13.297 12.607 11.943 11.321 10.722 10.21 9.697 9.255 8.844 8.471 8.143 7.842 7.541 7.266 7.028 6.773 6.547 6.339 6.111 5.869 5.671 5.474 5.263 5.09 4.913 4.735 4.544 4.342 4.205 4.062 3.847 3.705 3.541 3.459 3.303 3.134 2.954 2.853 2.492 2.513 2.401 2.289 2.069 1.959 1.811 1.64 1.469 1.264 1.031 -0.126 -4 ,2664 ,KEBNE ,17022361,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:58:39 CET,0.0 2.358 2.907 3.301 3.588 3.835 4.07 4.302 4.713 4.909 5.099 5.138 5.535 5.697 5.979 6.198 6.421 6.539 6.753 6.949 7.204 7.353 7.5 7.711 7.912 8.125 8.34 8.54 8.783 9.001 9.222 9.478 9.71 9.931 10.16 10.384 10.611 10.91 11.198 11.464 11.769 12.088 12.352 12.57 12.818 13.053 13.256 13.394 13.417 13.32 12.972 12.187 11.332 10.584 9.941 9.33 8.782 8.277 7.827 7.389 7.018 6.68 6.343 6.046 5.771 5.496 5.219 4.964 4.743 4.512 4.258 4.046 3.83 3.61 3.435 3.25 3.06 2.872 2.683 2.556 2.426 2.214 2.049 1.877 1.79 1.614 1.451 1.27 1.169 0.813 0.864 0.763 0.642 0.363 0.22 0.091 -0.051 -0.223 -0.424 -0.742 -2.131 -5 ,18457 ,KEBNE ,17022362,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:57:28 CET,0.0 1.55 2.037 2.397 2.672 2.883 3.077 3.268 3.615 3.779 3.934 3.972 4.349 4.466 4.676 4.888 5.102 5.201 5.398 5.59 5.863 6.016 6.16 6.39 6.61 6.831 7.038 7.232 7.474 7.696 7.913 8.162 8.39 8.591 8.806 9.021 9.214 9.445 9.69 9.944 10.186 10.459 10.81 11.15 11.484 11.779 12.054 12.306 12.493 12.469 12.095 11.385 10.648 9.93 9.27 8.639 8.078 7.582 7.131 6.677 6.282 5.933 5.606 5.29 5.003 4.755 4.501 4.268 4.055 3.815 3.55 3.337 3.123 2.914 2.746 2.553 2.355 2.155 1.952 1.803 1.648 1.409 1.254 1.099 1.015 0.837 0.65 0.464 0.357 -0.015 0.004 -0.134 -0.297 -0.643 -0.873 -1.148 -1.434 -1.734 -2.039 -2.438 -4.368 -6 ,24282 ,KEBNE ,17022363,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:58:17 CET,0.0 2.069 2.626 2.98 3.263 3.542 3.776 3.986 4.337 4.49 4.646 4.663 5.037 5.184 5.442 5.687 5.922 6.026 6.229 6.441 6.737 6.922 7.113 7.392 7.636 7.834 8.02 8.227 8.497 8.726 8.944 9.208 9.451 9.677 9.919 10.192 10.442 10.692 10.966 11.26 11.547 11.851 12.202 12.524 12.86 13.164 13.431 13.707 13.864 13.796 13.48 12.709 11.839 11.1 10.444 9.8 9.203 8.668 8.207 7.752 7.36 7.014 6.677 6.345 6.052 5.784 5.491 5.215 4.965 4.705 4.447 4.242 4.025 3.8 3.627 3.456 3.274 3.079 2.87 2.72 2.567 2.346 2.195 2.027 1.94 1.767 1.596 1.417 1.319 0.963 0.991 0.871 0.748 0.464 0.311 0.156 -0.013 -0.19 -0.403 -0.685 -1.392 -7 ,16831 ,KEBNE ,17022364,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:58:07 CET,0.0 1.105 1.502 1.781 2.025 2.269 2.508 2.724 3.08 3.263 3.429 3.445 3.817 3.95 4.21 4.467 4.705 4.826 5.04 5.214 5.477 5.65 5.804 6.021 6.227 6.425 6.615 6.808 7.059 7.285 7.484 7.718 7.934 8.125 8.34 8.581 8.811 9.066 9.332 9.585 9.822 10.105 10.427 10.711 11.037 11.352 11.627 11.85 12.008 12.013 11.622 10.785 9.853 8.961 8.176 7.475 6.853 6.277 5.787 5.3 4.874 4.496 4.126 3.766 3.457 3.178 2.889 2.617 2.374 2.127 1.868 1.665 1.447 1.212 1.031 0.845 0.657 0.453 0.22 0.054 -0.108 -0.338 -0.491 -0.649 -0.731 -0.906 -1.097 -1.296 -1.393 -1.741 -1.734 -1.87 -1.992 -2.246 -2.4 -2.572 -2.754 -2.949 -3.164 -3.454 -4.542 -8 ,31335 ,KEBNE ,17022365,Wed Dec 22 05:32:44 CET,Wed Dec 22 06:59:18 CET,0.0 1.765 2.328 2.723 3.097 3.432 3.715 3.945 4.31 4.493 4.666 4.723 5.111 5.253 5.563 5.846 6.078 6.199 6.432 6.653 6.937 7.078 7.214 7.419 7.614 7.813 8.012 8.185 8.397 8.607 8.81 9.058 9.3 9.547 9.812 10.094 10.363 10.619 10.881 11.155 11.45 11.809 12.176 12.505 12.868 13.231 13.581 13.878 14.133 14.212 13.91 13.346 12.695 12.006 11.41 10.871 10.327 9.824 9.413 8.951 8.547 8.198 7.866 7.551 7.258 6.988 6.71 6.466 6.248 6.022 5.775 5.569 5.362 5.133 4.953 4.774 4.589 4.402 4.189 4.036 3.884 3.647 3.481 3.307 3.223 3.036 2.829 2.622 2.514 2.151 2.142 2.018 1.903 1.658 1.536 1.397 1.227 1.03 0.779 0.402 -1.186 -9 ,14808 ,KEBNE ,17022366,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 06:59:43 CET,0.0 1.874 2.501 2.956 3.317 3.61 3.837 4.03 4.368 4.526 4.669 4.692 5.075 5.204 5.444 5.646 5.837 5.935 6.105 6.255 6.463 6.606 6.76 6.979 7.175 7.369 7.562 7.746 7.972 8.19 8.411 8.667 8.899 9.099 9.314 9.551 9.766 9.993 10.218 10.443 10.687 10.959 11.266 11.548 11.84 12.102 12.334 12.59 12.78 12.816 12.422 11.475 10.532 9.657 8.82 8.084 7.468 6.9 6.374 5.824 5.372 4.976 4.59 4.216 3.883 3.596 3.307 3.047 2.804 2.562 2.314 2.103 1.894 1.679 1.504 1.313 1.12 0.931 0.729 0.584 0.442 0.233 0.071 -0.118 -0.215 -0.402 -0.597 -0.792 -0.893 -1.251 -1.213 -1.323 -1.451 -1.761 -1.928 -2.085 -2.245 -2.418 -2.639 -2.943 -3.83 -10 ,15960 ,KEBNE ,17022367,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 06:58:31 CET,0.0 1.509 1.923 2.23 2.486 2.72 2.909 3.077 3.397 3.545 3.69 3.72 4.092 4.216 4.44 4.657 4.866 4.965 5.149 5.323 5.572 5.731 5.879 6.088 6.283 6.472 6.649 6.817 7.024 7.211 7.402 7.61 7.808 8.013 8.239 8.469 8.665 8.896 9.154 9.392 9.631 9.886 10.156 10.418 10.673 10.878 11.045 11.215 11.325 11.217 10.79 9.996 9.184 8.459 7.82 7.221 6.688 6.229 5.839 5.439 5.08 4.764 4.47 4.173 3.898 3.66 3.4 3.165 2.954 2.735 2.511 2.31 2.108 1.917 1.762 1.585 1.387 1.183 0.974 0.831 0.689 0.473 0.324 0.171 0.097 -0.053 -0.223 -0.428 -0.532 -0.885 -0.855 -0.968 -1.082 -1.33 -1.475 -1.646 -1.843 -2.058 -2.301 -2.583 -3.541 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_37_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_37_50.txt deleted file mode 100644 index 4ab353ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_37_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31404 ,TETRA ,17524629,Wed Nov 24 22:36:33 CET,Thu Nov 25 00:22:05 CET,0.0 0.612 0.856 1.069 1.273 1.458 1.626 1.775 2.004 2.116 2.234 2.221 2.574 2.675 2.867 3.048 3.23 3.319 3.493 3.661 3.898 4.045 4.184 4.389 4.587 4.777 4.966 5.147 5.376 5.593 5.792 6.044 6.295 6.532 6.806 7.11 7.401 7.705 8.016 8.338 8.676 9.071 9.526 10.001 10.556 11.142 11.817 12.523 13.23 14.0 14.775 15.154 15.222 15.117 14.912 14.659 14.431 14.213 13.973 13.726 13.518 13.327 13.149 12.973 12.792 12.618 12.429 12.253 12.1 11.934 11.748 11.591 11.433 11.271 11.146 11.008 10.85 10.674 10.505 10.403 10.293 10.118 10.011 9.9 9.835 9.702 9.558 9.411 9.336 9.006 9.064 8.977 8.88 8.672 8.548 8.402 8.249 8.056 7.841 7.631 7.201 -2 ,26142 ,TETRA ,17524631,Wed Nov 24 22:36:37 CET,Thu Nov 25 00:22:33 CET,0.0 0.502 0.803 1.03 1.235 1.404 1.559 1.725 2.013 2.136 2.255 2.241 2.601 2.696 2.882 3.065 3.241 3.333 3.516 3.692 3.935 4.084 4.236 4.462 4.693 4.926 5.122 5.286 5.503 5.717 5.934 6.194 6.446 6.695 6.98 7.3 7.598 7.919 8.261 8.623 8.988 9.385 9.855 10.308 10.833 11.422 12.062 12.796 13.602 14.401 15.185 15.527 15.525 15.392 15.208 14.991 14.754 14.485 14.21 13.898 13.636 13.432 13.245 13.056 12.841 12.65 12.479 12.327 12.189 12.04 11.89 11.757 11.618 11.448 11.309 11.179 11.026 10.871 10.727 10.622 10.501 10.311 10.187 10.064 10.0 9.863 9.716 9.556 9.471 9.136 9.207 9.116 9.015 8.801 8.677 8.544 8.4 8.24 8.057 7.842 7.231 -3 ,20961 ,TETRA ,17524633,Wed Nov 24 22:36:33 CET,Thu Nov 25 00:24:48 CET,0.0 0.666 0.988 1.216 1.394 1.56 1.706 1.856 2.144 2.272 2.412 2.452 2.807 2.922 3.149 3.352 3.532 3.619 3.793 3.974 4.231 4.394 4.551 4.772 4.989 5.205 5.414 5.605 5.853 6.089 6.304 6.553 6.792 7.029 7.297 7.603 7.902 8.23 8.583 8.936 9.307 9.732 10.218 10.689 11.232 11.84 12.486 13.16 13.914 14.701 15.484 15.947 15.963 15.794 15.616 15.393 15.131 14.898 14.678 14.422 14.181 13.963 13.756 13.538 13.327 13.142 12.949 12.763 12.597 12.438 12.256 12.096 11.947 11.797 11.677 11.546 11.411 11.267 11.108 11.0 10.891 10.717 10.599 10.472 10.406 10.277 10.141 9.982 9.895 9.565 9.622 9.528 9.416 9.155 9.022 8.881 8.708 8.517 8.3 8.006 7.304 -4 ,21476 ,TETRA ,17524635,Wed Nov 24 22:36:34 CET,Thu Nov 25 00:22:59 CET,0.0 0.49 0.752 0.953 1.118 1.264 1.408 1.551 1.818 1.94 2.054 2.044 2.417 2.527 2.733 2.918 3.081 3.164 3.33 3.484 3.719 3.874 4.031 4.256 4.464 4.662 4.849 5.033 5.266 5.481 5.696 5.986 6.252 6.49 6.77 7.08 7.368 7.682 8.028 8.394 8.752 9.131 9.576 10.048 10.586 11.149 11.774 12.44 13.165 13.926 14.729 15.224 15.308 15.21 15.025 14.79 14.549 14.324 14.104 13.854 13.63 13.419 13.214 13.019 12.838 12.664 12.464 12.277 12.113 11.932 11.732 11.566 11.397 11.244 11.136 11.018 10.889 10.747 10.592 10.486 10.391 10.247 10.137 10.022 9.963 9.839 9.698 9.54 9.45 9.119 9.175 9.068 8.952 8.7 8.572 8.441 8.307 8.161 7.992 7.792 7.375 -5 ,26314 ,TETRA ,17524637,Wed Nov 24 22:36:38 CET,Thu Nov 25 00:22:49 CET,0.0 0.717 1.024 1.276 1.485 1.69 1.883 2.052 2.382 2.535 2.677 2.689 3.052 3.157 3.371 3.571 3.759 3.856 4.042 4.22 4.455 4.599 4.766 5.013 5.215 5.399 5.583 5.776 6.039 6.287 6.503 6.772 7.055 7.3 7.559 7.852 8.14 8.461 8.794 9.132 9.507 9.934 10.409 10.86 11.386 11.997 12.642 13.302 14.051 14.834 15.543 15.889 15.903 15.784 15.614 15.35 15.052 14.748 14.472 14.192 13.952 13.756 13.555 13.367 13.172 12.969 12.771 12.591 12.43 12.264 12.096 11.953 11.793 11.618 11.486 11.356 11.215 11.066 10.898 10.783 10.674 10.487 10.334 10.159 10.077 9.925 9.765 9.607 9.525 9.195 9.24 9.13 9.022 8.783 8.649 8.516 8.373 8.204 8.0 7.752 7.211 -6 ,2549 ,TETRA ,17524639,Wed Nov 24 22:36:34 CET,Thu Nov 25 00:26:13 CET,0.0 0.363 0.603 0.794 0.998 1.189 1.359 1.522 1.833 1.968 2.085 2.067 2.42 2.516 2.703 2.885 3.069 3.163 3.33 3.467 3.672 3.81 3.947 4.155 4.354 4.561 4.762 4.937 5.174 5.409 5.627 5.896 6.137 6.366 6.639 6.947 7.24 7.549 7.882 8.228 8.603 9.023 9.473 9.888 10.372 10.93 11.53 12.168 12.906 13.723 14.47 14.808 14.798 14.629 14.376 14.09 13.832 13.566 13.33 13.082 12.843 12.63 12.419 12.197 11.983 11.79 11.596 11.426 11.28 11.112 10.923 10.769 10.612 10.449 10.307 10.155 9.997 9.823 9.654 9.551 9.448 9.275 9.148 9.027 8.963 8.813 8.662 8.511 8.43 8.109 8.159 8.041 7.915 7.657 7.525 7.404 7.281 7.132 6.923 6.628 5.995 -7 ,6068 ,TETRA ,17524641,Wed Nov 24 22:37:32 CET,Thu Nov 25 00:22:50 CET,0.0 0.454 0.707 0.928 1.134 1.316 1.482 1.637 1.915 2.055 2.198 2.195 2.54 2.638 2.838 3.044 3.236 3.334 3.531 3.694 3.916 4.073 4.223 4.428 4.623 4.814 4.992 5.158 5.375 5.583 5.797 6.062 6.313 6.562 6.845 7.149 7.437 7.767 8.111 8.459 8.83 9.234 9.698 10.163 10.69 11.278 11.936 12.619 13.379 14.215 15.101 15.531 15.522 15.387 15.208 14.991 14.748 14.486 14.239 13.985 13.76 13.571 13.384 13.183 13.005 12.842 12.656 12.481 12.333 12.171 11.995 11.838 11.66 11.494 11.377 11.252 11.114 10.976 10.83 10.73 10.628 10.466 10.351 10.223 10.155 10.008 9.849 9.685 9.608 9.29 9.37 9.279 9.185 8.973 8.864 8.758 8.62 8.453 8.293 8.11 7.674 -8 ,28653 ,TETRA ,17524643,Wed Nov 24 22:37:35 CET,Thu Nov 25 00:24:09 CET,0.0 0.668 0.976 1.16 1.313 1.47 1.634 1.785 2.029 2.149 2.273 2.264 2.622 2.732 2.934 3.121 3.29 3.373 3.537 3.702 3.943 4.108 4.259 4.453 4.653 4.855 5.045 5.227 5.461 5.681 5.896 6.164 6.417 6.646 6.913 7.227 7.531 7.853 8.19 8.539 8.9 9.339 9.856 10.329 10.86 11.456 12.126 12.858 13.645 14.445 15.245 15.663 15.725 15.614 15.387 15.128 14.862 14.609 14.384 14.129 13.908 13.694 13.48 13.277 13.085 12.914 12.725 12.546 12.378 12.21 12.052 11.916 11.771 11.606 11.466 11.328 11.185 11.024 10.856 10.745 10.627 10.437 10.301 10.163 10.094 9.944 9.783 9.604 9.514 9.18 9.199 9.096 8.998 8.792 8.675 8.532 8.38 8.205 8.021 7.782 7.244 -9 ,29667 ,TETRA ,17524645,Wed Nov 24 22:37:33 CET,Thu Nov 25 00:24:56 CET,0.0 0.394 0.602 0.828 1.043 1.214 1.373 1.531 1.813 1.937 2.054 2.024 2.379 2.489 2.694 2.894 3.086 3.178 3.343 3.5 3.73 3.875 4.018 4.223 4.43 4.635 4.822 5.007 5.241 5.455 5.657 5.892 6.141 6.402 6.702 7.024 7.302 7.593 7.927 8.28 8.648 9.054 9.53 10.021 10.579 11.182 11.852 12.607 13.404 14.214 15.012 15.473 15.529 15.376 15.171 14.939 14.694 14.456 14.248 14.011 13.794 13.599 13.401 13.191 12.994 12.816 12.614 12.437 12.271 12.091 11.925 11.786 11.637 11.474 11.353 11.224 11.069 10.918 10.773 10.665 10.557 10.388 10.268 10.157 10.105 9.98 9.834 9.673 9.586 9.259 9.306 9.201 9.096 8.876 8.751 8.627 8.489 8.341 8.185 7.991 7.512 -10 ,2895 ,TETRA ,17524647,Wed Nov 24 22:37:34 CET,Thu Nov 25 00:25:24 CET,0.0 0.869 1.227 1.5 1.727 1.93 2.116 2.296 2.62 2.761 2.886 2.87 3.214 3.317 3.533 3.746 3.941 4.031 4.21 4.377 4.621 4.777 4.924 5.135 5.333 5.524 5.715 5.905 6.152 6.381 6.6 6.87 7.125 7.371 7.667 8.006 8.318 8.64 8.975 9.335 9.707 10.119 10.595 11.066 11.625 12.254 12.922 13.608 14.397 15.175 15.911 16.37 16.451 16.37 16.206 15.981 15.746 15.501 15.273 15.046 14.818 14.592 14.378 14.196 14.033 13.87 13.683 13.504 13.353 13.198 13.029 12.877 12.726 12.566 12.439 12.317 12.178 12.032 11.892 11.788 11.668 11.474 11.357 11.251 11.193 11.068 10.937 10.78 10.69 10.369 10.411 10.291 10.16 9.903 9.752 9.589 9.441 9.295 9.106 8.854 8.426 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_37_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_37_53.txt deleted file mode 100644 index 32c78266..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_37_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12110 ,KEBNE ,17022368,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 07:01:08 CET,0.0 1.156 1.535 1.856 2.105 2.294 2.482 2.653 2.985 3.134 3.265 3.273 3.641 3.756 3.982 4.178 4.346 4.434 4.619 4.79 5.017 5.17 5.331 5.559 5.744 5.917 6.09 6.243 6.442 6.635 6.8 6.997 7.202 7.395 7.607 7.829 8.026 8.252 8.517 8.773 9.023 9.31 9.605 9.826 10.024 10.211 10.409 10.521 10.567 10.455 9.811 8.746 7.756 6.91 6.106 5.336 4.661 4.04 3.488 2.932 2.473 2.058 1.641 1.247 0.902 0.587 0.216 -0.144 -0.443 -0.725 -1.003 -1.238 -1.488 -1.751 -1.937 -2.115 -2.303 -2.512 -2.748 -2.917 -3.086 -3.325 -3.481 -3.653 -3.737 -3.901 -4.071 -4.243 -4.346 -4.73 -4.769 -4.921 -5.066 -5.377 -5.538 -5.696 -5.878 -6.085 -6.292 -6.583 -7.295 -2 ,24872 ,KEBNE ,17022369,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 07:00:53 CET,0.0 0.789 1.11 1.403 1.645 1.844 2.025 2.195 2.5 2.625 2.733 2.703 3.056 3.167 3.369 3.534 3.683 3.76 3.922 4.076 4.275 4.404 4.547 4.738 4.905 5.08 5.248 5.394 5.58 5.764 5.931 6.127 6.311 6.46 6.612 6.791 6.973 7.165 7.363 7.566 7.769 7.993 8.24 8.466 8.692 8.923 9.144 9.284 9.348 9.218 8.631 7.524 6.496 5.589 4.735 3.975 3.322 2.716 2.208 1.668 1.176 0.755 0.341 -0.047 -0.394 -0.717 -1.064 -1.379 -1.641 -1.941 -2.277 -2.544 -2.817 -3.103 -3.31 -3.52 -3.752 -3.994 -4.258 -4.445 -4.634 -4.905 -5.09 -5.283 -5.389 -5.613 -5.833 -6.062 -6.179 -6.556 -6.574 -6.709 -6.859 -7.183 -7.353 -7.557 -7.774 -8.002 -8.269 -8.638 -9.479 -3 ,19422 ,KEBNE ,17022370,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 06:59:12 CET,0.0 1.363 1.734 1.998 2.191 2.373 2.531 2.672 2.98 3.117 3.227 3.185 3.546 3.675 3.931 4.143 4.322 4.423 4.62 4.784 5.004 5.143 5.271 5.44 5.592 5.748 5.892 6.029 6.214 6.388 6.551 6.736 6.909 7.061 7.236 7.424 7.593 7.784 7.976 8.184 8.432 8.698 8.947 9.161 9.352 9.507 9.636 9.707 9.73 9.588 9.011 8.003 6.968 6.003 5.173 4.45 3.825 3.268 2.772 2.244 1.788 1.405 1.022 0.647 0.301 -0.022 -0.364 -0.665 -0.922 -1.225 -1.557 -1.81 -2.065 -2.318 -2.504 -2.706 -2.913 -3.135 -3.371 -3.525 -3.694 -3.995 -4.207 -4.402 -4.493 -4.685 -4.878 -5.085 -5.203 -5.594 -5.596 -5.713 -5.827 -6.081 -6.229 -6.405 -6.592 -6.791 -7.04 -7.378 -8.016 -4 ,24114 ,KEBNE ,17022371,Wed Dec 22 05:33:50 CET,Wed Dec 22 06:57:11 CET,0.0 1.784 2.239 2.547 2.788 2.985 3.174 3.362 3.686 3.818 3.949 3.965 4.332 4.445 4.647 4.834 5.008 5.093 5.273 5.444 5.67 5.808 5.949 6.149 6.337 6.526 6.707 6.876 7.09 7.296 7.494 7.722 7.912 8.061 8.232 8.436 8.649 8.874 9.053 9.248 9.469 9.691 9.927 10.118 10.289 10.446 10.588 10.659 10.617 10.364 9.699 8.714 7.723 6.833 6.038 5.295 4.631 4.018 3.506 2.994 2.52 2.069 1.631 1.206 0.822 0.487 0.153 -0.129 -0.373 -0.638 -0.913 -1.128 -1.356 -1.593 -1.778 -1.975 -2.177 -2.393 -2.624 -2.784 -2.948 -3.214 -3.391 -3.566 -3.661 -3.882 -4.112 -4.331 -4.436 -4.792 -4.775 -4.904 -5.04 -5.339 -5.517 -5.686 -5.845 -6.036 -6.274 -6.554 -7.336 -5 ,25978 ,KEBNE ,17022372,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 07:01:10 CET,0.0 1.486 1.849 2.16 2.432 2.633 2.765 2.9 3.206 3.335 3.449 3.434 3.795 3.91 4.128 4.333 4.517 4.607 4.795 4.968 5.196 5.348 5.496 5.685 5.861 6.045 6.211 6.361 6.577 6.776 6.96 7.197 7.411 7.582 7.757 7.955 8.13 8.321 8.521 8.705 8.88 9.068 9.298 9.517 9.756 9.98 10.14 10.225 10.192 9.932 9.227 8.219 7.28 6.423 5.657 4.925 4.242 3.609 3.073 2.537 2.069 1.667 1.294 0.926 0.567 0.238 -0.102 -0.407 -0.657 -0.915 -1.192 -1.417 -1.659 -1.918 -2.129 -2.347 -2.548 -2.757 -2.983 -3.14 -3.292 -3.529 -3.71 -3.907 -4.011 -4.207 -4.407 -4.619 -4.729 -5.095 -5.103 -5.242 -5.374 -5.656 -5.826 -6.032 -6.275 -6.55 -6.886 -7.312 -8.067 -6 ,1683 ,KEBNE ,17022373,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 07:00:57 CET,0.0 0.829 1.196 1.465 1.685 1.891 2.09 2.256 2.528 2.667 2.812 2.818 3.169 3.271 3.481 3.683 3.88 3.972 4.135 4.269 4.456 4.577 4.688 4.857 5.015 5.162 5.295 5.424 5.59 5.75 5.91 6.083 6.266 6.45 6.644 6.84 7.011 7.208 7.406 7.592 7.77 7.963 8.177 8.371 8.558 8.706 8.827 8.932 8.944 8.714 8.051 6.994 5.953 5.017 4.208 3.452 2.758 2.104 1.529 0.938 0.432 0.019 -0.358 -0.726 -1.063 -1.375 -1.72 -2.029 -2.291 -2.565 -2.839 -3.046 -3.276 -3.537 -3.737 -3.941 -4.144 -4.344 -4.553 -4.708 -4.881 -5.134 -5.321 -5.55 -5.667 -5.887 -6.094 -6.294 -6.411 -6.792 -6.785 -6.919 -7.08 -7.429 -7.596 -7.768 -7.948 -8.128 -8.342 -8.617 -9.415 -7 ,27913 ,KEBNE ,17022374,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 07:00:03 CET,0.0 0.904 1.244 1.503 1.702 1.9 2.092 2.247 2.521 2.652 2.776 2.783 3.14 3.231 3.43 3.63 3.802 3.893 4.072 4.248 4.482 4.609 4.726 4.903 5.073 5.24 5.391 5.522 5.703 5.889 6.06 6.251 6.451 6.629 6.798 6.988 7.162 7.332 7.52 7.712 7.896 8.079 8.281 8.48 8.669 8.829 8.966 9.053 9.041 8.83 8.197 7.128 6.103 5.171 4.347 3.61 2.923 2.279 1.725 1.156 0.666 0.248 -0.156 -0.553 -0.922 -1.268 -1.643 -1.986 -2.287 -2.598 -2.915 -3.184 -3.457 -3.724 -3.928 -4.145 -4.371 -4.598 -4.836 -5.0 -5.164 -5.415 -5.594 -5.8 -5.909 -6.115 -6.326 -6.55 -6.67 -7.038 -7.041 -7.173 -7.321 -7.646 -7.825 -8.022 -8.245 -8.501 -8.796 -9.197 -10.103 -8 ,28857 ,KEBNE ,17022375,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 07:01:02 CET,0.0 1.258 1.547 1.804 2.023 2.228 2.412 2.569 2.871 2.988 3.106 3.091 3.454 3.58 3.82 4.049 4.266 4.367 4.571 4.762 5.039 5.226 5.395 5.618 5.826 6.022 6.192 6.337 6.508 6.664 6.805 6.975 7.151 7.318 7.494 7.696 7.897 8.091 8.298 8.536 8.745 8.931 9.126 9.299 9.471 9.651 9.835 9.95 9.936 9.772 9.208 8.202 7.237 6.338 5.517 4.754 4.081 3.477 2.941 2.385 1.922 1.519 1.122 0.731 0.367 0.047 -0.275 -0.552 -0.799 -1.067 -1.356 -1.609 -1.871 -2.142 -2.354 -2.563 -2.77 -2.982 -3.209 -3.367 -3.532 -3.788 -3.963 -4.155 -4.263 -4.472 -4.667 -4.878 -4.987 -5.36 -5.391 -5.544 -5.718 -6.054 -6.23 -6.448 -6.686 -6.964 -7.31 -7.722 -8.522 -9 ,6528 ,KEBNE ,17022376,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 06:59:15 CET,0.0 0.716 1.088 1.341 1.575 1.775 1.971 2.159 2.447 2.562 2.683 2.667 3.006 3.102 3.287 3.453 3.598 3.675 3.831 3.979 4.191 4.336 4.486 4.691 4.889 5.069 5.236 5.395 5.574 5.745 5.917 6.126 6.308 6.464 6.681 6.946 7.149 7.358 7.58 7.806 8.027 8.216 8.397 8.561 8.741 8.917 9.055 9.123 9.086 8.907 8.296 7.197 6.114 5.19 4.448 3.746 3.068 2.45 1.938 1.402 0.926 0.497 0.074 -0.31 -0.658 -0.967 -1.295 -1.6 -1.85 -2.116 -2.4 -2.634 -2.88 -3.129 -3.348 -3.583 -3.803 -4.04 -4.28 -4.44 -4.608 -4.866 -5.05 -5.238 -5.331 -5.526 -5.734 -5.952 -6.063 -6.419 -6.413 -6.541 -6.666 -6.95 -7.117 -7.329 -7.589 -7.85 -8.112 -8.425 -9.429 -10 ,463 ,KEBNE ,17022377,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 07:00:04 CET,0.0 0.623 1.043 1.391 1.607 1.776 1.918 2.067 2.373 2.522 2.666 2.686 3.03 3.126 3.325 3.513 3.684 3.762 3.918 4.055 4.23 4.351 4.479 4.653 4.806 4.956 5.099 5.235 5.406 5.559 5.702 5.868 6.012 6.147 6.318 6.523 6.72 6.919 7.098 7.267 7.44 7.637 7.891 8.115 8.295 8.44 8.562 8.66 8.622 8.34 7.621 6.513 5.484 4.555 3.754 3.01 2.343 1.743 1.215 0.697 0.241 -0.166 -0.554 -0.922 -1.267 -1.601 -1.953 -2.252 -2.503 -2.764 -3.039 -3.274 -3.512 -3.763 -3.97 -4.186 -4.404 -4.628 -4.879 -5.052 -5.223 -5.487 -5.674 -5.874 -5.972 -6.169 -6.381 -6.605 -6.718 -7.077 -7.073 -7.194 -7.33 -7.656 -7.854 -8.084 -8.321 -8.545 -8.806 -9.203 -9.931 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_37_56.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_37_56.txt deleted file mode 100644 index 8223eeb1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_37_56.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18964 ,KEBNE ,17022378,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 07:00:45 CET,0.0 2.23 2.711 3.081 3.389 3.665 3.921 4.15 4.599 4.806 4.988 5.108 5.533 5.697 5.994 6.285 6.577 6.706 6.936 7.177 7.534 7.752 7.976 8.327 8.656 8.967 9.278 9.577 9.945 10.314 10.67 11.085 11.498 11.903 12.37 12.9 13.411 13.981 14.59 15.219 15.894 16.661 17.564 18.486 19.563 20.764 22.134 23.678 25.495 27.704 30.461 32.752 34.045 34.846 35.394 35.678 35.722 35.633 35.502 35.369 35.222 35.05 34.882 34.713 34.534 34.361 34.179 34.015 33.872 33.706 33.519 33.376 33.219 33.037 32.895 32.762 32.624 32.474 32.29 32.166 32.05 31.847 31.706 31.563 31.494 31.338 31.171 30.995 30.902 30.586 30.626 30.523 30.405 30.155 30.026 29.864 29.654 29.427 29.168 28.859 27.891 -2 ,24835 ,KEBNE ,17022379,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 07:00:49 CET,0.0 1.484 2.041 2.433 2.771 3.077 3.319 3.553 3.994 4.195 4.39 4.495 4.911 5.079 5.382 5.667 5.937 6.079 6.366 6.63 6.986 7.216 7.437 7.76 8.081 8.389 8.687 8.973 9.33 9.666 10.002 10.409 10.812 11.207 11.628 12.105 12.593 13.119 13.666 14.248 14.87 15.605 16.521 17.425 18.433 19.582 20.903 22.444 24.306 26.531 29.23 31.498 32.806 33.602 34.014 34.213 34.295 34.279 34.232 34.14 34.04 33.937 33.813 33.679 33.534 33.394 33.241 33.086 32.946 32.801 32.647 32.505 32.347 32.177 32.051 31.924 31.761 31.581 31.407 31.276 31.143 30.966 30.844 30.702 30.629 30.485 30.328 30.156 30.063 29.745 29.766 29.656 29.549 29.307 29.155 29.003 28.858 28.685 28.472 28.148 27.357 -3 ,23955 ,KEBNE ,17022380,Wed Dec 22 05:33:46 CET,Wed Dec 22 07:00:35 CET,0.0 1.882 2.368 2.698 2.999 3.313 3.594 3.822 4.213 4.391 4.571 4.684 5.102 5.265 5.592 5.896 6.179 6.312 6.584 6.858 7.251 7.498 7.727 8.06 8.385 8.7 9.016 9.326 9.705 10.071 10.42 10.838 11.237 11.615 12.07 12.605 13.111 13.66 14.265 14.9 15.552 16.27 17.144 18.083 19.205 20.426 21.794 23.307 25.1 27.3 29.944 32.09 33.312 34.01 34.452 34.703 34.826 34.92 34.956 34.958 34.939 34.889 34.828 34.752 34.652 34.535 34.415 34.318 34.221 34.118 34.01 33.927 33.847 33.758 33.693 33.635 33.556 33.446 33.321 33.237 33.155 33.017 32.916 32.815 32.769 32.669 32.558 32.441 32.371 32.064 32.083 31.967 31.854 31.591 31.436 31.28 31.121 30.919 30.671 30.39 29.792 -4 ,2405 ,KEBNE ,17022381,Wed Dec 22 05:34:48 CET,Wed Dec 22 07:00:11 CET,0.0 1.692 2.178 2.548 2.836 3.09 3.333 3.567 4.012 4.219 4.398 4.477 4.879 5.034 5.35 5.654 5.943 6.083 6.341 6.575 6.915 7.147 7.381 7.707 8.015 8.33 8.633 8.93 9.299 9.64 9.973 10.376 10.768 11.143 11.567 12.06 12.548 13.093 13.689 14.311 14.942 15.644 16.495 17.393 18.476 19.652 20.983 22.517 24.328 26.464 28.971 31.081 32.315 32.998 33.428 33.715 33.866 33.929 33.958 33.993 33.995 33.972 33.911 33.826 33.733 33.63 33.507 33.379 33.261 33.126 32.974 32.847 32.712 32.583 32.485 32.37 32.248 32.121 31.988 31.888 31.762 31.561 31.416 31.261 31.182 31.023 30.862 30.684 30.59 30.272 30.303 30.2 30.09 29.863 29.731 29.585 29.409 29.175 28.836 28.388 27.035 -5 ,23649 ,KEBNE ,17022382,Wed Dec 22 05:34:48 CET,Wed Dec 22 07:01:15 CET,0.0 1.33 1.826 2.222 2.552 2.841 3.107 3.343 3.771 3.955 4.125 4.227 4.636 4.785 5.081 5.376 5.659 5.791 6.037 6.285 6.649 6.88 7.099 7.41 7.721 8.03 8.346 8.641 9.01 9.356 9.677 10.071 10.456 10.818 11.232 11.731 12.208 12.729 13.332 13.957 14.604 15.339 16.221 17.107 18.124 19.303 20.662 22.198 24.048 26.299 29.034 31.377 32.847 33.761 34.321 34.646 34.832 34.937 34.975 34.982 34.974 34.958 34.938 34.884 34.737 34.555 34.379 34.208 34.058 33.902 33.737 33.617 33.476 33.319 33.203 33.08 32.95 32.811 32.668 32.561 32.444 32.255 32.115 31.98 31.919 31.784 31.635 31.488 31.407 31.094 31.137 31.041 30.938 30.655 30.5 30.364 30.226 30.069 29.903 29.702 29.128 -6 ,8380 ,KEBNE ,17022383,Wed Dec 22 05:34:48 CET,Wed Dec 22 06:59:54 CET,0.0 2.721 3.233 3.608 3.915 4.211 4.513 4.768 5.189 5.379 5.559 5.672 6.106 6.268 6.568 6.846 7.094 7.222 7.482 7.725 8.063 8.295 8.518 8.83 9.134 9.431 9.731 10.012 10.371 10.729 11.077 11.505 11.919 12.327 12.813 13.36 13.861 14.39 14.98 15.606 16.252 16.964 17.797 18.651 19.654 20.773 22.067 23.559 25.345 27.492 30.086 32.22 33.408 34.146 34.55 34.73 34.847 34.869 34.818 34.751 34.667 34.559 34.41 34.245 34.07 33.906 33.743 33.582 33.437 33.289 33.131 32.991 32.844 32.704 32.589 32.459 32.333 32.2 32.04 31.925 31.802 31.593 31.455 31.317 31.244 31.094 30.936 30.774 30.687 30.368 30.393 30.287 30.166 29.863 29.7 29.543 29.385 29.212 28.989 28.693 27.936 -7 ,13118 ,KEBNE ,17022384,Wed Dec 22 05:34:48 CET,Wed Dec 22 07:01:59 CET,0.0 1.369 1.889 2.263 2.568 2.843 3.067 3.285 3.732 3.94 4.126 4.201 4.605 4.769 5.08 5.369 5.645 5.778 6.048 6.301 6.658 6.893 7.107 7.424 7.741 8.039 8.325 8.599 8.943 9.278 9.607 9.997 10.37 10.753 11.211 11.722 12.199 12.711 13.277 13.883 14.516 15.211 16.024 16.847 17.814 18.921 20.218 21.724 23.539 25.691 28.387 30.69 31.959 32.756 33.278 33.53 33.574 33.553 33.554 33.578 33.561 33.503 33.417 33.322 33.233 33.161 33.064 32.943 32.841 32.73 32.596 32.486 32.372 32.242 32.118 31.979 31.844 31.711 31.597 31.516 31.412 31.208 31.047 30.889 30.808 30.634 30.44 30.226 30.115 29.774 29.789 29.684 29.577 29.339 29.179 28.993 28.809 28.607 28.404 28.138 27.565 -8 ,7810 ,KEBNE ,17022385,Wed Dec 22 05:34:48 CET,Wed Dec 22 07:00:48 CET,0.0 1.476 1.956 2.307 2.61 2.872 3.122 3.367 3.799 3.975 4.149 4.263 4.676 4.825 5.098 5.36 5.618 5.747 5.985 6.212 6.55 6.772 7.004 7.341 7.641 7.92 8.208 8.494 8.857 9.21 9.563 9.985 10.36 10.713 11.136 11.612 12.091 12.648 13.245 13.885 14.553 15.286 16.142 16.993 17.995 19.143 20.443 21.921 23.728 25.867 28.474 30.649 31.9 32.63 33.057 33.31 33.451 33.519 33.509 33.465 33.435 33.422 33.388 33.313 33.228 33.154 33.078 32.991 32.904 32.812 32.712 32.632 32.54 32.432 32.348 32.244 32.125 32.013 31.898 31.818 31.729 31.571 31.453 31.327 31.262 31.125 30.974 30.82 30.741 30.435 30.489 30.388 30.272 30.063 29.951 29.813 29.661 29.478 29.264 28.985 28.377 -9 ,7938 ,KEBNE ,17022386,Wed Dec 22 05:34:48 CET,Wed Dec 22 07:02:01 CET,0.0 1.402 1.952 2.396 2.748 3.03 3.285 3.509 3.922 4.123 4.319 4.43 4.843 5.011 5.321 5.61 5.879 6.004 6.264 6.525 6.881 7.11 7.336 7.653 7.947 8.225 8.501 8.783 9.153 9.51 9.853 10.25 10.633 11.009 11.445 11.947 12.428 12.957 13.526 14.112 14.728 15.452 16.322 17.181 18.19 19.329 20.638 22.139 23.918 26.021 28.563 30.775 32.115 32.91 33.397 33.716 33.889 33.959 33.983 33.994 33.94 33.833 33.712 33.595 33.506 33.402 33.246 33.095 32.956 32.807 32.659 32.528 32.375 32.224 32.12 32.004 31.874 31.741 31.575 31.459 31.338 31.121 30.974 30.824 30.754 30.619 30.461 30.293 30.208 29.887 29.894 29.782 29.668 29.422 29.293 29.134 28.969 28.769 28.489 28.127 26.674 -10 ,30581 ,KEBNE ,17022387,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:02:33 CET,0.0 1.141 1.628 1.991 2.279 2.533 2.771 3.0 3.425 3.622 3.817 3.955 4.365 4.519 4.825 5.101 5.362 5.489 5.742 5.999 6.358 6.592 6.819 7.129 7.442 7.758 8.062 8.357 8.757 9.145 9.495 9.904 10.307 10.709 11.18 11.724 12.248 12.797 13.376 14.007 14.679 15.427 16.316 17.22 18.285 19.485 20.874 22.46 24.278 26.406 28.988 31.028 32.129 32.759 33.13 33.304 33.32 33.312 33.326 33.33 33.29 33.222 33.132 33.046 32.959 32.868 32.769 32.664 32.56 32.451 32.337 32.242 32.139 31.99 31.876 31.782 31.679 31.558 31.406 31.295 31.19 31.017 30.884 30.756 30.694 30.577 30.462 30.326 30.239 29.919 29.947 29.816 29.68 29.414 29.255 29.1 28.923 28.702 28.484 28.252 27.548 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_38_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_38_39.txt deleted file mode 100644 index 1a0b2ab8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_38_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11341 ,TETRA ,17524676,Wed Nov 24 22:59:37 CET,Thu Nov 25 00:46:03 CET,0.0 1.351 1.822 2.187 2.489 2.745 2.983 3.213 3.652 3.854 4.031 4.114 4.528 4.685 4.987 5.269 5.531 5.643 5.858 6.089 6.418 6.608 6.799 7.08 7.324 7.549 7.774 8.007 8.316 8.592 8.831 9.118 9.399 9.658 9.937 10.256 10.596 10.998 11.4 11.804 12.235 12.697 13.197 13.672 14.198 14.747 15.377 16.044 16.598 16.875 16.766 16.078 15.167 14.271 13.502 12.816 12.179 11.552 11.018 10.47 9.982 9.544 9.112 8.718 8.372 8.057 7.696 7.373 7.104 6.833 6.546 6.29 6.034 5.755 5.509 5.263 5.018 4.779 4.541 4.36 4.176 3.92 3.739 3.543 3.42 3.17 2.958 2.729 2.599 2.21 2.157 1.998 1.848 1.526 1.331 1.123 0.897 0.628 0.335 -0.037 -1.819 -2 ,2062 ,TETRA ,17524678,Wed Nov 24 23:02:36 CET,Thu Nov 25 00:53:15 CET,0.0 1.905 2.532 3.033 3.435 3.797 4.122 4.421 4.937 5.161 5.373 5.513 5.937 6.131 6.476 6.75 7.012 7.14 7.371 7.59 7.932 8.145 8.348 8.63 8.874 9.122 9.373 9.607 9.913 10.202 10.468 10.778 11.069 11.35 11.671 12.026 12.385 12.747 13.08 13.389 13.69 14.039 14.467 14.918 15.452 16.076 16.709 17.194 17.666 18.012 17.945 17.307 16.573 15.901 15.192 14.482 13.854 13.286 12.766 12.213 11.729 11.305 10.907 10.521 10.152 9.833 9.504 9.189 8.912 8.617 8.298 8.045 7.777 7.495 7.272 7.036 6.785 6.526 6.267 6.099 5.928 5.641 5.429 5.203 5.085 4.848 4.611 4.342 4.212 3.852 3.803 3.627 3.435 3.066 2.879 2.648 2.35 2.069 1.726 1.152 -1.716 -3 ,29750 ,TETRA ,17524680,Wed Nov 24 23:04:35 CET,Thu Nov 25 00:52:10 CET,0.0 1.673 2.086 2.442 2.743 2.986 3.224 3.451 3.881 4.078 4.25 4.292 4.676 4.809 5.072 5.33 5.559 5.658 5.854 6.044 6.304 6.468 6.638 6.893 7.137 7.37 7.585 7.805 8.088 8.344 8.615 8.951 9.249 9.535 9.857 10.199 10.527 10.895 11.281 11.684 12.116 12.561 13.073 13.615 14.169 14.704 15.317 15.968 16.613 17.166 17.506 17.47 17.122 16.684 16.249 15.828 15.444 15.065 14.698 14.304 13.951 13.623 13.293 12.972 12.671 12.376 12.067 11.795 11.556 11.309 11.04 10.817 10.577 10.335 10.164 9.966 9.739 9.519 9.275 9.105 8.95 8.689 8.493 8.3 8.192 7.954 7.711 7.443 7.307 6.935 6.905 6.756 6.595 6.248 6.069 5.875 5.65 5.413 5.167 4.855 4.054 -4 ,17085 ,TETRA ,17524681,Wed Nov 24 23:01:35 CET,Thu Nov 25 00:48:47 CET,0.0 2.162 2.733 3.108 3.453 3.757 4.027 4.303 4.814 5.043 5.254 5.368 5.771 5.917 6.195 6.462 6.72 6.838 7.075 7.303 7.607 7.8 8.007 8.307 8.562 8.804 9.046 9.269 9.546 9.818 10.085 10.416 10.728 11.011 11.335 11.703 12.039 12.366 12.724 13.096 13.447 13.868 14.362 14.83 15.337 15.843 16.385 16.921 17.385 17.741 17.86 17.443 16.848 16.247 15.642 15.055 14.519 14.027 13.597 13.165 12.792 12.447 12.092 11.748 11.426 11.131 10.834 10.57 10.332 10.086 9.836 9.628 9.417 9.199 9.018 8.833 8.632 8.407 8.171 8.023 7.869 7.614 7.43 7.231 7.128 6.929 6.731 6.511 6.395 6.022 6.001 5.873 5.736 5.428 5.26 5.074 4.831 4.514 4.085 3.523 1.155 -5 ,9624 ,TETRA ,17524682,Wed Nov 24 23:04:38 CET,Thu Nov 25 00:52:29 CET,0.0 0.905 1.269 1.546 1.808 2.035 2.246 2.443 2.767 2.901 3.034 3.073 3.453 3.579 3.83 4.06 4.275 4.378 4.567 4.751 5.021 5.189 5.356 5.592 5.816 6.04 6.267 6.487 6.766 7.026 7.28 7.592 7.876 8.135 8.432 8.752 9.052 9.398 9.754 10.128 10.502 10.892 11.339 11.762 12.251 12.814 13.437 14.057 14.683 15.274 15.746 15.769 15.481 15.074 14.616 14.135 13.646 13.154 12.715 12.289 11.95 11.647 11.337 11.028 10.724 10.45 10.155 9.869 9.617 9.376 9.117 8.896 8.689 8.468 8.296 8.113 7.907 7.68 7.468 7.335 7.184 6.936 6.731 6.534 6.45 6.241 6.021 5.806 5.684 5.312 5.281 5.136 4.992 4.672 4.479 4.265 4.033 3.776 3.509 3.081 1.735 -6 ,1178 ,TETRA ,17524683,Wed Nov 24 23:04:39 CET,Thu Nov 25 00:52:38 CET,0.0 0.909 1.216 1.53 1.811 2.024 2.22 2.434 2.82 2.977 3.121 3.139 3.496 3.605 3.837 4.064 4.278 4.384 4.584 4.777 5.046 5.211 5.39 5.66 5.894 6.119 6.357 6.592 6.884 7.16 7.418 7.708 7.987 8.273 8.61 8.959 9.254 9.597 9.966 10.34 10.775 11.232 11.702 12.161 12.688 13.272 13.909 14.533 15.166 15.811 16.255 16.171 15.867 15.465 15.027 14.583 14.113 13.635 13.242 12.838 12.472 12.151 11.835 11.536 11.25 10.992 10.742 10.487 10.254 10.014 9.756 9.554 9.344 9.134 8.967 8.794 8.616 8.437 8.264 8.128 7.979 7.728 7.553 7.372 7.269 7.057 6.85 6.631 6.514 6.138 6.104 5.938 5.778 5.503 5.338 5.152 4.965 4.758 4.455 3.988 2.79 -7 ,10727 ,TETRA ,17524684,Wed Nov 24 23:04:36 CET,Thu Nov 25 00:55:50 CET,0.0 1.279 1.702 2.033 2.332 2.566 2.76 2.971 3.368 3.533 3.689 3.741 4.129 4.271 4.559 4.838 5.102 5.224 5.457 5.67 5.958 6.14 6.325 6.603 6.86 7.093 7.307 7.519 7.807 8.081 8.345 8.65 8.932 9.19 9.484 9.812 10.129 10.482 10.851 11.227 11.605 12.044 12.543 13.003 13.505 14.046 14.622 15.189 15.766 16.289 16.659 16.681 16.331 15.728 15.114 14.548 14.018 13.473 12.992 12.524 12.119 11.748 11.372 10.998 10.652 10.35 10.036 9.751 9.512 9.27 9.0 8.765 8.512 8.25 8.061 7.872 7.675 7.468 7.251 7.101 6.944 6.703 6.532 6.35 6.252 6.049 5.844 5.64 5.534 5.174 5.217 5.103 4.981 4.702 4.537 4.34 4.113 3.866 3.589 3.243 1.968 -8 ,7399 ,TETRA ,17524685,Wed Nov 24 23:04:38 CET,Thu Nov 25 00:56:05 CET,0.0 1.155 1.561 1.856 2.082 2.301 2.503 2.679 2.992 3.15 3.305 3.348 3.728 3.864 4.107 4.324 4.55 4.658 4.868 5.061 5.332 5.517 5.694 5.923 6.145 6.383 6.607 6.826 7.132 7.424 7.685 7.974 8.239 8.497 8.803 9.155 9.491 9.848 10.226 10.626 11.038 11.489 12.024 12.539 13.143 13.805 14.449 15.065 15.541 15.665 15.385 14.586 13.718 12.942 12.237 11.578 10.962 10.392 9.894 9.409 8.976 8.577 8.189 7.818 7.477 7.164 6.842 6.549 6.286 6.012 5.729 5.495 5.257 5.01 4.81 4.589 4.337 4.078 3.825 3.648 3.471 3.214 3.039 2.86 2.767 2.592 2.43 2.23 2.12 1.757 1.78 1.656 1.524 1.249 1.087 0.924 0.743 0.548 0.323 0.021 -0.755 -9 ,26345 ,TETRA ,17524686,Wed Nov 24 23:04:39 CET,Thu Nov 25 00:51:52 CET,0.0 1.126 1.505 1.79 2.053 2.306 2.51 2.686 3.009 3.163 3.31 3.342 3.714 3.836 4.075 4.305 4.527 4.628 4.826 5.01 5.249 5.4 5.545 5.755 5.979 6.205 6.424 6.635 6.907 7.157 7.385 7.674 7.946 8.197 8.506 8.856 9.17 9.491 9.823 10.181 10.544 10.938 11.394 11.845 12.334 12.845 13.387 13.934 14.502 14.988 15.241 15.127 14.812 14.39 13.959 13.513 13.068 12.625 12.238 11.78 11.349 10.964 10.61 10.298 10.004 9.73 9.432 9.184 8.978 8.753 8.496 8.273 8.046 7.801 7.602 7.398 7.187 6.959 6.712 6.547 6.375 6.081 5.865 5.642 5.536 5.313 5.074 4.829 4.708 4.34 4.306 4.156 3.994 3.617 3.4 3.18 2.962 2.702 2.404 1.983 0.38 -10 ,22644 ,TETRA ,17524688,Wed Nov 24 23:04:36 CET,Thu Nov 25 00:52:26 CET,0.0 1.393 1.757 2.05 2.329 2.586 2.8 3.0 3.358 3.518 3.663 3.685 4.052 4.179 4.428 4.668 4.889 4.991 5.191 5.383 5.657 5.83 5.995 6.229 6.453 6.664 6.876 7.088 7.357 7.633 7.894 8.189 8.467 8.743 9.07 9.406 9.719 10.081 10.457 10.844 11.273 11.76 12.306 12.834 13.364 13.925 14.593 15.257 15.845 16.344 16.754 16.718 16.403 16.004 15.592 15.168 14.714 14.243 13.837 13.431 13.076 12.759 12.446 12.156 11.902 11.668 11.419 11.186 10.97 10.744 10.5 10.298 10.095 9.883 9.716 9.541 9.359 9.163 8.96 8.822 8.68 8.458 8.29 8.11 8.014 7.819 7.634 7.441 7.34 6.985 6.974 6.816 6.643 6.244 6.044 5.84 5.617 5.367 5.05 4.646 2.994 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_38_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_38_40.txt deleted file mode 100644 index 8b3759eb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_38_40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25111 ,KEBNE ,17022388,Wed Dec 22 05:34:47 CET,Wed Dec 22 06:59:51 CET,0.0 1.979 2.548 2.937 3.25 3.516 3.771 4.012 4.442 4.633 4.796 4.853 5.24 5.379 5.63 5.85 6.061 6.159 6.359 6.556 6.822 6.991 7.154 7.39 7.633 7.849 8.035 8.223 8.479 8.723 8.963 9.244 9.493 9.732 10.012 10.319 10.609 10.906 11.23 11.588 11.957 12.382 12.9 13.384 13.81 14.206 14.612 14.916 15.14 15.216 14.867 14.095 13.24 12.439 11.753 11.159 10.645 10.156 9.699 9.202 8.784 8.428 8.068 7.711 7.383 7.082 6.771 6.493 6.252 6.005 5.743 5.525 5.268 5.014 4.832 4.645 4.451 4.248 4.054 3.923 3.771 3.511 3.339 3.157 3.061 2.853 2.644 2.417 2.291 1.917 1.91 1.776 1.635 1.315 1.129 0.873 0.572 0.275 -0.012 -0.389 -1.356 -2 ,1369 ,KEBNE ,17022389,Wed Dec 22 05:34:48 CET,Wed Dec 22 07:00:42 CET,0.0 2.377 2.917 3.285 3.569 3.823 4.071 4.287 4.634 4.82 4.989 5.034 5.407 5.536 5.787 6.031 6.265 6.375 6.59 6.802 7.09 7.266 7.438 7.693 7.933 8.172 8.404 8.625 8.928 9.21 9.489 9.836 10.175 10.499 10.837 11.182 11.498 11.849 12.215 12.58 12.946 13.353 13.814 14.234 14.704 15.202 15.693 16.171 16.619 17.02 17.134 16.736 16.151 15.515 14.928 14.372 13.805 13.244 12.794 12.376 11.95 11.545 11.191 10.848 10.521 10.239 9.948 9.682 9.469 9.231 8.973 8.768 8.544 8.302 8.119 7.931 7.717 7.489 7.268 7.115 6.953 6.704 6.542 6.376 6.281 6.079 5.869 5.646 5.532 5.167 5.154 5.01 4.863 4.548 4.324 4.091 3.913 3.693 3.395 3.061 1.942 -3 ,29767 ,KEBNE ,17022391,Wed Dec 22 05:35:52 CET,Wed Dec 22 07:02:22 CET,0.0 1.82 2.4 2.821 3.147 3.425 3.693 3.946 4.412 4.601 4.778 4.866 5.258 5.409 5.686 5.918 6.127 6.229 6.428 6.617 6.901 7.068 7.23 7.481 7.714 7.934 8.143 8.358 8.622 8.865 9.101 9.377 9.652 9.906 10.176 10.459 10.718 11.015 11.343 11.669 11.989 12.363 12.829 13.257 13.714 14.163 14.592 15.027 15.396 15.58 15.487 15.028 14.425 13.791 13.159 12.527 11.945 11.415 10.947 10.454 10.007 9.602 9.221 8.84 8.469 8.121 7.764 7.443 7.146 6.847 6.565 6.322 6.059 5.797 5.596 5.386 5.152 4.917 4.686 4.535 4.378 4.111 3.9 3.653 3.54 3.341 3.119 2.873 2.736 2.322 2.187 1.99 1.789 1.411 1.227 1.037 0.843 0.63 0.356 -0.037 -1.537 -4 ,31274 ,KEBNE ,17022392,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:01:30 CET,0.0 2.434 3.01 3.51 3.887 4.184 4.442 4.677 5.128 5.33 5.509 5.591 5.991 6.148 6.447 6.721 6.983 7.104 7.346 7.577 7.897 8.107 8.316 8.606 8.868 9.127 9.379 9.616 9.91 10.199 10.471 10.796 11.105 11.396 11.74 12.128 12.491 12.87 13.265 13.65 14.046 14.468 14.936 15.404 15.881 16.375 16.955 17.538 18.033 18.34 18.197 17.49 16.671 15.889 15.185 14.483 13.856 13.275 12.754 12.232 11.766 11.329 10.898 10.503 10.14 9.796 9.448 9.131 8.842 8.536 8.199 7.932 7.671 7.4 7.189 6.972 6.757 6.537 6.297 6.116 5.934 5.669 5.469 5.257 5.144 4.904 4.661 4.402 4.263 3.86 3.792 3.639 3.481 3.144 2.976 2.766 2.526 2.29 1.985 1.593 0.82 -5 ,27304 ,KEBNE ,17022393,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:02:45 CET,0.0 1.061 1.476 1.814 2.111 2.369 2.607 2.833 3.26 3.455 3.624 3.66 4.032 4.173 4.46 4.694 4.911 5.028 5.267 5.488 5.794 5.991 6.177 6.434 6.661 6.885 7.104 7.316 7.586 7.825 8.061 8.352 8.612 8.86 9.149 9.463 9.755 10.07 10.415 10.771 11.143 11.538 11.971 12.349 12.733 13.145 13.533 13.936 14.316 14.572 14.521 13.956 13.241 12.567 11.932 11.312 10.736 10.193 9.716 9.22 8.765 8.37 8.011 7.668 7.341 7.005 6.647 6.337 6.078 5.823 5.552 5.324 5.093 4.84 4.627 4.413 4.205 3.996 3.776 3.621 3.454 3.193 3.017 2.829 2.729 2.532 2.333 2.11 1.987 1.61 1.569 1.408 1.243 0.93 0.781 0.623 0.428 0.206 -0.069 -0.435 -1.272 -6 ,16567 ,KEBNE ,17022394,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:02:39 CET,0.0 2.258 2.899 3.363 3.755 4.091 4.403 4.691 5.195 5.429 5.646 5.764 6.175 6.344 6.661 6.972 7.259 7.39 7.649 7.897 8.271 8.496 8.687 8.966 9.224 9.458 9.694 9.92 10.201 10.466 10.723 11.026 11.311 11.575 11.873 12.23 12.563 12.872 13.181 13.537 13.926 14.367 14.87 15.338 15.84 16.29 16.671 17.013 17.273 17.379 17.151 16.509 15.769 15.043 14.364 13.684 13.058 12.485 11.958 11.39 10.899 10.458 10.032 9.637 9.266 8.931 8.559 8.211 7.915 7.61 7.291 7.024 6.736 6.418 6.185 5.95 5.698 5.451 5.2 5.024 4.843 4.567 4.383 4.175 4.063 3.83 3.596 3.355 3.213 2.818 2.804 2.654 2.497 2.164 1.97 1.748 1.513 1.263 0.945 0.486 -0.533 -7 ,30522 ,KEBNE ,17022395,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:02:09 CET,0.0 1.908 2.298 2.59 2.875 3.147 3.373 3.577 3.936 4.083 4.226 4.271 4.659 4.786 5.014 5.215 5.412 5.507 5.695 5.883 6.17 6.34 6.484 6.682 6.883 7.084 7.271 7.449 7.67 7.872 8.062 8.307 8.543 8.764 9.016 9.292 9.549 9.792 10.047 10.326 10.602 10.904 11.252 11.578 11.903 12.243 12.626 12.989 13.293 13.426 13.246 12.661 12.008 11.406 10.858 10.324 9.836 9.39 8.986 8.551 8.17 7.84 7.507 7.207 6.919 6.641 6.338 6.052 5.801 5.542 5.279 5.062 4.849 4.647 4.495 4.33 4.151 3.946 3.732 3.597 3.459 3.218 3.043 2.871 2.781 2.591 2.396 2.193 2.092 1.751 1.773 1.647 1.512 1.227 1.065 0.882 0.679 0.436 0.096 -0.338 -1.438 -8 ,25472 ,KEBNE ,17022396,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:02:01 CET,0.0 1.467 1.967 2.339 2.633 2.884 3.088 3.26 3.587 3.737 3.885 3.969 4.368 4.522 4.807 5.044 5.27 5.388 5.613 5.815 6.095 6.272 6.435 6.673 6.91 7.142 7.371 7.588 7.885 8.191 8.489 8.808 9.068 9.331 9.625 9.944 10.251 10.575 10.917 11.257 11.619 12.026 12.441 12.822 13.248 13.673 14.104 14.508 14.933 15.296 15.331 14.856 14.204 13.503 12.809 12.179 11.609 11.101 10.638 10.146 9.722 9.349 8.996 8.655 8.341 8.032 7.706 7.419 7.158 6.892 6.611 6.373 6.134 5.887 5.675 5.445 5.209 4.97 4.715 4.534 4.355 4.068 3.864 3.661 3.554 3.327 3.087 2.827 2.697 2.32 2.271 2.127 1.976 1.607 1.423 1.23 0.994 0.73 0.418 -0.04 -1.009 -9 ,30313 ,KEBNE ,17022397,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:02:35 CET,0.0 1.645 2.183 2.603 2.955 3.199 3.431 3.651 4.047 4.232 4.398 4.477 4.884 5.036 5.314 5.565 5.808 5.923 6.142 6.393 6.78 7.01 7.225 7.54 7.83 8.098 8.374 8.624 8.936 9.229 9.494 9.834 10.161 10.454 10.781 11.129 11.447 11.784 12.135 12.505 12.895 13.316 13.775 14.233 14.722 15.207 15.734 16.257 16.688 16.96 17.012 16.606 16.032 15.466 14.94 14.396 13.833 13.296 12.845 12.364 11.941 11.577 11.217 10.871 10.544 10.24 9.913 9.62 9.379 9.124 8.851 8.625 8.384 8.121 7.92 7.724 7.524 7.326 7.116 6.952 6.782 6.54 6.373 6.186 6.084 5.876 5.686 5.486 5.37 4.994 4.981 4.816 4.632 4.258 4.062 3.839 3.592 3.333 3.063 2.802 2.043 -10 ,9211 ,KEBNE ,17022398,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:01:59 CET,0.0 1.861 2.34 2.661 2.952 3.215 3.442 3.657 4.054 4.246 4.431 4.493 4.883 5.021 5.286 5.525 5.752 5.865 6.078 6.293 6.614 6.814 6.994 7.25 7.494 7.719 7.967 8.22 8.518 8.801 9.066 9.385 9.687 9.972 10.302 10.656 10.996 11.361 11.731 12.134 12.509 12.887 13.295 13.622 13.964 14.321 14.698 15.081 15.392 15.523 15.293 14.628 13.927 13.222 12.51 11.811 11.202 10.648 10.156 9.662 9.219 8.826 8.442 8.048 7.672 7.334 6.987 6.677 6.416 6.124 5.802 5.553 5.294 5.015 4.805 4.589 4.354 4.122 3.888 3.71 3.528 3.236 3.034 2.833 2.73 2.511 2.28 2.053 1.934 1.552 1.552 1.409 1.247 0.894 0.696 0.476 0.216 -0.079 -0.348 -0.668 -1.399 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_39_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_39_41.txt deleted file mode 100644 index 6dd2a70d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_39_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20899 ,KEBNE ,17022399,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:02:51 CET,0.0 3.208 3.89 4.34 4.663 4.968 5.232 5.44 5.863 6.06 6.232 6.292 6.67 6.814 7.087 7.341 7.572 7.679 7.889 8.09 8.388 8.568 8.734 8.975 9.214 9.462 9.69 9.89 10.144 10.395 10.637 10.911 11.155 11.389 11.658 11.948 12.217 12.531 12.848 13.145 13.456 13.827 14.253 14.632 15.052 15.477 15.888 16.245 16.514 16.608 16.411 15.879 15.257 14.601 13.963 13.383 12.858 12.348 11.877 11.404 10.981 10.565 10.178 9.799 9.447 9.15 8.832 8.539 8.273 7.987 7.694 7.458 7.216 6.959 6.749 6.527 6.299 6.054 5.784 5.591 5.398 5.104 4.9 4.691 4.58 4.342 4.084 3.796 3.637 3.229 3.172 3.013 2.828 2.445 2.254 2.024 1.747 1.432 1.073 0.546 -1.173 -2 ,29144 ,KEBNE ,17022400,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:03:07 CET,0.0 1.947 2.497 2.884 3.227 3.512 3.743 3.956 4.354 4.53 4.687 4.736 5.126 5.257 5.497 5.732 5.962 6.076 6.298 6.502 6.774 6.936 7.114 7.362 7.573 7.789 8.015 8.23 8.477 8.705 8.941 9.243 9.521 9.748 9.993 10.279 10.56 10.867 11.178 11.494 11.809 12.148 12.538 12.895 13.231 13.553 13.859 14.132 14.332 14.368 13.957 13.095 12.22 11.375 10.582 9.849 9.184 8.557 8.004 7.428 6.93 6.483 6.06 5.67 5.298 4.953 4.59 4.271 3.992 3.691 3.394 3.166 2.928 2.662 2.447 2.238 2.021 1.785 1.54 1.367 1.189 0.913 0.721 0.526 0.425 0.212 -0.015 -0.25 -0.366 -0.75 -0.806 -0.961 -1.111 -1.429 -1.613 -1.803 -1.994 -2.225 -2.506 -2.846 -4.966 -3 ,27132 ,KEBNE ,17022401,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:03:40 CET,0.0 2.284 2.806 3.217 3.588 3.881 4.123 4.348 4.774 4.958 5.135 5.213 5.598 5.724 5.991 6.266 6.522 6.641 6.873 7.104 7.43 7.618 7.792 8.059 8.327 8.568 8.792 9.009 9.274 9.517 9.741 9.997 10.243 10.503 10.803 11.121 11.422 11.71 11.994 12.294 12.597 12.948 13.37 13.763 14.173 14.546 14.91 15.312 15.676 15.859 15.619 14.845 13.988 13.102 12.291 11.58 10.953 10.35 9.816 9.279 8.783 8.322 7.897 7.507 7.141 6.802 6.453 6.143 5.863 5.574 5.278 5.034 4.781 4.522 4.317 4.106 3.887 3.654 3.415 3.246 3.066 2.787 2.594 2.385 2.283 2.07 1.837 1.615 1.5 1.129 1.101 0.95 0.788 0.457 0.276 0.06 -0.2 -0.495 -0.84 -1.277 -2.636 -4 ,1345 ,KEBNE ,17022402,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:02:59 CET,0.0 2.448 3.05 3.477 3.798 4.074 4.335 4.567 4.981 5.168 5.331 5.361 5.736 5.86 6.091 6.331 6.556 6.662 6.865 7.052 7.312 7.489 7.649 7.853 8.045 8.231 8.425 8.608 8.832 9.078 9.32 9.619 9.91 10.171 10.479 10.831 11.145 11.451 11.76 12.112 12.495 12.899 13.367 13.82 14.295 14.801 15.342 15.871 16.304 16.554 16.589 15.97 15.096 14.251 13.463 12.739 12.102 11.539 11.06 10.54 10.081 9.705 9.352 9.007 8.665 8.354 8.028 7.73 7.46 7.17 6.873 6.622 6.352 6.068 5.849 5.623 5.387 5.151 4.902 4.734 4.561 4.288 4.112 3.926 3.828 3.628 3.412 3.189 3.078 2.701 2.672 2.524 2.397 2.119 1.946 1.772 1.573 1.291 0.963 0.63 -0.219 -5 ,15050 ,KEBNE ,17022403,Wed Dec 22 05:35:52 CET,Wed Dec 22 07:03:15 CET,0.0 3.28 3.886 4.259 4.578 4.844 5.087 5.305 5.724 5.923 6.107 6.191 6.589 6.726 6.962 7.187 7.424 7.546 7.759 7.97 8.254 8.424 8.607 8.867 9.092 9.312 9.528 9.741 9.998 10.24 10.478 10.737 10.981 11.237 11.55 11.867 12.15 12.473 12.823 13.177 13.514 13.89 14.311 14.702 15.131 15.593 16.048 16.333 16.493 16.557 16.251 15.414 14.524 13.767 13.054 12.332 11.648 11.014 10.476 9.917 9.414 8.958 8.53 8.134 7.77 7.443 7.083 6.756 6.492 6.223 5.936 5.694 5.444 5.18 4.964 4.737 4.515 4.286 4.029 3.851 3.669 3.381 3.163 2.94 2.83 2.608 2.386 2.131 1.995 1.612 1.554 1.388 1.227 0.861 0.656 0.445 0.225 -0.027 -0.314 -0.698 -1.67 -6 ,11547 ,KEBNE ,17022404,Wed Dec 22 05:35:50 CET,Wed Dec 22 07:02:58 CET,0.0 1.808 2.385 2.701 2.987 3.252 3.507 3.784 4.306 4.548 4.782 4.96 5.381 5.536 5.8 6.057 6.292 6.397 6.583 6.761 7.052 7.265 7.478 7.77 8.041 8.308 8.579 8.851 9.186 9.495 9.789 10.138 10.451 10.739 11.073 11.414 11.732 12.084 12.445 12.796 13.127 13.464 13.849 14.264 14.778 15.309 15.85 16.419 16.987 17.415 17.528 17.155 16.647 16.055 15.415 14.799 14.217 13.638 13.113 12.568 12.111 11.677 11.258 10.891 10.545 10.242 9.927 9.631 9.367 9.095 8.828 8.617 8.385 8.133 7.947 7.761 7.555 7.335 7.098 6.937 6.781 6.515 6.315 6.105 6.0 5.795 5.583 5.336 5.208 4.841 4.818 4.671 4.52 4.189 4.017 3.825 3.616 3.389 3.118 2.726 1.328 -7 ,23431 ,KEBNE ,17022405,Wed Dec 22 05:36:52 CET,Wed Dec 22 07:05:29 CET,0.0 2.599 3.218 3.582 3.847 4.072 4.275 4.461 4.813 4.981 5.142 5.212 5.616 5.763 6.01 6.231 6.443 6.55 6.755 6.942 7.218 7.396 7.567 7.806 8.011 8.196 8.379 8.553 8.759 8.959 9.174 9.448 9.687 9.896 10.132 10.396 10.661 10.952 11.255 11.562 11.878 12.221 12.603 12.967 13.356 13.724 14.086 14.392 14.665 14.936 14.798 14.109 13.327 12.496 11.72 11.02 10.391 9.807 9.304 8.768 8.265 7.817 7.41 7.052 6.752 6.444 6.091 5.783 5.517 5.234 4.934 4.677 4.414 4.152 3.936 3.696 3.454 3.202 2.919 2.736 2.562 2.295 2.105 1.908 1.804 1.581 1.351 1.127 1.016 0.645 0.653 0.526 0.38 0.042 -0.141 -0.312 -0.514 -0.761 -1.038 -1.393 -2.552 -8 ,9685 ,KEBNE ,17022406,Wed Dec 22 05:36:53 CET,Wed Dec 22 07:04:01 CET,0.0 2.437 3.077 3.467 3.761 4.03 4.26 4.476 4.866 5.034 5.21 5.272 5.636 5.771 6.026 6.261 6.483 6.585 6.777 6.976 7.254 7.408 7.543 7.757 7.98 8.187 8.376 8.549 8.786 9.03 9.253 9.5 9.723 9.927 10.184 10.492 10.772 11.064 11.366 11.662 11.955 12.289 12.681 13.046 13.43 13.787 14.105 14.428 14.698 14.715 14.308 13.548 12.707 11.913 11.208 10.526 9.879 9.272 8.743 8.219 7.76 7.342 6.936 6.564 6.213 5.885 5.548 5.229 4.953 4.672 4.365 4.08 3.784 3.495 3.265 3.036 2.804 2.555 2.308 2.137 1.959 1.69 1.506 1.295 1.179 0.952 0.704 0.447 0.327 -0.052 -0.082 -0.224 -0.386 -0.737 -0.924 -1.125 -1.347 -1.589 -1.85 -2.224 -3.438 -9 ,3853 ,KEBNE ,17022407,Wed Dec 22 05:36:52 CET,Wed Dec 22 07:03:57 CET,0.0 2.747 3.254 3.563 3.837 4.081 4.282 4.46 4.776 4.921 5.078 5.131 5.513 5.627 5.833 6.052 6.259 6.354 6.538 6.702 6.941 7.099 7.25 7.476 7.698 7.91 8.121 8.329 8.575 8.801 9.017 9.262 9.509 9.761 10.031 10.296 10.548 10.827 11.12 11.433 11.751 12.088 12.478 12.87 13.293 13.696 14.092 14.494 14.873 15.167 15.173 14.812 14.331 13.839 13.357 12.874 12.408 11.963 11.564 11.136 10.752 10.384 10.018 9.672 9.328 8.998 8.672 8.377 8.116 7.855 7.573 7.326 7.076 6.824 6.628 6.427 6.212 5.976 5.723 5.545 5.361 5.05 4.823 4.576 4.451 4.206 3.947 3.676 3.55 3.167 3.118 2.959 2.793 2.418 2.193 1.961 1.73 1.453 1.101 0.62 -1.602 -10 ,17913 ,KEBNE ,17022408,Wed Dec 22 05:36:52 CET,Wed Dec 22 07:04:40 CET,0.0 2.049 2.642 3.12 3.492 3.783 4.041 4.29 4.758 4.958 5.134 5.226 5.618 5.752 5.994 6.212 6.419 6.514 6.709 6.902 7.167 7.317 7.464 7.7 7.929 8.139 8.348 8.55 8.799 9.037 9.277 9.552 9.8 10.045 10.31 10.606 10.899 11.204 11.527 11.866 12.216 12.589 12.972 13.311 13.682 14.08 14.434 14.733 14.949 14.955 14.509 13.585 12.632 11.682 10.839 10.103 9.448 8.844 8.319 7.78 7.293 6.838 6.411 6.009 5.631 5.279 4.903 4.57 4.285 4.007 3.712 3.449 3.177 2.912 2.725 2.528 2.317 2.089 1.854 1.689 1.512 1.238 1.037 0.827 0.722 0.506 0.294 0.072 -0.05 -0.422 -0.451 -0.597 -0.742 -1.024 -1.203 -1.423 -1.688 -1.964 -2.238 -2.648 -3.891 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_40_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_40_41.txt deleted file mode 100644 index a30e6ec2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_40_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4476 ,TETRA ,17524708,Wed Nov 24 23:04:39 CET,Thu Nov 25 00:52:27 CET,0.0 3.457 3.987 4.401 4.744 5.022 5.283 5.512 5.914 6.116 6.312 6.411 6.81 6.957 7.241 7.515 7.771 7.886 8.116 8.34 8.659 8.87 9.062 9.322 9.578 9.813 10.033 10.246 10.516 10.775 11.006 11.274 11.529 11.773 12.051 12.366 12.666 12.97 13.296 13.651 13.994 14.362 14.785 15.212 15.716 16.208 16.74 17.284 17.775 18.131 18.228 17.913 17.392 16.782 16.165 15.595 15.057 14.547 14.095 13.593 13.153 12.774 12.392 12.026 11.692 11.399 11.094 10.805 10.55 10.283 10.011 9.781 9.539 9.303 9.121 8.91 8.685 8.461 8.236 8.073 7.884 7.561 7.335 7.108 6.996 6.779 6.559 6.316 6.176 5.77 5.695 5.512 5.309 4.836 4.559 4.264 3.959 3.638 3.205 2.46 -0.583 -2 ,2717 ,TETRA ,17524709,Wed Nov 24 23:04:40 CET,Thu Nov 25 00:53:20 CET,0.0 2.976 3.579 4.014 4.365 4.674 4.951 5.214 5.702 5.884 6.051 6.141 6.532 6.682 7.001 7.29 7.536 7.654 7.862 8.054 8.328 8.494 8.669 8.936 9.178 9.426 9.652 9.848 10.104 10.332 10.541 10.806 11.066 11.309 11.586 11.879 12.156 12.471 12.795 13.109 13.428 13.783 14.209 14.645 15.12 15.618 16.139 16.641 17.122 17.539 17.634 17.289 16.655 15.842 15.073 14.38 13.8 13.293 12.871 12.436 12.039 11.611 11.146 10.717 10.343 10.019 9.686 9.372 9.092 8.806 8.501 8.236 7.956 7.673 7.457 7.223 6.971 6.704 6.415 6.233 6.057 5.747 5.516 5.254 5.103 4.782 4.476 4.183 4.025 3.61 3.503 3.331 3.159 2.763 2.541 2.259 1.896 1.475 0.935 0.178 -4.23 -3 ,8982 ,TETRA ,17524710,Wed Nov 24 23:05:07 CET,Thu Nov 25 00:55:09 CET,0.0 3.587 4.539 5.147 5.608 5.988 6.317 6.663 7.278 7.538 7.745 7.831 8.234 8.4 8.704 8.997 9.273 9.398 9.625 9.837 10.16 10.363 10.548 10.837 11.121 11.35 11.563 11.776 12.043 12.283 12.499 12.754 13.024 13.279 13.552 13.849 14.116 14.415 14.734 15.047 15.38 15.757 16.153 16.516 16.918 17.329 17.777 18.237 18.739 19.099 19.159 18.938 18.338 17.694 17.148 16.534 15.949 15.428 14.949 14.438 13.968 13.544 13.158 12.797 12.439 12.095 11.742 11.432 11.158 10.874 10.578 10.329 10.083 9.807 9.587 9.353 9.094 8.816 8.522 8.324 8.124 7.801 7.564 7.313 7.181 6.907 6.621 6.328 6.172 5.755 5.62 5.419 5.206 4.701 4.416 4.096 3.726 3.3 2.81 2.2 -0.671 -4 ,1809 ,TETRA ,17524711,Wed Nov 24 23:05:09 CET,Thu Nov 25 00:54:21 CET,0.0 2.735 3.337 3.755 4.07 4.326 4.563 4.752 5.113 5.292 5.459 5.524 5.909 6.043 6.304 6.54 6.751 6.861 7.068 7.259 7.546 7.722 7.881 8.114 8.327 8.513 8.7 8.887 9.133 9.369 9.589 9.841 10.078 10.299 10.557 10.86 11.134 11.414 11.705 11.996 12.336 12.779 13.292 13.776 14.272 14.781 15.324 15.773 16.209 16.626 16.836 16.66 16.318 15.895 15.418 14.936 14.474 13.994 13.562 13.124 12.728 12.37 12.034 11.714 11.411 11.136 10.848 10.59 10.362 10.101 9.814 9.577 9.322 9.035 8.793 8.552 8.316 8.058 7.768 7.551 7.331 7.009 6.787 6.549 6.419 6.136 5.855 5.571 5.414 5.001 4.92 4.73 4.546 4.158 3.922 3.599 3.215 2.826 2.343 1.71 -0.169 -5 ,17092 ,TETRA ,17524712,Wed Nov 24 23:06:08 CET,Thu Nov 25 00:56:25 CET,0.0 1.669 2.172 2.604 2.962 3.254 3.506 3.738 4.136 4.306 4.463 4.516 4.905 5.036 5.298 5.564 5.805 5.911 6.103 6.289 6.562 6.733 6.901 7.14 7.369 7.584 7.78 7.968 8.212 8.434 8.667 8.953 9.189 9.411 9.682 9.996 10.272 10.56 10.872 11.217 11.586 11.968 12.4 12.827 13.308 13.798 14.264 14.706 15.123 15.432 15.39 14.858 14.271 13.68 13.1 12.525 11.975 11.442 10.961 10.493 10.092 9.718 9.343 8.994 8.657 8.314 7.959 7.645 7.368 7.086 6.783 6.519 6.237 5.94 5.728 5.528 5.306 5.075 4.832 4.647 4.452 4.146 3.928 3.718 3.615 3.388 3.137 2.879 2.75 2.359 2.267 2.085 1.899 1.513 1.304 1.061 0.813 0.503 0.105 -0.417 -2.714 -6 ,3205 ,TETRA ,17524713,Wed Nov 24 23:12:09 CET,Thu Nov 25 00:42:33 CET,0.0 3.809 4.469 4.957 5.401 5.805 6.174 6.497 7.071 7.333 7.58 7.81 8.272 8.492 8.888 9.24 9.576 9.73 9.993 10.222 10.561 10.782 10.982 11.262 11.526 11.761 11.994 12.238 12.564 12.867 13.142 13.488 13.834 14.156 14.519 14.899 15.259 15.669 16.093 16.532 16.986 17.494 18.027 18.509 19.102 19.697 20.337 21.036 21.652 22.054 22.003 21.48 20.774 19.991 19.27 18.657 18.115 17.563 17.052 16.531 16.08 15.642 15.218 14.829 14.44 14.067 13.72 13.44 13.177 12.888 12.585 12.331 12.048 11.731 11.485 11.242 10.994 10.727 10.427 10.223 10.016 9.664 9.409 9.145 9.003 8.701 8.398 8.094 7.93 7.501 7.375 7.149 6.909 6.373 6.043 5.686 5.333 4.908 4.323 3.566 1.211 -7 ,4465 ,TETRA ,17524714,Wed Nov 24 23:13:07 CET,Thu Nov 25 01:01:19 CET,0.0 3.531 4.215 4.709 5.066 5.358 5.593 5.787 6.188 6.37 6.505 6.542 6.933 7.063 7.3 7.504 7.687 7.774 7.953 8.129 8.375 8.536 8.69 8.914 9.136 9.342 9.531 9.717 9.959 10.208 10.453 10.708 10.954 11.192 11.448 11.737 12.019 12.317 12.617 12.952 13.303 13.674 14.093 14.479 14.869 15.28 15.741 16.305 16.883 17.04 16.599 15.698 14.782 13.885 13.004 12.175 11.445 10.838 10.341 9.788 9.307 8.89 8.478 8.083 7.708 7.341 6.945 6.6 6.312 5.988 5.611 5.29 4.976 4.651 4.399 4.151 3.884 3.607 3.343 3.162 2.97 2.64 2.405 2.174 2.06 1.828 1.579 1.324 1.192 0.784 0.62 0.409 0.21 -0.164 -0.367 -0.618 -0.903 -1.228 -1.635 -2.217 -4.711 -8 ,16657 ,TETRA ,17524715,Wed Nov 24 23:13:07 CET,Thu Nov 25 01:02:59 CET,0.0 3.862 4.362 4.732 5.029 5.282 5.514 5.72 6.091 6.271 6.443 6.503 6.899 7.06 7.33 7.567 7.817 7.933 8.148 8.361 8.677 8.871 9.034 9.271 9.492 9.698 9.906 10.118 10.4 10.658 10.895 11.165 11.424 11.683 11.97 12.282 12.579 12.889 13.2 13.526 13.877 14.279 14.694 15.042 15.419 15.788 16.2 16.646 17.026 17.275 17.328 17.021 16.51 15.911 15.322 14.765 14.276 13.829 13.443 13.045 12.666 12.314 11.975 11.666 11.384 11.104 10.781 10.482 10.229 9.992 9.748 9.54 9.301 9.031 8.816 8.561 8.285 7.988 7.683 7.494 7.292 6.974 6.751 6.507 6.386 6.122 5.834 5.533 5.373 4.944 4.791 4.59 4.395 3.961 3.708 3.434 3.143 2.827 2.434 1.868 -1.016 -9 ,19976 ,TETRA ,17524716,Wed Nov 24 23:13:09 CET,Thu Nov 25 01:03:02 CET,0.0 2.775 3.394 3.844 4.21 4.528 4.805 5.07 5.496 5.684 5.872 5.953 6.353 6.5 6.764 6.997 7.212 7.334 7.577 7.8 8.114 8.323 8.528 8.791 9.022 9.246 9.459 9.658 9.946 10.217 10.459 10.744 11.007 11.275 11.584 11.893 12.17 12.472 12.774 13.072 13.365 13.667 14.014 14.39 14.81 15.217 15.644 16.018 16.339 16.542 16.351 15.644 14.829 14.037 13.287 12.569 11.938 11.33 10.769 10.212 9.744 9.298 8.843 8.421 8.041 7.699 7.346 7.027 6.741 6.424 6.074 5.775 5.458 5.135 4.904 4.675 4.422 4.156 3.875 3.676 3.476 3.164 2.952 2.733 2.617 2.369 2.101 1.81 1.666 1.269 1.194 1.017 0.829 0.328 0.029 -0.264 -0.551 -0.899 -1.323 -1.849 -4.007 -10 ,14565 ,TETRA ,17524717,Wed Nov 24 23:16:11 CET,Thu Nov 25 01:06:20 CET,0.0 3.868 4.366 4.824 5.206 5.51 5.795 6.05 6.485 6.662 6.806 6.862 7.295 7.463 7.715 7.956 8.193 8.309 8.52 8.724 9.036 9.233 9.409 9.658 9.894 10.105 10.315 10.529 10.813 11.086 11.34 11.629 11.891 12.138 12.43 12.765 13.077 13.416 13.783 14.158 14.533 14.937 15.384 15.834 16.327 16.817 17.348 17.863 18.306 18.573 18.528 18.05 17.438 16.792 16.115 15.47 14.927 14.44 13.984 13.47 12.973 12.525 12.11 11.696 11.291 10.927 10.54 10.173 9.841 9.492 9.127 8.838 8.541 8.211 7.946 7.681 7.416 7.149 6.88 6.69 6.496 6.171 5.948 5.743 5.641 5.4 5.108 4.806 4.65 4.223 4.063 3.856 3.643 3.164 2.892 2.598 2.26 1.845 1.309 0.558 -1.602 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_42_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_42_44.txt deleted file mode 100644 index 4e65e881..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_42_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9747 ,KEBNE ,17022409,Wed Dec 22 05:36:52 CET,Wed Dec 22 07:03:54 CET,0.0 1.185 1.481 1.666 1.873 2.058 2.213 2.348 2.595 2.722 2.838 2.821 3.158 3.241 3.405 3.566 3.716 3.783 3.924 4.067 4.275 4.414 4.544 4.723 4.891 5.047 5.189 5.328 5.515 5.7 5.87 6.06 6.255 6.44 6.637 6.863 7.074 7.302 7.541 7.786 8.044 8.318 8.614 8.91 9.239 9.571 9.916 10.246 10.519 10.742 10.831 10.487 10.02 9.56 9.103 8.667 8.267 7.885 7.552 7.23 6.955 6.691 6.436 6.195 5.97 5.774 5.568 5.383 5.226 5.053 4.86 4.7 4.535 4.355 4.211 4.075 3.947 3.813 3.663 3.557 3.449 3.276 3.148 3.008 2.938 2.81 2.668 2.502 2.409 2.072 2.126 2.019 1.916 1.708 1.592 1.473 1.335 1.198 1.029 0.655 -0.325 -2 ,24010 ,KEBNE ,17022410,Wed Dec 22 05:36:53 CET,Wed Dec 22 07:02:24 CET,0.0 0.709 1.086 1.297 1.454 1.598 1.74 1.877 2.144 2.243 2.325 2.284 2.625 2.717 2.884 3.034 3.187 3.258 3.383 3.51 3.693 3.815 3.933 4.09 4.24 4.39 4.534 4.68 4.856 5.022 5.185 5.37 5.548 5.726 5.927 6.142 6.339 6.542 6.757 6.974 7.189 7.451 7.763 8.05 8.372 8.715 9.023 9.295 9.573 9.817 9.838 9.448 9.016 8.606 8.182 7.757 7.357 6.983 6.648 6.304 6.012 5.749 5.492 5.252 5.038 4.837 4.619 4.426 4.26 4.093 3.921 3.761 3.586 3.403 3.243 3.086 2.942 2.787 2.624 2.512 2.386 2.188 2.053 1.923 1.857 1.718 1.578 1.4 1.311 1.003 1.073 0.984 0.873 0.634 0.514 0.39 0.236 0.031 -0.194 -0.453 -1.631 -3 ,1661 ,KEBNE ,17022411,Wed Dec 22 05:37:55 CET,Wed Dec 22 07:03:41 CET,0.0 1.105 1.383 1.576 1.737 1.893 2.048 2.174 2.406 2.525 2.639 2.591 2.913 3.002 3.163 3.316 3.464 3.54 3.696 3.85 4.053 4.174 4.29 4.481 4.654 4.81 4.972 5.118 5.294 5.46 5.619 5.819 6.018 6.211 6.433 6.661 6.87 7.107 7.37 7.672 7.974 8.262 8.565 8.851 9.183 9.534 9.883 10.204 10.531 10.794 10.835 10.521 10.084 9.622 9.14 8.691 8.299 7.909 7.561 7.227 6.931 6.653 6.376 6.098 5.844 5.627 5.379 5.154 4.978 4.801 4.609 4.45 4.287 4.109 3.968 3.828 3.682 3.523 3.361 3.252 3.129 2.934 2.815 2.682 2.613 2.472 2.307 2.138 2.059 1.73 1.79 1.693 1.601 1.399 1.278 1.147 0.979 0.756 0.519 0.285 -0.299 -4 ,18591 ,KEBNE ,17022412,Wed Dec 22 05:38:57 CET,Wed Dec 22 07:04:30 CET,0.0 1.13 1.411 1.625 1.8 1.973 2.127 2.271 2.545 2.66 2.768 2.749 3.071 3.144 3.286 3.427 3.57 3.643 3.782 3.927 4.151 4.289 4.411 4.573 4.722 4.87 5.011 5.144 5.315 5.481 5.639 5.833 6.03 6.222 6.443 6.674 6.895 7.145 7.416 7.681 7.944 8.242 8.551 8.834 9.155 9.475 9.812 10.176 10.527 10.814 10.959 10.695 10.309 9.921 9.535 9.153 8.773 8.438 8.137 7.813 7.527 7.274 7.039 6.811 6.6 6.412 6.207 6.019 5.85 5.674 5.505 5.355 5.185 5.012 4.887 4.74 4.57 4.408 4.246 4.137 4.024 3.841 3.725 3.601 3.537 3.409 3.259 3.095 3.005 2.68 2.742 2.653 2.55 2.321 2.214 2.1 1.969 1.791 1.575 1.31 0.734 -5 ,25546 ,KEBNE ,17022413,Wed Dec 22 05:41:00 CET,Wed Dec 22 07:06:07 CET,0.0 1.117 1.413 1.641 1.84 1.985 2.118 2.262 2.517 2.629 2.737 2.692 3.026 3.109 3.29 3.476 3.628 3.695 3.813 3.939 4.137 4.252 4.37 4.546 4.706 4.858 5.016 5.165 5.356 5.539 5.708 5.914 6.099 6.276 6.494 6.73 6.936 7.158 7.394 7.644 7.911 8.186 8.472 8.769 9.131 9.483 9.858 10.249 10.597 10.864 10.926 10.629 10.221 9.746 9.309 8.923 8.548 8.188 7.862 7.522 7.226 6.959 6.699 6.438 6.183 5.944 5.706 5.509 5.328 5.132 4.928 4.766 4.596 4.425 4.3 4.156 4.005 3.856 3.709 3.602 3.488 3.292 3.153 3.02 2.952 2.819 2.652 2.476 2.393 2.054 2.065 1.945 1.816 1.511 1.344 1.202 1.045 0.87 0.685 0.454 -0.241 -6 ,30069 ,KEBNE ,17022414,Wed Dec 22 05:41:00 CET,Wed Dec 22 07:06:46 CET,0.0 0.759 1.05 1.281 1.5 1.695 1.852 1.991 2.27 2.39 2.494 2.461 2.82 2.949 3.187 3.395 3.587 3.686 3.871 4.05 4.321 4.478 4.611 4.794 4.964 5.117 5.264 5.406 5.603 5.809 5.99 6.195 6.379 6.547 6.74 6.956 7.17 7.386 7.612 7.863 8.124 8.412 8.711 8.99 9.301 9.606 9.939 10.285 10.617 10.854 10.878 10.632 10.26 9.845 9.427 9.02 8.64 8.286 7.968 7.642 7.355 7.09 6.841 6.603 6.373 6.155 5.928 5.735 5.567 5.395 5.211 5.057 4.892 4.704 4.565 4.427 4.281 4.13 3.975 3.858 3.744 3.587 3.474 3.342 3.273 3.145 3.004 2.859 2.781 2.459 2.553 2.458 2.337 2.076 1.946 1.842 1.749 1.642 1.489 1.29 0.927 -7 ,18376 ,KEBNE ,17022415,Wed Dec 22 05:41:00 CET,Wed Dec 22 07:06:52 CET,0.0 0.979 1.263 1.498 1.7 1.912 2.106 2.257 2.527 2.644 2.739 2.665 2.998 3.088 3.248 3.401 3.551 3.628 3.765 3.888 4.059 4.163 4.265 4.412 4.55 4.685 4.844 5.008 5.198 5.369 5.53 5.74 5.942 6.127 6.359 6.617 6.837 7.064 7.314 7.577 7.849 8.13 8.436 8.75 9.093 9.441 9.827 10.199 10.507 10.752 10.79 10.45 9.991 9.513 9.054 8.599 8.213 7.884 7.569 7.225 6.945 6.722 6.489 6.249 6.027 5.818 5.592 5.393 5.227 5.049 4.86 4.703 4.544 4.369 4.225 4.095 3.957 3.806 3.649 3.544 3.441 3.274 3.149 3.022 2.958 2.82 2.668 2.51 2.429 2.094 2.157 2.066 1.969 1.762 1.648 1.517 1.375 1.214 1.022 0.737 0.074 -8 ,31480 ,KEBNE ,17022416,Wed Dec 22 05:41:00 CET,Wed Dec 22 07:08:25 CET,0.0 0.939 1.255 1.433 1.618 1.802 1.969 2.128 2.409 2.531 2.64 2.592 2.911 2.996 3.154 3.326 3.493 3.572 3.73 3.872 4.075 4.204 4.33 4.515 4.691 4.853 4.997 5.14 5.328 5.5 5.673 5.895 6.099 6.284 6.483 6.703 6.921 7.163 7.423 7.688 7.967 8.28 8.624 8.942 9.291 9.647 9.978 10.323 10.669 10.909 10.968 10.712 10.33 9.91 9.47 9.041 8.622 8.212 7.856 7.505 7.199 6.915 6.656 6.416 6.193 5.97 5.721 5.508 5.319 5.125 4.927 4.754 4.581 4.398 4.254 4.116 3.977 3.813 3.63 3.511 3.382 3.167 3.021 2.885 2.815 2.66 2.516 2.362 2.286 1.973 2.03 1.916 1.808 1.576 1.444 1.309 1.158 0.967 0.719 0.433 0.069 -9 ,641 ,KEBNE ,17022417,Wed Dec 22 05:41:00 CET,Wed Dec 22 07:06:08 CET,0.0 0.588 0.865 1.127 1.322 1.488 1.652 1.822 2.092 2.202 2.315 2.272 2.615 2.718 2.884 3.041 3.179 3.243 3.371 3.5 3.701 3.824 3.938 4.1 4.254 4.391 4.516 4.645 4.819 4.98 5.138 5.335 5.524 5.702 5.908 6.138 6.354 6.586 6.821 7.061 7.309 7.601 7.953 8.288 8.661 9.062 9.45 9.812 10.149 10.368 10.415 10.144 9.71 9.248 8.8 8.369 7.973 7.587 7.252 6.931 6.64 6.364 6.098 5.847 5.603 5.389 5.173 4.977 4.808 4.627 4.421 4.242 4.053 3.864 3.734 3.601 3.459 3.315 3.173 3.076 2.972 2.797 2.677 2.565 2.504 2.377 2.241 2.088 2.011 1.704 1.797 1.714 1.607 1.376 1.264 1.137 0.999 0.837 0.61 0.273 -0.815 -10 ,1536 ,KEBNE ,17022418,Wed Dec 22 05:41:00 CET,Wed Dec 22 07:06:44 CET,0.0 1.397 1.734 1.947 2.139 2.291 2.422 2.559 2.794 2.913 3.043 3.019 3.35 3.444 3.619 3.789 3.949 4.026 4.178 4.317 4.516 4.641 4.752 4.904 5.069 5.243 5.397 5.542 5.731 5.913 6.085 6.268 6.448 6.635 6.847 7.076 7.305 7.553 7.82 8.088 8.333 8.603 8.905 9.204 9.543 9.901 10.262 10.553 10.821 10.992 10.894 10.52 10.049 9.602 9.141 8.662 8.251 7.888 7.555 7.211 6.925 6.674 6.428 6.194 5.966 5.754 5.522 5.296 5.084 4.874 4.686 4.525 4.345 4.154 4.009 3.867 3.722 3.574 3.424 3.311 3.182 2.998 2.86 2.716 2.649 2.495 2.339 2.183 2.098 1.768 1.811 1.703 1.6 1.372 1.25 1.123 0.967 0.79 0.593 0.291 -0.47 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_42_51.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_42_51.txt deleted file mode 100644 index 1c18079e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_42_51.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7063 ,KEBNE ,17022419,Wed Dec 22 05:41:00 CET,Wed Dec 22 07:07:49 CET,0.0 2.138 2.636 3.141 3.563 3.889 4.145 4.338 4.67 4.827 4.985 5.041 5.413 5.541 5.776 6.002 6.208 6.3 6.482 6.663 6.922 7.083 7.256 7.503 7.736 7.966 8.168 8.358 8.612 8.859 9.093 9.391 9.691 9.979 10.301 10.622 10.919 11.25 11.62 12.001 12.373 12.813 13.36 13.918 14.535 15.191 15.924 16.747 17.645 18.6 19.601 20.165 20.285 20.213 20.097 19.983 19.852 19.692 19.534 19.323 19.076 18.84 18.624 18.422 18.238 18.082 17.924 17.788 17.667 17.507 17.335 17.197 17.039 16.882 16.751 16.597 16.446 16.287 16.126 16.02 15.919 15.771 15.659 15.54 15.474 15.294 15.105 14.919 14.812 14.469 14.456 14.341 14.226 13.967 13.845 13.717 13.526 13.326 13.135 12.883 12.121 -2 ,10668 ,KEBNE ,17022420,Wed Dec 22 05:41:00 CET,Wed Dec 22 07:08:14 CET,0.0 1.167 1.486 1.755 2.033 2.311 2.54 2.715 3.03 3.181 3.333 3.384 3.753 3.892 4.142 4.363 4.576 4.684 4.903 5.104 5.397 5.603 5.79 6.05 6.31 6.551 6.777 6.989 7.263 7.537 7.815 8.134 8.428 8.722 9.04 9.388 9.7 10.009 10.33 10.681 11.077 11.519 12.013 12.47 12.986 13.549 14.209 14.919 15.639 16.435 17.211 17.645 17.716 17.58 17.397 17.205 17.008 16.786 16.537 16.299 16.091 15.871 15.66 15.473 15.274 15.074 14.869 14.69 14.538 14.368 14.185 14.028 13.865 13.69 13.541 13.387 13.23 13.069 12.905 12.789 12.678 12.502 12.374 12.24 12.172 12.037 11.877 11.681 11.579 11.239 11.261 11.161 11.047 10.769 10.614 10.483 10.341 10.114 9.857 9.54 8.754 -3 ,31524 ,KEBNE ,17022421,Wed Dec 22 05:41:04 CET,Wed Dec 22 07:01:58 CET,0.0 1.667 2.051 2.312 2.557 2.773 2.972 3.14 3.416 3.543 3.678 3.718 4.071 4.178 4.397 4.625 4.834 4.931 5.118 5.303 5.57 5.734 5.89 6.108 6.321 6.537 6.743 6.941 7.194 7.434 7.662 7.926 8.178 8.419 8.689 8.988 9.288 9.607 9.941 10.303 10.682 11.114 11.631 12.16 12.763 13.407 14.052 14.719 15.527 16.368 17.183 17.635 17.734 17.65 17.505 17.318 17.093 16.877 16.677 16.451 16.243 16.038 15.811 15.582 15.378 15.201 15.014 14.845 14.696 14.544 14.38 14.235 14.081 13.937 13.83 13.716 13.606 13.492 13.355 13.235 13.112 12.95 12.838 12.726 12.669 12.531 12.364 12.185 12.095 11.783 11.834 11.73 11.611 11.346 11.202 11.043 10.837 10.612 10.367 10.001 8.588 -4 ,23562 ,KEBNE ,17022422,Wed Dec 22 05:42:01 CET,Wed Dec 22 07:07:59 CET,0.0 0.734 1.069 1.382 1.646 1.89 2.093 2.268 2.596 2.751 2.889 2.901 3.265 3.384 3.622 3.833 4.022 4.117 4.312 4.512 4.785 4.944 5.097 5.343 5.592 5.807 5.995 6.182 6.428 6.663 6.896 7.172 7.428 7.668 7.96 8.296 8.593 8.908 9.25 9.612 9.991 10.407 10.9 11.412 11.996 12.655 13.38 14.135 14.92 15.745 16.689 17.254 17.443 17.459 17.373 17.226 17.047 16.854 16.656 16.447 16.227 16.019 15.831 15.629 15.429 15.252 15.067 14.913 14.783 14.638 14.489 14.363 14.242 14.109 13.99 13.862 13.73 13.594 13.452 13.345 13.238 13.074 12.946 12.814 12.754 12.623 12.464 12.301 12.217 11.898 11.942 11.849 11.753 11.523 11.388 11.253 11.103 10.915 10.697 10.408 9.181 -5 ,5397 ,KEBNE ,17022423,Wed Dec 22 05:43:03 CET,Wed Dec 22 07:09:21 CET,0.0 1.179 1.561 1.847 2.083 2.291 2.484 2.66 3.004 3.169 3.327 3.387 3.759 3.888 4.123 4.338 4.537 4.637 4.843 5.049 5.339 5.514 5.68 5.937 6.182 6.398 6.602 6.798 7.048 7.289 7.525 7.805 8.077 8.338 8.625 8.93 9.226 9.562 9.926 10.299 10.67 11.085 11.554 11.994 12.495 13.05 13.647 14.3 15.036 15.875 16.739 17.131 17.189 17.113 16.942 16.749 16.55 16.316 16.065 15.798 15.57 15.366 15.165 14.974 14.788 14.611 14.426 14.261 14.104 13.932 13.756 13.607 13.458 13.299 13.163 13.015 12.867 12.726 12.587 12.486 12.382 12.22 12.098 11.968 11.898 11.745 11.607 11.476 11.402 11.093 11.126 11.013 10.894 10.64 10.487 10.303 10.124 9.928 9.706 9.337 8.045 -6 ,2403 ,KEBNE ,17022424,Wed Dec 22 05:43:03 CET,Wed Dec 22 07:10:05 CET,0.0 0.758 1.02 1.243 1.49 1.699 1.856 2.03 2.342 2.476 2.631 2.718 3.093 3.225 3.464 3.697 3.906 4.001 4.176 4.348 4.61 4.776 4.928 5.138 5.357 5.579 5.766 5.95 6.201 6.426 6.651 6.928 7.195 7.441 7.716 8.032 8.335 8.655 9.004 9.377 9.754 10.176 10.64 11.119 11.678 12.25 12.883 13.556 14.335 15.209 16.083 16.554 16.62 16.521 16.344 16.106 15.857 15.616 15.389 15.12 14.869 14.655 14.447 14.238 14.042 13.856 13.645 13.455 13.283 13.107 12.946 12.814 12.671 12.521 12.388 12.249 12.112 11.968 11.816 11.711 11.599 11.417 11.296 11.171 11.101 10.952 10.786 10.603 10.522 10.214 10.248 10.142 10.024 9.743 9.581 9.43 9.24 9.0 8.741 8.396 7.021 -7 ,17693 ,KEBNE ,17022425,Wed Dec 22 05:44:05 CET,Wed Dec 22 07:10:25 CET,0.0 1.416 1.681 1.881 2.05 2.227 2.414 2.582 2.936 3.101 3.258 3.308 3.675 3.798 4.023 4.249 4.456 4.546 4.718 4.903 5.17 5.337 5.498 5.733 5.965 6.169 6.346 6.516 6.736 6.959 7.18 7.446 7.697 7.925 8.181 8.479 8.766 9.088 9.447 9.836 10.232 10.662 11.16 11.635 12.156 12.717 13.394 14.146 14.899 15.677 16.444 16.851 16.864 16.7 16.492 16.279 16.065 15.861 15.675 15.444 15.229 15.031 14.829 14.629 14.431 14.267 14.111 13.944 13.79 13.628 13.466 13.337 13.201 13.07 12.962 12.846 12.727 12.585 12.43 12.334 12.229 12.038 11.912 11.786 11.716 11.57 11.405 11.212 11.114 10.796 10.854 10.745 10.63 10.407 10.281 10.147 9.949 9.708 9.445 8.967 7.578 -8 ,12023 ,KEBNE ,17022426,Wed Dec 22 05:46:08 CET,Wed Dec 22 07:12:54 CET,0.0 1.136 1.529 1.768 1.996 2.193 2.36 2.513 2.787 2.93 3.063 3.076 3.425 3.544 3.763 3.961 4.142 4.232 4.404 4.558 4.802 4.963 5.106 5.311 5.51 5.708 5.904 6.086 6.317 6.536 6.743 7.004 7.263 7.506 7.798 8.131 8.424 8.726 9.059 9.423 9.793 10.218 10.728 11.209 11.751 12.381 13.101 13.837 14.621 15.493 16.314 16.722 16.851 16.8 16.644 16.438 16.191 15.939 15.717 15.493 15.292 15.085 14.895 14.723 14.538 14.367 14.18 13.996 13.834 13.666 13.482 13.333 13.187 13.014 12.876 12.742 12.603 12.456 12.3 12.193 12.089 11.923 11.799 11.67 11.604 11.484 11.369 11.23 11.142 10.814 10.873 10.775 10.666 10.422 10.281 10.148 9.96 9.712 9.464 9.145 8.069 -9 ,16855 ,KEBNE ,17022427,Wed Dec 22 05:46:08 CET,Wed Dec 22 07:13:33 CET,0.0 1.379 1.803 2.105 2.379 2.633 2.861 3.071 3.428 3.592 3.751 3.784 4.149 4.277 4.537 4.788 4.992 5.08 5.26 5.438 5.7 5.862 6.012 6.234 6.454 6.652 6.836 7.021 7.258 7.483 7.723 8.03 8.298 8.543 8.832 9.147 9.442 9.768 10.107 10.456 10.824 11.246 11.745 12.217 12.748 13.358 14.049 14.766 15.545 16.358 17.144 17.515 17.519 17.409 17.23 17.019 16.805 16.586 16.355 16.08 15.83 15.619 15.43 15.237 15.042 14.87 14.679 14.503 14.36 14.212 14.038 13.884 13.74 13.578 13.443 13.298 13.148 12.993 12.83 12.723 12.608 12.412 12.271 12.135 12.07 11.923 11.764 11.598 11.506 11.178 11.185 11.073 10.961 10.726 10.585 10.425 10.253 10.039 9.766 9.376 7.953 -10 ,3359 ,KEBNE ,17022428,Wed Dec 22 05:47:10 CET,Wed Dec 22 07:13:26 CET,0.0 0.983 1.351 1.625 1.818 2.004 2.199 2.372 2.691 2.845 2.989 2.989 3.345 3.455 3.659 3.856 4.044 4.135 4.312 4.502 4.781 4.941 5.087 5.316 5.547 5.752 5.939 6.13 6.377 6.602 6.821 7.116 7.4 7.644 7.922 8.231 8.52 8.841 9.179 9.525 9.898 10.325 10.799 11.265 11.802 12.381 13.01 13.699 14.475 15.278 16.123 16.616 16.682 16.644 16.527 16.332 16.141 15.953 15.752 15.474 15.23 15.041 14.844 14.645 14.477 14.329 14.153 14.001 13.868 13.702 13.527 13.398 13.26 13.107 12.99 12.867 12.734 12.603 12.462 12.36 12.26 12.082 11.95 11.814 11.744 11.608 11.477 11.34 11.261 10.94 11.005 10.928 10.839 10.648 10.547 10.437 10.28 10.066 9.806 9.447 7.894 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_42_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_42_54.txt deleted file mode 100644 index 0e204efa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_42_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19301 ,KEBNE ,17022429,Wed Dec 22 05:46:08 CET,Wed Dec 22 07:12:08 CET,0.0 0.953 1.267 1.495 1.688 1.84 1.99 2.143 2.414 2.545 2.662 2.635 2.966 3.057 3.235 3.401 3.552 3.616 3.724 3.847 4.051 4.189 4.336 4.533 4.713 4.876 5.005 5.122 5.267 5.406 5.549 5.715 5.879 6.045 6.217 6.397 6.582 6.779 6.961 7.147 7.343 7.539 7.742 7.928 8.121 8.282 8.414 8.506 8.537 8.369 7.808 6.929 6.078 5.325 4.656 4.038 3.504 3.028 2.601 2.172 1.816 1.51 1.213 0.93 0.655 0.397 0.132 -0.092 -0.271 -0.459 -0.663 -0.834 -1.011 -1.187 -1.318 -1.456 -1.6 -1.757 -1.926 -2.035 -2.144 -2.322 -2.446 -2.571 -2.634 -2.764 -2.893 -3.041 -3.128 -3.447 -3.374 -3.477 -3.591 -3.806 -3.902 -3.991 -4.088 -4.206 -4.338 -4.507 -4.745 -2 ,18258 ,KEBNE ,17022430,Wed Dec 22 05:46:08 CET,Wed Dec 22 07:12:13 CET,0.0 0.632 0.97 1.153 1.285 1.415 1.51 1.598 1.782 1.873 1.967 1.926 2.262 2.346 2.515 2.685 2.835 2.906 3.059 3.205 3.399 3.525 3.656 3.822 3.973 4.119 4.252 4.38 4.555 4.726 4.874 5.054 5.212 5.339 5.482 5.646 5.807 5.961 6.113 6.282 6.468 6.651 6.824 6.971 7.124 7.25 7.325 7.358 7.32 7.069 6.442 5.545 4.732 3.97 3.304 2.721 2.21 1.744 1.312 0.861 0.478 0.132 -0.197 -0.505 -0.79 -1.042 -1.309 -1.538 -1.717 -1.907 -2.117 -2.291 -2.475 -2.658 -2.797 -2.937 -3.088 -3.241 -3.403 -3.515 -3.629 -3.819 -3.939 -4.059 -4.125 -4.268 -4.422 -4.575 -4.653 -4.975 -4.9 -4.99 -5.084 -5.271 -5.359 -5.454 -5.572 -5.707 -5.865 -6.103 -6.458 -3 ,18780 ,KEBNE ,17022431,Wed Dec 22 05:46:08 CET,Wed Dec 22 07:11:45 CET,0.0 0.478 0.75 0.955 1.126 1.261 1.375 1.507 1.753 1.846 1.935 1.876 2.187 2.256 2.393 2.548 2.706 2.779 2.914 3.024 3.166 3.259 3.356 3.509 3.64 3.756 3.872 3.99 4.13 4.246 4.363 4.5 4.614 4.719 4.846 4.985 5.12 5.272 5.399 5.518 5.667 5.851 6.042 6.197 6.368 6.519 6.628 6.666 6.621 6.37 5.713 4.781 3.946 3.196 2.504 1.861 1.293 0.795 0.369 -0.049 -0.411 -0.735 -1.049 -1.343 -1.607 -1.86 -2.117 -2.329 -2.514 -2.707 -2.907 -3.08 -3.251 -3.427 -3.57 -3.715 -3.869 -4.036 -4.203 -4.31 -4.42 -4.599 -4.716 -4.839 -4.905 -5.046 -5.203 -5.35 -5.424 -5.755 -5.674 -5.756 -5.851 -6.07 -6.191 -6.321 -6.466 -6.62 -6.785 -6.938 -7.338 -4 ,6321 ,KEBNE ,17022433,Wed Dec 22 05:46:08 CET,Wed Dec 22 07:12:37 CET,0.0 0.616 0.832 1.057 1.276 1.445 1.578 1.708 1.911 2.0 2.09 2.03 2.345 2.432 2.594 2.744 2.887 2.962 3.114 3.247 3.44 3.55 3.651 3.808 3.942 4.077 4.225 4.364 4.521 4.671 4.819 4.983 5.122 5.247 5.393 5.548 5.688 5.842 6.008 6.169 6.326 6.506 6.693 6.855 7.028 7.181 7.296 7.343 7.307 7.07 6.404 5.445 4.598 3.848 3.179 2.56 2.011 1.51 1.086 0.673 0.321 0.006 -0.297 -0.574 -0.835 -1.069 -1.309 -1.529 -1.725 -1.927 -2.134 -2.299 -2.476 -2.66 -2.794 -2.93 -3.074 -3.221 -3.376 -3.488 -3.604 -3.78 -3.9 -4.022 -4.085 -4.215 -4.359 -4.507 -4.58 -4.888 -4.8 -4.885 -4.969 -5.166 -5.28 -5.391 -5.511 -5.655 -5.781 -5.913 -6.306 -5 ,28004 ,KEBNE ,17022434,Wed Dec 22 05:48:12 CET,Wed Dec 22 07:14:06 CET,0.0 0.898 1.246 1.488 1.653 1.808 1.943 2.075 2.332 2.448 2.575 2.585 2.925 3.012 3.193 3.361 3.513 3.59 3.73 3.844 4.01 4.112 4.211 4.365 4.532 4.706 4.892 5.072 5.265 5.429 5.572 5.736 5.877 6.009 6.163 6.323 6.474 6.674 6.909 7.11 7.302 7.509 7.709 7.876 8.028 8.132 8.206 8.278 8.281 8.066 7.513 6.629 5.746 4.959 4.297 3.69 3.15 2.652 2.217 1.792 1.421 1.102 0.807 0.524 0.255 0.011 -0.24 -0.454 -0.638 -0.851 -1.069 -1.239 -1.413 -1.595 -1.739 -1.897 -2.067 -2.227 -2.397 -2.528 -2.661 -2.865 -3.002 -3.134 -3.202 -3.347 -3.503 -3.668 -3.744 -4.078 -4.04 -4.149 -4.256 -4.436 -4.527 -4.636 -4.761 -4.898 -5.064 -5.29 -5.837 -6 ,20997 ,KEBNE ,17022435,Wed Dec 22 05:48:12 CET,Wed Dec 22 07:14:39 CET,0.0 0.44 0.697 0.925 1.135 1.342 1.534 1.69 1.997 2.143 2.251 2.18 2.497 2.577 2.725 2.864 2.992 3.056 3.198 3.325 3.49 3.594 3.702 3.874 4.037 4.213 4.366 4.47 4.606 4.746 4.862 4.991 5.129 5.268 5.411 5.552 5.67 5.802 5.951 6.104 6.256 6.413 6.596 6.764 6.909 7.024 7.128 7.176 7.096 6.86 6.251 5.279 4.386 3.641 3.011 2.431 1.922 1.46 1.047 0.638 0.285 -0.029 -0.321 -0.584 -0.836 -1.079 -1.34 -1.584 -1.791 -1.991 -2.179 -2.333 -2.5 -2.678 -2.819 -2.966 -3.11 -3.265 -3.435 -3.547 -3.666 -3.851 -3.978 -4.103 -4.164 -4.293 -4.434 -4.589 -4.673 -5.005 -4.94 -5.023 -5.105 -5.302 -5.418 -5.532 -5.642 -5.768 -5.931 -6.211 -6.629 -7 ,2392 ,KEBNE ,17022436,Wed Dec 22 05:48:12 CET,Wed Dec 22 07:13:14 CET,0.0 0.39 0.595 0.783 0.958 1.129 1.274 1.403 1.636 1.738 1.832 1.74 2.059 2.153 2.323 2.484 2.648 2.723 2.862 3.008 3.219 3.346 3.454 3.593 3.726 3.847 3.95 4.055 4.214 4.386 4.544 4.724 4.896 5.053 5.238 5.436 5.628 5.825 6.006 6.203 6.415 6.632 6.866 7.105 7.351 7.538 7.687 7.731 7.667 7.491 6.925 6.022 5.186 4.435 3.772 3.169 2.636 2.178 1.776 1.347 0.983 0.666 0.378 0.093 -0.192 -0.445 -0.71 -0.949 -1.155 -1.365 -1.576 -1.752 -1.939 -2.124 -2.258 -2.398 -2.548 -2.709 -2.87 -2.983 -3.101 -3.278 -3.396 -3.526 -3.597 -3.724 -3.855 -4.003 -4.077 -4.386 -4.307 -4.397 -4.484 -4.671 -4.796 -4.952 -5.083 -5.196 -5.346 -5.533 -5.891 -8 ,13082 ,KEBNE ,17022437,Wed Dec 22 05:48:12 CET,Wed Dec 22 07:14:34 CET,0.0 0.521 0.711 0.854 1.009 1.143 1.252 1.356 1.58 1.683 1.792 1.769 2.097 2.185 2.36 2.509 2.634 2.699 2.82 2.943 3.12 3.231 3.335 3.462 3.59 3.722 3.838 3.946 4.099 4.246 4.377 4.539 4.695 4.847 5.015 5.198 5.349 5.478 5.633 5.798 5.964 6.17 6.371 6.522 6.694 6.871 7.009 7.091 7.096 6.889 6.195 5.224 4.405 3.686 3.04 2.438 1.903 1.421 1.0 0.584 0.241 -0.074 -0.389 -0.685 -0.952 -1.182 -1.421 -1.637 -1.83 -2.032 -2.232 -2.402 -2.587 -2.766 -2.906 -3.056 -3.215 -3.379 -3.553 -3.67 -3.782 -3.968 -4.111 -4.245 -4.304 -4.429 -4.566 -4.715 -4.787 -5.107 -5.052 -5.134 -5.22 -5.431 -5.552 -5.672 -5.781 -5.886 -6.024 -6.204 -7.059 -9 ,28172 ,KEBNE ,17022438,Wed Dec 22 05:48:12 CET,Wed Dec 22 07:14:13 CET,0.0 0.359 0.585 0.822 1.012 1.157 1.303 1.428 1.64 1.741 1.83 1.757 2.087 2.172 2.339 2.507 2.646 2.705 2.835 2.975 3.152 3.246 3.342 3.485 3.634 3.785 3.919 4.031 4.186 4.359 4.521 4.704 4.868 5.013 5.148 5.295 5.458 5.64 5.81 5.988 6.193 6.394 6.569 6.732 6.917 7.063 7.169 7.245 7.246 7.076 6.488 5.557 4.687 3.924 3.26 2.64 2.107 1.641 1.221 0.802 0.446 0.125 -0.182 -0.477 -0.735 -0.965 -1.221 -1.45 -1.644 -1.845 -2.052 -2.221 -2.406 -2.613 -2.767 -2.911 -3.062 -3.234 -3.423 -3.549 -3.666 -3.837 -3.962 -4.095 -4.158 -4.288 -4.443 -4.608 -4.695 -5.023 -4.969 -5.058 -5.143 -5.329 -5.436 -5.557 -5.692 -5.819 -5.974 -6.184 -6.512 -10 ,24420 ,KEBNE ,17022439,Wed Dec 22 05:48:12 CET,Wed Dec 22 07:13:17 CET,0.0 0.661 0.9 1.077 1.257 1.408 1.546 1.674 1.901 2.005 2.11 2.069 2.402 2.503 2.684 2.852 3.012 3.09 3.234 3.371 3.55 3.666 3.786 3.954 4.117 4.266 4.413 4.563 4.756 4.939 5.106 5.294 5.472 5.625 5.801 6.015 6.211 6.388 6.573 6.777 6.987 7.206 7.415 7.59 7.785 7.981 8.159 8.303 8.378 8.266 7.724 6.824 5.992 5.213 4.489 3.807 3.239 2.753 2.328 1.891 1.519 1.191 0.867 0.559 0.282 0.034 -0.223 -0.46 -0.669 -0.89 -1.115 -1.287 -1.475 -1.679 -1.833 -1.989 -2.142 -2.289 -2.443 -2.559 -2.676 -2.846 -2.969 -3.102 -3.171 -3.318 -3.476 -3.636 -3.716 -4.033 -3.969 -4.069 -4.168 -4.371 -4.48 -4.611 -4.749 -4.878 -5.003 -5.161 -5.377 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_45_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_45_42.txt deleted file mode 100644 index 6f7cb4e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_45_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28150 ,KEBNE ,17022440,Wed Dec 22 05:48:12 CET,Wed Dec 22 07:13:59 CET,0.0 0.521 0.838 1.063 1.223 1.354 1.504 1.64 1.846 1.951 2.062 2.023 2.365 2.452 2.629 2.787 2.934 3.008 3.152 3.294 3.498 3.636 3.774 3.964 4.142 4.308 4.463 4.61 4.804 5.005 5.2 5.419 5.629 5.836 6.074 6.34 6.594 6.866 7.152 7.474 7.84 8.235 8.668 9.096 9.599 10.163 10.801 11.517 12.336 13.194 14.118 14.737 14.935 14.949 14.847 14.692 14.503 14.292 14.098 13.902 13.718 13.53 13.344 13.164 12.979 12.786 12.574 12.393 12.235 12.049 11.848 11.68 11.522 11.372 11.243 11.101 10.957 10.808 10.641 10.529 10.421 10.244 10.116 9.973 9.897 9.743 9.567 9.383 9.295 8.973 9.031 8.932 8.826 8.605 8.486 8.359 8.21 8.043 7.826 7.464 6.591 -2 ,23184 ,KEBNE ,17022441,Wed Dec 22 05:48:12 CET,Wed Dec 22 07:12:53 CET,0.0 0.75 0.943 1.134 1.346 1.576 1.776 1.914 2.122 2.216 2.308 2.243 2.567 2.65 2.807 2.963 3.122 3.193 3.337 3.474 3.66 3.777 3.891 4.057 4.213 4.378 4.543 4.697 4.896 5.082 5.26 5.469 5.667 5.866 6.096 6.358 6.628 6.927 7.24 7.575 7.945 8.364 8.836 9.289 9.778 10.321 10.981 11.721 12.545 13.468 14.453 15.054 15.238 15.237 15.162 15.046 14.881 14.721 14.546 14.315 14.127 13.964 13.802 13.66 13.524 13.383 13.227 13.074 12.929 12.786 12.625 12.492 12.37 12.223 12.102 11.978 11.84 11.696 11.537 11.428 11.329 11.163 11.044 10.929 10.873 10.756 10.631 10.497 10.42 10.099 10.13 10.018 9.908 9.662 9.524 9.383 9.237 9.064 8.812 8.485 8.066 -3 ,27643 ,KEBNE ,17022442,Wed Dec 22 05:48:13 CET,Wed Dec 22 07:13:06 CET,0.0 1.431 1.816 1.982 2.137 2.283 2.412 2.527 2.767 2.879 2.984 2.935 3.274 3.356 3.523 3.693 3.849 3.923 4.06 4.191 4.403 4.543 4.675 4.868 5.056 5.241 5.427 5.604 5.829 6.049 6.256 6.51 6.743 6.938 7.177 7.474 7.759 8.066 8.385 8.719 9.072 9.455 9.905 10.367 10.906 11.508 12.166 12.888 13.701 14.59 15.593 16.199 16.385 16.39 16.243 16.005 15.792 15.598 15.398 15.192 14.995 14.793 14.583 14.386 14.197 14.027 13.848 13.676 13.54 13.392 13.215 13.059 12.907 12.74 12.597 12.464 12.335 12.194 12.035 11.916 11.804 11.63 11.499 11.364 11.291 11.127 10.965 10.787 10.689 10.357 10.418 10.327 10.228 9.978 9.828 9.659 9.489 9.299 9.083 8.772 7.613 -4 ,24665 ,KEBNE ,17022443,Wed Dec 22 05:48:12 CET,Wed Dec 22 07:14:36 CET,0.0 1.982 2.429 2.725 2.972 3.214 3.451 3.624 3.868 3.976 4.079 4.016 4.344 4.424 4.592 4.757 4.924 5.003 5.159 5.31 5.512 5.634 5.752 5.926 6.105 6.289 6.461 6.627 6.847 7.048 7.249 7.503 7.728 7.936 8.191 8.479 8.742 9.023 9.319 9.634 9.962 10.335 10.789 11.242 11.753 12.321 13.0 13.786 14.62 15.499 16.468 17.083 17.293 17.317 17.216 17.042 16.844 16.651 16.48 16.286 16.091 15.898 15.7 15.528 15.371 15.218 15.067 14.921 14.784 14.635 14.469 14.325 14.173 14.022 13.897 13.756 13.61 13.468 13.326 13.213 13.073 12.864 12.729 12.593 12.522 12.38 12.229 12.049 11.957 11.629 11.695 11.577 11.452 11.218 11.082 10.936 10.762 10.587 10.402 10.118 9.398 -5 ,19224 ,KEBNE ,17022444,Wed Dec 22 05:48:12 CET,Wed Dec 22 07:13:55 CET,0.0 1.811 2.278 2.619 2.851 3.021 3.189 3.353 3.631 3.743 3.846 3.793 4.142 4.241 4.431 4.615 4.794 4.889 5.073 5.236 5.46 5.597 5.734 5.943 6.131 6.313 6.506 6.69 6.904 7.108 7.308 7.553 7.799 8.022 8.259 8.523 8.776 9.056 9.378 9.718 10.058 10.43 10.855 11.307 11.823 12.377 13.009 13.671 14.419 15.261 16.209 16.929 17.207 17.177 17.041 16.906 16.749 16.555 16.338 16.086 15.883 15.704 15.517 15.33 15.149 14.979 14.8 14.64 14.486 14.318 14.144 13.991 13.828 13.66 13.54 13.425 13.291 13.136 12.965 12.832 12.694 12.486 12.345 12.199 12.116 11.948 11.773 11.585 11.48 11.129 11.118 10.983 10.825 10.487 10.305 10.104 9.896 9.653 9.334 8.893 7.416 -6 ,17560 ,KEBNE ,17022445,Wed Dec 22 05:50:19 CET,Wed Dec 22 07:16:09 CET,0.0 0.685 0.929 1.114 1.29 1.451 1.578 1.707 1.954 2.078 2.205 2.171 2.519 2.623 2.81 2.992 3.173 3.253 3.422 3.577 3.784 3.926 4.064 4.254 4.437 4.611 4.778 4.942 5.151 5.352 5.547 5.777 5.989 6.196 6.44 6.711 6.978 7.285 7.619 7.954 8.308 8.719 9.204 9.673 10.196 10.793 11.493 12.251 13.049 13.949 14.93 15.455 15.584 15.524 15.327 15.109 14.904 14.68 14.464 14.212 13.984 13.774 13.563 13.356 13.159 12.974 12.781 12.612 12.455 12.283 12.105 11.955 11.799 11.627 11.487 11.343 11.191 11.031 10.878 10.772 10.656 10.482 10.363 10.226 10.151 10.005 9.854 9.696 9.608 9.251 9.231 9.111 9.0 8.741 8.575 8.388 8.199 7.995 7.735 7.447 6.403 -7 ,26822 ,KEBNE ,17022446,Wed Dec 22 05:50:19 CET,Wed Dec 22 07:15:43 CET,0.0 0.578 0.831 1.009 1.148 1.304 1.464 1.606 1.822 1.908 1.999 1.924 2.26 2.352 2.508 2.654 2.798 2.866 2.999 3.124 3.311 3.437 3.563 3.753 3.95 4.144 4.322 4.477 4.672 4.874 5.063 5.284 5.479 5.661 5.881 6.136 6.388 6.664 6.946 7.244 7.569 7.923 8.332 8.746 9.215 9.717 10.272 10.891 11.623 12.427 13.265 13.812 13.991 13.97 13.841 13.659 13.446 13.242 13.054 12.822 12.57 12.319 12.07 11.832 11.612 11.419 11.234 11.065 10.903 10.726 10.535 10.367 10.189 10.002 9.864 9.722 9.562 9.406 9.238 9.115 8.995 8.802 8.669 8.534 8.466 8.33 8.193 8.042 7.957 7.629 7.684 7.572 7.466 7.236 7.106 6.966 6.815 6.608 6.337 5.973 4.214 -8 ,6064 ,KEBNE ,17022447,Wed Dec 22 05:50:19 CET,Wed Dec 22 07:15:27 CET,0.0 0.869 1.203 1.41 1.558 1.704 1.832 1.946 2.175 2.276 2.373 2.317 2.659 2.743 2.919 3.088 3.242 3.314 3.457 3.593 3.793 3.927 4.043 4.217 4.393 4.554 4.707 4.858 5.059 5.25 5.426 5.647 5.874 6.086 6.323 6.596 6.872 7.167 7.461 7.772 8.104 8.477 8.921 9.374 9.885 10.438 11.066 11.773 12.588 13.49 14.447 15.07 15.269 15.297 15.238 15.093 14.937 14.775 14.604 14.4 14.199 13.999 13.802 13.614 13.436 13.277 13.097 12.921 12.772 12.622 12.457 12.309 12.164 12.015 11.895 11.777 11.645 11.499 11.355 11.26 11.154 10.985 10.86 10.713 10.635 10.487 10.342 10.196 10.122 9.802 9.855 9.744 9.637 9.393 9.263 9.134 8.973 8.772 8.535 8.226 7.287 -9 ,31112 ,KEBNE ,17022448,Wed Dec 22 05:50:19 CET,Wed Dec 22 07:14:49 CET,0.0 0.296 0.49 0.633 0.752 0.88 1.03 1.157 1.357 1.447 1.525 1.427 1.751 1.831 1.991 2.149 2.29 2.359 2.509 2.646 2.831 2.956 3.076 3.252 3.431 3.613 3.786 3.95 4.165 4.367 4.564 4.792 5.016 5.235 5.483 5.762 6.029 6.317 6.633 6.979 7.333 7.737 8.221 8.723 9.295 9.928 10.6 11.279 12.093 13.011 13.964 14.604 14.838 14.842 14.744 14.593 14.419 14.226 14.033 13.827 13.608 13.39 13.174 12.923 12.652 12.424 12.229 12.061 11.904 11.733 11.558 11.409 11.239 11.061 10.929 10.795 10.65 10.494 10.32 10.19 10.073 9.91 9.787 9.655 9.582 9.434 9.282 9.122 9.036 8.717 8.766 8.651 8.528 8.278 8.137 7.991 7.809 7.591 7.351 7.021 6.017 -10 ,11287 ,KEBNE ,17022449,Wed Dec 22 05:50:19 CET,Wed Dec 22 07:15:04 CET,0.0 0.403 0.597 0.802 0.971 1.095 1.227 1.376 1.627 1.728 1.822 1.76 2.089 2.175 2.356 2.518 2.672 2.756 2.916 3.051 3.245 3.381 3.501 3.662 3.831 3.997 4.155 4.303 4.502 4.706 4.899 5.117 5.332 5.551 5.808 6.114 6.403 6.699 7.0 7.313 7.658 8.043 8.489 8.942 9.444 9.999 10.627 11.326 12.122 12.96 13.863 14.47 14.716 14.768 14.657 14.466 14.261 14.047 13.859 13.656 13.448 13.249 13.07 12.889 12.714 12.556 12.368 12.18 12.015 11.852 11.672 11.521 11.374 11.221 11.094 10.951 10.807 10.66 10.501 10.395 10.293 10.14 10.02 9.875 9.802 9.671 9.546 9.4 9.312 8.963 8.994 8.899 8.804 8.567 8.417 8.267 8.102 7.9 7.65 7.36 6.481 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_46_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_46_43.txt deleted file mode 100644 index ce33e13a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_46_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6443 ,KEBNE ,17022450,Wed Dec 22 05:50:19 CET,Wed Dec 22 07:16:21 CET,0.0 0.481 0.711 0.926 1.104 1.242 1.358 1.468 1.687 1.796 1.906 1.854 2.2 2.283 2.442 2.605 2.752 2.819 2.957 3.095 3.285 3.407 3.524 3.695 3.864 4.031 4.183 4.323 4.516 4.705 4.886 5.106 5.312 5.506 5.734 5.991 6.232 6.494 6.765 7.043 7.354 7.723 8.13 8.536 9.017 9.532 10.118 10.767 11.46 12.191 12.908 13.279 13.347 13.3 13.205 13.071 12.907 12.714 12.516 12.32 12.154 12.007 11.86 11.697 11.527 11.354 11.173 11.025 10.895 10.755 10.606 10.491 10.377 10.259 10.164 10.056 9.945 9.828 9.697 9.614 9.529 9.377 9.266 9.155 9.1 8.983 8.86 8.734 8.663 8.341 8.438 8.356 8.272 8.085 7.966 7.829 7.678 7.523 7.367 7.171 6.835 -2 ,3992 ,KEBNE ,17022451,Wed Dec 22 05:51:21 CET,Wed Dec 22 07:16:37 CET,0.0 0.361 0.572 0.755 0.92 1.066 1.194 1.312 1.547 1.657 1.758 1.7 2.047 2.134 2.284 2.414 2.555 2.634 2.772 2.892 3.073 3.194 3.31 3.478 3.642 3.805 3.96 4.106 4.296 4.485 4.667 4.877 5.081 5.283 5.517 5.778 6.025 6.28 6.549 6.852 7.168 7.503 7.886 8.278 8.732 9.22 9.773 10.427 11.206 12.022 12.836 13.331 13.491 13.463 13.339 13.169 12.99 12.817 12.632 12.416 12.237 12.077 11.906 11.736 11.567 11.406 11.243 11.098 10.966 10.822 10.671 10.547 10.426 10.29 10.175 10.063 9.949 9.823 9.691 9.606 9.519 9.386 9.292 9.185 9.126 8.999 8.864 8.721 8.653 8.349 8.433 8.353 8.263 8.056 7.952 7.84 7.724 7.594 7.422 7.189 6.902 -3 ,16338 ,KEBNE ,17022452,Wed Dec 22 05:51:21 CET,Wed Dec 22 07:16:34 CET,0.0 0.497 0.706 0.893 1.056 1.21 1.344 1.462 1.71 1.826 1.93 1.855 2.204 2.294 2.446 2.603 2.763 2.838 2.992 3.146 3.364 3.498 3.622 3.803 3.982 4.152 4.314 4.466 4.669 4.861 5.042 5.264 5.471 5.666 5.902 6.169 6.418 6.709 7.009 7.311 7.632 7.992 8.389 8.765 9.205 9.759 10.42 11.111 11.92 12.802 13.708 14.22 14.403 14.428 14.352 14.263 14.137 13.972 13.8 13.615 13.459 13.32 13.171 13.01 12.867 12.732 12.578 12.454 12.344 12.22 12.095 11.987 11.865 11.736 11.634 11.53 11.425 11.316 11.202 11.116 11.027 10.893 10.79 10.682 10.632 10.521 10.391 10.253 10.191 9.871 9.947 9.876 9.794 9.606 9.507 9.405 9.287 9.158 9.033 8.863 8.423 -4 ,2036 ,KEBNE ,17022453,Wed Dec 22 05:52:22 CET,Wed Dec 22 07:18:25 CET,0.0 0.633 0.898 1.089 1.221 1.335 1.46 1.587 1.827 1.937 2.033 1.977 2.319 2.396 2.551 2.699 2.838 2.9 3.031 3.162 3.355 3.486 3.611 3.787 3.952 4.102 4.24 4.38 4.587 4.795 4.975 5.174 5.378 5.577 5.797 6.056 6.306 6.573 6.864 7.181 7.511 7.865 8.279 8.685 9.144 9.647 10.176 10.756 11.435 12.183 13.036 13.592 13.764 13.785 13.715 13.598 13.468 13.313 13.143 12.943 12.76 12.618 12.495 12.381 12.241 12.09 11.934 11.795 11.678 11.549 11.399 11.282 11.17 11.042 10.945 10.843 10.727 10.598 10.454 10.356 10.266 10.128 10.024 9.901 9.837 9.712 9.581 9.442 9.367 9.051 9.141 9.05 8.959 8.72 8.593 8.478 8.339 8.192 8.053 7.885 7.465 -5 ,30006 ,KEBNE ,17022455,Wed Dec 22 05:52:23 CET,Wed Dec 22 07:18:37 CET,0.0 0.591 0.865 1.06 1.22 1.382 1.529 1.654 1.884 1.989 2.094 2.04 2.379 2.48 2.68 2.844 2.997 3.073 3.212 3.34 3.532 3.657 3.781 3.956 4.135 4.318 4.486 4.635 4.829 5.027 5.209 5.43 5.653 5.868 6.117 6.379 6.614 6.87 7.158 7.45 7.763 8.146 8.585 9.01 9.496 10.037 10.646 11.303 12.041 12.836 13.629 14.108 14.264 14.249 14.137 13.958 13.772 13.596 13.421 13.226 13.043 12.884 12.725 12.553 12.39 12.22 12.031 11.878 11.745 11.604 11.446 11.31 11.159 11.006 10.897 10.789 10.681 10.557 10.424 10.327 10.22 10.066 9.968 9.868 9.816 9.711 9.602 9.475 9.404 9.097 9.181 9.092 8.998 8.801 8.7 8.565 8.419 8.284 8.106 7.876 7.469 -6 ,12440 ,KEBNE ,17022456,Wed Dec 22 05:52:23 CET,Wed Dec 22 07:18:27 CET,0.0 0.318 0.563 0.788 0.969 1.108 1.222 1.352 1.579 1.675 1.78 1.732 2.072 2.156 2.322 2.466 2.609 2.682 2.826 2.96 3.156 3.282 3.387 3.536 3.69 3.848 4.01 4.162 4.354 4.543 4.719 4.933 5.142 5.347 5.59 5.863 6.132 6.419 6.731 7.058 7.379 7.724 8.121 8.544 9.046 9.583 10.178 10.87 11.626 12.429 13.33 13.93 14.168 14.204 14.138 14.037 13.929 13.801 13.653 13.505 13.361 13.2 13.038 12.882 12.732 12.584 12.43 12.282 12.147 12.004 11.854 11.742 11.633 11.5 11.38 11.266 11.149 11.021 10.893 10.806 10.713 10.563 10.461 10.341 10.276 10.156 10.041 9.927 9.861 9.547 9.639 9.56 9.464 9.267 9.167 9.052 8.931 8.804 8.634 8.427 8.039 -7 ,9331 ,KEBNE ,17022457,Wed Dec 22 05:52:23 CET,Wed Dec 22 07:18:18 CET,0.0 0.634 0.83 0.982 1.16 1.332 1.457 1.589 1.855 1.964 2.065 2.019 2.376 2.47 2.637 2.795 2.96 3.037 3.191 3.351 3.586 3.725 3.848 4.023 4.202 4.371 4.537 4.698 4.9 5.101 5.293 5.522 5.744 5.953 6.197 6.466 6.714 6.989 7.292 7.625 7.971 8.354 8.796 9.222 9.705 10.245 10.88 11.579 12.342 13.186 14.073 14.609 14.737 14.691 14.587 14.441 14.268 14.064 13.856 13.662 13.494 13.313 13.122 12.947 12.779 12.607 12.43 12.266 12.119 11.979 11.838 11.73 11.622 11.484 11.364 11.246 11.128 11.008 10.876 10.784 10.684 10.522 10.42 10.31 10.246 10.119 10.005 9.864 9.784 9.467 9.557 9.466 9.368 9.169 9.064 8.953 8.826 8.687 8.534 8.349 7.975 -8 ,25582 ,KEBNE ,17022458,Wed Dec 22 05:52:23 CET,Wed Dec 22 07:18:36 CET,0.0 0.368 0.569 0.748 0.892 1.02 1.15 1.291 1.537 1.633 1.724 1.655 1.99 2.072 2.223 2.37 2.523 2.594 2.727 2.853 3.029 3.143 3.266 3.445 3.61 3.771 3.939 4.103 4.29 4.469 4.634 4.814 5.001 5.202 5.431 5.665 5.888 6.142 6.42 6.726 7.054 7.413 7.816 8.228 8.711 9.245 9.836 10.495 11.212 11.933 12.69 13.141 13.253 13.218 13.106 12.947 12.765 12.575 12.411 12.231 12.054 11.886 11.705 11.52 11.339 11.165 10.986 10.83 10.688 10.541 10.398 10.277 10.157 10.03 9.916 9.795 9.661 9.519 9.388 9.294 9.194 9.051 8.943 8.824 8.762 8.62 8.484 8.342 8.26 7.929 7.991 7.907 7.827 7.641 7.538 7.421 7.292 7.098 6.854 6.619 6.089 -9 ,25529 ,KEBNE ,17022459,Wed Dec 22 05:52:23 CET,Wed Dec 22 07:19:17 CET,0.0 0.185 0.377 0.564 0.712 0.855 1.0 1.131 1.364 1.466 1.564 1.5 1.837 1.92 2.071 2.211 2.351 2.423 2.566 2.699 2.894 3.03 3.157 3.333 3.497 3.65 3.806 3.962 4.163 4.352 4.527 4.744 4.946 5.14 5.37 5.62 5.858 6.113 6.378 6.669 6.984 7.339 7.738 8.123 8.576 9.062 9.603 10.229 10.912 11.645 12.378 12.846 12.986 12.913 12.764 12.615 12.448 12.274 12.116 11.948 11.793 11.628 11.463 11.305 11.137 10.985 10.831 10.678 10.543 10.391 10.236 10.115 9.989 9.861 9.756 9.644 9.524 9.4 9.272 9.182 9.088 8.929 8.821 8.713 8.648 8.505 8.367 8.224 8.148 7.825 7.907 7.822 7.728 7.528 7.42 7.302 7.186 7.048 6.885 6.644 6.26 -10 ,11561 ,KEBNE ,17022460,Wed Dec 22 05:52:23 CET,Wed Dec 22 07:17:47 CET,0.0 0.381 0.576 0.735 0.884 1.013 1.129 1.242 1.486 1.594 1.686 1.629 1.978 2.068 2.216 2.342 2.468 2.54 2.681 2.807 2.985 3.093 3.189 3.346 3.52 3.696 3.878 4.049 4.254 4.447 4.629 4.863 5.095 5.314 5.559 5.841 6.114 6.406 6.731 7.071 7.422 7.818 8.274 8.705 9.187 9.724 10.315 10.951 11.672 12.443 13.294 13.861 14.009 13.969 13.857 13.668 13.437 13.217 13.022 12.814 12.637 12.462 12.274 12.104 11.927 11.753 11.567 11.385 11.243 11.107 10.932 10.776 10.623 10.459 10.336 10.203 10.07 9.944 9.808 9.701 9.586 9.414 9.292 9.158 9.089 8.95 8.806 8.664 8.593 8.274 8.34 8.244 8.153 7.943 7.832 7.717 7.568 7.404 7.24 7.049 6.697 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_47_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_47_43.txt deleted file mode 100644 index 778623b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_47_43.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,4695 ,KEBNE ,17022462,Wed Dec 22 05:52:23 CET,Wed Dec 22 07:17:31 CET,0.0 0.549 0.881 1.185 1.406 1.6 1.801 1.994 2.334 2.489 2.634 2.631 3.048 3.189 3.472 3.728 3.948 4.053 4.273 4.494 4.8 4.993 5.193 5.491 5.787 6.08 6.366 6.648 7.0 7.324 7.627 7.983 8.335 8.699 9.133 9.62 10.084 10.602 11.179 11.805 12.479 13.241 14.139 15.066 16.141 17.358 18.846 20.599 22.754 25.443 28.894 31.95 33.851 35.167 36.095 36.758 37.228 37.569 37.808 38.017 38.163 38.271 38.344 38.384 38.4 38.403 38.396 38.374 38.339 38.293 38.232 38.172 38.119 38.06 38.008 37.951 37.89 37.815 37.728 37.665 37.594 37.477 37.389 37.294 37.241 37.131 37.029 36.926 36.864 36.553 36.658 36.586 36.492 36.264 36.138 35.99 35.817 35.623 35.413 35.156 34.517 -5 ,3225 ,KEBNE ,17022465,Wed Dec 22 05:53:24 CET,Wed Dec 22 07:19:39 CET,0.0 0.32 0.594 0.809 1.027 1.216 1.373 1.508 1.741 1.859 1.996 1.994 2.396 2.516 2.743 2.954 3.151 3.249 3.444 3.644 3.931 4.103 4.278 4.557 4.823 5.069 5.313 5.552 5.852 6.157 6.465 6.839 7.193 7.541 7.966 8.44 8.899 9.422 10.001 10.615 11.263 12.017 12.902 13.803 14.872 16.085 17.542 19.265 21.368 23.975 27.391 30.362 32.172 33.383 34.224 34.857 35.335 35.691 35.93 36.109 36.235 36.319 36.357 36.372 36.377 36.361 36.326 36.278 36.232 36.191 36.14 36.098 36.054 35.99 35.932 35.87 35.804 35.716 35.618 35.557 35.492 35.376 35.287 35.19 35.142 35.051 34.94 34.816 34.754 34.44 34.531 34.448 34.358 34.165 34.055 33.916 33.753 33.585 33.414 33.168 32.688 -8 ,15606 ,KEBNE ,17022468,Wed Dec 22 05:53:25 CET,Wed Dec 22 07:19:45 CET,0.0 0.689 0.972 1.172 1.363 1.535 1.684 1.825 2.079 2.2 2.335 2.326 2.734 2.856 3.1 3.332 3.554 3.657 3.853 4.038 4.296 4.469 4.648 4.921 5.178 5.415 5.651 5.903 6.237 6.546 6.845 7.213 7.591 7.98 8.425 8.898 9.354 9.871 10.445 11.058 11.699 12.436 13.332 14.235 15.301 16.547 18.04 19.778 21.891 24.487 27.856 30.851 32.747 34.071 34.978 35.635 36.1 36.438 36.686 36.871 36.989 37.066 37.121 37.171 37.211 37.223 37.224 37.225 37.217 37.193 37.162 37.119 37.062 37.007 36.958 36.892 36.818 36.727 36.612 36.537 36.463 36.336 36.25 36.165 36.118 36.016 35.901 35.747 35.647 35.301 35.325 35.222 35.131 34.918 34.793 34.66 34.489 34.277 34.029 33.694 33.101 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_48_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_48_42.txt deleted file mode 100644 index 6b8230d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_48_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27637 ,KEBNE ,17022471,Wed Dec 22 05:53:25 CET,Wed Dec 22 07:20:12 CET,0.0 0.902 1.229 1.494 1.702 1.884 2.061 2.226 2.522 2.655 2.783 2.808 3.184 3.301 3.514 3.712 3.892 3.986 4.164 4.327 4.565 4.712 4.853 5.062 5.264 5.454 5.636 5.816 6.061 6.289 6.517 6.778 7.002 7.221 7.49 7.784 8.042 8.326 8.662 9.032 9.38 9.753 10.18 10.573 10.995 11.434 11.927 12.47 13.05 13.538 13.884 13.902 13.721 13.426 13.093 12.743 12.378 12.025 11.699 11.35 11.035 10.735 10.466 10.223 9.986 9.763 9.508 9.288 9.109 8.926 8.734 8.563 8.383 8.186 8.024 7.853 7.679 7.506 7.305 7.16 7.014 6.785 6.632 6.484 6.409 6.242 6.069 5.879 5.776 5.437 5.445 5.326 5.202 4.926 4.769 4.596 4.412 4.199 3.929 3.571 2.503 -2 ,28799 ,KEBNE ,17022472,Wed Dec 22 05:53:24 CET,Wed Dec 22 07:20:10 CET,0.0 0.674 0.982 1.222 1.413 1.588 1.752 1.919 2.225 2.361 2.484 2.492 2.845 2.941 3.122 3.29 3.443 3.515 3.661 3.788 3.971 4.106 4.24 4.42 4.591 4.76 4.906 5.03 5.198 5.368 5.525 5.713 5.894 6.078 6.304 6.545 6.781 7.028 7.269 7.53 7.809 8.114 8.461 8.795 9.164 9.549 9.923 10.315 10.726 11.055 11.183 10.961 10.63 10.267 9.878 9.479 9.143 8.823 8.502 8.166 7.86 7.596 7.355 7.122 6.882 6.646 6.391 6.164 5.978 5.779 5.561 5.376 5.189 4.992 4.84 4.682 4.507 4.327 4.137 3.995 3.853 3.648 3.507 3.351 3.267 3.094 2.92 2.733 2.637 2.287 2.308 2.198 2.073 1.809 1.66 1.483 1.294 1.108 0.888 0.55 -0.574 -3 ,443 ,KEBNE ,17022473,Wed Dec 22 05:54:27 CET,Wed Dec 22 07:21:59 CET,0.0 0.997 1.455 1.842 2.15 2.421 2.657 2.83 3.083 3.201 3.321 3.301 3.644 3.753 3.959 4.132 4.284 4.361 4.525 4.678 4.892 5.03 5.165 5.356 5.545 5.741 5.922 6.107 6.348 6.568 6.775 7.026 7.28 7.503 7.735 8.001 8.266 8.549 8.84 9.127 9.407 9.739 10.121 10.466 10.841 11.233 11.662 12.094 12.489 12.841 13.034 12.889 12.591 12.247 11.884 11.508 11.139 10.741 10.384 10.031 9.713 9.43 9.162 8.913 8.664 8.43 8.186 7.959 7.762 7.55 7.314 7.112 6.906 6.702 6.542 6.376 6.213 6.032 5.836 5.701 5.553 5.336 5.193 5.046 4.969 4.802 4.623 4.429 4.34 4.013 4.05 3.94 3.822 3.563 3.407 3.241 3.073 2.885 2.657 2.29 1.371 -4 ,26360 ,KEBNE ,17022474,Wed Dec 22 05:54:28 CET,Wed Dec 22 07:20:04 CET,0.0 0.797 1.129 1.347 1.545 1.721 1.899 2.057 2.316 2.428 2.532 2.511 2.863 2.967 3.153 3.345 3.519 3.598 3.752 3.9 4.107 4.234 4.371 4.578 4.772 4.945 5.09 5.24 5.451 5.664 5.863 6.089 6.291 6.477 6.701 6.96 7.207 7.478 7.767 8.065 8.404 8.741 9.076 9.388 9.715 10.091 10.524 10.991 11.476 11.882 12.069 11.86 11.489 11.09 10.67 10.256 9.875 9.497 9.106 8.714 8.419 8.153 7.882 7.644 7.401 7.131 6.837 6.573 6.346 6.116 5.875 5.676 5.463 5.23 5.044 4.848 4.649 4.431 4.207 4.057 3.888 3.618 3.434 3.255 3.161 2.954 2.744 2.535 2.429 2.094 2.086 1.951 1.814 1.534 1.374 1.189 1.017 0.836 0.609 0.324 -0.491 -5 ,31112 ,KEBNE ,17022475,Wed Dec 22 05:54:27 CET,Wed Dec 22 07:19:50 CET,0.0 0.771 1.102 1.312 1.501 1.652 1.792 1.911 2.15 2.284 2.398 2.366 2.704 2.806 3.01 3.192 3.352 3.431 3.587 3.735 3.957 4.096 4.233 4.438 4.626 4.805 4.977 5.131 5.327 5.524 5.712 5.942 6.162 6.36 6.578 6.818 7.041 7.267 7.504 7.758 8.007 8.29 8.634 8.968 9.341 9.708 10.083 10.462 10.836 11.223 11.46 11.292 10.914 10.489 10.099 9.724 9.365 9.005 8.659 8.301 7.971 7.677 7.405 7.148 6.898 6.647 6.388 6.156 5.946 5.736 5.528 5.356 5.171 4.987 4.849 4.699 4.537 4.368 4.192 4.066 3.931 3.717 3.571 3.42 3.34 3.175 2.992 2.793 2.691 2.348 2.36 2.226 2.086 1.791 1.632 1.459 1.263 1.044 0.8 0.417 -0.783 -6 ,29462 ,KEBNE ,17022476,Wed Dec 22 05:54:27 CET,Wed Dec 22 07:20:06 CET,0.0 0.86 1.213 1.463 1.685 1.885 2.078 2.252 2.554 2.696 2.818 2.793 3.139 3.243 3.44 3.637 3.819 3.899 4.049 4.194 4.42 4.565 4.705 4.908 5.101 5.279 5.457 5.647 5.884 6.095 6.292 6.54 6.776 7.002 7.272 7.592 7.893 8.198 8.51 8.827 9.137 9.496 9.91 10.289 10.7 11.113 11.56 12.021 12.443 12.796 12.984 12.823 12.513 12.135 11.743 11.373 11.0 10.648 10.336 9.997 9.708 9.449 9.184 8.916 8.654 8.406 8.148 7.916 7.714 7.511 7.299 7.127 6.942 6.73 6.565 6.406 6.239 6.056 5.875 5.752 5.626 5.433 5.295 5.145 5.062 4.898 4.737 4.558 4.449 4.101 4.114 3.984 3.852 3.56 3.39 3.233 3.08 2.872 2.581 2.244 1.101 -7 ,19632 ,KEBNE ,17022477,Wed Dec 22 05:56:31 CET,Wed Dec 22 07:23:18 CET,0.0 1.027 1.417 1.745 2.032 2.288 2.497 2.703 3.086 3.245 3.381 3.389 3.762 3.882 4.095 4.318 4.529 4.628 4.82 4.993 5.246 5.407 5.555 5.754 5.96 6.17 6.347 6.514 6.728 6.935 7.139 7.376 7.601 7.813 8.047 8.315 8.577 8.85 9.131 9.421 9.716 10.024 10.356 10.705 11.092 11.489 11.954 12.423 12.873 13.32 13.597 13.503 13.204 12.831 12.456 12.086 11.747 11.399 11.08 10.763 10.469 10.198 9.937 9.694 9.465 9.261 9.045 8.838 8.653 8.458 8.259 8.092 7.909 7.719 7.574 7.428 7.271 7.091 6.889 6.746 6.597 6.358 6.193 6.027 5.944 5.748 5.553 5.361 5.253 4.913 4.912 4.779 4.656 4.404 4.271 4.121 3.94 3.733 3.48 3.059 2.065 -8 ,441 ,KEBNE ,17022478,Wed Dec 22 05:56:31 CET,Wed Dec 22 07:22:53 CET,0.0 0.999 1.321 1.599 1.82 2.014 2.202 2.358 2.62 2.73 2.835 2.788 3.132 3.23 3.43 3.634 3.821 3.908 4.071 4.219 4.426 4.565 4.71 4.912 5.102 5.281 5.447 5.614 5.844 6.074 6.295 6.55 6.787 7.01 7.286 7.602 7.896 8.219 8.55 8.9 9.247 9.62 10.055 10.489 10.963 11.459 12.038 12.682 13.368 13.899 14.144 14.031 13.68 13.176 12.674 12.214 11.756 11.311 10.917 10.524 10.184 9.882 9.588 9.295 9.027 8.776 8.514 8.284 8.084 7.892 7.682 7.488 7.273 7.055 6.891 6.704 6.512 6.327 6.123 5.978 5.821 5.573 5.415 5.259 5.177 4.978 4.764 4.555 4.449 4.101 4.101 3.979 3.854 3.59 3.446 3.262 3.032 2.803 2.546 2.125 0.045 -9 ,30336 ,KEBNE ,17022479,Wed Dec 22 05:56:31 CET,Wed Dec 22 07:23:12 CET,0.0 0.971 1.284 1.496 1.692 1.878 2.039 2.191 2.458 2.569 2.688 2.651 2.987 3.08 3.245 3.413 3.594 3.682 3.834 3.975 4.163 4.272 4.381 4.534 4.674 4.81 4.939 5.077 5.248 5.405 5.569 5.766 5.955 6.142 6.35 6.57 6.799 7.051 7.303 7.556 7.816 8.114 8.465 8.795 9.131 9.474 9.855 10.266 10.653 10.981 11.149 10.936 10.545 10.144 9.775 9.43 9.134 8.817 8.516 8.205 7.895 7.612 7.346 7.104 6.877 6.653 6.42 6.216 6.036 5.833 5.622 5.462 5.284 5.086 4.941 4.784 4.613 4.447 4.27 4.138 3.996 3.778 3.64 3.488 3.411 3.256 3.078 2.896 2.799 2.462 2.462 2.34 2.216 1.948 1.795 1.639 1.48 1.275 1.006 0.578 -0.227 -10 ,30852 ,KEBNE ,17022480,Wed Dec 22 05:56:31 CET,Wed Dec 22 07:22:31 CET,0.0 1.294 1.679 1.992 2.244 2.453 2.674 2.883 3.214 3.362 3.509 3.515 3.849 3.951 4.146 4.316 4.49 4.578 4.745 4.907 5.13 5.259 5.375 5.543 5.696 5.851 6.026 6.193 6.389 6.571 6.745 6.953 7.164 7.375 7.625 7.904 8.15 8.414 8.685 8.975 9.31 9.695 10.105 10.459 10.845 11.266 11.76 12.297 12.853 13.408 13.891 13.969 13.701 13.359 13.009 12.686 12.355 12.012 11.722 11.416 11.138 10.871 10.593 10.321 10.061 9.822 9.568 9.342 9.154 8.943 8.702 8.515 8.331 8.133 7.973 7.805 7.64 7.466 7.279 7.153 7.019 6.804 6.662 6.512 6.435 6.284 6.122 5.93 5.823 5.475 5.492 5.383 5.259 4.988 4.845 4.694 4.512 4.286 4.04 3.72 2.183 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_49_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_49_50.txt deleted file mode 100644 index b7ec553c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_49_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20793 ,KEBNE ,17022481,Wed Dec 22 05:58:34 CET,Wed Dec 22 07:23:44 CET,0.0 1.048 1.314 1.535 1.719 1.907 2.067 2.189 2.438 2.56 2.672 2.646 2.991 3.098 3.276 3.44 3.606 3.686 3.839 3.989 4.203 4.337 4.47 4.663 4.85 5.03 5.197 5.36 5.57 5.761 5.934 6.143 6.348 6.559 6.819 7.085 7.336 7.615 7.899 8.205 8.515 8.812 9.157 9.503 9.889 10.297 10.719 11.163 11.599 11.935 12.054 11.786 11.333 10.847 10.374 9.915 9.499 9.118 8.77 8.417 8.11 7.826 7.54 7.27 7.022 6.784 6.521 6.28 6.082 5.88 5.668 5.498 5.32 5.128 4.974 4.814 4.661 4.5 4.323 4.202 4.075 3.872 3.735 3.604 3.536 3.39 3.236 3.068 2.981 2.646 2.698 2.592 2.47 2.231 2.111 1.988 1.863 1.717 1.559 1.385 1.121 -2 ,32340 ,KEBNE ,17022482,Wed Dec 22 05:58:34 CET,Wed Dec 22 07:25:06 CET,0.0 0.956 1.227 1.459 1.726 2.036 2.306 2.47 2.701 2.825 2.934 2.867 3.196 3.289 3.447 3.593 3.753 3.833 3.977 4.11 4.309 4.442 4.567 4.745 4.915 5.075 5.229 5.387 5.6 5.794 5.969 6.178 6.386 6.59 6.813 7.064 7.308 7.563 7.844 8.13 8.417 8.741 9.088 9.423 9.781 10.139 10.535 10.936 11.327 11.627 11.741 11.462 10.981 10.491 10.036 9.593 9.181 8.81 8.492 8.146 7.825 7.527 7.249 6.992 6.755 6.543 6.314 6.105 5.916 5.729 5.539 5.364 5.186 5.01 4.868 4.714 4.535 4.355 4.192 4.081 3.97 3.784 3.654 3.529 3.46 3.302 3.142 2.986 2.897 2.562 2.594 2.491 2.375 2.142 2.023 1.887 1.748 1.589 1.409 1.18 0.802 -3 ,1201 ,KEBNE ,17022483,Wed Dec 22 05:58:34 CET,Wed Dec 22 07:25:34 CET,0.0 0.407 0.641 0.839 1.025 1.188 1.331 1.463 1.683 1.792 1.896 1.847 2.186 2.284 2.462 2.629 2.779 2.851 2.987 3.119 3.332 3.469 3.6 3.789 3.97 4.144 4.316 4.482 4.682 4.863 5.044 5.275 5.5 5.712 5.949 6.217 6.461 6.71 6.974 7.264 7.566 7.894 8.258 8.595 8.975 9.381 9.796 10.216 10.616 10.944 11.108 10.921 10.549 10.157 9.747 9.32 8.917 8.53 8.179 7.807 7.487 7.199 6.931 6.668 6.421 6.197 5.952 5.735 5.554 5.36 5.146 4.965 4.767 4.556 4.407 4.263 4.111 3.97 3.825 3.713 3.591 3.401 3.264 3.12 3.048 2.903 2.753 2.603 2.52 2.19 2.238 2.124 2.012 1.796 1.684 1.568 1.442 1.309 1.132 0.867 0.415 -4 ,13430 ,KEBNE ,17022484,Wed Dec 22 05:58:34 CET,Wed Dec 22 07:24:10 CET,0.0 1.476 1.829 2.108 2.309 2.461 2.61 2.752 3.02 3.158 3.294 3.306 3.669 3.778 4.0 4.213 4.399 4.485 4.651 4.796 5.022 5.186 5.336 5.537 5.72 5.9 6.063 6.216 6.41 6.592 6.786 7.017 7.215 7.4 7.604 7.826 8.033 8.254 8.493 8.741 8.993 9.284 9.631 9.971 10.348 10.723 11.098 11.471 11.9 12.331 12.552 12.332 11.93 11.48 11.002 10.546 10.153 9.79 9.455 9.102 8.794 8.523 8.248 7.983 7.755 7.549 7.327 7.118 6.935 6.748 6.552 6.392 6.221 6.032 5.884 5.729 5.567 5.41 5.256 5.142 5.019 4.822 4.684 4.553 4.486 4.342 4.195 4.048 3.971 3.645 3.709 3.622 3.528 3.309 3.18 3.047 2.925 2.788 2.6 2.353 1.937 -5 ,5812 ,KEBNE ,17022485,Wed Dec 22 05:58:34 CET,Wed Dec 22 07:24:03 CET,0.0 1.491 1.974 2.335 2.612 2.841 3.056 3.249 3.593 3.762 3.917 3.955 4.335 4.467 4.713 4.951 5.167 5.252 5.403 5.548 5.757 5.897 6.039 6.243 6.419 6.584 6.758 6.923 7.134 7.334 7.511 7.718 7.923 8.116 8.335 8.567 8.794 9.056 9.33 9.608 9.884 10.179 10.5 10.805 11.138 11.503 11.891 12.306 12.697 12.927 12.952 12.674 12.217 11.722 11.282 10.87 10.484 10.1 9.753 9.42 9.13 8.86 8.595 8.342 8.108 7.894 7.666 7.45 7.272 7.098 6.906 6.742 6.57 6.391 6.255 6.106 5.942 5.775 5.608 5.491 5.366 5.175 5.049 4.913 4.845 4.711 4.56 4.401 4.315 3.979 4.013 3.908 3.802 3.575 3.458 3.326 3.19 3.039 2.85 2.619 2.097 -6 ,9069 ,KEBNE ,17022486,Wed Dec 22 06:00:37 CET,Wed Dec 22 07:26:42 CET,0.0 1.163 1.467 1.701 1.906 2.082 2.232 2.36 2.619 2.74 2.847 2.804 3.145 3.246 3.437 3.605 3.773 3.869 4.052 4.208 4.424 4.556 4.683 4.866 5.035 5.203 5.367 5.521 5.717 5.912 6.093 6.309 6.528 6.734 6.956 7.198 7.439 7.699 7.968 8.239 8.521 8.839 9.208 9.567 9.947 10.35 10.775 11.205 11.624 11.907 11.967 11.709 11.275 10.769 10.287 9.837 9.406 9.0 8.646 8.289 7.975 7.685 7.396 7.121 6.862 6.613 6.375 6.174 5.994 5.805 5.598 5.414 5.228 5.054 4.924 4.782 4.635 4.476 4.286 4.151 4.016 3.805 3.668 3.536 3.467 3.322 3.166 2.988 2.9 2.567 2.628 2.536 2.438 2.226 2.109 1.982 1.848 1.69 1.512 1.248 0.713 -7 ,13857 ,KEBNE ,17022487,Wed Dec 22 06:00:38 CET,Wed Dec 22 07:27:00 CET,0.0 1.002 1.346 1.631 1.873 2.088 2.263 2.419 2.731 2.858 2.973 2.957 3.302 3.404 3.625 3.829 4.018 4.111 4.281 4.433 4.657 4.803 4.937 5.131 5.32 5.497 5.67 5.842 6.055 6.251 6.446 6.684 6.9 7.1 7.322 7.579 7.829 8.094 8.383 8.684 8.99 9.317 9.681 10.053 10.46 10.851 11.258 11.685 12.106 12.492 12.668 12.44 12.046 11.601 11.179 10.757 10.341 9.943 9.59 9.239 8.932 8.643 8.369 8.115 7.882 7.661 7.422 7.214 7.033 6.839 6.635 6.464 6.288 6.1 5.949 5.802 5.649 5.484 5.319 5.213 5.098 4.916 4.795 4.665 4.597 4.459 4.293 4.109 4.026 3.714 3.779 3.692 3.604 3.409 3.306 3.208 3.08 2.923 2.766 2.559 2.214 -8 ,10396 ,KEBNE ,17022488,Wed Dec 22 06:00:37 CET,Wed Dec 22 07:26:36 CET,0.0 0.577 0.891 1.125 1.351 1.545 1.709 1.85 2.104 2.22 2.329 2.306 2.64 2.734 2.926 3.105 3.274 3.349 3.494 3.642 3.861 3.993 4.113 4.289 4.467 4.64 4.814 4.984 5.189 5.382 5.581 5.818 6.031 6.243 6.469 6.694 6.91 7.16 7.44 7.723 8.017 8.346 8.721 9.078 9.46 9.849 10.243 10.653 11.053 11.403 11.52 11.238 10.84 10.391 9.94 9.513 9.119 8.726 8.376 8.041 7.726 7.424 7.151 6.897 6.639 6.405 6.174 5.968 5.79 5.59 5.374 5.209 5.044 4.852 4.696 4.541 4.38 4.212 4.037 3.91 3.778 3.584 3.454 3.312 3.236 3.084 2.913 2.73 2.642 2.312 2.368 2.265 2.158 1.929 1.815 1.639 1.404 1.21 1.026 0.781 0.455 -9 ,17119 ,KEBNE ,17022489,Wed Dec 22 06:00:38 CET,Wed Dec 22 07:28:33 CET,0.0 0.779 1.15 1.455 1.708 1.92 2.122 2.309 2.635 2.782 2.929 2.974 3.344 3.467 3.675 3.865 4.054 4.143 4.316 4.482 4.705 4.842 4.976 5.176 5.362 5.534 5.706 5.881 6.097 6.294 6.476 6.695 6.915 7.112 7.322 7.564 7.81 8.078 8.347 8.633 8.922 9.244 9.638 10.003 10.39 10.793 11.211 11.659 12.14 12.52 12.63 12.397 12.019 11.593 11.156 10.72 10.293 9.875 9.529 9.192 8.881 8.606 8.346 8.087 7.851 7.631 7.384 7.163 6.979 6.783 6.57 6.399 6.222 6.043 5.901 5.745 5.594 5.441 5.284 5.174 5.051 4.875 4.754 4.615 4.542 4.389 4.23 4.076 3.99 3.65 3.696 3.601 3.501 3.285 3.164 3.027 2.871 2.725 2.521 2.254 1.812 -10 ,1146 ,KEBNE ,17022490,Wed Dec 22 06:00:38 CET,Wed Dec 22 07:25:40 CET,0.0 0.763 1.047 1.296 1.491 1.667 1.823 1.978 2.274 2.396 2.511 2.514 2.863 2.967 3.168 3.344 3.503 3.585 3.734 3.859 4.049 4.18 4.294 4.461 4.624 4.769 4.914 5.067 5.267 5.449 5.631 5.857 6.07 6.265 6.483 6.736 6.973 7.224 7.491 7.782 8.095 8.425 8.801 9.178 9.587 9.983 10.384 10.805 11.197 11.516 11.598 11.276 10.81 10.334 9.913 9.498 9.09 8.694 8.337 7.988 7.709 7.456 7.203 6.956 6.721 6.504 6.264 6.034 5.836 5.635 5.428 5.255 5.079 4.901 4.749 4.59 4.433 4.273 4.107 3.998 3.892 3.702 3.56 3.418 3.345 3.198 3.053 2.904 2.826 2.503 2.562 2.462 2.358 2.147 2.038 1.903 1.716 1.528 1.355 1.133 0.747 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_51_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_51_54.txt deleted file mode 100644 index d2f07d41..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_51_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32335 ,KEBNE ,17022491,Wed Dec 22 06:00:38 CET,Wed Dec 22 07:25:59 CET,0.0 0.96 1.358 1.705 1.986 2.194 2.389 2.549 2.797 2.897 2.998 2.984 3.314 3.395 3.544 3.679 3.809 3.886 4.033 4.152 4.311 4.41 4.514 4.672 4.806 4.941 5.093 5.251 5.431 5.578 5.724 5.909 6.07 6.207 6.372 6.562 6.734 6.908 7.079 7.236 7.382 7.527 7.669 7.797 7.888 7.922 7.915 7.824 7.613 7.09 5.92 4.353 3.005 1.726 0.554 -0.491 -1.358 -2.092 -2.715 -3.304 -3.787 -4.215 -4.63 -5.011 -5.367 -5.711 -6.057 -6.372 -6.665 -6.968 -7.27 -7.512 -7.783 -8.076 -8.286 -8.503 -8.727 -8.954 -9.214 -9.392 -9.573 -9.882 -10.094 -10.297 -10.401 -10.615 -10.838 -11.093 -11.231 -11.611 -11.667 -11.827 -12.001 -12.384 -12.599 -12.841 -13.098 -13.365 -13.72 -14.213 -16.453 -2 ,12937 ,KEBNE ,17022492,Wed Dec 22 06:01:39 CET,Wed Dec 22 07:27:17 CET,0.0 2.383 2.879 3.238 3.525 3.781 4.009 4.207 4.548 4.704 4.847 4.888 5.216 5.293 5.466 5.647 5.819 5.897 6.062 6.231 6.434 6.538 6.648 6.805 6.97 7.148 7.294 7.422 7.589 7.726 7.852 8.01 8.153 8.297 8.468 8.646 8.811 8.981 9.158 9.349 9.53 9.696 9.857 9.977 10.101 10.204 10.193 10.082 9.865 9.36 8.236 6.694 5.3 4.041 2.965 2.073 1.296 0.561 -0.112 -0.808 -1.408 -1.937 -2.416 -2.882 -3.32 -3.691 -4.079 -4.445 -4.772 -5.115 -5.473 -5.765 -6.047 -6.327 -6.555 -6.785 -7.006 -7.229 -7.481 -7.679 -7.889 -8.197 -8.414 -8.647 -8.762 -9.012 -9.269 -9.544 -9.711 -10.115 -10.179 -10.333 -10.494 -10.836 -11.023 -11.23 -11.469 -11.712 -11.964 -12.331 -13.61 -3 ,6096 ,KEBNE ,17022493,Wed Dec 22 06:02:41 CET,Wed Dec 22 07:29:52 CET,0.0 1.645 2.006 2.298 2.528 2.721 2.906 3.083 3.396 3.534 3.656 3.663 4.014 4.118 4.291 4.455 4.623 4.708 4.867 5.015 5.22 5.347 5.471 5.644 5.794 5.938 6.085 6.216 6.374 6.518 6.634 6.766 6.906 7.04 7.194 7.366 7.516 7.664 7.817 7.98 8.148 8.335 8.501 8.63 8.754 8.827 8.846 8.786 8.582 8.037 6.882 5.375 4.007 2.813 1.783 0.86 0.038 -0.695 -1.306 -1.929 -2.458 -2.938 -3.396 -3.824 -4.233 -4.607 -4.988 -5.337 -5.656 -5.984 -6.322 -6.603 -6.878 -7.144 -7.353 -7.58 -7.808 -8.042 -8.285 -8.445 -8.605 -8.88 -9.098 -9.321 -9.437 -9.678 -9.927 -10.192 -10.331 -10.715 -10.747 -10.881 -11.032 -11.436 -11.647 -11.843 -12.058 -12.302 -12.6 -13.047 -14.34 -4 ,31692 ,KEBNE ,17022494,Wed Dec 22 06:02:41 CET,Wed Dec 22 07:29:55 CET,0.0 1.492 1.806 2.085 2.346 2.561 2.734 2.894 3.192 3.318 3.432 3.425 3.748 3.841 4.019 4.204 4.382 4.468 4.625 4.751 4.928 5.048 5.167 5.336 5.49 5.633 5.765 5.876 6.014 6.15 6.287 6.459 6.61 6.739 6.885 7.041 7.183 7.333 7.503 7.669 7.829 7.993 8.146 8.254 8.312 8.365 8.373 8.245 7.91 7.309 6.088 4.489 3.135 1.946 0.897 -0.035 -0.875 -1.667 -2.346 -3.013 -3.576 -4.053 -4.503 -4.95 -5.362 -5.742 -6.151 -6.503 -6.802 -7.115 -7.446 -7.738 -8.038 -8.332 -8.557 -8.779 -8.998 -9.223 -9.478 -9.667 -9.856 -10.145 -10.336 -10.526 -10.622 -10.832 -11.099 -11.396 -11.533 -11.9 -11.906 -12.044 -12.193 -12.521 -12.693 -12.873 -13.098 -13.361 -13.696 -14.308 -16.375 -5 ,20638 ,KEBNE ,17022495,Wed Dec 22 06:03:42 CET,Wed Dec 22 07:31:23 CET,0.0 1.619 2.04 2.236 2.417 2.618 2.801 2.96 3.231 3.348 3.454 3.41 3.719 3.81 4.002 4.173 4.314 4.38 4.518 4.656 4.873 5.011 5.138 5.317 5.478 5.622 5.758 5.894 6.064 6.22 6.363 6.524 6.68 6.847 7.034 7.222 7.377 7.527 7.684 7.829 7.96 8.109 8.255 8.389 8.545 8.645 8.64 8.512 8.267 7.804 6.746 5.235 3.898 2.742 1.757 0.861 0.079 -0.635 -1.249 -1.844 -2.364 -2.82 -3.254 -3.686 -4.102 -4.493 -4.886 -5.23 -5.545 -5.887 -6.229 -6.502 -6.784 -7.069 -7.288 -7.504 -7.725 -7.964 -8.215 -8.399 -8.604 -8.935 -9.161 -9.395 -9.509 -9.736 -9.976 -10.222 -10.352 -10.731 -10.791 -10.95 -11.126 -11.507 -11.726 -11.971 -12.25 -12.551 -12.854 -13.278 -15.173 -6 ,16918 ,KEBNE ,17022496,Wed Dec 22 06:16:07 CET,Wed Dec 22 07:41:30 CET,0.0 1.987 2.487 2.8 3.028 3.195 3.329 3.473 3.742 3.851 3.95 3.905 4.226 4.33 4.518 4.679 4.824 4.897 5.043 5.179 5.367 5.489 5.609 5.772 5.91 6.055 6.205 6.334 6.5 6.67 6.851 7.043 7.183 7.304 7.436 7.558 7.66 7.783 7.911 8.044 8.207 8.362 8.507 8.614 8.702 8.805 8.83 8.744 8.474 7.919 6.814 5.257 3.871 2.618 1.513 0.523 -0.352 -1.129 -1.78 -2.444 -3.031 -3.541 -4.024 -4.467 -4.854 -5.21 -5.581 -5.908 -6.209 -6.533 -6.87 -7.158 -7.464 -7.795 -8.053 -8.305 -8.559 -8.817 -9.08 -9.268 -9.457 -9.739 -9.939 -10.149 -10.253 -10.459 -10.675 -10.917 -11.055 -11.432 -11.501 -11.661 -11.825 -12.187 -12.374 -12.556 -12.774 -12.994 -13.202 -13.547 -15.176 -7 ,32729 ,KEBNE ,17022497,Wed Dec 22 06:17:08 CET,Wed Dec 22 07:42:28 CET,0.0 2.168 2.55 2.856 3.103 3.325 3.497 3.653 3.944 4.079 4.205 4.188 4.52 4.626 4.843 5.057 5.239 5.314 5.443 5.583 5.801 5.941 6.071 6.242 6.409 6.582 6.735 6.862 7.034 7.209 7.369 7.542 7.692 7.821 7.955 8.095 8.226 8.381 8.541 8.703 8.893 9.086 9.252 9.416 9.537 9.608 9.609 9.475 9.203 8.612 7.496 6.091 4.747 3.514 2.464 1.543 0.75 0.049 -0.569 -1.19 -1.729 -2.203 -2.652 -3.08 -3.473 -3.833 -4.219 -4.566 -4.857 -5.166 -5.479 -5.726 -5.98 -6.251 -6.466 -6.694 -6.926 -7.156 -7.394 -7.565 -7.744 -8.024 -8.222 -8.433 -8.535 -8.726 -8.93 -9.141 -9.253 -9.612 -9.69 -9.864 -10.009 -10.303 -10.501 -10.729 -10.969 -11.244 -11.568 -12.11 -13.502 -8 ,29531 ,KEBNE ,17022498,Wed Dec 22 06:17:13 CET,Wed Dec 22 07:37:05 CET,0.0 2.36 2.704 2.93 3.118 3.303 3.47 3.623 3.893 4.005 4.123 4.105 4.438 4.541 4.727 4.907 5.071 5.145 5.282 5.414 5.599 5.711 5.817 5.972 6.151 6.315 6.447 6.579 6.76 6.928 7.073 7.228 7.368 7.494 7.639 7.813 7.983 8.165 8.346 8.509 8.647 8.773 8.879 8.965 9.056 9.087 9.036 8.869 8.569 8.002 6.809 5.249 3.9 2.786 1.802 0.855 0.014 -0.749 -1.391 -2.013 -2.553 -3.034 -3.491 -3.923 -4.339 -4.718 -5.098 -5.42 -5.704 -6.009 -6.317 -6.572 -6.83 -7.093 -7.295 -7.51 -7.736 -7.957 -8.184 -8.348 -8.512 -8.757 -8.927 -9.126 -9.228 -9.412 -9.622 -9.86 -9.979 -10.333 -10.355 -10.506 -10.65 -10.969 -11.163 -11.365 -11.584 -11.945 -12.383 -12.945 -13.871 -9 ,7694 ,KEBNE ,17022499,Wed Dec 22 06:18:12 CET,Wed Dec 22 07:39:31 CET,0.0 1.392 1.753 1.979 2.198 2.418 2.599 2.75 2.98 3.097 3.213 3.19 3.54 3.646 3.862 4.082 4.249 4.32 4.454 4.587 4.778 4.896 5.002 5.154 5.304 5.448 5.574 5.682 5.822 5.95 6.091 6.273 6.434 6.59 6.778 6.995 7.181 7.378 7.574 7.759 7.948 8.124 8.27 8.363 8.407 8.428 8.436 8.395 8.196 7.581 6.273 4.596 3.162 1.92 0.797 -0.195 -1.039 -1.81 -2.489 -3.156 -3.704 -4.205 -4.683 -5.117 -5.536 -5.933 -6.347 -6.698 -7.005 -7.342 -7.677 -7.951 -8.226 -8.503 -8.72 -8.941 -9.195 -9.475 -9.738 -9.916 -10.108 -10.408 -10.615 -10.824 -10.941 -11.195 -11.443 -11.667 -11.788 -12.156 -12.177 -12.325 -12.484 -12.832 -13.019 -13.214 -13.419 -13.696 -14.042 -14.391 -15.154 -10 ,3410 ,KEBNE ,17022500,Wed Dec 22 06:19:14 CET,Wed Dec 22 07:45:16 CET,0.0 1.594 2.019 2.372 2.62 2.812 3.002 3.184 3.501 3.664 3.81 3.809 4.149 4.264 4.49 4.686 4.86 4.946 5.106 5.259 5.479 5.618 5.744 5.901 6.052 6.21 6.352 6.489 6.656 6.8 6.957 7.15 7.324 7.477 7.642 7.818 7.982 8.152 8.313 8.463 8.606 8.748 8.861 8.932 8.962 8.93 8.839 8.718 8.489 7.855 6.59 4.958 3.569 2.349 1.296 0.409 -0.357 -1.051 -1.669 -2.304 -2.838 -3.318 -3.791 -4.236 -4.642 -5.001 -5.366 -5.696 -5.993 -6.305 -6.628 -6.885 -7.145 -7.43 -7.655 -7.896 -8.144 -8.376 -8.617 -8.787 -8.952 -9.2 -9.384 -9.579 -9.684 -9.909 -10.144 -10.393 -10.51 -10.87 -10.923 -11.077 -11.227 -11.565 -11.743 -11.928 -12.124 -12.331 -12.592 -13.141 -14.774 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_51_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_51_62.txt deleted file mode 100644 index d7c6fe95..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_51_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22722 ,KEBNE ,17045871,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:04:41 CET,0.0 0.526 0.829 1.07 1.288 1.484 1.669 1.841 2.162 2.319 2.477 2.535 2.899 3.036 3.275 3.49 3.703 3.815 4.044 4.26 4.57 4.771 4.971 5.268 5.55 5.822 6.1 6.37 6.712 7.055 7.391 7.781 8.157 8.526 8.936 9.39 9.826 10.321 10.87 11.453 12.073 12.785 13.602 14.4 15.365 16.452 17.711 19.163 20.843 22.811 25.215 27.157 28.265 28.99 29.459 29.729 29.901 30.02 30.062 30.055 30.037 29.964 29.846 29.715 29.556 29.394 29.227 29.103 29.006 28.892 28.766 28.662 28.568 28.477 28.393 28.295 28.183 28.043 27.88 27.766 27.656 27.47 27.331 27.192 27.122 26.984 26.838 26.688 26.607 26.303 26.333 26.25 26.157 25.934 25.817 25.716 25.62 25.479 25.303 25.098 24.758 -2 ,17695 ,KEBNE ,17045872,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:08:16 CET,0.0 0.716 1.023 1.272 1.466 1.631 1.786 1.939 2.244 2.389 2.532 2.612 2.984 3.113 3.379 3.635 3.866 3.982 4.215 4.435 4.759 4.969 5.159 5.427 5.688 5.949 6.205 6.463 6.794 7.097 7.39 7.749 8.086 8.418 8.823 9.274 9.698 10.163 10.68 11.237 11.859 12.585 13.42 14.262 15.24 16.339 17.607 18.998 20.62 22.566 24.871 26.789 27.87 28.53 28.966 29.244 29.406 29.489 29.553 29.572 29.524 29.452 29.342 29.226 29.117 28.992 28.872 28.776 28.684 28.583 28.471 28.381 28.263 28.132 28.041 27.924 27.799 27.673 27.539 27.451 27.354 27.195 27.086 26.978 26.924 26.807 26.665 26.515 26.438 26.145 26.204 26.117 26.021 25.832 25.746 25.65 25.536 25.407 25.262 24.858 23.395 -3 ,16280 ,KEBNE ,17045873,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:07:35 CET,0.0 0.802 1.214 1.514 1.76 1.984 2.165 2.344 2.691 2.851 3.004 3.049 3.415 3.556 3.831 4.1 4.347 4.458 4.672 4.883 5.192 5.39 5.581 5.873 6.158 6.429 6.683 6.937 7.272 7.577 7.865 8.216 8.563 8.908 9.314 9.78 10.226 10.699 11.214 11.785 12.415 13.1 13.871 14.703 15.666 16.701 17.939 19.35 20.991 22.963 25.385 27.358 28.47 29.158 29.585 29.841 29.984 30.073 30.12 30.146 30.112 30.031 29.951 29.872 29.784 29.679 29.559 29.41 29.271 29.139 28.968 28.82 28.674 28.508 28.365 28.233 28.1 27.956 27.803 27.697 27.596 27.413 27.278 27.146 27.071 26.917 26.781 26.655 26.59 26.305 26.338 26.245 26.155 25.967 25.852 25.721 25.598 25.477 25.314 25.102 24.624 -4 ,11851 ,KEBNE ,17045874,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:08:10 CET,0.0 0.52 0.811 1.052 1.278 1.474 1.654 1.826 2.14 2.293 2.435 2.483 2.852 2.987 3.261 3.516 3.741 3.849 4.067 4.275 4.576 4.776 4.971 5.256 5.534 5.803 6.058 6.311 6.648 6.971 7.287 7.691 8.063 8.397 8.782 9.217 9.645 10.131 10.681 11.266 11.867 12.546 13.331 14.117 15.05 16.104 17.353 18.772 20.432 22.375 24.63 26.409 27.428 28.06 28.439 28.615 28.681 28.702 28.687 28.605 28.496 28.413 28.322 28.19 28.047 27.937 27.837 27.742 27.652 27.547 27.432 27.335 27.229 27.114 27.026 26.932 26.832 26.727 26.613 26.536 26.451 26.322 26.224 26.117 26.062 25.946 25.826 25.7 25.632 25.354 25.399 25.313 25.224 25.058 24.96 24.836 24.706 24.571 24.402 24.139 23.549 -5 ,5735 ,KEBNE ,17045875,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:08:36 CET,0.0 0.624 1.054 1.303 1.514 1.695 1.88 2.048 2.355 2.519 2.668 2.697 3.043 3.167 3.403 3.63 3.854 3.966 4.174 4.375 4.662 4.843 5.022 5.286 5.547 5.803 6.058 6.312 6.63 6.93 7.23 7.607 7.97 8.322 8.729 9.165 9.591 10.071 10.602 11.167 11.76 12.424 13.208 14.02 14.96 16.031 17.272 18.656 20.288 22.198 24.559 26.559 27.721 28.391 28.772 29.033 29.204 29.286 29.281 29.249 29.221 29.181 29.13 29.065 28.991 28.913 28.783 28.647 28.553 28.457 28.346 28.259 28.156 28.04 27.95 27.857 27.755 27.621 27.463 27.349 27.239 27.084 26.98 26.871 26.815 26.711 26.602 26.48 26.418 26.145 26.216 26.127 26.028 25.812 25.682 25.538 25.404 25.244 25.036 24.744 24.345 -6 ,8202 ,KEBNE ,17045876,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:07:38 CET,0.0 0.87 1.263 1.529 1.752 1.975 2.166 2.337 2.673 2.823 2.963 2.993 3.363 3.507 3.779 4.048 4.299 4.414 4.636 4.854 5.183 5.399 5.604 5.886 6.149 6.408 6.655 6.893 7.202 7.509 7.821 8.195 8.559 8.908 9.305 9.761 10.204 10.697 11.227 11.788 12.392 13.08 13.864 14.655 15.598 16.638 17.862 19.276 20.903 22.816 25.214 27.18 28.324 29.059 29.514 29.816 29.989 30.045 30.053 30.033 29.922 29.795 29.717 29.649 29.565 29.484 29.397 29.306 29.234 29.16 29.049 28.941 28.829 28.711 28.624 28.535 28.432 28.323 28.192 28.096 27.995 27.842 27.737 27.62 27.567 27.457 27.327 27.191 27.127 26.851 26.918 26.828 26.724 26.529 26.418 26.298 26.164 26.005 25.84 25.634 25.242 -7 ,26427 ,KEBNE ,17045877,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:07:43 CET,0.0 0.397 0.723 0.985 1.187 1.386 1.575 1.758 2.068 2.214 2.36 2.401 2.767 2.905 3.163 3.41 3.659 3.773 3.994 4.215 4.531 4.729 4.926 5.227 5.51 5.784 6.045 6.296 6.623 6.947 7.266 7.647 8.011 8.368 8.786 9.266 9.723 10.2 10.729 11.289 11.868 12.53 13.306 14.138 15.13 16.184 17.397 18.784 20.382 22.26 24.677 26.732 27.912 28.633 29.054 29.309 29.46 29.555 29.596 29.585 29.554 29.516 29.447 29.363 29.248 29.133 29.038 28.962 28.882 28.744 28.583 28.458 28.324 28.189 28.092 27.98 27.856 27.737 27.585 27.471 27.357 27.178 27.053 26.924 26.853 26.695 26.536 26.366 26.281 25.992 26.057 25.971 25.873 25.663 25.556 25.441 25.316 25.186 25.018 24.778 24.448 -8 ,23780 ,KEBNE ,17045878,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:08:29 CET,0.0 0.728 1.129 1.453 1.704 1.92 2.118 2.295 2.606 2.757 2.917 3.006 3.39 3.536 3.813 4.064 4.302 4.418 4.642 4.848 5.142 5.341 5.554 5.865 6.157 6.444 6.719 6.982 7.327 7.654 7.975 8.362 8.72 9.066 9.481 9.952 10.403 10.915 11.451 12.009 12.605 13.29 14.084 14.892 15.831 16.886 18.129 19.508 21.164 23.163 25.565 27.529 28.658 29.343 29.786 30.07 30.237 30.328 30.342 30.303 30.262 30.212 30.149 30.07 29.976 29.906 29.836 29.763 29.675 29.553 29.445 29.348 29.208 29.074 28.978 28.88 28.778 28.663 28.539 28.457 28.369 28.241 28.149 28.045 27.997 27.892 27.767 27.638 27.57 27.289 27.358 27.286 27.2 27.002 26.902 26.812 26.716 26.605 26.488 26.319 25.929 -9 ,434 ,KEBNE ,17045879,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:09:01 CET,0.0 0.481 0.724 0.938 1.166 1.368 1.544 1.706 2.031 2.19 2.336 2.382 2.733 2.857 3.114 3.358 3.58 3.692 3.911 4.112 4.39 4.57 4.756 5.035 5.299 5.556 5.815 6.064 6.375 6.68 6.991 7.386 7.761 8.103 8.511 8.981 9.427 9.926 10.455 10.995 11.565 12.21 12.963 13.731 14.628 15.642 16.846 18.225 19.852 21.835 24.3 26.265 27.4 28.062 28.375 28.578 28.739 28.842 28.875 28.841 28.746 28.654 28.593 28.536 28.466 28.367 28.255 28.154 28.06 27.966 27.851 27.74 27.619 27.497 27.408 27.311 27.207 27.091 26.963 26.874 26.784 26.655 26.566 26.464 26.406 26.289 26.172 26.039 25.972 25.7 25.782 25.712 25.633 25.435 25.318 25.214 25.094 24.928 24.75 24.539 24.202 -10 ,27794 ,KEBNE ,17045880,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:08:57 CET,0.0 0.522 0.845 1.118 1.338 1.564 1.786 1.977 2.326 2.488 2.643 2.688 3.058 3.198 3.485 3.757 4.003 4.116 4.33 4.553 4.884 5.085 5.273 5.543 5.813 6.083 6.34 6.581 6.891 7.191 7.484 7.849 8.214 8.566 8.98 9.467 9.91 10.386 10.903 11.475 12.093 12.783 13.579 14.365 15.317 16.396 17.616 19.001 20.636 22.558 24.929 26.946 28.093 28.751 29.153 29.443 29.625 29.674 29.655 29.605 29.517 29.417 29.311 29.225 29.126 29.017 28.888 28.755 28.624 28.475 28.357 28.265 28.167 28.072 27.988 27.894 27.789 27.674 27.541 27.439 27.339 27.2 27.102 26.994 26.934 26.793 26.648 26.512 26.443 26.153 26.19 26.109 26.027 25.836 25.737 25.632 25.506 25.364 25.218 25.083 24.835 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_52_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_52_53.txt deleted file mode 100644 index ac21b8be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_52_53.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21742 ,KEBNE ,17022501,Wed Dec 22 06:19:18 CET,Wed Dec 22 07:38:46 CET,0.0 0.887 1.172 1.442 1.704 1.936 2.135 2.317 2.626 2.764 2.897 2.875 3.24 3.357 3.537 3.711 3.895 3.981 4.139 4.289 4.514 4.657 4.79 4.963 5.128 5.3 5.46 5.617 5.82 6.004 6.177 6.401 6.634 6.84 7.078 7.358 7.614 7.884 8.16 8.447 8.751 9.084 9.453 9.794 10.15 10.496 10.882 11.272 11.603 11.879 11.873 11.393 10.848 10.318 9.825 9.344 8.891 8.441 8.039 7.631 7.256 6.93 6.62 6.323 6.041 5.769 5.486 5.224 5.001 4.768 4.504 4.286 4.053 3.805 3.612 3.417 3.224 3.011 2.783 2.627 2.462 2.215 2.047 1.872 1.789 1.619 1.41 1.194 1.093 0.736 0.74 0.594 0.452 0.156 -0.019 -0.208 -0.435 -0.739 -1.075 -1.412 -2.806 -3 ,31326 ,KEBNE ,17022503,Wed Dec 22 06:20:21 CET,Wed Dec 22 07:39:13 CET,0.0 1.361 1.778 2.099 2.34 2.549 2.76 2.94 3.258 3.411 3.547 3.526 3.891 4.007 4.23 4.459 4.665 4.757 4.946 5.13 5.377 5.525 5.668 5.869 6.051 6.227 6.414 6.596 6.798 6.998 7.19 7.441 7.71 7.95 8.201 8.456 8.693 8.947 9.229 9.517 9.774 10.057 10.377 10.659 10.98 11.327 11.669 11.973 12.26 12.537 12.492 11.998 11.464 10.911 10.391 9.923 9.454 8.998 8.6 8.19 7.835 7.513 7.198 6.891 6.606 6.339 6.046 5.778 5.537 5.283 5.026 4.816 4.602 4.362 4.157 3.936 3.695 3.448 3.193 3.016 2.836 2.559 2.366 2.163 2.067 1.862 1.617 1.381 1.263 0.878 0.869 0.73 0.579 0.266 0.099 -0.087 -0.276 -0.489 -0.761 -1.116 -1.975 -4 ,11204 ,KEBNE ,17022504,Wed Dec 22 06:21:20 CET,Wed Dec 22 07:46:07 CET,0.0 0.812 1.041 1.251 1.453 1.655 1.814 1.93 2.158 2.271 2.385 2.358 2.72 2.816 3.005 3.195 3.365 3.448 3.608 3.739 3.921 4.05 4.183 4.383 4.568 4.743 4.904 5.05 5.243 5.431 5.611 5.809 6.001 6.181 6.407 6.688 6.917 7.157 7.431 7.705 7.981 8.277 8.629 8.979 9.351 9.707 10.042 10.323 10.512 10.557 10.404 9.964 9.398 8.833 8.307 7.811 7.349 6.907 6.51 6.111 5.769 5.465 5.171 4.887 4.605 4.323 4.035 3.783 3.559 3.319 3.057 2.84 2.607 2.364 2.174 1.976 1.77 1.553 1.31 1.135 0.962 0.688 0.493 0.299 0.197 -0.016 -0.25 -0.521 -0.649 -1.016 -1.026 -1.174 -1.323 -1.614 -1.793 -1.978 -2.159 -2.36 -2.638 -3.122 -4.277 -5 ,13356 ,KEBNE ,17022505,Wed Dec 22 06:21:23 CET,Wed Dec 22 07:43:56 CET,0.0 0.878 1.252 1.559 1.827 2.067 2.251 2.407 2.728 2.886 3.026 3.023 3.395 3.511 3.717 3.912 4.084 4.167 4.334 4.497 4.731 4.872 5.008 5.209 5.397 5.588 5.786 5.971 6.197 6.41 6.613 6.826 7.003 7.176 7.377 7.606 7.836 8.083 8.334 8.567 8.801 9.063 9.344 9.627 9.936 10.226 10.518 10.813 11.054 11.184 11.063 10.546 9.94 9.299 8.697 8.139 7.617 7.15 6.752 6.339 5.997 5.674 5.34 5.02 4.725 4.448 4.158 3.906 3.671 3.428 3.174 2.96 2.753 2.536 2.354 2.163 1.962 1.744 1.528 1.378 1.225 0.991 0.822 0.645 0.551 0.34 0.126 -0.095 -0.217 -0.595 -0.627 -0.782 -0.951 -1.328 -1.523 -1.722 -1.958 -2.24 -2.565 -2.948 -4.0 -6 ,20655 ,KEBNE ,17022506,Wed Dec 22 06:25:28 CET,Wed Dec 22 07:50:24 CET,0.0 1.732 2.17 2.473 2.733 2.963 3.18 3.384 3.731 3.881 4.017 4.011 4.39 4.514 4.748 4.957 5.144 5.229 5.4 5.566 5.805 5.951 6.076 6.25 6.44 6.61 6.749 6.909 7.135 7.343 7.544 7.777 7.989 8.186 8.407 8.656 8.898 9.155 9.395 9.626 9.853 10.064 10.31 10.575 10.884 11.192 11.497 11.764 11.97 12.07 11.903 11.409 10.757 10.11 9.553 9.034 8.547 8.082 7.663 7.208 6.798 6.453 6.108 5.745 5.419 5.14 4.85 4.605 4.39 4.149 3.892 3.67 3.43 3.193 3.003 2.803 2.61 2.405 2.174 2.011 1.848 1.59 1.403 1.198 1.092 0.879 0.65 0.41 0.283 -0.098 -0.135 -0.284 -0.424 -0.689 -0.851 -1.055 -1.258 -1.552 -1.989 -2.479 -5.063 -7 ,31132 ,KEBNE ,17022507,Wed Dec 22 06:27:33 CET,Wed Dec 22 07:51:49 CET,0.0 2.105 2.553 2.884 3.16 3.349 3.517 3.691 3.989 4.112 4.241 4.252 4.631 4.742 4.951 5.155 5.349 5.438 5.598 5.752 5.984 6.135 6.279 6.477 6.656 6.839 7.02 7.172 7.344 7.527 7.716 7.93 8.142 8.348 8.558 8.785 9.025 9.282 9.547 9.835 10.108 10.403 10.744 11.046 11.412 11.811 12.18 12.464 12.675 12.817 12.675 12.199 11.703 11.112 10.555 10.052 9.56 9.094 8.686 8.286 7.931 7.607 7.309 7.031 6.766 6.511 6.233 5.981 5.751 5.51 5.267 5.064 4.843 4.601 4.414 4.235 4.064 3.873 3.65 3.49 3.329 3.088 2.928 2.759 2.672 2.491 2.293 2.098 1.996 1.622 1.646 1.521 1.374 1.047 0.859 0.652 0.437 0.179 -0.115 -0.482 -1.259 -8 ,31512 ,KEBNE ,17022508,Wed Dec 22 06:27:32 CET,Wed Dec 22 07:53:17 CET,0.0 1.195 1.509 1.762 1.993 2.193 2.358 2.515 2.798 2.926 3.043 2.991 3.34 3.433 3.613 3.786 3.949 4.04 4.217 4.372 4.593 4.737 4.863 5.048 5.236 5.399 5.543 5.69 5.884 6.067 6.25 6.463 6.654 6.85 7.086 7.33 7.546 7.779 8.038 8.307 8.557 8.806 9.081 9.331 9.63 9.989 10.368 10.675 10.924 11.044 10.804 10.23 9.59 8.947 8.345 7.756 7.211 6.725 6.314 5.866 5.472 5.122 4.766 4.418 4.101 3.804 3.485 3.202 2.954 2.702 2.438 2.21 1.981 1.747 1.554 1.357 1.16 0.959 0.743 0.585 0.424 0.168 -0.025 -0.221 -0.314 -0.503 -0.702 -0.907 -1.016 -1.379 -1.392 -1.534 -1.687 -2.022 -2.209 -2.415 -2.64 -2.889 -3.152 -3.5 -4.626 -9 ,17391 ,KEBNE ,17022509,Wed Dec 22 06:27:33 CET,Wed Dec 22 07:52:01 CET,0.0 0.867 1.21 1.518 1.766 1.972 2.169 2.321 2.6 2.733 2.851 2.833 3.211 3.331 3.549 3.75 3.923 4.009 4.191 4.365 4.602 4.757 4.911 5.133 5.331 5.517 5.692 5.847 6.041 6.228 6.407 6.614 6.813 7.004 7.218 7.48 7.748 8.02 8.285 8.552 8.818 9.094 9.378 9.647 9.963 10.283 10.585 10.856 11.114 11.258 11.098 10.558 9.945 9.353 8.805 8.256 7.736 7.28 6.872 6.433 6.044 5.695 5.372 5.063 4.773 4.51 4.229 3.973 3.748 3.531 3.302 3.093 2.855 2.611 2.437 2.25 2.04 1.817 1.597 1.432 1.253 0.996 0.829 0.657 0.563 0.341 0.1 -0.121 -0.239 -0.628 -0.636 -0.766 -0.905 -1.246 -1.439 -1.637 -1.847 -2.112 -2.483 -3.06 -4.606 -10 ,11352 ,KEBNE ,17022510,Wed Dec 22 06:27:32 CET,Wed Dec 22 07:52:51 CET,0.0 1.264 1.704 2.038 2.284 2.503 2.712 2.894 3.212 3.356 3.501 3.535 3.908 4.028 4.246 4.444 4.633 4.729 4.915 5.09 5.351 5.517 5.666 5.876 6.082 6.268 6.455 6.649 6.885 7.112 7.319 7.55 7.77 7.983 8.225 8.497 8.766 9.045 9.321 9.607 9.902 10.259 10.679 11.054 11.459 11.908 12.394 12.856 13.348 13.856 14.171 14.032 13.698 13.281 12.786 12.27 11.802 11.378 10.986 10.58 10.241 9.92 9.609 9.325 9.06 8.802 8.533 8.295 8.083 7.86 7.619 7.419 7.209 6.991 6.847 6.703 6.531 6.336 6.134 5.998 5.848 5.608 5.436 5.25 5.153 4.97 4.806 4.617 4.508 4.148 4.151 3.999 3.821 3.435 3.253 3.105 2.926 2.725 2.483 2.187 1.79 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_53_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_53_54.txt deleted file mode 100644 index de9a38de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_53_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11719 ,TETRA ,17524945,Wed Nov 24 23:38:24 CET,Thu Nov 25 01:25:40 CET,0.0 1.107 1.366 1.577 1.755 1.917 2.071 2.215 2.466 2.571 2.681 2.631 2.985 3.079 3.251 3.423 3.583 3.654 3.802 3.941 4.127 4.26 4.4 4.593 4.764 4.941 5.12 5.293 5.515 5.734 5.941 6.174 6.399 6.618 6.874 7.155 7.434 7.743 8.069 8.426 8.807 9.235 9.741 10.233 10.787 11.408 12.11 12.893 13.802 14.785 15.841 16.533 16.808 16.877 16.801 16.662 16.522 16.382 16.223 16.03 15.837 15.663 15.501 15.327 15.147 14.967 14.778 14.609 14.464 14.317 14.154 14.022 13.889 13.727 13.589 13.457 13.313 13.151 12.992 12.886 12.763 12.569 12.442 12.311 12.247 12.117 11.97 11.827 11.751 11.424 11.489 11.376 11.259 11.046 10.923 10.775 10.635 10.502 10.268 9.941 9.208 -2 ,16773 ,TETRA ,17524948,Wed Nov 24 23:38:28 CET,Thu Nov 25 01:27:08 CET,0.0 1.855 2.122 2.331 2.558 2.748 2.887 3.023 3.28 3.411 3.537 3.515 3.861 3.96 4.137 4.29 4.436 4.509 4.651 4.794 5.0 5.127 5.256 5.435 5.605 5.779 5.939 6.096 6.314 6.524 6.723 6.96 7.186 7.402 7.647 7.913 8.175 8.474 8.796 9.127 9.473 9.887 10.358 10.826 11.41 12.053 12.745 13.532 14.41 15.271 16.168 16.787 17.029 17.107 17.094 17.015 16.889 16.721 16.549 16.353 16.186 16.047 15.913 15.773 15.624 15.487 15.354 15.22 15.082 14.943 14.815 14.707 14.591 14.452 14.332 14.222 14.104 13.967 13.823 13.719 13.615 13.463 13.35 13.228 13.165 13.034 12.905 12.775 12.704 12.389 12.453 12.359 12.266 12.061 11.942 11.818 11.684 11.538 11.358 11.127 8.647 -3 ,19993 ,TETRA ,17524950,Wed Nov 24 23:38:30 CET,Thu Nov 25 01:25:28 CET,0.0 0.546 0.827 1.089 1.328 1.511 1.668 1.802 2.038 2.129 2.215 2.166 2.495 2.583 2.761 2.926 3.076 3.146 3.275 3.4 3.581 3.702 3.824 4.001 4.175 4.352 4.534 4.692 4.878 5.076 5.277 5.505 5.702 5.903 6.151 6.416 6.669 6.947 7.265 7.599 7.945 8.338 8.774 9.223 9.772 10.378 11.056 11.766 12.561 13.495 14.539 15.231 15.489 15.549 15.505 15.39 15.247 15.093 14.941 14.781 14.632 14.482 14.34 14.198 14.038 13.884 13.723 13.576 13.454 13.319 13.175 13.049 12.911 12.766 12.656 12.552 12.447 12.329 12.196 12.103 12.001 11.841 11.732 11.618 11.56 11.436 11.299 11.147 11.059 10.734 10.804 10.716 10.619 10.364 10.219 10.079 9.937 9.818 9.667 9.485 8.853 -4 ,13450 ,TETRA ,17524952,Wed Nov 24 23:38:29 CET,Thu Nov 25 01:26:48 CET,0.0 0.631 0.915 1.117 1.285 1.441 1.581 1.707 1.915 2.013 2.119 2.059 2.409 2.51 2.698 2.872 3.031 3.111 3.266 3.415 3.62 3.748 3.871 4.042 4.211 4.367 4.524 4.678 4.88 5.084 5.285 5.525 5.746 5.967 6.22 6.501 6.765 7.052 7.358 7.676 8.029 8.437 8.941 9.455 10.028 10.664 11.368 12.152 13.073 14.091 15.21 15.932 16.204 16.288 16.29 16.229 16.121 15.998 15.869 15.707 15.536 15.369 15.216 15.074 14.938 14.797 14.635 14.475 14.325 14.181 14.044 13.929 13.793 13.651 13.545 13.424 13.292 13.161 13.018 12.925 12.831 12.662 12.544 12.418 12.352 12.215 12.07 11.923 11.851 11.53 11.593 11.506 11.415 11.202 11.078 10.945 10.796 10.615 10.414 10.158 9.699 -5 ,31157 ,TETRA ,17524953,Wed Nov 24 23:38:30 CET,Thu Nov 25 01:27:19 CET,0.0 1.0 1.291 1.552 1.736 1.873 2.003 2.136 2.376 2.491 2.607 2.555 2.9 2.991 3.155 3.297 3.439 3.513 3.661 3.815 4.048 4.202 4.342 4.53 4.715 4.904 5.084 5.252 5.464 5.669 5.873 6.122 6.36 6.598 6.893 7.228 7.532 7.842 8.179 8.56 8.957 9.369 9.853 10.366 10.968 11.623 12.347 13.14 14.068 15.084 16.198 16.992 17.355 17.495 17.468 17.382 17.263 17.121 16.989 16.845 16.697 16.546 16.394 16.245 16.077 15.92 15.765 15.614 15.481 15.342 15.192 15.06 14.925 14.777 14.653 14.517 14.377 14.232 14.083 13.969 13.844 13.64 13.494 13.35 13.267 13.1 12.929 12.748 12.656 12.312 12.374 12.27 12.162 11.92 11.787 11.629 11.45 11.264 11.027 10.718 10.262 -6 ,26379 ,TETRA ,17524955,Wed Nov 24 23:38:31 CET,Thu Nov 25 01:28:08 CET,0.0 0.679 0.923 1.089 1.266 1.438 1.578 1.689 1.9 2.009 2.116 2.053 2.398 2.489 2.65 2.804 2.956 3.033 3.179 3.316 3.522 3.655 3.779 3.949 4.108 4.276 4.451 4.618 4.83 5.033 5.233 5.478 5.73 5.968 6.23 6.522 6.797 7.11 7.431 7.769 8.134 8.557 9.065 9.558 10.109 10.726 11.446 12.241 13.123 14.089 15.187 15.974 16.324 16.419 16.391 16.338 16.233 16.09 15.932 15.764 15.617 15.453 15.284 15.136 15.001 14.862 14.714 14.588 14.476 14.35 14.213 14.095 13.965 13.816 13.697 13.585 13.474 13.346 13.202 13.1 12.982 12.806 12.691 12.573 12.511 12.373 12.243 12.097 12.014 11.703 11.769 11.679 11.587 11.375 11.236 11.09 10.962 10.805 10.597 10.336 9.529 -7 ,2034 ,TETRA ,17524957,Wed Nov 24 23:38:30 CET,Thu Nov 25 01:27:38 CET,0.0 0.374 0.625 0.834 1.014 1.17 1.328 1.467 1.717 1.827 1.936 1.898 2.255 2.348 2.528 2.699 2.862 2.947 3.104 3.263 3.491 3.626 3.754 3.935 4.117 4.305 4.488 4.666 4.888 5.092 5.294 5.548 5.784 6.006 6.268 6.564 6.846 7.158 7.496 7.859 8.242 8.659 9.128 9.589 10.133 10.738 11.409 12.165 13.003 13.902 14.96 15.746 16.041 16.086 16.046 15.975 15.843 15.694 15.542 15.354 15.182 15.016 14.835 14.656 14.484 14.329 14.147 13.982 13.866 13.737 13.594 13.475 13.347 13.203 13.089 12.962 12.828 12.694 12.543 12.446 12.348 12.175 12.062 11.948 11.88 11.74 11.595 11.417 11.323 10.997 11.05 10.963 10.879 10.68 10.568 10.45 10.322 10.194 9.994 9.681 8.721 -8 ,12370 ,TETRA ,17524959,Wed Nov 24 23:38:30 CET,Thu Nov 25 01:27:27 CET,0.0 0.988 1.287 1.509 1.673 1.816 1.949 2.064 2.278 2.383 2.48 2.434 2.797 2.896 3.085 3.274 3.445 3.52 3.67 3.813 4.013 4.15 4.291 4.511 4.722 4.903 5.071 5.23 5.437 5.625 5.806 6.04 6.269 6.501 6.763 7.05 7.347 7.676 8.022 8.409 8.801 9.212 9.684 10.159 10.711 11.322 12.032 12.831 13.735 14.733 15.785 16.496 16.774 16.822 16.781 16.695 16.553 16.369 16.205 16.011 15.822 15.644 15.464 15.285 15.117 14.962 14.792 14.637 14.495 14.338 14.185 14.068 13.937 13.795 13.672 13.538 13.413 13.284 13.143 13.05 12.956 12.797 12.692 12.585 12.526 12.4 12.243 12.08 11.997 11.667 11.734 11.628 11.508 11.273 11.155 11.027 10.902 10.762 10.595 10.368 9.478 -9 ,21789 ,TETRA ,17524961,Wed Nov 24 23:38:30 CET,Thu Nov 25 01:29:29 CET,0.0 0.625 0.917 1.115 1.291 1.447 1.589 1.726 1.998 2.122 2.241 2.198 2.55 2.655 2.853 3.017 3.19 3.28 3.451 3.611 3.835 3.976 4.11 4.315 4.51 4.696 4.886 5.064 5.283 5.504 5.722 5.991 6.261 6.527 6.827 7.166 7.487 7.838 8.221 8.631 9.061 9.53 10.078 10.601 11.21 11.918 12.737 13.607 14.533 15.558 16.706 17.445 17.691 17.716 17.645 17.501 17.311 17.121 16.924 16.7 16.504 16.304 16.089 15.896 15.714 15.542 15.358 15.184 15.033 14.868 14.679 14.508 14.33 14.144 14.002 13.86 13.715 13.565 13.402 13.286 13.162 12.957 12.813 12.665 12.586 12.434 12.278 12.09 11.997 11.662 11.715 11.615 11.508 11.267 11.115 10.946 10.769 10.587 10.391 10.09 8.544 -10 ,16222 ,TETRA ,17524963,Wed Nov 24 23:38:32 CET,Thu Nov 25 01:26:50 CET,0.0 0.624 0.916 1.184 1.356 1.511 1.661 1.8 2.046 2.15 2.255 2.186 2.533 2.629 2.801 2.97 3.128 3.199 3.336 3.479 3.697 3.843 3.982 4.195 4.407 4.592 4.767 4.934 5.152 5.362 5.561 5.803 6.027 6.243 6.494 6.782 7.061 7.344 7.663 8.02 8.379 8.792 9.308 9.816 10.381 10.998 11.691 12.467 13.362 14.355 15.421 16.11 16.335 16.379 16.344 16.252 16.117 15.934 15.737 15.537 15.373 15.213 15.044 14.865 14.679 14.518 14.357 14.21 14.086 13.946 13.785 13.648 13.499 13.342 13.225 13.106 12.979 12.843 12.691 12.586 12.474 12.283 12.146 12.016 11.951 11.807 11.632 11.449 11.367 11.044 11.082 10.961 10.839 10.589 10.462 10.331 10.184 10.012 9.777 9.483 8.866 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_53_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_53_58.txt deleted file mode 100644 index 7839cc9f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_53_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11620 ,TETRA ,17524966,Wed Nov 24 23:39:23 CET,Thu Nov 25 01:28:14 CET,0.0 2.974 3.54 3.906 4.201 4.458 4.699 4.939 5.36 5.557 5.738 5.817 6.225 6.372 6.642 6.899 7.137 7.26 7.512 7.746 8.089 8.309 8.535 8.878 9.179 9.45 9.728 10.002 10.352 10.679 10.994 11.387 11.754 12.111 12.538 13.02 13.485 13.995 14.552 15.152 15.768 16.46 17.245 18.021 18.981 20.089 21.397 22.865 24.521 26.516 28.867 30.601 31.557 32.159 32.539 32.754 32.854 32.85 32.787 32.709 32.626 32.53 32.419 32.302 32.195 32.078 31.931 31.785 31.665 31.559 31.451 31.352 31.235 31.106 31.001 30.885 30.769 30.642 30.503 30.415 30.327 30.187 30.078 29.974 29.921 29.783 29.636 29.495 29.416 29.091 29.159 29.058 28.952 28.731 28.6 28.436 28.263 28.114 27.961 27.768 27.245 -2 ,20443 ,TETRA ,17524968,Wed Nov 24 23:38:26 CET,Thu Nov 25 01:26:50 CET,0.0 1.343 1.795 2.17 2.506 2.783 3.029 3.247 3.643 3.829 4.003 4.1 4.502 4.663 4.977 5.271 5.535 5.657 5.9 6.121 6.436 6.647 6.855 7.181 7.509 7.812 8.09 8.364 8.745 9.116 9.449 9.85 10.24 10.613 11.038 11.513 11.97 12.467 13.002 13.582 14.214 14.921 15.717 16.527 17.497 18.525 19.732 21.146 22.777 24.721 27.089 29.012 30.043 30.613 30.979 31.211 31.298 31.309 31.3 31.261 31.214 31.164 31.088 30.995 30.895 30.793 30.669 30.546 30.433 30.316 30.194 30.08 29.953 29.818 29.712 29.602 29.491 29.379 29.254 29.166 29.069 28.909 28.796 28.686 28.633 28.52 28.396 28.255 28.177 27.871 27.95 27.869 27.782 27.575 27.461 27.337 27.212 27.053 26.881 26.62 25.709 -3 ,30162 ,TETRA ,17524970,Wed Nov 24 23:39:22 CET,Thu Nov 25 01:27:30 CET,0.0 1.236 1.689 2.09 2.431 2.735 3.027 3.282 3.66 3.834 4.011 4.099 4.486 4.633 4.917 5.182 5.437 5.563 5.803 6.042 6.4 6.627 6.834 7.137 7.447 7.753 8.035 8.291 8.616 8.922 9.225 9.611 9.994 10.365 10.781 11.237 11.665 12.169 12.739 13.31 13.899 14.566 15.377 16.205 17.153 18.189 19.392 20.79 22.416 24.357 26.674 28.606 29.723 30.36 30.762 31.052 31.262 31.387 31.44 31.443 31.428 31.383 31.32 31.254 31.173 31.071 30.939 30.826 30.745 30.658 30.545 30.442 30.34 30.225 30.123 30.017 29.915 29.799 29.683 29.599 29.497 29.332 29.229 29.127 29.071 28.967 28.854 28.722 28.656 28.354 28.428 28.347 28.268 28.108 27.997 27.866 27.73 27.584 27.425 27.22 26.744 -4 ,1204 ,TETRA ,17524972,Wed Nov 24 23:40:25 CET,Thu Nov 25 01:29:24 CET,0.0 1.529 2.006 2.408 2.757 3.032 3.274 3.502 3.95 4.163 4.367 4.471 4.886 5.046 5.349 5.643 5.925 6.054 6.314 6.572 6.909 7.118 7.337 7.658 7.95 8.239 8.524 8.806 9.167 9.495 9.814 10.21 10.599 10.974 11.413 11.897 12.354 12.874 13.439 14.039 14.662 15.347 16.168 17.009 17.984 19.068 20.297 21.686 23.397 25.449 27.839 29.777 30.887 31.533 31.912 32.15 32.255 32.311 32.364 32.355 32.324 32.309 32.249 32.187 32.12 32.039 31.954 31.87 31.791 31.706 31.621 31.551 31.475 31.396 31.313 31.21 31.118 31.025 30.9 30.796 30.692 30.553 30.454 30.338 30.28 30.157 30.039 29.908 29.835 29.533 29.608 29.521 29.418 29.187 29.07 28.934 28.806 28.681 28.499 28.248 27.513 -5 ,871 ,TETRA ,17524974,Wed Nov 24 23:39:24 CET,Thu Nov 25 01:30:19 CET,0.0 1.553 2.052 2.452 2.784 3.08 3.346 3.555 3.91 4.095 4.285 4.385 4.799 4.951 5.23 5.493 5.752 5.888 6.158 6.411 6.737 6.941 7.149 7.446 7.743 8.036 8.306 8.563 8.903 9.241 9.562 9.946 10.32 10.69 11.138 11.646 12.111 12.598 13.132 13.72 14.345 15.062 15.9 16.736 17.724 18.804 20.012 21.399 23.077 25.021 27.342 29.279 30.382 31.034 31.463 31.775 31.96 32.079 32.148 32.157 32.138 32.133 32.109 32.069 32.037 31.993 31.938 31.878 31.814 31.74 31.661 31.581 31.497 31.418 31.357 31.296 31.226 31.133 31.039 30.978 30.909 30.809 30.74 30.66 30.618 30.528 30.434 30.329 30.266 29.974 30.068 30.007 29.939 29.746 29.631 29.529 29.419 29.267 29.076 28.845 28.202 -6 ,18103 ,TETRA ,17524976,Wed Nov 24 23:39:24 CET,Thu Nov 25 01:29:38 CET,0.0 1.704 2.125 2.46 2.777 3.05 3.3 3.525 3.915 4.083 4.246 4.321 4.718 4.88 5.192 5.459 5.711 5.831 6.047 6.255 6.556 6.76 6.97 7.273 7.566 7.83 8.081 8.338 8.665 8.967 9.272 9.656 10.025 10.383 10.794 11.253 11.709 12.221 12.761 13.327 13.903 14.571 15.393 16.201 17.127 18.189 19.428 20.855 22.518 24.454 26.845 28.825 29.982 30.712 31.217 31.571 31.79 31.933 31.996 32.041 32.071 32.035 31.939 31.83 31.731 31.644 31.531 31.407 31.297 31.196 31.111 31.038 30.933 30.798 30.691 30.584 30.486 30.381 30.248 30.154 30.063 29.911 29.801 29.696 29.641 29.526 29.391 29.25 29.186 28.884 28.953 28.863 28.773 28.572 28.472 28.363 28.231 28.068 27.866 27.576 26.834 -7 ,13168 ,TETRA ,17524978,Wed Nov 24 23:39:24 CET,Thu Nov 25 01:27:48 CET,0.0 1.557 2.129 2.608 2.98 3.246 3.468 3.693 4.109 4.314 4.512 4.603 5.018 5.19 5.508 5.797 6.062 6.182 6.423 6.667 7.022 7.25 7.468 7.789 8.094 8.388 8.667 8.928 9.265 9.598 9.915 10.294 10.675 11.04 11.46 11.951 12.444 12.977 13.541 14.142 14.747 15.424 16.24 17.07 18.044 19.13 20.407 21.828 23.466 25.426 27.836 29.804 30.869 31.477 31.844 32.094 32.263 32.359 32.41 32.42 32.401 32.375 32.36 32.344 32.308 32.259 32.206 32.161 32.108 32.046 31.977 31.918 31.862 31.782 31.718 31.652 31.578 31.504 31.417 31.346 31.27 31.153 31.071 30.988 30.943 30.846 30.742 30.622 30.555 30.263 30.385 30.311 30.231 30.035 29.912 29.785 29.651 29.51 29.344 29.114 28.302 -8 ,28844 ,TETRA ,17524980,Wed Nov 24 23:40:26 CET,Thu Nov 25 01:28:22 CET,0.0 1.516 1.968 2.369 2.686 2.935 3.185 3.408 3.794 3.979 4.17 4.274 4.684 4.827 5.121 5.396 5.645 5.765 6.013 6.256 6.593 6.822 7.054 7.363 7.641 7.909 8.182 8.457 8.807 9.152 9.496 9.911 10.3 10.67 11.088 11.562 12.032 12.552 13.111 13.692 14.305 15.023 15.852 16.689 17.68 18.76 20.008 21.45 23.175 25.191 27.485 29.289 30.329 30.951 31.316 31.527 31.628 31.664 31.667 31.641 31.606 31.561 31.507 31.432 31.313 31.207 31.117 31.03 30.942 30.815 30.672 30.563 30.455 30.352 30.256 30.146 30.032 29.924 29.804 29.713 29.621 29.486 29.388 29.286 29.241 29.133 29.005 28.864 28.792 28.478 28.549 28.454 28.338 28.093 27.975 27.848 27.718 27.569 27.351 27.106 26.357 -9 ,25551 ,TETRA ,17524982,Wed Nov 24 23:40:26 CET,Thu Nov 25 01:32:21 CET,0.0 1.751 2.228 2.623 2.957 3.257 3.527 3.783 4.221 4.415 4.615 4.732 5.151 5.312 5.636 5.941 6.236 6.366 6.612 6.852 7.208 7.44 7.656 7.981 8.306 8.626 8.926 9.2 9.546 9.884 10.216 10.633 11.044 11.416 11.846 12.325 12.772 13.282 13.85 14.432 15.056 15.779 16.581 17.364 18.28 19.364 20.646 22.106 23.852 25.837 28.181 30.079 31.095 31.711 32.091 32.33 32.471 32.548 32.585 32.582 32.561 32.526 32.476 32.424 32.357 32.287 32.189 32.091 31.996 31.887 31.786 31.7 31.609 31.512 31.434 31.347 31.246 31.131 31.02 30.952 30.867 30.719 30.631 30.544 30.5 30.404 30.29 30.184 30.124 29.825 29.92 29.844 29.763 29.596 29.501 29.375 29.225 29.042 28.867 28.664 27.915 -10 ,30147 ,TETRA ,17524985,Wed Nov 24 23:40:27 CET,Thu Nov 25 01:28:03 CET,0.0 1.962 2.53 2.93 3.245 3.495 3.705 3.936 4.374 4.556 4.73 4.801 5.198 5.346 5.663 5.95 6.211 6.345 6.615 6.872 7.242 7.477 7.686 7.994 8.295 8.58 8.852 9.114 9.468 9.802 10.132 10.551 10.938 11.3 11.728 12.226 12.686 13.17 13.701 14.259 14.856 15.551 16.354 17.155 18.117 19.215 20.488 21.915 23.606 25.668 28.198 30.224 31.379 32.107 32.587 32.899 33.081 33.189 33.249 33.284 33.282 33.249 33.203 33.163 33.12 33.069 33.016 32.958 32.874 32.767 32.661 32.581 32.498 32.406 32.326 32.245 32.163 32.074 31.978 31.9 31.825 31.724 31.639 31.536 31.49 31.39 31.277 31.172 31.11 30.808 30.868 30.791 30.721 30.565 30.484 30.364 30.223 30.078 29.9 29.698 28.971 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_56_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_56_57.txt deleted file mode 100644 index 39f9ef57..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_56_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7204 ,KEBNE ,17022511,Wed Dec 22 06:27:32 CET,Wed Dec 22 07:53:59 CET,0.0 0.524 0.84 1.113 1.356 1.545 1.71 1.879 2.175 2.303 2.431 2.455 2.797 2.919 3.157 3.385 3.605 3.713 3.913 4.099 4.378 4.565 4.75 5.017 5.27 5.513 5.753 5.994 6.297 6.589 6.886 7.249 7.601 7.934 8.301 8.694 9.063 9.48 9.952 10.446 10.953 11.52 12.165 12.79 13.477 14.224 15.104 16.019 17.002 18.152 19.424 20.257 20.523 20.501 20.373 20.16 19.903 19.644 19.381 19.087 18.817 18.575 18.321 18.056 17.804 17.571 17.313 17.078 16.88 16.657 16.417 16.23 16.053 15.87 15.715 15.532 15.334 15.13 14.923 14.794 14.669 14.483 14.341 14.169 14.086 13.932 13.756 13.573 13.477 13.164 13.175 13.076 12.966 12.714 12.579 12.444 12.297 12.089 11.837 11.524 10.956 -2 ,7621 ,KEBNE ,17022512,Wed Dec 22 06:27:37 CET,Wed Dec 22 07:48:52 CET,0.0 0.514 0.842 1.116 1.34 1.544 1.732 1.91 2.282 2.442 2.581 2.61 2.97 3.112 3.382 3.627 3.844 3.944 4.164 4.39 4.695 4.889 5.075 5.327 5.581 5.832 6.059 6.279 6.572 6.864 7.145 7.482 7.785 8.062 8.399 8.778 9.146 9.55 9.968 10.409 10.879 11.401 12.009 12.629 13.349 14.153 15.044 15.971 17.039 18.256 19.542 20.295 20.469 20.432 20.316 20.101 19.85 19.584 19.333 19.054 18.754 18.465 18.204 17.961 17.727 17.505 17.261 17.036 16.837 16.625 16.395 16.2 16.004 15.814 15.666 15.499 15.316 15.126 14.936 14.801 14.657 14.432 14.273 14.1 14.01 13.823 13.629 13.408 13.289 12.952 12.918 12.791 12.654 12.374 12.235 12.07 11.89 11.687 11.419 11.078 10.474 -3 ,2245 ,KEBNE ,17022513,Wed Dec 22 06:28:35 CET,Wed Dec 22 07:55:58 CET,0.0 0.843 1.144 1.394 1.6 1.791 1.961 2.112 2.421 2.583 2.737 2.779 3.133 3.253 3.474 3.689 3.904 4.012 4.211 4.384 4.62 4.776 4.934 5.169 5.392 5.604 5.827 6.052 6.335 6.599 6.849 7.161 7.452 7.736 8.073 8.453 8.804 9.179 9.597 10.034 10.473 10.965 11.562 12.171 12.857 13.624 14.495 15.391 16.381 17.545 18.773 19.562 19.825 19.794 19.683 19.547 19.365 19.144 18.93 18.659 18.375 18.137 17.919 17.698 17.501 17.336 17.154 16.957 16.782 16.608 16.418 16.266 16.115 15.932 15.786 15.644 15.489 15.32 15.146 15.023 14.885 14.664 14.5 14.338 14.267 14.11 13.921 13.734 13.647 13.342 13.347 13.232 13.117 12.89 12.77 12.631 12.474 12.287 12.065 11.779 11.187 -4 ,21025 ,KEBNE ,17022514,Wed Dec 22 06:28:35 CET,Wed Dec 22 07:56:15 CET,0.0 0.977 1.28 1.531 1.751 1.971 2.174 2.367 2.75 2.91 3.061 3.111 3.455 3.577 3.827 4.058 4.275 4.38 4.577 4.772 5.078 5.275 5.463 5.732 5.992 6.264 6.519 6.75 7.044 7.333 7.626 7.972 8.285 8.587 8.936 9.318 9.677 10.061 10.466 10.871 11.307 11.806 12.4 13.003 13.686 14.46 15.365 16.317 17.334 18.454 19.651 20.425 20.64 20.578 20.411 20.195 19.947 19.661 19.4 19.111 18.835 18.582 18.324 18.068 17.808 17.551 17.279 17.029 16.809 16.589 16.352 16.146 15.929 15.695 15.51 15.326 15.145 14.945 14.719 14.565 14.42 14.195 14.033 13.865 13.775 13.59 13.415 13.236 13.129 12.8 12.779 12.647 12.511 12.206 12.026 11.831 11.636 11.441 11.207 10.954 10.543 -5 ,2677 ,KEBNE ,17022515,Wed Dec 22 06:28:35 CET,Wed Dec 22 07:55:30 CET,0.0 0.386 0.623 0.84 1.075 1.281 1.464 1.631 1.948 2.092 2.233 2.27 2.608 2.728 2.978 3.207 3.403 3.503 3.72 3.927 4.21 4.393 4.58 4.844 5.095 5.345 5.572 5.789 6.077 6.338 6.582 6.893 7.195 7.476 7.817 8.191 8.546 8.949 9.363 9.781 10.237 10.764 11.351 11.93 12.615 13.407 14.275 15.18 16.193 17.367 18.635 19.496 19.837 19.86 19.758 19.577 19.332 19.051 18.784 18.509 18.256 18.015 17.782 17.561 17.356 17.146 16.916 16.727 16.547 16.336 16.14 15.967 15.761 15.561 15.404 15.244 15.079 14.89 14.691 14.546 14.392 14.169 14.021 13.862 13.772 13.576 13.381 13.179 13.068 12.744 12.719 12.588 12.453 12.145 11.98 11.809 11.624 11.44 11.184 10.813 10.201 -6 ,24484 ,KEBNE ,17022516,Wed Dec 22 06:28:35 CET,Wed Dec 22 07:56:20 CET,0.0 0.608 0.974 1.236 1.485 1.707 1.887 2.056 2.381 2.528 2.673 2.722 3.066 3.188 3.435 3.676 3.898 4.001 4.206 4.41 4.699 4.89 5.079 5.349 5.621 5.887 6.13 6.349 6.648 6.959 7.258 7.587 7.875 8.152 8.479 8.857 9.208 9.581 9.989 10.424 10.891 11.41 11.988 12.564 13.244 13.998 14.841 15.762 16.779 17.885 19.103 19.878 20.112 20.092 19.929 19.653 19.399 19.181 18.944 18.676 18.411 18.16 17.93 17.725 17.533 17.334 17.109 16.887 16.667 16.429 16.197 16.005 15.799 15.586 15.429 15.264 15.088 14.905 14.699 14.558 14.42 14.205 14.047 13.871 13.783 13.61 13.422 13.219 13.111 12.768 12.697 12.559 12.428 12.128 11.966 11.804 11.638 11.455 11.227 10.916 10.276 -7 ,18566 ,KEBNE ,17022517,Wed Dec 22 06:29:39 CET,Wed Dec 22 07:56:58 CET,0.0 0.401 0.619 0.821 1.03 1.252 1.448 1.605 1.924 2.085 2.232 2.252 2.59 2.707 2.921 3.121 3.328 3.43 3.627 3.81 4.065 4.243 4.421 4.664 4.899 5.129 5.357 5.579 5.866 6.149 6.418 6.738 7.052 7.356 7.69 8.052 8.404 8.814 9.265 9.726 10.205 10.736 11.368 12.002 12.721 13.474 14.277 15.189 16.269 17.407 18.6 19.384 19.711 19.753 19.599 19.354 19.091 18.838 18.611 18.351 18.089 17.837 17.596 17.37 17.131 16.894 16.647 16.429 16.245 16.054 15.838 15.652 15.466 15.255 15.088 14.923 14.756 14.587 14.393 14.254 14.126 13.915 13.759 13.593 13.514 13.376 13.229 13.055 12.965 12.66 12.646 12.506 12.366 12.092 11.943 11.779 11.589 11.365 11.092 10.786 10.195 -8 ,16374 ,KEBNE ,17022518,Wed Dec 22 06:29:39 CET,Wed Dec 22 07:55:40 CET,0.0 0.633 0.921 1.149 1.351 1.548 1.74 1.907 2.213 2.36 2.502 2.548 2.89 3.001 3.23 3.439 3.649 3.753 3.94 4.118 4.371 4.535 4.705 4.952 5.174 5.39 5.6 5.803 6.059 6.31 6.557 6.851 7.138 7.423 7.746 8.085 8.416 8.802 9.217 9.645 10.089 10.591 11.171 11.748 12.434 13.202 14.059 14.972 15.969 17.093 18.333 19.079 19.286 19.264 19.172 19.011 18.762 18.497 18.26 17.991 17.735 17.498 17.276 17.056 16.829 16.622 16.398 16.195 16.022 15.845 15.662 15.499 15.316 15.122 14.967 14.799 14.617 14.431 14.249 14.116 13.978 13.775 13.627 13.47 13.404 13.262 13.09 12.902 12.803 12.498 12.498 12.388 12.276 12.018 11.882 11.742 11.588 11.414 11.231 10.924 10.156 -9 ,18383 ,KEBNE ,17022519,Wed Dec 22 06:30:42 CET,Wed Dec 22 07:56:34 CET,0.0 0.363 0.656 0.877 1.083 1.291 1.456 1.595 1.86 1.987 2.108 2.135 2.479 2.59 2.809 3.013 3.194 3.292 3.483 3.659 3.934 4.101 4.25 4.477 4.704 4.917 5.12 5.31 5.561 5.815 6.061 6.365 6.655 6.944 7.293 7.663 8.004 8.394 8.829 9.291 9.764 10.289 10.892 11.485 12.184 12.947 13.772 14.695 15.747 16.914 18.16 18.99 19.321 19.341 19.218 19.041 18.865 18.693 18.512 18.298 18.091 17.888 17.682 17.47 17.254 17.049 16.831 16.644 16.483 16.312 16.126 15.978 15.829 15.674 15.539 15.389 15.234 15.075 14.899 14.776 14.653 14.469 14.331 14.183 14.111 13.945 13.771 13.6 13.514 13.21 13.197 13.076 12.948 12.674 12.535 12.389 12.225 12.049 11.856 11.588 11.136 -10 ,18124 ,KEBNE ,17022520,Wed Dec 22 06:30:42 CET,Wed Dec 22 07:57:02 CET,0.0 0.803 1.154 1.398 1.641 1.854 2.043 2.225 2.566 2.716 2.839 2.863 3.204 3.326 3.58 3.822 4.033 4.135 4.348 4.561 4.854 5.034 5.212 5.473 5.737 6.005 6.252 6.474 6.755 7.026 7.303 7.643 7.958 8.244 8.563 8.948 9.34 9.756 10.215 10.71 11.185 11.694 12.276 12.876 13.615 14.411 15.271 16.214 17.248 18.33 19.509 20.311 20.587 20.602 20.497 20.327 20.083 19.809 19.564 19.286 19.027 18.787 18.545 18.287 18.03 17.808 17.564 17.342 17.165 16.975 16.763 16.581 16.379 16.169 16.022 15.872 15.709 15.527 15.328 15.199 15.079 14.899 14.778 14.653 14.583 14.435 14.278 14.116 14.034 13.733 13.749 13.646 13.534 13.288 13.138 12.971 12.773 12.555 12.314 12.006 11.36 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_56_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_56_58.txt deleted file mode 100644 index 93d8361a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_56_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29950 ,KEBNE ,17022521,Wed Dec 22 06:30:42 CET,Wed Dec 22 07:57:05 CET,0.0 1.617 2.065 2.375 2.604 2.814 3.006 3.201 3.595 3.79 3.969 4.054 4.423 4.563 4.824 5.057 5.285 5.395 5.615 5.828 6.141 6.344 6.519 6.752 6.979 7.191 7.376 7.568 7.84 8.089 8.321 8.6 8.853 9.081 9.333 9.599 9.856 10.187 10.527 10.846 11.156 11.49 11.879 12.202 12.495 12.785 13.034 13.179 13.234 13.073 12.4 11.221 10.022 8.935 7.964 7.026 6.217 5.499 4.84 4.178 3.637 3.154 2.678 2.236 1.821 1.426 1.017 0.658 0.364 0.057 -0.271 -0.538 -0.826 -1.122 -1.35 -1.592 -1.835 -2.082 -2.343 -2.52 -2.692 -2.955 -3.15 -3.356 -3.467 -3.703 -3.945 -4.197 -4.322 -4.68 -4.709 -4.845 -4.997 -5.347 -5.524 -5.711 -5.919 -6.163 -6.457 -6.842 -7.843 -2 ,25132 ,KEBNE ,17022522,Wed Dec 22 06:30:42 CET,Wed Dec 22 07:59:22 CET,0.0 1.086 1.558 1.91 2.194 2.459 2.685 2.901 3.308 3.493 3.644 3.646 4.004 4.129 4.361 4.601 4.835 4.943 5.137 5.322 5.587 5.76 5.947 6.231 6.497 6.741 6.966 7.178 7.426 7.645 7.863 8.142 8.424 8.7 8.988 9.295 9.575 9.872 10.193 10.499 10.788 11.117 11.481 11.778 12.089 12.386 12.64 12.852 12.969 12.855 12.202 11.013 9.865 8.831 7.927 7.098 6.327 5.615 4.962 4.311 3.783 3.295 2.814 2.367 1.964 1.585 1.16 0.777 0.463 0.15 -0.187 -0.485 -0.773 -1.067 -1.306 -1.545 -1.791 -2.045 -2.292 -2.462 -2.649 -2.959 -3.188 -3.42 -3.529 -3.755 -3.994 -4.232 -4.355 -4.725 -4.76 -4.901 -5.051 -5.359 -5.519 -5.707 -5.93 -6.209 -6.512 -6.885 -8.958 -3 ,21957 ,KEBNE ,17022523,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:59:25 CET,0.0 0.956 1.406 1.758 2.088 2.372 2.601 2.816 3.223 3.403 3.556 3.583 3.92 4.043 4.296 4.538 4.76 4.86 5.068 5.276 5.568 5.74 5.885 6.092 6.285 6.471 6.646 6.82 7.055 7.267 7.476 7.714 7.935 8.147 8.371 8.602 8.814 9.046 9.283 9.531 9.774 10.024 10.316 10.592 10.853 11.079 11.284 11.406 11.368 11.025 10.137 8.867 7.677 6.609 5.641 4.729 3.958 3.266 2.655 2.051 1.535 1.067 0.615 0.188 -0.218 -0.585 -0.987 -1.354 -1.656 -1.962 -2.288 -2.572 -2.863 -3.162 -3.397 -3.637 -3.881 -4.125 -4.377 -4.548 -4.724 -5.013 -5.223 -5.453 -5.568 -5.81 -6.067 -6.329 -6.46 -6.82 -6.842 -6.979 -7.125 -7.444 -7.604 -7.771 -7.964 -8.187 -8.46 -8.827 -9.818 -4 ,26086 ,KEBNE ,17022524,Wed Dec 22 06:31:45 CET,Wed Dec 22 07:59:42 CET,0.0 1.62 1.941 2.212 2.469 2.692 2.902 3.113 3.509 3.685 3.842 3.927 4.294 4.431 4.703 4.923 5.139 5.25 5.446 5.637 5.905 6.07 6.256 6.529 6.749 6.95 7.152 7.362 7.616 7.838 8.062 8.32 8.559 8.787 9.029 9.284 9.528 9.748 9.964 10.228 10.497 10.778 11.084 11.391 11.693 11.91 12.138 12.305 12.281 12.002 11.191 9.915 8.767 7.704 6.782 5.971 5.237 4.577 3.998 3.4 2.885 2.435 1.993 1.576 1.183 0.827 0.473 0.151 -0.129 -0.435 -0.741 -0.976 -1.236 -1.514 -1.746 -1.983 -2.209 -2.447 -2.725 -2.922 -3.1 -3.36 -3.551 -3.763 -3.869 -4.079 -4.298 -4.528 -4.65 -5.011 -5.05 -5.188 -5.349 -5.705 -5.893 -6.085 -6.268 -6.475 -6.77 -7.138 -8.411 -5 ,916 ,KEBNE ,17022525,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:58:05 CET,0.0 1.9 2.404 2.763 3.027 3.287 3.542 3.755 4.134 4.321 4.509 4.629 5.005 5.146 5.41 5.643 5.873 5.985 6.18 6.386 6.723 6.916 7.086 7.326 7.552 7.784 8.02 8.235 8.479 8.708 8.938 9.238 9.514 9.735 9.968 10.237 10.499 10.753 11.021 11.291 11.575 11.881 12.183 12.451 12.688 12.9 13.121 13.277 13.271 13.044 12.305 11.045 9.866 8.794 7.815 6.93 6.138 5.383 4.733 4.103 3.572 3.079 2.599 2.146 1.714 1.327 0.913 0.548 0.253 -0.051 -0.371 -0.638 -0.926 -1.225 -1.45 -1.689 -1.937 -2.178 -2.419 -2.589 -2.765 -3.031 -3.227 -3.439 -3.546 -3.776 -4.016 -4.269 -4.397 -4.761 -4.815 -4.961 -5.12 -5.501 -5.705 -5.902 -6.108 -6.356 -6.611 -6.963 -7.591 -6 ,4718 ,KEBNE ,17022526,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:58:17 CET,0.0 2.165 2.662 2.964 3.235 3.502 3.748 3.968 4.355 4.516 4.664 4.716 5.072 5.202 5.427 5.639 5.835 5.919 6.09 6.272 6.53 6.701 6.861 7.072 7.274 7.474 7.664 7.833 8.053 8.262 8.464 8.707 8.913 9.103 9.327 9.578 9.828 10.107 10.381 10.646 10.885 11.128 11.432 11.73 12.037 12.31 12.512 12.646 12.727 12.583 11.942 10.775 9.613 8.554 7.644 6.813 6.056 5.343 4.714 4.091 3.552 3.061 2.594 2.139 1.704 1.319 0.935 0.602 0.313 0.008 -0.31 -0.567 -0.841 -1.143 -1.374 -1.597 -1.825 -2.058 -2.305 -2.49 -2.676 -2.95 -3.134 -3.327 -3.428 -3.647 -3.883 -4.129 -4.257 -4.622 -4.651 -4.798 -4.962 -5.3 -5.463 -5.645 -5.86 -6.114 -6.419 -6.796 -7.717 -7 ,20414 ,KEBNE ,17022527,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:57:37 CET,0.0 2.025 2.563 2.952 3.288 3.578 3.835 4.07 4.48 4.671 4.847 4.965 5.362 5.523 5.822 6.121 6.388 6.509 6.752 6.99 7.302 7.486 7.662 7.912 8.163 8.422 8.65 8.83 9.075 9.33 9.557 9.827 10.079 10.311 10.576 10.85 11.107 11.394 11.672 11.942 12.21 12.482 12.792 13.09 13.35 13.583 13.788 13.926 13.929 13.66 12.895 11.736 10.6 9.524 8.596 7.758 7.028 6.362 5.746 5.148 4.662 4.217 3.796 3.405 3.042 2.708 2.351 2.032 1.768 1.49 1.193 0.933 0.668 0.399 0.178 -0.042 -0.264 -0.495 -0.745 -0.918 -1.087 -1.369 -1.564 -1.751 -1.853 -2.073 -2.299 -2.529 -2.646 -2.993 -3.01 -3.139 -3.27 -3.558 -3.73 -3.928 -4.149 -4.363 -4.578 -4.901 -5.711 -8 ,30537 ,KEBNE ,17022528,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:57:15 CET,0.0 1.718 2.28 2.69 2.956 3.205 3.444 3.669 4.053 4.225 4.385 4.453 4.812 4.937 5.166 5.383 5.591 5.685 5.866 6.053 6.34 6.512 6.67 6.891 7.102 7.308 7.508 7.709 7.944 8.161 8.381 8.623 8.844 9.045 9.261 9.496 9.71 9.934 10.16 10.428 10.737 11.02 11.269 11.489 11.741 11.987 12.192 12.35 12.376 12.1 11.298 10.13 9.004 7.924 6.963 6.118 5.403 4.736 4.124 3.479 2.937 2.484 2.048 1.636 1.245 0.884 0.526 0.214 -0.059 -0.354 -0.686 -0.953 -1.212 -1.494 -1.724 -1.968 -2.23 -2.496 -2.746 -2.912 -3.091 -3.356 -3.529 -3.709 -3.8 -3.984 -4.182 -4.387 -4.499 -4.848 -4.866 -4.999 -5.133 -5.453 -5.639 -5.84 -6.075 -6.332 -6.605 -6.94 -7.799 -9 ,6737 ,KEBNE ,17022529,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:57:39 CET,0.0 2.408 3.071 3.504 3.813 4.057 4.297 4.505 4.883 5.083 5.257 5.334 5.695 5.814 6.056 6.287 6.513 6.621 6.834 7.039 7.329 7.524 7.712 7.956 8.187 8.409 8.613 8.819 9.077 9.323 9.55 9.805 10.071 10.321 10.564 10.83 11.103 11.392 11.721 12.046 12.312 12.564 12.823 13.061 13.348 13.665 13.921 14.107 14.23 14.122 13.445 12.188 10.993 9.965 9.008 8.057 7.223 6.502 5.866 5.214 4.67 4.172 3.694 3.227 2.762 2.369 1.995 1.646 1.336 1.017 0.682 0.42 0.159 -0.115 -0.335 -0.553 -0.755 -0.976 -1.219 -1.4 -1.586 -1.869 -2.064 -2.261 -2.357 -2.541 -2.741 -2.963 -3.083 -3.428 -3.435 -3.564 -3.711 -4.034 -4.214 -4.409 -4.623 -4.846 -5.106 -5.488 -6.659 -10 ,8758 ,KEBNE ,17022530,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:59:09 CET,0.0 2.164 2.686 3.074 3.372 3.636 3.871 4.078 4.412 4.558 4.701 4.796 5.178 5.32 5.571 5.814 6.04 6.142 6.326 6.491 6.722 6.867 7.016 7.235 7.444 7.635 7.8 7.964 8.181 8.366 8.54 8.748 8.948 9.144 9.372 9.625 9.872 10.11 10.336 10.579 10.815 11.074 11.399 11.679 11.917 12.125 12.322 12.48 12.466 12.21 11.408 10.094 8.902 7.811 6.835 5.981 5.208 4.521 3.94 3.347 2.839 2.365 1.927 1.527 1.144 0.785 0.388 0.033 -0.253 -0.539 -0.854 -1.112 -1.365 -1.637 -1.854 -2.06 -2.262 -2.485 -2.721 -2.888 -3.055 -3.315 -3.507 -3.706 -3.811 -4.028 -4.244 -4.474 -4.591 -4.944 -4.995 -5.131 -5.273 -5.582 -5.756 -5.949 -6.151 -6.385 -6.657 -6.998 -15.648 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_57_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_57_42.txt deleted file mode 100644 index 412a7e1e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_57_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6892 ,KEBNE ,17045881,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:09:41 CET,0.0 1.025 1.358 1.59 1.791 1.977 2.148 2.318 2.608 2.73 2.85 2.848 3.168 3.267 3.424 3.532 3.631 3.687 3.783 3.861 3.98 4.052 4.123 4.235 4.337 4.444 4.545 4.627 4.72 4.8 4.872 4.974 5.047 5.103 5.187 5.284 5.377 5.443 5.475 5.49 5.495 5.486 5.449 5.408 5.307 5.045 4.627 4.129 3.379 2.157 -0.058 -2.775 -4.941 -6.712 -8.213 -9.547 -10.645 -11.615 -12.442 -13.264 -13.985 -14.613 -15.194 -15.733 -16.232 -16.689 -17.17 -17.596 -17.962 -18.345 -18.75 -19.085 -19.419 -19.765 -20.031 -20.301 -20.602 -20.92 -21.237 -21.44 -21.664 -22.022 -22.241 -22.472 -22.593 -22.85 -23.131 -23.42 -23.566 -23.958 -24.047 -24.207 -24.386 -24.814 -25.042 -25.27 -25.51 -25.822 -26.182 -26.65 -28.623 -2 ,28326 ,KEBNE ,17045882,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:09:07 CET,0.0 0.779 1.017 1.204 1.343 1.465 1.576 1.671 1.849 1.936 2.008 1.915 2.19 2.25 2.353 2.438 2.508 2.54 2.602 2.663 2.751 2.803 2.848 2.92 3.005 3.07 3.121 3.173 3.239 3.29 3.328 3.37 3.402 3.422 3.438 3.465 3.485 3.501 3.504 3.486 3.468 3.411 3.264 3.095 2.887 2.573 2.101 1.442 0.483 -0.956 -3.284 -6.006 -8.218 -10.071 -11.636 -12.987 -14.145 -15.159 -16.01 -16.855 -17.592 -18.252 -18.868 -19.452 -19.973 -20.457 -20.957 -21.369 -21.735 -22.149 -22.588 -22.941 -23.285 -23.633 -23.908 -24.179 -24.451 -24.741 -25.057 -25.29 -25.513 -25.848 -26.098 -26.371 -26.512 -26.785 -27.062 -27.372 -27.542 -27.953 -28.047 -28.214 -28.406 -28.815 -29.041 -29.297 -29.552 -29.865 -30.287 -30.84 -32.19 -3 ,15542 ,KEBNE ,17045883,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:08:39 CET,0.0 0.574 0.799 0.959 1.103 1.213 1.307 1.388 1.552 1.636 1.711 1.629 1.901 1.96 2.058 2.158 2.252 2.293 2.387 2.474 2.587 2.657 2.726 2.814 2.879 2.936 2.989 3.051 3.126 3.175 3.226 3.286 3.33 3.36 3.375 3.375 3.37 3.372 3.365 3.337 3.291 3.209 3.092 2.952 2.739 2.437 2.02 1.411 0.496 -0.931 -3.299 -6.044 -8.239 -10.105 -11.715 -13.103 -14.274 -15.305 -16.191 -17.079 -17.831 -18.468 -19.054 -19.609 -20.118 -20.578 -21.054 -21.493 -21.874 -22.252 -22.635 -22.954 -23.296 -23.663 -23.93 -24.219 -24.55 -24.894 -25.253 -25.493 -25.742 -26.155 -26.428 -26.707 -26.853 -27.148 -27.46 -27.779 -27.943 -28.356 -28.515 -28.727 -28.939 -29.41 -29.695 -30.014 -30.367 -30.775 -31.273 -31.894 -33.761 -4 ,23275 ,KEBNE ,17045884,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:07:04 CET,0.0 0.754 1.037 1.209 1.354 1.504 1.646 1.766 1.986 2.092 2.178 2.1 2.384 2.461 2.597 2.719 2.824 2.875 2.977 3.074 3.209 3.292 3.371 3.48 3.576 3.667 3.763 3.855 3.951 4.036 4.105 4.178 4.245 4.305 4.366 4.42 4.478 4.55 4.606 4.674 4.74 4.756 4.738 4.679 4.539 4.302 3.918 3.313 2.371 0.931 -1.426 -4.215 -6.431 -8.267 -9.812 -11.135 -12.274 -13.304 -14.178 -15.043 -15.773 -16.408 -17.007 -17.569 -18.102 -18.594 -19.089 -19.523 -19.9 -20.294 -20.703 -21.048 -21.414 -21.76 -22.014 -22.297 -22.613 -22.939 -23.265 -23.488 -23.709 -24.074 -24.34 -24.604 -24.742 -25.041 -25.331 -25.631 -25.8 -26.205 -26.315 -26.486 -26.662 -27.075 -27.315 -27.593 -27.89 -28.18 -28.511 -29.016 -30.47 -5 ,5871 ,KEBNE ,17045885,Thu Dec 23 05:42:34 CET,Thu Dec 23 07:06:56 CET,0.0 0.511 0.781 1.027 1.201 1.331 1.444 1.565 1.801 1.9 1.98 1.908 2.192 2.259 2.373 2.471 2.564 2.613 2.705 2.794 2.912 2.987 3.067 3.176 3.277 3.374 3.465 3.549 3.652 3.742 3.827 3.907 3.968 4.034 4.105 4.166 4.215 4.269 4.318 4.333 4.325 4.302 4.264 4.207 4.084 3.835 3.404 2.787 1.878 0.505 -1.849 -4.641 -6.89 -8.733 -10.266 -11.614 -12.749 -13.745 -14.589 -15.407 -16.103 -16.705 -17.291 -17.866 -18.399 -18.87 -19.351 -19.779 -20.145 -20.522 -20.929 -21.275 -21.623 -21.968 -22.233 -22.525 -22.822 -23.119 -23.428 -23.644 -23.859 -24.186 -24.435 -24.698 -24.824 -25.077 -25.361 -25.681 -25.839 -26.247 -26.406 -26.593 -26.768 -27.181 -27.424 -27.684 -27.979 -28.269 -28.636 -29.184 -30.559 -6 ,14897 ,KEBNE ,17045886,Thu Dec 23 05:45:39 CET,Thu Dec 23 07:12:31 CET,0.0 0.716 0.922 1.084 1.237 1.339 1.422 1.494 1.654 1.742 1.809 1.702 1.98 2.037 2.133 2.231 2.319 2.359 2.435 2.504 2.602 2.651 2.689 2.757 2.832 2.892 2.934 2.977 3.036 3.082 3.114 3.159 3.209 3.238 3.261 3.288 3.301 3.303 3.294 3.277 3.241 3.155 3.036 2.917 2.732 2.448 2.056 1.498 0.627 -0.737 -3.077 -5.866 -8.069 -9.9 -11.43 -12.749 -13.905 -14.912 -15.762 -16.632 -17.373 -18.014 -18.607 -19.155 -19.673 -20.137 -20.613 -21.058 -21.449 -21.85 -22.267 -22.6 -22.927 -23.255 -23.509 -23.791 -24.084 -24.368 -24.655 -24.859 -25.086 -25.433 -25.667 -25.916 -26.05 -26.33 -26.609 -26.892 -27.036 -27.424 -27.51 -27.686 -27.859 -28.25 -28.479 -28.739 -29.023 -29.33 -29.762 -30.354 -31.68 -7 ,29587 ,KEBNE ,17045887,Thu Dec 23 05:45:39 CET,Thu Dec 23 07:11:54 CET,0.0 0.662 0.942 1.117 1.246 1.362 1.453 1.533 1.693 1.761 1.818 1.714 1.979 2.028 2.131 2.221 2.306 2.347 2.421 2.5 2.605 2.667 2.728 2.808 2.88 2.956 3.029 3.079 3.129 3.173 3.225 3.281 3.323 3.356 3.395 3.45 3.488 3.507 3.503 3.485 3.451 3.388 3.274 3.133 2.924 2.612 2.176 1.544 0.618 -0.78 -3.092 -5.795 -8.013 -9.878 -11.407 -12.72 -13.849 -14.886 -15.761 -16.594 -17.317 -17.975 -18.575 -19.135 -19.68 -20.157 -20.639 -21.08 -21.47 -21.853 -22.261 -22.615 -22.97 -23.356 -23.648 -23.937 -24.222 -24.497 -24.8 -25.025 -25.253 -25.588 -25.816 -26.06 -26.192 -26.445 -26.718 -27.009 -27.157 -27.549 -27.656 -27.837 -28.018 -28.4 -28.614 -28.87 -29.163 -29.465 -29.845 -30.382 -31.816 -8 ,23840 ,KEBNE ,17045888,Thu Dec 23 05:45:39 CET,Thu Dec 23 07:11:48 CET,0.0 0.599 0.828 0.988 1.157 1.294 1.398 1.483 1.638 1.718 1.792 1.707 1.996 2.072 2.213 2.335 2.432 2.476 2.566 2.66 2.779 2.847 2.917 3.012 3.095 3.174 3.255 3.341 3.442 3.536 3.628 3.738 3.82 3.889 3.971 4.057 4.107 4.138 4.187 4.226 4.218 4.135 4.043 3.94 3.729 3.521 3.188 2.564 1.677 0.42 -1.746 -4.407 -6.611 -8.473 -10.049 -11.415 -12.564 -13.568 -14.417 -15.279 -16.025 -16.676 -17.271 -17.841 -18.384 -18.854 -19.34 -19.802 -20.188 -20.56 -20.975 -21.321 -21.65 -21.993 -22.269 -22.552 -22.851 -23.163 -23.478 -23.702 -23.947 -24.305 -24.53 -24.771 -24.896 -25.154 -25.431 -25.734 -25.893 -26.288 -26.406 -26.595 -26.794 -27.224 -27.457 -27.71 -27.973 -28.25 -28.62 -29.2 -30.77 -9 ,32698 ,KEBNE ,17045889,Thu Dec 23 05:45:39 CET,Thu Dec 23 07:11:27 CET,0.0 0.564 0.78 0.969 1.12 1.248 1.367 1.478 1.661 1.734 1.805 1.715 1.985 2.05 2.176 2.276 2.377 2.421 2.499 2.58 2.693 2.751 2.804 2.874 2.953 3.039 3.106 3.17 3.262 3.357 3.441 3.534 3.633 3.71 3.78 3.857 3.916 3.969 3.998 4.027 4.056 4.053 4.039 3.966 3.81 3.541 3.098 2.536 1.691 0.348 -1.827 -4.355 -6.48 -8.261 -9.706 -10.962 -12.03 -12.968 -13.822 -14.678 -15.39 -16.036 -16.646 -17.198 -17.699 -18.169 -18.673 -19.113 -19.48 -19.864 -20.258 -20.598 -20.959 -21.309 -21.58 -21.856 -22.138 -22.439 -22.736 -22.941 -23.158 -23.503 -23.749 -24.015 -24.146 -24.398 -24.679 -24.984 -25.147 -25.562 -25.689 -25.851 -26.02 -26.428 -26.646 -26.895 -27.167 -27.505 -27.942 -28.487 -30.04 -10 ,7807 ,KEBNE ,17045890,Thu Dec 23 05:45:39 CET,Thu Dec 23 07:12:07 CET,0.0 0.418 0.593 0.769 0.916 1.048 1.168 1.265 1.43 1.499 1.561 1.464 1.721 1.773 1.889 1.991 2.098 2.152 2.246 2.32 2.416 2.486 2.56 2.679 2.792 2.879 2.958 3.041 3.129 3.188 3.258 3.351 3.426 3.487 3.544 3.602 3.656 3.692 3.737 3.794 3.83 3.827 3.774 3.668 3.51 3.319 2.992 2.479 1.695 0.414 -1.793 -4.337 -6.421 -8.221 -9.752 -11.066 -12.196 -13.187 -14.014 -14.877 -15.614 -16.246 -16.844 -17.405 -17.931 -18.398 -18.871 -19.301 -19.698 -20.096 -20.509 -20.866 -21.212 -21.565 -21.852 -22.159 -22.476 -22.776 -23.088 -23.303 -23.528 -23.874 -24.091 -24.343 -24.476 -24.729 -24.999 -25.269 -25.409 -25.804 -25.889 -26.076 -26.278 -26.673 -26.883 -27.173 -27.564 -28.035 -28.626 -29.393 -31.596 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_60_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_60_37.txt deleted file mode 100644 index c7e94afe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_60_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18283 ,KEBNE ,17022531,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:56:59 CET,0.0 0.915 1.271 1.56 1.777 1.95 2.117 2.282 2.581 2.713 2.831 2.814 3.159 3.262 3.464 3.644 3.805 3.885 4.05 4.202 4.403 4.539 4.666 4.846 5.02 5.182 5.326 5.445 5.612 5.806 6.01 6.223 6.37 6.499 6.657 6.832 7.003 7.212 7.435 7.628 7.774 7.936 8.115 8.275 8.391 8.42 8.41 8.327 8.107 7.492 6.12 4.34 2.801 1.516 0.435 -0.538 -1.392 -2.155 -2.804 -3.448 -4.017 -4.558 -5.074 -5.524 -5.936 -6.323 -6.713 -7.063 -7.356 -7.64 -7.924 -8.158 -8.408 -8.679 -8.894 -9.125 -9.365 -9.605 -9.847 -10.016 -10.182 -10.434 -10.618 -10.824 -10.931 -11.15 -11.357 -11.557 -11.664 -12.018 -12.045 -12.188 -12.345 -12.718 -12.9 -13.094 -13.298 -13.51 -13.77 -14.116 -15.484 -2 ,15621 ,KEBNE ,17022532,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:56:56 CET,0.0 0.878 1.079 1.205 1.335 1.464 1.577 1.681 1.879 1.966 2.046 1.98 2.303 2.378 2.505 2.639 2.759 2.816 2.949 3.065 3.222 3.326 3.414 3.527 3.645 3.77 3.897 4.021 4.154 4.28 4.426 4.625 4.803 4.957 5.156 5.381 5.573 5.769 5.99 6.222 6.44 6.626 6.826 7.037 7.237 7.407 7.508 7.47 7.169 6.558 5.403 3.851 2.463 1.208 0.089 -0.929 -1.771 -2.527 -3.2 -3.865 -4.43 -4.921 -5.403 -5.853 -6.254 -6.626 -7.014 -7.37 -7.67 -7.985 -8.31 -8.559 -8.824 -9.105 -9.321 -9.547 -9.792 -10.033 -10.275 -10.451 -10.631 -10.907 -11.095 -11.291 -11.387 -11.577 -11.792 -12.019 -12.133 -12.498 -12.488 -12.618 -12.764 -13.057 -13.206 -13.382 -13.593 -13.818 -14.057 -14.361 -15.423 -3 ,27809 ,KEBNE ,17022533,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:57:27 CET,0.0 0.613 0.884 1.106 1.313 1.494 1.64 1.776 2.054 2.177 2.304 2.333 2.683 2.786 2.977 3.147 3.313 3.398 3.557 3.701 3.902 4.038 4.167 4.343 4.516 4.672 4.815 4.963 5.152 5.326 5.466 5.605 5.752 5.899 6.06 6.223 6.364 6.5 6.632 6.761 6.878 6.993 7.119 7.231 7.304 7.332 7.32 7.186 6.861 6.233 5.003 3.279 1.795 0.566 -0.516 -1.477 -2.289 -3.016 -3.628 -4.223 -4.761 -5.248 -5.68 -6.08 -6.469 -6.844 -7.228 -7.563 -7.879 -8.216 -8.549 -8.82 -9.093 -9.361 -9.561 -9.766 -9.974 -10.2 -10.442 -10.602 -10.771 -11.056 -11.26 -11.474 -11.583 -11.796 -12.023 -12.256 -12.379 -12.752 -12.776 -12.921 -13.059 -13.365 -13.536 -13.725 -13.933 -14.162 -14.422 -14.728 -16.002 -4 ,30598 ,KEBNE ,17022534,Wed Dec 22 06:31:45 CET,Wed Dec 22 07:57:12 CET,0.0 0.672 1.009 1.242 1.423 1.584 1.742 1.889 2.139 2.248 2.352 2.308 2.65 2.76 2.968 3.17 3.362 3.444 3.607 3.752 3.955 4.093 4.221 4.4 4.579 4.773 4.959 5.121 5.324 5.535 5.739 5.95 6.125 6.297 6.494 6.725 6.95 7.176 7.406 7.642 7.883 8.163 8.456 8.676 8.873 9.023 9.096 9.057 8.783 8.072 6.775 5.079 3.594 2.282 1.113 0.099 -0.754 -1.531 -2.201 -2.881 -3.451 -3.932 -4.408 -4.862 -5.265 -5.619 -6.002 -6.355 -6.641 -6.944 -7.262 -7.521 -7.8 -8.113 -8.354 -8.584 -8.817 -9.058 -9.299 -9.454 -9.615 -9.875 -10.078 -10.291 -10.39 -10.584 -10.788 -11.027 -11.158 -11.538 -11.547 -11.682 -11.834 -12.146 -12.315 -12.501 -12.709 -12.93 -13.163 -13.457 -14.571 -5 ,22668 ,KEBNE ,17022535,Wed Dec 22 06:31:48 CET,Wed Dec 22 07:52:32 CET,0.0 0.799 1.12 1.346 1.527 1.714 1.9 2.049 2.308 2.44 2.571 2.55 2.89 2.993 3.194 3.377 3.546 3.626 3.79 3.955 4.176 4.317 4.453 4.641 4.828 5.022 5.21 5.375 5.586 5.782 5.955 6.166 6.358 6.534 6.743 6.989 7.234 7.484 7.743 7.99 8.198 8.369 8.493 8.606 8.706 8.72 8.729 8.666 8.317 7.66 6.429 4.762 3.316 2.051 0.987 0.075 -0.742 -1.5 -2.167 -2.839 -3.413 -3.895 -4.341 -4.772 -5.175 -5.543 -5.913 -6.24 -6.523 -6.825 -7.144 -7.408 -7.698 -7.995 -8.208 -8.423 -8.657 -8.913 -9.175 -9.347 -9.527 -9.807 -9.998 -10.202 -10.302 -10.501 -10.717 -10.953 -11.083 -11.464 -11.471 -11.601 -11.743 -12.044 -12.231 -12.468 -12.718 -12.967 -13.263 -13.681 -14.683 -6 ,604 ,KEBNE ,17022536,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:57:19 CET,0.0 0.851 1.169 1.435 1.659 1.833 2.014 2.184 2.437 2.553 2.665 2.65 2.99 3.08 3.255 3.42 3.565 3.645 3.809 3.941 4.123 4.255 4.382 4.553 4.7 4.83 4.965 5.087 5.24 5.392 5.54 5.731 5.899 6.031 6.173 6.332 6.48 6.644 6.805 6.967 7.139 7.315 7.472 7.623 7.794 7.854 7.8 7.682 7.406 6.753 5.437 3.77 2.334 1.103 0.057 -0.89 -1.735 -2.511 -3.162 -3.796 -4.347 -4.836 -5.299 -5.729 -6.115 -6.473 -6.842 -7.16 -7.444 -7.737 -8.045 -8.317 -8.6 -8.886 -9.113 -9.347 -9.574 -9.809 -10.066 -10.24 -10.41 -10.669 -10.843 -11.035 -11.141 -11.345 -11.555 -11.782 -11.904 -12.274 -12.284 -12.421 -12.575 -12.898 -13.056 -13.238 -13.463 -13.709 -13.974 -14.286 -14.92 -7 ,14199 ,KEBNE ,17022537,Wed Dec 22 06:31:45 CET,Wed Dec 22 07:57:07 CET,0.0 0.911 1.214 1.45 1.674 1.867 2.049 2.207 2.468 2.599 2.725 2.717 3.064 3.162 3.37 3.571 3.747 3.828 3.98 4.123 4.334 4.479 4.622 4.829 5.019 5.195 5.367 5.534 5.747 5.956 6.159 6.403 6.64 6.875 7.138 7.409 7.606 7.761 7.914 8.064 8.22 8.362 8.488 8.628 8.763 8.782 8.709 8.549 8.211 7.585 6.334 4.659 3.192 1.927 0.86 -0.102 -0.972 -1.774 -2.455 -3.146 -3.754 -4.272 -4.753 -5.226 -5.665 -6.042 -6.426 -6.768 -7.065 -7.364 -7.659 -7.937 -8.241 -8.535 -8.753 -8.959 -9.179 -9.434 -9.686 -9.862 -10.043 -10.302 -10.495 -10.694 -10.786 -10.986 -11.21 -11.436 -11.549 -11.915 -11.921 -12.056 -12.199 -12.505 -12.671 -12.841 -13.015 -13.218 -13.477 -13.783 -14.76 -8 ,1709 ,KEBNE ,17022538,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:58:33 CET,0.0 0.866 1.173 1.421 1.636 1.811 1.96 2.112 2.408 2.544 2.67 2.663 3.013 3.114 3.299 3.468 3.648 3.733 3.881 4.032 4.246 4.375 4.503 4.696 4.889 5.064 5.228 5.375 5.543 5.714 5.892 6.1 6.287 6.476 6.681 6.879 7.078 7.307 7.528 7.729 7.918 8.116 8.313 8.521 8.741 8.856 8.912 8.866 8.599 8.061 6.907 5.354 4.004 2.821 1.79 0.809 -0.049 -0.768 -1.406 -2.073 -2.627 -3.104 -3.546 -3.972 -4.389 -4.768 -5.177 -5.544 -5.856 -6.175 -6.515 -6.796 -7.074 -7.374 -7.602 -7.829 -8.062 -8.312 -8.559 -8.715 -8.892 -9.169 -9.334 -9.496 -9.586 -9.78 -9.986 -10.208 -10.327 -10.686 -10.656 -10.776 -10.904 -11.176 -11.328 -11.502 -11.693 -11.886 -12.111 -12.4 -13.048 -9 ,24388 ,KEBNE ,17022539,Wed Dec 22 06:31:45 CET,Wed Dec 22 07:57:08 CET,0.0 0.428 0.683 0.98 1.244 1.442 1.599 1.753 2.04 2.172 2.291 2.259 2.605 2.711 2.895 3.056 3.213 3.302 3.466 3.616 3.831 3.97 4.108 4.299 4.47 4.624 4.78 4.938 5.141 5.338 5.52 5.74 5.948 6.128 6.318 6.538 6.764 7.028 7.309 7.545 7.733 7.917 8.101 8.238 8.349 8.443 8.451 8.289 7.948 7.37 6.196 4.505 3.027 1.799 0.8 -0.111 -0.948 -1.72 -2.378 -3.036 -3.629 -4.165 -4.681 -5.149 -5.556 -5.933 -6.338 -6.691 -6.983 -7.276 -7.574 -7.838 -8.121 -8.417 -8.646 -8.868 -9.079 -9.312 -9.569 -9.737 -9.906 -10.195 -10.405 -10.61 -10.714 -10.917 -11.119 -11.343 -11.469 -11.847 -11.858 -11.994 -12.139 -12.454 -12.618 -12.792 -13.012 -13.298 -13.582 -13.925 -14.757 -10 ,19595 ,KEBNE ,17022540,Wed Dec 22 06:31:45 CET,Wed Dec 22 07:56:58 CET,0.0 1.034 1.385 1.621 1.818 1.988 2.142 2.299 2.562 2.677 2.789 2.763 3.098 3.202 3.412 3.589 3.746 3.822 3.96 4.087 4.282 4.408 4.536 4.719 4.89 5.064 5.225 5.371 5.543 5.721 5.927 6.17 6.4 6.612 6.804 6.968 7.125 7.287 7.449 7.601 7.733 7.866 8.038 8.201 8.32 8.371 8.32 8.139 7.798 7.123 5.817 4.161 2.731 1.464 0.327 -0.678 -1.63 -2.519 -3.227 -3.92 -4.512 -5.055 -5.582 -6.069 -6.515 -6.906 -7.329 -7.723 -8.059 -8.412 -8.779 -9.08 -9.394 -9.722 -9.966 -10.208 -10.457 -10.731 -11.024 -11.221 -11.426 -11.743 -11.952 -12.166 -12.281 -12.531 -12.792 -13.052 -13.189 -13.59 -13.635 -13.788 -13.947 -14.259 -14.456 -14.694 -14.951 -15.259 -15.651 -16.192 -17.427 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_60_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_60_61.txt deleted file mode 100644 index 188f9ae9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_60_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1258 ,KEBNE ,17022541,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:56:51 CET,0.0 1.834 2.327 2.651 2.932 3.187 3.411 3.616 4.008 4.185 4.351 4.425 4.797 4.925 5.191 5.469 5.738 5.868 6.111 6.339 6.683 6.907 7.118 7.419 7.709 7.973 8.235 8.497 8.839 9.15 9.449 9.848 10.246 10.627 11.048 11.506 11.98 12.526 13.079 13.658 14.272 14.941 15.703 16.432 17.284 18.258 19.375 20.576 21.889 23.294 24.799 25.891 26.417 26.655 26.669 26.566 26.419 26.258 26.089 25.878 25.678 25.503 25.323 25.122 24.917 24.749 24.585 24.413 24.256 24.071 23.871 23.718 23.537 23.345 23.203 23.039 22.863 22.678 22.479 22.345 22.199 21.961 21.807 21.661 21.589 21.431 21.251 21.054 20.95 20.618 20.625 20.511 20.385 20.116 19.941 19.723 19.489 19.214 18.883 18.455 17.155 -2 ,12482 ,KEBNE ,17022542,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:56:52 CET,0.0 0.862 1.233 1.545 1.832 2.096 2.349 2.588 3.007 3.191 3.372 3.466 3.867 4.032 4.34 4.645 4.93 5.066 5.319 5.557 5.921 6.157 6.384 6.715 7.029 7.329 7.615 7.881 8.229 8.579 8.916 9.354 9.779 10.15 10.555 11.044 11.544 12.086 12.649 13.248 13.885 14.574 15.343 16.128 16.995 17.885 18.927 20.096 21.444 22.981 24.645 25.732 26.213 26.426 26.488 26.454 26.365 26.264 26.127 25.959 25.827 25.678 25.517 25.379 25.237 25.096 24.938 24.774 24.616 24.453 24.29 24.159 24.002 23.827 23.699 23.571 23.427 23.265 23.11 22.999 22.881 22.681 22.538 22.397 22.33 22.178 21.999 21.807 21.717 21.406 21.431 21.336 21.24 21.018 20.893 20.76 20.603 20.379 20.091 19.687 18.649 -3 ,26538 ,KEBNE ,17022543,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:56:49 CET,0.0 1.273 1.67 1.984 2.259 2.516 2.77 2.99 3.378 3.569 3.752 3.861 4.267 4.427 4.731 5.021 5.307 5.444 5.702 5.95 6.324 6.571 6.803 7.131 7.454 7.772 8.063 8.315 8.611 8.893 9.189 9.56 9.905 10.242 10.657 11.095 11.48 11.905 12.362 12.853 13.383 14.019 14.756 15.442 16.217 17.08 18.081 19.238 20.601 22.122 23.813 25.004 25.505 25.736 25.824 25.776 25.683 25.547 25.393 25.24 25.079 24.903 24.74 24.569 24.394 24.236 24.072 23.94 23.817 23.669 23.506 23.343 23.137 22.906 22.739 22.595 22.458 22.321 22.162 22.034 21.901 21.684 21.534 21.393 21.32 21.172 21.027 20.86 20.771 20.454 20.471 20.343 20.211 19.932 19.77 19.608 19.425 19.198 18.933 18.589 17.537 -4 ,6208 ,KEBNE ,17022544,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:57:26 CET,0.0 1.445 1.841 2.148 2.427 2.698 2.929 3.127 3.529 3.723 3.911 4.031 4.433 4.583 4.864 5.126 5.385 5.51 5.756 5.991 6.336 6.569 6.792 7.123 7.444 7.747 8.028 8.307 8.683 9.03 9.355 9.751 10.142 10.534 10.951 11.4 11.876 12.401 12.938 13.487 14.058 14.722 15.474 16.202 17.042 17.894 18.877 19.992 21.238 22.683 24.269 25.328 25.796 25.987 26.023 25.978 25.878 25.736 25.573 25.376 25.184 25.014 24.844 24.655 24.46 24.287 24.1 23.92 23.756 23.587 23.403 23.25 23.085 22.909 22.769 22.624 22.47 22.299 22.134 22.021 21.904 21.737 21.623 21.481 21.391 21.196 21.008 20.833 20.734 20.402 20.414 20.312 20.196 19.92 19.778 19.635 19.459 19.233 18.963 18.616 17.739 -5 ,22918 ,KEBNE ,17022545,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:56:32 CET,0.0 1.473 1.884 2.22 2.524 2.77 2.984 3.179 3.545 3.717 3.884 3.978 4.36 4.508 4.802 5.067 5.325 5.444 5.674 5.9 6.219 6.424 6.633 6.943 7.221 7.491 7.771 8.038 8.381 8.718 9.036 9.412 9.765 10.093 10.48 10.948 11.392 11.864 12.378 12.888 13.428 14.024 14.693 15.386 16.166 17.003 17.956 18.991 20.171 21.503 22.973 23.996 24.495 24.71 24.686 24.539 24.398 24.277 24.136 23.966 23.818 23.655 23.467 23.289 23.108 22.938 22.762 22.58 22.417 22.234 22.049 21.924 21.783 21.616 21.485 21.345 21.209 21.062 20.894 20.778 20.652 20.466 20.341 20.201 20.13 19.984 19.811 19.627 19.538 19.217 19.22 19.115 19.003 18.717 18.562 18.408 18.244 18.055 17.792 17.428 16.485 -6 ,13410 ,KEBNE ,17022546,Wed Dec 22 06:31:45 CET,Wed Dec 22 07:56:19 CET,0.0 0.99 1.413 1.743 2.024 2.308 2.552 2.762 3.177 3.378 3.558 3.64 4.034 4.181 4.462 4.73 5.01 5.149 5.405 5.638 5.98 6.21 6.424 6.726 7.03 7.327 7.607 7.872 8.207 8.545 8.87 9.258 9.63 9.989 10.403 10.854 11.306 11.805 12.357 12.945 13.535 14.216 15.016 15.817 16.712 17.636 18.65 19.763 21.013 22.361 23.803 24.82 25.327 25.592 25.711 25.727 25.648 25.556 25.457 25.337 25.201 25.027 24.844 24.677 24.516 24.342 24.15 23.973 23.815 23.666 23.512 23.366 23.196 22.999 22.847 22.685 22.527 22.378 22.21 22.092 21.971 21.755 21.593 21.425 21.329 21.129 20.929 20.715 20.61 20.284 20.314 20.197 20.068 19.804 19.657 19.502 19.321 19.099 18.86 18.563 16.907 -7 ,21847 ,KEBNE ,17022547,Wed Dec 22 06:31:44 CET,Wed Dec 22 07:56:55 CET,0.0 0.817 1.136 1.442 1.727 1.989 2.232 2.435 2.816 3.001 3.185 3.316 3.727 3.889 4.175 4.439 4.701 4.828 5.069 5.307 5.652 5.87 6.086 6.41 6.722 7.02 7.3 7.572 7.937 8.285 8.622 9.027 9.396 9.752 10.179 10.671 11.129 11.637 12.193 12.773 13.394 14.09 14.878 15.632 16.465 17.328 18.279 19.345 20.57 21.917 23.471 24.529 24.908 25.069 25.122 25.097 25.02 24.894 24.73 24.52 24.347 24.183 23.967 23.759 23.566 23.378 23.194 23.01 22.847 22.683 22.488 22.314 22.15 22.001 21.885 21.749 21.591 21.431 21.274 21.157 21.02 20.799 20.654 20.492 20.408 20.24 20.059 19.871 19.777 19.46 19.486 19.372 19.245 18.976 18.814 18.625 18.441 18.253 18.038 17.77 16.978 -8 ,31001 ,KEBNE ,17022548,Wed Dec 22 06:31:45 CET,Wed Dec 22 07:56:38 CET,0.0 2.806 3.238 3.513 3.774 4.026 4.258 4.478 4.907 5.102 5.274 5.354 5.75 5.905 6.209 6.49 6.755 6.886 7.155 7.42 7.807 8.048 8.266 8.587 8.918 9.233 9.527 9.809 10.165 10.524 10.871 11.249 11.622 11.989 12.361 12.765 13.162 13.601 14.08 14.597 15.145 15.738 16.406 17.075 17.868 18.802 19.842 20.953 22.212 23.611 25.283 26.552 27.162 27.49 27.599 27.56 27.464 27.319 27.163 27.023 26.907 26.78 26.632 26.453 26.26 26.067 25.875 25.723 25.573 25.422 25.276 25.139 24.982 24.808 24.66 24.504 24.349 24.192 24.034 23.93 23.832 23.679 23.548 23.409 23.329 23.146 22.975 22.794 22.691 22.359 22.356 22.242 22.117 21.835 21.678 21.513 21.339 21.14 20.877 20.56 19.551 -9 ,14710 ,KEBNE ,17022549,Wed Dec 22 06:31:45 CET,Wed Dec 22 07:56:19 CET,0.0 1.764 2.289 2.627 2.896 3.16 3.396 3.607 3.969 4.129 4.296 4.369 4.746 4.89 5.171 5.438 5.691 5.816 6.068 6.305 6.651 6.866 7.077 7.407 7.731 8.037 8.312 8.564 8.898 9.234 9.555 9.914 10.228 10.53 10.908 11.346 11.766 12.225 12.708 13.218 13.768 14.398 15.115 15.829 16.627 17.479 18.498 19.657 20.976 22.474 24.059 25.222 25.796 26.059 26.155 26.126 26.042 25.902 25.749 25.594 25.414 25.227 25.037 24.832 24.633 24.464 24.272 24.069 23.888 23.691 23.485 23.32 23.137 22.922 22.759 22.609 22.452 22.294 22.139 22.023 21.891 21.681 21.533 21.367 21.279 21.091 20.907 20.724 20.623 20.307 20.33 20.204 20.064 19.762 19.598 19.426 19.249 19.006 18.673 18.173 17.08 -10 ,31814 ,KEBNE ,17022550,Wed Dec 22 06:32:46 CET,Wed Dec 22 07:57:33 CET,0.0 1.257 1.657 1.996 2.266 2.478 2.675 2.854 3.19 3.36 3.526 3.59 3.972 4.106 4.365 4.62 4.87 4.993 5.22 5.452 5.811 6.022 6.225 6.537 6.838 7.135 7.42 7.702 8.061 8.391 8.717 9.124 9.518 9.902 10.342 10.831 11.303 11.813 12.359 12.946 13.559 14.257 15.046 15.771 16.62 17.562 18.605 19.788 21.093 22.45 23.948 24.967 25.419 25.585 25.573 25.481 25.371 25.229 25.053 24.851 24.631 24.417 24.204 23.988 23.785 23.578 23.357 23.162 22.975 22.782 22.584 22.421 22.245 22.056 21.912 21.757 21.597 21.44 21.272 21.158 21.04 20.82 20.672 20.523 20.439 20.272 20.105 19.92 19.817 19.481 19.472 19.349 19.218 18.932 18.777 18.596 18.398 18.199 17.946 17.568 15.959 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_60_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_60_63.txt deleted file mode 100644 index 526afc33..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_60_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29336 ,KEBNE ,17022551,Wed Dec 22 06:33:52 CET,Wed Dec 22 08:00:21 CET,0.0 0.685 0.989 1.241 1.437 1.613 1.79 1.943 2.223 2.359 2.476 2.466 2.81 2.909 3.105 3.285 3.447 3.524 3.674 3.805 3.997 4.123 4.244 4.429 4.598 4.766 4.946 5.135 5.374 5.543 5.669 5.834 5.98 6.122 6.321 6.55 6.76 6.963 7.162 7.374 7.59 7.817 8.086 8.344 8.616 8.853 9.016 9.13 9.175 9.017 8.441 7.521 6.643 5.838 5.114 4.46 3.889 3.359 2.889 2.406 1.971 1.577 1.196 0.835 0.5 0.186 -0.126 -0.388 -0.634 -0.9 -1.156 -1.365 -1.602 -1.849 -2.037 -2.216 -2.385 -2.555 -2.748 -2.897 -3.057 -3.305 -3.464 -3.618 -3.692 -3.846 -4.016 -4.188 -4.284 -4.644 -4.615 -4.713 -4.818 -5.046 -5.166 -5.284 -5.408 -5.559 -5.731 -5.958 -6.338 -2 ,2672 ,KEBNE ,17022552,Wed Dec 22 06:32:46 CET,Wed Dec 22 07:58:04 CET,0.0 0.661 0.981 1.204 1.419 1.645 1.851 2.021 2.321 2.466 2.595 2.619 2.989 3.1 3.297 3.477 3.647 3.733 3.892 4.03 4.232 4.37 4.505 4.695 4.874 5.039 5.201 5.35 5.539 5.723 5.888 6.098 6.302 6.453 6.61 6.821 7.005 7.195 7.418 7.651 7.875 8.073 8.28 8.492 8.733 8.956 9.119 9.227 9.285 9.192 8.64 7.689 6.786 5.969 5.221 4.545 3.966 3.446 2.997 2.543 2.158 1.81 1.491 1.186 0.893 0.641 0.386 0.161 -0.028 -0.226 -0.433 -0.617 -0.824 -1.029 -1.175 -1.322 -1.481 -1.654 -1.833 -1.946 -2.07 -2.279 -2.415 -2.55 -2.614 -2.743 -2.894 -3.049 -3.128 -3.443 -3.356 -3.448 -3.546 -3.752 -3.864 -3.972 -4.079 -4.213 -4.36 -4.564 -4.902 -3 ,26004 ,KEBNE ,17022553,Wed Dec 22 06:32:46 CET,Wed Dec 22 07:59:25 CET,0.0 1.162 1.504 1.762 1.981 2.161 2.287 2.423 2.704 2.828 2.938 2.904 3.241 3.339 3.524 3.697 3.855 3.928 4.082 4.228 4.427 4.552 4.675 4.843 5.008 5.17 5.328 5.484 5.673 5.867 6.079 6.318 6.542 6.763 7.007 7.274 7.52 7.8 8.096 8.383 8.658 8.917 9.179 9.433 9.669 9.904 10.169 10.363 10.401 10.211 9.632 8.672 7.748 6.938 6.246 5.614 5.04 4.493 3.994 3.488 3.054 2.655 2.273 1.935 1.626 1.34 1.036 0.774 0.54 0.3 0.072 -0.115 -0.313 -0.527 -0.685 -0.846 -1.019 -1.198 -1.371 -1.492 -1.625 -1.834 -1.987 -2.144 -2.221 -2.388 -2.573 -2.765 -2.869 -3.213 -3.163 -3.259 -3.355 -3.561 -3.678 -3.824 -3.98 -4.121 -4.286 -4.477 -4.732 -4 ,6160 ,KEBNE ,17022554,Wed Dec 22 06:32:46 CET,Wed Dec 22 07:58:37 CET,0.0 0.386 0.599 0.774 0.952 1.133 1.319 1.509 1.851 1.995 2.129 2.145 2.479 2.565 2.771 2.979 3.167 3.258 3.417 3.578 3.841 4.001 4.13 4.318 4.504 4.67 4.813 4.953 5.152 5.375 5.605 5.849 6.076 6.28 6.514 6.795 7.052 7.314 7.577 7.83 8.094 8.372 8.67 8.962 9.297 9.644 9.937 10.153 10.255 10.123 9.567 8.661 7.742 6.859 6.089 5.399 4.807 4.218 3.675 3.164 2.736 2.346 1.976 1.604 1.263 0.966 0.639 0.358 0.127 -0.118 -0.373 -0.59 -0.825 -1.056 -1.228 -1.406 -1.585 -1.763 -1.952 -2.085 -2.212 -2.42 -2.575 -2.742 -2.83 -2.993 -3.149 -3.317 -3.406 -3.745 -3.699 -3.813 -3.923 -4.15 -4.27 -4.394 -4.535 -4.7 -4.903 -5.136 -5.499 -5 ,9578 ,KEBNE ,17022555,Wed Dec 22 06:32:46 CET,Wed Dec 22 07:58:56 CET,0.0 0.623 0.901 1.115 1.335 1.581 1.773 1.934 2.226 2.35 2.456 2.409 2.75 2.858 3.064 3.266 3.454 3.529 3.672 3.82 4.058 4.201 4.329 4.533 4.721 4.886 5.046 5.217 5.435 5.651 5.893 6.157 6.365 6.542 6.739 6.962 7.173 7.406 7.628 7.852 8.09 8.351 8.636 8.911 9.172 9.381 9.623 9.839 9.903 9.713 9.122 8.178 7.275 6.475 5.764 5.09 4.5 3.98 3.498 3.013 2.609 2.242 1.906 1.59 1.292 1.027 0.749 0.501 0.29 0.067 -0.17 -0.373 -0.578 -0.78 -0.938 -1.102 -1.261 -1.436 -1.628 -1.75 -1.87 -2.055 -2.188 -2.331 -2.403 -2.543 -2.686 -2.839 -2.914 -3.232 -3.166 -3.257 -3.355 -3.576 -3.691 -3.808 -3.936 -4.093 -4.261 -4.442 -4.824 -6 ,17875 ,KEBNE ,17022556,Wed Dec 22 06:32:46 CET,Wed Dec 22 07:58:33 CET,0.0 0.593 0.906 1.15 1.379 1.582 1.766 1.917 2.179 2.299 2.409 2.409 2.788 2.928 3.181 3.436 3.683 3.801 4.007 4.192 4.446 4.596 4.743 4.984 5.22 5.43 5.617 5.791 6.013 6.232 6.441 6.651 6.837 7.024 7.254 7.504 7.737 7.986 8.219 8.439 8.677 8.925 9.204 9.464 9.716 9.943 10.142 10.273 10.292 10.144 9.611 8.633 7.704 6.859 6.098 5.397 4.771 4.22 3.749 3.274 2.857 2.472 2.115 1.784 1.456 1.145 0.825 0.543 0.301 0.058 -0.2 -0.421 -0.639 -0.848 -1.003 -1.183 -1.372 -1.564 -1.769 -1.911 -2.06 -2.298 -2.457 -2.61 -2.686 -2.84 -2.996 -3.173 -3.275 -3.627 -3.576 -3.677 -3.785 -4.013 -4.144 -4.273 -4.397 -4.532 -4.69 -4.935 -5.472 -7 ,28192 ,KEBNE ,17022557,Wed Dec 22 06:32:46 CET,Wed Dec 22 07:57:27 CET,0.0 0.799 1.147 1.433 1.641 1.808 1.97 2.132 2.405 2.514 2.622 2.597 2.917 3.006 3.192 3.359 3.504 3.577 3.719 3.846 4.034 4.154 4.27 4.433 4.587 4.76 4.945 5.125 5.34 5.523 5.698 5.91 6.095 6.278 6.503 6.732 6.932 7.131 7.336 7.572 7.805 8.046 8.302 8.514 8.762 9.02 9.236 9.401 9.454 9.294 8.792 7.899 6.983 6.161 5.435 4.733 4.124 3.582 3.098 2.627 2.22 1.848 1.492 1.151 0.837 0.561 0.275 0.016 -0.212 -0.458 -0.707 -0.915 -1.141 -1.381 -1.574 -1.769 -1.967 -2.166 -2.364 -2.507 -2.65 -2.864 -3.014 -3.177 -3.263 -3.426 -3.601 -3.794 -3.891 -4.225 -4.189 -4.294 -4.395 -4.609 -4.732 -4.875 -5.031 -5.204 -5.379 -5.621 -6.136 -8 ,20059 ,KEBNE ,17022558,Wed Dec 22 06:32:46 CET,Wed Dec 22 07:56:59 CET,0.0 1.258 1.579 1.822 2.049 2.257 2.423 2.541 2.773 2.894 3.005 2.989 3.338 3.443 3.62 3.796 3.949 4.017 4.156 4.283 4.488 4.626 4.759 4.951 5.106 5.265 5.44 5.596 5.777 5.945 6.107 6.297 6.494 6.694 6.907 7.126 7.338 7.579 7.824 8.079 8.367 8.661 8.956 9.214 9.462 9.679 9.848 9.984 10.065 9.952 9.454 8.605 7.706 6.852 6.112 5.466 4.913 4.409 3.96 3.509 3.125 2.786 2.444 2.114 1.803 1.514 1.224 0.978 0.777 0.563 0.334 0.145 -0.052 -0.245 -0.401 -0.568 -0.738 -0.916 -1.096 -1.224 -1.354 -1.548 -1.676 -1.805 -1.872 -2.011 -2.164 -2.334 -2.429 -2.751 -2.695 -2.795 -2.886 -3.089 -3.203 -3.327 -3.464 -3.603 -3.781 -4.011 -4.402 -9 ,3733 ,KEBNE ,17022559,Wed Dec 22 06:32:46 CET,Wed Dec 22 07:57:59 CET,0.0 0.597 0.902 1.138 1.335 1.542 1.736 1.881 2.146 2.288 2.417 2.42 2.773 2.884 3.099 3.298 3.466 3.55 3.719 3.867 4.096 4.234 4.377 4.605 4.814 5.008 5.189 5.371 5.608 5.832 6.029 6.247 6.465 6.679 6.914 7.16 7.372 7.59 7.853 8.126 8.357 8.61 8.916 9.219 9.51 9.778 9.987 10.106 10.143 10.001 9.499 8.53 7.562 6.713 5.986 5.293 4.641 4.095 3.634 3.153 2.775 2.466 2.134 1.756 1.381 1.061 0.75 0.485 0.262 0.036 -0.186 -0.369 -0.572 -0.803 -0.982 -1.161 -1.349 -1.536 -1.709 -1.825 -1.942 -2.13 -2.274 -2.432 -2.514 -2.676 -2.838 -3.025 -3.118 -3.453 -3.443 -3.566 -3.688 -3.929 -4.072 -4.217 -4.36 -4.519 -4.671 -4.846 -5.225 -10 ,24703 ,KEBNE ,17022560,Wed Dec 22 06:32:46 CET,Wed Dec 22 07:57:54 CET,0.0 0.814 1.113 1.359 1.55 1.73 1.886 2.011 2.28 2.406 2.511 2.473 2.817 2.933 3.14 3.304 3.462 3.543 3.687 3.833 4.056 4.198 4.34 4.553 4.734 4.895 5.062 5.206 5.37 5.542 5.714 5.916 6.106 6.292 6.504 6.705 6.898 7.122 7.349 7.579 7.802 8.015 8.233 8.478 8.719 8.938 9.17 9.293 9.35 9.229 8.602 7.639 6.767 6.008 5.316 4.629 4.045 3.553 3.093 2.594 2.167 1.782 1.43 1.117 0.821 0.544 0.254 0.006 -0.202 -0.423 -0.648 -0.827 -1.017 -1.219 -1.375 -1.529 -1.678 -1.841 -2.02 -2.151 -2.28 -2.46 -2.582 -2.716 -2.789 -2.93 -3.076 -3.25 -3.335 -3.656 -3.582 -3.683 -3.795 -4.007 -4.125 -4.259 -4.385 -4.52 -4.696 -4.912 -5.28 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_60_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_60_65.txt deleted file mode 100644 index b2ed866f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_60_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24355 ,KEBNE ,17022561,Wed Dec 22 06:32:46 CET,Wed Dec 22 07:58:26 CET,0.0 0.69 0.956 1.17 1.359 1.514 1.671 1.833 2.109 2.221 2.326 2.31 2.658 2.755 2.937 3.105 3.268 3.355 3.528 3.699 3.947 4.09 4.226 4.427 4.62 4.806 4.981 5.153 5.377 5.585 5.771 5.998 6.228 6.45 6.692 6.94 7.183 7.453 7.746 8.063 8.368 8.677 9.003 9.307 9.665 10.047 10.403 10.748 11.068 11.223 11.131 10.623 9.969 9.336 8.742 8.179 7.646 7.135 6.666 6.185 5.807 5.48 5.144 4.835 4.555 4.284 3.996 3.741 3.513 3.274 3.042 2.842 2.63 2.405 2.222 2.038 1.856 1.665 1.465 1.331 1.186 0.954 0.8 0.634 0.547 0.367 0.177 -0.015 -0.113 -0.451 -0.432 -0.542 -0.649 -0.875 -0.996 -1.141 -1.292 -1.444 -1.605 -1.827 -2.525 -2 ,29763 ,KEBNE ,17022562,Wed Dec 22 06:32:46 CET,Wed Dec 22 07:57:47 CET,0.0 0.587 0.831 1.047 1.238 1.387 1.522 1.671 1.987 2.12 2.246 2.268 2.62 2.719 2.897 3.078 3.256 3.344 3.525 3.691 3.926 4.076 4.222 4.432 4.608 4.771 4.944 5.117 5.331 5.529 5.727 5.968 6.196 6.406 6.634 6.874 7.099 7.339 7.583 7.836 8.083 8.383 8.752 9.075 9.368 9.635 9.959 10.296 10.605 10.793 10.75 10.321 9.718 9.124 8.554 7.985 7.465 7.001 6.605 6.191 5.791 5.421 5.08 4.744 4.433 4.162 3.857 3.587 3.366 3.138 2.892 2.688 2.493 2.306 2.161 1.994 1.806 1.604 1.388 1.243 1.104 0.885 0.73 0.568 0.486 0.334 0.171 -0.01 -0.112 -0.469 -0.469 -0.581 -0.691 -0.938 -1.073 -1.219 -1.392 -1.571 -1.759 -1.964 -2.286 -3 ,5120 ,KEBNE ,17022563,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:55 CET,0.0 0.622 0.936 1.197 1.396 1.543 1.68 1.819 2.08 2.204 2.313 2.258 2.597 2.716 2.94 3.123 3.307 3.405 3.584 3.746 3.98 4.132 4.278 4.485 4.678 4.845 4.999 5.162 5.366 5.56 5.747 5.963 6.181 6.389 6.614 6.855 7.096 7.366 7.634 7.913 8.183 8.45 8.729 8.998 9.316 9.661 9.976 10.237 10.48 10.615 10.418 9.845 9.191 8.54 7.984 7.45 6.933 6.465 6.09 5.705 5.351 5.028 4.699 4.389 4.083 3.783 3.48 3.223 3.011 2.789 2.549 2.343 2.12 1.89 1.712 1.526 1.338 1.155 0.968 0.838 0.698 0.474 0.324 0.164 0.085 -0.075 -0.265 -0.476 -0.586 -0.951 -0.912 -1.006 -1.109 -1.344 -1.484 -1.641 -1.811 -1.988 -2.165 -2.362 -2.803 -4 ,9889 ,KEBNE ,17022564,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:58:57 CET,0.0 0.608 0.898 1.117 1.334 1.533 1.702 1.843 2.11 2.231 2.34 2.303 2.639 2.745 2.96 3.158 3.334 3.421 3.592 3.754 3.987 4.13 4.262 4.451 4.65 4.845 5.021 5.181 5.382 5.585 5.773 5.993 6.201 6.413 6.654 6.901 7.146 7.408 7.674 7.935 8.219 8.546 8.884 9.208 9.587 9.976 10.336 10.676 10.961 11.09 10.937 10.389 9.804 9.211 8.649 8.128 7.634 7.159 6.721 6.258 5.862 5.5 5.141 4.798 4.481 4.205 3.941 3.705 3.5 3.295 3.077 2.885 2.69 2.499 2.357 2.207 2.031 1.85 1.675 1.556 1.439 1.264 1.138 1.007 0.933 0.777 0.622 0.45 0.354 0.009 0.045 -0.072 -0.191 -0.41 -0.526 -0.651 -0.787 -0.938 -1.098 -1.294 -1.761 -5 ,23593 ,KEBNE ,17022565,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:58:38 CET,0.0 0.508 0.778 1.029 1.251 1.42 1.582 1.732 2.012 2.135 2.247 2.214 2.548 2.646 2.827 3.004 3.193 3.282 3.44 3.586 3.804 3.941 4.073 4.275 4.465 4.652 4.833 5.0 5.21 5.409 5.604 5.847 6.074 6.283 6.519 6.782 7.024 7.274 7.541 7.807 8.085 8.377 8.66 8.917 9.228 9.565 9.924 10.259 10.499 10.638 10.52 9.977 9.309 8.699 8.123 7.535 6.993 6.507 6.088 5.661 5.287 4.941 4.583 4.235 3.927 3.658 3.38 3.123 2.901 2.666 2.412 2.219 2.029 1.835 1.68 1.502 1.312 1.122 0.926 0.796 0.657 0.437 0.289 0.133 0.052 -0.115 -0.301 -0.492 -0.587 -0.933 -0.902 -1.008 -1.129 -1.394 -1.523 -1.67 -1.842 -2.034 -2.226 -2.453 -2.778 -6 ,7428 ,KEBNE ,17022566,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:40 CET,0.0 0.756 1.048 1.278 1.455 1.639 1.805 1.936 2.18 2.304 2.429 2.413 2.76 2.862 3.074 3.267 3.443 3.534 3.715 3.897 4.143 4.291 4.431 4.643 4.847 5.026 5.196 5.374 5.61 5.815 6.014 6.255 6.477 6.705 6.96 7.209 7.448 7.702 7.937 8.177 8.437 8.732 9.084 9.419 9.756 10.09 10.412 10.722 11.031 11.201 11.049 10.516 9.834 9.177 8.582 8.022 7.545 7.118 6.71 6.272 5.885 5.538 5.223 4.901 4.584 4.316 4.041 3.768 3.537 3.311 3.059 2.85 2.631 2.41 2.244 2.069 1.89 1.706 1.503 1.357 1.21 0.995 0.857 0.703 0.616 0.441 0.25 0.052 -0.044 -0.386 -0.356 -0.463 -0.575 -0.832 -0.975 -1.126 -1.286 -1.447 -1.627 -1.898 -2.313 -7 ,17255 ,KEBNE ,17022567,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:11 CET,0.0 0.802 1.053 1.285 1.511 1.705 1.875 2.017 2.258 2.373 2.485 2.454 2.8 2.914 3.122 3.312 3.484 3.562 3.716 3.87 4.095 4.229 4.358 4.561 4.758 4.932 5.089 5.246 5.46 5.657 5.834 6.06 6.279 6.475 6.712 6.979 7.223 7.478 7.753 8.042 8.335 8.646 8.974 9.283 9.642 10.016 10.374 10.677 10.912 11.099 11.01 10.439 9.775 9.105 8.469 7.885 7.373 6.9 6.495 6.063 5.678 5.335 4.991 4.672 4.381 4.094 3.785 3.511 3.281 3.058 2.832 2.647 2.459 2.251 2.078 1.899 1.72 1.532 1.351 1.228 1.073 0.814 0.646 0.487 0.41 0.256 0.084 -0.098 -0.195 -0.54 -0.503 -0.619 -0.744 -1.006 -1.138 -1.278 -1.441 -1.617 -1.813 -2.095 -2.611 -8 ,9520 ,KEBNE ,17022568,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:57 CET,0.0 0.728 0.968 1.157 1.33 1.511 1.672 1.842 2.141 2.26 2.379 2.373 2.71 2.806 3.0 3.187 3.359 3.442 3.607 3.77 4.001 4.153 4.308 4.508 4.685 4.858 5.029 5.203 5.424 5.623 5.818 6.056 6.281 6.493 6.725 6.968 7.193 7.441 7.696 7.98 8.297 8.611 8.951 9.312 9.706 10.085 10.458 10.793 11.079 11.227 11.111 10.609 9.94 9.284 8.665 8.065 7.539 7.065 6.662 6.252 5.878 5.53 5.21 4.913 4.634 4.393 4.143 3.9 3.689 3.486 3.281 3.103 2.907 2.699 2.549 2.402 2.247 2.08 1.891 1.761 1.624 1.408 1.252 1.088 1.011 0.849 0.666 0.482 0.393 0.061 0.094 -0.021 -0.143 -0.384 -0.501 -0.629 -0.789 -0.961 -1.142 -1.38 -1.804 -9 ,3373 ,KEBNE ,17022569,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:25 CET,0.0 0.431 0.7 0.91 1.106 1.292 1.464 1.615 1.882 2.011 2.129 2.124 2.483 2.588 2.77 2.953 3.131 3.216 3.392 3.562 3.804 3.957 4.1 4.311 4.515 4.702 4.877 5.043 5.262 5.466 5.653 5.881 6.091 6.271 6.471 6.719 6.97 7.216 7.472 7.755 8.044 8.346 8.686 9.003 9.322 9.634 9.939 10.291 10.615 10.73 10.537 9.993 9.378 8.766 8.196 7.633 7.101 6.637 6.224 5.802 5.436 5.108 4.801 4.474 4.174 3.921 3.622 3.343 3.116 2.887 2.644 2.443 2.244 2.019 1.83 1.645 1.461 1.274 1.084 0.953 0.822 0.618 0.468 0.317 0.239 0.075 -0.099 -0.295 -0.396 -0.744 -0.727 -0.849 -0.968 -1.207 -1.334 -1.47 -1.621 -1.812 -2.031 -2.304 -2.86 -10 ,4023 ,KEBNE ,17022570,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:15 CET,0.0 0.548 0.817 1.031 1.213 1.376 1.526 1.667 1.946 2.067 2.177 2.152 2.492 2.594 2.785 2.978 3.161 3.253 3.429 3.586 3.828 3.99 4.136 4.336 4.525 4.698 4.883 5.069 5.284 5.491 5.695 5.928 6.136 6.339 6.579 6.852 7.114 7.392 7.681 7.974 8.269 8.591 8.936 9.267 9.623 9.935 10.235 10.567 10.912 11.137 11.062 10.548 9.927 9.321 8.745 8.221 7.739 7.277 6.87 6.418 6.02 5.679 5.328 4.992 4.705 4.45 4.18 3.939 3.72 3.484 3.229 3.011 2.793 2.589 2.444 2.298 2.139 1.971 1.8 1.671 1.527 1.315 1.173 1.032 0.96 0.821 0.687 0.543 0.46 0.136 0.202 0.104 -0.003 -0.223 -0.343 -0.465 -0.605 -0.789 -0.976 -1.218 -1.741 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_61_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_61_50.txt deleted file mode 100644 index 4b1026d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_61_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26723 ,KEBNE ,17022571,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:15 CET,0.0 0.622 0.908 1.106 1.265 1.396 1.517 1.63 1.831 1.923 2.016 1.968 2.262 2.335 2.487 2.621 2.738 2.788 2.886 2.99 3.133 3.214 3.292 3.403 3.506 3.612 3.73 3.864 4.029 4.167 4.28 4.406 4.522 4.614 4.709 4.811 4.898 4.994 5.096 5.185 5.285 5.38 5.396 5.389 5.337 5.199 4.973 4.576 3.943 2.884 0.926 -1.43 -3.376 -5.099 -6.598 -7.87 -8.944 -9.915 -10.74 -11.534 -12.228 -12.851 -13.427 -13.958 -14.433 -14.854 -15.313 -15.741 -16.109 -16.486 -16.875 -17.194 -17.511 -17.834 -18.097 -18.386 -18.68 -18.969 -19.264 -19.461 -19.671 -20.029 -20.268 -20.499 -20.62 -20.881 -21.152 -21.403 -21.536 -21.924 -21.991 -22.147 -22.31 -22.64 -22.805 -22.976 -23.193 -23.456 -23.749 -24.087 -24.714 -2 ,1362 ,KEBNE ,17022572,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:57 CET,0.0 0.857 1.169 1.419 1.61 1.773 1.909 2.023 2.235 2.328 2.409 2.358 2.658 2.729 2.873 3.025 3.16 3.227 3.356 3.476 3.649 3.754 3.841 3.957 4.07 4.175 4.286 4.395 4.518 4.639 4.745 4.863 4.989 5.09 5.201 5.317 5.418 5.539 5.639 5.73 5.814 5.855 5.873 5.887 5.867 5.759 5.532 5.12 4.444 3.327 1.348 -1.039 -2.999 -4.645 -6.065 -7.321 -8.413 -9.408 -10.208 -10.971 -11.643 -12.229 -12.777 -13.304 -13.797 -14.25 -14.719 -15.125 -15.466 -15.814 -16.185 -16.501 -16.825 -17.166 -17.444 -17.732 -18.016 -18.295 -18.576 -18.776 -18.999 -19.338 -19.566 -19.797 -19.908 -20.144 -20.392 -20.651 -20.79 -21.172 -21.236 -21.395 -21.564 -21.912 -22.093 -22.295 -22.502 -22.736 -23.039 -23.464 -24.173 -3 ,9690 ,KEBNE ,17022573,Wed Dec 22 06:33:52 CET,Wed Dec 22 07:56:01 CET,0.0 1.598 1.991 2.215 2.383 2.524 2.647 2.757 2.969 3.066 3.158 3.099 3.391 3.467 3.616 3.753 3.897 3.972 4.113 4.242 4.42 4.526 4.61 4.713 4.811 4.9 4.989 5.082 5.196 5.3 5.403 5.534 5.662 5.784 5.889 6.029 6.202 6.37 6.538 6.695 6.812 6.854 6.862 6.844 6.75 6.611 6.348 5.939 5.302 4.155 2.222 -0.119 -2.162 -3.865 -5.267 -6.493 -7.567 -8.525 -9.331 -10.132 -10.817 -11.425 -11.997 -12.527 -13.006 -13.44 -13.911 -14.334 -14.694 -15.061 -15.427 -15.733 -16.071 -16.427 -16.695 -16.975 -17.257 -17.536 -17.833 -18.041 -18.244 -18.553 -18.781 -19.022 -19.141 -19.389 -19.652 -19.928 -20.08 -20.466 -20.52 -20.67 -20.812 -21.135 -21.337 -21.559 -21.767 -21.983 -22.253 -22.644 -23.835 -4 ,9823 ,KEBNE ,17022574,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:45 CET,0.0 0.854 1.116 1.304 1.504 1.689 1.832 1.961 2.179 2.281 2.39 2.373 2.685 2.773 2.938 3.081 3.217 3.282 3.407 3.523 3.678 3.775 3.863 3.989 4.127 4.27 4.404 4.516 4.644 4.765 4.865 4.977 5.087 5.213 5.346 5.486 5.603 5.668 5.749 5.845 5.935 6.009 6.021 5.99 5.944 5.84 5.606 5.223 4.542 3.427 1.544 -0.785 -2.759 -4.447 -5.863 -7.085 -8.139 -9.084 -9.881 -10.695 -11.407 -12.035 -12.635 -13.197 -13.711 -14.17 -14.652 -15.085 -15.452 -15.828 -16.21 -16.522 -16.845 -17.186 -17.439 -17.694 -17.975 -18.261 -18.551 -18.751 -18.947 -19.239 -19.442 -19.652 -19.763 -20.002 -20.253 -20.522 -20.659 -21.031 -21.078 -21.237 -21.399 -21.736 -21.944 -22.169 -22.412 -22.673 -22.914 -23.241 -23.996 -5 ,2277 ,KEBNE ,17022575,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:24 CET,0.0 0.684 0.946 1.164 1.328 1.481 1.643 1.788 2.017 2.128 2.239 2.214 2.532 2.619 2.798 2.972 3.124 3.188 3.311 3.431 3.596 3.706 3.803 3.932 4.045 4.154 4.261 4.367 4.506 4.621 4.72 4.858 4.992 5.118 5.295 5.504 5.682 5.862 6.067 6.267 6.424 6.499 6.5 6.474 6.378 6.214 5.951 5.52 4.829 3.729 1.746 -0.725 -2.72 -4.387 -5.841 -7.121 -8.182 -9.089 -9.871 -10.681 -11.365 -11.947 -12.491 -13.018 -13.529 -13.987 -14.45 -14.876 -15.25 -15.612 -15.951 -16.249 -16.568 -16.888 -17.145 -17.399 -17.648 -17.918 -18.213 -18.415 -18.622 -18.941 -19.152 -19.382 -19.502 -19.74 -19.993 -20.268 -20.413 -20.799 -20.865 -21.024 -21.196 -21.536 -21.719 -21.923 -22.137 -22.377 -22.654 -23.037 -23.969 -6 ,26356 ,KEBNE ,17022576,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:05 CET,0.0 0.768 1.046 1.297 1.484 1.652 1.793 1.9 2.102 2.187 2.264 2.214 2.514 2.585 2.709 2.827 2.941 2.995 3.108 3.226 3.385 3.475 3.562 3.685 3.803 3.926 4.035 4.136 4.255 4.388 4.541 4.697 4.827 4.934 5.045 5.203 5.389 5.559 5.652 5.725 5.791 5.832 5.861 5.857 5.802 5.696 5.468 5.087 4.422 3.277 1.263 -1.174 -3.174 -4.854 -6.292 -7.614 -8.763 -9.713 -10.487 -11.283 -11.971 -12.576 -13.158 -13.716 -14.234 -14.701 -15.181 -15.604 -15.969 -16.348 -16.756 -17.098 -17.43 -17.771 -18.046 -18.316 -18.599 -18.904 -19.198 -19.395 -19.597 -19.921 -20.152 -20.389 -20.515 -20.782 -21.053 -21.32 -21.455 -21.847 -21.946 -22.127 -22.302 -22.66 -22.856 -23.055 -23.267 -23.496 -23.793 -24.222 -25.672 -7 ,2295 ,KEBNE ,17022577,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:58:50 CET,0.0 0.769 1.049 1.253 1.457 1.63 1.758 1.876 2.098 2.204 2.312 2.287 2.59 2.669 2.827 2.972 3.108 3.171 3.297 3.421 3.603 3.713 3.811 3.943 4.053 4.156 4.25 4.342 4.478 4.587 4.695 4.847 4.961 5.052 5.162 5.286 5.398 5.503 5.596 5.679 5.763 5.817 5.851 5.872 5.834 5.715 5.506 5.139 4.488 3.397 1.478 -0.921 -2.937 -4.605 -6.017 -7.285 -8.378 -9.355 -10.175 -10.973 -11.658 -12.268 -12.835 -13.363 -13.845 -14.272 -14.716 -15.127 -15.482 -15.839 -16.215 -16.526 -16.859 -17.203 -17.459 -17.726 -18.008 -18.293 -18.575 -18.783 -18.999 -19.331 -19.552 -19.765 -19.879 -20.119 -20.369 -20.642 -20.783 -21.161 -21.223 -21.389 -21.561 -21.93 -22.129 -22.362 -22.601 -22.842 -23.144 -23.502 -24.303 -8 ,27405 ,KEBNE ,17022578,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:22 CET,0.0 1.088 1.367 1.599 1.789 1.928 2.046 2.159 2.394 2.517 2.629 2.604 2.916 2.993 3.146 3.286 3.414 3.476 3.592 3.708 3.88 3.983 4.083 4.232 4.363 4.476 4.581 4.688 4.819 4.933 5.038 5.155 5.267 5.365 5.496 5.649 5.767 5.879 6.005 6.15 6.244 6.267 6.317 6.35 6.283 6.122 5.853 5.441 4.781 3.737 1.822 -0.519 -2.433 -4.134 -5.551 -6.755 -7.785 -8.701 -9.506 -10.326 -11.013 -11.621 -12.182 -12.678 -13.142 -13.569 -14.025 -14.421 -14.754 -15.117 -15.481 -15.777 -16.097 -16.413 -16.651 -16.903 -17.171 -17.45 -17.744 -17.956 -18.17 -18.486 -18.699 -18.914 -19.025 -19.265 -19.513 -19.754 -19.875 -20.246 -20.29 -20.456 -20.623 -20.961 -21.154 -21.382 -21.62 -21.857 -22.153 -22.522 -23.766 -9 ,8722 ,KEBNE ,17022579,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:55 CET,0.0 0.706 1.006 1.258 1.462 1.633 1.795 1.949 2.212 2.317 2.414 2.381 2.677 2.752 2.896 3.023 3.141 3.197 3.312 3.421 3.582 3.685 3.784 3.933 4.063 4.174 4.275 4.362 4.468 4.583 4.7 4.823 4.957 5.079 5.17 5.273 5.355 5.424 5.5 5.578 5.64 5.685 5.73 5.747 5.715 5.64 5.413 4.989 4.363 3.305 1.402 -0.997 -3.01 -4.672 -6.089 -7.362 -8.445 -9.38 -10.219 -11.062 -11.764 -12.377 -12.942 -13.476 -13.97 -14.409 -14.861 -15.265 -15.609 -15.975 -16.366 -16.676 -16.983 -17.305 -17.557 -17.825 -18.108 -18.396 -18.685 -18.879 -19.085 -19.397 -19.608 -19.827 -19.946 -20.21 -20.478 -20.754 -20.893 -21.275 -21.332 -21.488 -21.65 -21.989 -22.183 -22.402 -22.647 -22.927 -23.244 -23.65 -24.755 -10 ,11133 ,KEBNE ,17022580,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:25 CET,0.0 1.179 1.514 1.719 1.892 2.052 2.185 2.298 2.537 2.652 2.75 2.711 3.01 3.093 3.267 3.431 3.593 3.665 3.783 3.896 4.068 4.184 4.29 4.431 4.58 4.725 4.86 4.984 5.126 5.27 5.406 5.537 5.668 5.798 5.907 6.015 6.117 6.221 6.323 6.39 6.456 6.517 6.516 6.478 6.423 6.325 6.124 5.76 5.116 4.026 2.128 -0.26 -2.235 -3.884 -5.296 -6.532 -7.619 -8.604 -9.418 -10.227 -10.917 -11.531 -12.138 -12.72 -13.25 -13.714 -14.191 -14.619 -14.984 -15.363 -15.767 -16.084 -16.4 -16.742 -17.002 -17.264 -17.531 -17.799 -18.093 -18.3 -18.507 -18.837 -19.069 -19.315 -19.445 -19.701 -19.944 -20.195 -20.334 -20.706 -20.77 -20.933 -21.11 -21.476 -21.679 -21.921 -22.157 -22.383 -22.653 -23.002 -24.039 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_61_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_61_65.txt deleted file mode 100644 index a770a62c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_61_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4587 ,TETRA ,17525104,Wed Nov 24 23:56:15 CET,Thu Nov 25 01:47:14 CET,0.0 2.253 2.655 2.919 3.154 3.383 3.588 3.764 4.084 4.236 4.387 4.423 4.758 4.865 5.052 5.241 5.437 5.527 5.7 5.862 6.075 6.217 6.361 6.558 6.738 6.905 7.054 7.2 7.399 7.588 7.761 7.959 8.143 8.321 8.511 8.698 8.876 9.057 9.238 9.419 9.587 9.767 9.95 10.102 10.221 10.267 10.248 10.105 9.759 9.116 7.76 5.85 4.202 2.713 1.371 0.185 -0.807 -1.746 -2.6 -3.444 -4.172 -4.823 -5.444 -6.035 -6.593 -7.103 -7.636 -8.11 -8.516 -8.941 -9.383 -9.74 -10.108 -10.492 -10.791 -11.095 -11.393 -11.704 -12.032 -12.244 -12.469 -12.84 -13.099 -13.38 -13.526 -13.817 -14.116 -14.435 -14.606 -15.023 -15.143 -15.334 -15.52 -15.912 -16.144 -16.389 -16.642 -16.935 -17.301 -17.738 -19.048 -2 ,256 ,TETRA ,17525107,Wed Nov 24 23:56:17 CET,Thu Nov 25 01:44:39 CET,0.0 1.408 2.004 2.443 2.725 3.019 3.253 3.441 3.807 3.968 4.113 4.136 4.46 4.565 4.768 4.955 5.142 5.233 5.399 5.552 5.768 5.905 6.031 6.221 6.416 6.579 6.73 6.891 7.101 7.29 7.457 7.652 7.843 7.999 8.178 8.397 8.58 8.76 8.934 9.112 9.275 9.448 9.622 9.739 9.839 9.886 9.862 9.721 9.382 8.694 7.265 5.346 3.657 2.119 0.733 -0.525 -1.607 -2.59 -3.435 -4.26 -4.999 -5.661 -6.284 -6.876 -7.449 -7.988 -8.532 -9.012 -9.44 -9.866 -10.274 -10.626 -11.009 -11.395 -11.691 -11.998 -12.317 -12.64 -12.975 -13.214 -13.464 -13.859 -14.132 -14.398 -14.537 -14.838 -15.149 -15.493 -15.67 -16.085 -16.181 -16.352 -16.552 -17.019 -17.269 -17.537 -17.831 -18.135 -18.539 -19.118 -20.725 -3 ,12173 ,TETRA ,17525109,Wed Nov 24 23:56:17 CET,Thu Nov 25 01:44:44 CET,0.0 1.85 2.268 2.594 2.859 3.114 3.314 3.485 3.786 3.929 4.046 4.042 4.379 4.488 4.681 4.852 5.013 5.092 5.255 5.412 5.609 5.735 5.844 5.985 6.135 6.275 6.42 6.558 6.712 6.865 7.016 7.184 7.34 7.495 7.669 7.86 8.036 8.238 8.442 8.631 8.805 8.983 9.171 9.306 9.432 9.533 9.585 9.517 9.299 8.736 7.265 5.272 3.523 1.973 0.621 -0.635 -1.802 -2.889 -3.809 -4.714 -5.495 -6.192 -6.862 -7.485 -8.052 -8.579 -9.155 -9.69 -10.14 -10.583 -11.034 -11.401 -11.768 -12.16 -12.474 -12.793 -13.122 -13.472 -13.833 -14.085 -14.353 -14.775 -15.068 -15.353 -15.495 -15.799 -16.101 -16.397 -16.564 -16.979 -17.075 -17.258 -17.447 -17.86 -18.093 -18.358 -18.63 -18.914 -19.309 -19.851 -21.668 -4 ,20311 ,TETRA ,17525111,Wed Nov 24 23:56:19 CET,Thu Nov 25 01:44:42 CET,0.0 1.52 1.864 2.143 2.386 2.593 2.799 2.985 3.315 3.477 3.626 3.676 4.032 4.147 4.353 4.537 4.702 4.791 4.97 5.124 5.338 5.468 5.577 5.732 5.893 6.046 6.203 6.362 6.534 6.676 6.823 6.994 7.154 7.329 7.525 7.725 7.916 8.116 8.301 8.473 8.631 8.781 8.921 9.05 9.187 9.251 9.217 9.081 8.727 8.018 6.593 4.603 2.852 1.327 0.006 -1.211 -2.336 -3.395 -4.284 -5.141 -5.898 -6.592 -7.255 -7.862 -8.437 -8.982 -9.542 -10.036 -10.455 -10.872 -11.287 -11.638 -12.006 -12.382 -12.674 -12.982 -13.304 -13.643 -13.992 -14.222 -14.464 -14.843 -15.112 -15.379 -15.512 -15.804 -16.109 -16.419 -16.586 -16.996 -17.088 -17.263 -17.453 -17.869 -18.098 -18.351 -18.641 -18.967 -19.334 -19.783 -21.388 -5 ,22438 ,TETRA ,17525116,Wed Nov 24 23:57:04 CET,Thu Nov 25 01:42:57 CET,0.0 1.529 1.984 2.282 2.513 2.74 2.965 3.16 3.49 3.645 3.791 3.82 4.155 4.268 4.485 4.697 4.904 5.001 5.178 5.333 5.529 5.641 5.753 5.939 6.11 6.277 6.44 6.604 6.816 6.994 7.159 7.364 7.571 7.755 7.95 8.182 8.39 8.579 8.786 8.993 9.167 9.328 9.5 9.651 9.775 9.841 9.839 9.762 9.444 8.712 7.304 5.443 3.825 2.39 1.051 -0.194 -1.331 -2.365 -3.225 -4.098 -4.859 -5.575 -6.251 -6.856 -7.422 -7.94 -8.488 -8.97 -9.375 -9.78 -10.22 -10.596 -10.968 -11.353 -11.657 -11.974 -12.295 -12.619 -12.956 -13.195 -13.443 -13.817 -14.08 -14.357 -14.496 -14.769 -15.048 -15.349 -15.515 -15.934 -16.051 -16.236 -16.427 -16.846 -17.057 -17.297 -17.577 -17.916 -18.292 -18.733 -20.317 -6 ,25726 ,TETRA ,17525118,Wed Nov 24 23:57:04 CET,Thu Nov 25 01:43:42 CET,0.0 1.091 1.504 1.802 2.038 2.23 2.391 2.558 2.897 3.042 3.158 3.154 3.478 3.583 3.789 3.976 4.138 4.21 4.35 4.503 4.725 4.849 4.969 5.14 5.285 5.424 5.563 5.704 5.879 6.029 6.18 6.366 6.54 6.709 6.879 7.058 7.234 7.418 7.588 7.737 7.909 8.107 8.313 8.476 8.6 8.667 8.684 8.59 8.279 7.6 6.153 4.213 2.527 1.022 -0.324 -1.582 -2.671 -3.626 -4.457 -5.311 -6.07 -6.763 -7.422 -8.02 -8.568 -9.082 -9.645 -10.136 -10.545 -10.963 -11.401 -11.76 -12.119 -12.491 -12.785 -13.091 -13.398 -13.694 -13.998 -14.217 -14.463 -14.848 -15.102 -15.388 -15.532 -15.798 -16.077 -16.374 -16.522 -16.92 -17.011 -17.18 -17.367 -17.782 -18.009 -18.251 -18.508 -18.783 -19.104 -19.534 -21.146 -7 ,19825 ,TETRA ,17525120,Wed Nov 24 23:57:04 CET,Thu Nov 25 01:44:50 CET,0.0 2.024 2.472 2.795 3.052 3.26 3.449 3.633 3.96 4.112 4.26 4.3 4.643 4.759 4.968 5.145 5.331 5.422 5.588 5.749 5.986 6.141 6.287 6.478 6.649 6.81 6.957 7.102 7.288 7.463 7.634 7.872 8.104 8.307 8.531 8.783 8.997 9.187 9.406 9.609 9.778 9.949 10.131 10.292 10.404 10.473 10.457 10.281 9.892 9.188 7.833 5.931 4.212 2.663 1.302 0.074 -1.027 -1.984 -2.748 -3.518 -4.205 -4.838 -5.467 -6.077 -6.623 -7.074 -7.559 -8.01 -8.404 -8.816 -9.213 -9.532 -9.87 -10.235 -10.511 -10.794 -11.097 -11.409 -11.735 -11.959 -12.176 -12.524 -12.782 -13.062 -13.202 -13.474 -13.782 -14.12 -14.286 -14.681 -14.782 -14.952 -15.127 -15.5 -15.703 -15.927 -16.189 -16.495 -16.879 -17.363 -18.813 -8 ,2141 ,TETRA ,17525121,Wed Nov 24 23:57:04 CET,Thu Nov 25 01:45:13 CET,0.0 1.417 1.848 2.181 2.431 2.662 2.889 3.094 3.417 3.569 3.725 3.759 4.1 4.214 4.425 4.602 4.764 4.844 5.006 5.162 5.385 5.537 5.678 5.878 6.068 6.25 6.428 6.598 6.8 6.981 7.155 7.349 7.54 7.728 7.924 8.138 8.358 8.579 8.771 8.974 9.21 9.437 9.635 9.798 9.946 10.017 10.005 9.863 9.526 8.829 7.344 5.282 3.41 1.854 0.504 -0.738 -1.831 -2.846 -3.739 -4.604 -5.322 -5.972 -6.609 -7.23 -7.812 -8.345 -8.902 -9.382 -9.775 -10.191 -10.633 -10.992 -11.364 -11.757 -12.061 -12.371 -12.69 -13.023 -13.376 -13.615 -13.862 -14.225 -14.473 -14.749 -14.889 -15.181 -15.492 -15.817 -15.987 -16.404 -16.527 -16.705 -16.884 -17.331 -17.585 -17.836 -18.123 -18.459 -18.822 -19.269 -20.609 -9 ,31881 ,TETRA ,17525123,Wed Nov 24 23:57:03 CET,Thu Nov 25 01:45:07 CET,0.0 1.213 1.567 1.859 2.142 2.408 2.628 2.812 3.129 3.27 3.406 3.427 3.765 3.878 4.094 4.282 4.458 4.551 4.729 4.893 5.127 5.274 5.416 5.607 5.778 5.945 6.111 6.264 6.462 6.652 6.836 7.04 7.226 7.407 7.596 7.791 7.95 8.101 8.249 8.406 8.597 8.808 8.984 9.097 9.193 9.283 9.277 9.113 8.765 8.064 6.655 4.695 2.971 1.448 0.125 -1.041 -2.059 -2.994 -3.819 -4.684 -5.441 -6.088 -6.713 -7.3 -7.837 -8.337 -8.89 -9.371 -9.753 -10.149 -10.576 -10.949 -11.345 -11.739 -12.038 -12.361 -12.697 -13.045 -13.389 -13.617 -13.857 -14.229 -14.488 -14.753 -14.888 -15.165 -15.442 -15.739 -15.898 -16.3 -16.413 -16.61 -16.81 -17.234 -17.467 -17.714 -17.969 -18.243 -18.596 -19.05 -20.23 -10 ,27133 ,TETRA ,17525125,Wed Nov 24 23:57:06 CET,Thu Nov 25 01:44:10 CET,0.0 1.695 2.116 2.421 2.687 2.907 3.119 3.326 3.692 3.842 3.982 4.03 4.391 4.517 4.73 4.912 5.097 5.191 5.366 5.533 5.777 5.921 6.06 6.262 6.439 6.596 6.744 6.885 7.06 7.219 7.371 7.569 7.753 7.907 8.076 8.261 8.431 8.607 8.785 8.943 9.11 9.274 9.418 9.55 9.669 9.729 9.742 9.673 9.382 8.712 7.395 5.564 3.848 2.314 0.981 -0.253 -1.353 -2.364 -3.23 -4.091 -4.837 -5.486 -6.111 -6.718 -7.291 -7.814 -8.359 -8.838 -9.256 -9.677 -10.124 -10.503 -10.881 -11.285 -11.594 -11.906 -12.222 -12.531 -12.854 -13.082 -13.311 -13.663 -13.914 -14.181 -14.321 -14.612 -14.9 -15.204 -15.373 -15.793 -15.924 -16.108 -16.304 -16.687 -16.902 -17.158 -17.44 -17.73 -18.025 -18.455 -19.684 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_63_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_63_53.txt deleted file mode 100644 index a614ff73..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_63_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25713 ,TETRA ,17525135,Wed Nov 24 23:57:05 CET,Thu Nov 25 01:44:29 CET,0.0 0.698 0.941 1.115 1.24 1.36 1.483 1.598 1.784 1.858 1.939 1.844 2.152 2.228 2.378 2.513 2.633 2.691 2.803 2.899 3.039 3.136 3.23 3.369 3.491 3.609 3.728 3.842 3.988 4.12 4.235 4.37 4.508 4.631 4.753 4.896 5.033 5.157 5.287 5.414 5.506 5.555 5.611 5.707 5.824 5.915 5.886 5.619 5.147 4.396 2.969 1.178 -0.329 -1.652 -2.741 -3.691 -4.538 -5.284 -5.924 -6.577 -7.152 -7.646 -8.089 -8.498 -8.895 -9.276 -9.673 -10.017 -10.324 -10.643 -10.951 -11.216 -11.497 -11.775 -11.99 -12.212 -12.437 -12.674 -12.924 -13.086 -13.252 -13.523 -13.71 -13.909 -14.005 -14.193 -14.395 -14.604 -14.711 -15.06 -15.049 -15.168 -15.289 -15.552 -15.692 -15.872 -16.062 -16.251 -16.468 -16.719 -17.158 -2 ,12964 ,TETRA ,17525137,Wed Nov 24 23:57:05 CET,Thu Nov 25 01:44:07 CET,0.0 0.44 0.689 0.841 0.973 1.066 1.162 1.265 1.437 1.504 1.561 1.429 1.724 1.784 1.9 2.005 2.096 2.14 2.22 2.299 2.417 2.498 2.577 2.688 2.795 2.879 2.96 3.049 3.156 3.247 3.328 3.429 3.533 3.633 3.732 3.824 3.917 4.009 4.088 4.162 4.234 4.304 4.377 4.426 4.428 4.36 4.25 4.056 3.685 3.022 1.649 -0.109 -1.615 -2.928 -4.03 -5.016 -5.853 -6.598 -7.28 -7.953 -8.507 -9.01 -9.482 -9.925 -10.343 -10.701 -11.079 -11.429 -11.72 -12.01 -12.313 -12.573 -12.842 -13.114 -13.329 -13.553 -13.792 -14.041 -14.285 -14.445 -14.607 -14.852 -15.027 -15.221 -15.319 -15.513 -15.72 -15.949 -16.072 -16.451 -16.457 -16.586 -16.714 -16.988 -17.137 -17.304 -17.496 -17.715 -17.991 -18.257 -18.685 -3 ,4925 ,TETRA ,17525139,Wed Nov 24 23:57:06 CET,Thu Nov 25 01:44:39 CET,0.0 0.764 0.915 1.087 1.246 1.36 1.47 1.574 1.736 1.816 1.892 1.817 2.137 2.201 2.316 2.429 2.549 2.611 2.724 2.828 2.973 3.057 3.132 3.248 3.361 3.463 3.565 3.669 3.801 3.918 4.027 4.143 4.244 4.34 4.451 4.572 4.689 4.813 4.925 5.039 5.158 5.271 5.373 5.462 5.537 5.565 5.473 5.26 4.879 4.164 2.848 1.114 -0.378 -1.639 -2.726 -3.691 -4.55 -5.315 -5.942 -6.59 -7.141 -7.619 -8.066 -8.491 -8.905 -9.281 -9.675 -10.018 -10.313 -10.625 -10.934 -11.179 -11.444 -11.725 -11.931 -12.145 -12.374 -12.615 -12.847 -12.997 -13.156 -13.419 -13.601 -13.779 -13.871 -14.078 -14.304 -14.53 -14.645 -15.0 -14.987 -15.108 -15.249 -15.563 -15.721 -15.909 -16.109 -16.305 -16.53 -16.843 -17.776 -4 ,28545 ,TETRA ,17525141,Wed Nov 24 23:57:07 CET,Thu Nov 25 01:46:37 CET,0.0 0.604 0.761 0.923 1.069 1.186 1.315 1.435 1.626 1.706 1.787 1.709 2.034 2.107 2.268 2.41 2.534 2.596 2.714 2.823 2.991 3.113 3.227 3.37 3.504 3.644 3.774 3.891 4.03 4.17 4.31 4.473 4.624 4.75 4.897 5.067 5.214 5.359 5.498 5.62 5.735 5.866 5.965 6.045 6.076 6.063 6.032 5.871 5.547 4.847 3.38 1.529 -0.021 -1.343 -2.46 -3.399 -4.184 -4.911 -5.568 -6.245 -6.805 -7.281 -7.748 -8.184 -8.579 -8.946 -9.32 -9.659 -9.97 -10.3 -10.636 -10.91 -11.185 -11.471 -11.687 -11.902 -12.125 -12.375 -12.659 -12.837 -12.997 -13.232 -13.394 -13.563 -13.659 -13.861 -14.078 -14.305 -14.408 -14.763 -14.754 -14.881 -15.018 -15.34 -15.513 -15.704 -15.897 -16.076 -16.319 -16.591 -17.191 -5 ,1538 ,TETRA ,17525142,Wed Nov 24 23:57:07 CET,Thu Nov 25 01:47:35 CET,0.0 0.464 0.642 0.783 0.913 1.018 1.126 1.235 1.419 1.497 1.573 1.484 1.775 1.822 1.915 2.021 2.136 2.186 2.267 2.342 2.458 2.534 2.605 2.715 2.81 2.893 2.978 3.065 3.172 3.267 3.344 3.426 3.503 3.595 3.708 3.798 3.881 3.988 4.113 4.246 4.351 4.445 4.568 4.659 4.721 4.743 4.702 4.571 4.24 3.567 2.249 0.466 -1.075 -2.344 -3.441 -4.425 -5.242 -5.97 -6.608 -7.257 -7.819 -8.323 -8.811 -9.261 -9.665 -10.022 -10.411 -10.764 -11.054 -11.349 -11.65 -11.909 -12.18 -12.448 -12.653 -12.858 -13.067 -13.304 -13.55 -13.713 -13.888 -14.171 -14.37 -14.567 -14.657 -14.839 -15.035 -15.234 -15.343 -15.723 -15.71 -15.823 -15.952 -16.218 -16.351 -16.526 -16.722 -16.941 -17.233 -17.542 -18.381 -6 ,4788 ,TETRA ,17525144,Wed Nov 24 23:57:33 CET,Thu Nov 25 01:45:04 CET,0.0 0.695 0.911 1.07 1.201 1.304 1.403 1.501 1.712 1.804 1.879 1.793 2.106 2.171 2.314 2.439 2.542 2.594 2.692 2.778 2.914 2.999 3.068 3.177 3.286 3.388 3.482 3.553 3.642 3.724 3.807 3.927 4.024 4.108 4.201 4.28 4.345 4.426 4.519 4.591 4.651 4.713 4.77 4.813 4.838 4.855 4.767 4.507 4.07 3.339 1.884 0.036 -1.489 -2.814 -3.919 -4.865 -5.714 -6.479 -7.12 -7.716 -8.239 -8.73 -9.194 -9.615 -9.996 -10.358 -10.733 -11.069 -11.358 -11.651 -11.952 -12.201 -12.464 -12.737 -12.943 -13.155 -13.385 -13.631 -13.874 -14.038 -14.212 -14.469 -14.634 -14.8 -14.889 -15.077 -15.265 -15.462 -15.57 -15.938 -15.942 -16.067 -16.199 -16.471 -16.608 -16.747 -16.917 -17.123 -17.361 -17.647 -18.137 -7 ,31178 ,TETRA ,17525147,Wed Nov 24 23:57:33 CET,Thu Nov 25 01:51:39 CET,0.0 0.607 0.901 1.095 1.209 1.326 1.444 1.56 1.79 1.889 1.977 1.878 2.185 2.247 2.38 2.517 2.654 2.715 2.828 2.931 3.072 3.173 3.266 3.382 3.491 3.6 3.72 3.841 3.984 4.104 4.203 4.33 4.452 4.571 4.711 4.873 5.01 5.136 5.268 5.39 5.516 5.632 5.734 5.823 5.875 5.861 5.804 5.645 5.299 4.599 3.141 1.245 -0.274 -1.567 -2.678 -3.636 -4.472 -5.256 -5.921 -6.569 -7.135 -7.64 -8.137 -8.596 -9.007 -9.393 -9.788 -10.137 -10.428 -10.724 -11.05 -11.322 -11.611 -11.9 -12.125 -12.37 -12.619 -12.884 -13.16 -13.343 -13.526 -13.823 -14.027 -14.241 -14.347 -14.554 -14.771 -14.99 -15.108 -15.504 -15.552 -15.695 -15.837 -16.145 -16.304 -16.48 -16.689 -16.917 -17.154 -17.453 -18.066 -8 ,3107 ,TETRA ,17525149,Wed Nov 24 23:57:33 CET,Thu Nov 25 01:45:24 CET,0.0 0.329 0.499 0.611 0.7 0.789 0.881 0.954 1.08 1.148 1.21 1.094 1.406 1.474 1.601 1.721 1.829 1.875 1.96 2.045 2.173 2.257 2.331 2.428 2.52 2.609 2.697 2.786 2.906 3.004 3.082 3.185 3.287 3.389 3.492 3.593 3.686 3.782 3.863 3.909 3.963 4.02 4.059 4.096 4.098 4.038 3.904 3.653 3.184 2.356 0.937 -0.923 -2.514 -3.857 -5.014 -6.015 -6.894 -7.694 -8.383 -9.081 -9.683 -10.207 -10.698 -11.156 -11.567 -11.93 -12.309 -12.634 -12.91 -13.21 -13.539 -13.805 -14.06 -14.319 -14.523 -14.743 -14.962 -15.191 -15.445 -15.614 -15.78 -16.045 -16.24 -16.432 -16.53 -16.731 -16.925 -17.146 -17.262 -17.625 -17.64 -17.78 -17.913 -18.209 -18.376 -18.554 -18.74 -18.963 -19.234 -19.558 -20.238 -9 ,32443 ,TETRA ,17525151,Wed Nov 24 23:57:34 CET,Thu Nov 25 01:44:58 CET,0.0 0.803 1.009 1.164 1.309 1.435 1.537 1.623 1.78 1.856 1.926 1.83 2.147 2.214 2.327 2.429 2.524 2.571 2.648 2.717 2.822 2.894 2.965 3.072 3.176 3.263 3.346 3.432 3.538 3.64 3.749 3.862 3.96 4.067 4.177 4.285 4.392 4.502 4.605 4.719 4.842 4.94 5.007 5.051 5.056 5.0 4.886 4.705 4.379 3.701 2.332 0.553 -0.912 -2.187 -3.307 -4.285 -5.163 -5.957 -6.632 -7.309 -7.871 -8.386 -8.865 -9.291 -9.697 -10.059 -10.442 -10.796 -11.105 -11.418 -11.729 -11.988 -12.269 -12.576 -12.808 -13.04 -13.279 -13.523 -13.786 -13.964 -14.139 -14.43 -14.621 -14.813 -14.919 -15.124 -15.334 -15.567 -15.683 -16.061 -16.069 -16.195 -16.324 -16.624 -16.786 -16.934 -17.108 -17.326 -17.527 -17.774 -18.256 -10 ,29399 ,TETRA ,17525152,Wed Nov 24 23:57:34 CET,Thu Nov 25 01:45:05 CET,0.0 0.463 0.637 0.793 0.92 1.023 1.121 1.221 1.388 1.469 1.542 1.425 1.737 1.8 1.916 2.021 2.116 2.164 2.258 2.356 2.508 2.592 2.667 2.78 2.894 3.007 3.102 3.197 3.317 3.43 3.544 3.66 3.764 3.858 3.963 4.085 4.187 4.258 4.334 4.453 4.561 4.636 4.719 4.766 4.766 4.725 4.611 4.383 3.957 3.159 1.713 -0.121 -1.633 -2.941 -4.097 -5.102 -6.009 -6.835 -7.531 -8.223 -8.797 -9.295 -9.77 -10.212 -10.614 -10.97 -11.345 -11.695 -11.997 -12.309 -12.626 -12.891 -13.159 -13.432 -13.656 -13.877 -14.105 -14.344 -14.588 -14.758 -14.92 -15.152 -15.316 -15.493 -15.584 -15.794 -16.019 -16.247 -16.366 -16.74 -16.758 -16.905 -17.044 -17.35 -17.524 -17.711 -17.927 -18.14 -18.35 -18.611 -19.191 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_63_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_63_58.txt deleted file mode 100644 index 06983b38..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_63_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9111 ,KEBNE ,17022581,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:05 CET,0.0 0.907 1.241 1.483 1.684 1.858 2.018 2.158 2.44 2.58 2.709 2.734 3.1 3.217 3.415 3.606 3.806 3.902 4.084 4.258 4.504 4.663 4.836 5.099 5.341 5.557 5.756 5.953 6.218 6.475 6.716 7.008 7.294 7.57 7.902 8.274 8.606 8.949 9.33 9.751 10.19 10.664 11.2 11.735 12.354 13.034 13.779 14.545 15.372 16.271 17.186 17.712 17.825 17.734 17.579 17.355 17.1 16.871 16.663 16.439 16.235 16.02 15.785 15.554 15.347 15.163 14.957 14.769 14.608 14.443 14.261 14.106 13.949 13.778 13.653 13.522 13.376 13.226 13.079 12.983 12.882 12.726 12.612 12.482 12.408 12.254 12.11 11.968 11.894 11.593 11.66 11.575 11.485 11.308 11.203 11.098 10.99 10.83 10.645 10.419 9.858 -2 ,26741 ,KEBNE ,17022582,Wed Dec 22 06:33:48 CET,Wed Dec 22 07:59:46 CET,0.0 0.561 0.855 1.132 1.364 1.567 1.751 1.903 2.183 2.332 2.476 2.491 2.847 2.967 3.195 3.398 3.599 3.697 3.891 4.085 4.354 4.524 4.689 4.921 5.15 5.377 5.579 5.772 6.03 6.296 6.557 6.874 7.174 7.433 7.724 8.069 8.39 8.743 9.117 9.518 9.974 10.503 11.118 11.673 12.246 12.895 13.676 14.472 15.319 16.228 17.15 17.637 17.732 17.722 17.612 17.448 17.246 17.029 16.825 16.593 16.385 16.199 16.0 15.792 15.602 15.432 15.246 15.074 14.924 14.767 14.605 14.472 14.328 14.179 14.068 13.946 13.811 13.682 13.545 13.438 13.335 13.167 13.048 12.933 12.87 12.741 12.608 12.466 12.389 12.08 12.151 12.056 11.964 11.749 11.621 11.479 11.328 11.16 10.967 10.688 10.034 -3 ,7889 ,KEBNE ,17022583,Wed Dec 22 06:34:51 CET,Wed Dec 22 08:01:54 CET,0.0 0.853 1.149 1.372 1.621 1.865 2.062 2.218 2.51 2.661 2.803 2.802 3.177 3.317 3.552 3.766 3.985 4.093 4.299 4.486 4.753 4.936 5.115 5.381 5.639 5.878 6.11 6.329 6.614 6.889 7.131 7.431 7.748 8.058 8.41 8.81 9.189 9.58 9.996 10.44 10.899 11.408 12.006 12.612 13.304 14.015 14.772 15.604 16.483 17.387 18.306 18.734 18.726 18.571 18.339 18.077 17.798 17.495 17.206 16.885 16.593 16.335 16.064 15.787 15.533 15.295 15.054 14.849 14.653 14.448 14.248 14.079 13.89 13.697 13.556 13.388 13.199 13.025 12.866 12.742 12.594 12.377 12.237 12.09 12.017 11.869 11.691 11.488 11.391 11.06 11.09 10.98 10.876 10.644 10.509 10.37 10.226 10.056 9.83 9.569 9.018 -4 ,14869 ,KEBNE ,17022584,Wed Dec 22 06:34:51 CET,Wed Dec 22 08:01:32 CET,0.0 0.734 1.05 1.28 1.505 1.703 1.877 2.034 2.328 2.474 2.615 2.629 2.998 3.118 3.341 3.556 3.772 3.886 4.112 4.32 4.597 4.782 4.964 5.228 5.489 5.749 5.993 6.225 6.524 6.796 7.058 7.382 7.727 8.068 8.427 8.815 9.192 9.613 10.028 10.442 10.907 11.432 12.027 12.602 13.218 13.864 14.572 15.336 16.174 17.08 18.096 18.664 18.76 18.687 18.563 18.373 18.13 17.863 17.598 17.304 17.009 16.761 16.522 16.272 16.024 15.767 15.507 15.288 15.095 14.895 14.681 14.489 14.285 14.089 13.933 13.767 13.593 13.408 13.237 13.124 13.0 12.798 12.659 12.524 12.449 12.291 12.125 11.954 11.868 11.534 11.569 11.467 11.365 11.146 11.026 10.893 10.751 10.608 10.416 10.188 9.914 -5 ,32310 ,KEBNE ,17022585,Wed Dec 22 06:34:51 CET,Wed Dec 22 08:01:54 CET,0.0 0.845 1.172 1.423 1.643 1.858 2.05 2.204 2.484 2.635 2.787 2.813 3.17 3.283 3.493 3.692 3.905 4.008 4.187 4.358 4.602 4.767 4.937 5.171 5.393 5.619 5.847 6.068 6.353 6.616 6.848 7.128 7.422 7.697 8.007 8.36 8.685 9.048 9.444 9.861 10.274 10.72 11.26 11.809 12.417 13.051 13.781 14.567 15.439 16.423 17.399 17.949 18.068 17.982 17.801 17.608 17.408 17.196 16.993 16.743 16.537 16.347 16.14 15.93 15.734 15.562 15.38 15.226 15.098 14.95 14.792 14.655 14.503 14.346 14.223 14.091 13.956 13.821 13.684 13.597 13.513 13.373 13.27 13.164 13.108 12.989 12.864 12.718 12.638 12.332 12.393 12.3 12.208 11.987 11.849 11.725 11.591 11.454 11.3 11.083 10.813 -6 ,27347 ,KEBNE ,17022586,Wed Dec 22 06:34:51 CET,Wed Dec 22 08:01:30 CET,0.0 0.521 0.852 1.124 1.352 1.546 1.726 1.887 2.172 2.309 2.453 2.489 2.87 2.996 3.232 3.462 3.679 3.786 3.994 4.186 4.464 4.634 4.806 5.06 5.298 5.529 5.75 5.972 6.252 6.502 6.757 7.087 7.408 7.71 8.038 8.402 8.754 9.133 9.527 9.931 10.372 10.877 11.452 12.0 12.613 13.254 13.933 14.676 15.498 16.421 17.363 17.809 17.854 17.735 17.536 17.282 17.012 16.711 16.436 16.168 15.934 15.718 15.495 15.275 15.063 14.867 14.659 14.468 14.298 14.122 13.94 13.775 13.596 13.428 13.293 13.146 12.993 12.829 12.663 12.548 12.43 12.266 12.143 12.002 11.928 11.778 11.617 11.446 11.358 11.022 11.05 10.938 10.839 10.634 10.488 10.323 10.163 9.995 9.789 9.517 8.924 -7 ,23592 ,KEBNE ,17022587,Wed Dec 22 06:34:51 CET,Wed Dec 22 08:00:55 CET,0.0 0.876 1.281 1.57 1.837 2.092 2.295 2.473 2.788 2.919 3.048 3.052 3.416 3.531 3.754 3.954 4.143 4.238 4.426 4.622 4.909 5.081 5.234 5.461 5.689 5.898 6.104 6.318 6.59 6.841 7.09 7.383 7.66 7.933 8.255 8.619 8.969 9.341 9.733 10.154 10.586 11.065 11.598 12.112 12.717 13.402 14.156 14.918 15.773 16.747 17.744 18.234 18.283 18.157 17.966 17.78 17.572 17.333 17.122 16.916 16.722 16.527 16.33 16.134 15.953 15.788 15.594 15.402 15.234 15.062 14.884 14.735 14.584 14.433 14.309 14.163 13.995 13.828 13.679 13.575 13.46 13.265 13.142 13.028 12.972 12.856 12.725 12.59 12.511 12.196 12.276 12.203 12.115 11.902 11.777 11.643 11.49 11.314 11.121 10.844 10.236 -8 ,850 ,KEBNE ,17022588,Wed Dec 22 06:34:51 CET,Wed Dec 22 08:01:36 CET,0.0 0.634 0.918 1.137 1.325 1.493 1.659 1.82 2.105 2.231 2.353 2.351 2.704 2.823 3.041 3.256 3.473 3.564 3.738 3.921 4.195 4.367 4.527 4.757 4.976 5.195 5.409 5.613 5.867 6.115 6.36 6.648 6.934 7.217 7.56 7.942 8.3 8.68 9.076 9.495 9.902 10.322 10.832 11.397 12.045 12.73 13.466 14.216 15.005 15.825 16.684 17.161 17.261 17.22 17.096 16.861 16.627 16.435 16.252 16.022 15.806 15.591 15.359 15.143 14.939 14.746 14.533 14.346 14.184 14.006 13.809 13.639 13.453 13.261 13.113 12.944 12.768 12.611 12.451 12.34 12.23 12.047 11.923 11.791 11.724 11.587 11.43 11.259 11.174 10.844 10.887 10.782 10.67 10.45 10.332 10.204 10.049 9.856 9.637 9.332 8.823 -9 ,28646 ,KEBNE ,17022589,Wed Dec 22 06:35:53 CET,Wed Dec 22 08:02:23 CET,0.0 0.637 0.936 1.196 1.448 1.665 1.856 2.03 2.379 2.55 2.694 2.691 3.063 3.188 3.434 3.67 3.887 3.98 4.159 4.346 4.607 4.77 4.939 5.197 5.459 5.702 5.922 6.133 6.422 6.711 6.993 7.32 7.641 7.959 8.298 8.684 9.057 9.446 9.885 10.348 10.828 11.36 11.966 12.563 13.238 13.949 14.737 15.562 16.472 17.422 18.293 18.829 18.934 18.849 18.681 18.463 18.264 18.073 17.896 17.7 17.514 17.34 17.163 16.972 16.778 16.592 16.404 16.246 16.097 15.933 15.765 15.623 15.477 15.313 15.182 15.065 14.942 14.806 14.659 14.556 14.454 14.287 14.17 14.056 13.994 13.864 13.721 13.575 13.506 13.201 13.285 13.209 13.121 12.903 12.801 12.715 12.593 12.458 12.334 12.157 11.661 -10 ,27130 ,KEBNE ,17022590,Wed Dec 22 06:34:51 CET,Wed Dec 22 08:02:02 CET,0.0 0.697 1.099 1.415 1.713 1.962 2.15 2.329 2.661 2.805 2.952 3.01 3.387 3.505 3.732 3.945 4.149 4.251 4.461 4.665 4.941 5.12 5.294 5.532 5.749 5.965 6.19 6.412 6.688 6.947 7.203 7.518 7.831 8.135 8.486 8.861 9.218 9.61 10.004 10.416 10.872 11.382 11.956 12.54 13.217 13.937 14.706 15.536 16.42 17.349 18.278 18.682 18.682 18.591 18.413 18.149 17.886 17.594 17.346 17.088 16.815 16.563 16.315 16.083 15.861 15.657 15.443 15.236 15.058 14.864 14.665 14.509 14.338 14.164 14.029 13.894 13.759 13.606 13.443 13.333 13.218 13.012 12.872 12.731 12.661 12.529 12.379 12.207 12.114 11.791 11.829 11.724 11.62 11.402 11.291 11.166 11.032 10.875 10.707 10.524 10.162 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_63_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_63_64.txt deleted file mode 100644 index 04152eed..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_63_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11391 ,TETRA ,17525181,Wed Nov 24 23:59:28 CET,Thu Nov 25 01:48:27 CET,0.0 0.735 0.995 1.173 1.343 1.506 1.639 1.759 1.986 2.094 2.205 2.201 2.528 2.619 2.811 2.987 3.136 3.205 3.347 3.49 3.711 3.861 3.998 4.188 4.383 4.582 4.774 4.948 5.186 5.419 5.626 5.878 6.127 6.381 6.664 6.96 7.27 7.604 7.934 8.29 8.672 9.112 9.633 10.163 10.779 11.444 12.181 13.028 14.027 15.127 16.369 17.222 17.518 17.536 17.437 17.323 17.196 17.024 16.865 16.695 16.516 16.331 16.143 15.962 15.77 15.576 15.414 15.287 15.154 14.989 14.795 14.632 14.467 14.306 14.187 14.064 13.944 13.822 13.697 13.606 13.486 13.288 13.167 13.051 12.988 12.853 12.713 12.572 12.499 12.194 12.239 12.137 12.032 11.808 11.687 11.562 11.424 11.262 11.084 10.864 10.383 -2 ,16542 ,TETRA ,17525182,Wed Nov 24 23:59:28 CET,Thu Nov 25 01:50:16 CET,0.0 0.538 0.803 0.987 1.153 1.342 1.489 1.619 1.875 1.991 2.098 2.064 2.383 2.476 2.658 2.819 2.97 3.044 3.189 3.334 3.551 3.694 3.837 4.034 4.222 4.404 4.571 4.74 4.971 5.195 5.404 5.657 5.906 6.138 6.404 6.7 6.995 7.321 7.655 8.001 8.365 8.798 9.298 9.797 10.373 10.987 11.696 12.477 13.379 14.427 15.563 16.34 16.635 16.733 16.717 16.629 16.523 16.402 16.249 16.068 15.893 15.715 15.552 15.393 15.227 15.063 14.884 14.734 14.593 14.439 14.281 14.157 14.027 13.888 13.776 13.651 13.51 13.35 13.189 13.092 13.001 12.846 12.714 12.565 12.492 12.344 12.171 11.974 11.867 11.525 11.544 11.435 11.313 11.044 10.912 10.768 10.612 10.458 10.262 9.999 9.346 -3 ,30969 ,TETRA ,17525184,Wed Nov 24 23:59:28 CET,Thu Nov 25 01:45:59 CET,0.0 0.525 0.758 0.969 1.148 1.311 1.459 1.613 1.894 2.011 2.13 2.119 2.463 2.551 2.733 2.92 3.096 3.177 3.333 3.481 3.708 3.863 4.014 4.222 4.42 4.614 4.798 4.989 5.251 5.507 5.743 6.012 6.266 6.524 6.831 7.158 7.476 7.826 8.175 8.549 8.962 9.424 9.93 10.428 11.014 11.638 12.338 13.127 14.054 15.122 16.221 16.971 17.32 17.425 17.405 17.314 17.187 17.04 16.856 16.648 16.486 16.333 16.174 16.023 15.874 15.72 15.549 15.411 15.302 15.175 15.035 14.922 14.801 14.668 14.553 14.433 14.318 14.191 14.051 13.951 13.854 13.707 13.589 13.463 13.405 13.287 13.167 13.039 12.964 12.67 12.728 12.633 12.529 12.301 12.159 11.974 11.776 11.566 11.339 11.053 10.334 -4 ,7890 ,TETRA ,17525187,Thu Nov 25 00:00:22 CET,Thu Nov 25 01:47:57 CET,0.0 0.548 0.817 1.018 1.209 1.359 1.489 1.622 1.863 1.974 2.083 2.067 2.423 2.531 2.725 2.902 3.079 3.174 3.354 3.524 3.783 3.956 4.114 4.312 4.497 4.689 4.883 5.078 5.328 5.573 5.808 6.083 6.349 6.589 6.878 7.209 7.495 7.814 8.163 8.544 8.944 9.366 9.851 10.364 10.97 11.607 12.289 13.047 13.954 14.956 16.027 16.754 17.01 17.074 17.02 16.896 16.755 16.604 16.457 16.266 16.065 15.891 15.715 15.542 15.402 15.28 15.14 15.002 14.885 14.758 14.61 14.479 14.335 14.191 14.084 13.962 13.829 13.685 13.527 13.423 13.321 13.169 13.059 12.928 12.853 12.699 12.548 12.393 12.317 12.015 12.057 11.957 11.852 11.615 11.489 11.353 11.208 11.04 10.802 10.467 9.43 -5 ,14785 ,TETRA ,17525188,Wed Nov 24 23:59:29 CET,Thu Nov 25 01:47:00 CET,0.0 0.626 0.863 1.1 1.315 1.491 1.65 1.786 2.046 2.153 2.255 2.226 2.557 2.646 2.841 3.03 3.19 3.267 3.419 3.557 3.769 3.913 4.046 4.241 4.428 4.61 4.795 4.98 5.223 5.467 5.693 5.959 6.214 6.451 6.745 7.074 7.383 7.717 8.064 8.432 8.819 9.265 9.788 10.307 10.918 11.581 12.308 13.088 14.025 15.061 16.103 16.904 17.316 17.443 17.453 17.401 17.314 17.196 17.06 16.914 16.767 16.628 16.476 16.32 16.186 16.043 15.86 15.7 15.561 15.415 15.265 15.135 14.998 14.85 14.725 14.594 14.461 14.315 14.166 14.063 13.955 13.799 13.705 13.605 13.542 13.41 13.273 13.125 13.04 12.722 12.763 12.666 12.582 12.386 12.264 12.135 11.972 11.791 11.612 11.362 10.628 -6 ,23860 ,TETRA ,17525190,Wed Nov 24 23:59:29 CET,Thu Nov 25 01:46:56 CET,0.0 0.838 1.115 1.343 1.537 1.701 1.863 2.009 2.262 2.387 2.507 2.474 2.818 2.908 3.086 3.262 3.43 3.512 3.656 3.782 3.989 4.137 4.282 4.498 4.704 4.896 5.076 5.263 5.501 5.719 5.94 6.207 6.456 6.701 6.988 7.309 7.64 8.009 8.395 8.806 9.225 9.681 10.217 10.761 11.368 12.02 12.79 13.669 14.637 15.695 16.828 17.527 17.798 17.871 17.877 17.815 17.65 17.459 17.311 17.151 16.978 16.797 16.625 16.468 16.312 16.175 16.032 15.899 15.779 15.645 15.498 15.378 15.243 15.102 15.006 14.909 14.793 14.655 14.509 14.399 14.288 14.13 14.022 13.912 13.851 13.712 13.555 13.405 13.319 12.988 13.03 12.925 12.798 12.539 12.402 12.254 12.088 11.876 11.608 11.257 10.734 -7 ,22238 ,TETRA ,17525192,Wed Nov 24 23:59:33 CET,Thu Nov 25 01:44:59 CET,0.0 0.979 1.235 1.404 1.569 1.71 1.841 1.973 2.207 2.317 2.423 2.373 2.702 2.794 2.971 3.125 3.272 3.354 3.52 3.667 3.873 4.02 4.16 4.355 4.545 4.726 4.91 5.094 5.324 5.536 5.743 5.99 6.231 6.475 6.751 7.05 7.346 7.686 8.048 8.425 8.826 9.27 9.777 10.292 10.88 11.521 12.244 13.017 13.895 14.91 16.045 16.755 17.015 17.101 17.061 16.967 16.873 16.751 16.6 16.43 16.3 16.172 16.026 15.861 15.708 15.572 15.406 15.246 15.101 14.942 14.783 14.66 14.519 14.357 14.225 14.094 13.955 13.789 13.613 13.494 13.372 13.186 13.05 12.913 12.84 12.689 12.542 12.374 12.282 11.952 11.946 11.831 11.724 11.501 11.384 11.267 11.124 10.943 10.748 10.383 9.438 -8 ,27908 ,TETRA ,17525195,Thu Nov 25 00:00:24 CET,Thu Nov 25 01:49:01 CET,0.0 0.796 1.053 1.286 1.464 1.615 1.748 1.881 2.124 2.232 2.332 2.278 2.605 2.689 2.864 3.04 3.204 3.291 3.464 3.622 3.842 3.977 4.121 4.331 4.53 4.725 4.897 5.079 5.323 5.541 5.758 6.022 6.265 6.5 6.798 7.146 7.464 7.815 8.196 8.588 8.988 9.437 9.951 10.465 11.086 11.784 12.546 13.38 14.329 15.376 16.543 17.314 17.628 17.753 17.743 17.672 17.574 17.436 17.286 17.118 16.95 16.779 16.587 16.394 16.217 16.055 15.891 15.749 15.622 15.481 15.34 15.22 15.092 14.95 14.838 14.722 14.591 14.456 14.299 14.185 14.083 13.94 13.835 13.72 13.664 13.543 13.392 13.225 13.146 12.835 12.847 12.741 12.632 12.4 12.278 12.166 12.045 11.882 11.666 11.399 10.939 -9 ,24369 ,TETRA ,17525197,Thu Nov 25 00:00:26 CET,Thu Nov 25 01:47:35 CET,0.0 1.155 1.443 1.671 1.903 2.081 2.215 2.352 2.621 2.746 2.866 2.846 3.181 3.285 3.477 3.645 3.807 3.892 4.052 4.204 4.427 4.571 4.703 4.879 5.056 5.237 5.408 5.573 5.782 5.992 6.209 6.473 6.712 6.929 7.189 7.483 7.774 8.081 8.421 8.801 9.202 9.657 10.196 10.768 11.397 12.042 12.748 13.532 14.423 15.416 16.543 17.304 17.594 17.668 17.623 17.557 17.473 17.32 17.139 16.924 16.74 16.588 16.443 16.288 16.125 15.968 15.811 15.679 15.564 15.426 15.267 15.121 14.973 14.842 14.741 14.622 14.49 14.366 14.236 14.146 14.054 13.89 13.761 13.627 13.565 13.443 13.308 13.175 13.112 12.826 12.87 12.761 12.651 12.424 12.287 12.139 11.992 11.854 11.683 11.416 10.7 -10 ,4826 ,TETRA ,17525199,Thu Nov 25 00:00:24 CET,Thu Nov 25 01:47:55 CET,0.0 0.964 1.31 1.537 1.714 1.889 2.061 2.198 2.42 2.534 2.647 2.625 2.976 3.076 3.265 3.433 3.589 3.68 3.867 4.036 4.284 4.429 4.565 4.78 4.978 5.167 5.36 5.551 5.796 6.033 6.253 6.523 6.799 7.055 7.343 7.682 8.005 8.36 8.74 9.128 9.559 10.035 10.576 11.122 11.723 12.405 13.203 14.028 14.893 15.863 16.976 17.579 17.729 17.734 17.682 17.539 17.323 17.136 16.956 16.734 16.507 16.288 16.093 15.903 15.715 15.511 15.285 15.093 14.908 14.704 14.499 14.344 14.196 14.046 13.917 13.772 13.628 13.481 13.327 13.206 13.075 12.885 12.755 12.614 12.517 12.279 12.04 11.777 11.624 11.223 11.105 10.93 10.748 10.368 10.163 9.922 9.65 9.378 9.089 8.705 7.495 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_63_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_63_65.txt deleted file mode 100644 index 1c62f9c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_63_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21176 ,TETRA ,17525205,Thu Nov 25 00:00:26 CET,Thu Nov 25 01:47:41 CET,0.0 0.608 0.905 1.11 1.287 1.432 1.562 1.686 1.9 2.01 2.113 2.06 2.389 2.476 2.645 2.797 2.945 3.028 3.193 3.338 3.547 3.679 3.798 3.979 4.157 4.336 4.503 4.655 4.86 5.06 5.267 5.516 5.751 5.993 6.254 6.51 6.761 7.051 7.357 7.68 8.019 8.397 8.832 9.243 9.707 10.226 10.766 11.299 11.875 12.561 13.254 13.521 13.441 13.129 12.791 12.434 12.081 11.752 11.429 11.102 10.843 10.595 10.33 10.065 9.796 9.529 9.236 8.985 8.778 8.56 8.324 8.12 7.908 7.686 7.522 7.351 7.167 6.971 6.761 6.603 6.437 6.199 6.036 5.855 5.753 5.546 5.35 5.145 5.037 4.688 4.686 4.562 4.439 4.204 4.05 3.858 3.647 3.436 3.222 2.911 1.674 -2 ,10133 ,TETRA ,17525207,Thu Nov 25 00:01:22 CET,Thu Nov 25 01:48:13 CET,0.0 0.524 0.747 0.939 1.111 1.275 1.423 1.552 1.784 1.894 2.009 1.999 2.348 2.458 2.655 2.833 3.004 3.085 3.234 3.369 3.571 3.711 3.848 4.046 4.234 4.409 4.583 4.765 4.999 5.234 5.45 5.685 5.928 6.149 6.384 6.667 6.933 7.213 7.528 7.864 8.213 8.599 9.04 9.453 9.919 10.416 10.926 11.5 12.192 12.861 13.43 13.746 13.734 13.573 13.329 12.984 12.662 12.352 12.058 11.747 11.473 11.22 10.956 10.71 10.501 10.304 10.072 9.848 9.639 9.415 9.182 8.98 8.776 8.565 8.395 8.211 8.017 7.824 7.604 7.438 7.271 7.036 6.878 6.694 6.596 6.389 6.142 5.864 5.727 5.359 5.36 5.231 5.102 4.831 4.666 4.462 4.272 4.075 3.831 3.473 2.807 -3 ,6655 ,TETRA ,17525208,Thu Nov 25 00:01:22 CET,Thu Nov 25 01:48:31 CET,0.0 0.556 0.835 1.04 1.241 1.404 1.538 1.68 1.939 2.055 2.169 2.155 2.521 2.64 2.842 3.024 3.186 3.266 3.439 3.616 3.855 3.996 4.134 4.34 4.537 4.734 4.93 5.121 5.378 5.619 5.842 6.103 6.353 6.597 6.859 7.137 7.414 7.722 8.044 8.397 8.783 9.194 9.632 10.048 10.525 11.067 11.664 12.268 12.943 13.662 14.328 14.5 14.314 14.083 13.788 13.432 13.111 12.76 12.449 12.148 11.862 11.599 11.324 11.065 10.833 10.621 10.392 10.166 9.965 9.76 9.558 9.403 9.24 9.074 8.947 8.801 8.625 8.447 8.258 8.121 7.995 7.793 7.647 7.504 7.427 7.257 7.081 6.906 6.824 6.498 6.547 6.446 6.349 6.145 6.027 5.922 5.806 5.645 5.469 5.254 4.802 -4 ,18031 ,TETRA ,17525210,Thu Nov 25 00:01:22 CET,Thu Nov 25 01:49:37 CET,0.0 0.592 0.853 1.065 1.228 1.372 1.506 1.625 1.854 1.969 2.081 2.041 2.351 2.442 2.634 2.818 2.992 3.071 3.219 3.354 3.54 3.67 3.809 4.004 4.189 4.36 4.524 4.683 4.875 5.064 5.253 5.478 5.7 5.913 6.149 6.419 6.687 6.968 7.274 7.589 7.921 8.309 8.748 9.173 9.65 10.189 10.792 11.448 12.127 12.768 13.351 13.49 13.326 13.121 12.885 12.567 12.256 11.965 11.717 11.459 11.205 10.952 10.694 10.467 10.256 10.056 9.855 9.665 9.496 9.326 9.13 8.971 8.821 8.65 8.506 8.354 8.197 8.031 7.862 7.747 7.62 7.422 7.282 7.122 7.038 6.868 6.695 6.532 6.455 6.136 6.152 6.033 5.923 5.653 5.496 5.349 5.194 5.019 4.831 4.55 3.705 -5 ,18736 ,TETRA ,17525212,Thu Nov 25 00:01:22 CET,Thu Nov 25 01:51:02 CET,0.0 0.729 1.033 1.235 1.403 1.562 1.708 1.825 2.041 2.151 2.256 2.206 2.539 2.627 2.789 2.955 3.111 3.183 3.322 3.461 3.661 3.783 3.906 4.085 4.256 4.429 4.595 4.757 4.965 5.162 5.358 5.583 5.799 6.022 6.277 6.569 6.846 7.145 7.466 7.796 8.126 8.467 8.87 9.303 9.788 10.299 10.875 11.487 12.121 12.762 13.403 13.665 13.607 13.43 13.197 12.935 12.69 12.439 12.187 11.928 11.672 11.423 11.191 10.961 10.733 10.521 10.31 10.105 9.92 9.736 9.54 9.363 9.181 9.001 8.858 8.695 8.512 8.333 8.15 8.007 7.851 7.616 7.448 7.27 7.181 7.004 6.825 6.631 6.533 6.197 6.212 6.094 5.959 5.653 5.475 5.294 5.11 4.936 4.725 4.415 3.366 -6 ,4989 ,TETRA ,17525214,Thu Nov 25 00:01:22 CET,Thu Nov 25 01:48:59 CET,0.0 0.465 0.727 0.987 1.235 1.423 1.587 1.737 1.966 2.075 2.197 2.183 2.52 2.612 2.787 2.947 3.093 3.173 3.336 3.494 3.733 3.884 4.027 4.238 4.449 4.656 4.837 5.002 5.218 5.428 5.621 5.846 6.067 6.293 6.571 6.885 7.161 7.452 7.768 8.103 8.463 8.857 9.321 9.761 10.228 10.762 11.39 12.065 12.755 13.458 14.077 14.254 14.147 13.944 13.634 13.267 12.94 12.619 12.322 11.995 11.682 11.397 11.09 10.765 10.462 10.168 9.826 9.537 9.307 9.06 8.794 8.584 8.384 8.17 7.978 7.772 7.549 7.304 7.06 6.906 6.735 6.434 6.228 6.018 5.909 5.669 5.438 5.198 5.075 4.728 4.729 4.594 4.445 4.098 3.912 3.722 3.521 3.308 3.079 2.748 1.792 -7 ,29588 ,TETRA ,17525216,Thu Nov 25 00:02:22 CET,Thu Nov 25 01:50:19 CET,0.0 0.705 1.003 1.222 1.442 1.662 1.842 1.98 2.223 2.354 2.486 2.459 2.814 2.92 3.106 3.288 3.466 3.551 3.724 3.883 4.104 4.255 4.407 4.615 4.812 4.998 5.183 5.368 5.594 5.825 6.055 6.315 6.556 6.786 7.054 7.359 7.64 7.933 8.24 8.577 8.955 9.384 9.859 10.306 10.825 11.373 11.964 12.624 13.279 13.907 14.472 14.575 14.37 14.048 13.677 13.299 12.903 12.52 12.191 11.837 11.513 11.204 10.893 10.59 10.308 10.053 9.774 9.509 9.267 9.023 8.77 8.54 8.292 8.035 7.841 7.643 7.434 7.223 6.999 6.84 6.694 6.465 6.29 6.109 6.02 5.844 5.622 5.372 5.256 4.897 4.907 4.769 4.627 4.339 4.182 4.018 3.839 3.63 3.38 3.063 2.556 -8 ,26474 ,TETRA ,17525218,Thu Nov 25 00:02:22 CET,Thu Nov 25 01:50:42 CET,0.0 0.435 0.72 0.952 1.145 1.312 1.455 1.583 1.846 1.988 2.111 2.076 2.425 2.53 2.719 2.888 3.039 3.115 3.261 3.399 3.615 3.755 3.882 4.072 4.259 4.438 4.61 4.776 4.97 5.153 5.344 5.573 5.789 6.002 6.248 6.522 6.786 7.066 7.379 7.704 8.027 8.401 8.829 9.254 9.739 10.255 10.778 11.32 11.95 12.619 13.213 13.418 13.347 13.121 12.791 12.451 12.151 11.828 11.531 11.214 10.896 10.607 10.339 10.088 9.847 9.606 9.356 9.15 8.976 8.792 8.6 8.446 8.292 8.116 7.957 7.787 7.607 7.408 7.203 7.078 6.968 6.791 6.657 6.508 6.431 6.271 6.092 5.899 5.796 5.459 5.475 5.358 5.251 5.0 4.85 4.703 4.54 4.315 4.015 3.705 3.053 -9 ,30000 ,TETRA ,17525220,Thu Nov 25 00:02:22 CET,Thu Nov 25 01:49:47 CET,0.0 0.406 0.636 0.813 0.965 1.117 1.249 1.382 1.635 1.753 1.878 1.876 2.211 2.313 2.52 2.709 2.89 2.978 3.164 3.333 3.557 3.699 3.833 4.021 4.206 4.382 4.553 4.718 4.935 5.149 5.354 5.597 5.813 6.023 6.264 6.532 6.799 7.095 7.412 7.758 8.119 8.493 8.914 9.373 9.886 10.402 10.993 11.585 12.21 12.887 13.532 13.835 13.722 13.447 13.183 12.901 12.635 12.391 12.141 11.835 11.554 11.311 11.079 10.854 10.632 10.429 10.229 10.043 9.854 9.641 9.421 9.237 9.038 8.838 8.691 8.534 8.38 8.225 8.053 7.923 7.784 7.572 7.422 7.267 7.182 7.002 6.807 6.603 6.509 6.161 6.148 6.022 5.864 5.528 5.367 5.19 5.004 4.813 4.599 4.277 3.414 -10 ,6000 ,TETRA ,17525222,Thu Nov 25 00:02:23 CET,Thu Nov 25 01:49:01 CET,0.0 0.606 0.816 1.035 1.228 1.382 1.517 1.664 1.93 2.05 2.166 2.131 2.474 2.579 2.785 2.97 3.144 3.225 3.395 3.565 3.805 3.967 4.121 4.337 4.545 4.751 4.939 5.114 5.344 5.566 5.791 6.067 6.326 6.566 6.851 7.186 7.493 7.802 8.127 8.49 8.874 9.277 9.696 10.11 10.578 11.109 11.746 12.388 13.054 13.756 14.375 14.56 14.433 14.18 13.874 13.554 13.248 12.968 12.734 12.456 12.182 11.936 11.689 11.435 11.194 10.954 10.681 10.435 10.233 10.043 9.847 9.673 9.462 9.231 9.053 8.864 8.688 8.516 8.317 8.163 8.021 7.813 7.657 7.511 7.43 7.24 7.029 6.81 6.713 6.37 6.387 6.262 6.119 5.813 5.652 5.468 5.26 5.002 4.712 4.375 3.649 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_64_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_64_54.txt deleted file mode 100644 index 007e70c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_64_54.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,9366 ,KEBNE ,17022593,Wed Dec 22 06:34:55 CET,Wed Dec 22 07:57:05 CET,0.0 0.475 0.768 0.987 1.119 1.238 1.344 1.433 1.601 1.678 1.745 1.66 1.974 2.046 2.158 2.245 2.333 2.378 2.465 2.545 2.658 2.737 2.82 2.94 3.051 3.157 3.265 3.367 3.486 3.59 3.689 3.789 3.882 3.983 4.081 4.181 4.274 4.367 4.448 4.512 4.563 4.604 4.633 4.647 4.63 4.539 4.382 4.104 3.626 2.832 1.423 -0.297 -1.763 -3.029 -4.111 -5.034 -5.838 -6.591 -7.226 -7.839 -8.372 -8.856 -9.303 -9.729 -10.137 -10.489 -10.843 -11.146 -11.407 -11.691 -12.006 -12.278 -12.553 -12.831 -13.042 -13.257 -13.466 -13.681 -13.903 -14.055 -14.213 -14.448 -14.606 -14.775 -14.864 -15.058 -15.263 -15.483 -15.597 -15.939 -15.931 -16.048 -16.177 -16.476 -16.629 -16.778 -16.948 -17.152 -17.396 -17.719 -18.601 -4 ,10540 ,KEBNE ,17022594,Wed Dec 22 06:34:55 CET,Wed Dec 22 07:54:43 CET,0.0 0.838 1.018 1.163 1.293 1.412 1.531 1.632 1.794 1.872 1.955 1.877 2.173 2.241 2.361 2.47 2.586 2.646 2.744 2.83 2.963 3.05 3.138 3.269 3.368 3.451 3.547 3.633 3.73 3.823 3.924 4.039 4.134 4.23 4.362 4.522 4.65 4.776 4.908 5.03 5.138 5.233 5.276 5.269 5.235 5.167 5.033 4.774 4.349 3.619 2.369 0.743 -0.743 -2.025 -3.105 -4.056 -4.876 -5.616 -6.257 -6.88 -7.404 -7.881 -8.344 -8.777 -9.183 -9.538 -9.898 -10.22 -10.509 -10.807 -11.107 -11.35 -11.604 -11.876 -12.085 -12.31 -12.546 -12.777 -13.005 -13.163 -13.329 -13.589 -13.767 -13.942 -14.033 -14.224 -14.423 -14.622 -14.734 -15.096 -15.108 -15.232 -15.354 -15.626 -15.774 -15.913 -16.087 -16.293 -16.508 -16.812 -17.584 -5 ,9324 ,KEBNE ,17022595,Wed Dec 22 06:35:53 CET,Wed Dec 22 08:02:04 CET,0.0 0.338 0.507 0.65 0.785 0.925 1.04 1.134 1.338 1.416 1.49 1.422 1.711 1.772 1.886 1.975 2.054 2.099 2.193 2.28 2.406 2.476 2.549 2.675 2.796 2.912 3.02 3.12 3.238 3.35 3.462 3.597 3.732 3.847 3.974 4.113 4.239 4.359 4.476 4.592 4.671 4.737 4.769 4.773 4.771 4.721 4.569 4.288 3.824 3.052 1.612 -0.191 -1.677 -2.918 -4.0 -4.965 -5.801 -6.562 -7.188 -7.808 -8.335 -8.792 -9.223 -9.612 -9.98 -10.335 -10.691 -11.01 -11.288 -11.582 -11.895 -12.147 -12.401 -12.667 -12.875 -13.08 -13.301 -13.532 -13.749 -13.892 -14.046 -14.303 -14.483 -14.677 -14.774 -14.967 -15.176 -15.393 -15.5 -15.837 -15.83 -15.967 -16.098 -16.354 -16.478 -16.623 -16.785 -16.982 -17.224 -17.478 -17.868 -8 ,8615 ,KEBNE ,17022598,Wed Dec 22 06:35:56 CET,Wed Dec 22 07:57:55 CET,0.0 0.733 0.933 1.094 1.246 1.381 1.475 1.558 1.734 1.83 1.938 1.924 2.247 2.329 2.482 2.612 2.724 2.778 2.875 2.96 3.094 3.178 3.256 3.37 3.469 3.569 3.673 3.774 3.901 4.016 4.138 4.288 4.411 4.535 4.68 4.83 4.959 5.077 5.174 5.233 5.28 5.329 5.357 5.373 5.365 5.265 5.081 4.836 4.437 3.747 2.452 0.75 -0.727 -2.021 -3.136 -4.108 -4.96 -5.721 -6.338 -6.929 -7.451 -7.925 -8.39 -8.85 -9.276 -9.657 -10.057 -10.41 -10.712 -11.025 -11.335 -11.587 -11.858 -12.123 -12.322 -12.539 -12.774 -13.01 -13.248 -13.421 -13.586 -13.835 -14.018 -14.203 -14.293 -14.466 -14.656 -14.865 -14.977 -15.336 -15.336 -15.457 -15.578 -15.857 -16.009 -16.144 -16.281 -16.444 -16.614 -16.818 -17.325 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_65_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_65_61.txt deleted file mode 100644 index 183a86d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_65_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27033 ,KEBNE ,17022601,Wed Dec 22 06:36:54 CET,Wed Dec 22 08:01:38 CET,0.0 1.294 1.738 2.079 2.404 2.681 2.933 3.162 3.545 3.721 3.89 3.978 4.376 4.522 4.818 5.119 5.405 5.536 5.788 6.043 6.423 6.667 6.904 7.236 7.554 7.863 8.168 8.463 8.844 9.219 9.579 10.004 10.412 10.815 11.298 11.852 12.406 12.992 13.575 14.155 14.771 15.532 16.402 17.205 18.083 19.105 20.319 21.619 23.068 24.723 26.676 28.115 28.851 29.222 29.323 29.276 29.212 29.123 29.015 28.858 28.674 28.51 28.349 28.168 27.977 27.791 27.58 27.396 27.236 27.065 26.881 26.719 26.552 26.358 26.196 26.037 25.884 25.716 25.525 25.386 25.247 25.024 24.857 24.686 24.604 24.439 24.267 24.061 23.948 23.619 23.614 23.503 23.371 23.033 22.835 22.633 22.413 22.158 21.822 21.35 19.521 -2 ,4830 ,KEBNE ,17022602,Wed Dec 22 06:36:58 CET,Wed Dec 22 07:59:32 CET,0.0 1.354 1.797 2.167 2.462 2.715 2.953 3.189 3.639 3.839 4.031 4.152 4.57 4.738 5.069 5.385 5.676 5.815 6.099 6.374 6.753 6.984 7.212 7.55 7.875 8.196 8.504 8.801 9.171 9.531 9.9 10.346 10.768 11.184 11.667 12.182 12.699 13.274 13.878 14.551 15.247 15.958 16.759 17.607 18.548 19.618 20.863 22.184 23.685 25.368 27.334 28.784 29.495 29.871 30.044 30.095 30.062 29.96 29.827 29.648 29.438 29.221 29.007 28.812 28.626 28.435 28.214 28.001 27.826 27.664 27.465 27.273 27.082 26.885 26.725 26.557 26.374 26.178 25.98 25.83 25.673 25.438 25.29 25.134 25.041 24.86 24.67 24.458 24.345 24.0 23.986 23.849 23.698 23.356 23.159 22.953 22.718 22.42 22.086 21.608 19.801 -3 ,6306 ,KEBNE ,17022603,Wed Dec 22 06:36:54 CET,Wed Dec 22 08:03:20 CET,0.0 1.671 2.178 2.565 2.874 3.136 3.37 3.597 4.023 4.201 4.365 4.445 4.827 4.977 5.28 5.561 5.827 5.958 6.21 6.461 6.82 7.04 7.265 7.599 7.914 8.222 8.513 8.774 9.11 9.439 9.762 10.161 10.543 10.915 11.344 11.837 12.319 12.834 13.427 14.077 14.746 15.506 16.339 17.122 18.03 19.049 20.164 21.386 22.842 24.515 26.338 27.656 28.328 28.652 28.774 28.796 28.734 28.636 28.54 28.4 28.224 28.026 27.813 27.568 27.328 27.135 26.93 26.752 26.603 26.427 26.224 26.051 25.858 25.665 25.513 25.333 25.152 24.982 24.81 24.684 24.546 24.331 24.184 24.024 23.938 23.735 23.488 23.207 23.072 22.734 22.705 22.578 22.444 22.128 21.954 21.76 21.572 21.374 21.086 20.718 19.668 -4 ,29618 ,KEBNE ,17022604,Wed Dec 22 06:36:54 CET,Wed Dec 22 08:03:08 CET,0.0 2.945 3.502 3.85 4.133 4.397 4.626 4.83 5.222 5.416 5.588 5.671 6.071 6.234 6.554 6.845 7.104 7.231 7.491 7.737 8.079 8.309 8.538 8.852 9.144 9.426 9.693 9.953 10.292 10.622 10.96 11.368 11.747 12.124 12.554 13.015 13.495 14.046 14.649 15.311 16.0 16.792 17.633 18.439 19.419 20.453 21.631 22.96 24.394 25.971 27.809 29.17 29.867 30.205 30.332 30.329 30.258 30.156 30.006 29.798 29.587 29.412 29.248 29.058 28.856 28.663 28.444 28.228 28.05 27.876 27.696 27.53 27.339 27.142 26.993 26.838 26.674 26.49 26.299 26.178 26.034 25.786 25.62 25.451 25.361 25.168 24.975 24.782 24.682 24.35 24.3 24.145 23.991 23.677 23.496 23.276 23.008 22.701 22.372 21.935 20.733 -5 ,930 ,KEBNE ,17022605,Wed Dec 22 06:39:00 CET,Wed Dec 22 08:05:44 CET,0.0 1.746 2.236 2.619 2.934 3.196 3.447 3.689 4.099 4.285 4.472 4.572 4.968 5.12 5.41 5.679 5.93 6.054 6.299 6.532 6.866 7.077 7.289 7.604 7.914 8.213 8.491 8.754 9.103 9.446 9.776 10.184 10.576 10.955 11.396 11.885 12.348 12.849 13.403 14.006 14.616 15.304 16.114 16.932 17.923 19.048 20.268 21.531 22.994 24.694 26.66 28.15 28.855 29.224 29.413 29.476 29.437 29.342 29.231 29.095 28.954 28.789 28.603 28.407 28.213 28.012 27.775 27.538 27.344 27.148 26.927 26.764 26.589 26.376 26.212 26.058 25.888 25.699 25.52 25.406 25.27 25.052 24.913 24.763 24.685 24.515 24.323 24.109 23.997 23.656 23.614 23.463 23.307 22.97 22.772 22.567 22.349 22.08 21.731 21.268 19.376 -6 ,13664 ,KEBNE ,17022606,Wed Dec 22 06:39:00 CET,Wed Dec 22 08:05:55 CET,0.0 1.839 2.329 2.703 3.017 3.302 3.559 3.785 4.193 4.378 4.558 4.668 5.093 5.264 5.577 5.873 6.15 6.283 6.547 6.798 7.152 7.389 7.614 7.921 8.227 8.537 8.836 9.122 9.52 9.907 10.248 10.649 11.053 11.437 11.859 12.34 12.81 13.318 13.861 14.443 15.072 15.784 16.607 17.441 18.406 19.449 20.619 21.872 23.286 24.912 26.801 28.219 28.912 29.263 29.366 29.305 29.213 29.112 28.949 28.721 28.496 28.304 28.117 27.92 27.747 27.571 27.37 27.189 27.016 26.83 26.657 26.529 26.39 26.228 26.079 25.92 25.757 25.58 25.39 25.258 25.118 24.88 24.714 24.54 24.45 24.273 24.074 23.853 23.729 23.381 23.368 23.221 23.048 22.645 22.436 22.252 22.054 21.813 21.502 21.032 18.972 -7 ,16670 ,KEBNE ,17022607,Wed Dec 22 06:38:59 CET,Wed Dec 22 08:05:00 CET,0.0 1.366 1.92 2.221 2.468 2.698 2.941 3.174 3.578 3.763 3.944 4.067 4.479 4.643 4.962 5.25 5.524 5.669 5.96 6.235 6.63 6.881 7.121 7.473 7.811 8.118 8.408 8.681 9.015 9.343 9.674 10.076 10.454 10.799 11.196 11.679 12.143 12.639 13.188 13.746 14.322 14.994 15.769 16.542 17.454 18.469 19.643 20.949 22.42 24.091 26.095 27.643 28.424 28.811 28.965 28.976 28.892 28.749 28.587 28.406 28.22 28.019 27.828 27.639 27.451 27.283 27.077 26.855 26.658 26.453 26.254 26.085 25.897 25.703 25.547 25.393 25.226 25.03 24.803 24.658 24.526 24.303 24.14 23.941 23.833 23.627 23.393 23.14 23.016 22.673 22.64 22.492 22.338 21.98 21.792 21.61 21.383 21.088 20.713 20.22 18.587 -8 ,3189 ,KEBNE ,17022608,Wed Dec 22 06:39:00 CET,Wed Dec 22 08:05:39 CET,0.0 1.339 1.824 2.2 2.531 2.803 3.061 3.299 3.696 3.875 4.049 4.132 4.529 4.675 4.963 5.248 5.518 5.654 5.93 6.197 6.569 6.81 7.047 7.381 7.693 7.993 8.295 8.604 8.998 9.364 9.718 10.144 10.562 10.984 11.466 11.994 12.499 13.059 13.668 14.32 15.028 15.797 16.575 17.306 18.227 19.275 20.501 21.898 23.396 25.055 26.935 28.358 28.996 29.26 29.376 29.414 29.371 29.271 29.128 28.937 28.752 28.582 28.411 28.217 28.028 27.839 27.612 27.42 27.262 27.098 26.935 26.802 26.658 26.489 26.35 26.197 26.027 25.831 25.604 25.448 25.29 25.061 24.901 24.717 24.624 24.427 24.205 23.957 23.833 23.467 23.382 23.211 23.027 22.624 22.41 22.19 21.942 21.607 21.193 20.715 17.849 -9 ,28940 ,KEBNE ,17022609,Wed Dec 22 06:39:00 CET,Wed Dec 22 08:04:53 CET,0.0 1.618 2.144 2.502 2.83 3.121 3.407 3.658 4.07 4.274 4.476 4.611 5.032 5.193 5.498 5.798 6.097 6.244 6.53 6.809 7.204 7.454 7.701 8.064 8.416 8.752 9.075 9.382 9.777 10.159 10.53 10.987 11.418 11.849 12.364 12.951 13.524 14.134 14.783 15.486 16.199 17.004 17.966 18.911 19.966 21.074 22.274 23.537 24.999 26.676 28.617 30.013 30.632 30.939 31.061 31.047 30.984 30.886 30.756 30.594 30.433 30.259 30.045 29.836 29.647 29.438 29.215 29.02 28.837 28.624 28.406 28.23 28.035 27.857 27.722 27.553 27.361 27.158 26.941 26.784 26.61 26.318 26.12 25.922 25.823 25.646 25.467 25.276 25.168 24.833 24.811 24.675 24.533 24.204 24.001 23.808 23.582 23.271 22.946 22.517 20.968 -10 ,30476 ,KEBNE ,17022610,Wed Dec 22 06:38:59 CET,Wed Dec 22 08:04:13 CET,0.0 1.321 1.784 2.152 2.446 2.707 2.959 3.183 3.594 3.788 3.967 4.074 4.476 4.634 4.936 5.233 5.518 5.65 5.907 6.152 6.508 6.745 6.981 7.325 7.651 7.961 8.264 8.556 8.934 9.303 9.663 10.105 10.541 10.977 11.479 12.019 12.541 13.122 13.757 14.426 15.117 15.892 16.792 17.642 18.558 19.588 20.792 22.121 23.615 25.324 27.269 28.675 29.355 29.706 29.862 29.881 29.845 29.785 29.672 29.499 29.285 29.044 28.816 28.605 28.418 28.256 28.075 27.91 27.758 27.561 27.359 27.193 26.996 26.776 26.613 26.454 26.28 26.1 25.909 25.767 25.622 25.412 25.265 25.099 25.009 24.84 24.654 24.432 24.311 23.966 23.951 23.816 23.663 23.308 23.12 22.934 22.709 22.416 22.078 21.685 20.53 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_65_66.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_65_66.txt deleted file mode 100644 index 1be528a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_65_66.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1159 ,TETRA ,17525249,Thu Nov 25 00:05:17 CET,Thu Nov 25 01:53:58 CET,0.0 1.017 1.347 1.581 1.794 1.992 2.166 2.323 2.636 2.791 2.927 2.918 3.273 3.388 3.605 3.814 4.02 4.113 4.296 4.473 4.708 4.858 5.006 5.221 5.427 5.63 5.832 6.037 6.304 6.559 6.813 7.113 7.386 7.643 7.931 8.251 8.567 8.936 9.335 9.762 10.228 10.739 11.313 11.893 12.536 13.222 14.009 14.867 15.834 16.875 17.992 18.774 19.081 19.129 19.068 18.947 18.789 18.608 18.445 18.253 18.067 17.881 17.701 17.543 17.396 17.245 17.079 16.935 16.796 16.635 16.442 16.267 16.097 15.924 15.792 15.652 15.493 15.321 15.132 15.006 14.869 14.629 14.471 14.338 14.278 14.13 13.954 13.762 13.667 13.35 13.387 13.274 13.134 12.812 12.659 12.482 12.273 12.017 11.704 11.346 10.581 -2 ,3351 ,TETRA ,17525251,Thu Nov 25 00:05:13 CET,Thu Nov 25 01:52:20 CET,0.0 0.799 1.043 1.258 1.457 1.616 1.773 1.933 2.236 2.391 2.535 2.535 2.887 3.008 3.247 3.459 3.654 3.748 3.94 4.121 4.369 4.537 4.696 4.92 5.136 5.348 5.545 5.726 5.963 6.193 6.428 6.719 6.99 7.241 7.525 7.843 8.153 8.509 8.885 9.259 9.662 10.133 10.683 11.221 11.826 12.481 13.247 14.147 15.159 16.24 17.397 18.139 18.425 18.475 18.384 18.234 18.074 17.873 17.643 17.375 17.138 16.912 16.669 16.449 16.241 16.034 15.812 15.623 15.455 15.279 15.083 14.898 14.699 14.491 14.344 14.187 14.027 13.86 13.679 13.558 13.43 13.203 13.031 12.865 12.792 12.652 12.488 12.294 12.197 11.877 11.872 11.755 11.633 11.357 11.195 11.004 10.838 10.688 10.497 10.192 9.547 -3 ,29676 ,TETRA ,17525252,Thu Nov 25 00:05:18 CET,Thu Nov 25 01:52:52 CET,0.0 1.014 1.289 1.509 1.686 1.838 1.979 2.12 2.375 2.495 2.616 2.61 2.951 3.055 3.278 3.476 3.667 3.762 3.932 4.096 4.33 4.487 4.648 4.881 5.106 5.327 5.523 5.702 5.943 6.174 6.388 6.642 6.891 7.14 7.42 7.722 8.021 8.355 8.728 9.134 9.55 10.025 10.577 11.113 11.719 12.375 13.111 13.914 14.825 15.813 16.87 17.576 17.825 17.839 17.8 17.73 17.606 17.454 17.297 17.129 16.958 16.773 16.59 16.421 16.245 16.078 15.911 15.744 15.589 15.436 15.274 15.137 14.993 14.829 14.705 14.592 14.472 14.331 14.172 14.052 13.938 13.769 13.64 13.503 13.435 13.284 13.123 12.96 12.88 12.576 12.617 12.518 12.419 12.206 12.084 11.939 11.775 11.593 11.4 11.136 10.534 -4 ,20339 ,TETRA ,17525253,Thu Nov 25 00:05:14 CET,Thu Nov 25 01:52:53 CET,0.0 0.876 1.191 1.419 1.597 1.764 1.928 2.087 2.358 2.484 2.597 2.565 2.907 3.009 3.21 3.397 3.573 3.667 3.859 4.031 4.269 4.429 4.583 4.804 5.007 5.204 5.395 5.575 5.801 6.018 6.242 6.513 6.769 7.021 7.317 7.657 7.985 8.326 8.681 9.08 9.525 10.01 10.543 11.075 11.701 12.379 13.129 13.947 14.878 15.938 17.062 17.794 18.045 18.036 17.921 17.756 17.557 17.336 17.132 16.908 16.696 16.492 16.29 16.087 15.873 15.663 15.454 15.262 15.093 14.909 14.709 14.547 14.373 14.183 14.038 13.899 13.753 13.582 13.393 13.269 13.141 12.934 12.786 12.631 12.558 12.418 12.251 12.054 11.95 11.621 11.644 11.534 11.425 11.17 11.011 10.842 10.672 10.459 10.171 9.742 9.144 -5 ,3689 ,TETRA ,17525255,Thu Nov 25 00:05:14 CET,Thu Nov 25 01:47:43 CET,0.0 0.753 1.068 1.292 1.5 1.694 1.878 2.057 2.396 2.537 2.666 2.689 3.059 3.166 3.367 3.575 3.769 3.861 4.046 4.223 4.468 4.62 4.765 4.974 5.184 5.382 5.57 5.76 6.007 6.25 6.491 6.743 6.973 7.211 7.487 7.805 8.115 8.452 8.812 9.195 9.597 10.038 10.552 11.064 11.642 12.279 13.001 13.803 14.718 15.722 16.817 17.543 17.794 17.835 17.778 17.666 17.52 17.339 17.133 16.913 16.726 16.554 16.363 16.147 15.917 15.683 15.441 15.226 15.045 14.867 14.67 14.48 14.293 14.117 13.977 13.826 13.659 13.495 13.332 13.214 13.096 12.926 12.81 12.666 12.586 12.426 12.242 12.032 11.917 11.568 11.526 11.38 11.228 10.881 10.683 10.456 10.243 10.045 9.8 9.459 8.565 -6 ,18669 ,TETRA ,17525257,Thu Nov 25 00:05:14 CET,Thu Nov 25 01:53:49 CET,0.0 0.727 1.077 1.335 1.545 1.73 1.891 2.036 2.309 2.438 2.558 2.529 2.874 2.979 3.176 3.366 3.547 3.637 3.822 3.989 4.219 4.376 4.529 4.733 4.913 5.103 5.299 5.491 5.741 5.967 6.18 6.431 6.669 6.89 7.138 7.43 7.743 8.097 8.449 8.834 9.257 9.709 10.228 10.763 11.36 12.001 12.765 13.598 14.509 15.566 16.728 17.438 17.74 17.803 17.683 17.477 17.26 17.06 16.869 16.652 16.449 16.255 16.043 15.815 15.609 15.423 15.216 15.022 14.857 14.685 14.488 14.312 14.134 13.951 13.811 13.68 13.544 13.387 13.209 13.083 12.95 12.745 12.616 12.478 12.403 12.255 12.101 11.922 11.826 11.502 11.525 11.4 11.263 10.955 10.787 10.623 10.44 10.199 9.921 9.557 8.852 -7 ,26778 ,TETRA ,17525259,Thu Nov 25 00:05:16 CET,Thu Nov 25 01:53:02 CET,0.0 0.601 0.902 1.128 1.309 1.469 1.627 1.783 2.065 2.179 2.281 2.241 2.592 2.704 2.919 3.122 3.31 3.4 3.571 3.736 3.983 4.142 4.304 4.541 4.757 4.958 5.15 5.342 5.579 5.803 6.023 6.306 6.581 6.842 7.138 7.448 7.735 8.053 8.402 8.766 9.155 9.606 10.123 10.629 11.22 11.861 12.587 13.4 14.338 15.428 16.619 17.458 17.849 18.015 18.056 17.987 17.856 17.689 17.543 17.363 17.174 16.997 16.809 16.611 16.421 16.25 16.073 15.899 15.739 15.574 15.41 15.268 15.097 14.924 14.793 14.658 14.521 14.369 14.208 14.092 13.969 13.773 13.623 13.472 13.399 13.243 13.091 12.917 12.817 12.493 12.533 12.433 12.338 12.124 11.994 11.868 11.74 11.586 11.415 11.209 10.574 -8 ,5107 ,TETRA ,17525261,Thu Nov 25 00:05:15 CET,Thu Nov 25 01:52:18 CET,0.0 1.254 1.602 1.865 2.054 2.212 2.366 2.505 2.766 2.898 3.025 3.004 3.354 3.471 3.69 3.891 4.088 4.182 4.36 4.528 4.767 4.919 5.058 5.27 5.476 5.678 5.878 6.069 6.321 6.559 6.789 7.054 7.299 7.548 7.84 8.168 8.484 8.819 9.182 9.58 10.005 10.505 11.092 11.643 12.266 12.966 13.734 14.541 15.448 16.478 17.481 18.062 18.258 18.232 18.108 17.941 17.718 17.463 17.242 16.98 16.722 16.484 16.251 16.026 15.81 15.594 15.354 15.153 14.986 14.816 14.636 14.478 14.306 14.139 14.012 13.863 13.706 13.538 13.354 13.229 13.105 12.925 12.806 12.674 12.6 12.451 12.298 12.116 12.026 11.719 11.736 11.612 11.497 11.257 11.118 10.949 10.774 10.581 10.341 10.041 9.094 -9 ,28272 ,TETRA ,17525263,Thu Nov 25 00:06:14 CET,Thu Nov 25 01:53:35 CET,0.0 0.561 0.852 1.107 1.32 1.518 1.669 1.799 2.064 2.183 2.292 2.269 2.62 2.725 2.913 3.094 3.267 3.352 3.525 3.692 3.912 4.049 4.196 4.415 4.619 4.826 5.031 5.227 5.48 5.724 5.948 6.208 6.477 6.74 7.037 7.334 7.61 7.944 8.304 8.697 9.126 9.581 10.099 10.613 11.201 11.897 12.72 13.583 14.527 15.558 16.688 17.495 17.793 17.83 17.744 17.618 17.442 17.257 17.076 16.883 16.705 16.531 16.366 16.178 15.98 15.795 15.595 15.411 15.248 15.073 14.904 14.778 14.641 14.473 14.331 14.173 14.01 13.85 13.685 13.565 13.44 13.248 13.11 12.964 12.893 12.743 12.572 12.389 12.283 11.948 11.98 11.881 11.765 11.499 11.362 11.217 11.055 10.829 10.552 10.276 9.732 -10 ,1823 ,TETRA ,17525265,Thu Nov 25 00:07:05 CET,Thu Nov 25 01:54:13 CET,0.0 0.93 1.261 1.473 1.67 1.856 2.018 2.167 2.436 2.56 2.667 2.633 2.974 3.076 3.285 3.479 3.659 3.751 3.939 4.124 4.375 4.522 4.668 4.867 5.056 5.247 5.434 5.617 5.861 6.104 6.328 6.599 6.861 7.108 7.412 7.768 8.1 8.446 8.835 9.252 9.68 10.146 10.674 11.194 11.781 12.434 13.193 14.047 15.008 16.02 17.098 17.845 18.121 18.125 18.047 17.921 17.754 17.605 17.431 17.211 17.031 16.855 16.673 16.507 16.349 16.188 16.002 15.836 15.694 15.545 15.379 15.229 15.075 14.921 14.799 14.67 14.535 14.391 14.243 14.146 14.049 13.891 13.775 13.647 13.571 13.422 13.288 13.128 13.038 12.726 12.74 12.627 12.519 12.313 12.204 12.061 11.897 11.731 11.536 11.204 10.081 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_66_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_66_62.txt deleted file mode 100644 index 4eebf846..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_66_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9349 ,KEBNE ,17022611,Wed Dec 22 06:39:00 CET,Wed Dec 22 08:05:27 CET,0.0 0.989 1.41 1.69 1.928 2.165 2.377 2.568 2.959 3.141 3.309 3.388 3.75 3.88 4.141 4.411 4.674 4.8 5.051 5.278 5.582 5.778 5.972 6.26 6.553 6.837 7.094 7.345 7.682 7.999 8.301 8.678 9.032 9.366 9.759 10.217 10.658 11.134 11.649 12.202 12.784 13.447 14.246 15.037 15.947 16.93 18.013 19.199 20.6 22.309 24.358 25.875 26.624 27.053 27.299 27.425 27.449 27.414 27.321 27.18 27.048 26.909 26.755 26.603 26.462 26.34 26.216 26.063 25.895 25.736 25.58 25.449 25.311 25.151 25.027 24.908 24.771 24.609 24.444 24.334 24.22 24.032 23.891 23.748 23.683 23.532 23.339 23.129 23.025 22.712 22.693 22.577 22.46 22.222 22.076 21.898 21.728 21.552 21.305 20.963 20.142 -2 ,25212 ,KEBNE ,17022612,Wed Dec 22 06:39:00 CET,Wed Dec 22 08:05:42 CET,0.0 0.741 1.177 1.566 1.844 2.072 2.289 2.501 2.894 3.069 3.238 3.333 3.729 3.893 4.185 4.459 4.714 4.831 5.066 5.301 5.636 5.857 6.083 6.408 6.715 7.008 7.255 7.491 7.811 8.099 8.369 8.698 9.018 9.334 9.726 10.174 10.592 11.057 11.561 12.158 12.807 13.435 14.158 14.918 15.794 16.775 17.885 19.148 20.615 22.301 24.301 25.783 26.56 26.98 27.177 27.251 27.268 27.241 27.153 27.034 26.92 26.813 26.688 26.519 26.342 26.196 26.056 25.91 25.767 25.614 25.436 25.292 25.161 25.016 24.886 24.746 24.592 24.426 24.26 24.145 24.026 23.84 23.713 23.586 23.52 23.391 23.23 23.037 22.948 22.65 22.667 22.554 22.431 22.175 22.026 21.853 21.633 21.379 21.094 20.743 19.881 -3 ,22586 ,KEBNE ,17022613,Wed Dec 22 06:39:04 CET,Wed Dec 22 08:01:12 CET,0.0 0.833 1.238 1.528 1.744 1.975 2.181 2.37 2.749 2.934 3.11 3.214 3.598 3.756 4.061 4.339 4.613 4.748 5.011 5.269 5.623 5.84 6.06 6.371 6.659 6.962 7.267 7.56 7.953 8.333 8.707 9.148 9.557 9.932 10.347 10.806 11.236 11.705 12.203 12.733 13.298 13.937 14.667 15.404 16.284 17.259 18.372 19.6 20.994 22.587 24.461 25.96 26.705 27.093 27.288 27.355 27.347 27.312 27.22 27.09 26.963 26.803 26.647 26.485 26.296 26.108 25.907 25.72 25.565 25.414 25.262 25.108 24.934 24.749 24.603 24.469 24.328 24.179 24.016 23.899 23.77 23.557 23.414 23.278 23.209 23.051 22.89 22.726 22.644 22.353 22.362 22.242 22.111 21.811 21.665 21.507 21.318 21.117 20.863 20.51 19.175 -4 ,4088 ,KEBNE ,17022614,Wed Dec 22 06:39:03 CET,Wed Dec 22 08:01:46 CET,0.0 0.722 1.062 1.331 1.565 1.785 1.982 2.147 2.487 2.666 2.837 2.951 3.334 3.48 3.758 4.031 4.292 4.413 4.645 4.875 5.223 5.454 5.675 5.98 6.26 6.515 6.768 7.009 7.311 7.615 7.926 8.296 8.633 8.961 9.353 9.811 10.255 10.731 11.219 11.756 12.341 12.974 13.741 14.525 15.404 16.354 17.416 18.628 20.061 21.72 23.676 25.156 25.919 26.327 26.487 26.505 26.465 26.381 26.289 26.163 26.022 25.87 25.706 25.564 25.419 25.277 25.132 24.994 24.854 24.683 24.491 24.33 24.166 24.008 23.874 23.722 23.571 23.427 23.29 23.185 23.071 22.895 22.76 22.598 22.51 22.335 22.161 21.964 21.85 21.511 21.507 21.392 21.249 20.976 20.847 20.685 20.504 20.3 20.046 19.689 18.39 -5 ,1557 ,KEBNE ,17022615,Wed Dec 22 06:39:00 CET,Wed Dec 22 08:04:24 CET,0.0 0.983 1.439 1.755 2.014 2.27 2.512 2.733 3.126 3.309 3.487 3.593 3.975 4.126 4.444 4.741 5.011 5.146 5.395 5.626 5.972 6.198 6.419 6.741 7.063 7.38 7.691 7.982 8.349 8.714 9.065 9.49 9.904 10.296 10.761 11.292 11.797 12.347 12.94 13.577 14.22 14.929 15.778 16.587 17.504 18.565 19.753 21.043 22.526 24.158 25.979 27.396 28.124 28.533 28.703 28.765 28.763 28.68 28.558 28.423 28.314 28.207 28.097 27.974 27.844 27.695 27.519 27.374 27.244 27.085 26.887 26.715 26.546 26.373 26.234 26.094 25.963 25.815 25.643 25.525 25.407 25.232 25.113 24.982 24.914 24.772 24.601 24.417 24.323 24.008 24.005 23.894 23.773 23.496 23.349 23.18 22.992 22.771 22.473 22.037 20.842 -6 ,1513 ,KEBNE ,17022616,Wed Dec 22 06:39:00 CET,Wed Dec 22 08:04:56 CET,0.0 0.797 1.231 1.564 1.827 2.071 2.294 2.5 2.864 3.019 3.165 3.23 3.607 3.763 4.046 4.3 4.554 4.675 4.917 5.145 5.456 5.66 5.856 6.145 6.438 6.714 6.977 7.225 7.53 7.826 8.119 8.48 8.822 9.155 9.557 10.006 10.442 10.904 11.415 11.977 12.525 13.142 13.896 14.659 15.522 16.471 17.544 18.748 20.185 21.845 23.729 25.161 25.917 26.359 26.586 26.64 26.62 26.558 26.457 26.278 26.079 25.905 25.761 25.607 25.427 25.255 25.075 24.919 24.776 24.63 24.482 24.338 24.166 23.967 23.812 23.666 23.537 23.402 23.229 23.101 22.977 22.798 22.67 22.528 22.454 22.302 22.12 21.918 21.83 21.534 21.536 21.432 21.312 21.006 20.836 20.669 20.497 20.326 20.122 19.815 19.099 -7 ,13736 ,KEBNE ,17022617,Wed Dec 22 06:39:00 CET,Wed Dec 22 08:03:36 CET,0.0 0.737 1.151 1.462 1.739 2.004 2.253 2.473 2.874 3.071 3.264 3.367 3.758 3.919 4.216 4.499 4.782 4.92 5.19 5.451 5.812 6.043 6.27 6.6 6.918 7.223 7.524 7.819 8.204 8.583 8.96 9.416 9.8 10.139 10.555 11.047 11.524 12.054 12.618 13.197 13.775 14.439 15.315 16.221 17.145 18.061 19.146 20.34 21.734 23.376 25.251 26.656 27.29 27.587 27.739 27.776 27.737 27.663 27.571 27.452 27.308 27.167 27.01 26.833 26.662 26.508 26.352 26.187 26.026 25.859 25.687 25.53 25.368 25.2 25.053 24.894 24.73 24.558 24.364 24.225 24.094 23.902 23.774 23.64 23.568 23.401 23.218 23.047 22.958 22.656 22.692 22.594 22.476 22.233 22.094 21.924 21.748 21.534 21.276 21.033 20.458 -8 ,4774 ,KEBNE ,17022618,Wed Dec 22 06:38:59 CET,Wed Dec 22 08:05:58 CET,0.0 0.687 1.113 1.45 1.751 2.011 2.221 2.422 2.785 2.953 3.116 3.199 3.568 3.702 3.97 4.225 4.466 4.592 4.844 5.09 5.459 5.685 5.882 6.148 6.387 6.627 6.871 7.107 7.413 7.724 8.06 8.474 8.877 9.266 9.703 10.207 10.684 11.167 11.663 12.188 12.745 13.388 14.111 14.823 15.673 16.587 17.624 18.812 20.233 21.879 23.765 25.207 25.931 26.339 26.542 26.616 26.614 26.544 26.409 26.236 26.1 25.974 25.832 25.673 25.501 25.357 25.204 25.026 24.866 24.715 24.536 24.349 24.168 24.013 23.89 23.751 23.596 23.433 23.264 23.146 23.03 22.863 22.75 22.616 22.538 22.354 22.164 21.976 21.879 21.586 21.624 21.523 21.414 21.164 21.014 20.866 20.719 20.549 20.315 20.007 19.133 -9 ,30491 ,KEBNE ,17022619,Wed Dec 22 06:38:59 CET,Wed Dec 22 08:05:04 CET,0.0 1.396 1.734 2.0 2.221 2.425 2.638 2.825 3.148 3.296 3.449 3.522 3.894 4.047 4.341 4.629 4.923 5.065 5.335 5.562 5.846 6.032 6.232 6.533 6.809 7.066 7.322 7.572 7.898 8.217 8.529 8.914 9.267 9.602 9.992 10.424 10.863 11.352 11.871 12.414 12.966 13.591 14.339 15.075 15.929 16.909 18.02 19.284 20.773 22.464 24.42 25.848 26.515 26.849 27.016 27.069 27.053 26.997 26.914 26.757 26.591 26.434 26.259 26.091 25.955 25.803 25.6 25.42 25.259 25.091 24.921 24.778 24.615 24.433 24.298 24.165 24.03 23.883 23.716 23.603 23.502 23.336 23.201 23.048 22.968 22.794 22.601 22.399 22.3 22.002 22.016 21.887 21.76 21.482 21.311 21.131 20.955 20.776 20.557 20.223 19.38 -10 ,28235 ,KEBNE ,17022620,Wed Dec 22 06:38:59 CET,Wed Dec 22 08:04:10 CET,0.0 0.75 1.11 1.383 1.644 1.851 2.041 2.237 2.613 2.782 2.951 3.058 3.442 3.581 3.854 4.123 4.389 4.517 4.766 5.0 5.333 5.543 5.74 6.047 6.37 6.672 6.965 7.249 7.603 7.946 8.269 8.633 8.964 9.283 9.665 10.103 10.522 10.976 11.463 11.966 12.492 13.104 13.83 14.575 15.421 16.348 17.407 18.557 19.913 21.552 23.506 24.97 25.7 26.114 26.341 26.428 26.415 26.341 26.252 26.135 26.008 25.869 25.708 25.552 25.407 25.274 25.126 24.991 24.868 24.708 24.524 24.367 24.216 24.053 23.909 23.764 23.618 23.458 23.276 23.142 23.0 22.772 22.609 22.434 22.34 22.139 21.927 21.673 21.543 21.213 21.186 21.07 20.946 20.66 20.49 20.298 20.087 19.82 19.471 19.06 18.226 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_66_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_66_64.txt deleted file mode 100644 index 1eda32a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_66_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14756 ,TETRA ,17525297,Thu Nov 25 00:10:04 CET,Thu Nov 25 02:03:51 CET,0.0 1.408 2.007 2.363 2.597 2.812 3.022 3.235 3.6 3.744 3.88 3.975 4.368 4.508 4.75 4.965 5.171 5.27 5.457 5.637 5.897 6.059 6.217 6.447 6.648 6.841 7.04 7.233 7.47 7.688 7.89 8.141 8.384 8.608 8.858 9.13 9.379 9.645 9.949 10.269 10.599 10.963 11.363 11.721 12.056 12.364 12.72 13.03 13.272 13.326 12.947 12.265 11.576 10.9 10.236 9.587 8.999 8.455 7.98 7.492 7.068 6.692 6.326 5.958 5.613 5.305 4.986 4.698 4.447 4.188 3.902 3.676 3.451 3.197 3.001 2.8 2.584 2.355 2.114 1.937 1.762 1.493 1.313 1.143 1.053 0.867 0.663 0.438 0.324 -0.025 -0.05 -0.198 -0.362 -0.706 -0.889 -1.098 -1.325 -1.571 -1.864 -2.324 -4.682 -2 ,9440 ,TETRA ,17525299,Thu Nov 25 00:10:05 CET,Thu Nov 25 01:58:26 CET,0.0 1.168 1.583 1.931 2.256 2.523 2.755 2.967 3.339 3.505 3.675 3.815 4.248 4.397 4.623 4.847 5.081 5.196 5.422 5.654 5.972 6.164 6.348 6.594 6.823 7.044 7.244 7.45 7.724 7.98 8.224 8.495 8.738 8.97 9.23 9.522 9.813 10.122 10.448 10.78 11.13 11.466 11.767 12.07 12.438 12.823 13.169 13.474 13.771 13.92 13.617 12.906 12.201 11.528 10.914 10.349 9.839 9.337 8.882 8.401 7.969 7.575 7.2 6.844 6.504 6.176 5.821 5.508 5.226 4.954 4.67 4.426 4.182 3.911 3.685 3.479 3.287 3.077 2.851 2.696 2.541 2.288 2.107 1.919 1.823 1.616 1.38 1.16 1.042 0.671 0.639 0.494 0.341 0.017 -0.174 -0.389 -0.61 -0.855 -1.152 -1.569 -2.558 -3 ,7594 ,TETRA ,17525301,Thu Nov 25 00:10:09 CET,Thu Nov 25 01:58:44 CET,0.0 3.172 3.532 3.804 4.098 4.342 4.552 4.737 5.026 5.171 5.321 5.377 5.705 5.806 5.992 6.168 6.351 6.439 6.596 6.747 6.972 7.119 7.247 7.419 7.605 7.821 8.059 8.27 8.521 8.745 8.949 9.195 9.418 9.629 9.885 10.185 10.432 10.662 10.943 11.246 11.53 11.857 12.25 12.606 12.917 13.194 13.481 13.738 13.941 14.043 13.824 13.147 12.403 11.698 11.044 10.416 9.885 9.436 9.016 8.541 8.136 7.785 7.45 7.122 6.809 6.533 6.22 5.926 5.682 5.416 5.117 4.872 4.62 4.351 4.132 3.909 3.694 3.459 3.206 3.039 2.881 2.623 2.422 2.219 2.118 1.913 1.692 1.468 1.356 1.006 0.983 0.835 0.678 0.342 0.158 -0.021 -0.281 -0.606 -0.931 -1.325 -2.702 -4 ,20329 ,TETRA ,17525303,Thu Nov 25 00:10:06 CET,Thu Nov 25 01:57:57 CET,0.0 1.84 2.201 2.48 2.762 3.014 3.22 3.422 3.8 3.958 4.094 4.11 4.462 4.593 4.849 5.085 5.295 5.391 5.559 5.74 5.991 6.126 6.28 6.522 6.731 6.911 7.095 7.282 7.5 7.692 7.881 8.116 8.346 8.599 8.874 9.137 9.38 9.638 9.914 10.192 10.487 10.796 11.128 11.45 11.849 12.296 12.686 13.016 13.307 13.465 13.323 12.647 11.888 11.202 10.564 9.95 9.4 8.897 8.451 8.0 7.595 7.215 6.836 6.485 6.173 5.887 5.566 5.269 5.013 4.745 4.476 4.231 3.962 3.709 3.514 3.307 3.094 2.867 2.637 2.474 2.295 2.014 1.824 1.634 1.537 1.331 1.098 0.862 0.75 0.4 0.359 0.216 0.067 -0.275 -0.455 -0.645 -0.876 -1.12 -1.348 -1.604 -2.528 -5 ,16803 ,TETRA ,17525305,Thu Nov 25 00:11:09 CET,Thu Nov 25 02:03:58 CET,0.0 2.659 3.144 3.504 3.753 3.952 4.159 4.356 4.691 4.83 4.959 4.996 5.339 5.462 5.703 5.914 6.12 6.218 6.396 6.57 6.837 7.0 7.159 7.401 7.621 7.825 8.025 8.215 8.447 8.68 8.911 9.143 9.351 9.576 9.866 10.178 10.461 10.791 11.144 11.474 11.777 12.132 12.512 12.845 13.209 13.627 14.084 14.433 14.698 14.843 14.678 14.066 13.384 12.725 12.07 11.463 10.954 10.485 10.067 9.637 9.261 8.925 8.592 8.281 7.999 7.734 7.455 7.22 7.012 6.779 6.542 6.34 6.115 5.885 5.709 5.529 5.347 5.156 4.937 4.78 4.634 4.418 4.264 4.087 3.993 3.805 3.605 3.389 3.276 2.935 2.932 2.812 2.675 2.383 2.218 2.026 1.826 1.564 1.225 0.825 -0.553 -6 ,9374 ,TETRA ,17525307,Thu Nov 25 00:11:09 CET,Thu Nov 25 01:59:45 CET,0.0 1.179 1.728 2.163 2.473 2.745 2.992 3.217 3.638 3.807 3.967 4.061 4.448 4.603 4.881 5.132 5.369 5.49 5.725 5.945 6.271 6.476 6.671 6.95 7.221 7.489 7.739 7.954 8.231 8.494 8.725 8.994 9.268 9.538 9.831 10.148 10.446 10.748 11.059 11.374 11.677 11.994 12.337 12.668 12.994 13.297 13.611 13.911 14.146 14.262 14.04 13.416 12.727 12.115 11.522 10.909 10.379 9.875 9.419 8.94 8.527 8.154 7.774 7.402 7.057 6.735 6.413 6.129 5.87 5.616 5.343 5.116 4.881 4.633 4.448 4.25 4.042 3.829 3.604 3.446 3.283 3.022 2.852 2.686 2.593 2.402 2.201 1.969 1.838 1.471 1.403 1.239 1.074 0.702 0.483 0.23 -0.06 -0.379 -0.752 -1.283 -3.409 -7 ,28585 ,TETRA ,17525310,Thu Nov 25 00:11:11 CET,Thu Nov 25 01:55:40 CET,0.0 1.805 2.235 2.531 2.775 2.976 3.154 3.346 3.69 3.826 3.96 3.987 4.336 4.457 4.7 4.927 5.14 5.241 5.435 5.616 5.859 6.004 6.13 6.324 6.53 6.712 6.889 7.069 7.293 7.489 7.672 7.906 8.113 8.31 8.556 8.837 9.105 9.398 9.674 9.911 10.187 10.513 10.859 11.198 11.583 11.977 12.382 12.733 12.95 13.069 12.92 12.359 11.684 11.013 10.404 9.816 9.284 8.805 8.374 7.922 7.537 7.2 6.875 6.562 6.265 5.998 5.686 5.405 5.181 4.939 4.674 4.461 4.255 4.025 3.851 3.664 3.424 3.153 2.876 2.68 2.476 2.147 1.921 1.698 1.574 1.303 1.032 0.744 0.583 0.191 0.077 -0.101 -0.296 -0.743 -0.985 -1.238 -1.537 -1.929 -2.444 -3.128 -5.151 -8 ,30809 ,TETRA ,17525311,Thu Nov 25 00:12:52 CET,Thu Nov 25 02:03:20 CET,0.0 1.356 1.828 2.211 2.433 2.596 2.777 2.951 3.259 3.408 3.532 3.507 3.836 3.944 4.148 4.325 4.484 4.571 4.744 4.913 5.129 5.26 5.41 5.622 5.8 5.958 6.123 6.282 6.508 6.743 6.943 7.178 7.412 7.655 7.951 8.273 8.564 8.877 9.195 9.469 9.722 10.008 10.299 10.562 10.888 11.248 11.622 12.017 12.418 12.688 12.59 11.987 11.277 10.507 9.765 9.1 8.515 7.987 7.538 7.046 6.581 6.166 5.771 5.413 5.083 4.767 4.435 4.13 3.866 3.616 3.379 3.164 2.924 2.683 2.491 2.289 2.086 1.868 1.636 1.48 1.32 1.078 0.909 0.727 0.623 0.413 0.207 -0.016 -0.143 -0.498 -0.529 -0.665 -0.802 -1.114 -1.302 -1.491 -1.677 -1.889 -2.163 -2.565 -3.671 -9 ,32433 ,TETRA ,17525312,Thu Nov 25 00:12:52 CET,Thu Nov 25 01:59:02 CET,0.0 1.81 2.266 2.677 3.049 3.341 3.574 3.79 4.194 4.372 4.529 4.583 4.94 5.07 5.346 5.599 5.851 5.973 6.19 6.405 6.706 6.897 7.088 7.353 7.594 7.826 8.043 8.25 8.52 8.756 8.964 9.213 9.452 9.691 9.941 10.164 10.381 10.638 10.928 11.235 11.514 11.801 12.122 12.411 12.72 13.013 13.27 13.482 13.606 13.561 13.283 12.659 11.936 11.28 10.665 10.075 9.519 9.018 8.571 8.079 7.643 7.256 6.892 6.547 6.21 5.891 5.586 5.338 5.13 4.896 4.646 4.427 4.184 3.959 3.79 3.596 3.396 3.184 2.948 2.795 2.643 2.418 2.267 2.101 2.019 1.846 1.636 1.408 1.28 0.922 0.88 0.743 0.592 0.255 0.058 -0.157 -0.35 -0.575 -0.864 -1.274 -3.756 -10 ,8883 ,TETRA ,17525314,Thu Nov 25 00:12:53 CET,Thu Nov 25 01:55:45 CET,0.0 1.069 1.591 2.003 2.302 2.564 2.812 3.014 3.368 3.543 3.727 3.811 4.183 4.335 4.617 4.86 5.106 5.224 5.444 5.658 5.952 6.128 6.298 6.562 6.83 7.081 7.306 7.527 7.817 8.095 8.361 8.643 8.876 9.076 9.306 9.563 9.816 10.083 10.348 10.637 10.916 11.203 11.557 11.93 12.303 12.626 12.962 13.278 13.616 13.97 14.049 13.454 12.697 11.981 11.328 10.733 10.163 9.619 9.139 8.623 8.168 7.777 7.431 7.092 6.754 6.431 6.08 5.76 5.488 5.225 4.944 4.704 4.455 4.203 4.009 3.803 3.591 3.373 3.145 2.985 2.822 2.562 2.365 2.17 2.073 1.856 1.642 1.424 1.302 0.942 0.89 0.749 0.603 0.238 0.047 -0.159 -0.408 -0.689 -0.971 -1.353 -2.677 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_67_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_67_26.txt deleted file mode 100644 index f9a98933..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_67_26.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,13700 ,TETRA ,17525325,Thu Nov 25 00:58:34 CET,Thu Nov 25 02:44:36 CET,0.0 1.136 1.584 1.899 2.139 2.363 2.593 2.806 3.191 3.361 3.515 3.577 3.919 4.042 4.287 4.514 4.73 4.839 5.042 5.221 5.489 5.68 5.866 6.142 6.389 6.609 6.835 7.051 7.327 7.587 7.833 8.127 8.389 8.641 8.945 9.287 9.627 10.009 10.4 10.8 11.208 11.651 12.179 12.719 13.334 14.015 14.79 15.605 16.575 17.679 18.847 19.679 20.014 20.084 20.066 19.981 19.867 19.732 19.561 19.35 19.148 18.943 18.756 18.592 18.425 18.259 18.08 17.916 17.768 17.592 17.402 17.252 17.098 16.937 16.804 16.681 16.55 16.381 16.202 16.088 15.976 15.787 15.637 15.476 15.399 15.248 15.087 14.916 14.817 14.509 14.482 14.364 14.243 13.956 13.781 13.587 13.386 13.176 12.948 12.617 11.799 -3 ,29530 ,TETRA ,17525327,Thu Nov 25 00:58:34 CET,Thu Nov 25 02:44:56 CET,0.0 1.453 1.833 2.12 2.357 2.573 2.775 2.963 3.299 3.437 3.571 3.623 3.952 4.067 4.286 4.477 4.657 4.751 4.941 5.133 5.4 5.566 5.728 5.944 6.143 6.339 6.531 6.722 6.99 7.236 7.478 7.801 8.098 8.368 8.68 9.017 9.329 9.673 10.039 10.428 10.834 11.279 11.814 12.361 12.96 13.63 14.429 15.289 16.275 17.417 18.691 19.63 20.049 20.201 20.179 20.067 19.943 19.821 19.705 19.566 19.436 19.292 19.118 18.955 18.81 18.666 18.5 18.349 18.224 18.099 17.954 17.82 17.691 17.575 17.479 17.365 17.24 17.093 16.931 16.824 16.713 16.546 16.438 16.321 16.264 16.146 15.995 15.836 15.757 15.47 15.483 15.381 15.277 15.055 14.938 14.808 14.666 14.481 14.23 13.956 13.353 -4 ,24193 ,TETRA ,17525329,Thu Nov 25 00:58:35 CET,Thu Nov 25 02:35:31 CET,0.0 1.377 1.741 2.042 2.294 2.482 2.655 2.83 3.125 3.261 3.406 3.462 3.818 3.94 4.163 4.388 4.618 4.717 4.889 5.052 5.317 5.5 5.66 5.878 6.105 6.334 6.556 6.767 7.027 7.294 7.566 7.865 8.135 8.416 8.754 9.124 9.474 9.859 10.253 10.646 11.042 11.48 12.016 12.581 13.213 13.908 14.703 15.562 16.596 17.738 18.958 19.805 20.165 20.328 20.362 20.334 20.258 20.118 19.967 19.835 19.71 19.591 19.463 19.32 19.181 19.055 18.92 18.759 18.592 18.429 18.264 18.129 17.978 17.799 17.672 17.552 17.419 17.283 17.139 17.036 16.934 16.759 16.634 16.506 16.438 16.288 16.119 15.956 15.863 15.564 15.563 15.447 15.327 15.088 14.947 14.787 14.63 14.451 14.192 13.792 12.17 -5 ,21806 ,TETRA ,17525331,Thu Nov 25 00:59:29 CET,Thu Nov 25 02:46:17 CET,0.0 1.154 1.464 1.718 1.947 2.157 2.325 2.478 2.765 2.892 3.012 3.027 3.352 3.459 3.672 3.873 4.059 4.148 4.337 4.523 4.76 4.911 5.064 5.294 5.524 5.737 5.941 6.139 6.399 6.651 6.875 7.129 7.391 7.646 7.927 8.281 8.638 9.007 9.411 9.819 10.207 10.649 11.191 11.709 12.299 12.967 13.735 14.582 15.504 16.583 17.791 18.573 18.943 19.133 19.185 19.148 19.071 18.961 18.823 18.667 18.52 18.386 18.248 18.081 17.912 17.772 17.626 17.483 17.352 17.22 17.092 16.971 16.82 16.671 16.565 16.446 16.32 16.195 16.066 15.956 15.835 15.672 15.56 15.431 15.362 15.221 15.07 14.897 14.802 14.497 14.475 14.362 14.241 14.001 13.865 13.696 13.484 13.259 13.028 12.697 11.235 -6 ,26192 ,TETRA ,17525333,Thu Nov 25 00:59:30 CET,Thu Nov 25 02:43:07 CET,0.0 1.027 1.331 1.516 1.694 1.875 2.057 2.215 2.525 2.659 2.77 2.764 3.076 3.176 3.374 3.55 3.731 3.819 3.98 4.136 4.352 4.49 4.632 4.841 5.036 5.225 5.409 5.585 5.81 6.033 6.241 6.477 6.723 6.979 7.276 7.588 7.895 8.228 8.57 8.931 9.31 9.758 10.262 10.735 11.29 11.908 12.62 13.447 14.402 15.459 16.624 17.378 17.702 17.854 17.844 17.738 17.598 17.47 17.344 17.161 16.996 16.836 16.666 16.519 16.376 16.224 16.046 15.872 15.72 15.543 15.363 15.229 15.094 14.956 14.844 14.728 14.621 14.491 14.332 14.242 14.155 13.998 13.882 13.76 13.696 13.57 13.432 13.28 13.206 12.927 12.939 12.835 12.729 12.462 12.309 12.149 11.993 11.836 11.61 11.279 10.097 -7 ,12639 ,TETRA ,17525335,Thu Nov 25 01:00:27 CET,Thu Nov 25 02:45:37 CET,0.0 1.072 1.458 1.812 2.127 2.398 2.6 2.759 3.073 3.223 3.378 3.456 3.78 3.882 4.11 4.344 4.552 4.656 4.865 5.052 5.301 5.46 5.613 5.839 6.057 6.256 6.444 6.628 6.883 7.161 7.438 7.752 8.042 8.315 8.622 8.964 9.302 9.681 10.083 10.531 10.984 11.453 11.974 12.478 13.12 13.845 14.625 15.468 16.435 17.515 18.694 19.543 19.918 20.045 20.039 19.933 19.802 19.642 19.456 19.288 19.141 19.008 18.881 18.742 18.594 18.451 18.301 18.169 18.041 17.889 17.739 17.613 17.474 17.327 17.21 17.078 16.925 16.775 16.622 16.517 16.408 16.229 16.108 15.978 15.903 15.749 15.602 15.449 15.37 15.077 15.106 15.019 14.908 14.653 14.533 14.388 14.219 14.05 13.822 13.404 11.407 -8 ,5943 ,TETRA ,17525337,Thu Nov 25 01:00:29 CET,Thu Nov 25 02:47:11 CET,0.0 1.428 1.942 2.327 2.643 2.907 3.154 3.352 3.648 3.781 3.916 3.963 4.292 4.402 4.623 4.826 5.026 5.116 5.284 5.456 5.716 5.881 6.038 6.266 6.482 6.718 6.969 7.195 7.46 7.709 7.96 8.276 8.58 8.887 9.22 9.566 9.897 10.259 10.636 11.027 11.451 11.9 12.41 12.907 13.478 14.149 14.917 15.748 16.709 17.804 19.011 19.854 20.206 20.325 20.324 20.28 20.215 20.12 19.998 19.842 19.679 19.507 19.351 19.183 19.01 18.858 18.69 18.534 18.388 18.227 18.066 17.942 17.795 17.632 17.51 17.379 17.241 17.096 16.943 16.844 16.745 16.552 16.402 16.252 16.175 16.017 15.856 15.67 15.579 15.297 15.294 15.173 15.044 14.764 14.598 14.433 14.243 14.009 13.711 13.245 11.135 -9 ,2786 ,TETRA ,17525339,Thu Nov 25 01:00:29 CET,Thu Nov 25 02:44:10 CET,0.0 0.49 0.698 0.917 1.115 1.286 1.457 1.612 1.901 2.03 2.145 2.138 2.46 2.569 2.786 2.98 3.165 3.254 3.42 3.583 3.82 3.965 4.103 4.296 4.506 4.726 4.929 5.122 5.376 5.63 5.886 6.212 6.523 6.808 7.129 7.495 7.836 8.189 8.566 8.997 9.457 9.912 10.418 10.946 11.57 12.26 13.044 13.879 14.826 15.926 17.153 18.051 18.448 18.616 18.655 18.589 18.509 18.427 18.308 18.164 18.02 17.874 17.72 17.547 17.381 17.231 17.055 16.889 16.744 16.601 16.453 16.322 16.177 16.014 15.895 15.775 15.64 15.495 15.352 15.254 15.141 14.955 14.828 14.69 14.62 14.479 14.325 14.163 14.07 13.775 13.791 13.678 13.55 13.279 13.108 12.924 12.75 12.552 12.3 11.994 9.746 -10 ,17996 ,TETRA ,17525341,Thu Nov 25 01:01:30 CET,Thu Nov 25 02:45:56 CET,0.0 2.028 2.472 2.812 3.1 3.353 3.589 3.808 4.196 4.365 4.515 4.558 4.91 5.039 5.281 5.502 5.708 5.813 6.009 6.2 6.492 6.676 6.844 7.074 7.291 7.498 7.695 7.901 8.189 8.456 8.69 8.969 9.242 9.5 9.799 10.147 10.479 10.841 11.23 11.642 12.063 12.525 13.068 13.604 14.191 14.837 15.575 16.404 17.357 18.449 19.69 20.524 20.828 20.885 20.84 20.752 20.635 20.501 20.352 20.149 19.96 19.793 19.6 19.381 19.2 19.055 18.889 18.731 18.579 18.422 18.264 18.112 17.944 17.77 17.639 17.507 17.365 17.22 17.061 16.959 16.861 16.69 16.563 16.429 16.359 16.208 16.041 15.864 15.772 15.473 15.45 15.32 15.209 14.956 14.811 14.638 14.438 14.211 13.936 13.527 11.708 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_67_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_67_37.txt deleted file mode 100644 index cfe061a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_67_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18481 ,KEBNE ,17022621,Wed Dec 22 06:38:59 CET,Wed Dec 22 08:04:06 CET,0.0 0.688 0.977 1.181 1.359 1.536 1.696 1.823 2.022 2.122 2.22 2.19 2.488 2.583 2.759 2.896 3.031 3.096 3.22 3.337 3.488 3.582 3.671 3.786 3.889 3.997 4.102 4.2 4.32 4.426 4.53 4.631 4.711 4.785 4.867 4.959 5.04 5.098 5.148 5.189 5.185 5.142 5.004 4.797 4.559 4.251 3.683 2.789 1.529 -0.317 -3.346 -6.841 -9.536 -11.664 -13.408 -14.907 -16.15 -17.244 -18.201 -19.14 -19.904 -20.565 -21.19 -21.757 -22.271 -22.747 -23.241 -23.663 -24.018 -24.388 -24.78 -25.097 -25.406 -25.725 -25.982 -26.246 -26.506 -26.773 -27.044 -27.219 -27.402 -27.7 -27.9 -28.103 -28.212 -28.434 -28.664 -28.9 -29.013 -29.374 -29.394 -29.529 -29.669 -29.957 -30.116 -30.303 -30.504 -30.717 -30.944 -31.181 -31.95 -2 ,11464 ,KEBNE ,17022622,Wed Dec 22 06:38:59 CET,Wed Dec 22 08:05:53 CET,0.0 0.521 0.774 0.985 1.155 1.308 1.448 1.573 1.804 1.904 1.988 1.949 2.246 2.331 2.504 2.671 2.818 2.877 2.974 3.086 3.261 3.347 3.422 3.527 3.618 3.714 3.804 3.885 3.996 4.108 4.216 4.349 4.465 4.571 4.688 4.799 4.897 4.957 4.998 5.038 5.03 5.01 4.977 4.885 4.675 4.331 3.787 2.95 1.695 -0.169 -3.112 -6.473 -9.116 -11.277 -13.014 -14.475 -15.724 -16.848 -17.812 -18.75 -19.537 -20.219 -20.854 -21.443 -21.974 -22.467 -22.978 -23.421 -23.799 -24.19 -24.599 -24.921 -25.244 -25.582 -25.841 -26.098 -26.351 -26.61 -26.884 -27.07 -27.26 -27.563 -27.778 -27.994 -28.096 -28.309 -28.54 -28.783 -28.912 -29.297 -29.32 -29.459 -29.603 -29.914 -30.084 -30.264 -30.469 -30.679 -30.917 -31.223 -31.901 -3 ,10413 ,KEBNE ,17022623,Wed Dec 22 06:38:59 CET,Wed Dec 22 08:05:00 CET,0.0 0.63 0.963 1.183 1.362 1.54 1.708 1.86 2.124 2.248 2.378 2.382 2.676 2.741 2.878 3.001 3.118 3.18 3.291 3.392 3.542 3.622 3.694 3.8 3.91 4.014 4.104 4.187 4.282 4.356 4.442 4.569 4.68 4.765 4.853 4.957 5.006 5.002 5.043 5.095 5.1 5.057 4.885 4.631 4.294 3.835 3.185 2.302 1.059 -0.821 -3.922 -7.448 -10.13 -12.287 -14.093 -15.617 -16.876 -18.005 -18.958 -19.874 -20.636 -21.312 -21.964 -22.565 -23.093 -23.554 -24.049 -24.481 -24.837 -25.207 -25.595 -25.919 -26.243 -26.568 -26.823 -27.096 -27.383 -27.67 -27.96 -28.168 -28.376 -28.684 -28.901 -29.125 -29.234 -29.453 -29.675 -29.911 -30.03 -30.389 -30.407 -30.556 -30.71 -31.059 -31.248 -31.425 -31.643 -31.863 -32.071 -32.419 -33.034 -4 ,7450 ,KEBNE ,17022624,Wed Dec 22 06:39:03 CET,Wed Dec 22 08:05:24 CET,0.0 0.989 1.346 1.568 1.752 1.92 2.087 2.229 2.472 2.58 2.675 2.642 2.961 3.05 3.222 3.378 3.528 3.599 3.704 3.801 3.962 4.069 4.164 4.272 4.376 4.484 4.596 4.699 4.819 4.933 5.044 5.168 5.252 5.31 5.358 5.394 5.432 5.446 5.427 5.416 5.42 5.416 5.367 5.242 4.989 4.562 3.917 3.042 1.771 -0.145 -3.174 -6.616 -9.272 -11.405 -13.223 -14.762 -16.046 -17.186 -18.144 -19.065 -19.831 -20.494 -21.1 -21.67 -22.2 -22.663 -23.142 -23.578 -23.936 -24.3 -24.683 -24.998 -25.318 -25.644 -25.896 -26.145 -26.416 -26.716 -27.009 -27.194 -27.373 -27.67 -27.9 -28.123 -28.228 -28.459 -28.702 -28.94 -29.058 -29.429 -29.421 -29.555 -29.692 -29.988 -30.145 -30.314 -30.502 -30.706 -30.931 -31.186 -31.627 -5 ,23550 ,KEBNE ,17022625,Wed Dec 22 06:38:59 CET,Wed Dec 22 08:05:12 CET,0.0 0.656 0.956 1.159 1.307 1.445 1.569 1.684 1.893 1.984 2.063 1.99 2.276 2.349 2.498 2.625 2.744 2.796 2.895 2.993 3.133 3.225 3.312 3.433 3.544 3.654 3.758 3.854 3.955 4.031 4.115 4.198 4.249 4.291 4.322 4.335 4.364 4.412 4.44 4.44 4.396 4.309 4.194 4.016 3.741 3.345 2.737 1.83 0.487 -1.429 -4.489 -7.992 -10.725 -12.929 -14.742 -16.286 -17.57 -18.686 -19.635 -20.559 -21.343 -22.036 -22.653 -23.208 -23.717 -24.185 -24.662 -25.091 -25.471 -25.85 -26.25 -26.573 -26.889 -27.214 -27.466 -27.736 -28.001 -28.258 -28.536 -28.736 -28.939 -29.236 -29.439 -29.667 -29.788 -30.034 -30.275 -30.519 -30.647 -31.02 -31.044 -31.187 -31.33 -31.647 -31.827 -32.007 -32.211 -32.453 -32.699 -32.99 -33.63 -6 ,3708 ,KEBNE ,17022626,Wed Dec 22 06:39:00 CET,Wed Dec 22 08:05:55 CET,0.0 0.698 1.037 1.29 1.469 1.623 1.793 1.928 2.138 2.238 2.342 2.323 2.631 2.719 2.883 3.031 3.167 3.229 3.342 3.46 3.634 3.744 3.855 4.004 4.132 4.236 4.341 4.448 4.573 4.684 4.781 4.898 4.998 5.087 5.187 5.292 5.376 5.433 5.487 5.56 5.59 5.544 5.454 5.285 4.991 4.572 3.934 3.051 1.815 -0.076 -3.068 -6.566 -9.322 -11.487 -13.293 -14.839 -16.123 -17.224 -18.151 -19.07 -19.837 -20.495 -21.112 -21.69 -22.221 -22.69 -23.155 -23.577 -23.95 -24.322 -24.697 -25.007 -25.325 -25.646 -25.893 -26.157 -26.437 -26.711 -26.987 -27.179 -27.378 -27.683 -27.89 -28.113 -28.226 -28.459 -28.699 -28.938 -29.061 -29.435 -29.461 -29.602 -29.74 -30.038 -30.203 -30.35 -30.526 -30.734 -30.975 -31.261 -32.03 -7 ,1224 ,KEBNE ,17022627,Wed Dec 22 06:39:00 CET,Wed Dec 22 08:04:49 CET,0.0 0.988 1.308 1.55 1.772 1.946 2.103 2.258 2.567 2.704 2.813 2.761 3.038 3.102 3.208 3.321 3.453 3.523 3.651 3.764 3.921 4.018 4.107 4.215 4.328 4.458 4.565 4.638 4.719 4.78 4.839 4.917 4.981 5.024 5.074 5.106 5.104 5.086 5.051 5.012 4.978 4.893 4.719 4.531 4.221 3.734 3.084 2.231 0.999 -0.912 -3.98 -7.383 -10.07 -12.268 -14.066 -15.583 -16.856 -17.965 -18.893 -19.809 -20.582 -21.237 -21.865 -22.465 -22.999 -23.472 -23.954 -24.394 -24.787 -25.194 -25.596 -25.908 -26.223 -26.559 -26.829 -27.108 -27.385 -27.663 -27.949 -28.138 -28.33 -28.631 -28.839 -29.054 -29.162 -29.383 -29.609 -29.843 -29.965 -30.334 -30.349 -30.475 -30.615 -30.912 -31.06 -31.237 -31.446 -31.682 -31.922 -32.157 -32.642 -8 ,22778 ,KEBNE ,17022628,Wed Dec 22 06:39:00 CET,Wed Dec 22 08:06:02 CET,0.0 0.802 1.082 1.3 1.477 1.632 1.765 1.878 2.084 2.184 2.274 2.241 2.531 2.602 2.737 2.855 2.962 3.007 3.095 3.202 3.37 3.471 3.554 3.656 3.744 3.823 3.894 3.962 4.046 4.125 4.198 4.269 4.337 4.392 4.436 4.495 4.546 4.56 4.556 4.551 4.502 4.416 4.298 4.103 3.793 3.375 2.792 1.962 0.738 -1.074 -4.046 -7.389 -9.991 -12.179 -13.971 -15.503 -16.805 -17.937 -18.866 -19.771 -20.547 -21.217 -21.835 -22.4 -22.916 -23.392 -23.879 -24.302 -24.678 -25.067 -25.45 -25.764 -26.107 -26.455 -26.709 -26.97 -27.249 -27.531 -27.801 -27.99 -28.187 -28.48 -28.684 -28.895 -28.999 -29.229 -29.484 -29.744 -29.877 -30.255 -30.282 -30.429 -30.586 -30.939 -31.154 -31.381 -31.596 -31.822 -32.059 -32.333 -33.118 -9 ,19519 ,KEBNE ,17022629,Wed Dec 22 06:40:03 CET,Wed Dec 22 08:05:53 CET,0.0 0.753 1.004 1.183 1.365 1.514 1.636 1.749 1.95 2.044 2.133 2.081 2.382 2.459 2.603 2.742 2.871 2.939 3.061 3.16 3.305 3.407 3.496 3.607 3.712 3.81 3.898 3.972 4.057 4.145 4.24 4.351 4.433 4.482 4.532 4.597 4.627 4.621 4.6 4.578 4.546 4.488 4.348 4.132 3.83 3.415 2.798 1.935 0.701 -1.124 -4.116 -7.549 -10.181 -12.315 -14.084 -15.629 -16.975 -18.151 -19.128 -20.081 -20.863 -21.543 -22.184 -22.779 -23.323 -23.815 -24.329 -24.762 -25.131 -25.516 -25.908 -26.232 -26.554 -26.875 -27.107 -27.339 -27.583 -27.835 -28.107 -28.294 -28.487 -28.793 -29.001 -29.212 -29.327 -29.565 -29.797 -30.021 -30.136 -30.506 -30.553 -30.719 -30.883 -31.226 -31.418 -31.62 -31.852 -32.091 -32.367 -32.716 -33.4 -10 ,27943 ,KEBNE ,17022630,Wed Dec 22 06:40:03 CET,Wed Dec 22 08:04:36 CET,0.0 0.522 0.835 1.106 1.316 1.469 1.605 1.716 1.933 2.041 2.141 2.102 2.402 2.485 2.644 2.8 2.941 3.0 3.112 3.21 3.353 3.444 3.522 3.621 3.711 3.804 3.894 3.968 4.044 4.121 4.202 4.283 4.335 4.376 4.417 4.47 4.523 4.545 4.542 4.521 4.47 4.383 4.265 4.088 3.763 3.324 2.704 1.877 0.68 -1.188 -4.183 -7.601 -10.286 -12.457 -14.221 -15.736 -17.024 -18.174 -19.135 -20.06 -20.874 -21.575 -22.186 -22.759 -23.295 -23.777 -24.273 -24.695 -25.041 -25.392 -25.781 -26.113 -26.437 -26.768 -27.032 -27.299 -27.561 -27.823 -28.089 -28.276 -28.475 -28.79 -29.014 -29.241 -29.352 -29.57 -29.807 -30.06 -30.179 -30.542 -30.561 -30.701 -30.847 -31.167 -31.345 -31.516 -31.705 -31.917 -32.146 -32.457 -32.985 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_67_60.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_67_60.txt deleted file mode 100644 index 8c4a9cdd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_67_60.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14225 ,KEBNE ,17022631,Wed Dec 22 06:40:03 CET,Wed Dec 22 08:05:10 CET,0.0 0.762 0.995 1.157 1.288 1.428 1.566 1.681 1.878 1.975 2.072 2.031 2.325 2.399 2.555 2.688 2.793 2.849 2.951 3.044 3.2 3.299 3.377 3.499 3.634 3.746 3.839 3.919 4.017 4.099 4.173 4.278 4.391 4.492 4.599 4.704 4.789 4.888 4.998 5.097 5.183 5.287 5.362 5.349 5.298 5.207 5.023 4.714 4.196 3.337 1.73 -0.228 -1.856 -3.316 -4.552 -5.632 -6.559 -7.356 -8.037 -8.702 -9.266 -9.762 -10.212 -10.639 -11.05 -11.426 -11.82 -12.17 -12.467 -12.763 -13.069 -13.322 -13.591 -13.876 -14.084 -14.298 -14.531 -14.776 -15.023 -15.187 -15.352 -15.604 -15.787 -15.979 -16.074 -16.269 -16.469 -16.664 -16.765 -17.116 -17.107 -17.229 -17.354 -17.634 -17.773 -17.907 -18.07 -18.265 -18.494 -18.822 -19.58 -2 ,9813 ,KEBNE ,17022632,Wed Dec 22 06:40:04 CET,Wed Dec 22 08:02:27 CET,0.0 0.401 0.672 0.901 1.103 1.239 1.346 1.457 1.682 1.78 1.873 1.829 2.107 2.171 2.327 2.479 2.623 2.693 2.816 2.924 3.068 3.162 3.257 3.39 3.514 3.647 3.776 3.888 4.019 4.131 4.236 4.358 4.476 4.59 4.711 4.842 4.97 5.105 5.211 5.307 5.399 5.449 5.495 5.548 5.544 5.456 5.28 4.948 4.363 3.402 1.729 -0.355 -2.053 -3.394 -4.472 -5.431 -6.276 -7.053 -7.764 -8.478 -9.054 -9.545 -10.017 -10.471 -10.898 -11.271 -11.647 -11.986 -12.271 -12.581 -12.925 -13.189 -13.448 -13.731 -13.953 -14.172 -14.398 -14.632 -14.867 -15.029 -15.2 -15.476 -15.674 -15.871 -15.961 -16.145 -16.344 -16.545 -16.654 -17.002 -16.993 -17.125 -17.274 -17.545 -17.68 -17.826 -17.979 -18.157 -18.388 -18.698 -19.255 -3 ,19831 ,KEBNE ,17022633,Wed Dec 22 06:40:03 CET,Wed Dec 22 08:04:53 CET,0.0 0.562 0.804 1.019 1.186 1.302 1.41 1.512 1.682 1.761 1.85 1.805 2.092 2.164 2.315 2.459 2.6 2.661 2.769 2.866 3.017 3.11 3.189 3.314 3.443 3.552 3.645 3.734 3.845 3.954 4.057 4.179 4.29 4.385 4.491 4.599 4.693 4.791 4.885 4.968 5.029 5.093 5.153 5.152 5.112 5.04 4.888 4.584 4.02 3.046 1.383 -0.622 -2.323 -3.765 -4.994 -6.095 -6.998 -7.774 -8.435 -9.081 -9.653 -10.156 -10.627 -11.063 -11.467 -11.849 -12.243 -12.591 -12.878 -13.17 -13.478 -13.715 -13.954 -14.22 -14.438 -14.658 -14.875 -15.1 -15.338 -15.495 -15.648 -15.888 -16.067 -16.266 -16.364 -16.56 -16.768 -16.977 -17.086 -17.441 -17.458 -17.582 -17.705 -17.949 -18.079 -18.251 -18.437 -18.604 -18.796 -19.033 -19.51 -4 ,4637 ,KEBNE ,17022634,Wed Dec 22 06:40:03 CET,Wed Dec 22 08:05:18 CET,0.0 0.507 0.796 1.032 1.207 1.347 1.497 1.625 1.84 1.952 2.059 2.012 2.314 2.395 2.543 2.679 2.798 2.85 2.964 3.085 3.242 3.338 3.436 3.57 3.693 3.801 3.91 4.025 4.154 4.257 4.364 4.492 4.614 4.732 4.844 4.954 5.061 5.148 5.249 5.361 5.452 5.55 5.597 5.6 5.602 5.53 5.335 5.013 4.489 3.575 1.931 -0.118 -1.793 -3.164 -4.338 -5.352 -6.239 -7.067 -7.766 -8.451 -9.032 -9.547 -10.034 -10.48 -10.887 -11.256 -11.647 -11.995 -12.302 -12.623 -12.958 -13.233 -13.512 -13.791 -14.011 -14.244 -14.482 -14.711 -14.949 -15.126 -15.301 -15.563 -15.758 -15.965 -16.067 -16.275 -16.477 -16.677 -16.777 -17.117 -17.1 -17.223 -17.352 -17.597 -17.742 -17.899 -18.065 -18.242 -18.434 -18.669 -19.289 -5 ,7961 ,KEBNE ,17022635,Wed Dec 22 06:40:02 CET,Wed Dec 22 08:05:10 CET,0.0 0.64 0.883 1.069 1.226 1.358 1.513 1.661 1.874 1.961 2.046 1.996 2.296 2.371 2.5 2.615 2.733 2.792 2.903 3.009 3.143 3.23 3.326 3.457 3.584 3.707 3.802 3.887 4.011 4.128 4.235 4.374 4.506 4.62 4.74 4.871 4.98 5.071 5.151 5.219 5.304 5.391 5.444 5.454 5.449 5.388 5.21 4.923 4.405 3.487 1.857 -0.109 -1.709 -3.1 -4.318 -5.39 -6.304 -7.102 -7.76 -8.397 -8.965 -9.486 -9.974 -10.449 -10.894 -11.299 -11.711 -12.073 -12.402 -12.736 -13.058 -13.319 -13.595 -13.863 -14.06 -14.267 -14.496 -14.739 -14.984 -15.162 -15.343 -15.611 -15.8 -15.995 -16.092 -16.297 -16.52 -16.748 -16.862 -17.212 -17.21 -17.339 -17.465 -17.733 -17.883 -18.038 -18.203 -18.383 -18.564 -18.779 -19.147 -6 ,16777 ,KEBNE ,17022636,Wed Dec 22 06:40:02 CET,Wed Dec 22 08:06:21 CET,0.0 0.885 1.14 1.281 1.427 1.575 1.697 1.804 2.019 2.123 2.224 2.191 2.495 2.564 2.688 2.813 2.932 2.987 3.088 3.193 3.35 3.441 3.523 3.646 3.769 3.877 3.976 4.078 4.209 4.32 4.42 4.546 4.662 4.754 4.846 4.95 5.034 5.12 5.216 5.3 5.369 5.451 5.537 5.595 5.609 5.553 5.417 5.155 4.669 3.794 2.211 0.275 -1.273 -2.548 -3.657 -4.652 -5.488 -6.224 -6.871 -7.514 -8.058 -8.548 -9.01 -9.423 -9.79 -10.119 -10.477 -10.795 -11.061 -11.337 -11.626 -11.867 -12.108 -12.356 -12.539 -12.721 -12.913 -13.109 -13.313 -13.455 -13.602 -13.837 -13.999 -14.162 -14.243 -14.402 -14.584 -14.797 -14.903 -15.242 -15.2 -15.308 -15.419 -15.655 -15.79 -15.945 -16.09 -16.256 -16.443 -16.663 -17.171 -7 ,8314 ,KEBNE ,17022637,Wed Dec 22 06:40:03 CET,Wed Dec 22 08:05:58 CET,0.0 0.531 0.758 0.937 1.109 1.264 1.394 1.503 1.708 1.81 1.897 1.847 2.143 2.217 2.366 2.516 2.653 2.721 2.853 2.984 3.157 3.245 3.336 3.481 3.609 3.714 3.81 3.906 4.053 4.189 4.315 4.465 4.579 4.667 4.772 4.902 5.019 5.13 5.231 5.311 5.388 5.456 5.501 5.527 5.515 5.409 5.209 4.902 4.38 3.46 1.764 -0.303 -1.964 -3.377 -4.609 -5.681 -6.55 -7.332 -8.022 -8.732 -9.348 -9.86 -10.327 -10.768 -11.199 -11.594 -11.991 -12.333 -12.626 -12.934 -13.231 -13.476 -13.753 -14.045 -14.258 -14.47 -14.682 -14.902 -15.134 -15.289 -15.452 -15.707 -15.889 -16.077 -16.169 -16.361 -16.578 -16.801 -16.912 -17.257 -17.253 -17.382 -17.506 -17.748 -17.89 -18.036 -18.196 -18.389 -18.632 -18.877 -19.332 -8 ,10111 ,KEBNE ,17022638,Wed Dec 22 06:40:03 CET,Wed Dec 22 08:05:53 CET,0.0 0.383 0.553 0.715 0.876 1.02 1.144 1.269 1.465 1.542 1.623 1.567 1.86 1.923 2.044 2.175 2.297 2.352 2.477 2.586 2.705 2.781 2.861 2.969 3.074 3.181 3.281 3.378 3.497 3.596 3.696 3.814 3.92 4.028 4.153 4.27 4.361 4.466 4.574 4.677 4.774 4.84 4.885 4.934 4.952 4.91 4.756 4.442 3.907 3.026 1.428 -0.537 -2.13 -3.488 -4.639 -5.684 -6.594 -7.408 -8.119 -8.805 -9.369 -9.864 -10.345 -10.8 -11.211 -11.59 -12.001 -12.363 -12.659 -12.967 -13.277 -13.519 -13.794 -14.093 -14.32 -14.549 -14.781 -15.035 -15.29 -15.455 -15.643 -15.937 -16.123 -16.32 -16.422 -16.628 -16.842 -17.062 -17.168 -17.514 -17.519 -17.635 -17.759 -18.037 -18.2 -18.357 -18.509 -18.69 -18.883 -19.129 -19.805 -9 ,8263 ,KEBNE ,17022639,Wed Dec 22 06:40:07 CET,Wed Dec 22 08:00:04 CET,0.0 0.487 0.684 0.857 1.001 1.136 1.263 1.373 1.588 1.695 1.79 1.723 2.011 2.076 2.182 2.296 2.41 2.462 2.566 2.681 2.851 2.951 3.054 3.189 3.285 3.359 3.438 3.535 3.667 3.787 3.894 4.0 4.102 4.187 4.275 4.385 4.495 4.613 4.72 4.816 4.898 4.972 5.033 5.063 5.052 4.967 4.798 4.512 4.047 3.243 1.658 -0.294 -1.897 -3.278 -4.411 -5.396 -6.238 -6.966 -7.593 -8.222 -8.769 -9.263 -9.713 -10.111 -10.487 -10.832 -11.187 -11.505 -11.768 -12.036 -12.33 -12.578 -12.829 -13.081 -13.274 -13.474 -13.679 -13.886 -14.092 -14.237 -14.39 -14.62 -14.77 -14.934 -15.019 -15.184 -15.362 -15.549 -15.647 -15.99 -15.964 -16.075 -16.193 -16.423 -16.553 -16.693 -16.827 -16.974 -17.145 -17.346 -17.77 -10 ,18132 ,KEBNE ,17022640,Wed Dec 22 06:40:04 CET,Wed Dec 22 08:02:25 CET,0.0 0.437 0.634 0.812 0.975 1.116 1.251 1.381 1.597 1.688 1.77 1.706 2.001 2.074 2.203 2.335 2.458 2.508 2.607 2.717 2.878 2.97 3.049 3.155 3.259 3.367 3.464 3.56 3.684 3.796 3.901 4.041 4.167 4.258 4.364 4.483 4.584 4.69 4.794 4.887 4.959 5.022 5.067 5.083 5.077 4.993 4.773 4.453 3.903 3.012 1.533 -0.336 -1.909 -3.251 -4.397 -5.403 -6.274 -7.082 -7.782 -8.463 -9.035 -9.533 -10.004 -10.47 -10.924 -11.317 -11.699 -12.032 -12.328 -12.645 -12.973 -13.235 -13.499 -13.784 -14.008 -14.231 -14.452 -14.681 -14.926 -15.089 -15.265 -15.528 -15.7 -15.891 -15.99 -16.182 -16.376 -16.587 -16.695 -17.05 -17.05 -17.171 -17.29 -17.543 -17.68 -17.817 -17.972 -18.169 -18.419 -18.684 -19.141 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_68_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_68_54.txt deleted file mode 100644 index d235a25d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_68_54.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -5 ,22289 ,KEBNE ,17022645,Wed Dec 22 06:41:09 CET,Wed Dec 22 08:03:40 CET,0.0 0.737 0.942 1.116 1.251 1.365 1.475 1.566 1.735 1.824 1.912 1.839 2.108 2.174 2.287 2.37 2.453 2.495 2.572 2.64 2.737 2.793 2.847 2.938 3.014 3.076 3.15 3.226 3.309 3.381 3.443 3.503 3.553 3.596 3.634 3.649 3.631 3.572 3.474 3.36 3.237 3.064 2.801 2.486 2.091 1.612 0.929 -0.015 -1.333 -3.197 -6.154 -9.653 -12.426 -14.627 -16.433 -18.035 -19.395 -20.573 -21.543 -22.49 -23.302 -23.991 -24.633 -25.236 -25.789 -26.294 -26.809 -27.265 -27.659 -28.073 -28.488 -28.835 -29.196 -29.554 -29.829 -30.117 -30.427 -30.735 -31.032 -31.23 -31.428 -31.747 -31.98 -32.217 -32.33 -32.56 -32.819 -33.087 -33.227 -33.618 -33.673 -33.826 -34.003 -34.377 -34.562 -34.767 -34.969 -35.157 -35.417 -35.866 -37.104 -6 ,27577 ,KEBNE ,17022646,Wed Dec 22 06:41:05 CET,Wed Dec 22 08:06:00 CET,0.0 0.821 1.166 1.461 1.715 1.918 2.085 2.232 2.539 2.66 2.752 2.738 3.06 3.16 3.317 3.47 3.637 3.713 3.835 3.928 4.046 4.12 4.19 4.29 4.384 4.459 4.531 4.611 4.711 4.802 4.891 4.984 5.025 5.045 5.075 5.11 5.119 5.11 5.1 5.062 5.012 4.906 4.706 4.478 4.172 3.732 3.077 2.174 0.844 -1.093 -4.13 -7.55 -10.251 -12.487 -14.312 -15.848 -17.143 -18.282 -19.236 -20.16 -20.948 -21.651 -22.315 -22.914 -23.462 -23.965 -24.474 -24.93 -25.347 -25.776 -26.211 -26.561 -26.912 -27.283 -27.574 -27.873 -28.182 -28.492 -28.797 -29.018 -29.245 -29.579 -29.807 -30.042 -30.162 -30.404 -30.652 -30.925 -31.063 -31.44 -31.498 -31.648 -31.806 -32.149 -32.349 -32.562 -32.773 -33.026 -33.313 -33.686 -34.633 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_68_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_68_64.txt deleted file mode 100644 index 9da082e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/protein/Summary_FEP_68_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19351 ,TETRA ,17525415,Thu Nov 25 01:13:28 CET,Thu Nov 25 02:59:55 CET,0.0 1.469 1.848 2.136 2.349 2.525 2.664 2.782 3.007 3.117 3.208 3.186 3.47 3.533 3.662 3.794 3.908 3.963 4.083 4.194 4.33 4.411 4.495 4.623 4.731 4.828 4.938 5.045 5.152 5.252 5.33 5.415 5.515 5.595 5.675 5.777 5.87 5.949 6.017 6.096 6.174 6.238 6.279 6.278 6.237 6.14 5.967 5.662 5.113 4.209 2.622 0.636 -0.932 -2.195 -3.273 -4.253 -5.134 -5.921 -6.562 -7.195 -7.787 -8.31 -8.793 -9.236 -9.637 -10.017 -10.412 -10.748 -11.04 -11.35 -11.679 -11.948 -12.204 -12.462 -12.669 -12.895 -13.148 -13.393 -13.623 -13.779 -13.934 -14.175 -14.342 -14.507 -14.596 -14.806 -15.018 -15.244 -15.368 -15.711 -15.754 -15.896 -16.021 -16.296 -16.439 -16.604 -16.785 -17.006 -17.31 -17.669 -19.951 -2 ,2808 ,TETRA ,17525417,Thu Nov 25 01:14:28 CET,Thu Nov 25 03:00:16 CET,0.0 0.888 1.186 1.399 1.585 1.782 1.957 2.122 2.435 2.58 2.709 2.758 3.079 3.179 3.373 3.555 3.724 3.797 3.929 4.05 4.218 4.317 4.408 4.538 4.668 4.803 4.93 5.04 5.169 5.281 5.385 5.505 5.606 5.692 5.777 5.856 5.94 6.042 6.138 6.21 6.265 6.35 6.441 6.464 6.437 6.335 6.17 5.89 5.386 4.496 2.907 1.001 -0.576 -1.999 -3.214 -4.233 -5.113 -5.891 -6.552 -7.218 -7.787 -8.276 -8.74 -9.197 -9.609 -9.981 -10.37 -10.704 -10.995 -11.285 -11.585 -11.833 -12.081 -12.355 -12.565 -12.783 -13.011 -13.232 -13.457 -13.612 -13.775 -14.041 -14.238 -14.439 -14.538 -14.751 -14.984 -15.226 -15.348 -15.686 -15.709 -15.853 -15.989 -16.262 -16.409 -16.597 -16.812 -17.033 -17.311 -17.679 -19.773 -3 ,15056 ,TETRA ,17525419,Thu Nov 25 01:14:30 CET,Thu Nov 25 03:00:34 CET,0.0 1.344 1.6 1.825 2.005 2.173 2.33 2.462 2.699 2.81 2.905 2.872 3.158 3.238 3.391 3.532 3.67 3.738 3.867 3.992 4.165 4.271 4.372 4.517 4.65 4.77 4.883 4.989 5.124 5.239 5.34 5.471 5.583 5.68 5.811 5.968 6.107 6.235 6.361 6.486 6.579 6.643 6.691 6.718 6.737 6.691 6.513 6.197 5.674 4.803 3.294 1.376 -0.266 -1.621 -2.754 -3.745 -4.576 -5.306 -5.911 -6.521 -7.046 -7.496 -7.953 -8.419 -8.848 -9.23 -9.623 -9.96 -10.272 -10.613 -10.952 -11.229 -11.517 -11.809 -12.025 -12.243 -12.466 -12.691 -12.909 -13.063 -13.237 -13.51 -13.684 -13.866 -13.961 -14.151 -14.353 -14.557 -14.658 -14.98 -15.018 -15.154 -15.295 -15.594 -15.764 -15.964 -16.185 -16.428 -16.717 -17.037 -17.954 -4 ,7926 ,TETRA ,17525421,Thu Nov 25 01:14:30 CET,Thu Nov 25 03:01:04 CET,0.0 1.657 2.0 2.269 2.446 2.577 2.713 2.843 3.046 3.131 3.22 3.186 3.458 3.538 3.686 3.81 3.926 3.985 4.106 4.224 4.37 4.462 4.555 4.679 4.781 4.865 4.956 5.051 5.179 5.291 5.395 5.511 5.614 5.724 5.832 5.939 6.053 6.175 6.299 6.414 6.515 6.583 6.612 6.623 6.622 6.577 6.432 6.139 5.624 4.805 3.344 1.497 -0.035 -1.332 -2.422 -3.415 -4.295 -5.053 -5.677 -6.302 -6.852 -7.36 -7.854 -8.302 -8.713 -9.086 -9.483 -9.848 -10.163 -10.488 -10.825 -11.1 -11.387 -11.684 -11.915 -12.151 -12.395 -12.644 -12.879 -13.037 -13.202 -13.458 -13.637 -13.824 -13.92 -14.118 -14.357 -14.615 -14.733 -15.07 -15.063 -15.184 -15.317 -15.609 -15.781 -15.969 -16.19 -16.423 -16.684 -17.038 -18.358 -5 ,17676 ,TETRA ,17525423,Thu Nov 25 01:15:26 CET,Thu Nov 25 03:01:55 CET,0.0 0.867 1.169 1.408 1.628 1.838 2.023 2.197 2.498 2.619 2.736 2.721 3.026 3.116 3.282 3.419 3.54 3.6 3.718 3.833 3.995 4.097 4.201 4.343 4.464 4.58 4.693 4.804 4.936 5.056 5.161 5.284 5.41 5.517 5.635 5.751 5.863 5.967 6.07 6.199 6.31 6.423 6.517 6.558 6.573 6.535 6.408 6.14 5.649 4.811 3.295 1.406 -0.226 -1.589 -2.725 -3.722 -4.571 -5.335 -5.991 -6.635 -7.19 -7.704 -8.19 -8.621 -9.003 -9.343 -9.691 -10.001 -10.276 -10.565 -10.877 -11.143 -11.418 -11.702 -11.909 -12.112 -12.326 -12.535 -12.752 -12.914 -13.078 -13.321 -13.493 -13.689 -13.792 -14.006 -14.23 -14.455 -14.566 -14.913 -14.953 -15.099 -15.249 -15.567 -15.736 -15.903 -16.094 -16.291 -16.507 -16.749 -17.526 -6 ,7089 ,TETRA ,17525425,Thu Nov 25 01:15:27 CET,Thu Nov 25 03:01:18 CET,0.0 0.64 0.97 1.181 1.342 1.492 1.639 1.776 2.014 2.118 2.217 2.206 2.51 2.613 2.778 2.915 3.049 3.105 3.219 3.333 3.483 3.589 3.694 3.831 3.956 4.085 4.203 4.303 4.428 4.56 4.671 4.773 4.871 4.969 5.079 5.201 5.317 5.408 5.49 5.599 5.717 5.821 5.903 5.949 5.93 5.837 5.653 5.332 4.824 4.009 2.51 0.541 -1.081 -2.395 -3.503 -4.532 -5.457 -6.288 -6.961 -7.617 -8.222 -8.736 -9.177 -9.59 -9.976 -10.335 -10.723 -11.06 -11.339 -11.661 -12.006 -12.273 -12.545 -12.835 -13.065 -13.289 -13.503 -13.73 -13.966 -14.13 -14.301 -14.557 -14.735 -14.91 -14.996 -15.182 -15.374 -15.583 -15.696 -16.037 -16.082 -16.21 -16.337 -16.59 -16.73 -16.909 -17.103 -17.288 -17.514 -17.81 -19.303 -7 ,27591 ,TETRA ,17525427,Thu Nov 25 01:15:27 CET,Thu Nov 25 03:02:46 CET,0.0 1.66 2.001 2.267 2.473 2.611 2.75 2.885 3.111 3.215 3.315 3.321 3.611 3.695 3.867 4.016 4.152 4.212 4.327 4.442 4.603 4.704 4.792 4.908 5.021 5.133 5.239 5.335 5.462 5.574 5.678 5.804 5.93 6.043 6.155 6.273 6.377 6.476 6.571 6.652 6.708 6.766 6.826 6.844 6.791 6.694 6.548 6.295 5.804 4.889 3.258 1.316 -0.25 -1.588 -2.695 -3.632 -4.471 -5.254 -5.903 -6.536 -7.085 -7.563 -8.022 -8.474 -8.908 -9.285 -9.669 -10.019 -10.32 -10.619 -10.907 -11.14 -11.385 -11.647 -11.852 -12.063 -12.276 -12.502 -12.74 -12.895 -13.061 -13.334 -13.512 -13.698 -13.791 -13.971 -14.156 -14.346 -14.462 -14.81 -14.842 -14.979 -15.133 -15.436 -15.581 -15.734 -15.901 -16.089 -16.319 -16.691 -17.851 -8 ,10838 ,TETRA ,17525428,Thu Nov 25 01:15:28 CET,Thu Nov 25 02:59:54 CET,0.0 1.487 1.785 1.97 2.171 2.366 2.529 2.657 2.883 2.987 3.077 3.054 3.332 3.407 3.539 3.661 3.786 3.841 3.946 4.042 4.179 4.27 4.357 4.481 4.598 4.706 4.803 4.886 4.992 5.119 5.236 5.366 5.493 5.597 5.717 5.85 5.969 6.098 6.217 6.308 6.379 6.44 6.477 6.471 6.42 6.32 6.166 5.888 5.377 4.525 3.033 1.158 -0.433 -1.747 -2.865 -3.857 -4.714 -5.507 -6.223 -6.92 -7.496 -8.009 -8.498 -8.949 -9.352 -9.714 -10.074 -10.372 -10.632 -10.907 -11.203 -11.461 -11.74 -12.03 -12.251 -12.474 -12.699 -12.932 -13.166 -13.315 -13.465 -13.718 -13.906 -14.106 -14.207 -14.413 -14.62 -14.83 -14.937 -15.275 -15.335 -15.475 -15.612 -15.877 -16.033 -16.209 -16.374 -16.558 -16.785 -17.074 -18.285 -9 ,863 ,TETRA ,17525430,Thu Nov 25 01:16:29 CET,Thu Nov 25 03:03:47 CET,0.0 1.259 1.578 1.87 2.097 2.297 2.479 2.664 3.01 3.17 3.32 3.405 3.727 3.834 4.022 4.221 4.438 4.535 4.696 4.851 5.078 5.204 5.314 5.472 5.608 5.736 5.866 5.993 6.149 6.303 6.459 6.645 6.828 6.999 7.186 7.385 7.552 7.699 7.834 7.947 8.017 8.072 8.14 8.176 8.143 8.041 7.849 7.577 7.122 6.254 4.656 2.727 1.151 -0.172 -1.272 -2.284 -3.186 -3.981 -4.637 -5.261 -5.805 -6.284 -6.713 -7.117 -7.503 -7.859 -8.237 -8.566 -8.827 -9.099 -9.394 -9.636 -9.886 -10.146 -10.354 -10.593 -10.843 -11.091 -11.345 -11.508 -11.67 -11.933 -12.115 -12.293 -12.385 -12.585 -12.795 -13.031 -13.156 -13.492 -13.499 -13.632 -13.785 -14.089 -14.241 -14.409 -14.581 -14.778 -15.039 -15.387 -16.519 -10 ,28912 ,TETRA ,17525432,Thu Nov 25 01:17:28 CET,Thu Nov 25 03:03:13 CET,0.0 1.758 2.073 2.284 2.466 2.63 2.782 2.936 3.202 3.34 3.457 3.422 3.72 3.812 4.002 4.173 4.334 4.406 4.556 4.721 4.913 5.016 5.113 5.236 5.361 5.478 5.578 5.673 5.787 5.886 5.98 6.104 6.231 6.346 6.444 6.533 6.638 6.762 6.872 6.964 7.037 7.11 7.193 7.229 7.198 7.089 6.905 6.586 6.065 5.209 3.571 1.549 -0.12 -1.509 -2.68 -3.729 -4.653 -5.479 -6.154 -6.82 -7.389 -7.884 -8.363 -8.814 -9.249 -9.63 -9.991 -10.319 -10.591 -10.87 -11.171 -11.434 -11.707 -11.986 -12.203 -12.417 -12.628 -12.849 -13.099 -13.277 -13.453 -13.721 -13.914 -14.107 -14.204 -14.399 -14.601 -14.818 -14.926 -15.246 -15.235 -15.357 -15.489 -15.799 -15.974 -16.137 -16.309 -16.49 -16.694 -17.058 -18.681 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_23_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_23_62.txt deleted file mode 100644 index 4a499f10..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_23_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25727 ,KEBNE ,17022651,Wed Dec 22 06:41:05 CET,Wed Dec 22 08:02:39 CET,0.0 1.864 2.413 2.832 3.16 3.429 3.677 3.918 4.327 4.502 4.661 4.786 5.132 5.294 5.586 5.868 6.13 6.251 6.5 6.74 7.077 7.297 7.503 7.799 8.074 8.346 8.625 8.888 9.207 9.519 9.839 10.211 10.549 10.891 11.297 11.74 12.167 12.622 13.104 13.625 14.177 14.777 15.463 16.162 16.945 17.808 18.788 19.874 21.127 22.541 24.134 25.335 25.939 26.19 26.27 26.231 26.131 26.026 25.898 25.746 25.596 25.441 25.276 25.117 24.965 24.808 24.632 24.472 24.323 24.159 24.008 23.892 23.747 23.575 23.444 23.306 23.172 23.035 22.885 22.765 22.647 22.484 22.36 22.227 22.151 21.993 21.831 21.656 21.568 21.297 21.242 21.142 21.038 20.764 20.592 20.401 20.208 19.929 19.568 19.127 18.085 -2 ,16544 ,KEBNE ,17022652,Wed Dec 22 06:41:05 CET,Wed Dec 22 08:04:00 CET,0.0 1.979 2.5 2.858 3.182 3.463 3.732 3.997 4.445 4.628 4.803 4.943 5.286 5.439 5.724 6.001 6.262 6.39 6.642 6.879 7.234 7.465 7.686 7.998 8.289 8.581 8.878 9.15 9.472 9.787 10.09 10.447 10.777 11.114 11.514 11.947 12.373 12.864 13.369 13.854 14.361 14.94 15.628 16.322 17.12 18.027 19.03 20.07 21.266 22.686 24.283 25.398 25.981 26.251 26.303 26.27 26.202 26.088 25.956 25.804 25.653 25.5 25.353 25.215 25.067 24.928 24.761 24.593 24.461 24.318 24.146 24.005 23.861 23.697 23.555 23.405 23.258 23.108 22.953 22.84 22.72 22.544 22.415 22.278 22.207 22.059 21.904 21.74 21.651 21.381 21.319 21.202 21.062 20.73 20.564 20.411 20.231 20.032 19.803 19.385 18.298 -3 ,24422 ,KEBNE ,17022653,Wed Dec 22 06:41:05 CET,Wed Dec 22 08:02:33 CET,0.0 3.319 3.794 4.181 4.479 4.796 5.087 5.321 5.744 5.934 6.107 6.28 6.643 6.804 7.099 7.379 7.643 7.773 8.027 8.269 8.612 8.833 9.054 9.345 9.618 9.889 10.148 10.407 10.74 11.055 11.366 11.752 12.123 12.47 12.879 13.321 13.736 14.199 14.696 15.244 15.793 16.383 17.082 17.795 18.617 19.48 20.478 21.582 22.812 24.188 25.699 26.824 27.382 27.632 27.683 27.622 27.554 27.452 27.317 27.17 27.024 26.883 26.745 26.589 26.431 26.287 26.137 26.002 25.868 25.713 25.551 25.422 25.281 25.122 24.999 24.862 24.709 24.558 24.407 24.292 24.17 23.993 23.861 23.708 23.627 23.465 23.306 23.128 23.032 22.762 22.705 22.581 22.447 22.156 21.988 21.804 21.618 21.404 21.144 20.755 19.301 -4 ,20826 ,KEBNE ,17022654,Wed Dec 22 06:41:09 CET,Wed Dec 22 07:59:47 CET,0.0 1.961 2.46 2.82 3.106 3.39 3.661 3.908 4.34 4.525 4.704 4.859 5.198 5.348 5.62 5.908 6.197 6.328 6.569 6.801 7.145 7.364 7.572 7.871 8.153 8.42 8.688 8.947 9.286 9.629 9.934 10.288 10.627 10.953 11.355 11.784 12.193 12.665 13.147 13.648 14.187 14.78 15.466 16.17 16.966 17.819 18.779 19.821 21.017 22.423 24.048 25.228 25.82 26.077 26.146 26.126 26.07 25.975 25.849 25.699 25.546 25.398 25.251 25.104 24.96 24.814 24.646 24.49 24.339 24.17 24.012 23.874 23.705 23.541 23.413 23.271 23.114 22.955 22.791 22.674 22.557 22.361 22.224 22.082 22.0 21.828 21.643 21.431 21.326 21.059 20.993 20.868 20.737 20.434 20.276 20.095 19.866 19.607 19.318 18.92 18.041 -5 ,3943 ,KEBNE ,17022655,Wed Dec 22 06:41:09 CET,Wed Dec 22 07:58:38 CET,0.0 1.769 2.25 2.617 2.947 3.231 3.471 3.681 4.064 4.246 4.432 4.571 4.903 5.059 5.363 5.633 5.896 6.03 6.27 6.496 6.824 7.027 7.231 7.52 7.798 8.079 8.331 8.578 8.906 9.214 9.525 9.899 10.234 10.55 10.933 11.371 11.779 12.231 12.731 13.25 13.785 14.405 15.101 15.783 16.569 17.439 18.445 19.558 20.79 22.153 23.762 24.949 25.493 25.714 25.764 25.717 25.619 25.485 25.334 25.16 25.003 24.851 24.696 24.554 24.402 24.247 24.083 23.931 23.794 23.646 23.493 23.355 23.196 23.038 22.911 22.764 22.612 22.452 22.28 22.168 22.051 21.858 21.726 21.581 21.502 21.34 21.173 20.985 20.89 20.621 20.547 20.415 20.277 19.962 19.802 19.648 19.443 19.199 18.838 18.352 16.374 -6 ,29927 ,KEBNE ,17022656,Wed Dec 22 06:41:09 CET,Wed Dec 22 07:57:59 CET,0.0 1.636 2.177 2.566 2.863 3.118 3.354 3.571 3.954 4.148 4.332 4.482 4.814 4.952 5.223 5.488 5.737 5.867 6.119 6.352 6.706 6.925 7.13 7.433 7.717 7.997 8.267 8.525 8.866 9.185 9.49 9.851 10.189 10.518 10.904 11.353 11.803 12.27 12.745 13.257 13.793 14.391 15.086 15.782 16.602 17.493 18.466 19.544 20.776 22.196 23.787 24.955 25.531 25.787 25.864 25.828 25.732 25.598 25.457 25.32 25.193 25.064 24.924 24.755 24.574 24.404 24.224 24.071 23.933 23.771 23.602 23.477 23.345 23.181 23.053 22.924 22.77 22.612 22.449 22.336 22.229 22.065 21.948 21.814 21.736 21.566 21.398 21.228 21.135 20.862 20.817 20.708 20.599 20.352 20.208 20.048 19.866 19.659 19.411 19.087 17.942 -7 ,14187 ,KEBNE ,17022657,Wed Dec 22 06:43:10 CET,Wed Dec 22 08:06:21 CET,0.0 1.538 2.038 2.378 2.716 3.039 3.319 3.547 3.93 4.111 4.286 4.449 4.796 4.95 5.266 5.554 5.819 5.952 6.217 6.473 6.826 7.043 7.246 7.538 7.832 8.107 8.368 8.629 8.97 9.295 9.604 9.965 10.304 10.636 11.029 11.468 11.883 12.333 12.804 13.298 13.826 14.419 15.104 15.799 16.61 17.51 18.538 19.657 20.847 22.181 23.692 24.759 25.262 25.487 25.542 25.497 25.408 25.304 25.189 25.045 24.911 24.756 24.585 24.409 24.244 24.099 23.926 23.764 23.634 23.489 23.332 23.214 23.077 22.919 22.802 22.68 22.548 22.389 22.21 22.098 21.99 21.804 21.662 21.507 21.424 21.24 21.046 20.864 20.77 20.498 20.443 20.306 20.152 19.828 19.661 19.501 19.323 19.113 18.836 18.449 17.241 -8 ,156 ,KEBNE ,17022658,Wed Dec 22 06:43:10 CET,Wed Dec 22 08:04:41 CET,0.0 1.926 2.399 2.735 3.009 3.268 3.547 3.799 4.24 4.436 4.608 4.741 5.088 5.248 5.539 5.823 6.086 6.21 6.465 6.723 7.084 7.296 7.503 7.825 8.116 8.379 8.655 8.923 9.245 9.557 9.858 10.221 10.572 10.893 11.265 11.699 12.115 12.567 13.043 13.539 14.059 14.645 15.345 16.025 16.824 17.749 18.766 19.815 21.032 22.477 24.073 25.274 25.851 26.088 26.189 26.177 26.111 26.008 25.879 25.711 25.537 25.375 25.205 25.038 24.894 24.768 24.611 24.455 24.316 24.17 24.007 23.867 23.712 23.555 23.439 23.308 23.17 23.026 22.877 22.759 22.633 22.453 22.31 22.155 22.074 21.909 21.744 21.562 21.459 21.182 21.127 21.017 20.917 20.69 20.546 20.354 20.136 19.916 19.624 19.225 17.848 -9 ,27199 ,KEBNE ,17022659,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:04:55 CET,0.0 2.045 2.429 2.756 3.05 3.286 3.502 3.702 4.072 4.24 4.397 4.523 4.855 4.986 5.223 5.466 5.712 5.824 6.025 6.228 6.531 6.719 6.901 7.173 7.435 7.672 7.894 8.105 8.382 8.661 8.919 9.22 9.528 9.83 10.171 10.547 10.901 11.299 11.729 12.182 12.661 13.188 13.804 14.402 15.094 15.899 16.839 17.87 19.009 20.318 21.772 22.788 23.275 23.502 23.565 23.565 23.513 23.419 23.303 23.153 23.027 22.913 22.773 22.619 22.477 22.331 22.178 22.037 21.913 21.791 21.658 21.546 21.423 21.281 21.172 21.056 20.923 20.77 20.603 20.494 20.385 20.187 20.054 19.912 19.824 19.625 19.382 19.157 19.058 18.773 18.723 18.624 18.53 18.306 18.178 18.06 17.919 17.723 17.476 17.072 15.632 -10 ,167 ,KEBNE ,17022660,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:04:31 CET,0.0 2.271 2.807 3.19 3.534 3.825 4.062 4.279 4.667 4.854 5.04 5.186 5.533 5.697 6.001 6.286 6.557 6.682 6.92 7.159 7.501 7.715 7.92 8.21 8.5 8.792 9.072 9.346 9.696 10.022 10.33 10.695 11.053 11.391 11.78 12.214 12.649 13.135 13.631 14.155 14.698 15.297 16.0 16.679 17.442 18.287 19.257 20.378 21.658 23.074 24.65 25.792 26.316 26.497 26.521 26.498 26.421 26.304 26.187 26.033 25.876 25.718 25.564 25.409 25.251 25.099 24.92 24.738 24.59 24.449 24.282 24.133 23.979 23.823 23.707 23.583 23.455 23.314 23.159 23.047 22.918 22.736 22.612 22.482 22.416 22.266 22.117 21.95 21.862 21.605 21.577 21.456 21.329 21.079 20.915 20.716 20.508 20.26 19.969 19.605 18.557 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_23_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_23_64.txt deleted file mode 100644 index 7c97bd52..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_23_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22394 ,KEBNE ,17022661,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:06:12 CET,0.0 1.389 1.858 2.178 2.396 2.599 2.799 2.983 3.274 3.399 3.53 3.626 3.948 4.076 4.288 4.457 4.621 4.706 4.869 5.019 5.253 5.408 5.545 5.735 5.926 6.102 6.259 6.41 6.591 6.76 6.933 7.138 7.324 7.498 7.694 7.903 8.097 8.316 8.551 8.782 9.013 9.25 9.506 9.768 10.034 10.281 10.519 10.704 10.803 10.784 10.415 9.643 8.874 8.154 7.501 6.905 6.358 5.848 5.388 4.92 4.531 4.186 3.855 3.549 3.259 2.984 2.683 2.422 2.205 1.968 1.729 1.533 1.315 1.082 0.897 0.705 0.516 0.324 0.105 -0.049 -0.191 -0.406 -0.554 -0.72 -0.813 -0.989 -1.165 -1.355 -1.446 -1.732 -1.764 -1.886 -2.02 -2.301 -2.449 -2.627 -2.83 -3.054 -3.371 -3.792 -4.834 -2 ,10148 ,KEBNE ,17022662,Wed Dec 22 06:43:10 CET,Wed Dec 22 08:06:35 CET,0.0 1.786 2.157 2.44 2.693 2.915 3.1 3.263 3.561 3.693 3.824 3.896 4.186 4.287 4.503 4.706 4.877 4.958 5.116 5.266 5.478 5.622 5.767 5.962 6.135 6.309 6.475 6.626 6.818 7.003 7.182 7.388 7.567 7.741 7.951 8.17 8.375 8.595 8.819 9.05 9.27 9.509 9.783 10.043 10.3 10.518 10.726 10.902 11.012 10.994 10.594 9.748 8.925 8.152 7.446 6.831 6.306 5.8 5.363 4.924 4.526 4.159 3.815 3.521 3.242 2.986 2.71 2.45 2.236 2.017 1.797 1.609 1.396 1.187 1.03 0.855 0.67 0.479 0.28 0.134 -0.018 -0.268 -0.446 -0.63 -0.719 -0.893 -1.086 -1.298 -1.42 -1.741 -1.804 -1.935 -2.095 -2.426 -2.596 -2.795 -3.023 -3.306 -3.65 -4.101 -4.923 -3 ,24081 ,KEBNE ,17022663,Wed Dec 22 06:43:13 CET,Wed Dec 22 08:02:11 CET,0.0 1.245 1.733 2.112 2.421 2.671 2.874 3.056 3.407 3.565 3.71 3.788 4.088 4.202 4.414 4.608 4.799 4.897 5.077 5.238 5.471 5.614 5.738 5.903 6.072 6.244 6.407 6.557 6.745 6.929 7.115 7.312 7.479 7.646 7.846 8.083 8.312 8.547 8.784 9.029 9.27 9.507 9.769 10.005 10.265 10.544 10.769 10.926 11.025 10.992 10.606 9.851 9.097 8.377 7.736 7.13 6.578 6.061 5.601 5.151 4.778 4.445 4.12 3.815 3.531 3.258 2.974 2.717 2.484 2.245 2.008 1.803 1.593 1.381 1.21 1.04 0.859 0.66 0.456 0.313 0.156 -0.067 -0.218 -0.391 -0.474 -0.634 -0.823 -1.024 -1.125 -1.417 -1.446 -1.564 -1.699 -1.994 -2.145 -2.324 -2.514 -2.743 -3.095 -3.612 -4.526 -4 ,30962 ,KEBNE ,17022664,Wed Dec 22 06:43:10 CET,Wed Dec 22 08:02:31 CET,0.0 1.35 1.801 2.109 2.355 2.605 2.824 3.009 3.329 3.475 3.619 3.693 3.999 4.126 4.349 4.544 4.736 4.825 4.989 5.144 5.378 5.53 5.666 5.843 6.003 6.165 6.355 6.543 6.746 6.92 7.091 7.297 7.497 7.704 7.962 8.266 8.527 8.745 8.971 9.223 9.463 9.703 9.945 10.185 10.463 10.72 10.972 11.174 11.303 11.279 10.884 10.121 9.379 8.664 7.997 7.381 6.837 6.327 5.878 5.427 5.034 4.68 4.32 3.974 3.657 3.384 3.104 2.848 2.635 2.417 2.159 1.95 1.738 1.515 1.352 1.182 0.997 0.799 0.587 0.441 0.299 0.088 -0.064 -0.234 -0.318 -0.492 -0.686 -0.883 -0.982 -1.285 -1.355 -1.486 -1.624 -1.908 -2.076 -2.258 -2.448 -2.669 -2.945 -3.35 -5.338 -5 ,7038 ,KEBNE ,17022665,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:05:06 CET,0.0 1.793 2.306 2.673 3.016 3.321 3.564 3.777 4.121 4.272 4.414 4.482 4.779 4.888 5.102 5.297 5.477 5.556 5.699 5.853 6.095 6.243 6.371 6.539 6.711 6.886 7.047 7.208 7.412 7.6 7.775 7.974 8.165 8.354 8.57 8.799 9.006 9.231 9.452 9.662 9.88 10.114 10.365 10.605 10.862 11.09 11.311 11.491 11.604 11.576 11.2 10.448 9.668 8.924 8.259 7.634 7.063 6.559 6.115 5.641 5.221 4.86 4.53 4.212 3.909 3.625 3.326 3.059 2.822 2.576 2.334 2.137 1.926 1.71 1.549 1.392 1.225 1.034 0.835 0.707 0.573 0.354 0.19 0.012 -0.086 -0.288 -0.479 -0.674 -0.778 -1.069 -1.096 -1.212 -1.342 -1.629 -1.785 -1.954 -2.125 -2.305 -2.542 -2.924 -3.824 -6 ,25608 ,KEBNE ,17022666,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:04:55 CET,0.0 2.441 2.976 3.373 3.657 3.893 4.105 4.305 4.641 4.78 4.913 4.982 5.278 5.38 5.595 5.808 5.998 6.084 6.247 6.411 6.643 6.778 6.901 7.074 7.233 7.391 7.553 7.703 7.888 8.065 8.228 8.416 8.593 8.766 8.974 9.208 9.415 9.628 9.85 10.073 10.315 10.577 10.833 11.061 11.31 11.551 11.779 11.952 12.044 11.97 11.584 10.84 10.021 9.252 8.572 7.969 7.408 6.888 6.451 5.991 5.595 5.239 4.892 4.571 4.278 4.004 3.712 3.462 3.249 3.012 2.771 2.579 2.387 2.187 2.029 1.859 1.665 1.467 1.273 1.144 1.01 0.792 0.642 0.481 0.399 0.23 0.048 -0.154 -0.255 -0.545 -0.615 -0.745 -0.862 -1.121 -1.262 -1.41 -1.569 -1.752 -2.002 -2.439 -4.491 -7 ,32392 ,KEBNE ,17022667,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:06:08 CET,0.0 1.165 1.546 1.842 2.109 2.38 2.613 2.807 3.15 3.299 3.437 3.501 3.801 3.92 4.153 4.374 4.58 4.668 4.824 4.973 5.2 5.341 5.475 5.675 5.862 6.041 6.204 6.352 6.54 6.72 6.899 7.103 7.282 7.463 7.673 7.912 8.135 8.362 8.612 8.865 9.086 9.307 9.568 9.831 10.106 10.354 10.589 10.816 10.989 10.981 10.61 9.86 9.081 8.333 7.644 7.02 6.488 5.991 5.555 5.116 4.74 4.403 4.062 3.736 3.435 3.162 2.872 2.605 2.374 2.139 1.906 1.709 1.497 1.274 1.099 0.912 0.724 0.53 0.312 0.162 0.021 -0.197 -0.347 -0.511 -0.6 -0.784 -0.967 -1.16 -1.266 -1.55 -1.553 -1.668 -1.804 -2.119 -2.28 -2.456 -2.651 -2.851 -3.138 -3.59 -5.027 -8 ,22895 ,KEBNE ,17022668,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:06:16 CET,0.0 2.795 3.355 3.747 4.079 4.374 4.607 4.849 5.304 5.47 5.601 5.643 5.942 6.057 6.263 6.458 6.632 6.717 6.894 7.069 7.307 7.45 7.581 7.755 7.922 8.093 8.258 8.411 8.598 8.784 8.959 9.165 9.359 9.545 9.761 9.988 10.201 10.418 10.625 10.839 11.054 11.308 11.611 11.879 12.145 12.42 12.692 12.895 13.025 12.972 12.543 11.716 10.915 10.189 9.553 8.941 8.384 7.895 7.472 7.047 6.649 6.284 5.954 5.662 5.376 5.098 4.813 4.559 4.338 4.112 3.867 3.667 3.46 3.231 3.065 2.901 2.731 2.547 2.349 2.213 2.066 1.84 1.685 1.514 1.427 1.274 1.099 0.899 0.798 0.508 0.476 0.351 0.206 -0.082 -0.234 -0.408 -0.601 -0.816 -1.067 -1.384 -2.268 -9 ,23029 ,KEBNE ,17022669,Wed Dec 22 06:43:10 CET,Wed Dec 22 08:04:51 CET,0.0 1.727 2.243 2.599 2.87 3.089 3.304 3.542 3.978 4.148 4.275 4.33 4.63 4.744 4.95 5.129 5.3 5.382 5.546 5.71 5.93 6.064 6.2 6.398 6.576 6.746 6.915 7.073 7.278 7.467 7.634 7.832 8.028 8.216 8.417 8.631 8.832 9.053 9.283 9.509 9.721 9.944 10.211 10.449 10.714 11.002 11.266 11.501 11.691 11.671 11.221 10.416 9.589 8.813 8.121 7.471 6.91 6.415 5.97 5.523 5.132 4.774 4.43 4.108 3.822 3.544 3.241 2.99 2.786 2.57 2.331 2.137 1.934 1.709 1.524 1.34 1.168 0.981 0.771 0.631 0.487 0.265 0.115 -0.045 -0.128 -0.291 -0.472 -0.693 -0.828 -1.16 -1.292 -1.457 -1.646 -2.013 -2.173 -2.335 -2.532 -2.775 -3.032 -3.326 -4.317 -10 ,23055 ,KEBNE ,17022670,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:04:55 CET,0.0 1.511 2.043 2.37 2.635 2.878 3.12 3.315 3.608 3.757 3.905 3.969 4.26 4.359 4.585 4.811 5.006 5.096 5.25 5.405 5.613 5.736 5.867 6.061 6.243 6.426 6.602 6.745 6.929 7.123 7.302 7.506 7.699 7.875 8.064 8.269 8.469 8.696 8.925 9.137 9.354 9.59 9.855 10.108 10.366 10.605 10.836 11.048 11.187 11.187 10.786 10.013 9.25 8.502 7.822 7.187 6.643 6.166 5.739 5.311 4.94 4.593 4.266 3.949 3.656 3.397 3.12 2.858 2.629 2.399 2.157 1.949 1.736 1.524 1.353 1.184 1.007 0.81 0.606 0.46 0.311 0.092 -0.053 -0.21 -0.306 -0.506 -0.695 -0.894 -0.998 -1.293 -1.336 -1.452 -1.591 -1.919 -2.09 -2.259 -2.46 -2.698 -2.997 -3.381 -4.689 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_23_66.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_23_66.txt deleted file mode 100644 index e7c5ef02..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_23_66.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11407 ,KEBNE ,17022671,Wed Dec 22 06:43:10 CET,Wed Dec 22 08:04:49 CET,0.0 1.007 1.29 1.561 1.818 2.059 2.295 2.484 2.792 2.923 3.045 3.103 3.399 3.501 3.711 3.914 4.107 4.194 4.35 4.502 4.719 4.847 4.973 5.167 5.349 5.516 5.693 5.856 6.042 6.231 6.419 6.634 6.838 7.043 7.276 7.528 7.764 8.007 8.275 8.545 8.801 9.092 9.407 9.708 10.041 10.389 10.762 11.109 11.391 11.589 11.555 11.099 10.545 9.979 9.414 8.905 8.467 8.037 7.651 7.261 6.916 6.601 6.304 6.032 5.765 5.512 5.268 5.05 4.835 4.611 4.396 4.215 4.021 3.818 3.654 3.488 3.32 3.144 2.963 2.844 2.72 2.507 2.354 2.194 2.111 1.937 1.754 1.569 1.473 1.183 1.13 1.011 0.887 0.617 0.454 0.269 0.074 -0.151 -0.441 -0.78 -1.275 -2 ,23033 ,KEBNE ,17022672,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:06:12 CET,0.0 1.57 2.12 2.501 2.796 3.044 3.252 3.434 3.744 3.875 4.007 4.121 4.445 4.566 4.802 5.028 5.229 5.323 5.495 5.664 5.896 6.042 6.195 6.408 6.607 6.815 7.015 7.2 7.426 7.62 7.815 8.05 8.256 8.449 8.673 8.924 9.15 9.388 9.63 9.866 10.141 10.452 10.774 11.078 11.416 11.749 12.092 12.455 12.778 12.968 12.916 12.463 11.877 11.304 10.752 10.245 9.818 9.404 9.022 8.648 8.327 8.038 7.761 7.505 7.269 7.05 6.818 6.601 6.404 6.203 5.99 5.81 5.616 5.402 5.247 5.092 4.917 4.735 4.548 4.414 4.274 4.059 3.909 3.758 3.676 3.5 3.336 3.163 3.068 2.782 2.737 2.618 2.5 2.238 2.077 1.897 1.698 1.489 1.279 1.035 0.409 -3 ,21197 ,KEBNE ,17022673,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:04:38 CET,0.0 0.794 1.182 1.492 1.731 1.932 2.116 2.291 2.589 2.712 2.828 2.863 3.154 3.259 3.478 3.691 3.881 3.974 4.158 4.334 4.57 4.71 4.841 5.041 5.23 5.398 5.56 5.72 5.926 6.123 6.303 6.519 6.746 6.968 7.198 7.421 7.634 7.879 8.126 8.372 8.639 8.947 9.264 9.557 9.888 10.209 10.531 10.849 11.172 11.401 11.335 10.879 10.321 9.77 9.271 8.749 8.261 7.825 7.418 7.012 6.687 6.367 6.049 5.776 5.526 5.295 5.051 4.814 4.603 4.39 4.176 4.004 3.818 3.618 3.472 3.319 3.139 2.952 2.768 2.637 2.496 2.276 2.137 1.993 1.918 1.754 1.574 1.396 1.303 1.008 0.959 0.843 0.718 0.44 0.285 0.109 -0.064 -0.252 -0.504 -0.819 -1.436 -4 ,5794 ,KEBNE ,17022674,Wed Dec 22 06:43:10 CET,Wed Dec 22 08:06:16 CET,0.0 1.07 1.416 1.678 1.882 2.065 2.231 2.388 2.728 2.89 3.029 3.092 3.39 3.502 3.721 3.921 4.103 4.186 4.345 4.496 4.715 4.859 4.995 5.192 5.369 5.538 5.702 5.857 6.06 6.252 6.432 6.646 6.85 7.044 7.264 7.509 7.738 7.964 8.208 8.469 8.725 9.013 9.328 9.613 9.946 10.299 10.626 10.939 11.22 11.392 11.346 10.951 10.413 9.861 9.373 8.883 8.402 7.977 7.613 7.213 6.877 6.583 6.277 5.976 5.707 5.458 5.19 4.958 4.749 4.531 4.307 4.11 3.905 3.686 3.512 3.33 3.146 2.958 2.763 2.621 2.469 2.246 2.096 1.937 1.853 1.678 1.488 1.287 1.179 0.878 0.842 0.727 0.597 0.305 0.138 -0.056 -0.262 -0.503 -0.754 -1.093 -2.066 -5 ,8411 ,KEBNE ,17022675,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:04:55 CET,0.0 0.81 1.288 1.673 1.976 2.213 2.414 2.596 2.921 3.07 3.219 3.29 3.587 3.7 3.905 4.097 4.284 4.372 4.536 4.693 4.896 5.024 5.157 5.343 5.51 5.672 5.833 5.991 6.194 6.38 6.552 6.761 6.954 7.149 7.379 7.632 7.867 8.094 8.338 8.601 8.871 9.169 9.516 9.826 10.164 10.528 10.91 11.259 11.534 11.737 11.719 11.292 10.692 10.099 9.536 8.977 8.508 8.081 7.693 7.308 6.957 6.648 6.358 6.086 5.836 5.595 5.333 5.098 4.884 4.655 4.435 4.253 4.053 3.842 3.672 3.509 3.341 3.164 2.983 2.849 2.713 2.512 2.368 2.212 2.134 1.969 1.782 1.579 1.483 1.211 1.203 1.082 0.938 0.656 0.506 0.361 0.212 0.025 -0.192 -0.534 -1.517 -6 ,28855 ,KEBNE ,17022676,Wed Dec 22 06:43:10 CET,Wed Dec 22 08:04:43 CET,0.0 1.116 1.58 1.867 2.117 2.346 2.545 2.742 3.068 3.194 3.317 3.377 3.678 3.784 3.993 4.2 4.395 4.492 4.665 4.833 5.068 5.199 5.324 5.51 5.688 5.86 6.026 6.182 6.382 6.574 6.756 6.974 7.19 7.387 7.59 7.806 8.02 8.256 8.52 8.801 9.079 9.367 9.668 9.95 10.244 10.566 10.931 11.25 11.526 11.692 11.619 11.227 10.68 10.106 9.563 9.059 8.625 8.202 7.812 7.42 7.085 6.771 6.465 6.171 5.887 5.647 5.414 5.192 4.992 4.788 4.56 4.365 4.185 3.994 3.842 3.702 3.545 3.354 3.166 3.039 2.906 2.718 2.588 2.442 2.357 2.183 2.014 1.828 1.719 1.43 1.383 1.26 1.143 0.874 0.714 0.545 0.384 0.209 0.007 -0.293 -1.085 -7 ,27621 ,KEBNE ,17022677,Wed Dec 22 06:43:10 CET,Wed Dec 22 08:04:50 CET,0.0 1.817 2.381 2.748 3.034 3.272 3.467 3.638 3.945 4.102 4.251 4.346 4.65 4.757 4.965 5.165 5.345 5.428 5.592 5.748 5.969 6.108 6.243 6.429 6.618 6.802 6.969 7.13 7.339 7.555 7.764 7.978 8.182 8.376 8.599 8.833 9.04 9.281 9.529 9.787 10.048 10.328 10.649 10.952 11.287 11.63 11.998 12.341 12.613 12.796 12.744 12.273 11.684 11.1 10.548 10.051 9.587 9.136 8.748 8.373 8.047 7.752 7.461 7.168 6.875 6.61 6.352 6.113 5.9 5.675 5.443 5.255 5.052 4.852 4.696 4.524 4.356 4.175 3.99 3.873 3.748 3.541 3.392 3.244 3.162 2.985 2.803 2.617 2.521 2.229 2.166 2.048 1.94 1.715 1.582 1.389 1.146 0.883 0.591 0.182 -0.748 -8 ,3573 ,KEBNE ,17022678,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:04:49 CET,0.0 1.17 1.589 1.887 2.116 2.317 2.498 2.664 2.945 3.076 3.208 3.254 3.538 3.645 3.861 4.036 4.201 4.294 4.468 4.633 4.858 4.993 5.123 5.307 5.489 5.669 5.839 5.997 6.208 6.413 6.602 6.82 7.032 7.243 7.473 7.721 7.953 8.194 8.455 8.73 9.01 9.287 9.582 9.89 10.239 10.594 10.963 11.277 11.529 11.692 11.619 11.2 10.684 10.12 9.555 9.019 8.527 8.072 7.679 7.306 6.961 6.633 6.324 6.042 5.775 5.521 5.266 5.029 4.81 4.602 4.388 4.192 3.996 3.789 3.629 3.466 3.283 3.091 2.893 2.759 2.615 2.403 2.269 2.111 2.022 1.851 1.673 1.484 1.394 1.114 1.076 0.957 0.837 0.572 0.427 0.251 0.063 -0.142 -0.392 -0.682 -1.357 -9 ,6985 ,KEBNE ,17022679,Wed Dec 22 06:43:09 CET,Wed Dec 22 08:04:49 CET,0.0 1.334 1.793 2.2 2.53 2.77 2.966 3.142 3.442 3.566 3.677 3.7 3.994 4.105 4.328 4.534 4.724 4.815 4.982 5.143 5.382 5.535 5.668 5.846 6.023 6.184 6.341 6.504 6.707 6.907 7.103 7.328 7.538 7.738 7.969 8.205 8.42 8.663 8.922 9.188 9.454 9.726 10.034 10.374 10.734 11.058 11.389 11.708 12.007 12.208 12.159 11.71 11.148 10.621 10.133 9.655 9.191 8.735 8.348 7.978 7.634 7.335 7.053 6.774 6.514 6.284 6.059 5.837 5.636 5.43 5.212 5.035 4.859 4.678 4.528 4.355 4.178 4.003 3.826 3.704 3.566 3.344 3.202 3.057 2.983 2.826 2.65 2.46 2.355 2.071 2.042 1.933 1.823 1.585 1.459 1.328 1.169 0.973 0.731 0.38 -0.146 -10 ,28002 ,KEBNE ,17022680,Wed Dec 22 06:43:10 CET,Wed Dec 22 08:06:34 CET,0.0 1.258 1.699 2.03 2.298 2.51 2.703 2.927 3.329 3.48 3.628 3.718 4.018 4.126 4.334 4.529 4.71 4.793 4.952 5.11 5.337 5.474 5.606 5.8 5.976 6.143 6.312 6.476 6.684 6.883 7.075 7.286 7.479 7.666 7.878 8.129 8.357 8.599 8.863 9.15 9.445 9.74 10.066 10.398 10.768 11.126 11.48 11.842 12.149 12.288 12.173 11.714 11.159 10.606 10.064 9.56 9.108 8.697 8.303 7.882 7.532 7.217 6.914 6.623 6.349 6.092 5.832 5.597 5.397 5.201 4.99 4.813 4.629 4.437 4.285 4.111 3.944 3.783 3.605 3.478 3.35 3.155 3.022 2.88 2.801 2.631 2.458 2.282 2.189 1.911 1.883 1.768 1.646 1.37 1.221 1.058 0.867 0.632 0.371 0.033 -0.748 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_26_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_26_23.txt deleted file mode 100644 index 7d0201d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_26_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30985 ,KEBNE ,17022681,Wed Dec 22 06:43:10 CET,Wed Dec 22 08:06:44 CET,0.0 1.561 2.057 2.396 2.646 2.875 3.064 3.237 3.58 3.731 3.86 3.924 4.194 4.285 4.439 4.606 4.771 4.845 4.987 5.116 5.299 5.42 5.531 5.686 5.829 5.956 6.079 6.186 6.33 6.477 6.603 6.75 6.857 6.955 7.091 7.214 7.308 7.425 7.566 7.69 7.776 7.849 7.895 7.899 7.897 7.832 7.643 7.34 6.818 5.892 4.189 2.093 0.391 -1.042 -2.276 -3.337 -4.256 -5.092 -5.787 -6.466 -7.069 -7.602 -8.126 -8.647 -9.119 -9.537 -9.959 -10.33 -10.657 -10.997 -11.357 -11.672 -11.988 -12.294 -12.531 -12.781 -13.022 -13.258 -13.499 -13.673 -13.867 -14.166 -14.353 -14.553 -14.667 -14.893 -15.119 -15.365 -15.497 -15.835 -15.959 -16.113 -16.283 -16.667 -16.868 -17.067 -17.296 -17.577 -17.922 -18.32 -19.327 -2 ,7040 ,KEBNE ,17022682,Wed Dec 22 06:45:12 CET,Wed Dec 22 08:08:17 CET,0.0 1.283 1.735 2.041 2.287 2.49 2.668 2.828 3.134 3.273 3.404 3.464 3.728 3.826 4.019 4.198 4.357 4.438 4.586 4.71 4.874 4.975 5.073 5.225 5.379 5.513 5.633 5.736 5.866 5.997 6.125 6.268 6.387 6.496 6.624 6.752 6.856 6.97 7.079 7.173 7.251 7.311 7.381 7.415 7.387 7.316 7.141 6.823 6.282 5.402 3.795 1.769 0.117 -1.319 -2.558 -3.663 -4.61 -5.453 -6.173 -6.916 -7.556 -8.138 -8.675 -9.16 -9.617 -10.015 -10.43 -10.805 -11.13 -11.459 -11.79 -12.079 -12.382 -12.688 -12.925 -13.163 -13.424 -13.706 -13.975 -14.162 -14.364 -14.688 -14.923 -15.166 -15.288 -15.552 -15.831 -16.11 -16.255 -16.597 -16.736 -16.906 -17.103 -17.528 -17.744 -17.969 -18.224 -18.525 -18.907 -19.437 -20.548 -3 ,4076 ,KEBNE ,17022683,Wed Dec 22 06:45:12 CET,Wed Dec 22 08:06:44 CET,0.0 0.932 1.375 1.663 1.875 2.074 2.274 2.51 2.95 3.106 3.249 3.345 3.62 3.715 3.88 4.038 4.186 4.263 4.423 4.575 4.763 4.877 4.992 5.146 5.288 5.43 5.557 5.664 5.806 5.936 6.058 6.204 6.337 6.467 6.602 6.733 6.844 6.939 7.042 7.151 7.244 7.318 7.366 7.369 7.322 7.241 7.08 6.768 6.248 5.341 3.586 1.445 -0.258 -1.682 -2.897 -3.968 -4.89 -5.698 -6.39 -7.087 -7.673 -8.203 -8.703 -9.155 -9.594 -10.017 -10.46 -10.836 -11.152 -11.484 -11.833 -12.126 -12.42 -12.726 -12.973 -13.232 -13.485 -13.727 -14.003 -14.215 -14.432 -14.753 -14.972 -15.201 -15.32 -15.558 -15.81 -16.081 -16.23 -16.583 -16.751 -16.933 -17.104 -17.478 -17.681 -17.897 -18.164 -18.466 -18.794 -19.261 -20.336 -4 ,5864 ,KEBNE ,17022684,Wed Dec 22 06:45:13 CET,Wed Dec 22 08:06:47 CET,0.0 1.032 1.366 1.658 1.886 2.084 2.271 2.417 2.675 2.793 2.901 2.969 3.247 3.344 3.518 3.685 3.857 3.945 4.101 4.248 4.466 4.587 4.69 4.835 4.977 5.106 5.227 5.357 5.51 5.639 5.762 5.901 6.024 6.133 6.246 6.379 6.503 6.615 6.722 6.831 6.908 6.979 7.054 7.07 7.025 6.891 6.67 6.353 5.813 4.908 3.301 1.272 -0.431 -1.853 -3.06 -4.132 -5.061 -5.869 -6.557 -7.255 -7.852 -8.373 -8.867 -9.338 -9.788 -10.2 -10.625 -11.0 -11.322 -11.663 -12.021 -12.313 -12.628 -12.939 -13.184 -13.463 -13.738 -14.011 -14.285 -14.474 -14.668 -14.978 -15.212 -15.454 -15.576 -15.817 -16.075 -16.358 -16.498 -16.834 -16.979 -17.148 -17.327 -17.709 -17.917 -18.158 -18.45 -18.765 -19.12 -19.597 -20.719 -5 ,2650 ,KEBNE ,17022685,Wed Dec 22 06:45:13 CET,Wed Dec 22 08:06:53 CET,0.0 1.501 1.945 2.247 2.496 2.731 2.936 3.095 3.372 3.505 3.635 3.702 3.971 4.085 4.281 4.452 4.606 4.671 4.794 4.912 5.081 5.198 5.312 5.472 5.622 5.752 5.879 6.003 6.154 6.292 6.425 6.57 6.697 6.809 6.921 7.032 7.14 7.254 7.367 7.467 7.549 7.638 7.718 7.749 7.74 7.649 7.444 7.124 6.578 5.672 3.988 1.942 0.298 -1.111 -2.346 -3.434 -4.376 -5.208 -5.921 -6.629 -7.222 -7.744 -8.235 -8.694 -9.138 -9.536 -9.936 -10.3 -10.628 -10.966 -11.306 -11.589 -11.881 -12.177 -12.406 -12.666 -12.935 -13.194 -13.475 -13.676 -13.873 -14.175 -14.389 -14.609 -14.722 -14.951 -15.195 -15.459 -15.599 -15.931 -16.034 -16.189 -16.372 -16.802 -17.032 -17.28 -17.55 -17.869 -18.236 -18.656 -19.86 -6 ,6399 ,KEBNE ,17022686,Wed Dec 22 06:45:12 CET,Wed Dec 22 08:06:53 CET,0.0 1.321 1.777 2.103 2.385 2.617 2.824 3.004 3.307 3.442 3.565 3.648 3.923 4.025 4.195 4.353 4.519 4.595 4.753 4.904 5.078 5.179 5.291 5.451 5.592 5.729 5.858 5.974 6.118 6.25 6.363 6.489 6.616 6.736 6.861 6.99 7.106 7.227 7.349 7.462 7.56 7.636 7.686 7.72 7.721 7.653 7.509 7.172 6.598 5.711 4.069 2.023 0.355 -1.053 -2.285 -3.367 -4.332 -5.199 -5.918 -6.626 -7.225 -7.771 -8.315 -8.833 -9.316 -9.746 -10.184 -10.561 -10.87 -11.199 -11.562 -11.871 -12.174 -12.486 -12.739 -13.018 -13.307 -13.575 -13.848 -14.044 -14.242 -14.55 -14.777 -15.019 -15.138 -15.388 -15.657 -15.939 -16.092 -16.429 -16.553 -16.719 -16.885 -17.212 -17.397 -17.596 -17.827 -18.11 -18.429 -18.834 -20.083 -7 ,12443 ,KEBNE ,17022687,Wed Dec 22 06:45:13 CET,Wed Dec 22 08:08:31 CET,0.0 1.616 2.037 2.322 2.547 2.741 2.928 3.111 3.417 3.553 3.696 3.788 4.058 4.155 4.326 4.478 4.616 4.689 4.837 4.964 5.152 5.267 5.377 5.535 5.664 5.797 5.923 6.028 6.184 6.328 6.435 6.563 6.679 6.782 6.896 7.036 7.168 7.289 7.407 7.531 7.635 7.694 7.744 7.763 7.749 7.687 7.523 7.215 6.689 5.779 4.101 2.031 0.32 -1.109 -2.327 -3.417 -4.367 -5.198 -5.913 -6.621 -7.198 -7.704 -8.185 -8.654 -9.093 -9.497 -9.95 -10.342 -10.663 -10.988 -11.329 -11.618 -11.931 -12.271 -12.526 -12.779 -13.033 -13.29 -13.567 -13.766 -13.964 -14.266 -14.487 -14.716 -14.832 -15.073 -15.316 -15.578 -15.719 -16.054 -16.196 -16.358 -16.541 -16.925 -17.142 -17.375 -17.619 -17.928 -18.286 -18.71 -20.081 -8 ,29027 ,KEBNE ,17022688,Wed Dec 22 06:45:12 CET,Wed Dec 22 08:06:44 CET,0.0 1.298 1.742 2.072 2.303 2.499 2.693 2.88 3.181 3.32 3.463 3.55 3.813 3.908 4.102 4.276 4.429 4.5 4.634 4.758 4.921 5.022 5.13 5.296 5.454 5.593 5.725 5.856 5.994 6.112 6.231 6.364 6.486 6.611 6.746 6.888 7.012 7.13 7.24 7.324 7.392 7.471 7.538 7.577 7.581 7.53 7.39 7.09 6.58 5.67 3.962 1.843 0.118 -1.281 -2.479 -3.568 -4.509 -5.353 -6.1 -6.836 -7.441 -7.98 -8.493 -8.968 -9.422 -9.832 -10.242 -10.625 -10.966 -11.304 -11.64 -11.925 -12.226 -12.542 -12.802 -13.06 -13.311 -13.579 -13.861 -14.06 -14.261 -14.564 -14.779 -15.006 -15.122 -15.36 -15.614 -15.879 -16.012 -16.325 -16.427 -16.578 -16.747 -17.158 -17.384 -17.618 -17.886 -18.187 -18.583 -19.16 -21.528 -9 ,20004 ,KEBNE ,17022689,Wed Dec 22 06:45:13 CET,Wed Dec 22 08:08:25 CET,0.0 1.091 1.484 1.72 1.947 2.173 2.357 2.526 2.796 2.918 3.053 3.114 3.357 3.437 3.616 3.786 3.929 3.994 4.141 4.289 4.478 4.6 4.717 4.861 4.995 5.124 5.234 5.337 5.486 5.624 5.739 5.87 5.995 6.111 6.245 6.38 6.487 6.594 6.685 6.774 6.87 6.945 6.999 7.041 7.042 6.954 6.76 6.427 5.851 4.931 3.248 1.15 -0.538 -1.941 -3.176 -4.302 -5.238 -6.052 -6.75 -7.434 -8.037 -8.591 -9.141 -9.675 -10.151 -10.545 -10.938 -11.284 -11.583 -11.899 -12.217 -12.473 -12.737 -13.03 -13.258 -13.473 -13.699 -13.944 -14.197 -14.372 -14.552 -14.825 -15.014 -15.222 -15.328 -15.536 -15.752 -15.981 -16.101 -16.407 -16.479 -16.615 -16.759 -17.078 -17.27 -17.483 -17.719 -17.981 -18.313 -18.804 -20.185 -10 ,20870 ,KEBNE ,17022690,Wed Dec 22 06:45:13 CET,Wed Dec 22 08:06:45 CET,0.0 0.985 1.439 1.735 1.992 2.238 2.449 2.648 3.005 3.139 3.248 3.298 3.568 3.67 3.86 4.04 4.207 4.279 4.415 4.537 4.71 4.827 4.939 5.104 5.253 5.383 5.507 5.614 5.743 5.86 5.978 6.112 6.222 6.327 6.454 6.593 6.711 6.826 6.913 6.992 7.102 7.2 7.275 7.324 7.307 7.2 6.998 6.649 6.101 5.194 3.534 1.511 -0.172 -1.628 -2.86 -3.9 -4.817 -5.66 -6.367 -7.072 -7.668 -8.193 -8.701 -9.176 -9.62 -10.022 -10.43 -10.803 -11.126 -11.467 -11.819 -12.106 -12.409 -12.706 -12.931 -13.177 -13.432 -13.696 -13.98 -14.173 -14.377 -14.713 -14.937 -15.186 -15.313 -15.549 -15.799 -16.073 -16.214 -16.547 -16.683 -16.851 -17.026 -17.416 -17.627 -17.833 -18.05 -18.353 -18.744 -19.193 -20.622 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_26_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_26_57.txt deleted file mode 100644 index fb0d3dc7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_26_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11143 ,KEBNE ,17022691,Wed Dec 22 06:45:12 CET,Wed Dec 22 08:08:56 CET,0.0 1.657 2.213 2.672 2.998 3.287 3.552 3.792 4.229 4.426 4.603 4.746 5.071 5.228 5.492 5.72 5.95 6.06 6.258 6.46 6.764 6.945 7.119 7.366 7.595 7.819 8.047 8.271 8.539 8.786 9.006 9.263 9.501 9.729 9.995 10.292 10.563 10.827 11.082 11.341 11.611 11.898 12.225 12.541 12.841 13.099 13.319 13.502 13.594 13.413 12.777 11.737 10.722 9.758 8.878 8.053 7.282 6.614 6.082 5.544 5.056 4.622 4.223 3.841 3.473 3.128 2.785 2.457 2.163 1.868 1.564 1.305 1.026 0.734 0.534 0.349 0.141 -0.098 -0.346 -0.503 -0.654 -0.888 -1.044 -1.207 -1.302 -1.487 -1.673 -1.913 -2.045 -2.346 -2.458 -2.598 -2.742 -3.077 -3.248 -3.435 -3.662 -3.968 -4.311 -4.686 -5.568 -2 ,15294 ,KEBNE ,17022692,Wed Dec 22 06:45:13 CET,Wed Dec 22 08:08:35 CET,0.0 1.56 2.227 2.752 3.125 3.403 3.656 3.904 4.339 4.534 4.733 4.917 5.221 5.351 5.603 5.847 6.072 6.186 6.428 6.658 6.974 7.185 7.378 7.63 7.848 8.041 8.237 8.427 8.668 8.91 9.143 9.394 9.612 9.813 10.061 10.333 10.586 10.864 11.148 11.428 11.69 11.975 12.315 12.615 12.888 13.176 13.446 13.635 13.73 13.554 12.903 11.814 10.718 9.742 8.922 8.157 7.465 6.821 6.254 5.71 5.215 4.753 4.345 3.98 3.634 3.298 2.946 2.64 2.361 2.067 1.752 1.497 1.232 0.944 0.715 0.483 0.256 0.011 -0.251 -0.432 -0.609 -0.887 -1.08 -1.281 -1.389 -1.617 -1.842 -2.078 -2.215 -2.533 -2.66 -2.82 -2.987 -3.345 -3.539 -3.722 -3.911 -4.157 -4.403 -4.679 -5.507 -3 ,1903 ,KEBNE ,17022693,Wed Dec 22 06:45:13 CET,Wed Dec 22 08:07:25 CET,0.0 1.672 2.268 2.707 3.051 3.346 3.622 3.866 4.296 4.476 4.643 4.811 5.123 5.26 5.535 5.787 6.011 6.124 6.334 6.527 6.809 6.974 7.132 7.363 7.576 7.763 7.944 8.127 8.352 8.573 8.782 9.005 9.205 9.413 9.65 9.891 10.112 10.351 10.612 10.868 11.116 11.389 11.67 11.938 12.247 12.534 12.742 12.904 12.988 12.83 12.183 11.022 9.916 8.957 8.106 7.287 6.558 5.903 5.327 4.753 4.225 3.758 3.356 2.995 2.659 2.339 2.008 1.721 1.461 1.191 0.922 0.694 0.426 0.135 -0.062 -0.255 -0.452 -0.651 -0.86 -1.002 -1.159 -1.41 -1.578 -1.759 -1.858 -2.056 -2.249 -2.465 -2.581 -2.869 -2.935 -3.066 -3.206 -3.512 -3.678 -3.856 -4.049 -4.273 -4.547 -4.914 -5.992 -4 ,20218 ,KEBNE ,17022694,Wed Dec 22 06:45:17 CET,Wed Dec 22 08:06:29 CET,0.0 1.751 2.334 2.783 3.133 3.441 3.704 3.942 4.367 4.561 4.748 4.931 5.251 5.402 5.67 5.904 6.132 6.239 6.441 6.645 6.928 7.099 7.276 7.545 7.788 7.995 8.182 8.377 8.628 8.841 9.038 9.29 9.532 9.745 9.986 10.244 10.469 10.701 10.932 11.172 11.424 11.709 12.03 12.341 12.627 12.89 13.134 13.279 13.293 13.072 12.401 11.316 10.31 9.385 8.549 7.81 7.188 6.594 6.083 5.604 5.186 4.805 4.42 4.042 3.704 3.417 3.106 2.82 2.57 2.315 2.066 1.856 1.63 1.386 1.19 0.996 0.794 0.566 0.333 0.189 0.035 -0.214 -0.393 -0.582 -0.671 -0.854 -1.058 -1.292 -1.421 -1.738 -1.87 -2.006 -2.136 -2.432 -2.604 -2.789 -2.966 -3.191 -3.479 -3.865 -5.473 -5 ,29702 ,KEBNE ,17022695,Wed Dec 22 06:45:15 CET,Wed Dec 22 08:03:27 CET,0.0 2.193 2.866 3.334 3.677 3.961 4.243 4.509 4.978 5.182 5.385 5.605 5.93 6.079 6.36 6.632 6.872 6.976 7.178 7.367 7.608 7.758 7.913 8.149 8.365 8.562 8.765 8.976 9.235 9.467 9.676 9.922 10.169 10.397 10.651 10.908 11.151 11.432 11.719 11.983 12.222 12.48 12.756 13.027 13.324 13.612 13.873 14.078 14.163 13.989 13.314 12.173 11.087 10.107 9.274 8.488 7.78 7.16 6.591 6.018 5.548 5.107 4.665 4.259 3.902 3.579 3.241 2.915 2.619 2.331 2.04 1.803 1.551 1.29 1.091 0.872 0.648 0.422 0.166 -0.013 -0.19 -0.433 -0.591 -0.764 -0.855 -1.048 -1.25 -1.464 -1.58 -1.882 -1.993 -2.135 -2.285 -2.6 -2.757 -2.951 -3.195 -3.47 -3.77 -4.154 -5.718 -6 ,23804 ,KEBNE ,17022696,Wed Dec 22 06:45:16 CET,Wed Dec 22 08:03:05 CET,0.0 1.663 2.247 2.693 3.052 3.343 3.618 3.878 4.34 4.564 4.772 4.954 5.27 5.419 5.688 5.927 6.167 6.281 6.515 6.759 7.068 7.243 7.405 7.64 7.872 8.084 8.289 8.51 8.793 9.026 9.227 9.462 9.68 9.89 10.117 10.357 10.592 10.84 11.1 11.38 11.664 11.953 12.241 12.496 12.767 13.027 13.253 13.43 13.517 13.368 12.713 11.635 10.575 9.593 8.75 7.969 7.234 6.553 5.984 5.429 4.951 4.517 4.075 3.665 3.303 2.967 2.613 2.294 2.021 1.745 1.46 1.212 0.939 0.644 0.415 0.174 -0.075 -0.33 -0.583 -0.742 -0.905 -1.18 -1.369 -1.591 -1.717 -1.954 -2.178 -2.39 -2.493 -2.772 -2.844 -2.977 -3.102 -3.363 -3.526 -3.706 -3.89 -4.119 -4.387 -4.795 -5.882 -7 ,1106 ,KEBNE ,17022697,Wed Dec 22 06:45:17 CET,Wed Dec 22 08:02:45 CET,0.0 1.701 2.297 2.707 2.998 3.26 3.515 3.748 4.202 4.417 4.599 4.781 5.1 5.238 5.509 5.763 5.99 6.098 6.324 6.552 6.859 7.039 7.218 7.46 7.677 7.889 8.1 8.303 8.547 8.772 8.984 9.235 9.474 9.698 9.945 10.214 10.452 10.706 10.992 11.281 11.57 11.871 12.166 12.428 12.693 12.924 13.15 13.36 13.446 13.219 12.483 11.313 10.284 9.347 8.48 7.705 7.009 6.367 5.816 5.258 4.766 4.311 3.882 3.491 3.13 2.805 2.458 2.154 1.897 1.647 1.391 1.165 0.933 0.702 0.514 0.307 0.099 -0.109 -0.323 -0.474 -0.631 -0.863 -1.023 -1.206 -1.307 -1.496 -1.703 -1.931 -2.061 -2.385 -2.481 -2.617 -2.758 -3.087 -3.29 -3.509 -3.74 -3.99 -4.271 -4.677 -5.656 -8 ,7001 ,KEBNE ,17022698,Wed Dec 22 06:47:16 CET,Wed Dec 22 08:09:08 CET,0.0 2.01 2.721 3.217 3.599 3.925 4.21 4.447 4.898 5.087 5.261 5.422 5.74 5.888 6.166 6.441 6.687 6.796 7.009 7.203 7.467 7.637 7.793 8.022 8.257 8.484 8.709 8.914 9.152 9.377 9.583 9.82 10.038 10.244 10.473 10.724 10.961 11.193 11.442 11.725 11.996 12.24 12.508 12.752 13.013 13.289 13.536 13.697 13.751 13.624 13.005 11.892 10.802 9.844 9.006 8.25 7.574 6.939 6.397 5.878 5.415 4.981 4.582 4.2 3.84 3.521 3.179 2.858 2.578 2.277 1.956 1.701 1.442 1.172 0.954 0.728 0.492 0.255 0.005 -0.17 -0.353 -0.634 -0.83 -1.03 -1.136 -1.368 -1.596 -1.849 -1.992 -2.301 -2.379 -2.524 -2.697 -3.073 -3.278 -3.52 -3.79 -4.076 -4.375 -4.739 -5.997 -9 ,29649 ,KEBNE ,17022699,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:11:02 CET,0.0 1.505 2.095 2.473 2.772 3.022 3.265 3.499 3.888 4.058 4.21 4.345 4.658 4.788 5.033 5.265 5.486 5.59 5.788 5.986 6.243 6.388 6.536 6.765 6.995 7.212 7.422 7.623 7.855 8.075 8.303 8.575 8.813 9.038 9.293 9.57 9.818 10.079 10.353 10.615 10.892 11.183 11.485 11.771 12.063 12.334 12.581 12.775 12.81 12.624 12.018 10.95 9.91 8.969 8.121 7.353 6.675 6.05 5.485 4.914 4.43 3.994 3.572 3.175 2.813 2.429 1.993 1.625 1.319 1.006 0.679 0.426 0.169 -0.118 -0.335 -0.546 -0.781 -1.029 -1.279 -1.453 -1.633 -1.932 -2.138 -2.335 -2.447 -2.694 -2.946 -3.205 -3.337 -3.654 -3.802 -3.96 -4.119 -4.472 -4.687 -4.922 -5.164 -5.438 -5.732 -6.093 -7.347 -10 ,16683 ,KEBNE ,17022700,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:10:34 CET,0.0 2.011 2.58 3.01 3.426 3.758 4.043 4.321 4.767 4.952 5.146 5.334 5.652 5.793 6.056 6.311 6.558 6.674 6.878 7.081 7.385 7.562 7.737 7.995 8.219 8.443 8.669 8.889 9.162 9.401 9.619 9.865 10.095 10.316 10.563 10.801 11.024 11.285 11.563 11.858 12.141 12.418 12.735 13.023 13.287 13.52 13.742 13.897 13.909 13.729 13.065 11.992 11.013 10.1 9.264 8.492 7.791 7.121 6.533 5.975 5.495 5.053 4.636 4.24 3.875 3.543 3.195 2.879 2.603 2.31 2.024 1.797 1.552 1.309 1.124 0.916 0.705 0.488 0.25 0.089 -0.071 -0.327 -0.502 -0.692 -0.795 -0.998 -1.201 -1.438 -1.579 -1.894 -2.001 -2.142 -2.287 -2.637 -2.822 -3.005 -3.203 -3.447 -3.745 -4.095 -5.17 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_26_68.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_26_68.txt deleted file mode 100644 index d64f718a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_26_68.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30217 ,KEBNE ,17022701,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:10:23 CET,0.0 1.768 2.238 2.617 2.897 3.097 3.276 3.458 3.778 3.923 4.063 4.149 4.433 4.544 4.753 4.954 5.142 5.233 5.395 5.538 5.751 5.891 6.04 6.267 6.467 6.645 6.827 6.994 7.186 7.362 7.52 7.698 7.873 8.045 8.226 8.416 8.602 8.805 8.993 9.176 9.359 9.554 9.763 9.944 10.155 10.336 10.479 10.584 10.558 10.279 9.54 8.416 7.339 6.373 5.531 4.753 4.074 3.465 2.896 2.33 1.85 1.41 1.0 0.615 0.251 -0.097 -0.479 -0.822 -1.124 -1.435 -1.738 -1.979 -2.222 -2.483 -2.704 -2.932 -3.158 -3.391 -3.642 -3.83 -4.024 -4.313 -4.504 -4.704 -4.813 -5.035 -5.264 -5.503 -5.638 -5.948 -6.078 -6.238 -6.407 -6.798 -7.006 -7.211 -7.445 -7.723 -8.06 -8.604 -10.062 -2 ,27590 ,KEBNE ,17022702,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:09:09 CET,0.0 1.075 1.468 1.759 2.011 2.247 2.478 2.676 3.006 3.154 3.294 3.396 3.681 3.807 4.035 4.223 4.399 4.482 4.644 4.798 5.017 5.158 5.289 5.468 5.628 5.777 5.931 6.076 6.257 6.442 6.632 6.845 7.028 7.191 7.379 7.601 7.8 7.987 8.174 8.376 8.586 8.799 9.019 9.234 9.44 9.588 9.735 9.836 9.799 9.516 8.765 7.616 6.565 5.557 4.643 3.86 3.18 2.562 2.022 1.471 0.992 0.559 0.141 -0.26 -0.642 -0.985 -1.325 -1.62 -1.879 -2.15 -2.432 -2.677 -2.937 -3.199 -3.411 -3.636 -3.88 -4.116 -4.352 -4.522 -4.701 -5.001 -5.204 -5.399 -5.505 -5.732 -5.972 -6.248 -6.376 -6.669 -6.776 -6.936 -7.102 -7.446 -7.631 -7.839 -8.055 -8.327 -8.681 -9.081 -10.458 -3 ,15312 ,KEBNE ,17022703,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:10:22 CET,0.0 1.278 1.711 1.989 2.249 2.466 2.673 2.88 3.232 3.377 3.508 3.564 3.825 3.928 4.128 4.305 4.473 4.558 4.712 4.842 5.052 5.189 5.314 5.501 5.669 5.826 5.985 6.133 6.303 6.466 6.632 6.843 7.028 7.191 7.376 7.569 7.74 7.922 8.128 8.332 8.524 8.731 8.956 9.149 9.352 9.536 9.676 9.736 9.693 9.467 8.738 7.591 6.549 5.608 4.747 3.993 3.357 2.763 2.249 1.739 1.288 0.887 0.526 0.199 -0.11 -0.392 -0.678 -0.941 -1.188 -1.456 -1.706 -1.895 -2.112 -2.363 -2.563 -2.761 -2.97 -3.181 -3.377 -3.517 -3.665 -3.882 -4.046 -4.23 -4.319 -4.492 -4.688 -4.906 -5.023 -5.331 -5.429 -5.576 -5.742 -6.095 -6.272 -6.502 -6.792 -7.09 -7.46 -7.934 -9.44 -4 ,4119 ,KEBNE ,17022704,Wed Dec 22 06:47:20 CET,Wed Dec 22 08:05:53 CET,0.0 1.636 2.161 2.489 2.74 2.953 3.152 3.337 3.665 3.816 3.955 4.049 4.33 4.425 4.612 4.794 4.951 5.034 5.206 5.37 5.626 5.78 5.916 6.128 6.329 6.508 6.682 6.843 7.047 7.236 7.408 7.616 7.807 7.98 8.192 8.432 8.642 8.853 9.071 9.286 9.504 9.759 10.031 10.243 10.439 10.63 10.771 10.818 10.751 10.528 9.835 8.679 7.67 6.761 5.946 5.172 4.466 3.846 3.303 2.752 2.278 1.849 1.442 1.077 0.719 0.376 0.029 -0.292 -0.566 -0.841 -1.124 -1.36 -1.607 -1.862 -2.077 -2.299 -2.533 -2.778 -3.031 -3.205 -3.367 -3.636 -3.838 -4.063 -4.177 -4.41 -4.656 -4.925 -5.065 -5.367 -5.471 -5.612 -5.753 -6.086 -6.284 -6.51 -6.756 -7.002 -7.313 -7.682 -8.76 -5 ,23185 ,KEBNE ,17022705,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:09:09 CET,0.0 1.143 1.584 1.924 2.2 2.435 2.657 2.845 3.178 3.331 3.464 3.552 3.83 3.938 4.139 4.323 4.494 4.573 4.732 4.886 5.094 5.234 5.365 5.537 5.707 5.876 6.03 6.164 6.325 6.49 6.653 6.843 7.008 7.168 7.364 7.565 7.754 7.958 8.158 8.348 8.536 8.753 8.974 9.176 9.379 9.542 9.682 9.73 9.668 9.461 8.754 7.564 6.473 5.52 4.68 3.928 3.248 2.624 2.099 1.552 1.056 0.626 0.227 -0.161 -0.538 -0.883 -1.214 -1.502 -1.762 -2.014 -2.256 -2.465 -2.685 -2.915 -3.104 -3.298 -3.49 -3.688 -3.902 -4.051 -4.207 -4.488 -4.715 -4.953 -5.074 -5.314 -5.547 -5.782 -5.91 -6.225 -6.382 -6.56 -6.733 -7.062 -7.259 -7.47 -7.682 -7.941 -8.321 -8.807 -9.98 -6 ,15794 ,KEBNE ,17022706,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:09:43 CET,0.0 1.569 2.077 2.42 2.716 2.957 3.168 3.357 3.677 3.825 3.972 4.094 4.386 4.504 4.734 4.954 5.165 5.273 5.471 5.643 5.88 6.026 6.154 6.336 6.518 6.678 6.843 7.004 7.192 7.362 7.527 7.726 7.9 8.069 8.258 8.455 8.639 8.833 9.04 9.243 9.456 9.681 9.893 10.101 10.314 10.476 10.575 10.634 10.57 10.257 9.508 8.416 7.403 6.471 5.631 4.844 4.145 3.512 2.963 2.405 1.908 1.458 1.043 0.664 0.31 -0.027 -0.385 -0.694 -0.958 -1.241 -1.533 -1.769 -2.011 -2.268 -2.473 -2.693 -2.922 -3.161 -3.407 -3.585 -3.769 -4.051 -4.24 -4.439 -4.543 -4.746 -4.952 -5.192 -5.329 -5.637 -5.757 -5.917 -6.091 -6.457 -6.658 -6.876 -7.121 -7.404 -7.73 -8.115 -9.262 -7 ,12532 ,KEBNE ,17022707,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:09:07 CET,0.0 1.793 2.367 2.707 2.951 3.177 3.425 3.635 3.989 4.136 4.255 4.324 4.602 4.716 4.938 5.133 5.302 5.385 5.541 5.681 5.885 6.025 6.156 6.326 6.484 6.649 6.799 6.929 7.096 7.255 7.418 7.597 7.748 7.902 8.092 8.304 8.489 8.682 8.891 9.104 9.319 9.562 9.808 10.018 10.213 10.355 10.513 10.649 10.626 10.309 9.55 8.425 7.354 6.408 5.559 4.779 4.076 3.433 2.874 2.305 1.813 1.376 0.958 0.543 0.145 -0.238 -0.639 -0.963 -1.234 -1.517 -1.818 -2.08 -2.349 -2.617 -2.82 -3.018 -3.23 -3.457 -3.694 -3.864 -4.032 -4.302 -4.51 -4.723 -4.825 -5.065 -5.319 -5.561 -5.684 -5.989 -6.15 -6.313 -6.479 -6.864 -7.07 -7.288 -7.527 -7.803 -8.164 -8.662 -9.914 -8 ,4223 ,KEBNE ,17022708,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:09:01 CET,0.0 1.665 2.114 2.48 2.786 3.034 3.257 3.448 3.801 3.958 4.103 4.228 4.515 4.634 4.861 5.066 5.263 5.364 5.558 5.736 5.976 6.116 6.235 6.402 6.578 6.747 6.899 7.036 7.223 7.405 7.571 7.76 7.932 8.096 8.279 8.486 8.678 8.88 9.086 9.282 9.469 9.681 9.927 10.14 10.359 10.568 10.711 10.749 10.69 10.446 9.716 8.55 7.505 6.559 5.707 4.94 4.255 3.657 3.147 2.615 2.127 1.696 1.321 0.959 0.61 0.286 -0.071 -0.388 -0.658 -0.954 -1.257 -1.493 -1.742 -2.004 -2.215 -2.432 -2.654 -2.881 -3.119 -3.285 -3.458 -3.743 -3.941 -4.14 -4.244 -4.46 -4.686 -4.923 -5.038 -5.323 -5.435 -5.593 -5.739 -6.082 -6.294 -6.525 -6.778 -7.06 -7.42 -7.887 -9.402 -9 ,4778 ,KEBNE ,17022709,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:08:51 CET,0.0 1.573 2.097 2.447 2.743 2.98 3.182 3.351 3.616 3.747 3.874 3.947 4.223 4.331 4.516 4.689 4.872 4.956 5.131 5.297 5.515 5.648 5.778 5.98 6.161 6.32 6.479 6.64 6.833 7.003 7.163 7.374 7.574 7.743 7.935 8.144 8.338 8.542 8.753 8.965 9.187 9.42 9.655 9.856 10.034 10.195 10.352 10.436 10.385 10.156 9.549 8.525 7.518 6.598 5.745 4.985 4.341 3.753 3.244 2.72 2.26 1.847 1.444 1.052 0.688 0.365 0.035 -0.269 -0.548 -0.826 -1.113 -1.361 -1.615 -1.872 -2.071 -2.279 -2.488 -2.708 -2.955 -3.123 -3.303 -3.588 -3.777 -3.982 -4.086 -4.307 -4.545 -4.782 -4.91 -5.209 -5.282 -5.418 -5.572 -5.958 -6.159 -6.368 -6.598 -6.851 -7.153 -7.524 -9.986 -10 ,31081 ,KEBNE ,17022710,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:09:06 CET,0.0 3.396 4.059 4.39 4.684 4.934 5.156 5.365 5.725 5.877 6.028 6.135 6.416 6.532 6.752 6.958 7.146 7.252 7.461 7.628 7.849 7.99 8.121 8.302 8.474 8.645 8.804 8.945 9.133 9.311 9.479 9.684 9.869 10.037 10.22 10.412 10.586 10.777 10.962 11.142 11.337 11.54 11.735 11.905 12.115 12.335 12.485 12.555 12.548 12.3 11.575 10.507 9.515 8.616 7.796 7.03 6.366 5.743 5.169 4.611 4.139 3.712 3.262 2.81 2.407 2.061 1.712 1.388 1.105 0.816 0.494 0.221 -0.039 -0.311 -0.532 -0.738 -0.929 -1.142 -1.36 -1.5 -1.651 -1.887 -2.059 -2.241 -2.331 -2.513 -2.705 -2.916 -3.031 -3.316 -3.405 -3.542 -3.678 -3.982 -4.143 -4.345 -4.602 -4.899 -5.236 -5.679 -7.062 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_28.txt deleted file mode 100644 index 4b256c15..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18066 ,KEBNE ,17022711,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:08:05 CET,0.0 1.699 2.201 2.556 2.841 3.08 3.297 3.478 3.793 3.93 4.047 4.071 4.378 4.47 4.644 4.809 4.973 5.06 5.24 5.41 5.652 5.794 5.928 6.125 6.306 6.468 6.619 6.763 6.957 7.144 7.308 7.511 7.709 7.893 8.091 8.31 8.529 8.799 9.099 9.368 9.647 9.95 10.235 10.506 10.816 11.107 11.407 11.72 11.961 12.066 11.854 11.264 10.638 10.061 9.503 8.968 8.482 8.02 7.607 7.172 6.808 6.494 6.189 5.905 5.636 5.378 5.115 4.889 4.697 4.504 4.29 4.103 3.903 3.664 3.481 3.297 3.095 2.893 2.695 2.542 2.357 2.065 1.878 1.712 1.627 1.448 1.285 1.08 0.95 0.625 0.593 0.475 0.354 0.052 -0.113 -0.303 -0.499 -0.73 -1.066 -1.592 -3.201 -2 ,23857 ,KEBNE ,17022712,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:08:13 CET,0.0 2.259 2.884 3.269 3.511 3.764 4.0 4.222 4.591 4.735 4.889 5.003 5.347 5.464 5.69 5.891 6.059 6.146 6.312 6.467 6.695 6.831 6.948 7.117 7.313 7.535 7.714 7.855 8.048 8.226 8.39 8.589 8.766 8.929 9.124 9.34 9.535 9.739 9.945 10.156 10.376 10.606 10.859 11.116 11.401 11.672 11.902 12.117 12.26 12.224 11.919 11.319 10.732 10.146 9.606 9.113 8.647 8.21 7.806 7.392 7.055 6.775 6.51 6.249 6.003 5.765 5.515 5.302 5.118 4.913 4.688 4.489 4.283 4.07 3.898 3.708 3.511 3.336 3.152 3.022 2.891 2.646 2.46 2.272 2.18 2.005 1.824 1.622 1.507 1.192 1.166 1.036 0.883 0.522 0.332 0.148 -0.033 -0.272 -0.582 -1.093 -2.537 -3 ,5157 ,KEBNE ,17022713,Wed Dec 22 06:47:16 CET,Wed Dec 22 08:08:28 CET,0.0 1.382 1.766 2.094 2.403 2.644 2.859 3.074 3.439 3.589 3.736 3.785 4.106 4.224 4.459 4.665 4.868 4.972 5.146 5.31 5.549 5.689 5.811 5.996 6.176 6.338 6.487 6.63 6.814 7.004 7.186 7.367 7.539 7.708 7.91 8.144 8.356 8.57 8.794 9.015 9.224 9.443 9.712 10.0 10.337 10.667 10.987 11.277 11.471 11.569 11.365 10.789 10.14 9.493 8.877 8.303 7.821 7.394 7.02 6.632 6.289 5.98 5.695 5.422 5.166 4.92 4.648 4.404 4.195 3.965 3.715 3.517 3.323 3.126 2.98 2.82 2.63 2.426 2.174 2.001 1.842 1.611 1.481 1.34 1.256 1.082 0.908 0.692 0.561 0.226 0.187 0.065 -0.052 -0.351 -0.528 -0.721 -0.949 -1.164 -1.445 -1.895 -3.262 -4 ,32506 ,KEBNE ,17022714,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:07:59 CET,0.0 1.994 2.403 2.684 2.943 3.179 3.392 3.573 3.849 3.967 4.095 4.151 4.465 4.56 4.749 4.922 5.093 5.184 5.37 5.555 5.81 5.977 6.139 6.363 6.584 6.787 6.994 7.185 7.399 7.606 7.814 8.072 8.327 8.573 8.857 9.144 9.376 9.625 9.905 10.184 10.451 10.75 11.085 11.41 11.756 12.096 12.434 12.733 12.969 13.117 13.007 12.446 11.787 11.15 10.573 10.049 9.542 9.037 8.61 8.193 7.829 7.484 7.151 6.832 6.511 6.222 5.928 5.661 5.439 5.203 4.95 4.736 4.519 4.313 4.134 3.925 3.714 3.5 3.286 3.142 2.999 2.787 2.629 2.463 2.378 2.196 1.995 1.762 1.636 1.306 1.239 1.087 0.926 0.572 0.373 0.176 -0.008 -0.229 -0.543 -0.943 -2.506 -5 ,28786 ,KEBNE ,17022715,Wed Dec 22 06:47:21 CET,Wed Dec 22 08:08:24 CET,0.0 1.792 2.3 2.645 2.939 3.184 3.373 3.538 3.865 4.011 4.164 4.249 4.558 4.669 4.895 5.096 5.278 5.363 5.521 5.673 5.907 6.069 6.226 6.426 6.607 6.794 6.956 7.096 7.273 7.456 7.645 7.864 8.048 8.206 8.402 8.639 8.865 9.106 9.369 9.613 9.837 10.095 10.379 10.628 10.899 11.156 11.395 11.648 11.836 11.85 11.556 10.975 10.364 9.753 9.186 8.657 8.172 7.717 7.325 6.946 6.629 6.322 6.0 5.682 5.392 5.108 4.802 4.536 4.287 4.038 3.803 3.612 3.426 3.228 3.059 2.88 2.694 2.512 2.318 2.179 2.032 1.791 1.62 1.439 1.352 1.186 0.984 0.732 0.615 0.301 0.258 0.109 -0.059 -0.451 -0.662 -0.861 -1.101 -1.402 -1.731 -2.175 -3.725 -6 ,10525 ,KEBNE ,17022716,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:08:19 CET,0.0 3.264 3.88 4.234 4.515 4.764 4.98 5.168 5.458 5.595 5.733 5.8 6.123 6.248 6.466 6.65 6.84 6.932 7.094 7.224 7.421 7.552 7.674 7.859 8.037 8.2 8.361 8.524 8.718 8.883 9.038 9.234 9.417 9.588 9.786 9.982 10.159 10.369 10.602 10.833 11.044 11.271 11.523 11.751 11.991 12.249 12.519 12.776 13.0 13.083 12.905 12.345 11.691 11.11 10.58 10.046 9.564 9.141 8.794 8.423 8.077 7.787 7.516 7.256 7.016 6.795 6.537 6.284 6.067 5.842 5.618 5.444 5.253 5.05 4.898 4.746 4.591 4.421 4.208 4.059 3.911 3.677 3.526 3.367 3.281 3.094 2.866 2.605 2.479 2.145 2.084 1.956 1.832 1.54 1.362 1.161 0.943 0.655 0.291 -0.099 -1.338 -7 ,21000 ,KEBNE ,17022717,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:09:42 CET,0.0 2.649 3.269 3.653 3.948 4.219 4.463 4.669 4.984 5.129 5.276 5.36 5.685 5.807 6.051 6.275 6.467 6.561 6.752 6.941 7.194 7.344 7.487 7.675 7.851 8.035 8.229 8.412 8.65 8.877 9.072 9.301 9.526 9.73 9.954 10.21 10.457 10.72 10.979 11.247 11.522 11.812 12.102 12.383 12.727 13.061 13.392 13.711 13.982 14.127 13.943 13.357 12.712 12.051 11.426 10.854 10.351 9.909 9.553 9.197 8.873 8.565 8.263 7.986 7.737 7.511 7.249 6.997 6.788 6.581 6.366 6.179 5.973 5.759 5.593 5.421 5.248 5.071 4.881 4.741 4.59 4.351 4.188 4.029 3.95 3.773 3.573 3.362 3.248 2.914 2.856 2.696 2.523 2.169 1.973 1.761 1.559 1.337 0.984 0.461 -1.193 -8 ,32752 ,KEBNE ,17022718,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:08:11 CET,0.0 2.266 2.731 3.063 3.356 3.587 3.818 4.032 4.351 4.5 4.654 4.718 5.031 5.136 5.323 5.505 5.69 5.786 5.967 6.129 6.346 6.481 6.616 6.811 6.997 7.176 7.342 7.491 7.682 7.876 8.064 8.277 8.483 8.688 8.929 9.181 9.417 9.691 9.97 10.238 10.485 10.767 11.107 11.413 11.741 12.07 12.363 12.597 12.773 12.867 12.672 12.113 11.525 10.941 10.376 9.847 9.371 8.925 8.53 8.118 7.738 7.374 7.027 6.732 6.477 6.239 6.0 5.788 5.598 5.394 5.165 4.956 4.737 4.515 4.346 4.15 3.942 3.758 3.585 3.468 3.335 3.11 2.949 2.788 2.709 2.525 2.324 2.111 1.992 1.655 1.6 1.442 1.263 0.9 0.686 0.456 0.23 -0.04 -0.377 -0.775 -2.003 -9 ,23977 ,KEBNE ,17022719,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:08:16 CET,0.0 1.498 1.989 2.327 2.585 2.799 2.988 3.19 3.602 3.772 3.917 3.97 4.284 4.398 4.63 4.842 5.044 5.137 5.3 5.455 5.683 5.811 5.934 6.126 6.306 6.486 6.657 6.797 6.966 7.128 7.288 7.5 7.704 7.886 8.085 8.305 8.52 8.739 8.967 9.213 9.425 9.647 9.914 10.156 10.394 10.615 10.821 11.032 11.203 11.221 10.996 10.429 9.727 9.104 8.545 8.011 7.557 7.148 6.787 6.407 6.076 5.776 5.477 5.199 4.945 4.706 4.468 4.249 4.045 3.845 3.642 3.449 3.224 2.995 2.829 2.664 2.495 2.315 2.115 1.976 1.841 1.616 1.45 1.286 1.202 1.027 0.859 0.668 0.557 0.245 0.243 0.127 -0.013 -0.317 -0.488 -0.725 -0.987 -1.285 -1.649 -2.143 -3.495 -10 ,8605 ,KEBNE ,17022720,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:08:14 CET,0.0 2.341 2.913 3.3 3.574 3.809 4.026 4.231 4.574 4.721 4.873 4.975 5.301 5.423 5.659 5.867 6.058 6.152 6.33 6.504 6.77 6.944 7.104 7.313 7.504 7.679 7.843 7.998 8.196 8.388 8.56 8.77 8.97 9.147 9.363 9.611 9.831 10.058 10.301 10.557 10.794 11.04 11.327 11.606 11.938 12.288 12.646 13.006 13.322 13.523 13.383 12.651 11.838 11.181 10.637 10.119 9.62 9.166 8.769 8.338 7.94 7.592 7.288 7.014 6.749 6.493 6.23 5.99 5.792 5.58 5.341 5.131 4.899 4.659 4.479 4.299 4.102 3.878 3.655 3.525 3.389 3.166 3.025 2.875 2.788 2.612 2.426 2.218 2.117 1.814 1.793 1.658 1.514 1.223 1.056 0.867 0.656 0.385 -0.003 -0.525 -1.927 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_30.txt deleted file mode 100644 index 7ba1eefa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19246 ,KEBNE ,17022721,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:09:42 CET,0.0 1.273 1.75 2.088 2.373 2.615 2.843 3.043 3.325 3.442 3.548 3.558 3.862 3.966 4.166 4.354 4.519 4.601 4.767 4.912 5.095 5.208 5.319 5.488 5.642 5.781 5.923 6.057 6.229 6.415 6.588 6.774 6.939 7.099 7.29 7.5 7.699 7.905 8.116 8.351 8.587 8.838 9.129 9.397 9.669 9.966 10.31 10.611 10.821 10.951 10.894 10.567 10.144 9.679 9.234 8.81 8.413 8.035 7.704 7.371 7.07 6.787 6.527 6.288 6.061 5.859 5.631 5.43 5.262 5.076 4.889 4.732 4.559 4.384 4.253 4.113 3.963 3.815 3.653 3.53 3.402 3.211 3.078 2.941 2.87 2.713 2.541 2.371 2.275 1.957 1.931 1.826 1.733 1.529 1.39 1.215 1.029 0.8 0.5 0.13 -0.759 -2 ,5346 ,KEBNE ,17022722,Wed Dec 22 06:47:18 CET,Wed Dec 22 08:08:29 CET,0.0 1.498 1.877 2.168 2.395 2.584 2.753 2.908 3.164 3.28 3.396 3.415 3.709 3.803 3.988 4.156 4.331 4.417 4.576 4.72 4.906 5.034 5.159 5.322 5.482 5.626 5.759 5.891 6.062 6.212 6.366 6.575 6.764 6.931 7.131 7.348 7.552 7.771 7.981 8.203 8.441 8.7 8.971 9.208 9.469 9.773 10.102 10.354 10.564 10.712 10.618 10.232 9.799 9.348 8.888 8.444 8.066 7.708 7.378 7.047 6.751 6.476 6.222 5.98 5.752 5.543 5.311 5.116 4.952 4.76 4.544 4.371 4.199 4.029 3.893 3.751 3.601 3.426 3.259 3.145 3.018 2.832 2.707 2.571 2.49 2.333 2.186 2.019 1.926 1.626 1.621 1.52 1.399 1.095 0.92 0.725 0.512 0.285 -0.033 -0.47 -1.43 -3 ,11517 ,KEBNE ,17022723,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:08:32 CET,0.0 1.393 1.839 2.145 2.367 2.56 2.739 2.899 3.174 3.301 3.417 3.426 3.725 3.827 4.0 4.154 4.298 4.369 4.524 4.666 4.858 4.971 5.075 5.24 5.412 5.579 5.729 5.874 6.054 6.222 6.385 6.578 6.762 6.936 7.148 7.384 7.588 7.789 7.997 8.221 8.47 8.742 9.024 9.282 9.558 9.817 10.08 10.342 10.594 10.771 10.736 10.357 9.87 9.406 8.96 8.512 8.113 7.763 7.45 7.117 6.815 6.546 6.309 6.081 5.858 5.643 5.42 5.225 5.052 4.855 4.647 4.486 4.318 4.147 4.02 3.884 3.732 3.573 3.409 3.293 3.17 2.965 2.82 2.682 2.61 2.452 2.284 2.113 2.027 1.726 1.708 1.586 1.463 1.209 1.077 0.933 0.764 0.548 0.272 -0.091 -0.881 -4 ,9134 ,KEBNE ,17022724,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:09:54 CET,0.0 1.124 1.521 1.809 2.076 2.311 2.503 2.672 2.936 3.063 3.189 3.242 3.565 3.686 3.925 4.154 4.352 4.441 4.612 4.77 5.005 5.149 5.274 5.453 5.623 5.775 5.913 6.044 6.218 6.393 6.552 6.739 6.926 7.098 7.29 7.49 7.679 7.886 8.112 8.343 8.565 8.821 9.102 9.367 9.652 9.926 10.214 10.507 10.784 10.933 10.818 10.429 9.997 9.552 9.105 8.674 8.282 7.916 7.595 7.271 7.0 6.761 6.527 6.302 6.079 5.872 5.657 5.459 5.284 5.111 4.924 4.767 4.609 4.439 4.3 4.132 3.932 3.721 3.504 3.366 3.216 2.956 2.787 2.617 2.531 2.345 2.123 1.903 1.801 1.486 1.443 1.302 1.151 0.825 0.642 0.446 0.229 -0.014 -0.264 -0.608 -1.349 -5 ,23604 ,KEBNE ,17022725,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:08:36 CET,0.0 1.37 1.861 2.187 2.441 2.669 2.863 3.024 3.345 3.491 3.609 3.614 3.919 4.028 4.257 4.466 4.637 4.71 4.856 5.01 5.231 5.362 5.485 5.65 5.811 5.97 6.112 6.248 6.412 6.563 6.717 6.905 7.087 7.26 7.464 7.682 7.863 8.061 8.293 8.525 8.759 9.017 9.292 9.568 9.869 10.162 10.479 10.777 11.051 11.235 11.189 10.852 10.383 9.916 9.488 9.068 8.683 8.314 7.972 7.604 7.294 7.031 6.785 6.541 6.298 6.075 5.849 5.657 5.49 5.31 5.108 4.94 4.769 4.587 4.448 4.301 4.149 3.996 3.837 3.719 3.598 3.41 3.277 3.136 3.058 2.917 2.775 2.608 2.523 2.229 2.223 2.104 1.984 1.741 1.607 1.436 1.201 0.93 0.633 0.24 -1.394 -6 ,1596 ,KEBNE ,17022727,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:08:31 CET,0.0 1.189 1.614 1.948 2.192 2.391 2.586 2.77 3.09 3.23 3.353 3.392 3.701 3.791 3.985 4.173 4.323 4.397 4.555 4.703 4.898 5.017 5.139 5.329 5.51 5.674 5.829 5.968 6.136 6.303 6.459 6.654 6.83 6.987 7.172 7.388 7.591 7.809 8.038 8.263 8.488 8.747 9.045 9.321 9.61 9.904 10.207 10.479 10.723 10.882 10.825 10.465 10.017 9.572 9.124 8.701 8.332 7.985 7.651 7.32 7.037 6.764 6.509 6.263 6.026 5.803 5.558 5.337 5.144 4.941 4.741 4.559 4.36 4.155 3.993 3.832 3.674 3.506 3.335 3.215 3.086 2.871 2.721 2.58 2.504 2.332 2.151 1.968 1.864 1.549 1.515 1.389 1.251 0.943 0.782 0.58 0.357 0.142 -0.144 -0.618 -1.943 -7 ,7880 ,KEBNE ,17022728,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:09:37 CET,0.0 1.56 2.0 2.315 2.586 2.832 3.034 3.215 3.56 3.717 3.865 3.935 4.264 4.393 4.602 4.783 4.966 5.056 5.212 5.369 5.59 5.715 5.837 6.005 6.172 6.35 6.517 6.666 6.843 7.011 7.169 7.349 7.516 7.686 7.9 8.13 8.329 8.539 8.749 8.963 9.201 9.439 9.697 9.976 10.277 10.576 10.871 11.154 11.422 11.588 11.476 11.016 10.498 10.0 9.538 9.08 8.656 8.282 7.952 7.602 7.304 7.041 6.772 6.522 6.292 6.078 5.857 5.657 5.481 5.294 5.093 4.926 4.756 4.583 4.452 4.304 4.124 3.926 3.708 3.559 3.426 3.22 3.071 2.893 2.795 2.606 2.397 2.179 2.068 1.747 1.697 1.56 1.424 1.131 0.958 0.777 0.586 0.361 0.078 -0.33 -1.319 -8 ,18067 ,KEBNE ,17022729,Wed Dec 22 06:47:17 CET,Wed Dec 22 08:09:39 CET,0.0 1.524 1.886 2.165 2.41 2.623 2.81 2.974 3.262 3.389 3.507 3.533 3.834 3.924 4.104 4.269 4.446 4.534 4.687 4.822 5.015 5.142 5.265 5.445 5.61 5.777 5.932 6.068 6.242 6.4 6.559 6.752 6.935 7.109 7.308 7.529 7.724 7.922 8.134 8.365 8.593 8.834 9.106 9.366 9.653 9.953 10.279 10.573 10.788 10.906 10.818 10.458 10.014 9.546 9.094 8.664 8.272 7.908 7.573 7.225 6.935 6.677 6.429 6.199 5.981 5.781 5.575 5.377 5.204 5.033 4.837 4.683 4.532 4.358 4.22 4.088 3.944 3.789 3.639 3.537 3.43 3.252 3.115 2.973 2.903 2.769 2.633 2.468 2.379 2.074 2.013 1.845 1.67 1.319 1.136 0.968 0.761 0.478 0.135 -0.273 -1.064 -9 ,31010 ,KEBNE ,17022730,Wed Dec 22 06:48:18 CET,Wed Dec 22 08:09:09 CET,0.0 1.413 1.853 2.101 2.319 2.504 2.656 2.798 3.096 3.232 3.347 3.381 3.692 3.793 3.994 4.166 4.321 4.4 4.553 4.698 4.901 5.025 5.143 5.309 5.462 5.61 5.75 5.89 6.075 6.253 6.433 6.634 6.813 6.988 7.177 7.385 7.58 7.774 7.975 8.202 8.453 8.708 8.969 9.216 9.481 9.768 10.083 10.39 10.662 10.827 10.784 10.424 9.958 9.501 9.081 8.683 8.26 7.87 7.553 7.215 6.92 6.653 6.401 6.157 5.919 5.71 5.491 5.283 5.09 4.901 4.717 4.561 4.386 4.201 4.067 3.92 3.763 3.613 3.455 3.335 3.204 2.998 2.87 2.729 2.65 2.489 2.319 2.118 1.995 1.672 1.614 1.472 1.34 1.096 0.962 0.789 0.548 0.265 -0.046 -0.467 -1.582 -10 ,22381 ,KEBNE ,17022731,Wed Dec 22 06:48:19 CET,Wed Dec 22 08:10:33 CET,0.0 2.205 2.648 2.932 3.147 3.334 3.502 3.644 3.908 4.042 4.174 4.229 4.552 4.674 4.884 5.1 5.315 5.407 5.566 5.716 5.953 6.103 6.248 6.462 6.667 6.858 7.015 7.154 7.329 7.496 7.658 7.856 8.039 8.207 8.398 8.603 8.8 9.005 9.209 9.451 9.704 9.952 10.24 10.505 10.786 11.081 11.355 11.632 11.883 12.02 11.923 11.494 11.042 10.585 10.106 9.653 9.258 8.887 8.559 8.229 7.943 7.68 7.416 7.166 6.917 6.697 6.483 6.286 6.111 5.924 5.733 5.582 5.428 5.262 5.126 4.974 4.801 4.605 4.413 4.294 4.159 3.93 3.773 3.612 3.528 3.336 3.131 2.944 2.839 2.516 2.473 2.356 2.228 1.91 1.72 1.518 1.308 1.086 0.831 0.422 -0.764 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_32.txt deleted file mode 100644 index 1fc60f52..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9093 ,KEBNE ,17022732,Wed Dec 22 06:48:19 CET,Wed Dec 22 08:10:54 CET,0.0 1.081 1.514 1.778 1.996 2.191 2.37 2.524 2.798 2.915 3.028 3.054 3.356 3.464 3.663 3.842 3.999 4.07 4.21 4.352 4.546 4.659 4.77 4.949 5.129 5.287 5.424 5.558 5.726 5.883 6.033 6.218 6.402 6.572 6.765 6.978 7.17 7.365 7.568 7.793 8.031 8.274 8.521 8.777 9.064 9.327 9.572 9.777 9.959 10.019 9.79 9.238 8.644 8.084 7.563 7.061 6.616 6.209 5.85 5.497 5.202 4.931 4.663 4.415 4.175 3.955 3.725 3.508 3.324 3.138 2.951 2.788 2.607 2.429 2.289 2.138 1.983 1.817 1.655 1.547 1.425 1.236 1.087 0.934 0.862 0.694 0.531 0.364 0.276 -0.021 -0.012 -0.119 -0.244 -0.522 -0.683 -0.857 -1.031 -1.236 -1.503 -1.822 -2.667 -2 ,13133 ,KEBNE ,17022733,Wed Dec 22 06:48:19 CET,Wed Dec 22 08:10:32 CET,0.0 1.675 2.152 2.459 2.742 3.006 3.211 3.387 3.719 3.867 3.983 4.005 4.31 4.405 4.599 4.781 4.939 5.013 5.155 5.299 5.498 5.616 5.723 5.884 6.051 6.213 6.36 6.492 6.659 6.819 6.971 7.151 7.329 7.505 7.703 7.918 8.116 8.321 8.525 8.727 8.932 9.155 9.395 9.628 9.877 10.117 10.332 10.544 10.751 10.827 10.633 10.093 9.529 9.002 8.507 8.071 7.664 7.248 6.883 6.53 6.23 5.958 5.695 5.433 5.185 4.961 4.726 4.524 4.337 4.133 3.928 3.767 3.609 3.436 3.289 3.134 2.97 2.8 2.61 2.465 2.296 2.037 1.866 1.713 1.643 1.489 1.325 1.144 1.058 0.766 0.783 0.677 0.559 0.313 0.191 0.043 -0.153 -0.374 -0.623 -0.933 -1.873 -3 ,10702 ,KEBNE ,17022734,Wed Dec 22 06:48:23 CET,Wed Dec 22 08:06:08 CET,0.0 1.306 1.728 2.02 2.251 2.426 2.576 2.728 3.019 3.145 3.268 3.3 3.612 3.719 3.914 4.106 4.284 4.365 4.519 4.666 4.875 5.01 5.137 5.306 5.454 5.598 5.736 5.87 6.036 6.201 6.371 6.569 6.744 6.895 7.054 7.24 7.445 7.682 7.944 8.197 8.413 8.637 8.893 9.143 9.385 9.631 9.889 10.111 10.298 10.381 10.137 9.596 8.999 8.408 7.874 7.374 6.925 6.522 6.186 5.852 5.556 5.278 4.995 4.716 4.466 4.249 4.021 3.814 3.628 3.427 3.229 3.065 2.883 2.702 2.569 2.434 2.288 2.126 1.961 1.842 1.719 1.529 1.39 1.249 1.179 1.01 0.829 0.643 0.548 0.255 0.275 0.162 0.043 -0.191 -0.346 -0.52 -0.705 -0.942 -1.245 -1.606 -2.893 -4 ,18463 ,KEBNE ,17022735,Wed Dec 22 06:49:24 CET,Wed Dec 22 08:03:40 CET,0.0 1.382 1.768 2.032 2.246 2.449 2.614 2.766 3.072 3.202 3.314 3.317 3.616 3.717 3.902 4.063 4.216 4.291 4.425 4.558 4.759 4.875 4.989 5.15 5.288 5.421 5.561 5.702 5.872 6.025 6.169 6.351 6.527 6.683 6.871 7.075 7.259 7.465 7.692 7.934 8.181 8.444 8.689 8.908 9.157 9.393 9.626 9.834 10.003 10.078 9.877 9.348 8.764 8.222 7.706 7.194 6.741 6.341 5.995 5.649 5.353 5.069 4.793 4.542 4.305 4.088 3.857 3.638 3.451 3.255 3.058 2.901 2.719 2.528 2.385 2.239 2.084 1.915 1.737 1.62 1.496 1.298 1.162 1.005 0.924 0.765 0.61 0.455 0.373 0.068 0.047 -0.075 -0.201 -0.477 -0.631 -0.786 -0.956 -1.154 -1.437 -1.801 -2.853 -5 ,11127 ,KEBNE ,17022736,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:12:30 CET,0.0 1.324 1.732 2.092 2.399 2.626 2.801 2.962 3.252 3.39 3.517 3.546 3.853 3.957 4.141 4.327 4.502 4.58 4.731 4.868 5.078 5.206 5.326 5.514 5.692 5.847 5.976 6.106 6.287 6.457 6.621 6.812 6.978 7.138 7.324 7.521 7.711 7.905 8.116 8.36 8.593 8.816 9.06 9.305 9.573 9.851 10.1 10.29 10.466 10.574 10.362 9.814 9.251 8.702 8.185 7.686 7.233 6.822 6.458 6.088 5.748 5.441 5.156 4.893 4.658 4.43 4.19 3.985 3.812 3.63 3.43 3.261 3.082 2.903 2.768 2.628 2.478 2.314 2.133 2.003 1.883 1.7 1.564 1.426 1.353 1.201 1.041 0.869 0.778 0.482 0.485 0.373 0.251 -0.001 -0.141 -0.307 -0.486 -0.682 -0.924 -1.281 -3.108 -6 ,30133 ,KEBNE ,17022737,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:12:24 CET,0.0 1.01 1.466 1.753 1.976 2.152 2.322 2.486 2.757 2.899 3.034 3.094 3.424 3.542 3.749 3.911 4.067 4.149 4.297 4.431 4.623 4.756 4.888 5.066 5.225 5.376 5.517 5.649 5.82 5.977 6.124 6.301 6.471 6.641 6.829 7.029 7.222 7.43 7.647 7.859 8.079 8.314 8.574 8.837 9.09 9.334 9.6 9.841 10.032 10.115 9.91 9.416 8.891 8.336 7.825 7.359 6.944 6.554 6.198 5.842 5.535 5.263 5.007 4.749 4.507 4.285 4.035 3.819 3.637 3.44 3.24 3.073 2.89 2.708 2.572 2.425 2.286 2.141 1.97 1.851 1.726 1.517 1.385 1.247 1.172 1.02 0.858 0.686 0.593 0.291 0.3 0.203 0.081 -0.209 -0.344 -0.484 -0.646 -0.828 -1.052 -1.344 -2.069 -7 ,25562 ,KEBNE ,17022738,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:12:05 CET,0.0 1.053 1.366 1.635 1.869 2.075 2.238 2.403 2.711 2.832 2.945 2.963 3.266 3.374 3.585 3.759 3.907 3.978 4.114 4.249 4.45 4.567 4.679 4.851 5.011 5.166 5.313 5.438 5.596 5.751 5.904 6.092 6.261 6.426 6.625 6.829 7.017 7.21 7.395 7.587 7.786 8.005 8.246 8.481 8.714 8.944 9.19 9.398 9.567 9.66 9.501 9.017 8.496 7.947 7.426 6.95 6.506 6.09 5.724 5.355 5.042 4.752 4.476 4.207 3.953 3.733 3.512 3.311 3.126 2.926 2.704 2.515 2.322 2.116 1.96 1.811 1.667 1.513 1.354 1.243 1.125 0.931 0.798 0.667 0.599 0.454 0.291 0.122 0.036 -0.261 -0.276 -0.402 -0.53 -0.758 -0.883 -1.047 -1.261 -1.48 -1.729 -2.07 -3.331 -8 ,7433 ,KEBNE ,17022739,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:12:29 CET,0.0 1.624 2.114 2.439 2.72 2.977 3.195 3.383 3.739 3.901 4.05 4.116 4.422 4.532 4.751 4.956 5.147 5.239 5.425 5.595 5.797 5.916 6.033 6.19 6.351 6.518 6.674 6.819 6.999 7.157 7.297 7.489 7.664 7.824 8.014 8.208 8.392 8.591 8.802 9.026 9.248 9.498 9.782 10.031 10.287 10.522 10.766 11.011 11.216 11.298 11.093 10.579 10.03 9.485 8.969 8.5 8.073 7.653 7.293 6.929 6.598 6.273 5.935 5.635 5.387 5.152 4.909 4.704 4.507 4.29 4.08 3.916 3.74 3.547 3.393 3.219 3.033 2.855 2.667 2.537 2.4 2.164 1.995 1.826 1.746 1.59 1.417 1.225 1.123 0.805 0.779 0.67 0.562 0.328 0.189 0.014 -0.183 -0.398 -0.677 -1.058 -2.207 -9 ,22195 ,KEBNE ,17022740,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:13:46 CET,0.0 1.171 1.623 1.977 2.286 2.522 2.71 2.875 3.157 3.277 3.385 3.399 3.705 3.806 3.992 4.167 4.342 4.428 4.592 4.741 4.95 5.086 5.201 5.371 5.531 5.671 5.807 5.945 6.128 6.297 6.456 6.636 6.794 6.952 7.129 7.309 7.493 7.705 7.912 8.121 8.333 8.546 8.775 9.019 9.283 9.514 9.741 9.959 10.127 10.198 10.041 9.564 8.989 8.407 7.877 7.375 6.931 6.53 6.171 5.801 5.467 5.176 4.908 4.658 4.421 4.208 3.997 3.795 3.612 3.416 3.223 3.081 2.934 2.768 2.63 2.473 2.313 2.15 1.965 1.842 1.724 1.546 1.411 1.267 1.195 1.049 0.884 0.717 0.631 0.323 0.281 0.151 0.033 -0.228 -0.38 -0.551 -0.754 -0.968 -1.248 -1.673 -2.682 -10 ,18161 ,KEBNE ,17022741,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:12:22 CET,0.0 1.825 2.306 2.586 2.808 2.988 3.193 3.389 3.723 3.873 4.007 4.053 4.375 4.492 4.696 4.888 5.083 5.176 5.355 5.529 5.782 5.942 6.092 6.307 6.491 6.651 6.79 6.918 7.092 7.265 7.422 7.587 7.744 7.898 8.067 8.255 8.434 8.638 8.872 9.097 9.296 9.517 9.775 10.01 10.247 10.492 10.766 11.039 11.236 11.28 11.113 10.631 10.049 9.498 9.0 8.528 8.091 7.686 7.334 6.986 6.681 6.4 6.136 5.884 5.638 5.414 5.171 4.919 4.684 4.447 4.212 4.015 3.805 3.593 3.425 3.245 3.054 2.856 2.648 2.505 2.366 2.126 1.943 1.762 1.669 1.49 1.31 1.099 0.986 0.661 0.608 0.48 0.339 0.011 -0.156 -0.361 -0.621 -0.926 -1.299 -1.747 -3.2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_33.txt deleted file mode 100644 index c40a2f53..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18494 ,KEBNE ,17022742,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:12:22 CET,0.0 1.161 1.569 1.903 2.162 2.386 2.585 2.743 3.019 3.147 3.261 3.26 3.55 3.641 3.817 3.993 4.14 4.21 4.359 4.484 4.667 4.791 4.905 5.069 5.211 5.359 5.517 5.657 5.829 5.988 6.138 6.311 6.473 6.629 6.804 6.997 7.174 7.359 7.555 7.745 7.932 8.142 8.375 8.587 8.824 9.024 9.172 9.331 9.459 9.46 9.12 8.44 7.723 7.061 6.486 5.94 5.438 4.969 4.56 4.153 3.814 3.513 3.216 2.93 2.662 2.417 2.16 1.929 1.725 1.513 1.296 1.114 0.915 0.716 0.559 0.387 0.215 0.043 -0.14 -0.264 -0.389 -0.59 -0.721 -0.86 -0.936 -1.09 -1.255 -1.428 -1.514 -1.812 -1.802 -1.925 -2.083 -2.442 -2.626 -2.797 -2.981 -3.213 -3.483 -3.856 -4.836 -2 ,3711 ,KEBNE ,17022743,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:12:16 CET,0.0 0.929 1.327 1.679 1.965 2.194 2.382 2.539 2.814 2.935 3.056 3.109 3.43 3.539 3.725 3.908 4.113 4.214 4.397 4.568 4.793 4.943 5.099 5.302 5.477 5.672 5.874 6.048 6.27 6.477 6.675 6.917 7.104 7.274 7.47 7.678 7.859 8.042 8.232 8.426 8.632 8.833 9.036 9.254 9.499 9.715 9.922 10.087 10.184 10.148 9.811 9.111 8.378 7.701 7.098 6.526 6.014 5.551 5.144 4.741 4.409 4.103 3.771 3.466 3.207 2.967 2.716 2.481 2.27 2.062 1.85 1.666 1.491 1.315 1.166 1.01 0.848 0.681 0.501 0.369 0.233 0.024 -0.132 -0.299 -0.376 -0.525 -0.696 -0.867 -0.957 -1.263 -1.268 -1.387 -1.513 -1.802 -1.972 -2.149 -2.355 -2.573 -2.863 -3.288 -4.158 -3 ,24258 ,KEBNE ,17022744,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:12:07 CET,0.0 0.977 1.34 1.604 1.805 1.979 2.147 2.31 2.602 2.739 2.872 2.88 3.171 3.276 3.472 3.637 3.799 3.88 4.029 4.173 4.392 4.525 4.636 4.781 4.93 5.075 5.205 5.33 5.489 5.654 5.816 6.002 6.178 6.339 6.522 6.72 6.896 7.088 7.284 7.47 7.649 7.857 8.104 8.322 8.538 8.759 8.969 9.124 9.198 9.133 8.762 8.053 7.331 6.664 6.055 5.505 5.022 4.547 4.144 3.764 3.43 3.111 2.8 2.515 2.259 2.028 1.786 1.555 1.354 1.155 0.944 0.764 0.576 0.381 0.229 0.068 -0.097 -0.268 -0.444 -0.555 -0.677 -0.877 -1.007 -1.15 -1.227 -1.38 -1.545 -1.74 -1.848 -2.175 -2.232 -2.364 -2.513 -2.853 -3.04 -3.236 -3.457 -3.667 -3.928 -4.372 -5.673 -4 ,5803 ,KEBNE ,17022745,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:11:58 CET,0.0 1.289 1.738 2.008 2.214 2.436 2.665 2.858 3.178 3.327 3.486 3.58 3.903 4.012 4.191 4.366 4.541 4.619 4.768 4.916 5.117 5.242 5.356 5.53 5.698 5.847 5.989 6.119 6.29 6.457 6.617 6.808 6.976 7.144 7.338 7.524 7.7 7.898 8.09 8.291 8.494 8.703 8.923 9.135 9.364 9.569 9.791 9.965 10.046 10.006 9.656 8.972 8.257 7.568 6.944 6.39 5.885 5.409 5.005 4.604 4.262 3.96 3.665 3.377 3.108 2.858 2.596 2.364 2.164 1.951 1.732 1.552 1.357 1.165 1.013 0.844 0.677 0.513 0.335 0.21 0.082 -0.114 -0.254 -0.419 -0.503 -0.655 -0.816 -0.988 -1.074 -1.368 -1.403 -1.544 -1.686 -2.025 -2.21 -2.374 -2.547 -2.726 -2.939 -3.269 -3.957 -5 ,31551 ,KEBNE ,17022746,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:12:10 CET,0.0 1.318 1.838 2.19 2.427 2.622 2.8 2.962 3.217 3.336 3.461 3.515 3.825 3.923 4.107 4.284 4.449 4.523 4.667 4.799 4.974 5.086 5.19 5.337 5.482 5.618 5.76 5.907 6.08 6.238 6.388 6.566 6.739 6.894 7.066 7.268 7.462 7.652 7.83 8.0 8.185 8.399 8.643 8.874 9.105 9.312 9.506 9.666 9.745 9.7 9.345 8.692 8.048 7.413 6.808 6.242 5.733 5.262 4.857 4.43 4.064 3.756 3.465 3.179 2.916 2.688 2.446 2.213 1.996 1.763 1.525 1.339 1.15 0.949 0.792 0.638 0.463 0.284 0.108 -0.023 -0.166 -0.386 -0.531 -0.693 -0.782 -0.959 -1.138 -1.325 -1.426 -1.732 -1.75 -1.874 -2.009 -2.32 -2.496 -2.677 -2.896 -3.144 -3.421 -3.832 -5.188 -6 ,4895 ,KEBNE ,17022747,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:12:16 CET,0.0 1.404 1.904 2.201 2.434 2.649 2.843 3.005 3.269 3.379 3.483 3.498 3.801 3.901 4.077 4.241 4.385 4.456 4.6 4.739 4.945 5.069 5.185 5.344 5.488 5.635 5.778 5.91 6.089 6.249 6.397 6.585 6.751 6.904 7.075 7.264 7.441 7.649 7.864 8.068 8.274 8.483 8.705 8.911 9.142 9.381 9.602 9.753 9.833 9.798 9.419 8.694 7.964 7.275 6.657 6.109 5.626 5.172 4.775 4.377 4.033 3.731 3.438 3.148 2.878 2.628 2.36 2.129 1.94 1.739 1.531 1.36 1.174 0.98 0.836 0.685 0.525 0.364 0.192 0.074 -0.04 -0.231 -0.375 -0.512 -0.584 -0.761 -0.957 -1.154 -1.262 -1.572 -1.578 -1.691 -1.82 -2.078 -2.219 -2.396 -2.596 -2.809 -3.092 -3.544 -4.83 -7 ,26117 ,KEBNE ,17022748,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:12:22 CET,0.0 1.067 1.521 1.829 2.064 2.254 2.459 2.646 2.932 3.058 3.172 3.203 3.513 3.614 3.798 3.96 4.124 4.203 4.35 4.495 4.689 4.803 4.925 5.102 5.266 5.423 5.57 5.705 5.864 6.024 6.181 6.369 6.548 6.719 6.895 7.095 7.295 7.494 7.697 7.884 8.069 8.279 8.529 8.758 8.97 9.196 9.423 9.61 9.739 9.701 9.34 8.696 8.011 7.304 6.656 6.084 5.597 5.148 4.762 4.373 4.027 3.727 3.431 3.143 2.888 2.647 2.388 2.151 1.949 1.746 1.524 1.339 1.142 0.927 0.767 0.613 0.455 0.285 0.106 -0.026 -0.162 -0.372 -0.517 -0.667 -0.739 -0.889 -1.067 -1.26 -1.363 -1.67 -1.674 -1.778 -1.875 -2.122 -2.284 -2.443 -2.606 -2.79 -2.991 -3.297 -4.355 -8 ,2881 ,KEBNE ,17022749,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:12:18 CET,0.0 1.628 2.113 2.456 2.727 2.981 3.191 3.363 3.692 3.833 3.954 3.971 4.269 4.363 4.576 4.793 4.98 5.064 5.207 5.339 5.536 5.653 5.767 5.928 6.068 6.203 6.346 6.487 6.653 6.798 6.947 7.138 7.311 7.474 7.666 7.877 8.051 8.228 8.416 8.608 8.808 9.035 9.288 9.503 9.719 9.937 10.147 10.324 10.432 10.388 10.001 9.285 8.545 7.87 7.253 6.685 6.176 5.721 5.341 4.941 4.582 4.266 3.97 3.693 3.425 3.175 2.91 2.678 2.483 2.282 2.065 1.884 1.705 1.52 1.378 1.226 1.057 0.876 0.686 0.541 0.389 0.163 0.001 -0.164 -0.245 -0.41 -0.585 -0.795 -0.906 -1.214 -1.237 -1.359 -1.493 -1.805 -1.976 -2.153 -2.356 -2.589 -2.876 -3.245 -4.257 -9 ,8059 ,KEBNE ,17022750,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:12:11 CET,0.0 3.018 3.454 3.789 4.056 4.255 4.419 4.588 4.892 5.011 5.114 5.093 5.385 5.487 5.678 5.85 6.005 6.074 6.214 6.359 6.546 6.652 6.754 6.928 7.094 7.228 7.367 7.506 7.673 7.827 7.974 8.146 8.316 8.482 8.665 8.862 9.039 9.223 9.425 9.627 9.816 10.021 10.229 10.428 10.667 10.914 11.174 11.371 11.444 11.375 11.01 10.303 9.575 8.912 8.33 7.776 7.252 6.776 6.368 5.949 5.585 5.26 4.961 4.658 4.375 4.131 3.87 3.632 3.429 3.229 3.019 2.838 2.652 2.455 2.299 2.141 1.975 1.8 1.627 1.511 1.379 1.17 1.036 0.904 0.833 0.645 0.429 0.233 0.127 -0.196 -0.256 -0.402 -0.544 -0.814 -0.965 -1.141 -1.339 -1.594 -1.897 -2.292 -3.257 -10 ,14141 ,KEBNE ,17022751,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:12:16 CET,0.0 1.228 1.774 2.228 2.534 2.776 3.005 3.216 3.551 3.692 3.832 3.868 4.171 4.27 4.458 4.636 4.807 4.887 5.037 5.184 5.398 5.525 5.641 5.806 5.959 6.088 6.22 6.364 6.546 6.722 6.896 7.097 7.28 7.45 7.65 7.877 8.083 8.304 8.533 8.773 9.013 9.253 9.512 9.749 9.993 10.227 10.437 10.612 10.734 10.697 10.3 9.54 8.827 8.194 7.623 7.084 6.601 6.166 5.796 5.416 5.079 4.766 4.467 4.195 3.949 3.718 3.453 3.217 3.027 2.825 2.604 2.413 2.216 2.022 1.878 1.724 1.566 1.414 1.243 1.11 0.974 0.764 0.618 0.477 0.405 0.24 0.065 -0.104 -0.186 -0.492 -0.503 -0.611 -0.724 -0.975 -1.116 -1.269 -1.472 -1.705 -1.953 -2.299 -3.353 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_34.txt deleted file mode 100644 index 1a60e222..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15164 ,KEBNE ,17022752,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:12:21 CET,0.0 0.974 1.448 1.786 2.095 2.385 2.655 2.882 3.281 3.442 3.588 3.676 4.011 4.118 4.328 4.541 4.735 4.829 5.012 5.188 5.414 5.557 5.71 5.922 6.113 6.29 6.466 6.632 6.859 7.093 7.302 7.547 7.78 7.983 8.219 8.473 8.701 8.956 9.236 9.55 9.894 10.266 10.689 11.099 11.548 12.034 12.571 13.118 13.647 14.133 14.558 14.625 14.411 14.097 13.748 13.369 13.009 12.638 12.253 11.866 11.564 11.277 10.972 10.706 10.478 10.275 10.073 9.875 9.697 9.527 9.329 9.14 8.94 8.743 8.6 8.462 8.325 8.187 8.047 7.942 7.829 7.629 7.487 7.354 7.286 7.124 6.949 6.768 6.669 6.382 6.366 6.255 6.149 5.899 5.748 5.587 5.414 5.244 5.057 4.8 4.18 -2 ,6776 ,KEBNE ,17022753,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:12:39 CET,0.0 1.787 2.251 2.594 2.867 3.126 3.354 3.576 3.974 4.124 4.258 4.308 4.624 4.739 4.976 5.198 5.403 5.499 5.689 5.876 6.113 6.257 6.397 6.614 6.85 7.077 7.292 7.503 7.754 7.999 8.26 8.56 8.816 9.062 9.371 9.713 10.015 10.338 10.683 11.041 11.406 11.8 12.245 12.661 13.102 13.594 14.141 14.687 15.245 15.782 16.144 16.06 15.732 15.363 15.019 14.654 14.303 13.974 13.653 13.315 13.015 12.748 12.499 12.251 12.021 11.828 11.597 11.358 11.162 10.963 10.757 10.585 10.411 10.231 10.092 9.936 9.768 9.61 9.437 9.316 9.183 8.96 8.819 8.679 8.596 8.422 8.251 8.071 7.975 7.68 7.66 7.533 7.394 7.13 6.989 6.819 6.612 6.37 6.077 5.711 5.21 -3 ,24112 ,KEBNE ,17022754,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:12:15 CET,0.0 1.322 1.727 2.091 2.398 2.65 2.879 3.064 3.35 3.485 3.631 3.682 4.017 4.148 4.372 4.586 4.783 4.875 5.05 5.237 5.521 5.7 5.878 6.139 6.394 6.633 6.851 7.072 7.365 7.627 7.876 8.172 8.436 8.678 8.969 9.31 9.616 9.93 10.277 10.643 11.012 11.407 11.851 12.299 12.766 13.227 13.739 14.267 14.802 15.283 15.621 15.566 15.239 14.854 14.463 14.082 13.748 13.419 13.11 12.785 12.485 12.213 11.957 11.731 11.52 11.308 11.086 10.884 10.703 10.522 10.314 10.128 9.935 9.712 9.537 9.372 9.21 9.046 8.856 8.706 8.567 8.379 8.25 8.114 8.05 7.912 7.766 7.611 7.522 7.237 7.254 7.16 7.054 6.792 6.652 6.519 6.375 6.198 5.955 5.543 4.208 -4 ,5537 ,KEBNE ,17022755,Wed Dec 22 06:51:29 CET,Wed Dec 22 08:10:55 CET,0.0 1.921 2.517 2.88 3.151 3.367 3.578 3.789 4.167 4.325 4.469 4.551 4.889 5.009 5.243 5.455 5.642 5.735 5.916 6.096 6.346 6.486 6.627 6.834 7.034 7.236 7.424 7.599 7.825 8.03 8.224 8.46 8.68 8.901 9.148 9.417 9.679 9.962 10.25 10.573 10.912 11.251 11.643 12.037 12.45 12.915 13.428 13.899 14.39 14.86 15.164 15.105 14.869 14.559 14.215 13.875 13.546 13.216 12.93 12.633 12.381 12.143 11.887 11.657 11.441 11.235 11.022 10.839 10.682 10.501 10.295 10.123 9.953 9.78 9.635 9.489 9.352 9.213 9.063 8.95 8.824 8.631 8.498 8.357 8.286 8.137 7.976 7.785 7.686 7.396 7.401 7.289 7.168 6.898 6.752 6.59 6.408 6.204 5.929 5.566 4.99 -5 ,23151 ,KEBNE ,17022756,Wed Dec 22 06:51:30 CET,Wed Dec 22 08:11:15 CET,0.0 1.477 1.895 2.24 2.525 2.768 2.997 3.203 3.551 3.704 3.839 3.911 4.252 4.383 4.628 4.846 5.036 5.129 5.33 5.522 5.794 5.965 6.119 6.334 6.53 6.717 6.906 7.108 7.358 7.58 7.777 8.028 8.303 8.549 8.808 9.1 9.39 9.671 9.949 10.261 10.579 10.941 11.332 11.691 12.124 12.585 13.076 13.554 14.007 14.499 14.859 14.655 14.19 13.708 13.273 12.856 12.448 12.061 11.706 11.344 11.025 10.728 10.443 10.198 9.995 9.809 9.61 9.424 9.249 9.067 8.878 8.703 8.526 8.359 8.235 8.094 7.931 7.763 7.596 7.489 7.376 7.191 7.049 6.894 6.817 6.644 6.46 6.26 6.155 5.855 5.852 5.762 5.668 5.45 5.333 5.19 5.017 4.78 4.516 4.227 3.446 -6 ,21635 ,KEBNE ,17022757,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:12:23 CET,0.0 1.456 1.958 2.371 2.676 2.916 3.124 3.332 3.72 3.877 4.027 4.112 4.443 4.563 4.796 5.037 5.266 5.364 5.556 5.738 5.992 6.156 6.31 6.536 6.741 6.919 7.095 7.272 7.492 7.71 7.916 8.157 8.409 8.66 8.965 9.291 9.58 9.907 10.238 10.576 10.912 11.287 11.751 12.209 12.687 13.175 13.715 14.261 14.817 15.342 15.695 15.626 15.341 14.98 14.602 14.212 13.875 13.582 13.308 13.017 12.756 12.508 12.27 12.044 11.83 11.633 11.416 11.227 11.063 10.878 10.677 10.522 10.362 10.172 10.031 9.891 9.743 9.594 9.443 9.332 9.219 9.044 8.907 8.764 8.699 8.558 8.393 8.217 8.12 7.814 7.788 7.675 7.56 7.318 7.186 7.055 6.927 6.777 6.565 6.242 5.39 -7 ,3020 ,KEBNE ,17022758,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:12:22 CET,0.0 1.658 2.275 2.697 3.035 3.318 3.577 3.811 4.183 4.341 4.492 4.563 4.89 5.028 5.299 5.546 5.763 5.855 6.047 6.24 6.527 6.719 6.891 7.104 7.301 7.503 7.697 7.869 8.092 8.327 8.544 8.794 9.051 9.318 9.636 9.978 10.285 10.612 10.948 11.301 11.653 12.035 12.516 12.987 13.46 13.943 14.479 15.049 15.639 16.208 16.597 16.594 16.354 15.998 15.608 15.222 14.857 14.511 14.2 13.887 13.598 13.323 13.069 12.83 12.595 12.375 12.147 11.939 11.759 11.575 11.381 11.221 11.041 10.842 10.704 10.565 10.406 10.243 10.073 9.954 9.836 9.64 9.489 9.333 9.259 9.097 8.921 8.741 8.645 8.346 8.338 8.23 8.103 7.823 7.663 7.481 7.284 7.06 6.825 6.542 5.876 -8 ,9138 ,KEBNE ,17022759,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:12:26 CET,0.0 1.336 1.767 2.099 2.395 2.677 2.927 3.125 3.479 3.64 3.782 3.864 4.203 4.33 4.545 4.761 5.002 5.113 5.299 5.465 5.712 5.878 6.047 6.296 6.509 6.697 6.879 7.062 7.288 7.492 7.689 7.914 8.128 8.345 8.597 8.867 9.127 9.406 9.686 9.997 10.332 10.682 11.048 11.397 11.83 12.278 12.754 13.267 13.77 14.288 14.699 14.61 14.274 13.933 13.586 13.213 12.849 12.519 12.222 11.917 11.663 11.425 11.182 10.938 10.723 10.547 10.37 10.199 10.039 9.872 9.708 9.572 9.423 9.26 9.124 8.981 8.835 8.673 8.498 8.382 8.264 8.085 7.966 7.835 7.764 7.623 7.486 7.333 7.245 6.956 6.959 6.851 6.739 6.458 6.298 6.141 5.947 5.722 5.493 5.207 4.575 -9 ,28079 ,KEBNE ,17022760,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:14:02 CET,0.0 1.274 1.805 2.162 2.459 2.706 2.938 3.143 3.489 3.657 3.806 3.852 4.174 4.315 4.583 4.801 5.0 5.091 5.265 5.452 5.728 5.904 6.084 6.338 6.573 6.797 6.999 7.187 7.446 7.681 7.902 8.192 8.457 8.716 9.035 9.374 9.665 9.974 10.316 10.653 10.993 11.372 11.774 12.182 12.65 13.139 13.669 14.183 14.672 15.159 15.519 15.448 15.15 14.777 14.423 14.078 13.716 13.356 13.019 12.67 12.389 12.113 11.835 11.606 11.398 11.19 10.977 10.783 10.607 10.434 10.269 10.129 9.974 9.817 9.677 9.516 9.362 9.208 9.022 8.888 8.768 8.579 8.441 8.3 8.233 8.095 7.946 7.792 7.706 7.421 7.418 7.311 7.205 6.977 6.84 6.688 6.527 6.36 6.147 5.839 5.428 -10 ,21231 ,KEBNE ,17022761,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:12:23 CET,0.0 1.85 2.448 2.867 3.213 3.513 3.762 3.978 4.381 4.557 4.717 4.815 5.158 5.293 5.546 5.799 6.045 6.157 6.362 6.56 6.846 7.028 7.203 7.461 7.703 7.934 8.156 8.363 8.606 8.832 9.063 9.35 9.614 9.857 10.149 10.49 10.797 11.108 11.443 11.804 12.171 12.556 12.985 13.374 13.807 14.278 14.818 15.346 15.833 16.3 16.631 16.585 16.335 16.024 15.672 15.286 14.917 14.591 14.293 13.966 13.671 13.413 13.164 12.916 12.677 12.453 12.22 12.016 11.834 11.631 11.422 11.246 11.044 10.834 10.677 10.51 10.324 10.115 9.903 9.766 9.62 9.387 9.223 9.047 8.962 8.811 8.653 8.464 8.361 8.052 8.023 7.906 7.784 7.501 7.347 7.18 6.988 6.763 6.495 6.178 5.412 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_37.txt deleted file mode 100644 index 9edb6760..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26702 ,TETRA ,17550698,Thu Nov 25 09:41:15 CET,Thu Nov 25 11:19:18 CET,0.0 1.83 2.373 2.806 3.132 3.419 3.692 3.938 4.361 4.55 4.728 4.86 5.198 5.339 5.599 5.829 6.067 6.174 6.375 6.589 6.871 7.044 7.207 7.438 7.657 7.862 8.08 8.294 8.549 8.769 8.974 9.225 9.457 9.678 9.933 10.206 10.473 10.757 11.054 11.389 11.733 12.058 12.391 12.725 13.069 13.392 13.713 14.013 14.204 14.255 13.965 13.182 12.368 11.599 10.884 10.19 9.586 9.04 8.591 8.181 7.834 7.521 7.209 6.917 6.64 6.386 6.137 5.903 5.692 5.483 5.265 5.082 4.892 4.682 4.517 4.344 4.156 3.955 3.749 3.611 3.478 3.268 3.119 2.955 2.869 2.707 2.543 2.359 2.256 1.941 1.911 1.778 1.635 1.336 1.157 0.962 0.757 0.534 0.257 -0.143 -1.268 -2 ,4942 ,TETRA ,17550699,Thu Nov 25 09:41:14 CET,Thu Nov 25 11:17:48 CET,0.0 2.205 2.746 3.185 3.565 3.841 4.095 4.331 4.742 4.945 5.136 5.282 5.634 5.782 6.061 6.311 6.546 6.658 6.871 7.079 7.381 7.559 7.698 7.896 8.105 8.306 8.494 8.683 8.91 9.101 9.278 9.488 9.702 9.905 10.121 10.355 10.576 10.811 11.089 11.396 11.717 12.036 12.339 12.651 13.036 13.39 13.684 13.962 14.215 14.248 13.854 13.119 12.352 11.625 10.995 10.408 9.89 9.403 8.965 8.528 8.158 7.832 7.509 7.192 6.898 6.618 6.33 6.067 5.828 5.585 5.331 5.129 4.923 4.702 4.531 4.361 4.173 3.967 3.763 3.628 3.486 3.262 3.108 2.931 2.835 2.637 2.43 2.203 2.087 1.775 1.727 1.58 1.43 1.132 0.957 0.753 0.55 0.327 0.02 -0.382 -1.279 -3 ,193 ,TETRA ,17550700,Thu Nov 25 09:41:42 CET,Thu Nov 25 11:16:57 CET,0.0 2.253 2.916 3.405 3.791 4.118 4.42 4.685 5.15 5.341 5.514 5.643 5.996 6.144 6.421 6.672 6.901 7.011 7.227 7.437 7.736 7.934 8.119 8.371 8.61 8.838 9.043 9.237 9.487 9.722 9.949 10.209 10.459 10.708 10.992 11.31 11.604 11.912 12.216 12.521 12.84 13.161 13.534 13.893 14.244 14.604 14.96 15.24 15.433 15.453 15.116 14.359 13.514 12.705 11.994 11.354 10.774 10.206 9.716 9.286 8.941 8.604 8.267 7.979 7.726 7.485 7.228 7.007 6.817 6.619 6.404 6.214 6.023 5.837 5.68 5.523 5.377 5.201 5.01 4.887 4.755 4.526 4.352 4.157 4.063 3.885 3.699 3.512 3.415 3.105 3.091 2.973 2.849 2.568 2.416 2.266 2.082 1.877 1.649 1.332 0.581 -4 ,1542 ,TETRA ,17550701,Thu Nov 25 09:41:44 CET,Thu Nov 25 11:17:21 CET,0.0 1.55 2.134 2.569 2.907 3.157 3.386 3.602 3.964 4.131 4.297 4.385 4.72 4.851 5.096 5.337 5.567 5.667 5.857 6.029 6.27 6.43 6.58 6.789 7.009 7.22 7.411 7.594 7.819 8.014 8.2 8.436 8.654 8.847 9.072 9.321 9.547 9.784 10.0 10.216 10.471 10.743 10.985 11.207 11.46 11.69 11.923 12.144 12.29 12.252 11.844 11.033 10.204 9.489 8.874 8.297 7.802 7.318 6.876 6.446 6.086 5.777 5.482 5.208 4.957 4.712 4.447 4.22 4.02 3.818 3.607 3.428 3.23 3.011 2.854 2.701 2.547 2.379 2.178 2.044 1.922 1.708 1.546 1.4 1.329 1.155 0.956 0.761 0.661 0.352 0.347 0.228 0.103 -0.16 -0.311 -0.496 -0.715 -0.945 -1.186 -1.505 -2.67 -5 ,9597 ,TETRA ,17550702,Thu Nov 25 09:41:46 CET,Thu Nov 25 11:16:57 CET,0.0 2.074 2.644 3.046 3.368 3.63 3.865 4.07 4.434 4.602 4.753 4.867 5.214 5.351 5.618 5.865 6.073 6.169 6.369 6.548 6.796 6.954 7.11 7.343 7.56 7.76 7.959 8.152 8.387 8.591 8.773 8.991 9.2 9.407 9.634 9.891 10.135 10.368 10.608 10.851 11.087 11.347 11.63 11.872 12.119 12.378 12.687 12.929 13.03 13.024 12.676 11.892 11.071 10.323 9.654 9.048 8.543 8.087 7.684 7.283 6.936 6.623 6.321 6.028 5.756 5.514 5.266 5.016 4.791 4.578 4.35 4.161 3.979 3.781 3.636 3.491 3.329 3.157 2.981 2.859 2.728 2.524 2.384 2.244 2.165 1.989 1.795 1.599 1.502 1.188 1.151 1.009 0.882 0.637 0.504 0.359 0.201 0.007 -0.262 -0.652 -1.613 -6 ,17543 ,TETRA ,17550703,Thu Nov 25 09:41:42 CET,Thu Nov 25 11:16:19 CET,0.0 1.832 2.384 2.831 3.183 3.472 3.775 4.041 4.492 4.714 4.916 5.055 5.405 5.55 5.824 6.092 6.331 6.443 6.672 6.873 7.152 7.34 7.522 7.765 7.991 8.221 8.444 8.657 8.91 9.139 9.349 9.604 9.847 10.079 10.354 10.649 10.928 11.22 11.497 11.78 12.079 12.396 12.73 13.025 13.325 13.642 13.956 14.249 14.462 14.431 14.029 13.279 12.504 11.776 11.155 10.565 10.017 9.513 9.07 8.621 8.24 7.898 7.552 7.235 6.95 6.694 6.434 6.188 5.968 5.722 5.466 5.271 5.072 4.864 4.699 4.525 4.351 4.173 3.987 3.86 3.73 3.53 3.392 3.247 3.164 2.993 2.823 2.635 2.523 2.204 2.203 2.093 1.975 1.723 1.578 1.415 1.246 1.051 0.795 0.344 -0.809 -7 ,12757 ,TETRA ,17550704,Thu Nov 25 09:41:44 CET,Thu Nov 25 11:08:02 CET,0.0 1.643 2.301 2.806 3.146 3.431 3.692 3.917 4.294 4.464 4.634 4.771 5.118 5.258 5.517 5.746 5.963 6.062 6.249 6.433 6.695 6.864 7.028 7.246 7.459 7.67 7.868 8.07 8.333 8.584 8.822 9.101 9.351 9.577 9.837 10.124 10.378 10.644 10.961 11.29 11.596 11.897 12.227 12.55 12.876 13.219 13.573 13.942 14.236 14.277 13.897 13.112 12.39 11.69 11.031 10.416 9.865 9.387 8.968 8.536 8.16 7.82 7.498 7.19 6.915 6.659 6.379 6.123 5.914 5.702 5.46 5.26 5.063 4.862 4.713 4.557 4.376 4.173 3.97 3.831 3.688 3.473 3.323 3.164 3.079 2.9 2.721 2.528 2.42 2.094 2.067 1.94 1.792 1.503 1.342 1.154 0.966 0.774 0.543 0.176 -0.944 -8 ,2841 ,TETRA ,17550705,Thu Nov 25 09:41:42 CET,Thu Nov 25 11:17:22 CET,0.0 2.163 2.776 3.188 3.523 3.825 4.11 4.332 4.699 4.877 5.043 5.145 5.483 5.618 5.872 6.096 6.31 6.421 6.63 6.829 7.116 7.276 7.414 7.632 7.847 8.042 8.236 8.427 8.663 8.874 9.068 9.286 9.495 9.718 9.995 10.284 10.531 10.785 11.02 11.251 11.48 11.736 11.993 12.246 12.55 12.822 13.065 13.266 13.395 13.366 12.959 12.199 11.436 10.725 10.109 9.552 9.063 8.589 8.164 7.739 7.377 7.055 6.745 6.47 6.204 5.935 5.666 5.431 5.229 5.015 4.785 4.606 4.43 4.247 4.114 3.97 3.803 3.627 3.428 3.288 3.147 2.921 2.769 2.608 2.524 2.349 2.177 2.001 1.892 1.576 1.568 1.46 1.348 1.083 0.931 0.759 0.536 0.264 -0.044 -0.402 -1.301 -9 ,3953 ,TETRA ,17550706,Thu Nov 25 09:41:42 CET,Thu Nov 25 11:19:43 CET,0.0 1.891 2.365 2.746 3.061 3.337 3.574 3.779 4.155 4.343 4.529 4.636 4.979 5.125 5.411 5.699 5.968 6.091 6.309 6.513 6.814 7.008 7.192 7.439 7.67 7.889 8.085 8.267 8.528 8.792 9.029 9.285 9.511 9.736 9.993 10.263 10.506 10.774 11.056 11.343 11.65 11.975 12.328 12.661 13.01 13.356 13.683 13.973 14.188 14.228 13.957 13.312 12.554 11.815 11.16 10.545 9.979 9.479 9.042 8.602 8.223 7.873 7.537 7.237 6.958 6.691 6.426 6.186 5.97 5.748 5.517 5.326 5.112 4.885 4.71 4.513 4.297 4.071 3.849 3.706 3.567 3.365 3.223 3.075 3.001 2.838 2.648 2.45 2.354 2.056 2.079 1.966 1.841 1.531 1.366 1.189 0.977 0.748 0.464 0.102 -0.516 -10 ,20173 ,TETRA ,17550707,Thu Nov 25 09:41:45 CET,Thu Nov 25 11:19:42 CET,0.0 2.309 2.943 3.447 3.882 4.208 4.468 4.717 5.137 5.338 5.538 5.699 6.067 6.22 6.494 6.752 6.988 7.091 7.293 7.505 7.804 7.983 8.156 8.414 8.668 8.9 9.099 9.285 9.547 9.801 10.032 10.32 10.582 10.805 11.054 11.328 11.582 11.857 12.15 12.454 12.752 13.059 13.392 13.747 14.142 14.474 14.77 15.035 15.2 15.199 14.9 14.176 13.415 12.701 12.044 11.424 10.88 10.365 9.914 9.469 9.089 8.757 8.435 8.129 7.849 7.6 7.337 7.088 6.854 6.626 6.41 6.225 6.012 5.789 5.627 5.46 5.282 5.089 4.881 4.742 4.61 4.406 4.246 4.062 3.969 3.783 3.598 3.406 3.308 3.0 2.971 2.831 2.682 2.397 2.241 2.057 1.88 1.692 1.441 1.005 -0.112 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_38.txt deleted file mode 100644 index e3a72eeb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_38.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3692 ,KEBNE ,17022762,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:13:01 CET,0.0 4.43 5.282 5.849 6.328 6.737 7.084 7.392 7.915 8.127 8.311 8.481 8.866 9.035 9.334 9.604 9.855 9.978 10.233 10.474 10.789 10.981 11.167 11.444 11.701 11.941 12.168 12.373 12.639 12.906 13.154 13.432 13.712 13.979 14.266 14.585 14.877 15.198 15.525 15.848 16.185 16.564 16.956 17.317 17.743 18.175 18.638 19.129 19.555 19.837 19.848 19.446 18.948 18.436 17.941 17.421 16.922 16.478 16.083 15.661 15.312 15.0 14.689 14.385 14.096 13.848 13.579 13.343 13.142 12.927 12.707 12.519 12.32 12.115 11.963 11.809 11.647 11.473 11.279 11.143 11.004 10.763 10.602 10.46 10.389 10.24 10.065 9.854 9.734 9.392 9.302 9.17 9.035 8.705 8.527 8.346 8.14 7.871 7.525 7.088 5.608 -3 ,30285 ,KEBNE ,17022764,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:13:12 CET,0.0 3.13 3.842 4.388 4.847 5.22 5.555 5.87 6.392 6.622 6.842 7.052 7.443 7.635 7.971 8.259 8.555 8.701 8.979 9.242 9.602 9.816 10.015 10.306 10.585 10.844 11.092 11.329 11.655 11.956 12.22 12.547 12.844 13.124 13.437 13.806 14.161 14.521 14.892 15.276 15.677 16.12 16.602 17.032 17.529 18.064 18.596 19.117 19.633 20.06 20.146 19.689 19.063 18.424 17.829 17.287 16.793 16.318 15.87 15.407 15.015 14.644 14.271 13.898 13.543 13.223 12.877 12.572 12.332 12.07 11.781 11.544 11.294 11.039 10.843 10.64 10.421 10.201 9.992 9.854 9.713 9.486 9.32 9.141 9.05 8.862 8.668 8.451 8.346 8.031 7.99 7.862 7.722 7.39 7.196 6.989 6.755 6.513 6.243 5.814 4.354 -4 ,21462 ,KEBNE ,17022765,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:13:37 CET,0.0 6.912 7.794 8.318 8.759 9.167 9.541 9.856 10.4 10.655 10.9 11.143 11.54 11.726 12.058 12.34 12.591 12.719 12.965 13.193 13.498 13.676 13.84 14.096 14.351 14.592 14.823 15.022 15.28 15.556 15.809 16.098 16.377 16.63 16.903 17.21 17.505 17.815 18.136 18.436 18.745 19.111 19.519 19.929 20.364 20.788 21.216 21.629 22.044 22.397 22.546 22.16 21.584 21.038 20.525 20.04 19.564 19.055 18.602 18.138 17.723 17.362 17.027 16.735 16.47 16.231 15.976 15.73 15.507 15.259 14.983 14.773 14.562 14.322 14.126 13.936 13.748 13.53 13.297 13.152 13.003 12.763 12.599 12.419 12.321 12.115 11.914 11.696 11.587 11.262 11.187 11.045 10.894 10.549 10.366 10.151 9.91 9.623 9.267 8.88 7.42 -5 ,12300 ,KEBNE ,17022766,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:13:15 CET,0.0 5.319 6.066 6.582 7.072 7.498 7.82 8.104 8.648 8.917 9.169 9.381 9.757 9.928 10.255 10.548 10.831 10.973 11.229 11.447 11.748 11.938 12.119 12.365 12.603 12.843 13.09 13.332 13.625 13.894 14.154 14.448 14.717 14.966 15.241 15.556 15.86 16.188 16.536 16.89 17.243 17.609 17.979 18.347 18.785 19.226 19.684 20.173 20.593 20.873 20.943 20.577 20.01 19.439 18.905 18.367 17.889 17.447 17.037 16.62 16.285 15.985 15.688 15.411 15.147 14.914 14.67 14.451 14.265 14.054 13.802 13.574 13.36 13.15 12.969 12.784 12.591 12.378 12.148 11.995 11.83 11.559 11.393 11.239 11.16 10.992 10.786 10.573 10.483 10.153 10.029 9.851 9.691 9.338 9.148 8.941 8.687 8.398 8.091 7.587 6.387 -6 ,19148 ,KEBNE ,17022767,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:12:58 CET,0.0 5.504 6.296 6.863 7.292 7.647 7.992 8.301 8.822 9.053 9.267 9.475 9.868 10.034 10.338 10.638 10.911 11.039 11.306 11.57 11.948 12.183 12.393 12.68 12.957 13.236 13.499 13.723 13.988 14.244 14.491 14.796 15.076 15.322 15.598 15.911 16.225 16.568 16.915 17.249 17.562 17.908 18.306 18.672 19.083 19.539 20.01 20.415 20.779 21.033 20.996 20.529 19.913 19.345 18.84 18.344 17.864 17.414 17.007 16.599 16.261 15.959 15.675 15.398 15.132 14.886 14.642 14.423 14.217 13.99 13.743 13.551 13.37 13.167 13.006 12.853 12.701 12.535 12.317 12.149 11.98 11.73 11.562 11.392 11.299 11.105 10.915 10.728 10.626 10.3 10.224 10.075 9.911 9.549 9.361 9.146 8.914 8.672 8.354 7.919 6.377 -7 ,5608 ,KEBNE ,17022768,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:12:55 CET,0.0 3.794 4.512 5.042 5.497 5.901 6.23 6.503 6.983 7.223 7.436 7.619 8.006 8.179 8.488 8.76 9.029 9.17 9.427 9.652 9.955 10.147 10.343 10.616 10.872 11.131 11.365 11.598 11.924 12.22 12.489 12.809 13.107 13.401 13.736 14.104 14.468 14.845 15.225 15.638 16.078 16.524 17.028 17.512 17.994 18.481 18.981 19.504 20.004 20.337 20.359 19.927 19.339 18.705 18.056 17.414 16.874 16.397 15.98 15.564 15.174 14.828 14.505 14.195 13.907 13.647 13.383 13.144 12.936 12.713 12.486 12.294 12.085 11.88 11.735 11.575 11.392 11.204 10.995 10.843 10.681 10.429 10.254 10.055 9.954 9.761 9.543 9.332 9.236 8.911 8.832 8.682 8.519 8.178 7.99 7.777 7.541 7.224 6.791 6.264 4.59 -8 ,32364 ,KEBNE ,17022769,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:13:03 CET,0.0 5.097 5.939 6.558 6.955 7.248 7.511 7.764 8.231 8.454 8.664 8.822 9.175 9.323 9.605 9.868 10.117 10.231 10.459 10.685 10.985 11.17 11.356 11.613 11.851 12.085 12.302 12.504 12.76 12.995 13.219 13.499 13.777 14.029 14.306 14.617 14.892 15.182 15.489 15.811 16.147 16.508 16.922 17.325 17.768 18.181 18.62 19.166 19.746 20.209 20.298 19.827 19.231 18.645 18.072 17.468 16.871 16.315 15.833 15.353 14.935 14.545 14.159 13.799 13.46 13.145 12.815 12.517 12.258 12.003 11.736 11.502 11.271 11.035 10.847 10.657 10.471 10.281 10.05 9.882 9.723 9.473 9.286 9.093 8.994 8.767 8.529 8.3 8.186 7.863 7.802 7.659 7.517 7.208 7.033 6.843 6.638 6.389 6.057 5.588 3.813 -9 ,21188 ,KEBNE ,17022770,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:13:07 CET,0.0 5.465 6.306 6.835 7.242 7.61 7.933 8.218 8.7 8.906 9.116 9.324 9.71 9.89 10.197 10.471 10.722 10.838 11.054 11.287 11.632 11.83 12.014 12.242 12.447 12.655 12.857 13.053 13.298 13.53 13.762 14.038 14.281 14.521 14.815 15.113 15.385 15.673 15.978 16.296 16.619 16.994 17.395 17.777 18.238 18.71 19.164 19.588 19.917 20.116 20.089 19.571 18.84 18.086 17.374 16.735 16.132 15.533 15.02 14.503 14.053 13.653 13.298 12.966 12.67 12.413 12.106 11.817 11.556 11.281 11.003 10.779 10.569 10.353 10.177 9.993 9.816 9.638 9.448 9.315 9.181 8.972 8.804 8.621 8.531 8.35 8.179 7.992 7.882 7.572 7.551 7.419 7.262 6.909 6.721 6.508 6.25 6.004 5.742 5.329 3.496 -10 ,987 ,KEBNE ,17022771,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:13:04 CET,0.0 4.693 5.493 6.033 6.498 6.915 7.269 7.567 8.103 8.335 8.565 8.796 9.187 9.366 9.705 9.993 10.241 10.361 10.58 10.776 11.059 11.244 11.436 11.698 11.926 12.155 12.373 12.574 12.844 13.109 13.35 13.642 13.93 14.179 14.452 14.766 15.048 15.326 15.618 15.931 16.261 16.631 17.044 17.465 17.902 18.312 18.738 19.175 19.596 19.92 19.944 19.542 18.991 18.387 17.859 17.345 16.842 16.397 16.048 15.673 15.313 15.005 14.698 14.398 14.124 13.863 13.588 13.347 13.147 12.929 12.696 12.512 12.317 12.083 11.873 11.649 11.431 11.212 10.977 10.809 10.627 10.34 10.156 9.969 9.866 9.661 9.452 9.233 9.117 8.791 8.707 8.552 8.395 8.042 7.848 7.618 7.349 7.06 6.707 6.268 4.792 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_39.txt deleted file mode 100644 index 07b3cf70..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23116 ,KEBNE ,17022772,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:13:19 CET,0.0 9.521 10.203 10.695 11.141 11.507 11.845 12.166 12.716 12.947 13.154 13.314 13.68 13.843 14.149 14.441 14.703 14.83 15.057 15.272 15.598 15.797 15.984 16.237 16.477 16.704 16.935 17.166 17.436 17.692 17.935 18.197 18.437 18.686 18.98 19.297 19.596 19.911 20.239 20.56 20.881 21.248 21.631 21.988 22.399 22.801 23.222 23.656 24.017 24.241 24.222 23.719 23.093 22.453 21.83 21.261 20.726 20.232 19.805 19.378 19.014 18.671 18.345 18.034 17.722 17.434 17.142 16.894 16.679 16.449 16.211 16.012 15.81 15.605 15.44 15.252 15.044 14.838 14.635 14.487 14.324 14.099 13.948 13.787 13.705 13.525 13.323 13.102 12.978 12.641 12.574 12.418 12.249 11.905 11.716 11.484 11.226 10.948 10.613 10.202 8.576 -2 ,8034 ,KEBNE ,17022773,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:13:08 CET,0.0 6.031 6.9 7.486 7.948 8.342 8.706 8.993 9.438 9.653 9.867 10.06 10.442 10.611 10.956 11.269 11.539 11.671 11.91 12.133 12.465 12.686 12.896 13.177 13.437 13.703 13.972 14.208 14.493 14.787 15.069 15.394 15.705 15.995 16.33 16.7 17.05 17.426 17.79 18.145 18.497 18.886 19.38 19.879 20.376 20.84 21.308 21.78 22.239 22.607 22.661 22.219 21.596 20.911 20.244 19.622 19.075 18.562 18.088 17.594 17.189 16.847 16.494 16.153 15.855 15.586 15.274 14.99 14.74 14.479 14.22 14.002 13.753 13.486 13.289 13.069 12.839 12.608 12.381 12.23 12.057 11.789 11.611 11.427 11.336 11.132 10.904 10.666 10.544 10.207 10.139 9.984 9.821 9.424 9.199 8.989 8.749 8.497 8.203 7.767 6.453 -3 ,12747 ,KEBNE ,17022774,Wed Dec 22 06:51:25 CET,Wed Dec 22 08:13:10 CET,0.0 3.542 4.31 4.939 5.461 5.867 6.212 6.544 7.106 7.331 7.553 7.787 8.201 8.398 8.758 9.07 9.338 9.48 9.776 10.026 10.354 10.571 10.777 11.06 11.317 11.57 11.816 12.044 12.338 12.627 12.894 13.202 13.481 13.75 14.062 14.409 14.752 15.124 15.497 15.878 16.292 16.728 17.194 17.628 18.093 18.567 19.068 19.539 19.977 20.311 20.267 19.693 19.023 18.376 17.759 17.131 16.534 15.994 15.531 15.042 14.603 14.207 13.838 13.491 13.155 12.858 12.548 12.26 12.018 11.777 11.52 11.297 11.057 10.812 10.63 10.439 10.233 10.007 9.773 9.609 9.45 9.22 9.049 8.855 8.754 8.532 8.297 8.072 7.954 7.622 7.582 7.451 7.296 6.904 6.699 6.509 6.287 6.033 5.747 5.374 4.204 -4 ,32628 ,KEBNE ,17022775,Wed Dec 22 06:51:24 CET,Wed Dec 22 08:13:21 CET,0.0 4.511 5.216 5.777 6.259 6.626 6.944 7.255 7.777 7.982 8.181 8.379 8.77 8.938 9.232 9.509 9.763 9.886 10.129 10.351 10.657 10.842 11.008 11.273 11.546 11.796 12.03 12.255 12.518 12.751 12.988 13.255 13.495 13.73 14.008 14.34 14.652 14.99 15.339 15.671 16.001 16.351 16.748 17.117 17.502 17.921 18.345 18.723 19.077 19.279 19.121 18.543 17.88 17.213 16.578 16.003 15.502 15.037 14.616 14.185 13.823 13.477 13.14 12.837 12.553 12.291 12.009 11.749 11.528 11.302 11.06 10.855 10.629 10.392 10.212 10.035 9.843 9.621 9.386 9.222 9.053 8.787 8.593 8.392 8.287 8.059 7.83 7.606 7.484 7.157 7.124 6.999 6.861 6.522 6.336 6.149 5.946 5.701 5.383 4.955 3.476 -5 ,13081 ,KEBNE ,17022776,Wed Dec 22 06:52:30 CET,Wed Dec 22 08:13:47 CET,0.0 4.433 5.201 5.677 6.008 6.297 6.587 6.883 7.371 7.586 7.795 8.0 8.378 8.536 8.846 9.098 9.317 9.423 9.633 9.856 10.165 10.338 10.506 10.754 11.017 11.277 11.496 11.704 11.978 12.23 12.471 12.748 12.99 13.208 13.461 13.753 14.036 14.329 14.637 14.949 15.259 15.611 15.996 16.36 16.759 17.149 17.547 17.938 18.287 18.457 18.278 17.747 17.104 16.472 15.887 15.326 14.845 14.389 13.967 13.551 13.207 12.9 12.591 12.29 11.999 11.731 11.476 11.241 11.029 10.8 10.556 10.359 10.15 9.923 9.751 9.583 9.407 9.212 8.991 8.841 8.698 8.467 8.298 8.117 8.022 7.817 7.589 7.352 7.243 6.925 6.883 6.766 6.637 6.337 6.169 5.967 5.747 5.511 5.205 4.717 3.225 -6 ,8955 ,KEBNE ,17022777,Wed Dec 22 06:52:25 CET,Wed Dec 22 08:15:46 CET,0.0 4.659 5.51 6.056 6.493 6.857 7.201 7.54 8.165 8.43 8.657 8.867 9.265 9.447 9.797 10.135 10.433 10.576 10.858 11.106 11.46 11.701 11.926 12.222 12.52 12.816 13.085 13.322 13.608 13.886 14.145 14.426 14.674 14.93 15.234 15.55 15.86 16.186 16.51 16.835 17.18 17.563 17.994 18.391 18.817 19.278 19.713 20.117 20.486 20.737 20.588 20.047 19.473 18.878 18.303 17.776 17.319 16.877 16.486 16.101 15.774 15.474 15.175 14.894 14.624 14.363 14.089 13.839 13.638 13.436 13.22 13.056 12.878 12.692 12.534 12.326 12.102 11.884 11.679 11.536 11.388 11.165 11.007 10.844 10.753 10.567 10.374 10.164 10.057 9.735 9.717 9.594 9.454 9.139 8.961 8.77 8.574 8.383 8.149 7.75 6.307 -7 ,31333 ,KEBNE ,17022778,Wed Dec 22 06:52:25 CET,Wed Dec 22 08:15:16 CET,0.0 5.54 6.337 6.886 7.294 7.654 7.984 8.255 8.756 9.0 9.24 9.492 9.89 10.049 10.333 10.594 10.834 10.952 11.192 11.42 11.731 11.927 12.11 12.362 12.592 12.824 13.055 13.267 13.522 13.763 14.005 14.3 14.563 14.803 15.076 15.369 15.645 15.947 16.251 16.558 16.876 17.215 17.61 17.987 18.41 18.835 19.203 19.545 19.883 20.1 19.936 19.304 18.646 17.976 17.368 16.819 16.318 15.87 15.448 15.0 14.61 14.253 13.904 13.574 13.28 13.019 12.736 12.478 12.26 12.034 11.789 11.578 11.364 11.153 10.99 10.806 10.609 10.415 10.212 10.075 9.924 9.667 9.5 9.335 9.252 9.086 8.909 8.716 8.616 8.303 8.255 8.106 7.953 7.667 7.504 7.266 6.976 6.696 6.408 5.839 3.351 -8 ,9863 ,KEBNE ,17022779,Wed Dec 22 06:52:26 CET,Wed Dec 22 08:13:47 CET,0.0 9.881 10.718 11.285 11.743 12.138 12.463 12.739 13.256 13.476 13.676 13.894 14.282 14.434 14.716 14.985 15.234 15.358 15.607 15.822 16.117 16.328 16.534 16.807 17.061 17.305 17.539 17.761 18.023 18.272 18.501 18.788 19.074 19.332 19.616 19.927 20.227 20.537 20.857 21.192 21.557 21.935 22.304 22.667 23.11 23.563 23.968 24.34 24.703 24.896 24.808 24.295 23.61 22.926 22.273 21.701 21.166 20.624 20.17 19.743 19.355 18.999 18.655 18.332 18.037 17.758 17.479 17.214 16.967 16.724 16.484 16.287 16.068 15.846 15.693 15.529 15.352 15.164 14.959 14.818 14.673 14.418 14.234 14.068 13.985 13.806 13.612 13.387 13.262 12.941 12.879 12.723 12.564 12.211 12.013 11.82 11.639 11.402 11.083 10.61 8.879 -9 ,16339 ,KEBNE ,17022780,Wed Dec 22 06:52:26 CET,Wed Dec 22 08:15:21 CET,0.0 5.186 6.112 6.718 7.148 7.47 7.789 8.111 8.684 8.92 9.128 9.325 9.715 9.916 10.286 10.607 10.899 11.027 11.283 11.539 11.909 12.138 12.348 12.647 12.929 13.209 13.478 13.73 14.047 14.33 14.602 14.938 15.235 15.514 15.84 16.209 16.563 16.941 17.329 17.728 18.139 18.564 19.018 19.48 19.956 20.435 20.975 21.461 21.841 22.018 21.891 21.431 20.81 20.164 19.486 18.811 18.254 17.701 17.188 16.695 16.259 15.858 15.495 15.157 14.829 14.525 14.193 13.887 13.619 13.345 13.059 12.82 12.572 12.311 12.124 11.929 11.718 11.496 11.272 11.13 10.975 10.73 10.567 10.384 10.288 10.095 9.89 9.687 9.582 9.262 9.196 9.034 8.88 8.568 8.396 8.207 7.989 7.771 7.488 7.072 6.034 -10 ,1176 ,KEBNE ,17022781,Wed Dec 22 06:52:26 CET,Wed Dec 22 08:13:54 CET,0.0 6.041 6.67 7.136 7.596 8.001 8.335 8.672 9.254 9.484 9.686 9.837 10.216 10.406 10.729 10.979 11.227 11.345 11.548 11.763 12.081 12.272 12.466 12.745 13.001 13.223 13.464 13.695 13.945 14.204 14.461 14.778 15.079 15.359 15.704 16.061 16.387 16.731 17.078 17.444 17.829 18.25 18.713 19.145 19.604 20.058 20.572 21.01 21.265 21.4 21.193 20.437 19.619 18.854 18.145 17.48 16.899 16.356 15.854 15.342 14.88 14.461 14.077 13.684 13.295 12.952 12.612 12.335 12.097 11.858 11.6 11.38 11.159 10.923 10.734 10.55 10.36 10.128 9.884 9.716 9.55 9.317 9.142 8.952 8.861 8.66 8.453 8.238 8.114 7.781 7.752 7.621 7.471 7.16 6.983 6.75 6.497 6.238 5.926 5.499 3.863 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_40.txt deleted file mode 100644 index ec64d856..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_40.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5701 ,KEBNE ,17022782,Wed Dec 22 06:52:26 CET,Wed Dec 22 08:14:11 CET,0.0 7.18 8.12 8.807 9.354 9.808 10.232 10.602 11.24 11.542 11.811 12.096 12.512 12.702 13.068 13.439 13.781 13.934 14.218 14.493 14.86 15.066 15.282 15.626 15.953 16.241 16.493 16.765 17.12 17.413 17.702 18.06 18.403 18.718 19.045 19.411 19.743 20.061 20.399 20.759 21.138 21.549 21.971 22.325 22.736 23.13 23.497 23.868 24.15 24.278 24.119 23.551 22.898 22.282 21.71 21.146 20.61 20.135 19.724 19.299 18.933 18.599 18.274 17.976 17.701 17.443 17.172 16.925 16.716 16.495 16.252 16.036 15.806 15.568 15.38 15.19 14.988 14.769 14.527 14.367 14.209 13.964 13.784 13.577 13.462 13.201 12.921 12.627 12.47 12.094 11.965 11.78 11.604 11.281 11.076 10.863 10.641 10.356 10.014 9.536 7.86 -2 ,24734 ,KEBNE ,17022783,Wed Dec 22 06:52:27 CET,Wed Dec 22 08:14:06 CET,0.0 7.255 8.158 8.83 9.415 9.889 10.257 10.597 11.199 11.456 11.703 11.964 12.394 12.596 12.932 13.254 13.546 13.681 13.915 14.141 14.473 14.681 14.877 15.165 15.474 15.749 15.967 16.156 16.399 16.649 16.888 17.198 17.515 17.8 18.113 18.44 18.735 19.045 19.348 19.652 19.978 20.354 20.745 21.081 21.45 21.825 22.214 22.571 22.929 23.266 23.267 22.736 22.076 21.475 20.85 20.182 19.552 18.968 18.466 17.957 17.498 17.091 16.721 16.373 16.038 15.719 15.388 15.077 14.815 14.581 14.333 14.108 13.869 13.606 13.403 13.208 13.01 12.816 12.619 12.467 12.294 12.041 11.873 11.676 11.568 11.354 11.139 10.903 10.777 10.429 10.313 10.171 10.032 9.693 9.485 9.254 9.002 8.719 8.327 7.776 5.811 -3 ,5706 ,KEBNE ,17022784,Wed Dec 22 06:52:26 CET,Wed Dec 22 08:14:08 CET,0.0 5.471 6.451 7.129 7.703 8.16 8.528 8.82 9.363 9.602 9.814 10.016 10.424 10.635 11.002 11.376 11.733 11.899 12.224 12.513 12.887 13.131 13.376 13.715 14.023 14.319 14.618 14.919 15.27 15.582 15.911 16.306 16.635 16.929 17.267 17.637 17.989 18.374 18.792 19.215 19.635 20.068 20.524 20.995 21.521 22.002 22.489 22.956 23.351 23.589 23.534 23.004 22.319 21.633 20.996 20.388 19.804 19.261 18.797 18.321 17.873 17.463 17.076 16.686 16.311 15.967 15.617 15.319 15.06 14.793 14.522 14.292 14.054 13.8 13.586 13.359 13.131 12.91 12.68 12.494 12.296 12.014 11.826 11.639 11.546 11.336 11.069 10.787 10.645 10.298 10.226 10.088 9.933 9.528 9.281 9.025 8.733 8.411 8.0 7.417 4.966 -4 ,27497 ,KEBNE ,17022785,Wed Dec 22 06:52:26 CET,Wed Dec 22 08:14:06 CET,0.0 4.69 5.662 6.323 6.874 7.329 7.754 8.131 8.777 9.055 9.306 9.549 9.937 10.142 10.551 10.907 11.212 11.356 11.65 11.921 12.291 12.526 12.756 13.085 13.405 13.71 13.972 14.213 14.532 14.831 15.105 15.431 15.734 16.009 16.33 16.696 17.011 17.337 17.689 18.065 18.477 18.911 19.404 19.888 20.381 20.834 21.211 21.58 21.97 22.241 22.115 21.475 20.663 19.944 19.329 18.732 18.166 17.624 17.157 16.664 16.193 15.78 15.407 15.036 14.698 14.386 14.037 13.736 13.477 13.208 12.925 12.681 12.436 12.161 11.934 11.701 11.463 11.25 11.032 10.876 10.714 10.427 10.216 10.017 9.914 9.672 9.41 9.119 8.971 8.627 8.544 8.39 8.221 7.861 7.669 7.464 7.24 6.964 6.586 6.051 4.38 -7 ,25783 ,KEBNE ,17022788,Wed Dec 22 06:52:26 CET,Wed Dec 22 08:14:01 CET,0.0 6.621 7.643 8.307 8.848 9.289 9.648 9.992 10.575 10.819 11.077 11.379 11.804 12.007 12.357 12.683 12.987 13.139 13.427 13.672 14.032 14.268 14.486 14.801 15.097 15.366 15.619 15.882 16.244 16.577 16.858 17.214 17.586 17.907 18.25 18.641 18.972 19.291 19.618 19.967 20.341 20.73 21.187 21.66 22.161 22.598 23.027 23.493 23.927 24.202 24.104 23.57 22.955 22.324 21.689 21.098 20.571 20.101 19.711 19.304 18.94 18.609 18.291 18.001 17.725 17.477 17.214 16.96 16.746 16.524 16.29 16.109 15.896 15.613 15.392 15.194 14.994 14.767 14.519 14.352 14.189 13.937 13.749 13.553 13.449 13.207 12.953 12.705 12.581 12.242 12.175 12.018 11.855 11.519 11.315 11.085 10.822 10.494 10.061 9.465 7.023 -9 ,20430 ,KEBNE ,17022790,Wed Dec 22 06:52:26 CET,Wed Dec 22 08:15:40 CET,0.0 13.16 14.19 14.849 15.354 15.819 16.226 16.554 17.101 17.346 17.579 17.807 18.185 18.371 18.719 19.018 19.332 19.496 19.78 20.04 20.423 20.658 20.873 21.188 21.491 21.762 22.023 22.28 22.606 22.902 23.173 23.507 23.824 24.117 24.458 24.827 25.14 25.462 25.81 26.174 26.533 26.914 27.318 27.699 28.15 28.578 29.015 29.47 29.897 30.181 30.122 29.479 28.634 27.888 27.227 26.568 25.956 25.383 24.874 24.386 24.0 23.64 23.28 22.938 22.612 22.336 22.056 21.787 21.526 21.247 20.985 20.767 20.529 20.273 20.067 19.863 19.648 19.418 19.205 19.053 18.878 18.608 18.419 18.221 18.122 17.912 17.701 17.483 17.365 17.025 16.945 16.803 16.631 16.257 16.069 15.867 15.649 15.39 15.08 14.581 11.986 -10 ,24277 ,KEBNE ,17022791,Wed Dec 22 06:53:27 CET,Wed Dec 22 08:15:11 CET,0.0 5.235 6.072 6.748 7.297 7.748 8.136 8.477 9.073 9.307 9.537 9.788 10.182 10.355 10.678 11.018 11.334 11.486 11.771 12.036 12.43 12.674 12.892 13.211 13.534 13.832 14.071 14.269 14.521 14.766 14.998 15.28 15.538 15.777 16.052 16.359 16.671 16.999 17.303 17.617 17.942 18.277 18.644 18.992 19.387 19.798 20.199 20.552 20.817 20.949 20.917 20.462 19.791 19.135 18.518 17.96 17.473 17.025 16.614 16.162 15.771 15.421 15.093 14.792 14.492 14.223 13.936 13.669 13.434 13.193 12.953 12.751 12.542 12.325 12.157 11.976 11.785 11.579 11.355 11.205 11.064 10.846 10.68 10.495 10.402 10.212 10.005 9.792 9.684 9.345 9.227 9.055 8.883 8.535 8.32 8.091 7.862 7.548 7.114 6.592 4.755 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_41.txt deleted file mode 100644 index 2ec4115b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_41.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4589 ,KEBNE ,17022792,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:16:37 CET,0.0 5.039 5.961 6.575 7.075 7.496 7.848 8.162 8.666 8.877 9.071 9.201 9.562 9.723 10.043 10.376 10.667 10.798 11.034 11.236 11.545 11.739 11.934 12.213 12.44 12.646 12.868 13.082 13.328 13.549 13.756 14.006 14.236 14.452 14.698 14.963 15.204 15.445 15.697 15.953 16.219 16.5 16.799 17.073 17.357 17.645 17.915 18.107 18.213 18.177 17.701 16.825 16.043 15.324 14.607 13.917 13.331 12.797 12.319 11.856 11.452 11.084 10.708 10.343 10.013 9.694 9.345 9.041 8.782 8.51 8.229 7.991 7.755 7.516 7.315 7.112 6.915 6.704 6.494 6.363 6.231 6.015 5.843 5.65 5.548 5.33 5.118 4.908 4.785 4.444 4.395 4.275 4.142 3.818 3.629 3.439 3.259 3.053 2.751 2.341 1.065 -3 ,3717 ,KEBNE ,17022794,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:16:20 CET,0.0 6.228 7.023 7.618 8.048 8.428 8.785 9.058 9.543 9.782 9.993 10.189 10.581 10.757 11.076 11.383 11.684 11.826 12.087 12.309 12.62 12.816 13.004 13.297 13.556 13.788 14.01 14.226 14.489 14.736 14.972 15.231 15.483 15.73 16.024 16.319 16.545 16.788 17.07 17.362 17.634 17.929 18.253 18.55 18.862 19.16 19.518 19.884 20.073 20.056 19.548 18.51 17.5 16.563 15.735 14.96 14.276 13.63 13.062 12.521 12.038 11.595 11.185 10.782 10.402 10.064 9.71 9.388 9.1 8.808 8.521 8.284 8.037 7.768 7.554 7.335 7.106 6.878 6.631 6.461 6.295 6.031 5.832 5.627 5.526 5.306 5.069 4.829 4.709 4.371 4.312 4.171 4.018 3.652 3.447 3.233 2.993 2.73 2.444 2.042 1.01 -4 ,10089 ,KEBNE ,17022795,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:14:56 CET,0.0 3.923 4.838 5.45 5.962 6.383 6.737 7.069 7.652 7.896 8.137 8.383 8.768 8.942 9.29 9.612 9.894 10.03 10.288 10.528 10.883 11.105 11.318 11.6 11.843 12.063 12.284 12.512 12.802 13.089 13.359 13.682 14.005 14.291 14.583 14.904 15.219 15.561 15.909 16.266 16.606 16.975 17.418 17.823 18.241 18.64 19.032 19.394 19.678 19.773 19.512 18.79 17.946 17.15 16.424 15.726 15.081 14.502 13.975 13.417 12.921 12.49 12.094 11.707 11.342 10.994 10.629 10.321 10.053 9.776 9.482 9.219 8.954 8.685 8.485 8.287 8.075 7.849 7.622 7.467 7.3 7.027 6.846 6.653 6.545 6.332 6.123 5.906 5.783 5.453 5.44 5.312 5.177 4.903 4.762 4.592 4.387 4.149 3.85 3.515 2.924 -5 ,30006 ,KEBNE ,17022796,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:14:59 CET,0.0 5.331 6.17 6.769 7.252 7.709 8.06 8.35 8.871 9.1 9.339 9.561 9.934 10.12 10.445 10.726 10.989 11.113 11.352 11.591 11.947 12.153 12.334 12.612 12.866 13.09 13.304 13.5 13.755 13.979 14.189 14.44 14.673 14.907 15.166 15.435 15.716 16.032 16.356 16.684 16.983 17.298 17.663 17.994 18.359 18.799 19.241 19.579 19.863 19.992 19.62 18.852 18.017 17.166 16.387 15.695 15.077 14.45 13.909 13.38 12.908 12.484 12.087 11.722 11.382 11.08 10.773 10.486 10.219 9.941 9.658 9.422 9.181 8.956 8.792 8.62 8.434 8.238 8.047 7.908 7.756 7.507 7.34 7.185 7.108 6.936 6.744 6.546 6.425 6.069 5.986 5.843 5.698 5.377 5.187 4.969 4.734 4.458 4.153 3.765 1.469 -7 ,8501 ,KEBNE ,17022798,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:25 CET,0.0 12.537 13.538 14.231 14.767 15.157 15.478 15.77 16.297 16.548 16.764 16.958 17.344 17.516 17.828 18.123 18.414 18.554 18.83 19.095 19.441 19.631 19.816 20.084 20.327 20.581 20.824 21.039 21.295 21.53 21.753 22.008 22.243 22.474 22.734 23.012 23.265 23.527 23.808 24.117 24.445 24.794 25.168 25.526 25.91 26.253 26.6 26.905 27.138 27.226 26.873 25.972 25.079 24.237 23.387 22.616 21.974 21.35 20.757 20.194 19.716 19.293 18.911 18.553 18.212 17.886 17.55 17.26 16.997 16.695 16.381 16.126 15.87 15.608 15.409 15.214 14.997 14.762 14.538 14.392 14.227 13.968 13.788 13.577 13.466 13.251 13.023 12.778 12.648 12.312 12.273 12.142 11.996 11.657 11.453 11.223 10.964 10.653 10.291 9.795 8.792 -8 ,30012 ,KEBNE ,17022799,Wed Dec 22 06:53:27 CET,Wed Dec 22 08:15:17 CET,0.0 7.248 8.128 8.746 9.226 9.56 9.825 10.078 10.574 10.786 10.975 11.114 11.47 11.625 11.93 12.213 12.483 12.62 12.869 13.091 13.397 13.593 13.766 14.025 14.299 14.566 14.823 15.077 15.404 15.707 15.976 16.283 16.58 16.857 17.163 17.505 17.839 18.205 18.573 18.941 19.306 19.688 20.098 20.497 20.942 21.33 21.701 22.061 22.329 22.482 22.292 21.636 20.825 19.971 19.179 18.455 17.799 17.194 16.689 16.172 15.713 15.268 14.814 14.387 13.996 13.655 13.284 12.955 12.697 12.432 12.146 11.915 11.686 11.437 11.233 11.014 10.785 10.555 10.315 10.144 9.976 9.729 9.557 9.385 9.292 9.093 8.881 8.635 8.499 8.164 8.116 7.964 7.81 7.492 7.299 7.085 6.858 6.603 6.302 5.895 4.852 -9 ,25573 ,KEBNE ,17022800,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:11 CET,0.0 7.098 8.026 8.651 9.116 9.52 9.915 10.263 10.81 11.046 11.264 11.457 11.836 12.001 12.284 12.571 12.859 13.0 13.279 13.53 13.885 14.102 14.308 14.603 14.878 15.15 15.412 15.657 15.969 16.258 16.52 16.812 17.092 17.372 17.67 17.968 18.275 18.621 18.984 19.354 19.691 20.046 20.472 20.869 21.31 21.755 22.233 22.664 22.959 23.14 22.911 22.012 21.099 20.272 19.508 18.791 18.156 17.575 17.069 16.542 16.096 15.72 15.341 14.965 14.614 14.285 13.947 13.645 13.379 13.113 12.811 12.556 12.318 12.075 11.893 11.698 11.481 11.259 11.029 10.866 10.703 10.448 10.262 10.073 9.968 9.745 9.53 9.299 9.175 8.836 8.776 8.62 8.449 8.116 7.934 7.746 7.547 7.324 7.068 6.705 5.655 -10 ,17087 ,KEBNE ,17022801,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:15 CET,0.0 9.375 10.493 11.133 11.624 12.067 12.458 12.824 13.469 13.745 13.977 14.191 14.594 14.779 15.121 15.413 15.682 15.806 16.047 16.282 16.59 16.775 16.952 17.229 17.483 17.718 17.944 18.154 18.395 18.625 18.856 19.124 19.377 19.6 19.839 20.121 20.399 20.68 20.96 21.255 21.565 21.882 22.198 22.494 22.828 23.138 23.433 23.712 23.914 23.961 23.581 22.816 22.085 21.371 20.736 20.138 19.581 19.073 18.649 18.223 17.848 17.503 17.166 16.862 16.585 16.33 16.061 15.803 15.584 15.357 15.118 14.934 14.741 14.531 14.362 14.152 13.922 13.716 13.514 13.378 13.242 13.019 12.863 12.683 12.587 12.416 12.231 12.019 11.891 11.537 11.455 11.31 11.15 10.799 10.619 10.397 10.136 9.881 9.552 9.111 7.416 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_42.txt deleted file mode 100644 index bd859379..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9879 ,TETRA ,17550728,Thu Nov 25 09:41:46 CET,Thu Nov 25 11:16:26 CET,0.0 2.082 2.615 2.979 3.348 3.682 3.969 4.207 4.587 4.765 4.924 5.012 5.36 5.504 5.782 6.036 6.26 6.367 6.566 6.744 7.003 7.173 7.338 7.563 7.773 7.979 8.174 8.368 8.611 8.833 9.048 9.293 9.535 9.776 10.054 10.361 10.643 10.92 11.201 11.529 11.873 12.227 12.628 13.025 13.478 13.965 14.46 14.947 15.455 15.949 16.359 16.441 16.274 15.996 15.666 15.328 14.949 14.539 14.169 13.771 13.427 13.143 12.835 12.52 12.234 11.976 11.714 11.472 11.25 11.017 10.796 10.626 10.451 10.272 10.135 9.985 9.82 9.654 9.452 9.319 9.195 8.975 8.831 8.694 8.622 8.451 8.26 8.06 7.949 7.615 7.519 7.367 7.221 6.956 6.783 6.558 6.319 6.004 5.575 4.999 2.579 -2 ,16465 ,TETRA ,17550729,Thu Nov 25 09:41:49 CET,Thu Nov 25 11:16:27 CET,0.0 3.809 4.406 4.821 5.17 5.469 5.715 5.935 6.351 6.548 6.745 6.897 7.264 7.418 7.671 7.901 8.122 8.229 8.44 8.635 8.904 9.092 9.276 9.526 9.771 9.998 10.209 10.419 10.674 10.908 11.133 11.397 11.656 11.903 12.175 12.478 12.784 13.125 13.461 13.788 14.133 14.539 15.013 15.46 15.957 16.473 17.014 17.593 18.219 18.787 19.208 19.268 19.08 18.784 18.428 18.034 17.66 17.276 16.929 16.602 16.316 16.066 15.82 15.581 15.36 15.157 14.955 14.763 14.584 14.386 14.175 13.996 13.818 13.643 13.508 13.367 13.207 13.038 12.842 12.689 12.544 12.319 12.147 11.97 11.877 11.666 11.434 11.201 11.078 10.747 10.695 10.569 10.431 10.094 9.918 9.724 9.519 9.289 8.978 8.552 6.867 -3 ,10033 ,TETRA ,17550730,Thu Nov 25 09:42:15 CET,Thu Nov 25 11:05:23 CET,0.0 3.008 3.647 4.067 4.394 4.705 4.984 5.232 5.634 5.803 5.968 6.055 6.386 6.513 6.768 7.005 7.193 7.284 7.473 7.658 7.917 8.077 8.229 8.456 8.679 8.89 9.094 9.287 9.528 9.773 10.012 10.295 10.547 10.781 11.055 11.364 11.628 11.882 12.179 12.493 12.81 13.172 13.59 13.983 14.413 14.889 15.412 15.965 16.542 17.069 17.466 17.59 17.458 17.158 16.812 16.49 16.186 15.878 15.594 15.308 15.058 14.831 14.54 14.203 13.915 13.68 13.441 13.232 13.047 12.833 12.604 12.411 12.198 11.984 11.811 11.625 11.441 11.249 11.048 10.911 10.753 10.497 10.325 10.156 10.076 9.904 9.737 9.555 9.446 9.13 9.079 8.94 8.781 8.436 8.243 8.045 7.816 7.507 7.127 6.663 3.962 -4 ,8425 ,TETRA ,17550731,Thu Nov 25 09:42:14 CET,Thu Nov 25 11:13:57 CET,0.0 4.22 4.833 5.197 5.5 5.746 5.967 6.174 6.552 6.73 6.898 6.996 7.334 7.471 7.728 7.954 8.175 8.283 8.488 8.678 8.942 9.111 9.275 9.52 9.755 9.97 10.162 10.344 10.591 10.863 11.12 11.383 11.618 11.852 12.117 12.397 12.674 12.957 13.265 13.625 13.97 14.325 14.753 15.169 15.62 16.092 16.618 17.153 17.685 18.247 18.743 18.789 18.583 18.33 18.062 17.772 17.471 17.171 16.888 16.583 16.327 16.091 15.858 15.623 15.36 15.109 14.855 14.639 14.461 14.266 14.062 13.905 13.739 13.562 13.424 13.271 13.109 12.941 12.774 12.652 12.513 12.307 12.163 11.988 11.895 11.729 11.577 11.383 11.259 10.944 10.897 10.764 10.632 10.348 10.2 10.014 9.788 9.547 9.258 8.845 7.15 -5 ,25450 ,TETRA ,17550732,Thu Nov 25 09:42:14 CET,Thu Nov 25 11:22:34 CET,0.0 3.009 3.696 4.106 4.411 4.698 4.932 5.165 5.569 5.747 5.922 6.017 6.356 6.485 6.751 7.003 7.235 7.343 7.542 7.735 8.01 8.17 8.331 8.566 8.777 8.971 9.16 9.331 9.543 9.771 9.993 10.241 10.485 10.721 10.991 11.312 11.606 11.893 12.202 12.524 12.833 13.183 13.6 14.012 14.483 14.988 15.514 16.06 16.633 17.191 17.659 17.785 17.611 17.33 17.042 16.751 16.453 16.146 15.869 15.574 15.304 15.051 14.807 14.59 14.37 14.159 13.944 13.762 13.604 13.419 13.221 13.057 12.895 12.729 12.585 12.432 12.282 12.122 11.954 11.832 11.711 11.528 11.384 11.227 11.15 10.996 10.802 10.606 10.514 10.21 10.191 10.07 9.931 9.619 9.474 9.3 9.078 8.804 8.442 8.044 6.02 -6 ,2000 ,TETRA ,17550733,Thu Nov 25 09:42:16 CET,Thu Nov 25 11:18:43 CET,0.0 5.149 5.802 6.232 6.518 6.761 6.988 7.193 7.581 7.77 7.944 8.061 8.414 8.563 8.826 9.047 9.248 9.341 9.541 9.727 9.966 10.125 10.286 10.513 10.724 10.926 11.121 11.303 11.529 11.757 11.969 12.217 12.449 12.668 12.932 13.212 13.475 13.764 14.066 14.396 14.747 15.123 15.528 15.908 16.334 16.823 17.377 17.931 18.496 19.023 19.399 19.437 19.279 19.002 18.671 18.373 18.103 17.822 17.561 17.288 17.03 16.797 16.567 16.344 16.128 15.935 15.73 15.524 15.355 15.165 14.945 14.77 14.59 14.398 14.229 14.034 13.828 13.63 13.457 13.329 13.191 13.003 12.863 12.706 12.628 12.475 12.291 12.054 11.926 11.584 11.497 11.359 11.206 10.847 10.638 10.421 10.145 9.84 9.534 9.106 6.973 -7 ,28794 ,TETRA ,17550734,Thu Nov 25 09:42:16 CET,Thu Nov 25 11:10:33 CET,0.0 2.611 3.181 3.568 3.894 4.191 4.47 4.721 5.182 5.388 5.582 5.731 6.09 6.25 6.501 6.702 6.913 7.02 7.225 7.427 7.703 7.872 8.044 8.273 8.478 8.677 8.869 9.056 9.284 9.492 9.699 9.952 10.195 10.426 10.697 10.992 11.268 11.572 11.877 12.19 12.521 12.897 13.315 13.729 14.244 14.821 15.428 15.994 16.535 17.085 17.494 17.508 17.341 17.091 16.808 16.499 16.205 15.939 15.671 15.384 15.143 14.914 14.687 14.461 14.236 14.029 13.814 13.607 13.422 13.233 13.035 12.875 12.699 12.511 12.364 12.22 12.074 11.922 11.761 11.646 11.533 11.347 11.221 11.089 11.018 10.859 10.693 10.493 10.386 10.075 10.039 9.925 9.795 9.532 9.376 9.197 9.019 8.804 8.436 7.863 5.693 -8 ,13082 ,TETRA ,17550735,Thu Nov 25 09:42:16 CET,Thu Nov 25 11:05:15 CET,0.0 3.281 3.908 4.315 4.644 4.954 5.233 5.5 6.012 6.24 6.435 6.612 6.997 7.167 7.488 7.783 8.047 8.168 8.409 8.649 8.968 9.168 9.349 9.583 9.814 10.028 10.216 10.396 10.635 10.859 11.078 11.346 11.583 11.81 12.076 12.37 12.65 12.945 13.258 13.587 13.918 14.282 14.694 15.079 15.502 15.969 16.484 17.004 17.521 18.042 18.422 18.43 18.261 18.014 17.709 17.399 17.114 16.828 16.554 16.258 16.013 15.801 15.574 15.345 15.13 14.914 14.681 14.481 14.299 14.108 13.9 13.725 13.556 13.382 13.254 13.12 12.968 12.794 12.616 12.504 12.367 12.128 11.966 11.807 11.729 11.558 11.372 11.184 11.085 10.775 10.726 10.609 10.493 10.189 10.008 9.813 9.594 9.327 8.994 8.526 7.417 -9 ,24712 ,TETRA ,17550736,Thu Nov 25 09:42:16 CET,Thu Nov 25 11:20:32 CET,0.0 2.517 3.099 3.542 3.883 4.155 4.4 4.615 5.0 5.179 5.353 5.469 5.813 5.954 6.192 6.417 6.636 6.736 6.929 7.115 7.394 7.571 7.744 7.99 8.225 8.442 8.649 8.855 9.118 9.376 9.618 9.911 10.186 10.424 10.693 10.997 11.296 11.643 11.993 12.338 12.676 13.03 13.427 13.819 14.256 14.718 15.221 15.741 16.299 16.817 17.176 17.22 17.069 16.804 16.509 16.206 15.89 15.573 15.292 15.013 14.759 14.512 14.242 13.945 13.677 13.469 13.262 13.072 12.907 12.731 12.546 12.388 12.224 12.049 11.911 11.77 11.623 11.475 11.307 11.178 11.045 10.848 10.711 10.565 10.492 10.345 10.187 9.965 9.833 9.526 9.457 9.31 9.171 8.839 8.654 8.432 8.182 7.913 7.541 7.016 5.453 -10 ,26185 ,TETRA ,17550737,Thu Nov 25 09:42:16 CET,Thu Nov 25 11:16:46 CET,0.0 4.532 5.063 5.514 5.899 6.189 6.466 6.727 7.135 7.316 7.471 7.539 7.868 7.984 8.211 8.432 8.648 8.752 8.955 9.154 9.411 9.572 9.731 9.939 10.137 10.35 10.554 10.734 10.97 11.197 11.412 11.671 11.917 12.156 12.431 12.713 12.977 13.284 13.61 13.928 14.252 14.612 15.026 15.428 15.871 16.333 16.816 17.346 17.903 18.43 18.888 18.961 18.794 18.507 18.17 17.819 17.483 17.176 16.906 16.624 16.366 16.12 15.892 15.678 15.46 15.264 15.056 14.852 14.676 14.497 14.307 14.152 13.979 13.782 13.628 13.474 13.328 13.18 13.007 12.889 12.779 12.608 12.483 12.326 12.228 12.014 11.794 11.568 11.45 11.127 11.035 10.868 10.693 10.309 10.109 9.904 9.686 9.415 9.077 8.623 6.936 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_43.txt deleted file mode 100644 index fc4ec910..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27394 ,TETRA ,17550738,Thu Nov 25 09:42:18 CET,Thu Nov 25 11:16:47 CET,0.0 2.618 3.131 3.524 3.877 4.135 4.372 4.583 4.912 5.06 5.198 5.248 5.558 5.669 5.909 6.125 6.309 6.396 6.57 6.736 6.974 7.135 7.275 7.455 7.635 7.804 7.975 8.149 8.365 8.575 8.763 8.969 9.177 9.38 9.603 9.83 10.04 10.278 10.534 10.821 11.114 11.409 11.739 12.047 12.354 12.668 12.996 13.332 13.67 13.911 13.954 13.66 13.171 12.677 12.23 11.813 11.44 11.06 10.728 10.393 10.078 9.804 9.549 9.307 9.09 8.882 8.662 8.467 8.288 8.096 7.903 7.738 7.567 7.39 7.244 7.104 6.969 6.809 6.628 6.501 6.367 6.163 6.025 5.885 5.814 5.662 5.51 5.357 5.277 4.983 4.96 4.824 4.685 4.364 4.174 3.97 3.74 3.507 3.24 2.879 2.109 -2 ,41 ,TETRA ,17550739,Thu Nov 25 09:42:18 CET,Thu Nov 25 11:16:48 CET,0.0 1.754 2.308 2.698 2.986 3.23 3.449 3.632 3.965 4.123 4.26 4.332 4.673 4.796 5.028 5.225 5.403 5.497 5.677 5.835 6.061 6.211 6.353 6.544 6.734 6.91 7.07 7.233 7.437 7.613 7.791 8.019 8.213 8.397 8.619 8.862 9.086 9.334 9.603 9.869 10.139 10.436 10.765 11.051 11.36 11.683 12.014 12.337 12.652 12.938 12.941 12.55 12.106 11.627 11.186 10.771 10.381 10.019 9.697 9.36 9.06 8.803 8.563 8.334 8.114 7.908 7.703 7.513 7.333 7.137 6.937 6.783 6.622 6.449 6.314 6.178 6.037 5.884 5.71 5.589 5.467 5.274 5.141 4.999 4.925 4.788 4.639 4.46 4.369 4.078 4.099 4.002 3.902 3.672 3.541 3.389 3.215 3.034 2.816 2.501 1.748 -3 ,10191 ,TETRA ,17550740,Thu Nov 25 09:42:15 CET,Thu Nov 25 11:18:25 CET,0.0 2.535 3.124 3.485 3.788 4.078 4.319 4.515 4.902 5.08 5.24 5.318 5.641 5.755 5.966 6.177 6.383 6.481 6.669 6.835 7.056 7.191 7.326 7.513 7.699 7.898 8.076 8.229 8.431 8.63 8.81 9.023 9.214 9.414 9.653 9.903 10.126 10.354 10.614 10.88 11.147 11.466 11.828 12.159 12.536 12.916 13.289 13.65 13.99 14.268 14.342 14.007 13.523 13.069 12.617 12.143 11.739 11.376 11.048 10.714 10.41 10.125 9.837 9.581 9.365 9.127 8.86 8.645 8.474 8.309 8.119 7.958 7.791 7.602 7.458 7.324 7.181 7.033 6.882 6.763 6.632 6.429 6.292 6.154 6.081 5.941 5.795 5.631 5.541 5.237 5.219 5.108 4.986 4.655 4.46 4.279 4.107 3.894 3.651 3.382 2.574 -4 ,27730 ,TETRA ,17550741,Thu Nov 25 09:42:18 CET,Thu Nov 25 11:21:06 CET,0.0 1.776 2.333 2.732 3.026 3.286 3.527 3.766 4.165 4.309 4.45 4.535 4.863 4.98 5.188 5.377 5.569 5.669 5.869 6.047 6.279 6.421 6.548 6.736 6.92 7.093 7.273 7.457 7.694 7.903 8.078 8.288 8.493 8.681 8.89 9.127 9.36 9.597 9.845 10.103 10.362 10.647 10.964 11.272 11.614 11.991 12.375 12.72 13.007 13.187 13.159 12.825 12.349 11.893 11.448 10.996 10.594 10.204 9.859 9.53 9.246 8.991 8.745 8.509 8.271 8.048 7.83 7.635 7.469 7.291 7.099 6.927 6.738 6.535 6.377 6.225 6.068 5.898 5.715 5.587 5.456 5.258 5.115 4.959 4.877 4.702 4.515 4.332 4.227 3.916 3.911 3.8 3.671 3.381 3.216 3.042 2.852 2.633 2.388 2.054 1.207 -5 ,17791 ,TETRA ,17550742,Thu Nov 25 09:42:16 CET,Thu Nov 25 11:26:05 CET,0.0 2.343 2.901 3.288 3.583 3.836 4.034 4.209 4.548 4.694 4.826 4.887 5.222 5.347 5.587 5.832 6.062 6.172 6.366 6.538 6.8 6.971 7.14 7.37 7.574 7.768 7.955 8.154 8.406 8.627 8.841 9.095 9.321 9.526 9.76 10.014 10.258 10.53 10.828 11.126 11.41 11.712 12.05 12.395 12.783 13.168 13.555 13.894 14.186 14.398 14.374 14.033 13.595 13.129 12.698 12.27 11.882 11.537 11.221 10.884 10.595 10.336 10.079 9.82 9.579 9.377 9.158 8.958 8.794 8.611 8.404 8.23 8.048 7.859 7.72 7.584 7.431 7.264 7.091 6.97 6.855 6.68 6.563 6.449 6.379 6.225 6.078 5.915 5.826 5.535 5.552 5.437 5.31 5.024 4.876 4.721 4.529 4.296 4.018 3.658 2.917 -6 ,3777 ,TETRA ,17550743,Thu Nov 25 09:42:18 CET,Thu Nov 25 11:08:34 CET,0.0 1.617 2.085 2.423 2.71 2.959 3.187 3.395 3.748 3.9 4.042 4.082 4.401 4.519 4.765 4.995 5.186 5.283 5.478 5.646 5.879 6.029 6.167 6.367 6.554 6.737 6.914 7.074 7.288 7.502 7.69 7.895 8.085 8.271 8.492 8.736 8.964 9.218 9.494 9.754 10.008 10.287 10.575 10.877 11.235 11.565 11.907 12.262 12.578 12.809 12.882 12.644 12.215 11.758 11.319 10.871 10.449 10.064 9.728 9.385 9.09 8.827 8.579 8.332 8.085 7.857 7.625 7.415 7.194 6.95 6.716 6.52 6.318 6.099 5.922 5.743 5.553 5.357 5.162 5.02 4.869 4.643 4.476 4.297 4.206 4.03 3.847 3.643 3.54 3.236 3.203 3.078 2.947 2.664 2.5 2.313 2.119 1.898 1.597 1.225 0.107 -7 ,32198 ,TETRA ,17550744,Thu Nov 25 09:42:16 CET,Thu Nov 25 11:21:26 CET,0.0 2.311 2.857 3.25 3.568 3.847 4.1 4.329 4.746 4.925 5.082 5.16 5.494 5.641 5.914 6.14 6.329 6.414 6.594 6.767 6.993 7.133 7.267 7.474 7.661 7.832 8.005 8.172 8.392 8.595 8.783 8.996 9.194 9.392 9.614 9.85 10.065 10.302 10.561 10.826 11.105 11.401 11.717 12.001 12.321 12.671 13.025 13.39 13.727 13.951 13.96 13.593 13.115 12.664 12.237 11.818 11.434 11.08 10.755 10.427 10.146 9.887 9.638 9.402 9.178 8.971 8.76 8.571 8.392 8.2 8.007 7.84 7.669 7.495 7.354 7.215 7.064 6.907 6.739 6.618 6.499 6.311 6.179 6.046 5.977 5.819 5.659 5.494 5.398 5.094 5.091 4.977 4.84 4.537 4.371 4.195 4.015 3.823 3.584 3.199 1.904 -8 ,13646 ,TETRA ,17550745,Thu Nov 25 09:42:18 CET,Thu Nov 25 11:18:58 CET,0.0 2.546 3.136 3.495 3.74 3.953 4.17 4.37 4.7 4.856 5.01 5.062 5.386 5.506 5.706 5.898 6.098 6.205 6.397 6.563 6.799 6.947 7.092 7.295 7.488 7.68 7.855 8.007 8.212 8.405 8.587 8.819 9.028 9.229 9.45 9.68 9.92 10.164 10.421 10.701 10.987 11.314 11.659 11.963 12.296 12.633 12.973 13.297 13.597 13.848 13.874 13.555 13.13 12.676 12.223 11.766 11.369 11.005 10.686 10.369 10.08 9.807 9.55 9.315 9.096 8.888 8.657 8.453 8.278 8.096 7.906 7.741 7.562 7.371 7.224 7.073 6.921 6.765 6.607 6.496 6.379 6.208 6.087 5.953 5.883 5.748 5.592 5.416 5.334 5.05 5.054 4.937 4.833 4.622 4.479 4.317 4.16 3.944 3.663 3.332 2.642 -9 ,10920 ,TETRA ,17550746,Thu Nov 25 09:42:15 CET,Thu Nov 25 11:22:29 CET,0.0 1.913 2.38 2.711 3.016 3.296 3.513 3.708 4.069 4.235 4.384 4.447 4.767 4.884 5.119 5.336 5.544 5.633 5.808 5.982 6.217 6.362 6.493 6.679 6.865 7.047 7.216 7.382 7.586 7.763 7.942 8.175 8.384 8.571 8.797 9.052 9.288 9.53 9.785 10.052 10.301 10.567 10.879 11.17 11.506 11.871 12.244 12.608 12.934 13.17 13.189 12.881 12.463 11.981 11.492 11.059 10.679 10.327 10.008 9.677 9.383 9.115 8.863 8.615 8.374 8.153 7.933 7.735 7.553 7.36 7.162 7.003 6.824 6.625 6.478 6.331 6.181 6.025 5.853 5.728 5.607 5.39 5.21 5.038 4.961 4.813 4.67 4.523 4.441 4.142 4.142 4.035 3.93 3.689 3.541 3.376 3.203 3.022 2.807 2.487 1.651 -10 ,10782 ,TETRA ,17550747,Thu Nov 25 09:42:18 CET,Thu Nov 25 11:22:00 CET,0.0 1.338 1.862 2.242 2.551 2.826 3.073 3.287 3.645 3.802 3.947 4.031 4.365 4.483 4.72 4.941 5.13 5.222 5.397 5.553 5.764 5.909 6.059 6.267 6.457 6.631 6.801 6.971 7.186 7.395 7.591 7.81 8.012 8.196 8.42 8.66 8.877 9.121 9.365 9.603 9.849 10.124 10.456 10.783 11.128 11.489 11.861 12.2 12.502 12.763 12.825 12.467 12.008 11.517 11.019 10.571 10.139 9.736 9.407 9.064 8.763 8.513 8.261 8.017 7.784 7.552 7.321 7.112 6.919 6.717 6.507 6.332 6.162 5.986 5.839 5.686 5.529 5.37 5.21 5.097 4.973 4.776 4.644 4.52 4.447 4.295 4.141 3.974 3.893 3.59 3.591 3.494 3.394 3.165 3.044 2.909 2.74 2.52 2.255 1.949 1.165 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_46.txt deleted file mode 100644 index ac64ca7c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,175 ,TETRA ,17550749,Thu Nov 25 09:42:17 CET,Thu Nov 25 11:17:26 CET,0.0 1.765 2.339 2.758 3.116 3.398 3.628 3.822 4.175 4.336 4.486 4.551 4.88 5.004 5.225 5.419 5.6 5.685 5.857 6.03 6.244 6.364 6.484 6.667 6.83 6.994 7.154 7.278 7.434 7.585 7.721 7.878 8.03 8.181 8.351 8.531 8.693 8.873 9.051 9.225 9.398 9.574 9.779 9.957 10.12 10.287 10.404 10.428 10.38 10.11 9.389 8.4 7.483 6.665 5.937 5.271 4.709 4.191 3.718 3.269 2.894 2.545 2.198 1.876 1.587 1.322 1.041 0.788 0.578 0.369 0.139 -0.053 -0.244 -0.447 -0.601 -0.754 -0.914 -1.092 -1.279 -1.399 -1.532 -1.75 -1.897 -2.045 -2.122 -2.286 -2.451 -2.635 -2.736 -3.051 -3.059 -3.171 -3.28 -3.566 -3.756 -3.957 -4.164 -4.38 -4.634 -5.035 -6.24 -2 ,8925 ,TETRA ,17550750,Thu Nov 25 09:42:19 CET,Thu Nov 25 11:17:38 CET,0.0 3.951 4.411 4.733 4.999 5.232 5.422 5.604 5.959 6.103 6.234 6.29 6.615 6.734 6.951 7.143 7.316 7.401 7.563 7.715 7.938 8.07 8.195 8.382 8.553 8.706 8.859 9.008 9.173 9.324 9.467 9.626 9.788 9.943 10.122 10.304 10.473 10.663 10.844 11.031 11.211 11.409 11.631 11.807 11.967 12.102 12.213 12.265 12.188 11.897 11.195 10.19 9.297 8.502 7.807 7.171 6.602 6.086 5.656 5.195 4.792 4.46 4.14 3.828 3.534 3.259 2.978 2.728 2.513 2.301 2.084 1.894 1.691 1.484 1.331 1.175 1.01 0.839 0.662 0.536 0.404 0.202 0.037 -0.167 -0.273 -0.468 -0.664 -0.874 -0.993 -1.338 -1.412 -1.562 -1.709 -1.993 -2.161 -2.355 -2.547 -2.739 -2.982 -3.324 -4.363 -3 ,14446 ,TETRA ,17550752,Thu Nov 25 09:42:17 CET,Thu Nov 25 11:18:52 CET,0.0 2.096 2.532 2.837 3.112 3.362 3.582 3.777 4.126 4.278 4.406 4.448 4.761 4.877 5.089 5.262 5.427 5.517 5.689 5.83 6.018 6.142 6.268 6.452 6.625 6.773 6.909 7.052 7.238 7.397 7.541 7.718 7.871 8.025 8.224 8.431 8.613 8.801 8.98 9.143 9.306 9.5 9.69 9.831 9.988 10.155 10.3 10.37 10.298 10.008 9.341 8.342 7.423 6.582 5.85 5.204 4.629 4.106 3.65 3.173 2.766 2.411 2.065 1.753 1.47 1.215 0.949 0.693 0.472 0.255 0.032 -0.156 -0.351 -0.555 -0.713 -0.885 -1.077 -1.264 -1.451 -1.584 -1.717 -1.921 -2.056 -2.202 -2.28 -2.441 -2.614 -2.8 -2.899 -3.21 -3.206 -3.307 -3.411 -3.671 -3.829 -3.983 -4.134 -4.317 -4.584 -4.964 -5.719 -4 ,11551 ,TETRA ,17550753,Thu Nov 25 09:42:19 CET,Thu Nov 25 11:08:48 CET,0.0 1.651 2.182 2.559 2.886 3.166 3.411 3.626 3.954 4.088 4.219 4.276 4.598 4.707 4.894 5.073 5.236 5.316 5.477 5.632 5.852 5.994 6.125 6.294 6.474 6.647 6.799 6.938 7.109 7.276 7.424 7.595 7.759 7.915 8.096 8.287 8.447 8.614 8.791 8.972 9.158 9.36 9.563 9.742 9.927 10.077 10.176 10.211 10.133 9.838 9.12 8.103 7.15 6.289 5.565 4.934 4.361 3.821 3.364 2.918 2.528 2.189 1.877 1.575 1.279 1.005 0.728 0.483 0.271 0.047 -0.19 -0.374 -0.573 -0.8 -0.978 -1.148 -1.325 -1.507 -1.691 -1.82 -1.957 -2.17 -2.31 -2.457 -2.532 -2.687 -2.859 -3.042 -3.138 -3.442 -3.426 -3.537 -3.678 -4.013 -4.195 -4.391 -4.599 -4.867 -5.22 -5.596 -6.457 -5 ,22135 ,TETRA ,17550754,Thu Nov 25 09:42:16 CET,Thu Nov 25 11:22:38 CET,0.0 1.786 2.373 2.778 3.098 3.397 3.627 3.795 4.121 4.276 4.403 4.445 4.763 4.87 5.081 5.287 5.471 5.555 5.719 5.871 6.078 6.2 6.315 6.491 6.658 6.798 6.932 7.069 7.245 7.402 7.549 7.749 7.933 8.089 8.272 8.468 8.649 8.831 9.013 9.204 9.417 9.633 9.853 10.032 10.175 10.345 10.51 10.576 10.522 10.283 9.622 8.565 7.615 6.779 6.067 5.445 4.85 4.289 3.832 3.393 3.014 2.67 2.343 2.043 1.758 1.493 1.221 0.975 0.77 0.557 0.328 0.133 -0.078 -0.294 -0.452 -0.615 -0.789 -0.969 -1.155 -1.281 -1.41 -1.623 -1.775 -1.925 -2.008 -2.198 -2.4 -2.604 -2.711 -3.048 -3.096 -3.244 -3.411 -3.802 -4.012 -4.201 -4.407 -4.624 -4.907 -5.302 -6.341 -6 ,23088 ,TETRA ,17550755,Thu Nov 25 09:42:19 CET,Thu Nov 25 11:17:27 CET,0.0 1.672 2.208 2.586 2.881 3.147 3.387 3.615 4.001 4.156 4.289 4.332 4.636 4.741 4.949 5.136 5.311 5.389 5.534 5.681 5.89 6.025 6.143 6.308 6.461 6.617 6.787 6.954 7.168 7.378 7.578 7.803 8.022 8.225 8.448 8.688 8.902 9.107 9.286 9.459 9.614 9.782 9.992 10.165 10.35 10.536 10.676 10.748 10.702 10.427 9.75 8.77 7.889 7.101 6.425 5.805 5.226 4.688 4.24 3.786 3.379 3.025 2.685 2.359 2.056 1.786 1.503 1.252 1.046 0.831 0.599 0.399 0.199 -0.006 -0.167 -0.327 -0.489 -0.662 -0.849 -0.971 -1.102 -1.321 -1.476 -1.643 -1.729 -1.9 -2.084 -2.282 -2.383 -2.709 -2.742 -2.87 -2.992 -3.258 -3.414 -3.592 -3.78 -3.982 -4.223 -4.563 -5.095 -7 ,18289 ,TETRA ,17550756,Thu Nov 25 09:42:20 CET,Thu Nov 25 11:16:05 CET,0.0 1.651 2.238 2.641 2.929 3.167 3.376 3.567 3.876 4.026 4.167 4.202 4.504 4.603 4.794 4.987 5.174 5.263 5.411 5.555 5.771 5.898 6.027 6.194 6.341 6.489 6.63 6.767 6.933 7.093 7.253 7.438 7.609 7.77 7.94 8.123 8.305 8.493 8.695 8.897 9.074 9.242 9.425 9.587 9.755 9.92 10.026 10.062 9.994 9.773 9.179 8.121 7.151 6.34 5.624 4.97 4.402 3.882 3.435 2.996 2.604 2.263 1.955 1.657 1.364 1.095 0.824 0.574 0.352 0.139 -0.077 -0.26 -0.445 -0.65 -0.814 -0.986 -1.165 -1.34 -1.525 -1.654 -1.786 -2.002 -2.157 -2.308 -2.381 -2.537 -2.711 -2.924 -3.039 -3.37 -3.445 -3.603 -3.759 -4.066 -4.224 -4.399 -4.608 -4.861 -5.18 -5.578 -6.347 -8 ,24167 ,TETRA ,17550757,Thu Nov 25 09:42:19 CET,Thu Nov 25 11:19:58 CET,0.0 1.478 1.957 2.32 2.622 2.893 3.123 3.325 3.676 3.838 3.995 4.098 4.421 4.533 4.769 4.999 5.207 5.301 5.475 5.656 5.897 6.038 6.181 6.381 6.561 6.722 6.87 7.013 7.19 7.347 7.499 7.685 7.862 8.016 8.184 8.369 8.539 8.735 8.927 9.108 9.304 9.518 9.742 9.92 10.064 10.186 10.291 10.368 10.334 10.081 9.395 8.392 7.466 6.623 5.888 5.218 4.648 4.13 3.678 3.218 2.83 2.506 2.188 1.884 1.607 1.353 1.087 0.84 0.618 0.395 0.152 -0.056 -0.26 -0.463 -0.621 -0.787 -0.975 -1.167 -1.348 -1.473 -1.599 -1.822 -1.982 -2.14 -2.223 -2.396 -2.58 -2.775 -2.883 -3.216 -3.266 -3.4 -3.558 -3.923 -4.137 -4.369 -4.575 -4.811 -5.11 -5.481 -6.175 -9 ,4075 ,TETRA ,17550758,Thu Nov 25 09:42:19 CET,Thu Nov 25 11:16:57 CET,0.0 1.731 2.206 2.545 2.837 3.105 3.339 3.54 3.879 4.05 4.213 4.275 4.595 4.716 4.935 5.125 5.301 5.385 5.552 5.703 5.911 6.049 6.178 6.355 6.505 6.658 6.811 6.954 7.14 7.313 7.473 7.664 7.838 7.988 8.165 8.38 8.567 8.739 8.925 9.113 9.299 9.517 9.711 9.841 10.001 10.165 10.293 10.362 10.338 10.113 9.439 8.409 7.481 6.635 5.894 5.247 4.668 4.123 3.653 3.198 2.82 2.485 2.157 1.845 1.564 1.311 1.045 0.801 0.588 0.369 0.138 -0.057 -0.255 -0.46 -0.62 -0.773 -0.944 -1.136 -1.319 -1.441 -1.577 -1.784 -1.921 -2.069 -2.148 -2.31 -2.478 -2.672 -2.773 -3.073 -3.057 -3.174 -3.305 -3.62 -3.795 -3.977 -4.175 -4.423 -4.723 -5.094 -5.82 -10 ,26418 ,TETRA ,17550759,Thu Nov 25 09:42:20 CET,Thu Nov 25 11:16:57 CET,0.0 1.904 2.405 2.767 3.07 3.282 3.498 3.707 4.028 4.169 4.307 4.36 4.683 4.796 5.012 5.225 5.408 5.493 5.66 5.812 6.015 6.141 6.262 6.443 6.604 6.752 6.901 7.044 7.223 7.393 7.552 7.742 7.916 8.081 8.265 8.451 8.622 8.809 9.004 9.197 9.374 9.557 9.771 9.965 10.17 10.324 10.419 10.498 10.475 10.235 9.586 8.564 7.625 6.764 6.044 5.424 4.86 4.351 3.902 3.448 3.075 2.738 2.408 2.105 1.815 1.525 1.232 0.986 0.773 0.558 0.319 0.116 -0.079 -0.284 -0.445 -0.612 -0.781 -0.957 -1.144 -1.273 -1.407 -1.621 -1.762 -1.904 -1.982 -2.144 -2.307 -2.477 -2.569 -2.884 -2.893 -2.997 -3.098 -3.356 -3.521 -3.676 -3.861 -4.136 -4.408 -4.67 -5.659 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_47.txt deleted file mode 100644 index ae55d245..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_27_47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7249 ,TETRA ,17550760,Thu Nov 25 09:42:18 CET,Thu Nov 25 11:14:51 CET,0.0 1.733 2.255 2.623 2.922 3.183 3.386 3.548 3.843 4.003 4.158 4.199 4.506 4.596 4.73 4.871 5.023 5.088 5.196 5.278 5.387 5.464 5.551 5.688 5.82 5.931 6.024 6.113 6.217 6.308 6.397 6.498 6.588 6.666 6.738 6.796 6.826 6.823 6.791 6.735 6.661 6.558 6.382 6.163 5.823 5.341 4.658 3.689 2.275 0.175 -3.139 -6.863 -9.777 -12.151 -14.103 -15.778 -17.18 -18.395 -19.434 -20.469 -21.337 -22.093 -22.778 -23.418 -24.013 -24.521 -25.051 -25.534 -25.937 -26.352 -26.771 -27.111 -27.468 -27.839 -28.115 -28.397 -28.689 -28.986 -29.315 -29.536 -29.749 -30.078 -30.31 -30.555 -30.687 -30.967 -31.237 -31.508 -31.652 -32.049 -32.139 -32.323 -32.502 -32.873 -33.077 -33.302 -33.554 -33.818 -34.129 -34.486 -35.292 -2 ,10606 ,TETRA ,17550761,Thu Nov 25 09:42:19 CET,Thu Nov 25 11:17:38 CET,0.0 1.563 2.038 2.356 2.598 2.794 2.946 3.09 3.371 3.496 3.619 3.638 3.946 4.047 4.245 4.426 4.569 4.636 4.786 4.922 5.074 5.159 5.242 5.352 5.452 5.536 5.597 5.653 5.711 5.751 5.777 5.81 5.855 5.892 5.916 5.915 5.889 5.846 5.782 5.675 5.545 5.373 5.117 4.802 4.363 3.815 3.057 2.013 0.554 -1.616 -5.048 -8.899 -11.809 -14.13 -16.057 -17.709 -19.094 -20.287 -21.269 -22.229 -23.04 -23.762 -24.433 -25.035 -25.577 -26.066 -26.594 -27.069 -27.482 -27.887 -28.273 -28.59 -28.915 -29.264 -29.534 -29.806 -30.085 -30.368 -30.655 -30.863 -31.089 -31.422 -31.659 -31.932 -32.073 -32.346 -32.618 -32.887 -33.028 -33.414 -33.481 -33.66 -33.829 -34.155 -34.342 -34.552 -34.8 -35.108 -35.401 -35.753 -36.919 -3 ,2381 ,TETRA ,17550762,Thu Nov 25 09:42:21 CET,Thu Nov 25 11:10:34 CET,0.0 2.509 3.054 3.416 3.697 3.918 4.113 4.281 4.541 4.671 4.799 4.831 5.134 5.218 5.357 5.5 5.623 5.674 5.777 5.87 6.017 6.119 6.209 6.308 6.388 6.466 6.548 6.616 6.693 6.761 6.815 6.875 6.917 6.946 6.97 6.99 6.986 6.946 6.879 6.786 6.671 6.532 6.341 6.073 5.661 5.121 4.383 3.399 1.986 -0.165 -3.626 -7.512 -10.5 -12.898 -14.855 -16.528 -17.92 -19.133 -20.163 -21.157 -21.993 -22.74 -23.422 -24.045 -24.628 -25.146 -25.676 -26.146 -26.544 -26.954 -27.384 -27.743 -28.106 -28.47 -28.745 -29.024 -29.317 -29.614 -29.918 -30.136 -30.363 -30.742 -31.004 -31.251 -31.376 -31.623 -31.871 -32.137 -32.274 -32.675 -32.783 -32.947 -33.104 -33.44 -33.634 -33.856 -34.09 -34.36 -34.714 -35.147 -35.944 -4 ,5614 ,TETRA ,17550763,Thu Nov 25 09:42:19 CET,Thu Nov 25 11:18:37 CET,0.0 2.052 2.56 2.952 3.272 3.541 3.756 3.96 4.36 4.551 4.703 4.719 5.01 5.098 5.246 5.39 5.532 5.586 5.676 5.767 5.897 5.966 6.045 6.197 6.346 6.468 6.565 6.646 6.753 6.85 6.928 7.033 7.127 7.178 7.22 7.274 7.305 7.31 7.284 7.236 7.17 7.071 6.914 6.677 6.304 5.776 5.03 4.066 2.716 0.708 -2.56 -6.353 -9.351 -11.819 -13.823 -15.491 -16.881 -18.178 -19.298 -20.338 -21.209 -21.986 -22.748 -23.442 -24.055 -24.609 -25.175 -25.678 -26.1 -26.536 -26.994 -27.359 -27.731 -28.119 -28.422 -28.737 -29.072 -29.425 -29.774 -30.005 -30.237 -30.594 -30.852 -31.133 -31.277 -31.561 -31.852 -32.145 -32.287 -32.676 -32.759 -32.931 -33.119 -33.507 -33.708 -33.962 -34.23 -34.498 -34.85 -35.332 -36.588 -5 ,14287 ,TETRA ,17550764,Thu Nov 25 09:42:47 CET,Thu Nov 25 11:17:17 CET,0.0 2.261 2.837 3.201 3.472 3.717 3.933 4.114 4.451 4.595 4.719 4.734 5.019 5.092 5.251 5.39 5.505 5.566 5.68 5.785 5.908 5.976 6.045 6.125 6.197 6.265 6.326 6.386 6.457 6.504 6.551 6.607 6.632 6.659 6.687 6.688 6.666 6.61 6.522 6.398 6.239 6.048 5.814 5.531 5.093 4.534 3.794 2.761 1.288 -0.8 -3.986 -7.535 -10.384 -12.791 -14.766 -16.456 -17.896 -19.139 -20.171 -21.172 -22.011 -22.759 -23.454 -24.103 -24.696 -25.213 -25.745 -26.206 -26.583 -26.989 -27.428 -27.775 -28.121 -28.476 -28.762 -29.067 -29.391 -29.72 -30.058 -30.294 -30.526 -30.897 -31.153 -31.405 -31.534 -31.804 -32.09 -32.386 -32.537 -32.931 -33.005 -33.175 -33.357 -33.766 -33.985 -34.201 -34.419 -34.698 -35.074 -35.565 -36.754 -6 ,9959 ,TETRA ,17550765,Thu Nov 25 09:42:47 CET,Thu Nov 25 11:16:30 CET,0.0 2.316 2.886 3.216 3.465 3.676 3.854 4.016 4.332 4.472 4.602 4.625 4.921 5.016 5.181 5.325 5.464 5.532 5.668 5.794 5.969 6.075 6.167 6.298 6.413 6.527 6.651 6.759 6.878 6.973 7.044 7.124 7.195 7.249 7.302 7.342 7.354 7.355 7.344 7.3 7.214 7.092 6.907 6.657 6.29 5.799 5.097 4.136 2.747 0.658 -2.66 -6.499 -9.493 -11.885 -13.832 -15.527 -16.99 -18.23 -19.271 -20.29 -21.125 -21.847 -22.528 -23.155 -23.721 -24.236 -24.77 -25.241 -25.629 -26.021 -26.433 -26.756 -27.085 -27.422 -27.676 -27.952 -28.236 -28.523 -28.835 -29.046 -29.242 -29.546 -29.772 -30.013 -30.141 -30.422 -30.711 -31.019 -31.176 -31.569 -31.645 -31.822 -32.01 -32.423 -32.664 -32.895 -33.135 -33.416 -33.741 -34.155 -35.34 -7 ,5101 ,TETRA ,17550766,Thu Nov 25 09:42:47 CET,Thu Nov 25 11:19:48 CET,0.0 2.122 2.73 3.091 3.352 3.588 3.796 3.978 4.281 4.4 4.515 4.527 4.818 4.908 5.096 5.282 5.443 5.52 5.664 5.782 5.945 6.051 6.147 6.279 6.406 6.531 6.634 6.716 6.835 6.936 7.013 7.111 7.2 7.283 7.37 7.423 7.44 7.432 7.398 7.346 7.25 7.135 6.98 6.751 6.405 5.908 5.21 4.285 2.946 0.883 -2.496 -6.352 -9.281 -11.597 -13.541 -15.185 -16.58 -17.849 -18.913 -19.925 -20.765 -21.501 -22.188 -22.824 -23.412 -23.936 -24.472 -24.947 -25.351 -25.758 -26.168 -26.5 -26.843 -27.206 -27.49 -27.773 -28.052 -28.354 -28.665 -28.874 -29.088 -29.422 -29.66 -29.907 -30.036 -30.299 -30.566 -30.845 -30.984 -31.377 -31.456 -31.624 -31.817 -32.225 -32.437 -32.658 -32.907 -33.181 -33.46 -33.815 -34.496 -8 ,23975 ,TETRA ,17550767,Thu Nov 25 09:42:47 CET,Thu Nov 25 11:18:37 CET,0.0 1.528 1.997 2.34 2.62 2.827 2.998 3.172 3.527 3.69 3.821 3.859 4.16 4.255 4.423 4.574 4.716 4.777 4.889 4.987 5.118 5.201 5.282 5.378 5.46 5.529 5.59 5.653 5.713 5.774 5.835 5.893 5.928 5.959 5.99 5.982 5.959 5.927 5.865 5.782 5.661 5.472 5.224 4.943 4.547 3.989 3.218 2.22 0.781 -1.388 -4.833 -8.655 -11.617 -13.986 -15.9 -17.524 -18.926 -20.17 -21.199 -22.169 -22.975 -23.706 -24.38 -24.987 -25.534 -26.028 -26.554 -27.013 -27.409 -27.811 -28.233 -28.588 -28.95 -29.315 -29.582 -29.859 -30.157 -30.448 -30.738 -30.939 -31.141 -31.459 -31.692 -31.931 -32.048 -32.299 -32.568 -32.833 -32.962 -33.35 -33.41 -33.576 -33.745 -34.102 -34.289 -34.48 -34.691 -34.933 -35.195 -35.544 -36.356 -9 ,29471 ,TETRA ,17550768,Thu Nov 25 09:42:47 CET,Thu Nov 25 11:08:47 CET,0.0 1.787 2.222 2.545 2.846 3.123 3.378 3.579 3.941 4.103 4.238 4.266 4.581 4.697 4.883 5.051 5.206 5.279 5.42 5.541 5.699 5.803 5.9 6.038 6.155 6.254 6.358 6.457 6.588 6.687 6.777 6.888 6.951 6.986 7.019 7.052 7.076 7.078 7.051 6.99 6.894 6.769 6.585 6.335 5.948 5.421 4.719 3.743 2.331 0.245 -3.16 -6.981 -9.873 -12.224 -14.185 -15.896 -17.332 -18.544 -19.559 -20.549 -21.384 -22.122 -22.8 -23.414 -23.976 -24.485 -25.01 -25.485 -25.889 -26.296 -26.723 -27.076 -27.431 -27.793 -28.081 -28.37 -28.65 -28.935 -29.238 -29.444 -29.648 -30.002 -30.25 -30.492 -30.623 -30.886 -31.157 -31.438 -31.579 -31.97 -32.045 -32.217 -32.389 -32.768 -32.991 -33.226 -33.455 -33.706 -34.006 -34.36 -35.318 -10 ,28580 ,TETRA ,17550769,Thu Nov 25 09:42:47 CET,Thu Nov 25 11:22:59 CET,0.0 2.006 2.466 2.812 3.082 3.328 3.557 3.765 4.183 4.349 4.481 4.54 4.861 4.988 5.214 5.391 5.543 5.623 5.765 5.89 6.07 6.172 6.26 6.386 6.504 6.614 6.721 6.809 6.907 6.997 7.068 7.147 7.212 7.263 7.333 7.391 7.407 7.421 7.416 7.377 7.299 7.172 6.986 6.738 6.374 5.867 5.188 4.286 2.913 0.833 -2.506 -6.317 -9.285 -11.707 -13.663 -15.319 -16.736 -17.972 -19.003 -20.002 -20.85 -21.596 -22.284 -22.919 -23.5 -24.018 -24.551 -25.014 -25.421 -25.865 -26.307 -26.647 -26.989 -27.349 -27.628 -27.905 -28.195 -28.499 -28.811 -29.018 -29.223 -29.544 -29.762 -29.997 -30.13 -30.399 -30.655 -30.912 -31.049 -31.44 -31.503 -31.669 -31.841 -32.199 -32.385 -32.569 -32.808 -33.095 -33.376 -33.742 -34.669 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_29.txt deleted file mode 100644 index 983798f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26707 ,KEBNE ,17022802,Wed Dec 22 06:53:29 CET,Wed Dec 22 08:14:51 CET,0.0 5.937 7.24 8.086 8.698 9.172 9.576 9.942 10.56 10.815 11.032 11.186 11.554 11.717 12.043 12.336 12.599 12.727 12.979 13.231 13.61 13.838 14.062 14.389 14.699 15.0 15.281 15.547 15.891 16.216 16.545 16.958 17.341 17.711 18.154 18.635 19.077 19.589 20.126 20.679 21.288 21.985 22.779 23.58 24.494 25.502 26.665 27.97 29.503 31.247 33.322 34.797 35.446 35.829 36.067 36.214 36.277 36.285 36.25 36.165 36.052 35.911 35.745 35.577 35.414 35.258 35.086 34.924 34.767 34.584 34.387 34.222 34.066 33.906 33.782 33.663 33.519 33.349 33.18 33.068 32.947 32.76 32.63 32.491 32.417 32.249 32.055 31.861 31.761 31.46 31.383 31.232 31.083 30.777 30.605 30.409 30.175 29.876 29.477 28.916 25.526 -2 ,15560 ,KEBNE ,17022803,Wed Dec 22 06:53:27 CET,Wed Dec 22 08:14:41 CET,0.0 2.608 3.187 3.579 3.913 4.205 4.488 4.738 5.161 5.365 5.559 5.708 6.08 6.237 6.541 6.81 7.059 7.187 7.432 7.669 7.998 8.194 8.392 8.701 9.007 9.314 9.61 9.892 10.241 10.572 10.887 11.253 11.607 11.957 12.35 12.773 13.184 13.652 14.171 14.738 15.331 15.999 16.763 17.483 18.336 19.333 20.47 21.721 23.173 24.877 26.962 28.656 29.494 29.9 30.124 30.216 30.196 30.127 30.037 29.91 29.761 29.618 29.478 29.342 29.197 29.051 28.893 28.732 28.594 28.452 28.29 28.146 27.999 27.856 27.743 27.621 27.496 27.37 27.24 27.146 27.038 26.884 26.793 26.689 26.631 26.486 26.314 26.14 26.049 25.769 25.776 25.675 25.564 25.306 25.152 24.984 24.816 24.632 24.379 24.025 22.725 -3 ,14080 ,KEBNE ,17022804,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:14:57 CET,0.0 3.503 4.126 4.507 4.838 5.135 5.383 5.617 6.052 6.251 6.431 6.567 6.935 7.091 7.396 7.692 7.976 8.109 8.359 8.594 8.947 9.183 9.406 9.715 10.026 10.331 10.612 10.884 11.245 11.584 11.899 12.277 12.638 12.993 13.395 13.837 14.287 14.789 15.319 15.89 16.469 17.107 17.9 18.702 19.577 20.545 21.666 22.898 24.312 26.004 28.009 29.507 30.264 30.696 30.944 31.052 31.086 31.079 31.035 30.957 30.855 30.732 30.599 30.449 30.299 30.17 30.009 29.847 29.712 29.554 29.384 29.246 29.108 28.957 28.81 28.652 28.511 28.365 28.194 28.083 27.986 27.831 27.72 27.596 27.522 27.366 27.22 27.074 27.0 26.731 26.714 26.608 26.505 26.275 26.148 26.001 25.838 25.66 25.447 25.141 23.672 -4 ,30298 ,KEBNE ,17022805,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:14:36 CET,0.0 2.494 3.062 3.483 3.808 4.072 4.282 4.516 4.988 5.181 5.365 5.51 5.872 6.03 6.32 6.586 6.872 7.014 7.271 7.509 7.835 8.047 8.25 8.541 8.823 9.093 9.367 9.63 9.969 10.311 10.631 11.025 11.401 11.735 12.125 12.564 12.994 13.478 13.994 14.533 15.091 15.749 16.517 17.282 18.152 19.102 20.248 21.591 23.068 24.689 26.616 28.064 28.795 29.159 29.35 29.45 29.451 29.402 29.327 29.211 29.09 28.974 28.86 28.762 28.648 28.526 28.39 28.261 28.143 28.016 27.889 27.774 27.651 27.519 27.405 27.292 27.179 27.053 26.907 26.796 26.674 26.491 26.371 26.235 26.159 25.982 25.776 25.577 25.472 25.175 25.136 25.01 24.885 24.615 24.447 24.263 24.008 23.689 23.329 22.806 20.845 -5 ,31230 ,KEBNE ,17022806,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:16:16 CET,0.0 2.094 2.673 3.111 3.457 3.769 4.032 4.291 4.753 4.951 5.124 5.249 5.622 5.78 6.069 6.369 6.657 6.789 7.055 7.307 7.646 7.871 8.105 8.45 8.778 9.076 9.355 9.623 9.96 10.275 10.586 10.966 11.339 11.698 12.095 12.548 12.999 13.494 14.022 14.59 15.201 15.904 16.71 17.488 18.362 19.367 20.491 21.681 23.071 24.734 26.753 28.276 29.131 29.638 29.881 29.964 29.971 29.94 29.866 29.745 29.625 29.507 29.378 29.233 29.067 28.91 28.744 28.597 28.456 28.29 28.117 27.963 27.783 27.593 27.462 27.32 27.169 27.02 26.866 26.77 26.668 26.493 26.375 26.245 26.176 26.046 25.905 25.747 25.653 25.355 25.298 25.183 25.074 24.811 24.673 24.525 24.316 24.039 23.761 23.434 21.334 -6 ,10075 ,KEBNE ,17022807,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:14:55 CET,0.0 2.239 2.98 3.482 3.901 4.246 4.539 4.803 5.256 5.463 5.647 5.788 6.164 6.324 6.642 6.934 7.198 7.327 7.59 7.841 8.206 8.448 8.674 8.988 9.276 9.557 9.848 10.127 10.475 10.815 11.141 11.532 11.917 12.296 12.713 13.16 13.59 14.054 14.586 15.178 15.761 16.377 17.089 17.817 18.683 19.698 20.917 22.216 23.701 25.452 27.347 28.854 29.708 30.088 30.275 30.415 30.428 30.369 30.293 30.167 30.037 29.928 29.813 29.688 29.548 29.393 29.229 29.071 28.933 28.778 28.605 28.474 28.334 28.177 28.056 27.933 27.796 27.657 27.522 27.425 27.314 27.132 27.007 26.884 26.817 26.661 26.501 26.337 26.248 25.96 25.934 25.821 25.7 25.426 25.267 25.087 24.9 24.715 24.468 24.158 23.142 -7 ,28238 ,KEBNE ,17022808,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:14:48 CET,0.0 3.135 3.659 4.048 4.376 4.668 4.923 5.152 5.561 5.761 5.956 6.131 6.509 6.671 6.985 7.268 7.536 7.67 7.932 8.185 8.547 8.774 8.988 9.292 9.593 9.877 10.149 10.417 10.75 11.08 11.415 11.795 12.154 12.515 12.935 13.425 13.9 14.406 14.93 15.488 16.103 16.788 17.572 18.364 19.266 20.234 21.344 22.62 24.132 25.849 27.79 29.276 30.04 30.413 30.592 30.643 30.572 30.441 30.326 30.23 30.107 29.985 29.866 29.728 29.587 29.451 29.295 29.146 29.012 28.865 28.695 28.567 28.453 28.329 28.227 28.11 27.978 27.822 27.647 27.535 27.431 27.257 27.123 26.98 26.912 26.775 26.631 26.484 26.402 26.127 26.142 26.043 25.934 25.723 25.591 25.436 25.247 24.996 24.711 24.335 21.564 -8 ,4817 ,KEBNE ,17022809,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:14:46 CET,0.0 2.336 2.938 3.386 3.752 4.062 4.326 4.57 5.055 5.277 5.459 5.596 5.973 6.135 6.472 6.812 7.111 7.24 7.478 7.722 8.072 8.293 8.506 8.82 9.125 9.412 9.691 9.96 10.31 10.654 10.985 11.374 11.755 12.128 12.543 13.013 13.462 13.943 14.471 15.042 15.644 16.311 17.094 17.895 18.843 19.872 21.044 22.357 23.865 25.688 27.783 29.385 30.27 30.696 30.859 30.928 30.914 30.849 30.767 30.665 30.563 30.452 30.314 30.174 30.034 29.889 29.739 29.601 29.461 29.312 29.159 29.023 28.879 28.714 28.579 28.441 28.299 28.157 27.999 27.887 27.768 27.579 27.438 27.286 27.214 27.071 26.92 26.764 26.69 26.424 26.433 26.336 26.233 25.986 25.84 25.689 25.508 25.286 25.039 24.717 23.789 -9 ,28816 ,KEBNE ,17022810,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:14:52 CET,0.0 2.746 3.317 3.733 4.102 4.432 4.698 4.929 5.324 5.493 5.667 5.839 6.229 6.399 6.717 7.014 7.28 7.415 7.699 7.951 8.279 8.498 8.723 9.03 9.304 9.559 9.813 10.076 10.428 10.776 11.116 11.54 11.944 12.308 12.706 13.132 13.55 14.02 14.527 15.061 15.634 16.279 17.003 17.73 18.565 19.492 20.593 21.827 23.25 24.864 26.718 28.143 28.945 29.442 29.665 29.723 29.689 29.595 29.501 29.375 29.223 29.067 28.902 28.738 28.567 28.388 28.197 28.027 27.88 27.728 27.554 27.399 27.22 27.045 26.928 26.801 26.655 26.501 26.342 26.239 26.145 25.979 25.85 25.714 25.647 25.502 25.339 25.167 25.083 24.812 24.79 24.682 24.571 24.305 24.148 23.988 23.801 23.588 23.344 23.026 21.841 -10 ,17163 ,KEBNE ,17022811,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:03 CET,0.0 1.63 2.178 2.6 2.949 3.27 3.58 3.83 4.232 4.422 4.602 4.727 5.103 5.267 5.573 5.875 6.164 6.302 6.575 6.827 7.169 7.395 7.617 7.929 8.229 8.532 8.832 9.117 9.462 9.777 10.078 10.447 10.79 11.112 11.519 11.976 12.393 12.872 13.404 13.969 14.562 15.216 15.965 16.705 17.565 18.522 19.606 20.814 22.206 23.9 25.875 27.408 28.298 28.791 29.027 29.057 29.008 28.94 28.832 28.704 28.577 28.416 28.232 28.081 27.945 27.811 27.644 27.477 27.343 27.199 27.045 26.927 26.809 26.667 26.548 26.427 26.32 26.212 26.069 25.964 25.853 25.657 25.519 25.38 25.317 25.183 25.025 24.864 24.782 24.505 24.51 24.41 24.311 24.026 23.816 23.593 23.359 23.096 22.804 22.382 20.856 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_42.txt deleted file mode 100644 index 4ab0190e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30998 ,KEBNE ,17022812,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:12 CET,0.0 1.176 1.623 1.946 2.201 2.404 2.598 2.803 3.152 3.301 3.445 3.52 3.863 3.988 4.217 4.435 4.661 4.776 4.968 5.149 5.412 5.575 5.731 5.955 6.159 6.352 6.547 6.738 6.977 7.209 7.427 7.681 7.921 8.156 8.438 8.746 9.038 9.356 9.679 10.011 10.357 10.751 11.215 11.668 12.183 12.754 13.395 14.076 14.811 15.568 16.314 16.708 16.747 16.621 16.457 16.247 15.989 15.737 15.51 15.255 14.992 14.751 14.545 14.336 14.135 13.944 13.721 13.526 13.353 13.169 12.974 12.807 12.649 12.495 12.378 12.248 12.106 11.968 11.822 11.71 11.594 11.414 11.285 11.161 11.098 10.967 10.831 10.663 10.57 10.287 10.313 10.219 10.121 9.928 9.817 9.7 9.568 9.415 9.25 9.059 8.584 -2 ,893 ,KEBNE ,17022813,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:14:54 CET,0.0 1.444 1.953 2.333 2.598 2.836 3.075 3.274 3.584 3.732 3.884 3.973 4.314 4.443 4.671 4.882 5.092 5.187 5.368 5.553 5.803 5.958 6.115 6.35 6.557 6.746 6.936 7.115 7.334 7.56 7.783 8.047 8.301 8.54 8.824 9.14 9.427 9.737 10.067 10.413 10.774 11.169 11.637 12.1 12.614 13.189 13.802 14.451 15.203 15.969 16.723 17.114 17.146 16.958 16.637 16.326 16.065 15.793 15.517 15.252 15.04 14.836 14.621 14.417 14.211 14.002 13.793 13.596 13.42 13.241 13.049 12.89 12.71 12.531 12.409 12.286 12.154 12.006 11.856 11.76 11.654 11.487 11.376 11.255 11.191 11.056 10.921 10.773 10.691 10.411 10.433 10.348 10.266 10.054 9.927 9.805 9.67 9.499 9.317 9.093 8.592 -3 ,4377 ,KEBNE ,17022814,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:21 CET,0.0 1.03 1.508 1.821 2.062 2.27 2.44 2.593 2.91 3.074 3.225 3.281 3.6 3.714 3.925 4.117 4.302 4.389 4.559 4.734 4.973 5.118 5.271 5.499 5.716 5.907 6.081 6.247 6.469 6.682 6.879 7.127 7.379 7.623 7.889 8.184 8.469 8.779 9.086 9.397 9.74 10.12 10.543 10.972 11.465 11.984 12.571 13.193 13.829 14.563 15.387 15.81 15.872 15.8 15.67 15.491 15.294 15.092 14.896 14.692 14.492 14.297 14.126 13.966 13.799 13.648 13.496 13.351 13.214 13.059 12.889 12.745 12.603 12.46 12.342 12.229 12.11 11.972 11.836 11.741 11.636 11.479 11.376 11.27 11.217 11.1 10.98 10.861 10.797 10.521 10.523 10.418 10.325 10.159 10.064 9.95 9.824 9.688 9.568 9.422 9.185 -4 ,2710 ,KEBNE ,17022815,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:14 CET,0.0 1.227 1.688 1.994 2.261 2.494 2.69 2.859 3.171 3.328 3.485 3.565 3.892 4.021 4.266 4.484 4.688 4.785 4.971 5.16 5.424 5.593 5.764 5.989 6.197 6.4 6.595 6.781 7.016 7.241 7.456 7.708 7.944 8.18 8.457 8.775 9.081 9.394 9.731 10.093 10.472 10.885 11.35 11.812 12.343 12.913 13.552 14.233 14.927 15.652 16.481 16.957 16.998 16.888 16.709 16.496 16.275 16.033 15.768 15.449 15.191 14.995 14.8 14.6 14.393 14.193 13.981 13.792 13.628 13.454 13.273 13.121 12.96 12.802 12.681 12.553 12.418 12.281 12.129 12.02 11.907 11.703 11.55 11.409 11.345 11.207 11.059 10.908 10.829 10.544 10.541 10.433 10.331 10.109 9.971 9.835 9.705 9.544 9.364 9.132 8.74 -5 ,28828 ,KEBNE ,17022816,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:13 CET,0.0 0.983 1.422 1.739 1.978 2.207 2.41 2.581 2.899 3.049 3.188 3.232 3.551 3.658 3.846 4.038 4.234 4.326 4.499 4.67 4.898 5.045 5.183 5.374 5.567 5.75 5.922 6.098 6.325 6.529 6.733 6.992 7.235 7.47 7.742 8.036 8.319 8.642 8.985 9.327 9.696 10.113 10.565 11.014 11.547 12.13 12.775 13.471 14.194 14.968 15.764 16.153 16.185 16.078 15.887 15.662 15.434 15.183 14.941 14.666 14.405 14.163 13.929 13.699 13.485 13.253 13.009 12.823 12.662 12.497 12.333 12.196 12.059 11.921 11.81 11.691 11.563 11.433 11.314 11.238 11.143 10.979 10.875 10.781 10.732 10.637 10.537 10.42 10.357 10.093 10.16 10.096 10.026 9.876 9.789 9.688 9.586 9.488 9.383 9.233 8.91 -6 ,24219 ,KEBNE ,17022817,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:15 CET,0.0 1.22 1.636 1.963 2.24 2.483 2.707 2.902 3.232 3.388 3.537 3.61 3.943 4.076 4.327 4.553 4.762 4.859 5.054 5.236 5.477 5.629 5.782 6.009 6.233 6.439 6.621 6.799 7.017 7.245 7.482 7.748 8.001 8.244 8.533 8.857 9.149 9.457 9.794 10.157 10.527 10.919 11.352 11.797 12.332 12.932 13.58 14.243 14.974 15.805 16.708 17.186 17.194 17.039 16.825 16.572 16.334 16.098 15.872 15.631 15.407 15.171 14.912 14.685 14.479 14.27 14.056 13.858 13.675 13.497 13.307 13.144 12.988 12.831 12.7 12.56 12.42 12.281 12.136 12.027 11.912 11.726 11.604 11.489 11.43 11.296 11.145 11.001 10.929 10.656 10.712 10.634 10.548 10.357 10.248 10.131 9.989 9.835 9.67 9.433 9.003 -7 ,886 ,KEBNE ,17022818,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:16:51 CET,0.0 1.019 1.474 1.854 2.137 2.371 2.608 2.818 3.129 3.279 3.443 3.53 3.867 3.997 4.227 4.435 4.64 4.738 4.923 5.103 5.361 5.522 5.686 5.929 6.149 6.357 6.559 6.747 6.975 7.209 7.433 7.684 7.932 8.168 8.443 8.748 9.03 9.342 9.678 10.02 10.375 10.777 11.252 11.692 12.195 12.786 13.441 14.129 14.856 15.616 16.377 16.778 16.846 16.755 16.592 16.377 16.137 15.898 15.655 15.375 15.149 14.947 14.728 14.513 14.314 14.135 13.944 13.76 13.598 13.445 13.287 13.138 12.974 12.802 12.677 12.552 12.425 12.29 12.139 12.035 11.93 11.757 11.64 11.515 11.444 11.296 11.144 10.985 10.905 10.613 10.63 10.537 10.443 10.25 10.14 10.018 9.896 9.762 9.597 9.402 8.993 -8 ,30066 ,KEBNE ,17022819,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:04 CET,0.0 1.596 2.075 2.434 2.763 3.044 3.281 3.506 3.876 4.023 4.174 4.232 4.553 4.674 4.914 5.125 5.315 5.41 5.582 5.751 6.004 6.165 6.32 6.539 6.759 6.97 7.169 7.355 7.582 7.807 8.022 8.272 8.531 8.771 9.032 9.33 9.608 9.924 10.287 10.657 11.026 11.434 11.902 12.354 12.869 13.425 14.037 14.728 15.493 16.273 17.057 17.398 17.301 17.085 16.866 16.635 16.418 16.196 15.954 15.681 15.421 15.169 14.931 14.709 14.515 14.33 14.133 13.949 13.781 13.608 13.413 13.247 13.085 12.919 12.781 12.622 12.459 12.303 12.141 12.034 11.925 11.764 11.651 11.527 11.466 11.332 11.201 11.061 10.984 10.697 10.684 10.577 10.473 10.272 10.161 10.041 9.906 9.75 9.569 9.362 9.029 -9 ,12858 ,KEBNE ,17022820,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:14 CET,0.0 1.067 1.51 1.851 2.158 2.432 2.634 2.8 3.092 3.22 3.352 3.406 3.735 3.849 4.055 4.248 4.444 4.537 4.713 4.877 5.118 5.289 5.453 5.68 5.899 6.112 6.317 6.516 6.757 6.972 7.177 7.424 7.678 7.934 8.214 8.52 8.794 9.092 9.42 9.752 10.085 10.461 10.919 11.381 11.89 12.442 13.077 13.764 14.539 15.37 16.162 16.577 16.618 16.507 16.308 16.053 15.795 15.514 15.253 14.986 14.745 14.542 14.354 14.17 13.991 13.817 13.629 13.451 13.295 13.143 12.969 12.818 12.665 12.507 12.386 12.259 12.126 11.984 11.831 11.727 11.625 11.451 11.312 11.171 11.098 10.938 10.771 10.586 10.489 10.196 10.2 10.099 9.987 9.701 9.561 9.418 9.26 9.114 8.952 8.716 8.251 -10 ,31765 ,KEBNE ,17022821,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:08 CET,0.0 1.24 1.65 1.927 2.157 2.381 2.604 2.82 3.153 3.294 3.443 3.52 3.853 3.973 4.198 4.401 4.602 4.703 4.899 5.083 5.348 5.515 5.67 5.897 6.107 6.301 6.496 6.675 6.905 7.136 7.355 7.617 7.869 8.092 8.346 8.649 8.931 9.232 9.569 9.938 10.308 10.71 11.187 11.664 12.193 12.759 13.398 14.101 14.889 15.725 16.553 16.985 17.041 16.871 16.656 16.445 16.211 15.969 15.723 15.449 15.224 15.014 14.794 14.598 14.419 14.238 14.041 13.878 13.735 13.571 13.398 13.255 13.102 12.951 12.835 12.704 12.554 12.412 12.273 12.165 12.051 11.878 11.765 11.642 11.577 11.439 11.302 11.16 11.082 10.806 10.848 10.749 10.628 10.389 10.269 10.127 9.948 9.766 9.578 9.329 8.733 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_44.txt deleted file mode 100644 index 4602a8b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1170 ,KEBNE ,17022822,Wed Dec 22 06:53:28 CET,Wed Dec 22 08:15:12 CET,0.0 1.626 2.137 2.542 2.926 3.271 3.553 3.783 4.197 4.395 4.567 4.665 5.03 5.181 5.43 5.649 5.878 5.994 6.205 6.413 6.714 6.904 7.087 7.345 7.592 7.823 8.044 8.261 8.528 8.789 9.033 9.323 9.611 9.876 10.168 10.509 10.86 11.215 11.568 11.954 12.344 12.783 13.306 13.802 14.348 14.948 15.631 16.352 17.121 17.914 18.636 18.983 18.988 18.824 18.604 18.341 18.08 17.854 17.622 17.334 17.072 16.819 16.546 16.29 16.055 15.837 15.605 15.385 15.196 14.991 14.752 14.548 14.329 14.1 13.931 13.752 13.575 13.394 13.199 13.067 12.942 12.748 12.601 12.453 12.382 12.23 12.061 11.867 11.758 11.451 11.421 11.291 11.158 10.895 10.745 10.578 10.4 10.205 9.965 9.649 8.899 -2 ,25125 ,KEBNE ,17022823,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:18:36 CET,0.0 3.361 4.008 4.46 4.764 5.024 5.271 5.505 5.906 6.093 6.275 6.373 6.72 6.872 7.15 7.4 7.637 7.759 8.003 8.216 8.537 8.743 8.928 9.183 9.413 9.654 9.888 10.116 10.408 10.681 10.961 11.294 11.598 11.888 12.219 12.565 12.888 13.239 13.606 14.014 14.43 14.889 15.424 15.942 16.514 17.141 17.857 18.603 19.367 20.114 20.731 20.866 20.768 20.601 20.364 20.093 19.803 19.502 19.233 18.923 18.632 18.372 18.127 17.887 17.647 17.421 17.207 17.035 16.874 16.692 16.504 16.356 16.201 16.031 15.888 15.738 15.587 15.424 15.258 15.137 15.009 14.829 14.711 14.587 14.517 14.372 14.225 14.057 13.969 13.683 13.694 13.596 13.489 13.247 13.119 12.974 12.808 12.625 12.426 12.186 11.719 -3 ,20395 ,KEBNE ,17022824,Wed Dec 22 06:55:31 CET,Wed Dec 22 08:18:17 CET,0.0 2.1 2.629 3.046 3.404 3.729 4.018 4.247 4.666 4.856 5.035 5.154 5.499 5.64 5.913 6.18 6.436 6.55 6.762 6.975 7.282 7.478 7.661 7.938 8.205 8.449 8.687 8.897 9.162 9.428 9.691 10.012 10.306 10.568 10.863 11.198 11.509 11.875 12.271 12.652 13.057 13.53 14.05 14.539 15.091 15.673 16.328 17.047 17.824 18.582 19.279 19.59 19.579 19.43 19.194 18.901 18.571 18.261 17.989 17.696 17.438 17.192 16.948 16.707 16.468 16.232 15.976 15.768 15.604 15.426 15.225 15.056 14.887 14.707 14.57 14.444 14.306 14.15 13.991 13.876 13.739 13.508 13.368 13.239 13.165 13.007 12.851 12.681 12.591 12.282 12.184 12.029 11.858 11.514 11.363 11.218 11.069 10.891 10.678 10.4 9.839 -4 ,23478 ,KEBNE ,17022825,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:16:45 CET,0.0 1.589 2.006 2.35 2.669 2.94 3.175 3.389 3.787 3.948 4.101 4.187 4.525 4.661 4.928 5.181 5.428 5.548 5.754 5.954 6.242 6.416 6.594 6.854 7.123 7.387 7.623 7.859 8.143 8.41 8.674 8.975 9.251 9.509 9.816 10.162 10.476 10.821 11.214 11.623 12.029 12.466 12.97 13.476 14.056 14.657 15.303 15.999 16.749 17.542 18.251 18.574 18.583 18.438 18.196 17.915 17.648 17.373 17.118 16.855 16.605 16.374 16.141 15.903 15.677 15.478 15.259 15.05 14.867 14.683 14.495 14.334 14.171 14.001 13.866 13.722 13.575 13.434 13.278 13.162 13.037 12.845 12.72 12.596 12.53 12.385 12.231 12.064 11.978 11.686 11.686 11.595 11.491 11.218 11.078 10.944 10.783 10.601 10.386 10.114 9.672 -5 ,4652 ,KEBNE ,17022826,Wed Dec 22 06:55:33 CET,Wed Dec 22 08:17:13 CET,0.0 3.361 3.921 4.342 4.704 4.991 5.265 5.516 5.934 6.126 6.3 6.403 6.755 6.897 7.152 7.394 7.624 7.735 7.959 8.173 8.471 8.669 8.865 9.134 9.38 9.605 9.834 10.06 10.333 10.587 10.818 11.1 11.394 11.679 11.994 12.331 12.646 12.982 13.336 13.72 14.122 14.566 15.067 15.559 16.139 16.782 17.48 18.191 18.962 19.801 20.545 20.848 20.833 20.648 20.413 20.172 19.876 19.561 19.267 18.956 18.689 18.446 18.203 17.959 17.725 17.489 17.234 17.01 16.805 16.594 16.375 16.188 15.993 15.784 15.618 15.453 15.288 15.104 14.921 14.796 14.654 14.416 14.253 14.1 14.024 13.858 13.682 13.508 13.417 13.116 13.093 12.982 12.866 12.608 12.447 12.272 12.098 11.9 11.671 11.394 10.468 -6 ,23994 ,KEBNE ,17022827,Wed Dec 22 06:55:34 CET,Wed Dec 22 08:14:35 CET,0.0 2.019 2.671 3.077 3.395 3.687 3.965 4.192 4.557 4.735 4.915 5.044 5.396 5.547 5.849 6.104 6.347 6.458 6.67 6.879 7.165 7.346 7.519 7.764 7.999 8.232 8.457 8.682 8.967 9.234 9.499 9.801 10.064 10.321 10.624 10.954 11.277 11.613 11.966 12.363 12.778 13.248 13.79 14.289 14.841 15.434 16.088 16.818 17.601 18.392 19.168 19.478 19.45 19.293 19.08 18.834 18.559 18.273 18.002 17.721 17.471 17.242 17.001 16.729 16.462 16.237 16.01 15.798 15.619 15.423 15.197 15.007 14.821 14.64 14.51 14.367 14.213 14.059 13.89 13.764 13.618 13.408 13.26 13.088 12.998 12.802 12.603 12.414 12.321 12.027 12.02 11.912 11.789 11.507 11.344 11.165 10.967 10.731 10.433 9.992 8.95 -7 ,28382 ,KEBNE ,17022828,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:18:26 CET,0.0 2.319 2.881 3.316 3.675 3.952 4.223 4.469 4.884 5.061 5.236 5.36 5.714 5.849 6.117 6.381 6.619 6.73 6.945 7.165 7.453 7.625 7.804 8.079 8.352 8.599 8.825 9.038 9.306 9.562 9.802 10.085 10.371 10.647 10.952 11.292 11.613 11.978 12.349 12.736 13.137 13.555 14.062 14.587 15.156 15.756 16.411 17.071 17.808 18.601 19.412 19.82 19.766 19.576 19.358 19.09 18.805 18.507 18.24 17.972 17.727 17.493 17.216 16.96 16.744 16.531 16.295 16.069 15.887 15.709 15.514 15.351 15.183 15.007 14.866 14.711 14.554 14.396 14.227 14.111 13.987 13.786 13.649 13.506 13.43 13.272 13.112 12.944 12.859 12.579 12.58 12.469 12.365 12.126 11.983 11.837 11.686 11.514 11.325 11.069 10.626 -8 ,32021 ,KEBNE ,17022829,Wed Dec 22 06:55:33 CET,Wed Dec 22 08:16:45 CET,0.0 1.922 2.436 2.83 3.146 3.424 3.7 3.978 4.464 4.658 4.839 4.951 5.297 5.43 5.677 5.9 6.12 6.228 6.431 6.636 6.924 7.099 7.26 7.508 7.744 7.966 8.182 8.377 8.629 8.873 9.104 9.383 9.64 9.89 10.19 10.518 10.858 11.255 11.66 12.07 12.493 12.958 13.491 14.031 14.626 15.255 15.957 16.698 17.504 18.328 19.091 19.438 19.422 19.255 19.014 18.719 18.421 18.12 17.858 17.589 17.337 17.109 16.883 16.667 16.45 16.232 16.017 15.837 15.677 15.498 15.31 15.155 14.998 14.84 14.707 14.566 14.428 14.308 14.175 14.071 13.958 13.783 13.665 13.53 13.454 13.292 13.139 12.98 12.895 12.615 12.665 12.58 12.477 12.262 12.123 11.95 11.773 11.558 11.277 10.863 9.781 -9 ,30529 ,KEBNE ,17022830,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:16:50 CET,0.0 1.771 2.324 2.731 3.04 3.314 3.558 3.776 4.159 4.325 4.481 4.583 4.931 5.069 5.319 5.554 5.771 5.875 6.095 6.301 6.598 6.805 6.989 7.25 7.516 7.754 7.963 8.172 8.461 8.736 8.98 9.256 9.526 9.804 10.133 10.477 10.799 11.145 11.501 11.909 12.327 12.748 13.245 13.729 14.263 14.833 15.474 16.166 16.935 17.71 18.435 18.805 18.796 18.603 18.336 18.037 17.739 17.454 17.155 16.836 16.582 16.331 16.077 15.847 15.638 15.434 15.204 14.979 14.767 14.567 14.384 14.23 14.058 13.867 13.715 13.565 13.412 13.248 13.09 12.978 12.851 12.652 12.521 12.393 12.322 12.17 12.012 11.827 11.732 11.437 11.412 11.299 11.183 10.918 10.758 10.59 10.433 10.24 9.981 9.681 8.774 -10 ,17736 ,KEBNE ,17022831,Wed Dec 22 06:55:33 CET,Wed Dec 22 08:18:33 CET,0.0 2.452 3.1 3.56 3.933 4.212 4.448 4.683 5.096 5.313 5.533 5.744 6.115 6.252 6.51 6.736 6.947 7.048 7.26 7.482 7.789 7.98 8.17 8.421 8.638 8.856 9.069 9.267 9.528 9.791 10.033 10.317 10.589 10.827 11.114 11.448 11.745 12.076 12.47 12.894 13.323 13.782 14.275 14.759 15.303 15.903 16.591 17.303 18.085 18.921 19.676 20.024 20.042 19.888 19.62 19.332 19.028 18.71 18.44 18.151 17.871 17.609 17.348 17.094 16.849 16.628 16.401 16.189 15.989 15.775 15.574 15.408 15.227 15.047 14.904 14.75 14.6 14.447 14.278 14.155 14.031 13.851 13.724 13.581 13.506 13.345 13.175 12.993 12.896 12.607 12.628 12.524 12.399 12.143 12.023 11.875 11.717 11.561 11.406 11.251 10.767 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_45.txt deleted file mode 100644 index cb03200c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_45.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24721 ,KEBNE ,17022832,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:19:05 CET,0.0 2.493 3.087 3.468 3.766 4.059 4.317 4.543 4.914 5.068 5.22 5.292 5.638 5.784 6.044 6.268 6.47 6.569 6.765 6.943 7.199 7.354 7.505 7.739 7.945 8.136 8.316 8.489 8.71 8.91 9.103 9.339 9.558 9.762 10.007 10.277 10.502 10.742 11.0 11.264 11.534 11.847 12.172 12.441 12.777 13.162 13.59 13.993 14.31 14.518 14.474 14.106 13.592 13.063 12.596 12.137 11.706 11.287 10.908 10.519 10.174 9.844 9.517 9.208 8.93 8.687 8.436 8.204 8.006 7.81 7.594 7.409 7.224 7.034 6.875 6.709 6.54 6.371 6.198 6.076 5.946 5.733 5.59 5.446 5.366 5.198 5.033 4.86 4.774 4.476 4.494 4.39 4.271 4.018 3.896 3.772 3.635 3.477 3.286 3.061 2.439 -2 ,14148 ,KEBNE ,17022833,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:17:23 CET,0.0 2.385 3.027 3.411 3.702 3.95 4.194 4.424 4.817 4.996 5.147 5.216 5.557 5.692 5.949 6.169 6.363 6.456 6.648 6.823 7.07 7.229 7.375 7.585 7.797 8.004 8.196 8.365 8.571 8.766 8.952 9.163 9.372 9.586 9.814 10.063 10.29 10.532 10.819 11.1 11.354 11.648 11.992 12.348 12.741 13.085 13.434 13.809 14.131 14.311 14.248 13.847 13.348 12.804 12.263 11.772 11.352 10.943 10.56 10.157 9.815 9.483 9.161 8.867 8.578 8.333 8.079 7.829 7.615 7.39 7.145 6.956 6.781 6.579 6.421 6.263 6.088 5.922 5.747 5.613 5.478 5.254 5.09 4.931 4.85 4.669 4.485 4.318 4.237 3.943 3.966 3.854 3.735 3.533 3.416 3.284 3.133 2.957 2.738 2.485 1.873 -3 ,2347 ,KEBNE ,17022834,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:18:54 CET,0.0 1.922 2.497 2.964 3.332 3.611 3.821 4.006 4.354 4.519 4.671 4.74 5.088 5.227 5.45 5.633 5.818 5.921 6.125 6.304 6.547 6.704 6.857 7.072 7.275 7.469 7.643 7.806 8.012 8.218 8.42 8.66 8.893 9.097 9.332 9.602 9.84 10.094 10.363 10.648 10.938 11.242 11.585 11.916 12.297 12.686 13.05 13.393 13.724 13.982 14.002 13.606 13.101 12.571 12.044 11.551 11.108 10.677 10.283 9.893 9.56 9.272 9.008 8.761 8.513 8.273 8.03 7.824 7.634 7.432 7.218 7.034 6.859 6.668 6.509 6.35 6.192 6.03 5.865 5.751 5.62 5.419 5.29 5.159 5.091 4.937 4.768 4.596 4.503 4.196 4.212 4.11 4.003 3.773 3.651 3.531 3.399 3.233 3.033 2.774 2.233 -4 ,15571 ,KEBNE ,17022835,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:18:56 CET,0.0 2.473 3.051 3.423 3.717 3.965 4.181 4.4 4.811 4.97 5.106 5.173 5.518 5.647 5.878 6.099 6.31 6.405 6.587 6.766 7.013 7.169 7.32 7.535 7.741 7.937 8.118 8.284 8.502 8.729 8.931 9.157 9.373 9.578 9.806 10.053 10.298 10.546 10.803 11.074 11.355 11.642 11.961 12.285 12.654 13.026 13.388 13.772 14.148 14.409 14.395 13.973 13.461 12.941 12.464 11.973 11.505 11.092 10.718 10.323 9.979 9.688 9.4 9.127 8.884 8.66 8.423 8.205 8.012 7.81 7.588 7.392 7.199 7.005 6.853 6.705 6.544 6.38 6.222 6.098 5.959 5.735 5.576 5.415 5.331 5.151 4.966 4.774 4.67 4.347 4.345 4.244 4.123 3.875 3.75 3.617 3.457 3.277 3.071 2.797 2.291 -5 ,16872 ,KEBNE ,17022836,Wed Dec 22 06:55:36 CET,Wed Dec 22 08:17:50 CET,0.0 2.209 2.778 3.156 3.441 3.68 3.889 4.072 4.418 4.583 4.742 4.795 5.119 5.24 5.473 5.696 5.904 6.001 6.187 6.352 6.599 6.762 6.925 7.149 7.343 7.536 7.725 7.911 8.146 8.351 8.535 8.762 8.976 9.178 9.425 9.681 9.914 10.175 10.455 10.746 11.033 11.347 11.703 12.026 12.376 12.765 13.156 13.514 13.83 14.099 14.155 13.787 13.314 12.814 12.307 11.817 11.358 10.945 10.589 10.19 9.843 9.513 9.213 8.98 8.764 8.563 8.354 8.168 7.996 7.817 7.64 7.494 7.349 7.195 7.076 6.943 6.797 6.649 6.501 6.394 6.281 6.116 6.002 5.885 5.824 5.705 5.578 5.428 5.351 5.056 5.095 5.015 4.931 4.751 4.659 4.544 4.416 4.282 4.132 3.927 3.473 -6 ,21535 ,KEBNE ,17022837,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:19:09 CET,0.0 1.833 2.329 2.702 2.992 3.256 3.486 3.669 4.002 4.158 4.309 4.397 4.724 4.838 5.061 5.245 5.418 5.509 5.691 5.879 6.147 6.306 6.448 6.651 6.841 7.028 7.215 7.385 7.594 7.795 7.998 8.244 8.467 8.67 8.915 9.168 9.384 9.629 9.913 10.199 10.476 10.792 11.141 11.462 11.817 12.156 12.515 12.907 13.243 13.428 13.323 12.941 12.459 11.953 11.457 10.945 10.501 10.099 9.725 9.349 9.0 8.666 8.363 8.075 7.798 7.55 7.292 7.055 6.848 6.632 6.406 6.219 6.029 5.837 5.686 5.533 5.38 5.21 5.029 4.906 4.778 4.583 4.451 4.318 4.247 4.078 3.917 3.749 3.654 3.355 3.388 3.288 3.187 2.936 2.793 2.652 2.504 2.348 2.18 1.958 1.384 -7 ,11232 ,KEBNE ,17022838,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:17:34 CET,0.0 2.213 2.841 3.377 3.772 4.062 4.309 4.532 4.921 5.081 5.24 5.346 5.689 5.823 6.067 6.287 6.496 6.588 6.756 6.935 7.196 7.342 7.476 7.679 7.868 8.054 8.24 8.41 8.624 8.816 8.994 9.217 9.425 9.632 9.88 10.151 10.399 10.65 10.921 11.21 11.483 11.761 12.078 12.407 12.755 13.123 13.505 13.84 14.171 14.386 14.327 13.935 13.412 12.882 12.358 11.848 11.413 10.988 10.578 10.115 9.709 9.391 9.101 8.804 8.527 8.277 8.014 7.788 7.599 7.396 7.173 6.987 6.799 6.601 6.447 6.288 6.134 5.981 5.812 5.691 5.561 5.361 5.222 5.079 5.004 4.839 4.668 4.498 4.409 4.112 4.116 4.01 3.908 3.683 3.55 3.404 3.26 3.097 2.907 2.661 2.136 -8 ,21685 ,KEBNE ,17022839,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:18:52 CET,0.0 1.991 2.583 2.995 3.242 3.468 3.702 3.907 4.246 4.391 4.526 4.573 4.91 5.045 5.311 5.547 5.775 5.877 6.046 6.202 6.445 6.603 6.748 6.956 7.141 7.319 7.501 7.67 7.884 8.088 8.289 8.535 8.751 8.948 9.165 9.404 9.642 9.893 10.14 10.411 10.701 10.997 11.345 11.683 12.019 12.376 12.754 13.103 13.443 13.695 13.707 13.347 12.852 12.345 11.862 11.393 10.939 10.487 10.094 9.717 9.387 9.081 8.783 8.501 8.232 7.987 7.712 7.456 7.237 7.012 6.789 6.59 6.387 6.206 6.063 5.904 5.74 5.579 5.404 5.284 5.164 4.948 4.793 4.641 4.57 4.429 4.267 4.088 3.994 3.686 3.687 3.588 3.485 3.249 3.118 2.969 2.802 2.602 2.391 2.145 1.676 -9 ,6555 ,KEBNE ,17022840,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:17:56 CET,0.0 1.795 2.36 2.801 3.13 3.394 3.645 3.859 4.23 4.398 4.556 4.637 4.978 5.111 5.349 5.565 5.778 5.877 6.052 6.218 6.46 6.603 6.743 6.956 7.162 7.378 7.583 7.757 7.977 8.215 8.437 8.678 8.899 9.096 9.321 9.569 9.816 10.083 10.353 10.622 10.881 11.176 11.542 11.865 12.191 12.547 12.921 13.33 13.746 14.062 14.121 13.748 13.253 12.733 12.233 11.746 11.291 10.859 10.47 10.076 9.744 9.44 9.148 8.859 8.574 8.326 8.077 7.857 7.673 7.473 7.256 7.084 6.907 6.722 6.567 6.399 6.239 6.075 5.893 5.761 5.629 5.43 5.292 5.146 5.068 4.908 4.744 4.572 4.477 4.169 4.181 4.076 3.962 3.695 3.556 3.413 3.263 3.105 2.899 2.63 2.142 -10 ,8228 ,KEBNE ,17022841,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:18:50 CET,0.0 1.968 2.59 3.004 3.302 3.588 3.847 4.057 4.411 4.575 4.733 4.827 5.172 5.297 5.52 5.742 5.955 6.053 6.236 6.406 6.661 6.816 6.969 7.206 7.434 7.644 7.823 7.988 8.187 8.386 8.581 8.815 9.042 9.241 9.456 9.708 9.942 10.19 10.448 10.705 10.977 11.266 11.591 11.935 12.312 12.652 12.993 13.343 13.668 13.91 13.999 13.715 13.19 12.608 12.076 11.567 11.093 10.661 10.272 9.855 9.474 9.144 8.85 8.604 8.392 8.186 7.987 7.82 7.674 7.517 7.349 7.213 7.062 6.905 6.793 6.667 6.517 6.367 6.222 6.123 6.017 5.845 5.726 5.612 5.554 5.431 5.303 5.162 5.094 4.821 4.869 4.787 4.713 4.535 4.436 4.334 4.209 4.071 3.942 3.79 3.526 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_48.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_48.txt deleted file mode 100644 index 58324382..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_28_48.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25330 ,KEBNE ,17022842,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:18:14 CET,0.0 2.229 2.829 3.287 3.646 3.929 4.18 4.398 4.787 4.965 5.118 5.206 5.556 5.689 5.959 6.225 6.46 6.573 6.784 6.978 7.254 7.43 7.608 7.867 8.11 8.337 8.549 8.754 9.009 9.259 9.511 9.803 10.068 10.32 10.619 10.94 11.239 11.567 11.91 12.26 12.626 13.042 13.477 13.894 14.408 14.969 15.569 16.184 16.826 17.453 17.944 17.973 17.724 17.367 16.949 16.553 16.194 15.81 15.446 15.087 14.768 14.456 14.146 13.855 13.591 13.344 13.067 12.834 12.646 12.459 12.269 12.101 11.927 11.736 11.588 11.439 11.277 11.105 10.905 10.759 10.616 10.389 10.227 10.052 9.959 9.768 9.566 9.344 9.221 8.892 8.833 8.673 8.51 8.147 7.927 7.66 7.334 6.997 6.62 6.13 4.196 -2 ,719 ,KEBNE ,17022843,Wed Dec 22 06:55:33 CET,Wed Dec 22 08:16:46 CET,0.0 1.49 1.931 2.292 2.563 2.819 3.057 3.271 3.664 3.839 4.003 4.089 4.425 4.558 4.813 5.052 5.271 5.371 5.558 5.748 6.029 6.212 6.39 6.63 6.851 7.066 7.271 7.476 7.732 7.967 8.194 8.478 8.76 9.014 9.281 9.581 9.891 10.222 10.559 10.9 11.268 11.694 12.159 12.612 13.122 13.646 14.237 14.911 15.584 16.137 16.587 16.688 16.473 16.145 15.755 15.358 14.978 14.604 14.265 13.903 13.588 13.298 13.009 12.735 12.48 12.247 12.0 11.767 11.575 11.388 11.194 11.021 10.82 10.604 10.421 10.223 10.025 9.818 9.597 9.453 9.322 9.133 8.996 8.825 8.735 8.556 8.369 8.163 8.046 7.693 7.599 7.436 7.274 6.941 6.735 6.502 6.254 5.995 5.686 5.288 3.969 -3 ,25056 ,KEBNE ,17022844,Wed Dec 22 06:55:31 CET,Wed Dec 22 08:18:11 CET,0.0 1.795 2.353 2.769 3.128 3.398 3.625 3.833 4.228 4.419 4.586 4.676 5.019 5.152 5.406 5.653 5.887 5.995 6.201 6.406 6.687 6.858 7.017 7.243 7.468 7.682 7.88 8.073 8.321 8.557 8.782 9.061 9.33 9.569 9.831 10.129 10.424 10.752 11.101 11.478 11.85 12.242 12.682 13.1 13.576 14.126 14.776 15.443 16.101 16.743 17.304 17.466 17.278 16.942 16.556 16.156 15.769 15.43 15.119 14.775 14.463 14.163 13.867 13.575 13.299 13.054 12.793 12.55 12.334 12.098 11.854 11.66 11.459 11.241 11.056 10.845 10.622 10.408 10.2 10.052 9.893 9.644 9.471 9.295 9.21 9.035 8.837 8.623 8.51 8.179 8.073 7.907 7.747 7.397 7.201 6.975 6.729 6.473 6.129 5.627 3.656 -4 ,26805 ,KEBNE ,17022845,Wed Dec 22 06:55:33 CET,Wed Dec 22 08:17:01 CET,0.0 1.784 2.315 2.705 3.042 3.342 3.612 3.869 4.31 4.49 4.674 4.812 5.167 5.314 5.579 5.838 6.092 6.203 6.41 6.612 6.907 7.09 7.258 7.509 7.752 7.98 8.192 8.391 8.659 8.906 9.135 9.404 9.653 9.898 10.178 10.488 10.784 11.113 11.462 11.82 12.199 12.631 13.125 13.587 14.104 14.669 15.278 15.876 16.538 17.202 17.749 17.858 17.61 17.286 16.916 16.524 16.146 15.789 15.45 15.078 14.769 14.485 14.188 13.909 13.641 13.373 13.091 12.862 12.653 12.414 12.183 11.995 11.797 11.605 11.462 11.304 11.124 10.931 10.717 10.567 10.402 10.156 9.988 9.805 9.706 9.499 9.298 9.068 8.943 8.62 8.583 8.44 8.271 7.929 7.755 7.548 7.319 7.072 6.763 6.366 5.262 -5 ,25184 ,KEBNE ,17022846,Wed Dec 22 06:55:33 CET,Wed Dec 22 08:16:47 CET,0.0 1.976 2.583 2.999 3.291 3.525 3.751 3.984 4.416 4.621 4.808 4.94 5.316 5.477 5.766 6.031 6.276 6.398 6.639 6.852 7.13 7.302 7.455 7.676 7.896 8.107 8.323 8.531 8.793 9.045 9.283 9.578 9.858 10.108 10.395 10.727 11.049 11.388 11.731 12.089 12.466 12.892 13.381 13.848 14.376 14.938 15.534 16.145 16.806 17.458 17.933 18.055 17.878 17.541 17.149 16.763 16.394 16.017 15.68 15.326 15.0 14.697 14.397 14.113 13.853 13.611 13.343 13.097 12.889 12.678 12.453 12.269 12.072 11.871 11.706 11.528 11.352 11.131 10.887 10.734 10.571 10.304 10.128 9.941 9.839 9.618 9.397 9.176 9.065 8.745 8.7 8.573 8.431 8.088 7.901 7.702 7.489 7.232 6.907 6.498 5.001 -6 ,2170 ,KEBNE ,17022847,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:18:34 CET,0.0 1.798 2.402 2.798 3.161 3.467 3.699 3.942 4.397 4.588 4.77 4.925 5.293 5.439 5.718 5.995 6.257 6.376 6.595 6.815 7.135 7.323 7.495 7.757 8.005 8.25 8.489 8.708 8.981 9.245 9.497 9.781 10.048 10.309 10.621 10.953 11.262 11.617 11.984 12.336 12.688 13.094 13.581 14.063 14.566 15.081 15.645 16.239 16.919 17.574 18.004 18.055 17.825 17.471 17.105 16.703 16.314 15.941 15.596 15.233 14.885 14.563 14.275 14.018 13.779 13.556 13.325 13.116 12.926 12.717 12.497 12.318 12.116 11.9 11.738 11.567 11.378 11.164 10.936 10.788 10.634 10.38 10.202 10.021 9.93 9.745 9.554 9.35 9.245 8.928 8.864 8.724 8.571 8.208 7.985 7.746 7.49 7.177 6.844 6.427 4.836 -7 ,8931 ,KEBNE ,17022848,Wed Dec 22 06:55:33 CET,Wed Dec 22 08:18:37 CET,0.0 1.721 2.322 2.71 3.008 3.287 3.566 3.822 4.24 4.417 4.588 4.676 5.015 5.145 5.391 5.629 5.847 5.948 6.134 6.316 6.594 6.77 6.932 7.165 7.386 7.598 7.804 7.999 8.237 8.454 8.671 8.936 9.207 9.481 9.769 10.064 10.352 10.65 10.96 11.31 11.674 12.064 12.51 12.952 13.433 13.926 14.473 15.033 15.644 16.308 16.837 16.93 16.777 16.511 16.189 15.843 15.47 15.073 14.751 14.439 14.147 13.886 13.624 13.345 13.097 12.887 12.66 12.454 12.258 12.054 11.857 11.686 11.509 11.329 11.176 11.013 10.832 10.634 10.444 10.314 10.185 9.99 9.839 9.677 9.592 9.401 9.186 8.952 8.835 8.512 8.473 8.342 8.216 7.956 7.804 7.611 7.361 7.071 6.768 6.305 4.851 -8 ,1151 ,KEBNE ,17022849,Wed Dec 22 06:55:36 CET,Wed Dec 22 08:17:04 CET,0.0 2.178 2.787 3.142 3.438 3.697 3.875 4.049 4.394 4.548 4.705 4.799 5.126 5.233 5.464 5.692 5.887 5.989 6.197 6.393 6.678 6.855 7.023 7.258 7.468 7.676 7.881 8.067 8.309 8.546 8.768 9.048 9.316 9.573 9.871 10.181 10.473 10.793 11.132 11.5 11.883 12.288 12.751 13.212 13.727 14.312 14.944 15.613 16.346 16.973 17.454 17.498 17.277 16.966 16.598 16.229 15.843 15.451 15.079 14.685 14.346 14.016 13.715 13.446 13.171 12.898 12.628 12.384 12.145 11.898 11.632 11.404 11.18 10.958 10.784 10.597 10.406 10.203 9.982 9.827 9.67 9.421 9.243 9.056 8.961 8.778 8.582 8.346 8.212 7.882 7.854 7.737 7.612 7.353 7.19 6.986 6.752 6.478 6.095 5.545 4.085 -9 ,19822 ,KEBNE ,17022850,Wed Dec 22 06:55:33 CET,Wed Dec 22 08:17:04 CET,0.0 1.94 2.344 2.654 2.951 3.192 3.404 3.592 3.961 4.146 4.304 4.355 4.68 4.794 5.01 5.217 5.408 5.497 5.676 5.854 6.116 6.279 6.433 6.672 6.909 7.134 7.337 7.527 7.78 8.003 8.213 8.481 8.747 8.996 9.272 9.6 9.914 10.246 10.603 10.967 11.345 11.755 12.257 12.752 13.264 13.788 14.356 14.969 15.616 16.266 16.82 16.909 16.703 16.421 16.093 15.776 15.498 15.195 14.896 14.599 14.315 14.044 13.794 13.556 13.331 13.116 12.888 12.665 12.468 12.271 12.06 11.876 11.684 11.494 11.347 11.198 11.043 10.877 10.696 10.57 10.439 10.227 10.068 9.889 9.809 9.659 9.482 9.282 9.17 8.85 8.831 8.696 8.556 8.267 8.108 7.913 7.693 7.472 7.197 6.766 4.936 -10 ,29380 ,KEBNE ,17022851,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:16:50 CET,0.0 1.612 2.149 2.557 2.917 3.193 3.458 3.694 4.112 4.304 4.489 4.628 4.993 5.155 5.455 5.724 5.972 6.085 6.307 6.513 6.794 6.972 7.142 7.375 7.597 7.816 8.019 8.227 8.491 8.721 8.935 9.198 9.472 9.734 10.021 10.346 10.65 10.965 11.298 11.651 12.016 12.418 12.872 13.314 13.825 14.379 14.98 15.636 16.329 16.945 17.413 17.488 17.27 16.956 16.58 16.174 15.816 15.473 15.126 14.769 14.438 14.135 13.865 13.589 13.305 13.059 12.83 12.605 12.401 12.186 11.948 11.743 11.517 11.295 11.126 10.941 10.754 10.561 10.349 10.204 10.06 9.831 9.668 9.5 9.414 9.233 9.038 8.821 8.71 8.392 8.337 8.192 8.034 7.686 7.51 7.31 7.084 6.846 6.559 6.199 4.862 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_29_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_29_42.txt deleted file mode 100644 index e69182ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_29_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,874 ,KEBNE ,17022852,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:18:47 CET,0.0 2.851 3.432 3.859 4.192 4.443 4.648 4.83 5.165 5.316 5.467 5.567 5.88 6.006 6.233 6.432 6.635 6.732 6.912 7.1 7.361 7.512 7.668 7.904 8.114 8.295 8.454 8.617 8.843 9.059 9.251 9.48 9.712 9.924 10.146 10.376 10.586 10.796 11.003 11.222 11.458 11.729 12.048 12.336 12.571 12.797 13.01 13.103 13.058 12.733 11.851 10.535 9.346 8.287 7.298 6.35 5.511 4.754 4.116 3.461 2.891 2.405 1.927 1.477 1.067 0.685 0.279 -0.092 -0.411 -0.744 -1.097 -1.383 -1.661 -1.961 -2.201 -2.444 -2.695 -2.962 -3.245 -3.44 -3.639 -3.939 -4.15 -4.372 -4.481 -4.709 -4.945 -5.2 -5.351 -5.706 -5.812 -5.977 -6.156 -6.534 -6.771 -7.042 -7.323 -7.648 -8.047 -8.608 -10.731 -2 ,30242 ,KEBNE ,17022853,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:18:57 CET,0.0 1.843 2.379 2.774 3.062 3.299 3.5 3.705 4.079 4.242 4.392 4.477 4.775 4.877 5.074 5.283 5.48 5.557 5.703 5.86 6.101 6.258 6.404 6.601 6.799 6.981 7.14 7.308 7.511 7.687 7.863 8.083 8.289 8.472 8.675 8.921 9.172 9.415 9.64 9.875 10.116 10.349 10.59 10.851 11.108 11.276 11.395 11.449 11.402 11.141 10.34 9.016 7.76 6.637 5.632 4.712 3.895 3.19 2.608 2.006 1.457 0.955 0.48 0.024 -0.421 -0.812 -1.2 -1.552 -1.852 -2.164 -2.5 -2.774 -3.06 -3.363 -3.6 -3.844 -4.093 -4.345 -4.607 -4.793 -4.983 -5.286 -5.51 -5.738 -5.847 -6.068 -6.32 -6.604 -6.749 -7.102 -7.241 -7.42 -7.609 -7.995 -8.205 -8.427 -8.683 -8.962 -9.296 -9.784 -11.206 -3 ,27441 ,KEBNE ,17022854,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:19:32 CET,0.0 2.542 3.07 3.445 3.759 3.994 4.207 4.405 4.731 4.879 5.018 5.096 5.416 5.541 5.764 5.948 6.133 6.23 6.406 6.573 6.802 6.941 7.074 7.273 7.471 7.67 7.855 8.022 8.23 8.427 8.585 8.765 8.964 9.146 9.349 9.566 9.767 9.997 10.244 10.504 10.765 11.006 11.266 11.499 11.698 11.891 12.095 12.226 12.195 11.902 11.014 9.643 8.388 7.277 6.303 5.417 4.631 3.893 3.267 2.641 2.077 1.586 1.146 0.728 0.314 -0.067 -0.459 -0.813 -1.118 -1.449 -1.801 -2.099 -2.404 -2.715 -2.972 -3.239 -3.501 -3.775 -4.056 -4.249 -4.444 -4.722 -4.92 -5.148 -5.272 -5.518 -5.756 -6.011 -6.153 -6.495 -6.602 -6.766 -6.938 -7.354 -7.587 -7.839 -8.114 -8.42 -8.772 -9.266 -10.963 -4 ,16395 ,KEBNE ,17022855,Wed Dec 22 06:55:33 CET,Wed Dec 22 08:17:14 CET,0.0 2.501 3.003 3.39 3.714 3.973 4.176 4.364 4.71 4.864 5.008 5.1 5.418 5.534 5.74 5.928 6.106 6.201 6.388 6.555 6.789 6.952 7.097 7.286 7.473 7.654 7.831 8.011 8.244 8.447 8.615 8.816 9.008 9.185 9.406 9.66 9.883 10.098 10.315 10.571 10.837 11.084 11.321 11.532 11.762 12.003 12.208 12.26 12.155 11.859 11.046 9.677 8.31 7.107 6.087 5.164 4.386 3.691 3.072 2.452 1.914 1.435 0.991 0.57 0.174 -0.206 -0.625 -0.994 -1.296 -1.599 -1.935 -2.23 -2.519 -2.812 -3.046 -3.288 -3.533 -3.792 -4.074 -4.274 -4.472 -4.807 -5.061 -5.31 -5.434 -5.699 -5.974 -6.267 -6.426 -6.787 -6.935 -7.124 -7.315 -7.73 -7.956 -8.188 -8.45 -8.747 -9.037 -9.44 -10.542 -5 ,12700 ,KEBNE ,17022856,Wed Dec 22 06:55:32 CET,Wed Dec 22 08:17:12 CET,0.0 1.526 2.071 2.451 2.747 2.99 3.211 3.424 3.798 3.964 4.122 4.196 4.497 4.616 4.845 5.06 5.252 5.341 5.523 5.691 5.908 6.048 6.191 6.396 6.591 6.782 6.955 7.111 7.325 7.525 7.717 7.947 8.136 8.304 8.485 8.689 8.899 9.121 9.366 9.612 9.842 10.105 10.383 10.656 10.942 11.143 11.305 11.419 11.333 10.907 9.963 8.604 7.31 6.161 5.191 4.317 3.532 2.805 2.124 1.45 0.912 0.421 -0.06 -0.524 -0.941 -1.298 -1.667 -2.004 -2.294 -2.595 -2.911 -3.179 -3.461 -3.748 -3.972 -4.214 -4.467 -4.711 -4.962 -5.133 -5.318 -5.634 -5.85 -6.084 -6.207 -6.448 -6.719 -7.006 -7.141 -7.477 -7.559 -7.71 -7.88 -8.271 -8.497 -8.753 -9.022 -9.3 -9.672 -10.245 -12.155 -6 ,18955 ,KEBNE ,17022857,Wed Dec 22 06:55:33 CET,Wed Dec 22 08:17:05 CET,0.0 1.328 1.819 2.213 2.523 2.776 2.981 3.18 3.572 3.733 3.879 3.962 4.272 4.401 4.657 4.883 5.083 5.18 5.356 5.525 5.778 5.939 6.097 6.312 6.507 6.694 6.875 7.041 7.246 7.443 7.615 7.821 8.033 8.232 8.455 8.715 8.947 9.16 9.388 9.655 9.931 10.212 10.523 10.799 11.028 11.196 11.357 11.437 11.406 11.208 10.388 9.07 7.874 6.751 5.746 4.823 3.994 3.278 2.679 2.082 1.553 1.049 0.549 0.103 -0.278 -0.632 -1.024 -1.356 -1.641 -1.957 -2.296 -2.582 -2.867 -3.181 -3.423 -3.658 -3.897 -4.151 -4.424 -4.606 -4.785 -5.075 -5.283 -5.49 -5.592 -5.807 -6.062 -6.336 -6.472 -6.81 -6.917 -7.077 -7.25 -7.69 -7.923 -8.173 -8.432 -8.74 -9.114 -9.518 -11.42 -7 ,31089 ,KEBNE ,17022858,Wed Dec 22 06:56:33 CET,Wed Dec 22 08:20:34 CET,0.0 1.388 1.887 2.281 2.555 2.799 3.011 3.185 3.506 3.66 3.812 3.908 4.224 4.348 4.561 4.754 4.928 5.022 5.218 5.405 5.658 5.804 5.939 6.142 6.333 6.507 6.683 6.852 7.054 7.231 7.399 7.594 7.782 7.979 8.202 8.434 8.654 8.882 9.082 9.296 9.533 9.757 9.995 10.218 10.416 10.6 10.761 10.854 10.839 10.532 9.661 8.299 6.982 5.794 4.73 3.768 2.952 2.238 1.58 0.896 0.345 -0.142 -0.624 -1.067 -1.484 -1.875 -2.277 -2.627 -2.929 -3.238 -3.556 -3.835 -4.118 -4.416 -4.667 -4.925 -5.182 -5.462 -5.756 -5.949 -6.14 -6.42 -6.61 -6.811 -6.924 -7.177 -7.434 -7.72 -7.866 -8.195 -8.304 -8.481 -8.666 -9.061 -9.29 -9.568 -9.857 -10.192 -10.641 -11.155 -12.441 -8 ,8178 ,KEBNE ,17022859,Wed Dec 22 06:56:33 CET,Wed Dec 22 08:19:32 CET,0.0 1.625 2.078 2.394 2.681 2.937 3.184 3.432 3.833 3.998 4.149 4.245 4.558 4.678 4.895 5.116 5.32 5.415 5.604 5.781 6.042 6.195 6.338 6.545 6.735 6.93 7.111 7.282 7.494 7.695 7.878 8.08 8.286 8.496 8.737 8.998 9.25 9.502 9.742 9.996 10.225 10.482 10.783 11.037 11.301 11.55 11.773 11.903 11.886 11.683 10.868 9.372 8.118 7.019 5.993 5.044 4.212 3.46 2.82 2.18 1.613 1.122 0.66 0.227 -0.167 -0.531 -0.929 -1.287 -1.611 -1.953 -2.289 -2.562 -2.843 -3.144 -3.372 -3.604 -3.85 -4.105 -4.375 -4.548 -4.724 -5.016 -5.24 -5.479 -5.592 -5.825 -6.079 -6.357 -6.496 -6.827 -6.899 -7.054 -7.22 -7.579 -7.795 -8.025 -8.245 -8.503 -8.832 -9.246 -10.254 -9 ,11325 ,KEBNE ,17022860,Wed Dec 22 06:56:33 CET,Wed Dec 22 08:19:22 CET,0.0 2.004 2.558 2.964 3.274 3.501 3.699 3.893 4.246 4.414 4.564 4.626 4.926 5.055 5.307 5.522 5.717 5.815 5.995 6.157 6.383 6.535 6.69 6.901 7.098 7.287 7.463 7.63 7.862 8.085 8.272 8.472 8.678 8.893 9.122 9.358 9.598 9.846 10.076 10.333 10.61 10.879 11.138 11.375 11.635 11.897 12.101 12.207 12.213 11.936 11.076 9.696 8.364 7.152 6.102 5.149 4.317 3.574 2.907 2.258 1.724 1.247 0.777 0.327 -0.078 -0.454 -0.846 -1.2 -1.514 -1.83 -2.158 -2.445 -2.745 -3.063 -3.312 -3.552 -3.808 -4.085 -4.359 -4.553 -4.751 -5.048 -5.262 -5.488 -5.608 -5.862 -6.131 -6.413 -6.559 -6.902 -7.01 -7.174 -7.347 -7.701 -7.905 -8.133 -8.363 -8.643 -9.009 -9.462 -10.739 -10 ,9417 ,KEBNE ,17022861,Wed Dec 22 06:56:33 CET,Wed Dec 22 08:17:52 CET,0.0 2.155 2.686 3.042 3.329 3.614 3.85 4.042 4.378 4.521 4.645 4.709 5.018 5.134 5.363 5.582 5.764 5.854 6.041 6.211 6.454 6.615 6.766 6.968 7.156 7.33 7.504 7.674 7.89 8.095 8.28 8.486 8.682 8.872 9.087 9.34 9.565 9.78 10.024 10.275 10.487 10.704 10.978 11.203 11.43 11.659 11.831 11.912 11.759 11.262 10.202 8.73 7.413 6.249 5.257 4.346 3.519 2.805 2.189 1.551 0.995 0.508 0.04 -0.412 -0.817 -1.19 -1.592 -1.939 -2.239 -2.557 -2.898 -3.181 -3.457 -3.755 -4.002 -4.259 -4.522 -4.806 -5.096 -5.296 -5.483 -5.744 -5.957 -6.184 -6.283 -6.488 -6.736 -7.014 -7.148 -7.483 -7.606 -7.77 -7.933 -8.268 -8.468 -8.713 -8.97 -9.275 -9.633 -10.147 -11.759 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_30_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_30_31.txt deleted file mode 100644 index 122b6660..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_30_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5236 ,KEBNE ,17022862,Wed Dec 22 06:56:33 CET,Wed Dec 22 08:19:05 CET,0.0 1.058 1.456 1.729 1.965 2.16 2.33 2.483 2.784 2.935 3.068 3.081 3.385 3.479 3.663 3.852 4.027 4.105 4.25 4.391 4.598 4.738 4.884 5.086 5.274 5.444 5.605 5.765 5.957 6.139 6.326 6.547 6.755 6.959 7.195 7.459 7.701 7.955 8.224 8.504 8.798 9.134 9.513 9.902 10.34 10.749 11.184 11.662 12.147 12.586 12.957 13.03 12.824 12.555 12.277 11.979 11.684 11.412 11.174 10.917 10.683 10.474 10.267 10.064 9.874 9.707 9.527 9.359 9.22 9.073 8.916 8.788 8.649 8.493 8.372 8.259 8.14 8.005 7.871 7.776 7.681 7.546 7.442 7.331 7.28 7.17 7.048 6.934 6.871 6.603 6.684 6.617 6.536 6.356 6.262 6.163 6.054 5.922 5.772 5.607 5.375 -2 ,7773 ,KEBNE ,17022863,Wed Dec 22 06:56:33 CET,Wed Dec 22 08:18:50 CET,0.0 0.744 1.036 1.252 1.427 1.591 1.765 1.926 2.206 2.335 2.463 2.503 2.819 2.92 3.095 3.266 3.434 3.517 3.669 3.804 4.018 4.155 4.284 4.491 4.678 4.838 4.998 5.156 5.361 5.552 5.74 5.969 6.186 6.404 6.646 6.894 7.142 7.415 7.691 7.965 8.245 8.567 8.932 9.303 9.702 10.092 10.55 11.042 11.578 12.143 12.542 12.529 12.34 12.11 11.846 11.559 11.285 11.017 10.766 10.504 10.265 10.038 9.82 9.624 9.45 9.286 9.114 8.958 8.816 8.671 8.526 8.399 8.263 8.123 8.014 7.907 7.797 7.675 7.537 7.448 7.357 7.214 7.109 6.999 6.943 6.815 6.684 6.549 6.481 6.216 6.281 6.213 6.148 6.006 5.917 5.828 5.724 5.605 5.487 5.329 5.038 -3 ,23690 ,KEBNE ,17022864,Wed Dec 22 06:56:33 CET,Wed Dec 22 08:17:37 CET,0.0 1.04 1.492 1.804 2.045 2.234 2.382 2.528 2.825 2.959 3.081 3.114 3.431 3.53 3.717 3.894 4.054 4.128 4.28 4.43 4.637 4.765 4.885 5.071 5.263 5.447 5.621 5.789 5.995 6.19 6.385 6.619 6.83 7.027 7.26 7.521 7.762 8.03 8.317 8.618 8.933 9.276 9.674 10.058 10.467 10.891 11.378 11.898 12.404 12.877 13.258 13.318 13.166 12.922 12.642 12.366 12.096 11.827 11.589 11.334 11.083 10.857 10.658 10.474 10.304 10.155 9.994 9.841 9.712 9.573 9.416 9.281 9.144 8.999 8.888 8.768 8.643 8.52 8.396 8.314 8.221 8.078 7.985 7.888 7.835 7.729 7.617 7.497 7.43 7.163 7.224 7.149 7.081 6.946 6.866 6.775 6.674 6.551 6.417 6.225 5.867 -4 ,2933 ,KEBNE ,17022865,Wed Dec 22 06:56:33 CET,Wed Dec 22 08:17:18 CET,0.0 0.996 1.38 1.705 1.999 2.194 2.346 2.499 2.791 2.93 3.054 3.087 3.407 3.532 3.767 3.946 4.099 4.182 4.349 4.49 4.699 4.843 4.973 5.157 5.346 5.527 5.69 5.852 6.068 6.27 6.455 6.667 6.872 7.073 7.295 7.543 7.798 8.058 8.321 8.6 8.895 9.224 9.599 9.971 10.376 10.825 11.307 11.8 12.31 12.746 13.048 13.051 12.878 12.591 12.259 11.93 11.64 11.364 11.111 10.851 10.619 10.418 10.223 10.024 9.834 9.646 9.453 9.288 9.137 8.991 8.841 8.71 8.569 8.428 8.323 8.211 8.096 7.978 7.852 7.762 7.674 7.542 7.441 7.333 7.277 7.163 7.054 6.942 6.883 6.62 6.693 6.624 6.553 6.402 6.311 6.206 6.104 6.004 5.874 5.692 5.283 -5 ,32265 ,KEBNE ,17022866,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:20:03 CET,0.0 0.876 1.265 1.542 1.758 1.971 2.164 2.318 2.572 2.688 2.795 2.804 3.12 3.217 3.399 3.586 3.76 3.847 4.017 4.17 4.389 4.531 4.667 4.86 5.044 5.212 5.369 5.526 5.728 5.926 6.117 6.341 6.555 6.762 6.994 7.245 7.486 7.753 8.044 8.353 8.668 9.001 9.362 9.717 10.134 10.579 11.084 11.637 12.174 12.633 13.003 13.031 12.83 12.561 12.259 11.925 11.627 11.371 11.125 10.87 10.642 10.417 10.2 10.0 9.816 9.654 9.485 9.323 9.169 9.01 8.853 8.728 8.602 8.465 8.36 8.249 8.121 7.997 7.88 7.788 7.688 7.547 7.457 7.367 7.318 7.22 7.11 6.976 6.912 6.643 6.707 6.638 6.56 6.41 6.325 6.208 6.064 5.921 5.787 5.656 5.478 -6 ,13190 ,KEBNE ,17022867,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:18:40 CET,0.0 0.452 0.687 0.848 1.007 1.168 1.323 1.481 1.758 1.875 1.992 2.016 2.332 2.45 2.67 2.86 3.028 3.109 3.251 3.392 3.626 3.77 3.902 4.082 4.247 4.409 4.576 4.742 4.956 5.161 5.346 5.571 5.795 5.991 6.21 6.464 6.704 6.967 7.253 7.555 7.861 8.19 8.573 8.959 9.401 9.839 10.292 10.793 11.262 11.696 12.066 12.039 11.824 11.505 11.173 10.877 10.601 10.327 10.082 9.828 9.607 9.405 9.206 9.022 8.849 8.683 8.5 8.327 8.185 8.047 7.894 7.762 7.629 7.499 7.401 7.29 7.174 7.061 6.939 6.847 6.753 6.613 6.513 6.401 6.345 6.235 6.123 6.004 5.942 5.675 5.741 5.666 5.586 5.434 5.353 5.255 5.156 5.049 4.904 4.718 4.439 -7 ,23223 ,KEBNE ,17022868,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:20:08 CET,0.0 0.609 0.909 1.178 1.435 1.664 1.842 1.992 2.317 2.469 2.604 2.634 2.943 3.039 3.223 3.401 3.558 3.631 3.777 3.927 4.151 4.288 4.414 4.604 4.785 4.95 5.119 5.282 5.486 5.682 5.863 6.091 6.317 6.524 6.751 7.006 7.257 7.524 7.803 8.1 8.413 8.759 9.141 9.52 9.946 10.4 10.889 11.362 11.835 12.278 12.638 12.673 12.518 12.301 12.039 11.735 11.446 11.169 10.89 10.612 10.387 10.177 9.956 9.755 9.581 9.415 9.236 9.074 8.921 8.768 8.615 8.486 8.345 8.184 8.07 7.963 7.852 7.736 7.617 7.531 7.437 7.285 7.177 7.069 7.017 6.904 6.791 6.685 6.622 6.348 6.408 6.337 6.255 6.076 5.983 5.878 5.746 5.589 5.438 5.301 5.004 -8 ,538 ,KEBNE ,17022869,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:18:24 CET,0.0 0.685 1.0 1.246 1.453 1.637 1.777 1.9 2.141 2.258 2.367 2.38 2.687 2.792 2.988 3.16 3.334 3.416 3.568 3.718 3.925 4.058 4.185 4.372 4.542 4.703 4.87 5.038 5.246 5.434 5.621 5.843 6.047 6.252 6.488 6.728 6.962 7.224 7.491 7.776 8.087 8.436 8.818 9.188 9.614 10.066 10.55 11.056 11.601 12.095 12.409 12.411 12.235 12.013 11.743 11.451 11.182 10.913 10.644 10.37 10.133 9.92 9.717 9.522 9.341 9.171 9.001 8.843 8.693 8.545 8.394 8.268 8.143 8.015 7.903 7.788 7.673 7.548 7.424 7.337 7.25 7.119 7.016 6.911 6.862 6.761 6.656 6.535 6.468 6.195 6.242 6.164 6.09 5.937 5.851 5.753 5.636 5.507 5.384 5.219 4.855 -9 ,11885 ,KEBNE ,17022870,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:18:33 CET,0.0 1.632 2.087 2.382 2.594 2.762 2.891 3.021 3.3 3.419 3.521 3.524 3.823 3.914 4.104 4.298 4.463 4.538 4.687 4.817 5.009 5.138 5.269 5.466 5.631 5.787 5.944 6.097 6.299 6.484 6.66 6.887 7.102 7.298 7.531 7.808 8.067 8.324 8.596 8.9 9.215 9.56 9.944 10.334 10.782 11.26 11.773 12.242 12.715 13.178 13.522 13.557 13.351 13.045 12.723 12.408 12.138 11.886 11.644 11.383 11.157 10.951 10.747 10.556 10.372 10.206 10.034 9.877 9.741 9.598 9.444 9.31 9.172 9.023 8.909 8.797 8.682 8.563 8.436 8.354 8.269 8.122 8.02 7.92 7.869 7.759 7.643 7.519 7.449 7.18 7.238 7.16 7.086 6.936 6.848 6.753 6.635 6.52 6.413 6.286 5.981 -10 ,1460 ,KEBNE ,17022871,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:18:41 CET,0.0 0.725 1.055 1.31 1.534 1.743 1.926 2.088 2.429 2.605 2.746 2.757 3.067 3.17 3.378 3.57 3.734 3.812 3.954 4.089 4.314 4.474 4.621 4.826 5.019 5.2 5.385 5.567 5.795 5.999 6.196 6.447 6.675 6.879 7.112 7.366 7.607 7.863 8.135 8.432 8.757 9.114 9.503 9.893 10.307 10.708 11.134 11.565 12.012 12.455 12.754 12.759 12.515 12.221 11.931 11.632 11.356 11.084 10.832 10.536 10.296 10.098 9.893 9.681 9.487 9.32 9.145 8.982 8.841 8.702 8.545 8.404 8.257 8.121 8.017 7.906 7.793 7.664 7.531 7.439 7.342 7.2 7.095 6.982 6.931 6.839 6.738 6.62 6.555 6.29 6.368 6.301 6.234 6.09 6.0 5.895 5.781 5.659 5.528 5.394 5.157 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_30_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_30_32.txt deleted file mode 100644 index d6437c51..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_30_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28683 ,KEBNE ,17022872,Wed Dec 22 06:57:39 CET,Wed Dec 22 08:14:23 CET,0.0 1.616 2.16 2.529 2.767 2.956 3.161 3.343 3.622 3.759 3.905 3.981 4.312 4.428 4.641 4.841 5.025 5.109 5.256 5.391 5.596 5.724 5.841 6.019 6.206 6.397 6.563 6.71 6.906 7.099 7.287 7.507 7.715 7.914 8.154 8.418 8.656 8.905 9.146 9.374 9.603 9.852 10.126 10.4 10.718 11.069 11.426 11.783 12.122 12.367 12.428 12.109 11.699 11.287 10.872 10.451 10.044 9.673 9.356 9.021 8.728 8.448 8.159 7.888 7.637 7.412 7.182 6.968 6.771 6.562 6.346 6.161 5.962 5.762 5.613 5.46 5.294 5.115 4.932 4.798 4.657 4.444 4.293 4.14 4.064 3.899 3.707 3.515 3.419 3.111 3.098 2.981 2.862 2.571 2.411 2.255 2.068 1.83 1.544 1.078 -0.166 -2 ,17215 ,KEBNE ,17022873,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:20:11 CET,0.0 1.116 1.585 1.927 2.188 2.405 2.596 2.767 3.099 3.258 3.415 3.496 3.829 3.962 4.208 4.426 4.611 4.697 4.876 5.052 5.308 5.456 5.579 5.752 5.907 6.058 6.21 6.345 6.527 6.705 6.859 7.03 7.2 7.377 7.577 7.788 8.0 8.23 8.457 8.703 8.95 9.2 9.489 9.79 10.108 10.438 10.801 11.148 11.471 11.703 11.737 11.446 11.047 10.635 10.232 9.838 9.45 9.086 8.781 8.462 8.172 7.906 7.641 7.376 7.131 6.925 6.707 6.497 6.307 6.112 5.903 5.722 5.528 5.316 5.157 5.001 4.84 4.668 4.493 4.374 4.239 4.021 3.877 3.738 3.662 3.493 3.319 3.151 3.056 2.743 2.711 2.591 2.448 2.094 1.908 1.71 1.49 1.229 0.912 0.494 -1.515 -3 ,27105 ,KEBNE ,17022874,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:20:07 CET,0.0 0.774 1.223 1.573 1.86 2.101 2.314 2.515 2.873 3.037 3.186 3.216 3.521 3.624 3.795 3.964 4.117 4.187 4.331 4.467 4.659 4.78 4.896 5.065 5.221 5.375 5.526 5.677 5.874 6.051 6.222 6.423 6.612 6.792 6.991 7.207 7.418 7.652 7.892 8.137 8.381 8.665 8.977 9.255 9.559 9.879 10.218 10.546 10.853 11.095 11.139 10.825 10.415 9.993 9.59 9.186 8.787 8.436 8.124 7.759 7.425 7.137 6.866 6.607 6.356 6.121 5.888 5.684 5.503 5.299 5.081 4.908 4.729 4.532 4.377 4.219 4.056 3.881 3.69 3.562 3.433 3.233 3.079 2.919 2.841 2.681 2.507 2.306 2.198 1.889 1.863 1.735 1.586 1.252 1.1 0.942 0.739 0.501 0.184 -0.248 -1.426 -4 ,23787 ,KEBNE ,17022875,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:18:44 CET,0.0 1.659 2.059 2.334 2.567 2.789 2.961 3.108 3.381 3.51 3.627 3.644 3.947 4.042 4.243 4.419 4.587 4.667 4.803 4.941 5.143 5.27 5.386 5.547 5.706 5.851 5.998 6.145 6.325 6.496 6.662 6.862 7.041 7.211 7.414 7.633 7.836 8.045 8.253 8.463 8.689 8.958 9.262 9.544 9.862 10.192 10.54 10.89 11.208 11.428 11.478 11.192 10.74 10.271 9.862 9.463 9.069 8.697 8.365 8.029 7.748 7.48 7.211 6.957 6.701 6.46 6.217 6.001 5.811 5.603 5.385 5.215 5.045 4.862 4.71 4.537 4.35 4.176 4.004 3.876 3.745 3.538 3.387 3.235 3.158 2.992 2.794 2.584 2.49 2.191 2.175 2.051 1.921 1.661 1.516 1.318 1.101 0.883 0.627 0.251 -1.43 -5 ,31432 ,KEBNE ,17022876,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:20:09 CET,0.0 1.56 2.035 2.359 2.617 2.835 3.053 3.248 3.567 3.71 3.863 3.952 4.279 4.391 4.62 4.841 5.039 5.131 5.302 5.472 5.711 5.855 5.999 6.2 6.382 6.562 6.756 6.943 7.136 7.306 7.475 7.67 7.845 8.02 8.221 8.434 8.637 8.852 9.074 9.319 9.575 9.841 10.145 10.453 10.791 11.136 11.496 11.828 12.124 12.32 12.315 12.013 11.612 11.177 10.754 10.344 9.946 9.565 9.223 8.893 8.609 8.346 8.092 7.829 7.579 7.349 7.112 6.902 6.711 6.513 6.3 6.119 5.932 5.747 5.604 5.446 5.285 5.125 4.948 4.823 4.704 4.51 4.36 4.202 4.119 3.937 3.746 3.552 3.455 3.146 3.107 2.965 2.828 2.507 2.331 2.156 1.981 1.792 1.562 1.195 -0.117 -6 ,31356 ,KEBNE ,17022877,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:20:10 CET,0.0 1.604 2.037 2.325 2.551 2.758 2.969 3.146 3.441 3.597 3.757 3.831 4.155 4.274 4.487 4.661 4.824 4.9 5.036 5.17 5.369 5.497 5.611 5.768 5.93 6.089 6.228 6.363 6.55 6.728 6.906 7.118 7.31 7.475 7.649 7.85 8.055 8.298 8.545 8.785 9.031 9.281 9.572 9.861 10.17 10.495 10.828 11.152 11.437 11.668 11.709 11.398 10.955 10.515 10.101 9.69 9.296 8.914 8.574 8.224 7.912 7.634 7.374 7.12 6.878 6.655 6.418 6.207 6.016 5.816 5.621 5.453 5.277 5.096 4.939 4.765 4.593 4.433 4.257 4.131 4.006 3.787 3.637 3.495 3.424 3.266 3.084 2.895 2.776 2.442 2.391 2.235 2.075 1.746 1.555 1.346 1.12 0.847 0.515 0.073 -1.301 -7 ,22471 ,KEBNE ,17022878,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:20:24 CET,0.0 1.143 1.597 1.888 2.148 2.407 2.624 2.793 3.046 3.168 3.291 3.313 3.623 3.716 3.877 4.054 4.231 4.304 4.446 4.599 4.813 4.944 5.061 5.217 5.367 5.517 5.665 5.813 5.993 6.166 6.354 6.57 6.77 6.952 7.14 7.35 7.559 7.778 8.013 8.247 8.48 8.746 9.053 9.349 9.676 9.997 10.308 10.606 10.868 11.133 11.248 10.953 10.524 10.098 9.686 9.256 8.865 8.516 8.201 7.865 7.569 7.31 7.062 6.804 6.568 6.353 6.128 5.922 5.732 5.532 5.318 5.136 4.935 4.726 4.573 4.422 4.257 4.088 3.914 3.788 3.664 3.472 3.34 3.199 3.122 2.952 2.759 2.529 2.402 2.065 1.992 1.85 1.673 1.281 1.082 0.854 0.609 0.335 -0.049 -0.563 -1.969 -8 ,1160 ,KEBNE ,17022879,Wed Dec 22 06:57:35 CET,Wed Dec 22 08:20:00 CET,0.0 1.294 1.673 1.96 2.198 2.407 2.608 2.797 3.122 3.266 3.405 3.458 3.776 3.888 4.091 4.288 4.463 4.545 4.712 4.87 5.097 5.24 5.376 5.564 5.745 5.913 6.065 6.217 6.422 6.607 6.78 6.994 7.198 7.391 7.622 7.873 8.1 8.367 8.648 8.922 9.193 9.497 9.837 10.12 10.427 10.749 11.063 11.359 11.658 11.915 11.956 11.603 11.139 10.686 10.244 9.822 9.427 9.048 8.717 8.375 8.074 7.819 7.566 7.309 7.07 6.839 6.581 6.35 6.161 5.964 5.758 5.586 5.402 5.205 5.051 4.899 4.745 4.588 4.416 4.276 4.135 3.939 3.791 3.626 3.547 3.388 3.217 3.021 2.914 2.611 2.596 2.475 2.362 2.126 1.992 1.855 1.7 1.484 1.22 0.926 0.029 -9 ,8290 ,KEBNE ,17022880,Wed Dec 22 06:59:38 CET,Wed Dec 22 08:21:00 CET,0.0 0.8 1.166 1.45 1.682 1.909 2.112 2.279 2.585 2.73 2.874 2.936 3.264 3.382 3.582 3.76 3.927 4.007 4.159 4.315 4.539 4.675 4.805 4.979 5.153 5.33 5.499 5.666 5.872 6.068 6.263 6.477 6.663 6.856 7.067 7.273 7.495 7.741 7.989 8.249 8.502 8.772 9.084 9.376 9.706 10.047 10.366 10.653 10.911 11.162 11.247 10.922 10.487 10.046 9.607 9.183 8.791 8.408 8.07 7.728 7.417 7.138 6.876 6.626 6.382 6.158 5.935 5.732 5.542 5.339 5.122 4.951 4.779 4.585 4.42 4.26 4.106 3.941 3.765 3.634 3.492 3.27 3.124 2.975 2.898 2.745 2.582 2.394 2.296 1.988 1.969 1.839 1.694 1.387 1.21 1.014 0.81 0.589 0.33 -0.066 -1.338 -10 ,3180 ,KEBNE ,17022881,Wed Dec 22 06:59:38 CET,Wed Dec 22 08:20:26 CET,0.0 0.849 1.257 1.564 1.82 2.03 2.199 2.357 2.648 2.787 2.931 2.969 3.266 3.353 3.526 3.686 3.836 3.909 4.05 4.181 4.362 4.481 4.604 4.786 4.948 5.107 5.258 5.402 5.593 5.778 5.966 6.184 6.377 6.557 6.753 6.959 7.152 7.38 7.629 7.871 8.11 8.377 8.673 8.947 9.256 9.571 9.893 10.221 10.529 10.784 10.86 10.601 10.177 9.705 9.266 8.847 8.472 8.119 7.788 7.433 7.139 6.878 6.609 6.355 6.119 5.9 5.662 5.44 5.245 5.041 4.831 4.651 4.456 4.256 4.102 3.942 3.778 3.601 3.419 3.297 3.171 2.967 2.814 2.666 2.59 2.414 2.225 2.032 1.932 1.619 1.581 1.45 1.315 1.05 0.9 0.721 0.518 0.295 -0.024 -0.418 -1.789 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_30_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_30_38.txt deleted file mode 100644 index 508dcaf6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_30_38.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26609 ,TETRA ,17550845,Thu Nov 25 09:43:55 CET,Thu Nov 25 11:25:41 CET,0.0 6.04 6.861 7.433 7.905 8.287 8.585 8.85 9.359 9.603 9.816 9.954 10.316 10.476 10.778 11.062 11.341 11.477 11.734 11.959 12.259 12.456 12.654 12.94 13.212 13.456 13.675 13.899 14.214 14.487 14.722 14.999 15.259 15.522 15.811 16.11 16.401 16.731 17.074 17.409 17.761 18.155 18.651 19.19 19.748 20.272 20.84 21.469 22.04 22.46 22.732 22.539 22.104 21.568 21.02 20.508 20.012 19.514 19.084 18.655 18.274 17.936 17.609 17.264 16.949 16.696 16.437 16.205 16.002 15.786 15.558 15.364 15.171 14.963 14.794 14.625 14.458 14.275 14.074 13.942 13.806 13.58 13.424 13.263 13.177 13.006 12.811 12.591 12.47 12.12 12.018 11.86 11.69 11.312 11.115 10.905 10.659 10.38 10.029 9.523 8.041 -2 ,1368 ,TETRA ,17550846,Thu Nov 25 09:43:55 CET,Thu Nov 25 11:23:07 CET,0.0 3.634 4.39 4.904 5.366 5.793 6.166 6.49 7.018 7.242 7.482 7.725 8.115 8.285 8.589 8.872 9.152 9.3 9.562 9.788 10.117 10.329 10.53 10.805 11.046 11.282 11.516 11.734 12.004 12.255 12.492 12.785 13.076 13.332 13.619 13.952 14.275 14.639 15.015 15.402 15.79 16.203 16.647 17.068 17.563 18.075 18.633 19.205 19.737 20.187 20.487 20.334 19.941 19.487 18.995 18.498 18.04 17.642 17.279 16.882 16.534 16.206 15.904 15.641 15.402 15.171 14.896 14.639 14.421 14.21 13.992 13.796 13.594 13.375 13.201 13.029 12.86 12.672 12.47 12.338 12.206 11.993 11.838 11.679 11.59 11.381 11.179 10.947 10.794 10.45 10.434 10.31 10.174 9.879 9.701 9.509 9.294 9.018 8.664 8.19 6.891 -3 ,4052 ,TETRA ,17550847,Thu Nov 25 09:43:54 CET,Thu Nov 25 11:24:56 CET,0.0 4.237 4.919 5.372 5.806 6.199 6.532 6.829 7.349 7.576 7.794 8.016 8.404 8.578 8.908 9.207 9.476 9.6 9.84 10.078 10.427 10.647 10.851 11.137 11.408 11.678 11.936 12.172 12.492 12.784 13.046 13.35 13.634 13.91 14.238 14.631 14.99 15.363 15.781 16.178 16.53 16.917 17.362 17.788 18.248 18.712 19.234 19.769 20.283 20.741 20.992 20.862 20.608 20.151 19.607 19.077 18.583 18.127 17.706 17.259 16.844 16.473 16.132 15.821 15.528 15.244 14.93 14.612 14.333 14.06 13.776 13.551 13.35 13.149 12.981 12.79 12.594 12.406 12.213 12.076 11.923 11.661 11.474 11.272 11.165 10.964 10.762 10.54 10.419 10.082 10.003 9.861 9.728 9.424 9.248 9.041 8.806 8.539 8.189 7.741 6.486 -4 ,18987 ,TETRA ,17550848,Thu Nov 25 09:43:55 CET,Thu Nov 25 11:06:02 CET,0.0 4.562 5.274 5.75 6.137 6.488 6.792 7.057 7.487 7.697 7.911 8.085 8.464 8.633 8.977 9.311 9.629 9.76 9.989 10.199 10.484 10.666 10.85 11.136 11.383 11.603 11.821 12.029 12.305 12.563 12.792 13.09 13.394 13.679 13.997 14.329 14.637 14.968 15.313 15.672 16.036 16.438 16.89 17.322 17.817 18.313 18.809 19.328 19.872 20.372 20.698 20.547 20.084 19.578 19.122 18.698 18.297 17.88 17.519 17.145 16.791 16.479 16.192 15.925 15.684 15.468 15.248 15.042 14.853 14.659 14.466 14.311 14.14 13.961 13.81 13.655 13.504 13.356 13.205 13.092 12.967 12.772 12.626 12.454 12.369 12.199 12.012 11.809 11.703 11.388 11.359 11.238 11.107 10.825 10.673 10.509 10.338 10.162 9.946 9.642 9.013 -5 ,28016 ,TETRA ,17550849,Thu Nov 25 09:43:53 CET,Thu Nov 25 11:11:09 CET,0.0 2.499 3.339 3.901 4.276 4.584 4.862 5.128 5.568 5.782 5.997 6.187 6.574 6.735 7.06 7.396 7.708 7.846 8.1 8.343 8.703 8.926 9.119 9.419 9.724 10.007 10.282 10.531 10.835 11.13 11.406 11.719 12.029 12.324 12.661 13.028 13.353 13.688 14.083 14.52 14.938 15.417 15.946 16.428 16.961 17.533 18.162 18.812 19.448 19.959 20.277 20.03 19.562 19.057 18.548 18.042 17.558 17.106 16.69 16.252 15.892 15.58 15.234 14.889 14.574 14.286 14.009 13.759 13.517 13.26 12.992 12.783 12.563 12.332 12.16 11.968 11.753 11.526 11.292 11.126 10.945 10.657 10.475 10.3 10.206 9.997 9.763 9.517 9.393 9.06 8.984 8.829 8.666 8.314 8.118 7.903 7.673 7.418 7.047 6.417 4.401 -6 ,1156 ,TETRA ,17550850,Thu Nov 25 09:43:55 CET,Thu Nov 25 11:18:56 CET,0.0 3.912 4.731 5.256 5.681 6.082 6.389 6.645 7.142 7.39 7.631 7.844 8.236 8.408 8.72 9.015 9.29 9.417 9.662 9.911 10.279 10.517 10.753 11.099 11.411 11.672 11.91 12.145 12.443 12.725 12.997 13.347 13.687 14.0 14.343 14.7 15.023 15.38 15.779 16.163 16.549 17.004 17.506 17.985 18.512 19.054 19.7 20.346 20.834 21.283 21.539 21.28 20.873 20.432 19.961 19.461 18.974 18.508 18.06 17.607 17.237 16.896 16.57 16.245 15.945 15.682 15.396 15.138 14.899 14.645 14.404 14.208 13.989 13.745 13.557 13.372 13.176 12.966 12.746 12.593 12.425 12.155 11.977 11.784 11.684 11.481 11.273 11.073 10.964 10.632 10.552 10.392 10.219 9.841 9.619 9.385 9.146 8.888 8.591 8.175 7.095 -7 ,8621 ,TETRA ,17550851,Thu Nov 25 09:43:56 CET,Thu Nov 25 11:19:41 CET,0.0 4.023 4.88 5.394 5.857 6.265 6.625 6.952 7.52 7.778 8.015 8.217 8.596 8.762 9.089 9.396 9.667 9.795 10.043 10.275 10.608 10.812 11.001 11.265 11.514 11.77 12.017 12.235 12.516 12.811 13.094 13.415 13.713 14.008 14.377 14.762 15.1 15.46 15.83 16.215 16.589 16.992 17.475 17.941 18.459 19.027 19.624 20.203 20.761 21.169 21.245 20.909 20.329 19.693 19.081 18.425 17.837 17.324 16.846 16.375 15.99 15.616 15.253 14.906 14.567 14.239 13.887 13.6 13.359 13.09 12.808 12.566 12.319 12.072 11.873 11.67 11.457 11.228 10.986 10.825 10.658 10.394 10.214 10.019 9.919 9.708 9.481 9.273 9.164 8.847 8.817 8.691 8.561 8.292 8.14 7.954 7.759 7.541 7.259 6.87 5.174 -8 ,16326 ,TETRA ,17550852,Thu Nov 25 09:43:59 CET,Thu Nov 25 11:10:58 CET,0.0 3.756 4.465 4.951 5.401 5.791 6.094 6.359 6.791 6.996 7.205 7.393 7.765 7.928 8.241 8.523 8.787 8.905 9.128 9.353 9.689 9.895 10.08 10.343 10.606 10.846 11.063 11.285 11.559 11.806 12.042 12.313 12.574 12.822 13.103 13.423 13.734 14.063 14.403 14.748 15.095 15.497 15.952 16.389 16.884 17.407 17.935 18.434 18.965 19.485 19.793 19.706 19.399 18.968 18.53 18.126 17.716 17.315 16.993 16.656 16.301 15.939 15.586 15.242 14.91 14.604 14.295 14.033 13.813 13.588 13.352 13.16 12.947 12.729 12.569 12.392 12.198 11.989 11.779 11.636 11.491 11.276 11.118 10.952 10.863 10.678 10.46 10.227 10.11 9.771 9.697 9.56 9.432 9.164 9.0 8.812 8.614 8.406 8.169 7.877 6.494 -9 ,14382 ,TETRA ,17550853,Thu Nov 25 09:43:55 CET,Thu Nov 25 11:20:09 CET,0.0 3.768 4.535 5.049 5.457 5.839 6.2 6.539 7.094 7.313 7.502 7.642 8.012 8.185 8.485 8.765 9.03 9.15 9.372 9.593 9.917 10.116 10.305 10.567 10.824 11.089 11.335 11.569 11.857 12.1 12.321 12.587 12.849 13.108 13.424 13.791 14.132 14.519 14.927 15.33 15.721 16.135 16.631 17.124 17.685 18.264 18.854 19.491 20.154 20.679 20.923 20.759 20.346 19.844 19.339 18.823 18.304 17.771 17.277 16.805 16.428 16.077 15.741 15.429 15.124 14.846 14.545 14.26 14.019 13.776 13.508 13.294 13.077 12.851 12.677 12.497 12.316 12.118 11.912 11.784 11.653 11.456 11.31 11.15 11.064 10.88 10.689 10.471 10.358 10.038 10.008 9.875 9.742 9.458 9.282 9.083 8.895 8.696 8.445 8.095 6.813 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_31_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_31_34.txt deleted file mode 100644 index 7eb77d8d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_31_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21092 ,KEBNE ,17022882,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:20:39 CET,0.0 1.183 1.626 1.963 2.239 2.462 2.636 2.814 3.141 3.285 3.442 3.541 3.871 3.988 4.242 4.491 4.703 4.796 4.979 5.152 5.379 5.54 5.7 5.916 6.116 6.3 6.484 6.666 6.876 7.061 7.244 7.48 7.702 7.913 8.185 8.478 8.729 8.98 9.26 9.567 9.885 10.243 10.622 10.981 11.39 11.836 12.333 12.837 13.358 13.85 14.307 14.472 14.272 13.959 13.599 13.208 12.855 12.527 12.223 11.885 11.569 11.271 10.965 10.663 10.395 10.16 9.901 9.649 9.431 9.224 9.014 8.827 8.631 8.44 8.293 8.134 7.967 7.78 7.574 7.443 7.305 7.073 6.912 6.739 6.649 6.456 6.235 6.017 5.9 5.57 5.52 5.394 5.23 4.907 4.767 4.554 4.267 3.948 3.596 3.171 1.106 -2 ,29780 ,KEBNE ,17022883,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:21:01 CET,0.0 1.229 1.666 2.014 2.336 2.61 2.839 3.041 3.405 3.561 3.704 3.774 4.1 4.233 4.503 4.766 4.988 5.087 5.275 5.46 5.741 5.92 6.086 6.324 6.553 6.756 6.939 7.125 7.368 7.599 7.827 8.107 8.392 8.669 8.956 9.259 9.543 9.833 10.152 10.474 10.802 11.186 11.628 12.064 12.561 13.085 13.627 14.185 14.763 15.317 15.746 15.79 15.589 15.281 14.928 14.57 14.215 13.887 13.604 13.288 12.998 12.736 12.476 12.228 11.997 11.787 11.559 11.352 11.174 10.981 10.78 10.599 10.398 10.198 10.038 9.873 9.708 9.527 9.341 9.217 9.091 8.869 8.691 8.51 8.422 8.244 8.051 7.827 7.705 7.376 7.296 7.147 6.994 6.644 6.447 6.235 6.011 5.759 5.438 5.029 4.07 -3 ,22566 ,KEBNE ,17022884,Wed Dec 22 06:59:38 CET,Wed Dec 22 08:22:15 CET,0.0 0.944 1.305 1.552 1.779 2.015 2.238 2.423 2.73 2.867 2.997 3.045 3.351 3.453 3.658 3.856 4.055 4.151 4.319 4.481 4.721 4.87 5.01 5.223 5.435 5.635 5.822 6.002 6.244 6.475 6.701 6.966 7.206 7.434 7.704 8.005 8.286 8.594 8.913 9.25 9.607 9.989 10.407 10.815 11.288 11.779 12.321 12.907 13.494 13.993 14.327 14.33 14.113 13.792 13.403 13.023 12.681 12.33 11.993 11.639 11.322 11.034 10.767 10.501 10.247 10.026 9.799 9.588 9.395 9.182 8.957 8.781 8.605 8.402 8.228 8.036 7.855 7.686 7.496 7.359 7.222 7.015 6.856 6.68 6.594 6.43 6.259 6.059 5.962 5.673 5.628 5.483 5.338 5.016 4.816 4.591 4.36 4.091 3.73 3.22 1.699 -4 ,22279 ,KEBNE ,17022885,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:22:23 CET,0.0 1.07 1.463 1.789 2.055 2.289 2.515 2.714 3.034 3.164 3.287 3.341 3.658 3.767 3.971 4.146 4.313 4.402 4.576 4.742 5.001 5.169 5.324 5.538 5.739 5.926 6.115 6.302 6.53 6.758 6.984 7.259 7.514 7.739 8.005 8.323 8.609 8.914 9.26 9.632 10.015 10.404 10.843 11.269 11.709 12.188 12.711 13.244 13.839 14.433 14.885 14.862 14.59 14.263 13.904 13.533 13.16 12.793 12.471 12.131 11.832 11.566 11.307 11.051 10.793 10.556 10.301 10.057 9.841 9.619 9.384 9.188 8.975 8.747 8.574 8.397 8.212 8.018 7.804 7.647 7.494 7.265 7.097 6.914 6.818 6.62 6.423 6.209 6.099 5.79 5.721 5.573 5.426 5.11 4.933 4.738 4.506 4.245 3.965 3.595 2.323 -5 ,23805 ,KEBNE ,17022886,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:22:06 CET,0.0 1.016 1.474 1.797 2.032 2.232 2.422 2.594 2.906 3.057 3.197 3.262 3.581 3.692 3.905 4.104 4.293 4.379 4.544 4.719 4.964 5.095 5.225 5.426 5.617 5.796 5.97 6.133 6.33 6.525 6.718 6.947 7.165 7.378 7.63 7.901 8.168 8.471 8.795 9.123 9.43 9.78 10.159 10.526 10.99 11.452 11.917 12.415 12.942 13.431 13.82 13.877 13.651 13.356 13.042 12.733 12.403 12.055 11.756 11.443 11.16 10.899 10.652 10.417 10.178 9.94 9.695 9.487 9.301 9.107 8.904 8.726 8.539 8.344 8.187 8.017 7.844 7.669 7.485 7.349 7.209 6.993 6.836 6.668 6.582 6.407 6.218 6.024 5.921 5.605 5.551 5.428 5.304 5.024 4.861 4.679 4.485 4.193 3.82 3.345 2.064 -6 ,614 ,KEBNE ,17022887,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:22:10 CET,0.0 1.636 2.067 2.373 2.629 2.87 3.098 3.286 3.603 3.746 3.878 3.933 4.247 4.353 4.544 4.714 4.878 4.96 5.127 5.286 5.531 5.685 5.814 6.019 6.209 6.371 6.564 6.757 6.968 7.17 7.373 7.61 7.852 8.111 8.403 8.72 9.008 9.305 9.618 9.94 10.269 10.663 11.12 11.543 11.991 12.456 12.958 13.481 14.013 14.51 14.942 14.982 14.705 14.328 13.948 13.561 13.207 12.854 12.528 12.217 11.925 11.653 11.376 11.087 10.795 10.532 10.27 10.04 9.836 9.617 9.402 9.222 9.022 8.828 8.691 8.541 8.371 8.187 7.997 7.853 7.702 7.476 7.307 7.124 7.027 6.831 6.618 6.395 6.284 5.97 5.924 5.8 5.655 5.294 5.087 4.882 4.65 4.378 4.12 3.762 2.249 -7 ,13719 ,KEBNE ,17022888,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:22:34 CET,0.0 0.953 1.425 1.762 1.992 2.204 2.418 2.615 2.944 3.088 3.237 3.329 3.663 3.796 4.041 4.256 4.448 4.544 4.734 4.918 5.174 5.316 5.456 5.659 5.839 6.026 6.229 6.413 6.626 6.844 7.043 7.258 7.474 7.686 7.919 8.179 8.425 8.702 8.995 9.291 9.588 9.911 10.303 10.701 11.149 11.669 12.222 12.739 13.262 13.782 14.192 14.129 13.783 13.395 12.996 12.585 12.197 11.815 11.446 11.043 10.692 10.393 10.103 9.798 9.515 9.292 9.045 8.813 8.614 8.401 8.183 8.006 7.821 7.613 7.45 7.296 7.126 6.936 6.726 6.576 6.428 6.188 6.025 5.868 5.783 5.603 5.428 5.231 5.115 4.803 4.777 4.653 4.516 4.202 4.025 3.849 3.655 3.407 3.125 2.819 1.846 -8 ,3526 ,KEBNE ,17022889,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:22:01 CET,0.0 1.274 1.731 2.119 2.448 2.716 2.947 3.147 3.51 3.658 3.782 3.818 4.124 4.232 4.448 4.638 4.81 4.897 5.074 5.246 5.49 5.646 5.792 5.997 6.192 6.379 6.555 6.72 6.925 7.14 7.366 7.618 7.836 8.049 8.307 8.61 8.904 9.198 9.488 9.802 10.137 10.519 10.964 11.399 11.85 12.308 12.823 13.381 13.984 14.532 14.917 14.858 14.565 14.191 13.825 13.464 13.125 12.801 12.489 12.144 11.83 11.552 11.283 11.018 10.732 10.451 10.167 9.919 9.722 9.531 9.33 9.156 8.953 8.726 8.57 8.401 8.227 8.052 7.84 7.689 7.539 7.317 7.169 7.023 6.948 6.778 6.586 6.375 6.265 5.95 5.902 5.769 5.631 5.297 5.11 4.898 4.653 4.371 4.067 3.679 2.618 -9 ,25997 ,KEBNE ,17022890,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:22:05 CET,0.0 1.028 1.439 1.8 2.092 2.353 2.603 2.799 3.123 3.29 3.443 3.552 3.888 3.998 4.197 4.388 4.582 4.669 4.834 5.004 5.251 5.404 5.556 5.777 5.977 6.17 6.347 6.507 6.725 6.941 7.138 7.369 7.59 7.8 8.038 8.312 8.585 8.872 9.158 9.438 9.726 10.051 10.429 10.809 11.278 11.762 12.232 12.762 13.339 13.9 14.38 14.467 14.302 14.014 13.691 13.376 13.072 12.746 12.441 12.138 11.853 11.594 11.34 11.095 10.864 10.651 10.416 10.206 10.03 9.834 9.621 9.438 9.229 9.015 8.868 8.716 8.545 8.365 8.168 8.009 7.832 7.591 7.441 7.263 7.167 6.979 6.775 6.56 6.449 6.136 6.096 5.971 5.817 5.398 5.16 4.937 4.699 4.415 4.042 3.574 2.295 -10 ,20141 ,KEBNE ,17022891,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:22:08 CET,0.0 1.103 1.551 1.887 2.134 2.355 2.56 2.758 3.117 3.287 3.433 3.474 3.795 3.915 4.149 4.356 4.532 4.625 4.797 4.952 5.188 5.34 5.487 5.695 5.882 6.047 6.201 6.365 6.585 6.793 6.991 7.238 7.466 7.679 7.945 8.251 8.532 8.826 9.148 9.485 9.817 10.184 10.597 11.002 11.492 12.008 12.545 13.095 13.631 14.177 14.607 14.557 14.246 13.859 13.473 13.105 12.752 12.405 12.09 11.765 11.462 11.192 10.926 10.658 10.401 10.146 9.881 9.645 9.439 9.216 8.97 8.77 8.557 8.339 8.173 8.003 7.803 7.572 7.35 7.205 7.052 6.817 6.652 6.469 6.368 6.163 5.958 5.728 5.6 5.264 5.167 5.02 4.875 4.57 4.389 4.201 3.98 3.692 3.299 2.794 1.642 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_32_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_32_43.txt deleted file mode 100644 index 1eb795ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_32_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25322 ,KEBNE ,17022892,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:21:11 CET,0.0 1.465 1.899 2.248 2.514 2.763 2.997 3.188 3.54 3.703 3.852 3.908 4.227 4.333 4.553 4.759 4.949 5.044 5.222 5.384 5.606 5.749 5.892 6.083 6.266 6.451 6.632 6.803 7.014 7.2 7.379 7.611 7.84 8.049 8.269 8.512 8.752 9.012 9.277 9.564 9.861 10.176 10.542 10.907 11.31 11.748 12.244 12.741 13.24 13.731 14.084 14.091 13.9 13.639 13.343 13.043 12.749 12.455 12.187 11.912 11.675 11.446 11.222 11.015 10.815 10.637 10.457 10.301 10.165 10.018 9.868 9.746 9.62 9.484 9.37 9.251 9.133 9.016 8.897 8.811 8.716 8.562 8.457 8.352 8.298 8.187 8.069 7.938 7.868 7.594 7.658 7.576 7.485 7.287 7.175 7.058 6.948 6.825 6.67 6.48 5.932 -2 ,29469 ,KEBNE ,17022893,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:22:37 CET,0.0 0.987 1.398 1.701 1.945 2.182 2.4 2.584 2.91 3.051 3.177 3.206 3.517 3.617 3.803 4.003 4.201 4.296 4.473 4.646 4.89 5.034 5.174 5.378 5.569 5.749 5.919 6.091 6.313 6.519 6.707 6.924 7.13 7.323 7.552 7.819 8.082 8.371 8.666 8.956 9.26 9.592 9.94 10.279 10.68 11.11 11.57 12.05 12.545 13.035 13.467 13.504 13.311 13.054 12.766 12.462 12.175 11.884 11.607 11.335 11.091 10.876 10.682 10.475 10.271 10.072 9.853 9.679 9.542 9.386 9.224 9.097 8.955 8.813 8.707 8.59 8.467 8.347 8.221 8.12 8.019 7.881 7.784 7.674 7.62 7.514 7.391 7.277 7.222 6.952 7.006 6.927 6.849 6.687 6.595 6.489 6.363 6.221 6.066 5.906 5.522 -3 ,11876 ,KEBNE ,17022894,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:23:07 CET,0.0 1.929 2.442 2.77 2.976 3.162 3.349 3.521 3.85 4.0 4.132 4.175 4.486 4.592 4.791 4.97 5.148 5.235 5.391 5.54 5.773 5.924 6.064 6.27 6.463 6.639 6.81 6.966 7.149 7.341 7.53 7.759 7.968 8.175 8.423 8.681 8.927 9.188 9.458 9.738 10.032 10.343 10.689 11.047 11.444 11.861 12.324 12.812 13.314 13.777 14.158 14.208 14.022 13.772 13.478 13.153 12.854 12.552 12.282 12.009 11.77 11.574 11.385 11.212 11.053 10.891 10.722 10.576 10.444 10.302 10.154 10.026 9.895 9.767 9.664 9.56 9.457 9.342 9.216 9.13 9.033 8.889 8.798 8.687 8.629 8.509 8.384 8.262 8.205 7.943 8.034 7.966 7.881 7.706 7.618 7.513 7.398 7.266 7.112 6.925 6.497 -4 ,30632 ,KEBNE ,17022895,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:22:44 CET,0.0 1.428 1.853 2.164 2.394 2.603 2.785 2.953 3.272 3.408 3.531 3.564 3.882 3.987 4.181 4.374 4.552 4.633 4.809 4.978 5.21 5.358 5.503 5.716 5.91 6.087 6.258 6.418 6.628 6.837 7.045 7.295 7.505 7.708 7.961 8.229 8.476 8.735 8.999 9.284 9.595 9.943 10.313 10.679 11.101 11.533 11.984 12.458 12.972 13.508 13.952 13.986 13.827 13.614 13.338 12.994 12.671 12.375 12.101 11.829 11.586 11.362 11.163 10.978 10.798 10.629 10.449 10.279 10.132 9.977 9.82 9.691 9.563 9.433 9.327 9.211 9.082 8.948 8.81 8.718 8.636 8.509 8.415 8.311 8.259 8.15 8.029 7.9 7.83 7.553 7.626 7.552 7.472 7.3 7.202 7.103 6.992 6.866 6.717 6.53 6.301 -5 ,10528 ,KEBNE ,17022896,Wed Dec 22 06:59:39 CET,Wed Dec 22 08:22:33 CET,0.0 1.148 1.608 2.0 2.303 2.537 2.741 2.931 3.272 3.429 3.579 3.649 3.977 4.101 4.355 4.576 4.771 4.879 5.086 5.276 5.532 5.689 5.84 6.051 6.246 6.413 6.571 6.732 6.934 7.12 7.308 7.544 7.766 7.968 8.187 8.424 8.669 8.951 9.243 9.532 9.817 10.13 10.496 10.859 11.255 11.66 12.102 12.579 13.081 13.546 13.851 13.864 13.697 13.461 13.179 12.86 12.559 12.288 12.052 11.82 11.609 11.411 11.219 11.012 10.8 10.596 10.389 10.22 10.078 9.922 9.764 9.648 9.526 9.392 9.286 9.179 9.064 8.936 8.794 8.695 8.597 8.44 8.33 8.219 8.166 8.06 7.938 7.811 7.748 7.474 7.54 7.475 7.403 7.23 7.138 7.038 6.944 6.843 6.705 6.538 6.245 -6 ,17597 ,KEBNE ,17022897,Wed Dec 22 07:00:41 CET,Wed Dec 22 08:23:24 CET,0.0 1.231 1.644 1.968 2.235 2.471 2.685 2.873 3.162 3.289 3.417 3.449 3.771 3.884 4.101 4.298 4.479 4.57 4.739 4.898 5.135 5.288 5.436 5.635 5.827 6.019 6.198 6.359 6.564 6.773 6.96 7.172 7.383 7.594 7.833 8.097 8.347 8.607 8.895 9.184 9.464 9.774 10.135 10.523 10.955 11.38 11.843 12.357 12.888 13.392 13.817 13.904 13.79 13.59 13.315 13.012 12.72 12.465 12.235 11.99 11.792 11.599 11.391 11.205 11.041 10.879 10.703 10.544 10.408 10.271 10.129 10.016 9.892 9.758 9.648 9.518 9.386 9.262 9.138 9.055 8.971 8.814 8.692 8.574 8.519 8.412 8.292 8.17 8.112 7.848 7.921 7.845 7.766 7.607 7.515 7.401 7.27 7.135 7.007 6.871 6.559 -7 ,19892 ,KEBNE ,17022898,Wed Dec 22 07:00:41 CET,Wed Dec 22 08:22:10 CET,0.0 2.092 2.615 3.024 3.315 3.526 3.732 3.922 4.219 4.348 4.478 4.51 4.824 4.933 5.149 5.346 5.521 5.604 5.76 5.921 6.151 6.291 6.424 6.616 6.804 6.982 7.152 7.317 7.521 7.713 7.898 8.122 8.345 8.557 8.802 9.078 9.327 9.587 9.874 10.166 10.458 10.787 11.151 11.491 11.87 12.271 12.705 13.203 13.735 14.227 14.625 14.675 14.491 14.237 13.941 13.655 13.392 13.143 12.901 12.643 12.427 12.238 12.046 11.854 11.681 11.514 11.337 11.186 11.043 10.901 10.757 10.632 10.51 10.379 10.277 10.176 10.073 9.962 9.839 9.747 9.653 9.51 9.411 9.301 9.242 9.128 9.012 8.901 8.84 8.567 8.627 8.553 8.473 8.291 8.182 8.082 7.976 7.848 7.696 7.461 7.056 -8 ,16778 ,KEBNE ,17022899,Wed Dec 22 07:00:41 CET,Wed Dec 22 08:23:32 CET,0.0 1.404 1.825 2.161 2.428 2.67 2.868 3.029 3.323 3.461 3.595 3.667 3.995 4.095 4.292 4.482 4.652 4.733 4.895 5.058 5.3 5.45 5.584 5.769 5.941 6.105 6.277 6.451 6.658 6.847 7.032 7.25 7.449 7.639 7.874 8.133 8.357 8.597 8.877 9.162 9.45 9.777 10.157 10.541 10.967 11.434 11.924 12.385 12.852 13.345 13.759 13.816 13.627 13.344 13.036 12.734 12.47 12.229 11.997 11.743 11.521 11.325 11.124 10.935 10.762 10.603 10.439 10.284 10.144 9.995 9.843 9.715 9.58 9.442 9.329 9.216 9.102 8.979 8.844 8.756 8.673 8.538 8.436 8.33 8.278 8.16 8.03 7.904 7.841 7.571 7.644 7.576 7.502 7.325 7.215 7.091 6.967 6.836 6.673 6.508 6.063 -9 ,26469 ,KEBNE ,17022900,Wed Dec 22 07:00:41 CET,Wed Dec 22 08:22:01 CET,0.0 1.495 2.012 2.349 2.625 2.875 3.093 3.275 3.573 3.719 3.876 3.979 4.324 4.439 4.657 4.873 5.07 5.161 5.35 5.542 5.801 5.957 6.108 6.327 6.536 6.728 6.903 7.071 7.295 7.509 7.704 7.922 8.131 8.329 8.551 8.806 9.048 9.307 9.588 9.878 10.155 10.467 10.846 11.215 11.631 12.077 12.525 12.99 13.494 13.973 14.395 14.484 14.293 13.988 13.684 13.384 13.077 12.781 12.515 12.222 11.961 11.731 11.516 11.307 11.116 10.941 10.738 10.556 10.402 10.241 10.06 9.897 9.737 9.583 9.463 9.34 9.207 9.058 8.9 8.798 8.706 8.56 8.457 8.352 8.299 8.194 8.061 7.927 7.868 7.602 7.654 7.573 7.501 7.326 7.213 7.1 6.974 6.844 6.702 6.511 6.136 -10 ,24811 ,KEBNE ,17022901,Wed Dec 22 07:00:41 CET,Wed Dec 22 08:22:00 CET,0.0 1.422 1.81 2.106 2.35 2.564 2.766 2.955 3.252 3.375 3.492 3.504 3.819 3.928 4.129 4.325 4.518 4.604 4.763 4.924 5.167 5.305 5.434 5.628 5.815 5.998 6.168 6.329 6.546 6.756 6.937 7.152 7.36 7.562 7.797 8.042 8.272 8.534 8.816 9.1 9.397 9.725 10.074 10.401 10.785 11.211 11.698 12.2 12.71 13.206 13.554 13.579 13.434 13.188 12.874 12.578 12.285 11.997 11.748 11.465 11.217 11.007 10.812 10.629 10.451 10.282 10.112 9.964 9.825 9.685 9.532 9.391 9.247 9.106 9.0 8.887 8.776 8.662 8.546 8.465 8.377 8.235 8.135 8.036 7.983 7.863 7.734 7.607 7.545 7.274 7.335 7.266 7.199 7.046 6.956 6.858 6.76 6.641 6.484 6.303 5.962 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_32_46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_32_46.txt deleted file mode 100644 index 5d360ed8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_32_46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27217 ,KEBNE ,17022902,Wed Dec 22 07:00:41 CET,Wed Dec 22 08:22:15 CET,0.0 1.736 2.293 2.672 2.978 3.235 3.471 3.665 4.016 4.176 4.332 4.426 4.765 4.89 5.118 5.332 5.544 5.644 5.815 5.974 6.208 6.356 6.499 6.706 6.89 7.074 7.258 7.431 7.63 7.784 7.939 8.133 8.304 8.471 8.672 8.886 9.071 9.265 9.471 9.711 9.947 10.182 10.45 10.68 10.911 11.16 11.375 11.53 11.668 11.675 11.355 10.719 10.098 9.513 8.96 8.439 7.959 7.517 7.13 6.756 6.451 6.183 5.927 5.689 5.467 5.255 5.039 4.833 4.658 4.493 4.306 4.148 3.985 3.811 3.673 3.533 3.401 3.264 3.118 3.02 2.921 2.764 2.659 2.551 2.493 2.372 2.248 2.124 2.063 1.774 1.809 1.726 1.651 1.495 1.407 1.302 1.196 1.059 0.888 0.691 0.339 -2 ,3097 ,KEBNE ,17022903,Wed Dec 22 07:00:41 CET,Wed Dec 22 08:23:43 CET,0.0 1.226 1.692 2.014 2.27 2.459 2.651 2.862 3.226 3.377 3.508 3.538 3.87 3.991 4.236 4.444 4.61 4.691 4.846 4.996 5.191 5.316 5.443 5.615 5.774 5.917 6.052 6.185 6.347 6.496 6.649 6.842 7.015 7.17 7.357 7.558 7.742 7.946 8.151 8.367 8.592 8.825 9.069 9.284 9.523 9.752 9.967 10.153 10.237 10.201 9.895 9.269 8.63 8.026 7.467 6.939 6.46 6.029 5.657 5.277 4.955 4.684 4.443 4.211 3.986 3.78 3.56 3.36 3.17 2.978 2.789 2.632 2.474 2.313 2.184 2.034 1.878 1.731 1.586 1.481 1.363 1.187 1.073 0.959 0.904 0.784 0.659 0.537 0.469 0.185 0.25 0.167 0.077 -0.128 -0.223 -0.306 -0.413 -0.537 -0.68 -0.85 -1.11 -3 ,12375 ,KEBNE ,17022904,Wed Dec 22 07:01:42 CET,Wed Dec 22 08:25:00 CET,0.0 1.888 2.385 2.785 3.077 3.311 3.504 3.686 4.024 4.161 4.284 4.335 4.655 4.757 4.953 5.113 5.271 5.351 5.487 5.614 5.829 5.974 6.099 6.269 6.424 6.572 6.71 6.845 7.024 7.191 7.335 7.497 7.666 7.829 8.01 8.209 8.387 8.571 8.763 8.952 9.144 9.365 9.615 9.818 10.007 10.196 10.396 10.549 10.6 10.509 10.132 9.451 8.779 8.188 7.644 7.13 6.694 6.303 5.959 5.633 5.339 5.051 4.783 4.543 4.322 4.107 3.879 3.671 3.493 3.312 3.123 2.971 2.823 2.671 2.549 2.416 2.273 2.126 1.981 1.88 1.778 1.608 1.481 1.365 1.306 1.174 1.042 0.914 0.843 0.549 0.579 0.486 0.398 0.232 0.143 0.042 -0.065 -0.182 -0.346 -0.542 -0.914 -4 ,21764 ,KEBNE ,17022905,Wed Dec 22 07:01:42 CET,Wed Dec 22 08:24:48 CET,0.0 1.391 1.862 2.153 2.375 2.587 2.778 2.953 3.274 3.413 3.528 3.539 3.844 3.933 4.153 4.416 4.655 4.75 4.899 5.045 5.259 5.386 5.505 5.677 5.837 5.986 6.127 6.259 6.446 6.613 6.763 6.952 7.131 7.306 7.487 7.673 7.855 8.041 8.23 8.429 8.622 8.825 9.069 9.309 9.564 9.803 10.014 10.194 10.331 10.331 9.995 9.376 8.746 8.118 7.561 7.004 6.473 6.021 5.645 5.262 4.923 4.625 4.358 4.112 3.88 3.666 3.438 3.229 3.057 2.892 2.717 2.565 2.41 2.26 2.152 2.041 1.916 1.78 1.637 1.537 1.435 1.281 1.17 1.047 0.988 0.875 0.749 0.608 0.534 0.251 0.311 0.221 0.132 -0.033 -0.14 -0.275 -0.417 -0.567 -0.733 -0.927 -1.236 -5 ,4634 ,KEBNE ,17022906,Wed Dec 22 07:01:42 CET,Wed Dec 22 08:23:20 CET,0.0 1.517 2.004 2.348 2.592 2.811 3.001 3.159 3.422 3.542 3.657 3.661 3.968 4.065 4.25 4.429 4.594 4.665 4.789 4.913 5.119 5.253 5.368 5.536 5.702 5.857 6.002 6.142 6.313 6.48 6.64 6.82 6.979 7.136 7.329 7.524 7.696 7.881 8.079 8.288 8.494 8.716 8.941 9.15 9.375 9.551 9.726 9.857 9.893 9.8 9.411 8.75 8.128 7.551 7.014 6.503 6.058 5.651 5.317 4.985 4.663 4.377 4.122 3.889 3.668 3.456 3.227 3.024 2.855 2.676 2.488 2.342 2.192 2.037 1.909 1.774 1.643 1.507 1.365 1.264 1.153 0.978 0.855 0.731 0.669 0.546 0.421 0.292 0.227 -0.057 0.014 -0.053 -0.133 -0.31 -0.397 -0.491 -0.586 -0.707 -0.852 -1.026 -1.284 -6 ,22106 ,KEBNE ,17022907,Wed Dec 22 07:01:42 CET,Wed Dec 22 08:24:48 CET,0.0 1.042 1.424 1.734 2.001 2.255 2.483 2.658 2.957 3.096 3.218 3.235 3.555 3.66 3.866 4.055 4.223 4.302 4.44 4.573 4.767 4.892 5.011 5.17 5.327 5.483 5.624 5.757 5.941 6.098 6.24 6.42 6.585 6.733 6.911 7.13 7.333 7.543 7.773 7.995 8.208 8.424 8.66 8.886 9.132 9.376 9.603 9.817 9.963 9.972 9.614 8.909 8.225 7.599 7.06 6.557 6.098 5.681 5.319 4.952 4.637 4.353 4.074 3.805 3.546 3.299 3.041 2.818 2.618 2.413 2.212 2.035 1.849 1.64 1.478 1.323 1.165 1.007 0.846 0.737 0.633 0.472 0.359 0.253 0.195 0.076 -0.037 -0.153 -0.216 -0.501 -0.45 -0.527 -0.614 -0.819 -0.928 -1.035 -1.143 -1.249 -1.375 -1.545 -1.853 -7 ,26054 ,KEBNE ,17022908,Wed Dec 22 07:01:42 CET,Wed Dec 22 08:23:14 CET,0.0 1.364 1.76 2.033 2.258 2.452 2.618 2.806 3.144 3.264 3.384 3.403 3.705 3.804 3.991 4.16 4.321 4.4 4.575 4.734 4.934 5.061 5.182 5.35 5.512 5.662 5.804 5.943 6.12 6.287 6.446 6.628 6.796 6.968 7.174 7.388 7.578 7.762 7.946 8.151 8.343 8.552 8.789 8.972 9.158 9.341 9.493 9.62 9.692 9.617 9.272 8.646 8.003 7.42 6.909 6.421 5.975 5.556 5.203 4.864 4.566 4.297 4.041 3.79 3.557 3.348 3.123 2.919 2.742 2.568 2.396 2.25 2.084 1.912 1.786 1.666 1.542 1.394 1.241 1.133 1.021 0.857 0.736 0.613 0.548 0.406 0.273 0.144 0.076 -0.212 -0.155 -0.235 -0.318 -0.497 -0.599 -0.702 -0.823 -0.966 -1.126 -1.344 -1.751 -8 ,23399 ,KEBNE ,17022909,Wed Dec 22 07:01:42 CET,Wed Dec 22 08:24:50 CET,0.0 1.656 2.231 2.541 2.793 2.999 3.18 3.349 3.635 3.762 3.882 3.894 4.198 4.306 4.521 4.696 4.849 4.928 5.088 5.236 5.445 5.581 5.713 5.897 6.083 6.261 6.421 6.575 6.776 6.959 7.107 7.272 7.443 7.611 7.789 7.982 8.158 8.361 8.576 8.768 8.957 9.182 9.439 9.662 9.882 10.1 10.293 10.434 10.5 10.438 10.098 9.438 8.747 8.137 7.6 7.094 6.647 6.241 5.884 5.537 5.238 4.955 4.685 4.44 4.213 3.999 3.768 3.558 3.382 3.204 3.016 2.854 2.693 2.535 2.402 2.264 2.127 1.981 1.847 1.752 1.642 1.477 1.362 1.233 1.169 1.049 0.919 0.784 0.715 0.427 0.486 0.402 0.315 0.126 0.027 -0.079 -0.2 -0.329 -0.45 -0.584 -0.931 -9 ,27011 ,KEBNE ,17022910,Wed Dec 22 07:01:42 CET,Wed Dec 22 08:24:50 CET,0.0 1.333 1.683 1.974 2.234 2.431 2.614 2.788 3.097 3.232 3.341 3.35 3.668 3.774 3.973 4.147 4.306 4.388 4.539 4.67 4.867 4.992 5.11 5.285 5.445 5.594 5.732 5.878 6.054 6.222 6.391 6.563 6.718 6.875 7.053 7.252 7.433 7.616 7.808 8.006 8.207 8.436 8.675 8.877 9.096 9.331 9.578 9.784 9.904 9.89 9.555 8.901 8.213 7.579 7.012 6.468 5.992 5.563 5.199 4.84 4.522 4.249 3.991 3.751 3.534 3.323 3.105 2.906 2.73 2.551 2.364 2.219 2.076 1.908 1.772 1.635 1.501 1.367 1.223 1.128 1.028 0.86 0.75 0.628 0.564 0.442 0.313 0.181 0.117 -0.17 -0.099 -0.179 -0.266 -0.432 -0.525 -0.637 -0.759 -0.896 -1.059 -1.327 -2.685 -10 ,23910 ,KEBNE ,17022911,Wed Dec 22 07:01:42 CET,Wed Dec 22 08:25:15 CET,0.0 1.179 1.538 1.821 2.053 2.235 2.404 2.556 2.812 2.942 3.064 3.063 3.37 3.467 3.651 3.823 4.003 4.083 4.221 4.358 4.542 4.658 4.77 4.941 5.109 5.259 5.406 5.555 5.739 5.894 6.05 6.244 6.415 6.569 6.743 6.941 7.12 7.304 7.502 7.714 7.921 8.122 8.35 8.564 8.808 9.069 9.256 9.428 9.601 9.607 9.305 8.661 7.988 7.365 6.794 6.273 5.793 5.342 4.966 4.613 4.313 4.044 3.784 3.526 3.288 3.08 2.861 2.661 2.495 2.327 2.141 1.982 1.82 1.649 1.52 1.387 1.254 1.126 0.988 0.892 0.792 0.637 0.528 0.411 0.352 0.225 0.085 -0.048 -0.114 -0.4 -0.325 -0.398 -0.481 -0.665 -0.753 -0.846 -0.96 -1.087 -1.239 -1.41 -1.614 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_32_47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_32_47.txt deleted file mode 100644 index 6e9cae51..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_32_47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17641 ,KEBNE ,17022912,Wed Dec 22 07:01:43 CET,Wed Dec 22 08:24:52 CET,0.0 2.345 2.823 3.109 3.336 3.572 3.787 3.964 4.251 4.372 4.472 4.458 4.761 4.856 5.024 5.153 5.267 5.325 5.448 5.559 5.687 5.77 5.856 5.963 6.043 6.119 6.199 6.271 6.342 6.387 6.431 6.505 6.592 6.648 6.679 6.694 6.693 6.688 6.662 6.609 6.524 6.394 6.212 5.976 5.653 5.211 4.579 3.682 2.41 0.634 -2.301 -5.749 -8.477 -10.719 -12.613 -14.238 -15.576 -16.747 -17.727 -18.686 -19.514 -20.234 -20.895 -21.499 -22.04 -22.521 -23.022 -23.46 -23.823 -24.197 -24.582 -24.892 -25.225 -25.576 -25.839 -26.107 -26.377 -26.655 -26.947 -27.14 -27.34 -27.676 -27.92 -28.168 -28.284 -28.515 -28.763 -29.012 -29.146 -29.534 -29.607 -29.776 -29.937 -30.363 -30.639 -30.87 -31.091 -31.339 -31.595 -31.931 -32.684 -2 ,15126 ,KEBNE ,17022913,Wed Dec 22 07:01:42 CET,Wed Dec 22 08:24:20 CET,0.0 1.318 1.715 2.057 2.347 2.562 2.757 2.917 3.173 3.29 3.387 3.357 3.656 3.753 3.92 4.067 4.218 4.288 4.412 4.523 4.665 4.76 4.864 5.003 5.111 5.197 5.276 5.349 5.44 5.515 5.577 5.66 5.726 5.777 5.829 5.863 5.871 5.888 5.924 5.944 5.916 5.833 5.687 5.495 5.213 4.841 4.286 3.499 2.31 0.454 -2.577 -5.999 -8.662 -10.877 -12.701 -14.255 -15.553 -16.666 -17.588 -18.515 -19.315 -20.004 -20.673 -21.285 -21.832 -22.334 -22.859 -23.315 -23.699 -24.092 -24.493 -24.828 -25.186 -25.562 -25.846 -26.133 -26.42 -26.717 -27.026 -27.22 -27.407 -27.698 -27.893 -28.092 -28.193 -28.405 -28.647 -28.901 -29.025 -29.394 -29.4 -29.525 -29.65 -29.929 -30.082 -30.241 -30.432 -30.646 -30.891 -31.189 -31.796 -3 ,31272 ,KEBNE ,17022914,Wed Dec 22 07:01:43 CET,Wed Dec 22 08:22:53 CET,0.0 2.223 2.732 3.037 3.325 3.575 3.76 3.918 4.243 4.399 4.531 4.539 4.842 4.937 5.118 5.283 5.437 5.515 5.656 5.78 5.976 6.101 6.215 6.364 6.484 6.596 6.708 6.807 6.926 7.04 7.128 7.214 7.301 7.378 7.442 7.499 7.546 7.576 7.587 7.588 7.561 7.497 7.379 7.214 6.958 6.574 6.008 5.234 4.083 2.261 -0.773 -4.232 -6.87 -9.009 -10.819 -12.385 -13.723 -14.895 -15.87 -16.828 -17.644 -18.349 -18.999 -19.612 -20.199 -20.719 -21.246 -21.709 -22.104 -22.508 -22.914 -23.25 -23.601 -23.962 -24.241 -24.527 -24.826 -25.136 -25.441 -25.649 -25.869 -26.203 -26.448 -26.699 -26.818 -27.065 -27.321 -27.597 -27.737 -28.109 -28.105 -28.23 -28.366 -28.66 -28.811 -28.964 -29.147 -29.333 -29.539 -29.8 -30.33 -4 ,12788 ,KEBNE ,17022915,Wed Dec 22 07:02:45 CET,Wed Dec 22 08:25:22 CET,0.0 1.597 2.193 2.558 2.848 3.099 3.325 3.518 3.838 3.977 4.105 4.138 4.448 4.554 4.744 4.913 5.064 5.134 5.273 5.402 5.583 5.701 5.803 5.939 6.065 6.184 6.291 6.402 6.536 6.635 6.723 6.825 6.927 7.008 7.072 7.131 7.187 7.25 7.281 7.293 7.285 7.212 7.09 6.945 6.709 6.33 5.797 5.007 3.815 2.032 -0.895 -4.29 -6.981 -9.199 -11.02 -12.581 -13.909 -15.069 -16.035 -16.975 -17.771 -18.471 -19.141 -19.745 -20.293 -20.797 -21.307 -21.774 -22.188 -22.607 -23.027 -23.378 -23.743 -24.093 -24.354 -24.626 -24.911 -25.21 -25.513 -25.712 -25.922 -26.273 -26.504 -26.741 -26.87 -27.141 -27.417 -27.697 -27.842 -28.225 -28.286 -28.447 -28.614 -28.963 -29.151 -29.365 -29.606 -29.876 -30.216 -30.684 -31.802 -5 ,7419 ,KEBNE ,17022916,Wed Dec 22 07:02:45 CET,Wed Dec 22 08:24:10 CET,0.0 1.491 1.856 2.176 2.44 2.622 2.784 2.906 3.128 3.242 3.343 3.308 3.605 3.705 3.862 3.989 4.13 4.205 4.328 4.422 4.585 4.708 4.813 4.95 5.066 5.164 5.27 5.378 5.512 5.607 5.662 5.729 5.795 5.843 5.884 5.937 5.964 5.974 5.967 5.922 5.871 5.816 5.705 5.526 5.223 4.814 4.233 3.396 2.199 0.406 -2.617 -6.125 -8.859 -11.062 -12.839 -14.396 -15.751 -16.9 -17.857 -18.828 -19.637 -20.326 -20.977 -21.575 -22.125 -22.627 -23.141 -23.58 -23.952 -24.33 -24.717 -25.042 -25.369 -25.699 -25.952 -26.215 -26.494 -26.784 -27.079 -27.281 -27.473 -27.765 -27.973 -28.185 -28.293 -28.508 -28.741 -28.988 -29.122 -29.521 -29.595 -29.755 -29.915 -30.231 -30.419 -30.656 -30.937 -31.212 -31.552 -32.0 -32.891 -6 ,4963 ,KEBNE ,17022917,Wed Dec 22 07:02:45 CET,Wed Dec 22 08:25:37 CET,0.0 1.697 2.133 2.443 2.695 2.933 3.146 3.34 3.669 3.809 3.929 3.918 4.212 4.288 4.426 4.539 4.653 4.711 4.812 4.899 5.008 5.082 5.152 5.237 5.307 5.368 5.439 5.51 5.587 5.648 5.706 5.754 5.791 5.825 5.841 5.855 5.869 5.858 5.806 5.726 5.639 5.521 5.333 5.078 4.717 4.26 3.635 2.798 1.609 -0.204 -3.129 -6.468 -9.069 -11.192 -12.97 -14.514 -15.819 -16.964 -17.94 -18.92 -19.78 -20.54 -21.243 -21.898 -22.495 -23.033 -23.582 -24.055 -24.472 -24.912 -25.354 -25.707 -26.077 -26.478 -26.778 -27.073 -27.376 -27.692 -28.023 -28.246 -28.475 -28.823 -29.071 -29.324 -29.446 -29.704 -30.003 -30.313 -30.467 -30.879 -30.978 -31.164 -31.348 -31.73 -31.948 -32.162 -32.365 -32.63 -33.008 -33.463 -34.531 -7 ,32732 ,KEBNE ,17022918,Wed Dec 22 07:02:45 CET,Wed Dec 22 08:25:35 CET,0.0 1.336 1.76 2.09 2.353 2.545 2.708 2.865 3.121 3.219 3.311 3.273 3.552 3.626 3.763 3.9 4.036 4.094 4.205 4.294 4.405 4.473 4.531 4.624 4.719 4.81 4.894 4.958 5.03 5.088 5.139 5.19 5.229 5.275 5.314 5.329 5.317 5.299 5.277 5.22 5.114 4.973 4.78 4.532 4.173 3.687 3.029 2.178 0.946 -0.916 -3.927 -7.351 -10.029 -12.212 -13.995 -15.545 -16.853 -18.014 -18.989 -19.89 -20.64 -21.297 -21.916 -22.5 -23.025 -23.488 -23.955 -24.369 -24.723 -25.082 -25.454 -25.768 -26.092 -26.399 -26.628 -26.867 -27.112 -27.359 -27.608 -27.781 -27.968 -28.274 -28.489 -28.71 -28.823 -29.058 -29.298 -29.544 -29.656 -30.02 -30.028 -30.155 -30.281 -30.569 -30.727 -30.909 -31.107 -31.317 -31.546 -31.771 -32.208 -8 ,18901 ,KEBNE ,17022919,Wed Dec 22 07:02:49 CET,Wed Dec 22 08:17:32 CET,0.0 2.288 2.718 3.078 3.385 3.651 3.881 4.091 4.421 4.549 4.668 4.691 5.011 5.12 5.31 5.48 5.629 5.695 5.821 5.942 6.115 6.219 6.315 6.456 6.594 6.715 6.82 6.915 7.027 7.13 7.217 7.311 7.391 7.456 7.527 7.597 7.657 7.702 7.715 7.711 7.677 7.599 7.465 7.288 7.027 6.653 6.104 5.301 4.124 2.303 -0.712 -4.076 -6.756 -8.981 -10.82 -12.4 -13.728 -14.896 -15.871 -16.817 -17.624 -18.341 -19.021 -19.65 -20.207 -20.716 -21.259 -21.734 -22.138 -22.557 -22.975 -23.327 -23.688 -24.043 -24.311 -24.583 -24.858 -25.128 -25.406 -25.595 -25.807 -26.145 -26.358 -26.579 -26.688 -26.909 -27.141 -27.389 -27.531 -27.932 -28.004 -28.161 -28.316 -28.65 -28.86 -29.113 -29.374 -29.641 -29.959 -30.386 -31.842 -9 ,18116 ,KEBNE ,17022920,Wed Dec 22 07:02:45 CET,Wed Dec 22 08:25:31 CET,0.0 1.94 2.309 2.618 2.846 3.022 3.183 3.332 3.614 3.731 3.834 3.821 4.104 4.19 4.342 4.486 4.632 4.69 4.802 4.905 5.05 5.139 5.221 5.337 5.443 5.54 5.631 5.706 5.793 5.871 5.945 6.046 6.122 6.178 6.227 6.273 6.311 6.317 6.285 6.225 6.13 5.996 5.8 5.543 5.194 4.723 4.045 3.177 1.954 0.11 -2.911 -6.352 -9.043 -11.252 -13.034 -14.589 -15.925 -17.063 -18.028 -19.001 -19.803 -20.489 -21.149 -21.765 -22.325 -22.827 -23.341 -23.795 -24.181 -24.576 -24.983 -25.306 -25.633 -25.963 -26.217 -26.493 -26.77 -27.063 -27.361 -27.551 -27.748 -28.071 -28.291 -28.514 -28.632 -28.871 -29.105 -29.372 -29.515 -29.899 -29.932 -30.078 -30.237 -30.578 -30.75 -30.92 -31.111 -31.391 -31.781 -32.319 -33.457 -10 ,8322 ,KEBNE ,17022921,Wed Dec 22 07:02:45 CET,Wed Dec 22 08:24:03 CET,0.0 2.18 2.631 2.93 3.164 3.355 3.535 3.696 3.965 4.08 4.19 4.19 4.494 4.586 4.763 4.948 5.12 5.193 5.314 5.423 5.573 5.667 5.758 5.885 5.991 6.079 6.157 6.233 6.34 6.425 6.49 6.56 6.627 6.687 6.737 6.772 6.783 6.778 6.757 6.707 6.623 6.51 6.345 6.142 5.864 5.47 4.889 4.1 2.937 1.134 -1.822 -5.168 -7.806 -9.998 -11.808 -13.34 -14.653 -15.836 -16.85 -17.832 -18.658 -19.387 -20.064 -20.7 -21.283 -21.809 -22.361 -22.857 -23.278 -23.698 -24.108 -24.456 -24.832 -25.204 -25.479 -25.76 -26.04 -26.329 -26.636 -26.84 -27.051 -27.382 -27.605 -27.843 -27.968 -28.233 -28.518 -28.825 -28.982 -29.374 -29.396 -29.537 -29.681 -29.963 -30.112 -30.275 -30.468 -30.671 -30.892 -31.156 -31.761 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_32.txt deleted file mode 100644 index 7911be02..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3757 ,TETRA ,17550866,Thu Nov 25 09:44:28 CET,Thu Nov 25 11:19:40 CET,0.0 0.369 0.595 0.767 0.912 1.039 1.156 1.264 1.454 1.547 1.634 1.599 1.891 1.969 2.115 2.255 2.393 2.457 2.578 2.692 2.86 2.972 3.08 3.23 3.379 3.528 3.675 3.815 3.99 4.153 4.311 4.5 4.678 4.849 5.04 5.249 5.455 5.682 5.916 6.167 6.421 6.698 7.036 7.379 7.752 8.159 8.616 9.079 9.559 10.017 10.378 10.396 10.194 9.924 9.636 9.315 8.984 8.671 8.393 8.099 7.822 7.57 7.348 7.131 6.912 6.709 6.484 6.285 6.115 5.935 5.748 5.587 5.424 5.255 5.117 4.982 4.847 4.697 4.541 4.433 4.318 4.13 3.994 3.844 3.769 3.613 3.445 3.272 3.18 2.874 2.861 2.741 2.615 2.368 2.24 2.064 1.833 1.542 1.21 0.791 -0.5 -2 ,4378 ,TETRA ,17550867,Thu Nov 25 09:44:26 CET,Thu Nov 25 11:11:22 CET,0.0 0.982 1.278 1.496 1.675 1.823 1.934 2.035 2.225 2.324 2.425 2.383 2.657 2.724 2.871 3.024 3.165 3.224 3.345 3.475 3.656 3.761 3.862 4.015 4.161 4.304 4.447 4.586 4.766 4.935 5.083 5.266 5.46 5.654 5.878 6.124 6.346 6.591 6.86 7.137 7.43 7.75 8.105 8.451 8.834 9.235 9.661 10.132 10.671 11.209 11.63 11.661 11.427 11.117 10.778 10.439 10.138 9.843 9.58 9.305 9.053 8.823 8.597 8.353 8.121 7.927 7.712 7.523 7.35 7.169 6.976 6.808 6.632 6.449 6.321 6.191 6.04 5.887 5.732 5.614 5.475 5.237 5.059 4.864 4.77 4.579 4.372 4.15 4.042 3.721 3.648 3.489 3.318 2.97 2.785 2.594 2.39 2.173 1.958 1.652 0.108 -3 ,1497 ,TETRA ,17550868,Thu Nov 25 09:44:25 CET,Thu Nov 25 11:18:19 CET,0.0 0.48 0.709 0.894 1.079 1.244 1.382 1.503 1.73 1.828 1.912 1.867 2.16 2.241 2.39 2.544 2.69 2.761 2.9 3.035 3.232 3.354 3.458 3.615 3.773 3.907 4.025 4.144 4.305 4.466 4.631 4.818 4.981 5.14 5.332 5.566 5.797 6.036 6.29 6.562 6.854 7.187 7.546 7.891 8.299 8.713 9.154 9.632 10.131 10.582 10.904 10.921 10.73 10.439 10.124 9.828 9.533 9.217 8.911 8.606 8.362 8.132 7.907 7.695 7.491 7.288 7.068 6.881 6.72 6.535 6.34 6.194 6.04 5.872 5.738 5.594 5.444 5.292 5.126 4.996 4.862 4.681 4.553 4.407 4.328 4.17 4.013 3.841 3.752 3.461 3.435 3.282 3.131 2.807 2.608 2.372 2.11 1.856 1.558 1.14 0.038 -4 ,20171 ,TETRA ,17550869,Thu Nov 25 09:44:27 CET,Thu Nov 25 11:21:05 CET,0.0 1.248 1.639 1.958 2.242 2.434 2.582 2.73 3.023 3.139 3.225 3.18 3.475 3.552 3.682 3.82 3.966 4.032 4.167 4.296 4.473 4.587 4.693 4.852 5.022 5.184 5.338 5.492 5.687 5.866 6.04 6.247 6.441 6.634 6.853 7.093 7.322 7.568 7.826 8.117 8.414 8.718 9.064 9.399 9.779 10.196 10.641 11.102 11.662 12.234 12.608 12.587 12.338 12.013 11.7 11.385 11.066 10.76 10.49 10.195 9.93 9.683 9.442 9.225 9.026 8.843 8.642 8.443 8.246 8.04 7.851 7.703 7.519 7.301 7.134 6.971 6.819 6.664 6.492 6.373 6.257 6.071 5.934 5.798 5.73 5.582 5.421 5.253 5.165 4.857 4.835 4.726 4.612 4.341 4.166 3.96 3.75 3.511 3.179 2.711 1.568 -5 ,17645 ,TETRA ,17550870,Thu Nov 25 09:44:29 CET,Thu Nov 25 11:04:47 CET,0.0 0.49 0.744 0.919 1.053 1.178 1.314 1.47 1.749 1.855 1.946 1.916 2.206 2.283 2.418 2.559 2.7 2.775 2.931 3.073 3.269 3.403 3.528 3.686 3.86 4.038 4.193 4.343 4.526 4.699 4.874 5.079 5.272 5.463 5.674 5.913 6.153 6.387 6.629 6.889 7.162 7.485 7.846 8.195 8.599 9.043 9.528 10.021 10.516 11.015 11.403 11.348 11.077 10.74 10.386 10.038 9.715 9.41 9.141 8.848 8.579 8.339 8.107 7.879 7.651 7.456 7.259 7.056 6.876 6.687 6.496 6.336 6.172 6.005 5.873 5.741 5.606 5.462 5.305 5.191 5.066 4.882 4.751 4.61 4.535 4.373 4.207 4.024 3.934 3.639 3.651 3.55 3.435 3.155 2.976 2.769 2.532 2.255 1.941 1.551 0.46 -6 ,26003 ,TETRA ,17550871,Thu Nov 25 09:44:26 CET,Thu Nov 25 11:19:51 CET,0.0 0.483 0.72 0.947 1.151 1.323 1.486 1.644 1.912 2.03 2.165 2.243 2.57 2.686 2.884 3.038 3.169 3.239 3.382 3.518 3.715 3.841 3.961 4.141 4.319 4.483 4.639 4.791 4.968 5.145 5.323 5.522 5.713 5.894 6.11 6.34 6.562 6.814 7.054 7.323 7.622 7.935 8.278 8.608 9.0 9.434 9.874 10.322 10.798 11.239 11.595 11.64 11.413 11.117 10.843 10.53 10.22 9.918 9.629 9.339 9.08 8.853 8.63 8.399 8.169 7.972 7.768 7.569 7.401 7.229 7.045 6.89 6.727 6.553 6.423 6.288 6.137 5.987 5.841 5.728 5.604 5.423 5.298 5.165 5.099 4.963 4.79 4.557 4.432 4.103 4.048 3.907 3.753 3.428 3.259 3.075 2.848 2.589 2.269 1.849 0.818 -7 ,3246 ,TETRA ,17550872,Thu Nov 25 09:44:29 CET,Thu Nov 25 11:17:52 CET,0.0 1.194 1.584 1.899 2.173 2.413 2.571 2.669 2.85 2.936 3.02 2.967 3.243 3.316 3.458 3.594 3.736 3.811 3.954 4.083 4.265 4.375 4.476 4.621 4.762 4.899 5.027 5.152 5.321 5.486 5.637 5.816 5.997 6.164 6.344 6.551 6.751 6.977 7.224 7.481 7.736 8.021 8.357 8.684 9.047 9.422 9.829 10.281 10.759 11.236 11.61 11.611 11.357 11.033 10.694 10.335 9.994 9.659 9.372 9.067 8.802 8.577 8.35 8.132 7.939 7.766 7.585 7.423 7.274 7.108 6.933 6.784 6.622 6.464 6.347 6.216 6.048 5.872 5.703 5.578 5.456 5.285 5.177 5.055 4.981 4.807 4.6 4.395 4.308 4.016 4.01 3.884 3.749 3.442 3.282 3.109 2.913 2.678 2.385 2.022 0.75 -8 ,22263 ,TETRA ,17550873,Thu Nov 25 09:44:27 CET,Thu Nov 25 11:11:32 CET,0.0 0.887 1.107 1.263 1.386 1.514 1.639 1.758 1.976 2.083 2.183 2.152 2.443 2.515 2.644 2.769 2.9 2.974 3.107 3.226 3.405 3.524 3.635 3.788 3.946 4.105 4.257 4.402 4.591 4.775 4.949 5.164 5.368 5.558 5.783 6.012 6.23 6.483 6.75 7.021 7.304 7.611 7.966 8.317 8.695 9.105 9.573 10.056 10.541 10.983 11.314 11.348 11.164 10.863 10.52 10.178 9.862 9.544 9.231 8.921 8.672 8.43 8.195 7.978 7.766 7.564 7.337 7.132 6.956 6.775 6.595 6.434 6.269 6.099 5.956 5.811 5.67 5.522 5.364 5.25 5.125 4.941 4.801 4.634 4.539 4.337 4.148 3.955 3.842 3.511 3.464 3.344 3.23 2.97 2.815 2.663 2.485 2.238 1.92 1.482 0.302 -9 ,7087 ,TETRA ,17550874,Thu Nov 25 09:44:26 CET,Thu Nov 25 11:18:40 CET,0.0 0.739 0.973 1.157 1.315 1.473 1.615 1.757 2.047 2.185 2.308 2.314 2.621 2.727 2.936 3.129 3.316 3.411 3.606 3.784 4.03 4.194 4.354 4.604 4.845 5.058 5.266 5.468 5.718 5.926 6.087 6.29 6.494 6.683 6.906 7.172 7.414 7.657 7.913 8.184 8.468 8.768 9.123 9.485 9.87 10.271 10.709 11.154 11.599 12.053 12.425 12.393 12.17 11.89 11.582 11.25 10.926 10.638 10.372 10.085 9.84 9.621 9.389 9.15 8.926 8.727 8.519 8.324 8.147 7.972 7.798 7.65 7.5 7.344 7.207 7.067 6.924 6.768 6.602 6.485 6.369 6.187 6.046 5.885 5.795 5.567 5.336 5.135 5.027 4.693 4.599 4.454 4.306 4.009 3.86 3.698 3.476 3.206 2.911 2.57 1.542 -10 ,19994 ,TETRA ,17550875,Thu Nov 25 09:44:28 CET,Thu Nov 25 11:18:31 CET,0.0 1.25 1.726 2.065 2.323 2.559 2.761 2.93 3.279 3.436 3.562 3.587 3.896 3.996 4.182 4.362 4.53 4.612 4.78 4.947 5.182 5.316 5.436 5.611 5.789 5.983 6.167 6.323 6.517 6.701 6.886 7.098 7.299 7.496 7.702 7.944 8.176 8.412 8.672 8.942 9.212 9.523 9.874 10.209 10.587 10.998 11.451 11.911 12.41 12.933 13.293 13.29 13.055 12.746 12.436 12.126 11.844 11.561 11.283 10.977 10.725 10.494 10.266 10.044 9.823 9.633 9.436 9.265 9.115 8.948 8.778 8.619 8.443 8.275 8.152 8.021 7.888 7.736 7.563 7.457 7.345 7.15 7.015 6.869 6.789 6.642 6.491 6.308 6.203 5.894 5.88 5.757 5.628 5.298 5.125 4.936 4.713 4.477 4.205 3.868 3.19 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_35.txt deleted file mode 100644 index 760df34f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7085 ,KEBNE ,17022922,Wed Dec 22 07:02:45 CET,Wed Dec 22 08:25:00 CET,0.0 1.168 1.531 1.819 2.067 2.286 2.472 2.625 2.937 3.079 3.215 3.269 3.587 3.694 3.879 4.053 4.222 4.299 4.449 4.597 4.812 4.949 5.081 5.268 5.436 5.594 5.74 5.893 6.099 6.292 6.477 6.683 6.876 7.065 7.288 7.538 7.764 7.996 8.237 8.482 8.737 9.039 9.372 9.685 10.036 10.397 10.762 11.131 11.508 11.812 11.957 11.806 11.478 11.102 10.726 10.343 9.982 9.656 9.352 9.04 8.766 8.524 8.287 8.044 7.823 7.621 7.396 7.187 7.018 6.85 6.675 6.522 6.36 6.194 6.068 5.931 5.776 5.611 5.436 5.323 5.184 4.946 4.791 4.64 4.563 4.404 4.257 4.095 3.999 3.705 3.726 3.624 3.516 3.212 3.037 2.882 2.675 2.435 2.185 1.818 0.931 -2 ,25620 ,KEBNE ,17022923,Wed Dec 22 07:02:45 CET,Wed Dec 22 08:23:37 CET,0.0 1.657 2.131 2.444 2.678 2.869 3.036 3.187 3.478 3.608 3.732 3.766 4.081 4.189 4.379 4.556 4.733 4.819 4.984 5.142 5.368 5.506 5.638 5.823 5.999 6.168 6.321 6.463 6.648 6.821 6.993 7.2 7.397 7.589 7.82 8.075 8.288 8.518 8.771 9.02 9.284 9.583 9.915 10.241 10.572 10.914 11.284 11.65 12.003 12.292 12.413 12.232 11.895 11.521 11.138 10.769 10.411 10.063 9.769 9.461 9.181 8.921 8.684 8.459 8.24 8.044 7.824 7.628 7.464 7.285 7.096 6.945 6.775 6.587 6.446 6.303 6.171 6.036 5.878 5.766 5.641 5.448 5.314 5.174 5.107 4.953 4.778 4.609 4.524 4.237 4.263 4.166 4.07 3.874 3.744 3.584 3.405 3.183 2.926 2.626 1.909 -3 ,5386 ,KEBNE ,17022924,Wed Dec 22 07:02:45 CET,Wed Dec 22 08:24:54 CET,0.0 1.174 1.549 1.868 2.155 2.411 2.646 2.842 3.177 3.327 3.46 3.506 3.819 3.922 4.142 4.34 4.519 4.609 4.782 4.938 5.156 5.292 5.43 5.635 5.824 5.995 6.151 6.312 6.549 6.771 6.965 7.203 7.423 7.619 7.838 8.067 8.28 8.52 8.767 9.017 9.277 9.54 9.822 10.107 10.433 10.77 11.154 11.562 11.943 12.253 12.356 12.138 11.78 11.397 11.035 10.675 10.321 9.971 9.675 9.379 9.117 8.897 8.676 8.461 8.258 8.054 7.828 7.636 7.47 7.3 7.129 6.976 6.821 6.658 6.518 6.358 6.202 6.061 5.907 5.793 5.676 5.485 5.355 5.21 5.132 4.993 4.853 4.686 4.596 4.299 4.292 4.187 4.088 3.765 3.573 3.415 3.223 3.014 2.794 2.499 1.691 -4 ,26613 ,KEBNE ,17022925,Wed Dec 22 07:02:45 CET,Wed Dec 22 08:23:38 CET,0.0 1.505 2.003 2.362 2.657 2.911 3.133 3.318 3.656 3.812 3.952 4.031 4.374 4.498 4.742 5.006 5.237 5.342 5.544 5.722 5.992 6.166 6.322 6.543 6.756 6.958 7.153 7.349 7.608 7.845 8.065 8.326 8.54 8.723 8.951 9.194 9.412 9.644 9.882 10.135 10.396 10.673 10.977 11.269 11.62 11.996 12.361 12.723 13.087 13.389 13.529 13.337 12.978 12.605 12.256 11.903 11.574 11.246 10.937 10.612 10.339 10.096 9.858 9.653 9.452 9.249 9.038 8.856 8.679 8.457 8.227 8.046 7.844 7.62 7.449 7.273 7.101 6.942 6.791 6.688 6.583 6.387 6.239 6.085 6.006 5.847 5.693 5.523 5.423 5.118 5.09 4.965 4.844 4.581 4.41 4.229 4.046 3.835 3.553 3.212 2.366 -5 ,19243 ,KEBNE ,17022926,Wed Dec 22 07:03:47 CET,Wed Dec 22 08:26:03 CET,0.0 1.027 1.418 1.687 1.915 2.151 2.368 2.541 2.824 2.965 3.104 3.146 3.471 3.59 3.817 4.03 4.225 4.325 4.51 4.669 4.886 5.022 5.158 5.37 5.562 5.749 5.928 6.079 6.263 6.445 6.619 6.822 7.022 7.215 7.426 7.648 7.854 8.078 8.306 8.549 8.802 9.071 9.366 9.648 9.979 10.345 10.724 11.093 11.448 11.744 11.842 11.594 11.197 10.755 10.357 9.983 9.638 9.315 9.015 8.696 8.425 8.179 7.935 7.7 7.481 7.279 7.071 6.874 6.697 6.514 6.327 6.17 6.0 5.806 5.653 5.512 5.365 5.204 5.003 4.851 4.704 4.48 4.32 4.155 4.079 3.922 3.742 3.543 3.446 3.146 3.149 3.035 2.894 2.569 2.417 2.273 2.127 1.935 1.677 1.34 0.59 -6 ,8459 ,KEBNE ,17022927,Wed Dec 22 07:03:47 CET,Wed Dec 22 08:24:38 CET,0.0 1.067 1.442 1.702 1.912 2.1 2.276 2.434 2.739 2.887 3.018 3.038 3.349 3.46 3.679 3.86 4.027 4.118 4.286 4.43 4.636 4.758 4.871 5.059 5.242 5.403 5.553 5.699 5.893 6.077 6.262 6.489 6.69 6.877 7.083 7.312 7.525 7.761 8.025 8.285 8.539 8.831 9.178 9.493 9.815 10.16 10.53 10.902 11.3 11.632 11.767 11.585 11.242 10.853 10.482 10.1 9.735 9.403 9.101 8.777 8.498 8.244 7.988 7.752 7.539 7.332 7.114 6.907 6.728 6.552 6.362 6.206 6.027 5.807 5.632 5.459 5.28 5.086 4.865 4.707 4.541 4.28 4.106 3.917 3.819 3.626 3.41 3.185 3.079 2.77 2.756 2.631 2.485 2.134 1.936 1.729 1.484 1.185 0.831 0.399 -0.828 -7 ,31789 ,KEBNE ,17022928,Wed Dec 22 07:03:47 CET,Wed Dec 22 08:24:51 CET,0.0 1.159 1.713 2.098 2.379 2.643 2.88 3.095 3.483 3.651 3.814 3.898 4.204 4.298 4.484 4.651 4.808 4.885 5.03 5.164 5.371 5.516 5.646 5.821 5.992 6.157 6.337 6.519 6.731 6.912 7.08 7.286 7.473 7.648 7.846 8.082 8.318 8.558 8.806 9.074 9.35 9.639 9.952 10.243 10.554 10.89 11.259 11.652 12.04 12.309 12.392 12.16 11.768 11.345 10.925 10.534 10.168 9.812 9.498 9.196 8.94 8.698 8.457 8.22 7.999 7.784 7.558 7.377 7.216 7.031 6.836 6.675 6.512 6.343 6.212 6.083 5.94 5.785 5.628 5.516 5.394 5.203 5.083 4.956 4.883 4.731 4.577 4.417 4.334 4.045 4.049 3.935 3.805 3.478 3.302 3.1 2.863 2.611 2.333 1.981 1.043 -8 ,13032 ,KEBNE ,17022929,Wed Dec 22 07:03:47 CET,Wed Dec 22 08:25:56 CET,0.0 1.46 1.896 2.21 2.444 2.649 2.845 2.999 3.285 3.426 3.559 3.615 3.933 4.036 4.214 4.388 4.558 4.639 4.791 4.938 5.157 5.295 5.424 5.596 5.765 5.928 6.08 6.228 6.413 6.587 6.769 6.983 7.179 7.362 7.575 7.812 8.023 8.249 8.477 8.721 8.988 9.273 9.581 9.877 10.229 10.596 10.958 11.321 11.678 11.995 12.149 11.934 11.562 11.16 10.791 10.431 10.077 9.741 9.455 9.157 8.888 8.631 8.371 8.137 7.915 7.701 7.484 7.291 7.121 6.95 6.771 6.614 6.45 6.274 6.143 6.007 5.857 5.702 5.546 5.444 5.341 5.156 5.016 4.874 4.803 4.658 4.5 4.326 4.238 3.949 3.948 3.845 3.727 3.438 3.286 3.109 2.889 2.676 2.461 2.203 1.472 -9 ,20342 ,KEBNE ,17022930,Wed Dec 22 07:03:47 CET,Wed Dec 22 08:24:34 CET,0.0 0.985 1.345 1.674 1.935 2.156 2.345 2.512 2.827 2.969 3.107 3.165 3.478 3.58 3.788 4.001 4.192 4.284 4.451 4.595 4.807 4.943 5.078 5.281 5.469 5.631 5.783 5.931 6.131 6.32 6.506 6.717 6.907 7.085 7.292 7.531 7.742 7.969 8.22 8.491 8.767 9.065 9.4 9.719 10.059 10.416 10.785 11.155 11.521 11.807 11.964 11.813 11.445 11.009 10.578 10.196 9.865 9.537 9.243 8.95 8.686 8.43 8.182 7.946 7.728 7.522 7.302 7.098 6.927 6.759 6.568 6.402 6.226 6.05 5.924 5.786 5.641 5.495 5.331 5.214 5.093 4.921 4.807 4.677 4.61 4.464 4.286 4.097 3.997 3.684 3.66 3.537 3.389 3.063 2.872 2.698 2.537 2.317 2.073 1.804 1.177 -10 ,17877 ,KEBNE ,17022931,Wed Dec 22 07:03:47 CET,Wed Dec 22 08:26:03 CET,0.0 1.386 1.845 2.213 2.499 2.737 2.932 3.074 3.353 3.495 3.636 3.687 4.0 4.105 4.288 4.448 4.611 4.693 4.856 5.023 5.253 5.409 5.578 5.805 6.01 6.213 6.446 6.672 6.897 7.083 7.252 7.451 7.652 7.846 8.068 8.319 8.548 8.784 9.023 9.27 9.527 9.789 10.084 10.396 10.718 11.051 11.442 11.857 12.241 12.534 12.637 12.386 12.068 11.681 11.259 10.864 10.507 10.171 9.886 9.583 9.3 9.065 8.842 8.608 8.396 8.207 7.996 7.8 7.634 7.459 7.273 7.111 6.937 6.768 6.64 6.512 6.367 6.212 6.062 5.948 5.826 5.638 5.507 5.375 5.301 5.131 4.949 4.778 4.695 4.403 4.411 4.299 4.19 3.93 3.748 3.543 3.349 3.13 2.851 2.498 1.48 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_36.txt deleted file mode 100644 index e7e69b72..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_36.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4570 ,KEBNE ,17022932,Wed Dec 22 07:03:47 CET,Wed Dec 22 08:26:54 CET,0.0 1.87 2.315 2.622 2.918 3.182 3.415 3.625 3.999 4.167 4.323 4.406 4.742 4.871 5.104 5.322 5.531 5.629 5.824 5.996 6.213 6.362 6.511 6.708 6.904 7.094 7.264 7.431 7.643 7.852 8.059 8.298 8.518 8.713 8.933 9.179 9.402 9.646 9.902 10.157 10.419 10.7 11.04 11.38 11.745 12.107 12.476 12.881 13.284 13.597 13.7 13.474 13.105 12.696 12.284 11.862 11.471 11.118 10.814 10.493 10.203 9.952 9.706 9.472 9.257 9.06 8.853 8.654 8.488 8.317 8.127 7.961 7.784 7.604 7.477 7.344 7.195 7.046 6.893 6.785 6.669 6.477 6.337 6.189 6.113 5.952 5.787 5.613 5.513 5.213 5.244 5.135 5.022 4.798 4.669 4.534 4.345 4.073 3.761 3.329 2.12 -2 ,26489 ,KEBNE ,17022933,Wed Dec 22 07:03:47 CET,Wed Dec 22 08:26:33 CET,0.0 2.045 2.671 3.118 3.427 3.717 4.0 4.249 4.683 4.866 5.017 5.112 5.471 5.607 5.879 6.13 6.318 6.407 6.58 6.734 6.966 7.124 7.269 7.474 7.663 7.832 8.002 8.171 8.385 8.586 8.777 9.008 9.228 9.432 9.672 9.935 10.159 10.416 10.701 10.976 11.238 11.52 11.84 12.171 12.564 12.931 13.311 13.72 14.052 14.283 14.352 14.056 13.624 13.214 12.804 12.379 11.999 11.635 11.311 10.997 10.737 10.502 10.258 10.005 9.767 9.545 9.31 9.115 8.948 8.77 8.588 8.437 8.276 8.104 7.972 7.831 7.678 7.522 7.37 7.269 7.163 6.985 6.857 6.723 6.654 6.504 6.336 6.153 6.059 5.755 5.739 5.637 5.534 5.307 5.176 5.013 4.821 4.64 4.441 4.199 3.641 -3 ,28209 ,KEBNE ,17022934,Wed Dec 22 07:04:48 CET,Wed Dec 22 08:27:16 CET,0.0 2.315 2.908 3.338 3.673 3.938 4.176 4.394 4.802 4.991 5.152 5.238 5.578 5.695 5.926 6.138 6.325 6.414 6.591 6.755 6.986 7.144 7.295 7.499 7.691 7.883 8.07 8.241 8.442 8.642 8.835 9.059 9.266 9.464 9.69 9.947 10.201 10.453 10.724 11.007 11.271 11.564 11.918 12.238 12.571 12.922 13.276 13.624 13.949 14.203 14.305 14.082 13.645 13.183 12.761 12.336 11.941 11.592 11.281 10.959 10.671 10.401 10.156 9.919 9.696 9.504 9.297 9.096 8.921 8.741 8.567 8.428 8.276 8.114 7.988 7.849 7.694 7.532 7.366 7.256 7.141 6.963 6.846 6.711 6.633 6.485 6.323 6.152 6.069 5.775 5.798 5.701 5.603 5.397 5.273 5.127 4.973 4.81 4.602 4.362 3.742 -4 ,23280 ,KEBNE ,17022935,Wed Dec 22 07:04:49 CET,Wed Dec 22 08:26:23 CET,0.0 1.961 2.395 2.74 3.033 3.321 3.58 3.787 4.13 4.286 4.439 4.531 4.868 5.006 5.272 5.531 5.772 5.873 6.067 6.247 6.474 6.611 6.748 6.96 7.167 7.367 7.549 7.72 7.949 8.175 8.373 8.589 8.798 9.011 9.256 9.506 9.734 9.977 10.245 10.535 10.819 11.134 11.464 11.77 12.136 12.52 12.933 13.349 13.729 13.996 14.05 13.745 13.312 12.853 12.435 12.072 11.717 11.383 11.086 10.758 10.453 10.153 9.835 9.525 9.236 8.986 8.76 8.575 8.414 8.238 8.044 7.882 7.717 7.55 7.421 7.281 7.135 6.982 6.822 6.711 6.59 6.4 6.28 6.155 6.087 5.944 5.793 5.64 5.546 5.237 5.238 5.128 5.012 4.764 4.632 4.471 4.28 4.091 3.894 3.624 2.899 -5 ,29290 ,KEBNE ,17022936,Wed Dec 22 07:04:48 CET,Wed Dec 22 08:27:35 CET,0.0 1.958 2.457 2.805 3.153 3.437 3.653 3.84 4.159 4.303 4.445 4.5 4.826 4.954 5.203 5.418 5.612 5.715 5.887 6.047 6.288 6.433 6.588 6.81 7.009 7.192 7.361 7.534 7.751 7.944 8.128 8.35 8.553 8.744 8.969 9.228 9.469 9.718 9.981 10.24 10.512 10.827 11.178 11.519 11.861 12.189 12.595 13.01 13.364 13.629 13.687 13.418 13.023 12.584 12.179 11.788 11.415 11.061 10.746 10.439 10.166 9.903 9.655 9.413 9.182 8.972 8.748 8.54 8.352 8.156 7.941 7.772 7.601 7.406 7.257 7.114 6.956 6.78 6.598 6.474 6.348 6.142 5.993 5.83 5.745 5.58 5.416 5.24 5.148 4.841 4.82 4.697 4.576 4.333 4.179 3.985 3.781 3.569 3.291 2.914 1.953 -6 ,5802 ,KEBNE ,17022937,Wed Dec 22 07:04:48 CET,Wed Dec 22 08:25:52 CET,0.0 2.748 3.39 3.808 4.149 4.445 4.707 4.938 5.358 5.534 5.683 5.753 6.082 6.208 6.459 6.675 6.872 6.964 7.133 7.299 7.535 7.684 7.829 8.034 8.22 8.397 8.561 8.729 8.955 9.151 9.335 9.557 9.77 9.978 10.217 10.487 10.743 11.017 11.297 11.564 11.832 12.128 12.449 12.777 13.144 13.516 13.881 14.212 14.545 14.845 14.95 14.669 14.28 13.9 13.518 13.134 12.767 12.39 12.063 11.748 11.48 11.244 11.012 10.789 10.571 10.365 10.156 9.963 9.8 9.623 9.416 9.235 9.054 8.87 8.721 8.566 8.406 8.245 8.081 7.958 7.818 7.616 7.489 7.355 7.282 7.119 6.938 6.753 6.653 6.336 6.327 6.223 6.11 5.841 5.692 5.525 5.337 5.14 4.908 4.598 4.092 -7 ,2781 ,KEBNE ,17022938,Wed Dec 22 07:04:48 CET,Wed Dec 22 08:27:37 CET,0.0 2.629 3.154 3.513 3.832 4.121 4.365 4.549 4.905 5.081 5.227 5.261 5.578 5.687 5.886 6.064 6.237 6.328 6.502 6.666 6.903 7.053 7.197 7.41 7.601 7.782 7.958 8.125 8.336 8.537 8.725 8.932 9.131 9.339 9.578 9.827 10.058 10.303 10.557 10.839 11.145 11.471 11.828 12.159 12.507 12.891 13.303 13.712 14.087 14.394 14.561 14.307 13.889 13.462 13.065 12.689 12.324 11.974 11.651 11.325 11.068 10.839 10.596 10.354 10.12 9.905 9.685 9.486 9.319 9.131 8.92 8.761 8.615 8.455 8.325 8.193 8.042 7.882 7.723 7.609 7.496 7.319 7.169 7.013 6.94 6.792 6.627 6.445 6.362 6.074 6.093 5.977 5.849 5.588 5.452 5.296 5.098 4.877 4.626 4.276 3.435 -8 ,30898 ,KEBNE ,17022939,Wed Dec 22 07:05:50 CET,Wed Dec 22 08:28:25 CET,0.0 2.7 3.296 3.692 4.017 4.288 4.512 4.733 5.165 5.357 5.532 5.679 6.044 6.187 6.436 6.661 6.88 6.985 7.175 7.36 7.623 7.781 7.928 8.125 8.311 8.496 8.669 8.834 9.036 9.225 9.406 9.632 9.853 10.067 10.306 10.554 10.802 11.072 11.34 11.61 11.887 12.18 12.525 12.864 13.212 13.57 13.937 14.29 14.652 15.001 15.144 14.896 14.512 14.1 13.685 13.27 12.894 12.55 12.236 11.924 11.649 11.383 11.134 10.897 10.668 10.461 10.225 10.017 9.847 9.668 9.468 9.303 9.138 8.953 8.815 8.679 8.536 8.381 8.219 8.108 7.986 7.783 7.646 7.512 7.439 7.287 7.136 6.979 6.897 6.609 6.631 6.529 6.427 6.187 6.032 5.832 5.616 5.386 5.129 4.777 4.039 -9 ,2141 ,KEBNE ,17022940,Wed Dec 22 07:07:54 CET,Wed Dec 22 08:29:02 CET,0.0 1.549 2.093 2.527 2.871 3.153 3.389 3.573 3.942 4.128 4.272 4.318 4.657 4.79 5.03 5.227 5.425 5.516 5.682 5.848 6.09 6.234 6.38 6.596 6.796 6.984 7.166 7.335 7.537 7.753 7.956 8.195 8.434 8.657 8.893 9.149 9.394 9.638 9.887 10.145 10.407 10.705 11.064 11.416 11.808 12.197 12.568 12.95 13.316 13.63 13.761 13.537 13.166 12.741 12.339 11.931 11.549 11.193 10.882 10.572 10.288 10.027 9.786 9.543 9.319 9.131 8.929 8.737 8.572 8.396 8.211 8.052 7.885 7.719 7.583 7.454 7.324 7.178 7.029 6.921 6.804 6.616 6.483 6.346 6.277 6.134 5.987 5.838 5.758 5.469 5.498 5.395 5.276 5.013 4.862 4.706 4.544 4.343 4.141 3.896 2.844 -10 ,3220 ,KEBNE ,17022941,Wed Dec 22 07:07:55 CET,Wed Dec 22 08:29:14 CET,0.0 2.364 2.926 3.306 3.61 3.841 4.042 4.247 4.583 4.721 4.869 4.956 5.283 5.403 5.635 5.841 6.042 6.142 6.341 6.515 6.747 6.913 7.089 7.319 7.499 7.67 7.853 8.037 8.25 8.448 8.646 8.886 9.119 9.335 9.562 9.81 10.038 10.283 10.559 10.866 11.179 11.487 11.832 12.174 12.551 12.927 13.299 13.701 14.089 14.368 14.495 14.289 13.904 13.489 13.08 12.659 12.241 11.823 11.458 11.115 10.809 10.515 10.228 9.948 9.689 9.461 9.208 8.969 8.767 8.552 8.329 8.151 7.952 7.737 7.578 7.417 7.243 7.066 6.887 6.752 6.61 6.39 6.238 6.085 6.006 5.836 5.654 5.46 5.365 5.061 5.053 4.938 4.812 4.534 4.396 4.259 4.089 3.895 3.651 3.263 2.08 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_37.txt deleted file mode 100644 index 31d94ee2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7232 ,KEBNE ,17022942,Wed Dec 22 07:07:55 CET,Wed Dec 22 08:28:48 CET,0.0 1.785 2.292 2.671 3.021 3.338 3.599 3.842 4.301 4.482 4.649 4.771 5.126 5.265 5.53 5.784 6.008 6.114 6.319 6.512 6.794 6.971 7.142 7.396 7.631 7.841 8.048 8.253 8.51 8.751 8.979 9.243 9.487 9.728 10.009 10.313 10.591 10.898 11.238 11.582 11.938 12.328 12.746 13.153 13.619 14.08 14.57 15.086 15.526 15.862 16.013 15.74 15.319 14.883 14.41 13.942 13.496 13.074 12.707 12.318 11.968 11.647 11.34 11.059 10.786 10.515 10.231 9.986 9.777 9.553 9.296 9.09 8.878 8.668 8.509 8.355 8.185 7.99 7.791 7.662 7.544 7.361 7.229 7.085 7.003 6.842 6.683 6.519 6.427 6.121 6.144 6.035 5.903 5.621 5.458 5.278 5.109 4.905 4.657 4.328 3.161 -2 ,13864 ,KEBNE ,17022943,Wed Dec 22 07:07:55 CET,Wed Dec 22 08:29:00 CET,0.0 1.627 2.184 2.608 2.903 3.144 3.334 3.509 3.867 4.048 4.213 4.272 4.61 4.747 4.989 5.192 5.374 5.469 5.657 5.832 6.071 6.229 6.381 6.575 6.751 6.932 7.109 7.277 7.492 7.711 7.939 8.211 8.453 8.686 8.969 9.285 9.572 9.881 10.195 10.496 10.81 11.175 11.583 11.956 12.369 12.827 13.285 13.719 14.155 14.534 14.747 14.523 14.093 13.609 13.141 12.716 12.317 11.936 11.583 11.208 10.897 10.623 10.35 10.085 9.847 9.631 9.402 9.195 9.005 8.804 8.597 8.418 8.229 8.033 7.892 7.737 7.57 7.4 7.215 7.09 6.969 6.778 6.642 6.487 6.402 6.221 6.036 5.835 5.716 5.386 5.356 5.224 5.081 4.749 4.572 4.359 4.138 3.937 3.688 3.329 2.412 -3 ,14380 ,KEBNE ,17022944,Wed Dec 22 07:07:55 CET,Wed Dec 22 08:28:58 CET,0.0 2.315 2.859 3.283 3.667 3.991 4.249 4.459 4.87 5.061 5.244 5.387 5.738 5.874 6.124 6.358 6.601 6.725 6.956 7.161 7.46 7.651 7.855 8.137 8.378 8.615 8.834 9.037 9.288 9.534 9.769 10.039 10.296 10.544 10.826 11.126 11.421 11.739 12.045 12.353 12.673 13.043 13.464 13.856 14.283 14.727 15.191 15.671 16.15 16.536 16.695 16.476 16.082 15.612 15.168 14.742 14.331 13.936 13.592 13.245 12.942 12.667 12.393 12.128 11.872 11.631 11.373 11.126 10.916 10.704 10.477 10.288 10.091 9.893 9.74 9.584 9.413 9.218 9.015 8.874 8.724 8.504 8.351 8.184 8.102 7.927 7.736 7.535 7.436 7.123 7.063 6.913 6.763 6.467 6.294 6.113 5.918 5.669 5.381 5.002 4.106 -4 ,15071 ,KEBNE ,17022945,Wed Dec 22 07:07:55 CET,Wed Dec 22 08:29:10 CET,0.0 2.277 2.92 3.274 3.573 3.836 4.071 4.271 4.62 4.793 4.941 5.01 5.345 5.469 5.731 5.973 6.185 6.283 6.46 6.619 6.859 7.021 7.163 7.385 7.614 7.8 7.972 8.17 8.411 8.643 8.866 9.116 9.378 9.62 9.865 10.136 10.4 10.685 10.979 11.267 11.591 11.955 12.349 12.747 13.206 13.653 14.111 14.624 15.128 15.541 15.733 15.544 15.2 14.8 14.359 13.924 13.521 13.149 12.822 12.46 12.134 11.835 11.56 11.31 11.074 10.841 10.581 10.37 10.198 10.005 9.795 9.626 9.442 9.252 9.104 8.94 8.77 8.605 8.437 8.307 8.173 7.971 7.826 7.68 7.603 7.439 7.261 7.074 6.968 6.638 6.568 6.421 6.281 5.976 5.785 5.583 5.349 5.094 4.825 4.416 3.015 -5 ,4347 ,KEBNE ,17022946,Wed Dec 22 07:08:57 CET,Wed Dec 22 08:30:01 CET,0.0 2.151 2.63 3.003 3.283 3.506 3.746 3.966 4.32 4.473 4.633 4.745 5.108 5.264 5.549 5.812 6.078 6.209 6.446 6.661 6.937 7.098 7.273 7.551 7.793 8.006 8.218 8.424 8.678 8.921 9.156 9.431 9.691 9.947 10.225 10.512 10.79 11.093 11.408 11.726 12.067 12.444 12.901 13.34 13.788 14.244 14.699 15.161 15.572 15.858 15.963 15.765 15.357 14.873 14.414 13.968 13.545 13.145 12.792 12.441 12.135 11.851 11.581 11.325 11.081 10.849 10.595 10.373 10.182 9.984 9.778 9.597 9.408 9.221 9.071 8.912 8.75 8.581 8.398 8.265 8.132 7.941 7.803 7.656 7.581 7.425 7.246 7.062 6.977 6.681 6.677 6.551 6.418 6.138 5.967 5.776 5.563 5.32 5.06 4.689 3.143 -6 ,27822 ,KEBNE ,17022947,Wed Dec 22 07:08:57 CET,Wed Dec 22 08:30:02 CET,0.0 1.39 1.875 2.191 2.472 2.716 2.932 3.109 3.429 3.613 3.784 3.872 4.219 4.358 4.602 4.819 5.029 5.135 5.356 5.569 5.853 6.019 6.174 6.396 6.599 6.806 7.018 7.218 7.475 7.717 7.939 8.206 8.469 8.712 8.987 9.317 9.629 9.934 10.229 10.54 10.888 11.258 11.665 12.081 12.536 12.968 13.391 13.799 14.249 14.625 14.748 14.497 14.114 13.682 13.246 12.807 12.402 12.017 11.69 11.354 11.031 10.731 10.456 10.19 9.935 9.706 9.458 9.224 9.014 8.814 8.61 8.434 8.258 8.072 7.93 7.784 7.64 7.493 7.333 7.218 7.087 6.886 6.746 6.599 6.52 6.335 6.135 5.933 5.829 5.511 5.492 5.368 5.227 4.927 4.772 4.603 4.409 4.217 3.983 3.606 2.203 -7 ,8247 ,KEBNE ,17022948,Wed Dec 22 07:08:57 CET,Wed Dec 22 08:32:29 CET,0.0 1.377 1.941 2.408 2.803 3.12 3.372 3.585 3.978 4.182 4.377 4.504 4.853 5.002 5.323 5.607 5.832 5.946 6.184 6.394 6.689 6.872 7.04 7.274 7.492 7.705 7.922 8.124 8.366 8.594 8.813 9.096 9.373 9.622 9.9 10.211 10.501 10.809 11.12 11.443 11.773 12.132 12.54 12.932 13.35 13.769 14.192 14.618 15.047 15.409 15.603 15.367 14.953 14.518 14.078 13.64 13.231 12.857 12.522 12.159 11.83 11.547 11.272 10.998 10.754 10.538 10.31 10.093 9.901 9.705 9.493 9.313 9.132 8.938 8.79 8.632 8.458 8.277 8.075 7.928 7.785 7.565 7.413 7.251 7.162 6.989 6.806 6.614 6.526 6.222 6.209 6.092 5.954 5.636 5.474 5.301 5.102 4.854 4.55 4.199 3.233 -8 ,15454 ,KEBNE ,17022949,Wed Dec 22 07:09:59 CET,Wed Dec 22 08:31:10 CET,0.0 2.031 2.55 2.985 3.305 3.548 3.787 4.006 4.382 4.566 4.74 4.851 5.206 5.341 5.6 5.845 6.087 6.21 6.433 6.628 6.889 7.062 7.239 7.472 7.695 7.924 8.155 8.366 8.635 8.9 9.136 9.42 9.677 9.912 10.181 10.474 10.761 11.059 11.373 11.712 12.05 12.422 12.847 13.249 13.663 14.067 14.496 14.949 15.408 15.78 15.924 15.722 15.333 14.872 14.408 13.979 13.587 13.213 12.887 12.547 12.235 11.955 11.693 11.435 11.181 10.961 10.738 10.522 10.335 10.143 9.937 9.76 9.576 9.385 9.235 9.077 8.918 8.76 8.586 8.47 8.347 8.133 7.986 7.834 7.756 7.589 7.416 7.239 7.138 6.826 6.798 6.677 6.552 6.309 6.16 5.966 5.74 5.497 5.213 4.86 3.801 -9 ,24959 ,KEBNE ,17022950,Wed Dec 22 07:11:01 CET,Wed Dec 22 08:31:57 CET,0.0 2.145 2.725 3.14 3.534 3.847 4.093 4.3 4.639 4.793 4.954 5.048 5.387 5.521 5.782 6.034 6.285 6.401 6.591 6.751 6.975 7.123 7.275 7.493 7.69 7.881 8.076 8.268 8.508 8.727 8.929 9.165 9.381 9.577 9.802 10.067 10.303 10.557 10.841 11.131 11.418 11.725 12.061 12.398 12.79 13.178 13.596 14.0 14.364 14.654 14.75 14.521 14.146 13.708 13.265 12.86 12.477 12.101 11.785 11.459 11.171 10.914 10.655 10.404 10.171 9.957 9.739 9.542 9.355 9.154 8.948 8.787 8.624 8.449 8.315 8.175 8.024 7.853 7.668 7.545 7.416 7.223 7.098 6.945 6.867 6.72 6.563 6.396 6.301 5.989 5.98 5.871 5.752 5.484 5.337 5.176 4.992 4.78 4.521 4.147 2.948 -10 ,9148 ,KEBNE ,17022951,Wed Dec 22 07:11:01 CET,Wed Dec 22 08:32:06 CET,0.0 2.274 2.743 3.079 3.353 3.608 3.821 4.011 4.365 4.528 4.69 4.764 5.088 5.201 5.418 5.628 5.829 5.924 6.109 6.286 6.529 6.695 6.86 7.071 7.275 7.48 7.684 7.885 8.146 8.417 8.674 8.964 9.237 9.494 9.792 10.107 10.395 10.739 11.132 11.495 11.821 12.183 12.616 13.017 13.448 13.894 14.322 14.779 15.24 15.59 15.728 15.462 15.008 14.54 14.087 13.636 13.255 12.915 12.594 12.245 11.94 11.665 11.39 11.138 10.908 10.69 10.45 10.229 10.039 9.829 9.597 9.404 9.204 9.011 8.869 8.721 8.558 8.384 8.214 8.086 7.944 7.739 7.603 7.467 7.394 7.248 7.084 6.885 6.796 6.507 6.499 6.369 6.234 5.947 5.787 5.593 5.374 5.129 4.845 4.504 3.506 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_54.txt deleted file mode 100644 index 23b248c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2805 ,KEBNE ,17022952,Wed Dec 22 07:12:02 CET,Wed Dec 22 08:33:12 CET,0.0 2.168 2.771 3.212 3.578 3.878 4.166 4.412 4.816 5.008 5.206 5.376 5.748 5.899 6.181 6.449 6.681 6.782 6.977 7.203 7.528 7.715 7.898 8.148 8.372 8.597 8.825 9.052 9.334 9.588 9.829 10.118 10.393 10.662 10.974 11.302 11.605 11.932 12.268 12.631 13.012 13.43 13.902 14.343 14.853 15.421 16.024 16.635 17.255 17.86 18.338 18.347 18.079 17.739 17.419 17.083 16.699 16.318 15.98 15.653 15.377 15.093 14.812 14.567 14.336 14.111 13.86 13.626 13.425 13.229 13.031 12.855 12.66 12.467 12.316 12.138 11.952 11.78 11.604 11.472 11.331 11.117 10.971 10.812 10.729 10.562 10.385 10.19 10.093 9.786 9.766 9.645 9.5 9.182 8.996 8.815 8.635 8.427 8.134 7.682 4.551 -2 ,32463 ,KEBNE ,17022953,Wed Dec 22 07:13:04 CET,Wed Dec 22 08:35:32 CET,0.0 2.987 3.537 3.944 4.333 4.687 4.969 5.2 5.571 5.735 5.917 6.082 6.446 6.588 6.868 7.145 7.385 7.492 7.696 7.893 8.185 8.369 8.55 8.811 9.065 9.314 9.554 9.777 10.036 10.274 10.512 10.806 11.085 11.36 11.67 11.994 12.291 12.619 12.974 13.352 13.753 14.173 14.646 15.113 15.608 16.125 16.711 17.308 17.929 18.545 18.918 18.829 18.514 18.172 17.783 17.362 16.993 16.658 16.329 15.992 15.713 15.466 15.23 14.997 14.771 14.554 14.322 14.108 13.916 13.719 13.523 13.361 13.184 12.989 12.843 12.697 12.542 12.373 12.185 12.058 11.931 11.734 11.595 11.425 11.331 11.146 10.957 10.776 10.687 10.389 10.376 10.253 10.12 9.81 9.609 9.41 9.227 9.011 8.745 8.362 6.223 -3 ,30262 ,KEBNE ,17022954,Wed Dec 22 07:13:04 CET,Wed Dec 22 08:34:11 CET,0.0 1.593 2.111 2.471 2.77 3.024 3.259 3.474 3.867 4.045 4.218 4.357 4.715 4.869 5.172 5.429 5.667 5.789 6.021 6.242 6.565 6.776 6.972 7.24 7.503 7.755 7.985 8.2 8.475 8.731 8.978 9.288 9.576 9.842 10.178 10.551 10.877 11.2 11.52 11.864 12.251 12.684 13.133 13.547 14.017 14.517 15.062 15.654 16.261 16.838 17.287 17.358 17.196 16.909 16.546 16.149 15.779 15.443 15.125 14.798 14.507 14.216 13.935 13.69 13.454 13.225 12.994 12.787 12.602 12.416 12.224 12.047 11.86 11.673 11.525 11.38 11.221 11.037 10.86 10.739 10.603 10.393 10.251 10.098 10.02 9.846 9.615 9.363 9.237 8.911 8.836 8.689 8.536 8.196 8.001 7.78 7.539 7.236 6.825 6.251 4.178 -4 ,22680 ,KEBNE ,17022955,Wed Dec 22 07:13:04 CET,Wed Dec 22 08:34:14 CET,0.0 2.876 3.482 3.905 4.259 4.546 4.769 4.993 5.469 5.685 5.873 5.996 6.344 6.478 6.75 7.014 7.237 7.345 7.554 7.746 8.019 8.191 8.356 8.611 8.86 9.089 9.306 9.515 9.787 10.042 10.269 10.539 10.812 11.068 11.356 11.681 11.979 12.299 12.635 12.978 13.352 13.782 14.257 14.7 15.208 15.764 16.318 16.893 17.529 18.135 18.554 18.534 18.288 17.92 17.479 17.051 16.681 16.316 15.973 15.639 15.355 15.07 14.783 14.518 14.269 14.033 13.784 13.575 13.387 13.188 12.981 12.806 12.63 12.443 12.294 12.138 11.951 11.74 11.52 11.365 11.209 10.965 10.786 10.602 10.506 10.294 10.072 9.851 9.734 9.397 9.267 9.105 8.975 8.704 8.538 8.355 8.156 7.918 7.626 7.224 5.018 -5 ,22595 ,KEBNE ,17022956,Wed Dec 22 07:13:04 CET,Wed Dec 22 08:34:06 CET,0.0 3.083 3.672 4.144 4.488 4.806 5.096 5.378 5.837 6.014 6.192 6.33 6.694 6.841 7.111 7.368 7.618 7.728 7.931 8.141 8.433 8.607 8.781 9.052 9.289 9.487 9.694 9.909 10.174 10.432 10.679 10.971 11.249 11.517 11.814 12.135 12.445 12.774 13.13 13.513 13.9 14.31 14.785 15.246 15.772 16.319 16.893 17.491 18.132 18.749 19.199 19.128 18.801 18.46 18.099 17.738 17.36 16.989 16.684 16.361 16.048 15.772 15.517 15.259 15.001 14.782 14.556 14.333 14.13 13.907 13.686 13.492 13.265 13.036 12.871 12.695 12.506 12.337 12.179 12.04 11.881 11.646 11.495 11.351 11.27 11.093 10.896 10.682 10.576 10.267 10.216 10.081 9.949 9.646 9.481 9.302 9.092 8.821 8.454 7.875 5.762 -6 ,11617 ,KEBNE ,17022957,Wed Dec 22 07:13:04 CET,Wed Dec 22 08:34:02 CET,0.0 3.375 3.913 4.36 4.726 5.016 5.278 5.519 5.908 6.083 6.265 6.404 6.762 6.905 7.183 7.438 7.666 7.782 8.012 8.226 8.531 8.726 8.919 9.189 9.438 9.68 9.915 10.145 10.422 10.681 10.939 11.25 11.535 11.813 12.139 12.492 12.823 13.164 13.511 13.876 14.263 14.705 15.216 15.707 16.248 16.83 17.427 18.069 18.76 19.352 19.722 19.721 19.532 19.221 18.836 18.427 18.047 17.695 17.37 17.03 16.736 16.479 16.23 15.952 15.693 15.484 15.256 15.04 14.853 14.659 14.461 14.298 14.12 13.931 13.776 13.605 13.428 13.244 13.052 12.93 12.809 12.593 12.431 12.275 12.195 12.045 11.85 11.636 11.534 11.215 11.191 11.065 10.932 10.67 10.513 10.328 10.133 9.918 9.613 9.143 6.926 -7 ,2230 ,KEBNE ,17022958,Wed Dec 22 07:14:06 CET,Wed Dec 22 08:35:37 CET,0.0 1.514 2.063 2.47 2.805 3.076 3.319 3.57 4.017 4.215 4.391 4.508 4.875 5.019 5.289 5.558 5.804 5.915 6.123 6.327 6.623 6.814 7.003 7.27 7.509 7.744 7.967 8.177 8.448 8.695 8.927 9.217 9.491 9.756 10.059 10.386 10.686 11.009 11.365 11.739 12.105 12.503 12.969 13.406 13.907 14.45 15.013 15.582 16.188 16.767 17.143 17.152 16.94 16.555 16.136 15.759 15.4 15.015 14.658 14.289 13.961 13.682 13.406 13.135 12.873 12.617 12.344 12.099 11.875 11.64 11.403 11.204 10.989 10.746 10.561 10.383 10.207 10.019 9.81 9.657 9.494 9.24 9.066 8.888 8.794 8.6 8.389 8.166 8.05 7.727 7.686 7.559 7.42 7.109 6.925 6.702 6.443 6.186 5.902 5.447 3.179 -8 ,26303 ,KEBNE ,17022959,Wed Dec 22 07:14:06 CET,Wed Dec 22 08:36:46 CET,0.0 4.755 5.329 5.783 6.155 6.45 6.718 6.956 7.37 7.558 7.735 7.849 8.205 8.351 8.607 8.859 9.104 9.223 9.453 9.665 9.97 10.186 10.389 10.642 10.898 11.149 11.377 11.594 11.864 12.115 12.355 12.648 12.929 13.201 13.525 13.884 14.209 14.563 14.937 15.317 15.73 16.192 16.703 17.171 17.696 18.262 18.832 19.436 20.107 20.748 21.207 21.232 20.936 20.557 20.201 19.843 19.496 19.142 18.783 18.433 18.136 17.856 17.588 17.319 17.069 16.841 16.605 16.387 16.188 15.99 15.789 15.613 15.434 15.251 15.103 14.951 14.789 14.607 14.413 14.275 14.128 13.902 13.732 13.553 13.46 13.254 13.035 12.797 12.664 12.337 12.283 12.133 11.954 11.572 11.377 11.155 10.905 10.602 10.238 9.821 7.865 -9 ,15295 ,KEBNE ,17022960,Wed Dec 22 07:14:06 CET,Wed Dec 22 08:35:19 CET,0.0 2.576 3.253 3.748 4.145 4.457 4.73 4.994 5.447 5.639 5.818 5.97 6.338 6.508 6.819 7.089 7.351 7.469 7.692 7.922 8.241 8.427 8.603 8.864 9.109 9.333 9.562 9.774 10.05 10.322 10.579 10.887 11.167 11.421 11.709 12.043 12.357 12.699 13.071 13.471 13.859 14.256 14.731 15.223 15.774 16.331 16.898 17.473 18.103 18.68 19.079 19.153 18.953 18.629 18.302 17.968 17.615 17.272 16.965 16.626 16.338 16.085 15.819 15.551 15.31 15.091 14.858 14.648 14.465 14.268 14.052 13.871 13.688 13.5 13.351 13.192 13.026 12.857 12.673 12.544 12.417 12.217 12.073 11.916 11.839 11.675 11.496 11.325 11.233 10.937 10.926 10.809 10.68 10.411 10.258 10.095 9.909 9.702 9.41 8.917 7.362 -10 ,32741 ,KEBNE ,17022961,Wed Dec 22 07:14:06 CET,Wed Dec 22 08:34:59 CET,0.0 3.284 3.913 4.365 4.763 5.109 5.405 5.669 6.165 6.375 6.554 6.69 7.037 7.183 7.484 7.756 8.018 8.143 8.363 8.578 8.894 9.089 9.271 9.524 9.774 10.009 10.227 10.435 10.709 10.99 11.25 11.539 11.817 12.094 12.415 12.77 13.095 13.437 13.803 14.186 14.58 15.024 15.53 16.05 16.656 17.253 17.842 18.462 19.105 19.724 20.215 20.224 20.018 19.68 19.312 18.939 18.547 18.181 17.857 17.518 17.221 16.965 16.706 16.444 16.197 15.96 15.71 15.486 15.284 15.057 14.81 14.613 14.428 14.242 14.079 13.893 13.693 13.488 13.285 13.144 12.988 12.75 12.588 12.397 12.301 12.117 11.919 11.707 11.596 11.291 11.261 11.123 10.982 10.653 10.455 10.251 10.029 9.748 9.394 8.889 6.811 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_64.txt deleted file mode 100644 index 882c1b97..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_33_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21653 ,KEBNE ,17022962,Wed Dec 22 07:14:06 CET,Wed Dec 22 08:34:44 CET,0.0 5.479 6.459 7.04 7.525 7.959 8.323 8.658 9.246 9.514 9.755 9.971 10.368 10.554 10.903 11.208 11.495 11.64 11.905 12.154 12.51 12.749 12.995 13.331 13.642 13.941 14.227 14.515 14.889 15.226 15.539 15.933 16.312 16.657 17.081 17.571 18.023 18.527 19.087 19.669 20.254 20.92 21.732 22.538 23.45 24.495 25.698 27.027 28.512 30.122 31.973 33.472 34.281 34.705 34.87 34.898 34.884 34.823 34.725 34.604 34.489 34.364 34.215 34.064 33.923 33.789 33.641 33.507 33.382 33.238 33.081 32.949 32.817 32.682 32.558 32.415 32.259 32.104 31.942 31.829 31.693 31.446 31.296 31.162 31.09 30.916 30.732 30.538 30.433 30.137 30.095 29.977 29.852 29.538 29.362 29.191 28.994 28.748 28.476 28.059 26.756 -2 ,22051 ,KEBNE ,17022963,Wed Dec 22 07:14:06 CET,Wed Dec 22 08:34:59 CET,0.0 3.283 3.915 4.414 4.789 5.134 5.472 5.772 6.302 6.556 6.789 6.992 7.383 7.557 7.884 8.204 8.514 8.666 8.97 9.252 9.644 9.894 10.135 10.487 10.815 11.127 11.417 11.698 12.067 12.426 12.768 13.171 13.569 13.945 14.386 14.886 15.339 15.838 16.377 16.937 17.533 18.195 18.964 19.747 20.651 21.652 22.78 24.009 25.468 27.181 29.134 30.571 31.287 31.66 31.82 31.871 31.837 31.768 31.667 31.525 31.397 31.288 31.168 31.023 30.891 30.77 30.624 30.479 30.348 30.21 30.061 29.94 29.775 29.568 29.413 29.272 29.135 28.981 28.825 28.711 28.572 28.329 28.162 28.011 27.938 27.77 27.591 27.403 27.299 26.984 26.854 26.683 26.509 26.146 25.948 25.726 25.508 25.297 24.968 24.453 22.697 -3 ,9872 ,KEBNE ,17022964,Wed Dec 22 07:14:06 CET,Wed Dec 22 08:35:01 CET,0.0 2.797 3.537 4.164 4.697 5.166 5.531 5.852 6.394 6.64 6.873 7.109 7.517 7.716 8.101 8.47 8.785 8.921 9.186 9.463 9.885 10.125 10.344 10.678 10.998 11.306 11.626 11.939 12.322 12.668 12.996 13.4 13.794 14.176 14.613 15.106 15.579 16.103 16.635 17.181 17.807 18.517 19.298 20.087 20.998 21.996 23.167 24.494 25.996 27.708 29.663 31.109 31.874 32.295 32.497 32.561 32.548 32.49 32.421 32.299 32.162 32.056 31.937 31.791 31.637 31.493 31.334 31.181 31.053 30.922 30.777 30.653 30.512 30.349 30.224 30.085 29.932 29.781 29.625 29.514 29.4 29.213 29.077 28.949 28.88 28.744 28.585 28.392 28.291 27.997 27.969 27.852 27.728 27.466 27.299 27.116 26.907 26.656 26.358 25.861 23.75 -4 ,32544 ,KEBNE ,17022965,Wed Dec 22 07:14:06 CET,Wed Dec 22 08:34:49 CET,0.0 2.728 3.416 3.995 4.448 4.832 5.18 5.483 6.026 6.283 6.512 6.722 7.131 7.323 7.684 8.04 8.38 8.536 8.844 9.14 9.561 9.828 10.076 10.426 10.748 11.053 11.346 11.615 11.974 12.331 12.674 13.093 13.498 13.886 14.322 14.819 15.301 15.829 16.38 16.938 17.523 18.163 18.932 19.73 20.645 21.656 22.79 24.057 25.528 27.242 29.232 30.627 31.241 31.52 31.63 31.619 31.565 31.466 31.336 31.168 30.996 30.825 30.637 30.454 30.268 30.096 29.919 29.743 29.585 29.414 29.234 29.083 28.911 28.723 28.583 28.43 28.271 28.112 27.936 27.814 27.694 27.499 27.358 27.209 27.124 26.952 26.796 26.623 26.515 26.213 26.177 26.051 25.93 25.62 25.419 25.203 24.969 24.724 24.435 24.032 22.273 -5 ,22879 ,KEBNE ,17022966,Wed Dec 22 07:15:08 CET,Wed Dec 22 08:35:57 CET,0.0 3.822 4.82 5.416 5.827 6.183 6.505 6.804 7.331 7.567 7.785 7.999 8.408 8.601 8.968 9.322 9.642 9.794 10.077 10.339 10.733 10.983 11.231 11.582 11.926 12.289 12.626 12.915 13.282 13.643 14.022 14.47 14.857 15.226 15.655 16.133 16.587 17.088 17.618 18.175 18.76 19.432 20.221 21.007 21.901 22.898 24.041 25.307 26.853 28.655 30.664 32.165 32.947 33.38 33.591 33.672 33.677 33.609 33.509 33.382 33.268 33.161 33.022 32.869 32.727 32.563 32.365 32.206 32.076 31.938 31.779 31.633 31.486 31.337 31.218 31.097 30.966 30.816 30.664 30.553 30.437 30.262 30.143 30.022 29.954 29.808 29.634 29.446 29.349 29.063 29.053 28.951 28.841 28.592 28.417 28.216 27.983 27.694 27.407 27.064 25.697 -6 ,14253 ,KEBNE ,17022967,Wed Dec 22 07:15:08 CET,Wed Dec 22 08:36:21 CET,0.0 3.022 3.864 4.433 4.931 5.312 5.666 6.002 6.546 6.766 6.992 7.197 7.584 7.77 8.117 8.43 8.731 8.877 9.149 9.411 9.798 10.056 10.308 10.679 11.021 11.34 11.691 12.042 12.458 12.812 13.145 13.566 13.963 14.338 14.753 15.207 15.673 16.195 16.716 17.264 17.868 18.549 19.332 20.084 20.936 21.926 23.083 24.323 25.789 27.544 29.518 30.972 31.68 32.057 32.263 32.314 32.3 32.264 32.176 32.044 31.905 31.766 31.632 31.501 31.363 31.226 31.078 30.944 30.814 30.673 30.517 30.386 30.26 30.092 29.933 29.78 29.617 29.442 29.278 29.16 29.037 28.837 28.686 28.513 28.418 28.226 28.028 27.828 27.715 27.417 27.377 27.251 27.11 26.767 26.569 26.334 26.072 25.792 25.453 24.919 23.214 -7 ,3339 ,KEBNE ,17022968,Wed Dec 22 07:15:08 CET,Wed Dec 22 08:36:10 CET,0.0 3.103 3.678 4.083 4.434 4.788 5.163 5.481 5.975 6.21 6.433 6.644 7.033 7.199 7.507 7.804 8.09 8.231 8.506 8.764 9.137 9.381 9.611 9.93 10.242 10.543 10.821 11.092 11.456 11.81 12.138 12.555 12.966 13.337 13.773 14.271 14.738 15.232 15.767 16.35 16.976 17.692 18.493 19.283 20.209 21.217 22.373 23.687 25.21 26.935 28.859 30.323 31.108 31.492 31.647 31.701 31.696 31.618 31.502 31.37 31.244 31.112 30.97 30.834 30.698 30.559 30.401 30.258 30.121 29.969 29.81 29.67 29.527 29.375 29.253 29.121 28.978 28.831 28.678 28.557 28.428 28.242 28.111 27.978 27.911 27.772 27.623 27.441 27.328 27.02 26.953 26.811 26.653 26.32 26.165 25.996 25.797 25.578 25.276 24.841 22.855 -8 ,28691 ,KEBNE ,17022969,Wed Dec 22 07:15:08 CET,Wed Dec 22 08:36:00 CET,0.0 3.342 4.062 4.564 4.991 5.373 5.71 6.013 6.488 6.698 6.913 7.106 7.52 7.729 8.079 8.41 8.73 8.887 9.217 9.528 9.961 10.226 10.465 10.806 11.134 11.445 11.753 12.058 12.43 12.776 13.102 13.48 13.851 14.222 14.64 15.123 15.591 16.105 16.684 17.278 17.858 18.518 19.31 20.102 21.019 22.021 23.189 24.526 26.054 27.822 29.902 31.42 32.129 32.511 32.667 32.687 32.672 32.596 32.483 32.358 32.24 32.11 31.949 31.779 31.608 31.451 31.301 31.159 31.02 30.87 30.708 30.577 30.444 30.301 30.19 30.073 29.948 29.792 29.612 29.487 29.357 29.132 28.96 28.813 28.749 28.601 28.438 28.236 28.12 27.833 27.809 27.682 27.548 27.233 27.049 26.869 26.667 26.412 26.106 25.738 24.248 -9 ,13685 ,KEBNE ,17022970,Wed Dec 22 07:15:08 CET,Wed Dec 22 08:37:30 CET,0.0 3.34 4.18 4.794 5.317 5.748 6.073 6.339 6.817 7.048 7.265 7.459 7.85 8.031 8.392 8.763 9.099 9.241 9.506 9.768 10.146 10.377 10.596 10.941 11.285 11.603 11.899 12.181 12.535 12.867 13.181 13.565 13.944 14.319 14.753 15.233 15.689 16.186 16.722 17.292 17.877 18.524 19.297 20.068 20.981 21.994 23.118 24.363 25.798 27.5 29.514 30.968 31.667 32.002 32.161 32.228 32.22 32.17 32.088 31.983 31.861 31.72 31.574 31.424 31.276 31.131 30.978 30.829 30.701 30.57 30.42 30.282 30.139 29.985 29.86 29.729 29.588 29.45 29.313 29.218 29.118 28.94 28.81 28.669 28.597 28.442 28.244 28.044 27.954 27.679 27.676 27.568 27.432 27.071 26.871 26.645 26.369 26.091 25.765 25.313 23.219 -10 ,25765 ,KEBNE ,17022971,Wed Dec 22 07:15:07 CET,Wed Dec 22 08:35:44 CET,0.0 3.343 4.06 4.581 4.985 5.335 5.695 6.009 6.493 6.701 6.909 7.095 7.478 7.664 8.025 8.337 8.628 8.763 9.021 9.294 9.679 9.926 10.171 10.509 10.846 11.17 11.463 11.746 12.112 12.453 12.766 13.155 13.55 13.916 14.328 14.808 15.264 15.755 16.29 16.87 17.48 18.145 18.939 19.741 20.641 21.631 22.762 24.025 25.458 27.099 29.049 30.577 31.335 31.72 31.883 31.95 31.947 31.866 31.772 31.665 31.549 31.415 31.273 31.134 30.994 30.841 30.67 30.495 30.312 30.125 29.955 29.816 29.674 29.526 29.393 29.25 29.111 28.962 28.799 28.682 28.563 28.393 28.256 28.101 28.027 27.852 27.642 27.421 27.302 27.005 26.967 26.847 26.717 26.409 26.254 26.084 25.851 25.558 25.193 24.648 22.765 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_35_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_35_36.txt deleted file mode 100644 index c59b6646..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_35_36.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12310 ,KEBNE ,17022972,Wed Dec 22 07:15:07 CET,Wed Dec 22 08:36:34 CET,0.0 1.458 1.856 2.179 2.421 2.618 2.798 2.971 3.266 3.406 3.534 3.55 3.878 3.997 4.191 4.36 4.538 4.625 4.788 4.947 5.165 5.304 5.439 5.623 5.78 5.943 6.11 6.258 6.458 6.656 6.837 7.054 7.265 7.465 7.689 7.932 8.167 8.41 8.647 8.913 9.21 9.528 9.886 10.227 10.596 10.973 11.351 11.774 12.231 12.61 12.734 12.494 12.132 11.74 11.33 10.918 10.564 10.243 9.938 9.61 9.328 9.088 8.861 8.623 8.389 8.186 7.975 7.781 7.619 7.459 7.298 7.156 7.006 6.861 6.748 6.629 6.509 6.381 6.234 6.133 6.028 5.864 5.753 5.636 5.58 5.465 5.345 5.214 5.135 4.847 4.902 4.817 4.729 4.538 4.428 4.322 4.215 4.08 3.914 3.712 3.366 -2 ,25143 ,KEBNE ,17022973,Wed Dec 22 07:16:09 CET,Wed Dec 22 08:37:48 CET,0.0 0.839 1.233 1.51 1.745 1.97 2.163 2.34 2.695 2.854 3.012 3.132 3.468 3.593 3.853 4.098 4.33 4.447 4.651 4.816 5.043 5.198 5.356 5.581 5.799 6.014 6.224 6.412 6.627 6.825 7.026 7.271 7.493 7.71 7.96 8.218 8.467 8.752 9.051 9.358 9.654 9.975 10.33 10.66 11.042 11.459 11.884 12.266 12.619 12.933 13.09 12.9 12.579 12.197 11.811 11.402 11.02 10.691 10.377 10.033 9.739 9.496 9.277 9.057 8.846 8.663 8.47 8.291 8.129 7.967 7.813 7.678 7.529 7.373 7.255 7.131 7.001 6.872 6.734 6.64 6.546 6.379 6.26 6.15 6.093 5.975 5.851 5.724 5.656 5.371 5.403 5.313 5.234 5.058 4.966 4.86 4.727 4.58 4.402 4.211 3.908 -3 ,18663 ,KEBNE ,17022974,Wed Dec 22 07:16:09 CET,Wed Dec 22 08:37:28 CET,0.0 0.937 1.323 1.647 1.935 2.15 2.341 2.532 2.894 3.051 3.197 3.249 3.574 3.698 3.946 4.17 4.367 4.464 4.657 4.841 5.067 5.205 5.353 5.558 5.731 5.9 6.09 6.272 6.487 6.695 6.891 7.126 7.34 7.524 7.735 7.973 8.185 8.428 8.694 8.959 9.242 9.55 9.888 10.23 10.6 10.965 11.365 11.796 12.201 12.55 12.735 12.513 12.132 11.746 11.355 10.933 10.543 10.172 9.863 9.567 9.299 9.054 8.804 8.556 8.33 8.127 7.916 7.735 7.586 7.429 7.252 7.104 6.947 6.782 6.665 6.544 6.422 6.286 6.137 6.036 5.931 5.783 5.672 5.543 5.48 5.361 5.243 5.105 5.032 4.75 4.811 4.729 4.646 4.486 4.404 4.309 4.202 4.086 3.938 3.694 3.27 -4 ,25591 ,KEBNE ,17022975,Wed Dec 22 07:16:09 CET,Wed Dec 22 08:37:50 CET,0.0 1.06 1.515 1.819 2.08 2.308 2.516 2.718 3.047 3.196 3.335 3.389 3.724 3.839 4.044 4.244 4.426 4.514 4.689 4.84 5.053 5.192 5.338 5.585 5.823 6.027 6.208 6.377 6.591 6.783 6.96 7.174 7.381 7.584 7.813 8.062 8.306 8.568 8.831 9.103 9.381 9.681 10.006 10.321 10.681 11.075 11.514 11.941 12.338 12.654 12.803 12.649 12.315 11.937 11.55 11.145 10.773 10.428 10.105 9.767 9.465 9.208 8.968 8.725 8.501 8.307 8.115 7.946 7.798 7.635 7.469 7.338 7.198 7.046 6.926 6.796 6.66 6.525 6.384 6.284 6.187 6.044 5.944 5.837 5.782 5.664 5.538 5.411 5.341 5.058 5.102 5.02 4.938 4.75 4.638 4.514 4.375 4.239 4.101 3.922 3.487 -5 ,7763 ,KEBNE ,17022976,Wed Dec 22 07:17:12 CET,Wed Dec 22 08:38:30 CET,0.0 1.093 1.462 1.764 2.033 2.227 2.405 2.574 2.882 3.033 3.176 3.22 3.542 3.651 3.85 4.027 4.199 4.287 4.461 4.639 4.896 5.043 5.182 5.383 5.568 5.741 5.91 6.076 6.293 6.487 6.661 6.858 7.052 7.253 7.477 7.719 7.95 8.208 8.478 8.747 9.026 9.34 9.691 10.031 10.387 10.751 11.148 11.522 11.889 12.227 12.425 12.265 11.913 11.525 11.101 10.679 10.308 9.934 9.597 9.279 9.002 8.749 8.512 8.282 8.058 7.857 7.657 7.477 7.319 7.152 6.977 6.843 6.709 6.55 6.411 6.277 6.154 6.023 5.884 5.788 5.678 5.518 5.418 5.298 5.234 5.105 4.975 4.845 4.774 4.488 4.535 4.452 4.369 4.207 4.103 3.983 3.856 3.726 3.601 3.417 2.983 -6 ,783 ,KEBNE ,17022977,Wed Dec 22 07:17:12 CET,Wed Dec 22 08:38:21 CET,0.0 1.191 1.68 1.981 2.217 2.433 2.653 2.875 3.281 3.449 3.62 3.757 4.106 4.227 4.425 4.6 4.762 4.844 5.0 5.15 5.381 5.529 5.669 5.872 6.062 6.241 6.42 6.581 6.772 6.958 7.146 7.375 7.586 7.78 8.009 8.251 8.478 8.738 9.001 9.285 9.581 9.9 10.267 10.618 10.996 11.379 11.765 12.131 12.512 12.862 13.02 12.846 12.479 12.035 11.609 11.221 10.868 10.539 10.221 9.908 9.635 9.366 9.112 8.877 8.655 8.438 8.216 8.033 7.883 7.728 7.565 7.431 7.284 7.123 6.998 6.871 6.743 6.615 6.482 6.386 6.281 6.114 6.002 5.89 5.828 5.701 5.574 5.444 5.376 5.088 5.114 5.016 4.919 4.742 4.639 4.513 4.387 4.258 4.128 3.956 3.456 -7 ,13006 ,KEBNE ,17022978,Wed Dec 22 07:17:12 CET,Wed Dec 22 08:38:50 CET,0.0 0.991 1.349 1.642 1.916 2.142 2.326 2.496 2.803 2.949 3.094 3.139 3.47 3.592 3.813 4.008 4.191 4.281 4.451 4.611 4.833 4.964 5.101 5.299 5.477 5.66 5.839 5.987 6.178 6.37 6.551 6.773 6.992 7.193 7.421 7.685 7.931 8.186 8.451 8.72 8.99 9.28 9.595 9.931 10.306 10.66 11.07 11.478 11.869 12.242 12.406 12.215 11.874 11.485 11.082 10.652 10.25 9.891 9.58 9.268 8.995 8.742 8.484 8.249 8.042 7.823 7.566 7.356 7.181 6.988 6.798 6.639 6.474 6.3 6.165 6.009 5.821 5.647 5.488 5.383 5.279 5.12 5.016 4.904 4.841 4.717 4.591 4.458 4.391 4.113 4.177 4.098 3.998 3.761 3.63 3.488 3.347 3.199 3.045 2.855 2.392 -8 ,24914 ,KEBNE ,17022979,Wed Dec 22 07:17:12 CET,Wed Dec 22 08:38:42 CET,0.0 0.993 1.47 1.786 2.043 2.283 2.531 2.74 3.072 3.206 3.325 3.337 3.656 3.779 4.003 4.188 4.356 4.441 4.608 4.755 4.963 5.103 5.242 5.439 5.619 5.793 5.966 6.121 6.31 6.507 6.703 6.927 7.131 7.32 7.54 7.785 8.024 8.276 8.519 8.776 9.059 9.355 9.69 10.035 10.402 10.776 11.175 11.544 11.908 12.232 12.386 12.187 11.811 11.412 11.018 10.629 10.269 9.95 9.655 9.359 9.079 8.807 8.55 8.316 8.081 7.829 7.573 7.364 7.191 6.984 6.767 6.595 6.417 6.24 6.104 5.96 5.798 5.63 5.457 5.345 5.235 5.045 4.911 4.787 4.724 4.584 4.441 4.295 4.223 3.937 3.948 3.846 3.747 3.542 3.433 3.311 3.172 3.002 2.79 2.56 2.214 -9 ,25709 ,KEBNE ,17022980,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:22 CET,0.0 1.963 2.532 2.936 3.288 3.561 3.792 3.971 4.284 4.43 4.559 4.585 4.898 5.01 5.211 5.406 5.602 5.694 5.862 6.023 6.258 6.392 6.53 6.75 6.965 7.182 7.385 7.558 7.765 7.963 8.154 8.369 8.565 8.761 8.991 9.241 9.475 9.724 9.982 10.257 10.549 10.859 11.187 11.488 11.836 12.203 12.598 13.026 13.441 13.807 14.004 13.785 13.416 13.003 12.574 12.169 11.833 11.499 11.189 10.881 10.615 10.384 10.153 9.922 9.691 9.475 9.247 9.012 8.792 8.573 8.348 8.156 7.949 7.725 7.562 7.403 7.234 7.059 6.876 6.742 6.609 6.405 6.259 6.116 6.035 5.855 5.675 5.492 5.401 5.103 5.117 5.01 4.904 4.668 4.522 4.356 4.169 3.969 3.771 3.549 3.157 -10 ,19715 ,KEBNE ,17022981,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:42:42 CET,0.0 1.313 1.786 2.123 2.391 2.628 2.858 3.059 3.391 3.551 3.71 3.812 4.158 4.296 4.562 4.793 5.018 5.123 5.305 5.458 5.676 5.819 5.955 6.153 6.333 6.495 6.642 6.792 7.0 7.203 7.38 7.593 7.807 7.998 8.209 8.442 8.661 8.885 9.129 9.408 9.691 10.0 10.332 10.639 11.002 11.371 11.75 12.133 12.521 12.861 13.033 12.876 12.534 12.113 11.681 11.255 10.878 10.509 10.159 9.818 9.52 9.259 9.016 8.781 8.55 8.339 8.121 7.923 7.753 7.577 7.391 7.238 7.088 6.943 6.823 6.694 6.565 6.427 6.276 6.174 6.075 5.926 5.814 5.686 5.623 5.5 5.373 5.228 5.155 4.882 4.939 4.849 4.757 4.592 4.511 4.396 4.269 4.149 4.01 3.81 3.438 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_35_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_35_37.txt deleted file mode 100644 index 67c7c3b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_35_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2371 ,KEBNE ,17022982,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:37 CET,0.0 0.99 1.331 1.583 1.799 1.993 2.188 2.377 2.715 2.866 3.015 3.083 3.412 3.534 3.743 3.933 4.124 4.217 4.387 4.549 4.791 4.936 5.075 5.281 5.47 5.651 5.828 5.995 6.215 6.421 6.62 6.853 7.055 7.242 7.453 7.69 7.917 8.155 8.413 8.683 8.941 9.212 9.516 9.813 10.149 10.516 10.92 11.301 11.676 12.015 12.165 11.956 11.581 11.173 10.78 10.38 10.025 9.699 9.406 9.125 8.857 8.6 8.346 8.107 7.88 7.663 7.433 7.24 7.088 6.931 6.77 6.634 6.49 6.334 6.207 6.079 5.951 5.815 5.669 5.57 5.474 5.327 5.216 5.09 5.024 4.889 4.747 4.598 4.512 4.211 4.256 4.171 4.09 3.933 3.833 3.716 3.577 3.407 3.21 2.981 2.4 -2 ,13815 ,KEBNE ,17022983,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:22 CET,0.0 0.84 1.152 1.384 1.563 1.731 1.877 2.008 2.238 2.35 2.461 2.444 2.742 2.834 3.025 3.193 3.35 3.426 3.559 3.692 3.879 4.007 4.13 4.291 4.45 4.619 4.788 4.945 5.142 5.337 5.515 5.733 5.958 6.176 6.412 6.656 6.904 7.193 7.519 7.84 8.142 8.485 8.877 9.271 9.695 10.125 10.599 11.082 11.548 11.948 12.133 11.971 11.634 11.19 10.748 10.306 9.871 9.467 9.108 8.752 8.43 8.11 7.79 7.495 7.236 6.988 6.703 6.467 6.283 6.098 5.923 5.774 5.597 5.415 5.271 5.128 4.994 4.824 4.633 4.517 4.404 4.201 4.056 3.921 3.844 3.686 3.532 3.356 3.264 2.97 2.986 2.884 2.795 2.611 2.494 2.373 2.25 2.104 1.9 1.671 0.947 -3 ,20680 ,KEBNE ,17022984,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:35 CET,0.0 1.384 1.897 2.28 2.572 2.823 3.065 3.291 3.656 3.82 3.988 4.098 4.428 4.541 4.765 4.989 5.214 5.323 5.518 5.698 5.954 6.122 6.285 6.509 6.734 6.948 7.15 7.364 7.627 7.879 8.119 8.387 8.631 8.871 9.179 9.507 9.805 10.121 10.45 10.783 11.111 11.469 11.852 12.228 12.664 13.13 13.631 14.115 14.607 15.026 15.217 15.021 14.621 14.184 13.718 13.273 12.887 12.512 12.158 11.787 11.471 11.192 10.923 10.652 10.407 10.211 10.007 9.802 9.622 9.45 9.276 9.121 8.948 8.782 8.661 8.528 8.399 8.267 8.112 8.01 7.911 7.747 7.638 7.529 7.463 7.329 7.187 7.027 6.95 6.655 6.658 6.545 6.417 6.1 5.93 5.783 5.643 5.466 5.259 4.953 3.944 -4 ,4080 ,KEBNE ,17022985,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:09 CET,0.0 0.841 1.05 1.235 1.437 1.623 1.776 1.919 2.188 2.319 2.451 2.489 2.823 2.936 3.127 3.311 3.489 3.573 3.733 3.874 4.065 4.192 4.313 4.494 4.67 4.837 5.001 5.156 5.355 5.545 5.732 5.968 6.185 6.382 6.613 6.879 7.124 7.37 7.627 7.904 8.209 8.525 8.853 9.164 9.508 9.88 10.294 10.715 11.088 11.389 11.532 11.335 10.998 10.648 10.25 9.84 9.492 9.161 8.858 8.55 8.252 7.99 7.749 7.5 7.271 7.072 6.846 6.633 6.45 6.251 6.048 5.887 5.711 5.533 5.398 5.26 5.108 4.94 4.775 4.667 4.559 4.389 4.266 4.146 4.087 3.961 3.833 3.687 3.606 3.306 3.335 3.246 3.148 2.87 2.709 2.558 2.404 2.237 2.054 1.791 1.06 -5 ,2019 ,KEBNE ,17022986,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:25 CET,0.0 1.158 1.486 1.707 1.915 2.11 2.267 2.419 2.691 2.816 2.948 2.969 3.274 3.369 3.547 3.725 3.893 3.971 4.112 4.255 4.473 4.612 4.752 4.949 5.128 5.296 5.453 5.616 5.831 6.034 6.228 6.45 6.667 6.882 7.106 7.342 7.578 7.832 8.093 8.356 8.614 8.914 9.266 9.614 10.019 10.416 10.873 11.336 11.784 12.242 12.479 12.197 11.749 11.346 10.96 10.576 10.23 9.872 9.53 9.194 8.875 8.588 8.345 8.121 7.909 7.712 7.499 7.302 7.12 6.925 6.724 6.551 6.372 6.203 6.071 5.915 5.755 5.611 5.449 5.315 5.171 4.971 4.85 4.712 4.627 4.44 4.243 4.048 3.961 3.659 3.645 3.538 3.419 3.121 2.945 2.741 2.513 2.273 1.99 1.611 0.301 -6 ,28836 ,KEBNE ,17022987,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:17 CET,0.0 0.746 1.083 1.353 1.567 1.765 1.954 2.118 2.414 2.557 2.691 2.725 3.04 3.156 3.412 3.642 3.847 3.943 4.128 4.3 4.523 4.666 4.81 5.039 5.261 5.468 5.693 5.905 6.149 6.393 6.646 6.936 7.184 7.422 7.68 7.962 8.243 8.548 8.868 9.201 9.531 9.913 10.359 10.786 11.25 11.709 12.201 12.663 13.103 13.465 13.569 13.38 13.024 12.578 12.146 11.706 11.278 10.901 10.583 10.241 9.913 9.632 9.367 9.115 8.88 8.651 8.413 8.211 8.038 7.855 7.656 7.49 7.328 7.144 6.985 6.826 6.679 6.536 6.365 6.243 6.135 5.958 5.822 5.683 5.617 5.467 5.302 5.143 5.062 4.771 4.814 4.718 4.616 4.401 4.277 4.14 3.997 3.822 3.609 3.386 3.127 -7 ,23651 ,KEBNE ,17022988,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:17 CET,0.0 1.634 2.071 2.388 2.652 2.887 3.077 3.235 3.551 3.71 3.852 3.882 4.195 4.304 4.494 4.667 4.845 4.93 5.103 5.267 5.488 5.623 5.745 5.93 6.118 6.299 6.473 6.635 6.835 7.024 7.205 7.411 7.602 7.792 8.014 8.252 8.474 8.722 8.997 9.28 9.551 9.834 10.164 10.506 10.906 11.3 11.698 12.126 12.552 12.942 13.125 12.942 12.656 12.279 11.861 11.456 11.113 10.771 10.452 10.131 9.829 9.57 9.323 9.082 8.864 8.66 8.433 8.221 8.045 7.856 7.652 7.489 7.326 7.143 6.991 6.845 6.69 6.537 6.398 6.296 6.19 6.019 5.903 5.795 5.733 5.587 5.445 5.308 5.239 4.955 5.004 4.922 4.834 4.621 4.506 4.402 4.268 4.096 3.925 3.705 3.086 -8 ,18138 ,KEBNE ,17022989,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:33 CET,0.0 0.916 1.243 1.495 1.697 1.879 2.055 2.244 2.586 2.735 2.88 2.947 3.282 3.401 3.638 3.861 4.044 4.124 4.277 4.441 4.703 4.869 5.027 5.245 5.442 5.624 5.792 5.94 6.136 6.32 6.5 6.732 6.946 7.151 7.381 7.636 7.868 8.096 8.344 8.609 8.878 9.174 9.494 9.809 10.165 10.531 10.93 11.353 11.791 12.18 12.383 12.19 11.877 11.525 11.115 10.715 10.358 10.022 9.728 9.388 9.067 8.765 8.481 8.208 7.955 7.74 7.509 7.292 7.109 6.925 6.719 6.536 6.335 6.132 5.993 5.832 5.659 5.501 5.335 5.217 5.096 4.906 4.772 4.622 4.545 4.383 4.224 4.079 4.013 3.731 3.788 3.707 3.622 3.427 3.305 3.173 3.044 2.895 2.72 2.498 2.128 -9 ,13061 ,KEBNE ,17022990,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:43:09 CET,0.0 0.542 0.81 1.024 1.207 1.358 1.476 1.589 1.84 1.963 2.078 2.103 2.424 2.536 2.729 2.909 3.099 3.186 3.342 3.488 3.693 3.826 3.954 4.145 4.335 4.513 4.692 4.854 5.051 5.243 5.423 5.635 5.832 6.023 6.248 6.495 6.725 6.98 7.238 7.506 7.793 8.109 8.467 8.814 9.188 9.559 9.99 10.503 11.028 11.425 11.652 11.535 11.207 10.806 10.423 10.075 9.722 9.38 9.089 8.794 8.527 8.268 8.026 7.796 7.568 7.353 7.123 6.914 6.741 6.566 6.376 6.211 6.032 5.848 5.699 5.543 5.38 5.206 5.021 4.898 4.763 4.522 4.353 4.191 4.113 3.935 3.737 3.511 3.393 3.061 2.978 2.828 2.687 2.444 2.319 2.172 2.017 1.837 1.619 1.377 1.045 -10 ,10926 ,KEBNE ,17022991,Wed Dec 22 07:20:00 CET,Wed Dec 22 08:36:34 CET,0.0 1.086 1.361 1.545 1.715 1.883 2.024 2.149 2.372 2.488 2.602 2.584 2.888 2.982 3.155 3.311 3.462 3.54 3.692 3.844 4.041 4.168 4.302 4.495 4.681 4.852 5.024 5.19 5.385 5.565 5.724 5.927 6.138 6.333 6.551 6.788 7.011 7.252 7.505 7.756 8.032 8.35 8.694 9.009 9.342 9.703 10.083 10.481 10.874 11.184 11.302 10.95 10.454 10.024 9.627 9.209 8.795 8.419 8.076 7.711 7.404 7.141 6.867 6.585 6.309 6.068 5.841 5.627 5.431 5.218 5.008 4.84 4.657 4.466 4.317 4.166 3.995 3.801 3.609 3.478 3.347 3.152 3.015 2.872 2.798 2.657 2.503 2.351 2.278 1.991 2.022 1.934 1.841 1.625 1.5 1.364 1.222 1.056 0.879 0.678 0.15 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_35_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_35_49.txt deleted file mode 100644 index 9e190363..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_35_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10589 ,KEBNE ,17022992,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:01 CET,0.0 1.156 1.429 1.664 1.858 2.024 2.175 2.325 2.584 2.711 2.838 2.866 3.18 3.276 3.465 3.642 3.812 3.897 4.062 4.209 4.419 4.561 4.698 4.889 5.065 5.234 5.387 5.534 5.766 5.997 6.196 6.454 6.706 6.939 7.206 7.495 7.772 8.105 8.472 8.834 9.206 9.614 10.078 10.551 11.112 11.751 12.493 13.286 14.145 15.093 15.968 16.356 16.395 16.299 16.107 15.844 15.592 15.336 15.098 14.84 14.605 14.405 14.224 14.041 13.854 13.687 13.505 13.335 13.195 13.054 12.893 12.733 12.562 12.409 12.302 12.185 12.051 11.902 11.752 11.658 11.566 11.429 11.338 11.234 11.177 11.062 10.928 10.791 10.726 10.463 10.521 10.444 10.37 10.192 10.092 9.994 9.874 9.732 9.571 9.373 9.006 -2 ,18280 ,KEBNE ,17022993,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:42:24 CET,0.0 0.885 1.215 1.473 1.69 1.892 2.095 2.278 2.634 2.792 2.915 2.936 3.259 3.37 3.574 3.778 3.998 4.113 4.315 4.483 4.734 4.923 5.115 5.378 5.628 5.863 6.086 6.301 6.585 6.865 7.119 7.432 7.738 8.026 8.359 8.719 9.048 9.413 9.821 10.256 10.709 11.218 11.789 12.314 12.907 13.57 14.31 15.104 15.98 16.913 17.845 18.299 18.317 18.18 17.996 17.767 17.499 17.249 17.02 16.768 16.546 16.348 16.129 15.905 15.706 15.519 15.305 15.122 14.977 14.822 14.654 14.518 14.392 14.23 14.084 13.94 13.794 13.633 13.453 13.336 13.213 13.004 12.864 12.721 12.652 12.533 12.406 12.266 12.193 11.91 11.936 11.851 11.763 11.572 11.468 11.353 11.21 11.065 10.922 10.722 10.315 -3 ,3801 ,KEBNE ,17022994,Wed Dec 22 07:19:56 CET,Wed Dec 22 08:42:23 CET,0.0 0.937 1.426 1.882 2.171 2.364 2.546 2.726 3.04 3.172 3.304 3.365 3.705 3.825 4.046 4.256 4.457 4.549 4.74 4.935 5.199 5.373 5.55 5.785 6.014 6.244 6.451 6.644 6.905 7.17 7.42 7.721 8.019 8.312 8.64 8.999 9.343 9.709 10.09 10.506 10.957 11.449 12.001 12.555 13.19 13.893 14.636 15.378 16.19 17.106 18.038 18.523 18.61 18.493 18.326 18.125 17.869 17.602 17.352 17.099 16.875 16.652 16.424 16.2 15.998 15.814 15.626 15.457 15.305 15.158 15.01 14.874 14.733 14.597 14.482 14.358 14.225 14.058 13.874 13.757 13.626 13.395 13.245 13.094 13.014 12.844 12.674 12.502 12.404 12.101 12.07 11.951 11.835 11.569 11.419 11.271 11.101 10.928 10.707 10.4 9.85 -4 ,10302 ,KEBNE ,17022995,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:40:51 CET,0.0 0.437 0.698 0.932 1.143 1.34 1.534 1.716 2.053 2.197 2.338 2.387 2.717 2.834 3.049 3.258 3.469 3.579 3.782 3.961 4.236 4.414 4.59 4.841 5.065 5.27 5.469 5.663 5.926 6.198 6.441 6.724 6.999 7.262 7.571 7.916 8.264 8.647 9.052 9.477 9.892 10.368 10.926 11.464 12.079 12.737 13.449 14.233 15.084 15.941 16.845 17.35 17.4 17.271 17.074 16.857 16.621 16.374 16.155 15.915 15.68 15.472 15.28 15.07 14.846 14.643 14.443 14.264 14.099 13.911 13.725 13.575 13.412 13.234 13.069 12.887 12.71 12.533 12.36 12.254 12.148 11.981 11.862 11.731 11.661 11.514 11.371 11.218 11.132 10.853 10.869 10.76 10.634 10.349 10.197 10.036 9.863 9.642 9.371 9.012 7.996 -5 ,16054 ,KEBNE ,17022996,Wed Dec 22 07:19:56 CET,Wed Dec 22 08:40:58 CET,0.0 2.487 3.226 3.743 4.19 4.575 4.891 5.104 5.427 5.587 5.73 5.796 6.125 6.246 6.491 6.731 6.961 7.065 7.26 7.439 7.684 7.855 8.026 8.261 8.498 8.732 8.945 9.153 9.432 9.703 9.964 10.281 10.595 10.893 11.226 11.589 11.94 12.324 12.714 13.119 13.548 14.018 14.55 15.081 15.695 16.385 17.144 17.976 18.869 19.762 20.704 21.238 21.234 21.044 20.851 20.616 20.334 20.076 19.859 19.596 19.352 19.147 18.949 18.738 18.54 18.352 18.15 17.975 17.821 17.648 17.456 17.295 17.132 16.967 16.845 16.721 16.586 16.451 16.309 16.213 16.12 15.949 15.82 15.7 15.643 15.521 15.384 15.235 15.156 14.875 14.882 14.79 14.699 14.466 14.33 14.192 14.03 13.844 13.598 13.278 12.631 -6 ,2858 ,KEBNE ,17022997,Wed Dec 22 07:20:00 CET,Wed Dec 22 08:41:07 CET,0.0 0.904 1.279 1.57 1.81 2.01 2.19 2.36 2.68 2.852 3.023 3.133 3.479 3.612 3.88 4.132 4.37 4.484 4.71 4.929 5.229 5.418 5.602 5.87 6.134 6.391 6.615 6.815 7.084 7.343 7.597 7.907 8.199 8.491 8.829 9.204 9.559 9.946 10.359 10.783 11.217 11.727 12.312 12.838 13.437 14.095 14.844 15.643 16.5 17.368 18.191 18.681 18.794 18.678 18.486 18.273 18.034 17.801 17.577 17.336 17.128 16.926 16.712 16.487 16.28 16.097 15.88 15.688 15.54 15.385 15.221 15.096 14.975 14.844 14.728 14.593 14.456 14.319 14.19 14.102 14.005 13.863 13.755 13.622 13.555 13.429 13.294 13.16 13.092 12.818 12.848 12.758 12.674 12.489 12.377 12.268 12.139 11.966 11.801 11.629 11.141 -7 ,95 ,KEBNE ,17022998,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:11 CET,0.0 0.812 1.126 1.395 1.637 1.837 2.007 2.176 2.513 2.679 2.83 2.907 3.246 3.368 3.599 3.818 4.02 4.114 4.301 4.501 4.803 5.005 5.209 5.495 5.758 6.007 6.243 6.473 6.771 7.049 7.319 7.627 7.917 8.205 8.537 8.918 9.278 9.671 10.072 10.479 10.904 11.361 11.89 12.439 13.036 13.662 14.404 15.164 15.976 16.882 17.796 18.288 18.342 18.249 18.048 17.77 17.507 17.256 17.037 16.785 16.536 16.302 16.067 15.862 15.668 15.486 15.276 15.071 14.899 14.718 14.523 14.351 14.175 14.0 13.864 13.721 13.578 13.416 13.247 13.139 13.018 12.819 12.69 12.56 12.489 12.34 12.195 12.038 11.943 11.652 11.674 11.574 11.457 11.21 11.061 10.883 10.691 10.494 10.257 9.982 9.254 -8 ,28493 ,KEBNE ,17022999,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:00 CET,0.0 1.318 1.745 2.057 2.291 2.492 2.667 2.847 3.189 3.342 3.481 3.522 3.845 3.958 4.195 4.424 4.629 4.73 4.931 5.117 5.386 5.561 5.737 5.996 6.224 6.438 6.664 6.887 7.157 7.427 7.689 7.991 8.284 8.578 8.911 9.262 9.603 9.985 10.405 10.827 11.258 11.748 12.29 12.808 13.391 14.015 14.697 15.475 16.328 17.26 18.202 18.665 18.715 18.594 18.398 18.112 17.812 17.553 17.317 17.049 16.817 16.614 16.402 16.184 15.987 15.803 15.605 15.437 15.285 15.118 14.931 14.76 14.576 14.371 14.209 14.059 13.907 13.747 13.596 13.48 13.362 13.202 13.103 13.003 12.953 12.852 12.738 12.619 12.552 12.284 12.326 12.237 12.141 11.902 11.785 11.663 11.52 11.345 11.131 10.866 10.316 -9 ,18454 ,KEBNE ,17023000,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:42:24 CET,0.0 0.75 1.049 1.279 1.467 1.632 1.799 1.942 2.208 2.342 2.46 2.456 2.757 2.857 3.057 3.278 3.508 3.619 3.817 3.993 4.259 4.432 4.589 4.809 5.007 5.212 5.421 5.623 5.878 6.106 6.313 6.575 6.858 7.127 7.417 7.739 8.072 8.453 8.859 9.278 9.707 10.222 10.823 11.378 11.987 12.647 13.393 14.211 15.081 15.914 16.709 17.047 17.103 17.039 16.891 16.719 16.533 16.315 16.104 15.882 15.679 15.487 15.301 15.119 14.935 14.76 14.579 14.421 14.273 14.122 13.972 13.849 13.733 13.616 13.513 13.387 13.237 13.076 12.908 12.781 12.642 12.431 12.307 12.189 12.117 11.973 11.836 11.687 11.616 11.335 11.32 11.22 11.129 10.931 10.815 10.707 10.583 10.417 10.211 9.969 9.561 -10 ,11561 ,KEBNE ,17023001,Wed Dec 22 07:19:58 CET,Wed Dec 22 08:41:23 CET,0.0 0.92 1.293 1.563 1.823 2.055 2.261 2.438 2.752 2.902 3.054 3.13 3.456 3.567 3.79 4.008 4.204 4.306 4.516 4.694 4.935 5.096 5.259 5.492 5.715 5.942 6.177 6.399 6.672 6.935 7.192 7.515 7.831 8.132 8.472 8.85 9.2 9.587 10.006 10.43 10.869 11.348 11.896 12.434 13.044 13.716 14.471 15.296 16.198 17.15 18.006 18.371 18.457 18.355 18.156 17.923 17.689 17.466 17.257 17.0 16.748 16.53 16.318 16.107 15.897 15.701 15.496 15.316 15.155 14.983 14.804 14.66 14.504 14.329 14.197 14.055 13.896 13.742 13.584 13.459 13.324 13.11 12.973 12.83 12.744 12.564 12.402 12.259 12.183 11.909 11.934 11.846 11.755 11.543 11.422 11.298 11.182 11.063 10.923 10.702 10.176 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_35_52.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_35_52.txt deleted file mode 100644 index 2772ddf6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_35_52.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3498 ,KEBNE ,17023002,Wed Dec 22 07:19:57 CET,Wed Dec 22 08:41:06 CET,0.0 1.514 2.068 2.472 2.796 3.073 3.288 3.482 3.847 4.021 4.19 4.255 4.592 4.718 4.928 5.147 5.348 5.439 5.61 5.754 5.967 6.107 6.244 6.442 6.628 6.792 6.963 7.121 7.287 7.456 7.626 7.825 8.029 8.23 8.448 8.689 8.909 9.13 9.368 9.623 9.884 10.181 10.502 10.795 11.141 11.47 11.787 12.075 12.26 12.322 12.01 11.282 10.508 9.747 9.059 8.407 7.815 7.254 6.751 6.289 5.902 5.56 5.234 4.922 4.619 4.324 4.016 3.74 3.511 3.268 3.013 2.802 2.56 2.325 2.156 1.976 1.789 1.587 1.372 1.226 1.07 0.817 0.638 0.46 0.37 0.181 -0.017 -0.255 -0.383 -0.718 -0.787 -0.932 -1.082 -1.387 -1.557 -1.724 -1.874 -2.061 -2.339 -2.737 -3.918 -2 ,6882 ,KEBNE ,17023003,Wed Dec 22 07:19:58 CET,Wed Dec 22 08:42:24 CET,0.0 1.415 1.97 2.367 2.696 2.965 3.173 3.366 3.718 3.891 4.051 4.137 4.473 4.589 4.81 5.023 5.23 5.328 5.517 5.708 5.986 6.167 6.334 6.542 6.743 6.931 7.107 7.283 7.497 7.698 7.889 8.123 8.336 8.536 8.77 9.012 9.231 9.472 9.738 10.013 10.281 10.575 10.93 11.269 11.612 11.934 12.249 12.526 12.742 12.818 12.469 11.693 10.918 10.166 9.446 8.783 8.216 7.664 7.168 6.681 6.266 5.908 5.554 5.198 4.877 4.599 4.298 4.021 3.788 3.536 3.277 3.046 2.792 2.553 2.372 2.178 1.962 1.745 1.52 1.363 1.206 0.958 0.786 0.593 0.491 0.283 0.068 -0.168 -0.3 -0.632 -0.676 -0.804 -0.935 -1.233 -1.401 -1.582 -1.789 -2.049 -2.346 -2.706 -3.603 -3 ,24058 ,KEBNE ,17023004,Wed Dec 22 07:19:58 CET,Wed Dec 22 08:42:50 CET,0.0 0.935 1.374 1.739 1.994 2.217 2.41 2.579 2.929 3.089 3.231 3.297 3.624 3.74 3.978 4.187 4.377 4.472 4.659 4.826 5.052 5.199 5.345 5.566 5.776 5.977 6.17 6.358 6.584 6.795 6.993 7.209 7.412 7.622 7.879 8.149 8.391 8.649 8.917 9.183 9.451 9.772 10.123 10.442 10.792 11.11 11.425 11.703 11.895 11.913 11.573 10.827 10.034 9.242 8.499 7.875 7.286 6.718 6.247 5.786 5.383 5.005 4.649 4.326 3.996 3.664 3.322 3.014 2.74 2.465 2.189 1.968 1.741 1.478 1.259 1.042 0.834 0.603 0.35 0.185 0.02 -0.243 -0.444 -0.661 -0.764 -0.965 -1.195 -1.434 -1.555 -1.898 -1.982 -2.119 -2.251 -2.532 -2.685 -2.852 -3.04 -3.264 -3.555 -3.89 -4.641 -4 ,3408 ,KEBNE ,17023005,Wed Dec 22 07:20:02 CET,Wed Dec 22 08:41:11 CET,0.0 2.144 2.713 3.159 3.493 3.747 3.997 4.238 4.681 4.866 5.015 5.09 5.418 5.544 5.801 6.03 6.255 6.359 6.543 6.719 6.962 7.115 7.261 7.474 7.69 7.91 8.124 8.318 8.555 8.79 9.021 9.289 9.531 9.751 10.023 10.321 10.595 10.906 11.205 11.507 11.798 12.102 12.422 12.705 13.014 13.324 13.625 13.874 14.041 14.025 13.676 12.949 12.189 11.485 10.871 10.28 9.732 9.214 8.733 8.265 7.882 7.53 7.189 6.858 6.543 6.26 5.964 5.707 5.473 5.236 5.011 4.828 4.628 4.414 4.24 4.053 3.864 3.669 3.463 3.315 3.175 2.947 2.777 2.61 2.521 2.337 2.152 1.953 1.847 1.525 1.475 1.327 1.184 0.886 0.693 0.5 0.295 0.044 -0.222 -0.54 -1.614 -5 ,22888 ,KEBNE ,17023006,Wed Dec 22 07:20:02 CET,Wed Dec 22 08:42:28 CET,0.0 0.954 1.385 1.713 2.014 2.255 2.489 2.733 3.147 3.304 3.449 3.522 3.851 3.973 4.212 4.435 4.63 4.725 4.912 5.079 5.317 5.464 5.595 5.788 5.976 6.16 6.337 6.498 6.703 6.907 7.09 7.298 7.514 7.707 7.925 8.183 8.42 8.674 8.941 9.212 9.495 9.801 10.145 10.489 10.853 11.184 11.46 11.706 11.951 12.093 11.867 11.172 10.392 9.634 8.939 8.291 7.69 7.127 6.63 6.143 5.736 5.384 5.049 4.714 4.371 4.049 3.699 3.382 3.118 2.849 2.564 2.317 2.071 1.816 1.605 1.395 1.186 0.977 0.749 0.585 0.418 0.146 -0.035 -0.21 -0.305 -0.505 -0.717 -0.952 -1.066 -1.389 -1.435 -1.569 -1.721 -2.059 -2.24 -2.422 -2.637 -2.924 -3.305 -3.715 -4.967 -6 ,18590 ,KEBNE ,17023007,Wed Dec 22 07:20:04 CET,Wed Dec 22 08:41:15 CET,0.0 0.949 1.283 1.582 1.844 2.068 2.258 2.393 2.647 2.772 2.897 2.944 3.269 3.387 3.589 3.745 3.914 4.003 4.17 4.339 4.589 4.749 4.907 5.123 5.306 5.481 5.653 5.826 6.057 6.265 6.448 6.656 6.846 7.024 7.233 7.473 7.693 7.922 8.175 8.425 8.683 8.992 9.321 9.624 9.96 10.29 10.617 10.923 11.204 11.324 11.052 10.368 9.65 8.907 8.191 7.549 6.959 6.401 5.898 5.383 4.964 4.586 4.219 3.853 3.501 3.191 2.877 2.597 2.346 2.092 1.83 1.597 1.352 1.113 0.935 0.745 0.546 0.352 0.147 -0.01 -0.177 -0.43 -0.611 -0.801 -0.897 -1.09 -1.295 -1.53 -1.65 -1.974 -2.016 -2.151 -2.301 -2.604 -2.76 -2.972 -3.247 -3.58 -3.997 -4.438 -5.52 -7 ,9111 ,KEBNE ,17023008,Wed Dec 22 07:20:04 CET,Wed Dec 22 08:42:30 CET,0.0 0.881 1.305 1.662 1.93 2.139 2.343 2.544 2.877 3.013 3.145 3.199 3.536 3.67 3.903 4.109 4.309 4.396 4.57 4.739 5.001 5.177 5.336 5.568 5.78 5.986 6.206 6.402 6.632 6.856 7.052 7.31 7.582 7.819 8.07 8.338 8.59 8.852 9.133 9.434 9.71 9.992 10.34 10.67 11.003 11.324 11.632 11.943 12.186 12.214 11.887 11.213 10.427 9.671 8.975 8.291 7.697 7.18 6.726 6.251 5.854 5.496 5.145 4.816 4.487 4.189 3.893 3.621 3.389 3.143 2.867 2.639 2.409 2.165 1.971 1.771 1.555 1.32 1.069 0.914 0.764 0.507 0.33 0.156 0.062 -0.142 -0.348 -0.565 -0.687 -1.021 -1.067 -1.215 -1.379 -1.723 -1.916 -2.124 -2.333 -2.578 -2.921 -3.39 -4.849 -8 ,43 ,KEBNE ,17023009,Wed Dec 22 07:20:04 CET,Wed Dec 22 08:41:06 CET,0.0 1.071 1.539 1.856 2.126 2.366 2.586 2.808 3.226 3.395 3.545 3.647 3.988 4.118 4.373 4.622 4.855 4.962 5.164 5.349 5.625 5.794 5.946 6.173 6.382 6.582 6.775 6.962 7.199 7.428 7.642 7.88 8.121 8.35 8.596 8.868 9.118 9.387 9.674 9.953 10.237 10.559 10.914 11.221 11.531 11.855 12.194 12.49 12.688 12.707 12.385 11.656 10.836 10.049 9.329 8.678 8.098 7.56 7.089 6.609 6.192 5.804 5.445 5.135 4.837 4.555 4.267 4.007 3.787 3.557 3.304 3.079 2.862 2.652 2.477 2.288 2.099 1.904 1.69 1.528 1.34 1.053 0.868 0.687 0.584 0.347 0.115 -0.113 -0.225 -0.559 -0.609 -0.73 -0.876 -1.201 -1.359 -1.53 -1.749 -2.033 -2.342 -2.791 -3.924 -9 ,32083 ,KEBNE ,17023010,Wed Dec 22 07:20:04 CET,Wed Dec 22 08:41:03 CET,0.0 1.006 1.452 1.79 2.092 2.389 2.623 2.809 3.161 3.327 3.475 3.527 3.862 3.98 4.2 4.431 4.647 4.742 4.919 5.106 5.387 5.555 5.722 5.98 6.215 6.415 6.598 6.77 7.0 7.235 7.457 7.715 7.951 8.177 8.446 8.728 8.985 9.252 9.522 9.822 10.13 10.42 10.736 11.042 11.385 11.719 12.025 12.306 12.532 12.652 12.34 11.591 10.813 10.029 9.319 8.684 8.087 7.508 7.012 6.516 6.094 5.735 5.391 5.059 4.754 4.463 4.152 3.884 3.644 3.383 3.089 2.849 2.621 2.378 2.175 1.97 1.759 1.539 1.325 1.181 1.026 0.767 0.583 0.399 0.303 0.098 -0.112 -0.324 -0.432 -0.752 -0.773 -0.889 -1.004 -1.252 -1.399 -1.571 -1.746 -1.95 -2.204 -2.556 -3.61 -10 ,15275 ,KEBNE ,17023011,Wed Dec 22 07:20:04 CET,Wed Dec 22 08:42:27 CET,0.0 1.17 1.523 1.781 1.967 2.144 2.314 2.48 2.806 2.968 3.119 3.167 3.481 3.58 3.768 3.933 4.083 4.157 4.301 4.452 4.654 4.767 4.893 5.113 5.324 5.518 5.713 5.904 6.141 6.359 6.571 6.818 7.048 7.271 7.522 7.789 8.035 8.321 8.628 8.922 9.22 9.53 9.862 10.183 10.516 10.868 11.214 11.49 11.711 11.792 11.515 10.834 10.062 9.302 8.614 7.987 7.45 6.942 6.472 6.0 5.586 5.203 4.842 4.51 4.202 3.912 3.593 3.302 3.052 2.804 2.548 2.33 2.106 1.878 1.697 1.505 1.299 1.074 0.829 0.668 0.509 0.256 0.081 -0.097 -0.182 -0.345 -0.509 -0.688 -0.79 -1.11 -1.12 -1.239 -1.368 -1.638 -1.801 -1.972 -2.156 -2.372 -2.615 -2.879 -3.546 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_37_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_37_50.txt deleted file mode 100644 index d87e3368..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_37_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18545 ,TETRA ,17550950,Thu Nov 25 09:45:38 CET,Thu Nov 25 11:23:02 CET,0.0 0.475 0.692 0.901 1.102 1.276 1.435 1.572 1.829 1.963 2.106 2.132 2.437 2.534 2.726 2.907 3.077 3.161 3.326 3.478 3.691 3.834 3.972 4.175 4.37 4.555 4.734 4.911 5.134 5.339 5.546 5.807 6.05 6.291 6.573 6.866 7.151 7.477 7.838 8.205 8.58 9.0 9.48 9.946 10.48 11.077 11.757 12.509 13.313 14.14 14.945 15.407 15.492 15.396 15.223 15.002 14.766 14.522 14.301 14.039 13.777 13.546 13.319 13.099 12.887 12.704 12.512 12.311 12.141 11.98 11.823 11.688 11.545 11.403 11.282 11.16 11.04 10.911 10.782 10.691 10.598 10.456 10.352 10.245 10.191 10.074 9.94 9.794 9.722 9.448 9.509 9.437 9.354 9.176 9.078 8.975 8.863 8.72 8.573 8.388 8.023 -2 ,5696 ,TETRA ,17550951,Thu Nov 25 09:45:41 CET,Thu Nov 25 11:14:21 CET,0.0 0.641 0.887 1.1 1.302 1.458 1.605 1.762 2.037 2.164 2.279 2.29 2.6 2.702 2.904 3.082 3.258 3.351 3.522 3.673 3.885 4.023 4.157 4.358 4.56 4.75 4.938 5.139 5.393 5.624 5.851 6.121 6.36 6.598 6.884 7.211 7.527 7.863 8.217 8.571 8.938 9.362 9.867 10.367 10.92 11.533 12.204 12.914 13.756 14.654 15.57 16.047 16.079 15.927 15.75 15.539 15.278 15.016 14.76 14.474 14.225 14.006 13.792 13.555 13.316 13.117 12.928 12.755 12.599 12.441 12.281 12.147 12.001 11.839 11.717 11.599 11.48 11.353 11.217 11.12 11.029 10.89 10.786 10.68 10.624 10.499 10.368 10.234 10.166 9.893 9.924 9.837 9.75 9.559 9.458 9.355 9.238 9.112 8.98 8.827 8.568 -3 ,11246 ,TETRA ,17550952,Thu Nov 25 09:45:37 CET,Thu Nov 25 11:23:18 CET,0.0 0.694 1.068 1.344 1.534 1.674 1.812 1.952 2.2 2.31 2.42 2.453 2.771 2.87 3.067 3.255 3.421 3.495 3.645 3.796 4.029 4.188 4.332 4.522 4.707 4.888 5.071 5.252 5.469 5.672 5.879 6.123 6.361 6.601 6.875 7.181 7.474 7.799 8.16 8.553 8.952 9.388 9.887 10.379 10.944 11.551 12.202 12.925 13.744 14.592 15.42 15.838 15.907 15.825 15.638 15.38 15.12 14.873 14.642 14.39 14.158 13.947 13.727 13.506 13.305 13.113 12.908 12.729 12.57 12.391 12.211 12.063 11.902 11.743 11.627 11.498 11.367 11.241 11.103 11.001 10.903 10.754 10.648 10.537 10.478 10.353 10.217 10.068 9.993 9.723 9.774 9.692 9.603 9.418 9.321 9.224 9.107 8.971 8.802 8.582 8.236 -4 ,1552 ,TETRA ,17550953,Thu Nov 25 09:45:37 CET,Thu Nov 25 11:23:20 CET,0.0 0.483 0.773 0.991 1.164 1.331 1.474 1.607 1.869 1.989 2.105 2.104 2.414 2.517 2.705 2.88 3.044 3.121 3.272 3.427 3.647 3.792 3.934 4.129 4.314 4.49 4.657 4.815 5.025 5.239 5.464 5.741 6.005 6.266 6.56 6.88 7.192 7.53 7.889 8.26 8.648 9.106 9.615 10.078 10.625 11.238 11.909 12.652 13.459 14.312 15.167 15.637 15.698 15.557 15.37 15.133 14.852 14.576 14.34 14.095 13.866 13.653 13.441 13.217 12.98 12.741 12.492 12.297 12.15 12.002 11.838 11.705 11.571 11.432 11.325 11.211 11.09 10.951 10.808 10.719 10.623 10.474 10.369 10.245 10.181 10.063 9.936 9.788 9.71 9.434 9.47 9.381 9.29 9.105 8.99 8.864 8.741 8.603 8.436 8.24 7.884 -5 ,16528 ,TETRA ,17550954,Thu Nov 25 09:45:41 CET,Thu Nov 25 11:13:49 CET,0.0 0.471 0.834 1.084 1.254 1.405 1.571 1.721 1.984 2.098 2.214 2.239 2.552 2.653 2.865 3.06 3.244 3.333 3.499 3.668 3.904 4.043 4.179 4.386 4.589 4.784 4.962 5.136 5.366 5.579 5.789 6.044 6.289 6.516 6.79 7.122 7.434 7.772 8.122 8.48 8.864 9.281 9.743 10.217 10.775 11.377 12.053 12.779 13.607 14.489 15.267 15.656 15.751 15.675 15.517 15.308 15.066 14.825 14.599 14.348 14.124 13.918 13.704 13.501 13.289 13.08 12.875 12.702 12.555 12.389 12.207 12.061 11.919 11.766 11.648 11.531 11.411 11.288 11.155 11.063 10.964 10.81 10.705 10.589 10.533 10.422 10.295 10.161 10.091 9.811 9.845 9.765 9.685 9.501 9.399 9.289 9.177 9.068 8.932 8.759 8.508 -6 ,28670 ,TETRA ,17550955,Thu Nov 25 09:45:38 CET,Thu Nov 25 11:20:31 CET,0.0 0.348 0.588 0.832 1.033 1.209 1.364 1.516 1.79 1.911 2.02 2.032 2.348 2.444 2.645 2.832 3.012 3.102 3.28 3.446 3.663 3.802 3.947 4.162 4.365 4.564 4.78 4.984 5.227 5.457 5.68 5.954 6.22 6.493 6.797 7.1 7.393 7.742 8.122 8.506 8.9 9.344 9.855 10.36 10.94 11.54 12.198 12.925 13.702 14.49 15.245 15.659 15.712 15.594 15.399 15.177 14.953 14.707 14.455 14.181 13.944 13.75 13.549 13.342 13.146 12.952 12.736 12.533 12.361 12.191 12.021 11.886 11.742 11.598 11.498 11.386 11.261 11.137 11.005 10.911 10.812 10.655 10.547 10.428 10.364 10.236 10.107 9.979 9.911 9.645 9.711 9.635 9.554 9.383 9.293 9.192 9.075 8.941 8.781 8.584 8.282 -7 ,8678 ,TETRA ,17550956,Thu Nov 25 09:45:41 CET,Thu Nov 25 11:23:09 CET,0.0 0.638 0.94 1.159 1.323 1.463 1.594 1.723 1.966 2.068 2.171 2.194 2.51 2.608 2.804 2.996 3.186 3.274 3.435 3.591 3.816 3.959 4.101 4.309 4.5 4.684 4.861 5.033 5.264 5.482 5.69 5.95 6.201 6.439 6.714 7.016 7.315 7.645 7.997 8.363 8.732 9.156 9.663 10.177 10.773 11.433 12.162 12.891 13.691 14.544 15.334 15.764 15.849 15.764 15.572 15.34 15.096 14.853 14.643 14.405 14.159 13.931 13.72 13.519 13.316 13.142 12.974 12.817 12.68 12.53 12.371 12.238 12.095 11.951 11.836 11.714 11.588 11.462 11.336 11.25 11.159 11.007 10.893 10.771 10.712 10.594 10.463 10.33 10.264 9.992 10.006 9.902 9.808 9.611 9.509 9.4 9.282 9.169 9.007 8.837 8.511 -8 ,21189 ,TETRA ,17550957,Thu Nov 25 09:45:41 CET,Thu Nov 25 11:11:52 CET,0.0 0.457 0.692 0.869 1.019 1.17 1.325 1.482 1.779 1.908 2.021 2.038 2.347 2.44 2.628 2.811 2.999 3.088 3.254 3.419 3.653 3.802 3.944 4.151 4.345 4.517 4.681 4.846 5.048 5.241 5.441 5.687 5.927 6.149 6.392 6.667 6.94 7.254 7.588 7.953 8.344 8.758 9.223 9.696 10.253 10.839 11.484 12.224 13.035 13.877 14.702 15.117 15.17 15.054 14.854 14.635 14.4 14.14 13.897 13.64 13.406 13.193 12.989 12.785 12.574 12.363 12.161 11.991 11.832 11.665 11.487 11.33 11.167 11.007 10.876 10.735 10.599 10.468 10.332 10.235 10.129 9.956 9.838 9.717 9.659 9.549 9.425 9.292 9.224 8.951 9.007 8.93 8.839 8.64 8.539 8.428 8.312 8.186 8.025 7.827 7.474 -9 ,20281 ,TETRA ,17550958,Thu Nov 25 09:47:06 CET,Thu Nov 25 11:24:01 CET,0.0 0.614 0.883 1.097 1.316 1.528 1.713 1.879 2.142 2.256 2.372 2.4 2.716 2.816 3.007 3.19 3.367 3.451 3.619 3.774 4.012 4.172 4.314 4.525 4.734 4.945 5.15 5.352 5.614 5.859 6.09 6.366 6.642 6.901 7.196 7.524 7.827 8.166 8.541 8.934 9.336 9.774 10.267 10.759 11.33 11.935 12.597 13.337 14.145 14.951 15.781 16.265 16.325 16.207 16.036 15.827 15.604 15.371 15.115 14.842 14.611 14.375 14.145 13.927 13.719 13.537 13.33 13.127 12.96 12.786 12.593 12.436 12.27 12.086 11.949 11.821 11.691 11.551 11.419 11.336 11.241 11.077 10.971 10.866 10.807 10.687 10.557 10.423 10.356 10.08 10.106 10.018 9.931 9.755 9.656 9.541 9.414 9.277 9.131 8.956 8.675 -10 ,17729 ,TETRA ,17550959,Thu Nov 25 09:46:07 CET,Thu Nov 25 11:24:18 CET,0.0 0.723 0.981 1.207 1.375 1.531 1.686 1.843 2.174 2.316 2.438 2.457 2.776 2.876 3.07 3.25 3.422 3.506 3.664 3.818 4.036 4.172 4.319 4.538 4.735 4.926 5.105 5.28 5.514 5.739 5.947 6.195 6.458 6.729 7.026 7.34 7.645 7.978 8.327 8.712 9.12 9.542 10.036 10.528 11.074 11.703 12.387 13.081 13.868 14.724 15.597 16.098 16.217 16.142 15.977 15.76 15.518 15.261 15.016 14.757 14.522 14.307 14.091 13.889 13.701 13.512 13.305 13.127 12.971 12.8 12.63 12.496 12.361 12.214 12.092 11.972 11.853 11.723 11.591 11.499 11.402 11.254 11.148 11.03 10.972 10.857 10.743 10.62 10.55 10.281 10.34 10.258 10.162 9.952 9.849 9.744 9.629 9.501 9.359 9.189 8.854 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_37_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_37_53.txt deleted file mode 100644 index 08afc4ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_37_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,445 ,KEBNE ,17023012,Wed Dec 22 07:20:04 CET,Wed Dec 22 08:41:44 CET,0.0 0.69 0.99 1.236 1.464 1.666 1.831 1.991 2.304 2.443 2.566 2.601 2.918 3.023 3.219 3.403 3.578 3.66 3.816 3.965 4.167 4.297 4.435 4.626 4.787 4.935 5.091 5.251 5.448 5.638 5.83 6.04 6.226 6.404 6.6 6.83 7.062 7.306 7.557 7.831 8.126 8.415 8.705 9.016 9.357 9.642 9.904 10.191 10.447 10.46 10.126 9.38 8.556 7.729 6.967 6.287 5.663 5.068 4.554 4.04 3.591 3.189 2.79 2.406 2.067 1.754 1.43 1.142 0.874 0.607 0.356 0.17 -0.014 -0.211 -0.372 -0.544 -0.706 -0.883 -1.076 -1.202 -1.337 -1.542 -1.681 -1.821 -1.892 -2.043 -2.214 -2.374 -2.449 -2.754 -2.764 -2.887 -3.025 -3.312 -3.438 -3.567 -3.717 -3.878 -4.046 -4.253 -4.737 -2 ,31314 ,KEBNE ,17023013,Wed Dec 22 07:20:07 CET,Wed Dec 22 08:41:41 CET,0.0 1.123 1.523 1.837 2.094 2.322 2.526 2.694 2.949 3.063 3.172 3.167 3.473 3.552 3.712 3.868 4.015 4.085 4.228 4.361 4.532 4.648 4.768 4.939 5.091 5.222 5.345 5.468 5.625 5.779 5.929 6.107 6.276 6.451 6.648 6.857 7.063 7.282 7.504 7.722 7.939 8.171 8.444 8.702 9.02 9.379 9.702 9.95 10.153 10.19 9.828 9.055 8.184 7.411 6.736 6.044 5.417 4.898 4.481 4.066 3.67 3.287 2.93 2.596 2.287 2.026 1.766 1.52 1.303 1.067 0.83 0.641 0.418 0.179 -0.018 -0.204 -0.363 -0.527 -0.694 -0.807 -0.921 -1.105 -1.225 -1.359 -1.434 -1.586 -1.719 -1.85 -1.932 -2.226 -2.175 -2.259 -2.355 -2.574 -2.68 -2.792 -2.91 -3.035 -3.193 -3.398 -3.814 -3 ,10411 ,KEBNE ,17023014,Wed Dec 22 07:20:07 CET,Wed Dec 22 08:41:41 CET,0.0 0.445 0.679 0.884 1.059 1.217 1.356 1.473 1.688 1.789 1.878 1.838 2.128 2.215 2.363 2.502 2.655 2.728 2.852 2.966 3.142 3.253 3.362 3.517 3.664 3.808 3.934 4.048 4.204 4.357 4.506 4.681 4.842 4.996 5.177 5.382 5.587 5.813 6.046 6.281 6.522 6.764 7.027 7.318 7.623 7.864 8.108 8.373 8.587 8.652 8.323 7.486 6.641 5.843 5.09 4.399 3.756 3.149 2.574 1.982 1.51 1.09 0.684 0.306 -0.027 -0.324 -0.658 -0.965 -1.226 -1.5 -1.802 -2.066 -2.339 -2.611 -2.813 -3.023 -3.245 -3.45 -3.649 -3.796 -3.945 -4.179 -4.348 -4.536 -4.634 -4.824 -5.022 -5.257 -5.392 -5.734 -5.791 -5.935 -6.093 -6.439 -6.61 -6.783 -6.987 -7.245 -7.521 -7.824 -8.535 -4 ,12653 ,KEBNE ,17023015,Wed Dec 22 07:20:07 CET,Wed Dec 22 08:41:50 CET,0.0 0.813 1.155 1.411 1.597 1.749 1.902 2.043 2.286 2.4 2.51 2.493 2.789 2.871 3.028 3.183 3.337 3.407 3.549 3.707 3.953 4.109 4.241 4.419 4.592 4.751 4.9 5.049 5.237 5.412 5.578 5.756 5.939 6.135 6.351 6.57 6.791 7.036 7.278 7.539 7.808 8.091 8.396 8.665 8.963 9.301 9.65 9.963 10.19 10.205 9.788 8.923 8.036 7.21 6.478 5.807 5.216 4.658 4.16 3.648 3.196 2.798 2.412 2.045 1.701 1.383 1.055 0.759 0.5 0.24 -0.03 -0.272 -0.532 -0.792 -0.984 -1.187 -1.393 -1.613 -1.847 -2.004 -2.158 -2.39 -2.562 -2.739 -2.833 -3.023 -3.221 -3.436 -3.541 -3.86 -3.893 -4.023 -4.153 -4.433 -4.583 -4.73 -4.881 -5.057 -5.27 -5.576 -6.476 -5 ,8476 ,KEBNE ,17023016,Wed Dec 22 07:20:08 CET,Wed Dec 22 08:41:20 CET,0.0 0.639 0.952 1.195 1.379 1.538 1.702 1.85 2.11 2.237 2.357 2.384 2.703 2.807 3.011 3.186 3.338 3.415 3.578 3.726 3.922 4.043 4.167 4.357 4.536 4.702 4.865 5.026 5.221 5.425 5.622 5.846 6.063 6.274 6.514 6.77 6.999 7.23 7.469 7.713 7.969 8.257 8.557 8.806 9.104 9.452 9.795 10.075 10.292 10.361 10.029 9.284 8.481 7.702 6.977 6.289 5.644 5.044 4.532 4.007 3.539 3.129 2.739 2.359 1.967 1.597 1.251 0.989 0.785 0.56 0.321 0.13 -0.075 -0.297 -0.455 -0.599 -0.74 -0.893 -1.068 -1.189 -1.305 -1.499 -1.625 -1.747 -1.815 -1.968 -2.127 -2.271 -2.352 -2.654 -2.627 -2.729 -2.832 -3.037 -3.142 -3.243 -3.354 -3.489 -3.647 -3.842 -4.252 -6 ,6378 ,KEBNE ,17023017,Wed Dec 22 07:20:09 CET,Wed Dec 22 08:43:17 CET,0.0 0.967 1.276 1.526 1.748 1.926 2.086 2.226 2.459 2.577 2.683 2.653 2.947 3.03 3.185 3.333 3.481 3.555 3.684 3.806 3.982 4.099 4.213 4.365 4.499 4.631 4.776 4.929 5.125 5.305 5.474 5.666 5.844 6.029 6.239 6.465 6.671 6.891 7.125 7.35 7.583 7.845 8.118 8.356 8.63 8.882 9.101 9.324 9.488 9.465 9.125 8.444 7.676 6.924 6.243 5.62 5.065 4.555 4.117 3.68 3.287 2.94 2.619 2.319 2.042 1.769 1.479 1.228 0.997 0.761 0.542 0.372 0.201 0.013 -0.131 -0.276 -0.428 -0.576 -0.737 -0.849 -0.96 -1.146 -1.287 -1.437 -1.506 -1.638 -1.776 -1.917 -1.993 -2.284 -2.25 -2.347 -2.443 -2.66 -2.795 -2.934 -3.075 -3.22 -3.396 -3.636 -4.028 -7 ,28576 ,KEBNE ,17023018,Wed Dec 22 07:20:09 CET,Wed Dec 22 08:41:42 CET,0.0 0.759 1.094 1.358 1.586 1.761 1.9 2.044 2.364 2.523 2.655 2.656 2.965 3.067 3.26 3.425 3.575 3.659 3.83 3.978 4.177 4.302 4.437 4.638 4.817 4.988 5.147 5.292 5.465 5.637 5.821 6.037 6.235 6.419 6.628 6.878 7.114 7.357 7.619 7.895 8.171 8.468 8.785 9.065 9.384 9.693 9.967 10.234 10.416 10.402 10.083 9.409 8.621 7.809 7.056 6.361 5.719 5.114 4.626 4.136 3.697 3.308 2.925 2.557 2.208 1.889 1.564 1.278 1.03 0.778 0.523 0.297 0.043 -0.235 -0.47 -0.704 -0.926 -1.138 -1.339 -1.48 -1.637 -1.891 -2.059 -2.251 -2.355 -2.557 -2.772 -2.996 -3.117 -3.457 -3.523 -3.677 -3.842 -4.181 -4.356 -4.545 -4.748 -4.971 -5.231 -5.563 -6.458 -8 ,25198 ,KEBNE ,17023019,Wed Dec 22 07:20:10 CET,Wed Dec 22 08:41:54 CET,0.0 0.596 0.906 1.154 1.361 1.533 1.678 1.806 2.044 2.15 2.252 2.221 2.517 2.608 2.775 2.942 3.098 3.168 3.3 3.427 3.614 3.747 3.881 4.077 4.252 4.42 4.588 4.744 4.934 5.122 5.309 5.549 5.785 5.991 6.212 6.457 6.693 6.934 7.171 7.422 7.689 7.97 8.27 8.572 8.901 9.205 9.504 9.733 9.875 9.902 9.597 8.828 8.019 7.248 6.493 5.788 5.145 4.539 4.023 3.51 3.061 2.666 2.286 1.918 1.563 1.229 0.876 0.564 0.292 0.02 -0.237 -0.448 -0.669 -0.903 -1.088 -1.28 -1.484 -1.681 -1.88 -2.029 -2.18 -2.403 -2.567 -2.752 -2.845 -3.033 -3.228 -3.436 -3.543 -3.856 -3.886 -4.022 -4.154 -4.438 -4.606 -4.795 -5.0 -5.217 -5.462 -5.792 -6.777 -9 ,9760 ,KEBNE ,17023020,Wed Dec 22 07:20:16 CET,Wed Dec 22 08:35:08 CET,0.0 0.759 1.077 1.337 1.553 1.741 1.896 2.052 2.362 2.494 2.613 2.629 2.945 3.045 3.23 3.395 3.563 3.646 3.807 3.965 4.178 4.308 4.431 4.604 4.765 4.924 5.072 5.206 5.392 5.577 5.753 5.967 6.174 6.374 6.613 6.868 7.098 7.346 7.614 7.874 8.134 8.44 8.784 9.097 9.386 9.674 9.948 10.162 10.308 10.277 9.943 9.199 8.364 7.568 6.829 6.101 5.432 4.838 4.327 3.813 3.359 2.937 2.54 2.181 1.843 1.528 1.198 0.89 0.616 0.327 0.028 -0.228 -0.498 -0.776 -0.989 -1.204 -1.416 -1.627 -1.847 -1.994 -2.143 -2.372 -2.529 -2.694 -2.787 -2.984 -3.173 -3.366 -3.473 -3.791 -3.816 -3.939 -4.059 -4.321 -4.466 -4.622 -4.779 -4.948 -5.144 -5.378 -5.795 -10 ,21437 ,KEBNE ,17023021,Wed Dec 22 07:20:13 CET,Wed Dec 22 08:43:15 CET,0.0 0.799 1.099 1.292 1.504 1.713 1.903 2.072 2.337 2.453 2.569 2.577 2.882 2.98 3.169 3.345 3.512 3.593 3.738 3.883 4.102 4.238 4.366 4.534 4.689 4.839 4.989 5.134 5.316 5.501 5.667 5.851 6.035 6.211 6.423 6.664 6.899 7.155 7.415 7.672 7.942 8.243 8.551 8.819 9.126 9.462 9.75 9.971 10.152 10.196 9.862 9.088 8.272 7.487 6.808 6.169 5.575 4.999 4.474 3.951 3.513 3.115 2.715 2.335 1.985 1.673 1.334 0.995 0.696 0.401 0.101 -0.131 -0.364 -0.616 -0.807 -0.991 -1.183 -1.393 -1.61 -1.76 -1.916 -2.164 -2.343 -2.53 -2.626 -2.818 -3.019 -3.22 -3.316 -3.635 -3.669 -3.786 -3.91 -4.18 -4.322 -4.484 -4.669 -4.859 -5.087 -5.372 -6.115 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_37_56.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_37_56.txt deleted file mode 100644 index 3aa0a3c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_37_56.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8680 ,KEBNE ,17023022,Wed Dec 22 07:20:22 CET,Wed Dec 22 08:37:39 CET,0.0 1.531 2.009 2.392 2.74 3.026 3.259 3.473 3.865 4.047 4.223 4.357 4.75 4.927 5.262 5.58 5.894 6.051 6.34 6.603 6.99 7.244 7.495 7.865 8.203 8.519 8.838 9.154 9.55 9.924 10.309 10.794 11.256 11.709 12.218 12.785 13.353 13.987 14.668 15.381 16.138 16.968 17.921 18.862 19.932 21.153 22.563 24.209 26.18 28.469 31.218 33.465 34.853 35.761 36.332 36.695 36.907 37.03 37.113 37.142 37.097 37.013 36.919 36.829 36.735 36.653 36.548 36.422 36.313 36.184 36.023 35.895 35.759 35.619 35.52 35.425 35.339 35.247 35.137 35.054 34.969 34.844 34.75 34.647 34.591 34.47 34.347 34.22 34.155 33.905 33.918 33.826 33.744 33.593 33.509 33.416 33.308 33.177 33.011 32.799 32.456 -2 ,6988 ,KEBNE ,17023023,Wed Dec 22 07:20:22 CET,Wed Dec 22 08:39:05 CET,0.0 1.215 1.782 2.224 2.529 2.799 3.068 3.319 3.756 3.945 4.135 4.328 4.715 4.879 5.195 5.486 5.763 5.902 6.171 6.43 6.792 7.012 7.243 7.59 7.916 8.228 8.548 8.855 9.223 9.585 9.939 10.388 10.824 11.217 11.687 12.245 12.769 13.335 13.937 14.572 15.262 16.045 16.927 17.826 18.915 20.156 21.598 23.223 25.145 27.476 30.309 32.591 33.935 34.807 35.346 35.701 35.923 36.07 36.142 36.158 36.144 36.082 36.002 35.934 35.858 35.742 35.637 35.57 35.496 35.403 35.293 35.198 35.099 34.994 34.911 34.823 34.733 34.639 34.54 34.469 34.393 34.266 34.182 34.102 34.055 33.953 33.855 33.743 33.676 33.427 33.489 33.432 33.363 33.199 33.094 32.983 32.883 32.736 32.556 32.361 31.835 -3 ,15255 ,KEBNE ,17023024,Wed Dec 22 07:20:15 CET,Wed Dec 22 08:42:16 CET,0.0 1.196 1.632 1.984 2.262 2.505 2.739 2.965 3.381 3.58 3.783 3.979 4.366 4.547 4.901 5.21 5.491 5.624 5.881 6.14 6.519 6.757 6.99 7.342 7.681 8.001 8.309 8.61 8.995 9.38 9.762 10.228 10.66 11.054 11.511 12.03 12.54 13.105 13.716 14.374 15.077 15.867 16.786 17.701 18.784 20.002 21.409 23.004 24.878 27.15 29.929 32.248 33.651 34.541 35.075 35.404 35.618 35.767 35.832 35.847 35.826 35.78 35.705 35.612 35.485 35.348 35.228 35.121 35.009 34.875 34.734 34.595 34.435 34.289 34.181 34.062 33.922 33.775 33.629 33.528 33.42 33.241 33.115 32.981 32.908 32.757 32.612 32.457 32.374 32.113 32.128 32.043 31.956 31.739 31.605 31.455 31.292 31.113 30.904 30.681 29.946 -4 ,32399 ,KEBNE ,17023025,Wed Dec 22 07:20:16 CET,Wed Dec 22 08:43:38 CET,0.0 1.301 1.73 2.09 2.396 2.669 2.927 3.188 3.69 3.903 4.086 4.201 4.564 4.713 4.995 5.261 5.517 5.638 5.888 6.135 6.475 6.691 6.913 7.217 7.492 7.781 8.064 8.331 8.679 9.018 9.354 9.764 10.152 10.541 10.998 11.525 12.05 12.636 13.287 13.962 14.642 15.426 16.367 17.313 18.387 19.597 21.006 22.577 24.441 26.686 29.441 31.74 33.128 34.073 34.727 35.178 35.482 35.705 35.819 35.856 35.885 35.918 35.924 35.902 35.88 35.848 35.782 35.712 35.655 35.591 35.522 35.466 35.411 35.344 35.279 35.219 35.165 35.094 35.02 34.967 34.905 34.814 34.746 34.664 34.619 34.529 34.44 34.34 34.28 34.038 34.099 34.034 33.968 33.817 33.725 33.632 33.533 33.421 33.268 33.008 32.243 -5 ,9501 ,KEBNE ,17023026,Wed Dec 22 07:20:16 CET,Wed Dec 22 08:42:17 CET,0.0 1.211 1.681 2.027 2.33 2.567 2.796 3.014 3.388 3.558 3.734 3.878 4.252 4.399 4.683 4.973 5.244 5.377 5.631 5.867 6.195 6.397 6.591 6.893 7.201 7.493 7.774 8.05 8.415 8.783 9.142 9.586 10.001 10.398 10.866 11.376 11.879 12.445 13.052 13.717 14.417 15.159 16.023 16.922 17.992 19.174 20.531 22.104 24.0 26.306 29.14 31.535 32.97 33.891 34.484 34.888 35.167 35.349 35.457 35.532 35.58 35.583 35.555 35.528 35.473 35.408 35.349 35.289 35.234 35.158 35.053 34.974 34.911 34.85 34.79 34.726 34.661 34.588 34.505 34.446 34.377 34.239 34.146 34.062 34.022 33.952 33.882 33.792 33.736 33.486 33.542 33.47 33.383 33.185 33.082 32.962 32.829 32.697 32.571 32.389 31.667 -6 ,6963 ,KEBNE ,17023027,Wed Dec 22 07:20:16 CET,Wed Dec 22 08:43:40 CET,0.0 1.545 2.175 2.607 2.931 3.199 3.459 3.721 4.168 4.364 4.551 4.7 5.093 5.275 5.565 5.841 6.125 6.264 6.531 6.781 7.131 7.355 7.579 7.907 8.22 8.522 8.809 9.086 9.444 9.783 10.102 10.499 10.897 11.281 11.727 12.23 12.711 13.242 13.851 14.535 15.251 16.028 16.921 17.821 18.867 20.065 21.464 23.07 25.019 27.329 30.074 32.356 33.711 34.548 35.094 35.44 35.637 35.758 35.827 35.863 35.844 35.809 35.766 35.687 35.599 35.521 35.438 35.35 35.274 35.197 35.099 35.018 34.944 34.869 34.823 34.775 34.713 34.645 34.575 34.525 34.467 34.363 34.294 34.22 34.175 34.073 33.973 33.876 33.828 33.598 33.67 33.604 33.523 33.355 33.267 33.174 33.061 32.925 32.779 32.565 31.99 -7 ,25462 ,KEBNE ,17023028,Wed Dec 22 07:20:16 CET,Wed Dec 22 08:42:23 CET,0.0 1.534 2.131 2.535 2.89 3.211 3.468 3.7 4.151 4.353 4.539 4.707 5.078 5.244 5.573 5.867 6.141 6.276 6.541 6.799 7.181 7.434 7.686 8.056 8.393 8.715 9.04 9.357 9.756 10.136 10.503 10.93 11.338 11.736 12.21 12.734 13.238 13.813 14.441 15.103 15.783 16.535 17.444 18.398 19.512 20.726 22.124 23.734 25.63 27.912 30.7 33.033 34.421 35.293 35.838 36.193 36.418 36.538 36.595 36.594 36.545 36.49 36.432 36.354 36.277 36.211 36.089 35.978 35.904 35.824 35.745 35.672 35.588 35.498 35.428 35.355 35.293 35.221 35.136 35.089 35.035 34.923 34.841 34.763 34.718 34.624 34.524 34.42 34.371 34.131 34.183 34.113 34.05 33.906 33.818 33.7 33.583 33.471 33.32 33.129 32.68 -8 ,21360 ,KEBNE ,17023029,Wed Dec 22 07:20:16 CET,Wed Dec 22 08:42:26 CET,0.0 1.233 1.723 2.086 2.392 2.682 2.938 3.175 3.601 3.802 3.987 4.12 4.497 4.664 4.996 5.301 5.587 5.723 5.984 6.242 6.617 6.864 7.099 7.413 7.711 8.019 8.329 8.62 8.986 9.323 9.639 10.035 10.442 10.844 11.316 11.862 12.364 12.913 13.519 14.159 14.844 15.62 16.531 17.473 18.587 19.825 21.241 22.888 24.86 27.195 30.057 32.413 33.794 34.682 35.205 35.512 35.75 35.924 36.022 36.107 36.162 36.178 36.165 36.151 36.121 36.067 35.994 35.928 35.871 35.785 35.695 35.631 35.568 35.512 35.473 35.426 35.358 35.281 35.202 35.154 35.103 35.018 34.953 34.858 34.79 34.667 34.56 34.397 34.3 34.036 34.084 34.016 33.942 33.771 33.675 33.58 33.479 33.326 33.167 32.994 32.221 -9 ,19164 ,KEBNE ,17023030,Wed Dec 22 07:20:16 CET,Wed Dec 22 08:43:43 CET,0.0 1.488 1.975 2.315 2.648 2.943 3.16 3.367 3.779 3.974 4.162 4.324 4.705 4.861 5.149 5.451 5.769 5.925 6.216 6.481 6.846 7.077 7.303 7.636 7.947 8.248 8.544 8.837 9.221 9.594 9.949 10.378 10.805 11.231 11.706 12.251 12.774 13.314 13.915 14.575 15.265 16.05 16.973 17.886 18.954 20.173 21.584 23.198 25.08 27.293 30.059 32.4 33.715 34.492 34.983 35.315 35.533 35.645 35.698 35.704 35.685 35.645 35.58 35.523 35.449 35.36 35.258 35.16 35.067 34.935 34.78 34.661 34.53 34.386 34.281 34.17 34.043 33.909 33.777 33.677 33.565 33.397 33.284 33.151 33.072 32.916 32.766 32.612 32.531 32.265 32.254 32.157 32.06 31.847 31.707 31.537 31.348 31.163 30.983 30.717 30.038 -10 ,6109 ,KEBNE ,17023031,Wed Dec 22 07:20:17 CET,Wed Dec 22 08:42:20 CET,0.0 1.721 2.2 2.568 2.89 3.185 3.457 3.725 4.198 4.412 4.614 4.756 5.121 5.279 5.575 5.838 6.091 6.208 6.426 6.633 6.946 7.159 7.36 7.665 7.975 8.275 8.584 8.886 9.259 9.631 9.987 10.417 10.85 11.276 11.782 12.345 12.883 13.479 14.101 14.759 15.486 16.336 17.338 18.313 19.417 20.649 22.12 23.848 25.899 28.28 31.098 33.525 35.011 35.946 36.522 36.866 37.044 37.162 37.241 37.28 37.296 37.317 37.308 37.278 37.246 37.203 37.153 37.103 37.056 36.997 36.922 36.861 36.792 36.709 36.652 36.589 36.515 36.45 36.377 36.318 36.255 36.137 36.056 35.989 35.952 35.863 35.761 35.656 35.605 35.356 35.395 35.321 35.241 35.074 34.991 34.896 34.78 34.643 34.513 34.34 33.526 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_38_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_38_39.txt deleted file mode 100644 index f89d9239..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_38_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22026 ,TETRA ,17550970,Thu Nov 25 09:46:08 CET,Thu Nov 25 11:13:30 CET,0.0 1.718 2.26 2.592 2.849 3.098 3.322 3.513 3.848 4.005 4.161 4.237 4.562 4.686 4.942 5.18 5.405 5.512 5.741 5.971 6.275 6.465 6.646 6.896 7.133 7.352 7.565 7.784 8.059 8.305 8.53 8.798 9.06 9.307 9.576 9.872 10.172 10.508 10.864 11.223 11.59 11.987 12.428 12.859 13.369 13.98 14.616 15.175 15.788 16.419 16.824 16.818 16.452 15.878 15.281 14.668 14.091 13.574 13.103 12.59 12.144 11.747 11.355 10.98 10.636 10.326 9.993 9.68 9.408 9.144 8.856 8.604 8.352 8.086 7.866 7.637 7.402 7.154 6.889 6.694 6.501 6.221 6.018 5.803 5.697 5.481 5.252 5.009 4.869 4.514 4.397 4.223 4.037 3.622 3.401 3.16 2.907 2.587 2.199 1.682 -0.054 -2 ,26567 ,TETRA ,17550971,Thu Nov 25 09:46:09 CET,Thu Nov 25 11:23:03 CET,0.0 1.384 1.77 2.063 2.332 2.584 2.804 3.011 3.403 3.559 3.687 3.727 4.06 4.184 4.415 4.651 4.884 4.996 5.208 5.419 5.709 5.883 6.063 6.312 6.541 6.755 6.965 7.174 7.44 7.712 7.975 8.264 8.541 8.831 9.147 9.478 9.795 10.116 10.448 10.798 11.17 11.588 12.033 12.458 12.927 13.403 13.971 14.572 15.145 15.613 15.719 15.296 14.636 13.956 13.316 12.689 12.092 11.515 11.006 10.476 10.003 9.585 9.179 8.8 8.443 8.106 7.749 7.427 7.153 6.881 6.588 6.339 6.09 5.823 5.603 5.361 5.111 4.853 4.578 4.382 4.177 3.859 3.631 3.388 3.26 3.021 2.805 2.535 2.386 2.035 1.942 1.78 1.612 1.284 1.077 0.823 0.532 0.239 -0.082 -0.485 -1.68 -3 ,23824 ,TETRA ,17550972,Thu Nov 25 09:46:11 CET,Thu Nov 25 11:23:10 CET,0.0 1.416 1.922 2.324 2.613 2.843 3.058 3.265 3.667 3.874 4.059 4.17 4.509 4.624 4.846 5.068 5.28 5.39 5.61 5.818 6.123 6.312 6.491 6.74 6.971 7.188 7.389 7.585 7.844 8.104 8.348 8.624 8.892 9.144 9.424 9.757 10.073 10.399 10.75 11.094 11.467 11.918 12.37 12.77 13.27 13.802 14.347 14.886 15.411 15.889 16.075 15.749 15.277 14.686 14.087 13.501 12.911 12.368 11.902 11.424 10.994 10.575 10.168 9.817 9.495 9.196 8.867 8.552 8.28 7.99 7.69 7.438 7.169 6.889 6.669 6.438 6.205 5.973 5.739 5.571 5.384 5.11 4.913 4.705 4.599 4.348 4.087 3.827 3.697 3.356 3.254 3.091 2.926 2.573 2.367 2.135 1.865 1.579 1.262 0.86 -0.412 -4 ,8003 ,TETRA ,17550973,Thu Nov 25 09:46:13 CET,Thu Nov 25 11:16:22 CET,0.0 1.648 2.214 2.678 3.039 3.349 3.611 3.829 4.196 4.364 4.519 4.596 4.945 5.09 5.361 5.599 5.825 5.933 6.136 6.333 6.622 6.812 7.0 7.263 7.503 7.741 7.955 8.159 8.443 8.712 8.968 9.269 9.552 9.819 10.115 10.448 10.767 11.097 11.45 11.825 12.203 12.618 13.094 13.556 14.057 14.582 15.156 15.723 16.267 16.736 16.976 16.877 16.538 16.061 15.599 15.138 14.665 14.217 13.812 13.362 12.931 12.553 12.221 11.885 11.553 11.258 10.958 10.683 10.439 10.165 9.883 9.66 9.423 9.185 8.994 8.792 8.591 8.374 8.14 7.976 7.806 7.544 7.337 7.119 7.02 6.83 6.622 6.385 6.252 5.914 5.847 5.682 5.505 5.115 4.876 4.623 4.352 4.049 3.641 3.081 1.568 -5 ,20620 ,TETRA ,17550974,Thu Nov 25 09:46:09 CET,Thu Nov 25 11:25:30 CET,0.0 1.571 2.031 2.378 2.672 2.953 3.235 3.503 3.943 4.131 4.313 4.447 4.811 4.958 5.236 5.505 5.757 5.889 6.131 6.348 6.676 6.864 7.041 7.305 7.54 7.751 7.958 8.174 8.457 8.711 8.955 9.247 9.522 9.775 10.087 10.449 10.762 11.091 11.462 11.856 12.254 12.684 13.145 13.577 14.028 14.492 14.991 15.51 16.019 16.38 16.432 16.003 15.383 14.7 14.043 13.431 12.885 12.348 11.823 11.305 10.881 10.485 10.087 9.706 9.354 9.022 8.663 8.331 8.05 7.776 7.477 7.218 6.943 6.649 6.424 6.205 5.986 5.75 5.49 5.309 5.137 4.869 4.674 4.464 4.351 4.121 3.857 3.573 3.43 3.079 2.945 2.756 2.575 2.186 1.966 1.715 1.45 1.148 0.751 0.204 -1.781 -6 ,9497 ,TETRA ,17550975,Thu Nov 25 09:46:10 CET,Thu Nov 25 11:23:48 CET,0.0 1.008 1.454 1.841 2.156 2.399 2.622 2.846 3.231 3.382 3.524 3.599 3.942 4.069 4.332 4.588 4.814 4.924 5.138 5.353 5.655 5.846 6.034 6.301 6.546 6.773 7.001 7.218 7.498 7.774 8.035 8.327 8.581 8.817 9.097 9.404 9.686 9.996 10.338 10.706 11.09 11.517 11.995 12.469 12.962 13.475 14.069 14.657 15.243 15.684 15.69 15.201 14.625 14.019 13.398 12.774 12.188 11.65 11.199 10.728 10.304 9.903 9.487 9.089 8.724 8.403 8.071 7.759 7.464 7.147 6.828 6.56 6.276 5.975 5.738 5.501 5.271 5.031 4.776 4.604 4.427 4.13 3.911 3.68 3.56 3.322 3.078 2.813 2.683 2.343 2.26 2.093 1.92 1.52 1.281 1.045 0.79 0.522 0.203 -0.202 -1.394 -7 ,27449 ,TETRA ,17550976,Thu Nov 25 09:46:12 CET,Thu Nov 25 11:14:44 CET,0.0 2.12 2.609 2.945 3.227 3.497 3.738 3.955 4.362 4.547 4.717 4.846 5.21 5.357 5.623 5.86 6.068 6.171 6.38 6.594 6.908 7.089 7.261 7.517 7.754 7.972 8.174 8.397 8.706 8.982 9.241 9.542 9.834 10.126 10.438 10.776 11.092 11.426 11.811 12.195 12.582 13.04 13.556 14.044 14.561 15.052 15.575 16.121 16.69 17.159 17.311 16.941 16.307 15.66 15.068 14.446 13.885 13.392 12.924 12.414 12.0 11.644 11.288 10.948 10.618 10.302 9.969 9.655 9.363 9.071 8.794 8.547 8.277 8.018 7.815 7.596 7.374 7.144 6.885 6.703 6.518 6.227 6.029 5.814 5.698 5.468 5.224 4.952 4.817 4.474 4.385 4.23 4.064 3.688 3.481 3.252 2.989 2.719 2.416 2.011 1.238 -8 ,12863 ,TETRA ,17550977,Thu Nov 25 09:46:10 CET,Thu Nov 25 11:24:27 CET,0.0 1.541 1.967 2.316 2.562 2.786 3.006 3.207 3.553 3.716 3.891 4.03 4.397 4.534 4.77 5.005 5.231 5.345 5.554 5.752 6.041 6.21 6.373 6.628 6.873 7.106 7.335 7.546 7.805 8.059 8.304 8.594 8.87 9.154 9.479 9.803 10.094 10.408 10.737 11.074 11.408 11.746 12.108 12.463 12.88 13.308 13.741 14.215 14.728 15.144 15.233 14.77 14.163 13.539 12.906 12.241 11.631 11.117 10.663 10.169 9.744 9.362 8.968 8.587 8.239 7.917 7.573 7.25 6.969 6.671 6.348 6.103 5.86 5.59 5.371 5.143 4.913 4.67 4.408 4.217 4.014 3.695 3.485 3.252 3.132 2.891 2.609 2.3 2.142 1.787 1.649 1.465 1.281 0.867 0.638 0.367 0.056 -0.249 -0.629 -1.114 -2.679 -9 ,14612 ,TETRA ,17550978,Thu Nov 25 09:46:12 CET,Thu Nov 25 11:22:10 CET,0.0 2.484 3.019 3.455 3.807 4.103 4.356 4.578 5.003 5.195 5.383 5.521 5.879 6.037 6.322 6.567 6.789 6.903 7.123 7.31 7.572 7.747 7.918 8.158 8.393 8.618 8.823 9.017 9.277 9.536 9.771 10.051 10.338 10.601 10.891 11.23 11.553 11.873 12.202 12.546 12.912 13.333 13.803 14.243 14.724 15.229 15.777 16.317 16.857 17.309 17.576 17.479 17.109 16.656 16.224 15.835 15.417 14.899 14.392 13.916 13.512 13.109 12.679 12.264 11.901 11.576 11.226 10.912 10.645 10.367 10.083 9.839 9.562 9.263 9.04 8.823 8.603 8.357 8.087 7.904 7.72 7.424 7.214 6.997 6.883 6.642 6.385 6.104 5.961 5.611 5.49 5.307 5.112 4.687 4.448 4.188 3.9 3.59 3.189 2.697 1.862 -10 ,19089 ,TETRA ,17550979,Thu Nov 25 09:46:13 CET,Thu Nov 25 11:13:13 CET,0.0 1.542 1.937 2.289 2.623 2.902 3.145 3.356 3.723 3.904 4.072 4.189 4.539 4.67 4.932 5.178 5.404 5.507 5.706 5.913 6.214 6.387 6.546 6.788 7.005 7.208 7.413 7.609 7.87 8.125 8.355 8.621 8.878 9.132 9.422 9.733 10.015 10.325 10.666 11.017 11.383 11.777 12.217 12.674 13.167 13.688 14.264 14.809 15.287 15.723 15.946 15.528 14.889 14.189 13.46 12.759 12.173 11.609 11.07 10.484 9.974 9.54 9.113 8.69 8.29 7.938 7.572 7.251 6.985 6.717 6.43 6.179 5.918 5.655 5.447 5.218 4.986 4.752 4.5 4.317 4.135 3.862 3.668 3.473 3.366 3.125 2.859 2.564 2.411 2.045 1.922 1.757 1.579 1.12 0.859 0.605 0.316 0.002 -0.357 -0.844 -2.295 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_38_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_38_40.txt deleted file mode 100644 index 32eca8fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_38_40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32371 ,KEBNE ,17023032,Wed Dec 22 07:20:17 CET,Wed Dec 22 08:44:26 CET,0.0 1.884 2.515 2.976 3.363 3.696 3.978 4.218 4.618 4.807 4.992 5.13 5.492 5.645 5.955 6.236 6.466 6.575 6.816 7.048 7.368 7.561 7.739 8.022 8.285 8.536 8.77 8.968 9.223 9.476 9.713 10.004 10.279 10.517 10.764 11.035 11.298 11.61 11.978 12.363 12.754 13.192 13.681 14.123 14.589 15.128 15.705 16.271 16.868 17.315 17.438 17.218 16.767 16.145 15.522 14.923 14.308 13.75 13.29 12.787 12.361 11.973 11.581 11.199 10.851 10.53 10.173 9.857 9.583 9.288 8.983 8.751 8.526 8.278 8.077 7.853 7.609 7.366 7.111 6.938 6.757 6.46 6.25 6.028 5.912 5.666 5.409 5.141 5.009 4.672 4.591 4.452 4.302 3.923 3.719 3.513 3.281 3.013 2.681 2.186 0.042 -2 ,26521 ,KEBNE ,17023033,Wed Dec 22 07:20:17 CET,Wed Dec 22 08:42:50 CET,0.0 2.219 2.878 3.324 3.697 3.995 4.218 4.42 4.782 4.963 5.135 5.209 5.54 5.674 5.955 6.244 6.506 6.634 6.886 7.115 7.422 7.612 7.804 8.085 8.344 8.594 8.836 9.072 9.383 9.666 9.924 10.229 10.515 10.792 11.122 11.485 11.826 12.199 12.597 13.005 13.404 13.845 14.333 14.807 15.355 15.911 16.481 17.033 17.595 18.104 18.371 18.075 17.524 16.968 16.443 15.87 15.292 14.808 14.397 13.943 13.531 13.141 12.762 12.4 12.055 11.741 11.402 11.083 10.807 10.516 10.21 9.96 9.704 9.429 9.214 8.993 8.767 8.545 8.306 8.135 7.95 7.656 7.449 7.228 7.113 6.859 6.585 6.317 6.183 5.832 5.743 5.596 5.443 5.122 4.945 4.744 4.509 4.265 4.002 3.573 2.356 -3 ,12776 ,KEBNE ,17023034,Wed Dec 22 07:20:18 CET,Wed Dec 22 08:43:18 CET,0.0 1.835 2.357 2.76 3.097 3.365 3.602 3.825 4.225 4.39 4.546 4.663 5.026 5.17 5.429 5.667 5.9 6.018 6.236 6.435 6.702 6.872 7.03 7.247 7.466 7.674 7.87 8.072 8.343 8.586 8.8 9.051 9.296 9.534 9.795 10.093 10.377 10.667 10.966 11.263 11.572 11.923 12.333 12.751 13.203 13.613 14.009 14.441 14.878 15.282 15.496 15.217 14.76 14.189 13.59 13.046 12.545 12.063 11.637 11.204 10.817 10.456 10.131 9.847 9.559 9.279 8.99 8.733 8.511 8.265 8.004 7.784 7.555 7.314 7.119 6.897 6.665 6.451 6.209 6.032 5.865 5.618 5.445 5.251 5.157 4.974 4.768 4.53 4.404 4.076 4.003 3.858 3.706 3.368 3.2 3.017 2.804 2.554 2.258 1.853 1.052 -4 ,23041 ,KEBNE ,17023035,Wed Dec 22 07:20:18 CET,Wed Dec 22 08:44:33 CET,0.0 2.263 2.826 3.279 3.638 3.915 4.197 4.494 5.031 5.247 5.418 5.541 5.916 6.063 6.327 6.585 6.814 6.932 7.172 7.389 7.681 7.871 8.056 8.333 8.614 8.88 9.128 9.353 9.649 9.939 10.211 10.541 10.852 11.121 11.434 11.792 12.105 12.458 12.85 13.249 13.66 14.101 14.575 15.05 15.601 16.147 16.721 17.343 17.936 18.343 18.55 18.28 17.629 16.953 16.363 15.798 15.3 14.819 14.324 13.821 13.421 13.039 12.658 12.299 11.94 11.606 11.264 10.978 10.723 10.441 10.135 9.88 9.619 9.341 9.112 8.878 8.65 8.405 8.147 7.974 7.795 7.518 7.328 7.128 7.016 6.767 6.51 6.245 6.114 5.775 5.682 5.513 5.333 4.921 4.691 4.468 4.233 3.93 3.546 3.058 1.369 -5 ,16218 ,KEBNE ,17023036,Wed Dec 22 07:20:18 CET,Wed Dec 22 08:43:10 CET,0.0 1.64 2.134 2.503 2.814 3.08 3.329 3.57 3.995 4.163 4.323 4.422 4.76 4.888 5.132 5.397 5.647 5.751 5.964 6.171 6.452 6.63 6.806 7.057 7.299 7.527 7.732 7.938 8.207 8.458 8.698 8.987 9.267 9.538 9.839 10.163 10.463 10.78 11.129 11.483 11.818 12.193 12.62 13.012 13.419 13.887 14.444 15.036 15.586 16.012 16.238 15.905 15.365 14.778 14.225 13.679 13.123 12.614 12.2 11.763 11.353 10.974 10.599 10.238 9.906 9.608 9.282 8.967 8.716 8.463 8.18 7.943 7.691 7.424 7.208 6.987 6.773 6.552 6.314 6.145 5.974 5.711 5.526 5.333 5.234 5.02 4.793 4.541 4.396 4.049 3.977 3.816 3.632 3.281 3.079 2.823 2.524 2.195 1.804 1.3 -0.437 -6 ,24109 ,KEBNE ,17023037,Wed Dec 22 07:20:18 CET,Wed Dec 22 08:42:57 CET,0.0 2.068 2.646 3.176 3.617 3.935 4.2 4.471 4.927 5.125 5.298 5.409 5.771 5.929 6.216 6.492 6.76 6.882 7.125 7.364 7.684 7.889 8.086 8.354 8.604 8.845 9.078 9.289 9.563 9.832 10.093 10.406 10.713 11.008 11.324 11.663 12.006 12.381 12.757 13.134 13.51 13.942 14.44 14.91 15.39 15.862 16.421 17.015 17.489 17.816 17.961 17.627 17.048 16.404 15.786 15.168 14.586 14.031 13.532 13.059 12.659 12.302 11.929 11.522 11.148 10.827 10.507 10.217 9.959 9.698 9.41 9.169 8.925 8.668 8.459 8.245 8.035 7.806 7.566 7.398 7.202 6.886 6.676 6.464 6.359 6.146 5.916 5.672 5.537 5.194 5.138 4.971 4.755 4.215 3.953 3.718 3.451 3.137 2.745 2.233 -0.127 -7 ,15413 ,KEBNE ,17023038,Wed Dec 22 07:20:18 CET,Wed Dec 22 08:44:11 CET,0.0 2.232 2.911 3.389 3.755 4.048 4.305 4.541 4.946 5.131 5.302 5.418 5.781 5.932 6.216 6.47 6.701 6.813 7.046 7.279 7.588 7.788 7.975 8.223 8.466 8.69 8.898 9.117 9.391 9.641 9.88 10.152 10.396 10.627 10.883 11.168 11.45 11.75 12.062 12.384 12.704 13.031 13.422 13.787 14.164 14.587 15.055 15.531 15.95 16.189 16.221 15.849 15.267 14.639 14.061 13.536 13.035 12.558 12.134 11.685 11.281 10.916 10.55 10.194 9.856 9.548 9.218 8.917 8.663 8.386 8.11 7.885 7.625 7.361 7.171 6.974 6.757 6.524 6.277 6.09 5.88 5.56 5.336 5.114 5.003 4.767 4.518 4.231 4.076 3.709 3.564 3.381 3.191 2.792 2.584 2.354 2.099 1.786 1.374 0.88 0.045 -8 ,20894 ,KEBNE ,17023039,Wed Dec 22 07:20:19 CET,Wed Dec 22 08:43:08 CET,0.0 1.659 2.286 2.804 3.217 3.51 3.795 4.064 4.493 4.667 4.831 4.965 5.337 5.496 5.77 6.027 6.287 6.413 6.667 6.905 7.232 7.46 7.67 7.956 8.223 8.472 8.712 8.944 9.249 9.532 9.793 10.1 10.394 10.692 11.034 11.386 11.714 12.069 12.46 12.88 13.308 13.752 14.257 14.733 15.264 15.834 16.376 16.89 17.396 17.854 18.034 17.697 17.134 16.459 15.823 15.245 14.734 14.26 13.831 13.371 13.002 12.682 12.349 12.041 11.734 11.399 11.032 10.71 10.446 10.169 9.86 9.599 9.349 9.116 8.931 8.745 8.565 8.365 8.148 8.005 7.854 7.597 7.413 7.225 7.111 6.866 6.645 6.425 6.315 6.003 5.94 5.788 5.622 5.271 5.077 4.867 4.639 4.38 4.038 3.559 2.416 -9 ,4933 ,KEBNE ,17023040,Wed Dec 22 07:20:19 CET,Wed Dec 22 08:44:21 CET,0.0 1.872 2.431 2.816 3.132 3.417 3.676 3.9 4.323 4.523 4.702 4.797 5.162 5.315 5.591 5.858 6.096 6.195 6.375 6.578 6.906 7.108 7.294 7.554 7.783 8.001 8.214 8.426 8.703 8.96 9.214 9.528 9.816 10.068 10.347 10.642 10.907 11.191 11.486 11.771 12.077 12.428 12.816 13.199 13.628 14.09 14.554 15.011 15.408 15.669 15.672 15.277 14.784 14.265 13.736 13.179 12.635 12.124 11.688 11.254 10.87 10.531 10.207 9.892 9.582 9.296 9.008 8.744 8.512 8.265 8.008 7.795 7.549 7.286 7.07 6.834 6.603 6.367 6.112 5.939 5.757 5.448 5.234 5.013 4.9 4.675 4.439 4.202 4.081 3.743 3.653 3.503 3.346 2.971 2.767 2.555 2.307 2.0 1.637 1.235 -0.13 -10 ,17623 ,KEBNE ,17023041,Wed Dec 22 07:20:19 CET,Wed Dec 22 08:43:06 CET,0.0 2.132 2.739 3.174 3.53 3.856 4.138 4.361 4.786 4.999 5.184 5.316 5.688 5.854 6.166 6.451 6.711 6.829 7.053 7.282 7.609 7.811 8.014 8.312 8.58 8.823 9.065 9.3 9.592 9.869 10.128 10.448 10.745 11.019 11.344 11.687 12.014 12.375 12.746 13.159 13.599 14.055 14.561 15.023 15.519 16.048 16.573 17.103 17.694 18.155 18.295 17.924 17.306 16.602 15.967 15.365 14.777 14.22 13.715 13.198 12.766 12.373 11.998 11.643 11.289 10.953 10.603 10.296 10.029 9.759 9.471 9.226 8.978 8.702 8.454 8.19 7.946 7.699 7.457 7.307 7.137 6.851 6.639 6.414 6.299 6.054 5.807 5.564 5.426 5.088 5.002 4.833 4.656 4.276 4.068 3.851 3.601 3.292 2.894 2.376 0.868 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_39_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_39_41.txt deleted file mode 100644 index e76c7996..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_39_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5060 ,KEBNE ,17023042,Wed Dec 22 07:20:19 CET,Wed Dec 22 08:42:59 CET,0.0 1.966 2.534 2.942 3.272 3.565 3.822 4.053 4.467 4.635 4.795 4.923 5.288 5.453 5.759 6.025 6.264 6.38 6.615 6.842 7.15 7.327 7.51 7.785 8.027 8.259 8.48 8.7 8.968 9.194 9.405 9.657 9.892 10.102 10.346 10.633 10.894 11.164 11.464 11.795 12.142 12.498 12.882 13.26 13.692 14.128 14.579 14.99 15.378 15.722 15.776 15.365 14.823 14.206 13.557 12.941 12.404 11.925 11.505 11.056 10.645 10.258 9.908 9.562 9.233 8.954 8.651 8.366 8.11 7.854 7.594 7.383 7.15 6.908 6.733 6.549 6.345 6.121 5.889 5.725 5.555 5.278 5.087 4.89 4.789 4.587 4.374 4.147 4.031 3.703 3.672 3.54 3.377 2.988 2.774 2.55 2.299 2.046 1.708 1.158 -0.817 -2 ,30678 ,KEBNE ,17023043,Wed Dec 22 07:20:19 CET,Wed Dec 22 08:44:18 CET,0.0 2.137 2.691 3.081 3.404 3.688 3.958 4.218 4.665 4.865 5.069 5.235 5.603 5.757 6.03 6.276 6.497 6.608 6.844 7.052 7.333 7.517 7.698 7.967 8.226 8.479 8.716 8.927 9.18 9.407 9.633 9.91 10.162 10.375 10.625 10.937 11.261 11.604 11.933 12.249 12.578 12.932 13.314 13.687 14.094 14.54 15.019 15.458 15.842 16.102 16.13 15.767 15.197 14.515 13.868 13.304 12.778 12.262 11.783 11.295 10.876 10.487 10.111 9.729 9.374 9.072 8.736 8.427 8.165 7.885 7.588 7.35 7.114 6.854 6.634 6.41 6.178 5.926 5.665 5.485 5.306 5.034 4.834 4.632 4.525 4.309 4.093 3.849 3.705 3.345 3.214 3.026 2.84 2.435 2.213 1.973 1.719 1.445 1.1 0.6 -0.887 -3 ,27571 ,KEBNE ,17023044,Wed Dec 22 07:20:19 CET,Wed Dec 22 08:42:56 CET,0.0 2.089 2.701 3.14 3.473 3.762 4.02 4.262 4.669 4.844 5.005 5.1 5.446 5.588 5.884 6.171 6.424 6.543 6.766 6.97 7.251 7.43 7.608 7.877 8.151 8.398 8.614 8.814 9.065 9.304 9.536 9.819 10.084 10.331 10.611 10.908 11.193 11.506 11.843 12.179 12.503 12.863 13.265 13.635 14.043 14.499 14.984 15.477 15.965 16.317 16.333 15.842 15.2 14.585 13.954 13.304 12.744 12.241 11.78 11.306 10.893 10.525 10.17 9.823 9.506 9.224 8.903 8.59 8.323 8.049 7.764 7.548 7.331 7.08 6.87 6.669 6.459 6.235 5.999 5.831 5.665 5.393 5.195 4.997 4.9 4.7 4.493 4.262 4.132 3.794 3.718 3.57 3.411 2.994 2.781 2.563 2.32 2.049 1.756 1.412 0.319 -4 ,21651 ,KEBNE ,17023045,Wed Dec 22 07:20:20 CET,Wed Dec 22 08:44:14 CET,0.0 3.383 3.953 4.369 4.734 5.018 5.262 5.476 5.84 6.0 6.143 6.2 6.536 6.667 6.919 7.141 7.368 7.483 7.688 7.875 8.137 8.308 8.482 8.742 8.985 9.218 9.451 9.666 9.913 10.134 10.343 10.604 10.855 11.094 11.357 11.638 11.904 12.19 12.486 12.789 13.111 13.477 13.9 14.299 14.704 15.149 15.655 16.167 16.649 16.982 17.044 16.595 15.891 15.211 14.619 14.024 13.437 12.881 12.423 11.985 11.582 11.2 10.822 10.452 10.112 9.793 9.445 9.142 8.89 8.628 8.332 8.079 7.818 7.562 7.377 7.178 6.965 6.736 6.486 6.319 6.148 5.861 5.662 5.472 5.373 5.169 4.927 4.639 4.487 4.13 4.03 3.861 3.683 3.31 3.112 2.878 2.625 2.345 1.988 1.529 -0.092 -5 ,17374 ,KEBNE ,17023046,Wed Dec 22 07:20:20 CET,Wed Dec 22 08:42:34 CET,0.0 2.791 3.422 3.921 4.301 4.601 4.87 5.134 5.611 5.799 5.973 6.108 6.462 6.595 6.854 7.116 7.368 7.484 7.691 7.877 8.153 8.332 8.503 8.762 8.992 9.194 9.38 9.566 9.802 10.02 10.23 10.495 10.75 10.966 11.194 11.453 11.709 11.986 12.287 12.609 12.936 13.296 13.689 14.057 14.471 14.896 15.309 15.74 16.163 16.493 16.59 16.17 15.573 14.947 14.361 13.761 13.202 12.698 12.234 11.75 11.338 10.977 10.637 10.319 10.008 9.717 9.404 9.129 8.897 8.646 8.387 8.166 7.934 7.68 7.496 7.305 7.101 6.897 6.661 6.497 6.342 6.109 5.942 5.754 5.655 5.434 5.206 4.976 4.846 4.495 4.412 4.261 4.114 3.809 3.607 3.396 3.194 2.933 2.618 2.236 0.96 -6 ,25623 ,KEBNE ,17023047,Wed Dec 22 07:20:20 CET,Wed Dec 22 08:42:42 CET,0.0 2.197 2.818 3.228 3.559 3.876 4.126 4.315 4.69 4.878 5.075 5.246 5.621 5.794 6.108 6.367 6.612 6.73 6.961 7.181 7.478 7.66 7.836 8.088 8.324 8.536 8.738 8.958 9.238 9.477 9.715 9.995 10.236 10.476 10.762 11.087 11.392 11.708 12.025 12.353 12.707 13.092 13.507 13.892 14.318 14.741 15.135 15.541 15.998 16.376 16.423 15.984 15.35 14.672 14.009 13.398 12.87 12.363 11.899 11.429 11.04 10.693 10.351 10.02 9.711 9.434 9.136 8.872 8.653 8.406 8.134 7.912 7.67 7.419 7.231 7.031 6.816 6.609 6.4 6.239 6.062 5.791 5.613 5.438 5.341 5.135 4.92 4.673 4.549 4.214 4.119 3.961 3.801 3.447 3.251 3.056 2.847 2.576 2.23 1.764 0.215 -7 ,26414 ,KEBNE ,17023048,Wed Dec 22 07:20:20 CET,Wed Dec 22 08:44:18 CET,0.0 2.086 2.806 3.272 3.59 3.874 4.116 4.342 4.778 4.976 5.154 5.267 5.632 5.782 6.064 6.313 6.533 6.643 6.861 7.075 7.384 7.57 7.734 7.969 8.196 8.412 8.63 8.845 9.107 9.344 9.578 9.857 10.099 10.328 10.6 10.902 11.194 11.52 11.879 12.22 12.538 12.888 13.277 13.666 14.098 14.552 14.992 15.416 15.857 16.182 16.202 15.768 15.201 14.597 13.97 13.332 12.783 12.285 11.826 11.372 10.979 10.598 10.206 9.824 9.495 9.21 8.902 8.606 8.332 8.062 7.791 7.566 7.332 7.086 6.897 6.715 6.521 6.313 6.091 5.938 5.771 5.506 5.319 5.118 5.02 4.817 4.613 4.403 4.284 3.954 3.911 3.782 3.636 3.272 3.081 2.889 2.638 2.331 1.98 1.528 0.266 -8 ,3762 ,KEBNE ,17023049,Wed Dec 22 07:20:20 CET,Wed Dec 22 08:44:09 CET,0.0 1.97 2.496 2.839 3.111 3.386 3.652 3.887 4.321 4.507 4.684 4.791 5.132 5.272 5.527 5.747 5.956 6.052 6.253 6.454 6.742 6.937 7.133 7.399 7.631 7.848 8.052 8.25 8.493 8.744 8.994 9.256 9.508 9.733 9.97 10.237 10.499 10.809 11.114 11.415 11.743 12.092 12.492 12.89 13.329 13.783 14.226 14.658 15.119 15.466 15.437 14.963 14.401 13.745 13.05 12.424 11.876 11.363 10.887 10.425 10.029 9.648 9.287 8.949 8.621 8.327 8.023 7.745 7.499 7.24 6.963 6.728 6.49 6.234 6.035 5.839 5.627 5.399 5.166 4.999 4.831 4.572 4.388 4.191 4.084 3.844 3.58 3.316 3.192 2.858 2.759 2.59 2.412 2.049 1.854 1.628 1.381 1.115 0.782 0.345 -0.94 -9 ,18251 ,KEBNE ,17023050,Wed Dec 22 07:20:20 CET,Wed Dec 22 08:42:44 CET,0.0 2.405 2.956 3.373 3.743 4.055 4.338 4.594 5.026 5.213 5.396 5.553 5.925 6.07 6.367 6.678 6.941 7.056 7.277 7.505 7.832 8.018 8.188 8.459 8.718 8.93 9.126 9.319 9.583 9.829 10.048 10.322 10.578 10.82 11.1 11.41 11.694 12.006 12.318 12.624 12.969 13.354 13.752 14.108 14.51 14.96 15.448 15.858 16.234 16.616 16.585 15.981 15.308 14.631 13.969 13.346 12.771 12.231 11.762 11.285 10.859 10.478 10.125 9.786 9.454 9.151 8.821 8.523 8.276 8.003 7.727 7.499 7.242 6.985 6.787 6.583 6.369 6.131 5.883 5.713 5.539 5.259 5.063 4.853 4.736 4.483 4.209 3.937 3.799 3.46 3.411 3.261 3.091 2.739 2.547 2.336 2.103 1.838 1.527 1.097 -0.855 -10 ,26972 ,KEBNE ,17023051,Wed Dec 22 07:20:21 CET,Wed Dec 22 08:44:20 CET,0.0 2.263 2.796 3.174 3.489 3.825 4.135 4.388 4.809 4.997 5.186 5.312 5.667 5.796 6.046 6.28 6.506 6.613 6.808 7.003 7.304 7.507 7.701 7.959 8.199 8.435 8.647 8.838 9.077 9.303 9.532 9.799 10.039 10.262 10.525 10.823 11.097 11.385 11.687 11.993 12.286 12.6 12.97 13.328 13.743 14.154 14.567 14.969 15.3 15.532 15.405 14.886 14.343 13.744 13.177 12.591 11.982 11.441 10.997 10.512 10.072 9.685 9.318 8.954 8.635 8.359 8.052 7.786 7.558 7.313 7.057 6.839 6.597 6.351 6.17 5.984 5.783 5.567 5.346 5.201 5.041 4.786 4.611 4.436 4.346 4.148 3.94 3.72 3.59 3.233 3.125 2.959 2.798 2.442 2.23 1.993 1.726 1.455 1.132 0.641 -0.951 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_40_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_40_41.txt deleted file mode 100644 index a3d476b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_40_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25083 ,TETRA ,17550991,Thu Nov 25 09:51:07 CET,Thu Nov 25 11:31:05 CET,0.0 4.364 5.105 5.657 6.085 6.426 6.723 7.052 7.591 7.8 8.005 8.166 8.53 8.688 9.005 9.293 9.56 9.681 9.896 10.109 10.401 10.59 10.79 11.07 11.34 11.604 11.857 12.111 12.406 12.641 12.854 13.133 13.405 13.653 13.934 14.242 14.528 14.825 15.121 15.437 15.774 16.13 16.537 16.923 17.315 17.7 18.107 18.53 18.918 19.164 19.024 18.332 17.626 16.934 16.257 15.58 14.928 14.327 13.821 13.308 12.843 12.414 11.983 11.559 11.171 10.801 10.385 10.018 9.708 9.409 9.117 8.874 8.619 8.339 8.094 7.82 7.531 7.224 6.908 6.686 6.461 6.113 5.864 5.594 5.45 5.162 4.856 4.525 4.351 3.949 3.738 3.534 3.306 2.741 2.44 2.138 1.799 1.44 0.975 0.178 -3.274 -2 ,9245 ,TETRA ,17550992,Thu Nov 25 09:52:07 CET,Thu Nov 25 11:19:06 CET,0.0 2.764 3.511 4.053 4.492 4.865 5.184 5.448 5.899 6.079 6.268 6.475 6.874 7.049 7.378 7.668 7.935 8.061 8.307 8.536 8.83 9.014 9.202 9.457 9.679 9.898 10.105 10.296 10.545 10.803 11.051 11.343 11.638 11.91 12.201 12.525 12.806 13.084 13.371 13.675 14.0 14.349 14.728 15.114 15.582 16.056 16.509 16.94 17.362 17.678 17.687 17.186 16.441 15.622 14.856 14.133 13.488 12.949 12.493 12.014 11.594 11.231 10.898 10.54 10.174 9.857 9.537 9.263 9.007 8.698 8.386 8.145 7.894 7.616 7.392 7.171 6.939 6.686 6.415 6.228 6.036 5.737 5.517 5.284 5.166 4.923 4.65 4.328 4.158 3.763 3.572 3.353 3.134 2.657 2.349 2.008 1.681 1.276 0.709 -0.149 -3.354 -3 ,2238 ,TETRA ,17550993,Thu Nov 25 09:51:07 CET,Thu Nov 25 11:35:55 CET,0.0 3.425 4.039 4.526 4.936 5.243 5.497 5.748 6.222 6.431 6.622 6.766 7.136 7.296 7.606 7.904 8.172 8.286 8.496 8.695 9.01 9.22 9.412 9.694 9.958 10.196 10.407 10.596 10.844 11.085 11.311 11.596 11.875 12.128 12.413 12.741 13.059 13.383 13.684 13.985 14.337 14.733 15.138 15.529 15.977 16.433 16.88 17.274 17.656 17.997 18.005 17.497 16.832 16.17 15.561 14.949 14.369 13.844 13.377 12.871 12.415 12.003 11.599 11.205 10.83 10.49 10.14 9.819 9.544 9.249 8.927 8.676 8.422 8.149 7.935 7.718 7.501 7.266 6.976 6.774 6.566 6.22 5.992 5.746 5.612 5.362 5.126 4.868 4.725 4.375 4.275 4.093 3.887 3.41 3.126 2.786 2.449 2.041 1.453 0.591 -2.699 -4 ,28887 ,TETRA ,17550994,Thu Nov 25 09:51:07 CET,Thu Nov 25 11:31:39 CET,0.0 3.349 4.167 4.674 5.028 5.337 5.613 5.893 6.39 6.597 6.792 6.943 7.318 7.48 7.774 8.034 8.257 8.363 8.589 8.8 9.067 9.243 9.415 9.646 9.875 10.086 10.279 10.474 10.74 10.982 11.202 11.483 11.741 11.987 12.271 12.601 12.912 13.208 13.522 13.86 14.215 14.572 14.926 15.254 15.614 16.018 16.456 16.855 17.217 17.467 17.363 16.847 16.201 15.532 14.958 14.434 13.93 13.438 12.991 12.527 12.129 11.772 11.416 11.077 10.749 10.437 10.113 9.824 9.58 9.312 9.02 8.783 8.536 8.284 8.086 7.881 7.66 7.424 7.17 6.995 6.794 6.436 6.19 5.945 5.821 5.547 5.267 4.99 4.847 4.476 4.354 4.176 3.967 3.469 3.201 2.909 2.531 2.062 1.448 0.649 -2.206 -5 ,3249 ,TETRA ,17550995,Thu Nov 25 09:53:05 CET,Thu Nov 25 11:30:45 CET,0.0 3.036 3.777 4.363 4.782 5.153 5.502 5.797 6.285 6.494 6.679 6.834 7.22 7.382 7.682 7.954 8.186 8.293 8.495 8.689 8.972 9.157 9.341 9.613 9.872 10.106 10.309 10.495 10.745 10.989 11.209 11.478 11.733 11.958 12.203 12.483 12.745 13.01 13.292 13.632 13.986 14.317 14.677 15.034 15.421 15.842 16.291 16.718 17.118 17.378 17.356 16.884 16.245 15.525 14.885 14.317 13.778 13.292 12.874 12.423 12.031 11.683 11.343 11.02 10.697 10.401 10.079 9.777 9.516 9.231 8.928 8.668 8.379 8.068 7.818 7.559 7.275 6.973 6.658 6.439 6.228 5.909 5.69 5.455 5.333 5.058 4.761 4.462 4.286 3.887 3.679 3.453 3.225 2.74 2.438 2.097 1.74 1.347 0.87 0.277 -9.207 -6 ,25655 ,TETRA ,17550996,Thu Nov 25 09:53:05 CET,Thu Nov 25 11:30:53 CET,0.0 3.642 4.377 4.876 5.256 5.577 5.878 6.15 6.62 6.846 7.051 7.196 7.547 7.684 7.968 8.214 8.435 8.547 8.758 8.953 9.229 9.391 9.554 9.822 10.072 10.292 10.508 10.723 11.003 11.249 11.477 11.767 12.049 12.303 12.578 12.885 13.183 13.477 13.781 14.107 14.427 14.817 15.311 15.733 16.135 16.569 17.026 17.468 17.863 18.149 18.161 17.7 17.016 16.329 15.713 15.104 14.523 13.965 13.429 12.882 12.422 12.01 11.601 11.208 10.853 10.529 10.184 9.867 9.577 9.284 8.977 8.714 8.448 8.174 7.957 7.715 7.451 7.181 6.91 6.704 6.495 6.169 5.922 5.673 5.545 5.262 4.973 4.663 4.506 4.146 3.996 3.784 3.54 3.004 2.739 2.396 1.966 1.557 1.116 0.48 -1.968 -7 ,3899 ,TETRA ,17550997,Thu Nov 25 09:55:04 CET,Thu Nov 25 11:33:35 CET,0.0 3.579 4.224 4.661 5.086 5.451 5.763 6.055 6.566 6.794 6.99 7.15 7.536 7.711 8.043 8.337 8.607 8.74 8.991 9.239 9.589 9.802 10.007 10.307 10.598 10.846 11.055 11.251 11.51 11.752 11.964 12.202 12.44 12.69 12.982 13.29 13.579 13.88 14.208 14.573 14.924 15.323 15.799 16.215 16.646 17.081 17.532 17.91 18.204 18.459 18.46 17.982 17.293 16.557 15.885 15.275 14.725 14.214 13.745 13.237 12.762 12.316 11.897 11.498 11.119 10.749 10.38 10.074 9.809 9.533 9.222 8.972 8.724 8.431 8.189 7.949 7.694 7.432 7.167 6.975 6.768 6.446 6.214 5.969 5.845 5.574 5.307 5.049 4.896 4.526 4.395 4.209 4.0 3.565 3.31 3.007 2.661 2.23 1.703 1.004 -2.117 -8 ,23886 ,TETRA ,17550998,Thu Nov 25 09:55:05 CET,Thu Nov 25 11:36:56 CET,0.0 5.185 5.944 6.524 6.916 7.216 7.498 7.763 8.202 8.398 8.608 8.796 9.174 9.331 9.63 9.915 10.178 10.303 10.535 10.765 11.108 11.312 11.492 11.745 11.988 12.213 12.421 12.634 12.914 13.192 13.459 13.76 14.045 14.323 14.629 14.944 15.271 15.631 15.991 16.37 16.753 17.149 17.551 17.951 18.433 18.927 19.407 19.887 20.328 20.607 20.516 19.808 18.956 18.123 17.364 16.694 16.025 15.325 14.738 14.198 13.693 13.222 12.767 12.333 11.919 11.525 11.111 10.718 10.376 10.035 9.678 9.354 9.015 8.676 8.384 8.072 7.766 7.462 7.165 6.951 6.708 6.314 6.051 5.795 5.658 5.361 5.045 4.723 4.55 4.154 3.933 3.692 3.437 2.896 2.598 2.253 1.872 1.407 0.822 -0.012 -2.8 -9 ,7754 ,TETRA ,17550999,Thu Nov 25 09:56:04 CET,Thu Nov 25 11:34:38 CET,0.0 3.594 4.346 4.861 5.256 5.584 5.893 6.168 6.624 6.841 7.06 7.238 7.628 7.802 8.099 8.377 8.652 8.786 9.034 9.266 9.591 9.799 10.004 10.295 10.577 10.843 11.059 11.243 11.505 11.769 12.041 12.376 12.667 12.929 13.206 13.487 13.754 14.036 14.319 14.608 14.937 15.306 15.697 16.092 16.506 16.881 17.27 17.704 18.135 18.371 18.285 17.803 17.235 16.639 16.045 15.449 14.831 14.247 13.794 13.317 12.893 12.532 12.165 11.811 11.487 11.178 10.834 10.528 10.257 9.971 9.674 9.426 9.171 8.895 8.672 8.43 8.171 7.897 7.61 7.411 7.208 6.893 6.664 6.406 6.278 6.044 5.79 5.493 5.34 4.967 4.826 4.64 4.418 3.894 3.637 3.36 3.009 2.56 2.025 1.294 -2.193 -10 ,21805 ,TETRA ,17551000,Thu Nov 25 09:56:05 CET,Thu Nov 25 11:34:18 CET,0.0 3.733 4.402 4.973 5.447 5.803 6.099 6.381 6.905 7.123 7.306 7.427 7.779 7.918 8.181 8.427 8.666 8.786 9.019 9.223 9.531 9.74 9.923 10.165 10.415 10.669 10.895 11.08 11.312 11.543 11.764 12.021 12.255 12.491 12.794 13.136 13.421 13.701 14.009 14.33 14.644 15.015 15.458 15.87 16.326 16.778 17.235 17.669 17.999 18.203 18.17 17.714 17.087 16.452 15.805 15.125 14.472 13.918 13.432 12.889 12.438 12.032 11.615 11.218 10.852 10.49 10.08 9.712 9.393 9.055 8.728 8.485 8.23 7.975 7.78 7.55 7.3 7.035 6.747 6.549 6.355 6.02 5.759 5.48 5.343 5.076 4.794 4.488 4.327 3.929 3.722 3.506 3.289 2.813 2.554 2.245 1.865 1.43 0.898 0.125 -2.945 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_42_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_42_44.txt deleted file mode 100644 index 860a3674..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_42_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11953 ,KEBNE ,17023052,Wed Dec 22 07:20:20 CET,Wed Dec 22 08:41:52 CET,0.0 1.517 1.993 2.331 2.571 2.763 2.955 3.128 3.391 3.509 3.63 3.69 4.002 4.1 4.284 4.463 4.651 4.74 4.909 5.069 5.287 5.426 5.552 5.729 5.903 6.08 6.255 6.416 6.619 6.82 7.001 7.215 7.422 7.615 7.832 8.073 8.308 8.55 8.799 9.059 9.338 9.654 10.015 10.345 10.699 11.07 11.45 11.812 12.168 12.508 12.672 12.522 12.195 11.795 11.416 11.041 10.668 10.328 10.023 9.702 9.422 9.151 8.884 8.628 8.39 8.172 7.96 7.762 7.577 7.39 7.199 7.047 6.873 6.685 6.548 6.416 6.274 6.092 5.901 5.787 5.66 5.455 5.327 5.2 5.132 4.98 4.817 4.649 4.564 4.281 4.285 4.182 4.064 3.8 3.657 3.485 3.307 3.09 2.811 2.462 1.102 -2 ,22179 ,KEBNE ,17023053,Wed Dec 22 07:20:20 CET,Wed Dec 22 08:42:09 CET,0.0 3.24 3.717 4.031 4.278 4.477 4.672 4.845 5.124 5.24 5.365 5.401 5.703 5.807 6.0 6.193 6.373 6.451 6.609 6.76 6.963 7.096 7.228 7.409 7.584 7.749 7.9 8.054 8.266 8.452 8.621 8.832 9.038 9.22 9.436 9.697 9.937 10.186 10.442 10.722 11.001 11.284 11.619 11.949 12.319 12.706 13.108 13.527 13.962 14.288 14.397 14.192 13.825 13.428 13.034 12.633 12.211 11.832 11.522 11.19 10.874 10.588 10.322 10.066 9.823 9.599 9.358 9.144 8.968 8.782 8.595 8.441 8.269 8.089 7.952 7.813 7.663 7.498 7.334 7.215 7.09 6.906 6.769 6.625 6.554 6.404 6.24 6.052 5.951 5.653 5.619 5.479 5.321 4.985 4.787 4.561 4.324 4.056 3.757 3.375 2.671 -3 ,12713 ,KEBNE ,17023054,Wed Dec 22 07:20:21 CET,Wed Dec 22 08:42:00 CET,0.0 1.43 1.875 2.132 2.357 2.559 2.732 2.897 3.202 3.337 3.465 3.485 3.791 3.894 4.09 4.273 4.438 4.522 4.694 4.857 5.077 5.213 5.342 5.548 5.743 5.918 6.079 6.234 6.44 6.632 6.816 7.028 7.219 7.399 7.595 7.829 8.068 8.323 8.606 8.9 9.201 9.528 9.889 10.234 10.586 10.988 11.434 11.849 12.268 12.619 12.737 12.518 12.161 11.74 11.34 10.957 10.59 10.235 9.931 9.634 9.359 9.105 8.838 8.587 8.363 8.144 7.932 7.748 7.581 7.398 7.201 7.046 6.881 6.704 6.567 6.422 6.271 6.116 5.958 5.839 5.719 5.522 5.387 5.258 5.183 5.019 4.862 4.69 4.589 4.281 4.234 4.102 3.959 3.648 3.468 3.273 3.075 2.865 2.589 2.213 1.235 -4 ,8131 ,KEBNE ,17023055,Wed Dec 22 07:20:21 CET,Wed Dec 22 08:43:43 CET,0.0 1.825 2.304 2.65 2.929 3.156 3.375 3.58 3.935 4.107 4.268 4.332 4.656 4.772 4.969 5.14 5.301 5.38 5.533 5.686 5.908 6.048 6.177 6.364 6.548 6.719 6.888 7.045 7.234 7.418 7.599 7.818 8.026 8.224 8.458 8.719 8.96 9.209 9.457 9.715 9.978 10.261 10.592 10.903 11.245 11.62 12.012 12.391 12.752 13.061 13.219 12.983 12.604 12.219 11.806 11.409 11.075 10.756 10.438 10.113 9.832 9.564 9.305 9.065 8.841 8.635 8.396 8.186 8.007 7.821 7.631 7.457 7.272 7.088 6.954 6.812 6.67 6.526 6.364 6.251 6.134 5.947 5.809 5.66 5.584 5.431 5.273 5.082 4.984 4.7 4.69 4.588 4.487 4.21 4.018 3.816 3.616 3.372 3.081 2.749 1.724 -5 ,28490 ,KEBNE ,17023056,Wed Dec 22 07:20:21 CET,Wed Dec 22 08:42:03 CET,0.0 1.385 1.753 2.084 2.393 2.653 2.861 3.034 3.337 3.473 3.6 3.631 3.938 4.041 4.205 4.371 4.545 4.63 4.8 4.956 5.177 5.322 5.454 5.642 5.82 5.983 6.147 6.313 6.509 6.703 6.892 7.094 7.285 7.464 7.683 7.938 8.18 8.441 8.702 8.968 9.259 9.579 9.929 10.269 10.651 11.025 11.444 11.884 12.264 12.616 12.819 12.637 12.269 11.862 11.472 11.069 10.708 10.375 10.07 9.757 9.481 9.232 8.986 8.749 8.516 8.296 8.082 7.888 7.71 7.533 7.347 7.186 7.014 6.829 6.693 6.553 6.4 6.241 6.084 5.97 5.841 5.652 5.528 5.395 5.322 5.16 4.997 4.839 4.756 4.461 4.436 4.327 4.213 3.959 3.827 3.678 3.51 3.316 3.049 2.655 1.472 -6 ,21634 ,KEBNE ,17023057,Wed Dec 22 07:20:22 CET,Wed Dec 22 08:42:24 CET,0.0 1.39 1.767 2.026 2.231 2.426 2.627 2.823 3.181 3.323 3.444 3.496 3.816 3.934 4.144 4.346 4.537 4.628 4.801 4.964 5.21 5.368 5.519 5.733 5.928 6.107 6.274 6.434 6.648 6.856 7.045 7.262 7.461 7.654 7.87 8.104 8.342 8.592 8.843 9.107 9.4 9.725 10.07 10.397 10.77 11.165 11.568 11.964 12.361 12.698 12.822 12.62 12.277 11.877 11.452 11.011 10.614 10.27 9.948 9.593 9.286 9.037 8.812 8.578 8.347 8.132 7.895 7.691 7.53 7.36 7.172 7.005 6.825 6.636 6.491 6.343 6.187 6.028 5.864 5.745 5.622 5.42 5.277 5.139 5.068 4.915 4.744 4.574 4.487 4.195 4.196 4.091 3.975 3.715 3.581 3.46 3.31 3.117 2.859 2.526 1.054 -7 ,19077 ,KEBNE ,17023058,Wed Dec 22 07:20:22 CET,Wed Dec 22 08:42:03 CET,0.0 0.874 1.203 1.466 1.676 1.882 2.07 2.218 2.494 2.617 2.735 2.762 3.068 3.172 3.363 3.551 3.729 3.816 3.986 4.139 4.341 4.473 4.608 4.8 4.986 5.178 5.353 5.53 5.753 5.937 6.115 6.332 6.534 6.73 6.946 7.176 7.406 7.659 7.939 8.226 8.52 8.832 9.174 9.515 9.893 10.285 10.675 11.071 11.466 11.824 11.998 11.81 11.447 11.019 10.604 10.221 9.878 9.555 9.25 8.916 8.629 8.356 8.06 7.772 7.486 7.232 6.988 6.769 6.578 6.379 6.18 6.004 5.8 5.592 5.434 5.275 5.111 4.944 4.778 4.652 4.517 4.296 4.144 4.004 3.932 3.774 3.603 3.417 3.314 3.014 2.981 2.85 2.726 2.453 2.296 2.145 1.979 1.761 1.517 1.264 0.433 -8 ,20861 ,KEBNE ,17023059,Wed Dec 22 07:20:24 CET,Wed Dec 22 08:43:20 CET,0.0 1.44 1.991 2.361 2.582 2.77 2.944 3.113 3.43 3.573 3.711 3.778 4.082 4.174 4.374 4.571 4.745 4.823 4.973 5.122 5.338 5.473 5.604 5.81 5.999 6.163 6.324 6.48 6.675 6.861 7.032 7.229 7.427 7.615 7.829 8.074 8.309 8.56 8.809 9.062 9.329 9.629 9.971 10.315 10.704 11.068 11.444 11.866 12.305 12.655 12.818 12.632 12.266 11.83 11.42 11.057 10.685 10.323 10.003 9.678 9.398 9.135 8.873 8.635 8.413 8.203 7.984 7.777 7.59 7.395 7.193 7.022 6.85 6.672 6.533 6.385 6.213 6.04 5.88 5.77 5.655 5.47 5.339 5.202 5.133 4.988 4.817 4.643 4.544 4.237 4.207 4.093 3.982 3.728 3.579 3.432 3.248 2.971 2.636 2.176 0.624 -9 ,24512 ,KEBNE ,17023060,Wed Dec 22 07:20:35 CET,Wed Dec 22 08:38:11 CET,0.0 1.83 2.293 2.587 2.846 3.08 3.299 3.505 3.843 3.988 4.131 4.196 4.51 4.622 4.846 5.05 5.237 5.326 5.494 5.642 5.865 6.019 6.154 6.348 6.543 6.724 6.902 7.07 7.286 7.498 7.708 7.972 8.196 8.379 8.593 8.828 9.057 9.314 9.595 9.896 10.19 10.516 10.878 11.206 11.554 11.902 12.289 12.686 13.108 13.524 13.761 13.593 13.236 12.807 12.392 11.995 11.633 11.29 10.961 10.626 10.339 10.091 9.842 9.603 9.374 9.155 8.943 8.753 8.576 8.386 8.186 8.026 7.86 7.683 7.54 7.395 7.248 7.081 6.897 6.772 6.656 6.476 6.341 6.2 6.129 5.965 5.79 5.62 5.528 5.24 5.238 5.124 4.997 4.752 4.637 4.484 4.297 4.106 3.874 3.578 2.514 -10 ,27844 ,KEBNE ,17023061,Wed Dec 22 07:20:35 CET,Wed Dec 22 08:39:36 CET,0.0 0.873 1.164 1.44 1.712 1.961 2.189 2.396 2.721 2.862 3.002 3.065 3.377 3.471 3.649 3.828 4.003 4.091 4.263 4.432 4.664 4.804 4.936 5.116 5.288 5.463 5.632 5.798 6.016 6.213 6.4 6.619 6.818 7.01 7.231 7.472 7.706 7.953 8.185 8.433 8.711 9.01 9.325 9.626 9.971 10.355 10.767 11.203 11.66 12.038 12.17 11.926 11.573 11.171 10.762 10.351 9.979 9.63 9.308 8.985 8.689 8.407 8.146 7.917 7.69 7.479 7.263 7.059 6.884 6.705 6.519 6.361 6.196 6.014 5.88 5.744 5.593 5.442 5.278 5.158 5.024 4.812 4.673 4.534 4.461 4.31 4.142 3.943 3.843 3.554 3.539 3.42 3.304 3.058 2.906 2.739 2.57 2.332 2.06 1.71 0.611 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_42_51.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_42_51.txt deleted file mode 100644 index bd7586cc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_42_51.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6627 ,KEBNE ,17023062,Wed Dec 22 07:21:32 CET,Wed Dec 22 08:43:26 CET,0.0 1.926 2.446 2.778 3.062 3.308 3.497 3.659 3.987 4.145 4.297 4.374 4.689 4.802 5.04 5.275 5.486 5.579 5.764 5.942 6.191 6.363 6.531 6.771 6.986 7.178 7.355 7.529 7.772 8.003 8.218 8.466 8.707 8.938 9.19 9.483 9.77 10.085 10.43 10.799 11.194 11.639 12.143 12.625 13.175 13.766 14.412 15.131 15.894 16.714 17.585 18.06 18.119 18.051 17.942 17.786 17.6 17.38 17.182 16.98 16.779 16.599 16.428 16.253 16.075 15.898 15.72 15.56 15.414 15.259 15.09 14.951 14.802 14.632 14.493 14.345 14.196 14.037 13.86 13.748 13.647 13.491 13.381 13.267 13.201 13.056 12.902 12.718 12.606 12.307 12.309 12.195 12.058 11.776 11.644 11.506 11.33 11.128 10.841 10.396 9.165 -2 ,15833 ,KEBNE ,17023063,Wed Dec 22 07:21:32 CET,Wed Dec 22 08:43:19 CET,0.0 1.536 1.981 2.386 2.701 2.932 3.156 3.38 3.769 3.965 4.151 4.272 4.619 4.761 5.021 5.245 5.468 5.58 5.8 6.003 6.287 6.461 6.635 6.914 7.184 7.422 7.643 7.846 8.095 8.352 8.617 8.934 9.231 9.515 9.84 10.177 10.493 10.849 11.235 11.631 12.048 12.52 13.048 13.572 14.166 14.816 15.559 16.351 17.204 18.121 18.991 19.51 19.643 19.571 19.425 19.221 19.001 18.792 18.601 18.36 18.139 17.962 17.773 17.588 17.413 17.231 17.033 16.861 16.712 16.546 16.363 16.212 16.051 15.89 15.771 15.644 15.511 15.367 15.209 15.105 14.994 14.791 14.622 14.453 14.377 14.22 14.052 13.871 13.774 13.489 13.468 13.346 13.226 12.996 12.85 12.673 12.452 12.193 11.889 11.465 10.53 -3 ,31174 ,KEBNE ,17023064,Wed Dec 22 07:22:21 CET,Wed Dec 22 08:46:35 CET,0.0 1.615 2.1 2.425 2.664 2.902 3.124 3.328 3.721 3.905 4.071 4.172 4.5 4.627 4.863 5.082 5.307 5.42 5.631 5.832 6.125 6.309 6.478 6.724 6.968 7.195 7.411 7.619 7.888 8.155 8.404 8.692 8.972 9.254 9.578 9.922 10.262 10.634 11.016 11.439 11.891 12.353 12.877 13.39 13.957 14.586 15.296 16.101 16.981 17.938 18.858 19.312 19.429 19.361 19.174 18.956 18.757 18.546 18.322 18.089 17.899 17.733 17.556 17.371 17.206 17.051 16.881 16.719 16.558 16.387 16.186 16.017 15.89 15.762 15.654 15.53 15.391 15.249 15.11 15.006 14.888 14.717 14.597 14.465 14.396 14.266 14.132 13.97 13.888 13.614 13.599 13.494 13.393 13.172 13.043 12.899 12.727 12.536 12.311 12.01 10.576 -4 ,10547 ,KEBNE ,17023065,Wed Dec 22 07:22:21 CET,Wed Dec 22 08:44:00 CET,0.0 1.407 1.853 2.204 2.509 2.755 2.973 3.178 3.508 3.657 3.82 3.921 4.262 4.402 4.645 4.867 5.083 5.187 5.389 5.585 5.877 6.064 6.245 6.497 6.725 6.954 7.178 7.385 7.658 7.926 8.171 8.469 8.743 8.995 9.308 9.653 9.96 10.295 10.656 11.043 11.45 11.901 12.422 12.962 13.577 14.246 14.982 15.714 16.484 17.336 18.274 18.74 18.806 18.717 18.521 18.252 17.984 17.761 17.57 17.363 17.138 16.906 16.712 16.516 16.31 16.135 15.958 15.8 15.664 15.527 15.38 15.24 15.087 14.932 14.796 14.639 14.491 14.341 14.185 14.086 13.983 13.814 13.684 13.554 13.493 13.359 13.213 13.056 12.967 12.681 12.666 12.553 12.427 12.178 12.066 11.94 11.773 11.579 11.327 11.016 10.48 -5 ,3560 ,KEBNE ,17023066,Wed Dec 22 07:23:22 CET,Wed Dec 22 08:45:13 CET,0.0 1.043 1.386 1.77 2.122 2.35 2.561 2.773 3.158 3.327 3.489 3.579 3.912 4.051 4.335 4.589 4.821 4.929 5.133 5.339 5.631 5.814 5.984 6.223 6.461 6.698 6.914 7.127 7.434 7.723 7.972 8.264 8.57 8.859 9.164 9.504 9.816 10.159 10.533 10.913 11.32 11.792 12.342 12.892 13.501 14.17 14.94 15.745 16.57 17.442 18.306 18.783 18.902 18.852 18.695 18.497 18.306 18.1 17.899 17.662 17.438 17.241 17.053 16.863 16.667 16.476 16.266 16.082 15.92 15.743 15.554 15.4 15.248 15.06 14.903 14.761 14.622 14.479 14.318 14.211 14.119 13.979 13.863 13.738 13.673 13.532 13.379 13.21 13.12 12.837 12.813 12.699 12.582 12.315 12.159 11.972 11.758 11.558 11.36 11.034 9.91 -6 ,9708 ,KEBNE ,17023067,Wed Dec 22 07:23:22 CET,Wed Dec 22 08:46:28 CET,0.0 1.656 2.108 2.441 2.719 2.98 3.201 3.391 3.756 3.924 4.075 4.184 4.536 4.669 4.893 5.125 5.355 5.456 5.654 5.831 6.08 6.253 6.432 6.673 6.902 7.135 7.367 7.586 7.857 8.126 8.381 8.671 8.941 9.207 9.522 9.855 10.175 10.552 10.946 11.351 11.759 12.19 12.723 13.253 13.849 14.502 15.234 16.014 16.861 17.817 18.752 19.203 19.33 19.284 19.143 18.951 18.727 18.499 18.299 18.08 17.862 17.653 17.454 17.268 17.092 16.924 16.735 16.548 16.392 16.232 16.061 15.919 15.761 15.597 15.468 15.331 15.186 15.038 14.882 14.77 14.638 14.418 14.286 14.164 14.097 13.951 13.779 13.585 13.487 13.194 13.157 13.04 12.913 12.608 12.447 12.285 12.119 11.902 11.643 11.345 10.324 -7 ,26515 ,KEBNE ,17023068,Wed Dec 22 07:23:22 CET,Wed Dec 22 08:45:15 CET,0.0 1.163 1.619 1.97 2.244 2.499 2.732 2.951 3.354 3.535 3.699 3.783 4.118 4.254 4.511 4.785 5.045 5.158 5.372 5.586 5.895 6.082 6.26 6.506 6.74 6.965 7.186 7.402 7.666 7.935 8.2 8.507 8.807 9.089 9.403 9.755 10.073 10.408 10.798 11.205 11.602 12.07 12.633 13.187 13.819 14.475 15.217 16.019 16.853 17.725 18.626 19.205 19.346 19.294 19.126 18.908 18.678 18.443 18.24 18.025 17.806 17.591 17.395 17.203 17.019 16.835 16.629 16.453 16.302 16.133 15.937 15.788 15.633 15.46 15.324 15.182 15.043 14.895 14.724 14.604 14.481 14.285 14.166 14.027 13.943 13.78 13.615 13.441 13.355 13.083 13.087 12.981 12.859 12.571 12.414 12.257 12.099 11.923 11.716 11.444 10.222 -8 ,16934 ,KEBNE ,17023069,Wed Dec 22 07:23:22 CET,Wed Dec 22 08:46:27 CET,0.0 1.623 2.102 2.408 2.679 2.922 3.139 3.337 3.673 3.831 3.995 4.107 4.44 4.563 4.817 5.049 5.278 5.391 5.597 5.789 6.069 6.25 6.42 6.68 6.939 7.181 7.411 7.628 7.902 8.152 8.392 8.709 9.013 9.291 9.627 10.016 10.359 10.716 11.092 11.486 11.903 12.381 12.92 13.433 14.039 14.69 15.377 16.124 16.963 17.841 18.709 19.235 19.392 19.328 19.165 18.973 18.785 18.588 18.408 18.207 17.988 17.777 17.557 17.343 17.165 17.004 16.812 16.61 16.445 16.291 16.123 15.985 15.833 15.669 15.545 15.411 15.272 15.131 14.973 14.855 14.722 14.518 14.379 14.239 14.165 14.014 13.855 13.668 13.571 13.285 13.287 13.183 13.048 12.736 12.581 12.413 12.221 11.993 11.751 11.396 9.186 -9 ,1150 ,KEBNE ,17023070,Wed Dec 22 07:23:22 CET,Wed Dec 22 08:46:31 CET,0.0 1.34 1.793 2.124 2.389 2.61 2.829 3.04 3.411 3.575 3.74 3.851 4.191 4.331 4.604 4.849 5.074 5.187 5.406 5.609 5.884 6.061 6.234 6.487 6.738 6.974 7.199 7.421 7.698 7.953 8.197 8.5 8.793 9.063 9.37 9.726 10.079 10.455 10.837 11.231 11.644 12.123 12.692 13.234 13.821 14.45 15.164 15.952 16.845 17.806 18.705 19.19 19.301 19.228 19.106 18.905 18.667 18.448 18.243 18.039 17.862 17.679 17.489 17.308 17.13 16.966 16.787 16.602 16.444 16.275 16.066 15.888 15.72 15.559 15.431 15.305 15.18 15.021 14.854 14.745 14.629 14.442 14.314 14.171 14.096 13.943 13.772 13.596 13.502 13.222 13.233 13.128 13.006 12.731 12.573 12.378 12.174 11.955 11.642 11.174 9.783 -10 ,22728 ,KEBNE ,17023071,Wed Dec 22 07:23:22 CET,Wed Dec 22 08:46:45 CET,0.0 1.212 1.614 1.885 2.155 2.399 2.616 2.84 3.21 3.369 3.518 3.603 3.939 4.083 4.354 4.59 4.798 4.895 5.097 5.293 5.571 5.759 5.938 6.184 6.437 6.677 6.895 7.11 7.374 7.616 7.861 8.16 8.444 8.72 9.032 9.377 9.718 10.09 10.485 10.872 11.255 11.701 12.246 12.781 13.371 14.032 14.738 15.5 16.371 17.255 18.081 18.596 18.679 18.559 18.395 18.208 18.008 17.783 17.565 17.329 17.12 16.925 16.724 16.531 16.355 16.19 15.994 15.807 15.634 15.458 15.294 15.143 14.969 14.795 14.665 14.527 14.375 14.203 14.023 13.905 13.785 13.589 13.445 13.287 13.214 13.091 12.945 12.76 12.669 12.394 12.387 12.282 12.157 11.882 11.75 11.625 11.472 11.267 10.973 10.616 9.501 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_42_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_42_54.txt deleted file mode 100644 index 29478343..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_42_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17174 ,KEBNE ,17023072,Wed Dec 22 07:24:24 CET,Wed Dec 22 08:46:00 CET,0.0 1.24 1.74 2.054 2.306 2.551 2.733 2.862 3.119 3.236 3.351 3.386 3.688 3.785 3.949 4.102 4.26 4.336 4.475 4.601 4.785 4.91 5.03 5.186 5.331 5.479 5.616 5.758 5.945 6.106 6.254 6.429 6.6 6.764 6.945 7.135 7.314 7.503 7.68 7.882 8.112 8.341 8.585 8.795 9.027 9.258 9.465 9.65 9.766 9.755 9.38 8.64 7.945 7.268 6.659 6.105 5.593 5.114 4.702 4.281 3.938 3.651 3.358 3.081 2.814 2.562 2.312 2.073 1.851 1.637 1.424 1.244 1.055 0.866 0.722 0.581 0.437 0.261 0.071 -0.054 -0.185 -0.4 -0.549 -0.7 -0.775 -0.923 -1.083 -1.253 -1.339 -1.639 -1.654 -1.751 -1.856 -2.12 -2.259 -2.409 -2.598 -2.824 -3.076 -3.387 -4.223 -2 ,6987 ,KEBNE ,17023073,Wed Dec 22 07:24:23 CET,Wed Dec 22 08:47:32 CET,0.0 1.289 1.712 1.988 2.211 2.4 2.562 2.698 2.962 3.102 3.235 3.26 3.552 3.643 3.822 3.982 4.136 4.215 4.365 4.509 4.717 4.845 4.959 5.111 5.258 5.403 5.535 5.654 5.798 5.943 6.091 6.268 6.441 6.606 6.794 7.007 7.192 7.384 7.579 7.774 7.989 8.21 8.454 8.701 8.945 9.173 9.41 9.617 9.748 9.694 9.292 8.51 7.756 7.084 6.468 5.928 5.439 4.994 4.61 4.209 3.878 3.577 3.278 2.997 2.734 2.492 2.25 2.022 1.814 1.604 1.39 1.212 1.011 0.794 0.631 0.466 0.28 0.078 -0.126 -0.256 -0.389 -0.613 -0.766 -0.915 -0.997 -1.168 -1.338 -1.524 -1.628 -1.932 -1.984 -2.118 -2.249 -2.576 -2.747 -2.902 -3.072 -3.289 -3.53 -3.869 -5.034 -3 ,13868 ,KEBNE ,17023074,Wed Dec 22 07:24:23 CET,Wed Dec 22 08:46:00 CET,0.0 1.256 1.701 2.035 2.297 2.529 2.733 2.898 3.15 3.26 3.371 3.383 3.681 3.779 3.944 4.112 4.282 4.36 4.501 4.634 4.836 4.949 5.059 5.226 5.384 5.538 5.67 5.794 5.962 6.117 6.268 6.449 6.61 6.759 6.952 7.16 7.349 7.554 7.77 7.998 8.213 8.427 8.629 8.834 9.071 9.277 9.444 9.603 9.744 9.719 9.36 8.685 7.966 7.236 6.592 6.021 5.528 5.065 4.648 4.239 3.885 3.567 3.274 3.003 2.737 2.481 2.223 1.999 1.805 1.606 1.397 1.215 1.028 0.827 0.668 0.505 0.341 0.168 -0.015 -0.134 -0.26 -0.472 -0.611 -0.751 -0.827 -0.987 -1.161 -1.347 -1.444 -1.735 -1.737 -1.853 -1.973 -2.223 -2.353 -2.499 -2.66 -2.857 -3.146 -3.565 -4.362 -4 ,7942 ,KEBNE ,17023075,Wed Dec 22 07:24:23 CET,Wed Dec 22 08:47:41 CET,0.0 0.99 1.322 1.608 1.864 2.065 2.24 2.386 2.646 2.769 2.889 2.917 3.224 3.322 3.503 3.683 3.848 3.93 4.1 4.244 4.424 4.543 4.663 4.833 4.996 5.151 5.289 5.423 5.605 5.772 5.92 6.105 6.285 6.459 6.667 6.88 7.069 7.278 7.49 7.708 7.922 8.147 8.401 8.627 8.858 9.082 9.305 9.5 9.611 9.556 9.157 8.413 7.653 6.967 6.372 5.831 5.329 4.864 4.468 4.045 3.676 3.357 3.051 2.749 2.474 2.228 1.955 1.713 1.515 1.317 1.112 0.934 0.749 0.547 0.389 0.23 0.064 -0.114 -0.303 -0.423 -0.547 -0.775 -0.933 -1.081 -1.156 -1.315 -1.478 -1.656 -1.749 -2.044 -2.055 -2.171 -2.292 -2.556 -2.711 -2.883 -3.071 -3.322 -3.65 -4.065 -4.9 -5 ,20347 ,KEBNE ,17023076,Wed Dec 22 07:24:23 CET,Wed Dec 22 08:46:28 CET,0.0 0.91 1.338 1.625 1.816 1.988 2.144 2.294 2.59 2.725 2.841 2.855 3.156 3.257 3.429 3.588 3.75 3.825 3.966 4.107 4.31 4.443 4.569 4.736 4.884 5.022 5.162 5.303 5.476 5.628 5.768 5.933 6.093 6.251 6.437 6.648 6.831 7.022 7.233 7.447 7.651 7.872 8.112 8.329 8.567 8.787 8.989 9.164 9.259 9.225 8.884 8.151 7.405 6.713 6.116 5.545 5.028 4.563 4.165 3.779 3.422 3.094 2.792 2.503 2.22 1.945 1.666 1.44 1.254 1.053 0.831 0.637 0.441 0.251 0.094 -0.072 -0.233 -0.397 -0.572 -0.702 -0.848 -1.072 -1.213 -1.361 -1.445 -1.602 -1.764 -1.954 -2.043 -2.339 -2.352 -2.464 -2.588 -2.857 -2.995 -3.137 -3.312 -3.535 -3.786 -4.057 -4.803 -6 ,19062 ,KEBNE ,17023077,Wed Dec 22 07:24:23 CET,Wed Dec 22 08:46:23 CET,0.0 1.328 1.759 2.101 2.355 2.545 2.73 2.913 3.238 3.379 3.509 3.569 3.881 3.983 4.176 4.359 4.52 4.596 4.743 4.875 5.067 5.191 5.306 5.477 5.635 5.78 5.918 6.047 6.221 6.382 6.538 6.736 6.913 7.066 7.226 7.399 7.559 7.753 7.955 8.148 8.345 8.556 8.808 9.057 9.307 9.554 9.781 9.945 10.039 9.989 9.63 8.897 8.151 7.47 6.848 6.271 5.755 5.284 4.883 4.47 4.098 3.759 3.442 3.156 2.895 2.662 2.422 2.198 2.004 1.798 1.584 1.405 1.217 1.013 0.858 0.706 0.55 0.383 0.212 0.088 -0.059 -0.282 -0.432 -0.578 -0.645 -0.792 -0.955 -1.133 -1.227 -1.514 -1.492 -1.604 -1.725 -1.972 -2.116 -2.291 -2.5 -2.747 -3.062 -3.434 -4.118 -7 ,11991 ,KEBNE ,17023078,Wed Dec 22 07:25:25 CET,Wed Dec 22 08:48:42 CET,0.0 0.836 1.22 1.491 1.713 1.923 2.11 2.268 2.554 2.673 2.78 2.801 3.102 3.196 3.382 3.561 3.728 3.814 3.968 4.1 4.29 4.405 4.522 4.688 4.836 4.977 5.111 5.246 5.418 5.577 5.731 5.916 6.082 6.233 6.418 6.62 6.804 7.0 7.212 7.434 7.656 7.876 8.098 8.306 8.539 8.783 8.992 9.128 9.216 9.209 8.859 8.131 7.36 6.625 5.955 5.333 4.807 4.351 3.944 3.53 3.182 2.848 2.54 2.267 1.994 1.749 1.5 1.276 1.074 0.853 0.64 0.464 0.271 0.089 -0.046 -0.205 -0.375 -0.54 -0.713 -0.835 -0.969 -1.178 -1.312 -1.45 -1.524 -1.674 -1.831 -1.996 -2.083 -2.378 -2.403 -2.518 -2.621 -2.843 -2.986 -3.157 -3.351 -3.569 -3.838 -4.271 -5.153 -8 ,24574 ,KEBNE ,17023079,Wed Dec 22 07:25:25 CET,Wed Dec 22 08:48:30 CET,0.0 0.955 1.279 1.549 1.802 2.017 2.191 2.342 2.602 2.722 2.835 2.836 3.129 3.227 3.409 3.57 3.728 3.803 3.937 4.067 4.258 4.376 4.483 4.635 4.79 4.95 5.1 5.232 5.388 5.538 5.691 5.865 6.031 6.193 6.379 6.583 6.754 6.947 7.162 7.372 7.572 7.786 8.032 8.27 8.503 8.718 8.948 9.132 9.245 9.213 8.879 8.211 7.474 6.75 6.098 5.495 4.973 4.508 4.12 3.724 3.363 3.048 2.752 2.478 2.218 1.972 1.711 1.481 1.281 1.066 0.832 0.641 0.457 0.271 0.122 -0.036 -0.196 -0.362 -0.539 -0.663 -0.79 -0.969 -1.097 -1.241 -1.316 -1.473 -1.65 -1.831 -1.912 -2.197 -2.192 -2.298 -2.412 -2.659 -2.791 -2.942 -3.109 -3.294 -3.549 -3.864 -4.535 -9 ,23841 ,KEBNE ,17023080,Wed Dec 22 07:25:25 CET,Wed Dec 22 08:46:55 CET,0.0 0.792 1.168 1.399 1.591 1.77 1.943 2.105 2.385 2.505 2.612 2.612 2.911 3.0 3.18 3.356 3.495 3.569 3.725 3.854 4.034 4.152 4.263 4.421 4.583 4.731 4.872 5.005 5.171 5.334 5.489 5.67 5.827 5.972 6.147 6.353 6.554 6.753 6.945 7.15 7.365 7.59 7.826 8.057 8.298 8.547 8.781 8.943 9.034 8.977 8.599 7.891 7.152 6.493 5.917 5.35 4.822 4.349 3.952 3.555 3.187 2.853 2.545 2.26 1.982 1.715 1.45 1.22 1.017 0.812 0.596 0.412 0.233 0.044 -0.111 -0.271 -0.434 -0.603 -0.77 -0.886 -1.013 -1.206 -1.343 -1.485 -1.556 -1.713 -1.879 -2.047 -2.138 -2.436 -2.434 -2.539 -2.647 -2.914 -3.077 -3.241 -3.407 -3.61 -3.849 -4.105 -4.654 -10 ,15454 ,KEBNE ,17023081,Wed Dec 22 07:26:28 CET,Wed Dec 22 08:49:37 CET,0.0 0.881 1.269 1.581 1.847 2.094 2.321 2.507 2.811 2.952 3.084 3.11 3.419 3.524 3.717 3.903 4.079 4.164 4.327 4.488 4.717 4.863 4.998 5.201 5.396 5.564 5.706 5.838 6.012 6.175 6.331 6.511 6.68 6.842 7.019 7.211 7.395 7.591 7.801 8.006 8.216 8.443 8.681 8.903 9.143 9.371 9.587 9.757 9.864 9.815 9.42 8.698 7.96 7.273 6.656 6.092 5.593 5.131 4.732 4.323 3.96 3.639 3.329 3.046 2.78 2.527 2.256 2.007 1.801 1.607 1.4 1.22 1.038 0.854 0.705 0.552 0.391 0.221 0.054 -0.071 -0.213 -0.428 -0.571 -0.725 -0.804 -0.954 -1.114 -1.291 -1.382 -1.674 -1.678 -1.788 -1.901 -2.143 -2.277 -2.436 -2.604 -2.764 -2.941 -3.15 -3.699 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_45_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_45_42.txt deleted file mode 100644 index c17122eb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_45_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5921 ,KEBNE ,17023082,Wed Dec 22 07:26:28 CET,Wed Dec 22 08:48:49 CET,0.0 1.544 1.898 2.164 2.375 2.579 2.753 2.901 3.19 3.313 3.424 3.429 3.742 3.836 4.022 4.202 4.377 4.464 4.625 4.773 4.985 5.113 5.233 5.419 5.604 5.774 5.94 6.112 6.329 6.533 6.74 6.973 7.193 7.415 7.669 7.948 8.217 8.526 8.84 9.151 9.488 9.871 10.3 10.733 11.235 11.788 12.418 13.11 13.931 14.866 15.869 16.432 16.577 16.586 16.494 16.349 16.183 16.003 15.839 15.645 15.45 15.26 15.072 14.895 14.722 14.569 14.417 14.271 14.129 13.983 13.824 13.683 13.532 13.369 13.239 13.107 12.972 12.819 12.659 12.545 12.433 12.263 12.132 11.985 11.907 11.756 11.605 11.436 11.337 11.035 10.994 10.871 10.749 10.467 10.316 10.151 9.899 9.609 9.32 8.853 7.515 -2 ,13655 ,KEBNE ,17023083,Wed Dec 22 07:26:28 CET,Wed Dec 22 08:48:43 CET,0.0 0.942 1.283 1.548 1.757 1.977 2.227 2.446 2.784 2.93 3.071 3.135 3.473 3.594 3.824 4.041 4.243 4.334 4.515 4.706 4.966 5.118 5.267 5.481 5.675 5.856 6.038 6.225 6.461 6.687 6.904 7.153 7.394 7.641 7.914 8.201 8.479 8.77 9.078 9.412 9.749 10.109 10.529 10.966 11.467 12.008 12.652 13.375 14.174 15.065 16.011 16.609 16.863 16.911 16.829 16.703 16.562 16.414 16.246 16.035 15.844 15.679 15.511 15.327 15.152 15.004 14.825 14.639 14.487 14.327 14.158 14.03 13.894 13.74 13.609 13.466 13.317 13.167 13.016 12.918 12.813 12.632 12.504 12.366 12.29 12.132 11.978 11.821 11.723 11.419 11.403 11.295 11.195 10.951 10.803 10.616 10.412 10.19 9.917 9.541 8.576 -3 ,10942 ,KEBNE ,17023084,Wed Dec 22 07:27:30 CET,Wed Dec 22 08:49:53 CET,0.0 0.963 1.276 1.55 1.782 1.983 2.161 2.315 2.599 2.729 2.853 2.879 3.196 3.301 3.496 3.665 3.819 3.897 4.057 4.204 4.408 4.537 4.667 4.861 5.044 5.22 5.401 5.57 5.783 5.984 6.169 6.405 6.634 6.845 7.103 7.393 7.66 7.95 8.256 8.575 8.902 9.279 9.726 10.161 10.663 11.224 11.873 12.614 13.443 14.342 15.31 15.954 16.18 16.211 16.138 15.999 15.823 15.648 15.475 15.258 15.043 14.84 14.641 14.452 14.278 14.113 13.939 13.777 13.627 13.466 13.285 13.129 12.979 12.828 12.708 12.574 12.423 12.269 12.112 12.003 11.886 11.692 11.559 11.419 11.349 11.207 11.05 10.879 10.788 10.493 10.473 10.355 10.224 9.94 9.762 9.562 9.354 9.113 8.825 8.472 7.492 -4 ,25556 ,KEBNE ,17023085,Wed Dec 22 07:27:29 CET,Wed Dec 22 08:50:05 CET,0.0 0.718 1.116 1.419 1.629 1.804 1.981 2.124 2.363 2.485 2.605 2.62 2.921 3.005 3.189 3.394 3.585 3.661 3.81 3.961 4.17 4.299 4.42 4.606 4.797 4.968 5.137 5.299 5.496 5.683 5.857 6.079 6.306 6.524 6.775 7.051 7.31 7.606 7.927 8.242 8.561 8.938 9.401 9.862 10.374 10.934 11.586 12.307 13.1 13.948 14.826 15.411 15.63 15.626 15.513 15.348 15.153 14.96 14.793 14.613 14.426 14.239 14.04 13.835 13.643 13.471 13.291 13.126 12.984 12.824 12.648 12.496 12.333 12.178 12.066 11.947 11.808 11.648 11.482 11.37 11.262 11.096 10.969 10.823 10.749 10.601 10.441 10.264 10.168 9.879 9.874 9.766 9.655 9.359 9.191 9.012 8.8 8.568 8.292 7.927 7.187 -5 ,10187 ,KEBNE ,17023086,Wed Dec 22 07:27:30 CET,Wed Dec 22 08:50:10 CET,0.0 0.771 1.188 1.468 1.681 1.87 2.036 2.187 2.478 2.63 2.78 2.866 3.208 3.339 3.618 3.875 4.091 4.196 4.4 4.59 4.847 4.994 5.129 5.327 5.511 5.699 5.875 6.028 6.236 6.439 6.632 6.863 7.084 7.298 7.535 7.811 8.082 8.366 8.681 9.036 9.391 9.778 10.226 10.664 11.191 11.775 12.406 13.108 13.897 14.775 15.749 16.324 16.483 16.524 16.464 16.297 16.095 15.872 15.676 15.494 15.313 15.14 14.982 14.82 14.665 14.516 14.334 14.156 13.993 13.826 13.662 13.525 13.375 13.228 13.111 12.982 12.852 12.7 12.535 12.423 12.305 12.114 11.984 11.861 11.795 11.647 11.471 11.273 11.182 10.89 10.866 10.754 10.628 10.318 10.133 9.937 9.745 9.511 9.166 8.69 7.398 -6 ,18769 ,KEBNE ,17023087,Wed Dec 22 07:27:30 CET,Wed Dec 22 08:49:49 CET,0.0 1.281 1.665 1.986 2.21 2.408 2.589 2.761 3.071 3.212 3.348 3.368 3.686 3.786 3.966 4.152 4.329 4.415 4.581 4.737 4.96 5.099 5.227 5.411 5.6 5.786 5.964 6.132 6.348 6.548 6.736 6.965 7.184 7.392 7.628 7.879 8.125 8.409 8.717 9.04 9.368 9.741 10.186 10.617 11.101 11.635 12.255 12.972 13.775 14.642 15.556 16.149 16.343 16.365 16.291 16.135 15.961 15.792 15.619 15.392 15.194 15.035 14.863 14.68 14.518 14.364 14.186 14.024 13.873 13.709 13.551 13.421 13.284 13.133 13.008 12.882 12.743 12.589 12.433 12.329 12.216 12.03 11.911 11.785 11.711 11.56 11.404 11.241 11.154 10.852 10.829 10.724 10.609 10.33 10.174 10.005 9.807 9.622 9.415 9.062 7.752 -7 ,26796 ,KEBNE ,17023088,Wed Dec 22 07:27:30 CET,Wed Dec 22 08:49:53 CET,0.0 0.732 1.191 1.482 1.682 1.84 1.984 2.115 2.36 2.473 2.582 2.598 2.908 3.003 3.183 3.35 3.523 3.608 3.766 3.917 4.128 4.263 4.401 4.606 4.785 4.945 5.106 5.265 5.47 5.662 5.857 6.1 6.323 6.54 6.789 7.065 7.33 7.609 7.908 8.23 8.574 8.965 9.41 9.849 10.36 10.92 11.584 12.327 13.117 13.993 14.975 15.578 15.775 15.79 15.713 15.583 15.422 15.236 15.042 14.837 14.645 14.473 14.297 14.113 13.925 13.75 13.558 13.376 13.215 13.036 12.861 12.719 12.565 12.401 12.273 12.145 12.012 11.88 11.734 11.624 11.51 11.329 11.199 11.057 10.975 10.814 10.652 10.476 10.384 10.081 10.066 9.947 9.822 9.564 9.426 9.267 9.075 8.844 8.582 8.234 7.199 -8 ,2545 ,KEBNE ,17023089,Wed Dec 22 07:29:35 CET,Wed Dec 22 08:51:38 CET,0.0 0.775 1.097 1.337 1.526 1.701 1.882 2.035 2.307 2.437 2.555 2.559 2.867 2.963 3.159 3.341 3.508 3.59 3.752 3.905 4.125 4.27 4.41 4.616 4.808 4.975 5.131 5.286 5.494 5.694 5.893 6.128 6.353 6.582 6.829 7.093 7.354 7.622 7.92 8.263 8.617 9.013 9.477 9.933 10.462 11.037 11.7 12.417 13.208 14.126 15.103 15.709 15.932 15.957 15.865 15.702 15.511 15.301 15.096 14.871 14.661 14.478 14.299 14.134 13.977 13.806 13.624 13.469 13.318 13.152 12.98 12.831 12.679 12.523 12.395 12.255 12.109 11.962 11.799 11.68 11.561 11.389 11.279 11.151 11.077 10.925 10.766 10.601 10.52 10.232 10.219 10.116 10.014 9.717 9.509 9.277 9.037 8.734 8.376 7.953 6.948 -9 ,28430 ,KEBNE ,17023090,Wed Dec 22 07:29:35 CET,Wed Dec 22 08:53:24 CET,0.0 0.825 1.219 1.496 1.724 1.924 2.105 2.265 2.529 2.648 2.764 2.783 3.091 3.188 3.382 3.555 3.724 3.808 3.961 4.096 4.3 4.441 4.575 4.77 4.955 5.127 5.29 5.45 5.66 5.855 6.054 6.307 6.53 6.74 6.993 7.273 7.535 7.831 8.162 8.513 8.86 9.246 9.696 10.155 10.689 11.255 11.879 12.563 13.34 14.234 15.233 15.85 16.045 16.028 15.932 15.795 15.613 15.42 15.258 15.079 14.878 14.683 14.498 14.325 14.166 14.013 13.848 13.689 13.538 13.387 13.23 13.087 12.942 12.792 12.664 12.531 12.387 12.232 12.064 11.942 11.827 11.661 11.536 11.4 11.328 11.177 11.018 10.839 10.745 10.44 10.38 10.241 10.11 9.86 9.717 9.549 9.375 9.179 8.911 8.516 7.449 -10 ,4881 ,KEBNE ,17023091,Wed Dec 22 07:30:39 CET,Wed Dec 22 08:54:15 CET,0.0 0.814 1.119 1.379 1.577 1.758 1.936 2.092 2.37 2.494 2.611 2.628 2.936 3.027 3.225 3.408 3.567 3.645 3.795 3.944 4.184 4.342 4.482 4.68 4.861 5.033 5.211 5.38 5.583 5.782 5.978 6.216 6.447 6.655 6.892 7.169 7.425 7.711 8.044 8.391 8.727 9.11 9.575 10.017 10.524 11.101 11.743 12.423 13.205 14.12 15.069 15.701 15.915 15.927 15.843 15.694 15.542 15.337 15.143 14.973 14.807 14.643 14.447 14.253 14.077 13.908 13.734 13.556 13.398 13.249 13.096 12.96 12.81 12.653 12.532 12.408 12.277 12.125 11.961 11.843 11.722 11.546 11.408 11.27 11.202 11.047 10.896 10.729 10.631 10.338 10.339 10.226 10.099 9.834 9.645 9.385 9.146 8.926 8.664 8.371 7.359 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_46_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_46_43.txt deleted file mode 100644 index 1a301487..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_46_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30124 ,KEBNE ,17023092,Wed Dec 22 07:30:38 CET,Wed Dec 22 08:54:03 CET,0.0 0.858 1.175 1.463 1.697 1.918 2.135 2.317 2.592 2.719 2.858 2.923 3.249 3.355 3.56 3.747 3.916 4.003 4.168 4.305 4.494 4.624 4.762 4.964 5.157 5.336 5.498 5.652 5.856 6.053 6.245 6.458 6.658 6.868 7.118 7.391 7.653 7.942 8.254 8.575 8.903 9.285 9.721 10.145 10.645 11.193 11.789 12.435 13.187 14.026 14.904 15.445 15.573 15.534 15.453 15.317 15.152 14.959 14.775 14.594 14.429 14.267 14.095 13.925 13.773 13.629 13.457 13.297 13.168 13.026 12.88 12.762 12.617 12.468 12.363 12.249 12.127 11.984 11.826 11.725 11.631 11.479 11.37 11.258 11.197 11.055 10.91 10.762 10.686 10.408 10.462 10.371 10.277 10.087 9.966 9.822 9.651 9.455 9.165 8.741 7.892 -2 ,21368 ,KEBNE ,17023093,Wed Dec 22 07:30:38 CET,Wed Dec 22 08:54:07 CET,0.0 0.953 1.295 1.542 1.735 1.921 2.117 2.289 2.567 2.69 2.806 2.812 3.123 3.224 3.417 3.598 3.772 3.855 4.018 4.174 4.377 4.509 4.636 4.83 5.022 5.208 5.389 5.551 5.746 5.934 6.117 6.341 6.551 6.753 6.998 7.26 7.513 7.793 8.093 8.413 8.754 9.132 9.561 9.999 10.503 11.061 11.673 12.301 13.005 13.79 14.649 15.185 15.306 15.276 15.184 15.055 14.905 14.753 14.607 14.415 14.241 14.084 13.926 13.77 13.617 13.466 13.302 13.152 13.024 12.885 12.736 12.616 12.484 12.334 12.215 12.089 11.961 11.824 11.66 11.548 11.441 11.283 11.175 11.06 11.0 10.871 10.733 10.581 10.498 10.216 10.248 10.147 10.041 9.8 9.665 9.529 9.363 9.149 8.919 8.621 7.6 -3 ,4845 ,KEBNE ,17023094,Wed Dec 22 07:30:38 CET,Wed Dec 22 08:52:36 CET,0.0 0.893 1.289 1.547 1.758 1.938 2.1 2.247 2.528 2.654 2.764 2.768 3.093 3.202 3.38 3.537 3.704 3.784 3.932 4.08 4.295 4.433 4.566 4.75 4.927 5.108 5.287 5.451 5.651 5.865 6.08 6.31 6.532 6.751 6.99 7.26 7.521 7.81 8.126 8.455 8.79 9.159 9.604 10.048 10.546 11.098 11.741 12.438 13.209 14.065 14.966 15.526 15.734 15.741 15.638 15.477 15.292 15.1 14.917 14.708 14.535 14.381 14.208 14.027 13.854 13.703 13.539 13.385 13.248 13.101 12.94 12.802 12.663 12.52 12.411 12.298 12.183 12.058 11.914 11.815 11.72 11.56 11.449 11.341 11.278 11.137 10.999 10.864 10.783 10.483 10.495 10.395 10.291 10.062 9.929 9.767 9.591 9.403 9.181 8.917 7.972 -4 ,6274 ,KEBNE ,17023095,Wed Dec 22 07:31:41 CET,Wed Dec 22 08:55:34 CET,0.0 0.962 1.346 1.577 1.771 1.955 2.12 2.269 2.519 2.639 2.756 2.749 3.059 3.157 3.364 3.551 3.71 3.789 3.951 4.101 4.307 4.446 4.577 4.761 4.935 5.112 5.281 5.442 5.663 5.865 6.048 6.266 6.477 6.678 6.917 7.199 7.465 7.747 8.056 8.384 8.709 9.086 9.54 9.998 10.512 11.072 11.738 12.453 13.22 14.076 14.975 15.484 15.625 15.632 15.562 15.433 15.271 15.089 14.914 14.729 14.557 14.385 14.217 14.057 13.901 13.757 13.6 13.449 13.327 13.199 13.055 12.924 12.784 12.644 12.534 12.418 12.296 12.174 12.047 11.958 11.867 11.713 11.598 11.481 11.421 11.283 11.13 10.978 10.908 10.629 10.618 10.49 10.36 10.078 9.905 9.719 9.514 9.279 8.965 8.453 7.101 -5 ,24342 ,KEBNE ,17023096,Wed Dec 22 07:33:50 CET,Wed Dec 22 08:52:27 CET,0.0 0.716 1.09 1.381 1.585 1.776 1.957 2.116 2.37 2.475 2.57 2.556 2.863 2.958 3.139 3.317 3.495 3.581 3.733 3.871 4.076 4.205 4.331 4.519 4.698 4.882 5.062 5.232 5.439 5.63 5.814 6.034 6.249 6.453 6.695 6.963 7.212 7.498 7.823 8.158 8.507 8.882 9.301 9.725 10.215 10.788 11.416 12.073 12.816 13.593 14.425 15.015 15.236 15.266 15.202 15.098 14.96 14.786 14.602 14.415 14.259 14.102 13.938 13.768 13.593 13.438 13.281 13.126 12.998 12.868 12.717 12.589 12.449 12.313 12.214 12.09 11.967 11.841 11.705 11.614 11.52 11.377 11.269 11.142 11.071 10.933 10.786 10.619 10.537 10.26 10.284 10.187 10.087 9.842 9.707 9.571 9.419 9.228 8.972 8.578 7.237 -6 ,14602 ,KEBNE ,17023097,Wed Dec 22 07:37:57 CET,Wed Dec 22 08:53:16 CET,0.0 1.102 1.604 1.945 2.206 2.436 2.622 2.783 3.123 3.273 3.401 3.407 3.707 3.803 4.007 4.196 4.377 4.465 4.624 4.784 5.026 5.2 5.362 5.554 5.732 5.904 6.077 6.259 6.503 6.737 6.96 7.212 7.424 7.616 7.849 8.111 8.362 8.64 8.943 9.262 9.587 9.962 10.385 10.788 11.248 11.761 12.367 13.029 13.769 14.617 15.499 16.01 16.136 16.129 16.062 15.941 15.816 15.671 15.503 15.32 15.157 15.0 14.847 14.692 14.539 14.398 14.249 14.111 13.979 13.836 13.679 13.535 13.374 13.206 13.093 12.988 12.872 12.738 12.603 12.506 12.398 12.238 12.125 12.011 11.953 11.824 11.671 11.504 11.413 11.109 11.113 11.011 10.899 10.629 10.461 10.318 10.195 10.011 9.75 9.363 8.506 -7 ,13753 ,KEBNE ,17023098,Wed Dec 22 07:38:54 CET,Wed Dec 22 09:02:15 CET,0.0 0.759 1.052 1.245 1.422 1.626 1.807 1.961 2.244 2.364 2.476 2.486 2.795 2.887 3.071 3.255 3.426 3.507 3.671 3.818 4.011 4.139 4.264 4.463 4.666 4.84 4.997 5.149 5.34 5.534 5.734 5.963 6.178 6.398 6.644 6.913 7.188 7.494 7.8 8.122 8.454 8.82 9.263 9.695 10.189 10.728 11.331 12.035 12.825 13.671 14.546 15.056 15.236 15.261 15.205 15.068 14.891 14.736 14.602 14.426 14.234 14.069 13.922 13.775 13.631 13.486 13.318 13.164 13.03 12.885 12.729 12.59 12.437 12.284 12.171 12.05 11.921 11.787 11.659 11.566 11.458 11.295 11.186 11.075 11.019 10.878 10.728 10.583 10.506 10.219 10.227 10.12 9.993 9.719 9.57 9.413 9.23 9.009 8.757 8.373 7.497 -8 ,15897 ,KEBNE ,17023099,Wed Dec 22 07:38:54 CET,Wed Dec 22 09:00:55 CET,0.0 0.758 1.11 1.375 1.59 1.769 1.937 2.094 2.346 2.463 2.589 2.617 2.937 3.037 3.218 3.389 3.54 3.607 3.752 3.9 4.116 4.253 4.383 4.59 4.779 4.948 5.117 5.283 5.503 5.699 5.879 6.105 6.327 6.543 6.787 7.052 7.315 7.611 7.912 8.212 8.53 8.902 9.338 9.779 10.277 10.825 11.45 12.118 12.863 13.698 14.581 15.136 15.332 15.353 15.294 15.166 15.004 14.826 14.671 14.507 14.334 14.152 13.974 13.813 13.656 13.507 13.346 13.193 13.061 12.931 12.793 12.67 12.544 12.415 12.307 12.194 12.075 11.943 11.805 11.711 11.613 11.456 11.347 11.207 11.129 10.989 10.846 10.703 10.635 10.351 10.332 10.201 10.048 9.718 9.565 9.399 9.194 8.948 8.637 8.253 7.538 -9 ,29839 ,KEBNE ,17023100,Wed Dec 22 07:38:54 CET,Wed Dec 22 09:02:11 CET,0.0 1.385 1.81 2.117 2.322 2.488 2.635 2.773 3.039 3.164 3.286 3.311 3.627 3.737 3.928 4.096 4.265 4.347 4.507 4.657 4.859 4.991 5.133 5.33 5.517 5.702 5.874 6.037 6.232 6.416 6.611 6.859 7.076 7.284 7.529 7.795 8.053 8.327 8.621 8.952 9.305 9.689 10.136 10.57 11.067 11.642 12.275 12.927 13.675 14.509 15.367 15.904 16.077 16.074 15.988 15.846 15.693 15.541 15.354 15.142 14.961 14.792 14.628 14.451 14.272 14.111 13.925 13.756 13.618 13.472 13.326 13.199 13.053 12.892 12.781 12.672 12.547 12.419 12.279 12.18 12.077 11.906 11.793 11.668 11.602 11.471 11.338 11.207 11.135 10.849 10.885 10.777 10.662 10.423 10.266 10.099 9.933 9.715 9.463 9.152 8.381 -10 ,26003 ,KEBNE ,17023101,Wed Dec 22 07:38:54 CET,Wed Dec 22 09:00:37 CET,0.0 1.006 1.454 1.833 2.121 2.34 2.536 2.724 3.03 3.152 3.265 3.258 3.566 3.655 3.826 4.007 4.177 4.258 4.415 4.565 4.784 4.917 5.041 5.227 5.414 5.591 5.751 5.899 6.098 6.295 6.475 6.697 6.92 7.139 7.382 7.658 7.936 8.241 8.558 8.883 9.212 9.582 10.028 10.48 11.003 11.576 12.195 12.868 13.611 14.427 15.309 15.812 15.963 15.976 15.907 15.766 15.613 15.461 15.288 15.098 14.931 14.761 14.592 14.42 14.248 14.098 13.951 13.825 13.699 13.553 13.405 13.285 13.139 12.951 12.813 12.696 12.576 12.433 12.283 12.186 12.084 11.919 11.799 11.673 11.608 11.474 11.324 11.158 11.072 10.782 10.804 10.711 10.62 10.387 10.246 10.089 9.911 9.716 9.465 9.116 8.22 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_47_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_47_43.txt deleted file mode 100644 index 944a59e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_47_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15316 ,KEBNE ,17023102,Wed Dec 22 07:39:56 CET,Wed Dec 22 09:01:31 CET,0.0 0.987 1.403 1.747 2.038 2.295 2.507 2.723 3.136 3.306 3.465 3.526 3.927 4.077 4.361 4.625 4.881 5.009 5.265 5.516 5.87 6.095 6.314 6.631 6.927 7.218 7.501 7.773 8.128 8.486 8.832 9.258 9.683 10.08 10.544 11.088 11.626 12.206 12.825 13.51 14.271 15.137 16.107 17.103 18.301 19.656 21.273 23.148 25.42 28.225 31.849 35.004 36.941 38.311 39.286 39.945 40.407 40.779 41.017 41.198 41.324 41.401 41.443 41.466 41.504 41.539 41.571 41.588 41.595 41.592 41.588 41.595 41.587 41.565 41.537 41.506 41.484 41.452 41.404 41.365 41.316 41.234 41.189 41.139 41.105 41.016 40.918 40.803 40.734 40.474 40.568 40.513 40.447 40.282 40.19 40.087 39.971 39.831 39.582 39.281 38.817 -2 ,6294 ,KEBNE ,17023103,Wed Dec 22 07:39:56 CET,Wed Dec 22 09:01:26 CET,0.0 0.86 1.294 1.674 2.007 2.273 2.505 2.723 3.112 3.276 3.424 3.48 3.876 4.026 4.305 4.566 4.817 4.952 5.227 5.477 5.847 6.093 6.318 6.64 6.949 7.242 7.515 7.778 8.138 8.489 8.843 9.28 9.699 10.116 10.603 11.142 11.654 12.223 12.849 13.525 14.237 15.054 16.027 17.024 18.232 19.621 21.26 23.139 25.395 28.215 31.859 35.022 36.983 38.323 39.222 39.877 40.362 40.711 40.958 41.165 41.301 41.382 41.441 41.482 41.5 41.511 41.499 41.462 41.428 41.38 41.326 41.286 41.233 41.157 41.083 41.01 40.94 40.85 40.741 40.663 40.583 40.441 40.333 40.234 40.185 40.069 39.964 39.887 39.84 39.582 39.666 39.589 39.517 39.325 39.206 39.077 38.912 38.733 38.556 38.342 37.772 -3 ,15773 ,KEBNE ,17023104,Wed Dec 22 07:40:00 CET,Wed Dec 22 08:54:48 CET,0.0 0.929 1.283 1.539 1.828 2.082 2.31 2.508 2.847 3.006 3.166 3.251 3.647 3.786 4.05 4.308 4.577 4.714 4.967 5.197 5.532 5.755 5.967 6.259 6.571 6.905 7.214 7.493 7.848 8.205 8.556 8.971 9.368 9.758 10.229 10.762 11.262 11.825 12.439 13.101 13.822 14.66 15.662 16.692 17.876 19.213 20.839 22.738 25.03 27.84 31.513 34.756 36.734 38.079 39.01 39.661 40.103 40.441 40.672 40.847 40.976 41.056 41.101 41.133 41.164 41.16 41.117 41.08 41.036 40.978 40.896 40.824 40.766 40.697 40.637 40.569 40.488 40.403 40.311 40.24 40.161 40.029 39.926 39.816 39.763 39.649 39.536 39.415 39.346 39.076 39.131 39.024 38.91 38.68 38.543 38.382 38.216 38.024 37.734 37.33 36.267 -4 ,23406 ,KEBNE ,17023105,Wed Dec 22 07:39:57 CET,Wed Dec 22 08:54:58 CET,0.0 1.256 1.647 1.955 2.251 2.535 2.795 3.021 3.431 3.616 3.8 3.915 4.316 4.476 4.794 5.081 5.351 5.486 5.75 6.012 6.396 6.644 6.887 7.242 7.593 7.902 8.179 8.456 8.815 9.167 9.526 9.963 10.374 10.773 11.25 11.803 12.338 12.928 13.574 14.241 14.948 15.775 16.766 17.788 18.996 20.373 21.993 23.877 26.178 28.945 32.517 35.731 37.709 39.072 40.043 40.715 41.185 41.544 41.795 42.007 42.146 42.241 42.306 42.333 42.341 42.32 42.277 42.248 42.222 42.174 42.083 41.991 41.913 41.822 41.746 41.677 41.596 41.507 41.402 41.318 41.226 41.081 40.976 40.873 40.817 40.697 40.581 40.446 40.376 40.1 40.14 40.049 39.937 39.676 39.532 39.38 39.206 39.003 38.796 38.532 37.713 -5 ,23471 ,KEBNE ,17023106,Wed Dec 22 07:40:00 CET,Wed Dec 22 08:54:55 CET,0.0 0.706 1.085 1.38 1.647 1.876 2.09 2.328 2.779 2.975 3.156 3.282 3.691 3.841 4.16 4.456 4.726 4.868 5.145 5.414 5.79 6.033 6.27 6.603 6.931 7.252 7.551 7.823 8.188 8.55 8.889 9.304 9.72 10.127 10.595 11.128 11.647 12.204 12.832 13.52 14.236 15.082 16.077 17.091 18.312 19.691 21.318 23.183 25.444 28.267 31.969 35.254 37.224 38.575 39.533 40.244 40.715 41.028 41.26 41.428 41.548 41.603 41.623 41.62 41.586 41.566 41.555 41.539 41.51 41.463 41.399 41.343 41.281 41.205 41.143 41.076 40.989 40.897 40.799 40.727 40.649 40.518 40.417 40.309 40.246 40.116 39.978 39.826 39.757 39.484 39.529 39.435 39.331 39.099 38.965 38.83 38.679 38.476 38.266 37.969 36.981 -6 ,32075 ,KEBNE ,17023107,Wed Dec 22 07:41:59 CET,Wed Dec 22 09:03:13 CET,0.0 1.414 1.87 2.198 2.461 2.725 3.0 3.24 3.65 3.838 4.023 4.115 4.5 4.651 4.966 5.275 5.572 5.711 5.966 6.207 6.561 6.808 7.056 7.397 7.72 8.047 8.353 8.642 9.021 9.392 9.754 10.184 10.594 10.99 11.464 12.0 12.529 13.138 13.788 14.457 15.166 16.002 16.994 18.029 19.28 20.679 22.288 24.191 26.537 29.357 32.935 36.115 38.079 39.376 40.286 40.957 41.449 41.842 42.092 42.27 42.407 42.499 42.568 42.619 42.646 42.651 42.634 42.617 42.613 42.607 42.596 42.583 42.563 42.539 42.52 42.491 42.455 42.416 42.36 42.312 42.266 42.198 42.147 42.082 42.039 41.955 41.869 41.772 41.723 41.467 41.553 41.454 41.335 41.113 40.998 40.867 40.708 40.477 40.195 39.893 39.201 -7 ,5109 ,KEBNE ,17023108,Wed Dec 22 07:43:00 CET,Wed Dec 22 09:06:01 CET,0.0 0.842 1.195 1.48 1.717 1.933 2.161 2.381 2.763 2.941 3.098 3.169 3.571 3.721 4.031 4.344 4.646 4.783 5.044 5.303 5.645 5.859 6.065 6.352 6.631 6.896 7.164 7.434 7.794 8.158 8.501 8.896 9.291 9.69 10.147 10.664 11.165 11.702 12.289 12.941 13.639 14.442 15.399 16.382 17.557 18.885 20.459 22.298 24.539 27.337 30.978 34.23 36.282 37.705 38.727 39.465 40.011 40.423 40.723 40.966 41.134 41.28 41.41 41.52 41.6 41.661 41.701 41.717 41.731 41.746 41.744 41.734 41.71 41.669 41.631 41.585 41.533 41.489 41.434 41.389 41.343 41.253 41.183 41.105 41.068 40.985 40.886 40.759 40.678 40.4 40.473 40.4 40.33 40.204 40.111 39.996 39.879 39.701 39.43 39.056 38.167 -8 ,28486 ,KEBNE ,17023109,Wed Dec 22 07:45:03 CET,Wed Dec 22 09:07:51 CET,0.0 0.599 0.955 1.298 1.584 1.815 2.046 2.285 2.718 2.907 3.063 3.103 3.497 3.671 4.006 4.289 4.533 4.65 4.9 5.172 5.559 5.81 6.056 6.382 6.684 6.989 7.306 7.616 8.002 8.383 8.749 9.176 9.596 10.015 10.525 11.089 11.615 12.203 12.847 13.544 14.294 15.174 16.233 17.293 18.534 19.928 21.57 23.47 25.742 28.564 32.125 35.252 37.218 38.54 39.454 40.147 40.634 40.966 41.217 41.426 41.578 41.679 41.738 41.788 41.82 41.818 41.805 41.772 41.723 41.674 41.622 41.573 41.509 41.419 41.342 41.277 41.211 41.11 41.001 40.934 40.856 40.712 40.602 40.499 40.444 40.325 40.175 40.019 39.945 39.659 39.697 39.6 39.485 39.226 39.059 38.883 38.71 38.487 38.214 37.817 37.092 -9 ,26794 ,KEBNE ,17023110,Wed Dec 22 07:45:03 CET,Wed Dec 22 09:06:31 CET,0.0 0.954 1.384 1.717 2.002 2.257 2.506 2.73 3.1 3.261 3.424 3.507 3.916 4.08 4.387 4.683 4.955 5.092 5.356 5.614 5.999 6.237 6.477 6.827 7.169 7.505 7.812 8.107 8.504 8.9 9.28 9.731 10.156 10.566 11.049 11.595 12.132 12.725 13.35 14.025 14.761 15.603 16.6 17.628 18.856 20.242 21.859 23.714 25.948 28.678 32.231 35.479 37.476 38.806 39.743 40.399 40.85 41.204 41.465 41.654 41.786 41.896 41.963 41.996 42.016 42.001 41.955 41.915 41.872 41.827 41.769 41.702 41.645 41.591 41.536 41.474 41.406 41.327 41.231 41.142 41.051 40.918 40.821 40.723 40.676 40.561 40.439 40.321 40.245 39.959 39.992 39.899 39.797 39.584 39.457 39.315 39.161 38.982 38.746 38.456 37.698 -10 ,20094 ,KEBNE ,17023111,Wed Dec 22 07:45:05 CET,Wed Dec 22 09:03:28 CET,0.0 0.834 1.231 1.523 1.771 1.999 2.223 2.447 2.862 3.032 3.171 3.187 3.567 3.713 3.999 4.268 4.533 4.657 4.899 5.131 5.468 5.682 5.892 6.2 6.495 6.799 7.099 7.388 7.762 8.113 8.447 8.854 9.265 9.69 10.18 10.733 11.263 11.831 12.459 13.137 13.878 14.724 15.704 16.706 17.91 19.302 20.956 22.857 25.137 27.958 31.611 34.807 36.806 38.131 39.057 39.735 40.204 40.563 40.815 40.994 41.101 41.153 41.177 41.21 41.226 41.201 41.168 41.131 41.081 41.022 40.947 40.877 40.804 40.712 40.636 40.552 40.453 40.352 40.247 40.172 40.088 39.927 39.821 39.715 39.654 39.538 39.42 39.288 39.219 38.932 38.93 38.834 38.742 38.564 38.473 38.384 38.271 38.127 37.961 37.706 36.603 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_48_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_48_42.txt deleted file mode 100644 index 960468a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_48_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6068 ,KEBNE ,17023112,Wed Dec 22 07:46:04 CET,Wed Dec 22 09:09:08 CET,0.0 1.719 2.222 2.551 2.803 3.057 3.296 3.493 3.883 4.056 4.201 4.253 4.58 4.697 4.923 5.121 5.307 5.397 5.571 5.743 6.002 6.171 6.329 6.558 6.76 6.95 7.129 7.294 7.523 7.747 7.95 8.184 8.417 8.653 8.92 9.193 9.446 9.748 10.093 10.459 10.82 11.197 11.625 12.045 12.508 13.014 13.582 14.127 14.655 15.256 15.79 15.811 15.583 15.231 14.829 14.409 14.02 13.649 13.303 12.937 12.612 12.317 12.032 11.752 11.471 11.204 10.93 10.69 10.468 10.234 9.986 9.78 9.567 9.34 9.157 8.966 8.783 8.586 8.374 8.23 8.063 7.791 7.607 7.416 7.323 7.132 6.94 6.746 6.633 6.305 6.246 6.112 5.964 5.618 5.424 5.209 4.96 4.634 4.207 3.606 2.148 -2 ,3754 ,KEBNE ,17023113,Wed Dec 22 07:47:06 CET,Wed Dec 22 09:09:43 CET,0.0 1.662 2.091 2.425 2.7 2.947 3.168 3.371 3.732 3.909 4.068 4.155 4.499 4.613 4.824 5.033 5.231 5.326 5.51 5.691 5.939 6.096 6.249 6.46 6.657 6.851 7.046 7.237 7.49 7.723 7.931 8.185 8.418 8.632 8.894 9.197 9.489 9.805 10.115 10.429 10.757 11.124 11.537 11.945 12.429 12.944 13.496 14.065 14.665 15.277 15.822 15.97 15.828 15.572 15.244 14.896 14.583 14.256 13.944 13.631 13.344 13.057 12.784 12.54 12.31 12.094 11.85 11.627 11.437 11.234 11.016 10.844 10.66 10.449 10.282 10.114 9.946 9.767 9.564 9.425 9.283 9.054 8.902 8.746 8.665 8.492 8.293 8.083 7.978 7.662 7.616 7.493 7.35 7.018 6.831 6.636 6.438 6.159 5.768 5.26 4.22 -3 ,16817 ,KEBNE ,17023114,Wed Dec 22 07:47:06 CET,Wed Dec 22 09:10:07 CET,0.0 1.475 1.908 2.216 2.453 2.65 2.833 2.989 3.272 3.43 3.581 3.635 3.96 4.074 4.3 4.493 4.667 4.757 4.927 5.078 5.297 5.455 5.628 5.876 6.091 6.288 6.481 6.674 6.922 7.165 7.403 7.683 7.947 8.189 8.474 8.803 9.113 9.445 9.774 10.119 10.506 10.922 11.4 11.871 12.376 12.914 13.491 14.099 14.73 15.331 15.872 16.016 15.81 15.512 15.195 14.842 14.463 14.085 13.744 13.401 13.112 12.84 12.563 12.302 12.071 11.846 11.594 11.368 11.165 10.956 10.747 10.581 10.407 10.214 10.057 9.891 9.705 9.511 9.323 9.192 9.055 8.839 8.687 8.51 8.416 8.238 8.054 7.848 7.718 7.372 7.29 7.134 6.982 6.655 6.455 6.21 5.938 5.638 5.295 4.812 3.168 -4 ,20088 ,KEBNE ,17023115,Wed Dec 22 07:47:06 CET,Wed Dec 22 09:08:22 CET,0.0 2.163 2.812 3.22 3.502 3.712 3.912 4.115 4.468 4.621 4.76 4.798 5.119 5.223 5.414 5.594 5.767 5.853 6.028 6.195 6.425 6.572 6.709 6.907 7.105 7.298 7.479 7.665 7.898 8.104 8.319 8.576 8.804 9.027 9.283 9.572 9.841 10.123 10.44 10.778 11.118 11.482 11.89 12.308 12.778 13.301 13.876 14.432 15.032 15.623 16.093 16.235 16.071 15.78 15.459 15.125 14.815 14.516 14.207 13.875 13.591 13.324 13.052 12.801 12.558 12.322 12.072 11.848 11.658 11.448 11.225 11.048 10.862 10.672 10.519 10.351 10.168 9.976 9.779 9.641 9.502 9.282 9.12 8.948 8.86 8.68 8.484 8.289 8.188 7.876 7.83 7.696 7.554 7.238 7.059 6.873 6.654 6.409 6.094 5.697 4.601 -5 ,27041 ,KEBNE ,17023116,Wed Dec 22 07:49:13 CET,Wed Dec 22 09:04:04 CET,0.0 1.23 1.569 1.845 2.056 2.272 2.494 2.688 3.024 3.179 3.332 3.394 3.722 3.841 4.053 4.261 4.47 4.562 4.745 4.922 5.156 5.301 5.436 5.634 5.818 6.006 6.201 6.372 6.58 6.78 6.966 7.211 7.447 7.67 7.933 8.225 8.498 8.774 9.059 9.365 9.702 10.072 10.48 10.905 11.393 11.921 12.473 13.022 13.614 14.219 14.74 14.832 14.646 14.385 14.045 13.67 13.333 13.013 12.723 12.41 12.116 11.834 11.556 11.29 11.028 10.79 10.55 10.323 10.131 9.943 9.736 9.566 9.382 9.166 9.001 8.841 8.671 8.482 8.292 8.165 8.033 7.801 7.619 7.44 7.351 7.165 6.978 6.781 6.67 6.354 6.298 6.165 6.037 5.733 5.543 5.333 5.088 4.813 4.475 4.002 2.437 -6 ,31256 ,KEBNE ,17023117,Wed Dec 22 07:51:11 CET,Wed Dec 22 09:12:32 CET,0.0 2.297 2.882 3.246 3.541 3.765 3.945 4.125 4.439 4.572 4.697 4.721 5.035 5.141 5.367 5.583 5.774 5.863 6.029 6.187 6.41 6.562 6.717 6.936 7.13 7.312 7.496 7.672 7.884 8.095 8.295 8.543 8.786 9.008 9.268 9.549 9.817 10.108 10.416 10.752 11.101 11.487 11.942 12.378 12.831 13.326 13.886 14.477 15.13 15.84 16.42 16.483 16.336 16.089 15.748 15.388 15.05 14.726 14.436 14.141 13.866 13.608 13.357 13.097 12.842 12.624 12.395 12.164 11.976 11.787 11.563 11.379 11.203 11.014 10.854 10.682 10.512 10.338 10.15 10.012 9.864 9.627 9.457 9.285 9.202 9.024 8.831 8.62 8.51 8.201 8.131 7.997 7.865 7.561 7.405 7.238 7.02 6.714 6.341 5.796 4.59 -7 ,1637 ,KEBNE ,17023118,Wed Dec 22 07:52:13 CET,Wed Dec 22 09:13:36 CET,0.0 1.303 1.753 2.057 2.326 2.561 2.777 2.994 3.356 3.522 3.675 3.728 4.063 4.196 4.436 4.638 4.828 4.926 5.122 5.307 5.557 5.715 5.875 6.12 6.35 6.546 6.725 6.907 7.158 7.387 7.606 7.864 8.105 8.345 8.607 8.894 9.168 9.459 9.786 10.138 10.49 10.888 11.36 11.812 12.308 12.818 13.352 13.9 14.483 15.105 15.679 15.871 15.719 15.381 15.032 14.686 14.347 14.025 13.723 13.404 13.114 12.861 12.62 12.368 12.121 11.888 11.645 11.423 11.225 11.02 10.805 10.621 10.421 10.21 10.05 9.891 9.721 9.54 9.351 9.214 9.071 8.843 8.683 8.508 8.415 8.228 8.024 7.811 7.707 7.398 7.359 7.224 7.069 6.727 6.561 6.379 6.161 5.918 5.639 5.235 3.91 -8 ,25393 ,KEBNE ,17023119,Wed Dec 22 07:52:13 CET,Wed Dec 22 09:13:25 CET,0.0 1.225 1.712 2.039 2.274 2.476 2.654 2.8 3.065 3.201 3.339 3.389 3.713 3.84 4.082 4.323 4.549 4.653 4.84 5.015 5.264 5.417 5.562 5.772 5.967 6.157 6.339 6.509 6.739 6.956 7.165 7.416 7.657 7.89 8.157 8.457 8.726 9.017 9.327 9.648 9.977 10.371 10.841 11.274 11.736 12.226 12.766 13.349 13.999 14.625 15.132 15.192 14.962 14.678 14.387 14.031 13.668 13.339 13.028 12.718 12.451 12.185 11.916 11.653 11.403 11.176 10.951 10.745 10.553 10.342 10.124 9.953 9.767 9.569 9.418 9.257 9.085 8.895 8.698 8.564 8.424 8.198 8.029 7.854 7.765 7.581 7.395 7.197 7.083 6.755 6.725 6.606 6.467 6.111 5.919 5.738 5.53 5.286 5.021 4.632 3.397 -9 ,1271 ,KEBNE ,17023120,Wed Dec 22 07:53:14 CET,Wed Dec 22 09:14:59 CET,0.0 1.638 2.008 2.29 2.545 2.736 2.916 3.089 3.366 3.498 3.633 3.675 3.99 4.106 4.347 4.555 4.75 4.84 5.005 5.175 5.4 5.54 5.689 5.906 6.101 6.285 6.476 6.661 6.881 7.099 7.32 7.574 7.824 8.062 8.328 8.624 8.889 9.16 9.457 9.78 10.115 10.494 10.927 11.341 11.811 12.325 12.911 13.534 14.206 14.87 15.381 15.47 15.229 14.922 14.606 14.277 13.954 13.636 13.341 13.029 12.749 12.497 12.252 12.0 11.766 11.56 11.323 11.092 10.892 10.68 10.451 10.274 10.091 9.897 9.748 9.585 9.41 9.222 9.032 8.896 8.755 8.549 8.4 8.235 8.153 7.985 7.782 7.559 7.445 7.123 7.071 6.938 6.792 6.464 6.281 6.08 5.872 5.634 5.298 4.896 4.083 -10 ,199 ,KEBNE ,17023121,Wed Dec 22 07:53:14 CET,Wed Dec 22 09:14:44 CET,0.0 1.804 2.293 2.629 2.852 3.06 3.261 3.448 3.78 3.935 4.096 4.177 4.514 4.641 4.88 5.105 5.312 5.413 5.618 5.818 6.084 6.24 6.39 6.615 6.825 7.017 7.201 7.378 7.608 7.822 8.019 8.257 8.5 8.73 8.995 9.284 9.547 9.845 10.168 10.5 10.842 11.226 11.651 12.053 12.505 12.993 13.551 14.178 14.828 15.424 15.938 16.052 15.85 15.568 15.246 14.89 14.546 14.214 13.912 13.616 13.327 13.05 12.791 12.538 12.286 12.047 11.802 11.582 11.391 11.188 10.973 10.794 10.605 10.411 10.258 10.095 9.92 9.724 9.511 9.373 9.232 9.006 8.851 8.684 8.599 8.417 8.224 8.017 7.895 7.57 7.505 7.371 7.239 6.924 6.735 6.54 6.313 6.04 5.691 5.105 3.662 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_49_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_49_50.txt deleted file mode 100644 index 2b2d0fdf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_49_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10825 ,KEBNE ,17023122,Wed Dec 22 07:53:15 CET,Wed Dec 22 09:14:44 CET,0.0 0.519 0.771 0.99 1.18 1.365 1.535 1.675 1.913 2.026 2.133 2.121 2.415 2.511 2.69 2.86 3.031 3.119 3.29 3.456 3.686 3.834 3.975 4.175 4.365 4.544 4.721 4.893 5.115 5.324 5.523 5.759 5.985 6.2 6.441 6.708 6.966 7.243 7.533 7.83 8.137 8.481 8.862 9.235 9.658 10.08 10.525 10.972 11.408 11.757 11.917 11.706 11.298 10.87 10.469 10.06 9.673 9.305 8.963 8.596 8.273 7.984 7.713 7.476 7.254 7.032 6.787 6.566 6.372 6.166 5.955 5.78 5.597 5.403 5.253 5.094 4.925 4.756 4.596 4.492 4.386 4.221 4.098 3.97 3.906 3.773 3.63 3.471 3.391 3.118 3.159 3.06 2.959 2.759 2.643 2.525 2.405 2.272 2.117 1.941 1.68 -2 ,15619 ,KEBNE ,17023123,Wed Dec 22 07:53:18 CET,Wed Dec 22 09:07:57 CET,0.0 0.587 0.824 1.018 1.206 1.378 1.527 1.671 1.947 2.074 2.187 2.181 2.466 2.555 2.725 2.897 3.063 3.139 3.298 3.444 3.642 3.78 3.918 4.128 4.325 4.503 4.672 4.855 5.09 5.301 5.496 5.71 5.92 6.131 6.375 6.63 6.872 7.141 7.436 7.753 8.064 8.405 8.793 9.166 9.567 9.968 10.405 10.858 11.281 11.646 11.815 11.608 11.264 10.838 10.408 9.99 9.583 9.185 8.816 8.448 8.144 7.864 7.579 7.316 7.077 6.845 6.601 6.383 6.189 5.997 5.796 5.617 5.425 5.217 5.056 4.887 4.714 4.535 4.351 4.234 4.121 3.942 3.818 3.69 3.626 3.498 3.357 3.202 3.123 2.841 2.882 2.802 2.715 2.522 2.417 2.299 2.163 2.026 1.869 1.631 1.141 -3 ,2150 ,KEBNE ,17023124,Wed Dec 22 07:54:15 CET,Wed Dec 22 09:17:01 CET,0.0 0.562 0.811 1.037 1.204 1.335 1.472 1.608 1.851 1.953 2.063 2.089 2.395 2.509 2.722 2.915 3.099 3.192 3.361 3.523 3.768 3.912 4.051 4.24 4.423 4.613 4.785 4.952 5.172 5.37 5.576 5.817 6.022 6.231 6.478 6.754 7.008 7.267 7.551 7.853 8.163 8.504 8.896 9.282 9.695 10.12 10.568 11.018 11.466 11.809 11.99 11.826 11.432 10.995 10.561 10.142 9.778 9.409 9.068 8.719 8.412 8.126 7.842 7.586 7.334 7.092 6.841 6.62 6.444 6.277 6.095 5.941 5.779 5.602 5.472 5.343 5.203 5.047 4.893 4.792 4.683 4.517 4.401 4.277 4.209 4.075 3.939 3.775 3.692 3.414 3.445 3.354 3.252 3.042 2.928 2.8 2.671 2.524 2.378 2.214 1.951 -4 ,24290 ,KEBNE ,17023125,Wed Dec 22 07:54:15 CET,Wed Dec 22 09:15:24 CET,0.0 0.617 0.874 1.098 1.293 1.426 1.557 1.681 1.878 1.969 2.066 2.067 2.358 2.442 2.599 2.758 2.906 2.97 3.103 3.254 3.471 3.6 3.73 3.915 4.098 4.278 4.448 4.61 4.797 4.975 5.164 5.38 5.578 5.79 6.042 6.316 6.579 6.857 7.136 7.423 7.728 8.058 8.417 8.775 9.172 9.584 10.031 10.468 10.877 11.244 11.441 11.228 10.836 10.383 9.901 9.451 9.072 8.712 8.388 8.037 7.72 7.431 7.161 6.912 6.664 6.422 6.172 5.953 5.758 5.553 5.337 5.156 4.974 4.791 4.641 4.494 4.337 4.157 3.974 3.841 3.702 3.498 3.365 3.214 3.132 2.992 2.852 2.711 2.639 2.361 2.391 2.302 2.208 2.021 1.916 1.808 1.691 1.564 1.413 1.221 0.936 -5 ,21978 ,KEBNE ,17023126,Wed Dec 22 07:55:21 CET,Wed Dec 22 09:09:48 CET,0.0 0.485 0.763 0.965 1.129 1.286 1.427 1.568 1.826 1.92 2.013 2.012 2.307 2.399 2.566 2.736 2.901 2.978 3.138 3.282 3.481 3.609 3.731 3.906 4.064 4.222 4.375 4.518 4.706 4.895 5.088 5.32 5.538 5.75 5.992 6.251 6.488 6.755 7.061 7.376 7.679 8.009 8.377 8.751 9.191 9.618 10.059 10.494 10.899 11.243 11.374 11.144 10.776 10.337 9.909 9.491 9.072 8.665 8.297 7.946 7.654 7.388 7.128 6.863 6.61 6.382 6.121 5.894 5.708 5.506 5.293 5.112 4.924 4.75 4.624 4.49 4.351 4.203 4.055 3.949 3.83 3.652 3.53 3.41 3.35 3.219 3.071 2.916 2.84 2.557 2.566 2.471 2.388 2.195 2.081 1.959 1.823 1.687 1.526 1.317 0.913 -6 ,32596 ,KEBNE ,17023127,Wed Dec 22 07:56:18 CET,Wed Dec 22 09:17:29 CET,0.0 0.573 0.866 1.121 1.334 1.506 1.662 1.796 2.034 2.149 2.259 2.271 2.565 2.669 2.886 3.067 3.241 3.329 3.487 3.637 3.856 4.0 4.144 4.345 4.541 4.741 4.928 5.099 5.32 5.525 5.715 5.948 6.172 6.394 6.649 6.917 7.16 7.434 7.724 8.031 8.336 8.664 9.031 9.385 9.775 10.16 10.58 11.027 11.479 11.917 12.149 11.954 11.576 11.145 10.734 10.322 9.939 9.566 9.224 8.858 8.542 8.275 8.015 7.757 7.502 7.261 7.021 6.806 6.621 6.439 6.25 6.093 5.929 5.759 5.629 5.497 5.367 5.223 5.068 4.963 4.849 4.674 4.542 4.403 4.337 4.21 4.078 3.937 3.86 3.576 3.609 3.525 3.434 3.247 3.147 3.035 2.901 2.757 2.591 2.41 2.107 -7 ,15269 ,KEBNE ,17023128,Wed Dec 22 07:56:18 CET,Wed Dec 22 09:17:29 CET,0.0 0.565 0.871 1.097 1.27 1.449 1.615 1.767 2.048 2.176 2.304 2.327 2.625 2.72 2.893 3.054 3.197 3.267 3.415 3.559 3.753 3.88 4.006 4.181 4.361 4.535 4.683 4.838 5.041 5.22 5.392 5.6 5.804 6.001 6.233 6.509 6.782 7.063 7.342 7.635 7.922 8.221 8.575 8.913 9.291 9.702 10.121 10.535 10.957 11.339 11.545 11.355 10.968 10.563 10.156 9.749 9.374 9.008 8.674 8.318 8.002 7.724 7.462 7.208 6.973 6.76 6.514 6.294 6.1 5.889 5.665 5.477 5.29 5.101 4.941 4.767 4.584 4.407 4.234 4.108 3.977 3.763 3.62 3.493 3.427 3.283 3.143 2.99 2.907 2.627 2.652 2.559 2.462 2.257 2.148 2.022 1.88 1.745 1.61 1.445 1.051 -8 ,3711 ,KEBNE ,17023129,Wed Dec 22 07:56:18 CET,Wed Dec 22 09:17:28 CET,0.0 0.589 0.824 1.039 1.225 1.377 1.51 1.645 1.903 2.016 2.124 2.127 2.41 2.492 2.645 2.784 2.927 2.993 3.115 3.244 3.437 3.552 3.662 3.824 3.979 4.129 4.272 4.399 4.572 4.74 4.896 5.096 5.285 5.48 5.719 5.963 6.187 6.432 6.695 6.968 7.248 7.563 7.938 8.315 8.721 9.127 9.525 9.916 10.307 10.616 10.717 10.535 10.179 9.763 9.386 8.973 8.564 8.199 7.896 7.579 7.3 7.065 6.822 6.578 6.351 6.137 5.907 5.711 5.533 5.345 5.156 4.995 4.818 4.638 4.51 4.375 4.228 4.076 3.909 3.795 3.685 3.502 3.372 3.242 3.169 3.011 2.855 2.705 2.635 2.362 2.389 2.304 2.226 2.054 1.962 1.865 1.763 1.644 1.481 1.287 0.923 -9 ,1463 ,KEBNE ,17023130,Wed Dec 22 07:56:22 CET,Wed Dec 22 09:12:59 CET,0.0 0.658 0.94 1.181 1.368 1.514 1.651 1.785 2.041 2.15 2.259 2.274 2.572 2.665 2.849 3.022 3.181 3.26 3.406 3.553 3.765 3.891 4.012 4.191 4.355 4.501 4.66 4.813 5.008 5.199 5.385 5.619 5.837 6.039 6.277 6.543 6.793 7.057 7.334 7.615 7.908 8.236 8.604 8.963 9.364 9.798 10.242 10.679 11.14 11.546 11.72 11.543 11.155 10.677 10.223 9.792 9.413 9.061 8.721 8.362 8.046 7.762 7.49 7.235 6.988 6.754 6.511 6.292 6.097 5.893 5.681 5.501 5.307 5.103 4.964 4.83 4.683 4.531 4.37 4.26 4.152 3.995 3.89 3.775 3.709 3.569 3.417 3.265 3.193 2.913 2.935 2.853 2.773 2.592 2.487 2.378 2.253 2.114 1.976 1.822 1.484 -10 ,22955 ,KEBNE ,17023131,Wed Dec 22 07:57:19 CET,Wed Dec 22 09:19:58 CET,0.0 0.644 0.84 1.033 1.181 1.3 1.423 1.533 1.743 1.845 1.954 1.988 2.293 2.403 2.61 2.794 2.974 3.058 3.231 3.398 3.598 3.711 3.819 3.984 4.144 4.296 4.439 4.582 4.79 4.992 5.174 5.398 5.616 5.82 6.044 6.279 6.513 6.767 7.027 7.292 7.543 7.82 8.157 8.494 8.885 9.284 9.677 10.095 10.547 10.935 11.143 10.971 10.633 10.244 9.844 9.444 9.062 8.713 8.408 8.094 7.809 7.542 7.276 7.024 6.798 6.592 6.373 6.171 5.999 5.828 5.643 5.485 5.32 5.138 5.006 4.879 4.744 4.585 4.408 4.285 4.167 4.021 3.929 3.825 3.767 3.658 3.544 3.416 3.347 3.077 3.135 3.052 2.963 2.812 2.733 2.64 2.547 2.447 2.314 2.176 1.869 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_51_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_51_54.txt deleted file mode 100644 index d1322cdd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_51_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32428 ,KEBNE ,17023132,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:41 CET,0.0 1.481 1.986 2.352 2.617 2.826 2.993 3.147 3.445 3.601 3.759 3.835 4.128 4.223 4.385 4.526 4.665 4.738 4.878 5.012 5.233 5.363 5.479 5.645 5.808 5.968 6.12 6.276 6.464 6.633 6.796 6.983 7.151 7.315 7.503 7.701 7.891 8.08 8.267 8.45 8.624 8.809 9.011 9.187 9.347 9.48 9.555 9.522 9.306 8.821 7.734 6.242 4.908 3.701 2.638 1.66 0.804 0.052 -0.611 -1.311 -1.892 -2.4 -2.877 -3.308 -3.712 -4.094 -4.503 -4.865 -5.168 -5.478 -5.806 -6.082 -6.372 -6.67 -6.901 -7.141 -7.388 -7.636 -7.899 -8.097 -8.306 -8.626 -8.85 -9.088 -9.209 -9.447 -9.695 -9.97 -10.117 -10.458 -10.562 -10.734 -10.904 -11.27 -11.479 -11.701 -11.939 -12.214 -12.634 -13.216 -15.252 -2 ,23141 ,KEBNE ,17023133,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:58 CET,0.0 1.896 2.479 2.838 3.116 3.353 3.587 3.804 4.145 4.297 4.426 4.442 4.722 4.804 4.965 5.124 5.282 5.357 5.5 5.651 5.884 6.031 6.164 6.355 6.554 6.737 6.905 7.066 7.274 7.45 7.603 7.786 7.948 8.104 8.276 8.452 8.614 8.781 8.958 9.136 9.297 9.455 9.617 9.793 9.959 10.064 10.109 10.053 9.845 9.301 8.245 6.793 5.474 4.292 3.241 2.313 1.48 0.719 0.075 -0.578 -1.145 -1.656 -2.142 -2.588 -3.007 -3.387 -3.769 -4.112 -4.422 -4.752 -5.09 -5.36 -5.641 -5.942 -6.172 -6.41 -6.665 -6.926 -7.208 -7.401 -7.589 -7.896 -8.114 -8.348 -8.463 -8.691 -8.937 -9.198 -9.35 -9.714 -9.829 -9.995 -10.172 -10.528 -10.718 -10.959 -11.228 -11.505 -11.851 -12.335 -13.735 -3 ,23250 ,KEBNE ,17023134,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:54 CET,0.0 2.406 2.927 3.298 3.578 3.835 4.073 4.266 4.607 4.77 4.92 5.005 5.316 5.425 5.638 5.848 6.035 6.122 6.291 6.444 6.659 6.797 6.937 7.148 7.328 7.481 7.626 7.774 7.977 8.166 8.337 8.529 8.702 8.869 9.076 9.304 9.497 9.683 9.89 10.097 10.279 10.486 10.711 10.893 11.076 11.224 11.313 11.331 11.19 10.717 9.682 8.225 6.886 5.71 4.662 3.719 2.921 2.18 1.534 0.904 0.344 -0.146 -0.614 -1.082 -1.531 -1.937 -2.344 -2.718 -3.039 -3.346 -3.659 -3.915 -4.195 -4.49 -4.707 -4.943 -5.19 -5.439 -5.712 -5.912 -6.115 -6.415 -6.623 -6.851 -6.966 -7.205 -7.461 -7.74 -7.89 -8.24 -8.358 -8.524 -8.705 -9.098 -9.3 -9.507 -9.768 -10.073 -10.437 -11.097 -13.936 -4 ,2274 ,KEBNE ,17023135,Wed Dec 22 07:57:23 CET,Wed Dec 22 09:14:32 CET,0.0 1.509 1.905 2.195 2.419 2.615 2.825 3.015 3.311 3.441 3.561 3.577 3.863 3.962 4.157 4.356 4.55 4.64 4.8 4.938 5.13 5.241 5.337 5.493 5.661 5.829 5.998 6.164 6.37 6.553 6.722 6.909 7.074 7.245 7.42 7.583 7.745 7.917 8.088 8.244 8.398 8.57 8.736 8.871 9.007 9.142 9.21 9.132 8.902 8.42 7.383 5.933 4.636 3.459 2.409 1.497 0.697 -0.07 -0.737 -1.388 -1.946 -2.464 -2.973 -3.441 -3.866 -4.259 -4.671 -5.035 -5.357 -5.671 -5.982 -6.247 -6.527 -6.824 -7.056 -7.292 -7.551 -7.806 -8.057 -8.243 -8.429 -8.716 -8.93 -9.162 -9.282 -9.519 -9.767 -10.048 -10.196 -10.548 -10.662 -10.82 -10.991 -11.385 -11.609 -11.904 -12.303 -12.713 -13.105 -13.598 -18.083 -5 ,12685 ,KEBNE ,17023136,Wed Dec 22 07:57:19 CET,Wed Dec 22 09:18:49 CET,0.0 2.213 2.75 3.121 3.391 3.585 3.76 3.919 4.221 4.392 4.544 4.607 4.906 4.996 5.175 5.35 5.501 5.57 5.712 5.855 6.039 6.15 6.27 6.436 6.586 6.727 6.851 6.979 7.164 7.332 7.478 7.638 7.791 7.946 8.116 8.283 8.427 8.584 8.747 8.923 9.099 9.26 9.419 9.539 9.647 9.736 9.756 9.711 9.521 9.011 7.847 6.288 4.943 3.789 2.81 1.933 1.14 0.364 -0.311 -0.982 -1.561 -2.061 -2.535 -2.991 -3.406 -3.786 -4.198 -4.559 -4.86 -5.174 -5.506 -5.78 -6.074 -6.392 -6.629 -6.862 -7.115 -7.391 -7.693 -7.905 -8.108 -8.43 -8.668 -8.908 -9.029 -9.279 -9.536 -9.807 -9.959 -10.305 -10.373 -10.524 -10.697 -11.059 -11.261 -11.48 -11.726 -12.046 -12.426 -12.96 -15.953 -6 ,22318 ,KEBNE ,17023137,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:58 CET,0.0 2.363 2.813 3.157 3.439 3.701 3.917 4.112 4.494 4.662 4.794 4.836 5.127 5.213 5.371 5.536 5.718 5.797 5.937 6.062 6.23 6.352 6.472 6.654 6.817 6.95 7.087 7.232 7.416 7.592 7.755 7.929 8.088 8.243 8.421 8.598 8.764 8.938 9.099 9.267 9.427 9.58 9.749 9.898 10.043 10.162 10.21 10.164 9.965 9.534 8.535 6.978 5.651 4.529 3.525 2.616 1.822 1.066 0.406 -0.232 -0.789 -1.287 -1.746 -2.188 -2.596 -2.97 -3.388 -3.761 -4.078 -4.407 -4.739 -5.008 -5.287 -5.577 -5.797 -6.024 -6.282 -6.559 -6.822 -7.013 -7.214 -7.518 -7.74 -7.961 -8.074 -8.325 -8.579 -8.849 -9.005 -9.354 -9.432 -9.591 -9.765 -10.129 -10.329 -10.561 -10.832 -11.112 -11.429 -11.897 -14.549 -7 ,12719 ,KEBNE ,17023138,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:19:05 CET,0.0 2.265 2.791 3.157 3.443 3.647 3.863 4.064 4.401 4.558 4.704 4.777 5.095 5.223 5.432 5.618 5.799 5.882 6.06 6.23 6.461 6.603 6.725 6.9 7.067 7.241 7.405 7.542 7.697 7.86 8.035 8.219 8.379 8.533 8.709 8.902 9.058 9.22 9.4 9.57 9.724 9.875 10.02 10.148 10.279 10.376 10.443 10.435 10.235 9.75 8.766 7.309 6.004 4.827 3.766 2.843 2.039 1.307 0.691 0.065 -0.478 -0.958 -1.414 -1.846 -2.258 -2.638 -3.034 -3.373 -3.666 -3.985 -4.326 -4.617 -4.915 -5.216 -5.446 -5.695 -5.956 -6.216 -6.493 -6.68 -6.874 -7.183 -7.416 -7.663 -7.777 -8.009 -8.255 -8.52 -8.66 -9.023 -9.149 -9.313 -9.497 -9.911 -10.136 -10.371 -10.614 -10.891 -11.261 -11.909 -13.751 -8 ,26982 ,KEBNE ,17023139,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:19:03 CET,0.0 2.123 2.543 2.898 3.175 3.43 3.644 3.831 4.21 4.381 4.526 4.581 4.886 5.007 5.243 5.446 5.638 5.727 5.888 6.04 6.269 6.401 6.519 6.688 6.846 6.998 7.145 7.278 7.436 7.591 7.739 7.906 8.065 8.216 8.375 8.549 8.717 8.883 9.044 9.217 9.394 9.56 9.726 9.866 9.988 10.09 10.148 10.123 9.914 9.344 8.215 6.717 5.357 4.152 3.117 2.176 1.279 0.48 -0.169 -0.818 -1.377 -1.882 -2.367 -2.832 -3.255 -3.616 -4.014 -4.379 -4.686 -5.021 -5.361 -5.634 -5.922 -6.226 -6.454 -6.696 -6.959 -7.22 -7.482 -7.668 -7.863 -8.167 -8.383 -8.616 -8.744 -9.003 -9.279 -9.564 -9.703 -10.052 -10.172 -10.337 -10.504 -10.897 -11.125 -11.371 -11.634 -11.922 -12.354 -12.956 -15.11 -9 ,3996 ,KEBNE ,17023140,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:58 CET,0.0 1.625 2.146 2.478 2.763 2.998 3.193 3.386 3.764 3.932 4.07 4.144 4.453 4.559 4.767 4.962 5.144 5.235 5.42 5.597 5.835 5.979 6.106 6.286 6.471 6.652 6.821 6.97 7.155 7.333 7.493 7.683 7.862 8.025 8.211 8.416 8.605 8.804 8.996 9.172 9.341 9.505 9.652 9.779 9.921 10.026 10.084 10.042 9.89 9.464 8.347 6.831 5.555 4.423 3.383 2.43 1.599 0.861 0.221 -0.437 -1.004 -1.512 -1.988 -2.419 -2.839 -3.239 -3.662 -4.033 -4.329 -4.635 -4.971 -5.249 -5.535 -5.828 -6.059 -6.298 -6.533 -6.779 -7.057 -7.244 -7.428 -7.731 -7.941 -8.152 -8.252 -8.462 -8.699 -8.943 -9.065 -9.396 -9.509 -9.685 -9.847 -10.169 -10.347 -10.552 -10.809 -11.119 -11.464 -11.96 -14.792 -10 ,1302 ,KEBNE ,17023141,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:20:10 CET,0.0 2.894 3.512 3.936 4.225 4.487 4.715 4.905 5.257 5.419 5.554 5.595 5.897 6.016 6.225 6.404 6.574 6.661 6.826 6.969 7.157 7.275 7.402 7.601 7.782 7.95 8.101 8.236 8.407 8.561 8.706 8.887 9.061 9.231 9.42 9.601 9.755 9.915 10.091 10.268 10.439 10.617 10.776 10.931 11.1 11.201 11.247 11.204 10.975 10.437 9.348 7.87 6.568 5.377 4.319 3.361 2.506 1.766 1.133 0.486 -0.065 -0.535 -0.98 -1.415 -1.83 -2.201 -2.578 -2.915 -3.202 -3.504 -3.812 -4.051 -4.308 -4.591 -4.815 -5.052 -5.3 -5.55 -5.807 -5.989 -6.189 -6.516 -6.72 -6.921 -7.032 -7.266 -7.51 -7.789 -7.937 -8.281 -8.397 -8.574 -8.765 -9.169 -9.394 -9.651 -9.938 -10.231 -10.544 -11.039 -12.905 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_51_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_51_62.txt deleted file mode 100644 index 3547785c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_51_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28506 ,KEBNE ,17045891,Thu Dec 23 05:45:39 CET,Thu Dec 23 07:08:09 CET,0.0 0.749 1.213 1.581 1.867 2.117 2.344 2.542 2.904 3.068 3.227 3.351 3.686 3.835 4.127 4.395 4.646 4.772 5.009 5.238 5.578 5.787 5.991 6.288 6.574 6.854 7.135 7.399 7.727 8.06 8.38 8.75 9.096 9.433 9.863 10.346 10.79 11.285 11.812 12.39 13.007 13.691 14.476 15.247 16.163 17.203 18.392 19.775 21.46 23.476 25.857 27.793 28.88 29.541 29.942 30.201 30.372 30.466 30.502 30.513 30.499 30.453 30.388 30.314 30.241 30.154 30.044 29.951 29.868 29.759 29.63 29.531 29.446 29.35 29.255 29.154 29.047 28.923 28.793 28.703 28.6 28.425 28.305 28.19 28.132 28.005 27.859 27.702 27.614 27.35 27.332 27.235 27.129 26.902 26.776 26.633 26.452 26.251 26.068 25.819 25.248 -2 ,19868 ,KEBNE ,17045892,Thu Dec 23 05:45:43 CET,Thu Dec 23 07:00:19 CET,0.0 0.723 1.082 1.391 1.672 1.916 2.13 2.327 2.728 2.922 3.09 3.203 3.531 3.667 3.946 4.219 4.468 4.582 4.792 4.997 5.322 5.534 5.735 6.035 6.325 6.599 6.853 7.099 7.417 7.736 8.046 8.408 8.759 9.103 9.496 9.936 10.389 10.895 11.432 12.01 12.611 13.258 14.012 14.811 15.731 16.743 17.931 19.31 20.968 22.938 25.313 27.265 28.421 29.095 29.489 29.741 29.89 29.964 29.997 29.999 29.963 29.916 29.86 29.803 29.722 29.623 29.526 29.437 29.352 29.251 29.132 29.035 28.93 28.815 28.709 28.593 28.49 28.385 28.254 28.15 28.046 27.882 27.776 27.673 27.607 27.455 27.295 27.125 27.032 26.764 26.74 26.63 26.521 26.282 26.149 26.012 25.845 25.658 25.461 25.195 24.619 -3 ,11546 ,KEBNE ,17045893,Thu Dec 23 05:45:43 CET,Thu Dec 23 07:00:19 CET,0.0 1.338 1.837 2.21 2.49 2.737 2.968 3.182 3.548 3.71 3.87 4.007 4.357 4.506 4.792 5.067 5.316 5.43 5.656 5.88 6.206 6.422 6.622 6.906 7.193 7.472 7.748 8.01 8.337 8.662 8.982 9.366 9.732 10.095 10.516 10.977 11.406 11.869 12.402 12.976 13.552 14.224 15.031 15.845 16.785 17.828 19.036 20.411 22.077 24.053 26.412 28.339 29.46 30.145 30.595 30.888 31.054 31.166 31.221 31.225 31.188 31.129 31.061 30.98 30.884 30.765 30.637 30.544 30.453 30.344 30.221 30.106 29.994 29.879 29.79 29.701 29.596 29.472 29.336 29.254 29.172 29.031 28.92 28.793 28.734 28.615 28.484 28.332 28.239 27.961 27.92 27.813 27.693 27.431 27.287 27.114 26.908 26.673 26.404 26.042 25.467 -4 ,24869 ,KEBNE ,17045894,Thu Dec 23 05:48:45 CET,Thu Dec 23 07:11:35 CET,0.0 1.361 1.8 2.131 2.423 2.671 2.886 3.095 3.462 3.631 3.81 3.943 4.28 4.425 4.698 4.959 5.205 5.326 5.562 5.784 6.095 6.299 6.498 6.787 7.061 7.332 7.601 7.853 8.178 8.495 8.805 9.171 9.522 9.867 10.264 10.712 11.167 11.663 12.189 12.753 13.345 14.024 14.813 15.619 16.566 17.615 18.824 20.227 21.914 23.888 26.243 28.184 29.334 30.062 30.481 30.747 30.909 31.012 31.068 31.063 31.015 30.942 30.864 30.793 30.709 30.616 30.513 30.4 30.296 30.196 30.085 29.988 29.887 29.765 29.656 29.546 29.433 29.314 29.187 29.101 29.012 28.86 28.739 28.608 28.547 28.422 28.269 28.103 28.025 27.776 27.75 27.64 27.525 27.311 27.192 27.062 26.92 26.733 26.503 26.186 25.461 -5 ,11216 ,KEBNE ,17045895,Thu Dec 23 05:48:45 CET,Thu Dec 23 07:11:25 CET,0.0 1.193 1.641 1.976 2.252 2.492 2.719 2.934 3.277 3.437 3.602 3.717 4.05 4.186 4.465 4.733 4.99 5.118 5.36 5.583 5.89 6.091 6.299 6.601 6.892 7.179 7.448 7.707 8.031 8.347 8.644 8.983 9.327 9.668 10.067 10.514 10.944 11.43 11.962 12.531 13.139 13.813 14.587 15.393 16.343 17.383 18.575 19.971 21.647 23.611 25.977 27.918 28.99 29.653 30.067 30.338 30.499 30.591 30.631 30.635 30.61 30.562 30.513 30.453 30.371 30.275 30.182 30.092 29.985 29.864 29.751 29.655 29.528 29.398 29.306 29.201 29.088 28.963 28.832 28.736 28.644 28.514 28.409 28.293 28.234 28.099 27.943 27.796 27.719 27.462 27.461 27.367 27.259 27.01 26.877 26.74 26.57 26.378 26.151 25.87 25.137 -6 ,15111 ,KEBNE ,17045896,Thu Dec 23 05:48:49 CET,Thu Dec 23 07:07:48 CET,0.0 0.924 1.38 1.767 2.097 2.352 2.579 2.79 3.176 3.351 3.521 3.656 3.993 4.139 4.419 4.702 4.969 5.094 5.334 5.561 5.888 6.097 6.307 6.6 6.875 7.145 7.41 7.672 8.0 8.315 8.627 9.0 9.363 9.706 10.108 10.566 11.013 11.509 12.053 12.641 13.246 13.923 14.721 15.525 16.476 17.537 18.791 20.23 21.894 23.862 26.196 28.151 29.308 30.02 30.444 30.703 30.876 30.953 30.979 30.987 30.956 30.916 30.861 30.797 30.723 30.643 30.556 30.461 30.37 30.271 30.157 30.057 29.959 29.845 29.746 29.65 29.539 29.416 29.289 29.188 29.081 28.942 28.824 28.693 28.637 28.516 28.362 28.191 28.106 27.838 27.787 27.675 27.559 27.3 27.158 26.991 26.796 26.57 26.307 26.021 25.416 -7 ,23393 ,KEBNE ,17045897,Thu Dec 23 05:48:49 CET,Thu Dec 23 07:03:20 CET,0.0 1.002 1.487 1.839 2.159 2.439 2.671 2.882 3.252 3.426 3.601 3.715 4.053 4.205 4.508 4.796 5.054 5.18 5.42 5.641 5.953 6.164 6.372 6.676 6.976 7.25 7.509 7.76 8.082 8.402 8.717 9.095 9.449 9.793 10.21 10.677 11.118 11.601 12.127 12.7 13.292 13.937 14.709 15.53 16.494 17.56 18.78 20.163 21.802 23.773 26.244 28.268 29.366 30.039 30.468 30.744 30.921 31.037 31.092 31.104 31.096 31.063 31.007 30.92 30.831 30.745 30.646 30.55 30.452 30.35 30.25 30.163 30.055 29.934 29.842 29.747 29.638 29.523 29.412 29.329 29.234 29.069 28.945 28.83 28.765 28.607 28.444 28.295 28.23 27.988 27.973 27.876 27.791 27.611 27.49 27.329 27.149 26.961 26.74 26.421 25.667 -8 ,10901 ,KEBNE ,17045898,Thu Dec 23 05:48:48 CET,Thu Dec 23 07:03:47 CET,0.0 1.12 1.642 1.989 2.268 2.495 2.701 2.905 3.275 3.448 3.608 3.71 4.038 4.183 4.461 4.706 4.954 5.077 5.287 5.486 5.807 6.014 6.208 6.498 6.79 7.066 7.322 7.58 7.918 8.238 8.552 8.94 9.303 9.664 10.085 10.537 10.969 11.466 12.007 12.594 13.202 13.864 14.674 15.509 16.453 17.502 18.708 20.103 21.782 23.76 26.153 28.127 29.301 30.038 30.465 30.739 30.894 30.983 31.031 31.017 30.982 30.951 30.897 30.832 30.754 30.674 30.588 30.493 30.4 30.291 30.171 30.083 29.993 29.881 29.788 29.685 29.575 29.45 29.313 29.23 29.134 28.955 28.825 28.709 28.65 28.515 28.364 28.196 28.113 27.854 27.821 27.726 27.636 27.416 27.3 27.172 27.021 26.847 26.625 26.309 25.374 -9 ,3225 ,KEBNE ,17045899,Thu Dec 23 05:48:53 CET,Thu Dec 23 07:06:04 CET,0.0 0.797 1.16 1.461 1.754 2.045 2.309 2.532 2.905 3.068 3.221 3.339 3.676 3.818 4.099 4.367 4.623 4.743 4.975 5.203 5.528 5.735 5.934 6.215 6.481 6.745 7.003 7.265 7.616 7.949 8.262 8.638 9.007 9.369 9.788 10.25 10.693 11.176 11.702 12.288 12.899 13.574 14.365 15.154 16.062 17.086 18.295 19.661 21.278 23.196 25.565 27.509 28.612 29.301 29.73 30.024 30.173 30.244 30.299 30.312 30.279 30.25 30.223 30.167 30.08 29.992 29.888 29.77 29.67 29.567 29.457 29.358 29.25 29.141 29.045 28.949 28.844 28.719 28.588 28.504 28.416 28.255 28.136 28.013 27.949 27.816 27.674 27.518 27.43 27.165 27.143 27.04 26.932 26.669 26.524 26.38 26.216 26.007 25.758 25.485 24.908 -10 ,23071 ,KEBNE ,17045900,Thu Dec 23 05:48:53 CET,Thu Dec 23 07:05:14 CET,0.0 0.887 1.272 1.577 1.808 2.011 2.224 2.432 2.787 2.95 3.114 3.229 3.56 3.699 3.966 4.225 4.473 4.597 4.841 5.066 5.39 5.598 5.797 6.073 6.324 6.572 6.819 7.061 7.366 7.659 7.952 8.31 8.64 8.97 9.373 9.838 10.281 10.763 11.281 11.837 12.427 13.095 13.88 14.681 15.624 16.672 17.915 19.323 20.959 22.92 25.28 27.198 28.286 28.944 29.384 29.685 29.85 29.915 29.923 29.908 29.873 29.83 29.782 29.712 29.637 29.569 29.477 29.379 29.283 29.186 29.081 28.979 28.879 28.765 28.674 28.587 28.483 28.372 28.259 28.176 28.081 27.895 27.76 27.626 27.558 27.428 27.284 27.131 27.051 26.791 26.757 26.659 26.557 26.325 26.189 26.056 25.888 25.678 25.443 25.114 24.249 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_52_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_52_53.txt deleted file mode 100644 index fbc5a33f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_52_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26514 ,KEBNE ,17023142,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:41 CET,0.0 1.479 1.961 2.333 2.62 2.839 3.038 3.218 3.529 3.682 3.831 3.902 4.244 4.372 4.62 4.856 5.081 5.183 5.372 5.555 5.801 5.956 6.11 6.327 6.543 6.75 6.945 7.136 7.366 7.58 7.788 8.028 8.256 8.489 8.768 9.08 9.349 9.621 9.903 10.196 10.508 10.832 11.181 11.522 11.93 12.363 12.781 13.183 13.591 13.978 14.186 13.989 13.611 13.116 12.571 12.08 11.656 11.223 10.828 10.432 10.082 9.768 9.46 9.153 8.868 8.603 8.323 8.069 7.835 7.594 7.356 7.164 6.97 6.758 6.58 6.395 6.216 6.035 5.849 5.721 5.58 5.358 5.2 5.041 4.961 4.789 4.596 4.395 4.292 3.972 3.957 3.843 3.724 3.463 3.324 3.176 3.007 2.808 2.578 2.262 1.282 -2 ,22068 ,KEBNE ,17023143,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:53 CET,0.0 1.208 1.636 1.955 2.259 2.523 2.776 3.001 3.397 3.572 3.734 3.84 4.182 4.309 4.551 4.773 4.975 5.069 5.251 5.421 5.642 5.785 5.935 6.162 6.365 6.55 6.728 6.898 7.118 7.318 7.499 7.717 7.94 8.158 8.404 8.682 8.945 9.222 9.513 9.849 10.192 10.538 10.91 11.271 11.683 12.118 12.579 12.999 13.373 13.731 13.971 13.78 13.329 12.866 12.419 11.965 11.553 11.159 10.797 10.428 10.083 9.767 9.471 9.187 8.908 8.639 8.349 8.073 7.846 7.623 7.404 7.229 7.034 6.821 6.66 6.483 6.282 6.071 5.865 5.729 5.584 5.37 5.218 5.061 4.989 4.836 4.667 4.493 4.397 4.086 4.114 4.015 3.923 3.702 3.537 3.353 3.162 2.934 2.7 2.458 1.754 -3 ,27722 ,KEBNE ,17023144,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:51 CET,0.0 0.656 0.943 1.151 1.338 1.48 1.628 1.798 2.125 2.282 2.433 2.496 2.842 2.983 3.227 3.449 3.658 3.761 3.979 4.186 4.452 4.613 4.774 5.01 5.221 5.421 5.624 5.805 6.023 6.228 6.426 6.663 6.89 7.114 7.365 7.652 7.928 8.214 8.509 8.827 9.149 9.498 9.884 10.247 10.645 11.053 11.494 11.969 12.412 12.796 12.998 12.746 12.301 11.795 11.289 10.828 10.417 9.959 9.524 9.112 8.736 8.375 8.043 7.731 7.438 7.167 6.867 6.6 6.369 6.127 5.88 5.668 5.461 5.252 5.09 4.913 4.724 4.542 4.351 4.214 4.074 3.867 3.726 3.578 3.503 3.344 3.17 2.985 2.885 2.57 2.567 2.459 2.347 2.077 1.928 1.77 1.59 1.404 1.176 0.842 0.129 -4 ,21642 ,KEBNE ,17023145,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:54 CET,0.0 1.271 1.769 2.128 2.407 2.636 2.829 3.009 3.322 3.461 3.595 3.622 3.939 4.046 4.243 4.434 4.633 4.731 4.912 5.077 5.312 5.467 5.611 5.814 6.021 6.228 6.416 6.606 6.848 7.061 7.267 7.512 7.757 7.984 8.217 8.509 8.801 9.092 9.392 9.683 9.981 10.325 10.715 11.087 11.481 11.878 12.299 12.73 13.185 13.608 13.764 13.527 13.136 12.68 12.246 11.813 11.377 10.943 10.55 10.153 9.804 9.486 9.185 8.903 8.624 8.378 8.128 7.896 7.702 7.493 7.273 7.089 6.9 6.704 6.535 6.361 6.191 6.012 5.816 5.679 5.543 5.342 5.198 5.032 4.945 4.778 4.611 4.426 4.322 3.998 3.984 3.866 3.736 3.457 3.315 3.148 2.96 2.758 2.536 2.24 1.493 -5 ,12017 ,KEBNE ,17023146,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:19:06 CET,0.0 0.952 1.339 1.683 1.952 2.182 2.377 2.566 2.936 3.09 3.238 3.309 3.635 3.75 3.993 4.226 4.432 4.535 4.729 4.915 5.182 5.338 5.484 5.691 5.882 6.059 6.233 6.394 6.602 6.819 7.032 7.284 7.514 7.724 7.97 8.243 8.485 8.754 9.054 9.365 9.671 9.977 10.327 10.696 11.098 11.522 11.994 12.463 12.908 13.278 13.443 13.176 12.755 12.277 11.763 11.197 10.689 10.277 9.9 9.492 9.134 8.806 8.484 8.196 7.922 7.665 7.39 7.136 6.925 6.713 6.495 6.305 6.095 5.878 5.708 5.536 5.361 5.178 4.995 4.855 4.71 4.505 4.351 4.18 4.092 3.918 3.742 3.551 3.446 3.121 3.103 2.986 2.876 2.613 2.444 2.261 2.063 1.848 1.561 1.146 -0.088 -6 ,2639 ,KEBNE ,17023147,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:49 CET,0.0 0.987 1.315 1.538 1.724 1.886 2.025 2.164 2.421 2.543 2.655 2.646 2.956 3.047 3.226 3.405 3.591 3.682 3.858 4.023 4.258 4.424 4.586 4.823 5.039 5.224 5.402 5.571 5.787 6.0 6.202 6.442 6.68 6.908 7.169 7.452 7.702 7.976 8.276 8.595 8.915 9.239 9.591 9.944 10.356 10.788 11.245 11.682 12.088 12.418 12.542 12.355 11.979 11.44 10.833 10.327 9.904 9.476 9.102 8.712 8.354 8.028 7.705 7.398 7.081 6.778 6.486 6.22 5.978 5.74 5.486 5.276 5.082 4.882 4.727 4.561 4.394 4.215 4.022 3.879 3.721 3.493 3.324 3.138 3.042 2.848 2.644 2.404 2.291 1.984 1.986 1.867 1.747 1.506 1.368 1.23 1.088 0.927 0.754 0.541 0.05 -7 ,2764 ,KEBNE ,17023148,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:44 CET,0.0 1.028 1.411 1.741 1.986 2.185 2.385 2.578 2.922 3.07 3.206 3.246 3.571 3.692 3.923 4.138 4.345 4.434 4.597 4.755 4.965 5.1 5.242 5.466 5.67 5.863 6.063 6.238 6.452 6.672 6.874 7.121 7.371 7.612 7.869 8.134 8.38 8.637 8.929 9.246 9.55 9.862 10.216 10.582 10.984 11.386 11.817 12.25 12.687 13.041 13.172 12.94 12.52 12.044 11.569 11.099 10.655 10.22 9.843 9.454 9.109 8.81 8.521 8.251 8.001 7.769 7.524 7.294 7.097 6.882 6.649 6.457 6.252 6.034 5.858 5.685 5.515 5.328 5.143 5.021 4.886 4.677 4.522 4.363 4.285 4.117 3.936 3.754 3.66 3.344 3.332 3.209 3.087 2.793 2.626 2.477 2.303 2.11 1.846 1.465 0.439 -8 ,31053 ,KEBNE ,17023149,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:46 CET,0.0 1.495 1.869 2.147 2.404 2.626 2.828 3.03 3.393 3.555 3.715 3.8 4.147 4.27 4.488 4.709 4.914 5.01 5.201 5.379 5.655 5.836 6.001 6.234 6.445 6.653 6.854 7.047 7.294 7.52 7.733 7.992 8.251 8.502 8.783 9.083 9.366 9.669 9.983 10.315 10.641 10.996 11.386 11.73 12.115 12.529 12.953 13.399 13.864 14.262 14.442 14.227 13.831 13.337 12.857 12.395 11.934 11.511 11.153 10.766 10.424 10.126 9.83 9.528 9.233 8.969 8.681 8.396 8.147 7.92 7.693 7.52 7.36 7.169 7.023 6.888 6.751 6.592 6.426 6.318 6.204 6.038 5.93 5.809 5.746 5.625 5.503 5.365 5.274 4.958 4.948 4.839 4.735 4.504 4.383 4.258 4.12 3.962 3.761 3.505 3.096 -9 ,15397 ,KEBNE ,17023150,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:19:00 CET,0.0 1.065 1.515 1.763 1.982 2.164 2.317 2.478 2.777 2.918 3.059 3.106 3.421 3.526 3.731 3.913 4.108 4.207 4.385 4.549 4.781 4.924 5.049 5.233 5.428 5.629 5.811 5.973 6.21 6.446 6.653 6.882 7.115 7.353 7.594 7.866 8.137 8.425 8.713 8.998 9.317 9.668 10.04 10.405 10.799 11.178 11.599 12.026 12.416 12.775 12.921 12.659 12.274 11.83 11.346 10.878 10.448 10.023 9.645 9.243 8.878 8.57 8.279 7.988 7.714 7.471 7.225 6.994 6.782 6.567 6.319 6.097 5.858 5.61 5.436 5.266 5.091 4.909 4.719 4.585 4.441 4.211 4.062 3.913 3.829 3.651 3.461 3.238 3.126 2.798 2.781 2.677 2.564 2.32 2.184 2.039 1.878 1.677 1.451 1.161 0.038 -10 ,13010 ,KEBNE ,17023151,Wed Dec 22 07:57:20 CET,Wed Dec 22 09:18:35 CET,0.0 1.198 1.596 1.89 2.088 2.281 2.461 2.616 2.919 3.075 3.215 3.271 3.605 3.728 3.95 4.139 4.322 4.418 4.596 4.755 4.997 5.145 5.279 5.48 5.683 5.878 6.053 6.223 6.445 6.649 6.839 7.064 7.291 7.525 7.798 8.077 8.318 8.583 8.872 9.178 9.491 9.819 10.193 10.547 10.956 11.39 11.844 12.333 12.868 13.304 13.534 13.326 12.895 12.429 11.908 11.397 10.965 10.575 10.228 9.841 9.461 9.112 8.82 8.576 8.349 8.142 7.906 7.691 7.519 7.335 7.155 7.012 6.86 6.69 6.558 6.427 6.294 6.158 5.997 5.879 5.76 5.572 5.451 5.33 5.264 5.127 4.985 4.84 4.76 4.466 4.52 4.43 4.336 4.147 4.037 3.906 3.775 3.626 3.437 3.175 2.071 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_53_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_53_54.txt deleted file mode 100644 index d7c76d60..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_53_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14950 ,TETRA ,17551207,Thu Nov 25 11:13:52 CET,Thu Nov 25 12:39:56 CET,0.0 0.775 1.15 1.438 1.695 1.925 2.114 2.285 2.633 2.796 2.949 3.003 3.32 3.428 3.64 3.856 4.057 4.154 4.347 4.511 4.748 4.909 5.065 5.301 5.536 5.753 5.961 6.172 6.452 6.718 6.964 7.245 7.488 7.716 7.986 8.301 8.611 8.937 9.289 9.654 10.029 10.467 10.975 11.47 12.029 12.659 13.351 14.109 14.963 15.881 16.833 17.392 17.536 17.506 17.392 17.209 16.993 16.751 16.522 16.27 16.045 15.845 15.644 15.443 15.231 15.012 14.774 14.547 14.348 14.141 13.922 13.719 13.505 13.286 13.12 12.967 12.813 12.658 12.503 12.393 12.268 12.075 11.943 11.792 11.714 11.553 11.359 11.15 11.035 10.712 10.672 10.539 10.399 10.1 9.962 9.816 9.629 9.4 9.092 8.732 7.89 -2 ,22340 ,TETRA ,17551209,Thu Nov 25 11:13:52 CET,Thu Nov 25 12:39:43 CET,0.0 0.846 1.226 1.563 1.836 2.07 2.297 2.483 2.828 2.992 3.146 3.238 3.59 3.733 3.986 4.194 4.387 4.48 4.652 4.812 5.045 5.201 5.356 5.562 5.743 5.924 6.105 6.287 6.514 6.725 6.934 7.186 7.427 7.663 7.929 8.239 8.572 8.931 9.302 9.689 10.099 10.593 11.175 11.704 12.249 12.852 13.526 14.242 15.071 16.027 17.045 17.643 17.813 17.797 17.652 17.455 17.243 16.991 16.769 16.542 16.322 16.099 15.876 15.671 15.468 15.269 15.059 14.87 14.704 14.523 14.313 14.148 13.991 13.811 13.68 13.552 13.411 13.263 13.123 13.019 12.894 12.708 12.586 12.443 12.368 12.229 12.082 11.907 11.807 11.508 11.528 11.43 11.323 11.097 10.972 10.834 10.693 10.516 10.304 10.106 9.443 -3 ,22193 ,TETRA ,17551211,Thu Nov 25 11:13:52 CET,Thu Nov 25 12:39:17 CET,0.0 1.13 1.485 1.758 1.985 2.176 2.369 2.555 2.874 3.032 3.189 3.295 3.656 3.796 4.023 4.233 4.441 4.535 4.706 4.868 5.098 5.245 5.398 5.613 5.811 6.015 6.212 6.399 6.636 6.866 7.084 7.344 7.584 7.813 8.07 8.367 8.667 8.996 9.361 9.728 10.11 10.555 11.057 11.548 12.11 12.721 13.389 14.122 14.932 15.835 16.861 17.498 17.683 17.619 17.48 17.333 17.121 16.896 16.668 16.422 16.226 16.038 15.837 15.646 15.462 15.27 15.047 14.843 14.679 14.517 14.345 14.2 14.047 13.881 13.751 13.61 13.469 13.329 13.178 13.072 12.952 12.744 12.595 12.446 12.374 12.214 12.05 11.888 11.788 11.482 11.477 11.365 11.249 10.999 10.846 10.654 10.453 10.245 9.976 9.646 8.839 -4 ,3991 ,TETRA ,17551213,Thu Nov 25 11:14:53 CET,Thu Nov 25 12:43:57 CET,0.0 1.08 1.417 1.643 1.85 2.041 2.201 2.348 2.658 2.806 2.934 2.932 3.24 3.336 3.512 3.682 3.849 3.933 4.095 4.257 4.495 4.643 4.783 4.99 5.196 5.394 5.574 5.748 5.976 6.194 6.413 6.684 6.938 7.168 7.433 7.735 8.037 8.347 8.681 9.062 9.454 9.889 10.368 10.84 11.402 12.008 12.712 13.493 14.365 15.306 16.299 16.923 17.076 17.054 16.914 16.693 16.464 16.226 16.008 15.778 15.542 15.316 15.109 14.901 14.693 14.491 14.283 14.096 13.914 13.73 13.542 13.397 13.26 13.105 12.986 12.862 12.724 12.575 12.422 12.316 12.208 12.04 11.912 11.769 11.699 11.572 11.439 11.284 11.201 10.919 10.945 10.843 10.739 10.53 10.408 10.252 10.084 9.914 9.714 9.467 8.787 -5 ,6668 ,TETRA ,17551215,Thu Nov 25 11:14:53 CET,Thu Nov 25 12:50:32 CET,0.0 1.019 1.445 1.781 2.039 2.257 2.462 2.665 3.035 3.202 3.359 3.453 3.801 3.912 4.1 4.285 4.462 4.546 4.714 4.877 5.092 5.228 5.362 5.571 5.766 5.943 6.12 6.291 6.512 6.736 6.959 7.218 7.469 7.714 7.97 8.251 8.538 8.85 9.171 9.527 9.911 10.334 10.819 11.305 11.868 12.487 13.198 13.968 14.825 15.775 16.818 17.446 17.576 17.512 17.392 17.257 17.081 16.859 16.652 16.425 16.19 15.975 15.769 15.572 15.373 15.181 14.968 14.77 14.604 14.404 14.197 14.034 13.858 13.683 13.541 13.393 13.242 13.088 12.914 12.78 12.642 12.421 12.267 12.119 12.039 11.878 11.712 11.53 11.446 11.158 11.185 11.092 10.988 10.764 10.647 10.509 10.352 10.199 10.028 9.756 8.972 -6 ,11180 ,TETRA ,17551216,Thu Nov 25 11:14:53 CET,Thu Nov 25 12:49:28 CET,0.0 0.715 1.089 1.373 1.595 1.783 1.953 2.129 2.435 2.57 2.709 2.764 3.093 3.211 3.425 3.619 3.81 3.908 4.085 4.242 4.494 4.657 4.826 5.072 5.286 5.477 5.643 5.813 6.051 6.286 6.505 6.758 6.993 7.216 7.477 7.808 8.133 8.454 8.804 9.17 9.552 9.978 10.462 10.963 11.54 12.179 12.889 13.655 14.494 15.405 16.409 17.03 17.21 17.145 16.954 16.728 16.515 16.288 16.067 15.823 15.584 15.36 15.141 14.935 14.736 14.537 14.32 14.125 13.951 13.755 13.527 13.317 13.104 12.884 12.721 12.55 12.373 12.198 12.015 11.886 11.752 11.551 11.404 11.252 11.178 11.022 10.854 10.698 10.62 10.315 10.289 10.169 10.053 9.804 9.666 9.523 9.356 9.143 8.87 8.582 7.819 -7 ,2639 ,TETRA ,17551218,Thu Nov 25 11:14:53 CET,Thu Nov 25 12:49:16 CET,0.0 1.024 1.341 1.581 1.822 2.04 2.218 2.385 2.728 2.879 3.019 3.077 3.403 3.519 3.745 3.963 4.162 4.252 4.428 4.609 4.871 5.031 5.187 5.407 5.613 5.811 6.011 6.209 6.455 6.683 6.906 7.188 7.456 7.703 8.007 8.365 8.701 9.067 9.437 9.811 10.194 10.617 11.101 11.603 12.18 12.801 13.494 14.273 15.133 16.033 16.996 17.573 17.735 17.719 17.588 17.398 17.166 16.913 16.705 16.47 16.215 15.997 15.795 15.571 15.362 15.175 14.96 14.746 14.559 14.362 14.155 13.99 13.811 13.631 13.501 13.364 13.221 13.072 12.92 12.811 12.702 12.552 12.435 12.297 12.229 12.092 11.943 11.785 11.698 11.399 11.392 11.279 11.165 10.942 10.809 10.667 10.524 10.348 10.121 9.85 9.254 -8 ,28022 ,TETRA ,17551220,Thu Nov 25 11:14:53 CET,Thu Nov 25 12:40:25 CET,0.0 0.848 1.232 1.486 1.723 1.9 2.072 2.245 2.536 2.671 2.795 2.813 3.131 3.235 3.453 3.66 3.847 3.934 4.097 4.252 4.48 4.631 4.774 4.98 5.179 5.373 5.564 5.746 5.981 6.206 6.416 6.656 6.882 7.106 7.383 7.683 7.957 8.273 8.627 8.988 9.356 9.78 10.285 10.779 11.326 11.922 12.59 13.339 14.237 15.185 16.133 16.735 16.875 16.83 16.679 16.454 16.229 15.983 15.745 15.511 15.299 15.098 14.891 14.686 14.433 14.163 13.89 13.652 13.427 13.198 12.989 12.827 12.659 12.466 12.305 12.133 11.959 11.785 11.621 11.504 11.376 11.185 11.043 10.892 10.814 10.648 10.47 10.28 10.183 9.869 9.837 9.717 9.582 9.297 9.13 8.951 8.745 8.474 8.16 7.793 6.888 -9 ,6477 ,TETRA ,17551222,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 12:50:24 CET,0.0 1.274 1.677 1.934 2.173 2.371 2.547 2.739 3.1 3.265 3.42 3.489 3.82 3.938 4.144 4.319 4.5 4.582 4.753 4.934 5.203 5.364 5.502 5.718 5.929 6.12 6.302 6.482 6.711 6.929 7.146 7.401 7.644 7.887 8.173 8.488 8.775 9.093 9.453 9.825 10.207 10.625 11.12 11.61 12.152 12.749 13.446 14.214 15.009 15.895 16.812 17.319 17.455 17.393 17.254 17.09 16.87 16.627 16.415 16.187 15.977 15.771 15.564 15.361 15.154 14.953 14.72 14.496 14.318 14.138 13.961 13.808 13.639 13.468 13.328 13.186 13.042 12.882 12.706 12.584 12.456 12.269 12.149 12.022 11.95 11.797 11.641 11.47 11.379 11.089 11.125 11.037 10.944 10.737 10.604 10.458 10.289 10.099 9.906 9.568 8.272 -10 ,4521 ,TETRA ,17551224,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 12:42:50 CET,0.0 1.152 1.585 1.904 2.154 2.386 2.571 2.728 3.026 3.155 3.282 3.318 3.642 3.751 3.963 4.173 4.368 4.468 4.656 4.831 5.072 5.215 5.356 5.556 5.747 5.937 6.127 6.313 6.542 6.755 6.962 7.205 7.442 7.683 7.954 8.243 8.539 8.863 9.202 9.576 9.961 10.386 10.87 11.357 11.943 12.552 13.241 13.994 14.808 15.752 16.715 17.24 17.357 17.315 17.165 16.96 16.75 16.5 16.254 16.008 15.782 15.575 15.376 15.173 14.975 14.789 14.582 14.402 14.238 14.047 13.848 13.695 13.524 13.337 13.195 13.038 12.871 12.68 12.477 12.34 12.198 11.985 11.831 11.666 11.582 11.42 11.267 11.103 11.011 10.715 10.741 10.645 10.535 10.283 10.146 10.0 9.847 9.679 9.455 9.182 8.682 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_53_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_53_58.txt deleted file mode 100644 index 54d23fb2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_53_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16823 ,TETRA ,17551228,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 12:51:07 CET,0.0 1.408 1.893 2.258 2.533 2.756 2.978 3.188 3.595 3.776 3.951 4.076 4.437 4.593 4.894 5.177 5.44 5.566 5.794 6.014 6.342 6.545 6.753 7.05 7.333 7.617 7.895 8.153 8.484 8.82 9.16 9.574 9.984 10.375 10.806 11.29 11.759 12.278 12.834 13.435 14.074 14.765 15.573 16.409 17.388 18.483 19.771 21.244 22.969 25.041 27.601 29.7 30.902 31.623 32.087 32.382 32.553 32.637 32.661 32.635 32.607 32.598 32.575 32.527 32.475 32.418 32.348 32.287 32.229 32.162 32.063 31.974 31.899 31.816 31.74 31.655 31.569 31.475 31.377 31.309 31.236 31.127 31.043 30.947 30.901 30.818 30.723 30.621 30.566 30.312 30.324 30.243 30.174 30.026 29.938 29.823 29.702 29.585 29.431 29.228 28.586 -2 ,1238 ,TETRA ,17551230,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 12:50:32 CET,0.0 1.137 1.537 1.881 2.201 2.466 2.706 2.922 3.325 3.53 3.726 3.839 4.193 4.339 4.61 4.859 5.103 5.221 5.453 5.701 6.043 6.266 6.487 6.787 7.074 7.352 7.626 7.882 8.206 8.516 8.834 9.222 9.598 9.97 10.403 10.875 11.3 11.785 12.348 12.971 13.612 14.315 15.142 15.974 16.961 18.073 19.375 20.879 22.599 24.579 27.056 29.136 30.299 31.063 31.532 31.776 31.944 32.062 32.115 32.13 32.115 32.084 32.029 31.953 31.865 31.788 31.722 31.655 31.589 31.501 31.408 31.339 31.267 31.182 31.108 31.034 30.965 30.885 30.783 30.697 30.604 30.453 30.354 30.253 30.195 30.085 29.961 29.812 29.736 29.477 29.508 29.427 29.351 29.17 29.057 28.937 28.797 28.643 28.457 28.205 27.547 -3 ,18939 ,TETRA ,17551232,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 12:41:46 CET,0.0 1.609 2.055 2.392 2.675 2.921 3.15 3.371 3.78 3.969 4.152 4.292 4.664 4.818 5.12 5.407 5.662 5.78 6.018 6.252 6.569 6.766 6.974 7.29 7.582 7.87 8.158 8.441 8.812 9.175 9.532 9.966 10.368 10.75 11.197 11.688 12.164 12.698 13.277 13.902 14.549 15.258 16.086 16.93 17.941 19.08 20.41 21.874 23.581 25.606 28.05 30.067 31.209 31.945 32.424 32.719 32.901 33.012 33.06 33.072 33.072 33.051 33.018 32.969 32.881 32.782 32.659 32.547 32.46 32.36 32.256 32.164 32.041 31.911 31.821 31.725 31.62 31.506 31.385 31.298 31.198 31.043 30.956 30.871 30.823 30.724 30.61 30.486 30.426 30.183 30.24 30.171 30.103 29.943 29.856 29.769 29.655 29.507 29.362 29.184 28.491 -4 ,26389 ,TETRA ,17551234,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 12:42:42 CET,0.0 1.263 1.782 2.203 2.521 2.783 3.011 3.233 3.648 3.837 4.021 4.176 4.563 4.718 5.01 5.274 5.525 5.655 5.897 6.123 6.444 6.649 6.844 7.127 7.415 7.703 7.973 8.23 8.553 8.86 9.167 9.567 9.945 10.291 10.697 11.149 11.596 12.087 12.62 13.218 13.853 14.568 15.41 16.274 17.294 18.433 19.697 21.144 22.893 24.96 27.447 29.478 30.692 31.437 31.893 32.148 32.272 32.371 32.432 32.475 32.47 32.431 32.385 32.333 32.291 32.23 32.135 32.042 31.948 31.85 31.757 31.662 31.551 31.44 31.353 31.258 31.138 31.016 30.897 30.807 30.708 30.553 30.448 30.345 30.289 30.17 30.033 29.867 29.776 29.492 29.47 29.368 29.269 29.085 28.98 28.865 28.748 28.618 28.427 28.158 27.371 -5 ,9839 ,TETRA ,17551236,Thu Nov 25 11:16:53 CET,Thu Nov 25 12:52:49 CET,0.0 1.729 2.231 2.591 2.885 3.17 3.428 3.666 4.107 4.294 4.466 4.553 4.902 5.053 5.33 5.571 5.797 5.91 6.136 6.362 6.698 6.922 7.139 7.434 7.714 7.987 8.263 8.531 8.866 9.206 9.536 9.914 10.294 10.682 11.127 11.629 12.121 12.68 13.269 13.875 14.533 15.258 16.092 16.948 17.942 19.053 20.336 21.783 23.497 25.525 28.021 30.152 31.367 32.108 32.564 32.859 33.045 33.154 33.194 33.199 33.192 33.153 33.089 33.033 32.963 32.888 32.806 32.723 32.639 32.557 32.477 32.404 32.326 32.246 32.182 32.11 32.027 31.913 31.786 31.714 31.648 31.54 31.458 31.357 31.308 31.221 31.124 31.008 30.941 30.686 30.734 30.665 30.601 30.458 30.373 30.266 30.144 30.027 29.86 29.598 29.125 -6 ,4453 ,TETRA ,17551238,Thu Nov 25 11:16:53 CET,Thu Nov 25 12:51:40 CET,0.0 1.835 2.321 2.717 3.015 3.268 3.517 3.753 4.17 4.36 4.557 4.755 5.145 5.321 5.648 5.94 6.201 6.329 6.602 6.877 7.251 7.491 7.736 8.075 8.387 8.689 8.985 9.285 9.667 10.037 10.374 10.769 11.161 11.527 11.946 12.424 12.89 13.4 13.951 14.558 15.209 15.926 16.755 17.595 18.554 19.632 20.912 22.357 24.063 26.075 28.554 30.598 31.741 32.471 32.965 33.286 33.497 33.639 33.703 33.724 33.708 33.66 33.6 33.531 33.459 33.365 33.241 33.143 33.05 32.951 32.845 32.753 32.649 32.537 32.458 32.366 32.269 32.173 32.067 31.989 31.897 31.754 31.658 31.548 31.49 31.373 31.254 31.139 31.091 30.839 30.872 30.794 30.709 30.547 30.459 30.362 30.244 30.103 29.92 29.702 29.283 -7 ,2791 ,TETRA ,17551240,Thu Nov 25 11:16:53 CET,Thu Nov 25 12:53:20 CET,0.0 1.213 1.705 2.07 2.396 2.703 2.966 3.184 3.607 3.823 4.023 4.157 4.518 4.663 4.942 5.202 5.447 5.569 5.803 6.031 6.359 6.576 6.786 7.08 7.357 7.612 7.859 8.113 8.458 8.801 9.136 9.557 9.962 10.344 10.768 11.254 11.73 12.228 12.778 13.382 14.001 14.687 15.525 16.371 17.357 18.485 19.762 21.201 22.931 25.001 27.477 29.435 30.589 31.304 31.756 32.078 32.275 32.375 32.412 32.416 32.385 32.338 32.265 32.174 32.079 32.001 31.922 31.832 31.735 31.638 31.548 31.458 31.354 31.221 31.115 31.019 30.924 30.821 30.723 30.669 30.613 30.522 30.445 30.35 30.302 30.201 30.086 29.979 29.932 29.685 29.727 29.649 29.57 29.404 29.319 29.236 29.137 29.003 28.834 28.617 28.084 -8 ,28430 ,TETRA ,17551242,Thu Nov 25 11:16:53 CET,Thu Nov 25 12:52:39 CET,0.0 1.389 1.909 2.311 2.635 2.913 3.167 3.38 3.781 3.96 4.129 4.26 4.614 4.77 5.072 5.329 5.579 5.703 5.945 6.187 6.536 6.764 6.98 7.256 7.526 7.798 8.059 8.317 8.668 9.013 9.33 9.706 10.074 10.425 10.821 11.272 11.742 12.297 12.889 13.485 14.111 14.812 15.611 16.441 17.434 18.535 19.788 21.237 22.959 25.034 27.58 29.672 30.841 31.538 31.976 32.252 32.422 32.521 32.559 32.553 32.513 32.466 32.398 32.327 32.266 32.2 32.111 32.021 31.944 31.856 31.751 31.651 31.547 31.438 31.35 31.261 31.158 31.046 30.932 30.861 30.795 30.685 30.597 30.503 30.455 30.361 30.267 30.165 30.111 29.867 29.905 29.819 29.731 29.535 29.433 29.322 29.165 29.0 28.839 28.657 28.252 -9 ,15577 ,TETRA ,17551244,Thu Nov 25 11:16:53 CET,Thu Nov 25 12:51:49 CET,0.0 1.953 2.382 2.712 3.04 3.334 3.57 3.805 4.253 4.447 4.626 4.774 5.144 5.289 5.556 5.815 6.07 6.192 6.429 6.655 6.974 7.185 7.388 7.681 7.975 8.248 8.519 8.799 9.17 9.527 9.863 10.257 10.632 10.993 11.411 11.889 12.359 12.863 13.407 14.004 14.654 15.393 16.257 17.11 18.094 19.196 20.462 21.91 23.63 25.699 28.157 30.149 31.302 32.051 32.497 32.748 32.907 33.024 33.088 33.111 33.12 33.091 33.021 32.959 32.883 32.795 32.7 32.61 32.518 32.427 32.319 32.214 32.117 32.028 31.962 31.889 31.805 31.706 31.596 31.528 31.454 31.33 31.244 31.159 31.12 31.029 30.93 30.819 30.752 30.504 30.554 30.477 30.415 30.279 30.196 30.105 29.993 29.866 29.733 29.536 29.143 -10 ,23225 ,TETRA ,17551247,Thu Nov 25 11:17:52 CET,Thu Nov 25 12:52:54 CET,0.0 1.391 1.85 2.212 2.524 2.803 3.074 3.322 3.769 3.965 4.136 4.261 4.631 4.787 5.064 5.336 5.604 5.737 6.003 6.233 6.545 6.754 6.959 7.246 7.526 7.81 8.089 8.355 8.7 9.025 9.341 9.734 10.114 10.498 10.934 11.417 11.889 12.424 13.012 13.621 14.241 14.945 15.797 16.656 17.634 18.729 20.028 21.469 23.175 25.224 27.669 29.705 30.93 31.704 32.184 32.464 32.607 32.702 32.758 32.778 32.767 32.735 32.688 32.624 32.555 32.497 32.439 32.351 32.263 32.187 32.092 32.009 31.921 31.826 31.745 31.657 31.579 31.495 31.394 31.321 31.244 31.118 31.034 30.942 30.897 30.81 30.703 30.592 30.532 30.275 30.286 30.193 30.117 29.934 29.833 29.723 29.58 29.422 29.206 28.934 28.262 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_56_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_56_57.txt deleted file mode 100644 index 32134296..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_56_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31814 ,KEBNE ,17023152,Wed Dec 22 07:58:21 CET,Wed Dec 22 09:20:43 CET,0.0 0.849 1.315 1.681 1.956 2.198 2.427 2.616 2.976 3.136 3.277 3.382 3.69 3.815 4.078 4.314 4.522 4.625 4.827 5.019 5.298 5.484 5.664 5.927 6.173 6.398 6.625 6.853 7.131 7.398 7.662 7.981 8.279 8.562 8.901 9.274 9.617 10.004 10.423 10.859 11.309 11.813 12.38 12.937 13.583 14.321 15.166 16.047 17.034 18.075 19.158 19.78 19.817 19.648 19.45 19.21 18.943 18.663 18.383 18.076 17.784 17.51 17.239 16.966 16.721 16.476 16.189 15.948 15.734 15.5 15.262 15.067 14.86 14.631 14.455 14.29 14.119 13.933 13.736 13.598 13.465 13.265 13.115 12.962 12.885 12.714 12.532 12.349 12.253 11.97 11.903 11.783 11.665 11.366 11.187 11.011 10.834 10.626 10.39 10.137 9.411 -2 ,31212 ,KEBNE ,17023153,Wed Dec 22 07:58:21 CET,Wed Dec 22 09:20:46 CET,0.0 0.805 1.27 1.577 1.831 2.071 2.304 2.507 2.866 3.044 3.219 3.353 3.675 3.802 4.048 4.288 4.501 4.605 4.816 5.021 5.297 5.474 5.647 5.893 6.133 6.362 6.581 6.808 7.108 7.391 7.659 7.96 8.245 8.539 8.878 9.242 9.585 9.966 10.377 10.818 11.285 11.826 12.452 13.055 13.728 14.468 15.312 16.228 17.232 18.242 19.213 19.77 19.908 19.843 19.647 19.373 19.093 18.797 18.508 18.192 17.885 17.599 17.316 17.056 16.806 16.557 16.302 16.068 15.848 15.625 15.393 15.178 14.965 14.754 14.588 14.416 14.227 14.025 13.822 13.688 13.55 13.327 13.174 13.021 12.939 12.763 12.574 12.377 12.276 12.0 11.959 11.843 11.728 11.457 11.301 11.145 10.971 10.776 10.572 10.325 9.7 -3 ,24373 ,KEBNE ,17023154,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:21:46 CET,0.0 0.928 1.361 1.701 1.988 2.231 2.443 2.642 3.01 3.192 3.352 3.444 3.766 3.907 4.154 4.393 4.617 4.728 4.949 5.145 5.419 5.597 5.777 6.021 6.24 6.466 6.695 6.934 7.259 7.536 7.782 8.084 8.381 8.669 8.987 9.334 9.675 10.066 10.483 10.912 11.363 11.867 12.448 13.045 13.725 14.464 15.285 16.154 17.089 18.096 19.214 19.871 19.981 19.938 19.818 19.602 19.364 19.094 18.837 18.584 18.32 18.045 17.779 17.516 17.263 17.048 16.801 16.544 16.328 16.114 15.883 15.684 15.477 15.268 15.116 14.958 14.774 14.574 14.386 14.26 14.125 13.91 13.766 13.613 13.532 13.365 13.176 12.979 12.871 12.586 12.554 12.452 12.323 12.018 11.875 11.714 11.525 11.331 11.098 10.818 10.273 -4 ,459 ,KEBNE ,17023155,Wed Dec 22 07:58:21 CET,Wed Dec 22 09:20:47 CET,0.0 0.835 1.194 1.504 1.804 2.068 2.299 2.509 2.866 3.018 3.155 3.25 3.56 3.688 3.948 4.176 4.411 4.533 4.74 4.943 5.234 5.412 5.59 5.857 6.106 6.342 6.577 6.802 7.084 7.344 7.598 7.903 8.191 8.477 8.81 9.182 9.535 9.929 10.352 10.785 11.226 11.743 12.344 12.915 13.577 14.317 15.139 16.001 16.994 18.082 19.099 19.744 19.948 19.863 19.68 19.431 19.12 18.786 18.49 18.199 17.922 17.657 17.386 17.1 16.833 16.598 16.346 16.109 15.89 15.652 15.411 15.209 14.989 14.743 14.556 14.368 14.165 13.958 13.758 13.609 13.438 13.169 13.003 12.842 12.758 12.576 12.387 12.21 12.12 11.852 11.824 11.715 11.594 11.308 11.138 10.963 10.78 10.565 10.283 9.93 9.305 -5 ,1880 ,KEBNE ,17023156,Wed Dec 22 07:58:21 CET,Wed Dec 22 09:20:54 CET,0.0 1.355 1.854 2.221 2.527 2.802 3.03 3.215 3.53 3.67 3.804 3.924 4.242 4.363 4.61 4.856 5.073 5.173 5.371 5.559 5.836 6.02 6.193 6.439 6.676 6.895 7.116 7.336 7.612 7.878 8.138 8.464 8.778 9.072 9.416 9.798 10.164 10.553 10.969 11.418 11.883 12.405 13.004 13.596 14.282 15.048 15.885 16.754 17.717 18.77 19.838 20.399 20.471 20.322 20.065 19.755 19.439 19.101 18.773 18.425 18.115 17.841 17.574 17.299 17.034 16.793 16.529 16.29 16.074 15.832 15.586 15.383 15.169 14.948 14.775 14.596 14.413 14.229 14.029 13.883 13.731 13.517 13.375 13.217 13.139 12.972 12.79 12.603 12.504 12.232 12.155 12.029 11.904 11.64 11.493 11.323 11.144 10.949 10.723 10.46 9.687 -6 ,26631 ,KEBNE ,17023157,Wed Dec 22 07:58:21 CET,Wed Dec 22 09:21:03 CET,0.0 0.837 1.251 1.584 1.883 2.15 2.377 2.582 2.976 3.153 3.323 3.467 3.797 3.939 4.186 4.428 4.664 4.778 5.001 5.204 5.495 5.678 5.856 6.118 6.38 6.631 6.862 7.083 7.362 7.64 7.908 8.22 8.52 8.815 9.161 9.544 9.903 10.273 10.685 11.135 11.573 12.068 12.653 13.244 13.937 14.689 15.535 16.448 17.427 18.459 19.518 20.095 20.187 20.065 19.819 19.479 19.16 18.863 18.573 18.249 17.949 17.671 17.382 17.126 16.858 16.6 16.335 16.081 15.863 15.629 15.375 15.163 14.931 14.688 14.515 14.349 14.18 14.008 13.839 13.719 13.589 13.381 13.232 13.067 12.978 12.794 12.608 12.421 12.321 12.04 11.98 11.856 11.731 11.458 11.297 11.116 10.938 10.742 10.514 10.218 9.657 -7 ,31829 ,KEBNE ,17023158,Wed Dec 22 07:58:21 CET,Wed Dec 22 09:20:57 CET,0.0 0.917 1.356 1.69 1.964 2.207 2.403 2.59 2.946 3.101 3.241 3.323 3.637 3.783 4.056 4.322 4.574 4.691 4.911 5.1 5.381 5.569 5.75 6.022 6.278 6.527 6.769 7.005 7.295 7.555 7.816 8.139 8.447 8.749 9.088 9.447 9.798 10.184 10.599 11.034 11.476 11.98 12.585 13.203 13.896 14.626 15.45 16.312 17.252 18.318 19.397 20.013 20.127 20.008 19.764 19.459 19.174 18.909 18.622 18.283 17.99 17.723 17.451 17.195 16.953 16.708 16.441 16.203 15.984 15.76 15.545 15.368 15.188 14.989 14.826 14.667 14.503 14.32 14.13 13.996 13.863 13.654 13.494 13.334 13.255 13.08 12.901 12.718 12.615 12.335 12.282 12.166 12.039 11.744 11.585 11.409 11.216 10.998 10.726 10.384 9.423 -8 ,3673 ,KEBNE ,17023159,Wed Dec 22 07:58:21 CET,Wed Dec 22 09:20:55 CET,0.0 0.721 1.138 1.432 1.679 1.885 2.085 2.27 2.597 2.755 2.901 2.995 3.311 3.436 3.666 3.896 4.127 4.23 4.425 4.618 4.903 5.077 5.244 5.506 5.762 5.997 6.22 6.445 6.74 7.01 7.259 7.551 7.826 8.106 8.446 8.828 9.188 9.588 10.017 10.461 10.924 11.427 11.99 12.558 13.208 13.922 14.742 15.63 16.592 17.57 18.611 19.254 19.392 19.291 19.036 18.753 18.471 18.152 17.858 17.559 17.273 17.0 16.728 16.446 16.176 15.932 15.68 15.453 15.224 14.984 14.768 14.601 14.422 14.219 14.051 13.886 13.724 13.549 13.36 13.218 13.068 12.847 12.699 12.547 12.463 12.296 12.123 11.932 11.831 11.557 11.538 11.421 11.292 11.017 10.875 10.729 10.549 10.312 10.061 9.791 9.233 -9 ,28401 ,KEBNE ,17023160,Wed Dec 22 07:58:21 CET,Wed Dec 22 09:20:39 CET,0.0 0.723 1.155 1.527 1.798 2.046 2.315 2.553 2.889 3.045 3.2 3.315 3.637 3.766 3.989 4.229 4.47 4.577 4.778 4.976 5.275 5.465 5.652 5.935 6.202 6.444 6.673 6.9 7.181 7.445 7.706 8.02 8.317 8.617 8.95 9.321 9.689 10.074 10.503 10.976 11.478 12.004 12.568 13.147 13.827 14.555 15.363 16.229 17.155 18.169 19.236 19.826 19.958 19.822 19.555 19.274 19.008 18.705 18.398 18.084 17.798 17.506 17.217 16.961 16.704 16.448 16.17 15.922 15.708 15.481 15.236 15.026 14.812 14.599 14.45 14.306 14.14 13.95 13.759 13.63 13.499 13.297 13.144 12.969 12.882 12.718 12.536 12.331 12.223 11.933 11.871 11.741 11.617 11.382 11.262 11.122 10.942 10.742 10.507 10.186 9.542 -10 ,19800 ,KEBNE ,17023161,Wed Dec 22 07:58:21 CET,Wed Dec 22 09:20:53 CET,0.0 1.058 1.534 1.873 2.156 2.403 2.622 2.815 3.135 3.284 3.445 3.566 3.878 4.001 4.244 4.485 4.725 4.837 5.054 5.275 5.583 5.772 5.948 6.199 6.438 6.674 6.915 7.135 7.406 7.664 7.915 8.228 8.532 8.821 9.15 9.533 9.906 10.295 10.692 11.105 11.541 12.044 12.625 13.194 13.869 14.578 15.348 16.21 17.157 18.183 19.255 19.915 20.081 19.972 19.725 19.44 19.14 18.797 18.486 18.169 17.862 17.589 17.335 17.079 16.833 16.602 16.35 16.104 15.875 15.643 15.396 15.19 14.982 14.725 14.514 14.305 14.077 13.854 13.652 13.527 13.41 13.201 13.042 12.891 12.819 12.663 12.482 12.28 12.177 11.903 11.857 11.742 11.617 11.34 11.192 11.022 10.837 10.643 10.422 10.105 9.473 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_56_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_56_58.txt deleted file mode 100644 index fafa368a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_56_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25696 ,KEBNE ,17023162,Wed Dec 22 07:58:21 CET,Wed Dec 22 09:20:25 CET,0.0 1.272 1.693 1.998 2.345 2.601 2.79 2.976 3.296 3.435 3.571 3.65 3.952 4.068 4.286 4.507 4.701 4.786 4.956 5.135 5.399 5.552 5.696 5.911 6.128 6.33 6.51 6.681 6.912 7.143 7.353 7.571 7.78 7.988 8.217 8.458 8.688 8.944 9.228 9.529 9.82 10.128 10.453 10.745 11.067 11.386 11.667 11.896 12.033 11.897 11.227 10.131 9.086 8.083 7.179 6.353 5.62 4.923 4.315 3.713 3.181 2.689 2.226 1.794 1.37 0.995 0.614 0.267 -0.028 -0.345 -0.671 -0.923 -1.182 -1.482 -1.718 -1.954 -2.206 -2.468 -2.742 -2.925 -3.111 -3.399 -3.595 -3.791 -3.892 -4.083 -4.274 -4.491 -4.599 -4.901 -4.97 -5.108 -5.251 -5.533 -5.688 -5.867 -6.095 -6.337 -6.619 -6.979 -7.545 -2 ,10839 ,KEBNE ,17023163,Wed Dec 22 07:58:25 CET,Wed Dec 22 09:15:55 CET,0.0 2.078 2.514 2.755 2.98 3.216 3.413 3.585 3.906 4.062 4.214 4.342 4.676 4.817 5.086 5.33 5.546 5.657 5.865 6.056 6.338 6.519 6.689 6.925 7.145 7.355 7.555 7.756 8.016 8.256 8.487 8.751 8.983 9.2 9.467 9.752 10.003 10.284 10.586 10.888 11.193 11.504 11.856 12.179 12.478 12.784 13.09 13.306 13.43 13.375 12.854 11.814 10.767 9.775 8.868 8.048 7.308 6.623 6.037 5.456 4.947 4.486 4.049 3.626 3.225 2.869 2.498 2.174 1.888 1.591 1.264 0.988 0.707 0.368 0.091 -0.19 -0.488 -0.788 -1.114 -1.345 -1.55 -1.854 -2.081 -2.313 -2.434 -2.676 -2.928 -3.216 -3.383 -3.724 -3.809 -3.95 -4.105 -4.437 -4.621 -4.815 -5.011 -5.217 -5.462 -5.757 -6.629 -3 ,6813 ,KEBNE ,17023164,Wed Dec 22 07:58:25 CET,Wed Dec 22 09:18:00 CET,0.0 1.369 1.762 2.067 2.325 2.546 2.771 2.969 3.288 3.446 3.595 3.663 3.965 4.087 4.337 4.586 4.822 4.93 5.14 5.34 5.608 5.783 5.954 6.196 6.424 6.63 6.835 7.035 7.298 7.542 7.767 8.029 8.265 8.486 8.733 9.001 9.275 9.575 9.851 10.118 10.401 10.701 11.021 11.341 11.663 11.948 12.222 12.391 12.46 12.404 11.89 10.824 9.8 8.841 7.943 7.117 6.332 5.607 5.002 4.399 3.859 3.383 2.955 2.532 2.127 1.77 1.394 1.03 0.693 0.334 -0.057 -0.387 -0.727 -1.082 -1.366 -1.656 -1.958 -2.258 -2.574 -2.793 -3.01 -3.361 -3.604 -3.852 -3.978 -4.231 -4.503 -4.795 -4.956 -5.305 -5.46 -5.633 -5.831 -6.315 -6.575 -6.82 -7.077 -7.365 -7.719 -8.221 -9.646 -4 ,17198 ,KEBNE ,17023165,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:21:40 CET,0.0 2.735 3.148 3.449 3.716 3.943 4.146 4.319 4.635 4.792 4.944 5.053 5.368 5.486 5.714 5.917 6.106 6.198 6.386 6.566 6.813 6.969 7.104 7.31 7.511 7.687 7.858 8.023 8.249 8.461 8.641 8.858 9.074 9.28 9.526 9.813 10.084 10.35 10.625 10.929 11.233 11.544 11.864 12.168 12.505 12.805 13.053 13.28 13.398 13.306 12.677 11.523 10.474 9.522 8.638 7.826 7.101 6.423 5.811 5.19 4.676 4.198 3.731 3.314 2.924 2.562 2.187 1.864 1.578 1.225 0.837 0.528 0.235 -0.062 -0.3 -0.533 -0.767 -1.022 -1.284 -1.467 -1.666 -1.98 -2.199 -2.422 -2.529 -2.731 -2.937 -3.154 -3.267 -3.573 -3.631 -3.768 -3.925 -4.244 -4.415 -4.605 -4.824 -5.072 -5.374 -5.796 -6.765 -5 ,11625 ,KEBNE ,17023166,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:21:34 CET,0.0 1.102 1.421 1.7 1.944 2.175 2.385 2.583 2.933 3.089 3.233 3.308 3.618 3.74 3.959 4.17 4.368 4.462 4.644 4.829 5.093 5.248 5.384 5.576 5.766 5.954 6.13 6.295 6.515 6.749 6.966 7.203 7.43 7.653 7.905 8.171 8.417 8.69 8.978 9.258 9.53 9.814 10.116 10.43 10.761 11.04 11.353 11.621 11.735 11.628 11.006 9.915 8.849 7.842 6.931 6.092 5.369 4.72 4.138 3.54 3.006 2.537 2.108 1.694 1.31 0.974 0.631 0.322 0.06 -0.22 -0.535 -0.803 -1.064 -1.321 -1.526 -1.733 -1.938 -2.16 -2.387 -2.538 -2.7 -2.965 -3.153 -3.346 -3.443 -3.639 -3.858 -4.092 -4.212 -4.52 -4.587 -4.723 -4.873 -5.23 -5.43 -5.634 -5.855 -6.09 -6.38 -6.808 -7.721 -6 ,17178 ,KEBNE ,17023167,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:21:43 CET,0.0 1.603 2.024 2.303 2.535 2.755 2.963 3.159 3.481 3.621 3.781 3.888 4.202 4.325 4.533 4.731 4.951 5.064 5.274 5.449 5.693 5.846 5.983 6.191 6.388 6.568 6.738 6.902 7.107 7.312 7.53 7.793 8.035 8.248 8.49 8.774 9.033 9.3 9.577 9.849 10.105 10.391 10.745 11.086 11.44 11.763 12.061 12.289 12.345 12.234 11.702 10.605 9.542 8.552 7.638 6.785 5.994 5.297 4.713 4.101 3.553 3.086 2.659 2.243 1.864 1.534 1.201 0.904 0.649 0.39 0.108 -0.139 -0.395 -0.651 -0.842 -1.04 -1.251 -1.472 -1.708 -1.869 -2.032 -2.291 -2.488 -2.714 -2.822 -3.025 -3.235 -3.439 -3.55 -3.851 -3.907 -4.045 -4.178 -4.451 -4.612 -4.795 -4.995 -5.208 -5.441 -5.742 -6.517 -7 ,8785 ,KEBNE ,17023168,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:21:36 CET,0.0 1.357 1.764 2.042 2.268 2.45 2.62 2.796 3.149 3.316 3.473 3.561 3.86 3.976 4.197 4.405 4.61 4.7 4.863 5.024 5.256 5.416 5.57 5.79 5.99 6.178 6.36 6.528 6.726 6.923 7.119 7.362 7.6 7.835 8.114 8.404 8.659 8.925 9.215 9.498 9.773 10.1 10.452 10.739 11.051 11.354 11.626 11.84 11.945 11.84 11.267 10.214 9.183 8.249 7.375 6.527 5.789 5.15 4.575 3.975 3.429 2.945 2.507 2.081 1.688 1.339 0.972 0.626 0.324 0.005 -0.324 -0.596 -0.876 -1.165 -1.394 -1.627 -1.882 -2.145 -2.414 -2.605 -2.803 -3.109 -3.319 -3.531 -3.634 -3.838 -4.048 -4.264 -4.382 -4.681 -4.717 -4.844 -4.973 -5.268 -5.445 -5.624 -5.809 -6.006 -6.269 -6.644 -9.95 -8 ,12403 ,KEBNE ,17023169,Wed Dec 22 07:59:27 CET,Wed Dec 22 09:17:38 CET,0.0 1.537 1.847 2.152 2.417 2.623 2.833 3.045 3.444 3.617 3.778 3.916 4.244 4.395 4.697 4.968 5.196 5.298 5.488 5.677 5.954 6.12 6.281 6.53 6.751 6.948 7.14 7.326 7.553 7.759 7.992 8.311 8.601 8.878 9.197 9.554 9.858 10.133 10.42 10.709 10.993 11.304 11.63 11.919 12.241 12.562 12.842 13.078 13.194 13.084 12.541 11.453 10.385 9.411 8.456 7.581 6.845 6.154 5.548 4.958 4.455 4.008 3.571 3.146 2.759 2.417 2.039 1.691 1.411 1.113 0.809 0.576 0.332 0.072 -0.134 -0.335 -0.534 -0.755 -1.0 -1.166 -1.32 -1.553 -1.732 -1.929 -2.03 -2.233 -2.436 -2.654 -2.765 -3.066 -3.135 -3.272 -3.41 -3.705 -3.857 -4.06 -4.326 -4.611 -4.937 -5.319 -6.859 -9 ,24394 ,KEBNE ,17023170,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:21:36 CET,0.0 1.496 1.923 2.232 2.497 2.725 2.907 3.083 3.422 3.577 3.708 3.775 4.083 4.204 4.42 4.616 4.808 4.909 5.122 5.298 5.534 5.681 5.815 6.015 6.207 6.393 6.564 6.726 6.937 7.15 7.359 7.606 7.84 8.057 8.307 8.58 8.837 9.115 9.4 9.68 9.974 10.307 10.658 10.964 11.3 11.592 11.852 12.092 12.205 12.109 11.468 10.258 9.138 8.152 7.285 6.465 5.709 5.017 4.404 3.798 3.298 2.847 2.413 1.999 1.618 1.251 0.866 0.52 0.204 -0.106 -0.414 -0.675 -0.943 -1.229 -1.451 -1.661 -1.873 -2.091 -2.324 -2.489 -2.652 -2.905 -3.081 -3.27 -3.372 -3.582 -3.793 -3.996 -4.098 -4.396 -4.444 -4.577 -4.714 -5.006 -5.17 -5.348 -5.557 -5.772 -6.007 -6.389 -7.51 -10 ,26199 ,KEBNE ,17023171,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:21:28 CET,0.0 1.14 1.548 1.867 2.09 2.291 2.485 2.66 3.042 3.227 3.374 3.462 3.773 3.894 4.118 4.331 4.512 4.597 4.773 4.937 5.175 5.325 5.478 5.693 5.894 6.093 6.269 6.436 6.657 6.885 7.108 7.382 7.64 7.875 8.127 8.385 8.639 8.922 9.227 9.526 9.813 10.109 10.43 10.735 11.063 11.381 11.655 11.862 11.982 11.935 11.43 10.396 9.329 8.363 7.471 6.645 5.925 5.257 4.66 4.048 3.53 3.071 2.636 2.211 1.802 1.433 1.028 0.672 0.383 0.076 -0.257 -0.545 -0.836 -1.133 -1.354 -1.577 -1.809 -2.058 -2.346 -2.545 -2.746 -3.041 -3.244 -3.473 -3.586 -3.825 -4.087 -4.337 -4.463 -4.779 -4.864 -5.011 -5.164 -5.507 -5.693 -5.89 -6.095 -6.326 -6.611 -6.996 -7.825 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_57_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_57_42.txt deleted file mode 100644 index 5f59d978..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_57_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24043 ,KEBNE ,17045901,Thu Dec 23 05:48:48 CET,Thu Dec 23 07:03:51 CET,0.0 1.207 1.52 1.775 1.979 2.137 2.276 2.408 2.668 2.773 2.85 2.818 3.061 3.129 3.258 3.384 3.497 3.547 3.649 3.741 3.867 3.943 4.008 4.112 4.211 4.302 4.391 4.469 4.559 4.633 4.699 4.772 4.837 4.882 4.922 4.963 4.997 5.037 5.051 5.025 4.988 4.932 4.839 4.713 4.529 4.259 3.824 3.221 2.297 0.85 -1.539 -4.324 -6.536 -8.34 -9.853 -11.207 -12.397 -13.459 -14.37 -15.254 -15.984 -16.643 -17.269 -17.876 -18.431 -18.912 -19.428 -19.9 -20.315 -20.743 -21.18 -21.541 -21.926 -22.316 -22.608 -22.92 -23.257 -23.615 -23.986 -24.245 -24.505 -24.896 -25.176 -25.471 -25.623 -25.954 -26.281 -26.626 -26.813 -27.19 -27.379 -27.584 -27.803 -28.275 -28.536 -28.836 -29.19 -29.558 -29.973 -30.544 -33.02 -2 ,9895 ,KEBNE ,17045902,Thu Dec 23 05:49:46 CET,Thu Dec 23 07:11:19 CET,0.0 1.25 1.626 1.894 2.064 2.216 2.354 2.477 2.665 2.752 2.84 2.83 3.073 3.142 3.262 3.381 3.503 3.553 3.65 3.745 3.871 3.938 3.994 4.088 4.184 4.274 4.349 4.419 4.495 4.564 4.628 4.693 4.762 4.819 4.869 4.912 4.935 4.951 4.963 4.958 4.927 4.864 4.751 4.581 4.334 4.021 3.569 2.939 2.003 0.555 -1.873 -4.699 -6.927 -8.765 -10.306 -11.673 -12.861 -13.904 -14.783 -15.663 -16.411 -17.066 -17.674 -18.215 -18.717 -19.184 -19.677 -20.123 -20.502 -20.882 -21.266 -21.582 -21.919 -22.275 -22.556 -22.854 -23.171 -23.488 -23.808 -24.02 -24.232 -24.61 -24.876 -25.143 -25.279 -25.566 -25.865 -26.182 -26.352 -26.708 -26.867 -27.057 -27.253 -27.674 -27.913 -28.197 -28.505 -28.83 -29.224 -29.828 -32.143 -3 ,17088 ,KEBNE ,17045903,Thu Dec 23 05:50:48 CET,Thu Dec 23 07:12:46 CET,0.0 1.176 1.661 1.937 2.104 2.238 2.342 2.445 2.661 2.754 2.848 2.837 3.086 3.166 3.295 3.416 3.501 3.536 3.619 3.7 3.806 3.87 3.928 4.027 4.131 4.218 4.293 4.365 4.457 4.523 4.576 4.643 4.701 4.756 4.829 4.897 4.922 4.936 4.954 4.947 4.903 4.836 4.752 4.631 4.443 4.149 3.69 3.027 2.064 0.625 -1.767 -4.639 -6.938 -8.83 -10.409 -11.758 -12.918 -13.937 -14.792 -15.65 -16.383 -17.01 -17.594 -18.155 -18.691 -19.174 -19.683 -20.148 -20.539 -20.935 -21.349 -21.697 -22.048 -22.4 -22.67 -22.955 -23.246 -23.557 -23.883 -24.114 -24.352 -24.688 -24.929 -25.184 -25.323 -25.628 -25.925 -26.24 -26.408 -26.768 -26.913 -27.106 -27.319 -27.793 -28.056 -28.35 -28.686 -29.083 -29.528 -30.056 -32.054 -4 ,18716 ,KEBNE ,17045904,Thu Dec 23 05:50:48 CET,Thu Dec 23 07:12:25 CET,0.0 1.197 1.521 1.774 1.965 2.12 2.264 2.384 2.572 2.664 2.762 2.78 3.027 3.089 3.234 3.394 3.533 3.605 3.729 3.814 3.929 3.999 4.058 4.14 4.217 4.292 4.362 4.432 4.515 4.582 4.642 4.697 4.744 4.799 4.846 4.898 4.955 4.997 5.023 5.007 4.971 4.919 4.824 4.69 4.49 4.167 3.688 3.063 2.139 0.708 -1.685 -4.469 -6.66 -8.466 -10.03 -11.403 -12.549 -13.586 -14.476 -15.332 -16.061 -16.707 -17.337 -17.925 -18.462 -18.952 -19.463 -19.926 -20.313 -20.703 -21.112 -21.462 -21.837 -22.222 -22.515 -22.832 -23.161 -23.506 -23.872 -24.114 -24.361 -24.76 -25.044 -25.324 -25.456 -25.733 -26.045 -26.36 -26.539 -26.941 -27.19 -27.437 -27.685 -28.192 -28.446 -28.719 -29.051 -29.431 -29.882 -30.515 -32.165 -5 ,11485 ,KEBNE ,17045905,Thu Dec 23 05:50:48 CET,Thu Dec 23 07:12:12 CET,0.0 1.411 1.748 1.999 2.217 2.38 2.527 2.653 2.901 3.035 3.142 3.131 3.369 3.43 3.536 3.634 3.742 3.795 3.898 4.001 4.129 4.196 4.26 4.342 4.421 4.506 4.583 4.658 4.739 4.805 4.877 4.973 5.043 5.084 5.131 5.189 5.231 5.264 5.279 5.276 5.259 5.21 5.093 4.916 4.681 4.361 3.904 3.257 2.301 0.851 -1.536 -4.301 -6.554 -8.426 -9.965 -11.328 -12.525 -13.586 -14.465 -15.357 -16.104 -16.761 -17.398 -17.972 -18.5 -18.982 -19.481 -19.911 -20.275 -20.659 -21.05 -21.373 -21.714 -22.077 -22.365 -22.669 -22.984 -23.29 -23.602 -23.831 -24.071 -24.451 -24.733 -25.034 -25.183 -25.477 -25.777 -26.082 -26.248 -26.629 -26.811 -27.008 -27.216 -27.657 -27.932 -28.24 -28.584 -28.975 -29.413 -30.088 -32.257 -6 ,29477 ,KEBNE ,17045906,Thu Dec 23 05:50:48 CET,Thu Dec 23 07:12:24 CET,0.0 1.062 1.361 1.573 1.737 1.886 2.018 2.124 2.309 2.401 2.483 2.459 2.701 2.766 2.877 2.991 3.098 3.146 3.246 3.34 3.479 3.559 3.631 3.739 3.824 3.914 3.993 4.05 4.118 4.182 4.241 4.312 4.372 4.419 4.464 4.515 4.556 4.582 4.592 4.581 4.553 4.49 4.371 4.237 4.015 3.692 3.238 2.567 1.571 0.115 -2.256 -5.048 -7.258 -9.112 -10.718 -12.1 -13.254 -14.269 -15.12 -15.964 -16.685 -17.332 -17.936 -18.478 -19.016 -19.532 -20.044 -20.484 -20.859 -21.252 -21.665 -21.996 -22.327 -22.681 -22.966 -23.248 -23.543 -23.863 -24.189 -24.424 -24.666 -25.027 -25.289 -25.559 -25.689 -25.963 -26.257 -26.561 -26.718 -27.086 -27.274 -27.48 -27.698 -28.161 -28.427 -28.741 -29.105 -29.515 -29.982 -30.612 -32.177 -7 ,31021 ,KEBNE ,17045907,Thu Dec 23 05:50:48 CET,Thu Dec 23 07:12:21 CET,0.0 1.206 1.506 1.775 1.979 2.148 2.293 2.413 2.628 2.709 2.785 2.753 2.987 3.058 3.19 3.301 3.409 3.46 3.563 3.669 3.822 3.913 3.994 4.101 4.192 4.276 4.342 4.406 4.496 4.574 4.64 4.719 4.794 4.849 4.895 4.949 4.987 5.006 5.011 4.993 4.96 4.881 4.748 4.607 4.394 4.096 3.647 2.977 1.969 0.501 -1.847 -4.648 -6.884 -8.711 -10.262 -11.638 -12.786 -13.796 -14.676 -15.554 -16.292 -16.942 -17.552 -18.126 -18.686 -19.179 -19.662 -20.103 -20.49 -20.886 -21.3 -21.647 -22.013 -22.388 -22.657 -22.925 -23.219 -23.55 -23.891 -24.113 -24.34 -24.738 -25.051 -25.375 -25.529 -25.832 -26.165 -26.534 -26.733 -27.132 -27.346 -27.574 -27.825 -28.387 -28.692 -28.995 -29.304 -29.641 -30.081 -30.79 -33.15 -8 ,14142 ,KEBNE ,17045908,Thu Dec 23 05:50:48 CET,Thu Dec 23 07:12:21 CET,0.0 0.909 1.233 1.463 1.66 1.821 1.96 2.093 2.334 2.451 2.552 2.553 2.795 2.862 3.005 3.124 3.221 3.276 3.374 3.456 3.596 3.675 3.74 3.838 3.931 4.015 4.083 4.143 4.227 4.307 4.384 4.466 4.531 4.577 4.623 4.673 4.715 4.748 4.776 4.783 4.777 4.767 4.678 4.519 4.295 4.018 3.607 2.979 2.062 0.646 -1.769 -4.6 -6.83 -8.684 -10.249 -11.616 -12.781 -13.816 -14.708 -15.592 -16.342 -16.995 -17.607 -18.181 -18.716 -19.194 -19.678 -20.125 -20.514 -20.912 -21.328 -21.67 -22.02 -22.401 -22.688 -22.964 -23.253 -23.59 -23.971 -24.228 -24.489 -24.884 -25.156 -25.442 -25.586 -25.877 -26.184 -26.503 -26.674 -27.046 -27.224 -27.422 -27.64 -28.175 -28.473 -28.786 -29.11 -29.469 -29.949 -30.532 -33.207 -9 ,12902 ,KEBNE ,17045909,Thu Dec 23 05:50:48 CET,Thu Dec 23 07:12:31 CET,0.0 0.495 0.737 0.952 1.127 1.29 1.435 1.56 1.777 1.864 1.942 1.913 2.15 2.211 2.33 2.439 2.555 2.613 2.715 2.806 2.933 3.011 3.085 3.195 3.29 3.372 3.45 3.507 3.576 3.645 3.707 3.779 3.841 3.885 3.921 3.969 4.011 4.056 4.073 4.039 3.987 3.921 3.815 3.66 3.447 3.151 2.725 2.124 1.194 -0.236 -2.635 -5.486 -7.734 -9.584 -11.117 -12.488 -13.69 -14.73 -15.607 -16.491 -17.222 -17.875 -18.487 -19.047 -19.578 -20.041 -20.515 -20.964 -21.357 -21.752 -22.166 -22.504 -22.849 -23.213 -23.492 -23.767 -24.049 -24.352 -24.665 -24.886 -25.117 -25.467 -25.715 -25.982 -26.118 -26.41 -26.713 -27.029 -27.193 -27.56 -27.736 -27.939 -28.156 -28.633 -28.886 -29.166 -29.489 -29.827 -30.235 -30.824 -34.263 -10 ,2868 ,KEBNE ,17045910,Thu Dec 23 05:50:48 CET,Thu Dec 23 07:12:20 CET,0.0 0.799 1.102 1.322 1.512 1.671 1.805 1.928 2.146 2.247 2.332 2.292 2.528 2.595 2.71 2.829 2.936 2.982 3.068 3.152 3.258 3.318 3.387 3.489 3.571 3.646 3.724 3.793 3.87 3.946 4.019 4.088 4.159 4.225 4.283 4.33 4.364 4.4 4.431 4.435 4.398 4.33 4.227 4.068 3.837 3.529 3.087 2.432 1.46 0.009 -2.413 -5.224 -7.463 -9.292 -10.836 -12.196 -13.34 -14.355 -15.209 -16.061 -16.78 -17.418 -18.026 -18.6 -19.136 -19.619 -20.112 -20.557 -20.951 -21.353 -21.761 -22.1 -22.458 -22.832 -23.107 -23.379 -23.685 -23.995 -24.311 -24.542 -24.775 -25.143 -25.402 -25.669 -25.81 -26.107 -26.42 -26.746 -26.913 -27.274 -27.483 -27.734 -27.979 -28.492 -28.795 -29.128 -29.511 -29.947 -30.446 -31.2 -34.278 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_60_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_60_37.txt deleted file mode 100644 index d05a7bf3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_60_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4000 ,KEBNE ,17023172,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:20:58 CET,0.0 0.309 0.473 0.596 0.71 0.828 0.956 1.079 1.276 1.353 1.433 1.398 1.657 1.711 1.814 1.915 2.014 2.059 2.15 2.244 2.43 2.56 2.675 2.841 2.992 3.117 3.225 3.334 3.474 3.619 3.773 3.979 4.163 4.315 4.483 4.652 4.816 4.988 5.137 5.266 5.394 5.543 5.689 5.805 5.901 5.933 5.918 5.801 5.453 4.77 3.438 1.665 0.155 -1.175 -2.339 -3.368 -4.247 -5.024 -5.694 -6.364 -6.938 -7.454 -7.953 -8.426 -8.859 -9.238 -9.638 -10.01 -10.337 -10.683 -11.021 -11.275 -11.533 -11.802 -12.016 -12.226 -12.447 -12.696 -12.941 -13.101 -13.258 -13.506 -13.701 -13.932 -14.043 -14.237 -14.431 -14.651 -14.76 -15.069 -15.081 -15.202 -15.337 -15.639 -15.806 -15.972 -16.126 -16.302 -16.513 -16.77 -17.339 -2 ,19826 ,KEBNE ,17023173,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:20:45 CET,0.0 0.371 0.546 0.665 0.786 0.893 0.983 1.076 1.257 1.332 1.41 1.374 1.648 1.718 1.832 1.94 2.037 2.085 2.177 2.26 2.393 2.481 2.57 2.697 2.81 2.923 3.031 3.134 3.257 3.366 3.473 3.599 3.721 3.84 3.964 4.079 4.18 4.288 4.383 4.474 4.578 4.669 4.746 4.822 4.925 4.963 4.871 4.716 4.4 3.73 2.434 0.657 -0.939 -2.308 -3.459 -4.487 -5.372 -6.142 -6.774 -7.427 -8.001 -8.483 -8.937 -9.374 -9.779 -10.136 -10.498 -10.82 -11.092 -11.378 -11.674 -11.92 -12.176 -12.431 -12.632 -12.833 -13.04 -13.268 -13.506 -13.676 -13.847 -14.091 -14.257 -14.436 -14.537 -14.732 -14.923 -15.135 -15.248 -15.57 -15.576 -15.699 -15.824 -16.088 -16.234 -16.393 -16.575 -16.761 -16.965 -17.22 -17.842 -3 ,14018 ,KEBNE ,17023174,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:20:57 CET,0.0 0.844 1.087 1.228 1.368 1.517 1.637 1.726 1.89 1.96 2.031 1.967 2.21 2.264 2.373 2.473 2.576 2.628 2.722 2.813 2.938 3.005 3.076 3.184 3.28 3.356 3.427 3.505 3.602 3.695 3.779 3.871 3.964 4.058 4.161 4.281 4.381 4.467 4.574 4.689 4.787 4.871 4.937 4.966 4.959 4.929 4.844 4.621 4.185 3.467 2.084 0.316 -1.191 -2.485 -3.546 -4.513 -5.358 -6.099 -6.741 -7.389 -7.955 -8.449 -8.919 -9.355 -9.76 -10.123 -10.517 -10.904 -11.244 -11.569 -11.89 -12.149 -12.412 -12.69 -12.896 -13.117 -13.352 -13.581 -13.815 -13.978 -14.141 -14.39 -14.564 -14.732 -14.817 -14.996 -15.183 -15.384 -15.493 -15.813 -15.84 -15.977 -16.114 -16.378 -16.53 -16.685 -16.835 -17.012 -17.215 -17.449 -18.114 -4 ,14384 ,KEBNE ,17023175,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:21:16 CET,0.0 0.316 0.559 0.749 0.887 1.008 1.147 1.273 1.437 1.506 1.583 1.524 1.788 1.856 1.975 2.087 2.19 2.238 2.333 2.427 2.548 2.624 2.691 2.78 2.864 2.943 3.029 3.125 3.248 3.368 3.475 3.609 3.738 3.841 3.959 4.072 4.17 4.303 4.454 4.581 4.681 4.777 4.881 4.953 4.982 4.969 4.874 4.681 4.308 3.567 2.141 0.323 -1.212 -2.51 -3.637 -4.632 -5.491 -6.272 -6.953 -7.621 -8.185 -8.676 -9.147 -9.587 -10.003 -10.381 -10.751 -11.078 -11.367 -11.666 -11.969 -12.219 -12.479 -12.746 -12.94 -13.139 -13.353 -13.562 -13.774 -13.934 -14.099 -14.353 -14.532 -14.712 -14.802 -14.98 -15.172 -15.377 -15.485 -15.8 -15.839 -15.974 -16.109 -16.392 -16.55 -16.708 -16.88 -17.069 -17.288 -17.559 -18.23 -5 ,20978 ,KEBNE ,17023176,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:21:14 CET,0.0 0.325 0.508 0.642 0.754 0.84 0.921 1.002 1.172 1.256 1.333 1.275 1.532 1.587 1.691 1.801 1.911 1.957 2.045 2.134 2.257 2.331 2.407 2.515 2.598 2.676 2.755 2.845 2.977 3.1 3.217 3.366 3.511 3.644 3.806 3.966 4.083 4.221 4.396 4.566 4.732 4.885 5.001 5.121 5.236 5.285 5.261 5.153 4.853 4.21 2.882 1.097 -0.457 -1.804 -2.958 -4.032 -5.004 -5.847 -6.526 -7.192 -7.759 -8.26 -8.743 -9.22 -9.678 -10.077 -10.494 -10.861 -11.16 -11.482 -11.808 -12.06 -12.317 -12.595 -12.809 -13.023 -13.247 -13.481 -13.728 -13.898 -14.076 -14.373 -14.574 -14.772 -14.868 -15.06 -15.276 -15.505 -15.625 -15.959 -16.005 -16.133 -16.281 -16.656 -16.858 -17.086 -17.348 -17.611 -17.895 -18.271 -18.942 -6 ,22279 ,KEBNE ,17023177,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:22:17 CET,0.0 0.233 0.374 0.542 0.779 1.018 1.199 1.366 1.672 1.801 1.919 1.912 2.187 2.258 2.406 2.563 2.69 2.747 2.875 2.994 3.148 3.243 3.334 3.464 3.604 3.732 3.833 3.934 4.072 4.195 4.303 4.432 4.547 4.657 4.786 4.929 5.074 5.233 5.387 5.559 5.723 5.844 5.963 6.101 6.221 6.264 6.22 6.058 5.721 5.019 3.59 1.736 0.17 -1.159 -2.283 -3.298 -4.186 -4.994 -5.692 -6.377 -6.967 -7.482 -7.966 -8.422 -8.839 -9.219 -9.603 -9.945 -10.242 -10.544 -10.859 -11.114 -11.372 -11.634 -11.837 -12.057 -12.289 -12.527 -12.781 -12.963 -13.146 -13.402 -13.58 -13.785 -13.886 -14.076 -14.274 -14.509 -14.639 -14.975 -15.04 -15.18 -15.315 -15.604 -15.758 -15.937 -16.133 -16.379 -16.659 -16.958 -17.814 -7 ,16621 ,KEBNE ,17023178,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:21:03 CET,0.0 0.703 1.023 1.304 1.541 1.744 1.944 2.105 2.388 2.52 2.626 2.62 2.904 2.99 3.158 3.341 3.504 3.569 3.703 3.837 4.011 4.118 4.225 4.391 4.543 4.674 4.799 4.922 5.09 5.242 5.371 5.517 5.657 5.782 5.92 6.076 6.221 6.375 6.533 6.683 6.835 6.988 7.115 7.216 7.287 7.329 7.305 7.121 6.735 6.039 4.704 2.963 1.452 0.133 -1.008 -2.047 -2.928 -3.717 -4.423 -5.131 -5.737 -6.275 -6.775 -7.232 -7.653 -8.045 -8.456 -8.802 -9.106 -9.428 -9.759 -10.036 -10.314 -10.606 -10.84 -11.07 -11.289 -11.528 -11.78 -11.94 -12.102 -12.359 -12.546 -12.748 -12.856 -13.072 -13.295 -13.536 -13.663 -13.996 -14.034 -14.161 -14.297 -14.598 -14.756 -14.92 -15.114 -15.347 -15.617 -15.951 -16.88 -8 ,18496 ,KEBNE ,17023179,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:20:53 CET,0.0 0.71 0.969 1.156 1.309 1.44 1.552 1.647 1.838 1.939 2.029 1.996 2.274 2.372 2.552 2.714 2.86 2.93 3.062 3.188 3.385 3.5 3.598 3.747 3.892 4.035 4.183 4.315 4.458 4.599 4.718 4.837 4.972 5.098 5.221 5.35 5.482 5.627 5.763 5.879 5.98 6.112 6.27 6.364 6.424 6.45 6.414 6.282 5.938 5.254 3.914 2.137 0.636 -0.662 -1.799 -2.794 -3.652 -4.446 -5.148 -5.836 -6.394 -6.884 -7.369 -7.837 -8.27 -8.663 -9.065 -9.424 -9.726 -10.04 -10.371 -10.639 -10.913 -11.197 -11.433 -11.678 -11.919 -12.155 -12.393 -12.564 -12.737 -13.001 -13.18 -13.367 -13.474 -13.694 -13.898 -14.118 -14.232 -14.556 -14.598 -14.735 -14.88 -15.173 -15.323 -15.49 -15.682 -15.891 -16.139 -16.44 -17.053 -9 ,12276 ,KEBNE ,17023180,Wed Dec 22 07:59:23 CET,Wed Dec 22 09:22:04 CET,0.0 0.597 0.846 1.03 1.169 1.291 1.416 1.542 1.792 1.91 1.998 1.943 2.216 2.287 2.434 2.587 2.728 2.798 2.932 3.038 3.184 3.288 3.386 3.523 3.647 3.761 3.883 4.001 4.162 4.326 4.473 4.641 4.793 4.962 5.152 5.317 5.481 5.648 5.803 5.953 6.104 6.272 6.415 6.516 6.61 6.648 6.599 6.423 6.085 5.418 4.031 2.234 0.708 -0.629 -1.793 -2.809 -3.705 -4.523 -5.197 -5.882 -6.473 -6.993 -7.505 -7.975 -8.408 -8.807 -9.227 -9.607 -9.921 -10.25 -10.601 -10.883 -11.171 -11.451 -11.654 -11.868 -12.092 -12.311 -12.534 -12.705 -12.879 -13.136 -13.314 -13.494 -13.583 -13.771 -13.976 -14.188 -14.296 -14.622 -14.649 -14.773 -14.889 -15.135 -15.272 -15.425 -15.6 -15.788 -15.97 -16.178 -16.676 -10 ,25122 ,KEBNE ,17023181,Wed Dec 22 08:00:25 CET,Wed Dec 22 09:23:14 CET,0.0 0.489 0.753 0.986 1.176 1.345 1.502 1.645 1.928 2.066 2.192 2.23 2.514 2.601 2.788 2.957 3.11 3.177 3.307 3.438 3.612 3.717 3.831 4.018 4.201 4.366 4.519 4.654 4.807 4.941 5.065 5.226 5.378 5.527 5.686 5.828 5.984 6.174 6.355 6.532 6.692 6.833 6.974 7.094 7.219 7.268 7.189 7.03 6.699 6.029 4.682 2.807 1.234 -0.076 -1.219 -2.233 -3.116 -3.933 -4.615 -5.285 -5.876 -6.409 -6.916 -7.367 -7.789 -8.198 -8.612 -8.977 -9.292 -9.604 -9.939 -10.221 -10.515 -10.817 -11.041 -11.285 -11.536 -11.793 -12.067 -12.247 -12.427 -12.707 -12.903 -13.098 -13.196 -13.403 -13.632 -13.874 -13.998 -14.333 -14.377 -14.497 -14.632 -14.921 -15.079 -15.272 -15.48 -15.705 -15.963 -16.306 -16.906 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_60_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_60_61.txt deleted file mode 100644 index 118000b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_60_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7002 ,KEBNE ,17023182,Wed Dec 22 08:00:24 CET,Wed Dec 22 09:21:44 CET,0.0 1.15 1.58 1.903 2.212 2.47 2.66 2.844 3.213 3.381 3.541 3.664 4.013 4.151 4.421 4.702 4.985 5.121 5.365 5.59 5.929 6.147 6.357 6.654 6.925 7.194 7.459 7.71 8.029 8.343 8.633 8.973 9.323 9.659 10.065 10.561 11.031 11.51 12.01 12.533 13.093 13.736 14.477 15.19 16.007 16.914 17.916 19.049 20.36 21.769 23.288 24.329 24.816 25.012 25.032 24.967 24.837 24.672 24.516 24.337 24.149 23.94 23.734 23.55 23.377 23.22 23.042 22.878 22.738 22.579 22.412 22.274 22.128 21.981 21.871 21.743 21.608 21.463 21.294 21.182 21.073 20.89 20.764 20.643 20.578 20.438 20.297 20.137 20.058 19.792 19.769 19.665 19.557 19.311 19.173 19.018 18.816 18.605 18.376 18.023 16.983 -2 ,28619 ,KEBNE ,17023183,Wed Dec 22 08:00:25 CET,Wed Dec 22 09:21:52 CET,0.0 0.935 1.266 1.536 1.788 2.06 2.306 2.528 2.925 3.104 3.284 3.446 3.799 3.94 4.22 4.498 4.765 4.888 5.117 5.339 5.654 5.857 6.053 6.336 6.618 6.899 7.162 7.404 7.711 8.023 8.331 8.688 9.03 9.365 9.763 10.224 10.651 11.094 11.579 12.092 12.638 13.281 14.015 14.727 15.545 16.477 17.52 18.645 19.923 21.335 22.799 23.799 24.293 24.461 24.447 24.365 24.232 24.057 23.879 23.669 23.472 23.284 23.086 22.883 22.691 22.503 22.291 22.112 21.958 21.784 21.601 21.458 21.311 21.164 21.048 20.925 20.788 20.64 20.476 20.352 20.234 20.061 19.94 19.814 19.747 19.605 19.443 19.26 19.169 18.892 18.858 18.764 18.663 18.407 18.266 18.099 17.893 17.661 17.41 17.085 15.775 -3 ,20542 ,KEBNE ,17023184,Wed Dec 22 08:00:24 CET,Wed Dec 22 09:23:24 CET,0.0 1.115 1.534 1.879 2.158 2.406 2.653 2.875 3.288 3.487 3.658 3.755 4.099 4.266 4.588 4.844 5.088 5.21 5.451 5.689 5.994 6.184 6.389 6.685 6.967 7.231 7.481 7.738 8.066 8.389 8.712 9.07 9.388 9.716 10.116 10.543 10.959 11.439 11.941 12.473 13.04 13.67 14.399 15.121 15.929 16.8 17.822 18.934 20.155 21.543 23.07 24.113 24.555 24.709 24.695 24.592 24.459 24.313 24.176 24.022 23.859 23.712 23.566 23.422 23.291 23.164 23.029 22.895 22.779 22.661 22.519 22.391 22.26 22.122 22.013 21.903 21.796 21.682 21.549 21.45 21.353 21.208 21.102 20.986 20.923 20.797 20.668 20.506 20.406 20.115 20.047 19.915 19.781 19.473 19.323 19.195 19.059 18.878 18.641 18.347 17.616 -4 ,25726 ,KEBNE ,17023185,Wed Dec 22 08:00:25 CET,Wed Dec 22 09:23:29 CET,0.0 1.598 2.066 2.39 2.657 2.898 3.13 3.342 3.698 3.869 4.043 4.213 4.567 4.706 4.983 5.251 5.501 5.62 5.855 6.081 6.395 6.591 6.787 7.085 7.387 7.676 7.946 8.208 8.548 8.892 9.231 9.626 9.992 10.363 10.781 11.229 11.687 12.176 12.68 13.225 13.817 14.461 15.175 15.892 16.714 17.608 18.645 19.771 20.968 22.291 23.769 24.804 25.243 25.314 25.253 25.164 25.022 24.836 24.652 24.451 24.253 24.064 23.873 23.678 23.478 23.28 23.074 22.9 22.744 22.564 22.38 22.223 22.069 21.914 21.783 21.648 21.504 21.351 21.195 21.09 20.98 20.796 20.669 20.544 20.471 20.319 20.17 20.018 19.941 19.673 19.632 19.503 19.358 19.068 18.893 18.661 18.425 18.174 17.886 17.494 15.687 -5 ,20103 ,KEBNE ,17023186,Wed Dec 22 08:00:25 CET,Wed Dec 22 09:21:53 CET,0.0 1.472 1.959 2.275 2.531 2.756 2.964 3.185 3.601 3.764 3.925 4.07 4.412 4.557 4.843 5.117 5.372 5.496 5.734 5.954 6.277 6.49 6.696 6.997 7.3 7.591 7.851 8.101 8.441 8.762 9.056 9.395 9.726 10.072 10.477 10.92 11.347 11.821 12.33 12.885 13.455 14.044 14.741 15.45 16.254 17.141 18.141 19.242 20.502 21.892 23.378 24.318 24.675 24.788 24.772 24.689 24.545 24.378 24.21 24.009 23.813 23.621 23.415 23.223 23.035 22.84 22.639 22.449 22.271 22.086 21.887 21.721 21.546 21.354 21.214 21.069 20.903 20.734 20.552 20.418 20.283 20.074 19.927 19.77 19.689 19.527 19.355 19.178 19.086 18.811 18.786 18.669 18.545 18.282 18.133 17.968 17.789 17.588 17.368 17.121 15.695 -6 ,21061 ,KEBNE ,17023187,Wed Dec 22 08:00:24 CET,Wed Dec 22 09:21:51 CET,0.0 1.116 1.493 1.809 2.116 2.388 2.607 2.812 3.174 3.341 3.509 3.634 3.959 4.078 4.305 4.539 4.781 4.895 5.112 5.313 5.607 5.803 5.991 6.287 6.588 6.87 7.135 7.386 7.707 8.005 8.293 8.655 9.004 9.346 9.754 10.213 10.639 11.097 11.598 12.117 12.644 13.24 13.928 14.627 15.441 16.341 17.364 18.471 19.725 21.088 22.573 23.528 23.908 24.002 23.957 23.863 23.718 23.536 23.361 23.147 22.938 22.749 22.541 22.332 22.146 21.976 21.807 21.664 21.52 21.359 21.198 21.066 20.926 20.779 20.658 20.519 20.368 20.218 20.073 19.976 19.876 19.714 19.588 19.447 19.372 19.211 19.042 18.869 18.781 18.508 18.484 18.385 18.287 18.026 17.881 17.725 17.539 17.32 17.048 16.66 15.304 -7 ,28787 ,KEBNE ,17023188,Wed Dec 22 08:00:25 CET,Wed Dec 22 09:23:22 CET,0.0 1.184 1.643 1.968 2.227 2.49 2.722 2.926 3.293 3.465 3.627 3.733 4.064 4.19 4.452 4.725 4.985 5.107 5.349 5.579 5.894 6.116 6.344 6.667 6.964 7.243 7.512 7.773 8.109 8.432 8.75 9.141 9.517 9.869 10.26 10.712 11.189 11.708 12.231 12.797 13.374 13.975 14.687 15.43 16.29 17.196 18.202 19.318 20.583 21.976 23.429 24.349 24.744 24.857 24.823 24.727 24.573 24.402 24.231 24.029 23.831 23.635 23.45 23.246 23.039 22.856 22.664 22.485 22.322 22.163 21.978 21.803 21.628 21.448 21.312 21.171 21.022 20.866 20.705 20.594 20.482 20.309 20.184 20.052 19.985 19.842 19.66 19.453 19.353 19.067 19.014 18.89 18.757 18.461 18.287 18.1 17.9 17.673 17.392 17.048 15.783 -8 ,18015 ,KEBNE ,17023189,Wed Dec 22 08:00:25 CET,Wed Dec 22 09:21:54 CET,0.0 1.461 1.854 2.185 2.478 2.724 2.934 3.141 3.538 3.71 3.88 4.003 4.339 4.477 4.75 5.013 5.249 5.362 5.597 5.827 6.143 6.344 6.536 6.825 7.102 7.362 7.63 7.893 8.238 8.562 8.884 9.286 9.654 9.991 10.372 10.795 11.21 11.691 12.214 12.778 13.352 13.994 14.728 15.42 16.212 17.104 18.097 19.175 20.418 21.753 23.196 24.22 24.633 24.781 24.796 24.699 24.517 24.32 24.123 23.888 23.683 23.509 23.339 23.159 22.983 22.817 22.624 22.452 22.296 22.114 21.935 21.793 21.638 21.469 21.344 21.213 21.072 20.928 20.782 20.676 20.564 20.394 20.28 20.156 20.09 19.95 19.788 19.601 19.497 19.214 19.205 19.105 18.979 18.703 18.558 18.399 18.22 17.977 17.576 17.045 15.365 -9 ,506 ,KEBNE ,17023190,Wed Dec 22 08:00:28 CET,Wed Dec 22 09:18:32 CET,0.0 1.003 1.358 1.641 1.856 2.066 2.271 2.447 2.762 2.911 3.057 3.145 3.465 3.577 3.807 4.026 4.228 4.331 4.537 4.74 5.016 5.191 5.363 5.604 5.84 6.071 6.308 6.533 6.808 7.075 7.337 7.661 7.982 8.286 8.635 9.026 9.4 9.814 10.254 10.723 11.209 11.759 12.402 13.032 13.778 14.595 15.513 16.543 17.714 19.048 20.592 21.677 22.081 22.148 22.074 21.923 21.718 21.46 21.207 20.925 20.656 20.412 20.174 19.944 19.711 19.476 19.207 18.979 18.778 18.545 18.295 18.108 17.934 17.742 17.598 17.447 17.277 17.108 16.913 16.774 16.643 16.434 16.282 16.122 16.039 15.871 15.696 15.494 15.394 15.118 15.07 14.944 14.806 14.513 14.356 14.176 13.981 13.754 13.448 13.067 11.725 -10 ,23610 ,KEBNE ,17023191,Wed Dec 22 08:00:24 CET,Wed Dec 22 09:21:44 CET,0.0 1.23 1.618 1.946 2.218 2.47 2.685 2.878 3.235 3.392 3.558 3.697 4.04 4.179 4.456 4.719 4.959 5.079 5.324 5.548 5.861 6.063 6.259 6.536 6.793 7.056 7.32 7.574 7.904 8.227 8.532 8.913 9.301 9.663 10.085 10.576 11.015 11.479 11.991 12.537 13.099 13.722 14.448 15.198 16.058 16.982 17.99 19.061 20.284 21.653 23.124 24.065 24.474 24.591 24.549 24.439 24.287 24.131 23.972 23.787 23.603 23.416 23.215 23.006 22.792 22.584 22.379 22.202 22.027 21.839 21.646 21.486 21.33 21.167 21.038 20.896 20.744 20.591 20.432 20.327 20.216 20.046 19.921 19.782 19.71 19.572 19.438 19.296 19.222 18.956 18.905 18.769 18.623 18.31 18.141 17.949 17.737 17.507 17.226 16.876 15.821 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_60_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_60_63.txt deleted file mode 100644 index b038ac0d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_60_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25802 ,KEBNE ,17023192,Wed Dec 22 08:00:24 CET,Wed Dec 22 09:22:21 CET,0.0 0.74 1.049 1.282 1.485 1.646 1.784 1.923 2.185 2.29 2.387 2.382 2.664 2.752 2.923 3.085 3.24 3.318 3.463 3.585 3.763 3.895 4.017 4.178 4.323 4.461 4.599 4.732 4.908 5.062 5.207 5.409 5.608 5.786 5.993 6.225 6.445 6.683 6.922 7.157 7.392 7.649 7.941 8.206 8.502 8.796 9.035 9.229 9.366 9.302 8.852 8.058 7.257 6.524 5.859 5.205 4.618 4.11 3.656 3.199 2.827 2.489 2.14 1.798 1.473 1.196 0.91 0.643 0.417 0.177 -0.074 -0.277 -0.491 -0.722 -0.898 -1.076 -1.252 -1.442 -1.652 -1.786 -1.911 -2.1 -2.234 -2.369 -2.433 -2.562 -2.693 -2.843 -2.925 -3.203 -3.183 -3.278 -3.38 -3.602 -3.716 -3.828 -3.939 -4.059 -4.201 -4.385 -4.71 -2 ,17972 ,KEBNE ,17023193,Wed Dec 22 08:00:25 CET,Wed Dec 22 09:22:03 CET,0.0 0.613 0.883 1.071 1.23 1.379 1.519 1.657 1.898 2.012 2.119 2.112 2.395 2.476 2.623 2.774 2.92 2.987 3.123 3.256 3.44 3.558 3.671 3.836 3.99 4.139 4.279 4.408 4.585 4.765 4.93 5.136 5.346 5.545 5.756 5.973 6.186 6.427 6.661 6.896 7.15 7.398 7.679 7.945 8.191 8.441 8.7 8.93 9.061 9.005 8.589 7.744 6.893 6.102 5.4 4.763 4.185 3.641 3.155 2.677 2.277 1.913 1.564 1.237 0.927 0.644 0.34 0.068 -0.165 -0.418 -0.655 -0.838 -1.024 -1.208 -1.359 -1.533 -1.701 -1.862 -2.032 -2.151 -2.274 -2.459 -2.586 -2.725 -2.797 -2.95 -3.115 -3.273 -3.349 -3.626 -3.596 -3.691 -3.786 -3.979 -4.082 -4.194 -4.33 -4.473 -4.644 -4.85 -5.181 -3 ,21624 ,KEBNE ,17023194,Wed Dec 22 08:00:24 CET,Wed Dec 22 09:21:46 CET,0.0 0.521 0.767 0.976 1.153 1.318 1.463 1.591 1.839 1.947 2.033 2.002 2.279 2.361 2.543 2.728 2.908 2.987 3.134 3.283 3.493 3.633 3.766 3.955 4.139 4.317 4.479 4.618 4.795 4.975 5.146 5.351 5.54 5.71 5.913 6.159 6.391 6.616 6.828 7.041 7.274 7.534 7.828 8.095 8.356 8.599 8.829 9.029 9.162 9.096 8.664 7.828 7.003 6.261 5.565 4.932 4.382 3.882 3.447 3.007 2.608 2.238 1.885 1.559 1.244 0.964 0.703 0.464 0.22 -0.031 -0.255 -0.435 -0.621 -0.807 -0.954 -1.109 -1.261 -1.42 -1.595 -1.711 -1.82 -1.993 -2.128 -2.273 -2.345 -2.501 -2.665 -2.824 -2.898 -3.167 -3.136 -3.228 -3.324 -3.512 -3.621 -3.772 -3.922 -4.061 -4.225 -4.439 -4.812 -4 ,10271 ,KEBNE ,17023195,Wed Dec 22 08:00:24 CET,Wed Dec 22 09:21:53 CET,0.0 0.59 0.814 1.032 1.205 1.336 1.463 1.591 1.819 1.918 2.024 2.029 2.311 2.401 2.58 2.758 2.925 2.998 3.134 3.273 3.472 3.587 3.701 3.868 4.032 4.187 4.332 4.482 4.689 4.878 5.064 5.297 5.507 5.711 5.966 6.245 6.473 6.687 6.918 7.167 7.402 7.656 7.953 8.197 8.425 8.684 8.953 9.128 9.212 9.151 8.757 8.022 7.255 6.519 5.851 5.204 4.618 4.106 3.653 3.194 2.81 2.445 2.09 1.753 1.443 1.166 0.884 0.64 0.436 0.241 0.03 -0.155 -0.339 -0.523 -0.664 -0.811 -0.976 -1.148 -1.312 -1.435 -1.56 -1.741 -1.876 -2.021 -2.094 -2.245 -2.393 -2.532 -2.618 -2.915 -2.918 -3.019 -3.109 -3.304 -3.417 -3.536 -3.671 -3.806 -3.938 -4.133 -4.457 -5 ,28277 ,KEBNE ,17023196,Wed Dec 22 08:00:24 CET,Wed Dec 22 09:21:58 CET,0.0 0.449 0.696 0.881 1.051 1.202 1.348 1.488 1.734 1.847 1.953 1.959 2.253 2.341 2.492 2.631 2.766 2.829 2.956 3.088 3.281 3.398 3.505 3.657 3.795 3.932 4.069 4.192 4.346 4.499 4.645 4.813 4.967 5.116 5.306 5.526 5.73 5.939 6.157 6.401 6.644 6.896 7.19 7.454 7.723 7.99 8.237 8.445 8.567 8.487 8.077 7.35 6.568 5.806 5.106 4.48 3.922 3.385 2.915 2.445 2.035 1.661 1.318 0.983 0.673 0.395 0.097 -0.167 -0.405 -0.637 -0.877 -1.089 -1.311 -1.562 -1.749 -1.926 -2.113 -2.313 -2.553 -2.714 -2.846 -3.037 -3.162 -3.285 -3.348 -3.484 -3.632 -3.775 -3.849 -4.123 -4.079 -4.179 -4.295 -4.509 -4.612 -4.721 -4.847 -4.986 -5.155 -5.347 -5.592 -6 ,10927 ,KEBNE ,17023197,Wed Dec 22 08:00:25 CET,Wed Dec 22 09:21:53 CET,0.0 0.523 0.764 0.946 1.133 1.302 1.433 1.549 1.787 1.896 1.99 1.97 2.247 2.336 2.495 2.652 2.799 2.866 3.003 3.137 3.325 3.446 3.564 3.728 3.872 4.011 4.158 4.306 4.492 4.658 4.808 5.006 5.202 5.371 5.565 5.796 6.003 6.213 6.449 6.703 6.952 7.206 7.498 7.768 8.031 8.301 8.589 8.82 8.945 8.924 8.585 7.851 7.048 6.262 5.539 4.88 4.308 3.777 3.32 2.864 2.459 2.089 1.74 1.421 1.1 0.816 0.524 0.26 0.048 -0.167 -0.384 -0.566 -0.755 -0.944 -1.089 -1.241 -1.408 -1.589 -1.776 -1.899 -2.028 -2.226 -2.347 -2.471 -2.537 -2.679 -2.835 -2.986 -3.061 -3.335 -3.285 -3.364 -3.451 -3.648 -3.75 -3.861 -3.991 -4.137 -4.295 -4.498 -4.72 -7 ,25748 ,KEBNE ,17023198,Wed Dec 22 08:00:25 CET,Wed Dec 22 09:22:06 CET,0.0 0.765 1.076 1.319 1.516 1.67 1.809 1.951 2.187 2.288 2.388 2.386 2.667 2.75 2.924 3.076 3.208 3.279 3.419 3.552 3.74 3.853 3.965 4.125 4.269 4.409 4.551 4.693 4.873 5.046 5.198 5.367 5.54 5.707 5.9 6.127 6.337 6.544 6.765 7.005 7.237 7.48 7.752 8.019 8.309 8.578 8.848 9.107 9.27 9.261 8.848 7.998 7.141 6.326 5.62 4.993 4.449 3.938 3.471 2.973 2.548 2.198 1.857 1.535 1.234 0.969 0.705 0.47 0.272 0.061 -0.158 -0.328 -0.5 -0.692 -0.837 -0.977 -1.149 -1.33 -1.499 -1.625 -1.753 -1.947 -2.088 -2.24 -2.323 -2.486 -2.641 -2.799 -2.881 -3.158 -3.114 -3.194 -3.28 -3.486 -3.616 -3.749 -3.869 -4.013 -4.198 -4.423 -4.872 -8 ,13180 ,KEBNE ,17023199,Wed Dec 22 08:00:29 CET,Wed Dec 22 09:15:14 CET,0.0 0.374 0.627 0.826 1.002 1.181 1.357 1.512 1.773 1.89 1.989 1.972 2.252 2.339 2.506 2.663 2.812 2.885 3.018 3.135 3.311 3.417 3.531 3.711 3.871 4.033 4.196 4.345 4.537 4.717 4.889 5.095 5.289 5.479 5.686 5.906 6.112 6.333 6.564 6.802 7.026 7.257 7.522 7.784 8.05 8.299 8.578 8.804 8.915 8.842 8.337 7.483 6.678 5.918 5.203 4.534 3.949 3.42 2.957 2.508 2.125 1.76 1.409 1.098 0.81 0.543 0.254 -0.03 -0.266 -0.481 -0.699 -0.869 -1.051 -1.245 -1.393 -1.551 -1.72 -1.895 -2.068 -2.175 -2.287 -2.476 -2.606 -2.75 -2.819 -2.961 -3.124 -3.283 -3.356 -3.633 -3.626 -3.715 -3.802 -3.985 -4.09 -4.204 -4.321 -4.449 -4.604 -4.777 -5.127 -9 ,24231 ,KEBNE ,17023200,Wed Dec 22 08:00:29 CET,Wed Dec 22 09:18:38 CET,0.0 0.505 0.766 0.973 1.156 1.324 1.482 1.633 1.895 2.01 2.118 2.118 2.412 2.501 2.662 2.814 2.958 3.03 3.168 3.301 3.491 3.62 3.741 3.896 4.04 4.199 4.363 4.502 4.664 4.818 4.966 5.153 5.339 5.51 5.7 5.916 6.114 6.307 6.508 6.726 6.97 7.243 7.549 7.829 8.095 8.363 8.617 8.81 8.894 8.796 8.413 7.625 6.781 6.028 5.319 4.678 4.123 3.579 3.105 2.645 2.247 1.9 1.564 1.224 0.909 0.626 0.324 0.046 -0.186 -0.41 -0.636 -0.824 -1.021 -1.218 -1.37 -1.527 -1.697 -1.871 -2.033 -2.15 -2.271 -2.445 -2.574 -2.712 -2.777 -2.925 -3.077 -3.215 -3.291 -3.575 -3.581 -3.686 -3.781 -3.966 -4.076 -4.195 -4.306 -4.437 -4.579 -4.75 -5.184 -10 ,14188 ,KEBNE ,17023201,Wed Dec 22 08:01:31 CET,Wed Dec 22 09:24:01 CET,0.0 0.598 0.892 1.11 1.28 1.431 1.564 1.694 1.93 2.038 2.144 2.173 2.464 2.558 2.757 2.935 3.092 3.164 3.301 3.44 3.65 3.774 3.888 4.054 4.207 4.351 4.503 4.658 4.855 5.047 5.229 5.447 5.627 5.789 5.982 6.21 6.433 6.667 6.899 7.115 7.342 7.581 7.843 8.079 8.347 8.631 8.886 9.112 9.257 9.235 8.854 8.045 7.214 6.458 5.74 5.076 4.488 3.936 3.457 2.974 2.552 2.195 1.872 1.562 1.254 0.963 0.674 0.417 0.179 -0.067 -0.303 -0.485 -0.672 -0.861 -0.998 -1.146 -1.3 -1.473 -1.65 -1.767 -1.891 -2.078 -2.207 -2.342 -2.407 -2.538 -2.685 -2.837 -2.922 -3.203 -3.171 -3.264 -3.363 -3.558 -3.661 -3.787 -3.928 -4.06 -4.23 -4.43 -4.87 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_60_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_60_65.txt deleted file mode 100644 index 055e981c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_60_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32468 ,KEBNE ,17023202,Wed Dec 22 08:01:27 CET,Wed Dec 22 09:23:59 CET,0.0 0.661 0.879 1.06 1.232 1.384 1.516 1.643 1.892 2.003 2.102 2.109 2.399 2.49 2.668 2.826 2.98 3.056 3.207 3.343 3.539 3.669 3.783 3.955 4.129 4.286 4.435 4.585 4.769 4.938 5.112 5.33 5.541 5.739 5.976 6.243 6.484 6.745 7.011 7.306 7.605 7.898 8.229 8.545 8.875 9.236 9.644 10.032 10.331 10.489 10.383 9.831 9.176 8.567 8.012 7.503 7.031 6.567 6.162 5.743 5.368 5.042 4.744 4.461 4.204 3.973 3.725 3.496 3.305 3.125 2.934 2.766 2.588 2.407 2.264 2.121 1.975 1.816 1.653 1.542 1.423 1.233 1.094 0.949 0.882 0.751 0.609 0.456 0.375 0.096 0.126 0.041 -0.055 -0.272 -0.384 -0.504 -0.641 -0.778 -0.915 -1.096 -1.455 -2 ,30812 ,KEBNE ,17023203,Wed Dec 22 08:01:30 CET,Wed Dec 22 09:18:15 CET,0.0 0.548 0.761 0.958 1.151 1.314 1.448 1.593 1.882 2.011 2.127 2.13 2.415 2.497 2.658 2.822 2.972 3.041 3.181 3.322 3.515 3.637 3.77 3.956 4.119 4.281 4.442 4.612 4.832 5.024 5.203 5.425 5.643 5.856 6.089 6.343 6.586 6.843 7.118 7.398 7.667 7.949 8.298 8.626 8.962 9.302 9.656 10.039 10.382 10.539 10.411 9.94 9.33 8.718 8.166 7.637 7.132 6.659 6.235 5.794 5.416 5.075 4.756 4.462 4.18 3.92 3.653 3.421 3.236 3.048 2.853 2.687 2.518 2.354 2.222 2.081 1.934 1.771 1.601 1.496 1.385 1.2 1.074 0.946 0.876 0.721 0.557 0.4 0.323 0.05 0.073 -0.013 -0.097 -0.292 -0.403 -0.532 -0.673 -0.839 -1.028 -1.236 -1.601 -3 ,7235 ,KEBNE ,17023204,Wed Dec 22 08:02:29 CET,Wed Dec 22 09:25:06 CET,0.0 0.43 0.651 0.848 1.048 1.216 1.35 1.49 1.748 1.851 1.947 1.965 2.256 2.342 2.518 2.684 2.841 2.921 3.061 3.191 3.385 3.51 3.632 3.797 3.966 4.13 4.28 4.434 4.62 4.789 4.965 5.183 5.392 5.592 5.819 6.068 6.301 6.537 6.783 7.06 7.345 7.659 8.035 8.371 8.702 9.076 9.449 9.77 10.061 10.25 10.148 9.646 9.047 8.431 7.858 7.329 6.847 6.375 5.955 5.517 5.145 4.816 4.499 4.209 3.935 3.674 3.381 3.125 2.919 2.697 2.457 2.264 2.067 1.856 1.694 1.53 1.348 1.166 0.985 0.844 0.696 0.467 0.318 0.186 0.118 -0.015 -0.16 -0.322 -0.401 -0.676 -0.628 -0.707 -0.791 -0.983 -1.105 -1.229 -1.344 -1.465 -1.595 -1.727 -1.984 -4 ,25206 ,KEBNE ,17023205,Wed Dec 22 08:02:29 CET,Wed Dec 22 09:25:10 CET,0.0 0.565 0.838 1.06 1.231 1.369 1.506 1.644 1.899 2.017 2.129 2.117 2.398 2.487 2.64 2.803 2.96 3.03 3.181 3.328 3.527 3.648 3.768 3.938 4.094 4.26 4.437 4.598 4.806 5.021 5.217 5.432 5.63 5.819 6.04 6.305 6.555 6.819 7.104 7.378 7.671 8.019 8.369 8.677 9.041 9.435 9.791 10.101 10.387 10.582 10.519 10.008 9.437 8.877 8.302 7.751 7.248 6.778 6.36 5.948 5.61 5.299 4.983 4.677 4.404 4.155 3.884 3.638 3.427 3.21 2.976 2.776 2.576 2.381 2.225 2.054 1.863 1.659 1.462 1.34 1.224 1.051 0.931 0.798 0.728 0.596 0.468 0.321 0.242 -0.029 -0.005 -0.106 -0.21 -0.4 -0.495 -0.602 -0.72 -0.847 -1.026 -1.268 -1.552 -5 ,24278 ,KEBNE ,17023206,Wed Dec 22 08:02:30 CET,Wed Dec 22 09:25:18 CET,0.0 0.701 0.932 1.122 1.324 1.499 1.65 1.787 2.018 2.124 2.226 2.236 2.521 2.602 2.761 2.936 3.091 3.156 3.29 3.422 3.606 3.72 3.836 4.013 4.177 4.328 4.475 4.621 4.795 4.957 5.122 5.321 5.516 5.698 5.908 6.143 6.367 6.64 6.933 7.202 7.465 7.758 8.091 8.417 8.756 9.099 9.474 9.808 10.087 10.314 10.26 9.792 9.191 8.57 7.97 7.407 6.936 6.463 6.037 5.634 5.283 4.968 4.649 4.345 4.072 3.818 3.544 3.305 3.1 2.88 2.675 2.517 2.357 2.194 2.056 1.911 1.777 1.645 1.503 1.405 1.296 1.127 1.019 0.911 0.856 0.731 0.604 0.46 0.376 0.098 0.146 0.067 -0.019 -0.213 -0.326 -0.444 -0.574 -0.72 -0.892 -1.097 -1.438 -6 ,25202 ,KEBNE ,17023207,Wed Dec 22 08:02:29 CET,Wed Dec 22 09:25:16 CET,0.0 0.506 0.791 1.027 1.209 1.358 1.49 1.612 1.851 1.963 2.059 2.03 2.312 2.402 2.57 2.727 2.878 2.957 3.113 3.254 3.454 3.589 3.714 3.878 4.032 4.176 4.319 4.464 4.655 4.83 4.99 5.19 5.375 5.55 5.756 5.974 6.176 6.393 6.638 6.905 7.178 7.482 7.804 8.099 8.419 8.756 9.098 9.418 9.732 9.932 9.839 9.337 8.707 8.052 7.461 6.931 6.435 5.969 5.551 5.146 4.808 4.493 4.19 3.907 3.642 3.398 3.143 2.923 2.74 2.536 2.316 2.144 1.962 1.77 1.628 1.487 1.35 1.217 1.068 0.95 0.83 0.647 0.51 0.372 0.31 0.182 0.049 -0.096 -0.176 -0.451 -0.428 -0.522 -0.62 -0.834 -0.956 -1.087 -1.21 -1.333 -1.479 -1.688 -2.038 -7 ,6825 ,KEBNE ,17023208,Wed Dec 22 08:02:29 CET,Wed Dec 22 09:25:18 CET,0.0 0.445 0.739 0.993 1.183 1.342 1.493 1.627 1.862 1.972 2.089 2.108 2.396 2.494 2.68 2.842 2.997 3.074 3.22 3.37 3.598 3.737 3.859 4.019 4.171 4.322 4.469 4.616 4.821 5.014 5.188 5.398 5.579 5.76 5.989 6.25 6.488 6.734 6.99 7.259 7.53 7.817 8.145 8.471 8.814 9.161 9.571 9.947 10.253 10.477 10.388 9.838 9.194 8.582 7.995 7.457 7.001 6.565 6.16 5.756 5.398 5.058 4.747 4.452 4.161 3.901 3.643 3.413 3.22 3.025 2.826 2.657 2.473 2.287 2.147 2.014 1.877 1.723 1.561 1.449 1.34 1.185 1.077 0.956 0.89 0.755 0.613 0.468 0.39 0.112 0.153 0.059 -0.036 -0.201 -0.305 -0.422 -0.553 -0.706 -0.851 -1.038 -1.649 -8 ,5586 ,KEBNE ,17023209,Wed Dec 22 08:02:29 CET,Wed Dec 22 09:25:21 CET,0.0 0.564 0.824 1.041 1.233 1.392 1.53 1.665 1.907 2.034 2.151 2.154 2.449 2.546 2.72 2.865 2.996 3.06 3.193 3.331 3.529 3.646 3.772 3.962 4.148 4.328 4.509 4.689 4.911 5.128 5.313 5.529 5.747 5.952 6.187 6.44 6.673 6.922 7.174 7.439 7.709 7.999 8.335 8.656 8.998 9.36 9.73 10.073 10.353 10.486 10.325 9.812 9.229 8.624 8.068 7.549 7.06 6.611 6.213 5.791 5.425 5.091 4.773 4.48 4.197 3.931 3.637 3.368 3.149 2.929 2.704 2.51 2.297 2.088 1.94 1.788 1.633 1.475 1.313 1.205 1.092 0.909 0.782 0.655 0.588 0.443 0.288 0.127 0.049 -0.231 -0.199 -0.284 -0.376 -0.575 -0.686 -0.805 -0.929 -1.043 -1.161 -1.322 -1.757 -9 ,22619 ,KEBNE ,17023210,Wed Dec 22 08:02:29 CET,Wed Dec 22 09:23:42 CET,0.0 0.726 1.038 1.249 1.416 1.588 1.742 1.876 2.122 2.239 2.349 2.362 2.646 2.729 2.894 3.052 3.19 3.254 3.391 3.535 3.722 3.83 3.941 4.121 4.305 4.491 4.667 4.815 5.013 5.22 5.42 5.654 5.857 6.047 6.278 6.527 6.752 7.001 7.268 7.545 7.825 8.14 8.499 8.831 9.182 9.534 9.874 10.184 10.477 10.691 10.637 10.209 9.638 9.044 8.493 7.963 7.48 7.025 6.611 6.18 5.803 5.474 5.161 4.867 4.583 4.329 4.071 3.85 3.66 3.465 3.274 3.103 2.915 2.73 2.585 2.435 2.288 2.131 1.961 1.849 1.747 1.582 1.446 1.299 1.229 1.096 0.954 0.8 0.723 0.451 0.473 0.379 0.283 0.095 -0.015 -0.142 -0.275 -0.41 -0.573 -0.786 -1.061 -10 ,11569 ,KEBNE ,17023211,Wed Dec 22 08:02:30 CET,Wed Dec 22 09:25:46 CET,0.0 0.724 1.038 1.276 1.463 1.616 1.759 1.904 2.188 2.31 2.418 2.418 2.702 2.79 2.966 3.135 3.303 3.377 3.517 3.655 3.831 3.951 4.072 4.238 4.402 4.56 4.704 4.856 5.072 5.265 5.443 5.665 5.875 6.084 6.319 6.57 6.801 7.03 7.28 7.56 7.838 8.154 8.512 8.832 9.182 9.533 9.886 10.213 10.473 10.627 10.553 10.074 9.536 8.96 8.372 7.827 7.328 6.841 6.408 5.986 5.614 5.286 4.976 4.678 4.405 4.149 3.884 3.652 3.45 3.249 3.054 2.893 2.718 2.531 2.384 2.229 2.071 1.922 1.776 1.666 1.546 1.367 1.248 1.122 1.056 0.924 0.781 0.614 0.53 0.252 0.287 0.212 0.124 -0.083 -0.19 -0.304 -0.431 -0.57 -0.71 -0.874 -1.112 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_61_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_61_50.txt deleted file mode 100644 index 3912c687..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_61_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7135 ,KEBNE ,17023212,Wed Dec 22 08:02:29 CET,Wed Dec 22 09:25:39 CET,0.0 0.502 0.703 0.859 1.008 1.151 1.281 1.392 1.569 1.659 1.744 1.713 1.966 2.035 2.149 2.258 2.384 2.44 2.534 2.634 2.766 2.843 2.92 3.019 3.123 3.23 3.321 3.408 3.516 3.609 3.691 3.782 3.869 3.964 4.053 4.138 4.226 4.305 4.38 4.442 4.483 4.512 4.518 4.503 4.461 4.369 4.16 3.755 3.107 2.068 0.181 -2.211 -4.18 -5.824 -7.198 -8.425 -9.522 -10.498 -11.33 -12.165 -12.87 -13.474 -14.065 -14.637 -15.132 -15.564 -16.02 -16.425 -16.776 -17.144 -17.517 -17.808 -18.104 -18.413 -18.653 -18.897 -19.157 -19.424 -19.689 -19.871 -20.065 -20.362 -20.569 -20.788 -20.901 -21.13 -21.367 -21.607 -21.728 -22.064 -22.137 -22.267 -22.415 -22.743 -22.91 -23.086 -23.28 -23.52 -23.819 -24.154 -25.081 -2 ,31492 ,KEBNE ,17023213,Wed Dec 22 08:02:33 CET,Wed Dec 22 09:21:29 CET,0.0 0.555 0.822 0.998 1.15 1.31 1.45 1.57 1.776 1.875 1.965 1.94 2.195 2.266 2.401 2.527 2.649 2.7 2.788 2.875 3.004 3.086 3.156 3.268 3.369 3.458 3.545 3.625 3.725 3.819 3.903 4.011 4.117 4.21 4.317 4.428 4.519 4.617 4.717 4.798 4.848 4.882 4.892 4.867 4.81 4.681 4.447 4.065 3.408 2.291 0.365 -2.036 -4.006 -5.668 -7.101 -8.364 -9.475 -10.447 -11.263 -12.059 -12.767 -13.423 -14.044 -14.64 -15.193 -15.686 -16.19 -16.632 -17.019 -17.424 -17.843 -18.189 -18.553 -18.918 -19.188 -19.472 -19.783 -20.126 -20.453 -20.661 -20.888 -21.256 -21.511 -21.785 -21.927 -22.22 -22.544 -22.871 -23.043 -23.404 -23.513 -23.675 -23.854 -24.243 -24.45 -24.654 -24.844 -25.059 -25.316 -25.624 -26.459 -3 ,2681 ,KEBNE ,17023215,Wed Dec 22 08:02:33 CET,Wed Dec 22 09:20:44 CET,0.0 0.499 0.71 0.88 1.018 1.131 1.238 1.337 1.507 1.582 1.663 1.644 1.898 1.971 2.093 2.201 2.302 2.349 2.453 2.568 2.754 2.866 2.96 3.086 3.209 3.335 3.444 3.555 3.71 3.836 3.953 4.109 4.253 4.378 4.496 4.601 4.696 4.799 4.886 4.961 5.046 5.105 5.136 5.11 5.034 4.911 4.673 4.249 3.561 2.482 0.554 -1.882 -3.884 -5.558 -6.988 -8.265 -9.354 -10.336 -11.181 -11.987 -12.669 -13.275 -13.841 -14.364 -14.856 -15.288 -15.716 -16.099 -16.446 -16.812 -17.181 -17.485 -17.786 -18.092 -18.332 -18.574 -18.83 -19.099 -19.382 -19.573 -19.76 -20.065 -20.286 -20.522 -20.64 -20.869 -21.117 -21.368 -21.484 -21.803 -21.853 -21.982 -22.132 -22.499 -22.71 -22.916 -23.121 -23.374 -23.644 -23.979 -24.639 -4 ,97 ,KEBNE ,17023216,Wed Dec 22 08:02:30 CET,Wed Dec 22 09:24:05 CET,0.0 0.51 0.712 0.901 1.053 1.167 1.267 1.365 1.547 1.632 1.712 1.687 1.944 2.012 2.124 2.231 2.358 2.418 2.537 2.65 2.788 2.87 2.951 3.075 3.199 3.316 3.434 3.55 3.686 3.8 3.905 4.039 4.159 4.267 4.39 4.512 4.628 4.742 4.835 4.926 4.994 5.055 5.087 5.06 5.007 4.891 4.651 4.292 3.693 2.607 0.595 -1.873 -3.862 -5.537 -6.974 -8.258 -9.335 -10.279 -11.109 -11.941 -12.639 -13.246 -13.826 -14.389 -14.915 -15.389 -15.882 -16.327 -16.697 -17.055 -17.42 -17.726 -18.042 -18.359 -18.598 -18.852 -19.118 -19.375 -19.648 -19.84 -20.034 -20.337 -20.543 -20.762 -20.884 -21.122 -21.363 -21.616 -21.747 -22.086 -22.161 -22.315 -22.482 -22.824 -23.021 -23.217 -23.414 -23.629 -23.899 -24.229 -24.694 -5 ,29718 ,KEBNE ,17023217,Wed Dec 22 08:02:29 CET,Wed Dec 22 09:25:23 CET,0.0 0.562 0.796 0.982 1.126 1.257 1.382 1.489 1.672 1.755 1.833 1.807 2.062 2.132 2.252 2.364 2.468 2.52 2.621 2.714 2.839 2.91 2.983 3.103 3.231 3.36 3.467 3.572 3.721 3.856 3.989 4.138 4.269 4.399 4.531 4.649 4.747 4.839 4.932 5.024 5.115 5.186 5.207 5.195 5.135 5.01 4.806 4.432 3.794 2.721 0.786 -1.629 -3.63 -5.268 -6.645 -7.89 -8.983 -9.979 -10.837 -11.665 -12.357 -12.977 -13.561 -14.096 -14.588 -15.016 -15.451 -15.847 -16.195 -16.559 -16.929 -17.226 -17.538 -17.857 -18.096 -18.36 -18.628 -18.888 -19.172 -19.376 -19.582 -19.889 -20.1 -20.312 -20.426 -20.671 -20.916 -21.17 -21.303 -21.647 -21.743 -21.884 -22.023 -22.329 -22.497 -22.677 -22.878 -23.104 -23.406 -23.824 -24.641 -6 ,10926 ,KEBNE ,17023218,Wed Dec 22 08:03:31 CET,Wed Dec 22 09:25:09 CET,0.0 0.782 0.999 1.198 1.38 1.525 1.653 1.772 1.968 2.049 2.133 2.114 2.365 2.436 2.561 2.673 2.786 2.843 2.95 3.055 3.209 3.313 3.413 3.546 3.684 3.815 3.923 4.029 4.161 4.276 4.388 4.52 4.653 4.767 4.879 4.996 5.109 5.232 5.332 5.407 5.464 5.52 5.55 5.543 5.496 5.36 5.103 4.688 4.01 2.932 1.002 -1.444 -3.472 -5.175 -6.609 -7.876 -8.966 -9.935 -10.781 -11.638 -12.375 -13.01 -13.599 -14.143 -14.638 -15.092 -15.557 -15.964 -16.309 -16.661 -17.048 -17.37 -17.691 -18.019 -18.261 -18.513 -18.78 -19.052 -19.319 -19.499 -19.703 -20.022 -20.226 -20.441 -20.559 -20.795 -21.029 -21.291 -21.425 -21.747 -21.812 -21.96 -22.116 -22.449 -22.632 -22.827 -23.049 -23.304 -23.553 -23.848 -24.539 -7 ,26661 ,KEBNE ,17023219,Wed Dec 22 08:03:31 CET,Wed Dec 22 09:26:41 CET,0.0 0.806 1.102 1.252 1.375 1.503 1.618 1.712 1.893 1.967 2.03 1.976 2.219 2.295 2.437 2.553 2.661 2.715 2.825 2.939 3.107 3.213 3.319 3.453 3.572 3.69 3.808 3.924 4.06 4.18 4.296 4.426 4.536 4.633 4.746 4.865 4.952 5.042 5.115 5.171 5.227 5.283 5.341 5.344 5.272 5.147 4.947 4.579 3.944 2.871 0.92 -1.471 -3.48 -5.189 -6.64 -7.921 -8.993 -9.951 -10.776 -11.575 -12.27 -12.906 -13.514 -14.074 -14.59 -15.067 -15.561 -15.991 -16.357 -16.745 -17.147 -17.473 -17.812 -18.169 -18.439 -18.71 -18.992 -19.284 -19.583 -19.794 -20.013 -20.362 -20.606 -20.841 -20.964 -21.232 -21.491 -21.75 -21.886 -22.225 -22.306 -22.45 -22.597 -22.902 -23.071 -23.256 -23.484 -23.739 -24.018 -24.327 -25.099 -8 ,29251 ,KEBNE ,17023220,Wed Dec 22 08:03:33 CET,Wed Dec 22 09:22:07 CET,0.0 0.912 1.124 1.298 1.459 1.59 1.707 1.823 2.018 2.096 2.169 2.147 2.403 2.47 2.597 2.721 2.843 2.9 3.013 3.109 3.24 3.332 3.405 3.508 3.614 3.705 3.795 3.885 4.002 4.134 4.265 4.399 4.498 4.59 4.7 4.803 4.897 4.987 5.066 5.134 5.183 5.226 5.289 5.332 5.314 5.204 4.982 4.594 3.947 2.859 0.962 -1.378 -3.346 -5.014 -6.411 -7.631 -8.693 -9.652 -10.502 -11.343 -12.052 -12.683 -13.274 -13.828 -14.355 -14.819 -15.304 -15.757 -16.136 -16.514 -16.912 -17.25 -17.576 -17.893 -18.14 -18.384 -18.644 -18.929 -19.21 -19.395 -19.584 -19.881 -20.088 -20.297 -20.408 -20.631 -20.857 -21.1 -21.229 -21.555 -21.639 -21.787 -21.942 -22.277 -22.458 -22.639 -22.817 -23.028 -23.264 -23.559 -24.197 -9 ,21500 ,KEBNE ,17023221,Wed Dec 22 08:03:32 CET,Wed Dec 22 09:26:52 CET,0.0 0.648 0.911 1.1 1.246 1.367 1.476 1.591 1.801 1.886 1.97 1.942 2.191 2.263 2.4 2.526 2.642 2.696 2.792 2.888 3.04 3.135 3.213 3.317 3.427 3.523 3.614 3.705 3.827 3.93 4.012 4.106 4.195 4.287 4.395 4.517 4.611 4.703 4.792 4.867 4.941 4.986 5.019 5.017 4.951 4.816 4.593 4.252 3.623 2.51 0.519 -1.921 -3.933 -5.605 -7.006 -8.259 -9.361 -10.351 -11.199 -12.023 -12.706 -13.327 -13.904 -14.434 -14.938 -15.392 -15.874 -16.305 -16.67 -17.043 -17.426 -17.755 -18.104 -18.448 -18.705 -18.969 -19.238 -19.512 -19.782 -19.971 -20.173 -20.484 -20.692 -20.922 -21.04 -21.263 -21.504 -21.768 -21.9 -22.228 -22.323 -22.474 -22.627 -22.951 -23.123 -23.319 -23.523 -23.738 -23.97 -24.293 -25.072 -10 ,17003 ,KEBNE ,17023222,Wed Dec 22 08:03:31 CET,Wed Dec 22 09:26:44 CET,0.0 0.641 0.876 1.038 1.179 1.313 1.418 1.509 1.676 1.751 1.823 1.801 2.054 2.119 2.252 2.378 2.499 2.552 2.656 2.766 2.903 2.987 3.073 3.19 3.306 3.415 3.507 3.586 3.684 3.781 3.866 3.949 4.031 4.123 4.21 4.289 4.349 4.43 4.538 4.639 4.726 4.774 4.772 4.744 4.676 4.553 4.342 3.952 3.264 2.187 0.31 -2.032 -3.98 -5.641 -7.053 -8.309 -9.415 -10.406 -11.256 -12.104 -12.805 -13.419 -14.022 -14.58 -15.084 -15.538 -16.0 -16.414 -16.767 -17.13 -17.489 -17.774 -18.077 -18.394 -18.639 -18.894 -19.156 -19.424 -19.693 -19.876 -20.066 -20.368 -20.578 -20.804 -20.92 -21.151 -21.38 -21.612 -21.746 -22.078 -22.151 -22.293 -22.436 -22.736 -22.919 -23.132 -23.344 -23.559 -23.825 -24.128 -24.744 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_61_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_61_65.txt deleted file mode 100644 index ce4fdf46..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_61_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18912 ,TETRA ,17551350,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 12:57:29 CET,0.0 2.376 2.873 3.206 3.483 3.71 3.903 4.109 4.508 4.671 4.813 4.904 5.201 5.305 5.519 5.743 5.939 6.022 6.192 6.364 6.607 6.76 6.9 7.108 7.305 7.472 7.643 7.82 8.037 8.223 8.395 8.611 8.812 8.988 9.177 9.41 9.632 9.847 10.075 10.298 10.505 10.722 10.966 11.173 11.344 11.491 11.596 11.613 11.428 10.84 9.543 7.788 6.225 4.822 3.595 2.49 1.48 0.579 -0.172 -0.924 -1.569 -2.153 -2.702 -3.221 -3.718 -4.172 -4.674 -5.12 -5.475 -5.84 -6.204 -6.517 -6.859 -7.192 -7.457 -7.744 -8.03 -8.318 -8.606 -8.815 -9.046 -9.422 -9.697 -9.964 -10.092 -10.35 -10.617 -10.904 -11.062 -11.422 -11.56 -11.738 -11.924 -12.313 -12.564 -12.879 -13.224 -13.615 -14.048 -14.587 -16.912 -2 ,12590 ,TETRA ,17551352,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 12:55:12 CET,0.0 3.099 3.598 3.951 4.228 4.481 4.708 4.903 5.236 5.393 5.55 5.663 5.969 6.083 6.284 6.474 6.665 6.756 6.929 7.092 7.299 7.421 7.548 7.743 7.927 8.098 8.249 8.391 8.565 8.723 8.896 9.115 9.311 9.474 9.665 9.884 10.076 10.281 10.489 10.707 10.915 11.128 11.346 11.52 11.679 11.808 11.874 11.809 11.578 10.97 9.654 7.795 6.059 4.536 3.232 2.106 1.11 0.19 -0.612 -1.441 -2.155 -2.775 -3.353 -3.902 -4.43 -4.903 -5.398 -5.845 -6.219 -6.603 -7.012 -7.362 -7.718 -8.079 -8.357 -8.648 -8.947 -9.272 -9.612 -9.843 -10.101 -10.502 -10.772 -11.054 -11.196 -11.498 -11.814 -12.142 -12.315 -12.679 -12.861 -13.056 -13.257 -13.718 -13.963 -14.207 -14.461 -14.736 -15.071 -15.51 -17.237 -3 ,5380 ,TETRA ,17551354,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 12:57:07 CET,0.0 1.925 2.619 3.047 3.379 3.686 3.957 4.184 4.539 4.692 4.843 4.963 5.269 5.38 5.593 5.79 5.973 6.058 6.22 6.381 6.596 6.724 6.849 7.029 7.198 7.362 7.53 7.7 7.903 8.079 8.25 8.443 8.637 8.831 9.036 9.259 9.468 9.687 9.889 10.122 10.358 10.565 10.787 10.959 11.131 11.276 11.309 11.237 10.992 10.376 9.042 7.151 5.458 3.954 2.66 1.529 0.523 -0.385 -1.172 -1.963 -2.649 -3.269 -3.862 -4.437 -4.96 -5.434 -5.933 -6.36 -6.733 -7.12 -7.511 -7.843 -8.177 -8.521 -8.786 -9.055 -9.35 -9.655 -9.972 -10.196 -10.418 -10.753 -10.989 -11.244 -11.377 -11.649 -11.926 -12.202 -12.347 -12.688 -12.829 -13.017 -13.207 -13.627 -13.836 -14.032 -14.269 -14.578 -14.942 -15.375 -16.644 -4 ,10073 ,TETRA ,17551356,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 12:59:47 CET,0.0 1.909 2.32 2.632 2.902 3.149 3.351 3.536 3.855 4.008 4.157 4.239 4.534 4.643 4.866 5.078 5.27 5.36 5.527 5.678 5.901 6.039 6.169 6.362 6.541 6.709 6.869 7.024 7.223 7.391 7.54 7.734 7.918 8.077 8.267 8.488 8.685 8.907 9.141 9.351 9.573 9.808 10.016 10.189 10.354 10.479 10.548 10.499 10.284 9.768 8.508 6.605 4.873 3.366 2.101 0.996 -0.008 -0.938 -1.767 -2.584 -3.286 -3.906 -4.499 -5.088 -5.622 -6.091 -6.58 -7.022 -7.403 -7.807 -8.235 -8.592 -8.96 -9.318 -9.601 -9.907 -10.207 -10.538 -10.895 -11.131 -11.353 -11.684 -11.927 -12.182 -12.314 -12.585 -12.863 -13.146 -13.305 -13.661 -13.783 -13.953 -14.15 -14.577 -14.792 -15.027 -15.305 -15.648 -16.062 -16.567 -18.03 -5 ,21061 ,TETRA ,17551358,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 12:54:48 CET,0.0 1.859 2.31 2.679 2.977 3.218 3.435 3.631 3.951 4.085 4.228 4.306 4.6 4.715 4.921 5.107 5.29 5.379 5.548 5.711 5.953 6.089 6.211 6.379 6.543 6.716 6.871 7.018 7.196 7.364 7.536 7.734 7.926 8.101 8.297 8.519 8.714 8.915 9.127 9.342 9.541 9.767 9.991 10.173 10.344 10.48 10.583 10.545 10.304 9.72 8.405 6.578 4.996 3.637 2.378 1.189 0.159 -0.774 -1.567 -2.341 -3.033 -3.683 -4.284 -4.843 -5.361 -5.828 -6.322 -6.777 -7.181 -7.583 -8.002 -8.355 -8.695 -9.024 -9.288 -9.578 -9.879 -10.191 -10.507 -10.721 -10.947 -11.29 -11.515 -11.756 -11.886 -12.14 -12.41 -12.709 -12.86 -13.203 -13.328 -13.5 -13.689 -14.088 -14.299 -14.545 -14.814 -15.12 -15.484 -15.946 -17.277 -6 ,11373 ,TETRA ,17551360,Thu Nov 25 11:20:32 CET,Thu Nov 25 12:54:45 CET,0.0 2.191 2.669 3.034 3.323 3.579 3.803 4.011 4.373 4.535 4.697 4.809 5.104 5.212 5.42 5.62 5.798 5.876 6.026 6.178 6.399 6.538 6.67 6.853 7.025 7.196 7.357 7.507 7.694 7.865 8.031 8.224 8.402 8.569 8.78 9.01 9.2 9.403 9.624 9.832 10.031 10.242 10.435 10.592 10.746 10.868 10.929 10.854 10.571 9.956 8.685 6.858 5.242 3.764 2.407 1.164 0.065 -0.896 -1.715 -2.511 -3.185 -3.81 -4.411 -4.957 -5.482 -5.965 -6.45 -6.887 -7.26 -7.638 -8.017 -8.32 -8.653 -9.016 -9.284 -9.54 -9.814 -10.123 -10.447 -10.664 -10.89 -11.24 -11.473 -11.708 -11.824 -12.071 -12.323 -12.593 -12.739 -13.069 -13.163 -13.322 -13.509 -13.967 -14.197 -14.441 -14.752 -15.093 -15.437 -15.878 -18.037 -7 ,32337 ,TETRA ,17551362,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 12:55:21 CET,0.0 3.349 3.98 4.343 4.652 4.901 5.093 5.266 5.599 5.748 5.883 5.95 6.237 6.344 6.561 6.767 6.948 7.03 7.19 7.346 7.569 7.709 7.838 8.023 8.194 8.356 8.52 8.669 8.848 9.023 9.188 9.382 9.572 9.746 9.917 10.105 10.281 10.47 10.698 10.914 11.114 11.343 11.553 11.728 11.91 12.024 12.086 12.03 11.759 11.169 9.872 8.071 6.405 4.924 3.613 2.416 1.409 0.486 -0.321 -1.097 -1.792 -2.428 -3.025 -3.596 -4.134 -4.631 -5.126 -5.579 -5.996 -6.41 -6.816 -7.151 -7.497 -7.854 -8.121 -8.388 -8.659 -8.952 -9.26 -9.467 -9.675 -10.013 -10.254 -10.5 -10.637 -10.919 -11.189 -11.467 -11.616 -11.97 -12.137 -12.327 -12.506 -12.912 -13.142 -13.384 -13.655 -13.95 -14.274 -14.748 -16.874 -8 ,31763 ,TETRA ,17551364,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 12:56:11 CET,0.0 1.363 1.725 2.021 2.285 2.519 2.749 2.952 3.259 3.384 3.516 3.598 3.894 4.003 4.215 4.41 4.58 4.66 4.816 4.963 5.16 5.284 5.409 5.59 5.765 5.92 6.079 6.236 6.413 6.594 6.75 6.92 7.095 7.248 7.425 7.624 7.805 8.014 8.232 8.459 8.678 8.9 9.118 9.29 9.458 9.57 9.604 9.539 9.298 8.702 7.32 5.436 3.812 2.419 1.205 0.094 -0.883 -1.796 -2.602 -3.39 -4.093 -4.74 -5.334 -5.869 -6.38 -6.864 -7.372 -7.844 -8.25 -8.667 -9.101 -9.449 -9.789 -10.139 -10.412 -10.678 -10.954 -11.244 -11.534 -11.74 -11.957 -12.304 -12.545 -12.789 -12.918 -13.18 -13.449 -13.721 -13.869 -14.229 -14.381 -14.557 -14.738 -15.143 -15.365 -15.613 -15.878 -16.16 -16.544 -17.059 -18.696 -9 ,16365 ,TETRA ,17551366,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 12:55:14 CET,0.0 1.325 1.769 2.082 2.356 2.598 2.817 3.007 3.321 3.48 3.63 3.715 4.029 4.148 4.374 4.593 4.776 4.866 5.042 5.204 5.422 5.562 5.698 5.881 6.048 6.203 6.351 6.484 6.662 6.847 7.031 7.256 7.472 7.664 7.873 8.092 8.277 8.454 8.652 8.877 9.087 9.303 9.537 9.728 9.888 10.004 10.03 9.943 9.714 9.136 7.844 6.048 4.456 2.991 1.743 0.653 -0.341 -1.236 -2.036 -2.854 -3.539 -4.127 -4.716 -5.288 -5.8 -6.267 -6.739 -7.168 -7.552 -7.943 -8.35 -8.695 -9.038 -9.385 -9.678 -9.982 -10.277 -10.581 -10.889 -11.098 -11.318 -11.674 -11.917 -12.167 -12.304 -12.576 -12.849 -13.131 -13.276 -13.615 -13.715 -13.877 -14.055 -14.424 -14.639 -14.877 -15.112 -15.381 -15.715 -16.198 -17.6 -10 ,10679 ,TETRA ,17551368,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 12:56:04 CET,0.0 1.604 2.1 2.468 2.758 2.968 3.129 3.284 3.587 3.722 3.839 3.88 4.172 4.272 4.464 4.65 4.819 4.895 5.039 5.196 5.404 5.52 5.633 5.797 5.956 6.092 6.222 6.363 6.553 6.744 6.924 7.141 7.354 7.548 7.751 7.966 8.167 8.359 8.56 8.77 8.968 9.16 9.358 9.572 9.779 9.919 10.005 9.983 9.771 9.183 7.883 6.033 4.365 2.93 1.682 0.536 -0.441 -1.349 -2.162 -2.939 -3.621 -4.231 -4.82 -5.365 -5.832 -6.255 -6.682 -7.071 -7.419 -7.771 -8.147 -8.464 -8.803 -9.158 -9.419 -9.675 -9.932 -10.221 -10.543 -10.757 -10.976 -11.319 -11.547 -11.772 -11.886 -12.123 -12.376 -12.656 -12.799 -13.137 -13.285 -13.473 -13.658 -14.019 -14.234 -14.467 -14.702 -14.965 -15.256 -15.666 -17.483 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_63_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_63_53.txt deleted file mode 100644 index 1ed946dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_63_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11747 ,TETRA ,17551369,Thu Nov 25 11:20:32 CET,Thu Nov 25 12:56:22 CET,0.0 0.576 0.78 0.959 1.1 1.215 1.295 1.383 1.559 1.629 1.699 1.624 1.88 1.935 2.037 2.142 2.246 2.296 2.396 2.482 2.601 2.686 2.762 2.864 2.96 3.049 3.138 3.222 3.319 3.411 3.515 3.648 3.77 3.882 4.009 4.139 4.259 4.388 4.535 4.679 4.787 4.89 4.986 5.061 5.124 5.15 5.087 4.918 4.592 3.919 2.562 0.806 -0.673 -1.909 -2.982 -3.974 -4.832 -5.581 -6.233 -6.892 -7.453 -7.965 -8.453 -8.896 -9.308 -9.695 -10.103 -10.456 -10.754 -11.062 -11.393 -11.674 -11.943 -12.202 -12.406 -12.614 -12.829 -13.052 -13.281 -13.433 -13.585 -13.827 -13.994 -14.176 -14.267 -14.452 -14.649 -14.854 -14.969 -15.295 -15.325 -15.457 -15.586 -15.847 -16.005 -16.184 -16.354 -16.542 -16.765 -17.015 -17.569 -2 ,13508 ,TETRA ,17551370,Thu Nov 25 11:21:12 CET,Thu Nov 25 12:57:13 CET,0.0 0.534 0.84 1.089 1.278 1.432 1.602 1.737 1.957 2.071 2.183 2.218 2.512 2.614 2.804 2.931 3.037 3.097 3.208 3.297 3.409 3.489 3.571 3.677 3.785 3.888 3.975 4.056 4.158 4.257 4.355 4.457 4.548 4.638 4.737 4.854 4.954 5.059 5.171 5.279 5.391 5.487 5.591 5.653 5.672 5.659 5.583 5.423 5.069 4.382 3.061 1.372 -0.058 -1.31 -2.43 -3.445 -4.315 -5.111 -5.78 -6.423 -6.971 -7.462 -7.927 -8.373 -8.796 -9.169 -9.541 -9.867 -10.152 -10.449 -10.766 -11.032 -11.31 -11.605 -11.841 -12.083 -12.338 -12.594 -12.839 -13.029 -13.254 -13.578 -13.783 -14.002 -14.117 -14.344 -14.582 -14.828 -14.953 -15.287 -15.344 -15.493 -15.652 -16.024 -16.209 -16.399 -16.628 -16.872 -17.118 -17.414 -17.926 -3 ,19110 ,TETRA ,17551371,Thu Nov 25 11:21:12 CET,Thu Nov 25 12:59:42 CET,0.0 0.5 0.658 0.793 0.901 1.01 1.118 1.233 1.437 1.517 1.596 1.557 1.827 1.891 2.004 2.114 2.225 2.274 2.378 2.481 2.603 2.68 2.751 2.847 2.953 3.062 3.164 3.259 3.37 3.463 3.56 3.688 3.805 3.912 4.042 4.197 4.322 4.451 4.597 4.733 4.856 4.963 5.05 5.131 5.226 5.266 5.196 5.012 4.633 3.977 2.691 0.935 -0.549 -1.802 -2.863 -3.818 -4.686 -5.476 -6.131 -6.781 -7.34 -7.812 -8.276 -8.724 -9.135 -9.51 -9.895 -10.219 -10.49 -10.803 -11.128 -11.376 -11.635 -11.907 -12.106 -12.306 -12.513 -12.727 -12.958 -13.114 -13.268 -13.506 -13.669 -13.837 -13.927 -14.125 -14.325 -14.53 -14.643 -14.963 -14.989 -15.113 -15.242 -15.531 -15.668 -15.817 -16.001 -16.212 -16.444 -16.747 -17.342 -4 ,16558 ,TETRA ,17551372,Thu Nov 25 11:21:12 CET,Thu Nov 25 12:58:08 CET,0.0 0.481 0.682 0.838 0.968 1.071 1.164 1.255 1.425 1.499 1.574 1.516 1.772 1.82 1.93 2.038 2.127 2.171 2.263 2.355 2.481 2.556 2.633 2.758 2.88 2.977 3.067 3.152 3.255 3.36 3.461 3.573 3.665 3.756 3.869 3.976 4.07 4.164 4.272 4.392 4.506 4.638 4.748 4.81 4.844 4.803 4.718 4.558 4.209 3.531 2.241 0.536 -0.984 -2.292 -3.407 -4.409 -5.27 -6.005 -6.632 -7.297 -7.848 -8.338 -8.808 -9.231 -9.616 -9.971 -10.348 -10.672 -10.939 -11.226 -11.532 -11.769 -12.011 -12.26 -12.454 -12.661 -12.871 -13.082 -13.317 -13.496 -13.68 -13.941 -14.111 -14.28 -14.369 -14.559 -14.757 -14.969 -15.078 -15.405 -15.437 -15.567 -15.702 -15.981 -16.131 -16.297 -16.46 -16.665 -16.94 -17.26 -18.004 -5 ,26227 ,TETRA ,17551375,Thu Nov 25 11:21:12 CET,Thu Nov 25 12:56:04 CET,0.0 0.537 0.768 0.929 1.078 1.223 1.347 1.461 1.656 1.738 1.822 1.762 2.031 2.112 2.26 2.391 2.518 2.581 2.692 2.798 2.948 3.042 3.136 3.275 3.405 3.523 3.632 3.741 3.886 4.022 4.141 4.289 4.426 4.539 4.68 4.822 4.939 5.077 5.226 5.385 5.541 5.702 5.882 6.017 6.135 6.228 6.234 6.11 5.799 5.214 4.019 2.279 0.741 -0.517 -1.623 -2.642 -3.512 -4.293 -4.982 -5.674 -6.264 -6.775 -7.256 -7.726 -8.161 -8.548 -8.959 -9.33 -9.647 -9.979 -10.328 -10.607 -10.888 -11.179 -11.399 -11.614 -11.841 -12.076 -12.304 -12.452 -12.605 -12.853 -13.032 -13.221 -13.316 -13.502 -13.691 -13.909 -14.022 -14.339 -14.365 -14.504 -14.643 -14.948 -15.114 -15.285 -15.471 -15.662 -15.844 -16.067 -16.505 -6 ,12326 ,TETRA ,17551379,Thu Nov 25 11:21:11 CET,Thu Nov 25 13:02:03 CET,0.0 0.452 0.653 0.798 0.931 1.061 1.181 1.285 1.449 1.513 1.579 1.514 1.765 1.819 1.928 2.035 2.135 2.183 2.279 2.36 2.484 2.577 2.658 2.764 2.873 2.984 3.075 3.152 3.268 3.398 3.522 3.66 3.784 3.909 4.037 4.158 4.273 4.397 4.533 4.668 4.789 4.901 5.011 5.083 5.135 5.148 5.067 4.889 4.52 3.819 2.473 0.715 -0.748 -1.983 -3.055 -4.029 -4.873 -5.638 -6.306 -6.959 -7.503 -7.984 -8.445 -8.886 -9.305 -9.674 -10.051 -10.388 -10.676 -10.981 -11.302 -11.567 -11.844 -12.153 -12.386 -12.607 -12.822 -13.042 -13.262 -13.413 -13.576 -13.827 -13.997 -14.169 -14.263 -14.464 -14.66 -14.861 -14.967 -15.29 -15.317 -15.437 -15.554 -15.801 -15.94 -16.1 -16.284 -16.47 -16.699 -17.02 -17.469 -7 ,18770 ,TETRA ,17551380,Thu Nov 25 11:21:12 CET,Thu Nov 25 12:57:12 CET,0.0 1.358 1.713 1.931 2.067 2.172 2.267 2.367 2.541 2.618 2.702 2.667 2.937 3.004 3.113 3.212 3.322 3.376 3.48 3.577 3.702 3.778 3.856 3.972 4.067 4.162 4.255 4.347 4.461 4.556 4.648 4.76 4.866 4.967 5.086 5.198 5.284 5.375 5.474 5.572 5.675 5.76 5.821 5.877 5.938 5.93 5.802 5.593 5.233 4.561 3.242 1.526 0.061 -1.182 -2.261 -3.232 -4.08 -4.839 -5.495 -6.139 -6.683 -7.181 -7.656 -8.099 -8.5 -8.856 -9.22 -9.55 -9.833 -10.111 -10.401 -10.654 -10.901 -11.147 -11.353 -11.562 -11.771 -11.985 -12.212 -12.373 -12.542 -12.809 -12.983 -13.158 -13.249 -13.446 -13.661 -13.889 -14.003 -14.318 -14.317 -14.43 -14.557 -14.834 -14.982 -15.135 -15.304 -15.49 -15.731 -16.063 -16.745 -8 ,17666 ,TETRA ,17551384,Thu Nov 25 11:21:13 CET,Thu Nov 25 12:57:51 CET,0.0 0.364 0.563 0.707 0.813 0.906 0.998 1.078 1.224 1.301 1.394 1.364 1.627 1.694 1.813 1.914 2.008 2.056 2.154 2.245 2.362 2.441 2.52 2.645 2.783 2.909 3.037 3.168 3.31 3.431 3.553 3.706 3.844 3.959 4.074 4.207 4.334 4.448 4.556 4.668 4.775 4.883 5.0 5.077 5.116 5.125 5.05 4.866 4.489 3.802 2.549 0.877 -0.608 -1.887 -2.98 -3.97 -4.818 -5.583 -6.251 -6.904 -7.45 -7.926 -8.389 -8.843 -9.258 -9.638 -10.041 -10.39 -10.672 -10.966 -11.284 -11.551 -11.838 -12.147 -12.379 -12.6 -12.82 -13.04 -13.276 -13.444 -13.604 -13.852 -14.022 -14.194 -14.286 -14.469 -14.654 -14.847 -14.948 -15.274 -15.309 -15.444 -15.581 -15.851 -15.998 -16.154 -16.332 -16.53 -16.74 -16.98 -17.475 -9 ,31796 ,TETRA ,17551386,Thu Nov 25 11:21:13 CET,Thu Nov 25 12:57:51 CET,0.0 0.544 0.764 0.908 1.028 1.145 1.263 1.38 1.581 1.663 1.721 1.629 1.887 1.947 2.058 2.171 2.281 2.326 2.412 2.505 2.626 2.696 2.773 2.897 3.005 3.094 3.184 3.276 3.404 3.519 3.62 3.746 3.855 3.954 4.076 4.216 4.329 4.444 4.575 4.688 4.784 4.892 5.009 5.106 5.183 5.192 5.121 4.927 4.51 3.853 2.641 0.976 -0.472 -1.745 -2.883 -3.874 -4.705 -5.446 -6.089 -6.752 -7.325 -7.826 -8.286 -8.709 -9.095 -9.436 -9.786 -10.114 -10.41 -10.701 -11.005 -11.27 -11.538 -11.802 -11.997 -12.202 -12.417 -12.636 -12.871 -13.045 -13.219 -13.467 -13.644 -13.823 -13.913 -14.093 -14.283 -14.486 -14.581 -14.894 -14.931 -15.062 -15.188 -15.457 -15.599 -15.74 -15.904 -16.124 -16.357 -16.667 -17.309 -10 ,550 ,TETRA ,17551388,Thu Nov 25 11:21:13 CET,Thu Nov 25 12:55:50 CET,0.0 0.66 0.867 1.013 1.137 1.267 1.382 1.492 1.702 1.8 1.898 1.89 2.179 2.264 2.413 2.548 2.665 2.714 2.809 2.9 3.026 3.102 3.181 3.3 3.417 3.521 3.612 3.703 3.823 3.939 4.054 4.193 4.339 4.466 4.6 4.757 4.883 5.014 5.151 5.266 5.378 5.484 5.597 5.699 5.745 5.753 5.679 5.487 5.113 4.41 3.125 1.43 -0.045 -1.339 -2.417 -3.356 -4.205 -4.963 -5.632 -6.323 -6.91 -7.402 -7.856 -8.297 -8.706 -9.065 -9.435 -9.779 -10.078 -10.386 -10.714 -10.979 -11.24 -11.522 -11.743 -11.967 -12.194 -12.411 -12.64 -12.791 -12.945 -13.184 -13.35 -13.531 -13.631 -13.83 -14.041 -14.258 -14.361 -14.676 -14.691 -14.808 -14.93 -15.196 -15.338 -15.495 -15.673 -15.873 -16.114 -16.403 -16.912 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_63_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_63_58.txt deleted file mode 100644 index 54a16a26..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_63_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,358 ,KEBNE ,17023223,Wed Dec 22 08:03:31 CET,Wed Dec 22 09:25:33 CET,0.0 0.55 0.816 1.052 1.248 1.421 1.593 1.759 2.042 2.167 2.29 2.336 2.651 2.771 3.003 3.219 3.421 3.515 3.703 3.879 4.124 4.287 4.451 4.69 4.922 5.15 5.382 5.604 5.872 6.131 6.379 6.697 7.012 7.303 7.649 8.047 8.412 8.817 9.261 9.717 10.184 10.693 11.262 11.823 12.474 13.207 14.041 14.915 15.847 16.844 17.87 18.398 18.522 18.49 18.384 18.224 17.994 17.744 17.525 17.285 17.073 16.869 16.661 16.461 16.262 16.076 15.879 15.689 15.514 15.336 15.156 15.015 14.878 14.717 14.592 14.463 14.332 14.212 14.069 13.966 13.863 13.712 13.61 13.49 13.428 13.295 13.149 13.006 12.935 12.676 12.707 12.628 12.543 12.334 12.213 12.1 11.994 11.849 11.681 11.511 11.202 -2 ,24834 ,KEBNE ,17023224,Wed Dec 22 08:03:31 CET,Wed Dec 22 09:25:27 CET,0.0 0.864 1.195 1.416 1.62 1.82 1.996 2.161 2.487 2.631 2.762 2.814 3.122 3.23 3.445 3.653 3.839 3.927 4.106 4.299 4.585 4.751 4.908 5.137 5.353 5.55 5.743 5.943 6.21 6.467 6.716 7.031 7.336 7.623 7.964 8.347 8.711 9.108 9.523 9.956 10.421 10.958 11.552 12.123 12.766 13.477 14.257 15.092 16.044 17.096 18.189 18.777 18.928 18.889 18.767 18.607 18.379 18.131 17.915 17.696 17.495 17.3 17.098 16.897 16.715 16.543 16.352 16.148 15.967 15.817 15.677 15.551 15.416 15.278 15.161 15.045 14.929 14.808 14.677 14.585 14.486 14.322 14.213 14.101 14.041 13.914 13.764 13.602 13.52 13.247 13.263 13.186 13.114 12.928 12.816 12.703 12.592 12.467 12.319 12.119 11.796 -3 ,190 ,KEBNE ,17023225,Wed Dec 22 08:03:35 CET,Wed Dec 22 09:20:46 CET,0.0 0.569 0.886 1.124 1.32 1.511 1.68 1.826 2.1 2.245 2.38 2.433 2.751 2.868 3.084 3.28 3.481 3.584 3.788 3.974 4.217 4.372 4.52 4.744 4.978 5.202 5.414 5.611 5.867 6.123 6.362 6.658 6.949 7.239 7.581 7.935 8.268 8.649 9.065 9.505 9.943 10.436 11.029 11.625 12.319 13.041 13.847 14.708 15.65 16.668 17.707 18.294 18.408 18.346 18.195 17.999 17.791 17.55 17.326 17.084 16.855 16.64 16.429 16.222 16.018 15.834 15.646 15.481 15.318 15.138 14.956 14.798 14.617 14.438 14.308 14.158 13.997 13.848 13.693 13.581 13.463 13.284 13.168 13.054 12.998 12.886 12.765 12.634 12.563 12.297 12.324 12.244 12.157 11.963 11.857 11.749 11.619 11.485 11.311 11.089 10.644 -4 ,18473 ,KEBNE ,17023226,Wed Dec 22 08:03:33 CET,Wed Dec 22 09:21:03 CET,0.0 0.594 0.903 1.125 1.316 1.488 1.645 1.799 2.072 2.197 2.317 2.342 2.649 2.758 2.974 3.179 3.374 3.47 3.653 3.82 4.078 4.249 4.418 4.662 4.88 5.094 5.311 5.517 5.767 6.009 6.26 6.576 6.876 7.163 7.501 7.877 8.236 8.614 9.013 9.443 9.899 10.4 10.978 11.555 12.207 12.927 13.729 14.592 15.57 16.585 17.626 18.299 18.483 18.402 18.244 18.07 17.859 17.635 17.427 17.174 16.944 16.743 16.543 16.351 16.152 15.972 15.783 15.617 15.479 15.339 15.198 15.071 14.943 14.809 14.701 14.587 14.46 14.327 14.187 14.091 13.997 13.848 13.738 13.615 13.551 13.425 13.283 13.137 13.068 12.806 12.84 12.749 12.653 12.472 12.374 12.276 12.162 12.03 11.874 11.686 11.239 -5 ,29071 ,KEBNE ,17023227,Wed Dec 22 08:03:33 CET,Wed Dec 22 09:22:29 CET,0.0 0.589 0.869 1.123 1.345 1.556 1.739 1.9 2.201 2.34 2.474 2.545 2.861 2.963 3.155 3.349 3.551 3.65 3.839 4.018 4.264 4.42 4.577 4.814 5.043 5.252 5.447 5.645 5.888 6.109 6.333 6.619 6.898 7.17 7.504 7.884 8.258 8.664 9.106 9.572 10.024 10.518 11.09 11.677 12.341 13.05 13.854 14.73 15.714 16.731 17.746 18.307 18.413 18.386 18.278 18.092 17.878 17.62 17.367 17.137 16.92 16.707 16.514 16.311 16.1 15.904 15.701 15.515 15.347 15.179 15.017 14.872 14.712 14.548 14.418 14.273 14.129 13.977 13.812 13.698 13.576 13.388 13.257 13.116 13.036 12.861 12.688 12.537 12.465 12.195 12.215 12.123 12.026 11.834 11.741 11.639 11.501 11.364 11.224 11.036 10.672 -6 ,9739 ,KEBNE ,17023228,Wed Dec 22 08:03:35 CET,Wed Dec 22 09:20:43 CET,0.0 0.587 0.879 1.085 1.298 1.496 1.661 1.815 2.119 2.265 2.396 2.445 2.757 2.869 3.089 3.314 3.514 3.605 3.786 3.945 4.188 4.358 4.526 4.77 4.992 5.21 5.43 5.641 5.908 6.18 6.46 6.798 7.117 7.421 7.769 8.154 8.524 8.919 9.327 9.75 10.202 10.725 11.339 11.949 12.633 13.361 14.161 15.035 15.984 16.997 18.078 18.696 18.872 18.815 18.661 18.453 18.247 18.047 17.829 17.581 17.355 17.143 16.95 16.764 16.573 16.4 16.207 16.026 15.887 15.751 15.603 15.47 15.32 15.171 15.061 14.939 14.813 14.688 14.554 14.458 14.359 14.209 14.107 13.987 13.927 13.812 13.687 13.554 13.48 13.218 13.255 13.174 13.092 12.922 12.825 12.71 12.56 12.409 12.235 12.031 11.755 -7 ,5202 ,KEBNE ,17023229,Wed Dec 22 08:04:33 CET,Wed Dec 22 09:26:29 CET,0.0 0.484 0.733 0.944 1.163 1.353 1.519 1.67 1.935 2.064 2.185 2.218 2.53 2.645 2.883 3.107 3.303 3.404 3.593 3.763 4.017 4.185 4.349 4.583 4.796 4.998 5.203 5.402 5.652 5.89 6.117 6.393 6.667 6.931 7.229 7.558 7.88 8.247 8.641 9.047 9.493 10.03 10.625 11.181 11.818 12.541 13.381 14.28 15.229 16.268 17.329 17.947 18.084 18.007 17.865 17.691 17.486 17.278 17.075 16.837 16.614 16.412 16.211 15.988 15.759 15.568 15.372 15.182 15.01 14.839 14.66 14.507 14.348 14.185 14.066 13.952 13.834 13.703 13.548 13.436 13.334 13.182 13.076 12.958 12.898 12.783 12.655 12.514 12.446 12.188 12.228 12.151 12.063 11.861 11.757 11.649 11.533 11.408 11.238 10.981 10.594 -8 ,32075 ,KEBNE ,17023230,Wed Dec 22 08:04:33 CET,Wed Dec 22 09:27:45 CET,0.0 0.637 0.973 1.192 1.39 1.591 1.776 1.95 2.254 2.393 2.524 2.546 2.847 2.959 3.172 3.37 3.564 3.661 3.839 4.002 4.272 4.47 4.654 4.897 5.148 5.409 5.658 5.897 6.206 6.493 6.759 7.07 7.378 7.675 8.017 8.41 8.783 9.192 9.627 10.061 10.492 10.964 11.512 12.064 12.712 13.421 14.212 15.103 16.101 17.162 18.185 18.688 18.848 18.832 18.698 18.524 18.312 18.078 17.872 17.668 17.465 17.254 17.05 16.839 16.634 16.458 16.268 16.09 15.924 15.751 15.566 15.405 15.258 15.122 15.001 14.874 14.748 14.611 14.454 14.344 14.228 14.052 13.934 13.816 13.764 13.649 13.522 13.387 13.314 13.054 13.067 12.976 12.869 12.627 12.5 12.382 12.265 12.116 11.967 11.783 11.523 -9 ,27215 ,KEBNE ,17023231,Wed Dec 22 08:04:33 CET,Wed Dec 22 09:26:22 CET,0.0 0.967 1.349 1.625 1.829 2.019 2.203 2.367 2.673 2.828 2.992 3.106 3.44 3.586 3.887 4.156 4.379 4.476 4.656 4.829 5.083 5.238 5.392 5.622 5.848 6.066 6.263 6.463 6.747 7.031 7.292 7.585 7.875 8.174 8.532 8.928 9.286 9.692 10.145 10.604 11.07 11.581 12.149 12.7 13.361 14.1 14.894 15.744 16.708 17.738 18.81 19.411 19.545 19.486 19.345 19.174 18.968 18.746 18.533 18.299 18.098 17.897 17.679 17.466 17.257 17.075 16.887 16.704 16.54 16.362 16.181 16.039 15.902 15.758 15.642 15.521 15.395 15.256 15.118 15.028 14.934 14.78 14.672 14.554 14.49 14.36 14.233 14.105 14.041 13.792 13.836 13.753 13.666 13.471 13.361 13.252 13.124 12.981 12.821 12.633 12.194 -10 ,5191 ,KEBNE ,17023232,Wed Dec 22 08:04:33 CET,Wed Dec 22 09:26:20 CET,0.0 0.579 0.872 1.121 1.312 1.484 1.652 1.81 2.114 2.254 2.379 2.424 2.738 2.849 3.071 3.276 3.454 3.538 3.715 3.901 4.169 4.335 4.493 4.723 4.965 5.192 5.395 5.589 5.833 6.071 6.304 6.599 6.876 7.124 7.424 7.772 8.105 8.45 8.836 9.271 9.711 10.2 10.765 11.317 11.977 12.689 13.478 14.364 15.356 16.383 17.394 17.98 18.129 18.122 18.008 17.84 17.665 17.47 17.277 17.062 16.872 16.692 16.506 16.32 16.135 15.94 15.736 15.569 15.403 15.223 15.039 14.869 14.7 14.539 14.411 14.283 14.138 13.978 13.812 13.692 13.558 13.331 13.178 13.032 12.951 12.782 12.616 12.431 12.337 12.06 12.052 11.95 11.844 11.603 11.471 11.337 11.215 11.098 10.95 10.777 10.373 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_63_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_63_64.txt deleted file mode 100644 index 53c648fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_63_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28936 ,TETRA ,17551414,Thu Nov 25 11:23:12 CET,Thu Nov 25 13:03:56 CET,0.0 0.908 1.267 1.552 1.801 2.028 2.23 2.406 2.726 2.873 3.008 3.073 3.391 3.501 3.694 3.877 4.061 4.155 4.337 4.509 4.766 4.933 5.091 5.321 5.534 5.736 5.93 6.112 6.352 6.591 6.816 7.084 7.345 7.595 7.878 8.203 8.532 8.888 9.25 9.615 10.004 10.459 10.966 11.464 12.044 12.681 13.405 14.208 15.119 16.134 17.137 17.656 17.772 17.739 17.598 17.393 17.159 16.913 16.679 16.417 16.193 16.001 15.792 15.569 15.353 15.151 14.933 14.727 14.53 14.32 14.114 13.948 13.774 13.578 13.426 13.289 13.152 12.997 12.835 12.729 12.611 12.399 12.261 12.141 12.082 11.938 11.777 11.615 11.53 11.253 11.254 11.153 11.046 10.809 10.67 10.528 10.385 10.217 10.024 9.717 9.141 -2 ,2116 ,TETRA ,17551415,Thu Nov 25 11:23:13 CET,Thu Nov 25 12:59:41 CET,0.0 2.783 3.167 3.486 3.714 3.894 4.064 4.221 4.497 4.64 4.792 4.875 5.2 5.327 5.566 5.794 6.008 6.105 6.296 6.48 6.724 6.876 7.023 7.231 7.439 7.64 7.832 8.028 8.278 8.527 8.772 9.052 9.332 9.595 9.878 10.18 10.483 10.831 11.204 11.587 11.976 12.42 12.94 13.465 14.065 14.729 15.48 16.293 17.217 18.188 19.154 19.728 19.886 19.836 19.711 19.516 19.274 19.044 18.837 18.591 18.33 18.09 17.865 17.654 17.461 17.284 17.106 16.936 16.769 16.604 16.43 16.271 16.1 15.921 15.788 15.653 15.509 15.36 15.205 15.091 14.97 14.779 14.646 14.517 14.451 14.314 14.176 14.033 13.95 13.671 13.669 13.562 13.462 13.259 13.15 13.008 12.847 12.679 12.492 12.246 11.652 -3 ,15055 ,TETRA ,17551416,Thu Nov 25 11:23:13 CET,Thu Nov 25 13:00:44 CET,0.0 0.63 0.97 1.245 1.468 1.675 1.861 2.035 2.351 2.49 2.625 2.697 3.02 3.139 3.337 3.545 3.758 3.861 4.055 4.229 4.473 4.637 4.796 5.0 5.203 5.412 5.606 5.792 6.046 6.305 6.553 6.842 7.104 7.344 7.618 7.951 8.29 8.631 8.994 9.385 9.78 10.223 10.753 11.28 11.876 12.525 13.241 14.019 14.887 15.852 16.842 17.44 17.583 17.502 17.312 17.076 16.857 16.634 16.396 16.127 15.883 15.651 15.423 15.196 14.976 14.77 14.536 14.335 14.174 14.015 13.859 13.719 13.581 13.444 13.322 13.189 13.042 12.896 12.75 12.644 12.527 12.328 12.187 12.039 11.966 11.821 11.66 11.482 11.39 11.092 11.055 10.946 10.832 10.579 10.44 10.289 10.103 9.866 9.569 9.229 8.575 -4 ,8846 ,TETRA ,17551417,Thu Nov 25 11:23:13 CET,Thu Nov 25 13:03:09 CET,0.0 1.969 2.33 2.597 2.816 3.037 3.236 3.421 3.751 3.912 4.084 4.224 4.572 4.699 4.914 5.122 5.311 5.41 5.626 5.833 6.131 6.32 6.499 6.761 7.028 7.281 7.518 7.735 7.982 8.218 8.461 8.763 9.032 9.266 9.54 9.855 10.164 10.493 10.847 11.228 11.614 12.038 12.553 13.085 13.676 14.307 15.003 15.747 16.594 17.549 18.567 19.208 19.355 19.32 19.203 18.988 18.75 18.514 18.281 18.017 17.77 17.555 17.339 17.113 16.9 16.696 16.484 16.285 16.099 15.912 15.714 15.55 15.393 15.237 15.109 14.976 14.832 14.682 14.528 14.411 14.279 14.076 13.945 13.806 13.732 13.585 13.428 13.264 13.182 12.898 12.874 12.785 12.688 12.402 12.249 12.11 11.93 11.721 11.54 11.348 10.736 -5 ,27471 ,TETRA ,17551418,Thu Nov 25 11:23:13 CET,Thu Nov 25 13:00:57 CET,0.0 1.096 1.421 1.638 1.83 2.045 2.243 2.398 2.661 2.786 2.916 2.984 3.299 3.42 3.647 3.853 4.043 4.137 4.312 4.473 4.729 4.904 5.08 5.357 5.601 5.797 5.985 6.182 6.439 6.671 6.894 7.172 7.428 7.674 7.954 8.264 8.578 8.907 9.249 9.637 10.029 10.456 10.962 11.464 12.044 12.692 13.454 14.296 15.201 16.14 17.143 17.74 17.865 17.809 17.631 17.4 17.167 16.92 16.686 16.429 16.19 15.962 15.74 15.519 15.319 15.143 14.946 14.752 14.56 14.363 14.156 13.966 13.772 13.576 13.42 13.255 13.085 12.914 12.734 12.603 12.475 12.294 12.168 12.037 11.967 11.821 11.677 11.518 11.438 11.172 11.175 11.082 10.982 10.741 10.611 10.471 10.309 10.143 9.967 9.755 9.344 -6 ,7684 ,TETRA ,17551419,Thu Nov 25 11:23:14 CET,Thu Nov 25 13:02:11 CET,0.0 1.043 1.405 1.711 1.938 2.136 2.321 2.495 2.768 2.893 3.024 3.081 3.393 3.506 3.72 3.924 4.112 4.202 4.382 4.558 4.815 4.989 5.149 5.373 5.587 5.803 6.018 6.216 6.465 6.705 6.942 7.219 7.474 7.721 8.015 8.341 8.649 8.989 9.356 9.741 10.137 10.585 11.1 11.616 12.196 12.843 13.584 14.374 15.229 16.207 17.271 17.8 17.901 17.818 17.65 17.438 17.214 16.951 16.683 16.406 16.142 15.902 15.679 15.448 15.236 15.048 14.829 14.602 14.398 14.193 13.977 13.801 13.622 13.447 13.308 13.166 13.031 12.883 12.722 12.612 12.488 12.297 12.181 12.058 11.988 11.835 11.68 11.516 11.42 11.14 11.148 11.047 10.937 10.688 10.547 10.384 10.229 10.067 9.865 9.654 9.347 -7 ,29075 ,TETRA ,17551420,Thu Nov 25 11:23:14 CET,Thu Nov 25 13:03:26 CET,0.0 0.869 1.224 1.513 1.76 1.967 2.162 2.356 2.689 2.845 2.988 3.041 3.359 3.481 3.712 3.915 4.116 4.216 4.405 4.591 4.833 4.969 5.103 5.31 5.52 5.726 5.93 6.124 6.363 6.604 6.846 7.132 7.393 7.644 7.924 8.243 8.569 8.913 9.272 9.663 10.086 10.556 11.07 11.574 12.157 12.834 13.6 14.378 15.206 16.134 17.162 17.759 17.914 17.817 17.653 17.464 17.204 16.946 16.702 16.461 16.274 16.086 15.886 15.681 15.486 15.312 15.114 14.93 14.779 14.614 14.441 14.295 14.138 13.976 13.847 13.717 13.581 13.434 13.286 13.175 13.053 12.881 12.754 12.622 12.556 12.404 12.258 12.1 12.018 11.75 11.746 11.644 11.534 11.284 11.167 11.032 10.865 10.686 10.514 10.267 9.65 -8 ,15543 ,TETRA ,17551421,Thu Nov 25 11:24:09 CET,Thu Nov 25 13:05:15 CET,0.0 0.723 1.047 1.278 1.486 1.713 1.916 2.094 2.389 2.527 2.667 2.735 3.054 3.172 3.392 3.6 3.8 3.896 4.085 4.259 4.497 4.66 4.823 5.046 5.257 5.477 5.685 5.885 6.139 6.369 6.598 6.899 7.174 7.418 7.698 8.009 8.304 8.63 8.99 9.376 9.782 10.225 10.716 11.209 11.781 12.404 13.13 13.947 14.847 15.808 16.812 17.407 17.528 17.48 17.321 17.077 16.825 16.572 16.324 16.073 15.863 15.647 15.423 15.212 14.993 14.771 14.538 14.332 14.159 13.983 13.799 13.625 13.426 13.242 13.107 12.952 12.778 12.599 12.419 12.3 12.186 12.008 11.88 11.748 11.677 11.534 11.389 11.221 11.133 10.858 10.865 10.771 10.667 10.436 10.313 10.174 10.021 9.855 9.687 9.468 8.909 -9 ,10722 ,TETRA ,17551422,Thu Nov 25 11:23:14 CET,Thu Nov 25 12:58:09 CET,0.0 1.109 1.434 1.766 2.041 2.263 2.48 2.671 3.004 3.15 3.281 3.335 3.654 3.775 4.004 4.229 4.421 4.504 4.679 4.854 5.097 5.251 5.418 5.668 5.883 6.083 6.271 6.463 6.718 6.962 7.209 7.495 7.762 8.016 8.3 8.628 8.95 9.297 9.665 10.056 10.445 10.872 11.362 11.845 12.42 13.057 13.751 14.511 15.384 16.323 17.187 17.665 17.765 17.719 17.551 17.318 17.049 16.748 16.506 16.254 16.007 15.78 15.543 15.29 15.056 14.854 14.625 14.388 14.183 13.978 13.767 13.584 13.385 13.194 13.047 12.893 12.734 12.571 12.401 12.272 12.143 11.957 11.822 11.674 11.6 11.446 11.276 11.099 11.01 10.728 10.714 10.609 10.506 10.259 10.129 10.0 9.854 9.692 9.51 9.24 8.463 -10 ,10412 ,TETRA ,17551424,Thu Nov 25 11:23:14 CET,Thu Nov 25 12:57:56 CET,0.0 0.944 1.292 1.561 1.795 2.026 2.206 2.362 2.658 2.804 2.933 2.97 3.283 3.394 3.597 3.782 3.965 4.061 4.246 4.418 4.675 4.84 4.994 5.209 5.423 5.636 5.839 6.036 6.282 6.518 6.756 7.033 7.289 7.537 7.824 8.146 8.458 8.785 9.134 9.524 9.934 10.41 10.966 11.5 12.096 12.721 13.448 14.258 15.113 16.033 17.042 17.627 17.739 17.687 17.549 17.336 17.104 16.864 16.622 16.36 16.125 15.901 15.703 15.526 15.349 15.166 14.953 14.755 14.594 14.436 14.262 14.112 13.964 13.809 13.669 13.526 13.393 13.258 13.107 12.994 12.876 12.685 12.542 12.394 12.322 12.175 12.027 11.867 11.774 11.49 11.483 11.37 11.256 10.975 10.819 10.681 10.525 10.34 10.084 9.748 9.165 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_63_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_63_65.txt deleted file mode 100644 index 953a872c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_63_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14237 ,TETRA ,17551434,Thu Nov 25 11:24:08 CET,Thu Nov 25 12:59:54 CET,0.0 0.391 0.609 0.846 1.028 1.168 1.304 1.432 1.682 1.8 1.901 1.892 2.179 2.273 2.45 2.614 2.784 2.866 3.016 3.16 3.368 3.496 3.618 3.811 3.989 4.154 4.314 4.462 4.655 4.844 5.033 5.266 5.485 5.684 5.915 6.196 6.467 6.755 7.075 7.412 7.752 8.145 8.591 9.004 9.479 9.989 10.541 11.106 11.726 12.391 12.938 13.113 12.979 12.703 12.371 11.991 11.603 11.246 10.943 10.615 10.331 10.06 9.768 9.5 9.259 9.026 8.789 8.583 8.388 8.179 7.953 7.763 7.577 7.391 7.251 7.091 6.933 6.782 6.611 6.49 6.364 6.159 6.011 5.858 5.78 5.619 5.458 5.276 5.18 4.876 4.838 4.726 4.611 4.364 4.23 4.078 3.927 3.756 3.529 3.283 2.801 -2 ,259 ,TETRA ,17551435,Thu Nov 25 11:24:09 CET,Thu Nov 25 13:02:21 CET,0.0 0.609 0.849 1.062 1.254 1.401 1.533 1.67 1.928 2.032 2.14 2.157 2.454 2.547 2.722 2.904 3.099 3.193 3.352 3.501 3.727 3.874 4.007 4.202 4.396 4.589 4.785 4.973 5.191 5.397 5.612 5.869 6.103 6.328 6.587 6.884 7.166 7.45 7.752 8.074 8.415 8.807 9.255 9.702 10.221 10.77 11.331 11.905 12.54 13.178 13.711 13.855 13.663 13.315 12.96 12.607 12.261 11.934 11.622 11.303 11.026 10.753 10.472 10.206 9.957 9.71 9.46 9.253 9.072 8.859 8.633 8.457 8.263 8.054 7.9 7.749 7.591 7.422 7.247 7.125 6.998 6.814 6.686 6.543 6.47 6.321 6.161 5.991 5.898 5.609 5.611 5.503 5.398 5.167 5.037 4.901 4.765 4.615 4.425 4.163 3.72 -3 ,20150 ,TETRA ,17551436,Thu Nov 25 11:24:09 CET,Thu Nov 25 13:00:47 CET,0.0 0.505 0.838 1.078 1.263 1.439 1.59 1.727 1.966 2.064 2.167 2.178 2.468 2.554 2.709 2.873 3.046 3.128 3.28 3.419 3.624 3.759 3.883 4.073 4.268 4.439 4.595 4.753 4.958 5.156 5.349 5.575 5.795 6.019 6.278 6.557 6.814 7.104 7.442 7.785 8.127 8.517 8.955 9.392 9.911 10.437 10.991 11.591 12.226 12.838 13.344 13.43 13.224 12.918 12.577 12.221 11.873 11.536 11.237 10.927 10.643 10.381 10.107 9.841 9.587 9.356 9.114 8.917 8.764 8.603 8.427 8.258 8.084 7.909 7.77 7.634 7.5 7.351 7.185 7.077 6.965 6.777 6.641 6.501 6.43 6.282 6.123 5.938 5.846 5.559 5.54 5.422 5.311 5.078 4.949 4.808 4.649 4.464 4.24 3.975 3.429 -4 ,15047 ,TETRA ,17551437,Thu Nov 25 11:24:10 CET,Thu Nov 25 12:58:28 CET,0.0 0.495 0.705 0.881 1.052 1.23 1.393 1.53 1.808 1.931 2.032 2.023 2.318 2.415 2.605 2.775 2.934 3.012 3.159 3.296 3.506 3.645 3.782 3.972 4.153 4.331 4.495 4.653 4.845 5.034 5.245 5.509 5.752 5.992 6.262 6.558 6.842 7.145 7.456 7.791 8.139 8.519 8.941 9.345 9.831 10.356 10.933 11.534 12.158 12.806 13.391 13.563 13.426 13.159 12.823 12.458 12.086 11.72 11.406 11.054 10.738 10.474 10.209 9.933 9.686 9.469 9.21 8.958 8.752 8.534 8.296 8.11 7.93 7.747 7.612 7.479 7.335 7.179 7.006 6.884 6.766 6.583 6.448 6.3 6.225 6.055 5.887 5.719 5.621 5.334 5.311 5.182 5.047 4.734 4.562 4.393 4.226 4.04 3.799 3.493 2.951 -5 ,755 ,TETRA ,17551438,Thu Nov 25 11:24:10 CET,Thu Nov 25 12:59:28 CET,0.0 0.657 0.911 1.118 1.287 1.444 1.582 1.715 1.979 2.104 2.235 2.286 2.595 2.69 2.86 3.031 3.2 3.28 3.437 3.589 3.803 3.938 4.067 4.265 4.474 4.676 4.865 5.048 5.277 5.494 5.689 5.914 6.138 6.366 6.622 6.904 7.186 7.51 7.861 8.218 8.583 8.982 9.447 9.91 10.418 10.949 11.55 12.179 12.836 13.491 14.004 14.098 13.864 13.469 13.042 12.594 12.184 11.824 11.482 11.109 10.778 10.471 10.156 9.85 9.571 9.332 9.076 8.834 8.613 8.384 8.15 7.938 7.718 7.503 7.339 7.182 7.02 6.852 6.685 6.559 6.409 6.195 6.063 5.916 5.83 5.65 5.483 5.324 5.232 4.928 4.907 4.799 4.677 4.399 4.244 4.078 3.903 3.695 3.463 3.198 2.644 -6 ,17099 ,TETRA ,17551439,Thu Nov 25 11:24:10 CET,Thu Nov 25 12:59:53 CET,0.0 0.566 0.814 1.023 1.223 1.437 1.658 1.842 2.15 2.278 2.402 2.442 2.755 2.872 3.092 3.299 3.495 3.587 3.758 3.923 4.161 4.318 4.468 4.676 4.89 5.1 5.301 5.49 5.736 5.977 6.198 6.463 6.744 7.031 7.35 7.705 8.042 8.388 8.746 9.12 9.509 9.956 10.465 10.971 11.519 12.051 12.605 13.169 13.784 14.437 14.999 15.07 14.838 14.524 14.179 13.799 13.416 13.053 12.742 12.407 12.118 11.862 11.587 11.327 11.074 10.833 10.598 10.386 10.199 10.028 9.842 9.676 9.505 9.336 9.211 9.063 8.91 8.759 8.598 8.486 8.36 8.145 8.006 7.87 7.8 7.659 7.501 7.319 7.232 6.956 6.939 6.834 6.736 6.492 6.342 6.187 6.026 5.856 5.677 5.408 4.796 -7 ,4290 ,TETRA ,17551440,Thu Nov 25 11:24:10 CET,Thu Nov 25 13:00:54 CET,0.0 0.888 1.146 1.331 1.486 1.639 1.795 1.953 2.226 2.34 2.449 2.474 2.777 2.891 3.115 3.317 3.5 3.58 3.736 3.892 4.097 4.231 4.367 4.564 4.759 4.935 5.096 5.248 5.447 5.655 5.867 6.132 6.38 6.609 6.886 7.198 7.472 7.766 8.09 8.432 8.788 9.205 9.67 10.082 10.552 11.087 11.719 12.37 13.003 13.627 14.098 14.142 13.929 13.638 13.336 12.983 12.643 12.317 11.998 11.651 11.336 11.057 10.791 10.542 10.316 10.097 9.858 9.641 9.45 9.251 9.04 8.867 8.709 8.552 8.406 8.25 8.09 7.918 7.754 7.641 7.514 7.313 7.178 7.036 6.958 6.804 6.645 6.469 6.379 6.092 6.081 5.963 5.848 5.629 5.509 5.355 5.185 5.023 4.838 4.563 3.676 -8 ,14844 ,TETRA ,17551441,Thu Nov 25 11:24:10 CET,Thu Nov 25 12:58:43 CET,0.0 0.65 0.887 1.06 1.231 1.386 1.532 1.683 1.949 2.067 2.175 2.183 2.482 2.577 2.738 2.896 3.058 3.135 3.284 3.424 3.609 3.736 3.874 4.065 4.259 4.457 4.636 4.812 5.044 5.26 5.472 5.735 5.976 6.207 6.483 6.786 7.075 7.388 7.703 8.026 8.376 8.775 9.226 9.667 10.173 10.704 11.274 11.877 12.514 13.158 13.629 13.65 13.393 13.04 12.675 12.3 11.92 11.552 11.245 10.925 10.619 10.346 10.097 9.85 9.607 9.372 9.132 8.902 8.698 8.497 8.279 8.099 7.916 7.727 7.585 7.44 7.288 7.133 6.969 6.854 6.727 6.53 6.404 6.262 6.187 6.031 5.855 5.664 5.567 5.276 5.272 5.167 5.065 4.824 4.686 4.549 4.399 4.253 4.076 3.8 3.193 -9 ,9023 ,TETRA ,17551442,Thu Nov 25 11:24:12 CET,Thu Nov 25 12:59:16 CET,0.0 0.499 0.732 0.932 1.108 1.292 1.472 1.607 1.841 1.948 2.041 2.036 2.33 2.421 2.597 2.768 2.943 3.025 3.166 3.304 3.504 3.633 3.76 3.949 4.129 4.3 4.462 4.627 4.844 5.05 5.251 5.497 5.731 5.953 6.22 6.517 6.793 7.097 7.421 7.764 8.118 8.498 8.936 9.388 9.881 10.383 10.96 11.586 12.244 12.871 13.332 13.423 13.226 12.903 12.56 12.19 11.837 11.508 11.193 10.856 10.534 10.232 9.958 9.682 9.42 9.202 8.977 8.757 8.558 8.362 8.156 7.986 7.819 7.63 7.478 7.321 7.161 7.0 6.834 6.723 6.609 6.414 6.268 6.116 6.039 5.89 5.73 5.551 5.459 5.176 5.172 5.062 4.95 4.729 4.621 4.5 4.36 4.197 4.009 3.776 3.261 -10 ,30902 ,TETRA ,17551443,Thu Nov 25 11:24:10 CET,Thu Nov 25 12:58:54 CET,0.0 0.548 0.818 1.017 1.197 1.357 1.496 1.608 1.859 2.006 2.126 2.11 2.392 2.472 2.642 2.825 2.986 3.063 3.229 3.374 3.577 3.719 3.857 4.056 4.248 4.43 4.6 4.753 4.951 5.138 5.321 5.549 5.772 5.997 6.266 6.559 6.828 7.127 7.458 7.799 8.169 8.584 9.037 9.485 9.983 10.51 11.09 11.685 12.305 12.946 13.466 13.564 13.395 13.105 12.773 12.416 12.058 11.699 11.385 11.064 10.77 10.496 10.223 9.97 9.73 9.502 9.261 9.038 8.832 8.632 8.446 8.278 8.099 7.922 7.78 7.638 7.489 7.325 7.162 7.052 6.938 6.756 6.623 6.479 6.405 6.254 6.086 5.917 5.818 5.516 5.519 5.413 5.308 5.06 4.916 4.772 4.619 4.458 4.261 4.034 3.453 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_64_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_64_54.txt deleted file mode 100644 index f79af993..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_64_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,874 ,KEBNE ,17023233,Wed Dec 22 08:04:33 CET,Wed Dec 22 09:26:18 CET,0.0 1.553 1.839 2.059 2.224 2.377 2.522 2.635 2.828 2.921 3.008 2.985 3.251 3.325 3.471 3.617 3.755 3.818 3.931 4.037 4.184 4.272 4.36 4.488 4.622 4.741 4.842 4.942 5.069 5.181 5.289 5.403 5.506 5.621 5.754 5.903 6.024 6.144 6.254 6.339 6.432 6.534 6.611 6.662 6.683 6.652 6.578 6.395 6.009 5.283 3.937 2.225 0.744 -0.534 -1.641 -2.595 -3.421 -4.184 -4.825 -5.442 -5.947 -6.403 -6.843 -7.255 -7.651 -8.012 -8.388 -8.722 -9.011 -9.318 -9.636 -9.901 -10.175 -10.458 -10.668 -10.875 -11.106 -11.354 -11.604 -11.768 -11.928 -12.172 -12.357 -12.549 -12.645 -12.863 -13.104 -13.349 -13.471 -13.795 -13.88 -14.037 -14.19 -14.525 -14.715 -14.918 -15.146 -15.409 -15.705 -16.091 -16.902 -2 ,19587 ,KEBNE ,17023234,Wed Dec 22 08:04:33 CET,Wed Dec 22 09:26:01 CET,0.0 1.154 1.477 1.697 1.915 2.106 2.251 2.38 2.61 2.736 2.876 2.926 3.202 3.269 3.42 3.583 3.716 3.777 3.897 4.003 4.154 4.257 4.359 4.509 4.646 4.76 4.859 4.961 5.092 5.209 5.317 5.444 5.557 5.664 5.788 5.912 6.017 6.118 6.211 6.301 6.403 6.507 6.581 6.625 6.635 6.59 6.466 6.257 5.868 5.156 3.819 2.056 0.605 -0.605 -1.658 -2.586 -3.374 -4.084 -4.722 -5.366 -5.899 -6.381 -6.846 -7.265 -7.659 -8.012 -8.379 -8.726 -9.02 -9.309 -9.61 -9.86 -10.132 -10.421 -10.639 -10.859 -11.086 -11.324 -11.567 -11.743 -11.924 -12.2 -12.401 -12.603 -12.702 -12.899 -13.117 -13.37 -13.501 -13.833 -13.907 -14.05 -14.216 -14.598 -14.791 -14.988 -15.204 -15.447 -15.704 -16.041 -17.339 -3 ,22041 ,KEBNE ,17023235,Wed Dec 22 08:04:37 CET,Wed Dec 22 09:22:55 CET,0.0 1.189 1.652 1.942 2.196 2.42 2.604 2.767 3.01 3.117 3.218 3.207 3.472 3.548 3.697 3.842 3.963 4.023 4.144 4.255 4.409 4.505 4.589 4.706 4.822 4.931 5.035 5.139 5.261 5.378 5.497 5.613 5.722 5.821 5.92 6.041 6.16 6.279 6.403 6.508 6.603 6.699 6.758 6.786 6.795 6.776 6.69 6.518 6.182 5.474 4.13 2.4 0.946 -0.291 -1.342 -2.274 -3.086 -3.808 -4.442 -5.073 -5.59 -6.045 -6.492 -6.924 -7.319 -7.668 -8.037 -8.381 -8.677 -8.966 -9.263 -9.508 -9.769 -10.044 -10.256 -10.472 -10.698 -10.936 -11.176 -11.345 -11.515 -11.799 -12.007 -12.216 -12.323 -12.529 -12.773 -13.069 -13.221 -13.571 -13.678 -13.842 -14.032 -14.478 -14.716 -14.945 -15.179 -15.427 -15.708 -16.155 -17.69 -4 ,22727 ,KEBNE ,17023236,Wed Dec 22 08:04:37 CET,Wed Dec 22 09:19:28 CET,0.0 0.466 0.716 0.945 1.145 1.33 1.495 1.635 1.856 1.955 2.048 2.023 2.282 2.356 2.494 2.624 2.756 2.813 2.913 3.012 3.149 3.237 3.324 3.445 3.566 3.691 3.802 3.908 4.041 4.153 4.258 4.378 4.477 4.564 4.675 4.8 4.92 5.046 5.152 5.254 5.343 5.407 5.485 5.564 5.62 5.606 5.506 5.309 4.917 4.166 2.816 1.129 -0.347 -1.607 -2.66 -3.579 -4.392 -5.153 -5.79 -6.417 -6.958 -7.43 -7.875 -8.3 -8.701 -9.076 -9.466 -9.793 -10.059 -10.344 -10.669 -10.939 -11.207 -11.485 -11.7 -11.915 -12.13 -12.369 -12.626 -12.795 -12.966 -13.223 -13.408 -13.605 -13.704 -13.918 -14.143 -14.369 -14.492 -14.828 -14.922 -15.081 -15.246 -15.576 -15.779 -16.013 -16.227 -16.47 -16.803 -17.225 -18.143 -5 ,2245 ,KEBNE ,17023237,Wed Dec 22 08:04:35 CET,Wed Dec 22 09:23:16 CET,0.0 0.927 1.258 1.511 1.695 1.875 2.031 2.171 2.425 2.529 2.634 2.638 2.908 2.99 3.159 3.322 3.465 3.529 3.65 3.766 3.914 4.011 4.127 4.294 4.444 4.574 4.7 4.821 4.975 5.106 5.214 5.349 5.479 5.59 5.697 5.814 5.939 6.065 6.185 6.316 6.443 6.565 6.648 6.714 6.76 6.729 6.617 6.393 6.044 5.426 4.135 2.406 0.916 -0.329 -1.372 -2.3 -3.109 -3.818 -4.425 -5.038 -5.573 -6.065 -6.512 -6.911 -7.292 -7.64 -8.009 -8.343 -8.622 -8.91 -9.207 -9.463 -9.738 -10.022 -10.243 -10.464 -10.69 -10.929 -11.183 -11.358 -11.54 -11.831 -12.041 -12.249 -12.344 -12.529 -12.733 -12.971 -13.094 -13.428 -13.494 -13.622 -13.779 -14.165 -14.374 -14.586 -14.816 -15.072 -15.381 -15.827 -16.799 -6 ,7317 ,KEBNE ,17023238,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:27:09 CET,0.0 0.788 1.023 1.242 1.435 1.602 1.762 1.894 2.106 2.21 2.319 2.335 2.61 2.691 2.84 2.971 3.088 3.146 3.266 3.375 3.537 3.644 3.738 3.86 3.989 4.109 4.215 4.32 4.441 4.541 4.64 4.758 4.868 4.983 5.111 5.253 5.381 5.492 5.587 5.682 5.781 5.871 5.957 6.008 6.03 5.993 5.895 5.698 5.314 4.643 3.329 1.59 0.088 -1.148 -2.198 -3.15 -3.959 -4.693 -5.335 -5.957 -6.479 -6.95 -7.419 -7.849 -8.246 -8.629 -9.019 -9.348 -9.637 -9.945 -10.24 -10.477 -10.735 -11.02 -11.242 -11.469 -11.706 -11.954 -12.199 -12.357 -12.528 -12.799 -12.992 -13.196 -13.3 -13.527 -13.765 -14.003 -14.137 -14.479 -14.557 -14.696 -14.84 -15.161 -15.342 -15.548 -15.772 -16.019 -16.323 -16.72 -17.973 -7 ,24083 ,KEBNE ,17023239,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:27:14 CET,0.0 1.209 1.555 1.757 1.931 2.101 2.26 2.411 2.696 2.817 2.916 2.902 3.169 3.249 3.399 3.544 3.681 3.747 3.858 3.957 4.111 4.212 4.309 4.435 4.564 4.699 4.82 4.921 5.048 5.176 5.295 5.418 5.528 5.637 5.756 5.865 5.969 6.082 6.201 6.311 6.397 6.482 6.541 6.571 6.592 6.573 6.487 6.28 5.862 5.154 3.918 2.319 0.876 -0.38 -1.447 -2.403 -3.241 -3.989 -4.63 -5.244 -5.774 -6.254 -6.706 -7.133 -7.526 -7.898 -8.281 -8.613 -8.895 -9.169 -9.459 -9.703 -9.956 -10.22 -10.422 -10.641 -10.866 -11.096 -11.342 -11.512 -11.686 -11.953 -12.137 -12.338 -12.44 -12.643 -12.87 -13.125 -13.256 -13.592 -13.677 -13.825 -13.981 -14.317 -14.486 -14.683 -14.92 -15.179 -15.48 -15.871 -16.808 -8 ,9122 ,KEBNE ,17023240,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:28:35 CET,0.0 1.348 1.675 1.903 2.073 2.224 2.368 2.491 2.739 2.857 2.947 2.925 3.197 3.277 3.405 3.527 3.654 3.71 3.825 3.943 4.103 4.196 4.288 4.414 4.532 4.644 4.744 4.843 4.957 5.069 5.188 5.33 5.461 5.569 5.675 5.795 5.907 6.026 6.155 6.268 6.378 6.482 6.547 6.602 6.631 6.601 6.496 6.287 5.881 5.175 3.866 2.198 0.782 -0.467 -1.569 -2.514 -3.331 -4.08 -4.709 -5.339 -5.871 -6.335 -6.774 -7.172 -7.557 -7.92 -8.295 -8.627 -8.909 -9.191 -9.482 -9.73 -9.995 -10.274 -10.489 -10.713 -10.93 -11.166 -11.424 -11.596 -11.783 -12.075 -12.27 -12.462 -12.563 -12.789 -13.023 -13.256 -13.372 -13.699 -13.782 -13.95 -14.117 -14.426 -14.605 -14.816 -15.084 -15.371 -15.669 -16.087 -17.192 -9 ,9117 ,KEBNE ,17023241,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:27:27 CET,0.0 0.616 0.865 1.073 1.239 1.385 1.513 1.624 1.843 1.942 2.032 2.015 2.28 2.356 2.506 2.629 2.733 2.79 2.922 3.044 3.179 3.267 3.355 3.482 3.609 3.73 3.839 3.934 4.05 4.168 4.276 4.403 4.53 4.634 4.736 4.845 4.964 5.086 5.188 5.282 5.378 5.46 5.514 5.549 5.568 5.563 5.47 5.245 4.861 4.198 2.908 1.187 -0.297 -1.513 -2.526 -3.431 -4.21 -4.94 -5.579 -6.211 -6.753 -7.22 -7.675 -8.116 -8.517 -8.88 -9.241 -9.55 -9.842 -10.159 -10.488 -10.75 -11.011 -11.285 -11.504 -11.731 -11.959 -12.2 -12.455 -12.631 -12.799 -13.065 -13.271 -13.489 -13.595 -13.803 -14.021 -14.258 -14.397 -14.741 -14.814 -14.959 -15.115 -15.441 -15.644 -15.878 -16.12 -16.416 -16.788 -17.233 -18.231 -10 ,29553 ,KEBNE ,17023242,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:28:36 CET,0.0 0.938 1.256 1.46 1.631 1.768 1.901 2.019 2.244 2.35 2.441 2.429 2.705 2.784 2.914 3.053 3.193 3.258 3.364 3.458 3.609 3.704 3.799 3.941 4.07 4.189 4.295 4.387 4.514 4.63 4.739 4.878 5.001 5.114 5.233 5.37 5.481 5.572 5.677 5.789 5.865 5.931 6.002 6.077 6.148 6.125 6.041 5.85 5.48 4.803 3.48 1.776 0.341 -0.877 -1.927 -2.854 -3.623 -4.316 -4.961 -5.614 -6.145 -6.623 -7.088 -7.496 -7.874 -8.231 -8.591 -8.908 -9.186 -9.482 -9.802 -10.074 -10.348 -10.622 -10.841 -11.073 -11.301 -11.536 -11.786 -11.963 -12.148 -12.425 -12.622 -12.834 -12.939 -13.158 -13.391 -13.643 -13.773 -14.098 -14.174 -14.312 -14.454 -14.781 -14.984 -15.214 -15.445 -15.693 -15.993 -16.405 -17.812 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_65_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_65_61.txt deleted file mode 100644 index d5e0db66..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_65_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3506 ,KEBNE ,17023243,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:28:38 CET,0.0 1.583 2.005 2.346 2.614 2.855 3.086 3.292 3.669 3.853 4.022 4.129 4.469 4.607 4.886 5.172 5.441 5.573 5.828 6.058 6.396 6.618 6.824 7.119 7.413 7.713 8.002 8.262 8.581 8.907 9.246 9.659 10.041 10.393 10.812 11.29 11.764 12.291 12.849 13.45 14.075 14.771 15.576 16.359 17.273 18.312 19.514 20.814 22.236 23.829 25.655 26.927 27.453 27.666 27.698 27.651 27.549 27.382 27.176 26.95 26.756 26.571 26.363 26.144 25.932 25.712 25.461 25.228 25.039 24.855 24.644 24.454 24.257 24.046 23.877 23.715 23.547 23.363 23.172 23.026 22.874 22.637 22.47 22.301 22.206 22.007 21.798 21.565 21.439 21.128 21.036 20.892 20.735 20.374 20.172 19.952 19.707 19.42 19.067 18.61 16.911 -2 ,982 ,KEBNE ,17023244,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:26:55 CET,0.0 1.273 1.705 2.036 2.322 2.58 2.811 3.002 3.319 3.456 3.591 3.672 4.008 4.151 4.416 4.659 4.875 4.984 5.209 5.44 5.77 5.982 6.186 6.471 6.743 6.99 7.236 7.467 7.774 8.092 8.397 8.747 9.094 9.456 9.868 10.316 10.752 11.227 11.745 12.314 12.887 13.529 14.274 15.006 15.868 16.828 17.938 19.17 20.588 22.201 24.069 25.418 26.049 26.301 26.314 26.246 26.102 25.917 25.718 25.49 25.292 25.097 24.892 24.679 24.464 24.27 24.075 23.871 23.664 23.462 23.252 23.067 22.871 22.671 22.516 22.348 22.163 21.971 21.785 21.661 21.53 21.319 21.159 21.005 20.927 20.745 20.533 20.301 20.185 19.871 19.775 19.645 19.504 19.187 18.992 18.789 18.566 18.322 18.015 17.573 15.512 -3 ,12038 ,KEBNE ,17023245,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:27:41 CET,0.0 1.13 1.612 1.978 2.285 2.545 2.787 3.016 3.401 3.576 3.746 3.892 4.249 4.398 4.693 4.968 5.224 5.355 5.613 5.858 6.196 6.407 6.623 6.941 7.24 7.536 7.829 8.11 8.447 8.776 9.117 9.544 9.963 10.342 10.796 11.32 11.816 12.367 12.961 13.563 14.178 14.883 15.703 16.521 17.471 18.543 19.767 21.112 22.65 24.4 26.336 27.647 28.247 28.519 28.588 28.543 28.394 28.202 28.03 27.819 27.634 27.459 27.267 27.087 26.923 26.76 26.578 26.412 26.241 26.049 25.865 25.716 25.559 25.385 25.243 25.086 24.912 24.736 24.543 24.416 24.291 24.074 23.913 23.743 23.662 23.498 23.3 23.088 22.981 22.684 22.597 22.45 22.295 21.956 21.763 21.547 21.316 21.039 20.691 20.274 18.92 -4 ,6614 ,KEBNE ,17023246,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:27:21 CET,0.0 1.706 2.133 2.446 2.716 2.967 3.196 3.418 3.825 4.008 4.178 4.313 4.664 4.804 5.088 5.364 5.632 5.763 6.004 6.248 6.587 6.81 7.033 7.348 7.644 7.927 8.208 8.491 8.857 9.221 9.575 9.989 10.401 10.799 11.259 11.783 12.271 12.791 13.334 13.91 14.535 15.247 16.076 16.899 17.814 18.82 19.967 21.236 22.693 24.326 26.167 27.425 27.981 28.194 28.192 28.107 27.987 27.815 27.605 27.353 27.12 26.904 26.699 26.504 26.297 26.084 25.852 25.626 25.431 25.234 25.02 24.823 24.616 24.416 24.249 24.074 23.902 23.732 23.565 23.443 23.317 23.106 22.944 22.782 22.697 22.514 22.303 22.073 21.965 21.67 21.602 21.463 21.309 20.98 20.787 20.585 20.362 20.053 19.69 19.228 17.731 -5 ,186 ,KEBNE ,17023247,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:27:03 CET,0.0 1.023 1.417 1.726 1.998 2.228 2.433 2.62 2.977 3.155 3.318 3.432 3.774 3.904 4.164 4.427 4.667 4.776 4.99 5.216 5.539 5.732 5.918 6.206 6.505 6.791 7.069 7.338 7.679 8.027 8.366 8.766 9.148 9.511 9.928 10.41 10.871 11.357 11.878 12.434 13.026 13.693 14.443 15.198 16.087 17.058 18.182 19.454 20.899 22.485 24.322 25.602 26.12 26.324 26.365 26.266 26.114 25.942 25.743 25.525 25.304 25.091 24.884 24.672 24.463 24.252 24.041 23.853 23.677 23.47 23.248 23.074 22.885 22.695 22.553 22.395 22.229 22.057 21.874 21.733 21.572 21.322 21.158 20.993 20.902 20.7 20.485 20.253 20.138 19.835 19.74 19.607 19.452 19.082 18.895 18.702 18.471 18.206 17.886 17.424 16.015 -6 ,25357 ,KEBNE ,17023248,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:27:34 CET,0.0 1.056 1.402 1.698 1.983 2.244 2.455 2.648 2.985 3.152 3.318 3.43 3.778 3.92 4.174 4.421 4.662 4.779 5.001 5.22 5.54 5.735 5.935 6.245 6.528 6.796 7.072 7.343 7.695 8.056 8.392 8.777 9.153 9.505 9.896 10.365 10.828 11.312 11.831 12.39 12.963 13.618 14.394 15.148 16.009 16.951 18.028 19.254 20.67 22.214 23.945 25.188 25.71 25.941 26.009 25.915 25.76 25.577 25.359 25.1 24.85 24.618 24.409 24.208 24.024 23.867 23.703 23.547 23.411 23.272 23.11 22.977 22.822 22.653 22.531 22.4 22.249 22.088 21.938 21.826 21.692 21.503 21.382 21.232 21.149 20.993 20.841 20.681 20.589 20.305 20.246 20.117 19.977 19.682 19.52 19.328 19.12 18.9 18.601 18.216 16.447 -7 ,4070 ,KEBNE ,17023249,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:27:18 CET,0.0 1.166 1.715 2.139 2.472 2.765 3.013 3.235 3.644 3.839 4.025 4.167 4.512 4.658 4.946 5.24 5.504 5.627 5.886 6.141 6.494 6.715 6.935 7.251 7.553 7.849 8.127 8.385 8.745 9.105 9.442 9.867 10.293 10.692 11.136 11.649 12.144 12.674 13.233 13.816 14.419 15.115 15.943 16.737 17.671 18.71 19.882 21.165 22.618 24.304 26.13 27.465 28.124 28.424 28.491 28.427 28.304 28.154 27.978 27.755 27.532 27.316 27.106 26.875 26.644 26.425 26.202 26.018 25.834 25.626 25.397 25.207 25.014 24.812 24.658 24.501 24.323 24.122 23.932 23.808 23.678 23.467 23.3 23.134 23.059 22.884 22.687 22.506 22.418 22.141 22.114 22.012 21.905 21.642 21.481 21.28 21.032 20.776 20.491 20.141 19.159 -8 ,13431 ,KEBNE ,17023250,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:28:59 CET,0.0 1.013 1.454 1.789 2.059 2.312 2.568 2.801 3.195 3.376 3.552 3.695 4.051 4.209 4.499 4.767 5.028 5.161 5.415 5.639 5.965 6.179 6.385 6.687 6.981 7.287 7.61 7.922 8.306 8.677 9.025 9.424 9.822 10.211 10.657 11.175 11.675 12.217 12.799 13.398 14.003 14.671 15.464 16.262 17.202 18.242 19.381 20.603 21.986 23.588 25.415 26.648 27.193 27.457 27.534 27.458 27.313 27.135 26.946 26.742 26.549 26.361 26.168 25.975 25.785 25.599 25.406 25.237 25.081 24.91 24.729 24.575 24.407 24.228 24.086 23.931 23.761 23.576 23.375 23.233 23.095 22.884 22.73 22.57 22.482 22.298 22.11 21.9 21.788 21.491 21.422 21.288 21.144 20.801 20.61 20.417 20.194 19.912 19.568 19.101 17.565 -9 ,2313 ,KEBNE ,17023251,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:27:02 CET,0.0 1.47 1.971 2.332 2.639 2.9 3.134 3.359 3.769 3.954 4.126 4.237 4.581 4.737 5.042 5.332 5.584 5.707 5.954 6.184 6.519 6.737 6.948 7.264 7.57 7.865 8.136 8.384 8.713 9.045 9.374 9.764 10.127 10.464 10.862 11.349 11.824 12.356 12.949 13.575 14.198 14.867 15.667 16.472 17.389 18.391 19.537 20.848 22.316 23.977 25.904 27.22 27.846 28.148 28.254 28.241 28.134 27.963 27.778 27.575 27.371 27.164 26.941 26.714 26.497 26.296 26.062 25.836 25.646 25.437 25.212 25.026 24.838 24.639 24.474 24.311 24.158 23.994 23.796 23.662 23.534 23.318 23.165 23.01 22.926 22.738 22.527 22.304 22.191 21.889 21.798 21.652 21.499 21.172 20.985 20.771 20.503 20.198 19.874 19.415 18.0 -10 ,22121 ,KEBNE ,17023252,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:27:15 CET,0.0 1.407 1.822 2.163 2.453 2.722 2.968 3.18 3.565 3.75 3.93 4.066 4.404 4.55 4.835 5.097 5.363 5.497 5.756 6.004 6.357 6.576 6.791 7.099 7.392 7.69 7.976 8.241 8.578 8.907 9.236 9.635 10.014 10.391 10.831 11.315 11.784 12.307 12.866 13.445 14.073 14.781 15.572 16.361 17.271 18.246 19.409 20.73 22.188 23.859 25.747 27.049 27.633 27.908 28.023 27.988 27.869 27.689 27.483 27.253 27.048 26.862 26.65 26.411 26.172 25.958 25.737 25.544 25.375 25.201 25.015 24.849 24.683 24.506 24.347 24.18 24.018 23.846 23.659 23.532 23.387 23.144 22.985 22.83 22.745 22.554 22.354 22.144 22.032 21.739 21.686 21.558 21.417 21.056 20.861 20.672 20.462 20.186 19.808 19.315 17.464 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_65_66.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_65_66.txt deleted file mode 100644 index 92d33a29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_65_66.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24827 ,TETRA ,17551465,Thu Nov 25 11:27:06 CET,Thu Nov 25 13:04:40 CET,0.0 0.824 1.215 1.501 1.732 1.93 2.129 2.309 2.59 2.713 2.831 2.866 3.18 3.299 3.528 3.733 3.925 4.019 4.192 4.362 4.616 4.77 4.921 5.142 5.354 5.557 5.751 5.954 6.207 6.434 6.659 6.919 7.172 7.423 7.708 8.019 8.316 8.659 9.031 9.403 9.782 10.22 10.74 11.235 11.804 12.446 13.159 13.949 14.836 15.8 16.803 17.362 17.528 17.508 17.354 17.124 16.894 16.668 16.437 16.184 15.948 15.722 15.501 15.284 15.085 14.908 14.709 14.502 14.32 14.141 13.945 13.768 13.586 13.409 13.268 13.118 12.971 12.815 12.643 12.515 12.38 12.174 12.036 11.911 11.843 11.688 11.537 11.373 11.282 11.006 11.012 10.908 10.788 10.542 10.416 10.272 10.126 9.958 9.747 9.496 8.715 -2 ,32663 ,TETRA ,17551466,Thu Nov 25 11:28:09 CET,Thu Nov 25 13:03:06 CET,0.0 0.869 1.31 1.64 1.901 2.105 2.262 2.43 2.776 2.932 3.071 3.112 3.416 3.534 3.752 3.95 4.141 4.23 4.411 4.595 4.838 4.993 5.15 5.371 5.579 5.783 5.977 6.166 6.409 6.643 6.875 7.163 7.428 7.682 7.967 8.272 8.572 8.902 9.26 9.631 10.024 10.468 10.994 11.509 12.086 12.733 13.474 14.241 15.105 16.1 17.113 17.754 17.952 17.927 17.768 17.547 17.292 17.027 16.795 16.55 16.319 16.103 15.884 15.687 15.503 15.304 15.067 14.842 14.654 14.474 14.283 14.128 13.973 13.801 13.678 13.552 13.416 13.277 13.126 13.01 12.889 12.706 12.581 12.449 12.377 12.24 12.097 11.912 11.808 11.523 11.528 11.417 11.303 11.08 10.95 10.807 10.66 10.471 10.226 9.912 9.336 -3 ,10800 ,TETRA ,17551467,Thu Nov 25 11:28:09 CET,Thu Nov 25 13:04:19 CET,0.0 1.034 1.528 1.901 2.16 2.395 2.601 2.79 3.134 3.276 3.409 3.465 3.783 3.899 4.114 4.327 4.545 4.647 4.831 5.018 5.273 5.429 5.583 5.812 6.029 6.226 6.429 6.628 6.874 7.107 7.329 7.604 7.877 8.14 8.435 8.759 9.07 9.397 9.746 10.118 10.504 10.936 11.435 11.949 12.53 13.177 13.902 14.681 15.566 16.568 17.614 18.192 18.357 18.335 18.212 18.033 17.829 17.617 17.425 17.23 17.041 16.863 16.69 16.524 16.353 16.183 16.003 15.838 15.691 15.532 15.366 15.224 15.065 14.893 14.757 14.611 14.461 14.31 14.152 14.039 13.916 13.729 13.596 13.443 13.374 13.239 13.095 12.931 12.839 12.563 12.545 12.436 12.326 12.075 11.934 11.788 11.633 11.461 11.263 11.001 10.231 -4 ,10582 ,TETRA ,17551468,Thu Nov 25 11:28:09 CET,Thu Nov 25 13:10:41 CET,0.0 1.104 1.498 1.817 2.1 2.341 2.549 2.721 3.027 3.174 3.302 3.367 3.68 3.796 4.009 4.19 4.366 4.456 4.635 4.806 5.044 5.186 5.33 5.56 5.781 5.984 6.171 6.358 6.606 6.842 7.071 7.347 7.606 7.854 8.145 8.487 8.803 9.128 9.49 9.859 10.233 10.662 11.179 11.69 12.279 12.94 13.665 14.445 15.338 16.289 17.317 17.981 18.141 18.129 17.998 17.801 17.609 17.376 17.142 16.876 16.635 16.435 16.221 16.01 15.801 15.606 15.412 15.209 15.029 14.854 14.664 14.503 14.331 14.147 13.999 13.836 13.677 13.535 13.386 13.278 13.164 12.976 12.842 12.714 12.647 12.491 12.336 12.174 12.083 11.809 11.81 11.703 11.589 11.365 11.229 11.083 10.921 10.738 10.535 10.269 9.552 -5 ,31328 ,TETRA ,17551470,Thu Nov 25 11:29:10 CET,Thu Nov 25 13:04:53 CET,0.0 1.002 1.417 1.717 1.967 2.155 2.339 2.519 2.819 2.962 3.099 3.181 3.504 3.622 3.848 4.066 4.274 4.365 4.549 4.729 4.973 5.134 5.287 5.511 5.727 5.928 6.126 6.323 6.577 6.814 7.033 7.289 7.535 7.779 8.071 8.39 8.694 9.022 9.379 9.755 10.129 10.577 11.111 11.62 12.186 12.844 13.587 14.372 15.253 16.176 17.161 17.753 17.914 17.865 17.713 17.503 17.288 17.092 16.889 16.639 16.414 16.209 15.983 15.753 15.532 15.317 15.102 14.91 14.735 14.542 14.334 14.165 13.992 13.81 13.663 13.513 13.363 13.199 13.029 12.922 12.811 12.622 12.491 12.373 12.309 12.161 12.003 11.834 11.746 11.472 11.466 11.351 11.24 11.026 10.901 10.734 10.526 10.331 10.116 9.822 9.216 -6 ,7621 ,TETRA ,17551472,Thu Nov 25 11:29:10 CET,Thu Nov 25 13:04:09 CET,0.0 1.182 1.508 1.767 1.985 2.192 2.391 2.56 2.842 2.981 3.115 3.162 3.474 3.594 3.811 4.019 4.218 4.31 4.486 4.656 4.906 5.07 5.229 5.455 5.67 5.882 6.081 6.264 6.489 6.71 6.935 7.215 7.47 7.711 8.002 8.323 8.637 8.975 9.325 9.702 10.108 10.561 11.075 11.585 12.145 12.76 13.494 14.318 15.226 16.183 17.203 17.821 17.982 17.99 17.864 17.656 17.434 17.212 17.012 16.763 16.508 16.269 16.036 15.813 15.62 15.436 15.217 15.018 14.832 14.62 14.407 14.225 14.032 13.839 13.686 13.534 13.394 13.249 13.099 12.997 12.885 12.699 12.568 12.442 12.377 12.239 12.088 11.913 11.822 11.556 11.563 11.458 11.343 11.086 10.931 10.771 10.593 10.383 10.174 9.899 9.316 -7 ,2737 ,TETRA ,17551474,Thu Nov 25 11:30:06 CET,Thu Nov 25 13:04:50 CET,0.0 0.825 1.168 1.403 1.621 1.85 2.049 2.22 2.529 2.673 2.813 2.872 3.18 3.295 3.503 3.722 3.972 4.092 4.316 4.537 4.818 4.97 5.123 5.36 5.58 5.775 5.97 6.161 6.401 6.637 6.861 7.137 7.415 7.669 7.955 8.273 8.575 8.912 9.27 9.636 10.015 10.461 10.984 11.489 12.08 12.755 13.474 14.256 15.177 16.156 17.18 17.857 18.084 18.102 17.978 17.769 17.551 17.31 17.084 16.835 16.6 16.393 16.175 15.956 15.743 15.542 15.335 15.142 14.963 14.784 14.595 14.431 14.246 14.049 13.913 13.759 13.587 13.418 13.238 13.113 13.004 12.839 12.713 12.575 12.501 12.359 12.214 12.062 11.979 11.702 11.669 11.56 11.446 11.209 11.093 10.963 10.822 10.633 10.414 10.208 9.609 -8 ,25823 ,TETRA ,17551476,Thu Nov 25 11:30:08 CET,Thu Nov 25 13:04:46 CET,0.0 1.569 1.985 2.298 2.573 2.8 2.985 3.147 3.462 3.611 3.75 3.818 4.144 4.275 4.494 4.709 4.909 4.999 5.172 5.347 5.62 5.79 5.938 6.15 6.373 6.586 6.784 6.966 7.19 7.423 7.659 7.937 8.195 8.438 8.72 9.04 9.356 9.699 10.049 10.414 10.808 11.272 11.797 12.304 12.885 13.522 14.232 15.004 15.894 16.868 17.847 18.434 18.614 18.558 18.368 18.142 17.9 17.651 17.419 17.16 16.909 16.68 16.457 16.246 16.038 15.84 15.647 15.471 15.293 15.094 14.901 14.746 14.58 14.396 14.244 14.075 13.909 13.742 13.562 13.443 13.314 13.105 12.968 12.817 12.737 12.568 12.392 12.218 12.127 11.851 11.852 11.749 11.637 11.383 11.254 11.107 10.945 10.783 10.559 10.26 9.82 -9 ,2524 ,TETRA ,17551478,Thu Nov 25 11:31:06 CET,Thu Nov 25 12:56:59 CET,0.0 1.332 1.689 1.981 2.243 2.459 2.662 2.829 3.102 3.226 3.356 3.438 3.752 3.867 4.092 4.31 4.513 4.616 4.816 4.983 5.211 5.362 5.516 5.737 5.947 6.149 6.342 6.534 6.77 6.991 7.205 7.48 7.762 8.013 8.299 8.628 8.951 9.293 9.652 10.037 10.421 10.86 11.39 11.914 12.506 13.151 13.893 14.716 15.634 16.628 17.658 18.212 18.354 18.362 18.284 18.102 17.874 17.656 17.432 17.187 16.955 16.695 16.442 16.22 15.991 15.796 15.595 15.396 15.211 15.016 14.809 14.634 14.454 14.25 14.091 13.934 13.774 13.612 13.446 13.333 13.213 13.015 12.87 12.718 12.639 12.459 12.266 12.091 12.004 11.724 11.695 11.59 11.483 11.218 11.071 10.925 10.763 10.569 10.331 10.01 9.415 -10 ,7186 ,TETRA ,17551480,Thu Nov 25 11:31:07 CET,Thu Nov 25 13:06:06 CET,0.0 0.869 1.236 1.533 1.772 1.975 2.172 2.367 2.694 2.841 2.995 3.069 3.376 3.482 3.706 3.942 4.145 4.235 4.422 4.6 4.833 4.988 5.147 5.377 5.596 5.803 6.0 6.185 6.408 6.625 6.85 7.124 7.383 7.647 7.946 8.269 8.573 8.917 9.292 9.696 10.168 10.664 11.184 11.709 12.288 12.915 13.66 14.515 15.448 16.414 17.431 18.036 18.205 18.178 18.028 17.811 17.592 17.372 17.16 16.938 16.72 16.496 16.276 16.073 15.86 15.651 15.445 15.243 15.066 14.909 14.757 14.62 14.461 14.29 14.157 14.018 13.873 13.719 13.548 13.428 13.312 13.141 13.026 12.892 12.818 12.67 12.517 12.359 12.274 11.998 11.99 11.882 11.751 11.463 11.332 11.201 11.032 10.837 10.633 10.411 10.017 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_66_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_66_62.txt deleted file mode 100644 index c6230587..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_66_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5530 ,KEBNE ,17023253,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:27:04 CET,0.0 0.931 1.327 1.682 1.985 2.267 2.519 2.757 3.177 3.36 3.547 3.705 4.037 4.195 4.519 4.815 5.088 5.221 5.474 5.721 6.052 6.263 6.485 6.802 7.107 7.394 7.671 7.941 8.292 8.636 8.954 9.335 9.697 10.038 10.443 10.903 11.335 11.807 12.31 12.836 13.412 14.081 14.848 15.579 16.425 17.368 18.435 19.629 20.99 22.562 24.422 25.819 26.471 26.81 26.982 27.006 26.946 26.847 26.732 26.595 26.445 26.288 26.126 25.945 25.76 25.59 25.41 25.223 25.051 24.906 24.766 24.631 24.492 24.339 24.201 24.068 23.941 23.791 23.619 23.488 23.352 23.159 23.027 22.881 22.796 22.619 22.442 22.228 22.112 21.839 21.798 21.691 21.587 21.333 21.155 20.942 20.72 20.498 20.223 19.813 18.369 -2 ,3347 ,KEBNE ,17023254,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:27:00 CET,0.0 1.583 2.025 2.401 2.71 2.982 3.236 3.474 3.872 4.054 4.228 4.365 4.691 4.829 5.115 5.413 5.68 5.799 6.04 6.285 6.625 6.823 7.024 7.338 7.644 7.936 8.212 8.461 8.796 9.126 9.432 9.816 10.179 10.527 10.959 11.45 11.895 12.362 12.863 13.413 13.979 14.6 15.337 16.078 16.952 17.941 19.058 20.291 21.721 23.381 25.29 26.67 27.307 27.602 27.744 27.777 27.678 27.522 27.374 27.184 27.017 26.875 26.709 26.55 26.386 26.202 26.013 25.851 25.704 25.546 25.375 25.231 25.061 24.845 24.673 24.52 24.359 24.183 24.008 23.885 23.752 23.543 23.402 23.254 23.181 23.019 22.839 22.636 22.526 22.259 22.211 22.087 21.95 21.614 21.405 21.157 20.909 20.664 20.376 19.994 18.618 -3 ,20864 ,KEBNE ,17023255,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:27:16 CET,0.0 1.11 1.535 1.878 2.188 2.432 2.642 2.832 3.21 3.39 3.554 3.664 3.978 4.096 4.324 4.566 4.793 4.908 5.141 5.362 5.674 5.866 6.051 6.327 6.589 6.828 7.061 7.296 7.602 7.922 8.23 8.581 8.931 9.263 9.626 10.029 10.425 10.861 11.327 11.82 12.343 12.949 13.67 14.393 15.216 16.131 17.21 18.416 19.764 21.286 23.034 24.372 25.031 25.326 25.401 25.364 25.269 25.124 24.98 24.806 24.644 24.489 24.302 24.103 23.921 23.755 23.569 23.399 23.239 23.069 22.896 22.743 22.591 22.443 22.317 22.174 22.014 21.841 21.657 21.532 21.402 21.201 21.056 20.895 20.815 20.654 20.486 20.299 20.198 19.921 19.862 19.743 19.619 19.34 19.174 18.994 18.788 18.525 18.184 17.683 16.411 -4 ,22005 ,KEBNE ,17023256,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:27:24 CET,0.0 1.343 1.735 2.041 2.36 2.639 2.874 3.113 3.546 3.729 3.905 4.055 4.4 4.547 4.843 5.136 5.397 5.524 5.776 6.012 6.33 6.532 6.737 7.036 7.322 7.601 7.876 8.137 8.474 8.792 9.092 9.458 9.812 10.165 10.563 11.0 11.434 11.904 12.404 12.927 13.488 14.152 14.924 15.691 16.571 17.55 18.666 19.904 21.343 22.961 24.817 26.154 26.788 27.075 27.223 27.323 27.313 27.207 27.059 26.891 26.736 26.584 26.44 26.286 26.14 26.007 25.841 25.676 25.525 25.37 25.212 25.077 24.923 24.737 24.596 24.47 24.328 24.162 23.988 23.867 23.739 23.524 23.378 23.223 23.133 22.942 22.745 22.534 22.421 22.134 22.05 21.925 21.789 21.468 21.281 21.067 20.827 20.539 20.207 19.721 18.737 -5 ,8832 ,KEBNE ,17023257,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:27:13 CET,0.0 1.436 1.899 2.276 2.586 2.841 3.065 3.286 3.684 3.866 4.04 4.197 4.545 4.698 4.984 5.251 5.507 5.632 5.878 6.118 6.458 6.676 6.888 7.193 7.487 7.768 8.037 8.298 8.628 8.95 9.264 9.625 9.973 10.319 10.737 11.217 11.673 12.17 12.694 13.241 13.808 14.448 15.195 15.947 16.812 17.777 18.893 20.112 21.538 23.191 25.073 26.438 27.039 27.33 27.498 27.566 27.552 27.492 27.399 27.267 27.127 26.975 26.822 26.679 26.515 26.343 26.15 25.954 25.789 25.631 25.453 25.302 25.141 24.965 24.829 24.68 24.525 24.365 24.19 24.075 23.951 23.75 23.608 23.454 23.371 23.198 23.001 22.777 22.67 22.384 22.253 22.112 21.981 21.677 21.509 21.289 21.05 20.822 20.534 20.103 19.257 -6 ,30714 ,KEBNE ,17023258,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:28:45 CET,0.0 0.881 1.282 1.621 1.892 2.159 2.41 2.637 3.042 3.225 3.403 3.545 3.885 4.039 4.335 4.62 4.902 5.031 5.273 5.512 5.851 6.062 6.264 6.582 6.9 7.189 7.455 7.727 8.082 8.397 8.707 9.097 9.476 9.842 10.261 10.73 11.183 11.677 12.2 12.744 13.316 13.967 14.717 15.476 16.33 17.233 18.302 19.589 21.045 22.657 24.557 25.944 26.6 26.952 27.107 27.123 27.066 26.954 26.823 26.667 26.527 26.379 26.221 26.065 25.895 25.737 25.567 25.399 25.241 25.072 24.889 24.731 24.563 24.395 24.268 24.124 23.979 23.833 23.67 23.549 23.425 23.229 23.08 22.934 22.855 22.678 22.493 22.27 22.162 21.878 21.778 21.653 21.537 21.279 21.115 20.92 20.719 20.498 20.223 19.866 18.702 -7 ,10470 ,KEBNE ,17023259,Wed Dec 22 08:05:42 CET,Wed Dec 22 09:28:37 CET,0.0 0.908 1.385 1.711 1.973 2.207 2.435 2.661 3.087 3.286 3.465 3.614 3.956 4.1 4.379 4.651 4.908 5.035 5.279 5.519 5.861 6.078 6.295 6.598 6.876 7.148 7.422 7.69 8.028 8.364 8.681 9.046 9.409 9.766 10.174 10.643 11.079 11.558 12.089 12.646 13.233 13.867 14.609 15.371 16.243 17.216 18.31 19.532 20.949 22.559 24.397 25.749 26.394 26.707 26.836 26.863 26.822 26.702 26.554 26.412 26.267 26.119 25.96 25.79 25.621 25.465 25.288 25.127 24.996 24.853 24.694 24.554 24.402 24.226 24.077 23.915 23.754 23.593 23.411 23.291 23.178 22.986 22.854 22.698 22.604 22.428 22.259 22.052 21.944 21.675 21.631 21.498 21.349 21.013 20.802 20.571 20.343 20.075 19.78 19.415 18.369 -8 ,20076 ,KEBNE ,17023260,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:28:21 CET,0.0 1.09 1.486 1.814 2.085 2.364 2.626 2.834 3.195 3.364 3.528 3.641 3.969 4.11 4.385 4.641 4.883 5.006 5.245 5.462 5.76 5.953 6.138 6.403 6.653 6.889 7.12 7.345 7.643 7.933 8.21 8.565 8.933 9.278 9.689 10.173 10.624 11.108 11.624 12.169 12.755 13.396 14.118 14.873 15.747 16.676 17.75 18.964 20.384 22.055 23.996 25.433 26.123 26.486 26.659 26.691 26.649 26.549 26.441 26.311 26.177 26.042 25.89 25.708 25.515 25.361 25.201 25.04 24.886 24.71 24.53 24.383 24.223 24.041 23.903 23.755 23.599 23.436 23.273 23.172 23.063 22.88 22.737 22.573 22.493 22.333 22.152 21.936 21.817 21.534 21.48 21.364 21.253 20.992 20.826 20.657 20.457 20.208 19.927 19.575 17.776 -9 ,21289 ,KEBNE ,17023261,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:27:20 CET,0.0 1.698 2.282 2.665 2.963 3.257 3.541 3.773 4.172 4.365 4.544 4.681 5.026 5.18 5.484 5.755 5.991 6.113 6.357 6.591 6.944 7.164 7.361 7.661 7.973 8.26 8.511 8.768 9.108 9.425 9.746 10.134 10.491 10.848 11.245 11.677 12.1 12.557 13.059 13.605 14.2 14.858 15.593 16.32 17.187 18.19 19.335 20.605 22.03 23.654 25.489 26.834 27.493 27.825 27.99 28.046 28.008 27.917 27.808 27.665 27.521 27.363 27.196 27.042 26.885 26.736 26.568 26.414 26.271 26.112 25.939 25.764 25.59 25.426 25.301 25.164 25.011 24.847 24.638 24.475 24.324 24.125 23.989 23.843 23.762 23.591 23.404 23.208 23.104 22.827 22.788 22.658 22.5 22.175 22.02 21.845 21.607 21.277 20.921 20.518 19.387 -10 ,12184 ,KEBNE ,17023262,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:28:35 CET,0.0 1.498 2.135 2.498 2.812 3.119 3.376 3.609 4.04 4.235 4.416 4.565 4.906 5.064 5.376 5.655 5.914 6.045 6.293 6.53 6.865 7.085 7.309 7.623 7.913 8.193 8.468 8.733 9.085 9.418 9.714 10.087 10.479 10.852 11.27 11.733 12.16 12.626 13.147 13.701 14.277 14.929 15.675 16.425 17.296 18.268 19.409 20.67 22.114 23.816 25.755 27.139 27.79 28.067 28.17 28.215 28.2 28.117 28.006 27.87 27.744 27.63 27.486 27.33 27.199 27.072 26.906 26.737 26.586 26.421 26.232 26.061 25.879 25.7 25.564 25.432 25.294 25.134 24.95 24.826 24.705 24.484 24.334 24.183 24.101 23.927 23.733 23.519 23.405 23.123 23.069 22.927 22.77 22.425 22.22 22.011 21.799 21.569 21.271 20.876 19.464 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_66_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_66_64.txt deleted file mode 100644 index ef2eaf99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_66_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27508 ,TETRA ,17551505,Thu Nov 25 11:37:11 CET,Thu Nov 25 13:11:09 CET,0.0 3.053 3.631 4.039 4.352 4.619 4.853 5.028 5.331 5.484 5.651 5.767 6.07 6.184 6.415 6.638 6.842 6.938 7.122 7.292 7.537 7.689 7.83 8.027 8.218 8.409 8.59 8.751 8.949 9.145 9.346 9.583 9.788 9.982 10.197 10.439 10.677 10.944 11.225 11.504 11.768 12.055 12.385 12.7 13.05 13.391 13.729 14.061 14.34 14.466 14.251 13.67 13.011 12.334 11.747 11.178 10.622 10.103 9.661 9.213 8.8 8.42 8.056 7.697 7.374 7.093 6.8 6.528 6.292 6.037 5.76 5.533 5.295 5.058 4.866 4.644 4.417 4.189 3.955 3.791 3.614 3.35 3.161 2.96 2.861 2.661 2.447 2.192 2.062 1.744 1.623 1.453 1.277 0.918 0.705 0.454 0.163 -0.161 -0.504 -1.001 -3.315 -2 ,23349 ,TETRA ,17551506,Thu Nov 25 11:37:10 CET,Thu Nov 25 13:18:17 CET,0.0 1.852 2.394 2.764 3.051 3.284 3.486 3.684 4.028 4.182 4.325 4.423 4.737 4.862 5.1 5.303 5.489 5.579 5.757 5.934 6.175 6.316 6.451 6.658 6.859 7.044 7.226 7.403 7.622 7.832 8.032 8.263 8.483 8.689 8.913 9.17 9.409 9.663 9.937 10.203 10.466 10.76 11.074 11.361 11.683 12.019 12.374 12.734 13.026 13.224 13.168 12.707 12.094 11.416 10.793 10.24 9.725 9.237 8.799 8.329 7.943 7.603 7.258 6.926 6.611 6.325 6.016 5.727 5.487 5.234 4.948 4.704 4.437 4.172 3.983 3.78 3.581 3.384 3.152 2.996 2.843 2.578 2.391 2.177 2.067 1.851 1.613 1.357 1.216 0.88 0.774 0.626 0.472 0.125 -0.079 -0.313 -0.586 -0.898 -1.264 -1.785 -4.238 -3 ,13345 ,TETRA ,17551507,Thu Nov 25 11:37:11 CET,Thu Nov 25 13:11:48 CET,0.0 1.851 2.44 2.833 3.109 3.346 3.57 3.779 4.143 4.288 4.416 4.487 4.798 4.918 5.141 5.338 5.526 5.611 5.79 5.97 6.221 6.388 6.547 6.768 6.973 7.165 7.342 7.516 7.755 7.979 8.178 8.402 8.616 8.816 9.042 9.301 9.536 9.793 10.061 10.342 10.625 10.916 11.246 11.558 11.877 12.214 12.566 12.906 13.251 13.467 13.337 12.807 12.238 11.623 10.988 10.418 9.892 9.389 8.945 8.505 8.133 7.784 7.425 7.07 6.752 6.463 6.158 5.876 5.631 5.37 5.083 4.859 4.632 4.382 4.186 3.976 3.767 3.563 3.34 3.157 2.964 2.698 2.51 2.323 2.22 1.993 1.763 1.508 1.382 1.068 0.973 0.836 0.686 0.302 0.072 -0.152 -0.398 -0.713 -1.083 -1.561 -3.136 -4 ,27724 ,TETRA ,17551508,Thu Nov 25 11:37:13 CET,Thu Nov 25 13:11:54 CET,0.0 2.278 2.94 3.459 3.848 4.134 4.369 4.59 4.984 5.17 5.342 5.463 5.783 5.908 6.13 6.322 6.519 6.621 6.808 6.988 7.245 7.407 7.56 7.778 7.987 8.167 8.343 8.528 8.766 8.975 9.166 9.389 9.596 9.805 10.047 10.307 10.546 10.799 11.05 11.286 11.534 11.829 12.175 12.528 12.906 13.246 13.574 13.901 14.202 14.425 14.348 13.817 13.208 12.583 11.971 11.422 10.927 10.427 9.997 9.582 9.2 8.855 8.537 8.218 7.893 7.584 7.258 6.953 6.693 6.425 6.136 5.872 5.594 5.324 5.121 4.918 4.704 4.48 4.25 4.092 3.918 3.625 3.424 3.213 3.108 2.884 2.631 2.364 2.229 1.908 1.794 1.634 1.475 1.081 0.858 0.618 0.324 -0.025 -0.488 -1.128 -3.633 -5 ,17789 ,TETRA ,17551509,Thu Nov 25 11:37:10 CET,Thu Nov 25 13:11:23 CET,0.0 2.424 2.97 3.351 3.663 3.924 4.166 4.405 4.845 5.057 5.242 5.35 5.672 5.81 6.043 6.27 6.491 6.591 6.79 6.977 7.237 7.392 7.54 7.748 7.938 8.147 8.355 8.546 8.801 9.02 9.21 9.416 9.61 9.825 10.056 10.317 10.57 10.823 11.088 11.345 11.614 11.906 12.213 12.516 12.851 13.182 13.527 13.863 14.124 14.242 14.043 13.505 12.902 12.282 11.702 11.131 10.579 10.05 9.597 9.151 8.748 8.368 8.003 7.665 7.358 7.075 6.781 6.528 6.289 6.014 5.737 5.517 5.295 5.055 4.846 4.637 4.425 4.184 3.931 3.762 3.603 3.367 3.177 2.96 2.854 2.645 2.384 2.05 1.875 1.505 1.357 1.198 0.997 0.553 0.346 0.113 -0.164 -0.46 -0.807 -1.25 -3.656 -6 ,23988 ,TETRA ,17551510,Thu Nov 25 11:37:13 CET,Thu Nov 25 13:11:47 CET,0.0 1.429 1.991 2.376 2.655 2.917 3.158 3.353 3.682 3.836 3.984 4.079 4.406 4.548 4.809 5.036 5.239 5.336 5.525 5.716 5.962 6.11 6.265 6.486 6.695 6.885 7.06 7.233 7.444 7.649 7.854 8.085 8.29 8.488 8.694 8.914 9.157 9.425 9.681 9.946 10.216 10.517 10.846 11.154 11.487 11.785 12.109 12.44 12.757 12.973 12.91 12.437 11.823 11.181 10.564 9.988 9.467 8.98 8.553 8.115 7.712 7.339 6.972 6.623 6.304 6.007 5.702 5.435 5.191 4.929 4.666 4.449 4.209 3.955 3.762 3.558 3.334 3.104 2.851 2.663 2.49 2.179 1.952 1.748 1.646 1.415 1.153 0.914 0.799 0.479 0.367 0.199 0.023 -0.362 -0.618 -0.89 -1.152 -1.474 -1.971 -2.733 -6.534 -7 ,29041 ,TETRA ,17551511,Thu Nov 25 11:37:11 CET,Thu Nov 25 13:12:08 CET,0.0 2.19 2.771 3.135 3.458 3.73 3.944 4.167 4.601 4.781 4.941 5.062 5.371 5.479 5.686 5.892 6.123 6.229 6.404 6.575 6.829 6.985 7.122 7.323 7.528 7.731 7.918 8.088 8.296 8.494 8.678 8.903 9.128 9.373 9.696 10.067 10.421 10.756 11.05 11.318 11.586 11.893 12.239 12.549 12.869 13.21 13.563 13.873 14.158 14.365 14.267 13.793 13.184 12.523 11.922 11.348 10.805 10.285 9.824 9.358 8.966 8.606 8.231 7.887 7.57 7.28 6.986 6.718 6.464 6.2 5.937 5.713 5.453 5.174 4.977 4.779 4.559 4.323 4.088 3.928 3.759 3.495 3.319 3.138 3.036 2.816 2.576 2.341 2.219 1.893 1.784 1.613 1.445 1.068 0.848 0.595 0.276 -0.089 -0.531 -1.121 -3.785 -8 ,31499 ,TETRA ,17551512,Thu Nov 25 11:37:13 CET,Thu Nov 25 13:12:14 CET,0.0 2.925 3.536 3.992 4.372 4.664 4.893 5.101 5.442 5.583 5.709 5.772 6.069 6.181 6.411 6.625 6.813 6.901 7.076 7.241 7.482 7.631 7.777 7.991 8.183 8.354 8.517 8.686 8.893 9.087 9.297 9.54 9.757 9.957 10.182 10.439 10.684 10.933 11.192 11.478 11.749 12.029 12.346 12.646 12.989 13.332 13.667 14.004 14.282 14.434 14.351 13.86 13.283 12.688 12.085 11.515 10.98 10.509 10.102 9.654 9.268 8.913 8.547 8.211 7.904 7.62 7.313 7.027 6.782 6.534 6.274 6.036 5.796 5.565 5.376 5.183 4.981 4.758 4.527 4.37 4.209 3.934 3.742 3.556 3.454 3.232 3.017 2.771 2.634 2.301 2.157 1.996 1.835 1.464 1.255 0.997 0.713 0.441 0.106 -0.403 -2.045 -9 ,2027 ,TETRA ,17551513,Thu Nov 25 11:37:11 CET,Thu Nov 25 13:11:53 CET,0.0 2.198 2.649 2.956 3.26 3.498 3.708 3.915 4.259 4.419 4.567 4.651 4.971 5.097 5.341 5.561 5.762 5.864 6.046 6.213 6.438 6.588 6.731 6.924 7.113 7.292 7.468 7.64 7.841 8.034 8.231 8.482 8.705 8.912 9.154 9.421 9.668 9.919 10.188 10.466 10.743 11.034 11.397 11.751 12.094 12.422 12.747 13.07 13.365 13.557 13.452 12.955 12.342 11.702 11.1 10.514 9.978 9.475 9.021 8.568 8.165 7.781 7.424 7.117 6.825 6.539 6.227 5.954 5.706 5.448 5.182 4.956 4.712 4.439 4.225 4.005 3.793 3.568 3.333 3.186 3.031 2.764 2.576 2.376 2.272 2.06 1.847 1.612 1.478 1.164 1.071 0.914 0.758 0.416 0.22 -0.024 -0.297 -0.607 -1.013 -1.645 -4.458 -10 ,9026 ,TETRA ,17551514,Thu Nov 25 11:37:13 CET,Thu Nov 25 13:12:02 CET,0.0 1.879 2.544 3.019 3.396 3.684 3.904 4.094 4.425 4.573 4.723 4.798 5.112 5.238 5.502 5.763 5.971 6.065 6.261 6.443 6.696 6.857 7.008 7.226 7.426 7.617 7.817 7.997 8.228 8.462 8.673 8.922 9.14 9.339 9.58 9.819 10.042 10.302 10.57 10.842 11.123 11.425 11.763 12.08 12.408 12.736 13.056 13.355 13.604 13.748 13.58 13.032 12.412 11.792 11.197 10.606 10.042 9.51 9.065 8.603 8.182 7.813 7.447 7.094 6.766 6.469 6.167 5.894 5.652 5.388 5.13 4.917 4.686 4.451 4.257 4.041 3.816 3.588 3.371 3.218 3.043 2.777 2.602 2.406 2.292 2.059 1.817 1.553 1.428 1.117 1.0 0.84 0.678 0.31 0.096 -0.128 -0.379 -0.706 -1.133 -1.616 -3.363 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_67_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_67_26.txt deleted file mode 100644 index 7b910df1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_67_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18035 ,TETRA ,17551519,Thu Nov 25 11:37:11 CET,Thu Nov 25 13:14:30 CET,0.0 0.947 1.385 1.731 2.037 2.298 2.533 2.76 3.117 3.275 3.43 3.553 3.863 3.991 4.235 4.455 4.662 4.765 4.959 5.148 5.423 5.589 5.747 5.973 6.199 6.427 6.647 6.856 7.112 7.354 7.591 7.872 8.136 8.393 8.685 9.013 9.337 9.689 10.061 10.446 10.845 11.296 11.802 12.307 12.895 13.515 14.214 14.99 15.863 16.83 17.864 18.499 18.631 18.564 18.399 18.175 17.917 17.635 17.396 17.137 16.897 16.666 16.417 16.174 15.944 15.732 15.5 15.275 15.068 14.864 14.658 14.474 14.279 14.083 13.92 13.746 13.56 13.365 13.175 13.046 12.906 12.669 12.5 12.329 12.24 12.055 11.859 11.63 11.515 11.236 11.162 11.034 10.885 10.545 10.348 10.127 9.908 9.672 9.386 8.877 7.56 -2 ,15765 ,TETRA ,17551521,Thu Nov 25 11:37:11 CET,Thu Nov 25 13:12:40 CET,0.0 1.644 2.014 2.306 2.553 2.805 3.037 3.244 3.646 3.833 3.99 4.12 4.434 4.569 4.842 5.095 5.327 5.434 5.648 5.849 6.131 6.306 6.471 6.699 6.932 7.163 7.371 7.575 7.845 8.101 8.338 8.626 8.902 9.169 9.469 9.798 10.119 10.473 10.868 11.284 11.697 12.157 12.704 13.245 13.848 14.503 15.243 16.066 16.976 17.955 18.946 19.512 19.672 19.677 19.564 19.369 19.159 18.937 18.71 18.483 18.239 17.991 17.777 17.558 17.35 17.166 16.961 16.757 16.586 16.408 16.21 16.048 15.877 15.702 15.569 15.417 15.254 15.084 14.898 14.76 14.621 14.405 14.247 14.101 14.036 13.889 13.727 13.543 13.443 13.183 13.178 13.089 12.999 12.786 12.656 12.521 12.362 12.174 11.958 11.659 10.064 -3 ,2833 ,TETRA ,17551523,Thu Nov 25 11:38:15 CET,Thu Nov 25 13:15:51 CET,0.0 1.975 2.593 2.942 3.216 3.457 3.675 3.885 4.281 4.441 4.572 4.641 4.924 5.032 5.24 5.433 5.609 5.699 5.874 6.04 6.287 6.443 6.6 6.832 7.038 7.238 7.435 7.621 7.859 8.077 8.286 8.532 8.779 9.031 9.349 9.708 10.037 10.39 10.758 11.154 11.554 11.979 12.511 13.051 13.624 14.248 14.954 15.728 16.643 17.656 18.7 19.236 19.326 19.252 19.103 18.926 18.741 18.53 18.303 18.057 17.831 17.575 17.308 17.056 16.811 16.6 16.386 16.18 15.984 15.794 15.604 15.448 15.289 15.104 14.976 14.856 14.712 14.557 14.398 14.287 14.171 13.986 13.858 13.731 13.67 13.549 13.403 13.251 13.17 12.913 12.892 12.786 12.683 12.501 12.379 12.249 12.137 11.992 11.78 11.5 10.433 -4 ,18698 ,TETRA ,17551524,Thu Nov 25 11:39:15 CET,Thu Nov 25 13:16:39 CET,0.0 1.546 1.976 2.277 2.502 2.711 2.907 3.086 3.395 3.538 3.674 3.731 4.018 4.139 4.366 4.575 4.77 4.868 5.055 5.239 5.497 5.662 5.824 6.056 6.278 6.491 6.693 6.876 7.107 7.331 7.555 7.825 8.068 8.3 8.57 8.867 9.16 9.485 9.83 10.208 10.6 11.037 11.547 12.047 12.666 13.372 14.141 14.971 15.865 16.826 17.922 18.654 18.891 18.899 18.755 18.538 18.311 18.064 17.802 17.535 17.301 17.077 16.845 16.623 16.424 16.224 16.019 15.852 15.709 15.548 15.367 15.225 15.072 14.91 14.796 14.681 14.562 14.438 14.293 14.192 14.083 13.907 13.781 13.654 13.591 13.451 13.318 13.177 13.095 12.847 12.827 12.728 12.623 12.333 12.155 11.967 11.755 11.531 11.258 10.86 9.75 -5 ,29844 ,TETRA ,17551526,Thu Nov 25 11:39:15 CET,Thu Nov 25 13:19:26 CET,0.0 1.683 2.157 2.491 2.786 3.069 3.322 3.533 3.898 4.058 4.213 4.325 4.618 4.744 5.003 5.242 5.446 5.545 5.752 5.954 6.23 6.406 6.581 6.843 7.089 7.328 7.574 7.812 8.102 8.373 8.618 8.916 9.22 9.503 9.823 10.201 10.558 10.933 11.354 11.797 12.227 12.684 13.212 13.744 14.357 15.025 15.757 16.561 17.492 18.489 19.473 20.109 20.297 20.288 20.173 19.955 19.73 19.512 19.284 19.03 18.81 18.616 18.409 18.199 17.995 17.793 17.579 17.373 17.195 17.012 16.807 16.638 16.452 16.245 16.088 15.935 15.774 15.604 15.429 15.309 15.177 14.953 14.798 14.633 14.551 14.398 14.205 13.994 13.885 13.595 13.465 13.31 13.161 12.846 12.67 12.463 12.221 11.961 11.667 11.258 10.154 -6 ,20894 ,TETRA ,17551528,Thu Nov 25 11:39:15 CET,Thu Nov 25 13:14:22 CET,0.0 1.394 1.9 2.273 2.536 2.751 2.942 3.119 3.422 3.564 3.698 3.752 4.041 4.175 4.435 4.668 4.903 5.016 5.209 5.392 5.647 5.796 5.951 6.179 6.389 6.579 6.757 6.942 7.189 7.432 7.665 7.939 8.201 8.451 8.74 9.062 9.371 9.721 10.11 10.523 10.956 11.429 11.967 12.509 13.142 13.856 14.648 15.497 16.408 17.399 18.445 19.031 19.2 19.193 19.098 18.936 18.712 18.478 18.265 18.01 17.77 17.552 17.354 17.16 16.953 16.748 16.534 16.332 16.15 15.967 15.767 15.589 15.411 15.233 15.088 14.935 14.769 14.602 14.445 14.33 14.191 13.99 13.871 13.727 13.645 13.475 13.303 13.13 13.043 12.781 12.757 12.668 12.571 12.317 12.169 12.02 11.853 11.646 11.425 11.14 10.219 -7 ,12524 ,TETRA ,17551530,Thu Nov 25 11:39:15 CET,Thu Nov 25 13:14:48 CET,0.0 1.394 1.803 2.127 2.387 2.599 2.783 2.952 3.273 3.428 3.568 3.656 3.957 4.078 4.3 4.517 4.723 4.819 4.997 5.175 5.432 5.607 5.783 6.031 6.267 6.481 6.689 6.887 7.158 7.425 7.679 7.978 8.269 8.547 8.849 9.205 9.535 9.878 10.276 10.695 11.117 11.609 12.202 12.765 13.38 14.063 14.85 15.684 16.604 17.628 18.661 19.276 19.527 19.556 19.435 19.236 19.004 18.758 18.529 18.289 18.039 17.799 17.572 17.35 17.149 16.946 16.73 16.555 16.387 16.2 16.024 15.87 15.699 15.511 15.363 15.221 15.077 14.929 14.761 14.634 14.515 14.329 14.19 14.033 13.95 13.793 13.613 13.415 13.314 13.039 12.991 12.878 12.75 12.454 12.289 12.111 11.921 11.722 11.492 11.16 10.366 -8 ,2803 ,TETRA ,17551532,Thu Nov 25 11:39:17 CET,Thu Nov 25 13:16:33 CET,0.0 1.458 1.846 2.137 2.393 2.611 2.793 2.955 3.269 3.412 3.542 3.632 3.926 4.047 4.279 4.491 4.684 4.775 4.965 5.144 5.394 5.557 5.715 5.954 6.186 6.396 6.592 6.786 7.034 7.254 7.456 7.708 7.958 8.213 8.508 8.817 9.115 9.445 9.781 10.128 10.508 10.945 11.446 11.947 12.543 13.21 13.932 14.733 15.702 16.703 17.728 18.357 18.506 18.478 18.305 18.087 17.868 17.617 17.375 17.13 16.918 16.712 16.482 16.267 16.069 15.881 15.672 15.478 15.31 15.126 14.931 14.768 14.599 14.409 14.262 14.112 13.921 13.728 13.551 13.408 13.256 13.049 12.899 12.738 12.662 12.502 12.337 12.166 12.07 11.785 11.711 11.593 11.466 11.213 11.075 10.92 10.755 10.551 10.307 10.002 9.085 -9 ,31747 ,TETRA ,17551533,Thu Nov 25 11:39:18 CET,Thu Nov 25 13:14:18 CET,0.0 1.176 1.593 1.878 2.094 2.306 2.503 2.676 2.995 3.134 3.263 3.349 3.644 3.771 3.993 4.188 4.361 4.45 4.634 4.811 5.07 5.232 5.386 5.62 5.848 6.069 6.273 6.46 6.718 6.957 7.177 7.453 7.712 7.948 8.227 8.554 8.867 9.213 9.588 9.97 10.373 10.827 11.336 11.86 12.47 13.136 13.937 14.836 15.797 16.795 17.877 18.525 18.686 18.669 18.551 18.359 18.139 17.908 17.664 17.401 17.162 16.938 16.715 16.508 16.302 16.089 15.864 15.668 15.496 15.32 15.132 14.977 14.821 14.649 14.503 14.349 14.193 14.03 13.862 13.754 13.641 13.443 13.298 13.147 13.075 12.928 12.77 12.589 12.496 12.245 12.192 12.068 11.947 11.704 11.568 11.409 11.22 11.007 10.765 10.495 9.82 -10 ,24111 ,TETRA ,17551534,Thu Nov 25 11:39:15 CET,Thu Nov 25 13:14:45 CET,0.0 1.605 1.971 2.259 2.491 2.713 2.913 3.088 3.423 3.588 3.747 3.858 4.162 4.288 4.527 4.768 4.986 5.087 5.285 5.482 5.758 5.93 6.101 6.346 6.58 6.805 7.026 7.245 7.513 7.772 8.028 8.322 8.612 8.885 9.186 9.532 9.857 10.208 10.579 10.964 11.38 11.839 12.353 12.867 13.467 14.142 14.875 15.658 16.545 17.556 18.598 19.189 19.341 19.267 19.117 18.934 18.717 18.484 18.257 18.027 17.825 17.616 17.4 17.196 16.997 16.797 16.596 16.423 16.254 16.06 15.854 15.68 15.505 15.322 15.18 15.015 14.825 14.635 14.436 14.299 14.154 13.914 13.748 13.587 13.505 13.31 13.096 12.877 12.765 12.479 12.42 12.307 12.179 11.906 11.745 11.565 11.366 11.135 10.855 10.54 9.423 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_67_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_67_37.txt deleted file mode 100644 index a8c3afbf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_67_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26981 ,KEBNE ,17023263,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:27:20 CET,0.0 0.576 0.731 0.853 0.976 1.085 1.167 1.238 1.374 1.428 1.471 1.375 1.589 1.63 1.704 1.766 1.817 1.839 1.891 1.939 1.997 2.033 2.06 2.113 2.178 2.233 2.278 2.33 2.404 2.451 2.496 2.543 2.577 2.602 2.614 2.609 2.579 2.527 2.46 2.367 2.254 2.103 1.871 1.597 1.204 0.685 -0.035 -1.002 -2.345 -4.333 -7.619 -11.313 -14.102 -16.371 -18.297 -19.959 -21.309 -22.514 -23.576 -24.609 -25.486 -26.256 -26.957 -27.608 -28.194 -28.692 -29.198 -29.636 -30.011 -30.386 -30.749 -31.053 -31.365 -31.674 -31.913 -32.155 -32.409 -32.661 -32.913 -33.093 -33.276 -33.558 -33.748 -33.944 -34.045 -34.242 -34.438 -34.65 -34.76 -35.076 -35.099 -35.217 -35.345 -35.633 -35.773 -35.919 -36.086 -36.266 -36.445 -36.692 -37.159 -2 ,2784 ,KEBNE ,17023264,Wed Dec 22 08:05:37 CET,Wed Dec 22 09:27:20 CET,0.0 0.334 0.447 0.568 0.689 0.785 0.87 0.937 1.051 1.113 1.164 1.063 1.291 1.339 1.426 1.507 1.571 1.606 1.682 1.739 1.804 1.848 1.892 1.942 1.976 2.005 2.044 2.076 2.121 2.158 2.19 2.237 2.259 2.264 2.263 2.253 2.24 2.206 2.142 2.053 1.941 1.805 1.604 1.358 1.021 0.566 -0.099 -1.017 -2.264 -4.153 -7.308 -10.875 -13.64 -15.881 -17.722 -19.32 -20.681 -21.875 -22.876 -23.869 -24.696 -25.397 -26.064 -26.675 -27.223 -27.72 -28.223 -28.666 -29.056 -29.461 -29.873 -30.202 -30.534 -30.869 -31.12 -31.379 -31.644 -31.917 -32.195 -32.388 -32.593 -32.918 -33.129 -33.341 -33.45 -33.669 -33.89 -34.119 -34.238 -34.57 -34.628 -34.785 -34.95 -35.279 -35.455 -35.634 -35.818 -36.035 -36.302 -36.602 -37.015 -3 ,28283 ,KEBNE ,17023265,Wed Dec 22 08:05:38 CET,Wed Dec 22 09:27:28 CET,0.0 0.359 0.532 0.669 0.778 0.88 0.976 1.056 1.21 1.273 1.32 1.224 1.441 1.485 1.561 1.68 1.807 1.85 1.936 2.032 2.168 2.239 2.3 2.382 2.465 2.558 2.649 2.713 2.783 2.85 2.905 2.962 3.023 3.072 3.103 3.138 3.169 3.187 3.209 3.215 3.18 3.093 2.948 2.737 2.415 1.982 1.344 0.501 -0.717 -2.673 -5.889 -9.551 -12.421 -14.73 -16.642 -18.271 -19.614 -20.798 -21.803 -22.771 -23.595 -24.328 -25.015 -25.63 -26.166 -26.662 -27.179 -27.637 -28.028 -28.427 -28.857 -29.206 -29.548 -29.889 -30.15 -30.42 -30.705 -30.996 -31.278 -31.468 -31.663 -31.968 -32.188 -32.414 -32.525 -32.764 -33.032 -33.299 -33.418 -33.743 -33.792 -33.94 -34.091 -34.403 -34.576 -34.759 -34.95 -35.163 -35.402 -35.684 -36.343 -4 ,3983 ,KEBNE ,17023266,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:28:16 CET,0.0 0.583 0.825 1.017 1.177 1.32 1.456 1.581 1.767 1.852 1.947 1.959 2.206 2.275 2.405 2.532 2.652 2.706 2.799 2.887 3.015 3.093 3.177 3.3 3.427 3.547 3.644 3.734 3.854 3.974 4.082 4.175 4.251 4.308 4.354 4.416 4.483 4.509 4.493 4.443 4.372 4.281 4.135 3.953 3.65 3.208 2.591 1.675 0.364 -1.563 -4.768 -8.393 -11.208 -13.516 -15.419 -17.038 -18.383 -19.554 -20.54 -21.499 -22.305 -23.024 -23.692 -24.297 -24.856 -25.37 -25.89 -26.324 -26.695 -27.08 -27.485 -27.829 -28.175 -28.53 -28.803 -29.073 -29.337 -29.598 -29.871 -30.063 -30.258 -30.546 -30.752 -30.977 -31.084 -31.303 -31.529 -31.746 -31.859 -32.175 -32.202 -32.341 -32.484 -32.778 -32.945 -33.135 -33.336 -33.539 -33.77 -34.032 -34.47 -5 ,6952 ,KEBNE ,17023267,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:25 CET,0.0 0.347 0.537 0.674 0.773 0.851 0.932 1.011 1.137 1.206 1.27 1.182 1.398 1.431 1.5 1.566 1.626 1.659 1.719 1.768 1.826 1.858 1.886 1.931 1.975 2.012 2.04 2.066 2.095 2.116 2.124 2.126 2.125 2.12 2.115 2.09 2.045 1.996 1.932 1.841 1.73 1.588 1.363 1.11 0.793 0.349 -0.334 -1.32 -2.685 -4.679 -7.854 -11.458 -14.217 -16.376 -18.196 -19.793 -21.107 -22.252 -23.222 -24.168 -24.948 -25.63 -26.274 -26.868 -27.402 -27.885 -28.398 -28.845 -29.217 -29.601 -29.996 -30.322 -30.653 -30.981 -31.234 -31.499 -31.768 -32.033 -32.304 -32.495 -32.697 -32.994 -33.173 -33.359 -33.464 -33.671 -33.876 -34.095 -34.202 -34.523 -34.567 -34.694 -34.824 -35.098 -35.238 -35.397 -35.573 -35.742 -35.956 -36.225 -36.716 -6 ,30173 ,KEBNE ,17023268,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:46 CET,0.0 0.306 0.456 0.598 0.715 0.8 0.882 0.974 1.129 1.179 1.229 1.156 1.374 1.413 1.496 1.572 1.643 1.677 1.747 1.805 1.869 1.911 1.946 1.981 2.005 2.034 2.066 2.092 2.125 2.162 2.192 2.222 2.24 2.246 2.245 2.225 2.187 2.137 2.061 1.959 1.838 1.679 1.454 1.179 0.828 0.377 -0.279 -1.161 -2.453 -4.423 -7.608 -11.217 -14.024 -16.236 -18.057 -19.674 -21.073 -22.3 -23.313 -24.298 -25.15 -25.89 -26.566 -27.188 -27.771 -28.295 -28.813 -29.259 -29.635 -29.998 -30.363 -30.665 -30.967 -31.286 -31.532 -31.775 -32.018 -32.274 -32.532 -32.709 -32.899 -33.184 -33.372 -33.568 -33.674 -33.887 -34.104 -34.341 -34.465 -34.798 -34.815 -34.941 -35.072 -35.334 -35.473 -35.611 -35.765 -35.953 -36.178 -36.463 -37.045 -7 ,2112 ,KEBNE ,17023269,Wed Dec 22 08:06:39 CET,Wed Dec 22 09:29:39 CET,0.0 0.553 0.774 0.962 1.128 1.266 1.389 1.504 1.71 1.808 1.902 1.895 2.145 2.218 2.37 2.505 2.616 2.665 2.751 2.819 2.897 2.935 2.969 3.011 3.042 3.067 3.091 3.108 3.132 3.146 3.153 3.164 3.178 3.203 3.214 3.196 3.173 3.149 3.1 3.012 2.903 2.759 2.538 2.261 1.887 1.394 0.698 -0.237 -1.534 -3.512 -6.752 -10.333 -13.117 -15.355 -17.162 -18.72 -20.059 -21.221 -22.17 -23.077 -23.84 -24.513 -25.145 -25.745 -26.3 -26.802 -27.29 -27.698 -28.049 -28.399 -28.759 -29.049 -29.336 -29.632 -29.874 -30.136 -30.397 -30.665 -30.955 -31.154 -31.349 -31.639 -31.85 -32.083 -32.188 -32.377 -32.582 -32.802 -32.913 -33.239 -33.284 -33.413 -33.554 -33.855 -34.023 -34.208 -34.384 -34.597 -34.836 -35.089 -35.526 -8 ,11517 ,KEBNE ,17023270,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:27 CET,0.0 0.306 0.465 0.587 0.716 0.817 0.906 0.994 1.124 1.177 1.223 1.158 1.388 1.438 1.525 1.593 1.649 1.678 1.736 1.78 1.835 1.869 1.904 1.943 1.965 1.986 2.013 2.045 2.077 2.098 2.12 2.142 2.167 2.194 2.208 2.192 2.163 2.109 2.019 1.905 1.789 1.63 1.382 1.089 0.7 0.203 -0.481 -1.441 -2.817 -4.772 -7.855 -11.4 -14.177 -16.404 -18.202 -19.757 -21.071 -22.236 -23.229 -24.171 -24.975 -25.672 -26.313 -26.902 -27.429 -27.906 -28.383 -28.799 -29.151 -29.501 -29.865 -30.165 -30.469 -30.788 -31.021 -31.26 -31.51 -31.765 -32.027 -32.197 -32.378 -32.656 -32.84 -33.042 -33.145 -33.347 -33.553 -33.769 -33.877 -34.201 -34.252 -34.378 -34.499 -34.77 -34.909 -35.073 -35.265 -35.449 -35.624 -35.854 -36.299 -9 ,27139 ,KEBNE ,17023271,Wed Dec 22 08:07:42 CET,Wed Dec 22 09:29:07 CET,0.0 0.563 0.814 0.989 1.137 1.308 1.485 1.627 1.841 1.932 2.013 1.995 2.249 2.332 2.499 2.632 2.744 2.801 2.904 2.985 3.122 3.231 3.315 3.403 3.486 3.567 3.637 3.705 3.784 3.858 3.951 4.056 4.123 4.173 4.225 4.261 4.277 4.29 4.279 4.25 4.189 4.091 3.947 3.737 3.412 2.976 2.323 1.403 0.106 -1.851 -4.945 -8.41 -11.124 -13.367 -15.229 -16.822 -18.153 -19.317 -20.29 -21.236 -22.045 -22.736 -23.371 -23.955 -24.483 -24.976 -25.5 -25.955 -26.336 -26.718 -27.116 -27.466 -27.841 -28.216 -28.498 -28.782 -29.062 -29.332 -29.599 -29.785 -29.983 -30.292 -30.5 -30.71 -30.819 -31.05 -31.291 -31.545 -31.679 -32.017 -32.097 -32.254 -32.409 -32.723 -32.888 -33.049 -33.23 -33.435 -33.664 -33.906 -34.323 -10 ,17685 ,KEBNE ,17023272,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:31 CET,0.0 0.596 0.821 1.018 1.189 1.326 1.444 1.553 1.751 1.841 1.922 1.891 2.139 2.211 2.341 2.45 2.555 2.608 2.7 2.79 2.913 2.989 3.062 3.166 3.257 3.334 3.4 3.458 3.53 3.59 3.645 3.705 3.755 3.797 3.846 3.906 3.959 3.995 3.991 3.957 3.894 3.788 3.628 3.432 3.123 2.692 2.073 1.168 -0.154 -2.152 -5.327 -8.892 -11.694 -13.984 -15.839 -17.425 -18.767 -19.943 -20.923 -21.859 -22.641 -23.328 -23.968 -24.56 -25.096 -25.569 -26.057 -26.486 -26.851 -27.231 -27.616 -27.933 -28.258 -28.593 -28.85 -29.114 -29.382 -29.654 -29.937 -30.125 -30.313 -30.593 -30.789 -30.993 -31.094 -31.284 -31.472 -31.675 -31.788 -32.117 -32.142 -32.262 -32.384 -32.642 -32.774 -32.917 -33.068 -33.237 -33.408 -33.599 -33.959 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_67_60.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_67_60.txt deleted file mode 100644 index 3c5f6f8f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_67_60.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22256 ,KEBNE ,17023273,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:30:29 CET,0.0 0.416 0.623 0.782 0.91 1.039 1.165 1.28 1.471 1.553 1.635 1.61 1.845 1.897 2.015 2.137 2.238 2.289 2.392 2.498 2.64 2.711 2.779 2.89 2.992 3.093 3.19 3.275 3.377 3.472 3.568 3.682 3.769 3.839 3.917 3.995 4.071 4.151 4.219 4.27 4.303 4.335 4.386 4.399 4.352 4.284 4.144 3.862 3.361 2.463 0.854 -1.112 -2.725 -4.093 -5.259 -6.278 -7.167 -7.949 -8.617 -9.293 -9.87 -10.366 -10.827 -11.263 -11.666 -12.034 -12.419 -12.779 -13.096 -13.4 -13.701 -13.937 -14.174 -14.426 -14.617 -14.81 -15.01 -15.218 -15.429 -15.569 -15.711 -15.931 -16.096 -16.266 -16.346 -16.515 -16.691 -16.865 -16.95 -17.243 -17.255 -17.361 -17.476 -17.714 -17.831 -17.952 -18.093 -18.249 -18.412 -18.628 -19.171 -2 ,17558 ,KEBNE ,17023274,Wed Dec 22 08:07:42 CET,Wed Dec 22 09:28:56 CET,0.0 0.973 1.276 1.53 1.74 1.891 2.011 2.129 2.351 2.434 2.512 2.508 2.754 2.822 2.95 3.056 3.155 3.213 3.327 3.427 3.577 3.671 3.757 3.893 4.047 4.192 4.314 4.427 4.577 4.704 4.814 4.943 5.047 5.145 5.266 5.383 5.491 5.622 5.724 5.797 5.891 5.986 6.066 6.086 6.04 5.962 5.814 5.528 5.037 4.128 2.487 0.583 -0.995 -2.336 -3.463 -4.468 -5.349 -6.138 -6.824 -7.502 -8.056 -8.539 -9.006 -9.44 -9.829 -10.199 -10.595 -10.941 -11.232 -11.535 -11.857 -12.116 -12.381 -12.65 -12.844 -13.033 -13.227 -13.436 -13.644 -13.79 -13.946 -14.178 -14.345 -14.512 -14.596 -14.771 -14.938 -15.101 -15.189 -15.469 -15.488 -15.601 -15.7 -15.931 -16.064 -16.195 -16.325 -16.454 -16.606 -16.823 -17.239 -3 ,24588 ,KEBNE ,17023275,Wed Dec 22 08:06:44 CET,Wed Dec 22 09:24:51 CET,0.0 0.322 0.523 0.698 0.84 0.944 1.046 1.15 1.346 1.432 1.506 1.469 1.712 1.781 1.906 2.018 2.13 2.183 2.282 2.372 2.487 2.561 2.641 2.748 2.843 2.944 3.044 3.134 3.242 3.341 3.428 3.528 3.625 3.73 3.858 3.975 4.087 4.201 4.292 4.391 4.476 4.542 4.614 4.642 4.63 4.594 4.438 4.125 3.619 2.783 1.257 -0.709 -2.352 -3.759 -4.929 -5.949 -6.833 -7.634 -8.325 -8.993 -9.55 -10.018 -10.461 -10.879 -11.29 -11.672 -12.052 -12.391 -12.673 -12.976 -13.306 -13.56 -13.827 -14.095 -14.281 -14.471 -14.677 -14.895 -15.118 -15.268 -15.416 -15.637 -15.785 -15.951 -16.044 -16.232 -16.41 -16.599 -16.694 -16.981 -16.991 -17.107 -17.225 -17.468 -17.592 -17.729 -17.884 -18.047 -18.217 -18.39 -18.811 -4 ,22563 ,KEBNE ,17023276,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:20 CET,0.0 0.645 0.901 1.073 1.228 1.366 1.468 1.555 1.729 1.813 1.886 1.826 2.059 2.127 2.251 2.359 2.468 2.522 2.625 2.726 2.864 2.946 3.031 3.148 3.246 3.339 3.423 3.509 3.644 3.776 3.883 3.999 4.106 4.205 4.314 4.433 4.557 4.678 4.786 4.883 4.955 5.008 5.076 5.125 5.113 5.022 4.806 4.453 3.925 3.037 1.413 -0.6 -2.269 -3.655 -4.806 -5.831 -6.727 -7.521 -8.205 -8.87 -9.419 -9.916 -10.406 -10.853 -11.248 -11.61 -11.988 -12.322 -12.609 -12.907 -13.223 -13.487 -13.757 -14.035 -14.251 -14.473 -14.708 -14.943 -15.158 -15.306 -15.465 -15.695 -15.838 -15.982 -16.06 -16.229 -16.404 -16.592 -16.69 -16.986 -16.996 -17.106 -17.229 -17.478 -17.593 -17.714 -17.847 -18.024 -18.24 -18.475 -18.891 -5 ,3378 ,KEBNE ,17023277,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:38 CET,0.0 0.47 0.662 0.81 0.924 1.057 1.19 1.296 1.479 1.56 1.636 1.609 1.847 1.911 2.044 2.163 2.268 2.319 2.416 2.516 2.645 2.727 2.808 2.915 3.021 3.123 3.217 3.3 3.393 3.482 3.573 3.678 3.774 3.867 3.969 4.09 4.198 4.288 4.383 4.479 4.562 4.628 4.681 4.705 4.687 4.598 4.419 4.131 3.628 2.757 1.183 -0.797 -2.446 -3.804 -4.978 -6.022 -6.925 -7.726 -8.428 -9.129 -9.708 -10.223 -10.707 -11.177 -11.587 -11.938 -12.307 -12.627 -12.91 -13.21 -13.514 -13.757 -14.022 -14.316 -14.546 -14.767 -14.975 -15.185 -15.406 -15.555 -15.703 -15.926 -16.079 -16.236 -16.315 -16.477 -16.655 -16.842 -16.936 -17.225 -17.22 -17.32 -17.429 -17.662 -17.786 -17.917 -18.048 -18.192 -18.371 -18.554 -18.876 -6 ,28937 ,KEBNE ,17023278,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:27:59 CET,0.0 0.513 0.722 0.867 0.991 1.114 1.236 1.338 1.536 1.63 1.71 1.679 1.915 1.975 2.102 2.225 2.335 2.388 2.493 2.59 2.72 2.805 2.885 2.997 3.096 3.189 3.272 3.357 3.483 3.594 3.695 3.817 3.937 4.05 4.174 4.314 4.424 4.524 4.627 4.723 4.798 4.85 4.882 4.883 4.844 4.731 4.516 4.185 3.668 2.805 1.228 -0.767 -2.414 -3.796 -4.951 -6.019 -6.935 -7.72 -8.399 -9.072 -9.641 -10.141 -10.607 -11.037 -11.449 -11.815 -12.197 -12.542 -12.828 -13.115 -13.392 -13.636 -13.897 -14.156 -14.344 -14.528 -14.717 -14.913 -15.111 -15.245 -15.388 -15.617 -15.781 -15.947 -16.026 -16.182 -16.347 -16.514 -16.607 -16.904 -16.91 -17.009 -17.13 -17.396 -17.521 -17.657 -17.803 -17.966 -18.161 -18.371 -18.703 -7 ,18671 ,KEBNE ,17023279,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:30:13 CET,0.0 0.562 0.772 0.935 1.093 1.234 1.347 1.442 1.609 1.688 1.778 1.786 2.028 2.089 2.212 2.335 2.436 2.48 2.581 2.683 2.809 2.884 2.958 3.061 3.155 3.251 3.338 3.417 3.533 3.642 3.743 3.862 3.966 4.065 4.184 4.31 4.407 4.515 4.623 4.698 4.761 4.838 4.887 4.902 4.895 4.849 4.715 4.433 3.96 3.087 1.45 -0.571 -2.245 -3.633 -4.789 -5.806 -6.681 -7.46 -8.128 -8.791 -9.359 -9.845 -10.296 -10.735 -11.151 -11.533 -11.905 -12.222 -12.521 -12.84 -13.155 -13.404 -13.672 -13.949 -14.153 -14.366 -14.576 -14.784 -15.0 -15.149 -15.299 -15.524 -15.675 -15.834 -15.923 -16.109 -16.295 -16.488 -16.592 -16.893 -16.907 -17.014 -17.123 -17.358 -17.488 -17.617 -17.758 -17.91 -18.11 -18.371 -18.8 -8 ,12685 ,KEBNE ,17023280,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:33 CET,0.0 0.664 0.917 1.086 1.222 1.348 1.474 1.589 1.79 1.877 1.952 1.923 2.169 2.235 2.358 2.469 2.568 2.619 2.722 2.822 2.942 3.01 3.085 3.195 3.294 3.39 3.484 3.575 3.674 3.773 3.869 3.971 4.078 4.174 4.283 4.409 4.512 4.606 4.687 4.78 4.867 4.935 4.987 5.018 5.007 4.908 4.717 4.381 3.821 2.95 1.383 -0.556 -2.163 -3.547 -4.722 -5.729 -6.593 -7.38 -8.037 -8.692 -9.263 -9.75 -10.206 -10.652 -11.072 -11.434 -11.792 -12.109 -12.396 -12.719 -13.04 -13.286 -13.538 -13.814 -14.029 -14.237 -14.435 -14.637 -14.848 -14.987 -15.133 -15.367 -15.523 -15.691 -15.781 -15.957 -16.138 -16.322 -16.415 -16.702 -16.691 -16.792 -16.902 -17.121 -17.242 -17.37 -17.503 -17.648 -17.84 -18.075 -18.534 -9 ,22123 ,KEBNE ,17023281,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:31 CET,0.0 0.602 0.85 1.022 1.157 1.289 1.41 1.507 1.688 1.773 1.854 1.816 2.054 2.124 2.251 2.368 2.47 2.517 2.609 2.701 2.836 2.914 2.996 3.128 3.245 3.341 3.438 3.522 3.624 3.732 3.826 3.928 4.018 4.099 4.189 4.277 4.364 4.458 4.547 4.646 4.743 4.818 4.866 4.879 4.852 4.77 4.597 4.282 3.758 2.861 1.198 -0.816 -2.464 -3.86 -5.017 -5.989 -6.837 -7.625 -8.291 -8.946 -9.489 -9.963 -10.439 -10.879 -11.27 -11.616 -11.961 -12.272 -12.533 -12.788 -13.052 -13.274 -13.501 -13.735 -13.914 -14.107 -14.319 -14.553 -14.797 -14.96 -15.138 -15.416 -15.604 -15.796 -15.894 -16.118 -16.353 -16.576 -16.683 -16.973 -16.956 -17.053 -17.159 -17.392 -17.5 -17.607 -17.746 -17.895 -18.055 -18.245 -18.733 -10 ,273 ,KEBNE ,17023282,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:23 CET,0.0 0.403 0.623 0.791 0.913 1.031 1.15 1.245 1.424 1.523 1.612 1.601 1.849 1.912 2.027 2.128 2.227 2.282 2.385 2.475 2.599 2.675 2.753 2.861 2.953 3.048 3.135 3.214 3.32 3.422 3.507 3.6 3.695 3.788 3.907 4.039 4.157 4.275 4.389 4.497 4.589 4.678 4.749 4.779 4.741 4.626 4.443 4.126 3.57 2.637 1.0 -0.989 -2.622 -3.998 -5.156 -6.167 -7.051 -7.836 -8.525 -9.218 -9.788 -10.281 -10.747 -11.176 -11.577 -11.963 -12.361 -12.699 -12.979 -13.261 -13.566 -13.821 -14.07 -14.319 -14.509 -14.701 -14.896 -15.092 -15.285 -15.418 -15.556 -15.784 -15.952 -16.129 -16.216 -16.377 -16.538 -16.712 -16.809 -17.098 -17.101 -17.208 -17.326 -17.605 -17.747 -17.88 -18.009 -18.154 -18.327 -18.54 -18.925 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_68_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_68_54.txt deleted file mode 100644 index 8c004120..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_68_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9132 ,KEBNE ,17023283,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:40 CET,0.0 1.653 2.096 2.445 2.678 2.859 3.01 3.154 3.41 3.526 3.636 3.673 3.936 4.022 4.187 4.333 4.467 4.533 4.648 4.761 4.939 5.044 5.142 5.269 5.382 5.478 5.551 5.613 5.692 5.771 5.834 5.89 5.924 5.966 6.029 6.099 6.175 6.256 6.304 6.311 6.282 6.2 6.075 5.904 5.61 5.205 4.646 3.865 2.704 0.99 -1.841 -5.116 -7.667 -9.776 -11.51 -12.996 -14.255 -15.35 -16.29 -17.192 -17.962 -18.634 -19.255 -19.858 -20.41 -20.891 -21.379 -21.812 -22.186 -22.56 -22.944 -23.262 -23.594 -23.941 -24.204 -24.477 -24.759 -25.052 -25.355 -25.566 -25.787 -26.111 -26.328 -26.555 -26.67 -26.918 -27.184 -27.478 -27.634 -27.988 -28.11 -28.285 -28.46 -28.835 -29.058 -29.294 -29.509 -29.735 -30.026 -30.506 -32.615 -2 ,26014 ,KEBNE ,17023284,Wed Dec 22 08:06:44 CET,Wed Dec 22 09:25:06 CET,0.0 1.039 1.399 1.662 1.867 2.05 2.207 2.352 2.618 2.73 2.824 2.835 3.095 3.183 3.347 3.481 3.585 3.637 3.731 3.826 3.981 4.07 4.146 4.249 4.346 4.443 4.532 4.605 4.677 4.738 4.789 4.854 4.918 4.965 5.013 5.059 5.081 5.091 5.081 5.044 5.001 4.905 4.737 4.542 4.249 3.834 3.245 2.44 1.292 -0.467 -3.306 -6.564 -9.144 -11.232 -12.984 -14.471 -15.702 -16.792 -17.69 -18.579 -19.346 -20.003 -20.628 -21.218 -21.753 -22.238 -22.726 -23.147 -23.51 -23.887 -24.292 -24.646 -25.002 -25.343 -25.603 -25.86 -26.138 -26.436 -26.733 -26.933 -27.134 -27.464 -27.697 -27.933 -28.059 -28.306 -28.568 -28.846 -28.99 -29.346 -29.484 -29.649 -29.816 -30.206 -30.433 -30.68 -30.944 -31.218 -31.558 -32.008 -33.448 -3 ,8206 ,KEBNE ,17023285,Wed Dec 22 08:06:44 CET,Wed Dec 22 09:27:38 CET,0.0 1.763 2.252 2.533 2.753 2.957 3.152 3.335 3.644 3.785 3.908 3.954 4.231 4.333 4.503 4.636 4.763 4.83 4.951 5.069 5.232 5.319 5.406 5.532 5.645 5.747 5.836 5.929 6.047 6.144 6.227 6.311 6.38 6.443 6.501 6.556 6.594 6.612 6.626 6.624 6.603 6.539 6.413 6.235 5.963 5.614 5.134 4.418 3.258 1.466 -1.381 -4.65 -7.174 -9.223 -10.936 -12.418 -13.694 -14.801 -15.731 -16.645 -17.409 -18.079 -18.718 -19.307 -19.835 -20.312 -20.805 -21.24 -21.62 -22.019 -22.416 -22.741 -23.074 -23.395 -23.651 -23.922 -24.194 -24.475 -24.772 -24.988 -25.2 -25.509 -25.727 -25.961 -26.083 -26.317 -26.578 -26.87 -27.038 -27.421 -27.625 -27.836 -28.048 -28.507 -28.769 -29.044 -29.322 -29.635 -30.005 -30.535 -31.677 -4 ,25479 ,KEBNE ,17023286,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:24 CET,0.0 2.704 3.195 3.505 3.737 3.931 4.1 4.247 4.499 4.602 4.698 4.76 5.049 5.142 5.294 5.426 5.566 5.635 5.739 5.838 5.994 6.08 6.152 6.267 6.37 6.45 6.54 6.634 6.737 6.813 6.875 6.937 6.991 7.036 7.066 7.083 7.109 7.136 7.133 7.12 7.094 7.011 6.864 6.676 6.386 6.004 5.489 4.733 3.565 1.768 -1.136 -4.449 -7.024 -9.132 -10.898 -12.419 -13.701 -14.825 -15.786 -16.713 -17.47 -18.133 -18.769 -19.368 -19.914 -20.404 -20.904 -21.357 -21.746 -22.119 -22.509 -22.832 -23.168 -23.52 -23.788 -24.062 -24.343 -24.631 -24.925 -25.135 -25.349 -25.673 -25.894 -26.13 -26.257 -26.521 -26.805 -27.102 -27.264 -27.631 -27.76 -27.932 -28.108 -28.477 -28.689 -28.916 -29.176 -29.498 -29.882 -30.344 -31.815 -5 ,11238 ,KEBNE ,17023287,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:56 CET,0.0 2.049 2.58 2.892 3.117 3.319 3.51 3.669 3.957 4.088 4.198 4.215 4.478 4.571 4.75 4.896 5.005 5.066 5.201 5.321 5.471 5.551 5.625 5.727 5.821 5.903 5.971 6.035 6.115 6.19 6.262 6.347 6.404 6.432 6.475 6.531 6.571 6.592 6.595 6.572 6.507 6.404 6.236 6.031 5.744 5.354 4.797 4.011 2.844 1.058 -1.791 -4.978 -7.509 -9.609 -11.358 -12.858 -14.105 -15.199 -16.113 -16.992 -17.783 -18.474 -19.088 -19.671 -20.217 -20.709 -21.204 -21.639 -22.01 -22.384 -22.762 -23.089 -23.431 -23.777 -24.045 -24.321 -24.614 -24.91 -25.209 -25.411 -25.616 -25.932 -26.154 -26.39 -26.507 -26.748 -26.992 -27.247 -27.385 -27.728 -27.842 -28.014 -28.192 -28.617 -28.862 -29.123 -29.409 -29.762 -30.175 -30.611 -31.828 -6 ,4942 ,KEBNE ,17023288,Wed Dec 22 08:06:41 CET,Wed Dec 22 09:29:59 CET,0.0 1.599 2.053 2.342 2.592 2.804 2.974 3.137 3.415 3.543 3.665 3.694 3.952 4.038 4.183 4.305 4.422 4.479 4.58 4.681 4.834 4.925 5.003 5.1 5.186 5.265 5.345 5.423 5.508 5.581 5.641 5.727 5.794 5.836 5.877 5.887 5.895 5.914 5.926 5.898 5.819 5.721 5.577 5.384 5.11 4.748 4.207 3.404 2.234 0.454 -2.423 -5.638 -8.167 -10.259 -11.981 -13.475 -14.725 -15.793 -16.69 -17.589 -18.361 -19.024 -19.639 -20.214 -20.76 -21.253 -21.753 -22.203 -22.587 -22.976 -23.381 -23.713 -24.044 -24.383 -24.66 -24.943 -25.223 -25.505 -25.796 -26.006 -26.219 -26.549 -26.785 -27.02 -27.139 -27.412 -27.693 -27.966 -28.111 -28.453 -28.554 -28.714 -28.894 -29.287 -29.474 -29.671 -29.914 -30.235 -30.701 -31.291 -33.069 -7 ,22018 ,KEBNE ,17023289,Wed Dec 22 08:06:40 CET,Wed Dec 22 09:29:31 CET,0.0 1.522 1.919 2.235 2.481 2.666 2.818 2.975 3.248 3.368 3.485 3.513 3.768 3.849 4.008 4.148 4.274 4.328 4.429 4.53 4.653 4.733 4.808 4.906 5.008 5.102 5.19 5.275 5.368 5.443 5.514 5.589 5.651 5.699 5.74 5.774 5.814 5.847 5.846 5.819 5.756 5.661 5.515 5.31 5.015 4.643 4.121 3.343 2.179 0.399 -2.489 -5.683 -8.216 -10.313 -12.056 -13.565 -14.844 -15.985 -16.934 -17.843 -18.61 -19.287 -19.921 -20.496 -21.023 -21.502 -21.994 -22.425 -22.803 -23.187 -23.574 -23.893 -24.218 -24.563 -24.834 -25.108 -25.386 -25.668 -25.967 -26.175 -26.389 -26.728 -26.962 -27.192 -27.313 -27.56 -27.811 -28.101 -28.257 -28.617 -28.857 -29.115 -29.346 -29.766 -29.996 -30.289 -30.601 -30.932 -31.333 -31.805 -33.078 -8 ,9270 ,KEBNE ,17023290,Wed Dec 22 08:07:42 CET,Wed Dec 22 09:29:07 CET,0.0 2.075 2.479 2.751 3.006 3.207 3.349 3.472 3.707 3.801 3.895 3.898 4.141 4.223 4.372 4.502 4.632 4.693 4.803 4.907 5.055 5.13 5.187 5.272 5.369 5.459 5.541 5.618 5.707 5.782 5.853 5.923 5.966 6.0 6.028 6.063 6.096 6.097 6.073 6.06 6.036 5.957 5.819 5.654 5.406 5.019 4.445 3.661 2.524 0.759 -2.119 -5.37 -7.947 -10.018 -11.721 -13.204 -14.499 -15.641 -16.573 -17.491 -18.258 -18.919 -19.549 -20.128 -20.652 -21.13 -21.612 -22.028 -22.386 -22.765 -23.166 -23.487 -23.814 -24.15 -24.405 -24.661 -24.928 -25.223 -25.528 -25.737 -25.952 -26.275 -26.499 -26.758 -26.895 -27.169 -27.478 -27.814 -27.977 -28.349 -28.52 -28.706 -28.885 -29.299 -29.522 -29.737 -29.963 -30.277 -30.693 -31.18 -32.372 -9 ,10606 ,KEBNE ,17023291,Wed Dec 22 08:07:42 CET,Wed Dec 22 09:29:03 CET,0.0 1.204 1.664 1.967 2.196 2.382 2.545 2.708 2.979 3.092 3.199 3.238 3.499 3.584 3.741 3.883 4.006 4.057 4.155 4.245 4.367 4.454 4.532 4.629 4.721 4.801 4.871 4.934 5.003 5.075 5.145 5.219 5.264 5.293 5.331 5.372 5.409 5.442 5.466 5.45 5.402 5.304 5.134 4.936 4.648 4.235 3.663 2.875 1.73 0.015 -2.837 -6.202 -8.848 -10.938 -12.657 -14.141 -15.387 -16.482 -17.417 -18.338 -19.124 -19.811 -20.445 -21.03 -21.561 -22.03 -22.511 -22.946 -23.335 -23.731 -24.132 -24.463 -24.81 -25.173 -25.438 -25.701 -25.976 -26.265 -26.577 -26.789 -26.995 -27.316 -27.538 -27.773 -27.891 -28.125 -28.362 -28.604 -28.737 -29.076 -29.214 -29.41 -29.61 -30.036 -30.271 -30.509 -30.761 -31.091 -31.52 -32.077 -33.756 -10 ,23596 ,KEBNE ,17023292,Wed Dec 22 08:07:42 CET,Wed Dec 22 09:29:23 CET,0.0 2.839 3.326 3.67 3.948 4.171 4.353 4.535 4.867 5.002 5.111 5.109 5.362 5.45 5.607 5.733 5.844 5.902 6.006 6.099 6.244 6.334 6.418 6.537 6.647 6.733 6.806 6.866 6.93 6.997 7.063 7.128 7.179 7.218 7.257 7.302 7.343 7.354 7.345 7.302 7.232 7.139 6.984 6.778 6.479 6.089 5.521 4.698 3.514 1.816 -0.966 -4.208 -6.768 -8.879 -10.604 -12.066 -13.288 -14.374 -15.31 -16.228 -17.005 -17.681 -18.289 -18.846 -19.365 -19.851 -20.361 -20.808 -21.191 -21.574 -21.981 -22.316 -22.65 -23.001 -23.279 -23.561 -23.84 -24.135 -24.46 -24.673 -24.872 -25.186 -25.415 -25.661 -25.783 -26.032 -26.287 -26.554 -26.698 -27.047 -27.159 -27.325 -27.495 -27.831 -28.029 -28.261 -28.52 -28.874 -29.371 -29.986 -32.315 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_68_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_68_64.txt deleted file mode 100644 index 60743954..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/MCL1/water/Summary_FEP_68_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30626 ,TETRA ,17551575,Thu Nov 25 11:46:13 CET,Thu Nov 25 13:12:39 CET,0.0 1.855 2.373 2.721 3.028 3.256 3.422 3.571 3.861 3.993 4.111 4.175 4.454 4.57 4.782 4.953 5.117 5.197 5.343 5.484 5.689 5.814 5.93 6.088 6.239 6.372 6.496 6.626 6.796 6.959 7.112 7.287 7.433 7.554 7.71 7.885 8.035 8.189 8.343 8.497 8.626 8.738 8.859 8.959 9.032 9.07 9.019 8.833 8.453 7.786 6.474 4.742 3.32 2.107 1.021 0.058 -0.757 -1.479 -2.103 -2.725 -3.25 -3.709 -4.148 -4.569 -4.947 -5.299 -5.668 -5.987 -6.269 -6.558 -6.85 -7.087 -7.328 -7.586 -7.799 -8.017 -8.233 -8.447 -8.677 -8.844 -9.025 -9.316 -9.503 -9.694 -9.812 -10.053 -10.261 -10.468 -10.583 -10.903 -10.987 -11.149 -11.326 -11.701 -11.903 -12.1 -12.341 -12.636 -12.974 -13.666 -16.412 -2 ,1737 ,TETRA ,17551577,Thu Nov 25 11:46:13 CET,Thu Nov 25 13:21:16 CET,0.0 1.723 2.156 2.508 2.796 3.004 3.202 3.405 3.766 3.925 4.104 4.296 4.613 4.744 4.963 5.131 5.296 5.374 5.516 5.665 5.877 6.001 6.117 6.296 6.452 6.596 6.742 6.862 7.009 7.157 7.296 7.459 7.611 7.754 7.924 8.118 8.282 8.445 8.616 8.772 8.916 9.056 9.179 9.275 9.347 9.364 9.327 9.167 8.797 8.127 6.823 5.127 3.703 2.498 1.453 0.52 -0.308 -1.058 -1.686 -2.295 -2.813 -3.28 -3.728 -4.143 -4.547 -4.928 -5.311 -5.638 -5.919 -6.216 -6.527 -6.785 -7.044 -7.299 -7.503 -7.725 -7.954 -8.2 -8.441 -8.606 -8.785 -9.046 -9.23 -9.427 -9.524 -9.722 -9.948 -10.198 -10.326 -10.642 -10.727 -10.874 -11.034 -11.36 -11.531 -11.747 -12.005 -12.27 -12.634 -13.167 -15.199 -3 ,28363 ,TETRA ,17551579,Thu Nov 25 11:49:11 CET,Thu Nov 25 13:26:11 CET,0.0 1.79 2.252 2.541 2.782 2.977 3.169 3.336 3.643 3.795 3.948 4.049 4.319 4.419 4.608 4.806 4.993 5.076 5.233 5.378 5.572 5.687 5.804 5.971 6.115 6.261 6.406 6.538 6.698 6.844 6.991 7.172 7.323 7.445 7.588 7.754 7.899 8.05 8.198 8.341 8.486 8.617 8.754 8.879 8.967 9.014 8.997 8.84 8.46 7.754 6.45 4.769 3.308 2.041 0.947 -0.012 -0.821 -1.54 -2.164 -2.784 -3.297 -3.746 -4.175 -4.581 -4.972 -5.324 -5.683 -5.996 -6.259 -6.543 -6.841 -7.097 -7.365 -7.628 -7.826 -8.034 -8.252 -8.481 -8.729 -8.894 -9.055 -9.316 -9.504 -9.692 -9.793 -10.037 -10.294 -10.555 -10.693 -11.013 -11.11 -11.27 -11.427 -11.719 -11.891 -12.099 -12.337 -12.63 -12.998 -13.427 -15.213 -4 ,15706 ,TETRA ,17551581,Thu Nov 25 11:54:13 CET,Thu Nov 25 13:29:08 CET,0.0 2.034 2.544 2.873 3.123 3.342 3.529 3.716 4.048 4.177 4.301 4.371 4.66 4.774 4.969 5.145 5.314 5.399 5.558 5.7 5.902 6.023 6.138 6.304 6.463 6.611 6.744 6.871 7.031 7.175 7.305 7.453 7.61 7.762 7.911 8.073 8.227 8.37 8.524 8.677 8.819 8.961 9.075 9.154 9.198 9.222 9.186 9.05 8.711 8.059 6.784 5.09 3.652 2.407 1.335 0.398 -0.398 -1.112 -1.715 -2.306 -2.81 -3.27 -3.714 -4.128 -4.521 -4.894 -5.277 -5.605 -5.893 -6.193 -6.496 -6.746 -6.998 -7.258 -7.47 -7.688 -7.913 -8.149 -8.387 -8.551 -8.723 -8.999 -9.197 -9.39 -9.491 -9.707 -9.937 -10.167 -10.276 -10.591 -10.674 -10.813 -10.956 -11.266 -11.449 -11.646 -11.875 -12.147 -12.44 -12.808 -14.356 -5 ,8762 ,TETRA ,17551583,Thu Nov 25 11:55:20 CET,Thu Nov 25 13:28:30 CET,0.0 1.69 2.088 2.345 2.586 2.802 2.991 3.15 3.432 3.559 3.681 3.74 4.021 4.125 4.313 4.495 4.649 4.72 4.855 5.005 5.219 5.333 5.456 5.634 5.789 5.931 6.057 6.17 6.319 6.463 6.601 6.759 6.902 7.019 7.155 7.316 7.452 7.591 7.734 7.882 8.015 8.14 8.26 8.345 8.407 8.433 8.373 8.223 7.911 7.218 5.822 4.126 2.725 1.503 0.472 -0.459 -1.288 -2.02 -2.656 -3.291 -3.819 -4.277 -4.712 -5.127 -5.504 -5.84 -6.201 -6.52 -6.797 -7.08 -7.358 -7.592 -7.849 -8.113 -8.304 -8.514 -8.751 -8.989 -9.232 -9.4 -9.571 -9.834 -10.024 -10.219 -10.316 -10.522 -10.74 -10.95 -11.052 -11.352 -11.448 -11.61 -11.771 -12.125 -12.335 -12.572 -12.838 -13.125 -13.461 -13.996 -15.408 -6 ,17135 ,TETRA ,17551585,Thu Nov 25 12:09:13 CET,Thu Nov 25 13:47:45 CET,0.0 2.486 2.835 3.116 3.369 3.62 3.82 3.975 4.327 4.506 4.656 4.744 5.037 5.161 5.386 5.596 5.78 5.856 6.005 6.161 6.368 6.484 6.597 6.764 6.927 7.084 7.222 7.348 7.511 7.667 7.813 7.967 8.107 8.235 8.386 8.556 8.694 8.836 8.974 9.104 9.244 9.407 9.54 9.618 9.716 9.789 9.749 9.584 9.23 8.57 7.326 5.684 4.263 3.009 1.962 1.077 0.312 -0.4 -1.019 -1.606 -2.102 -2.547 -2.983 -3.401 -3.772 -4.111 -4.468 -4.781 -5.065 -5.37 -5.675 -5.921 -6.179 -6.458 -6.675 -6.884 -7.101 -7.327 -7.564 -7.728 -7.902 -8.183 -8.38 -8.59 -8.697 -8.911 -9.13 -9.365 -9.492 -9.798 -9.863 -10.011 -10.17 -10.512 -10.715 -10.943 -11.21 -11.507 -11.823 -12.274 -13.767 -7 ,31175 ,TETRA ,17551587,Thu Nov 25 12:12:13 CET,Thu Nov 25 13:39:45 CET,0.0 1.693 2.193 2.517 2.77 3.026 3.239 3.411 3.715 3.857 3.998 4.082 4.357 4.458 4.658 4.841 5.016 5.1 5.257 5.401 5.588 5.706 5.838 6.025 6.178 6.317 6.441 6.565 6.727 6.883 7.026 7.182 7.321 7.451 7.589 7.741 7.886 8.01 8.126 8.259 8.381 8.499 8.627 8.734 8.8 8.812 8.794 8.681 8.381 7.743 6.466 4.818 3.396 2.175 1.134 0.211 -0.592 -1.325 -1.965 -2.583 -3.107 -3.576 -4.01 -4.42 -4.792 -5.126 -5.482 -5.791 -6.053 -6.337 -6.641 -6.897 -7.152 -7.416 -7.636 -7.863 -8.094 -8.329 -8.585 -8.782 -8.977 -9.247 -9.44 -9.633 -9.728 -9.933 -10.144 -10.369 -10.485 -10.796 -10.927 -11.107 -11.272 -11.616 -11.815 -12.025 -12.259 -12.501 -12.805 -13.236 -14.982 -8 ,2889 ,TETRA ,17551589,Thu Nov 25 12:13:16 CET,Thu Nov 25 13:47:11 CET,0.0 2.25 2.768 3.175 3.504 3.79 4.023 4.203 4.495 4.63 4.76 4.849 5.136 5.247 5.46 5.655 5.834 5.923 6.099 6.258 6.481 6.624 6.754 6.936 7.094 7.233 7.367 7.486 7.622 7.751 7.885 8.053 8.213 8.358 8.503 8.646 8.783 8.919 9.052 9.19 9.313 9.435 9.551 9.651 9.746 9.793 9.758 9.596 9.252 8.564 7.227 5.541 4.124 2.91 1.833 0.871 0.052 -0.656 -1.261 -1.858 -2.346 -2.792 -3.243 -3.689 -4.116 -4.494 -4.898 -5.261 -5.555 -5.865 -6.186 -6.441 -6.706 -6.995 -7.221 -7.446 -7.688 -7.953 -8.227 -8.405 -8.598 -8.929 -9.171 -9.403 -9.516 -9.769 -10.034 -10.301 -10.437 -10.769 -10.93 -11.144 -11.36 -11.85 -12.141 -12.476 -12.841 -13.157 -13.474 -13.918 -15.769 -9 ,18237 ,TETRA ,17551591,Thu Nov 25 11:52:13 CET,Thu Nov 25 13:36:06 CET,0.0 1.818 2.306 2.599 2.847 3.043 3.243 3.43 3.72 3.851 3.984 4.049 4.326 4.435 4.621 4.78 4.93 5.006 5.145 5.281 5.483 5.603 5.72 5.897 6.056 6.201 6.338 6.467 6.634 6.779 6.918 7.087 7.238 7.379 7.549 7.717 7.852 7.997 8.148 8.288 8.416 8.514 8.603 8.7 8.79 8.841 8.803 8.619 8.232 7.56 6.251 4.547 3.105 1.88 0.831 -0.097 -0.897 -1.624 -2.257 -2.875 -3.416 -3.916 -4.365 -4.767 -5.152 -5.514 -5.898 -6.234 -6.514 -6.81 -7.113 -7.359 -7.614 -7.886 -8.096 -8.312 -8.541 -8.77 -9.009 -9.172 -9.34 -9.604 -9.784 -9.97 -10.069 -10.28 -10.522 -10.792 -10.927 -11.249 -11.348 -11.508 -11.69 -12.086 -12.284 -12.482 -12.705 -12.944 -13.278 -13.703 -14.833 -10 ,19239 ,TETRA ,17551593,Thu Nov 25 11:53:10 CET,Thu Nov 25 13:28:14 CET,0.0 1.47 1.887 2.214 2.489 2.748 2.99 3.162 3.437 3.582 3.725 3.793 4.084 4.198 4.387 4.573 4.748 4.825 4.964 5.101 5.306 5.435 5.557 5.717 5.879 6.032 6.148 6.268 6.42 6.559 6.698 6.869 7.027 7.156 7.296 7.448 7.573 7.7 7.846 7.974 8.096 8.222 8.332 8.439 8.543 8.571 8.489 8.298 7.953 7.3 5.957 4.207 2.76 1.511 0.464 -0.462 -1.281 -2.025 -2.658 -3.275 -3.802 -4.266 -4.713 -5.131 -5.507 -5.852 -6.234 -6.585 -6.869 -7.152 -7.445 -7.683 -7.938 -8.208 -8.415 -8.624 -8.843 -9.07 -9.308 -9.469 -9.634 -9.91 -10.106 -10.309 -10.411 -10.621 -10.843 -11.072 -11.201 -11.516 -11.587 -11.736 -11.903 -12.242 -12.427 -12.63 -12.849 -13.11 -13.397 -13.844 -15.588 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt deleted file mode 100644 index 71f49899..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25137 ,TETRA ,17551001,Thu Nov 25 09:56:05 CET,Thu Nov 25 12:13:43 CET,0.0 0.951 1.514 1.882 2.205 2.493 2.762 3.026 3.485 3.687 3.878 3.604 4.378 4.533 4.816 5.084 5.334 5.443 5.684 5.911 6.214 6.419 6.604 6.871 7.13 7.373 7.597 7.794 8.034 8.251 8.445 8.669 8.851 9.006 9.195 9.423 9.624 9.861 10.096 10.267 10.426 10.582 10.749 10.876 10.925 10.904 10.809 10.583 10.108 9.156 7.274 4.873 2.782 0.981 -0.527 -1.885 -3.073 -4.14 -5.064 -5.964 -6.736 -7.428 -8.132 -8.826 -9.452 -10.041 -10.66 -11.192 -11.678 -12.22 -12.791 -13.289 -13.803 -14.334 -14.758 -15.189 -15.629 -16.087 -16.587 -16.936 -17.311 -17.912 -18.348 -18.788 -18.993 -19.435 -19.942 -20.469 -20.734 -21.626 -21.553 -21.863 -22.195 -23.046 -23.517 -24.013 -24.588 -25.209 -25.956 -27.024 -35.224 -2 ,13889 ,TETRA ,17551003,Thu Nov 25 09:57:05 CET,Thu Nov 25 12:06:14 CET,0.0 0.786 1.227 1.597 1.899 2.183 2.469 2.727 3.176 3.392 3.585 3.277 4.065 4.202 4.458 4.71 4.957 5.074 5.29 5.504 5.817 6.028 6.225 6.478 6.712 6.918 7.093 7.255 7.473 7.709 7.928 8.163 8.375 8.533 8.717 8.929 9.12 9.326 9.516 9.705 9.866 9.989 10.082 10.169 10.256 10.257 10.168 9.923 9.395 8.376 6.546 4.22 2.226 0.541 -0.948 -2.316 -3.515 -4.566 -5.492 -6.477 -7.415 -8.274 -9.018 -9.699 -10.329 -10.894 -11.525 -12.137 -12.67 -13.2 -13.781 -14.289 -14.782 -15.266 -15.663 -16.114 -16.582 -17.05 -17.534 -17.873 -18.231 -18.796 -19.177 -19.573 -19.78 -20.219 -20.708 -21.234 -21.517 -22.475 -22.488 -22.852 -23.226 -24.051 -24.475 -24.907 -25.441 -26.097 -26.875 -27.834 -33.984 -3 ,13887 ,TETRA ,17551005,Thu Nov 25 09:58:05 CET,Thu Nov 25 12:18:59 CET,0.0 1.03 1.487 1.814 2.081 2.338 2.603 2.821 3.195 3.38 3.549 3.238 4.021 4.169 4.453 4.71 4.936 5.056 5.273 5.456 5.711 5.9 6.11 6.367 6.58 6.786 7.015 7.262 7.539 7.755 7.958 8.195 8.39 8.555 8.761 9.002 9.228 9.479 9.744 10.001 10.193 10.369 10.551 10.668 10.742 10.786 10.747 10.575 10.12 9.146 7.279 4.819 2.744 0.965 -0.575 -1.964 -3.159 -4.253 -5.192 -6.128 -6.966 -7.726 -8.47 -9.173 -9.836 -10.431 -11.058 -11.655 -12.161 -12.644 -13.15 -13.592 -14.054 -14.546 -14.912 -15.321 -15.783 -16.236 -16.697 -17.037 -17.423 -18.048 -18.48 -18.922 -19.157 -19.631 -20.098 -20.617 -20.89 -21.805 -21.729 -22.072 -22.466 -23.344 -23.838 -24.341 -24.94 -25.677 -26.526 -27.752 -33.113 -4 ,6804 ,TETRA ,17551007,Thu Nov 25 10:00:06 CET,Thu Nov 25 12:07:33 CET,0.0 0.711 1.09 1.421 1.746 2.038 2.311 2.578 3.047 3.259 3.449 3.165 3.938 4.085 4.369 4.643 4.897 5.021 5.27 5.51 5.819 5.995 6.174 6.426 6.658 6.886 7.099 7.278 7.476 7.672 7.892 8.125 8.296 8.469 8.684 8.945 9.173 9.367 9.564 9.723 9.856 10.004 10.123 10.181 10.177 10.133 10.014 9.72 9.091 8.031 6.176 3.742 1.594 -0.251 -1.845 -3.313 -4.582 -5.72 -6.689 -7.646 -8.466 -9.189 -9.891 -10.564 -11.223 -11.834 -12.466 -13.041 -13.513 -13.983 -14.497 -14.958 -15.429 -15.928 -16.338 -16.773 -17.21 -17.645 -18.117 -18.451 -18.784 -19.292 -19.675 -20.139 -20.395 -20.876 -21.366 -21.9 -22.188 -23.155 -23.116 -23.472 -23.852 -24.679 -25.146 -25.634 -26.177 -26.826 -27.608 -28.625 -32.456 -5 ,22129 ,TETRA ,17551009,Thu Nov 25 10:01:08 CET,Thu Nov 25 12:26:48 CET,0.0 1.142 1.654 2.017 2.351 2.645 2.909 3.145 3.583 3.788 3.968 3.672 4.443 4.583 4.873 5.141 5.375 5.494 5.717 5.915 6.221 6.426 6.61 6.876 7.112 7.323 7.535 7.716 7.963 8.204 8.435 8.726 8.971 9.174 9.393 9.618 9.806 9.987 10.174 10.382 10.554 10.717 10.876 10.97 11.047 11.09 10.965 10.64 10.101 9.101 7.131 4.737 2.681 0.903 -0.62 -2.027 -3.239 -4.293 -5.213 -6.128 -6.939 -7.696 -8.41 -9.061 -9.685 -10.267 -10.868 -11.437 -11.931 -12.438 -12.978 -13.467 -13.98 -14.467 -14.854 -15.273 -15.689 -16.117 -16.57 -16.888 -17.229 -17.758 -18.12 -18.512 -18.733 -19.206 -19.668 -20.127 -20.39 -21.293 -21.291 -21.648 -22.018 -22.801 -23.205 -23.618 -24.11 -24.704 -25.399 -26.54 -33.559 -6 ,20380 ,TETRA ,17551012,Thu Nov 25 10:03:07 CET,Thu Nov 25 12:25:39 CET,0.0 1.039 1.632 1.981 2.272 2.581 2.886 3.158 3.641 3.849 4.035 3.748 4.514 4.659 4.944 5.226 5.508 5.634 5.858 6.071 6.335 6.505 6.696 6.988 7.237 7.463 7.68 7.87 8.101 8.322 8.52 8.73 8.932 9.125 9.343 9.584 9.792 9.989 10.203 10.447 10.648 10.814 11.01 11.134 11.189 11.187 11.025 10.702 10.206 9.294 7.471 5.061 2.955 1.199 -0.272 -1.644 -2.835 -3.897 -4.852 -5.832 -6.648 -7.366 -8.048 -8.699 -9.316 -9.882 -10.511 -11.086 -11.544 -12.036 -12.592 -13.044 -13.499 -13.992 -14.381 -14.759 -15.177 -15.657 -16.13 -16.448 -16.83 -17.475 -17.909 -18.332 -18.546 -18.987 -19.45 -19.968 -20.239 -21.143 -21.091 -21.41 -21.741 -22.504 -22.964 -23.458 -23.969 -24.613 -25.382 -26.344 -32.378 -7 ,10062 ,TETRA ,17551014,Thu Nov 25 10:03:08 CET,Thu Nov 25 12:22:16 CET,0.0 0.956 1.384 1.744 2.094 2.405 2.675 2.929 3.39 3.601 3.81 3.575 4.36 4.527 4.86 5.165 5.439 5.564 5.799 6.03 6.351 6.543 6.723 7.017 7.306 7.525 7.724 7.922 8.16 8.404 8.656 8.923 9.163 9.391 9.639 9.884 10.083 10.302 10.526 10.75 10.947 11.124 11.265 11.355 11.387 11.334 11.252 11.01 10.471 9.422 7.339 4.816 2.748 0.935 -0.629 -2.042 -3.275 -4.363 -5.31 -6.243 -7.033 -7.737 -8.417 -9.046 -9.617 -10.162 -10.737 -11.227 -11.671 -12.166 -12.715 -13.181 -13.65 -14.172 -14.575 -14.944 -15.319 -15.725 -16.203 -16.564 -16.937 -17.491 -17.857 -18.262 -18.475 -18.9 -19.338 -19.83 -20.097 -21.004 -20.965 -21.291 -21.623 -22.422 -22.922 -23.46 -24.061 -24.844 -25.721 -26.727 -34.134 -8 ,23098 ,TETRA ,17551016,Thu Nov 25 10:03:08 CET,Thu Nov 25 12:23:37 CET,0.0 0.927 1.304 1.672 1.977 2.204 2.433 2.686 3.137 3.33 3.506 3.202 3.978 4.123 4.402 4.669 4.91 5.026 5.247 5.459 5.802 6.016 6.191 6.432 6.684 6.914 7.118 7.314 7.546 7.777 8.011 8.269 8.519 8.73 8.894 9.07 9.231 9.352 9.454 9.585 9.711 9.829 9.914 9.926 9.91 9.872 9.734 9.375 8.665 7.492 5.423 2.767 0.547 -1.394 -3.115 -4.638 -5.945 -7.152 -8.2 -9.172 -9.991 -10.769 -11.516 -12.21 -12.865 -13.485 -14.093 -14.632 -15.125 -15.633 -16.179 -16.672 -17.172 -17.684 -18.112 -18.537 -18.968 -19.42 -19.877 -20.194 -20.538 -21.067 -21.428 -21.832 -22.042 -22.466 -22.9 -23.374 -23.647 -24.584 -24.558 -24.895 -25.247 -26.008 -26.451 -26.946 -27.486 -28.046 -28.69 -29.742 -34.217 -9 ,23832 ,TETRA ,17551018,Thu Nov 25 10:03:10 CET,Thu Nov 25 12:23:37 CET,0.0 1.199 1.689 2.045 2.303 2.509 2.702 2.894 3.281 3.452 3.606 3.294 4.066 4.204 4.464 4.722 4.993 5.119 5.348 5.555 5.831 6.007 6.174 6.411 6.656 6.902 7.108 7.279 7.501 7.711 7.909 8.116 8.311 8.514 8.693 8.909 9.128 9.305 9.456 9.599 9.734 9.834 9.937 10.011 10.003 9.95 9.811 9.514 8.95 7.883 5.92 3.459 1.353 -0.518 -2.1 -3.483 -4.753 -5.927 -6.901 -7.874 -8.748 -9.526 -10.26 -10.954 -11.591 -12.192 -12.827 -13.39 -13.877 -14.4 -14.964 -15.421 -15.903 -16.453 -16.848 -17.223 -17.633 -18.067 -18.539 -18.871 -19.228 -19.8 -20.215 -20.639 -20.852 -21.295 -21.749 -22.229 -22.504 -23.452 -23.442 -23.782 -24.144 -24.957 -25.417 -25.92 -26.502 -27.221 -27.974 -28.888 -34.786 -10 ,12428 ,TETRA ,17551020,Thu Nov 25 10:03:14 CET,Thu Nov 25 12:23:28 CET,0.0 1.022 1.482 1.845 2.159 2.455 2.712 2.956 3.429 3.64 3.833 3.54 4.334 4.479 4.76 5.022 5.262 5.384 5.638 5.855 6.143 6.335 6.532 6.822 7.068 7.285 7.499 7.71 7.973 8.241 8.489 8.746 8.993 9.237 9.528 9.795 10.005 10.241 10.484 10.71 10.92 11.124 11.309 11.439 11.508 11.502 11.408 11.197 10.758 9.858 8.068 5.718 3.711 1.974 0.498 -0.811 -1.952 -2.964 -3.853 -4.748 -5.551 -6.3 -6.983 -7.618 -8.238 -8.775 -9.364 -9.937 -10.45 -10.991 -11.551 -12.024 -12.516 -13.005 -13.38 -13.782 -14.196 -14.642 -15.136 -15.49 -15.838 -16.35 -16.718 -17.123 -17.336 -17.775 -18.217 -18.693 -18.955 -19.867 -19.832 -20.191 -20.55 -21.326 -21.814 -22.296 -22.788 -23.417 -24.238 -25.383 -29.965 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt deleted file mode 100644 index 77491a09..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28210 ,TETRA ,17551023,Thu Nov 25 10:03:10 CET,Thu Nov 25 12:24:13 CET,0.0 2.063 2.722 3.258 3.729 4.146 4.528 4.898 5.589 5.925 6.23 6.122 7.005 7.267 7.756 8.196 8.612 8.822 9.209 9.561 10.07 10.403 10.737 11.196 11.607 11.99 12.35 12.709 13.172 13.59 14.006 14.54 15.023 15.485 16.053 16.696 17.32 17.992 18.671 19.397 20.214 21.094 22.064 23.05 24.144 25.325 26.691 28.209 29.941 31.883 34.045 35.572 36.269 36.589 36.705 36.698 36.548 36.326 36.075 35.796 35.526 35.226 34.919 34.616 34.328 34.073 33.773 33.458 33.175 32.823 32.451 32.156 31.822 31.481 31.199 30.902 30.608 30.29 29.927 29.675 29.426 29.008 28.684 28.345 28.163 27.791 27.437 27.056 26.827 25.978 26.098 25.867 25.61 25.045 24.739 24.363 23.929 23.43 22.895 22.234 19.886 -2 ,19682 ,TETRA ,17551025,Thu Nov 25 10:04:06 CET,Thu Nov 25 12:31:27 CET,0.0 1.746 2.413 2.971 3.432 3.817 4.185 4.557 5.22 5.485 5.742 5.64 6.522 6.761 7.227 7.683 8.088 8.283 8.687 9.059 9.6 9.95 10.261 10.723 11.164 11.573 11.968 12.342 12.858 13.356 13.818 14.391 14.957 15.488 16.076 16.746 17.396 18.108 18.84 19.597 20.418 21.315 22.336 23.37 24.529 25.805 27.256 28.822 30.678 32.85 35.169 36.834 37.618 37.841 37.878 37.867 37.72 37.484 37.2 36.861 36.537 36.239 35.927 35.609 35.329 35.044 34.727 34.431 34.166 33.906 33.618 33.363 33.049 32.679 32.398 32.095 31.805 31.532 31.21 30.982 30.757 30.387 30.11 29.812 29.655 29.293 28.897 28.491 28.263 27.421 27.493 27.239 26.953 26.281 25.927 25.544 25.135 24.647 24.106 23.324 20.835 -3 ,16807 ,TETRA ,17551027,Thu Nov 25 10:04:11 CET,Thu Nov 25 12:26:47 CET,0.0 1.792 2.441 2.952 3.435 3.893 4.267 4.581 5.199 5.486 5.771 5.689 6.555 6.788 7.234 7.647 8.039 8.231 8.602 8.95 9.445 9.764 10.092 10.567 10.996 11.41 11.817 12.214 12.703 13.181 13.639 14.136 14.63 15.101 15.628 16.251 16.835 17.467 18.16 18.876 19.605 20.446 21.428 22.378 23.441 24.609 25.993 27.556 29.267 31.111 33.199 34.8 35.545 35.867 35.973 36.001 35.912 35.665 35.381 35.108 34.865 34.595 34.295 33.986 33.69 33.435 33.135 32.838 32.578 32.289 31.99 31.741 31.451 31.113 30.843 30.575 30.287 29.979 29.653 29.422 29.187 28.839 28.582 28.269 28.096 27.748 27.384 26.99 26.771 25.936 26.04 25.766 25.483 24.881 24.536 24.169 23.732 23.25 22.756 22.156 19.193 -4 ,31698 ,TETRA ,17551029,Thu Nov 25 10:04:10 CET,Thu Nov 25 12:26:14 CET,0.0 1.726 2.39 2.968 3.446 3.838 4.176 4.481 5.036 5.295 5.545 5.4 6.236 6.455 6.883 7.277 7.654 7.842 8.208 8.556 9.062 9.371 9.659 10.105 10.542 10.963 11.376 11.763 12.25 12.735 13.218 13.786 14.306 14.804 15.392 16.048 16.635 17.25 17.927 18.621 19.331 20.143 21.045 21.931 23.003 24.19 25.498 26.999 28.79 30.843 33.247 35.086 35.954 36.363 36.486 36.428 36.308 36.165 36.007 35.815 35.618 35.39 35.126 34.855 34.573 34.293 33.988 33.697 33.447 33.182 32.88 32.617 32.335 32.014 31.741 31.463 31.168 30.853 30.544 30.32 30.085 29.701 29.398 29.064 28.896 28.583 28.238 27.821 27.597 26.78 26.905 26.659 26.408 25.876 25.58 25.241 24.874 24.468 24.009 23.368 21.526 -5 ,27678 ,TETRA ,17551031,Thu Nov 25 10:04:07 CET,Thu Nov 25 12:25:52 CET,0.0 1.856 2.517 2.995 3.444 3.866 4.269 4.658 5.336 5.649 5.959 5.923 6.822 7.082 7.583 8.048 8.469 8.664 9.057 9.442 9.986 10.325 10.641 11.091 11.529 11.963 12.387 12.808 13.371 13.886 14.362 14.95 15.502 16.019 16.579 17.195 17.791 18.473 19.229 20.006 20.84 21.785 22.896 23.978 25.233 26.649 28.26 30.044 32.179 34.739 37.731 40.043 41.221 41.864 42.246 42.432 42.489 42.462 42.333 42.161 41.986 41.746 41.441 41.131 40.799 40.446 40.095 39.795 39.515 39.222 38.927 38.671 38.374 38.024 37.74 37.427 37.087 36.73 36.377 36.117 35.83 35.423 35.13 34.784 34.604 34.227 33.817 33.405 33.177 32.341 32.429 32.154 31.867 31.196 30.832 30.465 30.056 29.585 29.077 28.459 25.62 -6 ,22249 ,TETRA ,17551033,Thu Nov 25 10:04:13 CET,Thu Nov 25 12:26:04 CET,0.0 1.736 2.409 2.931 3.366 3.77 4.155 4.523 5.176 5.457 5.727 5.613 6.475 6.709 7.143 7.548 7.944 8.128 8.49 8.849 9.364 9.698 10.032 10.53 11.006 11.455 11.88 12.277 12.773 13.237 13.676 14.208 14.71 15.211 15.794 16.441 17.066 17.714 18.39 19.098 19.867 20.775 21.763 22.689 23.812 25.115 26.657 28.389 30.302 32.44 34.778 36.487 37.316 37.694 37.807 37.78 37.666 37.478 37.272 36.959 36.612 36.353 36.063 35.746 35.456 35.163 34.862 34.572 34.288 33.988 33.702 33.433 33.147 32.849 32.581 32.308 31.997 31.65 31.318 31.088 30.834 30.435 30.164 29.872 29.715 29.377 28.992 28.564 28.334 27.503 27.587 27.31 27.013 26.364 26.01 25.61 25.174 24.664 24.028 23.143 19.746 -7 ,9141 ,TETRA ,17551035,Thu Nov 25 10:04:10 CET,Thu Nov 25 12:25:48 CET,0.0 1.436 2.059 2.549 2.994 3.418 3.758 4.076 4.715 5.019 5.307 5.208 6.051 6.277 6.722 7.156 7.583 7.782 8.144 8.491 8.995 9.313 9.617 10.058 10.475 10.876 11.261 11.642 12.131 12.591 13.006 13.481 13.973 14.455 14.998 15.604 16.174 16.814 17.498 18.237 19.027 19.877 20.87 21.904 23.12 24.418 25.91 27.594 29.475 31.696 34.268 36.109 37.104 37.615 37.807 37.812 37.709 37.506 37.256 36.976 36.701 36.405 36.081 35.765 35.458 35.163 34.811 34.481 34.229 33.963 33.657 33.371 33.041 32.695 32.421 32.131 31.84 31.521 31.164 30.94 30.711 30.323 30.03 29.713 29.554 29.19 28.788 28.37 28.156 27.323 27.493 27.246 26.97 26.377 26.026 25.658 25.308 24.934 24.512 23.93 22.004 -8 ,28822 ,TETRA ,17551037,Thu Nov 25 10:04:13 CET,Thu Nov 25 12:24:16 CET,0.0 1.797 2.52 3.062 3.503 3.888 4.23 4.567 5.264 5.599 5.91 5.821 6.681 6.937 7.43 7.868 8.273 8.479 8.855 9.178 9.691 10.048 10.372 10.799 11.234 11.671 12.072 12.458 12.945 13.388 13.821 14.354 14.873 15.381 15.983 16.648 17.275 17.963 18.667 19.415 20.245 21.19 22.268 23.29 24.414 25.706 27.205 28.938 30.884 32.95 35.289 36.96 37.812 38.183 38.234 38.144 38.043 37.907 37.726 37.487 37.241 36.991 36.711 36.4 36.122 35.87 35.574 35.265 34.97 34.606 34.213 33.935 33.622 33.286 33.028 32.749 32.469 32.189 31.85 31.584 31.316 30.902 30.616 30.311 30.136 29.768 29.376 28.947 28.717 27.886 28.006 27.763 27.5 26.919 26.586 26.173 25.708 25.238 24.705 23.995 21.482 -9 ,8164 ,TETRA ,17551039,Thu Nov 25 10:04:10 CET,Thu Nov 25 12:25:58 CET,0.0 1.35 1.993 2.471 2.93 3.33 3.673 3.992 4.618 4.908 5.184 5.074 5.934 6.156 6.596 7.023 7.429 7.631 8.028 8.401 8.926 9.262 9.599 10.086 10.542 10.971 11.398 11.809 12.299 12.787 13.27 13.841 14.369 14.903 15.521 16.161 16.796 17.505 18.287 19.089 19.904 20.882 22.035 23.14 24.376 25.775 27.468 29.294 31.259 33.315 35.609 37.462 38.451 39.031 39.367 39.514 39.547 39.465 39.339 39.215 39.057 38.811 38.518 38.27 38.025 37.771 37.475 37.151 36.838 36.506 36.188 35.931 35.628 35.29 35.037 34.757 34.449 34.137 33.801 33.537 33.242 32.797 32.509 32.225 32.075 31.746 31.367 30.951 30.74 29.918 30.068 29.801 29.525 28.971 28.65 28.29 27.905 27.468 26.934 26.303 24.717 -10 ,30610 ,TETRA ,17551041,Thu Nov 25 10:04:11 CET,Thu Nov 25 12:23:12 CET,0.0 1.593 2.257 2.807 3.253 3.646 4.032 4.395 5.045 5.348 5.648 5.59 6.469 6.725 7.203 7.659 8.111 8.331 8.74 9.123 9.679 10.049 10.397 10.878 11.349 11.825 12.28 12.685 13.177 13.672 14.134 14.66 15.177 15.666 16.233 16.859 17.46 18.124 18.781 19.435 20.107 20.886 21.856 22.805 23.911 25.17 26.575 28.189 30.156 32.446 34.95 36.864 37.837 38.244 38.318 38.09 37.795 37.541 37.257 36.946 36.651 36.342 36.074 35.813 35.518 35.224 34.886 34.585 34.302 33.962 33.567 33.241 32.873 32.453 32.173 31.88 31.55 31.227 30.893 30.641 30.379 29.983 29.689 29.371 29.207 28.881 28.543 28.162 27.941 27.109 27.188 26.925 26.645 26.031 25.692 25.328 24.944 24.514 23.952 23.171 21.207 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt deleted file mode 100644 index ccc9ce08..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15892 ,TETRA ,17551043,Thu Nov 25 10:04:13 CET,Thu Nov 25 12:27:16 CET,0.0 0.895 1.255 1.509 1.743 1.978 2.208 2.424 2.809 2.989 3.174 2.862 3.612 3.752 4.058 4.34 4.599 4.726 4.974 5.222 5.563 5.768 5.981 6.303 6.595 6.872 7.135 7.374 7.698 8.022 8.323 8.676 8.994 9.297 9.642 10.027 10.415 10.829 11.248 11.69 12.175 12.717 13.301 13.874 14.562 15.287 16.053 16.88 17.746 18.609 19.372 19.509 19.252 18.932 18.501 18.008 17.583 17.155 16.738 16.266 15.818 15.419 15.024 14.637 14.302 13.993 13.641 13.301 12.988 12.646 12.276 11.946 11.591 11.214 10.928 10.645 10.354 10.043 9.69 9.441 9.164 8.721 8.422 8.111 7.961 7.622 7.203 6.787 6.591 5.752 5.962 5.746 5.509 4.952 4.637 4.306 3.954 3.588 3.143 2.535 1.272 -2 ,10724 ,TETRA ,17551044,Thu Nov 25 10:04:09 CET,Thu Nov 25 12:27:03 CET,0.0 0.677 1.085 1.333 1.553 1.775 1.992 2.189 2.554 2.723 2.882 2.57 3.355 3.478 3.721 3.961 4.2 4.327 4.583 4.819 5.14 5.356 5.575 5.862 6.133 6.388 6.63 6.867 7.187 7.492 7.769 8.103 8.421 8.721 9.082 9.5 9.893 10.322 10.786 11.274 11.783 12.349 12.981 13.59 14.281 15.035 15.838 16.65 17.488 18.32 19.035 19.176 18.951 18.571 18.116 17.639 17.154 16.63 16.096 15.542 15.118 14.743 14.347 13.942 13.545 13.171 12.76 12.394 12.082 11.742 11.35 11.015 10.683 10.329 10.038 9.723 9.396 9.064 8.724 8.486 8.226 7.843 7.58 7.298 7.141 6.774 6.42 6.067 5.87 5.026 5.242 5.018 4.775 4.258 3.971 3.666 3.35 2.995 2.573 2.035 1.016 -3 ,4804 ,TETRA ,17551045,Thu Nov 25 10:04:11 CET,Thu Nov 25 12:26:43 CET,0.0 0.597 0.958 1.283 1.545 1.766 1.989 2.208 2.6 2.766 2.92 2.583 3.364 3.501 3.767 4.018 4.266 4.39 4.611 4.807 5.102 5.293 5.48 5.75 6.016 6.28 6.537 6.767 7.063 7.361 7.648 7.975 8.278 8.599 8.971 9.369 9.749 10.155 10.575 11.041 11.553 12.095 12.71 13.303 13.967 14.681 15.439 16.232 17.026 17.874 18.623 18.811 18.667 18.349 17.89 17.397 16.932 16.454 15.982 15.499 15.083 14.689 14.314 13.907 13.522 13.228 12.911 12.592 12.287 11.962 11.65 11.383 11.066 10.717 10.436 10.129 9.812 9.477 9.122 8.883 8.632 8.231 7.937 7.611 7.448 7.113 6.764 6.412 6.227 5.399 5.619 5.402 5.185 4.706 4.433 4.124 3.777 3.377 2.874 2.286 1.171 -4 ,6883 ,TETRA ,17551046,Thu Nov 25 10:04:13 CET,Thu Nov 25 12:11:43 CET,0.0 0.992 1.423 1.762 2.076 2.36 2.627 2.861 3.277 3.469 3.643 3.331 4.121 4.274 4.556 4.819 5.078 5.209 5.466 5.71 6.063 6.286 6.495 6.815 7.121 7.41 7.691 7.946 8.259 8.561 8.862 9.231 9.566 9.87 10.214 10.589 10.961 11.374 11.806 12.275 12.765 13.332 13.986 14.601 15.304 16.069 16.893 17.736 18.62 19.533 20.342 20.53 20.316 19.991 19.648 19.29 18.877 18.422 18.007 17.603 17.223 16.861 16.518 16.167 15.817 15.497 15.157 14.832 14.533 14.212 13.874 13.571 13.208 12.83 12.552 12.258 11.962 11.666 11.346 11.111 10.852 10.441 10.152 9.847 9.693 9.371 9.04 8.677 8.473 7.617 7.782 7.552 7.311 6.775 6.482 6.168 5.808 5.393 4.89 4.207 2.626 -5 ,21951 ,TETRA ,17551047,Thu Nov 25 10:06:07 CET,Thu Nov 25 12:18:33 CET,0.0 1.004 1.442 1.749 1.998 2.241 2.471 2.67 3.031 3.214 3.385 3.06 3.841 3.984 4.261 4.523 4.77 4.899 5.151 5.377 5.682 5.898 6.114 6.418 6.719 7.007 7.265 7.502 7.836 8.154 8.47 8.862 9.204 9.531 9.91 10.32 10.686 11.082 11.516 11.974 12.442 12.956 13.555 14.142 14.801 15.494 16.27 17.108 17.989 18.747 19.181 19.077 18.655 18.111 17.54 16.964 16.401 15.841 15.339 14.815 14.307 13.85 13.411 12.947 12.501 12.111 11.69 11.307 10.982 10.635 10.253 9.919 9.578 9.218 8.942 8.667 8.361 8.02 7.666 7.424 7.176 6.771 6.469 6.147 5.97 5.595 5.225 4.824 4.61 3.771 3.962 3.725 3.479 2.933 2.632 2.324 2.007 1.626 1.169 0.592 -0.667 -6 ,15543 ,TETRA ,17551048,Thu Nov 25 10:06:07 CET,Thu Nov 25 12:33:13 CET,0.0 0.818 1.18 1.488 1.762 1.987 2.188 2.387 2.798 2.977 3.147 2.841 3.631 3.78 4.073 4.345 4.587 4.701 4.927 5.131 5.424 5.621 5.814 6.086 6.351 6.62 6.877 7.121 7.448 7.749 8.025 8.361 8.679 8.976 9.328 9.728 10.087 10.494 10.945 11.4 11.865 12.403 13.039 13.654 14.383 15.145 15.921 16.726 17.596 18.5 19.267 19.514 19.37 19.079 18.668 18.21 17.772 17.307 16.877 16.427 16.031 15.659 15.286 14.911 14.52 14.155 13.765 13.405 13.085 12.751 12.399 12.096 11.77 11.404 11.12 10.845 10.549 10.225 9.895 9.666 9.409 9.001 8.723 8.416 8.256 7.916 7.553 7.181 6.986 6.157 6.403 6.192 5.959 5.449 5.188 4.893 4.557 4.21 3.792 3.279 2.449 -7 ,15277 ,TETRA ,17551049,Thu Nov 25 10:06:08 CET,Thu Nov 25 12:30:12 CET,0.0 0.551 0.949 1.266 1.546 1.782 1.968 2.153 2.538 2.704 2.868 2.534 3.306 3.434 3.683 3.927 4.152 4.267 4.495 4.694 4.988 5.181 5.372 5.646 5.89 6.124 6.352 6.58 6.883 7.179 7.465 7.803 8.124 8.448 8.836 9.279 9.675 10.068 10.503 10.985 11.488 12.007 12.587 13.158 13.79 14.465 15.223 16.021 16.843 17.67 18.314 18.369 18.084 17.583 17.021 16.476 15.913 15.35 14.876 14.387 13.941 13.518 13.098 12.682 12.268 11.871 11.44 11.055 10.734 10.379 9.992 9.669 9.323 8.949 8.66 8.366 8.041 7.677 7.285 7.032 6.786 6.388 6.099 5.797 5.642 5.317 4.978 4.633 4.455 3.639 3.88 3.666 3.419 2.874 2.584 2.262 1.887 1.429 0.921 0.366 -0.737 -8 ,22836 ,TETRA ,17551050,Thu Nov 25 10:06:11 CET,Thu Nov 25 12:32:32 CET,0.0 0.645 0.944 1.201 1.45 1.652 1.829 2.009 2.336 2.499 2.666 2.348 3.123 3.26 3.497 3.72 3.931 4.045 4.277 4.479 4.782 4.987 5.193 5.48 5.752 6.019 6.28 6.525 6.827 7.13 7.417 7.765 8.099 8.412 8.765 9.152 9.527 9.934 10.376 10.831 11.281 11.777 12.363 12.958 13.633 14.356 15.158 15.979 16.858 17.762 18.446 18.559 18.278 17.823 17.295 16.762 16.268 15.793 15.34 14.856 14.413 13.98 13.562 13.191 12.834 12.495 12.121 11.732 11.373 11.023 10.653 10.334 9.992 9.606 9.299 8.983 8.648 8.299 7.934 7.683 7.412 6.959 6.657 6.331 6.16 5.815 5.445 5.029 4.801 3.93 4.105 3.867 3.617 3.091 2.811 2.496 2.169 1.805 1.376 0.842 -0.455 -9 ,7877 ,TETRA ,17551052,Thu Nov 25 10:06:12 CET,Thu Nov 25 12:34:53 CET,0.0 0.796 1.147 1.44 1.706 1.936 2.131 2.326 2.717 2.891 3.054 2.721 3.504 3.647 3.92 4.192 4.442 4.557 4.804 5.049 5.375 5.59 5.797 6.076 6.359 6.635 6.879 7.109 7.4 7.695 7.998 8.342 8.669 9.003 9.375 9.782 10.179 10.606 11.061 11.521 11.987 12.497 13.084 13.679 14.356 15.096 15.916 16.795 17.724 18.626 19.351 19.527 19.337 18.962 18.518 18.012 17.519 17.057 16.636 16.205 15.803 15.405 15.014 14.634 14.257 13.915 13.543 13.182 12.854 12.519 12.146 11.828 11.495 11.147 10.86 10.544 10.208 9.863 9.513 9.278 9.031 8.621 8.341 8.038 7.879 7.557 7.221 6.878 6.701 5.876 6.078 5.847 5.604 5.078 4.782 4.445 4.083 3.677 3.226 2.65 1.275 -10 ,23726 ,TETRA ,17551053,Thu Nov 25 10:08:07 CET,Thu Nov 25 12:31:03 CET,0.0 0.68 0.998 1.259 1.481 1.69 1.899 2.077 2.392 2.554 2.71 2.375 3.173 3.321 3.596 3.848 4.074 4.187 4.41 4.631 4.951 5.163 5.38 5.68 5.953 6.228 6.495 6.738 7.048 7.345 7.62 7.951 8.282 8.607 8.962 9.368 9.754 10.156 10.595 11.061 11.541 12.078 12.677 13.27 13.968 14.701 15.505 16.35 17.24 18.16 18.953 19.211 19.015 18.589 18.144 17.633 17.1 16.588 16.105 15.605 15.141 14.719 14.329 13.948 13.583 13.209 12.802 12.44 12.103 11.725 11.329 11.01 10.657 10.291 10.011 9.724 9.432 9.122 8.776 8.527 8.284 7.881 7.59 7.293 7.148 6.838 6.489 6.14 5.955 5.116 5.32 5.088 4.849 4.349 4.083 3.779 3.449 3.118 2.734 2.231 1.39 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt deleted file mode 100644 index 06769c60..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17862 ,TETRA ,17551064,Thu Nov 25 10:14:07 CET,Thu Nov 25 12:41:34 CET,0.0 1.749 2.496 3.105 3.564 3.94 4.269 4.566 5.108 5.348 5.588 5.4 6.22 6.4 6.724 7.004 7.264 7.396 7.656 7.889 8.208 8.411 8.614 8.913 9.184 9.431 9.672 9.922 10.248 10.54 10.792 11.071 11.361 11.675 12.011 12.369 12.729 13.112 13.513 13.916 14.336 14.809 15.345 15.838 16.364 16.949 17.635 18.327 19.012 19.75 20.335 20.336 19.999 19.554 19.066 18.561 18.086 17.614 17.147 16.68 16.3 15.952 15.591 15.228 14.886 14.55 14.192 13.874 13.586 13.275 12.949 12.678 12.393 12.099 11.867 11.631 11.371 11.081 10.767 10.546 10.33 9.982 9.733 9.473 9.339 9.067 8.783 8.481 8.313 7.504 7.744 7.535 7.334 6.899 6.642 6.379 6.094 5.754 5.346 4.839 3.851 -2 ,30908 ,TETRA ,17551065,Thu Nov 25 10:14:07 CET,Thu Nov 25 12:37:37 CET,0.0 1.893 2.541 3.057 3.501 3.869 4.185 4.471 4.961 5.162 5.351 5.12 5.95 6.134 6.462 6.759 7.038 7.181 7.448 7.702 8.062 8.266 8.471 8.775 9.06 9.333 9.585 9.816 10.119 10.425 10.713 11.042 11.348 11.633 11.963 12.344 12.706 13.089 13.491 13.902 14.303 14.76 15.301 15.828 16.434 17.082 17.734 18.359 19.047 19.738 20.235 20.235 19.966 19.618 19.184 18.693 18.212 17.771 17.388 16.957 16.54 16.163 15.799 15.455 15.133 14.827 14.503 14.202 13.911 13.598 13.274 12.982 12.684 12.371 12.118 11.857 11.574 11.265 10.938 10.718 10.491 10.116 9.858 9.579 9.435 9.15 8.846 8.539 8.373 7.553 7.808 7.612 7.394 6.919 6.674 6.379 6.043 5.688 5.26 4.766 3.641 -3 ,17656 ,TETRA ,17551066,Thu Nov 25 10:14:08 CET,Thu Nov 25 12:37:11 CET,0.0 2.165 2.936 3.514 4.031 4.458 4.801 5.109 5.622 5.865 6.096 5.872 6.71 6.886 7.187 7.483 7.779 7.929 8.207 8.448 8.793 9.027 9.25 9.559 9.833 10.093 10.361 10.605 10.884 11.156 11.422 11.731 12.034 12.314 12.627 12.994 13.348 13.716 14.108 14.54 14.983 15.459 16.011 16.56 17.16 17.771 18.471 19.21 19.919 20.583 21.072 21.139 20.848 20.376 19.881 19.358 18.887 18.437 18.005 17.586 17.205 16.853 16.494 16.134 15.79 15.457 15.121 14.801 14.508 14.22 13.898 13.61 13.297 12.975 12.736 12.475 12.193 11.904 11.615 11.398 11.152 10.779 10.511 10.237 10.096 9.778 9.45 9.097 8.914 8.082 8.319 8.11 7.892 7.416 7.15 6.851 6.51 6.169 5.797 5.337 4.415 -4 ,30655 ,TETRA ,17551067,Thu Nov 25 10:14:10 CET,Thu Nov 25 12:38:00 CET,0.0 1.689 2.296 2.741 3.132 3.488 3.817 4.13 4.743 4.998 5.21 4.991 5.81 5.977 6.286 6.598 6.878 7.008 7.276 7.533 7.886 8.099 8.287 8.543 8.788 9.038 9.287 9.53 9.848 10.163 10.449 10.763 11.065 11.368 11.71 12.087 12.459 12.846 13.253 13.7 14.174 14.673 15.229 15.778 16.365 16.97 17.653 18.341 19.004 19.651 20.119 20.038 19.63 19.186 18.744 18.26 17.768 17.269 16.794 16.347 15.974 15.614 15.253 14.901 14.557 14.249 13.919 13.585 13.29 12.99 12.662 12.373 12.071 11.741 11.488 11.235 10.946 10.634 10.311 10.084 9.842 9.445 9.18 8.913 8.764 8.453 8.156 7.836 7.656 6.826 7.099 6.899 6.69 6.238 5.972 5.678 5.337 4.932 4.54 4.078 3.149 -5 ,18581 ,TETRA ,17551068,Thu Nov 25 10:14:12 CET,Thu Nov 25 12:37:31 CET,0.0 1.676 2.324 2.812 3.225 3.603 3.929 4.202 4.749 5.01 5.221 4.953 5.745 5.901 6.208 6.546 6.865 7.007 7.266 7.51 7.85 8.07 8.288 8.581 8.842 9.088 9.346 9.591 9.898 10.187 10.461 10.808 11.141 11.459 11.821 12.192 12.536 12.922 13.326 13.735 14.154 14.623 15.155 15.678 16.277 16.909 17.612 18.311 18.981 19.622 20.031 19.964 19.624 19.178 18.681 18.165 17.683 17.218 16.739 16.205 15.78 15.387 14.991 14.624 14.249 13.882 13.507 13.168 12.864 12.532 12.209 11.966 11.695 11.388 11.149 10.894 10.608 10.312 9.996 9.772 9.548 9.173 8.904 8.633 8.499 8.215 7.915 7.601 7.407 6.56 6.809 6.618 6.424 5.946 5.685 5.426 5.125 4.797 4.42 3.967 2.96 -6 ,29795 ,TETRA ,17551069,Thu Nov 25 10:16:10 CET,Thu Nov 25 12:38:55 CET,0.0 1.716 2.37 2.856 3.271 3.626 3.951 4.251 4.835 5.089 5.294 5.055 5.89 6.073 6.401 6.71 6.996 7.138 7.425 7.699 8.063 8.289 8.517 8.824 9.106 9.369 9.623 9.871 10.208 10.52 10.799 11.115 11.411 11.715 12.057 12.439 12.813 13.22 13.62 14.031 14.473 14.951 15.483 15.99 16.558 17.175 17.855 18.53 19.195 19.84 20.371 20.443 20.158 19.72 19.242 18.745 18.248 17.801 17.424 16.983 16.572 16.209 15.843 15.477 15.111 14.769 14.413 14.109 13.857 13.56 13.231 12.944 12.615 12.298 12.061 11.801 11.502 11.183 10.866 10.64 10.415 10.049 9.776 9.511 9.374 9.073 8.755 8.413 8.234 7.411 7.618 7.39 7.171 6.638 6.333 6.025 5.687 5.331 4.942 4.437 3.563 -7 ,31554 ,TETRA ,17551070,Thu Nov 25 10:16:12 CET,Thu Nov 25 12:39:47 CET,0.0 1.893 2.64 3.143 3.537 3.908 4.239 4.554 5.124 5.349 5.562 5.37 6.214 6.392 6.728 7.059 7.38 7.525 7.777 8.031 8.414 8.641 8.854 9.19 9.506 9.787 10.049 10.304 10.654 10.976 11.259 11.595 11.926 12.244 12.599 12.957 13.261 13.598 13.975 14.375 14.778 15.221 15.72 16.211 16.793 17.395 18.044 18.702 19.35 19.978 20.454 20.442 20.113 19.708 19.289 18.833 18.369 17.916 17.509 17.052 16.622 16.236 15.864 15.494 15.156 14.854 14.505 14.165 13.873 13.572 13.231 12.947 12.657 12.344 12.092 11.827 11.551 11.229 10.892 10.671 10.437 10.081 9.844 9.591 9.45 9.148 8.828 8.491 8.319 7.495 7.726 7.512 7.291 6.82 6.564 6.3 6.002 5.651 5.292 4.876 4.236 -8 ,31847 ,TETRA ,17551071,Thu Nov 25 10:16:10 CET,Thu Nov 25 12:43:13 CET,0.0 1.837 2.517 3.051 3.495 3.887 4.245 4.578 5.156 5.408 5.646 5.444 6.275 6.44 6.729 7.003 7.263 7.39 7.658 7.922 8.287 8.496 8.681 8.969 9.254 9.511 9.741 9.966 10.263 10.532 10.783 11.081 11.365 11.646 11.962 12.304 12.61 12.951 13.37 13.799 14.212 14.658 15.12 15.576 16.096 16.643 17.205 17.787 18.426 19.003 19.448 19.438 19.166 18.781 18.344 17.9 17.471 17.054 16.635 16.167 15.746 15.362 14.956 14.552 14.199 13.879 13.528 13.187 12.88 12.552 12.217 11.949 11.643 11.297 11.012 10.728 10.463 10.184 9.865 9.649 9.423 9.058 8.793 8.5 8.341 8.012 7.695 7.36 7.172 6.345 6.587 6.387 6.174 5.688 5.434 5.164 4.87 4.541 4.13 3.637 2.632 -9 ,14811 ,TETRA ,17551072,Thu Nov 25 10:16:10 CET,Thu Nov 25 12:44:43 CET,0.0 1.776 2.465 2.985 3.402 3.748 4.074 4.4 4.955 5.199 5.435 5.255 6.088 6.3 6.676 6.984 7.287 7.433 7.708 7.977 8.341 8.56 8.758 9.047 9.339 9.595 9.856 10.126 10.448 10.746 11.031 11.376 11.707 12.008 12.368 12.781 13.135 13.491 13.871 14.279 14.702 15.135 15.639 16.146 16.721 17.339 17.973 18.656 19.382 20.028 20.516 20.513 20.152 19.721 19.257 18.751 18.304 17.864 17.467 17.066 16.681 16.308 15.938 15.582 15.26 14.93 14.565 14.268 14.024 13.757 13.46 13.191 12.892 12.576 12.317 12.029 11.728 11.428 11.115 10.898 10.671 10.309 10.057 9.789 9.649 9.347 9.024 8.707 8.54 7.73 8.003 7.806 7.587 7.094 6.819 6.539 6.238 5.884 5.48 4.995 4.191 -10 ,31964 ,TETRA ,17551073,Thu Nov 25 10:16:10 CET,Thu Nov 25 12:37:42 CET,0.0 1.88 2.594 3.151 3.622 4.018 4.389 4.705 5.245 5.488 5.722 5.559 6.42 6.609 6.962 7.307 7.609 7.739 7.989 8.241 8.606 8.846 9.073 9.38 9.658 9.933 10.228 10.501 10.819 11.093 11.352 11.677 11.978 12.261 12.613 13.008 13.355 13.752 14.172 14.562 14.97 15.429 15.92 16.392 16.947 17.52 18.137 18.8 19.535 20.279 20.867 20.849 20.516 20.099 19.62 19.138 18.657 18.164 17.711 17.209 16.763 16.364 15.978 15.601 15.243 14.915 14.568 14.268 13.981 13.686 13.363 13.069 12.769 12.448 12.2 11.935 11.645 11.344 11.022 10.791 10.538 10.153 9.914 9.654 9.512 9.21 8.891 8.548 8.374 7.576 7.837 7.652 7.444 6.979 6.726 6.468 6.187 5.87 5.505 5.027 4.135 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt deleted file mode 100644 index 665f95b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29559 ,TETRA ,17551084,Thu Nov 25 10:17:10 CET,Thu Nov 25 12:42:23 CET,0.0 1.321 1.804 2.154 2.461 2.753 3.028 3.277 3.745 3.961 4.168 3.911 4.718 4.878 5.206 5.533 5.831 5.97 6.234 6.498 6.876 7.105 7.332 7.663 7.941 8.2 8.468 8.71 9.02 9.312 9.586 9.915 10.203 10.469 10.78 11.121 11.447 11.8 12.186 12.602 13.004 13.439 13.926 14.385 14.878 15.364 15.937 16.524 17.027 17.475 17.761 17.524 17.083 16.594 16.055 15.501 14.989 14.517 14.073 13.613 13.178 12.742 12.328 11.964 11.644 11.348 11.015 10.706 10.426 10.122 9.772 9.453 9.121 8.781 8.523 8.252 7.954 7.656 7.356 7.121 6.866 6.465 6.175 5.868 5.705 5.37 5.032 4.674 4.489 3.676 3.874 3.639 3.418 2.936 2.643 2.338 2.04 1.696 1.263 0.801 -0.245 -2 ,5213 ,TETRA ,17551085,Thu Nov 25 10:19:04 CET,Thu Nov 25 12:46:34 CET,0.0 1.124 1.634 2.034 2.398 2.729 3.033 3.324 3.835 4.062 4.272 4.046 4.888 5.054 5.363 5.676 5.985 6.13 6.388 6.622 6.961 7.184 7.406 7.714 8.012 8.301 8.557 8.805 9.155 9.467 9.743 10.082 10.398 10.71 11.057 11.432 11.79 12.173 12.57 12.977 13.369 13.781 14.25 14.709 15.237 15.756 16.295 16.864 17.411 17.872 18.169 18.05 17.625 17.099 16.514 15.903 15.379 14.888 14.446 13.976 13.529 13.111 12.706 12.334 11.994 11.667 11.312 10.982 10.677 10.371 10.05 9.754 9.457 9.161 8.917 8.643 8.358 8.054 7.729 7.511 7.293 6.924 6.652 6.367 6.209 5.863 5.515 5.16 4.965 4.116 4.35 4.139 3.893 3.309 3.003 2.693 2.347 1.95 1.493 0.956 0.015 -3 ,3744 ,TETRA ,17551086,Thu Nov 25 10:17:09 CET,Thu Nov 25 12:40:38 CET,0.0 1.07 1.593 1.952 2.256 2.534 2.821 3.107 3.635 3.877 4.101 3.873 4.698 4.882 5.251 5.579 5.87 6.007 6.285 6.545 6.932 7.178 7.397 7.706 8.004 8.283 8.538 8.794 9.107 9.394 9.662 9.972 10.275 10.573 10.9 11.229 11.548 11.881 12.228 12.602 12.998 13.454 13.949 14.403 14.919 15.464 15.993 16.506 17.076 17.565 17.776 17.597 17.173 16.671 16.16 15.654 15.131 14.639 14.217 13.732 13.295 12.884 12.464 12.037 11.629 11.277 10.923 10.602 10.304 9.992 9.682 9.432 9.15 8.825 8.549 8.256 7.959 7.633 7.307 7.089 6.846 6.465 6.209 5.941 5.79 5.487 5.186 4.842 4.664 3.846 4.101 3.881 3.649 3.163 2.901 2.622 2.3 1.928 1.536 1.05 0.124 -4 ,14365 ,TETRA ,17551087,Thu Nov 25 10:17:11 CET,Thu Nov 25 12:42:07 CET,0.0 0.953 1.505 1.972 2.33 2.635 2.931 3.196 3.661 3.869 4.067 3.827 4.636 4.813 5.118 5.403 5.705 5.856 6.129 6.36 6.716 6.976 7.222 7.563 7.885 8.174 8.467 8.774 9.146 9.458 9.738 10.079 10.384 10.648 10.936 11.281 11.617 11.945 12.306 12.688 13.066 13.493 13.994 14.491 15.026 15.586 16.169 16.731 17.314 17.834 18.122 17.905 17.417 16.902 16.39 15.859 15.367 14.887 14.437 13.958 13.52 13.106 12.712 12.327 11.952 11.63 11.283 10.944 10.644 10.335 10.007 9.719 9.415 9.083 8.795 8.492 8.183 7.864 7.54 7.32 7.085 6.712 6.452 6.181 6.04 5.732 5.412 5.08 4.907 4.089 4.299 4.082 3.859 3.386 3.121 2.834 2.531 2.169 1.731 1.185 0.131 -5 ,5877 ,TETRA ,17551088,Thu Nov 25 10:17:13 CET,Thu Nov 25 12:40:12 CET,0.0 0.984 1.423 1.81 2.173 2.511 2.8 3.036 3.462 3.672 3.88 3.645 4.459 4.633 4.942 5.235 5.509 5.633 5.906 6.205 6.594 6.841 7.078 7.397 7.71 8.008 8.277 8.52 8.822 9.115 9.391 9.696 9.978 10.256 10.586 10.931 11.237 11.568 11.913 12.264 12.627 13.039 13.527 14.006 14.53 15.064 15.603 16.18 16.819 17.328 17.53 17.281 16.804 16.239 15.664 15.138 14.637 14.126 13.656 13.191 12.77 12.4 12.045 11.68 11.332 11.006 10.636 10.296 10.01 9.684 9.338 9.023 8.688 8.369 8.133 7.882 7.595 7.287 6.963 6.732 6.472 6.066 5.771 5.456 5.291 4.938 4.606 4.259 4.072 3.259 3.473 3.253 3.02 2.51 2.235 1.927 1.598 1.225 0.817 0.374 -0.517 -6 ,29437 ,TETRA ,17551089,Thu Nov 25 10:17:15 CET,Thu Nov 25 12:37:42 CET,0.0 0.984 1.449 1.822 2.167 2.512 2.812 3.086 3.561 3.772 3.983 3.744 4.568 4.752 5.096 5.423 5.721 5.858 6.134 6.4 6.76 6.969 7.167 7.463 7.738 7.995 8.246 8.485 8.768 9.045 9.323 9.64 9.933 10.215 10.546 10.9 11.217 11.551 11.901 12.287 12.648 13.04 13.491 13.9 14.364 14.86 15.388 15.934 16.456 16.941 17.21 16.981 16.563 16.088 15.524 14.938 14.431 13.938 13.457 12.958 12.532 12.173 11.831 11.48 11.125 10.791 10.458 10.168 9.893 9.587 9.266 8.991 8.705 8.399 8.148 7.884 7.596 7.295 6.977 6.751 6.511 6.13 5.868 5.583 5.439 5.145 4.813 4.45 4.266 3.441 3.711 3.501 3.265 2.78 2.518 2.23 1.921 1.559 1.156 0.659 -0.386 -7 ,2369 ,TETRA ,17551090,Thu Nov 25 10:22:05 CET,Thu Nov 25 12:45:23 CET,0.0 1.21 1.765 2.189 2.538 2.855 3.167 3.455 3.933 4.153 4.383 4.173 4.994 5.185 5.543 5.912 6.253 6.405 6.705 7.004 7.392 7.624 7.848 8.171 8.485 8.748 8.985 9.218 9.506 9.807 10.118 10.464 10.771 11.065 11.41 11.754 12.057 12.388 12.767 13.184 13.598 14.038 14.506 14.955 15.46 15.972 16.489 17.019 17.52 17.953 18.213 18.014 17.575 17.058 16.539 16.006 15.444 14.919 14.453 13.976 13.54 13.12 12.718 12.319 11.955 11.651 11.322 10.989 10.677 10.359 9.998 9.688 9.388 9.038 8.758 8.481 8.208 7.934 7.63 7.412 7.183 6.807 6.517 6.209 6.061 5.756 5.414 5.047 4.865 4.043 4.27 4.05 3.827 3.35 3.085 2.794 2.48 2.125 1.726 1.205 0.248 -8 ,7718 ,TETRA ,17551091,Thu Nov 25 10:22:07 CET,Thu Nov 25 12:44:32 CET,0.0 1.164 1.684 2.101 2.421 2.695 2.942 3.173 3.629 3.844 4.047 3.791 4.601 4.786 5.138 5.459 5.743 5.884 6.158 6.411 6.765 6.992 7.212 7.528 7.816 8.07 8.325 8.571 8.882 9.172 9.457 9.773 10.048 10.335 10.656 10.989 11.301 11.627 11.97 12.348 12.724 13.144 13.615 14.054 14.549 15.059 15.629 16.205 16.732 17.232 17.57 17.286 16.708 16.131 15.591 15.065 14.526 14.004 13.533 13.026 12.591 12.18 11.77 11.384 10.994 10.626 10.264 9.942 9.638 9.3 8.959 8.686 8.377 8.038 7.793 7.537 7.258 6.944 6.606 6.375 6.138 5.787 5.547 5.27 5.119 4.803 4.45 4.09 3.903 3.074 3.333 3.123 2.897 2.422 2.162 1.857 1.535 1.175 0.798 0.398 -0.538 -9 ,1605 ,TETRA ,17551092,Thu Nov 25 10:22:09 CET,Thu Nov 25 12:44:13 CET,0.0 0.967 1.528 1.935 2.279 2.582 2.848 3.098 3.566 3.789 4.004 3.765 4.582 4.772 5.126 5.452 5.769 5.916 6.173 6.419 6.816 7.077 7.304 7.647 7.98 8.27 8.564 8.842 9.158 9.455 9.738 10.085 10.384 10.664 11.016 11.405 11.75 12.12 12.503 12.865 13.243 13.668 14.121 14.557 15.061 15.595 16.158 16.73 17.273 17.723 18.009 17.753 17.193 16.602 16.059 15.503 14.976 14.477 13.99 13.486 13.035 12.621 12.232 11.837 11.47 11.135 10.789 10.48 10.167 9.84 9.518 9.248 8.951 8.631 8.365 8.085 7.806 7.523 7.212 6.974 6.736 6.377 6.115 5.844 5.704 5.399 5.085 4.759 4.584 3.76 4.013 3.807 3.59 3.097 2.841 2.56 2.232 1.886 1.508 1.031 0.217 -10 ,17014 ,TETRA ,17551093,Thu Nov 25 10:22:11 CET,Thu Nov 25 12:43:48 CET,0.0 0.934 1.346 1.688 2.001 2.28 2.562 2.837 3.322 3.55 3.758 3.507 4.32 4.485 4.817 5.142 5.445 5.581 5.842 6.099 6.453 6.67 6.883 7.196 7.487 7.742 7.994 8.248 8.539 8.793 9.05 9.375 9.675 9.936 10.221 10.548 10.845 11.154 11.51 11.871 12.209 12.594 13.046 13.474 13.941 14.433 14.942 15.455 15.987 16.484 16.755 16.574 16.192 15.664 15.108 14.58 14.053 13.555 13.102 12.63 12.199 11.794 11.385 10.981 10.635 10.3 9.921 9.598 9.299 8.975 8.638 8.362 8.07 7.738 7.483 7.223 6.958 6.669 6.348 6.126 5.903 5.54 5.268 4.984 4.84 4.548 4.226 3.872 3.683 2.854 3.058 2.833 2.607 2.115 1.851 1.585 1.277 0.927 0.52 -0.045 -1.169 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt deleted file mode 100644 index 24fb062c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26100 ,TETRA ,17551104,Thu Nov 25 10:28:11 CET,Thu Nov 25 12:42:58 CET,0.0 0.822 1.245 1.63 1.978 2.268 2.539 2.782 3.213 3.421 3.623 3.414 4.158 4.327 4.667 4.981 5.287 5.44 5.734 6.007 6.394 6.628 6.864 7.228 7.551 7.856 8.14 8.4 8.716 9.016 9.307 9.636 9.951 10.271 10.641 11.028 11.383 11.776 12.207 12.684 13.172 13.683 14.282 14.874 15.533 16.264 17.104 18.011 18.99 20.084 21.221 21.857 22.08 22.044 21.868 21.661 21.425 21.187 20.946 20.643 20.364 20.116 19.859 19.585 19.319 19.082 18.84 18.601 18.388 18.168 17.939 17.746 17.531 17.298 17.117 16.927 16.709 16.499 16.288 16.132 15.955 15.65 15.442 15.229 15.122 14.897 14.645 14.384 14.263 13.54 13.751 13.567 13.401 13.038 12.827 12.609 12.37 12.069 11.726 11.332 10.278 -2 ,13999 ,TETRA ,17551105,Thu Nov 25 10:28:11 CET,Thu Nov 25 12:42:46 CET,0.0 1.027 1.553 1.91 2.216 2.482 2.736 2.985 3.42 3.618 3.803 3.583 4.362 4.537 4.859 5.179 5.504 5.655 5.941 6.205 6.56 6.786 7.02 7.357 7.652 7.943 8.249 8.538 8.886 9.211 9.514 9.858 10.175 10.489 10.867 11.282 11.674 12.099 12.539 12.982 13.447 13.95 14.507 15.066 15.662 16.326 17.119 18.0 18.969 19.979 21.052 21.693 21.841 21.751 21.568 21.353 21.105 20.858 20.622 20.324 20.025 19.745 19.485 19.257 19.028 18.805 18.555 18.312 18.081 17.824 17.574 17.364 17.126 16.867 16.683 16.503 16.291 16.072 15.84 15.66 15.478 15.186 14.975 14.77 14.666 14.444 14.208 13.957 13.823 13.106 13.363 13.198 13.042 12.69 12.48 12.248 11.955 11.636 11.332 10.965 10.225 -3 ,25634 ,TETRA ,17551106,Thu Nov 25 10:29:05 CET,Thu Nov 25 12:40:31 CET,0.0 0.774 1.201 1.549 1.853 2.107 2.371 2.633 3.088 3.314 3.546 3.37 4.147 4.333 4.66 4.973 5.284 5.432 5.717 5.983 6.355 6.62 6.868 7.192 7.509 7.812 8.091 8.357 8.698 9.036 9.353 9.708 10.051 10.383 10.767 11.204 11.596 12.024 12.501 12.99 13.465 13.976 14.561 15.14 15.833 16.589 17.427 18.359 19.341 20.433 21.538 22.146 22.304 22.248 22.089 21.871 21.663 21.452 21.199 20.905 20.672 20.438 20.179 19.916 19.649 19.411 19.161 18.899 18.649 18.384 18.133 17.925 17.702 17.487 17.312 17.115 16.889 16.645 16.412 16.264 16.104 15.85 15.675 15.48 15.381 15.184 14.974 14.74 14.608 13.898 14.164 13.999 13.833 13.515 13.347 13.159 12.938 12.666 12.35 11.999 11.419 -4 ,29200 ,TETRA ,17551108,Thu Nov 25 10:29:09 CET,Thu Nov 25 12:39:51 CET,0.0 1.43 2.034 2.469 2.823 3.162 3.467 3.737 4.257 4.488 4.704 4.534 5.301 5.486 5.837 6.194 6.533 6.69 7.018 7.316 7.672 7.904 8.147 8.507 8.828 9.114 9.393 9.664 9.995 10.315 10.636 11.01 11.372 11.709 12.09 12.516 12.923 13.325 13.732 14.177 14.639 15.157 15.761 16.373 17.068 17.822 18.662 19.565 20.588 21.731 22.909 23.565 23.739 23.727 23.605 23.391 23.17 22.934 22.666 22.366 22.089 21.799 21.501 21.226 20.961 20.727 20.495 20.281 20.079 19.856 19.627 19.408 19.148 18.88 18.674 18.469 18.258 18.017 17.779 17.627 17.458 17.157 16.942 16.722 16.61 16.387 16.133 15.853 15.708 14.975 15.24 15.06 14.876 14.471 14.244 13.997 13.725 13.432 13.081 12.658 11.796 -5 ,30162 ,TETRA ,17551110,Thu Nov 25 10:30:13 CET,Thu Nov 25 12:42:07 CET,0.0 0.862 1.348 1.712 1.994 2.272 2.528 2.761 3.191 3.402 3.595 3.364 4.119 4.28 4.603 4.91 5.184 5.312 5.573 5.824 6.17 6.382 6.604 6.933 7.23 7.517 7.797 8.066 8.385 8.685 9.008 9.383 9.7 10.01 10.38 10.803 11.197 11.607 12.03 12.438 12.878 13.385 13.94 14.474 15.123 15.854 16.633 17.472 18.418 19.438 20.487 21.154 21.36 21.374 21.299 21.108 20.869 20.643 20.409 20.087 19.796 19.546 19.317 19.101 18.862 18.634 18.42 18.222 18.039 17.839 17.617 17.43 17.238 17.034 16.854 16.659 16.453 16.232 15.995 15.823 15.654 15.4 15.209 15.008 14.913 14.701 14.457 14.196 14.057 13.33 13.609 13.451 13.288 12.921 12.719 12.517 12.308 12.068 11.789 11.42 10.542 -6 ,1514 ,TETRA ,17551112,Thu Nov 25 10:35:10 CET,Thu Nov 25 12:46:49 CET,0.0 0.968 1.406 1.767 2.074 2.41 2.73 2.992 3.454 3.658 3.858 3.651 4.419 4.585 4.938 5.261 5.529 5.663 5.943 6.218 6.612 6.85 7.066 7.372 7.67 7.953 8.215 8.465 8.784 9.1 9.411 9.765 10.097 10.403 10.75 11.147 11.515 11.912 12.334 12.783 13.252 13.759 14.325 14.892 15.557 16.229 16.997 17.829 18.736 19.778 20.809 21.353 21.473 21.4 21.188 20.937 20.689 20.418 20.155 19.87 19.627 19.407 19.177 18.934 18.699 18.478 18.208 17.939 17.716 17.507 17.276 17.069 16.829 16.565 16.383 16.192 15.977 15.736 15.475 15.306 15.133 14.845 14.635 14.416 14.297 14.027 13.747 13.465 13.319 12.596 12.804 12.612 12.415 11.971 11.749 11.513 11.246 10.963 10.632 10.196 9.313 -7 ,318 ,TETRA ,17551114,Thu Nov 25 10:39:09 CET,Thu Nov 25 12:54:08 CET,0.0 0.975 1.437 1.783 2.077 2.347 2.596 2.842 3.289 3.488 3.687 3.459 4.224 4.392 4.686 4.983 5.264 5.404 5.68 5.945 6.299 6.515 6.748 7.086 7.39 7.668 7.942 8.211 8.554 8.88 9.176 9.515 9.839 10.154 10.497 10.874 11.254 11.655 12.062 12.491 12.94 13.428 13.977 14.536 15.19 15.888 16.668 17.527 18.473 19.505 20.522 20.998 21.012 20.872 20.704 20.505 20.276 20.035 19.771 19.476 19.215 18.985 18.744 18.486 18.243 18.013 17.767 17.538 17.332 17.113 16.878 16.677 16.449 16.2 16.004 15.799 15.583 15.342 15.087 14.924 14.747 14.438 14.221 14.0 13.893 13.689 13.475 13.213 13.067 12.321 12.545 12.375 12.191 11.747 11.51 11.282 11.045 10.774 10.446 10.063 9.248 -8 ,24139 ,TETRA ,17551116,Thu Nov 25 10:45:53 CET,Thu Nov 25 12:56:47 CET,0.0 0.617 1.022 1.337 1.652 1.929 2.18 2.415 2.846 3.056 3.254 3.046 3.814 3.986 4.309 4.616 4.892 5.032 5.308 5.581 5.976 6.212 6.442 6.779 7.094 7.375 7.636 7.909 8.26 8.599 8.931 9.285 9.603 9.918 10.288 10.688 11.049 11.445 11.868 12.305 12.763 13.274 13.875 14.465 15.123 15.842 16.623 17.414 18.303 19.339 20.409 21.003 21.145 21.069 20.866 20.637 20.428 20.166 19.872 19.596 19.379 19.155 18.907 18.677 18.474 18.27 18.061 17.863 17.67 17.445 17.191 17.001 16.8 16.575 16.398 16.209 16.007 15.782 15.537 15.366 15.186 14.888 14.668 14.449 14.348 14.129 13.885 13.63 13.496 12.776 13.063 12.918 12.759 12.405 12.218 12.016 11.774 11.477 11.159 10.748 9.892 -9 ,9075 ,TETRA ,17551118,Thu Nov 25 10:47:54 CET,Thu Nov 25 12:59:26 CET,0.0 0.619 1.014 1.322 1.606 1.877 2.157 2.429 2.933 3.152 3.354 3.161 3.935 4.102 4.4 4.696 4.979 5.117 5.384 5.645 6.04 6.291 6.519 6.83 7.122 7.4 7.668 7.926 8.263 8.603 8.914 9.267 9.604 9.917 10.279 10.687 11.052 11.434 11.857 12.301 12.737 13.234 13.824 14.393 15.042 15.755 16.554 17.401 18.3 19.269 20.302 20.894 21.014 20.946 20.748 20.477 20.166 19.857 19.594 19.297 19.014 18.729 18.438 18.153 17.884 17.64 17.397 17.178 16.96 16.712 16.449 16.239 16.038 15.789 15.582 15.39 15.175 14.928 14.668 14.49 14.315 14.048 13.845 13.629 13.523 13.296 13.028 12.749 12.612 11.885 12.131 11.964 11.796 11.447 11.249 11.01 10.744 10.494 10.227 9.842 9.123 -10 ,4340 ,TETRA ,17551120,Thu Nov 25 10:52:53 CET,Thu Nov 25 13:08:56 CET,0.0 0.847 1.315 1.691 2.029 2.286 2.521 2.75 3.193 3.399 3.594 3.396 4.158 4.326 4.652 4.958 5.252 5.398 5.668 5.92 6.286 6.508 6.716 7.024 7.32 7.589 7.842 8.088 8.423 8.747 9.045 9.41 9.747 10.06 10.408 10.784 11.18 11.606 12.01 12.439 12.914 13.443 14.032 14.611 15.271 15.971 16.747 17.598 18.511 19.445 20.403 20.911 20.94 20.784 20.523 20.212 19.898 19.606 19.336 19.018 18.73 18.461 18.196 17.945 17.689 17.446 17.196 16.954 16.733 16.475 16.16 15.922 15.696 15.447 15.268 15.072 14.845 14.631 14.411 14.253 14.082 13.784 13.571 13.364 13.266 13.039 12.762 12.48 12.346 11.622 11.854 11.682 11.515 11.14 10.946 10.745 10.509 10.246 9.911 9.476 8.455 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt deleted file mode 100644 index 1d77206b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19023 ,TETRA ,17551134,Thu Nov 25 11:05:58 CET,Thu Nov 25 13:00:38 CET,0.0 0.834 1.212 1.561 1.885 2.165 2.418 2.652 3.073 3.263 3.453 3.23 3.99 4.151 4.451 4.723 4.982 5.111 5.347 5.577 5.903 6.11 6.31 6.582 6.842 7.104 7.345 7.567 7.849 8.117 8.368 8.647 8.914 9.173 9.454 9.749 10.027 10.323 10.646 10.992 11.334 11.698 12.09 12.462 12.895 13.349 13.842 14.336 14.772 15.122 15.298 15.047 14.6 14.072 13.524 13.039 12.584 12.153 11.766 11.332 10.94 10.571 10.21 9.872 9.564 9.256 8.919 8.592 8.298 7.998 7.675 7.413 7.148 6.863 6.626 6.385 6.14 5.865 5.572 5.362 5.13 4.771 4.506 4.226 4.091 3.801 3.477 3.136 2.971 2.222 2.431 2.23 2.017 1.561 1.288 0.989 0.711 0.4 0.018 -0.397 -1.073 -2 ,24125 ,TETRA ,17551135,Thu Nov 25 11:05:58 CET,Thu Nov 25 13:00:34 CET,0.0 1.017 1.44 1.783 2.046 2.295 2.55 2.8 3.259 3.464 3.644 3.427 4.181 4.346 4.642 4.938 5.236 5.379 5.644 5.879 6.187 6.401 6.62 6.94 7.215 7.426 7.623 7.815 8.048 8.301 8.543 8.805 9.069 9.314 9.601 9.906 10.178 10.491 10.813 11.137 11.483 11.862 12.278 12.67 13.102 13.572 14.079 14.548 15.014 15.429 15.527 15.188 14.748 14.213 13.685 13.178 12.682 12.202 11.775 11.37 11.004 10.649 10.304 9.945 9.576 9.249 8.924 8.632 8.359 8.047 7.728 7.46 7.183 6.891 6.663 6.428 6.163 5.884 5.584 5.37 5.165 4.807 4.528 4.227 4.073 3.751 3.411 3.064 2.881 2.102 2.228 2.01 1.79 1.319 1.057 0.774 0.476 0.138 -0.26 -0.763 -2.029 -3 ,31893 ,TETRA ,17551136,Thu Nov 25 11:05:58 CET,Thu Nov 25 12:59:52 CET,0.0 0.919 1.345 1.736 2.084 2.397 2.69 2.931 3.372 3.59 3.793 3.611 4.346 4.509 4.833 5.133 5.379 5.497 5.753 5.993 6.354 6.561 6.728 6.998 7.267 7.515 7.737 7.967 8.276 8.527 8.752 9.019 9.27 9.5 9.75 10.038 10.32 10.657 11.04 11.396 11.744 12.12 12.514 12.909 13.378 13.842 14.32 14.787 15.22 15.619 15.775 15.466 14.956 14.424 13.874 13.322 12.789 12.268 11.824 11.382 10.979 10.609 10.251 9.902 9.568 9.26 8.942 8.644 8.372 8.102 7.8 7.521 7.233 6.924 6.668 6.387 6.087 5.771 5.436 5.209 4.986 4.6 4.32 4.046 3.903 3.599 3.29 2.971 2.793 2.032 2.155 1.917 1.69 1.219 0.945 0.643 0.304 -0.087 -0.529 -1.044 -2.118 -4 ,32489 ,TETRA ,17551137,Thu Nov 25 11:06:56 CET,Thu Nov 25 13:01:32 CET,0.0 0.824 1.267 1.683 2.036 2.348 2.624 2.875 3.332 3.553 3.764 3.556 4.285 4.451 4.777 5.081 5.356 5.49 5.75 5.969 6.299 6.511 6.724 7.017 7.298 7.575 7.787 7.982 8.241 8.519 8.784 9.078 9.338 9.574 9.875 10.207 10.488 10.79 11.102 11.414 11.728 12.094 12.523 12.937 13.379 13.847 14.362 14.852 15.306 15.678 15.861 15.588 15.101 14.587 14.072 13.537 13.016 12.497 12.045 11.611 11.224 10.866 10.506 10.164 9.824 9.511 9.191 8.88 8.611 8.323 7.999 7.719 7.421 7.11 6.863 6.593 6.313 6.027 5.714 5.48 5.238 4.888 4.647 4.386 4.254 3.97 3.658 3.31 3.123 2.349 2.572 2.371 2.155 1.689 1.419 1.101 0.777 0.458 0.07 -0.425 -1.57 -5 ,17019 ,TETRA ,17551138,Thu Nov 25 11:06:56 CET,Thu Nov 25 13:08:38 CET,0.0 0.863 1.31 1.658 1.984 2.285 2.549 2.787 3.221 3.419 3.607 3.381 4.117 4.292 4.626 4.91 5.192 5.324 5.589 5.832 6.142 6.334 6.52 6.798 7.057 7.316 7.553 7.774 8.078 8.362 8.619 8.925 9.204 9.481 9.799 10.118 10.411 10.739 11.077 11.397 11.718 12.081 12.494 12.907 13.374 13.841 14.338 14.828 15.269 15.667 15.933 15.734 15.278 14.764 14.262 13.764 13.268 12.777 12.33 11.854 11.427 11.065 10.737 10.414 10.096 9.781 9.442 9.134 8.871 8.584 8.252 7.96 7.65 7.339 7.111 6.862 6.601 6.309 5.987 5.777 5.544 5.195 4.955 4.685 4.554 4.289 3.975 3.622 3.433 2.65 2.782 2.566 2.332 1.784 1.487 1.208 0.912 0.564 0.123 -0.46 -1.868 -6 ,22315 ,TETRA ,17551139,Thu Nov 25 11:06:56 CET,Thu Nov 25 13:00:57 CET,0.0 0.767 1.107 1.402 1.683 1.93 2.149 2.357 2.767 2.959 3.133 2.868 3.612 3.768 4.06 4.319 4.563 4.691 4.939 5.179 5.513 5.713 5.907 6.188 6.446 6.696 6.935 7.142 7.396 7.635 7.864 8.134 8.382 8.611 8.873 9.176 9.444 9.732 10.042 10.332 10.639 11.006 11.421 11.786 12.17 12.615 13.073 13.535 14.034 14.493 14.792 14.62 14.109 13.512 12.975 12.469 11.995 11.525 11.083 10.62 10.229 9.854 9.457 9.074 8.718 8.39 8.035 7.692 7.382 7.074 6.767 6.503 6.221 5.909 5.651 5.363 5.055 4.76 4.456 4.242 4.018 3.667 3.408 3.121 2.966 2.631 2.294 1.949 1.765 0.986 1.171 0.967 0.74 0.221 -0.056 -0.346 -0.674 -1.035 -1.467 -1.961 -3.164 -7 ,16977 ,TETRA ,17551140,Thu Nov 25 11:06:56 CET,Thu Nov 25 13:06:44 CET,0.0 1.009 1.52 1.886 2.228 2.562 2.83 3.086 3.562 3.772 3.966 3.772 4.524 4.685 4.991 5.272 5.547 5.673 5.916 6.156 6.452 6.652 6.872 7.165 7.418 7.663 7.906 8.129 8.403 8.669 8.902 9.173 9.434 9.664 9.934 10.226 10.488 10.786 11.113 11.454 11.776 12.128 12.534 12.923 13.372 13.832 14.341 14.864 15.389 15.811 15.986 15.687 15.174 14.64 14.083 13.511 13.018 12.588 12.18 11.711 11.287 10.934 10.578 10.205 9.869 9.562 9.247 8.982 8.705 8.412 8.125 7.841 7.537 7.237 7.004 6.773 6.529 6.264 5.991 5.776 5.542 5.176 4.898 4.617 4.473 4.166 3.843 3.493 3.315 2.552 2.713 2.487 2.248 1.719 1.44 1.148 0.829 0.487 0.059 -0.506 -1.924 -8 ,25263 ,TETRA ,17551141,Thu Nov 25 11:06:56 CET,Thu Nov 25 13:02:03 CET,0.0 0.899 1.332 1.659 1.955 2.229 2.483 2.715 3.127 3.316 3.494 3.241 3.983 4.129 4.398 4.676 4.946 5.07 5.3 5.521 5.837 6.044 6.24 6.499 6.735 6.975 7.204 7.429 7.757 8.064 8.325 8.613 8.856 9.072 9.34 9.655 9.947 10.242 10.514 10.802 11.121 11.486 11.89 12.277 12.717 13.138 13.608 14.081 14.526 14.943 15.176 14.981 14.529 14.036 13.526 13.035 12.549 12.092 11.691 11.242 10.825 10.47 10.119 9.765 9.443 9.157 8.849 8.567 8.308 8.023 7.723 7.466 7.189 6.882 6.645 6.4 6.145 5.846 5.507 5.285 5.04 4.648 4.394 4.125 3.984 3.682 3.359 3.042 2.869 2.109 2.278 2.061 1.827 1.306 1.024 0.708 0.369 -0.027 -0.531 -1.103 -2.4 -9 ,24736 ,TETRA ,17551142,Thu Nov 25 11:07:57 CET,Thu Nov 25 13:09:32 CET,0.0 0.89 1.351 1.675 1.942 2.2 2.438 2.631 2.998 3.2 3.398 3.155 3.901 4.048 4.345 4.636 4.914 5.047 5.284 5.506 5.83 6.031 6.211 6.472 6.736 6.993 7.223 7.433 7.724 7.997 8.234 8.495 8.737 8.977 9.262 9.587 9.886 10.197 10.515 10.82 11.138 11.518 11.915 12.284 12.708 13.154 13.613 14.064 14.492 14.836 15.0 14.758 14.354 13.872 13.329 12.788 12.301 11.868 11.473 11.058 10.67 10.296 9.955 9.647 9.344 9.04 8.699 8.384 8.106 7.807 7.489 7.223 6.953 6.672 6.429 6.17 5.912 5.657 5.374 5.163 4.939 4.571 4.318 4.048 3.907 3.597 3.267 2.914 2.725 1.954 2.16 1.939 1.698 1.208 0.947 0.676 0.351 -0.038 -0.455 -1.015 -2.368 -10 ,26624 ,TETRA ,17551143,Thu Nov 25 11:07:57 CET,Thu Nov 25 13:09:03 CET,0.0 0.843 1.343 1.722 2.03 2.292 2.529 2.75 3.178 3.377 3.556 3.318 4.075 4.249 4.596 4.911 5.17 5.279 5.506 5.743 6.081 6.3 6.503 6.797 7.067 7.286 7.52 7.771 8.086 8.368 8.601 8.857 9.112 9.359 9.635 9.936 10.199 10.478 10.778 11.103 11.445 11.778 12.16 12.542 12.948 13.379 13.819 14.255 14.673 15.025 15.138 14.812 14.327 13.838 13.312 12.803 12.359 11.921 11.517 11.082 10.68 10.32 9.983 9.667 9.357 9.06 8.737 8.43 8.147 7.851 7.512 7.215 6.94 6.645 6.401 6.147 5.874 5.576 5.266 5.05 4.823 4.475 4.249 4.017 3.881 3.583 3.281 2.954 2.775 2.004 2.209 2.016 1.816 1.361 1.114 0.857 0.575 0.252 -0.142 -0.65 -1.716 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt deleted file mode 100644 index 4c20b429..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10072 ,TETRA ,17551145,Thu Nov 25 11:08:55 CET,Thu Nov 25 13:08:47 CET,0.0 1.015 1.488 1.883 2.192 2.462 2.717 2.96 3.403 3.601 3.795 3.571 4.319 4.484 4.798 5.082 5.356 5.498 5.784 6.045 6.397 6.604 6.806 7.116 7.413 7.672 7.911 8.167 8.506 8.831 9.117 9.449 9.778 10.063 10.356 10.684 11.02 11.385 11.759 12.174 12.601 13.056 13.578 14.07 14.629 15.241 15.902 16.644 17.484 18.379 19.253 19.547 19.401 19.142 18.909 18.648 18.314 17.988 17.693 17.352 17.034 16.737 16.437 16.127 15.814 15.528 15.243 14.982 14.737 14.467 14.172 13.918 13.65 13.357 13.129 12.899 12.627 12.344 12.071 11.884 11.681 11.343 11.107 10.859 10.73 10.457 10.154 9.83 9.663 8.906 9.12 8.93 8.737 8.29 8.044 7.771 7.456 7.087 6.684 6.19 5.003 -2 ,20529 ,TETRA ,17551147,Thu Nov 25 11:09:53 CET,Thu Nov 25 13:09:42 CET,0.0 1.031 1.541 1.979 2.331 2.636 2.941 3.19 3.601 3.809 4.026 3.851 4.614 4.796 5.122 5.43 5.721 5.848 6.116 6.385 6.741 6.968 7.172 7.449 7.76 8.072 8.339 8.604 8.943 9.249 9.553 9.894 10.193 10.471 10.789 11.145 11.472 11.821 12.195 12.599 13.028 13.49 14.012 14.534 15.105 15.737 16.48 17.287 18.097 18.858 19.619 19.997 19.895 19.61 19.315 18.993 18.676 18.329 17.984 17.634 17.326 17.043 16.75 16.441 16.134 15.831 15.511 15.236 15.001 14.761 14.492 14.246 13.998 13.738 13.523 13.285 13.0 12.676 12.361 12.157 11.951 11.596 11.326 11.042 10.884 10.555 10.225 9.857 9.663 8.904 9.044 8.818 8.598 8.094 7.815 7.55 7.276 6.956 6.562 6.067 5.253 -3 ,2618 ,TETRA ,17551149,Thu Nov 25 11:08:58 CET,Thu Nov 25 13:21:55 CET,0.0 0.686 1.101 1.458 1.807 2.119 2.375 2.641 3.12 3.324 3.53 3.324 4.07 4.228 4.531 4.821 5.089 5.22 5.482 5.717 6.036 6.251 6.464 6.758 7.022 7.269 7.515 7.746 8.045 8.34 8.626 8.951 9.235 9.53 9.865 10.218 10.55 10.914 11.31 11.708 12.11 12.531 13.024 13.536 14.12 14.754 15.472 16.221 17.011 17.808 18.56 18.894 18.85 18.662 18.395 18.079 17.762 17.461 17.137 16.773 16.439 16.137 15.838 15.547 15.274 14.98 14.678 14.42 14.178 13.934 13.675 13.43 13.187 12.942 12.738 12.516 12.269 11.998 11.702 11.488 11.257 10.89 10.638 10.39 10.254 9.94 9.61 9.274 9.1 8.326 8.469 8.225 7.996 7.517 7.256 6.999 6.72 6.383 5.995 5.546 4.709 -4 ,4908 ,TETRA ,17551151,Thu Nov 25 11:08:55 CET,Thu Nov 25 13:11:14 CET,0.0 1.036 1.523 1.935 2.301 2.63 2.911 3.165 3.621 3.83 4.033 3.876 4.652 4.83 5.164 5.486 5.793 5.936 6.175 6.431 6.812 7.065 7.296 7.573 7.856 8.128 8.398 8.632 8.888 9.142 9.405 9.715 9.995 10.28 10.593 10.941 11.292 11.665 12.055 12.458 12.903 13.428 14.003 14.509 15.049 15.634 16.304 17.054 17.853 18.676 19.42 19.659 19.558 19.375 19.063 18.662 18.322 18.015 17.704 17.372 17.037 16.694 16.361 16.068 15.813 15.577 15.31 15.047 14.796 14.529 14.267 14.03 13.783 13.53 13.318 13.095 12.866 12.59 12.304 12.116 11.919 11.592 11.334 11.062 10.916 10.609 10.311 9.995 9.82 9.068 9.233 9.032 8.811 8.303 8.026 7.734 7.403 7.014 6.563 5.921 4.487 -5 ,29628 ,TETRA ,17551153,Thu Nov 25 11:09:53 CET,Thu Nov 25 13:11:11 CET,0.0 0.959 1.336 1.664 1.931 2.186 2.43 2.66 3.066 3.249 3.436 3.217 3.988 4.152 4.451 4.739 5.007 5.134 5.377 5.604 5.937 6.144 6.335 6.607 6.867 7.135 7.395 7.644 7.951 8.241 8.52 8.829 9.132 9.408 9.704 10.045 10.405 10.802 11.195 11.597 11.997 12.441 12.961 13.45 13.981 14.589 15.288 16.036 16.829 17.696 18.532 18.764 18.634 18.407 18.083 17.747 17.372 16.982 16.636 16.274 15.967 15.678 15.395 15.143 14.874 14.607 14.325 14.07 13.83 13.551 13.259 13.02 12.78 12.513 12.294 12.066 11.841 11.59 11.294 11.093 10.876 10.527 10.288 10.023 9.891 9.606 9.287 8.983 8.812 8.033 8.266 8.066 7.842 7.384 7.137 6.881 6.602 6.267 5.897 5.365 3.972 -6 ,4073 ,TETRA ,17551155,Thu Nov 25 11:09:54 CET,Thu Nov 25 13:10:27 CET,0.0 0.935 1.365 1.737 2.067 2.351 2.604 2.834 3.266 3.477 3.688 3.486 4.248 4.419 4.748 5.069 5.377 5.507 5.754 5.997 6.354 6.597 6.815 7.113 7.398 7.665 7.902 8.12 8.404 8.685 8.964 9.28 9.585 9.881 10.216 10.583 10.915 11.275 11.678 12.1 12.536 13.021 13.541 14.038 14.606 15.226 15.901 16.632 17.452 18.292 19.028 19.3 19.23 19.011 18.73 18.391 18.02 17.686 17.384 17.009 16.682 16.396 16.095 15.773 15.468 15.208 14.942 14.676 14.427 14.177 13.895 13.636 13.37 13.112 12.899 12.657 12.4 12.141 11.876 11.675 11.474 11.173 10.959 10.727 10.601 10.336 10.062 9.762 9.599 8.839 9.038 8.814 8.591 8.153 7.9 7.621 7.312 6.971 6.606 6.13 5.262 -7 ,24105 ,TETRA ,17551157,Thu Nov 25 11:09:54 CET,Thu Nov 25 13:10:16 CET,0.0 0.873 1.428 1.85 2.164 2.449 2.699 2.942 3.398 3.602 3.803 3.606 4.387 4.555 4.853 5.152 5.444 5.578 5.835 6.079 6.441 6.667 6.868 7.172 7.453 7.717 8.005 8.274 8.606 8.922 9.194 9.524 9.843 10.139 10.464 10.799 11.123 11.472 11.831 12.231 12.651 13.097 13.624 14.132 14.693 15.303 15.993 16.762 17.598 18.421 19.142 19.492 19.452 19.179 18.828 18.468 18.069 17.688 17.399 17.061 16.714 16.385 16.055 15.733 15.417 15.123 14.829 14.558 14.317 14.054 13.778 13.551 13.292 13.017 12.805 12.579 12.338 12.075 11.784 11.578 11.365 11.024 10.795 10.534 10.387 10.079 9.765 9.443 9.265 8.485 8.671 8.453 8.229 7.748 7.508 7.236 6.873 6.472 6.019 5.468 4.081 -8 ,9271 ,TETRA ,17551159,Thu Nov 25 11:09:54 CET,Thu Nov 25 13:11:06 CET,0.0 0.834 1.235 1.565 1.868 2.148 2.391 2.621 3.065 3.272 3.46 3.215 3.97 4.137 4.446 4.746 5.041 5.177 5.435 5.685 6.033 6.258 6.465 6.756 7.05 7.327 7.577 7.805 8.098 8.386 8.669 9.018 9.33 9.612 9.927 10.281 10.644 11.024 11.384 11.769 12.183 12.643 13.192 13.729 14.29 14.859 15.518 16.224 16.999 17.807 18.53 18.863 18.823 18.636 18.381 18.043 17.672 17.326 16.992 16.611 16.258 15.943 15.628 15.281 14.957 14.689 14.423 14.176 13.939 13.68 13.393 13.134 12.844 12.545 12.319 12.084 11.849 11.618 11.351 11.133 10.898 10.546 10.307 10.063 9.941 9.678 9.377 9.027 8.848 8.1 8.312 8.118 7.912 7.439 7.192 6.929 6.62 6.269 5.898 5.398 4.447 -9 ,11364 ,TETRA ,17551161,Thu Nov 25 11:10:57 CET,Thu Nov 25 13:19:14 CET,0.0 0.914 1.324 1.717 2.071 2.367 2.631 2.863 3.314 3.534 3.729 3.512 4.263 4.445 4.776 5.091 5.406 5.547 5.805 6.048 6.377 6.573 6.754 7.033 7.302 7.562 7.84 8.119 8.443 8.717 8.995 9.32 9.611 9.891 10.213 10.558 10.906 11.29 11.704 12.143 12.564 13.032 13.554 14.059 14.659 15.298 15.967 16.676 17.494 18.375 19.232 19.587 19.485 19.229 18.935 18.637 18.326 17.952 17.605 17.264 16.952 16.661 16.338 16.006 15.705 15.44 15.17 14.893 14.631 14.343 14.036 13.794 13.531 13.242 13.027 12.81 12.571 12.309 12.023 11.828 11.63 11.304 11.057 10.796 10.663 10.39 10.121 9.824 9.655 8.892 9.129 8.925 8.704 8.263 8.029 7.784 7.513 7.194 6.854 6.425 5.467 -10 ,18668 ,TETRA ,17551163,Thu Nov 25 11:10:58 CET,Thu Nov 25 13:16:27 CET,0.0 0.694 1.148 1.506 1.804 2.08 2.337 2.578 2.995 3.195 3.393 3.182 3.936 4.098 4.423 4.726 5.004 5.144 5.437 5.714 6.103 6.334 6.538 6.835 7.109 7.366 7.613 7.856 8.169 8.465 8.735 9.044 9.344 9.63 9.954 10.298 10.634 11.002 11.385 11.795 12.21 12.656 13.159 13.675 14.298 14.938 15.656 16.455 17.246 18.093 18.898 19.221 19.119 18.815 18.519 18.19 17.819 17.412 17.052 16.677 16.317 15.985 15.657 15.353 15.067 14.8 14.511 14.246 13.992 13.714 13.438 13.201 12.948 12.693 12.5 12.283 12.045 11.823 11.597 11.425 11.259 10.995 10.794 10.587 10.476 10.245 10.003 9.722 9.573 8.847 9.08 8.895 8.712 8.313 8.089 7.857 7.592 7.246 6.865 6.44 5.548 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt deleted file mode 100644 index 89d4b37f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7249 ,TETRA ,17551170,Thu Nov 25 11:11:55 CET,Thu Nov 25 13:15:21 CET,0.0 0.906 1.307 1.685 2.025 2.29 2.533 2.75 3.151 3.333 3.516 3.31 4.059 4.221 4.526 4.807 5.063 5.184 5.424 5.65 5.97 6.185 6.383 6.65 6.903 7.13 7.346 7.548 7.791 8.034 8.268 8.545 8.812 9.059 9.347 9.651 9.912 10.19 10.501 10.842 11.176 11.54 11.931 12.277 12.667 13.06 13.451 13.824 14.152 14.391 14.33 13.733 12.987 12.21 11.445 10.72 10.058 9.372 8.779 8.177 7.629 7.149 6.655 6.156 5.702 5.29 4.846 4.412 4.027 3.637 3.178 2.794 2.409 1.962 1.574 1.149 0.71 0.263 -0.195 -0.526 -0.86 -1.366 -1.763 -2.213 -2.432 -2.886 -3.41 -3.989 -4.301 -5.187 -5.26 -5.623 -6.011 -6.94 -7.471 -7.991 -8.566 -9.241 -10.151 -11.326 -16.152 -2 ,19066 ,TETRA ,17551172,Thu Nov 25 11:11:57 CET,Thu Nov 25 13:27:37 CET,0.0 1.061 1.516 1.894 2.195 2.47 2.714 2.932 3.329 3.509 3.705 3.507 4.258 4.441 4.764 5.029 5.278 5.403 5.644 5.855 6.158 6.353 6.556 6.849 7.104 7.334 7.553 7.777 8.063 8.325 8.556 8.816 9.08 9.333 9.615 9.91 10.171 10.441 10.719 11.006 11.31 11.637 11.99 12.324 12.709 13.096 13.44 13.854 14.259 14.488 14.416 13.864 13.087 12.305 11.546 10.803 10.139 9.535 8.981 8.382 7.855 7.352 6.824 6.354 5.909 5.417 4.882 4.431 4.048 3.641 3.161 2.747 2.332 1.891 1.549 1.185 0.797 0.358 -0.149 -0.518 -0.902 -1.495 -1.901 -2.293 -2.501 -2.999 -3.539 -4.101 -4.402 -5.274 -5.326 -5.708 -6.104 -6.925 -7.438 -8.044 -8.652 -9.344 -10.275 -11.488 -15.319 -3 ,18849 ,TETRA ,17551174,Thu Nov 25 11:11:55 CET,Thu Nov 25 13:21:00 CET,0.0 1.485 1.962 2.311 2.615 2.863 3.105 3.334 3.766 3.973 4.167 3.917 4.653 4.796 5.081 5.363 5.651 5.794 6.058 6.298 6.666 6.932 7.169 7.473 7.759 8.025 8.274 8.506 8.778 9.023 9.247 9.504 9.77 10.028 10.31 10.618 10.917 11.225 11.527 11.86 12.199 12.536 12.913 13.303 13.711 14.131 14.568 14.96 15.353 15.643 15.573 15.069 14.472 13.772 13.082 12.431 11.784 11.197 10.67 10.061 9.515 9.033 8.563 8.111 7.666 7.225 6.749 6.328 5.963 5.557 5.105 4.718 4.313 3.864 3.492 3.127 2.751 2.334 1.891 1.594 1.291 0.784 0.406 -0.005 -0.218 -0.63 -1.07 -1.578 -1.848 -2.697 -2.647 -2.961 -3.301 -4.059 -4.523 -5.027 -5.593 -6.269 -7.025 -8.104 -12.127 -4 ,13874 ,TETRA ,17551176,Thu Nov 25 11:11:55 CET,Thu Nov 25 13:22:16 CET,0.0 1.438 1.822 2.16 2.523 2.842 3.094 3.338 3.774 3.965 4.144 3.907 4.642 4.781 5.06 5.32 5.562 5.683 5.93 6.171 6.491 6.683 6.888 7.221 7.505 7.735 7.963 8.185 8.453 8.687 8.897 9.165 9.422 9.662 9.971 10.302 10.574 10.854 11.144 11.456 11.789 12.154 12.521 12.867 13.298 13.736 14.155 14.561 14.916 15.144 15.104 14.511 13.771 13.01 12.241 11.511 10.838 10.184 9.562 8.946 8.421 7.902 7.388 6.918 6.483 6.06 5.572 5.113 4.731 4.347 3.888 3.46 3.014 2.563 2.201 1.832 1.428 0.974 0.52 0.225 -0.116 -0.688 -1.082 -1.529 -1.749 -2.198 -2.689 -3.205 -3.489 -4.345 -4.333 -4.66 -5.022 -5.862 -6.384 -6.965 -7.594 -8.22 -8.872 -9.84 -12.937 -5 ,16741 ,TETRA ,17551178,Thu Nov 25 11:11:54 CET,Thu Nov 25 13:15:02 CET,0.0 1.027 1.479 1.887 2.267 2.561 2.81 3.048 3.537 3.757 3.952 3.743 4.491 4.647 4.922 5.172 5.419 5.549 5.791 6.008 6.34 6.555 6.743 7.001 7.254 7.504 7.737 7.939 8.203 8.476 8.725 8.992 9.225 9.444 9.713 10.024 10.313 10.609 10.898 11.202 11.537 11.902 12.277 12.612 12.987 13.357 13.761 14.206 14.62 14.903 14.801 14.191 13.504 12.844 12.171 11.489 10.863 10.258 9.696 9.104 8.571 8.065 7.564 7.083 6.617 6.18 5.711 5.273 4.891 4.49 4.047 3.671 3.302 2.876 2.525 2.164 1.774 1.352 0.885 0.568 0.231 -0.305 -0.658 -1.033 -1.229 -1.646 -2.098 -2.608 -2.908 -3.804 -3.864 -4.199 -4.577 -5.428 -5.902 -6.433 -7.016 -7.705 -8.523 -9.626 -13.997 -6 ,11283 ,TETRA ,17551179,Thu Nov 25 11:11:55 CET,Thu Nov 25 13:16:30 CET,0.0 1.284 1.845 2.213 2.537 2.836 3.096 3.333 3.75 3.944 4.124 3.869 4.611 4.771 5.083 5.377 5.644 5.775 6.019 6.239 6.54 6.739 6.933 7.187 7.441 7.705 7.947 8.178 8.466 8.719 8.939 9.187 9.444 9.697 9.978 10.298 10.573 10.865 11.169 11.441 11.721 12.054 12.446 12.814 13.209 13.589 13.98 14.403 14.78 15.026 15.037 14.493 13.711 12.944 12.215 11.518 10.877 10.293 9.759 9.154 8.6 8.098 7.606 7.136 6.678 6.248 5.803 5.408 5.057 4.65 4.187 3.8 3.409 2.997 2.664 2.298 1.89 1.476 1.013 0.674 0.335 -0.228 -0.643 -1.057 -1.27 -1.701 -2.141 -2.631 -2.903 -3.776 -3.786 -4.117 -4.479 -5.372 -5.869 -6.329 -6.874 -7.612 -8.505 -9.739 -13.689 -7 ,24198 ,TETRA ,17551180,Thu Nov 25 11:11:55 CET,Thu Nov 25 13:14:53 CET,0.0 1.626 2.177 2.573 2.883 3.138 3.374 3.616 4.045 4.24 4.437 4.214 4.945 5.111 5.42 5.701 5.965 6.099 6.363 6.618 7.01 7.242 7.434 7.713 8.002 8.256 8.498 8.722 8.967 9.227 9.511 9.832 10.125 10.39 10.67 10.982 11.241 11.515 11.814 12.13 12.465 12.813 13.179 13.547 13.952 14.337 14.736 15.169 15.598 15.838 15.76 15.156 14.377 13.629 12.919 12.214 11.558 10.948 10.381 9.784 9.247 8.757 8.278 7.822 7.403 6.986 6.513 6.065 5.674 5.282 4.853 4.495 4.102 3.684 3.367 3.039 2.686 2.283 1.839 1.529 1.206 0.659 0.262 -0.131 -0.326 -0.723 -1.145 -1.631 -1.901 -2.738 -2.711 -3.028 -3.362 -4.132 -4.556 -5.012 -5.554 -6.193 -6.898 -7.851 -11.082 -8 ,22055 ,TETRA ,17551181,Thu Nov 25 11:11:55 CET,Thu Nov 25 13:15:54 CET,0.0 1.139 1.616 1.938 2.24 2.543 2.809 3.03 3.435 3.665 3.902 3.688 4.432 4.581 4.868 5.15 5.415 5.542 5.787 6.024 6.353 6.558 6.756 7.024 7.258 7.485 7.704 7.916 8.194 8.452 8.705 9.008 9.292 9.55 9.829 10.139 10.416 10.701 11.013 11.322 11.61 11.915 12.271 12.609 12.972 13.372 13.786 14.171 14.526 14.772 14.751 14.154 13.377 12.7 12.023 11.334 10.696 10.043 9.438 8.785 8.195 7.692 7.225 6.766 6.344 5.966 5.51 5.091 4.737 4.324 3.89 3.547 3.163 2.741 2.401 2.019 1.619 1.227 0.799 0.457 0.117 -0.42 -0.817 -1.216 -1.432 -1.861 -2.284 -2.788 -3.073 -3.93 -3.976 -4.327 -4.678 -5.465 -5.934 -6.437 -6.952 -7.576 -8.385 -9.444 -14.185 -9 ,9168 ,TETRA ,17551182,Thu Nov 25 11:11:55 CET,Thu Nov 25 13:13:36 CET,0.0 0.894 1.327 1.796 2.195 2.503 2.76 3.0 3.406 3.584 3.761 3.505 4.252 4.409 4.699 4.984 5.253 5.377 5.608 5.834 6.153 6.346 6.526 6.771 7.009 7.245 7.459 7.667 7.938 8.19 8.437 8.743 9.034 9.278 9.533 9.816 10.081 10.369 10.691 11.027 11.326 11.665 12.057 12.386 12.752 13.181 13.59 13.94 14.252 14.501 14.554 14.105 13.447 12.752 12.006 11.27 10.582 9.927 9.368 8.771 8.26 7.792 7.308 6.842 6.419 6.021 5.552 5.111 4.751 4.38 3.978 3.617 3.217 2.784 2.424 2.052 1.672 1.256 0.799 0.471 0.129 -0.4 -0.767 -1.152 -1.358 -1.771 -2.19 -2.638 -2.882 -3.731 -3.719 -4.032 -4.367 -5.082 -5.496 -5.948 -6.434 -7.058 -7.86 -8.865 -12.669 -10 ,5961 ,TETRA ,17551183,Thu Nov 25 11:11:55 CET,Thu Nov 25 13:14:08 CET,0.0 1.107 1.653 2.026 2.325 2.604 2.869 3.105 3.469 3.637 3.822 3.598 4.341 4.488 4.779 5.053 5.302 5.427 5.672 5.909 6.242 6.455 6.659 6.924 7.178 7.411 7.634 7.859 8.139 8.398 8.644 8.918 9.187 9.454 9.732 10.033 10.31 10.605 10.928 11.241 11.532 11.874 12.293 12.685 13.089 13.497 13.918 14.318 14.703 15.008 14.989 14.467 13.796 13.056 12.306 11.632 11.02 10.426 9.872 9.285 8.769 8.266 7.766 7.294 6.83 6.39 5.878 5.42 5.027 4.624 4.186 3.794 3.383 2.951 2.619 2.267 1.862 1.428 0.998 0.697 0.37 -0.19 -0.583 -0.988 -1.188 -1.604 -2.054 -2.526 -2.801 -3.665 -3.686 -3.991 -4.298 -4.983 -5.382 -5.865 -6.421 -7.026 -7.706 -8.759 -12.535 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt deleted file mode 100644 index e04e3784..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8474 ,TETRA ,17551184,Thu Nov 25 11:11:55 CET,Thu Nov 25 13:15:59 CET,0.0 1.151 1.67 2.042 2.418 2.76 3.034 3.278 3.746 3.945 4.127 3.909 4.638 4.787 5.086 5.373 5.639 5.769 6.016 6.252 6.6 6.829 7.045 7.344 7.628 7.904 8.17 8.411 8.709 8.998 9.266 9.586 9.873 10.14 10.476 10.823 11.126 11.467 11.811 12.179 12.548 12.913 13.331 13.734 14.176 14.651 15.136 15.6 16.047 16.378 16.38 15.854 15.122 14.42 13.712 12.987 12.327 11.685 11.127 10.569 10.059 9.533 9.002 8.509 8.027 7.57 7.084 6.655 6.283 5.865 5.426 5.068 4.698 4.298 3.95 3.58 3.185 2.77 2.346 2.038 1.696 1.129 0.757 0.372 0.172 -0.221 -0.641 -1.102 -1.346 -2.182 -2.139 -2.435 -2.774 -3.557 -3.937 -4.341 -4.815 -5.368 -6.033 -6.864 -9.597 -2 ,30173 ,TETRA ,17551186,Thu Nov 25 11:13:01 CET,Thu Nov 25 13:16:51 CET,0.0 1.195 1.701 2.151 2.527 2.823 3.095 3.355 3.839 4.039 4.232 4.038 4.799 4.971 5.302 5.601 5.852 5.981 6.253 6.506 6.854 7.072 7.279 7.59 7.903 8.187 8.453 8.713 9.017 9.283 9.539 9.837 10.119 10.408 10.733 11.064 11.361 11.682 12.022 12.35 12.667 13.023 13.427 13.781 14.181 14.621 15.045 15.434 15.828 16.117 16.03 15.396 14.584 13.722 12.91 12.168 11.47 10.795 10.209 9.597 9.045 8.54 8.051 7.594 7.156 6.724 6.241 5.806 5.437 5.054 4.656 4.316 3.906 3.449 3.098 2.73 2.348 1.931 1.495 1.184 0.856 0.348 -0.034 -0.446 -0.656 -1.104 -1.579 -2.09 -2.346 -3.168 -3.159 -3.478 -3.819 -4.589 -5.028 -5.474 -5.954 -6.501 -7.133 -8.041 -12.078 -3 ,8465 ,TETRA ,17551188,Thu Nov 25 11:13:01 CET,Thu Nov 25 13:19:52 CET,0.0 1.312 1.827 2.281 2.647 2.949 3.236 3.502 4.002 4.26 4.481 4.28 5.037 5.214 5.537 5.835 6.107 6.26 6.573 6.836 7.235 7.486 7.696 8.01 8.286 8.529 8.797 9.075 9.41 9.717 10.003 10.354 10.695 10.976 11.294 11.633 11.907 12.203 12.54 12.887 13.217 13.587 13.991 14.38 14.865 15.322 15.751 16.187 16.58 16.874 16.873 16.395 15.673 14.892 14.119 13.41 12.807 12.233 11.635 10.958 10.343 9.788 9.256 8.792 8.352 7.896 7.429 6.994 6.594 6.182 5.736 5.37 4.97 4.519 4.175 3.812 3.446 3.043 2.575 2.254 1.926 1.372 0.988 0.599 0.384 -0.057 -0.532 -1.07 -1.359 -2.207 -2.179 -2.475 -2.815 -3.629 -4.105 -4.601 -5.122 -5.716 -6.366 -7.212 -9.896 -4 ,20713 ,TETRA ,17551190,Thu Nov 25 11:13:01 CET,Thu Nov 25 13:16:55 CET,0.0 1.237 1.727 2.122 2.455 2.781 3.067 3.314 3.786 4.009 4.23 4.048 4.78 4.95 5.316 5.656 5.954 6.108 6.393 6.64 7.009 7.253 7.472 7.784 8.082 8.354 8.619 8.852 9.13 9.418 9.703 10.03 10.309 10.565 10.884 11.241 11.548 11.849 12.174 12.503 12.87 13.288 13.718 14.134 14.589 15.048 15.52 15.999 16.468 16.831 16.864 16.31 15.562 14.849 14.209 13.496 12.754 12.032 11.417 10.819 10.286 9.768 9.256 8.783 8.355 7.972 7.558 7.148 6.777 6.405 6.002 5.648 5.252 4.83 4.501 4.154 3.791 3.397 2.933 2.611 2.306 1.788 1.404 0.968 0.748 0.323 -0.109 -0.575 -0.838 -1.682 -1.655 -1.94 -2.294 -3.191 -3.699 -4.211 -4.706 -5.305 -6.016 -7.036 -10.141 -5 ,5783 ,TETRA ,17551193,Thu Nov 25 11:13:01 CET,Thu Nov 25 13:25:59 CET,0.0 1.017 1.485 1.85 2.171 2.471 2.762 3.035 3.499 3.705 3.908 3.703 4.475 4.656 5.001 5.319 5.633 5.785 6.054 6.314 6.695 6.92 7.127 7.416 7.703 8.01 8.275 8.492 8.776 9.049 9.314 9.628 9.892 10.173 10.527 10.866 11.157 11.47 11.802 12.147 12.485 12.83 13.251 13.687 14.151 14.598 15.028 15.448 15.905 16.265 16.219 15.608 14.791 13.956 13.163 12.407 11.706 11.056 10.497 9.911 9.33 8.783 8.253 7.745 7.286 6.869 6.415 6.005 5.641 5.232 4.789 4.422 4.049 3.658 3.334 2.983 2.608 2.212 1.803 1.498 1.168 0.624 0.217 -0.208 -0.449 -0.95 -1.453 -1.976 -2.24 -3.088 -3.11 -3.441 -3.788 -4.53 -4.952 -5.432 -5.952 -6.543 -7.246 -8.115 -10.737 -6 ,27654 ,TETRA ,17551195,Thu Nov 25 11:13:01 CET,Thu Nov 25 13:17:08 CET,0.0 0.911 1.435 1.846 2.179 2.503 2.809 3.075 3.524 3.725 3.903 3.661 4.395 4.56 4.879 5.161 5.409 5.537 5.796 6.05 6.397 6.606 6.799 7.081 7.358 7.635 7.893 8.143 8.472 8.781 9.056 9.358 9.65 9.915 10.225 10.571 10.898 11.234 11.548 11.897 12.263 12.638 13.036 13.416 13.841 14.272 14.717 15.137 15.464 15.649 15.511 14.778 13.823 12.985 12.287 11.534 10.747 10.042 9.446 8.856 8.33 7.822 7.311 6.798 6.303 5.82 5.299 4.834 4.43 3.988 3.489 3.082 2.685 2.29 1.954 1.569 1.17 0.733 0.255 -0.102 -0.461 -0.994 -1.383 -1.78 -1.98 -2.419 -2.921 -3.45 -3.719 -4.618 -4.728 -5.07 -5.41 -6.114 -6.506 -6.95 -7.499 -8.2 -9.047 -10.028 -13.361 -7 ,14460 ,TETRA ,17551197,Thu Nov 25 11:13:01 CET,Thu Nov 25 13:15:57 CET,0.0 1.228 1.767 2.181 2.519 2.845 3.15 3.395 3.873 4.094 4.285 4.094 4.83 4.985 5.279 5.562 5.854 6.005 6.281 6.522 6.865 7.076 7.277 7.566 7.844 8.123 8.379 8.611 8.894 9.177 9.455 9.787 10.116 10.411 10.738 11.117 11.458 11.802 12.174 12.588 12.992 13.378 13.805 14.253 14.761 15.255 15.731 16.132 16.485 16.764 16.701 16.091 15.315 14.4 13.487 12.66 11.937 11.276 10.67 10.002 9.397 8.833 8.274 7.739 7.255 6.838 6.364 5.887 5.478 5.062 4.6 4.186 3.778 3.331 2.956 2.585 2.211 1.827 1.405 1.092 0.746 0.132 -0.29 -0.67 -0.86 -1.251 -1.653 -2.082 -2.32 -3.156 -3.141 -3.445 -3.772 -4.509 -4.912 -5.328 -5.777 -6.327 -7.022 -7.893 -11.33 -8 ,9728 ,TETRA ,17551199,Thu Nov 25 11:13:01 CET,Thu Nov 25 13:15:16 CET,0.0 0.962 1.421 1.837 2.214 2.524 2.771 3.013 3.474 3.68 3.869 3.666 4.414 4.582 4.887 5.181 5.456 5.588 5.84 6.081 6.412 6.616 6.823 7.141 7.44 7.707 7.956 8.202 8.51 8.811 9.107 9.435 9.716 9.98 10.288 10.626 10.928 11.247 11.577 11.913 12.258 12.63 13.028 13.383 13.832 14.322 14.804 15.298 15.709 15.92 15.801 15.074 14.262 13.45 12.581 11.762 11.019 10.256 9.576 8.877 8.278 7.777 7.276 6.774 6.304 5.848 5.364 4.936 4.527 4.094 3.648 3.239 2.803 2.349 1.962 1.559 1.17 0.778 0.347 0.039 -0.271 -0.756 -1.117 -1.512 -1.709 -2.108 -2.531 -2.994 -3.249 -4.09 -4.03 -4.329 -4.659 -5.316 -5.68 -6.153 -6.721 -7.317 -8.007 -8.995 -13.241 -9 ,28857 ,TETRA ,17551201,Thu Nov 25 11:13:52 CET,Thu Nov 25 13:30:36 CET,0.0 1.156 1.616 1.983 2.294 2.607 2.911 3.172 3.658 3.863 4.049 3.867 4.643 4.831 5.199 5.508 5.788 5.921 6.156 6.392 6.754 6.979 7.192 7.503 7.802 8.087 8.363 8.632 8.958 9.237 9.476 9.759 10.021 10.275 10.581 10.916 11.243 11.58 11.914 12.251 12.605 12.993 13.404 13.812 14.273 14.686 15.077 15.499 15.933 16.213 16.194 15.645 14.9 14.124 13.354 12.634 11.937 11.298 10.732 10.118 9.576 9.072 8.556 8.033 7.533 7.069 6.588 6.151 5.74 5.312 4.873 4.474 4.057 3.631 3.291 2.906 2.519 2.121 1.66 1.334 1.011 0.502 0.125 -0.258 -0.453 -0.876 -1.337 -1.836 -2.101 -2.953 -3.015 -3.342 -3.697 -4.538 -4.993 -5.449 -5.986 -6.691 -7.527 -8.688 -12.624 -10 ,31968 ,TETRA ,17551203,Thu Nov 25 11:13:53 CET,Thu Nov 25 13:17:53 CET,0.0 1.563 2.097 2.553 2.949 3.314 3.667 3.956 4.437 4.66 4.871 4.688 5.446 5.639 5.974 6.252 6.522 6.662 6.922 7.179 7.529 7.739 7.949 8.246 8.525 8.803 9.084 9.331 9.607 9.864 10.114 10.42 10.703 10.938 11.213 11.526 11.846 12.208 12.553 12.882 13.185 13.522 13.926 14.297 14.685 15.088 15.518 15.927 16.309 16.571 16.478 15.827 15.016 14.184 13.406 12.655 11.983 11.314 10.701 10.058 9.442 8.878 8.331 7.792 7.281 6.814 6.32 5.849 5.43 5.004 4.58 4.224 3.824 3.37 2.993 2.585 2.169 1.764 1.31 0.972 0.598 -0.012 -0.425 -0.863 -1.093 -1.563 -2.116 -2.722 -3.009 -3.865 -3.96 -4.328 -4.704 -5.486 -5.915 -6.433 -6.998 -7.627 -8.328 -9.237 -12.747 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23467_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23467_23466.txt deleted file mode 100644 index 8bb4699c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23467_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19331 ,TETRA ,17551208,Thu Nov 25 11:13:52 CET,Thu Nov 25 13:05:59 CET,0.0 0.755 1.122 1.388 1.619 1.824 2.027 2.236 2.608 2.795 2.963 2.636 3.325 3.436 3.646 3.842 4.032 4.13 4.312 4.476 4.7 4.836 4.979 5.192 5.38 5.572 5.752 5.913 6.122 6.318 6.511 6.747 6.961 7.142 7.362 7.618 7.848 8.079 8.313 8.573 8.833 9.095 9.39 9.686 9.999 10.302 10.566 10.817 11.075 11.223 11.096 10.521 9.827 9.165 8.535 7.924 7.346 6.777 6.259 5.757 5.332 4.933 4.547 4.162 3.789 3.43 3.048 2.718 2.439 2.142 1.8 1.51 1.217 0.914 0.671 0.426 0.178 -0.098 -0.381 -0.571 -0.765 -1.078 -1.289 -1.492 -1.605 -1.881 -2.176 -2.476 -2.652 -3.433 -3.267 -3.452 -3.628 -4.038 -4.278 -4.523 -4.777 -5.094 -5.587 -6.296 -9.163 -2 ,32570 ,TETRA ,17551210,Thu Nov 25 11:13:52 CET,Thu Nov 25 13:07:59 CET,0.0 0.492 0.848 1.131 1.382 1.609 1.812 2.017 2.38 2.547 2.689 2.381 3.102 3.25 3.511 3.733 3.945 4.047 4.223 4.405 4.692 4.863 5.007 5.228 5.453 5.645 5.826 6.01 6.237 6.437 6.629 6.839 7.036 7.224 7.434 7.675 7.899 8.134 8.383 8.663 8.948 9.241 9.567 9.849 10.128 10.454 10.827 11.175 11.412 11.533 11.417 10.916 10.3 9.663 9.081 8.493 7.934 7.395 6.885 6.4 6.007 5.612 5.208 4.823 4.473 4.152 3.795 3.471 3.188 2.884 2.565 2.308 2.036 1.742 1.483 1.204 0.924 0.633 0.328 0.109 -0.106 -0.455 -0.72 -0.989 -1.122 -1.415 -1.722 -2.071 -2.27 -3.042 -2.93 -3.152 -3.387 -3.917 -4.197 -4.493 -4.81 -5.176 -5.616 -6.234 -7.992 -3 ,24889 ,TETRA ,17551212,Thu Nov 25 11:14:52 CET,Thu Nov 25 13:16:47 CET,0.0 0.449 0.771 1.091 1.434 1.688 1.861 2.014 2.294 2.429 2.554 2.2 2.883 2.992 3.206 3.409 3.603 3.695 3.865 4.016 4.23 4.372 4.504 4.681 4.841 5.008 5.17 5.321 5.515 5.698 5.871 6.075 6.275 6.46 6.671 6.918 7.143 7.367 7.592 7.81 8.043 8.311 8.621 8.9 9.216 9.574 9.903 10.178 10.427 10.605 10.472 10.002 9.441 8.814 8.174 7.536 6.937 6.363 5.867 5.385 4.931 4.493 4.09 3.73 3.394 3.071 2.712 2.389 2.11 1.806 1.475 1.204 0.921 0.604 0.348 0.084 -0.195 -0.482 -0.772 -0.984 -1.215 -1.584 -1.839 -2.121 -2.271 -2.548 -2.831 -3.132 -3.294 -4.058 -3.896 -4.112 -4.335 -4.805 -5.063 -5.346 -5.671 -6.05 -6.525 -7.115 -8.819 -4 ,29253 ,TETRA ,17551214,Thu Nov 25 11:14:52 CET,Thu Nov 25 13:13:13 CET,0.0 1.629 2.127 2.468 2.738 2.963 3.158 3.305 3.584 3.723 3.856 3.535 4.237 4.346 4.56 4.778 4.975 5.068 5.238 5.411 5.666 5.817 5.959 6.148 6.335 6.518 6.697 6.87 7.074 7.262 7.454 7.666 7.852 8.054 8.31 8.59 8.836 9.085 9.303 9.531 9.805 10.077 10.368 10.671 11.008 11.324 11.607 11.874 12.109 12.299 12.225 11.649 10.965 10.298 9.716 9.128 8.519 7.951 7.463 6.941 6.482 6.073 5.686 5.329 4.98 4.666 4.34 4.026 3.743 3.434 3.107 2.831 2.535 2.207 1.955 1.693 1.431 1.17 0.89 0.684 0.462 0.118 -0.121 -0.364 -0.501 -0.787 -1.076 -1.415 -1.596 -2.346 -2.158 -2.382 -2.632 -3.157 -3.439 -3.755 -4.106 -4.502 -4.976 -5.75 -8.738 -5 ,30059 ,TETRA ,17551217,Thu Nov 25 11:14:53 CET,Thu Nov 25 13:13:08 CET,0.0 0.585 0.896 1.236 1.576 1.864 2.1 2.277 2.603 2.751 2.883 2.547 3.219 3.317 3.513 3.693 3.858 3.941 4.104 4.263 4.524 4.697 4.856 5.07 5.268 5.462 5.632 5.792 6.005 6.206 6.398 6.622 6.845 7.062 7.3 7.553 7.783 8.03 8.299 8.56 8.807 9.069 9.365 9.662 9.981 10.337 10.67 10.922 11.16 11.274 11.091 10.582 9.967 9.286 8.547 7.791 7.111 6.492 5.94 5.371 4.861 4.402 3.961 3.525 3.098 2.733 2.366 2.034 1.736 1.411 1.094 0.836 0.555 0.254 0.02 -0.217 -0.468 -0.755 -1.066 -1.294 -1.532 -1.889 -2.133 -2.377 -2.513 -2.788 -3.062 -3.362 -3.519 -4.259 -4.01 -4.208 -4.419 -4.859 -5.09 -5.339 -5.62 -5.964 -6.465 -7.074 -8.593 -6 ,16159 ,TETRA ,17551219,Thu Nov 25 11:14:52 CET,Thu Nov 25 13:20:01 CET,0.0 1.611 2.085 2.41 2.729 2.994 3.197 3.355 3.667 3.814 3.945 3.617 4.325 4.454 4.684 4.898 5.101 5.197 5.382 5.555 5.788 5.931 6.075 6.279 6.481 6.676 6.859 7.038 7.284 7.517 7.719 7.937 8.127 8.305 8.517 8.767 9.024 9.295 9.562 9.835 10.099 10.391 10.699 10.987 11.305 11.594 11.898 12.182 12.4 12.468 12.262 11.715 11.051 10.397 9.745 9.112 8.557 8.052 7.608 7.143 6.727 6.348 5.959 5.6 5.276 4.963 4.614 4.289 4.016 3.728 3.403 3.13 2.84 2.513 2.254 1.996 1.731 1.464 1.185 0.987 0.775 0.424 0.181 -0.088 -0.24 -0.544 -0.856 -1.19 -1.371 -2.166 -1.963 -2.158 -2.383 -2.922 -3.213 -3.5 -3.822 -4.216 -4.666 -5.24 -6.536 -7 ,1384 ,TETRA ,17551221,Thu Nov 25 11:14:52 CET,Thu Nov 25 13:07:34 CET,0.0 0.723 1.072 1.349 1.597 1.828 2.051 2.237 2.532 2.648 2.772 2.441 3.126 3.243 3.463 3.664 3.857 3.954 4.132 4.307 4.565 4.716 4.866 5.096 5.311 5.503 5.664 5.825 6.051 6.247 6.415 6.62 6.821 7.01 7.207 7.424 7.647 7.873 8.112 8.367 8.611 8.87 9.17 9.446 9.753 10.106 10.443 10.75 11.055 11.22 11.047 10.43 9.801 9.178 8.565 8.001 7.45 6.895 6.394 5.878 5.441 5.059 4.67 4.281 3.914 3.552 3.168 2.845 2.561 2.278 1.98 1.711 1.42 1.11 0.875 0.631 0.368 0.089 -0.196 -0.38 -0.573 -0.885 -1.107 -1.349 -1.47 -1.717 -1.982 -2.268 -2.419 -3.156 -2.931 -3.12 -3.311 -3.719 -3.946 -4.196 -4.455 -4.776 -5.212 -5.892 -8.367 -8 ,1314 ,TETRA ,17551223,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 13:21:47 CET,0.0 1.555 2.112 2.53 2.832 3.066 3.257 3.439 3.783 3.927 4.071 3.76 4.458 4.585 4.817 5.016 5.203 5.292 5.469 5.644 5.885 6.023 6.149 6.349 6.531 6.69 6.856 7.016 7.211 7.407 7.583 7.79 7.99 8.179 8.409 8.678 8.916 9.175 9.445 9.703 9.974 10.265 10.59 10.895 11.259 11.642 11.991 12.31 12.568 12.718 12.649 12.27 11.751 11.168 10.564 9.946 9.394 8.87 8.388 7.895 7.457 7.058 6.668 6.298 5.958 5.632 5.261 4.929 4.648 4.347 4.022 3.75 3.47 3.153 2.895 2.629 2.346 2.056 1.742 1.524 1.307 0.932 0.683 0.445 0.323 0.074 -0.203 -0.515 -0.705 -1.492 -1.329 -1.541 -1.755 -2.236 -2.511 -2.811 -3.142 -3.526 -3.987 -4.537 -5.715 -9 ,31890 ,TETRA ,17551225,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 13:20:27 CET,0.0 0.661 0.938 1.194 1.438 1.685 1.926 2.12 2.469 2.621 2.766 2.448 3.143 3.253 3.47 3.694 3.91 4.01 4.195 4.371 4.618 4.775 4.931 5.15 5.345 5.527 5.697 5.87 6.105 6.312 6.505 6.772 7.009 7.208 7.449 7.705 7.934 8.181 8.448 8.729 9.03 9.357 9.663 9.951 10.28 10.609 10.935 11.235 11.517 11.662 11.577 11.042 10.388 9.78 9.193 8.551 7.94 7.393 6.911 6.424 5.982 5.556 5.174 4.829 4.485 4.149 3.767 3.44 3.17 2.856 2.544 2.277 1.971 1.667 1.413 1.15 0.887 0.599 0.264 0.024 -0.198 -0.574 -0.842 -1.11 -1.25 -1.54 -1.863 -2.199 -2.377 -3.148 -2.991 -3.21 -3.435 -3.958 -4.273 -4.593 -4.93 -5.34 -5.872 -6.697 -9.995 -10 ,4300 ,TETRA ,17551226,Thu Nov 25 11:15:53 CET,Thu Nov 25 13:21:02 CET,0.0 0.821 1.226 1.51 1.772 2.01 2.214 2.396 2.719 2.864 3.002 2.688 3.377 3.488 3.7 3.914 4.123 4.215 4.402 4.59 4.812 4.936 5.066 5.267 5.463 5.657 5.832 6.01 6.239 6.453 6.662 6.895 7.094 7.282 7.511 7.744 7.966 8.215 8.479 8.741 9.002 9.294 9.619 9.941 10.285 10.616 10.944 11.231 11.508 11.661 11.44 10.849 10.148 9.474 8.822 8.162 7.572 7.005 6.485 5.966 5.496 5.04 4.594 4.194 3.794 3.422 3.042 2.697 2.393 2.061 1.713 1.434 1.145 0.808 0.546 0.29 0.016 -0.278 -0.571 -0.774 -0.994 -1.359 -1.616 -1.884 -2.024 -2.317 -2.632 -2.931 -3.089 -3.852 -3.709 -3.927 -4.149 -4.624 -4.898 -5.221 -5.554 -5.91 -6.347 -6.947 -8.64 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23466.txt deleted file mode 100644 index 88d800c4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24717 ,KEBNE ,17019431,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:24:56 CET,0.0 1.873 2.609 3.127 3.475 3.732 3.969 4.201 4.638 4.837 5.044 4.877 5.605 5.778 6.113 6.432 6.719 6.861 7.132 7.394 7.763 8.0 8.237 8.582 8.911 9.199 9.465 9.729 10.068 10.395 10.706 11.072 11.425 11.779 12.18 12.618 13.049 13.515 14.031 14.585 15.156 15.797 16.541 17.294 18.222 19.262 20.449 21.805 23.445 25.386 27.503 29.104 29.916 30.34 30.483 30.448 30.398 30.276 30.007 29.667 29.378 29.136 28.912 28.644 28.343 28.067 27.759 27.478 27.255 27.013 26.737 26.479 26.19 25.882 25.626 25.318 24.986 24.681 24.372 24.137 23.875 23.461 23.172 22.861 22.705 22.352 21.975 21.59 21.381 20.661 20.735 20.486 20.211 19.619 19.271 18.852 18.429 17.937 17.172 15.923 10.993 -2 ,30648 ,KEBNE ,17019432,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:24:44 CET,0.0 0.846 1.226 1.545 1.817 2.062 2.305 2.528 2.951 3.15 3.33 3.107 3.815 3.981 4.311 4.587 4.85 4.984 5.233 5.476 5.819 6.039 6.253 6.558 6.846 7.103 7.353 7.611 7.935 8.243 8.546 8.904 9.247 9.578 9.965 10.416 10.84 11.312 11.843 12.395 12.952 13.556 14.281 15.043 15.907 16.813 17.871 19.143 20.589 22.215 24.052 25.358 25.89 26.063 26.075 25.946 25.749 25.51 25.29 25.042 24.778 24.504 24.221 23.986 23.737 23.457 23.158 22.876 22.609 22.307 21.999 21.743 21.469 21.178 20.94 20.674 20.398 20.116 19.824 19.619 19.392 18.998 18.701 18.391 18.232 17.906 17.555 17.206 17.039 16.337 16.425 16.185 15.915 15.299 14.918 14.465 13.956 13.325 12.686 11.906 5.003 -3 ,19467 ,KEBNE ,17019433,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:23:17 CET,0.0 2.251 2.89 3.352 3.712 4.002 4.237 4.456 4.836 5.003 5.158 4.905 5.582 5.732 6.036 6.306 6.563 6.69 6.927 7.148 7.468 7.671 7.876 8.171 8.442 8.732 9.01 9.247 9.551 9.854 10.168 10.536 10.846 11.141 11.494 11.9 12.298 12.748 13.247 13.759 14.289 14.878 15.562 16.307 17.173 18.095 19.18 20.432 21.929 23.674 25.584 26.899 27.443 27.608 27.593 27.481 27.304 27.069 26.845 26.568 26.234 25.902 25.62 25.327 24.994 24.701 24.411 24.114 23.829 23.518 23.187 22.913 22.639 22.355 22.107 21.83 21.558 21.261 20.944 20.734 20.487 20.101 19.851 19.566 19.412 19.106 18.769 18.396 18.198 17.481 17.562 17.314 17.05 16.47 16.171 15.817 15.418 15.005 14.434 13.424 9.083 -4 ,27449 ,KEBNE ,17019434,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:23:48 CET,0.0 1.578 2.07 2.405 2.7 2.943 3.17 3.392 3.794 3.962 4.126 3.917 4.597 4.724 4.981 5.245 5.504 5.626 5.848 6.059 6.37 6.563 6.752 7.025 7.291 7.557 7.809 8.044 8.358 8.673 8.972 9.317 9.648 9.971 10.347 10.784 11.189 11.639 12.124 12.644 13.194 13.793 14.517 15.267 16.158 17.152 18.282 19.578 21.084 22.792 24.744 25.947 26.291 26.406 26.353 26.151 25.945 25.728 25.488 25.195 24.87 24.538 24.21 23.887 23.598 23.335 23.021 22.701 22.412 22.122 21.815 21.549 21.26 20.94 20.674 20.398 20.128 19.837 19.54 19.313 19.073 18.736 18.486 18.199 18.048 17.72 17.388 17.067 16.878 16.15 16.222 15.961 15.685 15.133 14.806 14.436 13.939 13.271 12.464 11.493 8.113 -5 ,12225 ,KEBNE ,17019435,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:23:16 CET,0.0 1.923 2.395 2.697 2.989 3.288 3.526 3.719 4.078 4.247 4.39 4.137 4.825 4.965 5.247 5.516 5.753 5.873 6.116 6.34 6.645 6.834 7.029 7.296 7.536 7.779 8.026 8.27 8.577 8.873 9.163 9.514 9.853 10.182 10.576 11.02 11.437 11.875 12.359 12.893 13.414 14.031 14.801 15.545 16.359 17.291 18.415 19.651 21.034 22.664 24.519 25.658 26.172 26.406 26.416 26.31 26.111 25.867 25.631 25.348 25.067 24.77 24.454 24.152 23.853 23.56 23.268 23.003 22.768 22.507 22.209 21.961 21.698 21.405 21.176 20.936 20.669 20.397 20.114 19.909 19.687 19.35 19.105 18.829 18.682 18.374 18.038 17.644 17.449 16.733 16.714 16.457 16.225 15.675 15.344 14.991 14.665 14.334 13.811 13.048 9.792 -6 ,20804 ,KEBNE ,17019436,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:23:22 CET,0.0 0.949 1.393 1.706 1.996 2.275 2.538 2.766 3.17 3.359 3.538 3.331 4.048 4.207 4.474 4.721 4.975 5.101 5.345 5.579 5.927 6.158 6.37 6.671 6.959 7.229 7.484 7.735 8.06 8.371 8.677 9.058 9.396 9.698 10.064 10.467 10.85 11.297 11.781 12.288 12.845 13.469 14.187 14.914 15.787 16.761 17.836 19.064 20.495 22.099 23.851 24.927 25.334 25.403 25.285 25.08 24.808 24.494 24.197 23.912 23.639 23.377 23.14 22.904 22.618 22.319 22.003 21.711 21.457 21.178 20.885 20.636 20.366 20.061 19.811 19.559 19.305 19.028 18.714 18.487 18.248 17.856 17.578 17.302 17.15 16.809 16.439 16.043 15.841 15.118 15.207 14.979 14.757 14.244 13.898 13.516 13.148 12.723 12.144 11.396 8.561 -7 ,13469 ,KEBNE ,17019437,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:23:45 CET,0.0 0.887 1.294 1.652 1.961 2.224 2.46 2.675 3.066 3.256 3.451 3.308 4.025 4.185 4.483 4.758 5.009 5.134 5.382 5.621 5.982 6.214 6.422 6.722 7.019 7.317 7.632 7.93 8.274 8.602 8.923 9.307 9.663 10.008 10.419 10.873 11.302 11.761 12.241 12.773 13.336 13.976 14.77 15.601 16.546 17.573 18.768 20.073 21.524 23.278 25.251 26.641 27.26 27.407 27.324 27.117 26.849 26.562 26.264 25.951 25.703 25.446 25.164 24.888 24.608 24.325 23.997 23.701 23.446 23.16 22.832 22.553 22.282 22.003 21.766 21.494 21.215 20.924 20.613 20.378 20.118 19.726 19.433 19.086 18.917 18.61 18.26 17.863 17.635 16.868 16.889 16.63 16.321 15.616 15.258 14.849 14.369 13.809 13.054 12.046 5.398 -8 ,26842 ,KEBNE ,17019438,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:23:42 CET,0.0 1.032 1.533 1.934 2.227 2.509 2.782 3.012 3.407 3.596 3.794 3.635 4.365 4.535 4.871 5.174 5.442 5.582 5.862 6.115 6.477 6.709 6.937 7.255 7.548 7.821 8.079 8.341 8.681 9.015 9.337 9.721 10.075 10.415 10.827 11.265 11.676 12.135 12.631 13.188 13.782 14.422 15.17 15.917 16.792 17.794 18.944 20.219 21.724 23.505 25.372 26.582 27.024 27.143 27.057 26.853 26.637 26.417 26.186 25.914 25.642 25.35 25.048 24.745 24.465 24.189 23.863 23.587 23.368 23.111 22.824 22.577 22.299 21.978 21.731 21.49 21.22 20.937 20.635 20.403 20.155 19.777 19.502 19.193 19.036 18.721 18.383 18.013 17.811 17.094 17.189 16.921 16.612 15.932 15.593 15.245 14.815 14.293 13.62 12.644 8.33 -9 ,9070 ,KEBNE ,17019439,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:25:35 CET,0.0 0.932 1.299 1.591 1.857 2.104 2.35 2.59 3.017 3.229 3.431 3.244 3.95 4.101 4.403 4.701 5.024 5.181 5.427 5.674 6.039 6.269 6.489 6.784 7.055 7.33 7.614 7.884 8.232 8.572 8.908 9.324 9.683 10.019 10.42 10.858 11.301 11.781 12.284 12.824 13.392 14.056 14.845 15.61 16.499 17.484 18.598 19.855 21.333 22.997 24.728 25.948 26.535 26.805 26.88 26.775 26.551 26.284 26.039 25.769 25.49 25.249 25.008 24.717 24.431 24.181 23.88 23.575 23.339 23.109 22.836 22.566 22.265 21.971 21.755 21.525 21.281 21.006 20.671 20.447 20.24 19.908 19.652 19.378 19.238 18.923 18.565 18.178 17.982 17.284 17.395 17.172 16.942 16.417 16.102 15.728 15.29 14.764 14.094 12.991 8.075 -10 ,8999 ,KEBNE ,17019440,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:24:36 CET,0.0 0.947 1.334 1.677 1.975 2.234 2.483 2.716 3.117 3.33 3.555 3.401 4.107 4.274 4.617 4.93 5.214 5.355 5.624 5.883 6.253 6.492 6.738 7.082 7.391 7.674 7.933 8.188 8.508 8.816 9.114 9.489 9.851 10.18 10.554 10.98 11.41 11.891 12.424 12.98 13.531 14.168 14.946 15.741 16.655 17.624 18.724 20.022 21.532 23.212 24.99 26.211 26.725 26.817 26.756 26.564 26.271 25.951 25.638 25.283 24.981 24.721 24.446 24.186 23.924 23.655 23.351 23.053 22.779 22.491 22.188 21.93 21.659 21.339 21.07 20.804 20.545 20.278 19.965 19.749 19.529 19.126 18.846 18.56 18.402 18.058 17.681 17.276 17.067 16.329 16.386 16.117 15.834 15.226 14.884 14.478 14.051 13.566 12.939 12.13 8.44 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23471.txt deleted file mode 100644 index 0b08aff5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15334 ,KEBNE ,17043846,Thu Dec 23 05:32:12 CET,Thu Dec 23 07:13:52 CET,0.0 1.154 1.717 2.16 2.519 2.815 3.085 3.346 3.873 4.108 4.315 4.181 4.929 5.127 5.502 5.821 6.141 6.288 6.535 6.777 7.143 7.378 7.602 7.923 8.222 8.515 8.794 9.046 9.362 9.652 9.917 10.238 10.55 10.86 11.231 11.63 12.01 12.419 12.835 13.26 13.682 14.132 14.666 15.206 15.741 16.253 16.839 17.44 18.0 18.49 18.679 18.257 17.689 17.098 16.492 15.883 15.337 14.819 14.334 13.827 13.371 12.945 12.519 12.115 11.738 11.392 11.046 10.725 10.434 10.114 9.759 9.467 9.177 8.866 8.595 8.318 8.051 7.764 7.448 7.225 6.993 6.621 6.353 6.065 5.916 5.604 5.288 4.936 4.744 4.02 4.207 3.998 3.756 3.274 2.986 2.636 2.248 1.839 1.393 0.812 -1.388 -2 ,22196 ,KEBNE ,17043847,Thu Dec 23 05:32:12 CET,Thu Dec 23 07:16:10 CET,0.0 2.309 2.948 3.416 3.806 4.158 4.474 4.759 5.279 5.534 5.777 5.663 6.413 6.625 7.021 7.371 7.691 7.848 8.174 8.47 8.848 9.081 9.305 9.635 9.945 10.236 10.494 10.742 11.071 11.398 11.724 12.084 12.397 12.691 13.016 13.355 13.724 14.127 14.526 14.934 15.338 15.792 16.317 16.794 17.322 17.903 18.498 19.1 19.689 20.179 20.318 19.989 19.48 18.714 17.89 17.163 16.511 15.869 15.303 14.742 14.249 13.808 13.366 12.938 12.555 12.205 11.827 11.475 11.154 10.83 10.51 10.24 9.932 9.597 9.327 9.039 8.753 8.455 8.131 7.911 7.687 7.316 7.054 6.783 6.643 6.353 6.054 5.73 5.553 4.821 4.983 4.774 4.558 4.105 3.856 3.562 3.225 2.868 2.471 1.976 1.086 -3 ,1504 ,KEBNE ,17043848,Thu Dec 23 05:32:11 CET,Thu Dec 23 07:14:05 CET,0.0 2.109 2.648 3.083 3.47 3.865 4.217 4.503 5.044 5.285 5.51 5.422 6.199 6.398 6.766 7.116 7.443 7.593 7.875 8.142 8.504 8.731 8.956 9.284 9.597 9.891 10.152 10.399 10.721 11.018 11.317 11.702 12.054 12.373 12.735 13.142 13.498 13.86 14.259 14.676 15.093 15.552 16.079 16.569 17.085 17.6 18.15 18.736 19.299 19.768 20.013 19.758 19.183 18.508 17.834 17.152 16.531 15.953 15.439 14.935 14.488 14.075 13.668 13.264 12.885 12.541 12.169 11.798 11.475 11.137 10.764 10.47 10.159 9.815 9.536 9.246 8.949 8.638 8.317 8.089 7.849 7.455 7.169 6.877 6.721 6.401 6.07 5.71 5.519 4.783 4.936 4.744 4.529 4.004 3.703 3.354 2.957 2.527 2.072 1.509 -0.279 -4 ,20637 ,KEBNE ,17043849,Thu Dec 23 05:32:11 CET,Thu Dec 23 07:15:02 CET,0.0 2.115 2.664 3.072 3.431 3.781 4.119 4.419 4.958 5.208 5.44 5.298 6.022 6.205 6.548 6.872 7.177 7.324 7.596 7.843 8.221 8.472 8.714 9.062 9.372 9.651 9.916 10.162 10.48 10.799 11.089 11.425 11.747 12.049 12.372 12.713 13.06 13.45 13.846 14.235 14.658 15.144 15.691 16.205 16.757 17.34 17.976 18.624 19.25 19.783 20.021 19.735 19.181 18.515 17.842 17.182 16.604 16.059 15.561 15.067 14.612 14.198 13.788 13.379 12.983 12.609 12.253 11.933 11.625 11.302 10.967 10.68 10.375 10.042 9.781 9.521 9.243 8.955 8.662 8.465 8.245 7.866 7.621 7.386 7.263 7.001 6.724 6.41 6.236 5.513 5.661 5.451 5.235 4.761 4.493 4.197 3.885 3.56 3.199 2.717 1.216 -5 ,6614 ,KEBNE ,17043850,Thu Dec 23 05:32:12 CET,Thu Dec 23 07:15:01 CET,0.0 1.297 1.883 2.317 2.674 2.97 3.238 3.499 3.977 4.211 4.448 4.326 5.089 5.298 5.701 6.1 6.467 6.628 6.926 7.225 7.643 7.91 8.166 8.52 8.854 9.177 9.498 9.786 10.152 10.502 10.822 11.221 11.573 11.887 12.238 12.616 12.963 13.319 13.719 14.166 14.618 15.088 15.618 16.136 16.734 17.37 18.032 18.657 19.264 19.859 20.182 19.812 19.146 18.451 17.8 17.186 16.592 16.032 15.566 15.061 14.586 14.155 13.761 13.392 13.015 12.671 12.305 11.962 11.656 11.337 10.992 10.692 10.372 10.026 9.767 9.497 9.206 8.91 8.594 8.361 8.123 7.768 7.525 7.256 7.109 6.829 6.561 6.248 6.074 5.357 5.523 5.315 5.087 4.6 4.336 4.046 3.727 3.373 2.968 2.439 0.799 -6 ,17963 ,KEBNE ,17043851,Thu Dec 23 05:34:15 CET,Thu Dec 23 07:19:44 CET,0.0 1.241 1.716 2.089 2.437 2.751 3.019 3.284 3.777 3.984 4.187 4.038 4.75 4.927 5.291 5.621 5.927 6.074 6.344 6.608 6.998 7.25 7.491 7.838 8.176 8.481 8.77 9.06 9.416 9.743 10.057 10.447 10.82 11.152 11.516 11.908 12.295 12.722 13.131 13.559 14.015 14.499 15.038 15.557 16.133 16.712 17.315 17.946 18.573 19.123 19.395 19.102 18.609 18.036 17.442 16.869 16.299 15.751 15.264 14.746 14.269 13.859 13.453 13.023 12.607 12.226 11.831 11.469 11.154 10.822 10.462 10.146 9.834 9.52 9.26 8.987 8.711 8.411 8.093 7.858 7.619 7.261 6.998 6.718 6.573 6.266 5.952 5.616 5.44 4.725 4.886 4.688 4.474 3.968 3.679 3.371 3.022 2.674 2.314 1.83 0.538 -7 ,26400 ,KEBNE ,17043852,Thu Dec 23 05:34:14 CET,Thu Dec 23 07:16:32 CET,0.0 2.499 3.047 3.471 3.83 4.133 4.409 4.684 5.188 5.417 5.649 5.551 6.31 6.514 6.914 7.256 7.566 7.721 8.013 8.302 8.746 9.023 9.274 9.638 9.983 10.303 10.596 10.876 11.216 11.512 11.795 12.146 12.48 12.799 13.178 13.561 13.922 14.333 14.764 15.198 15.623 16.114 16.66 17.186 17.78 18.336 18.904 19.464 20.04 20.574 20.8 20.529 20.049 19.454 18.827 18.224 17.633 17.036 16.504 15.982 15.533 15.125 14.722 14.31 13.901 13.516 13.116 12.768 12.461 12.111 11.711 11.393 11.066 10.708 10.436 10.161 9.876 9.575 9.24 8.994 8.743 8.367 8.093 7.806 7.662 7.354 7.045 6.735 6.567 5.832 5.992 5.762 5.512 5.003 4.724 4.396 4.035 3.645 3.184 2.681 1.179 -8 ,2527 ,KEBNE ,17043853,Thu Dec 23 05:34:14 CET,Thu Dec 23 07:17:33 CET,0.0 2.593 3.325 3.828 4.204 4.52 4.8 5.069 5.557 5.796 6.027 5.897 6.6 6.76 7.086 7.42 7.747 7.904 8.21 8.514 8.948 9.213 9.476 9.861 10.222 10.57 10.906 11.199 11.536 11.852 12.164 12.538 12.872 13.186 13.548 13.96 14.369 14.801 15.202 15.615 16.057 16.512 17.023 17.495 18.001 18.581 19.203 19.88 20.541 21.072 21.37 21.066 20.469 19.775 19.075 18.399 17.787 17.194 16.643 16.095 15.631 15.217 14.781 14.327 13.907 13.522 13.102 12.757 12.455 12.103 11.748 11.449 11.125 10.78 10.522 10.236 9.915 9.61 9.304 9.082 8.855 8.521 8.295 8.049 7.915 7.616 7.317 7.013 6.837 6.09 6.182 5.939 5.679 5.155 4.878 4.57 4.24 3.869 3.405 2.805 0.908 -9 ,21549 ,KEBNE ,17043854,Thu Dec 23 05:34:14 CET,Thu Dec 23 07:19:18 CET,0.0 1.445 2.006 2.464 2.858 3.198 3.461 3.7 4.17 4.387 4.591 4.428 5.149 5.339 5.701 6.021 6.316 6.452 6.718 6.997 7.396 7.633 7.855 8.171 8.471 8.757 9.035 9.307 9.628 9.908 10.191 10.521 10.827 11.135 11.512 11.933 12.299 12.684 13.109 13.563 14.017 14.501 15.065 15.581 16.135 16.745 17.421 18.05 18.561 19.015 19.256 18.957 18.266 17.431 16.67 15.9 15.168 14.533 13.99 13.428 12.905 12.41 11.947 11.507 11.071 10.671 10.28 9.927 9.591 9.255 8.913 8.594 8.272 7.956 7.698 7.438 7.169 6.885 6.585 6.367 6.128 5.726 5.427 5.111 4.947 4.602 4.257 3.892 3.699 2.957 3.071 2.853 2.591 1.994 1.686 1.331 0.973 0.608 0.191 -0.352 -1.656 -10 ,25168 ,KEBNE ,17043855,Thu Dec 23 05:34:14 CET,Thu Dec 23 07:18:49 CET,0.0 1.667 2.192 2.565 2.883 3.199 3.48 3.742 4.225 4.444 4.644 4.538 5.286 5.459 5.796 6.126 6.433 6.585 6.874 7.126 7.5 7.749 7.98 8.324 8.66 8.976 9.257 9.51 9.834 10.143 10.454 10.811 11.13 11.44 11.789 12.183 12.56 12.949 13.347 13.752 14.172 14.649 15.199 15.73 16.298 16.856 17.446 18.075 18.683 19.184 19.382 19.126 18.611 17.98 17.349 16.724 16.148 15.612 15.115 14.588 14.135 13.691 13.241 12.812 12.413 12.062 11.695 11.358 11.055 10.722 10.358 10.045 9.707 9.359 9.093 8.821 8.534 8.225 7.903 7.672 7.425 7.042 6.765 6.474 6.331 6.033 5.727 5.388 5.209 4.481 4.636 4.431 4.212 3.75 3.502 3.215 2.879 2.522 2.102 1.591 0.372 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index 89120e1e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18402 ,TETRA ,17551227,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 13:21:44 CET,0.0 0.96 1.447 1.781 2.076 2.352 2.608 2.826 3.205 3.389 3.574 3.363 4.13 4.284 4.592 4.881 5.138 5.26 5.484 5.704 6.025 6.242 6.458 6.745 7.006 7.255 7.503 7.758 8.086 8.386 8.663 8.989 9.306 9.626 9.98 10.353 10.709 11.092 11.474 11.841 12.246 12.721 13.225 13.701 14.269 14.879 15.532 16.173 16.885 17.634 17.999 17.678 17.097 16.447 15.822 15.185 14.535 13.91 13.364 12.806 12.364 11.989 11.596 11.201 10.831 10.503 10.15 9.822 9.55 9.267 8.95 8.675 8.404 8.098 7.845 7.584 7.301 7.006 6.696 6.483 6.265 5.923 5.673 5.408 5.27 5.0 4.73 4.435 4.282 3.535 3.764 3.573 3.374 2.913 2.666 2.396 2.109 1.817 1.479 1.06 0.258 -2 ,22636 ,TETRA ,17551229,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 13:33:07 CET,0.0 0.563 0.893 1.199 1.464 1.708 1.939 2.147 2.532 2.709 2.879 2.612 3.339 3.475 3.736 3.987 4.225 4.331 4.536 4.751 5.062 5.266 5.468 5.761 6.047 6.294 6.514 6.741 7.068 7.391 7.671 7.974 8.273 8.573 8.893 9.228 9.538 9.899 10.306 10.712 11.108 11.532 12.089 12.678 13.291 13.898 14.512 15.118 15.775 16.449 16.892 16.777 16.302 15.724 15.15 14.524 13.942 13.415 12.937 12.462 12.046 11.667 11.301 10.951 10.612 10.283 9.918 9.595 9.329 9.039 8.707 8.434 8.161 7.878 7.654 7.414 7.151 6.878 6.61 6.416 6.212 5.889 5.637 5.358 5.224 4.977 4.716 4.406 4.243 3.483 3.709 3.511 3.312 2.892 2.676 2.398 2.092 1.74 1.298 0.835 -0.11 -3 ,9038 ,TETRA ,17551231,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 13:27:59 CET,0.0 0.881 1.284 1.626 1.896 2.141 2.368 2.59 3.038 3.237 3.423 3.172 3.917 4.075 4.381 4.65 4.912 5.034 5.268 5.51 5.848 6.042 6.227 6.508 6.77 7.004 7.215 7.427 7.705 7.995 8.273 8.579 8.889 9.179 9.512 9.891 10.238 10.629 11.046 11.456 11.851 12.277 12.811 13.334 13.885 14.46 15.069 15.685 16.281 16.905 17.335 17.049 16.474 15.841 15.248 14.604 13.975 13.427 12.956 12.459 11.987 11.533 11.089 10.684 10.292 9.919 9.52 9.157 8.845 8.526 8.196 7.911 7.605 7.285 7.032 6.763 6.488 6.21 5.928 5.736 5.534 5.198 4.946 4.687 4.558 4.298 4.014 3.707 3.545 2.771 2.982 2.774 2.57 2.2 1.963 1.692 1.421 1.12 0.779 0.268 -0.966 -4 ,24423 ,TETRA ,17551233,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 13:15:13 CET,0.0 0.782 1.19 1.527 1.799 2.033 2.249 2.477 2.927 3.118 3.286 3.014 3.751 3.902 4.199 4.468 4.723 4.847 5.088 5.314 5.627 5.839 6.04 6.327 6.626 6.916 7.17 7.396 7.686 7.962 8.218 8.524 8.812 9.095 9.439 9.786 10.091 10.453 10.841 11.237 11.651 12.102 12.648 13.17 13.7 14.281 14.923 15.603 16.269 16.916 17.225 16.944 16.443 15.829 15.177 14.481 13.878 13.335 12.811 12.258 11.784 11.375 10.966 10.554 10.171 9.823 9.445 9.108 8.825 8.513 8.185 7.903 7.612 7.3 7.047 6.796 6.536 6.284 6.025 5.824 5.611 5.276 5.036 4.794 4.673 4.428 4.17 3.889 3.746 3.014 3.264 3.087 2.921 2.527 2.297 2.061 1.788 1.47 1.102 0.661 -0.38 -5 ,6736 ,TETRA ,17551235,Thu Nov 25 11:15:52 CET,Thu Nov 25 13:14:16 CET,0.0 0.878 1.306 1.65 1.931 2.181 2.42 2.636 3.017 3.199 3.379 3.15 3.903 4.073 4.386 4.683 4.98 5.111 5.354 5.584 5.904 6.1 6.295 6.573 6.821 7.066 7.316 7.567 7.889 8.186 8.461 8.783 9.091 9.397 9.727 10.101 10.456 10.806 11.188 11.576 11.973 12.428 12.941 13.441 14.04 14.652 15.278 15.967 16.638 17.206 17.469 17.193 16.659 15.967 15.305 14.688 14.069 13.465 12.928 12.369 11.864 11.4 10.96 10.525 10.125 9.782 9.419 9.075 8.763 8.458 8.139 7.845 7.531 7.219 6.967 6.699 6.419 6.129 5.831 5.622 5.404 5.042 4.792 4.544 4.41 4.126 3.837 3.522 3.355 2.598 2.835 2.653 2.455 2.005 1.767 1.515 1.224 0.914 0.584 0.176 -0.811 -6 ,30524 ,TETRA ,17551237,Thu Nov 25 11:16:54 CET,Thu Nov 25 13:24:33 CET,0.0 0.8 1.191 1.555 1.88 2.145 2.401 2.636 3.044 3.227 3.392 3.112 3.856 4.012 4.302 4.568 4.833 4.965 5.193 5.408 5.728 5.925 6.114 6.375 6.627 6.883 7.129 7.368 7.68 7.974 8.241 8.542 8.835 9.113 9.44 9.818 10.188 10.611 11.041 11.455 11.891 12.385 12.919 13.427 13.997 14.601 15.31 16.033 16.792 17.393 17.612 17.305 16.704 15.962 15.177 14.487 13.866 13.248 12.723 12.17 11.65 11.167 10.705 10.284 9.89 9.547 9.2 8.862 8.552 8.241 7.903 7.605 7.296 6.97 6.706 6.442 6.161 5.856 5.547 5.347 5.147 4.826 4.596 4.346 4.21 3.932 3.643 3.338 3.18 2.418 2.625 2.435 2.235 1.787 1.556 1.312 1.05 0.768 0.37 -0.108 -0.854 -7 ,974 ,TETRA ,17551239,Thu Nov 25 11:16:54 CET,Thu Nov 25 13:27:56 CET,0.0 0.889 1.205 1.48 1.695 1.902 2.152 2.375 2.702 2.868 3.018 2.704 3.446 3.57 3.795 4.012 4.233 4.342 4.538 4.729 5.016 5.206 5.388 5.638 5.878 6.106 6.322 6.539 6.815 7.053 7.283 7.576 7.848 8.12 8.446 8.795 9.12 9.482 9.893 10.298 10.675 11.104 11.614 12.11 12.623 13.145 13.771 14.436 15.137 15.84 16.263 16.092 15.555 14.935 14.301 13.593 12.908 12.311 11.786 11.24 10.736 10.26 9.815 9.397 9.008 8.662 8.294 7.956 7.639 7.304 6.959 6.65 6.325 5.997 5.745 5.496 5.22 4.93 4.639 4.422 4.201 3.864 3.641 3.405 3.269 2.967 2.656 2.349 2.192 1.466 1.679 1.492 1.3 0.898 0.67 0.393 0.09 -0.248 -0.643 -1.142 -2.106 -8 ,18294 ,TETRA ,17551241,Thu Nov 25 11:16:55 CET,Thu Nov 25 13:28:25 CET,0.0 1.441 1.833 2.195 2.531 2.781 3.01 3.227 3.601 3.772 3.938 3.618 4.331 4.456 4.703 4.946 5.184 5.296 5.513 5.721 6.022 6.206 6.382 6.653 6.897 7.128 7.355 7.569 7.832 8.083 8.332 8.638 8.926 9.201 9.521 9.874 10.213 10.583 11.003 11.435 11.873 12.367 12.919 13.462 14.027 14.613 15.269 15.905 16.492 16.987 17.324 17.103 16.524 15.863 15.211 14.535 13.874 13.256 12.705 12.166 11.695 11.265 10.853 10.445 10.065 9.71 9.326 8.986 8.687 8.355 8.007 7.727 7.433 7.113 6.85 6.569 6.288 6.008 5.689 5.457 5.223 4.877 4.651 4.413 4.285 4.028 3.758 3.446 3.271 2.512 2.737 2.542 2.348 1.928 1.681 1.406 1.143 0.85 0.483 -0.009 -1.001 -9 ,19563 ,TETRA ,17551243,Thu Nov 25 11:16:54 CET,Thu Nov 25 13:28:51 CET,0.0 0.996 1.47 1.842 2.18 2.451 2.705 2.934 3.325 3.515 3.694 3.416 4.18 4.347 4.62 4.866 5.116 5.235 5.464 5.695 6.014 6.221 6.431 6.721 6.999 7.26 7.488 7.721 8.013 8.269 8.54 8.863 9.154 9.445 9.803 10.183 10.545 10.947 11.347 11.736 12.143 12.59 13.079 13.591 14.174 14.789 15.507 16.274 17.004 17.649 18.038 17.901 17.416 16.859 16.294 15.721 15.196 14.686 14.252 13.82 13.42 13.009 12.59 12.197 11.807 11.429 11.028 10.679 10.374 10.031 9.663 9.376 9.076 8.736 8.475 8.204 7.925 7.628 7.307 7.091 6.872 6.526 6.272 6.009 5.872 5.592 5.303 4.986 4.816 4.063 4.311 4.111 3.896 3.463 3.226 2.948 2.648 2.328 1.986 1.627 0.882 -10 ,7356 ,TETRA ,17551246,Thu Nov 25 11:16:54 CET,Thu Nov 25 13:29:06 CET,0.0 0.88 1.258 1.514 1.764 2.003 2.236 2.465 2.866 3.05 3.229 2.974 3.711 3.855 4.14 4.418 4.683 4.811 5.064 5.302 5.61 5.813 6.016 6.311 6.599 6.875 7.139 7.389 7.703 7.993 8.273 8.604 8.9 9.188 9.508 9.852 10.202 10.592 10.988 11.361 11.762 12.244 12.773 13.292 13.922 14.612 15.299 15.946 16.61 17.159 17.379 17.073 16.516 15.841 15.232 14.668 14.103 13.526 12.981 12.454 12.015 11.598 11.181 10.774 10.384 10.037 9.67 9.334 9.029 8.693 8.344 8.052 7.746 7.425 7.183 6.929 6.666 6.388 6.084 5.878 5.664 5.327 5.077 4.812 4.669 4.368 4.08 3.773 3.608 2.87 3.091 2.892 2.684 2.239 1.983 1.716 1.428 1.078 0.687 0.226 -0.84 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23468.txt deleted file mode 100644 index 6269ca37..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12599 ,KEBNE ,17019441,Wed Dec 22 02:42:31 CET,Wed Dec 22 04:28:28 CET,0.0 1.863 2.433 2.905 3.294 3.6 3.909 4.189 4.605 4.805 5.003 4.826 5.522 5.7 6.031 6.323 6.589 6.719 6.966 7.196 7.496 7.689 7.905 8.202 8.455 8.694 8.919 9.158 9.474 9.732 9.986 10.306 10.578 10.818 11.1 11.415 11.713 12.042 12.362 12.68 13.034 13.41 13.801 14.137 14.489 14.872 15.233 15.519 15.711 15.683 15.284 14.467 13.506 12.568 11.721 10.897 10.104 9.408 8.801 8.106 7.509 7.034 6.55 6.033 5.54 5.081 4.595 4.143 3.745 3.331 2.89 2.528 2.153 1.742 1.432 1.113 0.772 0.398 0.005 -0.267 -0.562 -1.033 -1.37 -1.73 -1.916 -2.319 -2.754 -3.178 -3.383 -4.124 -4.052 -4.31 -4.59 -5.217 -5.56 -5.884 -6.224 -6.656 -7.125 -7.744 -9.721 -2 ,16493 ,KEBNE ,17019442,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:25:48 CET,0.0 1.414 1.97 2.413 2.82 3.155 3.436 3.702 4.205 4.457 4.701 4.576 5.31 5.515 5.872 6.194 6.51 6.661 6.954 7.248 7.655 7.896 8.122 8.449 8.766 9.076 9.382 9.678 10.041 10.37 10.693 11.081 11.434 11.771 12.151 12.578 12.989 13.437 13.921 14.427 14.938 15.485 16.132 16.758 17.426 18.16 18.977 19.665 20.186 20.571 20.503 19.85 19.079 18.212 17.289 16.442 15.701 14.988 14.331 13.659 13.067 12.521 11.994 11.455 10.906 10.408 9.867 9.343 8.885 8.409 7.931 7.546 7.121 6.622 6.222 5.794 5.344 4.909 4.441 4.091 3.712 3.156 2.773 2.367 2.167 1.747 1.29 0.785 0.518 -0.309 -0.417 -0.736 -1.07 -1.864 -2.338 -2.841 -3.406 -4.052 -4.87 -6.052 -10.956 -3 ,24981 ,KEBNE ,17019443,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:24:46 CET,0.0 1.929 2.456 2.76 3.026 3.281 3.509 3.706 4.069 4.243 4.425 4.208 4.893 5.043 5.324 5.572 5.79 5.893 6.108 6.316 6.606 6.787 6.97 7.222 7.448 7.691 7.912 8.103 8.36 8.624 8.876 9.142 9.375 9.591 9.852 10.175 10.518 10.931 11.349 11.785 12.24 12.707 13.253 13.812 14.458 15.124 15.708 16.167 16.508 16.637 16.378 15.492 14.502 13.596 12.743 11.906 11.186 10.491 9.864 9.215 8.604 8.075 7.595 7.087 6.552 6.032 5.515 5.102 4.741 4.329 3.856 3.469 3.088 2.674 2.363 2.031 1.63 1.205 0.787 0.497 0.202 -0.249 -0.586 -0.941 -1.117 -1.497 -1.869 -2.265 -2.495 -3.281 -3.243 -3.525 -3.81 -4.374 -4.716 -5.097 -5.497 -5.949 -6.466 -7.092 -9.003 -4 ,1360 ,KEBNE ,17019444,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:26:20 CET,0.0 1.785 2.288 2.668 2.995 3.286 3.541 3.788 4.259 4.455 4.631 4.443 5.152 5.323 5.634 5.909 6.165 6.292 6.55 6.794 7.126 7.324 7.508 7.784 8.047 8.294 8.519 8.719 8.966 9.235 9.504 9.763 10.006 10.275 10.563 10.839 11.135 11.478 11.803 12.156 12.529 12.896 13.303 13.713 14.137 14.532 14.92 15.297 15.629 15.769 15.424 14.602 13.683 12.744 11.878 11.064 10.31 9.604 8.934 8.229 7.599 7.034 6.494 5.994 5.513 5.069 4.618 4.194 3.829 3.445 3.016 2.631 2.236 1.836 1.526 1.208 0.864 0.497 0.118 -0.139 -0.413 -0.875 -1.194 -1.515 -1.684 -2.052 -2.445 -2.847 -3.056 -3.83 -3.798 -4.069 -4.349 -4.95 -5.279 -5.666 -6.105 -6.547 -7.057 -7.765 -10.102 -5 ,12580 ,KEBNE ,17019445,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:26:06 CET,0.0 1.118 1.551 1.92 2.27 2.579 2.868 3.133 3.593 3.811 4.017 3.887 4.581 4.766 5.112 5.428 5.702 5.83 6.098 6.359 6.702 6.909 7.103 7.4 7.679 7.946 8.22 8.458 8.736 9.012 9.273 9.565 9.835 10.098 10.386 10.694 10.977 11.26 11.575 11.911 12.237 12.591 12.992 13.349 13.751 14.119 14.42 14.754 15.003 14.979 14.594 13.65 12.67 11.721 10.773 9.943 9.223 8.468 7.762 7.072 6.479 5.958 5.436 4.95 4.523 4.09 3.618 3.196 2.804 2.396 1.973 1.599 1.212 0.823 0.51 0.154 -0.224 -0.593 -0.967 -1.223 -1.502 -1.971 -2.303 -2.643 -2.814 -3.156 -3.533 -3.951 -4.167 -4.932 -4.855 -5.094 -5.343 -5.924 -6.268 -6.657 -7.063 -7.511 -8.062 -8.675 -11.273 -6 ,23367 ,KEBNE ,17019446,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:26:16 CET,0.0 1.23 1.757 2.151 2.525 2.887 3.205 3.472 3.96 4.194 4.43 4.353 5.106 5.3 5.643 5.949 6.26 6.42 6.72 7.007 7.401 7.639 7.86 8.182 8.484 8.772 9.053 9.318 9.648 9.956 10.257 10.628 10.981 11.326 11.703 12.101 12.475 12.871 13.291 13.727 14.168 14.656 15.195 15.601 15.942 16.309 16.675 16.997 17.241 17.244 16.701 15.651 14.7 13.703 12.752 11.955 11.232 10.496 9.794 9.071 8.438 7.892 7.393 6.926 6.483 6.076 5.609 5.151 4.77 4.383 3.986 3.661 3.309 2.93 2.628 2.33 2.008 1.657 1.289 1.011 0.735 0.302 -0.019 -0.348 -0.515 -0.879 -1.288 -1.72 -1.932 -2.674 -2.58 -2.826 -3.093 -3.707 -4.019 -4.343 -4.708 -5.117 -5.654 -6.388 -8.237 -7 ,7242 ,KEBNE ,17019447,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:25:58 CET,0.0 1.331 1.905 2.314 2.633 2.94 3.242 3.505 3.962 4.172 4.377 4.214 4.927 5.096 5.398 5.702 5.982 6.114 6.365 6.598 6.928 7.123 7.322 7.63 7.916 8.165 8.396 8.638 8.938 9.192 9.451 9.791 10.106 10.401 10.722 11.064 11.389 11.739 12.087 12.42 12.755 13.117 13.529 13.911 14.306 14.738 15.154 15.493 15.749 15.823 15.459 14.559 13.57 12.658 11.81 10.954 10.149 9.377 8.703 8.036 7.443 6.907 6.365 5.844 5.367 4.921 4.444 3.999 3.622 3.237 2.813 2.472 2.126 1.744 1.436 1.113 0.782 0.433 0.048 -0.223 -0.489 -0.892 -1.205 -1.555 -1.722 -2.06 -2.404 -2.766 -2.973 -3.737 -3.678 -3.928 -4.174 -4.667 -4.965 -5.32 -5.691 -6.125 -6.661 -7.525 -11.17 -8 ,30368 ,KEBNE ,17019448,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:25:21 CET,0.0 1.032 1.496 1.854 2.215 2.535 2.804 3.061 3.527 3.731 3.931 3.793 4.502 4.677 5.02 5.337 5.62 5.761 6.051 6.311 6.672 6.9 7.115 7.43 7.715 7.977 8.219 8.448 8.729 8.996 9.266 9.581 9.897 10.205 10.529 10.88 11.193 11.497 11.838 12.198 12.547 12.957 13.385 13.743 14.103 14.498 14.959 15.364 15.633 15.679 15.327 14.482 13.551 12.601 11.67 10.735 9.844 9.054 8.393 7.707 7.083 6.485 5.907 5.401 4.917 4.448 3.955 3.529 3.178 2.816 2.414 2.077 1.719 1.326 1.03 0.73 0.403 0.059 -0.292 -0.55 -0.807 -1.214 -1.507 -1.835 -2.015 -2.368 -2.75 -3.156 -3.367 -4.117 -4.064 -4.338 -4.609 -5.192 -5.51 -5.879 -6.289 -6.724 -7.21 -7.893 -9.568 -9 ,26426 ,KEBNE ,17019449,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:26:18 CET,0.0 0.9 1.386 1.74 2.064 2.364 2.608 2.825 3.244 3.466 3.676 3.51 4.225 4.403 4.723 5.006 5.279 5.416 5.688 5.919 6.227 6.435 6.639 6.948 7.26 7.55 7.813 8.06 8.371 8.667 8.93 9.238 9.516 9.749 10.014 10.306 10.57 10.864 11.193 11.534 11.869 12.22 12.58 12.889 13.255 13.664 14.08 14.424 14.666 14.727 14.26 13.159 12.029 11.025 10.145 9.268 8.432 7.656 6.987 6.308 5.705 5.158 4.629 4.125 3.662 3.226 2.753 2.352 2.011 1.624 1.221 0.902 0.558 0.179 -0.124 -0.449 -0.841 -1.264 -1.691 -1.98 -2.274 -2.727 -3.05 -3.372 -3.537 -3.889 -4.25 -4.655 -4.861 -5.592 -5.502 -5.763 -6.042 -6.708 -7.09 -7.49 -7.927 -8.424 -8.978 -9.717 -12.86 -10 ,21336 ,KEBNE ,17019450,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:26:33 CET,0.0 0.826 1.241 1.613 1.94 2.206 2.463 2.727 3.182 3.375 3.567 3.393 4.065 4.228 4.544 4.845 5.144 5.277 5.514 5.734 6.052 6.251 6.439 6.716 6.977 7.221 7.448 7.657 7.93 8.183 8.406 8.678 8.924 9.168 9.452 9.765 10.066 10.364 10.669 10.986 11.315 11.691 12.098 12.466 12.854 13.243 13.614 13.94 14.141 14.132 13.67 12.701 11.757 10.848 9.986 9.148 8.367 7.64 7.019 6.415 5.892 5.393 4.914 4.449 3.995 3.576 3.084 2.621 2.218 1.782 1.31 0.919 0.537 0.137 -0.191 -0.521 -0.864 -1.23 -1.63 -1.923 -2.208 -2.622 -2.937 -3.281 -3.459 -3.831 -4.226 -4.649 -4.874 -5.635 -5.546 -5.8 -6.069 -6.651 -6.963 -7.284 -7.682 -8.157 -8.712 -9.469 -11.738 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23471.txt deleted file mode 100644 index 008fb697..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26732 ,TETRA ,17551258,Thu Nov 25 11:16:55 CET,Thu Nov 25 13:30:22 CET,0.0 0.99 1.471 1.832 2.134 2.391 2.647 2.882 3.271 3.451 3.62 3.363 4.106 4.257 4.542 4.816 5.058 5.172 5.407 5.644 5.973 6.176 6.382 6.684 6.961 7.228 7.466 7.682 7.979 8.255 8.492 8.773 9.061 9.339 9.637 9.957 10.261 10.599 10.943 11.273 11.618 11.992 12.407 12.794 13.225 13.65 14.041 14.418 14.743 14.882 14.526 13.517 12.392 11.373 10.448 9.579 8.818 8.129 7.501 6.827 6.229 5.7 5.199 4.727 4.261 3.824 3.376 2.962 2.6 2.225 1.826 1.477 1.114 0.747 0.452 0.145 -0.156 -0.484 -0.867 -1.142 -1.404 -1.788 -2.069 -2.354 -2.504 -2.824 -3.138 -3.463 -3.648 -4.465 -4.328 -4.566 -4.813 -5.395 -5.714 -6.055 -6.422 -6.858 -7.439 -8.304 -11.361 -2 ,27364 ,TETRA ,17551259,Thu Nov 25 11:16:55 CET,Thu Nov 25 13:28:56 CET,0.0 0.997 1.431 1.776 2.069 2.331 2.569 2.806 3.248 3.433 3.595 3.335 4.078 4.23 4.515 4.785 5.042 5.168 5.416 5.648 6.003 6.223 6.417 6.688 6.933 7.179 7.413 7.626 7.895 8.181 8.458 8.77 9.069 9.336 9.652 10.001 10.303 10.639 10.987 11.349 11.725 12.095 12.512 12.912 13.318 13.708 14.066 14.376 14.613 14.649 14.205 13.22 12.135 11.115 10.204 9.355 8.521 7.72 7.032 6.342 5.763 5.221 4.666 4.152 3.703 3.3 2.838 2.39 1.998 1.582 1.169 0.837 0.486 0.107 -0.204 -0.513 -0.836 -1.186 -1.568 -1.844 -2.133 -2.635 -2.986 -3.332 -3.518 -3.884 -4.255 -4.669 -4.897 -5.734 -5.664 -5.941 -6.224 -6.851 -7.194 -7.547 -7.934 -8.394 -8.949 -9.723 -12.014 -3 ,10481 ,TETRA ,17551260,Thu Nov 25 11:16:55 CET,Thu Nov 25 13:22:52 CET,0.0 1.738 2.32 2.663 2.948 3.207 3.443 3.667 4.103 4.314 4.512 4.289 5.054 5.217 5.513 5.794 6.073 6.197 6.419 6.632 6.939 7.153 7.364 7.646 7.922 8.193 8.448 8.689 8.995 9.28 9.54 9.837 10.123 10.403 10.714 11.055 11.377 11.754 12.151 12.502 12.839 13.218 13.626 14.002 14.432 14.808 15.152 15.548 15.903 16.034 15.752 14.903 13.878 12.868 11.927 11.051 10.257 9.493 8.833 8.137 7.506 6.973 6.455 5.914 5.417 4.981 4.54 4.139 3.792 3.422 3.017 2.668 2.308 1.95 1.652 1.336 1.017 0.711 0.36 0.102 -0.159 -0.58 -0.862 -1.17 -1.34 -1.68 -2.031 -2.425 -2.636 -3.438 -3.309 -3.58 -3.858 -4.464 -4.81 -5.153 -5.506 -5.948 -6.502 -7.15 -9.317 -4 ,1275 ,TETRA ,17551261,Thu Nov 25 11:16:55 CET,Thu Nov 25 13:20:34 CET,0.0 0.95 1.316 1.624 1.896 2.146 2.353 2.539 2.928 3.119 3.293 3.017 3.745 3.897 4.192 4.45 4.698 4.823 5.058 5.284 5.621 5.834 6.029 6.304 6.577 6.834 7.064 7.269 7.527 7.782 8.022 8.295 8.571 8.844 9.165 9.498 9.783 10.094 10.433 10.776 11.12 11.491 11.878 12.222 12.633 13.075 13.494 13.856 14.129 14.247 13.93 12.96 11.938 11.006 10.143 9.32 8.576 7.89 7.27 6.631 6.064 5.551 5.042 4.568 4.142 3.738 3.297 2.918 2.577 2.196 1.801 1.472 1.129 0.766 0.487 0.203 -0.092 -0.424 -0.795 -1.046 -1.304 -1.701 -1.969 -2.269 -2.43 -2.762 -3.162 -3.596 -3.811 -4.631 -4.47 -4.709 -4.961 -5.561 -5.905 -6.255 -6.686 -7.239 -7.948 -8.92 -12.346 -5 ,9149 ,TETRA ,17551262,Thu Nov 25 11:16:55 CET,Thu Nov 25 13:27:41 CET,0.0 0.918 1.364 1.741 2.058 2.317 2.56 2.802 3.23 3.403 3.567 3.313 4.06 4.211 4.493 4.758 5.022 5.152 5.406 5.639 5.952 6.151 6.356 6.657 6.927 7.163 7.394 7.624 7.902 8.177 8.433 8.71 8.978 9.248 9.555 9.9 10.237 10.579 10.92 11.266 11.607 11.988 12.43 12.822 13.227 13.643 14.046 14.428 14.796 14.917 14.431 13.465 12.481 11.517 10.656 9.844 9.063 8.344 7.695 7.013 6.439 5.911 5.4 4.915 4.421 3.948 3.466 3.026 2.646 2.261 1.85 1.494 1.131 0.758 0.471 0.164 -0.186 -0.557 -0.914 -1.152 -1.417 -1.845 -2.139 -2.449 -2.622 -3.009 -3.422 -3.843 -4.049 -4.871 -4.751 -5.007 -5.285 -5.874 -6.193 -6.54 -6.94 -7.39 -7.951 -8.769 -11.74 -6 ,29935 ,TETRA ,17551263,Thu Nov 25 11:16:55 CET,Thu Nov 25 13:29:04 CET,0.0 0.929 1.31 1.66 1.96 2.211 2.468 2.705 3.074 3.253 3.432 3.174 3.916 4.057 4.357 4.633 4.884 5.004 5.226 5.446 5.76 5.967 6.177 6.46 6.712 6.954 7.184 7.399 7.669 7.933 8.18 8.459 8.737 9.007 9.309 9.639 9.944 10.263 10.609 10.975 11.327 11.701 12.113 12.519 12.978 13.44 13.905 14.311 14.612 14.744 14.504 13.747 12.77 11.754 10.816 9.948 9.15 8.398 7.75 7.116 6.542 5.987 5.437 4.927 4.48 4.061 3.598 3.184 2.819 2.446 2.044 1.697 1.337 0.938 0.63 0.34 0.055 -0.25 -0.588 -0.814 -1.042 -1.408 -1.664 -1.946 -2.098 -2.43 -2.797 -3.176 -3.379 -4.197 -4.115 -4.398 -4.658 -5.228 -5.604 -6.008 -6.437 -6.959 -7.702 -8.745 -13.088 -7 ,5833 ,TETRA ,17551264,Thu Nov 25 11:16:55 CET,Thu Nov 25 13:27:09 CET,0.0 0.816 1.202 1.519 1.803 2.073 2.325 2.545 2.938 3.114 3.28 2.999 3.741 3.916 4.23 4.493 4.723 4.837 5.061 5.275 5.592 5.786 5.983 6.278 6.541 6.806 7.058 7.278 7.577 7.878 8.174 8.514 8.806 9.068 9.358 9.696 10.008 10.311 10.64 11.015 11.377 11.749 12.173 12.552 12.919 13.309 13.728 14.145 14.517 14.6 14.207 13.373 12.429 11.487 10.602 9.741 8.948 8.192 7.529 6.865 6.281 5.73 5.175 4.666 4.18 3.726 3.245 2.798 2.429 2.061 1.668 1.325 0.938 0.555 0.281 -0.004 -0.318 -0.646 -0.992 -1.247 -1.533 -2.005 -2.336 -2.679 -2.849 -3.185 -3.533 -3.933 -4.136 -4.939 -4.734 -4.964 -5.235 -5.787 -6.069 -6.431 -6.873 -7.334 -7.873 -8.663 -11.378 -8 ,18553 ,TETRA ,17551265,Thu Nov 25 11:16:55 CET,Thu Nov 25 13:27:43 CET,0.0 1.001 1.421 1.764 2.041 2.278 2.517 2.741 3.13 3.311 3.486 3.223 3.964 4.115 4.398 4.676 4.941 5.063 5.293 5.507 5.819 6.023 6.229 6.505 6.764 7.026 7.274 7.503 7.797 8.066 8.308 8.603 8.88 9.139 9.433 9.758 10.066 10.396 10.74 11.066 11.393 11.766 12.178 12.564 12.942 13.309 13.684 14.051 14.382 14.519 14.235 13.446 12.542 11.538 10.553 9.66 8.813 8.008 7.35 6.692 6.077 5.53 5.021 4.52 4.037 3.584 3.123 2.718 2.331 1.904 1.481 1.143 0.763 0.346 0.03 -0.309 -0.704 -1.104 -1.49 -1.758 -2.026 -2.464 -2.769 -3.086 -3.259 -3.613 -3.989 -4.424 -4.662 -5.484 -5.379 -5.652 -5.936 -6.627 -7.012 -7.368 -7.778 -8.278 -8.846 -9.614 -12.187 -9 ,26631 ,TETRA ,17551266,Thu Nov 25 11:16:55 CET,Thu Nov 25 13:27:36 CET,0.0 0.805 1.196 1.595 1.988 2.308 2.539 2.745 3.125 3.288 3.44 3.155 3.911 4.064 4.333 4.618 4.896 5.028 5.283 5.517 5.865 6.089 6.292 6.589 6.864 7.104 7.344 7.57 7.853 8.138 8.403 8.7 8.983 9.273 9.587 9.901 10.192 10.49 10.79 11.111 11.448 11.807 12.179 12.554 13.031 13.527 13.989 14.4 14.761 14.932 14.574 13.69 12.662 11.608 10.626 9.706 8.89 8.139 7.495 6.854 6.293 5.794 5.299 4.813 4.359 3.959 3.546 3.135 2.76 2.369 1.95 1.608 1.257 0.876 0.586 0.27 -0.083 -0.462 -0.882 -1.159 -1.429 -1.85 -2.148 -2.472 -2.643 -2.993 -3.346 -3.727 -3.933 -4.744 -4.624 -4.862 -5.098 -5.617 -5.945 -6.33 -6.735 -7.201 -7.781 -8.558 -11.021 -10 ,28695 ,TETRA ,17551267,Thu Nov 25 11:16:55 CET,Thu Nov 25 13:15:15 CET,0.0 1.376 1.904 2.316 2.679 2.963 3.197 3.411 3.79 3.967 4.152 3.919 4.666 4.814 5.104 5.407 5.686 5.802 6.024 6.251 6.586 6.783 6.968 7.265 7.573 7.858 8.119 8.362 8.675 8.979 9.226 9.493 9.759 10.008 10.299 10.618 10.908 11.213 11.534 11.874 12.201 12.524 12.89 13.25 13.611 13.995 14.391 14.731 14.983 15.108 14.719 13.697 12.717 11.763 10.834 9.999 9.29 8.601 7.957 7.302 6.727 6.199 5.692 5.208 4.731 4.272 3.793 3.353 2.968 2.593 2.195 1.855 1.506 1.078 0.736 0.407 0.056 -0.314 -0.694 -0.953 -1.228 -1.644 -1.929 -2.232 -2.398 -2.769 -3.144 -3.536 -3.749 -4.57 -4.432 -4.688 -4.98 -5.603 -5.941 -6.375 -6.917 -7.495 -8.185 -9.159 -12.121 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23468.txt deleted file mode 100644 index 1b9f2d0c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3228 ,TETRA ,17551277,Thu Nov 25 11:17:53 CET,Thu Nov 25 13:18:19 CET,0.0 1.028 1.562 2.02 2.383 2.676 2.957 3.249 3.789 4.011 4.229 4.033 4.853 5.049 5.418 5.781 6.122 6.28 6.597 6.912 7.379 7.658 7.921 8.288 8.625 8.948 9.251 9.538 9.907 10.276 10.629 11.046 11.449 11.837 12.277 12.761 13.207 13.717 14.303 14.913 15.553 16.254 17.021 17.74 18.565 19.506 20.535 21.683 23.001 24.44 26.043 27.172 27.684 27.867 27.787 27.576 27.319 27.037 26.796 26.506 26.198 25.902 25.626 25.373 25.116 24.842 24.539 24.264 24.0 23.723 23.436 23.177 22.916 22.634 22.384 22.116 21.831 21.536 21.247 21.058 20.857 20.521 20.278 20.022 19.871 19.552 19.214 18.856 18.68 17.892 18.05 17.82 17.546 16.933 16.602 16.221 15.803 15.377 14.892 14.225 12.665 -2 ,30348 ,TETRA ,17551279,Thu Nov 25 11:17:53 CET,Thu Nov 25 13:30:18 CET,0.0 0.754 1.219 1.637 1.997 2.286 2.539 2.782 3.248 3.465 3.671 3.44 4.246 4.431 4.801 5.127 5.413 5.548 5.822 6.089 6.475 6.712 6.956 7.328 7.682 8.02 8.325 8.608 8.965 9.306 9.629 10.037 10.428 10.792 11.211 11.676 12.125 12.613 13.148 13.709 14.282 14.889 15.607 16.333 17.131 18.054 19.11 20.276 21.571 22.934 24.321 25.228 25.59 25.671 25.54 25.3 25.04 24.741 24.471 24.18 23.895 23.616 23.319 23.02 22.746 22.49 22.177 21.878 21.627 21.375 21.068 20.776 20.492 20.195 19.935 19.639 19.317 18.994 18.672 18.459 18.238 17.833 17.53 17.231 17.078 16.754 16.402 16.007 15.794 14.975 15.1 14.832 14.561 13.992 13.668 13.339 13.009 12.602 12.033 11.277 9.701 -3 ,15355 ,TETRA ,17551280,Thu Nov 25 11:17:53 CET,Thu Nov 25 13:27:33 CET,0.0 1.011 1.547 1.988 2.367 2.715 3.029 3.317 3.827 4.061 4.28 4.065 4.867 5.053 5.399 5.722 6.034 6.184 6.488 6.776 7.179 7.437 7.674 8.007 8.329 8.638 8.931 9.208 9.541 9.859 10.188 10.61 11.007 11.364 11.802 12.325 12.794 13.281 13.794 14.338 14.91 15.537 16.25 16.927 17.72 18.637 19.707 20.9 22.139 23.461 24.919 25.861 26.17 26.194 26.03 25.734 25.429 25.09 24.757 24.414 24.115 23.818 23.512 23.211 22.92 22.643 22.34 22.05 21.772 21.483 21.19 20.928 20.624 20.318 20.083 19.821 19.54 19.252 18.974 18.787 18.57 18.155 17.864 17.557 17.395 17.073 16.73 16.377 16.181 15.371 15.55 15.311 15.057 14.528 14.239 13.918 13.583 13.196 12.686 12.077 10.16 -4 ,3355 ,TETRA ,17551281,Thu Nov 25 11:17:55 CET,Thu Nov 25 13:26:58 CET,0.0 0.922 1.477 1.884 2.238 2.557 2.845 3.106 3.587 3.808 4.017 3.79 4.586 4.777 5.157 5.527 5.848 5.995 6.307 6.602 6.987 7.231 7.466 7.817 8.169 8.494 8.782 9.049 9.401 9.748 10.068 10.458 10.837 11.179 11.567 12.006 12.427 12.892 13.388 13.909 14.45 15.062 15.774 16.467 17.274 18.16 19.136 20.197 21.381 22.707 24.126 25.108 25.439 25.37 25.179 24.923 24.636 24.329 23.997 23.63 23.322 23.062 22.783 22.472 22.154 21.838 21.501 21.221 20.982 20.722 20.436 20.183 19.903 19.601 19.369 19.102 18.812 18.523 18.234 18.035 17.818 17.436 17.155 16.854 16.695 16.382 16.055 15.686 15.477 14.672 14.813 14.571 14.312 13.734 13.421 13.088 12.71 12.265 11.742 11.077 9.154 -5 ,8077 ,TETRA ,17551282,Thu Nov 25 11:17:57 CET,Thu Nov 25 13:28:11 CET,0.0 0.928 1.424 1.85 2.226 2.546 2.826 3.088 3.554 3.765 3.975 3.754 4.562 4.754 5.112 5.449 5.77 5.926 6.254 6.567 6.969 7.228 7.488 7.865 8.211 8.53 8.853 9.157 9.521 9.87 10.221 10.656 11.06 11.422 11.85 12.327 12.764 13.234 13.731 14.253 14.823 15.484 16.224 16.932 17.748 18.656 19.734 20.934 22.244 23.721 25.484 26.698 27.198 27.414 27.42 27.304 27.142 26.943 26.714 26.42 26.142 25.9 25.633 25.353 25.104 24.855 24.548 24.259 24.011 23.747 23.455 23.197 22.92 22.61 22.33 22.038 21.748 21.426 21.07 20.849 20.626 20.227 19.942 19.65 19.507 19.185 18.826 18.467 18.266 17.455 17.562 17.316 17.059 16.479 16.151 15.776 15.36 14.937 14.447 13.775 11.644 -6 ,28403 ,TETRA ,17551283,Thu Nov 25 11:17:52 CET,Thu Nov 25 13:26:38 CET,0.0 1.018 1.503 1.885 2.223 2.533 2.839 3.123 3.646 3.884 4.092 3.851 4.654 4.842 5.198 5.535 5.867 6.016 6.305 6.585 6.99 7.248 7.489 7.818 8.148 8.483 8.793 9.086 9.463 9.829 10.169 10.555 10.922 11.28 11.693 12.158 12.596 13.073 13.595 14.148 14.697 15.32 16.063 16.783 17.576 18.424 19.375 20.448 21.72 23.084 24.525 25.496 25.84 25.876 25.771 25.551 25.274 24.996 24.721 24.347 24.004 23.727 23.44 23.153 22.891 22.621 22.307 22.023 21.745 21.422 21.101 20.828 20.535 20.215 19.946 19.682 19.393 19.052 18.69 18.429 18.148 17.729 17.418 17.095 16.929 16.575 16.2 15.799 15.584 14.757 14.917 14.655 14.382 13.776 13.452 13.136 12.79 12.413 11.946 11.274 9.555 -7 ,24823 ,TETRA ,17551284,Thu Nov 25 11:17:53 CET,Thu Nov 25 13:19:54 CET,0.0 0.998 1.483 1.909 2.264 2.579 2.873 3.144 3.645 3.881 4.11 3.92 4.745 4.937 5.298 5.642 5.966 6.115 6.399 6.676 7.073 7.34 7.6 7.967 8.321 8.64 8.95 9.258 9.628 9.985 10.318 10.701 11.076 11.447 11.861 12.305 12.737 13.223 13.745 14.266 14.799 15.401 16.067 16.744 17.531 18.395 19.396 20.457 21.644 23.01 24.444 25.34 25.649 25.741 25.709 25.595 25.433 25.185 24.927 24.657 24.422 24.197 23.952 23.679 23.389 23.126 22.844 22.591 22.364 22.1 21.805 21.535 21.268 21.018 20.799 20.538 20.264 19.978 19.655 19.429 19.199 18.808 18.521 18.235 18.099 17.802 17.438 17.035 16.838 16.034 16.17 15.907 15.597 14.916 14.533 14.145 13.752 13.298 12.766 12.06 9.585 -8 ,4066 ,TETRA ,17551285,Thu Nov 25 11:17:52 CET,Thu Nov 25 13:27:07 CET,0.0 1.21 1.715 2.078 2.414 2.704 2.972 3.233 3.709 3.928 4.135 3.935 4.741 4.92 5.245 5.563 5.884 6.038 6.325 6.614 7.034 7.283 7.523 7.855 8.163 8.471 8.766 9.062 9.425 9.741 10.049 10.429 10.798 11.156 11.565 12.043 12.488 12.946 13.431 13.934 14.473 15.091 15.821 16.553 17.38 18.307 19.377 20.579 21.906 23.386 24.994 26.035 26.487 26.63 26.601 26.495 26.327 26.09 25.843 25.551 25.29 25.055 24.803 24.565 24.306 24.036 23.752 23.484 23.247 23.018 22.711 22.432 22.19 21.932 21.723 21.491 21.253 20.968 20.659 20.451 20.224 19.872 19.612 19.33 19.194 18.896 18.546 18.171 17.983 17.201 17.399 17.175 16.945 16.46 16.193 15.87 15.502 15.05 14.485 13.893 12.221 -9 ,4613 ,TETRA ,17551286,Thu Nov 25 11:17:53 CET,Thu Nov 25 13:27:01 CET,0.0 1.741 2.272 2.628 2.948 3.261 3.571 3.852 4.321 4.533 4.732 4.486 5.29 5.49 5.891 6.257 6.577 6.722 7.011 7.297 7.714 7.994 8.265 8.65 9.002 9.308 9.611 9.915 10.298 10.655 10.992 11.395 11.779 12.152 12.571 13.016 13.437 13.91 14.402 14.902 15.444 16.07 16.791 17.483 18.26 19.141 20.138 21.24 22.485 23.833 25.312 26.356 26.663 26.637 26.531 26.356 26.138 25.878 25.569 25.201 24.898 24.628 24.338 24.04 23.756 23.487 23.187 22.9 22.641 22.374 22.092 21.829 21.543 21.256 21.007 20.737 20.461 20.173 19.881 19.673 19.447 19.079 18.825 18.551 18.401 18.078 17.715 17.322 17.12 16.313 16.435 16.196 15.948 15.375 15.043 14.705 14.334 13.866 13.313 12.675 11.091 -10 ,12763 ,TETRA ,17551287,Thu Nov 25 11:17:56 CET,Thu Nov 25 13:26:58 CET,0.0 1.184 1.795 2.331 2.743 3.094 3.412 3.7 4.184 4.397 4.598 4.35 5.147 5.317 5.63 5.947 6.269 6.41 6.679 6.944 7.341 7.605 7.853 8.197 8.519 8.824 9.114 9.401 9.767 10.119 10.452 10.856 11.257 11.626 12.054 12.547 13.011 13.48 14.007 14.589 15.155 15.788 16.488 17.163 17.977 18.856 19.826 20.898 22.161 23.553 25.019 25.961 26.337 26.412 26.281 26.072 25.83 25.569 25.31 25.055 24.775 24.479 24.203 23.896 23.613 23.369 23.072 22.77 22.507 22.223 21.927 21.692 21.45 21.198 20.984 20.743 20.483 20.203 19.874 19.627 19.379 19.004 18.746 18.464 18.299 17.944 17.579 17.179 16.964 16.157 16.314 16.083 15.833 15.249 14.926 14.592 14.239 13.815 13.311 12.681 11.237 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23471.txt deleted file mode 100644 index 54c5102d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21513 ,TETRA ,17551294,Thu Nov 25 11:17:53 CET,Thu Nov 25 13:15:19 CET,0.0 0.739 1.227 1.624 1.956 2.274 2.582 2.868 3.383 3.615 3.825 3.628 4.453 4.659 5.059 5.416 5.738 5.908 6.253 6.562 6.99 7.256 7.524 7.93 8.309 8.672 9.029 9.374 9.798 10.187 10.572 11.068 11.532 11.947 12.453 13.057 13.614 14.208 14.852 15.507 16.197 16.978 17.89 18.786 19.757 20.787 21.929 23.234 24.805 26.462 28.142 29.271 29.716 29.839 29.786 29.587 29.286 29.006 28.75 28.462 28.203 27.927 27.647 27.361 27.066 26.791 26.481 26.192 25.937 25.666 25.346 25.051 24.738 24.404 24.125 23.836 23.565 23.294 22.995 22.784 22.549 22.156 21.881 21.581 21.432 21.135 20.827 20.465 20.256 19.449 19.616 19.375 19.125 18.551 18.228 17.884 17.501 17.016 16.45 15.807 13.918 -2 ,28126 ,TETRA ,17551296,Thu Nov 25 11:18:56 CET,Thu Nov 25 13:23:36 CET,0.0 1.145 1.603 1.97 2.296 2.596 2.879 3.147 3.635 3.861 4.078 3.886 4.691 4.879 5.238 5.585 5.911 6.069 6.381 6.697 7.151 7.421 7.681 8.072 8.443 8.794 9.144 9.476 9.866 10.254 10.626 11.07 11.491 11.876 12.332 12.845 13.351 13.9 14.449 15.022 15.644 16.325 17.138 17.983 18.938 19.96 21.119 22.374 23.77 25.365 27.057 28.219 28.691 28.802 28.709 28.46 28.157 27.904 27.685 27.394 27.099 26.764 26.398 26.065 25.759 25.434 25.052 24.725 24.444 24.13 23.762 23.448 23.136 22.81 22.547 22.278 21.994 21.703 21.396 21.172 20.93 20.541 20.244 19.931 19.78 19.466 19.115 18.733 18.521 17.711 17.883 17.627 17.366 16.843 16.55 16.219 15.846 15.426 14.889 14.115 11.973 -3 ,24446 ,TETRA ,17551298,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:27:11 CET,0.0 0.786 1.293 1.718 2.107 2.464 2.795 3.075 3.543 3.76 3.981 3.793 4.615 4.81 5.174 5.523 5.856 6.013 6.313 6.609 7.058 7.348 7.63 8.036 8.405 8.739 9.069 9.393 9.813 10.232 10.643 11.109 11.534 11.94 12.394 12.908 13.396 13.93 14.519 15.143 15.768 16.459 17.283 18.075 18.988 19.993 21.088 22.306 23.708 25.315 27.055 28.182 28.63 28.747 28.669 28.437 28.194 27.965 27.74 27.48 27.21 26.955 26.7 26.422 26.117 25.801 25.448 25.107 24.788 24.476 24.175 23.908 23.613 23.274 22.988 22.688 22.383 22.094 21.779 21.532 21.254 20.812 20.52 20.21 20.051 19.723 19.353 18.942 18.72 17.911 18.037 17.796 17.548 16.994 16.672 16.313 15.911 15.44 14.888 14.115 11.558 -4 ,1915 ,TETRA ,17551300,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:29:36 CET,0.0 1.118 1.608 2.01 2.384 2.746 3.084 3.393 3.959 4.208 4.448 4.297 5.117 5.331 5.73 6.103 6.476 6.648 6.977 7.298 7.755 8.051 8.337 8.75 9.138 9.501 9.836 10.16 10.609 11.02 11.407 11.884 12.318 12.716 13.18 13.697 14.205 14.778 15.354 15.945 16.577 17.286 18.098 18.883 19.764 20.783 21.95 23.188 24.565 26.066 27.696 28.787 29.254 29.366 29.279 29.081 28.844 28.578 28.296 27.972 27.625 27.268 26.881 26.486 26.112 25.763 25.414 25.067 24.738 24.414 24.079 23.792 23.484 23.144 22.878 22.638 22.394 22.107 21.779 21.541 21.289 20.869 20.582 20.267 20.101 19.78 19.429 19.021 18.798 17.986 18.113 17.857 17.581 16.984 16.67 16.287 15.873 15.418 14.834 14.127 11.463 -5 ,17104 ,TETRA ,17551302,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:29:31 CET,0.0 1.228 1.816 2.273 2.673 3.022 3.343 3.644 4.177 4.413 4.63 4.425 5.239 5.439 5.821 6.173 6.492 6.643 6.942 7.241 7.662 7.923 8.189 8.566 8.908 9.248 9.585 9.907 10.335 10.771 11.186 11.665 12.101 12.501 12.951 13.457 13.963 14.509 15.058 15.646 16.267 16.948 17.74 18.537 19.468 20.452 21.511 22.714 24.092 25.667 27.417 28.578 29.034 29.22 29.233 29.11 28.905 28.63 28.368 28.088 27.827 27.583 27.314 27.03 26.747 26.491 26.239 26.005 25.787 25.521 25.198 24.914 24.626 24.321 24.068 23.79 23.473 23.148 22.828 22.598 22.362 21.964 21.674 21.373 21.208 20.852 20.502 20.149 19.938 19.105 19.247 19.012 18.772 18.251 17.956 17.615 17.221 16.796 16.288 15.598 13.573 -6 ,13991 ,TETRA ,17551303,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:28:09 CET,0.0 0.993 1.439 1.837 2.231 2.576 2.862 3.142 3.64 3.858 4.077 3.895 4.733 4.925 5.288 5.642 5.975 6.125 6.418 6.718 7.162 7.433 7.689 8.071 8.44 8.825 9.203 9.519 9.895 10.264 10.62 11.051 11.469 11.859 12.316 12.828 13.315 13.866 14.453 15.045 15.673 16.373 17.145 17.925 18.854 19.886 21.052 22.301 23.659 25.195 26.908 28.02 28.42 28.546 28.517 28.334 28.045 27.706 27.375 26.98 26.599 26.245 25.902 25.589 25.28 24.977 24.678 24.398 24.096 23.756 23.415 23.132 22.829 22.52 22.271 21.992 21.679 21.317 20.93 20.677 20.416 20.025 19.759 19.468 19.299 18.925 18.548 18.152 17.926 17.107 17.177 16.915 16.633 16.009 15.67 15.298 14.854 14.379 13.842 13.055 11.335 -7 ,5022 ,TETRA ,17551304,Thu Nov 25 11:18:56 CET,Thu Nov 25 13:16:57 CET,0.0 1.894 2.381 2.786 3.172 3.521 3.841 4.159 4.698 4.926 5.159 4.971 5.796 5.994 6.376 6.712 7.027 7.181 7.49 7.788 8.221 8.497 8.746 9.121 9.499 9.851 10.188 10.521 10.925 11.283 11.621 12.032 12.435 12.819 13.278 13.797 14.302 14.85 15.445 16.073 16.717 17.456 18.278 19.065 19.944 20.912 22.068 23.403 24.86 26.382 27.973 28.939 29.263 29.397 29.399 29.276 29.072 28.858 28.634 28.331 28.039 27.762 27.481 27.18 26.875 26.615 26.333 26.058 25.811 25.534 25.238 24.995 24.733 24.424 24.169 23.893 23.594 23.305 23.003 22.783 22.542 22.168 21.902 21.596 21.443 21.135 20.785 20.406 20.214 19.405 19.565 19.328 19.065 18.44 18.08 17.685 17.257 16.821 16.294 15.599 13.807 -8 ,11159 ,TETRA ,17551305,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:31:29 CET,0.0 1.266 1.731 2.134 2.502 2.862 3.191 3.484 4.029 4.27 4.499 4.349 5.17 5.385 5.797 6.19 6.562 6.742 7.085 7.411 7.881 8.17 8.458 8.879 9.269 9.636 9.983 10.322 10.763 11.166 11.519 11.93 12.325 12.713 13.161 13.666 14.15 14.683 15.289 15.925 16.555 17.236 18.053 18.876 19.793 20.787 21.898 23.125 24.476 25.892 27.331 28.196 28.421 28.364 28.094 27.681 27.249 26.868 26.532 26.13 25.757 25.393 25.034 24.695 24.366 24.078 23.763 23.433 23.139 22.839 22.51 22.243 21.972 21.656 21.375 21.066 20.774 20.452 20.104 19.876 19.628 19.227 18.94 18.645 18.496 18.142 17.74 17.327 17.126 16.345 16.476 16.221 15.956 15.36 15.023 14.655 14.227 13.749 13.196 12.496 10.629 -9 ,22814 ,TETRA ,17551306,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:27:20 CET,0.0 1.081 1.571 1.978 2.341 2.65 2.925 3.188 3.707 3.955 4.192 4.033 4.842 5.034 5.427 5.796 6.144 6.316 6.635 6.939 7.377 7.649 7.919 8.32 8.706 9.066 9.399 9.719 10.109 10.473 10.825 11.257 11.679 12.074 12.536 13.044 13.511 14.019 14.591 15.235 15.894 16.603 17.395 18.208 19.171 20.239 21.445 22.705 24.137 25.676 27.37 28.485 28.822 28.855 28.797 28.613 28.3 27.963 27.621 27.228 26.847 26.494 26.111 25.74 25.427 25.113 24.766 24.463 24.181 23.866 23.543 23.276 22.986 22.656 22.397 22.141 21.86 21.56 21.252 21.035 20.808 20.45 20.189 19.894 19.732 19.406 19.058 18.695 18.5 17.686 17.842 17.589 17.329 16.792 16.496 16.142 15.737 15.279 14.754 14.076 12.428 -10 ,8290 ,TETRA ,17551307,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:28:06 CET,0.0 0.894 1.254 1.557 1.87 2.153 2.395 2.629 3.041 3.242 3.44 3.177 3.962 4.134 4.451 4.752 5.017 5.145 5.407 5.665 6.021 6.24 6.451 6.76 7.046 7.315 7.584 7.844 8.168 8.49 8.799 9.16 9.524 9.881 10.289 10.735 11.138 11.563 12.001 12.449 12.911 13.42 14.013 14.608 15.281 15.996 16.763 17.618 18.541 19.45 20.442 20.861 20.697 20.391 20.034 19.626 19.194 18.762 18.394 17.978 17.55 17.135 16.757 16.42 16.072 15.708 15.3 14.926 14.594 14.251 13.896 13.588 13.256 12.906 12.643 12.365 12.064 11.742 11.372 11.117 10.873 10.474 10.168 9.859 9.713 9.383 9.006 8.597 8.376 7.551 7.754 7.538 7.28 6.711 6.38 6.015 5.627 5.179 4.658 3.96 2.268 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23466.txt deleted file mode 100644 index d9ac2d78..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15303 ,TETRA ,17551308,Thu Nov 25 11:18:56 CET,Thu Nov 25 13:25:09 CET,0.0 0.964 1.474 1.839 2.151 2.437 2.724 2.987 3.436 3.653 3.856 3.633 4.401 4.58 4.934 5.247 5.544 5.697 5.985 6.25 6.627 6.854 7.06 7.371 7.673 7.955 8.216 8.48 8.839 9.188 9.524 9.925 10.304 10.65 11.052 11.514 11.95 12.435 12.965 13.518 14.118 14.805 15.601 16.405 17.345 18.396 19.559 20.753 22.034 23.537 25.311 26.539 27.017 27.262 27.389 27.369 27.2 26.882 26.546 26.215 25.892 25.577 25.261 24.936 24.625 24.346 24.045 23.741 23.441 23.119 22.806 22.536 22.248 21.94 21.687 21.407 21.096 20.759 20.426 20.207 19.965 19.558 19.285 18.988 18.82 18.496 18.171 17.825 17.628 16.829 16.982 16.76 16.527 16.034 15.704 15.295 14.813 14.303 13.752 12.986 10.453 -2 ,1737 ,TETRA ,17551309,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:24:22 CET,0.0 1.138 1.582 1.935 2.226 2.498 2.742 2.947 3.335 3.522 3.699 3.433 4.194 4.346 4.629 4.921 5.201 5.332 5.592 5.838 6.198 6.422 6.624 6.914 7.205 7.491 7.775 8.049 8.389 8.716 9.025 9.394 9.75 10.108 10.503 10.923 11.343 11.814 12.335 12.881 13.445 14.099 14.896 15.693 16.586 17.553 18.719 20.052 21.575 23.336 25.351 26.784 27.244 27.278 27.14 26.909 26.623 26.334 26.04 25.677 25.322 25.007 24.705 24.402 24.091 23.8 23.467 23.152 22.895 22.615 22.284 21.992 21.719 21.427 21.172 20.909 20.624 20.335 20.029 19.796 19.554 19.197 18.949 18.671 18.507 18.156 17.831 17.473 17.272 16.507 16.6 16.344 16.106 15.549 15.206 14.831 14.405 13.905 13.314 12.569 9.549 -3 ,32219 ,TETRA ,17551310,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:24:29 CET,0.0 1.596 2.052 2.374 2.669 2.922 3.156 3.366 3.721 3.877 4.038 3.729 4.497 4.653 4.934 5.184 5.442 5.567 5.799 6.018 6.35 6.566 6.757 7.051 7.338 7.595 7.846 8.084 8.386 8.684 8.993 9.37 9.71 10.05 10.458 10.907 11.323 11.79 12.298 12.836 13.429 14.087 14.856 15.657 16.617 17.665 18.798 20.067 21.504 23.074 24.863 26.141 26.643 26.742 26.631 26.413 26.15 25.86 25.56 25.235 24.931 24.641 24.337 24.012 23.706 23.452 23.182 22.897 22.626 22.349 22.039 21.78 21.508 21.179 20.928 20.671 20.376 20.061 19.765 19.56 19.34 18.979 18.708 18.438 18.304 17.989 17.605 17.202 17.0 16.204 16.357 16.138 15.877 15.264 14.929 14.572 14.203 13.738 13.151 12.156 7.612 -4 ,15873 ,TETRA ,17551311,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:26:56 CET,0.0 0.742 1.124 1.428 1.671 1.901 2.112 2.316 2.717 2.902 3.07 2.795 3.575 3.727 4.003 4.275 4.545 4.674 4.927 5.189 5.564 5.796 6.01 6.308 6.596 6.877 7.151 7.427 7.769 8.073 8.356 8.715 9.093 9.45 9.832 10.249 10.654 11.123 11.632 12.148 12.686 13.306 14.059 14.82 15.712 16.721 17.849 19.062 20.485 22.163 24.108 25.428 25.979 26.2 26.157 25.981 25.836 25.59 25.271 24.942 24.648 24.351 24.014 23.699 23.4 23.099 22.772 22.455 22.178 21.898 21.608 21.362 21.093 20.813 20.582 20.331 20.067 19.781 19.476 19.268 19.058 18.723 18.47 18.181 18.021 17.697 17.37 17.017 16.826 16.046 16.16 15.897 15.638 15.141 14.819 14.446 14.055 13.608 13.111 12.427 8.744 -5 ,20179 ,TETRA ,17551312,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:25:08 CET,0.0 0.792 1.205 1.551 1.836 2.13 2.395 2.624 3.082 3.285 3.446 3.126 3.859 3.979 4.229 4.469 4.695 4.811 5.045 5.263 5.575 5.77 5.966 6.268 6.539 6.791 7.043 7.279 7.578 7.893 8.204 8.556 8.916 9.283 9.686 10.107 10.519 11.004 11.524 12.079 12.683 13.37 14.151 14.918 15.843 16.878 18.049 19.347 20.817 22.543 24.496 25.942 26.548 26.685 26.57 26.307 26.029 25.742 25.432 25.054 24.707 24.395 24.077 23.763 23.462 23.171 22.854 22.545 22.259 21.962 21.64 21.365 21.096 20.811 20.563 20.307 20.061 19.781 19.498 19.322 19.102 18.747 18.511 18.252 18.098 17.731 17.368 16.995 16.8 16.034 16.198 15.954 15.696 15.18 14.874 14.536 14.126 13.657 13.091 12.138 8.535 -6 ,25665 ,TETRA ,17551313,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:22:16 CET,0.0 0.968 1.401 1.739 2.005 2.249 2.471 2.672 3.075 3.253 3.405 3.111 3.856 3.991 4.256 4.502 4.73 4.849 5.091 5.327 5.656 5.852 6.04 6.326 6.59 6.832 7.081 7.327 7.657 8.003 8.336 8.707 9.064 9.418 9.828 10.284 10.713 11.181 11.689 12.215 12.79 13.45 14.222 15.011 15.937 16.98 18.209 19.632 21.292 23.151 25.138 26.562 27.176 27.333 27.315 27.154 26.904 26.631 26.376 26.044 25.718 25.414 25.081 24.755 24.445 24.171 23.868 23.551 23.271 22.986 22.666 22.39 22.116 21.819 21.575 21.28 20.944 20.63 20.301 20.072 19.838 19.457 19.158 18.801 18.629 18.291 17.915 17.518 17.316 16.508 16.517 16.239 15.942 15.337 15.029 14.687 14.312 13.823 13.178 12.303 9.002 -7 ,7000 ,TETRA ,17551314,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:26:00 CET,0.0 0.625 1.011 1.321 1.605 1.866 2.091 2.296 2.701 2.889 3.064 2.811 3.596 3.758 4.081 4.376 4.647 4.785 5.05 5.302 5.658 5.884 6.112 6.427 6.722 7.028 7.319 7.594 7.94 8.272 8.619 9.035 9.415 9.77 10.179 10.633 11.067 11.579 12.151 12.751 13.355 14.002 14.795 15.605 16.528 17.576 18.742 20.035 21.542 23.237 25.122 26.377 26.87 27.063 27.146 27.029 26.768 26.445 26.1 25.736 25.426 25.136 24.843 24.555 24.242 23.901 23.556 23.245 22.962 22.675 22.362 22.086 21.763 21.424 21.173 20.921 20.678 20.411 20.129 19.935 19.722 19.35 19.061 18.759 18.609 18.287 17.916 17.528 17.343 16.568 16.66 16.421 16.165 15.59 15.251 14.894 14.544 14.116 13.616 12.881 10.73 -8 ,14280 ,TETRA ,17551315,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:24:21 CET,0.0 0.772 1.226 1.577 1.844 2.145 2.443 2.677 3.034 3.195 3.367 3.065 3.816 3.959 4.235 4.495 4.737 4.847 5.044 5.252 5.566 5.764 5.959 6.24 6.527 6.807 7.07 7.33 7.655 7.959 8.256 8.624 8.987 9.332 9.717 10.139 10.546 10.998 11.484 12.01 12.572 13.208 13.961 14.722 15.624 16.65 17.841 19.187 20.711 22.4 24.358 25.66 26.172 26.331 26.256 26.075 25.853 25.597 25.314 24.959 24.587 24.241 23.937 23.618 23.311 23.031 22.701 22.401 22.127 21.814 21.482 21.192 20.885 20.561 20.29 20.022 19.734 19.435 19.139 18.913 18.66 18.248 17.965 17.665 17.509 17.194 16.856 16.497 16.311 15.535 15.631 15.368 15.112 14.554 14.234 13.877 13.497 13.083 12.575 11.723 9.102 -9 ,26667 ,TETRA ,17551316,Thu Nov 25 11:18:51 CET,Thu Nov 25 13:22:59 CET,0.0 0.699 1.113 1.421 1.687 1.935 2.163 2.387 2.812 3.014 3.203 2.964 3.734 3.893 4.219 4.509 4.781 4.921 5.193 5.445 5.801 6.028 6.247 6.562 6.867 7.157 7.423 7.676 8.002 8.322 8.619 8.985 9.352 9.714 10.164 10.64 11.059 11.532 12.055 12.617 13.184 13.847 14.613 15.351 16.228 17.214 18.407 19.766 21.27 22.952 24.844 26.131 26.698 26.948 26.935 26.745 26.408 26.038 25.71 25.335 25.004 24.671 24.326 24.007 23.725 23.45 23.138 22.864 22.607 22.322 22.036 21.784 21.508 21.236 21.013 20.787 20.547 20.262 19.939 19.714 19.5 19.169 18.916 18.638 18.494 18.163 17.802 17.433 17.234 16.449 16.591 16.359 16.124 15.58 15.241 14.898 14.535 14.081 13.431 12.444 8.011 -10 ,10869 ,TETRA ,17551317,Thu Nov 25 11:18:52 CET,Thu Nov 25 13:23:59 CET,0.0 0.732 1.111 1.421 1.707 1.96 2.189 2.408 2.827 3.028 3.211 2.95 3.721 3.884 4.203 4.498 4.781 4.928 5.218 5.478 5.821 6.045 6.26 6.561 6.862 7.14 7.393 7.631 7.941 8.25 8.557 8.953 9.326 9.674 10.086 10.56 11.025 11.509 12.01 12.562 13.166 13.832 14.579 15.334 16.238 17.256 18.394 19.674 21.243 23.002 24.781 26.133 26.858 27.02 26.896 26.677 26.395 26.127 25.875 25.544 25.165 24.783 24.428 24.086 23.764 23.457 23.088 22.751 22.479 22.198 21.893 21.637 21.362 21.049 20.805 20.54 20.253 19.955 19.621 19.384 19.141 18.734 18.435 18.148 17.992 17.658 17.303 16.901 16.68 15.899 15.959 15.651 15.333 14.697 14.357 14.012 13.591 13.049 12.406 11.433 7.559 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23467.txt deleted file mode 100644 index 16699acc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10856 ,TETRA ,17551330,Thu Nov 25 11:19:32 CET,Thu Nov 25 13:25:02 CET,0.0 0.817 1.281 1.668 2.027 2.356 2.664 2.94 3.436 3.665 3.892 3.752 4.553 4.749 5.129 5.474 5.809 5.976 6.301 6.619 7.042 7.298 7.541 7.889 8.245 8.595 8.921 9.23 9.634 10.008 10.371 10.834 11.267 11.659 12.115 12.653 13.166 13.736 14.344 14.999 15.726 16.528 17.461 18.391 19.429 20.601 21.967 23.445 25.081 26.977 29.19 30.766 31.487 31.727 31.738 31.63 31.456 31.267 31.056 30.792 30.515 30.204 29.9 29.626 29.349 29.092 28.794 28.518 28.279 28.004 27.716 27.47 27.202 26.921 26.7 26.478 26.233 25.931 25.61 25.393 25.166 24.806 24.55 24.288 24.142 23.842 23.53 23.16 22.968 22.23 22.381 22.157 21.936 21.457 21.169 20.854 20.498 20.117 19.669 19.02 17.351 -2 ,10628 ,TETRA ,17551332,Thu Nov 25 11:19:33 CET,Thu Nov 25 13:15:42 CET,0.0 0.886 1.285 1.634 1.967 2.264 2.544 2.816 3.308 3.532 3.738 3.517 4.307 4.482 4.823 5.145 5.444 5.597 5.906 6.195 6.601 6.855 7.102 7.46 7.809 8.149 8.472 8.788 9.188 9.561 9.939 10.395 10.801 11.215 11.726 12.277 12.791 13.362 13.975 14.645 15.366 16.161 17.094 18.05 19.101 20.206 21.447 22.807 24.379 26.251 28.427 29.936 30.631 30.906 30.934 30.85 30.706 30.5 30.229 29.896 29.629 29.361 29.064 28.777 28.504 28.263 27.997 27.742 27.489 27.192 26.875 26.612 26.341 26.063 25.858 25.628 25.37 25.11 24.846 24.653 24.45 24.126 23.892 23.645 23.511 23.225 22.917 22.545 22.362 21.618 21.783 21.596 21.415 20.988 20.744 20.493 20.212 19.879 19.463 18.87 16.883 -3 ,24968 ,TETRA ,17551334,Thu Nov 25 11:19:33 CET,Thu Nov 25 13:25:46 CET,0.0 0.949 1.412 1.792 2.119 2.412 2.675 2.937 3.433 3.65 3.846 3.608 4.382 4.565 4.935 5.288 5.622 5.786 6.103 6.414 6.838 7.094 7.349 7.716 8.057 8.385 8.702 9.012 9.412 9.782 10.136 10.563 10.97 11.374 11.863 12.403 12.913 13.47 14.068 14.71 15.361 16.069 16.923 17.797 18.789 19.888 21.178 22.669 24.391 26.319 28.469 30.074 30.78 31.114 31.23 31.181 31.077 30.895 30.674 30.425 30.174 29.94 29.69 29.426 29.154 28.884 28.6 28.309 28.05 27.753 27.422 27.176 26.943 26.697 26.491 26.281 26.067 25.836 25.59 25.421 25.24 24.959 24.766 24.553 24.437 24.194 23.917 23.628 23.489 22.774 23.0 22.819 22.644 22.194 21.95 21.639 21.27 20.83 20.287 19.596 17.141 -4 ,19099 ,TETRA ,17551336,Thu Nov 25 11:19:33 CET,Thu Nov 25 13:13:10 CET,0.0 1.704 2.302 2.729 3.049 3.338 3.612 3.862 4.32 4.528 4.721 4.466 5.256 5.426 5.744 6.043 6.314 6.452 6.726 6.98 7.356 7.598 7.843 8.194 8.536 8.873 9.18 9.47 9.846 10.23 10.612 11.048 11.445 11.842 12.305 12.814 13.304 13.845 14.432 15.063 15.729 16.448 17.285 18.143 19.16 20.334 21.699 23.174 24.844 26.781 28.949 30.431 31.119 31.354 31.315 31.189 31.032 30.851 30.65 30.384 30.092 29.809 29.543 29.293 29.018 28.727 28.421 28.157 27.937 27.714 27.463 27.234 27.007 26.763 26.54 26.298 26.071 25.845 25.596 25.413 25.224 24.917 24.684 24.425 24.287 24.025 23.77 23.506 23.361 22.623 22.832 22.653 22.459 22.033 21.796 21.545 21.228 20.827 20.349 19.726 18.144 -5 ,4576 ,TETRA ,17551338,Thu Nov 25 11:19:33 CET,Thu Nov 25 13:26:56 CET,0.0 1.816 2.356 2.757 3.094 3.376 3.645 3.901 4.325 4.519 4.711 4.454 5.23 5.386 5.707 6.023 6.316 6.457 6.718 6.969 7.352 7.604 7.843 8.173 8.493 8.815 9.133 9.436 9.834 10.222 10.599 11.058 11.476 11.876 12.354 12.901 13.426 13.993 14.593 15.206 15.869 16.605 17.448 18.282 19.211 20.285 21.555 22.991 24.65 26.582 28.871 30.491 31.094 31.341 31.412 31.371 31.238 31.023 30.814 30.578 30.32 30.06 29.799 29.519 29.226 28.942 28.644 28.37 28.114 27.847 27.56 27.303 27.036 26.752 26.519 26.289 26.057 25.8 25.52 25.329 25.137 24.828 24.609 24.376 24.249 23.989 23.703 23.368 23.174 22.397 22.576 22.365 22.146 21.655 21.381 21.101 20.786 20.383 19.911 19.251 16.974 -6 ,31613 ,TETRA ,17551340,Thu Nov 25 11:19:33 CET,Thu Nov 25 13:26:14 CET,0.0 0.934 1.428 1.78 2.1 2.391 2.642 2.884 3.325 3.53 3.725 3.495 4.27 4.442 4.765 5.085 5.387 5.527 5.799 6.049 6.403 6.631 6.862 7.205 7.52 7.832 8.14 8.438 8.808 9.153 9.493 9.923 10.333 10.714 11.138 11.622 12.127 12.687 13.28 13.908 14.569 15.294 16.127 17.012 18.072 19.244 20.565 22.053 23.789 25.674 27.774 29.331 30.067 30.346 30.357 30.252 30.048 29.811 29.604 29.39 29.171 28.945 28.701 28.417 28.117 27.837 27.562 27.317 27.083 26.82 26.529 26.275 26.004 25.714 25.486 25.248 24.985 24.72 24.454 24.278 24.094 23.758 23.525 23.284 23.157 22.895 22.598 22.282 22.128 21.392 21.572 21.364 21.154 20.687 20.426 20.131 19.815 19.495 19.166 18.657 16.85 -7 ,15389 ,TETRA ,17551342,Thu Nov 25 11:19:33 CET,Thu Nov 25 13:22:13 CET,0.0 0.917 1.392 1.796 2.123 2.436 2.753 3.043 3.518 3.739 3.953 3.748 4.536 4.715 5.068 5.413 5.727 5.878 6.195 6.489 6.887 7.143 7.395 7.759 8.103 8.447 8.786 9.101 9.508 9.913 10.292 10.758 11.217 11.632 12.109 12.625 13.114 13.668 14.263 14.892 15.559 16.3 17.184 18.099 19.161 20.38 21.766 23.36 25.246 27.466 29.913 31.41 32.111 32.403 32.476 32.412 32.262 32.081 31.893 31.652 31.412 31.176 30.89 30.604 30.351 30.112 29.852 29.61 29.359 29.055 28.751 28.514 28.264 28.005 27.789 27.559 27.334 27.092 26.844 26.642 26.411 26.054 25.795 25.532 25.402 25.12 24.79 24.421 24.237 23.488 23.684 23.487 23.284 22.851 22.594 22.319 22.044 21.742 21.355 20.827 19.216 -8 ,31983 ,TETRA ,17551344,Thu Nov 25 11:19:33 CET,Thu Nov 25 13:21:36 CET,0.0 0.893 1.302 1.624 1.946 2.25 2.506 2.755 3.239 3.461 3.67 3.462 4.258 4.457 4.824 5.148 5.444 5.584 5.869 6.153 6.547 6.798 7.04 7.393 7.739 8.051 8.347 8.642 9.02 9.392 9.763 10.194 10.6 11.007 11.476 11.984 12.477 13.017 13.59 14.218 14.871 15.606 16.486 17.405 18.483 19.666 20.99 22.438 24.117 25.994 28.035 29.429 29.991 30.203 30.265 30.205 30.047 29.857 29.641 29.352 29.062 28.793 28.496 28.197 27.927 27.673 27.382 27.107 26.867 26.614 26.355 26.139 25.88 25.586 25.377 25.162 24.921 24.662 24.379 24.183 23.985 23.655 23.391 23.117 22.99 22.709 22.402 22.099 21.941 21.191 21.387 21.192 20.961 20.398 20.103 19.791 19.44 19.045 18.558 17.904 16.011 -9 ,8981 ,TETRA ,17551346,Thu Nov 25 11:20:31 CET,Thu Nov 25 13:20:46 CET,0.0 1.121 1.627 2.027 2.403 2.766 3.091 3.368 3.854 4.09 4.314 4.127 4.945 5.15 5.526 5.89 6.234 6.393 6.681 6.942 7.329 7.586 7.834 8.179 8.512 8.836 9.137 9.423 9.774 10.125 10.471 10.893 11.303 11.666 12.091 12.602 13.082 13.578 14.112 14.685 15.295 16.001 16.842 17.669 18.599 19.62 20.839 22.244 23.841 25.736 27.987 29.55 30.236 30.501 30.494 30.335 30.101 29.86 29.644 29.372 29.092 28.828 28.579 28.304 27.999 27.725 27.417 27.129 26.876 26.586 26.273 26.022 25.776 25.494 25.253 25.007 24.756 24.501 24.223 24.022 23.81 23.458 23.22 22.98 22.843 22.54 22.24 21.908 21.712 20.948 21.108 20.888 20.674 20.231 19.979 19.689 19.372 19.014 18.573 17.963 15.437 -10 ,3649 ,TETRA ,17551348,Thu Nov 25 11:20:31 CET,Thu Nov 25 13:29:27 CET,0.0 0.742 1.163 1.531 1.872 2.185 2.464 2.74 3.271 3.496 3.709 3.536 4.34 4.533 4.882 5.208 5.526 5.676 5.972 6.272 6.679 6.918 7.158 7.538 7.894 8.228 8.538 8.827 9.197 9.571 9.942 10.375 10.79 11.206 11.691 12.232 12.743 13.292 13.903 14.57 15.275 16.019 16.872 17.763 18.806 19.914 21.142 22.574 24.197 26.083 28.231 29.787 30.509 30.77 30.801 30.648 30.481 30.272 30.033 29.784 29.526 29.24 28.902 28.579 28.302 28.045 27.748 27.486 27.244 26.944 26.62 26.368 26.106 25.827 25.62 25.404 25.165 24.917 24.649 24.452 24.262 23.949 23.719 23.491 23.377 23.112 22.808 22.506 22.333 21.58 21.789 21.588 21.384 20.957 20.704 20.426 20.125 19.731 19.139 18.251 16.356 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23468.txt deleted file mode 100644 index fa275ae7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26803 ,TETRA ,17551349,Thu Nov 25 11:21:11 CET,Thu Nov 25 13:24:15 CET,0.0 1.039 1.533 2.001 2.418 2.776 3.075 3.334 3.811 4.035 4.258 4.084 4.871 5.047 5.387 5.716 6.027 6.176 6.473 6.739 7.097 7.33 7.557 7.9 8.242 8.552 8.832 9.113 9.478 9.797 10.091 10.433 10.759 11.056 11.4 11.799 12.175 12.571 12.986 13.432 13.857 14.293 14.799 15.307 15.851 16.417 17.079 17.757 18.443 19.062 19.35 19.113 18.552 17.9 17.336 16.761 16.164 15.603 15.117 14.578 14.086 13.652 13.254 12.876 12.486 12.124 11.739 11.393 11.099 10.787 10.452 10.158 9.842 9.51 9.243 8.959 8.662 8.36 8.043 7.822 7.58 7.191 6.918 6.61 6.453 6.142 5.83 5.5 5.318 4.543 4.759 4.557 4.336 3.87 3.616 3.355 3.071 2.718 2.252 1.709 0.313 -2 ,12476 ,TETRA ,17551351,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 13:32:53 CET,0.0 1.014 1.497 1.867 2.192 2.511 2.801 3.067 3.548 3.768 3.981 3.762 4.538 4.721 5.048 5.375 5.691 5.844 6.13 6.396 6.786 7.037 7.275 7.605 7.912 8.193 8.467 8.72 9.025 9.347 9.677 10.058 10.416 10.756 11.131 11.539 11.901 12.277 12.686 13.128 13.59 14.052 14.576 15.08 15.6 16.172 16.797 17.48 18.139 18.629 18.872 18.572 18.0 17.316 16.644 16.0 15.393 14.825 14.321 13.808 13.33 12.893 12.482 12.073 11.684 11.344 10.991 10.652 10.355 10.021 9.646 9.339 9.03 8.698 8.412 8.116 7.808 7.49 7.17 6.943 6.714 6.337 6.07 5.795 5.649 5.349 5.032 4.679 4.493 3.696 3.868 3.625 3.367 2.828 2.539 2.226 1.89 1.522 1.068 0.529 -1.258 -3 ,24262 ,TETRA ,17551353,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 13:32:32 CET,0.0 1.214 1.793 2.215 2.545 2.835 3.123 3.396 3.906 4.128 4.336 4.155 4.94 5.112 5.439 5.755 6.072 6.223 6.511 6.798 7.195 7.439 7.687 8.048 8.366 8.651 8.93 9.204 9.582 9.925 10.213 10.542 10.866 11.179 11.531 11.926 12.297 12.689 13.088 13.511 13.971 14.464 14.997 15.487 16.029 16.625 17.269 17.932 18.614 19.203 19.573 19.394 18.889 18.368 17.824 17.221 16.664 16.153 15.682 15.184 14.726 14.3 13.861 13.435 13.052 12.693 12.307 11.973 11.689 11.385 11.036 10.73 10.417 10.08 9.811 9.535 9.246 8.945 8.626 8.38 8.118 7.732 7.461 7.162 7.014 6.727 6.41 6.062 5.868 5.073 5.227 4.994 4.761 4.27 4.0 3.707 3.358 2.98 2.543 2.03 0.991 -4 ,13767 ,TETRA ,17551355,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 13:28:27 CET,0.0 1.376 1.916 2.386 2.76 3.097 3.41 3.7 4.21 4.439 4.673 4.543 5.366 5.578 5.954 6.282 6.586 6.736 7.024 7.314 7.744 8.021 8.247 8.551 8.885 9.194 9.502 9.815 10.215 10.589 10.891 11.254 11.607 11.942 12.327 12.743 13.153 13.587 14.013 14.447 14.881 15.322 15.823 16.325 16.905 17.501 18.124 18.8 19.465 19.998 20.261 20.069 19.595 19.0 18.388 17.762 17.148 16.577 16.087 15.551 15.054 14.604 14.188 13.784 13.365 12.963 12.544 12.173 11.851 11.508 11.154 10.855 10.54 10.225 9.97 9.71 9.439 9.148 8.841 8.619 8.395 8.058 7.815 7.558 7.425 7.145 6.837 6.513 6.345 5.571 5.765 5.554 5.336 4.866 4.61 4.33 4.024 3.678 3.221 2.637 0.76 -5 ,23541 ,TETRA ,17551357,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 13:29:06 CET,0.0 1.926 2.453 2.902 3.289 3.6 3.871 4.149 4.649 4.864 5.062 4.842 5.646 5.841 6.196 6.511 6.813 6.958 7.237 7.5 7.857 8.085 8.311 8.635 8.943 9.229 9.485 9.745 10.092 10.428 10.75 11.11 11.439 11.75 12.097 12.459 12.798 13.175 13.577 13.979 14.405 14.875 15.398 15.879 16.439 17.039 17.644 18.258 18.855 19.342 19.624 19.471 19.026 18.493 17.906 17.322 16.755 16.185 15.69 15.154 14.657 14.185 13.705 13.247 12.837 12.478 12.106 11.759 11.448 11.133 10.792 10.492 10.173 9.835 9.561 9.278 8.996 8.709 8.39 8.155 7.89 7.456 7.164 6.859 6.706 6.382 6.023 5.625 5.409 4.585 4.758 4.53 4.295 3.809 3.561 3.254 2.908 2.536 2.103 1.602 -0.322 -6 ,12688 ,TETRA ,17551359,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 13:24:52 CET,0.0 2.912 3.635 4.158 4.599 4.99 5.34 5.66 6.229 6.484 6.728 6.582 7.405 7.611 8.004 8.356 8.695 8.875 9.21 9.515 9.946 10.227 10.498 10.87 11.197 11.494 11.773 12.041 12.366 12.686 13.004 13.363 13.703 14.032 14.412 14.821 15.192 15.601 16.05 16.507 16.959 17.477 18.066 18.645 19.269 19.861 20.475 21.148 21.811 22.333 22.692 22.506 21.991 21.42 20.831 20.254 19.704 19.156 18.66 18.142 17.692 17.269 16.833 16.414 16.034 15.688 15.334 15.036 14.732 14.365 13.997 13.694 13.378 13.031 12.741 12.45 12.158 11.844 11.51 11.278 11.049 10.718 10.485 10.234 10.103 9.81 9.494 9.171 8.993 8.211 8.423 8.21 7.996 7.556 7.308 7.03 6.724 6.376 5.986 5.479 4.101 -7 ,29138 ,TETRA ,17551361,Thu Nov 25 11:20:32 CET,Thu Nov 25 13:31:03 CET,0.0 1.466 1.936 2.284 2.607 2.924 3.196 3.454 3.965 4.207 4.429 4.229 5.01 5.19 5.55 5.894 6.228 6.398 6.708 6.981 7.373 7.623 7.863 8.196 8.51 8.815 9.107 9.384 9.73 10.055 10.357 10.722 11.088 11.438 11.817 12.213 12.595 13.006 13.412 13.837 14.272 14.74 15.254 15.743 16.281 16.858 17.482 18.109 18.752 19.36 19.729 19.503 18.961 18.317 17.651 16.998 16.348 15.73 15.201 14.638 14.143 13.718 13.285 12.856 12.47 12.111 11.726 11.378 11.078 10.75 10.396 10.103 9.803 9.484 9.218 8.946 8.677 8.391 8.1 7.896 7.671 7.322 7.064 6.792 6.656 6.366 6.067 5.742 5.563 4.796 5.02 4.832 4.616 4.114 3.843 3.549 3.224 2.875 2.454 1.934 1.001 -8 ,12406 ,TETRA ,17551363,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 13:21:40 CET,0.0 1.584 2.149 2.527 2.919 3.27 3.583 3.875 4.369 4.58 4.774 4.575 5.369 5.547 5.89 6.205 6.523 6.679 6.967 7.236 7.612 7.851 8.088 8.425 8.74 9.036 9.317 9.582 9.906 10.202 10.492 10.856 11.208 11.52 11.856 12.246 12.61 12.996 13.382 13.766 14.225 14.742 15.271 15.781 16.329 16.866 17.432 18.041 18.664 19.188 19.498 19.252 18.741 18.161 17.505 16.859 16.265 15.707 15.211 14.707 14.273 13.86 13.447 13.042 12.67 12.332 11.939 11.566 11.241 10.924 10.596 10.292 9.939 9.546 9.254 8.972 8.681 8.369 8.045 7.818 7.593 7.231 6.965 6.706 6.572 6.256 5.922 5.59 5.41 4.626 4.813 4.59 4.364 3.882 3.596 3.303 3.003 2.648 2.244 1.739 0.554 -9 ,11903 ,TETRA ,17551365,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 13:25:11 CET,0.0 2.67 3.193 3.578 3.916 4.221 4.495 4.758 5.246 5.464 5.67 5.459 6.262 6.431 6.763 7.068 7.351 7.487 7.746 7.999 8.376 8.603 8.812 9.135 9.447 9.726 9.995 10.254 10.57 10.871 11.144 11.447 11.735 12.034 12.377 12.738 13.085 13.445 13.826 14.226 14.615 15.039 15.531 16.02 16.561 17.097 17.679 18.277 18.824 19.302 19.55 19.323 18.859 18.322 17.742 17.162 16.648 16.162 15.702 15.201 14.746 14.33 13.934 13.566 13.213 12.884 12.512 12.169 11.891 11.589 11.264 10.969 10.645 10.317 10.053 9.784 9.493 9.182 8.863 8.637 8.408 8.03 7.758 7.475 7.331 7.035 6.712 6.363 6.174 5.379 5.603 5.391 5.172 4.714 4.436 4.11 3.763 3.386 2.925 2.344 0.563 -10 ,17465 ,TETRA ,17551367,Thu Nov 25 11:20:33 CET,Thu Nov 25 13:26:39 CET,0.0 1.285 1.826 2.248 2.607 2.94 3.241 3.5 3.987 4.207 4.421 4.25 5.062 5.248 5.576 5.898 6.219 6.366 6.64 6.896 7.281 7.536 7.78 8.117 8.421 8.708 8.995 9.26 9.59 9.907 10.207 10.579 10.924 11.232 11.592 11.981 12.337 12.758 13.199 13.639 14.091 14.589 15.169 15.708 16.27 16.845 17.429 18.004 18.624 19.255 19.615 19.408 18.901 18.297 17.662 17.031 16.446 15.886 15.37 14.851 14.396 13.962 13.534 13.114 12.716 12.339 11.937 11.583 11.272 10.933 10.583 10.29 9.978 9.65 9.387 9.113 8.828 8.542 8.23 7.99 7.749 7.39 7.121 6.822 6.66 6.331 5.99 5.641 5.465 4.683 4.876 4.667 4.45 3.98 3.729 3.436 3.103 2.754 2.337 1.809 0.498 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index bce63fb1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16374 ,TETRA ,17551374,Thu Nov 25 11:21:11 CET,Thu Nov 25 13:35:07 CET,0.0 0.915 1.401 1.819 2.207 2.556 2.872 3.16 3.689 3.922 4.133 3.933 4.733 4.918 5.26 5.589 5.913 6.067 6.357 6.637 7.043 7.306 7.563 7.946 8.317 8.669 9.014 9.34 9.737 10.101 10.455 10.905 11.338 11.743 12.219 12.753 13.257 13.805 14.396 15.023 15.689 16.443 17.351 18.267 19.323 20.522 21.89 23.447 25.258 27.234 29.51 31.367 32.304 32.701 32.847 32.907 32.861 32.705 32.511 32.273 32.045 31.805 31.544 31.308 31.087 30.862 30.588 30.324 30.113 29.889 29.64 29.414 29.173 28.92 28.698 28.483 28.269 28.013 27.719 27.512 27.309 26.998 26.764 26.496 26.36 26.089 25.788 25.47 25.302 24.519 24.688 24.494 24.288 23.814 23.521 23.208 22.893 22.525 22.141 21.706 20.665 -2 ,24960 ,TETRA ,17551378,Thu Nov 25 11:21:11 CET,Thu Nov 25 13:32:26 CET,0.0 1.239 1.721 2.14 2.521 2.862 3.182 3.498 4.031 4.26 4.477 4.28 5.085 5.288 5.671 6.029 6.393 6.567 6.877 7.172 7.597 7.856 8.11 8.488 8.86 9.217 9.545 9.866 10.284 10.678 11.042 11.483 11.91 12.311 12.775 13.286 13.769 14.303 14.896 15.525 16.179 16.936 17.823 18.703 19.766 20.959 22.26 23.743 25.503 27.585 30.059 31.854 32.665 33.025 33.163 33.204 33.142 32.997 32.863 32.701 32.507 32.297 32.081 31.843 31.581 31.337 31.093 30.857 30.631 30.396 30.148 29.932 29.687 29.403 29.179 28.952 28.736 28.498 28.229 28.022 27.798 27.459 27.227 26.977 26.84 26.566 26.269 25.955 25.789 25.03 25.192 24.976 24.756 24.279 23.999 23.702 23.385 22.999 22.566 21.951 20.424 -3 ,22217 ,TETRA ,17551381,Thu Nov 25 11:21:11 CET,Thu Nov 25 13:27:31 CET,0.0 1.129 1.672 2.113 2.484 2.824 3.11 3.364 3.843 4.07 4.292 4.124 4.95 5.133 5.488 5.822 6.143 6.298 6.605 6.909 7.328 7.595 7.864 8.255 8.633 8.982 9.295 9.59 9.979 10.371 10.758 11.224 11.663 12.078 12.554 13.095 13.634 14.215 14.844 15.515 16.194 16.974 17.898 18.813 19.878 21.077 22.461 23.959 25.733 27.962 30.563 32.479 33.415 33.856 34.035 34.112 34.052 33.886 33.711 33.464 33.233 33.0 32.738 32.475 32.22 32.004 31.768 31.521 31.302 31.071 30.795 30.549 30.309 30.049 29.836 29.622 29.397 29.156 28.875 28.671 28.476 28.179 27.956 27.708 27.582 27.306 26.999 26.678 26.514 25.762 25.952 25.737 25.497 24.965 24.685 24.357 24.004 23.63 23.172 22.593 20.954 -4 ,21161 ,TETRA ,17551383,Thu Nov 25 11:21:11 CET,Thu Nov 25 13:23:00 CET,0.0 1.065 1.573 2.049 2.438 2.769 3.071 3.347 3.822 4.051 4.268 4.063 4.875 5.067 5.448 5.805 6.131 6.286 6.605 6.913 7.331 7.605 7.876 8.263 8.638 8.984 9.321 9.654 10.063 10.449 10.825 11.267 11.675 12.062 12.516 13.015 13.496 14.073 14.685 15.293 15.939 16.662 17.527 18.476 19.579 20.748 22.099 23.634 25.444 27.568 29.975 31.814 32.762 33.257 33.531 33.609 33.582 33.495 33.341 33.144 32.927 32.707 32.495 32.249 31.989 31.765 31.516 31.26 31.032 30.814 30.594 30.399 30.2 29.993 29.8 29.616 29.433 29.208 28.965 28.803 28.626 28.321 28.09 27.837 27.714 27.459 27.195 26.917 26.763 26.005 26.242 26.039 25.823 25.39 25.167 24.902 24.569 24.221 23.865 23.398 22.229 -5 ,7827 ,TETRA ,17551385,Thu Nov 25 11:22:15 CET,Thu Nov 25 13:30:43 CET,0.0 1.307 1.798 2.18 2.5 2.804 3.095 3.366 3.869 4.111 4.341 4.147 4.954 5.147 5.501 5.844 6.169 6.324 6.631 6.921 7.351 7.63 7.889 8.263 8.622 8.96 9.29 9.61 10.0 10.377 10.752 11.222 11.667 12.055 12.508 13.038 13.545 14.103 14.727 15.396 16.076 16.815 17.683 18.571 19.602 20.773 22.107 23.58 25.367 27.396 29.726 31.616 32.464 32.793 32.913 32.938 32.876 32.773 32.664 32.463 32.217 31.994 31.763 31.536 31.314 31.089 30.827 30.575 30.341 30.075 29.802 29.587 29.35 29.074 28.868 28.654 28.426 28.154 27.813 27.558 27.323 26.98 26.737 26.459 26.3 25.997 25.725 25.441 25.268 24.515 24.742 24.543 24.324 23.887 23.644 23.358 23.022 22.635 22.215 21.711 19.506 -6 ,9623 ,TETRA ,17551387,Thu Nov 25 11:21:12 CET,Thu Nov 25 13:33:44 CET,0.0 1.119 1.688 2.127 2.445 2.731 3.028 3.321 3.852 4.092 4.31 4.1 4.897 5.104 5.507 5.86 6.186 6.345 6.655 6.959 7.392 7.654 7.911 8.282 8.621 8.934 9.238 9.53 9.926 10.327 10.702 11.152 11.588 12.004 12.462 12.962 13.445 13.982 14.575 15.209 15.849 16.589 17.483 18.35 19.376 20.551 21.919 23.455 25.188 27.354 30.015 32.027 33.041 33.575 33.899 34.027 33.952 33.812 33.651 33.418 33.192 32.952 32.676 32.404 32.147 31.912 31.639 31.356 31.114 30.871 30.607 30.368 30.095 29.824 29.625 29.386 29.11 28.854 28.598 28.397 28.174 27.797 27.522 27.219 27.06 26.737 26.368 25.952 25.743 24.961 25.068 24.812 24.547 23.979 23.664 23.328 22.968 22.538 22.049 21.376 19.524 -7 ,27912 ,TETRA ,17551389,Thu Nov 25 11:21:13 CET,Thu Nov 25 13:31:52 CET,0.0 1.276 1.779 2.145 2.458 2.75 3.047 3.33 3.845 4.087 4.314 4.132 4.953 5.146 5.525 5.886 6.223 6.383 6.69 6.979 7.394 7.668 7.938 8.32 8.664 8.986 9.302 9.595 9.988 10.382 10.757 11.216 11.662 12.094 12.579 13.109 13.64 14.228 14.863 15.519 16.191 16.977 17.9 18.814 19.871 21.071 22.418 23.945 25.796 27.951 30.297 31.963 32.879 33.36 33.512 33.546 33.527 33.423 33.261 33.053 32.837 32.608 32.392 32.182 31.951 31.72 31.477 31.247 31.042 30.809 30.53 30.297 30.073 29.83 29.617 29.381 29.12 28.84 28.538 28.331 28.121 27.784 27.558 27.313 27.178 26.891 26.595 26.301 26.144 25.386 25.603 25.4 25.195 24.735 24.463 24.177 23.867 23.512 23.112 22.578 21.002 -8 ,27219 ,TETRA ,17551391,Thu Nov 25 11:21:14 CET,Thu Nov 25 13:32:44 CET,0.0 1.175 1.696 2.126 2.489 2.822 3.145 3.431 3.906 4.118 4.334 4.154 4.942 5.136 5.512 5.863 6.186 6.341 6.653 6.947 7.365 7.631 7.892 8.283 8.664 9.026 9.368 9.704 10.136 10.539 10.931 11.398 11.838 12.282 12.795 13.336 13.833 14.365 14.961 15.613 16.299 17.076 17.967 18.877 19.955 21.134 22.494 24.044 25.869 28.011 30.439 32.154 33.025 33.564 33.782 33.823 33.76 33.631 33.49 33.295 33.099 32.906 32.683 32.45 32.228 32.005 31.762 31.536 31.319 31.07 30.799 30.578 30.341 30.085 29.873 29.639 29.401 29.142 28.856 28.654 28.455 28.141 27.904 27.648 27.521 27.271 26.979 26.637 26.456 25.695 25.87 25.657 25.418 24.876 24.573 24.234 23.863 23.461 23.005 22.426 20.749 -9 ,17215 ,TETRA ,17551392,Thu Nov 25 11:21:14 CET,Thu Nov 25 13:27:56 CET,0.0 0.874 1.324 1.707 2.047 2.343 2.614 2.875 3.365 3.605 3.85 3.702 4.51 4.712 5.103 5.49 5.844 6.003 6.301 6.583 7.002 7.272 7.532 7.918 8.305 8.678 9.018 9.338 9.745 10.142 10.53 11.0 11.467 11.913 12.418 12.989 13.535 14.111 14.728 15.374 16.057 16.836 17.748 18.653 19.659 20.786 22.129 23.649 25.452 27.521 29.825 31.523 32.315 32.693 32.883 32.95 32.921 32.836 32.698 32.487 32.28 32.09 31.877 31.641 31.4 31.159 30.9 30.665 30.455 30.194 29.917 29.712 29.467 29.208 29.001 28.757 28.51 28.251 27.951 27.732 27.515 27.176 26.929 26.688 26.554 26.266 25.977 25.655 25.486 24.722 24.914 24.71 24.505 24.023 23.741 23.451 23.15 22.798 22.389 21.796 19.879 -10 ,20868 ,TETRA ,17551393,Thu Nov 25 11:21:14 CET,Thu Nov 25 13:28:04 CET,0.0 1.09 1.599 1.998 2.356 2.69 2.99 3.235 3.681 3.911 4.146 3.97 4.76 4.949 5.321 5.662 5.981 6.134 6.436 6.745 7.197 7.477 7.741 8.122 8.476 8.814 9.16 9.497 9.913 10.302 10.669 11.095 11.5 11.916 12.397 12.909 13.399 13.942 14.517 15.145 15.811 16.545 17.423 18.317 19.381 20.559 21.906 23.468 25.23 27.235 29.588 31.371 32.267 32.634 32.775 32.827 32.782 32.673 32.543 32.398 32.217 32.023 31.816 31.549 31.287 31.046 30.78 30.518 30.284 30.053 29.772 29.521 29.272 28.97 28.734 28.505 28.255 28.008 27.748 27.561 27.365 27.047 26.794 26.528 26.396 26.116 25.813 25.472 25.29 24.527 24.729 24.515 24.295 23.822 23.55 23.243 22.918 22.565 22.153 21.64 20.342 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23469.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23469.txt deleted file mode 100644 index bfef0d03..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23469.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23906 ,KEBNE ,17019451,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:26:31 CET,0.0 1.249 1.785 2.205 2.579 2.917 3.21 3.492 3.998 4.225 4.452 4.363 5.145 5.341 5.698 6.037 6.355 6.504 6.78 7.046 7.453 7.722 7.983 8.366 8.718 9.04 9.374 9.697 10.095 10.487 10.885 11.363 11.819 12.273 12.775 13.291 13.783 14.318 14.897 15.528 16.161 16.867 17.705 18.544 19.525 20.621 21.858 23.289 24.968 26.856 29.03 30.559 31.179 31.463 31.565 31.49 31.361 31.187 30.98 30.76 30.54 30.313 30.095 29.882 29.663 29.431 29.161 28.932 28.703 28.441 28.186 27.984 27.778 27.53 27.306 27.075 26.846 26.602 26.327 26.126 25.924 25.587 25.36 25.131 25.004 24.746 24.475 24.188 24.045 23.362 23.563 23.387 23.2 22.78 22.552 22.286 21.988 21.608 21.102 20.494 19.612 -2 ,12679 ,KEBNE ,17019452,Wed Dec 22 02:41:30 CET,Wed Dec 22 04:26:46 CET,0.0 2.666 3.376 3.949 4.427 4.838 5.222 5.568 6.189 6.462 6.707 6.603 7.362 7.567 7.945 8.291 8.635 8.796 9.088 9.384 9.839 10.13 10.404 10.767 11.107 11.45 11.774 12.089 12.533 12.946 13.306 13.767 14.227 14.674 15.178 15.728 16.253 16.785 17.357 17.993 18.662 19.408 20.229 21.026 21.991 23.082 24.328 25.746 27.438 29.37 31.588 33.291 34.046 34.367 34.42 34.318 34.169 33.999 33.781 33.491 33.232 32.973 32.711 32.465 32.231 32.005 31.752 31.538 31.366 31.172 30.948 30.747 30.534 30.311 30.137 29.962 29.772 29.563 29.354 29.201 29.03 28.766 28.582 28.389 28.285 28.063 27.822 27.551 27.415 26.775 27.017 26.853 26.677 26.308 26.089 25.802 25.426 25.074 24.778 24.376 23.371 -3 ,10140 ,KEBNE ,17019453,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:26:04 CET,0.0 1.677 2.377 2.925 3.346 3.701 4.014 4.322 4.876 5.13 5.374 5.247 6.01 6.211 6.576 6.918 7.259 7.427 7.74 8.037 8.472 8.755 9.018 9.373 9.713 10.06 10.397 10.719 11.127 11.509 11.889 12.351 12.798 13.248 13.749 14.296 14.807 15.374 16.004 16.677 17.374 18.136 19.028 19.908 20.935 22.106 23.481 24.988 26.67 28.587 30.825 32.513 33.38 33.776 33.906 33.907 33.835 33.668 33.475 33.271 33.072 32.869 32.626 32.387 32.156 31.94 31.695 31.448 31.24 31.009 30.746 30.509 30.256 30.005 29.796 29.554 29.31 29.05 28.756 28.563 28.367 28.055 27.826 27.584 27.46 27.218 26.957 26.665 26.512 25.816 25.998 25.802 25.603 25.137 24.875 24.596 24.304 24.009 23.652 23.109 22.009 -4 ,27667 ,KEBNE ,17019454,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:25:44 CET,0.0 1.291 1.8 2.236 2.627 2.955 3.24 3.501 3.998 4.223 4.438 4.292 5.031 5.224 5.596 5.957 6.284 6.439 6.755 7.064 7.499 7.768 8.027 8.393 8.737 9.062 9.379 9.699 10.102 10.478 10.835 11.266 11.679 12.08 12.55 13.065 13.551 14.089 14.672 15.276 15.914 16.634 17.475 18.337 19.344 20.49 21.779 23.173 24.794 26.597 28.609 30.192 30.992 31.278 31.328 31.305 31.19 31.041 30.891 30.669 30.453 30.276 30.069 29.809 29.553 29.346 29.126 28.909 28.699 28.465 28.213 28.005 27.782 27.528 27.324 27.089 26.84 26.599 26.339 26.155 25.948 25.62 25.407 25.172 25.051 24.801 24.514 24.209 24.065 23.389 23.589 23.415 23.206 22.7 22.438 22.189 21.922 21.555 21.112 20.565 18.974 -5 ,11244 ,KEBNE ,17019455,Wed Dec 22 02:41:30 CET,Wed Dec 22 04:25:34 CET,0.0 1.931 2.485 2.922 3.255 3.578 3.859 4.111 4.6 4.84 5.07 4.93 5.673 5.862 6.227 6.577 6.917 7.072 7.372 7.672 8.092 8.35 8.608 9.011 9.394 9.758 10.098 10.399 10.806 11.213 11.582 12.011 12.421 12.825 13.295 13.822 14.317 14.861 15.469 16.125 16.799 17.549 18.399 19.199 20.149 21.229 22.439 23.801 25.445 27.37 29.422 30.811 31.437 31.705 31.75 31.718 31.678 31.572 31.407 31.194 30.965 30.74 30.527 30.319 30.099 29.868 29.579 29.307 29.07 28.835 28.597 28.379 28.151 27.904 27.719 27.528 27.313 27.098 26.873 26.704 26.521 26.242 26.038 25.829 25.726 25.503 25.263 24.986 24.847 24.17 24.371 24.177 23.963 23.472 23.226 22.991 22.731 22.436 21.968 21.174 18.085 -6 ,25726 ,KEBNE ,17019456,Wed Dec 22 02:41:30 CET,Wed Dec 22 04:25:58 CET,0.0 3.104 3.853 4.369 4.821 5.165 5.472 5.804 6.434 6.695 6.932 6.81 7.574 7.786 8.187 8.529 8.825 8.97 9.266 9.549 9.933 10.174 10.421 10.77 11.087 11.423 11.763 12.086 12.495 12.882 13.261 13.72 14.167 14.587 15.066 15.609 16.114 16.662 17.262 17.91 18.609 19.409 20.325 21.216 22.248 23.413 24.751 26.202 27.899 29.793 31.886 33.533 34.248 34.492 34.592 34.561 34.393 34.161 33.937 33.679 33.433 33.2 32.958 32.75 32.56 32.353 32.117 31.897 31.681 31.452 31.241 31.047 30.835 30.621 30.441 30.247 30.028 29.794 29.555 29.385 29.216 28.949 28.75 28.516 28.395 28.169 27.947 27.679 27.533 26.85 27.093 26.936 26.775 26.448 26.255 26.015 25.753 25.434 24.934 24.349 22.793 -7 ,23773 ,KEBNE ,17019457,Wed Dec 22 02:41:29 CET,Wed Dec 22 04:27:16 CET,0.0 2.279 2.875 3.245 3.57 3.883 4.216 4.52 5.059 5.318 5.547 5.405 6.166 6.372 6.776 7.156 7.483 7.651 7.995 8.312 8.733 8.991 9.235 9.586 9.94 10.288 10.615 10.923 11.299 11.664 12.023 12.437 12.829 13.212 13.65 14.153 14.664 15.221 15.81 16.416 17.036 17.737 18.578 19.454 20.452 21.533 22.79 24.21 25.812 27.581 29.448 30.628 31.148 31.362 31.379 31.287 31.09 30.845 30.618 30.387 30.156 29.903 29.656 29.411 29.159 28.935 28.666 28.412 28.201 27.933 27.66 27.466 27.23 26.948 26.743 26.539 26.304 26.051 25.781 25.576 25.371 25.035 24.813 24.603 24.483 24.21 23.912 23.614 23.455 22.751 22.943 22.756 22.557 22.13 21.904 21.664 21.402 21.09 20.694 20.028 17.252 -8 ,15023 ,KEBNE ,17019458,Wed Dec 22 02:42:31 CET,Wed Dec 22 04:26:51 CET,0.0 2.516 3.14 3.606 4.009 4.379 4.718 5.019 5.543 5.778 6.006 5.877 6.631 6.826 7.227 7.594 7.933 8.101 8.428 8.743 9.188 9.465 9.727 10.084 10.456 10.811 11.132 11.446 11.836 12.219 12.621 13.1 13.527 13.939 14.409 14.939 15.45 15.976 16.56 17.2 17.859 18.591 19.435 20.311 21.364 22.505 23.757 25.175 26.875 28.799 30.959 32.591 33.472 33.941 34.111 34.099 33.992 33.796 33.608 33.417 33.195 32.983 32.761 32.54 32.334 32.12 31.885 31.665 31.463 31.246 31.009 30.801 30.578 30.355 30.178 29.967 29.733 29.487 29.229 29.055 28.852 28.55 28.354 28.128 28.011 27.764 27.503 27.231 27.094 26.426 26.599 26.415 26.232 25.792 25.533 25.258 24.903 24.466 23.94 23.362 22.493 -9 ,11602 ,KEBNE ,17019459,Wed Dec 22 02:42:31 CET,Wed Dec 22 04:27:34 CET,0.0 1.113 1.61 2.007 2.35 2.704 3.047 3.329 3.889 4.168 4.415 4.279 5.021 5.239 5.665 6.061 6.42 6.598 6.967 7.314 7.798 8.103 8.387 8.804 9.217 9.609 9.974 10.301 10.731 11.17 11.588 12.11 12.58 13.003 13.515 14.096 14.629 15.232 15.896 16.534 17.198 17.953 18.763 19.585 20.583 21.696 23.005 24.438 26.119 28.099 30.266 31.798 32.55 32.961 33.102 33.015 32.861 32.734 32.604 32.431 32.212 31.995 31.786 31.548 31.324 31.12 30.917 30.735 30.539 30.305 30.053 29.859 29.648 29.414 29.243 29.052 28.831 28.607 28.372 28.203 28.025 27.737 27.541 27.339 27.232 26.977 26.699 26.406 26.247 25.561 25.748 25.548 25.332 24.845 24.564 24.255 23.912 23.507 22.998 22.297 20.534 -10 ,19752 ,KEBNE ,17019460,Wed Dec 22 02:42:31 CET,Wed Dec 22 04:26:42 CET,0.0 1.34 1.933 2.365 2.742 3.07 3.373 3.653 4.157 4.383 4.597 4.472 5.243 5.449 5.816 6.173 6.528 6.7 7.02 7.332 7.777 8.056 8.349 8.76 9.106 9.432 9.755 10.061 10.464 10.852 11.197 11.604 12.004 12.398 12.877 13.412 13.922 14.496 15.086 15.696 16.354 17.08 17.907 18.735 19.697 20.754 22.019 23.537 25.26 27.066 29.026 30.57 31.311 31.635 31.742 31.738 31.624 31.416 31.232 31.047 30.851 30.62 30.379 30.143 29.899 29.672 29.441 29.2 28.982 28.774 28.552 28.357 28.133 27.893 27.715 27.526 27.323 27.06 26.778 26.6 26.417 26.121 25.899 25.671 25.551 25.256 24.923 24.603 24.437 23.739 23.873 23.668 23.472 23.047 22.832 22.599 22.315 21.961 21.531 21.035 19.407 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23471.txt deleted file mode 100644 index e70b7a4c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2325 ,TETRA ,17551399,Thu Nov 25 11:22:15 CET,Thu Nov 25 13:34:35 CET,0.0 1.224 1.762 2.191 2.573 2.939 3.275 3.589 4.168 4.432 4.682 4.56 5.372 5.571 5.973 6.353 6.721 6.898 7.234 7.575 8.086 8.394 8.672 9.063 9.407 9.766 10.137 10.477 10.881 11.276 11.671 12.112 12.528 12.942 13.422 13.922 14.394 14.915 15.483 16.083 16.68 17.371 18.164 18.916 19.808 20.812 21.905 23.042 24.315 25.79 27.364 28.383 28.747 28.746 28.644 28.53 28.374 28.138 27.853 27.551 27.279 27.018 26.748 26.464 26.168 25.874 25.538 25.2 24.913 24.619 24.315 24.08 23.795 23.486 23.26 23.004 22.725 22.435 22.143 21.935 21.714 21.352 21.08 20.785 20.63 20.292 19.959 19.611 19.401 18.582 18.664 18.361 18.069 17.512 17.207 16.867 16.481 15.94 15.241 14.348 10.052 -2 ,22205 ,TETRA ,17551401,Thu Nov 25 11:22:15 CET,Thu Nov 25 13:42:35 CET,0.0 1.601 2.172 2.625 2.996 3.302 3.59 3.88 4.429 4.678 4.907 4.768 5.58 5.788 6.192 6.566 6.909 7.061 7.354 7.644 8.043 8.29 8.541 8.911 9.257 9.575 9.889 10.228 10.676 11.081 11.459 11.9 12.304 12.699 13.161 13.662 14.139 14.664 15.211 15.777 16.405 17.119 17.927 18.715 19.622 20.62 21.711 22.891 24.183 25.622 27.252 28.315 28.65 28.699 28.617 28.435 28.181 27.894 27.6 27.253 26.913 26.609 26.29 25.954 25.632 25.323 25.005 24.691 24.429 24.169 23.866 23.6 23.306 22.987 22.731 22.469 22.194 21.896 21.583 21.364 21.142 20.788 20.531 20.236 20.073 19.742 19.403 19.049 18.859 18.048 18.193 17.974 17.74 17.212 16.909 16.551 16.137 15.658 15.094 14.245 7.902 -3 ,926 ,TETRA ,17551403,Thu Nov 25 11:22:15 CET,Thu Nov 25 13:39:27 CET,0.0 1.18 1.724 2.16 2.521 2.844 3.143 3.432 3.97 4.231 4.483 4.328 5.128 5.333 5.731 6.117 6.487 6.664 7.007 7.339 7.798 8.097 8.381 8.754 9.135 9.532 9.89 10.229 10.656 11.069 11.454 11.886 12.297 12.693 13.136 13.612 14.084 14.615 15.186 15.777 16.397 17.117 17.939 18.725 19.586 20.536 21.653 22.825 24.063 25.401 26.93 27.906 28.148 28.094 27.94 27.739 27.481 27.183 26.913 26.632 26.34 26.039 25.743 25.43 25.11 24.797 24.461 24.148 23.863 23.56 23.223 22.939 22.643 22.306 22.051 21.812 21.557 21.258 20.909 20.68 20.459 20.091 19.823 19.521 19.359 19.059 18.743 18.381 18.189 17.38 17.529 17.302 17.046 16.453 16.143 15.82 15.456 15.058 14.581 13.928 12.215 -4 ,12563 ,TETRA ,17551405,Thu Nov 25 11:22:15 CET,Thu Nov 25 13:39:27 CET,0.0 1.048 1.553 1.979 2.361 2.681 2.955 3.211 3.697 3.939 4.166 3.969 4.774 4.976 5.364 5.721 6.042 6.195 6.499 6.8 7.232 7.476 7.703 8.068 8.43 8.771 9.093 9.408 9.814 10.186 10.558 11.003 11.408 11.808 12.283 12.829 13.344 13.886 14.467 15.094 15.76 16.475 17.252 18.035 18.99 20.061 21.236 22.549 24.072 25.637 27.263 28.321 28.735 28.777 28.575 28.323 28.064 27.747 27.446 27.135 26.823 26.498 26.194 25.877 25.55 25.268 24.933 24.612 24.357 24.086 23.783 23.543 23.278 22.952 22.68 22.401 22.089 21.768 21.449 21.228 20.99 20.59 20.318 20.055 19.915 19.609 19.255 18.868 18.681 17.9 18.058 17.803 17.533 16.884 16.541 16.208 15.86 15.498 14.899 13.79 9.426 -5 ,15852 ,TETRA ,17551407,Thu Nov 25 11:22:14 CET,Thu Nov 25 13:33:08 CET,0.0 1.121 1.653 2.058 2.392 2.704 2.976 3.233 3.734 3.951 4.161 3.969 4.786 4.979 5.329 5.654 5.975 6.137 6.465 6.767 7.185 7.472 7.741 8.092 8.432 8.759 9.071 9.378 9.762 10.115 10.453 10.862 11.272 11.659 12.102 12.628 13.154 13.717 14.298 14.936 15.613 16.335 17.213 18.083 19.014 20.027 21.171 22.42 23.837 25.351 26.883 27.913 28.262 28.271 28.155 27.921 27.59 27.204 26.831 26.442 26.1 25.778 25.455 25.13 24.804 24.492 24.165 23.854 23.559 23.244 22.935 22.662 22.359 22.045 21.796 21.539 21.262 20.962 20.628 20.388 20.157 19.803 19.552 19.291 19.151 18.81 18.459 18.112 17.9 17.078 17.236 17.013 16.763 16.204 15.886 15.547 15.189 14.791 14.276 13.618 10.39 -6 ,6513 ,TETRA ,17551409,Thu Nov 25 11:22:15 CET,Thu Nov 25 13:33:36 CET,0.0 1.327 1.884 2.308 2.662 2.964 3.249 3.519 3.986 4.199 4.416 4.214 5.007 5.197 5.572 5.917 6.247 6.403 6.69 6.978 7.411 7.679 7.945 8.328 8.675 9.035 9.377 9.67 10.073 10.473 10.833 11.27 11.703 12.115 12.586 13.127 13.638 14.174 14.747 15.336 15.94 16.626 17.423 18.205 19.095 20.062 21.157 22.395 23.8 25.338 26.969 27.962 28.292 28.385 28.309 28.152 27.959 27.705 27.456 27.197 26.94 26.653 26.37 26.101 25.847 25.629 25.391 25.13 24.882 24.602 24.26 23.975 23.688 23.372 23.108 22.839 22.579 22.317 22.026 21.829 21.62 21.25 21.01 20.763 20.628 20.354 20.047 19.711 19.546 18.754 18.873 18.604 18.322 17.783 17.505 17.198 16.814 16.275 15.463 14.421 10.502 -7 ,11892 ,TETRA ,17551410,Thu Nov 25 11:22:15 CET,Thu Nov 25 13:30:00 CET,0.0 1.298 1.816 2.273 2.658 2.951 3.219 3.494 3.994 4.232 4.462 4.28 5.09 5.283 5.67 6.054 6.398 6.561 6.886 7.197 7.612 7.862 8.115 8.493 8.856 9.208 9.531 9.834 10.233 10.609 10.958 11.385 11.818 12.229 12.721 13.273 13.777 14.323 14.899 15.504 16.13 16.838 17.655 18.478 19.409 20.41 21.598 22.884 24.243 25.73 27.267 28.222 28.509 28.462 28.272 28.04 27.8 27.52 27.191 26.81 26.482 26.151 25.807 25.497 25.185 24.883 24.57 24.293 24.027 23.717 23.368 23.061 22.761 22.456 22.198 21.916 21.643 21.366 21.059 20.809 20.522 20.112 19.855 19.567 19.411 19.104 18.759 18.372 18.163 17.348 17.458 17.169 16.859 16.157 15.789 15.409 14.967 14.423 13.679 12.738 9.809 -8 ,26697 ,TETRA ,17551411,Thu Nov 25 11:22:16 CET,Thu Nov 25 13:28:24 CET,0.0 1.244 1.74 2.149 2.494 2.797 3.092 3.356 3.83 4.071 4.311 4.158 4.973 5.167 5.55 5.9 6.213 6.371 6.68 6.969 7.385 7.654 7.909 8.266 8.63 8.975 9.297 9.62 10.013 10.378 10.745 11.174 11.58 11.976 12.425 12.922 13.403 13.942 14.519 15.121 15.727 16.418 17.23 18.007 18.897 19.858 20.984 22.29 23.755 25.303 26.803 27.738 28.132 28.217 28.142 27.956 27.715 27.451 27.182 26.865 26.586 26.336 26.057 25.793 25.552 25.301 25.024 24.758 24.498 24.206 23.904 23.631 23.325 23.003 22.729 22.439 22.146 21.842 21.527 21.309 21.082 20.727 20.485 20.229 20.09 19.796 19.479 19.158 18.991 18.213 18.375 18.128 17.888 17.366 17.087 16.75 16.362 15.947 15.396 14.655 10.426 -9 ,16774 ,TETRA ,17551412,Thu Nov 25 11:23:13 CET,Thu Nov 25 13:42:44 CET,0.0 1.256 1.756 2.166 2.567 2.931 3.272 3.579 4.133 4.387 4.629 4.492 5.295 5.513 5.926 6.312 6.691 6.874 7.237 7.6 8.089 8.392 8.671 9.034 9.386 9.712 10.016 10.336 10.749 11.136 11.5 11.95 12.394 12.808 13.301 13.842 14.33 14.879 15.49 16.153 16.835 17.586 18.451 19.284 20.204 21.204 22.349 23.623 25.072 26.606 28.215 29.153 29.381 29.371 29.239 28.971 28.663 28.395 28.132 27.829 27.517 27.199 26.899 26.597 26.287 25.965 25.605 25.293 25.051 24.789 24.439 24.15 23.869 23.526 23.253 22.993 22.714 22.396 22.048 21.794 21.526 21.073 20.757 20.441 20.268 19.89 19.471 19.029 18.801 17.99 18.106 17.858 17.6 17.036 16.702 16.345 15.934 15.417 14.78 13.82 10.751 -10 ,12967 ,TETRA ,17551413,Thu Nov 25 11:23:13 CET,Thu Nov 25 13:40:09 CET,0.0 1.79 2.355 2.843 3.25 3.605 3.919 4.187 4.668 4.894 5.111 4.952 5.756 5.966 6.366 6.737 7.08 7.233 7.517 7.793 8.184 8.434 8.671 9.027 9.373 9.699 10.018 10.33 10.75 11.144 11.491 11.918 12.332 12.707 13.16 13.683 14.157 14.667 15.235 15.827 16.408 17.103 17.916 18.699 19.617 20.571 21.678 22.939 24.343 25.77 27.206 28.116 28.4 28.412 28.289 28.079 27.835 27.601 27.343 27.022 26.677 26.342 26.01 25.674 25.35 25.063 24.739 24.44 24.167 23.85 23.53 23.258 22.967 22.652 22.386 22.092 21.8 21.488 21.126 20.88 20.623 20.216 19.95 19.669 19.519 19.202 18.853 18.486 18.294 17.485 17.589 17.29 17.009 16.45 16.12 15.73 15.311 14.874 14.309 13.538 10.634 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23473_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23473_23467.txt deleted file mode 100644 index 2e616208..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23473_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22838 ,TETRA ,17551423,Thu Nov 25 11:23:15 CET,Thu Nov 25 13:32:50 CET,0.0 0.877 1.381 1.754 2.056 2.316 2.558 2.774 3.159 3.341 3.523 3.294 4.028 4.179 4.456 4.724 4.978 5.1 5.345 5.571 5.884 6.099 6.309 6.574 6.809 7.046 7.272 7.474 7.743 8.019 8.279 8.581 8.87 9.14 9.457 9.81 10.121 10.468 10.845 11.202 11.574 11.991 12.459 12.92 13.457 14.063 14.722 15.403 16.113 16.838 17.528 17.772 17.615 17.312 16.942 16.558 16.182 15.762 15.375 14.985 14.6 14.226 13.862 13.49 13.13 12.803 12.437 12.099 11.799 11.493 11.172 10.881 10.562 10.238 9.995 9.727 9.457 9.176 8.841 8.603 8.37 8.001 7.742 7.456 7.307 6.974 6.586 6.215 6.03 5.25 5.351 5.105 4.845 4.262 3.951 3.589 3.187 2.755 2.186 1.394 -2.503 -2 ,22616 ,TETRA ,17551425,Thu Nov 25 11:23:15 CET,Thu Nov 25 13:29:35 CET,0.0 0.924 1.306 1.595 1.839 2.086 2.316 2.521 2.879 3.034 3.201 2.956 3.684 3.825 4.099 4.371 4.621 4.737 4.965 5.179 5.493 5.695 5.883 6.152 6.412 6.659 6.886 7.102 7.385 7.651 7.916 8.231 8.517 8.793 9.096 9.436 9.748 10.082 10.461 10.851 11.233 11.661 12.179 12.668 13.241 13.884 14.561 15.296 16.05 16.776 17.339 17.43 17.253 16.896 16.484 16.056 15.629 15.21 14.796 14.373 14.019 13.671 13.313 12.967 12.653 12.356 12.026 11.722 11.427 11.106 10.785 10.529 10.242 9.903 9.65 9.403 9.148 8.88 8.582 8.362 8.118 7.746 7.51 7.263 7.133 6.834 6.499 6.142 5.941 5.159 5.259 5.02 4.76 4.103 3.746 3.368 2.924 2.357 1.61 0.526 -5.355 -3 ,32724 ,TETRA ,17551426,Thu Nov 25 11:23:15 CET,Thu Nov 25 13:36:32 CET,0.0 0.701 1.119 1.442 1.713 1.977 2.214 2.442 2.861 3.06 3.273 3.083 3.81 3.972 4.279 4.566 4.835 4.966 5.223 5.449 5.747 5.941 6.152 6.451 6.708 6.976 7.247 7.484 7.782 8.064 8.318 8.614 8.9 9.172 9.482 9.839 10.175 10.547 10.935 11.312 11.706 12.145 12.656 13.156 13.718 14.313 14.954 15.627 16.347 17.066 17.694 17.867 17.679 17.256 16.761 16.283 15.836 15.371 14.93 14.462 14.064 13.726 13.402 13.069 12.74 12.419 12.067 11.743 11.475 11.199 10.903 10.649 10.351 10.04 9.805 9.54 9.242 8.925 8.591 8.349 8.094 7.675 7.379 7.068 6.896 6.527 6.149 5.753 5.525 4.737 4.796 4.497 4.193 3.569 3.217 2.855 2.46 1.999 1.434 0.647 -2.447 -5 ,19500 ,TETRA ,17551428,Thu Nov 25 11:23:15 CET,Thu Nov 25 13:32:51 CET,0.0 1.152 1.55 1.878 2.176 2.433 2.655 2.864 3.237 3.407 3.573 3.326 4.049 4.195 4.467 4.713 4.941 5.057 5.276 5.473 5.757 5.946 6.138 6.415 6.673 6.921 7.165 7.388 7.671 7.952 8.203 8.491 8.758 9.025 9.365 9.722 10.042 10.395 10.76 11.125 11.507 11.942 12.44 12.914 13.446 14.031 14.689 15.41 16.19 16.92 17.504 17.729 17.621 17.373 17.076 16.72 16.317 15.873 15.442 14.999 14.61 14.224 13.845 13.484 13.146 12.834 12.504 12.194 11.902 11.588 11.24 10.949 10.642 10.304 10.024 9.721 9.412 9.1 8.788 8.558 8.295 7.87 7.577 7.26 7.096 6.74 6.363 5.947 5.73 4.95 5.04 4.779 4.521 4.007 3.696 3.343 2.914 2.388 1.739 0.885 -7.936 -6 ,26455 ,TETRA ,17551429,Thu Nov 25 11:24:09 CET,Thu Nov 25 13:30:19 CET,0.0 0.942 1.474 1.902 2.203 2.437 2.642 2.82 3.157 3.324 3.495 3.28 4.025 4.174 4.47 4.756 5.014 5.141 5.385 5.587 5.871 6.055 6.239 6.522 6.786 7.024 7.256 7.468 7.729 7.993 8.24 8.531 8.813 9.075 9.378 9.714 10.039 10.401 10.764 11.125 11.517 11.954 12.441 12.908 13.43 13.986 14.581 15.207 15.882 16.546 17.102 17.196 17.031 16.744 16.343 15.858 15.399 14.949 14.496 14.057 13.713 13.384 13.052 12.737 12.411 12.067 11.704 11.382 11.08 10.757 10.44 10.197 9.922 9.577 9.294 9.01 8.706 8.398 8.093 7.879 7.65 7.277 7.028 6.777 6.626 6.296 5.951 5.574 5.395 4.639 4.81 4.588 4.358 3.847 3.547 3.224 2.86 2.393 1.734 0.917 -2.936 -7 ,17690 ,TETRA ,17551430,Thu Nov 25 11:24:08 CET,Thu Nov 25 13:33:49 CET,0.0 0.701 1.125 1.429 1.714 1.974 2.192 2.394 2.754 2.932 3.115 2.88 3.609 3.756 4.037 4.287 4.548 4.675 4.908 5.13 5.428 5.609 5.792 6.062 6.323 6.559 6.786 7.018 7.313 7.581 7.855 8.188 8.464 8.712 9.001 9.348 9.67 10.024 10.389 10.748 11.121 11.526 12.028 12.529 13.07 13.627 14.24 14.917 15.637 16.383 17.04 17.194 17.034 16.754 16.41 16.065 15.728 15.347 14.965 14.549 14.171 13.824 13.463 13.098 12.769 12.466 12.154 11.874 11.592 11.272 10.945 10.668 10.37 10.059 9.818 9.57 9.292 8.978 8.654 8.432 8.182 7.773 7.509 7.222 7.063 6.725 6.344 5.937 5.721 4.91 4.989 4.743 4.471 3.802 3.428 3.061 2.66 2.115 1.47 0.709 -3.261 -8 ,29873 ,TETRA ,17551431,Thu Nov 25 11:24:09 CET,Thu Nov 25 13:41:39 CET,0.0 0.702 1.087 1.361 1.629 1.892 2.129 2.349 2.772 2.963 3.133 2.879 3.63 3.787 4.072 4.323 4.56 4.681 4.924 5.157 5.493 5.7 5.887 6.142 6.38 6.607 6.83 7.05 7.332 7.603 7.859 8.166 8.449 8.701 8.99 9.328 9.671 10.053 10.453 10.853 11.252 11.66 12.12 12.596 13.136 13.72 14.407 15.138 15.854 16.619 17.313 17.59 17.514 17.257 16.874 16.484 16.121 15.69 15.295 14.933 14.581 14.191 13.797 13.444 13.102 12.76 12.413 12.113 11.828 11.501 11.167 10.886 10.529 10.132 9.839 9.549 9.235 8.897 8.533 8.244 7.94 7.479 7.148 6.803 6.635 6.329 5.988 5.583 5.381 4.597 4.667 4.423 4.157 3.526 3.159 2.719 2.201 1.606 0.878 -0.093 -4.996 -9 ,25635 ,TETRA ,17551432,Thu Nov 25 11:24:09 CET,Thu Nov 25 13:38:11 CET,0.0 0.721 1.07 1.418 1.723 1.978 2.202 2.4 2.766 2.945 3.114 2.863 3.605 3.747 4.019 4.284 4.524 4.645 4.881 5.095 5.384 5.564 5.742 6.003 6.248 6.482 6.715 6.947 7.237 7.517 7.773 8.06 8.328 8.587 8.899 9.254 9.561 9.882 10.24 10.604 10.983 11.398 11.901 12.399 12.936 13.51 14.128 14.739 15.416 16.164 16.778 16.981 16.861 16.594 16.246 15.861 15.488 15.116 14.728 14.334 13.993 13.648 13.314 12.986 12.659 12.357 12.015 11.7 11.441 11.137 10.801 10.51 10.19 9.86 9.61 9.357 9.07 8.763 8.431 8.207 7.988 7.607 7.314 7.003 6.844 6.509 6.132 5.742 5.54 4.734 4.804 4.52 4.215 3.568 3.182 2.75 2.275 1.59 0.651 -0.405 -4.251 -10 ,16077 ,TETRA ,17551433,Thu Nov 25 11:24:08 CET,Thu Nov 25 13:33:30 CET,0.0 0.725 1.173 1.561 1.817 2.041 2.257 2.472 2.838 3.012 3.206 2.961 3.676 3.819 4.087 4.327 4.568 4.685 4.914 5.132 5.433 5.624 5.803 6.057 6.301 6.524 6.733 6.941 7.202 7.461 7.71 8.009 8.29 8.551 8.858 9.225 9.584 9.959 10.363 10.763 11.16 11.606 12.093 12.592 13.18 13.805 14.502 15.216 15.979 16.745 17.413 17.637 17.42 17.006 16.573 16.145 15.724 15.308 14.922 14.525 14.173 13.826 13.48 13.148 12.818 12.5 12.17 11.858 11.561 11.259 10.958 10.673 10.345 10.022 9.763 9.487 9.209 8.896 8.554 8.32 8.077 7.692 7.427 7.162 7.022 6.73 6.391 5.975 5.764 4.964 5.038 4.808 4.568 4.031 3.709 3.33 2.919 2.493 1.973 1.199 -5.953 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index 96f854c7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14551 ,TETRA ,17551444,Thu Nov 25 11:25:08 CET,Thu Nov 25 13:43:50 CET,0.0 1.301 1.82 2.214 2.555 2.868 3.151 3.414 3.915 4.153 4.388 4.251 5.004 5.177 5.514 5.805 6.058 6.182 6.432 6.669 6.975 7.182 7.383 7.658 7.915 8.164 8.403 8.626 8.927 9.208 9.456 9.745 10.031 10.321 10.655 11.005 11.329 11.684 12.04 12.406 12.804 13.258 13.772 14.244 14.732 15.281 15.868 16.466 17.108 17.712 18.195 18.166 17.798 17.293 16.775 16.292 15.812 15.325 14.878 14.425 14.019 13.631 13.246 12.886 12.548 12.219 11.861 11.545 11.273 10.977 10.659 10.391 10.107 9.809 9.563 9.301 9.03 8.743 8.436 8.216 7.985 7.611 7.318 7.015 6.867 6.566 6.259 5.921 5.745 4.988 5.168 4.943 4.705 4.19 3.907 3.606 3.286 2.928 2.547 2.032 0.629 -2 ,11495 ,TETRA ,17551447,Thu Nov 25 11:25:09 CET,Thu Nov 25 13:40:38 CET,0.0 0.995 1.448 1.829 2.173 2.484 2.774 3.026 3.488 3.705 3.91 3.721 4.474 4.664 5.025 5.365 5.687 5.837 6.111 6.375 6.741 6.971 7.201 7.519 7.804 8.074 8.335 8.584 8.933 9.267 9.558 9.88 10.181 10.473 10.781 11.105 11.44 11.82 12.215 12.621 13.017 13.474 14.003 14.494 15.078 15.699 16.301 16.894 17.513 18.097 18.399 18.164 17.693 17.213 16.696 16.165 15.691 15.234 14.79 14.332 13.926 13.536 13.149 12.796 12.465 12.138 11.766 11.419 11.132 10.834 10.535 10.306 10.011 9.638 9.365 9.088 8.776 8.414 8.032 7.785 7.529 7.138 6.88 6.604 6.448 6.118 5.768 5.398 5.199 4.416 4.51 4.27 4.013 3.448 3.164 2.855 2.454 2.035 1.63 1.068 -0.281 -3 ,15025 ,TETRA ,17551449,Thu Nov 25 11:25:08 CET,Thu Nov 25 13:35:52 CET,0.0 1.175 1.692 2.154 2.483 2.775 3.025 3.216 3.59 3.763 3.928 3.685 4.428 4.579 4.869 5.126 5.378 5.499 5.73 5.955 6.262 6.46 6.655 6.932 7.19 7.46 7.728 7.958 8.245 8.525 8.805 9.137 9.449 9.733 10.049 10.403 10.704 11.039 11.403 11.786 12.194 12.602 13.033 13.455 13.957 14.507 15.139 15.832 16.505 17.094 17.571 17.679 17.427 16.99 16.489 16.012 15.606 15.214 14.84 14.452 14.1 13.773 13.463 13.154 12.825 12.52 12.203 11.885 11.61 11.323 11.0 10.747 10.484 10.195 9.96 9.7 9.449 9.179 8.858 8.641 8.414 8.049 7.808 7.548 7.413 7.118 6.787 6.436 6.246 5.471 5.669 5.461 5.251 4.767 4.504 4.232 3.9 3.518 3.108 2.527 1.383 -4 ,3729 ,TETRA ,17551451,Thu Nov 25 11:25:08 CET,Thu Nov 25 13:34:08 CET,0.0 0.944 1.368 1.729 2.054 2.349 2.603 2.834 3.269 3.471 3.668 3.449 4.184 4.358 4.686 4.965 5.236 5.376 5.634 5.861 6.214 6.452 6.665 6.966 7.285 7.57 7.803 8.032 8.329 8.587 8.832 9.151 9.456 9.755 10.089 10.435 10.77 11.121 11.48 11.86 12.258 12.716 13.256 13.769 14.348 14.98 15.658 16.359 17.099 17.783 18.266 18.249 17.928 17.475 16.972 16.497 16.042 15.582 15.15 14.704 14.34 14.015 13.673 13.342 13.027 12.714 12.354 12.02 11.741 11.456 11.129 10.84 10.57 10.271 9.977 9.665 9.387 9.1 8.771 8.528 8.262 7.874 7.618 7.367 7.233 6.904 6.539 6.146 5.949 5.179 5.316 5.077 4.83 4.314 4.037 3.742 3.418 3.036 2.583 1.944 0.157 -5 ,27197 ,TETRA ,17551453,Thu Nov 25 11:25:08 CET,Thu Nov 25 13:37:24 CET,0.0 1.054 1.5 1.805 2.108 2.395 2.63 2.845 3.24 3.414 3.59 3.351 4.099 4.259 4.552 4.838 5.089 5.211 5.465 5.716 6.075 6.274 6.454 6.722 6.961 7.188 7.43 7.668 7.954 8.218 8.474 8.792 9.089 9.373 9.691 10.023 10.375 10.757 11.124 11.508 11.913 12.367 12.85 13.283 13.793 14.328 14.908 15.542 16.165 16.754 17.19 17.123 16.785 16.376 15.923 15.443 14.979 14.542 14.146 13.714 13.326 12.985 12.647 12.301 11.969 11.645 11.291 10.981 10.704 10.4 10.085 9.823 9.53 9.201 8.965 8.714 8.441 8.16 7.844 7.606 7.357 6.989 6.723 6.459 6.325 6.034 5.72 5.381 5.207 4.428 4.584 4.359 4.112 3.591 3.313 3.004 2.665 2.28 1.817 1.266 0.284 -6 ,8042 ,TETRA ,17551455,Thu Nov 25 11:26:07 CET,Thu Nov 25 13:31:33 CET,0.0 0.959 1.426 1.788 2.077 2.353 2.626 2.872 3.318 3.53 3.719 3.5 4.258 4.419 4.736 5.04 5.311 5.446 5.702 5.935 6.278 6.504 6.709 6.994 7.28 7.55 7.812 8.06 8.362 8.636 8.896 9.194 9.458 9.725 10.026 10.349 10.657 10.969 11.294 11.64 12.0 12.403 12.861 13.298 13.822 14.412 14.998 15.575 16.2 16.794 17.141 17.077 16.766 16.313 15.837 15.36 14.882 14.414 13.997 13.561 13.164 12.798 12.444 12.101 11.772 11.488 11.194 10.902 10.647 10.386 10.107 9.859 9.581 9.291 9.078 8.832 8.551 8.276 7.982 7.776 7.574 7.214 6.934 6.663 6.52 6.218 5.929 5.615 5.435 4.646 4.777 4.549 4.323 3.804 3.488 3.14 2.773 2.377 1.934 1.357 -0.505 -7 ,20656 ,TETRA ,17551457,Thu Nov 25 11:26:07 CET,Thu Nov 25 13:39:37 CET,0.0 0.859 1.293 1.654 1.973 2.254 2.509 2.753 3.195 3.394 3.581 3.352 4.108 4.268 4.579 4.866 5.123 5.254 5.519 5.746 6.081 6.305 6.507 6.793 7.075 7.336 7.571 7.801 8.103 8.382 8.637 8.95 9.237 9.511 9.843 10.197 10.516 10.873 11.257 11.661 12.077 12.508 12.988 13.42 13.881 14.375 14.9 15.46 16.088 16.703 17.091 17.013 16.634 16.139 15.653 15.138 14.627 14.16 13.755 13.33 12.949 12.569 12.177 11.806 11.441 11.108 10.773 10.457 10.179 9.893 9.596 9.345 9.074 8.795 8.572 8.323 8.062 7.787 7.481 7.27 7.052 6.684 6.432 6.172 6.032 5.741 5.427 5.097 4.934 4.174 4.356 4.147 3.919 3.421 3.161 2.895 2.593 2.209 1.755 1.133 -0.815 -8 ,18836 ,TETRA ,17551459,Thu Nov 25 11:26:07 CET,Thu Nov 25 13:43:19 CET,0.0 1.244 1.74 2.095 2.4 2.669 2.923 3.175 3.617 3.824 4.015 3.79 4.546 4.711 5.038 5.335 5.598 5.725 5.97 6.213 6.56 6.775 6.983 7.308 7.609 7.864 8.102 8.338 8.649 8.954 9.229 9.552 9.875 10.178 10.518 10.867 11.175 11.51 11.883 12.287 12.706 13.167 13.714 14.259 14.853 15.455 16.076 16.714 17.379 17.992 18.516 18.604 18.292 17.804 17.296 16.74 16.214 15.72 15.291 14.856 14.449 14.081 13.708 13.348 12.992 12.657 12.32 12.01 11.74 11.453 11.147 10.891 10.605 10.28 10.018 9.766 9.512 9.244 8.957 8.755 8.552 8.222 7.973 7.708 7.563 7.262 6.978 6.658 6.482 5.717 5.92 5.709 5.475 4.957 4.677 4.394 4.106 3.767 3.353 2.776 1.419 -9 ,13298 ,TETRA ,17551461,Thu Nov 25 11:26:07 CET,Thu Nov 25 13:36:29 CET,0.0 0.919 1.388 1.796 2.148 2.433 2.7 2.955 3.414 3.626 3.834 3.657 4.429 4.606 4.923 5.235 5.526 5.664 5.919 6.177 6.582 6.84 7.065 7.36 7.65 7.932 8.2 8.486 8.854 9.176 9.461 9.796 10.128 10.428 10.769 11.157 11.53 11.915 12.315 12.722 13.126 13.553 14.075 14.605 15.177 15.743 16.308 16.889 17.452 17.976 18.292 18.119 17.81 17.381 16.85 16.343 15.863 15.346 14.867 14.404 14.02 13.659 13.276 12.882 12.511 12.175 11.807 11.464 11.149 10.846 10.571 10.311 10.018 9.736 9.528 9.301 9.048 8.773 8.458 8.234 7.999 7.609 7.331 7.049 6.906 6.583 6.242 5.91 5.724 4.957 5.103 4.869 4.642 4.13 3.82 3.477 3.107 2.745 2.287 1.643 -0.149 -10 ,29129 ,TETRA ,17551463,Thu Nov 25 11:26:07 CET,Thu Nov 25 13:39:24 CET,0.0 1.24 1.712 2.106 2.453 2.78 3.05 3.278 3.699 3.886 4.067 3.829 4.592 4.762 5.071 5.351 5.604 5.723 5.957 6.2 6.539 6.759 6.977 7.273 7.545 7.817 8.087 8.316 8.597 8.878 9.165 9.533 9.872 10.174 10.54 10.939 11.29 11.651 12.019 12.398 12.783 13.215 13.686 14.137 14.668 15.201 15.749 16.338 16.981 17.585 17.969 17.871 17.556 17.203 16.777 16.284 15.848 15.458 15.104 14.727 14.355 13.998 13.642 13.314 12.993 12.664 12.319 12.006 11.735 11.441 11.115 10.844 10.562 10.252 9.976 9.699 9.423 9.121 8.831 8.618 8.397 8.044 7.763 7.469 7.325 7.028 6.72 6.396 6.22 5.442 5.606 5.406 5.175 4.65 4.394 4.083 3.701 3.327 2.907 2.209 0.329 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_23475.txt deleted file mode 100644 index dbc5fa5c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13986 ,KEBNE ,17019461,Wed Dec 22 02:42:31 CET,Wed Dec 22 04:26:51 CET,0.0 1.244 1.72 2.077 2.403 2.713 2.995 3.252 3.699 3.904 4.095 3.911 4.59 4.748 5.052 5.341 5.62 5.746 5.975 6.195 6.528 6.759 6.968 7.262 7.548 7.792 8.025 8.257 8.536 8.798 9.046 9.343 9.647 9.919 10.195 10.499 10.797 11.119 11.456 11.8 12.13 12.509 12.957 13.373 13.806 14.241 14.691 15.189 15.684 16.043 16.179 15.768 15.184 14.546 13.867 13.292 12.817 12.344 11.911 11.439 10.965 10.54 10.13 9.742 9.377 9.025 8.665 8.356 8.079 7.763 7.446 7.177 6.857 6.518 6.279 6.039 5.747 5.411 5.081 4.856 4.602 4.195 3.934 3.649 3.485 3.165 2.834 2.477 2.295 1.564 1.631 1.395 1.17 0.653 0.338 0.011 -0.327 -0.741 -1.26 -1.902 -3.653 -2 ,20295 ,KEBNE ,17019462,Wed Dec 22 02:42:31 CET,Wed Dec 22 04:27:56 CET,0.0 1.273 1.751 2.115 2.423 2.695 2.964 3.211 3.661 3.876 4.082 3.953 4.659 4.824 5.142 5.42 5.666 5.794 6.055 6.315 6.693 6.91 7.106 7.401 7.696 7.984 8.246 8.48 8.768 9.022 9.263 9.551 9.824 10.101 10.43 10.761 11.053 11.373 11.695 12.035 12.355 12.667 13.025 13.377 13.771 14.173 14.613 15.074 15.502 15.855 15.974 15.595 14.996 14.378 13.788 13.211 12.647 12.056 11.542 11.049 10.625 10.229 9.829 9.448 9.055 8.678 8.307 7.97 7.672 7.365 7.012 6.707 6.415 6.125 5.891 5.634 5.366 5.084 4.791 4.569 4.318 3.937 3.673 3.381 3.211 2.834 2.447 2.084 1.896 1.155 1.22 0.968 0.725 0.195 -0.141 -0.53 -0.941 -1.403 -1.942 -2.657 -4.518 -3 ,27381 ,KEBNE ,17019463,Wed Dec 22 02:42:32 CET,Wed Dec 22 04:25:18 CET,0.0 1.343 1.873 2.281 2.632 2.926 3.185 3.426 3.854 4.058 4.259 4.112 4.815 4.987 5.345 5.667 5.952 6.085 6.344 6.595 6.94 7.152 7.347 7.617 7.881 8.156 8.395 8.595 8.864 9.098 9.318 9.595 9.854 10.107 10.385 10.688 10.968 11.277 11.595 11.898 12.212 12.611 13.083 13.507 13.942 14.372 14.831 15.311 15.774 16.169 16.362 16.035 15.506 14.959 14.341 13.692 13.117 12.587 12.102 11.597 11.132 10.67 10.211 9.803 9.44 9.095 8.685 8.294 7.936 7.549 7.172 6.87 6.559 6.232 5.957 5.671 5.4 5.125 4.796 4.531 4.264 3.878 3.596 3.276 3.109 2.749 2.392 2.03 1.842 1.133 1.212 0.963 0.692 0.076 -0.266 -0.622 -1.014 -1.442 -1.898 -2.425 -4.868 -4 ,5847 ,KEBNE ,17019464,Wed Dec 22 02:42:32 CET,Wed Dec 22 04:26:22 CET,0.0 1.344 1.912 2.405 2.792 3.131 3.427 3.691 4.161 4.382 4.589 4.419 5.112 5.264 5.553 5.836 6.12 6.257 6.506 6.739 7.063 7.264 7.461 7.739 7.981 8.194 8.398 8.615 8.899 9.155 9.411 9.705 9.964 10.23 10.542 10.864 11.131 11.421 11.768 12.14 12.483 12.866 13.299 13.668 14.094 14.57 15.076 15.554 15.988 16.384 16.542 16.245 15.769 15.181 14.48 13.776 13.171 12.602 12.055 11.512 11.066 10.649 10.225 9.816 9.433 9.055 8.641 8.28 7.96 7.626 7.296 7.004 6.693 6.364 6.109 5.848 5.537 5.227 4.934 4.718 4.498 4.125 3.827 3.53 3.381 3.059 2.697 2.286 2.068 1.311 1.384 1.129 0.842 0.274 -0.008 -0.336 -0.72 -1.158 -1.714 -2.453 -5.606 -5 ,27754 ,KEBNE ,17019465,Wed Dec 22 02:42:31 CET,Wed Dec 22 04:27:06 CET,0.0 1.391 1.923 2.321 2.635 2.913 3.173 3.415 3.858 4.073 4.28 4.126 4.828 4.985 5.298 5.608 5.886 6.008 6.24 6.472 6.817 7.037 7.25 7.584 7.899 8.164 8.387 8.593 8.856 9.111 9.356 9.637 9.904 10.162 10.475 10.801 11.072 11.357 11.683 12.028 12.374 12.779 13.214 13.577 13.959 14.407 14.903 15.394 15.872 16.255 16.395 16.006 15.452 14.871 14.169 13.478 12.855 12.246 11.719 11.187 10.748 10.339 9.913 9.512 9.142 8.821 8.47 8.12 7.806 7.454 7.08 6.773 6.446 6.103 5.843 5.564 5.243 4.904 4.543 4.284 4.024 3.625 3.321 3.013 2.86 2.541 2.203 1.819 1.615 0.87 0.962 0.715 0.44 -0.151 -0.447 -0.757 -1.117 -1.519 -1.948 -2.532 -4.991 -6 ,23375 ,KEBNE ,17019466,Wed Dec 22 02:42:32 CET,Wed Dec 22 04:26:55 CET,0.0 1.116 1.624 2.014 2.352 2.625 2.889 3.164 3.68 3.909 4.127 4.029 4.726 4.896 5.22 5.538 5.853 6.011 6.298 6.536 6.855 7.058 7.264 7.55 7.805 8.041 8.255 8.477 8.763 9.028 9.269 9.552 9.809 10.043 10.327 10.659 10.963 11.278 11.62 11.993 12.347 12.71 13.134 13.539 13.994 14.477 14.965 15.431 15.893 16.31 16.423 16.051 15.501 14.858 14.223 13.606 13.004 12.42 11.9 11.356 10.885 10.495 10.1 9.682 9.289 8.893 8.475 8.098 7.78 7.458 7.079 6.768 6.471 6.144 5.871 5.594 5.293 4.97 4.625 4.377 4.127 3.72 3.431 3.132 2.967 2.621 2.257 1.844 1.627 0.881 0.966 0.71 0.421 -0.221 -0.605 -1.005 -1.361 -1.753 -2.264 -2.993 -5.69 -7 ,7519 ,KEBNE ,17019467,Wed Dec 22 02:42:31 CET,Wed Dec 22 04:27:03 CET,0.0 1.383 1.915 2.359 2.723 3.021 3.282 3.531 4.003 4.218 4.417 4.251 4.961 5.139 5.465 5.748 6.011 6.148 6.42 6.674 6.998 7.194 7.393 7.676 7.953 8.214 8.453 8.67 8.948 9.211 9.449 9.743 10.032 10.293 10.565 10.883 11.201 11.53 11.851 12.158 12.491 12.845 13.246 13.688 14.171 14.634 15.093 15.54 15.993 16.343 16.441 16.12 15.653 15.083 14.38 13.7 13.13 12.574 12.07 11.533 11.05 10.653 10.249 9.839 9.463 9.105 8.721 8.376 8.064 7.713 7.376 7.094 6.79 6.482 6.235 5.972 5.657 5.302 4.944 4.703 4.447 4.041 3.748 3.444 3.289 2.967 2.627 2.243 2.04 1.292 1.39 1.17 0.919 0.357 0.053 -0.303 -0.686 -1.081 -1.496 -2.069 -4.102 -8 ,74 ,KEBNE ,17019468,Wed Dec 22 02:42:31 CET,Wed Dec 22 04:25:36 CET,0.0 1.815 2.311 2.723 3.094 3.405 3.689 3.964 4.44 4.649 4.858 4.707 5.419 5.596 5.919 6.207 6.482 6.621 6.888 7.138 7.479 7.686 7.898 8.217 8.501 8.754 8.987 9.207 9.492 9.762 10.027 10.334 10.612 10.888 11.198 11.511 11.813 12.128 12.438 12.763 13.098 13.457 13.861 14.23 14.68 15.169 15.663 16.165 16.614 16.996 17.014 16.449 15.774 15.057 14.42 13.822 13.196 12.599 12.068 11.513 11.02 10.58 10.186 9.809 9.448 9.097 8.703 8.345 8.01 7.664 7.304 7.0 6.666 6.295 6.0 5.696 5.411 5.12 4.793 4.562 4.332 3.947 3.652 3.34 3.185 2.856 2.5 2.124 1.914 1.14 1.121 0.878 0.64 0.066 -0.272 -0.645 -1.048 -1.469 -1.867 -2.45 -4.888 -9 ,11945 ,KEBNE ,17019469,Wed Dec 22 02:42:31 CET,Wed Dec 22 04:27:52 CET,0.0 2.187 2.668 3.057 3.413 3.718 3.982 4.231 4.691 4.886 5.076 4.904 5.577 5.732 6.049 6.356 6.63 6.761 7.008 7.239 7.562 7.764 7.96 8.239 8.51 8.74 8.96 9.187 9.463 9.71 9.934 10.203 10.479 10.765 11.079 11.418 11.72 12.023 12.373 12.736 13.078 13.446 13.881 14.3 14.743 15.191 15.65 16.112 16.603 16.958 17.02 16.67 16.048 15.291 14.549 13.901 13.289 12.691 12.202 11.719 11.271 10.872 10.456 10.008 9.616 9.302 8.96 8.621 8.289 7.937 7.586 7.288 6.987 6.681 6.429 6.167 5.891 5.576 5.242 5.014 4.769 4.395 4.148 3.898 3.768 3.473 3.116 2.697 2.487 1.756 1.833 1.609 1.368 0.795 0.487 0.133 -0.269 -0.677 -1.182 -1.961 -3.484 -10 ,1776 ,KEBNE ,17019470,Wed Dec 22 02:42:32 CET,Wed Dec 22 04:26:58 CET,0.0 1.263 1.825 2.247 2.562 2.851 3.13 3.381 3.842 4.057 4.268 4.116 4.818 4.976 5.258 5.528 5.793 5.923 6.167 6.386 6.708 6.929 7.131 7.401 7.649 7.89 8.136 8.373 8.665 8.923 9.159 9.444 9.708 9.955 10.244 10.548 10.829 11.119 11.423 11.758 12.109 12.496 12.913 13.309 13.759 14.217 14.665 15.06 15.435 15.7 15.599 15.083 14.405 13.634 12.929 12.276 11.65 11.079 10.593 10.118 9.697 9.282 8.857 8.45 8.07 7.704 7.308 6.923 6.6 6.26 5.896 5.609 5.294 4.933 4.637 4.356 4.072 3.735 3.384 3.148 2.89 2.499 2.226 1.92 1.759 1.424 1.071 0.691 0.486 -0.246 -0.112 -0.335 -0.574 -1.078 -1.365 -1.71 -2.125 -2.594 -3.095 -3.738 -6.09 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23475_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23475_23468.txt deleted file mode 100644 index d58efc4d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23475_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10288 ,KEBNE ,17019471,Wed Dec 22 02:42:32 CET,Wed Dec 22 04:27:00 CET,0.0 0.772 1.145 1.448 1.755 2.04 2.287 2.508 2.919 3.114 3.305 3.127 3.813 3.975 4.29 4.593 4.884 5.02 5.269 5.499 5.826 6.031 6.241 6.542 6.809 7.079 7.342 7.587 7.915 8.226 8.503 8.809 9.088 9.355 9.653 10.017 10.376 10.76 11.157 11.541 11.949 12.378 12.835 13.312 13.871 14.386 14.918 15.505 16.071 16.541 16.709 16.219 15.493 14.792 14.104 13.4 12.77 12.145 11.589 11.04 10.573 10.139 9.702 9.273 8.876 8.51 8.115 7.755 7.436 7.089 6.726 6.445 6.151 5.828 5.556 5.267 4.976 4.662 4.298 4.024 3.755 3.358 3.064 2.772 2.635 2.341 2.029 1.682 1.489 0.765 0.895 0.69 0.459 -0.041 -0.298 -0.586 -0.908 -1.247 -1.666 -2.198 -3.485 -2 ,28452 ,KEBNE ,17019472,Wed Dec 22 02:42:32 CET,Wed Dec 22 04:27:03 CET,0.0 0.786 1.216 1.586 1.895 2.165 2.404 2.607 3.005 3.211 3.411 3.253 3.944 4.096 4.377 4.644 4.913 5.048 5.313 5.555 5.901 6.115 6.307 6.586 6.857 7.116 7.358 7.586 7.893 8.194 8.473 8.795 9.102 9.404 9.73 10.087 10.438 10.803 11.175 11.553 11.952 12.422 12.966 13.473 14.011 14.52 15.074 15.672 16.157 16.538 16.726 16.411 15.771 15.014 14.284 13.573 12.93 12.374 11.879 11.334 10.836 10.384 9.954 9.537 9.104 8.71 8.316 7.94 7.617 7.296 6.961 6.675 6.371 6.059 5.807 5.547 5.289 5.012 4.694 4.479 4.27 3.902 3.626 3.349 3.201 2.886 2.552 2.207 2.014 1.274 1.4 1.186 0.949 0.421 0.139 -0.171 -0.512 -0.884 -1.323 -1.851 -3.243 -3 ,19359 ,KEBNE ,17019473,Wed Dec 22 02:42:32 CET,Wed Dec 22 04:26:46 CET,0.0 0.861 1.287 1.656 1.989 2.256 2.49 2.715 3.117 3.297 3.471 3.294 4.002 4.165 4.488 4.754 4.994 5.123 5.369 5.605 5.933 6.135 6.334 6.623 6.907 7.174 7.418 7.66 7.967 8.231 8.477 8.779 9.064 9.344 9.663 10.001 10.329 10.67 11.017 11.384 11.777 12.19 12.641 13.135 13.677 14.18 14.684 15.22 15.849 16.367 16.519 16.038 15.314 14.581 13.858 13.179 12.557 11.927 11.391 10.834 10.293 9.829 9.413 9.02 8.624 8.237 7.823 7.431 7.079 6.715 6.347 6.034 5.692 5.346 5.082 4.797 4.502 4.193 3.869 3.653 3.424 3.045 2.768 2.469 2.321 2.017 1.695 1.351 1.175 0.441 0.542 0.321 0.086 -0.455 -0.738 -1.044 -1.366 -1.704 -2.116 -2.629 -3.936 -4 ,24736 ,KEBNE ,17019474,Wed Dec 22 02:43:34 CET,Wed Dec 22 04:28:25 CET,0.0 0.888 1.326 1.647 1.961 2.25 2.503 2.746 3.197 3.4 3.609 3.462 4.158 4.329 4.667 4.979 5.259 5.392 5.647 5.885 6.233 6.454 6.662 6.949 7.229 7.499 7.758 8.013 8.319 8.607 8.866 9.19 9.521 9.807 10.116 10.467 10.809 11.183 11.58 11.99 12.397 12.834 13.349 13.867 14.451 15.073 15.732 16.346 16.906 17.375 17.559 17.127 16.364 15.484 14.602 13.786 13.102 12.455 11.859 11.227 10.649 10.133 9.665 9.242 8.819 8.398 7.948 7.542 7.167 6.786 6.415 6.084 5.715 5.352 5.085 4.799 4.495 4.184 3.856 3.612 3.358 2.975 2.709 2.417 2.261 1.95 1.618 1.262 1.075 0.349 0.477 0.251 0.016 -0.508 -0.797 -1.087 -1.377 -1.717 -2.13 -2.694 -4.04 -5 ,2084 ,KEBNE ,17019475,Wed Dec 22 02:43:34 CET,Wed Dec 22 04:28:26 CET,0.0 0.597 1.05 1.398 1.677 1.954 2.207 2.442 2.876 3.075 3.277 3.101 3.808 3.994 4.337 4.639 4.922 5.06 5.323 5.566 5.915 6.135 6.352 6.659 6.952 7.234 7.495 7.747 8.073 8.373 8.647 8.969 9.271 9.551 9.866 10.193 10.51 10.872 11.219 11.571 11.942 12.32 12.757 13.211 13.721 14.239 14.805 15.421 15.968 16.372 16.463 15.863 15.059 14.284 13.525 12.811 12.15 11.487 10.932 10.393 9.892 9.42 8.952 8.526 8.119 7.765 7.389 7.012 6.677 6.325 5.954 5.64 5.308 4.93 4.624 4.298 3.942 3.598 3.274 3.014 2.735 2.297 1.965 1.637 1.47 1.126 0.774 0.376 0.167 -0.563 -0.479 -0.697 -0.921 -1.42 -1.698 -2.011 -2.397 -2.809 -3.233 -3.846 -5.735 -6 ,29295 ,KEBNE ,17019476,Wed Dec 22 02:43:33 CET,Wed Dec 22 04:28:50 CET,0.0 0.873 1.322 1.712 2.018 2.28 2.523 2.744 3.141 3.334 3.516 3.328 4.031 4.196 4.505 4.772 5.037 5.17 5.421 5.662 5.996 6.209 6.411 6.691 6.969 7.239 7.488 7.73 8.029 8.299 8.567 8.886 9.186 9.466 9.78 10.117 10.419 10.755 11.127 11.497 11.877 12.334 12.817 13.263 13.81 14.379 14.975 15.576 16.068 16.425 16.553 16.158 15.397 14.531 13.694 12.93 12.283 11.65 11.081 10.499 9.982 9.527 9.068 8.635 8.232 7.849 7.467 7.106 6.776 6.417 6.0 5.667 5.345 4.986 4.712 4.419 4.066 3.716 3.373 3.133 2.885 2.487 2.19 1.876 1.715 1.376 1.014 0.606 0.384 -0.341 -0.278 -0.547 -0.831 -1.437 -1.767 -2.096 -2.467 -2.889 -3.363 -4.001 -6.015 -7 ,20472 ,KEBNE ,17019477,Wed Dec 22 02:43:34 CET,Wed Dec 22 04:28:54 CET,0.0 0.794 1.262 1.674 2.037 2.342 2.618 2.885 3.379 3.604 3.823 3.707 4.45 4.635 4.971 5.307 5.61 5.754 6.03 6.269 6.594 6.803 7.005 7.284 7.559 7.832 8.09 8.321 8.6 8.877 9.158 9.488 9.781 10.076 10.398 10.741 11.079 11.423 11.792 12.171 12.543 12.942 13.389 13.867 14.412 14.961 15.54 16.1 16.617 17.106 17.325 16.827 16.015 15.207 14.44 13.695 13.006 12.36 11.782 11.176 10.634 10.141 9.671 9.203 8.735 8.296 7.835 7.427 7.074 6.695 6.323 6.026 5.703 5.366 5.095 4.824 4.539 4.205 3.867 3.642 3.402 3.017 2.743 2.456 2.303 1.976 1.634 1.267 1.069 0.326 0.464 0.25 0.025 -0.475 -0.742 -1.008 -1.302 -1.651 -2.082 -2.663 -4.101 -8 ,12829 ,KEBNE ,17019478,Wed Dec 22 02:43:33 CET,Wed Dec 22 04:28:08 CET,0.0 0.584 0.993 1.356 1.662 1.937 2.198 2.45 2.922 3.137 3.355 3.256 3.957 4.139 4.477 4.778 5.055 5.195 5.481 5.745 6.089 6.322 6.552 6.85 7.125 7.386 7.643 7.917 8.275 8.578 8.833 9.152 9.464 9.747 10.072 10.418 10.743 11.111 11.5 11.884 12.271 12.694 13.198 13.684 14.188 14.777 15.395 16.004 16.585 16.891 16.76 16.179 15.477 14.738 13.972 13.248 12.57 11.899 11.34 10.789 10.287 9.819 9.354 8.907 8.474 8.085 7.679 7.311 7.0 6.678 6.346 6.047 5.719 5.397 5.147 4.842 4.504 4.153 3.734 3.458 3.194 2.757 2.466 2.174 2.022 1.692 1.331 0.957 0.758 0.028 0.074 -0.17 -0.418 -0.982 -1.315 -1.674 -2.051 -2.486 -3.002 -3.618 -4.959 -9 ,26837 ,KEBNE ,17019479,Wed Dec 22 02:43:34 CET,Wed Dec 22 04:27:19 CET,0.0 0.667 1.055 1.415 1.712 1.958 2.21 2.43 2.827 3.024 3.212 3.047 3.754 3.933 4.269 4.579 4.874 5.008 5.269 5.527 5.888 6.105 6.32 6.638 6.915 7.163 7.41 7.638 7.909 8.165 8.409 8.726 9.058 9.359 9.679 10.022 10.354 10.715 11.101 11.511 11.902 12.324 12.827 13.324 13.88 14.452 15.012 15.611 16.239 16.73 16.771 16.071 15.306 14.563 13.85 13.159 12.495 11.852 11.3 10.706 10.141 9.627 9.154 8.748 8.367 7.993 7.604 7.269 6.949 6.588 6.225 5.927 5.606 5.276 5.024 4.739 4.441 4.144 3.815 3.572 3.33 2.932 2.63 2.336 2.187 1.872 1.537 1.168 0.967 0.216 0.327 0.101 -0.144 -0.703 -1.018 -1.357 -1.716 -2.104 -2.55 -3.12 -4.867 -10 ,4414 ,KEBNE ,17019480,Wed Dec 22 02:43:34 CET,Wed Dec 22 04:28:16 CET,0.0 0.765 1.177 1.525 1.839 2.112 2.347 2.588 3.054 3.257 3.452 3.285 3.989 4.157 4.503 4.823 5.11 5.251 5.524 5.783 6.157 6.388 6.601 6.899 7.171 7.433 7.688 7.917 8.188 8.461 8.726 9.033 9.341 9.63 9.935 10.286 10.642 11.031 11.443 11.846 12.256 12.704 13.2 13.678 14.184 14.713 15.295 15.922 16.539 17.019 17.22 16.832 16.135 15.348 14.599 13.877 13.236 12.656 12.092 11.488 10.994 10.553 10.101 9.675 9.272 8.894 8.514 8.157 7.827 7.485 7.135 6.851 6.528 6.174 5.906 5.618 5.303 4.974 4.645 4.418 4.168 3.781 3.516 3.231 3.089 2.766 2.415 2.053 1.859 1.121 1.234 1.017 0.773 0.237 -0.031 -0.327 -0.663 -1.048 -1.519 -2.143 -3.458 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt deleted file mode 100644 index 4353741f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19544 ,TETRA ,17551469,Thu Nov 25 11:29:08 CET,Thu Nov 25 13:37:00 CET,0.0 0.745 1.234 1.649 2.004 2.287 2.548 2.804 3.249 3.441 3.623 3.4 4.163 4.334 4.637 4.964 5.287 5.426 5.679 5.922 6.264 6.466 6.662 6.943 7.214 7.465 7.705 7.944 8.242 8.51 8.766 9.093 9.396 9.68 10.005 10.349 10.678 11.022 11.356 11.696 12.083 12.518 12.996 13.463 13.997 14.541 15.072 15.616 16.184 16.708 17.026 16.843 16.44 15.947 15.438 14.953 14.477 13.977 13.549 13.145 12.778 12.441 12.089 11.727 11.393 11.067 10.715 10.4 10.117 9.822 9.501 9.221 8.922 8.605 8.353 8.079 7.793 7.498 7.175 6.945 6.712 6.382 6.152 5.88 5.738 5.467 5.163 4.831 4.662 3.908 4.105 3.902 3.695 3.255 3.015 2.765 2.469 2.14 1.763 1.277 -1.671 -2 ,9002 ,TETRA ,17551471,Thu Nov 25 11:29:08 CET,Thu Nov 25 13:41:47 CET,0.0 1.059 1.508 1.878 2.208 2.525 2.811 3.071 3.55 3.765 3.974 3.792 4.562 4.742 5.094 5.424 5.726 5.867 6.134 6.388 6.739 6.96 7.165 7.462 7.753 8.031 8.294 8.533 8.84 9.133 9.391 9.711 10.032 10.316 10.637 10.997 11.305 11.622 11.972 12.364 12.743 13.123 13.569 13.99 14.463 15.025 15.672 16.297 16.885 17.434 17.828 17.785 17.521 17.149 16.681 16.185 15.734 15.278 14.836 14.383 13.973 13.6 13.243 12.867 12.513 12.188 11.809 11.461 11.16 10.869 10.576 10.312 10.035 9.758 9.536 9.286 9.012 8.729 8.433 8.228 8.001 7.624 7.362 7.089 6.947 6.65 6.347 5.983 5.777 5.017 5.201 4.998 4.769 4.273 3.997 3.672 3.361 2.997 2.539 1.895 -0.023 -3 ,6957 ,TETRA ,17551473,Thu Nov 25 11:30:06 CET,Thu Nov 25 13:56:20 CET,0.0 0.853 1.263 1.632 1.963 2.233 2.453 2.655 3.049 3.229 3.401 3.159 3.905 4.061 4.369 4.645 4.913 5.051 5.311 5.56 5.925 6.155 6.355 6.643 6.937 7.203 7.463 7.715 8.009 8.281 8.554 8.891 9.189 9.478 9.804 10.125 10.414 10.73 11.07 11.418 11.805 12.248 12.736 13.212 13.728 14.24 14.791 15.364 15.98 16.548 16.854 16.779 16.474 16.006 15.489 14.966 14.482 13.994 13.56 13.139 12.729 12.347 11.99 11.664 11.359 11.046 10.718 10.422 10.13 9.81 9.504 9.245 8.951 8.647 8.416 8.173 7.906 7.619 7.317 7.094 6.851 6.478 6.218 5.944 5.815 5.546 5.246 4.931 4.748 3.971 4.126 3.905 3.682 3.189 2.918 2.627 2.312 1.979 1.592 1.074 -0.644 -4 ,21616 ,TETRA ,17551475,Thu Nov 25 11:30:06 CET,Thu Nov 25 13:41:56 CET,0.0 1.496 2.007 2.396 2.698 2.963 3.208 3.444 3.884 4.078 4.267 4.068 4.827 4.987 5.269 5.54 5.787 5.906 6.14 6.381 6.742 6.968 7.183 7.472 7.758 8.03 8.283 8.537 8.851 9.148 9.419 9.727 10.015 10.28 10.573 10.894 11.204 11.533 11.883 12.269 12.671 13.1 13.594 14.053 14.536 15.018 15.531 16.072 16.643 17.157 17.455 17.281 16.872 16.343 15.792 15.267 14.792 14.355 13.939 13.474 13.065 12.704 12.33 11.959 11.592 11.254 10.897 10.537 10.234 9.961 9.676 9.412 9.121 8.822 8.587 8.333 8.068 7.774 7.457 7.242 7.012 6.624 6.345 6.05 5.897 5.594 5.256 4.911 4.738 3.97 4.145 3.93 3.71 3.247 3.001 2.727 2.449 2.149 1.761 1.251 0.087 -5 ,17743 ,TETRA ,17551477,Thu Nov 25 11:31:06 CET,Thu Nov 25 13:37:34 CET,0.0 1.039 1.491 1.886 2.201 2.454 2.715 2.962 3.402 3.613 3.806 3.606 4.369 4.529 4.838 5.122 5.388 5.518 5.787 6.055 6.429 6.648 6.851 7.153 7.447 7.744 8.021 8.254 8.534 8.792 9.039 9.343 9.638 9.909 10.208 10.541 10.872 11.229 11.575 11.93 12.299 12.71 13.2 13.661 14.156 14.673 15.214 15.819 16.446 17.045 17.433 17.307 16.978 16.58 16.127 15.662 15.213 14.754 14.378 13.971 13.54 13.148 12.786 12.443 12.101 11.768 11.422 11.11 10.813 10.501 10.19 9.89 9.565 9.223 8.962 8.721 8.468 8.19 7.881 7.657 7.422 7.021 6.74 6.465 6.325 6.034 5.703 5.348 5.161 4.384 4.549 4.336 4.107 3.597 3.309 3.011 2.71 2.347 1.908 1.434 0.356 -6 ,29664 ,TETRA ,17551479,Thu Nov 25 11:31:06 CET,Thu Nov 25 13:50:11 CET,0.0 1.582 2.105 2.459 2.776 3.071 3.34 3.594 4.058 4.28 4.496 4.314 5.049 5.217 5.54 5.856 6.158 6.302 6.579 6.838 7.193 7.408 7.612 7.897 8.162 8.412 8.65 8.881 9.169 9.442 9.713 10.005 10.271 10.532 10.822 11.153 11.486 11.84 12.209 12.596 12.987 13.392 13.825 14.252 14.743 15.265 15.824 16.387 16.972 17.546 17.944 17.813 17.453 17.004 16.469 15.963 15.51 15.07 14.671 14.245 13.852 13.457 13.07 12.705 12.349 12.038 11.743 11.449 11.173 10.876 10.552 10.295 10.015 9.706 9.459 9.196 8.915 8.617 8.304 8.088 7.863 7.494 7.211 6.924 6.785 6.485 6.167 5.807 5.616 4.854 4.982 4.758 4.546 4.077 3.816 3.535 3.231 2.845 2.411 1.959 0.237 -7 ,9761 ,TETRA ,17551481,Thu Nov 25 11:31:09 CET,Thu Nov 25 13:39:12 CET,0.0 0.79 1.181 1.505 1.778 2.039 2.287 2.51 2.94 3.142 3.33 3.125 3.87 4.03 4.34 4.617 4.897 5.028 5.263 5.493 5.817 6.022 6.234 6.545 6.828 7.092 7.342 7.581 7.867 8.137 8.39 8.674 8.946 9.228 9.544 9.881 10.206 10.546 10.918 11.286 11.644 12.049 12.518 12.997 13.543 14.1 14.666 15.241 15.864 16.436 16.837 16.77 16.413 15.968 15.477 14.95 14.446 13.978 13.533 13.05 12.654 12.291 11.92 11.557 11.21 10.911 10.592 10.299 10.029 9.725 9.401 9.129 8.839 8.526 8.283 8.038 7.774 7.491 7.173 6.919 6.632 6.175 5.884 5.623 5.495 5.212 4.916 4.613 4.453 3.697 3.879 3.651 3.408 2.912 2.645 2.334 1.98 1.625 1.212 0.723 -0.459 -8 ,30615 ,TETRA ,17551482,Thu Nov 25 11:31:06 CET,Thu Nov 25 13:39:40 CET,0.0 1.148 1.652 2.012 2.286 2.54 2.779 3.002 3.421 3.618 3.803 3.563 4.305 4.469 4.776 5.062 5.336 5.46 5.685 5.902 6.233 6.438 6.651 6.973 7.254 7.527 7.783 8.003 8.281 8.546 8.799 9.121 9.428 9.717 10.026 10.342 10.632 10.952 11.291 11.626 11.983 12.372 12.822 13.238 13.677 14.175 14.718 15.261 15.783 16.286 16.624 16.481 16.068 15.542 15.003 14.502 14.004 13.504 13.053 12.602 12.232 11.891 11.547 11.206 10.878 10.561 10.22 9.917 9.641 9.364 9.081 8.811 8.532 8.261 8.039 7.789 7.516 7.229 6.932 6.731 6.511 6.16 5.918 5.649 5.502 5.207 4.904 4.556 4.361 3.59 3.804 3.592 3.357 2.852 2.577 2.285 1.947 1.571 1.18 0.673 -1.052 -9 ,10310 ,TETRA ,17551483,Thu Nov 25 11:32:06 CET,Thu Nov 25 13:43:10 CET,0.0 1.179 1.653 1.978 2.264 2.539 2.804 3.044 3.495 3.703 3.889 3.666 4.414 4.566 4.882 5.218 5.512 5.64 5.905 6.169 6.531 6.743 6.938 7.239 7.526 7.781 8.027 8.269 8.551 8.808 9.061 9.368 9.658 9.915 10.204 10.531 10.837 11.17 11.504 11.849 12.235 12.652 13.107 13.538 14.02 14.553 15.128 15.698 16.316 16.94 17.326 17.213 16.89 16.473 16.039 15.586 15.141 14.71 14.31 13.871 13.457 13.103 12.784 12.459 12.136 11.829 11.494 11.196 10.928 10.629 10.318 10.069 9.818 9.544 9.338 9.101 8.813 8.513 8.214 8.008 7.77 7.375 7.095 6.798 6.656 6.352 6.013 5.662 5.478 4.708 4.867 4.664 4.458 3.974 3.694 3.381 3.043 2.688 2.317 1.845 0.647 -10 ,18725 ,TETRA ,17551484,Thu Nov 25 11:32:06 CET,Thu Nov 25 13:51:47 CET,0.0 1.543 2.05 2.438 2.762 3.065 3.343 3.574 3.982 4.186 4.388 4.179 4.927 5.092 5.403 5.706 6.006 6.145 6.41 6.656 6.981 7.183 7.381 7.665 7.944 8.21 8.447 8.675 8.961 9.241 9.517 9.838 10.131 10.379 10.671 10.999 11.302 11.643 11.992 12.36 12.742 13.158 13.623 14.07 14.555 15.064 15.625 16.206 16.775 17.248 17.558 17.506 17.214 16.776 16.246 15.688 15.194 14.737 14.308 13.881 13.494 13.088 12.685 12.338 12.023 11.729 11.388 11.052 10.77 10.46 10.147 9.897 9.597 9.29 9.059 8.802 8.526 8.24 7.939 7.729 7.505 7.136 6.878 6.609 6.466 6.141 5.812 5.484 5.307 4.555 4.723 4.522 4.314 3.834 3.559 3.255 2.93 2.598 2.228 1.764 0.334 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23474.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23474.txt deleted file mode 100644 index 98c698ab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23474.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17446 ,TETRA ,17551495,Thu Nov 25 11:36:14 CET,Thu Nov 25 13:50:09 CET,0.0 1.795 2.264 2.674 3.069 3.424 3.753 4.046 4.523 4.748 4.973 4.81 5.579 5.764 6.117 6.444 6.772 6.943 7.244 7.507 7.884 8.124 8.356 8.69 9.032 9.351 9.646 9.941 10.282 10.599 10.921 11.29 11.626 11.95 12.301 12.688 13.056 13.448 13.88 14.319 14.765 15.26 15.815 16.359 16.976 17.617 18.294 19.03 19.815 20.557 21.092 21.086 20.744 20.371 19.911 19.373 18.863 18.378 17.979 17.579 17.196 16.806 16.426 16.083 15.754 15.44 15.078 14.732 14.433 14.102 13.758 13.479 13.179 12.867 12.625 12.374 12.125 11.857 11.553 11.331 11.101 10.736 10.484 10.215 10.074 9.792 9.472 9.108 8.922 8.183 8.357 8.148 7.93 7.462 7.199 6.909 6.587 6.191 5.747 5.239 3.109 -2 ,21562 ,TETRA ,17551496,Thu Nov 25 11:36:12 CET,Thu Nov 25 13:49:06 CET,0.0 1.638 2.243 2.7 3.041 3.332 3.605 3.857 4.298 4.499 4.703 4.505 5.248 5.403 5.718 6.023 6.319 6.462 6.726 6.975 7.35 7.589 7.802 8.109 8.411 8.708 8.98 9.23 9.583 9.92 10.203 10.55 10.882 11.181 11.566 12.004 12.377 12.774 13.18 13.602 14.057 14.551 15.107 15.631 16.209 16.88 17.579 18.253 19.036 19.836 20.458 20.7 20.549 20.195 19.74 19.271 18.857 18.431 18.035 17.647 17.288 16.914 16.538 16.145 15.779 15.455 15.084 14.723 14.413 14.114 13.795 13.504 13.19 12.872 12.615 12.331 12.035 11.735 11.407 11.184 10.958 10.581 10.315 10.024 9.866 9.558 9.254 8.936 8.769 8.025 8.203 7.983 7.749 7.208 6.925 6.645 6.336 5.994 5.583 5.073 3.194 -3 ,4362 ,TETRA ,17551497,Thu Nov 25 11:36:12 CET,Thu Nov 25 13:51:45 CET,0.0 1.342 1.809 2.189 2.494 2.771 3.051 3.299 3.724 3.933 4.138 3.919 4.669 4.851 5.187 5.477 5.74 5.869 6.125 6.378 6.744 6.964 7.171 7.478 7.774 8.04 8.314 8.583 8.902 9.221 9.531 9.88 10.196 10.483 10.831 11.21 11.574 11.979 12.411 12.861 13.288 13.779 14.352 14.894 15.493 16.119 16.808 17.481 18.112 18.85 19.565 19.732 19.541 19.147 18.617 18.064 17.527 17.011 16.558 16.09 15.689 15.29 14.888 14.513 14.156 13.829 13.458 13.112 12.81 12.475 12.144 11.871 11.567 11.238 10.986 10.723 10.42 10.091 9.757 9.518 9.271 8.887 8.601 8.297 8.151 7.865 7.527 7.154 6.966 6.196 6.389 6.181 5.94 5.404 5.097 4.796 4.483 4.115 3.682 3.075 0.721 -4 ,29043 ,TETRA ,17551498,Thu Nov 25 11:36:14 CET,Thu Nov 25 13:52:25 CET,0.0 1.189 1.674 2.111 2.51 2.792 3.034 3.268 3.705 3.923 4.128 3.929 4.68 4.836 5.126 5.416 5.719 5.865 6.124 6.37 6.745 6.981 7.197 7.508 7.788 8.05 8.321 8.575 8.885 9.192 9.501 9.87 10.216 10.533 10.892 11.264 11.616 12.039 12.48 12.946 13.443 13.96 14.511 15.064 15.675 16.345 17.136 17.88 18.619 19.337 19.844 19.875 19.488 19.002 18.548 18.021 17.503 16.994 16.503 15.995 15.561 15.161 14.746 14.375 14.02 13.669 13.279 12.915 12.596 12.275 11.931 11.622 11.321 11.006 10.751 10.481 10.195 9.875 9.551 9.351 9.127 8.767 8.514 8.227 8.085 7.811 7.501 7.149 6.963 6.211 6.376 6.15 5.907 5.359 5.086 4.797 4.464 4.113 3.703 3.15 0.486 -5 ,20211 ,TETRA ,17551499,Thu Nov 25 11:36:12 CET,Thu Nov 25 13:50:03 CET,0.0 1.256 1.769 2.158 2.472 2.764 3.054 3.349 3.899 4.127 4.343 4.183 4.933 5.111 5.451 5.759 6.054 6.192 6.442 6.68 7.022 7.246 7.463 7.769 8.077 8.382 8.672 8.952 9.289 9.592 9.902 10.278 10.6 10.901 11.25 11.646 12.028 12.419 12.828 13.282 13.739 14.201 14.738 15.298 15.952 16.628 17.334 18.046 18.806 19.589 20.196 20.257 19.977 19.525 19.054 18.616 18.21 17.782 17.368 16.929 16.525 16.148 15.799 15.481 15.148 14.814 14.467 14.157 13.881 13.603 13.309 13.059 12.806 12.52 12.277 12.02 11.77 11.491 11.164 10.937 10.709 10.356 10.109 9.851 9.708 9.401 9.096 8.783 8.617 7.88 8.081 7.884 7.667 7.205 6.951 6.668 6.339 5.93 5.416 4.716 2.841 -6 ,22806 ,TETRA ,17551500,Thu Nov 25 11:36:14 CET,Thu Nov 25 13:49:14 CET,0.0 1.773 2.361 2.78 3.119 3.419 3.686 3.921 4.413 4.642 4.848 4.647 5.415 5.588 5.929 6.255 6.569 6.716 6.997 7.267 7.629 7.844 8.061 8.394 8.692 8.972 9.248 9.519 9.856 10.168 10.438 10.725 11.025 11.344 11.695 12.045 12.365 12.718 13.099 13.506 13.934 14.41 14.982 15.525 16.128 16.782 17.458 18.148 18.93 19.744 20.464 20.638 20.382 20.051 19.688 19.298 18.907 18.509 18.145 17.747 17.374 16.991 16.595 16.233 15.917 15.611 15.254 14.936 14.655 14.366 14.043 13.755 13.461 13.127 12.872 12.609 12.323 12.046 11.72 11.473 11.232 10.857 10.592 10.304 10.16 9.869 9.534 9.172 8.999 8.225 8.357 8.127 7.903 7.424 7.145 6.833 6.487 6.1 5.64 5.078 3.533 -7 ,9315 ,TETRA ,17551501,Thu Nov 25 11:36:12 CET,Thu Nov 25 13:50:28 CET,0.0 1.078 1.577 1.99 2.324 2.621 2.9 3.17 3.687 3.927 4.148 3.956 4.723 4.903 5.242 5.602 5.96 6.118 6.412 6.687 7.045 7.28 7.508 7.833 8.139 8.443 8.739 8.984 9.3 9.614 9.901 10.25 10.6 10.923 11.289 11.725 12.11 12.483 12.894 13.334 13.784 14.247 14.742 15.28 15.904 16.562 17.275 17.943 18.615 19.233 19.669 19.572 19.202 18.777 18.311 17.853 17.359 16.871 16.456 15.995 15.559 15.17 14.783 14.429 14.104 13.791 13.431 13.105 12.843 12.555 12.24 11.968 11.67 11.367 11.127 10.871 10.616 10.351 10.049 9.838 9.626 9.274 9.02 8.738 8.589 8.28 7.969 7.646 7.484 6.747 6.916 6.699 6.472 6.007 5.757 5.489 5.152 4.732 4.272 3.769 1.892 -8 ,23072 ,TETRA ,17551502,Thu Nov 25 11:36:14 CET,Thu Nov 25 13:49:53 CET,0.0 1.682 2.209 2.618 2.969 3.266 3.553 3.819 4.257 4.48 4.712 4.557 5.317 5.501 5.849 6.174 6.463 6.608 6.892 7.163 7.569 7.822 8.056 8.394 8.704 9.013 9.306 9.556 9.881 10.199 10.502 10.863 11.214 11.533 11.873 12.269 12.656 13.064 13.493 13.948 14.426 14.941 15.523 16.115 16.798 17.535 18.28 19.057 19.86 20.488 20.983 21.077 20.762 20.265 19.762 19.249 18.773 18.318 17.877 17.404 16.955 16.528 16.119 15.734 15.379 15.055 14.724 14.406 14.1 13.794 13.465 13.159 12.819 12.482 12.242 11.983 11.715 11.433 11.116 10.895 10.664 10.291 10.025 9.734 9.579 9.28 8.98 8.661 8.491 7.745 7.926 7.719 7.483 6.974 6.702 6.415 6.123 5.817 5.434 4.981 3.722 -9 ,22517 ,TETRA ,17551503,Thu Nov 25 11:36:12 CET,Thu Nov 25 13:49:36 CET,0.0 1.472 2.016 2.448 2.813 3.128 3.389 3.633 4.091 4.309 4.525 4.337 5.111 5.287 5.621 5.935 6.244 6.394 6.671 6.954 7.368 7.604 7.816 8.11 8.422 8.73 8.986 9.235 9.585 9.909 10.176 10.476 10.761 11.028 11.339 11.701 12.062 12.435 12.813 13.219 13.634 14.084 14.609 15.135 15.742 16.402 17.13 17.866 18.628 19.453 20.022 19.99 19.794 19.469 19.078 18.641 18.154 17.669 17.209 16.756 16.389 16.061 15.715 15.344 14.984 14.655 14.307 13.958 13.647 13.335 13.002 12.711 12.411 12.122 11.873 11.603 11.321 10.966 10.566 10.314 10.061 9.662 9.397 9.13 8.995 8.71 8.388 8.028 7.837 7.046 7.186 6.975 6.737 6.178 5.866 5.547 5.234 4.889 4.432 3.786 1.534 -10 ,27810 ,TETRA ,17551504,Thu Nov 25 11:36:14 CET,Thu Nov 25 13:50:01 CET,0.0 1.395 1.936 2.317 2.637 2.945 3.251 3.52 4.043 4.301 4.527 4.314 5.085 5.279 5.616 5.923 6.212 6.348 6.624 6.901 7.291 7.516 7.71 8.009 8.297 8.572 8.846 9.117 9.459 9.765 10.053 10.384 10.71 11.034 11.404 11.819 12.201 12.616 13.061 13.517 13.986 14.503 15.101 15.674 16.279 16.938 17.709 18.504 19.259 19.931 20.377 20.294 19.952 19.513 19.044 18.601 18.141 17.652 17.232 16.814 16.414 16.018 15.616 15.25 14.921 14.61 14.244 13.896 13.602 13.288 12.957 12.675 12.392 12.093 11.851 11.589 11.311 11.02 10.689 10.463 10.246 9.896 9.628 9.346 9.206 8.914 8.615 8.31 8.147 7.4 7.602 7.384 7.146 6.669 6.4 6.107 5.774 5.407 4.998 4.508 3.252 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23475.txt deleted file mode 100644 index 9fc7e730..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5855 ,TETRA ,17551515,Thu Nov 25 11:37:11 CET,Thu Nov 25 13:50:15 CET,0.0 0.9 1.3 1.653 1.953 2.224 2.452 2.66 3.066 3.258 3.433 3.231 3.977 4.126 4.405 4.666 4.915 5.038 5.289 5.52 5.842 6.042 6.224 6.498 6.758 6.989 7.218 7.451 7.733 7.985 8.223 8.505 8.776 9.025 9.295 9.606 9.9 10.21 10.526 10.843 11.185 11.571 11.998 12.411 12.885 13.378 13.888 14.411 14.928 15.391 15.709 15.563 15.071 14.529 14.033 13.534 13.023 12.522 12.089 11.635 11.211 10.821 10.426 10.021 9.651 9.329 8.989 8.661 8.37 8.075 7.753 7.461 7.156 6.863 6.632 6.372 6.093 5.768 5.412 5.204 4.993 4.624 4.373 4.072 3.905 3.583 3.251 2.894 2.689 1.904 2.066 1.826 1.577 1.019 0.713 0.393 0.043 -0.374 -0.879 -1.525 -3.239 -2 ,32269 ,TETRA ,17551516,Thu Nov 25 11:37:11 CET,Thu Nov 25 13:50:15 CET,0.0 0.921 1.373 1.752 2.06 2.34 2.605 2.848 3.275 3.479 3.665 3.425 4.166 4.336 4.652 4.952 5.228 5.357 5.616 5.848 6.171 6.392 6.603 6.883 7.138 7.414 7.666 7.889 8.177 8.439 8.674 8.936 9.189 9.426 9.693 9.996 10.274 10.601 10.945 11.258 11.602 11.976 12.374 12.755 13.207 13.738 14.307 14.858 15.391 15.859 16.16 16.05 15.623 15.166 14.694 14.193 13.7 13.203 12.775 12.34 11.925 11.503 11.097 10.744 10.405 10.07 9.716 9.384 9.06 8.72 8.375 8.087 7.791 7.466 7.209 6.939 6.64 6.31 5.952 5.702 5.448 5.062 4.803 4.525 4.375 4.046 3.714 3.372 3.18 2.414 2.569 2.353 2.109 1.596 1.326 1.031 0.652 0.207 -0.251 -0.847 -2.314 -3 ,31107 ,TETRA ,17551517,Thu Nov 25 11:37:11 CET,Thu Nov 25 13:50:42 CET,0.0 0.997 1.439 1.782 2.086 2.337 2.562 2.774 3.155 3.334 3.509 3.267 4.021 4.177 4.447 4.71 4.948 5.059 5.282 5.484 5.76 5.939 6.116 6.361 6.568 6.781 7.015 7.233 7.478 7.705 7.936 8.211 8.463 8.696 8.964 9.283 9.583 9.885 10.197 10.524 10.886 11.272 11.693 12.115 12.57 13.071 13.628 14.201 14.746 15.176 15.434 15.194 14.713 14.162 13.591 12.99 12.406 11.847 11.345 10.834 10.39 9.967 9.557 9.185 8.833 8.495 8.136 7.824 7.563 7.273 6.94 6.661 6.368 6.057 5.808 5.525 5.224 4.918 4.599 4.373 4.146 3.771 3.474 3.17 3.018 2.691 2.335 1.977 1.793 1.018 1.161 0.948 0.717 0.189 -0.095 -0.398 -0.721 -1.108 -1.637 -2.22 -3.222 -4 ,19163 ,TETRA ,17551518,Thu Nov 25 11:37:13 CET,Thu Nov 25 13:48:54 CET,0.0 0.808 1.291 1.642 1.939 2.216 2.478 2.726 3.181 3.386 3.584 3.402 4.141 4.31 4.628 4.934 5.223 5.352 5.606 5.858 6.196 6.393 6.581 6.874 7.17 7.433 7.662 7.88 8.147 8.412 8.673 8.971 9.253 9.502 9.777 10.1 10.401 10.719 11.05 11.395 11.746 12.132 12.583 13.025 13.553 14.127 14.709 15.284 15.849 16.365 16.693 16.525 16.08 15.566 15.014 14.453 13.941 13.436 12.97 12.482 12.047 11.636 11.247 10.896 10.533 10.183 9.834 9.527 9.235 8.933 8.636 8.384 8.111 7.801 7.553 7.295 7.024 6.745 6.422 6.188 5.954 5.581 5.305 4.989 4.83 4.5 4.148 3.792 3.587 2.799 2.943 2.707 2.467 1.945 1.649 1.344 1.013 0.62 0.172 -0.397 -2.313 -5 ,21583 ,TETRA ,17551520,Thu Nov 25 11:37:14 CET,Thu Nov 25 13:48:15 CET,0.0 0.884 1.291 1.641 1.918 2.164 2.397 2.616 3.035 3.226 3.408 3.175 3.903 4.051 4.341 4.606 4.887 5.025 5.286 5.527 5.854 6.065 6.265 6.549 6.814 7.064 7.289 7.517 7.829 8.114 8.387 8.717 9.025 9.304 9.61 9.927 10.23 10.565 10.902 11.258 11.618 11.984 12.399 12.797 13.245 13.74 14.281 14.802 15.297 15.774 16.037 15.818 15.348 14.802 14.281 13.762 13.258 12.764 12.316 11.864 11.469 11.094 10.715 10.338 9.966 9.623 9.26 8.933 8.625 8.282 7.922 7.618 7.309 6.98 6.719 6.431 6.131 5.827 5.492 5.262 5.019 4.63 4.363 4.092 3.945 3.634 3.321 2.982 2.799 2.033 2.188 1.969 1.749 1.276 1.018 0.716 0.397 0.049 -0.427 -1.041 -2.673 -6 ,15835 ,TETRA ,17551522,Thu Nov 25 11:37:14 CET,Thu Nov 25 13:45:52 CET,0.0 1.109 1.55 1.919 2.226 2.507 2.77 3.007 3.452 3.652 3.843 3.635 4.38 4.551 4.875 5.182 5.458 5.584 5.832 6.086 6.425 6.616 6.805 7.093 7.389 7.655 7.883 8.108 8.405 8.699 8.968 9.26 9.52 9.756 10.025 10.32 10.606 10.91 11.233 11.581 11.914 12.266 12.688 13.1 13.554 14.025 14.534 15.06 15.647 16.183 16.488 16.361 15.934 15.37 14.786 14.216 13.715 13.2 12.706 12.207 11.744 11.326 10.946 10.558 10.195 9.874 9.508 9.187 8.914 8.621 8.294 8.006 7.709 7.38 7.113 6.824 6.51 6.172 5.812 5.573 5.327 4.968 4.718 4.427 4.273 3.97 3.632 3.23 3.022 2.234 2.381 2.154 1.917 1.373 1.079 0.759 0.38 -0.055 -0.548 -1.19 -2.675 -7 ,3176 ,TETRA ,17551525,Thu Nov 25 11:39:16 CET,Thu Nov 25 13:49:20 CET,0.0 0.868 1.297 1.656 1.961 2.217 2.457 2.7 3.101 3.289 3.471 3.205 3.937 4.094 4.39 4.663 4.924 5.054 5.297 5.529 5.856 6.056 6.254 6.524 6.774 7.019 7.246 7.456 7.737 8.001 8.252 8.558 8.842 9.098 9.388 9.707 9.979 10.296 10.651 11.003 11.37 11.754 12.18 12.601 13.081 13.582 14.076 14.582 15.133 15.669 16.066 15.923 15.479 14.966 14.431 13.857 13.325 12.831 12.377 11.91 11.479 11.094 10.687 10.273 9.898 9.555 9.203 8.869 8.576 8.263 7.892 7.563 7.242 6.913 6.657 6.375 6.059 5.727 5.362 5.105 4.855 4.467 4.195 3.916 3.763 3.433 3.067 2.677 2.475 1.687 1.812 1.543 1.267 0.683 0.381 0.052 -0.324 -0.751 -1.258 -1.959 -3.766 -8 ,25977 ,TETRA ,17551527,Thu Nov 25 11:39:17 CET,Thu Nov 25 13:50:06 CET,0.0 1.11 1.586 1.962 2.302 2.585 2.849 3.076 3.466 3.661 3.857 3.666 4.411 4.578 4.893 5.175 5.407 5.518 5.754 5.988 6.341 6.557 6.756 7.032 7.327 7.61 7.849 8.075 8.376 8.675 8.951 9.297 9.607 9.87 10.158 10.494 10.804 11.142 11.504 11.847 12.222 12.641 13.106 13.537 14.043 14.619 15.205 15.801 16.432 16.972 17.294 17.179 16.786 16.274 15.751 15.238 14.781 14.318 13.891 13.468 13.066 12.687 12.32 11.977 11.643 11.325 10.975 10.657 10.373 10.069 9.753 9.477 9.159 8.819 8.557 8.288 8.0 7.687 7.351 7.107 6.867 6.513 6.245 5.953 5.81 5.488 5.124 4.748 4.548 3.777 3.9 3.665 3.439 2.952 2.654 2.329 1.984 1.617 1.214 0.656 -0.677 -9 ,25045 ,TETRA ,17551529,Thu Nov 25 11:39:15 CET,Thu Nov 25 13:44:44 CET,0.0 0.685 1.132 1.551 1.916 2.218 2.469 2.673 3.046 3.24 3.43 3.219 3.948 4.101 4.398 4.667 4.939 5.072 5.328 5.569 5.926 6.149 6.343 6.618 6.857 7.089 7.336 7.562 7.865 8.165 8.441 8.781 9.08 9.34 9.634 9.962 10.295 10.641 10.989 11.36 11.72 12.14 12.658 13.121 13.601 14.131 14.716 15.266 15.782 16.252 16.636 16.589 16.165 15.645 15.128 14.63 14.138 13.619 13.138 12.661 12.239 11.853 11.487 11.131 10.765 10.402 10.011 9.65 9.354 9.065 8.756 8.485 8.153 7.817 7.574 7.304 7.01 6.699 6.37 6.141 5.911 5.536 5.254 4.942 4.784 4.472 4.156 3.808 3.617 2.842 2.978 2.738 2.491 1.966 1.677 1.358 0.982 0.591 0.172 -0.464 -2.807 -10 ,8001 ,TETRA ,17551531,Thu Nov 25 11:39:15 CET,Thu Nov 25 13:50:06 CET,0.0 0.71 1.062 1.377 1.664 1.923 2.157 2.365 2.774 2.972 3.155 2.901 3.632 3.769 4.061 4.328 4.567 4.684 4.913 5.126 5.414 5.617 5.823 6.106 6.362 6.607 6.855 7.096 7.41 7.686 7.943 8.26 8.546 8.81 9.104 9.422 9.732 10.106 10.504 10.881 11.272 11.726 12.253 12.742 13.254 13.766 14.298 14.81 15.282 15.658 15.917 15.789 15.307 14.742 14.167 13.608 13.118 12.665 12.212 11.718 11.273 10.84 10.425 10.017 9.621 9.292 8.924 8.519 8.197 7.892 7.55 7.25 6.934 6.593 6.318 6.039 5.732 5.41 5.066 4.816 4.563 4.144 3.832 3.493 3.315 2.965 2.601 2.216 2.015 1.244 1.39 1.131 0.848 0.258 -0.073 -0.416 -0.786 -1.23 -1.728 -2.299 -3.657 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23477_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23477_23475.txt deleted file mode 100644 index 1fe7e24f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23477_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30190 ,TETRA ,17551535,Thu Nov 25 11:40:14 CET,Thu Nov 25 13:49:02 CET,0.0 0.926 1.373 1.727 2.019 2.3 2.577 2.831 3.262 3.459 3.66 3.455 4.17 4.335 4.681 5.009 5.279 5.38 5.63 5.896 6.226 6.436 6.656 6.944 7.172 7.383 7.594 7.797 8.053 8.347 8.617 8.883 9.12 9.348 9.669 10.032 10.316 10.601 10.892 11.2 11.504 11.839 12.243 12.59 12.919 13.217 13.525 13.856 14.108 14.111 13.74 12.983 12.138 11.277 10.424 9.659 9.023 8.438 7.943 7.433 6.954 6.512 6.079 5.668 5.309 4.98 4.611 4.279 3.984 3.637 3.291 3.04 2.757 2.45 2.21 1.923 1.609 1.295 0.934 0.684 0.441 0.083 -0.169 -0.462 -0.612 -0.917 -1.223 -1.541 -1.723 -2.495 -2.342 -2.566 -2.806 -3.295 -3.545 -3.819 -4.131 -4.488 -4.904 -5.453 -6.696 -2 ,7821 ,TETRA ,17551536,Thu Nov 25 11:39:15 CET,Thu Nov 25 13:51:39 CET,0.0 0.831 1.235 1.564 1.856 2.133 2.38 2.602 2.984 3.149 3.322 3.088 3.848 3.997 4.27 4.525 4.766 4.888 5.123 5.329 5.611 5.808 6.001 6.273 6.543 6.784 6.999 7.217 7.497 7.736 7.958 8.244 8.499 8.723 8.992 9.285 9.537 9.815 10.11 10.4 10.726 11.075 11.441 11.785 12.162 12.521 12.875 13.182 13.416 13.473 13.099 12.308 11.447 10.61 9.847 9.129 8.476 7.85 7.28 6.724 6.227 5.767 5.32 4.911 4.547 4.179 3.774 3.424 3.095 2.744 2.411 2.147 1.876 1.562 1.289 1.005 0.713 0.408 0.103 -0.101 -0.328 -0.681 -0.916 -1.178 -1.328 -1.644 -1.98 -2.344 -2.52 -3.285 -3.075 -3.283 -3.506 -3.968 -4.217 -4.48 -4.771 -5.096 -5.428 -5.851 -6.864 -3 ,22306 ,TETRA ,17551537,Thu Nov 25 11:39:18 CET,Thu Nov 25 13:52:06 CET,0.0 0.773 1.22 1.575 1.874 2.144 2.372 2.59 3.017 3.222 3.409 3.163 3.894 4.041 4.3 4.549 4.794 4.917 5.164 5.387 5.703 5.905 6.098 6.387 6.653 6.89 7.108 7.322 7.594 7.819 8.029 8.302 8.563 8.793 9.081 9.402 9.65 9.918 10.205 10.517 10.829 11.129 11.426 11.706 12.03 12.347 12.637 12.932 13.205 13.311 12.931 12.089 11.227 10.337 9.525 8.753 8.064 7.456 6.934 6.36 5.84 5.404 4.971 4.538 4.14 3.778 3.401 3.041 2.714 2.369 2.019 1.73 1.437 1.126 0.877 0.617 0.317 -0.025 -0.364 -0.587 -0.817 -1.177 -1.435 -1.707 -1.846 -2.143 -2.465 -2.789 -2.952 -3.722 -3.527 -3.731 -3.94 -4.392 -4.654 -4.945 -5.254 -5.63 -6.079 -6.591 -7.549 -4 ,17782 ,TETRA ,17551538,Thu Nov 25 12:01:28 CET,Thu Nov 25 14:14:01 CET,0.0 0.993 1.402 1.782 2.113 2.407 2.67 2.904 3.327 3.524 3.711 3.485 4.256 4.43 4.731 5.003 5.269 5.397 5.665 5.931 6.288 6.507 6.707 6.98 7.245 7.489 7.707 7.917 8.2 8.464 8.69 8.974 9.249 9.48 9.748 10.059 10.348 10.64 10.932 11.219 11.548 11.917 12.289 12.638 12.988 13.298 13.564 13.794 13.97 13.983 13.652 12.879 12.063 11.257 10.497 9.823 9.191 8.569 8.005 7.415 6.923 6.489 6.065 5.647 5.255 4.915 4.573 4.246 3.901 3.55 3.218 2.936 2.657 2.346 2.07 1.784 1.482 1.161 0.841 0.627 0.407 0.044 -0.225 -0.51 -0.651 -0.935 -1.228 -1.562 -1.753 -2.538 -2.335 -2.533 -2.747 -3.222 -3.481 -3.76 -4.072 -4.409 -4.786 -5.246 -6.186 -5 ,9378 ,TETRA ,17551539,Thu Nov 25 11:40:14 CET,Thu Nov 25 13:52:32 CET,0.0 0.89 1.319 1.684 2.004 2.27 2.518 2.751 3.163 3.361 3.558 3.364 4.109 4.278 4.546 4.788 5.029 5.149 5.421 5.667 5.984 6.186 6.39 6.682 6.936 7.156 7.353 7.563 7.837 8.048 8.251 8.534 8.787 9.008 9.255 9.512 9.741 9.984 10.251 10.55 10.849 11.174 11.535 11.856 12.176 12.488 12.815 13.073 13.305 13.394 13.023 12.219 11.361 10.557 9.811 9.095 8.477 7.876 7.346 6.811 6.345 5.902 5.459 5.051 4.656 4.313 3.962 3.611 3.299 2.963 2.605 2.323 2.022 1.699 1.457 1.206 0.919 0.611 0.281 0.044 -0.184 -0.511 -0.758 -1.044 -1.191 -1.481 -1.8 -2.132 -2.301 -3.056 -2.847 -3.049 -3.256 -3.728 -3.995 -4.305 -4.662 -5.031 -5.412 -5.854 -7.228 -6 ,22232 ,TETRA ,17551540,Thu Nov 25 11:40:15 CET,Thu Nov 25 13:52:59 CET,0.0 0.686 1.081 1.399 1.685 1.959 2.197 2.428 2.853 3.044 3.224 2.986 3.727 3.872 4.157 4.439 4.698 4.817 5.032 5.226 5.513 5.7 5.874 6.134 6.373 6.611 6.851 7.051 7.307 7.555 7.763 8.001 8.242 8.474 8.722 8.972 9.226 9.511 9.807 10.11 10.422 10.778 11.15 11.453 11.796 12.149 12.486 12.811 13.102 13.23 12.933 12.117 11.172 10.285 9.503 8.806 8.128 7.462 6.902 6.323 5.807 5.375 4.952 4.523 4.117 3.735 3.337 2.974 2.665 2.361 2.034 1.755 1.468 1.154 0.886 0.598 0.306 -0.003 -0.376 -0.617 -0.845 -1.269 -1.567 -1.864 -2.024 -2.353 -2.691 -3.048 -3.239 -4.013 -3.841 -4.055 -4.287 -4.808 -5.076 -5.353 -5.648 -5.978 -6.388 -6.89 -8.113 -7 ,20462 ,TETRA ,17551541,Thu Nov 25 11:40:18 CET,Thu Nov 25 13:52:57 CET,0.0 0.879 1.286 1.643 1.918 2.177 2.453 2.714 3.179 3.381 3.567 3.336 4.093 4.252 4.557 4.867 5.149 5.272 5.516 5.763 6.11 6.317 6.522 6.82 7.096 7.346 7.577 7.794 8.05 8.282 8.487 8.745 9.01 9.242 9.505 9.799 10.067 10.349 10.636 10.928 11.207 11.493 11.828 12.156 12.472 12.801 13.105 13.346 13.553 13.577 13.33 12.682 11.883 11.055 10.26 9.524 8.868 8.24 7.673 7.099 6.6 6.161 5.727 5.333 4.96 4.6 4.233 3.89 3.574 3.242 2.892 2.589 2.274 1.95 1.691 1.427 1.149 0.859 0.549 0.325 0.094 -0.261 -0.515 -0.789 -0.927 -1.219 -1.533 -1.902 -2.105 -2.891 -2.693 -2.91 -3.139 -3.62 -3.889 -4.172 -4.467 -4.78 -5.148 -5.607 -6.39 -8 ,3544 ,TETRA ,17551542,Thu Nov 25 11:40:16 CET,Thu Nov 25 13:53:27 CET,0.0 0.926 1.353 1.643 1.905 2.15 2.394 2.616 3.009 3.198 3.383 3.168 3.925 4.093 4.396 4.677 4.943 5.069 5.305 5.532 5.843 6.023 6.214 6.477 6.712 6.942 7.15 7.346 7.614 7.878 8.136 8.417 8.649 8.889 9.17 9.463 9.733 10.011 10.294 10.606 10.933 11.29 11.701 12.059 12.396 12.731 13.04 13.333 13.559 13.59 13.251 12.465 11.597 10.743 9.962 9.244 8.6 7.98 7.436 6.917 6.461 6.057 5.651 5.247 4.895 4.571 4.2 3.849 3.535 3.209 2.88 2.59 2.266 1.923 1.666 1.396 1.111 0.817 0.51 0.297 0.071 -0.316 -0.581 -0.828 -0.962 -1.269 -1.577 -1.893 -2.066 -2.838 -2.655 -2.877 -3.093 -3.545 -3.786 -4.047 -4.362 -4.696 -5.017 -5.403 -6.363 -9 ,15690 ,TETRA ,17551543,Thu Nov 25 11:40:15 CET,Thu Nov 25 13:58:04 CET,0.0 0.843 1.284 1.647 1.93 2.161 2.377 2.587 2.986 3.187 3.371 3.128 3.887 4.041 4.319 4.589 4.844 4.967 5.202 5.423 5.729 5.926 6.123 6.386 6.627 6.858 7.067 7.254 7.485 7.749 8.014 8.27 8.49 8.722 9.009 9.322 9.596 9.876 10.162 10.455 10.76 11.07 11.422 11.796 12.154 12.483 12.835 13.151 13.328 13.316 12.999 12.324 11.549 10.768 10.052 9.355 8.724 8.151 7.644 7.123 6.657 6.235 5.833 5.444 5.072 4.729 4.368 4.039 3.729 3.412 3.07 2.765 2.443 2.121 1.874 1.609 1.322 1.012 0.691 0.465 0.233 -0.142 -0.41 -0.686 -0.823 -1.132 -1.455 -1.801 -1.99 -2.759 -2.554 -2.746 -2.954 -3.446 -3.698 -3.952 -4.266 -4.624 -5.021 -5.505 -6.491 -10 ,31417 ,TETRA ,17551544,Thu Nov 25 11:40:18 CET,Thu Nov 25 13:57:50 CET,0.0 0.963 1.385 1.71 1.999 2.295 2.589 2.845 3.262 3.455 3.645 3.42 4.178 4.346 4.642 4.911 5.18 5.312 5.577 5.828 6.162 6.365 6.562 6.833 7.086 7.319 7.534 7.735 8.0 8.252 8.482 8.752 9.013 9.25 9.521 9.818 10.076 10.378 10.674 10.958 11.24 11.529 11.868 12.191 12.533 12.889 13.203 13.453 13.665 13.709 13.245 12.311 11.429 10.566 9.799 9.1 8.435 7.798 7.275 6.757 6.278 5.845 5.434 5.026 4.651 4.311 3.949 3.626 3.332 3.015 2.693 2.419 2.131 1.821 1.557 1.28 1.0 0.685 0.355 0.131 -0.103 -0.451 -0.706 -0.984 -1.126 -1.42 -1.767 -2.142 -2.316 -3.082 -2.866 -3.073 -3.291 -3.733 -3.965 -4.228 -4.545 -4.866 -5.209 -5.623 -6.768 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23475.txt deleted file mode 100644 index d851b283..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19705 ,TETRA ,17551555,Thu Nov 25 11:41:09 CET,Thu Nov 25 14:00:31 CET,0.0 0.794 1.164 1.531 1.873 2.151 2.402 2.644 3.07 3.268 3.47 3.257 4.044 4.223 4.555 4.861 5.118 5.243 5.516 5.774 6.113 6.343 6.586 6.927 7.248 7.548 7.812 8.066 8.4 8.718 9.017 9.366 9.689 10.001 10.355 10.746 11.117 11.52 11.954 12.417 12.933 13.452 13.986 14.514 15.123 15.819 16.677 17.616 18.645 19.756 20.797 21.275 21.177 20.919 20.605 20.23 19.824 19.381 18.946 18.46 18.019 17.648 17.325 17.019 16.704 16.382 16.045 15.752 15.495 15.183 14.822 14.533 14.229 13.908 13.65 13.362 13.061 12.753 12.42 12.185 11.942 11.551 11.253 10.923 10.763 10.444 10.091 9.723 9.521 8.697 8.798 8.567 8.318 7.753 7.436 7.09 6.7 6.27 5.783 5.129 2.99 -2 ,7289 ,TETRA ,17551557,Thu Nov 25 11:41:09 CET,Thu Nov 25 13:56:42 CET,0.0 1.028 1.484 1.84 2.141 2.425 2.704 2.944 3.378 3.59 3.784 3.532 4.311 4.472 4.792 5.106 5.405 5.552 5.832 6.091 6.446 6.657 6.858 7.133 7.387 7.638 7.878 8.109 8.425 8.725 9.001 9.324 9.636 9.947 10.297 10.686 11.07 11.501 11.974 12.453 12.907 13.403 13.988 14.549 15.172 15.869 16.641 17.427 18.281 19.221 20.13 20.421 20.277 19.98 19.595 19.179 18.771 18.349 17.942 17.536 17.15 16.767 16.425 16.111 15.799 15.473 15.09 14.752 14.465 14.154 13.81 13.509 13.211 12.901 12.634 12.348 12.069 11.782 11.461 11.219 10.962 10.566 10.273 9.953 9.789 9.446 9.046 8.613 8.381 7.538 7.589 7.303 7.028 6.442 6.107 5.758 5.36 4.895 4.326 3.616 1.381 -3 ,13373 ,TETRA ,17551559,Thu Nov 25 11:41:09 CET,Thu Nov 25 13:57:41 CET,0.0 0.972 1.363 1.715 2.036 2.306 2.562 2.808 3.27 3.491 3.688 3.453 4.237 4.408 4.734 5.044 5.335 5.474 5.74 6.014 6.42 6.651 6.869 7.192 7.497 7.791 8.077 8.351 8.675 8.988 9.317 9.698 10.028 10.335 10.679 11.077 11.456 11.856 12.304 12.773 13.243 13.756 14.327 14.887 15.528 16.195 16.948 17.819 18.814 19.817 20.711 21.004 20.86 20.564 20.164 19.714 19.263 18.841 18.427 17.964 17.577 17.222 16.858 16.493 16.131 15.774 15.392 15.066 14.787 14.491 14.141 13.81 13.446 13.068 12.784 12.473 12.137 11.778 11.427 11.188 10.924 10.508 10.216 9.894 9.729 9.386 9.011 8.626 8.409 7.596 7.719 7.474 7.179 6.476 6.124 5.751 5.333 4.848 4.228 3.438 0.915 -4 ,24739 ,TETRA ,17551561,Thu Nov 25 11:41:09 CET,Thu Nov 25 13:52:07 CET,0.0 0.671 1.094 1.423 1.712 1.993 2.255 2.494 2.909 3.096 3.287 3.062 3.83 3.994 4.309 4.589 4.86 5.001 5.262 5.504 5.867 6.1 6.328 6.643 6.947 7.247 7.532 7.786 8.094 8.417 8.731 9.101 9.45 9.775 10.154 10.584 10.987 11.408 11.85 12.32 12.824 13.37 13.998 14.641 15.362 16.166 17.117 18.127 19.175 20.179 21.014 21.381 21.363 21.141 20.81 20.395 19.974 19.541 19.132 18.708 18.286 17.896 17.548 17.213 16.889 16.58 16.248 15.927 15.627 15.298 14.91 14.597 14.289 13.928 13.633 13.35 13.034 12.663 12.299 12.059 11.788 11.338 11.049 10.746 10.577 10.219 9.81 9.349 9.122 8.319 8.448 8.207 7.937 7.302 6.954 6.604 6.203 5.676 5.051 4.329 2.313 -5 ,9158 ,TETRA ,17551563,Thu Nov 25 11:42:14 CET,Thu Nov 25 13:56:47 CET,0.0 1.318 1.712 2.004 2.277 2.543 2.785 3.013 3.446 3.64 3.837 3.63 4.403 4.568 4.907 5.242 5.529 5.652 5.894 6.148 6.526 6.771 6.992 7.297 7.59 7.851 8.103 8.358 8.672 8.963 9.222 9.519 9.813 10.104 10.465 10.867 11.26 11.714 12.188 12.67 13.175 13.678 14.224 14.786 15.409 16.107 16.943 17.823 18.722 19.654 20.51 20.865 20.773 20.478 20.132 19.743 19.324 18.905 18.484 18.029 17.652 17.302 16.934 16.552 16.177 15.82 15.448 15.115 14.802 14.447 14.054 13.737 13.424 13.055 12.751 12.45 12.131 11.798 11.452 11.209 10.963 10.551 10.239 9.916 9.744 9.386 9.019 8.614 8.388 7.576 7.69 7.434 7.181 6.622 6.296 5.936 5.522 5.072 4.533 3.88 1.588 -6 ,17535 ,TETRA ,17551565,Thu Nov 25 11:43:12 CET,Thu Nov 25 13:59:01 CET,0.0 0.844 1.342 1.74 2.054 2.35 2.613 2.883 3.383 3.588 3.785 3.548 4.338 4.515 4.855 5.188 5.488 5.626 5.907 6.197 6.6 6.854 7.108 7.463 7.787 8.102 8.393 8.664 9.009 9.317 9.601 9.928 10.244 10.562 10.934 11.33 11.711 12.126 12.558 13.013 13.48 13.988 14.579 15.164 15.824 16.545 17.328 18.172 19.083 20.131 21.197 21.685 21.747 21.556 21.24 20.904 20.568 20.2 19.841 19.46 19.102 18.754 18.413 18.071 17.733 17.406 17.047 16.712 16.413 16.085 15.705 15.392 15.071 14.716 14.449 14.188 13.878 13.529 13.184 12.942 12.686 12.243 11.916 11.573 11.4 11.053 10.683 10.266 10.054 9.264 9.359 9.075 8.764 8.095 7.736 7.363 6.945 6.465 5.911 5.162 1.77 -7 ,28967 ,TETRA ,17551567,Thu Nov 25 11:45:15 CET,Thu Nov 25 13:54:07 CET,0.0 0.898 1.362 1.741 2.048 2.34 2.614 2.865 3.332 3.532 3.728 3.501 4.272 4.434 4.751 5.081 5.392 5.535 5.821 6.101 6.509 6.758 6.987 7.305 7.605 7.893 8.168 8.434 8.767 9.085 9.383 9.732 10.086 10.42 10.777 11.187 11.582 11.995 12.431 12.884 13.367 13.934 14.571 15.189 15.93 16.745 17.617 18.498 19.439 20.547 21.666 22.113 22.126 21.901 21.54 21.168 20.771 20.379 20.024 19.611 19.222 18.869 18.485 18.092 17.726 17.399 17.078 16.772 16.465 16.117 15.759 15.456 15.097 14.696 14.394 14.101 13.797 13.473 13.149 12.908 12.641 12.227 11.93 11.624 11.462 11.079 10.675 10.258 10.03 9.2 9.306 9.051 8.768 8.151 7.804 7.453 7.095 6.679 6.09 5.19 1.743 -8 ,5672 ,TETRA ,17551569,Thu Nov 25 11:58:14 CET,Thu Nov 25 14:28:10 CET,0.0 0.717 1.115 1.489 1.805 2.076 2.335 2.597 3.078 3.291 3.487 3.249 4.022 4.189 4.525 4.844 5.151 5.299 5.578 5.837 6.204 6.449 6.674 6.976 7.264 7.539 7.8 8.061 8.403 8.731 9.025 9.368 9.698 10.019 10.426 10.861 11.258 11.689 12.133 12.569 12.995 13.48 14.08 14.682 15.346 16.068 16.87 17.727 18.661 19.616 20.521 20.874 20.759 20.5 20.131 19.685 19.235 18.784 18.379 17.934 17.524 17.149 16.755 16.372 16.01 15.672 15.31 14.992 14.727 14.424 14.09 13.805 13.495 13.17 12.919 12.656 12.374 12.075 11.743 11.493 11.221 10.771 10.444 10.119 9.958 9.624 9.268 8.896 8.694 7.896 8.058 7.821 7.567 7.005 6.71 6.402 6.056 5.616 5.037 4.248 2.004 -9 ,23514 ,TETRA ,17551571,Thu Nov 25 12:05:11 CET,Thu Nov 25 14:07:18 CET,0.0 0.857 1.289 1.669 1.997 2.285 2.542 2.775 3.186 3.391 3.596 3.356 4.13 4.306 4.654 4.993 5.312 5.461 5.737 5.989 6.341 6.557 6.772 7.082 7.378 7.669 7.941 8.195 8.532 8.854 9.156 9.517 9.858 10.161 10.502 10.9 11.277 11.68 12.113 12.557 12.992 13.46 14.047 14.621 15.22 15.928 16.725 17.555 18.522 19.509 20.444 20.931 20.91 20.705 20.399 20.021 19.627 19.205 18.779 18.318 17.953 17.603 17.219 16.817 16.441 16.112 15.743 15.399 15.106 14.786 14.428 14.133 13.813 13.464 13.17 12.838 12.485 12.116 11.741 11.49 11.219 10.772 10.472 10.148 9.969 9.602 9.229 8.839 8.634 7.825 7.902 7.642 7.379 6.756 6.408 6.037 5.63 5.191 4.672 3.972 1.229 -10 ,572 ,TETRA ,17551573,Thu Nov 25 12:08:13 CET,Thu Nov 25 14:07:10 CET,0.0 1.33 1.823 2.239 2.596 2.896 3.175 3.457 3.983 4.22 4.45 4.272 5.045 5.233 5.597 5.918 6.24 6.394 6.67 6.924 7.27 7.503 7.744 8.085 8.389 8.689 8.975 9.246 9.629 9.973 10.254 10.592 10.921 11.218 11.57 11.973 12.352 12.787 13.241 13.698 14.162 14.675 15.264 15.847 16.509 17.215 17.993 18.878 19.851 20.848 21.833 22.213 22.06 21.714 21.369 20.97 20.559 20.178 19.82 19.423 19.026 18.62 18.185 17.78 17.424 17.101 16.729 16.375 16.073 15.692 15.268 14.961 14.649 14.288 13.998 13.715 13.434 13.138 12.817 12.578 12.33 11.945 11.646 11.335 11.174 10.795 10.387 9.973 9.76 8.951 8.995 8.713 8.422 7.791 7.45 7.071 6.598 6.074 5.456 4.584 2.17 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23476.txt deleted file mode 100644 index 3385b29b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5727 ,TETRA ,17551576,Thu Nov 25 11:46:13 CET,Thu Nov 25 13:56:04 CET,0.0 1.843 2.449 2.908 3.298 3.629 3.887 4.148 4.68 4.912 5.137 4.989 5.792 5.998 6.385 6.75 7.106 7.268 7.562 7.856 8.3 8.581 8.831 9.163 9.495 9.809 10.085 10.357 10.709 11.038 11.351 11.693 12.012 12.323 12.678 13.085 13.485 13.923 14.386 14.853 15.335 15.88 16.477 17.075 17.783 18.503 19.268 20.114 21.036 21.961 22.764 23.022 22.839 22.496 22.056 21.536 21.045 20.609 20.19 19.725 19.288 18.868 18.475 18.09 17.733 17.388 16.998 16.633 16.311 15.992 15.621 15.28 14.912 14.519 14.246 13.965 13.637 13.276 12.901 12.66 12.43 12.047 11.747 11.449 11.295 10.95 10.594 10.228 10.023 9.208 9.362 9.13 8.877 8.319 8.004 7.673 7.319 6.924 6.389 5.683 3.326 -2 ,15164 ,TETRA ,17551578,Thu Nov 25 11:47:17 CET,Thu Nov 25 14:03:51 CET,0.0 1.35 1.839 2.283 2.712 3.058 3.341 3.635 4.179 4.415 4.64 4.49 5.29 5.497 5.856 6.209 6.558 6.731 7.057 7.351 7.788 8.061 8.326 8.691 9.018 9.361 9.698 9.996 10.404 10.81 11.173 11.577 11.933 12.273 12.66 13.128 13.561 13.999 14.463 14.926 15.419 15.973 16.616 17.236 17.936 18.709 19.624 20.661 21.748 22.841 23.866 24.115 23.799 23.343 22.802 22.265 21.788 21.316 20.872 20.427 19.998 19.538 19.116 18.747 18.364 17.984 17.581 17.235 16.93 16.61 16.258 15.947 15.643 15.322 15.04 14.744 14.445 14.109 13.734 13.483 13.228 12.804 12.514 12.208 12.039 11.689 11.312 10.905 10.665 9.848 9.984 9.745 9.487 8.934 8.645 8.301 7.922 7.546 7.051 6.362 4.818 -3 ,11118 ,TETRA ,17551580,Thu Nov 25 11:50:14 CET,Thu Nov 25 13:56:05 CET,0.0 1.12 1.656 2.076 2.438 2.773 3.08 3.367 3.914 4.148 4.37 4.256 5.046 5.236 5.628 6.01 6.371 6.537 6.834 7.127 7.557 7.837 8.101 8.472 8.823 9.153 9.458 9.738 10.096 10.43 10.764 11.198 11.586 11.934 12.332 12.794 13.271 13.788 14.325 14.855 15.386 15.97 16.604 17.256 18.052 18.939 19.926 20.862 21.734 22.592 23.296 23.468 23.199 22.756 22.286 21.754 21.266 20.787 20.336 19.863 19.434 19.029 18.61 18.201 17.809 17.443 17.039 16.661 16.329 15.989 15.632 15.297 14.937 14.557 14.258 13.951 13.615 13.248 12.877 12.617 12.336 11.906 11.61 11.301 11.141 10.804 10.463 10.088 9.874 9.081 9.208 8.98 8.731 8.168 7.844 7.485 7.086 6.586 5.965 5.213 1.546 -4 ,9650 ,TETRA ,17551582,Thu Nov 25 11:54:16 CET,Thu Nov 25 14:06:16 CET,0.0 1.525 2.125 2.528 2.905 3.263 3.596 3.895 4.436 4.69 4.934 4.783 5.576 5.783 6.21 6.6 6.938 7.102 7.429 7.745 8.206 8.501 8.772 9.158 9.514 9.836 10.157 10.461 10.827 11.187 11.528 11.909 12.248 12.585 12.991 13.42 13.847 14.348 14.848 15.318 15.804 16.342 16.941 17.527 18.218 18.993 19.867 20.826 21.844 22.896 23.814 24.114 23.962 23.618 23.179 22.678 22.219 21.789 21.404 21.012 20.6 20.199 19.833 19.432 19.018 18.666 18.284 17.899 17.576 17.233 16.854 16.536 16.214 15.885 15.614 15.316 14.982 14.653 14.322 14.078 13.809 13.381 13.089 12.787 12.634 12.302 11.941 11.558 11.352 10.563 10.686 10.452 10.204 9.695 9.407 9.082 8.703 8.272 7.738 7.066 5.503 -5 ,23580 ,TETRA ,17551584,Thu Nov 25 11:55:20 CET,Thu Nov 25 13:57:50 CET,0.0 1.347 2.101 2.668 3.052 3.378 3.667 3.953 4.504 4.752 4.993 4.859 5.666 5.864 6.239 6.585 6.935 7.107 7.448 7.793 8.229 8.483 8.732 9.088 9.439 9.792 10.106 10.391 10.783 11.156 11.491 11.874 12.253 12.62 13.006 13.417 13.806 14.216 14.657 15.122 15.585 16.102 16.693 17.25 17.876 18.564 19.353 20.188 21.054 21.973 22.822 23.118 22.908 22.484 22.057 21.596 21.112 20.654 20.255 19.814 19.372 18.978 18.628 18.277 17.921 17.579 17.224 16.9 16.595 16.269 15.926 15.612 15.269 14.912 14.632 14.345 14.019 13.673 13.338 13.107 12.872 12.517 12.243 11.918 11.751 11.414 11.026 10.621 10.412 9.597 9.629 9.354 9.093 8.497 8.162 7.812 7.441 7.015 6.535 5.956 4.489 -6 ,8282 ,TETRA ,17551586,Thu Nov 25 12:12:13 CET,Thu Nov 25 14:31:05 CET,0.0 1.262 1.766 2.173 2.563 2.886 3.194 3.495 4.047 4.307 4.554 4.447 5.27 5.465 5.84 6.204 6.549 6.718 7.031 7.316 7.742 8.028 8.29 8.658 9.004 9.317 9.624 9.937 10.322 10.669 11.014 11.433 11.82 12.178 12.596 13.034 13.45 13.917 14.422 14.976 15.502 16.074 16.749 17.413 18.178 18.957 19.802 20.709 21.708 22.777 23.591 23.642 23.458 23.152 22.68 22.145 21.631 21.133 20.676 20.204 19.758 19.345 18.944 18.521 18.119 17.746 17.309 16.904 16.564 16.171 15.738 15.404 15.063 14.676 14.342 14.013 13.705 13.376 13.018 12.762 12.494 12.088 11.784 11.455 11.287 10.908 10.509 10.127 9.918 9.108 9.145 8.867 8.577 7.955 7.62 7.256 6.875 6.423 5.899 5.193 3.087 -7 ,7863 ,TETRA ,17551588,Thu Nov 25 12:12:13 CET,Thu Nov 25 14:15:41 CET,0.0 1.498 2.054 2.465 2.899 3.347 3.685 3.985 4.513 4.741 4.962 4.829 5.621 5.82 6.211 6.577 6.916 7.075 7.405 7.704 8.122 8.415 8.698 9.102 9.463 9.786 10.1 10.408 10.783 11.149 11.488 11.854 12.236 12.637 13.089 13.561 14.019 14.509 15.01 15.53 16.053 16.647 17.313 17.97 18.725 19.484 20.303 21.192 22.216 23.341 24.313 24.646 24.51 24.106 23.604 23.111 22.657 22.189 21.776 21.374 20.974 20.594 20.221 19.862 19.52 19.175 18.817 18.501 18.227 17.939 17.597 17.268 16.897 16.509 16.206 15.901 15.597 15.265 14.914 14.674 14.408 13.971 13.682 13.383 13.227 12.904 12.548 12.161 11.938 11.143 11.262 11.028 10.778 10.238 9.953 9.615 9.232 8.818 8.384 7.907 6.868 -8 ,28005 ,TETRA ,17551590,Thu Nov 25 11:51:15 CET,Thu Nov 25 14:14:23 CET,0.0 1.816 2.398 2.872 3.261 3.608 3.932 4.233 4.757 4.987 5.217 5.074 5.861 6.056 6.454 6.838 7.173 7.329 7.628 7.909 8.327 8.606 8.889 9.301 9.672 10.026 10.361 10.651 11.035 11.417 11.772 12.163 12.484 12.825 13.247 13.721 14.183 14.658 15.15 15.638 16.138 16.676 17.28 17.885 18.511 19.151 19.908 20.731 21.598 22.483 23.354 23.665 23.463 23.085 22.673 22.18 21.639 21.126 20.661 20.163 19.753 19.378 18.978 18.58 18.211 17.863 17.476 17.119 16.799 16.436 16.037 15.734 15.408 15.013 14.732 14.462 14.169 13.859 13.502 13.239 12.962 12.533 12.256 11.944 11.762 11.385 10.985 10.576 10.374 9.599 9.708 9.46 9.202 8.657 8.335 7.955 7.557 7.096 6.569 5.938 4.479 -9 ,25255 ,TETRA ,17551592,Thu Nov 25 11:53:10 CET,Thu Nov 25 14:13:11 CET,0.0 1.232 1.872 2.385 2.797 3.154 3.495 3.801 4.346 4.626 4.885 4.74 5.52 5.717 6.165 6.614 7.002 7.189 7.52 7.811 8.25 8.531 8.786 9.155 9.514 9.841 10.148 10.443 10.804 11.116 11.43 11.842 12.207 12.523 12.885 13.32 13.747 14.193 14.667 15.149 15.639 16.177 16.79 17.427 18.215 19.038 19.879 20.789 21.708 22.547 23.334 23.659 23.573 23.274 22.877 22.447 21.974 21.522 21.106 20.646 20.239 19.852 19.469 19.073 18.69 18.362 18.004 17.674 17.381 17.093 16.759 16.443 16.134 15.812 15.513 15.193 14.885 14.569 14.264 14.006 13.716 13.277 12.958 12.627 12.461 12.097 11.715 11.313 11.096 10.301 10.392 10.13 9.87 9.337 9.018 8.672 8.294 7.818 7.216 6.546 5.061 -10 ,18840 ,TETRA ,17551594,Thu Nov 25 11:53:13 CET,Thu Nov 25 14:10:12 CET,0.0 2.158 2.742 3.117 3.462 3.779 4.076 4.341 4.805 5.024 5.242 5.075 5.854 6.036 6.394 6.747 7.084 7.242 7.56 7.861 8.293 8.576 8.848 9.224 9.556 9.866 10.165 10.449 10.837 11.212 11.566 11.995 12.374 12.729 13.142 13.588 13.996 14.467 14.979 15.494 16.022 16.58 17.187 17.743 18.392 19.138 19.916 20.746 21.669 22.604 23.427 23.666 23.511 23.159 22.667 22.167 21.682 21.182 20.746 20.32 19.883 19.45 19.036 18.639 18.265 17.897 17.516 17.169 16.85 16.498 16.127 15.812 15.45 15.065 14.773 14.483 14.196 13.883 13.536 13.304 13.066 12.694 12.42 12.125 11.971 11.664 11.342 10.979 10.79 10.027 10.205 9.988 9.746 9.192 8.861 8.481 8.102 7.652 7.099 6.415 4.443 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23479.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23479.txt deleted file mode 100644 index 0acfe489..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23479.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24559 ,TETRA ,17551595,Thu Nov 25 11:53:15 CET,Thu Nov 25 14:09:22 CET,0.0 1.016 1.488 1.904 2.293 2.654 2.98 3.269 3.775 3.994 4.206 4.023 4.806 4.979 5.324 5.657 5.977 6.125 6.4 6.675 7.041 7.264 7.486 7.798 8.075 8.329 8.577 8.828 9.126 9.382 9.638 9.955 10.24 10.502 10.833 11.206 11.547 11.947 12.381 12.771 13.141 13.559 13.997 14.434 14.978 15.516 16.04 16.593 17.141 17.577 17.767 17.5 16.95 16.281 15.664 15.085 14.512 13.966 13.491 12.974 12.502 12.085 11.68 11.27 10.887 10.539 10.175 9.858 9.576 9.268 8.913 8.613 8.329 8.002 7.716 7.44 7.175 6.877 6.549 6.33 6.098 5.728 5.473 5.208 5.063 4.754 4.433 4.084 3.899 3.1 3.275 3.053 2.822 2.295 2.033 1.746 1.433 1.129 0.769 0.283 -0.692 -2 ,29463 ,TETRA ,17551596,Thu Nov 25 12:13:14 CET,Thu Nov 25 14:22:58 CET,0.0 1.053 1.615 2.028 2.407 2.751 3.05 3.318 3.792 4.015 4.239 4.051 4.833 5.009 5.355 5.68 5.987 6.136 6.425 6.689 7.064 7.302 7.514 7.835 8.14 8.411 8.665 8.901 9.221 9.544 9.835 10.153 10.467 10.772 11.119 11.491 11.828 12.183 12.559 12.949 13.323 13.733 14.183 14.623 15.136 15.64 16.164 16.739 17.295 17.717 17.881 17.441 16.75 16.058 15.399 14.749 14.147 13.593 13.117 12.641 12.217 11.788 11.366 10.964 10.567 10.216 9.851 9.502 9.206 8.897 8.558 8.276 7.969 7.626 7.35 7.066 6.766 6.437 6.096 5.871 5.641 5.291 5.029 4.722 4.573 4.268 3.926 3.58 3.405 2.617 2.81 2.59 2.364 1.889 1.623 1.319 0.975 0.611 0.205 -0.317 -1.608 -3 ,14328 ,TETRA ,17551597,Thu Nov 25 12:13:16 CET,Thu Nov 25 14:19:30 CET,0.0 1.03 1.479 1.883 2.254 2.544 2.803 3.053 3.493 3.71 3.919 3.717 4.508 4.694 5.023 5.339 5.656 5.811 6.106 6.384 6.751 6.976 7.197 7.517 7.838 8.127 8.375 8.604 8.884 9.164 9.457 9.806 10.117 10.397 10.725 11.085 11.421 11.781 12.164 12.594 13.018 13.448 13.925 14.387 14.866 15.3 15.765 16.294 16.807 17.278 17.533 17.197 16.61 15.959 15.322 14.704 14.153 13.644 13.178 12.675 12.215 11.806 11.408 11.01 10.622 10.282 9.918 9.57 9.267 8.948 8.603 8.306 7.992 7.678 7.423 7.153 6.872 6.575 6.261 6.029 5.803 5.453 5.195 4.941 4.81 4.508 4.181 3.833 3.651 2.865 3.087 2.886 2.663 2.188 1.945 1.694 1.411 1.058 0.644 0.159 -0.95 -4 ,20111 ,TETRA ,17551598,Thu Nov 25 12:14:15 CET,Thu Nov 25 14:21:07 CET,0.0 1.131 1.64 2.023 2.343 2.639 2.921 3.174 3.633 3.852 4.061 3.856 4.632 4.809 5.145 5.449 5.715 5.845 6.106 6.348 6.681 6.893 7.111 7.423 7.718 7.989 8.244 8.481 8.777 9.06 9.314 9.615 9.901 10.167 10.475 10.821 11.166 11.525 11.875 12.236 12.602 13.008 13.489 14.001 14.555 15.086 15.621 16.102 16.522 16.851 16.892 16.364 15.703 15.035 14.354 13.699 13.103 12.524 12.011 11.489 11.026 10.617 10.193 9.764 9.373 9.012 8.622 8.278 7.989 7.661 7.297 7.01 6.725 6.407 6.153 5.905 5.637 5.336 4.997 4.762 4.523 4.152 3.891 3.607 3.462 3.151 2.827 2.458 2.261 1.47 1.653 1.434 1.202 0.681 0.414 0.139 -0.155 -0.489 -0.875 -1.314 -2.176 -5 ,16532 ,TETRA ,17551599,Thu Nov 25 12:17:16 CET,Thu Nov 25 14:32:42 CET,0.0 0.959 1.457 1.855 2.212 2.547 2.852 3.14 3.671 3.913 4.131 3.908 4.691 4.861 5.206 5.536 5.823 5.96 6.225 6.478 6.838 7.074 7.306 7.62 7.925 8.228 8.496 8.741 9.053 9.352 9.634 9.976 10.286 10.571 10.891 11.243 11.573 11.923 12.298 12.687 13.079 13.506 14.003 14.479 15.005 15.574 16.17 16.77 17.389 17.935 18.2 17.896 17.331 16.694 16.068 15.432 14.847 14.3 13.81 13.295 12.81 12.362 11.961 11.576 11.183 10.82 10.427 10.063 9.747 9.429 9.091 8.802 8.504 8.168 7.905 7.639 7.35 7.041 6.727 6.52 6.29 5.896 5.61 5.315 5.168 4.872 4.565 4.247 4.083 3.301 3.467 3.237 3.015 2.536 2.272 1.984 1.68 1.357 0.999 0.552 -0.398 -6 ,14481 ,TETRA ,17551600,Thu Nov 25 12:17:17 CET,Thu Nov 25 14:24:28 CET,0.0 1.002 1.487 1.852 2.178 2.476 2.751 3.015 3.504 3.713 3.906 3.694 4.494 4.669 5.013 5.34 5.638 5.785 6.06 6.328 6.699 6.937 7.168 7.49 7.803 8.09 8.361 8.605 8.906 9.199 9.485 9.811 10.095 10.377 10.721 11.104 11.455 11.798 12.16 12.557 12.94 13.373 13.871 14.342 14.866 15.392 15.955 16.546 17.137 17.59 17.759 17.443 16.885 16.258 15.582 14.9 14.257 13.634 13.092 12.56 12.087 11.63 11.208 10.828 10.448 10.086 9.681 9.332 9.027 8.7 8.379 8.099 7.783 7.444 7.179 6.895 6.585 6.255 5.916 5.678 5.424 5.001 4.718 4.461 4.32 4.006 3.66 3.295 3.109 2.31 2.488 2.27 2.05 1.603 1.36 1.099 0.806 0.476 0.049 -0.508 -1.607 -7 ,27317 ,TETRA ,17551601,Thu Nov 25 12:19:16 CET,Thu Nov 25 14:20:13 CET,0.0 1.197 1.798 2.213 2.563 2.846 3.115 3.382 3.866 4.086 4.298 4.13 4.934 5.118 5.455 5.764 6.044 6.184 6.474 6.734 7.098 7.345 7.574 7.885 8.177 8.451 8.715 8.974 9.31 9.607 9.862 10.177 10.477 10.751 11.07 11.423 11.748 12.095 12.448 12.806 13.182 13.597 14.078 14.555 15.051 15.564 16.124 16.702 17.245 17.618 17.76 17.461 16.959 16.395 15.813 15.248 14.701 14.134 13.616 13.106 12.669 12.242 11.805 11.414 11.07 10.749 10.399 10.071 9.782 9.479 9.17 8.882 8.564 8.257 8.003 7.72 7.444 7.176 6.872 6.645 6.394 6.012 5.743 5.424 5.257 4.914 4.583 4.23 4.022 3.208 3.35 3.124 2.895 2.41 2.137 1.775 1.382 1.017 0.611 0.12 -0.82 -8 ,12170 ,TETRA ,17551602,Thu Nov 25 12:23:20 CET,Thu Nov 25 14:43:05 CET,0.0 0.785 1.22 1.613 1.959 2.254 2.524 2.77 3.212 3.423 3.63 3.431 4.212 4.38 4.706 5.037 5.333 5.469 5.736 6.01 6.39 6.612 6.824 7.112 7.392 7.657 7.903 8.149 8.45 8.736 9.019 9.35 9.656 9.941 10.247 10.575 10.892 11.243 11.629 12.021 12.421 12.877 13.371 13.837 14.394 14.965 15.545 16.111 16.612 17.016 17.137 16.801 16.219 15.503 14.839 14.2 13.588 13.028 12.504 11.964 11.486 11.03 10.599 10.167 9.768 9.4 9.008 8.662 8.357 8.042 7.717 7.443 7.145 6.821 6.552 6.288 6.023 5.718 5.393 5.178 4.951 4.58 4.318 4.038 3.895 3.599 3.273 2.917 2.722 1.917 2.062 1.823 1.592 1.092 0.823 0.547 0.231 -0.145 -0.55 -1.09 -2.441 -9 ,21815 ,TETRA ,17551603,Thu Nov 25 12:24:14 CET,Thu Nov 25 14:25:46 CET,0.0 0.848 1.312 1.732 2.078 2.386 2.665 2.909 3.367 3.576 3.768 3.518 4.289 4.461 4.802 5.115 5.41 5.558 5.857 6.136 6.508 6.732 6.954 7.275 7.558 7.833 8.101 8.358 8.67 8.962 9.25 9.569 9.861 10.139 10.466 10.842 11.18 11.535 11.923 12.325 12.745 13.194 13.682 14.17 14.727 15.35 15.964 16.489 16.989 17.375 17.49 17.095 16.441 15.751 15.069 14.401 13.803 13.245 12.734 12.214 11.77 11.35 10.945 10.546 10.163 9.81 9.431 9.091 8.792 8.482 8.145 7.822 7.464 7.103 6.812 6.511 6.207 5.901 5.582 5.356 5.119 4.748 4.487 4.212 4.058 3.712 3.362 3.015 2.833 2.042 2.232 2.018 1.791 1.333 1.075 0.776 0.452 0.104 -0.272 -0.712 -1.718 -10 ,6462 ,TETRA ,17551604,Thu Nov 25 12:24:14 CET,Thu Nov 25 14:37:11 CET,0.0 1.241 1.804 2.252 2.664 3.021 3.346 3.636 4.157 4.389 4.597 4.437 5.216 5.404 5.752 6.071 6.383 6.533 6.814 7.084 7.491 7.769 8.025 8.357 8.649 8.924 9.18 9.398 9.681 9.959 10.239 10.593 10.927 11.245 11.593 11.955 12.281 12.643 13.018 13.405 13.809 14.255 14.752 15.246 15.805 16.372 16.947 17.529 18.122 18.619 18.938 18.743 18.217 17.656 17.067 16.447 15.877 15.305 14.795 14.287 13.833 13.438 13.04 12.644 12.282 11.946 11.573 11.23 10.947 10.648 10.334 10.07 9.783 9.48 9.235 8.962 8.681 8.389 8.077 7.864 7.632 7.27 7.005 6.695 6.539 6.247 5.939 5.611 5.438 4.655 4.867 4.673 4.479 4.011 3.757 3.485 3.14 2.729 2.262 1.672 0.603 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23482.txt deleted file mode 100644 index 2dcac855..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13738 ,TETRA ,17551605,Thu Nov 25 12:24:16 CET,Thu Nov 25 14:42:12 CET,0.0 1.453 1.942 2.334 2.708 2.989 3.237 3.484 3.907 4.092 4.259 3.98 4.702 4.844 5.13 5.39 5.609 5.706 5.899 6.074 6.3 6.45 6.593 6.802 6.988 7.15 7.305 7.437 7.584 7.715 7.824 7.925 7.987 8.047 8.13 8.198 8.21 8.206 8.196 8.131 8.018 7.85 7.637 7.351 6.846 6.12 5.085 3.758 1.916 -0.929 -5.602 -10.979 -15.26 -18.69 -21.499 -23.921 -25.951 -27.708 -29.194 -30.669 -31.915 -32.993 -33.991 -34.919 -35.8 -36.596 -37.393 -38.115 -38.73 -39.36 -40.018 -40.596 -41.193 -41.765 -42.221 -42.697 -43.197 -43.732 -44.272 -44.641 -45.029 -45.62 -46.032 -46.466 -46.69 -47.15 -47.622 -48.088 -48.329 -49.224 -49.154 -49.452 -49.754 -50.404 -50.763 -51.146 -51.562 -52.016 -52.537 -53.235 -55.01 -2 ,32661 ,TETRA ,17551606,Thu Nov 25 12:24:14 CET,Thu Nov 25 14:41:40 CET,0.0 1.821 2.445 2.851 3.187 3.476 3.727 3.951 4.341 4.512 4.691 4.52 5.284 5.438 5.718 5.99 6.221 6.326 6.544 6.74 6.987 7.141 7.314 7.55 7.732 7.884 8.036 8.173 8.326 8.464 8.562 8.702 8.843 8.943 9.021 9.067 9.093 9.088 9.048 8.969 8.869 8.746 8.534 8.181 7.645 6.906 5.85 4.419 2.458 -0.402 -5.073 -10.411 -14.593 -17.96 -20.785 -23.154 -25.112 -26.874 -28.385 -29.869 -31.137 -32.23 -33.237 -34.191 -35.055 -35.843 -36.657 -37.356 -37.955 -38.582 -39.217 -39.738 -40.281 -40.862 -41.311 -41.77 -42.27 -42.787 -43.316 -43.688 -44.061 -44.608 -45.003 -45.422 -45.633 -46.075 -46.543 -47.046 -47.31 -48.209 -48.122 -48.426 -48.733 -49.404 -49.776 -50.191 -50.639 -51.135 -51.717 -52.433 -54.197 -3 ,30167 ,TETRA ,17551607,Thu Nov 25 12:26:15 CET,Thu Nov 25 14:29:07 CET,0.0 1.978 2.633 3.099 3.476 3.812 4.096 4.355 4.811 5.027 5.222 4.955 5.702 5.861 6.152 6.396 6.623 6.733 6.931 7.105 7.349 7.518 7.693 7.911 8.099 8.27 8.416 8.549 8.695 8.828 8.98 9.16 9.272 9.342 9.396 9.446 9.477 9.482 9.464 9.402 9.319 9.166 8.915 8.613 8.17 7.554 6.7 5.495 3.709 1.003 -3.638 -9.145 -13.37 -16.759 -19.582 -22.048 -24.107 -25.885 -27.398 -28.87 -30.094 -31.169 -32.197 -33.142 -34.01 -34.799 -35.6 -36.308 -36.935 -37.566 -38.235 -38.808 -39.394 -39.998 -40.461 -40.927 -41.402 -41.895 -42.387 -42.734 -43.11 -43.699 -44.116 -44.541 -44.757 -45.19 -45.627 -46.1 -46.347 -47.248 -47.133 -47.4 -47.675 -48.296 -48.652 -49.04 -49.463 -49.939 -50.5 -51.15 -52.224 -4 ,30721 ,TETRA ,17551608,Thu Nov 25 12:26:15 CET,Thu Nov 25 14:31:43 CET,0.0 1.319 1.818 2.179 2.478 2.733 2.999 3.245 3.689 3.895 4.07 3.825 4.556 4.692 4.944 5.208 5.455 5.566 5.791 6.0 6.265 6.421 6.547 6.722 6.9 7.044 7.176 7.322 7.464 7.59 7.705 7.821 7.921 7.983 8.045 8.075 8.094 8.099 8.075 8.029 7.919 7.75 7.545 7.269 6.845 6.234 5.373 4.235 2.56 -0.05 -4.432 -9.356 -13.169 -16.338 -18.995 -21.299 -23.261 -25.002 -26.438 -27.838 -29.059 -30.106 -31.09 -32.019 -32.865 -33.642 -34.442 -35.122 -35.722 -36.331 -36.966 -37.532 -38.111 -38.703 -39.159 -39.611 -40.089 -40.591 -41.088 -41.445 -41.825 -42.414 -42.815 -43.233 -43.452 -43.897 -44.361 -44.841 -45.088 -45.989 -45.924 -46.218 -46.533 -47.205 -47.609 -48.041 -48.452 -48.926 -49.494 -50.133 -51.515 -5 ,5365 ,TETRA ,17551609,Thu Nov 25 12:26:15 CET,Thu Nov 25 14:25:51 CET,0.0 2.264 2.907 3.382 3.76 4.093 4.389 4.639 5.077 5.268 5.435 5.158 5.897 6.044 6.303 6.56 6.798 6.901 7.104 7.303 7.545 7.686 7.829 8.045 8.261 8.437 8.58 8.73 8.913 9.059 9.154 9.222 9.263 9.311 9.393 9.461 9.459 9.437 9.433 9.398 9.316 9.177 8.936 8.585 8.018 7.262 6.28 4.903 2.842 -0.217 -5.021 -10.491 -14.721 -17.926 -20.435 -22.531 -24.367 -26.064 -27.484 -28.882 -30.08 -31.097 -32.041 -32.913 -33.736 -34.502 -35.289 -35.996 -36.587 -37.201 -37.847 -38.395 -38.986 -39.578 -40.028 -40.51 -41.016 -41.525 -42.064 -42.448 -42.832 -43.405 -43.798 -44.207 -44.412 -44.829 -45.287 -45.763 -45.998 -46.865 -46.759 -47.058 -47.361 -47.971 -48.296 -48.65 -49.046 -49.502 -49.987 -50.544 -51.959 -6 ,15798 ,TETRA ,17551610,Thu Nov 25 12:27:18 CET,Thu Nov 25 14:43:31 CET,0.0 1.558 2.084 2.475 2.762 3.04 3.307 3.567 4.01 4.198 4.392 4.146 4.879 5.003 5.25 5.498 5.735 5.844 6.046 6.24 6.493 6.645 6.782 6.985 7.189 7.362 7.523 7.668 7.826 7.999 8.143 8.267 8.381 8.468 8.556 8.632 8.653 8.654 8.637 8.563 8.51 8.447 8.221 7.935 7.538 6.904 5.953 4.621 2.641 -0.399 -5.359 -10.886 -15.176 -18.644 -21.501 -23.937 -26.016 -27.842 -29.292 -30.715 -31.972 -33.072 -34.079 -34.993 -35.842 -36.64 -37.445 -38.133 -38.781 -39.439 -40.076 -40.608 -41.161 -41.761 -42.22 -42.689 -43.184 -43.689 -44.198 -44.55 -44.924 -45.503 -45.911 -46.331 -46.547 -46.99 -47.449 -47.913 -48.154 -49.059 -48.993 -49.296 -49.612 -50.27 -50.625 -50.995 -51.408 -51.873 -52.409 -53.053 -54.394 -7 ,6097 ,TETRA ,17551611,Thu Nov 25 12:27:19 CET,Thu Nov 25 14:39:31 CET,0.0 1.538 2.177 2.611 2.931 3.209 3.46 3.68 4.065 4.252 4.456 4.229 4.97 5.114 5.382 5.647 5.9 6.013 6.215 6.415 6.71 6.878 7.036 7.272 7.479 7.66 7.809 7.919 8.046 8.163 8.26 8.365 8.461 8.554 8.634 8.688 8.758 8.813 8.824 8.796 8.697 8.515 8.258 7.921 7.417 6.768 5.923 4.695 2.863 0.12 -4.357 -9.49 -13.548 -16.912 -19.697 -22.09 -24.13 -25.929 -27.433 -28.916 -30.185 -31.288 -32.323 -33.262 -34.122 -34.904 -35.73 -36.461 -37.068 -37.702 -38.378 -38.949 -39.522 -40.103 -40.565 -41.065 -41.573 -42.086 -42.608 -42.971 -43.359 -43.969 -44.386 -44.803 -45.017 -45.468 -45.937 -46.43 -46.687 -47.587 -47.446 -47.747 -48.071 -48.715 -49.063 -49.418 -49.784 -50.224 -50.734 -51.382 -52.814 -8 ,5474 ,TETRA ,17551612,Thu Nov 25 12:27:21 CET,Thu Nov 25 14:30:09 CET,0.0 2.471 3.13 3.561 3.929 4.263 4.55 4.79 5.184 5.369 5.565 5.363 6.113 6.261 6.548 6.846 7.114 7.234 7.457 7.652 7.909 8.076 8.247 8.464 8.631 8.79 8.917 9.05 9.256 9.431 9.591 9.764 9.885 9.984 10.077 10.133 10.163 10.178 10.164 10.099 10.017 9.895 9.634 9.281 8.79 8.093 7.128 5.816 3.912 0.976 -3.729 -8.961 -13.129 -16.591 -19.376 -21.738 -23.79 -25.602 -27.163 -28.654 -29.879 -30.981 -32.007 -32.979 -33.869 -34.691 -35.532 -36.256 -36.892 -37.538 -38.218 -38.801 -39.409 -40.02 -40.472 -40.938 -41.431 -41.942 -42.466 -42.838 -43.215 -43.786 -44.198 -44.644 -44.877 -45.356 -45.854 -46.359 -46.622 -47.541 -47.469 -47.772 -48.088 -48.748 -49.113 -49.513 -49.937 -50.396 -50.911 -51.556 -53.023 -9 ,21352 ,TETRA ,17551613,Thu Nov 25 12:27:21 CET,Thu Nov 25 14:37:33 CET,0.0 1.295 1.819 2.248 2.576 2.858 3.109 3.352 3.802 4.004 4.208 3.979 4.74 4.891 5.143 5.361 5.58 5.7 5.928 6.13 6.412 6.586 6.75 6.989 7.215 7.421 7.574 7.678 7.791 7.899 8.029 8.186 8.274 8.334 8.391 8.426 8.453 8.477 8.471 8.402 8.277 8.067 7.763 7.392 6.858 6.182 5.203 3.846 1.846 -1.18 -5.983 -11.405 -15.625 -19.102 -21.945 -24.365 -26.429 -28.22 -29.736 -31.214 -32.458 -33.568 -34.577 -35.486 -36.343 -37.135 -37.949 -38.679 -39.289 -39.897 -40.541 -41.071 -41.611 -42.173 -42.614 -43.085 -43.56 -44.077 -44.632 -44.984 -45.36 -45.952 -46.357 -46.787 -46.992 -47.416 -47.885 -48.376 -48.619 -49.511 -49.431 -49.727 -50.016 -50.603 -50.94 -51.316 -51.717 -52.156 -52.637 -53.19 -54.616 -10 ,9887 ,TETRA ,17551614,Thu Nov 25 12:27:19 CET,Thu Nov 25 14:37:25 CET,0.0 1.361 1.848 2.204 2.526 2.823 3.07 3.285 3.703 3.918 4.107 3.817 4.538 4.67 4.932 5.183 5.426 5.543 5.75 5.921 6.153 6.297 6.439 6.654 6.848 6.996 7.119 7.263 7.451 7.605 7.732 7.843 7.939 8.009 8.068 8.118 8.14 8.158 8.114 7.999 7.873 7.704 7.419 7.06 6.535 5.79 4.766 3.388 1.32 -1.795 -6.712 -12.295 -16.622 -20.099 -22.969 -25.412 -27.439 -29.185 -30.664 -32.133 -33.371 -34.443 -35.431 -36.382 -37.273 -38.07 -38.869 -39.542 -40.133 -40.763 -41.424 -41.964 -42.52 -43.116 -43.585 -44.073 -44.572 -45.091 -45.625 -45.98 -46.338 -46.903 -47.311 -47.718 -47.926 -48.384 -48.866 -49.364 -49.619 -50.523 -50.429 -50.707 -51.01 -51.663 -51.996 -52.359 -52.764 -53.179 -53.658 -54.282 -55.973 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23475.txt deleted file mode 100644 index 92bff14b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17138 ,KEBNE ,17019481,Wed Dec 22 02:44:36 CET,Wed Dec 22 04:30:57 CET,0.0 1.103 1.6 2.009 2.359 2.685 2.985 3.293 3.88 4.131 4.365 4.229 5.051 5.297 5.761 6.176 6.584 6.779 7.157 7.517 8.019 8.354 8.686 9.151 9.617 10.088 10.537 10.968 11.555 12.136 12.683 13.329 13.944 14.561 15.29 16.098 16.869 17.716 18.659 19.693 20.822 22.088 23.56 25.105 26.947 29.023 31.483 34.437 38.131 42.726 48.571 53.578 56.723 58.905 60.417 61.523 62.357 62.948 63.314 63.637 63.886 64.055 64.167 64.225 64.211 64.194 64.167 64.097 64.008 63.905 63.767 63.627 63.465 63.292 63.168 63.006 62.769 62.511 62.278 62.135 61.966 61.646 61.404 61.146 61.015 60.734 60.428 60.08 59.888 59.165 59.2 58.95 58.677 58.027 57.664 57.268 56.831 56.313 55.647 54.75 52.2 -2 ,16376 ,KEBNE ,17019482,Wed Dec 22 02:44:35 CET,Wed Dec 22 04:30:27 CET,0.0 1.161 1.785 2.264 2.655 3.005 3.329 3.64 4.259 4.556 4.836 4.769 5.591 5.817 6.258 6.689 7.109 7.306 7.681 8.045 8.58 8.934 9.259 9.702 10.148 10.594 11.0 11.411 11.971 12.499 12.998 13.621 14.244 14.843 15.516 16.27 17.011 17.827 18.739 19.72 20.756 21.963 23.416 24.874 26.599 28.609 30.998 33.794 37.151 41.372 47.061 52.179 55.275 57.415 58.91 59.923 60.657 61.23 61.657 61.989 62.179 62.316 62.408 62.46 62.508 62.534 62.55 62.535 62.461 62.37 62.278 62.181 62.042 61.873 61.75 61.602 61.406 61.167 60.888 60.706 60.532 60.214 59.96 59.694 59.545 59.216 58.872 58.507 58.325 57.625 57.722 57.482 57.205 56.655 56.358 56.001 55.576 55.054 54.407 53.55 49.814 -3 ,13117 ,KEBNE ,17019483,Wed Dec 22 02:44:36 CET,Wed Dec 22 04:30:32 CET,0.0 1.68 2.245 2.675 3.065 3.432 3.787 4.124 4.723 5.008 5.284 5.226 6.056 6.294 6.755 7.189 7.616 7.828 8.232 8.611 9.16 9.517 9.845 10.304 10.774 11.261 11.716 12.137 12.706 13.266 13.795 14.435 15.074 15.652 16.317 17.106 17.906 18.84 19.851 20.902 22.008 23.271 24.753 26.217 27.959 30.011 32.502 35.449 39.024 43.365 48.92 53.98 57.145 59.235 60.642 61.646 62.389 62.956 63.342 63.682 63.929 64.089 64.187 64.209 64.214 64.22 64.213 64.176 64.089 63.956 63.776 63.59 63.398 63.183 62.997 62.816 62.609 62.422 62.249 62.096 61.95 61.722 61.513 61.256 61.104 60.754 60.39 59.959 59.709 58.928 58.966 58.717 58.443 57.844 57.489 57.046 56.597 56.065 55.395 54.538 49.498 -4 ,24676 ,KEBNE ,17019484,Wed Dec 22 02:44:36 CET,Wed Dec 22 04:30:40 CET,0.0 1.188 1.716 2.133 2.5 2.835 3.137 3.419 3.954 4.205 4.446 4.334 5.144 5.367 5.818 6.238 6.63 6.827 7.226 7.594 8.112 8.441 8.758 9.218 9.657 10.082 10.489 10.897 11.45 11.976 12.478 13.09 13.725 14.35 15.03 15.782 16.531 17.383 18.305 19.29 20.327 21.495 22.863 24.272 26.028 28.085 30.522 33.355 36.85 41.216 46.851 51.811 54.841 56.916 58.337 59.368 60.141 60.747 61.16 61.491 61.76 61.967 62.082 62.099 62.054 61.993 61.92 61.859 61.789 61.67 61.524 61.411 61.26 61.095 60.964 60.809 60.624 60.4 60.148 59.97 59.796 59.493 59.243 58.94 58.771 58.429 58.101 57.729 57.525 56.796 56.864 56.612 56.351 55.732 55.379 54.963 54.502 53.974 53.264 52.228 47.992 -5 ,774 ,KEBNE ,17019485,Wed Dec 22 02:45:37 CET,Wed Dec 22 04:31:58 CET,0.0 1.028 1.531 1.94 2.291 2.624 2.929 3.213 3.737 3.985 4.226 4.119 4.933 5.164 5.595 5.985 6.354 6.536 6.9 7.271 7.828 8.197 8.558 9.094 9.619 10.089 10.519 10.954 11.521 12.035 12.541 13.182 13.758 14.31 14.989 15.755 16.487 17.295 18.196 19.168 20.19 21.356 22.761 24.239 26.014 28.018 30.341 33.101 36.49 40.801 46.614 51.646 54.769 56.923 58.448 59.517 60.277 60.891 61.291 61.569 61.765 61.878 61.946 61.991 62.013 61.992 61.941 61.9 61.826 61.723 61.593 61.464 61.336 61.171 61.003 60.839 60.67 60.458 60.206 60.038 59.861 59.528 59.292 59.034 58.91 58.655 58.354 58.019 57.847 57.141 57.252 57.042 56.813 56.247 55.907 55.564 55.145 54.604 54.008 53.302 50.736 -6 ,2232 ,KEBNE ,17019486,Wed Dec 22 02:48:44 CET,Wed Dec 22 04:33:56 CET,0.0 0.851 1.345 1.734 2.095 2.45 2.768 3.052 3.555 3.8 4.043 3.934 4.764 4.989 5.422 5.822 6.221 6.407 6.759 7.126 7.665 8.001 8.328 8.81 9.277 9.747 10.197 10.619 11.161 11.688 12.211 12.869 13.521 14.136 14.859 15.673 16.456 17.311 18.237 19.241 20.282 21.475 22.908 24.372 26.143 28.161 30.577 33.479 37.096 41.555 47.27 52.25 55.315 57.454 58.959 60.068 60.873 61.462 61.874 62.192 62.391 62.534 62.625 62.683 62.671 62.604 62.543 62.463 62.405 62.333 62.196 62.066 61.891 61.7 61.557 61.387 61.185 60.962 60.718 60.526 60.34 60.076 59.855 59.574 59.423 59.127 58.829 58.51 58.342 57.639 57.782 57.562 57.331 56.854 56.596 56.285 55.917 55.485 54.941 54.176 51.996 -7 ,6640 ,KEBNE ,17019487,Wed Dec 22 02:48:44 CET,Wed Dec 22 04:34:33 CET,0.0 1.255 1.898 2.376 2.76 3.111 3.432 3.738 4.315 4.583 4.844 4.756 5.597 5.837 6.306 6.739 7.14 7.339 7.723 8.09 8.609 8.954 9.303 9.815 10.314 10.791 11.227 11.644 12.189 12.713 13.242 13.89 14.515 15.139 15.887 16.715 17.508 18.413 19.39 20.418 21.521 22.837 24.402 25.987 27.914 30.131 32.8 35.941 39.828 44.735 51.251 57.031 60.65 63.153 64.724 65.747 66.469 66.99 67.37 67.718 67.962 68.095 68.155 68.2 68.246 68.256 68.211 68.129 68.017 67.876 67.736 67.604 67.402 67.195 67.049 66.874 66.653 66.422 66.191 66.008 65.822 65.556 65.357 65.101 64.969 64.707 64.424 64.127 63.954 63.243 63.313 63.057 62.803 62.257 61.968 61.632 61.258 60.816 60.227 59.505 56.057 -8 ,11664 ,KEBNE ,17019488,Wed Dec 22 02:50:24 CET,Wed Dec 22 04:36:26 CET,0.0 1.078 1.585 1.991 2.343 2.679 2.983 3.273 3.812 4.076 4.323 4.156 4.968 5.195 5.634 6.049 6.442 6.629 6.992 7.347 7.859 8.199 8.55 9.055 9.508 9.967 10.422 10.853 11.413 11.954 12.48 13.105 13.711 14.318 15.027 15.833 16.575 17.406 18.343 19.313 20.376 21.656 23.198 24.733 26.522 28.571 31.019 33.939 37.468 41.701 47.159 52.128 55.316 57.487 58.958 60.012 60.821 61.438 61.892 62.251 62.487 62.65 62.715 62.72 62.704 62.657 62.583 62.492 62.372 62.208 62.042 61.907 61.738 61.528 61.359 61.2 61.042 60.865 60.669 60.503 60.301 60.003 59.791 59.57 59.461 59.181 58.861 58.523 58.345 57.651 57.779 57.566 57.333 56.753 56.43 56.087 55.686 55.225 54.664 53.911 50.537 -9 ,30591 ,KEBNE ,17019489,Wed Dec 22 02:50:24 CET,Wed Dec 22 04:35:51 CET,0.0 1.473 1.921 2.324 2.723 3.113 3.45 3.775 4.385 4.669 4.942 4.849 5.651 5.887 6.335 6.747 7.138 7.324 7.684 8.036 8.55 8.892 9.235 9.725 10.177 10.621 11.063 11.487 12.037 12.599 13.157 13.813 14.463 15.099 15.824 16.633 17.39 18.233 19.163 20.165 21.238 22.484 23.982 25.528 27.365 29.474 31.993 34.875 38.422 42.834 48.414 53.601 56.943 59.192 60.776 61.912 62.708 63.312 63.734 64.049 64.26 64.424 64.524 64.596 64.621 64.575 64.471 64.349 64.23 64.099 63.986 63.884 63.745 63.579 63.432 63.271 63.097 62.891 62.659 62.477 62.284 61.963 61.703 61.445 61.32 61.067 60.806 60.485 60.305 59.577 59.652 59.435 59.184 58.591 58.284 57.929 57.464 56.906 56.24 55.197 51.812 -10 ,9328 ,KEBNE ,17019490,Wed Dec 22 02:50:24 CET,Wed Dec 22 04:36:37 CET,0.0 0.974 1.476 1.918 2.309 2.673 3.024 3.351 3.934 4.207 4.473 4.428 5.259 5.493 5.934 6.361 6.791 7.001 7.395 7.792 8.347 8.668 9.002 9.5 9.956 10.396 10.83 11.272 11.815 12.317 12.842 13.484 14.089 14.678 15.365 16.149 16.903 17.757 18.705 19.697 20.762 21.978 23.432 24.966 26.796 28.884 31.349 34.199 37.786 42.312 48.122 53.272 56.568 58.802 60.344 61.538 62.389 62.967 63.339 63.637 63.849 64.016 64.111 64.135 64.164 64.16 64.077 63.998 63.92 63.802 63.653 63.528 63.367 63.146 62.987 62.841 62.661 62.458 62.247 62.096 61.888 61.521 61.299 61.065 60.932 60.622 60.289 59.944 59.749 59.011 59.067 58.815 58.551 57.96 57.627 57.242 56.805 56.322 55.694 54.779 51.369 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23476.txt deleted file mode 100644 index 39bc4cba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14118 ,TETRA ,17551615,Thu Nov 25 12:27:18 CET,Thu Nov 25 14:26:20 CET,0.0 1.334 1.865 2.301 2.713 3.081 3.429 3.737 4.308 4.593 4.859 4.711 5.606 5.857 6.34 6.795 7.218 7.426 7.843 8.235 8.79 9.144 9.487 9.993 10.465 10.915 11.358 11.794 12.349 12.901 13.458 14.11 14.715 15.316 16.026 16.826 17.616 18.49 19.432 20.451 21.55 22.782 24.22 25.679 27.452 29.507 31.908 34.668 37.965 42.108 47.608 52.503 55.601 57.71 59.085 60.112 60.869 61.389 61.789 62.093 62.255 62.356 62.435 62.488 62.525 62.532 62.505 62.443 62.36 62.274 62.161 62.057 61.936 61.788 61.652 61.477 61.293 61.109 60.872 60.697 60.529 60.271 60.078 59.858 59.743 59.499 59.258 58.979 58.806 58.053 58.276 58.086 57.858 57.313 57.035 56.746 56.411 56.025 55.585 55.055 52.943 -2 ,5109 ,TETRA ,17551616,Thu Nov 25 12:28:14 CET,Thu Nov 25 14:44:52 CET,0.0 2.595 3.254 3.797 4.275 4.678 5.058 5.424 6.106 6.412 6.699 6.607 7.517 7.78 8.293 8.77 9.216 9.425 9.834 10.245 10.817 11.171 11.512 11.999 12.47 12.953 13.416 13.862 14.478 15.071 15.631 16.302 16.925 17.534 18.248 19.046 19.822 20.687 21.648 22.673 23.733 24.961 26.46 27.968 29.716 31.717 34.088 36.916 40.364 44.522 49.918 54.658 57.709 59.804 61.199 62.195 62.931 63.445 63.742 63.99 64.186 64.316 64.402 64.436 64.427 64.405 64.373 64.347 64.296 64.201 64.118 64.045 63.931 63.782 63.648 63.507 63.345 63.162 62.935 62.775 62.622 62.363 62.138 61.856 61.715 61.433 61.126 60.794 60.634 59.905 60.097 59.877 59.625 59.127 58.84 58.501 58.104 57.614 57.055 56.261 53.538 -3 ,18528 ,TETRA ,17551617,Thu Nov 25 12:28:14 CET,Thu Nov 25 14:44:28 CET,0.0 1.925 2.55 3.074 3.499 3.846 4.182 4.504 5.076 5.361 5.654 5.557 6.445 6.707 7.205 7.664 8.109 8.325 8.744 9.154 9.734 10.104 10.472 11.02 11.555 12.058 12.527 12.977 13.545 14.101 14.644 15.299 15.945 16.557 17.253 18.055 18.832 19.691 20.656 21.674 22.749 23.996 25.488 26.983 28.731 30.798 33.287 36.104 39.416 43.517 48.942 53.658 56.518 58.525 59.904 60.914 61.65 62.136 62.466 62.769 62.957 63.059 63.109 63.119 63.101 63.05 62.971 62.909 62.829 62.706 62.602 62.513 62.416 62.311 62.182 62.01 61.814 61.606 61.368 61.199 61.041 60.78 60.558 60.316 60.199 59.945 59.665 59.364 59.212 58.477 58.738 58.534 58.293 57.814 57.56 57.289 56.98 56.642 56.212 55.519 53.733 -4 ,30093 ,TETRA ,17551618,Thu Nov 25 12:28:16 CET,Thu Nov 25 14:43:55 CET,0.0 1.464 2.068 2.582 3.037 3.403 3.751 4.109 4.743 5.026 5.293 5.178 6.082 6.337 6.831 7.303 7.777 7.991 8.394 8.786 9.332 9.692 10.041 10.544 11.045 11.545 12.024 12.468 12.99 13.474 13.966 14.579 15.164 15.724 16.409 17.225 17.994 18.856 19.815 20.814 21.88 23.086 24.543 26.102 27.957 30.029 32.465 35.353 38.81 42.932 48.347 53.173 56.12 58.092 59.466 60.463 61.15 61.654 62.059 62.378 62.559 62.677 62.746 62.777 62.758 62.699 62.624 62.535 62.44 62.344 62.224 62.075 61.903 61.713 61.546 61.365 61.157 60.925 60.691 60.531 60.357 60.064 59.848 59.612 59.484 59.216 58.924 58.606 58.437 57.669 57.883 57.664 57.449 56.993 56.714 56.417 56.115 55.777 55.288 54.642 52.857 -5 ,16787 ,TETRA ,17551619,Thu Nov 25 12:31:14 CET,Thu Nov 25 14:48:14 CET,0.0 1.652 2.241 2.704 3.112 3.473 3.826 4.17 4.79 5.082 5.377 5.316 6.212 6.465 6.966 7.433 7.891 8.113 8.541 8.939 9.521 9.894 10.259 10.792 11.294 11.777 12.247 12.692 13.25 13.804 14.343 14.99 15.637 16.283 17.008 17.802 18.567 19.426 20.389 21.408 22.499 23.766 25.225 26.68 28.449 30.501 32.863 35.585 38.981 43.194 48.575 53.4 56.403 58.405 59.882 61.033 61.85 62.416 62.764 62.973 63.107 63.225 63.3 63.333 63.335 63.322 63.306 63.274 63.214 63.119 62.99 62.853 62.695 62.545 62.434 62.297 62.139 61.963 61.76 61.622 61.475 61.22 61.021 60.796 60.668 60.408 60.153 59.846 59.682 58.931 59.141 58.953 58.738 58.232 57.944 57.641 57.336 56.976 56.534 56.048 53.635 -6 ,10401 ,TETRA ,17551620,Thu Nov 25 12:31:13 CET,Thu Nov 25 14:50:43 CET,0.0 1.855 2.564 3.137 3.635 4.084 4.511 4.904 5.599 5.895 6.178 6.124 7.054 7.308 7.802 8.28 8.711 8.915 9.329 9.734 10.317 10.687 11.038 11.535 12.039 12.529 12.998 13.467 14.063 14.631 15.159 15.785 16.385 16.975 17.693 18.55 19.37 20.208 21.123 22.131 23.206 24.422 25.84 27.313 29.098 31.137 33.591 36.506 39.985 44.229 49.607 54.408 57.569 59.676 61.046 62.066 62.866 63.48 63.864 64.131 64.311 64.426 64.5 64.565 64.594 64.568 64.522 64.478 64.419 64.338 64.248 64.161 64.011 63.822 63.693 63.568 63.424 63.261 63.041 62.868 62.691 62.405 62.207 62.0 61.89 61.631 61.322 60.99 60.824 60.079 60.251 60.043 59.821 59.307 59.008 58.692 58.355 57.939 57.436 56.766 54.126 -7 ,11631 ,TETRA ,17551621,Thu Nov 25 12:32:16 CET,Thu Nov 25 14:52:09 CET,0.0 2.139 2.833 3.331 3.805 4.238 4.627 4.992 5.677 5.993 6.294 6.193 7.087 7.36 7.92 8.427 8.868 9.081 9.486 9.865 10.42 10.762 11.109 11.628 12.143 12.637 13.078 13.509 14.106 14.699 15.275 15.992 16.686 17.333 18.074 18.9 19.691 20.559 21.515 22.54 23.622 24.906 26.455 27.998 29.791 31.863 34.277 37.026 40.523 44.937 50.521 55.58 58.832 61.003 62.481 63.551 64.311 64.854 65.217 65.525 65.744 65.884 65.958 65.977 65.978 65.961 65.864 65.746 65.663 65.542 65.367 65.196 64.993 64.81 64.689 64.525 64.346 64.124 63.855 63.691 63.519 63.243 63.057 62.83 62.693 62.399 62.099 61.799 61.628 60.863 61.035 60.825 60.601 60.055 59.75 59.435 59.07 58.637 58.086 57.366 55.326 -8 ,14672 ,TETRA ,17551622,Thu Nov 25 12:32:16 CET,Thu Nov 25 14:37:32 CET,0.0 1.486 2.042 2.513 2.911 3.272 3.632 3.976 4.579 4.864 5.149 5.053 5.951 6.191 6.651 7.108 7.555 7.771 8.19 8.572 9.109 9.463 9.811 10.33 10.83 11.302 11.758 12.202 12.788 13.356 13.891 14.527 15.132 15.713 16.398 17.172 17.957 18.841 19.781 20.772 21.819 23.064 24.555 26.059 27.85 29.923 32.4 35.238 38.707 43.164 48.663 53.423 56.403 58.377 59.748 60.818 61.674 62.294 62.698 63.022 63.205 63.318 63.42 63.484 63.525 63.543 63.519 63.475 63.404 63.314 63.199 63.066 62.926 62.773 62.628 62.455 62.244 62.023 61.816 61.667 61.514 61.276 61.085 60.867 60.755 60.51 60.25 59.969 59.812 59.062 59.288 59.094 58.878 58.372 58.12 57.869 57.533 57.016 56.418 55.768 53.982 -9 ,31683 ,TETRA ,17551623,Thu Nov 25 12:32:16 CET,Thu Nov 25 14:33:32 CET,0.0 1.873 2.476 2.941 3.343 3.725 4.095 4.452 5.101 5.382 5.659 5.521 6.42 6.667 7.143 7.59 8.013 8.214 8.598 8.966 9.508 9.873 10.234 10.758 11.238 11.689 12.133 12.561 13.114 13.66 14.186 14.819 15.466 16.106 16.821 17.648 18.465 19.352 20.298 21.311 22.394 23.635 25.1 26.579 28.377 30.42 32.851 35.738 39.184 43.403 48.953 54.03 57.058 59.059 60.508 61.532 62.261 62.828 63.247 63.53 63.676 63.789 63.866 63.894 63.907 63.908 63.87 63.796 63.698 63.566 63.407 63.262 63.111 62.949 62.815 62.655 62.483 62.315 62.128 61.977 61.809 61.546 61.362 61.145 61.031 60.788 60.53 60.267 60.116 59.368 59.552 59.338 59.107 58.623 58.383 58.113 57.763 57.339 56.894 56.236 53.169 -10 ,11018 ,TETRA ,17551624,Thu Nov 25 12:32:16 CET,Thu Nov 25 14:32:16 CET,0.0 1.71 2.284 2.784 3.253 3.667 4.034 4.4 5.078 5.358 5.618 5.499 6.388 6.634 7.116 7.593 8.044 8.26 8.692 9.112 9.696 10.06 10.398 10.892 11.371 11.843 12.309 12.753 13.324 13.865 14.387 15.004 15.617 16.219 16.929 17.722 18.47 19.314 20.244 21.258 22.367 23.631 25.105 26.599 28.321 30.295 32.664 35.467 38.939 43.155 48.599 53.436 56.552 58.788 60.315 61.366 62.131 62.69 63.046 63.337 63.531 63.664 63.736 63.756 63.782 63.794 63.746 63.672 63.598 63.503 63.363 63.228 63.076 62.908 62.762 62.603 62.44 62.26 62.057 61.888 61.702 61.444 61.269 61.055 60.938 60.683 60.39 60.091 59.948 59.234 59.469 59.285 59.081 58.616 58.337 58.019 57.663 57.279 56.813 56.148 53.856 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23479.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23479.txt deleted file mode 100644 index deb04f8f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23479.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26320 ,TETRA ,17551625,Thu Nov 25 12:32:16 CET,Thu Nov 25 14:54:12 CET,0.0 1.542 2.195 2.734 3.229 3.623 3.953 4.275 4.918 5.229 5.516 5.391 6.289 6.546 7.023 7.468 7.902 8.107 8.519 8.917 9.497 9.867 10.206 10.723 11.232 11.7 12.144 12.576 13.135 13.666 14.186 14.859 15.513 16.126 16.829 17.626 18.43 19.344 20.33 21.336 22.379 23.601 25.064 26.55 28.297 30.331 32.787 35.625 39.02 43.201 48.615 53.403 56.354 58.317 59.607 60.472 61.102 61.534 61.809 62.036 62.165 62.241 62.273 62.255 62.212 62.156 62.097 62.02 61.926 61.819 61.687 61.546 61.4 61.254 61.138 60.991 60.803 60.61 60.377 60.203 60.039 59.767 59.558 59.326 59.209 58.984 58.73 58.456 58.302 57.537 57.741 57.551 57.343 56.839 56.556 56.258 55.98 55.677 55.295 54.639 52.893 -2 ,17431 ,TETRA ,17551626,Thu Nov 25 12:32:18 CET,Thu Nov 25 14:54:58 CET,0.0 0.986 1.524 1.981 2.397 2.79 3.139 3.457 4.046 4.316 4.567 4.429 5.315 5.546 5.991 6.403 6.809 7.017 7.41 7.771 8.314 8.678 9.03 9.531 10.031 10.525 10.991 11.426 11.962 12.498 13.028 13.651 14.279 14.9 15.62 16.454 17.258 18.145 19.091 20.052 21.043 22.224 23.668 25.098 26.765 28.671 30.893 33.424 36.53 40.429 45.457 49.874 52.531 54.152 55.277 56.161 56.761 57.199 57.517 57.738 57.839 57.891 57.926 57.936 57.897 57.845 57.782 57.699 57.595 57.474 57.353 57.225 57.095 56.957 56.829 56.68 56.509 56.324 56.12 55.984 55.847 55.606 55.426 55.228 55.118 54.883 54.64 54.39 54.244 53.492 53.742 53.543 53.341 52.912 52.689 52.445 52.168 51.794 51.326 50.675 49.423 -3 ,18765 ,TETRA ,17551627,Thu Nov 25 12:33:15 CET,Thu Nov 25 14:55:10 CET,0.0 1.075 1.564 1.985 2.343 2.688 3.026 3.348 3.947 4.239 4.53 4.432 5.319 5.562 6.009 6.429 6.846 7.053 7.444 7.821 8.382 8.744 9.104 9.608 10.076 10.543 10.998 11.436 12.002 12.553 13.086 13.724 14.347 14.936 15.585 16.37 17.146 17.975 18.89 19.865 20.886 22.051 23.431 24.808 26.421 28.29 30.467 32.983 36.093 39.883 44.749 49.095 51.767 53.517 54.718 55.602 56.236 56.696 56.985 57.192 57.363 57.462 57.492 57.51 57.508 57.482 57.416 57.302 57.184 57.086 56.99 56.87 56.7 56.519 56.398 56.282 56.141 55.99 55.81 55.664 55.521 55.257 55.048 54.848 54.745 54.501 54.226 53.953 53.803 53.034 53.277 53.094 52.902 52.48 52.243 51.993 51.696 51.382 51.052 50.601 49.338 -4 ,24879 ,TETRA ,17551628,Thu Nov 25 12:34:13 CET,Thu Nov 25 14:53:54 CET,0.0 1.478 2.135 2.64 3.074 3.471 3.848 4.195 4.825 5.116 5.395 5.288 6.185 6.43 6.903 7.363 7.815 8.033 8.43 8.814 9.382 9.745 10.094 10.604 11.106 11.573 12.015 12.46 13.02 13.543 14.054 14.66 15.236 15.792 16.462 17.221 17.94 18.764 19.684 20.654 21.697 22.879 24.259 25.683 27.341 29.195 31.416 34.001 37.116 40.942 45.765 49.899 52.455 54.203 55.431 56.334 56.997 57.424 57.689 57.918 58.041 58.125 58.179 58.188 58.169 58.127 58.063 57.985 57.899 57.8 57.702 57.603 57.477 57.312 57.168 57.007 56.839 56.672 56.485 56.35 56.195 55.937 55.737 55.523 55.411 55.152 54.865 54.565 54.41 53.666 53.91 53.73 53.537 53.091 52.842 52.577 52.295 51.99 51.563 51.01 49.79 -5 ,17369 ,TETRA ,17551629,Thu Nov 25 12:35:16 CET,Thu Nov 25 14:44:32 CET,0.0 1.488 2.143 2.623 3.054 3.454 3.82 4.182 4.86 5.169 5.461 5.35 6.251 6.504 6.981 7.41 7.815 8.018 8.436 8.84 9.424 9.795 10.14 10.653 11.153 11.651 12.14 12.592 13.164 13.691 14.182 14.794 15.394 15.973 16.639 17.41 18.185 19.039 19.939 20.929 22.024 23.268 24.723 26.189 27.943 29.933 32.29 34.976 38.195 42.276 47.27 51.396 53.942 55.715 56.933 57.769 58.361 58.796 59.089 59.277 59.396 59.461 59.482 59.509 59.511 59.49 59.456 59.379 59.302 59.213 59.093 58.977 58.845 58.672 58.534 58.401 58.259 58.114 57.943 57.816 57.67 57.421 57.25 57.047 56.934 56.703 56.447 56.16 56.03 55.32 55.634 55.475 55.324 54.979 54.758 54.499 54.213 53.918 53.568 53.086 52.248 -6 ,7444 ,TETRA ,17551630,Thu Nov 25 12:35:19 CET,Thu Nov 25 14:54:51 CET,0.0 1.369 1.992 2.475 2.915 3.302 3.658 3.978 4.569 4.859 5.131 5.028 5.947 6.195 6.663 7.113 7.56 7.787 8.219 8.616 9.139 9.469 9.811 10.305 10.749 11.153 11.576 12.007 12.548 13.068 13.549 14.115 14.674 15.238 15.892 16.615 17.327 18.149 19.04 19.993 20.991 22.123 23.465 24.823 26.466 28.333 30.519 33.016 36.014 39.763 44.674 48.969 51.566 53.314 54.521 55.366 55.949 56.371 56.653 56.873 57.005 57.073 57.108 57.1 57.073 57.054 57.031 56.977 56.9 56.806 56.687 56.575 56.433 56.268 56.142 55.982 55.795 55.613 55.417 55.259 55.09 54.826 54.637 54.425 54.311 54.068 53.8 53.495 53.334 52.597 52.86 52.682 52.483 52.075 51.828 51.549 51.266 50.927 50.549 50.043 48.948 -7 ,18349 ,TETRA ,17551631,Thu Nov 25 12:35:21 CET,Thu Nov 25 14:55:19 CET,0.0 1.638 2.247 2.702 3.08 3.449 3.798 4.103 4.668 4.946 5.222 5.106 6.0 6.242 6.707 7.153 7.572 7.775 8.181 8.577 9.128 9.495 9.861 10.367 10.856 11.32 11.771 12.225 12.803 13.364 13.905 14.545 15.152 15.751 16.465 17.265 18.064 18.924 19.821 20.776 21.782 22.931 24.275 25.617 27.226 29.105 31.337 33.882 36.934 40.76 45.62 49.86 52.543 54.343 55.469 56.229 56.749 57.101 57.374 57.624 57.759 57.792 57.79 57.756 57.703 57.64 57.547 57.453 57.353 57.21 57.049 56.924 56.781 56.625 56.49 56.356 56.221 56.054 55.862 55.72 55.574 55.324 55.128 54.918 54.813 54.592 54.347 54.098 53.977 53.244 53.55 53.374 53.19 52.832 52.639 52.408 52.156 51.898 51.551 51.03 49.046 -8 ,32595 ,TETRA ,17551632,Thu Nov 25 12:35:16 CET,Thu Nov 25 14:40:26 CET,0.0 1.499 2.167 2.712 3.17 3.571 3.944 4.289 4.905 5.204 5.488 5.393 6.293 6.551 7.032 7.474 7.902 8.107 8.5 8.888 9.471 9.85 10.198 10.692 11.185 11.664 12.113 12.556 13.126 13.67 14.215 14.833 15.416 16.004 16.693 17.472 18.209 19.015 19.893 20.809 21.817 23.023 24.436 25.875 27.586 29.559 31.893 34.563 37.831 41.977 47.3 51.881 54.77 56.667 57.84 58.619 59.223 59.691 59.985 60.228 60.392 60.457 60.471 60.469 60.443 60.402 60.338 60.273 60.196 60.091 59.95 59.806 59.673 59.534 59.398 59.229 59.064 58.882 58.655 58.499 58.334 58.078 57.903 57.717 57.608 57.372 57.125 56.836 56.677 55.927 56.165 55.966 55.764 55.315 55.072 54.814 54.541 54.258 53.956 53.576 52.551 -9 ,30918 ,TETRA ,17551633,Thu Nov 25 12:35:16 CET,Thu Nov 25 14:56:15 CET,0.0 1.055 1.701 2.197 2.612 2.988 3.34 3.656 4.242 4.519 4.799 4.718 5.623 5.858 6.337 6.806 7.244 7.454 7.861 8.254 8.826 9.185 9.545 10.094 10.625 11.125 11.608 12.079 12.663 13.232 13.797 14.468 15.135 15.785 16.511 17.312 18.075 18.966 19.95 20.999 22.121 23.357 24.821 26.318 28.044 29.982 32.337 35.134 38.541 42.596 47.523 51.909 54.62 56.423 57.62 58.424 59.002 59.431 59.768 60.046 60.181 60.226 60.254 60.268 60.26 60.222 60.101 59.986 59.886 59.765 59.655 59.521 59.346 59.154 58.988 58.812 58.634 58.443 58.233 58.086 57.932 57.687 57.497 57.291 57.189 56.973 56.748 56.488 56.334 55.577 55.853 55.675 55.473 55.042 54.828 54.596 54.318 54.007 53.613 53.083 51.943 -10 ,31993 ,TETRA ,17551634,Thu Nov 25 12:35:16 CET,Thu Nov 25 14:39:41 CET,0.0 1.17 1.744 2.22 2.654 3.069 3.435 3.778 4.452 4.752 5.039 4.96 5.852 6.108 6.584 7.029 7.484 7.702 8.105 8.493 9.085 9.464 9.817 10.325 10.828 11.308 11.754 12.172 12.698 13.238 13.763 14.367 14.968 15.571 16.253 16.998 17.721 18.536 19.479 20.514 21.559 22.76 24.182 25.583 27.283 29.247 31.503 34.047 37.025 40.592 45.224 49.316 51.913 53.751 54.944 55.735 56.345 56.826 57.124 57.33 57.473 57.568 57.611 57.656 57.669 57.613 57.537 57.481 57.418 57.326 57.172 57.009 56.839 56.629 56.475 56.325 56.145 55.931 55.693 55.545 55.395 55.101 54.883 54.671 54.566 54.351 54.125 53.866 53.725 53.003 53.257 53.076 52.883 52.424 52.172 51.91 51.612 51.264 50.864 50.348 48.613 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23483_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23483_23482.txt deleted file mode 100644 index 3be02e13..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23483_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22297 ,TETRA ,17551635,Thu Nov 25 12:36:16 CET,Thu Nov 25 14:34:05 CET,0.0 0.89 1.272 1.572 1.857 2.108 2.327 2.528 2.887 3.048 3.199 2.91 3.635 3.758 3.983 4.192 4.389 4.483 4.648 4.801 5.034 5.167 5.298 5.467 5.609 5.724 5.814 5.887 5.965 6.049 6.14 6.253 6.314 6.348 6.378 6.396 6.378 6.293 6.176 6.037 5.868 5.644 5.338 4.952 4.442 3.847 3.021 1.84 0.102 -2.551 -6.71 -11.309 -14.932 -17.914 -20.339 -22.46 -24.262 -25.782 -27.092 -28.392 -29.483 -30.456 -31.361 -32.208 -32.983 -33.695 -34.432 -35.091 -35.664 -36.262 -36.883 -37.416 -37.955 -38.488 -38.912 -39.359 -39.841 -40.326 -40.818 -41.17 -41.546 -42.153 -42.574 -43.003 -43.23 -43.717 -44.245 -44.786 -45.056 -45.967 -45.888 -46.177 -46.503 -47.279 -47.709 -48.163 -48.661 -49.21 -49.851 -50.701 -54.077 -2 ,1155 ,TETRA ,17551636,Thu Nov 25 12:36:17 CET,Thu Nov 25 14:43:50 CET,0.0 0.939 1.414 1.737 2.004 2.262 2.488 2.678 3.007 3.159 3.299 2.972 3.702 3.83 4.097 4.326 4.531 4.622 4.792 4.957 5.169 5.319 5.468 5.655 5.841 6.005 6.11 6.176 6.236 6.278 6.334 6.392 6.467 6.546 6.566 6.587 6.608 6.596 6.548 6.458 6.318 6.092 5.814 5.486 4.988 4.319 3.413 2.176 0.387 -2.216 -6.234 -10.784 -14.33 -17.251 -19.667 -21.751 -23.581 -25.185 -26.511 -27.795 -28.882 -29.854 -30.756 -31.582 -32.398 -33.154 -33.904 -34.555 -35.117 -35.706 -36.333 -36.886 -37.448 -37.996 -38.427 -38.869 -39.32 -39.799 -40.326 -40.703 -41.094 -41.673 -42.116 -42.6 -42.824 -43.301 -43.808 -44.336 -44.621 -45.574 -45.614 -45.988 -46.378 -47.152 -47.564 -48.024 -48.555 -49.142 -49.842 -50.819 -53.409 -3 ,14386 ,TETRA ,17551637,Thu Nov 25 12:37:18 CET,Thu Nov 25 14:44:21 CET,0.0 0.843 1.303 1.697 2.0 2.228 2.447 2.654 3.045 3.224 3.384 3.087 3.805 3.911 4.127 4.337 4.519 4.609 4.79 4.933 5.131 5.274 5.393 5.544 5.697 5.838 5.944 6.035 6.177 6.308 6.401 6.468 6.516 6.549 6.599 6.617 6.572 6.516 6.445 6.348 6.218 6.01 5.706 5.336 4.815 4.135 3.225 2.008 0.226 -2.36 -6.408 -10.976 -14.559 -17.458 -19.872 -21.93 -23.639 -25.154 -26.469 -27.801 -28.963 -29.98 -30.896 -31.729 -32.538 -33.265 -34.006 -34.731 -35.391 -36.022 -36.653 -37.195 -37.746 -38.317 -38.769 -39.235 -39.728 -40.236 -40.748 -41.117 -41.503 -42.095 -42.512 -42.946 -43.173 -43.623 -44.075 -44.562 -44.838 -45.755 -45.673 -46.013 -46.39 -47.167 -47.571 -48.025 -48.553 -49.11 -49.762 -50.755 -55.094 -4 ,12360 ,TETRA ,17551638,Thu Nov 25 12:37:18 CET,Thu Nov 25 15:02:32 CET,0.0 0.813 1.197 1.471 1.719 1.968 2.189 2.381 2.701 2.85 2.995 2.669 3.371 3.493 3.742 3.989 4.184 4.267 4.425 4.567 4.775 4.901 5.016 5.168 5.288 5.412 5.563 5.704 5.826 5.901 5.969 6.03 6.069 6.088 6.095 6.101 6.098 6.072 6.003 5.907 5.768 5.555 5.246 4.858 4.358 3.709 2.767 1.509 -0.324 -3.055 -7.309 -12.142 -15.954 -19.028 -21.596 -23.833 -25.678 -27.264 -28.624 -29.923 -30.972 -31.933 -32.864 -33.724 -34.505 -35.24 -36.017 -36.711 -37.344 -38.0 -38.621 -39.129 -39.685 -40.261 -40.699 -41.141 -41.621 -42.115 -42.613 -42.972 -43.348 -43.932 -44.345 -44.792 -45.032 -45.561 -46.091 -46.631 -46.937 -47.88 -47.876 -48.214 -48.59 -49.389 -49.81 -50.275 -50.786 -51.331 -51.97 -52.886 -56.047 -5 ,4287 ,TETRA ,17551639,Thu Nov 25 12:37:17 CET,Thu Nov 25 14:46:48 CET,0.0 0.779 1.169 1.518 1.82 2.083 2.288 2.465 2.812 2.974 3.123 2.807 3.532 3.661 3.892 4.094 4.306 4.403 4.58 4.751 4.968 5.105 5.236 5.402 5.538 5.691 5.836 5.958 6.1 6.237 6.357 6.446 6.5 6.528 6.547 6.541 6.546 6.567 6.52 6.402 6.259 6.08 5.831 5.499 4.995 4.32 3.393 2.141 0.394 -2.169 -6.297 -11.006 -14.652 -17.583 -19.993 -22.037 -23.776 -25.33 -26.655 -27.986 -29.124 -30.105 -31.031 -31.928 -32.728 -33.416 -34.139 -34.81 -35.379 -35.96 -36.568 -37.078 -37.649 -38.236 -38.662 -39.118 -39.628 -40.151 -40.703 -41.086 -41.465 -42.042 -42.447 -42.9 -43.152 -43.666 -44.174 -44.692 -44.954 -45.883 -45.87 -46.196 -46.542 -47.325 -47.773 -48.256 -48.822 -49.523 -50.381 -51.44 -54.563 -6 ,17983 ,TETRA ,17551640,Thu Nov 25 12:37:18 CET,Thu Nov 25 14:44:58 CET,0.0 0.851 1.268 1.608 1.901 2.16 2.419 2.643 3.002 3.167 3.315 2.977 3.686 3.817 4.076 4.3 4.497 4.585 4.764 4.927 5.129 5.25 5.377 5.552 5.696 5.818 5.941 6.046 6.169 6.271 6.332 6.379 6.419 6.454 6.486 6.491 6.474 6.465 6.405 6.301 6.16 5.93 5.649 5.344 4.854 4.179 3.256 2.073 0.353 -2.236 -6.313 -10.924 -14.506 -17.402 -19.769 -21.833 -23.604 -25.194 -26.522 -27.79 -28.84 -29.768 -30.668 -31.542 -32.373 -33.094 -33.838 -34.511 -35.082 -35.689 -36.339 -36.884 -37.412 -37.981 -38.425 -38.871 -39.351 -39.858 -40.397 -40.753 -41.127 -41.71 -42.115 -42.562 -42.803 -43.305 -43.812 -44.351 -44.644 -45.573 -45.524 -45.876 -46.232 -46.976 -47.393 -47.835 -48.318 -48.928 -49.639 -50.531 -54.136 -7 ,5940 ,TETRA ,17551641,Thu Nov 25 12:37:18 CET,Thu Nov 25 14:55:20 CET,0.0 0.836 1.257 1.536 1.779 2.001 2.206 2.412 2.767 2.93 3.077 2.728 3.42 3.539 3.754 3.94 4.099 4.178 4.333 4.466 4.662 4.816 4.967 5.172 5.346 5.452 5.542 5.641 5.767 5.851 5.907 6.012 6.105 6.16 6.192 6.22 6.218 6.147 6.047 5.95 5.82 5.597 5.305 4.999 4.573 3.977 3.097 1.914 0.212 -2.355 -6.532 -11.199 -14.755 -17.696 -20.151 -22.247 -24.023 -25.565 -26.88 -28.202 -29.299 -30.245 -31.166 -32.025 -32.805 -33.539 -34.292 -34.95 -35.539 -36.167 -36.834 -37.364 -37.909 -38.472 -38.914 -39.417 -39.95 -40.485 -41.022 -41.395 -41.79 -42.422 -42.853 -43.285 -43.518 -43.985 -44.499 -45.051 -45.329 -46.271 -46.244 -46.572 -46.928 -47.694 -48.101 -48.584 -49.146 -49.74 -50.42 -51.349 -54.631 -8 ,14989 ,TETRA ,17551642,Thu Nov 25 12:38:15 CET,Thu Nov 25 14:44:42 CET,0.0 0.739 1.115 1.42 1.689 1.921 2.149 2.366 2.691 2.828 2.969 2.68 3.387 3.502 3.716 3.903 4.107 4.214 4.393 4.533 4.699 4.812 4.926 5.059 5.19 5.318 5.441 5.57 5.702 5.786 5.85 5.912 5.944 5.966 5.98 5.976 5.957 5.937 5.873 5.741 5.593 5.398 5.089 4.698 4.169 3.45 2.45 1.161 -0.665 -3.311 -7.444 -12.04 -15.615 -18.524 -20.931 -23.012 -24.734 -26.216 -27.462 -28.73 -29.809 -30.747 -31.668 -32.528 -33.282 -33.971 -34.699 -35.349 -35.922 -36.502 -37.069 -37.551 -38.076 -38.612 -39.034 -39.497 -39.969 -40.463 -41.002 -41.371 -41.752 -42.364 -42.797 -43.227 -43.433 -43.88 -44.392 -44.936 -45.201 -46.104 -46.076 -46.419 -46.782 -47.514 -47.926 -48.362 -48.843 -49.432 -50.126 -51.017 -55.345 -9 ,9658 ,TETRA ,17551643,Thu Nov 25 12:37:18 CET,Thu Nov 25 14:36:17 CET,0.0 0.691 1.086 1.391 1.651 1.909 2.15 2.387 2.824 2.984 3.122 2.793 3.513 3.643 3.872 4.074 4.268 4.36 4.543 4.692 4.873 4.986 5.081 5.211 5.337 5.453 5.541 5.61 5.698 5.792 5.882 5.98 6.043 6.063 6.055 6.037 6.018 5.955 5.853 5.711 5.534 5.341 5.082 4.744 4.275 3.637 2.73 1.505 -0.241 -2.729 -6.654 -11.175 -14.722 -17.62 -20.032 -22.124 -23.879 -25.38 -26.631 -27.867 -28.903 -29.807 -30.679 -31.513 -32.285 -33.003 -33.723 -34.336 -34.861 -35.424 -36.047 -36.563 -37.076 -37.616 -38.037 -38.468 -38.938 -39.427 -39.93 -40.291 -40.67 -41.26 -41.692 -42.141 -42.365 -42.892 -43.481 -44.08 -44.374 -45.286 -45.269 -45.62 -46.001 -46.844 -47.298 -47.764 -48.259 -48.829 -49.579 -50.6 -53.5 -10 ,23054 ,TETRA ,17551644,Thu Nov 25 12:37:18 CET,Thu Nov 25 14:38:02 CET,0.0 1.138 1.574 1.881 2.116 2.325 2.518 2.707 3.088 3.254 3.388 3.039 3.744 3.858 4.076 4.305 4.499 4.575 4.722 4.856 5.039 5.159 5.269 5.407 5.529 5.63 5.705 5.778 5.87 5.964 6.047 6.143 6.239 6.299 6.343 6.393 6.421 6.423 6.387 6.287 6.121 5.895 5.624 5.291 4.815 4.157 3.232 2.001 0.245 -2.309 -6.346 -10.936 -14.516 -17.396 -19.802 -21.866 -23.579 -25.101 -26.401 -27.657 -28.703 -29.618 -30.501 -31.355 -32.167 -32.876 -33.581 -34.257 -34.856 -35.444 -36.061 -36.587 -37.108 -37.634 -38.052 -38.497 -38.952 -39.412 -39.907 -40.282 -40.692 -41.334 -41.761 -42.195 -42.426 -42.929 -43.449 -44.004 -44.294 -45.212 -45.185 -45.507 -45.848 -46.586 -46.994 -47.471 -47.992 -48.539 -49.209 -50.119 -53.348 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23484.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23484.txt deleted file mode 100644 index 7436bf1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23484.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11195 ,TETRA ,17551645,Thu Nov 25 12:38:15 CET,Thu Nov 25 14:46:12 CET,0.0 0.51 0.872 1.165 1.417 1.643 1.851 2.051 2.408 2.581 2.747 2.413 3.196 3.322 3.569 3.811 4.051 4.169 4.388 4.607 4.939 5.144 5.346 5.634 5.908 6.179 6.437 6.675 6.961 7.251 7.535 7.871 8.2 8.509 8.856 9.251 9.628 10.058 10.498 10.925 11.381 11.889 12.446 12.99 13.606 14.251 14.986 15.759 16.545 17.335 17.993 18.145 17.923 17.54 17.093 16.647 16.184 15.658 15.223 14.789 14.352 13.938 13.518 13.102 12.729 12.38 12.016 11.69 11.397 11.087 10.75 10.453 10.147 9.828 9.564 9.292 9.0 8.7 8.396 8.181 7.956 7.584 7.316 7.046 6.9 6.566 6.227 5.886 5.702 4.89 5.127 4.913 4.695 4.233 3.947 3.607 3.234 2.824 2.387 1.809 0.687 -2 ,12855 ,TETRA ,17551646,Thu Nov 25 12:38:15 CET,Thu Nov 25 14:45:07 CET,0.0 0.707 1.071 1.39 1.647 1.867 2.066 2.263 2.621 2.782 2.943 2.621 3.421 3.57 3.829 4.067 4.294 4.402 4.621 4.843 5.164 5.364 5.562 5.856 6.136 6.405 6.653 6.896 7.206 7.489 7.756 8.09 8.422 8.743 9.103 9.469 9.81 10.192 10.613 11.048 11.514 12.062 12.658 13.217 13.883 14.603 15.346 16.188 17.108 17.948 18.59 18.759 18.536 18.154 17.733 17.222 16.718 16.242 15.84 15.433 15.059 14.692 14.285 13.891 13.518 13.162 12.805 12.502 12.226 11.915 11.591 11.311 10.987 10.664 10.425 10.158 9.882 9.585 9.247 9.017 8.79 8.431 8.177 7.901 7.75 7.424 7.095 6.753 6.572 5.759 6.018 5.81 5.579 5.109 4.859 4.578 4.232 3.821 3.383 2.819 1.611 -3 ,25769 ,TETRA ,17551647,Thu Nov 25 12:24:19 CET,Thu Nov 25 14:48:03 CET,0.0 0.567 0.868 1.105 1.341 1.581 1.795 1.976 2.314 2.48 2.645 2.323 3.108 3.254 3.555 3.822 4.071 4.197 4.425 4.642 4.972 5.183 5.389 5.695 6.001 6.277 6.521 6.757 7.048 7.324 7.587 7.897 8.202 8.507 8.851 9.228 9.617 10.032 10.455 10.909 11.371 11.861 12.418 12.969 13.574 14.247 14.982 15.744 16.558 17.371 18.087 18.28 18.09 17.682 17.185 16.717 16.266 15.791 15.359 14.926 14.501 14.062 13.652 13.277 12.897 12.551 12.184 11.842 11.543 11.229 10.903 10.632 10.321 9.972 9.694 9.407 9.116 8.802 8.47 8.249 8.03 7.673 7.384 7.065 6.908 6.582 6.251 5.91 5.731 4.909 5.147 4.949 4.75 4.295 4.018 3.728 3.446 3.131 2.741 2.232 1.054 -4 ,10562 ,TETRA ,17551648,Thu Nov 25 12:24:14 CET,Thu Nov 25 14:48:04 CET,0.0 0.623 0.999 1.292 1.539 1.755 1.957 2.141 2.479 2.639 2.797 2.466 3.226 3.357 3.614 3.858 4.084 4.194 4.409 4.616 4.916 5.107 5.302 5.583 5.832 6.065 6.295 6.521 6.821 7.109 7.374 7.686 8.007 8.328 8.706 9.112 9.478 9.876 10.297 10.737 11.182 11.676 12.243 12.771 13.378 14.064 14.803 15.539 16.309 17.08 17.785 17.928 17.592 17.132 16.646 16.15 15.669 15.189 14.768 14.345 13.955 13.604 13.268 12.931 12.597 12.303 11.996 11.686 11.402 11.096 10.79 10.529 10.221 9.874 9.598 9.321 9.029 8.718 8.401 8.183 7.955 7.591 7.336 7.065 6.922 6.634 6.313 5.95 5.769 4.954 5.202 4.997 4.776 4.282 4.028 3.764 3.468 3.115 2.715 2.206 1.161 -5 ,11924 ,TETRA ,17551649,Thu Nov 25 12:24:17 CET,Thu Nov 25 14:47:17 CET,0.0 0.582 0.908 1.198 1.438 1.705 1.995 2.238 2.659 2.846 3.005 2.662 3.445 3.604 3.903 4.185 4.442 4.56 4.791 5.023 5.361 5.575 5.786 6.112 6.398 6.652 6.894 7.125 7.442 7.743 8.02 8.344 8.651 8.964 9.318 9.713 10.099 10.498 10.902 11.336 11.795 12.332 12.928 13.449 14.05 14.71 15.468 16.26 17.03 17.748 18.326 18.37 18.081 17.699 17.201 16.665 16.186 15.73 15.281 14.795 14.369 13.948 13.514 13.079 12.669 12.318 11.951 11.602 11.302 10.999 10.655 10.357 10.031 9.667 9.388 9.107 8.814 8.512 8.186 7.95 7.715 7.347 7.068 6.774 6.63 6.309 5.97 5.624 5.446 4.628 4.862 4.64 4.405 3.934 3.684 3.389 3.054 2.69 2.287 1.779 0.808 -6 ,24567 ,TETRA ,17551650,Thu Nov 25 12:24:19 CET,Thu Nov 25 14:46:17 CET,0.0 0.829 1.245 1.526 1.8 2.044 2.247 2.474 2.879 3.045 3.205 2.904 3.707 3.854 4.124 4.378 4.624 4.746 4.981 5.21 5.517 5.709 5.904 6.184 6.434 6.68 6.929 7.171 7.512 7.821 8.094 8.416 8.732 9.05 9.392 9.771 10.148 10.558 10.979 11.412 11.865 12.398 13.008 13.581 14.254 14.947 15.664 16.452 17.321 18.209 18.884 19.052 18.91 18.587 18.176 17.709 17.219 16.766 16.392 16.002 15.668 15.352 15.015 14.646 14.26 13.914 13.526 13.173 12.878 12.543 12.191 11.896 11.595 11.277 10.999 10.712 10.436 10.151 9.828 9.586 9.355 8.986 8.707 8.424 8.269 7.945 7.631 7.281 7.088 6.269 6.486 6.265 6.022 5.499 5.23 4.932 4.608 4.226 3.722 3.149 2.033 -7 ,15507 ,TETRA ,17551651,Thu Nov 25 12:24:14 CET,Thu Nov 25 14:23:37 CET,0.0 0.818 1.161 1.47 1.755 2.024 2.261 2.466 2.833 2.986 3.126 2.795 3.575 3.724 3.996 4.262 4.531 4.649 4.862 5.059 5.362 5.574 5.761 6.025 6.293 6.575 6.849 7.098 7.413 7.704 7.979 8.307 8.621 8.924 9.283 9.697 10.088 10.519 10.982 11.459 11.934 12.443 13.02 13.571 14.187 14.863 15.605 16.361 17.126 17.912 18.659 18.831 18.569 18.155 17.728 17.295 16.825 16.334 15.888 15.434 15.018 14.645 14.272 13.899 13.552 13.222 12.879 12.583 12.304 11.995 11.681 11.41 11.107 10.793 10.558 10.3 10.011 9.713 9.406 9.179 8.946 8.615 8.377 8.13 7.997 7.699 7.366 6.993 6.801 5.996 6.237 6.023 5.807 5.314 5.024 4.72 4.392 3.998 3.532 3.026 1.712 -8 ,4530 ,TETRA ,17551652,Thu Nov 25 12:24:14 CET,Thu Nov 25 14:22:58 CET,0.0 0.756 1.094 1.405 1.702 1.936 2.146 2.345 2.738 2.923 3.086 2.74 3.516 3.675 3.979 4.223 4.456 4.579 4.82 5.056 5.401 5.626 5.845 6.156 6.448 6.709 6.97 7.237 7.563 7.884 8.195 8.563 8.942 9.286 9.635 10.047 10.467 10.895 11.338 11.808 12.284 12.809 13.412 14.002 14.678 15.382 16.115 16.891 17.744 18.591 19.28 19.432 19.211 18.843 18.452 18.021 17.579 17.103 16.659 16.195 15.772 15.394 15.029 14.683 14.358 14.046 13.699 13.361 13.079 12.79 12.475 12.2 11.893 11.574 11.323 11.044 10.741 10.441 10.139 9.929 9.703 9.341 9.083 8.794 8.646 8.347 8.007 7.657 7.478 6.658 6.851 6.602 6.353 5.822 5.513 5.179 4.845 4.462 3.96 3.362 2.36 -9 ,8578 ,TETRA ,17551653,Thu Nov 25 12:24:15 CET,Thu Nov 25 14:31:15 CET,0.0 0.798 1.176 1.438 1.694 1.937 2.12 2.293 2.648 2.804 2.95 2.622 3.387 3.519 3.793 4.038 4.262 4.378 4.606 4.807 5.083 5.274 5.465 5.747 6.004 6.256 6.513 6.746 7.037 7.311 7.584 7.924 8.232 8.546 8.915 9.3 9.652 10.027 10.423 10.842 11.287 11.78 12.358 12.928 13.547 14.211 14.932 15.66 16.39 17.095 17.691 17.76 17.502 17.106 16.604 16.082 15.604 15.126 14.672 14.202 13.774 13.389 13.022 12.66 12.285 11.914 11.547 11.23 10.924 10.579 10.224 9.922 9.592 9.258 8.999 8.737 8.46 8.148 7.824 7.591 7.356 6.999 6.745 6.457 6.296 5.987 5.664 5.282 5.076 4.249 4.503 4.281 4.05 3.57 3.302 3.016 2.706 2.313 1.889 1.465 0.505 -10 ,7626 ,TETRA ,17551654,Thu Nov 25 12:24:17 CET,Thu Nov 25 14:38:53 CET,0.0 0.65 0.946 1.212 1.464 1.673 1.864 2.058 2.416 2.573 2.727 2.396 3.178 3.321 3.618 3.903 4.16 4.282 4.522 4.756 5.079 5.284 5.484 5.77 6.047 6.319 6.564 6.791 7.089 7.387 7.671 8.006 8.323 8.623 8.997 9.412 9.768 10.167 10.612 11.052 11.512 12.013 12.566 13.105 13.7 14.329 15.061 15.901 16.752 17.479 17.994 18.026 17.732 17.31 16.823 16.317 15.845 15.375 14.934 14.453 14.027 13.66 13.287 12.927 12.588 12.26 11.881 11.534 11.249 10.936 10.599 10.311 10.014 9.696 9.431 9.15 8.873 8.58 8.258 8.048 7.826 7.449 7.183 6.907 6.77 6.496 6.171 5.805 5.628 4.821 5.057 4.826 4.574 4.02 3.709 3.392 3.084 2.732 2.303 1.813 0.984 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23485.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23485.txt deleted file mode 100644 index c58e9fdf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23485.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26486 ,TETRA ,17551655,Thu Nov 25 12:24:14 CET,Thu Nov 25 14:45:58 CET,0.0 1.5 2.15 2.68 3.107 3.468 3.793 4.117 4.725 4.979 5.2 4.954 5.774 5.97 6.335 6.65 6.957 7.099 7.373 7.645 8.018 8.235 8.45 8.764 9.045 9.312 9.575 9.83 10.162 10.475 10.773 11.122 11.446 11.746 12.083 12.438 12.769 13.137 13.539 13.971 14.408 14.888 15.415 15.921 16.492 17.1 17.719 18.345 19.049 19.727 20.208 20.14 19.754 19.283 18.797 18.308 17.812 17.295 16.809 16.338 15.92 15.516 15.148 14.807 14.474 14.167 13.841 13.543 13.28 12.984 12.663 12.387 12.096 11.767 11.496 11.25 10.989 10.672 10.335 10.091 9.844 9.475 9.202 8.94 8.812 8.529 8.213 7.857 7.664 6.85 7.123 6.905 6.661 6.156 5.897 5.629 5.338 5.015 4.629 4.146 3.238 -2 ,22928 ,TETRA ,17551656,Thu Nov 25 12:24:14 CET,Thu Nov 25 14:29:32 CET,0.0 1.652 2.378 2.924 3.358 3.727 4.067 4.403 4.983 5.237 5.47 5.227 6.052 6.252 6.611 6.932 7.235 7.37 7.631 7.896 8.26 8.477 8.698 9.01 9.304 9.595 9.879 10.14 10.444 10.738 11.031 11.368 11.695 12.012 12.372 12.777 13.12 13.467 13.839 14.241 14.656 15.096 15.608 16.144 16.741 17.359 18.016 18.648 19.309 19.923 20.332 20.301 20.038 19.621 19.15 18.619 18.115 17.664 17.241 16.807 16.432 16.089 15.758 15.429 15.104 14.794 14.458 14.161 13.878 13.573 13.253 12.978 12.706 12.403 12.159 11.909 11.634 11.342 11.034 10.808 10.569 10.208 9.941 9.661 9.517 9.222 8.917 8.58 8.405 7.585 7.841 7.636 7.433 7.039 6.827 6.581 6.308 5.984 5.636 5.213 4.275 -3 ,15880 ,TETRA ,17551657,Thu Nov 25 12:24:14 CET,Thu Nov 25 14:34:23 CET,0.0 1.933 2.635 3.16 3.592 3.965 4.292 4.584 5.13 5.364 5.593 5.397 6.199 6.381 6.736 7.045 7.358 7.52 7.8 8.048 8.38 8.581 8.782 9.078 9.361 9.612 9.852 10.102 10.421 10.715 10.988 11.325 11.645 11.933 12.268 12.644 12.985 13.346 13.747 14.164 14.59 15.074 15.593 16.083 16.67 17.315 18.003 18.693 19.364 19.954 20.326 20.209 19.899 19.508 19.06 18.616 18.193 17.788 17.413 16.998 16.629 16.295 15.966 15.631 15.292 14.972 14.635 14.311 14.024 13.73 13.402 13.102 12.8 12.505 12.259 12.001 11.754 11.496 11.196 10.972 10.74 10.386 10.144 9.886 9.751 9.468 9.161 8.846 8.678 7.852 8.089 7.872 7.648 7.173 6.897 6.596 6.25 5.877 5.428 4.867 4.023 -4 ,29248 ,TETRA ,17551658,Thu Nov 25 12:25:15 CET,Thu Nov 25 14:44:13 CET,0.0 1.884 2.628 3.248 3.732 4.114 4.447 4.777 5.367 5.605 5.812 5.59 6.394 6.592 6.946 7.24 7.507 7.645 7.94 8.234 8.627 8.86 9.087 9.409 9.702 9.988 10.241 10.472 10.786 11.088 11.387 11.747 12.085 12.416 12.786 13.182 13.557 13.964 14.4 14.854 15.324 15.84 16.41 16.954 17.556 18.169 18.85 19.538 20.191 20.788 21.214 21.17 20.776 20.259 19.731 19.165 18.614 18.103 17.655 17.213 16.83 16.464 16.103 15.762 15.441 15.154 14.852 14.552 14.287 14.022 13.725 13.47 13.185 12.872 12.64 12.405 12.148 11.864 11.548 11.322 11.095 10.71 10.407 10.074 9.921 9.638 9.322 8.983 8.798 7.975 8.175 7.959 7.724 7.183 6.9 6.6 6.256 5.846 5.356 4.781 3.562 -5 ,933 ,TETRA ,17551659,Thu Nov 25 12:25:15 CET,Thu Nov 25 14:38:19 CET,0.0 1.837 2.453 2.949 3.39 3.792 4.133 4.422 4.954 5.185 5.399 5.179 6.009 6.212 6.596 6.943 7.222 7.344 7.581 7.817 8.182 8.424 8.65 8.971 9.278 9.563 9.811 10.041 10.354 10.655 10.936 11.277 11.604 11.916 12.273 12.669 13.026 13.422 13.859 14.275 14.706 15.225 15.8 16.319 16.908 17.531 18.189 18.873 19.526 20.096 20.463 20.361 19.966 19.499 19.026 18.522 18.074 17.652 17.223 16.767 16.384 16.018 15.673 15.336 15.001 14.684 14.329 14.004 13.72 13.419 13.088 12.814 12.515 12.185 11.946 11.712 11.458 11.172 10.836 10.597 10.357 9.969 9.693 9.425 9.289 8.986 8.664 8.336 8.166 7.358 7.601 7.387 7.167 6.708 6.451 6.167 5.851 5.486 5.061 4.566 3.569 -6 ,20103 ,TETRA ,17551660,Thu Nov 25 12:25:15 CET,Thu Nov 25 14:31:30 CET,0.0 1.817 2.558 3.108 3.542 3.904 4.218 4.498 5.037 5.285 5.493 5.247 6.061 6.248 6.569 6.883 7.187 7.316 7.558 7.783 8.109 8.347 8.575 8.889 9.206 9.506 9.767 10.006 10.31 10.603 10.878 11.195 11.51 11.811 12.145 12.503 12.841 13.202 13.587 14.002 14.44 14.913 15.44 15.96 16.536 17.138 17.783 18.432 19.082 19.685 20.135 20.115 19.742 19.252 18.782 18.31 17.84 17.363 16.92 16.453 16.029 15.653 15.289 14.939 14.59 14.258 13.917 13.603 13.328 13.042 12.759 12.517 12.248 11.959 11.728 11.472 11.194 10.905 10.616 10.403 10.177 9.824 9.572 9.299 9.148 8.839 8.521 8.183 8.001 7.179 7.448 7.256 7.04 6.583 6.328 6.043 5.746 5.437 5.001 4.322 2.507 -7 ,9307 ,TETRA ,17551661,Thu Nov 25 12:26:15 CET,Thu Nov 25 14:53:45 CET,0.0 1.954 2.613 3.138 3.576 3.93 4.265 4.584 5.116 5.362 5.596 5.4 6.245 6.427 6.788 7.113 7.413 7.561 7.837 8.078 8.398 8.612 8.818 9.122 9.408 9.666 9.92 10.158 10.45 10.741 11.027 11.372 11.693 11.974 12.272 12.634 12.98 13.339 13.75 14.183 14.614 15.064 15.567 16.072 16.635 17.221 17.845 18.498 19.207 19.893 20.373 20.354 20.044 19.656 19.216 18.726 18.261 17.836 17.46 17.074 16.704 16.351 16.033 15.707 15.359 15.014 14.65 14.328 14.039 13.747 13.45 13.195 12.903 12.586 12.344 12.089 11.823 11.55 11.258 11.037 10.801 10.437 10.18 9.887 9.738 9.438 9.115 8.776 8.598 7.77 7.969 7.742 7.512 7.001 6.721 6.421 6.087 5.695 5.265 4.75 3.789 -8 ,26055 ,TETRA ,17551662,Thu Nov 25 12:26:17 CET,Thu Nov 25 14:53:26 CET,0.0 1.892 2.614 3.141 3.629 4.061 4.413 4.718 5.322 5.6 5.83 5.636 6.451 6.643 6.97 7.261 7.536 7.678 7.957 8.228 8.619 8.847 9.061 9.353 9.635 9.924 10.199 10.443 10.75 11.044 11.327 11.672 11.983 12.278 12.621 12.974 13.3 13.663 14.04 14.443 14.864 15.322 15.839 16.335 16.85 17.395 18.019 18.655 19.31 19.976 20.489 20.462 20.158 19.746 19.284 18.777 18.282 17.819 17.403 16.962 16.567 16.201 15.851 15.506 15.168 14.824 14.442 14.126 13.853 13.576 13.283 13.022 12.743 12.429 12.174 11.91 11.643 11.363 11.044 10.824 10.593 10.212 9.949 9.666 9.518 9.214 8.905 8.571 8.386 7.552 7.763 7.535 7.318 6.856 6.605 6.344 6.039 5.702 5.326 4.818 3.636 -9 ,27849 ,TETRA ,17551663,Thu Nov 25 12:26:15 CET,Thu Nov 25 14:26:06 CET,0.0 2.015 2.743 3.273 3.705 4.074 4.442 4.774 5.323 5.566 5.796 5.576 6.385 6.558 6.892 7.195 7.487 7.628 7.88 8.116 8.479 8.699 8.913 9.218 9.5 9.773 10.055 10.319 10.607 10.897 11.197 11.557 11.898 12.217 12.57 12.942 13.289 13.659 14.038 14.416 14.81 15.271 15.805 16.329 16.912 17.532 18.191 18.875 19.572 20.175 20.605 20.498 20.138 19.709 19.195 18.636 18.116 17.629 17.188 16.725 16.298 15.902 15.513 15.134 14.776 14.447 14.109 13.801 13.528 13.223 12.902 12.636 12.349 12.045 11.795 11.549 11.305 11.021 10.711 10.504 10.299 9.953 9.699 9.425 9.286 9.001 8.7 8.393 8.234 7.44 7.696 7.498 7.28 6.805 6.528 6.203 5.862 5.502 5.097 4.613 3.509 -10 ,22011 ,TETRA ,17551664,Thu Nov 25 12:26:15 CET,Thu Nov 25 14:41:15 CET,0.0 1.896 2.617 3.172 3.643 4.033 4.363 4.674 5.232 5.475 5.696 5.468 6.312 6.501 6.832 7.136 7.423 7.575 7.866 8.117 8.524 8.775 9.006 9.332 9.61 9.881 10.133 10.387 10.743 11.059 11.349 11.707 12.032 12.34 12.693 13.095 13.492 13.893 14.303 14.717 15.117 15.547 16.056 16.548 17.081 17.655 18.297 18.965 19.646 20.259 20.589 20.443 20.082 19.59 19.079 18.534 18.009 17.509 17.043 16.574 16.15 15.754 15.364 14.986 14.635 14.301 13.952 13.64 13.357 13.066 12.768 12.508 12.229 11.934 11.691 11.454 11.216 10.942 10.624 10.396 10.175 9.838 9.594 9.322 9.176 8.882 8.587 8.269 8.091 7.271 7.541 7.357 7.161 6.688 6.421 6.141 5.812 5.462 5.112 4.702 3.905 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt deleted file mode 100644 index 146d34c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2329 ,TETRA ,17524027,Wed Nov 24 20:26:12 CET,Wed Nov 24 22:06:58 CET,0.0 1.553 2.094 2.503 2.863 3.199 3.503 3.768 4.232 4.454 4.67 4.632 5.231 5.402 5.694 5.972 6.247 6.375 6.635 6.895 7.24 7.459 7.715 8.061 8.309 8.562 8.793 8.986 9.266 9.539 9.788 10.053 10.279 10.498 10.75 11.014 11.236 11.461 11.681 11.883 12.083 12.292 12.426 12.472 12.472 12.418 12.279 11.967 11.361 10.153 7.911 5.146 2.829 0.843 -0.873 -2.415 -3.75 -4.943 -5.939 -6.936 -7.819 -8.622 -9.384 -10.111 -10.794 -11.422 -12.099 -12.719 -13.265 -13.827 -14.424 -14.908 -15.397 -15.932 -16.349 -16.762 -17.188 -17.669 -18.174 -18.51 -18.859 -19.434 -19.839 -20.248 -20.461 -20.913 -21.4 -21.916 -22.187 -22.899 -23.036 -23.357 -23.712 -24.473 -24.945 -25.488 -26.056 -26.694 -27.486 -28.651 -32.215 -2 ,3024 ,TETRA ,17524028,Wed Nov 24 20:26:11 CET,Wed Nov 24 22:01:08 CET,0.0 1.541 2.081 2.532 2.906 3.218 3.501 3.777 4.295 4.529 4.736 4.7 5.288 5.449 5.78 6.104 6.38 6.51 6.776 7.022 7.359 7.58 7.781 8.052 8.311 8.548 8.763 8.973 9.231 9.452 9.637 9.863 10.114 10.345 10.579 10.833 11.069 11.287 11.449 11.588 11.73 11.862 11.999 12.095 12.103 12.01 11.767 11.322 10.631 9.462 7.215 4.384 2.029 -0.011 -1.749 -3.229 -4.538 -5.736 -6.792 -7.882 -8.824 -9.678 -10.491 -11.249 -11.939 -12.598 -13.318 -13.976 -14.564 -15.14 -15.733 -16.272 -16.83 -17.375 -17.798 -18.243 -18.697 -19.159 -19.669 -20.035 -20.398 -20.989 -21.409 -21.833 -22.046 -22.489 -22.995 -23.543 -23.825 -24.563 -24.75 -25.075 -25.408 -26.218 -26.666 -27.142 -27.693 -28.349 -29.133 -30.273 -34.763 -4 ,26547 ,TETRA ,17524030,Wed Nov 24 20:26:12 CET,Wed Nov 24 22:03:33 CET,0.0 1.177 1.768 2.244 2.652 3.018 3.316 3.566 4.008 4.204 4.395 4.354 4.936 5.106 5.432 5.726 5.987 6.106 6.331 6.54 6.863 7.08 7.284 7.556 7.786 7.997 8.209 8.409 8.665 8.911 9.124 9.337 9.556 9.772 10.014 10.296 10.531 10.737 10.93 11.137 11.315 11.462 11.567 11.613 11.6 11.52 11.306 10.861 10.122 8.916 6.68 3.841 1.511 -0.426 -2.156 -3.705 -5.049 -6.287 -7.306 -8.304 -9.199 -10.02 -10.798 -11.532 -12.249 -12.928 -13.637 -14.273 -14.807 -15.34 -15.95 -16.471 -17.0 -17.564 -18.012 -18.477 -18.939 -19.416 -19.927 -20.289 -20.673 -21.315 -21.741 -22.134 -22.345 -22.816 -23.298 -23.801 -24.083 -24.822 -24.961 -25.277 -25.635 -26.415 -26.84 -27.291 -27.809 -28.448 -29.205 -30.317 -34.001 -5 ,25386 ,TETRA ,17524031,Wed Nov 24 20:26:10 CET,Wed Nov 24 22:05:00 CET,0.0 1.31 1.854 2.387 2.888 3.261 3.564 3.834 4.305 4.521 4.73 4.687 5.267 5.426 5.737 6.031 6.267 6.377 6.606 6.842 7.185 7.387 7.571 7.843 8.095 8.313 8.511 8.712 8.98 9.219 9.436 9.647 9.849 10.067 10.293 10.527 10.747 10.951 11.154 11.348 11.509 11.631 11.709 11.752 11.755 11.668 11.427 10.994 10.295 9.101 6.923 4.211 1.913 -0.096 -1.826 -3.36 -4.745 -5.978 -7.002 -8.036 -8.959 -9.752 -10.476 -11.195 -11.931 -12.646 -13.344 -13.947 -14.499 -15.089 -15.71 -16.201 -16.701 -17.251 -17.678 -18.131 -18.641 -19.15 -19.642 -19.984 -20.334 -20.892 -21.299 -21.737 -21.965 -22.444 -22.936 -23.463 -23.755 -24.482 -24.634 -24.959 -25.324 -26.159 -26.618 -27.091 -27.63 -28.255 -29.006 -30.055 -33.848 -6 ,24061 ,TETRA ,17524032,Wed Nov 24 20:26:10 CET,Wed Nov 24 22:04:17 CET,0.0 1.142 1.709 2.12 2.537 2.934 3.238 3.506 3.985 4.199 4.402 4.344 4.933 5.088 5.373 5.645 5.913 6.037 6.261 6.473 6.798 7.005 7.187 7.459 7.72 7.965 8.206 8.424 8.667 8.914 9.164 9.452 9.701 9.904 10.118 10.344 10.537 10.712 10.895 11.094 11.271 11.418 11.531 11.608 11.675 11.634 11.429 11.107 10.477 9.318 7.154 4.389 2.024 0.022 -1.67 -3.226 -4.573 -5.755 -6.789 -7.884 -8.839 -9.675 -10.456 -11.176 -11.872 -12.536 -13.192 -13.78 -14.306 -14.861 -15.418 -15.872 -16.383 -16.927 -17.353 -17.8 -18.298 -18.814 -19.352 -19.723 -20.088 -20.676 -21.091 -21.547 -21.775 -22.211 -22.698 -23.233 -23.513 -24.255 -24.441 -24.766 -25.124 -25.901 -26.356 -26.901 -27.535 -28.253 -29.028 -30.069 -39.039 -7 ,19542 ,TETRA ,17524033,Wed Nov 24 20:26:11 CET,Wed Nov 24 22:04:43 CET,0.0 1.392 1.919 2.356 2.698 3.015 3.307 3.582 4.103 4.313 4.531 4.52 5.11 5.291 5.602 5.873 6.13 6.254 6.472 6.657 6.917 7.096 7.303 7.627 7.886 8.101 8.319 8.529 8.77 9.007 9.247 9.499 9.731 9.944 10.148 10.365 10.569 10.768 10.946 11.116 11.277 11.452 11.601 11.679 11.693 11.566 11.29 10.911 10.247 9.031 6.851 4.113 1.739 -0.257 -1.959 -3.517 -4.879 -6.104 -7.178 -8.277 -9.199 -9.983 -10.727 -11.414 -12.091 -12.733 -13.382 -13.962 -14.471 -15.005 -15.601 -16.101 -16.591 -17.139 -17.578 -18.011 -18.466 -18.955 -19.479 -19.845 -20.221 -20.816 -21.228 -21.669 -21.902 -22.379 -22.879 -23.436 -23.735 -24.473 -24.712 -25.073 -25.45 -26.265 -26.706 -27.169 -27.671 -28.29 -29.07 -30.116 -35.347 -8 ,11285 ,TETRA ,17524034,Wed Nov 24 20:26:11 CET,Wed Nov 24 22:04:25 CET,0.0 2.181 2.767 3.201 3.537 3.875 4.173 4.425 4.905 5.126 5.332 5.33 5.92 6.078 6.386 6.674 6.952 7.088 7.334 7.554 7.863 8.058 8.243 8.518 8.759 8.987 9.21 9.416 9.687 9.938 10.19 10.463 10.709 10.935 11.165 11.425 11.683 11.927 12.097 12.235 12.378 12.518 12.639 12.723 12.764 12.694 12.502 12.174 11.554 10.4 8.273 5.584 3.257 1.241 -0.476 -2.028 -3.338 -4.488 -5.492 -6.514 -7.424 -8.252 -9.042 -9.797 -10.479 -11.115 -11.808 -12.427 -12.962 -13.546 -14.195 -14.726 -15.288 -15.866 -16.3 -16.759 -17.235 -17.705 -18.182 -18.532 -18.916 -19.526 -19.943 -20.387 -20.616 -21.085 -21.595 -22.159 -22.442 -23.169 -23.383 -23.727 -24.095 -24.89 -25.337 -25.863 -26.506 -27.184 -28.051 -29.325 -35.645 -9 ,2031 ,TETRA ,17524035,Wed Nov 24 20:26:12 CET,Wed Nov 24 22:04:11 CET,0.0 1.418 2.008 2.381 2.733 3.054 3.321 3.548 3.948 4.146 4.358 4.334 4.922 5.098 5.443 5.742 6.02 6.146 6.37 6.611 6.984 7.2 7.394 7.668 7.914 8.111 8.303 8.501 8.703 8.895 9.109 9.351 9.588 9.815 10.056 10.353 10.631 10.865 11.086 11.312 11.55 11.755 11.909 11.978 11.983 11.937 11.758 11.385 10.681 9.45 7.173 4.31 1.924 -0.107 -1.823 -3.355 -4.73 -5.977 -7.048 -8.092 -8.986 -9.839 -10.649 -11.367 -12.043 -12.67 -13.318 -13.912 -14.438 -14.967 -15.537 -16.008 -16.508 -17.042 -17.431 -17.849 -18.316 -18.829 -19.357 -19.7 -20.054 -20.612 -21.02 -21.455 -21.675 -22.131 -22.627 -23.157 -23.431 -24.151 -24.31 -24.633 -24.981 -25.745 -26.19 -26.679 -27.211 -27.838 -28.597 -29.656 -35.343 -10 ,23356 ,TETRA ,17524036,Wed Nov 24 20:26:11 CET,Wed Nov 24 22:05:14 CET,0.0 1.406 2.026 2.483 2.865 3.18 3.467 3.736 4.25 4.458 4.629 4.579 5.171 5.346 5.665 5.959 6.247 6.377 6.62 6.843 7.103 7.276 7.461 7.719 7.968 8.21 8.446 8.666 8.934 9.184 9.427 9.721 9.961 10.155 10.366 10.596 10.819 11.031 11.197 11.336 11.48 11.636 11.747 11.803 11.849 11.816 11.623 11.252 10.6 9.414 7.194 4.39 2.04 -0.014 -1.773 -3.298 -4.631 -5.842 -6.884 -7.945 -8.878 -9.708 -10.528 -11.272 -11.954 -12.62 -13.302 -13.904 -14.425 -14.956 -15.57 -16.119 -16.633 -17.156 -17.587 -18.028 -18.48 -18.946 -19.442 -19.785 -20.15 -20.751 -21.175 -21.625 -21.85 -22.303 -22.778 -23.294 -23.574 -24.303 -24.454 -24.775 -25.116 -25.852 -26.278 -26.788 -27.347 -27.964 -28.758 -29.821 -35.091 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt deleted file mode 100644 index e150b633..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2323 ,TETRA ,17524043,Wed Nov 24 20:26:14 CET,Wed Nov 24 22:08:24 CET,0.0 2.407 3.337 3.965 4.442 4.883 5.345 5.774 6.529 6.859 7.149 7.309 7.988 8.224 8.666 9.102 9.527 9.727 10.127 10.511 11.02 11.338 11.647 12.104 12.541 12.97 13.409 13.817 14.306 14.764 15.235 15.79 16.273 16.757 17.327 17.955 18.556 19.188 19.864 20.606 21.398 22.254 23.225 24.21 25.353 26.595 28.015 29.647 31.459 33.479 35.786 37.458 38.337 38.717 38.812 38.788 38.658 38.465 38.238 37.93 37.636 37.345 37.063 36.772 36.446 36.138 35.768 35.427 35.156 34.862 34.52 34.223 33.923 33.605 33.36 33.087 32.786 32.459 32.098 31.843 31.578 31.172 30.876 30.559 30.388 30.042 29.673 29.259 29.032 28.4 28.264 27.989 27.697 27.081 26.743 26.377 25.953 25.42 24.773 23.827 20.568 -2 ,10683 ,TETRA ,17524044,Wed Nov 24 20:26:11 CET,Wed Nov 24 22:11:25 CET,0.0 3.036 3.751 4.29 4.795 5.243 5.648 6.025 6.682 6.973 7.243 7.332 7.992 8.242 8.714 9.149 9.564 9.773 10.183 10.559 11.077 11.411 11.737 12.214 12.672 13.099 13.508 13.904 14.433 14.936 15.391 15.966 16.538 17.052 17.629 18.272 18.848 19.466 20.141 20.858 21.669 22.576 23.581 24.564 25.711 26.989 28.423 30.03 31.883 33.956 36.362 38.123 38.909 39.216 39.296 39.219 39.075 38.863 38.638 38.423 38.164 37.856 37.542 37.254 36.971 36.689 36.361 36.044 35.758 35.466 35.15 34.867 34.56 34.231 33.967 33.71 33.461 33.148 32.806 32.557 32.282 31.871 31.556 31.228 31.071 30.738 30.366 29.949 29.729 29.118 29.063 28.818 28.545 27.91 27.552 27.17 26.76 26.287 25.657 24.856 22.627 -3 ,25042 ,TETRA ,17524045,Wed Nov 24 20:26:12 CET,Wed Nov 24 22:14:57 CET,0.0 3.026 3.799 4.406 4.899 5.346 5.757 6.133 6.8 7.091 7.369 7.491 8.159 8.401 8.851 9.271 9.687 9.89 10.265 10.617 11.119 11.453 11.773 12.232 12.695 13.135 13.514 13.865 14.338 14.816 15.261 15.777 16.274 16.776 17.366 17.992 18.566 19.196 19.887 20.631 21.407 22.244 23.211 24.161 25.277 26.538 27.966 29.517 31.295 33.287 35.48 37.11 37.871 38.181 38.254 38.156 37.916 37.653 37.405 37.097 36.819 36.554 36.286 36.024 35.721 35.408 35.08 34.763 34.481 34.186 33.848 33.579 33.311 32.992 32.739 32.479 32.195 31.887 31.538 31.296 31.045 30.64 30.361 30.066 29.909 29.561 29.176 28.793 28.589 27.976 27.884 27.616 27.35 26.772 26.434 26.047 25.613 25.09 24.46 23.692 21.275 -4 ,26499 ,TETRA ,17524048,Wed Nov 24 20:28:03 CET,Wed Nov 24 22:00:05 CET,0.0 2.327 3.153 3.752 4.243 4.673 5.053 5.403 6.056 6.352 6.619 6.714 7.394 7.633 8.102 8.551 8.951 9.147 9.524 9.874 10.387 10.728 11.059 11.529 11.963 12.383 12.779 13.166 13.686 14.179 14.656 15.22 15.709 16.169 16.759 17.407 18.001 18.671 19.39 20.133 20.887 21.743 22.735 23.675 24.728 25.914 27.351 28.951 30.741 32.81 35.114 36.678 37.385 37.726 37.812 37.734 37.597 37.405 37.167 36.877 36.54 36.214 35.918 35.595 35.252 34.896 34.529 34.232 33.937 33.571 33.213 32.933 32.632 32.316 32.052 31.757 31.457 31.155 30.811 30.564 30.298 29.892 29.608 29.287 29.116 28.748 28.368 27.977 27.769 27.155 27.042 26.785 26.51 25.893 25.548 25.164 24.741 24.257 23.66 22.792 20.276 -5 ,4895 ,TETRA ,17524050,Wed Nov 24 20:28:04 CET,Wed Nov 24 22:07:55 CET,0.0 2.263 3.078 3.634 4.115 4.569 4.964 5.312 5.955 6.25 6.531 6.643 7.297 7.527 7.993 8.432 8.807 8.987 9.358 9.731 10.272 10.593 10.914 11.395 11.839 12.26 12.671 13.07 13.567 14.032 14.495 15.056 15.603 16.135 16.686 17.282 17.897 18.564 19.252 19.972 20.702 21.557 22.544 23.464 24.54 25.753 27.149 28.68 30.453 32.487 34.744 36.374 37.139 37.449 37.487 37.395 37.243 36.987 36.73 36.481 36.208 35.872 35.497 35.173 34.883 34.593 34.274 33.956 33.674 33.361 33.01 32.726 32.427 32.102 31.843 31.558 31.259 30.961 30.631 30.394 30.144 29.721 29.425 29.11 28.94 28.594 28.225 27.832 27.625 27.013 26.922 26.677 26.405 25.763 25.41 25.028 24.606 24.125 23.525 22.654 19.599 -6 ,5362 ,TETRA ,17524052,Wed Nov 24 20:28:04 CET,Wed Nov 24 22:07:06 CET,0.0 2.378 3.16 3.736 4.197 4.608 5.001 5.36 6.008 6.291 6.562 6.691 7.366 7.612 8.082 8.511 8.925 9.125 9.517 9.907 10.452 10.796 11.119 11.578 12.019 12.444 12.858 13.252 13.739 14.213 14.686 15.248 15.778 16.278 16.847 17.472 18.052 18.697 19.38 20.097 20.857 21.725 22.713 23.686 24.821 26.037 27.445 29.019 30.842 32.885 35.128 36.782 37.565 37.897 37.94 37.843 37.724 37.587 37.366 37.039 36.703 36.384 36.04 35.674 35.342 35.047 34.715 34.407 34.142 33.859 33.549 33.255 32.937 32.608 32.327 32.013 31.69 31.372 31.04 30.805 30.56 30.15 29.837 29.512 29.346 28.986 28.603 28.211 27.996 27.359 27.207 26.931 26.656 26.042 25.708 25.337 24.913 24.432 23.799 22.863 18.613 -7 ,5722 ,TETRA ,17524053,Wed Nov 24 20:28:05 CET,Wed Nov 24 22:07:24 CET,0.0 1.918 2.766 3.415 3.92 4.334 4.699 5.061 5.749 6.054 6.337 6.468 7.139 7.387 7.848 8.274 8.677 8.881 9.275 9.631 10.132 10.448 10.763 11.225 11.647 12.064 12.489 12.895 13.394 13.867 14.339 14.902 15.416 15.91 16.481 17.101 17.684 18.363 19.067 19.777 20.578 21.49 22.514 23.547 24.722 25.992 27.422 28.972 30.746 32.825 35.165 36.793 37.538 37.871 37.944 37.895 37.766 37.547 37.319 37.027 36.719 36.443 36.177 35.886 35.59 35.297 34.935 34.594 34.311 34.009 33.671 33.38 33.064 32.726 32.463 32.185 31.897 31.579 31.233 30.996 30.748 30.335 30.04 29.717 29.554 29.242 28.879 28.488 28.286 27.674 27.586 27.32 27.058 26.508 26.159 25.754 25.335 24.866 24.287 23.499 21.043 -8 ,332 ,TETRA ,17524054,Wed Nov 24 20:29:01 CET,Wed Nov 24 22:10:31 CET,0.0 3.219 4.16 4.725 5.166 5.586 5.968 6.312 6.934 7.234 7.515 7.636 8.286 8.511 8.95 9.385 9.769 9.946 10.321 10.689 11.201 11.531 11.858 12.329 12.773 13.202 13.609 13.986 14.475 14.945 15.401 15.941 16.458 16.95 17.504 18.119 18.707 19.393 20.121 20.871 21.666 22.576 23.596 24.59 25.805 27.105 28.547 30.138 31.947 34.027 36.361 38.06 38.819 39.1 39.132 39.072 38.921 38.66 38.398 38.101 37.822 37.562 37.289 36.984 36.652 36.352 36.025 35.708 35.441 35.144 34.813 34.528 34.2 33.858 33.605 33.338 33.043 32.715 32.364 32.114 31.851 31.415 31.116 30.8 30.63 30.285 29.907 29.486 29.282 28.678 28.56 28.282 28.004 27.412 27.065 26.688 26.289 25.8 25.151 24.288 21.462 -9 ,31312 ,TETRA ,17524056,Wed Nov 24 20:29:02 CET,Wed Nov 24 22:09:27 CET,0.0 2.011 2.819 3.384 3.859 4.269 4.65 5.016 5.663 5.971 6.257 6.383 7.059 7.31 7.8 8.247 8.675 8.882 9.278 9.649 10.195 10.548 10.883 11.377 11.832 12.244 12.643 13.062 13.59 14.066 14.544 15.113 15.652 16.157 16.733 17.394 18.015 18.677 19.371 20.107 20.884 21.718 22.684 23.678 24.82 26.108 27.587 29.207 31.078 33.168 35.557 37.307 38.156 38.5 38.583 38.529 38.398 38.158 37.871 37.516 37.149 36.826 36.495 36.179 35.886 35.596 35.279 34.997 34.725 34.419 34.082 33.773 33.464 33.136 32.867 32.613 32.335 32.016 31.696 31.468 31.218 30.819 30.522 30.205 30.043 29.708 29.338 28.922 28.692 28.066 27.97 27.717 27.452 26.817 26.448 26.082 25.69 25.18 24.553 23.735 21.469 -10 ,32218 ,TETRA ,17524058,Wed Nov 24 20:29:02 CET,Wed Nov 24 22:08:16 CET,0.0 3.06 3.828 4.478 5.017 5.437 5.829 6.191 6.808 7.091 7.372 7.465 8.12 8.379 8.871 9.273 9.642 9.831 10.21 10.545 11.019 11.36 11.683 12.138 12.578 12.998 13.411 13.805 14.291 14.771 15.241 15.803 16.323 16.819 17.393 18.021 18.635 19.292 19.964 20.699 21.484 22.328 23.307 24.31 25.448 26.71 28.156 29.805 31.671 33.832 36.351 38.024 38.738 39.024 39.078 38.978 38.792 38.575 38.353 38.114 37.861 37.555 37.232 36.894 36.562 36.235 35.882 35.577 35.293 34.998 34.683 34.386 34.037 33.674 33.396 33.117 32.835 32.51 32.148 31.894 31.619 31.171 30.862 30.533 30.359 29.992 29.606 29.179 28.944 28.315 28.215 27.967 27.715 27.08 26.719 26.346 25.939 25.469 24.899 24.111 21.425 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt deleted file mode 100644 index 87190df0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2041 ,TETRA ,17524068,Wed Nov 24 20:29:03 CET,Wed Nov 24 22:08:14 CET,0.0 1.244 1.774 2.138 2.483 2.778 3.011 3.231 3.647 3.854 4.058 4.024 4.614 4.779 5.102 5.414 5.693 5.819 6.086 6.353 6.724 6.951 7.16 7.468 7.756 8.026 8.294 8.55 8.882 9.199 9.492 9.841 10.194 10.532 10.92 11.382 11.798 12.243 12.734 13.22 13.72 14.315 14.991 15.594 16.277 17.022 17.795 18.614 19.519 20.402 21.108 21.147 20.767 20.178 19.503 18.847 18.259 17.654 17.104 16.56 16.052 15.547 15.028 14.56 14.145 13.753 13.351 12.987 12.652 12.293 11.895 11.559 11.201 10.804 10.508 10.214 9.899 9.559 9.197 8.953 8.682 8.24 7.94 7.613 7.441 7.105 6.754 6.37 6.148 5.492 5.462 5.234 4.99 4.459 4.162 3.831 3.467 3.035 2.53 1.879 0.404 -2 ,20150 ,TETRA ,17524069,Wed Nov 24 20:29:03 CET,Wed Nov 24 22:09:04 CET,0.0 0.94 1.393 1.757 2.071 2.35 2.608 2.847 3.311 3.512 3.704 3.688 4.269 4.43 4.748 5.036 5.304 5.444 5.702 5.942 6.288 6.501 6.704 7.015 7.305 7.583 7.872 8.142 8.477 8.819 9.149 9.523 9.882 10.225 10.626 11.071 11.487 11.928 12.398 12.898 13.392 13.946 14.591 15.2 15.917 16.688 17.48 18.309 19.19 20.107 20.857 20.975 20.608 19.997 19.358 18.804 18.298 17.736 17.159 16.598 16.114 15.608 15.106 14.636 14.189 13.769 13.315 12.897 12.533 12.159 11.776 11.45 11.101 10.755 10.465 10.148 9.805 9.452 9.103 8.854 8.601 8.198 7.922 7.633 7.484 7.162 6.803 6.413 6.218 5.605 5.559 5.33 5.104 4.54 4.222 3.88 3.487 3.05 2.553 1.886 0.022 -3 ,3923 ,TETRA ,17524070,Wed Nov 24 20:29:05 CET,Wed Nov 24 22:00:31 CET,0.0 1.069 1.505 1.833 2.136 2.412 2.676 2.937 3.437 3.665 3.863 3.82 4.41 4.569 4.88 5.2 5.484 5.603 5.861 6.109 6.46 6.699 6.916 7.232 7.536 7.806 8.069 8.346 8.698 9.022 9.343 9.72 10.08 10.43 10.818 11.238 11.674 12.138 12.594 13.075 13.566 14.11 14.766 15.434 16.154 16.864 17.635 18.5 19.378 20.247 20.912 20.965 20.667 20.09 19.481 18.872 18.255 17.65 17.114 16.565 16.07 15.63 15.155 14.672 14.233 13.81 13.333 12.894 12.53 12.162 11.765 11.424 11.076 10.713 10.417 10.115 9.821 9.487 9.115 8.85 8.58 8.179 7.875 7.549 7.382 7.031 6.662 6.28 6.086 5.469 5.459 5.22 4.978 4.473 4.186 3.856 3.508 3.122 2.616 1.995 0.441 -4 ,25715 ,TETRA ,17524072,Wed Nov 24 20:29:56 CET,Wed Nov 24 22:11:00 CET,0.0 0.872 1.342 1.783 2.132 2.418 2.692 2.947 3.389 3.584 3.79 3.749 4.336 4.483 4.765 5.056 5.343 5.481 5.767 6.027 6.349 6.559 6.774 7.081 7.367 7.666 7.953 8.221 8.573 8.89 9.191 9.582 9.941 10.266 10.658 11.111 11.507 11.923 12.398 12.886 13.382 13.934 14.585 15.227 15.92 16.67 17.478 18.347 19.332 20.227 20.997 21.19 20.86 20.222 19.604 19.044 18.483 17.938 17.389 16.785 16.258 15.774 15.305 14.882 14.492 14.094 13.665 13.278 12.92 12.526 12.103 11.748 11.377 11.007 10.716 10.419 10.109 9.765 9.403 9.149 8.884 8.475 8.189 7.887 7.727 7.396 7.045 6.651 6.434 5.78 5.684 5.41 5.13 4.508 4.178 3.859 3.49 3.052 2.469 1.717 0.177 -5 ,9273 ,TETRA ,17524076,Wed Nov 24 20:30:59 CET,Wed Nov 24 22:13:43 CET,0.0 0.916 1.389 1.766 2.083 2.363 2.624 2.88 3.356 3.567 3.761 3.71 4.278 4.423 4.732 5.02 5.269 5.395 5.665 5.929 6.29 6.511 6.743 7.076 7.361 7.628 7.9 8.163 8.495 8.835 9.152 9.537 9.905 10.229 10.589 10.988 11.369 11.813 12.294 12.759 13.235 13.776 14.378 14.962 15.604 16.291 17.096 17.963 18.863 19.79 20.553 20.601 20.21 19.688 19.064 18.394 17.794 17.242 16.76 16.207 15.668 15.19 14.714 14.229 13.789 13.361 12.894 12.485 12.097 11.71 11.307 10.972 10.632 10.26 9.96 9.645 9.329 8.987 8.601 8.335 8.075 7.675 7.384 7.075 6.913 6.565 6.19 5.789 5.584 4.952 4.911 4.672 4.433 3.9 3.57 3.213 2.849 2.432 1.889 1.157 -0.48 -6 ,25259 ,TETRA ,17524078,Wed Nov 24 20:32:01 CET,Wed Nov 24 22:14:11 CET,0.0 0.79 1.231 1.584 1.889 2.179 2.458 2.727 3.16 3.347 3.543 3.491 4.076 4.238 4.551 4.846 5.138 5.279 5.544 5.808 6.203 6.44 6.651 6.939 7.206 7.48 7.751 8.004 8.335 8.655 8.964 9.356 9.723 10.067 10.471 10.892 11.267 11.686 12.153 12.647 13.142 13.673 14.288 14.874 15.542 16.278 17.038 17.828 18.695 19.527 20.072 20.122 19.851 19.355 18.737 18.116 17.563 16.994 16.443 15.855 15.327 14.836 14.342 13.857 13.406 13.004 12.57 12.164 11.811 11.42 10.97 10.61 10.26 9.879 9.569 9.248 8.919 8.576 8.211 7.951 7.671 7.219 6.889 6.547 6.376 6.039 5.68 5.286 5.071 4.442 4.442 4.196 3.944 3.432 3.13 2.787 2.391 1.932 1.379 0.649 -0.999 -7 ,26436 ,TETRA ,17524080,Wed Nov 24 20:32:56 CET,Wed Nov 24 22:15:16 CET,0.0 1.12 1.636 2.02 2.33 2.615 2.879 3.118 3.544 3.732 3.915 3.867 4.466 4.638 4.933 5.21 5.476 5.609 5.868 6.102 6.424 6.643 6.857 7.135 7.419 7.707 7.967 8.213 8.535 8.844 9.14 9.491 9.823 10.16 10.595 11.058 11.477 11.952 12.436 12.928 13.446 14.013 14.655 15.29 15.989 16.753 17.583 18.386 19.225 20.086 20.801 20.854 20.551 20.127 19.62 19.065 18.473 17.869 17.322 16.748 16.23 15.747 15.274 14.852 14.443 14.02 13.572 13.154 12.784 12.412 12.011 11.661 11.301 10.912 10.609 10.296 9.957 9.607 9.241 8.989 8.726 8.308 8.018 7.717 7.556 7.229 6.895 6.536 6.334 5.698 5.668 5.419 5.161 4.633 4.338 4.003 3.643 3.221 2.651 1.885 0.523 -8 ,15286 ,TETRA ,17524083,Wed Nov 24 20:32:56 CET,Wed Nov 24 22:15:53 CET,0.0 1.077 1.534 1.919 2.229 2.51 2.755 2.974 3.379 3.576 3.769 3.697 4.276 4.439 4.732 4.999 5.272 5.407 5.667 5.922 6.301 6.526 6.733 7.053 7.351 7.621 7.891 8.148 8.464 8.767 9.05 9.394 9.73 10.053 10.415 10.807 11.185 11.626 12.088 12.554 13.055 13.647 14.328 14.934 15.626 16.373 17.173 18.002 18.894 19.856 20.572 20.68 20.384 19.776 19.173 18.58 17.922 17.304 16.761 16.168 15.628 15.128 14.666 14.237 13.794 13.379 12.943 12.535 12.178 11.81 11.424 11.085 10.736 10.389 10.106 9.802 9.488 9.153 8.802 8.557 8.29 7.878 7.586 7.276 7.116 6.801 6.466 6.109 5.921 5.292 5.285 5.07 4.833 4.286 3.977 3.65 3.265 2.842 2.388 1.728 0.349 -9 ,30922 ,TETRA ,17524084,Wed Nov 24 20:34:55 CET,Wed Nov 24 22:14:34 CET,0.0 1.034 1.437 1.784 2.133 2.425 2.664 2.874 3.288 3.501 3.718 3.693 4.269 4.423 4.7 4.959 5.23 5.367 5.635 5.883 6.238 6.485 6.712 7.028 7.332 7.624 7.922 8.197 8.533 8.876 9.196 9.581 9.959 10.306 10.699 11.146 11.56 11.997 12.463 12.957 13.476 14.045 14.658 15.257 15.948 16.653 17.435 18.245 19.056 19.79 20.339 20.307 19.914 19.372 18.765 18.178 17.568 16.922 16.381 15.81 15.273 14.79 14.31 13.836 13.399 13.015 12.581 12.167 11.801 11.399 10.98 10.632 10.264 9.866 9.567 9.262 8.938 8.615 8.295 8.074 7.825 7.404 7.116 6.812 6.656 6.33 5.977 5.589 5.378 4.74 4.683 4.43 4.135 3.503 3.159 2.74 2.243 1.723 1.139 0.315 -1.533 -10 ,3612 ,TETRA ,17524085,Wed Nov 24 20:34:56 CET,Wed Nov 24 22:15:01 CET,0.0 1.705 2.181 2.515 2.8 3.076 3.339 3.576 4.003 4.203 4.417 4.424 5.024 5.21 5.518 5.799 6.082 6.224 6.48 6.707 7.036 7.257 7.478 7.793 8.091 8.37 8.656 8.941 9.293 9.614 9.932 10.306 10.643 10.974 11.36 11.779 12.172 12.615 13.065 13.522 13.985 14.519 15.172 15.814 16.523 17.235 17.968 18.785 19.707 20.623 21.335 21.438 21.156 20.703 20.137 19.513 18.898 18.313 17.754 17.192 16.715 16.259 15.803 15.341 14.897 14.48 14.04 13.652 13.316 12.923 12.489 12.152 11.778 11.37 11.048 10.687 10.318 9.943 9.555 9.285 8.981 8.506 8.18 7.829 7.65 7.271 6.874 6.459 6.237 5.597 5.475 5.204 4.93 4.298 3.938 3.566 3.174 2.706 2.145 1.408 -0.446 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt deleted file mode 100644 index 5bf04737..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13479 ,TETRA ,17524090,Wed Nov 24 20:40:55 CET,Wed Nov 24 22:20:43 CET,0.0 2.028 2.801 3.382 3.818 4.183 4.526 4.841 5.412 5.673 5.909 5.91 6.527 6.718 7.092 7.435 7.744 7.9 8.205 8.495 8.933 9.2 9.433 9.793 10.142 10.457 10.74 11.006 11.368 11.691 11.983 12.336 12.677 13.007 13.381 13.821 14.213 14.606 15.04 15.492 15.989 16.524 17.065 17.612 18.221 18.801 19.424 20.074 20.768 21.386 21.636 21.244 20.701 20.096 19.493 18.925 18.343 17.76 17.243 16.686 16.159 15.671 15.203 14.772 14.331 13.906 13.474 13.097 12.785 12.453 12.069 11.739 11.418 11.084 10.818 10.541 10.228 9.893 9.556 9.308 9.05 8.631 8.323 7.994 7.821 7.478 7.139 6.779 6.589 5.982 5.971 5.739 5.493 4.958 4.663 4.347 3.993 3.598 3.14 2.553 0.993 -2 ,9744 ,TETRA ,17524091,Wed Nov 24 20:40:57 CET,Wed Nov 24 22:21:03 CET,0.0 2.3 3.055 3.577 4.039 4.45 4.795 5.118 5.683 5.948 6.189 6.201 6.836 7.04 7.403 7.741 8.064 8.224 8.551 8.846 9.239 9.481 9.698 10.001 10.281 10.546 10.838 11.122 11.459 11.774 12.072 12.413 12.743 13.073 13.438 13.846 14.214 14.618 15.05 15.48 15.925 16.412 16.952 17.458 18.009 18.603 19.223 19.842 20.476 21.05 21.38 21.117 20.596 19.994 19.337 18.681 18.052 17.469 16.936 16.38 15.918 15.5 15.066 14.633 14.22 13.824 13.411 13.042 12.706 12.33 11.929 11.597 11.245 10.875 10.585 10.275 9.95 9.619 9.275 9.03 8.776 8.39 8.112 7.803 7.646 7.319 6.975 6.617 6.426 5.808 5.76 5.528 5.298 4.765 4.467 4.145 3.798 3.386 2.887 2.299 1.11 -3 ,31913 ,TETRA ,17524093,Wed Nov 24 20:42:54 CET,Wed Nov 24 22:23:36 CET,0.0 2.145 2.979 3.589 4.061 4.452 4.83 5.159 5.723 5.984 6.232 6.265 6.88 7.07 7.437 7.824 8.166 8.313 8.607 8.884 9.296 9.557 9.799 10.135 10.435 10.726 11.014 11.283 11.629 11.994 12.334 12.683 12.983 13.284 13.653 14.045 14.398 14.773 15.184 15.627 16.082 16.562 17.079 17.569 18.111 18.706 19.367 20.064 20.751 21.291 21.55 21.32 20.783 20.129 19.5 18.868 18.275 17.684 17.142 16.607 16.132 15.694 15.24 14.781 14.373 13.963 13.533 13.167 12.816 12.42 12.02 11.698 11.357 10.998 10.712 10.409 10.085 9.762 9.426 9.19 8.938 8.534 8.25 7.938 7.778 7.458 7.123 6.756 6.555 5.925 5.892 5.659 5.42 4.882 4.569 4.228 3.854 3.421 2.888 2.204 0.68 -4 ,8154 ,TETRA ,17524094,Wed Nov 24 20:42:55 CET,Wed Nov 24 22:22:19 CET,0.0 1.862 2.674 3.267 3.719 4.126 4.499 4.821 5.417 5.683 5.918 5.942 6.57 6.776 7.153 7.485 7.807 7.966 8.252 8.535 8.943 9.178 9.391 9.713 10.04 10.352 10.66 10.945 11.28 11.583 11.874 12.222 12.574 12.937 13.339 13.754 14.135 14.56 14.988 15.447 15.929 16.405 16.943 17.52 18.149 18.763 19.366 19.958 20.569 21.104 21.457 21.231 20.637 19.981 19.335 18.677 18.07 17.492 16.953 16.365 15.863 15.425 14.988 14.52 14.075 13.687 13.259 12.86 12.504 12.124 11.737 11.411 11.085 10.744 10.468 10.173 9.827 9.44 9.05 8.804 8.557 8.144 7.853 7.552 7.395 7.06 6.694 6.304 6.102 5.477 5.456 5.198 4.942 4.405 4.117 3.797 3.431 3.05 2.54 1.876 0.381 -5 ,12606 ,TETRA ,17524099,Wed Nov 24 20:48:15 CET,Wed Nov 24 22:31:13 CET,0.0 2.028 2.789 3.352 3.829 4.253 4.614 4.921 5.485 5.734 5.96 5.965 6.582 6.79 7.18 7.534 7.87 8.031 8.35 8.65 9.059 9.308 9.528 9.84 10.162 10.459 10.743 11.015 11.35 11.68 11.988 12.351 12.678 12.997 13.389 13.804 14.176 14.573 15.014 15.471 15.899 16.367 16.941 17.516 18.111 18.711 19.344 19.957 20.6 21.194 21.542 21.301 20.754 20.156 19.51 18.869 18.292 17.712 17.179 16.635 16.151 15.712 15.28 14.859 14.467 14.089 13.651 13.273 12.956 12.605 12.219 11.871 11.539 11.219 10.922 10.579 10.249 9.944 9.598 9.357 9.127 8.719 8.433 8.164 8.019 7.692 7.341 6.992 6.813 6.201 6.193 5.976 5.758 5.28 4.985 4.638 4.273 3.886 3.384 2.715 1.187 -6 ,13931 ,TETRA ,17524100,Wed Nov 24 20:48:15 CET,Wed Nov 24 22:29:44 CET,0.0 1.988 2.67 3.194 3.649 4.047 4.384 4.689 5.263 5.533 5.781 5.785 6.395 6.578 6.955 7.313 7.642 7.797 8.068 8.34 8.736 8.974 9.212 9.566 9.878 10.162 10.452 10.733 11.1 11.449 11.749 12.084 12.405 12.708 13.052 13.457 13.851 14.256 14.686 15.143 15.589 16.074 16.614 17.169 17.783 18.356 19.005 19.659 20.3 20.884 21.214 20.977 20.454 19.856 19.233 18.635 18.082 17.516 16.991 16.451 15.923 15.436 15.004 14.582 14.189 13.849 13.491 13.138 12.801 12.454 12.09 11.783 11.469 11.116 10.823 10.553 10.265 9.945 9.608 9.356 9.096 8.676 8.367 8.056 7.906 7.612 7.279 6.913 6.73 6.108 6.077 5.839 5.6 5.078 4.777 4.44 4.065 3.662 3.166 2.42 0.568 -7 ,30581 ,TETRA ,17524102,Wed Nov 24 20:48:20 CET,Wed Nov 24 22:28:37 CET,0.0 1.906 2.64 3.205 3.64 4.016 4.347 4.643 5.214 5.484 5.75 5.8 6.419 6.624 6.994 7.319 7.633 7.78 8.075 8.368 8.779 9.036 9.274 9.613 9.933 10.237 10.53 10.802 11.144 11.469 11.777 12.122 12.447 12.783 13.178 13.612 14.006 14.398 14.813 15.269 15.732 16.246 16.816 17.372 17.971 18.569 19.177 19.798 20.468 21.066 21.375 21.077 20.535 19.908 19.244 18.587 17.981 17.423 16.895 16.349 15.885 15.45 15.028 14.64 14.244 13.85 13.43 13.04 12.708 12.349 11.945 11.605 11.24 10.863 10.581 10.258 9.929 9.622 9.292 9.052 8.794 8.411 8.137 7.832 7.674 7.354 7.001 6.617 6.433 5.826 5.817 5.571 5.321 4.796 4.482 4.139 3.739 3.291 2.804 2.193 0.936 -8 ,3323 ,TETRA ,17524104,Wed Nov 24 20:49:12 CET,Wed Nov 24 22:29:52 CET,0.0 1.823 2.448 2.975 3.413 3.794 4.152 4.511 5.157 5.427 5.654 5.661 6.268 6.471 6.826 7.138 7.511 7.708 8.072 8.411 8.835 9.07 9.293 9.617 9.925 10.232 10.525 10.796 11.145 11.472 11.783 12.158 12.508 12.835 13.195 13.611 14.007 14.425 14.846 15.266 15.718 16.212 16.742 17.233 17.787 18.397 19.069 19.729 20.344 20.885 21.168 20.905 20.325 19.679 19.026 18.365 17.703 17.076 16.529 15.945 15.447 15.002 14.55 14.095 13.642 13.183 12.736 12.351 12.005 11.646 11.213 10.844 10.491 10.097 9.774 9.451 9.114 8.77 8.41 8.164 7.896 7.469 7.186 6.887 6.722 6.379 6.042 5.663 5.463 4.843 4.823 4.596 4.343 3.784 3.492 3.192 2.856 2.465 2.007 1.439 0.1 -9 ,4698 ,TETRA ,17524106,Wed Nov 24 20:50:10 CET,Wed Nov 24 22:30:54 CET,0.0 2.107 2.858 3.408 3.87 4.254 4.609 4.94 5.548 5.824 6.048 6.053 6.681 6.879 7.251 7.582 7.913 8.08 8.368 8.644 9.042 9.28 9.509 9.839 10.159 10.473 10.773 11.048 11.386 11.718 12.043 12.416 12.789 13.138 13.514 13.949 14.366 14.768 15.152 15.565 16.026 16.534 17.095 17.632 18.191 18.782 19.419 20.054 20.665 21.226 21.546 21.294 20.792 20.167 19.557 18.961 18.38 17.832 17.324 16.809 16.348 15.872 15.381 14.913 14.477 14.08 13.659 13.261 12.905 12.532 12.127 11.777 11.416 11.051 10.771 10.484 10.159 9.806 9.453 9.213 8.958 8.544 8.264 7.967 7.801 7.467 7.118 6.746 6.557 5.936 5.905 5.666 5.408 4.846 4.557 4.251 3.883 3.433 2.922 2.26 0.953 -10 ,24097 ,TETRA ,17524108,Wed Nov 24 20:51:39 CET,Wed Nov 24 22:33:01 CET,0.0 1.726 2.491 3.088 3.563 3.952 4.295 4.597 5.146 5.408 5.649 5.729 6.378 6.576 6.953 7.319 7.65 7.802 8.11 8.394 8.781 9.028 9.255 9.591 9.881 10.145 10.447 10.744 11.086 11.422 11.733 12.092 12.442 12.755 13.105 13.504 13.866 14.26 14.698 15.138 15.578 16.065 16.616 17.119 17.65 18.215 18.849 19.489 20.089 20.646 20.976 20.691 20.123 19.527 18.898 18.243 17.641 17.098 16.61 16.079 15.593 15.103 14.661 14.241 13.81 13.426 13.019 12.647 12.304 11.92 11.53 11.212 10.872 10.506 10.203 9.891 9.576 9.239 8.887 8.639 8.36 7.91 7.607 7.287 7.12 6.767 6.393 6.013 5.818 5.195 5.149 4.899 4.643 4.137 3.81 3.426 3.055 2.665 2.175 1.593 0.346 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt deleted file mode 100644 index 40ddd9e3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29657 ,TETRA ,17524112,Wed Nov 24 20:53:47 CET,Wed Nov 24 22:32:59 CET,0.0 1.575 2.248 2.755 3.173 3.555 3.899 4.206 4.761 5.002 5.22 5.229 5.841 6.041 6.424 6.758 7.081 7.245 7.544 7.835 8.269 8.551 8.805 9.154 9.512 9.835 10.115 10.415 10.803 11.141 11.48 11.86 12.201 12.513 12.872 13.304 13.69 14.079 14.528 15.037 15.509 15.982 16.528 17.024 17.564 18.134 18.723 19.332 20.0 20.65 21.023 20.855 20.42 19.844 19.262 18.709 18.181 17.666 17.16 16.649 16.185 15.737 15.315 14.919 14.546 14.19 13.816 13.485 13.176 12.832 12.468 12.168 11.836 11.449 11.164 10.888 10.585 10.257 9.908 9.666 9.413 9.0 8.715 8.41 8.251 7.928 7.564 7.17 6.982 6.388 6.396 6.179 5.922 5.331 5.024 4.7 4.343 3.954 3.453 2.741 1.4 -2 ,23236 ,TETRA ,17524113,Wed Nov 24 20:53:50 CET,Wed Nov 24 22:33:29 CET,0.0 1.383 1.989 2.427 2.808 3.14 3.417 3.668 4.159 4.39 4.613 4.588 5.184 5.37 5.741 6.081 6.395 6.539 6.791 7.017 7.372 7.597 7.805 8.114 8.424 8.721 8.985 9.23 9.543 9.826 10.116 10.482 10.823 11.133 11.462 11.819 12.157 12.519 12.908 13.343 13.789 14.265 14.807 15.319 15.881 16.483 17.103 17.714 18.345 18.874 19.175 19.01 18.588 18.11 17.547 16.945 16.4 15.907 15.46 14.97 14.545 14.142 13.726 13.321 12.944 12.6 12.252 11.911 11.597 11.26 10.878 10.573 10.257 9.893 9.622 9.352 9.041 8.719 8.403 8.17 7.911 7.521 7.259 6.985 6.842 6.518 6.16 5.791 5.593 4.978 4.982 4.764 4.526 4.017 3.722 3.416 3.085 2.669 2.183 1.487 0.042 -3 ,21248 ,TETRA ,17524114,Wed Nov 24 20:53:48 CET,Wed Nov 24 22:35:13 CET,0.0 1.23 1.769 2.202 2.627 3.014 3.353 3.662 4.24 4.491 4.716 4.732 5.35 5.54 5.919 6.283 6.616 6.77 7.051 7.337 7.768 8.028 8.281 8.654 8.997 9.296 9.576 9.84 10.19 10.537 10.856 11.263 11.634 11.964 12.405 12.878 13.254 13.692 14.168 14.633 15.077 15.535 16.046 16.518 17.04 17.638 18.264 18.862 19.519 20.141 20.498 20.368 19.989 19.508 18.958 18.364 17.802 17.292 16.852 16.351 15.884 15.482 15.078 14.662 14.259 13.873 13.463 13.101 12.799 12.503 12.184 11.894 11.567 11.195 10.905 10.602 10.278 9.944 9.608 9.374 9.121 8.728 8.472 8.191 8.042 7.719 7.358 6.989 6.796 6.183 6.111 5.87 5.621 5.035 4.708 4.37 4.011 3.606 3.14 2.476 1.01 -4 ,30539 ,TETRA ,17524115,Wed Nov 24 20:53:50 CET,Wed Nov 24 22:35:30 CET,0.0 1.547 2.22 2.721 3.152 3.51 3.846 4.14 4.624 4.859 5.095 5.155 5.782 5.982 6.361 6.696 7.024 7.179 7.449 7.714 8.107 8.352 8.581 8.928 9.307 9.633 9.905 10.169 10.495 10.795 11.108 11.495 11.813 12.104 12.49 12.96 13.387 13.8 14.24 14.715 15.166 15.642 16.167 16.672 17.271 17.883 18.519 19.201 19.911 20.523 20.866 20.687 20.214 19.69 19.151 18.616 18.08 17.544 17.064 16.549 16.098 15.689 15.282 14.866 14.483 14.126 13.725 13.37 13.062 12.735 12.383 12.084 11.751 11.403 11.132 10.844 10.523 10.182 9.831 9.572 9.31 8.93 8.656 8.362 8.201 7.863 7.524 7.15 6.935 6.303 6.265 6.036 5.807 5.297 5.024 4.733 4.396 4.008 3.498 2.877 1.745 -5 ,5993 ,TETRA ,17524117,Wed Nov 24 20:55:29 CET,Wed Nov 24 22:32:41 CET,0.0 1.414 2.043 2.568 2.968 3.331 3.645 3.932 4.456 4.699 4.957 5.049 5.68 5.877 6.263 6.618 6.905 7.042 7.323 7.581 7.949 8.188 8.403 8.702 9.017 9.344 9.653 9.938 10.295 10.628 10.935 11.287 11.641 11.979 12.356 12.746 13.112 13.549 13.992 14.426 14.888 15.367 15.871 16.343 16.874 17.448 18.095 18.756 19.391 19.943 20.296 20.157 19.749 19.261 18.711 18.136 17.607 17.08 16.577 16.063 15.594 15.17 14.75 14.348 13.984 13.642 13.282 12.966 12.678 12.345 12.009 11.726 11.427 11.13 10.871 10.593 10.3 9.967 9.624 9.382 9.132 8.764 8.483 8.183 8.038 7.731 7.402 7.042 6.858 6.263 6.277 6.054 5.803 5.244 4.956 4.655 4.328 3.946 3.458 2.831 1.323 -6 ,8479 ,TETRA ,17524118,Wed Nov 24 20:55:31 CET,Wed Nov 24 22:35:16 CET,0.0 1.894 2.521 2.952 3.352 3.751 4.073 4.357 4.888 5.125 5.347 5.385 6.005 6.196 6.552 6.884 7.198 7.347 7.642 7.922 8.305 8.561 8.816 9.164 9.489 9.806 10.103 10.379 10.733 11.052 11.387 11.797 12.138 12.455 12.855 13.281 13.632 14.016 14.432 14.9 15.379 15.882 16.476 17.004 17.526 18.065 18.663 19.295 19.942 20.555 20.983 20.905 20.517 20.016 19.476 18.926 18.37 17.795 17.296 16.761 16.263 15.825 15.385 14.965 14.567 14.199 13.82 13.453 13.114 12.754 12.373 12.048 11.707 11.349 11.059 10.762 10.44 10.087 9.711 9.442 9.173 8.744 8.452 8.157 8.011 7.719 7.4 7.06 6.877 6.274 6.27 6.048 5.805 5.279 5.012 4.706 4.324 3.882 3.384 2.734 1.391 -7 ,23219 ,TETRA ,17524120,Wed Nov 24 20:58:32 CET,Wed Nov 24 22:37:46 CET,0.0 0.948 1.515 1.966 2.332 2.669 2.988 3.298 3.858 4.109 4.344 4.365 4.975 5.17 5.538 5.879 6.22 6.378 6.688 6.986 7.368 7.606 7.839 8.178 8.505 8.818 9.118 9.41 9.777 10.134 10.503 10.926 11.266 11.602 12.014 12.448 12.83 13.216 13.66 14.142 14.628 15.14 15.702 16.199 16.712 17.291 17.927 18.6 19.294 19.89 20.288 20.147 19.726 19.197 18.626 18.044 17.505 16.983 16.514 16.036 15.626 15.241 14.848 14.443 14.061 13.696 13.298 12.928 12.606 12.282 11.919 11.586 11.222 10.877 10.623 10.348 10.073 9.763 9.437 9.229 9.006 8.645 8.387 8.099 7.947 7.637 7.308 6.977 6.807 6.202 6.225 6.01 5.767 5.233 4.942 4.605 4.223 3.759 3.213 2.64 1.338 -8 ,32172 ,TETRA ,17524122,Wed Nov 24 20:58:36 CET,Wed Nov 24 22:38:16 CET,0.0 1.462 2.02 2.471 2.867 3.223 3.54 3.808 4.31 4.55 4.792 4.82 5.438 5.63 5.982 6.33 6.676 6.82 7.098 7.391 7.793 8.048 8.285 8.629 8.975 9.284 9.585 9.901 10.281 10.636 10.963 11.361 11.766 12.14 12.523 12.932 13.323 13.733 14.156 14.6 15.046 15.517 16.049 16.562 17.153 17.784 18.442 19.115 19.785 20.381 20.789 20.703 20.301 19.821 19.279 18.683 18.13 17.627 17.173 16.66 16.189 15.751 15.308 14.921 14.568 14.212 13.823 13.478 13.17 12.845 12.49 12.166 11.834 11.496 11.225 10.918 10.579 10.229 9.849 9.592 9.34 8.915 8.613 8.313 8.156 7.832 7.491 7.111 6.915 6.297 6.259 6.008 5.742 5.175 4.893 4.597 4.221 3.798 3.334 2.791 1.596 -9 ,29127 ,TETRA ,17524125,Wed Nov 24 21:00:35 CET,Wed Nov 24 22:38:46 CET,0.0 1.757 2.326 2.755 3.116 3.434 3.749 4.057 4.588 4.825 5.021 4.959 5.561 5.741 6.061 6.381 6.71 6.867 7.162 7.449 7.86 8.115 8.359 8.687 8.985 9.303 9.626 9.918 10.272 10.602 10.91 11.286 11.637 11.953 12.32 12.739 13.123 13.543 13.995 14.47 14.93 15.402 15.952 16.474 17.057 17.679 18.323 18.943 19.542 20.131 20.554 20.389 19.949 19.433 18.874 18.316 17.783 17.261 16.79 16.273 15.826 15.418 14.957 14.523 14.117 13.724 13.313 12.927 12.558 12.184 11.826 11.523 11.187 10.816 10.545 10.292 10.005 9.66 9.309 9.09 8.859 8.487 8.229 7.945 7.784 7.443 7.101 6.746 6.56 5.946 5.928 5.702 5.481 4.973 4.683 4.367 3.984 3.59 3.124 2.414 0.37 -10 ,26688 ,TETRA ,17524127,Wed Nov 24 21:03:27 CET,Wed Nov 24 22:35:30 CET,0.0 1.093 1.6 2.043 2.46 2.83 3.156 3.451 3.972 4.209 4.433 4.467 5.111 5.309 5.651 5.977 6.295 6.45 6.743 7.02 7.389 7.626 7.856 8.189 8.53 8.845 9.135 9.404 9.761 10.113 10.432 10.788 11.139 11.486 11.844 12.227 12.595 12.976 13.376 13.812 14.26 14.744 15.32 15.858 16.411 17.005 17.656 18.299 18.967 19.602 19.972 19.796 19.378 18.807 18.196 17.586 16.998 16.459 15.947 15.418 14.962 14.535 14.103 13.67 13.267 12.896 12.507 12.175 11.881 11.573 11.218 10.867 10.503 10.153 9.878 9.585 9.267 8.938 8.625 8.403 8.16 7.776 7.493 7.193 7.033 6.69 6.346 5.981 5.795 5.194 5.168 4.92 4.662 4.092 3.788 3.473 3.117 2.706 2.207 1.554 0.173 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt deleted file mode 100644 index 55c39757..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13846 ,TETRA ,17524133,Wed Nov 24 21:10:29 CET,Wed Nov 24 22:46:16 CET,0.0 1.304 1.929 2.425 2.798 3.107 3.402 3.672 4.139 4.368 4.594 4.653 5.22 5.415 5.786 6.118 6.439 6.616 6.969 7.29 7.751 8.028 8.282 8.643 8.978 9.319 9.659 9.976 10.354 10.694 11.028 11.442 11.846 12.243 12.697 13.156 13.58 14.061 14.566 15.103 15.677 16.279 16.939 17.567 18.278 19.076 19.977 20.955 21.969 23.038 24.099 24.641 24.72 24.589 24.364 24.07 23.751 23.411 23.053 22.688 22.385 22.072 21.743 21.418 21.081 20.781 20.497 20.225 19.961 19.679 19.379 19.097 18.799 18.49 18.236 17.983 17.726 17.448 17.16 16.961 16.752 16.414 16.156 15.869 15.727 15.446 15.137 14.791 14.613 14.083 14.11 13.917 13.699 13.263 13.042 12.781 12.472 12.104 11.638 11.057 10.038 -2 ,32177 ,TETRA ,17524134,Wed Nov 24 21:10:29 CET,Wed Nov 24 22:44:25 CET,0.0 1.243 1.845 2.29 2.665 2.998 3.305 3.6 4.123 4.366 4.599 4.66 5.229 5.399 5.754 6.12 6.456 6.611 6.904 7.183 7.573 7.84 8.1 8.462 8.812 9.153 9.495 9.825 10.215 10.585 10.94 11.357 11.756 12.142 12.572 13.022 13.457 13.935 14.421 14.939 15.471 16.045 16.713 17.347 18.053 18.851 19.738 20.67 21.686 22.759 23.802 24.394 24.484 24.359 24.123 23.795 23.482 23.178 22.86 22.524 22.225 21.942 21.67 21.371 21.054 20.763 20.467 20.181 19.921 19.656 19.371 19.132 18.885 18.618 18.396 18.138 17.863 17.609 17.333 17.123 16.904 16.564 16.319 16.062 15.939 15.655 15.338 15.007 14.83 14.29 14.263 14.062 13.847 13.385 13.11 12.803 12.517 12.165 11.725 11.202 10.307 -3 ,20793 ,TETRA ,17524136,Wed Nov 24 21:10:32 CET,Wed Nov 24 22:44:47 CET,0.0 1.358 1.942 2.463 2.909 3.266 3.6 3.918 4.462 4.7 4.924 4.972 5.546 5.737 6.085 6.421 6.745 6.901 7.213 7.513 7.951 8.229 8.478 8.823 9.156 9.476 9.795 10.11 10.504 10.857 11.193 11.609 11.994 12.354 12.794 13.303 13.759 14.236 14.757 15.278 15.806 16.383 17.003 17.634 18.372 19.13 19.969 20.913 21.953 23.066 24.12 24.644 24.762 24.658 24.446 24.153 23.825 23.498 23.158 22.771 22.435 22.15 21.869 21.576 21.266 20.937 20.601 20.314 20.061 19.796 19.512 19.274 19.003 18.706 18.472 18.213 17.948 17.669 17.364 17.162 16.956 16.605 16.351 16.106 15.978 15.698 15.386 15.058 14.893 14.357 14.352 14.169 13.973 13.535 13.285 12.99 12.642 12.213 11.676 11.008 9.757 -4 ,27389 ,TETRA ,17524138,Wed Nov 24 21:12:31 CET,Wed Nov 24 22:46:19 CET,0.0 1.267 1.882 2.384 2.781 3.094 3.405 3.716 4.251 4.485 4.7 4.756 5.335 5.519 5.862 6.197 6.522 6.68 6.976 7.256 7.648 7.922 8.198 8.555 8.909 9.237 9.525 9.823 10.225 10.602 10.951 11.352 11.733 12.118 12.58 13.108 13.567 14.03 14.513 15.009 15.535 16.1 16.716 17.333 18.061 18.829 19.649 20.555 21.574 22.648 23.697 24.238 24.294 24.146 23.903 23.583 23.277 22.96 22.638 22.282 21.949 21.642 21.304 20.971 20.649 20.334 20.006 19.704 19.443 19.173 18.882 18.637 18.377 18.07 17.816 17.555 17.285 17.007 16.697 16.491 16.291 15.953 15.686 15.423 15.297 15.023 14.743 14.447 14.275 13.745 13.765 13.569 13.367 12.911 12.658 12.388 12.086 11.734 11.274 10.735 9.68 -5 ,20514 ,TETRA ,17524140,Wed Nov 24 21:14:30 CET,Wed Nov 24 22:51:52 CET,0.0 1.286 1.918 2.381 2.787 3.159 3.481 3.776 4.31 4.556 4.785 4.854 5.442 5.637 5.985 6.328 6.648 6.8 7.088 7.351 7.748 8.006 8.26 8.631 8.97 9.299 9.623 9.931 10.307 10.65 10.984 11.406 11.796 12.166 12.638 13.161 13.624 14.096 14.57 15.053 15.561 16.15 16.82 17.477 18.256 19.097 19.945 20.829 21.828 22.829 23.786 24.291 24.352 24.174 23.89 23.582 23.278 22.948 22.631 22.305 21.97 21.642 21.311 20.974 20.672 20.416 20.13 19.854 19.602 19.322 19.033 18.777 18.484 18.193 18.003 17.824 17.598 17.343 17.102 16.927 16.735 16.437 16.239 16.031 15.908 15.647 15.372 15.086 14.93 14.4 14.431 14.247 14.057 13.626 13.383 13.098 12.751 12.387 11.972 11.449 10.172 -6 ,26814 ,TETRA ,17524142,Wed Nov 24 21:16:30 CET,Wed Nov 24 22:52:38 CET,0.0 1.494 2.166 2.715 3.16 3.508 3.842 4.155 4.667 4.899 5.106 5.135 5.703 5.889 6.219 6.536 6.845 7.004 7.331 7.632 8.043 8.283 8.505 8.829 9.156 9.493 9.812 10.118 10.516 10.891 11.226 11.623 12.032 12.414 12.838 13.3 13.729 14.231 14.749 15.233 15.746 16.336 17.002 17.657 18.39 19.193 20.045 20.917 21.943 23.05 24.065 24.502 24.534 24.411 24.208 23.881 23.558 23.282 22.973 22.585 22.23 21.916 21.612 21.272 20.932 20.638 20.335 20.056 19.773 19.469 19.162 18.892 18.6 18.297 18.07 17.837 17.588 17.323 17.039 16.831 16.613 16.283 16.066 15.841 15.716 15.454 15.202 14.938 14.781 14.233 14.219 14.038 13.84 13.393 13.132 12.856 12.576 12.257 11.873 11.328 10.038 -7 ,11833 ,TETRA ,17524144,Wed Nov 24 21:22:33 CET,Wed Nov 24 22:56:18 CET,0.0 1.584 2.264 2.714 3.076 3.405 3.725 4.036 4.586 4.851 5.103 5.189 5.765 5.954 6.323 6.67 6.991 7.146 7.437 7.714 8.089 8.323 8.563 8.928 9.256 9.546 9.836 10.123 10.496 10.835 11.145 11.532 11.903 12.249 12.669 13.111 13.51 13.966 14.436 14.903 15.39 15.948 16.598 17.237 17.96 18.714 19.564 20.529 21.596 22.712 23.763 24.291 24.371 24.229 23.993 23.655 23.301 23.005 22.732 22.393 22.053 21.748 21.459 21.164 20.871 20.596 20.276 19.971 19.695 19.424 19.177 18.957 18.708 18.443 18.222 17.978 17.733 17.477 17.188 16.998 16.799 16.478 16.263 16.023 15.892 15.624 15.341 15.044 14.882 14.343 14.347 14.148 13.948 13.509 13.245 12.967 12.665 12.321 11.917 11.351 9.486 -8 ,31106 ,TETRA ,17524145,Wed Nov 24 21:22:35 CET,Wed Nov 24 22:56:20 CET,0.0 1.501 2.076 2.579 3.004 3.352 3.662 3.945 4.494 4.743 4.986 5.074 5.644 5.849 6.235 6.595 6.952 7.118 7.437 7.737 8.138 8.402 8.667 9.033 9.363 9.68 9.992 10.297 10.703 11.085 11.429 11.832 12.206 12.565 12.964 13.395 13.819 14.277 14.757 15.271 15.798 16.396 17.071 17.736 18.521 19.361 20.293 21.233 22.223 23.278 24.29 24.822 24.894 24.748 24.486 24.19 23.913 23.611 23.281 22.922 22.58 22.23 21.882 21.554 21.24 20.951 20.651 20.357 20.099 19.837 19.549 19.308 19.028 18.721 18.494 18.262 17.988 17.68 17.38 17.179 16.97 16.633 16.373 16.078 15.934 15.65 15.344 15.016 14.842 14.296 14.266 14.081 13.888 13.448 13.196 12.92 12.601 12.233 11.83 11.328 9.2 -9 ,8239 ,TETRA ,17524146,Wed Nov 24 21:24:24 CET,Wed Nov 24 22:57:49 CET,0.0 1.236 1.788 2.211 2.609 2.98 3.315 3.642 4.265 4.547 4.808 4.891 5.47 5.668 6.028 6.371 6.709 6.876 7.198 7.502 7.929 8.192 8.451 8.827 9.193 9.526 9.841 10.164 10.569 10.932 11.28 11.685 12.046 12.406 12.824 13.292 13.737 14.205 14.698 15.209 15.726 16.27 16.904 17.552 18.301 19.105 19.934 20.814 21.825 22.941 23.985 24.474 24.503 24.36 24.068 23.73 23.401 23.026 22.665 22.28 21.933 21.619 21.321 21.029 20.73 20.462 20.186 19.924 19.667 19.391 19.092 18.831 18.57 18.306 18.095 17.867 17.611 17.337 17.045 16.834 16.616 16.264 16.03 15.793 15.66 15.373 15.091 14.81 14.653 14.119 14.111 13.93 13.732 13.255 13.008 12.719 12.372 12.005 11.542 10.971 9.837 -10 ,30561 ,TETRA ,17524148,Wed Nov 24 21:29:20 CET,Wed Nov 24 23:05:00 CET,0.0 1.67 2.288 2.751 3.147 3.516 3.854 4.151 4.677 4.911 5.131 5.18 5.754 5.953 6.33 6.691 7.026 7.18 7.48 7.77 8.181 8.426 8.665 9.023 9.379 9.715 10.013 10.299 10.665 11.024 11.377 11.812 12.225 12.622 13.066 13.505 13.907 14.387 14.901 15.394 15.921 16.51 17.156 17.814 18.535 19.251 20.074 20.984 21.983 23.076 24.118 24.681 24.76 24.603 24.334 24.048 23.738 23.36 22.999 22.624 22.313 22.023 21.691 21.356 21.045 20.76 20.437 20.118 19.845 19.561 19.261 18.992 18.705 18.42 18.193 17.939 17.659 17.375 17.079 16.866 16.634 16.281 16.029 15.742 15.597 15.298 14.973 14.628 14.455 13.927 13.9 13.689 13.484 13.017 12.762 12.485 12.142 11.753 11.314 10.81 9.473 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt deleted file mode 100644 index ba47a9ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4975 ,TETRA ,17524153,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:25:15 CET,0.0 1.4 2.006 2.412 2.751 3.073 3.368 3.648 4.143 4.355 4.589 4.706 5.286 5.482 5.856 6.246 6.578 6.706 6.94 7.17 7.496 7.692 7.881 8.185 8.485 8.757 9.025 9.281 9.591 9.889 10.16 10.471 10.772 11.045 11.329 11.651 11.992 12.348 12.671 12.996 13.342 13.735 14.186 14.607 15.071 15.557 16.08 16.634 17.122 17.509 17.693 17.41 16.897 16.288 15.66 15.05 14.479 13.946 13.487 13.021 12.603 12.193 11.791 11.393 11.001 10.651 10.245 9.854 9.53 9.215 8.885 8.592 8.288 7.934 7.645 7.357 7.04 6.695 6.349 6.126 5.873 5.464 5.19 4.884 4.72 4.397 4.07 3.713 3.523 2.95 2.904 2.673 2.404 1.837 1.557 1.254 0.923 0.539 0.041 -0.623 -2.304 -2 ,20468 ,TETRA ,17524154,Wed Nov 24 21:42:20 CET,Wed Nov 24 23:18:17 CET,0.0 1.577 2.172 2.649 3.021 3.354 3.665 3.931 4.398 4.609 4.817 4.84 5.407 5.579 5.897 6.209 6.506 6.642 6.922 7.197 7.561 7.776 7.99 8.305 8.597 8.879 9.128 9.369 9.715 10.048 10.335 10.652 10.973 11.288 11.63 12.004 12.345 12.676 13.01 13.397 13.79 14.182 14.659 15.124 15.603 16.082 16.568 17.069 17.562 17.964 18.136 17.813 17.267 16.679 16.11 15.497 14.931 14.423 13.977 13.505 13.053 12.638 12.234 11.837 11.475 11.138 10.74 10.379 10.095 9.815 9.494 9.201 8.901 8.58 8.314 8.025 7.694 7.351 7.012 6.778 6.55 6.19 5.923 5.638 5.475 5.141 4.819 4.484 4.304 3.734 3.686 3.461 3.232 2.707 2.41 2.097 1.734 1.326 0.824 0.158 -1.837 -3 ,22422 ,TETRA ,17524156,Wed Nov 24 21:42:21 CET,Wed Nov 24 23:17:27 CET,0.0 1.198 1.766 2.217 2.613 2.972 3.288 3.549 4.017 4.252 4.469 4.464 5.02 5.198 5.539 5.848 6.133 6.277 6.54 6.799 7.165 7.39 7.61 7.922 8.229 8.515 8.777 9.02 9.325 9.624 9.916 10.26 10.566 10.856 11.198 11.571 11.908 12.274 12.687 13.086 13.463 13.86 14.309 14.752 15.23 15.733 16.207 16.671 17.138 17.514 17.606 17.174 16.596 15.978 15.365 14.768 14.207 13.647 13.134 12.639 12.192 11.757 11.32 10.906 10.523 10.132 9.73 9.376 9.055 8.721 8.362 8.055 7.728 7.389 7.119 6.815 6.494 6.164 5.8 5.541 5.284 4.898 4.617 4.31 4.154 3.852 3.525 3.147 2.951 2.374 2.295 2.052 1.807 1.272 0.979 0.668 0.333 -0.079 -0.601 -1.351 -3.481 -4 ,21405 ,TETRA ,17524157,Wed Nov 24 21:42:23 CET,Wed Nov 24 23:18:29 CET,0.0 1.211 1.796 2.208 2.557 2.869 3.151 3.407 3.88 4.111 4.335 4.359 4.923 5.107 5.446 5.749 6.019 6.154 6.419 6.665 7.029 7.253 7.46 7.79 8.107 8.385 8.635 8.88 9.179 9.457 9.752 10.081 10.347 10.602 10.924 11.279 11.61 11.965 12.317 12.66 13.003 13.378 13.822 14.264 14.731 15.216 15.693 16.12 16.554 16.944 17.075 16.785 16.305 15.72 15.126 14.531 13.957 13.409 12.914 12.41 11.948 11.516 11.104 10.714 10.351 10.025 9.693 9.364 9.041 8.711 8.381 8.101 7.793 7.459 7.2 6.923 6.613 6.294 5.967 5.741 5.516 5.159 4.91 4.646 4.496 4.172 3.83 3.445 3.231 2.637 2.53 2.272 1.981 1.393 1.087 0.764 0.434 0.042 -0.431 -1.064 -2.687 -5 ,27160 ,TETRA ,17524158,Wed Nov 24 21:43:23 CET,Wed Nov 24 23:18:45 CET,0.0 1.671 2.211 2.648 3.033 3.367 3.662 3.92 4.388 4.611 4.823 4.844 5.402 5.576 5.916 6.224 6.504 6.646 6.92 7.179 7.561 7.782 7.981 8.292 8.597 8.874 9.138 9.405 9.741 10.057 10.346 10.657 10.955 11.25 11.558 11.894 12.216 12.54 12.893 13.264 13.647 14.058 14.524 14.972 15.457 15.935 16.407 16.862 17.278 17.614 17.738 17.411 16.867 16.273 15.685 15.098 14.529 13.977 13.497 13.025 12.594 12.11 11.637 11.237 10.856 10.48 10.06 9.699 9.378 9.011 8.625 8.317 8.012 7.703 7.444 7.172 6.905 6.613 6.274 6.043 5.809 5.435 5.175 4.898 4.747 4.425 4.076 3.723 3.537 2.955 2.893 2.658 2.41 1.902 1.611 1.266 0.92 0.546 0.082 -0.633 -2.808 -6 ,23548 ,TETRA ,17524159,Wed Nov 24 21:43:25 CET,Wed Nov 24 23:20:19 CET,0.0 1.412 1.968 2.396 2.777 3.115 3.412 3.678 4.144 4.356 4.55 4.54 5.095 5.272 5.596 5.907 6.213 6.36 6.648 6.929 7.306 7.526 7.73 8.038 8.322 8.579 8.839 9.095 9.386 9.673 9.97 10.316 10.644 10.95 11.296 11.656 11.971 12.316 12.703 13.108 13.51 13.939 14.396 14.838 15.303 15.774 16.302 16.779 17.202 17.573 17.685 17.321 16.739 16.147 15.599 15.044 14.505 13.994 13.487 12.953 12.492 12.063 11.653 11.248 10.837 10.463 10.063 9.682 9.371 9.056 8.685 8.358 8.039 7.728 7.488 7.207 6.893 6.581 6.25 6.008 5.752 5.343 5.065 4.767 4.606 4.273 3.919 3.556 3.364 2.783 2.717 2.504 2.271 1.68 1.319 0.939 0.569 0.186 -0.235 -0.786 -2.662 -7 ,16032 ,TETRA ,17524163,Wed Nov 24 21:44:25 CET,Wed Nov 24 23:19:01 CET,0.0 1.402 2.129 2.655 3.045 3.337 3.597 3.845 4.312 4.534 4.743 4.755 5.309 5.484 5.826 6.15 6.444 6.584 6.853 7.109 7.473 7.712 7.931 8.232 8.549 8.852 9.123 9.371 9.667 9.939 10.216 10.538 10.815 11.08 11.384 11.734 12.041 12.363 12.738 13.109 13.46 13.835 14.269 14.706 15.177 15.65 16.171 16.684 17.19 17.606 17.725 17.411 16.907 16.315 15.728 15.12 14.536 13.971 13.466 12.966 12.502 12.079 11.688 11.34 10.97 10.583 10.188 9.834 9.521 9.188 8.825 8.517 8.177 7.799 7.503 7.212 6.91 6.592 6.255 6.01 5.76 5.357 5.084 4.814 4.667 4.354 4.036 3.703 3.517 2.936 2.847 2.616 2.376 1.851 1.561 1.253 0.903 0.499 0.032 -0.511 -1.845 -8 ,24927 ,TETRA ,17524164,Wed Nov 24 21:45:20 CET,Wed Nov 24 23:21:20 CET,0.0 1.596 2.233 2.629 2.977 3.308 3.589 3.84 4.288 4.506 4.729 4.753 5.302 5.471 5.795 6.096 6.382 6.524 6.789 7.046 7.429 7.67 7.88 8.183 8.477 8.75 9.024 9.283 9.6 9.903 10.182 10.51 10.829 11.15 11.545 11.944 12.256 12.576 12.915 13.28 13.657 14.028 14.442 14.845 15.292 15.81 16.351 16.795 17.223 17.601 17.697 17.379 16.888 16.293 15.672 15.069 14.485 13.948 13.508 13.031 12.609 12.21 11.748 11.283 10.857 10.477 10.076 9.664 9.315 8.979 8.593 8.274 7.944 7.599 7.346 7.077 6.785 6.48 6.167 5.947 5.717 5.359 5.106 4.832 4.681 4.373 4.052 3.702 3.518 2.938 2.859 2.63 2.379 1.818 1.512 1.182 0.819 0.392 -0.101 -0.754 -2.476 -9 ,26232 ,TETRA ,17524166,Wed Nov 24 21:48:23 CET,Wed Nov 24 23:23:20 CET,0.0 1.819 2.566 3.129 3.618 4.003 4.303 4.563 5.036 5.259 5.468 5.493 6.056 6.225 6.519 6.827 7.143 7.293 7.57 7.826 8.195 8.424 8.635 8.945 9.223 9.477 9.744 10.024 10.372 10.676 10.977 11.336 11.639 11.937 12.285 12.657 12.999 13.352 13.714 14.092 14.462 14.876 15.336 15.752 16.208 16.661 17.133 17.619 18.088 18.459 18.611 18.283 17.783 17.191 16.587 16.016 15.496 14.977 14.502 14.023 13.58 13.167 12.739 12.306 11.9 11.523 11.118 10.758 10.424 10.059 9.684 9.357 9.021 8.687 8.415 8.126 7.833 7.525 7.175 6.925 6.676 6.285 5.993 5.688 5.535 5.204 4.838 4.464 4.279 3.711 3.667 3.456 3.235 2.738 2.462 2.141 1.748 1.295 0.75 0.031 -1.788 -10 ,10910 ,TETRA ,17524167,Wed Nov 24 21:48:24 CET,Wed Nov 24 23:23:40 CET,0.0 1.178 1.743 2.23 2.608 2.919 3.222 3.511 4.02 4.254 4.478 4.491 5.037 5.198 5.52 5.835 6.125 6.272 6.563 6.814 7.159 7.393 7.616 7.909 8.181 8.476 8.767 9.032 9.381 9.705 10.001 10.345 10.641 10.896 11.194 11.531 11.82 12.128 12.456 12.788 13.12 13.516 13.967 14.369 14.817 15.239 15.686 16.177 16.647 16.997 17.079 16.684 16.124 15.549 15.005 14.477 13.965 13.464 12.983 12.402 11.91 11.526 11.127 10.725 10.341 9.98 9.589 9.214 8.878 8.514 8.114 7.784 7.449 7.095 6.791 6.469 6.153 5.823 5.495 5.275 5.031 4.64 4.354 4.045 3.895 3.587 3.24 2.872 2.685 2.124 2.107 1.889 1.656 1.111 0.781 0.424 0.063 -0.338 -0.789 -1.357 -3.907 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt deleted file mode 100644 index f6cc0ba6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18541 ,TETRA ,17524170,Wed Nov 24 21:48:22 CET,Wed Nov 24 23:23:56 CET,0.0 1.154 1.807 2.284 2.652 2.969 3.257 3.548 4.06 4.286 4.499 4.524 5.101 5.302 5.645 5.951 6.241 6.386 6.671 6.954 7.359 7.608 7.838 8.159 8.468 8.769 9.073 9.365 9.711 10.023 10.32 10.685 11.041 11.377 11.77 12.196 12.592 13.016 13.455 13.92 14.383 14.879 15.444 16.002 16.625 17.332 18.113 18.887 19.742 20.665 21.442 21.67 21.532 21.191 20.796 20.385 19.922 19.443 19.001 18.535 18.15 17.808 17.455 17.107 16.753 16.425 16.088 15.768 15.476 15.165 14.824 14.524 14.201 13.846 13.58 13.299 12.996 12.699 12.382 12.145 11.903 11.546 11.29 11.014 10.866 10.568 10.248 9.884 9.694 9.13 9.085 8.849 8.613 8.1 7.794 7.456 7.091 6.667 6.147 5.431 4.084 -2 ,32737 ,TETRA ,17524172,Wed Nov 24 21:48:27 CET,Wed Nov 24 23:23:59 CET,0.0 1.552 2.229 2.641 2.979 3.279 3.574 3.853 4.362 4.586 4.774 4.774 5.34 5.533 5.895 6.206 6.505 6.655 6.945 7.238 7.628 7.869 8.11 8.459 8.792 9.109 9.424 9.702 10.025 10.362 10.686 11.044 11.371 11.683 12.059 12.477 12.866 13.282 13.732 14.238 14.746 15.294 15.943 16.571 17.214 17.865 18.588 19.391 20.242 21.082 21.822 22.055 21.894 21.551 21.177 20.766 20.352 19.936 19.544 19.13 18.748 18.404 18.074 17.721 17.358 17.012 16.627 16.29 15.999 15.676 15.336 15.031 14.707 14.398 14.151 13.881 13.619 13.327 13.004 12.787 12.556 12.199 11.936 11.665 11.534 11.243 10.916 10.552 10.356 9.788 9.744 9.525 9.29 8.781 8.507 8.215 7.87 7.444 6.978 6.389 4.943 -3 ,28613 ,TETRA ,17524175,Wed Nov 24 21:48:27 CET,Wed Nov 24 23:24:08 CET,0.0 1.945 2.596 3.03 3.432 3.79 4.108 4.389 4.861 5.062 5.257 5.254 5.794 5.958 6.289 6.599 6.877 7.014 7.286 7.554 7.928 8.159 8.388 8.697 8.978 9.248 9.516 9.787 10.122 10.438 10.733 11.067 11.403 11.719 12.057 12.455 12.85 13.262 13.668 14.077 14.513 15.044 15.642 16.203 16.839 17.484 18.197 18.963 19.83 20.745 21.566 21.859 21.74 21.413 21.027 20.645 20.253 19.854 19.465 19.041 18.628 18.259 17.922 17.552 17.186 16.858 16.515 16.19 15.87 15.543 15.235 14.92 14.572 14.279 14.058 13.807 13.548 13.284 12.981 12.76 12.538 12.197 11.956 11.687 11.538 11.238 10.921 10.577 10.396 9.837 9.802 9.579 9.335 8.77 8.431 8.091 7.736 7.368 6.95 6.357 4.395 -4 ,11024 ,TETRA ,17524177,Wed Nov 24 21:48:29 CET,Wed Nov 24 23:23:37 CET,0.0 1.894 2.474 2.936 3.303 3.622 3.916 4.186 4.692 4.929 5.152 5.176 5.745 5.935 6.266 6.575 6.88 7.021 7.295 7.569 7.957 8.19 8.405 8.705 8.986 9.297 9.619 9.903 10.246 10.571 10.884 11.265 11.618 11.948 12.304 12.675 13.039 13.433 13.842 14.278 14.74 15.265 15.829 16.358 16.962 17.626 18.363 19.123 19.922 20.752 21.508 21.736 21.542 21.184 20.802 20.407 20.026 19.606 19.15 18.686 18.272 17.874 17.514 17.169 16.829 16.506 16.149 15.814 15.521 15.217 14.886 14.604 14.305 13.969 13.7 13.422 13.139 12.839 12.499 12.268 12.047 11.717 11.464 11.159 11.003 10.709 10.401 10.073 9.898 9.342 9.299 9.077 8.851 8.326 8.037 7.738 7.413 7.02 6.584 6.006 4.546 -5 ,14210 ,TETRA ,17524179,Wed Nov 24 21:48:27 CET,Wed Nov 24 23:24:56 CET,0.0 1.416 2.005 2.507 2.939 3.289 3.574 3.848 4.365 4.58 4.791 4.803 5.359 5.548 5.893 6.203 6.525 6.678 6.95 7.232 7.629 7.874 8.128 8.508 8.85 9.138 9.409 9.68 10.022 10.341 10.674 11.102 11.465 11.77 12.128 12.53 12.905 13.323 13.766 14.195 14.621 15.118 15.732 16.297 16.918 17.592 18.308 19.094 19.994 20.918 21.683 21.953 21.816 21.528 21.146 20.718 20.317 19.897 19.487 19.059 18.665 18.281 17.887 17.499 17.129 16.794 16.451 16.145 15.88 15.583 15.236 14.941 14.651 14.336 14.07 13.798 13.519 13.217 12.901 12.69 12.474 12.116 11.861 11.593 11.455 11.159 10.835 10.488 10.303 9.738 9.686 9.479 9.247 8.716 8.429 8.125 7.785 7.385 6.886 6.235 5.145 -6 ,30791 ,TETRA ,17524180,Wed Nov 24 21:48:27 CET,Wed Nov 24 23:25:04 CET,0.0 1.124 1.653 2.1 2.495 2.851 3.165 3.421 3.893 4.141 4.373 4.406 4.982 5.175 5.528 5.854 6.151 6.297 6.591 6.882 7.316 7.583 7.814 8.14 8.462 8.761 9.056 9.344 9.705 10.064 10.397 10.765 11.109 11.445 11.822 12.218 12.579 12.986 13.417 13.872 14.352 14.848 15.45 16.029 16.631 17.332 18.146 18.972 19.831 20.704 21.457 21.734 21.608 21.28 20.917 20.524 20.083 19.637 19.229 18.787 18.385 17.991 17.603 17.229 16.863 16.514 16.141 15.807 15.511 15.191 14.848 14.58 14.304 13.986 13.727 13.445 13.137 12.839 12.538 12.334 12.113 11.747 11.511 11.264 11.128 10.819 10.468 10.11 9.936 9.385 9.335 9.113 8.893 8.434 8.16 7.859 7.529 7.106 6.64 6.152 5.014 -7 ,16848 ,TETRA ,17524182,Wed Nov 24 21:49:21 CET,Wed Nov 24 23:24:21 CET,0.0 1.218 1.754 2.173 2.538 2.928 3.284 3.571 4.099 4.345 4.557 4.567 5.12 5.292 5.631 5.943 6.23 6.365 6.623 6.89 7.242 7.441 7.642 7.963 8.288 8.588 8.883 9.157 9.482 9.803 10.113 10.49 10.86 11.207 11.581 12.02 12.443 12.848 13.265 13.734 14.218 14.722 15.276 15.821 16.445 17.113 17.848 18.623 19.47 20.365 21.14 21.377 21.264 20.994 20.612 20.198 19.789 19.39 19.024 18.612 18.225 17.828 17.436 17.089 16.749 16.433 16.068 15.72 15.419 15.095 14.739 14.457 14.173 13.86 13.61 13.359 13.075 12.756 12.44 12.215 11.981 11.608 11.352 11.09 10.949 10.645 10.293 9.915 9.734 9.179 9.16 8.953 8.735 8.253 7.977 7.659 7.299 6.914 6.44 5.802 3.72 -8 ,22031 ,TETRA ,17524184,Wed Nov 24 21:49:25 CET,Wed Nov 24 23:24:47 CET,0.0 1.289 1.804 2.22 2.569 2.878 3.178 3.472 3.974 4.208 4.426 4.399 4.954 5.137 5.482 5.809 6.119 6.261 6.54 6.829 7.248 7.506 7.745 8.072 8.389 8.701 8.988 9.267 9.638 9.978 10.288 10.668 11.026 11.361 11.735 12.124 12.497 12.911 13.35 13.822 14.309 14.808 15.369 15.958 16.637 17.337 18.08 18.885 19.776 20.667 21.408 21.608 21.443 21.146 20.784 20.367 19.932 19.488 19.074 18.626 18.241 17.872 17.442 17.04 16.675 16.329 15.989 15.671 15.371 15.058 14.731 14.448 14.145 13.821 13.56 13.281 12.998 12.721 12.424 12.214 11.995 11.636 11.377 11.1 10.968 10.685 10.352 9.967 9.767 9.199 9.119 8.894 8.659 8.101 7.824 7.53 7.144 6.724 6.275 5.693 4.306 -9 ,444 ,TETRA ,17524186,Wed Nov 24 21:49:21 CET,Wed Nov 24 23:24:22 CET,0.0 1.506 2.061 2.476 2.881 3.227 3.504 3.749 4.222 4.444 4.647 4.655 5.222 5.425 5.794 6.12 6.42 6.563 6.851 7.144 7.568 7.814 8.043 8.371 8.698 9.018 9.311 9.601 9.95 10.271 10.585 10.983 11.359 11.683 12.066 12.505 12.901 13.325 13.778 14.224 14.694 15.26 15.911 16.532 17.192 17.862 18.573 19.33 20.169 21.029 21.766 22.03 21.903 21.545 21.078 20.643 20.207 19.762 19.361 18.918 18.514 18.15 17.787 17.422 17.067 16.731 16.386 16.066 15.751 15.403 15.028 14.704 14.397 14.105 13.864 13.611 13.349 13.075 12.773 12.541 12.296 11.914 11.635 11.354 11.223 10.946 10.631 10.293 10.115 9.561 9.549 9.336 9.099 8.607 8.341 8.022 7.658 7.253 6.753 6.078 4.318 -10 ,7929 ,TETRA ,17524187,Wed Nov 24 21:49:23 CET,Wed Nov 24 23:24:06 CET,0.0 1.689 2.24 2.658 3.045 3.387 3.684 3.952 4.42 4.65 4.874 4.902 5.471 5.656 6.027 6.38 6.695 6.839 7.122 7.395 7.783 8.043 8.306 8.699 9.049 9.344 9.626 9.895 10.238 10.583 10.889 11.229 11.566 11.904 12.278 12.681 13.082 13.497 13.934 14.39 14.854 15.365 15.935 16.505 17.145 17.839 18.614 19.359 20.129 20.947 21.69 21.916 21.756 21.509 21.193 20.771 20.299 19.841 19.453 19.023 18.621 18.269 17.915 17.55 17.199 16.855 16.471 16.128 15.817 15.491 15.151 14.857 14.552 14.226 13.97 13.713 13.444 13.162 12.858 12.653 12.447 12.1 11.844 11.563 11.415 11.099 10.751 10.384 10.204 9.654 9.65 9.434 9.19 8.683 8.404 8.07 7.689 7.277 6.757 6.132 4.996 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt deleted file mode 100644 index 25048eb8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28983 ,TETRA ,17524191,Wed Nov 24 21:49:24 CET,Wed Nov 24 23:26:12 CET,0.0 2.441 3.27 3.795 4.16 4.476 4.775 5.04 5.504 5.728 5.964 6.025 6.587 6.777 7.12 7.429 7.723 7.864 8.144 8.412 8.771 9.034 9.282 9.57 9.848 10.137 10.401 10.639 10.928 11.198 11.476 11.82 12.123 12.377 12.644 12.943 13.232 13.534 13.839 14.141 14.476 14.874 15.279 15.599 15.928 16.296 16.685 17.002 17.201 17.232 16.888 15.991 15.049 14.11 13.139 12.224 11.44 10.674 9.969 9.234 8.579 7.991 7.406 6.795 6.23 5.688 5.12 4.632 4.19 3.717 3.193 2.739 2.235 1.72 1.319 0.889 0.446 -0.031 -0.51 -0.845 -1.218 -1.816 -2.261 -2.741 -2.982 -3.488 -4.031 -4.617 -4.939 -5.643 -5.948 -6.291 -6.656 -7.48 -7.936 -8.426 -8.995 -9.689 -10.568 -11.77 -19.299 -2 ,12906 ,TETRA ,17524193,Wed Nov 24 21:49:23 CET,Wed Nov 24 23:25:59 CET,0.0 1.554 2.172 2.651 3.065 3.393 3.681 3.974 4.534 4.792 5.03 5.054 5.626 5.818 6.155 6.487 6.802 6.944 7.221 7.51 7.899 8.118 8.32 8.621 8.917 9.2 9.475 9.744 10.084 10.383 10.663 10.984 11.282 11.556 11.875 12.225 12.519 12.832 13.206 13.563 13.851 14.202 14.62 14.971 15.359 15.757 16.134 16.482 16.733 16.781 16.434 15.595 14.616 13.631 12.736 11.882 11.056 10.289 9.59 8.853 8.21 7.594 6.976 6.368 5.806 5.292 4.725 4.201 3.763 3.32 2.81 2.36 1.893 1.373 0.954 0.533 0.111 -0.325 -0.818 -1.187 -1.59 -2.222 -2.642 -3.079 -3.305 -3.768 -4.265 -4.795 -5.085 -5.778 -6.093 -6.498 -6.922 -7.84 -8.349 -8.869 -9.477 -10.234 -11.141 -12.33 -16.628 -3 ,2465 ,TETRA ,17524194,Wed Nov 24 21:49:22 CET,Wed Nov 24 23:26:12 CET,0.0 2.122 2.792 3.28 3.639 3.942 4.226 4.502 4.992 5.208 5.42 5.461 6.005 6.172 6.525 6.898 7.223 7.362 7.624 7.856 8.21 8.44 8.658 8.963 9.231 9.48 9.719 9.948 10.242 10.542 10.812 11.111 11.408 11.685 11.986 12.276 12.555 12.863 13.179 13.512 13.844 14.2 14.583 14.928 15.295 15.71 16.111 16.432 16.702 16.792 16.439 15.514 14.546 13.57 12.605 11.725 10.968 10.231 9.525 8.787 8.119 7.509 6.909 6.345 5.815 5.302 4.718 4.186 3.726 3.241 2.736 2.306 1.845 1.37 0.997 0.577 0.132 -0.325 -0.803 -1.149 -1.552 -2.193 -2.607 -3.048 -3.278 -3.731 -4.226 -4.777 -5.071 -5.752 -6.028 -6.39 -6.802 -7.68 -8.153 -8.702 -9.342 -10.054 -10.91 -12.199 -17.968 -4 ,1029 ,TETRA ,17524197,Wed Nov 24 21:49:29 CET,Wed Nov 24 23:27:21 CET,0.0 1.7 2.329 2.835 3.23 3.579 3.875 4.174 4.717 4.955 5.179 5.2 5.751 5.936 6.29 6.602 6.874 7.014 7.298 7.565 7.95 8.183 8.401 8.728 9.044 9.332 9.593 9.821 10.116 10.401 10.652 10.933 11.204 11.492 11.81 12.162 12.482 12.798 13.17 13.553 13.882 14.201 14.55 14.92 15.349 15.757 16.109 16.408 16.634 16.717 16.355 15.442 14.411 13.409 12.51 11.645 10.81 10.016 9.35 8.653 7.999 7.416 6.855 6.33 5.795 5.263 4.722 4.219 3.731 3.213 2.701 2.275 1.821 1.353 1.0 0.614 0.185 -0.294 -0.802 -1.15 -1.536 -2.171 -2.603 -3.049 -3.286 -3.754 -4.237 -4.841 -5.146 -5.813 -6.09 -6.438 -6.841 -7.712 -8.178 -8.724 -9.37 -10.094 -10.975 -12.175 -17.102 -5 ,10457 ,TETRA ,17524198,Wed Nov 24 21:49:24 CET,Wed Nov 24 23:26:02 CET,0.0 1.877 2.628 3.162 3.582 3.93 4.234 4.51 4.972 5.191 5.399 5.411 5.959 6.16 6.509 6.806 7.109 7.254 7.506 7.746 8.076 8.287 8.488 8.785 9.096 9.377 9.637 9.866 10.133 10.395 10.655 10.943 11.21 11.464 11.763 12.117 12.426 12.718 12.998 13.324 13.665 14.024 14.459 14.854 15.233 15.607 15.986 16.314 16.554 16.638 16.344 15.503 14.502 13.566 12.675 11.754 10.884 10.068 9.356 8.635 8.012 7.418 6.81 6.236 5.699 5.186 4.634 4.104 3.645 3.212 2.759 2.364 1.932 1.444 1.072 0.669 0.18 -0.345 -0.838 -1.159 -1.503 -2.064 -2.465 -2.898 -3.13 -3.619 -4.155 -4.726 -5.022 -5.705 -5.987 -6.348 -6.731 -7.575 -8.052 -8.577 -9.198 -9.921 -10.776 -11.986 -16.48 -6 ,3802 ,TETRA ,17524199,Wed Nov 24 21:49:24 CET,Wed Nov 24 23:25:50 CET,0.0 2.059 2.636 3.069 3.428 3.747 4.063 4.371 4.899 5.143 5.359 5.364 5.914 6.098 6.454 6.766 7.046 7.193 7.478 7.737 8.092 8.319 8.529 8.821 9.149 9.468 9.737 9.993 10.312 10.609 10.884 11.194 11.488 11.779 12.114 12.452 12.744 13.049 13.362 13.683 14.052 14.458 14.859 15.222 15.629 16.027 16.363 16.649 16.845 16.877 16.51 15.586 14.591 13.635 12.689 11.763 10.94 10.159 9.432 8.686 8.059 7.486 6.918 6.338 5.775 5.269 4.75 4.277 3.835 3.359 2.838 2.386 1.902 1.393 1.004 0.598 0.147 -0.35 -0.894 -1.256 -1.605 -2.174 -2.559 -2.959 -3.197 -3.691 -4.225 -4.822 -5.111 -5.787 -6.056 -6.412 -6.78 -7.642 -8.159 -8.673 -9.27 -9.997 -10.889 -12.176 -16.996 -7 ,32021 ,TETRA ,17524201,Wed Nov 24 21:49:26 CET,Wed Nov 24 23:26:23 CET,0.0 1.912 2.484 2.976 3.388 3.719 4.029 4.292 4.772 5.008 5.236 5.309 5.88 6.07 6.403 6.738 7.101 7.261 7.53 7.781 8.155 8.394 8.611 8.921 9.215 9.512 9.803 10.082 10.452 10.778 11.059 11.382 11.7 12.006 12.367 12.741 13.045 13.37 13.723 14.06 14.383 14.727 15.098 15.452 15.834 16.222 16.577 16.905 17.187 17.298 16.959 16.067 15.067 14.029 13.091 12.196 11.303 10.475 9.784 9.044 8.37 7.781 7.193 6.611 6.062 5.56 5.025 4.499 4.035 3.558 3.026 2.579 2.129 1.657 1.269 0.847 0.358 -0.158 -0.665 -1.008 -1.363 -1.935 -2.344 -2.789 -3.016 -3.471 -3.946 -4.467 -4.761 -5.434 -5.706 -6.08 -6.473 -7.309 -7.787 -8.351 -8.992 -9.705 -10.542 -11.687 -16.302 -8 ,11963 ,TETRA ,17524204,Wed Nov 24 21:49:27 CET,Wed Nov 24 23:26:30 CET,0.0 2.5 3.016 3.469 3.866 4.217 4.529 4.807 5.292 5.521 5.743 5.795 6.352 6.527 6.873 7.215 7.536 7.68 7.946 8.215 8.602 8.833 9.052 9.357 9.657 9.944 10.215 10.476 10.774 11.069 11.36 11.69 11.983 12.235 12.545 12.869 13.142 13.464 13.817 14.164 14.503 14.864 15.238 15.59 15.997 16.415 16.822 17.159 17.413 17.434 17.016 16.191 15.181 14.191 13.269 12.351 11.498 10.674 9.95 9.222 8.554 7.924 7.304 6.72 6.189 5.67 5.098 4.57 4.107 3.652 3.178 2.753 2.306 1.855 1.473 1.038 0.581 0.104 -0.406 -0.764 -1.115 -1.653 -2.052 -2.489 -2.714 -3.215 -3.768 -4.325 -4.619 -5.305 -5.622 -5.991 -6.356 -7.218 -7.73 -8.26 -8.913 -9.708 -10.616 -11.844 -15.644 -9 ,2819 ,TETRA ,17524206,Wed Nov 24 21:49:24 CET,Wed Nov 24 23:26:29 CET,0.0 2.218 2.851 3.325 3.713 4.072 4.4 4.661 5.138 5.356 5.562 5.581 6.121 6.295 6.63 6.933 7.223 7.371 7.661 7.933 8.311 8.542 8.756 9.055 9.326 9.585 9.838 10.088 10.397 10.699 11.001 11.335 11.643 11.929 12.239 12.59 12.899 13.214 13.55 13.881 14.225 14.576 14.959 15.338 15.706 16.066 16.431 16.759 17.044 17.1 16.68 15.801 14.856 13.848 12.923 12.058 11.225 10.45 9.736 9.021 8.366 7.746 7.105 6.496 5.951 5.419 4.852 4.356 3.922 3.446 2.943 2.521 2.047 1.52 1.085 0.643 0.198 -0.295 -0.822 -1.206 -1.586 -2.153 -2.556 -2.989 -3.218 -3.669 -4.149 -4.7 -5.005 -5.687 -5.959 -6.319 -6.696 -7.57 -8.086 -8.628 -9.28 -10.043 -10.986 -12.177 -16.29 -10 ,28524 ,TETRA ,17524208,Wed Nov 24 21:49:25 CET,Wed Nov 24 23:26:13 CET,0.0 1.669 2.261 2.679 3.033 3.378 3.693 3.974 4.428 4.637 4.851 4.881 5.434 5.625 5.966 6.274 6.574 6.721 7.025 7.297 7.647 7.877 8.094 8.412 8.712 8.982 9.234 9.468 9.751 10.015 10.296 10.626 10.904 11.18 11.485 11.799 12.108 12.435 12.753 13.044 13.344 13.699 14.062 14.392 14.765 15.148 15.506 15.825 16.073 16.139 15.757 14.882 13.913 12.942 12.055 11.167 10.339 9.574 8.849 8.12 7.48 6.871 6.275 5.71 5.179 4.655 4.077 3.536 3.071 2.593 2.084 1.649 1.214 0.764 0.376 -0.02 -0.417 -0.866 -1.351 -1.692 -2.058 -2.633 -3.051 -3.504 -3.721 -4.189 -4.711 -5.262 -5.551 -6.225 -6.508 -6.87 -7.261 -8.094 -8.587 -9.135 -9.754 -10.498 -11.401 -12.661 -17.297 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt deleted file mode 100644 index d3033b11..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17631 ,TETRA ,17524210,Wed Nov 24 21:49:25 CET,Wed Nov 24 23:26:59 CET,0.0 1.565 2.269 2.758 3.164 3.502 3.826 4.131 4.686 4.945 5.186 5.282 5.861 6.047 6.411 6.765 7.089 7.243 7.522 7.78 8.151 8.389 8.615 8.936 9.242 9.531 9.802 10.04 10.329 10.635 10.922 11.265 11.593 11.897 12.268 12.636 12.965 13.332 13.742 14.147 14.515 14.915 15.348 15.778 16.208 16.64 17.123 17.535 17.856 18.006 17.741 16.959 15.992 14.982 14.067 13.202 12.398 11.655 10.982 10.273 9.639 9.069 8.521 7.974 7.423 6.921 6.354 5.828 5.397 4.918 4.398 3.979 3.539 3.059 2.682 2.293 1.88 1.43 0.943 0.608 0.261 -0.288 -0.676 -1.076 -1.286 -1.727 -2.192 -2.742 -3.044 -3.712 -3.951 -4.275 -4.615 -5.382 -5.817 -6.277 -6.794 -7.476 -8.356 -9.474 -13.362 -2 ,11776 ,TETRA ,17524211,Wed Nov 24 21:49:26 CET,Wed Nov 24 23:26:46 CET,0.0 1.96 2.713 3.236 3.66 4.049 4.385 4.692 5.213 5.475 5.733 5.808 6.379 6.577 6.963 7.344 7.676 7.817 8.096 8.375 8.779 9.033 9.268 9.595 9.911 10.226 10.522 10.796 11.151 11.455 11.732 12.091 12.425 12.72 13.058 13.439 13.798 14.168 14.557 14.983 15.349 15.692 16.114 16.506 16.906 17.332 17.762 18.158 18.46 18.552 18.303 17.506 16.523 15.464 14.487 13.619 12.819 12.053 11.391 10.7 10.011 9.386 8.803 8.247 7.724 7.208 6.642 6.142 5.733 5.278 4.749 4.301 3.798 3.273 2.884 2.472 2.027 1.561 1.087 0.758 0.419 -0.147 -0.568 -1.014 -1.249 -1.706 -2.192 -2.737 -3.008 -3.673 -3.974 -4.308 -4.618 -5.388 -5.836 -6.297 -6.8 -7.386 -8.176 -9.287 -13.279 -3 ,20564 ,TETRA ,17524213,Wed Nov 24 21:49:57 CET,Wed Nov 24 23:27:27 CET,0.0 1.907 2.593 3.048 3.431 3.791 4.136 4.463 5.003 5.239 5.46 5.524 6.097 6.296 6.669 7.002 7.323 7.469 7.752 8.033 8.431 8.673 8.916 9.275 9.627 9.956 10.232 10.504 10.882 11.223 11.528 11.898 12.231 12.527 12.864 13.229 13.566 13.895 14.212 14.583 14.969 15.368 15.822 16.245 16.698 17.115 17.503 17.872 18.14 18.229 17.934 17.086 16.092 15.104 14.196 13.359 12.57 11.764 11.055 10.32 9.664 9.089 8.491 7.874 7.338 6.859 6.342 5.869 5.415 4.93 4.436 4.006 3.561 3.112 2.741 2.359 1.957 1.503 1.026 0.678 0.327 -0.213 -0.591 -0.972 -1.162 -1.571 -2.027 -2.527 -2.802 -3.443 -3.642 -3.993 -4.361 -5.135 -5.598 -6.095 -6.64 -7.255 -8.007 -9.044 -12.197 -4 ,12211 ,TETRA ,17524215,Wed Nov 24 21:49:59 CET,Wed Nov 24 23:27:17 CET,0.0 1.9 2.629 3.148 3.59 3.991 4.335 4.65 5.224 5.479 5.713 5.752 6.306 6.491 6.837 7.171 7.493 7.649 7.956 8.247 8.656 8.912 9.153 9.483 9.802 10.11 10.4 10.674 11.029 11.37 11.681 12.038 12.372 12.662 12.98 13.353 13.727 14.12 14.49 14.874 15.269 15.684 16.111 16.506 16.939 17.377 17.813 18.177 18.445 18.52 18.163 17.28 16.342 15.423 14.531 13.639 12.822 12.056 11.343 10.634 10.052 9.501 8.96 8.448 7.936 7.444 6.911 6.409 5.967 5.497 4.999 4.578 4.141 3.681 3.31 2.912 2.491 2.08 1.64 1.309 0.971 0.441 0.06 -0.365 -0.581 -0.997 -1.503 -2.041 -2.295 -2.955 -3.208 -3.528 -3.852 -4.561 -4.962 -5.401 -5.923 -6.542 -7.318 -8.414 -12.487 -5 ,15416 ,TETRA ,17524217,Wed Nov 24 21:49:56 CET,Wed Nov 24 23:27:41 CET,0.0 2.075 2.729 3.241 3.679 4.046 4.385 4.726 5.278 5.526 5.775 5.829 6.378 6.561 6.899 7.204 7.5 7.643 7.935 8.229 8.64 8.888 9.124 9.466 9.798 10.083 10.335 10.581 10.901 11.201 11.509 11.883 12.194 12.498 12.87 13.264 13.619 13.982 14.333 14.678 15.034 15.42 15.858 16.261 16.659 17.085 17.543 17.955 18.221 18.3 18.023 17.208 16.301 15.392 14.487 13.593 12.723 11.922 11.244 10.537 9.916 9.317 8.729 8.154 7.523 6.963 6.403 5.915 5.49 5.013 4.539 4.123 3.651 3.158 2.771 2.365 1.935 1.466 1.001 0.687 0.347 -0.177 -0.562 -0.965 -1.164 -1.578 -2.068 -2.619 -2.889 -3.55 -3.792 -4.115 -4.481 -5.361 -5.846 -6.337 -6.862 -7.502 -8.265 -9.255 -14.173 -6 ,15447 ,TETRA ,17524219,Wed Nov 24 21:49:57 CET,Wed Nov 24 23:28:18 CET,0.0 2.144 2.752 3.273 3.731 4.138 4.481 4.797 5.349 5.594 5.83 5.852 6.414 6.624 6.999 7.323 7.647 7.814 8.117 8.417 8.84 9.08 9.313 9.628 9.921 10.21 10.481 10.751 11.083 11.385 11.687 12.046 12.37 12.66 13.01 13.387 13.707 14.067 14.475 14.897 15.303 15.711 16.161 16.571 16.973 17.351 17.774 18.203 18.579 18.744 18.421 17.535 16.585 15.657 14.779 13.92 13.097 12.309 11.616 10.905 10.268 9.687 9.116 8.541 7.995 7.456 6.87 6.347 5.859 5.344 4.834 4.424 3.983 3.511 3.138 2.734 2.304 1.859 1.407 1.086 0.751 0.214 -0.165 -0.559 -0.775 -1.211 -1.68 -2.205 -2.473 -3.117 -3.325 -3.642 -3.982 -4.791 -5.26 -5.787 -6.354 -6.954 -7.719 -8.72 -12.767 -7 ,23274 ,TETRA ,17524220,Wed Nov 24 21:49:58 CET,Wed Nov 24 23:27:28 CET,0.0 2.53 3.173 3.663 4.089 4.452 4.766 5.038 5.537 5.776 6.024 6.1 6.671 6.867 7.229 7.562 7.864 8.012 8.305 8.572 8.963 9.225 9.466 9.799 10.11 10.394 10.675 10.924 11.265 11.641 11.953 12.288 12.616 12.918 13.252 13.599 13.912 14.258 14.607 14.944 15.282 15.671 16.082 16.492 16.965 17.37 17.739 18.059 18.31 18.433 18.155 17.3 16.331 15.359 14.482 13.642 12.855 12.107 11.428 10.701 10.048 9.446 8.85 8.292 7.767 7.283 6.756 6.266 5.843 5.405 4.926 4.511 4.064 3.572 3.194 2.806 2.396 1.963 1.455 1.097 0.746 0.174 -0.216 -0.623 -0.842 -1.296 -1.774 -2.308 -2.595 -3.247 -3.456 -3.768 -4.117 -4.936 -5.407 -5.918 -6.447 -7.061 -7.865 -8.902 -12.395 -8 ,32763 ,TETRA ,17524221,Wed Nov 24 21:49:59 CET,Wed Nov 24 23:27:14 CET,0.0 2.222 2.929 3.484 3.963 4.36 4.741 5.125 5.75 6.005 6.252 6.364 6.937 7.124 7.466 7.785 8.105 8.258 8.536 8.809 9.189 9.432 9.671 10.018 10.334 10.618 10.874 11.14 11.491 11.804 12.111 12.462 12.778 13.085 13.414 13.771 14.113 14.453 14.806 15.185 15.56 15.944 16.394 16.818 17.253 17.653 18.045 18.416 18.693 18.812 18.491 17.576 16.603 15.629 14.721 13.874 13.078 12.295 11.588 10.904 10.302 9.745 9.206 8.677 8.159 7.643 7.068 6.553 6.128 5.664 5.145 4.701 4.223 3.729 3.348 2.964 2.555 2.104 1.641 1.333 0.99 0.366 -0.087 -0.543 -0.778 -1.227 -1.697 -2.229 -2.509 -3.16 -3.372 -3.677 -3.986 -4.689 -5.118 -5.636 -6.214 -6.837 -7.618 -8.641 -12.025 -9 ,7354 ,TETRA ,17524222,Wed Nov 24 21:49:56 CET,Wed Nov 24 23:27:30 CET,0.0 1.985 2.698 3.195 3.603 3.931 4.252 4.58 5.143 5.378 5.613 5.698 6.261 6.461 6.85 7.217 7.551 7.699 7.991 8.27 8.685 8.954 9.215 9.614 9.971 10.256 10.509 10.773 11.119 11.433 11.726 12.069 12.373 12.662 12.997 13.349 13.699 14.056 14.41 14.766 15.127 15.542 15.972 16.345 16.767 17.194 17.574 17.962 18.347 18.511 18.173 17.306 16.337 15.387 14.535 13.69 12.845 12.081 11.411 10.691 10.065 9.48 8.895 8.344 7.813 7.314 6.771 6.264 5.814 5.338 4.835 4.417 3.97 3.476 3.097 2.699 2.259 1.808 1.346 1.025 0.681 0.115 -0.267 -0.665 -0.88 -1.319 -1.791 -2.314 -2.591 -3.256 -3.543 -3.914 -4.276 -5.031 -5.48 -5.971 -6.533 -7.179 -7.984 -9.101 -14.409 -10 ,32403 ,TETRA ,17524226,Wed Nov 24 21:49:57 CET,Wed Nov 24 23:27:48 CET,0.0 2.073 2.802 3.296 3.684 4.035 4.351 4.659 5.175 5.398 5.623 5.694 6.26 6.44 6.776 7.097 7.411 7.563 7.853 8.145 8.533 8.757 8.976 9.301 9.603 9.886 10.166 10.432 10.758 11.066 11.366 11.696 12.007 12.335 12.69 13.055 13.374 13.707 14.065 14.419 14.798 15.206 15.62 16.012 16.405 16.793 17.17 17.532 17.9 18.095 17.844 17.042 16.078 15.114 14.211 13.345 12.526 11.758 11.069 10.348 9.702 9.086 8.51 7.969 7.427 6.889 6.273 5.706 5.233 4.767 4.275 3.813 3.356 2.93 2.561 2.164 1.728 1.239 0.749 0.427 0.084 -0.457 -0.829 -1.212 -1.413 -1.845 -2.313 -2.839 -3.112 -3.774 -4.039 -4.359 -4.71 -5.57 -6.052 -6.541 -7.081 -7.728 -8.533 -9.619 -13.056 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23467_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23467_23466.txt deleted file mode 100644 index d78db6ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23467_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17480 ,TETRA ,17524232,Wed Nov 24 21:49:59 CET,Wed Nov 24 23:21:59 CET,0.0 1.346 1.919 2.331 2.694 3.011 3.296 3.553 4.018 4.224 4.419 4.441 4.971 5.125 5.42 5.7 5.961 6.097 6.353 6.584 6.888 7.074 7.27 7.555 7.815 8.052 8.276 8.498 8.779 9.05 9.295 9.553 9.794 10.065 10.376 10.679 10.972 11.297 11.616 11.952 12.303 12.633 12.976 13.311 13.66 14.046 14.474 14.864 15.171 15.291 15.104 14.454 13.665 12.888 12.162 11.446 10.78 10.156 9.576 9.0 8.521 8.064 7.592 7.142 6.742 6.374 5.954 5.562 5.194 4.792 4.397 4.107 3.771 3.351 3.046 2.75 2.434 2.085 1.726 1.479 1.205 0.765 0.469 0.174 0.015 -0.325 -0.682 -1.083 -1.306 -1.891 -1.988 -2.234 -2.499 -3.107 -3.426 -3.769 -4.166 -4.632 -5.196 -5.893 -7.7 -2 ,16982 ,TETRA ,17524234,Wed Nov 24 21:50:52 CET,Wed Nov 24 23:21:48 CET,0.0 1.621 2.258 2.701 3.042 3.339 3.624 3.885 4.319 4.503 4.685 4.684 5.198 5.358 5.656 5.923 6.175 6.294 6.521 6.731 7.037 7.232 7.429 7.736 8.03 8.295 8.523 8.751 9.051 9.323 9.594 9.92 10.192 10.428 10.717 11.027 11.288 11.583 11.902 12.194 12.466 12.776 13.15 13.524 13.909 14.29 14.692 15.065 15.406 15.609 15.464 14.869 14.169 13.462 12.784 12.125 11.44 10.778 10.204 9.623 9.116 8.67 8.246 7.796 7.353 6.923 6.453 6.022 5.66 5.309 4.938 4.613 4.271 3.911 3.631 3.348 3.043 2.712 2.367 2.135 1.901 1.507 1.209 0.895 0.741 0.437 0.11 -0.257 -0.448 -1.002 -1.068 -1.294 -1.534 -2.087 -2.383 -2.7 -3.098 -3.591 -4.172 -4.887 -6.831 -3 ,15864 ,TETRA ,17524235,Wed Nov 24 21:50:57 CET,Wed Nov 24 23:22:14 CET,0.0 1.51 2.084 2.481 2.804 3.082 3.319 3.556 4.019 4.24 4.44 4.489 5.036 5.205 5.468 5.731 5.986 6.106 6.327 6.531 6.811 6.992 7.19 7.477 7.743 7.997 8.226 8.447 8.745 9.011 9.251 9.534 9.791 10.025 10.279 10.564 10.843 11.137 11.447 11.768 12.07 12.374 12.725 13.073 13.436 13.793 14.136 14.43 14.754 15.008 14.94 14.419 13.681 12.908 12.186 11.523 10.914 10.298 9.726 9.115 8.6 8.126 7.657 7.217 6.758 6.338 5.877 5.44 5.085 4.719 4.324 3.999 3.669 3.326 3.049 2.741 2.4 2.056 1.702 1.454 1.205 0.797 0.499 0.19 0.026 -0.319 -0.682 -1.07 -1.28 -1.867 -1.947 -2.18 -2.43 -2.965 -3.267 -3.627 -4.021 -4.483 -5.062 -5.819 -7.658 -4 ,11097 ,TETRA ,17524237,Wed Nov 24 21:50:55 CET,Wed Nov 24 23:22:17 CET,0.0 1.11 1.633 2.029 2.388 2.725 3.003 3.234 3.637 3.834 4.021 3.979 4.493 4.652 4.956 5.233 5.485 5.602 5.832 6.047 6.335 6.52 6.71 6.979 7.226 7.45 7.66 7.861 8.108 8.344 8.588 8.878 9.142 9.397 9.681 9.987 10.254 10.536 10.855 11.18 11.495 11.85 12.236 12.586 12.954 13.33 13.718 14.084 14.413 14.606 14.48 13.933 13.304 12.622 11.886 11.178 10.539 9.91 9.342 8.761 8.26 7.805 7.354 6.903 6.482 6.117 5.698 5.285 4.954 4.606 4.205 3.871 3.523 3.159 2.876 2.56 2.225 1.895 1.541 1.296 1.039 0.598 0.299 -0.008 -0.181 -0.52 -0.857 -1.235 -1.434 -1.989 -2.043 -2.273 -2.513 -3.093 -3.438 -3.822 -4.24 -4.667 -5.14 -5.826 -7.937 -5 ,3370 ,TETRA ,17524240,Wed Nov 24 21:50:57 CET,Wed Nov 24 23:25:28 CET,0.0 1.346 1.846 2.24 2.546 2.837 3.112 3.358 3.769 3.958 4.145 4.12 4.633 4.788 5.071 5.353 5.627 5.75 5.984 6.205 6.504 6.701 6.908 7.189 7.447 7.685 7.909 8.124 8.397 8.657 8.893 9.171 9.409 9.628 9.89 10.202 10.496 10.818 11.165 11.483 11.805 12.174 12.547 12.88 13.253 13.638 14.051 14.434 14.767 14.941 14.766 14.151 13.4 12.635 11.934 11.252 10.616 9.998 9.418 8.839 8.33 7.858 7.409 6.982 6.557 6.148 5.721 5.335 4.974 4.554 4.123 3.809 3.47 3.091 2.815 2.533 2.214 1.87 1.51 1.275 1.046 0.665 0.37 0.057 -0.095 -0.418 -0.773 -1.164 -1.365 -1.945 -2.056 -2.323 -2.609 -3.277 -3.638 -3.991 -4.382 -4.809 -5.309 -5.997 -8.16 -6 ,24013 ,TETRA ,17524243,Wed Nov 24 21:50:55 CET,Wed Nov 24 23:22:34 CET,0.0 1.372 1.875 2.291 2.65 2.957 3.222 3.452 3.846 4.035 4.233 4.267 4.799 4.948 5.255 5.537 5.777 5.894 6.143 6.384 6.703 6.907 7.106 7.378 7.618 7.864 8.127 8.369 8.656 8.906 9.135 9.438 9.701 9.931 10.224 10.541 10.826 11.122 11.427 11.738 12.033 12.326 12.672 13.024 13.395 13.77 14.155 14.516 14.854 15.104 14.957 14.349 13.623 12.853 12.142 11.447 10.794 10.181 9.622 9.052 8.538 8.04 7.558 7.122 6.696 6.295 5.883 5.515 5.193 4.845 4.466 4.134 3.773 3.395 3.1 2.805 2.504 2.167 1.807 1.549 1.285 0.885 0.594 0.287 0.132 -0.238 -0.633 -1.031 -1.241 -1.822 -1.917 -2.16 -2.416 -3.017 -3.364 -3.731 -4.136 -4.612 -5.191 -5.988 -8.549 -7 ,20327 ,TETRA ,17524245,Wed Nov 24 21:50:55 CET,Wed Nov 24 23:22:50 CET,0.0 1.317 1.846 2.294 2.659 2.959 3.238 3.48 3.926 4.14 4.333 4.346 4.874 5.028 5.326 5.614 5.88 6.011 6.274 6.513 6.846 7.066 7.256 7.502 7.738 7.966 8.183 8.38 8.641 8.883 9.095 9.36 9.62 9.863 10.144 10.461 10.754 11.075 11.397 11.708 12.035 12.354 12.701 13.067 13.487 13.845 14.176 14.531 14.834 15.022 14.946 14.409 13.657 12.868 12.1 11.36 10.712 10.124 9.603 9.059 8.569 8.114 7.671 7.211 6.757 6.356 5.943 5.574 5.246 4.905 4.549 4.235 3.894 3.534 3.25 2.968 2.642 2.293 1.965 1.728 1.466 1.041 0.741 0.433 0.278 -0.069 -0.461 -0.849 -1.045 -1.627 -1.71 -1.939 -2.183 -2.74 -3.08 -3.459 -3.85 -4.264 -4.767 -5.46 -7.374 -8 ,14511 ,TETRA ,17524247,Wed Nov 24 21:50:55 CET,Wed Nov 24 23:22:27 CET,0.0 1.377 1.902 2.309 2.637 2.897 3.15 3.394 3.828 4.034 4.23 4.236 4.755 4.918 5.203 5.464 5.711 5.826 6.063 6.295 6.594 6.784 6.974 7.243 7.494 7.735 7.963 8.176 8.465 8.726 8.964 9.246 9.526 9.812 10.132 10.507 10.825 11.098 11.393 11.71 12.027 12.35 12.749 13.137 13.531 13.942 14.337 14.704 14.995 15.149 15.048 14.501 13.801 13.039 12.286 11.553 10.872 10.237 9.683 9.127 8.605 8.099 7.602 7.14 6.704 6.281 5.845 5.442 5.039 4.623 4.212 3.889 3.564 3.198 2.895 2.578 2.255 1.925 1.58 1.337 1.082 0.672 0.4 0.111 -0.043 -0.379 -0.755 -1.145 -1.349 -1.932 -2.053 -2.294 -2.543 -3.11 -3.434 -3.792 -4.19 -4.651 -5.207 -5.946 -8.411 -9 ,31970 ,TETRA ,17524248,Wed Nov 24 21:50:56 CET,Wed Nov 24 23:22:17 CET,0.0 1.496 2.044 2.466 2.802 3.071 3.317 3.553 3.981 4.174 4.353 4.326 4.844 5.007 5.303 5.563 5.817 5.944 6.191 6.42 6.736 6.938 7.13 7.402 7.657 7.88 8.095 8.316 8.599 8.863 9.098 9.366 9.628 9.863 10.119 10.403 10.7 11.008 11.341 11.677 11.999 12.355 12.715 13.077 13.461 13.837 14.223 14.542 14.825 15.061 14.954 14.277 13.513 12.761 11.989 11.29 10.691 10.093 9.554 8.999 8.511 8.067 7.603 7.129 6.692 6.293 5.864 5.473 5.13 4.778 4.402 4.066 3.708 3.323 3.024 2.736 2.409 2.037 1.645 1.38 1.11 0.696 0.408 0.096 -0.07 -0.415 -0.751 -1.098 -1.287 -1.859 -1.973 -2.221 -2.473 -3.037 -3.357 -3.716 -4.129 -4.593 -5.12 -5.838 -7.752 -10 ,21614 ,TETRA ,17524249,Wed Nov 24 21:50:57 CET,Wed Nov 24 23:22:41 CET,0.0 1.086 1.556 1.969 2.364 2.706 2.977 3.223 3.651 3.829 3.997 3.964 4.496 4.652 4.935 5.2 5.451 5.577 5.817 6.035 6.318 6.507 6.703 6.974 7.212 7.439 7.663 7.867 8.107 8.371 8.634 8.913 9.194 9.492 9.813 10.133 10.449 10.777 11.064 11.354 11.656 11.983 12.369 12.721 13.106 13.475 13.831 14.18 14.477 14.669 14.56 14.013 13.274 12.547 11.842 11.106 10.441 9.818 9.261 8.701 8.221 7.771 7.296 6.83 6.408 6.013 5.563 5.169 4.836 4.477 4.074 3.71 3.36 3.008 2.735 2.455 2.149 1.828 1.485 1.242 0.99 0.617 0.359 0.075 -0.082 -0.415 -0.754 -1.13 -1.331 -1.89 -1.964 -2.23 -2.509 -3.059 -3.373 -3.731 -4.103 -4.545 -5.096 -5.79 -7.588 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23466.txt deleted file mode 100644 index f22f9bc4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31605 ,KEBNE ,17019491,Wed Dec 22 02:50:24 CET,Wed Dec 22 04:09:36 CET,0.0 1.314 1.87 2.27 2.621 2.998 3.349 3.648 4.121 4.339 4.547 4.55 5.112 5.299 5.669 6.011 6.339 6.494 6.782 7.067 7.504 7.771 8.021 8.393 8.75 9.087 9.393 9.704 10.117 10.496 10.879 11.336 11.739 12.13 12.592 13.092 13.57 14.125 14.724 15.316 15.894 16.587 17.405 18.149 19.055 20.094 21.268 22.572 24.028 25.62 27.444 28.832 29.399 29.498 29.428 29.267 28.98 28.638 28.327 27.974 27.624 27.255 26.882 26.523 26.174 25.863 25.509 25.163 24.871 24.562 24.194 23.85 23.491 23.11 22.808 22.479 22.131 21.781 21.381 21.1 20.795 20.316 20.004 19.667 19.484 19.089 18.669 18.218 17.975 17.36 17.175 16.888 16.583 15.934 15.597 15.168 14.641 14.07 13.409 12.442 7.761 -2 ,28639 ,KEBNE ,17019492,Wed Dec 22 02:50:35 CET,Wed Dec 22 04:09:40 CET,0.0 1.701 2.254 2.72 3.081 3.41 3.7 3.961 4.455 4.679 4.886 4.894 5.485 5.682 6.062 6.434 6.783 6.94 7.24 7.521 7.92 8.181 8.429 8.778 9.123 9.453 9.778 10.094 10.491 10.888 11.256 11.686 12.122 12.527 12.98 13.467 13.93 14.441 15.006 15.619 16.255 16.941 17.722 18.539 19.462 20.456 21.64 22.953 24.438 26.149 28.029 29.167 29.494 29.521 29.451 29.301 29.043 28.722 28.407 28.067 27.723 27.392 27.079 26.76 26.437 26.105 25.708 25.358 25.067 24.744 24.394 24.092 23.76 23.396 23.115 22.806 22.487 22.138 21.74 21.478 21.201 20.771 20.479 20.15 19.978 19.614 19.221 18.805 18.579 17.966 17.823 17.551 17.242 16.593 16.203 15.704 15.141 14.54 13.824 12.842 7.724 -3 ,16175 ,KEBNE ,17019493,Wed Dec 22 02:50:35 CET,Wed Dec 22 04:11:00 CET,0.0 1.272 1.846 2.297 2.673 3.016 3.352 3.652 4.154 4.387 4.59 4.588 5.153 5.33 5.733 6.142 6.484 6.63 6.903 7.158 7.555 7.817 8.063 8.4 8.749 9.11 9.428 9.737 10.167 10.541 10.875 11.303 11.712 12.103 12.544 13.036 13.506 14.032 14.596 15.185 15.814 16.496 17.265 18.054 18.962 19.969 21.114 22.444 24.043 25.738 27.517 28.659 29.089 29.236 29.172 28.974 28.737 28.439 28.096 27.715 27.355 27.025 26.69 26.312 25.932 25.599 25.265 24.975 24.696 24.37 24.015 23.693 23.363 23.017 22.732 22.43 22.1 21.738 21.337 21.059 20.769 20.289 19.95 19.61 19.438 19.096 18.669 18.168 17.926 17.312 17.152 16.864 16.555 15.862 15.468 15.059 14.589 14.003 13.245 12.19 6.662 -4 ,4810 ,KEBNE ,17019494,Wed Dec 22 02:50:35 CET,Wed Dec 22 04:09:35 CET,0.0 1.398 2.018 2.48 2.858 3.189 3.476 3.729 4.185 4.404 4.626 4.67 5.26 5.444 5.777 6.096 6.408 6.558 6.843 7.121 7.525 7.779 8.037 8.39 8.71 9.026 9.324 9.622 10.014 10.377 10.715 11.116 11.499 11.876 12.341 12.847 13.375 13.965 14.511 15.071 15.655 16.337 17.129 17.907 18.823 19.855 20.999 22.303 23.811 25.459 27.225 28.461 29.009 29.147 29.011 28.715 28.448 28.192 27.89 27.528 27.196 26.87 26.54 26.17 25.789 25.419 25.002 24.648 24.326 23.991 23.656 23.373 23.051 22.703 22.431 22.109 21.775 21.434 21.074 20.821 20.558 20.143 19.839 19.538 19.371 18.989 18.588 18.158 17.938 17.34 17.15 16.864 16.558 15.823 15.427 15.004 14.527 13.972 13.258 12.278 8.296 -5 ,7655 ,KEBNE ,17019495,Wed Dec 22 03:00:17 CET,Wed Dec 22 04:19:30 CET,0.0 2.11 2.739 3.2 3.573 3.87 4.144 4.406 4.886 5.117 5.34 5.356 5.931 6.119 6.486 6.88 7.249 7.411 7.733 8.036 8.485 8.777 9.051 9.425 9.788 10.153 10.479 10.786 11.181 11.59 11.993 12.425 12.846 13.259 13.726 14.237 14.73 15.261 15.824 16.427 17.065 17.753 18.521 19.339 20.296 21.313 22.452 23.701 25.188 26.864 28.612 29.808 30.34 30.52 30.453 30.278 30.03 29.722 29.389 29.013 28.686 28.339 27.968 27.624 27.321 27.006 26.629 26.303 25.998 25.621 25.227 24.932 24.615 24.27 23.996 23.702 23.389 23.043 22.667 22.391 22.122 21.682 21.352 21.02 20.836 20.44 20.022 19.6 19.361 18.727 18.559 18.279 17.975 17.241 16.765 16.303 15.813 15.201 14.451 13.43 7.971 -6 ,5908 ,KEBNE ,17019496,Wed Dec 22 03:00:17 CET,Wed Dec 22 04:20:32 CET,0.0 1.388 2.027 2.494 2.891 3.235 3.544 3.834 4.339 4.578 4.811 4.869 5.446 5.617 5.954 6.303 6.625 6.768 7.043 7.313 7.71 7.975 8.234 8.609 8.971 9.299 9.613 9.916 10.338 10.744 11.098 11.532 11.966 12.371 12.811 13.276 13.719 14.232 14.788 15.374 15.972 16.658 17.478 18.279 19.195 20.213 21.374 22.659 24.155 25.861 27.734 29.056 29.578 29.662 29.505 29.31 29.1 28.829 28.567 28.25 27.92 27.564 27.194 26.843 26.495 26.148 25.783 25.459 25.149 24.8 24.414 24.118 23.823 23.462 23.144 22.823 22.481 22.093 21.723 21.474 21.205 20.758 20.452 20.105 19.909 19.516 19.093 18.612 18.349 17.731 17.54 17.261 16.958 16.307 15.936 15.51 14.991 14.384 13.683 12.689 8.502 -7 ,29370 ,KEBNE ,17019497,Wed Dec 22 03:00:17 CET,Wed Dec 22 04:19:22 CET,0.0 1.054 1.62 2.077 2.473 2.836 3.178 3.469 3.995 4.257 4.505 4.571 5.155 5.347 5.703 6.057 6.42 6.573 6.847 7.127 7.566 7.847 8.096 8.431 8.763 9.086 9.379 9.667 10.035 10.389 10.745 11.176 11.578 11.973 12.428 12.921 13.403 13.935 14.51 15.091 15.696 16.39 17.168 17.908 18.747 19.663 20.754 22.078 23.569 25.217 27.095 28.246 28.638 28.708 28.616 28.477 28.284 28.031 27.726 27.352 26.989 26.617 26.262 25.918 25.576 25.229 24.855 24.533 24.225 23.867 23.459 23.143 22.862 22.539 22.258 21.969 21.647 21.273 20.868 20.612 20.358 19.928 19.632 19.32 19.151 18.767 18.337 17.9 17.654 17.022 16.855 16.583 16.294 15.621 15.245 14.812 14.296 13.737 13.075 12.09 8.145 -8 ,24431 ,KEBNE ,17019498,Wed Dec 22 03:00:39 CET,Wed Dec 22 04:19:46 CET,0.0 1.111 1.662 2.129 2.499 2.813 3.123 3.414 3.911 4.153 4.379 4.392 4.978 5.169 5.526 5.893 6.234 6.394 6.708 6.998 7.413 7.674 7.919 8.285 8.663 9.02 9.354 9.681 10.08 10.44 10.786 11.21 11.637 12.045 12.5 13.003 13.473 13.961 14.465 15.019 15.627 16.298 17.059 17.8 18.679 19.668 20.782 22.03 23.507 25.233 27.022 28.17 28.648 28.789 28.757 28.58 28.35 28.098 27.824 27.469 27.106 26.777 26.454 26.133 25.788 25.456 25.088 24.732 24.417 24.055 23.685 23.37 23.025 22.66 22.342 22.028 21.716 21.368 21.01 20.754 20.483 19.982 19.62 19.269 19.08 18.688 18.252 17.782 17.55 16.948 16.784 16.486 16.175 15.444 15.046 14.623 14.132 13.59 12.917 12.119 8.318 -9 ,23246 ,KEBNE ,17019499,Wed Dec 22 03:00:39 CET,Wed Dec 22 04:21:01 CET,0.0 2.008 2.705 3.171 3.566 3.887 4.17 4.448 4.971 5.223 5.473 5.532 6.122 6.31 6.677 7.029 7.352 7.509 7.833 8.14 8.539 8.777 9.014 9.381 9.73 10.059 10.387 10.699 11.076 11.445 11.806 12.214 12.623 13.042 13.493 13.962 14.402 14.906 15.462 16.043 16.667 17.354 18.134 18.933 19.865 20.887 22.07 23.391 24.911 26.64 28.521 29.809 30.295 30.347 30.178 29.95 29.703 29.42 29.113 28.738 28.412 28.108 27.778 27.422 27.056 26.715 26.33 25.973 25.649 25.295 24.93 24.619 24.286 23.94 23.672 23.37 23.036 22.693 22.323 22.031 21.725 21.289 20.976 20.651 20.474 20.07 19.666 19.259 19.042 18.449 18.302 18.025 17.745 17.083 16.709 16.321 15.876 15.296 14.546 13.534 8.843 -10 ,21331 ,KEBNE ,17019500,Wed Dec 22 03:00:39 CET,Wed Dec 22 04:19:44 CET,0.0 1.244 1.817 2.26 2.634 2.969 3.253 3.503 3.999 4.24 4.465 4.501 5.081 5.26 5.624 5.981 6.28 6.428 6.719 7.0 7.432 7.708 7.969 8.335 8.689 9.034 9.34 9.632 10.014 10.37 10.725 11.157 11.577 11.973 12.426 12.955 13.462 13.998 14.567 15.161 15.769 16.459 17.265 18.048 18.923 19.897 21.068 22.405 23.919 25.57 27.345 28.674 29.232 29.358 29.258 29.036 28.795 28.497 28.184 27.882 27.563 27.218 26.892 26.587 26.281 25.982 25.617 25.266 24.966 24.645 24.301 23.996 23.66 23.284 22.987 22.665 22.331 21.972 21.59 21.343 21.076 20.636 20.322 19.994 19.821 19.463 19.079 18.674 18.458 17.856 17.692 17.416 17.124 16.464 16.082 15.687 15.275 14.743 14.059 13.091 9.733 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23471.txt deleted file mode 100644 index 726b0599..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3618 ,KEBNE ,17043856,Thu Dec 23 05:34:15 CET,Thu Dec 23 06:55:19 CET,0.0 1.75 2.432 2.908 3.319 3.656 3.97 4.288 4.864 5.136 5.396 5.45 6.03 6.235 6.642 7.034 7.399 7.569 7.884 8.177 8.596 8.854 9.106 9.481 9.844 10.204 10.528 10.811 11.175 11.548 11.918 12.341 12.722 13.076 13.478 13.897 14.285 14.733 15.199 15.668 16.166 16.709 17.279 17.831 18.43 19.025 19.683 20.321 20.916 21.428 21.618 21.231 20.643 19.966 19.247 18.55 17.929 17.344 16.786 16.195 15.67 15.155 14.631 14.158 13.708 13.284 12.84 12.393 11.985 11.585 11.153 10.785 10.428 10.068 9.762 9.44 9.139 8.804 8.424 8.154 7.873 7.45 7.151 6.833 6.671 6.323 5.928 5.508 5.308 4.729 4.687 4.447 4.203 3.655 3.322 2.952 2.539 2.047 1.392 0.461 -2.239 -2 ,21629 ,KEBNE ,17043857,Thu Dec 23 05:34:15 CET,Thu Dec 23 06:54:03 CET,0.0 3.361 4.117 4.589 5.019 5.401 5.733 6.045 6.628 6.922 7.196 7.289 7.891 8.093 8.468 8.825 9.156 9.306 9.605 9.901 10.318 10.582 10.844 11.215 11.563 11.907 12.23 12.529 12.914 13.266 13.604 14.061 14.487 14.84 15.228 15.687 16.126 16.568 17.004 17.453 17.929 18.458 19.043 19.588 20.177 20.774 21.408 22.085 22.758 23.306 23.546 23.161 22.549 21.875 21.162 20.473 19.839 19.232 18.65 17.998 17.465 17.017 16.564 16.105 15.649 15.219 14.781 14.392 14.053 13.688 13.307 12.972 12.601 12.22 11.923 11.619 11.317 11.01 10.677 10.434 10.174 9.756 9.467 9.172 9.019 8.686 8.323 7.917 7.707 7.119 7.024 6.746 6.475 5.927 5.608 5.247 4.898 4.48 3.943 3.324 1.42 -3 ,18605 ,KEBNE ,17043858,Thu Dec 23 05:34:15 CET,Thu Dec 23 06:54:22 CET,0.0 1.104 1.693 2.183 2.604 2.995 3.358 3.7 4.264 4.495 4.734 4.797 5.399 5.603 5.985 6.35 6.691 6.858 7.176 7.467 7.867 8.12 8.387 8.767 9.133 9.487 9.807 10.121 10.525 10.919 11.3 11.724 12.153 12.567 12.988 13.448 13.885 14.346 14.804 15.289 15.777 16.329 16.961 17.518 18.09 18.693 19.351 19.937 20.503 21.003 21.231 20.868 20.247 19.596 18.947 18.264 17.548 16.85 16.207 15.534 14.952 14.444 13.955 13.488 13.067 12.666 12.188 11.738 11.364 11.0 10.612 10.265 9.893 9.514 9.233 8.938 8.62 8.291 7.926 7.658 7.389 6.973 6.673 6.351 6.189 5.848 5.487 5.117 4.916 4.316 4.234 3.962 3.683 3.088 2.745 2.385 1.982 1.502 0.914 0.113 -2.593 -4 ,12380 ,KEBNE ,17043859,Thu Dec 23 05:34:15 CET,Thu Dec 23 06:54:04 CET,0.0 1.372 2.018 2.493 2.913 3.336 3.726 4.079 4.67 4.927 5.167 5.254 5.846 6.048 6.438 6.805 7.178 7.356 7.674 7.976 8.407 8.681 8.96 9.351 9.711 10.075 10.437 10.788 11.198 11.597 11.99 12.448 12.862 13.21 13.613 14.069 14.489 14.944 15.429 15.89 16.33 16.808 17.364 17.921 18.517 19.115 19.766 20.418 21.001 21.491 21.68 21.246 20.584 19.869 19.142 18.468 17.864 17.289 16.747 16.136 15.588 15.11 14.624 14.136 13.674 13.245 12.759 12.312 11.954 11.601 11.211 10.853 10.481 10.108 9.815 9.488 9.146 8.8 8.421 8.157 7.881 7.452 7.152 6.833 6.665 6.319 5.967 5.603 5.404 4.808 4.748 4.482 4.188 3.504 3.118 2.743 2.35 1.929 1.44 0.756 -1.178 -5 ,659 ,KEBNE ,17043860,Thu Dec 23 05:34:14 CET,Thu Dec 23 06:53:42 CET,0.0 1.937 2.608 3.141 3.6 4.011 4.368 4.674 5.204 5.46 5.709 5.786 6.383 6.585 6.967 7.333 7.706 7.881 8.196 8.505 8.92 9.18 9.433 9.811 10.195 10.536 10.84 11.138 11.508 11.855 12.202 12.605 12.988 13.354 13.76 14.209 14.635 15.076 15.571 16.094 16.581 17.107 17.722 18.297 18.915 19.547 20.179 20.814 21.433 21.992 22.25 21.922 21.309 20.627 20.007 19.363 18.705 18.06 17.412 16.757 16.185 15.622 15.111 14.628 14.151 13.718 13.266 12.852 12.502 12.125 11.694 11.325 10.959 10.571 10.266 9.947 9.599 9.238 8.86 8.592 8.33 7.944 7.649 7.325 7.162 6.783 6.349 5.889 5.66 5.057 4.99 4.752 4.506 3.966 3.659 3.326 2.934 2.478 1.965 1.308 -0.702 -6 ,23296 ,KEBNE ,17043861,Thu Dec 23 05:34:14 CET,Thu Dec 23 06:53:48 CET,0.0 2.534 3.348 3.899 4.333 4.71 5.083 5.431 6.041 6.328 6.589 6.661 7.272 7.472 7.83 8.193 8.536 8.695 8.998 9.287 9.71 9.981 10.26 10.68 11.052 11.38 11.719 12.06 12.458 12.821 13.175 13.587 13.984 14.375 14.794 15.239 15.672 16.118 16.552 17.008 17.504 18.055 18.682 19.272 19.871 20.484 21.157 21.788 22.349 22.89 23.167 22.836 22.277 21.635 20.972 20.319 19.674 19.044 18.479 17.897 17.395 16.939 16.485 16.038 15.614 15.23 14.815 14.416 14.049 13.669 13.273 12.94 12.58 12.211 11.902 11.564 11.23 10.871 10.505 10.27 10.034 9.64 9.353 9.056 8.895 8.552 8.21 7.853 7.655 7.059 7.017 6.774 6.517 5.974 5.656 5.309 4.93 4.492 4.002 3.271 0.669 -7 ,8300 ,KEBNE ,17043862,Thu Dec 23 05:35:18 CET,Thu Dec 23 06:56:51 CET,0.0 1.755 2.362 2.903 3.336 3.676 3.986 4.27 4.807 5.063 5.303 5.377 5.997 6.214 6.594 6.962 7.316 7.495 7.843 8.149 8.549 8.794 9.055 9.437 9.793 10.127 10.43 10.712 11.103 11.501 11.846 12.243 12.644 13.004 13.415 13.86 14.264 14.74 15.227 15.691 16.158 16.701 17.301 17.837 18.472 19.159 19.838 20.454 21.072 21.613 21.812 21.46 20.895 20.234 19.55 18.854 18.149 17.455 16.847 16.23 15.673 15.154 14.663 14.175 13.687 13.221 12.729 12.325 11.994 11.621 11.201 10.854 10.493 10.097 9.773 9.429 9.076 8.718 8.349 8.1 7.848 7.436 7.134 6.835 6.662 6.265 5.853 5.416 5.176 4.528 4.437 4.215 3.973 3.396 3.071 2.733 2.336 1.853 1.331 0.68 -2.035 -8 ,6012 ,KEBNE ,17043863,Thu Dec 23 05:34:15 CET,Thu Dec 23 06:53:44 CET,0.0 2.019 2.763 3.341 3.76 4.109 4.434 4.735 5.315 5.568 5.793 5.845 6.437 6.633 7.023 7.393 7.728 7.898 8.22 8.517 8.944 9.224 9.495 9.861 10.184 10.495 10.801 11.109 11.538 11.95 12.316 12.728 13.126 13.484 13.875 14.337 14.783 15.24 15.715 16.209 16.689 17.225 17.825 18.37 18.959 19.565 20.262 20.94 21.522 22.034 22.211 21.847 21.287 20.609 19.859 19.15 18.525 17.931 17.387 16.794 16.277 15.821 15.382 14.952 14.54 14.105 13.554 13.062 12.665 12.254 11.802 11.4 10.979 10.535 10.214 9.911 9.589 9.236 8.857 8.598 8.332 7.927 7.636 7.327 7.157 6.792 6.435 6.056 5.843 5.246 5.221 4.992 4.755 4.208 3.884 3.553 3.199 2.798 2.284 1.627 -0.197 -9 ,27614 ,KEBNE ,17043864,Thu Dec 23 05:34:15 CET,Thu Dec 23 06:54:00 CET,0.0 2.208 2.882 3.384 3.831 4.179 4.486 4.775 5.346 5.61 5.86 5.952 6.551 6.762 7.166 7.531 7.874 8.044 8.366 8.672 9.096 9.358 9.617 9.984 10.332 10.674 11.0 11.312 11.701 12.054 12.399 12.822 13.23 13.606 14.025 14.494 14.948 15.424 15.893 16.358 16.818 17.324 17.938 18.526 19.126 19.712 20.338 21.021 21.648 22.153 22.364 21.974 21.341 20.638 19.988 19.328 18.662 18.073 17.525 16.91 16.364 15.87 15.414 14.936 14.478 14.074 13.64 13.222 12.85 12.477 12.102 11.789 11.434 11.043 10.741 10.421 10.068 9.71 9.337 9.078 8.823 8.402 8.094 7.792 7.631 7.286 6.929 6.527 6.315 5.708 5.642 5.405 5.163 4.619 4.307 3.971 3.585 3.145 2.618 1.931 0.071 -10 ,32493 ,KEBNE ,17043865,Thu Dec 23 05:34:15 CET,Thu Dec 23 06:54:46 CET,0.0 1.894 2.532 3.091 3.552 3.941 4.285 4.607 5.17 5.431 5.681 5.752 6.358 6.578 6.997 7.393 7.773 7.947 8.263 8.571 9.03 9.319 9.573 9.901 10.226 10.533 10.825 11.129 11.525 11.885 12.24 12.665 13.036 13.4 13.818 14.258 14.677 15.117 15.571 16.031 16.503 17.005 17.557 18.095 18.711 19.36 20.01 20.634 21.203 21.698 21.91 21.5 20.878 20.177 19.526 18.887 18.26 17.67 17.151 16.596 16.084 15.599 15.107 14.658 14.248 13.835 13.39 12.994 12.631 12.25 11.848 11.491 11.105 10.717 10.41 10.088 9.744 9.377 9.006 8.756 8.503 8.094 7.796 7.486 7.326 6.969 6.588 6.21 6.015 5.415 5.376 5.135 4.884 4.362 4.061 3.738 3.352 2.859 2.243 1.454 -0.683 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index f67ff869..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13672 ,TETRA ,17524259,Wed Nov 24 21:51:22 CET,Wed Nov 24 23:25:46 CET,0.0 1.915 2.398 2.801 3.146 3.433 3.699 3.959 4.424 4.635 4.847 4.89 5.458 5.614 5.914 6.221 6.512 6.652 6.924 7.183 7.572 7.819 8.048 8.365 8.671 8.964 9.235 9.501 9.867 10.202 10.5 10.844 11.192 11.573 11.998 12.428 12.821 13.229 13.658 14.126 14.593 15.124 15.746 16.31 16.934 17.569 18.27 19.046 19.832 20.575 21.072 20.923 20.443 19.855 19.28 18.682 18.055 17.466 16.933 16.348 15.827 15.356 14.862 14.403 13.974 13.543 13.091 12.695 12.348 11.977 11.617 11.32 10.99 10.633 10.339 10.015 9.668 9.327 8.971 8.721 8.473 8.083 7.801 7.497 7.343 7.023 6.667 6.286 6.093 5.519 5.474 5.244 5.01 4.491 4.181 3.87 3.559 3.198 2.76 2.217 0.612 -2 ,11330 ,TETRA ,17524260,Wed Nov 24 21:51:27 CET,Wed Nov 24 23:25:39 CET,0.0 1.203 1.664 2.075 2.496 2.854 3.125 3.392 3.889 4.101 4.288 4.29 4.872 5.072 5.448 5.777 6.089 6.252 6.572 6.881 7.294 7.536 7.763 8.091 8.422 8.736 9.047 9.349 9.717 10.063 10.391 10.767 11.124 11.457 11.845 12.3 12.709 13.125 13.562 14.012 14.501 15.046 15.652 16.229 16.862 17.546 18.273 19.005 19.734 20.413 20.789 20.455 19.916 19.354 18.76 18.097 17.462 16.882 16.351 15.774 15.252 14.77 14.315 13.849 13.4 12.999 12.536 12.132 11.785 11.388 10.965 10.594 10.224 9.871 9.574 9.293 9.013 8.684 8.33 8.081 7.819 7.388 7.084 6.791 6.638 6.298 5.941 5.585 5.403 4.842 4.784 4.561 4.34 3.846 3.562 3.257 2.916 2.514 2.058 1.547 0.596 -3 ,16638 ,TETRA ,17524261,Wed Nov 24 21:51:24 CET,Wed Nov 24 23:26:33 CET,0.0 1.502 2.094 2.533 2.885 3.226 3.568 3.879 4.375 4.598 4.801 4.793 5.353 5.527 5.868 6.192 6.482 6.621 6.908 7.188 7.562 7.793 8.016 8.338 8.656 8.973 9.26 9.521 9.86 10.199 10.523 10.919 11.281 11.626 12.034 12.439 12.817 13.26 13.734 14.191 14.657 15.182 15.764 16.314 16.956 17.624 18.302 19.027 19.81 20.499 20.894 20.665 20.063 19.372 18.685 18.011 17.34 16.671 16.107 15.497 14.954 14.477 14.003 13.568 13.154 12.748 12.33 11.959 11.62 11.283 10.91 10.583 10.263 9.929 9.649 9.342 9.021 8.702 8.371 8.142 7.899 7.515 7.236 6.923 6.77 6.477 6.147 5.772 5.582 5.019 4.959 4.721 4.465 3.864 3.55 3.244 2.94 2.611 2.185 1.583 -0.19 -4 ,21167 ,TETRA ,17524263,Wed Nov 24 21:51:24 CET,Wed Nov 24 23:25:54 CET,0.0 1.468 2.076 2.567 3.013 3.418 3.764 4.044 4.562 4.819 5.048 5.104 5.693 5.88 6.247 6.588 6.904 7.057 7.346 7.632 8.034 8.283 8.532 8.913 9.253 9.543 9.833 10.131 10.546 10.919 11.247 11.658 12.044 12.407 12.831 13.29 13.71 14.153 14.635 15.154 15.67 16.249 16.917 17.548 18.272 19.079 19.939 20.864 21.876 22.903 23.738 23.853 23.589 23.191 22.711 22.188 21.661 21.156 20.704 20.215 19.743 19.292 18.86 18.444 18.046 17.698 17.311 16.939 16.594 16.215 15.808 15.461 15.09 14.681 14.351 14.021 13.66 13.254 12.835 12.549 12.245 11.756 11.419 11.073 10.893 10.522 10.151 9.754 9.527 8.925 8.826 8.568 8.277 7.619 7.26 6.876 6.433 5.871 5.234 4.421 2.102 -5 ,9903 ,TETRA ,17524265,Wed Nov 24 21:51:28 CET,Wed Nov 24 23:25:41 CET,0.0 1.219 1.746 2.262 2.666 2.986 3.285 3.545 4.077 4.335 4.566 4.597 5.159 5.335 5.66 5.99 6.315 6.465 6.769 7.048 7.431 7.678 7.913 8.247 8.549 8.843 9.138 9.397 9.746 10.078 10.389 10.781 11.123 11.439 11.813 12.218 12.607 13.025 13.444 13.885 14.351 14.883 15.512 16.105 16.744 17.414 18.155 18.923 19.632 20.362 20.955 20.763 20.168 19.504 18.817 18.154 17.532 16.919 16.369 15.821 15.339 14.892 14.455 14.014 13.579 13.193 12.794 12.428 12.088 11.724 11.363 11.037 10.696 10.33 10.038 9.741 9.432 9.122 8.773 8.535 8.308 7.943 7.663 7.367 7.222 6.919 6.606 6.284 6.109 5.553 5.511 5.283 5.053 4.554 4.248 3.905 3.562 3.166 2.651 2.018 0.872 -6 ,28499 ,TETRA ,17524267,Wed Nov 24 21:51:28 CET,Wed Nov 24 23:25:25 CET,0.0 1.682 2.388 2.828 3.193 3.524 3.825 4.087 4.595 4.835 5.041 5.038 5.605 5.816 6.174 6.484 6.797 6.947 7.219 7.472 7.863 8.122 8.359 8.693 9.014 9.331 9.641 9.929 10.286 10.641 10.991 11.382 11.751 12.104 12.503 12.945 13.369 13.8 14.284 14.818 15.346 15.913 16.563 17.218 17.933 18.658 19.461 20.379 21.351 22.233 22.998 23.261 23.026 22.619 22.144 21.635 21.131 20.636 20.179 19.663 19.189 18.736 18.281 17.826 17.392 17.001 16.573 16.195 15.862 15.488 15.105 14.772 14.402 14.008 13.711 13.414 13.094 12.748 12.388 12.122 11.829 11.363 11.02 10.669 10.495 10.118 9.719 9.29 9.058 8.448 8.335 8.077 7.795 7.113 6.741 6.353 5.931 5.468 4.866 4.033 0.827 -7 ,6446 ,TETRA ,17524269,Wed Nov 24 21:51:24 CET,Wed Nov 24 23:27:46 CET,0.0 1.586 2.216 2.651 3.045 3.4 3.705 3.977 4.464 4.688 4.905 4.919 5.485 5.673 6.042 6.376 6.683 6.845 7.184 7.488 7.908 8.174 8.419 8.784 9.118 9.417 9.719 10.014 10.367 10.675 10.981 11.354 11.683 11.991 12.352 12.755 13.151 13.596 14.031 14.448 14.894 15.416 16.001 16.574 17.259 17.979 18.704 19.399 20.07 20.729 21.273 21.085 20.565 19.994 19.345 18.672 18.043 17.421 16.853 16.255 15.731 15.236 14.776 14.346 13.934 13.537 13.089 12.697 12.373 12.044 11.674 11.343 11.003 10.66 10.397 10.112 9.791 9.459 9.129 8.898 8.649 8.258 7.968 7.671 7.529 7.212 6.87 6.506 6.308 5.718 5.628 5.391 5.143 4.643 4.366 4.05 3.714 3.336 2.875 2.245 1.136 -8 ,20435 ,TETRA ,17524272,Wed Nov 24 21:52:22 CET,Wed Nov 24 23:11:46 CET,0.0 1.582 2.123 2.571 2.959 3.293 3.571 3.854 4.389 4.622 4.842 4.864 5.428 5.626 6.022 6.378 6.695 6.849 7.153 7.436 7.815 8.066 8.306 8.64 8.981 9.297 9.607 9.9 10.247 10.598 10.937 11.325 11.712 12.088 12.516 12.986 13.414 13.887 14.368 14.844 15.364 15.934 16.567 17.205 17.922 18.697 19.609 20.562 21.522 22.465 23.222 23.476 23.249 22.765 22.206 21.67 21.137 20.583 20.089 19.577 19.131 18.714 18.282 17.878 17.501 17.113 16.664 16.288 15.959 15.591 15.194 14.844 14.477 14.102 13.811 13.507 13.182 12.831 12.464 12.212 11.946 11.513 11.196 10.856 10.686 10.339 9.97 9.576 9.37 8.784 8.665 8.409 8.138 7.555 7.232 6.855 6.43 5.934 5.348 4.599 2.592 -9 ,26436 ,TETRA ,17524273,Wed Nov 24 21:55:22 CET,Wed Nov 24 23:29:43 CET,0.0 1.51 2.137 2.599 3.01 3.366 3.694 3.977 4.43 4.639 4.857 4.886 5.443 5.618 5.956 6.274 6.581 6.736 7.038 7.307 7.69 7.946 8.186 8.511 8.808 9.112 9.427 9.741 10.116 10.445 10.774 11.174 11.54 11.899 12.307 12.726 13.113 13.518 13.988 14.499 14.997 15.502 16.107 16.742 17.395 18.026 18.697 19.425 20.173 20.883 21.452 21.391 20.9 20.307 19.66 18.988 18.35 17.76 17.214 16.643 16.133 15.651 15.188 14.715 14.27 13.883 13.476 13.115 12.763 12.39 12.025 11.724 11.374 10.97 10.684 10.403 10.12 9.829 9.475 9.217 8.984 8.622 8.35 8.067 7.921 7.622 7.309 6.985 6.807 6.242 6.217 6.004 5.784 5.283 4.99 4.681 4.346 3.97 3.519 2.902 0.96 -10 ,14858 ,TETRA ,17524275,Wed Nov 24 21:55:23 CET,Wed Nov 24 23:30:54 CET,0.0 1.128 1.789 2.308 2.718 3.075 3.397 3.696 4.221 4.45 4.671 4.718 5.291 5.484 5.847 6.168 6.476 6.625 6.907 7.171 7.569 7.822 8.049 8.38 8.7 9.004 9.307 9.613 9.994 10.34 10.652 11.035 11.413 11.763 12.16 12.621 13.066 13.516 13.98 14.505 15.045 15.614 16.253 16.886 17.553 18.156 18.83 19.597 20.42 21.148 21.574 21.46 21.001 20.382 19.792 19.22 18.621 18.007 17.457 16.887 16.369 15.9 15.445 14.989 14.548 14.119 13.668 13.264 12.884 12.498 12.119 11.787 11.429 11.071 10.793 10.509 10.211 9.873 9.535 9.316 9.087 8.726 8.462 8.168 8.018 7.707 7.388 7.044 6.863 6.309 6.263 6.046 5.816 5.296 5.003 4.7 4.384 3.988 3.478 2.883 1.843 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23468.txt deleted file mode 100644 index c1340e2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11860 ,KEBNE ,17019501,Wed Dec 22 03:00:39 CET,Wed Dec 22 04:20:58 CET,0.0 2.126 2.798 3.31 3.742 4.091 4.436 4.771 5.336 5.596 5.855 5.942 6.538 6.735 7.089 7.411 7.724 7.869 8.135 8.401 8.756 8.986 9.218 9.536 9.84 10.148 10.437 10.688 11.004 11.319 11.585 11.876 12.171 12.44 12.726 13.076 13.422 13.745 14.073 14.436 14.783 15.194 15.653 16.029 16.442 16.845 17.226 17.554 17.811 17.846 17.383 16.378 15.274 14.219 13.25 12.338 11.512 10.689 9.946 9.202 8.559 7.97 7.382 6.836 6.311 5.814 5.291 4.808 4.375 3.941 3.471 3.061 2.653 2.203 1.865 1.525 1.138 0.74 0.326 0.026 -0.287 -0.783 -1.118 -1.457 -1.641 -2.041 -2.46 -2.889 -3.126 -3.779 -3.968 -4.256 -4.542 -5.175 -5.535 -5.939 -6.389 -6.888 -7.491 -8.271 -10.568 -2 ,13671 ,KEBNE ,17019502,Wed Dec 22 03:00:39 CET,Wed Dec 22 04:22:25 CET,0.0 1.719 2.458 2.924 3.35 3.721 4.042 4.334 4.85 5.078 5.289 5.327 5.897 6.075 6.417 6.748 7.051 7.194 7.483 7.762 8.146 8.376 8.58 8.868 9.188 9.505 9.786 10.065 10.417 10.735 11.035 11.369 11.693 12.021 12.382 12.753 13.099 13.484 13.84 14.176 14.512 14.874 15.288 15.667 16.089 16.487 16.827 17.143 17.402 17.473 17.043 15.982 14.845 13.756 12.75 11.806 10.974 10.184 9.433 8.676 8.03 7.393 6.784 6.234 5.715 5.234 4.716 4.255 3.831 3.38 2.928 2.538 2.112 1.671 1.321 0.942 0.555 0.155 -0.255 -0.538 -0.857 -1.362 -1.711 -2.081 -2.272 -2.667 -3.077 -3.504 -3.74 -4.363 -4.445 -4.703 -5.008 -5.676 -6.029 -6.414 -6.9 -7.465 -8.07 -8.937 -11.287 -3 ,18231 ,KEBNE ,17019503,Wed Dec 22 03:00:39 CET,Wed Dec 22 04:20:57 CET,0.0 1.987 2.581 3.072 3.467 3.814 4.125 4.41 4.947 5.19 5.402 5.434 6.018 6.213 6.545 6.849 7.163 7.322 7.619 7.895 8.303 8.567 8.8 9.136 9.45 9.723 9.978 10.229 10.568 10.89 11.184 11.548 11.891 12.183 12.501 12.874 13.234 13.571 13.926 14.3 14.657 15.043 15.48 15.851 16.222 16.616 17.026 17.372 17.577 17.552 17.078 16.049 14.945 13.923 12.974 12.085 11.245 10.404 9.672 8.953 8.337 7.781 7.197 6.63 6.135 5.646 5.102 4.636 4.247 3.823 3.377 2.999 2.562 2.092 1.717 1.32 0.928 0.523 0.083 -0.213 -0.528 -1.013 -1.354 -1.728 -1.919 -2.319 -2.734 -3.17 -3.407 -4.039 -4.183 -4.455 -4.741 -5.402 -5.775 -6.185 -6.62 -7.118 -7.746 -8.67 -11.198 -4 ,4298 ,KEBNE ,17019504,Wed Dec 22 03:00:40 CET,Wed Dec 22 04:21:01 CET,0.0 2.35 2.974 3.507 3.946 4.297 4.608 4.898 5.364 5.58 5.799 5.834 6.41 6.596 6.946 7.274 7.578 7.73 8.023 8.28 8.651 8.915 9.169 9.534 9.878 10.195 10.485 10.746 11.078 11.392 11.691 12.026 12.325 12.607 12.934 13.287 13.646 14.027 14.367 14.719 15.096 15.515 15.977 16.379 16.795 17.184 17.522 17.822 18.06 18.084 17.573 16.511 15.389 14.343 13.382 12.457 11.578 10.754 10.059 9.317 8.642 8.036 7.438 6.864 6.311 5.793 5.287 4.843 4.434 4.014 3.585 3.203 2.784 2.356 1.985 1.596 1.221 0.82 0.378 0.054 -0.285 -0.796 -1.141 -1.515 -1.716 -2.158 -2.608 -3.06 -3.298 -3.919 -4.053 -4.337 -4.645 -5.317 -5.685 -6.093 -6.516 -7.017 -7.658 -8.548 -11.276 -5 ,28606 ,KEBNE ,17019505,Wed Dec 22 03:00:40 CET,Wed Dec 22 04:22:21 CET,0.0 1.267 1.867 2.341 2.777 3.159 3.501 3.804 4.326 4.544 4.767 4.808 5.372 5.554 5.902 6.238 6.54 6.676 6.935 7.206 7.602 7.848 8.072 8.375 8.687 8.989 9.266 9.522 9.835 10.13 10.387 10.699 11.016 11.312 11.658 12.042 12.389 12.712 13.042 13.396 13.762 14.15 14.559 14.952 15.357 15.752 16.095 16.397 16.649 16.656 16.193 15.199 14.12 13.042 12.012 11.074 10.228 9.443 8.768 8.093 7.484 6.927 6.384 5.819 5.26 4.752 4.244 3.802 3.407 2.999 2.545 2.121 1.643 1.17 0.848 0.506 0.111 -0.324 -0.75 -1.038 -1.358 -1.833 -2.167 -2.564 -2.773 -3.181 -3.609 -4.1 -4.367 -5.014 -5.167 -5.465 -5.78 -6.467 -6.836 -7.225 -7.643 -8.145 -8.838 -9.833 -12.83 -6 ,4411 ,KEBNE ,17019506,Wed Dec 22 03:00:40 CET,Wed Dec 22 04:21:01 CET,0.0 1.656 2.354 2.85 3.244 3.606 3.931 4.225 4.736 4.962 5.183 5.291 5.875 6.063 6.399 6.704 7.006 7.155 7.466 7.746 8.081 8.308 8.531 8.837 9.14 9.435 9.711 9.964 10.288 10.576 10.85 11.184 11.483 11.764 12.088 12.46 12.808 13.202 13.599 13.973 14.365 14.765 15.178 15.577 16.003 16.435 16.858 17.18 17.412 17.489 17.014 15.864 14.769 13.736 12.738 11.784 10.936 10.131 9.384 8.618 7.998 7.432 6.851 6.294 5.75 5.251 4.72 4.209 3.789 3.363 2.891 2.483 2.024 1.568 1.237 0.866 0.471 0.066 -0.358 -0.643 -0.942 -1.452 -1.807 -2.147 -2.333 -2.733 -3.143 -3.59 -3.835 -4.477 -4.592 -4.866 -5.172 -5.851 -6.279 -6.729 -7.19 -7.752 -8.415 -9.182 -11.273 -7 ,7866 ,KEBNE ,17019507,Wed Dec 22 03:00:44 CET,Wed Dec 22 04:20:41 CET,0.0 1.769 2.356 2.804 3.167 3.537 3.88 4.166 4.677 4.908 5.126 5.156 5.729 5.92 6.276 6.583 6.876 7.029 7.335 7.615 7.971 8.194 8.42 8.748 9.049 9.324 9.601 9.88 10.219 10.514 10.781 11.125 11.464 11.756 12.105 12.504 12.866 13.229 13.565 13.91 14.283 14.663 15.089 15.495 15.892 16.294 16.664 17.018 17.332 17.356 16.851 15.781 14.623 13.548 12.576 11.659 10.797 9.98 9.256 8.549 7.954 7.398 6.797 6.174 5.586 5.082 4.548 4.03 3.602 3.129 2.602 2.182 1.76 1.307 0.945 0.57 0.183 -0.208 -0.632 -0.93 -1.236 -1.742 -2.102 -2.451 -2.624 -3.04 -3.482 -3.927 -4.182 -4.828 -4.95 -5.242 -5.556 -6.235 -6.608 -6.983 -7.398 -7.929 -8.602 -9.485 -11.685 -8 ,4934 ,KEBNE ,17019508,Wed Dec 22 03:00:44 CET,Wed Dec 22 04:22:25 CET,0.0 2.303 2.946 3.465 3.885 4.227 4.551 4.852 5.345 5.548 5.745 5.747 6.312 6.487 6.807 7.108 7.386 7.521 7.787 8.039 8.398 8.638 8.878 9.221 9.522 9.808 10.097 10.376 10.716 11.018 11.29 11.585 11.875 12.19 12.567 12.987 13.356 13.728 14.102 14.469 14.838 15.235 15.677 16.069 16.5 16.9 17.305 17.694 17.899 17.866 17.37 16.302 15.207 14.165 13.188 12.3 11.447 10.621 9.906 9.164 8.523 7.946 7.394 6.822 6.24 5.75 5.257 4.813 4.411 3.977 3.52 3.117 2.675 2.225 1.867 1.487 1.104 0.707 0.287 -0.012 -0.319 -0.784 -1.104 -1.46 -1.637 -2.003 -2.428 -2.915 -3.158 -3.769 -3.91 -4.206 -4.499 -5.162 -5.543 -5.952 -6.409 -6.934 -7.575 -8.388 -10.723 -9 ,1605 ,KEBNE ,17019509,Wed Dec 22 03:00:44 CET,Wed Dec 22 04:20:49 CET,0.0 1.684 2.352 2.886 3.271 3.594 3.909 4.189 4.693 4.926 5.137 5.163 5.731 5.911 6.269 6.626 6.938 7.088 7.383 7.631 8.015 8.281 8.506 8.81 9.112 9.403 9.686 9.95 10.311 10.655 10.94 11.296 11.642 11.934 12.256 12.615 12.966 13.339 13.692 14.083 14.485 14.873 15.281 15.667 16.101 16.515 16.887 17.168 17.425 17.489 16.985 15.968 14.864 13.782 12.793 11.818 10.917 10.108 9.414 8.712 8.09 7.518 6.951 6.419 5.897 5.4 4.866 4.364 3.908 3.437 2.958 2.553 2.146 1.723 1.382 1.029 0.668 0.29 -0.104 -0.385 -0.7 -1.206 -1.554 -1.914 -2.094 -2.478 -2.884 -3.34 -3.579 -4.195 -4.306 -4.587 -4.875 -5.503 -5.859 -6.272 -6.731 -7.201 -7.774 -8.559 -10.77 -10 ,9184 ,KEBNE ,17019510,Wed Dec 22 03:00:45 CET,Wed Dec 22 04:20:53 CET,0.0 1.328 1.991 2.451 2.836 3.235 3.621 3.94 4.464 4.706 4.947 5.032 5.621 5.812 6.191 6.559 6.875 7.023 7.301 7.554 7.91 8.135 8.347 8.658 8.961 9.268 9.574 9.851 10.191 10.505 10.792 11.159 11.526 11.892 12.284 12.686 13.093 13.531 13.934 14.328 14.739 15.224 15.794 16.275 16.719 17.1 17.463 17.81 18.012 17.992 17.531 16.493 15.319 14.185 13.151 12.17 11.289 10.47 9.752 9.044 8.422 7.845 7.292 6.746 6.219 5.738 5.222 4.758 4.337 3.893 3.43 3.028 2.586 2.13 1.792 1.437 1.062 0.667 0.254 -0.015 -0.281 -0.731 -1.059 -1.411 -1.6 -2.0 -2.403 -2.821 -3.039 -3.646 -3.759 -4.034 -4.322 -4.965 -5.329 -5.726 -6.154 -6.633 -7.262 -8.022 -10.379 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23471.txt deleted file mode 100644 index 40b7f60e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,527 ,TETRA ,17524279,Wed Nov 24 21:56:25 CET,Wed Nov 24 23:29:16 CET,0.0 1.147 1.727 2.223 2.612 2.943 3.253 3.546 4.086 4.315 4.537 4.587 5.159 5.363 5.728 6.052 6.371 6.519 6.785 7.048 7.427 7.656 7.883 8.203 8.507 8.804 9.073 9.328 9.691 10.038 10.331 10.676 11.006 11.312 11.662 12.047 12.414 12.79 13.163 13.539 13.911 14.31 14.742 15.138 15.578 15.987 16.384 16.742 16.943 16.932 16.416 15.274 14.099 12.993 11.997 11.023 10.125 9.292 8.573 7.9 7.316 6.744 6.191 5.679 5.171 4.692 4.179 3.692 3.26 2.803 2.314 1.907 1.482 1.033 0.68 0.319 -0.06 -0.482 -0.935 -1.232 -1.533 -2.027 -2.383 -2.752 -2.939 -3.339 -3.777 -4.226 -4.47 -5.114 -5.232 -5.508 -5.815 -6.454 -6.805 -7.227 -7.667 -8.177 -8.845 -9.736 -12.037 -2 ,17139 ,TETRA ,17524280,Wed Nov 24 21:56:27 CET,Wed Nov 24 23:28:54 CET,0.0 1.303 1.961 2.449 2.801 3.129 3.429 3.711 4.215 4.445 4.67 4.729 5.305 5.498 5.862 6.194 6.509 6.655 6.928 7.203 7.601 7.86 8.104 8.415 8.713 9.008 9.297 9.566 9.884 10.171 10.449 10.795 11.118 11.415 11.752 12.134 12.521 12.948 13.37 13.747 14.113 14.525 14.954 15.328 15.717 16.131 16.544 16.904 17.156 17.172 16.677 15.544 14.379 13.264 12.206 11.237 10.394 9.599 8.887 8.177 7.545 6.95 6.362 5.806 5.284 4.82 4.319 3.829 3.41 2.995 2.552 2.164 1.766 1.336 0.983 0.622 0.246 -0.135 -0.529 -0.819 -1.132 -1.653 -2.016 -2.372 -2.558 -2.951 -3.379 -3.853 -4.096 -4.733 -4.89 -5.178 -5.5 -6.194 -6.569 -6.99 -7.481 -8.052 -8.743 -9.637 -12.539 -3 ,21398 ,TETRA ,17524282,Wed Nov 24 21:57:23 CET,Wed Nov 24 23:30:46 CET,0.0 2.041 2.649 3.114 3.498 3.825 4.131 4.407 4.922 5.172 5.395 5.439 6.007 6.185 6.536 6.87 7.164 7.303 7.571 7.826 8.206 8.453 8.683 9.018 9.34 9.632 9.91 10.162 10.49 10.823 11.112 11.421 11.714 12.003 12.358 12.755 13.121 13.486 13.844 14.24 14.619 14.987 15.382 15.772 16.199 16.567 16.896 17.198 17.419 17.437 16.893 15.792 14.634 13.538 12.532 11.587 10.745 9.939 9.222 8.499 7.876 7.329 6.795 6.269 5.762 5.29 4.782 4.328 3.944 3.545 3.119 2.741 2.328 1.89 1.541 1.173 0.789 0.39 -0.005 -0.295 -0.608 -1.086 -1.435 -1.79 -1.972 -2.366 -2.785 -3.234 -3.476 -4.095 -4.255 -4.543 -4.827 -5.484 -5.851 -6.288 -6.796 -7.338 -7.958 -8.786 -11.829 -4 ,30472 ,TETRA ,17524283,Wed Nov 24 21:58:21 CET,Wed Nov 24 23:32:35 CET,0.0 1.373 2.025 2.433 2.776 3.089 3.33 3.541 3.956 4.159 4.351 4.327 4.871 5.044 5.39 5.678 5.927 6.045 6.286 6.522 6.868 7.103 7.325 7.619 7.906 8.183 8.446 8.705 9.009 9.259 9.504 9.802 10.089 10.388 10.704 11.003 11.27 11.55 11.857 12.165 12.484 12.823 13.153 13.411 13.656 13.898 14.067 14.142 14.11 13.818 12.807 11.191 9.698 8.32 7.06 5.952 4.969 4.066 3.252 2.401 1.681 1.047 0.442 -0.148 -0.7 -1.21 -1.764 -2.302 -2.791 -3.266 -3.751 -4.183 -4.624 -5.1 -5.483 -5.861 -6.259 -6.691 -7.16 -7.483 -7.804 -8.339 -8.711 -9.072 -9.268 -9.677 -10.091 -10.544 -10.786 -11.412 -11.543 -11.846 -12.168 -12.863 -13.231 -13.611 -14.082 -14.634 -15.253 -16.07 -19.147 -5 ,18655 ,TETRA ,17524284,Wed Nov 24 22:00:22 CET,Wed Nov 24 23:33:34 CET,0.0 1.873 2.541 3.041 3.438 3.827 4.195 4.49 4.996 5.231 5.456 5.503 6.078 6.285 6.67 7.039 7.387 7.552 7.867 8.173 8.59 8.848 9.11 9.501 9.877 10.224 10.534 10.832 11.204 11.529 11.831 12.183 12.519 12.852 13.235 13.661 14.065 14.494 14.909 15.309 15.743 16.215 16.723 17.212 17.745 18.3 18.84 19.265 19.596 19.723 19.287 18.228 17.033 15.778 14.697 13.691 12.676 11.75 10.944 10.117 9.386 8.696 8.035 7.416 6.784 6.213 5.628 5.067 4.582 4.08 3.566 3.126 2.645 2.153 1.77 1.359 0.922 0.478 0.002 -0.343 -0.696 -1.276 -1.701 -2.128 -2.351 -2.82 -3.303 -3.82 -4.098 -4.78 -5.014 -5.343 -5.711 -6.576 -7.084 -7.621 -8.238 -8.99 -9.854 -11.142 -17.059 -6 ,4586 ,TETRA ,17524286,Wed Nov 24 22:00:26 CET,Wed Nov 24 23:33:37 CET,0.0 1.211 1.848 2.339 2.714 3.041 3.375 3.666 4.168 4.404 4.63 4.675 5.258 5.446 5.809 6.148 6.461 6.604 6.88 7.158 7.559 7.822 8.066 8.4 8.708 9.017 9.308 9.577 9.926 10.253 10.576 10.967 11.329 11.652 12.009 12.404 12.762 13.135 13.512 13.923 14.345 14.76 15.226 15.681 16.121 16.495 16.865 17.16 17.315 17.294 16.808 15.738 14.597 13.539 12.534 11.55 10.661 9.81 9.08 8.337 7.65 7.046 6.462 5.852 5.26 4.736 4.178 3.644 3.146 2.622 2.121 1.718 1.292 0.854 0.505 0.134 -0.281 -0.732 -1.185 -1.48 -1.784 -2.298 -2.664 -3.045 -3.235 -3.651 -4.104 -4.55 -4.777 -5.403 -5.522 -5.803 -6.093 -6.697 -7.055 -7.465 -7.932 -8.486 -9.131 -10.052 -13.523 -9 ,28295 ,TETRA ,17524291,Wed Nov 24 22:00:26 CET,Wed Nov 24 23:33:50 CET,0.0 1.686 2.301 2.757 3.142 3.484 3.797 4.085 4.578 4.82 5.047 5.08 5.645 5.835 6.203 6.535 6.831 6.968 7.243 7.508 7.877 8.115 8.355 8.695 9.011 9.315 9.612 9.891 10.243 10.576 10.851 11.159 11.473 11.793 12.167 12.545 12.903 13.303 13.695 14.087 14.487 14.912 15.358 15.738 16.13 16.533 16.905 17.18 17.406 17.479 16.932 15.857 14.756 13.619 12.549 11.603 10.782 9.992 9.243 8.471 7.814 7.245 6.699 6.143 5.602 5.096 4.579 4.116 3.679 3.225 2.776 2.385 1.954 1.484 1.124 0.752 0.362 -0.031 -0.449 -0.746 -1.042 -1.514 -1.847 -2.201 -2.393 -2.799 -3.238 -3.685 -3.907 -4.555 -4.783 -5.082 -5.383 -6.055 -6.456 -6.875 -7.338 -7.872 -8.495 -9.353 -12.051 -10 ,21794 ,TETRA ,17524293,Wed Nov 24 22:00:26 CET,Wed Nov 24 23:33:30 CET,0.0 1.72 2.343 2.816 3.192 3.555 3.894 4.178 4.693 4.929 5.141 5.171 5.74 5.939 6.321 6.664 6.964 7.101 7.362 7.629 8.02 8.253 8.468 8.781 9.083 9.359 9.627 9.872 10.2 10.528 10.826 11.18 11.495 11.77 12.1 12.489 12.853 13.223 13.604 14.002 14.39 14.787 15.196 15.604 16.063 16.484 16.864 17.191 17.399 17.403 16.89 15.765 14.599 13.448 12.388 11.393 10.487 9.674 8.963 8.273 7.683 7.12 6.562 6.046 5.546 5.069 4.569 4.112 3.718 3.294 2.84 2.475 2.082 1.673 1.351 0.994 0.614 0.227 -0.171 -0.468 -0.787 -1.278 -1.633 -1.995 -2.174 -2.582 -3.016 -3.45 -3.674 -4.291 -4.395 -4.654 -4.932 -5.583 -5.94 -6.349 -6.832 -7.407 -8.174 -9.155 -12.493 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23468.txt deleted file mode 100644 index 0b061076..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20893 ,TETRA ,17524300,Wed Nov 24 22:00:25 CET,Wed Nov 24 23:33:31 CET,0.0 2.18 2.889 3.381 3.758 4.124 4.455 4.752 5.272 5.514 5.751 5.809 6.432 6.644 7.041 7.41 7.762 7.932 8.269 8.595 9.049 9.328 9.592 9.978 10.352 10.723 11.063 11.376 11.77 12.151 12.525 12.959 13.371 13.762 14.207 14.749 15.247 15.759 16.331 16.913 17.531 18.241 19.025 19.801 20.698 21.658 22.739 23.888 25.141 26.536 27.97 28.883 29.215 29.181 28.997 28.724 28.421 28.111 27.786 27.418 27.127 26.84 26.473 26.102 25.77 25.466 25.102 24.759 24.466 24.12 23.724 23.413 23.108 22.788 22.501 22.202 21.922 21.6 21.247 20.999 20.73 20.3 19.99 19.661 19.496 19.146 18.762 18.365 18.156 17.55 17.446 17.177 16.915 16.325 15.984 15.612 15.179 14.657 14.052 13.312 11.47 -2 ,19489 ,TETRA ,17524301,Wed Nov 24 22:00:25 CET,Wed Nov 24 23:33:57 CET,0.0 2.184 2.911 3.424 3.842 4.219 4.58 4.916 5.486 5.752 6.009 6.061 6.672 6.877 7.232 7.57 7.916 8.079 8.383 8.675 9.105 9.386 9.669 10.067 10.433 10.808 11.171 11.496 11.89 12.267 12.627 13.049 13.48 13.913 14.408 14.932 15.407 15.926 16.493 17.097 17.726 18.415 19.212 19.995 20.858 21.804 22.861 24.015 25.281 26.637 28.142 29.182 29.623 29.702 29.627 29.453 29.203 28.909 28.605 28.278 27.98 27.706 27.42 27.097 26.763 26.442 26.099 25.788 25.52 25.206 24.852 24.554 24.243 23.928 23.652 23.357 23.077 22.77 22.4 22.139 21.878 21.474 21.193 20.889 20.722 20.369 19.993 19.595 19.381 18.79 18.717 18.448 18.167 17.553 17.22 16.88 16.498 16.023 15.453 14.63 12.171 -3 ,2727 ,TETRA ,17524302,Wed Nov 24 22:00:28 CET,Wed Nov 24 23:33:49 CET,0.0 1.697 2.387 2.874 3.269 3.634 3.954 4.229 4.74 4.991 5.235 5.26 5.859 6.047 6.433 6.793 7.117 7.282 7.631 7.973 8.451 8.724 8.983 9.402 9.817 10.181 10.516 10.843 11.266 11.661 12.037 12.484 12.885 13.287 13.755 14.294 14.817 15.368 15.963 16.563 17.169 17.842 18.603 19.359 20.212 21.161 22.252 23.416 24.762 26.294 27.919 28.964 29.31 29.375 29.289 29.111 28.885 28.615 28.283 27.896 27.584 27.266 26.915 26.56 26.232 25.924 25.546 25.203 24.911 24.569 24.19 23.889 23.575 23.207 22.929 22.655 22.352 22.025 21.673 21.433 21.182 20.772 20.478 20.165 20.004 19.653 19.268 18.871 18.651 18.029 17.896 17.643 17.389 16.831 16.509 16.137 15.716 15.259 14.668 13.835 11.36 -4 ,13833 ,TETRA ,17524303,Wed Nov 24 22:00:30 CET,Wed Nov 24 23:33:58 CET,0.0 1.381 2.045 2.611 3.062 3.43 3.75 4.044 4.611 4.866 5.106 5.162 5.776 5.964 6.315 6.674 7.013 7.176 7.498 7.804 8.233 8.492 8.741 9.111 9.471 9.841 10.201 10.535 10.96 11.372 11.755 12.185 12.612 13.036 13.503 14.008 14.517 15.101 15.717 16.363 17.022 17.688 18.43 19.139 19.964 20.939 22.069 23.229 24.536 26.081 27.693 28.73 29.133 29.177 29.019 28.756 28.489 28.183 27.833 27.436 27.092 26.747 26.382 26.046 25.727 25.413 25.045 24.714 24.417 24.115 23.775 23.457 23.149 22.807 22.536 22.273 21.97 21.638 21.297 21.054 20.797 20.378 20.079 19.773 19.612 19.249 18.862 18.443 18.221 17.613 17.482 17.2 16.912 16.287 15.955 15.609 15.2 14.69 14.129 13.435 11.563 -5 ,27874 ,TETRA ,17524304,Wed Nov 24 22:00:26 CET,Wed Nov 24 23:33:41 CET,0.0 1.966 2.641 3.168 3.572 3.914 4.246 4.539 5.052 5.298 5.534 5.57 6.19 6.427 6.882 7.257 7.612 7.777 8.087 8.411 8.871 9.153 9.427 9.831 10.207 10.559 10.903 11.235 11.664 12.092 12.473 12.894 13.324 13.748 14.217 14.725 15.229 15.777 16.33 16.929 17.546 18.184 18.931 19.693 20.538 21.452 22.495 23.652 24.965 26.438 28.03 29.099 29.473 29.508 29.34 29.048 28.795 28.526 28.214 27.867 27.555 27.248 26.915 26.575 26.238 25.9 25.509 25.167 24.883 24.57 24.206 23.903 23.587 23.234 22.951 22.646 22.329 21.991 21.622 21.359 21.086 20.651 20.355 20.044 19.871 19.499 19.084 18.687 18.497 17.899 17.823 17.57 17.301 16.707 16.366 15.98 15.563 15.099 14.499 13.684 11.132 -6 ,7417 ,TETRA ,17524305,Wed Nov 24 22:01:21 CET,Wed Nov 24 23:34:19 CET,0.0 1.243 1.907 2.379 2.796 3.169 3.527 3.866 4.445 4.703 4.942 4.967 5.58 5.803 6.22 6.605 6.957 7.125 7.451 7.784 8.258 8.531 8.801 9.21 9.589 9.945 10.279 10.593 10.986 11.366 11.741 12.192 12.63 13.052 13.508 13.988 14.436 14.934 15.464 16.055 16.687 17.36 18.107 18.835 19.723 20.7 21.754 22.891 24.147 25.598 27.285 28.389 28.742 28.789 28.696 28.494 28.231 27.938 27.633 27.253 26.894 26.572 26.249 25.937 25.618 25.275 24.872 24.518 24.224 23.889 23.529 23.216 22.88 22.519 22.217 21.9 21.595 21.276 20.909 20.65 20.38 19.971 19.688 19.393 19.238 18.908 18.55 18.146 17.932 17.323 17.222 16.966 16.706 16.122 15.773 15.397 14.979 14.51 13.905 13.059 10.133 -7 ,6395 ,TETRA ,17524306,Wed Nov 24 22:01:22 CET,Wed Nov 24 23:36:34 CET,0.0 1.848 2.555 3.12 3.549 3.892 4.208 4.521 5.073 5.322 5.579 5.675 6.292 6.512 6.924 7.286 7.643 7.812 8.13 8.456 8.934 9.213 9.486 9.879 10.236 10.594 10.944 11.277 11.717 12.163 12.569 13.014 13.424 13.818 14.276 14.781 15.278 15.817 16.38 16.964 17.561 18.256 19.04 19.785 20.652 21.572 22.638 23.862 25.224 26.704 28.298 29.323 29.684 29.727 29.582 29.361 29.107 28.804 28.524 28.178 27.846 27.507 27.161 26.836 26.509 26.213 25.879 25.562 25.242 24.9 24.563 24.267 23.963 23.618 23.316 23.029 22.745 22.412 22.043 21.793 21.538 21.128 20.841 20.539 20.372 20.017 19.637 19.22 19.01 18.419 18.357 18.115 17.841 17.228 16.881 16.49 16.054 15.556 14.977 14.262 12.587 -8 ,4266 ,TETRA ,17524307,Wed Nov 24 22:04:26 CET,Wed Nov 24 23:37:20 CET,0.0 2.032 2.649 3.129 3.544 3.906 4.2 4.483 5.032 5.27 5.499 5.519 6.133 6.333 6.73 7.09 7.435 7.621 7.966 8.286 8.748 9.027 9.278 9.627 10.001 10.369 10.702 11.035 11.506 11.958 12.356 12.823 13.265 13.684 14.146 14.646 15.156 15.709 16.263 16.847 17.452 18.128 18.935 19.719 20.589 21.557 22.635 23.807 25.128 26.578 28.17 29.186 29.574 29.713 29.679 29.499 29.257 28.996 28.674 28.291 27.978 27.685 27.358 26.993 26.647 26.313 25.933 25.577 25.274 24.978 24.647 24.335 23.986 23.637 23.367 23.082 22.775 22.435 22.068 21.822 21.571 21.134 20.827 20.511 20.335 19.978 19.629 19.222 18.998 18.397 18.32 18.071 17.789 17.156 16.825 16.453 16.034 15.557 14.996 14.245 12.375 -9 ,10062 ,TETRA ,17524308,Wed Nov 24 22:02:23 CET,Wed Nov 24 23:35:46 CET,0.0 1.395 2.052 2.519 2.921 3.326 3.661 3.952 4.496 4.742 4.979 5.043 5.658 5.868 6.278 6.651 7.012 7.19 7.529 7.847 8.301 8.607 8.901 9.304 9.691 10.058 10.406 10.749 11.208 11.656 12.041 12.495 12.934 13.344 13.823 14.331 14.788 15.295 15.866 16.467 17.063 17.722 18.494 19.242 20.087 21.025 22.127 23.306 24.603 26.062 27.657 28.69 29.125 29.267 29.159 28.95 28.701 28.378 28.059 27.743 27.443 27.129 26.778 26.44 26.125 25.809 25.463 25.15 24.884 24.596 24.263 23.948 23.601 23.232 22.944 22.633 22.294 21.957 21.582 21.321 21.058 20.612 20.303 19.986 19.819 19.466 19.091 18.697 18.496 17.903 17.81 17.552 17.286 16.666 16.315 15.961 15.561 15.051 14.405 13.585 11.726 -10 ,25870 ,TETRA ,17524309,Wed Nov 24 22:04:27 CET,Wed Nov 24 23:38:43 CET,0.0 1.158 1.734 2.217 2.613 2.961 3.298 3.609 4.176 4.421 4.656 4.722 5.316 5.518 5.921 6.273 6.612 6.787 7.123 7.418 7.847 8.154 8.454 8.855 9.24 9.603 9.93 10.232 10.634 11.049 11.443 11.912 12.365 12.795 13.267 13.759 14.224 14.739 15.269 15.819 16.443 17.159 17.973 18.783 19.672 20.63 21.703 22.839 24.129 25.615 27.257 28.27 28.572 28.586 28.488 28.291 27.99 27.656 27.327 26.971 26.65 26.313 25.985 25.642 25.288 24.955 24.563 24.238 23.965 23.636 23.264 22.973 22.688 22.344 22.056 21.775 21.501 21.216 20.876 20.626 20.367 19.915 19.6 19.304 19.15 18.799 18.414 17.99 17.768 17.154 17.064 16.814 16.533 15.876 15.5 15.071 14.631 14.197 13.589 12.764 10.061 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23471.txt deleted file mode 100644 index 3e295c47..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8085 ,TETRA ,17524311,Wed Nov 24 22:04:22 CET,Wed Nov 24 23:37:38 CET,0.0 2.125 2.799 3.32 3.742 4.115 4.473 4.812 5.401 5.687 5.958 6.077 6.716 6.929 7.323 7.683 8.047 8.226 8.575 8.916 9.387 9.679 9.965 10.371 10.739 11.085 11.409 11.735 12.189 12.608 12.988 13.454 13.9 14.364 14.931 15.543 16.106 16.686 17.283 17.902 18.543 19.286 20.146 20.969 21.904 22.912 24.018 25.189 26.524 27.999 29.481 30.343 30.625 30.657 30.517 30.266 29.96 29.636 29.278 28.862 28.489 28.125 27.747 27.358 26.996 26.642 26.224 25.855 25.516 25.131 24.725 24.383 24.006 23.599 23.277 22.951 22.614 22.248 21.852 21.58 21.303 20.864 20.55 20.223 20.055 19.697 19.308 18.893 18.672 18.057 17.949 17.68 17.398 16.745 16.393 16.002 15.53 15.001 14.409 13.673 11.957 -2 ,20359 ,TETRA ,17524313,Wed Nov 24 22:04:25 CET,Wed Nov 24 23:37:25 CET,0.0 2.049 2.785 3.3 3.738 4.12 4.467 4.788 5.402 5.684 5.946 6.071 6.716 6.941 7.365 7.755 8.117 8.296 8.645 8.983 9.498 9.819 10.128 10.581 10.999 11.417 11.8 12.138 12.576 12.996 13.39 13.85 14.31 14.736 15.218 15.774 16.31 16.895 17.492 18.126 18.79 19.509 20.377 21.207 22.105 23.075 24.18 25.382 26.734 28.238 29.732 30.618 30.904 30.915 30.778 30.462 30.059 29.66 29.278 28.862 28.503 28.172 27.791 27.441 27.122 26.783 26.406 26.02 25.661 25.322 24.961 24.629 24.274 23.911 23.625 23.296 22.937 22.57 22.22 21.986 21.721 21.314 21.031 20.693 20.519 20.161 19.746 19.306 19.089 18.475 18.383 18.12 17.826 17.148 16.783 16.407 15.954 15.452 14.87 14.094 11.952 -3 ,28266 ,TETRA ,17524314,Wed Nov 24 22:05:23 CET,Wed Nov 24 23:40:06 CET,0.0 2.129 2.825 3.312 3.738 4.12 4.475 4.814 5.403 5.671 5.929 5.993 6.624 6.849 7.292 7.689 8.038 8.224 8.581 8.899 9.35 9.637 9.934 10.368 10.762 11.127 11.499 11.842 12.258 12.665 13.049 13.527 14.01 14.473 14.964 15.474 15.986 16.586 17.204 17.808 18.474 19.225 20.028 20.837 21.768 22.761 23.872 25.076 26.339 27.671 29.084 29.862 29.974 29.841 29.631 29.358 29.054 28.728 28.394 28.014 27.607 27.157 26.732 26.332 25.928 25.54 25.139 24.808 24.518 24.168 23.776 23.465 23.143 22.807 22.516 22.197 21.88 21.551 21.221 20.985 20.728 20.298 19.971 19.633 19.466 19.12 18.742 18.338 18.129 17.521 17.43 17.173 16.911 16.294 15.901 15.473 15.011 14.511 13.888 13.065 10.467 -4 ,27476 ,TETRA ,17524317,Wed Nov 24 22:05:25 CET,Wed Nov 24 23:38:28 CET,0.0 1.638 2.286 2.783 3.206 3.584 3.924 4.252 4.879 5.153 5.413 5.536 6.181 6.405 6.846 7.255 7.626 7.805 8.162 8.514 8.987 9.289 9.608 10.055 10.47 10.879 11.254 11.616 12.079 12.502 12.903 13.378 13.842 14.284 14.766 15.309 15.835 16.4 17.005 17.651 18.3 18.977 19.802 20.624 21.503 22.452 23.53 24.744 26.13 27.596 29.018 29.874 30.134 30.114 29.949 29.692 29.381 29.058 28.764 28.437 28.116 27.788 27.471 27.142 26.795 26.48 26.155 25.833 25.53 25.209 24.842 24.529 24.226 23.909 23.638 23.339 23.03 22.685 22.305 22.068 21.833 21.402 21.08 20.756 20.592 20.244 19.869 19.48 19.28 18.675 18.548 18.267 17.994 17.391 17.022 16.612 16.171 15.688 15.08 14.282 11.716 -5 ,5453 ,TETRA ,17524319,Wed Nov 24 22:05:25 CET,Wed Nov 24 23:38:18 CET,0.0 1.864 2.575 3.075 3.507 3.884 4.249 4.588 5.188 5.466 5.735 5.821 6.449 6.661 7.066 7.484 7.893 8.075 8.429 8.777 9.267 9.57 9.86 10.288 10.691 11.075 11.454 11.82 12.278 12.724 13.142 13.626 14.103 14.549 15.044 15.618 16.169 16.745 17.348 17.985 18.639 19.348 20.172 20.992 21.93 22.95 24.051 25.237 26.576 28.066 29.612 30.545 30.893 30.883 30.681 30.459 30.168 29.828 29.461 29.005 28.64 28.297 27.901 27.491 27.102 26.725 26.289 25.894 25.538 25.176 24.813 24.498 24.148 23.736 23.41 23.103 22.789 22.443 22.059 21.786 21.507 21.071 20.772 20.453 20.285 19.942 19.551 19.123 18.904 18.298 18.209 17.949 17.657 16.964 16.585 16.206 15.796 15.329 14.769 13.943 9.614 -6 ,5202 ,TETRA ,17524321,Wed Nov 24 22:06:23 CET,Wed Nov 24 23:39:15 CET,0.0 1.595 2.292 2.806 3.243 3.635 3.993 4.338 4.937 5.206 5.47 5.561 6.194 6.425 6.854 7.235 7.582 7.759 8.136 8.485 8.951 9.245 9.532 9.97 10.393 10.783 11.146 11.496 11.951 12.368 12.76 13.246 13.701 14.119 14.606 15.17 15.707 16.299 16.926 17.555 18.18 18.881 19.762 20.655 21.607 22.617 23.75 24.973 26.368 27.897 29.485 30.516 30.81 30.766 30.603 30.387 30.121 29.799 29.449 29.046 28.633 28.245 27.891 27.511 27.142 26.789 26.397 26.034 25.718 25.379 25.014 24.695 24.342 23.977 23.68 23.361 23.007 22.621 22.233 21.99 21.736 21.29 20.974 20.662 20.502 20.16 19.795 19.408 19.202 18.607 18.556 18.296 18.011 17.411 17.095 16.73 16.3 15.813 15.163 14.156 11.456 -7 ,6124 ,TETRA ,17524323,Wed Nov 24 22:06:25 CET,Wed Nov 24 23:39:43 CET,0.0 1.689 2.271 2.789 3.244 3.6 3.915 4.237 4.847 5.118 5.377 5.461 6.09 6.306 6.736 7.153 7.547 7.739 8.11 8.451 8.935 9.238 9.543 9.979 10.372 10.741 11.095 11.436 11.877 12.323 12.771 13.302 13.798 14.276 14.792 15.359 15.935 16.534 17.138 17.77 18.403 19.149 20.036 20.842 21.744 22.744 23.911 25.136 26.444 27.804 29.181 30.08 30.343 30.291 30.086 29.846 29.597 29.282 28.922 28.476 28.046 27.659 27.28 26.901 26.547 26.235 25.905 25.576 25.246 24.888 24.503 24.163 23.798 23.411 23.11 22.782 22.426 22.049 21.677 21.432 21.176 20.74 20.419 20.092 19.92 19.558 19.176 18.802 18.599 17.975 17.846 17.582 17.306 16.669 16.3 15.894 15.458 14.977 14.372 13.504 10.952 -8 ,19630 ,TETRA ,17524325,Wed Nov 24 22:07:22 CET,Wed Nov 24 23:42:53 CET,0.0 1.728 2.318 2.802 3.246 3.663 4.041 4.395 5.038 5.303 5.54 5.619 6.249 6.453 6.841 7.215 7.575 7.749 8.091 8.428 8.905 9.201 9.49 9.91 10.297 10.673 11.034 11.389 11.872 12.334 12.766 13.293 13.792 14.212 14.716 15.304 15.837 16.438 17.063 17.688 18.342 19.066 19.907 20.771 21.724 22.712 23.816 25.047 26.429 27.845 29.339 30.274 30.527 30.525 30.416 30.194 29.875 29.502 29.151 28.768 28.383 27.994 27.591 27.18 26.797 26.414 25.947 25.52 25.163 24.789 24.396 24.079 23.754 23.4 23.098 22.768 22.433 22.081 21.701 21.448 21.185 20.755 20.445 20.116 19.943 19.579 19.208 18.839 18.635 18.025 17.955 17.7 17.427 16.82 16.456 16.07 15.658 15.166 14.509 13.632 10.413 -9 ,24973 ,TETRA ,17524327,Wed Nov 24 22:07:22 CET,Wed Nov 24 23:40:16 CET,0.0 1.575 2.193 2.723 3.189 3.585 3.95 4.259 4.838 5.126 5.385 5.459 6.092 6.311 6.74 7.149 7.527 7.709 8.065 8.414 8.901 9.221 9.538 9.973 10.394 10.806 11.174 11.513 11.957 12.388 12.796 13.293 13.789 14.234 14.723 15.317 15.882 16.443 17.052 17.715 18.396 19.154 20.036 20.861 21.788 22.822 23.934 25.125 26.491 28.006 29.538 30.492 30.792 30.785 30.602 30.314 30.002 29.68 29.381 29.028 28.681 28.311 27.908 27.507 27.114 26.773 26.383 26.009 25.7 25.372 25.038 24.737 24.4 24.056 23.764 23.451 23.142 22.824 22.504 22.267 22.001 21.581 21.287 20.973 20.805 20.455 20.088 19.68 19.461 18.855 18.782 18.534 18.259 17.622 17.274 16.908 16.495 15.98 15.361 14.682 12.507 -10 ,24746 ,TETRA ,17524329,Wed Nov 24 22:07:24 CET,Wed Nov 24 23:42:45 CET,0.0 2.956 3.751 4.3 4.788 5.203 5.574 5.915 6.518 6.786 7.039 7.107 7.736 7.962 8.391 8.8 9.192 9.377 9.744 10.095 10.573 10.887 11.194 11.603 11.997 12.404 12.786 13.132 13.599 14.049 14.469 14.978 15.448 15.886 16.403 16.973 17.498 18.075 18.686 19.332 20.021 20.769 21.64 22.52 23.496 24.526 25.632 26.842 28.189 29.651 31.195 32.15 32.463 32.489 32.342 32.09 31.783 31.466 31.099 30.675 30.31 29.915 29.527 29.156 28.743 28.358 27.967 27.607 27.297 26.959 26.584 26.26 25.91 25.543 25.243 24.928 24.613 24.286 23.932 23.669 23.377 22.89 22.567 22.234 22.053 21.68 21.241 20.797 20.572 19.948 19.835 19.561 19.277 18.677 18.327 17.927 17.495 17.014 16.425 15.637 13.82 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23466.txt deleted file mode 100644 index 6ff00d5c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23461 ,TETRA ,17524330,Wed Nov 24 22:09:25 CET,Wed Nov 24 23:41:05 CET,0.0 0.919 1.456 1.9 2.28 2.601 2.877 3.136 3.627 3.841 4.052 4.072 4.654 4.844 5.223 5.573 5.892 6.048 6.354 6.648 7.043 7.273 7.498 7.851 8.199 8.54 8.857 9.145 9.526 9.891 10.244 10.67 11.09 11.48 11.902 12.39 12.866 13.408 13.999 14.596 15.229 15.927 16.729 17.525 18.439 19.479 20.682 22.005 23.528 25.331 27.364 28.734 29.224 29.355 29.247 28.983 28.673 28.343 28.022 27.615 27.245 26.898 26.53 26.177 25.823 25.501 25.146 24.791 24.491 24.165 23.796 23.474 23.126 22.767 22.484 22.174 21.83 21.471 21.087 20.813 20.545 20.113 19.806 19.471 19.293 18.925 18.531 18.097 17.864 17.269 17.133 16.87 16.591 15.926 15.547 15.149 14.667 14.104 13.466 12.485 9.132 -2 ,14670 ,TETRA ,17524332,Wed Nov 24 22:08:25 CET,Wed Nov 24 23:40:48 CET,0.0 1.339 1.885 2.318 2.672 2.986 3.269 3.516 3.963 4.184 4.409 4.462 5.035 5.214 5.563 5.882 6.184 6.333 6.627 6.915 7.32 7.571 7.816 8.17 8.51 8.834 9.142 9.438 9.821 10.198 10.557 10.988 11.426 11.845 12.287 12.762 13.214 13.709 14.264 14.855 15.456 16.146 16.952 17.761 18.722 19.75 20.898 22.198 23.691 25.344 27.207 28.474 28.922 28.973 28.846 28.637 28.397 28.101 27.725 27.319 26.96 26.589 26.183 25.813 25.473 25.135 24.754 24.396 24.08 23.755 23.414 23.099 22.745 22.35 22.046 21.752 21.464 21.157 20.829 20.578 20.296 19.87 19.564 19.254 19.095 18.749 18.354 17.931 17.717 17.115 16.949 16.678 16.399 15.752 15.367 14.926 14.442 13.925 13.303 12.273 7.522 -3 ,17997 ,TETRA ,17524334,Wed Nov 24 22:08:28 CET,Wed Nov 24 23:40:08 CET,0.0 1.255 1.827 2.281 2.663 2.987 3.269 3.558 4.104 4.338 4.555 4.566 5.151 5.349 5.746 6.108 6.439 6.599 6.898 7.186 7.615 7.877 8.13 8.512 8.853 9.178 9.503 9.828 10.234 10.605 10.976 11.431 11.872 12.278 12.747 13.28 13.773 14.303 14.857 15.443 16.074 16.796 17.626 18.432 19.381 20.441 21.639 22.971 24.582 26.398 28.293 29.574 30.028 30.097 29.985 29.78 29.488 29.13 28.774 28.376 28.004 27.647 27.304 26.952 26.581 26.233 25.876 25.523 25.199 24.847 24.463 24.159 23.843 23.492 23.197 22.906 22.59 22.228 21.848 21.579 21.29 20.85 20.542 20.223 20.063 19.706 19.32 18.911 18.69 18.095 17.971 17.713 17.427 16.774 16.416 16.043 15.62 15.123 14.521 13.628 10.048 -4 ,20315 ,TETRA ,17524335,Wed Nov 24 22:08:29 CET,Wed Nov 24 23:39:50 CET,0.0 1.805 2.35 2.791 3.181 3.509 3.792 4.056 4.545 4.793 5.023 5.034 5.612 5.785 6.118 6.459 6.799 6.95 7.239 7.517 7.93 8.195 8.439 8.789 9.13 9.456 9.758 10.067 10.494 10.879 11.232 11.689 12.116 12.492 12.937 13.448 13.941 14.474 15.047 15.639 16.267 16.974 17.806 18.651 19.596 20.62 21.794 23.118 24.666 26.427 28.294 29.534 30.087 30.322 30.305 30.151 29.88 29.495 29.156 28.791 28.427 28.102 27.773 27.412 27.058 26.727 26.374 26.031 25.712 25.377 25.012 24.711 24.4 24.033 23.723 23.427 23.135 22.787 22.422 22.162 21.906 21.504 21.179 20.844 20.663 20.265 19.838 19.383 19.157 18.566 18.421 18.143 17.848 17.155 16.754 16.337 15.866 15.308 14.642 13.695 10.409 -5 ,23452 ,TETRA ,17524337,Wed Nov 24 22:08:23 CET,Wed Nov 24 23:40:01 CET,0.0 1.302 1.815 2.241 2.595 2.914 3.205 3.471 3.949 4.168 4.387 4.443 5.033 5.251 5.689 6.097 6.479 6.657 6.976 7.258 7.652 7.91 8.148 8.48 8.811 9.14 9.467 9.78 10.16 10.527 10.904 11.349 11.749 12.138 12.596 13.082 13.542 14.049 14.598 15.195 15.84 16.568 17.386 18.161 19.074 20.101 21.294 22.658 24.223 26.007 27.938 29.208 29.753 29.898 29.798 29.612 29.352 29.042 28.736 28.346 27.985 27.622 27.251 26.893 26.515 26.157 25.744 25.329 24.966 24.624 24.275 23.97 23.654 23.296 22.986 22.676 22.358 22.035 21.711 21.444 21.147 20.683 20.346 19.99 19.81 19.441 19.031 18.585 18.353 17.754 17.641 17.385 17.096 16.424 16.058 15.648 15.147 14.593 13.953 13.014 9.824 -6 ,2388 ,TETRA ,17524340,Wed Nov 24 22:08:28 CET,Wed Nov 24 23:40:51 CET,0.0 0.946 1.445 1.881 2.243 2.569 2.869 3.157 3.679 3.89 4.097 4.105 4.692 4.89 5.271 5.601 5.897 6.047 6.337 6.615 7.012 7.266 7.511 7.855 8.203 8.551 8.87 9.171 9.569 9.964 10.311 10.72 11.121 11.49 11.921 12.413 12.905 13.435 13.972 14.551 15.161 15.825 16.596 17.41 18.344 19.382 20.604 21.94 23.461 25.23 27.224 28.474 28.955 29.079 28.963 28.672 28.333 28.046 27.75 27.399 27.084 26.75 26.377 26.0 25.647 25.323 24.954 24.613 24.299 23.955 23.607 23.281 22.914 22.532 22.228 21.905 21.567 21.221 20.848 20.589 20.314 19.875 19.569 19.215 19.028 18.645 18.232 17.825 17.599 16.984 16.816 16.531 16.221 15.578 15.208 14.807 14.364 13.842 13.248 12.369 8.331 -7 ,15180 ,TETRA ,17524342,Wed Nov 24 22:09:25 CET,Wed Nov 24 23:41:37 CET,0.0 1.178 1.736 2.139 2.495 2.803 3.1 3.4 3.926 4.157 4.377 4.394 4.976 5.161 5.495 5.833 6.161 6.308 6.589 6.863 7.259 7.507 7.739 8.075 8.418 8.765 9.095 9.4 9.782 10.165 10.537 10.962 11.364 11.751 12.189 12.69 13.191 13.73 14.281 14.868 15.484 16.153 16.933 17.717 18.654 19.704 20.859 22.124 23.593 25.259 27.106 28.367 28.776 28.809 28.739 28.563 28.309 27.994 27.623 27.207 26.852 26.527 26.183 25.83 25.486 25.158 24.77 24.426 24.124 23.776 23.406 23.062 22.696 22.326 22.011 21.691 21.358 21.01 20.673 20.421 20.14 19.712 19.408 19.066 18.895 18.556 18.178 17.749 17.522 16.922 16.789 16.532 16.258 15.605 15.211 14.788 14.341 13.778 13.108 12.18 9.017 -8 ,4313 ,TETRA ,17524344,Wed Nov 24 22:09:25 CET,Wed Nov 24 23:40:32 CET,0.0 1.263 1.691 2.077 2.432 2.731 3.009 3.268 3.745 3.97 4.194 4.214 4.788 4.977 5.351 5.685 5.986 6.131 6.437 6.752 7.176 7.439 7.7 8.07 8.423 8.748 9.06 9.372 9.755 10.129 10.505 10.919 11.319 11.732 12.194 12.71 13.211 13.731 14.307 14.929 15.558 16.295 17.15 17.991 18.936 19.934 21.123 22.516 24.091 25.831 27.739 28.92 29.372 29.508 29.439 29.198 28.909 28.587 28.232 27.856 27.495 27.121 26.73 26.35 25.983 25.602 25.177 24.821 24.507 24.156 23.783 23.461 23.123 22.769 22.494 22.209 21.898 21.561 21.205 20.943 20.653 20.207 19.905 19.572 19.393 19.027 18.62 18.159 17.928 17.342 17.219 16.944 16.664 16.025 15.661 15.274 14.808 14.312 13.699 12.763 8.474 -9 ,15810 ,TETRA ,17524346,Wed Nov 24 22:09:28 CET,Wed Nov 24 23:42:28 CET,0.0 2.017 2.677 3.13 3.483 3.783 4.075 4.349 4.817 5.033 5.25 5.247 5.829 6.013 6.363 6.701 7.025 7.179 7.461 7.725 8.105 8.349 8.59 8.952 9.298 9.628 9.941 10.225 10.633 11.018 11.361 11.796 12.199 12.601 13.09 13.606 14.079 14.622 15.206 15.789 16.393 17.101 17.924 18.73 19.687 20.774 21.992 23.333 24.876 26.627 28.614 29.904 30.355 30.437 30.349 30.134 29.895 29.589 29.247 28.883 28.507 28.143 27.801 27.455 27.103 26.756 26.362 26.008 25.697 25.365 25.019 24.716 24.38 24.015 23.713 23.391 23.049 22.682 22.313 22.046 21.772 21.348 21.036 20.697 20.513 20.15 19.778 19.379 19.167 18.567 18.411 18.136 17.84 17.214 16.852 16.453 15.994 15.434 14.734 13.853 9.362 -10 ,707 ,TETRA ,17524348,Wed Nov 24 22:09:25 CET,Wed Nov 24 23:43:16 CET,0.0 1.201 1.695 2.113 2.49 2.821 3.109 3.383 3.872 4.075 4.267 4.253 4.828 5.014 5.362 5.687 6.005 6.16 6.473 6.803 7.279 7.554 7.813 8.209 8.576 8.901 9.231 9.539 9.92 10.323 10.72 11.148 11.523 11.863 12.281 12.793 13.281 13.811 14.368 14.94 15.55 16.249 17.072 17.904 18.871 19.95 21.183 22.536 24.066 25.844 27.933 29.339 29.868 30.062 29.984 29.744 29.482 29.139 28.738 28.331 27.978 27.623 27.259 26.889 26.511 26.175 25.811 25.45 25.142 24.787 24.389 24.079 23.786 23.424 23.096 22.747 22.39 22.015 21.633 21.38 21.105 20.636 20.298 19.968 19.804 19.465 19.061 18.594 18.355 17.74 17.538 17.246 16.967 16.367 16.033 15.667 15.226 14.727 14.165 13.304 9.458 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23467.txt deleted file mode 100644 index 01651a8e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14897 ,TETRA ,17524351,Wed Nov 24 22:09:27 CET,Wed Nov 24 23:41:02 CET,0.0 1.267 1.819 2.273 2.684 3.038 3.341 3.632 4.181 4.431 4.663 4.705 5.306 5.509 5.879 6.233 6.572 6.741 7.075 7.399 7.867 8.176 8.46 8.853 9.232 9.589 9.936 10.272 10.687 11.096 11.531 12.049 12.525 12.963 13.484 14.106 14.67 15.264 15.918 16.637 17.361 18.157 19.118 20.054 21.082 22.221 23.51 24.924 26.602 28.545 30.744 32.351 33.141 33.467 33.509 33.384 33.181 32.93 32.645 32.319 31.992 31.669 31.343 31.03 30.704 30.383 30.034 29.699 29.432 29.165 28.863 28.55 28.194 27.862 27.592 27.288 26.969 26.654 26.328 26.092 25.841 25.452 25.178 24.893 24.746 24.408 24.046 23.677 23.478 22.913 22.804 22.554 22.289 21.714 21.404 21.073 20.701 20.244 19.653 18.794 15.793 -2 ,17190 ,TETRA ,17524352,Wed Nov 24 22:09:27 CET,Wed Nov 24 23:42:50 CET,0.0 1.783 2.469 2.96 3.389 3.75 4.056 4.329 4.85 5.101 5.343 5.379 5.967 6.163 6.551 6.92 7.279 7.467 7.82 8.135 8.601 8.914 9.22 9.639 10.027 10.403 10.758 11.113 11.571 12.014 12.442 12.936 13.402 13.842 14.341 14.931 15.519 16.148 16.801 17.51 18.27 19.112 20.093 21.09 22.252 23.551 24.996 26.567 28.331 30.286 32.429 33.908 34.572 34.777 34.723 34.545 34.281 33.948 33.624 33.284 32.941 32.617 32.308 31.993 31.699 31.425 31.106 30.799 30.527 30.25 29.94 29.66 29.371 29.067 28.803 28.518 28.241 27.93 27.577 27.332 27.068 26.646 26.361 26.061 25.902 25.568 25.214 24.843 24.644 24.077 24.029 23.794 23.518 22.942 22.627 22.276 21.863 21.382 20.817 20.14 18.284 -3 ,4001 ,TETRA ,17524354,Wed Nov 24 22:10:25 CET,Wed Nov 24 23:44:13 CET,0.0 1.312 1.964 2.396 2.767 3.105 3.432 3.739 4.289 4.54 4.778 4.848 5.432 5.625 5.99 6.335 6.679 6.844 7.152 7.468 7.929 8.218 8.486 8.874 9.267 9.629 9.965 10.297 10.721 11.122 11.522 12.002 12.458 12.914 13.43 13.992 14.563 15.196 15.839 16.507 17.197 17.982 18.923 19.858 20.914 22.079 23.437 24.965 26.731 28.722 30.951 32.487 33.136 33.384 33.39 33.253 33.055 32.808 32.526 32.251 32.008 31.74 31.44 31.105 30.788 30.523 30.222 29.887 29.582 29.299 28.996 28.738 28.484 28.184 27.934 27.67 27.391 27.084 26.733 26.486 26.23 25.831 25.534 25.204 25.036 24.693 24.31 23.921 23.724 23.15 23.028 22.777 22.52 21.924 21.575 21.208 20.807 20.367 19.818 19.091 17.531 -4 ,31089 ,TETRA ,17524356,Wed Nov 24 22:10:24 CET,Wed Nov 24 23:43:39 CET,0.0 1.725 2.4 2.925 3.39 3.782 4.122 4.417 4.919 5.161 5.398 5.455 6.051 6.262 6.681 7.096 7.487 7.666 7.984 8.284 8.733 9.014 9.295 9.721 10.125 10.508 10.883 11.247 11.714 12.158 12.593 13.107 13.581 14.019 14.511 15.092 15.672 16.302 16.981 17.705 18.464 19.313 20.307 21.31 22.463 23.693 25.113 26.704 28.544 30.622 32.795 34.221 34.808 35.028 35.019 34.872 34.673 34.383 34.085 33.77 33.424 33.083 32.726 32.397 32.079 31.755 31.411 31.08 30.772 30.422 30.067 29.796 29.482 29.145 28.891 28.609 28.319 28.022 27.697 27.467 27.212 26.793 26.507 26.212 26.042 25.656 25.241 24.805 24.594 24.034 23.951 23.705 23.454 22.842 22.485 22.136 21.749 21.291 20.747 19.981 18.236 -5 ,31508 ,TETRA ,17524357,Wed Nov 24 22:11:24 CET,Wed Nov 24 23:44:50 CET,0.0 1.73 2.365 2.844 3.262 3.63 3.948 4.226 4.744 4.991 5.228 5.298 5.907 6.109 6.503 6.884 7.231 7.395 7.74 8.099 8.585 8.879 9.156 9.578 9.993 10.398 10.773 11.126 11.58 12.002 12.431 12.96 13.458 13.946 14.513 15.136 15.725 16.347 17.014 17.732 18.46 19.27 20.228 21.188 22.293 23.535 24.957 26.518 28.304 30.311 32.532 34.136 34.853 35.144 35.247 35.227 35.103 34.855 34.564 34.239 33.953 33.689 33.392 33.092 32.822 32.542 32.206 31.867 31.535 31.188 30.834 30.558 30.261 29.936 29.682 29.407 29.115 28.787 28.428 28.196 27.957 27.571 27.298 27.005 26.855 26.535 26.178 25.795 25.591 25.02 24.938 24.699 24.431 23.851 23.518 23.149 22.768 22.313 21.775 21.098 19.454 -6 ,15267 ,TETRA ,17524359,Wed Nov 24 22:10:23 CET,Wed Nov 24 23:42:30 CET,0.0 1.243 1.826 2.324 2.74 3.09 3.412 3.715 4.26 4.515 4.758 4.828 5.442 5.652 6.032 6.388 6.737 6.897 7.197 7.501 7.935 8.206 8.474 8.859 9.219 9.573 9.909 10.237 10.677 11.114 11.55 12.05 12.507 12.947 13.432 13.957 14.472 15.042 15.655 16.289 16.961 17.739 18.616 19.5 20.524 21.636 22.911 24.354 26.054 27.998 30.209 31.876 32.653 32.945 32.94 32.768 32.492 32.191 31.916 31.619 31.33 31.041 30.713 30.368 30.032 29.698 29.319 28.959 28.647 28.335 28.025 27.751 27.439 27.109 26.848 26.569 26.288 25.99 25.679 25.476 25.26 24.889 24.61 24.32 24.172 23.852 23.492 23.1 22.879 22.302 22.233 21.982 21.721 21.161 20.839 20.493 20.106 19.634 19.084 18.425 16.401 -7 ,7443 ,TETRA ,17524362,Wed Nov 24 22:10:23 CET,Wed Nov 24 23:41:50 CET,0.0 1.165 1.753 2.261 2.686 3.062 3.392 3.694 4.244 4.494 4.746 4.811 5.391 5.599 5.994 6.339 6.679 6.853 7.175 7.456 7.864 8.162 8.445 8.79 9.129 9.473 9.799 10.123 10.568 11.003 11.413 11.891 12.353 12.82 13.359 13.951 14.511 15.132 15.789 16.455 17.117 17.867 18.79 19.722 20.797 22.012 23.422 24.964 26.706 28.674 30.966 32.567 33.209 33.421 33.444 33.344 33.132 32.848 32.561 32.259 31.97 31.653 31.279 30.898 30.558 30.242 29.888 29.537 29.239 28.93 28.594 28.318 28.021 27.698 27.443 27.166 26.871 26.586 26.269 26.037 25.793 25.4 25.126 24.832 24.677 24.347 24.008 23.657 23.459 22.877 22.775 22.549 22.311 21.778 21.468 21.121 20.724 20.295 19.788 19.07 17.129 -8 ,24349 ,TETRA ,17524363,Wed Nov 24 22:11:23 CET,Wed Nov 24 23:44:42 CET,0.0 2.4 3.059 3.536 3.944 4.313 4.648 4.965 5.535 5.785 6.016 6.067 6.678 6.891 7.288 7.669 8.04 8.213 8.554 8.883 9.336 9.621 9.909 10.328 10.725 11.089 11.448 11.806 12.246 12.688 13.13 13.653 14.138 14.592 15.127 15.717 16.282 16.914 17.569 18.253 18.982 19.791 20.749 21.717 22.817 24.032 25.409 26.943 28.723 30.743 33.012 34.615 35.338 35.644 35.668 35.556 35.425 35.262 35.031 34.732 34.446 34.176 33.879 33.574 33.304 33.043 32.73 32.42 32.15 31.858 31.542 31.285 31.008 30.697 30.443 30.168 29.868 29.543 29.196 28.944 28.676 28.253 27.966 27.668 27.51 27.175 26.804 26.404 26.191 25.62 25.523 25.283 25.018 24.412 24.081 23.725 23.316 22.849 22.292 21.611 19.258 -9 ,9098 ,TETRA ,17524365,Wed Nov 24 22:11:26 CET,Wed Nov 24 23:44:33 CET,0.0 1.555 2.141 2.594 3.037 3.463 3.804 4.088 4.608 4.851 5.095 5.163 5.738 5.927 6.298 6.634 6.974 7.157 7.502 7.813 8.259 8.556 8.842 9.249 9.636 10.003 10.362 10.721 11.171 11.568 11.948 12.407 12.84 13.268 13.781 14.387 14.963 15.557 16.169 16.807 17.502 18.296 19.178 20.074 21.117 22.249 23.623 25.19 26.968 28.999 31.28 32.866 33.578 33.869 33.898 33.756 33.595 33.393 33.104 32.761 32.436 32.116 31.769 31.405 31.059 30.729 30.378 30.046 29.741 29.401 29.055 28.776 28.448 28.071 27.791 27.506 27.188 26.876 26.564 26.333 26.089 25.719 25.464 25.164 25.008 24.71 24.388 24.006 23.796 23.238 23.165 22.93 22.674 22.08 21.77 21.434 21.063 20.595 19.998 19.279 17.894 -10 ,3699 ,TETRA ,17524367,Wed Nov 24 22:11:25 CET,Wed Nov 24 23:43:10 CET,0.0 1.528 2.128 2.582 3.006 3.404 3.768 4.085 4.611 4.867 5.108 5.157 5.774 5.98 6.374 6.755 7.105 7.273 7.592 7.893 8.314 8.597 8.872 9.266 9.665 10.031 10.379 10.732 11.19 11.628 12.029 12.521 13.003 13.456 13.998 14.605 15.18 15.8 16.448 17.138 17.853 18.642 19.534 20.416 21.446 22.546 23.827 25.269 26.956 28.92 31.114 32.662 33.329 33.551 33.491 33.312 33.096 32.836 32.563 32.247 31.946 31.636 31.285 30.929 30.591 30.246 29.873 29.544 29.236 28.902 28.55 28.259 27.957 27.626 27.364 27.093 26.8 26.503 26.209 25.988 25.749 25.387 25.118 24.834 24.687 24.383 24.072 23.686 23.469 22.889 22.761 22.499 22.223 21.62 21.297 20.947 20.57 20.147 19.587 18.846 16.658 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23468.txt deleted file mode 100644 index ef11ae02..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29371 ,TETRA ,17524370,Wed Nov 24 22:11:25 CET,Wed Nov 24 23:43:36 CET,0.0 1.59 2.271 2.782 3.193 3.537 3.864 4.192 4.754 5.006 5.248 5.305 5.918 6.134 6.497 6.849 7.192 7.357 7.688 8.026 8.5 8.778 9.03 9.388 9.727 10.031 10.328 10.62 10.982 11.322 11.648 12.052 12.437 12.793 13.184 13.611 14.012 14.447 14.915 15.396 15.869 16.395 16.997 17.548 18.136 18.729 19.366 20.067 20.769 21.367 21.722 21.507 20.996 20.374 19.696 18.98 18.328 17.728 17.163 16.592 16.06 15.541 15.072 14.641 14.175 13.712 13.243 12.832 12.495 12.138 11.731 11.384 11.012 10.638 10.339 10.013 9.681 9.304 8.91 8.643 8.376 7.968 7.666 7.334 7.16 6.806 6.444 6.07 5.875 5.281 5.222 4.99 4.746 4.2 3.906 3.582 3.209 2.774 2.257 1.571 -0.51 -2 ,7761 ,TETRA ,17524371,Wed Nov 24 22:11:27 CET,Wed Nov 24 23:43:48 CET,0.0 2.26 2.967 3.532 4.007 4.441 4.808 5.111 5.655 5.91 6.151 6.228 6.824 7.013 7.37 7.723 8.083 8.261 8.593 8.912 9.351 9.615 9.874 10.255 10.604 10.923 11.226 11.514 11.898 12.295 12.663 13.049 13.414 13.782 14.2 14.665 15.074 15.494 15.971 16.461 16.935 17.444 18.015 18.548 19.099 19.706 20.376 21.032 21.682 22.282 22.638 22.413 21.883 21.302 20.693 20.014 19.34 18.667 18.092 17.545 16.983 16.456 16.007 15.543 15.086 14.653 14.171 13.746 13.366 12.955 12.532 12.189 11.852 11.478 11.16 10.833 10.486 10.126 9.743 9.465 9.174 8.707 8.388 8.044 7.861 7.485 7.061 6.604 6.381 5.783 5.736 5.497 5.236 4.687 4.351 3.966 3.573 3.148 2.672 2.024 -1.501 -3 ,28640 ,TETRA ,17524373,Wed Nov 24 22:11:26 CET,Wed Nov 24 23:43:44 CET,0.0 2.71 3.451 4.049 4.551 4.948 5.278 5.568 6.108 6.365 6.596 6.64 7.234 7.43 7.816 8.164 8.488 8.649 8.943 9.214 9.65 9.93 10.18 10.55 10.896 11.213 11.509 11.8 12.183 12.557 12.916 13.322 13.709 14.083 14.5 14.952 15.365 15.807 16.254 16.698 17.147 17.639 18.249 18.876 19.519 20.153 20.804 21.433 22.104 22.721 23.07 22.861 22.37 21.749 21.091 20.46 19.852 19.26 18.735 18.179 17.652 17.151 16.667 16.202 15.756 15.314 14.839 14.425 14.05 13.63 13.216 12.89 12.525 12.121 11.807 11.494 11.166 10.79 10.386 10.113 9.845 9.446 9.154 8.825 8.652 8.305 7.943 7.557 7.348 6.735 6.652 6.384 6.097 5.474 5.095 4.698 4.281 3.815 3.267 2.452 0.597 -4 ,29883 ,TETRA ,17524376,Wed Nov 24 22:11:26 CET,Wed Nov 24 23:44:02 CET,0.0 2.201 2.879 3.441 3.903 4.282 4.611 4.907 5.454 5.717 5.96 6.029 6.635 6.844 7.222 7.581 7.923 8.087 8.408 8.71 9.129 9.413 9.675 10.007 10.332 10.646 10.959 11.28 11.679 12.043 12.38 12.778 13.141 13.49 13.899 14.358 14.785 15.241 15.716 16.202 16.745 17.295 17.863 18.437 19.042 19.65 20.313 21.011 21.677 22.287 22.704 22.552 22.015 21.42 20.795 20.12 19.469 18.861 18.281 17.654 17.131 16.655 16.21 15.8 15.35 14.885 14.418 14.017 13.669 13.288 12.881 12.529 12.143 11.745 11.443 11.115 10.76 10.405 10.029 9.766 9.492 9.061 8.76 8.454 8.294 7.964 7.631 7.257 7.049 6.452 6.378 6.133 5.883 5.322 4.999 4.657 4.299 3.91 3.407 2.672 0.292 -5 ,13568 ,TETRA ,17524378,Wed Nov 24 22:11:26 CET,Wed Nov 24 23:44:15 CET,0.0 2.275 2.948 3.453 3.91 4.3 4.646 4.967 5.557 5.806 6.037 6.114 6.712 6.921 7.314 7.682 8.026 8.183 8.498 8.808 9.226 9.482 9.727 10.07 10.411 10.733 11.032 11.328 11.692 12.024 12.353 12.755 13.137 13.506 13.913 14.33 14.723 15.161 15.605 16.048 16.492 16.991 17.539 18.053 18.657 19.277 19.903 20.538 21.218 21.836 22.179 21.923 21.367 20.752 20.054 19.338 18.68 18.037 17.457 16.873 16.374 15.865 15.372 14.942 14.537 14.171 13.76 13.32 12.927 12.537 12.113 11.763 11.372 10.969 10.683 10.382 10.066 9.733 9.384 9.135 8.868 8.461 8.18 7.871 7.71 7.385 7.045 6.657 6.451 5.853 5.75 5.506 5.239 4.598 4.253 3.883 3.46 2.963 2.39 1.655 -0.09 -6 ,12992 ,TETRA ,17524382,Wed Nov 24 22:11:31 CET,Wed Nov 24 23:45:04 CET,0.0 4.439 5.314 5.953 6.459 6.877 7.255 7.603 8.193 8.449 8.694 8.762 9.341 9.526 9.887 10.241 10.585 10.75 11.116 11.471 11.922 12.195 12.441 12.776 13.112 13.445 13.756 14.06 14.451 14.787 15.111 15.537 15.919 16.261 16.692 17.183 17.611 18.059 18.513 18.95 19.415 19.959 20.56 21.122 21.716 22.341 23.038 23.741 24.431 25.02 25.386 25.216 24.716 24.083 23.436 22.793 22.164 21.554 20.989 20.366 19.832 19.347 18.859 18.409 17.99 17.58 17.123 16.696 16.333 15.963 15.505 15.133 14.771 14.357 14.03 13.694 13.369 13.039 12.677 12.417 12.134 11.715 11.43 11.093 10.917 10.574 10.212 9.839 9.639 9.035 8.973 8.743 8.503 7.97 7.683 7.368 6.974 6.52 6.018 5.356 3.149 -7 ,23555 ,TETRA ,17524386,Wed Nov 24 22:11:26 CET,Wed Nov 24 23:44:28 CET,0.0 1.87 2.543 3.045 3.44 3.841 4.225 4.538 5.093 5.356 5.596 5.658 6.267 6.471 6.856 7.236 7.599 7.771 8.091 8.379 8.805 9.074 9.328 9.689 10.047 10.403 10.734 11.045 11.429 11.803 12.163 12.596 13.013 13.403 13.844 14.303 14.719 15.18 15.68 16.193 16.702 17.275 17.888 18.472 19.127 19.718 20.351 21.038 21.713 22.345 22.732 22.576 22.076 21.43 20.76 20.119 19.525 18.952 18.427 17.847 17.316 16.835 16.38 15.944 15.523 15.127 14.688 14.274 13.895 13.49 13.078 12.742 12.37 11.967 11.644 11.302 10.961 10.604 10.218 9.943 9.661 9.222 8.914 8.61 8.447 8.101 7.749 7.365 7.151 6.546 6.474 6.252 5.996 5.425 5.129 4.801 4.447 4.045 3.531 2.723 -0.646 -8 ,5008 ,TETRA ,17524388,Wed Nov 24 22:11:31 CET,Wed Nov 24 23:44:25 CET,0.0 2.233 2.993 3.538 3.967 4.353 4.737 5.079 5.656 5.929 6.176 6.204 6.797 6.998 7.385 7.739 8.075 8.244 8.582 8.891 9.303 9.568 9.833 10.213 10.564 10.89 11.208 11.523 11.914 12.296 12.654 13.054 13.416 13.773 14.199 14.648 15.073 15.521 15.987 16.476 16.974 17.531 18.162 18.758 19.436 20.177 20.982 21.778 22.521 23.12 23.45 23.204 22.732 22.182 21.531 20.887 20.288 19.682 19.122 18.556 18.059 17.6 17.144 16.68 16.235 15.851 15.455 15.069 14.724 14.376 13.995 13.647 13.268 12.884 12.592 12.291 12.003 11.699 11.36 11.093 10.779 10.321 10.021 9.698 9.514 9.122 8.75 8.358 8.132 7.512 7.442 7.2 6.946 6.393 6.096 5.769 5.385 4.934 4.393 3.744 1.305 -9 ,3921 ,TETRA ,17524389,Wed Nov 24 22:12:56 CET,Wed Nov 24 23:45:34 CET,0.0 2.094 2.791 3.301 3.716 4.081 4.423 4.753 5.396 5.675 5.935 6.048 6.669 6.898 7.331 7.738 8.105 8.279 8.613 8.919 9.367 9.647 9.894 10.251 10.6 10.936 11.248 11.54 11.909 12.254 12.613 13.036 13.415 13.763 14.136 14.535 14.912 15.338 15.777 16.213 16.702 17.259 17.834 18.391 19.014 19.662 20.358 21.065 21.758 22.353 22.687 22.51 22.024 21.412 20.782 20.071 19.405 18.791 18.213 17.609 17.1 16.64 16.156 15.686 15.246 14.825 14.374 13.958 13.595 13.222 12.813 12.454 12.073 11.669 11.353 11.009 10.66 10.314 9.953 9.708 9.449 9.048 8.747 8.423 8.263 7.931 7.588 7.19 6.952 6.319 6.225 5.99 5.741 5.147 4.837 4.504 4.134 3.726 3.252 2.613 0.746 -10 ,1466 ,TETRA ,17524391,Wed Nov 24 22:11:56 CET,Wed Nov 24 23:47:05 CET,0.0 2.333 3.014 3.585 4.075 4.508 4.857 5.159 5.758 6.044 6.288 6.342 6.956 7.156 7.52 7.853 8.169 8.32 8.615 8.91 9.312 9.564 9.808 10.149 10.479 10.791 11.1 11.397 11.729 12.021 12.321 12.719 13.11 13.493 13.965 14.494 14.965 15.448 15.956 16.472 16.985 17.551 18.191 18.791 19.454 20.171 20.992 21.862 22.752 23.659 24.537 24.854 24.773 24.525 24.133 23.7 23.321 22.935 22.532 22.08 21.657 21.279 20.882 20.488 20.107 19.769 19.443 19.134 18.866 18.578 18.269 18.007 17.715 17.412 17.161 16.879 16.591 16.3 15.982 15.755 15.522 15.168 14.932 14.684 14.543 14.232 13.919 13.569 13.387 12.832 12.881 12.681 12.445 11.923 11.642 11.344 10.985 10.532 10.049 9.482 7.736 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index 083a19f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18750 ,TETRA ,17524394,Wed Nov 24 22:12:00 CET,Wed Nov 24 23:52:30 CET,0.0 2.209 2.996 3.582 4.043 4.439 4.8 5.139 5.735 6.001 6.243 6.273 6.892 7.107 7.509 7.882 8.231 8.407 8.753 9.073 9.509 9.793 10.079 10.49 10.897 11.297 11.658 12.003 12.477 12.932 13.366 13.898 14.391 14.844 15.379 16.014 16.605 17.236 17.916 18.585 19.297 20.131 21.128 22.175 23.363 24.644 26.081 27.68 29.533 31.675 34.147 35.941 36.797 37.082 37.108 37.045 36.925 36.746 36.53 36.285 36.056 35.831 35.567 35.285 35.008 34.759 34.497 34.226 33.978 33.707 33.418 33.162 32.869 32.569 32.335 32.083 31.831 31.559 31.264 31.067 30.854 30.486 30.226 29.953 29.808 29.518 29.205 28.867 28.686 28.12 28.069 27.86 27.639 27.117 26.809 26.456 26.085 25.691 25.143 24.375 22.631 -2 ,27587 ,TETRA ,17524396,Wed Nov 24 22:11:58 CET,Wed Nov 24 23:46:03 CET,0.0 1.533 2.194 2.712 3.17 3.588 3.958 4.286 4.916 5.184 5.43 5.515 6.126 6.35 6.787 7.176 7.54 7.721 8.084 8.429 8.92 9.231 9.532 9.98 10.381 10.757 11.121 11.478 11.952 12.395 12.837 13.383 13.9 14.402 14.953 15.573 16.17 16.787 17.472 18.201 18.943 19.766 20.731 21.742 22.907 24.168 25.689 27.387 29.294 31.488 33.842 35.519 36.384 36.71 36.751 36.706 36.535 36.327 36.133 35.893 35.627 35.348 35.069 34.786 34.504 34.235 33.949 33.653 33.381 33.111 32.81 32.547 32.294 32.022 31.779 31.517 31.245 30.956 30.671 30.47 30.26 29.906 29.628 29.337 29.184 28.86 28.497 28.122 27.944 27.381 27.33 27.099 26.837 26.272 25.963 25.636 25.225 24.692 24.062 23.192 20.92 -3 ,4196 ,TETRA ,17524397,Wed Nov 24 22:11:57 CET,Wed Nov 24 23:45:49 CET,0.0 1.52 2.21 2.725 3.145 3.544 3.908 4.221 4.797 5.065 5.312 5.376 5.989 6.203 6.618 7.002 7.371 7.547 7.885 8.211 8.674 8.972 9.258 9.679 10.088 10.47 10.822 11.167 11.625 12.072 12.478 12.966 13.459 13.94 14.469 15.056 15.645 16.292 16.962 17.653 18.392 19.243 20.233 21.2 22.346 23.629 25.083 26.687 28.479 30.535 32.924 34.6 35.306 35.553 35.64 35.576 35.413 35.195 34.947 34.634 34.338 34.07 33.787 33.503 33.211 32.95 32.653 32.361 32.098 31.83 31.544 31.28 31.011 30.737 30.509 30.24 29.969 29.711 29.431 29.215 28.981 28.637 28.396 28.117 27.973 27.712 27.437 27.114 26.935 26.373 26.262 25.997 25.734 25.193 24.893 24.566 24.182 23.714 23.133 22.483 19.88 -4 ,30740 ,TETRA ,17524399,Wed Nov 24 22:11:57 CET,Wed Nov 24 23:50:55 CET,0.0 1.914 2.542 3.043 3.457 3.821 4.138 4.43 5.013 5.283 5.528 5.584 6.199 6.412 6.818 7.195 7.583 7.771 8.105 8.436 8.942 9.264 9.571 9.993 10.387 10.783 11.169 11.534 11.984 12.448 12.894 13.417 13.948 14.46 15.026 15.646 16.25 16.896 17.606 18.362 19.151 20.023 21.014 22.006 23.165 24.413 25.837 27.494 29.438 31.639 34.124 35.953 36.813 37.177 37.289 37.268 37.168 37.006 36.822 36.571 36.314 36.047 35.742 35.411 35.098 34.848 34.564 34.282 34.026 33.721 33.377 33.093 32.774 32.438 32.187 31.908 31.621 31.338 31.048 30.847 30.636 30.301 30.055 29.8 29.656 29.333 28.992 28.618 28.416 27.829 27.763 27.535 27.288 26.727 26.437 26.119 25.758 25.325 24.801 24.139 22.122 -5 ,19660 ,TETRA ,17524401,Wed Nov 24 22:12:00 CET,Wed Nov 24 23:47:09 CET,0.0 1.341 2.017 2.51 2.934 3.343 3.727 4.071 4.696 4.973 5.218 5.302 5.934 6.16 6.608 7.008 7.381 7.572 7.94 8.277 8.759 9.069 9.369 9.81 10.214 10.599 10.983 11.353 11.811 12.24 12.646 13.148 13.64 14.107 14.638 15.234 15.846 16.524 17.189 17.911 18.717 19.557 20.496 21.468 22.596 23.841 25.273 26.867 28.708 30.866 33.362 35.176 36.017 36.354 36.422 36.353 36.19 35.96 35.692 35.388 35.132 34.883 34.6 34.297 34.027 33.781 33.518 33.267 33.028 32.79 32.52 32.277 32.02 31.727 31.494 31.251 30.981 30.703 30.427 30.23 30.013 29.666 29.414 29.127 28.968 28.658 28.33 27.957 27.766 27.192 27.16 26.935 26.691 26.162 25.849 25.5 25.155 24.787 24.295 23.478 21.363 -6 ,15299 ,TETRA ,17524403,Wed Nov 24 22:12:04 CET,Wed Nov 24 23:47:13 CET,0.0 1.835 2.479 2.974 3.411 3.786 4.13 4.447 5.028 5.298 5.542 5.624 6.258 6.48 6.91 7.321 7.709 7.895 8.231 8.552 9.026 9.332 9.623 10.069 10.508 10.915 11.319 11.694 12.134 12.551 12.952 13.45 13.953 14.444 14.975 15.552 16.149 16.792 17.454 18.169 18.932 19.792 20.769 21.713 22.85 24.144 25.607 27.264 29.162 31.306 33.677 35.442 36.249 36.637 36.732 36.659 36.512 36.287 36.071 35.803 35.491 35.201 34.925 34.654 34.345 34.034 33.745 33.502 33.27 32.982 32.677 32.406 32.111 31.805 31.552 31.288 31.02 30.726 30.405 30.192 29.965 29.613 29.353 29.038 28.864 28.49 28.119 27.726 27.511 26.92 26.868 26.631 26.374 25.836 25.489 25.111 24.711 24.276 23.718 22.865 19.845 -7 ,23921 ,TETRA ,17524406,Wed Nov 24 22:11:58 CET,Wed Nov 24 23:46:42 CET,0.0 1.393 2.069 2.533 2.955 3.31 3.637 3.971 4.59 4.867 5.12 5.222 5.851 6.075 6.515 6.923 7.295 7.475 7.839 8.196 8.692 8.993 9.291 9.773 10.259 10.687 11.059 11.424 11.9 12.345 12.777 13.283 13.762 14.247 14.806 15.435 16.053 16.69 17.345 18.057 18.807 19.625 20.556 21.537 22.669 23.893 25.348 26.978 28.842 30.91 33.257 34.961 35.741 36.085 36.199 36.111 35.913 35.697 35.455 35.183 34.913 34.667 34.436 34.143 33.823 33.535 33.246 32.949 32.658 32.353 32.041 31.772 31.47 31.163 30.922 30.653 30.376 30.095 29.8 29.59 29.362 29.009 28.758 28.492 28.34 28.013 27.709 27.39 27.219 26.657 26.565 26.336 26.094 25.595 25.306 24.966 24.567 24.078 23.507 22.816 20.838 -8 ,22116 ,TETRA ,17524407,Wed Nov 24 22:12:00 CET,Wed Nov 24 23:45:48 CET,0.0 1.936 2.687 3.234 3.689 4.12 4.494 4.843 5.512 5.811 6.106 6.235 6.882 7.112 7.53 7.919 8.311 8.508 8.888 9.258 9.759 10.067 10.366 10.801 11.224 11.644 12.057 12.434 12.898 13.342 13.767 14.273 14.793 15.29 15.832 16.427 16.969 17.567 18.238 18.954 19.695 20.566 21.607 22.608 23.723 24.96 26.366 27.909 29.747 31.928 34.351 36.069 36.869 37.239 37.33 37.316 37.21 36.968 36.71 36.438 36.136 35.843 35.554 35.261 34.978 34.671 34.314 33.996 33.733 33.443 33.113 32.845 32.564 32.248 31.998 31.749 31.487 31.205 30.911 30.694 30.466 30.118 29.858 29.583 29.43 29.095 28.75 28.364 28.165 27.596 27.532 27.302 27.054 26.521 26.221 25.859 25.463 25.02 24.422 23.715 21.64 -9 ,16455 ,TETRA ,17524410,Wed Nov 24 22:12:03 CET,Wed Nov 24 23:46:07 CET,0.0 1.956 2.682 3.201 3.65 4.02 4.341 4.641 5.192 5.443 5.682 5.742 6.343 6.543 6.939 7.319 7.701 7.89 8.251 8.589 9.068 9.377 9.677 10.108 10.533 10.922 11.292 11.657 12.12 12.571 12.985 13.497 14.007 14.474 14.993 15.562 16.133 16.765 17.432 18.142 18.869 19.716 20.709 21.672 22.798 24.043 25.438 27.013 28.899 31.103 33.563 35.293 36.006 36.236 36.289 36.278 36.208 36.039 35.801 35.499 35.218 34.957 34.677 34.405 34.111 33.805 33.485 33.168 32.886 32.571 32.211 31.954 31.692 31.383 31.128 30.85 30.583 30.315 30.006 29.796 29.571 29.197 28.961 28.702 28.55 28.245 27.942 27.613 27.447 26.894 26.815 26.57 26.323 25.766 25.471 25.165 24.801 24.38 23.88 23.154 21.026 -10 ,2821 ,TETRA ,17524411,Wed Nov 24 22:12:04 CET,Wed Nov 24 23:46:07 CET,0.0 2.562 3.424 4.005 4.472 4.859 5.218 5.554 6.142 6.411 6.672 6.77 7.394 7.611 8.031 8.443 8.852 9.035 9.373 9.702 10.146 10.43 10.707 11.112 11.514 11.886 12.248 12.601 13.047 13.501 13.936 14.438 14.932 15.404 15.92 16.488 17.073 17.718 18.392 19.099 19.825 20.65 21.619 22.607 23.744 25.028 26.527 28.157 30.001 32.102 34.538 36.296 37.11 37.453 37.509 37.437 37.252 37.006 36.798 36.572 36.311 36.039 35.782 35.521 35.22 34.932 34.672 34.433 34.177 33.876 33.553 33.287 33.007 32.712 32.49 32.255 32.001 31.747 31.451 31.218 30.996 30.673 30.437 30.181 30.046 29.763 29.472 29.161 28.984 28.414 28.374 28.142 27.892 27.38 27.088 26.766 26.405 25.955 25.414 24.687 23.092 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23469.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23469.txt deleted file mode 100644 index ccc67ec6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23469.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31855 ,KEBNE ,17019511,Wed Dec 22 03:00:45 CET,Wed Dec 22 04:22:56 CET,0.0 1.877 2.7 3.273 3.697 4.055 4.379 4.696 5.242 5.503 5.753 5.794 6.418 6.644 7.058 7.431 7.802 7.979 8.316 8.635 9.097 9.402 9.689 10.09 10.462 10.828 11.185 11.526 11.971 12.401 12.814 13.313 13.808 14.284 14.823 15.435 16.046 16.683 17.345 18.049 18.747 19.547 20.481 21.409 22.496 23.678 25.076 26.587 28.205 30.125 32.423 34.074 34.823 35.179 35.279 35.245 35.121 34.941 34.753 34.515 34.283 34.035 33.776 33.529 33.275 33.019 32.739 32.473 32.222 31.962 31.671 31.429 31.169 30.873 30.629 30.356 30.071 29.774 29.466 29.249 29.025 28.668 28.403 28.142 28.018 27.744 27.431 27.075 26.879 26.305 26.265 26.047 25.833 25.307 25.002 24.674 24.303 23.903 23.442 22.788 20.673 -2 ,31009 ,KEBNE ,17019512,Wed Dec 22 03:00:45 CET,Wed Dec 22 04:21:20 CET,0.0 3.172 4.16 4.905 5.535 6.078 6.572 7.019 7.724 8.032 8.341 8.502 9.16 9.415 9.889 10.314 10.703 10.903 11.284 11.638 12.149 12.469 12.793 13.292 13.751 14.14 14.513 14.881 15.335 15.767 16.181 16.685 17.183 17.65 18.178 18.769 19.336 19.942 20.59 21.272 21.998 22.822 23.74 24.649 25.706 26.917 28.287 29.752 31.463 33.398 35.559 37.076 37.776 38.047 38.098 38.003 37.791 37.498 37.2 36.878 36.592 36.331 36.064 35.796 35.524 35.264 34.983 34.718 34.454 34.196 33.961 33.737 33.478 33.197 32.973 32.747 32.493 32.222 31.938 31.732 31.496 31.113 30.88 30.63 30.492 30.211 29.905 29.576 29.406 28.867 28.887 28.673 28.438 27.924 27.671 27.381 27.013 26.625 26.206 25.606 23.42 -3 ,16764 ,KEBNE ,17019513,Wed Dec 22 03:00:53 CET,Wed Dec 22 04:21:34 CET,0.0 1.647 2.418 3.044 3.536 3.924 4.274 4.592 5.123 5.403 5.696 5.88 6.537 6.806 7.293 7.699 8.057 8.239 8.587 8.92 9.404 9.709 9.998 10.416 10.822 11.208 11.572 11.912 12.345 12.745 13.146 13.668 14.169 14.628 15.142 15.726 16.285 16.892 17.522 18.186 18.887 19.67 20.581 21.495 22.56 23.721 25.019 26.469 28.173 30.167 32.423 34.027 34.765 35.001 35.012 34.917 34.774 34.61 34.402 34.136 33.885 33.643 33.38 33.104 32.83 32.567 32.272 31.997 31.753 31.487 31.208 30.971 30.694 30.381 30.15 29.931 29.684 29.413 29.137 28.951 28.747 28.398 28.142 27.883 27.753 27.467 27.175 26.834 26.65 26.107 26.115 25.903 25.675 25.154 24.855 24.513 24.133 23.679 23.104 22.379 20.849 -4 ,8698 ,KEBNE ,17019514,Wed Dec 22 03:00:53 CET,Wed Dec 22 04:23:10 CET,0.0 3.268 4.209 4.809 5.34 5.823 6.248 6.637 7.319 7.619 7.907 8.036 8.68 8.917 9.36 9.783 10.185 10.373 10.763 11.13 11.604 11.944 12.278 12.729 13.159 13.587 14.006 14.399 14.898 15.377 15.833 16.365 16.875 17.369 17.91 18.495 19.08 19.712 20.39 21.091 21.793 22.585 23.483 24.399 25.466 26.592 27.873 29.311 30.919 32.777 34.916 36.388 36.924 37.07 37.104 36.979 36.793 36.562 36.33 36.047 35.734 35.445 35.177 34.922 34.672 34.426 34.13 33.857 33.61 33.328 33.058 32.82 32.541 32.236 31.978 31.718 31.47 31.206 30.911 30.712 30.498 30.136 29.889 29.612 29.453 29.137 28.805 28.429 28.23 27.662 27.639 27.427 27.201 26.691 26.375 26.031 25.644 25.202 24.657 23.92 21.664 -5 ,9544 ,KEBNE ,17019515,Wed Dec 22 03:00:53 CET,Wed Dec 22 04:21:28 CET,0.0 1.679 2.383 2.895 3.348 3.731 4.079 4.4 4.993 5.264 5.523 5.606 6.216 6.421 6.82 7.204 7.573 7.749 8.073 8.386 8.842 9.145 9.452 9.878 10.28 10.662 11.04 11.416 11.882 12.324 12.74 13.233 13.709 14.138 14.642 15.228 15.768 16.369 17.022 17.729 18.453 19.239 20.152 21.081 22.137 23.27 24.569 26.004 27.681 29.627 31.837 33.383 34.061 34.389 34.533 34.5 34.365 34.145 33.916 33.644 33.365 33.089 32.801 32.507 32.213 31.949 31.643 31.332 31.086 30.837 30.528 30.248 29.972 29.677 29.425 29.168 28.912 28.66 28.383 28.165 27.938 27.586 27.341 27.087 26.946 26.651 26.348 25.996 25.816 25.259 25.23 25.021 24.799 24.298 24.009 23.666 23.294 22.898 22.456 21.85 20.309 -6 ,24153 ,KEBNE ,17019516,Wed Dec 22 03:00:59 CET,Wed Dec 22 04:21:52 CET,0.0 1.878 2.635 3.163 3.598 3.984 4.337 4.669 5.271 5.544 5.79 5.871 6.508 6.734 7.172 7.579 7.956 8.141 8.504 8.82 9.249 9.542 9.836 10.271 10.675 11.055 11.419 11.75 12.179 12.616 13.035 13.514 13.959 14.4 14.919 15.494 16.046 16.666 17.308 17.983 18.704 19.5 20.4 21.284 22.336 23.506 24.838 26.296 27.967 29.904 32.069 33.645 34.35 34.64 34.709 34.675 34.56 34.377 34.165 33.874 33.568 33.296 33.061 32.806 32.547 32.275 31.96 31.709 31.495 31.256 30.986 30.757 30.516 30.227 29.981 29.733 29.488 29.23 28.957 28.755 28.548 28.242 28.003 27.741 27.616 27.337 27.03 26.699 26.516 25.95 25.904 25.686 25.455 24.954 24.676 24.334 23.964 23.56 23.035 22.339 19.963 -7 ,26184 ,KEBNE ,17019517,Wed Dec 22 03:00:59 CET,Wed Dec 22 04:22:55 CET,0.0 6.823 7.81 8.466 8.994 9.416 9.783 10.155 10.817 11.093 11.353 11.439 12.068 12.286 12.695 13.112 13.501 13.68 14.043 14.389 14.898 15.233 15.546 15.982 16.398 16.823 17.241 17.648 18.142 18.574 18.997 19.517 20.017 20.513 21.066 21.652 22.225 22.848 23.473 24.123 24.811 25.583 26.49 27.36 28.369 29.505 30.771 32.205 33.842 35.675 37.748 39.171 39.746 40.001 40.01 39.9 39.761 39.543 39.288 38.988 38.675 38.353 38.044 37.735 37.45 37.201 36.927 36.655 36.408 36.124 35.801 35.549 35.269 34.984 34.758 34.489 34.207 33.924 33.64 33.446 33.226 32.886 32.643 32.344 32.195 31.92 31.61 31.249 31.065 30.502 30.471 30.247 30.002 29.479 29.201 28.889 28.539 28.08 27.465 26.708 24.75 -8 ,24211 ,KEBNE ,17019518,Wed Dec 22 03:00:59 CET,Wed Dec 22 04:21:35 CET,0.0 3.141 4.007 4.616 5.146 5.615 6.01 6.365 7.0 7.282 7.557 7.672 8.3 8.523 8.954 9.355 9.75 9.946 10.322 10.683 11.177 11.49 11.794 12.252 12.683 13.067 13.449 13.841 14.34 14.798 15.215 15.706 16.181 16.648 17.213 17.845 18.417 19.025 19.687 20.418 21.171 21.95 22.825 23.732 24.783 25.892 27.133 28.542 30.197 32.08 34.15 35.604 36.293 36.558 36.575 36.476 36.345 36.203 35.995 35.699 35.442 35.189 34.951 34.731 34.47 34.202 33.93 33.694 33.478 33.241 32.987 32.763 32.498 32.194 31.964 31.718 31.436 31.153 30.831 30.601 30.382 30.038 29.783 29.499 29.356 29.078 28.786 28.465 28.285 27.711 27.648 27.428 27.201 26.647 26.328 25.978 25.58 25.141 24.623 23.983 22.256 -9 ,28167 ,KEBNE ,17019519,Wed Dec 22 03:01:00 CET,Wed Dec 22 04:21:45 CET,0.0 1.668 2.387 2.949 3.452 3.855 4.194 4.495 5.04 5.295 5.552 5.653 6.288 6.519 6.949 7.339 7.694 7.878 8.255 8.588 9.052 9.35 9.642 10.052 10.442 10.847 11.24 11.6 12.07 12.522 12.939 13.447 13.951 14.445 14.985 15.577 16.169 16.793 17.43 18.093 18.765 19.54 20.447 21.326 22.337 23.465 24.831 26.342 28.084 30.135 32.235 33.722 34.421 34.689 34.785 34.773 34.676 34.473 34.212 33.92 33.665 33.417 33.175 32.905 32.565 32.275 32.02 31.782 31.563 31.313 31.044 30.808 30.547 30.277 30.043 29.804 29.566 29.285 28.97 28.767 28.558 28.223 27.984 27.712 27.567 27.277 26.964 26.627 26.458 25.9 25.859 25.647 25.424 24.89 24.569 24.244 23.88 23.406 22.865 22.106 19.466 -10 ,27660 ,KEBNE ,17019520,Wed Dec 22 03:01:00 CET,Wed Dec 22 04:23:02 CET,0.0 3.819 4.749 5.382 5.876 6.309 6.709 7.077 7.753 8.046 8.309 8.418 9.047 9.276 9.774 10.216 10.583 10.766 11.112 11.445 11.926 12.228 12.514 12.919 13.34 13.757 14.157 14.539 15.023 15.492 15.943 16.482 16.991 17.487 18.047 18.652 19.217 19.831 20.481 21.165 21.899 22.704 23.625 24.563 25.621 26.789 28.141 29.581 31.2 33.039 35.093 36.501 37.085 37.326 37.364 37.245 37.092 36.889 36.633 36.34 36.085 35.815 35.477 35.146 34.867 34.589 34.271 33.995 33.751 33.49 33.212 32.97 32.676 32.354 32.084 31.793 31.522 31.248 30.939 30.727 30.517 30.188 29.955 29.694 29.564 29.284 28.975 28.647 28.463 27.899 27.871 27.653 27.408 26.855 26.559 26.246 25.879 25.421 24.864 24.126 22.3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23471.txt deleted file mode 100644 index e974bcc7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,23311 ,TETRA ,17524417,Wed Nov 24 22:12:58 CET,Wed Nov 24 23:46:09 CET,0.0 1.546 2.147 2.618 3.04 3.41 3.754 4.058 4.577 4.837 5.095 5.188 5.81 6.015 6.41 6.808 7.164 7.332 7.685 8.04 8.529 8.822 9.114 9.524 9.92 10.309 10.68 11.028 11.484 11.956 12.377 12.881 13.389 13.894 14.451 15.014 15.549 16.142 16.758 17.387 18.08 18.871 19.761 20.596 21.546 22.589 23.699 24.923 26.312 27.792 29.265 30.075 30.242 29.984 29.537 29.021 28.501 28.043 27.643 27.179 26.761 26.338 25.882 25.463 25.053 24.662 24.241 23.855 23.532 23.181 22.769 22.422 22.057 21.686 21.385 21.048 20.712 20.362 19.998 19.752 19.484 19.037 18.732 18.394 18.215 17.862 17.477 17.059 16.837 16.213 16.074 15.778 15.469 14.738 14.339 13.932 13.46 12.903 12.238 11.306 7.205 -4 ,14620 ,TETRA ,17524420,Wed Nov 24 22:13:03 CET,Wed Nov 24 23:47:05 CET,0.0 1.286 1.897 2.397 2.785 3.127 3.45 3.75 4.291 4.556 4.806 4.875 5.491 5.704 6.097 6.458 6.802 6.973 7.3 7.623 8.092 8.389 8.674 9.081 9.481 9.866 10.24 10.598 11.053 11.501 11.92 12.398 12.859 13.296 13.814 14.425 14.981 15.567 16.213 16.902 17.627 18.385 19.227 20.082 21.048 22.115 23.269 24.514 25.945 27.36 28.725 29.528 29.623 29.454 29.192 28.861 28.538 28.221 27.907 27.53 27.163 26.813 26.449 26.087 25.704 25.337 24.951 24.597 24.285 23.924 23.554 23.239 22.898 22.546 22.273 21.99 21.69 21.36 21.0 20.758 20.504 20.085 19.784 19.461 19.3 18.952 18.527 18.057 17.821 17.199 17.081 16.816 16.504 15.741 15.315 14.854 14.354 13.786 13.066 11.943 5.988 -5 ,25162 ,TETRA ,17524422,Wed Nov 24 22:13:00 CET,Wed Nov 24 23:43:48 CET,0.0 1.163 1.811 2.379 2.828 3.204 3.546 3.852 4.408 4.67 4.913 4.977 5.589 5.797 6.199 6.574 6.94 7.113 7.43 7.748 8.234 8.541 8.829 9.248 9.645 10.012 10.372 10.732 11.157 11.557 11.945 12.402 12.869 13.322 13.821 14.381 14.894 15.44 16.077 16.751 17.412 18.159 19.033 19.914 20.895 21.984 23.216 24.445 25.705 27.048 28.522 29.364 29.501 29.376 29.102 28.749 28.354 27.944 27.548 27.118 26.756 26.403 26.012 25.601 25.195 24.85 24.462 24.074 23.717 23.339 22.944 22.606 22.235 21.831 21.517 21.188 20.848 20.487 20.111 19.86 19.578 19.124 18.832 18.539 18.378 18.022 17.657 17.288 17.099 16.49 16.425 16.191 15.928 15.309 14.963 14.609 14.192 13.671 13.027 11.896 6.441 -6 ,13111 ,TETRA ,17524423,Wed Nov 24 22:12:59 CET,Wed Nov 24 23:47:05 CET,0.0 1.1 1.758 2.277 2.673 3.023 3.33 3.648 4.246 4.5 4.737 4.809 5.426 5.642 6.051 6.429 6.832 7.031 7.401 7.742 8.207 8.502 8.793 9.233 9.648 10.024 10.392 10.746 11.176 11.599 12.017 12.523 12.992 13.435 13.941 14.484 15.006 15.58 16.189 16.809 17.453 18.183 18.977 19.789 20.747 21.795 22.962 24.184 25.548 27.003 28.542 29.419 29.513 29.379 29.144 28.798 28.468 28.096 27.686 27.276 26.917 26.565 26.214 25.822 25.424 25.068 24.661 24.265 23.921 23.572 23.212 22.887 22.518 22.141 21.855 21.562 21.243 20.885 20.517 20.245 19.954 19.532 19.232 18.888 18.711 18.373 17.991 17.575 17.362 16.751 16.645 16.367 16.077 15.43 15.053 14.643 14.175 13.642 12.967 11.905 6.859 -7 ,22184 ,TETRA ,17524425,Wed Nov 24 22:13:58 CET,Wed Nov 24 23:49:06 CET,0.0 1.278 1.883 2.364 2.803 3.166 3.511 3.839 4.414 4.674 4.914 4.974 5.594 5.807 6.207 6.606 6.984 7.153 7.481 7.808 8.295 8.591 8.862 9.277 9.701 10.087 10.447 10.825 11.307 11.765 12.192 12.688 13.149 13.576 14.097 14.677 15.234 15.859 16.524 17.229 17.946 18.717 19.57 20.399 21.377 22.419 23.575 24.824 26.124 27.581 29.07 29.936 30.236 30.155 29.883 29.529 29.181 28.81 28.434 28.008 27.608 27.256 26.892 26.476 26.058 25.686 25.292 24.906 24.564 24.167 23.758 23.477 23.171 22.813 22.53 22.234 21.915 21.57 21.199 20.945 20.676 20.233 19.915 19.598 19.437 19.096 18.724 18.301 18.083 17.472 17.373 17.113 16.836 16.222 15.847 15.439 15.004 14.451 13.653 12.603 8.032 -8 ,22176 ,TETRA ,17524427,Wed Nov 24 22:13:58 CET,Wed Nov 24 23:44:02 CET,0.0 1.543 2.203 2.717 3.13 3.525 3.877 4.167 4.734 4.992 5.22 5.272 5.88 6.078 6.455 6.811 7.146 7.312 7.636 7.939 8.391 8.678 8.953 9.386 9.788 10.149 10.506 10.852 11.264 11.659 12.091 12.61 13.089 13.552 14.062 14.624 15.153 15.727 16.388 17.105 17.784 18.503 19.354 20.188 21.149 22.25 23.463 24.69 26.058 27.517 28.858 29.601 29.675 29.48 29.269 28.96 28.563 28.166 27.749 27.249 26.798 26.354 25.915 25.48 25.068 24.696 24.28 23.886 23.527 23.124 22.675 22.32 21.985 21.615 21.306 20.975 20.603 20.216 19.855 19.614 19.319 18.83 18.467 18.095 17.925 17.55 17.158 16.771 16.553 15.93 15.794 15.483 15.127 14.366 13.977 13.534 13.067 12.509 11.789 10.655 0.542 -9 ,11147 ,TETRA ,17524432,Wed Nov 24 22:14:58 CET,Wed Nov 24 23:48:57 CET,0.0 1.131 1.707 2.173 2.582 2.93 3.234 3.528 4.076 4.341 4.609 4.698 5.298 5.513 5.912 6.269 6.627 6.801 7.134 7.46 7.935 8.234 8.524 8.948 9.344 9.711 10.051 10.395 10.825 11.205 11.588 12.043 12.47 12.908 13.419 13.99 14.539 15.145 15.795 16.467 17.176 17.939 18.774 19.621 20.625 21.699 22.876 24.123 25.468 26.92 28.385 29.096 29.072 28.846 28.558 28.229 27.863 27.439 27.006 26.533 26.109 25.743 25.358 24.97 24.6 24.224 23.831 23.479 23.17 22.823 22.455 22.156 21.837 21.476 21.161 20.85 20.533 20.17 19.799 19.549 19.298 18.88 18.565 18.242 18.071 17.703 17.292 16.859 16.624 15.999 15.877 15.596 15.299 14.611 14.224 13.808 13.321 12.75 12.014 10.992 5.902 -10 ,24368 ,TETRA ,17524433,Wed Nov 24 22:14:57 CET,Wed Nov 24 23:48:12 CET,0.0 1.361 2.022 2.457 2.836 3.213 3.559 3.869 4.424 4.679 4.93 4.988 5.582 5.784 6.164 6.517 6.857 7.031 7.385 7.719 8.181 8.467 8.747 9.152 9.527 9.91 10.28 10.612 11.032 11.445 11.833 12.279 12.717 13.149 13.648 14.209 14.738 15.287 15.874 16.506 17.143 17.877 18.711 19.504 20.408 21.394 22.52 23.753 25.136 26.503 27.784 28.488 28.624 28.515 28.262 27.923 27.518 27.053 26.572 26.019 25.54 25.125 24.728 24.354 23.987 23.623 23.247 22.909 22.581 22.255 21.93 21.611 21.273 20.905 20.612 20.299 19.978 19.665 19.311 19.047 18.776 18.362 18.075 17.766 17.609 17.267 16.862 16.435 16.214 15.598 15.491 15.221 14.926 14.258 13.899 13.504 13.02 12.423 11.72 10.688 5.374 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23473_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23473_23467.txt deleted file mode 100644 index 30b93db5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23473_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10526 ,TETRA ,17524435,Wed Nov 24 22:14:59 CET,Wed Nov 24 23:49:25 CET,0.0 1.397 1.976 2.407 2.747 3.028 3.29 3.549 4.009 4.218 4.415 4.422 4.971 5.152 5.485 5.782 6.064 6.21 6.496 6.755 7.119 7.344 7.567 7.887 8.165 8.421 8.672 8.934 9.284 9.608 9.919 10.254 10.562 10.878 11.258 11.671 12.034 12.424 12.865 13.326 13.763 14.228 14.764 15.273 15.815 16.4 17.0 17.614 18.23 18.77 19.104 18.898 18.409 17.814 17.148 16.468 15.858 15.273 14.74 14.169 13.664 13.211 12.769 12.338 11.942 11.565 11.12 10.725 10.361 9.959 9.522 9.149 8.787 8.418 8.128 7.844 7.533 7.16 6.743 6.453 6.167 5.697 5.326 4.936 4.741 4.308 3.861 3.444 3.214 2.61 2.431 2.122 1.812 1.146 0.734 0.289 -0.175 -0.767 -1.588 -2.663 -6.869 -2 ,32022 ,TETRA ,17524438,Wed Nov 24 22:14:58 CET,Wed Nov 24 23:47:49 CET,0.0 1.045 1.552 1.986 2.336 2.61 2.857 3.098 3.536 3.733 3.917 3.909 4.444 4.605 4.896 5.17 5.433 5.555 5.787 6.021 6.356 6.553 6.764 7.085 7.363 7.629 7.888 8.123 8.421 8.725 9.011 9.343 9.683 9.996 10.33 10.713 11.082 11.482 11.872 12.245 12.657 13.13 13.636 14.107 14.66 15.228 15.834 16.49 17.139 17.691 17.987 17.793 17.312 16.765 16.164 15.544 14.958 14.382 13.878 13.35 12.885 12.44 11.981 11.528 11.107 10.713 10.292 9.915 9.604 9.275 8.875 8.526 8.172 7.823 7.541 7.206 6.862 6.526 6.167 5.9 5.601 5.106 4.782 4.448 4.258 3.821 3.379 2.961 2.72 2.108 1.966 1.688 1.38 0.681 0.281 -0.16 -0.69 -1.307 -2.08 -3.172 -8.622 -3 ,16488 ,TETRA ,17524440,Wed Nov 24 22:15:02 CET,Wed Nov 24 23:48:01 CET,0.0 1.299 1.907 2.4 2.794 3.14 3.414 3.674 4.156 4.38 4.59 4.629 5.182 5.36 5.702 6.003 6.289 6.438 6.707 6.965 7.334 7.561 7.788 8.116 8.413 8.694 8.944 9.176 9.506 9.828 10.124 10.481 10.818 11.117 11.471 11.876 12.236 12.629 13.039 13.431 13.841 14.347 14.896 15.358 15.849 16.409 17.091 17.777 18.402 18.938 19.254 18.987 18.421 17.811 17.178 16.515 15.88 15.307 14.814 14.281 13.792 13.347 12.907 12.507 12.105 11.68 11.222 10.815 10.435 10.036 9.619 9.25 8.858 8.437 8.122 7.802 7.454 7.071 6.645 6.347 6.053 5.622 5.317 4.968 4.782 4.401 3.975 3.513 3.291 2.69 2.5 2.211 1.895 1.173 0.736 0.256 -0.228 -0.794 -1.526 -2.614 -6.868 -4 ,15452 ,TETRA ,17524442,Wed Nov 24 22:14:58 CET,Wed Nov 24 23:47:24 CET,0.0 1.972 2.575 3.052 3.411 3.73 4.042 4.35 4.858 5.073 5.283 5.306 5.854 6.02 6.329 6.631 6.911 7.042 7.301 7.543 7.875 8.095 8.311 8.599 8.896 9.21 9.481 9.698 9.981 10.264 10.539 10.878 11.206 11.512 11.831 12.184 12.543 12.927 13.34 13.777 14.181 14.623 15.131 15.603 16.129 16.668 17.187 17.731 18.35 18.921 19.211 18.978 18.496 17.893 17.301 16.684 16.113 15.604 15.112 14.573 14.079 13.652 13.203 12.73 12.267 11.793 11.296 10.885 10.545 10.186 9.776 9.43 9.07 8.705 8.395 8.035 7.657 7.263 6.863 6.586 6.299 5.857 5.522 5.14 4.953 4.575 4.151 3.701 3.46 2.85 2.644 2.356 2.053 1.337 0.924 0.476 -0.029 -0.627 -1.3 -2.128 -10.439 -5 ,12668 ,TETRA ,17524444,Wed Nov 24 22:15:02 CET,Wed Nov 24 23:48:05 CET,0.0 1.581 2.152 2.595 2.946 3.252 3.551 3.826 4.299 4.539 4.793 4.907 5.453 5.606 5.903 6.191 6.464 6.597 6.854 7.115 7.481 7.7 7.918 8.263 8.574 8.853 9.121 9.372 9.689 9.983 10.252 10.573 10.882 11.178 11.507 11.859 12.196 12.579 12.983 13.381 13.773 14.21 14.711 15.187 15.695 16.225 16.824 17.416 18.016 18.548 18.842 18.664 18.183 17.62 17.025 16.395 15.808 15.244 14.71 14.15 13.635 13.145 12.654 12.174 11.725 11.321 10.895 10.483 10.116 9.738 9.349 8.994 8.619 8.234 7.905 7.553 7.212 6.849 6.448 6.176 5.87 5.384 5.055 4.714 4.547 4.186 3.792 3.348 3.101 2.487 2.293 1.994 1.677 0.981 0.592 0.152 -0.317 -0.87 -1.58 -2.459 -6.372 -6 ,24230 ,TETRA ,17524447,Wed Nov 24 22:14:59 CET,Wed Nov 24 23:47:44 CET,0.0 1.295 1.909 2.315 2.666 2.989 3.268 3.531 3.988 4.186 4.386 4.434 4.982 5.151 5.451 5.736 6.027 6.165 6.426 6.67 7.022 7.25 7.469 7.781 8.052 8.297 8.55 8.791 9.09 9.392 9.666 9.986 10.326 10.666 11.042 11.422 11.787 12.18 12.563 12.982 13.435 13.897 14.399 14.903 15.444 16.021 16.66 17.27 17.875 18.412 18.711 18.544 18.094 17.503 16.892 16.328 15.799 15.285 14.804 14.277 13.763 13.278 12.81 12.366 11.938 11.517 11.03 10.575 10.201 9.819 9.427 9.076 8.669 8.255 7.957 7.64 7.286 6.915 6.514 6.211 5.898 5.412 5.076 4.737 4.551 4.144 3.718 3.268 3.031 2.422 2.247 1.948 1.612 0.843 0.399 -0.128 -0.726 -1.401 -2.208 -3.294 -8.423 -7 ,10997 ,TETRA ,17524449,Wed Nov 24 22:14:59 CET,Wed Nov 24 23:47:47 CET,0.0 1.039 1.592 1.995 2.331 2.622 2.896 3.153 3.607 3.804 3.993 4.013 4.545 4.708 5.032 5.341 5.638 5.778 6.052 6.324 6.705 6.94 7.157 7.48 7.791 8.082 8.362 8.616 8.924 9.234 9.543 9.898 10.22 10.534 10.876 11.232 11.616 12.031 12.445 12.883 13.287 13.681 14.153 14.629 15.143 15.696 16.292 16.911 17.534 18.104 18.49 18.327 17.847 17.254 16.634 16.043 15.453 14.834 14.304 13.794 13.309 12.84 12.412 11.998 11.598 11.214 10.786 10.376 9.998 9.615 9.2 8.816 8.422 7.993 7.646 7.297 6.942 6.586 6.209 5.942 5.661 5.207 4.877 4.52 4.323 3.898 3.435 2.991 2.781 2.191 2.028 1.735 1.427 0.717 0.3 -0.13 -0.585 -1.158 -1.874 -2.874 -6.741 -8 ,30078 ,TETRA ,17524451,Wed Nov 24 22:14:59 CET,Wed Nov 24 23:49:14 CET,0.0 1.254 1.871 2.311 2.662 2.979 3.255 3.513 3.99 4.204 4.416 4.448 4.997 5.18 5.516 5.819 6.106 6.243 6.491 6.725 7.066 7.276 7.483 7.787 8.065 8.348 8.607 8.85 9.192 9.512 9.812 10.19 10.548 10.866 11.21 11.563 11.887 12.267 12.676 13.056 13.445 13.879 14.359 14.814 15.331 15.91 16.494 17.047 17.617 18.188 18.543 18.382 17.93 17.396 16.86 16.269 15.69 15.142 14.65 14.128 13.643 13.19 12.741 12.318 11.947 11.581 11.174 10.823 10.499 10.13 9.735 9.38 9.009 8.654 8.378 8.065 7.727 7.372 6.99 6.71 6.407 5.925 5.572 5.208 5.025 4.626 4.209 3.796 3.57 2.961 2.801 2.515 2.211 1.519 1.107 0.664 0.167 -0.407 -1.103 -2.093 -5.877 -9 ,15707 ,TETRA ,17524453,Wed Nov 24 22:15:00 CET,Wed Nov 24 23:47:13 CET,0.0 1.402 1.997 2.409 2.75 3.044 3.359 3.652 4.114 4.332 4.531 4.517 5.048 5.22 5.537 5.815 6.094 6.236 6.507 6.754 7.115 7.339 7.548 7.868 8.152 8.389 8.636 8.882 9.175 9.464 9.765 10.129 10.462 10.764 11.084 11.434 11.774 12.167 12.564 12.953 13.346 13.763 14.28 14.771 15.318 15.901 16.48 17.043 17.603 18.136 18.444 18.214 17.7 17.112 16.484 15.877 15.313 14.767 14.268 13.748 13.284 12.872 12.47 12.048 11.635 11.235 10.823 10.426 10.075 9.718 9.334 9.01 8.643 8.243 7.909 7.565 7.233 6.861 6.459 6.173 5.87 5.408 5.08 4.75 4.579 4.194 3.757 3.308 3.062 2.44 2.237 1.928 1.598 0.855 0.457 0.017 -0.486 -1.054 -1.869 -2.947 -11.528 -10 ,15717 ,TETRA ,17524454,Wed Nov 24 22:14:59 CET,Wed Nov 24 23:48:19 CET,0.0 1.634 2.178 2.634 3.008 3.325 3.625 3.91 4.385 4.576 4.764 4.783 5.312 5.466 5.782 6.111 6.41 6.549 6.809 7.066 7.422 7.638 7.872 8.2 8.481 8.735 8.989 9.251 9.581 9.879 10.157 10.495 10.823 11.17 11.547 11.886 12.213 12.596 12.992 13.384 13.791 14.242 14.745 15.24 15.785 16.358 16.954 17.507 18.074 18.614 18.928 18.703 18.229 17.675 17.09 16.49 15.921 15.361 14.846 14.291 13.784 13.297 12.818 12.368 11.929 11.505 11.046 10.645 10.289 9.91 9.513 9.16 8.785 8.407 8.085 7.758 7.456 7.134 6.758 6.469 6.176 5.729 5.403 5.039 4.853 4.48 4.098 3.7 3.485 2.887 2.658 2.328 1.961 1.238 0.859 0.407 -0.106 -0.708 -1.507 -2.523 -6.005 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index 2be9d1dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17987 ,TETRA ,17524455,Wed Nov 24 22:15:00 CET,Wed Nov 24 23:53:44 CET,0.0 1.176 1.738 2.164 2.529 2.846 3.116 3.373 3.846 4.067 4.282 4.329 4.898 5.084 5.417 5.722 6.002 6.141 6.41 6.667 7.021 7.242 7.453 7.772 8.065 8.331 8.587 8.822 9.115 9.394 9.694 10.038 10.354 10.681 11.039 11.412 11.762 12.128 12.535 12.95 13.319 13.734 14.245 14.754 15.317 15.877 16.476 17.049 17.626 18.203 18.558 18.402 17.96 17.451 16.898 16.316 15.8 15.312 14.836 14.351 13.92 13.483 13.04 12.628 12.252 11.907 11.546 11.193 10.84 10.462 10.073 9.763 9.454 9.132 8.865 8.565 8.246 7.917 7.566 7.311 7.048 6.615 6.307 6.004 5.846 5.511 5.146 4.747 4.536 3.953 3.892 3.665 3.419 2.866 2.557 2.223 1.835 1.384 0.904 0.148 -2.385 -2 ,15741 ,TETRA ,17524456,Wed Nov 24 22:15:00 CET,Wed Nov 24 23:50:54 CET,0.0 1.074 1.58 2.001 2.397 2.72 3.001 3.253 3.713 3.932 4.147 4.191 4.75 4.919 5.267 5.591 5.893 6.036 6.298 6.552 6.913 7.145 7.363 7.668 7.982 8.285 8.562 8.811 9.138 9.468 9.764 10.075 10.351 10.628 10.953 11.313 11.664 12.047 12.438 12.848 13.248 13.691 14.255 14.799 15.38 15.997 16.603 17.185 17.814 18.429 18.762 18.597 18.199 17.685 17.15 16.593 16.057 15.537 15.049 14.507 14.018 13.583 13.167 12.777 12.384 11.977 11.575 11.232 10.916 10.581 10.209 9.896 9.578 9.228 8.942 8.65 8.352 8.042 7.696 7.45 7.199 6.788 6.494 6.201 6.049 5.732 5.402 5.04 4.853 4.299 4.252 4.005 3.753 3.192 2.855 2.491 2.078 1.609 1.073 0.349 -2.143 -3 ,21214 ,TETRA ,17524457,Wed Nov 24 22:15:27 CET,Wed Nov 24 23:57:00 CET,0.0 1.325 1.903 2.307 2.671 3.037 3.359 3.635 4.138 4.356 4.569 4.605 5.173 5.356 5.695 6.019 6.314 6.455 6.725 6.977 7.322 7.549 7.765 8.067 8.358 8.636 8.914 9.173 9.491 9.808 10.101 10.439 10.777 11.087 11.414 11.775 12.133 12.528 12.95 13.364 13.765 14.2 14.696 15.19 15.731 16.268 16.844 17.484 18.155 18.74 19.09 18.941 18.548 18.05 17.519 17.011 16.511 15.982 15.502 14.979 14.511 14.117 13.729 13.336 12.965 12.613 12.193 11.824 11.515 11.16 10.784 10.476 10.15 9.813 9.529 9.216 8.892 8.55 8.195 7.958 7.712 7.313 7.041 6.748 6.598 6.27 5.911 5.534 5.339 4.762 4.691 4.445 4.17 3.585 3.282 2.94 2.542 2.096 1.503 0.665 -2.015 -4 ,11621 ,TETRA ,17524458,Wed Nov 24 22:16:26 CET,Wed Nov 24 23:51:10 CET,0.0 1.63 2.279 2.782 3.152 3.475 3.795 4.096 4.611 4.84 5.064 5.123 5.691 5.88 6.237 6.558 6.861 7.0 7.265 7.539 7.947 8.189 8.415 8.744 9.031 9.309 9.621 9.909 10.262 10.587 10.899 11.29 11.637 11.961 12.32 12.689 13.031 13.405 13.805 14.224 14.679 15.159 15.652 16.102 16.608 17.183 17.776 18.393 19.051 19.581 19.917 19.816 19.452 18.952 18.438 17.933 17.441 16.936 16.467 15.966 15.54 15.169 14.791 14.396 13.973 13.579 13.168 12.796 12.483 12.13 11.724 11.384 11.03 10.654 10.367 10.078 9.773 9.447 9.091 8.833 8.569 8.142 7.834 7.513 7.351 7.011 6.65 6.289 6.105 5.533 5.464 5.223 4.973 4.453 4.118 3.703 3.257 2.761 2.151 1.365 -0.703 -5 ,2968 ,TETRA ,17524459,Wed Nov 24 22:15:26 CET,Wed Nov 24 23:52:53 CET,0.0 1.497 2.111 2.515 2.879 3.248 3.57 3.842 4.304 4.521 4.723 4.715 5.277 5.466 5.8 6.122 6.415 6.543 6.816 7.094 7.478 7.725 7.956 8.276 8.579 8.857 9.121 9.37 9.698 10.02 10.311 10.659 10.989 11.296 11.676 12.09 12.442 12.82 13.246 13.667 14.084 14.555 15.057 15.554 16.091 16.633 17.293 18.002 18.712 19.388 19.866 19.714 19.304 18.868 18.33 17.764 17.253 16.75 16.256 15.684 15.184 14.78 14.392 14.011 13.66 13.352 12.966 12.588 12.273 11.948 11.613 11.32 11.007 10.651 10.363 10.048 9.731 9.408 9.047 8.805 8.564 8.176 7.897 7.596 7.432 7.089 6.731 6.333 6.12 5.524 5.384 5.127 4.869 4.276 3.955 3.631 3.267 2.852 2.332 1.634 -0.191 -6 ,11511 ,TETRA ,17524460,Wed Nov 24 22:15:26 CET,Wed Nov 24 23:51:25 CET,0.0 1.18 1.71 2.136 2.479 2.787 3.061 3.312 3.785 4.012 4.218 4.228 4.776 4.953 5.281 5.579 5.865 5.997 6.258 6.513 6.885 7.129 7.372 7.712 8.034 8.34 8.632 8.909 9.252 9.569 9.872 10.239 10.583 10.898 11.245 11.624 11.984 12.371 12.764 13.163 13.592 14.052 14.541 15.046 15.613 16.195 16.803 17.39 18.005 18.579 18.933 18.795 18.39 17.865 17.303 16.792 16.317 15.831 15.335 14.831 14.407 13.993 13.572 13.172 12.795 12.393 11.958 11.596 11.262 10.903 10.537 10.236 9.918 9.592 9.331 9.036 8.724 8.412 8.09 7.858 7.61 7.231 6.963 6.662 6.506 6.186 5.827 5.402 5.177 4.577 4.465 4.211 3.941 3.359 3.049 2.724 2.351 1.913 1.376 0.603 -1.357 -7 ,8823 ,TETRA ,17524462,Wed Nov 24 22:15:26 CET,Wed Nov 24 23:54:04 CET,0.0 1.363 1.871 2.299 2.703 3.101 3.426 3.67 4.123 4.355 4.574 4.609 5.171 5.33 5.661 5.998 6.316 6.46 6.731 7.0 7.379 7.605 7.816 8.127 8.417 8.671 8.915 9.15 9.472 9.803 10.111 10.469 10.822 11.159 11.519 11.913 12.255 12.65 13.079 13.488 13.919 14.381 14.91 15.393 15.891 16.454 17.063 17.708 18.35 18.972 19.474 19.434 19.043 18.546 18.08 17.564 17.03 16.54 16.057 15.542 15.09 14.692 14.319 13.952 13.588 13.235 12.838 12.475 12.17 11.849 11.518 11.237 10.946 10.647 10.402 10.137 9.857 9.556 9.235 9.013 8.786 8.42 8.161 7.895 7.753 7.46 7.14 6.776 6.588 6.034 6.009 5.79 5.555 5.067 4.79 4.462 4.091 3.668 3.142 2.455 0.964 -8 ,32553 ,TETRA ,17524464,Wed Nov 24 22:15:27 CET,Wed Nov 24 23:51:48 CET,0.0 1.322 1.903 2.345 2.722 3.047 3.35 3.641 4.188 4.425 4.633 4.635 5.192 5.388 5.756 6.09 6.404 6.554 6.841 7.099 7.464 7.709 7.944 8.274 8.592 8.892 9.16 9.428 9.791 10.114 10.417 10.78 11.105 11.422 11.789 12.195 12.566 12.971 13.397 13.808 14.229 14.667 15.167 15.687 16.232 16.788 17.397 18.032 18.702 19.349 19.806 19.71 19.277 18.743 18.219 17.715 17.239 16.722 16.227 15.749 15.304 14.867 14.432 14.024 13.65 13.303 12.913 12.533 12.217 11.881 11.495 11.185 10.858 10.499 10.23 9.962 9.678 9.373 9.041 8.819 8.592 8.21 7.927 7.62 7.467 7.151 6.796 6.438 6.253 5.676 5.634 5.406 5.134 4.547 4.235 3.878 3.482 3.016 2.505 1.828 -0.139 -9 ,12339 ,TETRA ,17524466,Wed Nov 24 22:15:29 CET,Wed Nov 24 23:51:34 CET,0.0 0.935 1.424 1.851 2.233 2.571 2.872 3.147 3.628 3.862 4.091 4.087 4.635 4.814 5.144 5.444 5.712 5.851 6.126 6.386 6.744 6.959 7.166 7.462 7.727 8.003 8.289 8.569 8.911 9.233 9.545 9.892 10.236 10.573 10.947 11.336 11.717 12.166 12.595 12.995 13.415 13.882 14.37 14.821 15.328 15.862 16.458 17.086 17.721 18.313 18.594 18.375 17.946 17.433 16.911 16.341 15.764 15.233 14.776 14.271 13.797 13.348 12.894 12.469 12.069 11.676 11.254 10.858 10.492 10.091 9.675 9.346 9.012 8.664 8.385 8.091 7.79 7.491 7.154 6.896 6.628 6.211 5.916 5.594 5.419 5.065 4.71 4.351 4.164 3.586 3.519 3.291 3.044 2.513 2.19 1.837 1.466 1.048 0.531 -0.17 -2.205 -10 ,30500 ,TETRA ,17524468,Wed Nov 24 22:15:27 CET,Wed Nov 24 23:50:56 CET,0.0 1.751 2.409 2.845 3.202 3.518 3.792 4.046 4.513 4.736 4.953 4.983 5.54 5.734 6.102 6.44 6.772 6.925 7.2 7.469 7.85 8.092 8.334 8.674 8.982 9.27 9.549 9.811 10.125 10.419 10.715 11.091 11.463 11.816 12.18 12.559 12.925 13.328 13.771 14.227 14.647 15.076 15.587 16.092 16.623 17.176 17.786 18.42 19.106 19.699 19.988 19.853 19.507 19.021 18.506 17.97 17.432 16.892 16.427 15.949 15.539 15.14 14.693 14.294 13.913 13.552 13.2 12.836 12.497 12.165 11.824 11.544 11.229 10.893 10.626 10.342 10.04 9.73 9.412 9.173 8.92 8.527 8.246 7.941 7.784 7.481 7.169 6.82 6.618 6.034 5.964 5.721 5.46 4.896 4.604 4.277 3.872 3.348 2.723 1.909 -0.932 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_23475.txt deleted file mode 100644 index 1a66a558..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6171 ,KEBNE ,17019521,Wed Dec 22 03:01:00 CET,Wed Dec 22 04:22:32 CET,0.0 1.572 2.197 2.667 3.058 3.391 3.704 3.988 4.466 4.689 4.902 4.925 5.48 5.661 6.02 6.361 6.669 6.808 7.068 7.319 7.681 7.908 8.137 8.456 8.749 9.028 9.283 9.507 9.784 10.077 10.351 10.682 11.033 11.345 11.662 12.012 12.333 12.666 13.002 13.363 13.737 14.124 14.572 14.985 15.402 15.826 16.235 16.619 17.025 17.373 17.338 16.768 16.054 15.321 14.628 13.927 13.247 12.568 11.97 11.378 10.853 10.372 9.896 9.451 9.027 8.64 8.231 7.814 7.44 7.063 6.662 6.338 6.017 5.671 5.362 5.034 4.717 4.386 4.012 3.744 3.477 3.049 2.758 2.446 2.269 1.913 1.546 1.144 0.938 0.347 0.256 0.013 -0.254 -0.86 -1.213 -1.613 -2.049 -2.554 -3.157 -3.951 -6.231 -2 ,4010 ,KEBNE ,17019522,Wed Dec 22 03:01:00 CET,Wed Dec 22 04:22:40 CET,0.0 1.608 2.216 2.682 3.041 3.389 3.713 4.009 4.547 4.79 5.024 5.073 5.642 5.827 6.159 6.464 6.767 6.914 7.176 7.408 7.758 8.012 8.259 8.562 8.832 9.099 9.353 9.588 9.884 10.183 10.478 10.814 11.121 11.4 11.71 12.028 12.341 12.697 13.056 13.401 13.734 14.106 14.514 14.88 15.296 15.727 16.154 16.544 16.872 17.123 17.05 16.399 15.634 14.897 14.204 13.535 12.909 12.299 11.752 11.197 10.704 10.249 9.81 9.377 8.951 8.567 8.158 7.776 7.42 7.034 6.641 6.335 6.014 5.667 5.391 5.087 4.744 4.393 4.057 3.816 3.552 3.1 2.743 2.356 2.16 1.801 1.47 1.115 0.92 0.336 0.235 -0.027 -0.291 -0.855 -1.196 -1.575 -1.986 -2.45 -3.025 -3.793 -6.521 -3 ,32548 ,KEBNE ,17019523,Wed Dec 22 03:01:00 CET,Wed Dec 22 04:23:54 CET,0.0 1.812 2.482 2.985 3.386 3.737 4.064 4.343 4.828 5.054 5.259 5.256 5.802 5.978 6.323 6.644 6.932 7.073 7.354 7.617 7.99 8.22 8.445 8.787 9.103 9.393 9.667 9.9 10.176 10.463 10.772 11.15 11.474 11.761 12.08 12.466 12.816 13.153 13.546 13.94 14.301 14.705 15.15 15.533 15.944 16.355 16.776 17.182 17.52 17.754 17.703 17.208 16.569 15.852 15.158 14.463 13.796 13.188 12.647 12.082 11.547 11.032 10.555 10.086 9.641 9.25 8.828 8.447 8.113 7.733 7.344 7.031 6.682 6.322 6.016 5.677 5.336 4.997 4.656 4.402 4.129 3.695 3.39 3.095 2.927 2.572 2.202 1.79 1.572 0.968 0.83 0.559 0.279 -0.328 -0.66 -1.006 -1.397 -1.872 -2.466 -3.24 -6.106 -4 ,27359 ,KEBNE ,17019524,Wed Dec 22 03:01:00 CET,Wed Dec 22 04:22:26 CET,0.0 1.8 2.441 2.891 3.268 3.617 3.92 4.214 4.749 4.99 5.212 5.234 5.806 5.984 6.334 6.661 6.965 7.112 7.392 7.648 7.992 8.206 8.403 8.684 8.964 9.235 9.484 9.726 10.037 10.338 10.634 10.981 11.29 11.567 11.874 12.209 12.517 12.854 13.215 13.559 13.904 14.278 14.731 15.195 15.651 16.065 16.468 16.866 17.215 17.475 17.431 16.868 16.17 15.456 14.729 14.036 13.389 12.779 12.239 11.662 11.176 10.724 10.254 9.805 9.388 9.0 8.559 8.136 7.765 7.351 6.914 6.566 6.184 5.774 5.463 5.151 4.838 4.487 4.109 3.864 3.615 3.206 2.903 2.592 2.42 2.045 1.668 1.295 1.093 0.481 0.321 0.048 -0.232 -0.821 -1.171 -1.581 -2.003 -2.502 -3.109 -3.851 -5.981 -5 ,734 ,KEBNE ,17019525,Wed Dec 22 03:01:03 CET,Wed Dec 22 04:22:56 CET,0.0 2.533 3.485 4.187 4.76 5.235 5.632 5.956 6.47 6.694 6.905 6.956 7.531 7.711 8.042 8.358 8.651 8.793 9.063 9.319 9.701 9.951 10.181 10.492 10.782 11.061 11.335 11.594 11.892 12.159 12.422 12.753 13.072 13.357 13.681 14.015 14.328 14.681 15.028 15.387 15.754 16.136 16.566 16.999 17.452 17.898 18.35 18.78 19.171 19.387 19.252 18.649 17.922 17.159 16.418 15.715 15.03 14.393 13.837 13.216 12.646 12.142 11.679 11.228 10.803 10.427 9.973 9.56 9.217 8.842 8.465 8.128 7.761 7.378 7.067 6.753 6.425 6.085 5.734 5.476 5.193 4.776 4.478 4.14 3.967 3.596 3.21 2.816 2.603 1.998 1.889 1.643 1.39 0.814 0.494 0.124 -0.3 -0.824 -1.524 -2.464 -6.234 -6 ,13763 ,KEBNE ,17019526,Wed Dec 22 03:01:03 CET,Wed Dec 22 04:24:06 CET,0.0 2.047 2.693 3.189 3.601 3.96 4.264 4.53 5.04 5.288 5.519 5.581 6.165 6.364 6.755 7.115 7.414 7.555 7.836 8.107 8.481 8.721 8.955 9.262 9.552 9.841 10.109 10.367 10.695 10.994 11.274 11.601 11.905 12.182 12.496 12.845 13.15 13.469 13.809 14.155 14.504 14.891 15.319 15.713 16.177 16.656 17.093 17.506 17.894 18.16 18.104 17.522 16.756 15.956 15.207 14.522 13.878 13.252 12.696 12.136 11.634 11.156 10.688 10.242 9.808 9.403 8.985 8.583 8.221 7.84 7.438 7.099 6.734 6.354 6.043 5.71 5.351 4.978 4.617 4.376 4.114 3.676 3.365 3.031 2.853 2.484 2.102 1.709 1.499 0.895 0.809 0.569 0.294 -0.332 -0.655 -1.0 -1.402 -1.866 -2.427 -3.22 -6.963 -7 ,25552 ,KEBNE ,17019527,Wed Dec 22 03:01:03 CET,Wed Dec 22 04:22:43 CET,0.0 1.685 2.297 2.731 3.1 3.463 3.79 4.077 4.57 4.792 5.007 5.038 5.588 5.76 6.074 6.373 6.662 6.801 7.067 7.31 7.675 7.908 8.119 8.434 8.745 9.029 9.285 9.526 9.845 10.157 10.427 10.763 11.09 11.384 11.71 12.044 12.378 12.765 13.136 13.48 13.833 14.218 14.645 15.041 15.435 15.872 16.337 16.735 17.062 17.28 17.218 16.641 15.899 15.129 14.431 13.745 13.08 12.428 11.838 11.244 10.703 10.194 9.705 9.208 8.726 8.31 7.862 7.45 7.08 6.706 6.331 6.019 5.689 5.312 5.014 4.697 4.354 4.024 3.683 3.395 3.098 2.693 2.397 2.092 1.938 1.612 1.257 0.851 0.64 0.05 -0.061 -0.309 -0.571 -1.227 -1.625 -2.035 -2.429 -2.91 -3.517 -4.279 -6.722 -8 ,8564 ,KEBNE ,17019528,Wed Dec 22 03:09:13 CET,Wed Dec 22 04:24:22 CET,0.0 1.553 2.133 2.617 3.025 3.397 3.737 4.047 4.584 4.821 5.034 5.059 5.62 5.807 6.142 6.429 6.697 6.824 7.069 7.308 7.658 7.888 8.105 8.427 8.737 9.006 9.247 9.471 9.755 10.023 10.297 10.616 10.903 11.183 11.497 11.847 12.177 12.52 12.885 13.268 13.645 14.057 14.514 14.918 15.339 15.763 16.201 16.597 16.934 17.205 17.076 16.417 15.686 14.929 14.173 13.446 12.835 12.259 11.694 11.125 10.662 10.219 9.762 9.334 8.91 8.494 8.054 7.646 7.275 6.878 6.468 6.122 5.769 5.373 5.043 4.704 4.375 4.044 3.679 3.429 3.167 2.734 2.429 2.12 1.953 1.612 1.26 0.86 0.642 0.046 -0.076 -0.353 -0.64 -1.318 -1.682 -2.04 -2.439 -2.901 -3.489 -4.369 -7.215 -9 ,24570 ,KEBNE ,17019529,Wed Dec 22 03:09:18 CET,Wed Dec 22 04:31:16 CET,0.0 2.081 2.709 3.191 3.591 3.947 4.279 4.561 5.084 5.335 5.581 5.635 6.189 6.357 6.672 7.037 7.411 7.578 7.883 8.148 8.519 8.754 8.982 9.288 9.595 9.902 10.172 10.43 10.751 11.042 11.331 11.665 11.985 12.313 12.699 13.11 13.44 13.785 14.195 14.589 14.954 15.364 15.81 16.223 16.683 17.174 17.629 18.023 18.37 18.638 18.635 18.119 17.433 16.664 15.93 15.181 14.49 13.903 13.387 12.829 12.317 11.834 11.377 10.93 10.493 10.092 9.67 9.278 8.919 8.537 8.134 7.787 7.403 7.024 6.744 6.427 6.103 5.752 5.359 5.097 4.829 4.404 4.097 3.788 3.605 3.173 2.728 2.243 1.976 1.345 1.204 0.929 0.658 0.045 -0.301 -0.675 -1.112 -1.615 -2.169 -2.837 -5.473 -10 ,11541 ,KEBNE ,17019530,Wed Dec 22 03:09:18 CET,Wed Dec 22 04:32:23 CET,0.0 2.979 3.611 4.038 4.389 4.711 5.003 5.27 5.747 5.97 6.188 6.215 6.77 6.934 7.278 7.633 7.95 8.112 8.422 8.683 9.032 9.264 9.515 9.862 10.163 10.445 10.719 10.972 11.277 11.579 11.868 12.192 12.486 12.75 13.063 13.423 13.749 14.093 14.443 14.795 15.167 15.567 16.0 16.423 16.903 17.386 17.838 18.254 18.648 18.975 18.967 18.384 17.641 16.875 16.17 15.484 14.816 14.192 13.659 13.089 12.553 12.068 11.637 11.22 10.764 10.332 9.908 9.526 9.185 8.818 8.441 8.121 7.756 7.363 7.071 6.77 6.442 6.099 5.761 5.519 5.243 4.79 4.482 4.166 3.996 3.648 3.305 2.89 2.653 2.054 1.954 1.686 1.421 0.854 0.53 0.18 -0.205 -0.67 -1.274 -2.081 -4.347 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23475_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23475_23468.txt deleted file mode 100644 index 2a0da814..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23475_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25077 ,KEBNE ,17019531,Wed Dec 22 03:09:18 CET,Wed Dec 22 04:29:41 CET,0.0 1.62 2.304 2.763 3.125 3.437 3.73 4.01 4.518 4.744 4.961 4.998 5.565 5.765 6.154 6.508 6.836 6.994 7.3 7.567 7.941 8.183 8.398 8.687 8.989 9.299 9.581 9.844 10.166 10.451 10.743 11.123 11.447 11.735 12.068 12.439 12.822 13.206 13.564 13.937 14.344 14.808 15.289 15.743 16.268 16.803 17.307 17.766 18.224 18.474 18.228 17.502 16.598 15.667 14.767 13.901 13.107 12.369 11.701 11.023 10.418 9.868 9.355 8.88 8.428 7.958 7.42 6.95 6.566 6.168 5.757 5.426 5.074 4.692 4.39 4.055 3.699 3.34 2.977 2.719 2.442 2.001 1.672 1.327 1.155 0.806 0.422 0.005 -0.205 -0.8 -0.895 -1.151 -1.422 -2.029 -2.365 -2.738 -3.119 -3.538 -4.113 -4.853 -7.069 -2 ,27609 ,KEBNE ,17019532,Wed Dec 22 03:09:24 CET,Wed Dec 22 04:30:00 CET,0.0 1.31 1.837 2.247 2.619 2.949 3.242 3.505 3.984 4.222 4.447 4.461 5.016 5.205 5.56 5.89 6.198 6.345 6.618 6.884 7.279 7.52 7.757 8.095 8.398 8.671 8.94 9.201 9.545 9.883 10.186 10.537 10.869 11.173 11.518 11.888 12.222 12.6 13.009 13.415 13.833 14.275 14.75 15.183 15.642 16.177 16.748 17.284 17.815 18.192 18.123 17.398 16.377 15.343 14.404 13.556 12.766 12.003 11.327 10.656 10.084 9.563 9.05 8.522 7.993 7.531 7.045 6.59 6.206 5.804 5.362 5.003 4.638 4.226 3.897 3.557 3.221 2.862 2.478 2.214 1.93 1.475 1.145 0.802 0.625 0.258 -0.127 -0.533 -0.74 -1.329 -1.436 -1.692 -1.952 -2.561 -2.904 -3.255 -3.629 -4.087 -4.666 -5.394 -7.307 -3 ,12100 ,KEBNE ,17019533,Wed Dec 22 03:09:24 CET,Wed Dec 22 04:31:29 CET,0.0 1.096 1.59 1.999 2.361 2.694 2.99 3.246 3.731 3.974 4.198 4.214 4.764 4.945 5.301 5.622 5.909 6.053 6.331 6.582 6.941 7.166 7.393 7.746 8.082 8.388 8.67 8.933 9.267 9.605 9.927 10.273 10.595 10.914 11.278 11.657 12.019 12.419 12.853 13.29 13.682 14.126 14.652 15.152 15.723 16.318 16.937 17.496 17.962 18.235 18.087 17.286 16.285 15.33 14.438 13.584 12.796 12.054 11.379 10.698 10.091 9.538 9.014 8.504 8.013 7.543 7.046 6.602 6.231 5.854 5.441 5.089 4.708 4.299 3.98 3.666 3.343 2.974 2.571 2.294 2.012 1.572 1.251 0.919 0.768 0.436 0.041 -0.367 -0.581 -1.185 -1.285 -1.54 -1.798 -2.357 -2.672 -3.019 -3.404 -3.843 -4.347 -5.021 -7.652 -4 ,5784 ,KEBNE ,17019534,Wed Dec 22 03:09:24 CET,Wed Dec 22 04:29:53 CET,0.0 1.741 2.313 2.781 3.186 3.533 3.823 4.08 4.585 4.826 5.042 5.055 5.595 5.77 6.092 6.386 6.677 6.818 7.089 7.338 7.68 7.908 8.138 8.478 8.802 9.095 9.375 9.645 9.953 10.258 10.582 10.948 11.28 11.583 11.904 12.266 12.623 13.011 13.427 13.861 14.324 14.797 15.329 15.83 16.341 16.859 17.381 17.897 18.353 18.659 18.586 17.95 17.093 16.194 15.286 14.384 13.579 12.857 12.199 11.509 10.913 10.376 9.832 9.32 8.861 8.43 7.972 7.568 7.193 6.778 6.367 6.027 5.645 5.236 4.918 4.591 4.236 3.856 3.476 3.216 2.939 2.473 2.139 1.809 1.647 1.303 0.945 0.569 0.356 -0.234 -0.272 -0.523 -0.79 -1.4 -1.75 -2.104 -2.509 -2.991 -3.584 -4.344 -7.012 -5 ,8220 ,KEBNE ,17019535,Wed Dec 22 03:09:31 CET,Wed Dec 22 04:30:09 CET,0.0 0.971 1.563 2.009 2.372 2.716 3.012 3.283 3.809 4.05 4.274 4.302 4.866 5.037 5.356 5.678 5.97 6.113 6.391 6.646 7.022 7.263 7.487 7.789 8.068 8.363 8.658 8.948 9.298 9.59 9.865 10.216 10.549 10.85 11.184 11.559 11.938 12.353 12.79 13.225 13.647 14.103 14.587 15.058 15.594 16.117 16.656 17.162 17.588 17.851 17.747 16.924 16.027 15.163 14.258 13.38 12.603 11.871 11.194 10.502 9.895 9.317 8.75 8.238 7.757 7.287 6.776 6.332 5.945 5.547 5.124 4.747 4.365 3.964 3.645 3.322 2.991 2.625 2.212 1.939 1.654 1.212 0.921 0.612 0.449 0.122 -0.22 -0.6 -0.798 -1.391 -1.468 -1.69 -1.929 -2.476 -2.784 -3.134 -3.545 -3.982 -4.468 -5.166 -7.568 -6 ,5343 ,KEBNE ,17019536,Wed Dec 22 03:09:31 CET,Wed Dec 22 04:31:23 CET,0.0 1.309 1.878 2.247 2.579 2.888 3.171 3.459 3.979 4.199 4.425 4.473 5.044 5.239 5.604 5.944 6.263 6.409 6.668 6.918 7.289 7.544 7.787 8.114 8.43 8.739 9.011 9.255 9.577 9.877 10.174 10.539 10.886 11.225 11.613 12.04 12.409 12.782 13.184 13.605 14.026 14.461 14.932 15.422 15.935 16.43 17.001 17.597 18.13 18.402 18.187 17.421 16.503 15.589 14.729 13.872 13.062 12.324 11.677 10.998 10.372 9.805 9.25 8.724 8.254 7.795 7.303 6.88 6.516 6.118 5.693 5.332 4.958 4.569 4.248 3.907 3.555 3.2 2.813 2.55 2.28 1.852 1.55 1.235 1.071 0.704 0.328 -0.035 -0.239 -0.841 -0.937 -1.206 -1.467 -2.0 -2.284 -2.603 -2.956 -3.4 -3.97 -4.643 -6.581 -7 ,16625 ,KEBNE ,17019537,Wed Dec 22 03:09:31 CET,Wed Dec 22 04:30:02 CET,0.0 1.65 2.242 2.712 3.109 3.449 3.753 4.022 4.5 4.719 4.922 4.942 5.513 5.698 6.032 6.349 6.651 6.791 7.049 7.308 7.668 7.901 8.135 8.459 8.75 9.035 9.317 9.563 9.874 10.174 10.45 10.779 11.075 11.352 11.682 12.057 12.411 12.785 13.178 13.591 14.04 14.51 14.985 15.433 15.91 16.422 16.949 17.438 17.872 18.126 18.045 17.38 16.469 15.512 14.614 13.781 13.038 12.334 11.671 10.955 10.325 9.759 9.199 8.678 8.192 7.718 7.205 6.749 6.364 5.949 5.489 5.089 4.678 4.262 3.944 3.604 3.241 2.883 2.514 2.25 1.974 1.532 1.242 0.942 0.781 0.424 0.012 -0.4 -0.604 -1.199 -1.255 -1.503 -1.769 -2.305 -2.615 -2.977 -3.355 -3.799 -4.372 -5.179 -7.119 -8 ,10428 ,KEBNE ,17019538,Wed Dec 22 03:09:45 CET,Wed Dec 22 04:30:17 CET,0.0 0.93 1.478 1.927 2.298 2.635 2.949 3.212 3.658 3.875 4.08 4.075 4.632 4.811 5.135 5.438 5.748 5.893 6.165 6.439 6.814 7.054 7.286 7.607 7.902 8.177 8.459 8.758 9.155 9.489 9.781 10.154 10.5 10.811 11.167 11.569 11.939 12.335 12.758 13.171 13.583 14.045 14.573 15.067 15.586 16.075 16.588 17.139 17.55 17.776 17.737 16.943 15.942 15.061 14.199 13.381 12.633 11.902 11.251 10.578 9.992 9.46 8.932 8.43 7.952 7.506 7.017 6.558 6.155 5.728 5.297 4.943 4.569 4.175 3.865 3.538 3.211 2.889 2.533 2.266 1.996 1.568 1.265 0.936 0.762 0.415 0.052 -0.334 -0.53 -1.123 -1.238 -1.492 -1.753 -2.343 -2.67 -3.042 -3.455 -3.912 -4.444 -5.174 -7.34 -9 ,23964 ,KEBNE ,17019539,Wed Dec 22 03:09:45 CET,Wed Dec 22 04:31:40 CET,0.0 1.113 1.684 2.161 2.589 2.95 3.264 3.562 4.071 4.296 4.524 4.55 5.103 5.283 5.613 5.927 6.234 6.375 6.654 6.912 7.285 7.541 7.788 8.137 8.462 8.758 9.042 9.311 9.652 9.976 10.267 10.619 10.953 11.279 11.658 12.047 12.391 12.754 13.146 13.594 14.06 14.525 15.042 15.533 16.033 16.531 17.03 17.565 18.055 18.317 18.139 17.424 16.547 15.576 14.676 13.858 13.094 12.41 11.787 11.124 10.552 10.002 9.451 8.895 8.37 7.918 7.456 7.022 6.642 6.225 5.766 5.391 4.981 4.563 4.239 3.916 3.577 3.212 2.845 2.577 2.288 1.815 1.487 1.166 0.999 0.64 0.254 -0.144 -0.349 -0.946 -1.017 -1.266 -1.556 -2.237 -2.584 -2.961 -3.394 -3.964 -4.61 -5.37 -7.358 -10 ,1235 ,KEBNE ,17019540,Wed Dec 22 03:09:45 CET,Wed Dec 22 04:30:22 CET,0.0 1.125 1.772 2.298 2.733 3.09 3.391 3.662 4.126 4.341 4.556 4.591 5.149 5.334 5.713 6.064 6.373 6.521 6.801 7.075 7.472 7.699 7.914 8.226 8.547 8.869 9.163 9.438 9.765 10.055 10.335 10.67 10.966 11.261 11.623 12.021 12.428 12.862 13.24 13.635 14.105 14.584 15.063 15.516 16.017 16.538 17.042 17.53 18.021 18.385 18.224 17.47 16.537 15.586 14.707 13.866 13.104 12.354 11.657 10.974 10.392 9.849 9.331 8.856 8.374 7.911 7.428 6.976 6.595 6.205 5.756 5.366 4.997 4.618 4.306 3.949 3.564 3.192 2.798 2.529 2.25 1.772 1.426 1.09 0.925 0.568 0.2 -0.165 -0.364 -0.961 -1.013 -1.258 -1.54 -2.142 -2.453 -2.788 -3.161 -3.571 -4.115 -4.874 -6.684 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt deleted file mode 100644 index 2262d6a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15995 ,TETRA ,17524472,Wed Nov 24 22:16:31 CET,Wed Nov 24 23:53:16 CET,0.0 1.443 2.082 2.61 3.018 3.392 3.714 3.995 4.502 4.729 4.934 4.946 5.505 5.692 6.063 6.408 6.738 6.881 7.145 7.399 7.776 8.046 8.33 8.701 9.005 9.294 9.581 9.846 10.158 10.465 10.773 11.115 11.424 11.726 12.092 12.512 12.888 13.294 13.727 14.139 14.522 14.941 15.389 15.826 16.376 16.933 17.495 18.075 18.636 19.126 19.406 19.224 18.788 18.233 17.692 17.159 16.618 16.103 15.628 15.127 14.693 14.3 13.886 13.467 13.094 12.76 12.382 12.014 11.676 11.323 10.955 10.633 10.282 9.906 9.623 9.35 9.052 8.726 8.377 8.119 7.855 7.464 7.195 6.907 6.749 6.402 6.022 5.615 5.41 4.83 4.78 4.557 4.31 3.775 3.463 3.113 2.736 2.321 1.832 1.074 -0.831 -2 ,2975 ,TETRA ,17524474,Wed Nov 24 22:16:33 CET,Wed Nov 24 23:52:40 CET,0.0 2.256 2.893 3.38 3.8 4.143 4.444 4.709 5.186 5.421 5.637 5.661 6.221 6.404 6.766 7.095 7.393 7.543 7.84 8.111 8.48 8.725 8.964 9.289 9.607 9.903 10.152 10.379 10.682 10.984 11.291 11.678 12.034 12.355 12.716 13.111 13.469 13.855 14.273 14.711 15.158 15.624 16.137 16.633 17.175 17.765 18.395 19.008 19.629 20.142 20.416 20.25 19.807 19.275 18.698 18.143 17.64 17.143 16.683 16.211 15.793 15.373 14.947 14.568 14.21 13.837 13.434 13.069 12.736 12.385 12.009 11.684 11.344 10.97 10.677 10.4 10.098 9.738 9.37 9.129 8.884 8.513 8.243 7.938 7.778 7.445 7.083 6.705 6.511 5.931 5.87 5.648 5.389 4.835 4.552 4.226 3.865 3.462 2.953 2.257 0.467 -3 ,20828 ,TETRA ,17524476,Wed Nov 24 22:16:31 CET,Wed Nov 24 23:52:16 CET,0.0 1.93 2.593 3.059 3.412 3.762 4.075 4.341 4.802 5.017 5.242 5.292 5.86 6.041 6.399 6.746 7.059 7.202 7.479 7.746 8.123 8.359 8.593 8.927 9.228 9.496 9.762 10.034 10.36 10.679 11.007 11.394 11.737 12.043 12.381 12.748 13.086 13.433 13.804 14.194 14.605 15.063 15.553 16.026 16.568 17.159 17.812 18.436 19.024 19.531 19.812 19.613 19.178 18.673 18.115 17.529 17.008 16.495 16.006 15.522 15.112 14.728 14.321 13.903 13.502 13.152 12.769 12.406 12.076 11.707 11.336 11.047 10.722 10.331 10.029 9.739 9.427 9.078 8.728 8.494 8.239 7.826 7.537 7.251 7.108 6.796 6.457 6.088 5.884 5.306 5.275 5.037 4.768 4.19 3.885 3.576 3.23 2.826 2.329 1.721 0.086 -4 ,1891 ,TETRA ,17524478,Wed Nov 24 22:16:34 CET,Wed Nov 24 23:52:24 CET,0.0 1.609 2.171 2.63 3.037 3.39 3.709 3.994 4.493 4.731 4.951 4.979 5.549 5.723 6.081 6.436 6.749 6.895 7.176 7.448 7.83 8.07 8.3 8.625 8.932 9.237 9.538 9.815 10.159 10.492 10.789 11.12 11.438 11.737 12.076 12.448 12.788 13.121 13.471 13.841 14.243 14.7 15.18 15.634 16.144 16.683 17.258 17.831 18.401 18.898 19.182 19.012 18.578 18.025 17.459 16.893 16.351 15.833 15.372 14.869 14.391 13.979 13.566 13.169 12.801 12.431 12.031 11.682 11.361 11.007 10.641 10.318 9.973 9.617 9.337 9.036 8.715 8.39 8.062 7.824 7.567 7.182 6.907 6.599 6.442 6.133 5.807 5.432 5.237 4.675 4.606 4.351 4.082 3.524 3.205 2.858 2.496 2.098 1.581 0.824 -1.212 -5 ,4876 ,TETRA ,17524479,Wed Nov 24 22:16:27 CET,Wed Nov 24 23:55:54 CET,0.0 1.476 2.108 2.551 2.922 3.261 3.574 3.863 4.353 4.584 4.805 4.81 5.369 5.551 5.897 6.218 6.533 6.693 6.975 7.234 7.601 7.819 8.034 8.346 8.628 8.873 9.104 9.329 9.662 9.983 10.243 10.561 10.882 11.175 11.481 11.836 12.194 12.594 12.988 13.373 13.776 14.244 14.756 15.193 15.683 16.211 16.77 17.326 17.909 18.43 18.726 18.528 18.168 17.712 17.156 16.579 16.051 15.553 15.08 14.593 14.127 13.684 13.257 12.831 12.435 12.089 11.724 11.376 11.069 10.746 10.379 10.062 9.727 9.388 9.127 8.837 8.522 8.193 7.857 7.601 7.339 6.947 6.664 6.371 6.218 5.897 5.553 5.176 4.994 4.435 4.41 4.189 3.933 3.398 3.092 2.733 2.352 1.946 1.397 0.662 -2.3 -6 ,11301 ,TETRA ,17524480,Wed Nov 24 22:16:31 CET,Wed Nov 24 23:52:58 CET,0.0 1.798 2.349 2.799 3.21 3.561 3.879 4.17 4.633 4.854 5.061 5.06 5.608 5.788 6.128 6.433 6.727 6.865 7.112 7.362 7.736 7.971 8.214 8.555 8.848 9.123 9.379 9.635 9.958 10.244 10.509 10.82 11.152 11.476 11.815 12.213 12.619 13.025 13.424 13.847 14.262 14.684 15.145 15.618 16.16 16.685 17.255 17.827 18.373 18.892 19.235 19.1 18.697 18.196 17.639 17.036 16.477 15.963 15.463 14.918 14.47 14.062 13.641 13.227 12.853 12.502 12.115 11.773 11.46 11.12 10.744 10.416 10.079 9.732 9.448 9.146 8.845 8.54 8.197 7.963 7.718 7.285 6.964 6.65 6.493 6.162 5.825 5.475 5.296 4.733 4.686 4.461 4.221 3.666 3.369 3.054 2.69 2.235 1.676 0.998 -1.566 -7 ,4637 ,TETRA ,17524481,Wed Nov 24 22:16:31 CET,Wed Nov 24 23:53:02 CET,0.0 1.18 1.788 2.21 2.565 2.899 3.213 3.498 3.995 4.228 4.453 4.484 5.035 5.216 5.559 5.86 6.163 6.317 6.601 6.852 7.224 7.469 7.709 8.056 8.366 8.65 8.944 9.209 9.543 9.893 10.186 10.511 10.85 11.163 11.506 11.88 12.224 12.595 12.98 13.39 13.831 14.291 14.784 15.23 15.724 16.284 16.895 17.476 18.032 18.508 18.769 18.557 18.071 17.501 16.912 16.357 15.813 15.286 14.835 14.352 13.897 13.463 13.046 12.642 12.212 11.792 11.35 10.97 10.643 10.3 9.954 9.668 9.353 8.99 8.715 8.429 8.116 7.791 7.431 7.183 6.941 6.56 6.279 5.997 5.849 5.523 5.181 4.817 4.616 4.032 3.995 3.767 3.516 2.981 2.667 2.332 1.997 1.575 1.035 0.301 -2.25 -8 ,19290 ,TETRA ,17524482,Wed Nov 24 22:16:33 CET,Wed Nov 24 23:53:00 CET,0.0 1.511 2.17 2.673 3.074 3.44 3.728 3.974 4.44 4.686 4.922 4.969 5.526 5.717 6.083 6.405 6.72 6.851 7.093 7.334 7.666 7.875 8.094 8.419 8.717 8.981 9.228 9.485 9.838 10.159 10.441 10.781 11.105 11.4 11.758 12.142 12.482 12.895 13.326 13.713 14.085 14.533 15.052 15.515 16.025 16.531 17.059 17.652 18.251 18.781 19.075 18.878 18.4 17.88 17.336 16.782 16.251 15.734 15.278 14.797 14.336 13.923 13.521 13.128 12.753 12.358 11.936 11.579 11.251 10.914 10.582 10.278 9.954 9.626 9.362 9.086 8.81 8.5 8.164 7.935 7.696 7.329 7.063 6.781 6.638 6.332 5.999 5.638 5.442 4.868 4.808 4.58 4.346 3.814 3.51 3.201 2.853 2.381 1.817 1.152 -1.13 -9 ,21347 ,TETRA ,17524484,Wed Nov 24 22:16:31 CET,Wed Nov 24 23:52:24 CET,0.0 2.125 2.873 3.393 3.78 4.128 4.447 4.727 5.207 5.439 5.655 5.668 6.239 6.432 6.777 7.081 7.381 7.535 7.841 8.118 8.505 8.74 8.974 9.321 9.628 9.915 10.181 10.455 10.822 11.156 11.486 11.861 12.202 12.514 12.861 13.283 13.687 14.066 14.44 14.834 15.226 15.688 16.208 16.642 17.14 17.708 18.313 18.925 19.53 20.069 20.392 20.197 19.79 19.324 18.76 18.192 17.69 17.174 16.687 16.189 15.761 15.348 14.944 14.565 14.204 13.869 13.5 13.168 12.845 12.482 12.115 11.81 11.475 11.11 10.824 10.515 10.19 9.851 9.498 9.257 9.023 8.645 8.353 8.046 7.893 7.574 7.216 6.844 6.664 6.103 6.061 5.817 5.564 5.049 4.765 4.434 4.031 3.581 3.047 2.399 0.633 -10 ,24806 ,TETRA ,17524486,Wed Nov 24 22:16:31 CET,Wed Nov 24 23:53:41 CET,0.0 2.801 3.469 3.936 4.312 4.638 4.92 5.183 5.654 5.876 6.093 6.124 6.695 6.886 7.248 7.581 7.884 8.028 8.309 8.578 8.953 9.192 9.429 9.764 10.072 10.373 10.653 10.902 11.215 11.522 11.804 12.14 12.468 12.786 13.155 13.534 13.892 14.307 14.744 15.159 15.565 16.019 16.531 16.968 17.461 18.019 18.593 19.179 19.771 20.234 20.454 20.19 19.695 19.163 18.636 18.081 17.527 16.97 16.49 15.996 15.546 15.126 14.715 14.296 13.886 13.514 13.109 12.759 12.437 12.079 11.718 11.409 11.065 10.712 10.451 10.176 9.876 9.553 9.214 8.969 8.709 8.334 8.077 7.778 7.62 7.316 6.978 6.602 6.399 5.81 5.749 5.533 5.301 4.764 4.476 4.172 3.825 3.414 2.898 2.213 0.06 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23474.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23474.txt deleted file mode 100644 index b6e55ffe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23474.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,55 ,TETRA ,17524488,Wed Nov 24 22:16:31 CET,Wed Nov 24 23:52:34 CET,0.0 2.369 3.001 3.501 3.934 4.337 4.696 5.004 5.529 5.768 5.992 6.027 6.594 6.781 7.147 7.479 7.808 7.976 8.284 8.56 8.966 9.227 9.475 9.838 10.177 10.497 10.813 11.114 11.479 11.841 12.18 12.543 12.883 13.228 13.643 14.095 14.489 14.9 15.32 15.761 16.239 16.766 17.373 17.961 18.571 19.198 19.882 20.628 21.416 22.179 22.776 22.855 22.575 22.143 21.682 21.223 20.771 20.307 19.844 19.367 18.93 18.505 18.092 17.688 17.299 16.942 16.574 16.233 15.922 15.599 15.263 14.972 14.662 14.309 14.009 13.686 13.358 13.054 12.765 12.558 12.312 11.884 11.589 11.299 11.151 10.829 10.463 10.087 9.897 9.34 9.313 9.088 8.815 8.232 7.942 7.628 7.217 6.695 6.122 5.37 2.967 -2 ,24017 ,TETRA ,17524491,Wed Nov 24 22:16:29 CET,Wed Nov 24 23:52:17 CET,0.0 1.706 2.349 2.872 3.293 3.663 3.995 4.283 4.795 5.035 5.267 5.319 5.903 6.105 6.47 6.826 7.141 7.288 7.587 7.87 8.289 8.552 8.796 9.139 9.446 9.737 10.02 10.288 10.641 10.974 11.28 11.672 12.055 12.395 12.759 13.154 13.535 13.937 14.348 14.772 15.256 15.798 16.366 16.937 17.6 18.28 19.035 19.794 20.557 21.353 21.975 22.062 21.841 21.44 20.902 20.356 19.876 19.405 18.959 18.46 18.021 17.625 17.218 16.792 16.362 15.994 15.619 15.245 14.919 14.588 14.216 13.899 13.589 13.255 12.968 12.657 12.35 12.037 11.689 11.436 11.171 10.756 10.47 10.173 10.009 9.664 9.31 8.938 8.744 8.173 8.133 7.913 7.673 7.126 6.807 6.448 6.051 5.585 4.983 4.224 -0.5 -3 ,25536 ,TETRA ,17524493,Wed Nov 24 22:16:31 CET,Wed Nov 24 23:52:52 CET,0.0 3.297 4.11 4.601 4.977 5.317 5.641 5.975 6.588 6.847 7.099 7.163 7.736 7.939 8.319 8.704 9.054 9.206 9.516 9.804 10.216 10.48 10.722 11.087 11.429 11.74 12.047 12.352 12.756 13.116 13.426 13.804 14.178 14.54 14.942 15.375 15.791 16.247 16.719 17.182 17.665 18.197 18.81 19.391 20.028 20.75 21.475 22.192 22.981 23.75 24.318 24.43 24.136 23.618 23.111 22.638 22.109 21.586 21.152 20.689 20.256 19.847 19.443 19.072 18.723 18.388 18.032 17.708 17.398 17.067 16.736 16.432 16.103 15.769 15.501 15.227 14.919 14.575 14.228 13.982 13.73 13.305 13.009 12.706 12.537 12.19 11.841 11.485 11.291 10.717 10.656 10.428 10.181 9.619 9.328 9.004 8.611 8.175 7.657 6.942 4.35 -4 ,27890 ,TETRA ,17524495,Wed Nov 24 22:16:33 CET,Wed Nov 24 23:52:51 CET,0.0 1.763 2.343 2.839 3.266 3.654 4.007 4.343 4.946 5.196 5.429 5.502 6.08 6.287 6.708 7.07 7.373 7.528 7.845 8.133 8.556 8.84 9.106 9.473 9.83 10.16 10.465 10.764 11.13 11.483 11.812 12.181 12.534 12.901 13.324 13.729 14.086 14.489 14.914 15.349 15.839 16.363 16.878 17.404 18.023 18.67 19.426 20.179 20.947 21.766 22.446 22.537 22.276 21.907 21.468 20.998 20.542 20.102 19.663 19.168 18.731 18.35 17.978 17.594 17.192 16.809 16.388 16.02 15.728 15.403 15.048 14.74 14.4 14.041 13.755 13.462 13.179 12.876 12.533 12.278 12.002 11.576 11.277 10.966 10.813 10.482 10.102 9.665 9.423 8.805 8.686 8.456 8.209 7.675 7.389 7.07 6.703 6.279 5.755 5.051 2.853 -5 ,6312 ,TETRA ,17524497,Wed Nov 24 22:16:31 CET,Wed Nov 24 23:54:13 CET,0.0 1.959 2.699 3.245 3.673 4.056 4.401 4.723 5.277 5.534 5.781 5.845 6.43 6.623 6.969 7.312 7.634 7.786 8.075 8.364 8.762 8.999 9.235 9.569 9.88 10.197 10.502 10.783 11.141 11.456 11.767 12.159 12.533 12.883 13.278 13.717 14.106 14.506 14.948 15.405 15.88 16.412 16.987 17.526 18.134 18.776 19.48 20.199 20.868 21.547 21.954 21.737 21.375 20.812 20.169 19.528 18.906 18.354 17.842 17.289 16.8 16.325 15.86 15.419 14.974 14.549 14.115 13.737 13.405 13.059 12.69 12.374 12.032 11.652 11.353 11.045 10.72 10.377 10.027 9.798 9.551 9.13 8.84 8.547 8.394 8.079 7.74 7.373 7.168 6.572 6.523 6.29 6.038 5.521 5.235 4.901 4.535 4.144 3.677 3.004 0.344 -6 ,5333 ,TETRA ,17524499,Wed Nov 24 22:19:28 CET,Wed Nov 24 23:56:27 CET,0.0 1.552 2.096 2.593 3.044 3.419 3.753 4.057 4.622 4.882 5.114 5.176 5.754 5.948 6.309 6.639 6.959 7.104 7.383 7.687 8.129 8.374 8.62 8.975 9.3 9.628 9.93 10.199 10.542 10.874 11.205 11.606 11.967 12.3 12.699 13.144 13.529 13.92 14.336 14.81 15.294 15.805 16.391 16.963 17.577 18.226 18.958 19.708 20.502 21.309 22.029 22.174 21.935 21.563 21.113 20.652 20.155 19.629 19.16 18.683 18.267 17.892 17.476 17.006 16.56 16.181 15.801 15.474 15.188 14.863 14.522 14.251 13.957 13.636 13.385 13.129 12.873 12.573 12.214 11.961 11.716 11.337 11.059 10.751 10.587 10.248 9.89 9.522 9.324 8.748 8.674 8.429 8.179 7.662 7.346 6.98 6.6 6.18 5.686 4.949 2.768 -7 ,32436 ,TETRA ,17524501,Wed Nov 24 22:17:31 CET,Wed Nov 24 23:53:56 CET,0.0 1.833 2.443 2.942 3.387 3.749 4.054 4.354 4.946 5.218 5.47 5.558 6.137 6.338 6.737 7.112 7.455 7.607 7.892 8.177 8.581 8.836 9.093 9.48 9.826 10.13 10.398 10.679 11.055 11.389 11.748 12.183 12.56 12.918 13.35 13.796 14.175 14.59 15.03 15.485 15.951 16.446 17.057 17.663 18.28 18.943 19.644 20.365 21.113 21.85 22.469 22.615 22.422 22.046 21.593 21.075 20.581 20.117 19.677 19.175 18.718 18.329 17.963 17.569 17.18 16.817 16.415 16.039 15.722 15.409 15.067 14.756 14.425 14.088 13.809 13.513 13.207 12.875 12.526 12.284 12.032 11.637 11.359 11.061 10.907 10.579 10.219 9.855 9.659 9.079 8.973 8.707 8.446 7.899 7.588 7.239 6.828 6.324 5.738 5.007 2.886 -8 ,25104 ,TETRA ,17524502,Wed Nov 24 22:17:31 CET,Wed Nov 24 23:55:12 CET,0.0 2.919 3.649 4.189 4.598 4.962 5.308 5.606 6.177 6.446 6.676 6.708 7.27 7.468 7.836 8.171 8.488 8.646 8.948 9.231 9.619 9.872 10.119 10.459 10.803 11.129 11.398 11.65 11.996 12.307 12.617 13.018 13.38 13.726 14.127 14.541 14.909 15.32 15.817 16.335 16.797 17.279 17.823 18.369 19.002 19.686 20.405 21.127 21.913 22.696 23.381 23.545 23.205 22.741 22.283 21.803 21.311 20.826 20.375 19.889 19.431 19.011 18.614 18.205 17.818 17.474 17.064 16.639 16.275 15.929 15.577 15.272 14.95 14.62 14.346 14.056 13.745 13.417 13.086 12.855 12.608 12.233 11.965 11.656 11.494 11.146 10.784 10.415 10.222 9.629 9.488 9.231 8.964 8.358 8.007 7.613 7.201 6.685 6.103 5.435 3.363 -9 ,3988 ,TETRA ,17524503,Wed Nov 24 22:17:31 CET,Wed Nov 24 23:55:24 CET,0.0 2.637 3.368 3.893 4.326 4.686 4.985 5.293 5.847 6.104 6.381 6.539 7.139 7.369 7.816 8.223 8.575 8.726 9.027 9.328 9.732 9.968 10.207 10.559 10.882 11.207 11.515 11.799 12.176 12.535 12.846 13.217 13.587 13.967 14.403 14.875 15.317 15.789 16.288 16.776 17.246 17.74 18.312 18.861 19.496 20.2 20.944 21.726 22.533 23.266 23.883 24.063 23.85 23.461 23.003 22.492 22.028 21.579 21.098 20.583 20.155 19.771 19.382 18.992 18.62 18.255 17.868 17.535 17.221 16.878 16.526 16.232 15.91 15.544 15.261 14.983 14.678 14.334 13.99 13.756 13.504 13.09 12.814 12.53 12.375 12.047 11.69 11.302 11.101 10.518 10.424 10.192 9.949 9.391 9.072 8.716 8.311 7.842 7.287 6.588 4.842 -10 ,23690 ,TETRA ,17524505,Wed Nov 24 22:19:28 CET,Wed Nov 24 23:55:35 CET,0.0 1.928 2.642 3.18 3.653 4.046 4.377 4.702 5.269 5.523 5.779 5.887 6.481 6.699 7.094 7.445 7.769 7.928 8.253 8.545 8.94 9.194 9.441 9.822 10.183 10.499 10.806 11.101 11.466 11.822 12.16 12.524 12.894 13.273 13.687 14.131 14.543 14.989 15.451 15.928 16.397 16.92 17.504 18.049 18.686 19.369 20.134 20.908 21.642 22.364 22.953 22.966 22.646 22.256 21.807 21.314 20.85 20.377 19.944 19.476 19.046 18.655 18.247 17.836 17.441 17.056 16.651 16.29 15.953 15.614 15.278 14.994 14.685 14.343 14.074 13.779 13.468 13.142 12.801 12.556 12.299 11.911 11.632 11.325 11.155 10.814 10.446 10.033 9.814 9.223 9.129 8.87 8.596 8.031 7.703 7.345 6.861 6.21 5.5 4.508 1.981 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23475.txt deleted file mode 100644 index 90d68a6d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22114 ,TETRA ,17524506,Wed Nov 24 22:21:29 CET,Wed Nov 24 23:57:10 CET,0.0 1.244 1.803 2.192 2.523 2.853 3.157 3.419 3.869 4.074 4.265 4.246 4.804 4.976 5.309 5.622 5.909 6.055 6.332 6.574 6.901 7.119 7.339 7.656 7.949 8.224 8.498 8.76 9.091 9.382 9.654 9.988 10.306 10.601 10.916 11.285 11.649 12.019 12.389 12.784 13.2 13.644 14.133 14.637 15.18 15.664 16.211 16.767 17.264 17.666 17.868 17.656 17.194 16.621 16.005 15.362 14.744 14.179 13.674 13.136 12.658 12.22 11.771 11.349 10.962 10.572 10.146 9.752 9.415 9.051 8.642 8.301 7.939 7.591 7.336 7.045 6.713 6.355 5.977 5.711 5.435 5.022 4.736 4.418 4.256 3.918 3.548 3.148 2.937 2.354 2.274 2.032 1.78 1.195 0.873 0.518 0.127 -0.339 -0.904 -1.631 -4.005 -2 ,24581 ,TETRA ,17524508,Wed Nov 24 22:19:28 CET,Wed Nov 24 23:56:26 CET,0.0 1.295 1.883 2.329 2.683 2.986 3.252 3.515 4.025 4.26 4.473 4.462 5.002 5.168 5.499 5.807 6.09 6.226 6.495 6.757 7.133 7.355 7.563 7.895 8.205 8.477 8.741 9.001 9.333 9.656 9.935 10.248 10.555 10.845 11.198 11.606 11.967 12.33 12.682 13.057 13.456 13.854 14.309 14.752 15.227 15.734 16.27 16.784 17.277 17.742 17.995 17.712 17.172 16.582 15.996 15.401 14.86 14.331 13.829 13.297 12.813 12.332 11.849 11.372 10.938 10.552 10.117 9.733 9.379 9.02 8.66 8.359 8.059 7.721 7.456 7.171 6.863 6.536 6.19 5.944 5.686 5.305 5.017 4.704 4.55 4.225 3.858 3.461 3.259 2.678 2.594 2.353 2.111 1.525 1.192 0.838 0.456 0.014 -0.531 -1.259 -3.325 -3 ,25828 ,TETRA ,17524511,Wed Nov 24 22:20:29 CET,Wed Nov 24 23:56:02 CET,0.0 1.215 1.764 2.169 2.509 2.832 3.127 3.399 3.922 4.159 4.388 4.426 4.979 5.149 5.469 5.792 6.105 6.254 6.53 6.777 7.125 7.355 7.58 7.889 8.182 8.467 8.727 8.974 9.294 9.581 9.864 10.205 10.52 10.844 11.2 11.546 11.853 12.185 12.534 12.9 13.259 13.648 14.087 14.51 14.991 15.498 16.027 16.591 17.126 17.533 17.687 17.373 16.87 16.327 15.698 15.051 14.471 13.933 13.443 12.887 12.39 11.949 11.516 11.104 10.699 10.287 9.855 9.499 9.158 8.789 8.432 8.115 7.773 7.402 7.102 6.792 6.468 6.122 5.754 5.492 5.22 4.804 4.507 4.187 4.019 3.683 3.35 2.981 2.766 2.157 2.055 1.818 1.564 0.987 0.652 0.269 -0.157 -0.617 -1.182 -1.925 -4.33 -4 ,9868 ,TETRA ,17524513,Wed Nov 24 22:20:29 CET,Wed Nov 24 23:55:53 CET,0.0 1.53 2.163 2.635 3.031 3.369 3.672 3.934 4.404 4.629 4.842 4.854 5.398 5.572 5.918 6.232 6.524 6.659 6.917 7.16 7.5 7.721 7.938 8.264 8.575 8.866 9.138 9.397 9.708 9.995 10.27 10.592 10.895 11.168 11.488 11.837 12.147 12.491 12.878 13.275 13.645 14.06 14.554 15.001 15.473 15.987 16.571 17.2 17.785 18.214 18.333 18.026 17.508 16.898 16.281 15.653 15.062 14.468 13.932 13.391 12.896 12.444 12.009 11.578 11.174 10.804 10.383 9.988 9.631 9.217 8.783 8.438 8.08 7.682 7.366 7.052 6.727 6.391 6.035 5.783 5.506 5.074 4.772 4.448 4.289 3.962 3.606 3.231 3.022 2.423 2.339 2.089 1.821 1.241 0.917 0.567 0.167 -0.292 -0.822 -1.574 -3.325 -5 ,24122 ,TETRA ,17524515,Wed Nov 24 22:20:29 CET,Wed Nov 24 23:56:01 CET,0.0 2.074 2.733 3.193 3.555 3.902 4.225 4.505 5.003 5.212 5.405 5.429 5.981 6.156 6.515 6.838 7.128 7.281 7.588 7.851 8.215 8.444 8.661 8.987 9.278 9.553 9.834 10.101 10.418 10.704 10.959 11.284 11.648 11.98 12.306 12.639 12.948 13.293 13.684 14.084 14.471 14.906 15.401 15.842 16.31 16.811 17.373 17.931 18.49 18.96 19.155 18.894 18.407 17.823 17.237 16.636 16.025 15.46 14.983 14.47 14.019 13.613 13.193 12.752 12.337 11.975 11.547 11.143 10.777 10.402 10.027 9.688 9.299 8.891 8.617 8.32 7.995 7.65 7.281 7.039 6.783 6.352 6.06 5.758 5.584 5.222 4.85 4.439 4.233 3.651 3.555 3.295 3.027 2.464 2.118 1.736 1.339 0.868 0.321 -0.37 -3.214 -6 ,26082 ,TETRA ,17524518,Wed Nov 24 22:20:35 CET,Wed Nov 24 23:55:59 CET,0.0 1.763 2.418 2.86 3.219 3.533 3.808 4.047 4.487 4.709 4.921 4.944 5.497 5.657 5.962 6.28 6.574 6.702 6.954 7.188 7.489 7.691 7.891 8.184 8.475 8.743 8.987 9.211 9.492 9.776 10.054 10.376 10.698 11.0 11.319 11.672 12.006 12.374 12.758 13.131 13.521 13.962 14.479 14.958 15.44 15.956 16.524 17.069 17.554 17.978 18.221 17.94 17.448 16.905 16.327 15.748 15.213 14.664 14.142 13.601 13.134 12.702 12.262 11.841 11.423 11.033 10.616 10.213 9.86 9.483 9.072 8.738 8.396 8.016 7.719 7.424 7.106 6.754 6.358 6.076 5.802 5.37 5.063 4.747 4.58 4.227 3.855 3.481 3.283 2.703 2.617 2.341 2.048 1.442 1.114 0.756 0.354 -0.148 -0.712 -1.393 -3.247 -7 ,15396 ,TETRA ,17524520,Wed Nov 24 22:20:30 CET,Wed Nov 24 23:56:07 CET,0.0 1.815 2.395 2.863 3.245 3.562 3.858 4.167 4.693 4.91 5.12 5.116 5.661 5.832 6.17 6.472 6.741 6.882 7.14 7.364 7.701 7.92 8.137 8.457 8.757 9.049 9.324 9.575 9.879 10.186 10.488 10.836 11.143 11.439 11.778 12.136 12.497 12.895 13.324 13.728 14.095 14.536 15.017 15.451 15.943 16.424 16.924 17.465 18.034 18.522 18.745 18.408 17.832 17.229 16.608 15.992 15.412 14.869 14.394 13.893 13.419 12.959 12.462 11.991 11.58 11.209 10.811 10.405 10.027 9.643 9.252 8.911 8.558 8.2 7.907 7.589 7.272 6.943 6.588 6.332 6.068 5.629 5.314 5.014 4.851 4.487 4.102 3.691 3.468 2.849 2.72 2.472 2.218 1.657 1.353 0.972 0.52 0.013 -0.604 -1.317 -3.438 -8 ,15724 ,TETRA ,17524522,Wed Nov 24 22:20:34 CET,Wed Nov 24 23:58:52 CET,0.0 1.702 2.627 3.236 3.633 3.939 4.203 4.461 4.945 5.164 5.375 5.371 5.924 6.098 6.428 6.746 7.05 7.192 7.464 7.727 8.099 8.322 8.529 8.828 9.129 9.422 9.691 9.965 10.312 10.606 10.907 11.259 11.57 11.861 12.172 12.528 12.873 13.225 13.584 13.954 14.334 14.761 15.216 15.652 16.159 16.671 17.184 17.706 18.229 18.659 18.825 18.53 18.006 17.398 16.797 16.21 15.65 15.101 14.581 14.055 13.583 13.102 12.663 12.271 11.878 11.509 11.131 10.796 10.487 10.129 9.727 9.398 9.05 8.667 8.367 8.061 7.737 7.391 7.001 6.723 6.464 6.041 5.739 5.433 5.265 4.924 4.554 4.125 3.902 3.305 3.188 2.942 2.692 2.114 1.771 1.376 0.936 0.429 -0.13 -0.798 -2.433 -9 ,23805 ,TETRA ,17524524,Wed Nov 24 22:21:30 CET,Wed Nov 24 23:57:11 CET,0.0 1.266 1.971 2.437 2.802 3.1 3.358 3.603 4.048 4.249 4.456 4.481 5.047 5.224 5.541 5.853 6.155 6.294 6.576 6.833 7.169 7.379 7.575 7.856 8.126 8.387 8.622 8.858 9.165 9.435 9.699 10.028 10.336 10.616 10.917 11.263 11.614 11.975 12.367 12.755 13.131 13.565 14.066 14.534 15.016 15.53 16.068 16.601 17.115 17.558 17.743 17.428 16.877 16.292 15.737 15.156 14.611 14.094 13.622 13.125 12.662 12.22 11.759 11.316 10.916 10.538 10.106 9.688 9.331 8.945 8.53 8.186 7.833 7.471 7.193 6.886 6.563 6.209 5.817 5.562 5.292 4.853 4.554 4.243 4.084 3.757 3.412 3.042 2.84 2.253 2.159 1.903 1.635 1.059 0.744 0.387 -0.027 -0.503 -1.078 -1.76 -3.731 -10 ,18854 ,TETRA ,17524526,Wed Nov 24 22:21:30 CET,Wed Nov 24 23:56:48 CET,0.0 1.058 1.608 2.041 2.374 2.679 2.986 3.289 3.801 4.018 4.219 4.252 4.813 4.985 5.297 5.611 5.913 6.055 6.33 6.565 6.881 7.1 7.338 7.682 7.991 8.286 8.572 8.839 9.174 9.481 9.766 10.118 10.465 10.785 11.121 11.484 11.842 12.215 12.606 13.012 13.391 13.793 14.283 14.758 15.278 15.82 16.351 16.86 17.384 17.81 18.006 17.756 17.231 16.605 15.941 15.296 14.719 14.194 13.719 13.211 12.767 12.344 11.9 11.447 11.023 10.61 10.152 9.769 9.431 9.058 8.671 8.323 7.952 7.586 7.305 7.0 6.674 6.364 6.02 5.773 5.522 5.097 4.814 4.519 4.357 4.021 3.652 3.241 3.025 2.441 2.352 2.112 1.864 1.297 0.968 0.606 0.212 -0.251 -0.791 -1.472 -3.706 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23477_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23477_23475.txt deleted file mode 100644 index 2ee0b8f6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23477_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14241 ,TETRA ,17524527,Wed Nov 24 22:21:31 CET,Wed Nov 24 23:55:58 CET,0.0 1.475 2.054 2.459 2.827 3.183 3.516 3.793 4.276 4.517 4.719 4.717 5.255 5.424 5.743 6.024 6.298 6.441 6.703 6.928 7.283 7.519 7.724 8.002 8.255 8.502 8.756 8.988 9.286 9.575 9.85 10.159 10.46 10.753 11.052 11.363 11.663 12.01 12.352 12.667 12.981 13.325 13.74 14.127 14.507 14.906 15.294 15.656 15.949 15.983 15.589 14.746 13.81 12.853 12.01 11.248 10.521 9.858 9.277 8.623 8.032 7.534 7.061 6.591 6.157 5.769 5.322 4.913 4.586 4.221 3.817 3.505 3.174 2.791 2.502 2.199 1.87 1.542 1.185 0.936 0.694 0.306 0.027 -0.278 -0.43 -0.736 -1.07 -1.429 -1.625 -2.205 -2.258 -2.493 -2.736 -3.228 -3.511 -3.831 -4.199 -4.642 -5.156 -5.783 -7.381 -2 ,27192 ,TETRA ,17524530,Wed Nov 24 22:20:34 CET,Wed Nov 24 23:55:32 CET,0.0 1.877 2.494 2.878 3.238 3.575 3.871 4.142 4.615 4.817 5.005 5.017 5.566 5.745 6.071 6.377 6.675 6.812 7.081 7.341 7.694 7.923 8.151 8.473 8.763 9.032 9.303 9.568 9.89 10.191 10.477 10.805 11.117 11.417 11.761 12.137 12.448 12.773 13.121 13.469 13.82 14.19 14.618 15.036 15.444 15.858 16.273 16.624 16.951 17.09 16.81 16.003 15.081 14.191 13.365 12.553 11.799 11.096 10.495 9.893 9.355 8.881 8.41 7.918 7.441 7.004 6.579 6.208 5.867 5.496 5.101 4.758 4.399 4.049 3.767 3.455 3.128 2.781 2.428 2.172 1.904 1.497 1.211 0.926 0.769 0.423 0.056 -0.323 -0.518 -1.108 -1.156 -1.389 -1.64 -2.184 -2.484 -2.792 -3.147 -3.63 -4.257 -5.06 -7.05 -3 ,29219 ,TETRA ,17524531,Wed Nov 24 22:20:36 CET,Wed Nov 24 23:55:37 CET,0.0 1.407 2.005 2.491 2.875 3.186 3.47 3.737 4.21 4.434 4.654 4.691 5.245 5.411 5.739 6.061 6.351 6.492 6.768 7.024 7.387 7.615 7.827 8.126 8.412 8.678 8.938 9.186 9.473 9.769 10.069 10.396 10.713 11.002 11.304 11.619 11.918 12.274 12.634 12.981 13.321 13.68 14.095 14.482 14.89 15.264 15.655 16.045 16.303 16.353 15.953 15.077 14.127 13.202 12.324 11.518 10.794 10.112 9.519 8.908 8.368 7.885 7.405 6.92 6.456 6.036 5.597 5.214 4.872 4.488 4.079 3.753 3.418 3.044 2.746 2.445 2.135 1.809 1.468 1.221 0.963 0.559 0.271 -0.021 -0.167 -0.48 -0.829 -1.202 -1.393 -1.957 -2.002 -2.229 -2.465 -2.977 -3.272 -3.626 -4.044 -4.508 -5.009 -5.659 -7.166 -4 ,9797 ,TETRA ,17524532,Wed Nov 24 22:20:32 CET,Wed Nov 24 23:55:22 CET,0.0 1.831 2.492 2.972 3.375 3.731 4.058 4.38 4.955 5.201 5.428 5.431 5.977 6.168 6.527 6.844 7.129 7.265 7.534 7.787 8.145 8.373 8.595 8.943 9.251 9.514 9.752 9.984 10.291 10.584 10.855 11.148 11.421 11.68 11.985 12.341 12.662 12.991 13.312 13.636 13.991 14.358 14.736 15.091 15.453 15.824 16.209 16.57 16.826 16.885 16.574 15.731 14.806 13.928 13.142 12.393 11.669 10.985 10.386 9.782 9.272 8.793 8.302 7.825 7.376 6.969 6.549 6.154 5.81 5.458 5.09 4.793 4.456 4.084 3.794 3.491 3.191 2.898 2.583 2.354 2.118 1.714 1.434 1.15 0.991 0.647 0.304 -0.041 -0.223 -0.795 -0.852 -1.083 -1.32 -1.82 -2.109 -2.413 -2.748 -3.143 -3.581 -4.182 -6.281 -5 ,28867 ,TETRA ,17524534,Wed Nov 24 22:21:37 CET,Wed Nov 24 23:56:27 CET,0.0 1.728 2.316 2.74 3.08 3.402 3.693 3.963 4.457 4.682 4.897 4.922 5.475 5.643 5.955 6.267 6.571 6.72 7.012 7.275 7.655 7.899 8.13 8.453 8.746 9.024 9.292 9.54 9.846 10.133 10.4 10.708 11.0 11.275 11.592 11.952 12.276 12.604 12.934 13.252 13.579 13.948 14.339 14.697 15.084 15.478 15.843 16.161 16.404 16.445 16.088 15.215 14.243 13.304 12.471 11.689 10.985 10.337 9.747 9.128 8.571 8.038 7.552 7.087 6.654 6.277 5.862 5.458 5.094 4.713 4.321 4.004 3.661 3.279 2.981 2.678 2.376 2.051 1.662 1.393 1.13 0.723 0.439 0.134 -0.029 -0.367 -0.716 -1.09 -1.298 -1.879 -1.931 -2.163 -2.403 -2.898 -3.188 -3.501 -3.837 -4.23 -4.708 -5.341 -7.962 -6 ,31116 ,TETRA ,17524536,Wed Nov 24 22:21:31 CET,Wed Nov 24 23:55:58 CET,0.0 1.63 2.234 2.786 3.236 3.587 3.892 4.15 4.635 4.867 5.093 5.144 5.691 5.862 6.199 6.491 6.758 6.9 7.193 7.456 7.82 8.038 8.227 8.498 8.772 9.046 9.291 9.513 9.792 10.057 10.348 10.719 11.028 11.305 11.622 11.961 12.293 12.641 12.982 13.329 13.68 14.063 14.529 14.937 15.304 15.668 16.054 16.402 16.658 16.78 16.52 15.706 14.802 13.93 13.064 12.222 11.511 10.875 10.264 9.616 9.062 8.572 8.12 7.671 7.236 6.856 6.414 5.994 5.651 5.307 4.935 4.603 4.246 3.871 3.577 3.278 2.968 2.642 2.303 2.061 1.811 1.425 1.148 0.848 0.695 0.383 0.045 -0.326 -0.522 -1.093 -1.154 -1.386 -1.622 -2.135 -2.444 -2.804 -3.19 -3.598 -4.101 -4.742 -6.56 -7 ,27768 ,TETRA ,17524538,Wed Nov 24 22:20:32 CET,Wed Nov 24 23:59:37 CET,0.0 1.698 2.387 2.889 3.293 3.625 3.936 4.225 4.717 4.95 5.168 5.204 5.753 5.93 6.263 6.564 6.852 6.993 7.271 7.549 7.907 8.118 8.34 8.654 8.929 9.202 9.467 9.713 10.013 10.29 10.558 10.864 11.155 11.443 11.781 12.131 12.469 12.832 13.183 13.559 13.91 14.29 14.723 15.092 15.492 15.874 16.268 16.692 17.036 17.2 16.898 16.016 15.094 14.202 13.358 12.559 11.856 11.219 10.625 10.015 9.506 9.039 8.573 8.061 7.573 7.14 6.682 6.299 5.965 5.553 5.099 4.73 4.336 3.951 3.663 3.353 3.024 2.676 2.306 2.058 1.812 1.407 1.116 0.823 0.662 0.336 0.028 -0.299 -0.486 -1.056 -1.096 -1.324 -1.564 -2.058 -2.333 -2.639 -3.003 -3.43 -3.946 -4.679 -6.585 -8 ,10565 ,TETRA ,17524539,Wed Nov 24 22:21:34 CET,Wed Nov 24 23:56:15 CET,0.0 2.386 2.953 3.421 3.813 4.152 4.469 4.744 5.211 5.422 5.63 5.674 6.24 6.426 6.752 7.05 7.325 7.455 7.682 7.905 8.239 8.451 8.645 8.92 9.179 9.432 9.683 9.936 10.258 10.549 10.834 11.173 11.478 11.765 12.097 12.45 12.799 13.167 13.518 13.861 14.173 14.506 14.881 15.247 15.666 16.067 16.451 16.783 17.058 17.131 16.746 15.825 14.828 13.908 13.109 12.366 11.675 11.011 10.42 9.854 9.362 8.875 8.39 7.925 7.476 7.046 6.59 6.198 5.86 5.499 5.116 4.796 4.468 4.115 3.818 3.502 3.205 2.905 2.55 2.304 2.056 1.654 1.389 1.125 0.979 0.66 0.312 -0.074 -0.275 -0.855 -0.889 -1.105 -1.346 -1.874 -2.163 -2.468 -2.831 -3.27 -3.794 -4.36 -5.948 -9 ,9374 ,TETRA ,17524541,Wed Nov 24 22:21:33 CET,Wed Nov 24 23:57:10 CET,0.0 1.295 1.793 2.189 2.552 2.866 3.156 3.439 3.936 4.161 4.378 4.413 4.973 5.151 5.488 5.82 6.109 6.245 6.513 6.764 7.132 7.373 7.6 7.915 8.218 8.5 8.762 9.011 9.324 9.621 9.887 10.176 10.45 10.721 11.04 11.412 11.748 12.084 12.437 12.779 13.119 13.488 13.882 14.241 14.625 15.011 15.422 15.783 16.056 16.163 15.853 15.059 14.129 13.189 12.335 11.532 10.791 10.149 9.581 8.978 8.412 7.911 7.45 6.985 6.532 6.12 5.674 5.271 4.913 4.536 4.138 3.812 3.507 3.178 2.901 2.603 2.28 1.931 1.576 1.341 1.094 0.686 0.4 0.095 -0.061 -0.369 -0.701 -1.047 -1.221 -1.783 -1.837 -2.068 -2.299 -2.79 -3.102 -3.443 -3.818 -4.256 -4.74 -5.404 -7.044 -10 ,13431 ,TETRA ,17524543,Wed Nov 24 22:21:33 CET,Wed Nov 24 23:55:50 CET,0.0 1.624 2.254 2.684 3.047 3.385 3.721 4.033 4.57 4.805 5.009 5.013 5.554 5.721 6.044 6.35 6.646 6.788 7.072 7.338 7.684 7.904 8.127 8.444 8.749 9.038 9.325 9.608 9.936 10.231 10.504 10.822 11.094 11.351 11.672 12.012 12.328 12.666 13.009 13.383 13.756 14.139 14.54 14.87 15.268 15.709 16.11 16.484 16.782 16.833 16.406 15.473 14.484 13.542 12.7 11.913 11.166 10.473 9.901 9.309 8.731 8.204 7.704 7.218 6.762 6.351 5.903 5.485 5.123 4.751 4.322 3.955 3.603 3.226 2.93 2.604 2.243 1.873 1.532 1.3 1.048 0.633 0.339 0.046 -0.106 -0.438 -0.789 -1.122 -1.3 -1.876 -1.949 -2.19 -2.444 -2.994 -3.303 -3.656 -4.038 -4.454 -4.957 -5.734 -7.664 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23475.txt deleted file mode 100644 index 9ba0b147..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23130 ,TETRA ,17524548,Wed Nov 24 22:21:32 CET,Wed Nov 24 23:57:09 CET,0.0 1.066 1.596 1.986 2.345 2.716 3.03 3.291 3.785 4.007 4.221 4.244 4.832 5.013 5.356 5.694 6.013 6.163 6.459 6.757 7.164 7.421 7.673 8.019 8.349 8.662 8.965 9.249 9.611 9.967 10.275 10.63 11.02 11.406 11.802 12.258 12.72 13.217 13.725 14.252 14.814 15.411 16.04 16.666 17.386 18.163 19.023 19.926 20.991 22.051 22.87 23.126 23.016 22.646 22.15 21.661 21.167 20.666 20.193 19.678 19.186 18.737 18.292 17.862 17.465 17.081 16.659 16.264 15.892 15.484 15.047 14.696 14.338 13.924 13.588 13.26 12.912 12.528 12.108 11.824 11.536 11.07 10.753 10.38 10.188 9.828 9.429 8.982 8.746 8.133 8.003 7.725 7.435 6.773 6.397 5.967 5.457 4.91 4.272 3.333 0.834 -2 ,27186 ,TETRA ,17524549,Wed Nov 24 22:21:36 CET,Wed Nov 24 23:57:20 CET,0.0 1.552 2.176 2.621 3.002 3.357 3.672 3.963 4.491 4.732 4.974 5.023 5.611 5.804 6.192 6.567 6.872 7.019 7.306 7.558 7.941 8.193 8.436 8.8 9.141 9.455 9.739 10.01 10.374 10.718 11.042 11.423 11.785 12.151 12.575 13.038 13.466 13.924 14.423 14.945 15.469 16.032 16.714 17.394 18.131 18.904 19.759 20.705 21.718 22.755 23.695 23.957 23.728 23.345 22.873 22.318 21.81 21.325 20.814 20.261 19.805 19.349 18.873 18.425 18.012 17.642 17.247 16.853 16.49 16.128 15.716 15.349 14.981 14.622 14.345 14.042 13.721 13.369 12.992 12.733 12.459 12.007 11.698 11.393 11.231 10.851 10.44 10.025 9.809 9.193 9.011 8.728 8.424 7.76 7.413 7.021 6.548 5.991 5.34 4.324 0.782 -3 ,30854 ,TETRA ,17524550,Wed Nov 24 22:21:32 CET,Wed Nov 24 23:56:58 CET,0.0 1.632 2.309 2.792 3.184 3.525 3.811 4.064 4.57 4.831 5.069 5.085 5.665 5.849 6.209 6.56 6.892 7.052 7.355 7.632 8.032 8.285 8.543 8.922 9.26 9.581 9.887 10.166 10.518 10.842 11.167 11.56 11.933 12.301 12.702 13.135 13.539 13.995 14.47 14.943 15.458 16.032 16.703 17.329 18.036 18.887 19.784 20.683 21.727 22.835 23.781 24.159 23.998 23.576 23.083 22.58 22.068 21.53 21.032 20.494 19.996 19.553 19.11 18.652 18.207 17.811 17.373 16.945 16.602 16.24 15.8 15.411 15.022 14.659 14.386 14.093 13.77 13.41 13.009 12.721 12.425 11.95 11.61 11.265 11.081 10.693 10.302 9.875 9.642 9.012 8.804 8.512 8.206 7.511 7.127 6.69 6.2 5.614 4.86 3.853 0.171 -4 ,17870 ,TETRA ,17524551,Wed Nov 24 22:21:34 CET,Wed Nov 24 23:56:40 CET,0.0 1.302 1.916 2.356 2.706 3.01 3.308 3.588 4.065 4.294 4.523 4.539 5.097 5.275 5.637 5.968 6.274 6.421 6.708 6.984 7.389 7.642 7.878 8.218 8.554 8.861 9.164 9.462 9.804 10.152 10.502 10.888 11.27 11.655 12.067 12.511 12.922 13.381 13.865 14.377 14.905 15.472 16.122 16.764 17.492 18.273 19.126 20.018 20.984 21.929 22.682 22.873 22.73 22.343 21.886 21.41 20.911 20.42 19.925 19.422 18.988 18.558 18.104 17.663 17.233 16.83 16.413 16.012 15.63 15.232 14.852 14.531 14.168 13.771 13.453 13.106 12.754 12.396 12.003 11.731 11.452 10.99 10.652 10.315 10.142 9.754 9.342 8.913 8.688 8.061 7.868 7.56 7.237 6.54 6.168 5.767 5.317 4.816 4.181 3.304 0.683 -5 ,14493 ,TETRA ,17524552,Wed Nov 24 22:21:32 CET,Wed Nov 24 23:56:05 CET,0.0 1.16 1.717 2.188 2.58 2.917 3.228 3.501 3.966 4.191 4.413 4.444 5.018 5.202 5.554 5.884 6.195 6.339 6.633 6.925 7.308 7.556 7.804 8.156 8.496 8.819 9.125 9.412 9.78 10.117 10.458 10.894 11.28 11.636 12.028 12.447 12.86 13.303 13.803 14.341 14.874 15.45 16.112 16.764 17.489 18.29 19.175 20.1 21.116 22.19 23.206 23.475 23.237 22.874 22.466 21.974 21.458 20.947 20.49 20.016 19.567 19.121 18.656 18.219 17.829 17.469 17.058 16.67 16.323 15.945 15.53 15.193 14.83 14.431 14.124 13.791 13.434 13.055 12.667 12.4 12.125 11.671 11.328 10.976 10.801 10.415 10.008 9.591 9.358 8.743 8.614 8.335 8.031 7.358 6.987 6.595 6.156 5.671 5.003 4.015 0.127 -6 ,24512 ,TETRA ,17524553,Wed Nov 24 22:22:33 CET,Wed Nov 24 23:58:33 CET,0.0 1.504 1.975 2.397 2.789 3.166 3.477 3.749 4.296 4.555 4.776 4.8 5.391 5.589 5.973 6.326 6.645 6.796 7.074 7.339 7.739 7.996 8.242 8.606 8.943 9.246 9.547 9.85 10.254 10.634 10.99 11.418 11.808 12.166 12.585 13.036 13.443 13.908 14.421 14.94 15.464 16.044 16.721 17.405 18.174 18.965 19.834 20.81 21.842 22.89 23.887 24.24 24.062 23.71 23.25 22.753 22.271 21.767 21.265 20.725 20.224 19.78 19.357 18.93 18.534 18.134 17.676 17.248 16.856 16.434 15.999 15.641 15.264 14.879 14.563 14.213 13.854 13.486 13.104 12.845 12.56 12.102 11.768 11.418 11.233 10.82 10.388 9.931 9.681 9.057 8.908 8.62 8.33 7.708 7.332 6.907 6.453 5.944 5.36 4.537 2.171 -7 ,12530 ,TETRA ,17524554,Wed Nov 24 22:21:33 CET,Wed Nov 24 23:57:18 CET,0.0 1.422 2.073 2.532 2.917 3.279 3.57 3.838 4.337 4.579 4.804 4.802 5.371 5.54 5.886 6.221 6.55 6.705 6.995 7.275 7.653 7.884 8.115 8.446 8.763 9.075 9.377 9.654 10.016 10.348 10.64 11.019 11.396 11.764 12.205 12.678 13.1 13.569 14.071 14.597 15.106 15.651 16.285 16.917 17.621 18.388 19.284 20.24 21.259 22.311 23.245 23.554 23.368 22.914 22.398 21.88 21.384 20.878 20.376 19.841 19.392 18.986 18.564 18.121 17.691 17.294 16.837 16.432 16.08 15.683 15.263 14.913 14.508 14.076 13.756 13.409 13.054 12.709 12.323 12.044 11.763 11.293 10.959 10.627 10.452 10.091 9.702 9.261 9.038 8.429 8.273 7.998 7.716 7.024 6.619 6.22 5.796 5.275 4.599 3.697 0.69 -8 ,19594 ,TETRA ,17524555,Wed Nov 24 22:21:35 CET,Wed Nov 24 23:57:08 CET,0.0 1.328 1.914 2.4 2.831 3.168 3.457 3.721 4.231 4.47 4.686 4.688 5.258 5.438 5.774 6.105 6.425 6.578 6.888 7.179 7.584 7.854 8.112 8.467 8.819 9.143 9.427 9.733 10.146 10.507 10.839 11.226 11.596 11.942 12.323 12.767 13.183 13.626 14.114 14.615 15.133 15.706 16.374 17.046 17.776 18.547 19.421 20.363 21.351 22.396 23.337 23.666 23.484 23.065 22.602 22.131 21.641 21.132 20.677 20.155 19.67 19.247 18.842 18.45 18.052 17.688 17.279 16.875 16.51 16.124 15.709 15.35 14.972 14.577 14.256 13.916 13.564 13.184 12.797 12.527 12.236 11.785 11.459 11.105 10.921 10.531 10.117 9.648 9.394 8.779 8.638 8.347 8.042 7.4 7.047 6.622 6.09 5.51 4.841 3.948 0.799 -9 ,2238 ,TETRA ,17524556,Wed Nov 24 22:21:37 CET,Wed Nov 24 23:58:57 CET,0.0 1.363 1.898 2.294 2.643 2.969 3.264 3.532 4.013 4.252 4.501 4.545 5.13 5.323 5.699 6.027 6.342 6.502 6.809 7.092 7.5 7.757 7.993 8.343 8.652 8.956 9.269 9.562 9.944 10.317 10.681 11.079 11.434 11.799 12.219 12.684 13.107 13.538 14.008 14.522 15.052 15.615 16.26 16.888 17.589 18.38 19.267 20.192 21.165 22.104 23.009 23.38 23.199 22.835 22.385 21.862 21.321 20.775 20.25 19.701 19.235 18.819 18.428 18.031 17.612 17.214 16.785 16.404 16.068 15.69 15.284 14.93 14.562 14.166 13.855 13.531 13.196 12.831 12.448 12.199 11.917 11.426 11.086 10.75 10.575 10.212 9.825 9.397 9.162 8.535 8.295 7.96 7.613 6.868 6.472 6.056 5.597 5.077 4.392 3.492 0.669 -10 ,10180 ,TETRA ,17524561,Wed Nov 24 22:22:34 CET,Wed Nov 24 23:58:47 CET,0.0 2.412 3.113 3.559 3.954 4.326 4.657 4.952 5.478 5.726 5.945 5.962 6.562 6.762 7.127 7.463 7.774 7.925 8.229 8.506 8.891 9.15 9.377 9.711 10.06 10.385 10.706 11.019 11.406 11.774 12.121 12.531 12.928 13.293 13.683 14.126 14.557 15.026 15.529 16.035 16.528 17.093 17.781 18.423 19.132 19.908 20.769 21.661 22.604 23.602 24.56 24.927 24.711 24.31 23.865 23.369 22.866 22.33 21.837 21.355 20.88 20.402 19.956 19.526 19.087 18.696 18.311 17.935 17.58 17.204 16.827 16.511 16.144 15.75 15.436 15.087 14.725 14.364 13.96 13.674 13.384 12.924 12.598 12.249 12.067 11.684 11.254 10.784 10.55 9.922 9.774 9.5 9.19 8.49 8.033 7.533 7.047 6.526 5.865 5.024 2.9 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23476.txt deleted file mode 100644 index ec9d850e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31392 ,TETRA ,17524563,Wed Nov 24 22:22:36 CET,Wed Nov 24 23:59:19 CET,0.0 2.47 3.183 3.683 4.105 4.518 4.91 5.25 5.858 6.136 6.386 6.456 7.077 7.297 7.703 8.089 8.441 8.619 8.962 9.28 9.711 9.979 10.267 10.677 11.058 11.424 11.767 12.095 12.481 12.845 13.222 13.655 14.048 14.43 14.909 15.458 15.953 16.463 16.985 17.541 18.103 18.682 19.364 20.086 20.884 21.715 22.682 23.73 24.799 25.831 26.76 27.076 26.86 26.449 25.959 25.469 24.965 24.441 23.894 23.263 22.754 22.315 21.891 21.492 21.081 20.686 20.26 19.871 19.536 19.161 18.752 18.393 18.018 17.661 17.37 17.037 16.66 16.249 15.834 15.551 15.26 14.796 14.48 14.151 13.974 13.607 13.208 12.747 12.504 11.883 11.731 11.465 11.183 10.541 10.176 9.784 9.357 8.85 8.288 7.483 4.576 -2 ,7899 ,TETRA ,17524565,Wed Nov 24 22:22:33 CET,Wed Nov 24 23:58:53 CET,0.0 2.253 3.023 3.581 4.004 4.37 4.721 5.031 5.598 5.888 6.153 6.22 6.826 7.031 7.432 7.806 8.154 8.327 8.666 9.009 9.494 9.787 10.063 10.443 10.815 11.185 11.527 11.851 12.271 12.669 13.065 13.518 13.925 14.321 14.764 15.241 15.718 16.249 16.797 17.364 17.939 18.566 19.24 19.884 20.638 21.476 22.422 23.417 24.48 25.539 26.504 26.804 26.594 26.239 25.773 25.239 24.741 24.229 23.737 23.184 22.685 22.271 21.827 21.347 20.917 20.538 20.114 19.699 19.324 18.934 18.532 18.183 17.812 17.411 17.088 16.755 16.424 16.079 15.686 15.419 15.143 14.682 14.351 13.983 13.799 13.433 13.025 12.582 12.353 11.752 11.626 11.354 11.067 10.403 10.002 9.524 8.982 8.38 7.625 6.713 4.449 -3 ,13809 ,TETRA ,17524567,Wed Nov 24 22:22:34 CET,Wed Nov 24 23:58:15 CET,0.0 2.966 3.796 4.351 4.797 5.197 5.55 5.888 6.488 6.755 7.008 7.119 7.745 7.963 8.371 8.773 9.143 9.322 9.705 10.067 10.504 10.781 11.054 11.458 11.829 12.168 12.53 12.88 13.297 13.697 14.069 14.525 14.973 15.352 15.766 16.281 16.798 17.342 17.913 18.494 19.083 19.739 20.491 21.198 21.96 22.758 23.669 24.62 25.574 26.595 27.486 27.701 27.502 27.098 26.638 26.155 25.67 25.161 24.647 24.158 23.736 23.328 22.913 22.483 22.052 21.636 21.225 20.832 20.452 20.071 19.7 19.363 18.984 18.58 18.242 17.878 17.528 17.177 16.805 16.546 16.259 15.813 15.487 15.139 14.969 14.608 14.204 13.758 13.535 12.924 12.786 12.514 12.228 11.57 11.188 10.804 10.363 9.86 9.264 8.419 5.719 -4 ,29662 ,TETRA ,17524568,Wed Nov 24 22:22:39 CET,Wed Nov 24 23:58:28 CET,0.0 2.435 3.205 3.806 4.291 4.692 5.048 5.365 5.904 6.151 6.407 6.509 7.116 7.331 7.731 8.112 8.474 8.662 9.039 9.372 9.847 10.138 10.409 10.811 11.196 11.546 11.883 12.197 12.597 12.995 13.384 13.856 14.298 14.717 15.188 15.708 16.179 16.669 17.204 17.757 18.349 19.032 19.748 20.408 21.186 22.008 22.908 23.918 24.992 26.106 27.106 27.405 27.202 26.822 26.335 25.763 25.238 24.689 24.17 23.655 23.199 22.772 22.343 21.885 21.412 20.974 20.529 20.124 19.764 19.383 18.964 18.62 18.253 17.851 17.531 17.186 16.828 16.48 16.118 15.847 15.552 15.082 14.743 14.388 14.21 13.834 13.417 12.969 12.727 12.112 12.001 11.748 11.478 10.796 10.423 10.046 9.644 9.212 8.615 7.794 4.862 -5 ,30093 ,TETRA ,17524570,Wed Nov 24 22:22:37 CET,Wed Nov 24 23:58:53 CET,0.0 2.059 2.792 3.316 3.752 4.153 4.526 4.849 5.474 5.77 6.04 6.118 6.726 6.963 7.39 7.762 8.107 8.264 8.583 8.914 9.401 9.706 9.994 10.393 10.761 11.119 11.47 11.786 12.186 12.587 12.971 13.418 13.838 14.237 14.686 15.161 15.585 16.058 16.566 17.076 17.632 18.274 19.048 19.812 20.64 21.52 22.484 23.478 24.47 25.489 26.404 26.691 26.495 26.086 25.589 25.055 24.508 23.981 23.518 23.017 22.567 22.123 21.684 21.243 20.802 20.383 19.926 19.539 19.205 18.862 18.51 18.207 17.857 17.468 17.16 16.837 16.511 16.138 15.729 15.441 15.146 14.689 14.349 13.984 13.81 13.461 13.035 12.589 12.381 11.794 11.685 11.429 11.167 10.518 10.125 9.708 9.267 8.787 8.169 7.301 4.141 -6 ,30696 ,TETRA ,17524572,Wed Nov 24 22:22:36 CET,Wed Nov 24 23:59:20 CET,0.0 2.767 3.461 3.959 4.41 4.814 5.2 5.554 6.18 6.467 6.713 6.824 7.456 7.679 8.088 8.453 8.81 8.977 9.303 9.632 10.117 10.429 10.714 11.104 11.466 11.834 12.206 12.547 12.955 13.337 13.714 14.172 14.594 14.99 15.456 15.967 16.442 16.973 17.536 18.123 18.715 19.327 20.049 20.78 21.553 22.339 23.207 24.156 25.199 26.317 27.263 27.566 27.402 27.022 26.521 25.923 25.371 24.808 24.268 23.728 23.239 22.789 22.355 21.919 21.5 21.096 20.637 20.211 19.839 19.498 19.112 18.741 18.361 17.975 17.681 17.38 17.048 16.688 16.318 16.044 15.753 15.312 15.009 14.679 14.504 14.132 13.73 13.3 13.085 12.477 12.316 12.023 11.719 11.093 10.737 10.34 9.908 9.435 8.86 8.057 5.497 -7 ,24228 ,TETRA ,17524574,Wed Nov 24 22:22:41 CET,Wed Nov 24 23:59:01 CET,0.0 2.822 3.676 4.213 4.656 5.07 5.442 5.772 6.337 6.603 6.85 6.894 7.507 7.735 8.142 8.513 8.879 9.065 9.41 9.732 10.19 10.457 10.725 11.13 11.475 11.796 12.117 12.442 12.846 13.201 13.557 14.001 14.416 14.78 15.191 15.664 16.128 16.665 17.234 17.821 18.428 19.048 19.716 20.425 21.233 22.073 23.023 23.977 24.998 26.077 27.062 27.397 27.247 26.894 26.413 25.915 25.416 24.937 24.486 23.946 23.431 22.948 22.486 22.053 21.631 21.231 20.781 20.362 20.002 19.616 19.195 18.853 18.529 18.147 17.82 17.467 17.115 16.776 16.399 16.13 15.845 15.389 15.088 14.785 14.616 14.232 13.858 13.467 13.249 12.652 12.501 12.22 11.947 11.327 10.962 10.573 10.165 9.665 9.005 8.15 5.752 -8 ,12279 ,TETRA ,17524575,Wed Nov 24 22:23:32 CET,Wed Nov 24 23:58:59 CET,0.0 2.23 3.055 3.639 4.065 4.467 4.844 5.156 5.735 6.012 6.26 6.31 6.91 7.122 7.532 7.896 8.23 8.389 8.709 9.016 9.451 9.739 10.0 10.38 10.76 11.111 11.43 11.726 12.134 12.539 12.904 13.362 13.829 14.258 14.739 15.25 15.704 16.214 16.75 17.284 17.85 18.47 19.176 19.887 20.716 21.6 22.538 23.537 24.566 25.56 26.444 26.704 26.488 26.09 25.599 25.085 24.558 24.035 23.555 23.006 22.532 22.098 21.637 21.191 20.743 20.305 19.85 19.438 19.065 18.67 18.25 17.902 17.534 17.109 16.781 16.446 16.096 15.739 15.345 15.066 14.784 14.31 13.964 13.623 13.453 13.049 12.602 12.17 11.941 11.315 11.184 10.916 10.618 9.974 9.632 9.244 8.755 8.228 7.64 6.783 3.066 -9 ,20966 ,TETRA ,17524576,Wed Nov 24 22:23:34 CET,Wed Nov 24 23:59:21 CET,0.0 2.106 2.795 3.386 3.862 4.281 4.663 4.98 5.529 5.792 6.053 6.151 6.783 7.01 7.459 7.86 8.208 8.38 8.715 9.03 9.464 9.736 9.995 10.385 10.758 11.129 11.493 11.853 12.291 12.658 13.009 13.432 13.857 14.263 14.709 15.196 15.664 16.155 16.668 17.23 17.796 18.414 19.137 19.845 20.628 21.452 22.366 23.36 24.439 25.546 26.548 26.831 26.559 26.145 25.699 25.219 24.726 24.201 23.718 23.233 22.764 22.305 21.865 21.457 21.021 20.629 20.235 19.851 19.528 19.17 18.768 18.417 18.039 17.643 17.325 16.981 16.613 16.225 15.843 15.577 15.277 14.81 14.492 14.151 13.974 13.606 13.219 12.795 12.57 11.965 11.835 11.558 11.26 10.595 10.235 9.862 9.414 8.896 8.239 7.368 5.152 -10 ,5851 ,TETRA ,17524577,Wed Nov 24 22:23:36 CET,Thu Nov 25 00:00:19 CET,0.0 2.225 2.927 3.43 3.894 4.323 4.718 5.046 5.608 5.877 6.136 6.233 6.853 7.079 7.511 7.939 8.345 8.527 8.86 9.167 9.608 9.881 10.143 10.532 10.895 11.265 11.619 11.933 12.333 12.702 13.074 13.515 13.892 14.257 14.705 15.229 15.711 16.237 16.794 17.341 17.907 18.511 19.196 19.901 20.694 21.549 22.476 23.427 24.484 25.562 26.395 26.607 26.358 25.888 25.386 24.921 24.449 23.914 23.437 22.936 22.446 22.005 21.588 21.18 20.771 20.392 19.978 19.566 19.186 18.776 18.356 18.018 17.646 17.245 16.944 16.617 16.251 15.874 15.488 15.222 14.945 14.512 14.183 13.818 13.64 13.292 12.919 12.496 12.263 11.655 11.56 11.293 11.005 10.35 10.001 9.598 9.122 8.6 8.005 7.246 4.188 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23479.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23479.txt deleted file mode 100644 index 5934c19c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23479.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20838 ,TETRA ,17524578,Wed Nov 24 22:23:37 CET,Thu Nov 25 00:00:18 CET,0.0 1.766 2.475 2.974 3.393 3.737 4.061 4.367 4.909 5.169 5.418 5.491 6.085 6.284 6.641 6.983 7.319 7.48 7.816 8.133 8.57 8.841 9.082 9.426 9.756 10.083 10.414 10.709 11.059 11.38 11.677 12.085 12.504 12.863 13.276 13.713 14.094 14.539 15.049 15.55 15.996 16.473 16.997 17.516 18.113 18.72 19.348 19.985 20.55 21.011 21.233 20.882 20.239 19.472 18.733 18.051 17.404 16.744 16.133 15.498 14.929 14.407 13.913 13.486 13.069 12.653 12.232 11.84 11.477 11.091 10.675 10.334 9.992 9.598 9.265 8.94 8.601 8.262 7.927 7.678 7.414 7.01 6.716 6.398 6.242 5.918 5.567 5.152 4.913 4.303 4.266 4.039 3.8 3.281 2.955 2.578 2.156 1.682 1.134 0.412 -1.183 -2 ,29934 ,TETRA ,17524579,Wed Nov 24 22:24:32 CET,Thu Nov 25 00:00:53 CET,0.0 1.424 2.013 2.435 2.828 3.203 3.521 3.833 4.422 4.668 4.904 4.973 5.556 5.739 6.103 6.439 6.758 6.922 7.214 7.496 7.912 8.152 8.371 8.696 9.037 9.347 9.621 9.901 10.255 10.557 10.836 11.201 11.562 11.896 12.287 12.723 13.11 13.498 13.895 14.327 14.783 15.267 15.791 16.303 16.854 17.445 18.113 18.76 19.379 19.897 20.094 19.728 19.1 18.444 17.789 17.116 16.485 15.872 15.299 14.698 14.167 13.691 13.242 12.79 12.36 11.974 11.53 11.112 10.753 10.368 9.95 9.611 9.246 8.865 8.569 8.243 7.901 7.555 7.183 6.926 6.678 6.302 6.041 5.745 5.581 5.251 4.912 4.544 4.353 3.767 3.723 3.478 3.209 2.671 2.38 2.054 1.693 1.262 0.761 0.152 -1.817 -3 ,473 ,TETRA ,17524580,Wed Nov 24 22:25:32 CET,Thu Nov 25 00:02:20 CET,0.0 1.454 2.164 2.701 3.097 3.449 3.777 4.069 4.58 4.825 5.064 5.121 5.717 5.921 6.297 6.643 6.965 7.113 7.394 7.681 8.083 8.322 8.563 8.909 9.256 9.593 9.884 10.159 10.497 10.845 11.183 11.547 11.891 12.213 12.578 12.978 13.354 13.734 14.143 14.585 15.048 15.548 16.061 16.542 17.126 17.741 18.356 18.948 19.538 20.1 20.319 19.962 19.366 18.631 17.873 17.154 16.506 15.856 15.293 14.727 14.195 13.698 13.203 12.749 12.323 11.935 11.522 11.143 10.813 10.429 10.016 9.692 9.353 8.999 8.702 8.377 8.052 7.734 7.418 7.185 6.939 6.55 6.267 5.965 5.803 5.471 5.117 4.715 4.508 3.916 3.867 3.643 3.39 2.841 2.532 2.2 1.855 1.471 0.977 0.338 -1.037 -4 ,724 ,TETRA ,17524581,Wed Nov 24 22:25:35 CET,Thu Nov 25 00:02:54 CET,0.0 1.223 1.83 2.335 2.779 3.152 3.502 3.82 4.376 4.632 4.874 4.944 5.542 5.749 6.152 6.544 6.89 7.048 7.388 7.705 8.117 8.395 8.666 9.04 9.389 9.708 10.006 10.307 10.681 11.021 11.376 11.79 12.164 12.533 12.931 13.321 13.692 14.1 14.522 15.001 15.492 15.974 16.494 16.995 17.582 18.183 18.789 19.366 19.902 20.396 20.588 20.143 19.467 18.746 18.016 17.32 16.667 16.058 15.505 14.893 14.359 13.869 13.383 12.94 12.524 12.103 11.629 11.209 10.848 10.464 10.056 9.729 9.398 9.033 8.733 8.435 8.115 7.752 7.391 7.15 6.899 6.485 6.198 5.892 5.725 5.364 4.972 4.595 4.4 3.798 3.748 3.489 3.216 2.671 2.364 2.054 1.694 1.24 0.722 0.012 -1.598 -5 ,23471 ,TETRA ,17524582,Wed Nov 24 22:25:33 CET,Thu Nov 25 00:02:05 CET,0.0 1.287 1.894 2.337 2.719 3.08 3.404 3.7 4.236 4.478 4.704 4.742 5.338 5.541 5.91 6.266 6.6 6.752 7.027 7.297 7.716 7.974 8.219 8.58 8.921 9.245 9.547 9.837 10.193 10.532 10.849 11.205 11.545 11.885 12.311 12.758 13.139 13.536 13.941 14.371 14.828 15.304 15.843 16.395 16.995 17.577 18.177 18.77 19.335 19.862 20.076 19.661 18.967 18.241 17.513 16.777 16.119 15.48 14.895 14.311 13.786 13.301 12.833 12.374 11.938 11.548 11.11 10.701 10.358 9.989 9.586 9.251 8.897 8.517 8.221 7.91 7.575 7.238 6.899 6.659 6.4 5.976 5.677 5.379 5.23 4.914 4.56 4.19 4.005 3.415 3.369 3.14 2.892 2.334 2.023 1.698 1.338 0.932 0.471 -0.133 -1.271 -6 ,6499 ,TETRA ,17524583,Wed Nov 24 22:25:33 CET,Thu Nov 25 00:13:08 CET,0.0 1.173 1.81 2.318 2.729 3.102 3.428 3.75 4.346 4.6 4.832 4.884 5.475 5.669 6.037 6.383 6.714 6.876 7.174 7.449 7.863 8.126 8.388 8.767 9.108 9.462 9.801 10.093 10.446 10.787 11.125 11.525 11.872 12.206 12.617 13.061 13.458 13.895 14.351 14.783 15.234 15.733 16.285 16.828 17.404 17.994 18.626 19.228 19.803 20.32 20.556 20.174 19.498 18.773 18.085 17.388 16.728 16.102 15.53 14.916 14.346 13.862 13.401 12.96 12.525 12.102 11.676 11.276 10.914 10.511 10.087 9.754 9.405 9.026 8.729 8.418 8.09 7.741 7.379 7.141 6.893 6.495 6.205 5.89 5.733 5.406 5.064 4.717 4.523 3.929 3.851 3.607 3.366 2.874 2.615 2.294 1.913 1.501 1.008 0.4 -0.952 -7 ,2853 ,TETRA ,17524584,Wed Nov 24 22:25:33 CET,Thu Nov 25 00:03:43 CET,0.0 1.511 2.176 2.625 3.015 3.38 3.726 4.03 4.566 4.824 5.06 5.088 5.679 5.877 6.244 6.602 6.944 7.101 7.385 7.651 8.047 8.315 8.573 8.948 9.304 9.614 9.909 10.204 10.551 10.862 11.18 11.56 11.903 12.217 12.615 13.062 13.46 13.887 14.317 14.729 15.17 15.67 16.217 16.739 17.282 17.87 18.502 19.089 19.645 20.079 20.235 19.821 19.104 18.346 17.614 16.941 16.327 15.71 15.161 14.605 14.087 13.597 13.13 12.679 12.232 11.825 11.407 11.019 10.663 10.259 9.834 9.48 9.089 8.675 8.37 8.055 7.727 7.389 7.043 6.802 6.554 6.16 5.862 5.55 5.389 5.048 4.692 4.329 4.134 3.53 3.492 3.277 3.04 2.516 2.23 1.915 1.557 1.117 0.623 0.036 -2.016 -8 ,10749 ,TETRA ,17524585,Wed Nov 24 22:27:31 CET,Thu Nov 25 00:04:28 CET,0.0 1.345 1.899 2.367 2.805 3.191 3.53 3.844 4.374 4.606 4.84 4.907 5.509 5.703 6.061 6.409 6.756 6.919 7.216 7.512 7.928 8.179 8.421 8.764 9.092 9.406 9.726 10.022 10.38 10.713 11.033 11.432 11.798 12.12 12.485 12.886 13.294 13.743 14.176 14.618 15.034 15.48 16.028 16.567 17.142 17.743 18.358 18.929 19.534 20.07 20.239 19.834 19.216 18.528 17.818 17.139 16.47 15.837 15.29 14.737 14.222 13.718 13.256 12.803 12.352 11.945 11.527 11.127 10.772 10.413 10.014 9.666 9.33 8.984 8.707 8.413 8.086 7.734 7.392 7.167 6.931 6.518 6.218 5.926 5.773 5.422 5.021 4.629 4.441 3.867 3.846 3.618 3.37 2.87 2.612 2.331 1.972 1.506 1.009 0.416 -0.933 -9 ,30943 ,TETRA ,17524588,Wed Nov 24 22:27:34 CET,Thu Nov 25 00:04:16 CET,0.0 1.272 1.934 2.498 2.955 3.294 3.613 3.927 4.492 4.74 4.97 5.045 5.643 5.844 6.225 6.564 6.887 7.043 7.347 7.653 8.092 8.367 8.626 9.003 9.347 9.648 9.937 10.226 10.584 10.906 11.23 11.63 11.993 12.35 12.743 13.13 13.51 13.938 14.389 14.846 15.306 15.825 16.387 16.917 17.51 18.082 18.691 19.326 19.917 20.361 20.495 20.092 19.38 18.649 17.975 17.303 16.642 15.971 15.402 14.859 14.357 13.883 13.423 12.957 12.498 12.088 11.647 11.23 10.866 10.497 10.113 9.78 9.44 9.093 8.811 8.517 8.18 7.817 7.457 7.198 6.937 6.523 6.245 5.949 5.788 5.463 5.134 4.774 4.585 4.006 4.009 3.797 3.564 3.062 2.788 2.509 2.21 1.882 1.498 1.02 -0.059 -10 ,24735 ,TETRA ,17524590,Wed Nov 24 22:29:32 CET,Thu Nov 25 00:06:53 CET,0.0 1.606 2.166 2.59 3.0 3.372 3.681 3.975 4.525 4.777 5.001 5.02 5.599 5.789 6.164 6.518 6.868 7.031 7.329 7.612 8.028 8.302 8.559 8.913 9.234 9.54 9.86 10.173 10.529 10.854 11.17 11.542 11.884 12.208 12.576 12.972 13.359 13.776 14.189 14.607 15.064 15.599 16.186 16.719 17.298 17.907 18.53 19.161 19.759 20.23 20.414 20.021 19.372 18.677 17.963 17.277 16.651 16.054 15.514 14.919 14.378 13.892 13.436 13.005 12.589 12.183 11.728 11.297 10.936 10.555 10.149 9.813 9.443 9.067 8.771 8.459 8.145 7.81 7.453 7.204 6.935 6.488 6.171 5.846 5.678 5.33 4.99 4.634 4.433 3.844 3.847 3.641 3.416 2.896 2.594 2.291 1.966 1.539 1.008 0.354 -0.762 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23482.txt deleted file mode 100644 index ee62f411..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15095 ,TETRA ,17524597,Wed Nov 24 22:29:39 CET,Thu Nov 25 00:06:16 CET,0.0 1.641 2.275 2.767 3.18 3.524 3.841 4.123 4.607 4.827 5.042 5.056 5.612 5.775 6.088 6.373 6.626 6.742 6.959 7.162 7.461 7.644 7.815 8.072 8.301 8.498 8.667 8.815 8.982 9.14 9.294 9.447 9.601 9.758 9.873 9.956 10.041 10.078 10.085 10.064 9.999 9.913 9.77 9.533 9.135 8.593 7.814 6.713 5.051 2.474 -1.816 -6.83 -10.74 -13.886 -16.545 -18.881 -20.887 -22.668 -24.131 -25.588 -26.852 -27.95 -28.989 -29.985 -30.934 -31.776 -32.613 -33.361 -34.033 -34.731 -35.413 -35.969 -36.561 -37.177 -37.658 -38.156 -38.667 -39.211 -39.768 -40.139 -40.512 -41.131 -41.577 -42.016 -42.237 -42.683 -43.169 -43.685 -43.945 -44.657 -44.793 -45.104 -45.43 -46.121 -46.5 -46.918 -47.382 -47.88 -48.429 -49.163 -50.638 -2 ,16869 ,TETRA ,17524598,Wed Nov 24 22:29:32 CET,Thu Nov 25 00:05:25 CET,0.0 1.712 2.401 2.921 3.391 3.785 4.132 4.433 4.963 5.191 5.385 5.375 5.93 6.086 6.376 6.642 6.902 7.024 7.26 7.475 7.779 7.985 8.164 8.396 8.62 8.816 8.978 9.12 9.3 9.464 9.571 9.692 9.836 9.954 10.1 10.271 10.4 10.49 10.54 10.523 10.441 10.33 10.148 9.912 9.509 8.929 8.132 7.012 5.36 2.804 -1.43 -6.231 -10.112 -13.312 -15.955 -18.259 -20.2 -21.936 -23.396 -24.818 -26.044 -27.121 -28.151 -29.133 -30.065 -30.926 -31.753 -32.458 -33.092 -33.744 -34.41 -34.963 -35.559 -36.217 -36.722 -37.228 -37.743 -38.283 -38.85 -39.23 -39.627 -40.251 -40.672 -41.085 -41.293 -41.75 -42.252 -42.785 -43.064 -43.783 -43.955 -44.28 -44.61 -45.353 -45.767 -46.229 -46.731 -47.251 -47.844 -48.692 -50.228 -3 ,1764 ,TETRA ,17524600,Wed Nov 24 22:31:31 CET,Thu Nov 25 00:08:19 CET,0.0 2.361 3.089 3.638 4.086 4.483 4.822 5.104 5.567 5.766 5.959 5.953 6.512 6.671 6.964 7.247 7.54 7.672 7.902 8.118 8.404 8.57 8.743 9.008 9.22 9.405 9.586 9.759 9.996 10.184 10.346 10.54 10.676 10.777 10.887 10.995 11.064 11.115 11.149 11.142 11.096 11.008 10.841 10.604 10.227 9.682 8.856 7.668 5.925 3.344 -0.924 -5.764 -9.584 -12.829 -15.505 -17.769 -19.682 -21.386 -22.845 -24.277 -25.513 -26.635 -27.686 -28.667 -29.567 -30.366 -31.19 -31.949 -32.618 -33.287 -33.975 -34.558 -35.159 -35.781 -36.267 -36.771 -37.263 -37.762 -38.314 -38.69 -39.06 -39.644 -40.055 -40.483 -40.699 -41.142 -41.62 -42.132 -42.396 -43.109 -43.272 -43.601 -43.93 -44.609 -44.999 -45.398 -45.815 -46.291 -46.838 -47.608 -49.572 -4 ,2442 ,TETRA ,17524601,Wed Nov 24 22:32:35 CET,Thu Nov 25 00:09:11 CET,0.0 2.258 2.947 3.452 3.925 4.335 4.669 4.956 5.444 5.662 5.874 5.884 6.444 6.592 6.88 7.178 7.449 7.571 7.79 7.987 8.254 8.416 8.58 8.805 9.012 9.2 9.345 9.487 9.678 9.842 9.979 10.134 10.282 10.382 10.466 10.579 10.695 10.78 10.796 10.777 10.724 10.598 10.401 10.144 9.729 9.148 8.303 7.077 5.351 2.799 -1.508 -6.415 -10.229 -13.366 -16.039 -18.355 -20.345 -22.109 -23.585 -25.039 -26.264 -27.344 -28.356 -29.276 -30.139 -30.947 -31.804 -32.565 -33.21 -33.864 -34.551 -35.128 -35.718 -36.338 -36.822 -37.32 -37.819 -38.349 -38.89 -39.271 -39.675 -40.268 -40.701 -41.133 -41.363 -41.869 -42.353 -42.84 -43.099 -43.81 -43.935 -44.253 -44.596 -45.305 -45.688 -46.102 -46.54 -47.027 -47.582 -48.346 -50.075 -5 ,26465 ,TETRA ,17524602,Wed Nov 24 22:32:36 CET,Thu Nov 25 00:10:11 CET,0.0 1.761 2.411 2.905 3.35 3.722 4.036 4.317 4.8 5.005 5.196 5.171 5.715 5.863 6.123 6.387 6.644 6.759 6.982 7.189 7.455 7.628 7.796 8.036 8.269 8.481 8.648 8.791 9.005 9.197 9.344 9.523 9.681 9.797 9.886 9.977 10.055 10.13 10.185 10.194 10.154 10.051 9.869 9.591 9.172 8.602 7.763 6.573 4.855 2.278 -1.915 -6.815 -10.653 -13.771 -16.415 -18.765 -20.782 -22.554 -24.095 -25.615 -26.858 -27.948 -29.023 -30.031 -30.925 -31.715 -32.495 -33.2 -33.834 -34.491 -35.162 -35.716 -36.299 -36.9 -37.381 -37.886 -38.412 -38.949 -39.498 -39.881 -40.257 -40.846 -41.272 -41.698 -41.908 -42.358 -42.834 -43.33 -43.609 -44.336 -44.46 -44.764 -45.093 -45.799 -46.173 -46.564 -47.046 -47.607 -48.202 -49.004 -52.034 -6 ,10994 ,TETRA ,17524603,Wed Nov 24 22:30:31 CET,Thu Nov 25 00:07:16 CET,0.0 2.806 3.597 4.109 4.538 4.878 5.153 5.431 5.967 6.213 6.419 6.39 6.944 7.107 7.389 7.672 7.951 8.073 8.277 8.463 8.754 8.939 9.116 9.355 9.564 9.771 9.968 10.148 10.345 10.529 10.699 10.888 11.07 11.205 11.334 11.488 11.579 11.633 11.688 11.689 11.632 11.502 11.286 11.052 10.701 10.138 9.317 8.16 6.481 3.949 -0.287 -5.161 -9.061 -12.246 -14.906 -17.238 -19.212 -20.964 -22.456 -23.905 -25.17 -26.317 -27.397 -28.387 -29.296 -30.133 -30.996 -31.735 -32.368 -33.046 -33.739 -34.309 -34.883 -35.464 -35.917 -36.389 -36.896 -37.423 -37.939 -38.301 -38.687 -39.287 -39.698 -40.116 -40.339 -40.829 -41.334 -41.817 -42.072 -42.779 -42.91 -43.208 -43.522 -44.191 -44.556 -44.958 -45.437 -45.993 -46.629 -47.412 -48.997 -7 ,18043 ,TETRA ,17524604,Wed Nov 24 22:32:33 CET,Thu Nov 25 00:08:21 CET,0.0 1.683 2.265 2.715 3.065 3.377 3.705 3.983 4.434 4.649 4.852 4.843 5.411 5.583 5.899 6.164 6.405 6.524 6.754 6.961 7.264 7.448 7.602 7.825 8.035 8.225 8.388 8.558 8.765 8.933 9.087 9.277 9.474 9.621 9.742 9.85 9.948 10.05 10.115 10.155 10.138 10.02 9.811 9.569 9.188 8.619 7.803 6.637 4.952 2.399 -1.857 -6.823 -10.789 -14.026 -16.706 -18.996 -20.936 -22.684 -24.183 -25.642 -26.856 -27.916 -28.933 -29.89 -30.751 -31.558 -32.422 -33.168 -33.82 -34.489 -35.173 -35.733 -36.271 -36.838 -37.305 -37.784 -38.283 -38.813 -39.345 -39.697 -40.056 -40.648 -41.099 -41.561 -41.784 -42.246 -42.723 -43.216 -43.5 -44.246 -44.417 -44.725 -45.054 -45.735 -46.087 -46.491 -46.942 -47.421 -48.035 -48.885 -51.346 -8 ,24518 ,TETRA ,17524605,Wed Nov 24 22:30:31 CET,Thu Nov 25 00:06:52 CET,0.0 1.925 2.656 3.202 3.596 3.923 4.248 4.547 5.041 5.286 5.508 5.538 6.113 6.284 6.624 6.926 7.19 7.32 7.573 7.793 8.065 8.25 8.423 8.636 8.816 9.012 9.215 9.388 9.573 9.755 9.917 10.046 10.175 10.318 10.448 10.547 10.621 10.71 10.768 10.769 10.723 10.63 10.482 10.274 9.915 9.342 8.511 7.398 5.779 3.274 -0.835 -5.582 -9.495 -12.823 -15.573 -17.89 -19.855 -21.623 -23.103 -24.549 -25.806 -26.913 -27.94 -28.88 -29.735 -30.547 -31.38 -32.117 -32.737 -33.337 -33.987 -34.545 -35.131 -35.741 -36.224 -36.726 -37.225 -37.749 -38.298 -38.681 -39.082 -39.736 -40.193 -40.645 -40.878 -41.377 -41.896 -42.407 -42.658 -43.345 -43.452 -43.749 -44.069 -44.762 -45.143 -45.546 -45.98 -46.472 -47.023 -47.879 -50.139 -9 ,26873 ,TETRA ,17524606,Wed Nov 24 22:30:33 CET,Thu Nov 25 00:06:31 CET,0.0 1.831 2.499 3.058 3.533 3.925 4.25 4.524 4.999 5.214 5.419 5.41 5.973 6.135 6.441 6.733 6.99 7.108 7.341 7.563 7.853 8.027 8.19 8.439 8.68 8.878 9.055 9.219 9.441 9.639 9.804 9.973 10.111 10.243 10.365 10.465 10.558 10.631 10.672 10.684 10.665 10.584 10.409 10.146 9.779 9.277 8.468 7.303 5.617 3.077 -1.043 -5.814 -9.609 -12.71 -15.374 -17.725 -19.726 -21.496 -22.979 -24.427 -25.687 -26.827 -27.889 -28.848 -29.711 -30.493 -31.324 -32.072 -32.709 -33.363 -34.046 -34.625 -35.242 -35.854 -36.3 -36.788 -37.314 -37.839 -38.366 -38.727 -39.113 -39.724 -40.147 -40.596 -40.842 -41.344 -41.838 -42.36 -42.652 -43.383 -43.534 -43.85 -44.18 -44.871 -45.267 -45.696 -46.14 -46.647 -47.269 -48.041 -49.783 -10 ,32648 ,TETRA ,17524607,Wed Nov 24 22:33:32 CET,Thu Nov 25 00:10:45 CET,0.0 1.913 2.592 3.04 3.428 3.747 4.027 4.281 4.743 4.954 5.166 5.142 5.693 5.866 6.189 6.485 6.746 6.881 7.128 7.331 7.611 7.767 7.908 8.111 8.307 8.493 8.666 8.838 9.051 9.267 9.46 9.651 9.805 9.905 10.029 10.11 10.167 10.245 10.238 10.184 10.123 10.013 9.819 9.577 9.185 8.597 7.773 6.595 4.91 2.386 -1.881 -6.811 -10.662 -13.826 -16.537 -18.917 -20.919 -22.637 -24.033 -25.407 -26.598 -27.696 -28.735 -29.654 -30.491 -31.298 -32.13 -32.849 -33.492 -34.153 -34.833 -35.408 -36.011 -36.635 -37.11 -37.602 -38.117 -38.65 -39.213 -39.593 -39.988 -40.635 -41.077 -41.538 -41.775 -42.253 -42.767 -43.293 -43.579 -44.311 -44.427 -44.719 -45.033 -45.735 -46.125 -46.549 -46.995 -47.485 -48.023 -48.722 -50.399 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23475.txt deleted file mode 100644 index 6621cd38..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24778 ,KEBNE ,17019541,Wed Dec 22 03:09:57 CET,Wed Dec 22 04:31:44 CET,0.0 1.98 2.671 3.174 3.634 4.033 4.396 4.75 5.39 5.695 5.99 6.114 6.826 7.084 7.584 8.058 8.522 8.746 9.169 9.567 10.15 10.527 10.879 11.383 11.949 12.498 12.958 13.404 13.987 14.562 15.107 15.774 16.467 17.131 17.887 18.75 19.555 20.451 21.432 22.453 23.532 24.778 26.28 27.8 29.567 31.553 33.928 36.777 40.323 44.727 50.201 54.859 57.73 59.619 60.917 61.88 62.554 63.016 63.378 63.646 63.777 63.85 63.869 63.847 63.812 63.743 63.611 63.486 63.383 63.231 63.017 62.842 62.639 62.409 62.21 61.989 61.745 61.472 61.216 61.022 60.794 60.428 60.156 59.882 59.752 59.458 59.123 58.771 58.594 58.032 57.941 57.673 57.398 56.774 56.422 56.024 55.529 54.934 54.278 53.311 49.691 -2 ,6279 ,KEBNE ,17019542,Wed Dec 22 03:09:58 CET,Wed Dec 22 04:33:11 CET,0.0 1.345 2.054 2.614 3.119 3.589 3.98 4.321 4.95 5.223 5.492 5.569 6.252 6.5 6.969 7.397 7.827 8.042 8.45 8.831 9.392 9.766 10.118 10.649 11.166 11.635 12.1 12.566 13.18 13.748 14.278 14.958 15.612 16.243 16.954 17.714 18.483 19.368 20.361 21.435 22.556 23.819 25.352 26.94 28.778 30.818 33.248 36.172 39.698 43.994 49.623 54.604 57.68 59.726 61.053 61.966 62.658 63.157 63.474 63.735 63.893 64.002 64.052 64.041 64.02 63.988 63.917 63.808 63.672 63.526 63.389 63.23 63.022 62.794 62.618 62.422 62.185 61.926 61.666 61.505 61.329 61.025 60.8 60.517 60.357 60.035 59.689 59.326 59.126 58.535 58.48 58.248 57.977 57.359 57.019 56.65 56.194 55.645 54.968 54.093 51.44 -3 ,22808 ,KEBNE ,17019543,Wed Dec 22 03:09:57 CET,Wed Dec 22 04:31:45 CET,0.0 1.493 2.184 2.75 3.295 3.755 4.146 4.488 5.076 5.351 5.628 5.709 6.392 6.632 7.1 7.541 7.971 8.176 8.574 8.977 9.573 9.941 10.278 10.785 11.299 11.791 12.251 12.72 13.349 13.936 14.491 15.162 15.808 16.418 17.143 17.986 18.786 19.672 20.641 21.649 22.736 24.014 25.549 27.13 28.966 31.027 33.481 36.273 39.662 43.956 49.484 54.351 57.398 59.352 60.613 61.532 62.157 62.607 62.915 63.114 63.238 63.286 63.266 63.204 63.075 62.972 62.868 62.722 62.583 62.386 62.158 61.981 61.793 61.57 61.363 61.144 60.922 60.692 60.422 60.201 59.976 59.656 59.415 59.138 58.985 58.663 58.323 57.975 57.774 57.182 57.08 56.807 56.494 55.77 55.39 55.012 54.564 54.058 53.462 52.591 47.763 -4 ,25592 ,KEBNE ,17019544,Wed Dec 22 03:10:29 CET,Wed Dec 22 04:32:15 CET,0.0 2.099 2.757 3.282 3.743 4.156 4.53 4.87 5.53 5.841 6.12 6.189 6.884 7.13 7.601 8.06 8.497 8.71 9.125 9.521 10.09 10.464 10.833 11.364 11.875 12.372 12.857 13.34 13.944 14.549 15.13 15.791 16.445 17.084 17.822 18.649 19.459 20.351 21.314 22.341 23.403 24.623 26.125 27.689 29.542 31.613 34.024 36.821 40.248 44.451 49.746 54.411 57.382 59.374 60.718 61.731 62.439 62.909 63.213 63.42 63.549 63.633 63.68 63.703 63.666 63.597 63.503 63.384 63.267 63.119 62.931 62.75 62.547 62.323 62.142 61.935 61.699 61.476 61.238 61.054 60.843 60.536 60.304 60.023 59.883 59.586 59.262 58.894 58.678 58.089 58.042 57.786 57.541 56.947 56.585 56.211 55.777 55.266 54.616 53.62 49.741 -5 ,4668 ,KEBNE ,17019545,Wed Dec 22 03:10:29 CET,Wed Dec 22 04:33:30 CET,0.0 2.048 2.766 3.395 3.936 4.347 4.678 5.007 5.645 5.931 6.226 6.36 7.072 7.325 7.807 8.27 8.696 8.899 9.325 9.732 10.33 10.728 11.093 11.617 12.147 12.677 13.185 13.654 14.244 14.838 15.407 16.069 16.702 17.342 18.087 18.917 19.73 20.621 21.59 22.638 23.774 25.077 26.594 28.148 30.008 32.087 34.529 37.363 40.802 45.051 50.454 55.202 58.187 60.192 61.529 62.515 63.223 63.685 64.003 64.272 64.431 64.523 64.563 64.55 64.495 64.423 64.358 64.264 64.133 63.995 63.859 63.724 63.572 63.36 63.149 62.932 62.716 62.479 62.22 62.039 61.841 61.532 61.3 61.03 60.887 60.601 60.28 59.914 59.713 59.123 59.046 58.806 58.561 57.947 57.588 57.193 56.747 56.231 55.559 54.598 50.907 -6 ,29483 ,KEBNE ,17019546,Wed Dec 22 03:10:29 CET,Wed Dec 22 04:32:21 CET,0.0 1.353 1.941 2.404 2.831 3.215 3.568 3.895 4.548 4.854 5.136 5.236 5.918 6.172 6.66 7.105 7.533 7.736 8.126 8.499 9.062 9.461 9.842 10.395 10.935 11.432 11.92 12.404 13.005 13.577 14.136 14.803 15.455 16.103 16.864 17.701 18.506 19.43 20.443 21.488 22.565 23.848 25.415 26.976 28.79 30.921 33.489 36.409 39.918 44.119 49.454 54.253 57.145 59.048 60.341 61.251 61.86 62.312 62.641 62.868 63.005 63.088 63.149 63.191 63.198 63.178 63.112 62.993 62.848 62.691 62.534 62.361 62.136 61.901 61.712 61.486 61.263 61.053 60.822 60.645 60.462 60.116 59.838 59.563 59.434 59.156 58.846 58.519 58.321 57.731 57.669 57.441 57.183 56.587 56.242 55.86 55.404 54.886 54.268 53.375 50.322 -7 ,24973 ,KEBNE ,17019547,Wed Dec 22 03:13:28 CET,Wed Dec 22 04:35:25 CET,0.0 1.296 1.987 2.556 3.031 3.443 3.806 4.152 4.806 5.121 5.431 5.62 6.342 6.595 7.081 7.55 7.998 8.214 8.632 9.041 9.613 9.976 10.336 10.842 11.334 11.814 12.263 12.698 13.283 13.867 14.423 15.101 15.751 16.38 17.112 17.931 18.732 19.63 20.605 21.636 22.76 24.038 25.496 26.987 28.787 30.862 33.344 36.258 39.817 44.131 49.606 54.489 57.488 59.457 60.757 61.652 62.304 62.822 63.191 63.455 63.616 63.676 63.668 63.61 63.545 63.471 63.342 63.203 63.059 62.889 62.715 62.558 62.325 62.063 61.903 61.744 61.539 61.283 61.028 60.841 60.637 60.31 60.075 59.833 59.707 59.445 59.155 58.816 58.611 58.015 57.903 57.631 57.336 56.71 56.365 55.979 55.557 55.04 54.315 53.121 49.141 -8 ,24127 ,KEBNE ,17019548,Wed Dec 22 03:13:28 CET,Wed Dec 22 04:35:25 CET,0.0 1.73 2.448 3.007 3.455 3.852 4.197 4.536 5.178 5.476 5.768 5.861 6.552 6.807 7.33 7.825 8.261 8.476 8.919 9.352 9.929 10.301 10.683 11.208 11.715 12.223 12.715 13.195 13.811 14.397 14.982 15.705 16.413 17.075 17.814 18.627 19.428 20.333 21.296 22.322 23.434 24.701 26.194 27.74 29.586 31.678 34.1 36.95 40.459 44.775 50.275 55.016 57.874 59.855 61.229 62.188 62.895 63.396 63.694 63.915 64.033 64.036 64.014 63.959 63.888 63.838 63.74 63.6 63.462 63.308 63.143 62.984 62.768 62.528 62.336 62.125 61.903 61.658 61.366 61.16 60.961 60.638 60.396 60.139 60.001 59.686 59.333 58.955 58.757 58.175 58.037 57.751 57.468 56.845 56.489 56.104 55.672 55.189 54.594 53.67 49.918 -9 ,4821 ,KEBNE ,17019549,Wed Dec 22 03:14:29 CET,Wed Dec 22 04:37:42 CET,0.0 2.314 3.001 3.558 3.995 4.388 4.774 5.131 5.771 6.075 6.353 6.389 7.066 7.305 7.775 8.241 8.689 8.904 9.329 9.736 10.323 10.709 11.075 11.606 12.121 12.605 13.083 13.553 14.144 14.689 15.209 15.835 16.468 17.094 17.81 18.645 19.443 20.297 21.268 22.317 23.403 24.652 26.139 27.674 29.533 31.667 34.168 37.097 40.653 44.973 50.53 55.46 58.432 60.328 61.648 62.617 63.261 63.716 64.028 64.238 64.345 64.405 64.434 64.411 64.385 64.366 64.273 64.149 64.033 63.869 63.669 63.497 63.312 63.102 62.948 62.775 62.534 62.298 62.045 61.859 61.668 61.333 61.093 60.829 60.694 60.431 60.104 59.695 59.496 58.94 58.848 58.571 58.305 57.728 57.38 56.995 56.543 56.017 55.364 54.431 50.548 -10 ,10817 ,KEBNE ,17019550,Wed Dec 22 03:18:41 CET,Wed Dec 22 04:37:38 CET,0.0 1.913 2.779 3.43 3.997 4.47 4.872 5.238 5.91 6.227 6.525 6.633 7.326 7.583 8.087 8.541 8.965 9.179 9.598 9.996 10.57 10.942 11.312 11.843 12.347 12.843 13.329 13.795 14.371 14.896 15.413 16.09 16.772 17.429 18.176 19.008 19.84 20.744 21.705 22.76 23.865 25.142 26.652 28.152 29.928 31.966 34.443 37.33 40.755 44.981 50.392 55.177 58.205 60.259 61.642 62.606 63.295 63.81 64.119 64.33 64.459 64.515 64.529 64.504 64.429 64.308 64.158 64.03 63.907 63.741 63.541 63.366 63.149 62.891 62.69 62.458 62.195 61.937 61.659 61.459 61.239 60.888 60.649 60.389 60.254 59.957 59.624 59.267 59.076 58.495 58.424 58.173 57.913 57.251 56.852 56.446 55.962 55.416 54.81 53.878 49.393 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23476.txt deleted file mode 100644 index 778ebbb7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4337 ,TETRA ,17524611,Wed Nov 24 22:34:36 CET,Thu Nov 25 00:11:15 CET,0.0 2.244 3.001 3.597 4.139 4.62 5.046 5.442 6.145 6.476 6.785 6.909 7.619 7.892 8.418 8.927 9.437 9.691 10.148 10.565 11.187 11.587 11.977 12.549 13.087 13.61 14.123 14.615 15.243 15.837 16.433 17.171 17.842 18.492 19.267 20.129 20.977 21.942 22.969 24.03 25.142 26.398 27.925 29.46 31.274 33.396 35.884 38.82 42.408 46.751 52.225 56.995 60.032 62.078 63.485 64.448 65.03 65.432 65.759 66.002 66.152 66.285 66.302 66.234 66.175 66.1 65.936 65.733 65.563 65.392 65.215 65.059 64.879 64.623 64.417 64.208 63.973 63.749 63.481 63.275 63.064 62.719 62.483 62.24 62.106 61.804 61.467 61.105 60.928 60.374 60.342 60.115 59.852 59.273 58.946 58.579 58.174 57.689 57.1 56.271 53.494 -2 ,18254 ,TETRA ,17524614,Wed Nov 24 22:34:32 CET,Thu Nov 25 00:12:09 CET,0.0 2.29 3.181 3.874 4.406 4.804 5.207 5.622 6.306 6.626 6.94 7.12 7.839 8.118 8.65 9.1 9.538 9.755 10.184 10.625 11.287 11.68 12.039 12.597 13.142 13.665 14.17 14.659 15.307 15.912 16.476 17.149 17.797 18.434 19.188 20.027 20.843 21.747 22.741 23.845 24.984 26.233 27.769 29.391 31.272 33.398 35.944 38.852 42.378 46.78 52.177 56.868 59.843 61.859 63.296 64.263 64.883 65.333 65.648 65.895 66.07 66.178 66.202 66.2 66.196 66.168 66.068 65.909 65.79 65.682 65.533 65.398 65.229 65.028 64.865 64.702 64.519 64.306 64.091 63.914 63.72 63.413 63.178 62.899 62.756 62.467 62.164 61.842 61.662 61.103 61.09 60.876 60.623 60.069 59.759 59.403 58.948 58.417 57.762 56.893 54.455 -3 ,32304 ,TETRA ,17524616,Wed Nov 24 22:35:33 CET,Thu Nov 25 00:13:27 CET,0.0 1.837 2.57 3.173 3.642 4.084 4.506 4.9 5.606 5.911 6.193 6.291 7.004 7.275 7.796 8.323 8.817 9.05 9.508 9.953 10.604 11.01 11.411 11.993 12.527 13.047 13.553 14.048 14.715 15.351 15.952 16.635 17.286 17.965 18.77 19.636 20.486 21.435 22.445 23.527 24.673 25.958 27.477 29.052 30.898 33.006 35.517 38.39 41.875 46.078 51.343 56.04 58.974 60.999 62.36 63.309 63.972 64.384 64.644 64.852 64.975 65.036 65.031 65.005 64.962 64.887 64.797 64.687 64.588 64.491 64.344 64.212 64.06 63.826 63.642 63.451 63.252 63.058 62.795 62.599 62.4 62.096 61.879 61.608 61.458 61.166 60.86 60.521 60.342 59.766 59.698 59.457 59.196 58.645 58.326 57.949 57.523 57.038 56.426 55.591 52.763 -4 ,3245 ,TETRA ,17524618,Wed Nov 24 22:35:34 CET,Thu Nov 25 00:11:54 CET,0.0 2.219 3.024 3.616 4.118 4.55 4.967 5.352 6.091 6.437 6.751 6.92 7.638 7.901 8.404 8.895 9.369 9.597 10.029 10.446 11.071 11.469 11.846 12.396 12.926 13.425 13.897 14.357 14.971 15.587 16.182 16.907 17.606 18.271 19.05 19.958 20.801 21.716 22.729 23.809 24.955 26.262 27.813 29.402 31.285 33.407 35.904 38.847 42.42 46.745 52.383 57.281 60.142 62.069 63.382 64.29 64.957 65.442 65.769 65.971 66.1 66.149 66.112 66.046 65.95 65.862 65.758 65.617 65.476 65.314 65.145 65.006 64.838 64.66 64.496 64.295 64.085 63.848 63.581 63.399 63.215 62.88 62.579 62.273 62.119 61.763 61.382 60.973 60.762 60.172 59.999 59.723 59.446 58.812 58.435 58.01 57.552 57.101 56.549 55.774 53.23 -5 ,30156 ,TETRA ,17524621,Wed Nov 24 22:35:34 CET,Thu Nov 25 00:12:01 CET,0.0 2.333 3.172 3.801 4.302 4.739 5.141 5.512 6.197 6.529 6.84 6.959 7.681 7.955 8.485 8.991 9.488 9.732 10.196 10.638 11.246 11.651 12.055 12.612 13.152 13.702 14.231 14.717 15.345 15.949 16.532 17.249 17.936 18.582 19.335 20.206 21.06 21.996 23.041 24.168 25.342 26.681 28.255 29.828 31.694 33.837 36.354 39.308 42.847 47.156 52.691 57.442 60.286 62.193 63.527 64.504 65.218 65.729 66.063 66.277 66.422 66.517 66.535 66.502 66.438 66.352 66.247 66.149 66.035 65.872 65.696 65.541 65.374 65.179 64.997 64.809 64.598 64.345 64.069 63.889 63.7 63.383 63.157 62.9 62.759 62.475 62.15 61.803 61.629 61.068 61.016 60.767 60.508 59.948 59.604 59.221 58.818 58.33 57.753 56.918 52.56 -6 ,10800 ,TETRA ,17524623,Wed Nov 24 22:35:39 CET,Thu Nov 25 00:11:59 CET,0.0 2.642 3.426 4.049 4.572 4.992 5.362 5.726 6.406 6.744 7.049 7.161 7.874 8.13 8.632 9.125 9.584 9.796 10.237 10.675 11.258 11.649 12.045 12.588 13.098 13.617 14.134 14.623 15.26 15.858 16.419 17.112 17.795 18.469 19.233 20.107 20.981 21.949 22.992 24.053 25.188 26.587 28.19 29.717 31.602 33.792 36.344 39.228 42.74 47.072 52.452 57.253 60.241 62.2 63.502 64.497 65.239 65.725 65.987 66.167 66.332 66.443 66.49 66.481 66.469 66.378 66.215 66.094 65.956 65.783 65.584 65.406 65.194 64.938 64.751 64.555 64.325 64.082 63.816 63.621 63.416 63.074 62.826 62.569 62.435 62.151 61.832 61.468 61.275 60.704 60.658 60.429 60.181 59.611 59.282 58.925 58.524 58.04 57.465 56.658 53.853 -7 ,32227 ,TETRA ,17524624,Wed Nov 24 22:35:37 CET,Thu Nov 25 00:11:30 CET,0.0 3.707 4.504 5.095 5.549 5.978 6.363 6.757 7.524 7.864 8.185 8.338 9.066 9.348 9.885 10.385 10.85 11.072 11.51 11.93 12.527 12.926 13.334 13.918 14.489 15.026 15.542 16.045 16.665 17.27 17.85 18.549 19.249 19.921 20.681 21.563 22.41 23.328 24.319 25.38 26.52 27.836 29.399 30.983 32.851 34.947 37.438 40.375 43.875 48.154 53.753 58.713 61.626 63.508 64.833 65.717 66.309 66.74 67.039 67.264 67.382 67.436 67.459 67.421 67.33 67.229 67.093 66.959 66.84 66.688 66.491 66.324 66.141 65.906 65.715 65.527 65.336 65.146 64.927 64.756 64.573 64.254 64.027 63.777 63.635 63.337 63.025 62.68 62.475 61.886 61.802 61.546 61.287 60.717 60.396 60.048 59.635 59.164 58.562 57.746 55.274 -8 ,26652 ,TETRA ,17524625,Wed Nov 24 22:35:34 CET,Thu Nov 25 00:12:07 CET,0.0 2.568 3.519 4.187 4.679 5.109 5.511 5.887 6.614 6.962 7.285 7.419 8.137 8.414 8.926 9.398 9.866 10.096 10.549 11.008 11.667 12.064 12.452 13.022 13.55 14.055 14.544 15.008 15.606 16.216 16.816 17.511 18.162 18.802 19.575 20.483 21.355 22.294 23.328 24.423 25.555 26.851 28.423 30.015 31.861 33.97 36.432 39.283 42.755 47.007 52.521 57.475 60.518 62.453 63.793 64.819 65.407 65.772 66.077 66.277 66.421 66.522 66.577 66.596 66.536 66.437 66.323 66.188 66.061 65.929 65.759 65.59 65.399 65.183 64.995 64.795 64.592 64.359 64.089 63.915 63.731 63.421 63.188 62.941 62.811 62.527 62.216 61.864 61.678 61.121 61.071 60.828 60.585 60.065 59.756 59.394 58.977 58.487 57.849 57.058 54.25 -9 ,9727 ,TETRA ,17524626,Wed Nov 24 22:35:35 CET,Thu Nov 25 00:13:04 CET,0.0 2.324 3.152 3.808 4.364 4.831 5.238 5.623 6.313 6.628 6.941 7.104 7.816 8.093 8.615 9.093 9.543 9.761 10.202 10.618 11.195 11.572 11.938 12.474 12.998 13.508 13.991 14.472 15.076 15.664 16.276 16.984 17.644 18.298 19.057 19.931 20.776 21.686 22.684 23.748 24.872 26.173 27.693 29.257 31.132 33.225 35.654 38.519 42.054 46.435 52.016 56.751 59.662 61.624 62.965 63.945 64.601 65.063 65.403 65.615 65.725 65.812 65.843 65.846 65.807 65.715 65.613 65.506 65.399 65.258 65.058 64.885 64.681 64.461 64.306 64.115 63.902 63.67 63.419 63.256 63.073 62.763 62.494 62.21 62.093 61.819 61.499 61.171 60.989 60.407 60.332 60.103 59.849 59.259 58.951 58.601 58.172 57.637 57.052 56.29 52.324 -10 ,14893 ,TETRA ,17524627,Wed Nov 24 22:36:31 CET,Thu Nov 25 00:06:02 CET,0.0 2.688 3.44 4.033 4.551 5.007 5.408 5.764 6.433 6.746 7.057 7.222 7.936 8.2 8.729 9.249 9.725 9.962 10.409 10.828 11.459 11.856 12.241 12.812 13.371 13.902 14.408 14.892 15.493 16.096 16.701 17.432 18.139 18.82 19.577 20.416 21.238 22.129 23.142 24.252 25.428 26.771 28.327 29.893 31.704 33.828 36.382 39.279 42.789 47.122 52.608 57.364 60.311 62.22 63.487 64.478 65.208 65.713 66.049 66.268 66.39 66.467 66.497 66.484 66.463 66.399 66.277 66.141 65.995 65.799 65.588 65.421 65.23 65.019 64.831 64.6 64.371 64.148 63.891 63.699 63.5 63.19 62.964 62.717 62.585 62.305 61.977 61.601 61.412 60.847 60.797 60.557 60.307 59.779 59.476 59.131 58.727 58.258 57.727 56.889 53.586 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23479.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23479.txt deleted file mode 100644 index 83a888fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23479.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32561 ,TETRA ,17524628,Wed Nov 24 22:36:33 CET,Thu Nov 25 00:15:22 CET,0.0 2.9 3.781 4.418 4.915 5.33 5.701 6.077 6.799 7.108 7.406 7.556 8.273 8.54 9.033 9.503 9.936 10.14 10.539 10.957 11.575 11.945 12.3 12.84 13.363 13.858 14.356 14.843 15.447 16.03 16.602 17.268 17.92 18.565 19.311 20.138 20.914 21.79 22.739 23.759 24.838 26.045 27.445 28.867 30.577 32.477 34.642 37.131 40.219 44.074 48.827 52.861 55.32 56.915 58.045 58.891 59.463 59.887 60.176 60.353 60.442 60.489 60.492 60.448 60.394 60.332 60.193 60.05 59.937 59.795 59.627 59.453 59.245 59.026 58.837 58.649 58.46 58.232 57.977 57.807 57.627 57.295 57.063 56.827 56.706 56.465 56.205 55.901 55.728 55.172 55.175 54.95 54.718 54.232 53.971 53.678 53.328 52.912 52.413 51.849 50.01 -2 ,29152 ,TETRA ,17524630,Wed Nov 24 22:36:34 CET,Thu Nov 25 00:13:29 CET,0.0 1.493 2.208 2.819 3.281 3.688 4.094 4.488 5.229 5.546 5.832 5.972 6.694 6.972 7.494 7.982 8.447 8.667 9.101 9.515 10.121 10.517 10.898 11.452 11.992 12.522 13.017 13.496 14.124 14.732 15.298 15.946 16.584 17.218 17.97 18.83 19.653 20.531 21.453 22.478 23.571 24.752 26.178 27.656 29.366 31.322 33.615 36.219 39.383 43.303 48.274 52.531 55.077 56.71 57.82 58.631 59.178 59.542 59.767 59.94 60.008 59.991 59.958 59.907 59.847 59.779 59.682 59.573 59.457 59.309 59.086 58.874 58.68 58.496 58.348 58.158 57.943 57.719 57.462 57.264 57.07 56.774 56.509 56.215 56.081 55.819 55.543 55.233 55.063 54.475 54.431 54.21 53.992 53.524 53.248 52.943 52.588 52.171 51.685 51.019 49.086 -3 ,13763 ,TETRA ,17524632,Wed Nov 24 22:36:38 CET,Thu Nov 25 00:13:20 CET,0.0 1.893 2.629 3.184 3.644 4.059 4.464 4.849 5.552 5.894 6.21 6.376 7.104 7.372 7.896 8.403 8.884 9.118 9.568 9.981 10.603 11.009 11.395 11.948 12.463 12.972 13.46 13.918 14.522 15.135 15.728 16.427 17.116 17.774 18.511 19.33 20.133 21.044 22.035 23.075 24.145 25.341 26.784 28.234 29.913 31.828 34.051 36.618 39.734 43.477 48.172 52.215 54.676 56.348 57.439 58.144 58.662 59.057 59.302 59.46 59.534 59.545 59.52 59.504 59.437 59.343 59.239 59.103 58.973 58.84 58.657 58.488 58.306 58.093 57.926 57.744 57.561 57.357 57.094 56.895 56.693 56.349 56.112 55.889 55.763 55.49 55.197 54.899 54.739 54.169 54.165 53.957 53.725 53.17 52.861 52.518 52.133 51.697 51.172 50.375 47.7 -4 ,7594 ,TETRA ,17524634,Wed Nov 24 22:36:33 CET,Thu Nov 25 00:13:30 CET,0.0 1.919 2.576 3.132 3.62 4.079 4.522 4.92 5.616 5.939 6.245 6.394 7.103 7.376 7.943 8.457 8.952 9.195 9.631 10.042 10.623 10.997 11.367 11.895 12.408 12.909 13.396 13.88 14.505 15.087 15.646 16.32 16.965 17.583 18.307 19.115 19.884 20.761 21.716 22.712 23.771 24.999 26.414 27.805 29.464 31.349 33.592 36.205 39.278 43.044 47.746 51.727 54.193 55.85 56.991 57.771 58.283 58.618 58.83 58.974 59.075 59.148 59.164 59.114 59.034 58.956 58.855 58.733 58.592 58.445 58.292 58.138 57.984 57.837 57.703 57.521 57.296 57.057 56.826 56.654 56.469 56.207 55.999 55.761 55.635 55.372 55.09 54.814 54.67 54.104 54.129 53.937 53.698 53.167 52.882 52.559 52.216 51.821 51.335 50.671 48.983 -5 ,27406 ,TETRA ,17524636,Wed Nov 24 22:36:37 CET,Thu Nov 25 00:14:28 CET,0.0 1.589 2.301 2.91 3.419 3.852 4.248 4.61 5.294 5.62 5.923 6.064 6.787 7.075 7.618 8.1 8.571 8.797 9.218 9.627 10.235 10.627 11.003 11.625 12.239 12.756 13.229 13.709 14.33 14.912 15.473 16.134 16.791 17.439 18.167 18.996 19.813 20.698 21.687 22.771 23.903 25.197 26.705 28.22 29.957 31.88 34.224 36.953 40.231 44.211 49.127 53.293 55.758 57.369 58.457 59.183 59.685 60.053 60.265 60.359 60.341 60.329 60.365 60.364 60.321 60.203 60.047 59.911 59.755 59.605 59.459 59.301 59.122 58.942 58.785 58.617 58.414 58.172 57.925 57.748 57.557 57.272 57.072 56.862 56.746 56.495 56.189 55.84 55.67 55.108 55.11 54.91 54.684 54.168 53.884 53.557 53.16 52.697 52.141 51.458 49.494 -6 ,30575 ,TETRA ,17524638,Wed Nov 24 22:36:34 CET,Thu Nov 25 00:14:36 CET,0.0 1.599 2.319 2.85 3.295 3.73 4.132 4.512 5.217 5.554 5.885 6.02 6.726 6.985 7.48 7.937 8.361 8.572 9.011 9.43 10.007 10.384 10.757 11.289 11.817 12.331 12.81 13.248 13.828 14.418 14.981 15.65 16.307 16.958 17.716 18.543 19.308 20.147 21.083 22.117 23.197 24.4 25.838 27.323 29.07 31.017 33.294 35.986 39.206 42.969 47.606 51.646 54.104 55.765 56.886 57.672 58.196 58.581 58.843 59.026 59.162 59.227 59.229 59.201 59.164 59.085 58.955 58.835 58.72 58.584 58.417 58.237 58.049 57.867 57.709 57.528 57.323 57.109 56.828 56.6 56.388 56.053 55.814 55.578 55.457 55.208 54.953 54.652 54.486 53.933 53.977 53.786 53.559 53.022 52.72 52.412 52.088 51.723 51.257 50.646 48.793 -7 ,19609 ,TETRA ,17524640,Wed Nov 24 22:37:32 CET,Thu Nov 25 00:16:23 CET,0.0 1.665 2.394 2.985 3.51 3.969 4.372 4.761 5.444 5.757 6.053 6.18 6.905 7.181 7.686 8.176 8.646 8.867 9.309 9.743 10.328 10.696 11.05 11.574 12.11 12.629 13.136 13.634 14.241 14.824 15.405 16.092 16.747 17.418 18.199 19.046 19.844 20.718 21.715 22.789 23.884 25.114 26.499 27.93 29.652 31.579 33.873 36.498 39.679 43.571 48.325 52.483 55.126 56.808 57.93 58.708 59.254 59.608 59.808 59.967 60.056 60.105 60.103 60.073 60.01 59.902 59.769 59.625 59.461 59.288 59.124 58.969 58.8 58.601 58.436 58.277 58.099 57.896 57.662 57.477 57.285 56.96 56.729 56.486 56.358 56.088 55.776 55.443 55.274 54.719 54.726 54.519 54.308 53.817 53.551 53.257 52.905 52.487 51.95 51.212 49.655 -8 ,9848 ,TETRA ,17524642,Wed Nov 24 22:37:34 CET,Thu Nov 25 00:14:11 CET,0.0 2.742 3.589 4.272 4.889 5.373 5.841 6.247 6.875 7.173 7.485 7.676 8.398 8.672 9.198 9.701 10.195 10.431 10.869 11.278 11.875 12.254 12.626 13.165 13.677 14.157 14.626 15.084 15.637 16.199 16.754 17.392 18.037 18.693 19.429 20.225 21.002 21.885 22.847 23.856 24.949 26.208 27.671 29.077 30.703 32.642 34.903 37.416 40.421 44.053 48.66 52.72 55.295 56.979 58.054 58.807 59.35 59.732 59.955 60.12 60.206 60.223 60.19 60.1 60.006 59.904 59.747 59.598 59.465 59.296 59.102 58.943 58.755 58.555 58.381 58.163 57.945 57.732 57.497 57.335 57.156 56.83 56.62 56.389 56.268 56.02 55.704 55.36 55.189 54.635 54.639 54.433 54.217 53.712 53.435 53.139 52.744 52.309 51.821 51.074 48.94 -9 ,20356 ,TETRA ,17524644,Wed Nov 24 22:37:37 CET,Thu Nov 25 00:14:10 CET,0.0 1.621 2.472 3.088 3.585 4.024 4.412 4.794 5.526 5.841 6.148 6.286 6.983 7.233 7.743 8.206 8.657 8.887 9.343 9.771 10.328 10.689 11.061 11.596 12.099 12.587 13.094 13.611 14.256 14.831 15.362 16.017 16.66 17.307 18.042 18.894 19.723 20.597 21.548 22.553 23.639 24.883 26.289 27.695 29.374 31.284 33.539 36.131 39.217 43.014 47.753 51.779 54.214 55.801 56.857 57.601 58.112 58.472 58.722 58.884 58.975 58.999 58.982 58.939 58.864 58.768 58.655 58.547 58.408 58.227 58.023 57.83 57.633 57.425 57.252 57.068 56.866 56.656 56.41 56.224 56.035 55.727 55.512 55.296 55.179 54.927 54.636 54.303 54.142 53.588 53.64 53.445 53.233 52.779 52.491 52.143 51.752 51.318 50.823 50.171 48.196 -10 ,24891 ,TETRA ,17524646,Wed Nov 24 22:37:37 CET,Thu Nov 25 00:14:27 CET,0.0 1.698 2.503 3.132 3.669 4.133 4.583 4.996 5.696 6.026 6.342 6.489 7.216 7.492 8.005 8.497 8.951 9.177 9.629 10.047 10.626 10.997 11.363 11.897 12.415 12.922 13.419 13.89 14.469 15.044 15.648 16.368 17.044 17.697 18.435 19.292 20.136 21.053 22.044 23.07 24.141 25.383 26.84 28.281 29.964 31.912 34.197 36.811 39.977 43.788 48.538 52.579 54.989 56.64 57.763 58.501 59.032 59.414 59.652 59.806 59.889 59.926 59.902 59.866 59.816 59.744 59.656 59.556 59.443 59.321 59.188 59.056 58.857 58.664 58.525 58.348 58.143 57.926 57.7 57.533 57.363 57.065 56.851 56.639 56.521 56.256 55.97 55.658 55.486 54.913 54.92 54.703 54.471 54.016 53.759 53.467 53.118 52.7 52.237 51.627 50.205 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23483_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23483_23482.txt deleted file mode 100644 index 8f271146..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23483_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25167 ,TETRA ,17524648,Wed Nov 24 22:37:35 CET,Thu Nov 25 00:16:15 CET,0.0 1.053 1.476 1.831 2.136 2.397 2.617 2.81 3.171 3.35 3.525 3.485 4.036 4.182 4.437 4.659 4.868 4.957 5.114 5.267 5.472 5.588 5.696 5.839 5.961 6.099 6.234 6.331 6.428 6.545 6.683 6.826 6.93 7.004 7.06 7.111 7.136 7.157 7.161 7.114 7.011 6.811 6.525 6.187 5.686 4.984 4.037 2.755 0.913 -1.789 -6.008 -10.743 -14.463 -17.509 -20.058 -22.259 -24.109 -25.693 -27.046 -28.398 -29.555 -30.598 -31.571 -32.499 -33.368 -34.136 -34.931 -35.666 -36.301 -36.96 -37.629 -38.195 -38.815 -39.434 -39.915 -40.418 -40.925 -41.45 -41.986 -42.35 -42.717 -43.304 -43.753 -44.224 -44.457 -44.936 -45.43 -45.961 -46.239 -46.978 -47.191 -47.526 -47.849 -48.557 -49.016 -49.519 -50.058 -50.701 -51.46 -52.465 -55.484 -2 ,7947 ,TETRA ,17524649,Wed Nov 24 22:38:31 CET,Thu Nov 25 00:16:03 CET,0.0 1.022 1.534 1.905 2.21 2.448 2.669 2.894 3.286 3.46 3.626 3.548 4.08 4.203 4.433 4.653 4.856 4.95 5.133 5.291 5.475 5.597 5.728 5.898 6.048 6.198 6.345 6.479 6.634 6.765 6.869 6.982 7.068 7.143 7.229 7.307 7.328 7.304 7.259 7.172 7.038 6.871 6.62 6.25 5.735 5.085 4.18 2.929 1.111 -1.543 -5.759 -10.483 -14.153 -17.163 -19.707 -21.896 -23.714 -25.308 -26.684 -28.019 -29.155 -30.181 -31.151 -32.045 -32.877 -33.654 -34.468 -35.207 -35.844 -36.522 -37.205 -37.762 -38.359 -38.963 -39.446 -39.948 -40.461 -41.006 -41.558 -41.957 -42.373 -42.966 -43.386 -43.841 -44.071 -44.562 -45.081 -45.628 -45.908 -46.63 -46.783 -47.112 -47.492 -48.314 -48.752 -49.222 -49.748 -50.37 -51.105 -52.089 -56.256 -3 ,19179 ,TETRA ,17524651,Wed Nov 24 22:39:32 CET,Thu Nov 25 00:17:44 CET,0.0 1.054 1.455 1.799 2.128 2.436 2.725 2.974 3.372 3.535 3.682 3.566 4.092 4.237 4.504 4.725 4.92 5.014 5.208 5.396 5.642 5.798 5.933 6.093 6.243 6.375 6.491 6.613 6.747 6.839 6.942 7.057 7.132 7.189 7.25 7.309 7.364 7.395 7.337 7.23 7.092 6.888 6.584 6.211 5.703 4.995 4.019 2.736 0.929 -1.737 -5.966 -10.78 -14.546 -17.594 -20.122 -22.279 -24.126 -25.74 -27.107 -28.465 -29.61 -30.607 -31.548 -32.444 -33.284 -34.07 -34.887 -35.607 -36.22 -36.86 -37.541 -38.118 -38.721 -39.342 -39.818 -40.33 -40.852 -41.36 -41.889 -42.289 -42.71 -43.334 -43.77 -44.207 -44.444 -44.928 -45.422 -45.952 -46.232 -46.982 -47.171 -47.503 -47.869 -48.632 -49.045 -49.509 -50.032 -50.659 -51.368 -52.346 -56.107 -4 ,10719 ,TETRA ,17524653,Wed Nov 24 22:39:35 CET,Thu Nov 25 00:16:59 CET,0.0 1.22 1.737 2.096 2.382 2.644 2.881 3.101 3.512 3.692 3.858 3.762 4.279 4.399 4.661 4.908 5.114 5.216 5.396 5.544 5.766 5.906 6.034 6.217 6.391 6.558 6.708 6.843 6.996 7.118 7.219 7.317 7.397 7.469 7.548 7.613 7.636 7.637 7.623 7.572 7.469 7.293 7.006 6.649 6.178 5.557 4.65 3.397 1.661 -0.941 -5.214 -10.076 -13.853 -16.864 -19.38 -21.527 -23.315 -24.936 -26.354 -27.758 -28.939 -29.947 -30.862 -31.731 -32.59 -33.37 -34.132 -34.816 -35.423 -36.062 -36.747 -37.317 -37.878 -38.431 -38.897 -39.414 -39.928 -40.459 -41.024 -41.412 -41.807 -42.453 -42.914 -43.367 -43.594 -44.077 -44.598 -45.141 -45.437 -46.182 -46.381 -46.715 -47.07 -47.839 -48.257 -48.722 -49.25 -49.926 -50.716 -51.755 -55.13 -5 ,12731 ,TETRA ,17524655,Wed Nov 24 22:40:31 CET,Thu Nov 25 00:16:27 CET,0.0 1.307 2.027 2.502 2.839 3.139 3.388 3.601 3.967 4.15 4.321 4.2 4.722 4.851 5.109 5.337 5.535 5.636 5.835 6.01 6.255 6.402 6.536 6.758 6.952 7.104 7.236 7.366 7.507 7.604 7.697 7.815 7.917 7.971 8.001 8.046 8.087 8.073 8.03 7.949 7.81 7.634 7.391 7.095 6.641 5.977 5.087 3.915 2.145 -0.507 -4.696 -9.413 -13.129 -16.213 -18.762 -20.901 -22.728 -24.409 -25.816 -27.141 -28.27 -29.295 -30.255 -31.15 -31.983 -32.768 -33.581 -34.271 -34.866 -35.521 -36.204 -36.753 -37.331 -37.921 -38.379 -38.859 -39.381 -39.926 -40.474 -40.851 -41.253 -41.883 -42.295 -42.727 -42.962 -43.46 -43.989 -44.512 -44.786 -45.55 -45.782 -46.139 -46.507 -47.285 -47.705 -48.157 -48.683 -49.258 -49.935 -50.839 -53.803 -6 ,8672 ,TETRA ,17524657,Wed Nov 24 22:44:34 CET,Thu Nov 25 00:22:16 CET,0.0 0.965 1.491 1.871 2.172 2.439 2.667 2.873 3.214 3.375 3.531 3.422 3.959 4.087 4.348 4.601 4.831 4.933 5.115 5.281 5.524 5.683 5.824 6.022 6.206 6.341 6.467 6.605 6.755 6.859 6.962 7.093 7.192 7.244 7.269 7.297 7.292 7.274 7.242 7.155 7.049 6.869 6.612 6.318 5.838 5.166 4.235 3.006 1.211 -1.505 -5.805 -10.597 -14.329 -17.375 -19.911 -22.159 -24.062 -25.699 -27.095 -28.494 -29.681 -30.7 -31.691 -32.616 -33.467 -34.248 -35.036 -35.757 -36.397 -37.069 -37.757 -38.322 -38.902 -39.505 -39.978 -40.484 -41.029 -41.572 -42.135 -42.535 -42.933 -43.573 -44.024 -44.474 -44.707 -45.201 -45.731 -46.29 -46.56 -47.289 -47.481 -47.816 -48.18 -48.932 -49.362 -49.841 -50.375 -50.999 -51.802 -52.887 -56.468 -7 ,28626 ,TETRA ,17524659,Wed Nov 24 22:45:35 CET,Thu Nov 25 00:23:17 CET,0.0 1.224 1.818 2.261 2.651 2.955 3.172 3.365 3.724 3.892 4.068 4.007 4.539 4.677 4.92 5.142 5.372 5.481 5.674 5.847 6.088 6.229 6.355 6.528 6.666 6.786 6.901 7.007 7.135 7.258 7.354 7.448 7.532 7.621 7.699 7.733 7.751 7.742 7.727 7.7 7.595 7.42 7.166 6.851 6.403 5.713 4.756 3.511 1.724 -0.981 -5.25 -10.037 -13.829 -16.827 -19.327 -21.558 -23.435 -25.063 -26.439 -27.815 -28.977 -29.993 -30.973 -31.924 -32.826 -33.627 -34.441 -35.167 -35.785 -36.433 -37.111 -37.676 -38.279 -38.884 -39.346 -39.841 -40.359 -40.899 -41.469 -41.855 -42.25 -42.856 -43.265 -43.72 -43.964 -44.458 -44.974 -45.504 -45.779 -46.508 -46.674 -47.002 -47.367 -48.146 -48.558 -49.045 -49.598 -50.244 -51.039 -52.061 -57.18 -8 ,32581 ,TETRA ,17524661,Wed Nov 24 22:45:33 CET,Thu Nov 25 00:23:10 CET,0.0 1.521 1.989 2.368 2.686 2.937 3.171 3.382 3.746 3.913 4.08 4.017 4.552 4.691 4.939 5.146 5.345 5.442 5.61 5.775 6.019 6.163 6.312 6.517 6.688 6.824 6.952 7.087 7.243 7.369 7.491 7.631 7.724 7.806 7.912 7.986 8.004 7.995 7.976 7.919 7.809 7.627 7.349 7.017 6.541 5.922 5.07 3.841 2.026 -0.7 -5.008 -9.87 -13.645 -16.673 -19.187 -21.364 -23.18 -24.817 -26.252 -27.7 -28.865 -29.842 -30.817 -31.735 -32.575 -33.373 -34.204 -34.918 -35.553 -36.2 -36.835 -37.39 -37.999 -38.617 -39.086 -39.557 -40.041 -40.557 -41.104 -41.508 -41.932 -42.559 -42.998 -43.49 -43.74 -44.23 -44.729 -45.288 -45.597 -46.34 -46.498 -46.822 -47.185 -47.955 -48.392 -48.882 -49.386 -49.955 -50.667 -51.646 -55.42 -9 ,324 ,TETRA ,17524663,Wed Nov 24 22:46:33 CET,Thu Nov 25 00:25:17 CET,0.0 1.928 2.557 2.936 3.291 3.616 3.88 4.111 4.501 4.668 4.831 4.717 5.223 5.35 5.59 5.793 5.999 6.089 6.263 6.42 6.61 6.733 6.854 7.036 7.194 7.315 7.433 7.563 7.722 7.843 7.947 8.091 8.218 8.303 8.351 8.391 8.435 8.458 8.459 8.393 8.257 8.067 7.772 7.418 6.941 6.28 5.347 4.073 2.24 -0.436 -4.662 -9.51 -13.274 -16.342 -18.936 -21.136 -22.955 -24.591 -25.999 -27.408 -28.62 -29.66 -30.641 -31.559 -32.418 -33.213 -34.047 -34.815 -35.478 -36.167 -36.854 -37.41 -38.01 -38.61 -39.082 -39.575 -40.071 -40.611 -41.179 -41.561 -41.946 -42.553 -43.0 -43.452 -43.682 -44.183 -44.714 -45.287 -45.592 -46.312 -46.404 -46.718 -47.072 -47.849 -48.266 -48.737 -49.309 -49.952 -50.68 -51.619 -54.854 -10 ,3385 ,TETRA ,17524665,Wed Nov 24 22:47:32 CET,Thu Nov 25 00:27:46 CET,0.0 1.419 2.116 2.564 2.917 3.219 3.496 3.748 4.17 4.355 4.521 4.42 4.95 5.091 5.349 5.573 5.772 5.871 6.067 6.231 6.419 6.548 6.678 6.845 6.985 7.116 7.25 7.377 7.535 7.661 7.75 7.884 8.016 8.116 8.19 8.234 8.274 8.269 8.215 8.155 8.056 7.859 7.557 7.183 6.69 6.048 5.127 3.867 2.091 -0.566 -4.785 -9.515 -13.226 -16.254 -18.734 -20.852 -22.681 -24.317 -25.737 -27.145 -28.309 -29.327 -30.298 -31.233 -32.074 -32.825 -33.639 -34.354 -34.964 -35.606 -36.27 -36.816 -37.418 -38.056 -38.553 -39.064 -39.57 -40.137 -40.749 -41.168 -41.589 -42.221 -42.642 -43.071 -43.297 -43.793 -44.319 -44.866 -45.164 -45.902 -46.117 -46.489 -46.863 -47.663 -48.12 -48.608 -49.15 -49.757 -50.416 -51.299 -54.639 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23484.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23484.txt deleted file mode 100644 index e8c97cd6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23484.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13791 ,TETRA ,17524666,Wed Nov 24 22:50:34 CET,Thu Nov 25 00:29:37 CET,0.0 0.925 1.4 1.814 2.179 2.479 2.718 2.94 3.374 3.579 3.785 3.793 4.392 4.589 4.948 5.293 5.625 5.771 6.024 6.254 6.596 6.83 7.05 7.347 7.633 7.917 8.187 8.445 8.781 9.092 9.38 9.72 10.053 10.368 10.719 11.105 11.481 11.883 12.3 12.772 13.278 13.821 14.43 15.011 15.606 16.232 16.965 17.748 18.593 19.418 20.026 19.965 19.444 18.808 18.149 17.435 16.777 16.133 15.546 14.985 14.471 13.969 13.483 13.006 12.517 12.049 11.592 11.197 10.839 10.456 10.057 9.724 9.373 9.008 8.71 8.375 8.04 7.717 7.364 7.122 6.878 6.47 6.184 5.888 5.74 5.419 5.059 4.675 4.47 3.849 3.845 3.611 3.369 2.852 2.559 2.256 1.903 1.442 0.889 0.209 -1.75 -2 ,23186 ,TETRA ,17524669,Wed Nov 24 22:53:33 CET,Thu Nov 25 00:34:23 CET,0.0 1.208 1.8 2.237 2.55 2.835 3.099 3.341 3.783 3.995 4.188 4.123 4.704 4.87 5.181 5.475 5.74 5.878 6.159 6.411 6.769 6.996 7.225 7.556 7.872 8.155 8.446 8.756 9.115 9.444 9.751 10.096 10.422 10.759 11.155 11.57 11.957 12.38 12.809 13.242 13.71 14.251 14.906 15.534 16.181 16.902 17.672 18.448 19.298 20.063 20.603 20.414 19.753 19.131 18.605 18.007 17.379 16.783 16.208 15.598 15.074 14.572 14.076 13.6 13.107 12.629 12.134 11.684 11.294 10.883 10.452 10.108 9.746 9.364 9.055 8.742 8.402 8.005 7.591 7.304 7.007 6.537 6.208 5.871 5.703 5.342 4.936 4.517 4.297 3.675 3.653 3.413 3.168 2.629 2.291 1.912 1.479 0.998 0.482 -0.178 -1.641 -3 ,16419 ,TETRA ,17524670,Wed Nov 24 22:56:35 CET,Thu Nov 25 00:35:42 CET,0.0 1.373 1.866 2.255 2.61 2.968 3.288 3.548 3.923 4.106 4.316 4.293 4.871 5.044 5.374 5.649 5.906 6.034 6.3 6.56 6.913 7.123 7.33 7.647 7.954 8.255 8.536 8.797 9.121 9.426 9.722 10.066 10.384 10.681 11.026 11.427 11.811 12.212 12.628 13.081 13.563 14.097 14.702 15.271 15.907 16.581 17.302 18.055 18.815 19.525 20.024 19.947 19.465 18.914 18.364 17.736 17.106 16.424 15.833 15.252 14.747 14.273 13.777 13.298 12.855 12.441 11.981 11.56 11.199 10.804 10.377 10.023 9.673 9.332 9.053 8.742 8.4 8.038 7.657 7.39 7.121 6.694 6.414 6.133 5.98 5.649 5.288 4.913 4.718 4.097 4.081 3.845 3.59 3.06 2.765 2.444 2.101 1.671 1.157 0.52 -0.851 -4 ,30915 ,TETRA ,17524671,Wed Nov 24 22:56:36 CET,Thu Nov 25 00:35:55 CET,0.0 1.173 1.554 1.902 2.228 2.488 2.732 2.968 3.364 3.549 3.731 3.649 4.216 4.364 4.653 4.932 5.205 5.33 5.564 5.811 6.173 6.385 6.594 6.923 7.278 7.629 7.949 8.264 8.636 8.952 9.257 9.612 9.934 10.247 10.615 11.014 11.382 11.78 12.219 12.664 13.109 13.639 14.253 14.815 15.495 16.276 17.074 17.853 18.668 19.464 20.087 20.118 19.657 19.061 18.477 17.822 17.203 16.67 16.105 15.472 14.923 14.395 13.876 13.396 12.951 12.562 12.147 11.729 11.354 10.984 10.594 10.259 9.911 9.546 9.255 8.946 8.623 8.3 7.972 7.741 7.491 7.076 6.785 6.477 6.316 5.977 5.624 5.249 5.049 4.429 4.42 4.181 3.94 3.436 3.153 2.834 2.47 2.071 1.582 0.852 -0.909 -5 ,14359 ,TETRA ,17524672,Wed Nov 24 22:56:35 CET,Thu Nov 25 00:35:43 CET,0.0 0.889 1.402 1.787 2.091 2.372 2.632 2.881 3.345 3.548 3.725 3.627 4.183 4.337 4.667 4.989 5.261 5.386 5.632 5.875 6.229 6.457 6.669 6.974 7.269 7.544 7.817 8.081 8.4 8.697 8.993 9.363 9.707 10.03 10.413 10.819 11.197 11.61 12.057 12.529 13.006 13.538 14.136 14.707 15.324 16.006 16.778 17.598 18.477 19.274 19.82 19.785 19.336 18.734 18.127 17.511 16.88 16.248 15.636 15.049 14.561 14.071 13.58 13.094 12.627 12.235 11.824 11.41 11.049 10.678 10.288 9.955 9.585 9.206 8.922 8.612 8.283 7.935 7.57 7.331 7.082 6.646 6.331 6.025 5.859 5.509 5.164 4.811 4.617 3.996 3.958 3.715 3.454 2.862 2.525 2.169 1.77 1.304 0.814 0.243 -1.001 -6 ,25609 ,TETRA ,17524673,Wed Nov 24 22:57:35 CET,Thu Nov 25 00:40:28 CET,0.0 0.916 1.361 1.675 1.947 2.208 2.445 2.68 3.126 3.315 3.502 3.467 4.051 4.212 4.519 4.836 5.133 5.26 5.495 5.726 6.052 6.26 6.47 6.779 7.1 7.412 7.699 7.973 8.323 8.649 8.95 9.307 9.646 9.971 10.35 10.779 11.194 11.635 12.069 12.547 13.058 13.591 14.188 14.767 15.405 16.086 16.824 17.62 18.434 19.189 19.814 19.836 19.382 18.847 18.323 17.769 17.21 16.628 16.072 15.505 15.011 14.542 14.078 13.654 13.249 12.842 12.37 11.928 11.544 11.138 10.707 10.355 10.008 9.65 9.364 9.047 8.71 8.379 8.02 7.763 7.502 7.075 6.741 6.403 6.237 5.898 5.554 5.164 4.959 4.33 4.282 4.047 3.806 3.287 2.977 2.618 2.242 1.839 1.356 0.671 -0.827 -7 ,29177 ,TETRA ,17524674,Wed Nov 24 22:59:37 CET,Thu Nov 25 00:42:12 CET,0.0 1.213 1.67 2.062 2.404 2.719 3.006 3.246 3.658 3.858 4.041 3.975 4.554 4.698 4.977 5.25 5.522 5.668 5.934 6.154 6.484 6.709 6.926 7.254 7.561 7.842 8.109 8.364 8.687 8.979 9.256 9.604 9.966 10.318 10.702 11.139 11.556 11.967 12.406 12.879 13.351 13.848 14.431 15.004 15.579 16.212 16.929 17.678 18.467 19.188 19.727 19.733 19.294 18.696 18.014 17.255 16.59 15.998 15.47 14.914 14.384 13.85 13.334 12.862 12.427 12.009 11.551 11.143 10.79 10.42 10.036 9.703 9.338 8.958 8.649 8.32 7.977 7.632 7.288 7.05 6.793 6.395 6.109 5.797 5.637 5.314 4.962 4.582 4.391 3.774 3.787 3.552 3.3 2.801 2.528 2.207 1.871 1.48 1.006 0.419 -0.909 -8 ,10343 ,TETRA ,17524675,Wed Nov 24 22:58:34 CET,Thu Nov 25 00:37:44 CET,0.0 0.918 1.403 1.781 2.101 2.369 2.616 2.857 3.287 3.488 3.678 3.603 4.176 4.341 4.665 4.944 5.203 5.331 5.577 5.815 6.147 6.355 6.569 6.875 7.162 7.444 7.713 7.979 8.313 8.648 8.982 9.358 9.706 10.025 10.374 10.766 11.166 11.592 12.007 12.431 12.893 13.415 13.993 14.545 15.166 15.872 16.666 17.448 18.229 18.928 19.41 19.381 18.979 18.42 17.864 17.318 16.757 16.152 15.57 14.997 14.473 13.961 13.465 12.989 12.527 12.085 11.651 11.263 10.895 10.512 10.114 9.773 9.409 9.027 8.739 8.432 8.094 7.746 7.404 7.167 6.905 6.483 6.199 5.92 5.769 5.455 5.119 4.742 4.544 3.929 3.903 3.654 3.408 2.864 2.54 2.207 1.845 1.447 0.968 0.267 -1.391 -9 ,31299 ,TETRA ,17524677,Wed Nov 24 23:02:36 CET,Thu Nov 25 00:41:34 CET,0.0 1.051 1.57 1.975 2.308 2.599 2.898 3.154 3.544 3.726 3.903 3.874 4.468 4.625 4.929 5.232 5.533 5.686 5.999 6.298 6.696 6.944 7.195 7.559 7.901 8.218 8.489 8.732 9.047 9.344 9.627 9.98 10.318 10.636 10.989 11.381 11.777 12.212 12.68 13.152 13.619 14.15 14.752 15.324 15.983 16.696 17.428 18.16 18.941 19.718 20.306 20.295 19.792 19.154 18.568 17.919 17.275 16.674 16.117 15.536 15.0 14.486 13.987 13.501 13.043 12.634 12.201 11.788 11.422 11.059 10.68 10.343 9.991 9.629 9.341 9.02 8.669 8.318 7.965 7.715 7.451 7.035 6.743 6.437 6.28 5.969 5.636 5.279 5.096 4.475 4.449 4.23 3.979 3.407 3.1 2.788 2.416 1.979 1.499 0.809 -0.598 -10 ,9644 ,TETRA ,17524679,Wed Nov 24 23:04:35 CET,Thu Nov 25 00:44:55 CET,0.0 1.098 1.56 1.861 2.145 2.424 2.694 2.943 3.4 3.601 3.78 3.696 4.26 4.417 4.741 5.032 5.294 5.424 5.676 5.916 6.259 6.467 6.676 6.996 7.297 7.586 7.853 8.094 8.403 8.696 8.983 9.336 9.661 9.976 10.353 10.765 11.154 11.597 12.059 12.557 13.076 13.61 14.189 14.739 15.359 16.011 16.75 17.562 18.428 19.197 19.745 19.71 19.274 18.698 18.03 17.403 16.81 16.173 15.6 14.999 14.439 13.934 13.432 12.937 12.491 12.084 11.626 11.203 10.839 10.458 10.055 9.721 9.38 9.011 8.719 8.431 8.116 7.777 7.438 7.186 6.921 6.522 6.22 5.887 5.727 5.388 5.01 4.618 4.409 3.773 3.68 3.416 3.148 2.553 2.223 1.875 1.45 0.918 0.351 -0.414 -1.998 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23485.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23485.txt deleted file mode 100644 index ec4c7988..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23485.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14320 ,TETRA ,17524687,Wed Nov 24 23:04:42 CET,Thu Nov 25 00:45:59 CET,0.0 2.07 2.829 3.36 3.826 4.263 4.66 5.02 5.623 5.882 6.115 6.141 6.777 6.986 7.347 7.69 7.994 8.136 8.436 8.722 9.123 9.362 9.595 9.949 10.277 10.563 10.83 11.083 11.401 11.702 11.989 12.345 12.69 13.017 13.389 13.781 14.119 14.5 14.915 15.323 15.74 16.205 16.711 17.206 17.754 18.331 18.954 19.552 20.157 20.709 20.924 20.548 19.941 19.259 18.58 17.903 17.272 16.692 16.183 15.679 15.215 14.791 14.377 13.965 13.578 13.218 12.841 12.453 12.078 11.711 11.345 11.027 10.706 10.384 10.123 9.863 9.597 9.315 9.038 8.827 8.591 8.233 7.978 7.712 7.572 7.272 6.946 6.597 6.412 5.803 5.825 5.606 5.371 4.846 4.564 4.277 3.941 3.571 3.144 2.577 1.455 -2 ,27343 ,TETRA ,17524689,Wed Nov 24 23:04:38 CET,Thu Nov 25 00:45:55 CET,0.0 2.137 2.856 3.406 3.855 4.242 4.616 4.949 5.513 5.774 6.034 6.092 6.731 6.941 7.306 7.637 7.922 8.068 8.373 8.652 9.044 9.314 9.565 9.909 10.233 10.533 10.828 11.111 11.445 11.737 12.009 12.342 12.68 12.997 13.358 13.762 14.116 14.479 14.871 15.308 15.772 16.251 16.766 17.263 17.802 18.331 18.916 19.529 20.117 20.617 20.771 20.348 19.74 19.043 18.299 17.595 16.955 16.357 15.826 15.244 14.719 14.252 13.829 13.411 12.952 12.538 12.121 11.76 11.444 11.075 10.68 10.346 10.0 9.645 9.367 9.086 8.777 8.424 8.042 7.786 7.537 7.135 6.847 6.531 6.368 6.028 5.668 5.324 5.147 4.531 4.52 4.29 4.034 3.49 3.184 2.855 2.513 2.112 1.619 0.909 -0.423 -3 ,4504 ,TETRA ,17524690,Wed Nov 24 23:04:39 CET,Thu Nov 25 00:45:18 CET,0.0 1.99 2.782 3.354 3.833 4.281 4.683 5.013 5.591 5.871 6.105 6.083 6.687 6.883 7.265 7.634 7.957 8.107 8.431 8.744 9.171 9.435 9.676 10.011 10.331 10.649 10.954 11.249 11.606 11.908 12.193 12.546 12.883 13.198 13.554 13.95 14.31 14.679 15.071 15.497 15.949 16.431 16.959 17.43 17.959 18.571 19.204 19.807 20.401 20.903 21.053 20.608 19.995 19.337 18.683 18.006 17.374 16.817 16.313 15.786 15.315 14.872 14.438 13.991 13.549 13.14 12.703 12.306 11.967 11.601 11.203 10.851 10.496 10.139 9.852 9.576 9.281 8.945 8.602 8.361 8.096 7.668 7.374 7.092 6.945 6.631 6.279 5.917 5.736 5.118 5.151 4.94 4.717 4.226 3.952 3.651 3.301 2.906 2.452 1.823 -0.046 -4 ,29721 ,TETRA ,17524691,Wed Nov 24 23:04:42 CET,Thu Nov 25 00:45:03 CET,0.0 1.693 2.422 2.977 3.459 3.851 4.205 4.545 5.117 5.347 5.574 5.592 6.199 6.398 6.788 7.14 7.438 7.573 7.849 8.132 8.52 8.746 8.97 9.306 9.643 9.975 10.267 10.528 10.857 11.172 11.47 11.83 12.174 12.479 12.828 13.219 13.578 13.971 14.395 14.847 15.302 15.775 16.285 16.779 17.304 17.841 18.409 18.968 19.513 19.969 20.148 19.732 19.085 18.39 17.695 17.04 16.46 15.869 15.303 14.754 14.283 13.855 13.434 13.022 12.636 12.247 11.803 11.408 11.065 10.706 10.331 9.99 9.645 9.279 8.98 8.682 8.371 8.039 7.688 7.446 7.196 6.802 6.548 6.282 6.12 5.788 5.46 5.108 4.924 4.306 4.266 4.034 3.801 3.241 2.959 2.654 2.265 1.835 1.387 0.763 -1.084 -5 ,7543 ,TETRA ,17524693,Wed Nov 24 23:04:39 CET,Thu Nov 25 00:45:48 CET,0.0 2.006 2.764 3.356 3.842 4.227 4.556 4.851 5.384 5.645 5.903 5.964 6.587 6.787 7.153 7.482 7.797 7.949 8.265 8.564 8.927 9.152 9.371 9.703 10.047 10.336 10.591 10.866 11.206 11.514 11.816 12.164 12.499 12.824 13.169 13.539 13.899 14.285 14.689 15.115 15.543 16.0 16.521 17.005 17.544 18.122 18.738 19.348 19.901 20.341 20.504 20.107 19.47 18.798 18.153 17.5 16.875 16.262 15.721 15.184 14.708 14.242 13.796 13.373 12.957 12.578 12.172 11.784 11.435 11.065 10.677 10.357 10.01 9.625 9.318 9.025 8.74 8.447 8.125 7.89 7.645 7.266 7.001 6.691 6.522 6.188 5.851 5.469 5.26 4.643 4.66 4.421 4.151 3.598 3.302 2.975 2.619 2.203 1.699 1.069 -0.363 -6 ,14164 ,TETRA ,17524696,Wed Nov 24 23:04:38 CET,Thu Nov 25 00:46:27 CET,0.0 2.134 2.949 3.557 4.022 4.409 4.786 5.128 5.696 5.951 6.192 6.229 6.862 7.072 7.433 7.768 8.091 8.25 8.544 8.818 9.202 9.437 9.666 10.003 10.316 10.6 10.872 11.141 11.51 11.837 12.137 12.52 12.865 13.181 13.54 13.921 14.252 14.623 15.028 15.446 15.88 16.355 16.893 17.388 17.909 18.472 19.091 19.7 20.286 20.768 20.901 20.465 19.828 19.145 18.486 17.82 17.205 16.647 16.111 15.525 15.032 14.594 14.143 13.703 13.308 12.927 12.491 12.111 11.777 11.437 11.106 10.804 10.469 10.124 9.847 9.547 9.226 8.896 8.553 8.311 8.06 7.624 7.306 6.987 6.819 6.48 6.135 5.764 5.57 4.948 4.944 4.71 4.474 3.958 3.616 3.24 2.848 2.4 1.911 1.213 -0.77 -7 ,17192 ,TETRA ,17524698,Wed Nov 24 23:04:42 CET,Thu Nov 25 00:46:30 CET,0.0 1.825 2.577 3.189 3.681 4.061 4.393 4.705 5.279 5.552 5.821 5.841 6.454 6.664 7.052 7.382 7.69 7.838 8.127 8.431 8.837 9.067 9.304 9.641 9.959 10.268 10.556 10.819 11.14 11.458 11.772 12.111 12.407 12.691 13.029 13.444 13.833 14.203 14.578 14.981 15.381 15.804 16.283 16.787 17.34 17.888 18.487 19.075 19.606 20.062 20.293 19.983 19.437 18.812 18.161 17.53 16.863 16.237 15.707 15.125 14.621 14.168 13.722 13.285 12.878 12.494 12.072 11.698 11.363 10.97 10.503 10.163 9.851 9.506 9.232 8.956 8.666 8.33 7.958 7.697 7.433 7.018 6.739 6.441 6.274 5.925 5.57 5.213 5.014 4.384 4.386 4.16 3.923 3.408 3.136 2.824 2.474 2.066 1.563 0.932 -0.357 -8 ,8060 ,TETRA ,17524699,Wed Nov 24 23:04:43 CET,Thu Nov 25 00:46:13 CET,0.0 1.939 2.757 3.312 3.783 4.201 4.545 4.841 5.383 5.645 5.896 5.939 6.561 6.759 7.121 7.481 7.819 7.971 8.257 8.532 8.917 9.144 9.385 9.757 10.103 10.413 10.672 10.929 11.259 11.565 11.865 12.215 12.531 12.831 13.178 13.553 13.935 14.334 14.713 15.114 15.527 15.978 16.517 17.036 17.597 18.203 18.853 19.465 20.043 20.491 20.607 20.19 19.583 18.945 18.269 17.624 17.041 16.466 15.927 15.371 14.886 14.449 14.032 13.64 13.236 12.829 12.405 12.004 11.67 11.348 10.993 10.672 10.317 9.938 9.646 9.348 9.056 8.778 8.482 8.245 7.987 7.604 7.357 7.096 6.942 6.621 6.28 5.917 5.726 5.118 5.164 4.967 4.747 4.238 3.948 3.61 3.236 2.85 2.416 1.767 -0.488 -9 ,17545 ,TETRA ,17524703,Wed Nov 24 23:04:41 CET,Thu Nov 25 00:45:49 CET,0.0 2.269 3.072 3.642 4.09 4.462 4.804 5.119 5.676 5.925 6.172 6.23 6.867 7.08 7.432 7.776 8.094 8.243 8.535 8.81 9.2 9.45 9.68 9.981 10.281 10.574 10.841 11.121 11.484 11.808 12.114 12.451 12.767 13.079 13.414 13.78 14.151 14.535 14.931 15.339 15.764 16.239 16.744 17.217 17.751 18.309 18.889 19.497 20.102 20.583 20.826 20.573 19.958 19.255 18.598 17.959 17.349 16.792 16.293 15.748 15.248 14.786 14.346 13.922 13.516 13.148 12.77 12.429 12.139 11.833 11.504 11.239 10.956 10.616 10.338 10.067 9.796 9.488 9.141 8.915 8.694 8.35 8.081 7.789 7.636 7.333 7.017 6.651 6.469 5.871 5.878 5.66 5.419 4.895 4.619 4.263 3.855 3.44 2.958 2.4 0.969 -10 ,24519 ,TETRA ,17524704,Wed Nov 24 23:04:38 CET,Thu Nov 25 00:45:21 CET,0.0 1.84 2.536 3.057 3.473 3.846 4.203 4.511 5.054 5.297 5.534 5.549 6.148 6.329 6.679 7.003 7.303 7.446 7.732 8.004 8.37 8.597 8.811 9.134 9.463 9.783 10.06 10.323 10.665 10.986 11.286 11.646 12.009 12.338 12.697 13.094 13.45 13.818 14.208 14.63 15.075 15.551 16.063 16.535 17.078 17.628 18.204 18.786 19.378 19.891 20.086 19.738 19.173 18.558 17.9 17.255 16.659 16.07 15.533 14.981 14.509 14.091 13.677 13.273 12.888 12.51 12.106 11.751 11.433 11.095 10.722 10.406 10.074 9.734 9.475 9.203 8.908 8.594 8.289 8.064 7.81 7.408 7.134 6.857 6.716 6.422 6.096 5.74 5.555 4.951 4.962 4.726 4.473 3.963 3.683 3.365 3.002 2.563 2.069 1.504 -0.166 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1a_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1a_5.txt deleted file mode 100644 index 55f12516..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1a_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21763 ,TETRA ,17377500,Sat Nov 20 18:06:35 CET,Sat Nov 20 20:23:08 CET,0.0 0.539 0.806 1.0 1.155 1.311 1.459 1.595 1.853 1.979 2.093 2.123 2.433 2.535 2.735 2.916 3.073 3.146 3.292 3.441 3.659 3.796 3.93 4.118 4.285 4.447 4.612 4.759 4.941 5.124 5.298 5.519 5.734 5.927 6.137 6.372 6.599 6.845 7.12 7.405 7.674 7.977 8.322 8.678 9.089 9.5 9.937 10.409 10.952 11.506 11.878 11.797 11.512 11.203 10.86 10.488 10.151 9.818 9.517 9.205 8.923 8.684 8.437 8.196 7.956 7.748 7.542 7.337 7.164 6.989 6.821 6.686 6.537 6.366 6.226 6.084 5.94 5.798 5.661 5.563 5.457 5.285 5.169 5.044 4.97 4.824 4.672 4.506 4.413 4.131 4.119 4.016 3.909 3.641 3.487 3.344 3.184 2.986 2.759 2.435 0.876 -2 ,19869 ,TETRA ,17377503,Sat Nov 20 18:06:36 CET,Sat Nov 20 20:23:02 CET,0.0 0.834 1.116 1.344 1.514 1.664 1.809 1.951 2.232 2.352 2.471 2.514 2.812 2.907 3.093 3.269 3.447 3.531 3.673 3.81 4.01 4.139 4.279 4.465 4.626 4.794 4.961 5.119 5.314 5.505 5.697 5.916 6.119 6.309 6.531 6.787 7.005 7.229 7.479 7.722 8.001 8.36 8.763 9.132 9.549 9.975 10.435 10.989 11.608 12.179 12.592 12.619 12.43 12.18 11.861 11.556 11.258 10.927 10.641 10.35 10.075 9.831 9.607 9.394 9.199 9.016 8.816 8.625 8.458 8.285 8.094 7.94 7.788 7.614 7.479 7.335 7.175 7.011 6.832 6.71 6.58 6.376 6.233 6.083 6.003 5.843 5.694 5.528 5.437 5.147 5.107 4.991 4.887 4.674 4.536 4.376 4.225 4.058 3.821 3.515 2.461 -3 ,26998 ,TETRA ,17377505,Sat Nov 20 18:07:42 CET,Sat Nov 20 20:23:57 CET,0.0 0.873 1.169 1.411 1.629 1.819 1.971 2.117 2.397 2.52 2.631 2.637 2.939 3.031 3.2 3.355 3.507 3.584 3.733 3.878 4.095 4.231 4.355 4.54 4.708 4.861 5.013 5.162 5.355 5.538 5.728 5.962 6.17 6.358 6.588 6.85 7.083 7.334 7.608 7.875 8.165 8.499 8.843 9.159 9.52 9.917 10.348 10.806 11.28 11.757 12.146 12.271 12.195 11.999 11.714 11.353 10.988 10.687 10.43 10.159 9.908 9.665 9.428 9.208 8.991 8.789 8.59 8.415 8.248 8.054 7.858 7.698 7.515 7.329 7.2 7.059 6.905 6.745 6.56 6.433 6.31 6.125 6.002 5.86 5.789 5.648 5.469 5.279 5.18 4.882 4.862 4.765 4.663 4.431 4.277 4.105 3.934 3.735 3.463 3.146 2.154 -4 ,28433 ,TETRA ,17377507,Sat Nov 20 18:07:39 CET,Sat Nov 20 20:23:56 CET,0.0 0.388 0.616 0.829 1.032 1.222 1.399 1.561 1.824 1.936 2.04 2.053 2.349 2.44 2.618 2.773 2.917 2.988 3.129 3.264 3.465 3.603 3.734 3.922 4.114 4.292 4.455 4.617 4.821 5.001 5.171 5.386 5.59 5.778 5.995 6.238 6.472 6.722 6.978 7.258 7.556 7.894 8.289 8.69 9.148 9.631 10.134 10.655 11.223 11.805 12.297 12.357 12.167 11.86 11.524 11.196 10.905 10.603 10.301 9.991 9.722 9.488 9.234 8.959 8.717 8.508 8.285 8.091 7.928 7.76 7.578 7.41 7.232 7.052 6.907 6.754 6.603 6.446 6.286 6.181 6.065 5.883 5.76 5.628 5.559 5.407 5.25 5.066 4.966 4.67 4.636 4.522 4.4 4.109 3.955 3.803 3.633 3.442 3.21 2.903 2.122 -5 ,32690 ,TETRA ,17377509,Sat Nov 20 18:07:43 CET,Sat Nov 20 20:25:04 CET,0.0 0.763 1.105 1.384 1.597 1.775 1.932 2.065 2.305 2.424 2.54 2.564 2.869 2.965 3.154 3.326 3.495 3.576 3.725 3.879 4.097 4.231 4.363 4.565 4.756 4.932 5.095 5.254 5.463 5.659 5.849 6.078 6.3 6.499 6.71 6.966 7.211 7.456 7.726 8.013 8.32 8.661 9.052 9.439 9.849 10.308 10.814 11.307 11.817 12.341 12.732 12.754 12.575 12.312 11.985 11.641 11.319 10.989 10.712 10.455 10.236 10.025 9.805 9.582 9.364 9.164 8.949 8.73 8.532 8.36 8.188 8.038 7.889 7.719 7.578 7.442 7.301 7.139 6.965 6.836 6.701 6.506 6.38 6.25 6.184 6.056 5.92 5.777 5.694 5.4 5.408 5.296 5.183 4.956 4.822 4.669 4.495 4.308 4.08 3.792 2.916 -6 ,26347 ,TETRA ,17377511,Sat Nov 20 18:07:41 CET,Sat Nov 20 20:23:59 CET,0.0 0.701 1.0 1.218 1.429 1.611 1.761 1.904 2.157 2.277 2.403 2.428 2.721 2.824 3.02 3.203 3.374 3.452 3.604 3.734 3.914 4.044 4.181 4.375 4.544 4.698 4.853 5.007 5.193 5.373 5.552 5.768 5.965 6.147 6.368 6.637 6.889 7.145 7.412 7.687 8.003 8.349 8.702 9.056 9.479 9.945 10.432 10.91 11.411 11.989 12.556 12.788 12.683 12.401 12.12 11.88 11.649 11.418 11.168 10.892 10.669 10.468 10.263 10.053 9.86 9.691 9.485 9.281 9.115 8.941 8.757 8.585 8.399 8.232 8.102 7.949 7.8 7.655 7.494 7.386 7.274 7.079 6.931 6.772 6.694 6.554 6.402 6.227 6.144 5.861 5.831 5.722 5.613 5.379 5.258 5.121 4.955 4.742 4.505 4.196 3.322 -7 ,23629 ,TETRA ,17377513,Sat Nov 20 18:07:39 CET,Sat Nov 20 20:24:04 CET,0.0 0.685 0.994 1.235 1.427 1.584 1.731 1.868 2.126 2.25 2.372 2.408 2.707 2.799 2.986 3.158 3.31 3.386 3.553 3.714 3.935 4.078 4.218 4.405 4.573 4.738 4.898 5.054 5.253 5.444 5.628 5.85 6.062 6.275 6.509 6.747 6.977 7.219 7.482 7.795 8.105 8.418 8.779 9.151 9.577 10.01 10.498 11.018 11.557 12.089 12.502 12.53 12.331 12.098 11.83 11.515 11.189 10.889 10.615 10.309 10.054 9.826 9.594 9.365 9.146 8.936 8.719 8.524 8.349 8.17 7.98 7.827 7.669 7.484 7.327 7.167 7.013 6.851 6.672 6.549 6.426 6.218 6.067 5.92 5.84 5.658 5.463 5.241 5.127 4.837 4.814 4.695 4.565 4.266 4.104 3.935 3.732 3.506 3.24 2.917 2.123 -8 ,26362 ,TETRA ,17377515,Sat Nov 20 18:07:44 CET,Sat Nov 20 20:22:50 CET,0.0 1.015 1.379 1.644 1.849 2.019 2.185 2.352 2.634 2.762 2.886 2.915 3.214 3.324 3.531 3.718 3.9 3.987 4.139 4.283 4.494 4.631 4.761 4.937 5.102 5.268 5.432 5.595 5.796 5.97 6.137 6.343 6.542 6.737 6.944 7.156 7.35 7.563 7.822 8.109 8.387 8.724 9.136 9.521 9.945 10.381 10.886 11.436 11.963 12.464 12.842 12.806 12.584 12.303 12.041 11.787 11.509 11.236 10.969 10.689 10.442 10.209 9.956 9.713 9.494 9.3 9.104 8.922 8.763 8.589 8.419 8.284 8.122 7.958 7.836 7.7 7.55 7.392 7.229 7.115 6.994 6.798 6.664 6.522 6.445 6.296 6.148 5.968 5.86 5.567 5.556 5.441 5.33 5.076 4.926 4.769 4.617 4.462 4.244 3.945 3.087 -9 ,25215 ,TETRA ,17377517,Sat Nov 20 18:07:39 CET,Sat Nov 20 20:07:49 CET,0.0 0.522 0.821 1.046 1.226 1.39 1.537 1.666 1.899 2.012 2.12 2.104 2.4 2.488 2.658 2.832 3.009 3.096 3.258 3.402 3.604 3.747 3.885 4.061 4.224 4.389 4.546 4.69 4.876 5.073 5.259 5.473 5.699 5.921 6.164 6.423 6.667 6.935 7.235 7.56 7.898 8.249 8.612 8.96 9.352 9.801 10.332 10.869 11.41 11.935 12.352 12.444 12.282 12.056 11.807 11.519 11.231 10.949 10.687 10.401 10.134 9.881 9.621 9.364 9.127 8.907 8.692 8.491 8.282 8.07 7.875 7.71 7.526 7.327 7.18 7.022 6.853 6.69 6.529 6.419 6.307 6.12 5.974 5.829 5.758 5.606 5.441 5.261 5.164 4.862 4.842 4.724 4.593 4.353 4.234 4.081 3.902 3.678 3.391 3.036 2.319 -10 ,10844 ,TETRA ,17377520,Sat Nov 20 18:07:43 CET,Sat Nov 20 20:24:43 CET,0.0 0.531 0.761 0.974 1.169 1.335 1.492 1.653 1.923 2.046 2.177 2.209 2.51 2.601 2.766 2.948 3.115 3.194 3.359 3.509 3.721 3.86 3.983 4.155 4.33 4.489 4.65 4.812 5.012 5.212 5.401 5.603 5.799 5.994 6.219 6.47 6.709 6.976 7.255 7.529 7.814 8.165 8.571 8.929 9.33 9.779 10.25 10.741 11.251 11.729 12.158 12.276 12.11 11.885 11.654 11.377 11.097 10.833 10.566 10.241 9.981 9.76 9.541 9.326 9.112 8.925 8.729 8.549 8.387 8.211 8.027 7.859 7.676 7.5 7.355 7.202 7.044 6.874 6.707 6.587 6.451 6.229 6.072 5.911 5.838 5.693 5.529 5.351 5.251 4.952 4.878 4.733 4.581 4.266 4.106 3.943 3.768 3.565 3.299 2.979 2.224 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt deleted file mode 100644 index 4b7660e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20255 ,TETRA ,17377523,Sat Nov 20 18:07:42 CET,Sat Nov 20 20:25:59 CET,0.0 1.124 1.454 1.681 1.868 2.041 2.191 2.332 2.575 2.685 2.796 2.817 3.126 3.215 3.371 3.527 3.679 3.754 3.892 4.023 4.209 4.336 4.459 4.633 4.809 4.98 5.141 5.305 5.52 5.709 5.892 6.108 6.308 6.507 6.745 7.012 7.252 7.506 7.775 8.062 8.356 8.68 9.043 9.385 9.769 10.186 10.637 11.16 11.789 12.324 12.739 12.881 12.74 12.469 12.171 11.851 11.561 11.289 11.038 10.774 10.542 10.33 10.118 9.904 9.678 9.43 9.166 8.946 8.781 8.627 8.441 8.28 8.12 7.942 7.798 7.645 7.476 7.307 7.139 7.02 6.899 6.707 6.56 6.415 6.336 6.151 5.989 5.834 5.752 5.486 5.492 5.393 5.295 5.052 4.925 4.76 4.57 4.406 4.211 3.817 2.185 -2 ,32642 ,TETRA ,17377525,Sat Nov 20 18:07:46 CET,Sat Nov 20 20:25:55 CET,0.0 0.822 1.233 1.543 1.731 1.888 2.037 2.164 2.393 2.5 2.604 2.621 2.914 3.002 3.175 3.347 3.507 3.585 3.723 3.852 4.036 4.153 4.267 4.431 4.596 4.757 4.911 5.062 5.247 5.426 5.607 5.817 6.023 6.226 6.457 6.709 6.964 7.224 7.492 7.784 8.078 8.398 8.749 9.112 9.539 9.99 10.475 10.976 11.507 12.029 12.472 12.553 12.39 12.121 11.838 11.542 11.229 10.934 10.668 10.397 10.171 9.962 9.734 9.506 9.301 9.093 8.869 8.676 8.508 8.34 8.175 8.027 7.866 7.7 7.563 7.412 7.254 7.1 6.932 6.8 6.653 6.425 6.265 6.105 6.024 5.858 5.699 5.527 5.436 5.152 5.135 5.021 4.904 4.643 4.49 4.316 4.129 3.922 3.657 3.288 1.908 -3 ,15536 ,TETRA ,17377527,Sat Nov 20 18:07:42 CET,Sat Nov 20 20:25:21 CET,0.0 1.462 1.787 2.039 2.242 2.42 2.582 2.723 2.971 3.081 3.175 3.156 3.447 3.547 3.721 3.861 4.004 4.077 4.228 4.382 4.6 4.742 4.861 5.023 5.207 5.379 5.538 5.699 5.891 6.064 6.244 6.462 6.663 6.854 7.071 7.313 7.536 7.789 8.068 8.341 8.618 8.926 9.281 9.644 10.081 10.564 11.097 11.667 12.236 12.772 13.184 13.246 13.096 12.842 12.53 12.213 11.928 11.649 11.39 11.12 10.857 10.59 10.351 10.14 9.928 9.731 9.516 9.325 9.159 8.968 8.762 8.608 8.445 8.26 8.112 7.961 7.815 7.661 7.502 7.394 7.265 7.05 6.906 6.755 6.674 6.505 6.345 6.173 6.083 5.787 5.774 5.653 5.512 5.224 5.056 4.885 4.707 4.487 4.247 3.945 2.893 -4 ,31065 ,TETRA ,17377529,Sat Nov 20 18:07:44 CET,Sat Nov 20 20:25:58 CET,0.0 1.28 1.599 1.832 2.035 2.216 2.391 2.558 2.832 2.961 3.094 3.125 3.426 3.526 3.712 3.895 4.077 4.157 4.298 4.44 4.652 4.791 4.924 5.107 5.283 5.465 5.641 5.795 5.995 6.191 6.369 6.58 6.781 6.983 7.217 7.461 7.722 8.017 8.296 8.576 8.859 9.169 9.539 9.908 10.328 10.794 11.299 11.786 12.293 12.809 13.236 13.342 13.214 13.027 12.781 12.458 12.146 11.859 11.607 11.331 11.064 10.824 10.579 10.332 10.106 9.888 9.651 9.443 9.27 9.091 8.882 8.697 8.512 8.319 8.173 8.037 7.893 7.722 7.53 7.405 7.291 7.112 6.976 6.821 6.741 6.579 6.416 6.233 6.128 5.836 5.81 5.695 5.579 5.287 5.124 4.951 4.757 4.544 4.302 3.938 2.527 -5 ,14002 ,TETRA ,17377531,Sat Nov 20 18:07:44 CET,Sat Nov 20 20:24:29 CET,0.0 0.811 1.069 1.306 1.535 1.74 1.936 2.107 2.393 2.504 2.606 2.617 2.929 3.033 3.218 3.376 3.533 3.614 3.781 3.945 4.168 4.314 4.448 4.625 4.81 4.986 5.138 5.285 5.486 5.686 5.881 6.113 6.32 6.506 6.726 6.968 7.2 7.456 7.726 8.023 8.332 8.65 9.014 9.377 9.804 10.284 10.797 11.338 11.886 12.463 13.065 13.225 13.094 12.881 12.638 12.384 12.109 11.799 11.486 11.178 10.908 10.672 10.466 10.258 10.05 9.831 9.598 9.413 9.251 9.07 8.869 8.705 8.542 8.353 8.214 8.083 7.935 7.786 7.639 7.545 7.443 7.253 7.112 6.944 6.856 6.687 6.512 6.339 6.255 5.983 5.964 5.843 5.718 5.45 5.319 5.152 4.952 4.733 4.487 4.145 2.984 -6 ,28059 ,TETRA ,17377533,Sat Nov 20 18:07:46 CET,Sat Nov 20 20:26:46 CET,0.0 0.934 1.291 1.532 1.707 1.864 2.012 2.147 2.399 2.514 2.612 2.606 2.887 2.977 3.149 3.313 3.48 3.553 3.679 3.808 4.008 4.136 4.258 4.43 4.591 4.745 4.895 5.043 5.237 5.421 5.587 5.782 5.991 6.193 6.405 6.639 6.869 7.136 7.401 7.676 7.973 8.305 8.677 9.029 9.442 9.881 10.384 10.927 11.464 11.989 12.391 12.427 12.274 12.037 11.726 11.414 11.13 10.851 10.59 10.319 10.091 9.875 9.635 9.4 9.167 8.929 8.691 8.49 8.303 8.11 7.923 7.764 7.591 7.405 7.261 7.106 6.937 6.756 6.571 6.462 6.352 6.157 6.009 5.857 5.777 5.604 5.416 5.214 5.108 4.803 4.79 4.682 4.554 4.258 4.094 3.934 3.775 3.568 3.255 2.802 1.37 -7 ,24302 ,TETRA ,17377535,Sat Nov 20 18:08:07 CET,Sat Nov 20 20:25:42 CET,0.0 1.85 2.267 2.544 2.763 2.955 3.109 3.255 3.527 3.653 3.764 3.779 4.069 4.16 4.334 4.503 4.668 4.739 4.878 5.019 5.247 5.406 5.542 5.725 5.896 6.065 6.234 6.398 6.609 6.796 6.974 7.194 7.411 7.625 7.865 8.124 8.365 8.629 8.918 9.211 9.491 9.809 10.176 10.525 10.956 11.419 11.882 12.347 12.803 13.306 13.821 13.978 13.783 13.476 13.141 12.819 12.529 12.235 11.967 11.678 11.413 11.193 10.979 10.762 10.556 10.362 10.135 9.93 9.766 9.596 9.407 9.228 9.034 8.839 8.677 8.497 8.311 8.125 7.931 7.801 7.675 7.464 7.311 7.151 7.065 6.901 6.728 6.538 6.442 6.137 6.085 5.966 5.832 5.539 5.393 5.24 5.074 4.874 4.572 4.183 3.124 -8 ,8272 ,TETRA ,17377537,Sat Nov 20 18:08:10 CET,Sat Nov 20 20:25:42 CET,0.0 0.691 0.969 1.196 1.394 1.57 1.72 1.848 2.087 2.203 2.326 2.34 2.637 2.732 2.908 3.093 3.273 3.356 3.519 3.67 3.864 3.982 4.102 4.288 4.469 4.639 4.81 4.968 5.166 5.358 5.529 5.755 5.986 6.189 6.412 6.644 6.865 7.123 7.404 7.69 7.966 8.279 8.646 9.018 9.469 9.954 10.473 11.041 11.639 12.247 12.815 12.979 12.875 12.708 12.501 12.259 12.026 11.774 11.528 11.304 11.098 10.882 10.68 10.483 10.28 10.088 9.89 9.702 9.534 9.364 9.171 9.005 8.863 8.689 8.535 8.396 8.258 8.096 7.928 7.814 7.697 7.495 7.347 7.198 7.121 6.974 6.811 6.627 6.539 6.252 6.245 6.135 6.018 5.739 5.58 5.418 5.236 4.995 4.66 4.289 3.21 -9 ,24229 ,TETRA ,17377538,Sat Nov 20 18:08:11 CET,Sat Nov 20 20:25:30 CET,0.0 0.929 1.304 1.566 1.759 1.908 2.065 2.217 2.448 2.56 2.682 2.684 2.966 3.052 3.233 3.407 3.555 3.629 3.783 3.927 4.129 4.255 4.378 4.555 4.719 4.882 5.033 5.176 5.356 5.529 5.703 5.92 6.121 6.298 6.507 6.747 6.988 7.252 7.527 7.824 8.113 8.429 8.801 9.175 9.609 10.062 10.557 11.075 11.615 12.185 12.688 12.841 12.733 12.505 12.212 11.904 11.601 11.288 10.997 10.721 10.492 10.287 10.082 9.859 9.649 9.464 9.257 9.07 8.902 8.733 8.554 8.393 8.224 8.037 7.891 7.748 7.582 7.403 7.239 7.129 7.006 6.81 6.682 6.544 6.468 6.317 6.165 5.991 5.898 5.615 5.64 5.554 5.447 5.177 5.04 4.891 4.735 4.584 4.398 4.1 3.2 -10 ,30130 ,TETRA ,17377539,Sat Nov 20 18:09:09 CET,Sat Nov 20 20:25:42 CET,0.0 0.825 1.148 1.41 1.623 1.812 1.996 2.159 2.421 2.547 2.665 2.673 2.968 3.062 3.249 3.417 3.572 3.648 3.802 3.956 4.174 4.319 4.454 4.63 4.794 4.965 5.132 5.285 5.482 5.661 5.839 6.056 6.27 6.484 6.735 7.002 7.239 7.495 7.766 8.053 8.349 8.678 9.074 9.472 9.917 10.404 10.977 11.572 12.126 12.651 13.148 13.276 13.123 12.871 12.595 12.338 12.096 11.833 11.561 11.287 11.051 10.84 10.618 10.379 10.161 9.964 9.742 9.526 9.34 9.159 8.954 8.781 8.615 8.437 8.291 8.122 7.937 7.76 7.584 7.457 7.317 7.107 6.968 6.814 6.723 6.547 6.397 6.232 6.143 5.857 5.845 5.732 5.618 5.374 5.227 5.064 4.891 4.669 4.428 4.174 2.493 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1c.txt deleted file mode 100644 index 265b7cf1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3556 ,TETRA ,17377541,Sat Nov 20 18:08:10 CET,Sat Nov 20 20:25:56 CET,0.0 1.016 1.333 1.56 1.777 1.977 2.148 2.296 2.535 2.653 2.773 2.803 3.106 3.189 3.352 3.514 3.667 3.739 3.879 4.032 4.233 4.354 4.474 4.638 4.798 4.945 5.083 5.22 5.396 5.569 5.735 5.915 6.091 6.267 6.465 6.694 6.887 7.093 7.335 7.575 7.823 8.109 8.465 8.779 9.097 9.44 9.771 10.093 10.357 10.527 10.501 10.192 9.864 9.467 9.008 8.529 8.108 7.722 7.355 6.981 6.654 6.357 6.092 5.838 5.592 5.375 5.156 4.961 4.795 4.614 4.404 4.231 4.044 3.851 3.7 3.544 3.384 3.209 3.022 2.901 2.778 2.575 2.442 2.302 2.215 2.027 1.845 1.655 1.556 1.257 1.254 1.155 1.048 0.818 0.7 0.555 0.391 0.205 -0.044 -0.349 -1.432 -2 ,8653 ,TETRA ,17377543,Sat Nov 20 18:08:14 CET,Sat Nov 20 20:25:54 CET,0.0 1.528 1.955 2.235 2.458 2.652 2.835 3.023 3.375 3.511 3.637 3.669 3.973 4.076 4.272 4.441 4.613 4.694 4.84 4.991 5.216 5.359 5.49 5.665 5.846 6.021 6.167 6.311 6.506 6.689 6.847 7.032 7.227 7.415 7.63 7.85 8.038 8.254 8.489 8.754 9.041 9.314 9.594 9.863 10.179 10.542 10.949 11.337 11.683 11.898 11.884 11.556 11.086 10.61 10.161 9.727 9.317 8.93 8.573 8.179 7.849 7.57 7.311 7.071 6.852 6.634 6.399 6.204 6.028 5.826 5.606 5.428 5.233 5.032 4.892 4.752 4.6 4.434 4.256 4.134 4.013 3.816 3.66 3.489 3.41 3.26 3.08 2.887 2.798 2.51 2.486 2.37 2.255 1.973 1.811 1.629 1.425 1.221 0.996 0.644 -0.294 -3 ,20025 ,TETRA ,17377545,Sat Nov 20 18:08:12 CET,Sat Nov 20 20:26:46 CET,0.0 1.286 1.763 2.045 2.258 2.45 2.613 2.759 3.04 3.168 3.279 3.292 3.589 3.687 3.864 4.02 4.186 4.273 4.441 4.581 4.768 4.889 5.006 5.179 5.345 5.492 5.634 5.778 5.956 6.125 6.286 6.465 6.637 6.812 7.025 7.257 7.474 7.705 7.959 8.232 8.511 8.827 9.163 9.498 9.873 10.244 10.641 11.03 11.386 11.651 11.751 11.498 11.021 10.558 10.174 9.738 9.293 8.9 8.571 8.228 7.926 7.626 7.327 7.065 6.834 6.626 6.396 6.182 5.991 5.784 5.567 5.396 5.215 5.019 4.862 4.708 4.557 4.376 4.193 4.077 3.958 3.769 3.637 3.503 3.436 3.293 3.106 2.901 2.811 2.525 2.543 2.452 2.349 2.115 1.981 1.808 1.63 1.443 1.209 0.932 -0.149 -4 ,2034 ,TETRA ,17377548,Sat Nov 20 18:09:09 CET,Sat Nov 20 20:26:46 CET,0.0 0.772 1.105 1.356 1.561 1.788 1.995 2.147 2.417 2.545 2.664 2.681 2.985 3.093 3.29 3.458 3.606 3.671 3.805 3.942 4.124 4.233 4.347 4.518 4.68 4.83 4.974 5.115 5.309 5.486 5.639 5.829 5.991 6.147 6.368 6.594 6.795 7.01 7.236 7.481 7.704 7.958 8.247 8.505 8.805 9.11 9.434 9.77 10.117 10.386 10.399 10.095 9.665 9.202 8.771 8.392 8.004 7.613 7.262 6.885 6.556 6.259 5.953 5.664 5.415 5.201 4.979 4.769 4.575 4.371 4.163 3.982 3.795 3.605 3.456 3.307 3.151 2.986 2.818 2.7 2.573 2.365 2.216 2.067 1.992 1.815 1.628 1.43 1.316 0.995 0.985 0.874 0.754 0.47 0.319 0.155 -0.032 -0.248 -0.512 -0.92 -2.146 -5 ,27645 ,TETRA ,17377550,Sat Nov 20 18:08:16 CET,Sat Nov 20 20:25:54 CET,0.0 1.118 1.48 1.738 1.988 2.207 2.352 2.482 2.748 2.871 2.989 3.029 3.335 3.431 3.618 3.79 3.954 4.032 4.188 4.339 4.542 4.67 4.8 4.985 5.153 5.314 5.465 5.612 5.812 6.009 6.188 6.391 6.59 6.784 7.026 7.285 7.493 7.725 7.977 8.251 8.508 8.767 9.086 9.381 9.693 10.061 10.446 10.773 11.087 11.378 11.426 11.058 10.539 9.972 9.484 9.045 8.654 8.271 7.933 7.585 7.266 7.0 6.736 6.457 6.202 5.983 5.733 5.5 5.312 5.122 4.912 4.728 4.549 4.364 4.208 4.04 3.866 3.677 3.486 3.361 3.229 3.014 2.865 2.699 2.605 2.419 2.228 2.028 1.923 1.604 1.562 1.425 1.298 1.058 0.913 0.737 0.56 0.374 0.143 -0.127 -1.077 -6 ,7645 ,TETRA ,17377552,Sat Nov 20 18:08:14 CET,Sat Nov 20 20:25:54 CET,0.0 1.074 1.392 1.618 1.805 1.968 2.135 2.298 2.558 2.672 2.784 2.787 3.074 3.166 3.327 3.494 3.664 3.741 3.88 4.015 4.205 4.315 4.422 4.578 4.719 4.867 5.015 5.14 5.311 5.49 5.663 5.866 6.053 6.238 6.451 6.704 6.949 7.215 7.491 7.749 8.009 8.296 8.6 8.898 9.241 9.578 9.938 10.283 10.594 10.859 10.912 10.582 10.126 9.658 9.248 8.82 8.401 8.031 7.679 7.308 6.986 6.693 6.401 6.113 5.849 5.599 5.331 5.112 4.933 4.735 4.511 4.334 4.177 4.009 3.856 3.684 3.508 3.332 3.151 3.026 2.91 2.73 2.596 2.447 2.365 2.214 2.067 1.909 1.822 1.526 1.494 1.377 1.26 0.977 0.834 0.686 0.526 0.33 0.109 -0.186 -1.256 -7 ,12107 ,TETRA ,17377554,Sat Nov 20 18:09:09 CET,Sat Nov 20 20:26:54 CET,0.0 0.97 1.265 1.468 1.695 1.933 2.147 2.309 2.553 2.658 2.764 2.767 3.063 3.143 3.301 3.449 3.593 3.672 3.82 3.945 4.113 4.221 4.339 4.529 4.717 4.908 5.08 5.225 5.402 5.574 5.733 5.914 6.108 6.303 6.519 6.743 6.951 7.17 7.397 7.643 7.887 8.141 8.414 8.674 8.988 9.315 9.638 9.958 10.277 10.561 10.572 10.151 9.683 9.22 8.746 8.273 7.856 7.473 7.151 6.823 6.508 6.238 5.975 5.71 5.465 5.227 4.976 4.756 4.579 4.403 4.199 4.016 3.814 3.612 3.475 3.332 3.184 3.018 2.853 2.748 2.626 2.437 2.296 2.145 2.066 1.907 1.753 1.594 1.514 1.231 1.245 1.147 1.023 0.738 0.602 0.441 0.266 0.09 -0.132 -0.414 -1.44 -8 ,10393 ,TETRA ,17377556,Sat Nov 20 18:10:08 CET,Sat Nov 20 20:27:53 CET,0.0 0.716 1.054 1.342 1.553 1.724 1.914 2.087 2.32 2.428 2.533 2.549 2.85 2.942 3.112 3.273 3.411 3.47 3.579 3.691 3.862 3.983 4.105 4.276 4.443 4.603 4.754 4.894 5.06 5.218 5.371 5.544 5.72 5.882 6.084 6.328 6.539 6.763 6.995 7.237 7.495 7.775 8.081 8.338 8.593 8.881 9.221 9.563 9.87 10.071 10.029 9.678 9.26 8.798 8.306 7.839 7.413 7.025 6.672 6.307 6.009 5.735 5.449 5.175 4.931 4.72 4.501 4.301 4.108 3.92 3.738 3.575 3.395 3.209 3.069 2.917 2.756 2.591 2.425 2.304 2.173 1.969 1.836 1.703 1.629 1.475 1.318 1.15 1.061 0.766 0.784 0.698 0.582 0.319 0.185 0.033 -0.109 -0.243 -0.45 -0.696 -1.566 -9 ,1888 ,TETRA ,17377558,Sat Nov 20 18:09:09 CET,Sat Nov 20 20:27:00 CET,0.0 0.603 0.808 1.004 1.182 1.336 1.49 1.643 1.892 1.992 2.087 2.084 2.382 2.474 2.653 2.833 2.996 3.072 3.217 3.345 3.549 3.694 3.831 4.016 4.195 4.375 4.538 4.676 4.856 5.039 5.212 5.407 5.578 5.755 5.969 6.185 6.385 6.618 6.848 7.057 7.311 7.601 7.891 8.161 8.466 8.801 9.175 9.546 9.853 10.092 10.148 9.777 9.306 8.855 8.426 7.984 7.554 7.164 6.806 6.448 6.15 5.835 5.507 5.226 4.963 4.716 4.47 4.253 4.073 3.882 3.683 3.499 3.308 3.126 2.98 2.827 2.665 2.498 2.331 2.225 2.114 1.913 1.764 1.625 1.565 1.43 1.275 1.119 1.034 0.737 0.754 0.671 0.586 0.384 0.261 0.109 -0.1 -0.336 -0.596 -0.894 -1.874 -10 ,11119 ,TETRA ,17377559,Sat Nov 20 18:09:11 CET,Sat Nov 20 20:27:57 CET,0.0 1.145 1.489 1.744 1.948 2.11 2.263 2.391 2.638 2.741 2.845 2.843 3.119 3.193 3.346 3.516 3.667 3.74 3.897 4.054 4.277 4.413 4.522 4.678 4.827 4.965 5.105 5.222 5.374 5.534 5.694 5.882 6.052 6.211 6.376 6.578 6.802 7.045 7.285 7.524 7.766 8.034 8.343 8.623 8.905 9.205 9.499 9.799 10.074 10.217 10.146 9.807 9.373 8.907 8.453 8.027 7.648 7.289 6.94 6.58 6.294 6.021 5.767 5.533 5.297 5.089 4.857 4.632 4.452 4.263 4.049 3.886 3.704 3.506 3.357 3.194 3.028 2.865 2.685 2.554 2.438 2.267 2.131 1.99 1.912 1.757 1.613 1.455 1.372 1.084 1.089 0.98 0.87 0.621 0.472 0.304 0.123 -0.08 -0.303 -0.588 -2.134 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1d.txt deleted file mode 100644 index 7ecdc3c2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1523 ,TETRA ,17377561,Sat Nov 20 18:09:09 CET,Sat Nov 20 20:25:55 CET,0.0 1.22 1.511 1.721 1.92 2.103 2.268 2.411 2.688 2.817 2.938 2.973 3.293 3.405 3.6 3.778 3.939 4.022 4.18 4.33 4.56 4.696 4.831 5.026 5.187 5.348 5.512 5.657 5.817 5.964 6.129 6.337 6.529 6.703 6.902 7.124 7.326 7.527 7.733 7.968 8.207 8.448 8.752 9.063 9.375 9.685 9.999 10.272 10.479 10.59 10.475 10.031 9.495 8.972 8.406 7.822 7.34 6.892 6.472 6.045 5.683 5.359 5.054 4.767 4.486 4.221 3.962 3.721 3.497 3.272 3.039 2.847 2.659 2.443 2.265 2.09 1.909 1.724 1.535 1.399 1.253 1.025 0.861 0.693 0.606 0.432 0.24 0.024 -0.081 -0.401 -0.433 -0.555 -0.698 -0.996 -1.152 -1.339 -1.529 -1.736 -2.015 -2.372 -3.469 -2 ,10301 ,TETRA ,17377563,Sat Nov 20 18:09:14 CET,Sat Nov 20 20:27:06 CET,0.0 1.298 1.677 1.964 2.183 2.366 2.537 2.683 2.957 3.085 3.208 3.248 3.55 3.645 3.83 4.003 4.177 4.26 4.408 4.571 4.808 4.946 5.068 5.235 5.4 5.557 5.716 5.884 6.103 6.298 6.489 6.708 6.884 7.046 7.246 7.463 7.663 7.884 8.115 8.357 8.601 8.882 9.189 9.478 9.797 10.105 10.425 10.713 10.934 11.041 10.904 10.397 9.765 9.12 8.533 7.981 7.493 7.06 6.697 6.324 5.998 5.681 5.376 5.087 4.783 4.499 4.227 3.979 3.767 3.561 3.324 3.131 2.942 2.748 2.606 2.451 2.28 2.1 1.914 1.789 1.658 1.448 1.297 1.131 1.047 0.886 0.72 0.541 0.443 0.134 0.127 0.008 -0.113 -0.414 -0.586 -0.765 -0.979 -1.191 -1.433 -1.745 -2.597 -3 ,8651 ,TETRA ,17377565,Sat Nov 20 18:09:11 CET,Sat Nov 20 20:27:20 CET,0.0 1.183 1.495 1.732 1.937 2.119 2.286 2.459 2.795 2.918 3.016 2.999 3.283 3.368 3.536 3.702 3.866 3.948 4.098 4.235 4.428 4.553 4.672 4.853 5.024 5.19 5.358 5.514 5.702 5.859 6.003 6.186 6.367 6.55 6.746 6.955 7.155 7.368 7.606 7.854 8.097 8.366 8.656 8.928 9.221 9.479 9.726 9.972 10.204 10.367 10.265 9.749 9.155 8.579 8.053 7.565 7.088 6.649 6.279 5.911 5.603 5.321 5.035 4.757 4.494 4.251 4.005 3.793 3.594 3.396 3.19 2.99 2.793 2.609 2.46 2.301 2.126 1.943 1.757 1.624 1.485 1.268 1.114 0.97 0.9 0.753 0.588 0.387 0.292 0.008 0.044 -0.063 -0.192 -0.475 -0.624 -0.796 -0.979 -1.141 -1.35 -1.708 -2.714 -4 ,16197 ,TETRA ,17377567,Sat Nov 20 18:09:11 CET,Sat Nov 20 20:09:46 CET,0.0 1.922 2.338 2.656 2.888 3.09 3.277 3.452 3.757 3.876 3.998 4.01 4.321 4.429 4.623 4.804 4.972 5.047 5.192 5.336 5.572 5.72 5.84 5.992 6.151 6.321 6.485 6.631 6.82 7.012 7.196 7.416 7.625 7.816 8.019 8.243 8.466 8.687 8.902 9.133 9.375 9.643 9.955 10.241 10.536 10.867 11.249 11.583 11.83 11.967 11.863 11.457 10.942 10.387 9.841 9.326 8.858 8.406 8.008 7.639 7.322 7.017 6.729 6.451 6.191 5.942 5.659 5.406 5.179 4.943 4.722 4.543 4.346 4.134 3.974 3.812 3.632 3.457 3.286 3.157 3.013 2.788 2.634 2.462 2.378 2.216 2.037 1.854 1.764 1.454 1.437 1.305 1.17 0.94 0.803 0.643 0.473 0.271 0.024 -0.315 -1.037 -5 ,26400 ,TETRA ,17377569,Sat Nov 20 18:09:11 CET,Sat Nov 20 20:27:20 CET,0.0 1.294 1.76 2.054 2.268 2.455 2.624 2.783 3.061 3.188 3.323 3.359 3.653 3.739 3.906 4.087 4.262 4.334 4.481 4.622 4.808 4.928 5.047 5.221 5.385 5.541 5.692 5.833 6.0 6.157 6.338 6.564 6.764 6.954 7.151 7.383 7.622 7.856 8.084 8.303 8.552 8.845 9.138 9.405 9.682 9.964 10.304 10.616 10.833 10.96 10.8 10.248 9.612 9.012 8.48 7.989 7.536 7.096 6.706 6.294 5.943 5.65 5.35 5.027 4.734 4.49 4.23 3.992 3.766 3.519 3.278 3.073 2.857 2.639 2.476 2.322 2.149 1.947 1.747 1.621 1.498 1.307 1.163 1.01 0.937 0.781 0.587 0.38 0.282 -0.016 -0.023 -0.13 -0.235 -0.449 -0.579 -0.755 -0.945 -1.193 -1.506 -1.891 -3.155 -6 ,12373 ,TETRA ,17377571,Sat Nov 20 18:09:15 CET,Sat Nov 20 20:25:48 CET,0.0 1.382 1.788 2.063 2.324 2.577 2.805 3.018 3.409 3.582 3.723 3.761 4.082 4.189 4.375 4.543 4.708 4.787 4.925 5.056 5.243 5.365 5.48 5.644 5.81 5.962 6.1 6.245 6.436 6.616 6.792 6.996 7.181 7.349 7.544 7.754 7.951 8.176 8.4 8.633 8.867 9.112 9.382 9.646 9.936 10.218 10.516 10.75 10.928 11.01 10.823 10.354 9.815 9.307 8.807 8.279 7.807 7.367 7.001 6.636 6.31 6.029 5.753 5.482 5.228 4.979 4.712 4.483 4.28 4.048 3.813 3.628 3.443 3.242 3.073 2.908 2.745 2.571 2.376 2.233 2.091 1.89 1.754 1.593 1.506 1.348 1.184 1.017 0.938 0.642 0.654 0.533 0.395 0.125 -0.001 -0.149 -0.354 -0.562 -0.772 -1.061 -2.015 -7 ,124 ,TETRA ,17377573,Sat Nov 20 18:09:13 CET,Sat Nov 20 20:28:37 CET,0.0 0.868 1.143 1.342 1.538 1.777 1.973 2.12 2.372 2.479 2.589 2.597 2.896 2.988 3.176 3.349 3.506 3.584 3.731 3.874 4.07 4.186 4.301 4.459 4.604 4.747 4.882 5.019 5.196 5.356 5.497 5.666 5.847 6.029 6.223 6.42 6.613 6.819 7.045 7.282 7.505 7.768 8.061 8.326 8.632 8.944 9.246 9.503 9.702 9.811 9.754 9.397 8.92 8.398 7.88 7.374 6.933 6.557 6.222 5.874 5.55 5.244 4.952 4.674 4.423 4.179 3.904 3.657 3.453 3.264 3.072 2.897 2.702 2.499 2.354 2.187 2.01 1.844 1.669 1.541 1.414 1.238 1.104 0.95 0.873 0.718 0.541 0.351 0.252 -0.057 -0.072 -0.185 -0.311 -0.61 -0.757 -0.912 -1.087 -1.274 -1.52 -1.847 -2.973 -8 ,6268 ,TETRA ,17377575,Sat Nov 20 18:09:18 CET,Sat Nov 20 20:26:55 CET,0.0 1.04 1.357 1.603 1.797 1.946 2.093 2.226 2.472 2.591 2.703 2.71 2.998 3.098 3.304 3.478 3.628 3.697 3.833 3.991 4.196 4.316 4.432 4.577 4.73 4.879 5.015 5.163 5.356 5.529 5.685 5.882 6.084 6.26 6.454 6.666 6.865 7.084 7.322 7.551 7.768 8.008 8.266 8.532 8.831 9.107 9.378 9.626 9.848 9.961 9.744 9.164 8.535 7.969 7.46 6.968 6.516 6.094 5.713 5.326 4.98 4.667 4.364 4.073 3.812 3.586 3.347 3.127 2.929 2.711 2.481 2.296 2.112 1.913 1.754 1.591 1.416 1.22 1.036 0.92 0.791 0.56 0.386 0.218 0.129 -0.057 -0.234 -0.418 -0.514 -0.828 -0.87 -0.988 -1.118 -1.388 -1.538 -1.726 -1.93 -2.158 -2.567 -3.074 -4.092 -9 ,12864 ,TETRA ,17377577,Sat Nov 20 18:09:17 CET,Sat Nov 20 20:26:55 CET,0.0 1.297 1.587 1.847 2.069 2.237 2.383 2.515 2.731 2.826 2.929 2.943 3.264 3.387 3.605 3.789 3.953 4.035 4.184 4.326 4.535 4.667 4.803 4.978 5.135 5.293 5.447 5.598 5.785 5.978 6.158 6.355 6.552 6.744 6.957 7.182 7.386 7.613 7.86 8.1 8.35 8.628 8.923 9.207 9.539 9.864 10.196 10.564 10.876 11.078 11.014 10.571 10.018 9.435 8.866 8.321 7.828 7.38 6.999 6.623 6.29 5.981 5.695 5.402 5.109 4.847 4.559 4.295 4.073 3.838 3.591 3.389 3.174 2.953 2.788 2.616 2.423 2.217 2.014 1.882 1.752 1.544 1.399 1.245 1.163 0.996 0.821 0.62 0.507 0.188 0.165 0.045 -0.086 -0.401 -0.571 -0.754 -0.951 -1.173 -1.44 -1.779 -2.932 -10 ,14001 ,TETRA ,17377579,Sat Nov 20 18:09:15 CET,Sat Nov 20 20:27:01 CET,0.0 1.705 2.085 2.374 2.671 2.914 3.09 3.243 3.558 3.721 3.859 3.881 4.198 4.309 4.503 4.699 4.888 4.968 5.12 5.264 5.467 5.594 5.714 5.885 6.069 6.248 6.403 6.559 6.76 6.944 7.132 7.353 7.55 7.735 7.94 8.166 8.392 8.64 8.907 9.185 9.455 9.733 10.033 10.325 10.647 10.938 11.221 11.542 11.81 11.904 11.737 11.216 10.666 10.143 9.62 9.117 8.661 8.248 7.881 7.489 7.166 6.899 6.623 6.351 6.102 5.869 5.626 5.403 5.218 5.026 4.815 4.638 4.455 4.25 4.082 3.907 3.73 3.542 3.349 3.224 3.1 2.906 2.761 2.606 2.535 2.402 2.243 2.058 1.957 1.638 1.608 1.486 1.354 1.086 0.963 0.836 0.67 0.462 0.214 -0.059 -0.756 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_5.txt deleted file mode 100644 index 2491a463..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12021 ,TETRA ,17377581,Sat Nov 20 18:10:11 CET,Sat Nov 20 20:29:33 CET,0.0 1.614 2.006 2.28 2.508 2.716 2.9 3.065 3.354 3.481 3.604 3.653 3.962 4.057 4.249 4.435 4.598 4.679 4.843 4.994 5.21 5.347 5.474 5.665 5.844 6.026 6.208 6.363 6.559 6.752 6.942 7.169 7.384 7.608 7.869 8.144 8.399 8.67 8.969 9.292 9.621 9.983 10.401 10.804 11.272 11.796 12.348 12.936 13.62 14.346 15.095 15.45 15.416 15.293 15.105 14.866 14.586 14.281 14.029 13.786 13.559 13.348 13.142 12.94 12.756 12.589 12.411 12.241 12.099 11.948 11.779 11.629 11.464 11.303 11.181 11.015 10.832 10.672 10.502 10.385 10.269 10.088 9.948 9.79 9.714 9.553 9.38 9.192 9.096 8.811 8.762 8.624 8.476 8.156 7.993 7.815 7.619 7.416 7.16 6.843 5.86 -2 ,25865 ,TETRA ,17377583,Sat Nov 20 18:10:12 CET,Sat Nov 20 20:27:18 CET,0.0 0.916 1.265 1.57 1.832 2.041 2.229 2.426 2.776 2.92 3.06 3.113 3.424 3.537 3.758 3.949 4.116 4.201 4.372 4.54 4.786 4.937 5.08 5.275 5.456 5.637 5.803 5.954 6.161 6.374 6.576 6.805 7.052 7.291 7.531 7.799 8.062 8.352 8.674 9.019 9.392 9.807 10.263 10.725 11.197 11.674 12.219 12.841 13.572 14.365 15.167 15.528 15.564 15.453 15.271 15.1 14.932 14.722 14.51 14.282 14.059 13.855 13.654 13.442 13.232 13.054 12.881 12.721 12.581 12.416 12.213 12.035 11.845 11.647 11.497 11.335 11.159 10.97 10.789 10.668 10.54 10.349 10.202 10.044 9.969 9.832 9.685 9.499 9.387 9.077 9.006 8.87 8.733 8.448 8.278 8.116 7.97 7.77 7.47 7.096 6.109 -3 ,18681 ,TETRA ,17377585,Sat Nov 20 18:10:10 CET,Sat Nov 20 20:27:18 CET,0.0 0.986 1.378 1.668 1.871 2.053 2.232 2.39 2.655 2.792 2.927 2.938 3.241 3.337 3.524 3.695 3.856 3.939 4.098 4.242 4.447 4.583 4.716 4.922 5.128 5.316 5.483 5.65 5.859 6.039 6.216 6.453 6.686 6.903 7.155 7.432 7.693 7.988 8.309 8.63 8.947 9.29 9.694 10.103 10.553 11.054 11.656 12.335 13.091 13.854 14.595 14.897 14.868 14.716 14.49 14.253 14.035 13.83 13.641 13.415 13.171 12.935 12.694 12.459 12.244 12.038 11.825 11.625 11.44 11.265 11.074 10.894 10.714 10.53 10.392 10.256 10.104 9.919 9.721 9.597 9.457 9.215 9.064 8.904 8.818 8.654 8.485 8.286 8.176 7.881 7.805 7.633 7.48 7.173 6.995 6.767 6.507 6.236 5.937 5.543 3.683 -4 ,445 ,TETRA ,17377587,Sat Nov 20 18:10:14 CET,Sat Nov 20 20:27:09 CET,0.0 1.356 1.887 2.259 2.562 2.837 3.07 3.247 3.568 3.71 3.838 3.88 4.194 4.301 4.499 4.694 4.894 4.991 5.157 5.31 5.541 5.678 5.811 6.016 6.204 6.383 6.566 6.743 6.962 7.163 7.357 7.597 7.822 8.047 8.31 8.603 8.876 9.17 9.497 9.829 10.186 10.573 10.981 11.372 11.838 12.371 12.963 13.608 14.323 15.051 15.748 16.082 16.104 16.033 15.906 15.728 15.524 15.306 15.104 14.886 14.667 14.454 14.249 14.047 13.857 13.676 13.488 13.299 13.126 12.935 12.739 12.59 12.438 12.267 12.117 11.96 11.802 11.641 11.45 11.315 11.181 10.978 10.841 10.691 10.61 10.436 10.25 10.039 9.928 9.621 9.555 9.421 9.281 8.96 8.787 8.588 8.341 8.078 7.797 7.428 5.935 -5 ,3781 ,TETRA ,17377589,Sat Nov 20 18:10:13 CET,Sat Nov 20 20:27:18 CET,0.0 0.966 1.33 1.605 1.832 2.009 2.173 2.341 2.644 2.767 2.879 2.911 3.232 3.343 3.552 3.754 3.932 4.019 4.199 4.368 4.613 4.772 4.91 5.09 5.268 5.452 5.628 5.794 6.024 6.248 6.444 6.687 6.924 7.137 7.387 7.662 7.931 8.22 8.508 8.825 9.157 9.524 9.945 10.36 10.829 11.355 11.94 12.553 13.234 13.968 14.7 15.068 15.122 15.009 14.799 14.554 14.306 14.07 13.835 13.551 13.289 13.059 12.824 12.583 12.343 12.114 11.895 11.709 11.551 11.379 11.189 11.033 10.867 10.683 10.537 10.387 10.22 10.038 9.857 9.723 9.58 9.374 9.227 9.06 8.981 8.848 8.714 8.565 8.479 8.191 8.183 8.063 7.954 7.712 7.553 7.391 7.231 7.028 6.8 6.474 5.165 -6 ,18932 ,TETRA ,17377591,Sat Nov 20 18:10:10 CET,Sat Nov 20 20:26:34 CET,0.0 1.299 1.702 1.993 2.241 2.448 2.636 2.817 3.126 3.277 3.422 3.465 3.772 3.874 4.086 4.288 4.468 4.559 4.743 4.906 5.128 5.271 5.399 5.603 5.801 5.985 6.168 6.339 6.557 6.756 6.946 7.186 7.413 7.629 7.871 8.142 8.407 8.702 9.021 9.347 9.67 10.035 10.459 10.888 11.367 11.863 12.407 12.998 13.685 14.389 15.088 15.465 15.531 15.473 15.333 15.117 14.898 14.672 14.444 14.225 14.027 13.825 13.627 13.427 13.236 13.063 12.859 12.671 12.506 12.323 12.131 11.966 11.787 11.604 11.46 11.309 11.163 11.004 10.83 10.716 10.603 10.426 10.297 10.15 10.074 9.924 9.757 9.582 9.485 9.183 9.165 9.049 8.932 8.665 8.518 8.367 8.165 7.929 7.67 7.312 5.079 -7 ,30741 ,TETRA ,17377593,Sat Nov 20 18:10:17 CET,Sat Nov 20 20:28:12 CET,0.0 1.172 1.584 1.895 2.153 2.369 2.546 2.688 2.942 3.069 3.202 3.281 3.615 3.74 3.955 4.146 4.328 4.417 4.609 4.795 5.032 5.174 5.309 5.503 5.681 5.857 6.032 6.198 6.41 6.616 6.806 7.048 7.287 7.502 7.764 8.053 8.311 8.598 8.904 9.23 9.574 9.963 10.411 10.846 11.343 11.879 12.491 13.127 13.777 14.476 15.172 15.434 15.364 15.228 15.049 14.792 14.497 14.214 13.991 13.773 13.59 13.415 13.222 13.022 12.82 12.622 12.424 12.255 12.086 11.89 11.669 11.477 11.28 11.072 10.918 10.776 10.618 10.449 10.294 10.181 10.048 9.843 9.705 9.547 9.464 9.282 9.058 8.833 8.712 8.404 8.367 8.231 8.084 7.776 7.61 7.401 7.156 6.89 6.561 6.011 1.247 -8 ,31300 ,TETRA ,17377595,Sat Nov 20 18:10:15 CET,Sat Nov 20 20:27:05 CET,0.0 1.054 1.491 1.808 2.086 2.329 2.534 2.704 3.001 3.142 3.267 3.301 3.6 3.703 3.893 4.075 4.272 4.366 4.539 4.703 4.929 5.081 5.23 5.433 5.625 5.807 5.97 6.13 6.35 6.569 6.783 7.02 7.238 7.441 7.679 7.978 8.272 8.57 8.879 9.211 9.538 9.91 10.345 10.772 11.28 11.821 12.399 13.04 13.745 14.456 15.232 15.663 15.7 15.591 15.423 15.221 14.977 14.71 14.473 14.222 13.989 13.76 13.535 13.324 13.134 12.958 12.745 12.56 12.399 12.212 12.031 11.888 11.733 11.578 11.45 11.305 11.142 10.98 10.814 10.686 10.552 10.362 10.236 10.102 10.027 9.873 9.707 9.523 9.422 9.113 9.057 8.946 8.83 8.527 8.333 8.134 7.919 7.651 7.317 6.819 5.112 -9 ,7210 ,TETRA ,17377597,Sat Nov 20 18:10:13 CET,Sat Nov 20 20:23:13 CET,0.0 1.484 1.898 2.21 2.447 2.652 2.85 3.019 3.315 3.455 3.574 3.594 3.898 4.003 4.208 4.397 4.573 4.663 4.832 4.995 5.229 5.382 5.535 5.742 5.94 6.133 6.322 6.503 6.74 6.954 7.153 7.397 7.632 7.863 8.12 8.406 8.681 8.976 9.286 9.595 9.914 10.276 10.695 11.098 11.547 12.045 12.598 13.196 13.842 14.472 15.075 15.371 15.327 15.154 14.92 14.634 14.343 14.054 13.804 13.555 13.33 13.125 12.934 12.746 12.544 12.359 12.16 11.975 11.809 11.591 11.375 11.223 11.063 10.874 10.709 10.558 10.408 10.248 10.08 9.962 9.84 9.649 9.513 9.372 9.293 9.125 8.954 8.765 8.663 8.367 8.318 8.175 8.04 7.808 7.68 7.514 7.349 7.164 6.912 6.481 4.022 -10 ,4593 ,TETRA ,17377599,Sat Nov 20 18:11:08 CET,Sat Nov 20 20:28:06 CET,0.0 1.286 1.676 1.926 2.14 2.36 2.555 2.716 3.042 3.207 3.357 3.448 3.778 3.891 4.088 4.284 4.46 4.545 4.718 4.891 5.131 5.277 5.418 5.61 5.784 5.962 6.144 6.316 6.535 6.74 6.93 7.16 7.371 7.574 7.818 8.088 8.341 8.627 8.943 9.272 9.603 9.96 10.378 10.801 11.304 11.831 12.375 12.968 13.603 14.225 14.809 15.047 15.008 14.905 14.756 14.531 14.289 14.032 13.781 13.544 13.329 13.114 12.917 12.718 12.512 12.326 12.13 11.946 11.769 11.573 11.365 11.183 10.993 10.797 10.65 10.51 10.37 10.214 10.034 9.912 9.791 9.578 9.418 9.254 9.163 8.982 8.794 8.571 8.448 8.149 8.092 7.961 7.825 7.524 7.369 7.191 6.945 6.675 6.386 5.881 3.854 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1c_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1c_5.txt deleted file mode 100644 index c097fbb1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1c_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10578 ,TETRA ,17377601,Sat Nov 20 18:11:09 CET,Sat Nov 20 20:16:52 CET,0.0 0.764 1.131 1.421 1.654 1.867 2.07 2.27 2.624 2.786 2.93 2.965 3.272 3.378 3.574 3.746 3.923 4.015 4.191 4.354 4.573 4.725 4.878 5.074 5.268 5.465 5.66 5.855 6.103 6.326 6.546 6.8 7.035 7.271 7.531 7.814 8.082 8.379 8.696 9.017 9.356 9.722 10.133 10.554 11.055 11.586 12.201 12.896 13.671 14.502 15.284 15.696 15.731 15.608 15.447 15.269 15.054 14.822 14.579 14.313 14.088 13.896 13.713 13.53 13.334 13.131 12.927 12.752 12.589 12.408 12.232 12.097 11.946 11.773 11.635 11.491 11.344 11.189 11.038 10.933 10.821 10.625 10.474 10.32 10.238 10.062 9.884 9.718 9.629 9.342 9.305 9.176 9.048 8.772 8.601 8.416 8.198 7.954 7.631 7.159 5.331 -2 ,1399 ,TETRA ,17377603,Sat Nov 20 18:11:09 CET,Sat Nov 20 20:24:48 CET,0.0 0.879 1.295 1.627 1.905 2.144 2.35 2.529 2.842 2.992 3.137 3.186 3.509 3.623 3.851 4.068 4.257 4.347 4.531 4.719 4.975 5.133 5.28 5.484 5.689 5.906 6.101 6.279 6.503 6.714 6.925 7.179 7.428 7.666 7.932 8.228 8.514 8.827 9.168 9.515 9.857 10.247 10.696 11.117 11.596 12.158 12.786 13.466 14.271 15.199 16.157 16.654 16.761 16.753 16.647 16.443 16.213 16.004 15.798 15.538 15.308 15.105 14.87 14.633 14.425 14.245 14.068 13.885 13.694 13.472 13.221 13.029 12.839 12.634 12.472 12.29 12.104 11.92 11.729 11.584 11.432 11.214 11.061 10.9 10.819 10.646 10.454 10.257 10.159 9.852 9.765 9.604 9.434 9.07 8.842 8.599 8.332 8.023 7.616 6.998 1.861 -3 ,25012 ,TETRA ,17377605,Sat Nov 20 18:12:12 CET,Sat Nov 20 20:30:58 CET,0.0 1.131 1.555 1.864 2.128 2.332 2.505 2.689 3.05 3.2 3.333 3.392 3.699 3.804 4.005 4.205 4.405 4.498 4.677 4.852 5.074 5.201 5.341 5.539 5.719 5.901 6.081 6.255 6.47 6.672 6.882 7.137 7.375 7.606 7.881 8.194 8.502 8.849 9.205 9.571 9.946 10.371 10.834 11.277 11.819 12.401 13.04 13.71 14.429 15.293 16.24 16.733 16.761 16.655 16.547 16.356 16.167 15.98 15.791 15.582 15.373 15.162 14.934 14.717 14.518 14.344 14.151 13.948 13.768 13.591 13.407 13.232 13.05 12.867 12.72 12.585 12.453 12.296 12.11 11.981 11.861 11.67 11.545 11.415 11.344 11.196 11.02 10.838 10.759 10.482 10.464 10.35 10.226 9.932 9.757 9.58 9.38 9.132 8.785 8.332 5.531 -4 ,17109 ,TETRA ,17377607,Sat Nov 20 18:12:11 CET,Sat Nov 20 20:25:30 CET,0.0 1.048 1.475 1.81 2.077 2.288 2.471 2.657 2.981 3.121 3.268 3.324 3.649 3.766 3.997 4.206 4.384 4.478 4.661 4.815 5.031 5.164 5.3 5.512 5.714 5.917 6.122 6.315 6.549 6.766 6.984 7.242 7.478 7.706 7.968 8.26 8.539 8.842 9.175 9.542 9.908 10.298 10.756 11.21 11.71 12.247 12.885 13.614 14.47 15.436 16.433 16.996 17.124 17.099 16.988 16.82 16.641 16.427 16.209 15.97 15.735 15.515 15.308 15.118 14.933 14.754 14.569 14.394 14.212 14.013 13.826 13.665 13.485 13.309 13.177 13.036 12.884 12.732 12.578 12.47 12.33 12.104 11.96 11.801 11.714 11.525 11.316 11.093 10.977 10.661 10.592 10.465 10.325 9.956 9.74 9.542 9.314 9.016 8.624 8.138 6.531 -5 ,32658 ,TETRA ,17377608,Sat Nov 20 18:13:06 CET,Sat Nov 20 20:26:20 CET,0.0 1.975 2.358 2.627 2.864 3.069 3.256 3.426 3.749 3.901 4.038 4.09 4.405 4.525 4.756 4.973 5.169 5.258 5.431 5.598 5.825 5.974 6.123 6.323 6.499 6.667 6.85 7.035 7.259 7.469 7.667 7.902 8.132 8.354 8.607 8.876 9.126 9.421 9.738 10.058 10.386 10.741 11.159 11.585 12.088 12.621 13.18 13.818 14.529 15.262 16.037 16.5 16.582 16.576 16.499 16.311 16.069 15.796 15.566 15.359 15.172 14.976 14.784 14.581 14.379 14.2 14.012 13.835 13.677 13.512 13.332 13.178 13.021 12.86 12.718 12.563 12.409 12.228 12.039 11.909 11.771 11.57 11.421 11.249 11.159 10.974 10.765 10.522 10.399 10.095 10.051 9.905 9.741 9.43 9.251 9.023 8.763 8.476 8.127 7.63 5.576 -6 ,847 ,TETRA ,17377610,Sat Nov 20 18:13:08 CET,Sat Nov 20 20:29:52 CET,0.0 1.267 1.68 1.954 2.172 2.385 2.57 2.743 3.062 3.196 3.321 3.367 3.683 3.798 4.028 4.239 4.43 4.517 4.673 4.831 5.064 5.218 5.374 5.596 5.809 6.007 6.196 6.372 6.598 6.823 7.023 7.258 7.486 7.726 8.013 8.301 8.558 8.844 9.172 9.518 9.844 10.217 10.654 11.101 11.639 12.198 12.832 13.535 14.307 15.154 16.063 16.608 16.805 16.823 16.673 16.462 16.229 15.994 15.77 15.518 15.31 15.134 14.953 14.773 14.596 14.43 14.247 14.061 13.886 13.708 13.53 13.385 13.229 13.045 12.898 12.755 12.604 12.441 12.257 12.13 12.0 11.816 11.696 11.562 11.487 11.327 11.168 10.996 10.901 10.621 10.63 10.528 10.404 10.125 9.976 9.816 9.635 9.423 9.19 8.884 7.602 -7 ,12412 ,TETRA ,17377612,Sat Nov 20 18:14:07 CET,Sat Nov 20 20:28:20 CET,0.0 0.932 1.269 1.527 1.736 1.927 2.096 2.251 2.534 2.662 2.785 2.824 3.138 3.245 3.452 3.656 3.848 3.945 4.141 4.316 4.559 4.714 4.87 5.088 5.287 5.481 5.667 5.844 6.068 6.275 6.47 6.726 6.977 7.209 7.476 7.76 8.042 8.354 8.67 9.008 9.38 9.799 10.27 10.733 11.231 11.781 12.416 13.109 13.864 14.695 15.588 16.086 16.19 16.075 15.905 15.699 15.468 15.198 14.934 14.665 14.409 14.172 13.96 13.767 13.561 13.354 13.137 12.944 12.77 12.587 12.403 12.232 12.042 11.859 11.712 11.545 11.354 11.157 10.98 10.86 10.721 10.484 10.324 10.152 10.059 9.881 9.696 9.492 9.37 9.058 9.033 8.923 8.797 8.476 8.294 8.086 7.833 7.55 7.191 6.72 4.932 -8 ,20585 ,TETRA ,17377614,Sat Nov 20 18:15:11 CET,Sat Nov 20 20:34:12 CET,0.0 0.979 1.316 1.579 1.841 2.064 2.261 2.445 2.777 2.921 3.056 3.123 3.443 3.554 3.758 3.964 4.155 4.239 4.416 4.595 4.826 4.974 5.126 5.343 5.544 5.744 5.94 6.124 6.345 6.559 6.769 7.008 7.236 7.458 7.725 8.023 8.296 8.589 8.896 9.222 9.563 9.973 10.466 10.951 11.485 12.05 12.687 13.387 14.156 15.004 15.891 16.398 16.559 16.532 16.398 16.219 16.045 15.862 15.669 15.436 15.226 15.022 14.822 14.64 14.45 14.263 14.068 13.899 13.757 13.61 13.467 13.335 13.168 13.001 12.885 12.755 12.607 12.449 12.282 12.172 12.071 11.904 11.776 11.637 11.561 11.411 11.236 11.05 10.958 10.677 10.651 10.538 10.412 10.109 9.936 9.737 9.548 9.355 9.117 8.776 7.094 -9 ,2152 ,TETRA ,17377616,Sat Nov 20 18:15:13 CET,Sat Nov 20 20:25:03 CET,0.0 1.402 1.885 2.17 2.424 2.648 2.857 3.051 3.39 3.538 3.669 3.719 4.062 4.195 4.453 4.675 4.876 4.973 5.158 5.337 5.608 5.768 5.922 6.141 6.334 6.532 6.723 6.903 7.158 7.393 7.599 7.86 8.122 8.376 8.667 8.998 9.294 9.606 9.974 10.357 10.738 11.176 11.69 12.19 12.741 13.348 14.027 14.74 15.511 16.344 17.299 17.946 18.103 17.953 17.705 17.455 17.184 16.902 16.645 16.391 16.169 15.925 15.66 15.401 15.157 14.946 14.721 14.508 14.314 14.115 13.888 13.684 13.482 13.271 13.112 12.955 12.794 12.613 12.414 12.285 12.154 11.943 11.769 11.573 11.478 11.285 11.081 10.842 10.725 10.413 10.334 10.206 10.073 9.745 9.551 9.326 9.059 8.755 8.401 7.851 4.663 -10 ,5469 ,TETRA ,17377618,Sat Nov 20 18:16:21 CET,Sat Nov 20 20:37:26 CET,0.0 1.445 1.793 2.08 2.351 2.598 2.81 2.997 3.323 3.464 3.598 3.666 3.991 4.1 4.329 4.549 4.753 4.858 5.064 5.245 5.51 5.676 5.832 6.064 6.296 6.511 6.699 6.88 7.115 7.337 7.55 7.805 8.054 8.304 8.603 8.934 9.236 9.569 9.929 10.302 10.682 11.128 11.658 12.178 12.787 13.445 14.178 14.969 15.833 16.821 17.952 18.672 18.902 18.91 18.779 18.577 18.36 18.141 17.909 17.671 17.47 17.271 17.06 16.842 16.639 16.44 16.21 16.018 15.849 15.674 15.48 15.305 15.124 14.937 14.793 14.644 14.498 14.345 14.163 14.032 13.895 13.688 13.559 13.425 13.35 13.166 12.972 12.768 12.657 12.345 12.276 12.145 12.022 11.732 11.533 11.328 11.127 10.887 10.541 10.0 7.705 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1d_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1d_5.txt deleted file mode 100644 index cc43e3c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_1d_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26546 ,TETRA ,17377620,Sat Nov 20 18:16:19 CET,Sat Nov 20 20:33:42 CET,0.0 0.943 1.333 1.652 1.909 2.154 2.378 2.576 2.904 3.032 3.155 3.191 3.523 3.639 3.849 4.047 4.237 4.333 4.525 4.704 4.963 5.13 5.286 5.485 5.658 5.83 6.01 6.192 6.423 6.648 6.865 7.122 7.377 7.616 7.894 8.207 8.492 8.796 9.133 9.506 9.909 10.363 10.881 11.383 11.959 12.601 13.365 14.207 15.09 16.094 17.209 17.846 18.036 18.036 17.935 17.765 17.591 17.409 17.21 16.94 16.685 16.47 16.264 16.059 15.837 15.636 15.407 15.186 15.011 14.838 14.646 14.478 14.3 14.106 13.959 13.795 13.625 13.458 13.263 13.131 13.002 12.811 12.679 12.55 12.494 12.35 12.177 11.997 11.907 11.616 11.57 11.456 11.333 11.013 10.848 10.67 10.445 10.192 9.929 9.61 1.682 -2 ,26414 ,TETRA ,17377622,Sat Nov 20 18:16:20 CET,Sat Nov 20 20:31:24 CET,0.0 1.283 1.737 2.029 2.289 2.527 2.716 2.883 3.188 3.334 3.475 3.537 3.841 3.949 4.169 4.375 4.561 4.652 4.838 5.008 5.244 5.393 5.549 5.776 5.983 6.184 6.373 6.546 6.77 6.996 7.203 7.458 7.706 7.944 8.226 8.55 8.857 9.168 9.493 9.859 10.241 10.659 11.143 11.635 12.179 12.767 13.474 14.254 15.126 16.124 17.261 17.975 18.261 18.346 18.327 18.215 18.051 17.857 17.666 17.463 17.276 17.121 16.951 16.781 16.612 16.439 16.248 16.088 15.962 15.829 15.7 15.593 15.468 15.311 15.184 15.062 14.941 14.811 14.662 14.552 14.441 14.258 14.119 13.948 13.843 13.625 13.407 13.184 13.085 12.796 12.75 12.629 12.499 12.16 11.976 11.807 11.624 11.419 11.166 10.809 6.641 -3 ,10443 ,TETRA ,17377624,Sat Nov 20 18:16:23 CET,Sat Nov 20 20:33:39 CET,0.0 1.095 1.46 1.765 2.029 2.275 2.486 2.661 3.004 3.158 3.28 3.319 3.648 3.763 4.003 4.239 4.446 4.544 4.739 4.919 5.167 5.327 5.486 5.72 5.93 6.116 6.299 6.479 6.701 6.924 7.139 7.385 7.623 7.865 8.139 8.422 8.688 8.998 9.336 9.677 10.047 10.471 10.952 11.422 11.957 12.537 13.19 13.945 14.798 15.738 16.748 17.434 17.774 17.878 17.802 17.667 17.518 17.354 17.181 16.982 16.808 16.637 16.46 16.271 16.093 15.925 15.733 15.563 15.398 15.224 15.052 14.903 14.737 14.564 14.419 14.259 14.102 13.958 13.808 13.677 13.531 13.292 13.115 12.939 12.857 12.697 12.513 12.306 12.204 11.91 11.866 11.734 11.6 11.314 11.163 10.984 10.74 10.426 10.033 9.525 6.622 -4 ,4726 ,TETRA ,17377626,Sat Nov 20 18:22:35 CET,Sat Nov 20 20:34:55 CET,0.0 1.251 1.668 1.952 2.198 2.426 2.604 2.768 3.071 3.209 3.338 3.391 3.695 3.787 3.985 4.181 4.369 4.461 4.638 4.806 5.056 5.218 5.374 5.603 5.8 5.985 6.175 6.355 6.576 6.791 7.002 7.236 7.462 7.685 7.952 8.261 8.542 8.845 9.18 9.535 9.91 10.335 10.819 11.289 11.819 12.389 13.054 13.787 14.67 15.694 16.727 17.493 17.807 17.851 17.795 17.689 17.529 17.37 17.201 16.981 16.769 16.567 16.382 16.216 16.049 15.885 15.707 15.551 15.421 15.27 15.095 14.94 14.781 14.604 14.464 14.313 14.159 14.022 13.877 13.767 13.644 13.459 13.323 13.159 13.076 12.926 12.775 12.596 12.49 12.185 12.129 12.002 11.866 11.574 11.42 11.243 10.995 10.721 10.432 9.993 7.504 -5 ,7813 ,TETRA ,17377628,Sat Nov 20 18:25:33 CET,Sat Nov 20 20:24:14 CET,0.0 1.464 1.899 2.228 2.498 2.734 2.952 3.146 3.479 3.623 3.759 3.838 4.17 4.286 4.503 4.7 4.896 4.994 5.169 5.327 5.555 5.705 5.845 6.057 6.273 6.474 6.668 6.849 7.073 7.284 7.5 7.779 8.032 8.258 8.527 8.828 9.112 9.443 9.803 10.189 10.589 11.003 11.498 11.975 12.506 13.113 13.845 14.717 15.687 16.764 17.949 18.756 19.079 19.108 18.991 18.825 18.607 18.353 18.144 17.892 17.634 17.412 17.199 16.992 16.798 16.591 16.353 16.159 16.0 15.837 15.663 15.513 15.354 15.173 15.01 14.834 14.656 14.49 14.325 14.215 14.098 13.924 13.804 13.658 13.584 13.438 13.296 13.135 13.04 12.754 12.723 12.598 12.457 12.112 11.921 11.724 11.491 11.19 10.839 10.405 8.4 -6 ,12478 ,TETRA ,17377630,Sat Nov 20 18:25:32 CET,Sat Nov 20 20:42:21 CET,0.0 1.154 1.56 1.893 2.182 2.431 2.626 2.806 3.134 3.289 3.428 3.479 3.817 3.934 4.162 4.37 4.568 4.669 4.869 5.049 5.299 5.458 5.614 5.825 6.015 6.212 6.406 6.614 6.892 7.127 7.354 7.628 7.893 8.145 8.427 8.754 9.078 9.454 9.839 10.236 10.636 11.055 11.548 12.052 12.636 13.279 13.995 14.748 15.641 16.646 17.741 18.475 18.717 18.746 18.65 18.508 18.302 18.091 17.923 17.73 17.521 17.331 17.153 16.969 16.806 16.66 16.497 16.333 16.179 16.032 15.872 15.724 15.572 15.394 15.25 15.112 14.962 14.79 14.614 14.496 14.371 14.186 14.063 13.917 13.83 13.654 13.482 13.298 13.197 12.897 12.873 12.755 12.615 12.29 12.133 11.932 11.671 11.371 11.002 10.413 8.289 -7 ,23523 ,TETRA ,17377632,Sat Nov 20 18:25:33 CET,Sat Nov 20 20:43:24 CET,0.0 1.405 1.863 2.192 2.455 2.727 2.937 3.104 3.461 3.616 3.746 3.802 4.132 4.25 4.47 4.671 4.873 4.971 5.17 5.353 5.592 5.749 5.916 6.162 6.392 6.602 6.792 6.977 7.204 7.425 7.653 7.91 8.14 8.357 8.613 8.891 9.155 9.459 9.785 10.15 10.554 10.992 11.478 11.94 12.497 13.147 13.862 14.635 15.486 16.439 17.468 18.136 18.395 18.449 18.416 18.319 18.161 17.988 17.801 17.589 17.394 17.182 16.947 16.728 16.553 16.385 16.192 16.025 15.874 15.711 15.546 15.404 15.249 15.078 14.937 14.784 14.635 14.498 14.356 14.246 14.117 13.913 13.764 13.613 13.532 13.357 13.177 12.996 12.894 12.574 12.51 12.358 12.173 11.773 11.561 11.36 11.162 10.902 10.56 10.092 7.567 -8 ,23976 ,TETRA ,17377634,Sat Nov 20 18:25:34 CET,Sat Nov 20 20:42:32 CET,0.0 1.263 1.644 1.946 2.207 2.397 2.576 2.761 3.117 3.277 3.412 3.48 3.803 3.918 4.127 4.341 4.543 4.629 4.803 4.973 5.217 5.363 5.511 5.729 5.932 6.124 6.307 6.493 6.737 6.966 7.181 7.443 7.689 7.923 8.19 8.474 8.73 9.018 9.353 9.723 10.107 10.527 11.017 11.491 12.046 12.706 13.451 14.237 15.094 16.025 16.993 17.674 18.0 18.087 18.03 17.918 17.76 17.575 17.394 17.19 16.981 16.776 16.591 16.434 16.262 16.081 15.893 15.705 15.543 15.381 15.198 15.039 14.871 14.698 14.574 14.445 14.294 14.142 13.989 13.88 13.756 13.563 13.424 13.256 13.169 13.008 12.841 12.626 12.509 12.206 12.165 12.039 11.89 11.545 11.354 11.171 10.991 10.806 10.576 10.19 7.735 -9 ,12403 ,TETRA ,17377636,Sat Nov 20 18:25:34 CET,Sat Nov 20 20:20:45 CET,0.0 1.538 1.974 2.303 2.572 2.809 3.034 3.218 3.554 3.712 3.857 3.894 4.216 4.333 4.543 4.732 4.916 5.007 5.185 5.358 5.612 5.772 5.91 6.113 6.336 6.54 6.726 6.905 7.141 7.38 7.6 7.848 8.088 8.333 8.631 8.944 9.244 9.573 9.904 10.254 10.637 11.073 11.568 12.061 12.624 13.221 13.937 14.777 15.741 16.819 17.959 18.649 18.887 18.935 18.877 18.777 18.617 18.416 18.205 17.982 17.796 17.626 17.448 17.28 17.101 16.922 16.734 16.567 16.413 16.235 16.048 15.886 15.709 15.53 15.393 15.242 15.088 14.938 14.78 14.659 14.525 14.291 14.114 13.928 13.844 13.691 13.511 13.299 13.193 12.906 12.88 12.747 12.607 12.295 12.114 11.89 11.625 11.339 10.993 10.48 7.855 -10 ,24552 ,TETRA ,17377638,Sat Nov 20 21:07:57 CET,Sat Nov 20 23:20:38 CET,0.0 1.222 1.566 1.864 2.103 2.305 2.535 2.727 3.027 3.175 3.316 3.37 3.696 3.816 4.035 4.23 4.411 4.498 4.667 4.835 5.085 5.242 5.384 5.594 5.801 6.013 6.217 6.413 6.649 6.857 7.062 7.301 7.532 7.779 8.074 8.395 8.694 9.011 9.336 9.687 10.058 10.456 10.916 11.393 11.986 12.673 13.414 14.195 15.048 15.937 16.903 17.622 17.901 17.941 17.915 17.807 17.67 17.514 17.33 17.123 16.908 16.714 16.547 16.382 16.216 16.055 15.866 15.693 15.542 15.383 15.206 15.043 14.888 14.73 14.587 14.438 14.302 14.161 13.995 13.877 13.76 13.58 13.462 13.339 13.269 13.106 12.938 12.738 12.62 12.316 12.247 12.111 11.968 11.658 11.491 11.287 11.064 10.802 10.45 10.036 7.995 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_3a_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_3a_5.txt deleted file mode 100644 index 39dfb38a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_3a_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16518 ,TETRA ,17377640,Sat Nov 20 21:07:57 CET,Sat Nov 20 23:24:56 CET,0.0 0.626 0.936 1.143 1.359 1.564 1.739 1.881 2.144 2.279 2.396 2.414 2.716 2.811 2.989 3.176 3.35 3.43 3.575 3.717 3.923 4.048 4.174 4.36 4.549 4.737 4.906 5.066 5.28 5.473 5.656 5.892 6.122 6.329 6.565 6.838 7.089 7.364 7.642 7.944 8.278 8.623 8.993 9.377 9.836 10.315 10.847 11.417 12.029 12.597 13.123 13.449 13.464 13.292 13.098 12.852 12.551 12.235 11.956 11.658 11.371 11.137 10.928 10.73 10.528 10.323 10.098 9.902 9.744 9.563 9.368 9.195 8.997 8.811 8.667 8.514 8.343 8.166 7.983 7.854 7.733 7.52 7.361 7.21 7.127 6.958 6.776 6.58 6.491 6.204 6.151 6.034 5.921 5.684 5.525 5.342 5.163 4.935 4.639 4.213 2.304 -2 ,11673 ,TETRA ,17377642,Sat Nov 20 21:07:57 CET,Sat Nov 20 23:23:37 CET,0.0 0.941 1.236 1.465 1.673 1.834 1.979 2.124 2.362 2.466 2.575 2.585 2.886 2.988 3.18 3.35 3.506 3.581 3.721 3.854 4.061 4.195 4.323 4.495 4.656 4.815 4.963 5.109 5.309 5.498 5.673 5.899 6.112 6.306 6.54 6.801 7.043 7.299 7.561 7.845 8.151 8.483 8.869 9.262 9.739 10.258 10.827 11.46 12.176 12.931 13.692 14.117 14.114 13.947 13.744 13.522 13.309 13.093 12.885 12.627 12.372 12.171 11.976 11.775 11.577 11.38 11.167 11.006 10.867 10.692 10.521 10.361 10.181 10.002 9.859 9.703 9.556 9.424 9.279 9.181 9.072 8.881 8.745 8.591 8.513 8.351 8.186 8.004 7.892 7.585 7.553 7.437 7.307 7.04 6.902 6.748 6.553 6.306 5.967 5.515 3.851 -3 ,3689 ,TETRA ,17377643,Sat Nov 20 21:07:57 CET,Sat Nov 20 23:08:15 CET,0.0 0.692 0.915 1.124 1.327 1.511 1.666 1.802 2.052 2.164 2.271 2.268 2.56 2.662 2.837 3.01 3.17 3.248 3.415 3.573 3.78 3.906 4.026 4.193 4.344 4.497 4.666 4.824 5.022 5.221 5.407 5.614 5.8 5.981 6.199 6.451 6.701 6.963 7.255 7.568 7.87 8.202 8.577 8.974 9.444 9.942 10.497 11.098 11.753 12.439 13.144 13.549 13.635 13.56 13.37 13.134 12.872 12.622 12.397 12.102 11.808 11.545 11.277 11.017 10.793 10.586 10.358 10.147 9.971 9.788 9.577 9.398 9.209 9.018 8.877 8.716 8.542 8.361 8.164 8.015 7.863 7.627 7.464 7.303 7.214 7.033 6.849 6.629 6.497 6.187 6.139 6.006 5.877 5.595 5.427 5.228 4.995 4.721 4.405 4.011 2.289 -4 ,21887 ,TETRA ,17377645,Sat Nov 20 21:07:57 CET,Sat Nov 20 23:12:02 CET,0.0 0.681 0.954 1.158 1.336 1.495 1.657 1.81 2.04 2.153 2.267 2.265 2.542 2.63 2.807 2.973 3.142 3.215 3.349 3.484 3.683 3.821 3.944 4.125 4.308 4.473 4.634 4.795 4.992 5.192 5.379 5.596 5.808 6.011 6.266 6.541 6.782 7.03 7.287 7.57 7.891 8.258 8.659 9.059 9.519 10.031 10.603 11.188 11.828 12.556 13.19 13.45 13.39 13.203 12.986 12.739 12.518 12.3 12.079 11.848 11.659 11.485 11.268 11.054 10.867 10.682 10.497 10.328 10.163 9.999 9.835 9.693 9.539 9.379 9.252 9.11 8.956 8.78 8.603 8.496 8.375 8.17 8.028 7.858 7.769 7.563 7.35 7.165 7.068 6.778 6.757 6.659 6.553 6.294 6.133 5.958 5.764 5.531 5.273 4.923 3.083 -5 ,22128 ,TETRA ,17377647,Sat Nov 20 21:07:57 CET,Sat Nov 20 23:07:21 CET,0.0 0.765 1.042 1.239 1.41 1.582 1.716 1.839 2.076 2.196 2.304 2.303 2.601 2.694 2.867 3.033 3.193 3.27 3.414 3.553 3.749 3.865 3.966 4.132 4.315 4.484 4.655 4.82 5.003 5.197 5.398 5.621 5.827 6.029 6.259 6.522 6.772 7.035 7.331 7.646 7.956 8.32 8.75 9.162 9.618 10.13 10.728 11.351 12.023 12.72 13.445 13.873 13.929 13.837 13.681 13.436 13.155 12.899 12.638 12.38 12.136 11.907 11.715 11.512 11.315 11.134 10.924 10.737 10.586 10.431 10.271 10.137 9.989 9.815 9.669 9.517 9.371 9.228 9.065 8.952 8.835 8.65 8.517 8.372 8.293 8.117 7.948 7.767 7.669 7.373 7.337 7.222 7.099 6.818 6.668 6.5 6.269 6.018 5.73 5.358 3.91 -6 ,626 ,TETRA ,17377649,Sat Nov 20 21:08:00 CET,Sat Nov 20 23:21:25 CET,0.0 0.723 1.037 1.251 1.422 1.576 1.73 1.875 2.12 2.24 2.359 2.391 2.682 2.771 2.934 3.097 3.251 3.323 3.463 3.609 3.832 3.97 4.105 4.304 4.478 4.64 4.802 4.961 5.17 5.366 5.533 5.744 5.973 6.176 6.403 6.662 6.899 7.151 7.415 7.706 8.026 8.38 8.797 9.218 9.703 10.223 10.774 11.373 12.075 12.824 13.482 13.79 13.792 13.647 13.389 13.083 12.792 12.495 12.239 11.989 11.767 11.555 11.338 11.127 10.919 10.721 10.515 10.324 10.156 9.969 9.761 9.583 9.387 9.177 9.009 8.832 8.633 8.432 8.229 8.089 7.94 7.696 7.532 7.352 7.247 7.03 6.799 6.538 6.397 6.076 5.992 5.85 5.702 5.344 5.145 4.931 4.695 4.446 4.159 3.774 2.453 -7 ,28215 ,TETRA ,17377651,Sat Nov 20 21:07:58 CET,Sat Nov 20 23:23:18 CET,0.0 0.958 1.271 1.462 1.69 1.899 2.069 2.222 2.478 2.604 2.715 2.737 3.036 3.13 3.3 3.46 3.614 3.686 3.821 3.95 4.149 4.288 4.417 4.587 4.747 4.891 5.047 5.217 5.426 5.605 5.78 5.991 6.185 6.37 6.568 6.802 7.048 7.32 7.608 7.903 8.221 8.582 8.989 9.391 9.852 10.347 10.924 11.54 12.233 13.004 13.654 13.931 13.937 13.846 13.667 13.449 13.25 13.037 12.831 12.565 12.319 12.122 11.927 11.742 11.553 11.388 11.219 11.059 10.909 10.736 10.542 10.374 10.216 10.054 9.932 9.822 9.689 9.531 9.369 9.269 9.17 9.003 8.883 8.753 8.681 8.539 8.407 8.252 8.172 7.906 7.929 7.842 7.742 7.516 7.397 7.279 7.138 6.953 6.715 6.423 4.826 -8 ,2070 ,TETRA ,17377654,Sat Nov 20 21:08:01 CET,Sat Nov 20 23:21:49 CET,0.0 0.468 0.749 0.984 1.206 1.386 1.523 1.658 1.946 2.068 2.17 2.198 2.486 2.57 2.735 2.902 3.063 3.139 3.274 3.4 3.59 3.709 3.825 3.998 4.171 4.346 4.505 4.647 4.831 5.009 5.18 5.38 5.575 5.767 5.999 6.268 6.496 6.745 7.031 7.324 7.622 7.937 8.318 8.734 9.213 9.72 10.313 10.966 11.664 12.432 13.14 13.373 13.283 13.092 12.86 12.601 12.352 12.062 11.778 11.51 11.285 11.086 10.86 10.629 10.414 10.2 9.983 9.786 9.615 9.427 9.205 9.032 8.865 8.693 8.559 8.436 8.317 8.174 8.018 7.908 7.785 7.588 7.44 7.28 7.198 7.025 6.862 6.687 6.597 6.312 6.286 6.172 6.048 5.794 5.652 5.476 5.301 5.123 4.862 4.514 3.304 -9 ,7783 ,TETRA ,17377656,Sat Nov 20 21:07:59 CET,Sat Nov 20 23:10:25 CET,0.0 0.859 1.182 1.447 1.649 1.793 1.922 2.052 2.279 2.385 2.493 2.486 2.766 2.871 3.08 3.259 3.42 3.499 3.65 3.793 3.991 4.116 4.243 4.426 4.596 4.764 4.924 5.075 5.276 5.473 5.662 5.894 6.123 6.335 6.571 6.82 7.06 7.347 7.665 7.99 8.307 8.662 9.093 9.503 9.947 10.413 10.928 11.535 12.225 12.957 13.708 14.11 14.174 14.106 13.994 13.843 13.647 13.402 13.165 12.903 12.679 12.486 12.295 12.119 11.943 11.752 11.532 11.345 11.177 10.996 10.809 10.635 10.447 10.257 10.099 9.94 9.777 9.6 9.418 9.289 9.169 8.992 8.856 8.7 8.618 8.449 8.268 8.088 7.994 7.706 7.702 7.595 7.488 7.246 7.091 6.908 6.702 6.488 6.196 5.757 3.922 -10 ,28959 ,TETRA ,17377658,Sat Nov 20 21:08:00 CET,Sat Nov 20 23:24:15 CET,0.0 0.609 0.843 1.057 1.283 1.495 1.69 1.865 2.141 2.254 2.359 2.362 2.653 2.755 2.954 3.123 3.291 3.372 3.518 3.662 3.868 3.997 4.124 4.323 4.527 4.728 4.909 5.072 5.281 5.472 5.652 5.881 6.102 6.303 6.542 6.819 7.066 7.333 7.651 7.995 8.336 8.71 9.162 9.602 10.086 10.629 11.234 11.845 12.523 13.24 13.843 13.971 13.79 13.496 13.151 12.794 12.472 12.162 11.868 11.571 11.289 11.034 10.809 10.578 10.328 10.097 9.868 9.649 9.456 9.255 9.041 8.873 8.686 8.482 8.321 8.135 7.941 7.76 7.576 7.44 7.3 7.062 6.881 6.694 6.599 6.389 6.162 5.946 5.823 5.495 5.422 5.284 5.132 4.783 4.617 4.4 4.143 3.886 3.555 3.139 1.814 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt deleted file mode 100644 index 56f9f4c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10372 ,TETRA ,17377660,Sat Nov 20 21:08:00 CET,Sat Nov 20 23:09:57 CET,0.0 0.811 1.059 1.277 1.453 1.603 1.768 1.923 2.197 2.327 2.45 2.505 2.812 2.912 3.104 3.275 3.442 3.516 3.662 3.819 4.033 4.156 4.269 4.46 4.658 4.831 4.996 5.168 5.369 5.568 5.759 5.98 6.198 6.419 6.677 6.955 7.212 7.49 7.804 8.133 8.459 8.816 9.241 9.657 10.11 10.599 11.125 11.694 12.339 12.986 13.552 13.762 13.642 13.404 13.118 12.735 12.38 12.064 11.744 11.426 11.114 10.807 10.535 10.27 10.018 9.784 9.506 9.283 9.118 8.921 8.705 8.509 8.292 8.08 7.925 7.766 7.6 7.43 7.252 7.135 7.018 6.818 6.67 6.519 6.436 6.245 6.045 5.842 5.734 5.43 5.39 5.265 5.131 4.796 4.613 4.434 4.258 4.06 3.791 3.432 2.033 -2 ,19159 ,TETRA ,17377662,Sat Nov 20 21:08:02 CET,Sat Nov 20 23:23:48 CET,0.0 1.163 1.492 1.731 1.945 2.125 2.272 2.41 2.674 2.782 2.879 2.873 3.169 3.261 3.438 3.601 3.754 3.829 3.975 4.126 4.324 4.451 4.583 4.76 4.921 5.088 5.273 5.445 5.633 5.8 5.959 6.162 6.369 6.576 6.802 7.059 7.307 7.578 7.881 8.187 8.503 8.864 9.278 9.686 10.159 10.664 11.19 11.739 12.358 12.989 13.526 13.655 13.522 13.318 13.082 12.776 12.479 12.215 11.97 11.663 11.357 11.096 10.85 10.603 10.356 10.125 9.892 9.675 9.475 9.261 9.032 8.856 8.684 8.5 8.348 8.175 7.994 7.819 7.63 7.488 7.342 7.136 7.003 6.863 6.787 6.61 6.402 6.187 6.078 5.771 5.732 5.615 5.48 5.138 4.947 4.752 4.543 4.321 4.091 3.767 2.606 -3 ,22369 ,TETRA ,17377664,Sat Nov 20 21:14:54 CET,Sat Nov 20 23:25:20 CET,0.0 0.791 1.102 1.374 1.601 1.801 1.973 2.122 2.404 2.536 2.661 2.749 3.093 3.197 3.37 3.549 3.718 3.801 3.969 4.125 4.331 4.464 4.588 4.767 4.954 5.129 5.291 5.447 5.649 5.842 6.027 6.248 6.466 6.681 6.926 7.178 7.428 7.699 7.985 8.308 8.636 8.979 9.37 9.763 10.217 10.703 11.22 11.774 12.394 13.043 13.632 13.798 13.7 13.457 13.146 12.843 12.521 12.22 11.927 11.615 11.358 11.084 10.802 10.551 10.31 10.08 9.84 9.629 9.445 9.242 9.017 8.818 8.62 8.435 8.295 8.143 7.973 7.799 7.621 7.496 7.381 7.208 7.055 6.894 6.815 6.631 6.442 6.252 6.155 5.864 5.835 5.7 5.559 5.304 5.158 4.974 4.77 4.53 4.254 3.864 2.815 -4 ,25124 ,TETRA ,17377666,Sat Nov 20 21:14:54 CET,Sat Nov 20 23:23:30 CET,0.0 0.886 1.188 1.438 1.626 1.78 1.92 2.054 2.29 2.397 2.507 2.518 2.815 2.902 3.054 3.214 3.394 3.478 3.633 3.769 3.961 4.093 4.232 4.426 4.597 4.76 4.922 5.072 5.252 5.445 5.627 5.831 6.041 6.237 6.461 6.715 6.952 7.221 7.513 7.809 8.122 8.492 8.927 9.334 9.796 10.305 10.839 11.426 12.076 12.706 13.213 13.332 13.186 12.895 12.584 12.264 11.954 11.671 11.406 11.086 10.797 10.542 10.291 10.016 9.728 9.482 9.243 9.023 8.83 8.637 8.427 8.237 8.043 7.851 7.696 7.528 7.368 7.196 7.016 6.892 6.751 6.545 6.401 6.232 6.144 5.943 5.712 5.468 5.355 5.053 4.985 4.839 4.689 4.368 4.189 4.003 3.81 3.597 3.338 2.993 2.09 -5 ,3991 ,TETRA ,17377668,Sat Nov 20 21:14:54 CET,Sat Nov 20 23:27:55 CET,0.0 0.634 0.885 1.13 1.31 1.461 1.604 1.744 1.998 2.12 2.246 2.252 2.545 2.647 2.847 3.016 3.169 3.239 3.379 3.531 3.731 3.863 4.005 4.198 4.375 4.54 4.706 4.879 5.103 5.302 5.478 5.69 5.886 6.085 6.334 6.612 6.861 7.117 7.4 7.699 7.998 8.339 8.744 9.122 9.547 10.045 10.642 11.264 11.929 12.59 13.111 13.289 13.205 12.973 12.666 12.348 12.045 11.745 11.428 11.09 10.817 10.571 10.325 10.09 9.859 9.652 9.434 9.22 9.035 8.827 8.624 8.466 8.265 8.042 7.871 7.697 7.53 7.361 7.171 7.031 6.887 6.652 6.479 6.298 6.209 6.023 5.813 5.595 5.485 5.181 5.143 5.01 4.873 4.543 4.361 4.203 4.016 3.784 3.496 3.064 1.309 -6 ,21834 ,TETRA ,17377670,Sat Nov 20 21:14:54 CET,Sat Nov 20 23:33:31 CET,0.0 1.135 1.47 1.742 1.963 2.15 2.32 2.493 2.825 2.965 3.091 3.111 3.424 3.534 3.744 3.932 4.096 4.18 4.347 4.499 4.709 4.845 4.974 5.147 5.317 5.487 5.663 5.833 6.054 6.268 6.458 6.665 6.877 7.089 7.321 7.579 7.836 8.13 8.423 8.711 9.033 9.418 9.84 10.237 10.698 11.208 11.781 12.404 13.045 13.683 14.27 14.528 14.488 14.295 14.045 13.738 13.426 13.135 12.856 12.569 12.314 12.071 11.817 11.555 11.314 11.087 10.858 10.667 10.501 10.321 10.124 9.965 9.794 9.613 9.476 9.317 9.147 8.969 8.773 8.637 8.495 8.289 8.131 7.95 7.864 7.696 7.523 7.331 7.228 6.922 6.822 6.659 6.498 6.168 5.995 5.814 5.596 5.342 5.024 4.58 3.199 -7 ,12184 ,TETRA ,17377672,Sat Nov 20 21:14:54 CET,Sat Nov 20 23:16:45 CET,0.0 0.983 1.231 1.401 1.566 1.726 1.882 2.021 2.258 2.367 2.466 2.444 2.732 2.818 2.979 3.13 3.27 3.337 3.478 3.611 3.792 3.91 4.029 4.198 4.354 4.505 4.648 4.78 4.963 5.151 5.338 5.559 5.765 5.953 6.172 6.446 6.712 6.989 7.276 7.572 7.9 8.273 8.673 9.046 9.486 9.972 10.5 11.081 11.702 12.314 12.908 13.208 13.171 12.925 12.585 12.256 11.964 11.641 11.348 11.056 10.785 10.54 10.31 10.079 9.859 9.671 9.458 9.244 9.058 8.875 8.675 8.497 8.302 8.088 7.936 7.803 7.667 7.498 7.306 7.175 7.044 6.855 6.722 6.56 6.469 6.282 6.089 5.892 5.789 5.485 5.454 5.322 5.162 4.82 4.645 4.445 4.197 3.904 3.621 3.25 1.573 -8 ,15528 ,TETRA ,17377674,Sat Nov 20 21:14:58 CET,Sat Nov 20 23:32:24 CET,0.0 0.937 1.265 1.514 1.748 1.969 2.161 2.323 2.584 2.701 2.827 2.847 3.161 3.261 3.446 3.625 3.794 3.884 4.065 4.224 4.451 4.602 4.742 4.945 5.148 5.338 5.519 5.685 5.896 6.116 6.317 6.552 6.792 7.012 7.253 7.522 7.788 8.066 8.352 8.67 8.982 9.309 9.72 10.129 10.571 11.036 11.54 12.114 12.747 13.35 13.811 13.902 13.823 13.661 13.452 13.21 12.955 12.694 12.428 12.151 11.921 11.703 11.467 11.248 11.048 10.864 10.672 10.484 10.317 10.149 9.962 9.797 9.634 9.472 9.345 9.198 9.021 8.847 8.678 8.556 8.429 8.21 8.038 7.868 7.78 7.598 7.426 7.251 7.156 6.848 6.764 6.6 6.412 5.997 5.784 5.555 5.288 4.999 4.654 4.173 2.645 -9 ,21701 ,TETRA ,17377676,Sat Nov 20 21:14:55 CET,Sat Nov 20 23:31:50 CET,0.0 1.094 1.429 1.652 1.835 1.981 2.12 2.267 2.531 2.647 2.765 2.799 3.099 3.185 3.361 3.534 3.698 3.773 3.916 4.061 4.254 4.385 4.52 4.699 4.861 5.022 5.18 5.342 5.547 5.734 5.907 6.111 6.317 6.515 6.739 6.995 7.23 7.49 7.767 8.054 8.368 8.7 9.073 9.438 9.849 10.281 10.757 11.32 11.947 12.588 13.189 13.422 13.29 12.961 12.615 12.303 12.029 11.753 11.475 11.177 10.894 10.621 10.369 10.157 9.947 9.742 9.518 9.315 9.157 8.979 8.765 8.578 8.372 8.145 7.971 7.801 7.626 7.442 7.244 7.103 6.953 6.724 6.574 6.407 6.305 6.098 5.915 5.729 5.627 5.312 5.259 5.139 5.016 4.729 4.565 4.384 4.156 3.897 3.579 3.153 1.51 -10 ,24822 ,TETRA ,17377678,Sat Nov 20 21:14:55 CET,Sat Nov 20 23:26:26 CET,0.0 0.642 0.938 1.15 1.311 1.468 1.618 1.743 1.961 2.061 2.15 2.135 2.424 2.518 2.705 2.884 3.06 3.142 3.296 3.463 3.684 3.807 3.924 4.102 4.268 4.417 4.558 4.691 4.867 5.049 5.225 5.431 5.637 5.826 6.036 6.283 6.528 6.8 7.08 7.365 7.66 8.004 8.408 8.807 9.264 9.753 10.277 10.822 11.423 12.074 12.695 12.961 12.901 12.724 12.492 12.195 11.865 11.517 11.201 10.851 10.553 10.29 10.024 9.77 9.536 9.324 9.109 8.916 8.734 8.539 8.336 8.166 7.986 7.784 7.623 7.47 7.304 7.113 6.923 6.789 6.65 6.428 6.262 6.078 5.985 5.805 5.618 5.412 5.303 4.994 4.945 4.815 4.681 4.379 4.233 4.079 3.865 3.635 3.409 3.082 1.556 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_5.txt deleted file mode 100644 index e237468e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29192 ,TETRA ,17377680,Sat Nov 20 21:14:56 CET,Sat Nov 20 23:15:56 CET,0.0 0.551 0.816 1.042 1.246 1.422 1.585 1.743 2.051 2.19 2.31 2.346 2.665 2.775 2.99 3.188 3.378 3.472 3.643 3.809 4.06 4.212 4.353 4.557 4.759 4.957 5.146 5.331 5.573 5.803 6.023 6.289 6.539 6.764 7.02 7.304 7.579 7.902 8.244 8.614 9.019 9.452 9.953 10.462 11.035 11.644 12.382 13.236 14.164 15.168 16.257 17.031 17.338 17.403 17.4 17.317 17.159 16.962 16.732 16.486 16.283 16.092 15.892 15.704 15.512 15.304 15.085 14.893 14.718 14.542 14.365 14.204 14.034 13.864 13.729 13.588 13.438 13.268 13.089 12.971 12.836 12.597 12.433 12.271 12.189 12.013 11.809 11.602 11.484 11.156 11.044 10.887 10.724 10.348 10.129 9.881 9.618 9.308 8.92 8.375 6.061 -2 ,21565 ,TETRA ,17377683,Sat Nov 20 21:14:57 CET,Sat Nov 20 23:22:22 CET,0.0 0.87 1.232 1.499 1.725 1.905 2.069 2.216 2.447 2.547 2.657 2.67 2.963 3.053 3.228 3.413 3.585 3.663 3.823 3.974 4.182 4.328 4.47 4.667 4.859 5.042 5.219 5.379 5.598 5.821 6.026 6.266 6.504 6.735 6.999 7.3 7.589 7.902 8.246 8.619 9.012 9.457 9.975 10.478 11.045 11.68 12.419 13.217 14.094 15.16 16.381 17.12 17.388 17.467 17.425 17.286 17.077 16.866 16.666 16.426 16.2 15.976 15.752 15.543 15.334 15.131 14.912 14.716 14.554 14.381 14.186 14.014 13.82 13.609 13.435 13.256 13.082 12.915 12.748 12.63 12.502 12.274 12.098 11.931 11.846 11.658 11.431 11.197 11.084 10.769 10.703 10.551 10.38 10.037 9.841 9.63 9.386 9.084 8.732 8.256 6.28 -3 ,31082 ,TETRA ,17377685,Sat Nov 20 21:14:59 CET,Sat Nov 20 23:31:14 CET,0.0 1.47 1.817 2.096 2.31 2.504 2.696 2.869 3.164 3.299 3.424 3.448 3.754 3.864 4.114 4.337 4.521 4.605 4.765 4.931 5.182 5.339 5.48 5.668 5.844 6.015 6.188 6.358 6.564 6.751 6.93 7.152 7.398 7.64 7.911 8.228 8.519 8.842 9.194 9.554 9.931 10.346 10.829 11.304 11.883 12.543 13.272 14.103 15.029 16.041 17.15 17.769 17.956 17.945 17.781 17.579 17.371 17.16 16.92 16.603 16.347 16.138 15.922 15.701 15.478 15.272 15.065 14.867 14.692 14.506 14.282 14.076 13.867 13.654 13.471 13.284 13.093 12.884 12.658 12.499 12.34 12.089 11.9 11.673 11.555 11.344 11.123 10.853 10.708 10.379 10.283 10.129 9.953 9.545 9.316 9.079 8.842 8.55 8.159 7.675 5.709 -4 ,13993 ,TETRA ,17377687,Sat Nov 20 21:14:58 CET,Sat Nov 20 23:15:20 CET,0.0 0.993 1.297 1.528 1.742 1.938 2.114 2.261 2.539 2.674 2.785 2.772 3.071 3.162 3.357 3.553 3.735 3.822 3.98 4.147 4.379 4.52 4.657 4.863 5.07 5.263 5.446 5.626 5.846 6.059 6.265 6.519 6.768 6.996 7.253 7.556 7.857 8.177 8.491 8.826 9.195 9.604 10.101 10.602 11.18 11.832 12.572 13.389 14.299 15.309 16.429 17.212 17.565 17.696 17.625 17.479 17.361 17.205 17.033 16.818 16.598 16.392 16.167 15.961 15.766 15.557 15.344 15.175 15.028 14.857 14.666 14.511 14.352 14.179 14.052 13.929 13.787 13.636 13.48 13.364 13.236 13.059 12.949 12.81 12.732 12.58 12.415 12.245 12.15 11.85 11.815 11.701 11.566 11.208 11.007 10.815 10.595 10.323 10.014 9.605 7.524 -5 ,32186 ,TETRA ,17377689,Sat Nov 20 21:14:58 CET,Sat Nov 20 23:14:37 CET,0.0 0.939 1.246 1.481 1.709 1.882 2.02 2.167 2.45 2.575 2.698 2.726 3.007 3.094 3.287 3.478 3.647 3.729 3.895 4.044 4.248 4.382 4.523 4.735 4.936 5.116 5.275 5.443 5.666 5.875 6.084 6.342 6.593 6.841 7.114 7.415 7.702 8.01 8.35 8.714 9.087 9.504 9.975 10.437 10.974 11.576 12.287 13.094 13.989 14.941 15.966 16.642 16.872 16.854 16.725 16.577 16.42 16.251 16.076 15.859 15.651 15.452 15.252 15.062 14.892 14.722 14.541 14.36 14.175 13.999 13.842 13.689 13.505 13.326 13.177 13.022 12.861 12.681 12.49 12.346 12.196 11.975 11.822 11.649 11.558 11.396 11.253 11.084 10.987 10.703 10.67 10.55 10.429 10.141 9.965 9.768 9.559 9.31 8.975 8.405 6.028 -6 ,25548 ,TETRA ,17377691,Sat Nov 20 21:19:00 CET,Sat Nov 20 23:28:49 CET,0.0 0.967 1.272 1.504 1.704 1.871 2.004 2.139 2.425 2.544 2.654 2.671 2.967 3.067 3.273 3.464 3.641 3.732 3.899 4.061 4.313 4.467 4.611 4.811 4.994 5.181 5.361 5.526 5.749 5.963 6.165 6.414 6.652 6.885 7.163 7.491 7.792 8.096 8.434 8.81 9.22 9.659 10.148 10.645 11.216 11.821 12.521 13.347 14.264 15.212 16.218 16.871 17.059 17.082 16.99 16.852 16.689 16.44 16.163 15.878 15.644 15.412 15.158 14.922 14.71 14.496 14.263 14.067 13.894 13.698 13.489 13.307 13.091 12.852 12.67 12.493 12.311 12.116 11.913 11.764 11.594 11.331 11.145 10.928 10.815 10.583 10.336 10.069 9.925 9.594 9.499 9.339 9.182 8.852 8.655 8.431 8.194 7.883 7.466 6.927 4.878 -7 ,28535 ,TETRA ,17377693,Sat Nov 20 21:19:01 CET,Sat Nov 20 23:35:24 CET,0.0 0.579 0.866 1.044 1.214 1.38 1.531 1.666 1.887 1.996 2.116 2.137 2.432 2.534 2.737 2.929 3.097 3.172 3.325 3.486 3.707 3.843 3.977 4.17 4.359 4.542 4.723 4.892 5.103 5.323 5.528 5.765 5.985 6.192 6.445 6.729 7.013 7.327 7.654 8.013 8.401 8.824 9.303 9.795 10.367 10.982 11.672 12.475 13.407 14.4 15.466 16.121 16.309 16.357 16.324 16.178 15.953 15.742 15.539 15.289 15.064 14.843 14.627 14.426 14.242 14.076 13.884 13.7 13.537 13.362 13.185 13.018 12.828 12.629 12.473 12.308 12.126 11.943 11.752 11.621 11.481 11.251 11.081 10.903 10.814 10.628 10.437 10.236 10.129 9.829 9.775 9.632 9.485 9.18 9.006 8.795 8.542 8.255 7.927 7.483 5.143 -8 ,15682 ,TETRA ,17377695,Sat Nov 20 21:19:01 CET,Sat Nov 20 23:29:53 CET,0.0 0.504 0.806 1.085 1.312 1.494 1.667 1.83 2.082 2.193 2.317 2.382 2.713 2.832 3.067 3.283 3.469 3.561 3.747 3.927 4.171 4.319 4.455 4.649 4.837 5.017 5.196 5.378 5.618 5.841 6.049 6.319 6.584 6.819 7.066 7.367 7.662 7.982 8.336 8.713 9.096 9.534 10.057 10.578 11.21 11.911 12.683 13.496 14.383 15.375 16.457 17.195 17.45 17.513 17.504 17.398 17.222 17.05 16.898 16.693 16.48 16.277 16.068 15.874 15.699 15.533 15.336 15.143 14.963 14.757 14.566 14.431 14.273 14.104 13.967 13.812 13.643 13.465 13.283 13.143 12.989 12.768 12.615 12.451 12.365 12.17 11.964 11.771 11.67 11.368 11.299 11.176 11.046 10.748 10.587 10.417 10.234 10.01 9.723 9.39 7.56 -9 ,28517 ,TETRA ,17377697,Sat Nov 20 21:19:01 CET,Sun Nov 21 00:03:58 CET,0.0 0.934 1.258 1.514 1.749 1.949 2.124 2.282 2.572 2.717 2.854 2.874 3.178 3.279 3.471 3.645 3.82 3.906 4.072 4.238 4.473 4.62 4.755 4.952 5.147 5.343 5.532 5.708 5.942 6.155 6.36 6.607 6.85 7.095 7.37 7.678 7.99 8.332 8.701 9.088 9.483 9.951 10.475 10.971 11.542 12.159 12.867 13.654 14.559 15.599 16.673 17.303 17.5 17.469 17.317 17.112 16.887 16.672 16.454 16.201 16.013 15.839 15.632 15.412 15.202 15.026 14.833 14.625 14.441 14.252 14.038 13.856 13.66 13.456 13.299 13.129 12.964 12.811 12.657 12.543 12.427 12.255 12.122 11.99 11.916 11.73 11.557 11.372 11.267 10.976 10.945 10.823 10.683 10.342 10.177 10.009 9.807 9.532 9.156 8.647 6.257 -10 ,20798 ,TETRA ,17377699,Sat Nov 20 21:19:01 CET,Sat Nov 20 23:49:26 CET,0.0 0.886 1.249 1.505 1.75 1.974 2.155 2.32 2.648 2.798 2.94 3.004 3.311 3.426 3.636 3.83 4.017 4.102 4.277 4.465 4.769 4.937 5.072 5.276 5.475 5.676 5.862 6.038 6.271 6.486 6.7 6.965 7.216 7.463 7.757 8.08 8.382 8.719 9.074 9.439 9.817 10.228 10.735 11.278 11.867 12.511 13.256 14.05 14.926 15.887 16.959 17.66 17.878 17.868 17.825 17.736 17.58 17.419 17.23 16.997 16.778 16.574 16.389 16.189 15.95 15.723 15.499 15.301 15.126 14.915 14.696 14.525 14.334 14.126 13.971 13.81 13.628 13.441 13.259 13.13 12.996 12.794 12.64 12.464 12.376 12.195 11.995 11.786 11.677 11.37 11.326 11.196 11.049 10.723 10.554 10.344 10.131 9.918 9.595 9.135 5.516 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_1b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_1b.txt deleted file mode 100644 index 1a8eb174..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_1b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10760 ,TETRA ,17377701,Sat Nov 20 21:19:01 CET,Sun Nov 21 00:05:16 CET,0.0 0.793 1.06 1.276 1.452 1.609 1.734 1.837 2.04 2.148 2.267 2.31 2.617 2.695 2.861 3.02 3.175 3.251 3.406 3.547 3.745 3.882 4.007 4.182 4.339 4.493 4.644 4.793 4.998 5.177 5.332 5.531 5.739 5.944 6.164 6.397 6.632 6.881 7.155 7.472 7.81 8.191 8.61 8.997 9.446 9.951 10.514 11.121 11.798 12.488 13.085 13.278 13.085 12.807 12.571 12.254 11.932 11.639 11.377 11.081 10.797 10.531 10.272 10.058 9.854 9.627 9.364 9.13 8.944 8.768 8.577 8.412 8.225 8.013 7.855 7.7 7.532 7.354 7.187 7.065 6.93 6.735 6.595 6.435 6.353 6.187 6.014 5.845 5.755 5.459 5.471 5.36 5.231 4.941 4.766 4.594 4.397 4.17 3.92 3.596 2.231 -2 ,28590 ,TETRA ,17377703,Sat Nov 20 21:19:01 CET,Sat Nov 20 23:32:41 CET,0.0 0.486 0.694 0.864 1.021 1.154 1.277 1.412 1.675 1.782 1.888 1.891 2.202 2.297 2.491 2.701 2.893 2.977 3.138 3.293 3.51 3.652 3.78 3.962 4.148 4.317 4.486 4.664 4.888 5.063 5.219 5.422 5.612 5.793 6.003 6.242 6.484 6.753 7.027 7.313 7.608 7.924 8.306 8.697 9.126 9.608 10.165 10.756 11.354 11.874 12.275 12.296 11.982 11.519 11.094 10.761 10.374 9.977 9.683 9.372 9.08 8.813 8.552 8.311 8.077 7.853 7.603 7.371 7.174 6.963 6.736 6.555 6.38 6.204 6.053 5.885 5.695 5.475 5.252 5.108 4.967 4.759 4.618 4.472 4.389 4.185 3.976 3.782 3.677 3.359 3.298 3.156 3.027 2.792 2.654 2.478 2.271 2.073 1.824 1.47 0.374 -3 ,17558 ,TETRA ,17377705,Sat Nov 20 21:19:04 CET,Sat Nov 20 23:24:48 CET,0.0 0.432 0.606 0.794 1.003 1.188 1.351 1.478 1.708 1.828 1.937 1.898 2.185 2.27 2.434 2.58 2.733 2.813 2.966 3.112 3.294 3.409 3.533 3.71 3.877 4.038 4.197 4.359 4.562 4.75 4.938 5.151 5.348 5.557 5.801 6.076 6.325 6.594 6.902 7.215 7.534 7.902 8.307 8.691 9.139 9.626 10.189 10.78 11.368 12.016 12.64 12.953 12.933 12.707 12.431 12.115 11.818 11.519 11.236 10.954 10.685 10.438 10.206 9.979 9.752 9.531 9.313 9.122 8.933 8.7 8.465 8.271 8.053 7.805 7.622 7.46 7.3 7.142 6.985 6.862 6.724 6.5 6.347 6.182 6.084 5.875 5.648 5.403 5.279 4.967 4.916 4.795 4.676 4.418 4.261 4.1 3.952 3.775 3.54 3.225 1.958 -4 ,26713 ,TETRA ,17377707,Sat Nov 20 21:19:02 CET,Sun Nov 21 00:09:26 CET,0.0 0.784 1.079 1.312 1.511 1.704 1.869 2.015 2.303 2.432 2.549 2.543 2.872 2.984 3.188 3.384 3.576 3.667 3.841 4.0 4.215 4.357 4.497 4.709 4.93 5.141 5.326 5.489 5.699 5.903 6.099 6.328 6.55 6.769 7.006 7.261 7.508 7.783 8.072 8.398 8.749 9.124 9.57 9.985 10.447 10.971 11.513 12.086 12.755 13.456 14.159 14.474 14.442 14.208 13.907 13.61 13.319 13.046 12.783 12.508 12.258 12.015 11.78 11.528 11.273 11.052 10.815 10.6 10.43 10.246 10.036 9.826 9.596 9.373 9.193 9.016 8.826 8.604 8.36 8.202 8.035 7.763 7.584 7.385 7.275 7.032 6.78 6.514 6.38 6.044 5.941 5.776 5.614 5.287 5.114 4.914 4.671 4.401 4.077 3.593 2.303 -5 ,20050 ,TETRA ,17377709,Sat Nov 20 21:19:03 CET,Sun Nov 21 00:11:03 CET,0.0 0.618 0.958 1.199 1.4 1.605 1.781 1.927 2.171 2.281 2.391 2.393 2.717 2.825 3.012 3.172 3.34 3.434 3.61 3.764 3.99 4.143 4.291 4.499 4.693 4.865 5.03 5.197 5.403 5.594 5.79 6.01 6.211 6.424 6.688 6.995 7.276 7.568 7.877 8.196 8.523 8.903 9.354 9.78 10.284 10.825 11.397 12.004 12.679 13.402 14.025 14.226 14.081 13.768 13.425 13.095 12.724 12.307 11.957 11.599 11.247 10.929 10.629 10.332 10.04 9.787 9.503 9.25 9.028 8.787 8.541 8.34 8.133 7.904 7.732 7.55 7.353 7.155 6.931 6.777 6.613 6.324 6.129 5.931 5.829 5.636 5.425 5.207 5.096 4.766 4.688 4.539 4.383 4.05 3.902 3.739 3.544 3.334 3.042 2.648 1.688 -6 ,23335 ,TETRA ,17377711,Sat Nov 20 21:19:06 CET,Sun Nov 21 00:03:59 CET,0.0 0.464 0.735 0.958 1.151 1.302 1.446 1.582 1.826 1.949 2.066 2.065 2.355 2.438 2.598 2.744 2.886 2.965 3.101 3.231 3.428 3.547 3.66 3.816 3.97 4.138 4.305 4.455 4.635 4.806 4.988 5.215 5.426 5.623 5.846 6.1 6.348 6.618 6.911 7.213 7.519 7.872 8.289 8.698 9.157 9.662 10.229 10.811 11.422 12.047 12.646 12.872 12.719 12.43 12.133 11.842 11.553 11.254 10.996 10.726 10.457 10.204 9.941 9.687 9.466 9.256 9.007 8.766 8.55 8.321 8.073 7.88 7.69 7.494 7.336 7.147 6.955 6.771 6.579 6.46 6.349 6.154 6.002 5.835 5.746 5.569 5.357 5.113 4.996 4.68 4.63 4.49 4.335 3.997 3.802 3.602 3.4 3.087 2.667 2.262 0.778 -7 ,6185 ,TETRA ,17377713,Sat Nov 20 21:19:06 CET,Sat Nov 20 23:31:40 CET,0.0 0.602 0.855 1.11 1.298 1.435 1.558 1.676 1.892 1.986 2.087 2.088 2.381 2.467 2.654 2.848 3.02 3.098 3.256 3.414 3.647 3.791 3.92 4.109 4.285 4.443 4.585 4.738 4.957 5.15 5.326 5.542 5.756 5.973 6.232 6.508 6.764 7.045 7.343 7.67 8.01 8.371 8.77 9.172 9.642 10.17 10.747 11.347 12.027 12.718 13.356 13.581 13.432 13.181 12.899 12.577 12.244 11.96 11.697 11.383 11.105 10.839 10.564 10.299 10.048 9.817 9.587 9.386 9.21 9.023 8.819 8.635 8.429 8.224 8.078 7.912 7.735 7.555 7.354 7.201 7.045 6.825 6.662 6.474 6.382 6.225 6.06 5.858 5.745 5.428 5.384 5.267 5.141 4.833 4.659 4.487 4.28 4.015 3.73 3.398 2.629 -8 ,21263 ,TETRA ,17377715,Sat Nov 20 21:19:05 CET,Sat Nov 20 23:30:53 CET,0.0 0.585 0.864 1.097 1.281 1.444 1.578 1.704 1.939 2.073 2.197 2.196 2.499 2.585 2.747 2.898 3.044 3.119 3.278 3.428 3.633 3.767 3.909 4.114 4.305 4.465 4.631 4.824 5.06 5.279 5.496 5.766 6.014 6.248 6.513 6.792 7.056 7.353 7.681 7.997 8.323 8.702 9.147 9.59 10.069 10.584 11.166 11.755 12.423 13.131 13.699 13.894 13.738 13.393 12.964 12.514 12.067 11.691 11.412 11.083 10.761 10.479 10.202 9.927 9.658 9.407 9.154 8.926 8.698 8.431 8.16 7.954 7.76 7.558 7.386 7.194 6.986 6.769 6.544 6.393 6.236 5.981 5.812 5.64 5.544 5.346 5.13 4.901 4.793 4.491 4.444 4.292 4.114 3.735 3.538 3.346 3.145 2.863 2.447 1.885 0.321 -9 ,21493 ,TETRA ,17377717,Sat Nov 20 21:25:59 CET,Sat Nov 20 23:37:40 CET,0.0 1.409 1.76 1.985 2.196 2.406 2.589 2.74 2.987 3.105 3.224 3.24 3.547 3.646 3.853 4.042 4.213 4.295 4.447 4.597 4.807 4.934 5.061 5.253 5.445 5.618 5.782 5.945 6.149 6.36 6.562 6.778 6.978 7.165 7.383 7.643 7.923 8.26 8.589 8.9 9.238 9.632 10.087 10.544 11.037 11.549 12.126 12.722 13.342 14.027 14.683 14.91 14.78 14.557 14.266 13.944 13.653 13.325 12.991 12.62 12.308 12.043 11.765 11.493 11.255 11.037 10.799 10.589 10.403 10.206 10.009 9.842 9.666 9.489 9.335 9.168 9.012 8.842 8.647 8.508 8.354 8.119 7.961 7.802 7.726 7.561 7.387 7.206 7.114 6.816 6.802 6.678 6.526 6.207 6.044 5.862 5.639 5.387 5.073 4.611 3.259 -10 ,12031 ,TETRA ,17377719,Sat Nov 20 21:25:59 CET,Sat Nov 20 23:43:28 CET,0.0 0.687 0.989 1.227 1.449 1.64 1.833 1.994 2.275 2.427 2.582 2.658 2.984 3.086 3.274 3.491 3.752 3.868 4.047 4.212 4.44 4.59 4.734 4.933 5.12 5.309 5.496 5.671 5.904 6.133 6.352 6.614 6.858 7.109 7.395 7.697 7.97 8.278 8.626 8.994 9.376 9.755 10.173 10.609 11.115 11.625 12.207 12.86 13.528 14.233 14.942 15.255 15.241 15.094 14.825 14.486 14.158 13.81 13.487 13.165 12.89 12.635 12.374 12.116 11.869 11.639 11.382 11.145 10.941 10.727 10.504 10.306 10.112 9.918 9.77 9.624 9.448 9.25 9.057 8.917 8.761 8.517 8.342 8.159 8.072 7.905 7.723 7.532 7.429 7.093 7.046 6.926 6.779 6.439 6.236 6.002 5.765 5.5 5.199 4.819 3.416 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_6b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_6b.txt deleted file mode 100644 index 64a20cc4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_6b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17426 ,TETRA ,17377720,Sat Nov 20 21:25:59 CET,Sun Nov 21 00:02:53 CET,0.0 0.967 1.339 1.631 1.864 2.083 2.279 2.472 2.825 2.988 3.13 3.161 3.505 3.628 3.84 4.052 4.257 4.358 4.561 4.752 5.019 5.181 5.338 5.567 5.79 6.008 6.203 6.381 6.611 6.84 7.075 7.357 7.61 7.832 8.071 8.356 8.623 8.909 9.211 9.528 9.86 10.225 10.658 11.091 11.602 12.154 12.727 13.267 13.811 14.323 14.683 14.689 14.381 13.912 13.471 13.05 12.645 12.238 11.896 11.573 11.287 11.029 10.75 10.483 10.24 10.013 9.76 9.53 9.322 9.099 8.867 8.672 8.479 8.29 8.149 7.994 7.826 7.649 7.456 7.316 7.186 6.994 6.848 6.695 6.611 6.428 6.242 6.061 5.964 5.63 5.597 5.459 5.314 5.026 4.875 4.705 4.53 4.291 4.015 3.697 2.613 -2 ,13541 ,TETRA ,17377722,Sat Nov 20 21:25:59 CET,Sat Nov 20 23:56:56 CET,0.0 0.65 0.927 1.156 1.348 1.511 1.655 1.775 1.993 2.09 2.179 2.175 2.468 2.562 2.748 2.911 3.061 3.134 3.286 3.443 3.666 3.801 3.929 4.128 4.326 4.509 4.688 4.863 5.079 5.299 5.523 5.766 5.987 6.211 6.457 6.738 7.007 7.299 7.602 7.905 8.221 8.571 8.979 9.401 9.853 10.307 10.786 11.254 11.701 12.08 12.31 12.149 11.817 11.414 11.042 10.66 10.27 9.937 9.646 9.336 9.055 8.794 8.55 8.32 8.095 7.865 7.617 7.394 7.204 6.998 6.77 6.591 6.404 6.197 6.041 5.895 5.742 5.567 5.38 5.248 5.108 4.906 4.774 4.644 4.571 4.396 4.205 4.007 3.903 3.593 3.569 3.456 3.337 3.042 2.901 2.766 2.611 2.429 2.245 1.985 1.073 -3 ,30183 ,TETRA ,17377723,Sat Nov 20 21:25:59 CET,Sat Nov 20 23:38:46 CET,0.0 1.2 1.571 1.838 2.033 2.201 2.353 2.514 2.823 2.97 3.108 3.15 3.478 3.593 3.815 4.013 4.182 4.272 4.454 4.631 4.894 5.067 5.233 5.452 5.658 5.853 6.044 6.237 6.484 6.713 6.923 7.166 7.408 7.658 7.942 8.233 8.508 8.811 9.115 9.427 9.784 10.175 10.586 11.014 11.5 12.01 12.578 13.179 13.809 14.292 14.515 14.354 14.042 13.702 13.357 12.977 12.6 12.25 11.909 11.555 11.257 10.988 10.744 10.515 10.3 10.099 9.866 9.648 9.449 9.236 9.021 8.845 8.649 8.44 8.297 8.156 7.998 7.822 7.651 7.542 7.431 7.234 7.085 6.947 6.878 6.725 6.563 6.395 6.299 6.001 6.008 5.898 5.783 5.545 5.403 5.251 5.092 4.902 4.703 4.486 3.832 -4 ,28943 ,TETRA ,17377725,Sat Nov 20 21:25:59 CET,Sat Nov 20 23:32:42 CET,0.0 1.106 1.46 1.708 1.93 2.114 2.295 2.481 2.797 2.929 3.057 3.069 3.379 3.485 3.674 3.856 4.04 4.13 4.29 4.429 4.636 4.782 4.919 5.116 5.307 5.481 5.645 5.804 6.005 6.204 6.398 6.63 6.836 7.028 7.281 7.577 7.844 8.124 8.396 8.682 8.973 9.295 9.675 10.042 10.466 10.915 11.362 11.809 12.299 12.756 13.106 13.047 12.722 12.362 11.983 11.608 11.237 10.845 10.512 10.187 9.896 9.608 9.318 9.056 8.812 8.589 8.349 8.126 7.934 7.749 7.548 7.361 7.172 6.986 6.854 6.717 6.568 6.41 6.25 6.138 6.024 5.85 5.717 5.578 5.512 5.37 5.216 5.038 4.942 4.653 4.665 4.564 4.448 4.169 4.011 3.849 3.684 3.492 3.256 2.949 1.851 -5 ,20253 ,TETRA ,17377727,Sat Nov 20 21:25:59 CET,Sat Nov 20 23:32:42 CET,0.0 1.658 2.018 2.237 2.457 2.673 2.851 3.029 3.35 3.484 3.613 3.647 3.978 4.089 4.294 4.489 4.655 4.736 4.908 5.078 5.323 5.473 5.626 5.84 6.028 6.212 6.399 6.593 6.836 7.051 7.238 7.456 7.668 7.876 8.111 8.352 8.583 8.854 9.157 9.462 9.773 10.136 10.553 10.962 11.425 11.916 12.452 13.011 13.604 14.138 14.497 14.433 14.189 13.827 13.408 13.011 12.621 12.285 12.025 11.739 11.471 11.225 10.974 10.719 10.449 10.201 9.95 9.718 9.524 9.335 9.15 8.991 8.814 8.63 8.48 8.308 8.138 7.967 7.788 7.65 7.503 7.286 7.122 6.966 6.898 6.738 6.563 6.393 6.301 6.002 5.983 5.86 5.734 5.475 5.325 5.148 4.973 4.806 4.613 4.352 3.607 -6 ,807 ,TETRA ,17377729,Sat Nov 20 21:26:00 CET,Sat Nov 20 23:38:11 CET,0.0 1.086 1.393 1.608 1.805 2.004 2.185 2.362 2.666 2.786 2.91 2.958 3.283 3.381 3.588 3.812 4.013 4.107 4.29 4.459 4.688 4.832 4.97 5.174 5.37 5.555 5.731 5.901 6.124 6.325 6.509 6.743 6.964 7.169 7.409 7.681 7.964 8.282 8.597 8.891 9.179 9.507 9.906 10.302 10.764 11.211 11.678 12.244 12.841 13.373 13.701 13.664 13.387 13.039 12.674 12.303 11.97 11.655 11.374 11.082 10.828 10.6 10.363 10.139 9.924 9.718 9.484 9.27 9.081 8.876 8.667 8.498 8.328 8.128 7.97 7.823 7.666 7.497 7.328 7.214 7.105 6.925 6.792 6.658 6.586 6.44 6.279 6.139 6.063 5.762 5.752 5.636 5.517 5.266 5.137 5.004 4.869 4.708 4.505 4.172 3.358 -7 ,29590 ,TETRA ,17377731,Sat Nov 20 21:25:59 CET,Sat Nov 20 23:39:19 CET,0.0 1.109 1.443 1.649 1.859 2.084 2.289 2.458 2.767 2.916 3.064 3.128 3.456 3.563 3.78 3.982 4.171 4.269 4.452 4.618 4.858 5.011 5.152 5.356 5.56 5.758 5.949 6.117 6.337 6.562 6.76 6.991 7.224 7.447 7.701 7.985 8.26 8.575 8.898 9.209 9.508 9.853 10.291 10.695 11.123 11.575 12.092 12.616 13.139 13.68 14.18 14.348 14.199 13.997 13.721 13.34 12.944 12.575 12.227 11.874 11.58 11.308 11.055 10.803 10.568 10.368 10.144 9.923 9.737 9.538 9.329 9.164 8.995 8.822 8.682 8.529 8.372 8.21 8.04 7.916 7.786 7.589 7.451 7.312 7.241 7.087 6.912 6.734 6.64 6.322 6.331 6.217 6.082 5.821 5.688 5.517 5.303 5.069 4.79 4.498 3.768 -8 ,16132 ,TETRA ,17377733,Sat Nov 20 21:26:00 CET,Sat Nov 20 23:33:16 CET,0.0 0.986 1.334 1.657 1.897 2.103 2.308 2.478 2.772 2.912 3.049 3.091 3.409 3.522 3.731 3.921 4.103 4.191 4.354 4.523 4.792 4.957 5.103 5.312 5.52 5.719 5.899 6.075 6.307 6.527 6.743 7.0 7.215 7.423 7.67 7.951 8.222 8.493 8.787 9.098 9.433 9.812 10.232 10.642 11.1 11.567 12.055 12.559 13.115 13.696 14.097 14.053 13.79 13.465 13.116 12.795 12.462 12.094 11.765 11.418 11.109 10.829 10.573 10.331 10.103 9.896 9.663 9.461 9.281 9.086 8.89 8.711 8.527 8.348 8.201 8.05 7.885 7.704 7.522 7.408 7.292 7.08 6.931 6.781 6.708 6.564 6.417 6.262 6.174 5.88 5.889 5.798 5.695 5.435 5.28 5.113 4.94 4.765 4.547 4.292 3.63 -9 ,90 ,TETRA ,17377735,Sat Nov 20 21:26:03 CET,Sun Nov 21 00:12:44 CET,0.0 0.93 1.268 1.504 1.718 1.931 2.101 2.25 2.519 2.635 2.745 2.765 3.084 3.188 3.385 3.601 3.809 3.896 4.067 4.237 4.453 4.589 4.736 4.933 5.109 5.282 5.456 5.621 5.833 6.044 6.23 6.445 6.647 6.858 7.103 7.36 7.608 7.888 8.19 8.5 8.819 9.163 9.56 9.967 10.415 10.878 11.398 11.92 12.44 12.927 13.242 13.242 12.987 12.66 12.338 11.957 11.592 11.228 10.893 10.573 10.294 10.037 9.787 9.533 9.279 9.054 8.82 8.616 8.434 8.234 8.034 7.859 7.675 7.488 7.353 7.213 7.059 6.9 6.736 6.611 6.483 6.299 6.162 6.014 5.943 5.812 5.667 5.509 5.417 5.122 5.129 5.025 4.906 4.662 4.532 4.37 4.175 3.971 3.747 3.467 3.109 -10 ,6826 ,TETRA ,17377737,Sat Nov 20 21:26:01 CET,Sun Nov 21 00:05:52 CET,0.0 1.245 1.574 1.834 2.076 2.308 2.519 2.703 3.019 3.161 3.292 3.319 3.635 3.745 3.969 4.173 4.351 4.435 4.603 4.768 4.996 5.135 5.271 5.467 5.649 5.814 5.975 6.134 6.339 6.544 6.736 6.979 7.21 7.425 7.68 7.943 8.2 8.482 8.764 9.081 9.436 9.818 10.235 10.65 11.123 11.628 12.165 12.68 13.217 13.824 14.298 14.224 13.942 13.675 13.365 12.977 12.599 12.24 11.898 11.562 11.253 10.962 10.701 10.426 10.15 9.909 9.648 9.394 9.175 8.959 8.755 8.578 8.376 8.163 7.993 7.814 7.633 7.438 7.221 7.061 6.9 6.676 6.524 6.365 6.277 6.082 5.868 5.658 5.541 5.197 5.171 5.041 4.897 4.61 4.443 4.265 4.084 3.9 3.672 3.355 1.942 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_6e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_6e.txt deleted file mode 100644 index 52ff4537..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_6e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7119 ,KEBNE ,17043866,Thu Dec 23 05:34:14 CET,Thu Dec 23 07:18:15 CET,0.0 0.696 1.093 1.392 1.587 1.761 1.931 2.079 2.338 2.46 2.586 2.62 2.938 3.044 3.251 3.461 3.668 3.764 3.928 4.076 4.308 4.456 4.593 4.803 5.005 5.184 5.358 5.538 5.759 5.95 6.13 6.37 6.596 6.782 7.002 7.235 7.459 7.712 8.016 8.358 8.671 9.006 9.379 9.743 10.153 10.589 11.083 11.604 12.121 12.628 13.05 13.044 12.763 12.419 12.006 11.534 11.09 10.678 10.322 9.912 9.513 9.166 8.883 8.597 8.306 8.046 7.752 7.494 7.263 6.995 6.714 6.482 6.259 6.024 5.837 5.665 5.481 5.278 5.056 4.894 4.728 4.471 4.306 4.141 4.054 3.858 3.64 3.439 3.333 3.009 2.96 2.803 2.654 2.302 2.106 1.877 1.585 1.298 1.05 0.673 -0.401 -2 ,26071 ,KEBNE ,17043867,Thu Dec 23 05:34:14 CET,Thu Dec 23 07:19:12 CET,0.0 0.534 0.795 1.04 1.258 1.464 1.624 1.765 2.05 2.179 2.297 2.302 2.616 2.717 2.896 3.087 3.262 3.345 3.522 3.68 3.888 4.018 4.145 4.315 4.484 4.657 4.82 4.975 5.172 5.36 5.538 5.747 5.959 6.18 6.425 6.691 6.952 7.244 7.551 7.848 8.134 8.46 8.865 9.26 9.688 10.148 10.627 11.115 11.648 12.18 12.622 12.61 12.329 11.987 11.613 11.197 10.819 10.439 10.048 9.649 9.304 8.977 8.653 8.336 8.048 7.782 7.499 7.246 7.012 6.762 6.489 6.247 6.015 5.781 5.616 5.459 5.281 5.108 4.927 4.795 4.658 4.435 4.276 4.105 4.017 3.851 3.691 3.504 3.391 3.075 3.072 2.954 2.826 2.557 2.397 2.231 2.056 1.851 1.567 1.237 0.454 -3 ,20962 ,KEBNE ,17043868,Thu Dec 23 05:34:15 CET,Thu Dec 23 07:19:17 CET,0.0 0.488 0.762 0.974 1.171 1.348 1.499 1.639 1.912 2.039 2.172 2.199 2.526 2.631 2.812 2.975 3.141 3.228 3.397 3.561 3.777 3.912 4.043 4.233 4.415 4.587 4.764 4.927 5.116 5.309 5.492 5.704 5.917 6.112 6.341 6.612 6.851 7.109 7.407 7.717 8.012 8.311 8.659 9.02 9.41 9.844 10.351 10.825 11.293 11.703 11.923 11.872 11.642 11.316 10.966 10.62 10.26 9.895 9.593 9.296 9.029 8.771 8.488 8.189 7.91 7.661 7.368 7.109 6.889 6.647 6.403 6.194 5.973 5.738 5.559 5.365 5.147 4.925 4.71 4.572 4.429 4.191 4.023 3.85 3.749 3.538 3.327 3.1 2.976 2.63 2.59 2.451 2.302 1.973 1.791 1.614 1.411 1.172 0.842 0.372 -1.072 -4 ,27980 ,KEBNE ,17043869,Thu Dec 23 05:34:15 CET,Thu Dec 23 07:19:39 CET,0.0 1.263 1.581 1.82 2.036 2.234 2.386 2.519 2.797 2.912 3.02 3.045 3.368 3.475 3.682 3.869 4.042 4.125 4.287 4.448 4.676 4.814 4.948 5.158 5.349 5.519 5.682 5.843 6.062 6.27 6.463 6.702 6.931 7.138 7.375 7.625 7.859 8.125 8.42 8.742 9.054 9.397 9.809 10.21 10.646 11.111 11.595 12.09 12.65 13.192 13.49 13.329 12.925 12.444 11.969 11.473 11.003 10.54 10.115 9.696 9.318 8.954 8.598 8.28 8.001 7.763 7.51 7.267 7.057 6.85 6.591 6.354 6.134 5.894 5.705 5.51 5.31 5.112 4.907 4.772 4.624 4.366 4.171 3.978 3.883 3.681 3.471 3.243 3.114 2.79 2.758 2.621 2.48 2.145 1.959 1.783 1.572 1.319 0.983 0.466 -0.867 -5 ,31988 ,KEBNE ,17043870,Thu Dec 23 05:35:18 CET,Thu Dec 23 07:21:08 CET,0.0 1.008 1.286 1.493 1.677 1.843 2.01 2.165 2.432 2.549 2.661 2.664 2.974 3.082 3.297 3.491 3.67 3.749 3.906 4.056 4.278 4.413 4.537 4.72 4.905 5.09 5.271 5.449 5.666 5.875 6.081 6.313 6.514 6.711 6.954 7.226 7.456 7.693 7.956 8.239 8.553 8.904 9.288 9.653 10.08 10.529 11.0 11.475 11.958 12.466 12.785 12.703 12.402 12.005 11.616 11.194 10.775 10.387 10.028 9.649 9.298 8.994 8.722 8.462 8.223 7.991 7.734 7.492 7.263 7.036 6.805 6.592 6.382 6.153 5.972 5.794 5.599 5.409 5.221 5.08 4.932 4.701 4.554 4.402 4.318 4.144 3.955 3.743 3.622 3.293 3.237 3.1 2.942 2.645 2.499 2.311 2.049 1.775 1.484 1.126 -0.18 -6 ,6260 ,KEBNE ,17043871,Thu Dec 23 05:35:18 CET,Thu Dec 23 07:19:47 CET,0.0 0.507 0.802 1.053 1.268 1.434 1.578 1.715 1.969 2.083 2.192 2.208 2.531 2.632 2.812 2.975 3.134 3.225 3.393 3.532 3.736 3.867 4.004 4.207 4.374 4.536 4.695 4.852 5.054 5.247 5.457 5.708 5.929 6.158 6.417 6.671 6.918 7.192 7.455 7.724 8.013 8.334 8.703 9.058 9.473 9.907 10.366 10.885 11.485 12.057 12.492 12.427 12.062 11.634 11.227 10.845 10.478 10.122 9.774 9.395 9.078 8.776 8.471 8.195 7.934 7.691 7.451 7.23 7.02 6.785 6.533 6.336 6.137 5.914 5.731 5.529 5.316 5.102 4.887 4.73 4.567 4.33 4.161 3.979 3.882 3.681 3.475 3.259 3.144 2.817 2.755 2.61 2.471 2.173 1.984 1.786 1.596 1.347 1.038 0.603 -0.422 -7 ,21435 ,KEBNE ,17043872,Thu Dec 23 05:35:19 CET,Thu Dec 23 07:20:13 CET,0.0 0.558 0.813 1.021 1.209 1.394 1.528 1.67 1.984 2.11 2.216 2.22 2.534 2.629 2.797 2.948 3.076 3.147 3.297 3.445 3.644 3.768 3.88 4.036 4.189 4.342 4.502 4.662 4.857 5.035 5.205 5.418 5.633 5.827 6.052 6.294 6.529 6.788 7.055 7.339 7.633 7.975 8.357 8.706 9.095 9.512 9.942 10.349 10.83 11.341 11.684 11.595 11.288 10.924 10.533 10.168 9.794 9.407 9.049 8.657 8.345 8.097 7.829 7.573 7.314 7.057 6.793 6.537 6.328 6.122 5.871 5.66 5.463 5.246 5.084 4.913 4.728 4.535 4.317 4.168 4.026 3.821 3.682 3.523 3.436 3.266 3.092 2.896 2.788 2.469 2.42 2.283 2.146 1.877 1.728 1.566 1.375 1.185 0.995 0.67 -0.644 -8 ,14170 ,KEBNE ,17043873,Thu Dec 23 05:35:18 CET,Thu Dec 23 07:20:30 CET,0.0 0.52 0.756 1.029 1.251 1.429 1.584 1.737 2.001 2.121 2.242 2.233 2.539 2.636 2.815 2.987 3.152 3.241 3.411 3.538 3.74 3.898 4.033 4.191 4.343 4.49 4.635 4.783 4.973 5.148 5.328 5.553 5.763 5.944 6.146 6.385 6.618 6.875 7.142 7.431 7.738 8.063 8.413 8.755 9.116 9.51 9.966 10.439 10.948 11.457 11.865 11.943 11.765 11.422 11.016 10.645 10.313 9.955 9.597 9.234 8.897 8.587 8.312 8.057 7.805 7.564 7.297 7.06 6.882 6.697 6.487 6.309 6.124 5.937 5.786 5.594 5.389 5.2 5.001 4.863 4.72 4.491 4.346 4.192 4.11 3.935 3.742 3.559 3.465 3.164 3.145 3.029 2.905 2.628 2.482 2.32 2.119 1.891 1.632 1.278 0.286 -9 ,27737 ,KEBNE ,17043874,Thu Dec 23 05:35:18 CET,Thu Dec 23 07:20:38 CET,0.0 0.665 0.842 0.973 1.121 1.285 1.436 1.565 1.811 1.93 2.035 2.003 2.292 2.376 2.531 2.681 2.822 2.895 3.03 3.158 3.346 3.463 3.587 3.771 3.93 4.076 4.222 4.368 4.571 4.754 4.917 5.123 5.315 5.495 5.722 5.978 6.223 6.487 6.749 7.027 7.318 7.645 8.024 8.385 8.791 9.241 9.723 10.237 10.797 11.256 11.465 11.28 10.999 10.625 10.213 9.843 9.534 9.228 8.934 8.62 8.333 8.081 7.831 7.596 7.383 7.175 6.93 6.685 6.459 6.23 5.979 5.754 5.519 5.261 5.056 4.849 4.64 4.428 4.217 4.076 3.921 3.649 3.46 3.285 3.191 2.988 2.789 2.574 2.463 2.143 2.099 1.964 1.804 1.442 1.272 1.12 0.951 0.746 0.479 0.177 -0.886 -10 ,19043 ,KEBNE ,17043875,Thu Dec 23 05:35:18 CET,Thu Dec 23 07:19:44 CET,0.0 0.69 0.959 1.181 1.383 1.568 1.73 1.878 2.153 2.273 2.389 2.396 2.717 2.81 2.992 3.158 3.315 3.398 3.561 3.706 3.906 4.045 4.172 4.35 4.52 4.692 4.877 5.044 5.242 5.441 5.634 5.858 6.066 6.263 6.491 6.742 6.972 7.228 7.529 7.832 8.14 8.494 8.887 9.285 9.721 10.188 10.759 11.366 11.912 12.397 12.852 12.931 12.643 12.241 11.82 11.378 10.937 10.532 10.184 9.825 9.507 9.197 8.883 8.574 8.285 8.035 7.766 7.509 7.271 7.008 6.732 6.517 6.29 6.052 5.877 5.708 5.536 5.352 5.151 4.992 4.824 4.57 4.394 4.212 4.119 3.921 3.699 3.463 3.345 3.016 2.988 2.83 2.663 2.368 2.203 2.028 1.839 1.623 1.343 0.984 0.086 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_6a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_6a.txt deleted file mode 100644 index d10cbb56..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_6a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28878 ,KEBNE ,17043876,Thu Dec 23 05:35:18 CET,Thu Dec 23 07:21:10 CET,0.0 1.611 1.951 2.144 2.341 2.537 2.705 2.863 3.156 3.284 3.416 3.457 3.777 3.88 4.064 4.266 4.481 4.577 4.748 4.906 5.13 5.273 5.412 5.625 5.812 5.975 6.141 6.29 6.475 6.67 6.864 7.089 7.289 7.488 7.738 8.002 8.225 8.493 8.801 9.12 9.43 9.744 10.111 10.477 10.859 11.239 11.656 12.032 12.356 12.611 12.577 12.165 11.665 11.161 10.592 9.998 9.474 8.996 8.577 8.127 7.714 7.342 6.974 6.621 6.301 5.991 5.664 5.375 5.129 4.877 4.602 4.372 4.138 3.887 3.689 3.497 3.29 3.065 2.849 2.706 2.555 2.308 2.146 1.978 1.879 1.661 1.425 1.181 1.059 0.726 0.694 0.55 0.392 0.062 -0.127 -0.314 -0.497 -0.721 -1.025 -1.438 -2.736 -2 ,12125 ,KEBNE ,17043877,Thu Dec 23 05:35:18 CET,Thu Dec 23 07:21:00 CET,0.0 0.932 1.189 1.384 1.565 1.728 1.871 2.01 2.247 2.36 2.475 2.487 2.782 2.87 3.034 3.194 3.351 3.426 3.565 3.704 3.898 4.028 4.165 4.345 4.497 4.651 4.818 4.985 5.184 5.363 5.534 5.742 5.927 6.097 6.309 6.541 6.749 6.987 7.252 7.526 7.791 8.07 8.394 8.716 9.069 9.437 9.823 10.232 10.63 11.013 11.207 10.958 10.603 10.193 9.773 9.358 8.961 8.591 8.24 7.881 7.583 7.306 7.02 6.726 6.462 6.212 5.936 5.706 5.521 5.319 5.103 4.935 4.751 4.554 4.397 4.225 4.054 3.871 3.681 3.542 3.393 3.173 3.011 2.844 2.756 2.563 2.359 2.14 2.03 1.725 1.7 1.58 1.442 1.148 0.997 0.812 0.613 0.424 0.2 -0.147 -1.284 -3 ,15169 ,KEBNE ,17043878,Thu Dec 23 05:36:21 CET,Thu Dec 23 07:22:19 CET,0.0 1.26 1.651 1.893 2.082 2.274 2.444 2.562 2.777 2.883 2.996 3.003 3.304 3.395 3.563 3.718 3.865 3.939 4.082 4.209 4.391 4.523 4.655 4.831 4.997 5.152 5.304 5.45 5.64 5.832 6.011 6.221 6.425 6.609 6.819 7.057 7.274 7.484 7.723 8.008 8.298 8.61 8.955 9.259 9.593 9.955 10.342 10.73 11.1 11.435 11.62 11.403 10.905 10.32 9.772 9.235 8.786 8.402 8.022 7.613 7.262 6.915 6.564 6.238 5.913 5.612 5.321 5.064 4.826 4.583 4.342 4.134 3.914 3.689 3.513 3.329 3.135 2.936 2.728 2.588 2.444 2.22 2.075 1.908 1.815 1.611 1.412 1.212 1.092 0.773 0.749 0.606 0.452 0.164 -0.003 -0.171 -0.364 -0.604 -0.862 -1.183 -2.159 -4 ,7637 ,KEBNE ,17043879,Thu Dec 23 05:36:21 CET,Thu Dec 23 07:20:53 CET,0.0 0.766 1.06 1.288 1.493 1.654 1.796 1.936 2.219 2.351 2.474 2.474 2.766 2.864 3.056 3.246 3.418 3.501 3.646 3.767 3.958 4.088 4.21 4.394 4.581 4.754 4.908 5.054 5.26 5.45 5.607 5.798 5.991 6.174 6.38 6.598 6.789 6.995 7.225 7.477 7.74 8.02 8.339 8.667 9.01 9.34 9.703 10.026 10.308 10.513 10.476 10.053 9.528 9.044 8.573 8.098 7.684 7.258 6.877 6.508 6.168 5.848 5.546 5.272 5.02 4.781 4.533 4.304 4.099 3.888 3.666 3.476 3.279 3.077 2.915 2.743 2.573 2.397 2.197 2.065 1.946 1.767 1.632 1.479 1.398 1.236 1.054 0.832 0.719 0.415 0.416 0.292 0.152 -0.168 -0.346 -0.53 -0.754 -1.004 -1.296 -1.665 -2.882 -5 ,11570 ,KEBNE ,17043880,Thu Dec 23 05:36:21 CET,Thu Dec 23 07:21:47 CET,0.0 1.02 1.311 1.57 1.777 1.96 2.146 2.328 2.649 2.781 2.893 2.9 3.22 3.315 3.514 3.713 3.89 3.976 4.137 4.284 4.486 4.616 4.733 4.901 5.066 5.218 5.365 5.518 5.718 5.908 6.084 6.298 6.501 6.697 6.912 7.138 7.357 7.603 7.873 8.132 8.395 8.687 9.011 9.348 9.723 10.108 10.482 10.855 11.268 11.6 11.695 11.363 10.843 10.28 9.774 9.285 8.818 8.378 8.01 7.616 7.222 6.884 6.581 6.291 6.004 5.732 5.448 5.176 4.936 4.69 4.44 4.246 4.053 3.837 3.66 3.487 3.32 3.13 2.913 2.768 2.62 2.379 2.21 2.021 1.924 1.725 1.531 1.321 1.198 0.862 0.82 0.692 0.564 0.295 0.144 -0.026 -0.24 -0.467 -0.713 -1.02 -1.954 -6 ,8338 ,KEBNE ,17043881,Thu Dec 23 05:36:21 CET,Thu Dec 23 07:21:50 CET,0.0 0.721 0.968 1.161 1.35 1.538 1.71 1.846 2.069 2.173 2.267 2.233 2.529 2.629 2.84 3.017 3.171 3.241 3.374 3.495 3.673 3.796 3.929 4.115 4.279 4.436 4.588 4.734 4.909 5.079 5.238 5.426 5.615 5.794 5.999 6.232 6.447 6.69 6.939 7.202 7.475 7.733 8.023 8.332 8.67 9.055 9.465 9.832 10.168 10.448 10.558 10.267 9.804 9.306 8.823 8.316 7.82 7.37 6.998 6.629 6.303 6.011 5.68 5.355 5.079 4.834 4.577 4.342 4.139 3.92 3.693 3.504 3.3 3.091 2.926 2.749 2.569 2.375 2.157 1.998 1.832 1.564 1.372 1.173 1.068 0.849 0.629 0.413 0.3 -0.024 -0.059 -0.188 -0.335 -0.666 -0.833 -1.005 -1.229 -1.48 -1.729 -2.082 -3.354 -7 ,808 ,KEBNE ,17043882,Thu Dec 23 05:36:21 CET,Thu Dec 23 07:22:02 CET,0.0 0.633 0.937 1.15 1.328 1.493 1.641 1.767 2.006 2.129 2.244 2.256 2.564 2.654 2.827 2.98 3.122 3.198 3.358 3.509 3.716 3.85 3.983 4.156 4.315 4.466 4.623 4.788 4.989 5.169 5.333 5.515 5.689 5.863 6.07 6.312 6.535 6.779 7.033 7.287 7.553 7.844 8.161 8.47 8.808 9.166 9.569 9.946 10.246 10.474 10.547 10.283 9.873 9.376 8.878 8.416 7.983 7.585 7.244 6.878 6.544 6.233 5.92 5.622 5.351 5.103 4.839 4.606 4.394 4.173 3.937 3.735 3.525 3.309 3.144 2.97 2.797 2.625 2.44 2.308 2.176 1.967 1.824 1.667 1.588 1.425 1.24 1.021 0.901 0.574 0.511 0.379 0.248 -0.025 -0.186 -0.365 -0.557 -0.745 -0.957 -1.271 -2.198 -8 ,541 ,KEBNE ,17043883,Thu Dec 23 05:39:26 CET,Thu Dec 23 07:26:03 CET,0.0 1.079 1.402 1.611 1.805 1.975 2.129 2.294 2.587 2.706 2.816 2.795 3.092 3.193 3.377 3.537 3.705 3.78 3.93 4.094 4.312 4.44 4.57 4.75 4.92 5.09 5.254 5.408 5.615 5.817 6.001 6.23 6.458 6.66 6.875 7.122 7.361 7.609 7.866 8.147 8.424 8.713 9.04 9.347 9.695 10.06 10.441 10.832 11.198 11.497 11.514 11.104 10.638 10.158 9.673 9.207 8.784 8.357 7.947 7.524 7.179 6.882 6.591 6.316 6.054 5.791 5.481 5.198 4.976 4.753 4.521 4.33 4.126 3.913 3.74 3.532 3.32 3.119 2.906 2.757 2.594 2.313 2.122 1.944 1.854 1.632 1.407 1.184 1.055 0.698 0.596 0.434 0.268 -0.094 -0.287 -0.468 -0.656 -0.873 -1.11 -1.451 -2.933 -9 ,30181 ,KEBNE ,17043884,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:24:29 CET,0.0 1.196 1.55 1.769 1.969 2.156 2.33 2.485 2.733 2.859 2.989 3.02 3.327 3.425 3.61 3.795 3.958 4.044 4.215 4.359 4.55 4.676 4.81 5.009 5.189 5.339 5.489 5.641 5.831 6.016 6.183 6.381 6.583 6.787 7.01 7.242 7.459 7.684 7.923 8.174 8.422 8.698 9.014 9.328 9.675 10.058 10.489 10.896 11.264 11.57 11.65 11.317 10.86 10.355 9.827 9.345 8.914 8.504 8.147 7.788 7.484 7.203 6.903 6.61 6.334 6.084 5.817 5.561 5.336 5.118 4.884 4.681 4.48 4.26 4.081 3.9 3.713 3.53 3.339 3.197 3.053 2.819 2.649 2.463 2.372 2.187 1.985 1.763 1.64 1.304 1.26 1.121 0.981 0.705 0.558 0.393 0.203 -0.004 -0.252 -0.593 -1.884 -10 ,15498 ,KEBNE ,17043885,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:25:23 CET,0.0 1.185 1.623 1.922 2.125 2.302 2.477 2.629 2.885 3.018 3.138 3.148 3.472 3.575 3.768 3.948 4.116 4.206 4.383 4.543 4.787 4.942 5.09 5.298 5.471 5.628 5.79 5.952 6.174 6.382 6.546 6.736 6.942 7.153 7.398 7.672 7.924 8.186 8.469 8.765 9.074 9.418 9.793 10.153 10.533 10.913 11.344 11.801 12.199 12.476 12.529 12.163 11.619 11.011 10.397 9.799 9.272 8.793 8.377 7.919 7.53 7.195 6.845 6.521 6.22 5.933 5.63 5.358 5.123 4.873 4.619 4.408 4.185 3.971 3.803 3.613 3.406 3.199 2.988 2.855 2.712 2.465 2.306 2.148 2.054 1.836 1.624 1.415 1.309 0.98 0.953 0.83 0.687 0.396 0.242 0.085 -0.073 -0.284 -0.564 -0.914 -1.912 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_6e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_6e.txt deleted file mode 100644 index d0985b5f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_6e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2403 ,KEBNE ,17043886,Thu Dec 23 05:39:31 CET,Thu Dec 23 07:18:46 CET,0.0 0.476 0.748 0.984 1.194 1.369 1.531 1.684 1.956 2.077 2.18 2.167 2.489 2.592 2.795 2.994 3.165 3.26 3.449 3.596 3.808 3.96 4.112 4.316 4.496 4.657 4.826 5.0 5.209 5.404 5.598 5.823 6.037 6.238 6.458 6.724 6.995 7.272 7.56 7.878 8.199 8.544 8.927 9.29 9.713 10.14 10.562 10.993 11.398 11.743 11.968 11.806 11.371 10.869 10.334 9.8 9.311 8.829 8.408 7.98 7.562 7.156 6.76 6.397 6.082 5.796 5.475 5.191 4.941 4.666 4.385 4.158 3.921 3.657 3.442 3.224 3.015 2.82 2.584 2.398 2.22 1.959 1.773 1.579 1.487 1.292 1.056 0.823 0.715 0.417 0.418 0.301 0.174 -0.08 -0.238 -0.436 -0.67 -0.936 -1.233 -1.656 -2.955 -2 ,3179 ,KEBNE ,17043887,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:24:03 CET,0.0 0.771 1.069 1.307 1.524 1.7 1.83 1.96 2.195 2.295 2.393 2.378 2.671 2.764 2.924 3.084 3.234 3.307 3.468 3.617 3.81 3.935 4.063 4.262 4.453 4.625 4.782 4.932 5.136 5.342 5.519 5.726 5.933 6.131 6.36 6.599 6.814 7.065 7.33 7.612 7.916 8.238 8.589 8.887 9.234 9.637 10.036 10.454 10.89 11.195 11.228 10.971 10.589 10.044 9.491 9.029 8.566 8.105 7.678 7.199 6.779 6.408 6.036 5.667 5.325 5.03 4.733 4.477 4.232 3.948 3.658 3.417 3.175 2.936 2.747 2.543 2.329 2.115 1.854 1.657 1.482 1.233 1.055 0.868 0.776 0.588 0.371 0.133 0.013 -0.33 -0.432 -0.588 -0.763 -1.134 -1.317 -1.524 -1.761 -2.056 -2.387 -2.754 -4.358 -3 ,3995 ,KEBNE ,17043888,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:24:06 CET,0.0 0.464 0.712 0.919 1.099 1.259 1.413 1.561 1.831 1.941 2.054 2.064 2.371 2.463 2.639 2.809 2.981 3.064 3.223 3.366 3.551 3.663 3.784 3.98 4.155 4.306 4.446 4.58 4.761 4.932 5.104 5.31 5.493 5.676 5.894 6.135 6.347 6.587 6.863 7.153 7.434 7.746 8.128 8.508 8.923 9.342 9.768 10.208 10.643 11.064 11.43 11.431 11.169 10.804 10.455 10.004 9.531 9.129 8.703 8.248 7.904 7.616 7.325 7.015 6.702 6.432 6.166 5.919 5.692 5.443 5.148 4.893 4.677 4.487 4.317 4.108 3.884 3.672 3.453 3.302 3.163 2.951 2.797 2.614 2.52 2.321 2.097 1.839 1.698 1.357 1.288 1.126 0.96 0.631 0.444 0.222 -0.029 -0.306 -0.643 -1.023 -2.505 -4 ,20111 ,KEBNE ,17043889,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:24:12 CET,0.0 0.612 0.896 1.138 1.324 1.505 1.677 1.817 2.053 2.155 2.251 2.234 2.555 2.659 2.862 3.055 3.231 3.317 3.484 3.638 3.847 3.972 4.091 4.268 4.429 4.579 4.743 4.902 5.093 5.277 5.453 5.656 5.855 6.045 6.263 6.538 6.799 7.062 7.341 7.655 7.98 8.328 8.723 9.123 9.563 9.972 10.399 10.835 11.278 11.717 11.983 11.782 11.344 10.787 10.199 9.683 9.287 8.885 8.487 8.077 7.689 7.371 7.071 6.757 6.455 6.176 5.883 5.611 5.372 5.107 4.825 4.589 4.344 4.095 3.882 3.643 3.403 3.185 2.971 2.814 2.663 2.421 2.248 2.054 1.946 1.736 1.511 1.269 1.134 0.789 0.737 0.577 0.414 0.133 -0.026 -0.214 -0.443 -0.698 -0.978 -1.314 -2.934 -5 ,26542 ,KEBNE ,17043890,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:24:16 CET,0.0 0.537 0.763 0.934 1.111 1.278 1.417 1.533 1.753 1.863 1.974 1.976 2.268 2.352 2.511 2.678 2.823 2.891 3.037 3.175 3.359 3.473 3.584 3.749 3.915 4.074 4.243 4.41 4.608 4.814 5.002 5.211 5.41 5.592 5.793 6.016 6.234 6.472 6.744 7.022 7.291 7.57 7.88 8.21 8.571 8.988 9.452 9.912 10.421 10.943 11.371 11.272 10.914 10.55 10.169 9.73 9.282 8.862 8.496 8.114 7.78 7.466 7.146 6.845 6.549 6.273 6.009 5.766 5.554 5.323 5.082 4.888 4.665 4.438 4.264 4.08 3.898 3.712 3.515 3.375 3.23 3.01 2.842 2.655 2.557 2.36 2.147 1.926 1.809 1.472 1.418 1.27 1.122 0.798 0.61 0.386 0.129 -0.134 -0.434 -0.858 -2.633 -6 ,30337 ,KEBNE ,17043891,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:24:46 CET,0.0 1.239 1.554 1.777 1.953 2.113 2.271 2.42 2.681 2.799 2.903 2.859 3.133 3.206 3.364 3.533 3.679 3.75 3.89 4.019 4.221 4.347 4.458 4.643 4.818 4.973 5.12 5.26 5.442 5.622 5.789 5.983 6.176 6.352 6.541 6.763 6.989 7.221 7.455 7.723 7.992 8.284 8.642 8.983 9.358 9.758 10.158 10.562 10.972 11.253 11.301 11.01 10.551 10.124 9.717 9.312 8.928 8.539 8.187 7.816 7.493 7.183 6.866 6.574 6.302 6.054 5.772 5.515 5.295 5.055 4.805 4.595 4.373 4.14 3.943 3.747 3.556 3.356 3.132 2.977 2.832 2.598 2.434 2.269 2.183 2.001 1.797 1.553 1.428 1.108 1.04 0.889 0.716 0.374 0.182 -0.037 -0.271 -0.543 -0.867 -1.354 -2.912 -7 ,12129 ,KEBNE ,17043892,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:24:31 CET,0.0 0.817 1.095 1.31 1.511 1.706 1.865 1.995 2.235 2.368 2.492 2.506 2.819 2.912 3.107 3.31 3.488 3.563 3.711 3.867 4.092 4.224 4.347 4.529 4.702 4.864 5.023 5.179 5.366 5.551 5.742 5.965 6.175 6.376 6.599 6.852 7.091 7.363 7.643 7.913 8.179 8.513 8.933 9.294 9.667 10.088 10.542 11.014 11.484 11.829 12.0 11.796 11.375 10.859 10.322 9.828 9.375 8.927 8.505 8.042 7.621 7.257 6.918 6.575 6.227 5.911 5.595 5.314 5.077 4.816 4.535 4.313 4.069 3.825 3.625 3.398 3.187 2.965 2.731 2.56 2.379 2.129 1.958 1.763 1.663 1.458 1.245 1.011 0.883 0.533 0.451 0.303 0.159 -0.169 -0.368 -0.586 -0.837 -1.105 -1.385 -1.77 -3.863 -8 ,24412 ,KEBNE ,17043893,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:24:04 CET,0.0 0.557 0.822 1.027 1.222 1.381 1.523 1.67 1.939 2.064 2.181 2.213 2.506 2.598 2.787 2.955 3.121 3.205 3.362 3.506 3.7 3.827 3.959 4.158 4.341 4.506 4.656 4.799 5.002 5.197 5.377 5.586 5.778 5.972 6.189 6.421 6.661 6.914 7.159 7.418 7.681 7.956 8.297 8.647 9.024 9.409 9.828 10.242 10.676 11.059 11.194 10.972 10.557 10.063 9.553 9.026 8.568 8.148 7.765 7.387 7.029 6.7 6.39 6.084 5.806 5.544 5.245 4.97 4.72 4.452 4.186 3.961 3.701 3.431 3.244 3.053 2.855 2.627 2.382 2.221 2.05 1.79 1.619 1.432 1.327 1.1 0.87 0.66 0.545 0.225 0.155 0.016 -0.111 -0.413 -0.612 -0.835 -1.091 -1.363 -1.656 -2.023 -3.445 -9 ,12190 ,KEBNE ,17043894,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:25:00 CET,0.0 0.48 0.767 1.038 1.258 1.407 1.549 1.695 1.965 2.087 2.215 2.234 2.556 2.651 2.826 2.987 3.146 3.235 3.398 3.538 3.754 3.905 4.05 4.25 4.44 4.618 4.779 4.927 5.114 5.3 5.484 5.725 5.96 6.187 6.446 6.71 6.955 7.235 7.534 7.857 8.189 8.538 8.943 9.341 9.74 10.149 10.628 11.082 11.53 11.946 12.184 11.943 11.502 10.953 10.394 9.859 9.349 8.868 8.408 7.931 7.541 7.189 6.866 6.569 6.28 5.984 5.648 5.37 5.135 4.869 4.606 4.398 4.176 3.944 3.754 3.556 3.352 3.138 2.928 2.792 2.634 2.362 2.164 1.942 1.821 1.578 1.311 1.033 0.907 0.571 0.507 0.379 0.23 -0.148 -0.362 -0.587 -0.847 -1.14 -1.5 -1.927 -3.507 -10 ,572 ,KEBNE ,17043895,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:24:32 CET,0.0 1.061 1.433 1.691 1.882 2.044 2.193 2.314 2.556 2.694 2.819 2.819 3.131 3.232 3.435 3.629 3.808 3.886 4.049 4.196 4.382 4.516 4.649 4.837 5.022 5.204 5.379 5.55 5.779 5.993 6.184 6.425 6.658 6.872 7.107 7.375 7.627 7.897 8.211 8.521 8.803 9.104 9.446 9.756 10.102 10.522 10.985 11.401 11.84 12.286 12.486 12.237 11.815 11.303 10.767 10.273 9.801 9.325 8.913 8.549 8.211 7.872 7.549 7.244 6.942 6.635 6.315 6.042 5.813 5.57 5.305 5.074 4.837 4.604 4.419 4.228 4.028 3.804 3.573 3.415 3.244 2.96 2.771 2.584 2.489 2.299 2.083 1.837 1.713 1.366 1.287 1.136 0.975 0.619 0.416 0.203 -0.025 -0.273 -0.558 -0.955 -2.096 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_7a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_7a.txt deleted file mode 100644 index a58957ab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_7a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21020 ,TETRA ,17377741,Sat Nov 20 21:26:03 CET,Sat Nov 20 23:39:56 CET,0.0 2.04 2.452 2.767 3.018 3.245 3.46 3.636 3.978 4.157 4.31 4.369 4.686 4.809 5.035 5.228 5.408 5.497 5.667 5.827 6.054 6.187 6.319 6.522 6.708 6.881 7.045 7.209 7.427 7.624 7.802 8.029 8.259 8.486 8.742 9.015 9.276 9.547 9.837 10.143 10.435 10.743 11.127 11.497 11.883 12.315 12.798 13.3 13.764 14.192 14.582 14.613 14.403 14.141 13.798 13.361 12.928 12.51 12.142 11.774 11.458 11.156 10.846 10.547 10.26 10.001 9.726 9.478 9.275 9.063 8.831 8.635 8.426 8.197 8.028 7.853 7.684 7.502 7.29 7.152 7.021 6.821 6.675 6.515 6.426 6.224 6.019 5.79 5.666 5.351 5.323 5.202 5.077 4.796 4.616 4.407 4.174 3.935 3.595 3.119 1.7 -2 ,29009 ,TETRA ,17377744,Sat Nov 20 21:33:38 CET,Sat Nov 20 23:56:00 CET,0.0 2.419 2.851 3.199 3.481 3.71 3.914 4.094 4.403 4.55 4.69 4.74 5.043 5.158 5.387 5.571 5.747 5.827 6.003 6.182 6.395 6.521 6.653 6.855 7.047 7.235 7.419 7.602 7.838 8.045 8.224 8.435 8.643 8.833 9.053 9.306 9.525 9.789 10.067 10.329 10.618 10.945 11.288 11.607 11.989 12.386 12.793 13.207 13.615 13.985 14.241 14.113 13.725 13.288 12.854 12.411 12.011 11.652 11.326 10.954 10.635 10.347 10.066 9.811 9.556 9.316 9.067 8.844 8.653 8.457 8.239 8.049 7.859 7.67 7.52 7.359 7.202 7.035 6.845 6.715 6.571 6.338 6.181 6.019 5.939 5.766 5.582 5.384 5.271 4.962 4.922 4.79 4.644 4.339 4.162 3.963 3.76 3.518 3.206 2.714 0.731 -3 ,19175 ,TETRA ,17377745,Sat Nov 20 21:32:20 CET,Sat Nov 20 23:45:34 CET,0.0 1.326 1.744 2.067 2.292 2.494 2.673 2.846 3.204 3.368 3.513 3.587 3.935 4.065 4.28 4.489 4.729 4.835 5.001 5.148 5.36 5.513 5.675 5.911 6.128 6.341 6.541 6.718 6.936 7.145 7.348 7.595 7.828 8.05 8.303 8.593 8.845 9.099 9.391 9.71 10.021 10.345 10.739 11.136 11.586 12.081 12.608 13.138 13.655 14.115 14.49 14.456 14.15 13.741 13.316 12.878 12.437 12.026 11.675 11.327 11.029 10.762 10.493 10.215 9.948 9.687 9.407 9.155 8.943 8.724 8.48 8.284 8.097 7.912 7.751 7.569 7.381 7.192 6.994 6.856 6.71 6.485 6.342 6.186 6.103 5.935 5.758 5.57 5.463 5.146 5.105 4.99 4.863 4.566 4.38 4.168 3.951 3.713 3.408 2.964 1.189 -4 ,30704 ,TETRA ,17377747,Sat Nov 20 21:33:38 CET,Sat Nov 20 23:55:58 CET,0.0 2.326 2.755 3.035 3.27 3.478 3.666 3.842 4.159 4.31 4.458 4.535 4.855 4.96 5.174 5.366 5.547 5.636 5.801 5.968 6.197 6.336 6.462 6.651 6.842 7.016 7.177 7.326 7.53 7.728 7.917 8.14 8.344 8.541 8.768 9.01 9.233 9.488 9.784 10.1 10.434 10.791 11.185 11.583 12.009 12.443 12.887 13.355 13.869 14.399 14.757 14.654 14.372 14.017 13.614 13.194 12.815 12.437 12.085 11.715 11.379 11.096 10.822 10.549 10.293 10.061 9.815 9.582 9.381 9.175 8.965 8.781 8.581 8.383 8.241 8.091 7.915 7.724 7.535 7.41 7.266 7.032 6.88 6.71 6.632 6.475 6.295 6.108 6.003 5.7 5.656 5.512 5.368 5.1 4.952 4.79 4.625 4.394 4.066 3.645 2.101 -5 ,32696 ,TETRA ,17377749,Sat Nov 20 21:33:37 CET,Sat Nov 20 23:47:05 CET,0.0 2.204 2.61 2.921 3.214 3.463 3.652 3.837 4.164 4.281 4.381 4.392 4.697 4.8 5.022 5.215 5.39 5.479 5.647 5.823 6.076 6.219 6.354 6.567 6.76 6.944 7.121 7.274 7.468 7.661 7.851 8.064 8.26 8.451 8.662 8.906 9.137 9.372 9.616 9.882 10.157 10.46 10.811 11.158 11.563 11.961 12.369 12.783 13.215 13.596 13.726 13.477 13.104 12.66 12.219 11.819 11.446 11.109 10.786 10.45 10.16 9.898 9.635 9.368 9.137 8.93 8.703 8.487 8.303 8.112 7.889 7.704 7.51 7.312 7.168 7.01 6.839 6.657 6.475 6.345 6.207 5.997 5.843 5.687 5.604 5.43 5.257 5.086 4.982 4.664 4.632 4.512 4.396 4.127 3.964 3.773 3.56 3.323 3.017 2.675 0.853 -6 ,33 ,TETRA ,17377751,Sat Nov 20 21:33:38 CET,Sat Nov 20 23:47:13 CET,0.0 2.465 2.879 3.22 3.521 3.773 3.963 4.112 4.391 4.528 4.658 4.681 4.985 5.088 5.285 5.458 5.641 5.727 5.892 6.075 6.329 6.468 6.608 6.816 6.995 7.156 7.322 7.492 7.694 7.904 8.111 8.333 8.534 8.724 8.956 9.219 9.46 9.703 9.983 10.286 10.59 10.923 11.314 11.742 12.2 12.638 13.115 13.626 14.174 14.65 14.938 14.85 14.552 14.204 13.835 13.441 13.066 12.721 12.4 12.053 11.756 11.485 11.203 10.928 10.672 10.442 10.2 9.98 9.783 9.571 9.358 9.156 8.924 8.717 8.566 8.393 8.197 7.993 7.801 7.679 7.547 7.325 7.172 7.022 6.945 6.763 6.528 6.278 6.162 5.84 5.758 5.626 5.486 5.159 4.978 4.795 4.609 4.38 4.102 3.699 2.049 -7 ,7190 ,TETRA ,17377753,Sat Nov 20 21:33:37 CET,Sat Nov 20 23:51:01 CET,0.0 2.603 3.064 3.407 3.629 3.857 4.093 4.312 4.666 4.801 4.945 5.033 5.381 5.533 5.832 6.076 6.316 6.425 6.623 6.822 7.104 7.278 7.439 7.691 7.941 8.17 8.386 8.584 8.826 9.049 9.269 9.545 9.816 10.057 10.314 10.604 10.89 11.206 11.557 11.917 12.263 12.645 13.086 13.486 13.952 14.471 14.966 15.493 16.054 16.445 16.604 16.412 16.132 15.797 15.391 14.955 14.532 14.123 13.778 13.416 13.061 12.745 12.441 12.16 11.901 11.654 11.388 11.138 10.93 10.721 10.493 10.308 10.111 9.905 9.745 9.569 9.387 9.188 8.967 8.808 8.649 8.433 8.281 8.118 8.035 7.866 7.678 7.47 7.362 7.061 7.038 6.898 6.739 6.417 6.23 6.03 5.807 5.552 5.265 4.865 3.443 -8 ,4581 ,TETRA ,17377755,Sat Nov 20 21:33:41 CET,Sat Nov 20 23:42:37 CET,0.0 1.796 2.142 2.395 2.653 2.912 3.135 3.326 3.651 3.81 3.955 4.011 4.331 4.439 4.628 4.812 5.005 5.094 5.255 5.409 5.622 5.752 5.878 6.081 6.288 6.483 6.667 6.829 7.042 7.257 7.452 7.682 7.9 8.091 8.306 8.562 8.815 9.085 9.373 9.713 10.055 10.41 10.848 11.237 11.614 12.053 12.616 13.197 13.707 14.187 14.546 14.426 14.056 13.644 13.235 12.814 12.408 12.024 11.649 11.266 10.949 10.64 10.319 10.034 9.797 9.554 9.294 9.063 8.853 8.645 8.434 8.255 8.074 7.861 7.694 7.536 7.357 7.171 6.987 6.86 6.73 6.523 6.38 6.236 6.151 5.961 5.765 5.545 5.442 5.135 5.104 4.99 4.865 4.549 4.384 4.22 4.05 3.794 3.492 3.17 1.758 -9 ,16263 ,TETRA ,17377757,Sat Nov 20 21:33:40 CET,Sat Nov 20 23:50:57 CET,0.0 1.771 2.226 2.515 2.777 3.0 3.213 3.432 3.773 3.91 4.05 4.111 4.426 4.533 4.741 4.945 5.145 5.239 5.403 5.552 5.768 5.91 6.049 6.25 6.438 6.621 6.793 6.957 7.191 7.404 7.589 7.803 8.018 8.217 8.43 8.681 8.917 9.165 9.432 9.699 9.988 10.329 10.7 11.017 11.375 11.772 12.145 12.534 12.973 13.326 13.431 13.187 12.766 12.32 11.882 11.427 10.99 10.578 10.239 9.874 9.544 9.253 8.959 8.67 8.398 8.151 7.893 7.665 7.459 7.237 7.018 6.833 6.631 6.42 6.258 6.087 5.899 5.708 5.506 5.369 5.232 5.02 4.865 4.693 4.612 4.436 4.249 4.063 3.959 3.648 3.606 3.482 3.345 3.023 2.838 2.645 2.439 2.196 1.912 1.489 -0.043 -10 ,26942 ,TETRA ,17377759,Sat Nov 20 21:33:41 CET,Sat Nov 20 23:45:46 CET,0.0 2.503 2.9 3.19 3.469 3.726 3.95 4.137 4.487 4.647 4.796 4.86 5.193 5.305 5.55 5.783 5.999 6.096 6.267 6.423 6.654 6.826 6.994 7.223 7.434 7.638 7.85 8.047 8.287 8.512 8.705 8.923 9.139 9.351 9.589 9.866 10.132 10.411 10.722 11.077 11.441 11.785 12.194 12.621 13.037 13.471 13.963 14.436 14.922 15.386 15.724 15.688 15.43 15.092 14.693 14.297 13.947 13.583 13.23 12.875 12.56 12.288 12.029 11.768 11.507 11.273 11.028 10.769 10.539 10.325 10.109 9.907 9.686 9.473 9.321 9.161 8.983 8.808 8.619 8.479 8.335 8.102 7.937 7.764 7.68 7.516 7.335 7.124 7.0 6.672 6.607 6.469 6.339 6.081 5.936 5.763 5.543 5.312 5.032 4.647 3.434 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6a.txt deleted file mode 100644 index 5ced97eb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13082 ,TETRA ,17377761,Sat Nov 20 21:33:40 CET,Sat Nov 20 23:47:10 CET,0.0 1.026 1.354 1.585 1.792 1.99 2.177 2.336 2.563 2.677 2.802 2.828 3.155 3.276 3.521 3.737 3.943 4.044 4.217 4.375 4.613 4.77 4.905 5.078 5.245 5.43 5.642 5.834 6.052 6.267 6.478 6.718 6.935 7.168 7.44 7.705 7.966 8.261 8.564 8.877 9.208 9.55 9.933 10.363 10.86 11.355 11.837 12.309 12.787 13.215 13.401 12.996 12.425 11.865 11.368 10.906 10.458 10.046 9.675 9.311 9.001 8.713 8.44 8.176 7.912 7.672 7.423 7.2 7.025 6.846 6.653 6.483 6.302 6.125 5.981 5.812 5.655 5.511 5.335 5.214 5.096 4.907 4.783 4.647 4.569 4.408 4.259 4.105 4.015 3.717 3.719 3.621 3.528 3.312 3.161 2.982 2.815 2.649 2.443 2.158 1.369 -2 ,21404 ,TETRA ,17377763,Sat Nov 20 21:33:43 CET,Sat Nov 20 23:46:08 CET,0.0 0.885 1.219 1.46 1.672 1.879 2.057 2.231 2.559 2.704 2.848 2.9 3.221 3.335 3.573 3.798 4.0 4.093 4.271 4.432 4.668 4.814 4.943 5.133 5.33 5.525 5.71 5.888 6.114 6.319 6.5 6.701 6.919 7.143 7.365 7.621 7.885 8.15 8.412 8.7 9.029 9.381 9.733 10.065 10.435 10.844 11.292 11.667 11.962 12.18 12.239 11.929 11.464 10.949 10.456 9.97 9.508 9.062 8.679 8.319 8.004 7.732 7.462 7.197 6.939 6.706 6.476 6.247 6.052 5.85 5.625 5.437 5.247 5.051 4.89 4.712 4.524 4.324 4.136 4.007 3.862 3.635 3.479 3.326 3.242 3.052 2.851 2.642 2.54 2.233 2.223 2.108 1.992 1.724 1.57 1.402 1.219 1.038 0.831 0.56 -0.137 -3 ,27650 ,TETRA ,17377765,Sat Nov 20 21:34:13 CET,Sat Nov 20 23:46:09 CET,0.0 0.895 1.272 1.567 1.812 2.018 2.187 2.342 2.627 2.75 2.863 2.866 3.164 3.258 3.431 3.592 3.75 3.827 3.986 4.147 4.372 4.513 4.64 4.824 5.009 5.181 5.348 5.503 5.697 5.88 6.051 6.266 6.473 6.666 6.909 7.175 7.419 7.676 7.931 8.184 8.436 8.755 9.122 9.468 9.872 10.262 10.649 11.046 11.38 11.615 11.642 11.249 10.791 10.361 9.889 9.408 8.989 8.595 8.242 7.898 7.601 7.311 7.023 6.722 6.444 6.212 5.946 5.701 5.512 5.3 5.054 4.867 4.684 4.492 4.337 4.19 4.041 3.87 3.693 3.567 3.434 3.245 3.112 2.962 2.892 2.753 2.596 2.426 2.335 2.046 2.065 1.953 1.835 1.579 1.444 1.307 1.149 0.971 0.76 0.506 0.142 -4 ,21885 ,TETRA ,17377767,Sat Nov 20 21:34:15 CET,Sat Nov 20 23:42:21 CET,0.0 1.05 1.424 1.67 1.885 2.089 2.272 2.431 2.769 2.922 3.055 3.112 3.434 3.548 3.765 3.97 4.175 4.276 4.475 4.659 4.897 5.049 5.19 5.404 5.625 5.836 6.046 6.244 6.47 6.678 6.896 7.181 7.462 7.723 8.007 8.315 8.6 8.871 9.137 9.414 9.687 9.998 10.348 10.668 11.007 11.347 11.684 11.976 12.229 12.399 12.376 12.016 11.548 11.029 10.544 10.091 9.633 9.22 8.901 8.582 8.289 8.004 7.736 7.498 7.27 7.064 6.845 6.64 6.474 6.293 6.1 5.946 5.776 5.578 5.414 5.262 5.113 4.954 4.797 4.686 4.567 4.365 4.219 4.066 3.984 3.82 3.662 3.488 3.388 3.088 3.114 2.995 2.856 2.588 2.465 2.355 2.219 2.027 1.83 1.605 0.794 -5 ,32658 ,TETRA ,17377769,Sat Nov 20 21:34:15 CET,Sat Nov 20 23:50:59 CET,0.0 1.097 1.536 1.862 2.114 2.353 2.562 2.737 3.045 3.189 3.334 3.371 3.695 3.802 4.022 4.245 4.458 4.557 4.739 4.909 5.147 5.301 5.445 5.645 5.844 6.022 6.188 6.352 6.557 6.767 6.966 7.202 7.413 7.598 7.817 8.07 8.334 8.621 8.897 9.197 9.491 9.776 10.12 10.47 10.855 11.247 11.627 12.026 12.457 12.767 12.782 12.373 11.882 11.392 10.88 10.346 9.863 9.414 9.016 8.621 8.265 7.939 7.648 7.386 7.109 6.846 6.6 6.383 6.179 5.966 5.749 5.569 5.364 5.136 4.962 4.784 4.597 4.4 4.198 4.064 3.937 3.73 3.575 3.416 3.333 3.169 3.008 2.844 2.757 2.447 2.428 2.308 2.182 1.935 1.784 1.605 1.446 1.208 0.933 0.657 -0.56 -6 ,18454 ,TETRA ,17377771,Sat Nov 20 21:34:18 CET,Sat Nov 20 23:46:02 CET,0.0 1.438 1.876 2.233 2.495 2.695 2.882 3.041 3.347 3.503 3.651 3.739 4.09 4.212 4.448 4.676 4.899 5.003 5.183 5.362 5.618 5.777 5.936 6.179 6.432 6.658 6.849 7.04 7.283 7.504 7.712 7.966 8.211 8.446 8.725 9.012 9.285 9.586 9.899 10.218 10.534 10.861 11.196 11.481 11.826 12.225 12.621 13.048 13.502 13.838 13.86 13.477 12.988 12.487 12.017 11.526 11.056 10.636 10.277 9.921 9.595 9.292 9.002 8.722 8.453 8.208 7.95 7.723 7.534 7.323 7.114 6.947 6.76 6.566 6.414 6.252 6.077 5.901 5.715 5.582 5.457 5.258 5.089 4.924 4.845 4.671 4.485 4.288 4.183 3.871 3.888 3.757 3.597 3.261 3.101 2.927 2.742 2.539 2.29 2.011 1.338 -7 ,20279 ,TETRA ,17377773,Sat Nov 20 21:34:18 CET,Sat Nov 20 23:50:57 CET,0.0 0.931 1.339 1.706 2.0 2.22 2.398 2.564 2.888 3.021 3.147 3.208 3.53 3.656 3.902 4.113 4.305 4.403 4.59 4.769 5.044 5.22 5.384 5.598 5.789 5.982 6.154 6.317 6.522 6.705 6.886 7.118 7.339 7.533 7.757 8.017 8.247 8.482 8.745 9.03 9.331 9.653 9.993 10.32 10.675 11.016 11.364 11.755 12.152 12.437 12.418 11.99 11.533 11.045 10.55 10.104 9.687 9.293 8.932 8.57 8.265 7.98 7.697 7.415 7.143 6.899 6.652 6.415 6.204 5.978 5.754 5.58 5.361 5.139 4.982 4.804 4.613 4.422 4.237 4.111 3.969 3.737 3.58 3.424 3.345 3.158 2.961 2.751 2.646 2.327 2.305 2.182 2.042 1.715 1.547 1.369 1.165 0.959 0.704 0.399 -0.541 -8 ,21029 ,TETRA ,17377775,Sat Nov 20 21:34:18 CET,Sat Nov 20 23:45:54 CET,0.0 0.893 1.204 1.419 1.637 1.831 2.005 2.164 2.429 2.561 2.692 2.732 3.05 3.163 3.351 3.517 3.695 3.779 3.932 4.1 4.332 4.463 4.588 4.765 4.929 5.09 5.244 5.39 5.586 5.789 5.986 6.2 6.398 6.601 6.841 7.097 7.343 7.621 7.895 8.17 8.462 8.783 9.142 9.471 9.86 10.281 10.677 11.04 11.363 11.55 11.475 11.061 10.555 10.006 9.514 9.079 8.669 8.288 7.944 7.6 7.298 7.009 6.724 6.451 6.198 5.957 5.691 5.456 5.261 5.061 4.851 4.669 4.488 4.301 4.149 3.985 3.81 3.643 3.472 3.353 3.239 3.075 2.963 2.847 2.778 2.62 2.457 2.289 2.204 1.898 1.882 1.776 1.658 1.414 1.281 1.125 0.961 0.795 0.569 0.284 -0.366 -9 ,5373 ,TETRA ,17377777,Sat Nov 20 21:34:18 CET,Sat Nov 20 23:50:19 CET,0.0 1.063 1.373 1.66 1.949 2.218 2.425 2.593 2.925 3.066 3.195 3.25 3.579 3.697 3.933 4.15 4.353 4.456 4.65 4.82 5.054 5.194 5.325 5.52 5.702 5.889 6.078 6.252 6.472 6.67 6.86 7.106 7.332 7.538 7.782 8.064 8.313 8.584 8.854 9.134 9.423 9.727 10.086 10.44 10.82 11.198 11.601 11.974 12.331 12.679 12.859 12.612 12.16 11.621 11.092 10.604 10.142 9.709 9.335 8.99 8.686 8.394 8.133 7.871 7.611 7.383 7.143 6.929 6.749 6.553 6.347 6.167 5.956 5.711 5.525 5.36 5.192 5.013 4.819 4.679 4.533 4.318 4.176 4.021 3.943 3.765 3.571 3.375 3.28 2.971 2.945 2.829 2.706 2.391 2.211 2.011 1.824 1.636 1.397 1.124 0.113 -10 ,9442 ,TETRA ,17377779,Sat Nov 20 21:34:19 CET,Sat Nov 20 23:46:47 CET,0.0 0.83 1.179 1.479 1.73 1.944 2.117 2.289 2.58 2.702 2.847 2.906 3.232 3.352 3.586 3.802 3.999 4.092 4.27 4.44 4.7 4.866 5.018 5.224 5.397 5.565 5.742 5.908 6.102 6.294 6.492 6.722 6.954 7.176 7.425 7.694 7.931 8.202 8.496 8.775 9.039 9.35 9.708 10.063 10.492 10.922 11.326 11.687 12.034 12.301 12.227 11.767 11.223 10.678 10.15 9.608 9.099 8.619 8.205 7.812 7.485 7.188 6.91 6.668 6.435 6.217 5.962 5.713 5.511 5.317 5.114 4.938 4.762 4.59 4.451 4.291 4.131 3.975 3.805 3.682 3.557 3.368 3.218 3.062 2.992 2.857 2.713 2.543 2.458 2.166 2.179 2.078 1.973 1.731 1.576 1.412 1.242 1.066 0.858 0.504 -0.417 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6b.txt deleted file mode 100644 index 058f60d4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15091 ,TETRA ,17377781,Sat Nov 20 21:34:19 CET,Sat Nov 20 23:52:55 CET,0.0 1.405 1.77 2.048 2.294 2.536 2.739 2.909 3.224 3.363 3.496 3.542 3.861 3.982 4.211 4.42 4.627 4.729 4.92 5.116 5.37 5.523 5.67 5.881 6.082 6.259 6.421 6.58 6.792 7.02 7.245 7.5 7.751 7.983 8.223 8.486 8.736 8.998 9.296 9.624 9.958 10.305 10.685 11.058 11.512 12.013 12.514 12.972 13.391 13.786 14.009 13.759 13.308 12.824 12.373 11.955 11.503 11.066 10.73 10.39 10.073 9.787 9.519 9.278 9.048 8.815 8.573 8.356 8.151 7.941 7.742 7.57 7.378 7.169 6.997 6.823 6.649 6.486 6.333 6.224 6.119 5.944 5.817 5.687 5.613 5.445 5.269 5.096 5.015 4.709 4.69 4.586 4.489 4.274 4.156 4.018 3.864 3.709 3.47 3.097 2.003 -2 ,32650 ,TETRA ,17377782,Sat Nov 20 21:34:20 CET,Sat Nov 20 23:49:05 CET,0.0 1.365 1.743 2.056 2.302 2.478 2.645 2.813 3.122 3.257 3.386 3.424 3.721 3.828 4.018 4.194 4.377 4.456 4.607 4.764 4.985 5.131 5.293 5.535 5.741 5.917 6.084 6.248 6.486 6.749 6.999 7.258 7.475 7.677 7.915 8.185 8.442 8.709 8.996 9.331 9.677 10.02 10.38 10.765 11.205 11.645 12.112 12.572 13.066 13.538 13.778 13.586 13.165 12.673 12.227 11.824 11.407 10.983 10.646 10.319 10.005 9.726 9.463 9.198 8.94 8.708 8.472 8.256 8.066 7.859 7.648 7.49 7.321 7.135 6.992 6.847 6.694 6.518 6.33 6.206 6.078 5.882 5.747 5.611 5.541 5.397 5.243 5.073 4.988 4.706 4.723 4.628 4.526 4.274 4.125 3.969 3.8 3.598 3.344 3.07 2.324 -3 ,19201 ,TETRA ,17377784,Sat Nov 20 21:34:20 CET,Sat Nov 20 23:44:58 CET,0.0 1.911 2.297 2.601 2.862 3.109 3.326 3.508 3.847 4.002 4.159 4.224 4.56 4.696 4.945 5.159 5.344 5.438 5.642 5.839 6.099 6.254 6.402 6.627 6.849 7.053 7.248 7.442 7.702 7.961 8.191 8.453 8.715 8.977 9.254 9.558 9.857 10.157 10.469 10.804 11.136 11.476 11.876 12.277 12.728 13.19 13.665 14.135 14.596 15.01 15.239 15.013 14.592 14.131 13.643 13.169 12.708 12.285 11.932 11.563 11.234 10.932 10.643 10.372 10.115 9.874 9.622 9.392 9.202 9.014 8.817 8.637 8.441 8.249 8.099 7.943 7.768 7.583 7.401 7.266 7.125 6.915 6.78 6.631 6.544 6.373 6.188 5.991 5.888 5.577 5.589 5.473 5.338 4.995 4.806 4.626 4.446 4.24 3.973 3.661 3.064 -4 ,11623 ,TETRA ,17377786,Sat Nov 20 21:34:18 CET,Sat Nov 20 23:45:41 CET,0.0 1.013 1.342 1.597 1.82 2.015 2.201 2.362 2.674 2.831 2.977 3.043 3.351 3.46 3.708 3.959 4.167 4.258 4.435 4.613 4.871 5.018 5.159 5.37 5.568 5.756 5.945 6.124 6.34 6.548 6.745 6.995 7.237 7.448 7.688 7.973 8.265 8.58 8.892 9.195 9.494 9.846 10.267 10.632 11.027 11.472 11.929 12.372 12.794 13.168 13.437 13.265 12.832 12.379 11.951 11.533 11.129 10.732 10.366 9.976 9.641 9.361 9.101 8.83 8.551 8.305 8.057 7.84 7.664 7.464 7.243 7.063 6.888 6.715 6.574 6.434 6.29 6.132 5.963 5.834 5.693 5.492 5.355 5.205 5.127 4.979 4.811 4.627 4.544 4.261 4.279 4.187 4.087 3.856 3.736 3.607 3.469 3.335 3.173 2.927 2.394 -5 ,7741 ,TETRA ,17377788,Sat Nov 20 21:35:03 CET,Sat Nov 20 23:53:04 CET,0.0 1.087 1.55 1.868 2.112 2.32 2.493 2.668 2.976 3.108 3.238 3.263 3.578 3.698 3.912 4.083 4.275 4.377 4.54 4.689 4.92 5.072 5.212 5.419 5.631 5.823 6.008 6.202 6.444 6.672 6.881 7.121 7.367 7.602 7.865 8.15 8.43 8.736 9.035 9.342 9.652 9.987 10.337 10.665 11.055 11.482 11.939 12.419 12.925 13.37 13.637 13.527 13.175 12.669 12.142 11.709 11.312 10.922 10.562 10.207 9.913 9.629 9.331 9.056 8.812 8.566 8.326 8.122 7.923 7.739 7.563 7.405 7.244 7.075 6.936 6.786 6.64 6.485 6.308 6.187 6.059 5.864 5.733 5.595 5.522 5.37 5.212 5.03 4.945 4.653 4.674 4.576 4.46 4.211 4.077 3.939 3.783 3.608 3.398 3.168 2.788 -6 ,22906 ,TETRA ,17377790,Sat Nov 20 21:35:03 CET,Sat Nov 20 23:50:56 CET,0.0 1.408 1.751 2.006 2.214 2.44 2.637 2.809 3.141 3.282 3.421 3.492 3.819 3.941 4.159 4.365 4.557 4.644 4.817 4.989 5.231 5.377 5.51 5.722 5.934 6.11 6.28 6.452 6.667 6.887 7.117 7.391 7.644 7.879 8.134 8.4 8.658 8.941 9.234 9.529 9.815 10.134 10.491 10.835 11.255 11.691 12.14 12.622 13.069 13.405 13.591 13.435 13.109 12.735 12.323 11.914 11.538 11.189 10.882 10.55 10.249 9.96 9.67 9.404 9.157 8.937 8.701 8.491 8.308 8.119 7.91 7.725 7.539 7.324 7.153 6.988 6.811 6.629 6.445 6.314 6.187 5.975 5.819 5.664 5.584 5.418 5.241 5.062 4.962 4.634 4.609 4.5 4.398 4.129 3.966 3.792 3.613 3.453 3.262 2.95 2.247 -7 ,16452 ,TETRA ,17377792,Sat Nov 20 21:34:22 CET,Sat Nov 20 23:45:42 CET,0.0 1.294 1.709 2.062 2.391 2.67 2.897 3.094 3.448 3.607 3.753 3.838 4.17 4.302 4.552 4.787 4.999 5.103 5.305 5.487 5.755 5.934 6.096 6.311 6.518 6.717 6.915 7.105 7.334 7.548 7.753 8.031 8.301 8.552 8.844 9.155 9.438 9.722 10.027 10.349 10.684 11.084 11.533 11.925 12.298 12.691 13.109 13.513 13.89 14.226 14.347 14.026 13.577 13.083 12.617 12.21 11.838 11.424 11.061 10.707 10.385 10.108 9.847 9.585 9.323 9.084 8.826 8.599 8.405 8.203 7.994 7.813 7.617 7.413 7.254 7.09 6.926 6.76 6.594 6.472 6.336 6.131 5.987 5.847 5.777 5.615 5.438 5.275 5.202 4.916 4.94 4.846 4.738 4.5 4.365 4.224 4.07 3.916 3.717 3.46 2.818 -8 ,8509 ,TETRA ,17377794,Sat Nov 20 21:34:25 CET,Sat Nov 20 23:50:16 CET,0.0 1.305 1.787 2.118 2.407 2.633 2.825 3.014 3.351 3.513 3.671 3.758 4.102 4.231 4.48 4.694 4.904 5.014 5.219 5.415 5.689 5.864 6.016 6.231 6.457 6.676 6.897 7.099 7.337 7.565 7.791 8.085 8.365 8.623 8.933 9.271 9.591 9.948 10.301 10.649 11.011 11.418 11.88 12.308 12.793 13.335 13.9 14.444 15.007 15.473 15.671 15.516 15.188 14.678 14.132 13.661 13.266 12.871 12.485 12.1 11.774 11.47 11.163 10.887 10.64 10.407 10.17 9.954 9.773 9.584 9.369 9.203 9.034 8.841 8.68 8.507 8.341 8.176 7.998 7.865 7.727 7.515 7.368 7.226 7.159 7.014 6.842 6.644 6.537 6.215 6.211 6.104 5.987 5.735 5.601 5.45 5.3 5.137 4.94 4.714 4.212 -9 ,19755 ,TETRA ,17377796,Sat Nov 20 21:35:03 CET,Sat Nov 20 23:50:14 CET,0.0 1.211 1.563 1.858 2.083 2.289 2.497 2.69 3.042 3.191 3.32 3.372 3.7 3.836 4.097 4.325 4.525 4.623 4.822 5.014 5.293 5.455 5.598 5.82 6.03 6.223 6.408 6.583 6.792 6.998 7.214 7.477 7.721 7.93 8.17 8.448 8.702 8.967 9.251 9.562 9.89 10.246 10.656 11.039 11.446 11.914 12.39 12.823 13.277 13.582 13.715 13.516 13.074 12.612 12.153 11.694 11.259 10.843 10.488 10.144 9.843 9.563 9.28 8.995 8.747 8.521 8.292 8.102 7.928 7.736 7.532 7.36 7.176 6.982 6.827 6.661 6.486 6.314 6.141 6.022 5.903 5.717 5.571 5.407 5.328 5.177 5.021 4.867 4.78 4.482 4.488 4.389 4.279 4.049 3.908 3.753 3.581 3.394 3.204 2.919 2.288 -10 ,5387 ,TETRA ,17377798,Sat Nov 20 21:35:03 CET,Sat Nov 20 23:52:08 CET,0.0 0.868 1.281 1.653 1.935 2.165 2.357 2.518 2.823 2.955 3.076 3.104 3.431 3.563 3.8 4.028 4.246 4.355 4.55 4.723 4.986 5.149 5.304 5.533 5.751 5.953 6.153 6.337 6.549 6.751 6.941 7.169 7.413 7.654 7.904 8.2 8.501 8.806 9.11 9.415 9.739 10.118 10.546 10.928 11.328 11.705 12.085 12.499 12.918 13.296 13.441 13.249 12.878 12.402 11.962 11.58 11.2 10.803 10.432 10.051 9.751 9.477 9.187 8.919 8.67 8.428 8.168 7.931 7.723 7.503 7.283 7.106 6.917 6.718 6.563 6.404 6.231 6.055 5.881 5.759 5.629 5.42 5.271 5.118 5.04 4.869 4.701 4.544 4.464 4.166 4.143 4.025 3.902 3.646 3.504 3.341 3.184 3.035 2.859 2.6 1.99 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_7a_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_7a_3a.txt deleted file mode 100644 index ec6ad1fc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/protein/Summary_FEP_7a_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28720 ,TETRA ,17377801,Sat Nov 20 21:35:07 CET,Sat Nov 20 23:59:00 CET,0.0 1.029 1.387 1.615 1.788 1.941 2.082 2.222 2.454 2.56 2.662 2.656 2.948 3.034 3.191 3.337 3.49 3.568 3.711 3.84 4.022 4.146 4.268 4.449 4.625 4.805 4.971 5.102 5.279 5.469 5.643 5.825 6.004 6.195 6.419 6.669 6.91 7.167 7.425 7.698 7.989 8.301 8.653 8.994 9.393 9.847 10.332 10.828 11.292 11.787 12.168 12.127 11.88 11.485 11.049 10.644 10.287 9.943 9.627 9.288 8.963 8.677 8.381 8.069 7.796 7.556 7.337 7.13 6.923 6.7 6.468 6.288 6.088 5.853 5.674 5.501 5.312 5.105 4.884 4.726 4.568 4.35 4.204 4.039 3.952 3.769 3.57 3.367 3.258 2.947 2.887 2.739 2.562 2.191 2.001 1.785 1.56 1.343 1.075 0.688 -0.993 -2 ,13130 ,TETRA ,17377802,Sat Nov 20 21:35:03 CET,Sun Nov 21 00:24:07 CET,0.0 0.465 0.725 0.926 1.082 1.247 1.397 1.538 1.792 1.9 2.002 1.994 2.285 2.368 2.54 2.699 2.841 2.913 3.046 3.169 3.348 3.457 3.562 3.731 3.896 4.046 4.201 4.351 4.543 4.748 4.95 5.166 5.356 5.549 5.781 6.012 6.229 6.482 6.75 7.019 7.285 7.593 7.946 8.286 8.691 9.128 9.61 10.13 10.679 11.21 11.584 11.553 11.305 10.945 10.546 10.196 9.884 9.571 9.283 8.992 8.756 8.507 8.252 8.015 7.79 7.572 7.326 7.116 6.929 6.746 6.564 6.398 6.215 6.01 5.845 5.674 5.493 5.298 5.102 4.962 4.802 4.556 4.399 4.229 4.128 3.913 3.69 3.457 3.333 3.018 2.95 2.796 2.624 2.253 2.057 1.835 1.603 1.32 0.931 0.421 -1.632 -3 ,11532 ,TETRA ,17377804,Sat Nov 20 21:35:07 CET,Sun Nov 21 00:10:36 CET,0.0 0.994 1.29 1.509 1.696 1.87 2.03 2.165 2.4 2.503 2.607 2.599 2.885 2.963 3.109 3.254 3.392 3.461 3.593 3.717 3.891 4.006 4.124 4.307 4.481 4.629 4.763 4.902 5.092 5.268 5.44 5.643 5.826 5.996 6.2 6.443 6.668 6.908 7.176 7.472 7.772 8.099 8.49 8.867 9.26 9.69 10.171 10.667 11.195 11.693 12.051 12.054 11.811 11.521 11.211 10.836 10.466 10.13 9.804 9.45 9.173 8.925 8.661 8.408 8.174 7.934 7.64 7.367 7.142 6.919 6.669 6.455 6.249 6.042 5.866 5.669 5.465 5.232 4.97 4.795 4.628 4.383 4.203 4.003 3.903 3.656 3.388 3.164 3.048 2.732 2.67 2.534 2.378 2.042 1.854 1.657 1.461 1.244 0.947 0.537 -0.967 -4 ,2712 ,TETRA ,17377806,Sat Nov 20 21:35:07 CET,Sat Nov 20 23:49:21 CET,0.0 0.647 0.905 1.074 1.234 1.388 1.543 1.678 1.932 2.047 2.156 2.173 2.466 2.558 2.738 2.915 3.062 3.128 3.264 3.395 3.584 3.706 3.822 3.994 4.157 4.308 4.464 4.616 4.812 4.994 5.176 5.402 5.598 5.787 6.017 6.269 6.506 6.754 7.011 7.279 7.564 7.889 8.263 8.638 9.073 9.558 10.083 10.576 11.095 11.673 12.12 12.211 12.017 11.659 11.247 10.867 10.559 10.278 10.021 9.698 9.379 9.09 8.811 8.533 8.263 8.026 7.757 7.507 7.307 7.116 6.91 6.721 6.525 6.295 6.102 5.903 5.685 5.468 5.242 5.084 4.928 4.689 4.513 4.324 4.226 4.024 3.827 3.621 3.502 3.171 3.065 2.922 2.791 2.504 2.327 2.117 1.855 1.578 1.233 0.748 -0.876 -5 ,4000 ,TETRA ,17377808,Sat Nov 20 21:35:07 CET,Sun Nov 21 00:20:47 CET,0.0 0.737 1.057 1.345 1.559 1.723 1.864 1.999 2.259 2.375 2.47 2.44 2.738 2.837 3.03 3.209 3.372 3.446 3.585 3.732 3.957 4.082 4.187 4.329 4.463 4.603 4.751 4.897 5.079 5.256 5.424 5.617 5.807 5.993 6.197 6.42 6.641 6.884 7.14 7.394 7.677 8.005 8.375 8.746 9.156 9.588 10.062 10.55 11.048 11.494 11.83 11.846 11.644 11.378 11.099 10.765 10.432 10.134 9.828 9.471 9.152 8.896 8.637 8.373 8.126 7.879 7.626 7.404 7.223 7.039 6.827 6.639 6.435 6.227 6.074 5.919 5.746 5.563 5.377 5.23 5.071 4.839 4.683 4.522 4.431 4.247 4.053 3.821 3.702 3.386 3.313 3.17 3.025 2.702 2.521 2.289 2.014 1.724 1.429 1.003 -0.673 -6 ,10198 ,TETRA ,17377810,Sat Nov 20 21:35:08 CET,Sun Nov 21 00:12:40 CET,0.0 1.447 1.882 2.251 2.531 2.733 2.906 3.059 3.33 3.463 3.588 3.606 3.917 4.014 4.186 4.35 4.496 4.571 4.718 4.85 5.045 5.17 5.286 5.46 5.619 5.779 5.939 6.091 6.293 6.483 6.655 6.859 7.059 7.256 7.498 7.764 8.008 8.275 8.559 8.86 9.162 9.484 9.876 10.259 10.641 11.064 11.541 12.023 12.536 13.078 13.568 13.648 13.372 12.952 12.556 12.184 11.828 11.476 11.143 10.762 10.397 10.044 9.686 9.373 9.074 8.778 8.491 8.218 7.968 7.723 7.482 7.267 7.012 6.75 6.551 6.338 6.122 5.915 5.697 5.545 5.384 5.109 4.927 4.752 4.667 4.493 4.302 4.099 3.994 3.682 3.602 3.45 3.276 2.913 2.718 2.472 2.203 1.926 1.624 1.169 -0.289 -7 ,9700 ,TETRA ,17377812,Sat Nov 20 21:35:09 CET,Sat Nov 20 23:47:04 CET,0.0 0.782 1.068 1.264 1.425 1.574 1.707 1.823 2.057 2.182 2.303 2.353 2.668 2.778 2.986 3.168 3.337 3.417 3.562 3.698 3.906 4.04 4.162 4.346 4.521 4.676 4.822 4.966 5.157 5.356 5.554 5.781 5.995 6.21 6.441 6.692 6.935 7.188 7.453 7.752 8.079 8.42 8.818 9.215 9.633 10.064 10.52 10.983 11.457 11.921 12.325 12.342 12.087 11.663 11.215 10.802 10.402 10.033 9.677 9.325 9.048 8.781 8.532 8.272 7.998 7.728 7.441 7.176 6.929 6.671 6.412 6.201 5.982 5.759 5.593 5.431 5.242 5.026 4.826 4.689 4.534 4.28 4.087 3.89 3.796 3.604 3.407 3.205 3.097 2.792 2.742 2.594 2.422 2.05 1.848 1.626 1.386 1.091 0.709 0.222 -1.149 -8 ,10677 ,TETRA ,17377814,Sat Nov 20 21:35:47 CET,Sat Nov 20 23:42:33 CET,0.0 0.625 0.939 1.161 1.377 1.558 1.702 1.848 2.139 2.278 2.394 2.411 2.712 2.811 2.981 3.133 3.284 3.357 3.492 3.636 3.853 3.982 4.104 4.288 4.468 4.641 4.803 4.954 5.151 5.335 5.49 5.668 5.855 6.038 6.238 6.466 6.687 6.918 7.169 7.445 7.747 8.101 8.498 8.885 9.315 9.743 10.223 10.728 11.229 11.721 12.141 12.142 11.895 11.512 11.058 10.636 10.267 9.922 9.608 9.273 8.95 8.627 8.303 8.002 7.744 7.518 7.269 7.032 6.818 6.601 6.382 6.175 5.947 5.716 5.53 5.348 5.174 5.0 4.807 4.649 4.475 4.208 4.019 3.818 3.721 3.537 3.342 3.126 3.018 2.706 2.618 2.462 2.299 1.928 1.715 1.484 1.221 0.918 0.565 0.091 -1.856 -9 ,19985 ,TETRA ,17377816,Sat Nov 20 21:35:49 CET,Sat Nov 20 23:49:19 CET,0.0 0.633 0.881 1.07 1.244 1.407 1.55 1.682 1.919 2.022 2.128 2.134 2.434 2.524 2.698 2.887 3.063 3.135 3.256 3.363 3.541 3.663 3.779 3.951 4.12 4.28 4.424 4.549 4.717 4.89 5.057 5.254 5.453 5.648 5.859 6.107 6.371 6.658 6.951 7.271 7.625 7.997 8.387 8.761 9.166 9.605 10.081 10.564 11.055 11.524 11.881 11.953 11.801 11.526 11.184 10.784 10.35 9.94 9.617 9.312 9.039 8.772 8.509 8.26 8.011 7.781 7.523 7.257 7.034 6.827 6.601 6.39 6.163 5.931 5.732 5.54 5.375 5.196 4.986 4.848 4.711 4.472 4.306 4.133 4.039 3.844 3.636 3.391 3.261 2.938 2.852 2.697 2.536 2.171 1.943 1.702 1.464 1.203 0.873 0.439 -1.344 -10 ,22937 ,TETRA ,17377818,Sat Nov 20 21:37:37 CET,Sun Nov 21 00:22:50 CET,0.0 0.543 0.825 1.083 1.291 1.432 1.567 1.696 1.928 2.037 2.132 2.124 2.418 2.51 2.678 2.834 2.986 3.056 3.187 3.318 3.513 3.642 3.766 3.949 4.12 4.273 4.423 4.569 4.758 4.943 5.121 5.337 5.542 5.725 5.946 6.205 6.458 6.718 6.971 7.262 7.559 7.86 8.221 8.587 9.004 9.46 9.973 10.528 11.084 11.566 11.979 12.109 11.893 11.547 11.203 10.823 10.406 9.967 9.592 9.214 8.871 8.562 8.256 7.948 7.67 7.419 7.15 6.933 6.762 6.593 6.417 6.248 6.053 5.842 5.689 5.537 5.373 5.2 5.011 4.866 4.71 4.479 4.309 4.114 4.013 3.803 3.564 3.307 3.176 2.837 2.686 2.513 2.336 1.967 1.763 1.524 1.274 0.977 0.591 0.036 -1.916 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1a_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1a_5.txt deleted file mode 100644 index 678555ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1a_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10609 ,TETRA ,17377820,Sat Nov 20 21:37:29 CET,Sat Nov 20 23:35:26 CET,0.0 0.908 1.239 1.488 1.713 1.91 2.062 2.208 2.48 2.6 2.709 2.705 3.007 3.097 3.271 3.444 3.62 3.698 3.85 4.011 4.233 4.364 4.485 4.665 4.833 4.984 5.147 5.307 5.508 5.697 5.883 6.116 6.318 6.501 6.705 6.948 7.194 7.451 7.726 8.016 8.33 8.666 9.054 9.457 9.894 10.347 10.867 11.409 11.966 12.52 12.94 13.01 12.812 12.526 12.237 11.932 11.607 11.282 10.987 10.672 10.397 10.15 9.911 9.679 9.452 9.246 9.028 8.831 8.669 8.484 8.285 8.118 7.936 7.74 7.594 7.45 7.302 7.141 6.961 6.837 6.714 6.53 6.395 6.255 6.187 6.032 5.852 5.67 5.576 5.279 5.275 5.154 5.027 4.778 4.635 4.481 4.318 4.124 3.882 3.535 2.342 -2 ,16590 ,TETRA ,17377822,Sat Nov 20 21:35:51 CET,Sat Nov 20 23:16:27 CET,0.0 1.752 2.15 2.439 2.69 2.881 3.034 3.168 3.418 3.543 3.662 3.666 3.976 4.079 4.274 4.456 4.61 4.681 4.823 4.964 5.182 5.327 5.457 5.627 5.791 5.956 6.12 6.283 6.493 6.715 6.911 7.1 7.306 7.514 7.736 7.968 8.186 8.444 8.741 9.056 9.382 9.74 10.121 10.484 10.914 11.348 11.819 12.334 12.88 13.432 13.83 13.867 13.71 13.468 13.171 12.828 12.509 12.225 11.958 11.652 11.367 11.118 10.881 10.638 10.397 10.18 9.952 9.741 9.55 9.36 9.159 8.996 8.836 8.646 8.496 8.343 8.184 8.024 7.859 7.739 7.61 7.404 7.258 7.094 7.014 6.858 6.7 6.517 6.414 6.108 6.087 5.974 5.847 5.564 5.414 5.226 4.997 4.763 4.558 4.199 3.268 -3 ,21263 ,TETRA ,17377824,Sat Nov 20 21:35:50 CET,Sat Nov 20 23:49:50 CET,0.0 1.419 1.874 2.145 2.341 2.515 2.674 2.817 3.065 3.178 3.289 3.295 3.611 3.719 3.911 4.085 4.245 4.319 4.47 4.621 4.828 4.95 5.073 5.263 5.434 5.594 5.753 5.906 6.103 6.298 6.49 6.731 6.965 7.171 7.403 7.653 7.899 8.168 8.439 8.726 9.028 9.383 9.778 10.152 10.624 11.128 11.628 12.17 12.766 13.349 13.799 13.813 13.621 13.387 13.097 12.772 12.459 12.182 11.924 11.622 11.345 11.095 10.867 10.65 10.415 10.193 9.971 9.777 9.598 9.399 9.184 9.002 8.825 8.648 8.498 8.35 8.216 8.062 7.874 7.741 7.611 7.407 7.273 7.134 7.053 6.89 6.73 6.563 6.472 6.164 6.152 6.038 5.907 5.622 5.466 5.296 5.098 4.828 4.508 4.112 2.733 -4 ,15496 ,TETRA ,17377826,Sat Nov 20 21:35:54 CET,Sat Nov 20 23:42:23 CET,0.0 0.897 1.221 1.502 1.739 1.942 2.107 2.255 2.53 2.655 2.768 2.759 3.052 3.137 3.32 3.491 3.643 3.715 3.863 4.02 4.232 4.356 4.479 4.654 4.825 4.993 5.152 5.307 5.508 5.699 5.892 6.11 6.315 6.507 6.736 7.001 7.239 7.509 7.792 8.092 8.401 8.722 9.102 9.47 9.892 10.385 10.936 11.507 12.089 12.644 13.153 13.271 13.094 12.81 12.488 12.11 11.764 11.472 11.188 10.862 10.581 10.334 10.083 9.839 9.611 9.391 9.147 8.938 8.761 8.569 8.366 8.203 8.024 7.831 7.697 7.562 7.413 7.259 7.094 6.968 6.838 6.643 6.506 6.358 6.282 6.125 5.949 5.755 5.652 5.342 5.324 5.205 5.079 4.796 4.638 4.467 4.24 3.947 3.678 3.428 2.375 -5 ,8254 ,TETRA ,17377828,Sat Nov 20 21:35:53 CET,Sat Nov 20 23:51:07 CET,0.0 1.061 1.385 1.603 1.777 1.948 2.112 2.257 2.521 2.647 2.769 2.782 3.089 3.182 3.353 3.523 3.694 3.775 3.923 4.06 4.259 4.382 4.505 4.703 4.891 5.057 5.215 5.371 5.564 5.747 5.933 6.155 6.355 6.544 6.778 7.044 7.279 7.538 7.823 8.124 8.428 8.759 9.145 9.519 9.935 10.372 10.87 11.416 11.989 12.581 13.061 13.162 13.026 12.783 12.452 12.098 11.768 11.465 11.192 10.884 10.621 10.394 10.156 9.922 9.723 9.53 9.301 9.09 8.908 8.721 8.527 8.373 8.206 8.025 7.889 7.745 7.589 7.417 7.239 7.123 7.004 6.829 6.706 6.578 6.518 6.4 6.255 6.089 6.004 5.7 5.693 5.573 5.438 5.121 4.946 4.766 4.576 4.349 4.041 3.669 2.167 -6 ,23366 ,TETRA ,17377830,Sat Nov 20 21:39:40 CET,Sat Nov 20 23:46:24 CET,0.0 0.901 1.25 1.484 1.68 1.856 2.021 2.166 2.407 2.523 2.634 2.639 2.953 3.051 3.235 3.416 3.587 3.667 3.823 3.965 4.161 4.291 4.426 4.621 4.799 4.962 5.118 5.275 5.487 5.693 5.87 6.074 6.291 6.512 6.743 6.993 7.235 7.477 7.742 8.044 8.358 8.696 9.089 9.494 9.921 10.358 10.882 11.418 11.958 12.526 12.994 13.041 12.831 12.573 12.264 11.93 11.628 11.31 11.018 10.704 10.429 10.187 9.934 9.709 9.505 9.307 9.1 8.906 8.72 8.528 8.322 8.149 7.978 7.804 7.661 7.509 7.362 7.197 7.012 6.88 6.748 6.567 6.436 6.29 6.214 6.052 5.886 5.711 5.614 5.307 5.317 5.213 5.084 4.789 4.642 4.477 4.305 4.093 3.803 3.439 2.602 -7 ,17444 ,TETRA ,17377832,Sat Nov 20 21:39:40 CET,Sat Nov 20 23:40:16 CET,0.0 0.814 1.154 1.385 1.572 1.74 1.888 2.029 2.267 2.38 2.496 2.501 2.814 2.912 3.074 3.229 3.385 3.465 3.61 3.753 3.964 4.1 4.228 4.416 4.605 4.779 4.938 5.1 5.312 5.505 5.682 5.888 6.075 6.267 6.512 6.768 6.993 7.248 7.525 7.81 8.109 8.441 8.813 9.162 9.548 9.996 10.523 11.062 11.611 12.141 12.513 12.518 12.35 12.075 11.742 11.424 11.137 10.833 10.525 10.213 9.933 9.687 9.446 9.204 8.972 8.754 8.528 8.324 8.136 7.926 7.721 7.561 7.392 7.207 7.06 6.918 6.764 6.603 6.427 6.298 6.171 5.975 5.84 5.699 5.63 5.47 5.289 5.113 5.022 4.718 4.679 4.549 4.413 4.105 3.926 3.741 3.532 3.291 3.031 2.728 1.765 -8 ,11959 ,TETRA ,17377835,Sat Nov 20 21:38:01 CET,Sat Nov 20 23:09:59 CET,0.0 0.95 1.324 1.629 1.845 2.028 2.194 2.332 2.581 2.703 2.81 2.79 3.093 3.185 3.361 3.523 3.67 3.747 3.904 4.049 4.239 4.359 4.474 4.646 4.824 4.986 5.141 5.294 5.47 5.642 5.824 6.051 6.27 6.473 6.713 6.995 7.242 7.498 7.784 8.096 8.407 8.734 9.103 9.487 9.928 10.364 10.839 11.349 11.911 12.474 12.925 12.979 12.78 12.472 12.127 11.803 11.5 11.187 10.911 10.638 10.386 10.147 9.898 9.661 9.443 9.231 9.006 8.791 8.587 8.386 8.187 8.019 7.837 7.654 7.522 7.366 7.196 7.024 6.845 6.72 6.596 6.405 6.266 6.116 6.037 5.886 5.72 5.543 5.447 5.142 5.103 4.965 4.842 4.581 4.436 4.288 4.12 3.934 3.703 3.298 2.172 -9 ,32585 ,TETRA ,17377836,Sat Nov 20 21:37:19 CET,Sat Nov 20 23:30:45 CET,0.0 0.834 1.235 1.574 1.857 2.073 2.243 2.412 2.706 2.835 2.955 2.953 3.254 3.347 3.547 3.723 3.883 3.959 4.116 4.27 4.471 4.595 4.723 4.916 5.09 5.259 5.421 5.567 5.754 5.939 6.114 6.326 6.533 6.735 6.972 7.224 7.462 7.737 8.018 8.314 8.643 9.005 9.407 9.785 10.214 10.676 11.158 11.654 12.218 12.828 13.354 13.513 13.418 13.209 12.903 12.601 12.313 12.014 11.733 11.437 11.199 10.974 10.735 10.516 10.304 10.099 9.885 9.674 9.485 9.296 9.09 8.906 8.712 8.514 8.366 8.22 8.068 7.913 7.746 7.623 7.489 7.289 7.152 7.004 6.929 6.775 6.602 6.416 6.323 6.026 6.064 5.963 5.83 5.56 5.396 5.22 5.048 4.856 4.595 4.204 3.114 -10 ,2813 ,TETRA ,17377838,Sat Nov 20 21:37:19 CET,Sat Nov 20 23:16:52 CET,0.0 1.004 1.42 1.676 1.884 2.075 2.228 2.346 2.547 2.657 2.801 2.865 3.182 3.286 3.464 3.638 3.801 3.873 4.019 4.147 4.35 4.486 4.613 4.806 4.984 5.139 5.288 5.438 5.618 5.792 5.978 6.195 6.394 6.586 6.81 7.048 7.262 7.513 7.788 8.075 8.373 8.689 9.059 9.424 9.847 10.325 10.836 11.344 11.931 12.537 12.998 13.058 12.893 12.649 12.345 12.021 11.694 11.384 11.095 10.781 10.515 10.263 10.012 9.786 9.569 9.36 9.15 8.946 8.747 8.556 8.358 8.188 8.014 7.83 7.687 7.537 7.379 7.208 7.038 6.922 6.798 6.592 6.45 6.306 6.231 6.077 5.906 5.71 5.606 5.292 5.267 5.135 4.999 4.747 4.613 4.448 4.24 3.983 3.711 3.368 2.042 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1a.txt deleted file mode 100644 index 02c6f39c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16766 ,TETRA ,17377840,Sat Nov 20 21:37:23 CET,Sat Nov 20 23:10:15 CET,0.0 0.864 1.241 1.491 1.695 1.869 2.015 2.15 2.41 2.523 2.62 2.611 2.92 3.008 3.194 3.376 3.529 3.597 3.737 3.881 4.093 4.22 4.333 4.519 4.699 4.853 5.004 5.15 5.322 5.495 5.674 5.889 6.09 6.279 6.493 6.714 6.911 7.138 7.391 7.655 7.939 8.259 8.608 8.949 9.319 9.698 10.125 10.587 11.074 11.502 11.783 11.692 11.432 11.14 10.817 10.428 10.077 9.735 9.414 9.095 8.799 8.534 8.285 8.027 7.776 7.556 7.315 7.091 6.908 6.719 6.515 6.349 6.174 5.99 5.844 5.697 5.548 5.386 5.202 5.078 4.954 4.758 4.629 4.482 4.398 4.229 4.041 3.824 3.71 3.394 3.367 3.235 3.108 2.831 2.671 2.484 2.274 2.029 1.732 1.367 0.239 -2 ,27132 ,TETRA ,17377842,Sat Nov 20 21:37:23 CET,Sat Nov 20 23:16:54 CET,0.0 0.832 1.166 1.421 1.611 1.786 1.959 2.106 2.345 2.436 2.524 2.512 2.816 2.909 3.094 3.256 3.405 3.479 3.631 3.778 3.971 4.094 4.21 4.377 4.538 4.685 4.824 4.966 5.15 5.326 5.485 5.677 5.873 6.06 6.282 6.539 6.784 7.042 7.293 7.539 7.796 8.101 8.466 8.832 9.217 9.616 10.046 10.488 10.972 11.447 11.803 11.827 11.636 11.294 10.896 10.53 10.215 9.886 9.58 9.267 8.991 8.749 8.517 8.286 8.051 7.826 7.583 7.357 7.171 6.978 6.766 6.593 6.415 6.222 6.071 5.92 5.768 5.601 5.419 5.298 5.174 4.969 4.823 4.687 4.618 4.461 4.281 4.073 3.968 3.662 3.632 3.503 3.362 3.038 2.868 2.686 2.489 2.276 2.028 1.61 -0.562 -3 ,10802 ,TETRA ,17377844,Sat Nov 20 21:37:22 CET,Sat Nov 20 23:17:36 CET,0.0 0.751 1.121 1.371 1.593 1.798 1.956 2.083 2.319 2.438 2.546 2.532 2.839 2.935 3.113 3.276 3.437 3.506 3.642 3.787 3.991 4.13 4.258 4.437 4.606 4.767 4.93 5.085 5.271 5.44 5.603 5.813 6.015 6.189 6.388 6.623 6.858 7.103 7.348 7.607 7.87 8.162 8.5 8.836 9.215 9.64 10.119 10.586 11.054 11.532 11.929 11.914 11.665 11.357 10.996 10.634 10.311 9.981 9.681 9.368 9.083 8.834 8.588 8.344 8.107 7.882 7.636 7.412 7.227 7.042 6.833 6.655 6.473 6.286 6.134 5.973 5.805 5.624 5.434 5.297 5.153 4.939 4.795 4.651 4.572 4.394 4.214 4.025 3.919 3.611 3.604 3.479 3.348 3.075 2.912 2.74 2.552 2.317 2.007 1.547 -0.025 -4 ,29819 ,TETRA ,17377846,Sat Nov 20 21:39:37 CET,Sat Nov 20 23:56:53 CET,0.0 0.943 1.253 1.537 1.794 1.968 2.107 2.237 2.491 2.62 2.736 2.731 3.034 3.12 3.297 3.458 3.61 3.694 3.86 4.002 4.199 4.323 4.447 4.633 4.812 4.973 5.124 5.268 5.443 5.638 5.816 6.015 6.215 6.407 6.63 6.876 7.112 7.356 7.606 7.877 8.162 8.472 8.837 9.192 9.567 9.983 10.507 11.034 11.534 11.991 12.317 12.273 11.986 11.638 11.279 10.91 10.574 10.258 9.952 9.634 9.354 9.085 8.832 8.619 8.4 8.169 7.924 7.711 7.531 7.348 7.159 6.992 6.818 6.632 6.482 6.328 6.167 5.996 5.809 5.676 5.543 5.332 5.178 5.029 4.948 4.776 4.608 4.434 4.341 4.029 4.014 3.902 3.775 3.484 3.335 3.184 2.999 2.742 2.429 2.039 1.097 -5 ,28159 ,TETRA ,17377847,Sat Nov 20 21:39:40 CET,Sat Nov 20 23:50:03 CET,0.0 1.043 1.391 1.606 1.795 1.983 2.15 2.3 2.596 2.73 2.848 2.873 3.179 3.275 3.462 3.628 3.777 3.852 4.0 4.131 4.315 4.438 4.556 4.722 4.887 5.052 5.206 5.35 5.537 5.719 5.891 6.097 6.3 6.484 6.694 6.932 7.148 7.381 7.646 7.935 8.199 8.489 8.845 9.173 9.544 9.955 10.395 10.834 11.313 11.799 12.099 12.072 11.869 11.539 11.146 10.756 10.415 10.097 9.779 9.441 9.157 8.913 8.666 8.405 8.145 7.915 7.676 7.449 7.254 7.057 6.852 6.689 6.509 6.309 6.16 6.011 5.856 5.69 5.496 5.36 5.232 5.02 4.867 4.705 4.616 4.434 4.245 4.04 3.929 3.603 3.577 3.452 3.329 3.083 2.938 2.749 2.539 2.319 2.033 1.599 0.6 -6 ,28946 ,TETRA ,17377849,Sat Nov 20 21:39:19 CET,Sun Nov 21 00:07:07 CET,0.0 1.087 1.419 1.676 1.894 2.075 2.216 2.366 2.657 2.777 2.908 2.937 3.236 3.324 3.496 3.654 3.812 3.881 3.998 4.138 4.352 4.467 4.572 4.734 4.904 5.076 5.23 5.372 5.553 5.73 5.901 6.109 6.306 6.499 6.721 6.95 7.169 7.419 7.681 7.939 8.219 8.542 8.919 9.279 9.647 10.049 10.468 10.893 11.376 11.823 12.138 12.105 11.812 11.47 11.142 10.777 10.442 10.123 9.802 9.469 9.19 8.94 8.666 8.4 8.164 7.948 7.707 7.481 7.294 7.111 6.913 6.746 6.558 6.353 6.207 6.05 5.876 5.703 5.526 5.393 5.251 5.036 4.893 4.733 4.646 4.479 4.302 4.114 4.012 3.697 3.662 3.531 3.39 3.078 2.909 2.718 2.519 2.264 1.958 1.61 0.085 -7 ,30475 ,TETRA ,17377852,Sat Nov 20 21:38:01 CET,Sat Nov 20 23:17:36 CET,0.0 0.714 1.052 1.329 1.538 1.702 1.854 1.991 2.221 2.337 2.446 2.435 2.745 2.841 3.027 3.19 3.343 3.418 3.55 3.682 3.886 4.018 4.147 4.328 4.503 4.672 4.826 4.976 5.163 5.335 5.515 5.745 5.962 6.161 6.389 6.635 6.863 7.122 7.394 7.657 7.949 8.277 8.603 8.936 9.324 9.718 10.153 10.642 11.188 11.715 12.084 12.065 11.848 11.524 11.172 10.82 10.469 10.118 9.826 9.533 9.225 8.949 8.708 8.474 8.251 8.054 7.832 7.601 7.415 7.235 7.046 6.882 6.69 6.486 6.344 6.197 6.042 5.889 5.724 5.602 5.471 5.261 5.117 4.97 4.896 4.747 4.569 4.371 4.274 3.967 3.949 3.822 3.7 3.429 3.245 3.039 2.829 2.589 2.338 1.997 0.905 -8 ,1071 ,TETRA ,17377854,Sat Nov 20 21:38:02 CET,Sat Nov 20 23:10:45 CET,0.0 0.996 1.265 1.491 1.7 1.885 2.036 2.167 2.421 2.544 2.658 2.652 2.964 3.064 3.242 3.398 3.547 3.622 3.777 3.933 4.146 4.265 4.383 4.57 4.742 4.911 5.072 5.227 5.431 5.61 5.792 6.018 6.211 6.4 6.63 6.876 7.102 7.35 7.63 7.906 8.188 8.508 8.868 9.208 9.596 10.026 10.478 10.933 11.409 11.885 12.258 12.197 11.935 11.625 11.297 10.928 10.57 10.247 9.939 9.63 9.356 9.095 8.844 8.584 8.335 8.127 7.905 7.69 7.502 7.3 7.075 6.899 6.727 6.526 6.368 6.22 6.065 5.883 5.684 5.555 5.424 5.204 5.05 4.898 4.821 4.643 4.443 4.251 4.157 3.844 3.814 3.689 3.552 3.24 3.07 2.893 2.712 2.507 2.221 1.754 0.925 -9 ,22110 ,TETRA ,17377857,Sat Nov 20 21:38:04 CET,Sat Nov 20 23:10:30 CET,0.0 0.719 0.978 1.189 1.386 1.55 1.693 1.841 2.113 2.226 2.328 2.33 2.636 2.721 2.887 3.049 3.195 3.257 3.393 3.528 3.719 3.852 3.976 4.156 4.337 4.502 4.656 4.795 4.973 5.151 5.33 5.529 5.716 5.899 6.092 6.322 6.561 6.823 7.098 7.375 7.652 7.97 8.343 8.694 9.087 9.517 9.974 10.417 10.875 11.348 11.68 11.615 11.326 10.948 10.621 10.29 9.953 9.624 9.321 9.023 8.775 8.53 8.252 7.973 7.716 7.499 7.277 7.064 6.876 6.673 6.46 6.296 6.128 5.947 5.81 5.661 5.488 5.313 5.123 4.99 4.858 4.654 4.504 4.336 4.248 4.049 3.856 3.677 3.586 3.287 3.288 3.172 3.044 2.743 2.578 2.402 2.205 1.97 1.699 1.3 -0.195 -10 ,11963 ,TETRA ,17377859,Sat Nov 20 21:38:03 CET,Sat Nov 20 23:19:16 CET,0.0 0.863 1.231 1.455 1.685 1.868 2.025 2.178 2.411 2.512 2.61 2.597 2.908 3.003 3.184 3.382 3.568 3.651 3.804 3.944 4.141 4.278 4.408 4.582 4.751 4.917 5.064 5.204 5.393 5.578 5.757 5.967 6.154 6.329 6.534 6.783 7.032 7.283 7.546 7.823 8.123 8.455 8.806 9.153 9.568 9.998 10.429 10.881 11.347 11.833 12.2 12.14 11.893 11.547 11.179 10.833 10.504 10.169 9.863 9.54 9.246 8.971 8.696 8.438 8.202 7.965 7.715 7.505 7.323 7.123 6.903 6.725 6.55 6.36 6.2 6.037 5.875 5.695 5.508 5.379 5.246 5.051 4.902 4.747 4.663 4.478 4.294 4.106 4.003 3.686 3.654 3.526 3.399 3.131 2.978 2.784 2.564 2.339 2.088 1.676 0.487 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1c.txt deleted file mode 100644 index c3582e67..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22585 ,TETRA ,17377862,Sat Nov 20 21:38:07 CET,Sat Nov 20 23:10:37 CET,0.0 0.751 1.122 1.374 1.59 1.795 1.984 2.145 2.432 2.565 2.686 2.699 3.01 3.125 3.352 3.549 3.718 3.798 3.947 4.074 4.248 4.364 4.495 4.688 4.867 5.04 5.207 5.37 5.563 5.727 5.881 6.076 6.265 6.443 6.654 6.89 7.093 7.311 7.544 7.78 8.02 8.278 8.578 8.866 9.18 9.52 9.887 10.263 10.618 10.886 10.935 10.683 10.304 9.832 9.332 8.896 8.53 8.151 7.804 7.45 7.128 6.851 6.59 6.326 6.065 5.834 5.616 5.419 5.235 5.05 4.851 4.685 4.516 4.32 4.161 4.004 3.834 3.657 3.474 3.354 3.236 3.041 2.912 2.762 2.686 2.558 2.402 2.208 2.11 1.8 1.763 1.642 1.532 1.257 1.092 0.909 0.702 0.484 0.224 -0.144 -1.981 -2 ,10435 ,TETRA ,17377863,Sat Nov 20 21:38:04 CET,Sat Nov 20 23:19:45 CET,0.0 1.63 2.107 2.391 2.619 2.817 3.018 3.201 3.462 3.58 3.685 3.669 3.975 4.07 4.242 4.429 4.626 4.711 4.851 4.973 5.173 5.313 5.441 5.633 5.814 5.974 6.117 6.249 6.434 6.6 6.752 6.949 7.13 7.314 7.542 7.779 7.982 8.198 8.434 8.675 8.919 9.195 9.529 9.825 10.136 10.471 10.808 11.134 11.434 11.657 11.73 11.46 11.019 10.538 10.078 9.624 9.221 8.858 8.495 8.12 7.796 7.503 7.239 6.974 6.714 6.494 6.255 6.028 5.836 5.641 5.44 5.259 5.074 4.896 4.753 4.596 4.433 4.266 4.089 3.969 3.844 3.633 3.49 3.338 3.255 3.095 2.926 2.727 2.627 2.324 2.332 2.229 2.107 1.815 1.67 1.514 1.334 1.116 0.846 0.565 -1.302 -3 ,2331 ,TETRA ,17377864,Sat Nov 20 21:38:07 CET,Sat Nov 20 23:19:45 CET,0.0 1.734 2.127 2.379 2.596 2.803 2.971 3.118 3.376 3.491 3.599 3.605 3.921 4.023 4.225 4.424 4.597 4.678 4.827 4.966 5.182 5.317 5.445 5.629 5.801 5.96 6.121 6.279 6.472 6.652 6.822 7.027 7.23 7.416 7.615 7.816 8.021 8.257 8.504 8.767 9.03 9.33 9.682 9.996 10.327 10.665 11.033 11.389 11.77 12.083 12.095 11.762 11.312 10.829 10.362 9.948 9.563 9.168 8.806 8.449 8.135 7.857 7.594 7.337 7.084 6.843 6.611 6.401 6.21 6.01 5.819 5.656 5.477 5.308 5.175 5.021 4.848 4.672 4.504 4.383 4.249 4.037 3.904 3.774 3.696 3.517 3.329 3.139 3.052 2.747 2.731 2.615 2.488 2.212 2.063 1.895 1.705 1.474 1.188 0.804 0.086 -4 ,18737 ,TETRA ,17377866,Sat Nov 20 21:38:05 CET,Sat Nov 20 23:56:27 CET,0.0 1.229 1.568 1.843 2.064 2.265 2.458 2.622 2.887 3.02 3.147 3.158 3.47 3.566 3.764 3.937 4.093 4.171 4.315 4.453 4.644 4.764 4.886 5.067 5.24 5.405 5.56 5.705 5.896 6.074 6.228 6.411 6.604 6.785 6.993 7.243 7.475 7.713 7.957 8.18 8.401 8.654 8.939 9.247 9.62 9.988 10.333 10.679 11.045 11.342 11.409 11.106 10.646 10.143 9.678 9.25 8.86 8.499 8.168 7.816 7.521 7.251 6.978 6.711 6.462 6.236 5.993 5.784 5.604 5.406 5.2 5.041 4.878 4.701 4.56 4.402 4.23 4.052 3.871 3.747 3.618 3.423 3.297 3.155 3.075 2.904 2.739 2.575 2.481 2.175 2.173 2.048 1.909 1.619 1.461 1.283 1.104 0.857 0.548 0.223 -1.057 -5 ,8999 ,TETRA ,17377868,Sat Nov 20 21:38:43 CET,Sat Nov 20 23:49:55 CET,0.0 1.125 1.516 1.839 2.061 2.26 2.439 2.604 2.919 3.05 3.164 3.193 3.507 3.596 3.772 3.948 4.118 4.191 4.329 4.458 4.636 4.748 4.862 5.023 5.166 5.316 5.468 5.603 5.771 5.953 6.143 6.366 6.565 6.746 6.948 7.168 7.389 7.627 7.872 8.122 8.369 8.654 8.978 9.293 9.66 10.044 10.422 10.808 11.193 11.518 11.646 11.346 10.909 10.464 10.031 9.63 9.245 8.854 8.513 8.18 7.876 7.607 7.335 7.068 6.826 6.581 6.306 6.064 5.876 5.686 5.479 5.311 5.144 4.966 4.815 4.651 4.482 4.313 4.138 4.028 3.921 3.736 3.595 3.435 3.357 3.198 3.028 2.841 2.743 2.438 2.463 2.359 2.247 1.989 1.841 1.679 1.496 1.303 1.081 0.756 -0.155 -6 ,21212 ,TETRA ,17377870,Sat Nov 20 21:38:43 CET,Sat Nov 20 23:51:34 CET,0.0 2.111 2.478 2.747 3.001 3.203 3.38 3.539 3.822 3.949 4.07 4.099 4.416 4.516 4.705 4.891 5.056 5.134 5.292 5.434 5.653 5.795 5.917 6.091 6.247 6.395 6.543 6.686 6.864 7.043 7.239 7.462 7.647 7.811 8.022 8.263 8.47 8.696 8.945 9.211 9.479 9.76 10.067 10.365 10.704 11.075 11.455 11.833 12.224 12.502 12.576 12.282 11.864 11.443 10.99 10.514 10.08 9.68 9.351 9.016 8.72 8.458 8.193 7.936 7.698 7.488 7.253 7.028 6.84 6.646 6.416 6.225 6.055 5.882 5.737 5.586 5.438 5.287 5.117 4.99 4.854 4.648 4.518 4.38 4.308 4.162 3.995 3.807 3.708 3.4 3.392 3.273 3.153 2.88 2.721 2.552 2.372 2.153 1.845 1.448 0.618 -7 ,18690 ,TETRA ,17377871,Sat Nov 20 21:38:44 CET,Sat Nov 20 23:42:57 CET,0.0 0.757 1.127 1.435 1.655 1.826 1.98 2.119 2.381 2.51 2.646 2.673 2.978 3.065 3.25 3.434 3.594 3.663 3.803 3.943 4.139 4.26 4.384 4.565 4.723 4.891 5.049 5.181 5.359 5.524 5.675 5.872 6.066 6.256 6.476 6.706 6.911 7.123 7.357 7.61 7.865 8.142 8.462 8.771 9.097 9.431 9.8 10.183 10.544 10.765 10.766 10.54 10.124 9.639 9.203 8.8 8.403 8.014 7.68 7.335 7.021 6.737 6.471 6.217 5.97 5.752 5.522 5.3 5.1 4.888 4.671 4.5 4.314 4.11 3.955 3.793 3.623 3.45 3.242 3.07 2.914 2.714 2.578 2.434 2.352 2.181 2.01 1.831 1.732 1.419 1.41 1.294 1.173 0.888 0.731 0.561 0.356 0.107 -0.199 -0.604 -2.084 -8 ,21894 ,TETRA ,17377872,Sat Nov 20 21:38:43 CET,Sat Nov 20 23:20:04 CET,0.0 1.388 1.713 1.963 2.199 2.408 2.574 2.739 3.045 3.175 3.295 3.297 3.605 3.707 3.905 4.081 4.244 4.327 4.487 4.641 4.863 4.994 5.114 5.302 5.48 5.639 5.79 5.935 6.119 6.294 6.468 6.692 6.895 7.076 7.278 7.502 7.728 7.969 8.212 8.466 8.731 9.016 9.342 9.646 9.966 10.302 10.663 11.071 11.484 11.779 11.845 11.584 11.2 10.766 10.32 9.906 9.532 9.177 8.836 8.46 8.135 7.861 7.603 7.348 7.11 6.878 6.628 6.417 6.246 6.049 5.818 5.647 5.467 5.26 5.105 4.952 4.789 4.621 4.45 4.332 4.203 3.994 3.846 3.697 3.62 3.452 3.285 3.097 2.994 2.68 2.662 2.534 2.407 2.137 1.971 1.795 1.611 1.4 1.155 0.833 -0.579 -9 ,13836 ,TETRA ,17377874,Sat Nov 20 21:38:45 CET,Sat Nov 20 23:11:42 CET,0.0 1.202 1.677 2.076 2.336 2.523 2.688 2.865 3.204 3.339 3.459 3.478 3.802 3.907 4.106 4.297 4.47 4.544 4.676 4.811 4.997 5.113 5.237 5.42 5.586 5.741 5.897 6.051 6.229 6.396 6.569 6.776 6.965 7.145 7.345 7.569 7.775 8.003 8.256 8.506 8.76 9.042 9.34 9.628 9.94 10.254 10.644 11.034 11.35 11.616 11.753 11.493 11.08 10.611 10.17 9.77 9.387 9.01 8.662 8.288 7.978 7.707 7.42 7.149 6.911 6.682 6.438 6.217 6.03 5.839 5.648 5.479 5.292 5.101 4.944 4.782 4.62 4.448 4.278 4.168 4.038 3.83 3.685 3.518 3.435 3.276 3.108 2.935 2.845 2.534 2.506 2.381 2.257 1.961 1.777 1.585 1.376 1.148 0.9 0.564 -0.151 -10 ,21027 ,TETRA ,17377876,Sat Nov 20 21:38:44 CET,Sat Nov 20 23:18:36 CET,0.0 1.227 1.637 1.913 2.125 2.346 2.541 2.706 2.993 3.117 3.232 3.23 3.535 3.636 3.833 4.021 4.201 4.287 4.448 4.6 4.812 4.936 5.055 5.24 5.42 5.576 5.716 5.853 6.035 6.206 6.361 6.553 6.741 6.929 7.139 7.356 7.56 7.768 8.003 8.254 8.523 8.811 9.107 9.43 9.775 10.119 10.475 10.795 11.12 11.398 11.509 11.242 10.781 10.341 9.903 9.481 9.099 8.713 8.377 8.032 7.714 7.434 7.17 6.907 6.662 6.446 6.218 6.002 5.792 5.576 5.362 5.178 5.0 4.833 4.698 4.548 4.39 4.215 4.025 3.899 3.765 3.549 3.384 3.216 3.137 2.964 2.792 2.622 2.531 2.229 2.228 2.114 1.983 1.677 1.514 1.335 1.164 0.969 0.717 0.316 -0.668 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1d.txt deleted file mode 100644 index 499019b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7519 ,TETRA ,17377879,Sat Nov 20 21:38:44 CET,Sat Nov 20 23:19:20 CET,0.0 1.75 2.099 2.36 2.578 2.78 2.99 3.173 3.464 3.587 3.706 3.731 4.051 4.152 4.331 4.499 4.677 4.766 4.924 5.093 5.343 5.484 5.62 5.824 6.015 6.175 6.315 6.463 6.654 6.834 7.018 7.229 7.413 7.595 7.808 8.044 8.284 8.538 8.793 9.054 9.316 9.564 9.842 10.125 10.438 10.779 11.119 11.447 11.776 12.019 12.005 11.619 11.129 10.615 10.1 9.646 9.246 8.805 8.401 8.028 7.712 7.432 7.159 6.893 6.64 6.417 6.165 5.941 5.769 5.591 5.387 5.201 4.982 4.75 4.588 4.424 4.264 4.093 3.901 3.773 3.645 3.445 3.312 3.172 3.094 2.94 2.772 2.577 2.484 2.179 2.185 2.075 1.952 1.679 1.533 1.356 1.155 0.919 0.616 0.216 -0.853 -2 ,9914 ,TETRA ,17377883,Sat Nov 20 21:38:46 CET,Sat Nov 20 23:11:41 CET,0.0 1.339 1.796 2.145 2.421 2.642 2.824 2.989 3.29 3.414 3.548 3.591 3.903 4.016 4.233 4.424 4.601 4.689 4.847 4.989 5.211 5.348 5.481 5.677 5.865 6.04 6.199 6.346 6.533 6.713 6.89 7.102 7.301 7.483 7.691 7.931 8.151 8.387 8.648 8.915 9.162 9.435 9.767 10.099 10.449 10.78 11.161 11.574 11.922 12.155 12.144 11.775 11.296 10.807 10.315 9.853 9.429 9.038 8.679 8.263 7.918 7.63 7.353 7.087 6.835 6.603 6.365 6.147 5.957 5.761 5.553 5.384 5.202 4.999 4.836 4.668 4.499 4.334 4.16 4.029 3.89 3.7 3.577 3.43 3.349 3.172 2.993 2.811 2.711 2.405 2.44 2.334 2.215 1.93 1.775 1.633 1.477 1.293 1.086 0.728 -0.952 -3 ,5345 ,TETRA ,17377884,Sat Nov 20 21:38:44 CET,Sat Nov 20 23:20:20 CET,0.0 1.149 1.541 1.833 2.087 2.321 2.512 2.681 2.967 3.082 3.206 3.227 3.55 3.665 3.869 4.059 4.229 4.318 4.484 4.627 4.838 4.972 5.106 5.299 5.474 5.641 5.798 5.948 6.137 6.313 6.48 6.675 6.843 7.008 7.198 7.41 7.624 7.848 8.072 8.327 8.606 8.907 9.241 9.545 9.887 10.226 10.552 10.887 11.239 11.494 11.483 11.101 10.618 10.123 9.64 9.207 8.817 8.43 8.082 7.726 7.413 7.132 6.862 6.603 6.363 6.131 5.882 5.662 5.477 5.276 5.065 4.895 4.706 4.512 4.359 4.193 4.029 3.869 3.696 3.572 3.454 3.253 3.103 2.969 2.903 2.75 2.578 2.394 2.297 1.98 1.991 1.89 1.774 1.523 1.386 1.22 1.021 0.807 0.53 0.046 -1.141 -4 ,30352 ,TETRA ,17377885,Sat Nov 20 21:38:46 CET,Sat Nov 20 23:20:00 CET,0.0 2.103 2.606 2.915 3.166 3.41 3.633 3.833 4.156 4.293 4.423 4.435 4.751 4.869 5.097 5.291 5.452 5.523 5.664 5.799 5.994 6.124 6.255 6.446 6.623 6.792 6.952 7.104 7.296 7.46 7.629 7.83 8.012 8.204 8.425 8.657 8.876 9.106 9.339 9.585 9.838 10.115 10.444 10.756 11.058 11.401 11.773 12.086 12.341 12.566 12.652 12.343 11.84 11.314 10.873 10.457 10.053 9.651 9.271 8.885 8.553 8.267 8.017 7.789 7.574 7.358 7.111 6.896 6.715 6.515 6.289 6.103 5.92 5.733 5.587 5.438 5.281 5.108 4.932 4.808 4.679 4.467 4.319 4.171 4.092 3.935 3.774 3.589 3.497 3.188 3.171 3.057 2.944 2.669 2.529 2.372 2.185 1.987 1.687 1.31 0.381 -5 ,768 ,TETRA ,17377887,Sat Nov 20 21:40:11 CET,Sat Nov 20 23:53:18 CET,0.0 1.536 1.914 2.214 2.439 2.633 2.808 2.978 3.263 3.393 3.523 3.553 3.873 3.985 4.197 4.377 4.536 4.615 4.769 4.919 5.13 5.257 5.386 5.572 5.746 5.906 6.053 6.203 6.388 6.556 6.717 6.911 7.114 7.308 7.53 7.766 7.964 8.185 8.44 8.693 8.95 9.267 9.619 9.93 10.25 10.562 10.884 11.226 11.559 11.804 11.822 11.492 11.023 10.542 10.085 9.627 9.197 8.815 8.473 8.093 7.758 7.468 7.179 6.87 6.589 6.35 6.095 5.887 5.71 5.506 5.277 5.081 4.898 4.728 4.594 4.442 4.279 4.114 3.952 3.832 3.703 3.505 3.365 3.224 3.149 2.991 2.837 2.652 2.548 2.231 2.208 2.089 1.966 1.696 1.549 1.39 1.209 0.977 0.732 0.388 -0.958 -6 ,7316 ,TETRA ,17377889,Sat Nov 20 21:39:58 CET,Sat Nov 20 23:46:35 CET,0.0 1.488 2.074 2.416 2.694 2.963 3.185 3.354 3.635 3.765 3.889 3.904 4.219 4.328 4.531 4.712 4.876 4.956 5.117 5.281 5.554 5.723 5.848 6.02 6.215 6.396 6.553 6.706 6.899 7.067 7.223 7.42 7.627 7.82 8.031 8.279 8.513 8.763 9.012 9.26 9.53 9.831 10.15 10.466 10.81 11.177 11.583 11.922 12.232 12.495 12.483 12.12 11.635 11.137 10.66 10.189 9.74 9.303 8.932 8.588 8.294 8.015 7.74 7.491 7.267 7.057 6.815 6.587 6.399 6.207 5.982 5.78 5.589 5.398 5.241 5.083 4.932 4.776 4.612 4.493 4.373 4.185 4.045 3.89 3.806 3.637 3.458 3.267 3.173 2.866 2.85 2.739 2.636 2.369 2.219 2.067 1.86 1.636 1.373 1.019 0.249 -7 ,25098 ,TETRA ,17377891,Sat Nov 20 21:38:48 CET,Sun Nov 21 00:01:05 CET,0.0 1.605 2.132 2.454 2.679 2.883 3.056 3.206 3.49 3.619 3.751 3.786 4.097 4.198 4.402 4.587 4.756 4.844 5.015 5.166 5.375 5.504 5.623 5.802 5.975 6.13 6.287 6.442 6.622 6.804 6.98 7.185 7.392 7.577 7.787 8.038 8.267 8.504 8.747 8.99 9.257 9.543 9.858 10.168 10.484 10.813 11.197 11.549 11.827 12.053 12.019 11.673 11.241 10.771 10.316 9.859 9.475 9.111 8.756 8.38 8.048 7.752 7.452 7.165 6.918 6.698 6.461 6.235 6.04 5.843 5.637 5.469 5.298 5.112 4.967 4.817 4.659 4.488 4.293 4.16 4.036 3.844 3.712 3.57 3.492 3.317 3.119 2.912 2.811 2.49 2.468 2.338 2.206 1.923 1.77 1.576 1.347 1.101 0.843 0.468 -0.78 -8 ,8978 ,TETRA ,17377893,Sat Nov 20 21:40:04 CET,Sat Nov 20 23:22:47 CET,0.0 1.69 2.17 2.455 2.666 2.858 3.042 3.229 3.574 3.725 3.856 3.854 4.159 4.251 4.438 4.634 4.827 4.913 5.07 5.217 5.434 5.583 5.723 5.904 6.09 6.271 6.427 6.57 6.755 6.955 7.149 7.358 7.559 7.754 7.974 8.212 8.436 8.695 8.977 9.257 9.523 9.787 10.091 10.406 10.734 11.076 11.44 11.767 12.086 12.319 12.327 11.979 11.499 11.042 10.595 10.129 9.711 9.308 8.936 8.56 8.249 7.965 7.667 7.393 7.134 6.875 6.604 6.386 6.214 6.018 5.799 5.618 5.437 5.262 5.125 4.972 4.809 4.637 4.45 4.324 4.188 3.968 3.835 3.707 3.629 3.47 3.319 3.145 3.052 2.739 2.74 2.632 2.522 2.273 2.124 1.942 1.718 1.49 1.242 0.928 0.238 -9 ,12366 ,TETRA ,17377895,Sat Nov 20 21:39:25 CET,Sat Nov 20 23:21:30 CET,0.0 1.26 1.736 2.086 2.35 2.551 2.734 2.903 3.222 3.358 3.479 3.505 3.831 3.96 4.205 4.413 4.599 4.676 4.824 4.98 5.198 5.333 5.457 5.636 5.815 5.985 6.148 6.299 6.475 6.644 6.82 7.039 7.238 7.421 7.631 7.855 8.08 8.327 8.556 8.792 9.053 9.326 9.616 9.899 10.197 10.5 10.854 11.23 11.557 11.776 11.802 11.465 10.957 10.435 9.966 9.526 9.103 8.694 8.337 7.97 7.636 7.342 7.079 6.813 6.559 6.339 6.099 5.869 5.677 5.482 5.272 5.091 4.899 4.702 4.544 4.384 4.222 4.05 3.87 3.741 3.608 3.39 3.229 3.066 2.983 2.818 2.653 2.471 2.368 2.061 2.053 1.923 1.789 1.516 1.347 1.16 0.973 0.776 0.522 0.086 -1.55 -10 ,15965 ,TETRA ,17377896,Sat Nov 20 21:39:20 CET,Sat Nov 20 23:13:07 CET,0.0 1.083 1.465 1.74 1.984 2.222 2.446 2.629 2.938 3.09 3.223 3.247 3.569 3.676 3.868 4.037 4.192 4.273 4.444 4.594 4.81 4.957 5.084 5.257 5.438 5.622 5.799 5.969 6.169 6.359 6.543 6.753 6.948 7.123 7.332 7.561 7.789 8.035 8.282 8.545 8.806 9.102 9.431 9.734 10.076 10.425 10.769 11.092 11.389 11.599 11.589 11.226 10.731 10.227 9.74 9.275 8.862 8.469 8.121 7.772 7.446 7.137 6.854 6.591 6.345 6.112 5.868 5.652 5.466 5.286 5.083 4.902 4.714 4.507 4.343 4.181 4.018 3.858 3.695 3.575 3.446 3.242 3.097 2.944 2.867 2.712 2.559 2.397 2.306 1.992 1.97 1.857 1.752 1.529 1.393 1.234 1.054 0.862 0.642 0.29 -0.593 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_5.txt deleted file mode 100644 index ae2b7bc1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29622 ,TETRA ,17377898,Sat Nov 20 21:39:21 CET,Sat Nov 20 23:38:44 CET,0.0 0.881 1.218 1.448 1.66 1.839 1.985 2.136 2.427 2.566 2.7 2.71 3.025 3.134 3.328 3.492 3.655 3.738 3.91 4.08 4.301 4.449 4.589 4.773 4.952 5.123 5.298 5.478 5.7 5.904 6.112 6.362 6.576 6.787 7.033 7.299 7.561 7.84 8.133 8.432 8.756 9.137 9.555 9.947 10.409 10.91 11.465 12.081 12.717 13.353 13.968 14.271 14.21 14.012 13.773 13.483 13.243 13.004 12.756 12.483 12.205 11.958 11.719 11.475 11.244 11.03 10.801 10.602 10.442 10.26 10.06 9.898 9.721 9.524 9.372 9.22 9.064 8.897 8.724 8.6 8.464 8.267 8.122 7.955 7.868 7.682 7.488 7.275 7.159 6.836 6.782 6.638 6.488 6.147 5.96 5.773 5.515 5.185 4.818 4.349 2.184 -2 ,11634 ,TETRA ,17377900,Sat Nov 20 21:39:20 CET,Sat Nov 20 23:44:31 CET,0.0 0.905 1.24 1.513 1.738 1.942 2.124 2.287 2.565 2.679 2.799 2.823 3.133 3.239 3.447 3.63 3.801 3.886 4.036 4.171 4.373 4.507 4.641 4.825 4.991 5.144 5.301 5.461 5.659 5.848 6.05 6.313 6.545 6.749 6.967 7.228 7.492 7.786 8.099 8.41 8.732 9.109 9.554 9.977 10.43 10.921 11.469 12.044 12.658 13.303 13.929 14.181 14.1 13.872 13.602 13.343 13.094 12.8 12.508 12.206 11.931 11.694 11.464 11.234 11.016 10.82 10.6 10.382 10.196 10.016 9.824 9.652 9.483 9.306 9.155 8.996 8.831 8.66 8.479 8.345 8.203 7.975 7.818 7.646 7.557 7.387 7.187 6.955 6.844 6.532 6.505 6.368 6.216 5.893 5.716 5.514 5.286 5.025 4.664 4.147 2.421 -3 ,17223 ,TETRA ,17377902,Sat Nov 20 21:39:23 CET,Sat Nov 20 23:37:12 CET,0.0 1.174 1.535 1.744 1.958 2.203 2.403 2.528 2.777 2.907 3.032 3.064 3.386 3.487 3.678 3.854 4.021 4.107 4.28 4.438 4.642 4.774 4.916 5.113 5.298 5.482 5.655 5.819 6.038 6.246 6.448 6.686 6.916 7.141 7.391 7.672 7.943 8.242 8.555 8.868 9.178 9.527 9.928 10.322 10.796 11.311 11.861 12.444 13.092 13.779 14.415 14.702 14.617 14.394 14.142 13.83 13.516 13.222 12.933 12.619 12.346 12.096 11.858 11.638 11.437 11.242 11.024 10.828 10.65 10.448 10.237 10.062 9.88 9.7 9.558 9.422 9.259 9.072 8.885 8.759 8.624 8.376 8.2 8.021 7.931 7.747 7.532 7.291 7.177 6.853 6.801 6.662 6.516 6.197 6.023 5.818 5.559 5.233 4.828 4.246 2.118 -4 ,5787 ,TETRA ,17377904,Sat Nov 20 21:39:21 CET,Sat Nov 20 23:53:22 CET,0.0 1.152 1.437 1.7 1.93 2.153 2.346 2.498 2.771 2.893 3.009 3.032 3.348 3.449 3.649 3.81 3.958 4.036 4.194 4.353 4.571 4.695 4.827 5.025 5.205 5.385 5.56 5.728 5.942 6.159 6.369 6.595 6.813 7.039 7.289 7.547 7.788 8.068 8.364 8.691 9.052 9.419 9.826 10.233 10.718 11.253 11.834 12.414 13.01 13.684 14.365 14.593 14.485 14.251 13.97 13.664 13.375 13.102 12.83 12.52 12.245 12.007 11.78 11.539 11.306 11.095 10.871 10.675 10.501 10.316 10.136 9.974 9.788 9.587 9.419 9.252 9.082 8.906 8.708 8.563 8.42 8.195 8.048 7.882 7.79 7.591 7.394 7.189 7.071 6.756 6.72 6.578 6.437 6.11 5.92 5.716 5.492 5.23 4.908 4.478 3.056 -5 ,22832 ,TETRA ,17377905,Sat Nov 20 21:39:23 CET,Sat Nov 20 23:44:24 CET,0.0 1.032 1.466 1.797 2.059 2.244 2.408 2.553 2.812 2.933 3.04 3.042 3.35 3.447 3.647 3.839 4.003 4.079 4.23 4.385 4.618 4.759 4.892 5.083 5.278 5.457 5.617 5.778 5.973 6.154 6.342 6.569 6.779 6.991 7.235 7.513 7.777 8.057 8.357 8.661 8.993 9.351 9.75 10.154 10.598 11.089 11.634 12.202 12.839 13.464 13.968 14.2 14.196 13.999 13.707 13.382 13.082 12.792 12.518 12.231 11.965 11.722 11.479 11.234 11.002 10.777 10.54 10.333 10.153 9.966 9.76 9.58 9.381 9.172 9.006 8.834 8.662 8.49 8.298 8.17 8.037 7.812 7.663 7.5 7.413 7.229 7.028 6.833 6.739 6.432 6.403 6.264 6.109 5.787 5.602 5.379 5.139 4.907 4.609 4.153 2.632 -6 ,1893 ,TETRA ,17377907,Sat Nov 20 21:39:24 CET,Sat Nov 20 23:19:18 CET,0.0 1.142 1.45 1.706 1.898 2.069 2.222 2.366 2.646 2.787 2.92 2.955 3.282 3.389 3.588 3.773 3.954 4.039 4.203 4.368 4.594 4.729 4.858 5.04 5.21 5.387 5.553 5.71 5.925 6.126 6.315 6.545 6.765 6.984 7.239 7.51 7.759 8.036 8.339 8.668 9.003 9.356 9.778 10.193 10.666 11.195 11.753 12.343 12.997 13.657 14.213 14.377 14.284 14.105 13.814 13.472 13.195 12.942 12.69 12.419 12.17 11.928 11.666 11.397 11.156 10.953 10.743 10.539 10.349 10.153 9.945 9.773 9.592 9.4 9.248 9.087 8.926 8.756 8.577 8.444 8.291 8.058 7.903 7.743 7.667 7.488 7.287 7.088 6.964 6.636 6.578 6.434 6.289 5.989 5.823 5.618 5.391 5.158 4.822 4.237 2.59 -7 ,16498 ,TETRA ,17377909,Sat Nov 20 21:39:22 CET,Sat Nov 20 23:18:57 CET,0.0 0.985 1.304 1.552 1.771 1.951 2.135 2.317 2.614 2.739 2.867 2.89 3.2 3.299 3.487 3.659 3.826 3.907 4.053 4.199 4.426 4.564 4.694 4.907 5.119 5.305 5.48 5.645 5.85 6.046 6.242 6.476 6.699 6.915 7.155 7.407 7.647 7.915 8.201 8.495 8.819 9.184 9.576 9.983 10.476 10.973 11.519 12.123 12.784 13.454 14.06 14.298 14.285 14.139 13.868 13.56 13.276 12.972 12.691 12.397 12.145 11.904 11.655 11.425 11.219 11.012 10.793 10.6 10.417 10.219 10.015 9.846 9.65 9.451 9.301 9.133 8.971 8.81 8.616 8.488 8.36 8.127 7.969 7.814 7.727 7.541 7.341 7.118 7.006 6.699 6.677 6.532 6.367 6.025 5.825 5.581 5.32 5.037 4.665 4.138 2.12 -8 ,25359 ,TETRA ,17377912,Sat Nov 20 21:39:24 CET,Sat Nov 20 23:20:51 CET,0.0 1.135 1.491 1.799 2.027 2.218 2.395 2.563 2.86 2.99 3.127 3.155 3.46 3.55 3.734 3.93 4.116 4.202 4.359 4.505 4.715 4.85 4.972 5.149 5.333 5.508 5.684 5.866 6.085 6.286 6.488 6.724 6.934 7.127 7.357 7.652 7.94 8.247 8.56 8.883 9.199 9.541 9.949 10.344 10.802 11.298 11.818 12.364 12.968 13.587 14.2 14.47 14.424 14.215 13.961 13.707 13.433 13.129 12.848 12.574 12.327 12.09 11.859 11.641 11.424 11.209 10.994 10.802 10.618 10.423 10.236 10.079 9.899 9.7 9.54 9.37 9.195 9.025 8.837 8.69 8.539 8.312 8.144 7.968 7.876 7.679 7.489 7.295 7.186 6.866 6.843 6.719 6.586 6.296 6.116 5.923 5.713 5.455 5.167 4.767 3.643 -9 ,10815 ,TETRA ,17377913,Sat Nov 20 21:39:25 CET,Sat Nov 20 23:21:00 CET,0.0 1.211 1.545 1.781 2.033 2.244 2.392 2.566 2.896 3.033 3.155 3.155 3.464 3.566 3.766 3.955 4.159 4.255 4.419 4.576 4.791 4.922 5.061 5.261 5.432 5.611 5.802 5.987 6.211 6.412 6.607 6.845 7.069 7.274 7.506 7.767 8.026 8.306 8.613 8.92 9.228 9.588 10.007 10.43 10.885 11.389 11.954 12.538 13.163 13.824 14.451 14.742 14.723 14.525 14.26 13.958 13.69 13.439 13.151 12.844 12.574 12.322 12.082 11.853 11.633 11.417 11.169 10.945 10.768 10.584 10.381 10.21 10.02 9.815 9.66 9.496 9.325 9.146 8.948 8.807 8.664 8.444 8.297 8.141 8.061 7.885 7.684 7.459 7.334 7.009 6.969 6.839 6.702 6.4 6.204 5.985 5.756 5.465 5.154 4.792 3.67 -10 ,5403 ,TETRA ,17377916,Sat Nov 20 21:39:57 CET,Sat Nov 20 23:51:17 CET,0.0 1.113 1.492 1.738 1.924 2.085 2.243 2.398 2.7 2.831 2.946 2.953 3.273 3.378 3.572 3.756 3.932 4.017 4.187 4.349 4.567 4.709 4.849 5.048 5.23 5.401 5.585 5.758 5.968 6.167 6.359 6.598 6.817 7.022 7.272 7.554 7.804 8.074 8.387 8.707 9.024 9.397 9.832 10.251 10.74 11.279 11.873 12.495 13.141 13.845 14.526 14.745 14.677 14.497 14.23 13.901 13.544 13.231 12.99 12.737 12.497 12.266 12.026 11.781 11.555 11.338 11.104 10.895 10.699 10.489 10.279 10.113 9.933 9.721 9.557 9.399 9.237 9.066 8.882 8.751 8.611 8.4 8.252 8.086 8.003 7.826 7.627 7.398 7.278 6.955 6.902 6.769 6.635 6.331 6.143 5.928 5.681 5.399 5.109 4.702 2.878 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1c_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1c_5.txt deleted file mode 100644 index cea34a2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1c_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19011 ,TETRA ,17377918,Sat Nov 20 21:39:58 CET,Sat Nov 20 23:12:03 CET,0.0 1.295 1.699 1.971 2.211 2.436 2.601 2.747 3.016 3.143 3.278 3.312 3.629 3.732 3.929 4.11 4.3 4.385 4.529 4.672 4.906 5.069 5.21 5.412 5.612 5.795 5.964 6.127 6.337 6.539 6.732 6.968 7.211 7.438 7.7 8.001 8.268 8.559 8.87 9.184 9.523 9.895 10.328 10.776 11.276 11.813 12.381 13.002 13.722 14.414 15.017 15.282 15.253 15.113 14.93 14.685 14.396 14.119 13.856 13.563 13.298 13.042 12.802 12.569 12.349 12.145 11.918 11.717 11.528 11.315 11.1 10.906 10.706 10.511 10.355 10.194 10.024 9.842 9.64 9.504 9.372 9.166 9.021 8.856 8.761 8.556 8.34 8.117 8.009 7.681 7.629 7.488 7.323 6.971 6.774 6.559 6.315 6.029 5.681 5.286 3.358 -2 ,11384 ,TETRA ,17377921,Sat Nov 20 21:39:58 CET,Sat Nov 20 23:19:58 CET,0.0 0.838 1.182 1.466 1.68 1.86 2.031 2.198 2.514 2.649 2.777 2.788 3.1 3.205 3.411 3.609 3.796 3.88 4.043 4.211 4.447 4.597 4.743 4.942 5.125 5.3 5.464 5.623 5.833 6.045 6.258 6.493 6.711 6.935 7.194 7.477 7.748 8.05 8.355 8.675 9.032 9.435 9.885 10.308 10.781 11.305 11.89 12.52 13.224 14.029 14.87 15.245 15.22 15.074 14.894 14.664 14.404 14.131 13.86 13.585 13.352 13.119 12.871 12.633 12.402 12.187 11.973 11.788 11.629 11.453 11.253 11.083 10.9 10.706 10.559 10.398 10.218 10.035 9.839 9.685 9.539 9.325 9.16 8.99 8.905 8.732 8.54 8.316 8.179 7.838 7.762 7.605 7.443 7.067 6.852 6.603 6.312 5.98 5.585 5.082 3.053 -3 ,19927 ,TETRA ,17377923,Sat Nov 20 21:39:58 CET,Sat Nov 20 23:19:58 CET,0.0 1.484 1.801 2.035 2.211 2.382 2.555 2.73 3.059 3.2 3.327 3.344 3.667 3.77 3.955 4.134 4.3 4.377 4.541 4.709 4.934 5.071 5.202 5.396 5.588 5.763 5.924 6.088 6.308 6.525 6.734 6.973 7.206 7.431 7.676 7.944 8.209 8.498 8.8 9.117 9.457 9.833 10.265 10.687 11.158 11.689 12.274 12.906 13.676 14.495 15.218 15.556 15.48 15.269 15.05 14.821 14.571 14.308 14.054 13.77 13.517 13.284 13.045 12.803 12.588 12.388 12.164 11.96 11.779 11.587 11.372 11.174 10.974 10.791 10.642 10.47 10.287 10.089 9.903 9.776 9.637 9.417 9.252 9.071 8.971 8.772 8.563 8.316 8.183 7.848 7.786 7.648 7.487 7.069 6.848 6.628 6.383 6.105 5.685 4.981 2.536 -4 ,8891 ,TETRA ,17377926,Sat Nov 20 21:39:58 CET,Sat Nov 20 23:22:28 CET,0.0 0.997 1.353 1.623 1.858 2.056 2.208 2.348 2.613 2.736 2.857 2.881 3.19 3.286 3.496 3.695 3.885 3.979 4.148 4.307 4.551 4.706 4.852 5.061 5.25 5.422 5.589 5.765 5.989 6.193 6.402 6.641 6.845 7.045 7.275 7.535 7.791 8.07 8.398 8.742 9.101 9.506 9.941 10.38 10.878 11.415 12.023 12.677 13.406 14.163 14.932 15.383 15.408 15.262 15.038 14.792 14.526 14.243 13.971 13.67 13.413 13.178 12.932 12.704 12.489 12.276 12.046 11.834 11.645 11.436 11.22 11.053 10.874 10.675 10.516 10.355 10.189 10.004 9.804 9.661 9.517 9.301 9.141 8.977 8.896 8.72 8.503 8.266 8.148 7.805 7.714 7.564 7.402 7.025 6.825 6.629 6.382 6.077 5.754 5.334 3.402 -5 ,26394 ,TETRA ,17377927,Sat Nov 20 21:39:58 CET,Sat Nov 20 23:22:32 CET,0.0 0.971 1.32 1.571 1.798 2.017 2.221 2.392 2.697 2.822 2.959 3.007 3.315 3.416 3.61 3.78 3.95 4.034 4.191 4.341 4.543 4.689 4.838 5.03 5.225 5.416 5.591 5.755 5.964 6.15 6.34 6.59 6.82 7.051 7.32 7.601 7.863 8.162 8.473 8.797 9.139 9.514 9.981 10.433 10.907 11.464 12.109 12.743 13.471 14.295 15.084 15.376 15.314 15.157 14.977 14.78 14.537 14.27 14.024 13.737 13.475 13.254 13.031 12.798 12.592 12.412 12.197 12.004 11.823 11.623 11.415 11.231 11.043 10.844 10.683 10.516 10.34 10.126 9.909 9.776 9.637 9.412 9.247 9.063 8.966 8.769 8.567 8.362 8.264 7.947 7.887 7.744 7.584 7.262 7.084 6.877 6.661 6.403 6.021 5.527 3.323 -6 ,2263 ,TETRA ,17377930,Sat Nov 20 21:39:58 CET,Sat Nov 20 23:20:51 CET,0.0 1.163 1.541 1.792 1.983 2.159 2.317 2.474 2.772 2.909 3.039 3.055 3.364 3.459 3.648 3.829 4.004 4.086 4.24 4.391 4.613 4.757 4.9 5.101 5.294 5.485 5.66 5.818 6.019 6.227 6.427 6.671 6.907 7.131 7.39 7.671 7.923 8.211 8.523 8.859 9.232 9.626 10.072 10.529 11.043 11.564 12.165 12.807 13.506 14.297 15.058 15.392 15.395 15.261 15.058 14.794 14.513 14.23 13.941 13.633 13.375 13.123 12.869 12.638 12.425 12.224 12.012 11.81 11.635 11.453 11.239 11.054 10.869 10.689 10.546 10.383 10.208 10.014 9.804 9.662 9.533 9.319 9.167 9.012 8.922 8.734 8.527 8.293 8.174 7.852 7.783 7.633 7.48 7.133 6.934 6.703 6.436 6.086 5.657 5.165 3.374 -7 ,24460 ,TETRA ,17377931,Sat Nov 20 21:39:59 CET,Sat Nov 20 23:21:10 CET,0.0 0.999 1.373 1.683 1.959 2.2 2.398 2.56 2.854 2.992 3.121 3.135 3.448 3.549 3.748 3.944 4.137 4.236 4.435 4.609 4.84 4.991 5.136 5.34 5.534 5.724 5.896 6.064 6.288 6.492 6.694 6.955 7.199 7.417 7.676 7.986 8.274 8.565 8.881 9.216 9.56 9.943 10.378 10.805 11.285 11.816 12.439 13.115 13.803 14.601 15.444 15.809 15.79 15.668 15.481 15.216 14.957 14.699 14.434 14.138 13.884 13.653 13.408 13.182 12.991 12.797 12.569 12.347 12.148 11.95 11.753 11.58 11.387 11.175 11.015 10.864 10.701 10.524 10.328 10.185 10.034 9.801 9.646 9.489 9.403 9.218 9.025 8.836 8.731 8.404 8.35 8.212 8.043 7.596 7.347 7.101 6.831 6.491 6.069 5.474 3.261 -8 ,8702 ,TETRA ,17377932,Sat Nov 20 21:40:01 CET,Sat Nov 20 23:12:03 CET,0.0 0.889 1.222 1.525 1.774 1.989 2.169 2.341 2.648 2.78 2.903 2.925 3.245 3.356 3.566 3.746 3.926 4.01 4.168 4.327 4.547 4.678 4.815 5.016 5.207 5.39 5.554 5.718 5.923 6.114 6.322 6.578 6.817 7.038 7.291 7.571 7.828 8.12 8.438 8.766 9.113 9.499 9.932 10.368 10.87 11.392 11.928 12.548 13.313 14.115 14.817 15.121 15.072 14.887 14.682 14.435 14.151 13.869 13.6 13.316 13.06 12.801 12.533 12.25 12.0 11.797 11.584 11.382 11.199 11.011 10.803 10.618 10.429 10.243 10.099 9.943 9.773 9.593 9.409 9.28 9.138 8.895 8.733 8.568 8.473 8.279 8.096 7.89 7.768 7.426 7.322 7.167 7.004 6.641 6.458 6.277 6.027 5.704 5.329 4.829 2.712 -9 ,9216 ,TETRA ,17377933,Sat Nov 20 21:39:58 CET,Sat Nov 20 23:57:01 CET,0.0 1.251 1.621 1.889 2.084 2.268 2.434 2.601 2.922 3.07 3.213 3.244 3.562 3.667 3.856 4.036 4.221 4.309 4.478 4.649 4.878 5.016 5.153 5.349 5.532 5.718 5.902 6.064 6.266 6.462 6.651 6.889 7.131 7.351 7.59 7.867 8.134 8.419 8.737 9.073 9.411 9.784 10.228 10.678 11.187 11.721 12.292 12.897 13.603 14.359 15.096 15.488 15.519 15.381 15.188 14.967 14.708 14.427 14.165 13.891 13.619 13.36 13.109 12.845 12.612 12.414 12.195 12.001 11.842 11.663 11.449 11.273 11.095 10.884 10.713 10.552 10.393 10.212 10.015 9.883 9.756 9.562 9.427 9.275 9.182 8.973 8.775 8.573 8.461 8.136 8.069 7.933 7.802 7.494 7.303 7.112 6.921 6.68 6.332 5.848 3.869 -10 ,28474 ,TETRA ,17377937,Sat Nov 20 21:39:59 CET,Sat Nov 20 23:20:45 CET,0.0 1.25 1.609 1.937 2.225 2.456 2.645 2.801 3.079 3.199 3.324 3.363 3.676 3.784 4.01 4.22 4.39 4.464 4.632 4.799 5.035 5.185 5.315 5.502 5.695 5.893 6.085 6.255 6.465 6.681 6.893 7.144 7.382 7.61 7.871 8.162 8.432 8.72 9.03 9.367 9.737 10.135 10.575 11.039 11.57 12.119 12.731 13.401 14.164 14.995 15.758 16.069 16.042 15.894 15.68 15.429 15.186 14.901 14.6 14.306 14.051 13.809 13.566 13.318 13.084 12.873 12.665 12.481 12.295 12.084 11.875 11.716 11.544 11.346 11.199 11.053 10.894 10.706 10.505 10.365 10.203 9.953 9.787 9.61 9.523 9.349 9.128 8.888 8.761 8.427 8.364 8.203 8.028 7.673 7.485 7.271 7.041 6.783 6.401 5.846 3.925 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1d_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1d_5.txt deleted file mode 100644 index 6f88d025..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_1d_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22231 ,TETRA ,17377940,Sat Nov 20 21:40:03 CET,Sat Nov 20 23:12:21 CET,0.0 1.268 1.635 1.915 2.134 2.325 2.52 2.689 2.984 3.126 3.257 3.303 3.631 3.734 3.934 4.126 4.309 4.398 4.583 4.765 5.02 5.173 5.318 5.538 5.737 5.912 6.098 6.291 6.533 6.761 6.984 7.228 7.456 7.695 7.961 8.231 8.486 8.796 9.148 9.506 9.862 10.251 10.7 11.157 11.689 12.258 12.899 13.627 14.426 15.28 16.115 16.563 16.622 16.507 16.303 16.016 15.746 15.467 15.21 14.953 14.71 14.458 14.204 13.979 13.756 13.54 13.317 13.112 12.929 12.734 12.526 12.345 12.142 11.935 11.775 11.609 11.434 11.244 11.034 10.881 10.723 10.488 10.331 10.166 10.083 9.915 9.733 9.53 9.413 9.079 9.028 8.876 8.704 8.385 8.189 7.941 7.702 7.392 7.002 6.491 4.476 -2 ,11123 ,TETRA ,17377942,Sat Nov 20 21:40:03 CET,Sat Nov 20 23:54:47 CET,0.0 1.34 1.732 2.025 2.234 2.417 2.571 2.693 2.951 3.087 3.218 3.246 3.556 3.658 3.86 4.047 4.227 4.312 4.484 4.642 4.853 4.998 5.146 5.345 5.532 5.71 5.893 6.078 6.311 6.522 6.715 6.943 7.16 7.38 7.639 7.934 8.221 8.523 8.833 9.167 9.53 9.934 10.373 10.813 11.32 11.862 12.501 13.192 13.904 14.688 15.52 15.943 15.991 15.874 15.677 15.47 15.232 14.938 14.661 14.373 14.12 13.888 13.649 13.432 13.215 12.986 12.739 12.517 12.319 12.118 11.915 11.731 11.531 11.315 11.142 10.974 10.8 10.608 10.396 10.252 10.105 9.871 9.705 9.512 9.403 9.193 8.986 8.751 8.629 8.294 8.199 8.045 7.888 7.501 7.294 7.103 6.872 6.585 6.207 5.683 3.757 -3 ,24325 ,TETRA ,17377944,Sat Nov 20 21:40:01 CET,Sat Nov 20 23:39:09 CET,0.0 1.412 1.776 2.05 2.291 2.489 2.657 2.815 3.108 3.249 3.379 3.401 3.73 3.844 4.035 4.202 4.379 4.465 4.627 4.781 4.992 5.127 5.254 5.45 5.65 5.85 6.049 6.228 6.446 6.658 6.865 7.103 7.336 7.553 7.793 8.09 8.377 8.677 8.995 9.325 9.67 10.06 10.507 10.965 11.503 12.079 12.727 13.427 14.233 15.141 16.072 16.658 16.746 16.632 16.417 16.14 15.896 15.643 15.38 15.071 14.799 14.551 14.295 14.054 13.819 13.609 13.388 13.16 12.976 12.791 12.568 12.382 12.192 11.984 11.824 11.666 11.49 11.316 11.126 10.986 10.834 10.588 10.427 10.259 10.161 9.941 9.724 9.484 9.354 9.006 8.921 8.787 8.624 8.274 8.079 7.842 7.57 7.208 6.692 6.009 4.253 -4 ,5755 ,TETRA ,17377946,Sat Nov 20 21:40:05 CET,Sat Nov 20 23:24:40 CET,0.0 1.02 1.431 1.739 1.944 2.144 2.337 2.494 2.783 2.911 3.02 3.023 3.344 3.454 3.654 3.845 4.018 4.1 4.259 4.421 4.674 4.828 4.973 5.177 5.383 5.579 5.754 5.92 6.14 6.356 6.569 6.824 7.059 7.291 7.544 7.828 8.101 8.378 8.676 8.99 9.308 9.7 10.191 10.66 11.197 11.753 12.355 13.057 13.837 14.673 15.459 15.848 15.949 15.847 15.633 15.415 15.178 14.898 14.63 14.374 14.122 13.861 13.602 13.363 13.151 12.947 12.732 12.527 12.33 12.122 11.901 11.703 11.515 11.337 11.188 11.012 10.831 10.646 10.433 10.288 10.145 9.929 9.775 9.605 9.514 9.326 9.127 8.893 8.774 8.437 8.361 8.217 8.05 7.662 7.42 7.181 6.923 6.63 6.247 5.73 3.572 -5 ,25409 ,TETRA ,17377948,Sat Nov 20 21:41:54 CET,Sat Nov 20 23:28:25 CET,0.0 0.776 1.139 1.389 1.591 1.787 1.95 2.086 2.351 2.49 2.62 2.64 2.963 3.074 3.282 3.471 3.644 3.731 3.907 4.082 4.322 4.473 4.617 4.817 4.993 5.165 5.333 5.5 5.721 5.921 6.12 6.363 6.591 6.818 7.087 7.376 7.666 7.977 8.268 8.585 8.931 9.325 9.785 10.249 10.799 11.382 12.021 12.728 13.488 14.279 15.119 15.553 15.605 15.485 15.277 15.035 14.786 14.519 14.238 13.929 13.664 13.426 13.181 12.967 12.782 12.591 12.374 12.174 11.972 11.77 11.573 11.391 11.198 10.994 10.838 10.664 10.47 10.277 10.074 9.933 9.784 9.539 9.358 9.166 9.082 8.906 8.694 8.478 8.36 8.022 7.93 7.779 7.62 7.272 7.077 6.854 6.577 6.247 5.809 5.311 3.815 -6 ,27718 ,TETRA ,17377950,Sat Nov 20 21:40:59 CET,Sat Nov 20 23:13:21 CET,0.0 1.361 1.839 2.16 2.397 2.603 2.783 2.975 3.323 3.447 3.57 3.606 3.921 4.015 4.217 4.416 4.591 4.677 4.849 5.008 5.227 5.368 5.507 5.719 5.933 6.128 6.305 6.477 6.705 6.911 7.099 7.353 7.604 7.841 8.11 8.405 8.691 8.986 9.294 9.627 9.974 10.368 10.821 11.25 11.731 12.301 12.966 13.651 14.378 15.17 15.997 16.424 16.468 16.339 16.128 15.853 15.585 15.326 15.056 14.784 14.53 14.289 14.054 13.817 13.588 13.385 13.168 12.954 12.763 12.553 12.332 12.147 11.954 11.744 11.573 11.396 11.2 11.002 10.808 10.676 10.529 10.287 10.113 9.924 9.827 9.645 9.452 9.234 9.12 8.793 8.693 8.519 8.34 7.956 7.738 7.52 7.28 6.942 6.486 5.854 3.767 -7 ,16122 ,TETRA ,17377952,Sat Nov 20 21:40:59 CET,Sat Nov 20 23:13:10 CET,0.0 1.684 2.037 2.356 2.631 2.842 3.02 3.183 3.512 3.653 3.758 3.737 4.05 4.151 4.35 4.546 4.736 4.824 4.985 5.15 5.391 5.543 5.696 5.91 6.103 6.29 6.472 6.649 6.882 7.106 7.305 7.54 7.775 8.006 8.27 8.561 8.843 9.14 9.458 9.801 10.181 10.597 11.052 11.502 12.043 12.617 13.223 13.921 14.722 15.565 16.389 16.874 16.953 16.871 16.717 16.494 16.252 15.989 15.708 15.4 15.14 14.922 14.698 14.465 14.232 14.021 13.805 13.603 13.416 13.22 13.016 12.846 12.656 12.451 12.308 12.153 11.972 11.787 11.583 11.434 11.297 11.083 10.916 10.733 10.637 10.444 10.249 10.038 9.913 9.565 9.479 9.329 9.168 8.785 8.6 8.374 8.069 7.753 7.371 6.81 5.028 -8 ,11956 ,TETRA ,17377954,Sat Nov 20 21:41:53 CET,Sat Nov 20 23:23:14 CET,0.0 1.037 1.382 1.661 1.888 2.086 2.274 2.446 2.763 2.917 3.053 3.061 3.378 3.492 3.702 3.893 4.082 4.167 4.328 4.483 4.703 4.849 4.993 5.198 5.4 5.586 5.757 5.928 6.155 6.373 6.581 6.834 7.06 7.274 7.526 7.783 8.04 8.363 8.698 9.018 9.357 9.765 10.264 10.759 11.303 11.861 12.481 13.207 14.03 14.871 15.739 16.229 16.289 16.176 15.975 15.711 15.481 15.26 15.011 14.746 14.527 14.306 14.056 13.806 13.578 13.352 13.112 12.903 12.708 12.507 12.296 12.12 11.935 11.722 11.545 11.368 11.181 10.993 10.816 10.681 10.533 10.305 10.129 9.937 9.839 9.651 9.464 9.247 9.129 8.792 8.681 8.518 8.356 7.992 7.768 7.528 7.265 6.945 6.537 5.961 4.007 -9 ,23380 ,TETRA ,17377955,Sat Nov 20 21:42:56 CET,Sat Nov 20 23:24:44 CET,0.0 1.08 1.389 1.632 1.846 2.059 2.252 2.41 2.681 2.812 2.938 2.958 3.27 3.364 3.577 3.781 3.949 4.029 4.183 4.338 4.561 4.704 4.849 5.052 5.236 5.419 5.606 5.786 6.008 6.218 6.431 6.684 6.915 7.139 7.389 7.66 7.921 8.214 8.544 8.909 9.281 9.674 10.115 10.556 11.048 11.622 12.288 12.974 13.73 14.605 15.501 15.869 15.856 15.73 15.555 15.33 15.082 14.818 14.56 14.275 14.013 13.771 13.51 13.246 13.006 12.783 12.539 12.316 12.127 11.933 11.723 11.549 11.368 11.178 11.027 10.868 10.698 10.513 10.327 10.189 10.024 9.766 9.587 9.372 9.267 9.067 8.849 8.607 8.484 8.156 8.102 7.937 7.763 7.423 7.208 6.975 6.729 6.446 6.127 5.741 4.05 -10 ,12422 ,TETRA ,17377956,Sat Nov 20 21:42:57 CET,Sat Nov 20 23:22:33 CET,0.0 1.451 1.879 2.169 2.376 2.561 2.728 2.882 3.172 3.307 3.432 3.441 3.757 3.865 4.063 4.253 4.447 4.544 4.715 4.863 5.077 5.216 5.35 5.545 5.729 5.906 6.08 6.251 6.481 6.707 6.915 7.15 7.371 7.579 7.811 8.074 8.328 8.618 8.954 9.311 9.657 10.047 10.509 10.964 11.482 12.039 12.666 13.36 14.145 15.014 15.908 16.383 16.456 16.366 16.172 15.947 15.727 15.484 15.256 14.998 14.752 14.509 14.259 14.023 13.802 13.602 13.371 13.162 12.985 12.777 12.563 12.385 12.192 11.987 11.823 11.646 11.457 11.262 11.049 10.909 10.772 10.516 10.332 10.147 10.051 9.859 9.648 9.424 9.305 8.965 8.888 8.74 8.573 8.191 7.986 7.773 7.516 7.169 6.711 6.123 4.05 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_3a_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_3a_5.txt deleted file mode 100644 index 7d8e748d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_3a_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29348 ,TETRA ,17377959,Sat Nov 20 21:44:57 CET,Sat Nov 20 23:25:40 CET,0.0 1.032 1.459 1.77 1.949 2.115 2.267 2.408 2.677 2.798 2.903 2.886 3.197 3.296 3.479 3.64 3.792 3.872 4.028 4.187 4.414 4.543 4.666 4.844 5.02 5.192 5.343 5.488 5.686 5.872 6.047 6.263 6.46 6.636 6.856 7.116 7.355 7.625 7.906 8.192 8.495 8.846 9.262 9.654 10.076 10.526 11.028 11.57 12.191 12.838 13.349 13.499 13.434 13.218 12.95 12.68 12.409 12.141 11.896 11.629 11.369 11.129 10.889 10.663 10.457 10.259 10.037 9.828 9.645 9.45 9.252 9.09 8.903 8.7 8.549 8.392 8.232 8.079 7.91 7.784 7.652 7.452 7.299 7.133 7.053 6.893 6.716 6.519 6.42 6.109 6.077 5.956 5.835 5.548 5.384 5.193 4.969 4.713 4.387 3.89 2.61 -2 ,22157 ,TETRA ,17377961,Sat Nov 20 21:44:56 CET,Sat Nov 20 23:41:29 CET,0.0 1.413 1.783 2.1 2.331 2.519 2.679 2.819 3.083 3.212 3.331 3.337 3.652 3.751 3.932 4.096 4.252 4.329 4.477 4.624 4.823 4.96 5.094 5.273 5.447 5.623 5.789 5.945 6.139 6.31 6.48 6.7 6.92 7.123 7.343 7.583 7.826 8.081 8.342 8.635 8.948 9.293 9.684 10.079 10.519 10.945 11.426 11.957 12.533 13.092 13.617 13.832 13.722 13.478 13.2 12.938 12.678 12.393 12.152 11.879 11.59 11.329 11.095 10.88 10.665 10.455 10.251 10.074 9.899 9.711 9.511 9.344 9.17 8.979 8.83 8.677 8.514 8.344 8.157 8.024 7.892 7.696 7.56 7.409 7.335 7.182 6.99 6.788 6.685 6.363 6.348 6.214 6.067 5.743 5.556 5.353 5.13 4.886 4.605 4.147 3.017 -3 ,32006 ,TETRA ,17377963,Sat Nov 20 21:44:57 CET,Sat Nov 20 23:31:48 CET,0.0 0.817 1.15 1.43 1.673 1.881 2.058 2.211 2.473 2.593 2.705 2.714 3.029 3.12 3.299 3.464 3.616 3.688 3.825 3.965 4.171 4.305 4.438 4.638 4.821 4.987 5.151 5.304 5.512 5.702 5.875 6.096 6.3 6.493 6.7 6.921 7.135 7.383 7.656 7.943 8.247 8.569 8.933 9.321 9.773 10.259 10.801 11.367 11.967 12.568 13.092 13.316 13.207 12.973 12.72 12.445 12.177 11.909 11.642 11.347 11.098 10.877 10.642 10.394 10.163 9.964 9.749 9.546 9.375 9.193 8.994 8.835 8.665 8.48 8.344 8.196 8.022 7.837 7.646 7.521 7.398 7.195 7.053 6.891 6.803 6.622 6.432 6.233 6.128 5.816 5.768 5.625 5.483 5.157 4.972 4.778 4.554 4.321 4.055 3.636 2.126 -4 ,24662 ,TETRA ,17377966,Sat Nov 20 21:45:54 CET,Sat Nov 20 23:25:40 CET,0.0 1.018 1.367 1.636 1.837 2.009 2.164 2.317 2.575 2.685 2.82 2.839 3.144 3.232 3.402 3.572 3.741 3.827 3.992 4.147 4.355 4.488 4.617 4.803 4.984 5.158 5.324 5.481 5.69 5.88 6.053 6.271 6.476 6.668 6.886 7.134 7.381 7.642 7.92 8.221 8.539 8.886 9.265 9.63 10.075 10.557 11.069 11.63 12.248 12.886 13.428 13.568 13.448 13.23 12.964 12.667 12.375 12.1 11.844 11.573 11.317 11.087 10.86 10.629 10.414 10.211 10.003 9.804 9.626 9.449 9.262 9.098 8.921 8.735 8.584 8.436 8.284 8.118 7.941 7.812 7.676 7.464 7.327 7.189 7.112 6.921 6.71 6.518 6.414 6.091 6.048 5.916 5.768 5.397 5.226 5.07 4.869 4.645 4.333 3.887 2.339 -5 ,3386 ,TETRA ,17377968,Sat Nov 20 21:45:55 CET,Sat Nov 20 23:25:40 CET,0.0 1.22 1.586 1.851 2.089 2.282 2.435 2.575 2.865 3.002 3.123 3.152 3.466 3.566 3.746 3.903 4.046 4.12 4.266 4.402 4.597 4.726 4.857 5.05 5.224 5.399 5.576 5.737 5.932 6.127 6.316 6.529 6.737 6.934 7.168 7.416 7.646 7.895 8.147 8.432 8.746 9.086 9.477 9.845 10.26 10.766 11.332 11.871 12.428 13.026 13.524 13.615 13.505 13.292 13.028 12.733 12.425 12.124 11.84 11.556 11.304 11.053 10.82 10.604 10.376 10.165 9.944 9.739 9.562 9.387 9.196 9.027 8.857 8.682 8.539 8.386 8.233 8.06 7.868 7.728 7.574 7.347 7.2 7.054 6.975 6.797 6.604 6.402 6.294 5.979 5.931 5.799 5.674 5.389 5.217 5.042 4.839 4.579 4.286 3.883 2.407 -6 ,27735 ,TETRA ,17377970,Sat Nov 20 21:45:55 CET,Sat Nov 20 23:25:40 CET,0.0 1.245 1.558 1.768 1.965 2.17 2.356 2.502 2.774 2.896 3.009 3.016 3.311 3.397 3.579 3.748 3.901 3.98 4.151 4.306 4.521 4.662 4.795 4.97 5.127 5.283 5.426 5.561 5.737 5.901 6.059 6.261 6.453 6.644 6.882 7.133 7.364 7.626 7.904 8.194 8.514 8.859 9.268 9.688 10.126 10.583 11.124 11.72 12.333 12.936 13.455 13.595 13.462 13.236 12.941 12.624 12.333 12.051 11.789 11.52 11.265 11.019 10.788 10.565 10.361 10.174 9.958 9.76 9.602 9.422 9.222 9.06 8.887 8.709 8.573 8.416 8.24 8.071 7.907 7.779 7.646 7.462 7.317 7.152 7.064 6.87 6.664 6.471 6.372 6.056 6.012 5.886 5.758 5.459 5.281 5.09 4.894 4.662 4.341 3.951 2.612 -7 ,31575 ,TETRA ,17377972,Sat Nov 20 21:45:56 CET,Sat Nov 20 23:26:04 CET,0.0 0.909 1.198 1.414 1.622 1.806 1.984 2.152 2.43 2.553 2.662 2.643 2.94 3.032 3.228 3.428 3.597 3.669 3.817 3.964 4.187 4.331 4.456 4.634 4.83 5.016 5.174 5.324 5.51 5.695 5.883 6.117 6.341 6.548 6.775 7.036 7.28 7.519 7.765 8.039 8.347 8.676 9.047 9.432 9.851 10.311 10.835 11.394 12.036 12.718 13.321 13.593 13.555 13.358 13.098 12.801 12.502 12.197 11.92 11.659 11.412 11.181 10.955 10.714 10.5 10.3 10.079 9.885 9.72 9.543 9.348 9.177 9.002 8.804 8.642 8.488 8.34 8.186 8.015 7.89 7.754 7.549 7.382 7.197 7.112 6.941 6.766 6.595 6.5 6.18 6.128 6.006 5.889 5.622 5.468 5.266 5.032 4.789 4.508 4.134 2.675 -8 ,19217 ,TETRA ,17377974,Sat Nov 20 21:46:00 CET,Sat Nov 20 23:27:33 CET,0.0 1.184 1.584 1.839 2.03 2.221 2.384 2.523 2.787 2.903 3.021 3.039 3.351 3.444 3.621 3.796 3.952 4.029 4.195 4.345 4.538 4.674 4.8 4.971 5.133 5.286 5.438 5.597 5.792 5.976 6.16 6.379 6.594 6.785 6.999 7.247 7.486 7.745 8.028 8.323 8.626 8.963 9.331 9.693 10.117 10.575 11.09 11.673 12.284 12.841 13.328 13.497 13.401 13.183 12.939 12.7 12.431 12.141 11.872 11.57 11.264 10.99 10.749 10.526 10.318 10.128 9.905 9.673 9.48 9.297 9.108 8.939 8.761 8.573 8.424 8.272 8.11 7.942 7.756 7.626 7.491 7.271 7.119 6.96 6.879 6.719 6.553 6.359 6.245 5.921 5.889 5.766 5.631 5.345 5.178 5.001 4.789 4.535 4.226 3.777 2.583 -9 ,19059 ,TETRA ,17377977,Sat Nov 20 21:45:57 CET,Sat Nov 20 23:26:06 CET,0.0 0.803 1.173 1.506 1.726 1.891 2.056 2.191 2.44 2.565 2.683 2.677 2.985 3.089 3.28 3.457 3.628 3.714 3.884 4.027 4.233 4.371 4.492 4.667 4.844 5.018 5.187 5.346 5.533 5.717 5.907 6.134 6.354 6.561 6.783 7.024 7.255 7.51 7.788 8.083 8.391 8.733 9.138 9.514 9.915 10.384 10.926 11.511 12.131 12.802 13.378 13.512 13.317 13.062 12.835 12.576 12.263 11.944 11.674 11.382 11.121 10.89 10.667 10.44 10.228 10.029 9.787 9.54 9.338 9.159 8.97 8.795 8.612 8.429 8.283 8.138 7.984 7.808 7.624 7.5 7.367 7.149 6.993 6.841 6.767 6.599 6.408 6.211 6.112 5.802 5.779 5.661 5.534 5.225 5.068 4.911 4.739 4.513 4.171 3.779 2.597 -10 ,18243 ,TETRA ,17377979,Sat Nov 20 21:46:04 CET,Sat Nov 20 23:27:32 CET,0.0 0.782 1.106 1.347 1.571 1.78 1.973 2.152 2.472 2.616 2.742 2.765 3.074 3.164 3.34 3.517 3.687 3.767 3.925 4.068 4.288 4.434 4.564 4.738 4.912 5.091 5.252 5.398 5.588 5.775 5.961 6.192 6.397 6.594 6.829 7.084 7.328 7.607 7.912 8.218 8.525 8.854 9.234 9.623 10.066 10.545 11.073 11.61 12.217 12.85 13.352 13.497 13.39 13.149 12.822 12.481 12.154 11.844 11.582 11.319 11.069 10.847 10.627 10.396 10.165 9.936 9.712 9.509 9.324 9.116 8.896 8.728 8.556 8.374 8.22 8.059 7.889 7.709 7.539 7.414 7.278 7.082 6.943 6.778 6.69 6.517 6.333 6.137 6.034 5.718 5.669 5.527 5.376 5.028 4.854 4.69 4.503 4.285 4.018 3.615 2.198 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_3a.txt deleted file mode 100644 index c176ad27..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27024 ,TETRA ,17377982,Sat Nov 20 21:46:57 CET,Sat Nov 20 23:27:07 CET,0.0 0.643 0.914 1.113 1.269 1.374 1.467 1.566 1.757 1.84 1.933 1.902 2.193 2.263 2.395 2.537 2.668 2.722 2.835 2.955 3.117 3.211 3.302 3.445 3.578 3.711 3.838 3.955 4.106 4.261 4.425 4.616 4.793 4.948 5.125 5.332 5.534 5.774 6.015 6.252 6.514 6.801 7.105 7.404 7.77 8.171 8.618 9.075 9.526 9.977 10.379 10.423 10.245 10.003 9.686 9.345 9.061 8.798 8.505 8.165 7.866 7.58 7.296 7.028 6.787 6.571 6.331 6.108 5.902 5.685 5.468 5.294 5.117 4.925 4.76 4.584 4.398 4.202 4.002 3.876 3.755 3.546 3.391 3.237 3.162 2.995 2.814 2.622 2.495 2.158 2.15 2.036 1.908 1.613 1.449 1.264 1.028 0.755 0.447 0.031 -1.389 -2 ,24495 ,TETRA ,17377984,Sat Nov 20 21:46:55 CET,Sat Nov 20 23:45:20 CET,0.0 0.49 0.698 0.855 0.979 1.095 1.228 1.346 1.544 1.644 1.742 1.706 2.007 2.09 2.24 2.38 2.511 2.576 2.702 2.804 2.948 3.045 3.14 3.279 3.408 3.539 3.672 3.8 3.963 4.12 4.264 4.431 4.596 4.764 4.959 5.179 5.382 5.597 5.831 6.077 6.345 6.649 6.988 7.319 7.685 8.075 8.506 8.938 9.427 9.956 10.376 10.375 10.144 9.847 9.487 9.13 8.818 8.499 8.187 7.866 7.555 7.267 7.017 6.779 6.54 6.301 6.047 5.842 5.652 5.437 5.217 5.036 4.872 4.704 4.562 4.407 4.233 4.043 3.849 3.727 3.603 3.379 3.224 3.069 2.987 2.804 2.605 2.409 2.307 1.984 1.94 1.8 1.653 1.343 1.169 0.964 0.737 0.493 0.204 -0.174 -1.567 -3 ,3767 ,TETRA ,17377986,Sat Nov 20 21:46:56 CET,Sat Nov 20 23:35:10 CET,0.0 0.506 0.674 0.81 0.949 1.075 1.203 1.321 1.514 1.606 1.708 1.679 1.966 2.034 2.166 2.296 2.422 2.48 2.593 2.702 2.859 2.957 3.048 3.185 3.318 3.448 3.571 3.692 3.863 4.024 4.168 4.345 4.525 4.703 4.904 5.121 5.318 5.53 5.76 6.012 6.306 6.648 7.013 7.357 7.758 8.177 8.601 9.045 9.552 10.084 10.464 10.465 10.254 9.956 9.605 9.263 8.918 8.554 8.245 7.926 7.638 7.393 7.168 6.926 6.674 6.426 6.18 5.973 5.776 5.571 5.352 5.157 4.959 4.758 4.593 4.413 4.231 4.049 3.871 3.736 3.592 3.397 3.256 3.102 3.025 2.86 2.667 2.468 2.367 2.049 2.039 1.913 1.77 1.473 1.299 1.106 0.902 0.697 0.419 0.007 -1.417 -4 ,3748 ,TETRA ,17377989,Sat Nov 20 21:48:02 CET,Sat Nov 20 23:30:57 CET,0.0 0.3 0.525 0.697 0.813 0.93 1.052 1.161 1.358 1.447 1.536 1.477 1.763 1.839 1.975 2.112 2.248 2.313 2.442 2.554 2.718 2.825 2.93 3.097 3.263 3.42 3.577 3.73 3.926 4.123 4.303 4.516 4.731 4.922 5.131 5.365 5.599 5.866 6.124 6.379 6.656 6.973 7.347 7.707 8.1 8.538 8.988 9.436 9.954 10.433 10.766 10.761 10.534 10.232 9.892 9.519 9.147 8.822 8.501 8.144 7.861 7.613 7.345 7.084 6.838 6.606 6.366 6.149 5.95 5.737 5.526 5.353 5.173 4.988 4.838 4.676 4.507 4.33 4.154 4.031 3.893 3.676 3.522 3.352 3.261 3.065 2.872 2.674 2.565 2.243 2.224 2.097 1.949 1.638 1.475 1.289 1.084 0.865 0.574 0.147 -1.093 -5 ,4223 ,TETRA ,17377991,Sat Nov 20 21:48:03 CET,Sat Nov 20 23:28:55 CET,0.0 0.391 0.595 0.742 0.89 1.033 1.156 1.266 1.482 1.576 1.655 1.589 1.875 1.945 2.076 2.201 2.327 2.384 2.488 2.602 2.774 2.877 2.975 3.119 3.256 3.388 3.517 3.65 3.818 3.97 4.124 4.296 4.452 4.616 4.808 5.023 5.249 5.506 5.769 6.032 6.306 6.634 7.004 7.352 7.726 8.109 8.549 9.017 9.538 10.064 10.453 10.477 10.246 9.94 9.595 9.228 8.864 8.523 8.224 7.912 7.642 7.366 7.084 6.825 6.59 6.375 6.133 5.899 5.694 5.494 5.287 5.105 4.9 4.683 4.523 4.37 4.204 4.026 3.851 3.732 3.597 3.364 3.195 3.012 2.922 2.728 2.511 2.297 2.183 1.854 1.829 1.704 1.58 1.297 1.12 0.936 0.745 0.488 0.162 -0.235 -1.476 -6 ,654 ,TETRA ,17377993,Sat Nov 20 21:48:04 CET,Sat Nov 20 23:30:17 CET,0.0 0.387 0.593 0.745 0.887 1.012 1.131 1.247 1.439 1.525 1.602 1.528 1.821 1.903 2.041 2.169 2.299 2.359 2.468 2.578 2.741 2.837 2.939 3.1 3.239 3.382 3.525 3.644 3.79 3.926 4.064 4.241 4.4 4.551 4.73 4.935 5.133 5.367 5.623 5.872 6.131 6.407 6.711 7.035 7.412 7.8 8.197 8.595 9.042 9.505 9.844 9.855 9.669 9.411 9.131 8.863 8.572 8.244 7.93 7.594 7.276 6.998 6.741 6.489 6.247 6.019 5.799 5.591 5.386 5.184 4.976 4.792 4.597 4.394 4.238 4.068 3.89 3.712 3.527 3.408 3.282 3.071 2.922 2.769 2.692 2.522 2.326 2.124 2.017 1.69 1.656 1.532 1.4 1.085 0.914 0.73 0.531 0.315 0.04 -0.362 -1.604 -7 ,18970 ,TETRA ,17377995,Sat Nov 20 21:48:03 CET,Sat Nov 20 23:28:55 CET,0.0 0.501 0.713 0.882 1.032 1.148 1.25 1.355 1.561 1.663 1.748 1.692 1.995 2.079 2.232 2.373 2.5 2.559 2.672 2.781 2.949 3.058 3.164 3.313 3.454 3.586 3.709 3.838 4.01 4.168 4.333 4.541 4.751 4.95 5.157 5.388 5.612 5.861 6.124 6.408 6.703 7.012 7.355 7.704 8.1 8.506 8.967 9.471 9.992 10.459 10.877 10.974 10.739 10.398 10.041 9.684 9.327 8.992 8.692 8.346 8.034 7.777 7.522 7.248 6.989 6.765 6.522 6.291 6.09 5.879 5.653 5.46 5.27 5.073 4.917 4.768 4.599 4.418 4.243 4.105 3.948 3.698 3.524 3.343 3.254 3.085 2.914 2.716 2.597 2.269 2.238 2.108 1.972 1.678 1.525 1.335 1.091 0.834 0.478 0.012 -1.295 -8 ,7730 ,TETRA ,17377996,Sat Nov 20 21:48:02 CET,Sat Nov 20 23:30:17 CET,0.0 0.398 0.625 0.797 0.932 1.056 1.181 1.294 1.479 1.571 1.656 1.583 1.875 1.945 2.07 2.19 2.31 2.368 2.477 2.581 2.73 2.835 2.945 3.098 3.226 3.345 3.468 3.591 3.765 3.94 4.101 4.279 4.453 4.628 4.824 5.04 5.233 5.436 5.658 5.887 6.12 6.397 6.746 7.071 7.408 7.777 8.19 8.614 9.06 9.534 9.92 9.978 9.82 9.573 9.274 8.95 8.628 8.309 8.032 7.709 7.392 7.11 6.863 6.639 6.411 6.194 5.952 5.73 5.536 5.322 5.111 4.945 4.764 4.571 4.417 4.253 4.085 3.921 3.742 3.615 3.479 3.25 3.091 2.924 2.839 2.673 2.49 2.294 2.193 1.875 1.848 1.715 1.576 1.283 1.094 0.888 0.652 0.367 0.041 -0.357 -1.425 -9 ,49 ,TETRA ,17377997,Sat Nov 20 21:48:02 CET,Sat Nov 20 23:31:02 CET,0.0 0.72 0.913 1.073 1.198 1.313 1.417 1.516 1.706 1.795 1.88 1.856 2.162 2.242 2.386 2.534 2.679 2.737 2.853 2.971 3.118 3.209 3.305 3.454 3.612 3.782 3.945 4.091 4.28 4.455 4.618 4.813 5.0 5.19 5.427 5.696 5.944 6.202 6.469 6.749 7.019 7.307 7.662 8.02 8.409 8.836 9.326 9.821 10.339 10.87 11.254 11.307 11.11 10.787 10.443 10.073 9.728 9.385 9.063 8.731 8.419 8.145 7.878 7.619 7.379 7.142 6.88 6.65 6.459 6.259 6.039 5.862 5.684 5.488 5.332 5.17 4.991 4.808 4.624 4.485 4.335 4.127 4.001 3.856 3.77 3.581 3.384 3.18 3.071 2.75 2.725 2.598 2.458 2.163 1.995 1.799 1.558 1.288 0.927 0.447 -1.075 -10 ,13593 ,TETRA ,17377999,Sat Nov 20 21:48:05 CET,Sat Nov 20 23:29:49 CET,0.0 0.419 0.63 0.783 0.896 1.012 1.133 1.242 1.428 1.506 1.58 1.519 1.81 1.892 2.066 2.223 2.358 2.424 2.552 2.669 2.825 2.932 3.038 3.186 3.322 3.456 3.589 3.726 3.896 4.05 4.198 4.372 4.549 4.728 4.94 5.169 5.377 5.598 5.828 6.051 6.285 6.573 6.904 7.246 7.645 8.031 8.43 8.876 9.361 9.804 10.155 10.213 10.022 9.741 9.443 9.109 8.783 8.449 8.146 7.809 7.486 7.21 6.95 6.706 6.472 6.25 6.007 5.766 5.569 5.369 5.149 4.97 4.782 4.568 4.395 4.224 4.043 3.852 3.659 3.51 3.354 3.122 2.963 2.806 2.728 2.553 2.342 2.133 2.033 1.716 1.683 1.548 1.406 1.094 0.937 0.776 0.571 0.324 0.056 -0.297 -1.243 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_5.txt deleted file mode 100644 index 6d35f742..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6596 ,TETRA ,17378003,Sat Nov 20 21:48:05 CET,Sat Nov 20 23:29:13 CET,0.0 0.985 1.317 1.561 1.778 2.015 2.248 2.411 2.659 2.772 2.895 2.937 3.256 3.352 3.557 3.756 3.927 4.013 4.172 4.311 4.529 4.671 4.793 4.963 5.13 5.302 5.483 5.66 5.875 6.07 6.263 6.494 6.706 6.924 7.173 7.448 7.712 8.005 8.308 8.607 8.916 9.271 9.692 10.109 10.597 11.131 11.712 12.326 13.052 13.817 14.502 14.831 14.854 14.736 14.528 14.295 14.046 13.794 13.553 13.248 12.99 12.779 12.533 12.284 12.073 11.881 11.679 11.478 11.278 11.068 10.85 10.67 10.481 10.286 10.122 9.951 9.775 9.586 9.386 9.24 9.083 8.841 8.677 8.499 8.417 8.24 8.03 7.815 7.714 7.398 7.346 7.198 7.046 6.73 6.513 6.271 6.02 5.7 5.297 4.741 1.865 -2 ,2489 ,TETRA ,17378005,Sat Nov 20 21:48:03 CET,Sat Nov 20 23:29:51 CET,0.0 1.1 1.435 1.664 1.845 2.028 2.194 2.344 2.63 2.753 2.862 2.853 3.165 3.254 3.418 3.595 3.767 3.849 4.004 4.157 4.378 4.518 4.663 4.88 5.075 5.238 5.39 5.557 5.784 5.995 6.19 6.415 6.636 6.847 7.097 7.381 7.649 7.934 8.204 8.501 8.828 9.188 9.623 10.056 10.532 11.049 11.643 12.279 13.012 13.801 14.449 14.743 14.751 14.656 14.476 14.18 13.885 13.627 13.402 13.148 12.905 12.675 12.442 12.215 11.976 11.752 11.532 11.34 11.17 10.976 10.756 10.569 10.357 10.151 10.014 9.858 9.689 9.496 9.291 9.164 9.033 8.818 8.677 8.515 8.419 8.23 8.05 7.871 7.768 7.441 7.369 7.231 7.085 6.737 6.533 6.315 6.08 5.791 5.428 4.973 3.293 -3 ,15884 ,TETRA ,17378007,Sat Nov 20 21:48:04 CET,Sat Nov 20 23:29:11 CET,0.0 1.227 1.597 1.87 2.068 2.21 2.355 2.517 2.816 2.951 3.082 3.11 3.435 3.533 3.71 3.89 4.05 4.124 4.275 4.422 4.639 4.775 4.903 5.092 5.275 5.456 5.639 5.812 6.024 6.227 6.42 6.646 6.86 7.078 7.34 7.627 7.883 8.161 8.472 8.804 9.142 9.502 9.922 10.361 10.87 11.428 12.039 12.683 13.409 14.169 14.9 15.294 15.354 15.26 15.067 14.826 14.577 14.311 14.046 13.745 13.488 13.248 12.997 12.766 12.551 12.333 12.084 11.866 11.681 11.479 11.273 11.106 10.928 10.736 10.568 10.402 10.231 10.03 9.835 9.698 9.556 9.328 9.134 8.931 8.844 8.661 8.454 8.24 8.124 7.791 7.744 7.608 7.45 7.102 6.907 6.674 6.429 6.162 5.794 5.25 3.437 -4 ,14118 ,TETRA ,17378009,Sat Nov 20 21:48:04 CET,Sat Nov 20 23:31:35 CET,0.0 1.37 1.719 1.976 2.222 2.43 2.602 2.741 3.004 3.119 3.22 3.212 3.519 3.613 3.822 4.012 4.174 4.249 4.394 4.54 4.768 4.919 5.057 5.252 5.425 5.592 5.76 5.92 6.128 6.325 6.519 6.755 6.969 7.172 7.411 7.665 7.902 8.175 8.48 8.797 9.127 9.498 9.908 10.343 10.855 11.392 12.007 12.672 13.368 14.084 14.75 15.106 15.144 15.042 14.848 14.617 14.388 14.156 13.939 13.674 13.417 13.188 12.963 12.732 12.493 12.269 12.04 11.826 11.623 11.426 11.233 11.047 10.841 10.632 10.475 10.3 10.114 9.919 9.705 9.563 9.428 9.218 9.052 8.868 8.776 8.589 8.381 8.155 8.039 7.711 7.627 7.467 7.296 6.918 6.709 6.496 6.258 5.952 5.589 5.113 3.997 -5 ,4718 ,TETRA ,17378011,Sat Nov 20 21:48:39 CET,Sat Nov 20 23:28:28 CET,0.0 0.854 1.158 1.395 1.632 1.834 1.984 2.143 2.44 2.566 2.685 2.696 3.02 3.122 3.307 3.489 3.664 3.752 3.927 4.086 4.321 4.47 4.606 4.794 4.978 5.15 5.313 5.477 5.685 5.878 6.071 6.305 6.523 6.739 6.995 7.267 7.507 7.767 8.059 8.377 8.741 9.147 9.587 10.033 10.507 10.997 11.579 12.233 12.963 13.769 14.564 14.973 15.036 14.893 14.68 14.433 14.163 13.878 13.635 13.371 13.106 12.868 12.644 12.412 12.192 11.968 11.725 11.529 11.339 11.126 10.911 10.74 10.569 10.366 10.182 10.001 9.83 9.631 9.415 9.271 9.118 8.89 8.725 8.536 8.44 8.237 8.041 7.833 7.704 7.372 7.306 7.155 6.994 6.616 6.388 6.154 5.927 5.67 5.324 4.787 3.048 -6 ,31656 ,TETRA ,17378013,Sat Nov 20 21:48:39 CET,Sat Nov 20 23:32:58 CET,0.0 1.048 1.374 1.651 1.882 2.091 2.276 2.402 2.636 2.749 2.853 2.832 3.142 3.237 3.419 3.582 3.734 3.807 3.941 4.082 4.304 4.452 4.585 4.763 4.941 5.108 5.268 5.423 5.634 5.836 6.033 6.268 6.494 6.718 6.962 7.227 7.484 7.775 8.079 8.403 8.744 9.128 9.588 10.041 10.545 11.086 11.663 12.29 12.978 13.727 14.513 14.956 15.053 14.945 14.727 14.492 14.222 13.931 13.692 13.446 13.206 12.978 12.75 12.509 12.286 12.101 11.868 11.631 11.444 11.259 11.068 10.906 10.726 10.535 10.371 10.195 10.007 9.807 9.603 9.47 9.328 9.095 8.936 8.776 8.696 8.526 8.336 8.115 8.0 7.681 7.656 7.527 7.356 6.946 6.755 6.565 6.335 6.034 5.651 5.122 3.26 -7 ,9681 ,TETRA ,17378015,Sat Nov 20 21:48:39 CET,Sat Nov 20 23:30:56 CET,0.0 0.962 1.356 1.604 1.817 2.0 2.184 2.351 2.597 2.72 2.845 2.876 3.201 3.307 3.502 3.67 3.824 3.906 4.063 4.208 4.432 4.577 4.711 4.907 5.08 5.244 5.406 5.561 5.781 5.975 6.158 6.393 6.603 6.801 7.04 7.303 7.559 7.849 8.156 8.455 8.77 9.141 9.567 10.0 10.486 10.995 11.581 12.216 12.902 13.645 14.457 14.976 15.062 14.913 14.693 14.455 14.199 13.943 13.709 13.445 13.198 12.966 12.725 12.48 12.26 12.076 11.865 11.662 11.481 11.293 11.093 10.907 10.713 10.518 10.364 10.212 10.063 9.884 9.679 9.537 9.387 9.151 8.987 8.825 8.741 8.552 8.359 8.161 8.057 7.738 7.664 7.516 7.37 7.022 6.814 6.6 6.349 6.048 5.69 5.197 3.642 -8 ,1560 ,TETRA ,17378017,Sat Nov 20 21:48:39 CET,Sat Nov 20 23:29:41 CET,0.0 1.048 1.347 1.603 1.823 2.032 2.235 2.426 2.748 2.878 2.996 3.025 3.354 3.448 3.632 3.811 3.963 4.036 4.185 4.324 4.516 4.643 4.767 4.96 5.164 5.348 5.507 5.664 5.886 6.094 6.279 6.505 6.732 6.947 7.198 7.484 7.745 8.027 8.336 8.663 8.993 9.352 9.782 10.207 10.687 11.212 11.805 12.481 13.234 14.017 14.753 15.157 15.266 15.187 15.012 14.795 14.555 14.282 14.021 13.738 13.476 13.234 12.992 12.751 12.514 12.317 12.108 11.888 11.695 11.487 11.236 11.032 10.849 10.637 10.468 10.302 10.122 9.919 9.697 9.548 9.39 9.138 8.971 8.787 8.688 8.484 8.282 8.088 7.984 7.66 7.603 7.459 7.296 6.908 6.708 6.518 6.28 6.01 5.61 4.968 2.812 -9 ,6466 ,TETRA ,17378018,Sat Nov 20 21:48:39 CET,Sat Nov 20 23:33:02 CET,0.0 1.025 1.365 1.655 1.882 2.051 2.209 2.347 2.608 2.74 2.853 2.848 3.171 3.276 3.474 3.655 3.825 3.907 4.052 4.187 4.386 4.514 4.643 4.826 5.004 5.188 5.369 5.543 5.75 5.948 6.139 6.373 6.6 6.821 7.072 7.342 7.6 7.887 8.209 8.542 8.871 9.219 9.631 10.05 10.511 11.052 11.691 12.39 13.14 13.91 14.672 15.086 15.162 15.061 14.852 14.63 14.389 14.085 13.804 13.532 13.295 13.068 12.83 12.605 12.38 12.145 11.9 11.695 11.526 11.335 11.124 10.951 10.772 10.571 10.414 10.267 10.109 9.938 9.73 9.576 9.424 9.191 9.021 8.831 8.742 8.554 8.338 8.124 8.013 7.689 7.637 7.484 7.328 6.954 6.736 6.534 6.294 5.993 5.625 5.086 3.279 -10 ,5037 ,TETRA ,17378019,Sat Nov 20 21:48:40 CET,Sat Nov 20 23:33:02 CET,0.0 0.865 1.194 1.486 1.688 1.856 2.031 2.199 2.499 2.627 2.739 2.735 3.052 3.159 3.366 3.552 3.724 3.802 3.958 4.105 4.297 4.43 4.566 4.757 4.944 5.124 5.299 5.468 5.675 5.872 6.066 6.315 6.547 6.761 7.009 7.284 7.541 7.805 8.077 8.377 8.727 9.111 9.521 9.925 10.404 10.922 11.491 12.133 12.85 13.607 14.336 14.736 14.776 14.651 14.437 14.203 13.928 13.628 13.369 13.078 12.802 12.561 12.346 12.126 11.894 11.682 11.459 11.25 11.052 10.827 10.585 10.399 10.206 10.003 9.857 9.692 9.516 9.339 9.151 9.012 8.86 8.619 8.448 8.271 8.179 7.997 7.814 7.601 7.482 7.164 7.112 6.963 6.801 6.404 6.178 5.965 5.751 5.466 5.025 4.422 2.157 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_1b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_1b.txt deleted file mode 100644 index 8446576f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_1b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7096 ,TETRA ,17378023,Sat Nov 20 21:48:39 CET,Sat Nov 20 23:32:14 CET,0.0 0.751 1.014 1.217 1.425 1.619 1.791 1.942 2.215 2.349 2.467 2.447 2.752 2.85 3.069 3.282 3.46 3.539 3.691 3.83 4.015 4.134 4.25 4.435 4.629 4.815 4.997 5.162 5.355 5.55 5.744 5.971 6.187 6.38 6.598 6.847 7.078 7.328 7.605 7.899 8.211 8.54 8.912 9.299 9.747 10.199 10.676 11.208 11.798 12.397 12.88 12.985 12.785 12.479 12.192 11.846 11.48 11.169 10.912 10.631 10.325 10.053 9.818 9.585 9.348 9.134 8.908 8.705 8.52 8.312 8.117 7.964 7.801 7.619 7.473 7.321 7.131 6.933 6.732 6.59 6.449 6.224 6.075 5.917 5.833 5.663 5.482 5.281 5.178 4.871 4.845 4.709 4.565 4.236 4.063 3.885 3.682 3.432 3.132 2.696 1.434 -2 ,13050 ,TETRA ,17378025,Sat Nov 20 21:48:42 CET,Sat Nov 20 23:28:43 CET,0.0 0.899 1.255 1.519 1.719 1.875 2.028 2.177 2.433 2.54 2.643 2.649 2.975 3.073 3.232 3.399 3.583 3.667 3.816 3.964 4.167 4.305 4.452 4.638 4.799 4.959 5.108 5.256 5.451 5.652 5.846 6.063 6.281 6.48 6.707 6.968 7.23 7.511 7.779 8.062 8.36 8.692 9.085 9.472 9.923 10.424 10.964 11.51 12.072 12.646 13.144 13.252 13.13 12.88 12.57 12.268 11.929 11.583 11.287 10.975 10.697 10.435 10.183 9.946 9.719 9.504 9.267 9.056 8.879 8.698 8.492 8.313 8.133 7.936 7.791 7.636 7.455 7.271 7.085 6.958 6.83 6.622 6.467 6.313 6.237 6.068 5.879 5.657 5.534 5.209 5.192 5.063 4.925 4.661 4.507 4.335 4.142 3.915 3.673 3.35 2.237 -3 ,29543 ,TETRA ,17378027,Sat Nov 20 21:48:39 CET,Sat Nov 20 23:28:59 CET,0.0 1.282 1.688 1.96 2.144 2.321 2.473 2.599 2.833 2.949 3.067 3.078 3.401 3.496 3.663 3.819 3.966 4.044 4.2 4.337 4.536 4.673 4.798 4.979 5.157 5.319 5.476 5.623 5.802 5.989 6.172 6.37 6.554 6.74 6.953 7.198 7.454 7.728 7.998 8.278 8.556 8.88 9.266 9.626 10.04 10.488 10.983 11.502 12.022 12.496 12.888 12.936 12.771 12.526 12.278 11.969 11.631 11.291 10.975 10.676 10.409 10.139 9.892 9.673 9.455 9.245 9.003 8.781 8.607 8.417 8.214 8.066 7.905 7.709 7.564 7.417 7.25 7.084 6.914 6.784 6.64 6.413 6.233 6.035 5.946 5.78 5.601 5.396 5.291 4.98 4.952 4.819 4.679 4.389 4.231 4.076 3.891 3.643 3.355 2.964 1.71 -4 ,7849 ,TETRA ,17378030,Sat Nov 20 21:48:43 CET,Sat Nov 20 23:29:53 CET,0.0 0.96 1.274 1.518 1.723 1.904 2.051 2.192 2.444 2.556 2.683 2.71 3.022 3.113 3.282 3.456 3.629 3.714 3.88 4.036 4.25 4.382 4.498 4.663 4.84 5.02 5.183 5.33 5.526 5.728 5.913 6.133 6.354 6.559 6.788 7.039 7.281 7.54 7.804 8.068 8.357 8.697 9.07 9.449 9.879 10.342 10.851 11.385 11.926 12.485 12.965 13.038 12.908 12.678 12.441 12.169 11.863 11.568 11.29 10.984 10.704 10.452 10.186 9.928 9.687 9.451 9.214 8.997 8.791 8.58 8.366 8.175 7.962 7.734 7.559 7.387 7.217 7.052 6.863 6.721 6.578 6.345 6.175 6.001 5.916 5.743 5.543 5.311 5.192 4.869 4.841 4.726 4.592 4.271 4.111 3.947 3.758 3.52 3.2 2.763 1.815 -5 ,27706 ,TETRA ,17378032,Sat Nov 20 21:48:40 CET,Sat Nov 20 23:29:15 CET,0.0 0.714 0.987 1.248 1.45 1.615 1.772 1.922 2.187 2.301 2.413 2.417 2.719 2.81 2.988 3.169 3.346 3.422 3.575 3.726 3.929 4.059 4.187 4.375 4.548 4.709 4.868 5.027 5.235 5.429 5.611 5.82 6.019 6.208 6.43 6.69 6.944 7.22 7.513 7.801 8.098 8.43 8.815 9.192 9.619 10.082 10.597 11.165 11.786 12.389 12.863 12.901 12.71 12.473 12.172 11.851 11.549 11.236 10.945 10.647 10.365 10.111 9.866 9.629 9.406 9.188 8.971 8.764 8.56 8.352 8.143 7.962 7.768 7.567 7.413 7.251 7.085 6.916 6.73 6.596 6.464 6.228 6.059 5.899 5.809 5.633 5.452 5.251 5.154 4.854 4.868 4.756 4.623 4.342 4.164 3.96 3.745 3.49 3.209 2.82 1.524 -6 ,28530 ,TETRA ,17378034,Sat Nov 20 21:48:42 CET,Sat Nov 20 23:29:10 CET,0.0 0.981 1.336 1.655 1.907 2.093 2.251 2.419 2.735 2.852 2.953 2.94 3.241 3.328 3.514 3.7 3.877 3.961 4.1 4.24 4.455 4.589 4.718 4.9 5.069 5.234 5.401 5.569 5.788 5.986 6.17 6.4 6.624 6.823 7.043 7.295 7.542 7.802 8.086 8.391 8.698 9.042 9.459 9.861 10.293 10.75 11.243 11.782 12.399 13.009 13.468 13.574 13.427 13.165 12.836 12.476 12.127 11.81 11.539 11.227 10.922 10.65 10.401 10.151 9.909 9.702 9.48 9.271 9.099 8.907 8.685 8.505 8.318 8.114 7.95 7.774 7.607 7.442 7.269 7.145 6.998 6.761 6.589 6.415 6.331 6.146 5.956 5.759 5.654 5.345 5.336 5.209 5.075 4.769 4.587 4.382 4.174 3.959 3.696 3.331 2.131 -7 ,10570 ,TETRA ,17378036,Sat Nov 20 21:48:42 CET,Sat Nov 20 23:29:47 CET,0.0 1.17 1.527 1.744 1.935 2.127 2.3 2.445 2.711 2.821 2.908 2.878 3.185 3.284 3.476 3.649 3.806 3.879 4.038 4.203 4.434 4.578 4.711 4.898 5.078 5.259 5.415 5.552 5.741 5.933 6.118 6.33 6.543 6.742 6.947 7.182 7.44 7.732 8.03 8.329 8.628 8.969 9.35 9.728 10.163 10.639 11.147 11.673 12.278 12.848 13.281 13.427 13.291 13.009 12.706 12.41 12.119 11.806 11.497 11.196 10.924 10.677 10.462 10.238 10.004 9.782 9.541 9.324 9.126 8.911 8.686 8.5 8.323 8.122 7.955 7.792 7.62 7.449 7.272 7.145 7.014 6.811 6.665 6.502 6.402 6.212 6.041 5.852 5.754 5.44 5.423 5.301 5.174 4.869 4.694 4.503 4.273 4.024 3.769 3.467 2.782 -8 ,24689 ,TETRA ,17378038,Sat Nov 20 21:48:44 CET,Sat Nov 20 23:30:00 CET,0.0 0.985 1.373 1.76 2.013 2.178 2.308 2.455 2.757 2.876 2.995 3.016 3.317 3.416 3.613 3.784 3.95 4.023 4.157 4.289 4.471 4.6 4.732 4.918 5.108 5.288 5.446 5.6 5.795 5.979 6.158 6.355 6.55 6.761 6.992 7.232 7.46 7.701 7.967 8.257 8.565 8.908 9.283 9.655 10.099 10.555 11.043 11.577 12.139 12.68 13.139 13.241 13.064 12.776 12.448 12.122 11.833 11.522 11.204 10.886 10.614 10.381 10.143 9.903 9.684 9.469 9.228 9.014 8.821 8.624 8.43 8.255 8.069 7.861 7.705 7.56 7.395 7.221 7.047 6.928 6.801 6.594 6.449 6.286 6.195 6.012 5.834 5.649 5.555 5.249 5.222 5.085 4.939 4.638 4.454 4.254 4.051 3.797 3.481 3.121 2.235 -9 ,14100 ,TETRA ,17378039,Sat Nov 20 21:48:45 CET,Sat Nov 20 23:29:59 CET,0.0 1.242 1.552 1.756 1.916 2.07 2.214 2.352 2.604 2.718 2.821 2.815 3.135 3.238 3.418 3.591 3.764 3.839 3.997 4.152 4.359 4.492 4.627 4.83 5.008 5.17 5.332 5.488 5.684 5.88 6.073 6.302 6.508 6.689 6.895 7.142 7.374 7.624 7.897 8.182 8.487 8.836 9.226 9.599 10.037 10.503 11.021 11.582 12.167 12.761 13.282 13.41 13.241 12.947 12.658 12.324 11.972 11.64 11.337 11.023 10.744 10.483 10.211 9.958 9.696 9.44 9.164 8.915 8.696 8.45 8.199 7.986 7.77 7.565 7.413 7.27 7.117 6.945 6.755 6.615 6.484 6.28 6.13 5.953 5.848 5.651 5.474 5.273 5.158 4.831 4.788 4.657 4.523 4.239 4.069 3.874 3.651 3.405 3.079 2.516 0.83 -10 ,24488 ,TETRA ,17378041,Sat Nov 20 21:48:44 CET,Sat Nov 20 23:28:56 CET,0.0 0.765 1.166 1.444 1.668 1.859 2.027 2.182 2.446 2.576 2.711 2.719 3.021 3.108 3.268 3.434 3.607 3.69 3.838 3.982 4.194 4.332 4.464 4.644 4.823 5.004 5.172 5.322 5.518 5.711 5.892 6.088 6.283 6.484 6.716 6.983 7.247 7.517 7.792 8.089 8.41 8.762 9.152 9.531 9.949 10.421 10.924 11.409 11.94 12.5 12.994 13.079 12.881 12.594 12.289 11.962 11.645 11.348 11.078 10.789 10.535 10.304 10.061 9.816 9.584 9.38 9.166 8.961 8.785 8.595 8.398 8.236 8.056 7.872 7.73 7.572 7.387 7.201 7.024 6.893 6.756 6.538 6.384 6.221 6.141 5.973 5.778 5.573 5.462 5.149 5.138 5.021 4.9 4.587 4.385 4.186 3.989 3.781 3.501 3.006 1.344 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_6b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_6b.txt deleted file mode 100644 index 5d11ac1a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_6b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28113 ,TETRA ,17378044,Sat Nov 20 21:49:14 CET,Sat Nov 20 23:30:30 CET,0.0 0.39 0.702 0.916 1.093 1.294 1.487 1.646 1.948 2.083 2.205 2.238 2.555 2.659 2.859 3.039 3.23 3.319 3.48 3.63 3.85 3.993 4.118 4.3 4.48 4.647 4.81 4.986 5.222 5.435 5.629 5.862 6.089 6.3 6.545 6.827 7.086 7.377 7.663 7.943 8.245 8.572 8.948 9.319 9.728 10.149 10.622 11.143 11.666 12.129 12.404 12.332 12.08 11.737 11.345 10.947 10.566 10.182 9.833 9.483 9.187 8.918 8.652 8.384 8.122 7.893 7.682 7.489 7.316 7.134 6.928 6.753 6.571 6.373 6.219 6.071 5.926 5.758 5.565 5.435 5.294 5.081 4.937 4.786 4.708 4.539 4.366 4.169 4.069 3.754 3.755 3.625 3.491 3.194 3.02 2.84 2.622 2.385 2.114 1.698 0.565 -2 ,20383 ,TETRA ,17378046,Sat Nov 20 21:49:14 CET,Sat Nov 20 23:30:27 CET,0.0 1.31 1.653 1.953 2.213 2.416 2.607 2.77 3.038 3.162 3.285 3.295 3.608 3.715 3.928 4.128 4.314 4.401 4.574 4.738 4.948 5.088 5.226 5.422 5.609 5.797 5.975 6.136 6.334 6.523 6.722 6.957 7.161 7.361 7.582 7.825 8.073 8.349 8.624 8.909 9.226 9.571 9.96 10.35 10.794 11.25 11.725 12.218 12.72 13.158 13.417 13.209 12.797 12.404 12.014 11.567 11.168 10.816 10.503 10.182 9.899 9.66 9.421 9.192 8.973 8.763 8.539 8.328 8.137 7.928 7.718 7.549 7.369 7.185 7.044 6.9 6.737 6.555 6.369 6.245 6.117 5.904 5.754 5.619 5.549 5.39 5.232 5.058 4.958 4.634 4.583 4.451 4.318 4.045 3.909 3.747 3.542 3.303 2.997 2.653 1.859 -3 ,1049 ,TETRA ,17378048,Sat Nov 20 21:49:14 CET,Sat Nov 20 23:30:50 CET,0.0 0.423 0.67 0.909 1.168 1.389 1.559 1.726 2.033 2.167 2.289 2.305 2.623 2.722 2.923 3.116 3.28 3.364 3.548 3.715 3.929 4.065 4.202 4.402 4.6 4.778 4.938 5.1 5.312 5.51 5.699 5.953 6.206 6.419 6.653 6.918 7.159 7.435 7.72 7.989 8.288 8.626 9.008 9.391 9.818 10.26 10.785 11.316 11.806 12.377 12.862 12.829 12.507 12.142 11.77 11.395 11.028 10.67 10.353 10.028 9.756 9.495 9.227 8.979 8.751 8.551 8.314 8.074 7.886 7.701 7.494 7.32 7.147 6.966 6.819 6.665 6.507 6.343 6.181 6.062 5.932 5.744 5.595 5.413 5.327 5.17 4.996 4.803 4.708 4.402 4.39 4.274 4.156 3.903 3.767 3.604 3.385 3.136 2.856 2.444 1.341 -4 ,30521 ,TETRA ,17378050,Sat Nov 20 21:49:14 CET,Sat Nov 20 23:30:27 CET,0.0 1.312 1.701 1.977 2.214 2.417 2.596 2.755 3.032 3.172 3.307 3.322 3.64 3.742 3.917 4.087 4.265 4.349 4.504 4.653 4.873 5.005 5.12 5.299 5.479 5.65 5.831 6.01 6.214 6.4 6.582 6.807 7.022 7.223 7.453 7.706 7.943 8.207 8.489 8.777 9.073 9.392 9.772 10.154 10.565 11.022 11.544 12.067 12.605 13.118 13.477 13.426 13.163 12.848 12.46 12.068 11.715 11.358 11.027 10.711 10.428 10.15 9.883 9.645 9.418 9.203 8.964 8.748 8.569 8.366 8.158 7.998 7.826 7.636 7.489 7.335 7.175 7.015 6.841 6.714 6.585 6.392 6.264 6.104 6.016 5.843 5.66 5.462 5.356 5.048 5.035 4.905 4.782 4.51 4.37 4.226 4.041 3.85 3.631 3.292 2.327 -5 ,27090 ,TETRA ,17378052,Sat Nov 20 21:49:13 CET,Sat Nov 20 23:29:58 CET,0.0 1.162 1.533 1.831 2.11 2.338 2.516 2.677 2.977 3.119 3.253 3.265 3.578 3.679 3.872 4.047 4.209 4.286 4.465 4.651 4.882 5.024 5.155 5.342 5.547 5.746 5.914 6.071 6.282 6.487 6.682 6.944 7.18 7.375 7.599 7.837 8.085 8.357 8.62 8.914 9.21 9.521 9.886 10.244 10.683 11.18 11.69 12.203 12.742 13.274 13.648 13.591 13.305 12.944 12.546 12.169 11.81 11.433 11.133 10.811 10.52 10.274 10.018 9.749 9.491 9.264 9.019 8.804 8.623 8.425 8.2 8.019 7.854 7.679 7.53 7.375 7.216 7.044 6.876 6.763 6.647 6.464 6.33 6.196 6.12 5.956 5.785 5.614 5.525 5.214 5.216 5.1 4.973 4.713 4.56 4.399 4.216 4.014 3.826 3.574 2.504 -6 ,25627 ,TETRA ,17378055,Sat Nov 20 21:49:14 CET,Sat Nov 20 23:29:54 CET,0.0 1.327 1.645 1.888 2.108 2.315 2.514 2.692 2.977 3.112 3.23 3.219 3.533 3.632 3.82 3.998 4.169 4.255 4.427 4.59 4.807 4.941 5.073 5.254 5.432 5.613 5.792 5.959 6.162 6.342 6.511 6.731 6.955 7.169 7.409 7.67 7.9 8.151 8.429 8.718 9.021 9.359 9.741 10.113 10.534 10.967 11.446 11.975 12.539 13.041 13.363 13.351 13.085 12.703 12.295 11.874 11.473 11.107 10.81 10.488 10.186 9.916 9.658 9.403 9.155 8.922 8.693 8.503 8.318 8.108 7.906 7.741 7.549 7.35 7.207 7.064 6.911 6.755 6.58 6.444 6.306 6.108 5.972 5.813 5.735 5.572 5.381 5.201 5.114 4.816 4.823 4.705 4.587 4.335 4.203 4.057 3.891 3.704 3.457 3.077 2.298 -7 ,10081 ,TETRA ,17378057,Sat Nov 20 21:49:17 CET,Sat Nov 20 23:30:29 CET,0.0 0.24 0.438 0.612 0.769 0.949 1.119 1.273 1.555 1.675 1.794 1.804 2.112 2.206 2.389 2.566 2.741 2.829 3.0 3.164 3.407 3.551 3.678 3.876 4.079 4.261 4.425 4.586 4.803 4.993 5.175 5.393 5.608 5.826 6.075 6.332 6.575 6.842 7.114 7.387 7.693 8.057 8.454 8.845 9.273 9.716 10.204 10.706 11.225 11.705 12.066 12.05 11.796 11.452 11.08 10.682 10.323 9.98 9.663 9.356 9.064 8.785 8.513 8.236 7.984 7.772 7.544 7.328 7.144 6.947 6.743 6.566 6.376 6.188 6.024 5.848 5.684 5.532 5.372 5.247 5.122 4.925 4.776 4.63 4.557 4.395 4.216 4.017 3.917 3.612 3.64 3.542 3.429 3.194 3.058 2.886 2.693 2.475 2.19 1.816 0.917 -8 ,25146 ,TETRA ,17378059,Sat Nov 20 21:49:15 CET,Sat Nov 20 23:31:06 CET,0.0 1.005 1.421 1.752 1.987 2.162 2.322 2.467 2.729 2.865 3.005 3.041 3.365 3.458 3.648 3.852 4.032 4.117 4.28 4.439 4.671 4.81 4.943 5.161 5.38 5.583 5.767 5.931 6.146 6.355 6.548 6.779 7.001 7.219 7.454 7.699 7.949 8.225 8.518 8.828 9.146 9.484 9.868 10.228 10.627 11.056 11.518 12.013 12.535 12.968 13.181 13.071 12.794 12.438 12.023 11.618 11.24 10.866 10.565 10.284 10.022 9.765 9.527 9.314 9.081 8.862 8.631 8.413 8.212 8.016 7.816 7.634 7.449 7.257 7.119 6.973 6.803 6.632 6.46 6.333 6.201 5.986 5.837 5.685 5.607 5.427 5.23 5.027 4.926 4.614 4.573 4.445 4.331 4.077 3.933 3.758 3.542 3.292 3.033 2.71 1.943 -9 ,865 ,TETRA ,17378060,Sat Nov 20 21:49:14 CET,Sat Nov 20 23:31:56 CET,0.0 0.895 1.203 1.465 1.706 1.906 2.09 2.247 2.516 2.635 2.743 2.766 3.1 3.215 3.415 3.599 3.782 3.866 4.027 4.19 4.419 4.564 4.702 4.889 5.069 5.247 5.414 5.579 5.788 5.986 6.179 6.406 6.624 6.829 7.059 7.311 7.556 7.828 8.101 8.389 8.708 9.048 9.397 9.741 10.147 10.586 11.066 11.593 12.14 12.601 12.969 12.959 12.737 12.424 12.064 11.687 11.353 11.031 10.713 10.402 10.143 9.898 9.656 9.423 9.191 8.973 8.736 8.527 8.347 8.143 7.937 7.765 7.582 7.396 7.246 7.082 6.915 6.746 6.573 6.449 6.319 6.129 5.987 5.838 5.763 5.591 5.4 5.213 5.122 4.813 4.807 4.684 4.549 4.271 4.114 3.927 3.711 3.483 3.259 2.945 2.166 -10 ,22693 ,TETRA ,17378061,Sat Nov 20 21:49:14 CET,Sat Nov 20 23:31:32 CET,0.0 1.048 1.418 1.697 1.924 2.117 2.286 2.435 2.719 2.853 2.981 3.001 3.317 3.417 3.599 3.765 3.933 4.017 4.174 4.314 4.511 4.644 4.769 4.966 5.162 5.335 5.501 5.673 5.894 6.095 6.296 6.545 6.764 6.965 7.2 7.451 7.686 7.953 8.247 8.556 8.875 9.229 9.624 9.989 10.394 10.834 11.334 11.823 12.312 12.799 13.11 13.041 12.748 12.358 11.997 11.651 11.295 10.953 10.641 10.334 10.061 9.791 9.527 9.288 9.071 8.858 8.629 8.434 8.259 8.068 7.872 7.706 7.535 7.362 7.222 7.081 6.924 6.75 6.582 6.466 6.345 6.161 6.013 5.858 5.783 5.626 5.467 5.28 5.176 4.864 4.868 4.75 4.63 4.389 4.242 4.077 3.888 3.676 3.4 3.029 2.373 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_6e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_6e.txt deleted file mode 100644 index f944b5c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_6e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18430 ,KEBNE ,17043896,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:18 CET,0.0 0.971 1.339 1.637 1.857 2.053 2.223 2.368 2.652 2.768 2.876 2.877 3.186 3.278 3.463 3.643 3.813 3.891 4.033 4.168 4.368 4.497 4.618 4.794 4.967 5.114 5.255 5.398 5.586 5.766 5.932 6.131 6.319 6.516 6.744 6.969 7.177 7.417 7.675 7.936 8.205 8.513 8.864 9.194 9.571 9.97 10.383 10.793 11.217 11.598 11.854 11.778 11.453 11.103 10.724 10.328 9.965 9.597 9.259 8.92 8.619 8.345 8.084 7.821 7.567 7.331 7.079 6.855 6.668 6.475 6.271 6.099 5.922 5.727 5.566 5.408 5.243 5.052 4.844 4.708 4.574 4.361 4.206 4.039 3.954 3.782 3.605 3.43 3.332 3.011 2.99 2.868 2.736 2.454 2.285 2.088 1.883 1.645 1.352 0.97 -0.559 -2 ,11310 ,KEBNE ,17043897,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:29 CET,0.0 0.46 0.764 0.998 1.166 1.302 1.471 1.639 1.911 2.036 2.153 2.171 2.485 2.574 2.743 2.909 3.068 3.147 3.295 3.438 3.646 3.776 3.903 4.078 4.253 4.422 4.56 4.688 4.863 5.036 5.208 5.414 5.601 5.779 5.982 6.212 6.441 6.688 6.943 7.211 7.475 7.762 8.1 8.43 8.815 9.228 9.68 10.144 10.569 10.982 11.296 11.157 10.805 10.429 10.043 9.678 9.322 8.965 8.652 8.322 8.028 7.762 7.491 7.224 6.983 6.763 6.517 6.292 6.101 5.896 5.676 5.499 5.313 5.118 4.964 4.799 4.631 4.453 4.25 4.112 3.977 3.756 3.61 3.46 3.385 3.225 3.052 2.87 2.767 2.452 2.434 2.304 2.16 1.84 1.655 1.467 1.288 1.086 0.82 0.422 -0.716 -3 ,22893 ,KEBNE ,17043898,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:22 CET,0.0 1.06 1.426 1.653 1.852 2.047 2.223 2.389 2.65 2.773 2.894 2.886 3.198 3.29 3.466 3.645 3.813 3.893 4.037 4.173 4.362 4.48 4.6 4.76 4.924 5.093 5.257 5.417 5.615 5.802 5.968 6.155 6.342 6.53 6.74 6.954 7.17 7.417 7.667 7.93 8.2 8.501 8.839 9.175 9.551 9.934 10.33 10.735 11.183 11.587 11.809 11.681 11.421 11.077 10.661 10.24 9.856 9.493 9.162 8.802 8.48 8.186 7.907 7.64 7.399 7.19 6.965 6.756 6.553 6.343 6.137 5.961 5.774 5.575 5.416 5.243 5.053 4.859 4.671 4.539 4.402 4.182 4.027 3.88 3.803 3.641 3.457 3.255 3.159 2.85 2.84 2.723 2.595 2.267 2.089 1.931 1.766 1.554 1.28 0.838 -0.52 -4 ,22976 ,KEBNE ,17043899,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:39 CET,0.0 0.701 1.014 1.276 1.496 1.686 1.835 1.987 2.255 2.37 2.487 2.477 2.772 2.855 3.039 3.207 3.363 3.437 3.578 3.716 3.918 4.059 4.19 4.356 4.509 4.667 4.818 4.957 5.15 5.342 5.522 5.732 5.938 6.131 6.335 6.565 6.787 7.027 7.275 7.523 7.786 8.104 8.453 8.77 9.131 9.56 10.008 10.397 10.794 11.184 11.415 11.327 11.001 10.59 10.196 9.78 9.401 9.048 8.702 8.33 8.035 7.765 7.484 7.228 7.002 6.782 6.548 6.341 6.153 5.946 5.721 5.537 5.331 5.12 4.97 4.817 4.655 4.488 4.304 4.171 4.041 3.838 3.693 3.537 3.454 3.292 3.129 2.937 2.831 2.502 2.459 2.326 2.191 1.917 1.777 1.607 1.394 1.181 0.903 0.45 -0.367 -5 ,27319 ,KEBNE ,17043900,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:21 CET,0.0 0.718 1.008 1.229 1.422 1.612 1.778 1.911 2.156 2.274 2.381 2.356 2.656 2.741 2.93 3.119 3.298 3.384 3.541 3.69 3.908 4.053 4.192 4.371 4.525 4.682 4.837 4.986 5.177 5.354 5.528 5.737 5.932 6.111 6.314 6.53 6.727 6.95 7.192 7.439 7.705 8.02 8.383 8.731 9.098 9.507 9.984 10.461 10.915 11.324 11.596 11.439 11.075 10.653 10.236 9.849 9.483 9.103 8.765 8.425 8.12 7.851 7.601 7.357 7.117 6.893 6.658 6.44 6.252 6.077 5.887 5.719 5.553 5.362 5.212 5.063 4.884 4.696 4.513 4.372 4.219 4.006 3.85 3.684 3.604 3.443 3.274 3.08 2.985 2.674 2.65 2.528 2.406 2.153 2.015 1.851 1.657 1.425 1.154 0.8 -0.095 -6 ,12503 ,KEBNE ,17043901,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:22 CET,0.0 0.695 1.035 1.274 1.461 1.632 1.801 1.955 2.215 2.334 2.453 2.458 2.768 2.86 3.04 3.198 3.331 3.403 3.553 3.691 3.894 4.02 4.146 4.32 4.47 4.616 4.761 4.902 5.087 5.261 5.429 5.64 5.841 6.017 6.216 6.452 6.674 6.896 7.138 7.403 7.67 7.983 8.328 8.646 9.017 9.414 9.827 10.263 10.717 11.079 11.293 11.147 10.795 10.392 9.969 9.544 9.165 8.825 8.521 8.21 7.917 7.646 7.37 7.099 6.845 6.604 6.358 6.151 5.958 5.741 5.507 5.306 5.103 4.899 4.745 4.584 4.409 4.229 4.028 3.891 3.764 3.557 3.412 3.256 3.167 2.983 2.808 2.626 2.528 2.206 2.17 2.048 1.915 1.615 1.458 1.281 1.09 0.89 0.629 0.268 -1.019 -7 ,14701 ,KEBNE ,17043902,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:04 CET,0.0 1.022 1.369 1.579 1.732 1.93 2.149 2.319 2.571 2.682 2.788 2.793 3.103 3.197 3.392 3.581 3.756 3.829 3.978 4.13 4.319 4.431 4.556 4.747 4.922 5.09 5.241 5.383 5.572 5.765 5.943 6.141 6.335 6.528 6.75 7.0 7.228 7.466 7.72 7.981 8.253 8.539 8.858 9.166 9.503 9.871 10.292 10.723 11.124 11.457 11.666 11.551 11.198 10.769 10.338 9.889 9.476 9.114 8.79 8.464 8.179 7.897 7.612 7.336 7.064 6.83 6.598 6.389 6.211 6.022 5.834 5.663 5.464 5.269 5.115 4.939 4.765 4.594 4.418 4.291 4.145 3.909 3.768 3.627 3.546 3.363 3.173 2.981 2.88 2.559 2.536 2.407 2.267 1.955 1.745 1.548 1.36 1.116 0.844 0.503 -0.387 -8 ,23269 ,KEBNE ,17043903,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:03:22 CET,0.0 0.747 1.128 1.404 1.637 1.816 1.984 2.171 2.509 2.646 2.773 2.793 3.102 3.199 3.372 3.554 3.728 3.807 3.952 4.074 4.26 4.382 4.495 4.655 4.812 4.971 5.126 5.269 5.451 5.627 5.794 5.991 6.181 6.373 6.593 6.823 7.054 7.291 7.525 7.767 8.007 8.297 8.643 8.982 9.366 9.753 10.192 10.645 11.052 11.417 11.641 11.563 11.277 10.907 10.511 10.122 9.756 9.395 9.07 8.747 8.461 8.199 7.927 7.666 7.424 7.178 6.92 6.693 6.496 6.28 6.046 5.866 5.683 5.494 5.347 5.186 5.015 4.84 4.657 4.515 4.361 4.138 3.978 3.805 3.718 3.54 3.355 3.152 3.041 2.721 2.714 2.584 2.445 2.174 2.006 1.799 1.58 1.342 1.071 0.731 -0.102 -9 ,23174 ,KEBNE ,17043904,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:03:19 CET,0.0 1.135 1.509 1.738 1.921 2.095 2.243 2.375 2.603 2.716 2.838 2.848 3.156 3.248 3.436 3.611 3.768 3.84 3.984 4.132 4.328 4.454 4.571 4.736 4.907 5.078 5.234 5.374 5.55 5.726 5.898 6.113 6.313 6.49 6.685 6.898 7.111 7.339 7.587 7.857 8.126 8.41 8.71 9.002 9.348 9.715 10.122 10.54 10.955 11.365 11.607 11.5 11.166 10.773 10.411 10.029 9.658 9.293 8.967 8.639 8.344 8.061 7.807 7.575 7.321 7.08 6.826 6.597 6.423 6.236 6.02 5.828 5.632 5.447 5.294 5.125 4.957 4.778 4.59 4.457 4.314 4.098 3.954 3.8 3.718 3.544 3.355 3.136 3.021 2.706 2.714 2.6 2.455 2.145 1.998 1.836 1.646 1.403 1.095 0.692 -0.153 -10 ,28370 ,KEBNE ,17043905,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:03:07 CET,0.0 0.813 1.076 1.344 1.558 1.733 1.897 2.055 2.319 2.423 2.527 2.512 2.812 2.91 3.122 3.313 3.48 3.549 3.672 3.796 3.994 4.136 4.254 4.421 4.6 4.763 4.908 5.056 5.247 5.42 5.591 5.813 6.023 6.209 6.412 6.65 6.883 7.125 7.375 7.648 7.926 8.222 8.543 8.874 9.266 9.668 10.088 10.508 10.954 11.36 11.599 11.505 11.137 10.73 10.366 9.988 9.581 9.168 8.802 8.447 8.136 7.862 7.607 7.353 7.122 6.904 6.653 6.412 6.204 5.997 5.772 5.59 5.414 5.228 5.078 4.918 4.751 4.576 4.39 4.26 4.127 3.921 3.779 3.622 3.541 3.383 3.202 3.021 2.925 2.607 2.604 2.488 2.356 2.048 1.873 1.705 1.532 1.331 1.08 0.716 -0.5 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_6a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_6a.txt deleted file mode 100644 index 934f9068..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_6a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23701 ,KEBNE ,17043906,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:57 CET,0.0 0.708 1.155 1.44 1.652 1.834 1.981 2.12 2.384 2.511 2.64 2.657 2.984 3.102 3.304 3.48 3.635 3.71 3.861 4.003 4.194 4.31 4.424 4.587 4.749 4.916 5.072 5.221 5.409 5.588 5.76 5.968 6.16 6.331 6.543 6.775 6.982 7.22 7.46 7.696 7.961 8.248 8.574 8.907 9.266 9.622 10.013 10.439 10.902 11.318 11.483 11.189 10.76 10.287 9.84 9.412 8.989 8.594 8.233 7.845 7.494 7.181 6.888 6.596 6.311 6.045 5.782 5.554 5.364 5.175 4.955 4.766 4.573 4.365 4.194 4.026 3.865 3.683 3.478 3.318 3.165 2.959 2.809 2.646 2.553 2.366 2.182 1.997 1.908 1.594 1.514 1.371 1.248 0.94 0.753 0.566 0.311 0.038 -0.187 -0.58 -1.594 -2 ,16216 ,KEBNE ,17043907,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:03:45 CET,0.0 1.023 1.361 1.594 1.792 1.988 2.171 2.318 2.589 2.727 2.86 2.913 3.24 3.331 3.496 3.667 3.84 3.919 4.065 4.203 4.41 4.541 4.661 4.838 5.006 5.165 5.328 5.486 5.686 5.867 6.039 6.251 6.452 6.634 6.832 7.065 7.293 7.56 7.857 8.131 8.408 8.709 9.038 9.392 9.764 10.131 10.542 10.93 11.312 11.59 11.583 11.185 10.631 10.054 9.505 9.024 8.576 8.149 7.794 7.42 7.079 6.77 6.477 6.207 5.944 5.693 5.428 5.191 4.994 4.782 4.56 4.384 4.186 3.97 3.799 3.619 3.443 3.252 3.058 2.924 2.778 2.568 2.429 2.27 2.189 2.025 1.842 1.649 1.553 1.239 1.211 1.081 0.949 0.649 0.491 0.317 0.112 -0.121 -0.475 -0.929 -1.909 -3 ,13907 ,KEBNE ,17043908,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:04:07 CET,0.0 0.82 1.132 1.407 1.622 1.839 2.031 2.18 2.446 2.568 2.681 2.684 2.999 3.1 3.3 3.477 3.642 3.729 3.884 4.017 4.202 4.324 4.453 4.642 4.828 5.007 5.167 5.307 5.484 5.652 5.8 5.981 6.162 6.341 6.552 6.782 6.995 7.231 7.497 7.775 8.028 8.289 8.605 8.94 9.337 9.744 10.123 10.469 10.82 11.146 11.252 10.852 10.29 9.738 9.217 8.723 8.279 7.856 7.483 7.107 6.761 6.445 6.172 5.906 5.629 5.373 5.112 4.871 4.666 4.448 4.202 4.016 3.822 3.595 3.424 3.259 3.093 2.912 2.713 2.572 2.431 2.23 2.082 1.903 1.801 1.595 1.396 1.192 1.084 0.767 0.765 0.652 0.524 0.234 0.078 -0.104 -0.308 -0.494 -0.72 -1.092 -1.965 -4 ,16223 ,KEBNE ,17043909,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:04:19 CET,0.0 0.87 1.175 1.423 1.64 1.816 1.971 2.118 2.368 2.474 2.583 2.594 2.91 3.013 3.2 3.368 3.521 3.591 3.721 3.859 4.058 4.18 4.295 4.461 4.627 4.783 4.929 5.081 5.284 5.457 5.615 5.816 6.002 6.175 6.383 6.632 6.865 7.105 7.37 7.632 7.89 8.192 8.52 8.814 9.141 9.479 9.845 10.227 10.588 10.808 10.77 10.38 9.827 9.296 8.813 8.321 7.834 7.37 6.978 6.575 6.222 5.919 5.632 5.353 5.088 4.833 4.57 4.337 4.135 3.922 3.68 3.482 3.276 3.06 2.896 2.724 2.545 2.366 2.181 2.054 1.917 1.704 1.56 1.402 1.32 1.137 0.912 0.685 0.585 0.271 0.254 0.142 0.047 -0.16 -0.3 -0.448 -0.594 -0.74 -0.874 -1.045 -1.484 -5 ,1791 ,KEBNE ,17043910,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:04:08 CET,0.0 0.488 0.754 0.988 1.178 1.316 1.48 1.662 1.934 2.048 2.169 2.184 2.496 2.6 2.822 3.02 3.195 3.275 3.425 3.566 3.764 3.891 4.016 4.192 4.349 4.512 4.659 4.787 4.982 5.177 5.349 5.55 5.749 5.944 6.159 6.396 6.623 6.851 7.102 7.357 7.596 7.875 8.194 8.512 8.872 9.25 9.628 9.968 10.291 10.568 10.641 10.326 9.791 9.226 8.712 8.242 7.822 7.396 7.036 6.673 6.343 6.054 5.768 5.474 5.216 4.981 4.713 4.469 4.262 4.05 3.827 3.623 3.416 3.214 3.045 2.865 2.687 2.505 2.304 2.174 2.044 1.827 1.676 1.523 1.445 1.281 1.108 0.923 0.819 0.498 0.467 0.326 0.179 -0.126 -0.283 -0.449 -0.627 -0.803 -0.974 -1.159 -1.598 -6 ,1353 ,KEBNE ,17043911,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:32 CET,0.0 1.02 1.371 1.619 1.859 2.064 2.257 2.45 2.738 2.881 3.016 3.021 3.35 3.461 3.662 3.824 3.982 4.062 4.218 4.369 4.581 4.717 4.838 5.0 5.171 5.344 5.51 5.677 5.881 6.073 6.255 6.468 6.674 6.874 7.106 7.358 7.576 7.792 8.031 8.282 8.539 8.823 9.154 9.479 9.827 10.153 10.487 10.887 11.29 11.552 11.519 11.134 10.671 10.182 9.676 9.184 8.71 8.278 7.905 7.507 7.183 6.899 6.605 6.314 6.043 5.804 5.552 5.309 5.11 4.906 4.683 4.493 4.297 4.092 3.931 3.764 3.579 3.381 3.19 3.072 2.944 2.728 2.578 2.421 2.339 2.165 2.001 1.836 1.743 1.432 1.417 1.3 1.183 0.919 0.778 0.63 0.46 0.234 -0.044 -0.363 -0.962 -7 ,9291 ,KEBNE ,17043912,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:03:50 CET,0.0 0.91 1.235 1.475 1.659 1.834 1.983 2.117 2.373 2.534 2.717 2.783 3.091 3.166 3.339 3.534 3.71 3.784 3.922 4.061 4.272 4.402 4.523 4.711 4.895 5.065 5.236 5.391 5.573 5.734 5.886 6.095 6.304 6.492 6.713 6.954 7.168 7.403 7.654 7.918 8.185 8.463 8.785 9.117 9.462 9.802 10.154 10.461 10.754 11.012 11.032 10.655 10.171 9.648 9.16 8.7 8.248 7.822 7.474 7.117 6.779 6.464 6.14 5.829 5.555 5.308 5.041 4.802 4.604 4.396 4.169 3.986 3.804 3.6 3.432 3.252 3.068 2.873 2.675 2.551 2.412 2.181 2.028 1.868 1.789 1.623 1.442 1.265 1.169 0.844 0.833 0.724 0.606 0.333 0.171 0.01 -0.167 -0.378 -0.581 -0.761 -1.133 -8 ,14888 ,KEBNE ,17043913,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:03:41 CET,0.0 0.633 0.905 1.121 1.331 1.506 1.665 1.816 2.081 2.198 2.31 2.311 2.607 2.692 2.86 3.014 3.173 3.245 3.39 3.532 3.727 3.858 3.986 4.162 4.327 4.492 4.645 4.782 4.966 5.14 5.31 5.528 5.718 5.881 6.081 6.311 6.521 6.742 6.979 7.241 7.515 7.812 8.122 8.401 8.717 9.078 9.44 9.78 10.154 10.454 10.542 10.221 9.677 9.122 8.574 8.062 7.63 7.201 6.809 6.422 6.088 5.786 5.491 5.211 4.93 4.667 4.409 4.179 3.969 3.754 3.539 3.352 3.145 2.921 2.755 2.588 2.395 2.191 1.996 1.86 1.72 1.5 1.332 1.165 1.085 0.924 0.733 0.497 0.379 0.057 0.067 -0.04 -0.161 -0.418 -0.548 -0.707 -0.89 -1.064 -1.246 -1.55 -2.28 -9 ,28442 ,KEBNE ,17043914,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:04:09 CET,0.0 0.928 1.262 1.5 1.696 1.864 2.036 2.194 2.432 2.544 2.65 2.661 2.976 3.071 3.249 3.414 3.592 3.678 3.823 3.957 4.145 4.266 4.395 4.609 4.819 4.993 5.147 5.308 5.534 5.75 5.936 6.137 6.331 6.519 6.729 6.96 7.172 7.4 7.646 7.911 8.187 8.477 8.78 9.067 9.413 9.796 10.195 10.577 10.884 11.088 11.136 10.832 10.39 9.874 9.364 8.892 8.444 8.01 7.625 7.202 6.824 6.513 6.228 5.947 5.68 5.445 5.189 4.957 4.766 4.569 4.353 4.167 3.972 3.775 3.619 3.446 3.26 3.058 2.859 2.727 2.581 2.358 2.209 2.045 1.96 1.795 1.617 1.423 1.319 1.009 1.014 0.893 0.772 0.495 0.334 0.16 -0.027 -0.237 -0.478 -0.757 -1.294 -10 ,25944 ,KEBNE ,17043915,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:03:50 CET,0.0 0.726 1.045 1.304 1.512 1.69 1.854 2.002 2.263 2.367 2.479 2.486 2.804 2.908 3.1 3.281 3.444 3.518 3.663 3.795 3.981 4.108 4.225 4.389 4.554 4.712 4.864 5.01 5.204 5.392 5.568 5.793 6.007 6.21 6.442 6.694 6.925 7.158 7.402 7.655 7.925 8.207 8.542 8.88 9.216 9.554 9.905 10.247 10.578 10.814 10.766 10.312 9.783 9.254 8.746 8.246 7.774 7.329 6.941 6.582 6.274 5.972 5.662 5.368 5.094 4.844 4.582 4.354 4.154 3.926 3.704 3.527 3.332 3.126 2.97 2.819 2.645 2.447 2.258 2.128 1.987 1.784 1.639 1.477 1.398 1.228 1.045 0.875 0.801 0.516 0.557 0.457 0.357 0.147 0.019 -0.121 -0.262 -0.407 -0.576 -0.765 -1.051 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_6e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_6e.txt deleted file mode 100644 index 2fc9e584..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_6e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25960 ,KEBNE ,17043916,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:03:14 CET,0.0 1.28 1.63 1.885 2.081 2.268 2.452 2.611 2.887 3.011 3.124 3.116 3.425 3.525 3.704 3.866 4.035 4.113 4.248 4.382 4.583 4.709 4.826 4.991 5.144 5.293 5.454 5.606 5.781 5.967 6.145 6.34 6.525 6.709 6.918 7.168 7.401 7.632 7.88 8.138 8.424 8.748 9.097 9.428 9.807 10.199 10.578 10.933 11.279 11.613 11.764 11.467 10.964 10.408 9.885 9.396 8.942 8.525 8.169 7.779 7.403 7.055 6.731 6.439 6.175 5.948 5.707 5.451 5.226 5.012 4.783 4.591 4.389 4.178 4.017 3.843 3.666 3.483 3.283 3.146 2.991 2.729 2.554 2.372 2.278 2.091 1.894 1.673 1.551 1.214 1.16 1.013 0.852 0.468 0.268 0.087 -0.135 -0.383 -0.651 -1.037 -2.323 -2 ,23002 ,KEBNE ,17043917,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:03:38 CET,0.0 1.158 1.535 1.818 2.038 2.188 2.334 2.491 2.754 2.868 2.978 2.986 3.297 3.394 3.568 3.74 3.902 3.978 4.127 4.273 4.478 4.601 4.723 4.891 5.057 5.225 5.366 5.49 5.66 5.831 6.004 6.205 6.393 6.572 6.779 7.015 7.234 7.466 7.711 7.963 8.237 8.529 8.833 9.138 9.491 9.86 10.236 10.612 10.975 11.238 11.293 10.968 10.514 10.021 9.539 9.066 8.596 8.142 7.751 7.344 6.976 6.64 6.326 6.022 5.716 5.426 5.138 4.896 4.678 4.452 4.223 4.02 3.806 3.586 3.42 3.257 3.079 2.875 2.657 2.525 2.384 2.146 1.973 1.785 1.691 1.513 1.319 1.096 0.983 0.657 0.616 0.49 0.35 0.031 -0.141 -0.356 -0.612 -0.866 -1.153 -1.511 -2.299 -3 ,3799 ,KEBNE ,17043918,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:05:29 CET,0.0 0.821 1.099 1.345 1.584 1.785 1.954 2.101 2.356 2.47 2.58 2.564 2.867 2.957 3.127 3.291 3.444 3.523 3.671 3.806 4.002 4.129 4.243 4.403 4.569 4.733 4.886 5.041 5.239 5.427 5.606 5.815 6.018 6.197 6.413 6.664 6.896 7.135 7.39 7.658 7.921 8.222 8.575 8.886 9.218 9.582 9.978 10.352 10.692 10.982 11.046 10.731 10.252 9.656 9.105 8.626 8.17 7.727 7.319 6.91 6.537 6.183 5.868 5.587 5.303 5.036 4.766 4.522 4.32 4.102 3.843 3.628 3.419 3.201 3.027 2.844 2.651 2.464 2.258 2.109 1.967 1.721 1.536 1.361 1.265 1.052 0.831 0.609 0.495 0.166 0.137 0.014 -0.109 -0.401 -0.575 -0.746 -0.928 -1.153 -1.439 -1.823 -3.083 -4 ,19312 ,KEBNE ,17043919,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:28 CET,0.0 1.123 1.452 1.697 1.917 2.093 2.254 2.396 2.64 2.754 2.865 2.888 3.215 3.321 3.496 3.665 3.821 3.888 4.018 4.151 4.343 4.471 4.592 4.772 4.954 5.117 5.264 5.409 5.587 5.752 5.929 6.15 6.351 6.546 6.76 6.977 7.188 7.426 7.677 7.943 8.221 8.523 8.858 9.178 9.514 9.872 10.263 10.64 11.036 11.365 11.49 11.282 10.83 10.326 9.841 9.361 8.908 8.489 8.108 7.71 7.375 7.064 6.757 6.459 6.177 5.917 5.63 5.366 5.141 4.909 4.667 4.472 4.26 4.027 3.854 3.669 3.482 3.275 3.055 2.917 2.778 2.559 2.397 2.23 2.138 1.944 1.75 1.535 1.426 1.095 1.068 0.945 0.802 0.451 0.265 0.072 -0.146 -0.405 -0.722 -1.105 -2.079 -5 ,18898 ,KEBNE ,17043920,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:28 CET,0.0 1.313 1.58 1.804 1.996 2.17 2.347 2.495 2.753 2.875 2.979 2.964 3.267 3.356 3.53 3.708 3.874 3.954 4.113 4.264 4.491 4.63 4.743 4.906 5.06 5.191 5.348 5.509 5.692 5.866 6.037 6.241 6.425 6.606 6.826 7.064 7.302 7.561 7.81 8.083 8.363 8.662 9.003 9.311 9.662 10.025 10.419 10.877 11.305 11.637 11.806 11.56 11.094 10.59 10.118 9.649 9.188 8.75 8.371 7.993 7.651 7.34 7.039 6.754 6.486 6.225 5.929 5.68 5.484 5.27 5.035 4.833 4.629 4.417 4.247 4.068 3.888 3.691 3.472 3.33 3.192 2.955 2.773 2.586 2.491 2.305 2.11 1.899 1.786 1.466 1.461 1.335 1.209 0.953 0.8 0.603 0.38 0.133 -0.188 -0.598 -1.588 -6 ,16354 ,KEBNE ,17043921,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:03:23 CET,0.0 0.793 1.231 1.551 1.785 1.993 2.157 2.303 2.563 2.679 2.795 2.811 3.129 3.219 3.391 3.559 3.715 3.789 3.933 4.069 4.258 4.384 4.51 4.684 4.856 5.022 5.179 5.33 5.52 5.699 5.875 6.083 6.279 6.475 6.683 6.909 7.136 7.384 7.634 7.897 8.169 8.467 8.831 9.188 9.563 9.909 10.264 10.647 11.012 11.268 11.346 11.073 10.619 10.124 9.642 9.177 8.702 8.236 7.832 7.422 7.056 6.715 6.4 6.105 5.83 5.577 5.304 5.06 4.848 4.63 4.389 4.185 3.97 3.738 3.558 3.381 3.209 3.03 2.843 2.713 2.573 2.333 2.168 2.003 1.92 1.746 1.538 1.297 1.177 0.846 0.801 0.657 0.503 0.161 -0.025 -0.215 -0.436 -0.697 -1.01 -1.406 -2.464 -7 ,5010 ,KEBNE ,17043922,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:30 CET,0.0 1.114 1.508 1.774 1.983 2.161 2.324 2.475 2.749 2.867 2.976 2.975 3.284 3.383 3.566 3.734 3.89 3.959 4.094 4.226 4.405 4.528 4.657 4.829 4.977 5.129 5.284 5.432 5.616 5.793 5.953 6.146 6.342 6.536 6.764 7.011 7.223 7.447 7.698 7.958 8.233 8.541 8.884 9.201 9.562 9.955 10.333 10.669 11.002 11.264 11.299 10.992 10.522 10.024 9.533 9.052 8.611 8.195 7.821 7.44 7.087 6.756 6.441 6.148 5.895 5.668 5.419 5.186 4.977 4.75 4.494 4.267 4.029 3.794 3.618 3.44 3.263 3.075 2.868 2.73 2.582 2.344 2.181 2.007 1.913 1.712 1.488 1.266 1.158 0.824 0.77 0.633 0.493 0.213 0.044 -0.144 -0.337 -0.587 -0.925 -1.317 -2.302 -8 ,9912 ,KEBNE ,17043923,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:03:13 CET,0.0 0.9 1.242 1.463 1.645 1.813 1.977 2.138 2.39 2.491 2.591 2.58 2.889 2.981 3.162 3.334 3.487 3.567 3.727 3.874 4.066 4.191 4.317 4.492 4.654 4.809 4.966 5.115 5.303 5.483 5.647 5.848 6.049 6.24 6.448 6.683 6.908 7.13 7.377 7.638 7.909 8.217 8.554 8.881 9.214 9.561 9.984 10.393 10.744 11.004 11.075 10.83 10.426 9.988 9.511 9.021 8.561 8.135 7.75 7.338 6.989 6.698 6.393 6.07 5.77 5.497 5.217 4.961 4.737 4.507 4.253 4.042 3.823 3.595 3.419 3.23 3.033 2.849 2.667 2.523 2.364 2.131 1.97 1.78 1.683 1.497 1.3 1.079 0.968 0.642 0.599 0.477 0.346 0.021 -0.163 -0.362 -0.578 -0.838 -1.154 -1.592 -2.62 -9 ,4693 ,KEBNE ,17043924,Thu Dec 23 05:39:27 CET,Thu Dec 23 07:03:23 CET,0.0 0.982 1.262 1.511 1.766 1.988 2.154 2.295 2.532 2.645 2.756 2.743 3.046 3.131 3.304 3.463 3.616 3.69 3.827 3.961 4.156 4.29 4.414 4.584 4.748 4.905 5.07 5.226 5.42 5.605 5.775 5.984 6.186 6.386 6.611 6.853 7.08 7.322 7.565 7.833 8.117 8.416 8.76 9.095 9.463 9.845 10.245 10.672 11.116 11.472 11.607 11.339 10.912 10.442 9.952 9.467 8.993 8.543 8.142 7.737 7.404 7.105 6.815 6.522 6.238 5.983 5.722 5.477 5.248 5.014 4.768 4.566 4.366 4.143 3.964 3.787 3.615 3.437 3.222 3.077 2.941 2.716 2.552 2.367 2.267 2.05 1.834 1.627 1.515 1.187 1.154 1.011 0.857 0.524 0.306 0.08 -0.116 -0.348 -0.615 -0.957 -1.642 -10 ,11791 ,KEBNE ,17043925,Thu Dec 23 05:39:28 CET,Thu Dec 23 07:03:03 CET,0.0 0.625 0.925 1.16 1.356 1.527 1.654 1.778 2.068 2.227 2.371 2.366 2.668 2.761 2.958 3.138 3.315 3.397 3.537 3.677 3.871 3.99 4.111 4.282 4.447 4.607 4.765 4.918 5.106 5.272 5.429 5.616 5.799 5.991 6.203 6.433 6.648 6.864 7.1 7.383 7.685 7.994 8.31 8.621 8.978 9.355 9.756 10.148 10.536 10.852 10.976 10.737 10.31 9.797 9.299 8.784 8.3 7.869 7.489 7.084 6.714 6.374 6.043 5.727 5.432 5.167 4.883 4.628 4.412 4.182 3.938 3.731 3.509 3.282 3.111 2.94 2.767 2.575 2.343 2.178 2.023 1.789 1.63 1.46 1.369 1.184 0.989 0.755 0.63 0.3 0.258 0.111 -0.045 -0.374 -0.55 -0.726 -0.912 -1.151 -1.436 -1.782 -2.623 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_7a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_7a.txt deleted file mode 100644 index 15fee829..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_7a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11793 ,TETRA ,17378064,Sat Nov 20 21:49:14 CET,Sat Nov 20 23:31:18 CET,0.0 1.088 1.513 1.871 2.128 2.348 2.566 2.75 3.077 3.225 3.35 3.394 3.723 3.837 4.043 4.235 4.417 4.503 4.666 4.821 5.046 5.197 5.346 5.543 5.721 5.88 6.043 6.223 6.443 6.636 6.82 7.036 7.267 7.505 7.778 8.065 8.326 8.609 8.899 9.204 9.529 9.883 10.258 10.622 11.079 11.585 12.065 12.538 13.012 13.385 13.629 13.492 13.12 12.698 12.252 11.799 11.4 11.026 10.678 10.314 9.988 9.703 9.415 9.107 8.835 8.597 8.342 8.103 7.892 7.682 7.448 7.25 7.056 6.846 6.675 6.501 6.317 6.119 5.911 5.768 5.617 5.373 5.206 5.041 4.952 4.756 4.561 4.371 4.271 3.946 3.917 3.783 3.634 3.29 3.102 2.912 2.717 2.493 2.178 1.75 0.822 -2 ,15471 ,TETRA ,17378066,Sat Nov 20 21:49:18 CET,Sat Nov 20 23:34:29 CET,0.0 0.474 0.757 0.989 1.195 1.386 1.558 1.695 1.937 2.037 2.138 2.133 2.451 2.557 2.752 2.934 3.1 3.177 3.328 3.455 3.632 3.756 3.878 4.06 4.22 4.367 4.527 4.684 4.881 5.063 5.233 5.436 5.627 5.821 6.044 6.269 6.487 6.732 7.006 7.289 7.574 7.902 8.3 8.71 9.132 9.57 10.067 10.577 11.064 11.463 11.725 11.63 11.3 10.885 10.48 10.052 9.603 9.181 8.832 8.459 8.091 7.769 7.495 7.221 6.942 6.69 6.428 6.188 5.98 5.759 5.528 5.338 5.151 4.953 4.784 4.61 4.44 4.263 4.064 3.92 3.77 3.526 3.362 3.206 3.122 2.931 2.717 2.486 2.362 2.015 1.971 1.835 1.688 1.34 1.161 0.989 0.761 0.495 0.19 -0.166 -1.071 -3 ,21191 ,TETRA ,17378068,Sat Nov 20 21:49:16 CET,Sat Nov 20 23:31:48 CET,0.0 0.7 0.953 1.149 1.3 1.441 1.57 1.7 1.993 2.13 2.252 2.292 2.622 2.723 2.911 3.1 3.283 3.368 3.523 3.674 3.884 4.013 4.149 4.352 4.557 4.751 4.924 5.114 5.355 5.56 5.768 6.011 6.229 6.443 6.692 6.952 7.201 7.497 7.805 8.122 8.436 8.768 9.154 9.505 9.887 10.349 10.843 11.298 11.798 12.255 12.502 12.346 11.945 11.493 11.013 10.544 10.128 9.73 9.378 9.024 8.703 8.391 8.086 7.799 7.546 7.315 7.051 6.802 6.591 6.37 6.136 5.951 5.763 5.561 5.399 5.217 5.036 4.862 4.669 4.527 4.388 4.17 4.011 3.845 3.755 3.555 3.366 3.156 3.043 2.732 2.748 2.641 2.528 2.266 2.114 1.966 1.798 1.594 1.38 1.073 0.219 -4 ,16157 ,TETRA ,17378070,Sat Nov 20 21:49:16 CET,Sat Nov 20 23:32:11 CET,0.0 0.605 0.857 1.078 1.249 1.408 1.564 1.714 1.963 2.063 2.169 2.16 2.466 2.563 2.733 2.889 3.061 3.152 3.322 3.484 3.722 3.868 4.007 4.214 4.406 4.593 4.791 4.971 5.174 5.369 5.56 5.793 6.018 6.229 6.468 6.744 7.016 7.306 7.613 7.95 8.284 8.626 9.005 9.376 9.766 10.208 10.701 11.194 11.719 12.19 12.459 12.245 11.856 11.436 10.973 10.488 10.046 9.622 9.251 8.876 8.546 8.253 7.951 7.667 7.384 7.112 6.85 6.623 6.431 6.225 5.996 5.805 5.607 5.393 5.231 5.057 4.862 4.658 4.453 4.313 4.17 3.938 3.757 3.559 3.466 3.286 3.091 2.889 2.786 2.464 2.433 2.302 2.168 1.86 1.705 1.567 1.413 1.217 0.957 0.651 -0.203 -5 ,16478 ,TETRA ,17378072,Sat Nov 20 21:49:17 CET,Sat Nov 20 23:33:54 CET,0.0 0.491 0.706 0.902 1.07 1.238 1.389 1.507 1.724 1.823 1.93 1.929 2.233 2.326 2.496 2.653 2.803 2.873 3.018 3.167 3.38 3.519 3.647 3.817 3.994 4.186 4.378 4.546 4.764 4.982 5.173 5.395 5.603 5.79 6.003 6.234 6.465 6.706 6.95 7.212 7.495 7.831 8.198 8.549 8.954 9.405 9.882 10.401 10.955 11.45 11.708 11.498 11.135 10.724 10.299 9.854 9.439 9.046 8.687 8.31 7.985 7.694 7.411 7.15 6.883 6.633 6.372 6.13 5.921 5.698 5.472 5.285 5.096 4.896 4.726 4.546 4.353 4.149 3.948 3.813 3.663 3.412 3.245 3.076 2.981 2.782 2.581 2.387 2.284 1.951 1.905 1.767 1.632 1.351 1.203 1.058 0.882 0.663 0.406 0.084 -0.351 -6 ,928 ,TETRA ,17378074,Sat Nov 20 21:49:19 CET,Sat Nov 20 23:31:47 CET,0.0 1.162 1.513 1.729 1.908 2.056 2.177 2.317 2.573 2.674 2.776 2.764 3.071 3.174 3.379 3.548 3.703 3.779 3.928 4.076 4.282 4.399 4.516 4.683 4.84 4.994 5.141 5.291 5.483 5.657 5.827 6.027 6.217 6.42 6.675 6.948 7.203 7.487 7.769 8.053 8.343 8.664 9.058 9.434 9.844 10.295 10.781 11.283 11.769 12.18 12.428 12.299 11.914 11.488 11.068 10.624 10.202 9.798 9.449 9.094 8.771 8.467 8.163 7.87 7.605 7.361 7.093 6.851 6.65 6.445 6.217 6.032 5.85 5.659 5.508 5.339 5.163 4.979 4.784 4.653 4.518 4.294 4.122 3.95 3.858 3.664 3.452 3.215 3.102 2.786 2.802 2.7 2.593 2.356 2.212 2.023 1.835 1.668 1.471 1.193 0.543 -7 ,29393 ,TETRA ,17378076,Sat Nov 20 21:49:48 CET,Sat Nov 20 23:31:34 CET,0.0 1.279 1.609 1.82 1.992 2.148 2.303 2.465 2.735 2.842 2.942 2.891 3.18 3.26 3.412 3.553 3.698 3.774 3.923 4.067 4.265 4.393 4.528 4.715 4.878 5.044 5.207 5.358 5.584 5.803 6.008 6.259 6.477 6.683 6.936 7.226 7.487 7.756 8.034 8.323 8.658 9.038 9.423 9.774 10.191 10.647 11.101 11.547 12.01 12.468 12.797 12.649 12.295 11.878 11.448 11.036 10.642 10.256 9.906 9.551 9.225 8.911 8.606 8.319 8.046 7.795 7.519 7.281 7.086 6.869 6.642 6.453 6.252 6.046 5.881 5.703 5.523 5.33 5.107 4.953 4.796 4.561 4.402 4.235 4.145 3.967 3.79 3.576 3.453 3.114 3.06 2.916 2.782 2.469 2.251 2.031 1.817 1.534 1.15 0.629 -1.066 -8 ,7010 ,TETRA ,17378079,Sat Nov 20 21:49:48 CET,Sat Nov 20 23:33:03 CET,0.0 1.08 1.453 1.717 1.923 2.098 2.262 2.408 2.626 2.729 2.848 2.842 3.146 3.237 3.421 3.6 3.762 3.838 3.974 4.109 4.3 4.409 4.522 4.719 4.906 5.07 5.233 5.385 5.574 5.754 5.932 6.158 6.358 6.547 6.787 7.033 7.256 7.525 7.816 8.119 8.454 8.816 9.206 9.608 10.071 10.573 11.12 11.7 12.287 12.735 12.995 12.783 12.296 11.804 11.333 10.89 10.468 10.028 9.627 9.233 8.892 8.578 8.276 7.975 7.671 7.398 7.138 6.91 6.695 6.461 6.226 6.032 5.829 5.606 5.422 5.24 5.054 4.865 4.669 4.532 4.378 4.133 3.965 3.788 3.703 3.519 3.307 3.086 2.979 2.662 2.631 2.492 2.33 2.019 1.873 1.709 1.537 1.379 1.204 0.989 0.311 -9 ,29808 ,TETRA ,17378080,Sat Nov 20 21:49:49 CET,Sat Nov 20 23:33:46 CET,0.0 1.27 1.625 1.881 2.118 2.33 2.52 2.662 2.935 3.097 3.24 3.256 3.567 3.662 3.862 4.05 4.222 4.304 4.462 4.6 4.807 4.952 5.097 5.302 5.495 5.692 5.875 6.047 6.275 6.489 6.696 6.943 7.178 7.405 7.66 7.925 8.19 8.479 8.762 9.052 9.353 9.688 10.09 10.462 10.887 11.375 11.893 12.392 12.867 13.319 13.583 13.407 13.024 12.609 12.219 11.813 11.435 11.081 10.749 10.38 10.025 9.702 9.388 9.09 8.819 8.581 8.335 8.115 7.926 7.716 7.479 7.277 7.084 6.887 6.712 6.527 6.34 6.142 5.95 5.816 5.676 5.483 5.346 5.183 5.099 4.92 4.734 4.548 4.448 4.137 4.159 4.045 3.927 3.683 3.532 3.352 3.178 2.995 2.783 2.477 1.709 -10 ,10003 ,TETRA ,17378081,Sat Nov 20 21:49:48 CET,Sat Nov 20 23:33:00 CET,0.0 0.937 1.263 1.501 1.674 1.841 1.986 2.114 2.345 2.457 2.564 2.55 2.861 2.951 3.104 3.261 3.417 3.49 3.625 3.76 3.947 4.064 4.181 4.363 4.543 4.697 4.85 5.008 5.205 5.388 5.57 5.797 6.013 6.222 6.449 6.697 6.957 7.25 7.558 7.869 8.179 8.521 8.908 9.288 9.71 10.163 10.646 11.133 11.652 12.139 12.45 12.297 11.951 11.504 11.018 10.581 10.153 9.737 9.38 9.019 8.703 8.407 8.104 7.801 7.514 7.261 7.01 6.782 6.583 6.372 6.154 5.967 5.75 5.535 5.377 5.204 5.012 4.822 4.636 4.504 4.353 4.119 3.962 3.784 3.691 3.499 3.293 3.093 2.994 2.675 2.684 2.575 2.463 2.225 2.088 1.942 1.79 1.613 1.377 1.058 0.323 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6a.txt deleted file mode 100644 index 786fa552..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13264 ,TETRA ,17378085,Sat Nov 20 21:49:51 CET,Sat Nov 20 23:33:23 CET,0.0 0.855 1.198 1.505 1.731 1.913 2.08 2.231 2.5 2.616 2.733 2.76 3.104 3.223 3.406 3.587 3.752 3.832 3.991 4.149 4.35 4.469 4.596 4.779 4.957 5.14 5.312 5.477 5.669 5.835 5.999 6.211 6.425 6.628 6.843 7.075 7.305 7.556 7.823 8.088 8.38 8.715 9.063 9.401 9.793 10.169 10.559 10.965 11.365 11.75 11.986 11.765 11.337 10.875 10.454 10.055 9.662 9.315 8.997 8.668 8.384 8.109 7.847 7.593 7.333 7.101 6.87 6.661 6.469 6.269 6.061 5.889 5.722 5.541 5.4 5.247 5.087 4.937 4.77 4.646 4.518 4.333 4.213 4.077 4.009 3.866 3.701 3.516 3.423 3.121 3.135 3.034 2.931 2.712 2.576 2.431 2.29 2.108 1.894 1.65 0.887 -2 ,6794 ,TETRA ,17378087,Sat Nov 20 21:49:48 CET,Sat Nov 20 23:31:33 CET,0.0 1.328 1.693 1.96 2.193 2.386 2.571 2.746 3.059 3.203 3.321 3.323 3.645 3.754 3.944 4.108 4.255 4.327 4.47 4.61 4.817 4.95 5.068 5.235 5.398 5.564 5.72 5.874 6.088 6.282 6.461 6.674 6.875 7.079 7.307 7.549 7.776 8.033 8.3 8.571 8.855 9.142 9.474 9.802 10.177 10.594 10.99 11.391 11.8 12.119 12.203 11.983 11.588 11.104 10.68 10.292 9.907 9.531 9.2 8.866 8.573 8.307 8.037 7.787 7.553 7.321 7.092 6.893 6.702 6.487 6.283 6.127 5.947 5.768 5.63 5.48 5.317 5.146 4.979 4.863 4.739 4.525 4.383 4.246 4.17 4.012 3.84 3.673 3.587 3.278 3.287 3.179 3.06 2.827 2.705 2.561 2.4 2.227 2.021 1.752 0.947 -3 ,31319 ,TETRA ,17378089,Sat Nov 20 21:49:48 CET,Sat Nov 20 23:30:49 CET,0.0 1.231 1.567 1.855 2.097 2.314 2.495 2.697 3.092 3.229 3.349 3.35 3.66 3.754 3.938 4.106 4.273 4.358 4.518 4.669 4.885 5.022 5.148 5.329 5.511 5.694 5.861 6.0 6.186 6.38 6.565 6.783 6.986 7.179 7.406 7.664 7.903 8.156 8.416 8.684 8.968 9.276 9.619 9.941 10.276 10.632 11.028 11.411 11.791 12.148 12.28 12.045 11.66 11.223 10.791 10.37 9.971 9.617 9.296 8.952 8.648 8.349 8.05 7.783 7.554 7.344 7.111 6.9 6.719 6.53 6.315 6.13 5.964 5.803 5.658 5.503 5.35 5.197 5.031 4.908 4.788 4.599 4.458 4.326 4.262 4.104 3.914 3.718 3.621 3.296 3.272 3.174 3.069 2.797 2.647 2.493 2.285 2.031 1.763 1.397 0.605 -4 ,609 ,TETRA ,17378091,Sat Nov 20 21:50:24 CET,Sat Nov 20 23:31:47 CET,0.0 0.997 1.385 1.716 1.965 2.215 2.431 2.598 2.872 2.993 3.109 3.119 3.433 3.535 3.727 3.916 4.091 4.169 4.332 4.493 4.703 4.839 4.977 5.173 5.363 5.543 5.702 5.854 6.056 6.243 6.419 6.63 6.819 6.988 7.19 7.425 7.652 7.907 8.174 8.455 8.76 9.091 9.441 9.78 10.147 10.521 10.925 11.324 11.716 12.066 12.24 11.995 11.559 11.141 10.736 10.318 9.923 9.537 9.192 8.836 8.544 8.287 8.023 7.767 7.524 7.3 7.051 6.84 6.669 6.467 6.26 6.098 5.918 5.728 5.575 5.414 5.248 5.083 4.912 4.791 4.676 4.497 4.352 4.182 4.098 3.928 3.74 3.555 3.468 3.163 3.178 3.08 2.975 2.716 2.573 2.413 2.242 2.061 1.823 1.518 0.961 -5 ,22615 ,TETRA ,17378093,Sat Nov 20 21:49:48 CET,Sat Nov 20 23:29:58 CET,0.0 0.987 1.324 1.638 1.882 2.08 2.262 2.421 2.703 2.835 2.965 2.995 3.315 3.411 3.602 3.787 3.96 4.041 4.195 4.355 4.588 4.719 4.847 5.036 5.216 5.38 5.541 5.712 5.916 6.099 6.28 6.5 6.701 6.886 7.097 7.332 7.567 7.825 8.081 8.345 8.63 8.955 9.325 9.661 10.017 10.412 10.797 11.133 11.494 11.838 12.01 11.762 11.349 10.94 10.542 10.151 9.79 9.443 9.124 8.791 8.504 8.245 7.986 7.723 7.46 7.231 6.998 6.791 6.624 6.432 6.211 6.043 5.87 5.677 5.525 5.372 5.225 5.073 4.901 4.769 4.625 4.422 4.283 4.13 4.061 3.922 3.762 3.586 3.49 3.181 3.197 3.096 2.986 2.701 2.544 2.376 2.196 2.021 1.793 1.473 0.724 -6 ,25526 ,TETRA ,17378095,Sat Nov 20 21:49:52 CET,Sat Nov 20 23:31:01 CET,0.0 0.922 1.285 1.533 1.747 1.935 2.128 2.302 2.58 2.706 2.817 2.799 3.114 3.223 3.441 3.635 3.812 3.901 4.081 4.25 4.456 4.595 4.735 4.927 5.112 5.276 5.423 5.575 5.778 5.965 6.133 6.337 6.537 6.739 6.965 7.202 7.433 7.677 7.936 8.215 8.482 8.769 9.088 9.414 9.816 10.231 10.627 11.001 11.403 11.759 11.949 11.78 11.396 10.952 10.515 10.094 9.7 9.329 9.013 8.681 8.375 8.112 7.866 7.605 7.355 7.135 6.901 6.686 6.497 6.307 6.095 5.918 5.74 5.551 5.402 5.244 5.077 4.89 4.697 4.571 4.438 4.23 4.086 3.936 3.858 3.702 3.547 3.372 3.283 2.987 3.01 2.905 2.795 2.548 2.399 2.228 2.05 1.854 1.639 1.356 0.65 -7 ,871 ,TETRA ,17378097,Sat Nov 20 21:49:51 CET,Sat Nov 20 23:31:37 CET,0.0 0.849 1.188 1.475 1.712 1.89 2.052 2.218 2.511 2.635 2.75 2.747 3.06 3.165 3.359 3.537 3.716 3.8 3.972 4.148 4.372 4.507 4.637 4.83 5.02 5.196 5.37 5.535 5.732 5.928 6.123 6.348 6.556 6.757 6.991 7.24 7.477 7.748 8.009 8.261 8.54 8.861 9.199 9.506 9.849 10.233 10.648 11.066 11.47 11.763 11.881 11.662 11.278 10.844 10.428 10.008 9.619 9.258 8.93 8.585 8.273 8.002 7.747 7.511 7.288 7.063 6.834 6.643 6.464 6.27 6.068 5.895 5.71 5.512 5.363 5.209 5.058 4.901 4.729 4.609 4.489 4.304 4.164 4.015 3.939 3.788 3.632 3.453 3.353 3.045 3.03 2.92 2.815 2.573 2.441 2.283 2.112 1.898 1.606 1.255 0.562 -8 ,4447 ,TETRA ,17378099,Sat Nov 20 21:49:54 CET,Sat Nov 20 23:31:10 CET,0.0 0.692 1.01 1.263 1.508 1.739 1.948 2.117 2.39 2.526 2.667 2.708 3.024 3.124 3.313 3.492 3.668 3.755 3.916 4.054 4.261 4.401 4.53 4.715 4.89 5.059 5.217 5.364 5.546 5.727 5.919 6.142 6.348 6.543 6.772 7.03 7.26 7.516 7.795 8.07 8.329 8.608 8.953 9.323 9.725 10.099 10.457 10.847 11.285 11.641 11.766 11.513 11.103 10.626 10.206 9.862 9.49 9.121 8.793 8.459 8.162 7.877 7.614 7.36 7.114 6.879 6.647 6.447 6.261 6.072 5.879 5.719 5.552 5.376 5.236 5.093 4.942 4.782 4.595 4.463 4.338 4.138 3.99 3.819 3.732 3.551 3.36 3.169 3.077 2.781 2.809 2.706 2.595 2.344 2.186 1.998 1.83 1.641 1.397 0.944 -0.407 -9 ,31988 ,TETRA ,17378100,Sat Nov 20 21:49:51 CET,Sat Nov 20 23:33:15 CET,0.0 0.69 1.024 1.256 1.455 1.62 1.775 1.932 2.22 2.356 2.473 2.472 2.788 2.892 3.077 3.249 3.411 3.496 3.651 3.789 3.989 4.116 4.241 4.433 4.625 4.799 4.969 5.125 5.321 5.521 5.696 5.902 6.107 6.305 6.521 6.762 6.994 7.224 7.473 7.733 7.999 8.32 8.687 9.006 9.348 9.723 10.154 10.562 10.904 11.18 11.284 10.963 10.512 10.063 9.629 9.214 8.841 8.482 8.149 7.82 7.539 7.275 7.011 6.754 6.519 6.294 6.053 5.851 5.672 5.467 5.252 5.069 4.873 4.68 4.537 4.38 4.204 4.027 3.863 3.75 3.631 3.439 3.304 3.173 3.1 2.942 2.773 2.589 2.493 2.19 2.196 2.085 1.97 1.726 1.59 1.437 1.279 1.112 0.856 0.494 -0.198 -10 ,20259 ,TETRA ,17378101,Sat Nov 20 21:49:54 CET,Sat Nov 20 23:33:16 CET,0.0 1.027 1.398 1.713 1.975 2.184 2.37 2.532 2.848 2.985 3.112 3.141 3.447 3.536 3.715 3.885 4.052 4.133 4.296 4.466 4.715 4.865 5.001 5.184 5.363 5.543 5.712 5.868 6.061 6.248 6.427 6.631 6.831 7.035 7.256 7.512 7.765 8.03 8.302 8.575 8.866 9.186 9.518 9.825 10.183 10.568 10.958 11.355 11.736 12.044 12.212 12.002 11.62 11.19 10.782 10.398 10.026 9.682 9.373 9.026 8.711 8.447 8.187 7.926 7.678 7.453 7.219 7.0 6.803 6.603 6.408 6.254 6.081 5.891 5.746 5.597 5.441 5.261 5.079 4.958 4.827 4.619 4.475 4.325 4.251 4.098 3.926 3.734 3.632 3.319 3.315 3.189 3.059 2.81 2.676 2.523 2.339 2.122 1.896 1.643 0.959 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6b.txt deleted file mode 100644 index ba026864..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2822 ,TETRA ,17378105,Sat Nov 20 21:49:57 CET,Sat Nov 20 23:31:17 CET,0.0 0.972 1.375 1.711 1.965 2.172 2.361 2.536 2.843 2.974 3.098 3.12 3.453 3.578 3.806 4.004 4.193 4.284 4.449 4.617 4.849 4.985 5.123 5.339 5.544 5.736 5.925 6.11 6.342 6.565 6.777 7.027 7.258 7.461 7.708 8.028 8.32 8.609 8.92 9.243 9.551 9.902 10.309 10.694 11.146 11.644 12.162 12.674 13.237 13.728 14.004 13.837 13.469 13.084 12.723 12.328 11.942 11.594 11.276 10.957 10.691 10.436 10.179 9.927 9.671 9.44 9.21 9.01 8.837 8.651 8.435 8.239 8.043 7.849 7.705 7.546 7.371 7.191 7.016 6.908 6.795 6.598 6.456 6.312 6.233 6.07 5.903 5.723 5.63 5.329 5.357 5.263 5.159 4.909 4.754 4.588 4.416 4.212 3.993 3.621 2.361 -2 ,31399 ,TETRA ,17378107,Sat Nov 20 21:49:56 CET,Sat Nov 20 23:31:25 CET,0.0 1.021 1.411 1.738 1.984 2.216 2.415 2.584 2.906 3.049 3.188 3.235 3.564 3.673 3.88 4.07 4.268 4.363 4.541 4.709 4.941 5.091 5.236 5.453 5.656 5.837 6.006 6.174 6.399 6.607 6.793 7.016 7.241 7.455 7.703 7.979 8.236 8.526 8.83 9.147 9.453 9.795 10.213 10.618 11.068 11.523 12.001 12.521 13.028 13.432 13.647 13.535 13.203 12.782 12.364 11.98 11.628 11.268 10.93 10.59 10.284 10.02 9.757 9.462 9.198 8.991 8.77 8.557 8.366 8.155 7.94 7.764 7.577 7.391 7.248 7.093 6.933 6.772 6.589 6.455 6.327 6.132 5.997 5.842 5.761 5.611 5.447 5.273 5.187 4.882 4.882 4.751 4.62 4.385 4.246 4.078 3.899 3.706 3.426 3.07 1.915 -3 ,18945 ,TETRA ,17378109,Sat Nov 20 21:50:24 CET,Sat Nov 20 23:31:35 CET,0.0 0.961 1.354 1.631 1.868 2.069 2.275 2.471 2.813 2.965 3.103 3.162 3.495 3.61 3.857 4.08 4.273 4.368 4.547 4.7 4.918 5.064 5.21 5.428 5.623 5.8 5.974 6.147 6.385 6.606 6.814 7.064 7.283 7.501 7.74 7.991 8.253 8.536 8.824 9.141 9.469 9.814 10.205 10.591 11.029 11.491 11.995 12.516 13.024 13.462 13.763 13.686 13.361 12.977 12.588 12.191 11.808 11.466 11.142 10.797 10.508 10.232 9.968 9.705 9.438 9.213 8.983 8.77 8.582 8.392 8.201 8.038 7.861 7.675 7.539 7.404 7.259 7.104 6.934 6.807 6.68 6.487 6.361 6.22 6.142 5.987 5.811 5.615 5.52 5.219 5.219 5.108 4.988 4.7 4.534 4.366 4.192 3.992 3.758 3.471 2.417 -4 ,20723 ,TETRA ,17378111,Sat Nov 20 21:50:24 CET,Sat Nov 20 23:31:33 CET,0.0 0.733 1.076 1.351 1.578 1.795 2.002 2.166 2.426 2.552 2.702 2.78 3.113 3.235 3.457 3.678 3.876 3.956 4.113 4.273 4.515 4.665 4.811 5.03 5.231 5.42 5.596 5.766 5.977 6.19 6.4 6.641 6.878 7.099 7.346 7.62 7.873 8.141 8.409 8.673 8.977 9.34 9.752 10.146 10.576 11.009 11.459 11.929 12.418 12.89 13.212 13.132 12.81 12.417 12.032 11.643 11.27 10.912 10.581 10.244 9.959 9.669 9.384 9.125 8.872 8.635 8.402 8.207 8.023 7.83 7.624 7.444 7.268 7.082 6.934 6.771 6.585 6.397 6.217 6.101 5.984 5.761 5.601 5.463 5.391 5.212 5.03 4.867 4.783 4.484 4.505 4.404 4.269 3.98 3.83 3.658 3.462 3.202 2.869 2.422 1.361 -5 ,11920 ,TETRA ,17378113,Sat Nov 20 21:50:24 CET,Sat Nov 20 23:32:59 CET,0.0 0.743 1.125 1.473 1.771 1.992 2.16 2.325 2.665 2.829 2.978 3.024 3.349 3.457 3.676 3.87 4.049 4.139 4.318 4.482 4.723 4.877 5.021 5.23 5.438 5.637 5.812 5.978 6.202 6.428 6.663 6.921 7.145 7.367 7.607 7.871 8.13 8.433 8.763 9.087 9.416 9.763 10.144 10.505 10.916 11.368 11.818 12.285 12.799 13.275 13.586 13.466 13.102 12.679 12.292 11.92 11.569 11.222 10.904 10.596 10.326 10.07 9.816 9.581 9.36 9.151 8.919 8.704 8.519 8.329 8.137 7.966 7.78 7.593 7.449 7.295 7.128 6.962 6.791 6.671 6.537 6.335 6.21 6.077 6.006 5.845 5.668 5.48 5.388 5.081 5.064 4.942 4.82 4.559 4.408 4.236 4.017 3.758 3.481 3.146 1.818 -6 ,9221 ,TETRA ,17378115,Sat Nov 20 21:50:24 CET,Sat Nov 20 23:31:46 CET,0.0 0.832 1.182 1.451 1.681 1.869 2.059 2.245 2.567 2.715 2.866 2.927 3.252 3.363 3.571 3.771 3.97 4.056 4.21 4.365 4.6 4.751 4.896 5.101 5.296 5.49 5.681 5.85 6.065 6.286 6.502 6.748 6.979 7.194 7.426 7.683 7.931 8.211 8.509 8.813 9.138 9.497 9.896 10.29 10.712 11.154 11.628 12.143 12.653 13.108 13.412 13.281 12.969 12.594 12.209 11.838 11.455 11.101 10.777 10.436 10.139 9.87 9.617 9.363 9.127 8.918 8.689 8.465 8.275 8.091 7.887 7.712 7.521 7.308 7.152 6.996 6.832 6.673 6.501 6.363 6.229 6.034 5.881 5.732 5.664 5.505 5.332 5.156 5.052 4.728 4.721 4.595 4.465 4.226 4.079 3.887 3.685 3.462 3.209 2.768 1.642 -7 ,22076 ,TETRA ,17378117,Sat Nov 20 21:50:24 CET,Sat Nov 20 23:31:47 CET,0.0 1.157 1.548 1.854 2.116 2.334 2.534 2.728 3.054 3.183 3.302 3.325 3.648 3.758 3.96 4.162 4.351 4.436 4.595 4.768 5.03 5.18 5.32 5.51 5.695 5.882 6.059 6.223 6.433 6.62 6.792 7.033 7.272 7.479 7.723 8.007 8.26 8.51 8.791 9.104 9.428 9.78 10.176 10.553 10.982 11.424 11.864 12.353 12.89 13.36 13.661 13.56 13.261 12.913 12.494 12.044 11.63 11.255 10.928 10.578 10.276 10.004 9.74 9.489 9.237 9.013 8.805 8.606 8.419 8.227 8.033 7.864 7.685 7.494 7.345 7.203 7.039 6.866 6.691 6.564 6.439 6.245 6.105 5.948 5.864 5.71 5.55 5.357 5.25 4.934 4.913 4.786 4.654 4.371 4.197 3.999 3.804 3.604 3.378 3.057 2.218 -8 ,11252 ,TETRA ,17378119,Sat Nov 20 21:50:24 CET,Sat Nov 20 23:32:35 CET,0.0 1.265 1.691 1.989 2.23 2.442 2.656 2.864 3.192 3.33 3.483 3.559 3.888 3.998 4.203 4.403 4.581 4.664 4.84 5.014 5.267 5.428 5.57 5.777 5.988 6.188 6.361 6.52 6.728 6.934 7.135 7.392 7.639 7.848 8.085 8.369 8.634 8.919 9.233 9.541 9.86 10.22 10.598 10.993 11.438 11.876 12.324 12.754 13.226 13.734 14.05 13.843 13.502 13.165 12.778 12.387 12.04 11.718 11.431 11.108 10.809 10.536 10.267 10.024 9.788 9.557 9.307 9.081 8.886 8.693 8.5 8.328 8.148 7.959 7.812 7.659 7.497 7.335 7.164 7.045 6.913 6.706 6.566 6.405 6.324 6.149 5.959 5.785 5.696 5.398 5.434 5.333 5.233 4.977 4.82 4.661 4.474 4.247 4.024 3.755 2.757 -9 ,4491 ,TETRA ,17378120,Sat Nov 20 21:50:24 CET,Sat Nov 20 23:32:36 CET,0.0 1.147 1.537 1.857 2.145 2.392 2.588 2.776 3.089 3.224 3.355 3.375 3.699 3.803 4.0 4.196 4.395 4.494 4.669 4.834 5.078 5.235 5.386 5.591 5.786 5.987 6.17 6.341 6.549 6.733 6.925 7.169 7.404 7.632 7.884 8.147 8.404 8.684 8.964 9.255 9.545 9.88 10.291 10.688 11.141 11.624 12.156 12.686 13.226 13.723 13.988 13.832 13.536 13.185 12.795 12.402 11.994 11.6 11.261 10.887 10.552 10.258 9.961 9.69 9.444 9.209 8.963 8.739 8.545 8.331 8.103 7.922 7.75 7.565 7.405 7.247 7.083 6.907 6.72 6.596 6.477 6.289 6.148 6.003 5.927 5.748 5.554 5.357 5.246 4.93 4.936 4.82 4.694 4.403 4.247 4.078 3.879 3.674 3.453 3.148 2.201 -10 ,11524 ,TETRA ,17378122,Sat Nov 20 21:50:24 CET,Sat Nov 20 23:31:38 CET,0.0 0.753 1.13 1.439 1.713 1.961 2.175 2.351 2.637 2.77 2.901 2.956 3.292 3.409 3.622 3.812 3.997 4.086 4.262 4.43 4.656 4.801 4.948 5.166 5.366 5.556 5.743 5.926 6.161 6.396 6.608 6.823 7.031 7.244 7.488 7.767 8.029 8.323 8.632 8.934 9.252 9.593 9.978 10.354 10.77 11.218 11.726 12.236 12.737 13.187 13.561 13.535 13.267 12.916 12.53 12.134 11.727 11.346 11.011 10.674 10.389 10.121 9.865 9.61 9.36 9.126 8.886 8.681 8.486 8.288 8.097 7.932 7.753 7.575 7.436 7.289 7.128 6.967 6.81 6.689 6.565 6.37 6.22 6.06 5.986 5.835 5.656 5.458 5.358 5.056 5.048 4.921 4.801 4.551 4.413 4.264 4.082 3.869 3.635 3.372 2.768 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_7a_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_7a_3a.txt deleted file mode 100644 index 32189881..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Thrombin/water/Summary_FEP_7a_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24955 ,TETRA ,17378125,Sat Nov 20 21:50:25 CET,Sat Nov 20 23:33:51 CET,0.0 0.341 0.525 0.659 0.792 0.934 1.063 1.175 1.383 1.485 1.579 1.512 1.797 1.875 2.02 2.161 2.301 2.366 2.495 2.614 2.774 2.873 2.97 3.11 3.243 3.377 3.501 3.634 3.815 3.978 4.138 4.333 4.526 4.713 4.939 5.177 5.392 5.651 5.937 6.224 6.512 6.839 7.21 7.565 7.972 8.402 8.872 9.34 9.816 10.296 10.666 10.592 10.286 9.94 9.566 9.177 8.805 8.417 8.06 7.703 7.39 7.102 6.812 6.554 6.298 6.056 5.793 5.552 5.366 5.168 4.958 4.769 4.567 4.371 4.219 4.049 3.863 3.68 3.5 3.372 3.227 2.977 2.816 2.653 2.565 2.392 2.21 2.003 1.886 1.543 1.471 1.346 1.223 0.949 0.804 0.644 0.473 0.264 -0.021 -0.404 -1.161 -2 ,21001 ,TETRA ,17378126,Sat Nov 20 21:50:26 CET,Sat Nov 20 23:33:27 CET,0.0 0.513 0.739 0.87 0.994 1.113 1.23 1.351 1.561 1.65 1.741 1.693 1.976 2.045 2.175 2.31 2.45 2.515 2.638 2.757 2.933 3.047 3.151 3.301 3.446 3.58 3.704 3.822 3.995 4.186 4.361 4.568 4.771 4.959 5.176 5.41 5.634 5.877 6.142 6.436 6.73 7.051 7.433 7.806 8.198 8.599 9.031 9.479 9.981 10.495 10.852 10.809 10.599 10.317 9.945 9.53 9.158 8.805 8.483 8.164 7.893 7.601 7.287 6.991 6.728 6.503 6.263 6.055 5.879 5.703 5.531 5.376 5.203 5.017 4.874 4.733 4.593 4.45 4.284 4.156 4.026 3.832 3.69 3.543 3.465 3.294 3.116 2.933 2.837 2.529 2.568 2.482 2.376 2.144 2.01 1.862 1.715 1.534 1.31 0.993 0.355 -3 ,5859 ,TETRA ,17378128,Sat Nov 20 21:50:26 CET,Sat Nov 20 23:32:27 CET,0.0 0.213 0.385 0.52 0.648 0.783 0.932 1.054 1.241 1.34 1.44 1.403 1.701 1.779 1.927 2.059 2.183 2.243 2.36 2.476 2.635 2.749 2.856 2.994 3.127 3.258 3.388 3.516 3.682 3.842 3.998 4.197 4.399 4.597 4.809 5.034 5.245 5.471 5.739 6.033 6.32 6.652 7.002 7.323 7.707 8.101 8.554 9.044 9.532 9.985 10.276 10.22 10.007 9.656 9.271 8.909 8.559 8.22 7.892 7.548 7.246 6.973 6.699 6.429 6.172 5.935 5.707 5.486 5.274 5.065 4.867 4.715 4.546 4.367 4.23 4.088 3.944 3.791 3.623 3.501 3.385 3.208 3.076 2.922 2.837 2.673 2.488 2.282 2.18 1.869 1.88 1.746 1.598 1.316 1.147 0.965 0.77 0.538 0.27 -0.086 -1.128 -4 ,1620 ,TETRA ,17378130,Sat Nov 20 21:50:29 CET,Sat Nov 20 23:32:16 CET,0.0 0.374 0.559 0.743 0.886 0.997 1.116 1.223 1.413 1.498 1.573 1.503 1.79 1.865 2.006 2.135 2.257 2.317 2.44 2.558 2.717 2.815 2.907 3.046 3.184 3.313 3.446 3.585 3.765 3.925 4.058 4.23 4.409 4.577 4.773 5.011 5.246 5.491 5.763 6.049 6.322 6.621 6.984 7.323 7.713 8.135 8.602 9.102 9.587 10.063 10.427 10.364 10.099 9.757 9.358 8.951 8.582 8.244 7.933 7.583 7.287 7.034 6.763 6.494 6.243 5.996 5.743 5.525 5.324 5.11 4.898 4.718 4.528 4.331 4.18 4.028 3.871 3.693 3.5 3.374 3.25 3.053 2.912 2.776 2.706 2.556 2.393 2.217 2.126 1.824 1.851 1.737 1.626 1.408 1.272 1.116 0.954 0.791 0.598 0.334 -0.438 -5 ,7797 ,TETRA ,17378132,Sat Nov 20 21:50:29 CET,Sat Nov 20 23:32:19 CET,0.0 0.531 0.754 0.936 1.06 1.167 1.286 1.397 1.585 1.671 1.763 1.719 2.013 2.088 2.242 2.376 2.513 2.583 2.701 2.808 2.976 3.089 3.19 3.335 3.482 3.625 3.753 3.888 4.065 4.224 4.378 4.572 4.765 4.948 5.168 5.423 5.663 5.917 6.19 6.462 6.752 7.076 7.428 7.762 8.142 8.556 9.024 9.521 10.004 10.454 10.785 10.74 10.409 10.005 9.635 9.251 8.883 8.523 8.193 7.848 7.521 7.24 6.959 6.667 6.401 6.157 5.901 5.675 5.483 5.283 5.074 4.887 4.695 4.515 4.37 4.218 4.059 3.886 3.709 3.583 3.466 3.29 3.149 2.999 2.919 2.758 2.599 2.418 2.325 2.022 2.036 1.931 1.812 1.563 1.436 1.285 1.106 0.926 0.695 0.362 -0.527 -6 ,21459 ,TETRA ,17378135,Sat Nov 20 21:50:28 CET,Sat Nov 20 23:32:32 CET,0.0 0.491 0.696 0.844 0.969 1.092 1.207 1.324 1.538 1.635 1.722 1.656 1.941 2.007 2.14 2.283 2.424 2.484 2.607 2.733 2.897 3.006 3.116 3.279 3.447 3.618 3.783 3.932 4.109 4.285 4.459 4.659 4.847 5.036 5.27 5.513 5.738 5.995 6.254 6.528 6.817 7.135 7.489 7.836 8.262 8.71 9.156 9.604 10.101 10.612 10.936 10.845 10.587 10.255 9.829 9.383 9.01 8.65 8.326 7.99 7.693 7.436 7.185 6.956 6.743 6.522 6.294 6.097 5.914 5.736 5.551 5.387 5.206 4.994 4.842 4.706 4.553 4.376 4.187 4.064 3.932 3.711 3.572 3.439 3.37 3.226 3.064 2.891 2.798 2.49 2.512 2.404 2.297 2.082 1.968 1.83 1.678 1.516 1.296 1.05 0.446 -7 ,32246 ,TETRA ,17378138,Sat Nov 20 21:50:30 CET,Sat Nov 20 23:33:10 CET,0.0 0.37 0.586 0.72 0.823 0.923 1.025 1.134 1.34 1.424 1.504 1.47 1.771 1.848 1.988 2.124 2.265 2.335 2.46 2.584 2.756 2.857 2.958 3.129 3.291 3.438 3.575 3.716 3.907 4.073 4.231 4.428 4.626 4.816 5.023 5.271 5.506 5.759 6.033 6.32 6.631 6.947 7.277 7.623 8.024 8.437 8.867 9.32 9.814 10.313 10.69 10.645 10.374 9.991 9.584 9.167 8.798 8.453 8.123 7.772 7.462 7.173 6.888 6.625 6.373 6.133 5.888 5.668 5.465 5.248 5.032 4.856 4.664 4.463 4.311 4.142 3.959 3.777 3.59 3.456 3.312 3.076 2.905 2.731 2.644 2.455 2.262 2.062 1.957 1.634 1.598 1.475 1.353 1.049 0.873 0.696 0.51 0.295 0.016 -0.399 -1.481 -8 ,28645 ,TETRA ,17378139,Sat Nov 20 21:50:59 CET,Sat Nov 20 23:34:06 CET,0.0 0.29 0.484 0.655 0.81 0.947 1.063 1.176 1.371 1.456 1.544 1.497 1.793 1.871 2.002 2.123 2.245 2.301 2.41 2.525 2.689 2.796 2.901 3.059 3.216 3.355 3.486 3.618 3.783 3.941 4.082 4.248 4.418 4.586 4.788 5.024 5.243 5.468 5.714 5.963 6.206 6.477 6.817 7.165 7.539 7.944 8.407 8.894 9.44 9.972 10.293 10.307 10.08 9.745 9.379 8.972 8.569 8.173 7.822 7.446 7.1 6.814 6.558 6.303 6.067 5.853 5.607 5.375 5.178 4.982 4.78 4.619 4.462 4.295 4.16 4.033 3.903 3.754 3.592 3.479 3.364 3.182 3.05 2.903 2.828 2.679 2.519 2.345 2.259 1.956 1.944 1.829 1.715 1.423 1.257 1.106 0.954 0.772 0.544 0.256 -0.529 -9 ,5464 ,TETRA ,17378140,Sat Nov 20 21:51:00 CET,Sat Nov 20 23:34:32 CET,0.0 0.461 0.684 0.858 0.982 1.09 1.2 1.31 1.496 1.58 1.663 1.603 1.884 1.947 2.08 2.208 2.331 2.389 2.503 2.611 2.772 2.88 2.984 3.127 3.269 3.406 3.538 3.664 3.835 4.006 4.153 4.331 4.515 4.707 4.935 5.172 5.394 5.626 5.869 6.144 6.438 6.756 7.135 7.509 7.906 8.309 8.751 9.199 9.688 10.202 10.551 10.48 10.246 9.908 9.525 9.145 8.773 8.408 8.064 7.713 7.412 7.118 6.817 6.541 6.282 6.029 5.77 5.537 5.322 5.101 4.859 4.656 4.469 4.285 4.149 3.999 3.835 3.671 3.504 3.386 3.263 3.069 2.921 2.762 2.688 2.545 2.382 2.208 2.114 1.806 1.809 1.697 1.581 1.315 1.164 0.989 0.797 0.59 0.372 0.066 -0.748 -10 ,18787 ,TETRA ,17378142,Sat Nov 20 21:51:00 CET,Sat Nov 20 23:34:01 CET,0.0 0.407 0.635 0.842 1.008 1.156 1.27 1.363 1.543 1.645 1.731 1.672 1.967 2.043 2.193 2.333 2.475 2.545 2.684 2.806 2.971 3.082 3.186 3.331 3.463 3.602 3.738 3.859 4.019 4.192 4.363 4.547 4.742 4.941 5.167 5.418 5.657 5.904 6.146 6.398 6.684 7.012 7.364 7.709 8.103 8.539 8.993 9.443 9.944 10.427 10.734 10.643 10.367 10.043 9.704 9.321 8.93 8.58 8.257 7.894 7.58 7.295 7.031 6.787 6.531 6.282 6.019 5.787 5.593 5.372 5.134 4.947 4.759 4.569 4.407 4.229 4.049 3.874 3.697 3.578 3.458 3.265 3.124 2.979 2.901 2.743 2.572 2.386 2.295 1.983 1.991 1.883 1.76 1.486 1.34 1.192 1.049 0.887 0.661 0.323 -0.362 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 63f46d5e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11905 ,KEBNE ,17017825,Tue Dec 21 21:50:02 CET,Tue Dec 21 23:25:29 CET,0.0 0.417 0.683 0.89 1.074 1.231 1.384 1.548 1.851 1.98 2.105 2.233 2.459 2.569 2.788 2.997 3.192 3.29 3.494 3.683 3.936 4.098 4.25 4.473 4.685 4.895 5.098 5.296 5.551 5.785 6.002 6.268 6.528 6.779 7.064 7.38 7.671 7.993 8.347 8.711 9.079 9.479 9.918 10.351 10.863 11.389 11.941 12.483 13.008 13.555 13.995 13.933 13.531 13.032 12.535 12.046 11.58 11.127 10.702 10.235 9.826 9.454 9.094 8.751 8.423 8.117 7.803 7.524 7.276 7.004 6.703 6.461 6.224 5.971 5.764 5.538 5.298 5.059 4.825 4.655 4.473 4.193 3.995 3.783 3.671 3.443 3.212 2.975 2.857 2.624 2.461 2.313 2.169 1.856 1.67 1.464 1.245 1.016 0.754 0.391 -0.398 -3 ,30656 ,KEBNE ,17017827,Tue Dec 21 21:50:02 CET,Tue Dec 21 23:26:41 CET,0.0 0.382 0.645 0.854 1.049 1.238 1.417 1.587 1.898 2.042 2.183 2.323 2.555 2.667 2.885 3.095 3.294 3.394 3.59 3.775 4.047 4.22 4.378 4.604 4.827 5.047 5.255 5.45 5.693 5.919 6.134 6.413 6.676 6.919 7.198 7.523 7.835 8.171 8.533 8.9 9.282 9.692 10.16 10.596 11.064 11.575 12.151 12.754 13.341 13.853 14.162 14.013 13.604 13.159 12.679 12.163 11.66 11.16 10.726 10.282 9.869 9.503 9.167 8.845 8.524 8.218 7.897 7.601 7.339 7.075 6.799 6.561 6.31 6.042 5.84 5.642 5.43 5.195 4.947 4.785 4.624 4.345 4.141 3.935 3.826 3.595 3.365 3.126 2.999 2.76 2.598 2.448 2.291 1.959 1.785 1.603 1.392 1.147 0.881 0.558 -0.026 -4 ,17185 ,KEBNE ,17017828,Tue Dec 21 21:51:03 CET,Tue Dec 21 23:29:33 CET,0.0 0.423 0.676 0.905 1.109 1.29 1.459 1.619 1.905 2.038 2.176 2.339 2.579 2.701 2.924 3.132 3.336 3.432 3.618 3.8 4.067 4.236 4.398 4.638 4.864 5.078 5.275 5.467 5.714 5.941 6.16 6.43 6.681 6.916 7.194 7.507 7.796 8.103 8.441 8.8 9.164 9.577 10.05 10.491 10.988 11.527 12.119 12.697 13.278 13.824 14.129 14.015 13.642 13.163 12.647 12.12 11.582 11.065 10.633 10.164 9.735 9.361 9.016 8.671 8.332 8.017 7.694 7.409 7.151 6.884 6.608 6.368 6.084 5.77 5.528 5.272 5.019 4.745 4.442 4.251 4.066 3.754 3.522 3.273 3.153 2.916 2.648 2.345 2.187 1.913 1.698 1.536 1.364 0.981 0.762 0.537 0.294 0.037 -0.233 -0.557 -1.294 -5 ,28094 ,KEBNE ,17017829,Tue Dec 21 21:51:03 CET,Tue Dec 21 23:26:53 CET,0.0 0.493 0.763 1.006 1.221 1.418 1.604 1.771 2.061 2.195 2.335 2.496 2.736 2.856 3.078 3.284 3.49 3.59 3.772 3.945 4.192 4.356 4.513 4.738 4.97 5.201 5.424 5.636 5.893 6.141 6.376 6.654 6.921 7.177 7.475 7.795 8.097 8.436 8.8 9.174 9.549 9.941 10.382 10.836 11.365 11.919 12.507 13.119 13.747 14.301 14.634 14.517 14.13 13.615 13.063 12.494 11.976 11.488 11.036 10.591 10.178 9.777 9.394 9.007 8.625 8.293 7.941 7.605 7.31 7.01 6.694 6.419 6.125 5.824 5.605 5.364 5.091 4.819 4.538 4.335 4.126 3.798 3.574 3.352 3.244 3.008 2.742 2.483 2.342 2.073 1.858 1.685 1.512 1.157 0.959 0.756 0.55 0.307 0.02 -0.346 -1.05 -6 ,1022 ,KEBNE ,17017830,Tue Dec 21 21:52:05 CET,Tue Dec 21 23:29:44 CET,0.0 0.796 1.076 1.286 1.478 1.664 1.849 2.02 2.325 2.463 2.598 2.736 2.967 3.085 3.3 3.497 3.694 3.791 3.973 4.151 4.393 4.549 4.71 4.936 5.15 5.365 5.57 5.756 5.99 6.215 6.442 6.722 6.978 7.214 7.496 7.81 8.108 8.447 8.806 9.159 9.513 9.907 10.372 10.819 11.312 11.818 12.358 12.916 13.467 13.98 14.303 14.171 13.748 13.243 12.766 12.272 11.8 11.339 10.906 10.459 10.053 9.664 9.294 8.95 8.598 8.261 7.903 7.591 7.327 7.027 6.721 6.474 6.19 5.881 5.651 5.408 5.154 4.89 4.614 4.437 4.25 3.938 3.72 3.502 3.395 3.174 2.93 2.662 2.518 2.268 2.102 1.951 1.789 1.439 1.245 1.049 0.827 0.575 0.295 -0.086 -1.158 -7 ,2039 ,KEBNE ,17017831,Tue Dec 21 21:52:05 CET,Tue Dec 21 23:28:19 CET,0.0 0.382 0.658 0.915 1.145 1.324 1.496 1.665 1.979 2.13 2.274 2.432 2.669 2.785 3.016 3.238 3.452 3.551 3.738 3.924 4.195 4.364 4.528 4.781 5.023 5.25 5.463 5.66 5.916 6.166 6.402 6.682 6.946 7.201 7.492 7.793 8.085 8.404 8.738 9.091 9.439 9.828 10.298 10.75 11.25 11.805 12.367 12.93 13.513 14.046 14.378 14.214 13.822 13.362 12.903 12.405 11.918 11.438 10.99 10.528 10.146 9.798 9.438 9.083 8.718 8.361 7.99 7.663 7.36 7.055 6.744 6.475 6.186 5.884 5.643 5.381 5.107 4.813 4.507 4.305 4.103 3.776 3.524 3.257 3.131 2.875 2.595 2.286 2.121 1.841 1.621 1.455 1.287 0.915 0.688 0.46 0.249 -0.001 -0.314 -0.674 -1.329 -8 ,2409 ,KEBNE ,17017832,Tue Dec 21 21:53:06 CET,Tue Dec 21 23:30:19 CET,0.0 0.506 0.762 0.987 1.183 1.367 1.544 1.711 2.014 2.153 2.295 2.448 2.686 2.809 3.035 3.244 3.435 3.529 3.722 3.9 4.143 4.309 4.472 4.698 4.915 5.119 5.314 5.504 5.745 5.968 6.182 6.455 6.717 6.959 7.229 7.535 7.832 8.149 8.486 8.84 9.213 9.627 10.078 10.503 10.975 11.502 12.069 12.654 13.269 13.79 14.162 14.071 13.641 13.125 12.604 12.114 11.668 11.234 10.819 10.379 9.999 9.641 9.294 8.954 8.633 8.342 8.002 7.693 7.44 7.166 6.867 6.628 6.385 6.117 5.904 5.682 5.456 5.233 4.984 4.807 4.625 4.331 4.135 3.937 3.829 3.611 3.382 3.118 2.981 2.738 2.577 2.44 2.285 1.945 1.761 1.552 1.334 1.104 0.842 0.481 -0.428 -9 ,17866 ,KEBNE ,17017833,Tue Dec 21 21:53:06 CET,Tue Dec 21 23:30:38 CET,0.0 0.366 0.616 0.839 1.039 1.213 1.372 1.526 1.809 1.946 2.087 2.239 2.471 2.597 2.829 3.039 3.248 3.348 3.535 3.727 4.009 4.192 4.377 4.637 4.885 5.116 5.333 5.558 5.845 6.107 6.361 6.657 6.94 7.199 7.475 7.771 8.053 8.354 8.671 9.024 9.386 9.767 10.208 10.655 11.15 11.664 12.198 12.779 13.396 13.934 14.249 14.078 13.664 13.174 12.659 12.095 11.566 11.107 10.677 10.213 9.799 9.426 9.073 8.725 8.403 8.114 7.8 7.506 7.237 6.962 6.687 6.437 6.171 5.908 5.699 5.482 5.253 5.013 4.771 4.601 4.414 4.116 3.911 3.694 3.585 3.357 3.113 2.851 2.706 2.453 2.302 2.159 1.99 1.646 1.467 1.266 1.039 0.778 0.49 0.172 -0.634 -10 ,29298 ,KEBNE ,17017834,Tue Dec 21 21:54:08 CET,Tue Dec 21 23:31:45 CET,0.0 0.379 0.653 0.886 1.089 1.287 1.47 1.636 1.945 2.083 2.211 2.341 2.572 2.68 2.9 3.118 3.321 3.411 3.581 3.755 3.997 4.151 4.309 4.54 4.756 4.961 5.16 5.358 5.616 5.858 6.083 6.35 6.607 6.853 7.147 7.475 7.764 8.072 8.429 8.805 9.166 9.556 10.002 10.406 10.855 11.355 11.889 12.427 12.934 13.421 13.749 13.603 13.246 12.823 12.354 11.849 11.397 10.956 10.516 10.051 9.645 9.295 8.935 8.581 8.257 7.957 7.632 7.332 7.065 6.783 6.491 6.24 5.977 5.698 5.482 5.264 5.041 4.812 4.573 4.402 4.217 3.918 3.715 3.504 3.395 3.177 2.941 2.69 2.554 2.303 2.123 1.961 1.803 1.51 1.326 1.112 0.883 0.612 0.316 -0.011 -0.927 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index cbdebd81..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15497 ,KEBNE ,17017835,Tue Dec 21 21:54:08 CET,Tue Dec 21 23:30:13 CET,0.0 0.207 0.401 0.608 0.791 0.967 1.141 1.294 1.576 1.714 1.84 1.961 2.183 2.294 2.511 2.718 2.918 3.015 3.193 3.363 3.619 3.789 3.959 4.203 4.42 4.622 4.817 4.999 5.231 5.453 5.668 5.925 6.179 6.438 6.721 7.011 7.281 7.57 7.898 8.235 8.566 8.934 9.333 9.7 10.124 10.555 10.975 11.363 11.677 11.803 11.473 10.693 9.881 9.082 8.331 7.64 7.009 6.383 5.812 5.242 4.749 4.301 3.872 3.445 3.036 2.68 2.302 1.959 1.667 1.373 1.064 0.799 0.521 0.23 0.008 -0.219 -0.457 -0.717 -0.979 -1.158 -1.355 -1.662 -1.873 -2.093 -2.205 -2.438 -2.682 -2.935 -3.071 -3.325 -3.505 -3.67 -3.847 -4.215 -4.407 -4.604 -4.809 -5.038 -5.284 -5.544 -6.106 -2 ,23302 ,KEBNE ,17017836,Tue Dec 21 21:54:08 CET,Tue Dec 21 23:30:28 CET,0.0 0.362 0.588 0.779 0.945 1.102 1.247 1.399 1.691 1.821 1.94 2.042 2.26 2.361 2.553 2.734 2.912 3.002 3.178 3.349 3.594 3.744 3.893 4.101 4.292 4.48 4.655 4.824 5.046 5.262 5.466 5.697 5.927 6.151 6.4 6.669 6.92 7.189 7.483 7.793 8.108 8.443 8.83 9.215 9.616 9.996 10.376 10.742 11.046 11.244 11.092 10.441 9.729 9.022 8.343 7.695 7.082 6.494 5.944 5.375 4.892 4.432 3.982 3.564 3.157 2.763 2.325 1.951 1.643 1.327 1.014 0.747 0.454 0.151 -0.083 -0.326 -0.573 -0.836 -1.117 -1.305 -1.493 -1.8 -2.024 -2.259 -2.375 -2.612 -2.869 -3.125 -3.249 -3.5 -3.715 -3.886 -4.06 -4.432 -4.628 -4.844 -5.076 -5.31 -5.585 -5.926 -6.86 -3 ,7567 ,KEBNE ,17017837,Tue Dec 21 21:54:08 CET,Tue Dec 21 23:31:15 CET,0.0 0.266 0.479 0.665 0.851 1.015 1.167 1.323 1.621 1.758 1.893 2.044 2.276 2.387 2.595 2.8 2.997 3.091 3.277 3.462 3.725 3.883 4.036 4.25 4.46 4.671 4.87 5.056 5.297 5.539 5.78 6.047 6.288 6.54 6.823 7.113 7.386 7.677 7.979 8.293 8.604 8.924 9.29 9.628 9.971 10.32 10.684 11.053 11.351 11.48 11.298 10.645 9.86 9.114 8.427 7.749 7.108 6.537 6.044 5.546 5.11 4.682 4.269 3.907 3.563 3.228 2.875 2.553 2.259 1.946 1.618 1.341 1.058 0.77 0.547 0.326 0.098 -0.144 -0.401 -0.586 -0.773 -1.06 -1.259 -1.46 -1.567 -1.786 -2.007 -2.25 -2.382 -2.63 -2.777 -2.916 -3.067 -3.411 -3.601 -3.788 -3.988 -4.215 -4.496 -4.866 -5.584 -4 ,22850 ,KEBNE ,17017838,Tue Dec 21 21:54:08 CET,Tue Dec 21 23:30:06 CET,0.0 0.383 0.652 0.863 1.04 1.206 1.354 1.492 1.752 1.874 1.99 2.107 2.323 2.422 2.633 2.838 3.02 3.112 3.286 3.439 3.67 3.82 3.964 4.181 4.39 4.585 4.762 4.934 5.151 5.348 5.537 5.753 5.972 6.19 6.441 6.717 6.982 7.271 7.558 7.855 8.148 8.468 8.838 9.192 9.571 9.96 10.341 10.667 10.933 11.084 10.918 10.284 9.498 8.675 7.898 7.161 6.518 5.917 5.354 4.791 4.322 3.893 3.464 3.065 2.696 2.357 2.008 1.688 1.403 1.108 0.798 0.547 0.285 0.007 -0.217 -0.453 -0.694 -0.947 -1.213 -1.398 -1.582 -1.855 -2.056 -2.275 -2.389 -2.617 -2.85 -3.108 -3.249 -3.507 -3.678 -3.835 -3.991 -4.318 -4.487 -4.676 -4.912 -5.157 -5.439 -5.764 -6.303 -5 ,2607 ,KEBNE ,17017839,Tue Dec 21 21:54:08 CET,Tue Dec 21 23:31:40 CET,0.0 0.513 0.775 1.019 1.243 1.43 1.588 1.732 1.992 2.117 2.245 2.385 2.609 2.714 2.917 3.121 3.311 3.398 3.577 3.752 3.975 4.119 4.265 4.471 4.674 4.87 5.055 5.222 5.44 5.665 5.875 6.121 6.35 6.568 6.813 7.082 7.332 7.604 7.902 8.201 8.502 8.83 9.198 9.537 9.894 10.261 10.647 11.005 11.323 11.488 11.238 10.524 9.785 9.042 8.299 7.597 6.947 6.333 5.793 5.263 4.805 4.368 3.937 3.529 3.152 2.805 2.441 2.113 1.822 1.513 1.198 0.944 0.684 0.408 0.189 -0.043 -0.279 -0.514 -0.779 -0.971 -1.16 -1.453 -1.663 -1.89 -2.007 -2.238 -2.473 -2.716 -2.84 -3.082 -3.245 -3.386 -3.531 -3.872 -4.062 -4.279 -4.517 -4.774 -5.063 -5.396 -6.118 -6 ,19713 ,KEBNE ,17017840,Tue Dec 21 21:54:10 CET,Tue Dec 21 23:28:00 CET,0.0 0.45 0.708 0.913 1.078 1.23 1.391 1.537 1.796 1.92 2.039 2.155 2.372 2.469 2.659 2.84 3.01 3.094 3.252 3.41 3.659 3.819 3.969 4.18 4.384 4.579 4.765 4.958 5.216 5.454 5.674 5.937 6.182 6.42 6.699 6.989 7.255 7.546 7.854 8.175 8.493 8.845 9.23 9.579 9.968 10.363 10.773 11.131 11.418 11.591 11.439 10.792 10.056 9.345 8.621 7.905 7.271 6.7 6.161 5.564 5.056 4.611 4.161 3.723 3.344 2.997 2.619 2.267 1.958 1.652 1.339 1.082 0.809 0.509 0.278 0.05 -0.191 -0.435 -0.681 -0.852 -1.026 -1.299 -1.493 -1.697 -1.806 -2.036 -2.287 -2.549 -2.686 -2.946 -3.131 -3.29 -3.45 -3.772 -3.956 -4.161 -4.377 -4.608 -4.846 -5.14 -5.684 -7 ,5154 ,KEBNE ,17017841,Tue Dec 21 21:54:08 CET,Tue Dec 21 23:31:01 CET,0.0 0.347 0.592 0.787 0.958 1.112 1.263 1.4 1.682 1.827 1.96 2.094 2.318 2.421 2.618 2.803 2.984 3.073 3.25 3.425 3.658 3.801 3.951 4.165 4.356 4.535 4.707 4.874 5.08 5.284 5.487 5.73 5.959 6.18 6.441 6.73 7.005 7.311 7.619 7.931 8.256 8.602 8.982 9.353 9.776 10.198 10.579 10.918 11.218 11.356 11.121 10.445 9.656 8.872 8.142 7.429 6.778 6.192 5.669 5.128 4.653 4.21 3.77 3.351 2.957 2.608 2.258 1.944 1.678 1.395 1.092 0.835 0.549 0.243 0.008 -0.233 -0.477 -0.729 -0.994 -1.181 -1.377 -1.679 -1.888 -2.098 -2.202 -2.413 -2.63 -2.871 -2.997 -3.245 -3.419 -3.565 -3.732 -4.108 -4.306 -4.531 -4.755 -4.964 -5.196 -5.498 -6.466 -8 ,12817 ,KEBNE ,17017842,Tue Dec 21 21:54:08 CET,Tue Dec 21 23:30:09 CET,0.0 0.268 0.458 0.637 0.813 0.968 1.109 1.244 1.504 1.625 1.739 1.841 2.05 2.152 2.347 2.533 2.713 2.803 2.973 3.132 3.365 3.509 3.654 3.86 4.049 4.234 4.417 4.597 4.826 5.04 5.239 5.48 5.712 5.932 6.188 6.47 6.74 7.023 7.318 7.622 7.927 8.24 8.574 8.903 9.283 9.672 10.059 10.429 10.734 10.844 10.552 9.781 8.971 8.203 7.434 6.718 6.095 5.512 5.014 4.494 4.023 3.6 3.17 2.752 2.37 2.013 1.644 1.319 1.035 0.739 0.421 0.15 -0.13 -0.412 -0.622 -0.848 -1.089 -1.34 -1.61 -1.802 -1.996 -2.288 -2.495 -2.706 -2.81 -3.038 -3.278 -3.521 -3.648 -3.892 -4.056 -4.213 -4.369 -4.712 -4.907 -5.13 -5.377 -5.628 -5.91 -6.29 -7.281 -9 ,9714 ,KEBNE ,17017843,Tue Dec 21 21:54:08 CET,Tue Dec 21 23:31:53 CET,0.0 0.291 0.538 0.738 0.891 1.034 1.193 1.347 1.611 1.732 1.849 1.968 2.189 2.294 2.497 2.695 2.88 2.967 3.132 3.289 3.532 3.686 3.837 4.048 4.247 4.443 4.626 4.793 5.007 5.225 5.427 5.659 5.884 6.093 6.325 6.586 6.841 7.116 7.399 7.699 8.021 8.364 8.728 9.086 9.476 9.836 10.173 10.486 10.775 10.927 10.631 9.851 9.034 8.286 7.58 6.904 6.289 5.689 5.139 4.583 4.098 3.679 3.284 2.895 2.536 2.2 1.819 1.477 1.186 0.89 0.587 0.338 0.081 -0.196 -0.413 -0.639 -0.879 -1.121 -1.371 -1.547 -1.723 -2.005 -2.216 -2.436 -2.544 -2.757 -2.991 -3.242 -3.365 -3.606 -3.764 -3.914 -4.068 -4.391 -4.565 -4.749 -4.947 -5.162 -5.428 -5.754 -6.436 -10 ,30664 ,KEBNE ,17017844,Tue Dec 21 21:55:09 CET,Tue Dec 21 23:32:09 CET,0.0 0.403 0.648 0.843 1.031 1.216 1.391 1.551 1.827 1.951 2.077 2.223 2.456 2.571 2.783 2.973 3.161 3.253 3.43 3.604 3.854 4.014 4.174 4.395 4.594 4.789 4.976 5.16 5.397 5.618 5.827 6.065 6.282 6.495 6.747 7.023 7.284 7.558 7.83 8.119 8.408 8.73 9.13 9.488 9.869 10.251 10.588 10.925 11.227 11.329 11.03 10.348 9.601 8.86 8.128 7.421 6.81 6.239 5.707 5.146 4.641 4.194 3.779 3.386 3.012 2.675 2.32 1.986 1.692 1.382 1.049 0.773 0.496 0.189 -0.054 -0.291 -0.53 -0.777 -1.033 -1.209 -1.396 -1.701 -1.911 -2.121 -2.232 -2.48 -2.743 -3.012 -3.164 -3.434 -3.606 -3.748 -3.892 -4.209 -4.4 -4.609 -4.834 -5.068 -5.316 -5.599 -6.074 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index f5047426..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21129 ,KEBNE ,17017845,Tue Dec 21 21:55:09 CET,Tue Dec 21 23:31:06 CET,0.0 0.363 0.582 0.781 0.988 1.179 1.341 1.507 1.814 1.945 2.089 2.273 2.513 2.632 2.87 3.088 3.304 3.408 3.615 3.823 4.112 4.287 4.457 4.709 4.946 5.178 5.405 5.63 5.91 6.17 6.423 6.713 6.991 7.259 7.568 7.933 8.292 8.676 9.079 9.513 9.987 10.494 11.053 11.606 12.22 12.87 13.573 14.304 15.038 15.713 16.282 16.423 16.227 15.868 15.427 14.928 14.444 13.942 13.465 12.993 12.552 12.126 11.707 11.265 10.825 10.453 10.077 9.7 9.375 9.055 8.71 8.401 8.068 7.731 7.466 7.19 6.91 6.625 6.317 6.097 5.87 5.528 5.29 5.022 4.882 4.605 4.323 4.014 3.855 3.584 3.349 3.164 2.958 2.457 2.163 1.85 1.525 1.18 0.777 0.252 -1.296 -2 ,18807 ,KEBNE ,17017846,Tue Dec 21 21:56:11 CET,Tue Dec 21 23:33:17 CET,0.0 0.587 0.922 1.15 1.358 1.543 1.719 1.886 2.165 2.298 2.437 2.582 2.821 2.947 3.191 3.427 3.648 3.748 3.941 4.13 4.395 4.563 4.735 4.985 5.22 5.446 5.661 5.865 6.128 6.39 6.636 6.924 7.201 7.464 7.77 8.113 8.434 8.78 9.143 9.518 9.912 10.34 10.832 11.327 11.883 12.488 13.19 13.956 14.745 15.481 16.091 16.247 16.082 15.763 15.328 14.911 14.5 14.037 13.644 13.255 12.897 12.56 12.224 11.888 11.561 11.246 10.911 10.609 10.329 10.034 9.708 9.434 9.162 8.874 8.654 8.432 8.205 7.948 7.664 7.46 7.244 6.913 6.699 6.492 6.383 6.16 5.919 5.657 5.524 5.277 5.074 4.91 4.738 4.325 4.113 3.905 3.659 3.397 3.07 2.627 1.893 -3 ,647 ,KEBNE ,17017847,Tue Dec 21 21:56:11 CET,Tue Dec 21 23:31:39 CET,0.0 0.363 0.601 0.814 1.017 1.212 1.39 1.555 1.865 2.013 2.153 2.3 2.532 2.65 2.874 3.082 3.284 3.383 3.575 3.759 4.03 4.202 4.358 4.585 4.808 5.024 5.236 5.446 5.718 5.973 6.206 6.487 6.765 7.027 7.319 7.653 7.979 8.33 8.685 9.054 9.442 9.878 10.381 10.871 11.41 11.991 12.654 13.333 14.046 14.828 15.481 15.618 15.331 14.915 14.459 13.994 13.587 13.173 12.763 12.32 11.939 11.577 11.206 10.834 10.471 10.117 9.756 9.444 9.156 8.856 8.571 8.322 8.049 7.771 7.537 7.279 7.019 6.762 6.48 6.267 6.033 5.693 5.457 5.183 5.046 4.784 4.514 4.232 4.089 3.831 3.638 3.467 3.265 2.817 2.58 2.306 1.989 1.669 1.308 0.87 -0.289 -4 ,23679 ,KEBNE ,17017848,Tue Dec 21 21:56:11 CET,Tue Dec 21 23:33:19 CET,0.0 0.454 0.706 0.921 1.117 1.299 1.477 1.641 1.92 2.058 2.197 2.336 2.57 2.686 2.902 3.107 3.303 3.401 3.595 3.78 4.041 4.2 4.356 4.59 4.813 5.02 5.218 5.42 5.687 5.951 6.204 6.491 6.769 7.035 7.33 7.66 7.979 8.322 8.687 9.071 9.47 9.909 10.414 10.899 11.437 12.031 12.675 13.31 14.026 14.755 15.281 15.314 15.034 14.637 14.211 13.771 13.345 12.932 12.525 12.081 11.654 11.267 10.901 10.535 10.193 9.874 9.527 9.22 8.937 8.628 8.306 8.023 7.74 7.445 7.195 6.939 6.657 6.366 6.088 5.887 5.669 5.328 5.107 4.866 4.742 4.498 4.229 3.921 3.747 3.465 3.198 2.971 2.75 2.291 2.034 1.76 1.471 1.16 0.747 0.173 -1.555 -5 ,27161 ,KEBNE ,17017849,Tue Dec 21 21:56:11 CET,Tue Dec 21 23:33:21 CET,0.0 0.345 0.651 0.913 1.111 1.29 1.474 1.657 1.985 2.128 2.265 2.403 2.636 2.767 3.026 3.26 3.471 3.572 3.772 3.97 4.267 4.456 4.633 4.886 5.13 5.37 5.598 5.813 6.101 6.391 6.664 6.976 7.292 7.598 7.923 8.279 8.62 8.99 9.384 9.785 10.209 10.675 11.189 11.72 12.333 12.973 13.679 14.407 15.157 15.911 16.528 16.685 16.459 16.067 15.608 15.109 14.637 14.159 13.712 13.246 12.83 12.461 12.08 11.671 11.289 10.953 10.583 10.258 9.976 9.645 9.277 8.961 8.648 8.329 8.086 7.863 7.627 7.359 7.085 6.912 6.728 6.438 6.229 5.994 5.879 5.649 5.403 5.139 4.998 4.743 4.538 4.351 4.137 3.668 3.408 3.117 2.791 2.47 2.088 1.622 0.416 -6 ,29410 ,KEBNE ,17017850,Tue Dec 21 21:56:12 CET,Tue Dec 21 23:29:31 CET,0.0 0.505 0.772 1.016 1.224 1.41 1.581 1.742 2.075 2.223 2.359 2.514 2.746 2.863 3.091 3.302 3.505 3.603 3.786 3.958 4.209 4.376 4.539 4.777 5.007 5.228 5.436 5.634 5.887 6.13 6.371 6.663 6.942 7.218 7.539 7.898 8.229 8.583 8.965 9.364 9.776 10.233 10.756 11.265 11.834 12.441 13.071 13.704 14.371 14.995 15.489 15.531 15.263 14.885 14.436 13.939 13.469 13.0 12.541 12.061 11.612 11.18 10.754 10.332 9.94 9.567 9.17 8.826 8.492 8.126 7.763 7.459 7.145 6.842 6.624 6.414 6.196 5.954 5.692 5.506 5.319 5.043 4.84 4.604 4.479 4.221 3.954 3.676 3.529 3.263 3.05 2.89 2.723 2.351 2.135 1.891 1.627 1.357 1.058 0.615 -0.869 -7 ,20367 ,KEBNE ,17017851,Tue Dec 21 21:56:12 CET,Tue Dec 21 23:26:57 CET,0.0 0.333 0.642 0.907 1.134 1.317 1.496 1.665 1.98 2.134 2.293 2.472 2.721 2.848 3.081 3.308 3.53 3.634 3.836 4.044 4.342 4.516 4.688 4.937 5.175 5.399 5.619 5.842 6.124 6.394 6.648 6.958 7.263 7.555 7.878 8.22 8.553 8.915 9.301 9.732 10.176 10.641 11.184 11.727 12.317 12.934 13.627 14.339 15.038 15.688 16.238 16.359 16.142 15.773 15.335 14.88 14.406 13.877 13.388 12.882 12.406 11.961 11.533 11.093 10.689 10.343 9.959 9.614 9.318 9.014 8.698 8.44 8.155 7.827 7.584 7.332 7.054 6.76 6.447 6.228 5.988 5.595 5.338 5.069 4.91 4.562 4.209 3.848 3.651 3.339 3.054 2.846 2.641 2.174 1.916 1.659 1.385 1.052 0.674 0.289 -0.411 -8 ,15026 ,KEBNE ,17017852,Tue Dec 21 21:57:12 CET,Tue Dec 21 23:35:17 CET,0.0 0.35 0.613 0.835 1.029 1.218 1.417 1.622 1.956 2.088 2.219 2.355 2.587 2.711 2.963 3.198 3.413 3.518 3.722 3.92 4.203 4.379 4.55 4.808 5.06 5.292 5.523 5.739 6.005 6.269 6.519 6.811 7.095 7.366 7.678 8.025 8.333 8.683 9.077 9.47 9.872 10.314 10.817 11.293 11.817 12.394 13.04 13.696 14.385 15.057 15.533 15.485 15.106 14.639 14.111 13.58 13.046 12.537 12.105 11.632 11.219 10.817 10.405 10.048 9.702 9.357 8.982 8.649 8.356 8.037 7.709 7.424 7.102 6.752 6.498 6.245 5.959 5.646 5.324 5.096 4.86 4.478 4.199 3.927 3.798 3.529 3.235 2.924 2.767 2.494 2.261 2.068 1.862 1.422 1.175 0.913 0.641 0.291 -0.15 -0.662 -2.061 -9 ,19261 ,KEBNE ,17017853,Tue Dec 21 21:57:12 CET,Tue Dec 21 23:32:51 CET,0.0 0.471 0.794 1.049 1.252 1.433 1.595 1.749 2.044 2.196 2.338 2.476 2.712 2.827 3.054 3.27 3.474 3.573 3.768 3.953 4.225 4.401 4.563 4.798 5.025 5.243 5.453 5.65 5.898 6.135 6.374 6.664 6.939 7.2 7.494 7.817 8.126 8.475 8.843 9.217 9.609 10.041 10.55 11.028 11.525 12.096 12.735 13.357 14.001 14.649 15.181 15.333 15.111 14.688 14.178 13.69 13.229 12.747 12.317 11.88 11.509 11.162 10.821 10.501 10.19 9.877 9.531 9.222 8.958 8.672 8.349 8.088 7.824 7.516 7.263 7.013 6.76 6.501 6.243 6.061 5.87 5.564 5.325 5.081 4.961 4.697 4.418 4.123 3.96 3.673 3.445 3.259 3.063 2.66 2.424 2.17 1.915 1.635 1.24 0.665 -0.995 -10 ,2994 ,KEBNE ,17017854,Tue Dec 21 21:57:12 CET,Tue Dec 21 23:34:26 CET,0.0 0.328 0.62 0.858 1.06 1.238 1.407 1.56 1.838 1.982 2.138 2.31 2.55 2.668 2.887 3.082 3.264 3.355 3.533 3.709 3.973 4.14 4.296 4.522 4.745 4.963 5.179 5.383 5.649 5.914 6.159 6.449 6.718 6.981 7.302 7.661 7.998 8.363 8.742 9.124 9.519 9.957 10.47 10.98 11.57 12.219 12.891 13.6 14.333 15.039 15.664 15.771 15.511 15.168 14.8 14.347 13.896 13.452 13.052 12.642 12.238 11.881 11.534 11.174 10.833 10.525 10.196 9.884 9.604 9.302 8.988 8.724 8.433 8.127 7.902 7.663 7.413 7.164 6.883 6.664 6.442 6.112 5.886 5.647 5.511 5.234 4.939 4.633 4.478 4.194 3.921 3.712 3.501 3.041 2.774 2.495 2.207 1.888 1.508 1.016 -0.205 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index 2161bdc3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19978 ,KEBNE ,17017855,Tue Dec 21 21:57:12 CET,Tue Dec 21 23:33:34 CET,0.0 0.368 0.598 0.804 0.989 1.153 1.295 1.426 1.686 1.816 1.95 2.078 2.312 2.425 2.631 2.827 3.012 3.095 3.251 3.413 3.651 3.798 3.935 4.137 4.342 4.551 4.755 4.946 5.175 5.394 5.609 5.877 6.129 6.355 6.617 6.913 7.181 7.469 7.784 8.11 8.45 8.822 9.254 9.668 10.11 10.557 10.988 11.397 11.808 12.143 12.196 11.756 11.125 10.421 9.744 9.086 8.465 7.895 7.383 6.827 6.318 5.832 5.382 4.948 4.497 4.091 3.668 3.297 2.979 2.641 2.29 1.98 1.656 1.311 1.032 0.754 0.458 0.154 -0.151 -0.372 -0.595 -0.941 -1.198 -1.473 -1.614 -1.91 -2.228 -2.553 -2.716 -3.001 -3.254 -3.468 -3.696 -4.18 -4.426 -4.667 -4.936 -5.23 -5.582 -6.063 -7.207 -2 ,2112 ,KEBNE ,17017856,Tue Dec 21 21:57:12 CET,Tue Dec 21 23:34:24 CET,0.0 0.458 0.681 0.86 1.033 1.183 1.326 1.475 1.733 1.842 1.951 2.045 2.264 2.367 2.562 2.751 2.932 3.019 3.198 3.378 3.631 3.784 3.931 4.151 4.357 4.552 4.745 4.935 5.181 5.415 5.644 5.926 6.184 6.422 6.685 6.982 7.267 7.57 7.9 8.227 8.551 8.923 9.36 9.769 10.229 10.707 11.208 11.7 12.118 12.442 12.508 12.113 11.526 10.866 10.244 9.652 9.081 8.507 7.989 7.444 6.94 6.46 5.996 5.554 5.131 4.739 4.348 4.002 3.684 3.36 3.037 2.758 2.431 2.073 1.804 1.533 1.26 0.966 0.644 0.425 0.202 -0.149 -0.387 -0.617 -0.731 -0.976 -1.247 -1.535 -1.692 -1.971 -2.196 -2.38 -2.567 -2.965 -3.176 -3.402 -3.636 -3.904 -4.253 -4.705 -5.809 -3 ,4256 ,KEBNE ,17017857,Tue Dec 21 21:57:12 CET,Tue Dec 21 23:34:43 CET,0.0 0.353 0.593 0.794 0.959 1.112 1.261 1.397 1.646 1.762 1.883 2.0 2.229 2.339 2.544 2.734 2.911 3.001 3.18 3.351 3.594 3.741 3.878 4.081 4.286 4.488 4.674 4.85 5.079 5.296 5.496 5.735 5.973 6.202 6.468 6.765 7.041 7.344 7.662 7.997 8.352 8.731 9.14 9.535 9.966 10.423 10.911 11.411 11.893 12.255 12.318 11.864 11.244 10.611 9.947 9.31 8.735 8.172 7.684 7.17 6.675 6.232 5.816 5.407 5.032 4.675 4.272 3.904 3.593 3.265 2.919 2.644 2.355 2.037 1.785 1.529 1.256 0.966 0.64 0.398 0.164 -0.205 -0.469 -0.745 -0.899 -1.205 -1.5 -1.804 -1.961 -2.254 -2.493 -2.671 -2.856 -3.242 -3.457 -3.712 -3.996 -4.312 -4.68 -5.104 -6.338 -4 ,26682 ,KEBNE ,17017858,Tue Dec 21 21:57:12 CET,Tue Dec 21 23:33:27 CET,0.0 0.3 0.517 0.709 0.88 1.036 1.191 1.349 1.634 1.764 1.889 2.014 2.243 2.356 2.581 2.782 2.983 3.085 3.275 3.458 3.713 3.871 4.026 4.26 4.477 4.686 4.891 5.085 5.329 5.552 5.769 6.052 6.333 6.583 6.867 7.195 7.502 7.831 8.187 8.573 8.954 9.362 9.838 10.269 10.74 11.22 11.715 12.238 12.741 13.137 13.146 12.595 11.92 11.191 10.47 9.764 9.111 8.494 7.932 7.339 6.817 6.362 5.91 5.427 4.968 4.564 4.133 3.737 3.387 3.036 2.678 2.363 2.02 1.68 1.42 1.127 0.831 0.548 0.238 0.003 -0.236 -0.586 -0.836 -1.105 -1.241 -1.539 -1.866 -2.201 -2.366 -2.651 -2.904 -3.11 -3.323 -3.752 -4.001 -4.272 -4.57 -4.909 -5.31 -5.823 -7.005 -5 ,16756 ,KEBNE ,17017859,Tue Dec 21 21:57:12 CET,Tue Dec 21 23:34:36 CET,0.0 0.272 0.504 0.693 0.849 1.017 1.184 1.34 1.662 1.813 1.95 2.097 2.331 2.45 2.681 2.908 3.12 3.215 3.396 3.566 3.801 3.947 4.092 4.307 4.516 4.711 4.901 5.087 5.32 5.546 5.769 6.035 6.289 6.533 6.819 7.138 7.435 7.76 8.112 8.477 8.828 9.199 9.62 10.017 10.438 10.877 11.348 11.822 12.268 12.579 12.669 12.342 11.752 11.099 10.464 9.853 9.264 8.676 8.146 7.591 7.095 6.66 6.235 5.825 5.448 5.086 4.687 4.318 3.986 3.638 3.285 3.005 2.718 2.416 2.173 1.911 1.633 1.351 1.056 0.857 0.666 0.366 0.123 -0.128 -0.248 -0.5 -0.759 -1.033 -1.175 -1.439 -1.671 -1.875 -2.084 -2.514 -2.748 -3.002 -3.285 -3.602 -4.029 -4.546 -5.737 -6 ,17202 ,KEBNE ,17017860,Tue Dec 21 21:57:12 CET,Tue Dec 21 23:33:21 CET,0.0 0.358 0.58 0.793 1.001 1.162 1.307 1.447 1.733 1.866 1.982 2.09 2.311 2.418 2.628 2.821 2.996 3.081 3.261 3.433 3.693 3.864 4.02 4.238 4.433 4.621 4.808 4.992 5.23 5.463 5.689 5.949 6.199 6.441 6.71 6.986 7.241 7.527 7.839 8.162 8.49 8.863 9.292 9.709 10.19 10.68 11.161 11.642 12.085 12.414 12.526 12.196 11.628 10.976 10.322 9.637 8.958 8.31 7.77 7.239 6.788 6.365 5.926 5.515 5.12 4.753 4.362 4.017 3.722 3.421 3.107 2.807 2.473 2.141 1.893 1.646 1.368 1.067 0.782 0.581 0.367 0.044 -0.176 -0.404 -0.528 -0.79 -1.039 -1.283 -1.414 -1.673 -1.876 -2.049 -2.23 -2.588 -2.79 -3.032 -3.307 -3.604 -3.939 -4.357 -5.381 -7 ,21698 ,KEBNE ,17017861,Tue Dec 21 21:57:12 CET,Tue Dec 21 23:34:26 CET,0.0 0.411 0.641 0.836 1.001 1.179 1.35 1.489 1.738 1.862 1.99 2.105 2.329 2.434 2.634 2.813 2.992 3.078 3.243 3.404 3.639 3.794 3.94 4.152 4.361 4.567 4.758 4.942 5.178 5.393 5.596 5.849 6.086 6.306 6.566 6.857 7.138 7.432 7.734 8.039 8.352 8.701 9.097 9.485 9.906 10.35 10.807 11.26 11.728 12.041 11.972 11.441 10.813 10.153 9.515 8.88 8.249 7.685 7.183 6.652 6.186 5.751 5.315 4.913 4.533 4.169 3.8 3.465 3.16 2.841 2.509 2.229 1.916 1.586 1.339 1.084 0.825 0.558 0.281 0.087 -0.123 -0.461 -0.704 -0.946 -1.061 -1.295 -1.548 -1.83 -1.972 -2.231 -2.43 -2.596 -2.778 -3.173 -3.395 -3.634 -3.878 -4.135 -4.443 -4.834 -5.688 -8 ,26721 ,KEBNE ,17017862,Tue Dec 21 21:58:15 CET,Tue Dec 21 23:34:19 CET,0.0 0.447 0.706 0.912 1.079 1.238 1.393 1.531 1.785 1.904 2.021 2.14 2.362 2.464 2.667 2.866 3.049 3.136 3.307 3.47 3.711 3.864 4.013 4.225 4.425 4.612 4.796 4.98 5.231 5.47 5.681 5.943 6.198 6.443 6.718 7.017 7.317 7.622 7.929 8.273 8.619 8.979 9.39 9.815 10.32 10.822 11.311 11.758 12.188 12.623 12.767 12.385 11.753 11.03 10.355 9.725 9.163 8.574 8.004 7.46 7.007 6.585 6.168 5.772 5.369 4.989 4.614 4.291 4.001 3.681 3.354 3.076 2.779 2.479 2.243 1.986 1.7 1.398 1.111 0.92 0.727 0.414 0.197 -0.023 -0.145 -0.407 -0.673 -0.961 -1.114 -1.378 -1.578 -1.739 -1.898 -2.259 -2.467 -2.704 -2.966 -3.257 -3.585 -3.979 -4.848 -9 ,22491 ,KEBNE ,17017863,Tue Dec 21 21:58:15 CET,Tue Dec 21 23:35:38 CET,0.0 0.367 0.615 0.808 1.004 1.188 1.335 1.464 1.725 1.856 1.986 2.115 2.333 2.44 2.657 2.856 3.042 3.126 3.294 3.458 3.694 3.848 3.997 4.216 4.421 4.616 4.808 4.991 5.223 5.438 5.641 5.896 6.138 6.367 6.628 6.923 7.205 7.504 7.816 8.134 8.462 8.826 9.239 9.64 10.076 10.521 11.001 11.458 11.861 12.15 12.264 11.927 11.316 10.642 9.944 9.249 8.642 8.087 7.599 7.1 6.669 6.273 5.86 5.469 5.122 4.813 4.486 4.182 3.909 3.614 3.296 3.016 2.739 2.472 2.263 2.032 1.775 1.505 1.221 1.03 0.842 0.545 0.342 0.127 0.001 -0.265 -0.531 -0.822 -0.981 -1.253 -1.463 -1.645 -1.832 -2.221 -2.444 -2.7 -2.973 -3.271 -3.62 -4.028 -4.896 -10 ,19038 ,KEBNE ,17017864,Tue Dec 21 21:58:14 CET,Tue Dec 21 23:35:07 CET,0.0 0.327 0.525 0.689 0.842 0.993 1.146 1.289 1.544 1.664 1.783 1.89 2.109 2.222 2.436 2.629 2.811 2.9 3.064 3.218 3.452 3.598 3.738 3.945 4.151 4.349 4.529 4.706 4.948 5.179 5.39 5.653 5.908 6.148 6.42 6.724 7.021 7.339 7.667 8.006 8.373 8.775 9.21 9.634 10.108 10.58 11.039 11.48 11.946 12.307 12.324 11.855 11.208 10.519 9.854 9.221 8.611 8.024 7.449 6.862 6.377 5.922 5.476 5.049 4.637 4.231 3.819 3.478 3.184 2.866 2.522 2.252 1.963 1.652 1.418 1.169 0.888 0.584 0.288 0.084 -0.119 -0.427 -0.647 -0.878 -1.002 -1.283 -1.591 -1.898 -2.052 -2.329 -2.543 -2.715 -2.908 -3.324 -3.551 -3.824 -4.139 -4.475 -4.831 -5.252 -6.06 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 24306761..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30994 ,KEBNE ,17017865,Tue Dec 21 21:58:15 CET,Tue Dec 21 23:33:33 CET,0.0 0.484 0.738 0.954 1.155 1.347 1.529 1.686 1.981 2.129 2.276 2.431 2.667 2.791 3.045 3.289 3.515 3.627 3.84 4.034 4.315 4.496 4.666 4.909 5.144 5.378 5.608 5.837 6.139 6.418 6.676 6.981 7.283 7.58 7.92 8.3 8.652 9.035 9.435 9.837 10.265 10.741 11.285 11.8 12.363 12.987 13.681 14.407 15.178 15.977 16.736 16.976 16.801 16.52 16.154 15.683 15.178 14.686 14.204 13.678 13.241 12.836 12.404 11.979 11.594 11.245 10.865 10.52 10.21 9.848 9.494 9.199 8.855 8.481 8.168 7.852 7.534 7.215 6.872 6.612 6.347 5.944 5.672 5.377 5.225 4.883 4.495 4.133 3.942 3.633 3.348 3.141 2.905 2.349 2.026 1.679 1.285 0.832 0.347 -0.32 -2.148 -2 ,14293 ,KEBNE ,17017866,Tue Dec 21 21:58:14 CET,Tue Dec 21 23:34:21 CET,0.0 0.643 0.962 1.224 1.447 1.651 1.847 2.036 2.383 2.544 2.692 2.866 3.124 3.25 3.48 3.705 3.927 4.037 4.258 4.469 4.769 4.956 5.139 5.401 5.643 5.877 6.094 6.295 6.56 6.821 7.071 7.37 7.655 7.935 8.263 8.627 8.984 9.376 9.805 10.26 10.71 11.201 11.784 12.381 13.036 13.728 14.496 15.295 16.119 16.973 17.746 18.009 17.821 17.441 16.961 16.436 15.926 15.349 14.812 14.309 13.852 13.407 12.971 12.558 12.173 11.792 11.381 11.024 10.702 10.354 9.999 9.694 9.356 8.98 8.693 8.418 8.126 7.809 7.489 7.275 7.054 6.657 6.356 6.063 5.906 5.566 5.207 4.854 4.679 4.364 4.047 3.829 3.602 3.089 2.765 2.415 2.063 1.69 1.264 0.689 -1.098 -3 ,27490 ,KEBNE ,17017867,Tue Dec 21 21:58:14 CET,Tue Dec 21 23:35:01 CET,0.0 0.388 0.627 0.878 1.097 1.277 1.458 1.615 1.89 2.027 2.158 2.276 2.525 2.649 2.876 3.099 3.314 3.419 3.619 3.804 4.084 4.263 4.441 4.697 4.933 5.167 5.391 5.605 5.893 6.166 6.418 6.717 7.012 7.298 7.617 7.961 8.288 8.641 9.026 9.449 9.893 10.391 10.939 11.464 12.071 12.736 13.442 14.178 14.987 15.792 16.429 16.55 16.29 15.907 15.508 15.06 14.563 14.086 13.641 13.108 12.642 12.237 11.829 11.426 11.041 10.684 10.313 9.978 9.672 9.358 9.025 8.734 8.422 8.08 7.821 7.533 7.202 6.892 6.599 6.397 6.184 5.852 5.614 5.336 5.184 4.868 4.51 4.113 3.921 3.608 3.298 3.081 2.837 2.292 2.007 1.679 1.317 0.883 0.371 -0.258 -2.202 -4 ,25483 ,KEBNE ,17017868,Tue Dec 21 21:59:17 CET,Tue Dec 21 23:34:36 CET,0.0 0.494 0.767 0.995 1.192 1.358 1.519 1.68 1.985 2.126 2.264 2.411 2.647 2.76 2.989 3.208 3.414 3.517 3.725 3.921 4.195 4.365 4.533 4.786 5.03 5.263 5.483 5.691 5.965 6.236 6.496 6.792 7.063 7.326 7.626 7.952 8.264 8.62 9.02 9.447 9.887 10.379 10.954 11.534 12.166 12.805 13.487 14.22 15.034 15.849 16.579 16.795 16.682 16.333 15.874 15.353 14.831 14.341 13.859 13.35 12.928 12.533 12.107 11.713 11.328 10.945 10.541 10.189 9.896 9.57 9.231 8.957 8.66 8.332 8.059 7.738 7.411 7.095 6.777 6.549 6.298 5.895 5.617 5.35 5.207 4.875 4.523 4.121 3.908 3.6 3.26 3.005 2.736 2.141 1.84 1.51 1.147 0.695 0.123 -0.518 -2.325 -5 ,655 ,KEBNE ,17017869,Tue Dec 21 21:59:17 CET,Tue Dec 21 23:36:00 CET,0.0 0.332 0.571 0.777 0.981 1.186 1.366 1.534 1.857 2.007 2.147 2.289 2.526 2.649 2.892 3.117 3.333 3.441 3.643 3.84 4.116 4.29 4.47 4.73 4.98 5.228 5.469 5.695 5.985 6.264 6.532 6.865 7.178 7.477 7.814 8.166 8.509 8.884 9.278 9.697 10.124 10.591 11.128 11.661 12.249 12.871 13.585 14.375 15.204 16.043 16.808 17.124 17.047 16.659 16.139 15.579 15.028 14.49 14.0 13.468 12.984 12.558 12.149 11.741 11.327 10.934 10.512 10.103 9.743 9.404 9.017 8.665 8.316 7.94 7.669 7.399 7.11 6.797 6.469 6.259 6.013 5.591 5.282 4.941 4.766 4.429 4.062 3.641 3.422 3.088 2.713 2.435 2.163 1.571 1.256 0.903 0.437 -0.065 -0.615 -1.339 -3.014 -6 ,12117 ,KEBNE ,17017870,Tue Dec 21 21:59:17 CET,Tue Dec 21 23:35:00 CET,0.0 0.682 0.994 1.266 1.522 1.746 1.939 2.106 2.389 2.518 2.644 2.77 3.017 3.142 3.367 3.579 3.792 3.895 4.093 4.277 4.541 4.714 4.881 5.119 5.351 5.587 5.809 6.009 6.268 6.524 6.772 7.072 7.356 7.635 7.953 8.3 8.635 8.993 9.379 9.801 10.232 10.705 11.246 11.79 12.424 13.086 13.777 14.486 15.296 16.111 16.788 16.927 16.632 16.214 15.771 15.284 14.788 14.286 13.823 13.316 12.838 12.388 11.952 11.553 11.167 10.799 10.409 10.045 9.711 9.363 9.014 8.699 8.352 7.973 7.665 7.363 7.072 6.771 6.45 6.221 5.993 5.629 5.364 5.08 4.926 4.613 4.279 3.911 3.719 3.406 3.121 2.908 2.666 2.115 1.797 1.467 1.081 0.596 -0.001 -0.774 -2.944 -7 ,612 ,KEBNE ,17017871,Tue Dec 21 21:59:17 CET,Tue Dec 21 23:36:40 CET,0.0 0.303 0.549 0.759 0.954 1.151 1.328 1.484 1.768 1.902 2.034 2.179 2.41 2.526 2.742 2.935 3.127 3.23 3.427 3.612 3.883 4.058 4.227 4.467 4.698 4.921 5.126 5.318 5.578 5.843 6.096 6.399 6.688 6.962 7.271 7.614 7.94 8.302 8.691 9.096 9.518 9.977 10.483 10.999 11.628 12.289 12.983 13.729 14.535 15.377 16.12 16.327 16.071 15.618 15.097 14.576 14.074 13.554 13.075 12.555 12.06 11.614 11.181 10.756 10.348 9.974 9.58 9.203 8.856 8.475 8.071 7.752 7.428 7.077 6.781 6.466 6.129 5.796 5.444 5.188 4.907 4.449 4.157 3.856 3.683 3.297 2.927 2.557 2.344 2.012 1.668 1.439 1.199 0.625 0.305 -0.07 -0.476 -0.956 -1.565 -2.345 -4.854 -8 ,22574 ,KEBNE ,17017872,Tue Dec 21 22:00:18 CET,Tue Dec 21 23:35:41 CET,0.0 0.657 0.95 1.181 1.377 1.559 1.748 1.92 2.222 2.368 2.504 2.636 2.871 2.987 3.224 3.448 3.655 3.759 3.956 4.134 4.412 4.594 4.767 5.022 5.263 5.495 5.723 5.946 6.22 6.475 6.721 7.016 7.299 7.574 7.892 8.241 8.576 8.942 9.315 9.712 10.141 10.613 11.139 11.663 12.259 12.904 13.615 14.361 15.148 15.948 16.658 16.748 16.504 16.101 15.552 14.941 14.324 13.775 13.304 12.793 12.303 11.862 11.459 11.021 10.563 10.14 9.71 9.321 8.98 8.623 8.259 7.971 7.663 7.324 7.045 6.742 6.415 6.085 5.779 5.548 5.288 4.886 4.594 4.269 4.099 3.756 3.383 2.958 2.74 2.397 2.021 1.774 1.496 0.85 0.495 0.142 -0.226 -0.696 -1.284 -1.964 -4.052 -9 ,5767 ,KEBNE ,17017873,Tue Dec 21 22:00:18 CET,Tue Dec 21 23:36:51 CET,0.0 0.365 0.692 0.943 1.153 1.34 1.503 1.662 1.967 2.116 2.264 2.425 2.663 2.772 2.984 3.196 3.4 3.501 3.693 3.883 4.164 4.332 4.494 4.732 4.95 5.164 5.374 5.576 5.85 6.12 6.372 6.668 6.953 7.233 7.549 7.891 8.225 8.601 9.001 9.403 9.828 10.305 10.834 11.36 11.98 12.658 13.399 14.149 14.956 15.829 16.59 16.922 16.873 16.575 16.142 15.655 15.216 14.785 14.357 13.874 13.447 13.057 12.642 12.22 11.85 11.514 11.132 10.777 10.46 10.127 9.765 9.467 9.154 8.816 8.543 8.26 7.954 7.633 7.299 7.058 6.822 6.448 6.169 5.871 5.712 5.367 4.994 4.612 4.415 4.087 3.717 3.457 3.197 2.616 2.275 1.9 1.488 1.108 0.67 0.034 -1.894 -10 ,598 ,KEBNE ,17017874,Tue Dec 21 22:00:18 CET,Tue Dec 21 23:36:45 CET,0.0 0.294 0.527 0.745 0.949 1.131 1.298 1.461 1.771 1.915 2.053 2.212 2.46 2.583 2.819 3.05 3.274 3.379 3.583 3.783 4.072 4.264 4.444 4.687 4.924 5.158 5.381 5.601 5.883 6.16 6.431 6.743 7.044 7.322 7.632 7.99 8.341 8.717 9.115 9.55 9.996 10.49 11.044 11.555 12.168 12.84 13.552 14.305 15.14 16.0 16.782 17.109 16.931 16.57 16.191 15.764 15.297 14.846 14.442 14.001 13.582 13.196 12.817 12.457 12.116 11.782 11.409 11.066 10.764 10.437 10.08 9.773 9.48 9.167 8.909 8.652 8.38 8.074 7.769 7.568 7.344 6.993 6.758 6.506 6.372 6.093 5.777 5.412 5.211 4.908 4.623 4.393 4.156 3.681 3.427 3.14 2.807 2.444 2.045 1.494 0.068 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt deleted file mode 100644 index 9d1df3bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27479 ,KEBNE ,17017875,Tue Dec 21 22:00:18 CET,Tue Dec 21 23:37:09 CET,0.0 0.363 0.664 0.92 1.125 1.306 1.48 1.658 1.988 2.135 2.284 2.449 2.687 2.808 3.048 3.275 3.481 3.582 3.785 3.974 4.246 4.417 4.578 4.807 5.037 5.277 5.494 5.695 5.963 6.23 6.485 6.789 7.079 7.341 7.637 7.976 8.303 8.66 9.038 9.427 9.83 10.287 10.779 11.243 11.781 12.338 12.961 13.596 14.182 14.744 15.176 15.09 14.622 14.06 13.525 12.971 12.436 11.915 11.438 10.948 10.486 10.063 9.671 9.293 8.915 8.554 8.196 7.881 7.604 7.313 7.004 6.738 6.453 6.16 5.927 5.677 5.416 5.144 4.861 4.662 4.453 4.139 3.919 3.676 3.555 3.308 3.042 2.768 2.63 2.378 2.208 2.051 1.879 1.491 1.283 1.05 0.773 0.489 0.171 -0.224 -1.161 -2 ,16034 ,KEBNE ,17017876,Tue Dec 21 22:00:18 CET,Tue Dec 21 23:37:01 CET,0.0 0.571 0.908 1.161 1.378 1.582 1.766 1.943 2.283 2.437 2.581 2.751 3.001 3.118 3.347 3.567 3.767 3.86 4.041 4.224 4.499 4.675 4.84 5.072 5.292 5.517 5.74 5.943 6.203 6.448 6.684 6.973 7.24 7.494 7.787 8.12 8.449 8.795 9.143 9.509 9.886 10.302 10.786 11.24 11.744 12.299 12.894 13.503 14.136 14.705 15.04 14.887 14.413 13.842 13.27 12.707 12.166 11.633 11.16 10.643 10.172 9.762 9.369 8.992 8.635 8.292 7.924 7.593 7.301 6.992 6.671 6.398 6.092 5.78 5.545 5.289 5.029 4.77 4.505 4.315 4.106 3.753 3.522 3.305 3.186 2.924 2.668 2.406 2.269 2.015 1.821 1.647 1.451 1.049 0.846 0.623 0.378 0.126 -0.188 -0.589 -1.466 -3 ,25847 ,KEBNE ,17017877,Tue Dec 21 22:00:18 CET,Tue Dec 21 23:37:48 CET,0.0 0.386 0.641 0.861 1.068 1.256 1.444 1.625 1.938 2.082 2.223 2.369 2.612 2.736 2.966 3.192 3.42 3.522 3.706 3.885 4.153 4.326 4.492 4.725 4.955 5.179 5.396 5.607 5.871 6.116 6.355 6.639 6.901 7.162 7.458 7.78 8.097 8.454 8.843 9.231 9.637 10.095 10.591 11.051 11.535 12.041 12.634 13.296 13.927 14.485 14.823 14.659 14.235 13.666 13.083 12.492 11.926 11.406 10.927 10.42 9.977 9.578 9.178 8.775 8.386 8.04 7.68 7.346 7.069 6.789 6.475 6.207 5.918 5.603 5.353 5.086 4.8 4.503 4.21 4.013 3.811 3.495 3.267 3.034 2.907 2.63 2.347 2.056 1.901 1.615 1.4 1.236 1.068 0.694 0.473 0.235 -0.023 -0.305 -0.618 -1.031 -2.414 -4 ,19510 ,KEBNE ,17017878,Tue Dec 21 22:01:20 CET,Tue Dec 21 23:38:13 CET,0.0 0.358 0.605 0.818 1.005 1.194 1.377 1.545 1.867 2.015 2.156 2.311 2.564 2.698 2.959 3.203 3.43 3.535 3.742 3.95 4.244 4.429 4.605 4.86 5.103 5.322 5.528 5.729 5.998 6.253 6.486 6.766 7.048 7.316 7.618 7.967 8.305 8.666 9.05 9.441 9.824 10.249 10.746 11.222 11.752 12.339 12.981 13.622 14.274 14.873 15.238 15.047 14.619 14.079 13.486 12.933 12.416 11.893 11.424 10.916 10.435 9.99 9.543 9.121 8.726 8.362 7.986 7.629 7.321 7.004 6.652 6.359 6.064 5.758 5.514 5.258 4.995 4.721 4.431 4.236 4.031 3.705 3.48 3.235 3.106 2.838 2.563 2.286 2.138 1.863 1.64 1.463 1.273 0.862 0.646 0.415 0.169 -0.125 -0.49 -0.945 -1.777 -5 ,9517 ,KEBNE ,17017879,Tue Dec 21 22:01:20 CET,Tue Dec 21 23:38:59 CET,0.0 0.504 0.82 1.083 1.304 1.497 1.689 1.86 2.17 2.321 2.465 2.629 2.881 3.004 3.243 3.475 3.693 3.797 3.997 4.188 4.47 4.655 4.822 5.052 5.277 5.497 5.708 5.917 6.185 6.443 6.693 6.984 7.251 7.516 7.833 8.17 8.522 8.929 9.321 9.719 10.133 10.589 11.097 11.574 12.09 12.617 13.186 13.779 14.401 14.968 15.365 15.214 14.75 14.204 13.603 13.019 12.477 11.948 11.448 10.908 10.439 10.008 9.581 9.165 8.769 8.412 8.042 7.697 7.407 7.105 6.771 6.495 6.213 5.914 5.666 5.406 5.154 4.891 4.614 4.428 4.229 3.906 3.669 3.41 3.281 3.016 2.74 2.468 2.323 2.052 1.867 1.699 1.515 1.111 0.895 0.654 0.387 0.119 -0.178 -0.569 -1.539 -6 ,14300 ,KEBNE ,17017880,Tue Dec 21 22:02:21 CET,Tue Dec 21 23:38:59 CET,0.0 0.442 0.728 0.991 1.212 1.419 1.604 1.768 2.078 2.217 2.35 2.493 2.733 2.849 3.077 3.292 3.5 3.6 3.793 3.98 4.244 4.415 4.582 4.824 5.058 5.276 5.49 5.701 5.959 6.202 6.438 6.709 6.97 7.229 7.529 7.852 8.156 8.498 8.862 9.236 9.624 10.063 10.567 11.054 11.586 12.139 12.739 13.334 13.925 14.508 14.965 14.871 14.396 13.809 13.224 12.638 12.055 11.49 11.008 10.493 10.027 9.638 9.271 8.915 8.555 8.195 7.821 7.485 7.185 6.884 6.563 6.273 5.974 5.675 5.433 5.191 4.953 4.693 4.413 4.221 4.002 3.653 3.425 3.182 3.055 2.795 2.511 2.207 2.059 1.791 1.566 1.385 1.204 0.833 0.627 0.386 0.124 -0.164 -0.487 -0.866 -1.624 -7 ,18643 ,KEBNE ,17017881,Tue Dec 21 22:02:21 CET,Tue Dec 21 23:38:47 CET,0.0 0.571 0.887 1.145 1.383 1.593 1.787 1.968 2.309 2.47 2.621 2.784 3.033 3.165 3.423 3.663 3.893 4.001 4.2 4.398 4.679 4.854 5.025 5.281 5.524 5.751 5.975 6.19 6.458 6.719 6.963 7.244 7.516 7.781 8.077 8.398 8.703 9.033 9.39 9.775 10.172 10.592 11.074 11.54 12.065 12.638 13.257 13.879 14.51 15.091 15.524 15.453 15.071 14.595 14.066 13.495 12.961 12.483 12.02 11.514 11.091 10.707 10.336 9.978 9.611 9.265 8.907 8.578 8.298 8.009 7.707 7.446 7.156 6.871 6.657 6.417 6.161 5.917 5.671 5.497 5.309 4.99 4.763 4.537 4.418 4.167 3.91 3.618 3.455 3.181 2.96 2.779 2.592 2.183 1.958 1.731 1.504 1.264 0.986 0.609 -0.294 -8 ,10696 ,KEBNE ,17017882,Tue Dec 21 22:02:25 CET,Tue Dec 21 23:33:39 CET,0.0 0.508 0.825 1.111 1.357 1.559 1.731 1.904 2.229 2.383 2.535 2.704 2.961 3.092 3.333 3.573 3.795 3.902 4.109 4.305 4.595 4.786 4.972 5.223 5.466 5.7 5.93 6.149 6.411 6.674 6.942 7.262 7.565 7.864 8.211 8.594 8.95 9.328 9.719 10.116 10.52 10.98 11.493 11.953 12.47 13.038 13.639 14.246 14.877 15.488 15.934 15.862 15.446 14.932 14.413 13.881 13.324 12.773 12.264 11.707 11.229 10.807 10.39 9.96 9.548 9.173 8.777 8.411 8.086 7.752 7.385 7.08 6.789 6.475 6.225 5.968 5.685 5.378 5.063 4.845 4.615 4.266 4.025 3.772 3.643 3.374 3.085 2.783 2.639 2.377 2.138 1.948 1.764 1.374 1.16 0.94 0.69 0.412 0.114 -0.255 -1.011 -9 ,13951 ,KEBNE ,17017883,Tue Dec 21 22:02:25 CET,Tue Dec 21 23:36:16 CET,0.0 0.512 0.791 0.994 1.181 1.373 1.554 1.717 2.018 2.155 2.29 2.445 2.689 2.811 3.035 3.245 3.449 3.552 3.753 3.948 4.235 4.409 4.568 4.804 5.036 5.256 5.475 5.681 5.933 6.184 6.429 6.724 7.007 7.277 7.58 7.923 8.267 8.636 9.045 9.474 9.889 10.352 10.857 11.353 11.93 12.528 13.157 13.781 14.42 14.993 15.273 15.104 14.714 14.172 13.576 13.007 12.471 11.943 11.463 10.945 10.464 10.035 9.622 9.203 8.811 8.459 8.08 7.738 7.429 7.104 6.766 6.482 6.191 5.907 5.693 5.451 5.194 4.927 4.648 4.46 4.266 3.957 3.73 3.494 3.375 3.121 2.853 2.562 2.412 2.15 1.948 1.779 1.61 1.241 1.021 0.772 0.518 0.246 -0.101 -0.63 -1.755 -10 ,10573 ,KEBNE ,17017884,Tue Dec 21 22:04:28 CET,Tue Dec 21 23:37:08 CET,0.0 0.341 0.613 0.868 1.085 1.28 1.478 1.661 1.985 2.143 2.298 2.459 2.704 2.832 3.065 3.284 3.502 3.612 3.821 4.013 4.277 4.446 4.612 4.846 5.075 5.303 5.521 5.734 6.005 6.256 6.498 6.782 7.056 7.335 7.646 7.991 8.329 8.677 9.048 9.434 9.838 10.277 10.753 11.219 11.74 12.281 12.875 13.465 14.06 14.616 14.936 14.819 14.372 13.806 13.263 12.705 12.142 11.611 11.144 10.647 10.207 9.798 9.388 8.989 8.614 8.28 7.909 7.558 7.256 6.945 6.625 6.355 6.065 5.767 5.533 5.288 5.034 4.774 4.493 4.305 4.115 3.792 3.561 3.33 3.204 2.93 2.656 2.38 2.228 1.954 1.751 1.586 1.4 1.0 0.779 0.522 0.25 -0.051 -0.439 -0.875 -1.728 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index a8b1d543..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14601 ,TETRA ,17413659,Sun Nov 21 16:13:25 CET,Sun Nov 21 18:19:37 CET,0.0 0.413 0.718 0.954 1.136 1.303 1.457 1.607 1.874 2.001 2.131 2.254 2.487 2.603 2.812 3.01 3.202 3.294 3.47 3.643 3.893 4.056 4.217 4.443 4.661 4.869 5.069 5.268 5.528 5.765 5.987 6.257 6.517 6.763 7.039 7.352 7.651 7.984 8.334 8.694 9.053 9.432 9.883 10.356 10.872 11.385 11.96 12.516 13.018 13.48 13.721 13.54 13.188 12.712 12.142 11.542 10.919 10.303 9.736 9.117 8.568 8.074 7.609 7.167 6.735 6.325 5.88 5.488 5.146 4.773 4.363 4.01 3.661 3.293 3.0 2.706 2.367 1.996 1.643 1.392 1.113 0.672 0.366 0.055 -0.109 -0.435 -0.752 -1.098 -1.29 -1.598 -1.874 -2.089 -2.33 -2.888 -3.214 -3.568 -3.93 -4.314 -4.76 -5.289 -7.27 -2 ,10034 ,TETRA ,17413660,Sun Nov 21 16:13:27 CET,Sun Nov 21 18:21:27 CET,0.0 0.465 0.745 0.96 1.146 1.324 1.48 1.619 1.882 2.011 2.131 2.23 2.444 2.548 2.764 2.962 3.155 3.255 3.432 3.592 3.839 3.997 4.142 4.355 4.553 4.738 4.932 5.127 5.358 5.567 5.779 6.037 6.276 6.511 6.787 7.085 7.371 7.69 8.019 8.368 8.721 9.116 9.58 10.012 10.484 10.976 11.483 11.982 12.502 12.987 13.186 12.84 12.257 11.586 10.873 10.145 9.444 8.814 8.276 7.723 7.221 6.75 6.288 5.811 5.343 4.913 4.451 4.024 3.672 3.296 2.879 2.524 2.162 1.802 1.516 1.21 0.898 0.572 0.217 -0.037 -0.314 -0.761 -1.066 -1.378 -1.546 -1.909 -2.272 -2.622 -2.796 -3.103 -3.441 -3.689 -3.971 -4.639 -4.966 -5.295 -5.698 -6.155 -6.715 -7.429 -9.447 -3 ,25549 ,TETRA ,17413661,Sun Nov 21 16:13:27 CET,Sun Nov 21 18:21:19 CET,0.0 0.385 0.637 0.825 1.003 1.188 1.368 1.537 1.856 1.999 2.124 2.243 2.485 2.607 2.839 3.059 3.261 3.356 3.545 3.723 3.972 4.136 4.292 4.515 4.73 4.935 5.13 5.321 5.56 5.783 6.009 6.28 6.529 6.762 7.026 7.329 7.629 7.956 8.294 8.644 8.999 9.37 9.793 10.221 10.697 11.189 11.702 12.221 12.774 13.22 13.328 12.944 12.357 11.654 10.934 10.281 9.68 9.079 8.503 7.864 7.31 6.814 6.308 5.817 5.351 4.904 4.44 4.028 3.663 3.288 2.899 2.579 2.24 1.889 1.619 1.331 1.016 0.698 0.354 0.103 -0.144 -0.528 -0.8 -1.079 -1.225 -1.538 -1.9 -2.31 -2.518 -2.836 -3.129 -3.345 -3.56 -4.036 -4.298 -4.587 -4.935 -5.358 -5.892 -6.561 -8.51 -4 ,7948 ,TETRA ,17413662,Sun Nov 21 16:13:31 CET,Sun Nov 21 18:21:42 CET,0.0 0.448 0.694 0.922 1.138 1.327 1.488 1.64 1.926 2.063 2.192 2.318 2.546 2.648 2.844 3.037 3.228 3.329 3.526 3.702 3.939 4.088 4.24 4.471 4.692 4.895 5.087 5.275 5.508 5.726 5.946 6.215 6.457 6.69 6.971 7.288 7.588 7.919 8.26 8.591 8.936 9.325 9.757 10.167 10.614 11.101 11.655 12.228 12.772 13.256 13.63 13.509 13.056 12.423 11.743 11.068 10.434 9.85 9.298 8.667 8.107 7.611 7.158 6.723 6.302 5.931 5.533 5.152 4.813 4.463 4.103 3.783 3.437 3.09 2.802 2.502 2.204 1.888 1.552 1.325 1.098 0.758 0.506 0.218 0.072 -0.223 -0.549 -0.901 -1.081 -1.385 -1.69 -1.905 -2.115 -2.558 -2.811 -3.083 -3.37 -3.757 -4.247 -4.873 -6.948 -5 ,13899 ,TETRA ,17413663,Sun Nov 21 16:13:32 CET,Sun Nov 21 18:21:41 CET,0.0 0.328 0.571 0.781 0.954 1.123 1.289 1.438 1.724 1.861 1.989 2.112 2.344 2.455 2.659 2.853 3.038 3.129 3.31 3.482 3.726 3.882 4.026 4.236 4.457 4.68 4.887 5.085 5.34 5.589 5.821 6.086 6.341 6.586 6.869 7.175 7.464 7.793 8.142 8.497 8.862 9.265 9.714 10.144 10.631 11.141 11.688 12.228 12.712 13.15 13.421 13.135 12.608 11.988 11.32 10.667 10.068 9.472 8.882 8.259 7.718 7.227 6.728 6.237 5.8 5.411 5.015 4.658 4.323 3.941 3.542 3.219 2.906 2.574 2.299 2.007 1.679 1.346 1.016 0.787 0.551 0.186 -0.086 -0.389 -0.547 -0.876 -1.217 -1.568 -1.754 -2.081 -2.419 -2.659 -2.921 -3.5 -3.809 -4.14 -4.497 -4.894 -5.419 -6.093 -8.215 -6 ,29945 ,TETRA ,17413664,Sun Nov 21 16:13:28 CET,Sun Nov 21 18:21:34 CET,0.0 0.676 0.971 1.174 1.37 1.563 1.751 1.925 2.226 2.371 2.507 2.648 2.885 3.003 3.227 3.434 3.629 3.725 3.907 4.07 4.31 4.464 4.611 4.825 5.033 5.227 5.416 5.61 5.862 6.101 6.322 6.571 6.82 7.057 7.316 7.627 7.926 8.245 8.596 8.962 9.338 9.754 10.211 10.655 11.161 11.657 12.196 12.797 13.372 13.829 14.105 13.942 13.457 12.889 12.328 11.734 11.13 10.554 10.039 9.495 9.003 8.532 8.053 7.595 7.182 6.779 6.336 5.954 5.626 5.279 4.908 4.59 4.274 3.95 3.686 3.393 3.09 2.797 2.488 2.274 2.042 1.676 1.434 1.182 1.056 0.77 0.464 0.154 -0.017 -0.307 -0.594 -0.823 -1.038 -1.468 -1.724 -1.997 -2.298 -2.666 -3.106 -3.652 -4.943 -8 ,26020 ,TETRA ,17413666,Sun Nov 21 16:13:29 CET,Sun Nov 21 18:22:50 CET,0.0 0.29 0.517 0.715 0.895 1.067 1.236 1.386 1.643 1.761 1.88 2.0 2.235 2.341 2.528 2.711 2.895 2.989 3.176 3.357 3.611 3.762 3.904 4.11 4.305 4.494 4.681 4.869 5.118 5.348 5.558 5.814 6.06 6.295 6.571 6.881 7.179 7.495 7.825 8.173 8.527 8.926 9.376 9.804 10.28 10.763 11.288 11.818 12.343 12.818 13.05 12.78 12.231 11.604 10.976 10.394 9.874 9.321 8.77 8.211 7.712 7.225 6.743 6.301 5.894 5.505 5.085 4.686 4.336 3.982 3.626 3.322 2.989 2.621 2.331 2.043 1.739 1.412 1.074 0.815 0.514 0.047 -0.271 -0.604 -0.778 -1.117 -1.472 -1.863 -2.059 -2.371 -2.677 -2.919 -3.171 -3.678 -3.949 -4.25 -4.594 -4.981 -5.426 -6.028 -7.993 -9 ,22253 ,TETRA ,17413667,Sun Nov 21 16:13:31 CET,Sun Nov 21 18:22:49 CET,0.0 0.803 1.149 1.409 1.615 1.796 1.971 2.129 2.415 2.558 2.701 2.858 3.104 3.226 3.453 3.665 3.877 3.979 4.17 4.353 4.62 4.791 4.95 5.179 5.4 5.604 5.802 5.996 6.24 6.475 6.722 7.025 7.3 7.554 7.838 8.156 8.468 8.791 9.111 9.469 9.846 10.261 10.744 11.187 11.664 12.168 12.7 13.222 13.749 14.156 14.302 14.043 13.502 12.858 12.213 11.533 10.9 10.31 9.779 9.24 8.737 8.266 7.787 7.298 6.85 6.454 6.016 5.616 5.276 4.922 4.541 4.209 3.876 3.526 3.25 2.967 2.655 2.331 2.009 1.786 1.547 1.158 0.878 0.589 0.44 0.14 -0.178 -0.498 -0.662 -0.945 -1.211 -1.413 -1.618 -2.085 -2.345 -2.627 -2.956 -3.333 -3.748 -4.334 -6.12 -10 ,26817 ,TETRA ,17413668,Sun Nov 21 16:13:33 CET,Sun Nov 21 18:22:50 CET,0.0 0.387 0.616 0.822 1.015 1.198 1.353 1.509 1.801 1.921 2.041 2.161 2.393 2.505 2.712 2.911 3.101 3.191 3.372 3.539 3.771 3.916 4.06 4.268 4.466 4.658 4.837 5.018 5.253 5.48 5.707 5.978 6.232 6.47 6.753 7.069 7.365 7.699 8.062 8.429 8.802 9.198 9.637 10.073 10.559 11.088 11.651 12.197 12.754 13.287 13.624 13.459 12.93 12.25 11.593 10.938 10.307 9.738 9.225 8.674 8.142 7.635 7.139 6.659 6.233 5.846 5.438 5.058 4.69 4.294 3.878 3.543 3.218 2.883 2.622 2.328 2.005 1.646 1.268 1.009 0.74 0.337 0.057 -0.232 -0.38 -0.69 -1.009 -1.354 -1.536 -1.826 -2.061 -2.273 -2.531 -3.099 -3.405 -3.707 -4.041 -4.434 -4.903 -5.455 -6.876 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 26e283dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25209 ,KEBNE ,17017885,Tue Dec 21 22:03:26 CET,Tue Dec 21 23:36:31 CET,0.0 0.708 1.013 1.253 1.474 1.67 1.853 2.029 2.327 2.476 2.62 2.776 3.021 3.148 3.377 3.581 3.779 3.873 4.045 4.208 4.443 4.593 4.739 4.956 5.159 5.356 5.539 5.715 5.944 6.169 6.386 6.632 6.865 7.086 7.332 7.612 7.881 8.156 8.428 8.711 9.017 9.342 9.693 10.028 10.399 10.767 11.138 11.49 11.821 12.061 11.942 11.333 10.509 9.689 8.944 8.223 7.571 6.935 6.35 5.705 5.096 4.545 4.03 3.546 3.126 2.747 2.328 1.961 1.655 1.358 1.042 0.752 0.446 0.128 -0.128 -0.383 -0.651 -0.94 -1.255 -1.477 -1.705 -2.044 -2.273 -2.528 -2.666 -2.96 -3.274 -3.61 -3.787 -4.085 -4.365 -4.583 -4.806 -5.266 -5.522 -5.808 -6.133 -6.489 -6.878 -7.405 -8.856 -2 ,10764 ,KEBNE ,17017886,Tue Dec 21 22:05:25 CET,Tue Dec 21 23:40:57 CET,0.0 0.505 0.789 1.016 1.214 1.397 1.568 1.723 2.001 2.125 2.244 2.363 2.584 2.691 2.896 3.1 3.294 3.387 3.564 3.741 3.999 4.153 4.304 4.529 4.732 4.931 5.127 5.315 5.549 5.778 5.999 6.258 6.507 6.74 6.992 7.266 7.532 7.818 8.113 8.437 8.779 9.131 9.513 9.884 10.287 10.666 11.053 11.428 11.747 11.915 11.823 11.288 10.529 9.759 9.025 8.299 7.629 6.993 6.438 5.882 5.371 4.869 4.376 3.928 3.483 3.063 2.651 2.295 1.965 1.601 1.22 0.911 0.613 0.3 0.032 -0.256 -0.543 -0.857 -1.173 -1.375 -1.591 -1.948 -2.214 -2.489 -2.623 -2.895 -3.197 -3.525 -3.695 -3.98 -4.209 -4.391 -4.582 -5.021 -5.269 -5.555 -5.886 -6.248 -6.651 -7.18 -8.568 -3 ,19925 ,KEBNE ,17017887,Tue Dec 21 22:05:26 CET,Tue Dec 21 23:40:50 CET,0.0 0.382 0.653 0.886 1.118 1.322 1.484 1.633 1.917 2.053 2.181 2.304 2.524 2.64 2.854 3.048 3.231 3.319 3.487 3.655 3.901 4.053 4.202 4.422 4.631 4.831 5.006 5.175 5.397 5.614 5.832 6.089 6.334 6.567 6.826 7.119 7.392 7.681 7.992 8.312 8.618 8.935 9.317 9.694 10.097 10.519 10.944 11.333 11.652 11.813 11.692 11.169 10.463 9.727 9.013 8.321 7.711 7.093 6.496 5.875 5.363 4.907 4.476 4.076 3.71 3.369 2.997 2.649 2.329 2.015 1.694 1.429 1.16 0.84 0.575 0.313 0.036 -0.276 -0.607 -0.814 -1.014 -1.339 -1.574 -1.819 -1.95 -2.231 -2.531 -2.848 -3.016 -3.312 -3.587 -3.797 -4.007 -4.463 -4.728 -5.01 -5.31 -5.663 -6.085 -6.625 -8.204 -4 ,23380 ,KEBNE ,17017888,Tue Dec 21 22:05:25 CET,Tue Dec 21 23:40:58 CET,0.0 0.392 0.668 0.905 1.086 1.257 1.423 1.572 1.849 1.976 2.096 2.223 2.448 2.564 2.781 2.977 3.162 3.251 3.418 3.58 3.81 3.961 4.11 4.316 4.52 4.72 4.916 5.111 5.361 5.588 5.804 6.064 6.306 6.535 6.791 7.084 7.359 7.651 7.951 8.262 8.584 8.921 9.309 9.686 10.107 10.532 10.958 11.36 11.685 11.828 11.641 11.032 10.299 9.535 8.767 8.075 7.452 6.888 6.36 5.799 5.328 4.858 4.411 4.012 3.615 3.247 2.86 2.483 2.168 1.857 1.522 1.225 0.907 0.573 0.292 -0.014 -0.321 -0.621 -0.933 -1.144 -1.358 -1.716 -1.959 -2.206 -2.341 -2.623 -2.922 -3.227 -3.388 -3.671 -3.932 -4.131 -4.333 -4.762 -5.009 -5.272 -5.568 -5.916 -6.339 -6.859 -8.382 -5 ,1368 ,KEBNE ,17017889,Tue Dec 21 22:05:25 CET,Tue Dec 21 23:40:24 CET,0.0 0.355 0.609 0.831 1.025 1.202 1.36 1.506 1.805 1.947 2.08 2.222 2.453 2.563 2.774 2.974 3.179 3.278 3.452 3.624 3.876 4.035 4.187 4.403 4.612 4.817 5.011 5.195 5.422 5.642 5.857 6.102 6.335 6.56 6.817 7.108 7.393 7.689 7.977 8.27 8.579 8.933 9.321 9.687 10.103 10.54 10.985 11.37 11.722 11.987 11.811 11.087 10.231 9.398 8.683 8.027 7.404 6.753 6.185 5.672 5.215 4.787 4.37 3.922 3.49 3.113 2.716 2.375 2.067 1.733 1.386 1.078 0.759 0.448 0.187 -0.11 -0.409 -0.683 -0.974 -1.21 -1.455 -1.835 -2.106 -2.376 -2.516 -2.816 -3.139 -3.484 -3.661 -3.953 -4.22 -4.404 -4.59 -5.034 -5.285 -5.554 -5.854 -6.176 -6.526 -6.981 -8.096 -6 ,2123 ,KEBNE ,17017890,Tue Dec 21 22:09:33 CET,Tue Dec 21 23:46:55 CET,0.0 0.328 0.58 0.823 1.022 1.212 1.388 1.55 1.853 1.998 2.139 2.286 2.532 2.649 2.866 3.076 3.271 3.368 3.559 3.739 3.984 4.14 4.29 4.501 4.706 4.904 5.084 5.26 5.498 5.721 5.934 6.195 6.442 6.677 6.939 7.214 7.481 7.772 8.076 8.401 8.75 9.122 9.524 9.904 10.315 10.748 11.163 11.543 11.896 12.139 12.049 11.431 10.77 10.091 9.41 8.733 8.063 7.399 6.828 6.274 5.774 5.319 4.871 4.442 4.034 3.637 3.235 2.865 2.526 2.201 1.876 1.596 1.294 0.965 0.705 0.441 0.151 -0.173 -0.517 -0.751 -0.995 -1.37 -1.628 -1.893 -2.018 -2.272 -2.539 -2.834 -2.995 -3.28 -3.536 -3.729 -3.952 -4.44 -4.678 -4.926 -5.188 -5.495 -5.882 -6.394 -7.877 -7 ,32240 ,KEBNE ,17017891,Tue Dec 21 22:09:33 CET,Tue Dec 21 23:44:39 CET,0.0 0.411 0.63 0.828 1.032 1.216 1.374 1.524 1.819 1.966 2.106 2.249 2.464 2.573 2.791 3.001 3.206 3.306 3.491 3.663 3.924 4.089 4.248 4.474 4.684 4.888 5.076 5.259 5.5 5.725 5.925 6.167 6.407 6.639 6.899 7.17 7.424 7.707 8.015 8.332 8.651 9.007 9.41 9.774 10.178 10.601 11.027 11.411 11.731 11.929 11.833 11.321 10.622 9.856 9.124 8.423 7.793 7.22 6.687 6.114 5.608 5.126 4.675 4.278 3.871 3.49 3.066 2.665 2.327 1.98 1.605 1.291 0.981 0.648 0.376 0.097 -0.206 -0.517 -0.817 -1.031 -1.249 -1.607 -1.872 -2.146 -2.284 -2.576 -2.879 -3.194 -3.362 -3.643 -3.901 -4.108 -4.312 -4.753 -5.01 -5.286 -5.596 -5.965 -6.367 -6.812 -8.025 -8 ,7887 ,KEBNE ,17017892,Tue Dec 21 22:09:33 CET,Tue Dec 21 23:45:45 CET,0.0 0.386 0.667 0.902 1.102 1.278 1.446 1.603 1.899 2.04 2.169 2.318 2.549 2.658 2.865 3.064 3.251 3.344 3.529 3.71 3.979 4.138 4.286 4.508 4.716 4.917 5.108 5.295 5.533 5.753 5.966 6.214 6.447 6.674 6.945 7.242 7.522 7.831 8.146 8.478 8.811 9.171 9.582 9.948 10.32 10.719 11.153 11.566 11.954 12.192 12.061 11.469 10.763 10.021 9.221 8.475 7.824 7.193 6.586 5.921 5.363 4.899 4.462 4.023 3.597 3.2 2.789 2.405 2.055 1.72 1.371 1.081 0.784 0.454 0.192 -0.087 -0.368 -0.645 -0.948 -1.168 -1.387 -1.72 -1.963 -2.231 -2.373 -2.65 -2.943 -3.263 -3.432 -3.726 -3.987 -4.186 -4.408 -4.901 -5.159 -5.434 -5.736 -6.094 -6.511 -7.018 -8.102 -9 ,23173 ,KEBNE ,17017893,Tue Dec 21 22:09:33 CET,Tue Dec 21 23:46:02 CET,0.0 0.392 0.651 0.864 1.058 1.248 1.436 1.605 1.907 2.041 2.174 2.329 2.568 2.687 2.91 3.112 3.302 3.398 3.584 3.762 4.03 4.194 4.343 4.559 4.759 4.948 5.13 5.302 5.521 5.743 5.968 6.236 6.488 6.747 7.058 7.378 7.655 7.948 8.275 8.62 8.973 9.353 9.755 10.152 10.617 11.066 11.486 11.941 12.345 12.567 12.552 12.052 11.331 10.609 9.906 9.17 8.522 7.924 7.337 6.699 6.152 5.691 5.228 4.755 4.337 3.958 3.533 3.141 2.78 2.391 2.015 1.7 1.354 0.992 0.715 0.433 0.153 -0.165 -0.512 -0.747 -0.987 -1.335 -1.581 -1.852 -1.99 -2.288 -2.606 -2.948 -3.126 -3.415 -3.649 -3.846 -4.063 -4.495 -4.749 -5.061 -5.421 -5.817 -6.244 -6.816 -8.355 -10 ,13148 ,KEBNE ,17017894,Tue Dec 21 22:09:33 CET,Tue Dec 21 23:44:30 CET,0.0 0.469 0.727 0.951 1.161 1.34 1.516 1.679 1.962 2.087 2.211 2.351 2.59 2.707 2.931 3.136 3.33 3.426 3.601 3.762 4.004 4.168 4.325 4.542 4.751 4.948 5.14 5.327 5.56 5.78 5.992 6.251 6.502 6.739 7.012 7.313 7.591 7.887 8.191 8.53 8.874 9.212 9.589 9.953 10.352 10.761 11.168 11.554 11.902 12.129 12.044 11.516 10.813 10.05 9.329 8.684 8.091 7.508 6.978 6.436 5.959 5.489 5.016 4.578 4.164 3.772 3.36 2.985 2.664 2.33 1.985 1.699 1.369 1.036 0.781 0.51 0.215 -0.089 -0.399 -0.618 -0.849 -1.222 -1.489 -1.761 -1.899 -2.188 -2.491 -2.818 -2.988 -3.286 -3.559 -3.762 -3.992 -4.486 -4.75 -5.052 -5.396 -5.784 -6.217 -6.777 -8.738 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 9d25b991..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9083 ,KEBNE ,17017895,Tue Dec 21 22:09:33 CET,Tue Dec 21 23:45:20 CET,0.0 0.457 0.697 0.891 1.075 1.248 1.402 1.547 1.8 1.924 2.05 2.181 2.4 2.509 2.717 2.909 3.09 3.181 3.363 3.529 3.761 3.923 4.094 4.344 4.577 4.788 4.987 5.18 5.424 5.652 5.867 6.138 6.391 6.619 6.877 7.156 7.435 7.738 8.049 8.38 8.714 9.07 9.475 9.85 10.239 10.633 11.028 11.395 11.695 11.81 11.587 10.874 10.047 9.289 8.528 7.743 7.003 6.331 5.756 5.17 4.676 4.218 3.75 3.308 2.869 2.439 2.012 1.631 1.294 0.958 0.612 0.301 -0.013 -0.332 -0.603 -0.874 -1.159 -1.461 -1.754 -1.965 -2.192 -2.558 -2.825 -3.081 -3.215 -3.5 -3.798 -4.11 -4.271 -4.552 -4.785 -4.969 -5.166 -5.623 -5.86 -6.11 -6.417 -6.764 -7.144 -7.609 -8.718 -2 ,1958 ,KEBNE ,17017896,Tue Dec 21 22:09:34 CET,Tue Dec 21 23:45:49 CET,0.0 0.42 0.706 0.958 1.19 1.407 1.604 1.77 2.069 2.205 2.336 2.484 2.719 2.835 3.045 3.248 3.449 3.546 3.739 3.929 4.196 4.364 4.52 4.754 4.986 5.194 5.384 5.561 5.791 6.02 6.237 6.486 6.72 6.934 7.166 7.431 7.683 7.956 8.249 8.557 8.874 9.208 9.578 9.937 10.318 10.694 11.055 11.393 11.667 11.788 11.522 10.798 10.001 9.124 8.339 7.652 7.003 6.363 5.807 5.269 4.779 4.327 3.879 3.436 3.009 2.621 2.222 1.859 1.517 1.14 0.741 0.404 0.05 -0.33 -0.617 -0.894 -1.2 -1.53 -1.863 -2.099 -2.338 -2.712 -2.982 -3.264 -3.412 -3.7 -3.998 -4.329 -4.501 -4.789 -5.058 -5.256 -5.463 -5.92 -6.178 -6.468 -6.78 -7.105 -7.452 -7.915 -8.806 -3 ,15933 ,KEBNE ,17017897,Tue Dec 21 22:09:33 CET,Tue Dec 21 23:44:01 CET,0.0 0.495 0.781 1.06 1.278 1.453 1.628 1.802 2.109 2.247 2.381 2.53 2.762 2.883 3.115 3.325 3.512 3.604 3.791 3.971 4.223 4.388 4.548 4.77 4.984 5.187 5.383 5.57 5.804 6.006 6.203 6.461 6.716 6.961 7.227 7.509 7.778 8.075 8.386 8.712 9.022 9.348 9.712 10.07 10.47 10.854 11.243 11.586 11.852 11.999 11.847 11.24 10.516 9.783 9.053 8.359 7.736 7.168 6.632 6.068 5.575 5.124 4.681 4.245 3.823 3.429 3.022 2.637 2.306 1.988 1.655 1.367 1.063 0.729 0.468 0.201 -0.083 -0.379 -0.678 -0.893 -1.132 -1.497 -1.725 -1.962 -2.093 -2.365 -2.642 -2.927 -3.081 -3.364 -3.614 -3.797 -3.989 -4.414 -4.656 -4.898 -5.153 -5.437 -5.782 -6.266 -7.159 -4 ,24329 ,KEBNE ,17017898,Tue Dec 21 22:09:34 CET,Tue Dec 21 23:45:42 CET,0.0 0.608 0.878 1.097 1.295 1.487 1.69 1.877 2.187 2.336 2.48 2.638 2.875 2.993 3.225 3.447 3.665 3.773 3.975 4.164 4.416 4.576 4.741 4.988 5.224 5.438 5.645 5.844 6.091 6.329 6.551 6.824 7.099 7.345 7.62 7.923 8.2 8.484 8.766 9.054 9.371 9.738 10.127 10.487 10.867 11.231 11.621 11.988 12.291 12.433 12.225 11.642 10.943 10.167 9.378 8.655 7.994 7.352 6.794 6.211 5.641 5.118 4.611 4.171 3.797 3.449 3.079 2.72 2.412 2.107 1.787 1.506 1.2 0.86 0.573 0.293 0.002 -0.317 -0.646 -0.878 -1.123 -1.499 -1.746 -1.977 -2.094 -2.359 -2.655 -2.99 -3.16 -3.448 -3.725 -3.922 -4.128 -4.583 -4.816 -5.058 -5.347 -5.692 -6.09 -6.597 -7.725 -5 ,25408 ,KEBNE ,17017899,Tue Dec 21 22:09:34 CET,Tue Dec 21 23:46:19 CET,0.0 0.604 0.863 1.108 1.303 1.463 1.624 1.785 2.07 2.205 2.338 2.462 2.693 2.812 3.035 3.252 3.467 3.567 3.753 3.935 4.18 4.333 4.495 4.733 4.965 5.189 5.393 5.585 5.828 6.06 6.284 6.546 6.788 7.04 7.338 7.658 7.957 8.263 8.574 8.89 9.222 9.588 9.997 10.389 10.796 11.2 11.624 12.048 12.394 12.601 12.457 11.808 11.094 10.269 9.478 8.799 8.171 7.563 7.026 6.461 5.933 5.433 4.953 4.507 4.094 3.717 3.301 2.909 2.562 2.213 1.855 1.528 1.193 0.846 0.565 0.275 -0.029 -0.336 -0.646 -0.869 -1.114 -1.526 -1.826 -2.135 -2.298 -2.627 -2.953 -3.309 -3.498 -3.804 -4.092 -4.313 -4.549 -5.046 -5.319 -5.593 -5.903 -6.259 -6.664 -7.176 -8.445 -6 ,30975 ,KEBNE ,17017900,Tue Dec 21 22:09:33 CET,Tue Dec 21 23:45:38 CET,0.0 0.318 0.547 0.794 1.022 1.21 1.386 1.553 1.844 1.973 2.096 2.229 2.454 2.57 2.794 2.995 3.184 3.277 3.465 3.648 3.898 4.061 4.218 4.429 4.631 4.842 5.049 5.234 5.478 5.711 5.933 6.19 6.425 6.658 6.919 7.194 7.454 7.737 8.02 8.292 8.575 8.903 9.264 9.591 9.966 10.354 10.758 11.131 11.411 11.582 11.38 10.587 9.702 8.897 8.186 7.543 6.964 6.411 5.913 5.366 4.84 4.337 3.865 3.438 3.02 2.602 2.187 1.83 1.492 1.13 0.756 0.455 0.139 -0.195 -0.447 -0.708 -0.978 -1.266 -1.571 -1.795 -2.041 -2.419 -2.688 -2.976 -3.115 -3.404 -3.719 -4.075 -4.259 -4.546 -4.822 -5.025 -5.245 -5.721 -5.977 -6.254 -6.548 -6.886 -7.276 -7.743 -8.647 -7 ,19573 ,KEBNE ,17017901,Tue Dec 21 22:09:34 CET,Tue Dec 21 23:46:33 CET,0.0 0.8 1.132 1.376 1.572 1.742 1.922 2.096 2.387 2.52 2.649 2.795 3.027 3.14 3.357 3.563 3.753 3.843 4.026 4.214 4.491 4.662 4.826 5.059 5.282 5.498 5.697 5.893 6.164 6.428 6.675 6.955 7.214 7.454 7.717 8.004 8.276 8.565 8.868 9.193 9.523 9.859 10.23 10.579 10.96 11.367 11.756 12.107 12.405 12.598 12.502 11.922 11.211 10.448 9.669 8.917 8.221 7.587 7.044 6.459 5.933 5.466 5.015 4.558 4.128 3.731 3.284 2.885 2.53 2.178 1.821 1.503 1.183 0.84 0.557 0.279 0.008 -0.292 -0.628 -0.866 -1.12 -1.503 -1.74 -1.999 -2.135 -2.405 -2.701 -3.011 -3.182 -3.474 -3.729 -3.923 -4.131 -4.586 -4.837 -5.136 -5.444 -5.749 -6.071 -6.483 -7.405 -8 ,18362 ,KEBNE ,17017902,Tue Dec 21 22:09:33 CET,Tue Dec 21 23:46:43 CET,0.0 0.477 0.779 1.027 1.243 1.455 1.647 1.815 2.13 2.272 2.4 2.532 2.767 2.891 3.112 3.306 3.499 3.596 3.78 3.962 4.224 4.384 4.537 4.754 4.955 5.145 5.334 5.52 5.763 5.99 6.202 6.455 6.689 6.923 7.198 7.489 7.748 8.014 8.298 8.591 8.897 9.239 9.603 9.922 10.263 10.621 11.006 11.367 11.623 11.698 11.415 10.663 9.773 8.883 8.035 7.272 6.6 5.953 5.347 4.729 4.19 3.674 3.202 2.761 2.311 1.888 1.447 1.064 0.73 0.365 -0.023 -0.349 -0.669 -0.983 -1.229 -1.495 -1.784 -2.086 -2.404 -2.623 -2.839 -3.183 -3.431 -3.692 -3.832 -4.117 -4.407 -4.72 -4.879 -5.162 -5.43 -5.624 -5.824 -6.254 -6.487 -6.735 -7.009 -7.338 -7.73 -8.204 -9.133 -9 ,4052 ,KEBNE ,17017903,Tue Dec 21 22:09:33 CET,Tue Dec 21 23:45:42 CET,0.0 0.376 0.619 0.837 1.039 1.214 1.378 1.535 1.841 1.981 2.11 2.258 2.489 2.615 2.835 3.032 3.23 3.329 3.521 3.698 3.944 4.097 4.242 4.455 4.666 4.871 5.068 5.257 5.496 5.724 5.952 6.224 6.463 6.685 6.948 7.235 7.488 7.762 8.064 8.373 8.669 8.981 9.345 9.703 10.068 10.414 10.776 11.106 11.394 11.53 11.181 10.438 9.672 8.887 8.181 7.515 6.871 6.239 5.677 5.11 4.604 4.138 3.695 3.245 2.833 2.466 2.074 1.724 1.42 1.1 0.745 0.439 0.109 -0.232 -0.481 -0.722 -0.992 -1.314 -1.662 -1.918 -2.208 -2.655 -2.958 -3.27 -3.43 -3.758 -4.083 -4.424 -4.604 -4.9 -5.178 -5.379 -5.569 -6.008 -6.256 -6.505 -6.787 -7.117 -7.506 -7.969 -8.985 -10 ,32753 ,KEBNE ,17017904,Tue Dec 21 22:09:34 CET,Tue Dec 21 23:45:05 CET,0.0 0.348 0.595 0.792 0.982 1.166 1.35 1.513 1.789 1.922 2.053 2.194 2.435 2.56 2.788 3.006 3.206 3.304 3.491 3.67 3.925 4.096 4.266 4.51 4.737 4.946 5.148 5.349 5.609 5.861 6.101 6.362 6.592 6.819 7.08 7.36 7.626 7.917 8.224 8.509 8.798 9.145 9.518 9.859 10.255 10.649 11.044 11.406 11.649 11.709 11.461 10.754 9.972 9.235 8.553 7.892 7.28 6.689 6.134 5.566 5.087 4.604 4.112 3.621 3.167 2.784 2.354 1.975 1.671 1.324 0.947 0.632 0.269 -0.129 -0.437 -0.759 -1.088 -1.409 -1.728 -1.948 -2.176 -2.535 -2.789 -3.073 -3.219 -3.503 -3.794 -4.106 -4.279 -4.582 -4.874 -5.087 -5.313 -5.769 -6.001 -6.254 -6.516 -6.804 -7.143 -7.577 -8.464 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt deleted file mode 100644 index af386b6f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25199 ,KEBNE ,17017905,Tue Dec 21 22:09:38 CET,Tue Dec 21 23:44:33 CET,0.0 0.58 0.857 1.128 1.362 1.577 1.787 1.969 2.287 2.442 2.59 2.737 2.97 3.085 3.303 3.517 3.735 3.837 4.015 4.188 4.438 4.604 4.762 4.976 5.194 5.409 5.614 5.813 6.059 6.294 6.522 6.794 7.044 7.285 7.562 7.873 8.164 8.464 8.794 9.152 9.507 9.882 10.306 10.707 11.134 11.568 11.991 12.373 12.708 12.885 12.743 11.984 11.102 10.281 9.519 8.774 8.033 7.327 6.693 6.05 5.489 4.954 4.415 3.923 3.449 2.985 2.476 1.987 1.563 1.123 0.672 0.331 -0.049 -0.484 -0.827 -1.172 -1.529 -1.907 -2.305 -2.576 -2.851 -3.301 -3.611 -3.932 -4.102 -4.459 -4.83 -5.211 -5.41 -5.727 -6.059 -6.311 -6.572 -7.159 -7.478 -7.816 -8.18 -8.589 -9.129 -9.899 -12.288 -2 ,11553 ,KEBNE ,17017906,Tue Dec 21 22:09:34 CET,Tue Dec 21 23:45:36 CET,0.0 0.448 0.705 0.94 1.141 1.334 1.519 1.688 1.999 2.156 2.31 2.452 2.679 2.807 3.044 3.252 3.472 3.574 3.76 3.95 4.22 4.387 4.535 4.743 4.954 5.166 5.374 5.578 5.826 6.057 6.29 6.574 6.842 7.086 7.359 7.672 7.977 8.31 8.644 8.985 9.329 9.675 10.061 10.461 10.889 11.267 11.655 12.049 12.403 12.628 12.482 11.801 10.906 9.838 8.799 7.861 6.971 6.094 5.35 4.62 3.977 3.387 2.778 2.166 1.624 1.137 0.636 0.24 -0.128 -0.533 -0.956 -1.322 -1.723 -2.161 -2.494 -2.843 -3.214 -3.554 -3.888 -4.142 -4.402 -4.795 -5.068 -5.379 -5.567 -5.95 -6.31 -6.683 -6.882 -7.224 -7.618 -7.881 -8.127 -8.658 -8.975 -9.355 -9.754 -10.169 -10.695 -11.456 -14.112 -3 ,190 ,KEBNE ,17017907,Tue Dec 21 22:09:33 CET,Tue Dec 21 23:45:24 CET,0.0 0.523 0.831 1.095 1.325 1.54 1.725 1.899 2.216 2.369 2.517 2.68 2.919 3.039 3.279 3.526 3.762 3.874 4.081 4.279 4.565 4.746 4.929 5.186 5.421 5.647 5.861 6.067 6.331 6.58 6.818 7.114 7.407 7.681 7.978 8.302 8.599 8.931 9.312 9.701 10.074 10.479 10.916 11.327 11.789 12.271 12.786 13.245 13.619 13.904 13.905 13.27 12.398 11.478 10.622 9.846 9.08 8.321 7.659 6.996 6.384 5.807 5.24 4.657 4.092 3.614 3.092 2.556 2.105 1.644 1.133 0.698 0.285 -0.154 -0.527 -0.886 -1.253 -1.665 -2.118 -2.423 -2.725 -3.19 -3.516 -3.855 -4.043 -4.447 -4.83 -5.267 -5.514 -5.888 -6.283 -6.55 -6.825 -7.409 -7.746 -8.109 -8.503 -8.944 -9.435 -10.182 -13.35 -4 ,1228 ,KEBNE ,17017908,Tue Dec 21 22:10:37 CET,Tue Dec 21 23:46:01 CET,0.0 0.409 0.715 0.943 1.118 1.296 1.476 1.644 1.943 2.083 2.219 2.357 2.588 2.706 2.926 3.132 3.325 3.423 3.627 3.824 4.106 4.282 4.452 4.694 4.919 5.14 5.353 5.553 5.811 6.061 6.305 6.589 6.851 7.092 7.362 7.657 7.939 8.251 8.585 8.945 9.314 9.715 10.16 10.578 11.039 11.543 12.093 12.597 12.99 13.249 13.127 12.464 11.646 10.794 9.942 9.19 8.5 7.808 7.188 6.543 5.976 5.45 4.909 4.306 3.706 3.206 2.702 2.264 1.876 1.449 0.978 0.572 0.147 -0.279 -0.602 -0.948 -1.315 -1.714 -2.103 -2.367 -2.647 -3.087 -3.404 -3.738 -3.916 -4.287 -4.671 -5.106 -5.33 -5.667 -6.003 -6.255 -6.545 -7.181 -7.508 -7.828 -8.172 -8.592 -9.098 -9.767 -12.574 -6 ,3542 ,KEBNE ,17017910,Tue Dec 21 22:10:37 CET,Tue Dec 21 23:44:57 CET,0.0 0.444 0.734 0.954 1.153 1.334 1.504 1.665 1.95 2.084 2.211 2.339 2.57 2.688 2.922 3.142 3.344 3.446 3.641 3.824 4.081 4.238 4.392 4.635 4.872 5.093 5.298 5.493 5.747 5.993 6.232 6.507 6.763 7.006 7.281 7.593 7.884 8.186 8.512 8.869 9.233 9.625 10.052 10.452 10.898 11.364 11.862 12.336 12.69 12.893 12.799 12.097 11.22 10.34 9.495 8.726 8.044 7.395 6.811 6.157 5.545 5.014 4.515 4.025 3.503 2.982 2.469 2.027 1.634 1.217 0.805 0.475 0.133 -0.235 -0.538 -0.854 -1.196 -1.56 -1.93 -2.169 -2.415 -2.822 -3.099 -3.389 -3.546 -3.873 -4.225 -4.586 -4.778 -5.109 -5.451 -5.709 -6.013 -6.642 -6.974 -7.343 -7.744 -8.213 -8.74 -9.438 -11.931 -7 ,24208 ,KEBNE ,17017911,Tue Dec 21 22:10:41 CET,Tue Dec 21 23:45:42 CET,0.0 0.525 0.815 1.083 1.338 1.564 1.769 1.943 2.243 2.381 2.514 2.679 2.918 3.035 3.266 3.485 3.692 3.795 3.995 4.179 4.445 4.618 4.786 5.021 5.243 5.453 5.656 5.854 6.105 6.339 6.556 6.824 7.095 7.356 7.644 7.946 8.23 8.532 8.855 9.219 9.59 9.98 10.425 10.85 11.304 11.756 12.214 12.636 13.028 13.267 13.093 12.437 11.442 10.298 9.219 8.297 7.512 6.762 6.115 5.479 4.918 4.396 3.881 3.378 2.898 2.457 2.005 1.586 1.217 0.817 0.4 0.063 -0.289 -0.662 -0.953 -1.257 -1.583 -1.929 -2.269 -2.515 -2.785 -3.183 -3.457 -3.755 -3.907 -4.221 -4.572 -4.961 -5.161 -5.469 -5.744 -5.957 -6.193 -6.689 -6.966 -7.295 -7.655 -8.056 -8.561 -9.264 -11.99 -8 ,9034 ,KEBNE ,17017912,Tue Dec 21 22:11:38 CET,Tue Dec 21 23:47:53 CET,0.0 0.729 1.041 1.291 1.52 1.718 1.914 2.109 2.466 2.624 2.767 2.934 3.171 3.298 3.529 3.737 3.946 4.044 4.226 4.4 4.646 4.803 4.954 5.178 5.404 5.615 5.807 6.003 6.264 6.507 6.747 7.038 7.306 7.558 7.835 8.132 8.426 8.735 9.046 9.39 9.756 10.124 10.521 10.918 11.344 11.801 12.306 12.786 13.222 13.531 13.443 12.817 12.014 11.147 10.309 9.453 8.578 7.744 6.995 6.305 5.72 5.161 4.627 4.083 3.578 3.119 2.613 2.178 1.822 1.436 1.013 0.658 0.295 -0.075 -0.362 -0.642 -0.926 -1.24 -1.592 -1.848 -2.108 -2.509 -2.789 -3.092 -3.244 -3.558 -3.879 -4.208 -4.384 -4.683 -5.003 -5.232 -5.451 -5.963 -6.283 -6.642 -7.005 -7.394 -7.897 -8.53 -10.155 -9 ,3705 ,KEBNE ,17017913,Tue Dec 21 22:12:40 CET,Tue Dec 21 23:46:43 CET,0.0 0.443 0.74 0.975 1.178 1.37 1.552 1.721 2.053 2.201 2.337 2.501 2.735 2.848 3.065 3.271 3.465 3.562 3.758 3.947 4.213 4.382 4.535 4.754 4.973 5.188 5.396 5.596 5.847 6.082 6.303 6.559 6.814 7.051 7.312 7.597 7.868 8.177 8.497 8.815 9.131 9.489 9.906 10.303 10.733 11.167 11.576 12.006 12.443 12.623 12.394 11.572 10.46 9.316 8.244 7.245 6.325 5.469 4.75 3.985 3.285 2.65 2.039 1.458 0.889 0.39 -0.123 -0.596 -1.006 -1.452 -1.932 -2.335 -2.736 -3.132 -3.475 -3.869 -4.268 -4.659 -5.049 -5.327 -5.629 -6.123 -6.486 -6.855 -7.028 -7.388 -7.796 -8.219 -8.432 -8.783 -9.168 -9.441 -9.725 -10.365 -10.733 -11.12 -11.545 -11.988 -12.491 -13.279 -16.074 -10 ,28878 ,KEBNE ,17017914,Tue Dec 21 22:12:44 CET,Tue Dec 21 23:46:32 CET,0.0 0.568 0.879 1.125 1.348 1.562 1.757 1.929 2.24 2.408 2.576 2.743 2.976 3.098 3.333 3.554 3.76 3.863 4.057 4.236 4.499 4.669 4.835 5.067 5.281 5.487 5.688 5.884 6.141 6.378 6.604 6.873 7.126 7.367 7.639 7.959 8.258 8.571 8.901 9.223 9.552 9.909 10.318 10.745 11.208 11.661 12.158 12.63 13.047 13.341 13.205 12.402 11.453 10.603 9.749 8.849 7.996 7.194 6.5 5.829 5.203 4.601 4.065 3.547 2.997 2.478 1.964 1.519 1.147 0.755 0.316 -0.054 -0.422 -0.805 -1.114 -1.436 -1.773 -2.148 -2.562 -2.84 -3.12 -3.574 -3.928 -4.271 -4.428 -4.76 -5.106 -5.474 -5.672 -5.999 -6.313 -6.557 -6.814 -7.4 -7.753 -8.114 -8.522 -9.046 -9.663 -10.51 -12.887 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 3f267d32..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23516 ,KEBNE ,17017915,Tue Dec 21 22:14:44 CET,Tue Dec 21 23:53:18 CET,0.0 0.38 0.665 0.911 1.118 1.311 1.495 1.672 2.012 2.169 2.319 2.493 2.743 2.871 3.112 3.34 3.564 3.675 3.878 4.077 4.363 4.541 4.714 4.968 5.208 5.431 5.637 5.83 6.08 6.333 6.573 6.848 7.114 7.363 7.65 7.974 8.267 8.591 8.936 9.289 9.663 10.079 10.558 11.033 11.527 12.044 12.597 13.109 13.62 14.148 14.53 14.438 14.069 13.63 13.15 12.666 12.21 11.753 11.336 10.885 10.476 10.111 9.753 9.413 9.092 8.797 8.49 8.204 7.948 7.682 7.398 7.17 6.933 6.672 6.469 6.265 6.049 5.819 5.592 5.429 5.25 4.967 4.776 4.574 4.469 4.246 4.011 3.779 3.658 3.411 3.238 3.085 2.931 2.604 2.411 2.211 2.028 1.832 1.588 1.296 0.823 -2 ,20458 ,KEBNE ,17017916,Tue Dec 21 22:14:45 CET,Tue Dec 21 23:50:38 CET,0.0 0.455 0.751 0.967 1.158 1.341 1.508 1.66 1.932 2.062 2.195 2.352 2.583 2.694 2.916 3.124 3.315 3.405 3.588 3.763 4.012 4.173 4.33 4.558 4.781 4.993 5.192 5.385 5.634 5.875 6.106 6.376 6.642 6.898 7.185 7.501 7.798 8.13 8.496 8.875 9.245 9.635 10.07 10.471 10.935 11.436 11.941 12.474 13.054 13.548 13.845 13.739 13.351 12.898 12.415 11.901 11.433 11.001 10.589 10.161 9.793 9.446 9.097 8.752 8.441 8.164 7.868 7.594 7.332 7.052 6.773 6.539 6.301 6.057 5.861 5.658 5.436 5.2 4.961 4.794 4.627 4.367 4.183 3.991 3.892 3.689 3.471 3.23 3.098 2.848 2.692 2.55 2.391 2.035 1.842 1.643 1.427 1.172 0.89 0.562 0.002 -3 ,7708 ,KEBNE ,17017917,Tue Dec 21 22:14:44 CET,Tue Dec 21 23:51:09 CET,0.0 0.38 0.647 0.881 1.079 1.251 1.419 1.587 1.906 2.043 2.164 2.297 2.535 2.651 2.86 3.07 3.269 3.362 3.545 3.731 4.0 4.167 4.326 4.541 4.745 4.947 5.148 5.341 5.596 5.842 6.064 6.331 6.591 6.843 7.132 7.437 7.724 8.05 8.398 8.755 9.13 9.543 10.003 10.433 10.916 11.424 11.944 12.493 13.042 13.51 13.806 13.664 13.289 12.836 12.325 11.792 11.32 10.865 10.449 10.028 9.654 9.326 8.997 8.678 8.359 8.038 7.727 7.462 7.222 6.975 6.711 6.478 6.231 5.965 5.752 5.534 5.309 5.085 4.851 4.675 4.487 4.193 3.982 3.748 3.632 3.408 3.17 2.908 2.766 2.519 2.358 2.218 2.059 1.723 1.563 1.389 1.194 0.985 0.736 0.424 -0.078 -4 ,10509 ,KEBNE ,17017918,Tue Dec 21 22:14:44 CET,Tue Dec 21 23:51:15 CET,0.0 0.424 0.682 0.9 1.095 1.281 1.456 1.612 1.89 2.029 2.17 2.321 2.56 2.678 2.913 3.123 3.323 3.425 3.628 3.824 4.091 4.26 4.427 4.662 4.88 5.096 5.304 5.502 5.759 6.006 6.244 6.525 6.793 7.061 7.366 7.68 7.972 8.299 8.632 8.964 9.32 9.718 10.153 10.579 11.083 11.613 12.156 12.703 13.224 13.668 13.998 13.878 13.469 13.022 12.566 12.099 11.646 11.183 10.785 10.371 9.985 9.625 9.28 8.97 8.674 8.403 8.112 7.829 7.581 7.324 7.054 6.829 6.593 6.342 6.148 5.94 5.725 5.512 5.28 5.119 4.958 4.708 4.525 4.316 4.21 4.001 3.786 3.552 3.428 3.194 3.04 2.903 2.755 2.44 2.268 2.081 1.886 1.68 1.446 1.169 0.715 -5 ,32143 ,KEBNE ,17017919,Tue Dec 21 22:17:51 CET,Tue Dec 21 23:53:26 CET,0.0 0.485 0.798 1.063 1.303 1.516 1.707 1.882 2.199 2.342 2.48 2.645 2.885 3.012 3.256 3.481 3.688 3.789 3.998 4.197 4.474 4.646 4.81 5.051 5.275 5.491 5.702 5.897 6.151 6.395 6.626 6.908 7.179 7.439 7.746 8.081 8.392 8.726 9.083 9.449 9.816 10.213 10.646 11.084 11.586 12.076 12.588 13.126 13.66 14.114 14.369 14.234 13.823 13.325 12.831 12.317 11.853 11.404 10.978 10.551 10.182 9.838 9.488 9.154 8.844 8.553 8.25 7.978 7.73 7.46 7.177 6.942 6.692 6.435 6.229 6.011 5.793 5.567 5.324 5.155 4.977 4.682 4.487 4.294 4.192 3.978 3.754 3.535 3.419 3.184 3.037 2.887 2.736 2.404 2.229 2.03 1.8 1.557 1.294 0.971 0.348 -6 ,29190 ,KEBNE ,17017920,Tue Dec 21 22:17:52 CET,Tue Dec 21 23:53:57 CET,0.0 0.464 0.744 0.989 1.215 1.417 1.603 1.787 2.104 2.237 2.364 2.505 2.745 2.861 3.084 3.309 3.531 3.634 3.825 4.015 4.293 4.464 4.63 4.869 5.091 5.313 5.528 5.728 5.984 6.231 6.476 6.77 7.043 7.302 7.59 7.894 8.176 8.496 8.843 9.22 9.627 10.044 10.498 10.962 11.473 11.992 12.534 13.09 13.634 14.122 14.49 14.367 13.976 13.516 13.054 12.606 12.137 11.661 11.257 10.856 10.488 10.133 9.793 9.47 9.163 8.875 8.57 8.29 8.031 7.764 7.494 7.271 7.021 6.764 6.577 6.371 6.15 5.921 5.689 5.53 5.362 5.101 4.916 4.723 4.619 4.402 4.182 3.939 3.811 3.55 3.374 3.225 3.07 2.731 2.54 2.333 2.11 1.884 1.64 1.337 0.708 -7 ,4792 ,KEBNE ,17017921,Tue Dec 21 22:17:52 CET,Tue Dec 21 23:53:53 CET,0.0 0.365 0.68 0.952 1.17 1.369 1.548 1.702 1.992 2.143 2.294 2.451 2.697 2.825 3.067 3.297 3.512 3.612 3.807 3.996 4.278 4.458 4.623 4.855 5.075 5.286 5.496 5.71 5.988 6.245 6.487 6.768 7.029 7.283 7.583 7.912 8.221 8.553 8.906 9.289 9.682 10.111 10.601 11.084 11.618 12.152 12.702 13.299 13.957 14.516 14.797 14.663 14.32 13.908 13.461 12.99 12.507 12.042 11.631 11.201 10.826 10.489 10.159 9.832 9.522 9.247 8.95 8.674 8.434 8.184 7.924 7.696 7.453 7.196 6.99 6.786 6.586 6.367 6.125 5.958 5.789 5.525 5.337 5.144 5.047 4.848 4.631 4.395 4.277 4.043 3.898 3.762 3.615 3.297 3.122 2.93 2.716 2.492 2.262 1.985 1.401 -8 ,19486 ,KEBNE ,17017922,Tue Dec 21 22:18:53 CET,Tue Dec 21 23:55:00 CET,0.0 0.443 0.727 0.963 1.18 1.386 1.569 1.733 2.048 2.206 2.36 2.498 2.738 2.861 3.086 3.291 3.489 3.589 3.789 3.986 4.258 4.436 4.612 4.856 5.087 5.306 5.511 5.713 5.96 6.199 6.445 6.739 7.005 7.26 7.554 7.867 8.177 8.517 8.859 9.218 9.582 9.964 10.423 10.867 11.363 11.911 12.469 12.992 13.499 13.99 14.364 14.333 14.005 13.582 13.144 12.674 12.218 11.762 11.359 10.95 10.598 10.288 9.95 9.6 9.266 8.954 8.628 8.338 8.085 7.829 7.571 7.358 7.123 6.879 6.691 6.483 6.255 6.017 5.76 5.573 5.396 5.125 4.93 4.731 4.627 4.416 4.196 3.95 3.817 3.559 3.377 3.23 3.073 2.721 2.525 2.314 2.097 1.862 1.604 1.305 0.913 -9 ,7136 ,KEBNE ,17017923,Tue Dec 21 22:19:55 CET,Tue Dec 21 23:55:33 CET,0.0 0.547 0.868 1.148 1.37 1.559 1.732 1.899 2.2 2.337 2.472 2.615 2.847 2.959 3.171 3.37 3.568 3.667 3.858 4.04 4.307 4.483 4.642 4.863 5.082 5.296 5.497 5.696 5.951 6.191 6.42 6.692 6.944 7.185 7.473 7.79 8.102 8.449 8.812 9.184 9.577 9.999 10.463 10.92 11.423 11.913 12.426 12.973 13.513 14.025 14.303 14.101 13.71 13.206 12.697 12.18 11.716 11.28 10.873 10.464 10.092 9.741 9.392 9.057 8.74 8.443 8.134 7.855 7.605 7.335 7.044 6.804 6.565 6.315 6.112 5.89 5.666 5.449 5.219 5.058 4.899 4.633 4.432 4.234 4.14 3.936 3.705 3.457 3.331 3.092 2.941 2.789 2.624 2.294 2.13 1.953 1.754 1.542 1.279 0.932 0.299 -10 ,28387 ,KEBNE ,17017924,Tue Dec 21 22:19:55 CET,Tue Dec 21 23:55:15 CET,0.0 0.427 0.676 0.903 1.103 1.295 1.477 1.649 1.962 2.118 2.274 2.427 2.665 2.788 3.017 3.238 3.462 3.571 3.776 3.974 4.25 4.419 4.583 4.831 5.064 5.288 5.514 5.732 6.01 6.291 6.558 6.856 7.142 7.409 7.698 8.008 8.305 8.634 8.969 9.303 9.65 10.062 10.539 10.967 11.43 11.937 12.485 13.022 13.562 14.068 14.36 14.204 13.824 13.336 12.808 12.301 11.833 11.386 10.983 10.556 10.182 9.85 9.505 9.164 8.847 8.541 8.21 7.907 7.643 7.367 7.071 6.829 6.576 6.312 6.11 5.896 5.669 5.429 5.174 4.998 4.814 4.52 4.312 4.088 3.97 3.728 3.468 3.201 3.063 2.81 2.637 2.489 2.345 2.029 1.842 1.654 1.446 1.225 0.992 0.711 0.153 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 36ad8c69..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14573 ,KEBNE ,17017925,Tue Dec 21 22:19:55 CET,Tue Dec 21 23:55:56 CET,0.0 0.445 0.713 0.928 1.13 1.3 1.465 1.634 1.938 2.078 2.223 2.391 2.629 2.75 2.981 3.188 3.379 3.48 3.677 3.861 4.125 4.302 4.48 4.731 4.97 5.209 5.434 5.635 5.883 6.129 6.377 6.664 6.936 7.192 7.476 7.786 8.08 8.402 8.738 9.087 9.429 9.795 10.231 10.662 11.114 11.538 11.961 12.389 12.784 13.111 13.221 12.787 12.113 11.386 10.719 10.085 9.47 8.894 8.37 7.837 7.364 6.91 6.464 6.039 5.635 5.264 4.887 4.547 4.254 3.946 3.619 3.343 3.055 2.761 2.531 2.297 2.045 1.776 1.499 1.301 1.088 0.758 0.532 0.301 0.189 -0.038 -0.273 -0.518 -0.661 -0.927 -1.13 -1.303 -1.473 -1.814 -2.006 -2.209 -2.427 -2.667 -2.953 -3.304 -3.98 -2 ,18690 ,KEBNE ,17017926,Tue Dec 21 22:19:55 CET,Tue Dec 21 23:57:06 CET,0.0 0.419 0.724 0.971 1.154 1.312 1.468 1.625 1.923 2.061 2.19 2.305 2.526 2.642 2.862 3.069 3.272 3.366 3.544 3.721 3.977 4.141 4.299 4.527 4.738 4.94 5.13 5.302 5.52 5.741 5.961 6.224 6.479 6.718 6.983 7.275 7.546 7.852 8.188 8.515 8.831 9.187 9.59 9.975 10.4 10.824 11.26 11.72 12.149 12.407 12.369 11.934 11.312 10.658 10.015 9.378 8.754 8.154 7.633 7.103 6.636 6.208 5.802 5.39 4.981 4.619 4.247 3.911 3.604 3.291 2.977 2.716 2.438 2.145 1.925 1.698 1.454 1.192 0.923 0.743 0.553 0.251 0.047 -0.17 -0.283 -0.514 -0.766 -1.046 -1.187 -1.445 -1.643 -1.801 -1.96 -2.311 -2.527 -2.76 -3.001 -3.271 -3.59 -4.012 -4.753 -3 ,10989 ,KEBNE ,17017927,Tue Dec 21 22:19:55 CET,Tue Dec 21 23:55:16 CET,0.0 0.366 0.643 0.881 1.078 1.259 1.425 1.577 1.859 1.995 2.123 2.248 2.47 2.585 2.812 3.01 3.196 3.286 3.458 3.631 3.882 4.037 4.185 4.395 4.596 4.79 4.973 5.15 5.389 5.613 5.818 6.071 6.304 6.523 6.786 7.081 7.363 7.672 7.981 8.283 8.596 8.928 9.313 9.691 10.1 10.518 10.947 11.385 11.757 12.038 12.088 11.652 11.026 10.382 9.77 9.181 8.646 8.115 7.624 7.111 6.636 6.212 5.818 5.46 5.114 4.762 4.397 4.087 3.807 3.517 3.218 2.968 2.707 2.427 2.203 1.968 1.724 1.459 1.193 1.02 0.833 0.539 0.328 0.097 -0.021 -0.262 -0.511 -0.778 -0.917 -1.181 -1.372 -1.54 -1.714 -2.062 -2.25 -2.459 -2.712 -3.008 -3.345 -3.749 -4.503 -4 ,26960 ,KEBNE ,17017928,Tue Dec 21 22:20:59 CET,Tue Dec 21 23:57:14 CET,0.0 0.406 0.695 0.909 1.093 1.278 1.451 1.614 1.908 2.044 2.176 2.309 2.533 2.644 2.856 3.057 3.253 3.348 3.536 3.717 3.974 4.137 4.298 4.524 4.735 4.94 5.138 5.329 5.573 5.805 6.015 6.247 6.484 6.727 6.991 7.272 7.547 7.858 8.192 8.533 8.861 9.207 9.581 9.932 10.325 10.739 11.181 11.586 11.959 12.26 12.252 11.797 11.196 10.59 9.991 9.359 8.78 8.229 7.722 7.233 6.807 6.388 5.991 5.62 5.26 4.927 4.581 4.258 3.982 3.701 3.397 3.138 2.869 2.578 2.344 2.108 1.866 1.621 1.357 1.168 0.967 0.666 0.469 0.267 0.156 -0.082 -0.324 -0.583 -0.715 -0.972 -1.16 -1.307 -1.462 -1.836 -2.038 -2.251 -2.496 -2.758 -3.056 -3.449 -4.292 -5 ,15893 ,KEBNE ,17017930,Tue Dec 21 22:20:59 CET,Tue Dec 21 23:58:56 CET,0.0 0.475 0.788 1.034 1.217 1.39 1.567 1.734 2.034 2.168 2.306 2.462 2.691 2.793 2.998 3.201 3.39 3.477 3.649 3.815 4.042 4.195 4.349 4.569 4.788 4.995 5.179 5.345 5.562 5.773 5.972 6.216 6.443 6.662 6.916 7.203 7.488 7.786 8.091 8.399 8.712 9.063 9.442 9.808 10.229 10.656 11.086 11.505 11.895 12.147 12.086 11.588 10.972 10.353 9.742 9.132 8.521 7.932 7.432 6.93 6.489 6.085 5.694 5.313 4.962 4.636 4.281 3.956 3.667 3.365 3.051 2.786 2.51 2.242 2.03 1.799 1.552 1.292 1.028 0.84 0.64 0.332 0.122 -0.095 -0.209 -0.456 -0.716 -0.981 -1.137 -1.407 -1.579 -1.738 -1.91 -2.285 -2.493 -2.705 -2.918 -3.148 -3.4 -3.705 -4.55 -6 ,54 ,KEBNE ,17017931,Tue Dec 21 22:21:03 CET,Tue Dec 21 23:51:38 CET,0.0 0.308 0.564 0.774 0.97 1.154 1.338 1.525 1.865 2.005 2.139 2.285 2.52 2.64 2.865 3.093 3.305 3.401 3.58 3.752 4.011 4.18 4.342 4.582 4.81 5.02 5.228 5.426 5.673 5.909 6.137 6.42 6.676 6.916 7.202 7.496 7.765 8.057 8.376 8.701 9.028 9.406 9.812 10.202 10.637 11.075 11.544 11.991 12.403 12.734 12.755 12.285 11.691 11.059 10.407 9.774 9.192 8.631 8.111 7.577 7.114 6.706 6.311 5.911 5.531 5.203 4.87 4.564 4.294 4.004 3.706 3.464 3.205 2.935 2.721 2.485 2.237 1.974 1.696 1.505 1.317 1.015 0.802 0.588 0.473 0.241 -0.012 -0.27 -0.399 -0.654 -0.864 -1.042 -1.218 -1.589 -1.782 -1.992 -2.206 -2.452 -2.742 -3.108 -3.723 -7 ,7956 ,KEBNE ,17017932,Tue Dec 21 22:22:00 CET,Tue Dec 21 23:57:22 CET,0.0 0.426 0.697 0.93 1.147 1.342 1.521 1.698 2.019 2.165 2.303 2.445 2.684 2.806 3.03 3.244 3.461 3.562 3.746 3.923 4.175 4.347 4.504 4.708 4.915 5.119 5.304 5.484 5.723 5.95 6.166 6.426 6.678 6.919 7.185 7.48 7.76 8.06 8.381 8.715 9.05 9.425 9.833 10.213 10.659 11.103 11.541 11.979 12.388 12.71 12.756 12.342 11.739 11.078 10.43 9.807 9.232 8.684 8.172 7.654 7.187 6.768 6.375 5.973 5.581 5.232 4.86 4.523 4.229 3.899 3.559 3.289 3.013 2.728 2.501 2.253 1.992 1.738 1.471 1.285 1.106 0.801 0.581 0.36 0.245 0.016 -0.218 -0.479 -0.623 -0.876 -1.047 -1.207 -1.381 -1.762 -1.965 -2.191 -2.432 -2.666 -2.919 -3.249 -3.673 -8 ,30261 ,KEBNE ,17017933,Tue Dec 21 22:23:02 CET,Tue Dec 21 23:58:56 CET,0.0 0.376 0.663 0.908 1.13 1.328 1.498 1.662 1.975 2.117 2.242 2.347 2.568 2.675 2.9 3.101 3.286 3.381 3.565 3.74 4.002 4.171 4.329 4.545 4.751 4.957 5.149 5.329 5.557 5.789 6.02 6.285 6.533 6.766 7.022 7.3 7.561 7.845 8.159 8.499 8.85 9.217 9.622 10.018 10.445 10.897 11.384 11.862 12.264 12.562 12.563 12.027 11.392 10.682 9.974 9.332 8.744 8.207 7.741 7.238 6.788 6.395 5.98 5.558 5.187 4.843 4.467 4.15 3.879 3.588 3.263 2.985 2.719 2.44 2.213 1.977 1.733 1.472 1.182 0.987 0.791 0.48 0.261 0.02 -0.104 -0.347 -0.611 -0.887 -1.024 -1.279 -1.457 -1.617 -1.789 -2.155 -2.363 -2.597 -2.826 -3.062 -3.349 -3.721 -4.259 -9 ,15528 ,KEBNE ,17017934,Tue Dec 21 22:23:04 CET,Tue Dec 21 23:56:05 CET,0.0 0.287 0.494 0.713 0.942 1.134 1.307 1.466 1.745 1.879 2.01 2.138 2.355 2.463 2.671 2.87 3.071 3.172 3.364 3.541 3.786 3.941 4.097 4.328 4.545 4.752 4.954 5.147 5.399 5.641 5.865 6.128 6.371 6.596 6.86 7.153 7.423 7.713 8.02 8.344 8.68 9.049 9.45 9.829 10.242 10.664 11.094 11.527 11.956 12.276 12.295 11.829 11.265 10.619 9.962 9.381 8.833 8.312 7.831 7.32 6.879 6.489 6.097 5.695 5.319 4.978 4.601 4.245 3.931 3.617 3.305 3.05 2.774 2.484 2.265 2.036 1.788 1.525 1.258 1.079 0.888 0.567 0.338 0.108 -0.019 -0.295 -0.566 -0.834 -0.978 -1.245 -1.457 -1.633 -1.824 -2.201 -2.383 -2.598 -2.836 -3.113 -3.434 -3.785 -4.3 -10 ,20371 ,KEBNE ,17017935,Tue Dec 21 22:25:06 CET,Wed Dec 22 00:01:08 CET,0.0 0.601 0.922 1.151 1.364 1.552 1.724 1.888 2.188 2.336 2.474 2.619 2.855 2.97 3.198 3.403 3.588 3.679 3.855 4.022 4.275 4.429 4.569 4.773 4.973 5.172 5.361 5.542 5.772 5.995 6.213 6.469 6.703 6.922 7.181 7.47 7.734 8.004 8.295 8.626 8.963 9.312 9.697 10.065 10.47 10.902 11.352 11.762 12.128 12.454 12.546 12.134 11.521 10.846 10.184 9.568 9.018 8.491 8.013 7.531 7.085 6.654 6.256 5.903 5.562 5.229 4.871 4.541 4.237 3.905 3.569 3.287 2.991 2.693 2.472 2.247 2.008 1.756 1.496 1.302 1.091 0.765 0.536 0.295 0.181 -0.051 -0.314 -0.599 -0.751 -1.024 -1.215 -1.374 -1.539 -1.89 -2.083 -2.295 -2.547 -2.814 -3.115 -3.469 -4.06 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt deleted file mode 100644 index 1831cdcd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9238 ,TETRA ,17413699,Sun Nov 21 16:14:07 CET,Sun Nov 21 18:24:10 CET,0.0 0.53 0.819 1.103 1.352 1.556 1.748 1.942 2.305 2.471 2.625 2.78 3.018 3.147 3.392 3.61 3.818 3.917 4.106 4.295 4.555 4.715 4.881 5.125 5.361 5.579 5.785 5.986 6.231 6.457 6.689 6.966 7.213 7.452 7.719 8.013 8.294 8.587 8.893 9.223 9.568 9.936 10.344 10.743 11.177 11.583 11.976 12.369 12.729 12.964 12.876 12.29 11.55 10.795 10.066 9.353 8.726 8.138 7.602 7.08 6.613 6.173 5.754 5.353 4.981 4.647 4.297 3.976 3.687 3.374 3.055 2.807 2.552 2.274 2.046 1.797 1.546 1.278 1.011 0.833 0.642 0.355 0.157 -0.052 -0.168 -0.412 -0.654 -0.917 -1.058 -1.319 -1.499 -1.651 -1.802 -2.126 -2.298 -2.485 -2.703 -2.942 -3.237 -3.596 -4.402 -2 ,25915 ,TETRA ,17413700,Sun Nov 21 16:14:08 CET,Sun Nov 21 18:23:16 CET,0.0 0.959 1.289 1.538 1.776 1.998 2.2 2.396 2.738 2.894 3.049 3.216 3.458 3.586 3.831 4.063 4.274 4.379 4.589 4.777 5.055 5.236 5.402 5.642 5.885 6.113 6.315 6.521 6.796 7.054 7.304 7.606 7.882 8.128 8.408 8.735 9.056 9.391 9.727 10.071 10.425 10.799 11.205 11.601 11.992 12.368 12.769 13.136 13.487 13.711 13.655 13.148 12.402 11.635 10.924 10.231 9.597 9.027 8.525 7.996 7.522 7.074 6.639 6.238 5.86 5.508 5.142 4.818 4.53 4.22 3.895 3.627 3.355 3.065 2.832 2.595 2.354 2.102 1.839 1.665 1.482 1.17 0.944 0.711 0.593 0.343 0.077 -0.214 -0.368 -0.64 -0.827 -0.99 -1.159 -1.534 -1.751 -1.976 -2.219 -2.474 -2.739 -3.063 -3.509 -3 ,16843 ,TETRA ,17413701,Sun Nov 21 16:14:07 CET,Sun Nov 21 18:25:16 CET,0.0 0.843 1.185 1.448 1.672 1.879 2.063 2.239 2.554 2.707 2.848 2.997 3.236 3.357 3.593 3.829 4.055 4.159 4.352 4.54 4.804 4.979 5.143 5.364 5.594 5.817 6.021 6.215 6.475 6.726 6.954 7.231 7.497 7.741 8.015 8.322 8.619 8.942 9.288 9.664 10.061 10.467 10.878 11.272 11.735 12.22 12.708 13.173 13.611 13.927 13.906 13.259 12.5 11.736 10.995 10.272 9.565 8.916 8.351 7.777 7.284 6.846 6.425 6.001 5.597 5.222 4.848 4.527 4.234 3.908 3.576 3.311 3.026 2.726 2.493 2.249 1.988 1.721 1.451 1.269 1.072 0.756 0.546 0.335 0.224 -0.013 -0.262 -0.529 -0.666 -0.917 -1.088 -1.241 -1.4 -1.764 -1.976 -2.196 -2.436 -2.674 -2.948 -3.295 -3.793 -4 ,23164 ,TETRA ,17413702,Sun Nov 21 16:14:38 CET,Sun Nov 21 18:08:20 CET,0.0 0.587 0.879 1.128 1.359 1.566 1.753 1.919 2.222 2.368 2.5 2.634 2.858 2.976 3.212 3.435 3.645 3.743 3.927 4.109 4.376 4.549 4.709 4.931 5.145 5.35 5.561 5.764 6.01 6.242 6.465 6.747 7.017 7.269 7.542 7.824 8.096 8.393 8.687 8.998 9.322 9.659 10.059 10.457 10.872 11.285 11.694 12.056 12.36 12.528 12.397 11.747 10.997 10.258 9.542 8.841 8.168 7.555 7.019 6.463 5.973 5.532 5.115 4.718 4.339 3.98 3.6 3.253 2.942 2.618 2.285 2.012 1.729 1.415 1.178 0.937 0.674 0.398 0.096 -0.119 -0.338 -0.675 -0.917 -1.169 -1.295 -1.552 -1.823 -2.113 -2.259 -2.524 -2.735 -2.902 -3.071 -3.456 -3.67 -3.891 -4.107 -4.341 -4.636 -4.954 -5.407 -6 ,22996 ,TETRA ,17413704,Sun Nov 21 16:14:38 CET,Sun Nov 21 18:23:52 CET,0.0 0.79 1.128 1.434 1.672 1.883 2.082 2.263 2.595 2.748 2.901 3.09 3.342 3.469 3.709 3.941 4.154 4.258 4.454 4.637 4.901 5.08 5.257 5.508 5.746 5.971 6.172 6.366 6.614 6.852 7.084 7.357 7.61 7.857 8.152 8.465 8.749 9.05 9.386 9.735 10.079 10.441 10.834 11.201 11.592 12.004 12.452 12.861 13.205 13.439 13.318 12.609 11.734 10.908 10.158 9.463 8.81 8.21 7.675 7.116 6.643 6.231 5.818 5.404 5.019 4.671 4.299 3.973 3.684 3.38 3.071 2.808 2.526 2.239 2.015 1.778 1.543 1.297 1.034 0.856 0.677 0.397 0.202 0.0 -0.104 -0.326 -0.56 -0.821 -0.963 -1.22 -1.404 -1.555 -1.696 -2.009 -2.197 -2.39 -2.59 -2.815 -3.094 -3.431 -3.941 -7 ,7374 ,TETRA ,17413705,Sun Nov 21 16:14:38 CET,Sun Nov 21 18:23:52 CET,0.0 0.746 1.064 1.295 1.514 1.733 1.935 2.121 2.483 2.645 2.783 2.937 3.177 3.295 3.518 3.737 3.959 4.063 4.259 4.462 4.754 4.932 5.109 5.357 5.58 5.791 5.992 6.183 6.421 6.654 6.878 7.151 7.415 7.668 7.96 8.271 8.551 8.847 9.168 9.499 9.832 10.212 10.644 11.03 11.445 11.899 12.377 12.799 13.183 13.462 13.377 12.864 12.217 11.509 10.791 10.128 9.503 8.899 8.387 7.869 7.407 6.985 6.559 6.151 5.783 5.42 5.029 4.698 4.413 4.113 3.801 3.544 3.268 2.962 2.726 2.477 2.23 1.988 1.735 1.556 1.363 1.05 0.837 0.628 0.519 0.28 0.037 -0.211 -0.344 -0.604 -0.789 -0.951 -1.118 -1.482 -1.672 -1.877 -2.1 -2.345 -2.613 -2.936 -3.473 -8 ,25025 ,TETRA ,17413706,Sun Nov 21 16:14:38 CET,Sun Nov 21 18:24:50 CET,0.0 1.093 1.425 1.672 1.921 2.162 2.377 2.576 2.929 3.079 3.221 3.366 3.607 3.736 3.978 4.196 4.41 4.515 4.702 4.878 5.145 5.32 5.494 5.745 5.976 6.197 6.399 6.585 6.841 7.079 7.302 7.576 7.835 8.081 8.357 8.651 8.927 9.229 9.559 9.906 10.254 10.625 11.036 11.413 11.835 12.279 12.721 13.12 13.456 13.64 13.435 12.821 12.065 11.274 10.542 9.858 9.227 8.647 8.116 7.542 7.069 6.653 6.235 5.821 5.43 5.08 4.714 4.386 4.104 3.816 3.493 3.219 2.938 2.632 2.395 2.16 1.912 1.643 1.367 1.177 0.975 0.665 0.443 0.205 0.09 -0.138 -0.381 -0.645 -0.786 -1.053 -1.257 -1.423 -1.573 -1.885 -2.079 -2.292 -2.528 -2.804 -3.121 -3.49 -4.34 -9 ,19267 ,TETRA ,17413707,Sun Nov 21 16:14:38 CET,Sun Nov 21 18:23:29 CET,0.0 0.875 1.258 1.547 1.781 1.998 2.193 2.367 2.701 2.862 3.02 3.189 3.427 3.55 3.779 3.996 4.203 4.309 4.512 4.691 4.95 5.124 5.303 5.551 5.776 5.993 6.2 6.402 6.652 6.881 7.106 7.375 7.621 7.857 8.134 8.453 8.747 9.06 9.397 9.735 10.081 10.479 10.919 11.32 11.747 12.179 12.651 13.104 13.492 13.712 13.547 12.963 12.245 11.515 10.797 10.12 9.509 8.932 8.422 7.879 7.39 6.971 6.57 6.177 5.806 5.46 5.097 4.763 4.474 4.185 3.883 3.624 3.357 3.074 2.856 2.623 2.374 2.118 1.854 1.67 1.473 1.171 0.963 0.74 0.624 0.402 0.173 -0.079 -0.205 -0.454 -0.626 -0.765 -0.913 -1.221 -1.393 -1.59 -1.797 -2.027 -2.285 -2.565 -3.096 -10 ,5670 ,TETRA ,17413708,Sun Nov 21 16:14:38 CET,Sun Nov 21 18:24:45 CET,0.0 0.512 0.823 1.091 1.321 1.534 1.725 1.901 2.248 2.408 2.56 2.733 2.978 3.107 3.361 3.606 3.823 3.93 4.141 4.333 4.606 4.787 4.958 5.198 5.429 5.647 5.859 6.066 6.315 6.556 6.801 7.093 7.36 7.612 7.899 8.207 8.507 8.834 9.167 9.496 9.831 10.19 10.587 10.963 11.361 11.793 12.232 12.64 13.005 13.263 13.237 12.654 11.905 11.18 10.505 9.862 9.262 8.7 8.194 7.656 7.179 6.749 6.34 5.946 5.571 5.233 4.879 4.563 4.283 3.984 3.678 3.406 3.115 2.837 2.607 2.362 2.131 1.858 1.558 1.366 1.165 0.853 0.637 0.413 0.301 0.064 -0.175 -0.407 -0.533 -0.79 -0.948 -1.099 -1.262 -1.596 -1.788 -1.992 -2.226 -2.494 -2.761 -3.082 -3.658 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index a3aaa530..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18172 ,KEBNE ,17017936,Tue Dec 21 22:25:10 CET,Tue Dec 21 23:59:45 CET,0.0 0.662 0.922 1.131 1.32 1.493 1.647 1.792 2.076 2.211 2.336 2.466 2.694 2.811 3.035 3.236 3.43 3.526 3.707 3.883 4.132 4.284 4.431 4.654 4.872 5.073 5.262 5.444 5.675 5.898 6.116 6.381 6.62 6.847 7.12 7.404 7.658 7.935 8.228 8.519 8.813 9.145 9.508 9.874 10.289 10.686 11.092 11.534 11.948 12.176 12.06 11.499 10.842 10.155 9.466 8.813 8.217 7.646 7.123 6.592 6.089 5.623 5.178 4.755 4.36 3.976 3.564 3.189 2.876 2.559 2.216 1.939 1.652 1.336 1.092 0.841 0.584 0.326 0.041 -0.16 -0.38 -0.739 -0.989 -1.24 -1.364 -1.619 -1.89 -2.184 -2.337 -2.605 -2.84 -3.022 -3.198 -3.558 -3.756 -3.971 -4.231 -4.535 -4.896 -5.369 -6.497 -2 ,782 ,KEBNE ,17017937,Tue Dec 21 22:25:06 CET,Wed Dec 22 00:00:51 CET,0.0 0.314 0.556 0.764 0.956 1.137 1.306 1.467 1.747 1.879 2.013 2.157 2.378 2.482 2.698 2.909 3.11 3.203 3.387 3.561 3.809 3.972 4.122 4.333 4.528 4.711 4.892 5.078 5.316 5.54 5.746 5.997 6.244 6.479 6.745 7.029 7.295 7.58 7.888 8.221 8.551 8.892 9.275 9.645 10.048 10.462 10.852 11.189 11.482 11.687 11.635 10.998 10.217 9.471 8.78 8.126 7.494 6.873 6.319 5.754 5.269 4.816 4.345 3.892 3.469 3.063 2.62 2.241 1.912 1.559 1.204 0.909 0.583 0.238 -0.03 -0.291 -0.542 -0.818 -1.12 -1.326 -1.545 -1.898 -2.144 -2.407 -2.543 -2.823 -3.132 -3.475 -3.644 -3.93 -4.177 -4.375 -4.585 -5.044 -5.293 -5.558 -5.847 -6.171 -6.547 -7.064 -8.386 -3 ,12711 ,KEBNE ,17017938,Tue Dec 21 22:25:10 CET,Tue Dec 21 23:54:30 CET,0.0 0.367 0.631 0.859 1.061 1.261 1.449 1.609 1.883 2.016 2.145 2.286 2.52 2.636 2.876 3.091 3.276 3.367 3.552 3.729 3.989 4.145 4.289 4.507 4.72 4.919 5.104 5.284 5.521 5.746 5.954 6.2 6.437 6.659 6.908 7.197 7.484 7.769 8.06 8.386 8.712 9.04 9.41 9.78 10.165 10.519 10.891 11.264 11.57 11.801 11.703 11.012 10.245 9.516 8.812 8.063 7.373 6.76 6.216 5.672 5.19 4.722 4.252 3.794 3.359 2.989 2.585 2.197 1.858 1.489 1.11 0.771 0.401 0.057 -0.196 -0.47 -0.768 -1.096 -1.436 -1.652 -1.881 -2.266 -2.53 -2.808 -2.963 -3.291 -3.64 -3.984 -4.16 -4.479 -4.789 -5.016 -5.254 -5.746 -5.99 -6.259 -6.558 -6.887 -7.275 -7.736 -8.72 -4 ,22029 ,KEBNE ,17017939,Tue Dec 21 22:25:06 CET,Wed Dec 22 00:00:05 CET,0.0 0.505 0.785 1.007 1.191 1.355 1.524 1.694 1.988 2.117 2.239 2.368 2.6 2.717 2.938 3.144 3.349 3.446 3.627 3.799 4.04 4.2 4.356 4.571 4.776 4.98 5.163 5.335 5.567 5.789 6.003 6.259 6.506 6.741 7.001 7.293 7.573 7.868 8.17 8.47 8.79 9.142 9.522 9.881 10.264 10.674 11.096 11.468 11.8 12.005 11.834 11.301 10.598 9.808 9.102 8.408 7.758 7.172 6.638 6.067 5.576 5.131 4.688 4.267 3.875 3.518 3.133 2.774 2.464 2.13 1.786 1.515 1.214 0.88 0.622 0.354 0.076 -0.217 -0.52 -0.725 -0.932 -1.268 -1.521 -1.787 -1.925 -2.213 -2.51 -2.802 -2.952 -3.221 -3.462 -3.663 -3.869 -4.299 -4.537 -4.8 -5.086 -5.403 -5.797 -6.304 -7.331 -5 ,5087 ,KEBNE ,17017940,Tue Dec 21 22:25:06 CET,Tue Dec 21 23:59:07 CET,0.0 0.483 0.77 0.995 1.165 1.32 1.472 1.628 1.918 2.043 2.166 2.295 2.517 2.622 2.822 3.011 3.2 3.29 3.462 3.633 3.868 4.018 4.161 4.359 4.551 4.741 4.929 5.109 5.34 5.558 5.766 6.021 6.252 6.459 6.699 6.977 7.251 7.546 7.843 8.145 8.465 8.818 9.213 9.593 10.004 10.436 10.884 11.305 11.677 11.97 11.901 11.297 10.59 9.88 9.203 8.575 7.979 7.386 6.832 6.263 5.751 5.289 4.849 4.406 3.973 3.585 3.189 2.822 2.501 2.178 1.838 1.558 1.283 0.992 0.743 0.473 0.196 -0.087 -0.389 -0.599 -0.804 -1.122 -1.349 -1.587 -1.709 -1.982 -2.296 -2.641 -2.814 -3.088 -3.298 -3.473 -3.665 -4.078 -4.297 -4.544 -4.815 -5.146 -5.524 -5.946 -6.846 -6 ,9819 ,KEBNE ,17017941,Tue Dec 21 22:25:10 CET,Tue Dec 21 23:54:08 CET,0.0 0.35 0.632 0.863 1.057 1.239 1.406 1.571 1.877 2.012 2.135 2.256 2.476 2.589 2.802 3.005 3.198 3.29 3.466 3.634 3.877 4.029 4.177 4.395 4.601 4.799 4.99 5.174 5.41 5.629 5.836 6.085 6.31 6.529 6.794 7.091 7.362 7.634 7.912 8.227 8.549 8.878 9.248 9.611 10.003 10.381 10.779 11.132 11.421 11.551 11.345 10.734 9.998 9.25 8.511 7.764 7.055 6.371 5.789 5.216 4.698 4.227 3.773 3.32 2.88 2.5 2.116 1.775 1.471 1.152 0.833 0.552 0.248 -0.068 -0.306 -0.552 -0.809 -1.067 -1.342 -1.537 -1.746 -2.082 -2.323 -2.584 -2.72 -2.975 -3.212 -3.481 -3.636 -3.908 -4.13 -4.308 -4.505 -4.948 -5.183 -5.43 -5.699 -5.998 -6.351 -6.822 -8.03 -7 ,15508 ,KEBNE ,17017942,Tue Dec 21 22:25:07 CET,Tue Dec 21 23:56:47 CET,0.0 0.52 0.792 0.997 1.194 1.392 1.562 1.714 1.99 2.114 2.231 2.348 2.574 2.683 2.873 3.063 3.251 3.339 3.505 3.656 3.866 4.008 4.155 4.373 4.586 4.786 4.974 5.156 5.385 5.601 5.807 6.052 6.275 6.489 6.743 7.018 7.278 7.562 7.858 8.174 8.504 8.856 9.242 9.61 9.994 10.369 10.746 11.096 11.448 11.654 11.46 10.865 10.15 9.388 8.686 7.992 7.341 6.746 6.193 5.664 5.226 4.792 4.343 3.918 3.515 3.125 2.716 2.348 2.043 1.714 1.368 1.085 0.771 0.436 0.186 -0.067 -0.339 -0.616 -0.905 -1.106 -1.311 -1.655 -1.9 -2.164 -2.302 -2.581 -2.861 -3.152 -3.314 -3.591 -3.822 -4.01 -4.201 -4.599 -4.817 -5.068 -5.343 -5.639 -5.987 -6.435 -7.321 -8 ,25104 ,KEBNE ,17017943,Tue Dec 21 22:25:10 CET,Tue Dec 21 23:57:26 CET,0.0 0.323 0.584 0.78 0.952 1.132 1.3 1.45 1.749 1.884 1.997 2.106 2.318 2.421 2.62 2.805 2.982 3.07 3.241 3.404 3.649 3.808 3.955 4.167 4.375 4.568 4.755 4.942 5.182 5.403 5.605 5.85 6.09 6.308 6.555 6.833 7.092 7.375 7.684 7.999 8.31 8.643 9.004 9.35 9.724 10.113 10.547 10.961 11.33 11.574 11.491 10.92 10.229 9.551 8.856 8.165 7.545 6.969 6.438 5.895 5.411 4.969 4.533 4.09 3.672 3.309 2.9 2.51 2.172 1.821 1.486 1.208 0.908 0.587 0.32 0.044 -0.246 -0.552 -0.86 -1.073 -1.292 -1.611 -1.835 -2.073 -2.194 -2.463 -2.763 -3.105 -3.284 -3.559 -3.768 -3.956 -4.162 -4.624 -4.873 -5.128 -5.416 -5.76 -6.163 -6.623 -7.651 -9 ,8865 ,KEBNE ,17017944,Tue Dec 21 22:26:08 CET,Wed Dec 22 00:00:59 CET,0.0 0.383 0.686 0.948 1.153 1.349 1.533 1.697 2.003 2.143 2.269 2.386 2.611 2.725 2.939 3.141 3.335 3.426 3.611 3.79 4.039 4.204 4.359 4.577 4.786 4.977 5.157 5.339 5.583 5.804 6.006 6.257 6.495 6.709 6.958 7.237 7.51 7.794 8.075 8.368 8.67 9.004 9.383 9.73 10.107 10.497 10.896 11.275 11.624 11.915 11.855 11.258 10.515 9.788 9.069 8.33 7.626 6.966 6.377 5.751 5.201 4.695 4.192 3.738 3.332 2.938 2.519 2.135 1.802 1.456 1.086 0.774 0.436 0.068 -0.22 -0.497 -0.764 -1.043 -1.348 -1.563 -1.786 -2.156 -2.422 -2.692 -2.826 -3.091 -3.382 -3.696 -3.85 -4.133 -4.383 -4.572 -4.773 -5.222 -5.465 -5.706 -5.959 -6.258 -6.685 -7.234 -8.216 -10 ,8014 ,KEBNE ,17017945,Tue Dec 21 22:26:08 CET,Wed Dec 22 00:00:40 CET,0.0 0.344 0.572 0.768 0.963 1.136 1.302 1.461 1.725 1.847 1.971 2.097 2.316 2.427 2.645 2.851 3.054 3.152 3.33 3.498 3.745 3.904 4.068 4.323 4.567 4.786 4.981 5.164 5.404 5.636 5.851 6.1 6.338 6.563 6.816 7.102 7.388 7.685 7.986 8.293 8.598 8.919 9.276 9.614 9.988 10.394 10.805 11.19 11.524 11.75 11.669 11.103 10.41 9.714 9.047 8.371 7.731 7.11 6.555 5.976 5.48 5.072 4.674 4.283 3.911 3.574 3.201 2.847 2.547 2.23 1.88 1.577 1.266 0.962 0.714 0.44 0.168 -0.109 -0.402 -0.615 -0.842 -1.187 -1.416 -1.649 -1.77 -2.042 -2.33 -2.613 -2.754 -3.028 -3.269 -3.443 -3.634 -4.025 -4.236 -4.477 -4.724 -5.007 -5.335 -5.746 -6.59 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt deleted file mode 100644 index 68f57a10..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14015 ,KEBNE ,17017946,Tue Dec 21 22:26:09 CET,Wed Dec 22 00:01:42 CET,0.0 0.305 0.529 0.744 0.946 1.128 1.284 1.426 1.693 1.814 1.937 2.064 2.282 2.388 2.598 2.802 2.994 3.088 3.27 3.436 3.679 3.842 4.0 4.234 4.457 4.664 4.865 5.056 5.295 5.513 5.715 5.959 6.203 6.447 6.723 7.023 7.296 7.567 7.858 8.182 8.516 8.885 9.276 9.637 10.059 10.512 10.998 11.466 11.889 12.238 12.35 11.934 11.371 10.764 10.135 9.528 8.965 8.435 7.932 7.408 6.963 6.561 6.175 5.801 5.44 5.1 4.762 4.469 4.205 3.929 3.642 3.399 3.13 2.84 2.615 2.387 2.153 1.915 1.658 1.479 1.295 1.007 0.816 0.607 0.488 0.246 -0.004 -0.262 -0.387 -0.631 -0.804 -0.954 -1.112 -1.413 -1.568 -1.739 -1.92 -2.154 -2.43 -2.752 -3.211 -3 ,22573 ,KEBNE ,17017948,Tue Dec 21 22:26:08 CET,Wed Dec 22 00:00:43 CET,0.0 0.373 0.657 0.87 1.083 1.282 1.454 1.619 1.924 2.063 2.194 2.34 2.572 2.691 2.924 3.142 3.346 3.443 3.625 3.793 4.048 4.212 4.361 4.585 4.826 5.048 5.244 5.439 5.697 5.944 6.17 6.435 6.691 6.939 7.225 7.532 7.807 8.108 8.428 8.751 9.089 9.474 9.917 10.34 10.802 11.257 11.709 12.175 12.62 12.984 13.081 12.636 12.033 11.4 10.781 10.209 9.661 9.144 8.686 8.182 7.701 7.257 6.832 6.414 6.023 5.655 5.274 4.926 4.602 4.271 3.933 3.647 3.36 3.073 2.855 2.638 2.404 2.16 1.915 1.74 1.554 1.251 1.041 0.839 0.735 0.514 0.275 0.023 -0.104 -0.342 -0.493 -0.634 -0.789 -1.146 -1.335 -1.529 -1.742 -1.967 -2.213 -2.504 -2.951 -4 ,535 ,KEBNE ,17017949,Tue Dec 21 22:27:12 CET,Wed Dec 22 00:01:32 CET,0.0 0.343 0.585 0.798 0.989 1.175 1.349 1.506 1.822 1.974 2.113 2.271 2.51 2.636 2.856 3.063 3.267 3.363 3.54 3.714 3.974 4.143 4.314 4.565 4.807 5.029 5.234 5.427 5.683 5.925 6.152 6.425 6.683 6.938 7.231 7.551 7.84 8.143 8.462 8.793 9.131 9.495 9.89 10.286 10.732 11.176 11.636 12.09 12.511 12.831 12.921 12.576 12.026 11.421 10.807 10.209 9.669 9.133 8.645 8.126 7.68 7.276 6.881 6.518 6.165 5.838 5.484 5.151 4.86 4.559 4.249 3.996 3.729 3.444 3.221 2.99 2.755 2.515 2.257 2.069 1.883 1.596 1.393 1.178 1.066 0.838 0.609 0.357 0.222 -0.018 -0.183 -0.343 -0.514 -0.864 -1.044 -1.241 -1.459 -1.717 -1.987 -2.284 -3.087 -5 ,22086 ,KEBNE ,17017950,Tue Dec 21 22:27:12 CET,Wed Dec 22 00:01:06 CET,0.0 0.602 0.883 1.091 1.285 1.467 1.627 1.775 2.042 2.173 2.306 2.43 2.655 2.767 2.986 3.194 3.387 3.473 3.649 3.83 4.078 4.231 4.381 4.607 4.818 5.017 5.222 5.42 5.665 5.908 6.137 6.398 6.646 6.885 7.16 7.461 7.747 8.068 8.397 8.728 9.059 9.408 9.828 10.233 10.682 11.166 11.615 12.031 12.457 12.838 12.902 12.431 11.763 11.063 10.404 9.77 9.207 8.656 8.126 7.592 7.13 6.702 6.27 5.853 5.483 5.125 4.733 4.376 4.061 3.75 3.434 3.16 2.891 2.622 2.4 2.175 1.942 1.699 1.46 1.287 1.089 0.774 0.558 0.336 0.221 -0.014 -0.255 -0.513 -0.647 -0.897 -1.076 -1.232 -1.401 -1.778 -1.979 -2.192 -2.432 -2.699 -2.983 -3.376 -4.102 -6 ,12233 ,KEBNE ,17017951,Tue Dec 21 22:27:12 CET,Wed Dec 22 00:01:57 CET,0.0 0.571 0.881 1.13 1.363 1.551 1.713 1.87 2.143 2.267 2.389 2.522 2.753 2.862 3.074 3.29 3.499 3.599 3.791 3.98 4.261 4.435 4.598 4.824 5.042 5.256 5.461 5.66 5.92 6.171 6.397 6.669 6.929 7.169 7.456 7.762 8.029 8.337 8.678 9.019 9.36 9.748 10.187 10.584 11.014 11.446 11.888 12.318 12.731 13.031 12.981 12.573 12.038 11.404 10.807 10.218 9.65 9.111 8.621 8.12 7.679 7.279 6.892 6.525 6.174 5.85 5.494 5.169 4.889 4.608 4.315 4.055 3.788 3.518 3.297 3.049 2.797 2.546 2.287 2.107 1.913 1.61 1.412 1.202 1.09 0.865 0.634 0.391 0.257 -0.006 -0.197 -0.35 -0.515 -0.89 -1.097 -1.316 -1.527 -1.759 -2.081 -2.456 -2.974 -7 ,19953 ,KEBNE ,17017952,Tue Dec 21 22:27:12 CET,Wed Dec 22 00:02:10 CET,0.0 0.411 0.667 0.883 1.082 1.271 1.448 1.606 1.901 2.037 2.169 2.312 2.539 2.654 2.877 3.083 3.275 3.371 3.555 3.728 3.972 4.126 4.272 4.486 4.695 4.9 5.103 5.298 5.543 5.775 5.996 6.268 6.533 6.781 7.051 7.34 7.618 7.924 8.255 8.595 8.947 9.342 9.767 10.162 10.595 11.032 11.481 11.933 12.373 12.738 12.82 12.432 11.833 11.138 10.471 9.852 9.25 8.684 8.201 7.699 7.273 6.898 6.503 6.119 5.78 5.467 5.113 4.785 4.501 4.2 3.888 3.628 3.368 3.109 2.899 2.678 2.448 2.202 1.94 1.755 1.564 1.267 1.065 0.849 0.738 0.506 0.258 0.001 -0.14 -0.391 -0.566 -0.711 -0.865 -1.22 -1.423 -1.641 -1.857 -2.079 -2.353 -2.673 -3.205 -8 ,7268 ,KEBNE ,17017953,Tue Dec 21 22:28:14 CET,Wed Dec 22 00:03:21 CET,0.0 0.365 0.642 0.868 1.072 1.258 1.422 1.584 1.891 2.032 2.174 2.323 2.546 2.655 2.861 3.074 3.291 3.402 3.625 3.825 4.104 4.285 4.458 4.701 4.931 5.15 5.373 5.585 5.84 6.09 6.336 6.641 6.931 7.187 7.485 7.825 8.147 8.498 8.846 9.2 9.58 9.981 10.429 10.877 11.369 11.891 12.434 12.913 13.367 13.782 13.892 13.463 12.806 12.125 11.461 10.803 10.193 9.621 9.108 8.578 8.116 7.696 7.3 6.942 6.6 6.272 5.936 5.646 5.39 5.11 4.795 4.509 4.207 3.906 3.683 3.451 3.202 2.953 2.689 2.501 2.303 1.996 1.778 1.54 1.423 1.185 0.921 0.645 0.507 0.25 0.092 -0.052 -0.219 -0.588 -0.783 -0.979 -1.197 -1.462 -1.741 -2.073 -2.593 -9 ,1963 ,KEBNE ,17017954,Tue Dec 21 22:28:14 CET,Wed Dec 22 00:04:39 CET,0.0 0.375 0.662 0.905 1.135 1.323 1.481 1.632 1.933 2.078 2.209 2.336 2.562 2.675 2.893 3.088 3.281 3.374 3.554 3.732 3.994 4.157 4.308 4.522 4.734 4.939 5.132 5.32 5.565 5.796 6.003 6.254 6.499 6.722 6.983 7.279 7.552 7.847 8.181 8.535 8.88 9.255 9.669 10.057 10.488 10.937 11.41 11.845 12.205 12.459 12.429 11.976 11.371 10.764 10.161 9.565 9.002 8.444 7.945 7.428 6.974 6.574 6.186 5.804 5.431 5.076 4.709 4.379 4.077 3.756 3.408 3.118 2.816 2.495 2.244 1.999 1.753 1.484 1.212 1.032 0.845 0.541 0.334 0.117 0.001 -0.234 -0.486 -0.759 -0.898 -1.15 -1.326 -1.485 -1.664 -2.054 -2.258 -2.464 -2.691 -2.931 -3.225 -3.635 -4.285 -10 ,20375 ,KEBNE ,17017955,Tue Dec 21 22:28:18 CET,Wed Dec 22 00:00:06 CET,0.0 0.418 0.7 0.951 1.158 1.327 1.499 1.667 1.963 2.103 2.236 2.39 2.629 2.752 2.985 3.215 3.429 3.529 3.724 3.915 4.189 4.365 4.527 4.753 4.976 5.192 5.394 5.587 5.842 6.092 6.33 6.603 6.859 7.113 7.41 7.729 8.02 8.345 8.692 9.063 9.462 9.881 10.325 10.746 11.228 11.719 12.216 12.743 13.264 13.637 13.67 13.228 12.584 11.882 11.226 10.576 9.971 9.398 8.853 8.303 7.827 7.379 6.946 6.534 6.144 5.781 5.39 5.019 4.689 4.352 4.0 3.715 3.437 3.144 2.894 2.634 2.371 2.101 1.811 1.604 1.402 1.099 0.889 0.67 0.559 0.323 0.056 -0.229 -0.375 -0.628 -0.8 -0.953 -1.12 -1.499 -1.706 -1.904 -2.107 -2.326 -2.573 -2.884 -3.397 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 1704e536..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20709 ,KEBNE ,17017956,Tue Dec 21 22:28:14 CET,Wed Dec 22 00:03:08 CET,0.0 0.41 0.69 0.936 1.151 1.344 1.533 1.706 2.032 2.186 2.333 2.474 2.696 2.81 3.023 3.216 3.402 3.494 3.682 3.871 4.149 4.317 4.471 4.692 4.899 5.101 5.294 5.473 5.707 5.93 6.138 6.387 6.621 6.839 7.088 7.361 7.631 7.931 8.251 8.574 8.892 9.223 9.577 9.927 10.312 10.709 11.104 11.456 11.763 11.898 11.731 11.082 10.262 9.431 8.635 7.894 7.198 6.546 5.954 5.312 4.766 4.278 3.81 3.345 2.893 2.48 2.055 1.64 1.266 0.897 0.502 0.168 -0.181 -0.548 -0.842 -1.151 -1.474 -1.809 -2.143 -2.382 -2.648 -3.058 -3.357 -3.666 -3.818 -4.127 -4.479 -4.859 -5.052 -5.381 -5.728 -5.942 -6.185 -6.736 -7.047 -7.425 -7.841 -8.295 -8.854 -9.755 -13.355 -2 ,3309 ,KEBNE ,17017957,Tue Dec 21 22:28:14 CET,Wed Dec 22 00:02:44 CET,0.0 0.405 0.699 0.951 1.175 1.371 1.554 1.718 2.026 2.17 2.31 2.474 2.711 2.832 3.05 3.251 3.446 3.538 3.707 3.87 4.121 4.288 4.444 4.658 4.859 5.065 5.256 5.434 5.666 5.887 6.111 6.377 6.621 6.852 7.1 7.368 7.653 7.957 8.274 8.604 8.922 9.258 9.607 9.966 10.376 10.742 11.119 11.525 11.91 12.163 11.992 11.411 10.709 9.911 9.141 8.369 7.616 6.922 6.289 5.597 4.962 4.393 3.859 3.322 2.808 2.345 1.86 1.4 0.981 0.558 0.129 -0.24 -0.628 -1.014 -1.316 -1.646 -2.002 -2.381 -2.767 -3.03 -3.317 -3.786 -4.084 -4.369 -4.521 -4.846 -5.206 -5.6 -5.804 -6.129 -6.512 -6.756 -6.986 -7.572 -7.917 -8.276 -8.71 -9.156 -9.689 -10.357 -12.86 -3 ,4503 ,KEBNE ,17017958,Tue Dec 21 22:28:14 CET,Wed Dec 22 00:03:20 CET,0.0 0.467 0.736 0.949 1.151 1.336 1.492 1.636 1.925 2.068 2.205 2.371 2.611 2.723 2.933 3.145 3.346 3.447 3.645 3.835 4.108 4.282 4.453 4.702 4.926 5.127 5.321 5.505 5.737 5.956 6.172 6.441 6.693 6.924 7.179 7.455 7.721 8.012 8.311 8.62 8.947 9.299 9.688 10.07 10.478 10.879 11.318 11.766 12.142 12.387 12.316 11.669 10.864 10.027 9.219 8.469 7.771 7.085 6.461 5.836 5.282 4.75 4.228 3.758 3.312 2.893 2.463 2.061 1.707 1.332 0.934 0.611 0.268 -0.083 -0.352 -0.638 -0.943 -1.268 -1.615 -1.874 -2.143 -2.535 -2.808 -3.101 -3.244 -3.569 -3.93 -4.279 -4.454 -4.745 -5.039 -5.267 -5.491 -5.998 -6.294 -6.585 -6.895 -7.34 -7.898 -8.557 -10.703 -4 ,32052 ,KEBNE ,17017959,Tue Dec 21 22:28:14 CET,Wed Dec 22 00:03:12 CET,0.0 0.47 0.746 0.997 1.22 1.415 1.588 1.759 2.078 2.233 2.386 2.557 2.791 2.913 3.148 3.371 3.583 3.684 3.89 4.093 4.378 4.558 4.722 4.953 5.175 5.387 5.586 5.785 6.037 6.259 6.476 6.732 6.964 7.199 7.469 7.755 8.018 8.296 8.602 8.961 9.32 9.675 10.073 10.453 10.866 11.294 11.715 12.108 12.474 12.701 12.594 11.927 11.122 10.308 9.494 8.698 7.963 7.296 6.707 6.076 5.5 4.964 4.434 3.957 3.508 3.082 2.63 2.204 1.832 1.446 1.043 0.712 0.362 -0.02 -0.318 -0.631 -0.973 -1.306 -1.638 -1.88 -2.125 -2.496 -2.761 -3.038 -3.192 -3.52 -3.84 -4.171 -4.361 -4.673 -4.976 -5.223 -5.482 -6.018 -6.315 -6.64 -7.025 -7.459 -7.917 -8.53 -11.658 -5 ,1907 ,KEBNE ,17017960,Tue Dec 21 22:28:14 CET,Wed Dec 22 00:03:36 CET,0.0 0.7 1.018 1.271 1.505 1.716 1.895 2.056 2.343 2.484 2.632 2.786 3.019 3.137 3.353 3.568 3.77 3.864 4.046 4.217 4.468 4.628 4.789 5.025 5.254 5.471 5.669 5.867 6.13 6.374 6.591 6.847 7.102 7.335 7.584 7.863 8.14 8.448 8.767 9.078 9.395 9.769 10.191 10.574 10.97 11.399 11.88 12.354 12.764 13.006 12.94 12.373 11.635 10.825 9.997 9.246 8.538 7.822 7.18 6.526 5.924 5.348 4.796 4.307 3.882 3.487 3.05 2.62 2.228 1.807 1.358 0.988 0.594 0.152 -0.182 -0.497 -0.839 -1.225 -1.619 -1.877 -2.146 -2.587 -2.891 -3.218 -3.391 -3.731 -4.099 -4.486 -4.698 -5.026 -5.347 -5.588 -5.863 -6.475 -6.78 -7.111 -7.496 -7.901 -8.403 -9.157 -12.304 -6 ,10811 ,KEBNE ,17017961,Tue Dec 21 22:28:14 CET,Wed Dec 22 00:03:11 CET,0.0 0.465 0.746 0.977 1.173 1.347 1.507 1.669 1.962 2.095 2.221 2.342 2.556 2.66 2.861 3.056 3.24 3.335 3.525 3.699 3.944 4.103 4.258 4.476 4.688 4.893 5.077 5.255 5.492 5.71 5.92 6.173 6.414 6.646 6.907 7.198 7.469 7.77 8.112 8.472 8.844 9.252 9.694 10.118 10.572 11.03 11.503 11.947 12.284 12.492 12.44 11.826 11.037 10.218 9.404 8.593 7.839 7.139 6.529 5.932 5.382 4.873 4.388 3.893 3.424 3.008 2.55 2.127 1.747 1.372 1.008 0.684 0.334 -0.025 -0.326 -0.645 -0.944 -1.237 -1.541 -1.762 -1.998 -2.411 -2.737 -3.073 -3.239 -3.562 -3.905 -4.299 -4.516 -4.86 -5.241 -5.479 -5.723 -6.273 -6.562 -6.88 -7.273 -7.68 -8.137 -8.717 -10.503 -7 ,15323 ,KEBNE ,17017962,Tue Dec 21 22:28:14 CET,Wed Dec 22 00:05:00 CET,0.0 0.43 0.656 0.866 1.085 1.295 1.463 1.615 1.922 2.075 2.228 2.425 2.673 2.798 3.039 3.254 3.462 3.566 3.763 3.952 4.236 4.419 4.595 4.858 5.114 5.356 5.579 5.805 6.097 6.365 6.622 6.925 7.224 7.496 7.773 8.069 8.353 8.681 9.031 9.371 9.726 10.137 10.589 11.015 11.472 11.949 12.437 12.89 13.284 13.533 13.435 12.702 11.865 11.074 10.291 9.525 8.795 8.082 7.46 6.832 6.284 5.772 5.288 4.834 4.383 3.966 3.52 3.109 2.743 2.358 1.927 1.555 1.185 0.787 0.465 0.157 -0.148 -0.473 -0.805 -1.043 -1.298 -1.694 -1.977 -2.267 -2.419 -2.758 -3.117 -3.49 -3.685 -4.015 -4.362 -4.602 -4.849 -5.375 -5.638 -5.906 -6.235 -6.629 -7.13 -7.799 -11.114 -8 ,29088 ,KEBNE ,17017963,Tue Dec 21 22:28:14 CET,Wed Dec 22 00:03:00 CET,0.0 0.359 0.583 0.795 0.985 1.147 1.305 1.464 1.757 1.892 2.029 2.188 2.415 2.53 2.759 2.987 3.197 3.297 3.495 3.687 3.956 4.132 4.304 4.554 4.799 5.03 5.249 5.462 5.739 5.983 6.193 6.451 6.697 6.941 7.217 7.51 7.799 8.109 8.425 8.755 9.102 9.47 9.885 10.279 10.696 11.125 11.54 11.934 12.327 12.584 12.461 11.831 11.07 10.274 9.515 8.759 8.028 7.332 6.658 5.942 5.345 4.786 4.233 3.735 3.274 2.85 2.398 1.998 1.643 1.254 0.847 0.498 0.123 -0.263 -0.56 -0.865 -1.175 -1.484 -1.81 -2.06 -2.334 -2.743 -3.028 -3.353 -3.535 -3.897 -4.241 -4.601 -4.808 -5.151 -5.541 -5.816 -6.101 -6.683 -7.021 -7.444 -7.962 -8.492 -9.073 -9.879 -13.084 -9 ,6187 ,KEBNE ,17017964,Tue Dec 21 22:28:14 CET,Wed Dec 22 00:03:42 CET,0.0 0.31 0.538 0.731 0.92 1.118 1.315 1.502 1.853 2.007 2.143 2.292 2.521 2.645 2.892 3.125 3.337 3.438 3.635 3.82 4.076 4.252 4.431 4.681 4.923 5.166 5.391 5.605 5.878 6.125 6.36 6.657 6.944 7.209 7.5 7.816 8.115 8.444 8.797 9.155 9.531 9.935 10.364 10.804 11.29 11.756 12.248 12.715 13.098 13.289 13.169 12.605 11.865 11.093 10.322 9.558 8.818 8.088 7.44 6.777 6.216 5.724 5.253 4.786 4.309 3.872 3.414 3.002 2.623 2.21 1.787 1.441 1.09 0.718 0.42 0.104 -0.237 -0.609 -0.97 -1.201 -1.447 -1.842 -2.127 -2.463 -2.646 -2.985 -3.318 -3.681 -3.882 -4.21 -4.565 -4.809 -5.064 -5.641 -5.971 -6.329 -6.717 -7.152 -7.755 -8.553 -10.714 -10 ,31578 ,KEBNE ,17017965,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:06:45 CET,0.0 0.611 0.934 1.192 1.407 1.599 1.763 1.915 2.211 2.347 2.481 2.63 2.867 2.994 3.236 3.462 3.688 3.795 3.994 4.178 4.446 4.622 4.794 5.043 5.278 5.508 5.726 5.93 6.186 6.429 6.67 6.959 7.228 7.493 7.788 8.092 8.389 8.717 9.048 9.376 9.698 10.035 10.389 10.718 11.095 11.499 11.94 12.367 12.702 12.863 12.682 12.05 11.262 10.433 9.634 8.874 8.164 7.474 6.84 6.201 5.66 5.165 4.684 4.228 3.806 3.406 2.951 2.543 2.215 1.881 1.506 1.172 0.813 0.42 0.111 -0.198 -0.522 -0.86 -1.213 -1.466 -1.756 -2.215 -2.506 -2.808 -2.964 -3.28 -3.656 -4.091 -4.3 -4.613 -4.907 -5.138 -5.397 -5.909 -6.213 -6.568 -6.934 -7.35 -7.882 -8.631 -10.448 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt deleted file mode 100644 index f3d313ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,12206 ,KEBNE ,17017967,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:07:12 CET,0.0 0.926 1.324 1.577 1.798 2.022 2.236 2.414 2.743 2.907 3.076 3.272 3.521 3.65 3.878 4.103 4.311 4.406 4.595 4.782 5.042 5.205 5.369 5.606 5.826 6.03 6.227 6.434 6.691 6.923 7.149 7.425 7.682 7.918 8.191 8.509 8.808 9.117 9.44 9.751 10.044 10.349 10.676 10.976 11.307 11.639 11.926 12.162 12.304 12.169 11.503 10.304 9.091 7.982 6.997 6.054 5.185 4.385 3.678 2.945 2.317 1.759 1.213 0.7 0.22 -0.221 -0.693 -1.113 -1.467 -1.826 -2.217 -2.564 -2.926 -3.322 -3.623 -3.915 -4.219 -4.536 -4.864 -5.101 -5.343 -5.701 -5.946 -6.207 -6.344 -6.63 -6.926 -7.23 -7.393 -7.689 -7.977 -8.189 -8.397 -8.846 -9.087 -9.327 -9.617 -9.946 -10.353 -10.939 -12.232 -3 ,25294 ,KEBNE ,17017968,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:05:52 CET,0.0 0.847 1.195 1.46 1.719 1.944 2.144 2.323 2.657 2.819 2.982 3.175 3.417 3.545 3.771 3.985 4.21 4.323 4.529 4.728 5.0 5.156 5.313 5.55 5.789 6.019 6.224 6.413 6.652 6.884 7.108 7.362 7.588 7.822 8.1 8.391 8.657 8.944 9.251 9.556 9.861 10.184 10.524 10.832 11.159 11.494 11.839 12.088 12.213 12.168 11.648 10.637 9.55 8.477 7.508 6.612 5.788 4.999 4.329 3.634 3.016 2.491 1.984 1.503 1.039 0.6 0.151 -0.258 -0.631 -1.023 -1.439 -1.781 -2.12 -2.477 -2.761 -3.046 -3.325 -3.616 -3.941 -4.168 -4.394 -4.75 -5.0 -5.252 -5.382 -5.644 -5.931 -6.266 -6.45 -6.741 -7.005 -7.215 -7.425 -7.865 -8.126 -8.42 -8.733 -9.082 -9.548 -10.125 -11.357 -4 ,27483 ,KEBNE ,17017969,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:06:44 CET,0.0 0.956 1.274 1.549 1.778 2.001 2.196 2.376 2.735 2.898 3.046 3.216 3.457 3.589 3.832 4.047 4.245 4.339 4.534 4.726 5.002 5.164 5.319 5.548 5.761 5.955 6.141 6.326 6.55 6.763 6.974 7.223 7.459 7.69 7.944 8.221 8.484 8.754 9.054 9.379 9.698 10.016 10.343 10.647 10.972 11.305 11.638 11.921 12.09 12.038 11.489 10.423 9.311 8.254 7.262 6.341 5.506 4.728 4.076 3.386 2.766 2.218 1.682 1.164 0.698 0.276 -0.169 -0.566 -0.905 -1.256 -1.621 -1.944 -2.294 -2.646 -2.912 -3.185 -3.475 -3.789 -4.122 -4.348 -4.578 -4.944 -5.194 -5.447 -5.579 -5.845 -6.141 -6.469 -6.633 -6.917 -7.163 -7.361 -7.572 -8.036 -8.305 -8.588 -8.873 -9.193 -9.581 -10.094 -11.964 -5 ,23879 ,KEBNE ,17017970,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:08:59 CET,0.0 0.654 1.022 1.289 1.506 1.715 1.905 2.083 2.414 2.569 2.712 2.853 3.077 3.196 3.429 3.652 3.868 3.971 4.168 4.36 4.636 4.812 4.977 5.198 5.417 5.634 5.834 6.028 6.285 6.522 6.733 6.973 7.202 7.453 7.743 8.049 8.336 8.635 8.933 9.228 9.528 9.871 10.256 10.577 10.892 11.221 11.519 11.721 11.799 11.691 11.113 10.036 8.908 7.839 6.901 6.026 5.237 4.483 3.806 3.135 2.567 2.062 1.577 1.113 0.664 0.24 -0.205 -0.605 -0.967 -1.354 -1.748 -2.065 -2.397 -2.761 -3.037 -3.323 -3.622 -3.923 -4.247 -4.463 -4.67 -5.005 -5.248 -5.496 -5.63 -5.909 -6.191 -6.496 -6.65 -6.935 -7.184 -7.367 -7.573 -8.061 -8.325 -8.577 -8.831 -9.143 -9.547 -10.1 -11.568 -6 ,9531 ,KEBNE ,17017971,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:07:11 CET,0.0 1.025 1.321 1.616 1.87 2.117 2.375 2.59 2.949 3.119 3.276 3.459 3.692 3.822 4.104 4.365 4.596 4.706 4.913 5.102 5.375 5.556 5.738 6.012 6.27 6.5 6.714 6.926 7.209 7.458 7.683 7.959 8.219 8.485 8.794 9.119 9.414 9.715 10.034 10.365 10.722 11.119 11.535 11.932 12.345 12.723 13.053 13.329 13.541 13.563 13.106 12.023 10.886 9.772 8.766 7.891 7.143 6.402 5.72 5.03 4.421 3.875 3.352 2.843 2.365 1.931 1.445 1.002 0.629 0.237 -0.165 -0.507 -0.871 -1.256 -1.551 -1.842 -2.143 -2.463 -2.807 -3.054 -3.304 -3.682 -3.94 -4.199 -4.335 -4.629 -4.935 -5.265 -5.435 -5.717 -5.942 -6.125 -6.319 -6.736 -6.976 -7.232 -7.507 -7.851 -8.289 -8.83 -10.107 -7 ,24542 ,KEBNE ,17017972,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:06:14 CET,0.0 0.973 1.294 1.566 1.83 2.052 2.23 2.39 2.701 2.833 2.955 3.112 3.351 3.481 3.726 3.959 4.172 4.27 4.475 4.677 4.952 5.126 5.293 5.532 5.767 5.989 6.198 6.401 6.659 6.899 7.12 7.374 7.623 7.875 8.168 8.493 8.791 9.102 9.412 9.733 10.072 10.444 10.861 11.264 11.715 12.089 12.393 12.662 12.822 12.771 12.223 11.131 10.084 9.083 8.13 7.285 6.531 5.799 5.119 4.42 3.824 3.277 2.739 2.22 1.758 1.354 0.915 0.51 0.164 -0.196 -0.576 -0.894 -1.244 -1.61 -1.884 -2.176 -2.48 -2.8 -3.132 -3.353 -3.587 -3.957 -4.221 -4.497 -4.639 -4.943 -5.252 -5.561 -5.721 -6.01 -6.254 -6.446 -6.679 -7.242 -7.545 -7.83 -8.132 -8.489 -8.951 -9.525 -10.866 -8 ,25496 ,KEBNE ,17017973,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:08:13 CET,0.0 1.095 1.533 1.873 2.121 2.357 2.584 2.78 3.147 3.316 3.474 3.674 3.934 4.081 4.344 4.584 4.818 4.933 5.173 5.408 5.717 5.907 6.089 6.358 6.641 6.901 7.134 7.37 7.652 7.893 8.128 8.417 8.69 8.949 9.247 9.563 9.846 10.142 10.493 10.86 11.19 11.521 11.888 12.243 12.59 12.96 13.375 13.686 13.788 13.697 13.138 11.958 10.765 9.651 8.653 7.741 6.894 6.087 5.37 4.65 4.003 3.442 2.924 2.43 1.977 1.555 1.096 0.693 0.344 -0.025 -0.404 -0.716 -1.034 -1.364 -1.618 -1.893 -2.184 -2.482 -2.783 -2.992 -3.214 -3.572 -3.825 -4.081 -4.214 -4.496 -4.795 -5.138 -5.324 -5.626 -5.888 -6.089 -6.286 -6.719 -6.974 -7.24 -7.532 -7.897 -8.368 -8.945 -10.753 -9 ,849 ,KEBNE ,17017974,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:07:00 CET,0.0 0.894 1.246 1.53 1.784 2.016 2.233 2.451 2.869 3.057 3.229 3.433 3.692 3.838 4.122 4.386 4.632 4.756 4.988 5.196 5.483 5.671 5.855 6.116 6.375 6.642 6.889 7.101 7.373 7.63 7.869 8.137 8.38 8.62 8.901 9.223 9.515 9.821 10.174 10.525 10.855 11.197 11.538 11.866 12.244 12.687 13.124 13.487 13.788 13.862 13.409 12.351 11.194 10.106 9.105 8.157 7.299 6.501 5.775 5.026 4.381 3.801 3.265 2.735 2.226 1.768 1.29 0.863 0.482 0.086 -0.324 -0.657 -1.003 -1.372 -1.664 -1.972 -2.291 -2.62 -2.971 -3.22 -3.472 -3.858 -4.128 -4.413 -4.557 -4.869 -5.204 -5.537 -5.704 -5.993 -6.257 -6.467 -6.699 -7.192 -7.459 -7.748 -8.052 -8.384 -8.828 -9.434 -10.833 -10 ,23239 ,KEBNE ,17017975,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:06:48 CET,0.0 0.934 1.363 1.666 1.918 2.144 2.328 2.493 2.803 2.944 3.076 3.229 3.459 3.573 3.785 3.996 4.203 4.3 4.492 4.669 4.915 5.076 5.231 5.462 5.678 5.888 6.095 6.291 6.54 6.769 6.996 7.295 7.572 7.828 8.101 8.392 8.674 8.965 9.26 9.563 9.859 10.18 10.514 10.811 11.136 11.439 11.743 12.024 12.164 12.033 11.405 10.237 9.169 8.174 7.169 6.245 5.432 4.676 4.019 3.322 2.694 2.139 1.614 1.12 0.679 0.278 -0.157 -0.56 -0.93 -1.313 -1.717 -2.065 -2.414 -2.771 -3.033 -3.304 -3.605 -3.929 -4.264 -4.488 -4.722 -5.07 -5.304 -5.547 -5.68 -5.981 -6.283 -6.58 -6.743 -7.027 -7.265 -7.465 -7.68 -8.119 -8.353 -8.624 -8.942 -9.263 -9.625 -10.099 -11.438 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 338bdcd1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,29362 ,TETRA ,17413740,Sun Nov 21 16:15:15 CET,Sun Nov 21 18:22:35 CET,0.0 0.911 1.253 1.528 1.762 1.973 2.155 2.318 2.626 2.774 2.911 3.075 3.315 3.437 3.673 3.909 4.122 4.222 4.427 4.625 4.895 5.06 5.212 5.443 5.665 5.863 6.048 6.229 6.466 6.688 6.91 7.182 7.434 7.666 7.919 8.195 8.452 8.72 8.993 9.273 9.573 9.909 10.284 10.633 11.0 11.344 11.646 11.895 12.074 12.125 11.749 10.838 9.903 8.955 8.043 7.199 6.419 5.68 5.031 4.364 3.786 3.253 2.719 2.216 1.75 1.324 0.874 0.465 0.109 -0.271 -0.69 -1.049 -1.407 -1.772 -2.071 -2.388 -2.714 -3.064 -3.43 -3.676 -3.946 -4.384 -4.673 -4.967 -5.119 -5.444 -5.802 -6.18 -6.376 -6.682 -6.949 -7.164 -7.407 -7.942 -8.23 -8.538 -8.866 -9.274 -9.819 -10.509 -12.312 -4 ,19683 ,TETRA ,17413742,Sun Nov 21 16:15:13 CET,Sun Nov 21 18:21:28 CET,0.0 0.665 0.966 1.226 1.47 1.688 1.898 2.099 2.444 2.603 2.765 2.96 3.202 3.318 3.55 3.787 4.021 4.132 4.322 4.504 4.772 4.939 5.106 5.349 5.576 5.788 5.989 6.179 6.418 6.648 6.869 7.131 7.391 7.641 7.91 8.191 8.453 8.734 9.025 9.323 9.616 9.948 10.343 10.696 11.041 11.42 11.835 12.187 12.389 12.351 11.887 10.95 9.973 8.985 8.036 7.161 6.384 5.629 4.935 4.228 3.604 3.042 2.52 2.026 1.54 1.076 0.589 0.159 -0.208 -0.583 -0.98 -1.317 -1.668 -2.032 -2.31 -2.598 -2.901 -3.222 -3.548 -3.771 -3.999 -4.356 -4.62 -4.896 -5.039 -5.344 -5.663 -5.986 -6.156 -6.452 -6.742 -6.955 -7.182 -7.669 -7.927 -8.225 -8.53 -8.91 -9.401 -9.973 -11.219 -5 ,5581 ,TETRA ,17413743,Sun Nov 21 16:15:13 CET,Sun Nov 21 18:22:45 CET,0.0 0.748 1.079 1.354 1.602 1.835 2.055 2.248 2.586 2.743 2.892 3.071 3.32 3.456 3.706 3.925 4.123 4.217 4.406 4.589 4.847 5.014 5.171 5.404 5.637 5.869 6.095 6.314 6.586 6.829 7.057 7.328 7.585 7.828 8.103 8.413 8.709 9.018 9.329 9.647 9.965 10.316 10.704 11.076 11.455 11.82 12.171 12.458 12.723 12.879 12.593 11.797 10.894 9.932 9.008 8.164 7.4 6.686 6.039 5.366 4.771 4.234 3.716 3.228 2.753 2.314 1.889 1.519 1.184 0.83 0.452 0.121 -0.224 -0.577 -0.855 -1.157 -1.48 -1.808 -2.139 -2.37 -2.611 -2.986 -3.248 -3.525 -3.673 -3.971 -4.297 -4.668 -4.861 -5.18 -5.542 -5.798 -6.065 -6.638 -6.927 -7.212 -7.502 -7.863 -8.329 -8.916 -10.413 -6 ,1954 ,TETRA ,17413744,Sun Nov 21 16:15:14 CET,Sun Nov 21 18:22:47 CET,0.0 0.782 1.1 1.364 1.602 1.829 2.029 2.211 2.528 2.669 2.8 2.954 3.185 3.298 3.531 3.752 3.951 4.044 4.224 4.404 4.672 4.847 5.016 5.266 5.505 5.725 5.935 6.138 6.391 6.616 6.814 7.043 7.264 7.486 7.742 8.004 8.261 8.559 8.877 9.191 9.489 9.795 10.12 10.407 10.732 11.058 11.349 11.621 11.802 11.779 11.377 10.495 9.554 8.61 7.689 6.832 6.077 5.38 4.749 4.081 3.484 2.964 2.495 2.046 1.589 1.156 0.696 0.265 -0.112 -0.495 -0.889 -1.228 -1.572 -1.917 -2.203 -2.522 -2.854 -3.206 -3.562 -3.799 -4.059 -4.486 -4.796 -5.108 -5.253 -5.544 -5.873 -6.231 -6.411 -6.71 -7.005 -7.222 -7.449 -7.968 -8.233 -8.511 -8.864 -9.266 -9.707 -10.27 -12.456 -8 ,850 ,TETRA ,17413746,Sun Nov 21 16:15:13 CET,Sun Nov 21 18:20:38 CET,0.0 0.877 1.224 1.501 1.725 1.925 2.097 2.267 2.615 2.776 2.925 3.076 3.301 3.424 3.662 3.871 4.058 4.154 4.348 4.531 4.769 4.929 5.105 5.352 5.574 5.78 5.979 6.169 6.413 6.655 6.879 7.135 7.382 7.619 7.887 8.18 8.456 8.759 9.098 9.458 9.817 10.207 10.594 10.927 11.289 11.629 11.983 12.33 12.56 12.56 12.102 11.209 10.264 9.306 8.386 7.488 6.663 5.909 5.263 4.609 4.016 3.475 2.942 2.429 1.956 1.528 1.086 0.672 0.281 -0.127 -0.548 -0.904 -1.257 -1.626 -1.919 -2.228 -2.552 -2.87 -3.194 -3.423 -3.66 -4.047 -4.323 -4.6 -4.74 -5.037 -5.353 -5.689 -5.873 -6.172 -6.437 -6.641 -6.86 -7.333 -7.587 -7.866 -8.182 -8.524 -8.926 -9.433 -11.064 -10 ,8162 ,TETRA ,17413748,Sun Nov 21 16:15:17 CET,Sun Nov 21 18:19:38 CET,0.0 0.706 1.007 1.248 1.476 1.687 1.86 2.033 2.389 2.543 2.681 2.834 3.067 3.193 3.424 3.633 3.837 3.937 4.119 4.287 4.553 4.731 4.899 5.13 5.353 5.573 5.777 5.967 6.204 6.436 6.661 6.922 7.154 7.367 7.616 7.886 8.145 8.419 8.721 9.057 9.382 9.695 10.032 10.342 10.656 10.932 11.202 11.457 11.615 11.631 11.213 10.315 9.379 8.414 7.462 6.548 5.722 4.969 4.288 3.61 3.042 2.51 1.98 1.475 0.983 0.516 0.056 -0.342 -0.695 -1.076 -1.485 -1.819 -2.164 -2.53 -2.814 -3.092 -3.392 -3.72 -4.071 -4.317 -4.565 -4.958 -5.225 -5.5 -5.645 -5.942 -6.267 -6.616 -6.798 -7.105 -7.401 -7.617 -7.852 -8.376 -8.663 -8.958 -9.264 -9.614 -10.004 -10.507 -12.268 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 7d951113..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5119 ,KEBNE ,17017976,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:09:55 CET,0.0 0.454 0.737 0.975 1.196 1.395 1.581 1.758 2.087 2.242 2.385 2.532 2.783 2.914 3.164 3.392 3.623 3.737 3.941 4.132 4.408 4.588 4.764 5.011 5.25 5.481 5.707 5.929 6.207 6.474 6.725 7.017 7.307 7.591 7.893 8.207 8.537 8.909 9.288 9.7 10.167 10.687 11.258 11.85 12.558 13.244 13.914 14.628 15.373 16.053 16.534 16.528 16.137 15.636 15.154 14.655 14.186 13.754 13.366 12.944 12.563 12.221 11.89 11.565 11.236 10.936 10.62 10.321 10.065 9.79 9.495 9.257 9.02 8.768 8.559 8.348 8.125 7.888 7.645 7.468 7.287 7.02 6.835 6.639 6.535 6.309 6.07 5.809 5.682 5.431 5.243 5.087 4.928 4.604 4.433 4.244 4.037 3.778 3.463 3.13 2.487 -2 ,23384 ,KEBNE ,17017977,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:09:09 CET,0.0 0.37 0.662 0.934 1.168 1.389 1.581 1.748 2.071 2.23 2.381 2.524 2.76 2.886 3.137 3.371 3.594 3.7 3.908 4.12 4.438 4.638 4.827 5.099 5.36 5.606 5.847 6.079 6.368 6.651 6.92 7.246 7.558 7.857 8.209 8.595 8.95 9.345 9.757 10.162 10.604 11.071 11.59 12.111 12.664 13.27 13.937 14.63 15.384 16.074 16.565 16.553 16.17 15.68 15.194 14.71 14.229 13.747 13.318 12.871 12.453 12.064 11.696 11.331 10.977 10.667 10.351 10.073 9.83 9.565 9.277 9.034 8.791 8.534 8.321 8.099 7.876 7.654 7.418 7.244 7.069 6.799 6.604 6.402 6.3 6.092 5.872 5.63 5.502 5.261 5.099 4.957 4.813 4.506 4.335 4.146 3.946 3.714 3.422 3.049 2.425 -3 ,2215 ,KEBNE ,17017978,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:08:48 CET,0.0 0.447 0.767 1.02 1.254 1.451 1.632 1.81 2.13 2.271 2.407 2.556 2.805 2.931 3.184 3.422 3.643 3.747 3.946 4.136 4.418 4.597 4.771 5.028 5.275 5.512 5.744 5.981 6.288 6.567 6.819 7.12 7.415 7.7 8.027 8.396 8.748 9.13 9.528 9.937 10.38 10.863 11.393 11.944 12.542 13.159 13.818 14.442 15.047 15.679 16.254 16.239 15.86 15.413 14.916 14.366 13.867 13.415 12.978 12.492 12.061 11.68 11.321 10.977 10.656 10.352 10.021 9.712 9.436 9.151 8.859 8.618 8.375 8.119 7.91 7.68 7.432 7.179 6.926 6.757 6.583 6.294 6.093 5.888 5.776 5.551 5.323 5.073 4.946 4.708 4.539 4.397 4.244 3.916 3.737 3.532 3.325 3.119 2.886 2.579 1.884 -4 ,25607 ,KEBNE ,17017979,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:08:06 CET,0.0 0.394 0.682 0.907 1.116 1.317 1.508 1.69 2.013 2.166 2.315 2.474 2.737 2.875 3.144 3.407 3.662 3.783 4.004 4.212 4.517 4.708 4.887 5.155 5.436 5.723 6.002 6.26 6.58 6.876 7.15 7.49 7.818 8.102 8.399 8.744 9.081 9.446 9.819 10.224 10.705 11.219 11.767 12.318 12.915 13.524 14.194 14.867 15.47 16.036 16.522 16.489 16.144 15.7 15.204 14.699 14.205 13.7 13.25 12.81 12.402 12.014 11.643 11.293 10.956 10.638 10.312 10.025 9.769 9.493 9.195 8.946 8.705 8.451 8.238 8.019 7.8 7.557 7.283 7.098 6.922 6.648 6.455 6.256 6.157 5.951 5.728 5.493 5.368 5.128 4.97 4.828 4.675 4.337 4.147 3.928 3.701 3.447 3.172 2.878 2.467 -5 ,21778 ,KEBNE ,17017980,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:09:10 CET,0.0 0.411 0.706 0.929 1.152 1.345 1.524 1.696 2.005 2.147 2.288 2.435 2.688 2.82 3.06 3.295 3.519 3.628 3.838 4.032 4.305 4.478 4.651 4.9 5.136 5.371 5.603 5.831 6.13 6.407 6.683 7.041 7.357 7.638 7.97 8.343 8.691 9.058 9.428 9.813 10.24 10.724 11.271 11.78 12.342 12.965 13.645 14.431 15.327 16.174 16.804 16.902 16.66 16.232 15.751 15.249 14.72 14.232 13.817 13.369 12.962 12.58 12.192 11.821 11.485 11.173 10.839 10.537 10.272 10.001 9.708 9.464 9.207 8.934 8.73 8.518 8.286 8.045 7.799 7.621 7.436 7.166 6.98 6.781 6.676 6.461 6.24 5.999 5.874 5.623 5.425 5.261 5.092 4.752 4.573 4.368 4.149 3.928 3.688 3.391 2.84 -6 ,24502 ,KEBNE ,17017981,Tue Dec 21 22:31:20 CET,Wed Dec 22 00:09:22 CET,0.0 0.412 0.676 0.901 1.096 1.288 1.482 1.656 1.986 2.143 2.284 2.438 2.684 2.806 3.045 3.275 3.493 3.594 3.785 3.973 4.244 4.414 4.581 4.819 5.051 5.27 5.481 5.698 5.972 6.221 6.46 6.761 7.069 7.37 7.695 8.038 8.377 8.739 9.118 9.523 9.949 10.435 10.977 11.498 12.117 12.836 13.592 14.292 15.031 15.708 16.069 15.938 15.572 15.132 14.663 14.151 13.643 13.163 12.724 12.254 11.846 11.482 11.118 10.761 10.426 10.116 9.8 9.522 9.274 9.013 8.732 8.495 8.248 7.983 7.779 7.565 7.344 7.123 6.885 6.722 6.555 6.277 6.085 5.887 5.784 5.577 5.356 5.126 5.004 4.765 4.624 4.489 4.339 4.005 3.819 3.62 3.421 3.185 2.913 2.6 1.84 -7 ,22585 ,KEBNE ,17017982,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:08:07 CET,0.0 0.342 0.598 0.852 1.056 1.254 1.445 1.617 1.952 2.114 2.266 2.427 2.682 2.819 3.098 3.353 3.582 3.691 3.897 4.094 4.374 4.556 4.736 5.003 5.253 5.484 5.707 5.927 6.215 6.491 6.755 7.072 7.376 7.66 7.976 8.325 8.647 8.99 9.363 9.771 10.192 10.649 11.155 11.644 12.214 12.799 13.431 14.124 14.839 15.501 16.014 16.012 15.67 15.148 14.611 14.109 13.599 13.121 12.695 12.244 11.853 11.489 11.128 10.781 10.447 10.138 9.801 9.499 9.237 8.961 8.675 8.43 8.172 7.9 7.696 7.487 7.254 7.006 6.749 6.569 6.39 6.12 5.919 5.714 5.61 5.382 5.141 4.887 4.757 4.514 4.343 4.198 4.046 3.71 3.521 3.322 3.111 2.885 2.644 2.389 2.016 -8 ,4547 ,KEBNE ,17017983,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:08:50 CET,0.0 0.419 0.689 0.936 1.164 1.363 1.545 1.728 2.059 2.197 2.331 2.477 2.715 2.833 3.065 3.291 3.499 3.598 3.792 3.98 4.26 4.448 4.622 4.88 5.135 5.374 5.608 5.832 6.116 6.383 6.634 6.935 7.215 7.478 7.776 8.1 8.431 8.796 9.163 9.554 9.973 10.423 10.931 11.437 11.989 12.565 13.213 13.942 14.693 15.333 15.746 15.668 15.356 14.975 14.513 14.009 13.559 13.134 12.729 12.308 11.93 11.573 11.217 10.86 10.523 10.215 9.894 9.61 9.356 9.082 8.79 8.545 8.286 8.018 7.813 7.602 7.373 7.133 6.891 6.715 6.535 6.264 6.08 5.883 5.778 5.561 5.335 5.101 4.98 4.735 4.549 4.404 4.247 3.891 3.697 3.501 3.303 3.064 2.771 2.458 1.95 -9 ,18332 ,KEBNE ,17017984,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:09:21 CET,0.0 0.603 0.906 1.145 1.328 1.498 1.686 1.871 2.188 2.347 2.494 2.632 2.882 3.009 3.253 3.483 3.688 3.783 3.968 4.167 4.471 4.663 4.845 5.101 5.337 5.567 5.805 6.034 6.322 6.592 6.861 7.205 7.541 7.856 8.191 8.547 8.876 9.228 9.615 10.033 10.458 10.94 11.532 12.12 12.764 13.441 14.09 14.755 15.57 16.343 16.846 16.799 16.372 15.878 15.383 14.872 14.389 13.926 13.493 13.03 12.624 12.252 11.878 11.523 11.184 10.861 10.528 10.233 9.98 9.711 9.433 9.202 8.958 8.705 8.501 8.288 8.061 7.811 7.546 7.379 7.202 6.901 6.699 6.488 6.38 6.148 5.901 5.656 5.527 5.288 5.137 4.987 4.829 4.517 4.333 4.12 3.901 3.657 3.395 3.073 2.471 -10 ,22004 ,KEBNE ,17017985,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:08:21 CET,0.0 0.524 0.852 1.11 1.356 1.582 1.774 1.96 2.307 2.458 2.602 2.772 3.042 3.192 3.45 3.683 3.911 4.02 4.23 4.434 4.735 4.925 5.109 5.377 5.633 5.879 6.115 6.345 6.643 6.927 7.203 7.523 7.822 8.115 8.46 8.841 9.202 9.608 10.022 10.41 10.792 11.212 11.711 12.241 12.844 13.48 14.193 14.896 15.57 16.204 16.587 16.492 16.17 15.725 15.238 14.751 14.253 13.747 13.307 12.871 12.466 12.1 11.761 11.42 11.077 10.76 10.443 10.158 9.904 9.648 9.385 9.162 8.923 8.668 8.465 8.256 8.034 7.796 7.559 7.389 7.208 6.941 6.742 6.522 6.413 6.199 5.961 5.711 5.585 5.339 5.168 5.018 4.861 4.533 4.351 4.155 3.927 3.65 3.361 3.066 2.635 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index a6a802f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32501 ,KEBNE ,17017986,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:08:20 CET,0.0 0.807 1.158 1.451 1.711 1.953 2.175 2.364 2.714 2.885 3.055 3.255 3.528 3.675 3.951 4.192 4.431 4.553 4.786 5.009 5.324 5.52 5.715 5.996 6.26 6.522 6.785 7.035 7.347 7.636 7.911 8.236 8.574 8.915 9.287 9.678 10.036 10.413 10.808 11.229 11.669 12.176 12.736 13.272 13.87 14.496 15.211 15.904 16.551 17.103 17.432 17.204 16.737 16.193 15.631 15.099 14.597 14.077 13.59 13.118 12.696 12.306 11.929 11.57 11.236 10.916 10.572 10.253 9.974 9.693 9.4 9.161 8.91 8.641 8.433 8.217 7.992 7.756 7.504 7.327 7.153 6.897 6.717 6.516 6.414 6.212 6.0 5.765 5.644 5.415 5.27 5.138 4.999 4.693 4.537 4.371 4.171 3.949 3.719 3.432 2.921 -2 ,1476 ,KEBNE ,17017987,Tue Dec 21 22:31:20 CET,Wed Dec 22 00:08:49 CET,0.0 0.974 1.363 1.673 1.96 2.21 2.438 2.658 3.071 3.261 3.435 3.655 3.949 4.104 4.398 4.677 4.935 5.056 5.295 5.514 5.829 6.03 6.214 6.475 6.733 6.979 7.216 7.445 7.742 8.02 8.285 8.617 8.932 9.239 9.59 9.983 10.355 10.744 11.173 11.63 12.081 12.577 13.156 13.713 14.334 14.987 15.643 16.304 16.978 17.648 18.106 18.014 17.658 17.153 16.624 16.054 15.506 15.023 14.564 14.05 13.596 13.204 12.834 12.49 12.17 11.857 11.522 11.227 10.969 10.705 10.434 10.199 9.942 9.66 9.444 9.235 9.024 8.796 8.555 8.391 8.218 7.937 7.746 7.557 7.46 7.244 7.005 6.753 6.623 6.381 6.228 6.085 5.939 5.631 5.459 5.274 5.083 4.876 4.602 4.297 3.759 -3 ,28159 ,KEBNE ,17017988,Tue Dec 21 22:31:19 CET,Wed Dec 22 00:09:02 CET,0.0 1.146 1.536 1.806 2.052 2.282 2.508 2.719 3.105 3.283 3.451 3.651 3.916 4.061 4.345 4.627 4.899 5.017 5.244 5.47 5.795 6.007 6.211 6.494 6.759 7.018 7.277 7.526 7.834 8.132 8.418 8.761 9.091 9.4 9.763 10.167 10.541 10.947 11.371 11.824 12.271 12.719 13.204 13.676 14.243 14.888 15.624 16.403 17.125 17.799 18.183 17.982 17.651 17.227 16.736 16.163 15.66 15.199 14.745 14.264 13.847 13.472 13.094 12.73 12.389 12.083 11.753 11.452 11.206 10.933 10.643 10.407 10.148 9.881 9.677 9.464 9.234 8.987 8.729 8.562 8.392 8.126 7.936 7.735 7.636 7.421 7.193 6.96 6.843 6.615 6.462 6.31 6.149 5.835 5.667 5.483 5.285 5.058 4.81 4.503 4.072 -4 ,20506 ,KEBNE ,17017989,Tue Dec 21 22:31:20 CET,Wed Dec 22 00:08:06 CET,0.0 0.903 1.369 1.745 2.051 2.325 2.564 2.783 3.19 3.378 3.552 3.752 4.039 4.194 4.476 4.73 4.977 5.096 5.332 5.568 5.893 6.103 6.319 6.632 6.92 7.212 7.501 7.751 8.066 8.375 8.664 9.005 9.32 9.612 9.947 10.303 10.629 10.999 11.401 11.837 12.307 12.823 13.398 13.952 14.556 15.195 15.867 16.534 17.197 17.828 18.297 18.163 17.685 17.16 16.661 16.147 15.622 15.109 14.639 14.153 13.716 13.314 12.931 12.558 12.212 11.894 11.553 11.247 10.976 10.688 10.378 10.123 9.872 9.601 9.386 9.169 8.943 8.704 8.465 8.291 8.103 7.815 7.619 7.419 7.313 7.081 6.844 6.607 6.479 6.22 6.04 5.887 5.734 5.392 5.21 5.033 4.853 4.632 4.385 4.101 3.657 -5 ,5055 ,KEBNE ,17017990,Tue Dec 21 22:33:23 CET,Wed Dec 22 00:11:48 CET,0.0 1.262 1.667 1.992 2.253 2.49 2.704 2.884 3.225 3.392 3.551 3.738 3.993 4.124 4.372 4.607 4.841 4.953 5.173 5.384 5.68 5.874 6.075 6.361 6.619 6.871 7.115 7.354 7.668 7.978 8.273 8.615 8.95 9.262 9.611 10.002 10.366 10.758 11.173 11.591 11.998 12.43 12.944 13.482 14.101 14.785 15.477 16.085 16.648 17.127 17.466 17.357 16.957 16.47 15.93 15.356 14.835 14.35 13.899 13.433 13.023 12.651 12.272 11.91 11.584 11.277 10.944 10.641 10.367 10.079 9.786 9.536 9.274 9.004 8.796 8.577 8.349 8.118 7.872 7.7 7.528 7.253 7.055 6.854 6.746 6.518 6.294 6.067 5.939 5.69 5.536 5.39 5.223 4.884 4.719 4.546 4.347 4.151 3.929 3.603 3.13 -6 ,28404 ,KEBNE ,17017991,Tue Dec 21 22:33:23 CET,Wed Dec 22 00:10:41 CET,0.0 1.069 1.475 1.784 2.064 2.322 2.539 2.735 3.123 3.31 3.5 3.713 3.974 4.117 4.385 4.64 4.896 5.016 5.233 5.427 5.71 5.909 6.098 6.376 6.661 6.922 7.146 7.366 7.679 7.981 8.264 8.613 8.941 9.26 9.635 10.06 10.455 10.876 11.318 11.793 12.296 12.829 13.436 14.023 14.651 15.292 15.949 16.63 17.404 18.101 18.478 18.299 17.8 17.246 16.695 16.119 15.569 15.064 14.614 14.154 13.745 13.381 13.022 12.661 12.316 11.997 11.664 11.374 11.121 10.845 10.557 10.318 10.074 9.818 9.615 9.405 9.175 8.937 8.702 8.537 8.362 8.078 7.879 7.672 7.565 7.342 7.101 6.864 6.743 6.506 6.368 6.228 6.086 5.784 5.601 5.407 5.21 4.981 4.725 4.397 3.826 -7 ,16140 ,KEBNE ,17017992,Tue Dec 21 22:33:24 CET,Wed Dec 22 00:11:17 CET,0.0 0.717 1.059 1.353 1.625 1.857 2.072 2.279 2.66 2.839 3.006 3.198 3.465 3.606 3.865 4.104 4.34 4.46 4.696 4.909 5.186 5.359 5.533 5.798 6.057 6.303 6.537 6.76 7.069 7.383 7.662 7.97 8.266 8.555 8.898 9.276 9.612 9.965 10.367 10.799 11.252 11.772 12.366 12.905 13.467 14.055 14.651 15.286 15.988 16.616 16.994 16.823 16.362 15.816 15.245 14.668 14.11 13.592 13.136 12.648 12.223 11.856 11.475 11.093 10.737 10.423 10.094 9.795 9.54 9.266 8.985 8.759 8.518 8.257 8.041 7.815 7.587 7.344 7.1 6.941 6.765 6.489 6.305 6.11 6.012 5.806 5.585 5.362 5.243 4.998 4.832 4.687 4.539 4.218 4.043 3.857 3.665 3.451 3.207 2.923 2.419 -8 ,17673 ,KEBNE ,17017993,Tue Dec 21 22:33:27 CET,Wed Dec 22 00:07:17 CET,0.0 0.685 1.047 1.353 1.636 1.887 2.097 2.292 2.672 2.851 3.022 3.207 3.469 3.611 3.877 4.123 4.366 4.487 4.716 4.937 5.266 5.474 5.672 5.966 6.25 6.512 6.761 7.001 7.314 7.611 7.89 8.244 8.6 8.939 9.319 9.729 10.108 10.523 10.978 11.439 11.901 12.426 12.996 13.533 14.121 14.687 15.311 15.999 16.647 17.283 17.729 17.536 17.066 16.517 15.99 15.462 14.954 14.47 14.034 13.591 13.188 12.803 12.418 12.056 11.725 11.41 11.075 10.769 10.509 10.233 9.936 9.691 9.432 9.148 8.932 8.725 8.513 8.275 8.021 7.855 7.683 7.407 7.223 7.033 6.93 6.711 6.474 6.24 6.128 5.898 5.757 5.614 5.462 5.14 4.973 4.78 4.563 4.324 4.051 3.761 3.297 -9 ,3345 ,KEBNE ,17017994,Tue Dec 21 22:33:23 CET,Wed Dec 22 00:12:36 CET,0.0 0.601 0.949 1.256 1.519 1.792 2.048 2.263 2.644 2.822 2.991 3.206 3.475 3.622 3.905 4.158 4.391 4.509 4.733 4.954 5.275 5.481 5.682 5.964 6.243 6.507 6.748 6.988 7.311 7.61 7.897 8.257 8.608 8.939 9.311 9.706 10.066 10.445 10.849 11.315 11.809 12.341 12.92 13.475 14.104 14.746 15.42 16.143 16.89 17.544 17.979 17.811 17.341 16.828 16.302 15.752 15.245 14.755 14.275 13.775 13.358 12.96 12.569 12.214 11.868 11.545 11.208 10.899 10.624 10.336 10.05 9.825 9.587 9.33 9.126 8.9 8.669 8.436 8.176 8.0 7.831 7.569 7.391 7.199 7.098 6.881 6.652 6.422 6.297 6.051 5.881 5.736 5.573 5.211 5.018 4.817 4.62 4.411 4.154 3.813 3.182 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 47badee2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22855 ,KEBNE ,17017996,Tue Dec 21 22:34:26 CET,Wed Dec 22 00:10:08 CET,0.0 0.445 0.79 1.061 1.284 1.498 1.689 1.864 2.193 2.342 2.483 2.638 2.892 3.015 3.255 3.484 3.711 3.819 4.024 4.239 4.56 4.754 4.945 5.221 5.477 5.717 5.946 6.163 6.449 6.725 6.992 7.326 7.645 7.943 8.285 8.665 9.033 9.45 9.884 10.319 10.779 11.302 11.902 12.5 13.211 13.983 14.802 15.678 16.632 17.675 18.734 19.274 19.323 19.164 18.89 18.535 18.147 17.736 17.403 17.094 16.794 16.467 16.121 15.814 15.515 15.224 14.907 14.602 14.349 14.079 13.781 13.544 13.299 13.014 12.781 12.547 12.302 12.057 11.8 11.613 11.416 11.1 10.888 10.66 10.527 10.248 9.972 9.678 9.527 9.268 9.068 8.89 8.697 8.293 8.037 7.747 7.439 7.104 6.714 6.207 4.473 -2 ,8752 ,KEBNE ,17017997,Tue Dec 21 22:34:30 CET,Wed Dec 22 00:06:38 CET,0.0 0.414 0.691 0.96 1.216 1.439 1.645 1.857 2.251 2.412 2.562 2.729 2.984 3.109 3.337 3.552 3.758 3.86 4.063 4.262 4.554 4.736 4.911 5.172 5.429 5.661 5.877 6.102 6.398 6.67 6.942 7.276 7.587 7.878 8.205 8.583 8.955 9.354 9.764 10.184 10.625 11.135 11.726 12.307 12.953 13.651 14.441 15.32 16.309 17.378 18.464 19.044 19.107 18.953 18.722 18.44 18.12 17.777 17.455 17.089 16.758 16.45 16.132 15.844 15.562 15.286 14.984 14.709 14.477 14.211 13.918 13.686 13.442 13.176 12.965 12.741 12.511 12.268 12.005 11.823 11.631 11.337 11.138 10.933 10.826 10.594 10.343 10.072 9.921 9.652 9.465 9.295 9.1 8.671 8.447 8.21 7.923 7.573 7.179 6.773 5.044 -3 ,1014 ,KEBNE ,17017998,Tue Dec 21 22:34:26 CET,Wed Dec 22 00:09:59 CET,0.0 0.849 1.184 1.457 1.696 1.904 2.089 2.254 2.56 2.718 2.876 3.034 3.286 3.415 3.666 3.925 4.185 4.301 4.505 4.71 5.007 5.188 5.37 5.647 5.906 6.16 6.408 6.64 6.942 7.236 7.512 7.845 8.152 8.439 8.783 9.156 9.515 9.914 10.348 10.799 11.273 11.829 12.456 13.055 13.727 14.461 15.275 16.143 17.114 18.206 19.334 19.91 19.987 19.912 19.718 19.444 19.141 18.794 18.472 18.111 17.765 17.458 17.156 16.867 16.589 16.287 15.941 15.639 15.388 15.145 14.88 14.641 14.399 14.138 13.926 13.686 13.429 13.181 12.907 12.698 12.48 12.146 11.915 11.677 11.555 11.312 11.049 10.747 10.585 10.295 10.058 9.873 9.675 9.216 8.971 8.717 8.424 8.09 7.666 7.105 5.464 -4 ,28891 ,KEBNE ,17017999,Tue Dec 21 22:34:26 CET,Wed Dec 22 00:12:13 CET,0.0 0.616 0.933 1.173 1.383 1.583 1.769 1.944 2.289 2.443 2.587 2.743 3.001 3.142 3.428 3.684 3.907 4.016 4.233 4.435 4.72 4.904 5.087 5.36 5.612 5.843 6.076 6.303 6.596 6.874 7.128 7.446 7.762 8.06 8.392 8.761 9.12 9.502 9.913 10.348 10.796 11.318 11.925 12.517 13.201 13.935 14.774 15.68 16.629 17.645 18.759 19.386 19.484 19.374 19.119 18.792 18.431 18.059 17.723 17.361 17.016 16.677 16.343 16.031 15.717 15.423 15.126 14.833 14.571 14.283 13.96 13.713 13.453 13.174 12.956 12.71 12.457 12.214 11.962 11.778 11.588 11.29 11.068 10.843 10.733 10.492 10.238 9.981 9.831 9.566 9.375 9.207 9.018 8.606 8.388 8.155 7.882 7.558 7.195 6.675 4.404 -5 ,17542 ,KEBNE ,17018000,Tue Dec 21 22:35:29 CET,Wed Dec 22 00:10:51 CET,0.0 0.811 1.124 1.386 1.622 1.839 2.039 2.234 2.574 2.723 2.863 3.003 3.259 3.395 3.648 3.891 4.137 4.256 4.476 4.687 4.996 5.197 5.393 5.675 5.949 6.221 6.476 6.709 7.008 7.307 7.599 7.948 8.281 8.596 8.965 9.375 9.76 10.173 10.603 11.067 11.559 12.096 12.689 13.249 13.896 14.618 15.43 16.291 17.23 18.245 19.246 19.766 19.811 19.67 19.395 19.04 18.717 18.387 18.029 17.608 17.246 16.922 16.581 16.235 15.9 15.599 15.301 15.0 14.711 14.426 14.127 13.866 13.578 13.263 13.029 12.794 12.527 12.226 11.923 11.728 11.532 11.217 10.982 10.744 10.631 10.406 10.156 9.852 9.693 9.425 9.187 9.004 8.804 8.373 8.141 7.91 7.657 7.349 6.981 6.534 5.459 -6 ,20033 ,KEBNE ,17018001,Tue Dec 21 22:35:28 CET,Wed Dec 22 00:11:10 CET,0.0 0.518 0.844 1.112 1.338 1.535 1.717 1.882 2.177 2.324 2.481 2.651 2.913 3.051 3.301 3.546 3.783 3.898 4.122 4.337 4.649 4.844 5.028 5.29 5.545 5.788 6.016 6.236 6.52 6.801 7.076 7.416 7.737 8.047 8.4 8.779 9.137 9.514 9.919 10.36 10.83 11.345 11.953 12.571 13.261 13.984 14.772 15.652 16.639 17.705 18.793 19.43 19.584 19.477 19.218 18.903 18.538 18.153 17.804 17.403 17.039 16.726 16.406 16.087 15.794 15.521 15.225 14.952 14.686 14.412 14.156 13.926 13.653 13.364 13.157 12.939 12.692 12.432 12.145 11.953 11.769 11.447 11.215 10.966 10.833 10.579 10.338 10.076 9.934 9.653 9.383 9.197 9.012 8.561 8.294 8.002 7.666 7.286 6.837 6.31 4.636 -7 ,7402 ,KEBNE ,17018002,Tue Dec 21 22:35:29 CET,Wed Dec 22 00:11:55 CET,0.0 0.707 1.025 1.275 1.499 1.694 1.878 2.046 2.369 2.534 2.691 2.855 3.115 3.247 3.511 3.751 3.965 4.072 4.289 4.491 4.767 4.945 5.119 5.378 5.622 5.851 6.077 6.302 6.591 6.865 7.132 7.459 7.775 8.07 8.409 8.787 9.138 9.521 9.939 10.386 10.854 11.367 11.961 12.555 13.228 13.954 14.766 15.659 16.647 17.669 18.672 19.299 19.438 19.315 19.077 18.781 18.44 18.069 17.731 17.383 17.064 16.739 16.407 16.051 15.667 15.311 14.964 14.668 14.389 14.085 13.777 13.521 13.257 12.982 12.766 12.539 12.302 12.056 11.8 11.625 11.426 11.067 10.822 10.578 10.451 10.186 9.904 9.598 9.441 9.161 8.923 8.74 8.551 8.132 7.883 7.61 7.324 7.005 6.636 6.122 4.684 -8 ,3172 ,KEBNE ,17018003,Tue Dec 21 22:35:29 CET,Wed Dec 22 00:10:28 CET,0.0 0.739 1.084 1.344 1.559 1.763 1.953 2.135 2.465 2.618 2.769 2.951 3.214 3.34 3.578 3.816 4.045 4.152 4.362 4.569 4.859 5.054 5.245 5.507 5.766 6.012 6.241 6.467 6.761 7.046 7.326 7.652 7.957 8.252 8.583 8.961 9.332 9.735 10.166 10.608 11.061 11.574 12.159 12.732 13.378 14.072 14.85 15.674 16.583 17.596 18.575 19.126 19.278 19.16 18.903 18.582 18.236 17.879 17.558 17.208 16.86 16.541 16.216 15.877 15.544 15.229 14.892 14.577 14.304 14.026 13.719 13.454 13.19 12.908 12.673 12.432 12.18 11.911 11.635 11.438 11.222 10.879 10.645 10.389 10.25 9.971 9.687 9.372 9.209 8.936 8.688 8.502 8.307 7.901 7.671 7.407 7.129 6.815 6.434 5.983 4.358 -9 ,32120 ,KEBNE ,17018004,Tue Dec 21 22:35:28 CET,Wed Dec 22 00:11:04 CET,0.0 0.622 0.95 1.228 1.461 1.663 1.854 2.042 2.392 2.55 2.705 2.883 3.144 3.273 3.52 3.765 4.0 4.112 4.331 4.537 4.837 5.033 5.222 5.497 5.766 6.028 6.273 6.503 6.802 7.098 7.383 7.717 8.041 8.357 8.725 9.128 9.511 9.93 10.366 10.846 11.33 11.841 12.451 13.072 13.764 14.513 15.404 16.327 17.296 18.325 19.31 19.97 20.161 20.082 19.852 19.509 19.151 18.804 18.48 18.116 17.769 17.442 17.107 16.759 16.417 16.113 15.8 15.505 15.253 14.992 14.72 14.491 14.255 14.01 13.81 13.593 13.346 13.09 12.842 12.66 12.449 12.128 11.907 11.675 11.561 11.335 11.097 10.834 10.687 10.425 10.229 10.072 9.922 9.599 9.406 9.177 8.891 8.591 8.249 7.814 6.605 -10 ,9360 ,KEBNE ,17018005,Tue Dec 21 22:37:33 CET,Wed Dec 22 00:12:49 CET,0.0 0.396 0.669 0.939 1.196 1.418 1.617 1.781 2.101 2.247 2.388 2.546 2.796 2.927 3.177 3.419 3.645 3.751 3.963 4.168 4.479 4.67 4.843 5.11 5.367 5.605 5.829 6.049 6.335 6.613 6.888 7.213 7.514 7.804 8.136 8.488 8.836 9.235 9.662 10.109 10.586 11.113 11.697 12.277 12.916 13.605 14.41 15.32 16.343 17.466 18.623 19.274 19.391 19.257 19.019 18.697 18.358 18.029 17.708 17.334 17.002 16.689 16.368 16.064 15.783 15.519 15.223 14.964 14.718 14.448 14.174 13.949 13.726 13.445 13.217 12.995 12.756 12.504 12.231 12.036 11.851 11.584 11.384 11.16 11.038 10.78 10.535 10.262 10.108 9.838 9.615 9.441 9.247 8.815 8.586 8.344 8.054 7.712 7.352 6.882 5.401 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 29bf0ea5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24632 ,KEBNE ,17018006,Tue Dec 21 22:37:33 CET,Wed Dec 22 00:13:08 CET,0.0 1.226 1.644 1.917 2.162 2.388 2.601 2.801 3.138 3.294 3.451 3.618 3.869 3.993 4.237 4.473 4.693 4.805 5.026 5.231 5.537 5.734 5.916 6.175 6.427 6.664 6.886 7.104 7.383 7.653 7.916 8.228 8.52 8.806 9.157 9.558 9.922 10.309 10.721 11.15 11.615 12.132 12.713 13.285 13.921 14.616 15.382 16.227 17.192 18.232 19.235 19.699 19.727 19.57 19.308 19.007 18.657 18.262 17.895 17.505 17.165 16.851 16.545 16.242 15.952 15.682 15.378 15.117 14.907 14.671 14.396 14.169 13.922 13.663 13.473 13.259 13.026 12.788 12.536 12.36 12.179 11.898 11.702 11.498 11.384 11.149 10.892 10.61 10.473 10.226 10.043 9.881 9.718 9.38 9.194 8.993 8.757 8.48 8.175 7.832 6.986 -2 ,16511 ,KEBNE ,17018007,Tue Dec 21 22:37:33 CET,Wed Dec 22 00:11:02 CET,0.0 0.433 0.73 1.016 1.267 1.493 1.676 1.852 2.235 2.407 2.563 2.737 2.995 3.126 3.379 3.609 3.832 3.944 4.156 4.36 4.662 4.869 5.064 5.323 5.578 5.827 6.058 6.285 6.575 6.852 7.126 7.449 7.749 8.047 8.392 8.764 9.114 9.481 9.861 10.275 10.724 11.221 11.784 12.337 12.965 13.659 14.416 15.211 16.103 17.069 18.0 18.436 18.461 18.224 17.888 17.545 17.188 16.796 16.429 16.038 15.675 15.345 15.022 14.708 14.403 14.132 13.846 13.56 13.299 13.031 12.753 12.529 12.293 12.025 11.817 11.614 11.386 11.148 10.912 10.742 10.578 10.323 10.136 9.937 9.828 9.604 9.369 9.124 8.994 8.746 8.609 8.468 8.305 7.966 7.761 7.545 7.341 7.1 6.821 6.515 6.083 -3 ,31603 ,KEBNE ,17018008,Tue Dec 21 22:37:33 CET,Wed Dec 22 00:12:25 CET,0.0 0.439 0.771 1.026 1.248 1.455 1.648 1.837 2.174 2.332 2.487 2.671 2.93 3.052 3.286 3.513 3.719 3.817 4.008 4.206 4.499 4.683 4.865 5.132 5.392 5.637 5.863 6.073 6.353 6.629 6.893 7.217 7.525 7.822 8.167 8.545 8.902 9.287 9.69 10.122 10.579 11.1 11.679 12.244 12.93 13.647 14.399 15.2 16.085 17.005 17.899 18.322 18.329 18.142 17.818 17.455 17.062 16.636 16.272 15.89 15.538 15.209 14.874 14.556 14.27 14.004 13.706 13.42 13.168 12.909 12.638 12.405 12.158 11.906 11.718 11.522 11.307 11.067 10.807 10.637 10.468 10.202 10.004 9.793 9.693 9.49 9.271 9.038 8.918 8.684 8.527 8.392 8.238 7.885 7.706 7.514 7.285 7.034 6.736 6.338 5.438 -4 ,25402 ,KEBNE ,17018009,Tue Dec 21 22:37:33 CET,Wed Dec 22 00:13:55 CET,0.0 0.486 0.761 0.982 1.205 1.418 1.624 1.833 2.186 2.344 2.504 2.677 2.951 3.095 3.346 3.597 3.841 3.962 4.209 4.429 4.739 4.939 5.127 5.408 5.682 5.947 6.203 6.443 6.759 7.062 7.346 7.677 7.988 8.296 8.651 9.047 9.435 9.852 10.282 10.756 11.264 11.806 12.421 13.017 13.697 14.44 15.246 16.099 17.052 18.052 19.038 19.508 19.476 19.23 18.875 18.519 18.179 17.809 17.44 17.03 16.661 16.327 15.991 15.651 15.304 14.992 14.681 14.393 14.139 13.868 13.567 13.299 13.023 12.749 12.539 12.325 12.098 11.854 11.591 11.407 11.218 10.929 10.741 10.543 10.424 10.167 9.912 9.66 9.534 9.287 9.104 8.955 8.8 8.428 8.211 7.998 7.761 7.497 7.214 6.85 6.061 -5 ,26707 ,KEBNE ,17018010,Tue Dec 21 22:37:33 CET,Wed Dec 22 00:14:18 CET,0.0 0.663 0.985 1.282 1.543 1.761 1.951 2.125 2.452 2.602 2.758 2.936 3.197 3.34 3.608 3.855 4.092 4.206 4.417 4.621 4.931 5.12 5.295 5.559 5.826 6.093 6.342 6.575 6.871 7.156 7.433 7.769 8.086 8.387 8.725 9.103 9.468 9.858 10.286 10.736 11.185 11.686 12.269 12.843 13.499 14.211 14.985 15.79 16.667 17.58 18.511 19.009 19.005 18.775 18.45 18.079 17.739 17.425 17.131 16.781 16.445 16.133 15.817 15.518 15.231 14.963 14.683 14.42 14.196 13.973 13.724 13.512 13.291 13.049 12.853 12.651 12.446 12.225 11.993 11.827 11.644 11.358 11.16 10.952 10.849 10.639 10.399 10.131 9.991 9.738 9.546 9.395 9.245 8.908 8.719 8.493 8.247 7.968 7.658 7.295 6.374 -6 ,29463 ,KEBNE ,17018011,Tue Dec 21 22:37:33 CET,Wed Dec 22 00:12:27 CET,0.0 0.742 1.036 1.281 1.484 1.673 1.87 2.057 2.401 2.562 2.711 2.875 3.13 3.26 3.522 3.767 4.003 4.117 4.332 4.54 4.836 5.025 5.206 5.473 5.74 5.985 6.213 6.426 6.706 6.988 7.248 7.56 7.868 8.156 8.484 8.847 9.206 9.61 10.027 10.456 10.892 11.384 11.963 12.519 13.153 13.821 14.555 15.365 16.24 17.138 17.936 18.281 18.193 17.968 17.692 17.321 16.927 16.528 16.149 15.76 15.416 15.096 14.778 14.484 14.206 13.936 13.641 13.353 13.092 12.847 12.594 12.361 12.129 11.883 11.682 11.478 11.282 11.082 10.858 10.705 10.537 10.253 10.057 9.853 9.752 9.554 9.324 9.079 8.953 8.711 8.546 8.386 8.222 7.878 7.688 7.474 7.247 6.992 6.694 6.352 5.599 -7 ,7823 ,KEBNE ,17018012,Tue Dec 21 22:37:33 CET,Wed Dec 22 00:13:13 CET,0.0 0.364 0.67 0.934 1.15 1.362 1.566 1.746 2.067 2.217 2.373 2.551 2.81 2.936 3.183 3.419 3.648 3.76 3.977 4.189 4.495 4.691 4.888 5.164 5.428 5.69 5.934 6.166 6.472 6.774 7.059 7.396 7.723 8.034 8.394 8.787 9.148 9.538 9.966 10.42 10.889 11.399 11.972 12.554 13.201 13.92 14.738 15.578 16.523 17.562 18.497 18.892 18.889 18.697 18.376 18.01 17.645 17.246 16.893 16.54 16.159 15.794 15.449 15.115 14.796 14.494 14.181 13.888 13.621 13.327 13.013 12.761 12.502 12.219 11.997 11.775 11.531 11.262 10.985 10.814 10.647 10.359 10.146 9.925 9.807 9.552 9.28 8.992 8.846 8.578 8.363 8.205 8.049 7.703 7.512 7.307 7.081 6.835 6.55 6.198 5.36 -8 ,28781 ,KEBNE ,17018013,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:18:37 CET,0.0 0.368 0.712 1.014 1.258 1.47 1.664 1.857 2.209 2.373 2.538 2.735 3.005 3.149 3.416 3.649 3.876 3.99 4.215 4.431 4.745 4.953 5.15 5.435 5.695 5.939 6.192 6.448 6.764 7.052 7.33 7.66 7.964 8.261 8.6 8.976 9.339 9.723 10.121 10.542 10.99 11.502 12.093 12.674 13.323 14.014 14.78 15.612 16.522 17.446 18.288 18.583 18.504 18.291 17.978 17.628 17.294 16.953 16.623 16.261 15.917 15.577 15.232 14.914 14.627 14.351 14.049 13.776 13.539 13.29 13.002 12.755 12.501 12.211 11.987 11.767 11.543 11.311 11.056 10.878 10.694 10.395 10.183 9.954 9.834 9.595 9.346 9.087 8.946 8.685 8.474 8.307 8.139 7.777 7.574 7.343 7.1 6.851 6.562 6.19 5.287 -9 ,11180 ,KEBNE ,17018014,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:19:45 CET,0.0 0.399 0.655 0.88 1.099 1.311 1.514 1.707 2.063 2.228 2.378 2.53 2.794 2.927 3.178 3.424 3.663 3.776 3.987 4.189 4.486 4.675 4.857 5.124 5.391 5.651 5.894 6.138 6.458 6.755 7.038 7.367 7.686 7.981 8.316 8.699 9.061 9.455 9.879 10.353 10.854 11.383 11.976 12.566 13.229 13.944 14.759 15.616 16.54 17.493 18.373 18.811 18.777 18.556 18.259 17.891 17.525 17.138 16.76 16.401 16.06 15.718 15.392 15.059 14.717 14.399 14.065 13.768 13.507 13.227 12.945 12.72 12.473 12.205 12.006 11.782 11.535 11.286 11.036 10.866 10.693 10.428 10.241 10.03 9.924 9.728 9.521 9.283 9.145 8.878 8.67 8.515 8.357 7.993 7.793 7.585 7.35 7.119 6.87 6.515 5.94 -10 ,20762 ,KEBNE ,17018015,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:19:19 CET,0.0 0.567 0.911 1.191 1.43 1.642 1.837 2.021 2.368 2.531 2.686 2.851 3.098 3.227 3.48 3.735 3.984 4.099 4.321 4.533 4.825 5.018 5.204 5.459 5.71 5.957 6.19 6.416 6.712 6.999 7.285 7.627 7.952 8.26 8.611 9.002 9.368 9.751 10.159 10.59 11.031 11.515 12.065 12.614 13.246 13.925 14.662 15.46 16.321 17.217 18.074 18.511 18.529 18.31 17.98 17.626 17.258 16.861 16.481 16.076 15.717 15.386 15.062 14.75 14.449 14.177 13.876 13.608 13.387 13.156 12.913 12.686 12.45 12.209 12.007 11.793 11.569 11.339 11.098 10.935 10.769 10.493 10.297 10.086 9.977 9.738 9.469 9.206 9.086 8.851 8.683 8.53 8.37 8.005 7.795 7.566 7.325 7.069 6.782 6.401 5.55 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 7d4c11ef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5986 ,KEBNE ,17018016,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:22:54 CET,0.0 0.514 0.844 1.125 1.353 1.549 1.732 1.907 2.23 2.377 2.528 2.706 2.956 3.083 3.33 3.553 3.77 3.881 4.095 4.299 4.603 4.8 4.985 5.254 5.502 5.734 5.961 6.181 6.473 6.762 7.035 7.359 7.668 7.958 8.3 8.689 9.045 9.413 9.807 10.221 10.666 11.163 11.714 12.267 12.889 13.56 14.312 15.079 15.903 16.765 17.576 17.917 17.834 17.538 17.167 16.762 16.336 15.929 15.566 15.198 14.885 14.6 14.306 13.996 13.681 13.395 13.104 12.828 12.576 12.309 12.043 11.814 11.561 11.291 11.087 10.883 10.663 10.431 10.179 10.007 9.839 9.568 9.379 9.192 9.096 8.892 8.683 8.468 8.348 8.109 7.962 7.83 7.694 7.408 7.253 7.066 6.865 6.663 6.433 6.169 5.496 -2 ,11901 ,KEBNE ,17018017,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:21:30 CET,0.0 0.564 0.845 1.097 1.339 1.573 1.771 1.946 2.269 2.418 2.566 2.732 2.982 3.101 3.333 3.562 3.782 3.886 4.078 4.263 4.524 4.691 4.859 5.108 5.353 5.583 5.808 6.025 6.291 6.555 6.811 7.118 7.408 7.676 7.992 8.342 8.681 9.058 9.469 9.901 10.336 10.81 11.326 11.826 12.428 13.095 13.824 14.604 15.451 16.32 17.108 17.421 17.382 17.191 16.929 16.624 16.249 15.877 15.531 15.142 14.808 14.503 14.165 13.841 13.551 13.273 12.98 12.719 12.501 12.263 12.005 11.788 11.564 11.333 11.148 10.958 10.754 10.543 10.331 10.185 10.035 9.804 9.636 9.459 9.37 9.196 9.001 8.778 8.663 8.436 8.308 8.183 8.056 7.787 7.638 7.469 7.268 7.049 6.8 6.439 5.762 -3 ,2802 ,KEBNE ,17018018,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:21:54 CET,0.0 0.489 0.867 1.175 1.414 1.631 1.818 1.989 2.323 2.481 2.636 2.804 3.057 3.186 3.433 3.654 3.861 3.965 4.169 4.376 4.672 4.861 5.039 5.288 5.538 5.77 5.98 6.184 6.454 6.724 6.989 7.294 7.585 7.865 8.169 8.49 8.808 9.178 9.57 9.953 10.344 10.786 11.289 11.784 12.343 12.955 13.657 14.403 15.201 15.994 16.677 16.959 16.826 16.523 16.187 15.777 15.352 14.967 14.639 14.276 13.924 13.595 13.281 12.961 12.642 12.352 12.051 11.79 11.562 11.338 11.102 10.881 10.654 10.427 10.241 10.046 9.854 9.663 9.467 9.323 9.166 8.91 8.734 8.553 8.46 8.277 8.07 7.833 7.709 7.474 7.306 7.159 7.008 6.682 6.502 6.3 6.086 5.878 5.627 5.294 4.63 -4 ,22 ,KEBNE ,17018019,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:20:42 CET,0.0 0.543 0.823 1.074 1.29 1.488 1.676 1.847 2.161 2.313 2.465 2.632 2.887 3.017 3.26 3.487 3.707 3.812 4.006 4.193 4.462 4.64 4.808 5.048 5.284 5.514 5.745 5.964 6.237 6.496 6.74 7.025 7.307 7.585 7.904 8.253 8.593 8.959 9.341 9.755 10.177 10.639 11.177 11.704 12.302 12.957 13.674 14.422 15.217 16.028 16.698 16.916 16.816 16.583 16.274 15.911 15.536 15.149 14.785 14.41 14.079 13.761 13.437 13.123 12.83 12.565 12.289 12.033 11.794 11.537 11.263 11.029 10.805 10.583 10.404 10.219 10.018 9.79 9.549 9.387 9.225 8.977 8.801 8.619 8.524 8.327 8.119 7.909 7.8 7.574 7.44 7.307 7.168 6.868 6.716 6.554 6.372 6.178 5.948 5.658 4.853 -5 ,28903 ,KEBNE ,17018020,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:20:42 CET,0.0 0.71 1.042 1.285 1.499 1.714 1.917 2.099 2.422 2.577 2.728 2.883 3.129 3.252 3.481 3.705 3.925 4.037 4.247 4.435 4.706 4.885 5.058 5.305 5.541 5.769 5.989 6.198 6.464 6.723 6.973 7.278 7.568 7.845 8.158 8.495 8.815 9.183 9.584 9.996 10.417 10.888 11.416 11.926 12.504 13.125 13.792 14.502 15.3 16.125 16.858 17.118 17.0 16.717 16.368 15.977 15.587 15.175 14.787 14.386 14.03 13.705 13.372 13.036 12.716 12.43 12.127 11.837 11.589 11.324 11.028 10.786 10.548 10.299 10.096 9.879 9.658 9.433 9.202 9.05 8.892 8.622 8.43 8.236 8.134 7.927 7.724 7.496 7.36 7.105 6.939 6.795 6.653 6.338 6.148 5.954 5.761 5.549 5.293 4.985 4.381 -6 ,20255 ,KEBNE ,17018021,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:20:37 CET,0.0 0.611 0.922 1.192 1.427 1.624 1.814 2.008 2.353 2.499 2.644 2.809 3.068 3.191 3.441 3.696 3.927 4.03 4.228 4.42 4.706 4.898 5.085 5.349 5.584 5.808 6.034 6.261 6.543 6.808 7.066 7.376 7.676 7.966 8.302 8.679 9.037 9.413 9.791 10.19 10.608 11.085 11.645 12.177 12.783 13.44 14.141 14.934 15.805 16.698 17.489 17.795 17.778 17.575 17.28 16.966 16.623 16.218 15.828 15.433 15.085 14.761 14.422 14.095 13.793 13.511 13.218 12.97 12.747 12.498 12.223 11.98 11.728 11.46 11.244 11.026 10.802 10.573 10.339 10.173 10.003 9.738 9.545 9.335 9.233 9.023 8.807 8.58 8.455 8.21 8.028 7.889 7.749 7.435 7.271 7.075 6.87 6.652 6.4 6.091 5.472 -7 ,2619 ,KEBNE ,17018022,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:20:20 CET,0.0 0.432 0.733 0.969 1.212 1.442 1.635 1.814 2.136 2.281 2.416 2.554 2.79 2.912 3.154 3.385 3.594 3.7 3.909 4.115 4.41 4.59 4.758 5.004 5.247 5.483 5.708 5.915 6.181 6.436 6.692 7.008 7.306 7.586 7.903 8.271 8.617 8.988 9.384 9.798 10.243 10.746 11.292 11.819 12.429 13.094 13.818 14.571 15.381 16.189 16.906 17.173 17.026 16.698 16.346 15.977 15.595 15.211 14.844 14.476 14.143 13.822 13.489 13.167 12.886 12.613 12.305 12.017 11.769 11.512 11.235 11.01 10.786 10.551 10.354 10.151 9.96 9.76 9.541 9.386 9.228 8.976 8.806 8.645 8.56 8.38 8.185 7.957 7.835 7.605 7.467 7.33 7.178 6.859 6.682 6.498 6.308 6.095 5.856 5.593 5.132 -9 ,24887 ,KEBNE ,17018024,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:21:19 CET,0.0 0.522 0.851 1.107 1.321 1.516 1.713 1.899 2.216 2.361 2.503 2.652 2.905 3.041 3.281 3.499 3.714 3.817 4.019 4.224 4.516 4.7 4.875 5.123 5.362 5.582 5.793 6.01 6.29 6.553 6.806 7.122 7.428 7.708 8.022 8.381 8.732 9.102 9.495 9.918 10.352 10.826 11.357 11.876 12.474 13.117 13.823 14.595 15.443 16.362 17.277 17.685 17.653 17.439 17.147 16.823 16.481 16.115 15.769 15.415 15.086 14.75 14.42 14.101 13.806 13.529 13.233 12.97 12.735 12.488 12.223 11.99 11.749 11.511 11.325 11.14 10.954 10.748 10.52 10.361 10.201 9.96 9.786 9.598 9.498 9.281 9.072 8.868 8.763 8.536 8.409 8.288 8.144 7.833 7.674 7.494 7.292 7.068 6.817 6.489 5.855 -10 ,10736 ,KEBNE ,17018025,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:21:44 CET,0.0 0.673 0.923 1.15 1.374 1.579 1.761 1.927 2.256 2.405 2.545 2.696 2.938 3.058 3.297 3.521 3.725 3.83 4.034 4.221 4.496 4.683 4.866 5.127 5.373 5.605 5.829 6.05 6.33 6.59 6.845 7.155 7.444 7.72 8.042 8.409 8.758 9.129 9.527 9.933 10.348 10.825 11.36 11.9 12.533 13.174 13.85 14.574 15.336 16.104 16.867 17.227 17.154 16.89 16.55 16.185 15.809 15.4 15.01 14.607 14.249 13.905 13.556 13.218 12.907 12.629 12.319 12.009 11.746 11.477 11.181 10.928 10.68 10.421 10.209 9.991 9.759 9.52 9.281 9.111 8.937 8.674 8.496 8.314 8.213 7.999 7.779 7.535 7.406 7.161 6.998 6.865 6.717 6.357 6.166 5.989 5.817 5.617 5.399 5.165 4.724 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 6dffcf10..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1427 ,KEBNE ,17018026,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:21:33 CET,0.0 0.57 0.853 1.091 1.298 1.488 1.665 1.832 2.117 2.256 2.398 2.553 2.802 2.924 3.175 3.401 3.592 3.683 3.867 4.049 4.315 4.491 4.657 4.895 5.134 5.353 5.552 5.749 6.005 6.25 6.484 6.764 7.03 7.283 7.579 7.915 8.225 8.558 8.89 9.228 9.585 9.995 10.468 10.923 11.453 12.001 12.529 13.05 13.597 14.074 14.384 14.232 13.855 13.39 12.883 12.409 11.97 11.504 11.047 10.547 10.102 9.711 9.341 9.0 8.676 8.365 8.028 7.732 7.478 7.199 6.899 6.664 6.433 6.184 5.979 5.766 5.543 5.295 5.029 4.85 4.672 4.386 4.188 3.982 3.875 3.644 3.391 3.136 3.005 2.769 2.627 2.487 2.342 2.007 1.805 1.597 1.369 1.087 0.778 0.43 -0.104 -2 ,15538 ,KEBNE ,17018027,Tue Dec 21 22:43:50 CET,Wed Dec 22 00:16:33 CET,0.0 0.432 0.743 0.968 1.185 1.383 1.554 1.719 2.029 2.18 2.32 2.454 2.692 2.809 3.035 3.246 3.455 3.557 3.753 3.934 4.189 4.351 4.503 4.723 4.942 5.156 5.36 5.558 5.808 6.035 6.262 6.541 6.804 7.052 7.336 7.651 7.948 8.27 8.619 8.981 9.333 9.718 10.184 10.64 11.132 11.647 12.224 12.828 13.38 13.825 14.108 13.924 13.486 13.0 12.533 12.064 11.568 11.052 10.616 10.143 9.718 9.346 8.973 8.614 8.256 7.92 7.555 7.228 6.959 6.669 6.348 6.09 5.826 5.545 5.336 5.122 4.893 4.659 4.401 4.215 4.017 3.715 3.517 3.315 3.217 3.013 2.78 2.523 2.39 2.14 1.96 1.803 1.634 1.276 1.071 0.868 0.669 0.435 0.178 -0.114 -0.927 -3 ,7645 ,KEBNE ,17018028,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:20:15 CET,0.0 0.419 0.706 0.932 1.138 1.317 1.47 1.622 1.941 2.094 2.231 2.375 2.616 2.731 2.956 3.174 3.385 3.484 3.67 3.849 4.105 4.27 4.43 4.657 4.874 5.093 5.305 5.503 5.757 6.006 6.233 6.507 6.781 7.035 7.32 7.638 7.937 8.248 8.593 8.989 9.401 9.828 10.304 10.786 11.322 11.889 12.473 13.071 13.698 14.252 14.646 14.59 14.187 13.678 13.168 12.649 12.145 11.653 11.215 10.762 10.34 9.966 9.599 9.207 8.823 8.489 8.15 7.833 7.555 7.264 6.97 6.724 6.457 6.184 5.968 5.746 5.519 5.263 5.005 4.829 4.638 4.35 4.154 3.954 3.845 3.613 3.375 3.125 2.992 2.74 2.573 2.428 2.269 1.914 1.727 1.531 1.339 1.134 0.888 0.597 -0.173 -4 ,18969 ,KEBNE ,17018029,Tue Dec 21 22:43:46 CET,Wed Dec 22 00:19:52 CET,0.0 0.364 0.618 0.833 1.036 1.235 1.42 1.58 1.869 2.011 2.141 2.266 2.506 2.627 2.85 3.071 3.29 3.393 3.597 3.79 4.064 4.247 4.422 4.669 4.904 5.136 5.375 5.598 5.865 6.114 6.361 6.665 6.94 7.202 7.504 7.834 8.148 8.487 8.838 9.21 9.588 9.988 10.428 10.868 11.402 11.964 12.58 13.233 13.859 14.417 14.805 14.722 14.374 13.95 13.496 12.997 12.495 12.02 11.594 11.161 10.768 10.408 10.055 9.716 9.391 9.081 8.767 8.477 8.205 7.919 7.622 7.369 7.105 6.833 6.624 6.412 6.19 5.944 5.681 5.508 5.331 5.036 4.831 4.639 4.535 4.319 4.103 3.867 3.741 3.495 3.32 3.168 3.019 2.698 2.514 2.31 2.088 1.856 1.616 1.315 0.917 -5 ,15448 ,KEBNE ,17018030,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:26:43 CET,0.0 0.367 0.614 0.847 1.059 1.263 1.451 1.614 1.925 2.074 2.216 2.362 2.613 2.744 2.984 3.215 3.434 3.546 3.765 3.97 4.257 4.43 4.592 4.824 5.038 5.242 5.447 5.654 5.916 6.158 6.391 6.657 6.907 7.158 7.458 7.783 8.089 8.425 8.779 9.144 9.517 9.923 10.385 10.836 11.362 11.921 12.499 13.084 13.676 14.253 14.623 14.448 13.979 13.393 12.79 12.19 11.615 11.047 10.541 10.046 9.63 9.239 8.854 8.497 8.147 7.818 7.481 7.173 6.897 6.6 6.292 6.026 5.738 5.443 5.215 4.987 4.748 4.492 4.233 4.056 3.878 3.607 3.407 3.186 3.067 2.837 2.599 2.35 2.221 1.968 1.793 1.644 1.473 1.09 0.907 0.705 0.474 0.204 -0.09 -0.432 -0.934 -6 ,18264 ,KEBNE ,17018031,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:27:30 CET,0.0 0.369 0.619 0.831 1.03 1.228 1.406 1.558 1.832 1.965 2.092 2.21 2.442 2.556 2.784 3.007 3.213 3.31 3.498 3.679 3.934 4.106 4.275 4.514 4.741 4.954 5.166 5.363 5.609 5.847 6.082 6.373 6.642 6.897 7.191 7.519 7.832 8.17 8.529 8.908 9.294 9.717 10.213 10.688 11.208 11.776 12.354 12.942 13.551 14.076 14.446 14.395 13.986 13.439 12.848 12.265 11.753 11.294 10.861 10.386 9.96 9.573 9.198 8.813 8.454 8.117 7.737 7.408 7.145 6.87 6.569 6.316 6.038 5.731 5.489 5.251 5.012 4.757 4.486 4.289 4.083 3.771 3.564 3.36 3.248 3.009 2.759 2.498 2.36 2.105 1.901 1.717 1.533 1.155 0.964 0.766 0.531 0.257 -0.081 -0.451 -1.128 -7 ,15060 ,KEBNE ,17018032,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:27:33 CET,0.0 0.485 0.811 1.057 1.258 1.456 1.647 1.814 2.123 2.263 2.388 2.513 2.76 2.874 3.084 3.294 3.499 3.595 3.777 3.956 4.224 4.398 4.561 4.793 5.02 5.233 5.44 5.643 5.894 6.134 6.377 6.667 6.936 7.193 7.493 7.828 8.137 8.466 8.825 9.206 9.573 9.984 10.476 10.936 11.435 11.974 12.565 13.181 13.799 14.373 14.778 14.732 14.397 13.92 13.383 12.845 12.347 11.879 11.457 10.994 10.583 10.229 9.892 9.545 9.178 8.832 8.483 8.166 7.88 7.567 7.243 6.983 6.717 6.434 6.21 5.975 5.726 5.47 5.217 5.04 4.846 4.55 4.347 4.132 4.023 3.805 3.567 3.313 3.185 2.94 2.772 2.623 2.462 2.116 1.939 1.747 1.537 1.316 1.049 0.759 0.391 -8 ,8799 ,KEBNE ,17018033,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:26:36 CET,0.0 0.289 0.51 0.717 0.925 1.128 1.311 1.485 1.805 1.944 2.076 2.233 2.486 2.614 2.842 3.057 3.273 3.379 3.588 3.787 4.057 4.227 4.406 4.67 4.907 5.128 5.338 5.555 5.845 6.105 6.344 6.635 6.929 7.209 7.529 7.884 8.208 8.547 8.889 9.249 9.624 10.039 10.494 10.926 11.448 11.996 12.547 13.104 13.652 14.194 14.584 14.446 14.057 13.587 13.092 12.57 12.09 11.601 11.138 10.688 10.269 9.861 9.464 9.084 8.713 8.365 7.999 7.681 7.415 7.12 6.812 6.564 6.291 6.004 5.789 5.564 5.323 5.071 4.811 4.64 4.468 4.189 3.987 3.78 3.671 3.423 3.154 2.889 2.756 2.498 2.293 2.125 1.961 1.608 1.423 1.231 1.005 0.754 0.448 0.056 -0.724 -9 ,31190 ,KEBNE ,17018034,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:27:05 CET,0.0 0.397 0.686 0.918 1.112 1.285 1.454 1.621 1.924 2.057 2.188 2.328 2.558 2.672 2.898 3.109 3.299 3.392 3.578 3.757 4.012 4.178 4.332 4.56 4.79 5.002 5.2 5.391 5.638 5.882 6.124 6.401 6.647 6.885 7.149 7.447 7.747 8.079 8.427 8.796 9.204 9.646 10.103 10.527 11.012 11.537 12.102 12.717 13.365 13.916 14.304 14.293 13.953 13.491 13.022 12.546 12.056 11.571 11.126 10.636 10.209 9.857 9.51 9.146 8.801 8.504 8.182 7.885 7.633 7.361 7.089 6.862 6.621 6.361 6.153 5.935 5.702 5.47 5.235 5.064 4.889 4.624 4.427 4.209 4.094 3.846 3.595 3.354 3.227 2.979 2.783 2.609 2.436 2.036 1.815 1.612 1.384 1.106 0.789 0.42 -0.445 -10 ,8247 ,KEBNE ,17018035,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:28:48 CET,0.0 0.329 0.602 0.857 1.064 1.252 1.435 1.614 1.938 2.081 2.216 2.351 2.594 2.723 2.969 3.182 3.38 3.475 3.668 3.863 4.137 4.306 4.47 4.709 4.936 5.157 5.378 5.588 5.851 6.108 6.352 6.642 6.918 7.184 7.486 7.82 8.133 8.482 8.865 9.252 9.624 10.042 10.535 11.012 11.559 12.132 12.736 13.335 13.959 14.536 14.897 14.815 14.478 14.011 13.465 12.927 12.454 11.999 11.552 11.077 10.66 10.284 9.921 9.561 9.213 8.879 8.521 8.21 7.945 7.668 7.376 7.122 6.857 6.595 6.399 6.19 5.959 5.709 5.437 5.247 5.059 4.76 4.542 4.321 4.211 3.986 3.749 3.51 3.384 3.143 2.981 2.826 2.665 2.303 2.106 1.896 1.681 1.459 1.2 0.904 0.385 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt deleted file mode 100644 index 8b92f6fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12378 ,KEBNE ,17018036,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:27:44 CET,0.0 0.631 0.944 1.198 1.409 1.6 1.783 1.961 2.279 2.426 2.562 2.698 2.936 3.053 3.281 3.49 3.693 3.796 3.992 4.173 4.434 4.604 4.768 5.003 5.231 5.454 5.669 5.868 6.126 6.394 6.648 6.94 7.214 7.474 7.769 8.097 8.419 8.782 9.152 9.534 9.924 10.333 10.795 11.244 11.746 12.279 12.851 13.436 14.035 14.558 14.888 14.779 14.364 13.867 13.357 12.808 12.291 11.808 11.379 10.922 10.526 10.171 9.803 9.435 9.114 8.822 8.481 8.177 7.92 7.655 7.377 7.138 6.891 6.635 6.425 6.204 5.986 5.769 5.538 5.375 5.202 4.936 4.74 4.525 4.42 4.208 3.963 3.685 3.544 3.28 3.09 2.928 2.761 2.37 2.165 1.94 1.69 1.423 1.132 0.789 0.099 -2 ,18137 ,KEBNE ,17018037,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:27:08 CET,0.0 0.493 0.808 1.108 1.36 1.565 1.738 1.901 2.213 2.36 2.496 2.626 2.874 2.996 3.233 3.468 3.685 3.785 3.974 4.154 4.414 4.591 4.757 4.984 5.203 5.43 5.65 5.859 6.127 6.37 6.598 6.878 7.147 7.406 7.701 8.029 8.347 8.683 9.037 9.414 9.803 10.238 10.735 11.193 11.689 12.231 12.807 13.373 14.011 14.653 15.099 15.06 14.758 14.348 13.897 13.43 12.997 12.559 12.125 11.669 11.274 10.899 10.544 10.222 9.901 9.598 9.271 8.966 8.707 8.441 8.148 7.896 7.628 7.356 7.154 6.943 6.726 6.484 6.227 6.054 5.868 5.576 5.379 5.161 5.046 4.805 4.543 4.279 4.147 3.888 3.711 3.536 3.348 2.984 2.806 2.614 2.404 2.174 1.887 1.535 0.614 -3 ,23492 ,KEBNE ,17018038,Tue Dec 21 22:50:56 CET,Wed Dec 22 00:26:47 CET,0.0 0.448 0.719 0.963 1.183 1.381 1.568 1.745 2.072 2.215 2.347 2.472 2.714 2.84 3.081 3.291 3.492 3.593 3.778 3.957 4.232 4.406 4.57 4.811 5.041 5.263 5.481 5.678 5.924 6.162 6.39 6.67 6.945 7.2 7.479 7.78 8.078 8.409 8.75 9.112 9.484 9.878 10.335 10.796 11.277 11.772 12.333 12.925 13.548 14.147 14.534 14.465 14.141 13.692 13.232 12.735 12.24 11.799 11.408 10.985 10.609 10.269 9.916 9.567 9.23 8.912 8.583 8.282 8.009 7.726 7.431 7.179 6.915 6.649 6.436 6.207 5.978 5.754 5.515 5.345 5.158 4.862 4.657 4.437 4.328 4.11 3.884 3.642 3.506 3.251 3.09 2.94 2.775 2.41 2.206 1.997 1.771 1.514 1.218 0.84 -0.118 -4 ,8808 ,KEBNE ,17018039,Tue Dec 21 22:50:59 CET,Wed Dec 22 00:23:54 CET,0.0 0.419 0.697 0.96 1.183 1.386 1.567 1.729 2.043 2.182 2.317 2.47 2.715 2.838 3.066 3.28 3.486 3.586 3.777 3.956 4.214 4.374 4.538 4.778 4.995 5.211 5.427 5.632 5.882 6.114 6.347 6.633 6.903 7.15 7.43 7.745 8.056 8.405 8.773 9.159 9.555 9.975 10.449 10.921 11.439 11.998 12.627 13.277 13.939 14.544 14.936 14.812 14.433 13.98 13.497 13.007 12.534 12.117 11.731 11.295 10.9 10.536 10.186 9.866 9.567 9.274 8.954 8.655 8.396 8.134 7.864 7.642 7.408 7.151 6.942 6.724 6.478 6.217 5.969 5.805 5.637 5.374 5.187 4.985 4.88 4.671 4.456 4.229 4.111 3.873 3.715 3.561 3.406 3.09 2.911 2.714 2.508 2.273 1.983 1.636 1.024 -5 ,19993 ,KEBNE ,17018040,Tue Dec 21 22:51:02 CET,Wed Dec 22 00:27:25 CET,0.0 0.408 0.705 0.967 1.219 1.426 1.624 1.817 2.142 2.291 2.43 2.577 2.825 2.951 3.196 3.433 3.65 3.747 3.934 4.112 4.358 4.515 4.671 4.891 5.106 5.319 5.52 5.719 5.978 6.216 6.441 6.727 7.012 7.272 7.55 7.873 8.185 8.517 8.869 9.241 9.623 10.028 10.497 10.952 11.443 11.985 12.559 13.123 13.722 14.295 14.704 14.666 14.29 13.801 13.319 12.828 12.359 11.903 11.492 11.052 10.649 10.286 9.934 9.598 9.275 8.957 8.618 8.296 8.01 7.728 7.427 7.178 6.916 6.638 6.423 6.188 5.94 5.694 5.44 5.262 5.078 4.797 4.602 4.402 4.3 4.084 3.864 3.628 3.497 3.242 3.06 2.904 2.742 2.372 2.167 1.962 1.752 1.515 1.202 0.816 -0.055 -6 ,10574 ,KEBNE ,17018041,Tue Dec 21 22:51:02 CET,Wed Dec 22 00:28:16 CET,0.0 0.542 0.857 1.11 1.322 1.521 1.712 1.886 2.212 2.359 2.496 2.65 2.901 3.031 3.267 3.491 3.707 3.812 4.022 4.23 4.526 4.712 4.891 5.134 5.356 5.573 5.786 5.991 6.247 6.49 6.725 7.002 7.264 7.514 7.801 8.116 8.411 8.729 9.06 9.408 9.781 10.207 10.678 11.129 11.621 12.139 12.718 13.331 13.946 14.495 14.845 14.746 14.416 13.951 13.457 12.987 12.548 12.117 11.712 11.285 10.905 10.557 10.22 9.902 9.6 9.294 8.965 8.681 8.434 8.167 7.878 7.633 7.365 7.083 6.866 6.651 6.429 6.196 5.965 5.804 5.631 5.357 5.162 4.956 4.852 4.632 4.4 4.162 4.042 3.803 3.651 3.51 3.345 2.988 2.798 2.6 2.39 2.161 1.902 1.573 0.93 -7 ,23956 ,KEBNE ,17018042,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:27:11 CET,0.0 0.335 0.61 0.845 1.074 1.268 1.454 1.649 1.992 2.143 2.304 2.492 2.746 2.877 3.118 3.343 3.56 3.665 3.864 4.058 4.352 4.546 4.736 5.003 5.251 5.497 5.732 5.956 6.241 6.507 6.761 7.059 7.336 7.6 7.919 8.272 8.598 8.954 9.317 9.699 10.109 10.564 11.045 11.482 11.971 12.494 13.086 13.7 14.29 14.821 15.18 15.127 14.815 14.387 13.901 13.388 12.889 12.398 11.963 11.526 11.113 10.725 10.345 9.97 9.606 9.257 8.905 8.605 8.344 8.058 7.761 7.521 7.278 7.012 6.794 6.582 6.369 6.141 5.904 5.743 5.57 5.3 5.111 4.9 4.793 4.579 4.341 4.075 3.941 3.687 3.497 3.338 3.189 2.861 2.67 2.478 2.285 2.049 1.75 1.37 0.486 -8 ,24601 ,KEBNE ,17018043,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:26:48 CET,0.0 0.407 0.67 0.89 1.086 1.265 1.433 1.606 1.957 2.111 2.245 2.375 2.617 2.74 2.977 3.197 3.405 3.506 3.703 3.897 4.174 4.346 4.512 4.754 4.988 5.21 5.421 5.629 5.882 6.135 6.385 6.668 6.941 7.203 7.484 7.785 8.077 8.39 8.733 9.109 9.489 9.899 10.358 10.807 11.322 11.87 12.459 13.056 13.647 14.214 14.661 14.535 14.137 13.699 13.155 12.539 11.98 11.498 11.041 10.548 10.137 9.77 9.404 9.043 8.692 8.372 8.034 7.726 7.461 7.179 6.865 6.6 6.328 6.06 5.857 5.641 5.419 5.184 4.923 4.739 4.554 4.262 4.057 3.851 3.738 3.483 3.225 2.968 2.84 2.586 2.393 2.232 2.062 1.711 1.528 1.316 1.09 0.835 0.508 0.14 -0.458 -9 ,1365 ,KEBNE ,17018044,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:28:46 CET,0.0 0.51 0.728 0.947 1.151 1.337 1.514 1.678 1.983 2.125 2.26 2.403 2.645 2.761 2.983 3.204 3.413 3.515 3.714 3.89 4.141 4.309 4.479 4.723 4.945 5.156 5.358 5.558 5.82 6.071 6.303 6.584 6.847 7.092 7.386 7.706 8.003 8.328 8.669 9.018 9.391 9.816 10.291 10.745 11.245 11.768 12.347 12.936 13.539 14.137 14.506 14.334 13.912 13.405 12.891 12.379 11.865 11.34 10.872 10.412 10.006 9.646 9.291 8.941 8.607 8.266 7.908 7.596 7.323 7.052 6.763 6.509 6.245 5.983 5.785 5.58 5.356 5.096 4.809 4.614 4.428 4.161 3.979 3.781 3.676 3.463 3.244 3.007 2.883 2.647 2.5 2.344 2.181 1.85 1.676 1.507 1.309 1.086 0.835 0.506 -0.1 -10 ,32168 ,KEBNE ,17018045,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:27:10 CET,0.0 0.344 0.596 0.833 1.042 1.226 1.396 1.574 1.913 2.056 2.188 2.318 2.554 2.68 2.91 3.116 3.317 3.416 3.617 3.804 4.071 4.242 4.407 4.653 4.884 5.106 5.322 5.529 5.789 6.035 6.27 6.559 6.841 7.103 7.395 7.722 8.032 8.357 8.706 9.085 9.471 9.875 10.342 10.793 11.286 11.8 12.355 12.955 13.575 14.151 14.606 14.546 14.128 13.596 13.092 12.597 12.099 11.618 11.181 10.74 10.346 9.969 9.616 9.292 8.977 8.678 8.36 8.076 7.834 7.567 7.274 7.032 6.78 6.519 6.304 6.08 5.86 5.634 5.392 5.22 5.044 4.776 4.588 4.385 4.281 4.072 3.85 3.611 3.481 3.233 3.056 2.891 2.723 2.331 2.124 1.914 1.685 1.448 1.178 0.821 0.16 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt deleted file mode 100644 index 5f9bb713..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7305 ,KEBNE ,17018046,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:26:54 CET,0.0 0.479 0.807 1.087 1.347 1.593 1.795 1.983 2.331 2.483 2.634 2.816 3.081 3.215 3.461 3.693 3.927 4.042 4.265 4.477 4.781 4.969 5.155 5.424 5.673 5.922 6.16 6.383 6.682 6.972 7.237 7.555 7.865 8.167 8.512 8.893 9.256 9.648 10.078 10.541 11.028 11.567 12.193 12.816 13.479 14.171 14.94 15.759 16.69 17.624 18.395 18.67 18.579 18.346 18.016 17.606 17.201 16.818 16.467 16.101 15.766 15.451 15.139 14.844 14.574 14.314 14.028 13.772 13.543 13.295 13.037 12.813 12.566 12.308 12.109 11.917 11.73 11.512 11.28 11.13 10.969 10.699 10.515 10.337 10.248 10.06 9.845 9.61 9.492 9.269 9.142 9.01 8.871 8.58 8.417 8.235 8.046 7.844 7.611 7.32 6.861 -2 ,10259 ,KEBNE ,17018047,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:29:26 CET,0.0 0.691 1.057 1.357 1.606 1.844 2.086 2.289 2.615 2.778 2.941 3.112 3.367 3.505 3.769 4.016 4.257 4.374 4.587 4.795 5.098 5.289 5.474 5.732 5.975 6.213 6.443 6.668 6.954 7.237 7.517 7.833 8.134 8.43 8.771 9.15 9.498 9.857 10.237 10.639 11.061 11.545 12.108 12.669 13.315 13.995 14.733 15.531 16.373 17.192 17.955 18.219 18.105 17.886 17.542 17.143 16.766 16.39 16.048 15.682 15.362 15.073 14.782 14.495 14.218 13.957 13.691 13.46 13.243 13.012 12.768 12.555 12.329 12.1 11.915 11.714 11.518 11.327 11.122 10.973 10.813 10.569 10.404 10.235 10.146 9.948 9.732 9.494 9.378 9.155 8.987 8.842 8.7 8.395 8.208 7.981 7.748 7.514 7.261 6.952 6.353 -3 ,27706 ,KEBNE ,17018048,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:26:55 CET,0.0 0.79 1.147 1.458 1.709 1.935 2.156 2.366 2.751 2.923 3.071 3.244 3.501 3.65 3.943 4.198 4.427 4.543 4.761 4.964 5.254 5.443 5.632 5.912 6.176 6.417 6.648 6.872 7.18 7.485 7.766 8.088 8.386 8.682 9.034 9.406 9.751 10.146 10.597 11.057 11.508 12.003 12.577 13.135 13.757 14.413 15.138 15.935 16.8 17.67 18.408 18.671 18.55 18.253 17.922 17.55 17.145 16.752 16.407 16.052 15.727 15.407 15.09 14.79 14.506 14.234 13.943 13.684 13.46 13.218 12.95 12.729 12.504 12.273 12.089 11.88 11.642 11.399 11.157 10.979 10.79 10.513 10.313 10.097 9.987 9.758 9.532 9.299 9.172 8.93 8.766 8.625 8.474 8.137 7.953 7.769 7.574 7.372 7.144 6.795 6.242 -4 ,24473 ,KEBNE ,17018049,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:27:19 CET,0.0 0.47 0.81 1.079 1.333 1.582 1.803 2.007 2.393 2.573 2.744 2.951 3.215 3.356 3.613 3.856 4.096 4.213 4.44 4.655 4.964 5.162 5.353 5.64 5.919 6.179 6.418 6.643 6.936 7.221 7.495 7.821 8.141 8.457 8.81 9.179 9.528 9.918 10.325 10.743 11.192 11.686 12.244 12.821 13.473 14.142 14.862 15.607 16.419 17.29 18.037 18.301 18.21 17.966 17.641 17.259 16.862 16.464 16.098 15.705 15.348 15.037 14.733 14.418 14.115 13.826 13.523 13.258 13.032 12.797 12.539 12.315 12.064 11.792 11.593 11.387 11.171 10.941 10.693 10.532 10.372 10.121 9.939 9.747 9.652 9.458 9.252 9.035 8.913 8.675 8.53 8.399 8.258 7.937 7.761 7.582 7.395 7.177 6.923 6.624 5.928 -5 ,30508 ,KEBNE ,17018050,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:27:40 CET,0.0 0.542 0.845 1.132 1.394 1.64 1.871 2.071 2.436 2.61 2.78 2.968 3.218 3.349 3.608 3.857 4.089 4.209 4.447 4.67 4.973 5.174 5.373 5.64 5.898 6.149 6.4 6.649 6.946 7.219 7.496 7.824 8.129 8.422 8.754 9.124 9.479 9.863 10.274 10.712 11.155 11.658 12.256 12.829 13.454 14.132 14.862 15.605 16.427 17.31 18.095 18.344 18.255 18.008 17.663 17.283 16.9 16.51 16.138 15.731 15.365 15.042 14.736 14.437 14.153 13.878 13.563 13.28 13.047 12.798 12.53 12.314 12.088 11.842 11.647 11.447 11.24 11.004 10.76 10.598 10.427 10.163 9.968 9.76 9.66 9.451 9.228 8.998 8.88 8.652 8.501 8.352 8.198 7.883 7.708 7.525 7.33 7.106 6.849 6.525 5.964 -6 ,12656 ,KEBNE ,17018051,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:27:59 CET,0.0 0.557 0.916 1.209 1.453 1.676 1.884 2.078 2.439 2.599 2.749 2.926 3.186 3.329 3.6 3.854 4.088 4.197 4.427 4.651 4.956 5.15 5.338 5.596 5.843 6.091 6.323 6.553 6.858 7.143 7.421 7.754 8.079 8.388 8.737 9.134 9.504 9.885 10.278 10.724 11.197 11.694 12.26 12.808 13.451 14.172 14.96 15.798 16.698 17.604 18.383 18.679 18.59 18.299 17.914 17.523 17.148 16.755 16.404 16.019 15.662 15.359 15.062 14.767 14.484 14.213 13.921 13.665 13.437 13.185 12.918 12.691 12.444 12.187 11.996 11.803 11.605 11.39 11.159 11.002 10.837 10.563 10.368 10.161 10.059 9.844 9.613 9.379 9.256 9.019 8.856 8.704 8.544 8.193 8.006 7.805 7.596 7.375 7.097 6.723 6.025 -7 ,29001 ,KEBNE ,17018052,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:27:31 CET,0.0 0.635 0.991 1.257 1.49 1.701 1.9 2.082 2.425 2.592 2.757 2.95 3.216 3.355 3.617 3.866 4.089 4.195 4.419 4.632 4.929 5.128 5.319 5.593 5.858 6.111 6.352 6.585 6.886 7.17 7.436 7.757 8.066 8.36 8.688 9.053 9.411 9.796 10.203 10.638 11.081 11.564 12.123 12.675 13.308 13.985 14.707 15.47 16.287 17.12 17.87 18.149 17.994 17.71 17.403 17.056 16.704 16.326 15.952 15.573 15.251 14.96 14.679 14.395 14.112 13.832 13.524 13.262 13.045 12.811 12.564 12.345 12.103 11.872 11.703 11.515 11.309 11.094 10.872 10.712 10.549 10.293 10.101 9.91 9.816 9.61 9.376 9.126 8.999 8.764 8.628 8.488 8.327 7.985 7.809 7.63 7.437 7.193 6.922 6.64 6.09 -8 ,22172 ,KEBNE ,17018053,Tue Dec 21 22:50:55 CET,Wed Dec 22 00:26:43 CET,0.0 0.624 1.018 1.35 1.609 1.833 2.041 2.242 2.612 2.779 2.951 3.153 3.431 3.574 3.842 4.097 4.333 4.449 4.662 4.866 5.183 5.389 5.584 5.853 6.104 6.35 6.588 6.813 7.1 7.377 7.651 7.986 8.32 8.639 8.984 9.359 9.719 10.117 10.537 10.973 11.444 11.963 12.534 13.094 13.735 14.435 15.178 15.977 16.864 17.731 18.52 18.867 18.775 18.483 18.086 17.681 17.287 16.895 16.545 16.181 15.851 15.52 15.193 14.896 14.62 14.351 14.048 13.777 13.549 13.319 13.076 12.851 12.609 12.361 12.174 11.984 11.787 11.581 11.355 11.202 11.037 10.771 10.588 10.397 10.298 10.087 9.868 9.624 9.503 9.277 9.117 8.964 8.8 8.42 8.225 8.037 7.824 7.591 7.32 6.957 6.131 -9 ,13240 ,KEBNE ,17018054,Tue Dec 21 22:50:56 CET,Wed Dec 22 00:29:00 CET,0.0 0.683 1.048 1.349 1.61 1.862 2.087 2.284 2.64 2.804 2.97 3.164 3.422 3.566 3.832 4.082 4.329 4.445 4.677 4.908 5.223 5.407 5.585 5.849 6.11 6.381 6.637 6.873 7.173 7.448 7.71 8.026 8.328 8.618 8.959 9.344 9.707 10.09 10.503 10.954 11.416 11.909 12.462 13.018 13.644 14.296 15.028 15.812 16.683 17.606 18.425 18.749 18.678 18.43 18.1 17.726 17.348 16.982 16.633 16.245 15.884 15.577 15.295 14.996 14.697 14.434 14.141 13.866 13.625 13.377 13.129 12.903 12.662 12.418 12.225 12.029 11.828 11.619 11.401 11.243 11.072 10.81 10.627 10.417 10.308 10.093 9.877 9.662 9.542 9.303 9.148 9.009 8.859 8.542 8.377 8.206 8.01 7.789 7.54 7.255 6.815 -10 ,12793 ,KEBNE ,17018055,Tue Dec 21 22:50:59 CET,Wed Dec 22 00:21:55 CET,0.0 0.694 1.019 1.297 1.56 1.809 2.039 2.257 2.659 2.827 2.978 3.164 3.433 3.581 3.863 4.113 4.344 4.455 4.683 4.916 5.241 5.458 5.662 5.951 6.23 6.477 6.717 6.948 7.244 7.534 7.81 8.132 8.43 8.736 9.103 9.485 9.835 10.213 10.629 11.072 11.522 12.026 12.6 13.161 13.797 14.453 15.157 15.908 16.724 17.567 18.344 18.595 18.458 18.155 17.776 17.381 16.984 16.589 16.224 15.835 15.492 15.176 14.864 14.561 14.268 13.99 13.694 13.433 13.204 12.963 12.697 12.464 12.227 11.973 11.766 11.542 11.313 11.071 10.823 10.657 10.476 10.195 10.003 9.794 9.687 9.47 9.241 9.002 8.878 8.636 8.481 8.341 8.182 7.858 7.688 7.503 7.32 7.136 6.918 6.671 6.36 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index db47b647..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27397 ,KEBNE ,17018056,Tue Dec 21 22:50:59 CET,Wed Dec 22 00:25:23 CET,0.0 0.431 0.659 0.847 1.031 1.206 1.359 1.499 1.762 1.878 1.991 2.12 2.345 2.453 2.658 2.838 3.012 3.094 3.257 3.423 3.664 3.82 3.968 4.18 4.388 4.571 4.742 4.912 5.132 5.356 5.587 5.857 6.097 6.313 6.571 6.864 7.117 7.39 7.683 7.989 8.301 8.63 9.004 9.347 9.705 10.074 10.446 10.807 11.167 11.424 11.326 10.784 10.085 9.347 8.632 7.906 7.214 6.57 6.0 5.41 4.896 4.429 3.967 3.543 3.162 2.8 2.398 2.024 1.695 1.352 1.015 0.749 0.457 0.149 -0.09 -0.338 -0.605 -0.902 -1.212 -1.417 -1.618 -1.914 -2.145 -2.398 -2.521 -2.774 -3.04 -3.327 -3.474 -3.737 -3.949 -4.125 -4.321 -4.712 -4.908 -5.123 -5.377 -5.661 -5.959 -6.362 -7.412 -2 ,21198 ,KEBNE ,17018057,Tue Dec 21 22:52:58 CET,Wed Dec 22 00:29:59 CET,0.0 0.316 0.593 0.808 0.985 1.16 1.335 1.498 1.81 1.965 2.101 2.228 2.449 2.555 2.768 2.969 3.156 3.25 3.43 3.604 3.859 4.022 4.18 4.411 4.619 4.802 4.981 5.166 5.408 5.635 5.847 6.094 6.328 6.554 6.818 7.101 7.353 7.643 7.957 8.27 8.593 8.937 9.311 9.67 10.046 10.41 10.801 11.18 11.502 11.714 11.621 11.061 10.319 9.572 8.862 8.156 7.517 6.935 6.403 5.858 5.391 4.963 4.557 4.188 3.807 3.421 3.029 2.685 2.395 2.097 1.777 1.495 1.203 0.897 0.654 0.404 0.162 -0.084 -0.349 -0.537 -0.737 -1.065 -1.301 -1.54 -1.669 -1.943 -2.216 -2.493 -2.641 -2.918 -3.154 -3.336 -3.533 -3.965 -4.182 -4.392 -4.627 -4.9 -5.238 -5.702 -6.324 -3 ,13289 ,KEBNE ,17018058,Tue Dec 21 22:52:59 CET,Wed Dec 22 00:28:56 CET,0.0 0.381 0.67 0.919 1.101 1.267 1.427 1.578 1.884 2.027 2.164 2.314 2.538 2.651 2.869 3.078 3.272 3.366 3.558 3.736 3.995 4.172 4.343 4.578 4.79 4.999 5.202 5.393 5.646 5.895 6.126 6.392 6.637 6.87 7.141 7.434 7.704 7.992 8.291 8.609 8.936 9.297 9.734 10.155 10.588 10.999 11.402 11.771 12.057 12.218 12.104 11.462 10.694 9.952 9.23 8.565 7.961 7.382 6.845 6.261 5.765 5.325 4.889 4.466 4.07 3.712 3.34 3.004 2.706 2.383 2.038 1.762 1.475 1.179 0.951 0.703 0.449 0.191 -0.084 -0.279 -0.484 -0.812 -1.062 -1.32 -1.443 -1.702 -1.966 -2.237 -2.379 -2.642 -2.861 -3.024 -3.191 -3.574 -3.786 -4.029 -4.298 -4.581 -4.906 -5.325 -6.247 -4 ,3900 ,KEBNE ,17018059,Tue Dec 21 22:52:59 CET,Wed Dec 22 00:28:32 CET,0.0 0.504 0.744 0.945 1.13 1.302 1.472 1.625 1.89 2.009 2.123 2.245 2.474 2.584 2.785 2.974 3.155 3.239 3.414 3.586 3.816 3.964 4.105 4.312 4.515 4.717 4.909 5.09 5.326 5.548 5.761 6.021 6.264 6.49 6.737 7.007 7.272 7.561 7.868 8.196 8.538 8.899 9.277 9.635 10.01 10.379 10.769 11.12 11.436 11.646 11.573 11.035 10.302 9.545 8.827 8.171 7.57 7.006 6.49 5.952 5.487 5.064 4.648 4.251 3.878 3.504 3.11 2.773 2.47 2.155 1.833 1.569 1.297 1.011 0.782 0.547 0.312 0.071 -0.193 -0.391 -0.604 -0.928 -1.147 -1.387 -1.511 -1.758 -2.021 -2.295 -2.435 -2.701 -2.918 -3.104 -3.291 -3.697 -3.921 -4.16 -4.405 -4.659 -4.972 -5.358 -6.41 -5 ,14874 ,KEBNE ,17018060,Tue Dec 21 22:52:59 CET,Wed Dec 22 00:27:54 CET,0.0 0.637 0.913 1.132 1.33 1.505 1.658 1.798 2.066 2.188 2.305 2.415 2.634 2.739 2.922 3.094 3.262 3.349 3.532 3.706 3.952 4.114 4.264 4.477 4.687 4.899 5.104 5.291 5.537 5.769 5.982 6.242 6.489 6.717 6.973 7.242 7.484 7.751 8.044 8.345 8.657 8.991 9.342 9.683 10.077 10.486 10.907 11.319 11.689 11.92 11.824 11.28 10.534 9.778 9.043 8.334 7.72 7.163 6.664 6.114 5.638 5.207 4.789 4.4 4.01 3.64 3.276 2.948 2.655 2.349 2.017 1.735 1.441 1.14 0.904 0.661 0.413 0.153 -0.115 -0.297 -0.485 -0.782 -0.998 -1.228 -1.346 -1.58 -1.819 -2.09 -2.238 -2.506 -2.695 -2.854 -3.025 -3.374 -3.56 -3.769 -4.005 -4.281 -4.599 -4.978 -5.887 -6 ,9318 ,KEBNE ,17018061,Tue Dec 21 22:53:03 CET,Wed Dec 22 00:28:31 CET,0.0 0.549 0.838 1.078 1.289 1.472 1.639 1.799 2.089 2.218 2.341 2.466 2.69 2.81 3.028 3.221 3.423 3.522 3.704 3.882 4.13 4.289 4.446 4.664 4.874 5.076 5.272 5.46 5.69 5.92 6.147 6.407 6.653 6.883 7.141 7.433 7.716 8.017 8.332 8.67 9.019 9.363 9.736 10.11 10.51 10.925 11.345 11.733 12.089 12.312 12.201 11.59 10.842 10.064 9.32 8.631 7.992 7.377 6.818 6.222 5.708 5.262 4.819 4.407 4.03 3.669 3.289 2.947 2.634 2.309 1.96 1.66 1.364 1.056 0.823 0.583 0.327 0.047 -0.271 -0.492 -0.702 -1.013 -1.232 -1.465 -1.592 -1.859 -2.143 -2.441 -2.584 -2.836 -3.029 -3.198 -3.369 -3.741 -3.941 -4.139 -4.364 -4.647 -4.976 -5.321 -5.826 -7 ,31450 ,KEBNE ,17018062,Tue Dec 21 22:52:59 CET,Wed Dec 22 00:29:16 CET,0.0 0.391 0.658 0.877 1.076 1.25 1.417 1.59 1.899 2.031 2.171 2.329 2.554 2.665 2.895 3.126 3.343 3.439 3.62 3.801 4.056 4.221 4.389 4.626 4.846 5.053 5.257 5.465 5.712 5.944 6.172 6.434 6.69 6.939 7.224 7.527 7.806 8.097 8.401 8.707 9.003 9.331 9.699 10.04 10.411 10.812 11.23 11.613 11.933 12.137 12.0 11.343 10.603 9.869 9.155 8.45 7.79 7.201 6.694 6.165 5.693 5.248 4.82 4.428 4.047 3.693 3.333 3.007 2.722 2.428 2.124 1.873 1.608 1.321 1.092 0.85 0.598 0.345 0.084 -0.1 -0.289 -0.578 -0.78 -0.984 -1.094 -1.324 -1.558 -1.814 -1.951 -2.208 -2.412 -2.582 -2.752 -3.109 -3.301 -3.495 -3.707 -3.966 -4.259 -4.65 -5.592 -8 ,17031 ,KEBNE ,17018063,Tue Dec 21 22:52:59 CET,Wed Dec 22 00:28:19 CET,0.0 0.433 0.745 0.969 1.153 1.321 1.477 1.629 1.907 2.034 2.165 2.302 2.527 2.634 2.84 3.04 3.237 3.334 3.532 3.716 3.956 4.112 4.264 4.48 4.684 4.895 5.097 5.275 5.501 5.705 5.91 6.163 6.382 6.595 6.86 7.142 7.394 7.672 7.966 8.265 8.575 8.931 9.319 9.665 10.05 10.458 10.874 11.237 11.548 11.748 11.625 11.022 10.308 9.613 8.916 8.239 7.62 7.052 6.54 6.002 5.533 5.091 4.658 4.259 3.888 3.533 3.157 2.82 2.525 2.221 1.908 1.643 1.353 1.047 0.813 0.574 0.328 0.069 -0.204 -0.393 -0.585 -0.89 -1.114 -1.354 -1.474 -1.718 -1.983 -2.273 -2.425 -2.702 -2.931 -3.114 -3.31 -3.736 -3.977 -4.221 -4.485 -4.8 -5.163 -5.623 -6.782 -9 ,29608 ,KEBNE ,17018064,Tue Dec 21 22:52:59 CET,Wed Dec 22 00:28:42 CET,0.0 0.459 0.746 0.999 1.21 1.382 1.549 1.713 1.996 2.125 2.251 2.384 2.61 2.712 2.915 3.106 3.278 3.364 3.535 3.709 3.976 4.142 4.291 4.505 4.72 4.919 5.095 5.266 5.494 5.7 5.905 6.157 6.386 6.609 6.865 7.13 7.379 7.641 7.928 8.236 8.544 8.882 9.27 9.63 10.014 10.414 10.81 11.175 11.48 11.637 11.492 10.882 10.152 9.424 8.72 8.017 7.359 6.744 6.213 5.66 5.161 4.704 4.257 3.835 3.442 3.082 2.705 2.377 2.103 1.801 1.463 1.187 0.905 0.617 0.392 0.154 -0.087 -0.35 -0.63 -0.819 -1.012 -1.296 -1.492 -1.718 -1.844 -2.101 -2.37 -2.655 -2.808 -3.087 -3.315 -3.501 -3.687 -4.083 -4.289 -4.52 -4.782 -5.056 -5.352 -5.679 -6.336 -10 ,8170 ,KEBNE ,17018065,Tue Dec 21 22:52:59 CET,Wed Dec 22 00:27:56 CET,0.0 0.461 0.688 0.868 1.047 1.218 1.381 1.535 1.801 1.927 2.052 2.174 2.388 2.487 2.691 2.89 3.062 3.145 3.312 3.471 3.703 3.852 3.996 4.211 4.418 4.608 4.785 4.956 5.173 5.383 5.585 5.819 6.047 6.276 6.533 6.816 7.082 7.369 7.681 7.995 8.303 8.636 9.004 9.346 9.733 10.136 10.519 10.852 11.173 11.418 11.193 10.481 9.7 8.94 8.236 7.553 6.94 6.372 5.856 5.347 4.902 4.479 4.044 3.599 3.17 2.804 2.436 2.095 1.796 1.488 1.169 0.897 0.602 0.295 0.064 -0.176 -0.43 -0.704 -1.004 -1.207 -1.404 -1.711 -1.922 -2.134 -2.249 -2.493 -2.748 -3.03 -3.178 -3.45 -3.641 -3.804 -3.989 -4.379 -4.586 -4.817 -5.069 -5.379 -5.711 -6.174 -7.236 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt deleted file mode 100644 index e48bceb3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26216 ,KEBNE ,17018066,Tue Dec 21 22:52:59 CET,Wed Dec 22 00:28:24 CET,0.0 0.43 0.705 0.945 1.16 1.346 1.523 1.695 2.017 2.16 2.3 2.468 2.703 2.816 3.036 3.261 3.464 3.558 3.744 3.916 4.166 4.328 4.478 4.689 4.894 5.088 5.274 5.454 5.684 5.916 6.134 6.392 6.634 6.859 7.121 7.412 7.674 7.954 8.252 8.557 8.875 9.217 9.583 9.918 10.284 10.689 11.124 11.539 11.89 12.053 11.766 10.925 10.034 9.199 8.347 7.576 6.9 6.24 5.671 5.088 4.549 4.053 3.558 3.101 2.683 2.288 1.893 1.536 1.218 0.893 0.558 0.284 0.0 -0.31 -0.548 -0.773 -1.007 -1.258 -1.534 -1.732 -1.932 -2.245 -2.471 -2.708 -2.829 -3.083 -3.357 -3.631 -3.77 -4.035 -4.222 -4.39 -4.565 -4.94 -5.147 -5.378 -5.617 -5.882 -6.195 -6.546 -7.168 -2 ,17542 ,KEBNE ,17018067,Tue Dec 21 22:52:59 CET,Wed Dec 22 00:29:45 CET,0.0 0.4 0.732 0.974 1.181 1.388 1.572 1.744 2.06 2.198 2.336 2.481 2.711 2.826 3.051 3.271 3.465 3.553 3.727 3.902 4.154 4.308 4.459 4.679 4.897 5.098 5.284 5.459 5.679 5.902 6.12 6.381 6.64 6.886 7.158 7.434 7.691 7.982 8.299 8.619 8.938 9.291 9.681 10.059 10.496 10.947 11.391 11.816 12.184 12.43 12.343 11.795 11.149 10.479 9.826 9.179 8.535 7.929 7.401 6.834 6.314 5.844 5.418 5.009 4.606 4.221 3.823 3.468 3.158 2.833 2.486 2.208 1.93 1.624 1.385 1.129 0.856 0.583 0.313 0.117 -0.101 -0.433 -0.661 -0.895 -1.011 -1.249 -1.516 -1.795 -1.944 -2.217 -2.419 -2.591 -2.772 -3.164 -3.377 -3.619 -3.885 -4.156 -4.458 -4.86 -5.99 -4 ,26869 ,KEBNE ,17018069,Tue Dec 21 22:54:00 CET,Wed Dec 22 00:30:58 CET,0.0 0.427 0.727 0.946 1.154 1.359 1.54 1.701 1.992 2.125 2.25 2.379 2.609 2.725 2.947 3.154 3.349 3.439 3.612 3.781 4.026 4.182 4.33 4.535 4.733 4.935 5.131 5.314 5.55 5.783 6.01 6.277 6.532 6.766 7.018 7.298 7.567 7.859 8.169 8.488 8.82 9.186 9.598 9.983 10.378 10.829 11.321 11.759 12.101 12.26 12.103 11.432 10.613 9.783 8.998 8.25 7.591 6.96 6.408 5.85 5.336 4.882 4.447 4.012 3.595 3.225 2.831 2.488 2.188 1.844 1.494 1.219 0.929 0.611 0.35 0.084 -0.187 -0.468 -0.756 -0.962 -1.183 -1.516 -1.745 -1.977 -2.093 -2.345 -2.628 -2.935 -3.086 -3.355 -3.596 -3.788 -3.97 -4.344 -4.555 -4.8 -5.06 -5.331 -5.655 -6.033 -6.848 -5 ,12140 ,KEBNE ,17018070,Tue Dec 21 22:54:00 CET,Wed Dec 22 00:30:58 CET,0.0 0.418 0.66 0.857 1.053 1.235 1.387 1.53 1.792 1.922 2.057 2.193 2.415 2.524 2.728 2.913 3.099 3.192 3.376 3.551 3.798 3.956 4.108 4.326 4.54 4.762 4.972 5.166 5.419 5.657 5.878 6.14 6.391 6.625 6.893 7.189 7.476 7.79 8.101 8.418 8.747 9.101 9.498 9.873 10.266 10.637 11.01 11.402 11.709 11.82 11.61 10.986 10.198 9.336 8.496 7.726 7.061 6.438 5.868 5.241 4.688 4.204 3.747 3.319 2.918 2.562 2.194 1.85 1.539 1.211 0.872 0.6 0.324 0.027 -0.22 -0.486 -0.759 -1.043 -1.342 -1.543 -1.746 -2.064 -2.284 -2.519 -2.646 -2.901 -3.155 -3.431 -3.588 -3.864 -4.066 -4.241 -4.436 -4.847 -5.06 -5.28 -5.513 -5.761 -6.038 -6.388 -7.03 -6 ,17488 ,KEBNE ,17018071,Tue Dec 21 22:54:00 CET,Wed Dec 22 00:32:04 CET,0.0 0.499 0.74 0.983 1.213 1.411 1.587 1.745 2.035 2.167 2.295 2.429 2.65 2.755 2.956 3.15 3.337 3.431 3.614 3.79 4.034 4.185 4.334 4.554 4.77 4.979 5.175 5.365 5.603 5.816 6.015 6.259 6.503 6.744 7.017 7.318 7.6 7.887 8.194 8.517 8.843 9.191 9.572 9.937 10.341 10.742 11.152 11.52 11.88 12.165 12.062 11.44 10.664 9.844 9.004 8.209 7.524 6.885 6.29 5.688 5.2 4.756 4.304 3.851 3.42 3.052 2.661 2.305 1.99 1.663 1.329 1.049 0.754 0.442 0.205 -0.04 -0.286 -0.541 -0.818 -1.012 -1.208 -1.512 -1.732 -1.969 -2.081 -2.314 -2.567 -2.835 -2.989 -3.268 -3.5 -3.684 -3.861 -4.267 -4.493 -4.723 -4.962 -5.208 -5.486 -5.856 -6.874 -7 ,17458 ,KEBNE ,17018072,Tue Dec 21 22:54:00 CET,Wed Dec 22 00:29:38 CET,0.0 0.297 0.56 0.777 0.971 1.166 1.359 1.537 1.846 1.996 2.131 2.273 2.505 2.629 2.864 3.096 3.322 3.43 3.631 3.818 4.081 4.247 4.407 4.645 4.882 5.108 5.317 5.511 5.752 5.987 6.22 6.493 6.756 7.015 7.316 7.643 7.947 8.286 8.635 8.996 9.353 9.721 10.1 10.446 10.839 11.251 11.687 12.108 12.461 12.664 12.504 11.879 11.144 10.379 9.617 8.837 8.139 7.493 6.881 6.253 5.687 5.165 4.646 4.147 3.709 3.33 2.937 2.567 2.239 1.902 1.549 1.248 0.936 0.6 0.319 0.033 -0.236 -0.512 -0.822 -1.039 -1.251 -1.568 -1.801 -2.047 -2.172 -2.443 -2.735 -3.037 -3.188 -3.461 -3.7 -3.877 -4.051 -4.467 -4.686 -4.911 -5.158 -5.398 -5.677 -6.061 -7.009 -8 ,21247 ,KEBNE ,17018073,Tue Dec 21 22:54:00 CET,Wed Dec 22 00:31:16 CET,0.0 0.376 0.61 0.849 1.068 1.253 1.428 1.603 1.922 2.066 2.208 2.368 2.599 2.71 2.935 3.16 3.377 3.483 3.686 3.873 4.136 4.301 4.457 4.679 4.89 5.099 5.305 5.496 5.742 5.983 6.219 6.505 6.755 6.975 7.227 7.513 7.791 8.095 8.41 8.739 9.094 9.475 9.869 10.221 10.6 11.012 11.443 11.818 12.178 12.447 12.405 11.842 11.055 10.292 9.588 8.885 8.262 7.682 7.163 6.617 6.131 5.697 5.254 4.824 4.421 4.048 3.654 3.297 2.997 2.69 2.367 2.097 1.798 1.477 1.239 0.992 0.734 0.47 0.187 -0.011 -0.213 -0.541 -0.773 -1.008 -1.129 -1.378 -1.635 -1.912 -2.055 -2.318 -2.512 -2.678 -2.854 -3.218 -3.413 -3.629 -3.858 -4.113 -4.415 -4.791 -5.887 -9 ,26965 ,KEBNE ,17018074,Tue Dec 21 22:54:00 CET,Wed Dec 22 00:30:03 CET,0.0 0.381 0.652 0.876 1.057 1.236 1.399 1.547 1.826 1.956 2.086 2.223 2.458 2.575 2.783 2.985 3.188 3.285 3.464 3.635 3.899 4.06 4.209 4.425 4.639 4.856 5.062 5.248 5.47 5.683 5.9 6.157 6.397 6.624 6.886 7.181 7.467 7.784 8.104 8.427 8.755 9.115 9.524 9.915 10.347 10.809 11.283 11.716 12.092 12.326 12.301 11.769 11.058 10.328 9.608 8.898 8.259 7.709 7.227 6.709 6.219 5.766 5.325 4.902 4.513 4.157 3.792 3.463 3.177 2.879 2.561 2.284 2.007 1.72 1.484 1.236 0.981 0.726 0.468 0.288 0.094 -0.208 -0.417 -0.639 -0.757 -1.015 -1.287 -1.561 -1.7 -1.951 -2.127 -2.29 -2.452 -2.81 -3.0 -3.206 -3.438 -3.71 -4.02 -4.397 -5.141 -10 ,2938 ,KEBNE ,17018075,Tue Dec 21 22:54:00 CET,Wed Dec 22 00:30:56 CET,0.0 0.457 0.698 0.902 1.098 1.298 1.475 1.631 1.933 2.072 2.197 2.32 2.542 2.653 2.861 3.061 3.251 3.347 3.527 3.695 3.959 4.125 4.283 4.508 4.717 4.918 5.118 5.318 5.576 5.822 6.047 6.322 6.589 6.822 7.069 7.363 7.655 7.958 8.259 8.58 8.932 9.304 9.705 10.084 10.5 10.927 11.342 11.744 12.121 12.361 12.235 11.649 10.917 10.129 9.379 8.655 8.026 7.434 6.866 6.254 5.742 5.295 4.847 4.424 4.037 3.676 3.304 2.981 2.691 2.389 2.049 1.749 1.44 1.125 0.893 0.653 0.397 0.134 -0.153 -0.355 -0.555 -0.87 -1.089 -1.312 -1.429 -1.67 -1.909 -2.157 -2.303 -2.575 -2.758 -2.91 -3.08 -3.464 -3.675 -3.913 -4.183 -4.474 -4.805 -5.232 -6.21 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt deleted file mode 100644 index 9ede154d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1350 ,KEBNE ,17018076,Tue Dec 21 22:54:04 CET,Wed Dec 22 00:24:04 CET,0.0 0.47 0.792 1.07 1.323 1.546 1.756 1.963 2.346 2.533 2.719 2.92 3.226 3.379 3.672 3.939 4.19 4.313 4.564 4.814 5.161 5.379 5.589 5.899 6.2 6.491 6.77 7.039 7.379 7.705 8.03 8.409 8.775 9.137 9.573 10.065 10.514 10.99 11.498 12.036 12.613 13.276 14.035 14.78 15.637 16.622 17.775 19.038 20.465 22.15 24.238 25.853 26.746 27.285 27.524 27.565 27.516 27.399 27.236 27.046 26.877 26.694 26.503 26.315 26.115 25.935 25.761 25.602 25.438 25.247 25.056 24.893 24.718 24.526 24.368 24.205 24.027 23.84 23.637 23.488 23.338 23.102 22.941 22.776 22.689 22.504 22.304 22.096 21.986 21.748 21.624 21.495 21.362 21.088 20.93 20.742 20.521 20.285 20.013 19.636 18.825 -2 ,12577 ,KEBNE ,17018077,Tue Dec 21 22:54:03 CET,Wed Dec 22 00:26:55 CET,0.0 0.704 1.064 1.369 1.629 1.877 2.112 2.329 2.734 2.931 3.115 3.28 3.57 3.721 4.023 4.303 4.565 4.695 4.946 5.177 5.493 5.706 5.915 6.214 6.513 6.794 7.068 7.349 7.71 8.039 8.349 8.729 9.111 9.487 9.911 10.387 10.852 11.353 11.882 12.447 13.036 13.683 14.447 15.241 16.169 17.202 18.332 19.507 20.864 22.458 24.325 25.687 26.365 26.713 26.82 26.776 26.671 26.539 26.385 26.181 25.965 25.756 25.562 25.377 25.18 25.005 24.816 24.619 24.443 24.264 24.066 23.893 23.709 23.515 23.363 23.205 23.038 22.857 22.671 22.547 22.413 22.18 22.01 21.83 21.737 21.543 21.34 21.13 21.016 20.778 20.649 20.524 20.388 20.08 19.907 19.732 19.54 19.305 19.028 18.668 17.756 -3 ,20735 ,KEBNE ,17018078,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:35:39 CET,0.0 0.585 0.909 1.184 1.431 1.65 1.84 2.025 2.377 2.539 2.706 2.891 3.191 3.347 3.644 3.921 4.189 4.321 4.593 4.858 5.213 5.427 5.636 5.937 6.229 6.523 6.831 7.132 7.508 7.856 8.19 8.603 8.985 9.357 9.801 10.291 10.765 11.295 11.843 12.422 13.029 13.694 14.463 15.248 16.193 17.224 18.38 19.667 21.184 22.954 24.909 26.393 27.133 27.456 27.598 27.603 27.517 27.364 27.195 26.994 26.773 26.578 26.391 26.184 25.972 25.751 25.522 25.329 25.157 24.963 24.746 24.576 24.392 24.192 24.034 23.865 23.693 23.52 23.34 23.206 23.057 22.83 22.667 22.498 22.418 22.258 22.08 21.879 21.766 21.538 21.419 21.284 21.144 20.836 20.673 20.49 20.284 20.058 19.798 19.48 18.534 -4 ,29858 ,KEBNE ,17018079,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:36:23 CET,0.0 0.644 1.004 1.279 1.552 1.783 1.986 2.174 2.518 2.688 2.857 3.039 3.333 3.478 3.756 4.033 4.298 4.424 4.661 4.883 5.205 5.416 5.622 5.922 6.218 6.503 6.787 7.057 7.389 7.707 8.031 8.434 8.811 9.177 9.611 10.095 10.572 11.113 11.676 12.248 12.85 13.535 14.35 15.176 16.107 17.154 18.356 19.7 21.25 23.026 25.162 26.769 27.566 27.984 28.169 28.178 28.091 27.955 27.802 27.62 27.44 27.242 27.011 26.796 26.603 26.416 26.23 26.066 25.901 25.718 25.532 25.376 25.195 24.993 24.838 24.676 24.509 24.341 24.162 24.028 23.881 23.649 23.489 23.313 23.219 23.038 22.866 22.678 22.573 22.355 22.251 22.137 22.01 21.711 21.547 21.368 21.153 20.92 20.653 20.352 19.805 -5 ,2540 ,KEBNE ,17018080,Tue Dec 21 23:00:10 CET,Wed Dec 22 00:35:13 CET,0.0 0.602 0.96 1.236 1.485 1.713 1.925 2.121 2.488 2.663 2.83 3.005 3.292 3.436 3.718 3.988 4.246 4.372 4.618 4.858 5.215 5.438 5.655 5.972 6.264 6.54 6.804 7.067 7.41 7.726 8.032 8.413 8.786 9.144 9.557 10.027 10.48 10.987 11.516 12.069 12.692 13.4 14.222 15.058 16.012 17.044 18.206 19.557 21.179 23.105 25.365 27.061 27.952 28.417 28.593 28.61 28.521 28.367 28.212 28.036 27.86 27.677 27.463 27.241 27.036 26.843 26.623 26.418 26.245 26.056 25.858 25.685 25.495 25.306 25.162 25.02 24.87 24.698 24.499 24.361 24.22 23.987 23.827 23.668 23.585 23.405 23.219 23.018 22.911 22.687 22.572 22.44 22.297 21.987 21.811 21.619 21.407 21.17 20.899 20.562 19.729 -6 ,31676 ,KEBNE ,17018081,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:36:51 CET,0.0 0.594 0.91 1.201 1.457 1.687 1.892 2.08 2.454 2.629 2.79 2.979 3.284 3.44 3.733 4.004 4.266 4.391 4.624 4.853 5.199 5.422 5.639 5.952 6.253 6.537 6.811 7.082 7.438 7.79 8.117 8.515 8.909 9.274 9.68 10.136 10.591 11.104 11.651 12.232 12.834 13.517 14.335 15.165 16.143 17.187 18.35 19.682 21.303 23.263 25.624 27.445 28.303 28.646 28.766 28.762 28.643 28.495 28.342 28.152 27.964 27.771 27.563 27.344 27.132 26.94 26.715 26.493 26.29 26.081 25.865 25.678 25.48 25.26 25.079 24.902 24.723 24.515 24.311 24.177 24.031 23.803 23.637 23.464 23.374 23.192 23.006 22.791 22.679 22.447 22.328 22.198 22.05 21.743 21.578 21.374 21.13 20.876 20.607 20.283 19.575 -7 ,69 ,KEBNE ,17018082,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:37:25 CET,0.0 0.499 0.804 1.07 1.346 1.596 1.814 2.02 2.403 2.577 2.741 2.925 3.234 3.385 3.682 3.959 4.225 4.356 4.601 4.848 5.204 5.429 5.651 5.976 6.284 6.58 6.871 7.149 7.517 7.877 8.209 8.616 9.02 9.404 9.828 10.305 10.775 11.291 11.86 12.459 13.074 13.766 14.59 15.415 16.384 17.469 18.696 20.095 21.685 23.513 25.589 27.101 27.831 28.175 28.343 28.379 28.295 28.145 27.974 27.76 27.561 27.385 27.197 26.994 26.779 26.577 26.37 26.175 25.988 25.793 25.601 25.427 25.231 25.033 24.885 24.725 24.544 24.349 24.138 23.994 23.848 23.612 23.448 23.278 23.187 23.002 22.808 22.588 22.464 22.211 22.066 21.927 21.786 21.468 21.278 21.077 20.877 20.659 20.418 20.105 18.853 -8 ,26728 ,KEBNE ,17018083,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:36:23 CET,0.0 0.658 0.948 1.193 1.428 1.639 1.837 2.03 2.381 2.552 2.718 2.889 3.187 3.334 3.637 3.936 4.219 4.354 4.613 4.854 5.217 5.46 5.682 5.995 6.302 6.604 6.892 7.176 7.551 7.911 8.258 8.683 9.088 9.469 9.914 10.405 10.874 11.387 11.915 12.476 13.074 13.763 14.583 15.409 16.348 17.352 18.495 19.807 21.332 23.002 24.904 26.384 27.111 27.426 27.554 27.581 27.511 27.371 27.19 26.946 26.711 26.48 26.232 26.001 25.798 25.591 25.351 25.143 24.966 24.778 24.572 24.395 24.207 24.01 23.851 23.664 23.479 23.299 23.106 22.969 22.812 22.568 22.405 22.233 22.146 21.966 21.78 21.581 21.47 21.234 21.095 20.955 20.815 20.516 20.347 20.171 19.98 19.764 19.485 19.128 18.423 -9 ,24021 ,KEBNE ,17018084,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:36:23 CET,0.0 0.482 0.829 1.133 1.391 1.64 1.871 2.086 2.476 2.644 2.802 2.984 3.273 3.415 3.698 3.968 4.227 4.357 4.603 4.83 5.157 5.368 5.573 5.881 6.184 6.482 6.771 7.052 7.405 7.743 8.079 8.488 8.875 9.243 9.654 10.118 10.587 11.1 11.642 12.231 12.878 13.619 14.454 15.281 16.258 17.333 18.581 20.034 21.733 23.689 25.964 27.706 28.546 28.945 29.089 29.093 29.009 28.859 28.666 28.425 28.214 28.019 27.789 27.553 27.321 27.103 26.872 26.639 26.437 26.232 26.017 25.832 25.639 25.456 25.312 25.132 24.932 24.732 24.519 24.362 24.207 23.968 23.797 23.619 23.529 23.347 23.141 22.917 22.799 22.556 22.426 22.297 22.165 21.864 21.699 21.519 21.308 21.099 20.855 20.561 19.931 -10 ,435 ,KEBNE ,17018085,Tue Dec 21 23:00:10 CET,Wed Dec 22 00:35:39 CET,0.0 0.663 0.976 1.234 1.466 1.678 1.886 2.082 2.44 2.614 2.773 2.923 3.221 3.378 3.673 3.946 4.212 4.339 4.576 4.803 5.147 5.366 5.57 5.872 6.164 6.447 6.728 6.998 7.339 7.682 8.025 8.432 8.826 9.208 9.633 10.106 10.57 11.078 11.614 12.184 12.8 13.497 14.308 15.133 16.097 17.149 18.322 19.612 21.212 23.105 25.272 26.903 27.762 28.136 28.236 28.236 28.14 28.002 27.839 27.658 27.484 27.283 27.089 26.925 26.745 26.556 26.35 26.159 25.992 25.806 25.6 25.426 25.24 25.048 24.901 24.743 24.579 24.41 24.228 24.085 23.927 23.69 23.532 23.372 23.292 23.126 22.95 22.756 22.641 22.399 22.269 22.135 22.004 21.711 21.535 21.353 21.149 20.907 20.64 20.299 19.227 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt deleted file mode 100644 index ddbb3115..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23196 ,KEBNE ,17018086,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:36:52 CET,0.0 0.657 0.966 1.219 1.454 1.684 1.903 2.102 2.48 2.666 2.843 3.035 3.335 3.494 3.8 4.082 4.341 4.472 4.744 5.005 5.358 5.588 5.821 6.154 6.484 6.805 7.105 7.393 7.763 8.125 8.491 8.919 9.316 9.701 10.148 10.663 11.167 11.724 12.336 12.985 13.654 14.426 15.357 16.281 17.356 18.604 20.001 21.508 23.28 25.338 27.769 29.747 30.875 31.564 31.958 32.127 32.168 32.145 32.08 31.992 31.873 31.744 31.606 31.451 31.3 31.156 31.003 30.865 30.735 30.588 30.424 30.279 30.113 29.931 29.791 29.642 29.487 29.312 29.132 29.016 28.891 28.687 28.534 28.368 28.281 28.094 27.9 27.7 27.59 27.357 27.22 27.09 26.955 26.673 26.519 26.338 26.147 25.946 25.685 25.381 24.672 -2 ,11340 ,KEBNE ,17018087,Tue Dec 21 23:00:10 CET,Wed Dec 22 00:36:11 CET,0.0 0.534 0.871 1.142 1.397 1.633 1.86 2.07 2.458 2.656 2.857 3.063 3.357 3.512 3.844 4.167 4.455 4.599 4.883 5.156 5.556 5.814 6.05 6.389 6.714 7.018 7.323 7.632 8.036 8.429 8.801 9.232 9.649 10.063 10.544 11.092 11.63 12.211 12.838 13.524 14.243 15.031 15.955 16.848 17.846 18.997 20.387 21.975 23.784 25.82 28.136 29.964 30.932 31.449 31.719 31.836 31.876 31.859 31.793 31.662 31.534 31.416 31.274 31.121 30.963 30.814 30.655 30.508 30.372 30.214 30.033 29.869 29.698 29.518 29.376 29.221 29.056 28.889 28.718 28.592 28.456 28.249 28.106 27.953 27.871 27.7 27.535 27.359 27.26 27.034 26.898 26.765 26.629 26.335 26.174 26.003 25.83 25.655 25.409 25.073 24.206 -3 ,267 ,KEBNE ,17018088,Tue Dec 21 23:00:13 CET,Wed Dec 22 00:33:22 CET,0.0 0.51 0.823 1.1 1.365 1.618 1.846 2.06 2.469 2.663 2.851 3.074 3.381 3.544 3.881 4.203 4.514 4.666 4.964 5.253 5.677 5.945 6.195 6.56 6.92 7.272 7.606 7.928 8.355 8.761 9.149 9.625 10.085 10.535 11.057 11.637 12.213 12.867 13.568 14.285 15.045 15.93 16.936 17.947 19.146 20.47 21.965 23.624 25.454 27.586 30.205 32.11 33.114 33.711 33.992 34.089 34.104 34.063 33.985 33.873 33.732 33.577 33.416 33.225 33.015 32.825 32.607 32.412 32.248 32.058 31.855 31.687 31.515 31.335 31.19 31.04 30.884 30.694 30.475 30.33 30.178 29.94 29.779 29.604 29.514 29.321 29.106 28.901 28.794 28.557 28.414 28.28 28.141 27.864 27.71 27.541 27.363 27.152 26.901 26.618 26.054 -4 ,3360 ,KEBNE ,17018089,Tue Dec 21 23:00:16 CET,Wed Dec 22 00:32:59 CET,0.0 0.609 1.004 1.339 1.626 1.851 2.075 2.293 2.68 2.861 3.046 3.246 3.543 3.697 3.995 4.271 4.546 4.678 4.924 5.175 5.547 5.772 5.987 6.317 6.642 6.954 7.246 7.532 7.926 8.313 8.685 9.15 9.597 10.006 10.457 10.995 11.544 12.136 12.787 13.468 14.166 14.969 15.908 16.855 17.957 19.194 20.645 22.273 24.127 26.359 29.138 31.23 32.356 33.038 33.417 33.615 33.669 33.649 33.596 33.499 33.379 33.232 33.067 32.903 32.736 32.591 32.423 32.258 32.113 31.948 31.771 31.62 31.453 31.269 31.127 30.969 30.789 30.612 30.431 30.302 30.164 29.946 29.81 29.676 29.604 29.435 29.25 29.052 28.941 28.712 28.586 28.456 28.328 28.058 27.907 27.736 27.529 27.31 27.066 26.743 26.158 -5 ,19715 ,KEBNE ,17018090,Tue Dec 21 23:00:16 CET,Wed Dec 22 00:30:48 CET,0.0 0.464 0.807 1.095 1.354 1.599 1.818 2.014 2.399 2.592 2.783 3.003 3.328 3.503 3.845 4.183 4.497 4.645 4.928 5.202 5.593 5.841 6.087 6.453 6.802 7.137 7.456 7.772 8.186 8.581 8.969 9.425 9.857 10.274 10.771 11.346 11.894 12.509 13.153 13.823 14.546 15.375 16.349 17.314 18.431 19.689 21.156 22.76 24.582 26.737 29.293 31.294 32.318 32.846 33.106 33.244 33.299 33.265 33.184 33.073 32.95 32.817 32.681 32.538 32.375 32.212 32.026 31.854 31.705 31.549 31.376 31.223 31.059 30.875 30.734 30.599 30.453 30.291 30.122 30.0 29.86 29.632 29.479 29.329 29.249 29.069 28.882 28.682 28.574 28.357 28.216 28.081 27.951 27.671 27.52 27.359 27.181 26.971 26.717 26.396 25.674 -6 ,22617 ,KEBNE ,17018091,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:36:52 CET,0.0 0.533 0.889 1.181 1.435 1.675 1.898 2.099 2.488 2.679 2.864 3.065 3.384 3.555 3.877 4.172 4.449 4.585 4.858 5.123 5.51 5.754 5.979 6.31 6.632 6.935 7.233 7.525 7.889 8.263 8.633 9.066 9.475 9.886 10.368 10.898 11.407 11.962 12.576 13.241 13.92 14.676 15.585 16.482 17.492 18.624 19.918 21.384 23.165 25.238 27.751 29.759 30.807 31.44 31.79 31.925 31.981 31.97 31.923 31.889 31.808 31.672 31.529 31.391 31.241 31.084 30.901 30.733 30.579 30.397 30.202 30.038 29.863 29.67 29.516 29.362 29.203 29.022 28.819 28.672 28.526 28.31 28.153 27.975 27.882 27.699 27.494 27.27 27.156 26.932 26.812 26.688 26.548 26.24 26.074 25.89 25.697 25.497 25.264 24.97 24.29 -7 ,15225 ,KEBNE ,17018092,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:36:20 CET,0.0 0.545 0.907 1.199 1.478 1.722 1.942 2.144 2.524 2.704 2.876 3.067 3.379 3.541 3.851 4.141 4.418 4.554 4.823 5.088 5.458 5.691 5.922 6.272 6.6 6.902 7.188 7.478 7.859 8.231 8.596 9.025 9.436 9.847 10.345 10.894 11.418 12.0 12.63 13.304 14.009 14.846 15.817 16.731 17.779 18.93 20.235 21.74 23.508 25.556 28.05 29.944 30.928 31.518 31.842 31.993 32.054 32.047 31.983 31.87 31.745 31.596 31.427 31.277 31.136 30.977 30.789 30.609 30.442 30.263 30.063 29.906 29.759 29.591 29.444 29.297 29.141 28.964 28.768 28.634 28.489 28.233 28.059 27.889 27.801 27.613 27.418 27.205 27.094 26.869 26.738 26.59 26.434 26.109 25.93 25.747 25.542 25.307 25.027 24.681 24.048 -8 ,32392 ,KEBNE ,17018093,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:37:12 CET,0.0 0.552 0.932 1.278 1.571 1.821 2.052 2.278 2.69 2.884 3.076 3.293 3.607 3.777 4.098 4.404 4.694 4.829 5.084 5.338 5.705 5.947 6.182 6.519 6.852 7.173 7.478 7.777 8.178 8.56 8.914 9.348 9.777 10.192 10.66 11.183 11.678 12.239 12.873 13.531 14.2 14.968 15.873 16.758 17.782 18.945 20.358 22.098 24.173 26.429 28.953 30.911 32.007 32.674 33.02 33.152 33.178 33.151 33.095 32.986 32.858 32.718 32.553 32.354 32.147 31.975 31.787 31.585 31.401 31.21 31.01 30.838 30.643 30.439 30.278 30.104 29.922 29.732 29.539 29.401 29.252 29.017 28.853 28.685 28.602 28.423 28.217 27.999 27.883 27.65 27.503 27.369 27.243 26.98 26.834 26.68 26.503 26.31 26.087 25.83 25.415 -9 ,16827 ,KEBNE ,17018094,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:35:18 CET,0.0 0.457 0.843 1.151 1.419 1.667 1.901 2.11 2.494 2.677 2.865 3.082 3.395 3.562 3.897 4.226 4.544 4.693 4.971 5.253 5.671 5.936 6.195 6.57 6.921 7.254 7.585 7.915 8.345 8.765 9.155 9.62 10.072 10.499 11.013 11.611 12.175 12.785 13.444 14.135 14.877 15.716 16.674 17.665 18.824 20.096 21.602 23.315 25.345 27.829 30.886 33.317 34.731 35.595 36.009 36.189 36.238 36.241 36.209 36.112 35.974 35.827 35.684 35.518 35.346 35.186 35.014 34.854 34.699 34.52 34.336 34.184 34.023 33.854 33.716 33.575 33.432 33.274 33.096 32.973 32.843 32.637 32.493 32.341 32.256 32.076 31.898 31.702 31.594 31.378 31.277 31.155 31.023 30.733 30.573 30.423 30.263 30.06 29.837 29.542 28.878 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index bf7d6b0b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11267 ,KEBNE ,17018096,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:19:38 CET,0.0 0.606 0.892 1.119 1.325 1.511 1.677 1.829 2.115 2.248 2.38 2.535 2.748 2.862 3.077 3.286 3.484 3.583 3.766 3.938 4.199 4.353 4.496 4.716 4.935 5.147 5.353 5.553 5.798 6.022 6.245 6.525 6.807 7.055 7.315 7.601 7.872 8.174 8.499 8.818 9.165 9.574 10.03 10.47 10.938 11.416 11.972 12.517 13.008 13.491 13.804 13.617 13.163 12.673 12.166 11.615 11.104 10.602 10.13 9.641 9.217 8.831 8.478 8.126 7.756 7.407 7.052 6.738 6.454 6.159 5.85 5.603 5.354 5.077 4.859 4.643 4.418 4.165 3.898 3.72 3.532 3.241 3.034 2.795 2.673 2.43 2.174 1.917 1.773 1.518 1.277 1.112 0.944 0.57 0.359 0.127 -0.124 -0.41 -0.719 -1.102 -2.027 -2 ,24910 ,KEBNE ,17018097,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:19:58 CET,0.0 0.235 0.408 0.582 0.743 0.884 1.012 1.138 1.369 1.476 1.574 1.667 1.867 1.957 2.138 2.307 2.458 2.532 2.676 2.818 3.023 3.154 3.284 3.47 3.648 3.821 3.982 4.141 4.351 4.538 4.725 4.966 5.196 5.415 5.664 5.935 6.199 6.483 6.76 7.053 7.368 7.708 8.106 8.511 8.957 9.396 9.881 10.417 10.942 11.37 11.561 11.381 11.011 10.571 10.104 9.628 9.176 8.765 8.394 7.98 7.599 7.263 6.962 6.644 6.305 6.011 5.705 5.426 5.199 4.944 4.669 4.453 4.207 3.938 3.727 3.502 3.289 3.07 2.814 2.643 2.481 2.217 2.033 1.835 1.73 1.512 1.278 1.041 0.917 0.685 0.513 0.369 0.215 -0.132 -0.318 -0.512 -0.732 -0.987 -1.277 -1.67 -2.503 -3 ,23787 ,KEBNE ,17018098,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:19:37 CET,0.0 0.462 0.748 0.966 1.157 1.332 1.497 1.666 1.982 2.124 2.267 2.441 2.658 2.764 2.965 3.15 3.328 3.421 3.606 3.782 4.027 4.19 4.353 4.572 4.782 4.979 5.176 5.371 5.607 5.827 6.051 6.336 6.594 6.832 7.107 7.398 7.673 7.981 8.292 8.606 8.939 9.312 9.728 10.128 10.58 11.059 11.581 12.116 12.645 13.137 13.434 13.288 12.886 12.396 11.893 11.365 10.852 10.361 9.951 9.517 9.091 8.696 8.314 7.94 7.585 7.272 6.925 6.616 6.355 6.06 5.759 5.499 5.2 4.883 4.63 4.37 4.119 3.876 3.622 3.431 3.225 2.917 2.712 2.487 2.361 2.097 1.818 1.522 1.373 1.133 0.934 0.755 0.552 0.168 -0.013 -0.203 -0.423 -0.687 -1.008 -1.442 -2.268 -4 ,19256 ,KEBNE ,17018099,Tue Dec 21 23:00:11 CET,Wed Dec 22 00:14:37 CET,0.0 0.536 0.823 1.045 1.222 1.4 1.573 1.734 2.032 2.171 2.3 2.439 2.657 2.776 2.99 3.19 3.392 3.487 3.652 3.808 4.057 4.223 4.377 4.59 4.793 4.997 5.197 5.389 5.624 5.85 6.083 6.403 6.698 6.936 7.219 7.52 7.814 8.169 8.534 8.892 9.271 9.688 10.158 10.598 11.065 11.569 12.13 12.7 13.214 13.65 13.916 13.753 13.35 12.843 12.296 11.739 11.226 10.769 10.317 9.824 9.411 9.025 8.64 8.275 7.923 7.58 7.22 6.908 6.62 6.306 5.991 5.719 5.429 5.124 4.878 4.619 4.359 4.099 3.818 3.618 3.408 3.083 2.852 2.607 2.486 2.235 1.961 1.675 1.526 1.273 1.048 0.884 0.707 0.307 0.098 -0.129 -0.383 -0.657 -0.982 -1.421 -2.438 -5 ,25882 ,KEBNE ,17018100,Tue Dec 21 23:00:16 CET,Wed Dec 22 00:15:25 CET,0.0 0.355 0.616 0.832 1.015 1.194 1.372 1.544 1.844 1.973 2.095 2.227 2.442 2.558 2.778 2.978 3.162 3.254 3.438 3.615 3.877 4.046 4.2 4.425 4.654 4.869 5.081 5.281 5.537 5.784 6.006 6.278 6.546 6.807 7.09 7.377 7.661 7.984 8.328 8.688 9.048 9.439 9.896 10.352 10.827 11.295 11.78 12.285 12.801 13.255 13.514 13.358 12.916 12.357 11.813 11.267 10.779 10.291 9.824 9.363 8.941 8.548 8.17 7.801 7.457 7.134 6.789 6.478 6.198 5.909 5.619 5.362 5.075 4.78 4.552 4.308 4.056 3.804 3.544 3.357 3.14 2.766 2.49 2.215 2.097 1.889 1.674 1.436 1.306 1.07 0.887 0.741 0.592 0.256 0.073 -0.125 -0.35 -0.609 -0.911 -1.27 -2.553 -6 ,25753 ,KEBNE ,17018101,Tue Dec 21 23:00:16 CET,Wed Dec 22 00:16:50 CET,0.0 0.311 0.546 0.768 0.948 1.107 1.274 1.432 1.707 1.838 1.966 2.104 2.315 2.423 2.64 2.873 3.096 3.191 3.369 3.548 3.818 3.987 4.145 4.373 4.598 4.814 5.026 5.233 5.486 5.72 5.946 6.22 6.486 6.734 7.012 7.32 7.605 7.899 8.208 8.54 8.882 9.27 9.693 10.088 10.538 11.017 11.542 12.08 12.631 13.135 13.436 13.267 12.851 12.32 11.759 11.242 10.758 10.297 9.906 9.503 9.167 8.847 8.502 8.159 7.832 7.548 7.249 6.96 6.716 6.462 6.19 5.963 5.714 5.451 5.236 5.027 4.833 4.602 4.352 4.186 4.013 3.745 3.542 3.339 3.238 3.013 2.782 2.529 2.389 2.152 1.983 1.838 1.693 1.373 1.18 0.971 0.748 0.482 0.169 -0.217 -1.069 -7 ,6950 ,KEBNE ,17018102,Tue Dec 21 23:00:12 CET,Wed Dec 22 00:19:01 CET,0.0 0.607 0.852 1.075 1.279 1.459 1.624 1.777 2.056 2.195 2.327 2.475 2.696 2.804 3.001 3.202 3.397 3.488 3.667 3.844 4.105 4.28 4.445 4.649 4.851 5.071 5.286 5.492 5.75 5.981 6.195 6.444 6.679 6.911 7.167 7.476 7.77 8.065 8.372 8.685 9.016 9.4 9.841 10.284 10.771 11.24 11.757 12.297 12.811 13.256 13.512 13.304 12.861 12.354 11.82 11.282 10.753 10.251 9.789 9.321 8.911 8.538 8.182 7.843 7.512 7.176 6.827 6.513 6.225 5.909 5.567 5.277 4.987 4.705 4.496 4.272 4.024 3.767 3.492 3.298 3.096 2.784 2.574 2.349 2.233 1.999 1.752 1.489 1.351 1.102 0.87 0.692 0.508 0.117 -0.104 -0.362 -0.603 -0.838 -1.152 -1.585 -2.446 -8 ,16568 ,KEBNE ,17018103,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:19:41 CET,0.0 0.194 0.346 0.487 0.625 0.76 0.883 1.002 1.208 1.3 1.4 1.495 1.696 1.793 1.978 2.154 2.32 2.399 2.555 2.699 2.912 3.052 3.175 3.349 3.522 3.694 3.866 4.034 4.241 4.477 4.723 4.989 5.247 5.484 5.732 6.002 6.272 6.565 6.883 7.212 7.522 7.888 8.339 8.77 9.275 9.803 10.363 10.936 11.448 11.874 12.168 12.011 11.608 11.109 10.618 10.133 9.674 9.209 8.776 8.353 7.953 7.562 7.191 6.855 6.55 6.263 5.962 5.661 5.38 5.1 4.812 4.558 4.286 3.996 3.762 3.52 3.27 3.019 2.764 2.585 2.392 2.079 1.854 1.63 1.519 1.28 1.014 0.721 0.573 0.323 0.089 -0.077 -0.262 -0.685 -0.921 -1.18 -1.476 -1.801 -2.138 -2.481 -3.643 -9 ,21027 ,KEBNE ,17018104,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:19:45 CET,0.0 0.265 0.447 0.609 0.75 0.872 0.988 1.107 1.348 1.459 1.565 1.661 1.863 1.955 2.121 2.274 2.429 2.51 2.675 2.832 3.038 3.169 3.304 3.512 3.716 3.901 4.081 4.258 4.46 4.644 4.832 5.06 5.275 5.481 5.72 5.989 6.25 6.537 6.828 7.11 7.393 7.716 8.085 8.448 8.86 9.319 9.837 10.365 10.873 11.285 11.517 11.26 10.856 10.397 9.885 9.386 8.918 8.448 8.003 7.555 7.144 6.763 6.396 6.023 5.646 5.298 4.937 4.599 4.321 4.038 3.727 3.472 3.217 2.974 2.795 2.612 2.412 2.195 1.962 1.79 1.609 1.337 1.145 0.949 0.849 0.645 0.441 0.224 0.106 -0.126 -0.316 -0.474 -0.645 -1.003 -1.191 -1.379 -1.568 -1.806 -2.111 -2.511 -3.499 -10 ,13379 ,KEBNE ,17018105,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:21:03 CET,0.0 0.297 0.486 0.64 0.772 0.905 1.025 1.135 1.369 1.483 1.593 1.708 1.912 2.008 2.191 2.349 2.492 2.561 2.706 2.857 3.08 3.224 3.369 3.578 3.755 3.926 4.101 4.267 4.479 4.663 4.833 5.046 5.242 5.44 5.674 5.925 6.172 6.43 6.686 6.972 7.302 7.682 8.093 8.459 8.87 9.293 9.758 10.247 10.709 11.132 11.414 11.249 10.911 10.518 10.024 9.493 9.034 8.587 8.164 7.765 7.423 7.087 6.739 6.407 6.092 5.8 5.498 5.214 4.972 4.725 4.448 4.208 3.957 3.708 3.5 3.28 3.053 2.808 2.56 2.395 2.227 1.957 1.77 1.587 1.494 1.287 1.059 0.805 0.679 0.444 0.26 0.112 -0.04 -0.387 -0.578 -0.779 -0.992 -1.252 -1.571 -1.899 -3.02 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index d01c3cc6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31681 ,KEBNE ,17018106,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:21:51 CET,0.0 0.25 0.422 0.593 0.755 0.904 1.024 1.13 1.343 1.45 1.56 1.675 1.877 1.966 2.144 2.306 2.454 2.526 2.667 2.804 2.99 3.114 3.245 3.43 3.611 3.781 3.934 4.086 4.277 4.458 4.626 4.827 5.034 5.238 5.465 5.704 5.934 6.208 6.508 6.808 7.099 7.398 7.727 8.06 8.382 8.729 9.168 9.59 9.879 9.994 9.831 9.243 8.538 7.747 6.946 6.24 5.614 5.029 4.529 4.006 3.538 3.115 2.682 2.276 1.928 1.624 1.309 1.018 0.772 0.521 0.239 -0.014 -0.285 -0.557 -0.773 -1.003 -1.229 -1.457 -1.69 -1.855 -2.027 -2.274 -2.447 -2.645 -2.749 -2.953 -3.183 -3.435 -3.557 -3.791 -3.966 -4.102 -4.248 -4.591 -4.774 -4.966 -5.192 -5.452 -5.748 -6.087 -6.93 -2 ,1911 ,KEBNE ,17018107,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:20:03 CET,0.0 0.32 0.528 0.712 0.897 1.073 1.245 1.404 1.675 1.802 1.919 2.044 2.255 2.366 2.572 2.762 2.949 3.042 3.225 3.393 3.638 3.802 3.948 4.153 4.357 4.553 4.743 4.924 5.182 5.44 5.677 5.945 6.202 6.474 6.777 7.079 7.36 7.665 7.987 8.319 8.652 8.988 9.342 9.694 10.093 10.495 10.907 11.296 11.577 11.691 11.478 10.846 10.067 9.284 8.57 7.888 7.256 6.721 6.233 5.72 5.271 4.821 4.377 3.973 3.592 3.254 2.9 2.559 2.253 1.932 1.621 1.362 1.084 0.803 0.571 0.328 0.083 -0.176 -0.453 -0.647 -0.84 -1.146 -1.367 -1.601 -1.715 -1.929 -2.146 -2.383 -2.514 -2.743 -2.898 -3.045 -3.204 -3.524 -3.707 -3.902 -4.112 -4.358 -4.641 -4.967 -5.63 -3 ,1381 ,KEBNE ,17018108,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:20:00 CET,0.0 0.253 0.442 0.603 0.733 0.86 0.995 1.124 1.356 1.461 1.559 1.636 1.826 1.911 2.079 2.238 2.397 2.48 2.637 2.781 2.992 3.124 3.246 3.422 3.592 3.77 3.945 4.114 4.326 4.526 4.726 4.971 5.204 5.421 5.67 5.946 6.213 6.516 6.828 7.104 7.368 7.669 8.029 8.367 8.692 9.012 9.33 9.622 9.887 10.006 9.773 9.118 8.368 7.614 6.882 6.197 5.548 4.962 4.451 3.883 3.377 2.939 2.537 2.143 1.752 1.394 1.033 0.697 0.411 0.114 -0.222 -0.505 -0.794 -1.087 -1.305 -1.546 -1.807 -2.063 -2.327 -2.516 -2.709 -3.031 -3.284 -3.526 -3.643 -3.887 -4.139 -4.397 -4.531 -4.776 -4.999 -5.167 -5.334 -5.65 -5.832 -6.045 -6.261 -6.54 -6.891 -7.311 -8.051 -4 ,15431 ,KEBNE ,17018109,Tue Dec 21 23:00:10 CET,Wed Dec 22 00:19:53 CET,0.0 0.386 0.564 0.721 0.877 1.02 1.144 1.268 1.508 1.614 1.719 1.824 2.021 2.109 2.282 2.442 2.597 2.675 2.834 2.98 3.181 3.321 3.467 3.67 3.866 4.099 4.329 4.524 4.751 4.957 5.162 5.431 5.698 5.926 6.192 6.499 6.785 7.092 7.396 7.689 7.983 8.312 8.692 9.05 9.452 9.867 10.277 10.659 11.021 11.262 11.123 10.485 9.716 8.911 8.182 7.502 6.862 6.255 5.749 5.257 4.792 4.331 3.889 3.486 3.101 2.751 2.377 2.037 1.734 1.423 1.097 0.811 0.533 0.246 0.01 -0.236 -0.495 -0.777 -1.064 -1.263 -1.474 -1.788 -2.011 -2.248 -2.366 -2.607 -2.869 -3.144 -3.274 -3.518 -3.738 -3.877 -4.008 -4.308 -4.49 -4.707 -4.941 -5.174 -5.454 -5.825 -6.75 -5 ,5207 ,KEBNE ,17018110,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:19:48 CET,0.0 0.492 0.671 0.819 0.959 1.105 1.248 1.364 1.595 1.707 1.804 1.891 2.089 2.18 2.355 2.52 2.673 2.751 2.902 3.046 3.276 3.42 3.552 3.742 3.938 4.124 4.289 4.456 4.671 4.862 5.052 5.29 5.513 5.736 5.975 6.223 6.45 6.691 6.952 7.207 7.491 7.823 8.167 8.455 8.81 9.207 9.579 9.918 10.209 10.404 10.248 9.601 8.878 8.137 7.45 6.785 6.152 5.572 5.088 4.603 4.177 3.797 3.413 3.06 2.75 2.445 2.102 1.8 1.556 1.287 0.973 0.705 0.419 0.141 -0.078 -0.317 -0.55 -0.784 -1.028 -1.204 -1.379 -1.635 -1.83 -2.037 -2.135 -2.343 -2.566 -2.794 -2.911 -3.134 -3.295 -3.434 -3.571 -3.879 -4.062 -4.254 -4.462 -4.702 -4.966 -5.256 -5.755 -6 ,13220 ,KEBNE ,17018111,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:21:03 CET,0.0 0.245 0.437 0.596 0.734 0.866 0.992 1.115 1.348 1.452 1.552 1.641 1.84 1.934 2.102 2.265 2.424 2.495 2.633 2.776 2.982 3.11 3.238 3.429 3.611 3.786 3.95 4.108 4.304 4.486 4.669 4.892 5.093 5.28 5.493 5.732 5.958 6.188 6.426 6.674 6.933 7.235 7.587 7.897 8.22 8.538 8.853 9.122 9.323 9.431 9.24 8.564 7.764 6.985 6.299 5.651 5.033 4.436 3.875 3.289 2.778 2.317 1.88 1.474 1.077 0.717 0.338 -0.02 -0.321 -0.63 -0.936 -1.188 -1.461 -1.757 -1.99 -2.231 -2.488 -2.744 -3.013 -3.206 -3.408 -3.714 -3.922 -4.142 -4.257 -4.495 -4.745 -5.008 -5.156 -5.406 -5.589 -5.746 -5.921 -6.312 -6.529 -6.764 -7.016 -7.297 -7.618 -8.036 -8.812 -7 ,6930 ,KEBNE ,17018112,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:20:03 CET,0.0 0.319 0.522 0.686 0.847 0.993 1.148 1.299 1.545 1.669 1.801 1.944 2.153 2.271 2.513 2.744 2.964 3.072 3.276 3.456 3.709 3.863 4.02 4.269 4.51 4.745 4.958 5.161 5.439 5.686 5.897 6.151 6.393 6.628 6.915 7.227 7.502 7.812 8.144 8.459 8.763 9.1 9.487 9.864 10.265 10.665 11.079 11.464 11.767 11.947 11.861 11.257 10.544 9.803 9.062 8.364 7.709 7.064 6.521 5.981 5.479 5.025 4.604 4.201 3.812 3.469 3.122 2.809 2.529 2.209 1.874 1.596 1.289 0.972 0.727 0.484 0.235 -0.041 -0.336 -0.533 -0.726 -1.036 -1.25 -1.478 -1.601 -1.85 -2.106 -2.376 -2.525 -2.776 -2.977 -3.133 -3.299 -3.659 -3.853 -4.067 -4.312 -4.59 -4.892 -5.27 -6.055 -8 ,9306 ,KEBNE ,17018113,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:21:18 CET,0.0 0.324 0.498 0.657 0.803 0.937 1.068 1.188 1.398 1.504 1.61 1.708 1.911 2.002 2.163 2.315 2.47 2.548 2.69 2.827 3.041 3.18 3.32 3.529 3.718 3.882 4.059 4.243 4.469 4.686 4.893 5.159 5.42 5.656 5.909 6.219 6.533 6.851 7.188 7.539 7.886 8.243 8.64 9.029 9.429 9.826 10.256 10.612 10.875 11.032 10.843 10.167 9.351 8.574 7.858 7.159 6.538 5.949 5.405 4.806 4.274 3.821 3.415 3.009 2.612 2.279 1.907 1.558 1.268 0.96 0.627 0.347 0.081 -0.206 -0.451 -0.704 -0.955 -1.215 -1.5 -1.694 -1.886 -2.183 -2.399 -2.619 -2.728 -2.948 -3.187 -3.45 -3.59 -3.835 -4.05 -4.218 -4.387 -4.771 -4.983 -5.214 -5.455 -5.695 -5.961 -6.276 -6.923 -9 ,29646 ,KEBNE ,17018114,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:20:04 CET,0.0 0.584 0.851 1.074 1.253 1.415 1.581 1.739 2.047 2.186 2.301 2.411 2.611 2.713 2.911 3.105 3.285 3.367 3.537 3.706 3.948 4.102 4.25 4.477 4.696 4.889 5.065 5.229 5.439 5.631 5.814 6.049 6.274 6.497 6.758 7.032 7.281 7.564 7.855 8.147 8.455 8.816 9.237 9.642 10.078 10.506 10.926 11.283 11.564 11.757 11.637 10.985 10.222 9.486 8.784 8.108 7.476 6.869 6.334 5.781 5.301 4.868 4.467 4.072 3.682 3.318 2.938 2.627 2.357 2.057 1.736 1.46 1.175 0.868 0.614 0.359 0.099 -0.157 -0.407 -0.601 -0.812 -1.121 -1.335 -1.549 -1.658 -1.892 -2.133 -2.397 -2.547 -2.793 -2.99 -3.148 -3.317 -3.679 -3.88 -4.115 -4.379 -4.654 -4.955 -5.349 -6.124 -10 ,30274 ,KEBNE ,17018115,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:19:45 CET,0.0 0.303 0.512 0.706 0.875 1.036 1.184 1.321 1.578 1.705 1.833 1.966 2.177 2.284 2.481 2.682 2.869 2.953 3.125 3.294 3.536 3.697 3.856 4.088 4.31 4.534 4.738 4.928 5.168 5.384 5.591 5.848 6.108 6.37 6.674 6.988 7.263 7.545 7.847 8.175 8.499 8.827 9.217 9.586 9.959 10.35 10.722 11.066 11.369 11.515 11.353 10.786 10.061 9.308 8.582 7.918 7.326 6.77 6.314 5.839 5.412 5.057 4.698 4.335 3.983 3.647 3.315 3.027 2.767 2.475 2.165 1.916 1.652 1.372 1.152 0.934 0.714 0.489 0.258 0.089 -0.09 -0.378 -0.574 -0.769 -0.867 -1.07 -1.293 -1.53 -1.652 -1.88 -2.043 -2.178 -2.328 -2.66 -2.832 -3.031 -3.248 -3.492 -3.749 -4.027 -4.915 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index d128fb66..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11393 ,KEBNE ,17018116,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:21:20 CET,0.0 0.474 0.756 0.975 1.171 1.35 1.513 1.667 1.953 2.078 2.204 2.362 2.587 2.701 2.926 3.123 3.309 3.404 3.587 3.763 4.022 4.185 4.339 4.571 4.798 5.01 5.215 5.395 5.615 5.828 6.033 6.289 6.544 6.798 7.1 7.442 7.755 8.074 8.416 8.784 9.165 9.562 9.981 10.392 10.854 11.331 11.876 12.459 13.026 13.599 14.12 14.208 13.958 13.602 13.227 12.814 12.413 12.014 11.611 11.206 10.832 10.458 10.066 9.652 9.27 8.932 8.551 8.198 7.911 7.606 7.289 7.03 6.746 6.448 6.209 5.953 5.696 5.422 5.137 4.938 4.71 4.356 4.128 3.889 3.758 3.49 3.203 2.891 2.725 2.461 2.212 2.013 1.795 1.347 1.104 0.836 0.54 0.226 -0.146 -0.673 -2.64 -2 ,18180 ,KEBNE ,17018117,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:20:07 CET,0.0 0.339 0.541 0.684 0.81 0.942 1.07 1.197 1.439 1.545 1.642 1.728 1.927 2.018 2.207 2.389 2.561 2.647 2.81 2.96 3.179 3.328 3.474 3.669 3.853 4.034 4.209 4.382 4.617 4.837 5.057 5.349 5.624 5.884 6.186 6.504 6.804 7.136 7.476 7.854 8.266 8.693 9.174 9.66 10.187 10.733 11.323 11.949 12.576 13.195 13.788 13.96 13.784 13.46 13.041 12.614 12.174 11.701 11.272 10.8 10.38 10.008 9.626 9.253 8.901 8.576 8.228 7.913 7.623 7.302 6.964 6.678 6.381 6.068 5.838 5.614 5.348 5.041 4.724 4.531 4.335 4.021 3.806 3.582 3.472 3.24 3.001 2.743 2.595 2.336 2.108 1.947 1.776 1.384 1.164 0.91 0.628 0.319 -0.041 -0.495 -1.892 -3 ,27373 ,KEBNE ,17018118,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:21:21 CET,0.0 0.295 0.513 0.697 0.873 1.046 1.212 1.368 1.66 1.795 1.916 2.059 2.281 2.394 2.616 2.832 3.041 3.143 3.329 3.509 3.759 3.909 4.072 4.324 4.56 4.771 4.965 5.145 5.396 5.657 5.908 6.204 6.47 6.726 7.035 7.365 7.669 8.006 8.375 8.743 9.118 9.538 10.0 10.448 10.934 11.448 12.031 12.656 13.31 13.928 14.388 14.501 14.313 13.969 13.538 13.086 12.631 12.185 11.777 11.331 10.891 10.472 10.07 9.692 9.346 9.016 8.651 8.336 8.067 7.78 7.501 7.275 7.031 6.771 6.565 6.353 6.132 5.876 5.607 5.413 5.206 4.898 4.679 4.452 4.336 4.09 3.822 3.541 3.393 3.143 2.937 2.761 2.581 2.219 2.008 1.771 1.519 1.256 0.886 0.394 -0.755 -4 ,1784 ,KEBNE ,17018119,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:20:00 CET,0.0 0.498 0.835 1.094 1.327 1.55 1.747 1.902 2.181 2.318 2.452 2.609 2.834 2.949 3.169 3.381 3.589 3.688 3.874 4.058 4.325 4.491 4.647 4.871 5.094 5.304 5.504 5.704 5.955 6.195 6.425 6.678 6.915 7.148 7.411 7.716 8.025 8.363 8.72 9.098 9.475 9.874 10.315 10.737 11.215 11.733 12.3 12.916 13.6 14.226 14.723 14.838 14.661 14.323 13.949 13.579 13.186 12.74 12.304 11.857 11.457 11.082 10.708 10.363 10.054 9.758 9.417 9.075 8.769 8.449 8.111 7.843 7.572 7.301 7.104 6.893 6.678 6.454 6.196 6.006 5.806 5.507 5.304 5.088 4.972 4.723 4.464 4.183 4.041 3.801 3.609 3.448 3.259 2.85 2.641 2.409 2.131 1.821 1.476 1.036 -0.763 -5 ,4393 ,KEBNE ,17018120,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:21:29 CET,0.0 0.356 0.607 0.818 1.008 1.174 1.335 1.496 1.788 1.918 2.044 2.181 2.397 2.509 2.733 2.943 3.136 3.232 3.422 3.6 3.859 4.025 4.186 4.405 4.614 4.812 5.01 5.205 5.457 5.713 5.953 6.235 6.492 6.741 7.043 7.378 7.683 7.993 8.321 8.672 9.047 9.437 9.882 10.362 10.912 11.489 12.074 12.664 13.292 13.877 14.356 14.48 14.269 13.968 13.62 13.215 12.791 12.4 12.077 11.668 11.255 10.885 10.487 10.077 9.707 9.389 9.057 8.73 8.431 8.125 7.803 7.554 7.314 7.046 6.819 6.57 6.295 6.002 5.707 5.5 5.281 4.936 4.69 4.435 4.304 4.037 3.743 3.421 3.253 2.98 2.747 2.59 2.419 1.995 1.771 1.536 1.278 0.991 0.624 0.143 -1.339 -6 ,18611 ,KEBNE ,17018121,Tue Dec 21 23:00:10 CET,Wed Dec 22 00:21:35 CET,0.0 0.357 0.624 0.852 1.055 1.24 1.417 1.589 1.879 2.011 2.142 2.276 2.497 2.614 2.833 3.032 3.218 3.316 3.509 3.685 3.932 4.097 4.261 4.491 4.709 4.915 5.11 5.29 5.51 5.733 5.966 6.231 6.48 6.718 6.987 7.303 7.597 7.915 8.257 8.611 8.983 9.406 9.892 10.344 10.853 11.413 12.003 12.616 13.284 13.907 14.384 14.471 14.282 13.973 13.602 13.185 12.752 12.296 11.864 11.403 10.977 10.58 10.162 9.751 9.384 9.042 8.678 8.36 8.083 7.776 7.437 7.163 6.866 6.557 6.314 6.068 5.823 5.578 5.339 5.165 4.979 4.669 4.46 4.256 4.148 3.908 3.64 3.359 3.214 2.968 2.743 2.565 2.388 1.982 1.749 1.503 1.228 0.924 0.571 0.099 -1.26 -7 ,2031 ,KEBNE ,17018122,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:20:08 CET,0.0 0.349 0.526 0.686 0.842 1.004 1.163 1.304 1.565 1.69 1.813 1.962 2.192 2.301 2.476 2.636 2.803 2.891 3.06 3.205 3.407 3.549 3.691 3.88 4.069 4.267 4.449 4.624 4.85 5.07 5.284 5.527 5.806 6.14 6.474 6.797 7.106 7.442 7.774 8.092 8.43 8.797 9.218 9.674 10.197 10.729 11.33 11.963 12.625 13.264 13.732 13.815 13.61 13.292 12.917 12.503 12.093 11.683 11.285 10.846 10.438 10.05 9.68 9.32 8.986 8.693 8.368 8.052 7.771 7.477 7.166 6.894 6.601 6.277 6.015 5.752 5.482 5.204 4.909 4.701 4.494 4.157 3.901 3.652 3.534 3.293 3.045 2.772 2.611 2.344 2.132 1.958 1.774 1.392 1.186 0.964 0.721 0.44 0.069 -0.415 -1.564 -8 ,15131 ,KEBNE ,17018123,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:20:00 CET,0.0 0.375 0.622 0.836 1.03 1.202 1.359 1.506 1.783 1.929 2.089 2.305 2.562 2.694 2.921 3.136 3.34 3.437 3.648 3.853 4.12 4.285 4.45 4.681 4.889 5.078 5.263 5.454 5.708 5.953 6.187 6.445 6.677 6.909 7.199 7.532 7.813 8.095 8.404 8.728 9.086 9.508 9.977 10.405 10.874 11.393 11.967 12.553 13.151 13.762 14.242 14.281 14.099 13.776 13.367 12.956 12.567 12.18 11.8 11.346 10.939 10.545 10.133 9.767 9.422 9.091 8.748 8.439 8.147 7.848 7.532 7.252 6.963 6.647 6.397 6.148 5.879 5.593 5.283 5.073 4.859 4.49 4.24 3.982 3.847 3.573 3.281 3.0 2.84 2.567 2.296 2.105 1.911 1.482 1.222 0.94 0.662 0.32 -0.11 -0.68 -1.876 -9 ,25852 ,KEBNE ,17018124,Tue Dec 21 23:00:09 CET,Wed Dec 22 00:20:04 CET,0.0 0.316 0.568 0.792 0.982 1.159 1.326 1.478 1.744 1.871 1.998 2.134 2.344 2.458 2.693 2.908 3.112 3.211 3.402 3.586 3.852 4.025 4.191 4.426 4.648 4.858 5.062 5.263 5.519 5.772 6.002 6.276 6.546 6.79 7.072 7.395 7.698 7.987 8.296 8.658 9.026 9.457 9.95 10.367 10.804 11.276 11.831 12.432 13.032 13.644 14.167 14.242 14.039 13.716 13.325 12.954 12.577 12.161 11.766 11.316 10.891 10.498 10.133 9.799 9.474 9.146 8.764 8.416 8.147 7.882 7.595 7.357 7.117 6.871 6.678 6.457 6.201 5.938 5.671 5.487 5.294 4.986 4.767 4.537 4.422 4.176 3.908 3.643 3.505 3.261 3.051 2.877 2.697 2.299 2.066 1.822 1.549 1.213 0.858 0.411 -0.594 -10 ,27619 ,KEBNE ,17018125,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:20:09 CET,0.0 0.413 0.676 0.902 1.09 1.254 1.42 1.587 1.89 2.027 2.156 2.307 2.529 2.641 2.861 3.065 3.259 3.355 3.542 3.724 3.996 4.169 4.329 4.562 4.789 5.005 5.204 5.385 5.625 5.877 6.111 6.387 6.664 6.928 7.249 7.625 7.944 8.259 8.59 8.937 9.308 9.711 10.141 10.553 11.04 11.559 12.117 12.715 13.301 13.858 14.394 14.484 14.25 13.938 13.55 13.085 12.607 12.138 11.738 11.324 10.889 10.471 10.068 9.672 9.326 9.021 8.673 8.356 8.088 7.792 7.456 7.173 6.911 6.639 6.405 6.146 5.87 5.59 5.298 5.091 4.878 4.533 4.29 4.036 3.908 3.657 3.38 3.063 2.902 2.637 2.345 2.145 1.938 1.482 1.233 0.984 0.7 0.352 -0.049 -0.598 -1.887 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index 28fab820..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27750 ,KEBNE ,17018126,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:20:10 CET,0.0 0.359 0.623 0.831 1.011 1.18 1.34 1.487 1.74 1.858 1.972 2.088 2.298 2.403 2.607 2.806 2.986 3.072 3.246 3.422 3.696 3.875 4.053 4.323 4.581 4.816 5.034 5.241 5.504 5.759 6.0 6.278 6.561 6.842 7.135 7.451 7.752 8.064 8.406 8.756 9.088 9.437 9.851 10.282 10.739 11.234 11.778 12.263 12.679 12.987 13.007 12.58 11.971 11.317 10.633 9.974 9.391 8.835 8.353 7.868 7.412 6.97 6.542 6.145 5.765 5.395 5.009 4.663 4.368 4.056 3.709 3.413 3.112 2.799 2.548 2.289 2.019 1.727 1.418 1.212 0.997 0.648 0.408 0.163 0.038 -0.227 -0.526 -0.841 -1.003 -1.266 -1.519 -1.713 -1.922 -2.343 -2.569 -2.838 -3.109 -3.367 -3.673 -4.079 -5.1 -2 ,32740 ,KEBNE ,17018127,Tue Dec 21 23:00:08 CET,Wed Dec 22 00:20:06 CET,0.0 0.467 0.728 0.957 1.161 1.349 1.542 1.732 2.042 2.168 2.287 2.411 2.62 2.726 2.927 3.107 3.281 3.374 3.551 3.712 3.941 4.09 4.243 4.472 4.688 4.897 5.087 5.261 5.503 5.759 6.005 6.288 6.56 6.827 7.133 7.466 7.775 8.103 8.446 8.804 9.177 9.562 9.964 10.366 10.796 11.225 11.691 12.168 12.608 12.919 12.963 12.553 11.927 11.209 10.513 9.874 9.298 8.751 8.277 7.79 7.341 6.92 6.518 6.096 5.686 5.333 4.951 4.597 4.286 3.95 3.584 3.27 2.951 2.625 2.363 2.089 1.826 1.549 1.238 1.034 0.849 0.542 0.302 0.061 -0.067 -0.347 -0.635 -0.927 -1.089 -1.359 -1.608 -1.789 -1.974 -2.38 -2.6 -2.837 -3.103 -3.417 -3.82 -4.28 -5.626 -3 ,21322 ,KEBNE ,17018128,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:22:13 CET,0.0 0.333 0.546 0.728 0.889 1.047 1.21 1.368 1.636 1.756 1.882 2.004 2.204 2.307 2.51 2.705 2.888 2.973 3.142 3.3 3.524 3.677 3.826 4.025 4.22 4.405 4.587 4.766 4.99 5.21 5.428 5.684 5.927 6.167 6.44 6.719 6.987 7.295 7.621 7.945 8.27 8.626 9.039 9.459 9.87 10.274 10.736 11.217 11.673 11.937 11.889 11.48 10.883 10.235 9.595 8.939 8.331 7.756 7.249 6.702 6.228 5.818 5.413 5.002 4.599 4.231 3.859 3.524 3.229 2.916 2.577 2.306 2.027 1.712 1.464 1.217 0.962 0.641 0.291 0.086 -0.121 -0.452 -0.69 -0.943 -1.074 -1.344 -1.628 -1.926 -2.079 -2.338 -2.568 -2.755 -2.967 -3.418 -3.669 -3.932 -4.213 -4.512 -4.85 -5.316 -6.63 -4 ,24885 ,KEBNE ,17018129,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:22:43 CET,0.0 0.347 0.574 0.774 0.941 1.106 1.256 1.397 1.659 1.781 1.895 2.016 2.231 2.344 2.562 2.756 2.941 3.033 3.209 3.381 3.634 3.791 3.938 4.18 4.432 4.661 4.881 5.103 5.389 5.659 5.906 6.189 6.466 6.741 7.07 7.429 7.76 8.111 8.442 8.763 9.103 9.47 9.858 10.229 10.665 11.114 11.58 12.091 12.592 12.947 13.026 12.612 11.964 11.3 10.666 10.027 9.426 8.861 8.347 7.807 7.325 6.872 6.401 5.971 5.601 5.261 4.915 4.598 4.311 4.014 3.696 3.423 3.141 2.842 2.603 2.36 2.125 1.884 1.619 1.434 1.246 0.939 0.721 0.491 0.376 0.164 -0.064 -0.3 -0.433 -0.686 -0.895 -1.064 -1.237 -1.595 -1.794 -2.006 -2.251 -2.532 -2.871 -3.305 -4.524 -5 ,21988 ,KEBNE ,17018130,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:20:55 CET,0.0 0.275 0.488 0.678 0.86 1.037 1.186 1.324 1.59 1.718 1.837 1.945 2.147 2.247 2.452 2.64 2.811 2.895 3.054 3.215 3.459 3.612 3.754 3.956 4.159 4.36 4.569 4.784 5.048 5.299 5.54 5.836 6.122 6.393 6.703 7.026 7.311 7.625 7.972 8.308 8.653 9.053 9.493 9.926 10.396 10.827 11.248 11.705 12.183 12.556 12.632 12.214 11.587 10.936 10.318 9.684 9.064 8.471 7.956 7.402 6.877 6.429 6.01 5.619 5.251 4.887 4.479 4.115 3.813 3.486 3.137 2.844 2.548 2.219 1.949 1.68 1.395 1.094 0.796 0.598 0.396 0.065 -0.181 -0.42 -0.54 -0.798 -1.075 -1.376 -1.535 -1.809 -2.095 -2.286 -2.483 -2.892 -3.105 -3.358 -3.637 -3.93 -4.292 -4.817 -6.133 -6 ,5935 ,KEBNE ,17018131,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:03 CET,0.0 0.439 0.727 0.954 1.149 1.314 1.461 1.603 1.886 2.012 2.139 2.27 2.477 2.588 2.817 3.036 3.227 3.319 3.487 3.652 3.899 4.057 4.211 4.426 4.629 4.819 5.006 5.189 5.419 5.64 5.861 6.113 6.361 6.622 6.901 7.191 7.468 7.775 8.112 8.457 8.807 9.181 9.57 9.969 10.446 10.931 11.414 11.892 12.316 12.611 12.628 12.259 11.731 11.071 10.409 9.771 9.142 8.529 7.978 7.444 6.992 6.574 6.134 5.692 5.292 4.942 4.546 4.167 3.866 3.565 3.236 2.951 2.64 2.328 2.093 1.844 1.579 1.287 0.981 0.773 0.565 0.219 -0.032 -0.285 -0.415 -0.664 -0.919 -1.204 -1.355 -1.606 -1.843 -2.026 -2.228 -2.693 -2.929 -3.159 -3.43 -3.762 -4.154 -4.642 -5.868 -7 ,6583 ,KEBNE ,17018132,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:22:26 CET,0.0 0.46 0.685 0.881 1.054 1.217 1.371 1.51 1.775 1.899 2.02 2.153 2.366 2.48 2.691 2.883 3.066 3.156 3.339 3.511 3.745 3.891 4.037 4.252 4.453 4.637 4.823 5.009 5.239 5.465 5.689 5.959 6.216 6.454 6.735 7.065 7.416 7.802 8.179 8.566 8.943 9.349 9.799 10.215 10.639 11.082 11.55 11.982 12.367 12.66 12.686 12.184 11.515 10.855 10.261 9.691 9.11 8.547 8.055 7.528 7.039 6.596 6.17 5.753 5.358 5.008 4.625 4.257 3.951 3.653 3.32 3.027 2.734 2.421 2.15 1.885 1.637 1.376 1.104 0.916 0.729 0.443 0.227 -0.014 -0.14 -0.378 -0.623 -0.901 -1.045 -1.297 -1.489 -1.648 -1.823 -2.204 -2.406 -2.629 -2.874 -3.13 -3.446 -3.851 -4.824 -8 ,32060 ,KEBNE ,17018133,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:01 CET,0.0 0.294 0.495 0.647 0.778 0.908 1.029 1.144 1.355 1.457 1.556 1.634 1.83 1.914 2.067 2.211 2.36 2.435 2.58 2.726 2.931 3.06 3.181 3.346 3.521 3.702 3.871 4.037 4.246 4.434 4.611 4.849 5.101 5.353 5.646 5.962 6.244 6.548 6.862 7.168 7.463 7.775 8.139 8.493 8.878 9.281 9.682 10.072 10.432 10.697 10.707 10.26 9.678 9.042 8.393 7.772 7.207 6.693 6.224 5.716 5.272 4.884 4.533 4.21 3.877 3.549 3.207 2.882 2.596 2.31 2.017 1.776 1.528 1.256 1.034 0.797 0.55 0.291 0.036 -0.123 -0.302 -0.596 -0.807 -1.034 -1.147 -1.378 -1.635 -1.911 -2.045 -2.283 -2.487 -2.654 -2.828 -3.2 -3.403 -3.625 -3.852 -4.103 -4.407 -4.794 -5.743 -9 ,32049 ,KEBNE ,17018134,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:06 CET,0.0 0.343 0.574 0.766 0.937 1.095 1.238 1.371 1.633 1.752 1.865 1.978 2.179 2.282 2.478 2.654 2.819 2.898 3.057 3.224 3.465 3.625 3.785 4.008 4.208 4.393 4.564 4.742 4.976 5.192 5.402 5.635 5.868 6.126 6.438 6.771 7.063 7.389 7.781 8.177 8.549 8.921 9.326 9.718 10.167 10.649 11.139 11.617 12.055 12.394 12.44 11.959 11.352 10.705 10.018 9.338 8.706 8.115 7.585 7.036 6.571 6.153 5.728 5.304 4.899 4.519 4.11 3.763 3.495 3.2 2.859 2.578 2.288 2.009 1.809 1.59 1.355 1.111 0.847 0.657 0.474 0.192 -0.025 -0.249 -0.36 -0.591 -0.836 -1.102 -1.234 -1.47 -1.653 -1.803 -1.96 -2.312 -2.508 -2.718 -2.959 -3.257 -3.6 -3.997 -4.928 -10 ,17153 ,KEBNE ,17018135,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:22:15 CET,0.0 0.261 0.443 0.619 0.779 0.926 1.055 1.171 1.387 1.487 1.592 1.69 1.892 1.978 2.149 2.318 2.475 2.552 2.706 2.855 3.069 3.206 3.333 3.517 3.69 3.859 4.039 4.213 4.43 4.652 4.862 5.101 5.325 5.557 5.807 6.069 6.343 6.649 6.983 7.336 7.682 8.041 8.476 8.916 9.393 9.832 10.286 10.8 11.251 11.559 11.578 11.154 10.552 9.917 9.314 8.715 8.132 7.582 7.069 6.534 6.095 5.707 5.311 4.928 4.568 4.212 3.828 3.485 3.168 2.822 2.479 2.207 1.924 1.644 1.436 1.211 0.968 0.715 0.445 0.257 0.071 -0.228 -0.441 -0.665 -0.788 -1.043 -1.313 -1.597 -1.729 -1.981 -2.268 -2.464 -2.653 -3.047 -3.266 -3.502 -3.747 -4.004 -4.325 -4.718 -5.824 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 4b6d7018..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15456 ,KEBNE ,17018136,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:20 CET,0.0 0.319 0.548 0.745 0.934 1.108 1.271 1.425 1.738 1.886 2.014 2.15 2.371 2.485 2.698 2.892 3.075 3.169 3.354 3.541 3.819 3.986 4.149 4.382 4.595 4.802 5.005 5.207 5.468 5.7 5.911 6.176 6.433 6.666 6.929 7.24 7.548 7.908 8.299 8.69 9.093 9.557 10.097 10.613 11.175 11.772 12.441 13.173 13.908 14.627 15.313 15.575 15.499 15.251 14.897 14.459 14.02 13.58 13.178 12.772 12.386 12.029 11.687 11.333 10.993 10.667 10.329 10.024 9.751 9.466 9.139 8.84 8.537 8.227 7.981 7.732 7.473 7.214 6.921 6.698 6.464 6.079 5.814 5.533 5.375 5.061 4.763 4.452 4.281 4.0 3.744 3.552 3.338 2.876 2.633 2.376 2.073 1.702 1.251 0.71 -0.652 -2 ,4520 ,KEBNE ,17018137,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:10 CET,0.0 0.372 0.659 0.907 1.13 1.329 1.523 1.704 1.993 2.124 2.246 2.39 2.62 2.742 2.972 3.189 3.388 3.483 3.664 3.849 4.127 4.295 4.46 4.709 4.929 5.138 5.352 5.55 5.807 6.049 6.282 6.569 6.828 7.082 7.401 7.742 8.063 8.429 8.815 9.214 9.622 10.075 10.557 11.004 11.511 12.092 12.773 13.481 14.246 15.006 15.637 15.869 15.758 15.511 15.178 14.734 14.291 13.887 13.512 13.103 12.708 12.351 12.008 11.646 11.278 10.932 10.569 10.24 9.968 9.688 9.369 9.084 8.79 8.484 8.219 7.93 7.637 7.321 6.981 6.752 6.522 6.163 5.918 5.653 5.496 5.17 4.859 4.554 4.396 4.125 3.848 3.642 3.434 2.987 2.744 2.468 2.162 1.828 1.434 0.875 -0.568 -3 ,5866 ,KEBNE ,17018138,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:07 CET,0.0 0.277 0.496 0.718 0.915 1.093 1.27 1.429 1.71 1.844 1.974 2.12 2.35 2.471 2.695 2.908 3.117 3.217 3.395 3.572 3.84 4.008 4.175 4.415 4.643 4.862 5.074 5.264 5.506 5.787 6.051 6.333 6.609 6.864 7.162 7.481 7.76 8.091 8.468 8.86 9.253 9.699 10.217 10.736 11.353 11.956 12.581 13.231 13.925 14.689 15.411 15.67 15.602 15.369 15.043 14.683 14.32 13.926 13.572 13.215 12.877 12.561 12.225 11.87 11.528 11.185 10.815 10.478 10.18 9.877 9.559 9.289 8.994 8.658 8.399 8.129 7.817 7.461 7.073 6.805 6.531 6.133 5.855 5.563 5.417 5.105 4.778 4.433 4.243 3.952 3.648 3.431 3.179 2.613 2.316 1.994 1.636 1.229 0.729 0.084 -1.893 -4 ,14389 ,KEBNE ,17018139,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:12 CET,0.0 0.22 0.402 0.569 0.717 0.856 0.989 1.109 1.332 1.435 1.537 1.634 1.838 1.931 2.113 2.284 2.437 2.514 2.679 2.845 3.072 3.211 3.354 3.558 3.751 3.938 4.116 4.298 4.549 4.783 5.008 5.261 5.496 5.735 6.007 6.316 6.608 6.911 7.237 7.584 7.945 8.334 8.77 9.196 9.686 10.226 10.784 11.386 12.088 12.798 13.381 13.566 13.44 13.14 12.791 12.395 11.985 11.59 11.241 10.842 10.459 10.099 9.744 9.403 9.067 8.752 8.424 8.117 7.844 7.576 7.292 7.033 6.752 6.457 6.225 5.97 5.699 5.417 5.13 4.943 4.748 4.438 4.214 3.965 3.827 3.553 3.281 2.994 2.838 2.563 2.299 2.109 1.902 1.415 1.144 0.869 0.548 0.185 -0.197 -0.696 -2.164 -5 ,7116 ,KEBNE ,17018140,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:34 CET,0.0 0.46 0.73 0.957 1.159 1.343 1.504 1.656 1.958 2.092 2.214 2.348 2.573 2.69 2.904 3.116 3.326 3.423 3.609 3.793 4.067 4.247 4.412 4.646 4.871 5.091 5.309 5.515 5.768 6.005 6.224 6.497 6.776 7.034 7.316 7.65 7.977 8.311 8.644 8.98 9.38 9.845 10.331 10.795 11.32 11.896 12.521 13.202 13.946 14.692 15.386 15.638 15.544 15.264 14.88 14.416 13.958 13.511 13.102 12.696 12.328 11.964 11.604 11.27 10.949 10.62 10.256 9.941 9.66 9.355 9.033 8.757 8.461 8.13 7.864 7.591 7.307 7.017 6.722 6.503 6.261 5.875 5.603 5.339 5.204 4.935 4.659 4.354 4.196 3.932 3.669 3.47 3.259 2.778 2.512 2.252 1.941 1.598 1.198 0.648 -0.904 -6 ,702 ,KEBNE ,17018141,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:07 CET,0.0 0.355 0.598 0.827 1.024 1.196 1.367 1.531 1.84 1.993 2.136 2.29 2.514 2.631 2.862 3.083 3.286 3.382 3.578 3.769 4.021 4.18 4.343 4.591 4.821 5.035 5.251 5.467 5.749 6.015 6.263 6.557 6.847 7.13 7.446 7.783 8.096 8.437 8.813 9.224 9.628 10.036 10.515 11.007 11.555 12.139 12.799 13.523 14.313 15.073 15.747 16.017 15.92 15.695 15.377 14.982 14.552 14.131 13.75 13.324 12.9 12.501 12.143 11.797 11.461 11.145 10.786 10.437 10.122 9.791 9.438 9.145 8.812 8.463 8.205 7.935 7.649 7.342 7.02 6.79 6.55 6.171 5.898 5.614 5.477 5.176 4.84 4.482 4.303 4.02 3.691 3.451 3.196 2.686 2.429 2.161 1.896 1.612 1.233 0.675 -0.818 -7 ,24269 ,KEBNE ,17018142,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:16 CET,0.0 0.33 0.563 0.777 0.993 1.18 1.364 1.54 1.843 1.977 2.101 2.257 2.488 2.605 2.831 3.041 3.236 3.328 3.511 3.696 3.962 4.138 4.312 4.55 4.775 4.994 5.214 5.432 5.698 5.945 6.167 6.426 6.69 6.955 7.255 7.603 7.951 8.314 8.695 9.116 9.521 9.926 10.422 10.933 11.488 12.062 12.674 13.336 14.083 14.807 15.472 15.768 15.641 15.357 15.046 14.683 14.278 13.865 13.462 13.008 12.584 12.195 11.805 11.446 11.116 10.788 10.449 10.161 9.887 9.593 9.289 9.018 8.736 8.424 8.174 7.921 7.664 7.385 7.08 6.855 6.601 6.199 5.936 5.679 5.542 5.26 4.975 4.654 4.481 4.203 3.923 3.719 3.504 3.043 2.798 2.512 2.2 1.859 1.43 0.824 -0.835 -8 ,29860 ,KEBNE ,17018143,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:31 CET,0.0 0.323 0.492 0.637 0.772 0.9 1.027 1.153 1.374 1.482 1.588 1.684 1.891 1.985 2.156 2.329 2.497 2.577 2.739 2.892 3.107 3.246 3.382 3.581 3.767 3.952 4.134 4.306 4.54 4.763 4.974 5.233 5.492 5.734 5.988 6.269 6.545 6.843 7.17 7.542 7.944 8.367 8.869 9.354 9.865 10.45 11.141 11.891 12.692 13.47 14.092 14.274 14.126 13.867 13.491 13.061 12.632 12.185 11.782 11.361 10.974 10.623 10.278 9.929 9.6 9.302 8.971 8.644 8.351 8.051 7.73 7.449 7.158 6.853 6.61 6.358 6.085 5.778 5.452 5.232 5.006 4.621 4.329 4.059 3.935 3.678 3.4 3.095 2.938 2.675 2.425 2.23 2.027 1.597 1.348 1.076 0.78 0.434 0.024 -0.544 -1.97 -9 ,31321 ,KEBNE ,17018144,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:22:51 CET,0.0 0.334 0.571 0.786 0.973 1.152 1.332 1.512 1.844 1.995 2.13 2.284 2.514 2.633 2.877 3.104 3.301 3.398 3.581 3.763 4.031 4.193 4.351 4.58 4.807 5.019 5.226 5.435 5.69 5.914 6.142 6.455 6.752 7.007 7.295 7.618 7.917 8.261 8.644 9.035 9.435 9.87 10.349 10.832 11.395 12.009 12.683 13.352 14.088 14.886 15.589 15.857 15.717 15.395 15.029 14.618 14.17 13.731 13.358 12.954 12.554 12.207 11.882 11.528 11.164 10.831 10.494 10.156 9.854 9.55 9.226 8.958 8.677 8.374 8.122 7.841 7.548 7.249 6.92 6.689 6.455 6.072 5.793 5.517 5.376 5.067 4.746 4.416 4.236 3.948 3.636 3.417 3.183 2.666 2.387 2.08 1.724 1.32 0.861 0.264 -1.408 -10 ,17131 ,KEBNE ,17018145,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:09 CET,0.0 0.443 0.687 0.923 1.122 1.299 1.47 1.632 1.932 2.069 2.202 2.364 2.586 2.708 2.965 3.217 3.446 3.546 3.732 3.912 4.176 4.352 4.522 4.764 4.994 5.219 5.432 5.623 5.856 6.086 6.326 6.625 6.915 7.2 7.511 7.832 8.113 8.409 8.737 9.081 9.455 9.914 10.453 10.951 11.516 12.128 12.784 13.504 14.299 15.068 15.736 16.021 15.927 15.712 15.412 15.015 14.604 14.222 13.858 13.455 13.084 12.714 12.336 11.976 11.635 11.309 10.954 10.623 10.325 10.006 9.669 9.382 9.093 8.804 8.567 8.307 8.035 7.755 7.437 7.22 6.998 6.62 6.351 6.092 5.966 5.685 5.365 5.037 4.866 4.586 4.288 4.064 3.822 3.319 3.046 2.742 2.423 2.081 1.643 1.087 -0.379 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt deleted file mode 100644 index 23b6bf82..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26720 ,KEBNE ,17018146,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:56 CET,0.0 0.403 0.652 0.866 1.051 1.21 1.364 1.501 1.743 1.857 1.965 2.079 2.301 2.412 2.615 2.812 3.005 3.103 3.303 3.485 3.735 3.902 4.071 4.326 4.58 4.817 5.04 5.269 5.58 5.872 6.13 6.437 6.737 6.998 7.296 7.65 7.991 8.37 8.774 9.188 9.602 10.051 10.535 10.988 11.516 12.108 12.706 13.299 13.942 14.466 14.84 14.763 14.363 13.823 13.279 12.782 12.306 11.781 11.302 10.85 10.438 10.042 9.68 9.35 9.036 8.736 8.414 8.115 7.835 7.524 7.205 6.949 6.667 6.362 6.131 5.902 5.661 5.411 5.16 4.987 4.804 4.502 4.28 4.053 3.943 3.714 3.469 3.207 3.067 2.822 2.644 2.484 2.316 1.951 1.761 1.556 1.327 1.098 0.831 0.473 -0.492 -2 ,22161 ,KEBNE ,17018147,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:23:42 CET,0.0 0.485 0.836 1.128 1.401 1.664 1.887 2.073 2.407 2.568 2.722 2.928 3.174 3.314 3.567 3.798 4.044 4.168 4.407 4.628 4.925 5.113 5.3 5.582 5.839 6.075 6.296 6.513 6.811 7.107 7.379 7.682 7.967 8.247 8.566 8.903 9.231 9.591 9.974 10.37 10.784 11.275 11.814 12.297 12.835 13.414 14.043 14.678 15.31 15.856 16.208 16.125 15.731 15.196 14.627 14.043 13.492 12.952 12.462 11.965 11.496 11.056 10.669 10.306 9.966 9.649 9.281 8.928 8.624 8.311 7.979 7.706 7.411 7.09 6.841 6.582 6.299 5.993 5.687 5.471 5.24 4.891 4.639 4.38 4.251 3.986 3.726 3.445 3.286 3.025 2.786 2.611 2.445 2.089 1.904 1.69 1.444 1.208 0.951 0.591 -0.127 -3 ,24980 ,KEBNE ,17018148,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:58 CET,0.0 0.336 0.547 0.719 0.882 1.036 1.187 1.343 1.628 1.764 1.903 2.065 2.292 2.408 2.641 2.862 3.068 3.163 3.354 3.531 3.765 3.929 4.102 4.348 4.58 4.797 4.997 5.192 5.449 5.69 5.908 6.167 6.409 6.638 6.906 7.2 7.504 7.849 8.199 8.553 8.908 9.307 9.764 10.162 10.595 11.102 11.632 12.147 12.674 13.175 13.538 13.513 13.2 12.701 12.189 11.65 11.129 10.661 10.21 9.733 9.306 8.896 8.481 8.098 7.756 7.428 7.073 6.744 6.461 6.17 5.855 5.581 5.273 4.963 4.74 4.517 4.268 3.942 3.604 3.397 3.185 2.86 2.638 2.406 2.281 2.006 1.73 1.463 1.31 1.038 0.78 0.6 0.418 0.016 -0.202 -0.451 -0.719 -0.995 -1.332 -1.754 -2.782 -4 ,30827 ,KEBNE ,17018149,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:22:04 CET,0.0 0.388 0.604 0.814 1.025 1.223 1.406 1.584 1.927 2.084 2.224 2.369 2.592 2.714 2.939 3.128 3.295 3.386 3.571 3.747 4.006 4.17 4.321 4.521 4.708 4.89 5.067 5.254 5.52 5.771 5.995 6.253 6.486 6.716 6.994 7.308 7.607 7.922 8.255 8.592 8.96 9.396 9.89 10.332 10.783 11.266 11.774 12.334 12.93 13.452 13.86 13.795 13.367 12.871 12.368 11.875 11.408 10.907 10.412 9.937 9.552 9.191 8.823 8.448 8.094 7.752 7.39 7.077 6.819 6.56 6.274 6.014 5.741 5.478 5.283 5.067 4.824 4.578 4.33 4.147 3.955 3.667 3.463 3.25 3.137 2.897 2.637 2.366 2.231 1.987 1.821 1.675 1.523 1.186 0.989 0.786 0.578 0.361 0.125 -0.163 -0.638 -5 ,18323 ,KEBNE ,17018150,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:22:03 CET,0.0 0.586 0.923 1.154 1.363 1.575 1.77 1.942 2.252 2.388 2.519 2.674 2.897 3.014 3.239 3.455 3.669 3.777 3.975 4.15 4.392 4.548 4.71 4.976 5.248 5.5 5.744 5.977 6.258 6.516 6.775 7.108 7.418 7.694 7.985 8.314 8.634 8.959 9.323 9.718 10.116 10.595 11.165 11.692 12.26 12.833 13.42 14.038 14.682 15.26 15.657 15.588 15.225 14.762 14.24 13.671 13.116 12.569 12.121 11.669 11.247 10.827 10.395 9.999 9.616 9.241 8.854 8.519 8.229 7.929 7.597 7.32 7.041 6.738 6.512 6.284 6.019 5.727 5.45 5.256 5.036 4.699 4.48 4.251 4.123 3.854 3.585 3.309 3.152 2.896 2.7 2.528 2.334 1.898 1.665 1.432 1.173 0.871 0.481 0.05 -0.59 -6 ,21648 ,KEBNE ,17018151,Tue Dec 21 23:01:11 CET,Wed Dec 22 00:21:57 CET,0.0 0.475 0.762 1.028 1.264 1.469 1.637 1.781 2.057 2.191 2.332 2.502 2.732 2.85 3.073 3.289 3.492 3.589 3.781 3.961 4.209 4.373 4.528 4.756 4.99 5.204 5.411 5.621 5.879 6.129 6.378 6.657 6.909 7.152 7.426 7.756 8.071 8.404 8.773 9.142 9.525 9.956 10.424 10.87 11.359 11.861 12.43 13.034 13.657 14.274 14.646 14.501 14.095 13.592 13.074 12.546 12.013 11.457 10.93 10.404 9.939 9.524 9.13 8.743 8.37 8.019 7.662 7.336 7.038 6.71 6.367 6.093 5.793 5.477 5.242 4.999 4.734 4.45 4.162 3.965 3.756 3.412 3.163 2.913 2.778 2.492 2.203 1.907 1.749 1.463 1.199 1.023 0.836 0.424 0.183 -0.07 -0.321 -0.59 -0.894 -1.29 -2.047 -7 ,20394 ,KEBNE ,17018152,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:23:23 CET,0.0 0.79 1.197 1.511 1.762 1.986 2.212 2.432 2.801 2.951 3.097 3.269 3.506 3.652 3.939 4.205 4.429 4.538 4.755 4.952 5.25 5.44 5.616 5.888 6.162 6.415 6.657 6.893 7.196 7.476 7.735 8.019 8.274 8.543 8.875 9.25 9.595 9.942 10.285 10.631 11.023 11.481 11.992 12.509 13.085 13.653 14.219 14.804 15.426 15.998 16.415 16.332 15.933 15.395 14.866 14.354 13.877 13.405 12.959 12.487 12.063 11.643 11.233 10.855 10.489 10.157 9.801 9.47 9.182 8.876 8.563 8.315 8.031 7.711 7.458 7.197 6.928 6.629 6.304 6.097 5.892 5.565 5.341 5.111 4.988 4.749 4.499 4.223 4.077 3.827 3.603 3.424 3.244 2.859 2.632 2.366 2.097 1.835 1.544 1.219 0.744 -8 ,31911 ,KEBNE ,17018153,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:23:38 CET,0.0 0.522 0.82 1.035 1.241 1.426 1.599 1.764 2.069 2.203 2.33 2.49 2.71 2.815 3.014 3.207 3.386 3.468 3.631 3.791 4.034 4.193 4.345 4.56 4.758 4.952 5.146 5.337 5.585 5.829 6.083 6.388 6.682 6.965 7.274 7.604 7.922 8.299 8.696 9.088 9.496 9.968 10.489 10.947 11.457 11.992 12.571 13.196 13.825 14.348 14.639 14.521 14.217 13.748 13.215 12.713 12.196 11.631 11.12 10.616 10.155 9.739 9.349 8.972 8.603 8.237 7.834 7.479 7.175 6.853 6.515 6.224 5.925 5.627 5.395 5.158 4.892 4.612 4.322 4.116 3.895 3.548 3.309 3.064 2.941 2.692 2.431 2.148 1.995 1.734 1.495 1.31 1.132 0.79 0.61 0.417 0.191 -0.047 -0.329 -0.729 -1.696 -9 ,9571 ,KEBNE ,17018154,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:57 CET,0.0 0.651 0.999 1.267 1.517 1.756 1.977 2.185 2.587 2.754 2.905 3.093 3.33 3.471 3.757 4.011 4.233 4.345 4.582 4.81 5.093 5.266 5.451 5.721 5.977 6.216 6.443 6.679 6.961 7.215 7.459 7.759 8.055 8.329 8.638 8.984 9.302 9.637 10.003 10.391 10.796 11.248 11.779 12.269 12.782 13.352 13.943 14.509 15.126 15.666 15.959 15.856 15.473 14.953 14.4 13.841 13.326 12.845 12.398 11.91 11.47 11.075 10.677 10.301 9.96 9.635 9.314 9.017 8.755 8.477 8.171 7.921 7.65 7.374 7.174 6.961 6.721 6.472 6.232 6.058 5.87 5.585 5.369 5.142 5.029 4.788 4.543 4.285 4.142 3.889 3.7 3.543 3.372 2.989 2.797 2.611 2.402 2.19 1.964 1.712 1.374 -10 ,7009 ,KEBNE ,17018155,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:22:13 CET,0.0 0.633 0.93 1.161 1.369 1.558 1.723 1.878 2.165 2.3 2.436 2.589 2.816 2.931 3.143 3.34 3.533 3.628 3.814 4.0 4.269 4.43 4.59 4.841 5.077 5.296 5.501 5.706 5.987 6.25 6.481 6.766 7.058 7.325 7.605 7.89 8.166 8.5 8.847 9.198 9.58 10.002 10.442 10.862 11.337 11.837 12.4 13.016 13.655 14.188 14.5 14.394 14.032 13.574 13.065 12.537 12.075 11.611 11.182 10.74 10.323 9.943 9.577 9.221 8.885 8.578 8.235 7.896 7.613 7.322 7.008 6.757 6.494 6.216 6.001 5.77 5.522 5.261 5.004 4.834 4.653 4.36 4.156 3.951 3.851 3.63 3.386 3.121 2.972 2.713 2.51 2.35 2.186 1.843 1.668 1.477 1.272 1.067 0.819 0.521 -0.316 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index a84f1cf1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18569 ,TETRA ,17413899,Sun Nov 21 16:18:08 CET,Sun Nov 21 17:53:17 CET,0.0 0.352 0.571 0.784 0.992 1.182 1.353 1.505 1.78 1.913 2.045 2.187 2.404 2.515 2.736 2.946 3.145 3.238 3.404 3.566 3.821 3.989 4.143 4.359 4.567 4.762 4.955 5.156 5.406 5.637 5.871 6.155 6.412 6.659 6.935 7.248 7.558 7.868 8.202 8.567 8.916 9.294 9.805 10.292 10.792 11.316 11.849 12.408 12.948 13.437 13.713 13.396 12.831 12.237 11.647 11.046 10.455 9.884 9.339 8.747 8.248 7.806 7.36 6.929 6.53 6.137 5.719 5.356 5.024 4.669 4.297 3.97 3.63 3.283 3.004 2.725 2.439 2.139 1.818 1.585 1.326 0.957 0.733 0.488 0.363 0.1 -0.189 -0.494 -0.648 -0.903 -1.135 -1.311 -1.506 -1.973 -2.243 -2.516 -2.804 -3.126 -3.498 -3.965 -5.34 -2 ,26838 ,TETRA ,17413900,Sun Nov 21 16:18:07 CET,Sun Nov 21 17:53:17 CET,0.0 0.267 0.457 0.61 0.75 0.889 1.019 1.143 1.379 1.482 1.579 1.645 1.842 1.938 2.115 2.273 2.43 2.507 2.651 2.794 2.999 3.13 3.257 3.445 3.63 3.803 3.969 4.122 4.327 4.532 4.719 4.941 5.167 5.404 5.679 5.981 6.263 6.558 6.863 7.18 7.487 7.847 8.273 8.638 9.037 9.465 9.915 10.368 10.792 11.148 11.302 10.948 10.381 9.78 9.165 8.529 7.9 7.339 6.837 6.268 5.766 5.338 4.915 4.487 4.079 3.706 3.322 2.959 2.62 2.288 1.957 1.662 1.351 1.016 0.74 0.451 0.155 -0.14 -0.448 -0.662 -0.895 -1.283 -1.548 -1.832 -1.978 -2.272 -2.631 -3.004 -3.185 -3.476 -3.783 -3.992 -4.213 -4.737 -5.049 -5.38 -5.71 -6.102 -6.556 -7.12 -9.028 -3 ,8966 ,TETRA ,17413901,Sun Nov 21 16:18:08 CET,Sun Nov 21 17:53:57 CET,0.0 0.31 0.535 0.731 0.925 1.1 1.249 1.403 1.698 1.833 1.975 2.146 2.376 2.498 2.75 2.984 3.182 3.274 3.457 3.64 3.905 4.067 4.218 4.422 4.629 4.84 5.037 5.229 5.487 5.734 5.966 6.257 6.535 6.786 7.073 7.384 7.653 7.947 8.273 8.626 9.002 9.425 9.914 10.403 10.898 11.337 11.793 12.259 12.725 13.148 13.33 13.074 12.589 11.976 11.352 10.746 10.171 9.579 8.993 8.394 7.872 7.415 7.016 6.622 6.209 5.835 5.442 5.062 4.722 4.372 4.021 3.723 3.4 3.055 2.78 2.475 2.152 1.82 1.445 1.205 0.982 0.633 0.39 0.131 -0.006 -0.292 -0.601 -0.947 -1.122 -1.393 -1.684 -1.897 -2.121 -2.583 -2.834 -3.125 -3.461 -3.836 -4.301 -4.926 -6.942 -4 ,26786 ,TETRA ,17413902,Sun Nov 21 16:18:07 CET,Sun Nov 21 17:53:17 CET,0.0 0.232 0.455 0.681 0.906 1.104 1.283 1.447 1.714 1.829 1.948 2.088 2.309 2.416 2.613 2.805 2.985 3.071 3.234 3.389 3.63 3.791 3.944 4.177 4.413 4.656 4.91 5.16 5.454 5.702 5.928 6.196 6.469 6.737 7.037 7.367 7.674 7.993 8.325 8.681 9.073 9.514 9.978 10.394 10.839 11.349 11.897 12.412 12.93 13.4 13.628 13.333 12.819 12.204 11.563 10.934 10.326 9.749 9.215 8.653 8.159 7.716 7.277 6.846 6.458 6.088 5.684 5.32 5.008 4.677 4.31 4.006 3.678 3.33 3.068 2.789 2.492 2.184 1.866 1.626 1.388 1.051 0.789 0.506 0.368 0.068 -0.257 -0.583 -0.761 -1.051 -1.333 -1.544 -1.776 -2.273 -2.547 -2.826 -3.139 -3.536 -4.006 -4.599 -6.152 -5 ,13333 ,TETRA ,17413903,Sun Nov 21 16:18:07 CET,Sun Nov 21 17:53:55 CET,0.0 0.274 0.491 0.692 0.88 1.064 1.231 1.379 1.643 1.765 1.884 2.008 2.222 2.331 2.538 2.734 2.923 3.011 3.192 3.396 3.672 3.829 3.99 4.219 4.436 4.658 4.866 5.058 5.304 5.538 5.765 6.052 6.327 6.603 6.926 7.245 7.534 7.872 8.242 8.618 9.014 9.43 9.897 10.351 10.863 11.401 11.935 12.505 13.02 13.391 13.514 13.179 12.659 12.073 11.459 10.809 10.226 9.671 9.14 8.595 8.105 7.662 7.247 6.854 6.447 6.05 5.635 5.278 4.946 4.584 4.224 3.924 3.61 3.284 3.014 2.747 2.476 2.168 1.836 1.602 1.375 1.017 0.763 0.497 0.354 0.049 -0.257 -0.57 -0.742 -1.02 -1.308 -1.516 -1.735 -2.218 -2.485 -2.77 -3.106 -3.472 -3.872 -4.423 -5.816 -6 ,18889 ,TETRA ,17413904,Sun Nov 21 16:18:09 CET,Sun Nov 21 17:53:17 CET,0.0 0.334 0.517 0.675 0.81 0.945 1.08 1.2 1.415 1.524 1.633 1.725 1.929 2.015 2.175 2.34 2.503 2.577 2.72 2.872 3.08 3.211 3.344 3.525 3.699 3.869 4.029 4.181 4.387 4.593 4.787 5.018 5.243 5.464 5.699 5.948 6.185 6.436 6.71 7.039 7.402 7.781 8.206 8.603 9.006 9.423 9.882 10.336 10.781 11.209 11.395 11.078 10.551 9.897 9.255 8.664 8.114 7.57 7.022 6.448 5.986 5.59 5.207 4.821 4.436 4.074 3.697 3.358 3.073 2.78 2.447 2.155 1.852 1.544 1.296 1.033 0.766 0.47 0.155 -0.045 -0.258 -0.591 -0.803 -1.043 -1.177 -1.443 -1.713 -2.014 -2.175 -2.438 -2.68 -2.859 -3.046 -3.463 -3.699 -3.962 -4.265 -4.606 -4.995 -5.517 -6.984 -7 ,31020 ,TETRA ,17413905,Sun Nov 21 16:18:08 CET,Sun Nov 21 17:53:54 CET,0.0 0.364 0.554 0.732 0.904 1.057 1.207 1.353 1.628 1.759 1.887 2.03 2.239 2.344 2.562 2.774 2.972 3.062 3.244 3.426 3.677 3.832 3.987 4.219 4.43 4.632 4.825 5.013 5.261 5.5 5.711 5.958 6.203 6.444 6.731 7.039 7.326 7.629 7.939 8.292 8.688 9.122 9.577 10.014 10.54 11.092 11.66 12.247 12.789 13.207 13.336 12.977 12.456 11.798 11.117 10.472 9.856 9.266 8.737 8.183 7.705 7.28 6.871 6.486 6.105 5.745 5.367 5.025 4.718 4.386 4.028 3.742 3.454 3.146 2.888 2.621 2.35 2.067 1.78 1.583 1.374 1.053 0.828 0.575 0.441 0.155 -0.136 -0.415 -0.561 -0.827 -1.095 -1.289 -1.489 -1.92 -2.145 -2.394 -2.684 -3.006 -3.385 -3.936 -5.655 -8 ,11592 ,TETRA ,17413906,Sun Nov 21 16:18:07 CET,Sun Nov 21 17:53:17 CET,0.0 0.285 0.532 0.72 0.887 1.042 1.19 1.325 1.586 1.729 1.875 2.05 2.277 2.384 2.582 2.767 2.957 3.051 3.222 3.387 3.614 3.755 3.894 4.113 4.335 4.552 4.754 4.934 5.167 5.399 5.629 5.91 6.184 6.439 6.716 7.026 7.33 7.66 8.003 8.35 8.71 9.109 9.529 9.936 10.393 10.89 11.404 11.919 12.484 12.973 13.183 12.902 12.389 11.827 11.221 10.563 9.925 9.319 8.765 8.209 7.741 7.289 6.849 6.421 5.996 5.585 5.156 4.794 4.492 4.159 3.799 3.504 3.191 2.855 2.593 2.316 2.022 1.72 1.418 1.202 0.958 0.578 0.313 0.037 -0.11 -0.414 -0.736 -1.085 -1.267 -1.549 -1.814 -2.022 -2.247 -2.734 -3.001 -3.268 -3.586 -3.947 -4.349 -4.958 -6.796 -9 ,3237 ,TETRA ,17413907,Sun Nov 21 16:18:08 CET,Sun Nov 21 17:53:55 CET,0.0 0.234 0.435 0.592 0.732 0.886 1.031 1.153 1.376 1.483 1.583 1.668 1.872 1.962 2.126 2.285 2.442 2.518 2.666 2.809 3.017 3.158 3.293 3.47 3.65 3.82 3.97 4.13 4.331 4.513 4.698 4.923 5.142 5.34 5.559 5.806 6.058 6.36 6.725 7.116 7.493 7.907 8.345 8.779 9.263 9.735 10.247 10.757 11.268 11.74 11.934 11.555 11.007 10.426 9.795 9.136 8.515 7.935 7.401 6.837 6.367 5.925 5.464 5.01 4.568 4.173 3.769 3.405 3.097 2.755 2.387 2.091 1.778 1.457 1.188 0.89 0.591 0.297 0.001 -0.216 -0.447 -0.801 -1.054 -1.315 -1.452 -1.759 -2.056 -2.385 -2.579 -2.872 -3.166 -3.364 -3.579 -4.068 -4.341 -4.631 -4.956 -5.344 -5.749 -6.245 -7.783 -10 ,5042 ,TETRA ,17413908,Sun Nov 21 16:18:08 CET,Sun Nov 21 17:53:17 CET,0.0 0.205 0.37 0.522 0.663 0.802 0.921 1.028 1.243 1.35 1.452 1.533 1.729 1.819 1.987 2.152 2.319 2.396 2.549 2.694 2.894 3.035 3.171 3.361 3.546 3.724 3.896 4.058 4.266 4.48 4.691 4.955 5.214 5.446 5.726 6.052 6.331 6.616 6.93 7.278 7.637 8.039 8.488 8.904 9.348 9.816 10.311 10.806 11.304 11.685 11.8 11.452 10.944 10.367 9.759 9.155 8.588 8.055 7.539 6.94 6.409 5.961 5.516 5.068 4.65 4.261 3.827 3.417 3.059 2.713 2.359 2.059 1.749 1.429 1.182 0.928 0.674 0.391 0.086 -0.108 -0.314 -0.64 -0.855 -1.087 -1.218 -1.507 -1.792 -2.09 -2.247 -2.514 -2.775 -2.967 -3.16 -3.601 -3.857 -4.136 -4.429 -4.768 -5.159 -5.633 -7.055 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index c29e30d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6416 ,KEBNE ,17018156,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:29 CET,0.0 0.557 0.828 1.073 1.294 1.509 1.684 1.833 2.095 2.214 2.338 2.465 2.665 2.768 2.978 3.175 3.359 3.448 3.619 3.777 4.001 4.164 4.333 4.586 4.829 5.049 5.26 5.473 5.739 5.968 6.189 6.479 6.748 6.985 7.243 7.541 7.832 8.148 8.492 8.843 9.184 9.52 9.868 10.211 10.586 10.978 11.416 11.811 12.105 12.281 12.151 11.568 10.817 9.99 9.205 8.489 7.864 7.235 6.635 6.052 5.527 5.021 4.548 4.089 3.622 3.208 2.761 2.337 1.985 1.612 1.246 0.984 0.713 0.408 0.175 -0.074 -0.339 -0.61 -0.895 -1.098 -1.303 -1.612 -1.838 -2.09 -2.225 -2.492 -2.765 -3.046 -3.187 -3.442 -3.68 -3.867 -4.064 -4.472 -4.685 -4.928 -5.212 -5.533 -5.901 -6.39 -7.587 -2 ,11074 ,KEBNE ,17018157,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:19 CET,0.0 0.706 1.042 1.308 1.516 1.713 1.884 2.031 2.323 2.46 2.585 2.729 2.945 3.062 3.268 3.463 3.645 3.729 3.895 4.057 4.3 4.451 4.589 4.789 4.993 5.186 5.359 5.529 5.755 5.967 6.163 6.388 6.598 6.807 7.098 7.415 7.658 7.934 8.23 8.542 8.865 9.219 9.608 9.948 10.311 10.667 11.014 11.342 11.65 11.82 11.585 10.873 10.061 9.242 8.405 7.603 6.902 6.266 5.692 5.067 4.533 4.081 3.639 3.195 2.782 2.402 1.977 1.574 1.207 0.838 0.46 0.139 -0.183 -0.528 -0.812 -1.115 -1.416 -1.723 -2.055 -2.282 -2.517 -2.902 -3.189 -3.478 -3.624 -3.915 -4.206 -4.523 -4.7 -4.986 -5.297 -5.514 -5.748 -6.268 -6.522 -6.771 -7.071 -7.432 -7.881 -8.458 -9.888 -3 ,12707 ,KEBNE ,17018158,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:40 CET,0.0 0.664 0.981 1.212 1.425 1.632 1.828 1.991 2.26 2.378 2.481 2.6 2.811 2.92 3.148 3.373 3.581 3.674 3.839 3.984 4.195 4.33 4.461 4.675 4.893 5.091 5.285 5.475 5.694 5.888 6.095 6.347 6.579 6.807 7.077 7.366 7.654 7.988 8.322 8.641 8.945 9.27 9.639 10.004 10.388 10.791 11.203 11.551 11.836 11.958 11.667 10.927 10.166 9.399 8.643 7.909 7.232 6.59 6.046 5.506 4.99 4.49 4.025 3.552 3.075 2.647 2.199 1.805 1.461 1.087 0.685 0.354 0.022 -0.319 -0.583 -0.875 -1.177 -1.485 -1.815 -2.045 -2.294 -2.692 -2.975 -3.262 -3.403 -3.692 -3.995 -4.34 -4.528 -4.813 -5.103 -5.317 -5.532 -5.988 -6.238 -6.512 -6.814 -7.156 -7.548 -8.054 -9.433 -4 ,28740 ,KEBNE ,17018159,Tue Dec 21 23:01:10 CET,Wed Dec 22 00:21:42 CET,0.0 0.519 0.801 1.047 1.267 1.448 1.599 1.737 2.016 2.142 2.255 2.391 2.613 2.721 2.932 3.13 3.31 3.397 3.561 3.72 3.935 4.077 4.22 4.428 4.635 4.834 5.015 5.166 5.384 5.621 5.832 6.11 6.387 6.629 6.891 7.182 7.469 7.773 8.098 8.421 8.732 9.089 9.504 9.877 10.273 10.712 11.149 11.539 11.824 11.924 11.72 11.04 10.182 9.346 8.628 7.925 7.302 6.724 6.188 5.612 5.077 4.593 4.116 3.661 3.237 2.834 2.389 1.978 1.626 1.293 0.965 0.684 0.371 0.027 -0.249 -0.546 -0.864 -1.192 -1.543 -1.793 -2.044 -2.449 -2.727 -3.007 -3.17 -3.495 -3.806 -4.144 -4.321 -4.604 -4.9 -5.117 -5.362 -5.888 -6.153 -6.414 -6.71 -7.081 -7.547 -8.128 -9.346 -5 ,8198 ,KEBNE ,17018160,Tue Dec 21 23:02:12 CET,Wed Dec 22 00:22:33 CET,0.0 0.435 0.743 0.973 1.186 1.396 1.619 1.846 2.265 2.462 2.634 2.827 3.06 3.198 3.446 3.668 3.883 3.992 4.204 4.403 4.698 4.893 5.083 5.341 5.572 5.789 6.006 6.215 6.477 6.731 6.958 7.226 7.479 7.719 8.005 8.318 8.592 8.885 9.186 9.489 9.793 10.112 10.495 10.871 11.282 11.683 12.055 12.394 12.673 12.806 12.591 11.941 11.151 10.307 9.498 8.676 7.974 7.416 6.889 6.321 5.847 5.404 4.983 4.615 4.266 3.922 3.508 3.141 2.849 2.54 2.196 1.895 1.591 1.288 1.061 0.823 0.556 0.274 -0.006 -0.207 -0.417 -0.741 -0.979 -1.239 -1.377 -1.657 -1.936 -2.224 -2.382 -2.655 -2.891 -3.066 -3.247 -3.65 -3.887 -4.136 -4.409 -4.7 -5.014 -5.456 -7.051 -6 ,28524 ,KEBNE ,17018161,Tue Dec 21 23:02:12 CET,Wed Dec 22 00:22:57 CET,0.0 0.582 0.887 1.142 1.361 1.532 1.684 1.84 2.128 2.277 2.415 2.551 2.759 2.866 3.067 3.261 3.457 3.552 3.742 3.916 4.156 4.322 4.48 4.685 4.879 5.077 5.263 5.443 5.671 5.889 6.096 6.336 6.572 6.8 7.059 7.338 7.593 7.859 8.13 8.42 8.715 9.039 9.409 9.749 10.099 10.459 10.844 11.174 11.424 11.523 11.345 10.756 10.008 9.215 8.436 7.711 7.058 6.479 5.971 5.4 4.864 4.399 3.949 3.506 3.1 2.723 2.317 1.951 1.636 1.306 0.96 0.665 0.376 0.075 -0.168 -0.414 -0.685 -0.99 -1.314 -1.527 -1.743 -2.103 -2.362 -2.618 -2.742 -3.01 -3.308 -3.618 -3.769 -4.031 -4.284 -4.461 -4.645 -5.028 -5.252 -5.5 -5.758 -6.055 -6.404 -6.903 -8.389 -7 ,5454 ,KEBNE ,17018162,Tue Dec 21 23:02:12 CET,Wed Dec 22 00:22:31 CET,0.0 0.61 0.936 1.207 1.437 1.667 1.89 2.078 2.422 2.599 2.76 2.951 3.171 3.295 3.541 3.764 3.965 4.07 4.287 4.483 4.753 4.933 5.113 5.383 5.625 5.843 6.058 6.265 6.522 6.766 7.013 7.321 7.621 7.898 8.195 8.482 8.747 9.061 9.388 9.716 10.033 10.371 10.748 11.101 11.509 11.915 12.314 12.668 12.927 13.043 12.792 12.179 11.492 10.716 9.951 9.22 8.582 7.954 7.372 6.797 6.276 5.816 5.361 4.919 4.511 4.117 3.665 3.255 2.899 2.52 2.146 1.843 1.506 1.14 0.86 0.571 0.266 -0.048 -0.379 -0.629 -0.882 -1.243 -1.498 -1.78 -1.931 -2.244 -2.561 -2.887 -3.061 -3.343 -3.641 -3.857 -4.077 -4.519 -4.768 -5.058 -5.365 -5.695 -6.115 -6.701 -8.161 -8 ,22579 ,KEBNE ,17018163,Tue Dec 21 23:02:12 CET,Wed Dec 22 00:24:05 CET,0.0 0.393 0.679 0.916 1.121 1.314 1.488 1.641 1.923 2.054 2.18 2.366 2.601 2.731 2.97 3.203 3.423 3.522 3.719 3.919 4.192 4.352 4.51 4.749 5.0 5.235 5.438 5.639 5.91 6.159 6.382 6.656 6.905 7.145 7.413 7.7 7.984 8.296 8.619 8.933 9.263 9.622 9.993 10.335 10.723 11.125 11.53 11.905 12.192 12.31 12.085 11.372 10.565 9.819 9.079 8.348 7.65 6.971 6.399 5.845 5.349 4.889 4.423 3.927 3.435 2.994 2.552 2.16 1.828 1.484 1.109 0.781 0.445 0.116 -0.129 -0.382 -0.667 -0.967 -1.261 -1.468 -1.693 -2.036 -2.272 -2.528 -2.659 -2.906 -3.17 -3.465 -3.622 -3.886 -4.111 -4.292 -4.482 -4.913 -5.156 -5.403 -5.67 -5.971 -6.326 -6.753 -8.17 -9 ,27831 ,KEBNE ,17018164,Tue Dec 21 23:02:12 CET,Wed Dec 22 00:22:18 CET,0.0 0.654 0.986 1.256 1.474 1.651 1.808 1.947 2.223 2.357 2.483 2.635 2.852 2.975 3.178 3.353 3.534 3.624 3.809 3.977 4.205 4.352 4.5 4.715 4.916 5.107 5.283 5.452 5.692 5.932 6.14 6.384 6.601 6.776 6.998 7.272 7.531 7.805 8.076 8.348 8.641 8.991 9.372 9.735 10.122 10.515 10.915 11.23 11.469 11.592 11.407 10.784 10.002 9.22 8.476 7.792 7.212 6.63 6.064 5.485 5.027 4.632 4.237 3.862 3.505 3.171 2.791 2.452 2.178 1.877 1.511 1.203 0.913 0.604 0.363 0.11 -0.164 -0.447 -0.751 -0.959 -1.169 -1.509 -1.748 -1.992 -2.124 -2.402 -2.691 -2.987 -3.138 -3.406 -3.666 -3.853 -4.037 -4.453 -4.684 -4.933 -5.203 -5.527 -5.935 -6.453 -8.012 -10 ,31138 ,KEBNE ,17018165,Tue Dec 21 23:02:12 CET,Wed Dec 22 00:23:56 CET,0.0 0.59 0.864 1.099 1.307 1.495 1.659 1.806 2.079 2.213 2.349 2.512 2.729 2.834 3.028 3.227 3.414 3.501 3.676 3.838 4.073 4.229 4.383 4.594 4.794 4.987 5.161 5.324 5.537 5.739 5.94 6.18 6.387 6.593 6.86 7.133 7.367 7.628 7.909 8.176 8.451 8.782 9.139 9.483 9.866 10.237 10.589 10.895 11.13 11.198 10.94 10.322 9.662 8.976 8.244 7.514 6.878 6.277 5.717 5.112 4.573 4.121 3.688 3.279 2.898 2.524 2.147 1.809 1.49 1.173 0.864 0.592 0.306 0.003 -0.251 -0.52 -0.786 -1.069 -1.366 -1.568 -1.777 -2.107 -2.347 -2.59 -2.716 -2.977 -3.255 -3.545 -3.703 -3.977 -4.243 -4.434 -4.634 -5.06 -5.291 -5.558 -5.849 -6.175 -6.553 -7.032 -8.366 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index f410254e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24081 ,KEBNE ,17018167,Tue Dec 21 23:02:12 CET,Wed Dec 22 00:22:24 CET,0.0 0.876 1.28 1.554 1.813 2.061 2.267 2.446 2.783 2.94 3.095 3.298 3.526 3.647 3.88 4.11 4.31 4.405 4.61 4.807 5.081 5.257 5.428 5.684 5.924 6.127 6.322 6.527 6.784 7.039 7.282 7.531 7.779 8.018 8.272 8.537 8.774 9.044 9.355 9.686 10.013 10.387 10.819 11.202 11.582 11.945 12.328 12.747 13.12 13.298 13.053 12.353 11.571 10.807 10.049 9.321 8.671 8.041 7.486 6.884 6.341 5.856 5.398 4.965 4.529 4.102 3.646 3.255 2.919 2.553 2.168 1.855 1.521 1.152 0.858 0.554 0.241 -0.063 -0.36 -0.567 -0.8 -1.178 -1.421 -1.662 -1.792 -2.07 -2.371 -2.717 -2.903 -3.187 -3.458 -3.656 -3.87 -4.32 -4.571 -4.848 -5.159 -5.506 -5.932 -6.488 -7.616 -2 ,10736 ,KEBNE ,17018168,Tue Dec 21 23:02:12 CET,Wed Dec 22 00:24:09 CET,0.0 0.591 0.858 1.087 1.296 1.485 1.649 1.806 2.131 2.291 2.439 2.616 2.847 2.96 3.153 3.335 3.503 3.59 3.77 3.943 4.179 4.33 4.473 4.664 4.85 5.031 5.212 5.413 5.683 5.915 6.13 6.398 6.658 6.905 7.174 7.483 7.757 8.023 8.309 8.611 8.924 9.268 9.652 10.005 10.377 10.734 11.067 11.363 11.623 11.745 11.458 10.685 9.939 9.227 8.442 7.654 6.948 6.27 5.688 5.122 4.62 4.152 3.701 3.245 2.827 2.464 2.072 1.72 1.397 1.06 0.713 0.389 0.032 -0.315 -0.562 -0.823 -1.096 -1.373 -1.67 -1.873 -2.093 -2.417 -2.624 -2.858 -2.978 -3.226 -3.5 -3.787 -3.934 -4.181 -4.386 -4.55 -4.723 -5.144 -5.372 -5.608 -5.88 -6.189 -6.565 -7.025 -8.238 -3 ,21164 ,KEBNE ,17018169,Tue Dec 21 23:02:12 CET,Wed Dec 22 00:22:17 CET,0.0 0.505 0.787 1.037 1.264 1.461 1.666 1.849 2.153 2.282 2.396 2.53 2.746 2.855 3.053 3.235 3.42 3.515 3.692 3.869 4.127 4.283 4.435 4.654 4.86 5.046 5.213 5.367 5.568 5.772 5.989 6.284 6.56 6.797 7.065 7.338 7.598 7.91 8.219 8.517 8.831 9.188 9.571 9.897 10.235 10.602 10.972 11.315 11.632 11.752 11.49 10.735 9.941 9.182 8.372 7.641 6.999 6.383 5.835 5.237 4.697 4.208 3.719 3.26 2.835 2.437 2.015 1.637 1.327 0.985 0.583 0.237 -0.115 -0.48 -0.76 -1.041 -1.332 -1.638 -1.971 -2.216 -2.463 -2.831 -3.089 -3.368 -3.521 -3.823 -4.139 -4.486 -4.663 -4.946 -5.26 -5.478 -5.686 -6.155 -6.439 -6.732 -7.023 -7.338 -7.712 -8.189 -9.244 -4 ,19789 ,KEBNE ,17018170,Tue Dec 21 23:02:12 CET,Wed Dec 22 00:22:33 CET,0.0 0.624 0.941 1.194 1.389 1.566 1.733 1.899 2.215 2.349 2.474 2.606 2.811 2.917 3.129 3.331 3.531 3.63 3.81 3.973 4.203 4.37 4.546 4.785 5.001 5.193 5.371 5.545 5.775 5.991 6.195 6.459 6.722 6.959 7.22 7.523 7.821 8.148 8.489 8.807 9.099 9.427 9.776 10.106 10.505 10.928 11.344 11.675 11.907 12.022 11.799 11.116 10.302 9.508 8.783 8.099 7.438 6.772 6.17 5.563 5.036 4.556 4.06 3.571 3.115 2.726 2.372 2.037 1.713 1.361 0.987 0.687 0.36 0.002 -0.271 -0.551 -0.849 -1.163 -1.49 -1.72 -1.965 -2.351 -2.613 -2.88 -3.017 -3.303 -3.605 -3.928 -4.108 -4.389 -4.666 -4.872 -5.091 -5.534 -5.759 -6.02 -6.326 -6.664 -7.079 -7.565 -8.602 -5 ,32248 ,KEBNE ,17018171,Tue Dec 21 23:02:12 CET,Wed Dec 22 00:22:35 CET,0.0 0.571 0.873 1.109 1.329 1.535 1.73 1.907 2.234 2.38 2.515 2.658 2.866 2.974 3.19 3.415 3.622 3.72 3.907 4.074 4.314 4.465 4.604 4.825 5.041 5.245 5.466 5.672 5.901 6.11 6.303 6.553 6.768 6.963 7.225 7.512 7.767 8.036 8.321 8.641 8.955 9.261 9.576 9.869 10.21 10.544 10.865 11.127 11.357 11.481 11.223 10.528 9.797 9.11 8.45 7.783 7.158 6.58 6.079 5.574 5.129 4.691 4.242 3.853 3.49 3.136 2.771 2.435 2.14 1.833 1.488 1.201 0.917 0.603 0.356 0.118 -0.127 -0.41 -0.723 -0.93 -1.133 -1.445 -1.674 -1.918 -2.037 -2.288 -2.571 -2.873 -3.019 -3.262 -3.462 -3.645 -3.85 -4.258 -4.475 -4.711 -4.96 -5.244 -5.556 -5.983 -7.265 -6 ,21697 ,KEBNE ,17018172,Tue Dec 21 23:02:12 CET,Wed Dec 22 00:22:30 CET,0.0 0.597 0.974 1.23 1.449 1.64 1.817 1.986 2.32 2.483 2.637 2.826 3.055 3.191 3.437 3.67 3.895 4.007 4.227 4.44 4.723 4.886 5.045 5.286 5.524 5.742 5.956 6.146 6.386 6.624 6.839 7.103 7.367 7.604 7.867 8.163 8.436 8.734 9.059 9.389 9.702 10.042 10.431 10.805 11.194 11.572 11.941 12.269 12.588 12.741 12.472 11.72 10.91 10.158 9.405 8.623 7.898 7.282 6.756 6.169 5.615 5.092 4.604 4.183 3.778 3.382 2.948 2.541 2.207 1.854 1.467 1.106 0.732 0.383 0.109 -0.185 -0.499 -0.822 -1.157 -1.388 -1.626 -2.0 -2.26 -2.528 -2.666 -2.959 -3.275 -3.608 -3.771 -4.035 -4.342 -4.552 -4.773 -5.255 -5.502 -5.778 -6.073 -6.376 -6.756 -7.25 -8.304 -7 ,19395 ,KEBNE ,17018173,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:23:21 CET,0.0 0.694 1.033 1.307 1.575 1.82 2.031 2.223 2.596 2.77 2.928 3.132 3.353 3.468 3.717 3.957 4.172 4.273 4.475 4.669 4.945 5.122 5.286 5.53 5.783 6.021 6.227 6.429 6.746 7.041 7.271 7.532 7.783 8.024 8.294 8.6 8.884 9.148 9.437 9.785 10.108 10.429 10.796 11.157 11.546 11.945 12.388 12.774 13.045 13.145 12.907 12.233 11.445 10.597 9.807 9.088 8.369 7.675 7.074 6.46 5.916 5.456 5.014 4.538 4.083 3.666 3.251 2.903 2.578 2.232 1.884 1.58 1.249 0.9 0.622 0.325 0.009 -0.318 -0.678 -0.949 -1.224 -1.64 -1.908 -2.175 -2.309 -2.586 -2.896 -3.21 -3.372 -3.646 -3.955 -4.172 -4.383 -4.852 -5.11 -5.38 -5.692 -6.018 -6.365 -6.804 -7.925 -8 ,17157 ,KEBNE ,17018174,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:25:34 CET,0.0 0.545 0.881 1.155 1.405 1.641 1.853 2.057 2.444 2.617 2.782 2.987 3.217 3.347 3.602 3.837 4.058 4.172 4.395 4.596 4.872 5.045 5.211 5.455 5.677 5.889 6.104 6.311 6.571 6.823 7.064 7.341 7.605 7.831 8.079 8.405 8.725 9.038 9.342 9.63 9.931 10.278 10.621 10.943 11.354 11.767 12.154 12.512 12.829 12.98 12.749 12.068 11.301 10.522 9.775 9.11 8.508 7.894 7.332 6.745 6.169 5.646 5.16 4.687 4.267 3.882 3.453 3.056 2.711 2.362 1.992 1.678 1.354 1.023 0.769 0.495 0.213 -0.088 -0.432 -0.672 -0.916 -1.303 -1.561 -1.817 -1.96 -2.259 -2.555 -2.863 -3.025 -3.301 -3.593 -3.801 -4.028 -4.506 -4.75 -5.04 -5.376 -5.695 -6.028 -6.456 -7.399 -9 ,14237 ,KEBNE ,17018175,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:24:55 CET,0.0 0.52 0.785 1.02 1.235 1.421 1.614 1.8 2.125 2.26 2.376 2.493 2.7 2.814 3.037 3.241 3.438 3.531 3.719 3.899 4.129 4.27 4.416 4.647 4.862 5.057 5.252 5.439 5.655 5.845 6.029 6.271 6.516 6.748 7.006 7.285 7.541 7.801 8.071 8.345 8.59 8.877 9.231 9.564 9.93 10.299 10.651 10.97 11.213 11.303 11.094 10.418 9.611 8.807 8.042 7.286 6.587 5.907 5.293 4.696 4.156 3.657 3.176 2.738 2.321 1.923 1.507 1.114 0.759 0.389 0.011 -0.301 -0.645 -0.978 -1.213 -1.485 -1.783 -2.098 -2.433 -2.66 -2.898 -3.268 -3.514 -3.773 -3.909 -4.202 -4.515 -4.823 -4.983 -5.248 -5.5 -5.701 -5.926 -6.393 -6.644 -6.92 -7.228 -7.555 -7.94 -8.444 -9.612 -10 ,32559 ,KEBNE ,17018176,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:24:37 CET,0.0 0.867 1.268 1.556 1.792 1.997 2.192 2.376 2.723 2.888 3.046 3.251 3.477 3.603 3.859 4.106 4.335 4.448 4.661 4.851 5.127 5.296 5.457 5.699 5.931 6.149 6.358 6.562 6.817 7.062 7.29 7.559 7.816 8.041 8.307 8.604 8.873 9.172 9.471 9.784 10.105 10.401 10.71 11.033 11.401 11.779 12.167 12.503 12.752 12.853 12.585 11.831 11.037 10.26 9.504 8.828 8.233 7.647 7.109 6.584 6.132 5.713 5.3 4.878 4.482 4.13 3.76 3.428 3.12 2.795 2.467 2.187 1.883 1.569 1.326 1.068 0.801 0.527 0.241 0.036 -0.171 -0.469 -0.688 -0.916 -1.033 -1.294 -1.569 -1.849 -1.994 -2.25 -2.478 -2.652 -2.833 -3.238 -3.458 -3.69 -3.942 -4.209 -4.541 -5.02 -5.998 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt deleted file mode 100644 index f6b47a1d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3350 ,KEBNE ,17018177,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:23:32 CET,0.0 0.47 0.739 0.98 1.186 1.362 1.541 1.712 1.999 2.135 2.273 2.43 2.65 2.767 2.983 3.197 3.399 3.495 3.674 3.837 4.086 4.24 4.38 4.59 4.8 4.99 5.166 5.35 5.585 5.8 6.017 6.275 6.492 6.697 6.937 7.197 7.45 7.749 8.056 8.428 8.856 9.249 9.666 10.044 10.456 10.905 11.335 11.718 12.01 12.095 11.814 11.026 10.045 9.004 8.033 7.134 6.274 5.436 4.725 4.029 3.38 2.733 2.111 1.553 1.018 0.49 -0.111 -0.588 -0.938 -1.332 -1.748 -2.08 -2.453 -2.836 -3.118 -3.41 -3.692 -4.004 -4.357 -4.608 -4.863 -5.249 -5.522 -5.818 -5.974 -6.269 -6.56 -6.885 -7.068 -7.366 -7.667 -7.895 -8.139 -8.669 -8.962 -9.264 -9.587 -9.987 -10.498 -11.216 -13.732 -2 ,3689 ,KEBNE ,17018178,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:23:15 CET,0.0 0.934 1.311 1.604 1.865 2.077 2.273 2.469 2.845 3.019 3.197 3.418 3.643 3.768 4.011 4.235 4.445 4.547 4.749 4.956 5.256 5.441 5.616 5.854 6.071 6.272 6.48 6.692 6.956 7.207 7.441 7.71 7.967 8.222 8.505 8.843 9.181 9.497 9.799 10.124 10.483 10.892 11.358 11.769 12.174 12.608 13.065 13.459 13.775 13.901 13.542 12.643 11.805 10.987 10.105 9.232 8.417 7.581 6.875 6.193 5.566 4.998 4.4 3.839 3.329 2.817 2.273 1.817 1.426 0.998 0.55 0.176 -0.216 -0.621 -0.94 -1.272 -1.615 -1.986 -2.37 -2.631 -2.902 -3.342 -3.653 -3.967 -4.137 -4.495 -4.856 -5.241 -5.445 -5.762 -6.117 -6.376 -6.634 -7.17 -7.484 -7.836 -8.201 -8.602 -9.11 -9.759 -12.04 -3 ,12590 ,KEBNE ,17018179,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:23:31 CET,0.0 0.506 0.782 1.015 1.221 1.4 1.591 1.779 2.081 2.214 2.348 2.508 2.722 2.831 3.046 3.258 3.455 3.556 3.746 3.918 4.17 4.328 4.479 4.71 4.925 5.124 5.321 5.51 5.778 6.047 6.283 6.557 6.805 7.026 7.266 7.538 7.814 8.121 8.433 8.728 9.034 9.397 9.779 10.125 10.548 10.977 11.433 11.93 12.36 12.631 12.423 11.608 10.728 9.783 8.861 7.981 7.185 6.461 5.761 5.035 4.38 3.776 3.23 2.706 2.212 1.74 1.213 0.742 0.353 -0.043 -0.483 -0.849 -1.204 -1.583 -1.887 -2.236 -2.602 -2.946 -3.273 -3.489 -3.72 -4.099 -4.382 -4.706 -4.872 -5.182 -5.528 -5.89 -6.067 -6.369 -6.657 -6.862 -7.109 -7.67 -7.965 -8.284 -8.641 -9.044 -9.468 -10.054 -13.048 -4 ,28087 ,KEBNE ,17018180,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:23:06 CET,0.0 0.468 0.734 0.993 1.22 1.399 1.572 1.741 2.033 2.173 2.304 2.437 2.65 2.757 2.963 3.172 3.37 3.464 3.645 3.817 4.071 4.218 4.352 4.559 4.756 4.947 5.13 5.298 5.51 5.72 5.942 6.211 6.466 6.708 6.973 7.268 7.538 7.819 8.124 8.443 8.772 9.116 9.476 9.814 10.175 10.524 10.888 11.232 11.481 11.591 11.309 10.405 9.346 8.35 7.412 6.492 5.663 4.933 4.315 3.654 3.04 2.469 1.957 1.5 1.047 0.591 0.108 -0.319 -0.692 -1.086 -1.504 -1.854 -2.208 -2.557 -2.841 -3.145 -3.456 -3.768 -4.086 -4.325 -4.568 -4.928 -5.192 -5.475 -5.622 -5.931 -6.258 -6.619 -6.809 -7.119 -7.429 -7.652 -7.875 -8.328 -8.61 -8.94 -9.294 -9.685 -10.154 -10.798 -13.004 -5 ,3705 ,KEBNE ,17018181,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:23:43 CET,0.0 0.546 0.869 1.101 1.294 1.462 1.619 1.763 2.039 2.166 2.284 2.421 2.631 2.735 2.937 3.128 3.305 3.396 3.572 3.738 3.984 4.149 4.31 4.53 4.741 4.958 5.159 5.33 5.567 5.809 6.04 6.301 6.522 6.752 7.033 7.332 7.62 7.91 8.204 8.52 8.827 9.132 9.5 9.852 10.191 10.556 10.933 11.291 11.627 11.745 11.466 10.797 9.84 8.747 7.849 7.044 6.205 5.424 4.758 4.07 3.481 2.944 2.426 1.941 1.472 1.024 0.557 0.156 -0.18 -0.553 -0.967 -1.297 -1.645 -2.032 -2.345 -2.665 -3.012 -3.385 -3.744 -3.988 -4.241 -4.631 -4.909 -5.207 -5.366 -5.689 -6.019 -6.371 -6.559 -6.859 -7.129 -7.34 -7.563 -8.088 -8.384 -8.69 -9.016 -9.435 -9.963 -10.622 -13.207 -6 ,4489 ,KEBNE ,17018182,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:23:24 CET,0.0 0.642 0.972 1.26 1.481 1.653 1.816 1.977 2.291 2.431 2.564 2.697 2.898 3.004 3.206 3.398 3.583 3.675 3.861 4.043 4.293 4.45 4.594 4.8 5.001 5.194 5.379 5.552 5.785 6.014 6.222 6.472 6.712 6.926 7.158 7.412 7.663 7.955 8.247 8.546 8.882 9.234 9.61 9.996 10.413 10.791 11.194 11.63 11.966 12.14 11.96 11.066 9.94 8.886 8.009 7.183 6.422 5.746 5.114 4.429 3.81 3.237 2.688 2.149 1.652 1.219 0.754 0.338 -0.027 -0.405 -0.771 -1.081 -1.407 -1.767 -2.066 -2.372 -2.69 -3.016 -3.366 -3.613 -3.865 -4.232 -4.474 -4.728 -4.863 -5.163 -5.476 -5.802 -5.982 -6.289 -6.612 -6.834 -7.067 -7.571 -7.838 -8.132 -8.454 -8.88 -9.406 -10.082 -12.974 -7 ,31999 ,KEBNE ,17018183,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:23:17 CET,0.0 0.783 1.229 1.556 1.823 2.082 2.314 2.52 2.871 3.033 3.189 3.385 3.607 3.731 3.984 4.215 4.427 4.53 4.736 4.942 5.231 5.413 5.589 5.851 6.102 6.325 6.535 6.736 6.992 7.236 7.472 7.755 8.028 8.275 8.545 8.857 9.162 9.495 9.842 10.216 10.596 10.985 11.419 11.849 12.308 12.71 13.098 13.504 13.838 14.009 13.844 13.044 12.064 11.031 10.006 9.055 8.155 7.34 6.662 5.977 5.33 4.723 4.172 3.628 3.114 2.662 2.167 1.691 1.282 0.862 0.421 0.062 -0.306 -0.697 -0.999 -1.307 -1.636 -1.974 -2.318 -2.567 -2.845 -3.286 -3.593 -3.92 -4.076 -4.407 -4.788 -5.191 -5.396 -5.71 -6.058 -6.299 -6.548 -7.086 -7.408 -7.757 -8.127 -8.535 -9.034 -9.723 -11.783 -8 ,1524 ,KEBNE ,17018184,Tue Dec 21 23:03:19 CET,Wed Dec 22 00:16:40 CET,0.0 0.744 1.049 1.258 1.44 1.615 1.775 1.924 2.207 2.331 2.458 2.622 2.847 2.968 3.196 3.399 3.592 3.686 3.862 4.038 4.297 4.455 4.607 4.836 5.06 5.272 5.457 5.625 5.847 6.059 6.273 6.536 6.792 7.029 7.282 7.555 7.818 8.102 8.378 8.668 8.985 9.315 9.679 10.024 10.388 10.811 11.274 11.694 12.028 12.17 11.923 11.059 10.112 9.171 8.247 7.339 6.529 5.793 5.1 4.385 3.8 3.292 2.785 2.265 1.769 1.322 0.835 0.399 0.042 -0.309 -0.672 -1.004 -1.369 -1.74 -2.036 -2.34 -2.639 -2.962 -3.291 -3.516 -3.762 -4.18 -4.451 -4.718 -4.862 -5.185 -5.559 -5.937 -6.125 -6.422 -6.735 -6.964 -7.209 -7.726 -7.986 -8.261 -8.61 -9.002 -9.425 -10.027 -11.515 -9 ,15098 ,KEBNE ,17018185,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:23:24 CET,0.0 0.508 0.8 1.028 1.24 1.431 1.617 1.781 2.077 2.215 2.344 2.498 2.708 2.816 3.047 3.27 3.464 3.554 3.725 3.894 4.152 4.341 4.532 4.781 5.017 5.257 5.477 5.673 5.932 6.178 6.41 6.679 6.941 7.21 7.493 7.772 8.035 8.31 8.614 8.959 9.32 9.728 10.188 10.631 11.096 11.516 11.893 12.31 12.705 12.841 12.584 11.721 10.69 9.667 8.702 7.772 6.91 6.11 5.432 4.727 4.082 3.513 2.946 2.417 1.944 1.486 0.978 0.519 0.109 -0.333 -0.779 -1.116 -1.493 -1.932 -2.257 -2.586 -2.939 -3.302 -3.685 -3.957 -4.251 -4.705 -5.025 -5.356 -5.523 -5.873 -6.253 -6.663 -6.877 -7.2 -7.588 -7.852 -8.132 -8.775 -9.112 -9.45 -9.808 -10.224 -10.695 -11.3 -13.263 -10 ,11410 ,KEBNE ,17018186,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:23:20 CET,0.0 0.534 0.82 1.059 1.282 1.499 1.693 1.859 2.152 2.289 2.421 2.583 2.804 2.919 3.132 3.34 3.543 3.638 3.818 3.987 4.226 4.381 4.543 4.783 5.011 5.224 5.426 5.645 5.919 6.146 6.368 6.636 6.874 7.094 7.354 7.639 7.92 8.206 8.461 8.722 9.001 9.324 9.684 10.026 10.434 10.841 11.264 11.634 11.897 11.98 11.647 10.811 9.772 8.792 7.925 7.07 6.287 5.549 4.877 4.19 3.575 2.999 2.478 1.995 1.504 1.055 0.582 0.111 -0.314 -0.738 -1.157 -1.503 -1.87 -2.25 -2.541 -2.839 -3.16 -3.492 -3.838 -4.086 -4.332 -4.732 -5.011 -5.283 -5.432 -5.753 -6.072 -6.404 -6.591 -6.905 -7.227 -7.447 -7.678 -8.177 -8.442 -8.74 -9.066 -9.445 -9.912 -10.569 -13.582 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 4173cfd1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19775 ,KEBNE ,17018187,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:23:21 CET,0.0 0.493 0.824 1.143 1.381 1.588 1.793 1.971 2.304 2.468 2.619 2.803 3.045 3.184 3.442 3.689 3.929 4.04 4.253 4.462 4.744 4.93 5.119 5.391 5.659 5.913 6.152 6.381 6.669 6.947 7.212 7.52 7.809 8.089 8.396 8.7 8.973 9.284 9.637 10.004 10.355 10.726 11.178 11.611 12.062 12.504 12.995 13.511 13.973 14.381 14.611 14.43 14.04 13.516 12.958 12.418 11.89 11.358 10.891 10.42 10.008 9.633 9.276 8.92 8.577 8.28 7.971 7.691 7.434 7.153 6.872 6.638 6.403 6.168 5.971 5.755 5.53 5.295 5.041 4.871 4.713 4.478 4.301 4.116 4.021 3.814 3.596 3.379 3.262 3.038 2.889 2.76 2.622 2.296 2.12 1.94 1.73 1.499 1.218 0.839 0.166 -2 ,9935 ,KEBNE ,17018188,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:23:04 CET,0.0 0.681 0.947 1.159 1.345 1.52 1.68 1.832 2.122 2.265 2.401 2.532 2.75 2.878 3.129 3.37 3.603 3.712 3.923 4.128 4.43 4.637 4.824 5.074 5.314 5.55 5.783 5.994 6.244 6.489 6.737 7.016 7.289 7.568 7.875 8.203 8.518 8.864 9.228 9.606 9.977 10.36 10.78 11.187 11.638 12.119 12.617 13.112 13.586 13.998 14.216 13.979 13.518 12.99 12.466 11.968 11.488 10.991 10.547 10.096 9.684 9.306 8.953 8.631 8.317 8.006 7.661 7.349 7.087 6.802 6.498 6.243 5.964 5.662 5.432 5.204 4.952 4.698 4.451 4.276 4.092 3.805 3.601 3.375 3.259 3.026 2.773 2.498 2.357 2.126 1.941 1.777 1.608 1.241 1.04 0.827 0.611 0.366 0.03 -0.369 -1.03 -3 ,15990 ,KEBNE ,17018189,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:23:03 CET,0.0 0.617 0.958 1.242 1.505 1.728 1.924 2.111 2.457 2.623 2.783 3.004 3.247 3.382 3.65 3.889 4.104 4.21 4.42 4.608 4.887 5.072 5.247 5.513 5.765 5.988 6.191 6.386 6.635 6.878 7.114 7.397 7.669 7.929 8.222 8.529 8.815 9.119 9.444 9.781 10.138 10.537 10.973 11.397 11.896 12.386 12.865 13.41 13.947 14.371 14.594 14.377 13.935 13.425 12.935 12.448 11.934 11.44 11.023 10.596 10.243 9.926 9.602 9.273 8.952 8.655 8.345 8.057 7.801 7.532 7.266 7.055 6.831 6.588 6.392 6.178 5.963 5.762 5.549 5.384 5.207 4.946 4.769 4.581 4.487 4.29 4.075 3.858 3.743 3.52 3.369 3.233 3.094 2.81 2.652 2.465 2.266 2.052 1.803 1.498 0.944 -4 ,26976 ,KEBNE ,17018190,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:23:14 CET,0.0 0.388 0.699 0.961 1.172 1.345 1.505 1.667 1.958 2.083 2.211 2.354 2.58 2.702 2.922 3.117 3.301 3.394 3.568 3.726 3.956 4.111 4.261 4.471 4.686 4.899 5.095 5.283 5.512 5.722 5.927 6.192 6.46 6.694 6.954 7.25 7.538 7.847 8.167 8.483 8.822 9.206 9.618 10.018 10.444 10.892 11.359 11.798 12.217 12.58 12.786 12.6 12.221 11.798 11.331 10.831 10.385 9.993 9.636 9.234 8.847 8.479 8.141 7.833 7.522 7.227 6.934 6.662 6.4 6.125 5.855 5.633 5.389 5.131 4.931 4.726 4.516 4.296 4.06 3.892 3.731 3.494 3.314 3.114 3.013 2.814 2.602 2.376 2.264 2.042 1.875 1.737 1.582 1.252 1.095 0.913 0.704 0.489 0.251 -0.041 -0.666 -5 ,23414 ,KEBNE ,17018191,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:24:32 CET,0.0 0.578 0.866 1.078 1.286 1.48 1.653 1.816 2.135 2.283 2.426 2.587 2.806 2.912 3.121 3.316 3.506 3.602 3.783 3.951 4.198 4.357 4.51 4.734 4.945 5.137 5.327 5.522 5.758 5.96 6.159 6.423 6.66 6.883 7.145 7.417 7.686 8.006 8.335 8.651 8.964 9.285 9.657 10.065 10.478 10.901 11.397 11.909 12.4 12.815 13.024 12.836 12.462 11.991 11.491 11.009 10.565 10.151 9.783 9.382 8.994 8.623 8.284 7.956 7.648 7.393 7.138 6.905 6.681 6.451 6.212 5.975 5.722 5.474 5.274 5.071 4.864 4.641 4.41 4.246 4.079 3.838 3.659 3.464 3.365 3.162 2.947 2.707 2.591 2.376 2.221 2.088 1.959 1.682 1.51 1.322 1.118 0.87 0.579 0.273 -0.275 -6 ,15351 ,KEBNE ,17018192,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:23:10 CET,0.0 0.644 0.959 1.256 1.523 1.753 1.948 2.118 2.433 2.591 2.747 2.952 3.186 3.315 3.559 3.786 4.002 4.112 4.331 4.548 4.847 5.028 5.205 5.456 5.692 5.929 6.149 6.362 6.652 6.92 7.169 7.482 7.788 8.068 8.39 8.739 9.08 9.453 9.819 10.18 10.548 10.948 11.375 11.799 12.273 12.757 13.306 13.869 14.341 14.741 14.982 14.752 14.294 13.789 13.266 12.673 12.095 11.607 11.185 10.763 10.377 9.991 9.625 9.268 8.928 8.629 8.313 8.015 7.74 7.449 7.14 6.877 6.6 6.304 6.082 5.85 5.613 5.381 5.151 4.983 4.785 4.46 4.24 4.017 3.906 3.685 3.451 3.189 3.044 2.803 2.617 2.461 2.275 1.851 1.616 1.374 1.107 0.808 0.52 0.192 -0.477 -7 ,17833 ,KEBNE ,17018193,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:24:51 CET,0.0 0.604 0.96 1.229 1.45 1.649 1.822 1.986 2.274 2.404 2.535 2.677 2.892 3.003 3.199 3.391 3.596 3.697 3.874 4.047 4.299 4.452 4.606 4.825 5.037 5.245 5.44 5.638 5.891 6.125 6.346 6.587 6.796 7.007 7.269 7.581 7.893 8.233 8.581 8.929 9.295 9.695 10.13 10.541 10.995 11.501 12.065 12.6 13.109 13.555 13.786 13.579 13.135 12.63 12.09 11.511 10.967 10.467 10.038 9.617 9.223 8.825 8.45 8.114 7.791 7.49 7.177 6.887 6.622 6.346 6.048 5.789 5.53 5.262 5.039 4.796 4.559 4.305 4.022 3.835 3.642 3.347 3.139 2.889 2.764 2.555 2.347 2.133 2.017 1.791 1.631 1.485 1.34 1.056 0.902 0.733 0.535 0.309 0.05 -0.25 -0.838 -8 ,14788 ,KEBNE ,17018194,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:23:10 CET,0.0 0.676 0.988 1.213 1.39 1.576 1.752 1.9 2.179 2.318 2.451 2.595 2.815 2.93 3.142 3.354 3.566 3.664 3.843 4.017 4.276 4.442 4.588 4.784 4.977 5.168 5.364 5.557 5.782 5.983 6.188 6.456 6.72 6.995 7.308 7.613 7.9 8.236 8.599 8.962 9.333 9.763 10.267 10.728 11.204 11.666 12.179 12.723 13.221 13.671 13.949 13.695 13.247 12.781 12.23 11.663 11.194 10.747 10.339 9.889 9.476 9.098 8.738 8.403 8.074 7.752 7.403 7.089 6.822 6.556 6.266 6.018 5.774 5.504 5.283 5.047 4.811 4.592 4.349 4.163 3.96 3.637 3.409 3.184 3.069 2.834 2.584 2.3 2.157 1.916 1.719 1.571 1.41 1.045 0.84 0.615 0.361 0.072 -0.262 -0.667 -1.491 -9 ,31033 ,KEBNE ,17018195,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:23:06 CET,0.0 0.562 0.83 1.053 1.251 1.43 1.594 1.759 2.048 2.179 2.305 2.44 2.652 2.757 2.96 3.154 3.334 3.423 3.598 3.764 4.005 4.168 4.326 4.538 4.74 4.937 5.135 5.346 5.619 5.874 6.122 6.424 6.736 7.024 7.325 7.662 7.992 8.345 8.696 9.032 9.367 9.761 10.215 10.642 11.126 11.649 12.18 12.692 13.219 13.687 13.914 13.698 13.26 12.724 12.232 11.781 11.334 10.864 10.405 9.963 9.597 9.262 8.911 8.57 8.278 7.999 7.694 7.417 7.189 6.967 6.72 6.508 6.283 6.032 5.83 5.634 5.427 5.205 4.979 4.817 4.645 4.375 4.187 4.003 3.914 3.732 3.531 3.307 3.188 2.963 2.82 2.678 2.517 2.202 2.04 1.857 1.673 1.478 1.212 0.891 0.103 -10 ,32252 ,KEBNE ,17018196,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:23:22 CET,0.0 0.593 0.885 1.145 1.392 1.61 1.807 1.982 2.291 2.445 2.604 2.799 3.026 3.154 3.404 3.655 3.896 4.001 4.196 4.382 4.653 4.839 5.025 5.294 5.537 5.767 5.987 6.187 6.434 6.686 6.947 7.262 7.544 7.814 8.127 8.463 8.771 9.093 9.436 9.776 10.127 10.514 10.942 11.354 11.825 12.323 12.833 13.332 13.88 14.37 14.583 14.335 13.913 13.42 12.901 12.361 11.844 11.371 10.936 10.473 10.059 9.666 9.265 8.892 8.54 8.217 7.877 7.544 7.254 6.967 6.68 6.438 6.181 5.911 5.687 5.443 5.2 4.954 4.704 4.535 4.347 4.047 3.84 3.624 3.515 3.272 2.992 2.691 2.55 2.313 2.105 1.934 1.765 1.416 1.215 0.989 0.749 0.507 0.233 -0.122 -0.77 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 8e67c8f1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6801 ,KEBNE ,17018197,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:25:20 CET,0.0 0.785 1.139 1.438 1.671 1.904 2.136 2.338 2.696 2.863 3.007 3.18 3.411 3.54 3.792 4.026 4.265 4.387 4.615 4.825 5.126 5.328 5.513 5.755 5.974 6.189 6.403 6.612 6.89 7.158 7.408 7.708 7.989 8.256 8.563 8.888 9.169 9.47 9.79 10.132 10.494 10.855 11.236 11.626 12.072 12.527 12.972 13.372 13.73 13.998 13.991 13.516 12.902 12.251 11.588 10.961 10.397 9.847 9.345 8.834 8.366 7.93 7.499 7.077 6.702 6.378 6.039 5.74 5.478 5.208 4.936 4.686 4.424 4.165 3.968 3.751 3.51 3.267 3.019 2.855 2.688 2.427 2.229 2.014 1.912 1.702 1.468 1.225 1.103 0.882 0.718 0.57 0.423 0.111 -0.069 -0.262 -0.486 -0.74 -1.012 -1.368 -2.185 -2 ,18197 ,KEBNE ,17018198,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:24:57 CET,0.0 0.655 0.933 1.167 1.375 1.555 1.702 1.853 2.155 2.287 2.409 2.534 2.74 2.847 3.052 3.238 3.431 3.529 3.716 3.898 4.137 4.28 4.417 4.608 4.814 4.999 5.175 5.365 5.619 5.891 6.144 6.406 6.657 6.906 7.191 7.515 7.809 8.094 8.403 8.728 9.074 9.45 9.82 10.176 10.562 10.945 11.39 11.855 12.248 12.482 12.461 12.016 11.337 10.627 10.005 9.399 8.811 8.256 7.771 7.253 6.769 6.317 5.882 5.484 5.093 4.715 4.347 4.023 3.752 3.463 3.145 2.881 2.597 2.3 2.075 1.849 1.609 1.341 1.061 0.872 0.674 0.35 0.118 -0.131 -0.265 -0.531 -0.791 -1.067 -1.216 -1.462 -1.683 -1.854 -2.037 -2.427 -2.638 -2.869 -3.122 -3.406 -3.724 -4.097 -4.932 -3 ,30725 ,KEBNE ,17018199,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:23:43 CET,0.0 0.549 0.855 1.123 1.35 1.526 1.698 1.87 2.177 2.317 2.443 2.574 2.788 2.907 3.148 3.374 3.605 3.718 3.932 4.142 4.423 4.579 4.736 4.996 5.242 5.46 5.675 5.887 6.145 6.368 6.57 6.843 7.135 7.414 7.708 8.013 8.294 8.6 8.924 9.238 9.543 9.918 10.34 10.74 11.189 11.632 12.085 12.523 12.905 13.194 13.196 12.73 12.123 11.476 10.843 10.211 9.629 9.095 8.619 8.109 7.662 7.256 6.851 6.46 6.077 5.71 5.336 5.002 4.705 4.394 4.085 3.837 3.582 3.322 3.116 2.903 2.687 2.455 2.19 2.011 1.829 1.535 1.343 1.151 1.055 0.862 0.647 0.418 0.299 0.063 -0.106 -0.244 -0.387 -0.718 -0.914 -1.114 -1.332 -1.57 -1.856 -2.24 -2.846 -4 ,10665 ,KEBNE ,17018200,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:23:38 CET,0.0 0.587 0.924 1.185 1.409 1.596 1.764 1.907 2.178 2.319 2.455 2.587 2.801 2.915 3.136 3.344 3.532 3.614 3.77 3.943 4.203 4.359 4.5 4.698 4.893 5.093 5.289 5.496 5.769 6.011 6.242 6.521 6.787 7.051 7.333 7.638 7.924 8.227 8.563 8.901 9.231 9.583 9.992 10.395 10.81 11.218 11.66 12.113 12.528 12.824 12.811 12.36 11.72 11.032 10.392 9.779 9.205 8.646 8.139 7.603 7.139 6.726 6.319 5.925 5.565 5.233 4.875 4.559 4.276 3.98 3.673 3.4 3.098 2.795 2.571 2.337 2.085 1.819 1.543 1.352 1.163 0.864 0.658 0.438 0.321 0.076 -0.192 -0.474 -0.625 -0.878 -1.106 -1.279 -1.456 -1.847 -2.067 -2.302 -2.562 -2.843 -3.157 -3.572 -4.336 -5 ,5167 ,KEBNE ,17018201,Tue Dec 21 23:03:14 CET,Wed Dec 22 00:25:19 CET,0.0 0.607 0.842 1.066 1.273 1.462 1.632 1.779 2.052 2.186 2.31 2.452 2.68 2.798 3.014 3.222 3.416 3.504 3.668 3.822 4.034 4.176 4.316 4.525 4.73 4.924 5.117 5.297 5.534 5.767 5.977 6.215 6.442 6.669 6.918 7.175 7.429 7.723 8.038 8.345 8.633 8.956 9.323 9.665 10.047 10.46 10.871 11.239 11.586 11.843 11.78 11.262 10.623 9.99 9.377 8.78 8.215 7.672 7.19 6.668 6.212 5.795 5.373 4.975 4.594 4.251 3.942 3.671 3.412 3.122 2.824 2.585 2.332 2.064 1.852 1.625 1.409 1.197 0.95 0.767 0.586 0.301 0.1 -0.085 -0.177 -0.386 -0.608 -0.845 -0.968 -1.192 -1.35 -1.488 -1.635 -1.968 -2.16 -2.364 -2.563 -2.79 -3.066 -3.397 -4.013 -6 ,6532 ,KEBNE ,17018202,Tue Dec 21 23:03:15 CET,Wed Dec 22 00:23:56 CET,0.0 0.711 1.053 1.358 1.633 1.892 2.126 2.313 2.624 2.771 2.924 3.124 3.363 3.498 3.731 3.958 4.181 4.284 4.489 4.677 4.941 5.117 5.285 5.526 5.76 5.966 6.16 6.361 6.608 6.826 7.051 7.344 7.632 7.896 8.163 8.476 8.786 9.092 9.418 9.77 10.12 10.458 10.808 11.177 11.606 12.051 12.523 13.004 13.444 13.724 13.669 13.183 12.598 11.998 11.423 10.876 10.365 9.84 9.342 8.838 8.407 8.032 7.67 7.317 6.972 6.656 6.347 6.071 5.805 5.493 5.172 4.929 4.689 4.44 4.231 3.999 3.755 3.522 3.292 3.125 2.936 2.644 2.445 2.241 2.136 1.915 1.702 1.484 1.369 1.147 0.968 0.825 0.688 0.387 0.225 0.036 -0.187 -0.438 -0.722 -1.059 -1.66 -7 ,7598 ,KEBNE ,17018203,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:25:40 CET,0.0 0.525 0.803 1.001 1.175 1.34 1.487 1.628 1.902 2.034 2.164 2.3 2.513 2.625 2.831 3.024 3.214 3.307 3.489 3.658 3.895 4.042 4.186 4.405 4.608 4.789 4.954 5.108 5.33 5.577 5.822 6.114 6.376 6.615 6.896 7.209 7.518 7.855 8.187 8.521 8.869 9.227 9.595 9.956 10.381 10.821 11.253 11.667 12.043 12.315 12.328 11.873 11.278 10.627 9.986 9.369 8.778 8.21 7.7 7.185 6.727 6.328 5.948 5.563 5.18 4.835 4.467 4.122 3.816 3.49 3.167 2.888 2.568 2.236 1.993 1.744 1.468 1.186 0.908 0.713 0.514 0.203 -0.006 -0.214 -0.333 -0.576 -0.812 -1.082 -1.232 -1.477 -1.719 -1.91 -2.107 -2.517 -2.73 -2.951 -3.2 -3.484 -3.792 -4.168 -4.845 -8 ,9013 ,KEBNE ,17018204,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:24:48 CET,0.0 0.615 0.916 1.143 1.379 1.586 1.765 1.94 2.237 2.358 2.47 2.594 2.799 2.903 3.102 3.289 3.479 3.571 3.741 3.887 4.111 4.264 4.413 4.639 4.854 5.037 5.196 5.351 5.563 5.775 5.97 6.202 6.447 6.68 6.91 7.165 7.436 7.744 8.063 8.372 8.671 8.99 9.4 9.816 10.224 10.682 11.172 11.658 12.1 12.41 12.406 11.983 11.393 10.727 10.062 9.403 8.793 8.229 7.732 7.232 6.769 6.333 5.91 5.512 5.16 4.843 4.493 4.15 3.859 3.556 3.242 2.987 2.699 2.389 2.152 1.898 1.624 1.341 1.058 0.872 0.669 0.336 0.104 -0.128 -0.244 -0.484 -0.744 -1.025 -1.164 -1.395 -1.585 -1.758 -1.956 -2.387 -2.619 -2.847 -3.083 -3.358 -3.701 -4.16 -5.123 -9 ,24759 ,KEBNE ,17018205,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:26:12 CET,0.0 0.424 0.728 0.986 1.207 1.406 1.585 1.739 2.01 2.133 2.245 2.383 2.606 2.717 2.917 3.114 3.3 3.388 3.566 3.747 4.002 4.16 4.309 4.518 4.725 4.904 5.062 5.236 5.462 5.669 5.857 6.078 6.313 6.547 6.804 7.074 7.34 7.623 7.914 8.23 8.562 8.906 9.247 9.591 10.026 10.467 10.872 11.232 11.591 11.872 11.804 11.314 10.716 10.066 9.429 8.812 8.227 7.685 7.199 6.68 6.237 5.828 5.433 5.071 4.711 4.367 4.016 3.695 3.39 3.066 2.72 2.443 2.167 1.857 1.614 1.365 1.093 0.806 0.512 0.308 0.107 -0.202 -0.418 -0.634 -0.749 -1.007 -1.266 -1.527 -1.673 -1.923 -2.154 -2.331 -2.509 -2.875 -3.075 -3.279 -3.512 -3.789 -4.107 -4.472 -5.173 -10 ,14907 ,KEBNE ,17018206,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:24:21 CET,0.0 0.574 0.912 1.18 1.449 1.703 1.925 2.13 2.497 2.654 2.804 3.014 3.25 3.383 3.636 3.87 4.092 4.205 4.417 4.617 4.907 5.078 5.227 5.457 5.708 5.948 6.17 6.378 6.645 6.901 7.139 7.421 7.681 7.894 8.144 8.456 8.769 9.106 9.451 9.809 10.166 10.539 10.933 11.302 11.711 12.143 12.586 13.037 13.478 13.772 13.744 13.309 12.73 12.109 11.469 10.848 10.283 9.736 9.245 8.756 8.313 7.897 7.473 7.052 6.664 6.297 5.923 5.597 5.307 4.994 4.679 4.43 4.174 3.912 3.707 3.495 3.276 3.034 2.779 2.609 2.437 2.155 1.953 1.751 1.644 1.414 1.176 0.939 0.817 0.592 0.439 0.292 0.14 -0.193 -0.382 -0.589 -0.812 -1.054 -1.325 -1.672 -2.368 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt deleted file mode 100644 index 5604a709..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25754 ,TETRA ,17413939,Sun Nov 21 16:18:45 CET,Sun Nov 21 17:54:26 CET,0.0 0.798 1.163 1.467 1.739 1.95 2.146 2.338 2.676 2.833 2.978 3.129 3.35 3.469 3.714 3.952 4.178 4.285 4.482 4.668 4.949 5.12 5.283 5.517 5.725 5.943 6.173 6.38 6.647 6.931 7.192 7.457 7.703 7.962 8.261 8.568 8.855 9.171 9.478 9.796 10.147 10.526 10.938 11.35 11.795 12.232 12.671 13.076 13.442 13.69 13.696 13.168 12.483 11.78 11.059 10.331 9.667 9.07 8.535 7.954 7.467 7.041 6.617 6.224 5.85 5.503 5.129 4.798 4.504 4.196 3.887 3.614 3.32 3.021 2.779 2.52 2.264 2.007 1.752 1.586 1.407 1.108 0.914 0.714 0.613 0.406 0.162 -0.097 -0.223 -0.457 -0.625 -0.765 -0.914 -1.254 -1.448 -1.657 -1.867 -2.096 -2.366 -2.671 -3.254 -2 ,12940 ,TETRA ,17413940,Sun Nov 21 16:18:42 CET,Sun Nov 21 17:54:55 CET,0.0 0.641 0.968 1.236 1.466 1.669 1.865 2.041 2.37 2.529 2.679 2.872 3.11 3.26 3.537 3.793 4.06 4.182 4.411 4.641 4.96 5.157 5.345 5.62 5.887 6.143 6.395 6.617 6.909 7.217 7.482 7.768 8.061 8.338 8.607 8.899 9.183 9.468 9.793 10.18 10.567 10.985 11.471 11.914 12.349 12.783 13.272 13.737 14.17 14.486 14.437 13.856 13.152 12.438 11.739 11.087 10.449 9.835 9.321 8.794 8.336 7.914 7.503 7.109 6.732 6.388 6.016 5.664 5.361 5.059 4.732 4.46 4.167 3.862 3.627 3.383 3.126 2.845 2.533 2.327 2.125 1.79 1.554 1.318 1.194 0.93 0.661 0.366 0.212 -0.046 -0.298 -0.493 -0.695 -1.081 -1.291 -1.523 -1.764 -2.031 -2.329 -2.73 -3.515 -3 ,23129 ,TETRA ,17413941,Sun Nov 21 16:18:45 CET,Sun Nov 21 17:54:54 CET,0.0 0.803 1.132 1.423 1.71 1.965 2.166 2.35 2.725 2.888 3.028 3.2 3.435 3.564 3.793 3.996 4.183 4.276 4.48 4.683 4.959 5.126 5.288 5.536 5.772 5.98 6.165 6.346 6.599 6.865 7.111 7.397 7.677 7.941 8.254 8.608 8.937 9.288 9.646 10.034 10.45 10.9 11.362 11.78 12.248 12.745 13.254 13.705 14.133 14.461 14.424 13.903 13.254 12.517 11.802 11.125 10.513 9.91 9.376 8.826 8.308 7.854 7.422 7.004 6.623 6.256 5.855 5.504 5.197 4.877 4.539 4.239 3.91 3.581 3.346 3.103 2.856 2.611 2.342 2.141 1.927 1.601 1.387 1.172 1.064 0.837 0.584 0.308 0.156 -0.103 -0.323 -0.491 -0.672 -1.057 -1.258 -1.483 -1.729 -2.021 -2.376 -2.813 -3.628 -4 ,23452 ,TETRA ,17413942,Sun Nov 21 16:18:47 CET,Sun Nov 21 17:56:34 CET,0.0 1.017 1.412 1.753 2.073 2.342 2.563 2.773 3.158 3.336 3.508 3.734 3.991 4.146 4.424 4.677 4.931 5.065 5.313 5.534 5.849 6.054 6.243 6.509 6.77 7.024 7.264 7.49 7.778 8.053 8.326 8.651 8.951 9.238 9.574 9.916 10.242 10.611 11.005 11.424 11.824 12.225 12.677 13.137 13.615 14.047 14.458 14.874 15.3 15.617 15.593 15.066 14.406 13.69 12.956 12.259 11.626 11.024 10.512 9.974 9.461 9.016 8.582 8.167 7.781 7.402 7.01 6.665 6.369 6.063 5.731 5.454 5.167 4.876 4.641 4.38 4.125 3.863 3.586 3.401 3.216 2.936 2.744 2.552 2.459 2.265 2.036 1.78 1.655 1.422 1.25 1.093 0.936 0.607 0.417 0.212 0.008 -0.223 -0.503 -0.849 -1.517 -5 ,29777 ,TETRA ,17413943,Sun Nov 21 16:18:43 CET,Sun Nov 21 17:56:47 CET,0.0 0.661 1.004 1.293 1.541 1.755 1.935 2.114 2.489 2.662 2.823 3.032 3.271 3.418 3.698 3.967 4.231 4.355 4.575 4.776 5.083 5.281 5.472 5.745 5.997 6.242 6.484 6.721 7.032 7.325 7.601 7.929 8.245 8.553 8.87 9.206 9.536 9.898 10.275 10.645 11.005 11.428 11.926 12.38 12.858 13.305 13.787 14.258 14.617 14.877 14.91 14.441 13.821 13.167 12.487 11.801 11.159 10.53 9.938 9.332 8.821 8.38 7.938 7.516 7.115 6.733 6.364 6.03 5.74 5.437 5.086 4.791 4.491 4.171 3.924 3.666 3.412 3.165 2.895 2.685 2.467 2.156 1.941 1.712 1.594 1.348 1.085 0.813 0.677 0.432 0.178 -0.017 -0.204 -0.605 -0.809 -1.012 -1.268 -1.592 -1.94 -2.31 -2.976 -6 ,20205 ,TETRA ,17413944,Sun Nov 21 16:18:42 CET,Sun Nov 21 17:54:54 CET,0.0 0.61 0.964 1.234 1.483 1.721 1.935 2.121 2.45 2.611 2.771 2.982 3.225 3.353 3.595 3.819 4.032 4.129 4.32 4.52 4.789 4.956 5.131 5.405 5.688 5.931 6.148 6.357 6.619 6.886 7.136 7.412 7.708 8.004 8.291 8.58 8.846 9.126 9.446 9.788 10.116 10.468 10.872 11.254 11.654 12.082 12.56 12.991 13.39 13.698 13.603 13.015 12.255 11.505 10.798 10.083 9.415 8.812 8.309 7.779 7.29 6.853 6.434 6.045 5.67 5.316 4.955 4.612 4.308 4.0 3.685 3.417 3.147 2.892 2.68 2.448 2.195 1.922 1.623 1.411 1.22 0.914 0.678 0.44 0.319 0.078 -0.187 -0.492 -0.648 -0.903 -1.124 -1.292 -1.479 -1.86 -2.07 -2.315 -2.569 -2.848 -3.155 -3.508 -4.191 -7 ,9172 ,TETRA ,17413945,Sun Nov 21 16:18:47 CET,Sun Nov 21 17:54:55 CET,0.0 0.88 1.288 1.556 1.786 1.995 2.19 2.378 2.749 2.913 3.055 3.235 3.463 3.585 3.857 4.124 4.371 4.492 4.731 4.962 5.279 5.479 5.667 5.929 6.186 6.44 6.695 6.943 7.243 7.536 7.822 8.146 8.443 8.72 9.049 9.419 9.745 10.103 10.498 10.896 11.264 11.643 12.069 12.465 12.931 13.449 13.947 14.385 14.787 15.081 15.069 14.514 13.82 13.108 12.422 11.815 11.211 10.636 10.116 9.544 9.044 8.598 8.185 7.804 7.434 7.072 6.679 6.332 6.03 5.719 5.386 5.094 4.79 4.482 4.246 3.993 3.725 3.454 3.164 2.963 2.756 2.431 2.199 1.957 1.839 1.605 1.351 1.066 0.922 0.677 0.488 0.325 0.148 -0.256 -0.466 -0.693 -0.951 -1.248 -1.598 -2.006 -2.684 -8 ,10190 ,TETRA ,17413946,Sun Nov 21 16:18:44 CET,Sun Nov 21 17:54:55 CET,0.0 0.86 1.295 1.57 1.775 1.984 2.185 2.366 2.69 2.837 2.992 3.217 3.459 3.595 3.857 4.088 4.291 4.386 4.573 4.759 5.031 5.204 5.369 5.605 5.831 6.035 6.229 6.421 6.68 6.923 7.139 7.398 7.661 7.911 8.204 8.524 8.81 9.131 9.469 9.803 10.134 10.5 10.912 11.309 11.749 12.209 12.679 13.124 13.562 13.873 13.826 13.276 12.566 11.837 11.164 10.532 9.926 9.35 8.839 8.305 7.86 7.463 7.053 6.668 6.296 5.931 5.571 5.238 4.921 4.585 4.248 3.978 3.683 3.354 3.104 2.854 2.583 2.31 2.035 1.851 1.664 1.356 1.134 0.9 0.78 0.525 0.255 -0.034 -0.183 -0.429 -0.653 -0.824 -0.998 -1.401 -1.624 -1.854 -2.1 -2.387 -2.707 -3.06 -3.586 -9 ,19068 ,TETRA ,17413947,Sun Nov 21 16:18:46 CET,Sun Nov 21 17:54:56 CET,0.0 0.902 1.261 1.514 1.717 1.914 2.106 2.293 2.636 2.796 2.945 3.112 3.336 3.456 3.689 3.935 4.178 4.29 4.511 4.724 5.036 5.234 5.427 5.702 5.973 6.235 6.474 6.699 6.984 7.242 7.501 7.82 8.108 8.393 8.726 9.089 9.405 9.738 10.089 10.467 10.88 11.306 11.749 12.157 12.608 13.038 13.475 13.913 14.306 14.621 14.622 14.104 13.443 12.705 12.002 11.376 10.786 10.22 9.712 9.149 8.646 8.24 7.867 7.484 7.116 6.778 6.422 6.102 5.828 5.533 5.212 4.952 4.679 4.378 4.156 3.942 3.702 3.442 3.19 3.022 2.854 2.593 2.397 2.19 2.079 1.854 1.634 1.396 1.262 1.016 0.822 0.665 0.509 0.175 0.002 -0.19 -0.393 -0.592 -0.847 -1.167 -1.815 -10 ,19380 ,TETRA ,17413948,Sun Nov 21 16:18:43 CET,Sun Nov 21 17:54:26 CET,0.0 0.757 1.103 1.389 1.653 1.883 2.085 2.277 2.631 2.797 2.964 3.199 3.455 3.604 3.88 4.15 4.386 4.509 4.764 4.99 5.321 5.533 5.718 5.989 6.268 6.548 6.799 7.027 7.329 7.597 7.842 8.15 8.446 8.743 9.076 9.41 9.729 10.101 10.511 10.917 11.308 11.732 12.203 12.647 13.148 13.656 14.174 14.651 15.062 15.352 15.321 14.808 14.135 13.444 12.778 12.122 11.503 10.904 10.404 9.881 9.394 8.974 8.569 8.165 7.77 7.393 6.981 6.602 6.274 5.951 5.62 5.358 5.09 4.8 4.57 4.326 4.074 3.802 3.511 3.315 3.117 2.785 2.556 2.324 2.201 1.936 1.655 1.378 1.242 0.996 0.754 0.573 0.384 -0.017 -0.228 -0.454 -0.684 -0.947 -1.277 -1.678 -2.516 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index d8afe67c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22286 ,KEBNE ,17018207,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:26:47 CET,0.0 0.54 0.921 1.23 1.475 1.702 1.92 2.117 2.456 2.619 2.776 2.971 3.198 3.327 3.586 3.818 4.027 4.131 4.32 4.497 4.761 4.926 5.073 5.306 5.55 5.768 5.974 6.185 6.444 6.664 6.888 7.163 7.426 7.689 7.987 8.311 8.607 8.912 9.23 9.562 9.895 10.25 10.671 11.05 11.411 11.813 12.248 12.621 12.927 13.104 12.898 12.262 11.48 10.662 9.861 9.092 8.422 7.793 7.186 6.543 5.98 5.491 5.041 4.608 4.194 3.822 3.445 3.107 2.811 2.496 2.151 1.837 1.51 1.176 0.915 0.648 0.381 0.117 -0.158 -0.355 -0.572 -0.929 -1.178 -1.445 -1.585 -1.871 -2.176 -2.502 -2.66 -2.913 -3.172 -3.359 -3.543 -3.959 -4.192 -4.439 -4.727 -5.063 -5.433 -5.872 -6.919 -2 ,30254 ,KEBNE ,17018208,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:26:51 CET,0.0 0.526 0.809 1.015 1.205 1.397 1.615 1.828 2.173 2.343 2.508 2.704 2.938 3.063 3.297 3.537 3.755 3.857 4.061 4.257 4.542 4.712 4.873 5.109 5.327 5.54 5.746 5.927 6.142 6.351 6.564 6.826 7.085 7.34 7.623 7.932 8.217 8.523 8.848 9.17 9.465 9.801 10.208 10.576 10.97 11.392 11.816 12.182 12.527 12.796 12.709 12.117 11.409 10.672 9.973 9.308 8.688 8.121 7.619 7.08 6.565 6.097 5.661 5.233 4.835 4.467 4.065 3.706 3.379 3.012 2.631 2.332 2.036 1.714 1.445 1.169 0.88 0.59 0.295 0.081 -0.14 -0.494 -0.745 -1.003 -1.134 -1.418 -1.729 -2.052 -2.228 -2.496 -2.743 -2.933 -3.143 -3.622 -3.879 -4.151 -4.44 -4.784 -5.181 -5.617 -6.753 -3 ,23352 ,KEBNE ,17018209,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:26:34 CET,0.0 0.716 1.013 1.243 1.45 1.629 1.774 1.913 2.175 2.294 2.417 2.568 2.783 2.889 3.092 3.293 3.488 3.578 3.748 3.92 4.19 4.363 4.535 4.79 5.009 5.203 5.399 5.592 5.843 6.095 6.336 6.611 6.872 7.124 7.404 7.685 7.94 8.222 8.515 8.825 9.133 9.479 9.861 10.193 10.56 10.954 11.327 11.68 12.01 12.207 12.047 11.389 10.609 9.841 9.102 8.414 7.807 7.241 6.73 6.209 5.77 5.385 5.004 4.645 4.293 3.951 3.577 3.218 2.912 2.607 2.274 1.981 1.683 1.383 1.138 0.886 0.627 0.361 0.093 -0.081 -0.255 -0.545 -0.768 -1.0 -1.113 -1.347 -1.608 -1.884 -2.021 -2.271 -2.479 -2.644 -2.818 -3.181 -3.38 -3.588 -3.838 -4.146 -4.499 -4.916 -5.691 -4 ,13950 ,KEBNE ,17018210,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:25:57 CET,0.0 0.779 1.144 1.402 1.644 1.875 2.092 2.296 2.675 2.842 2.997 3.211 3.448 3.59 3.866 4.108 4.329 4.44 4.665 4.874 5.166 5.351 5.524 5.777 6.02 6.237 6.444 6.644 6.892 7.127 7.353 7.623 7.883 8.124 8.386 8.663 8.935 9.234 9.525 9.824 10.138 10.483 10.873 11.233 11.632 12.022 12.382 12.718 13.002 13.143 12.956 12.295 11.547 10.807 10.106 9.423 8.768 8.143 7.57 6.964 6.448 6.009 5.572 5.128 4.719 4.33 3.891 3.522 3.204 2.857 2.48 2.164 1.867 1.572 1.326 1.056 0.773 0.463 0.133 -0.078 -0.29 -0.641 -0.891 -1.153 -1.29 -1.573 -1.87 -2.194 -2.368 -2.638 -2.901 -3.084 -3.285 -3.736 -3.982 -4.253 -4.54 -4.865 -5.244 -5.701 -6.57 -5 ,19954 ,KEBNE ,17018211,Tue Dec 21 23:04:20 CET,Wed Dec 22 00:19:50 CET,0.0 0.584 0.866 1.082 1.259 1.422 1.575 1.718 1.985 2.106 2.22 2.333 2.537 2.645 2.856 3.046 3.216 3.302 3.474 3.637 3.879 4.039 4.187 4.403 4.604 4.788 4.958 5.113 5.321 5.535 5.735 5.949 6.159 6.379 6.622 6.887 7.119 7.372 7.652 7.926 8.193 8.484 8.819 9.145 9.525 9.952 10.38 10.724 10.977 11.143 11.033 10.385 9.613 8.827 8.08 7.364 6.689 6.07 5.507 4.911 4.391 3.929 3.502 3.114 2.77 2.433 2.06 1.726 1.43 1.136 0.837 0.576 0.301 0.019 -0.202 -0.448 -0.712 -0.97 -1.234 -1.42 -1.622 -1.945 -2.165 -2.397 -2.522 -2.768 -3.021 -3.307 -3.45 -3.691 -3.908 -4.073 -4.245 -4.615 -4.808 -5.024 -5.277 -5.549 -5.861 -6.319 -7.578 -6 ,10847 ,KEBNE ,17018212,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:26:34 CET,0.0 0.345 0.601 0.831 1.044 1.226 1.395 1.552 1.829 1.967 2.113 2.298 2.529 2.665 2.892 3.098 3.308 3.41 3.606 3.799 4.063 4.231 4.395 4.612 4.809 4.999 5.197 5.396 5.651 5.899 6.136 6.413 6.669 6.909 7.18 7.481 7.783 8.111 8.467 8.828 9.171 9.531 9.929 10.327 10.748 11.133 11.54 11.955 12.263 12.409 12.311 11.771 11.08 10.381 9.654 8.906 8.26 7.673 7.176 6.651 6.148 5.686 5.236 4.796 4.361 3.966 3.587 3.249 2.947 2.643 2.32 2.041 1.759 1.476 1.254 1.036 0.807 0.536 0.242 0.04 -0.168 -0.484 -0.706 -0.937 -1.057 -1.31 -1.582 -1.868 -2.016 -2.267 -2.475 -2.643 -2.828 -3.235 -3.453 -3.684 -3.94 -4.242 -4.571 -4.972 -5.918 -7 ,4630 ,KEBNE ,17018213,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:25:34 CET,0.0 0.48 0.776 1.018 1.214 1.386 1.557 1.711 1.978 2.101 2.217 2.343 2.558 2.668 2.865 3.048 3.221 3.304 3.471 3.617 3.799 3.92 4.053 4.257 4.443 4.621 4.801 4.969 5.182 5.381 5.56 5.79 6.019 6.242 6.488 6.739 6.965 7.186 7.428 7.704 7.964 8.231 8.543 8.862 9.224 9.582 9.931 10.3 10.707 10.972 10.835 10.149 9.449 8.803 8.097 7.356 6.702 6.113 5.57 4.97 4.447 3.992 3.556 3.115 2.691 2.316 1.922 1.567 1.237 0.875 0.529 0.249 -0.058 -0.403 -0.671 -0.939 -1.227 -1.542 -1.858 -2.069 -2.289 -2.633 -2.879 -3.137 -3.265 -3.523 -3.8 -4.11 -4.283 -4.556 -4.807 -4.996 -5.195 -5.62 -5.878 -6.147 -6.399 -6.674 -7.001 -7.394 -8.393 -8 ,17030 ,KEBNE ,17018214,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:26:40 CET,0.0 0.52 0.811 1.007 1.178 1.346 1.504 1.655 1.938 2.067 2.189 2.325 2.533 2.637 2.835 3.024 3.215 3.301 3.469 3.64 3.879 4.029 4.175 4.38 4.566 4.742 4.925 5.096 5.29 5.478 5.667 5.911 6.15 6.378 6.632 6.908 7.173 7.45 7.71 7.978 8.278 8.597 8.95 9.303 9.686 10.024 10.339 10.645 10.9 11.059 10.964 10.386 9.651 8.851 8.097 7.392 6.708 6.054 5.486 4.886 4.351 3.877 3.463 3.06 2.646 2.259 1.84 1.462 1.146 0.838 0.538 0.296 0.03 -0.286 -0.533 -0.765 -1.019 -1.304 -1.608 -1.818 -2.029 -2.348 -2.564 -2.787 -2.905 -3.147 -3.397 -3.668 -3.802 -4.039 -4.234 -4.394 -4.564 -4.923 -5.117 -5.34 -5.584 -5.835 -6.139 -6.556 -7.481 -9 ,9229 ,KEBNE ,17018215,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:26:42 CET,0.0 0.558 0.853 1.072 1.257 1.439 1.597 1.745 2.025 2.142 2.259 2.389 2.592 2.703 2.917 3.099 3.268 3.351 3.528 3.697 3.901 4.033 4.172 4.367 4.56 4.749 4.927 5.087 5.289 5.496 5.696 5.943 6.174 6.377 6.602 6.851 7.076 7.331 7.589 7.845 8.111 8.394 8.72 9.057 9.428 9.803 10.144 10.438 10.732 10.92 10.769 10.153 9.402 8.656 7.953 7.278 6.644 6.036 5.494 4.956 4.491 4.066 3.658 3.263 2.871 2.514 2.126 1.775 1.482 1.181 0.879 0.611 0.294 -0.041 -0.284 -0.533 -0.787 -1.043 -1.317 -1.511 -1.717 -2.035 -2.255 -2.494 -2.613 -2.863 -3.137 -3.41 -3.553 -3.804 -4.028 -4.198 -4.364 -4.73 -4.931 -5.155 -5.421 -5.721 -6.065 -6.531 -7.783 -10 ,5463 ,KEBNE ,17018216,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:25:01 CET,0.0 0.753 1.151 1.455 1.717 1.958 2.14 2.32 2.664 2.813 2.947 3.101 3.316 3.438 3.683 3.914 4.126 4.222 4.41 4.592 4.854 5.025 5.186 5.428 5.654 5.868 6.077 6.274 6.529 6.759 6.968 7.215 7.427 7.636 7.896 8.19 8.473 8.778 9.112 9.45 9.794 10.167 10.557 10.918 11.327 11.726 12.119 12.5 12.798 12.961 12.814 12.193 11.444 10.71 10.01 9.285 8.583 7.96 7.414 6.831 6.315 5.865 5.434 5.007 4.585 4.184 3.756 3.382 3.062 2.716 2.365 2.076 1.764 1.431 1.17 0.9 0.62 0.329 0.02 -0.205 -0.433 -0.775 -0.999 -1.231 -1.353 -1.596 -1.854 -2.109 -2.242 -2.499 -2.74 -2.909 -3.08 -3.469 -3.692 -3.937 -4.195 -4.464 -4.822 -5.315 -6.514 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt deleted file mode 100644 index 01354e78..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7036 ,KEBNE ,17018217,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:25:36 CET,0.0 0.443 0.734 0.959 1.154 1.345 1.511 1.654 1.924 2.051 2.177 2.324 2.536 2.643 2.852 3.053 3.243 3.336 3.51 3.678 3.922 4.07 4.207 4.411 4.616 4.825 5.035 5.232 5.465 5.683 5.914 6.195 6.454 6.712 7.007 7.327 7.625 7.954 8.33 8.731 9.109 9.501 9.95 10.366 10.755 11.138 11.564 12.025 12.488 12.82 12.855 12.421 11.851 11.287 10.705 10.083 9.474 8.885 8.367 7.807 7.268 6.815 6.423 6.028 5.636 5.274 4.923 4.614 4.33 4.039 3.729 3.451 3.143 2.828 2.585 2.329 2.063 1.789 1.492 1.293 1.105 0.815 0.623 0.425 0.323 0.114 -0.108 -0.357 -0.486 -0.714 -0.891 -1.036 -1.189 -1.544 -1.732 -1.923 -2.127 -2.35 -2.603 -2.912 -3.592 -2 ,12732 ,KEBNE ,17018218,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:26:59 CET,0.0 0.535 0.882 1.199 1.476 1.725 1.945 2.14 2.492 2.66 2.814 3.007 3.237 3.363 3.613 3.853 4.079 4.186 4.373 4.557 4.838 5.023 5.201 5.437 5.668 5.901 6.112 6.306 6.555 6.794 7.029 7.297 7.548 7.787 8.062 8.365 8.65 8.951 9.257 9.585 9.933 10.312 10.716 11.117 11.581 12.068 12.544 13.003 13.449 13.788 13.88 13.521 12.974 12.364 11.724 11.091 10.509 9.942 9.465 8.982 8.529 8.113 7.702 7.278 6.888 6.562 6.202 5.861 5.573 5.283 4.987 4.729 4.455 4.175 3.943 3.694 3.429 3.151 2.861 2.665 2.464 2.14 1.929 1.716 1.599 1.35 1.087 0.802 0.652 0.4 0.172 0.007 -0.177 -0.58 -0.78 -0.988 -1.219 -1.48 -1.785 -2.189 -2.97 -3 ,29266 ,KEBNE ,17018219,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:25:32 CET,0.0 0.418 0.684 0.924 1.13 1.312 1.481 1.622 1.883 2.011 2.132 2.267 2.477 2.593 2.848 3.09 3.314 3.419 3.62 3.816 4.094 4.272 4.449 4.702 4.953 5.19 5.407 5.61 5.869 6.12 6.35 6.615 6.875 7.141 7.443 7.773 8.095 8.443 8.807 9.176 9.518 9.89 10.361 10.814 11.279 11.73 12.192 12.625 13.029 13.377 13.449 13.089 12.538 11.898 11.219 10.542 9.932 9.406 8.974 8.532 8.109 7.718 7.35 6.975 6.616 6.289 5.924 5.578 5.299 5.003 4.653 4.368 4.088 3.792 3.563 3.316 3.048 2.778 2.495 2.295 2.096 1.761 1.524 1.291 1.168 0.913 0.643 0.366 0.23 -0.01 -0.233 -0.397 -0.573 -0.969 -1.174 -1.394 -1.649 -1.912 -2.226 -2.625 -3.427 -4 ,23484 ,KEBNE ,17018220,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:25:28 CET,0.0 0.601 0.893 1.133 1.375 1.591 1.793 1.988 2.34 2.501 2.649 2.835 3.064 3.192 3.423 3.65 3.884 3.995 4.213 4.427 4.724 4.907 5.091 5.354 5.586 5.807 6.018 6.221 6.494 6.747 6.987 7.266 7.537 7.796 8.085 8.424 8.733 9.048 9.374 9.703 10.068 10.482 10.93 11.362 11.839 12.358 12.935 13.473 13.919 14.228 14.273 13.884 13.315 12.647 11.95 11.275 10.698 10.172 9.674 9.179 8.749 8.348 7.952 7.55 7.186 6.869 6.507 6.17 5.884 5.593 5.276 5.002 4.719 4.414 4.154 3.856 3.544 3.223 2.896 2.683 2.478 2.18 1.958 1.718 1.599 1.353 1.098 0.818 0.66 0.395 0.175 0.019 -0.151 -0.5 -0.695 -0.918 -1.166 -1.442 -1.77 -2.187 -2.915 -5 ,4096 ,KEBNE ,17018221,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:26:52 CET,0.0 0.462 0.773 0.99 1.165 1.332 1.496 1.658 1.96 2.103 2.231 2.344 2.539 2.643 2.844 3.037 3.229 3.325 3.501 3.668 3.909 4.062 4.21 4.427 4.63 4.818 5.01 5.191 5.402 5.613 5.828 6.093 6.324 6.527 6.773 7.031 7.269 7.547 7.847 8.172 8.493 8.824 9.207 9.567 9.97 10.407 10.869 11.342 11.768 12.068 12.103 11.727 11.113 10.455 9.872 9.316 8.791 8.267 7.758 7.22 6.738 6.313 5.922 5.52 5.137 4.797 4.448 4.137 3.862 3.59 3.279 2.979 2.666 2.357 2.117 1.856 1.582 1.311 1.039 0.848 0.643 0.333 0.124 -0.106 -0.224 -0.444 -0.679 -0.949 -1.099 -1.341 -1.516 -1.667 -1.813 -2.13 -2.309 -2.502 -2.709 -2.946 -3.216 -3.489 -4.041 -6 ,10527 ,KEBNE ,17018222,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:25:22 CET,0.0 0.732 1.019 1.266 1.5 1.723 1.921 2.097 2.442 2.606 2.757 2.95 3.18 3.304 3.546 3.768 3.975 4.08 4.284 4.483 4.767 4.947 5.124 5.377 5.615 5.851 6.071 6.256 6.482 6.715 6.954 7.248 7.522 7.771 8.063 8.396 8.703 9.029 9.369 9.719 10.075 10.453 10.866 11.267 11.734 12.228 12.706 13.154 13.578 13.894 13.955 13.594 13.027 12.376 11.768 11.177 10.624 10.09 9.612 9.165 8.777 8.41 8.038 7.67 7.321 6.991 6.659 6.37 6.109 5.836 5.57 5.346 5.095 4.824 4.623 4.422 4.2 3.967 3.719 3.552 3.389 3.121 2.911 2.687 2.576 2.359 2.136 1.901 1.782 1.56 1.408 1.27 1.125 0.829 0.657 0.467 0.265 0.028 -0.264 -0.594 -1.255 -7 ,15388 ,KEBNE ,17018223,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:27:27 CET,0.0 0.483 0.744 0.978 1.213 1.412 1.58 1.741 2.056 2.194 2.32 2.474 2.686 2.797 3.036 3.259 3.469 3.586 3.795 3.965 4.208 4.368 4.515 4.722 4.917 5.1 5.291 5.476 5.713 5.937 6.14 6.388 6.63 6.874 7.162 7.474 7.785 8.13 8.483 8.834 9.175 9.548 9.967 10.373 10.811 11.255 11.735 12.207 12.612 12.884 12.897 12.517 11.96 11.347 10.721 10.135 9.589 9.067 8.561 7.999 7.524 7.134 6.739 6.358 6.003 5.652 5.278 4.942 4.64 4.336 4.032 3.748 3.445 3.14 2.896 2.634 2.361 2.083 1.798 1.611 1.414 1.101 0.879 0.634 0.501 0.238 -0.047 -0.374 -0.53 -0.773 -1.005 -1.177 -1.346 -1.712 -1.923 -2.159 -2.411 -2.675 -2.989 -3.377 -4.23 -8 ,21426 ,KEBNE ,17018224,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:25:27 CET,0.0 0.514 0.791 1.028 1.225 1.404 1.57 1.72 1.994 2.119 2.232 2.35 2.565 2.679 2.908 3.146 3.388 3.504 3.72 3.922 4.191 4.36 4.528 4.769 5.008 5.245 5.475 5.699 5.97 6.215 6.472 6.784 7.069 7.348 7.685 8.049 8.37 8.71 9.069 9.437 9.783 10.149 10.577 10.996 11.453 11.881 12.318 12.781 13.187 13.461 13.447 13.034 12.442 11.819 11.203 10.576 9.993 9.409 8.901 8.4 7.961 7.567 7.163 6.755 6.397 6.065 5.705 5.384 5.087 4.768 4.432 4.137 3.825 3.53 3.31 3.071 2.814 2.537 2.247 2.044 1.836 1.507 1.27 1.021 0.891 0.63 0.367 0.091 -0.054 -0.303 -0.525 -0.692 -0.869 -1.229 -1.437 -1.648 -1.881 -2.177 -2.513 -2.896 -3.532 -9 ,19830 ,KEBNE ,17018225,Tue Dec 21 23:04:16 CET,Wed Dec 22 00:25:27 CET,0.0 0.644 1.02 1.329 1.596 1.832 2.03 2.212 2.557 2.715 2.867 3.053 3.29 3.437 3.718 3.977 4.201 4.305 4.511 4.705 4.982 5.17 5.355 5.612 5.855 6.09 6.314 6.535 6.823 7.095 7.351 7.64 7.92 8.194 8.495 8.831 9.142 9.468 9.837 10.219 10.586 10.972 11.407 11.816 12.218 12.642 13.131 13.569 13.976 14.314 14.348 13.932 13.367 12.786 12.167 11.544 10.968 10.448 9.984 9.495 9.054 8.64 8.253 7.879 7.49 7.121 6.746 6.388 6.076 5.757 5.421 5.148 4.853 4.55 4.318 4.073 3.827 3.56 3.276 3.076 2.857 2.512 2.275 2.042 1.926 1.69 1.425 1.135 0.997 0.756 0.527 0.36 0.181 -0.184 -0.389 -0.625 -0.875 -1.142 -1.422 -1.769 -2.524 -10 ,11312 ,KEBNE ,17018226,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:26:25 CET,0.0 0.526 0.806 1.03 1.2 1.355 1.517 1.661 1.905 2.025 2.146 2.279 2.486 2.599 2.843 3.083 3.311 3.421 3.635 3.844 4.133 4.311 4.479 4.736 4.982 5.197 5.402 5.6 5.849 6.09 6.332 6.63 6.893 7.148 7.472 7.839 8.161 8.488 8.832 9.184 9.549 9.939 10.397 10.842 11.305 11.758 12.194 12.626 13.044 13.402 13.486 13.027 12.404 11.769 11.116 10.48 9.913 9.384 8.9 8.388 7.94 7.534 7.147 6.767 6.393 6.052 5.683 5.347 5.046 4.75 4.455 4.183 3.892 3.589 3.365 3.147 2.918 2.653 2.366 2.177 1.975 1.644 1.413 1.189 1.084 0.846 0.575 0.284 0.131 -0.113 -0.325 -0.5 -0.693 -1.096 -1.318 -1.536 -1.763 -2.038 -2.352 -2.72 -3.602 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 5db7d3f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16954 ,KEBNE ,17018227,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:27:00 CET,0.0 0.366 0.598 0.81 0.996 1.182 1.356 1.511 1.802 1.93 2.052 2.196 2.403 2.516 2.742 2.942 3.125 3.217 3.396 3.568 3.825 3.998 4.161 4.382 4.582 4.776 4.969 5.156 5.396 5.603 5.799 6.051 6.29 6.521 6.791 7.08 7.341 7.623 7.92 8.208 8.499 8.83 9.192 9.567 9.974 10.347 10.697 10.96 11.162 11.28 11.07 10.395 9.577 8.728 7.928 7.188 6.524 5.864 5.25 4.644 4.118 3.639 3.15 2.673 2.225 1.802 1.348 0.935 0.577 0.203 -0.181 -0.507 -0.857 -1.221 -1.496 -1.788 -2.093 -2.419 -2.779 -3.018 -3.259 -3.678 -3.992 -4.305 -4.462 -4.774 -5.1 -5.455 -5.637 -5.915 -6.237 -6.459 -6.688 -7.233 -7.533 -7.846 -8.221 -8.655 -9.214 -9.977 -12.891 -2 ,28689 ,KEBNE ,17018228,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:25:27 CET,0.0 0.528 0.761 0.955 1.142 1.319 1.481 1.634 1.914 2.038 2.159 2.307 2.523 2.659 2.94 3.192 3.428 3.537 3.724 3.898 4.15 4.297 4.434 4.639 4.848 5.052 5.24 5.412 5.627 5.85 6.082 6.352 6.608 6.854 7.118 7.398 7.651 7.907 8.172 8.469 8.779 9.118 9.518 9.856 10.204 10.581 10.975 11.354 11.713 11.88 11.594 10.861 10.015 9.224 8.518 7.828 7.184 6.562 5.994 5.379 4.849 4.384 3.939 3.503 3.078 2.685 2.272 1.909 1.593 1.281 0.947 0.648 0.324 -0.025 -0.296 -0.579 -0.864 -1.154 -1.464 -1.695 -1.941 -2.313 -2.573 -2.852 -2.995 -3.279 -3.552 -3.838 -4.0 -4.286 -4.562 -4.753 -4.963 -5.441 -5.731 -6.054 -6.377 -6.754 -7.259 -7.865 -10.799 -3 ,31028 ,KEBNE ,17018229,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:25:02 CET,0.0 0.331 0.528 0.713 0.896 1.07 1.231 1.383 1.667 1.802 1.929 2.106 2.344 2.481 2.725 2.925 3.121 3.226 3.43 3.602 3.843 4.023 4.217 4.481 4.719 4.944 5.141 5.326 5.576 5.815 6.036 6.301 6.551 6.778 7.041 7.344 7.636 7.938 8.252 8.578 8.887 9.191 9.54 9.905 10.326 10.699 11.05 11.431 11.761 11.902 11.585 10.758 9.864 9.025 8.243 7.52 6.853 6.169 5.525 4.876 4.326 3.824 3.352 2.899 2.464 2.064 1.628 1.213 0.855 0.489 0.111 -0.196 -0.506 -0.838 -1.114 -1.403 -1.682 -1.954 -2.233 -2.43 -2.639 -2.964 -3.207 -3.478 -3.624 -3.906 -4.173 -4.435 -4.573 -4.843 -5.118 -5.309 -5.518 -6.013 -6.299 -6.593 -6.912 -7.298 -7.766 -8.419 -11.074 -4 ,13611 ,KEBNE ,17018230,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:25:17 CET,0.0 0.221 0.404 0.574 0.72 0.853 0.971 1.077 1.3 1.408 1.508 1.601 1.789 1.883 2.079 2.252 2.404 2.48 2.632 2.773 2.983 3.126 3.268 3.49 3.689 3.869 4.05 4.234 4.469 4.687 4.883 5.114 5.353 5.579 5.837 6.139 6.42 6.716 7.003 7.296 7.618 7.934 8.248 8.558 8.921 9.287 9.653 10.009 10.322 10.525 10.388 9.725 8.925 8.113 7.312 6.516 5.779 5.13 4.561 3.93 3.37 2.886 2.404 1.927 1.462 1.053 0.639 0.26 -0.053 -0.391 -0.778 -1.112 -1.43 -1.766 -2.051 -2.322 -2.603 -2.9 -3.209 -3.426 -3.65 -4.0 -4.235 -4.473 -4.596 -4.874 -5.189 -5.513 -5.691 -5.971 -6.237 -6.463 -6.694 -7.16 -7.419 -7.702 -8.007 -8.388 -8.923 -9.632 -12.603 -5 ,4020 ,KEBNE ,17018231,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:26:49 CET,0.0 0.301 0.474 0.624 0.752 0.889 1.028 1.156 1.384 1.486 1.581 1.662 1.855 1.953 2.147 2.317 2.472 2.546 2.684 2.819 3.016 3.146 3.264 3.432 3.605 3.771 3.919 4.056 4.238 4.416 4.594 4.792 4.985 5.194 5.424 5.668 5.904 6.164 6.421 6.686 6.978 7.283 7.606 7.889 8.192 8.512 8.82 9.128 9.417 9.537 9.299 8.602 7.786 6.987 6.241 5.53 4.901 4.295 3.713 3.116 2.59 2.106 1.632 1.178 0.754 0.366 -0.033 -0.396 -0.729 -1.068 -1.399 -1.676 -1.965 -2.279 -2.535 -2.801 -3.09 -3.386 -3.674 -3.882 -4.11 -4.475 -4.73 -4.987 -5.125 -5.422 -5.705 -6.012 -6.191 -6.491 -6.779 -6.984 -7.222 -7.713 -7.962 -8.253 -8.563 -8.925 -9.406 -10.05 -12.223 -6 ,18698 ,KEBNE ,17018232,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:27:07 CET,0.0 0.32 0.569 0.8 0.982 1.163 1.342 1.501 1.801 1.945 2.078 2.231 2.434 2.541 2.754 2.942 3.12 3.214 3.399 3.57 3.812 3.955 4.097 4.301 4.481 4.666 4.851 5.035 5.269 5.486 5.678 5.901 6.136 6.35 6.595 6.899 7.189 7.483 7.795 8.141 8.485 8.849 9.218 9.575 9.967 10.325 10.7 11.053 11.311 11.387 11.155 10.46 9.658 8.855 8.086 7.362 6.685 6.045 5.479 4.864 4.305 3.809 3.324 2.839 2.378 1.967 1.529 1.113 0.755 0.376 -0.015 -0.335 -0.69 -1.065 -1.349 -1.645 -1.974 -2.341 -2.694 -2.901 -3.109 -3.442 -3.684 -3.941 -4.08 -4.378 -4.689 -5.024 -5.192 -5.457 -5.715 -5.919 -6.146 -6.64 -6.904 -7.176 -7.494 -7.909 -8.419 -9.138 -11.836 -7 ,22390 ,KEBNE ,17018233,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:25:14 CET,0.0 0.361 0.607 0.806 0.989 1.158 1.306 1.442 1.715 1.849 1.969 2.091 2.296 2.407 2.618 2.814 2.988 3.072 3.239 3.398 3.617 3.756 3.894 4.113 4.332 4.536 4.726 4.905 5.137 5.357 5.555 5.788 6.024 6.264 6.532 6.817 7.084 7.353 7.638 7.94 8.226 8.522 8.853 9.168 9.525 9.907 10.291 10.614 10.886 11.028 10.761 10.034 9.23 8.427 7.622 6.823 6.076 5.394 4.773 4.138 3.587 3.064 2.554 2.05 1.586 1.175 0.715 0.282 -0.086 -0.456 -0.844 -1.164 -1.488 -1.836 -2.121 -2.405 -2.701 -3.027 -3.355 -3.58 -3.817 -4.203 -4.481 -4.773 -4.927 -5.237 -5.56 -5.909 -6.094 -6.384 -6.684 -6.895 -7.128 -7.655 -7.952 -8.262 -8.596 -8.97 -9.479 -10.279 -12.996 -8 ,30997 ,KEBNE ,17018234,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:25:31 CET,0.0 0.318 0.551 0.773 0.955 1.126 1.289 1.446 1.733 1.862 1.985 2.122 2.339 2.451 2.648 2.838 3.029 3.12 3.3 3.476 3.725 3.887 4.035 4.24 4.437 4.621 4.799 4.969 5.198 5.432 5.659 5.924 6.145 6.341 6.572 6.831 7.088 7.351 7.621 7.922 8.205 8.498 8.847 9.182 9.541 9.895 10.252 10.581 10.85 10.989 10.785 10.088 9.299 8.472 7.669 6.905 6.187 5.485 4.825 4.183 3.662 3.209 2.767 2.325 1.887 1.464 1.028 0.634 0.275 -0.09 -0.462 -0.817 -1.197 -1.567 -1.858 -2.157 -2.457 -2.779 -3.121 -3.367 -3.622 -3.999 -4.266 -4.557 -4.703 -4.996 -5.309 -5.656 -5.841 -6.132 -6.449 -6.678 -6.921 -7.439 -7.731 -8.054 -8.459 -8.956 -9.524 -10.273 -12.495 -9 ,23949 ,KEBNE ,17018235,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:26:56 CET,0.0 0.416 0.606 0.764 0.905 1.036 1.165 1.285 1.497 1.592 1.686 1.765 1.953 2.038 2.201 2.362 2.513 2.586 2.729 2.873 3.076 3.204 3.337 3.518 3.687 3.858 4.024 4.176 4.376 4.562 4.74 4.967 5.187 5.393 5.615 5.853 6.08 6.316 6.545 6.783 7.045 7.356 7.689 7.983 8.288 8.605 8.944 9.256 9.504 9.567 9.276 8.572 7.751 6.93 6.142 5.399 4.711 4.068 3.513 2.971 2.493 2.024 1.538 1.083 0.674 0.293 -0.095 -0.437 -0.746 -1.061 -1.383 -1.672 -1.988 -2.311 -2.533 -2.765 -3.042 -3.331 -3.635 -3.845 -4.057 -4.406 -4.654 -4.908 -5.045 -5.338 -5.655 -5.985 -6.147 -6.412 -6.682 -6.894 -7.12 -7.583 -7.852 -8.146 -8.456 -8.815 -9.272 -9.92 -12.289 -10 ,28575 ,KEBNE ,17018236,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:26:52 CET,0.0 0.265 0.484 0.667 0.816 0.956 1.084 1.201 1.427 1.532 1.635 1.733 1.918 2.005 2.174 2.339 2.492 2.57 2.722 2.863 3.074 3.203 3.325 3.51 3.699 3.882 4.058 4.223 4.423 4.615 4.803 5.009 5.197 5.379 5.589 5.82 6.029 6.267 6.537 6.796 7.048 7.354 7.696 7.996 8.305 8.606 8.883 9.164 9.42 9.517 9.245 8.559 7.727 6.88 6.097 5.356 4.666 3.994 3.397 2.763 2.195 1.697 1.23 0.77 0.313 -0.114 -0.552 -0.962 -1.318 -1.685 -2.058 -2.357 -2.672 -2.999 -3.269 -3.568 -3.885 -4.196 -4.516 -4.757 -5.007 -5.4 -5.657 -5.929 -6.071 -6.338 -6.653 -7.013 -7.21 -7.507 -7.825 -8.055 -8.29 -8.778 -9.066 -9.395 -9.749 -10.167 -10.674 -11.457 -14.231 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt deleted file mode 100644 index a3b15e3d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6432 ,KEBNE ,17018237,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:27:26 CET,0.0 0.94 1.323 1.633 1.903 2.152 2.385 2.598 2.963 3.126 3.294 3.526 3.758 3.9 4.189 4.47 4.723 4.83 5.032 5.239 5.541 5.73 5.912 6.171 6.414 6.663 6.908 7.12 7.361 7.586 7.802 8.084 8.384 8.654 8.933 9.236 9.51 9.793 10.085 10.363 10.642 10.975 11.37 11.76 12.117 12.391 12.669 12.885 12.99 12.894 12.307 11.249 10.173 9.165 8.233 7.393 6.659 5.944 5.282 4.58 4.002 3.467 2.925 2.439 2.002 1.597 1.18 0.779 0.423 0.046 -0.338 -0.628 -0.945 -1.286 -1.548 -1.84 -2.154 -2.472 -2.806 -3.042 -3.3 -3.7 -3.975 -4.253 -4.388 -4.67 -4.974 -5.306 -5.474 -5.743 -6.029 -6.235 -6.446 -6.928 -7.189 -7.448 -7.739 -8.082 -8.487 -9.023 -10.219 -2 ,17980 ,KEBNE ,17018238,Tue Dec 21 23:05:19 CET,Wed Dec 22 00:26:02 CET,0.0 1.084 1.416 1.701 1.947 2.157 2.345 2.507 2.818 2.972 3.125 3.304 3.521 3.634 3.856 4.064 4.258 4.356 4.552 4.735 4.986 5.143 5.293 5.503 5.696 5.876 6.062 6.251 6.47 6.673 6.879 7.133 7.366 7.57 7.811 8.078 8.297 8.535 8.813 9.087 9.343 9.632 9.969 10.268 10.552 10.81 11.069 11.297 11.43 11.318 10.76 9.782 8.786 7.747 6.794 5.948 5.215 4.566 3.985 3.369 2.823 2.317 1.823 1.361 0.916 0.516 0.077 -0.311 -0.619 -0.953 -1.302 -1.585 -1.895 -2.239 -2.505 -2.773 -3.053 -3.348 -3.657 -3.865 -4.08 -4.428 -4.676 -4.931 -5.053 -5.304 -5.578 -5.878 -6.036 -6.289 -6.512 -6.703 -6.894 -7.287 -7.504 -7.763 -8.032 -8.33 -8.709 -9.206 -10.537 -3 ,9972 ,KEBNE ,17018239,Tue Dec 21 23:05:19 CET,Wed Dec 22 00:27:45 CET,0.0 0.948 1.342 1.639 1.917 2.171 2.401 2.613 2.996 3.179 3.35 3.576 3.817 3.954 4.215 4.481 4.759 4.892 5.1 5.279 5.542 5.713 5.89 6.149 6.405 6.644 6.859 7.074 7.337 7.583 7.833 8.132 8.416 8.67 8.955 9.278 9.568 9.86 10.135 10.422 10.735 11.061 11.408 11.739 12.085 12.46 12.854 13.122 13.246 13.238 12.817 11.821 10.759 9.713 8.787 7.981 7.219 6.486 5.817 5.138 4.563 4.04 3.541 3.058 2.587 2.128 1.665 1.281 0.942 0.573 0.182 -0.146 -0.496 -0.85 -1.122 -1.402 -1.702 -2.015 -2.331 -2.549 -2.776 -3.151 -3.408 -3.701 -3.854 -4.117 -4.372 -4.66 -4.813 -5.072 -5.327 -5.52 -5.729 -6.163 -6.371 -6.603 -6.865 -7.155 -7.524 -8.038 -9.729 -4 ,30271 ,KEBNE ,17018240,Tue Dec 21 23:05:19 CET,Wed Dec 22 00:27:43 CET,0.0 1.047 1.428 1.691 1.933 2.16 2.347 2.504 2.798 2.942 3.08 3.258 3.476 3.584 3.797 4.002 4.192 4.284 4.467 4.646 4.895 5.055 5.207 5.429 5.652 5.882 6.088 6.268 6.506 6.752 6.991 7.254 7.51 7.731 7.958 8.248 8.541 8.84 9.142 9.443 9.751 10.082 10.454 10.812 11.145 11.438 11.734 11.987 12.158 12.148 11.709 10.677 9.565 8.553 7.655 6.799 5.982 5.192 4.553 3.948 3.381 2.861 2.359 1.898 1.48 1.069 0.635 0.263 -0.05 -0.393 -0.761 -1.056 -1.371 -1.703 -1.952 -2.212 -2.481 -2.75 -3.049 -3.266 -3.489 -3.826 -4.059 -4.31 -4.433 -4.685 -4.959 -5.25 -5.406 -5.684 -5.935 -6.114 -6.3 -6.696 -6.903 -7.134 -7.433 -7.777 -8.164 -8.635 -10.044 -5 ,2072 ,KEBNE ,17018241,Tue Dec 21 23:05:19 CET,Wed Dec 22 00:26:01 CET,0.0 0.841 1.207 1.512 1.76 1.979 2.171 2.347 2.687 2.845 2.996 3.173 3.401 3.55 3.825 4.084 4.337 4.458 4.685 4.907 5.219 5.414 5.599 5.85 6.082 6.324 6.561 6.771 7.032 7.281 7.527 7.837 8.12 8.356 8.621 8.937 9.252 9.564 9.835 10.128 10.45 10.796 11.192 11.556 11.917 12.243 12.572 12.857 13.009 12.984 12.463 11.438 10.428 9.488 8.564 7.637 6.815 6.055 5.38 4.705 4.12 3.579 3.062 2.586 2.148 1.727 1.255 0.817 0.452 0.087 -0.297 -0.623 -0.96 -1.311 -1.587 -1.868 -2.137 -2.4 -2.682 -2.881 -3.096 -3.42 -3.654 -3.919 -4.052 -4.312 -4.591 -4.887 -5.041 -5.31 -5.533 -5.699 -5.878 -6.289 -6.514 -6.755 -7.026 -7.33 -7.671 -8.144 -9.484 -6 ,22673 ,KEBNE ,17018242,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:27:16 CET,0.0 0.753 1.093 1.362 1.601 1.817 2.032 2.255 2.659 2.823 2.972 3.174 3.414 3.556 3.803 4.039 4.28 4.393 4.604 4.8 5.089 5.279 5.461 5.737 6.006 6.236 6.467 6.694 6.966 7.226 7.476 7.775 8.047 8.315 8.594 8.876 9.161 9.478 9.82 10.165 10.519 10.885 11.276 11.619 11.975 12.357 12.718 13.036 13.199 13.117 12.595 11.575 10.475 9.448 8.523 7.614 6.776 6.045 5.422 4.775 4.203 3.687 3.169 2.649 2.16 1.725 1.275 0.847 0.484 0.112 -0.285 -0.598 -0.923 -1.275 -1.562 -1.867 -2.164 -2.469 -2.802 -3.029 -3.26 -3.648 -3.932 -4.229 -4.387 -4.72 -5.039 -5.341 -5.496 -5.765 -6.008 -6.196 -6.401 -6.841 -7.083 -7.332 -7.595 -7.881 -8.223 -8.674 -10.063 -7 ,19912 ,KEBNE ,17018243,Tue Dec 21 23:05:19 CET,Wed Dec 22 00:27:42 CET,0.0 0.978 1.305 1.572 1.81 2.028 2.223 2.389 2.686 2.837 2.982 3.143 3.358 3.479 3.732 3.954 4.147 4.242 4.433 4.604 4.828 4.977 5.127 5.346 5.563 5.758 5.935 6.123 6.383 6.628 6.859 7.147 7.426 7.703 8.006 8.332 8.619 8.919 9.24 9.571 9.917 10.256 10.611 10.971 11.331 11.666 11.989 12.238 12.403 12.318 11.692 10.568 9.517 8.482 7.523 6.675 5.918 5.218 4.561 3.911 3.356 2.841 2.349 1.872 1.412 0.958 0.477 0.071 -0.279 -0.655 -1.061 -1.387 -1.719 -2.085 -2.353 -2.637 -2.962 -3.312 -3.665 -3.895 -4.133 -4.51 -4.771 -5.039 -5.188 -5.485 -5.767 -6.087 -6.275 -6.584 -6.918 -7.13 -7.341 -7.786 -8.041 -8.328 -8.63 -8.999 -9.45 -9.997 -11.505 -8 ,12896 ,KEBNE ,17018244,Tue Dec 21 23:05:19 CET,Wed Dec 22 00:26:04 CET,0.0 0.739 1.198 1.547 1.845 2.098 2.307 2.506 2.886 3.061 3.226 3.444 3.68 3.822 4.098 4.356 4.605 4.719 4.942 5.145 5.423 5.607 5.79 6.053 6.289 6.52 6.741 6.944 7.224 7.49 7.722 8.003 8.288 8.56 8.826 9.128 9.442 9.77 10.076 10.383 10.705 11.05 11.441 11.782 12.11 12.392 12.646 12.874 13.045 12.987 12.446 11.473 10.463 9.46 8.501 7.646 6.928 6.241 5.6 4.959 4.394 3.883 3.404 2.945 2.51 2.118 1.699 1.312 0.985 0.651 0.3 -0.001 -0.326 -0.663 -0.916 -1.178 -1.461 -1.757 -2.075 -2.306 -2.543 -2.896 -3.141 -3.398 -3.521 -3.786 -4.066 -4.343 -4.487 -4.75 -4.978 -5.153 -5.336 -5.72 -5.946 -6.213 -6.478 -6.765 -7.107 -7.583 -8.93 -9 ,11260 ,KEBNE ,17018245,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:27:25 CET,0.0 0.8 1.178 1.467 1.696 1.888 2.07 2.247 2.568 2.716 2.866 3.035 3.253 3.376 3.611 3.829 4.039 4.144 4.341 4.525 4.796 4.967 5.112 5.31 5.519 5.71 5.905 6.091 6.324 6.562 6.782 7.045 7.301 7.538 7.798 8.086 8.364 8.657 8.952 9.247 9.538 9.832 10.104 10.348 10.645 10.948 11.225 11.449 11.559 11.478 10.952 9.931 8.933 8.04 7.2 6.361 5.56 4.85 4.229 3.554 2.981 2.489 2.01 1.545 1.104 0.694 0.253 -0.15 -0.483 -0.813 -1.167 -1.465 -1.784 -2.108 -2.354 -2.614 -2.868 -3.146 -3.475 -3.7 -3.921 -4.265 -4.502 -4.749 -4.876 -5.136 -5.41 -5.691 -5.842 -6.11 -6.337 -6.509 -6.697 -7.111 -7.335 -7.583 -7.839 -8.137 -8.515 -9.004 -10.577 -10 ,11425 ,KEBNE ,17018246,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:27:22 CET,0.0 1.099 1.466 1.713 1.948 2.18 2.391 2.585 2.916 3.062 3.204 3.393 3.614 3.729 3.968 4.189 4.399 4.502 4.69 4.865 5.111 5.261 5.412 5.629 5.829 6.03 6.234 6.43 6.693 6.934 7.142 7.392 7.627 7.847 8.131 8.464 8.757 9.043 9.35 9.663 9.963 10.316 10.693 11.026 11.362 11.696 12.05 12.334 12.536 12.482 11.897 10.816 9.76 8.789 7.863 6.987 6.194 5.451 4.765 4.067 3.489 2.974 2.478 2.021 1.591 1.184 0.752 0.351 0.0 -0.376 -0.782 -1.1 -1.429 -1.784 -2.056 -2.345 -2.653 -2.98 -3.319 -3.55 -3.79 -4.18 -4.439 -4.713 -4.861 -5.168 -5.487 -5.806 -5.969 -6.239 -6.494 -6.682 -6.878 -7.303 -7.536 -7.774 -8.039 -8.357 -8.724 -9.216 -10.723 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 47c57d53..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5827 ,TETRA ,17413979,Sun Nov 21 16:19:17 CET,Sun Nov 21 17:55:00 CET,0.0 0.705 1.096 1.368 1.613 1.831 2.032 2.233 2.624 2.808 2.969 3.168 3.397 3.538 3.795 4.024 4.247 4.349 4.555 4.767 5.058 5.236 5.411 5.67 5.925 6.171 6.386 6.582 6.837 7.083 7.303 7.571 7.827 8.057 8.333 8.67 8.991 9.306 9.631 9.98 10.338 10.732 11.124 11.476 11.903 12.307 12.632 12.918 13.158 13.236 12.937 12.122 11.162 10.218 9.365 8.556 7.801 7.07 6.421 5.769 5.157 4.611 4.103 3.625 3.167 2.732 2.273 1.859 1.512 1.144 0.767 0.464 0.12 -0.265 -0.56 -0.855 -1.173 -1.503 -1.822 -2.049 -2.293 -2.687 -2.968 -3.243 -3.384 -3.685 -4.001 -4.326 -4.5 -4.78 -5.001 -5.154 -5.335 -5.771 -6.004 -6.253 -6.524 -6.817 -7.131 -7.566 -8.883 -2 ,24030 ,TETRA ,17413980,Sun Nov 21 16:19:17 CET,Sun Nov 21 17:55:00 CET,0.0 0.671 1.012 1.268 1.489 1.682 1.851 2.007 2.303 2.455 2.6 2.756 2.97 3.085 3.302 3.505 3.69 3.778 3.95 4.113 4.347 4.499 4.648 4.868 5.087 5.304 5.51 5.704 5.947 6.173 6.378 6.617 6.852 7.071 7.322 7.606 7.875 8.154 8.427 8.698 8.974 9.261 9.625 9.984 10.297 10.605 10.921 11.175 11.362 11.35 10.889 9.958 9.009 8.136 7.333 6.535 5.823 5.199 4.627 4.036 3.52 3.051 2.595 2.137 1.7 1.306 0.882 0.484 0.151 -0.198 -0.597 -0.922 -1.225 -1.545 -1.805 -2.076 -2.362 -2.65 -2.949 -3.157 -3.368 -3.715 -3.958 -4.193 -4.314 -4.566 -4.835 -5.115 -5.254 -5.517 -5.751 -5.915 -6.098 -6.497 -6.715 -6.955 -7.22 -7.529 -7.925 -8.43 -10.14 -3 ,10835 ,TETRA ,17413981,Sun Nov 21 16:19:20 CET,Sun Nov 21 17:55:00 CET,0.0 0.813 1.09 1.3 1.502 1.683 1.874 2.043 2.333 2.47 2.597 2.752 2.96 3.069 3.295 3.504 3.695 3.79 3.983 4.182 4.468 4.652 4.832 5.076 5.299 5.523 5.76 5.992 6.276 6.53 6.756 7.014 7.258 7.488 7.744 8.023 8.32 8.649 8.95 9.254 9.569 9.911 10.281 10.616 10.954 11.287 11.622 11.92 12.142 12.156 11.77 10.841 9.879 8.966 8.117 7.327 6.578 5.861 5.222 4.593 4.055 3.542 3.047 2.577 2.147 1.74 1.306 0.903 0.556 0.225 -0.123 -0.411 -0.721 -1.083 -1.361 -1.614 -1.876 -2.158 -2.458 -2.671 -2.894 -3.235 -3.466 -3.705 -3.823 -4.077 -4.35 -4.634 -4.795 -5.065 -5.303 -5.486 -5.669 -6.087 -6.325 -6.567 -6.836 -7.178 -7.594 -8.088 -9.482 -4 ,27294 ,TETRA ,17413982,Sun Nov 21 16:19:21 CET,Sun Nov 21 17:55:00 CET,0.0 0.912 1.214 1.456 1.674 1.883 2.076 2.262 2.585 2.731 2.878 3.05 3.277 3.399 3.608 3.808 4.012 4.102 4.274 4.459 4.735 4.906 5.068 5.317 5.549 5.771 5.998 6.207 6.466 6.73 6.974 7.245 7.506 7.764 8.058 8.359 8.648 8.966 9.304 9.661 10.021 10.391 10.746 11.053 11.406 11.775 12.143 12.462 12.715 12.783 12.39 11.49 10.563 9.637 8.767 7.971 7.238 6.543 5.907 5.239 4.639 4.095 3.564 3.087 2.652 2.233 1.798 1.402 1.057 0.703 0.313 -0.027 -0.354 -0.674 -0.934 -1.214 -1.516 -1.839 -2.164 -2.374 -2.595 -2.949 -3.202 -3.48 -3.629 -3.934 -4.247 -4.579 -4.763 -5.055 -5.361 -5.576 -5.79 -6.251 -6.513 -6.795 -7.112 -7.487 -7.908 -8.437 -10.34 -5 ,4647 ,TETRA ,17413983,Sun Nov 21 16:19:18 CET,Sun Nov 21 17:55:00 CET,0.0 0.937 1.303 1.598 1.867 2.104 2.31 2.501 2.868 3.052 3.221 3.444 3.682 3.826 4.097 4.346 4.572 4.684 4.928 5.173 5.494 5.669 5.835 6.092 6.322 6.547 6.781 7.009 7.29 7.537 7.774 8.066 8.346 8.6 8.892 9.215 9.512 9.819 10.116 10.421 10.741 11.111 11.518 11.887 12.285 12.671 13.032 13.327 13.514 13.544 13.155 12.242 11.251 10.332 9.508 8.715 7.996 7.28 6.621 5.961 5.376 4.854 4.351 3.882 3.456 3.053 2.637 2.261 1.934 1.589 1.206 0.886 0.556 0.208 -0.057 -0.343 -0.641 -0.921 -1.207 -1.408 -1.62 -1.972 -2.223 -2.47 -2.597 -2.871 -3.156 -3.466 -3.623 -3.885 -4.13 -4.316 -4.508 -4.899 -5.125 -5.385 -5.681 -6.026 -6.404 -6.871 -8.071 -6 ,23008 ,TETRA ,17413984,Sun Nov 21 16:19:21 CET,Sun Nov 21 17:55:00 CET,0.0 0.744 1.107 1.353 1.56 1.755 1.932 2.102 2.426 2.564 2.692 2.863 3.087 3.223 3.479 3.701 3.911 4.023 4.266 4.51 4.828 5.009 5.176 5.415 5.65 5.888 6.125 6.355 6.626 6.871 7.107 7.377 7.64 7.903 8.191 8.48 8.754 9.061 9.376 9.688 9.997 10.335 10.731 11.12 11.541 11.972 12.434 12.831 13.106 13.203 12.804 11.81 10.807 9.954 9.145 8.347 7.596 6.874 6.274 5.708 5.167 4.644 4.155 3.674 3.224 2.819 2.386 1.979 1.634 1.283 0.896 0.57 0.237 -0.11 -0.385 -0.7 -1.014 -1.33 -1.674 -1.901 -2.123 -2.451 -2.69 -2.96 -3.102 -3.395 -3.694 -4.043 -4.24 -4.537 -4.83 -5.008 -5.199 -5.612 -5.818 -6.051 -6.311 -6.62 -6.99 -7.494 -8.97 -7 ,31594 ,TETRA ,17413985,Sun Nov 21 16:19:22 CET,Sun Nov 21 17:55:00 CET,0.0 1.024 1.393 1.701 1.95 2.19 2.412 2.606 2.958 3.124 3.296 3.518 3.745 3.878 4.139 4.379 4.602 4.709 4.932 5.143 5.418 5.6 5.783 6.034 6.261 6.49 6.706 6.904 7.184 7.467 7.717 7.993 8.264 8.531 8.816 9.128 9.421 9.732 10.069 10.426 10.762 11.103 11.472 11.822 12.189 12.579 13.003 13.39 13.647 13.656 13.259 12.374 11.401 10.485 9.643 8.831 8.072 7.366 6.722 6.053 5.479 4.946 4.445 3.983 3.541 3.122 2.684 2.283 1.936 1.584 1.205 0.906 0.599 0.252 -0.036 -0.321 -0.632 -0.967 -1.285 -1.5 -1.724 -2.071 -2.287 -2.515 -2.643 -2.907 -3.188 -3.515 -3.681 -3.93 -4.124 -4.286 -4.472 -4.876 -5.094 -5.317 -5.556 -5.855 -6.22 -6.674 -8.147 -8 ,31808 ,TETRA ,17413986,Sun Nov 21 16:19:18 CET,Sun Nov 21 17:55:00 CET,0.0 0.525 0.833 1.099 1.31 1.51 1.696 1.856 2.153 2.297 2.447 2.635 2.855 2.972 3.19 3.386 3.58 3.678 3.867 4.057 4.326 4.488 4.642 4.865 5.083 5.286 5.471 5.65 5.886 6.107 6.321 6.58 6.807 7.021 7.279 7.554 7.805 8.104 8.42 8.708 8.999 9.347 9.741 10.101 10.463 10.82 11.183 11.491 11.724 11.742 11.245 10.354 9.441 8.532 7.688 6.912 6.227 5.578 4.979 4.339 3.751 3.194 2.671 2.186 1.696 1.259 0.87 0.536 0.229 -0.109 -0.459 -0.756 -1.079 -1.421 -1.685 -1.947 -2.217 -2.495 -2.781 -2.991 -3.214 -3.539 -3.771 -4.041 -4.178 -4.452 -4.739 -5.029 -5.18 -5.448 -5.699 -5.877 -6.072 -6.502 -6.736 -6.997 -7.297 -7.641 -8.074 -8.625 -10.449 -9 ,16425 ,TETRA ,17413987,Sun Nov 21 16:19:20 CET,Sun Nov 21 17:55:00 CET,0.0 0.667 0.985 1.249 1.475 1.687 1.88 2.043 2.339 2.483 2.627 2.801 3.02 3.146 3.399 3.638 3.869 3.982 4.188 4.378 4.656 4.832 5.01 5.276 5.513 5.728 5.942 6.164 6.45 6.694 6.934 7.229 7.483 7.707 7.979 8.291 8.572 8.882 9.231 9.579 9.904 10.238 10.615 10.974 11.333 11.672 12.016 12.332 12.601 12.684 12.315 11.418 10.421 9.469 8.592 7.754 7.046 6.335 5.702 5.099 4.555 4.069 3.591 3.141 2.726 2.331 1.913 1.552 1.233 0.874 0.491 0.169 -0.175 -0.575 -0.886 -1.17 -1.469 -1.787 -2.104 -2.321 -2.554 -2.93 -3.194 -3.474 -3.616 -3.904 -4.208 -4.544 -4.719 -4.99 -5.257 -5.453 -5.667 -6.13 -6.387 -6.661 -6.961 -7.303 -7.719 -8.235 -9.465 -10 ,12583 ,TETRA ,17413988,Sun Nov 21 16:19:53 CET,Sun Nov 21 17:55:00 CET,0.0 0.829 1.146 1.4 1.629 1.856 2.063 2.248 2.606 2.779 2.942 3.14 3.371 3.501 3.753 3.998 4.219 4.326 4.543 4.748 5.025 5.203 5.377 5.631 5.879 6.107 6.344 6.574 6.852 7.123 7.371 7.664 7.941 8.202 8.491 8.802 9.083 9.383 9.715 10.03 10.308 10.621 10.994 11.343 11.701 12.047 12.392 12.657 12.842 12.861 12.408 11.48 10.568 9.664 8.781 7.968 7.227 6.517 5.886 5.269 4.744 4.267 3.783 3.319 2.882 2.473 2.064 1.68 1.337 0.983 0.595 0.271 -0.086 -0.454 -0.721 -1.007 -1.316 -1.639 -1.97 -2.203 -2.438 -2.775 -3.008 -3.266 -3.41 -3.731 -4.073 -4.416 -4.592 -4.876 -5.166 -5.369 -5.571 -6.044 -6.317 -6.63 -6.958 -7.305 -7.738 -8.368 -10.341 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index d5fe8b5e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17347 ,KEBNE ,17018249,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:24:43 CET,0.0 0.317 0.521 0.683 0.841 0.981 1.113 1.249 1.521 1.651 1.773 1.891 2.12 2.224 2.423 2.631 2.817 2.906 3.094 3.266 3.499 3.651 3.801 4.028 4.252 4.471 4.685 4.885 5.129 5.373 5.622 5.934 6.235 6.502 6.803 7.171 7.532 7.908 8.319 8.77 9.201 9.652 10.202 10.748 11.35 12.012 12.724 13.437 14.178 14.887 15.473 15.572 15.288 14.863 14.375 13.867 13.398 12.929 12.482 12.038 11.666 11.305 10.93 10.567 10.231 9.935 9.62 9.336 9.088 8.836 8.578 8.341 8.091 7.844 7.64 7.427 7.211 6.992 6.771 6.61 6.444 6.19 6.0 5.803 5.704 5.496 5.27 5.04 4.919 4.691 4.539 4.406 4.26 3.927 3.76 3.576 3.351 3.108 2.864 2.564 2.005 -2 ,31045 ,KEBNE ,17018250,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:24:37 CET,0.0 0.311 0.507 0.674 0.834 0.99 1.125 1.253 1.509 1.633 1.756 1.887 2.109 2.206 2.397 2.586 2.769 2.86 3.037 3.195 3.422 3.569 3.724 3.969 4.187 4.392 4.593 4.781 5.039 5.295 5.537 5.816 6.077 6.364 6.714 7.098 7.486 7.917 8.37 8.826 9.265 9.742 10.323 10.916 11.557 12.215 12.934 13.698 14.461 15.138 15.616 15.528 15.19 14.794 14.333 13.853 13.415 12.986 12.555 12.102 11.684 11.289 10.92 10.551 10.191 9.858 9.522 9.239 9.0 8.754 8.499 8.29 8.052 7.782 7.576 7.368 7.167 6.953 6.721 6.546 6.36 6.103 5.917 5.707 5.604 5.39 5.162 4.927 4.802 4.574 4.386 4.226 4.072 3.742 3.567 3.381 3.176 2.962 2.701 2.345 1.638 -3 ,29743 ,KEBNE ,17018251,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:26:02 CET,0.0 0.361 0.663 0.892 1.095 1.284 1.474 1.658 1.974 2.132 2.288 2.458 2.696 2.825 3.069 3.294 3.505 3.605 3.8 3.999 4.29 4.469 4.645 4.897 5.127 5.386 5.643 5.869 6.176 6.464 6.731 7.047 7.349 7.628 7.936 8.301 8.661 9.024 9.4 9.828 10.283 10.781 11.356 11.958 12.623 13.288 13.977 14.66 15.413 16.235 16.812 16.703 16.34 15.928 15.476 14.977 14.481 13.978 13.511 13.052 12.681 12.325 11.946 11.597 11.261 10.941 10.602 10.32 10.086 9.817 9.537 9.3 9.044 8.78 8.581 8.376 8.163 7.938 7.68 7.505 7.334 7.076 6.896 6.711 6.619 6.407 6.174 5.92 5.784 5.556 5.403 5.273 5.141 4.84 4.667 4.486 4.287 4.075 3.836 3.581 2.962 -4 ,31884 ,KEBNE ,17018252,Tue Dec 21 23:05:18 CET,Wed Dec 22 00:24:41 CET,0.0 0.512 0.715 0.906 1.067 1.199 1.333 1.475 1.738 1.861 1.983 2.084 2.291 2.388 2.575 2.754 2.938 3.031 3.215 3.392 3.648 3.801 3.938 4.153 4.382 4.601 4.801 4.997 5.266 5.535 5.769 6.049 6.333 6.604 6.917 7.241 7.541 7.895 8.288 8.708 9.109 9.514 10.009 10.508 11.078 11.678 12.316 12.997 13.727 14.419 14.911 15.005 14.776 14.364 13.921 13.456 12.993 12.532 12.107 11.695 11.336 10.992 10.649 10.313 10.013 9.743 9.422 9.129 8.897 8.651 8.382 8.161 7.942 7.7 7.495 7.282 7.063 6.836 6.593 6.425 6.258 5.981 5.794 5.617 5.527 5.325 5.1 4.872 4.744 4.506 4.341 4.205 4.051 3.71 3.537 3.361 3.177 2.964 2.694 2.335 1.533 -5 ,3762 ,KEBNE ,17018253,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:25:30 CET,0.0 0.447 0.727 0.969 1.181 1.358 1.531 1.702 2.039 2.192 2.328 2.479 2.716 2.84 3.074 3.302 3.52 3.627 3.83 4.015 4.278 4.459 4.643 4.9 5.144 5.376 5.598 5.827 6.123 6.397 6.657 6.957 7.228 7.497 7.823 8.194 8.55 8.943 9.374 9.821 10.261 10.749 11.321 11.842 12.45 13.198 13.969 14.695 15.47 16.231 16.81 16.883 16.546 16.018 15.497 14.988 14.496 14.002 13.525 13.039 12.64 12.279 11.908 11.537 11.16 10.815 10.473 10.18 9.933 9.667 9.373 9.127 8.884 8.644 8.457 8.243 8.016 7.792 7.554 7.39 7.22 6.953 6.764 6.574 6.48 6.282 6.064 5.84 5.725 5.498 5.325 5.177 5.026 4.678 4.49 4.3 4.1 3.872 3.606 3.281 2.151 -6 ,23630 ,KEBNE ,17018254,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:26:54 CET,0.0 0.526 0.794 1.024 1.227 1.451 1.692 1.909 2.267 2.432 2.597 2.766 2.996 3.118 3.358 3.582 3.782 3.889 4.107 4.305 4.578 4.744 4.91 5.163 5.414 5.679 5.923 6.142 6.419 6.685 6.959 7.289 7.587 7.856 8.149 8.503 8.866 9.25 9.636 10.061 10.536 11.053 11.617 12.134 12.697 13.342 14.101 14.857 15.608 16.346 16.962 17.125 16.92 16.546 16.032 15.463 14.938 14.473 14.075 13.661 13.254 12.875 12.516 12.155 11.826 11.524 11.193 10.894 10.631 10.345 10.029 9.76 9.465 9.162 8.941 8.701 8.447 8.2 7.945 7.757 7.565 7.251 7.018 6.78 6.664 6.43 6.172 5.887 5.752 5.523 5.355 5.222 5.084 4.788 4.607 4.408 4.205 3.983 3.736 3.406 2.785 -7 ,1704 ,KEBNE ,17018255,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:27:02 CET,0.0 0.307 0.533 0.713 0.877 1.035 1.183 1.324 1.599 1.722 1.836 1.946 2.161 2.265 2.478 2.674 2.859 2.951 3.128 3.297 3.545 3.702 3.851 4.077 4.305 4.546 4.782 5.011 5.307 5.597 5.872 6.157 6.427 6.705 7.024 7.384 7.731 8.095 8.488 8.901 9.318 9.767 10.277 10.793 11.381 12.021 12.705 13.383 14.116 14.856 15.384 15.41 15.104 14.629 14.102 13.561 13.012 12.492 12.043 11.558 11.121 10.736 10.363 10.031 9.72 9.406 9.059 8.724 8.437 8.12 7.777 7.52 7.251 6.952 6.709 6.458 6.207 5.946 5.678 5.498 5.314 5.023 4.817 4.597 4.477 4.23 3.971 3.687 3.546 3.313 3.11 2.945 2.773 2.383 2.175 1.952 1.719 1.47 1.157 0.771 0.138 -8 ,22737 ,KEBNE ,17018256,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:27:08 CET,0.0 0.342 0.559 0.74 0.894 1.044 1.2 1.347 1.61 1.725 1.829 1.934 2.154 2.265 2.5 2.711 2.898 2.993 3.174 3.348 3.623 3.807 3.976 4.222 4.464 4.702 4.924 5.133 5.406 5.68 5.953 6.267 6.544 6.801 7.133 7.543 7.921 8.301 8.683 9.088 9.533 10.038 10.641 11.247 11.875 12.479 13.151 13.914 14.673 15.347 15.902 15.981 15.717 15.281 14.784 14.294 13.812 13.35 12.937 12.501 12.105 11.729 11.378 11.056 10.753 10.447 10.121 9.833 9.582 9.337 9.083 8.869 8.649 8.401 8.204 8.009 7.807 7.597 7.358 7.189 7.02 6.757 6.549 6.322 6.214 5.999 5.775 5.537 5.408 5.164 4.978 4.844 4.702 4.383 4.212 4.023 3.83 3.623 3.358 3.058 2.425 -9 ,6504 ,KEBNE ,17018257,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:25:32 CET,0.0 0.36 0.68 0.978 1.236 1.457 1.639 1.813 2.125 2.265 2.406 2.574 2.805 2.93 3.162 3.371 3.577 3.687 3.922 4.148 4.464 4.673 4.876 5.172 5.473 5.747 6.0 6.247 6.546 6.833 7.117 7.437 7.748 8.054 8.396 8.779 9.15 9.549 9.949 10.381 10.823 11.304 11.866 12.425 13.068 13.727 14.434 15.178 15.977 16.718 17.215 17.176 16.815 16.315 15.787 15.254 14.695 14.146 13.702 13.274 12.886 12.542 12.222 11.897 11.591 11.319 11.035 10.771 10.53 10.279 10.016 9.793 9.556 9.305 9.116 8.925 8.724 8.496 8.252 8.091 7.922 7.66 7.492 7.313 7.215 7.012 6.798 6.565 6.446 6.22 6.048 5.895 5.737 5.397 5.215 5.036 4.845 4.626 4.382 4.077 3.506 -10 ,11216 ,KEBNE ,17018258,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:25:34 CET,0.0 0.469 0.771 1.013 1.215 1.395 1.582 1.754 2.056 2.196 2.33 2.485 2.716 2.843 3.085 3.311 3.532 3.637 3.843 4.044 4.33 4.516 4.694 4.923 5.139 5.371 5.604 5.819 6.096 6.37 6.642 6.971 7.27 7.547 7.877 8.278 8.683 9.104 9.514 9.946 10.393 10.907 11.508 12.062 12.656 13.28 13.991 14.735 15.508 16.242 16.792 16.862 16.574 16.128 15.586 15.025 14.512 13.993 13.505 13.007 12.559 12.154 11.767 11.386 11.001 10.648 10.305 10.01 9.744 9.465 9.186 8.91 8.596 8.297 8.067 7.822 7.563 7.307 7.046 6.85 6.639 6.321 6.116 5.905 5.792 5.554 5.308 5.053 4.914 4.664 4.428 4.265 4.104 3.75 3.557 3.34 3.111 2.846 2.562 2.183 1.432 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 9d343e6b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4612 ,KEBNE ,17018259,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:27:14 CET,0.0 0.925 1.292 1.595 1.866 2.119 2.342 2.529 2.866 3.024 3.189 3.401 3.664 3.813 4.084 4.333 4.584 4.701 4.918 5.128 5.423 5.616 5.808 6.079 6.345 6.619 6.884 7.126 7.425 7.706 7.973 8.292 8.597 8.885 9.224 9.622 9.984 10.361 10.776 11.268 11.797 12.351 12.981 13.557 14.158 14.828 15.561 16.304 17.083 17.795 18.204 18.041 17.634 17.126 16.561 16.001 15.456 14.958 14.54 14.105 13.719 13.374 13.049 12.705 12.362 12.049 11.75 11.49 11.255 11.015 10.753 10.536 10.322 10.091 9.903 9.691 9.466 9.253 9.037 8.886 8.725 8.453 8.258 8.062 7.963 7.745 7.529 7.321 7.209 6.984 6.828 6.69 6.539 6.219 6.049 5.878 5.672 5.401 5.12 4.846 4.271 -2 ,18883 ,KEBNE ,17018260,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:25:55 CET,0.0 1.409 1.839 2.145 2.421 2.66 2.9 3.142 3.56 3.751 3.929 4.149 4.402 4.562 4.877 5.163 5.43 5.563 5.825 6.067 6.408 6.635 6.856 7.173 7.479 7.758 8.017 8.267 8.602 8.934 9.249 9.618 9.956 10.283 10.661 11.087 11.486 11.924 12.385 12.833 13.282 13.77 14.322 14.873 15.511 16.179 16.882 17.606 18.309 19.012 19.536 19.469 19.065 18.597 18.095 17.509 16.98 16.468 15.984 15.495 15.045 14.625 14.253 13.905 13.55 13.219 12.868 12.585 12.35 12.062 11.74 11.472 11.208 10.909 10.679 10.472 10.254 10.036 9.816 9.659 9.494 9.238 9.053 8.859 8.756 8.553 8.359 8.158 8.05 7.823 7.672 7.541 7.404 7.1 6.923 6.721 6.501 6.284 6.046 5.734 5.252 -3 ,3563 ,KEBNE ,17018261,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:27:46 CET,0.0 0.943 1.35 1.649 1.9 2.147 2.382 2.599 2.943 3.099 3.261 3.455 3.706 3.838 4.096 4.357 4.597 4.712 4.956 5.192 5.492 5.685 5.88 6.171 6.441 6.681 6.934 7.19 7.505 7.81 8.11 8.453 8.771 9.069 9.382 9.74 10.102 10.509 10.947 11.396 11.871 12.415 13.0 13.531 14.118 14.707 15.348 16.054 16.756 17.415 17.887 17.899 17.578 17.07 16.556 16.004 15.463 14.962 14.482 13.978 13.521 13.11 12.715 12.336 11.974 11.637 11.31 11.007 10.727 10.447 10.18 9.958 9.729 9.492 9.303 9.095 8.865 8.639 8.409 8.247 8.077 7.804 7.618 7.421 7.32 7.116 6.904 6.698 6.591 6.367 6.223 6.096 5.941 5.613 5.436 5.253 5.052 4.833 4.598 4.25 3.742 -4 ,30136 ,KEBNE ,17018262,Tue Dec 21 23:06:24 CET,Wed Dec 22 00:25:50 CET,0.0 1.008 1.368 1.68 1.937 2.168 2.385 2.606 3.024 3.206 3.38 3.587 3.849 3.998 4.278 4.526 4.747 4.863 5.095 5.323 5.635 5.821 6.007 6.281 6.553 6.824 7.072 7.321 7.638 7.898 8.155 8.484 8.795 9.093 9.445 9.832 10.203 10.602 11.0 11.409 11.825 12.286 12.848 13.402 14.02 14.682 15.397 16.151 16.882 17.519 17.962 17.924 17.558 17.059 16.542 15.991 15.467 15.009 14.571 14.087 13.676 13.303 12.926 12.563 12.199 11.857 11.488 11.144 10.861 10.563 10.233 9.955 9.672 9.385 9.163 8.932 8.69 8.423 8.156 7.987 7.812 7.539 7.354 7.162 7.062 6.862 6.663 6.444 6.325 6.093 5.923 5.783 5.62 5.248 5.058 4.883 4.711 4.487 4.219 3.917 3.389 -5 ,5802 ,KEBNE ,17018263,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:26:11 CET,0.0 1.145 1.562 1.84 2.091 2.324 2.538 2.733 3.073 3.234 3.396 3.608 3.863 3.996 4.254 4.506 4.744 4.858 5.078 5.28 5.578 5.77 5.951 6.224 6.509 6.818 7.099 7.353 7.696 8.003 8.305 8.684 9.014 9.333 9.702 10.103 10.501 10.925 11.373 11.85 12.339 12.862 13.42 13.961 14.634 15.387 16.141 16.88 17.657 18.4 18.902 18.807 18.424 17.954 17.417 16.835 16.284 15.796 15.363 14.9 14.494 14.119 13.741 13.388 13.067 12.757 12.42 12.094 11.809 11.526 11.232 10.979 10.694 10.38 10.141 9.907 9.671 9.445 9.211 9.042 8.872 8.608 8.415 8.217 8.119 7.92 7.696 7.453 7.329 7.098 6.936 6.794 6.655 6.364 6.2 6.021 5.818 5.59 5.313 4.961 4.369 -6 ,29415 ,KEBNE ,17018264,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:25:58 CET,0.0 1.114 1.558 1.904 2.181 2.42 2.633 2.837 3.217 3.376 3.525 3.708 3.968 4.114 4.394 4.645 4.879 4.997 5.228 5.453 5.772 5.977 6.164 6.417 6.672 6.921 7.155 7.388 7.675 7.934 8.187 8.5 8.824 9.125 9.452 9.822 10.175 10.565 11.003 11.49 11.99 12.539 13.15 13.729 14.351 15.007 15.72 16.46 17.261 17.955 18.377 18.226 17.763 17.192 16.564 15.997 15.495 14.998 14.539 14.081 13.674 13.272 12.872 12.494 12.146 11.808 11.452 11.153 10.902 10.644 10.358 10.1 9.836 9.582 9.392 9.201 8.987 8.754 8.511 8.344 8.173 7.904 7.717 7.523 7.424 7.218 7.002 6.764 6.634 6.405 6.265 6.13 5.983 5.667 5.487 5.281 5.074 4.864 4.632 4.334 3.771 -7 ,4080 ,KEBNE ,17018265,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:27:34 CET,0.0 1.07 1.499 1.823 2.076 2.303 2.543 2.758 3.114 3.292 3.463 3.66 3.913 4.058 4.331 4.565 4.796 4.915 5.138 5.342 5.617 5.804 6.003 6.275 6.522 6.781 7.041 7.287 7.575 7.864 8.179 8.537 8.869 9.186 9.553 9.977 10.368 10.778 11.222 11.694 12.194 12.734 13.315 13.882 14.529 15.24 16.008 16.735 17.461 18.123 18.56 18.412 17.944 17.355 16.823 16.357 15.873 15.383 14.926 14.459 14.038 13.635 13.225 12.833 12.47 12.142 11.806 11.502 11.245 10.973 10.682 10.434 10.171 9.897 9.667 9.431 9.194 8.939 8.675 8.496 8.308 8.019 7.818 7.6 7.487 7.244 6.973 6.691 6.539 6.288 6.081 5.931 5.795 5.496 5.339 5.174 4.983 4.769 4.554 4.309 3.734 -8 ,16880 ,KEBNE ,17018266,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:26:03 CET,0.0 1.282 1.667 1.969 2.239 2.484 2.7 2.897 3.241 3.408 3.575 3.792 4.049 4.189 4.451 4.699 4.935 5.042 5.256 5.461 5.735 5.917 6.11 6.374 6.611 6.851 7.092 7.356 7.71 8.028 8.333 8.694 9.047 9.381 9.743 10.139 10.522 10.951 11.424 11.89 12.345 12.849 13.428 13.998 14.641 15.358 16.13 16.911 17.645 18.238 18.696 18.602 18.114 17.571 17.047 16.5 15.953 15.412 14.92 14.401 13.921 13.502 13.137 12.773 12.397 12.032 11.653 11.343 11.068 10.789 10.503 10.243 9.969 9.671 9.445 9.226 8.991 8.73 8.465 8.281 8.083 7.77 7.555 7.311 7.197 6.993 6.765 6.535 6.418 6.195 6.058 5.935 5.806 5.51 5.344 5.166 4.954 4.711 4.442 4.111 3.387 -9 ,11135 ,KEBNE ,17018267,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:27:33 CET,0.0 1.033 1.418 1.715 1.976 2.225 2.451 2.662 3.037 3.208 3.38 3.589 3.853 3.998 4.262 4.5 4.732 4.854 5.095 5.327 5.66 5.871 6.063 6.316 6.557 6.791 7.026 7.265 7.576 7.879 8.164 8.494 8.797 9.092 9.441 9.829 10.19 10.549 10.94 11.371 11.794 12.259 12.774 13.315 13.971 14.645 15.35 16.05 16.781 17.43 17.835 17.7 17.319 16.85 16.342 15.8 15.287 14.809 14.356 13.87 13.443 13.059 12.681 12.305 11.944 11.613 11.29 11.003 10.734 10.443 10.133 9.865 9.573 9.28 9.083 8.902 8.711 8.508 8.287 8.128 7.963 7.702 7.509 7.3 7.195 6.981 6.758 6.51 6.383 6.164 6.025 5.888 5.747 5.45 5.293 5.123 4.922 4.702 4.466 4.187 3.6 -10 ,21542 ,KEBNE ,17018268,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:26:17 CET,0.0 0.907 1.346 1.652 1.899 2.128 2.336 2.528 2.888 3.065 3.235 3.445 3.71 3.852 4.109 4.346 4.573 4.691 4.922 5.138 5.452 5.659 5.865 6.156 6.423 6.672 6.914 7.153 7.457 7.759 8.056 8.398 8.718 9.013 9.34 9.726 10.124 10.523 10.901 11.298 11.726 12.233 12.827 13.355 13.924 14.562 15.266 15.979 16.685 17.33 17.749 17.645 17.209 16.678 16.182 15.718 15.249 14.792 14.373 13.905 13.491 13.111 12.716 12.358 12.041 11.742 11.423 11.155 10.939 10.7 10.451 10.227 9.974 9.72 9.52 9.306 9.09 8.876 8.666 8.524 8.375 8.119 7.923 7.721 7.623 7.44 7.251 7.035 6.923 6.706 6.566 6.425 6.283 5.995 5.831 5.658 5.479 5.274 5.037 4.762 4.252 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 9fcafcba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32484 ,KEBNE ,17018269,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:27:18 CET,0.0 0.245 0.465 0.688 0.871 1.028 1.179 1.322 1.609 1.735 1.841 1.939 2.16 2.262 2.48 2.68 2.881 2.98 3.161 3.345 3.622 3.805 3.981 4.247 4.497 4.728 4.955 5.192 5.504 5.781 6.036 6.332 6.611 6.885 7.231 7.626 7.98 8.353 8.735 9.14 9.581 10.112 10.741 11.355 12.046 12.776 13.603 14.518 15.518 16.561 17.566 18.142 18.238 18.096 17.816 17.447 17.091 16.757 16.437 16.094 15.779 15.448 15.106 14.773 14.47 14.188 13.869 13.571 13.32 13.06 12.763 12.501 12.222 11.934 11.708 11.462 11.209 10.942 10.654 10.445 10.23 9.896 9.659 9.409 9.272 8.998 8.711 8.374 8.202 7.94 7.678 7.481 7.286 6.884 6.649 6.401 6.12 5.778 5.372 4.843 3.373 -2 ,14240 ,KEBNE ,17018270,Tue Dec 21 23:06:20 CET,Wed Dec 22 00:27:06 CET,0.0 0.664 1.066 1.378 1.632 1.851 2.068 2.288 2.684 2.873 3.047 3.251 3.512 3.654 3.916 4.175 4.447 4.581 4.827 5.049 5.354 5.547 5.742 6.045 6.34 6.608 6.862 7.115 7.441 7.755 8.065 8.418 8.745 9.077 9.465 9.881 10.282 10.744 11.209 11.653 12.1 12.616 13.254 13.884 14.572 15.311 16.113 16.941 17.906 18.96 19.911 20.42 20.464 20.288 20.023 19.664 19.304 18.942 18.569 18.206 17.897 17.574 17.218 16.868 16.533 16.203 15.856 15.534 15.245 14.945 14.645 14.407 14.147 13.853 13.6 13.351 13.122 12.87 12.592 12.419 12.246 11.935 11.708 11.465 11.33 11.072 10.825 10.551 10.405 10.169 10.005 9.854 9.684 9.334 9.142 8.918 8.654 8.32 7.921 7.42 6.148 -3 ,21601 ,KEBNE ,17018271,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:26:43 CET,0.0 0.633 0.996 1.297 1.55 1.788 2.034 2.262 2.696 2.88 3.03 3.191 3.437 3.572 3.824 4.064 4.295 4.406 4.626 4.829 5.103 5.29 5.482 5.761 6.024 6.277 6.522 6.763 7.088 7.404 7.691 8.043 8.392 8.713 9.081 9.487 9.887 10.317 10.751 11.207 11.685 12.208 12.787 13.375 14.068 14.823 15.648 16.523 17.489 18.513 19.454 19.89 19.886 19.653 19.342 18.985 18.632 18.29 17.935 17.534 17.152 16.803 16.453 16.078 15.712 15.36 14.976 14.645 14.352 14.049 13.72 13.448 13.194 12.937 12.728 12.505 12.282 12.039 11.788 11.604 11.414 11.152 10.951 10.723 10.609 10.378 10.143 9.902 9.772 9.516 9.291 9.125 8.948 8.56 8.332 8.111 7.861 7.532 7.177 6.707 5.319 -4 ,14679 ,KEBNE ,17018272,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:28:26 CET,0.0 0.586 0.906 1.172 1.403 1.626 1.832 2.01 2.335 2.507 2.689 2.923 3.183 3.33 3.614 3.876 4.124 4.253 4.504 4.739 5.076 5.279 5.473 5.78 6.081 6.36 6.621 6.868 7.178 7.469 7.748 8.087 8.422 8.731 9.089 9.499 9.885 10.319 10.766 11.216 11.697 12.203 12.776 13.362 13.998 14.691 15.461 16.314 17.296 18.277 19.176 19.648 19.663 19.509 19.29 19.012 18.698 18.375 18.06 17.707 17.388 17.097 16.804 16.501 16.218 15.946 15.633 15.356 15.128 14.871 14.592 14.358 14.1 13.812 13.582 13.363 13.151 12.921 12.65 12.47 12.305 12.03 11.827 11.62 11.51 11.274 11.017 10.745 10.603 10.347 10.125 9.964 9.804 9.429 9.208 8.975 8.701 8.354 7.929 7.442 5.953 -5 ,31354 ,KEBNE ,17018273,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:26:39 CET,0.0 0.378 0.586 0.775 0.943 1.106 1.263 1.405 1.661 1.776 1.891 1.996 2.216 2.317 2.511 2.703 2.889 2.978 3.161 3.342 3.596 3.759 3.926 4.17 4.392 4.597 4.796 5.004 5.28 5.548 5.804 6.103 6.389 6.685 7.024 7.37 7.696 8.048 8.439 8.875 9.335 9.846 10.425 11.007 11.669 12.363 13.123 13.922 14.801 15.758 16.722 17.206 17.284 17.178 16.927 16.591 16.258 15.926 15.611 15.312 15.008 14.693 14.407 14.13 13.857 13.599 13.327 13.068 12.82 12.553 12.279 12.068 11.85 11.6 11.396 11.191 10.959 10.697 10.451 10.283 10.1 9.822 9.623 9.394 9.273 9.03 8.78 8.508 8.364 8.122 7.937 7.79 7.636 7.287 7.054 6.783 6.524 6.234 5.883 5.417 3.902 -6 ,19517 ,KEBNE ,17018274,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:28:19 CET,0.0 0.338 0.583 0.771 0.924 1.064 1.197 1.332 1.585 1.702 1.819 1.937 2.171 2.281 2.479 2.668 2.856 2.946 3.136 3.314 3.547 3.702 3.862 4.084 4.282 4.478 4.681 4.882 5.142 5.395 5.641 5.936 6.212 6.473 6.788 7.14 7.452 7.804 8.2 8.626 9.077 9.599 10.184 10.725 11.366 12.089 12.88 13.719 14.649 15.649 16.588 16.946 16.898 16.719 16.44 16.083 15.713 15.32 14.94 14.565 14.236 13.909 13.578 13.256 12.947 12.644 12.32 12.041 11.783 11.482 11.157 10.891 10.618 10.326 10.103 9.864 9.597 9.319 9.056 8.869 8.657 8.327 8.075 7.792 7.653 7.381 7.091 6.771 6.615 6.368 6.118 5.931 5.725 5.289 5.068 4.822 4.542 4.204 3.767 3.188 2.007 -7 ,5393 ,KEBNE ,17018275,Tue Dec 21 23:07:26 CET,Wed Dec 22 00:24:14 CET,0.0 0.551 0.854 1.103 1.328 1.534 1.72 1.9 2.261 2.419 2.558 2.713 2.947 3.078 3.336 3.575 3.805 3.917 4.127 4.332 4.637 4.829 5.007 5.266 5.518 5.755 5.996 6.239 6.55 6.836 7.105 7.435 7.742 8.038 8.397 8.799 9.181 9.616 10.085 10.54 11.0 11.527 12.12 12.721 13.412 14.127 14.925 15.762 16.676 17.715 18.732 19.189 19.225 19.025 18.679 18.315 17.974 17.62 17.278 16.898 16.522 16.163 15.817 15.49 15.179 14.86 14.507 14.209 13.959 13.672 13.337 13.061 12.787 12.512 12.305 12.076 11.815 11.551 11.301 11.134 10.948 10.645 10.438 10.222 10.108 9.872 9.633 9.395 9.275 9.034 8.812 8.644 8.464 8.09 7.879 7.636 7.374 7.069 6.627 6.062 4.52 -8 ,28239 ,KEBNE ,17018276,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:26:58 CET,0.0 0.702 1.121 1.422 1.699 1.959 2.172 2.38 2.783 2.959 3.133 3.358 3.62 3.759 4.034 4.292 4.524 4.632 4.84 5.047 5.346 5.536 5.714 5.983 6.246 6.493 6.735 6.974 7.281 7.588 7.896 8.257 8.587 8.881 9.223 9.639 10.032 10.435 10.872 11.32 11.784 12.312 12.899 13.505 14.173 14.865 15.661 16.536 17.522 18.532 19.49 19.984 20.029 19.871 19.618 19.287 18.947 18.613 18.272 17.879 17.523 17.206 16.878 16.538 16.229 15.924 15.592 15.287 15.006 14.721 14.446 14.213 13.956 13.694 13.499 13.294 13.08 12.848 12.596 12.422 12.239 11.94 11.723 11.512 11.41 11.196 10.94 10.674 10.536 10.286 10.076 9.899 9.71 9.326 9.118 8.886 8.631 8.358 8.009 7.549 5.528 -9 ,10347 ,KEBNE ,17018277,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:28:16 CET,0.0 0.469 0.772 1.026 1.252 1.448 1.638 1.812 2.131 2.287 2.437 2.597 2.839 2.961 3.194 3.419 3.652 3.767 3.973 4.178 4.484 4.678 4.87 5.148 5.401 5.641 5.89 6.143 6.464 6.756 7.045 7.4 7.73 8.053 8.405 8.769 9.094 9.467 9.892 10.312 10.75 11.235 11.789 12.352 13.012 13.706 14.479 15.363 16.343 17.374 18.309 18.75 18.799 18.623 18.349 18.035 17.693 17.349 17.011 16.615 16.219 15.842 15.489 15.165 14.85 14.534 14.176 13.867 13.603 13.314 13.019 12.762 12.466 12.159 11.945 11.71 11.461 11.208 10.923 10.726 10.516 10.195 9.988 9.775 9.664 9.433 9.18 8.912 8.772 8.521 8.304 8.14 7.969 7.589 7.386 7.143 6.852 6.535 6.196 5.718 4.158 -10 ,10600 ,KEBNE ,17018278,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:28:39 CET,0.0 0.439 0.727 0.985 1.218 1.417 1.613 1.807 2.156 2.315 2.46 2.619 2.858 2.988 3.254 3.504 3.726 3.829 4.029 4.221 4.491 4.672 4.853 5.122 5.4 5.672 5.932 6.186 6.494 6.77 7.038 7.376 7.695 8.002 8.358 8.749 9.149 9.585 10.047 10.539 11.016 11.519 12.099 12.687 13.337 14.021 14.843 15.715 16.664 17.728 18.706 19.184 19.179 18.975 18.737 18.422 18.043 17.679 17.345 16.983 16.622 16.282 15.973 15.668 15.375 15.077 14.74 14.434 14.168 13.895 13.608 13.344 13.05 12.75 12.526 12.295 12.063 11.835 11.586 11.409 11.214 10.891 10.676 10.474 10.367 10.141 9.904 9.643 9.504 9.258 9.067 8.913 8.742 8.359 8.153 7.912 7.613 7.276 6.909 6.419 4.722 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 8344dab4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24070 ,KEBNE ,17018280,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:27:08 CET,0.0 0.699 1.085 1.379 1.605 1.824 2.031 2.227 2.556 2.696 2.837 2.986 3.223 3.347 3.583 3.806 4.031 4.143 4.35 4.552 4.845 5.018 5.192 5.442 5.675 5.916 6.144 6.36 6.64 6.908 7.167 7.477 7.77 8.049 8.373 8.738 9.081 9.443 9.859 10.289 10.721 11.226 11.772 12.277 12.852 13.497 14.222 14.98 15.814 16.659 17.413 17.778 17.768 17.586 17.327 16.999 16.646 16.33 16.062 15.728 15.373 15.054 14.776 14.492 14.193 13.928 13.667 13.433 13.203 12.944 12.694 12.48 12.239 11.998 11.807 11.616 11.416 11.201 10.98 10.81 10.631 10.384 10.22 10.046 9.954 9.755 9.534 9.283 9.151 8.912 8.731 8.583 8.419 8.078 7.902 7.701 7.452 7.173 6.858 6.5 5.802 -2 ,30518 ,KEBNE ,17018281,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:27:13 CET,0.0 0.656 0.992 1.238 1.446 1.641 1.845 2.036 2.384 2.547 2.699 2.872 3.123 3.253 3.5 3.735 3.961 4.074 4.286 4.482 4.782 4.988 5.186 5.472 5.745 6.013 6.275 6.514 6.816 7.11 7.393 7.723 8.029 8.34 8.712 9.11 9.499 9.937 10.365 10.786 11.261 11.826 12.464 13.029 13.654 14.356 15.152 16.025 16.918 17.862 18.781 19.158 19.13 18.886 18.559 18.21 17.87 17.522 17.214 16.874 16.552 16.258 15.971 15.711 15.442 15.185 14.923 14.669 14.432 14.188 13.945 13.751 13.542 13.301 13.109 12.92 12.727 12.519 12.279 12.097 11.933 11.681 11.476 11.274 11.175 10.962 10.737 10.496 10.363 10.12 9.921 9.762 9.6 9.249 9.055 8.851 8.627 8.353 8.02 7.633 6.683 -3 ,9084 ,KEBNE ,17018282,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:28:50 CET,0.0 0.779 1.173 1.471 1.719 1.96 2.195 2.42 2.818 2.993 3.164 3.375 3.647 3.808 4.089 4.342 4.601 4.729 4.981 5.235 5.594 5.804 5.998 6.271 6.527 6.781 7.031 7.283 7.607 7.924 8.217 8.557 8.894 9.194 9.533 9.936 10.32 10.751 11.217 11.691 12.179 12.722 13.341 13.928 14.552 15.238 16.02 16.84 17.712 18.645 19.548 19.881 19.818 19.595 19.271 18.909 18.563 18.218 17.871 17.479 17.143 16.842 16.537 16.215 15.894 15.609 15.287 14.98 14.713 14.429 14.122 13.881 13.668 13.466 13.298 13.104 12.907 12.687 12.446 12.281 12.099 11.812 11.626 11.451 11.359 11.149 10.923 10.688 10.57 10.342 10.18 10.035 9.885 9.558 9.362 9.16 8.937 8.668 8.334 7.878 6.825 -4 ,16438 ,KEBNE ,17018283,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:27:01 CET,0.0 0.808 1.168 1.436 1.659 1.867 2.06 2.241 2.558 2.705 2.849 3.003 3.242 3.36 3.595 3.813 4.02 4.128 4.33 4.544 4.883 5.094 5.302 5.601 5.909 6.241 6.532 6.772 7.075 7.364 7.642 7.985 8.312 8.614 8.97 9.388 9.772 10.163 10.582 11.033 11.496 11.996 12.578 13.146 13.768 14.442 15.179 15.99 16.909 17.862 18.756 19.222 19.243 18.998 18.643 18.303 17.969 17.597 17.277 16.945 16.596 16.26 15.947 15.647 15.334 15.04 14.734 14.448 14.178 13.882 13.574 13.316 13.063 12.819 12.629 12.42 12.182 11.913 11.622 11.429 11.22 10.893 10.687 10.464 10.35 10.112 9.859 9.591 9.446 9.201 8.994 8.823 8.637 8.225 8.002 7.751 7.462 7.173 6.842 6.401 5.274 -5 ,476 ,KEBNE ,17018284,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:26:59 CET,0.0 0.648 0.952 1.221 1.471 1.684 1.872 2.044 2.353 2.499 2.637 2.786 3.03 3.156 3.398 3.631 3.856 3.963 4.169 4.356 4.627 4.806 4.974 5.221 5.472 5.707 5.933 6.155 6.444 6.719 6.979 7.301 7.616 7.916 8.245 8.591 8.923 9.316 9.747 10.189 10.634 11.122 11.69 12.272 12.967 13.707 14.481 15.298 16.223 17.163 18.034 18.409 18.378 18.192 17.894 17.532 17.17 16.833 16.53 16.157 15.793 15.499 15.204 14.892 14.556 14.23 13.903 13.604 13.37 13.122 12.825 12.571 12.312 12.037 11.808 11.567 11.32 11.067 10.8 10.622 10.448 10.159 9.94 9.717 9.609 9.373 9.107 8.82 8.67 8.416 8.189 8.016 7.825 7.435 7.226 6.97 6.703 6.409 6.072 5.702 4.879 -6 ,13892 ,KEBNE ,17018285,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:27:13 CET,0.0 0.975 1.358 1.662 1.916 2.118 2.296 2.465 2.773 2.919 3.068 3.234 3.485 3.612 3.858 4.096 4.321 4.432 4.634 4.822 5.12 5.314 5.501 5.771 6.022 6.262 6.496 6.71 6.978 7.241 7.509 7.817 8.089 8.352 8.657 9.007 9.33 9.692 10.109 10.555 11.005 11.464 12.019 12.597 13.219 13.864 14.552 15.304 16.1 16.912 17.767 18.184 18.149 17.932 17.655 17.336 16.979 16.627 16.304 15.977 15.704 15.414 15.134 14.885 14.622 14.365 14.097 13.844 13.622 13.396 13.138 12.915 12.691 12.459 12.275 12.08 11.872 11.659 11.425 11.254 11.082 10.812 10.634 10.453 10.35 10.15 9.946 9.712 9.586 9.357 9.185 9.02 8.854 8.53 8.35 8.149 7.927 7.697 7.394 6.991 6.111 -7 ,17163 ,KEBNE ,17018286,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:28:39 CET,0.0 0.864 1.249 1.532 1.774 1.987 2.202 2.399 2.74 2.908 3.06 3.208 3.443 3.576 3.821 4.037 4.245 4.347 4.565 4.777 5.066 5.253 5.432 5.683 5.928 6.165 6.402 6.622 6.874 7.126 7.385 7.689 7.969 8.248 8.586 8.967 9.315 9.653 10.0 10.371 10.786 11.271 11.803 12.347 12.977 13.631 14.347 15.117 15.956 16.855 17.755 18.145 18.089 17.898 17.628 17.307 16.984 16.646 16.316 15.959 15.644 15.37 15.079 14.782 14.498 14.225 13.961 13.73 13.518 13.293 13.043 12.828 12.618 12.4 12.225 12.026 11.807 11.576 11.335 11.178 11.023 10.759 10.567 10.382 10.287 10.081 9.867 9.622 9.488 9.252 9.072 8.92 8.769 8.426 8.224 8.018 7.795 7.545 7.243 6.813 5.88 -8 ,3927 ,KEBNE ,17018287,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:26:59 CET,0.0 1.114 1.497 1.775 1.998 2.199 2.384 2.558 2.875 3.026 3.166 3.324 3.575 3.71 3.959 4.19 4.406 4.511 4.704 4.883 5.155 5.338 5.51 5.749 5.988 6.218 6.445 6.671 6.96 7.237 7.494 7.817 8.14 8.426 8.746 9.121 9.483 9.867 10.314 10.815 11.292 11.804 12.381 12.97 13.671 14.408 15.174 15.964 16.854 17.801 18.73 19.183 19.198 19.018 18.702 18.314 17.908 17.493 17.135 16.767 16.413 16.075 15.744 15.437 15.146 14.867 14.557 14.262 14.014 13.756 13.475 13.233 12.97 12.684 12.462 12.232 11.98 11.703 11.404 11.203 11.008 10.684 10.474 10.285 10.182 9.965 9.74 9.526 9.415 9.185 9.01 8.867 8.726 8.391 8.172 7.937 7.708 7.446 7.147 6.792 6.107 -9 ,22737 ,KEBNE ,17018288,Tue Dec 21 23:07:26 CET,Wed Dec 22 00:28:51 CET,0.0 0.851 1.244 1.553 1.836 2.098 2.343 2.571 2.964 3.14 3.31 3.533 3.803 3.958 4.251 4.526 4.799 4.933 5.179 5.41 5.737 5.93 6.108 6.377 6.644 6.893 7.132 7.372 7.696 8.0 8.302 8.663 8.981 9.287 9.655 10.079 10.498 10.948 11.405 11.879 12.366 12.887 13.479 14.073 14.745 15.453 16.233 17.092 18.022 19.018 19.952 20.333 20.267 20.061 19.796 19.487 19.18 18.872 18.557 18.197 17.853 17.521 17.221 16.925 16.625 16.372 16.122 15.879 15.649 15.403 15.133 14.901 14.643 14.354 14.146 13.937 13.712 13.453 13.187 13.027 12.864 12.616 12.445 12.259 12.162 11.974 11.779 11.545 11.408 11.168 11.01 10.877 10.729 10.427 10.26 10.06 9.859 9.642 9.359 8.971 7.959 -10 ,6065 ,KEBNE ,17018289,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:28:38 CET,0.0 0.709 1.103 1.454 1.748 1.991 2.203 2.406 2.787 2.96 3.124 3.341 3.615 3.767 4.047 4.306 4.548 4.672 4.921 5.156 5.489 5.693 5.881 6.166 6.456 6.716 6.959 7.202 7.529 7.86 8.166 8.522 8.872 9.178 9.52 9.928 10.319 10.745 11.231 11.744 12.248 12.787 13.371 13.939 14.588 15.257 15.973 16.779 17.671 18.579 19.431 19.798 19.748 19.495 19.214 18.917 18.552 18.139 17.785 17.462 17.147 16.812 16.481 16.178 15.89 15.6 15.28 14.993 14.735 14.455 14.144 13.864 13.572 13.282 13.053 12.823 12.594 12.335 12.063 11.885 11.703 11.427 11.232 11.015 10.893 10.641 10.377 10.102 9.958 9.708 9.507 9.362 9.198 8.796 8.585 8.354 8.086 7.787 7.453 7.05 6.372 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 9a5ed093..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14264 ,KEBNE ,17018290,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:27:52 CET,0.0 0.482 0.752 0.986 1.204 1.407 1.588 1.749 2.054 2.203 2.344 2.503 2.729 2.841 3.064 3.276 3.477 3.58 3.776 3.965 4.249 4.436 4.618 4.869 5.099 5.325 5.547 5.749 5.998 6.237 6.476 6.775 7.057 7.32 7.615 7.939 8.262 8.645 9.058 9.463 9.887 10.383 10.949 11.458 12.009 12.614 13.324 14.108 14.944 15.79 16.497 16.76 16.68 16.438 16.091 15.671 15.269 14.883 14.515 14.119 13.758 13.419 13.074 12.729 12.402 12.108 11.804 11.528 11.291 11.045 10.781 10.535 10.27 10.005 9.795 9.584 9.364 9.118 8.857 8.678 8.488 8.186 7.991 7.789 7.682 7.466 7.234 6.981 6.854 6.631 6.443 6.286 6.118 5.756 5.553 5.345 5.124 4.875 4.572 4.138 3.326 -2 ,18258 ,KEBNE ,17018291,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:26:40 CET,0.0 0.463 0.778 1.05 1.292 1.512 1.701 1.858 2.155 2.298 2.436 2.588 2.81 2.928 3.163 3.39 3.597 3.699 3.909 4.114 4.403 4.592 4.766 5.014 5.259 5.489 5.699 5.899 6.165 6.411 6.64 6.934 7.237 7.508 7.795 8.128 8.465 8.852 9.267 9.699 10.15 10.631 11.165 11.677 12.248 12.884 13.577 14.292 15.048 15.8 16.473 16.726 16.572 16.235 15.862 15.507 15.109 14.704 14.36 13.951 13.57 13.222 12.879 12.533 12.23 11.989 11.728 11.482 11.267 11.034 10.796 10.6 10.372 10.129 9.948 9.767 9.576 9.361 9.141 8.991 8.837 8.603 8.439 8.257 8.157 7.952 7.741 7.51 7.396 7.174 7.02 6.886 6.736 6.395 6.214 6.019 5.793 5.566 5.269 4.901 3.893 -3 ,3108 ,KEBNE ,17018292,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:26:30 CET,0.0 0.309 0.586 0.8 0.987 1.182 1.369 1.541 1.852 1.988 2.126 2.286 2.504 2.621 2.836 3.055 3.275 3.384 3.588 3.784 4.071 4.25 4.423 4.678 4.93 5.181 5.44 5.683 5.972 6.257 6.541 6.883 7.204 7.494 7.811 8.176 8.533 8.909 9.281 9.678 10.1 10.562 11.09 11.606 12.223 12.888 13.601 14.325 15.103 15.945 16.702 16.951 16.789 16.443 16.016 15.582 15.185 14.803 14.408 13.936 13.56 13.25 12.926 12.593 12.272 11.983 11.683 11.42 11.176 10.911 10.635 10.377 10.121 9.857 9.643 9.438 9.213 8.971 8.719 8.539 8.361 8.098 7.914 7.714 7.608 7.387 7.145 6.894 6.769 6.534 6.321 6.165 6.01 5.659 5.468 5.255 5.031 4.798 4.493 4.063 3.235 -4 ,26409 ,KEBNE ,17018293,Tue Dec 21 23:07:22 CET,Wed Dec 22 00:26:32 CET,0.0 0.699 1.044 1.309 1.511 1.699 1.879 2.046 2.339 2.485 2.635 2.808 3.028 3.145 3.405 3.681 3.952 4.077 4.306 4.505 4.766 4.934 5.107 5.359 5.599 5.823 6.027 6.224 6.473 6.712 6.949 7.229 7.505 7.782 8.102 8.434 8.722 9.054 9.44 9.875 10.326 10.805 11.352 11.885 12.457 13.098 13.838 14.573 15.339 16.129 16.813 17.049 16.945 16.682 16.349 15.972 15.6 15.219 14.844 14.476 14.164 13.858 13.524 13.195 12.89 12.593 12.295 12.023 11.781 11.544 11.293 11.069 10.829 10.565 10.358 10.135 9.887 9.625 9.362 9.183 8.99 8.677 8.46 8.24 8.122 7.883 7.649 7.407 7.278 7.039 6.809 6.626 6.433 6.028 5.815 5.595 5.373 5.11 4.792 4.443 3.831 -5 ,22870 ,KEBNE ,17018294,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:27:56 CET,0.0 0.353 0.568 0.763 0.938 1.098 1.238 1.371 1.623 1.74 1.85 1.945 2.149 2.252 2.453 2.654 2.854 2.946 3.119 3.287 3.515 3.659 3.802 4.012 4.226 4.438 4.636 4.823 5.095 5.389 5.658 5.954 6.241 6.538 6.892 7.273 7.636 8.043 8.443 8.862 9.289 9.725 10.224 10.725 11.339 11.974 12.613 13.305 14.071 14.875 15.56 15.725 15.532 15.228 14.882 14.506 14.119 13.721 13.359 13.001 12.665 12.32 11.968 11.64 11.352 11.067 10.753 10.482 10.239 9.988 9.724 9.479 9.217 8.955 8.752 8.543 8.308 8.041 7.762 7.573 7.377 7.073 6.855 6.609 6.481 6.239 6.0 5.718 5.557 5.313 5.135 4.962 4.766 4.374 4.185 3.964 3.685 3.402 3.122 2.763 1.984 -6 ,11708 ,KEBNE ,17018295,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:29:14 CET,0.0 0.409 0.688 0.924 1.125 1.306 1.49 1.668 1.976 2.127 2.29 2.523 2.77 2.906 3.173 3.429 3.663 3.772 3.98 4.179 4.463 4.651 4.846 5.115 5.367 5.619 5.859 6.096 6.409 6.704 6.978 7.281 7.559 7.84 8.175 8.547 8.911 9.28 9.635 10.024 10.454 10.936 11.479 11.988 12.585 13.224 13.923 14.685 15.455 16.198 16.848 17.025 16.856 16.581 16.227 15.821 15.416 15.019 14.652 14.267 13.915 13.582 13.272 12.979 12.681 12.381 12.05 11.768 11.536 11.293 11.034 10.813 10.575 10.318 10.112 9.893 9.66 9.423 9.173 8.987 8.804 8.551 8.375 8.183 8.09 7.893 7.674 7.439 7.317 7.096 6.951 6.819 6.687 6.383 6.204 6.017 5.812 5.597 5.353 5.031 4.249 -7 ,25511 ,KEBNE ,17018296,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:29:19 CET,0.0 0.456 0.669 0.855 1.006 1.139 1.266 1.393 1.659 1.783 1.9 2.023 2.238 2.344 2.549 2.765 2.997 3.104 3.289 3.463 3.72 3.901 4.092 4.354 4.589 4.825 5.039 5.247 5.517 5.78 6.031 6.307 6.573 6.829 7.132 7.491 7.848 8.201 8.544 8.916 9.309 9.763 10.273 10.773 11.339 11.939 12.63 13.318 13.999 14.693 15.395 15.746 15.722 15.453 15.082 14.759 14.461 14.151 13.848 13.517 13.196 12.896 12.605 12.308 12.029 11.789 11.507 11.242 11.031 10.822 10.596 10.382 10.161 9.926 9.737 9.554 9.377 9.195 8.989 8.847 8.705 8.474 8.31 8.133 8.042 7.857 7.665 7.449 7.336 7.118 6.955 6.815 6.666 6.348 6.18 6.002 5.794 5.536 5.208 4.869 4.272 -8 ,21456 ,KEBNE ,17018297,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:28:57 CET,0.0 0.477 0.699 0.894 1.074 1.22 1.35 1.471 1.71 1.825 1.93 2.026 2.23 2.33 2.523 2.703 2.879 2.965 3.134 3.311 3.559 3.71 3.86 4.071 4.292 4.517 4.714 4.896 5.138 5.372 5.588 5.851 6.116 6.377 6.67 6.98 7.293 7.635 7.989 8.374 8.8 9.304 9.867 10.387 10.941 11.521 12.205 12.94 13.679 14.46 15.19 15.454 15.337 15.006 14.572 14.148 13.759 13.347 12.969 12.602 12.28 11.991 11.667 11.313 10.983 10.691 10.39 10.096 9.828 9.569 9.313 9.092 8.84 8.531 8.276 8.014 7.731 7.454 7.195 7.026 6.846 6.554 6.346 6.131 6.025 5.809 5.581 5.324 5.188 4.954 4.742 4.574 4.402 4.024 3.817 3.613 3.396 3.126 2.77 2.368 1.381 -9 ,25765 ,KEBNE ,17018298,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:29:16 CET,0.0 0.4 0.663 0.889 1.092 1.285 1.463 1.628 1.918 2.055 2.204 2.388 2.614 2.733 2.951 3.166 3.383 3.485 3.684 3.876 4.144 4.321 4.499 4.745 4.981 5.216 5.438 5.649 5.915 6.165 6.393 6.664 6.937 7.204 7.515 7.868 8.191 8.521 8.885 9.277 9.656 10.093 10.614 11.116 11.664 12.236 12.892 13.609 14.366 15.106 15.741 15.982 15.831 15.585 15.3 14.943 14.583 14.197 13.83 13.422 13.048 12.734 12.404 12.078 11.781 11.497 11.184 10.907 10.678 10.428 10.165 9.93 9.67 9.391 9.176 8.965 8.762 8.545 8.285 8.104 7.924 7.644 7.449 7.253 7.149 6.934 6.722 6.491 6.357 6.116 5.912 5.753 5.594 5.252 5.052 4.834 4.608 4.346 4.024 3.607 2.487 -10 ,9352 ,KEBNE ,17018299,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:29:13 CET,0.0 0.469 0.745 0.985 1.212 1.416 1.599 1.767 2.081 2.235 2.378 2.527 2.752 2.873 3.099 3.319 3.526 3.626 3.824 4.015 4.298 4.474 4.636 4.87 5.089 5.31 5.542 5.762 6.042 6.306 6.551 6.842 7.124 7.388 7.696 8.035 8.335 8.687 9.055 9.443 9.863 10.307 10.803 11.307 11.875 12.469 13.133 13.835 14.556 15.275 15.923 16.093 15.937 15.665 15.305 14.858 14.443 14.052 13.66 13.237 12.838 12.46 12.13 11.827 11.515 11.231 10.921 10.624 10.365 10.099 9.815 9.563 9.293 9.01 8.817 8.631 8.43 8.242 8.042 7.886 7.724 7.461 7.273 7.088 6.991 6.773 6.546 6.317 6.199 5.978 5.827 5.697 5.54 5.189 5.011 4.83 4.64 4.415 4.16 3.832 3.17 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index da885058..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13714 ,KEBNE ,17018300,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:29:46 CET,0.0 0.509 0.782 0.989 1.178 1.371 1.543 1.694 1.974 2.098 2.227 2.384 2.613 2.729 2.948 3.144 3.32 3.411 3.592 3.771 4.048 4.219 4.383 4.619 4.834 5.022 5.198 5.38 5.619 5.838 6.028 6.269 6.521 6.762 7.03 7.319 7.605 7.942 8.312 8.687 9.081 9.517 9.977 10.4 10.875 11.411 11.987 12.558 13.136 13.624 13.93 13.751 13.276 12.735 12.182 11.647 11.132 10.607 10.155 9.72 9.312 8.889 8.457 8.059 7.708 7.367 7.009 6.71 6.452 6.193 5.907 5.661 5.41 5.128 4.902 4.669 4.432 4.181 3.906 3.718 3.534 3.246 3.051 2.843 2.723 2.478 2.229 1.968 1.833 1.599 1.396 1.214 1.03 0.677 0.495 0.303 0.074 -0.183 -0.494 -0.916 -1.764 -2 ,18084 ,KEBNE ,17018301,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:29:50 CET,0.0 0.504 0.816 1.119 1.387 1.626 1.857 2.073 2.455 2.626 2.79 2.988 3.216 3.346 3.619 3.876 4.113 4.227 4.443 4.642 4.916 5.092 5.274 5.565 5.836 6.074 6.299 6.503 6.782 7.072 7.34 7.65 7.934 8.214 8.542 8.888 9.202 9.543 9.911 10.297 10.708 11.164 11.674 12.151 12.622 13.112 13.682 14.254 14.831 15.354 15.665 15.525 15.084 14.458 13.855 13.325 12.815 12.301 11.793 11.289 10.901 10.561 10.227 9.892 9.555 9.235 8.923 8.656 8.406 8.132 7.84 7.602 7.354 7.109 6.933 6.733 6.515 6.291 6.037 5.857 5.668 5.378 5.186 4.969 4.858 4.649 4.422 4.159 4.023 3.785 3.584 3.425 3.26 2.903 2.714 2.512 2.267 2.014 1.698 1.282 0.322 -3 ,31983 ,KEBNE ,17018302,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:29:37 CET,0.0 0.806 1.206 1.488 1.725 1.938 2.131 2.313 2.651 2.807 2.958 3.141 3.38 3.512 3.763 4.019 4.259 4.368 4.583 4.793 5.103 5.305 5.495 5.759 6.001 6.241 6.481 6.709 6.982 7.223 7.453 7.756 8.05 8.3 8.6 8.95 9.271 9.631 9.98 10.337 10.725 11.166 11.662 12.102 12.603 13.163 13.774 14.386 14.976 15.501 15.804 15.648 15.19 14.639 14.083 13.51 12.972 12.463 12.027 11.585 11.196 10.835 10.459 10.098 9.734 9.367 8.999 8.681 8.379 8.045 7.709 7.442 7.154 6.86 6.647 6.418 6.156 5.88 5.595 5.399 5.201 4.89 4.676 4.443 4.322 4.063 3.779 3.487 3.341 3.083 2.843 2.663 2.464 2.04 1.809 1.563 1.291 0.984 0.642 0.249 -0.559 -4 ,14518 ,KEBNE ,17018303,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:29:49 CET,0.0 0.564 0.872 1.129 1.352 1.537 1.697 1.854 2.15 2.288 2.418 2.577 2.813 2.927 3.146 3.351 3.546 3.643 3.827 4.003 4.248 4.411 4.581 4.83 5.057 5.261 5.454 5.641 5.871 6.089 6.304 6.572 6.821 7.037 7.305 7.648 7.972 8.297 8.631 8.98 9.323 9.7 10.148 10.584 11.061 11.561 12.114 12.651 13.148 13.601 13.882 13.717 13.291 12.806 12.349 11.843 11.34 10.906 10.505 10.045 9.616 9.224 8.855 8.505 8.184 7.868 7.502 7.168 6.893 6.617 6.344 6.117 5.856 5.583 5.371 5.145 4.915 4.681 4.427 4.247 4.059 3.781 3.603 3.416 3.313 3.091 2.84 2.578 2.452 2.222 2.034 1.874 1.72 1.362 1.169 0.962 0.717 0.46 0.18 -0.204 -0.978 -5 ,15513 ,KEBNE ,17018304,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:28:38 CET,0.0 0.703 1.052 1.348 1.628 1.878 2.102 2.306 2.67 2.834 2.986 3.189 3.432 3.567 3.83 4.074 4.301 4.406 4.609 4.805 5.073 5.244 5.42 5.666 5.894 6.116 6.337 6.562 6.843 7.115 7.382 7.709 8.015 8.283 8.579 8.932 9.278 9.634 9.99 10.337 10.73 11.167 11.632 12.092 12.609 13.172 13.747 14.322 14.893 15.346 15.617 15.497 15.076 14.589 14.086 13.575 13.11 12.659 12.234 11.753 11.317 10.921 10.529 10.156 9.786 9.41 9.035 8.704 8.397 8.071 7.714 7.41 7.101 6.769 6.502 6.23 5.958 5.679 5.388 5.202 4.996 4.639 4.393 4.136 4.012 3.759 3.482 3.181 3.024 2.772 2.534 2.347 2.16 1.75 1.514 1.269 1.03 0.763 0.403 -0.064 -1.094 -6 ,12002 ,KEBNE ,17018305,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:28:18 CET,0.0 0.611 0.971 1.24 1.479 1.71 1.924 2.111 2.477 2.646 2.804 3.003 3.251 3.397 3.674 3.935 4.172 4.283 4.495 4.692 4.988 5.181 5.371 5.653 5.901 6.143 6.379 6.594 6.872 7.148 7.42 7.739 8.041 8.328 8.631 8.939 9.259 9.642 10.042 10.442 10.82 11.224 11.687 12.149 12.641 13.135 13.684 14.251 14.829 15.378 15.694 15.479 15.039 14.591 14.124 13.57 13.04 12.545 12.075 11.598 11.214 10.839 10.466 10.121 9.757 9.409 9.071 8.754 8.45 8.144 7.836 7.558 7.262 6.974 6.757 6.53 6.287 6.043 5.783 5.603 5.425 5.131 4.925 4.708 4.597 4.369 4.12 3.869 3.743 3.5 3.311 3.163 3.001 2.65 2.462 2.27 2.056 1.796 1.498 1.117 0.451 -7 ,23604 ,KEBNE ,17018306,Tue Dec 21 23:08:24 CET,Wed Dec 22 00:29:38 CET,0.0 0.724 1.074 1.344 1.617 1.854 2.063 2.262 2.604 2.755 2.899 3.059 3.286 3.404 3.637 3.875 4.112 4.224 4.442 4.646 4.907 5.06 5.213 5.456 5.698 5.941 6.18 6.406 6.697 6.96 7.208 7.515 7.803 8.067 8.377 8.729 9.065 9.423 9.786 10.17 10.574 11.002 11.478 11.944 12.469 13.039 13.624 14.175 14.759 15.32 15.617 15.401 14.959 14.464 13.953 13.415 12.868 12.323 11.855 11.395 10.968 10.592 10.229 9.863 9.51 9.181 8.859 8.565 8.288 8.004 7.708 7.439 7.162 6.904 6.712 6.514 6.289 6.04 5.784 5.608 5.434 5.179 5.006 4.82 4.719 4.503 4.262 4.009 3.881 3.639 3.446 3.284 3.114 2.75 2.559 2.369 2.158 1.907 1.618 1.224 0.292 -8 ,6567 ,KEBNE ,17018307,Tue Dec 21 23:09:27 CET,Wed Dec 22 00:29:20 CET,0.0 0.677 1.013 1.258 1.471 1.677 1.848 2.007 2.305 2.45 2.591 2.744 2.97 3.082 3.296 3.499 3.689 3.783 3.975 4.162 4.41 4.567 4.727 4.96 5.198 5.439 5.663 5.888 6.188 6.466 6.708 6.983 7.271 7.552 7.862 8.214 8.557 8.93 9.3 9.674 10.056 10.475 10.971 11.451 11.972 12.492 13.061 13.627 14.2 14.731 15.065 14.923 14.517 13.992 13.414 12.839 12.291 11.77 11.316 10.828 10.366 9.965 9.604 9.248 8.877 8.525 8.175 7.867 7.589 7.293 6.987 6.725 6.444 6.149 5.915 5.668 5.401 5.122 4.845 4.659 4.454 4.106 3.879 3.653 3.525 3.255 2.975 2.688 2.532 2.264 2.027 1.853 1.657 1.217 0.991 0.781 0.558 0.289 -0.057 -0.485 -1.352 -9 ,8477 ,KEBNE ,17018308,Tue Dec 21 23:09:26 CET,Wed Dec 22 00:29:16 CET,0.0 0.574 0.862 1.115 1.353 1.563 1.745 1.919 2.215 2.339 2.46 2.589 2.798 2.903 3.117 3.328 3.533 3.626 3.806 3.982 4.229 4.406 4.585 4.84 5.089 5.334 5.577 5.813 6.107 6.391 6.667 6.982 7.281 7.566 7.883 8.241 8.575 8.914 9.264 9.624 10.005 10.433 10.898 11.336 11.844 12.377 12.942 13.538 14.15 14.653 14.917 14.768 14.322 13.757 13.181 12.666 12.212 11.733 11.257 10.734 10.245 9.782 9.334 8.912 8.536 8.217 7.858 7.511 7.222 6.925 6.6 6.319 6.03 5.73 5.497 5.256 5.001 4.716 4.411 4.213 4.006 3.675 3.459 3.226 3.102 2.85 2.58 2.265 2.102 1.842 1.592 1.396 1.196 0.787 0.553 0.311 0.036 -0.28 -0.622 -1.057 -1.972 -10 ,932 ,KEBNE ,17018309,Tue Dec 21 23:09:26 CET,Wed Dec 22 00:29:25 CET,0.0 0.947 1.36 1.631 1.853 2.061 2.252 2.412 2.699 2.831 2.96 3.102 3.322 3.435 3.653 3.851 4.037 4.129 4.317 4.503 4.786 4.955 5.104 5.324 5.545 5.749 5.944 6.151 6.429 6.698 6.956 7.267 7.563 7.851 8.185 8.534 8.862 9.236 9.631 10.031 10.437 10.883 11.412 11.918 12.451 13.026 13.631 14.222 14.855 15.448 15.821 15.747 15.366 14.839 14.281 13.734 13.222 12.711 12.217 11.707 11.264 10.877 10.506 10.135 9.772 9.421 9.024 8.655 8.355 8.07 7.763 7.485 7.189 6.887 6.657 6.406 6.136 5.873 5.625 5.462 5.298 5.046 4.847 4.628 4.523 4.307 4.074 3.816 3.685 3.453 3.277 3.127 2.972 2.645 2.464 2.264 2.037 1.796 1.498 1.105 0.476 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt deleted file mode 100644 index 51b532a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13416 ,KEBNE ,17018310,Tue Dec 21 23:09:26 CET,Wed Dec 22 00:30:45 CET,0.0 0.652 1.087 1.435 1.707 1.953 2.168 2.36 2.717 2.886 3.055 3.268 3.518 3.655 3.921 4.171 4.394 4.498 4.696 4.905 5.217 5.41 5.601 5.861 6.102 6.339 6.568 6.794 7.086 7.362 7.621 7.917 8.196 8.464 8.78 9.153 9.53 9.925 10.31 10.676 11.038 11.452 11.927 12.376 12.84 13.366 13.949 14.525 15.12 15.691 16.043 15.919 15.526 15.027 14.495 13.97 13.452 12.95 12.493 12.01 11.594 11.226 10.884 10.539 10.215 9.924 9.592 9.275 9.008 8.732 8.437 8.188 7.926 7.652 7.438 7.22 6.985 6.709 6.41 6.23 6.067 5.804 5.622 5.431 5.329 5.12 4.901 4.662 4.534 4.288 4.11 3.976 3.826 3.457 3.258 3.049 2.811 2.551 2.238 1.846 1.213 -2 ,3684 ,KEBNE ,17018311,Tue Dec 21 23:10:29 CET,Wed Dec 22 00:30:28 CET,0.0 0.759 1.04 1.263 1.469 1.665 1.853 2.034 2.341 2.475 2.606 2.76 2.98 3.092 3.313 3.512 3.696 3.793 4.015 4.234 4.532 4.726 4.917 5.188 5.44 5.676 5.898 6.105 6.379 6.658 6.927 7.255 7.553 7.812 8.118 8.492 8.848 9.193 9.563 9.974 10.382 10.847 11.373 11.85 12.36 12.931 13.527 14.112 14.705 15.245 15.618 15.461 15.069 14.584 14.056 13.541 13.046 12.58 12.149 11.652 11.194 10.777 10.368 9.983 9.641 9.326 8.973 8.653 8.367 8.054 7.733 7.473 7.208 6.942 6.717 6.472 6.209 5.926 5.641 5.433 5.224 4.92 4.707 4.484 4.371 4.149 3.905 3.631 3.481 3.222 2.997 2.824 2.652 2.273 2.044 1.801 1.556 1.279 0.902 0.426 -0.491 -3 ,3276 ,KEBNE ,17018312,Tue Dec 21 23:10:29 CET,Wed Dec 22 00:31:47 CET,0.0 0.56 0.946 1.292 1.593 1.854 2.075 2.265 2.625 2.807 2.981 3.189 3.436 3.58 3.851 4.096 4.331 4.447 4.666 4.878 5.188 5.386 5.568 5.814 6.048 6.288 6.519 6.729 7.004 7.284 7.555 7.876 8.174 8.471 8.812 9.162 9.486 9.861 10.26 10.655 11.08 11.52 11.981 12.457 13.018 13.595 14.18 14.765 15.368 15.896 16.242 16.113 15.724 15.293 14.843 14.387 13.938 13.479 13.073 12.671 12.306 11.967 11.616 11.262 10.918 10.59 10.243 9.933 9.664 9.399 9.135 8.899 8.634 8.359 8.132 7.899 7.682 7.448 7.199 7.024 6.845 6.581 6.392 6.189 6.086 5.861 5.607 5.338 5.206 4.967 4.788 4.626 4.456 4.101 3.908 3.7 3.48 3.238 2.957 2.603 1.815 -4 ,7953 ,KEBNE ,17018313,Tue Dec 21 23:10:29 CET,Wed Dec 22 00:30:11 CET,0.0 0.465 0.734 0.957 1.174 1.385 1.562 1.722 2.015 2.145 2.281 2.468 2.713 2.838 3.056 3.249 3.443 3.549 3.764 3.948 4.202 4.382 4.553 4.79 5.008 5.213 5.406 5.583 5.813 6.064 6.321 6.611 6.882 7.145 7.456 7.792 8.095 8.435 8.797 9.173 9.57 9.996 10.467 10.933 11.492 12.088 12.708 13.357 14.043 14.627 14.936 14.775 14.369 13.866 13.346 12.846 12.323 11.817 11.355 10.88 10.486 10.108 9.728 9.364 9.017 8.687 8.358 8.052 7.758 7.469 7.169 6.904 6.625 6.326 6.085 5.826 5.555 5.297 5.029 4.831 4.635 4.336 4.104 3.855 3.735 3.482 3.205 2.907 2.748 2.484 2.249 2.075 1.898 1.508 1.279 1.03 0.768 0.488 0.152 -0.299 -1.233 -5 ,4937 ,KEBNE ,17018314,Tue Dec 21 23:10:28 CET,Wed Dec 22 00:30:17 CET,0.0 0.626 0.989 1.293 1.598 1.869 2.09 2.28 2.641 2.822 3.0 3.227 3.482 3.635 3.915 4.173 4.433 4.557 4.781 4.988 5.297 5.502 5.694 5.972 6.249 6.512 6.754 6.975 7.267 7.557 7.836 8.162 8.427 8.673 8.992 9.342 9.674 10.037 10.409 10.81 11.246 11.683 12.128 12.573 13.09 13.63 14.186 14.756 15.322 15.833 16.165 16.034 15.65 15.15 14.655 14.189 13.734 13.275 12.862 12.445 12.076 11.732 11.393 11.083 10.79 10.512 10.194 9.884 9.625 9.351 9.049 8.811 8.572 8.307 8.101 7.878 7.639 7.406 7.165 6.991 6.803 6.499 6.291 6.092 5.992 5.778 5.559 5.322 5.202 4.973 4.813 4.668 4.518 4.213 4.046 3.848 3.607 3.34 3.061 2.731 1.828 -6 ,10970 ,KEBNE ,17018315,Tue Dec 21 23:10:28 CET,Wed Dec 22 00:30:27 CET,0.0 0.732 1.09 1.383 1.642 1.861 2.073 2.29 2.677 2.849 3.013 3.219 3.475 3.63 3.927 4.194 4.421 4.532 4.756 4.971 5.281 5.475 5.652 5.91 6.172 6.426 6.684 6.922 7.214 7.495 7.747 8.03 8.312 8.595 8.911 9.242 9.571 9.93 10.296 10.69 11.089 11.525 12.018 12.476 12.969 13.491 14.035 14.578 15.166 15.693 16.01 15.9 15.508 14.986 14.458 13.968 13.493 13.027 12.591 12.132 11.773 11.449 11.109 10.775 10.446 10.144 9.827 9.556 9.308 9.015 8.707 8.444 8.16 7.883 7.679 7.47 7.249 7.013 6.762 6.593 6.422 6.137 5.935 5.726 5.62 5.39 5.148 4.913 4.794 4.559 4.357 4.196 4.026 3.644 3.454 3.264 3.062 2.827 2.548 2.174 1.361 -7 ,7261 ,KEBNE ,17018316,Tue Dec 21 23:11:31 CET,Wed Dec 22 00:32:51 CET,0.0 0.588 0.892 1.152 1.371 1.577 1.745 1.889 2.182 2.324 2.473 2.684 2.925 3.058 3.322 3.566 3.792 3.909 4.137 4.356 4.683 4.878 5.045 5.309 5.565 5.803 6.06 6.307 6.614 6.913 7.192 7.503 7.782 8.057 8.376 8.732 9.074 9.423 9.793 10.194 10.604 11.067 11.589 12.076 12.602 13.12 13.664 14.215 14.801 15.346 15.667 15.503 15.064 14.604 14.136 13.661 13.193 12.743 12.322 11.857 11.445 11.095 10.762 10.42 10.1 9.8 9.476 9.175 8.914 8.643 8.341 8.082 7.822 7.556 7.353 7.149 6.926 6.684 6.448 6.275 6.089 5.8 5.586 5.368 5.259 5.039 4.815 4.581 4.455 4.211 4.023 3.874 3.713 3.365 3.176 2.968 2.752 2.516 2.232 1.883 1.351 -8 ,27783 ,KEBNE ,17018317,Tue Dec 21 23:11:31 CET,Wed Dec 22 00:32:50 CET,0.0 0.365 0.624 0.885 1.12 1.319 1.502 1.662 1.95 2.099 2.242 2.399 2.62 2.734 2.956 3.171 3.38 3.478 3.668 3.863 4.153 4.331 4.488 4.711 4.937 5.159 5.398 5.638 5.924 6.194 6.435 6.726 7.005 7.243 7.51 7.821 8.129 8.475 8.871 9.292 9.691 10.126 10.646 11.126 11.631 12.177 12.784 13.387 13.976 14.491 14.807 14.664 14.302 13.835 13.297 12.744 12.21 11.738 11.33 10.875 10.454 10.057 9.662 9.29 8.937 8.595 8.224 7.882 7.584 7.274 6.94 6.689 6.452 6.201 6.001 5.788 5.571 5.34 5.088 4.918 4.744 4.464 4.264 4.054 3.952 3.742 3.503 3.25 3.118 2.88 2.722 2.579 2.426 2.101 1.905 1.698 1.489 1.234 0.912 0.529 -0.266 -9 ,24433 ,KEBNE ,17018318,Tue Dec 21 23:11:31 CET,Wed Dec 22 00:32:39 CET,0.0 0.412 0.682 0.943 1.181 1.4 1.613 1.804 2.156 2.327 2.477 2.643 2.879 3.017 3.287 3.546 3.804 3.926 4.145 4.359 4.673 4.86 5.032 5.287 5.545 5.792 6.028 6.271 6.586 6.876 7.151 7.447 7.717 8.005 8.358 8.744 9.097 9.454 9.828 10.203 10.604 11.083 11.605 12.051 12.503 13.01 13.61 14.214 14.809 15.36 15.681 15.596 15.242 14.774 14.243 13.685 13.195 12.729 12.266 11.775 11.348 10.941 10.552 10.176 9.808 9.473 9.11 8.762 8.451 8.138 7.826 7.562 7.268 6.938 6.693 6.451 6.206 5.953 5.676 5.485 5.272 4.941 4.719 4.483 4.355 4.084 3.805 3.507 3.35 3.096 2.888 2.713 2.523 2.117 1.901 1.676 1.415 1.108 0.736 0.292 -0.7 -10 ,5038 ,KEBNE ,17018319,Tue Dec 21 23:11:31 CET,Wed Dec 22 00:31:41 CET,0.0 0.569 0.95 1.239 1.491 1.716 1.92 2.111 2.473 2.643 2.801 3.006 3.251 3.388 3.659 3.911 4.158 4.277 4.509 4.733 5.046 5.247 5.439 5.708 5.973 6.25 6.517 6.757 7.048 7.334 7.609 7.922 8.212 8.51 8.88 9.276 9.64 10.014 10.383 10.759 11.167 11.61 12.078 12.526 13.035 13.599 14.25 14.909 15.534 16.053 16.329 16.144 15.722 15.282 14.828 14.303 13.804 13.338 12.896 12.437 12.003 11.584 11.194 10.848 10.519 10.186 9.841 9.526 9.229 8.944 8.629 8.335 8.036 7.73 7.493 7.259 7.031 6.808 6.568 6.388 6.202 5.911 5.712 5.513 5.407 5.182 4.94 4.684 4.546 4.3 4.121 3.963 3.8 3.47 3.288 3.084 2.847 2.602 2.332 1.95 1.223 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt deleted file mode 100644 index b249b200..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18040 ,KEBNE ,17018320,Tue Dec 21 23:11:31 CET,Wed Dec 22 00:31:35 CET,0.0 1.048 1.495 1.828 2.111 2.386 2.645 2.883 3.329 3.527 3.712 3.972 4.244 4.405 4.703 4.985 5.266 5.404 5.665 5.907 6.243 6.455 6.667 6.982 7.274 7.555 7.806 8.042 8.353 8.65 8.947 9.307 9.668 10.017 10.384 10.789 11.185 11.628 12.107 12.579 13.055 13.604 14.202 14.784 15.462 16.127 16.858 17.652 18.488 19.327 20.042 20.358 20.243 19.945 19.576 19.146 18.759 18.398 18.061 17.698 17.36 17.043 16.722 16.403 16.115 15.853 15.546 15.256 14.996 14.712 14.431 14.204 13.942 13.656 13.436 13.213 12.969 12.706 12.431 12.238 12.048 11.744 11.532 11.317 11.2 10.964 10.733 10.472 10.326 10.084 9.861 9.693 9.523 9.157 8.969 8.766 8.541 8.312 8.06 7.752 7.059 -2 ,14415 ,KEBNE ,17018321,Tue Dec 21 23:11:31 CET,Wed Dec 22 00:33:31 CET,0.0 0.745 1.131 1.466 1.753 1.999 2.23 2.446 2.84 3.029 3.218 3.463 3.728 3.887 4.19 4.472 4.737 4.871 5.126 5.374 5.727 5.936 6.14 6.438 6.728 7.009 7.272 7.527 7.856 8.146 8.44 8.805 9.127 9.428 9.779 10.18 10.584 11.035 11.505 11.964 12.443 12.999 13.597 14.157 14.813 15.532 16.301 17.103 17.972 18.828 19.548 19.723 19.588 19.337 19.043 18.701 18.336 17.921 17.467 17.035 16.674 16.328 16.001 15.659 15.318 15.013 14.677 14.364 14.096 13.813 13.543 13.319 13.064 12.796 12.576 12.342 12.099 11.849 11.596 11.414 11.227 10.939 10.719 10.461 10.341 10.129 9.901 9.661 9.532 9.303 9.129 8.991 8.848 8.544 8.37 8.176 7.964 7.719 7.433 7.114 6.323 -3 ,23324 ,KEBNE ,17018322,Tue Dec 21 23:12:33 CET,Wed Dec 22 00:34:24 CET,0.0 0.704 1.042 1.322 1.552 1.764 1.967 2.162 2.557 2.74 2.903 3.104 3.354 3.493 3.753 3.993 4.227 4.337 4.553 4.774 5.093 5.287 5.475 5.738 5.998 6.258 6.495 6.719 6.998 7.284 7.581 7.904 8.215 8.538 8.911 9.326 9.737 10.183 10.638 11.136 11.647 12.196 12.77 13.327 14.013 14.693 15.426 16.211 17.006 17.792 18.494 18.778 18.64 18.343 17.981 17.568 17.147 16.723 16.336 15.925 15.542 15.18 14.813 14.47 14.141 13.827 13.504 13.215 12.971 12.728 12.46 12.214 11.938 11.641 11.41 11.164 10.921 10.674 10.407 10.214 10.021 9.747 9.569 9.39 9.293 9.077 8.857 8.633 8.516 8.295 8.119 7.976 7.836 7.531 7.367 7.2 7.002 6.764 6.498 6.205 5.542 -4 ,28416 ,KEBNE ,17018323,Tue Dec 21 23:12:33 CET,Wed Dec 22 00:34:27 CET,0.0 0.731 1.136 1.463 1.737 1.992 2.26 2.507 2.948 3.146 3.329 3.59 3.866 4.023 4.309 4.591 4.877 5.013 5.271 5.528 5.892 6.125 6.343 6.627 6.904 7.196 7.47 7.722 8.051 8.374 8.675 9.03 9.356 9.639 9.991 10.402 10.765 11.162 11.585 12.023 12.495 13.027 13.603 14.139 14.735 15.399 16.136 16.916 17.778 18.644 19.44 19.75 19.638 19.362 19.024 18.693 18.329 17.941 17.58 17.168 16.819 16.498 16.159 15.806 15.478 15.215 14.923 14.641 14.387 14.11 13.816 13.575 13.329 13.06 12.838 12.61 12.391 12.173 11.936 11.767 11.579 11.26 11.036 10.808 10.696 10.456 10.186 9.911 9.771 9.529 9.298 9.125 8.95 8.58 8.377 8.156 7.915 7.636 7.294 6.892 6.198 -5 ,22958 ,KEBNE ,17018324,Tue Dec 21 23:12:33 CET,Wed Dec 22 00:34:25 CET,0.0 0.761 1.13 1.488 1.821 2.111 2.367 2.593 3.004 3.201 3.392 3.658 3.93 4.104 4.443 4.727 4.969 5.096 5.356 5.605 5.957 6.164 6.36 6.648 6.93 7.22 7.492 7.74 8.073 8.393 8.697 9.062 9.416 9.748 10.106 10.504 10.898 11.337 11.797 12.268 12.755 13.286 13.86 14.392 14.974 15.599 16.321 17.129 17.993 18.883 19.682 19.971 19.889 19.606 19.256 18.88 18.477 18.1 17.743 17.316 16.93 16.564 16.216 15.895 15.579 15.281 14.962 14.68 14.442 14.189 13.925 13.693 13.436 13.161 12.932 12.7 12.489 12.295 12.075 11.904 11.731 11.469 11.296 11.12 11.026 10.822 10.607 10.379 10.268 10.056 9.9 9.768 9.628 9.289 9.107 8.923 8.694 8.448 8.204 7.923 7.185 -6 ,24835 ,KEBNE ,17018325,Tue Dec 21 23:12:33 CET,Wed Dec 22 00:34:35 CET,0.0 0.78 1.14 1.47 1.749 1.969 2.16 2.336 2.668 2.831 3.0 3.207 3.455 3.613 3.942 4.219 4.494 4.63 4.881 5.117 5.455 5.668 5.881 6.191 6.487 6.775 7.053 7.315 7.636 7.947 8.26 8.626 8.962 9.31 9.706 10.112 10.483 10.893 11.325 11.764 12.226 12.766 13.399 13.996 14.654 15.389 16.155 16.942 17.803 18.665 19.39 19.623 19.496 19.193 18.833 18.417 17.965 17.551 17.186 16.786 16.433 16.126 15.836 15.544 15.265 15.026 14.761 14.513 14.299 14.07 13.819 13.609 13.398 13.174 12.988 12.795 12.595 12.37 12.149 12.002 11.847 11.592 11.407 11.219 11.122 10.925 10.721 10.502 10.383 10.163 10.013 9.882 9.736 9.409 9.219 9.02 8.834 8.624 8.377 8.033 7.404 -7 ,1849 ,KEBNE ,17018326,Tue Dec 21 23:13:35 CET,Wed Dec 22 00:35:18 CET,0.0 0.83 1.232 1.562 1.845 2.106 2.357 2.596 3.055 3.26 3.447 3.684 3.947 4.111 4.393 4.65 4.913 5.037 5.27 5.502 5.838 6.055 6.268 6.579 6.881 7.163 7.437 7.693 8.006 8.318 8.628 8.981 9.297 9.597 9.941 10.324 10.703 11.146 11.605 12.04 12.503 13.064 13.672 14.234 14.852 15.507 16.247 17.014 17.834 18.671 19.421 19.695 19.599 19.317 18.933 18.524 18.138 17.743 17.351 16.928 16.574 16.241 15.874 15.509 15.164 14.862 14.557 14.244 13.977 13.729 13.469 13.248 13.025 12.811 12.644 12.459 12.258 12.032 11.804 11.657 11.494 11.22 11.023 10.814 10.715 10.51 10.294 10.067 9.946 9.72 9.563 9.434 9.286 8.983 8.826 8.657 8.474 8.275 8.048 7.748 6.958 -8 ,17182 ,KEBNE ,17018327,Tue Dec 21 23:23:51 CET,Wed Dec 22 00:45:37 CET,0.0 0.985 1.35 1.623 1.872 2.116 2.34 2.541 2.923 3.106 3.278 3.481 3.727 3.865 4.134 4.417 4.694 4.822 5.065 5.294 5.63 5.844 6.049 6.357 6.649 6.924 7.193 7.456 7.807 8.137 8.445 8.784 9.103 9.439 9.824 10.258 10.681 11.111 11.553 12.039 12.529 13.063 13.662 14.231 14.869 15.552 16.3 17.046 17.866 18.75 19.51 19.782 19.675 19.397 19.067 18.684 18.288 17.892 17.52 17.126 16.782 16.459 16.143 15.83 15.497 15.176 14.843 14.529 14.237 13.956 13.673 13.439 13.208 12.939 12.722 12.498 12.261 12.027 11.772 11.591 11.412 11.121 10.919 10.704 10.59 10.349 10.087 9.803 9.648 9.4 9.161 8.981 8.807 8.47 8.284 8.06 7.814 7.53 7.215 6.832 6.212 -9 ,30197 ,KEBNE ,17018328,Tue Dec 21 23:25:55 CET,Wed Dec 22 00:46:05 CET,0.0 0.668 1.041 1.305 1.557 1.787 1.991 2.191 2.562 2.728 2.872 3.034 3.272 3.408 3.667 3.9 4.126 4.237 4.459 4.672 4.976 5.17 5.369 5.665 5.938 6.197 6.434 6.647 6.927 7.203 7.459 7.77 8.073 8.34 8.638 8.989 9.335 9.708 10.088 10.482 10.911 11.387 11.934 12.467 13.094 13.732 14.376 15.082 15.879 16.719 17.461 17.73 17.581 17.344 17.042 16.673 16.338 16.028 15.706 15.342 15.031 14.747 14.463 14.169 13.89 13.641 13.374 13.133 12.909 12.676 12.436 12.222 11.989 11.736 11.53 11.316 11.105 10.893 10.66 10.493 10.326 10.073 9.902 9.709 9.604 9.394 9.18 8.96 8.842 8.618 8.456 8.317 8.172 7.872 7.696 7.493 7.271 7.025 6.775 6.495 5.805 -10 ,12438 ,KEBNE ,17018329,Tue Dec 21 23:26:58 CET,Wed Dec 22 00:47:10 CET,0.0 0.818 1.178 1.475 1.715 1.925 2.114 2.302 2.664 2.838 3.002 3.203 3.457 3.591 3.845 4.088 4.332 4.449 4.676 4.899 5.202 5.394 5.581 5.845 6.096 6.34 6.585 6.828 7.139 7.42 7.67 7.984 8.296 8.592 8.938 9.313 9.671 10.074 10.499 10.929 11.371 11.832 12.35 12.915 13.563 14.226 14.985 15.809 16.695 17.575 18.328 18.632 18.551 18.283 17.909 17.478 17.068 16.689 16.338 15.944 15.575 15.249 14.952 14.666 14.386 14.112 13.805 13.522 13.264 12.98 12.675 12.43 12.167 11.868 11.637 11.402 11.157 10.905 10.652 10.468 10.266 9.958 9.744 9.515 9.4 9.163 8.916 8.655 8.513 8.28 8.076 7.91 7.732 7.346 7.146 6.925 6.686 6.428 6.118 5.674 4.847 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 65a33b2a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27131 ,KEBNE ,17018330,Tue Dec 21 23:28:00 CET,Wed Dec 22 00:41:39 CET,0.0 0.469 0.742 0.987 1.19 1.369 1.551 1.732 2.044 2.17 2.29 2.438 2.65 2.763 2.975 3.172 3.36 3.453 3.63 3.799 4.041 4.191 4.337 4.547 4.746 4.929 5.113 5.297 5.511 5.708 5.906 6.156 6.383 6.586 6.803 7.036 7.275 7.549 7.828 8.098 8.397 8.72 9.039 9.328 9.646 9.955 10.255 10.554 10.822 10.958 10.747 10.11 9.351 8.641 7.975 7.323 6.753 6.224 5.74 5.23 4.754 4.305 3.873 3.442 3.034 2.668 2.295 1.959 1.658 1.343 1.005 0.724 0.446 0.169 -0.045 -0.269 -0.52 -0.801 -1.086 -1.273 -1.473 -1.796 -2.013 -2.245 -2.366 -2.619 -2.878 -3.14 -3.279 -3.533 -3.756 -3.93 -4.112 -4.498 -4.706 -4.912 -5.153 -5.453 -5.773 -6.166 -7.022 -2 ,21493 ,KEBNE ,17018331,Tue Dec 21 23:29:03 CET,Wed Dec 22 00:45:56 CET,0.0 0.626 1.004 1.298 1.544 1.758 1.956 2.131 2.449 2.605 2.754 2.929 3.154 3.292 3.53 3.758 3.991 4.102 4.306 4.497 4.761 4.926 5.101 5.357 5.607 5.847 6.066 6.279 6.548 6.786 6.999 7.237 7.467 7.707 7.983 8.279 8.573 8.883 9.192 9.531 9.868 10.235 10.669 11.039 11.407 11.783 12.177 12.522 12.782 12.911 12.745 12.15 11.393 10.596 9.861 9.163 8.528 7.913 7.36 6.785 6.278 5.802 5.299 4.86 4.492 4.159 3.788 3.453 3.165 2.844 2.511 2.248 1.961 1.651 1.412 1.171 0.939 0.691 0.439 0.272 0.09 -0.199 -0.391 -0.605 -0.718 -0.94 -1.188 -1.465 -1.613 -1.865 -2.068 -2.226 -2.4 -2.782 -2.99 -3.218 -3.461 -3.716 -3.998 -4.392 -5.459 -3 ,7095 ,KEBNE ,17018332,Tue Dec 21 23:30:03 CET,Wed Dec 22 00:47:54 CET,0.0 0.703 1.06 1.368 1.632 1.885 2.112 2.303 2.605 2.744 2.884 3.065 3.297 3.426 3.664 3.892 4.113 4.226 4.439 4.641 4.932 5.103 5.255 5.486 5.703 5.906 6.12 6.313 6.551 6.789 7.021 7.289 7.535 7.769 8.044 8.347 8.619 8.922 9.263 9.621 9.95 10.285 10.68 11.05 11.433 11.817 12.185 12.528 12.832 12.978 12.813 12.162 11.322 10.533 9.787 9.085 8.432 7.818 7.283 6.724 6.225 5.76 5.313 4.881 4.48 4.131 3.736 3.355 3.039 2.715 2.36 2.067 1.772 1.45 1.177 0.89 0.603 0.304 0.006 -0.207 -0.442 -0.807 -1.069 -1.329 -1.455 -1.742 -2.058 -2.381 -2.547 -2.811 -3.058 -3.244 -3.452 -3.907 -4.161 -4.433 -4.718 -5.053 -5.427 -5.897 -6.951 -4 ,9621 ,KEBNE ,17018333,Tue Dec 21 23:31:04 CET,Wed Dec 22 00:51:22 CET,0.0 0.724 1.026 1.285 1.518 1.705 1.862 2.016 2.286 2.411 2.536 2.674 2.886 2.995 3.195 3.378 3.549 3.632 3.802 3.956 4.183 4.331 4.468 4.657 4.839 5.027 5.202 5.368 5.602 5.819 6.001 6.221 6.455 6.669 6.892 7.163 7.419 7.688 7.973 8.255 8.524 8.855 9.275 9.666 10.074 10.454 10.824 11.169 11.467 11.646 11.443 10.756 9.97 9.187 8.419 7.699 7.041 6.448 5.922 5.346 4.833 4.362 3.924 3.509 3.1 2.717 2.307 1.922 1.587 1.235 0.861 0.571 0.292 0.002 -0.241 -0.49 -0.736 -0.984 -1.252 -1.46 -1.676 -1.987 -2.205 -2.438 -2.555 -2.778 -3.011 -3.275 -3.421 -3.66 -3.844 -4.012 -4.189 -4.564 -4.778 -5.003 -5.242 -5.511 -5.805 -6.206 -7.624 -5 ,22436 ,KEBNE ,17018334,Tue Dec 21 23:31:04 CET,Wed Dec 22 00:51:19 CET,0.0 0.507 0.831 1.072 1.265 1.444 1.613 1.776 2.063 2.188 2.308 2.442 2.652 2.764 2.984 3.183 3.379 3.473 3.636 3.79 4.01 4.146 4.29 4.499 4.698 4.886 5.063 5.237 5.461 5.671 5.884 6.154 6.395 6.615 6.851 7.113 7.368 7.627 7.887 8.157 8.439 8.768 9.125 9.447 9.821 10.239 10.657 11.016 11.331 11.5 11.319 10.649 9.844 9.046 8.326 7.629 6.941 6.295 5.724 5.109 4.562 4.104 3.646 3.177 2.756 2.367 1.954 1.579 1.256 0.933 0.595 0.313 0.003 -0.334 -0.599 -0.868 -1.155 -1.458 -1.767 -1.99 -2.211 -2.553 -2.791 -3.031 -3.161 -3.443 -3.738 -4.055 -4.228 -4.493 -4.725 -4.91 -5.109 -5.569 -5.834 -6.103 -6.39 -6.704 -7.08 -7.569 -8.709 -6 ,25536 ,KEBNE ,17018335,Tue Dec 21 23:31:05 CET,Wed Dec 22 00:51:37 CET,0.0 0.543 0.899 1.2 1.444 1.669 1.882 2.077 2.417 2.575 2.728 2.916 3.151 3.29 3.552 3.785 4.002 4.113 4.318 4.499 4.758 4.93 5.104 5.343 5.579 5.803 6.002 6.19 6.435 6.675 6.909 7.195 7.476 7.727 8.007 8.313 8.584 8.881 9.18 9.478 9.791 10.117 10.471 10.835 11.214 11.57 11.934 12.269 12.561 12.703 12.487 11.796 10.995 10.165 9.363 8.63 7.979 7.353 6.785 6.213 5.704 5.245 4.821 4.429 4.032 3.64 3.226 2.844 2.501 2.133 1.744 1.416 1.076 0.724 0.456 0.187 -0.107 -0.426 -0.757 -0.977 -1.207 -1.583 -1.837 -2.093 -2.221 -2.509 -2.802 -3.07 -3.207 -3.449 -3.659 -3.832 -4.011 -4.384 -4.587 -4.809 -5.052 -5.328 -5.674 -6.12 -7.089 -7 ,7312 ,KEBNE ,17018336,Tue Dec 21 23:31:05 CET,Wed Dec 22 00:52:44 CET,0.0 0.631 1.016 1.333 1.593 1.803 2.002 2.19 2.554 2.725 2.897 3.117 3.349 3.477 3.726 3.954 4.167 4.274 4.471 4.66 4.937 5.106 5.271 5.517 5.749 5.971 6.181 6.377 6.624 6.857 7.079 7.346 7.634 7.959 8.299 8.584 8.844 9.147 9.454 9.755 10.087 10.498 10.913 11.255 11.591 11.921 12.272 12.613 12.905 13.047 12.843 12.122 11.277 10.439 9.732 9.079 8.462 7.901 7.389 6.85 6.371 5.957 5.592 5.239 4.863 4.516 4.154 3.81 3.515 3.218 2.892 2.599 2.314 2.034 1.813 1.576 1.326 1.073 0.806 0.618 0.422 0.102 -0.125 -0.351 -0.474 -0.744 -1.024 -1.312 -1.457 -1.705 -1.928 -2.101 -2.283 -2.705 -2.948 -3.2 -3.458 -3.748 -4.087 -4.477 -5.379 -8 ,22351 ,KEBNE ,17018337,Tue Dec 21 23:32:07 CET,Wed Dec 22 00:52:18 CET,0.0 0.458 0.735 0.953 1.174 1.388 1.569 1.725 1.993 2.118 2.243 2.392 2.606 2.713 2.931 3.135 3.318 3.407 3.573 3.734 3.97 4.113 4.247 4.443 4.641 4.833 5.011 5.175 5.401 5.633 5.839 6.072 6.309 6.553 6.815 7.08 7.329 7.59 7.891 8.221 8.527 8.861 9.248 9.611 9.981 10.363 10.767 11.125 11.443 11.637 11.502 10.859 10.05 9.272 8.557 7.869 7.242 6.657 6.127 5.578 5.076 4.636 4.239 3.866 3.508 3.166 2.817 2.499 2.208 1.898 1.575 1.298 1.013 0.737 0.519 0.282 0.026 -0.249 -0.533 -0.717 -0.915 -1.232 -1.446 -1.659 -1.766 -2.011 -2.276 -2.542 -2.678 -2.925 -3.134 -3.305 -3.487 -3.85 -4.05 -4.276 -4.529 -4.784 -5.089 -5.528 -6.665 -9 ,5766 ,KEBNE ,17018338,Tue Dec 21 23:32:07 CET,Wed Dec 22 00:53:41 CET,0.0 0.418 0.692 0.911 1.107 1.284 1.446 1.612 1.919 2.058 2.19 2.333 2.542 2.651 2.852 3.044 3.227 3.31 3.478 3.642 3.87 4.017 4.158 4.369 4.573 4.761 4.921 5.064 5.267 5.463 5.655 5.887 6.116 6.332 6.549 6.797 7.024 7.257 7.528 7.838 8.149 8.444 8.752 9.07 9.422 9.768 10.107 10.427 10.708 10.828 10.597 9.929 9.138 8.34 7.613 6.916 6.247 5.604 5.016 4.39 3.852 3.361 2.877 2.425 2.016 1.638 1.244 0.897 0.594 0.267 -0.087 -0.379 -0.685 -0.99 -1.215 -1.452 -1.743 -2.07 -2.396 -2.616 -2.835 -3.152 -3.356 -3.581 -3.695 -3.916 -4.154 -4.419 -4.565 -4.815 -5.045 -5.221 -5.404 -5.792 -5.989 -6.198 -6.431 -6.707 -7.036 -7.436 -8.285 -10 ,11071 ,KEBNE ,17018339,Tue Dec 21 23:32:07 CET,Wed Dec 22 00:52:17 CET,0.0 0.658 0.97 1.211 1.435 1.616 1.769 1.917 2.207 2.348 2.482 2.609 2.818 2.935 3.154 3.351 3.546 3.641 3.808 3.96 4.202 4.359 4.507 4.734 4.942 5.133 5.322 5.507 5.742 5.967 6.176 6.405 6.635 6.861 7.103 7.377 7.644 7.921 8.19 8.458 8.732 9.043 9.39 9.71 10.033 10.368 10.751 11.104 11.381 11.522 11.295 10.6 9.817 9.04 8.287 7.541 6.862 6.198 5.601 5.045 4.533 4.053 3.601 3.169 2.758 2.38 1.987 1.614 1.267 0.91 0.543 0.224 -0.093 -0.422 -0.683 -0.946 -1.228 -1.517 -1.824 -2.041 -2.262 -2.594 -2.818 -3.057 -3.177 -3.424 -3.684 -3.955 -4.103 -4.357 -4.555 -4.724 -4.91 -5.278 -5.477 -5.691 -5.933 -6.226 -6.539 -6.948 -8.028 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt deleted file mode 100644 index 89169728..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12021 ,KEBNE ,17018340,Tue Dec 21 23:32:07 CET,Wed Dec 22 00:53:48 CET,0.0 0.593 0.889 1.118 1.323 1.493 1.66 1.823 2.127 2.271 2.414 2.596 2.82 2.941 3.173 3.397 3.598 3.688 3.867 4.044 4.273 4.418 4.573 4.802 5.025 5.233 5.411 5.572 5.803 6.04 6.264 6.521 6.751 6.979 7.244 7.53 7.78 8.047 8.359 8.712 9.075 9.434 9.818 10.183 10.582 10.985 11.378 11.717 12.026 12.234 12.072 11.365 10.556 9.77 9.044 8.342 7.679 7.077 6.561 6.021 5.527 5.097 4.66 4.229 3.826 3.427 2.998 2.629 2.317 1.991 1.64 1.328 1.01 0.682 0.403 0.112 -0.17 -0.466 -0.751 -0.942 -1.155 -1.502 -1.742 -1.971 -2.087 -2.319 -2.563 -2.837 -2.974 -3.211 -3.393 -3.556 -3.731 -4.101 -4.296 -4.507 -4.758 -5.038 -5.343 -5.725 -6.686 -2 ,27643 ,KEBNE ,17018341,Tue Dec 21 23:32:07 CET,Wed Dec 22 00:52:43 CET,0.0 0.529 0.818 1.058 1.271 1.454 1.621 1.789 2.103 2.238 2.368 2.518 2.723 2.823 3.034 3.248 3.446 3.541 3.723 3.902 4.164 4.325 4.482 4.724 4.962 5.187 5.414 5.648 5.929 6.161 6.389 6.674 6.942 7.201 7.488 7.806 8.092 8.406 8.818 9.27 9.67 10.044 10.424 10.794 11.197 11.626 12.095 12.488 12.814 13.001 12.85 12.293 11.598 10.848 10.119 9.416 8.763 8.139 7.568 6.971 6.444 5.96 5.501 5.075 4.659 4.271 3.849 3.466 3.141 2.798 2.431 2.114 1.792 1.472 1.218 0.931 0.643 0.355 0.04 -0.187 -0.435 -0.806 -1.055 -1.312 -1.44 -1.723 -2.012 -2.299 -2.456 -2.713 -2.917 -3.078 -3.241 -3.607 -3.811 -4.024 -4.245 -4.502 -4.816 -5.182 -5.925 -3 ,31102 ,KEBNE ,17018342,Tue Dec 21 23:32:07 CET,Wed Dec 22 00:52:19 CET,0.0 0.559 0.878 1.194 1.467 1.691 1.89 2.087 2.459 2.628 2.792 3.028 3.275 3.412 3.674 3.936 4.186 4.315 4.553 4.754 5.032 5.213 5.39 5.634 5.876 6.105 6.304 6.5 6.768 7.029 7.276 7.573 7.855 8.108 8.403 8.745 9.067 9.421 9.794 10.182 10.56 10.936 11.34 11.727 12.187 12.657 13.081 13.429 13.707 13.866 13.653 12.923 12.08 11.217 10.381 9.668 9.011 8.343 7.779 7.2 6.643 6.124 5.643 5.189 4.743 4.325 3.895 3.498 3.154 2.809 2.451 2.142 1.817 1.468 1.191 0.921 0.628 0.302 -0.011 -0.213 -0.417 -0.731 -0.958 -1.194 -1.31 -1.549 -1.802 -2.065 -2.201 -2.462 -2.668 -2.824 -2.999 -3.374 -3.572 -3.797 -4.055 -4.318 -4.598 -4.952 -5.843 -4 ,24111 ,KEBNE ,17018343,Tue Dec 21 23:32:07 CET,Wed Dec 22 00:53:32 CET,0.0 0.589 0.922 1.169 1.359 1.532 1.705 1.87 2.159 2.294 2.431 2.587 2.806 2.916 3.127 3.324 3.509 3.604 3.781 3.946 4.185 4.336 4.484 4.699 4.906 5.108 5.332 5.57 5.871 6.15 6.414 6.736 7.012 7.248 7.532 7.871 8.184 8.518 8.85 9.178 9.537 9.955 10.433 10.86 11.291 11.74 12.181 12.543 12.858 13.043 12.881 12.278 11.552 10.761 9.96 9.207 8.559 7.973 7.44 6.887 6.412 5.986 5.544 5.117 4.729 4.355 3.946 3.586 3.269 2.956 2.641 2.366 2.093 1.815 1.589 1.344 1.087 0.822 0.551 0.365 0.165 -0.161 -0.391 -0.627 -0.745 -0.99 -1.24 -1.511 -1.657 -1.905 -2.082 -2.257 -2.46 -2.852 -3.059 -3.292 -3.553 -3.847 -4.178 -4.565 -5.36 -5 ,14766 ,KEBNE ,17018344,Tue Dec 21 23:33:08 CET,Wed Dec 22 00:53:17 CET,0.0 0.639 0.927 1.178 1.418 1.613 1.781 1.95 2.244 2.373 2.498 2.657 2.887 3.013 3.238 3.445 3.628 3.715 3.899 4.075 4.304 4.446 4.59 4.817 5.023 5.209 5.4 5.581 5.805 6.014 6.228 6.492 6.737 6.971 7.235 7.52 7.8 8.095 8.378 8.66 8.929 9.234 9.589 9.907 10.256 10.659 11.057 11.389 11.658 11.845 11.733 11.07 10.3 9.558 8.804 8.027 7.345 6.717 6.141 5.557 5.04 4.58 4.147 3.7 3.274 2.898 2.484 2.097 1.766 1.429 1.072 0.762 0.449 0.127 -0.133 -0.398 -0.685 -0.991 -1.296 -1.503 -1.716 -2.058 -2.302 -2.557 -2.683 -2.931 -3.193 -3.495 -3.665 -3.939 -4.187 -4.369 -4.563 -4.992 -5.233 -5.497 -5.78 -6.083 -6.453 -6.91 -7.88 -6 ,10003 ,KEBNE ,17018345,Tue Dec 21 23:33:08 CET,Wed Dec 22 00:55:07 CET,0.0 0.687 1.011 1.277 1.529 1.768 1.977 2.178 2.544 2.707 2.857 3.053 3.285 3.409 3.644 3.873 4.081 4.179 4.381 4.577 4.855 5.046 5.219 5.458 5.709 5.95 6.166 6.361 6.604 6.835 7.076 7.385 7.658 7.908 8.183 8.497 8.801 9.118 9.429 9.766 10.132 10.506 10.933 11.338 11.771 12.222 12.674 13.1 13.498 13.751 13.652 13.043 12.25 11.437 10.691 9.96 9.28 8.692 8.162 7.613 7.164 6.751 6.331 5.935 5.572 5.223 4.837 4.485 4.177 3.861 3.531 3.246 2.956 2.666 2.426 2.182 1.93 1.662 1.407 1.227 1.021 0.681 0.445 0.204 0.09 -0.135 -0.394 -0.681 -0.821 -1.057 -1.24 -1.411 -1.596 -1.967 -2.157 -2.379 -2.649 -2.949 -3.242 -3.597 -4.372 -7 ,27668 ,KEBNE ,17018346,Tue Dec 21 23:34:10 CET,Wed Dec 22 00:54:14 CET,0.0 0.556 0.875 1.144 1.377 1.585 1.789 1.972 2.305 2.475 2.641 2.844 3.074 3.197 3.436 3.67 3.887 3.996 4.208 4.416 4.723 4.917 5.107 5.38 5.606 5.818 6.048 6.272 6.542 6.799 7.051 7.333 7.592 7.853 8.162 8.478 8.757 9.079 9.427 9.776 10.127 10.496 10.92 11.299 11.683 12.126 12.577 12.993 13.36 13.56 13.387 12.699 11.927 11.153 10.408 9.697 9.011 8.376 7.79 7.188 6.686 6.22 5.769 5.352 4.946 4.559 4.147 3.764 3.444 3.104 2.744 2.454 2.121 1.755 1.493 1.226 0.945 0.67 0.385 0.185 -0.032 -0.388 -0.642 -0.911 -1.049 -1.347 -1.658 -1.965 -2.129 -2.402 -2.623 -2.788 -2.961 -3.329 -3.545 -3.786 -4.023 -4.275 -4.565 -4.932 -5.927 -8 ,8448 ,KEBNE ,17018347,Tue Dec 21 23:34:10 CET,Wed Dec 22 00:55:35 CET,0.0 0.464 0.708 0.927 1.114 1.289 1.458 1.609 1.903 2.039 2.166 2.325 2.54 2.648 2.86 3.059 3.258 3.362 3.556 3.728 3.962 4.103 4.238 4.451 4.68 4.926 5.163 5.376 5.631 5.878 6.12 6.406 6.687 6.95 7.205 7.49 7.788 8.118 8.45 8.777 9.129 9.52 9.951 10.327 10.722 11.168 11.651 12.055 12.402 12.62 12.462 11.805 11.02 10.238 9.515 8.793 8.091 7.457 6.876 6.253 5.716 5.247 4.819 4.405 3.986 3.587 3.168 2.787 2.444 2.073 1.685 1.376 1.063 0.744 0.502 0.247 -0.027 -0.314 -0.612 -0.829 -1.053 -1.405 -1.661 -1.934 -2.074 -2.354 -2.655 -2.98 -3.157 -3.451 -3.718 -3.906 -4.105 -4.548 -4.794 -5.044 -5.307 -5.599 -5.94 -6.381 -7.411 -9 ,20531 ,KEBNE ,17018348,Tue Dec 21 23:34:10 CET,Wed Dec 22 00:54:26 CET,0.0 0.787 1.149 1.456 1.707 1.93 2.155 2.362 2.735 2.905 3.071 3.304 3.544 3.684 3.942 4.19 4.421 4.531 4.744 4.928 5.189 5.368 5.543 5.806 6.062 6.288 6.506 6.734 7.023 7.264 7.474 7.725 7.976 8.234 8.523 8.853 9.19 9.511 9.808 10.118 10.456 10.826 11.23 11.624 12.064 12.498 12.904 13.307 13.671 13.93 13.799 13.147 12.398 11.616 10.873 10.171 9.491 8.832 8.267 7.681 7.16 6.702 6.254 5.854 5.489 5.143 4.78 4.451 4.171 3.887 3.592 3.335 3.045 2.731 2.49 2.238 1.984 1.738 1.473 1.281 1.079 0.768 0.549 0.316 0.2 -0.043 -0.305 -0.578 -0.722 -0.984 -1.197 -1.358 -1.538 -1.921 -2.127 -2.354 -2.596 -2.879 -3.226 -3.645 -4.48 -10 ,25947 ,KEBNE ,17018349,Tue Dec 21 23:34:10 CET,Wed Dec 22 00:54:14 CET,0.0 0.549 0.87 1.097 1.288 1.458 1.609 1.756 2.039 2.171 2.3 2.453 2.664 2.774 2.985 3.181 3.378 3.475 3.645 3.814 4.093 4.293 4.494 4.761 4.992 5.216 5.442 5.661 5.937 6.203 6.465 6.768 7.037 7.268 7.519 7.814 8.106 8.427 8.78 9.157 9.515 9.865 10.299 10.705 11.118 11.558 11.988 12.371 12.701 12.928 12.785 12.086 11.294 10.518 9.755 8.994 8.279 7.645 7.089 6.535 6.052 5.604 5.186 4.769 4.362 3.989 3.603 3.286 3.002 2.699 2.386 2.123 1.846 1.533 1.29 1.038 0.781 0.526 0.26 0.079 -0.113 -0.425 -0.642 -0.864 -0.972 -1.197 -1.436 -1.689 -1.833 -2.087 -2.284 -2.45 -2.627 -3.025 -3.23 -3.449 -3.689 -3.951 -4.284 -4.703 -5.538 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt deleted file mode 100644 index 438819fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15863 ,KEBNE ,17018351,Tue Dec 21 23:34:10 CET,Wed Dec 22 00:55:45 CET,0.0 0.662 1.092 1.423 1.696 1.963 2.219 2.457 2.885 3.079 3.264 3.488 3.789 3.962 4.294 4.595 4.869 5.007 5.283 5.547 5.945 6.193 6.423 6.77 7.107 7.423 7.733 8.039 8.422 8.801 9.169 9.609 10.043 10.461 10.922 11.437 11.94 12.47 13.038 13.645 14.273 14.954 15.723 16.513 17.439 18.497 19.723 21.108 22.749 24.62 26.783 28.43 29.24 29.639 29.743 29.74 29.673 29.526 29.348 29.138 28.944 28.733 28.503 28.271 28.035 27.81 27.575 27.374 27.187 26.975 26.751 26.549 26.343 26.144 25.982 25.81 25.617 25.402 25.174 25.004 24.823 24.557 24.371 24.137 24.007 23.757 23.504 23.252 23.125 22.896 22.716 22.558 22.396 22.034 21.85 21.678 21.471 21.236 20.98 20.654 19.944 -2 ,7259 ,KEBNE ,17018352,Tue Dec 21 23:34:10 CET,Wed Dec 22 00:54:18 CET,0.0 0.876 1.22 1.513 1.81 2.086 2.339 2.558 2.979 3.192 3.404 3.683 3.99 4.16 4.489 4.797 5.093 5.241 5.525 5.799 6.203 6.449 6.675 7.019 7.366 7.687 7.973 8.25 8.608 8.949 9.293 9.708 10.108 10.508 10.982 11.512 12.022 12.58 13.171 13.784 14.422 15.134 15.927 16.725 17.679 18.759 19.987 21.336 22.875 24.649 26.774 28.358 29.175 29.567 29.719 29.726 29.683 29.591 29.435 29.228 29.034 28.851 28.627 28.379 28.142 27.907 27.631 27.396 27.196 26.977 26.749 26.558 26.352 26.121 25.941 25.773 25.592 25.387 25.185 25.048 24.874 24.564 24.344 24.13 24.033 23.823 23.592 23.32 23.159 22.9 22.702 22.55 22.387 22.014 21.815 21.61 21.373 21.101 20.803 20.461 19.712 -3 ,3902 ,KEBNE ,17018353,Tue Dec 21 23:34:10 CET,Wed Dec 22 00:55:37 CET,0.0 0.829 1.278 1.635 1.934 2.198 2.425 2.641 3.056 3.251 3.457 3.736 4.042 4.212 4.548 4.872 5.179 5.329 5.616 5.879 6.246 6.488 6.728 7.073 7.408 7.726 8.048 8.371 8.779 9.165 9.508 9.902 10.297 10.679 11.121 11.645 12.137 12.642 13.198 13.807 14.433 15.124 15.955 16.799 17.764 18.84 20.067 21.43 23.031 24.882 27.018 28.599 29.348 29.716 29.872 29.92 29.919 29.888 29.788 29.612 29.461 29.32 29.152 28.99 28.846 28.7 28.524 28.344 28.172 27.982 27.78 27.602 27.413 27.197 27.035 26.882 26.711 26.52 26.319 26.176 26.037 25.817 25.651 25.488 25.394 25.188 24.98 24.769 24.665 24.45 24.323 24.187 24.045 23.705 23.52 23.352 23.183 22.97 22.698 22.362 21.609 -4 ,14794 ,KEBNE ,17018354,Tue Dec 21 23:34:14 CET,Wed Dec 22 00:51:22 CET,0.0 0.715 1.03 1.282 1.51 1.742 1.963 2.157 2.527 2.702 2.877 3.086 3.376 3.533 3.831 4.11 4.364 4.481 4.718 4.977 5.343 5.57 5.778 6.065 6.352 6.645 6.949 7.229 7.582 7.92 8.245 8.661 9.042 9.4 9.822 10.295 10.74 11.197 11.692 12.244 12.844 13.52 14.284 15.039 15.91 16.897 18.056 19.368 20.905 22.673 24.678 26.151 26.951 27.357 27.505 27.546 27.502 27.407 27.288 27.148 27.016 26.85 26.634 26.407 26.171 25.971 25.776 25.557 25.362 25.177 24.979 24.796 24.59 24.358 24.155 23.956 23.764 23.553 23.326 23.165 23.0 22.747 22.552 22.328 22.221 22.02 21.821 21.614 21.503 21.289 21.146 21.004 20.867 20.553 20.385 20.219 20.041 19.829 19.569 19.255 18.432 -5 ,5357 ,KEBNE ,17018355,Tue Dec 21 23:34:14 CET,Wed Dec 22 00:47:44 CET,0.0 0.489 0.81 1.077 1.312 1.528 1.735 1.936 2.315 2.49 2.649 2.82 3.1 3.255 3.543 3.802 4.054 4.177 4.427 4.673 5.025 5.257 5.481 5.781 6.065 6.351 6.634 6.921 7.283 7.63 7.97 8.365 8.75 9.123 9.545 10.026 10.495 10.982 11.497 12.075 12.693 13.408 14.22 15.006 15.918 16.935 18.122 19.45 20.977 22.727 24.769 26.428 27.286 27.697 27.855 27.859 27.849 27.793 27.674 27.529 27.385 27.225 27.08 26.937 26.769 26.599 26.402 26.213 26.039 25.866 25.679 25.518 25.337 25.133 24.982 24.828 24.668 24.494 24.305 24.172 24.033 23.803 23.639 23.479 23.396 23.211 23.008 22.791 22.679 22.459 22.321 22.188 22.05 21.752 21.59 21.419 21.219 21.002 20.757 20.458 19.626 -6 ,27575 ,KEBNE ,17018356,Tue Dec 21 23:34:10 CET,Wed Dec 22 00:54:18 CET,0.0 0.636 0.982 1.267 1.52 1.764 2.0 2.224 2.617 2.791 2.96 3.137 3.415 3.562 3.84 4.098 4.36 4.493 4.754 4.995 5.344 5.563 5.76 6.043 6.337 6.649 6.952 7.219 7.551 7.88 8.197 8.586 8.974 9.341 9.755 10.219 10.675 11.187 11.725 12.277 12.867 13.563 14.391 15.204 16.124 17.132 18.292 19.619 21.179 22.988 25.069 26.629 27.402 27.76 27.936 28.001 27.967 27.842 27.664 27.492 27.337 27.169 26.983 26.777 26.553 26.346 26.143 25.946 25.755 25.542 25.301 25.098 24.895 24.667 24.487 24.293 24.096 23.896 23.655 23.487 23.318 23.069 22.898 22.71 22.616 22.426 22.213 21.965 21.831 21.579 21.322 21.139 20.975 20.62 20.43 20.229 20.009 19.758 19.47 19.105 18.054 -7 ,24348 ,KEBNE ,17018357,Tue Dec 21 23:34:10 CET,Wed Dec 22 00:55:40 CET,0.0 0.63 1.017 1.335 1.577 1.801 2.024 2.232 2.594 2.761 2.926 3.106 3.383 3.526 3.801 4.077 4.353 4.479 4.722 4.952 5.269 5.476 5.687 5.989 6.268 6.539 6.811 7.079 7.416 7.732 8.039 8.427 8.801 9.157 9.584 10.079 10.576 11.114 11.676 12.274 12.92 13.682 14.563 15.423 16.4 17.455 18.671 20.055 21.637 23.428 25.452 26.994 27.745 28.061 28.187 28.235 28.204 28.107 27.95 27.765 27.604 27.432 27.244 27.043 26.824 26.598 26.367 26.152 25.969 25.78 25.56 25.362 25.151 24.947 24.782 24.594 24.404 24.197 23.977 23.838 23.698 23.469 23.311 23.151 23.065 22.878 22.691 22.489 22.372 22.151 22.001 21.863 21.729 21.441 21.273 21.077 20.868 20.653 20.399 20.138 19.506 -8 ,19134 ,KEBNE ,17018358,Tue Dec 21 23:34:10 CET,Wed Dec 22 00:54:29 CET,0.0 0.647 1.005 1.283 1.543 1.788 2.018 2.224 2.599 2.776 2.957 3.167 3.453 3.603 3.884 4.162 4.441 4.572 4.825 5.076 5.418 5.627 5.826 6.131 6.432 6.708 7.002 7.31 7.709 8.087 8.439 8.873 9.271 9.649 10.085 10.578 11.057 11.561 12.117 12.733 13.389 14.117 14.945 15.767 16.689 17.731 18.975 20.346 21.955 23.798 25.862 27.508 28.383 28.775 28.944 29.005 28.963 28.852 28.709 28.505 28.29 28.069 27.842 27.613 27.376 27.167 26.963 26.75 26.545 26.335 26.103 25.91 25.706 25.48 25.301 25.106 24.896 24.679 24.453 24.292 24.118 23.848 23.664 23.474 23.383 23.196 22.965 22.71 22.588 22.354 22.147 21.976 21.806 21.458 21.27 21.075 20.87 20.616 20.278 19.826 19.105 -9 ,25383 ,KEBNE ,17018359,Tue Dec 21 23:34:10 CET,Wed Dec 22 00:56:17 CET,0.0 0.688 1.075 1.415 1.695 1.939 2.159 2.381 2.751 2.914 3.082 3.263 3.544 3.689 3.995 4.286 4.543 4.669 4.901 5.123 5.458 5.674 5.885 6.2 6.496 6.776 7.057 7.329 7.667 8.001 8.325 8.719 9.11 9.485 9.888 10.329 10.767 11.259 11.796 12.372 12.985 13.67 14.476 15.283 16.207 17.236 18.413 19.735 21.247 22.988 25.059 26.643 27.437 27.842 28.04 28.088 28.052 27.987 27.882 27.737 27.601 27.472 27.313 27.129 26.931 26.717 26.493 26.313 26.153 25.986 25.798 25.623 25.439 25.262 25.117 24.946 24.756 24.549 24.337 24.204 24.064 23.842 23.7 23.546 23.465 23.304 23.135 22.951 22.849 22.635 22.494 22.359 22.226 21.952 21.794 21.615 21.394 21.163 20.942 20.626 19.788 -10 ,10691 ,KEBNE ,17018360,Tue Dec 21 23:35:12 CET,Wed Dec 22 00:56:57 CET,0.0 0.828 1.212 1.478 1.72 1.937 2.138 2.34 2.718 2.905 3.078 3.266 3.553 3.707 3.999 4.272 4.532 4.652 4.886 5.108 5.425 5.644 5.865 6.189 6.501 6.79 7.071 7.355 7.719 8.064 8.381 8.762 9.144 9.511 9.945 10.43 10.889 11.407 11.957 12.511 13.117 13.82 14.611 15.404 16.354 17.419 18.633 19.977 21.547 23.395 25.492 26.998 27.688 27.993 28.161 28.224 28.178 28.041 27.875 27.679 27.452 27.228 26.995 26.755 26.558 26.389 26.201 26.016 25.844 25.663 25.473 25.308 25.135 24.96 24.806 24.632 24.45 24.26 24.067 23.946 23.814 23.588 23.443 23.288 23.197 23.007 22.814 22.599 22.483 22.257 22.131 22.012 21.879 21.586 21.425 21.242 21.054 20.857 20.609 20.223 19.402 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt deleted file mode 100644 index 85b12acc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7042 ,KEBNE ,17018361,Tue Dec 21 23:36:14 CET,Wed Dec 22 00:58:32 CET,0.0 0.632 1.055 1.39 1.692 1.985 2.256 2.507 2.977 3.194 3.399 3.681 3.994 4.173 4.518 4.852 5.176 5.331 5.627 5.912 6.309 6.561 6.82 7.188 7.535 7.881 8.234 8.576 8.989 9.398 9.817 10.309 10.764 11.2 11.71 12.288 12.839 13.431 14.075 14.772 15.483 16.263 17.172 18.096 19.179 20.398 21.85 23.452 25.289 27.519 30.198 32.293 33.382 33.916 34.23 34.4 34.439 34.414 34.331 34.191 34.056 33.937 33.787 33.613 33.452 33.295 33.102 32.91 32.735 32.532 32.301 32.122 31.947 31.742 31.576 31.406 31.211 31.01 30.802 30.645 30.498 30.268 30.09 29.921 29.834 29.628 29.397 29.15 29.024 28.808 28.63 28.479 28.306 27.944 27.768 27.57 27.323 27.045 26.737 26.34 25.588 -2 ,31030 ,KEBNE ,17018362,Tue Dec 21 23:35:12 CET,Wed Dec 22 00:56:53 CET,0.0 0.723 1.179 1.521 1.827 2.113 2.374 2.619 3.073 3.286 3.484 3.748 4.07 4.251 4.585 4.903 5.2 5.346 5.64 5.937 6.366 6.631 6.888 7.251 7.596 7.94 8.285 8.633 9.072 9.465 9.847 10.303 10.737 11.187 11.717 12.3 12.855 13.457 14.075 14.741 15.481 16.284 17.184 18.128 19.245 20.506 21.961 23.566 25.437 27.657 30.309 32.359 33.456 34.075 34.399 34.575 34.644 34.613 34.538 34.403 34.212 34.018 33.83 33.66 33.48 33.283 33.059 32.83 32.627 32.426 32.225 32.043 31.837 31.614 31.44 31.261 31.066 30.863 30.655 30.501 30.332 30.073 29.894 29.707 29.608 29.399 29.196 28.972 28.839 28.616 28.447 28.3 28.133 27.757 27.558 27.348 27.122 26.882 26.631 26.293 25.334 -3 ,27054 ,KEBNE ,17018363,Tue Dec 21 23:35:12 CET,Wed Dec 22 00:55:59 CET,0.0 0.881 1.359 1.726 2.032 2.326 2.605 2.857 3.305 3.52 3.737 4.019 4.34 4.53 4.891 5.238 5.57 5.73 6.023 6.273 6.627 6.874 7.129 7.509 7.871 8.224 8.573 8.909 9.331 9.734 10.112 10.577 11.042 11.48 11.985 12.555 13.093 13.661 14.281 14.977 15.739 16.581 17.527 18.475 19.593 20.866 22.295 23.904 25.823 28.043 30.695 32.814 33.941 34.564 34.891 35.045 35.088 35.075 35.006 34.863 34.693 34.527 34.365 34.18 33.994 33.821 33.638 33.492 33.357 33.167 32.955 32.784 32.588 32.393 32.244 32.063 31.868 31.671 31.449 31.294 31.142 30.902 30.734 30.561 30.472 30.272 30.046 29.817 29.698 29.476 29.291 29.154 29.005 28.649 28.43 28.175 27.92 27.66 27.383 27.037 26.49 -4 ,14430 ,KEBNE ,17018364,Tue Dec 21 23:35:12 CET,Wed Dec 22 00:56:54 CET,0.0 0.702 1.085 1.405 1.683 1.916 2.139 2.362 2.762 2.947 3.134 3.334 3.616 3.77 4.072 4.372 4.671 4.812 5.082 5.368 5.794 6.05 6.292 6.666 7.042 7.397 7.731 8.06 8.501 8.944 9.363 9.862 10.345 10.798 11.306 11.891 12.459 13.065 13.747 14.471 15.21 16.033 16.968 17.92 19.048 20.268 21.714 23.361 25.253 27.484 30.108 32.155 33.27 33.917 34.272 34.447 34.482 34.429 34.34 34.233 34.103 33.959 33.809 33.632 33.46 33.289 33.102 32.921 32.75 32.552 32.322 32.127 31.922 31.726 31.57 31.411 31.235 31.039 30.831 30.678 30.518 30.261 30.067 29.868 29.766 29.541 29.323 29.109 28.991 28.772 28.593 28.45 28.305 27.988 27.805 27.597 27.379 27.139 26.839 26.456 25.709 -5 ,6733 ,KEBNE ,17018365,Tue Dec 21 23:35:12 CET,Wed Dec 22 00:57:10 CET,0.0 0.863 1.361 1.76 2.072 2.35 2.613 2.849 3.292 3.503 3.709 3.978 4.28 4.448 4.774 5.092 5.413 5.576 5.893 6.19 6.599 6.857 7.099 7.456 7.816 8.166 8.51 8.849 9.277 9.685 10.061 10.506 10.978 11.433 11.925 12.49 13.043 13.631 14.262 14.94 15.667 16.517 17.521 18.514 19.66 20.904 22.332 23.899 25.729 27.926 30.496 32.521 33.57 34.179 34.549 34.733 34.765 34.745 34.697 34.584 34.438 34.241 34.021 33.827 33.648 33.49 33.303 33.123 32.974 32.8 32.595 32.419 32.222 31.996 31.824 31.64 31.431 31.212 30.98 30.819 30.663 30.413 30.228 30.034 29.936 29.725 29.499 29.273 29.16 28.944 28.767 28.613 28.436 28.045 27.843 27.643 27.413 27.147 26.867 26.571 25.932 -6 ,25114 ,KEBNE ,17018366,Tue Dec 21 23:35:12 CET,Wed Dec 22 00:55:54 CET,0.0 0.885 1.295 1.624 1.922 2.203 2.479 2.737 3.186 3.386 3.589 3.893 4.224 4.413 4.764 5.103 5.43 5.589 5.892 6.182 6.591 6.841 7.091 7.465 7.82 8.165 8.504 8.827 9.236 9.631 10.014 10.492 10.961 11.406 11.908 12.488 13.059 13.677 14.33 15.026 15.782 16.624 17.57 18.486 19.565 20.798 22.25 23.909 25.807 28.006 30.642 32.718 33.794 34.364 34.684 34.879 34.96 34.897 34.743 34.604 34.468 34.291 34.111 33.933 33.741 33.541 33.325 33.129 32.947 32.738 32.53 32.367 32.185 31.986 31.81 31.625 31.454 31.275 31.069 30.913 30.751 30.498 30.32 30.133 30.038 29.851 29.634 29.405 29.294 29.084 28.927 28.786 28.626 28.271 28.065 27.842 27.621 27.376 27.052 26.655 25.952 -7 ,24441 ,KEBNE ,17018367,Tue Dec 21 23:35:12 CET,Wed Dec 22 00:56:56 CET,0.0 0.803 1.246 1.636 1.967 2.269 2.538 2.794 3.257 3.453 3.65 3.932 4.247 4.427 4.782 5.118 5.44 5.599 5.901 6.198 6.628 6.892 7.138 7.49 7.849 8.207 8.551 8.879 9.306 9.728 10.135 10.629 11.104 11.557 12.065 12.619 13.151 13.731 14.364 15.069 15.809 16.637 17.591 18.536 19.678 20.942 22.36 24.011 25.959 28.198 30.771 32.79 33.911 34.527 34.859 35.035 35.079 35.069 35.01 34.877 34.745 34.622 34.475 34.303 34.131 33.97 33.79 33.61 33.454 33.294 33.117 32.981 32.846 32.696 32.567 32.422 32.286 32.14 31.962 31.835 31.706 31.514 31.374 31.238 31.171 31.006 30.84 30.666 30.564 30.356 30.207 30.083 29.951 29.641 29.478 29.312 29.126 28.922 28.676 28.344 27.672 -8 ,21649 ,KEBNE ,17018368,Tue Dec 21 23:35:12 CET,Wed Dec 22 00:55:53 CET,0.0 0.876 1.312 1.679 1.984 2.268 2.54 2.784 3.231 3.444 3.649 3.919 4.229 4.407 4.762 5.11 5.429 5.577 5.871 6.159 6.555 6.813 7.084 7.496 7.891 8.262 8.608 8.922 9.323 9.732 10.112 10.57 11.048 11.511 12.026 12.6 13.158 13.754 14.404 15.111 15.827 16.623 17.578 18.558 19.72 21.009 22.496 24.182 26.104 28.299 30.873 32.93 34.036 34.59 34.853 34.958 34.957 34.891 34.796 34.664 34.538 34.411 34.244 34.025 33.811 33.613 33.415 33.24 33.082 32.917 32.722 32.557 32.375 32.179 32.016 31.827 31.637 31.437 31.204 31.04 30.877 30.61 30.417 30.225 30.127 29.93 29.729 29.511 29.396 29.174 28.977 28.821 28.655 28.313 28.122 27.9 27.662 27.384 27.054 26.631 25.955 -9 ,25482 ,KEBNE ,17018369,Tue Dec 21 23:36:14 CET,Wed Dec 22 00:56:49 CET,0.0 0.614 0.954 1.252 1.532 1.778 1.993 2.206 2.622 2.81 2.99 3.213 3.51 3.667 3.966 4.261 4.554 4.696 4.981 5.26 5.643 5.89 6.131 6.455 6.757 7.058 7.355 7.65 8.029 8.394 8.758 9.194 9.615 10.041 10.529 11.083 11.627 12.18 12.781 13.45 14.145 14.913 15.81 16.759 17.869 19.12 20.572 22.207 24.139 26.366 28.942 30.959 32.057 32.67 33.0 33.132 33.177 33.17 33.12 33.051 32.961 32.85 32.712 32.561 32.412 32.262 32.103 31.962 31.832 31.667 31.494 31.36 31.2 31.033 30.896 30.754 30.602 30.437 30.267 30.143 30.008 29.791 29.646 29.499 29.416 29.235 29.035 28.834 28.738 28.532 28.41 28.295 28.164 27.858 27.708 27.561 27.348 27.106 26.868 26.529 25.848 -10 ,13606 ,KEBNE ,17018370,Tue Dec 21 23:36:14 CET,Wed Dec 22 00:58:01 CET,0.0 0.648 1.007 1.313 1.559 1.785 1.997 2.197 2.597 2.783 2.96 3.168 3.455 3.611 3.919 4.212 4.487 4.619 4.877 5.133 5.496 5.721 5.947 6.284 6.604 6.903 7.19 7.493 7.892 8.267 8.627 9.035 9.442 9.869 10.369 10.939 11.485 12.042 12.622 13.255 13.942 14.733 15.652 16.561 17.659 18.908 20.313 21.906 23.804 26.013 28.576 30.584 31.687 32.284 32.619 32.82 32.875 32.881 32.843 32.752 32.661 32.564 32.454 32.337 32.204 32.055 31.884 31.723 31.586 31.436 31.254 31.107 30.956 30.777 30.622 30.456 30.298 30.128 29.929 29.81 29.697 29.502 29.354 29.188 29.112 28.971 28.82 28.636 28.534 28.334 28.211 28.094 27.97 27.699 27.537 27.354 27.172 26.965 26.736 26.457 25.701 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_15_14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_15_14.txt deleted file mode 100644 index 115483ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_15_14.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27951 ,KEBNE ,16653389,Mon Nov 22 02:13:14 CET,Mon Nov 22 03:53:28 CET,0.0 0.355 0.476 0.601 0.737 0.851 0.94 1.039 1.226 1.303 1.38 1.446 1.594 1.661 1.79 1.911 2.038 2.099 2.221 2.341 2.518 2.644 2.765 2.939 3.097 3.24 3.381 3.515 3.695 3.879 4.062 4.286 4.505 4.71 4.947 5.219 5.476 5.753 6.062 6.394 6.754 7.162 7.623 8.097 8.655 9.257 9.936 10.737 11.703 12.726 13.535 13.792 13.799 13.683 13.34 12.918 12.568 12.249 11.954 11.647 11.369 11.08 10.801 10.525 10.257 10.003 9.723 9.476 9.252 8.975 8.636 8.333 8.002 7.676 7.429 7.156 6.846 6.491 6.125 5.886 5.644 5.261 4.999 4.71 4.562 4.253 3.905 3.524 3.316 3.05 2.649 2.393 2.171 1.641 1.29 0.857 0.359 -0.154 -0.821 -1.962 -7.908 -4 ,5495 ,KEBNE ,16653392,Mon Nov 22 02:14:16 CET,Mon Nov 22 03:54:51 CET,0.0 0.295 0.535 0.703 0.831 0.958 1.075 1.174 1.364 1.461 1.546 1.622 1.782 1.862 2.008 2.156 2.283 2.342 2.469 2.584 2.75 2.861 2.972 3.133 3.283 3.431 3.583 3.732 3.921 4.113 4.295 4.507 4.705 4.889 5.114 5.385 5.631 5.897 6.222 6.564 6.89 7.29 7.768 8.226 8.759 9.343 10.003 10.743 11.624 12.521 13.405 13.892 13.832 13.619 13.388 13.087 12.757 12.399 12.036 11.665 11.353 11.052 10.737 10.447 10.199 9.965 9.705 9.473 9.268 9.043 8.743 8.433 8.079 7.696 7.41 7.136 6.86 6.549 6.213 5.988 5.751 5.361 5.08 4.751 4.576 4.229 3.844 3.454 3.241 2.918 2.406 2.074 1.737 1.062 0.668 0.21 -0.275 -0.824 -1.494 -2.443 -7.247 -5 ,7228 ,KEBNE ,16653393,Mon Nov 22 02:14:15 CET,Mon Nov 22 03:55:03 CET,0.0 0.503 0.685 0.812 0.934 1.05 1.164 1.263 1.436 1.525 1.616 1.703 1.863 1.935 2.089 2.248 2.379 2.442 2.572 2.698 2.874 2.992 3.106 3.271 3.443 3.61 3.774 3.932 4.116 4.297 4.484 4.701 4.901 5.101 5.332 5.594 5.849 6.118 6.411 6.746 7.124 7.53 7.975 8.427 8.96 9.537 10.158 10.864 11.633 12.425 13.247 13.77 13.81 13.591 13.281 12.967 12.622 12.23 11.865 11.474 11.136 10.829 10.522 10.218 9.922 9.594 9.186 8.808 8.483 8.164 7.832 7.533 7.223 6.926 6.699 6.463 6.21 5.903 5.526 5.258 4.98 4.534 4.232 3.903 3.735 3.406 3.047 2.668 2.463 2.163 1.72 1.454 1.16 0.479 0.119 -0.224 -0.591 -1.08 -1.773 -2.696 -11.347 -6 ,4104 ,KEBNE ,16653394,Mon Nov 22 02:15:18 CET,Mon Nov 22 03:55:44 CET,0.0 0.386 0.632 0.803 0.938 1.076 1.192 1.284 1.459 1.542 1.62 1.692 1.835 1.912 2.044 2.158 2.289 2.358 2.483 2.598 2.78 2.905 3.028 3.194 3.358 3.537 3.706 3.866 4.071 4.268 4.45 4.668 4.875 5.075 5.313 5.587 5.845 6.12 6.421 6.756 7.12 7.529 7.981 8.432 8.95 9.49 10.121 10.861 11.679 12.606 13.636 14.168 14.198 13.984 13.681 13.356 13.017 12.674 12.357 11.999 11.681 11.389 11.069 10.742 10.446 10.178 9.846 9.492 9.177 8.84 8.487 8.195 7.882 7.567 7.326 7.075 6.808 6.521 6.227 6.026 5.813 5.476 5.235 4.953 4.791 4.455 4.064 3.569 3.299 2.977 2.43 2.073 1.706 0.852 0.412 0.013 -0.402 -0.85 -1.561 -2.761 -7.876 -8 ,3484 ,KEBNE ,16653396,Mon Nov 22 02:16:19 CET,Mon Nov 22 03:56:48 CET,0.0 0.427 0.59 0.745 0.884 0.997 1.096 1.191 1.38 1.468 1.554 1.653 1.822 1.919 2.108 2.267 2.399 2.463 2.601 2.751 2.96 3.084 3.204 3.385 3.558 3.725 3.891 4.053 4.251 4.441 4.626 4.852 5.091 5.321 5.565 5.844 6.122 6.432 6.756 7.065 7.398 7.787 8.233 8.726 9.308 9.912 10.613 11.404 12.273 13.176 13.964 14.23 14.195 13.967 13.651 13.311 12.932 12.529 12.122 11.694 11.312 10.967 10.656 10.355 10.035 9.738 9.428 9.111 8.798 8.447 8.09 7.811 7.526 7.218 6.978 6.726 6.446 6.153 5.826 5.594 5.362 4.974 4.692 4.406 4.259 3.949 3.622 3.225 3.008 2.733 2.367 2.154 1.927 1.425 1.116 0.705 0.217 -0.329 -0.994 -2.001 -9.444 -9 ,30250 ,KEBNE ,16653397,Mon Nov 22 02:16:19 CET,Mon Nov 22 03:54:39 CET,0.0 0.414 0.624 0.791 0.922 1.071 1.195 1.297 1.493 1.585 1.682 1.789 1.945 2.022 2.178 2.344 2.502 2.572 2.694 2.815 3.002 3.116 3.224 3.39 3.552 3.711 3.865 4.01 4.193 4.372 4.565 4.8 5.019 5.225 5.463 5.74 6.0 6.292 6.601 6.911 7.24 7.64 8.105 8.563 9.118 9.758 10.475 11.247 12.153 13.12 14.029 14.564 14.677 14.529 14.281 14.03 13.771 13.481 13.203 12.904 12.618 12.278 11.882 11.572 11.334 11.099 10.84 10.603 10.394 10.157 9.869 9.592 9.274 8.951 8.688 8.378 8.045 7.724 7.413 7.179 6.905 6.402 6.004 5.616 5.424 4.984 4.495 4.014 3.775 3.451 2.991 2.722 2.436 1.744 1.301 0.849 0.405 -0.182 -0.881 -1.88 -10.948 -10 ,31431 ,KEBNE ,16653398,Mon Nov 22 02:16:20 CET,Mon Nov 22 03:57:23 CET,0.0 0.647 0.857 1.011 1.144 1.273 1.386 1.482 1.648 1.723 1.804 1.898 2.051 2.118 2.262 2.415 2.569 2.643 2.782 2.907 3.086 3.203 3.316 3.483 3.646 3.809 3.962 4.11 4.306 4.482 4.659 4.892 5.131 5.356 5.594 5.865 6.152 6.474 6.823 7.195 7.585 8.011 8.493 8.984 9.532 10.136 10.837 11.632 12.541 13.479 14.361 14.763 14.775 14.601 14.324 14.008 13.716 13.431 13.158 12.839 12.512 12.204 11.876 11.542 11.227 10.933 10.634 10.351 10.103 9.844 9.553 9.3 8.992 8.614 8.306 7.998 7.666 7.293 6.917 6.668 6.42 6.044 5.778 5.447 5.268 4.935 4.559 4.136 3.913 3.595 3.041 2.677 2.307 1.545 1.111 0.637 0.07 -0.664 -1.512 -2.718 -15.134 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_15_16.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_15_16.txt deleted file mode 100644 index ac4cf21d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_15_16.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25483 ,KEBNE ,17041935,Thu Dec 23 03:22:49 CET,Thu Dec 23 04:59:37 CET,0.0 0.371 0.491 0.591 0.678 0.788 0.883 0.941 1.041 1.096 1.148 1.182 1.314 1.375 1.49 1.59 1.685 1.727 1.803 1.881 2.006 2.084 2.15 2.255 2.362 2.458 2.548 2.64 2.759 2.869 2.977 3.1 3.214 3.328 3.462 3.619 3.769 3.92 4.1 4.324 4.568 4.824 5.111 5.414 5.791 6.187 6.602 7.047 7.501 7.925 8.349 8.58 8.288 7.733 7.222 6.754 6.336 5.945 5.581 5.171 4.791 4.422 4.053 3.711 3.381 3.078 2.751 2.458 2.197 1.928 1.647 1.403 1.159 0.898 0.677 0.452 0.225 -0.027 -0.281 -0.463 -0.674 -1.0 -1.241 -1.488 -1.595 -1.818 -2.07 -2.353 -2.52 -2.762 -3.022 -3.175 -3.339 -3.704 -3.92 -4.189 -4.464 -4.768 -5.191 -5.773 -7.367 -2 ,7950 ,KEBNE ,17041936,Thu Dec 23 03:22:49 CET,Thu Dec 23 05:00:05 CET,0.0 0.853 1.114 1.273 1.393 1.495 1.587 1.677 1.867 1.94 2.003 2.05 2.188 2.25 2.388 2.511 2.628 2.687 2.798 2.901 3.042 3.123 3.196 3.332 3.471 3.59 3.702 3.828 4.002 4.162 4.313 4.501 4.694 4.857 5.033 5.239 5.436 5.65 5.861 6.082 6.349 6.653 6.976 7.289 7.619 7.945 8.298 8.661 9.014 9.267 9.399 9.108 8.502 7.848 7.228 6.624 6.063 5.528 5.046 4.531 4.078 3.676 3.277 2.877 2.49 2.122 1.73 1.399 1.111 0.819 0.526 0.285 0.032 -0.243 -0.458 -0.683 -0.912 -1.151 -1.417 -1.6 -1.799 -2.134 -2.363 -2.598 -2.734 -3.016 -3.3 -3.595 -3.758 -4.009 -4.321 -4.512 -4.731 -5.199 -5.451 -5.766 -6.103 -6.473 -6.926 -7.512 -9.33 -3 ,19205 ,KEBNE ,17041937,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 05:00:35 CET,0.0 0.266 0.35 0.433 0.538 0.623 0.681 0.751 0.907 0.97 1.028 1.07 1.209 1.264 1.372 1.472 1.58 1.633 1.725 1.806 1.914 1.986 2.061 2.17 2.276 2.388 2.498 2.612 2.762 2.892 3.007 3.154 3.307 3.467 3.67 3.893 4.097 4.329 4.58 4.833 5.074 5.343 5.652 5.943 6.273 6.627 7.039 7.517 8.024 8.563 9.114 9.298 9.088 8.679 8.262 7.837 7.389 6.897 6.432 5.993 5.626 5.25 4.883 4.572 4.271 3.988 3.686 3.41 3.162 2.904 2.63 2.389 2.132 1.855 1.649 1.419 1.173 0.947 0.702 0.515 0.317 0.014 -0.181 -0.39 -0.508 -0.746 -0.998 -1.276 -1.427 -1.647 -1.946 -2.133 -2.318 -2.764 -2.996 -3.258 -3.561 -3.91 -4.325 -4.892 -6.553 -4 ,24825 ,KEBNE ,17041938,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 05:01:22 CET,0.0 0.321 0.432 0.51 0.599 0.695 0.787 0.856 0.975 1.035 1.092 1.151 1.274 1.326 1.438 1.531 1.615 1.66 1.745 1.821 1.929 1.996 2.056 2.154 2.254 2.339 2.414 2.503 2.625 2.725 2.833 2.977 3.108 3.227 3.36 3.512 3.663 3.824 3.996 4.172 4.359 4.591 4.847 5.083 5.351 5.633 5.971 6.365 6.752 7.092 7.264 7.075 6.716 6.295 5.841 5.371 4.937 4.518 4.111 3.657 3.241 2.874 2.527 2.184 1.877 1.605 1.31 1.034 0.778 0.489 0.191 -0.082 -0.383 -0.675 -0.905 -1.141 -1.377 -1.634 -1.924 -2.12 -2.323 -2.662 -2.888 -3.109 -3.223 -3.474 -3.748 -4.029 -4.177 -4.407 -4.672 -4.847 -5.04 -5.481 -5.728 -5.985 -6.289 -6.689 -7.199 -7.802 -9.048 -5 ,7902 ,KEBNE ,17041939,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 05:01:14 CET,0.0 0.588 0.727 0.812 0.882 0.978 1.079 1.161 1.318 1.403 1.475 1.516 1.645 1.696 1.794 1.89 1.997 2.056 2.167 2.256 2.369 2.441 2.521 2.66 2.794 2.913 3.015 3.101 3.217 3.332 3.435 3.555 3.668 3.767 3.885 4.027 4.183 4.366 4.549 4.732 4.923 5.119 5.356 5.626 5.918 6.2 6.53 6.92 7.381 7.801 7.978 7.725 7.294 6.844 6.363 5.818 5.278 4.775 4.34 3.893 3.516 3.154 2.798 2.46 2.12 1.796 1.455 1.141 0.87 0.575 0.246 -0.015 -0.277 -0.547 -0.757 -0.972 -1.189 -1.421 -1.658 -1.813 -1.98 -2.245 -2.422 -2.617 -2.734 -2.971 -3.207 -3.477 -3.634 -3.853 -4.101 -4.266 -4.438 -4.855 -5.089 -5.36 -5.679 -6.045 -6.5 -7.029 -8.249 -6 ,26431 ,KEBNE ,17041940,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 05:00:08 CET,0.0 0.669 0.873 1.014 1.121 1.218 1.301 1.37 1.521 1.592 1.652 1.681 1.806 1.858 1.95 2.036 2.129 2.183 2.281 2.357 2.472 2.548 2.619 2.735 2.84 2.928 3.021 3.129 3.265 3.377 3.497 3.659 3.806 3.942 4.091 4.251 4.405 4.572 4.756 4.952 5.147 5.364 5.641 5.907 6.2 6.517 6.865 7.215 7.552 7.848 7.935 7.57 7.008 6.388 5.789 5.213 4.659 4.12 3.638 3.153 2.711 2.28 1.869 1.501 1.132 0.794 0.467 0.173 -0.086 -0.38 -0.692 -0.962 -1.263 -1.563 -1.802 -2.044 -2.272 -2.509 -2.757 -2.934 -3.129 -3.434 -3.646 -3.876 -4.002 -4.285 -4.595 -4.924 -5.097 -5.323 -5.614 -5.826 -6.042 -6.513 -6.793 -7.069 -7.36 -7.733 -8.183 -8.727 -10.586 -7 ,14048 ,KEBNE ,17041941,Thu Dec 23 03:22:48 CET,Thu Dec 23 05:01:00 CET,0.0 0.598 0.767 0.866 0.985 1.111 1.212 1.305 1.459 1.527 1.605 1.671 1.808 1.866 1.967 2.067 2.158 2.205 2.296 2.384 2.522 2.617 2.707 2.82 2.92 3.029 3.146 3.255 3.395 3.524 3.656 3.807 3.937 4.062 4.23 4.431 4.617 4.818 5.021 5.246 5.483 5.755 6.086 6.411 6.789 7.156 7.549 8.016 8.479 8.887 9.17 9.115 8.88 8.57 8.224 7.849 7.484 7.115 6.759 6.387 6.034 5.712 5.405 5.115 4.816 4.458 4.117 3.876 3.632 3.387 3.165 2.978 2.757 2.502 2.295 2.04 1.745 1.446 1.175 1.006 0.832 0.556 0.348 0.118 0.008 -0.211 -0.462 -0.749 -0.908 -1.154 -1.491 -1.72 -1.951 -2.382 -2.632 -2.896 -3.205 -3.635 -4.143 -4.757 -6.038 -8 ,20423 ,KEBNE ,17041942,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:02:06 CET,0.0 0.522 0.636 0.751 0.874 0.983 1.08 1.165 1.315 1.376 1.449 1.529 1.673 1.729 1.839 1.957 2.077 2.13 2.219 2.31 2.448 2.537 2.624 2.757 2.891 2.997 3.095 3.196 3.328 3.45 3.568 3.723 3.869 4.003 4.165 4.361 4.53 4.695 4.869 5.066 5.286 5.542 5.844 6.149 6.484 6.842 7.228 7.609 8.018 8.461 8.885 8.922 8.646 8.252 7.802 7.296 6.799 6.344 5.943 5.529 5.145 4.796 4.47 4.137 3.807 3.51 3.184 2.895 2.647 2.38 2.096 1.857 1.612 1.357 1.169 0.969 0.746 0.523 0.285 0.105 -0.084 -0.373 -0.578 -0.803 -0.92 -1.143 -1.383 -1.649 -1.785 -1.994 -2.242 -2.402 -2.591 -2.993 -3.205 -3.476 -3.779 -4.142 -4.597 -5.217 -7.454 -9 ,10325 ,KEBNE ,17041943,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:02:05 CET,0.0 0.267 0.397 0.512 0.621 0.722 0.814 0.897 1.067 1.143 1.215 1.281 1.422 1.483 1.609 1.729 1.854 1.915 2.024 2.117 2.259 2.359 2.452 2.584 2.702 2.811 2.92 3.029 3.173 3.316 3.45 3.605 3.76 3.908 4.093 4.308 4.501 4.721 4.962 5.212 5.483 5.795 6.135 6.473 6.866 7.279 7.768 8.303 8.824 9.226 9.529 9.442 9.021 8.55 8.063 7.628 7.244 6.859 6.525 6.191 5.867 5.562 5.259 4.956 4.666 4.388 4.103 3.839 3.602 3.35 3.084 2.836 2.552 2.264 2.03 1.782 1.536 1.263 0.988 0.806 0.619 0.328 0.125 -0.091 -0.213 -0.469 -0.722 -0.963 -1.085 -1.296 -1.55 -1.722 -1.917 -2.296 -2.486 -2.708 -2.972 -3.261 -3.639 -4.194 -5.802 -10 ,13341 ,KEBNE ,17041944,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:01:21 CET,0.0 0.52 0.625 0.7 0.766 0.823 0.888 0.955 1.071 1.132 1.197 1.24 1.369 1.419 1.521 1.619 1.713 1.761 1.863 1.958 2.099 2.193 2.27 2.385 2.511 2.63 2.736 2.836 2.974 3.113 3.26 3.433 3.57 3.694 3.847 4.037 4.22 4.415 4.624 4.857 5.096 5.348 5.624 5.898 6.223 6.549 6.874 7.234 7.605 7.88 8.04 7.845 7.432 6.977 6.519 6.014 5.502 5.037 4.607 4.151 3.741 3.36 2.993 2.658 2.331 1.994 1.642 1.349 1.08 0.78 0.481 0.254 0.041 -0.192 -0.395 -0.622 -0.86 -1.088 -1.327 -1.498 -1.663 -1.943 -2.177 -2.42 -2.531 -2.74 -2.975 -3.287 -3.459 -3.702 -3.991 -4.167 -4.361 -4.81 -5.052 -5.275 -5.524 -5.773 -6.108 -6.686 -8.357 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_16_14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_16_14.txt deleted file mode 100644 index 1f118118..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_16_14.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,2352 ,KEBNE ,16653400,Mon Nov 22 02:17:21 CET,Mon Nov 22 03:55:46 CET,0.0 0.528 0.679 0.831 0.983 1.092 1.186 1.276 1.451 1.539 1.627 1.732 1.886 1.965 2.108 2.239 2.357 2.414 2.531 2.659 2.845 2.956 3.069 3.231 3.382 3.514 3.634 3.76 3.937 4.109 4.273 4.467 4.645 4.807 4.987 5.208 5.437 5.69 5.951 6.23 6.557 6.914 7.301 7.678 8.095 8.543 8.991 9.449 9.985 10.602 11.177 11.447 11.454 11.335 11.217 11.068 10.909 10.754 10.588 10.416 10.242 10.068 9.895 9.734 9.581 9.411 9.216 9.048 8.902 8.747 8.569 8.411 8.27 8.123 7.989 7.855 7.729 7.591 7.416 7.293 7.165 6.96 6.842 6.722 6.641 6.445 6.24 6.015 5.901 5.729 5.557 5.426 5.288 4.931 4.742 4.524 4.267 3.998 3.63 3.054 0.45 -3 ,17125 ,KEBNE ,16653401,Mon Nov 22 02:17:21 CET,Mon Nov 22 03:56:41 CET,0.0 0.46 0.655 0.825 0.984 1.109 1.223 1.319 1.492 1.576 1.658 1.739 1.88 1.951 2.095 2.222 2.341 2.403 2.524 2.642 2.811 2.918 3.017 3.15 3.276 3.398 3.52 3.642 3.792 3.95 4.105 4.284 4.444 4.583 4.764 4.97 5.172 5.393 5.623 5.88 6.126 6.388 6.707 7.034 7.401 7.78 8.208 8.707 9.241 9.752 10.315 10.649 10.675 10.551 10.383 10.207 9.986 9.785 9.634 9.456 9.26 9.079 8.929 8.753 8.532 8.318 8.124 7.958 7.811 7.626 7.406 7.231 7.045 6.838 6.669 6.479 6.286 6.068 5.807 5.659 5.525 5.257 5.042 4.83 4.729 4.505 4.27 4.038 3.898 3.676 3.437 3.277 3.1 2.691 2.466 2.209 1.902 1.55 1.153 0.61 -1.576 -4 ,28271 ,KEBNE ,16653402,Mon Nov 22 02:18:23 CET,Mon Nov 22 03:55:45 CET,0.0 0.523 0.719 0.894 1.023 1.156 1.27 1.359 1.541 1.619 1.687 1.747 1.881 1.948 2.065 2.182 2.297 2.358 2.478 2.592 2.776 2.898 3.004 3.16 3.313 3.44 3.539 3.642 3.795 3.953 4.1 4.276 4.465 4.632 4.806 5.002 5.188 5.381 5.584 5.814 6.045 6.299 6.599 6.917 7.311 7.731 8.19 8.653 9.145 9.623 10.006 10.13 10.163 10.105 9.935 9.727 9.483 9.212 8.982 8.763 8.562 8.377 8.178 7.942 7.712 7.513 7.299 7.104 6.922 6.709 6.49 6.328 6.17 6.014 5.867 5.687 5.528 5.38 5.21 5.096 4.983 4.77 4.618 4.468 4.38 4.182 3.995 3.812 3.708 3.52 3.334 3.22 3.106 2.86 2.733 2.587 2.4 2.148 1.822 1.402 -1.176 -5 ,13362 ,KEBNE ,16653403,Mon Nov 22 02:19:25 CET,Mon Nov 22 03:59:01 CET,0.0 0.558 0.783 0.91 1.03 1.14 1.231 1.315 1.46 1.539 1.621 1.696 1.837 1.902 2.026 2.155 2.283 2.342 2.461 2.573 2.735 2.853 2.963 3.116 3.266 3.414 3.562 3.692 3.869 4.051 4.215 4.401 4.582 4.765 4.97 5.18 5.368 5.574 5.809 6.055 6.31 6.6 6.927 7.279 7.677 8.081 8.562 9.08 9.646 10.292 10.956 11.295 11.349 11.274 11.095 10.874 10.651 10.421 10.193 9.932 9.708 9.523 9.322 9.112 8.926 8.757 8.586 8.432 8.282 8.126 7.969 7.828 7.672 7.511 7.372 7.218 7.066 6.898 6.717 6.577 6.426 6.223 6.105 5.976 5.894 5.713 5.531 5.329 5.226 5.072 4.886 4.747 4.61 4.249 4.034 3.798 3.528 3.193 2.798 2.283 -0.126 -6 ,1614 ,KEBNE ,16653404,Mon Nov 22 02:19:26 CET,Mon Nov 22 03:59:54 CET,0.0 0.289 0.462 0.585 0.69 0.776 0.855 0.949 1.136 1.217 1.29 1.359 1.491 1.554 1.691 1.823 1.939 1.994 2.097 2.204 2.363 2.466 2.576 2.741 2.892 3.029 3.159 3.286 3.442 3.593 3.745 3.915 4.076 4.235 4.419 4.627 4.822 5.039 5.288 5.546 5.813 6.118 6.473 6.79 7.105 7.471 7.92 8.453 9.053 9.673 10.274 10.572 10.577 10.458 10.3 10.11 9.913 9.669 9.392 9.1 8.834 8.58 8.334 8.079 7.831 7.624 7.436 7.284 7.135 6.958 6.773 6.608 6.416 6.206 6.035 5.85 5.682 5.514 5.325 5.205 5.104 4.926 4.782 4.626 4.539 4.346 4.166 4.003 3.892 3.689 3.484 3.342 3.198 2.835 2.621 2.416 2.165 1.868 1.486 0.975 -1.749 -7 ,17252 ,KEBNE ,16653405,Mon Nov 22 02:19:26 CET,Mon Nov 22 04:01:31 CET,0.0 0.64 0.867 1.015 1.148 1.281 1.407 1.519 1.698 1.783 1.86 1.937 2.074 2.146 2.292 2.412 2.526 2.58 2.697 2.825 3.002 3.115 3.231 3.392 3.555 3.711 3.852 3.988 4.145 4.291 4.439 4.615 4.786 4.954 5.156 5.388 5.598 5.822 6.058 6.295 6.539 6.819 7.123 7.435 7.829 8.277 8.794 9.332 9.934 10.604 11.238 11.51 11.509 11.423 11.24 11.047 10.856 10.628 10.442 10.232 10.006 9.808 9.602 9.383 9.193 9.018 8.831 8.666 8.524 8.376 8.219 8.077 7.914 7.752 7.637 7.511 7.37 7.211 7.012 6.831 6.646 6.427 6.283 6.128 6.048 5.879 5.685 5.467 5.356 5.18 5.034 4.897 4.74 4.398 4.202 4.0 3.778 3.528 3.247 2.716 -0.053 -8 ,17396 ,KEBNE ,16653406,Mon Nov 22 02:19:29 CET,Mon Nov 22 03:55:08 CET,0.0 0.34 0.488 0.633 0.754 0.852 0.951 1.041 1.214 1.29 1.353 1.395 1.527 1.595 1.711 1.822 1.932 1.989 2.109 2.218 2.367 2.463 2.561 2.705 2.837 2.957 3.076 3.189 3.335 3.483 3.627 3.809 3.977 4.135 4.323 4.536 4.744 4.969 5.216 5.487 5.766 6.102 6.486 6.829 7.237 7.659 8.077 8.529 9.025 9.543 10.176 10.585 10.666 10.637 10.562 10.431 10.271 10.093 9.944 9.76 9.583 9.446 9.292 9.128 8.982 8.855 8.687 8.514 8.369 8.21 8.023 7.84 7.647 7.442 7.276 7.119 6.961 6.787 6.62 6.523 6.415 6.211 6.052 5.894 5.814 5.645 5.446 5.203 5.07 4.859 4.629 4.494 4.369 4.083 3.891 3.648 3.358 3.066 2.721 2.146 -0.845 -9 ,10025 ,KEBNE ,16653407,Mon Nov 22 02:20:27 CET,Mon Nov 22 03:57:19 CET,0.0 0.638 0.855 1.023 1.191 1.367 1.522 1.652 1.894 2.0 2.095 2.208 2.369 2.456 2.627 2.799 2.955 3.022 3.141 3.253 3.42 3.532 3.636 3.794 3.949 4.092 4.229 4.356 4.525 4.694 4.855 5.051 5.241 5.426 5.645 5.908 6.152 6.402 6.671 6.942 7.213 7.531 7.904 8.295 8.754 9.23 9.744 10.307 10.88 11.436 11.979 12.295 12.381 12.304 12.16 11.963 11.721 11.448 11.191 10.922 10.669 10.428 10.167 9.887 9.649 9.442 9.177 8.956 8.806 8.645 8.46 8.301 8.106 7.891 7.729 7.545 7.362 7.167 6.951 6.792 6.615 6.354 6.197 6.027 5.928 5.738 5.51 5.226 5.081 4.875 4.649 4.491 4.324 3.929 3.704 3.489 3.23 2.916 2.6 2.131 -0.68 -10 ,1056 ,KEBNE ,16653408,Mon Nov 22 02:20:27 CET,Mon Nov 22 03:58:39 CET,0.0 1.054 1.301 1.498 1.657 1.794 1.923 2.034 2.238 2.338 2.428 2.508 2.641 2.713 2.844 2.969 3.094 3.146 3.254 3.367 3.533 3.65 3.758 3.91 4.054 4.184 4.316 4.445 4.606 4.765 4.923 5.101 5.261 5.42 5.599 5.803 6.024 6.268 6.512 6.772 7.042 7.352 7.731 8.117 8.544 8.964 9.433 9.971 10.564 11.211 11.843 12.102 12.078 11.937 11.71 11.468 11.266 11.026 10.758 10.478 10.251 10.045 9.842 9.67 9.509 9.356 9.192 9.004 8.837 8.677 8.528 8.399 8.239 8.05 7.886 7.714 7.539 7.364 7.173 7.04 6.914 6.714 6.572 6.44 6.375 6.224 6.047 5.857 5.746 5.564 5.412 5.292 5.164 4.868 4.688 4.497 4.293 4.031 3.637 3.163 1.389 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_16_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_16_15.txt deleted file mode 100644 index f9c8dbbc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_16_15.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20938 ,KEBNE ,16838593,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:43:04 CET,0.0 1.957 2.487 2.916 3.303 3.612 3.867 4.077 4.5 4.711 4.904 5.214 5.452 5.616 5.933 6.22 6.488 6.634 6.915 7.171 7.548 7.771 7.977 8.256 8.508 8.759 9.009 9.252 9.554 9.837 10.106 10.423 10.718 11.001 11.359 11.747 12.088 12.478 12.885 13.281 13.707 14.199 14.734 15.206 15.723 16.275 16.869 17.478 18.053 18.536 18.696 18.382 17.991 17.641 17.292 16.953 16.651 16.365 16.1 15.808 15.546 15.307 15.086 14.894 14.728 14.566 14.381 14.225 14.092 13.951 13.805 13.692 13.566 13.433 13.333 13.228 13.126 13.024 12.922 12.845 12.763 12.63 12.534 12.435 12.384 12.278 12.167 12.045 11.977 11.831 11.782 11.725 11.659 11.507 11.403 11.277 11.169 11.059 10.938 10.813 10.117 -2 ,780 ,KEBNE ,16838594,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:44:26 CET,0.0 1.614 2.148 2.6 2.97 3.249 3.47 3.673 4.07 4.256 4.435 4.709 4.929 5.082 5.363 5.599 5.819 5.933 6.148 6.344 6.64 6.84 7.027 7.285 7.524 7.754 7.989 8.204 8.461 8.711 8.945 9.225 9.498 9.769 10.1 10.469 10.799 11.13 11.455 11.776 12.116 12.497 12.97 13.457 13.979 14.504 15.057 15.641 16.207 16.672 16.856 16.676 16.317 15.802 15.318 14.881 14.458 14.05 13.686 13.345 13.05 12.775 12.538 12.338 12.153 11.975 11.779 11.599 11.445 11.287 11.119 10.968 10.805 10.636 10.514 10.385 10.251 10.126 10.007 9.915 9.803 9.636 9.527 9.418 9.365 9.259 9.149 9.044 8.989 8.843 8.771 8.7 8.623 8.463 8.373 8.28 8.18 8.041 7.886 7.695 7.169 -3 ,28518 ,KEBNE ,16838595,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:44:35 CET,0.0 1.952 2.517 2.928 3.248 3.549 3.812 4.046 4.456 4.642 4.844 5.147 5.378 5.535 5.844 6.127 6.384 6.508 6.756 6.999 7.342 7.553 7.745 8.015 8.257 8.488 8.699 8.893 9.155 9.389 9.611 9.888 10.174 10.493 10.844 11.188 11.507 11.867 12.271 12.689 13.101 13.553 14.053 14.491 14.938 15.414 15.914 16.372 16.832 17.223 17.424 17.295 16.926 16.542 16.211 15.879 15.556 15.233 14.936 14.635 14.372 14.136 13.9 13.674 13.465 13.279 13.096 12.921 12.771 12.627 12.458 12.308 12.159 12.006 11.896 11.783 11.652 11.519 11.39 11.298 11.199 11.051 10.949 10.836 10.778 10.651 10.514 10.381 10.307 10.152 10.093 10.024 9.949 9.805 9.729 9.62 9.499 9.363 9.197 9.015 8.485 -4 ,21748 ,KEBNE ,16838596,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:45:55 CET,0.0 1.676 2.13 2.459 2.763 3.031 3.274 3.506 3.91 4.086 4.253 4.488 4.696 4.832 5.087 5.338 5.583 5.693 5.895 6.08 6.346 6.523 6.703 6.965 7.205 7.429 7.637 7.831 8.078 8.313 8.536 8.815 9.077 9.314 9.609 9.932 10.219 10.51 10.814 11.15 11.519 11.911 12.318 12.718 13.144 13.543 13.95 14.342 14.662 14.949 15.039 14.707 14.237 13.715 13.246 12.817 12.403 12.039 11.722 11.392 11.101 10.852 10.632 10.42 10.23 10.05 9.852 9.679 9.538 9.385 9.211 9.079 8.937 8.785 8.668 8.549 8.433 8.315 8.193 8.106 8.019 7.876 7.778 7.682 7.631 7.512 7.393 7.281 7.219 7.068 7.007 6.934 6.854 6.667 6.548 6.414 6.298 6.188 6.026 5.835 5.164 -5 ,8640 ,KEBNE ,16838597,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:44:11 CET,0.0 2.418 2.991 3.401 3.771 4.118 4.402 4.63 5.083 5.313 5.529 5.836 6.079 6.246 6.556 6.857 7.131 7.25 7.486 7.719 8.051 8.26 8.462 8.749 9.0 9.249 9.492 9.725 10.042 10.332 10.593 10.906 11.205 11.482 11.805 12.156 12.466 12.81 13.184 13.572 13.986 14.45 14.942 15.352 15.788 16.289 16.82 17.285 17.701 17.997 18.012 17.626 17.185 16.755 16.323 15.905 15.517 15.186 14.925 14.671 14.447 14.251 14.061 13.876 13.71 13.569 13.43 13.299 13.18 13.059 12.93 12.823 12.714 12.608 12.52 12.417 12.324 12.233 12.139 12.072 11.994 11.865 11.775 11.681 11.639 11.559 11.468 11.366 11.309 11.17 11.122 11.065 10.989 10.817 10.743 10.643 10.545 10.435 10.303 10.134 9.754 -6 ,31443 ,KEBNE ,16838598,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:45:07 CET,0.0 1.751 2.241 2.624 2.96 3.246 3.505 3.745 4.193 4.396 4.573 4.818 5.03 5.172 5.45 5.735 6.017 6.147 6.393 6.62 6.953 7.164 7.347 7.594 7.833 8.051 8.262 8.473 8.739 8.98 9.203 9.474 9.726 9.977 10.28 10.617 10.92 11.241 11.584 11.933 12.267 12.636 13.094 13.531 13.962 14.373 14.816 15.286 15.709 16.021 16.168 15.962 15.541 15.059 14.659 14.292 13.966 13.665 13.392 13.126 12.889 12.68 12.48 12.287 12.104 11.932 11.736 11.538 11.39 11.249 11.09 10.947 10.797 10.662 10.56 10.451 10.331 10.215 10.098 10.017 9.937 9.818 9.742 9.653 9.608 9.518 9.423 9.322 9.269 9.144 9.101 9.026 8.956 8.798 8.702 8.591 8.464 8.312 8.161 8.006 7.408 -7 ,24407 ,KEBNE ,16838599,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:47:24 CET,0.0 1.574 2.088 2.548 2.939 3.243 3.54 3.801 4.245 4.436 4.602 4.848 5.063 5.201 5.473 5.719 5.943 6.049 6.28 6.504 6.801 6.99 7.17 7.437 7.693 7.937 8.164 8.375 8.653 8.928 9.202 9.514 9.775 10.04 10.386 10.76 11.101 11.486 11.883 12.3 12.725 13.122 13.542 13.956 14.414 14.837 15.199 15.564 16.005 16.304 16.278 15.885 15.418 14.955 14.494 14.069 13.698 13.38 13.085 12.782 12.545 12.323 12.108 11.913 11.719 11.546 11.385 11.228 11.091 10.946 10.799 10.686 10.57 10.446 10.345 10.23 10.119 10.008 9.886 9.816 9.751 9.629 9.531 9.427 9.379 9.292 9.203 9.106 9.05 8.909 8.856 8.8 8.736 8.564 8.484 8.42 8.347 8.259 8.148 7.968 7.267 -8 ,22194 ,KEBNE ,16838600,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:45:11 CET,0.0 2.016 2.635 3.072 3.389 3.649 3.887 4.127 4.582 4.761 4.935 5.244 5.501 5.669 5.962 6.232 6.468 6.582 6.805 7.019 7.312 7.494 7.675 7.948 8.219 8.46 8.682 8.917 9.227 9.509 9.766 10.094 10.433 10.734 11.047 11.412 11.761 12.117 12.508 12.916 13.31 13.719 14.187 14.661 15.203 15.768 16.391 17.042 17.598 17.966 18.06 17.681 17.102 16.558 16.048 15.558 15.105 14.682 14.336 13.988 13.683 13.407 13.147 12.911 12.705 12.53 12.336 12.156 11.998 11.825 11.641 11.496 11.359 11.21 11.087 10.966 10.842 10.709 10.578 10.486 10.389 10.24 10.133 10.024 9.967 9.838 9.705 9.589 9.531 9.39 9.337 9.266 9.192 9.041 8.947 8.854 8.774 8.662 8.495 8.309 7.912 -9 ,19111 ,KEBNE ,16838601,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:42:58 CET,0.0 1.663 2.314 2.836 3.273 3.611 3.884 4.157 4.646 4.864 5.077 5.385 5.628 5.776 6.059 6.328 6.57 6.691 6.926 7.142 7.446 7.638 7.852 8.161 8.428 8.669 8.894 9.111 9.392 9.658 9.902 10.201 10.494 10.778 11.094 11.45 11.801 12.151 12.505 12.896 13.308 13.749 14.22 14.682 15.23 15.788 16.35 16.908 17.508 18.023 18.271 18.194 17.924 17.567 17.155 16.726 16.341 15.986 15.679 15.385 15.136 14.889 14.649 14.442 14.245 14.065 13.875 13.686 13.532 13.378 13.21 13.073 12.934 12.797 12.691 12.574 12.45 12.315 12.171 12.078 11.989 11.854 11.759 11.652 11.594 11.478 11.367 11.258 11.201 11.068 11.008 10.922 10.844 10.697 10.597 10.484 10.39 10.303 10.205 10.064 9.627 -10 ,1571 ,KEBNE ,16838602,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:46:21 CET,0.0 1.486 2.127 2.619 2.992 3.297 3.569 3.811 4.269 4.484 4.684 4.967 5.193 5.343 5.64 5.923 6.181 6.308 6.565 6.804 7.151 7.368 7.565 7.831 8.085 8.341 8.596 8.842 9.135 9.398 9.661 9.993 10.311 10.606 10.938 11.316 11.685 12.077 12.448 12.806 13.184 13.624 14.122 14.596 15.123 15.624 16.148 16.717 17.246 17.663 17.843 17.572 17.096 16.542 15.938 15.368 14.918 14.544 14.21 13.873 13.591 13.328 13.073 12.85 12.635 12.432 12.217 12.017 11.848 11.668 11.491 11.352 11.208 11.063 10.943 10.812 10.682 10.542 10.386 10.29 10.194 10.037 9.938 9.824 9.765 9.648 9.518 9.394 9.337 9.189 9.113 9.037 8.949 8.77 8.684 8.572 8.458 8.354 8.203 7.965 7.46 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_17_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_17_15.txt deleted file mode 100644 index bda7745a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_17_15.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12587 ,KEBNE ,16653409,Mon Nov 22 02:20:27 CET,Mon Nov 22 03:59:00 CET,0.0 1.11 1.539 1.854 2.115 2.366 2.589 2.781 3.149 3.319 3.474 3.685 3.897 4.026 4.27 4.499 4.714 4.818 5.031 5.227 5.506 5.69 5.86 6.094 6.316 6.532 6.744 6.945 7.186 7.412 7.646 7.944 8.222 8.488 8.794 9.125 9.429 9.75 10.121 10.515 10.891 11.307 11.807 12.273 12.758 13.268 13.777 14.327 14.928 15.446 15.778 15.792 15.625 15.391 15.098 14.764 14.414 14.091 13.832 13.526 13.257 13.022 12.791 12.578 12.376 12.167 11.942 11.755 11.602 11.437 11.247 11.091 10.939 10.775 10.648 10.519 10.373 10.224 10.075 9.969 9.856 9.687 9.565 9.433 9.371 9.249 9.123 8.967 8.885 8.726 8.626 8.518 8.415 8.233 8.126 7.98 7.813 7.67 7.508 7.257 5.804 -3 ,24246 ,KEBNE ,16653411,Mon Nov 22 02:21:29 CET,Mon Nov 22 04:00:35 CET,0.0 1.134 1.534 1.858 2.14 2.39 2.593 2.775 3.103 3.262 3.422 3.626 3.823 3.953 4.207 4.446 4.664 4.763 4.967 5.158 5.417 5.586 5.75 5.979 6.196 6.4 6.594 6.785 7.035 7.266 7.501 7.787 8.039 8.277 8.556 8.88 9.192 9.511 9.833 10.168 10.531 10.931 11.347 11.733 12.145 12.577 13.049 13.539 14.025 14.442 14.755 14.711 14.41 14.097 13.752 13.317 12.917 12.597 12.292 11.981 11.735 11.504 11.256 11.011 10.783 10.554 10.342 10.186 10.03 9.849 9.67 9.533 9.39 9.233 9.112 8.99 8.868 8.728 8.578 8.475 8.362 8.185 8.063 7.939 7.87 7.733 7.598 7.419 7.33 7.179 7.07 6.976 6.889 6.696 6.582 6.446 6.294 6.126 5.917 5.552 4.864 -4 ,9622 ,KEBNE ,16653412,Mon Nov 22 02:22:31 CET,Mon Nov 22 04:01:30 CET,0.0 1.546 2.014 2.312 2.543 2.781 3.011 3.218 3.562 3.726 3.893 4.128 4.331 4.457 4.675 4.875 5.069 5.168 5.372 5.572 5.84 6.009 6.178 6.41 6.619 6.829 7.031 7.223 7.481 7.73 7.967 8.249 8.513 8.757 9.035 9.337 9.615 9.936 10.276 10.586 10.919 11.313 11.742 12.168 12.613 13.012 13.491 14.074 14.704 15.309 15.838 15.882 15.585 15.23 14.87 14.52 14.198 13.893 13.65 13.397 13.158 12.94 12.743 12.57 12.39 12.207 12.018 11.855 11.717 11.575 11.427 11.295 11.156 11.023 10.911 10.789 10.672 10.562 10.442 10.353 10.252 10.088 9.971 9.841 9.772 9.645 9.519 9.355 9.269 9.112 9.007 8.915 8.817 8.571 8.44 8.295 8.138 7.975 7.782 7.555 6.674 -5 ,31234 ,KEBNE ,16653413,Mon Nov 22 02:22:31 CET,Mon Nov 22 04:02:37 CET,0.0 1.319 1.805 2.202 2.522 2.778 2.989 3.181 3.518 3.672 3.815 4.004 4.214 4.345 4.61 4.872 5.105 5.221 5.453 5.656 5.911 6.06 6.224 6.464 6.682 6.885 7.084 7.277 7.525 7.757 7.992 8.278 8.526 8.77 9.043 9.337 9.617 9.915 10.226 10.552 10.893 11.259 11.697 12.146 12.61 13.081 13.59 14.131 14.67 15.07 15.244 15.102 14.757 14.315 13.912 13.554 13.215 12.899 12.634 12.37 12.129 11.898 11.668 11.434 11.2 10.982 10.777 10.604 10.44 10.274 10.108 9.962 9.82 9.674 9.56 9.441 9.318 9.194 9.052 8.957 8.871 8.725 8.613 8.492 8.43 8.292 8.132 7.961 7.873 7.713 7.63 7.549 7.454 7.248 7.135 7.008 6.87 6.695 6.503 6.263 5.477 -7 ,8411 ,KEBNE ,16653415,Mon Nov 22 02:24:35 CET,Mon Nov 22 04:06:27 CET,0.0 1.011 1.388 1.665 1.893 2.1 2.287 2.461 2.772 2.9 3.03 3.21 3.405 3.519 3.717 3.898 4.072 4.166 4.362 4.544 4.791 4.955 5.111 5.315 5.514 5.704 5.89 6.072 6.311 6.532 6.732 6.981 7.221 7.443 7.7 7.991 8.25 8.525 8.816 9.121 9.451 9.824 10.24 10.642 11.084 11.567 12.13 12.705 13.267 13.707 13.957 13.86 13.526 13.203 12.882 12.535 12.182 11.816 11.509 11.218 10.972 10.755 10.556 10.367 10.177 10.006 9.815 9.621 9.454 9.289 9.116 8.963 8.804 8.653 8.543 8.418 8.279 8.138 7.994 7.891 7.781 7.619 7.503 7.39 7.338 7.222 7.086 6.942 6.871 6.715 6.628 6.535 6.425 6.172 6.044 5.889 5.723 5.567 5.382 5.076 4.068 -9 ,22561 ,KEBNE ,16653417,Mon Nov 22 02:24:35 CET,Mon Nov 22 04:05:38 CET,0.0 0.704 1.103 1.445 1.724 1.942 2.14 2.348 2.733 2.9 3.051 3.254 3.449 3.565 3.803 4.031 4.246 4.347 4.524 4.706 4.993 5.172 5.337 5.575 5.797 5.995 6.195 6.383 6.625 6.857 7.07 7.327 7.569 7.811 8.097 8.408 8.691 8.995 9.331 9.675 10.016 10.399 10.83 11.248 11.7 12.16 12.671 13.185 13.66 14.018 14.11 13.697 13.148 12.693 12.258 11.838 11.443 11.103 10.773 10.372 10.038 9.781 9.537 9.279 9.029 8.798 8.571 8.388 8.238 8.078 7.894 7.717 7.534 7.361 7.219 7.067 6.913 6.751 6.594 6.482 6.368 6.217 6.115 5.997 5.934 5.807 5.67 5.515 5.435 5.287 5.192 5.096 4.99 4.808 4.713 4.602 4.474 4.31 4.105 3.837 3.142 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_18_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_18_15.txt deleted file mode 100644 index a0625901..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_18_15.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21452 ,KEBNE ,17023435,Wed Dec 22 08:07:41 CET,Wed Dec 22 09:46:36 CET,0.0 1.409 1.86 2.219 2.522 2.803 3.052 3.265 3.662 3.849 4.008 4.234 4.462 4.598 4.852 5.087 5.301 5.403 5.599 5.8 6.089 6.253 6.404 6.633 6.86 7.063 7.265 7.465 7.724 7.992 8.247 8.551 8.835 9.106 9.423 9.772 10.104 10.47 10.854 11.236 11.629 12.074 12.567 13.023 13.551 14.158 14.841 15.551 16.242 16.877 17.455 17.603 17.477 17.29 17.023 16.74 16.478 16.188 15.938 15.718 15.527 15.342 15.16 14.98 14.804 14.635 14.453 14.288 14.144 13.996 13.848 13.719 13.578 13.429 13.321 13.216 13.102 12.983 12.865 12.784 12.693 12.55 12.453 12.333 12.264 12.14 12.033 11.929 11.872 11.725 11.628 11.533 11.43 11.222 11.118 11.006 10.873 10.734 10.569 10.262 9.538 -2 ,29706 ,KEBNE ,17023436,Wed Dec 22 08:07:41 CET,Wed Dec 22 09:45:43 CET,0.0 1.178 1.589 1.936 2.207 2.442 2.672 2.883 3.241 3.392 3.547 3.789 4.015 4.141 4.39 4.63 4.847 4.944 5.133 5.333 5.6 5.775 5.946 6.185 6.425 6.671 6.918 7.14 7.397 7.624 7.853 8.149 8.421 8.676 8.981 9.322 9.661 10.048 10.433 10.8 11.185 11.623 12.092 12.535 13.046 13.613 14.244 14.943 15.703 16.474 17.184 17.491 17.448 17.26 17.034 16.812 16.53 16.199 15.95 15.756 15.564 15.352 15.145 14.949 14.767 14.601 14.44 14.29 14.139 13.995 13.864 13.756 13.629 13.494 13.397 13.293 13.185 13.067 12.95 12.882 12.806 12.678 12.58 12.48 12.434 12.312 12.157 12.005 11.935 11.789 11.696 11.612 11.537 11.381 11.288 11.185 11.057 10.915 10.794 10.604 10.13 -3 ,18949 ,KEBNE ,17023437,Wed Dec 22 08:07:42 CET,Wed Dec 22 09:45:50 CET,0.0 0.999 1.353 1.699 2.002 2.24 2.457 2.674 3.05 3.211 3.358 3.567 3.782 3.918 4.179 4.421 4.667 4.783 4.996 5.194 5.471 5.656 5.832 6.086 6.336 6.578 6.803 7.018 7.307 7.58 7.83 8.122 8.407 8.68 8.984 9.33 9.654 9.992 10.341 10.738 11.173 11.646 12.163 12.655 13.246 13.87 14.54 15.233 15.953 16.61 16.99 17.044 16.97 16.734 16.402 16.073 15.787 15.516 15.275 15.02 14.793 14.594 14.399 14.218 14.07 13.93 13.773 13.648 13.528 13.398 13.276 13.17 13.048 12.9 12.779 12.669 12.566 12.463 12.36 12.286 12.209 12.094 12.012 11.925 11.881 11.783 11.676 11.558 11.499 11.363 11.312 11.252 11.181 11.0 10.911 10.813 10.697 10.58 10.442 10.245 9.395 -4 ,6784 ,KEBNE ,17023438,Wed Dec 22 08:07:42 CET,Wed Dec 22 09:46:37 CET,0.0 1.085 1.568 1.892 2.16 2.428 2.697 2.937 3.34 3.524 3.719 3.981 4.22 4.385 4.704 4.985 5.252 5.383 5.621 5.846 6.15 6.321 6.491 6.746 6.989 7.221 7.446 7.673 7.961 8.212 8.444 8.726 9.001 9.242 9.505 9.812 10.117 10.454 10.804 11.185 11.609 12.056 12.539 13.011 13.535 14.133 14.799 15.518 16.277 16.9 17.357 17.503 17.374 17.149 16.913 16.663 16.396 16.144 15.901 15.649 15.436 15.237 15.044 14.845 14.654 14.483 14.295 14.119 13.962 13.813 13.693 13.61 13.514 13.392 13.293 13.198 13.093 12.973 12.85 12.774 12.704 12.592 12.51 12.415 12.364 12.269 12.17 12.066 12.015 11.881 11.799 11.717 11.632 11.451 11.349 11.244 11.151 11.052 10.932 10.757 10.308 -5 ,4793 ,KEBNE ,17023439,Wed Dec 22 08:07:42 CET,Wed Dec 22 09:47:03 CET,0.0 1.227 1.721 2.14 2.459 2.699 2.925 3.151 3.577 3.766 3.942 4.188 4.412 4.558 4.834 5.095 5.346 5.467 5.707 5.948 6.273 6.473 6.658 6.923 7.184 7.43 7.665 7.893 8.188 8.48 8.753 9.061 9.347 9.625 9.956 10.33 10.685 11.062 11.484 11.936 12.381 12.852 13.369 13.873 14.411 14.987 15.666 16.319 16.976 17.653 18.22 18.394 18.307 18.08 17.807 17.556 17.322 17.054 16.805 16.574 16.366 16.16 15.96 15.784 15.617 15.451 15.289 15.155 15.035 14.909 14.774 14.665 14.553 14.435 14.344 14.244 14.138 14.043 13.946 13.877 13.81 13.689 13.599 13.514 13.471 13.378 13.277 13.186 13.134 12.999 12.95 12.888 12.828 12.712 12.65 12.588 12.515 12.416 12.286 12.078 11.49 -6 ,28769 ,KEBNE ,17023440,Wed Dec 22 08:08:43 CET,Wed Dec 22 09:47:33 CET,0.0 1.369 1.84 2.226 2.545 2.823 3.069 3.296 3.682 3.854 4.031 4.263 4.473 4.606 4.861 5.102 5.314 5.415 5.611 5.797 6.056 6.22 6.398 6.669 6.905 7.118 7.32 7.515 7.759 7.998 8.229 8.493 8.742 8.997 9.316 9.659 9.963 10.288 10.651 11.035 11.439 11.899 12.416 12.905 13.442 14.041 14.734 15.429 16.098 16.714 17.291 17.509 17.444 17.301 17.101 16.873 16.61 16.324 16.093 15.878 15.637 15.408 15.203 15.008 14.819 14.643 14.492 14.356 14.218 14.08 13.948 13.823 13.67 13.502 13.389 13.278 13.178 13.096 12.997 12.931 12.87 12.772 12.69 12.598 12.553 12.444 12.328 12.206 12.137 11.991 11.921 11.846 11.773 11.648 11.577 11.494 11.425 11.351 11.24 11.06 10.468 -8 ,23361 ,KEBNE ,17023442,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:46:28 CET,0.0 1.27 1.71 2.03 2.304 2.568 2.803 3.001 3.353 3.51 3.663 3.884 4.103 4.236 4.472 4.699 4.924 5.038 5.245 5.434 5.702 5.871 6.035 6.289 6.539 6.769 6.991 7.207 7.47 7.714 7.965 8.26 8.543 8.825 9.144 9.499 9.835 10.175 10.538 10.926 11.321 11.774 12.284 12.79 13.381 13.931 14.472 15.116 15.824 16.533 17.132 17.361 17.362 17.233 17.041 16.801 16.556 16.329 16.122 15.892 15.695 15.52 15.345 15.181 15.024 14.868 14.704 14.558 14.444 14.332 14.198 14.084 13.971 13.849 13.758 13.663 13.554 13.452 13.348 13.276 13.203 13.085 13.005 12.931 12.891 12.8 12.701 12.604 12.55 12.418 12.378 12.311 12.245 12.095 12.023 11.939 11.843 11.742 11.622 11.504 11.299 -9 ,5721 ,KEBNE ,17023443,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:47:23 CET,0.0 0.828 1.213 1.518 1.786 2.026 2.256 2.483 2.882 3.051 3.208 3.434 3.648 3.781 4.038 4.286 4.529 4.648 4.872 5.082 5.402 5.607 5.794 6.053 6.294 6.529 6.771 7.012 7.305 7.567 7.805 8.097 8.386 8.659 8.96 9.296 9.627 9.988 10.34 10.701 11.083 11.502 11.989 12.472 12.992 13.502 14.072 14.659 15.231 15.837 16.328 16.393 16.267 16.075 15.848 15.597 15.334 15.1 14.894 14.668 14.473 14.288 14.121 13.981 13.826 13.673 13.538 13.415 13.298 13.178 13.048 12.928 12.801 12.687 12.602 12.511 12.416 12.307 12.169 12.072 11.981 11.849 11.749 11.648 11.606 11.514 11.399 11.259 11.182 11.034 10.957 10.884 10.805 10.621 10.51 10.392 10.278 10.14 9.946 9.643 8.672 -10 ,15497 ,KEBNE ,17023444,Wed Dec 22 08:08:43 CET,Wed Dec 22 09:47:54 CET,0.0 1.567 2.045 2.401 2.707 2.986 3.221 3.421 3.762 3.93 4.089 4.281 4.487 4.621 4.884 5.117 5.342 5.449 5.641 5.833 6.105 6.266 6.426 6.661 6.869 7.067 7.27 7.472 7.73 7.964 8.183 8.457 8.717 8.967 9.257 9.576 9.887 10.206 10.541 10.914 11.284 11.683 12.155 12.628 13.14 13.701 14.322 14.957 15.635 16.245 16.671 16.703 16.492 16.262 16.078 15.873 15.636 15.401 15.178 14.952 14.753 14.572 14.389 14.216 14.048 13.879 13.703 13.561 13.456 13.328 13.17 13.034 12.892 12.743 12.631 12.52 12.404 12.283 12.15 12.06 11.977 11.859 11.774 11.677 11.629 11.533 11.438 11.333 11.266 11.12 11.067 10.996 10.914 10.747 10.661 10.566 10.453 10.313 10.149 9.989 9.656 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_18_16.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_18_16.txt deleted file mode 100644 index 6e360a39..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_18_16.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27969 ,KEBNE ,16653419,Mon Nov 22 02:28:41 CET,Mon Nov 22 04:09:28 CET,0.0 0.338 0.462 0.568 0.655 0.732 0.819 0.899 1.015 1.087 1.159 1.216 1.365 1.424 1.524 1.63 1.727 1.774 1.871 1.961 2.1 2.199 2.297 2.428 2.56 2.686 2.803 2.918 3.053 3.177 3.307 3.469 3.626 3.779 3.966 4.187 4.374 4.574 4.828 5.121 5.414 5.733 6.094 6.447 6.897 7.389 7.911 8.501 9.126 9.684 10.158 10.375 10.421 10.352 10.206 10.024 9.83 9.655 9.486 9.31 9.168 9.028 8.889 8.762 8.634 8.512 8.38 8.259 8.162 8.058 7.936 7.826 7.703 7.573 7.47 7.358 7.247 7.125 6.991 6.907 6.824 6.679 6.575 6.469 6.415 6.298 6.171 6.039 5.976 5.837 5.727 5.638 5.545 5.356 5.258 5.143 4.981 4.784 4.536 4.246 3.242 -2 ,9164 ,KEBNE ,16653420,Mon Nov 22 02:29:47 CET,Mon Nov 22 04:02:52 CET,0.0 0.237 0.353 0.443 0.555 0.666 0.753 0.822 0.959 1.026 1.086 1.132 1.258 1.304 1.401 1.498 1.592 1.636 1.728 1.813 1.924 1.997 2.074 2.194 2.31 2.422 2.524 2.615 2.734 2.862 2.988 3.136 3.285 3.421 3.559 3.719 3.884 4.067 4.277 4.506 4.739 4.988 5.265 5.543 5.896 6.289 6.695 7.133 7.66 8.248 8.862 9.268 9.314 9.162 9.002 8.853 8.664 8.494 8.339 8.158 7.979 7.818 7.681 7.557 7.434 7.316 7.194 7.067 6.933 6.808 6.685 6.577 6.462 6.34 6.246 6.138 6.028 5.921 5.8 5.725 5.646 5.507 5.403 5.298 5.245 5.135 5.024 4.9 4.831 4.687 4.608 4.521 4.427 4.223 4.104 3.969 3.833 3.676 3.45 3.1 1.913 -3 ,21309 ,KEBNE ,16653421,Mon Nov 22 02:34:58 CET,Mon Nov 22 04:11:39 CET,0.0 0.356 0.505 0.613 0.71 0.822 0.925 0.991 1.096 1.151 1.21 1.25 1.379 1.436 1.539 1.646 1.755 1.804 1.896 1.985 2.115 2.195 2.276 2.395 2.494 2.593 2.694 2.783 2.9 3.021 3.129 3.264 3.407 3.551 3.718 3.886 4.043 4.218 4.396 4.596 4.828 5.073 5.339 5.608 5.914 6.26 6.649 7.029 7.459 7.968 8.432 8.665 8.689 8.588 8.4 8.16 7.928 7.717 7.488 7.253 7.07 6.901 6.736 6.561 6.393 6.258 6.108 5.953 5.823 5.696 5.56 5.443 5.314 5.189 5.1 5.001 4.899 4.796 4.687 4.605 4.511 4.361 4.239 4.132 4.088 3.98 3.869 3.757 3.689 3.538 3.434 3.342 3.238 3.027 2.912 2.795 2.67 2.495 2.259 1.902 0.704 -5 ,1760 ,KEBNE ,16653423,Mon Nov 22 02:35:55 CET,Mon Nov 22 04:14:40 CET,0.0 0.263 0.436 0.586 0.717 0.821 0.916 1.012 1.184 1.255 1.334 1.41 1.557 1.635 1.771 1.881 1.993 2.047 2.155 2.26 2.412 2.515 2.617 2.752 2.88 3.011 3.126 3.239 3.398 3.554 3.699 3.86 4.027 4.194 4.378 4.595 4.8 5.024 5.274 5.553 5.851 6.169 6.524 6.83 7.172 7.6 8.129 8.697 9.32 10.064 10.835 11.222 11.303 11.27 11.15 10.99 10.858 10.68 10.493 10.322 10.169 10.014 9.84 9.683 9.525 9.354 9.191 9.064 8.95 8.824 8.675 8.549 8.417 8.277 8.173 8.063 7.952 7.843 7.717 7.625 7.532 7.385 7.29 7.184 7.116 6.968 6.843 6.737 6.681 6.555 6.506 6.434 6.354 6.206 6.118 6.015 5.911 5.799 5.662 5.441 3.784 -6 ,16170 ,KEBNE ,16653424,Mon Nov 22 02:35:59 CET,Mon Nov 22 04:13:31 CET,0.0 0.195 0.319 0.42 0.5 0.57 0.632 0.697 0.841 0.92 0.995 1.039 1.166 1.216 1.312 1.408 1.505 1.549 1.627 1.714 1.851 1.931 2.006 2.114 2.222 2.329 2.429 2.519 2.64 2.76 2.878 3.022 3.159 3.289 3.438 3.605 3.782 4.012 4.258 4.509 4.782 5.07 5.392 5.71 6.086 6.526 7.042 7.62 8.278 8.946 9.652 10.112 10.169 10.113 10.023 9.886 9.742 9.609 9.457 9.275 9.107 8.915 8.728 8.582 8.439 8.319 8.205 8.072 7.955 7.832 7.686 7.572 7.463 7.349 7.241 7.115 6.987 6.851 6.71 6.613 6.508 6.341 6.218 6.082 6.005 5.833 5.658 5.5 5.422 5.275 5.182 5.102 5.018 4.84 4.748 4.631 4.513 4.4 4.236 3.936 2.898 -7 ,20462 ,KEBNE ,16653425,Mon Nov 22 02:37:59 CET,Mon Nov 22 04:16:37 CET,0.0 0.237 0.371 0.475 0.575 0.661 0.734 0.814 0.973 1.038 1.095 1.128 1.254 1.303 1.406 1.519 1.613 1.653 1.735 1.824 1.948 2.019 2.093 2.206 2.319 2.424 2.525 2.621 2.747 2.871 2.993 3.144 3.279 3.399 3.551 3.725 3.88 4.053 4.254 4.469 4.689 4.944 5.237 5.537 5.879 6.238 6.664 7.162 7.747 8.368 9.073 9.525 9.669 9.675 9.541 9.331 9.119 8.876 8.636 8.387 8.15 7.946 7.763 7.591 7.41 7.233 7.032 6.827 6.67 6.526 6.37 6.238 6.108 5.989 5.886 5.769 5.636 5.489 5.352 5.256 5.158 5.004 4.895 4.786 4.725 4.613 4.496 4.354 4.281 4.136 4.057 3.973 3.884 3.675 3.543 3.421 3.308 3.18 2.97 2.686 1.487 -8 ,12142 ,KEBNE ,16653426,Mon Nov 22 02:39:02 CET,Mon Nov 22 04:17:44 CET,0.0 0.281 0.403 0.52 0.633 0.737 0.835 0.924 1.073 1.143 1.215 1.278 1.425 1.488 1.598 1.71 1.824 1.877 1.969 2.049 2.16 2.235 2.317 2.445 2.571 2.695 2.818 2.939 3.103 3.263 3.405 3.564 3.732 3.892 4.076 4.291 4.501 4.73 4.978 5.257 5.545 5.862 6.249 6.661 7.091 7.56 8.154 8.723 9.326 10.055 10.797 11.275 11.385 11.308 11.177 11.011 10.855 10.726 10.6 10.461 10.332 10.197 10.057 9.93 9.81 9.7 9.553 9.419 9.32 9.212 9.094 8.987 8.876 8.764 8.664 8.546 8.412 8.27 8.129 8.034 7.939 7.776 7.652 7.537 7.489 7.394 7.287 7.169 7.098 6.954 6.883 6.817 6.753 6.583 6.466 6.341 6.196 5.998 5.754 5.434 4.457 -10 ,24445 ,KEBNE ,16653428,Mon Nov 22 02:41:05 CET,Mon Nov 22 04:20:14 CET,0.0 0.435 0.622 0.734 0.813 0.879 0.952 1.02 1.15 1.212 1.263 1.297 1.435 1.502 1.628 1.737 1.831 1.876 1.959 2.038 2.165 2.244 2.32 2.44 2.546 2.642 2.749 2.853 2.987 3.123 3.239 3.36 3.486 3.619 3.777 3.947 4.108 4.308 4.51 4.71 4.936 5.191 5.488 5.796 6.163 6.558 6.974 7.467 8.009 8.428 8.786 8.988 8.93 8.796 8.68 8.537 8.385 8.242 8.109 7.959 7.812 7.681 7.574 7.48 7.383 7.289 7.182 7.074 6.971 6.87 6.767 6.683 6.604 6.499 6.406 6.319 6.239 6.158 6.06 5.989 5.913 5.784 5.698 5.607 5.562 5.468 5.375 5.26 5.198 5.081 5.038 4.974 4.91 4.784 4.705 4.599 4.452 4.287 4.118 3.855 2.518 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_18_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_18_17.txt deleted file mode 100644 index 43f97fa4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_18_17.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,24032 ,KEBNE ,16653430,Mon Nov 22 02:42:07 CET,Mon Nov 22 04:21:39 CET,0.0 0.931 1.168 1.36 1.536 1.667 1.784 1.91 2.131 2.225 2.326 2.443 2.601 2.68 2.842 2.992 3.13 3.196 3.326 3.453 3.618 3.726 3.835 3.987 4.13 4.267 4.398 4.52 4.67 4.814 4.951 5.123 5.292 5.452 5.65 5.869 6.064 6.28 6.524 6.795 7.063 7.345 7.664 7.959 8.318 8.735 9.164 9.594 10.031 10.456 10.86 11.031 10.996 10.879 10.709 10.486 10.284 10.116 9.95 9.742 9.54 9.374 9.232 9.086 8.946 8.822 8.677 8.547 8.455 8.362 8.253 8.154 8.051 7.938 7.854 7.78 7.698 7.598 7.488 7.409 7.33 7.212 7.123 7.023 6.981 6.901 6.801 6.696 6.645 6.515 6.447 6.384 6.317 6.156 6.061 5.958 5.845 5.716 5.532 5.293 4.771 -3 ,16928 ,KEBNE ,16653431,Mon Nov 22 02:42:08 CET,Mon Nov 22 04:21:35 CET,0.0 0.612 0.809 0.966 1.088 1.21 1.341 1.45 1.618 1.693 1.766 1.827 1.963 2.031 2.165 2.292 2.415 2.472 2.59 2.716 2.88 2.984 3.094 3.232 3.344 3.456 3.568 3.685 3.821 3.942 4.063 4.215 4.358 4.491 4.649 4.838 5.039 5.24 5.456 5.7 5.955 6.246 6.562 6.876 7.205 7.557 7.991 8.42 8.864 9.292 9.61 9.728 9.626 9.454 9.257 9.007 8.784 8.594 8.418 8.229 8.065 7.907 7.748 7.588 7.453 7.343 7.209 7.079 6.952 6.808 6.667 6.566 6.468 6.365 6.278 6.188 6.09 5.99 5.89 5.811 5.731 5.61 5.531 5.441 5.393 5.304 5.204 5.088 5.032 4.903 4.864 4.798 4.718 4.521 4.422 4.304 4.17 4.05 3.919 3.713 2.948 -4 ,2020 ,KEBNE ,16653432,Mon Nov 22 02:42:07 CET,Mon Nov 22 04:21:32 CET,0.0 0.62 0.851 1.035 1.176 1.291 1.413 1.534 1.745 1.843 1.932 2.042 2.202 2.279 2.417 2.539 2.675 2.739 2.839 2.93 3.078 3.188 3.296 3.449 3.594 3.724 3.84 3.949 4.103 4.256 4.407 4.587 4.762 4.939 5.122 5.313 5.51 5.742 5.969 6.194 6.432 6.712 7.07 7.415 7.77 8.173 8.628 9.112 9.678 10.259 10.837 11.185 11.241 11.183 11.076 10.954 10.805 10.636 10.457 10.243 10.065 9.91 9.758 9.615 9.487 9.371 9.23 9.096 8.988 8.887 8.773 8.671 8.563 8.451 8.368 8.281 8.193 8.086 7.955 7.867 7.78 7.646 7.555 7.461 7.411 7.314 7.21 7.073 6.996 6.839 6.76 6.673 6.575 6.377 6.27 6.166 6.053 5.906 5.738 5.471 4.775 -5 ,24227 ,KEBNE ,16653433,Mon Nov 22 02:42:11 CET,Mon Nov 22 04:19:02 CET,0.0 1.103 1.34 1.508 1.656 1.802 1.932 2.053 2.313 2.429 2.525 2.622 2.781 2.869 3.022 3.144 3.26 3.326 3.464 3.597 3.785 3.897 3.996 4.142 4.288 4.431 4.567 4.685 4.823 4.963 5.113 5.291 5.452 5.608 5.8 6.015 6.23 6.461 6.69 6.925 7.171 7.445 7.776 8.11 8.494 8.924 9.397 9.898 10.45 11.015 11.567 11.809 11.781 11.638 11.455 11.261 11.042 10.81 10.582 10.343 10.141 9.954 9.782 9.613 9.436 9.293 9.159 9.031 8.899 8.754 8.619 8.505 8.384 8.266 8.174 8.076 7.97 7.867 7.758 7.679 7.602 7.471 7.384 7.29 7.241 7.154 7.054 6.94 6.881 6.748 6.702 6.639 6.574 6.411 6.327 6.232 6.124 6.003 5.864 5.641 4.85 -6 ,31626 ,KEBNE ,16653434,Mon Nov 22 02:43:09 CET,Mon Nov 22 04:23:50 CET,0.0 0.526 0.731 0.901 1.066 1.216 1.339 1.425 1.601 1.691 1.782 1.891 2.047 2.11 2.238 2.356 2.462 2.516 2.62 2.714 2.869 2.972 3.063 3.185 3.306 3.43 3.539 3.65 3.803 3.938 4.077 4.274 4.456 4.631 4.827 5.027 5.227 5.444 5.666 5.924 6.191 6.463 6.777 7.101 7.488 7.923 8.399 8.867 9.341 9.862 10.363 10.577 10.55 10.43 10.254 10.059 9.882 9.689 9.5 9.287 9.102 8.938 8.764 8.592 8.446 8.3 8.128 7.989 7.869 7.739 7.612 7.5 7.377 7.252 7.161 7.067 6.962 6.855 6.757 6.688 6.602 6.478 6.405 6.314 6.261 6.161 6.06 5.945 5.879 5.741 5.674 5.598 5.516 5.329 5.225 5.122 5.009 4.886 4.77 4.597 4.191 -7 ,11108 ,KEBNE ,16653435,Mon Nov 22 02:43:09 CET,Mon Nov 22 04:21:32 CET,0.0 0.862 1.106 1.31 1.46 1.615 1.762 1.881 2.091 2.189 2.278 2.372 2.541 2.624 2.798 2.947 3.076 3.146 3.29 3.427 3.622 3.752 3.874 4.047 4.207 4.353 4.499 4.642 4.825 5.015 5.199 5.404 5.585 5.754 5.965 6.189 6.376 6.572 6.797 7.056 7.337 7.661 8.045 8.408 8.819 9.259 9.694 10.189 10.784 11.402 11.974 12.197 12.145 11.981 11.739 11.478 11.26 11.053 10.855 10.661 10.483 10.308 10.132 9.957 9.804 9.672 9.531 9.39 9.272 9.146 8.995 8.873 8.768 8.662 8.569 8.471 8.366 8.256 8.135 8.051 7.96 7.829 7.739 7.627 7.569 7.451 7.336 7.228 7.171 7.047 7.015 6.944 6.865 6.697 6.595 6.476 6.367 6.265 6.119 5.942 5.274 -8 ,16679 ,KEBNE ,16653436,Mon Nov 22 02:43:09 CET,Mon Nov 22 04:24:52 CET,0.0 1.084 1.349 1.586 1.74 1.883 2.036 2.181 2.432 2.527 2.622 2.73 2.896 2.974 3.136 3.296 3.459 3.535 3.666 3.797 3.989 4.11 4.215 4.355 4.49 4.633 4.771 4.897 5.067 5.246 5.412 5.587 5.746 5.894 6.063 6.265 6.472 6.702 6.954 7.21 7.457 7.722 8.019 8.311 8.675 9.071 9.498 9.957 10.448 10.957 11.367 11.42 11.296 11.139 10.951 10.727 10.496 10.279 10.07 9.857 9.699 9.555 9.405 9.255 9.114 8.973 8.8 8.654 8.544 8.42 8.285 8.169 8.063 7.954 7.856 7.764 7.679 7.586 7.487 7.418 7.339 7.204 7.102 7.013 6.965 6.849 6.725 6.596 6.54 6.425 6.381 6.317 6.251 6.131 6.079 6.004 5.902 5.799 5.657 5.464 4.699 -9 ,16175 ,KEBNE ,16653437,Mon Nov 22 02:43:09 CET,Mon Nov 22 04:22:29 CET,0.0 1.038 1.345 1.562 1.715 1.865 2.012 2.154 2.406 2.509 2.602 2.711 2.883 2.966 3.128 3.278 3.423 3.481 3.586 3.696 3.855 3.963 4.073 4.23 4.38 4.531 4.682 4.82 4.986 5.14 5.293 5.479 5.647 5.805 6.013 6.25 6.443 6.632 6.837 7.065 7.317 7.607 7.927 8.219 8.544 8.896 9.352 9.841 10.299 10.803 11.226 11.419 11.373 11.243 11.086 10.861 10.629 10.403 10.196 9.972 9.761 9.58 9.423 9.266 9.124 8.99 8.828 8.686 8.571 8.44 8.28 8.142 7.994 7.846 7.741 7.635 7.528 7.421 7.3 7.209 7.115 6.97 6.872 6.781 6.732 6.619 6.488 6.363 6.304 6.163 6.091 6.003 5.903 5.672 5.537 5.401 5.267 5.115 4.921 4.636 3.768 -10 ,12260 ,KEBNE ,16653438,Mon Nov 22 02:43:09 CET,Mon Nov 22 04:22:14 CET,0.0 1.53 1.813 1.983 2.12 2.237 2.338 2.442 2.624 2.703 2.774 2.834 2.99 3.069 3.221 3.354 3.476 3.537 3.661 3.79 3.973 4.075 4.174 4.323 4.46 4.591 4.716 4.836 4.991 5.143 5.302 5.486 5.642 5.801 5.981 6.173 6.366 6.568 6.778 7.004 7.258 7.54 7.853 8.204 8.625 9.054 9.508 9.995 10.557 11.14 11.652 11.857 11.841 11.726 11.574 11.397 11.202 10.997 10.815 10.627 10.444 10.271 10.114 9.983 9.848 9.708 9.565 9.451 9.349 9.233 9.103 8.994 8.885 8.767 8.675 8.594 8.521 8.439 8.348 8.278 8.202 8.081 7.996 7.901 7.853 7.761 7.654 7.551 7.504 7.376 7.324 7.252 7.187 7.062 6.974 6.855 6.723 6.571 6.386 6.113 5.448 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_17.txt deleted file mode 100644 index 093569d4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6114 ,KEBNE ,16653439,Mon Nov 22 02:44:11 CET,Mon Nov 22 04:25:01 CET,0.0 1.788 2.19 2.492 2.757 2.953 3.116 3.273 3.569 3.716 3.853 4.033 4.26 4.389 4.615 4.819 5.02 5.121 5.325 5.509 5.774 5.938 6.087 6.32 6.534 6.727 6.915 7.096 7.327 7.563 7.805 8.086 8.331 8.564 8.848 9.168 9.482 9.837 10.202 10.582 11.014 11.53 12.143 12.741 13.4 14.099 14.937 15.868 16.913 18.102 19.32 20.206 20.643 20.824 20.89 20.909 20.859 20.778 20.644 20.47 20.318 20.146 19.962 19.793 19.645 19.503 19.353 19.182 19.004 18.819 18.612 18.441 18.292 18.151 18.005 17.85 17.726 17.582 17.405 17.292 17.187 17.001 16.86 16.714 16.635 16.438 16.216 15.973 15.839 15.655 15.521 15.396 15.254 14.92 14.729 14.537 14.316 14.011 13.581 13.054 10.559 -2 ,28164 ,KEBNE ,16653440,Mon Nov 22 02:44:11 CET,Mon Nov 22 04:24:24 CET,0.0 1.439 1.803 2.046 2.224 2.385 2.526 2.655 2.911 3.024 3.123 3.227 3.404 3.489 3.653 3.798 3.939 4.014 4.161 4.304 4.513 4.641 4.765 4.944 5.12 5.295 5.463 5.617 5.815 6.022 6.216 6.434 6.637 6.842 7.1 7.403 7.695 8.021 8.385 8.771 9.177 9.633 10.124 10.597 11.183 11.898 12.758 13.66 14.595 15.664 16.98 17.941 18.445 18.724 18.813 18.78 18.742 18.653 18.531 18.404 18.262 18.097 17.923 17.761 17.613 17.468 17.291 17.136 16.99 16.831 16.689 16.569 16.453 16.353 16.266 16.164 16.071 15.967 15.842 15.756 15.653 15.477 15.372 15.276 15.218 15.059 14.888 14.7 14.593 14.415 14.268 14.167 14.067 13.799 13.626 13.438 13.206 12.895 12.569 12.119 9.505 -3 ,12543 ,KEBNE ,16653441,Mon Nov 22 02:46:16 CET,Mon Nov 22 04:26:32 CET,0.0 2.151 2.517 2.776 2.98 3.16 3.326 3.498 3.814 3.951 4.069 4.194 4.375 4.474 4.675 4.863 5.043 5.131 5.295 5.449 5.697 5.858 6.008 6.219 6.403 6.581 6.775 6.966 7.204 7.427 7.634 7.883 8.118 8.362 8.661 8.98 9.295 9.674 10.09 10.527 10.98 11.496 12.1 12.696 13.383 14.163 15.074 16.082 17.273 18.617 20.122 21.172 21.647 21.836 21.91 21.929 21.886 21.801 21.698 21.589 21.495 21.38 21.236 21.106 20.976 20.844 20.714 20.606 20.485 20.34 20.202 20.063 19.903 19.744 19.619 19.512 19.419 19.302 19.168 19.076 18.981 18.842 18.759 18.667 18.609 18.479 18.321 18.113 18.001 17.83 17.667 17.552 17.457 17.229 17.097 16.947 16.748 16.523 16.264 15.901 13.252 -4 ,1626 ,KEBNE ,16653442,Mon Nov 22 02:46:16 CET,Mon Nov 22 04:28:29 CET,0.0 0.913 1.175 1.371 1.576 1.763 1.943 2.093 2.375 2.516 2.642 2.797 3.011 3.122 3.322 3.515 3.703 3.791 3.957 4.121 4.363 4.513 4.664 4.879 5.09 5.308 5.519 5.715 5.943 6.183 6.414 6.655 6.891 7.125 7.401 7.725 8.033 8.375 8.757 9.169 9.588 10.043 10.556 11.064 11.665 12.348 13.196 14.134 15.116 16.172 17.343 18.112 18.396 18.469 18.434 18.326 18.206 18.093 17.983 17.854 17.725 17.609 17.483 17.311 17.143 17.03 16.897 16.75 16.593 16.44 16.317 16.206 16.08 15.939 15.824 15.704 15.557 15.391 15.237 15.126 15.008 14.781 14.618 14.468 14.387 14.249 14.102 13.937 13.838 13.658 13.554 13.461 13.345 13.082 12.934 12.778 12.628 12.448 12.169 11.695 9.282 -5 ,1392 ,KEBNE ,16653443,Mon Nov 22 02:46:15 CET,Mon Nov 22 04:26:10 CET,0.0 1.003 1.33 1.593 1.784 1.927 2.077 2.226 2.475 2.584 2.695 2.833 3.025 3.123 3.308 3.486 3.637 3.704 3.848 3.993 4.22 4.363 4.505 4.734 4.955 5.147 5.33 5.53 5.793 6.035 6.261 6.539 6.813 7.101 7.449 7.798 8.117 8.493 8.918 9.363 9.808 10.294 10.817 11.309 11.901 12.581 13.313 14.108 15.084 16.188 17.389 18.234 18.633 18.813 18.832 18.793 18.736 18.623 18.484 18.319 18.17 18.015 17.862 17.726 17.567 17.389 17.198 17.011 16.843 16.691 16.537 16.394 16.242 16.081 15.951 15.806 15.638 15.46 15.295 15.186 15.056 14.845 14.694 14.539 14.45 14.233 14.035 13.846 13.741 13.559 13.415 13.306 13.18 12.816 12.61 12.41 12.161 11.892 11.591 11.156 9.682 -6 ,1232 ,KEBNE ,16653444,Mon Nov 22 02:46:16 CET,Mon Nov 22 04:26:55 CET,0.0 1.433 1.717 1.934 2.124 2.3 2.452 2.602 2.878 3.006 3.124 3.25 3.445 3.545 3.73 3.91 4.087 4.17 4.338 4.493 4.716 4.855 4.981 5.158 5.323 5.498 5.677 5.85 6.077 6.297 6.524 6.787 7.026 7.264 7.546 7.862 8.164 8.475 8.812 9.19 9.61 10.107 10.683 11.26 11.918 12.647 13.458 14.281 15.204 16.346 17.732 18.699 19.044 19.144 19.129 19.025 18.873 18.675 18.488 18.301 18.12 17.947 17.77 17.603 17.434 17.269 17.094 16.951 16.785 16.565 16.347 16.188 16.008 15.816 15.668 15.504 15.328 15.127 14.938 14.816 14.686 14.497 14.367 14.229 14.158 13.991 13.804 13.573 13.453 13.293 13.163 13.027 12.869 12.52 12.322 12.107 11.851 11.556 11.201 10.642 7.487 -7 ,8793 ,KEBNE ,16653445,Mon Nov 22 02:46:15 CET,Mon Nov 22 04:26:57 CET,0.0 1.885 2.329 2.628 2.871 3.1 3.307 3.489 3.844 4.018 4.172 4.358 4.574 4.682 4.894 5.105 5.309 5.411 5.609 5.796 6.064 6.231 6.393 6.626 6.844 7.052 7.27 7.479 7.734 7.992 8.245 8.545 8.826 9.103 9.416 9.774 10.124 10.495 10.928 11.392 11.86 12.373 12.965 13.575 14.281 14.994 15.755 16.592 17.454 18.486 19.757 20.661 21.021 21.079 21.015 20.837 20.577 20.353 20.169 19.955 19.746 19.523 19.295 19.075 18.853 18.637 18.416 18.226 18.059 17.867 17.667 17.48 17.258 17.069 16.941 16.783 16.606 16.426 16.243 16.102 15.952 15.762 15.638 15.502 15.424 15.228 15.006 14.758 14.636 14.437 14.22 14.043 13.855 13.465 13.252 13.045 12.828 12.535 12.152 11.719 9.457 -8 ,17621 ,KEBNE ,16653446,Mon Nov 22 02:46:15 CET,Mon Nov 22 04:26:24 CET,0.0 1.562 1.975 2.254 2.5 2.714 2.914 3.097 3.449 3.618 3.763 3.921 4.118 4.231 4.442 4.651 4.853 4.952 5.149 5.335 5.617 5.788 5.946 6.19 6.418 6.639 6.844 7.043 7.293 7.519 7.745 8.016 8.26 8.501 8.79 9.125 9.449 9.81 10.206 10.608 11.039 11.594 12.249 12.848 13.534 14.3 15.163 16.125 17.262 18.638 20.203 21.232 21.6 21.667 21.769 21.851 21.814 21.744 21.691 21.615 21.487 21.368 21.257 21.129 20.99 20.866 20.729 20.599 20.484 20.36 20.228 20.13 20.038 19.923 19.832 19.741 19.619 19.474 19.322 19.213 19.112 18.973 18.88 18.78 18.72 18.574 18.362 18.126 18.034 17.883 17.779 17.685 17.54 17.2 17.017 16.814 16.608 16.416 16.19 15.795 12.449 -9 ,3714 ,KEBNE ,16653447,Mon Nov 22 02:47:18 CET,Mon Nov 22 04:29:19 CET,0.0 1.311 1.661 1.911 2.129 2.347 2.543 2.696 2.967 3.092 3.199 3.353 3.57 3.666 3.849 4.029 4.21 4.304 4.482 4.649 4.886 5.042 5.192 5.4 5.597 5.785 5.973 6.164 6.412 6.632 6.838 7.082 7.318 7.556 7.838 8.13 8.394 8.678 8.969 9.284 9.642 10.058 10.542 11.064 11.678 12.346 13.148 14.038 14.985 16.069 17.381 18.462 19.023 19.319 19.47 19.498 19.408 19.316 19.218 19.065 18.926 18.785 18.637 18.492 18.352 18.235 18.124 18.009 17.878 17.73 17.59 17.468 17.33 17.17 17.043 16.915 16.786 16.637 16.46 16.35 16.233 16.014 15.867 15.718 15.629 15.465 15.332 15.171 15.085 14.915 14.784 14.664 14.537 14.277 14.142 13.978 13.739 13.46 13.152 12.709 11.048 -10 ,17000 ,KEBNE ,16653448,Mon Nov 22 02:47:17 CET,Mon Nov 22 04:29:25 CET,0.0 1.288 1.65 1.946 2.194 2.397 2.57 2.733 2.988 3.107 3.242 3.42 3.621 3.734 3.963 4.184 4.394 4.502 4.711 4.905 5.164 5.329 5.48 5.682 5.875 6.06 6.259 6.452 6.694 6.92 7.145 7.416 7.661 7.887 8.138 8.44 8.737 9.051 9.383 9.737 10.111 10.531 11.091 11.706 12.356 13.044 13.885 14.773 15.765 17.012 18.376 19.409 19.794 19.866 19.846 19.728 19.596 19.413 19.224 19.032 18.857 18.691 18.522 18.356 18.165 17.988 17.812 17.678 17.557 17.408 17.261 17.133 16.988 16.831 16.705 16.563 16.402 16.233 16.075 15.966 15.838 15.638 15.507 15.36 15.277 15.098 14.926 14.759 14.669 14.481 14.328 14.196 14.031 13.681 13.486 13.28 13.037 12.746 12.421 11.929 9.57 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_20.txt deleted file mode 100644 index 58d58617..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_20.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5856 ,KEBNE ,16653449,Mon Nov 22 02:47:18 CET,Mon Nov 22 04:30:19 CET,0.0 3.518 4.258 4.728 5.061 5.291 5.5 5.736 6.174 6.352 6.522 6.752 6.978 7.095 7.321 7.551 7.739 7.824 7.989 8.15 8.376 8.502 8.622 8.788 8.952 9.113 9.266 9.407 9.59 9.775 9.963 10.228 10.481 10.694 10.917 11.158 11.411 11.676 11.923 12.168 12.441 12.705 12.923 13.107 13.296 13.485 13.68 13.809 13.802 13.599 13.019 11.987 11.089 10.406 9.753 9.136 8.621 8.151 7.736 7.333 7.011 6.734 6.459 6.196 5.951 5.724 5.497 5.306 5.142 4.966 4.779 4.608 4.419 4.229 4.082 3.935 3.788 3.637 3.469 3.359 3.268 3.139 3.047 2.942 2.886 2.77 2.655 2.526 2.456 2.291 2.24 2.16 2.073 1.885 1.8 1.721 1.615 1.488 1.363 1.217 1.01 -2 ,15826 ,KEBNE ,16653450,Mon Nov 22 02:47:18 CET,Mon Nov 22 04:29:31 CET,0.0 2.489 2.975 3.333 3.662 3.965 4.266 4.512 4.892 5.09 5.288 5.568 5.785 5.877 6.076 6.269 6.439 6.523 6.686 6.858 7.106 7.243 7.385 7.599 7.766 7.938 8.114 8.28 8.515 8.737 8.905 9.08 9.271 9.449 9.629 9.827 10.006 10.249 10.57 10.881 11.198 11.534 11.831 12.08 12.348 12.607 12.869 13.091 13.264 13.269 12.811 11.959 11.066 10.235 9.557 9.022 8.541 8.047 7.623 7.214 6.865 6.552 6.256 5.965 5.683 5.44 5.189 4.958 4.749 4.521 4.285 4.107 3.932 3.751 3.611 3.458 3.308 3.156 2.995 2.886 2.78 2.612 2.495 2.38 2.323 2.207 2.087 1.955 1.887 1.715 1.663 1.58 1.504 1.334 1.237 1.132 1.02 0.915 0.782 0.606 0.205 -3 ,6902 ,KEBNE ,16653451,Mon Nov 22 02:47:18 CET,Mon Nov 22 04:29:25 CET,0.0 2.672 3.347 3.864 4.189 4.441 4.724 5.008 5.51 5.715 5.884 6.101 6.321 6.454 6.702 6.915 7.106 7.187 7.362 7.535 7.78 7.93 8.065 8.274 8.46 8.621 8.764 8.931 9.176 9.387 9.573 9.786 10.003 10.2 10.4 10.613 10.812 11.007 11.211 11.445 11.682 11.932 12.221 12.473 12.733 13.026 13.289 13.523 13.663 13.559 13.011 12.225 11.467 10.671 9.995 9.367 8.848 8.423 8.051 7.653 7.277 6.949 6.65 6.364 6.072 5.819 5.578 5.35 5.146 4.941 4.724 4.543 4.367 4.18 4.041 3.911 3.78 3.639 3.49 3.391 3.286 3.131 3.018 2.888 2.823 2.69 2.545 2.393 2.314 2.122 2.04 1.946 1.845 1.645 1.546 1.433 1.303 1.17 1.025 0.808 0.517 -4 ,600 ,KEBNE ,16653452,Mon Nov 22 02:48:20 CET,Mon Nov 22 04:30:12 CET,0.0 2.592 3.197 3.625 3.935 4.181 4.4 4.604 5.013 5.205 5.387 5.68 5.943 6.089 6.328 6.512 6.686 6.761 6.921 7.098 7.326 7.472 7.633 7.865 8.06 8.237 8.408 8.56 8.751 8.943 9.111 9.331 9.556 9.762 9.988 10.222 10.432 10.644 10.899 11.149 11.382 11.623 11.878 12.118 12.355 12.579 12.79 12.965 13.091 13.155 12.961 12.238 11.507 10.841 10.223 9.673 9.177 8.714 8.299 7.856 7.486 7.18 6.875 6.581 6.324 6.091 5.842 5.629 5.468 5.307 5.132 4.984 4.821 4.646 4.511 4.376 4.242 4.108 3.962 3.852 3.746 3.585 3.471 3.358 3.299 3.178 3.047 2.908 2.841 2.67 2.638 2.561 2.47 2.281 2.187 2.097 1.995 1.885 1.776 1.648 1.388 -5 ,3579 ,KEBNE ,16653453,Mon Nov 22 02:48:20 CET,Mon Nov 22 04:29:38 CET,0.0 2.299 2.865 3.338 3.709 3.973 4.225 4.452 4.841 5.032 5.21 5.431 5.654 5.776 6.012 6.261 6.469 6.563 6.738 6.889 7.127 7.282 7.433 7.663 7.869 8.067 8.254 8.423 8.628 8.823 9.033 9.3 9.536 9.723 9.92 10.14 10.332 10.546 10.808 11.129 11.419 11.675 11.975 12.192 12.415 12.683 12.912 13.037 13.077 13.012 12.49 11.557 10.612 9.759 9.063 8.456 7.921 7.43 7.055 6.701 6.382 6.107 5.83 5.551 5.298 5.078 4.854 4.649 4.474 4.301 4.111 3.941 3.787 3.637 3.515 3.392 3.264 3.132 2.979 2.875 2.777 2.626 2.526 2.419 2.361 2.245 2.12 1.997 1.937 1.766 1.725 1.656 1.584 1.425 1.329 1.225 1.117 1.005 0.876 0.688 0.265 -6 ,4910 ,KEBNE ,16653454,Mon Nov 22 02:48:21 CET,Mon Nov 22 04:30:49 CET,0.0 2.756 3.382 3.812 4.147 4.438 4.689 4.922 5.341 5.537 5.73 5.955 6.174 6.296 6.516 6.731 6.917 6.998 7.161 7.322 7.568 7.729 7.883 8.114 8.315 8.466 8.6 8.757 8.996 9.234 9.463 9.714 9.923 10.104 10.308 10.528 10.759 11.048 11.296 11.545 11.824 12.082 12.366 12.635 12.925 13.206 13.469 13.692 13.826 13.826 13.356 12.424 11.6 10.887 10.239 9.632 9.103 8.629 8.206 7.818 7.499 7.209 6.938 6.682 6.45 6.237 6.012 5.814 5.643 5.453 5.262 5.116 4.968 4.818 4.703 4.582 4.451 4.315 4.174 4.073 3.968 3.806 3.677 3.54 3.476 3.354 3.229 3.084 3.004 2.825 2.788 2.704 2.608 2.397 2.288 2.193 2.08 1.949 1.794 1.598 1.321 -7 ,21391 ,KEBNE ,16653455,Mon Nov 22 02:48:21 CET,Mon Nov 22 04:31:07 CET,0.0 3.148 3.831 4.232 4.574 4.873 5.154 5.41 5.807 5.976 6.114 6.247 6.44 6.545 6.755 6.95 7.118 7.203 7.374 7.529 7.774 7.945 8.09 8.291 8.476 8.641 8.798 8.938 9.105 9.298 9.504 9.721 9.919 10.107 10.315 10.542 10.751 10.981 11.233 11.479 11.708 11.948 12.207 12.452 12.694 12.892 13.075 13.271 13.431 13.353 12.666 11.549 10.585 9.737 9.02 8.357 7.78 7.262 6.806 6.361 5.975 5.635 5.312 5.005 4.727 4.484 4.245 4.048 3.864 3.655 3.453 3.297 3.137 2.964 2.83 2.694 2.557 2.406 2.242 2.137 2.034 1.858 1.733 1.612 1.549 1.418 1.284 1.154 1.087 0.919 0.876 0.796 0.728 0.58 0.499 0.423 0.329 0.225 0.107 -0.058 -0.248 -8 ,6976 ,KEBNE ,16653456,Mon Nov 22 02:48:21 CET,Mon Nov 22 04:30:13 CET,0.0 3.039 3.811 4.25 4.566 4.855 5.097 5.338 5.775 5.928 6.052 6.205 6.432 6.564 6.762 6.969 7.153 7.225 7.351 7.47 7.654 7.765 7.882 8.071 8.257 8.435 8.587 8.743 8.934 9.12 9.332 9.571 9.767 9.95 10.164 10.404 10.642 10.913 11.225 11.559 11.841 12.098 12.4 12.689 12.983 13.217 13.44 13.632 13.709 13.72 13.435 12.668 11.74 10.878 10.151 9.532 9.011 8.53 8.107 7.672 7.308 6.983 6.664 6.37 6.105 5.856 5.59 5.36 5.164 4.965 4.776 4.616 4.432 4.24 4.099 3.944 3.783 3.642 3.501 3.394 3.279 3.104 2.979 2.851 2.788 2.674 2.555 2.414 2.345 2.176 2.127 2.041 1.946 1.735 1.603 1.465 1.326 1.18 1.067 0.933 0.506 -9 ,3487 ,KEBNE ,16653457,Mon Nov 22 02:48:21 CET,Mon Nov 22 04:30:29 CET,0.0 2.647 3.284 3.77 4.142 4.402 4.628 4.82 5.175 5.354 5.528 5.771 5.993 6.114 6.35 6.611 6.859 6.987 7.218 7.393 7.676 7.854 7.991 8.173 8.363 8.562 8.756 8.951 9.214 9.465 9.703 9.965 10.165 10.358 10.597 10.868 11.147 11.416 11.663 11.94 12.21 12.472 12.757 13.02 13.296 13.549 13.795 14.023 14.186 14.19 13.654 12.574 11.553 10.647 9.852 9.113 8.481 7.964 7.543 7.148 6.824 6.527 6.237 5.968 5.722 5.481 5.22 4.992 4.808 4.625 4.43 4.268 4.102 3.928 3.81 3.692 3.558 3.421 3.284 3.19 3.093 2.947 2.848 2.751 2.703 2.588 2.474 2.37 2.307 2.138 2.091 2.009 1.928 1.776 1.685 1.57 1.457 1.364 1.244 1.095 0.814 -10 ,20568 ,KEBNE ,16653458,Mon Nov 22 02:49:22 CET,Mon Nov 22 04:31:43 CET,0.0 2.196 2.699 3.053 3.358 3.632 3.891 4.122 4.515 4.695 4.857 5.03 5.231 5.36 5.627 5.86 6.049 6.144 6.344 6.518 6.715 6.843 6.974 7.157 7.333 7.525 7.758 7.997 8.292 8.508 8.661 8.862 9.054 9.212 9.376 9.585 9.79 9.979 10.178 10.398 10.621 10.863 11.144 11.397 11.653 11.917 12.192 12.418 12.475 12.227 11.429 10.28 9.26 8.385 7.648 6.98 6.389 5.889 5.453 5.027 4.679 4.367 4.053 3.748 3.475 3.243 3.008 2.805 2.637 2.458 2.265 2.102 1.938 1.767 1.632 1.496 1.363 1.237 1.103 1.004 0.901 0.753 0.657 0.553 0.501 0.39 0.276 0.161 0.1 -0.06 -0.115 -0.199 -0.275 -0.431 -0.512 -0.592 -0.69 -0.805 -0.922 -1.076 -1.384 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_22.txt deleted file mode 100644 index 8ce7048a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17940 ,KEBNE ,16653459,Mon Nov 22 02:49:23 CET,Mon Nov 22 04:30:17 CET,0.0 1.329 1.743 2.032 2.295 2.542 2.736 2.896 3.218 3.368 3.497 3.652 3.855 3.949 4.129 4.318 4.497 4.591 4.781 4.949 5.174 5.316 5.444 5.621 5.807 5.982 6.153 6.322 6.521 6.722 6.924 7.165 7.398 7.617 7.871 8.157 8.425 8.715 9.022 9.362 9.721 10.098 10.531 10.977 11.483 12.041 12.681 13.355 14.093 14.86 15.687 16.352 16.637 16.711 16.724 16.68 16.589 16.495 16.408 16.298 16.191 16.093 15.997 15.91 15.825 15.741 15.65 15.564 15.482 15.391 15.288 15.199 15.095 14.996 14.932 14.857 14.772 14.676 14.578 14.513 14.444 14.341 14.273 14.2 14.161 14.069 13.971 13.879 13.831 13.691 13.644 13.575 13.505 13.328 13.236 13.144 13.019 12.91 12.8 12.66 12.316 -2 ,17223 ,KEBNE ,16653460,Mon Nov 22 02:49:22 CET,Mon Nov 22 04:30:23 CET,0.0 1.411 1.884 2.25 2.542 2.791 3.027 3.237 3.6 3.775 3.945 4.148 4.382 4.525 4.783 5.03 5.246 5.346 5.534 5.714 5.973 6.136 6.295 6.507 6.704 6.885 7.058 7.231 7.454 7.666 7.857 8.097 8.316 8.511 8.743 9.023 9.285 9.555 9.843 10.131 10.429 10.767 11.168 11.522 11.904 12.346 12.832 13.361 14.006 14.737 15.478 16.028 16.295 16.388 16.388 16.33 16.231 16.141 16.033 15.865 15.707 15.572 15.451 15.335 15.225 15.12 14.995 14.873 14.772 14.657 14.539 14.45 14.347 14.239 14.15 14.059 13.974 13.875 13.758 13.684 13.616 13.506 13.429 13.352 13.305 13.191 13.077 12.959 12.891 12.748 12.703 12.639 12.569 12.408 12.324 12.224 12.11 11.984 11.798 11.552 10.998 -3 ,28512 ,KEBNE ,16653461,Mon Nov 22 02:50:26 CET,Mon Nov 22 04:32:34 CET,0.0 1.479 2.04 2.377 2.649 2.894 3.096 3.292 3.636 3.799 3.949 4.117 4.324 4.441 4.642 4.826 5.012 5.099 5.268 5.441 5.686 5.835 5.982 6.181 6.373 6.582 6.768 6.943 7.175 7.367 7.556 7.794 8.014 8.239 8.495 8.76 9.012 9.291 9.6 9.919 10.251 10.636 11.064 11.46 11.919 12.412 12.923 13.452 14.061 14.841 15.753 16.304 16.553 16.665 16.647 16.559 16.471 16.4 16.31 16.21 16.127 16.041 15.961 15.874 15.791 15.707 15.597 15.484 15.394 15.295 15.178 15.092 15.003 14.909 14.842 14.762 14.672 14.589 14.499 14.436 14.37 14.255 14.178 14.105 14.066 13.987 13.902 13.803 13.749 13.628 13.615 13.57 13.516 13.388 13.324 13.258 13.177 13.082 12.941 12.763 12.558 -4 ,10408 ,KEBNE ,16653462,Mon Nov 22 02:50:25 CET,Mon Nov 22 04:32:02 CET,0.0 1.448 2.016 2.398 2.707 2.962 3.173 3.362 3.715 3.875 4.022 4.193 4.402 4.526 4.742 4.957 5.174 5.273 5.467 5.661 5.926 6.08 6.228 6.449 6.656 6.853 7.051 7.241 7.483 7.714 7.929 8.198 8.46 8.689 8.937 9.211 9.498 9.8 10.081 10.357 10.64 10.967 11.32 11.66 12.078 12.551 13.107 13.715 14.408 15.231 16.139 16.68 16.889 17.016 17.064 17.046 17.003 16.92 16.806 16.696 16.603 16.506 16.41 16.323 16.23 16.138 16.053 15.968 15.865 15.756 15.646 15.545 15.436 15.334 15.26 15.17 15.077 14.984 14.887 14.817 14.737 14.624 14.549 14.455 14.405 14.318 14.229 14.131 14.079 13.944 13.867 13.779 13.692 13.53 13.443 13.355 13.245 13.116 13.002 12.84 12.547 -5 ,25028 ,KEBNE ,16653463,Mon Nov 22 02:51:28 CET,Mon Nov 22 04:32:57 CET,0.0 1.486 1.886 2.165 2.397 2.601 2.792 2.958 3.239 3.366 3.488 3.628 3.817 3.923 4.134 4.342 4.527 4.612 4.778 4.938 5.161 5.295 5.421 5.613 5.802 5.98 6.174 6.362 6.586 6.781 6.974 7.232 7.492 7.761 8.055 8.358 8.627 8.913 9.229 9.539 9.832 10.138 10.478 10.807 11.188 11.625 12.131 12.671 13.318 14.023 14.833 15.444 15.652 15.726 15.741 15.737 15.704 15.644 15.552 15.413 15.286 15.167 15.054 14.93 14.798 14.684 14.57 14.462 14.366 14.269 14.162 14.077 14.001 13.922 13.852 13.78 13.714 13.644 13.561 13.487 13.406 13.306 13.238 13.155 13.113 13.034 12.949 12.851 12.794 12.656 12.62 12.563 12.507 12.386 12.317 12.223 12.108 11.996 11.885 11.736 11.377 -6 ,27906 ,KEBNE ,16653464,Mon Nov 22 02:51:28 CET,Mon Nov 22 04:33:09 CET,0.0 1.969 2.438 2.805 3.122 3.382 3.612 3.857 4.263 4.433 4.598 4.797 5.034 5.178 5.435 5.688 5.927 6.043 6.265 6.477 6.787 6.984 7.171 7.437 7.692 7.928 8.157 8.365 8.595 8.811 9.013 9.233 9.432 9.623 9.857 10.134 10.388 10.703 11.074 11.399 11.715 12.088 12.514 12.892 13.318 13.846 14.431 15.023 15.644 16.333 17.051 17.431 17.565 17.623 17.639 17.633 17.568 17.45 17.311 17.16 17.022 16.891 16.767 16.642 16.507 16.387 16.272 16.174 16.099 16.02 15.924 15.833 15.748 15.674 15.613 15.545 15.468 15.392 15.313 15.248 15.178 15.062 14.979 14.891 14.848 14.763 14.669 14.541 14.476 14.344 14.297 14.228 14.164 14.019 13.931 13.83 13.707 13.579 13.462 13.3 13.012 -7 ,7311 ,KEBNE ,16653465,Mon Nov 22 02:51:28 CET,Mon Nov 22 04:32:01 CET,0.0 1.548 1.948 2.208 2.44 2.662 2.858 3.039 3.355 3.488 3.627 3.847 4.087 4.213 4.426 4.623 4.826 4.916 5.114 5.339 5.692 5.907 6.082 6.308 6.507 6.692 6.857 7.009 7.213 7.423 7.634 7.877 8.111 8.33 8.557 8.803 9.048 9.321 9.618 9.928 10.257 10.616 11.03 11.452 11.914 12.411 12.959 13.601 14.347 15.146 16.077 16.787 17.067 17.192 17.235 17.212 17.156 17.059 16.968 16.858 16.735 16.619 16.513 16.414 16.312 16.209 16.114 16.044 15.964 15.854 15.741 15.649 15.556 15.471 15.405 15.335 15.258 15.172 15.092 15.038 14.981 14.883 14.811 14.741 14.699 14.613 14.54 14.478 14.444 14.33 14.295 14.219 14.139 13.999 13.936 13.868 13.794 13.707 13.604 13.47 13.252 -8 ,29964 ,KEBNE ,16653466,Mon Nov 22 02:52:29 CET,Mon Nov 22 04:35:28 CET,0.0 1.461 1.897 2.237 2.55 2.819 3.048 3.26 3.611 3.763 3.909 4.111 4.341 4.468 4.694 4.896 5.097 5.2 5.393 5.561 5.792 5.941 6.089 6.304 6.487 6.667 6.85 7.022 7.25 7.472 7.681 7.908 8.103 8.291 8.523 8.787 9.043 9.33 9.642 9.951 10.248 10.586 10.982 11.358 11.794 12.299 12.879 13.559 14.36 15.219 16.105 16.715 16.957 17.037 17.049 17.007 16.904 16.775 16.68 16.598 16.489 16.365 16.247 16.139 16.031 15.921 15.806 15.706 15.614 15.522 15.437 15.366 15.286 15.191 15.11 15.028 14.953 14.882 14.8 14.742 14.684 14.588 14.518 14.45 14.413 14.317 14.203 14.089 14.031 13.899 13.863 13.795 13.731 13.61 13.541 13.451 13.337 13.208 13.088 12.935 12.498 -9 ,16273 ,KEBNE ,16653467,Mon Nov 22 02:52:30 CET,Mon Nov 22 04:33:50 CET,0.0 1.748 2.219 2.519 2.777 3.011 3.22 3.393 3.712 3.866 4.009 4.162 4.372 4.507 4.769 5.01 5.241 5.358 5.585 5.802 6.099 6.28 6.456 6.713 6.944 7.167 7.404 7.633 7.906 8.13 8.316 8.542 8.775 9.008 9.273 9.559 9.832 10.146 10.481 10.823 11.188 11.613 12.122 12.618 13.157 13.758 14.445 15.202 16.071 17.051 18.073 18.723 18.976 18.999 18.954 18.878 18.79 18.71 18.614 18.476 18.336 18.2 18.062 17.923 17.777 17.652 17.531 17.428 17.337 17.245 17.15 17.051 16.932 16.814 16.72 16.617 16.536 16.456 16.353 16.283 16.218 16.127 16.063 15.987 15.948 15.87 15.793 15.711 15.665 15.543 15.513 15.462 15.4 15.23 15.148 15.079 14.993 14.881 14.762 14.572 14.086 -10 ,27578 ,KEBNE ,16653468,Mon Nov 22 02:52:30 CET,Mon Nov 22 04:33:57 CET,0.0 1.746 2.179 2.468 2.707 2.926 3.132 3.32 3.663 3.814 3.956 4.135 4.342 4.466 4.686 4.884 5.068 5.153 5.334 5.504 5.775 5.959 6.116 6.335 6.55 6.749 6.934 7.127 7.378 7.589 7.772 7.983 8.186 8.385 8.597 8.841 9.103 9.391 9.705 10.026 10.332 10.655 11.037 11.449 11.922 12.398 12.942 13.551 14.224 14.959 15.723 16.251 16.476 16.518 16.474 16.387 16.261 16.132 16.013 15.894 15.785 15.677 15.569 15.459 15.364 15.278 15.177 15.085 15.006 14.929 14.853 14.785 14.706 14.619 14.553 14.488 14.422 14.352 14.268 14.205 14.147 14.056 13.981 13.9 13.86 13.789 13.718 13.638 13.586 13.453 13.439 13.379 13.318 13.185 13.103 13.017 12.927 12.822 12.662 12.466 12.026 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_24.txt deleted file mode 100644 index 07fedd88..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_24.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14963 ,KEBNE ,16653469,Mon Nov 22 02:53:33 CET,Mon Nov 22 04:35:38 CET,0.0 0.929 1.178 1.327 1.464 1.634 1.79 1.925 2.164 2.273 2.391 2.513 2.691 2.774 2.924 3.07 3.199 3.262 3.382 3.506 3.698 3.805 3.906 4.058 4.2 4.331 4.456 4.578 4.739 4.898 5.051 5.229 5.399 5.571 5.763 5.97 6.163 6.38 6.611 6.845 7.066 7.272 7.516 7.749 7.996 8.247 8.503 8.716 8.852 8.886 8.66 8.098 7.487 6.946 6.458 5.949 5.481 5.075 4.703 4.317 3.996 3.693 3.386 3.094 2.845 2.623 2.372 2.141 1.939 1.727 1.508 1.334 1.139 0.937 0.791 0.632 0.46 0.285 0.112 -0.009 -0.139 -0.336 -0.477 -0.631 -0.712 -0.874 -1.037 -1.21 -1.295 -1.481 -1.583 -1.694 -1.806 -2.043 -2.178 -2.324 -2.476 -2.653 -2.894 -3.163 -4.013 -2 ,2963 ,KEBNE ,16653470,Mon Nov 22 02:53:33 CET,Mon Nov 22 04:34:59 CET,0.0 1.381 1.741 2.018 2.276 2.505 2.71 2.895 3.208 3.348 3.48 3.641 3.847 3.958 4.158 4.35 4.522 4.604 4.769 4.921 5.128 5.256 5.383 5.569 5.732 5.889 6.051 6.198 6.378 6.556 6.719 6.912 7.104 7.298 7.53 7.783 8.023 8.287 8.552 8.814 9.055 9.322 9.682 10.007 10.325 10.672 10.994 11.229 11.458 11.63 11.535 11.149 10.681 10.18 9.705 9.28 8.889 8.515 8.194 7.894 7.628 7.381 7.123 6.875 6.665 6.482 6.27 6.053 5.856 5.642 5.431 5.261 5.09 4.906 4.759 4.619 4.477 4.325 4.169 4.063 3.951 3.774 3.65 3.516 3.446 3.299 3.132 2.96 2.871 2.68 2.585 2.47 2.332 2.009 1.838 1.674 1.509 1.324 1.123 0.836 -0.042 -3 ,6616 ,KEBNE ,16653471,Mon Nov 22 02:53:33 CET,Mon Nov 22 04:35:56 CET,0.0 1.291 1.678 2.037 2.333 2.549 2.726 2.895 3.225 3.374 3.509 3.666 3.875 4.0 4.249 4.479 4.685 4.786 4.972 5.155 5.421 5.572 5.72 5.929 6.132 6.338 6.52 6.691 6.917 7.136 7.337 7.577 7.808 8.019 8.255 8.525 8.78 9.053 9.342 9.626 9.9 10.203 10.563 10.936 11.343 11.725 12.13 12.471 12.735 12.91 12.788 12.313 11.725 11.167 10.632 10.096 9.61 9.121 8.7 8.28 7.91 7.603 7.305 7.038 6.795 6.558 6.297 6.047 5.836 5.632 5.435 5.285 5.125 4.963 4.832 4.698 4.564 4.423 4.294 4.202 4.098 3.951 3.855 3.741 3.682 3.566 3.44 3.305 3.235 3.07 3.018 2.921 2.804 2.541 2.377 2.196 1.999 1.759 1.508 1.25 0.108 -4 ,25247 ,KEBNE ,16653472,Mon Nov 22 02:53:33 CET,Mon Nov 22 04:35:42 CET,0.0 1.114 1.425 1.645 1.848 2.027 2.187 2.334 2.581 2.696 2.807 2.924 3.117 3.227 3.438 3.609 3.765 3.839 3.984 4.13 4.336 4.462 4.584 4.759 4.932 5.101 5.257 5.401 5.586 5.767 5.929 6.118 6.301 6.489 6.699 6.907 7.104 7.325 7.546 7.771 8.012 8.249 8.498 8.733 9.017 9.337 9.631 9.881 10.077 10.093 9.764 9.201 8.536 7.859 7.334 6.84 6.374 5.957 5.579 5.192 4.848 4.545 4.275 4.021 3.774 3.552 3.336 3.131 2.94 2.739 2.527 2.352 2.173 1.99 1.847 1.693 1.52 1.34 1.155 1.033 0.911 0.728 0.598 0.454 0.38 0.226 0.069 -0.085 -0.162 -0.344 -0.444 -0.548 -0.652 -0.881 -1.032 -1.209 -1.373 -1.547 -1.776 -2.117 -3.825 -5 ,22247 ,KEBNE ,16653473,Mon Nov 22 02:53:33 CET,Mon Nov 22 04:36:10 CET,0.0 0.993 1.239 1.45 1.639 1.799 1.947 2.094 2.374 2.503 2.618 2.725 2.894 2.973 3.14 3.299 3.447 3.516 3.647 3.781 3.96 4.075 4.192 4.361 4.519 4.671 4.817 4.955 5.131 5.287 5.455 5.668 5.86 6.051 6.269 6.48 6.679 6.902 7.137 7.374 7.594 7.835 8.134 8.431 8.752 9.093 9.421 9.783 10.168 10.387 10.391 10.032 9.535 9.123 8.552 7.942 7.435 6.932 6.508 6.063 5.682 5.327 4.95 4.603 4.296 4.039 3.773 3.538 3.328 3.098 2.859 2.647 2.434 2.223 2.062 1.899 1.723 1.543 1.371 1.246 1.109 0.903 0.765 0.623 0.544 0.372 0.191 0.007 -0.086 -0.269 -0.358 -0.452 -0.553 -0.78 -0.925 -1.099 -1.262 -1.433 -1.655 -1.874 -2.772 -6 ,4616 ,KEBNE ,16653474,Mon Nov 22 02:54:35 CET,Mon Nov 22 04:37:21 CET,0.0 0.922 1.191 1.402 1.564 1.704 1.841 1.97 2.232 2.355 2.466 2.576 2.757 2.844 3.004 3.152 3.283 3.35 3.481 3.61 3.778 3.883 3.988 4.128 4.257 4.388 4.524 4.653 4.82 4.984 5.14 5.328 5.486 5.627 5.793 5.98 6.167 6.361 6.561 6.762 6.986 7.232 7.472 7.692 7.904 8.108 8.355 8.633 8.876 8.96 8.736 8.151 7.435 6.773 6.218 5.716 5.247 4.807 4.439 4.086 3.778 3.494 3.227 2.974 2.734 2.512 2.278 2.066 1.882 1.688 1.48 1.305 1.118 0.928 0.788 0.641 0.491 0.33 0.156 0.034 -0.094 -0.28 -0.4 -0.535 -0.609 -0.764 -0.932 -1.123 -1.225 -1.417 -1.513 -1.627 -1.749 -2.015 -2.168 -2.326 -2.485 -2.657 -2.874 -3.189 -4.47 -8 ,21467 ,KEBNE ,16653476,Mon Nov 22 02:55:38 CET,Mon Nov 22 04:35:52 CET,0.0 1.096 1.391 1.629 1.819 1.983 2.133 2.26 2.491 2.599 2.706 2.835 3.023 3.113 3.263 3.427 3.594 3.67 3.823 3.965 4.167 4.288 4.402 4.571 4.74 4.894 5.04 5.188 5.38 5.57 5.746 5.95 6.152 6.338 6.527 6.708 6.872 7.056 7.256 7.476 7.698 7.957 8.257 8.522 8.805 9.093 9.372 9.603 9.713 9.618 9.112 8.307 7.626 6.994 6.368 5.785 5.314 4.907 4.548 4.185 3.856 3.559 3.276 3.008 2.769 2.529 2.267 2.037 1.841 1.636 1.423 1.249 1.063 0.881 0.745 0.595 0.436 0.279 0.117 0.007 -0.107 -0.293 -0.424 -0.55 -0.613 -0.756 -0.904 -1.055 -1.135 -1.317 -1.401 -1.489 -1.576 -1.776 -1.89 -2.014 -2.15 -2.335 -2.579 -2.901 -4.531 -9 ,12106 ,KEBNE ,16653477,Mon Nov 22 02:57:41 CET,Mon Nov 22 04:38:09 CET,0.0 1.327 1.746 2.022 2.231 2.406 2.557 2.718 3.003 3.13 3.257 3.395 3.597 3.707 3.909 4.099 4.263 4.333 4.472 4.612 4.821 4.949 5.072 5.253 5.423 5.587 5.749 5.906 6.087 6.249 6.408 6.591 6.754 6.923 7.117 7.324 7.527 7.744 7.969 8.192 8.414 8.663 8.928 9.177 9.468 9.732 9.95 10.153 10.292 10.323 10.091 9.533 8.933 8.315 7.766 7.264 6.778 6.341 5.98 5.611 5.289 4.999 4.713 4.439 4.183 3.938 3.693 3.482 3.309 3.125 2.905 2.729 2.559 2.395 2.26 2.11 1.956 1.786 1.61 1.496 1.37 1.176 1.047 0.915 0.848 0.693 0.534 0.357 0.26 0.068 -0.04 -0.143 -0.244 -0.468 -0.609 -0.759 -0.911 -1.081 -1.263 -1.528 -2.979 -10 ,2217 ,KEBNE ,16653478,Mon Nov 22 02:57:41 CET,Mon Nov 22 04:38:53 CET,0.0 1.686 2.04 2.329 2.564 2.771 2.984 3.184 3.51 3.655 3.795 3.957 4.163 4.282 4.504 4.712 4.923 5.011 5.164 5.311 5.506 5.636 5.775 5.969 6.142 6.299 6.448 6.599 6.802 6.996 7.177 7.394 7.598 7.795 8.025 8.281 8.516 8.748 8.997 9.251 9.478 9.707 9.942 10.17 10.42 10.679 10.955 11.19 11.396 11.503 11.308 10.786 10.222 9.631 9.026 8.475 8.023 7.627 7.27 6.894 6.568 6.281 6.016 5.764 5.527 5.293 5.042 4.818 4.628 4.438 4.242 4.08 3.89 3.689 3.544 3.391 3.232 3.075 2.915 2.802 2.676 2.482 2.353 2.212 2.14 1.997 1.839 1.669 1.581 1.388 1.278 1.176 1.078 0.857 0.739 0.598 0.443 0.286 0.037 -0.345 -1.322 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_32.txt deleted file mode 100644 index ff017d69..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16576 ,KEBNE ,17041945,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:03:22 CET,0.0 0.319 0.415 0.501 0.593 0.675 0.744 0.799 0.895 0.941 0.987 0.981 1.101 1.135 1.207 1.274 1.326 1.356 1.426 1.473 1.528 1.566 1.603 1.648 1.676 1.709 1.755 1.797 1.839 1.876 1.903 1.931 1.967 2.007 2.046 2.068 2.086 2.104 2.095 2.08 2.065 2.009 1.928 1.859 1.754 1.575 1.292 0.895 0.312 -0.639 -2.275 -4.162 -5.615 -6.784 -7.801 -8.693 -9.431 -10.073 -10.601 -11.13 -11.584 -11.99 -12.367 -12.72 -13.051 -13.351 -13.668 -13.944 -14.182 -14.439 -14.702 -14.921 -15.149 -15.375 -15.551 -15.737 -15.92 -16.099 -16.287 -16.423 -16.571 -16.802 -16.962 -17.144 -17.25 -17.472 -17.684 -17.887 -17.985 -18.198 -18.321 -18.437 -18.568 -18.835 -18.969 -19.127 -19.317 -19.558 -19.858 -20.213 -21.338 -2 ,2862 ,KEBNE ,17041946,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:03:22 CET,0.0 0.266 0.353 0.428 0.514 0.571 0.603 0.643 0.713 0.75 0.79 0.777 0.892 0.922 0.986 1.043 1.092 1.113 1.149 1.186 1.239 1.262 1.284 1.319 1.356 1.398 1.438 1.468 1.5 1.534 1.568 1.608 1.64 1.666 1.701 1.74 1.759 1.769 1.781 1.781 1.759 1.716 1.645 1.554 1.419 1.207 0.901 0.469 -0.143 -1.031 -2.509 -4.27 -5.665 -6.821 -7.784 -8.637 -9.384 -10.058 -10.614 -11.179 -11.712 -12.181 -12.589 -12.958 -13.291 -13.592 -13.901 -14.184 -14.447 -14.736 -15.044 -15.283 -15.513 -15.727 -15.913 -16.129 -16.348 -16.575 -16.815 -16.984 -17.155 -17.427 -17.63 -17.831 -17.931 -18.144 -18.356 -18.573 -18.688 -18.925 -19.085 -19.228 -19.371 -19.672 -19.849 -20.05 -20.267 -20.496 -20.775 -21.142 -22.456 -3 ,6020 ,KEBNE ,17041947,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:04:12 CET,0.0 0.197 0.349 0.469 0.544 0.612 0.673 0.736 0.836 0.882 0.936 0.956 1.093 1.131 1.195 1.243 1.284 1.308 1.358 1.398 1.456 1.497 1.535 1.591 1.653 1.701 1.738 1.784 1.845 1.887 1.916 1.965 2.005 2.021 2.041 2.079 2.126 2.162 2.173 2.167 2.14 2.091 2.046 1.987 1.88 1.711 1.436 1.037 0.423 -0.485 -1.999 -3.73 -5.093 -6.29 -7.315 -8.199 -8.925 -9.544 -10.063 -10.574 -11.021 -11.414 -11.777 -12.121 -12.482 -12.85 -13.247 -13.596 -13.872 -14.122 -14.384 -14.628 -14.871 -15.094 -15.268 -15.445 -15.618 -15.792 -15.964 -16.083 -16.207 -16.4 -16.536 -16.684 -16.757 -16.914 -17.074 -17.229 -17.314 -17.514 -17.597 -17.702 -17.813 -18.054 -18.208 -18.373 -18.518 -18.703 -18.933 -19.226 -20.254 -4 ,944 ,KEBNE ,17041948,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:04:05 CET,0.0 0.224 0.395 0.523 0.617 0.694 0.748 0.809 0.914 0.955 1.003 1.006 1.129 1.163 1.212 1.261 1.315 1.343 1.394 1.437 1.502 1.545 1.583 1.643 1.702 1.755 1.819 1.875 1.916 1.952 1.992 2.035 2.072 2.112 2.176 2.243 2.292 2.321 2.314 2.309 2.298 2.247 2.184 2.113 2.027 1.915 1.688 1.334 0.8 -0.055 -1.5 -3.182 -4.525 -5.673 -6.667 -7.506 -8.202 -8.824 -9.34 -9.858 -10.314 -10.702 -11.057 -11.4 -11.724 -12.006 -12.297 -12.564 -12.788 -13.006 -13.232 -13.426 -13.629 -13.839 -14.006 -14.196 -14.408 -14.638 -14.886 -15.058 -15.234 -15.489 -15.646 -15.816 -15.916 -16.125 -16.328 -16.565 -16.701 -16.935 -17.076 -17.223 -17.366 -17.697 -17.89 -18.094 -18.32 -18.56 -18.814 -19.174 -20.736 -5 ,20042 ,KEBNE ,17041949,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:03:31 CET,0.0 0.694 0.823 0.929 1.028 1.094 1.145 1.198 1.295 1.339 1.378 1.365 1.489 1.522 1.588 1.649 1.706 1.736 1.791 1.828 1.873 1.91 1.945 1.993 2.049 2.103 2.143 2.179 2.21 2.225 2.249 2.29 2.326 2.353 2.371 2.377 2.388 2.396 2.382 2.351 2.31 2.256 2.162 2.031 1.88 1.691 1.391 0.972 0.339 -0.595 -2.087 -3.798 -5.2 -6.364 -7.315 -8.134 -8.882 -9.61 -10.243 -10.85 -11.352 -11.809 -12.235 -12.607 -12.961 -13.288 -13.634 -13.937 -14.192 -14.47 -14.758 -14.995 -15.231 -15.458 -15.625 -15.804 -16.001 -16.206 -16.433 -16.593 -16.742 -16.956 -17.103 -17.257 -17.341 -17.515 -17.692 -17.88 -17.984 -18.199 -18.31 -18.425 -18.528 -18.752 -18.893 -19.056 -19.248 -19.457 -19.706 -20.081 -21.263 -6 ,12416 ,KEBNE ,17041950,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:02:26 CET,0.0 0.176 0.282 0.386 0.459 0.524 0.579 0.625 0.689 0.717 0.75 0.733 0.847 0.872 0.932 0.99 1.049 1.075 1.133 1.195 1.271 1.313 1.349 1.389 1.427 1.466 1.514 1.556 1.585 1.619 1.656 1.697 1.736 1.764 1.778 1.782 1.787 1.796 1.798 1.788 1.783 1.767 1.712 1.633 1.482 1.243 0.918 0.471 -0.108 -0.914 -2.367 -4.111 -5.442 -6.545 -7.496 -8.345 -9.089 -9.72 -10.252 -10.8 -11.258 -11.667 -12.06 -12.428 -12.771 -13.079 -13.395 -13.704 -13.995 -14.268 -14.543 -14.764 -14.979 -15.207 -15.383 -15.563 -15.759 -15.969 -16.176 -16.313 -16.457 -16.678 -16.853 -17.059 -17.157 -17.361 -17.577 -17.774 -17.873 -18.082 -18.181 -18.301 -18.418 -18.65 -18.801 -18.949 -19.113 -19.331 -19.547 -19.892 -20.854 -7 ,2969 ,KEBNE ,17041952,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:03:43 CET,0.0 0.25 0.377 0.482 0.561 0.62 0.675 0.731 0.824 0.863 0.901 0.892 1.019 1.056 1.115 1.167 1.211 1.233 1.284 1.326 1.376 1.41 1.455 1.521 1.575 1.626 1.673 1.714 1.755 1.795 1.826 1.864 1.898 1.92 1.961 1.994 1.998 2.015 2.03 2.034 2.032 1.993 1.914 1.819 1.688 1.529 1.304 0.962 0.407 -0.489 -1.892 -3.542 -4.976 -6.221 -7.29 -8.225 -9.014 -9.699 -10.269 -10.824 -11.3 -11.723 -12.125 -12.501 -12.843 -13.144 -13.445 -13.71 -13.928 -14.156 -14.394 -14.598 -14.819 -15.027 -15.182 -15.351 -15.533 -15.719 -15.909 -16.038 -16.161 -16.368 -16.517 -16.658 -16.731 -16.892 -17.062 -17.245 -17.337 -17.542 -17.648 -17.763 -17.881 -18.104 -18.219 -18.351 -18.522 -18.703 -18.901 -19.214 -20.052 -8 ,16384 ,KEBNE ,17041953,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:02:05 CET,0.0 0.125 0.227 0.326 0.438 0.535 0.608 0.676 0.79 0.839 0.888 0.89 1.02 1.057 1.117 1.173 1.222 1.247 1.312 1.371 1.455 1.505 1.542 1.603 1.664 1.723 1.771 1.819 1.881 1.925 1.961 2.001 2.031 2.06 2.091 2.105 2.12 2.145 2.163 2.168 2.165 2.148 2.117 2.052 1.949 1.797 1.568 1.236 0.731 -0.059 -1.405 -2.938 -4.19 -5.269 -6.161 -6.908 -7.541 -8.119 -8.633 -9.171 -9.639 -10.048 -10.43 -10.779 -11.096 -11.376 -11.658 -11.916 -12.134 -12.352 -12.588 -12.784 -12.989 -13.202 -13.364 -13.529 -13.691 -13.855 -14.017 -14.137 -14.274 -14.486 -14.621 -14.788 -14.901 -15.146 -15.391 -15.64 -15.778 -16.029 -16.186 -16.333 -16.488 -16.819 -16.999 -17.182 -17.399 -17.664 -17.964 -18.331 -19.953 -9 ,8165 ,KEBNE ,17041954,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:03:56 CET,0.0 0.246 0.38 0.483 0.577 0.682 0.785 0.883 1.062 1.143 1.224 1.29 1.446 1.514 1.654 1.767 1.865 1.921 2.02 2.084 2.147 2.18 2.213 2.271 2.328 2.371 2.409 2.442 2.486 2.526 2.557 2.595 2.635 2.684 2.734 2.779 2.808 2.821 2.822 2.809 2.782 2.737 2.686 2.624 2.519 2.374 2.113 1.673 1.068 0.202 -1.236 -2.992 -4.429 -5.623 -6.619 -7.478 -8.194 -8.843 -9.412 -9.962 -10.425 -10.835 -11.221 -11.58 -11.905 -12.192 -12.505 -12.782 -13.007 -13.271 -13.554 -13.764 -13.993 -14.238 -14.414 -14.594 -14.781 -14.978 -15.189 -15.336 -15.489 -15.741 -15.919 -16.105 -16.202 -16.401 -16.594 -16.779 -16.871 -17.075 -17.217 -17.366 -17.521 -17.851 -18.041 -18.257 -18.488 -18.772 -19.155 -19.666 -21.103 -10 ,1172 ,KEBNE ,17041955,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:03:24 CET,0.0 0.352 0.513 0.655 0.759 0.836 0.902 0.954 1.051 1.109 1.158 1.143 1.275 1.321 1.384 1.435 1.493 1.522 1.578 1.619 1.687 1.738 1.787 1.854 1.917 1.977 2.03 2.078 2.132 2.183 2.224 2.27 2.316 2.36 2.388 2.394 2.399 2.413 2.423 2.411 2.391 2.358 2.312 2.261 2.149 1.945 1.672 1.299 0.712 -0.195 -1.742 -3.534 -4.912 -6.012 -6.932 -7.73 -8.444 -9.09 -9.622 -10.153 -10.599 -10.992 -11.378 -11.745 -12.105 -12.432 -12.751 -13.039 -13.276 -13.511 -13.748 -13.945 -14.164 -14.384 -14.552 -14.732 -14.924 -15.125 -15.331 -15.467 -15.604 -15.826 -16.0 -16.191 -16.289 -16.482 -16.643 -16.817 -16.909 -17.111 -17.222 -17.332 -17.455 -17.703 -17.831 -17.975 -18.151 -18.326 -18.54 -18.918 -20.5 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_33.txt deleted file mode 100644 index f42c7963..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_19_33.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3761 ,KEBNE ,16653479,Mon Nov 22 02:58:44 CET,Mon Nov 22 04:39:37 CET,0.0 1.176 1.511 1.717 1.88 2.028 2.18 2.317 2.541 2.645 2.751 2.878 3.071 3.165 3.352 3.532 3.699 3.775 3.919 4.063 4.262 4.381 4.5 4.682 4.848 5.018 5.187 5.335 5.506 5.677 5.846 6.046 6.235 6.415 6.623 6.844 7.048 7.267 7.491 7.713 7.946 8.216 8.53 8.844 9.201 9.601 10.022 10.452 10.878 11.257 11.505 11.439 11.257 11.027 10.798 10.579 10.352 10.141 9.966 9.757 9.555 9.383 9.22 9.065 8.914 8.788 8.661 8.546 8.438 8.31 8.183 8.092 7.999 7.891 7.807 7.726 7.627 7.513 7.413 7.351 7.284 7.171 7.095 7.016 6.974 6.885 6.791 6.693 6.644 6.511 6.494 6.431 6.368 6.243 6.176 6.101 6.01 5.918 5.77 5.582 5.327 -2 ,13534 ,KEBNE ,16653480,Mon Nov 22 02:58:43 CET,Mon Nov 22 04:39:13 CET,0.0 1.027 1.377 1.624 1.838 2.0 2.147 2.287 2.535 2.649 2.758 2.874 3.052 3.131 3.279 3.429 3.576 3.641 3.761 3.875 4.059 4.182 4.291 4.452 4.607 4.755 4.895 5.028 5.204 5.357 5.487 5.647 5.801 5.951 6.119 6.298 6.485 6.683 6.86 7.046 7.246 7.443 7.682 7.924 8.155 8.425 8.745 9.046 9.355 9.652 9.854 9.865 9.755 9.551 9.31 9.094 8.893 8.708 8.523 8.321 8.171 8.032 7.901 7.772 7.635 7.509 7.39 7.283 7.178 7.069 6.958 6.864 6.76 6.647 6.563 6.476 6.389 6.304 6.217 6.155 6.097 6.005 5.927 5.849 5.814 5.735 5.652 5.58 5.537 5.402 5.374 5.312 5.252 5.114 5.022 4.929 4.853 4.771 4.675 4.561 4.417 -4 ,23373 ,KEBNE ,16653482,Mon Nov 22 02:59:45 CET,Mon Nov 22 04:42:32 CET,0.0 1.045 1.332 1.532 1.742 1.925 2.071 2.202 2.4 2.493 2.595 2.698 2.872 2.955 3.103 3.237 3.381 3.451 3.583 3.73 3.937 4.061 4.171 4.322 4.468 4.604 4.725 4.846 5.019 5.197 5.362 5.549 5.733 5.898 6.07 6.273 6.479 6.709 6.962 7.2 7.43 7.706 8.014 8.304 8.631 9.002 9.413 9.874 10.39 10.925 11.428 11.601 11.505 11.315 11.073 10.82 10.604 10.387 10.185 9.985 9.814 9.655 9.48 9.309 9.152 9.006 8.864 8.745 8.634 8.505 8.38 8.291 8.196 8.094 8.015 7.934 7.847 7.739 7.61 7.526 7.443 7.314 7.233 7.157 7.113 7.01 6.915 6.821 6.765 6.615 6.576 6.51 6.447 6.318 6.239 6.159 6.075 5.974 5.863 5.709 5.211 -5 ,21441 ,KEBNE ,16653483,Mon Nov 22 02:59:45 CET,Mon Nov 22 04:40:48 CET,0.0 0.914 1.249 1.542 1.774 1.945 2.069 2.183 2.411 2.521 2.621 2.725 2.908 3.002 3.172 3.325 3.48 3.548 3.674 3.816 4.021 4.144 4.268 4.437 4.586 4.719 4.861 5.005 5.197 5.385 5.548 5.743 5.939 6.129 6.332 6.557 6.777 7.017 7.286 7.563 7.83 8.121 8.41 8.653 8.933 9.214 9.523 9.884 10.28 10.682 11.007 11.051 10.958 10.775 10.573 10.364 10.121 9.892 9.7 9.504 9.346 9.21 9.072 8.941 8.802 8.666 8.528 8.402 8.292 8.175 8.059 7.963 7.858 7.753 7.674 7.585 7.494 7.401 7.289 7.212 7.136 7.018 6.946 6.87 6.821 6.718 6.612 6.509 6.462 6.326 6.309 6.258 6.199 6.061 5.995 5.924 5.845 5.773 5.691 5.595 5.323 -6 ,4648 ,KEBNE ,16653484,Mon Nov 22 02:59:45 CET,Mon Nov 22 04:42:44 CET,0.0 1.171 1.562 1.854 2.061 2.237 2.396 2.553 2.847 2.968 3.099 3.259 3.448 3.552 3.762 3.952 4.119 4.187 4.305 4.427 4.602 4.723 4.847 5.037 5.216 5.385 5.544 5.682 5.868 6.047 6.203 6.387 6.569 6.742 6.943 7.156 7.358 7.596 7.844 8.079 8.318 8.568 8.835 9.109 9.4 9.713 10.059 10.377 10.679 11.045 11.35 11.359 11.272 11.111 10.896 10.673 10.474 10.279 10.085 9.88 9.69 9.506 9.34 9.197 9.062 8.927 8.777 8.645 8.527 8.406 8.288 8.185 8.075 7.957 7.863 7.771 7.68 7.583 7.483 7.415 7.339 7.238 7.172 7.093 7.054 6.958 6.856 6.761 6.712 6.57 6.546 6.488 6.428 6.323 6.243 6.145 6.053 5.947 5.819 5.682 5.456 -7 ,696 ,KEBNE ,16653485,Mon Nov 22 03:00:46 CET,Mon Nov 22 04:42:00 CET,0.0 1.195 1.563 1.872 2.079 2.248 2.398 2.54 2.793 2.901 3.006 3.123 3.294 3.372 3.522 3.651 3.777 3.841 3.951 4.057 4.212 4.307 4.395 4.519 4.655 4.778 4.887 4.995 5.147 5.293 5.431 5.602 5.765 5.932 6.122 6.328 6.509 6.691 6.905 7.138 7.378 7.645 7.945 8.209 8.487 8.802 9.136 9.457 9.804 10.144 10.447 10.482 10.316 10.157 10.006 9.818 9.618 9.405 9.196 8.987 8.811 8.67 8.528 8.385 8.252 8.135 8.015 7.891 7.789 7.688 7.567 7.464 7.37 7.274 7.193 7.111 7.028 6.951 6.879 6.819 6.744 6.632 6.56 6.487 6.442 6.352 6.275 6.193 6.147 6.009 5.958 5.892 5.827 5.679 5.596 5.51 5.425 5.348 5.232 5.06 4.867 -8 ,11749 ,KEBNE ,16653486,Mon Nov 22 03:00:46 CET,Mon Nov 22 04:41:15 CET,0.0 0.801 1.117 1.351 1.524 1.677 1.808 1.924 2.131 2.238 2.357 2.499 2.675 2.755 2.91 3.057 3.195 3.256 3.387 3.518 3.689 3.807 3.932 4.111 4.287 4.469 4.628 4.764 4.965 5.152 5.33 5.533 5.714 5.9 6.119 6.37 6.593 6.8 7.015 7.266 7.524 7.805 8.116 8.415 8.755 9.144 9.567 9.981 10.445 10.91 11.288 11.379 11.281 11.142 10.954 10.761 10.573 10.376 10.186 9.998 9.83 9.662 9.51 9.366 9.23 9.118 8.985 8.851 8.732 8.609 8.497 8.41 8.32 8.22 8.14 8.062 7.976 7.882 7.785 7.717 7.646 7.537 7.459 7.38 7.341 7.253 7.152 7.062 7.015 6.878 6.855 6.797 6.745 6.649 6.588 6.52 6.448 6.375 6.278 6.116 5.883 -9 ,9622 ,KEBNE ,16653487,Mon Nov 22 03:00:47 CET,Mon Nov 22 04:42:37 CET,0.0 0.727 0.99 1.228 1.437 1.596 1.729 1.862 2.106 2.208 2.309 2.411 2.591 2.678 2.853 3.031 3.188 3.26 3.397 3.533 3.726 3.845 3.97 4.153 4.311 4.445 4.584 4.73 4.9 5.061 5.206 5.376 5.544 5.702 5.887 6.096 6.292 6.506 6.718 6.947 7.206 7.465 7.764 8.079 8.419 8.76 9.162 9.588 10.009 10.466 10.821 10.863 10.758 10.586 10.396 10.183 9.962 9.753 9.549 9.344 9.17 8.993 8.811 8.644 8.498 8.369 8.208 8.053 7.943 7.829 7.707 7.608 7.499 7.389 7.301 7.202 7.106 7.012 6.913 6.85 6.787 6.674 6.578 6.485 6.439 6.339 6.242 6.148 6.105 5.96 5.917 5.861 5.809 5.663 5.594 5.538 5.465 5.356 5.227 5.034 4.397 -10 ,3587 ,KEBNE ,16653488,Mon Nov 22 03:00:47 CET,Mon Nov 22 04:42:29 CET,0.0 0.796 1.09 1.328 1.515 1.657 1.787 1.921 2.15 2.25 2.353 2.458 2.63 2.721 2.895 3.054 3.196 3.267 3.406 3.536 3.719 3.829 3.944 4.109 4.264 4.412 4.54 4.656 4.814 4.975 5.122 5.301 5.479 5.635 5.81 6.009 6.194 6.401 6.625 6.845 7.074 7.322 7.595 7.883 8.21 8.54 8.879 9.277 9.715 10.063 10.236 10.193 10.056 9.87 9.651 9.431 9.228 9.014 8.818 8.624 8.439 8.28 8.137 7.986 7.848 7.72 7.578 7.457 7.357 7.244 7.118 7.02 6.918 6.816 6.73 6.631 6.529 6.417 6.305 6.237 6.169 6.056 5.969 5.888 5.849 5.749 5.641 5.549 5.504 5.362 5.327 5.257 5.19 5.059 4.985 4.915 4.846 4.767 4.674 4.532 4.044 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_20_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_20_19.txt deleted file mode 100644 index baffe272..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_20_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20911 ,KEBNE ,17041956,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:00:57 CET,0.0 0.413 0.532 0.692 0.846 0.961 1.069 1.165 1.366 1.46 1.548 1.633 1.806 1.875 2.007 2.13 2.258 2.317 2.433 2.549 2.722 2.833 2.941 3.102 3.256 3.411 3.559 3.702 3.883 4.054 4.22 4.409 4.589 4.77 4.994 5.261 5.532 5.846 6.165 6.485 6.826 7.221 7.676 8.137 8.673 9.258 9.88 10.559 11.371 12.247 13.247 13.954 14.236 14.241 14.085 13.864 13.616 13.362 13.129 12.873 12.59 12.297 12.045 11.812 11.579 11.359 11.118 10.896 10.71 10.503 10.273 10.092 9.884 9.664 9.503 9.322 9.123 8.915 8.706 8.558 8.384 8.117 7.951 7.777 7.67 7.398 7.1 6.801 6.648 6.399 6.172 6.013 5.852 5.481 5.232 4.946 4.63 4.275 3.827 3.268 0.911 -2 ,462 ,KEBNE ,17041957,Thu Dec 23 03:23:50 CET,Thu Dec 23 05:01:02 CET,0.0 0.227 0.358 0.499 0.638 0.76 0.87 0.976 1.159 1.245 1.325 1.391 1.57 1.644 1.782 1.904 2.029 2.088 2.194 2.304 2.464 2.564 2.662 2.811 2.96 3.109 3.254 3.382 3.545 3.712 3.876 4.07 4.269 4.478 4.704 4.934 5.159 5.423 5.698 5.973 6.25 6.581 7.0 7.43 7.936 8.47 9.045 9.704 10.479 11.342 12.306 12.91 13.058 12.94 12.645 12.281 11.921 11.579 11.268 10.921 10.625 10.363 10.081 9.804 9.552 9.327 9.092 8.87 8.673 8.487 8.308 8.155 7.977 7.766 7.606 7.448 7.277 7.092 6.893 6.765 6.627 6.407 6.261 6.108 6.021 5.829 5.628 5.368 5.215 4.974 4.696 4.515 4.328 3.9 3.684 3.433 3.167 2.888 2.556 2.117 -0.924 -3 ,3004 ,KEBNE ,17041958,Thu Dec 23 03:24:53 CET,Thu Dec 23 05:02:18 CET,0.0 0.327 0.531 0.683 0.813 0.942 1.068 1.162 1.343 1.431 1.511 1.575 1.757 1.826 1.957 2.086 2.225 2.296 2.428 2.546 2.724 2.84 2.94 3.092 3.251 3.405 3.553 3.696 3.887 4.062 4.229 4.434 4.629 4.813 5.03 5.268 5.501 5.764 6.044 6.348 6.658 6.995 7.407 7.814 8.256 8.781 9.394 10.106 11.001 11.979 13.058 13.723 13.797 13.662 13.484 13.27 13.076 12.891 12.66 12.367 12.103 11.851 11.59 11.349 11.134 10.933 10.719 10.486 10.271 10.069 9.86 9.649 9.392 9.109 8.889 8.67 8.451 8.221 8.003 7.866 7.708 7.448 7.27 7.076 6.985 6.809 6.571 6.286 6.143 5.9 5.689 5.539 5.353 4.852 4.574 4.3 4.026 3.696 3.191 2.48 -0.086 -4 ,10632 ,KEBNE ,17041959,Thu Dec 23 03:24:54 CET,Thu Dec 23 05:03:41 CET,0.0 0.554 0.787 0.902 1.021 1.122 1.204 1.287 1.427 1.496 1.569 1.613 1.784 1.849 1.975 2.101 2.22 2.278 2.405 2.538 2.725 2.841 2.951 3.116 3.279 3.442 3.613 3.77 3.953 4.129 4.283 4.474 4.676 4.866 5.078 5.322 5.559 5.829 6.109 6.397 6.705 7.045 7.454 7.87 8.371 8.92 9.515 10.176 10.942 11.819 12.66 13.053 13.119 12.991 12.75 12.435 12.127 11.798 11.505 11.206 10.907 10.624 10.361 10.106 9.847 9.622 9.398 9.197 9.01 8.805 8.584 8.393 8.157 7.92 7.744 7.524 7.287 7.068 6.84 6.662 6.502 6.276 6.085 5.878 5.787 5.617 5.419 5.193 5.066 4.814 4.558 4.39 4.204 3.804 3.584 3.33 3.021 2.638 2.181 1.626 -1.331 -5 ,650 ,KEBNE ,17041960,Thu Dec 23 03:24:53 CET,Thu Dec 23 05:03:20 CET,0.0 0.358 0.508 0.64 0.748 0.84 0.926 1.008 1.156 1.216 1.284 1.338 1.502 1.57 1.693 1.814 1.934 1.995 2.117 2.225 2.382 2.487 2.587 2.738 2.894 3.052 3.198 3.332 3.501 3.657 3.818 4.024 4.201 4.37 4.586 4.85 5.099 5.369 5.679 6.0 6.341 6.748 7.218 7.684 8.244 8.852 9.552 10.362 11.257 12.199 13.254 13.961 14.157 14.191 14.065 13.816 13.608 13.374 13.098 12.745 12.422 12.167 11.915 11.662 11.437 11.235 11.014 10.822 10.649 10.456 10.24 10.057 9.87 9.651 9.476 9.286 9.102 8.915 8.698 8.561 8.42 8.185 7.992 7.79 7.712 7.554 7.353 7.116 6.988 6.766 6.562 6.403 6.221 5.764 5.517 5.255 4.968 4.65 4.171 3.41 0.314 -6 ,13605 ,KEBNE ,17041961,Thu Dec 23 03:24:54 CET,Thu Dec 23 05:01:59 CET,0.0 0.307 0.473 0.644 0.814 0.931 1.022 1.116 1.29 1.363 1.436 1.51 1.698 1.773 1.929 2.081 2.225 2.292 2.415 2.529 2.693 2.805 2.918 3.067 3.204 3.338 3.463 3.587 3.756 3.922 4.086 4.279 4.461 4.642 4.87 5.142 5.389 5.653 5.927 6.189 6.452 6.767 7.166 7.579 8.028 8.533 9.156 9.846 10.62 11.409 12.215 12.634 12.606 12.473 12.301 12.078 11.844 11.545 11.294 11.05 10.761 10.492 10.26 10.047 9.799 9.565 9.336 9.099 8.866 8.616 8.36 8.152 7.934 7.675 7.451 7.234 7.026 6.807 6.567 6.402 6.228 5.942 5.721 5.487 5.381 5.157 4.927 4.694 4.577 4.362 4.172 4.02 3.86 3.469 3.242 2.993 2.723 2.392 1.98 1.465 -1.034 -7 ,28985 ,KEBNE ,17041962,Thu Dec 23 03:24:54 CET,Thu Dec 23 05:02:06 CET,0.0 0.306 0.462 0.586 0.697 0.805 0.906 0.993 1.165 1.261 1.353 1.424 1.61 1.688 1.832 1.969 2.101 2.167 2.299 2.421 2.587 2.697 2.808 2.958 3.114 3.273 3.424 3.573 3.76 3.921 4.061 4.234 4.412 4.606 4.844 5.106 5.357 5.625 5.914 6.218 6.548 6.956 7.411 7.858 8.41 9.014 9.687 10.456 11.337 12.233 13.107 13.747 13.951 13.873 13.687 13.457 13.224 12.986 12.72 12.434 12.173 11.935 11.715 11.495 11.288 11.105 10.889 10.697 10.547 10.375 10.195 10.044 9.864 9.67 9.519 9.346 9.161 8.981 8.815 8.711 8.594 8.374 8.216 8.054 7.958 7.753 7.557 7.376 7.278 7.064 6.862 6.718 6.571 6.22 6.022 5.799 5.49 5.121 4.684 4.005 1.275 -8 ,21162 ,KEBNE ,17041963,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:04:40 CET,0.0 0.275 0.437 0.56 0.672 0.774 0.866 0.959 1.119 1.192 1.268 1.307 1.469 1.538 1.679 1.815 1.94 2.004 2.127 2.23 2.399 2.516 2.619 2.761 2.902 3.051 3.194 3.337 3.53 3.711 3.876 4.093 4.315 4.527 4.784 5.073 5.335 5.624 5.939 6.262 6.592 6.995 7.5 7.982 8.509 9.123 9.839 10.608 11.487 12.507 13.668 14.47 14.697 14.744 14.713 14.561 14.363 14.152 13.928 13.679 13.45 13.241 13.014 12.751 12.503 12.291 12.071 11.868 11.683 11.477 11.27 11.11 10.905 10.658 10.472 10.277 10.072 9.855 9.633 9.479 9.303 9.034 8.86 8.677 8.586 8.407 8.189 7.937 7.82 7.605 7.379 7.201 7.015 6.627 6.397 6.142 5.862 5.525 5.108 4.425 2.274 -9 ,25320 ,KEBNE ,17041965,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:04:51 CET,0.0 0.4 0.579 0.712 0.807 0.904 1.001 1.095 1.28 1.363 1.442 1.489 1.658 1.722 1.832 1.946 2.069 2.132 2.27 2.406 2.589 2.71 2.82 2.973 3.123 3.27 3.407 3.553 3.754 3.936 4.116 4.34 4.551 4.745 4.976 5.244 5.502 5.799 6.118 6.438 6.758 7.113 7.558 8.041 8.566 9.171 9.919 10.749 11.72 12.826 13.923 14.654 14.878 14.766 14.599 14.363 14.091 13.832 13.556 13.253 13.002 12.749 12.506 12.315 12.129 11.943 11.731 11.528 11.361 11.146 10.898 10.715 10.543 10.354 10.184 10.003 9.786 9.56 9.355 9.197 9.022 8.75 8.557 8.376 8.289 8.106 7.911 7.674 7.537 7.325 7.146 6.989 6.797 6.33 6.095 5.875 5.612 5.218 4.749 4.122 0.991 -10 ,18235 ,KEBNE ,17041966,Thu Dec 23 03:28:02 CET,Thu Dec 23 05:05:41 CET,0.0 0.482 0.633 0.744 0.836 0.916 0.984 1.055 1.223 1.3 1.361 1.373 1.526 1.585 1.689 1.791 1.891 1.94 2.048 2.153 2.293 2.387 2.485 2.632 2.77 2.892 3.003 3.118 3.27 3.416 3.556 3.718 3.878 4.04 4.226 4.44 4.649 4.884 5.134 5.4 5.703 6.055 6.491 6.95 7.45 7.973 8.584 9.234 9.968 10.843 11.614 11.935 11.995 11.901 11.663 11.344 10.989 10.672 10.394 10.091 9.855 9.653 9.434 9.202 8.961 8.736 8.509 8.282 8.037 7.766 7.495 7.274 7.061 6.843 6.689 6.531 6.366 6.179 5.965 5.82 5.663 5.427 5.262 5.075 4.972 4.758 4.517 4.258 4.133 3.917 3.713 3.557 3.4 3.038 2.837 2.618 2.362 2.044 1.608 0.987 -1.189 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_20_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_20_33.txt deleted file mode 100644 index d015e0ff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_20_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2316 ,KEBNE ,17041969,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:06:27 CET,0.0 1.041 1.312 1.495 1.662 1.822 1.975 2.133 2.405 2.521 2.62 2.706 2.885 2.955 3.098 3.259 3.409 3.475 3.622 3.775 3.999 4.132 4.248 4.416 4.569 4.704 4.84 4.984 5.174 5.36 5.537 5.741 5.949 6.159 6.397 6.634 6.851 7.112 7.394 7.701 8.044 8.411 8.825 9.265 9.758 10.276 10.876 11.488 12.205 13.093 14.072 14.686 14.837 14.718 14.532 14.355 14.108 13.857 13.652 13.422 13.174 12.947 12.757 12.571 12.386 12.181 11.98 11.806 11.641 11.462 11.272 11.129 10.968 10.785 10.639 10.482 10.308 10.125 9.959 9.845 9.677 9.348 9.133 8.938 8.853 8.686 8.508 8.302 8.199 8.023 7.899 7.77 7.61 7.237 7.037 6.794 6.483 6.132 5.734 5.194 2.759 -2 ,5957 ,KEBNE ,17041970,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:06:22 CET,0.0 0.815 1.081 1.322 1.52 1.695 1.85 1.986 2.247 2.369 2.478 2.59 2.795 2.887 3.048 3.206 3.358 3.434 3.592 3.752 3.995 4.144 4.287 4.499 4.7 4.892 5.079 5.26 5.489 5.733 5.978 6.263 6.552 6.825 7.139 7.499 7.832 8.18 8.566 8.985 9.434 9.95 10.521 11.051 11.627 12.256 12.992 13.794 14.715 15.719 16.562 16.942 16.996 16.858 16.678 16.509 16.315 16.128 15.924 15.65 15.4 15.151 14.927 14.721 14.496 14.29 14.099 13.909 13.737 13.579 13.41 13.256 13.087 12.914 12.789 12.646 12.495 12.336 12.16 12.047 11.924 11.726 11.566 11.409 11.329 11.107 10.897 10.702 10.589 10.391 10.215 10.087 9.959 9.677 9.507 9.306 9.06 8.715 8.272 7.526 4.679 -3 ,30649 ,KEBNE ,17041971,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:05:36 CET,0.0 0.783 1.072 1.328 1.525 1.669 1.811 1.948 2.176 2.273 2.38 2.492 2.667 2.745 2.904 3.068 3.228 3.308 3.461 3.605 3.812 3.945 4.083 4.266 4.431 4.61 4.777 4.928 5.129 5.314 5.486 5.715 5.944 6.164 6.422 6.69 6.945 7.235 7.53 7.846 8.204 8.606 9.073 9.536 10.048 10.581 11.218 11.968 12.847 13.833 14.745 15.201 15.311 15.191 14.951 14.717 14.485 14.228 13.991 13.751 13.521 13.289 13.045 12.764 12.48 12.197 11.907 11.67 11.473 11.278 11.034 10.802 10.581 10.38 10.208 10.012 9.819 9.612 9.382 9.216 9.026 8.724 8.525 8.327 8.23 8.052 7.88 7.668 7.546 7.335 7.142 6.964 6.785 6.39 6.141 5.883 5.584 5.26 4.886 4.373 2.208 -4 ,18334 ,KEBNE ,17041973,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:05:42 CET,0.0 0.958 1.232 1.43 1.602 1.773 1.946 2.09 2.351 2.457 2.555 2.66 2.854 2.952 3.136 3.337 3.535 3.621 3.785 3.946 4.178 4.335 4.487 4.682 4.854 5.017 5.175 5.327 5.517 5.708 5.919 6.187 6.446 6.71 7.032 7.379 7.708 8.052 8.409 8.763 9.098 9.486 9.981 10.496 11.049 11.599 12.221 12.924 13.668 14.447 15.267 15.667 15.594 15.396 15.22 14.978 14.701 14.458 14.24 14.012 13.791 13.568 13.352 13.14 12.923 12.747 12.563 12.368 12.184 11.995 11.785 11.587 11.371 11.136 10.974 10.822 10.663 10.503 10.342 10.224 10.097 9.91 9.743 9.548 9.457 9.262 9.069 8.843 8.711 8.489 8.256 8.094 7.94 7.599 7.391 7.129 6.789 6.421 6.007 5.554 2.687 -5 ,9565 ,KEBNE ,17041974,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:05:43 CET,0.0 1.085 1.418 1.688 1.885 2.043 2.18 2.333 2.623 2.748 2.871 2.984 3.188 3.287 3.472 3.665 3.87 3.968 4.133 4.287 4.528 4.677 4.819 5.036 5.251 5.455 5.648 5.83 6.067 6.316 6.553 6.828 7.085 7.331 7.619 7.939 8.254 8.623 9.021 9.438 9.887 10.394 10.979 11.544 12.169 12.861 13.531 14.174 14.978 15.927 16.967 17.588 17.663 17.509 17.413 17.298 17.061 16.779 16.519 16.237 15.932 15.624 15.329 15.048 14.762 14.512 14.259 14.009 13.782 13.555 13.327 13.132 12.96 12.793 12.637 12.457 12.244 11.977 11.712 11.563 11.409 11.119 10.913 10.712 10.607 10.393 10.157 9.884 9.725 9.482 9.225 9.037 8.844 8.432 8.207 7.955 7.631 7.22 6.672 6.009 2.775 -6 ,30687 ,KEBNE ,17041975,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:07:32 CET,0.0 0.712 1.045 1.268 1.473 1.697 1.9 2.062 2.316 2.428 2.539 2.663 2.868 2.967 3.17 3.369 3.54 3.62 3.782 3.928 4.16 4.317 4.46 4.664 4.851 5.022 5.198 5.383 5.623 5.843 6.02 6.231 6.445 6.658 6.926 7.197 7.444 7.72 7.998 8.287 8.638 9.061 9.541 10.031 10.588 11.172 11.826 12.601 13.518 14.527 15.567 16.093 16.107 16.003 15.828 15.503 15.167 14.84 14.55 14.247 13.992 13.777 13.547 13.336 13.167 12.997 12.816 12.649 12.482 12.307 12.089 11.893 11.699 11.497 11.331 11.151 10.965 10.756 10.528 10.381 10.216 9.94 9.757 9.57 9.47 9.25 9.005 8.757 8.624 8.397 8.2 8.032 7.845 7.496 7.277 6.987 6.661 6.339 5.934 5.317 2.57 -7 ,24414 ,KEBNE ,17041977,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:06:23 CET,0.0 1.018 1.286 1.479 1.659 1.83 1.973 2.092 2.308 2.415 2.528 2.635 2.82 2.915 3.099 3.266 3.413 3.485 3.635 3.784 3.994 4.112 4.234 4.414 4.577 4.74 4.907 5.081 5.29 5.475 5.655 5.874 6.106 6.325 6.572 6.872 7.146 7.433 7.721 8.018 8.341 8.697 9.151 9.638 10.168 10.793 11.576 12.425 13.341 14.344 15.46 16.17 16.359 16.277 16.135 15.929 15.685 15.46 15.236 14.987 14.762 14.553 14.334 14.109 13.891 13.705 13.498 13.319 13.173 13.005 12.818 12.643 12.476 12.319 12.182 12.027 11.866 11.687 11.481 11.344 11.21 10.977 10.792 10.595 10.497 10.28 10.034 9.78 9.647 9.425 9.204 9.032 8.864 8.462 8.191 7.895 7.581 7.238 6.811 6.22 3.839 -8 ,5012 ,KEBNE ,17041978,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:06:48 CET,0.0 0.891 1.221 1.467 1.657 1.807 1.94 2.061 2.3 2.413 2.518 2.629 2.819 2.895 3.053 3.219 3.367 3.442 3.599 3.735 3.905 4.009 4.121 4.294 4.455 4.614 4.77 4.91 5.084 5.258 5.429 5.617 5.792 5.977 6.22 6.501 6.778 7.082 7.404 7.731 8.071 8.469 8.935 9.432 9.983 10.509 11.082 11.782 12.574 13.352 14.174 14.685 14.732 14.605 14.38 14.107 13.838 13.552 13.284 12.996 12.753 12.548 12.342 12.106 11.883 11.69 11.472 11.256 11.07 10.884 10.675 10.497 10.325 10.142 9.987 9.833 9.693 9.533 9.323 9.183 9.047 8.819 8.662 8.502 8.413 8.232 8.019 7.775 7.657 7.455 7.28 7.129 6.943 6.552 6.361 6.115 5.788 5.376 4.934 4.399 2.131 -9 ,30370 ,KEBNE ,17041979,Thu Dec 23 03:28:02 CET,Thu Dec 23 05:05:51 CET,0.0 1.2 1.512 1.75 1.944 2.122 2.291 2.44 2.712 2.837 2.966 3.121 3.344 3.462 3.665 3.832 4.002 4.083 4.242 4.399 4.623 4.773 4.916 5.119 5.308 5.484 5.66 5.828 6.039 6.246 6.435 6.65 6.871 7.101 7.356 7.649 7.933 8.241 8.569 8.892 9.242 9.67 10.194 10.712 11.291 11.929 12.67 13.461 14.315 15.204 16.05 16.671 16.838 16.822 16.726 16.5 16.258 16.014 15.79 15.54 15.269 14.991 14.746 14.54 14.314 14.086 13.876 13.713 13.559 13.375 13.179 13.04 12.882 12.695 12.556 12.415 12.268 12.118 11.942 11.802 11.659 11.459 11.34 11.199 11.122 10.983 10.826 10.614 10.494 10.295 10.128 10.001 9.869 9.534 9.338 9.138 8.914 8.613 8.22 7.669 5.501 -10 ,25898 ,KEBNE ,17041981,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:07:11 CET,0.0 1.14 1.512 1.735 1.914 2.066 2.198 2.34 2.607 2.721 2.843 2.964 3.167 3.267 3.461 3.648 3.823 3.905 4.042 4.164 4.342 4.461 4.576 4.734 4.904 5.075 5.231 5.383 5.576 5.773 5.957 6.163 6.373 6.573 6.8 7.069 7.347 7.652 7.965 8.319 8.699 9.061 9.471 9.924 10.418 10.96 11.566 12.26 13.034 13.789 14.518 14.891 14.98 14.836 14.612 14.374 14.125 13.869 13.647 13.423 13.184 12.928 12.693 12.491 12.295 12.11 11.917 11.746 11.588 11.372 11.137 10.968 10.782 10.601 10.477 10.345 10.197 10.027 9.839 9.687 9.521 9.285 9.141 8.986 8.891 8.712 8.526 8.282 8.129 7.851 7.579 7.406 7.228 6.873 6.682 6.448 6.163 5.784 5.261 4.682 2.679 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_21_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_21_22.txt deleted file mode 100644 index 357ed942..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_21_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17620 ,KEBNE ,17041983,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:09:52 CET,0.0 1.187 1.643 1.987 2.256 2.51 2.734 2.929 3.294 3.465 3.623 3.824 4.043 4.176 4.428 4.675 4.899 4.992 5.16 5.313 5.529 5.674 5.807 5.999 6.189 6.374 6.549 6.706 6.897 7.088 7.274 7.495 7.716 7.937 8.195 8.476 8.733 8.997 9.276 9.598 9.944 10.314 10.717 11.102 11.546 12.072 12.653 13.254 13.977 14.799 15.688 16.207 16.355 16.379 16.329 16.233 16.118 15.994 15.851 15.662 15.495 15.328 15.153 15.015 14.896 14.778 14.652 14.53 14.412 14.293 14.167 14.055 13.942 13.815 13.693 13.575 13.46 13.32 13.147 13.03 12.922 12.752 12.626 12.491 12.417 12.278 12.141 11.983 11.904 11.741 11.624 11.517 11.404 11.167 11.025 10.872 10.706 10.501 10.226 9.839 8.75 -2 ,23574 ,KEBNE ,17041984,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:08:35 CET,0.0 1.164 1.522 1.806 2.033 2.242 2.439 2.625 2.932 3.075 3.222 3.4 3.603 3.713 3.909 4.103 4.297 4.386 4.558 4.711 4.938 5.092 5.236 5.442 5.633 5.819 6.003 6.178 6.398 6.599 6.792 7.038 7.285 7.521 7.788 8.073 8.349 8.653 8.97 9.309 9.64 10.0 10.421 10.825 11.292 11.819 12.404 13.028 13.74 14.502 15.228 15.659 15.856 15.917 15.849 15.719 15.602 15.492 15.377 15.22 15.03 14.837 14.658 14.499 14.358 14.211 14.047 13.914 13.806 13.685 13.54 13.407 13.243 13.062 12.931 12.792 12.652 12.516 12.372 12.265 12.152 11.99 11.867 11.727 11.662 11.531 11.386 11.245 11.172 11.026 10.96 10.875 10.774 10.559 10.438 10.297 10.158 9.998 9.804 9.509 8.294 -3 ,29190 ,KEBNE ,17041985,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:09:31 CET,0.0 1.245 1.595 1.874 2.107 2.312 2.498 2.671 2.987 3.146 3.286 3.429 3.623 3.734 3.962 4.166 4.351 4.439 4.609 4.77 4.997 5.128 5.267 5.481 5.678 5.867 6.033 6.196 6.397 6.582 6.75 6.956 7.176 7.388 7.613 7.865 8.12 8.404 8.705 9.022 9.331 9.672 10.091 10.498 10.968 11.478 12.05 12.667 13.334 14.075 14.856 15.342 15.547 15.605 15.559 15.471 15.379 15.268 15.141 15.002 14.881 14.756 14.607 14.46 14.338 14.225 14.103 13.988 13.868 13.752 13.637 13.519 13.389 13.251 13.145 13.038 12.926 12.809 12.694 12.619 12.535 12.386 12.278 12.16 12.093 11.962 11.841 11.693 11.612 11.466 11.38 11.286 11.188 10.971 10.859 10.752 10.629 10.478 10.269 9.98 9.016 -4 ,32602 ,KEBNE ,17041986,Thu Dec 23 03:28:00 CET,Thu Dec 23 05:07:40 CET,0.0 1.181 1.593 1.913 2.155 2.351 2.542 2.733 3.063 3.21 3.334 3.483 3.689 3.8 3.994 4.186 4.37 4.458 4.635 4.803 5.034 5.177 5.313 5.514 5.708 5.886 6.067 6.246 6.437 6.601 6.764 6.961 7.148 7.34 7.575 7.82 8.044 8.283 8.527 8.789 9.079 9.389 9.734 10.097 10.544 11.047 11.587 12.188 12.87 13.635 14.531 15.2 15.497 15.613 15.614 15.539 15.435 15.293 15.151 15.008 14.877 14.759 14.655 14.542 14.408 14.251 14.083 13.948 13.829 13.691 13.54 13.426 13.301 13.151 13.016 12.874 12.73 12.584 12.425 12.295 12.176 11.994 11.867 11.757 11.699 11.562 11.403 11.225 11.127 10.954 10.841 10.726 10.593 10.33 10.18 10.004 9.816 9.608 9.344 8.975 6.895 -5 ,31561 ,KEBNE ,17041987,Thu Dec 23 03:28:00 CET,Thu Dec 23 05:09:09 CET,0.0 0.94 1.214 1.426 1.618 1.788 1.946 2.097 2.334 2.446 2.559 2.682 2.878 2.982 3.151 3.3 3.451 3.533 3.704 3.856 4.065 4.205 4.329 4.498 4.649 4.793 4.953 5.116 5.32 5.513 5.7 5.921 6.117 6.302 6.512 6.751 6.996 7.266 7.537 7.826 8.131 8.46 8.844 9.225 9.676 10.181 10.715 11.312 12.065 12.946 13.898 14.58 14.814 14.883 14.914 14.881 14.773 14.644 14.522 14.373 14.243 14.117 13.994 13.886 13.763 13.633 13.495 13.363 13.234 13.099 12.966 12.85 12.716 12.57 12.456 12.332 12.206 12.078 11.929 11.824 11.719 11.548 11.424 11.29 11.214 11.069 10.919 10.747 10.663 10.499 10.381 10.266 10.151 9.893 9.726 9.537 9.319 9.08 8.806 8.44 7.073 -6 ,25938 ,KEBNE ,17041988,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:09:31 CET,0.0 1.166 1.568 1.878 2.135 2.341 2.526 2.704 3.016 3.146 3.267 3.434 3.636 3.75 3.96 4.158 4.363 4.463 4.647 4.816 5.044 5.198 5.35 5.559 5.753 5.943 6.133 6.312 6.527 6.745 6.968 7.216 7.446 7.669 7.926 8.21 8.479 8.76 9.047 9.349 9.674 10.029 10.437 10.831 11.279 11.824 12.436 13.064 13.786 14.562 15.31 15.83 16.046 16.11 16.058 15.923 15.772 15.608 15.414 15.178 14.968 14.771 14.565 14.368 14.187 14.03 13.871 13.715 13.573 13.435 13.294 13.167 13.016 12.833 12.706 12.601 12.492 12.378 12.242 12.149 12.068 11.93 11.828 11.714 11.649 11.509 11.357 11.184 11.091 10.915 10.792 10.688 10.567 10.304 10.157 9.949 9.724 9.488 9.194 8.812 7.639 -7 ,22925 ,KEBNE ,17041989,Thu Dec 23 03:28:02 CET,Thu Dec 23 05:07:22 CET,0.0 1.144 1.454 1.673 1.832 1.984 2.131 2.271 2.537 2.654 2.763 2.859 3.027 3.11 3.269 3.426 3.573 3.643 3.784 3.925 4.122 4.243 4.365 4.532 4.68 4.825 4.963 5.095 5.274 5.459 5.646 5.869 6.079 6.276 6.486 6.721 6.96 7.224 7.496 7.783 8.097 8.46 8.873 9.29 9.762 10.256 10.813 11.424 12.129 12.918 13.752 14.309 14.518 14.532 14.472 14.348 14.204 14.096 13.99 13.859 13.743 13.617 13.457 13.322 13.215 13.096 12.973 12.865 12.767 12.659 12.528 12.411 12.3 12.193 12.111 12.02 11.92 11.815 11.702 11.614 11.526 11.378 11.268 11.153 11.091 10.965 10.808 10.62 10.523 10.35 10.224 10.103 9.986 9.734 9.585 9.417 9.237 9.033 8.761 8.369 6.624 -8 ,1213 ,KEBNE ,17041990,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:09:41 CET,0.0 0.863 1.187 1.416 1.628 1.829 2.001 2.169 2.471 2.606 2.732 2.882 3.075 3.178 3.386 3.579 3.756 3.843 4.014 4.173 4.387 4.524 4.66 4.85 5.029 5.196 5.352 5.511 5.732 5.945 6.144 6.375 6.592 6.802 7.045 7.324 7.591 7.869 8.16 8.476 8.821 9.195 9.612 10.023 10.484 11.016 11.634 12.3 12.995 13.727 14.498 14.97 15.166 15.204 15.142 15.046 14.934 14.814 14.702 14.546 14.387 14.249 14.09 13.924 13.782 13.666 13.545 13.429 13.324 13.203 13.061 12.944 12.82 12.676 12.547 12.416 12.301 12.186 12.058 11.96 11.858 11.7 11.583 11.455 11.38 11.232 11.114 11.0 10.933 10.783 10.725 10.66 10.582 10.355 10.217 10.066 9.911 9.749 9.558 9.299 8.565 -9 ,20445 ,KEBNE ,17041991,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:07:51 CET,0.0 0.891 1.151 1.356 1.545 1.728 1.909 2.079 2.334 2.444 2.557 2.679 2.86 2.96 3.163 3.348 3.517 3.597 3.758 3.912 4.115 4.242 4.359 4.529 4.686 4.839 4.998 5.151 5.334 5.519 5.708 5.943 6.169 6.379 6.624 6.882 7.108 7.365 7.665 7.973 8.285 8.633 9.021 9.396 9.858 10.382 10.92 11.49 12.181 12.991 13.88 14.51 14.795 14.889 14.895 14.856 14.768 14.63 14.495 14.354 14.218 14.1 13.981 13.852 13.736 13.628 13.49 13.367 13.259 13.127 12.976 12.851 12.718 12.563 12.445 12.335 12.221 12.1 11.969 11.859 11.739 11.551 11.403 11.248 11.175 11.037 10.89 10.724 10.635 10.454 10.303 10.191 10.076 9.823 9.673 9.513 9.312 9.071 8.797 8.376 7.062 -10 ,13255 ,KEBNE ,17041992,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:08:41 CET,0.0 1.118 1.494 1.745 1.925 2.084 2.257 2.425 2.715 2.847 2.97 3.127 3.322 3.424 3.618 3.796 3.978 4.067 4.227 4.375 4.588 4.726 4.858 5.046 5.223 5.388 5.538 5.68 5.872 6.064 6.237 6.433 6.624 6.809 7.011 7.238 7.457 7.689 7.952 8.226 8.496 8.809 9.175 9.529 9.95 10.431 10.958 11.536 12.185 12.884 13.635 14.161 14.385 14.458 14.439 14.369 14.276 14.159 14.052 13.926 13.809 13.696 13.535 13.361 13.193 13.028 12.878 12.738 12.609 12.487 12.339 12.199 12.056 11.92 11.819 11.704 11.593 11.487 11.364 11.274 11.191 11.064 10.952 10.816 10.757 10.656 10.523 10.369 10.29 10.136 10.033 9.946 9.855 9.622 9.487 9.336 9.172 8.966 8.724 8.373 6.71 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_21_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_21_23.txt deleted file mode 100644 index 0ca633c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_21_23.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28894 ,KEBNE ,16653489,Mon Nov 22 03:00:47 CET,Mon Nov 22 04:42:18 CET,0.0 0.741 0.946 1.055 1.163 1.273 1.356 1.419 1.544 1.602 1.662 1.689 1.825 1.883 1.99 2.067 2.123 2.148 2.189 2.23 2.3 2.344 2.38 2.423 2.453 2.478 2.504 2.537 2.577 2.595 2.624 2.65 2.656 2.664 2.651 2.605 2.531 2.441 2.344 2.228 2.053 1.824 1.556 1.236 0.774 0.217 -0.45 -1.305 -2.581 -4.583 -7.884 -11.658 -14.422 -16.52 -18.184 -19.622 -20.875 -21.985 -22.929 -23.819 -24.55 -25.183 -25.772 -26.338 -26.847 -27.295 -27.771 -28.195 -28.539 -28.878 -29.228 -29.508 -29.796 -30.105 -30.338 -30.571 -30.821 -31.083 -31.339 -31.511 -31.686 -31.96 -32.148 -32.336 -32.437 -32.642 -32.834 -33.038 -33.146 -33.391 -33.523 -33.657 -33.794 -34.062 -34.205 -34.369 -34.558 -34.754 -34.972 -35.25 -36.172 -2 ,14372 ,KEBNE ,16653490,Mon Nov 22 03:00:47 CET,Mon Nov 22 04:42:40 CET,0.0 0.528 0.744 0.931 1.059 1.172 1.264 1.344 1.506 1.576 1.634 1.645 1.773 1.818 1.905 1.993 2.077 2.116 2.173 2.227 2.322 2.374 2.412 2.45 2.489 2.527 2.554 2.587 2.633 2.669 2.691 2.701 2.714 2.726 2.735 2.744 2.741 2.715 2.642 2.528 2.399 2.22 1.973 1.681 1.293 0.78 0.083 -0.857 -2.222 -4.196 -7.235 -10.63 -13.195 -15.226 -16.906 -18.34 -19.531 -20.571 -21.456 -22.345 -23.1 -23.733 -24.319 -24.875 -25.385 -25.841 -26.29 -26.682 -27.022 -27.365 -27.709 -27.985 -28.266 -28.568 -28.805 -29.039 -29.273 -29.52 -29.774 -29.944 -30.13 -30.449 -30.659 -30.851 -30.952 -31.164 -31.377 -31.603 -31.722 -31.962 -32.091 -32.222 -32.358 -32.663 -32.826 -32.979 -33.157 -33.366 -33.629 -33.942 -34.781 -3 ,12334 ,KEBNE ,16653491,Mon Nov 22 03:00:47 CET,Mon Nov 22 04:42:18 CET,0.0 0.585 0.771 0.913 1.032 1.14 1.231 1.32 1.489 1.562 1.622 1.65 1.79 1.838 1.917 1.975 2.022 2.047 2.092 2.134 2.193 2.232 2.278 2.347 2.396 2.415 2.43 2.455 2.495 2.533 2.549 2.558 2.58 2.595 2.586 2.549 2.513 2.476 2.412 2.32 2.195 2.024 1.796 1.522 1.161 0.7 0.023 -0.937 -2.265 -4.208 -7.39 -10.899 -13.492 -15.557 -17.261 -18.711 -19.905 -20.92 -21.775 -22.614 -23.32 -23.914 -24.441 -24.947 -25.438 -25.891 -26.355 -26.74 -27.063 -27.397 -27.732 -28.013 -28.304 -28.597 -28.827 -29.06 -29.297 -29.541 -29.778 -29.941 -30.116 -30.379 -30.564 -30.756 -30.855 -31.055 -31.254 -31.464 -31.57 -31.799 -31.918 -32.039 -32.168 -32.434 -32.581 -32.73 -32.864 -33.024 -33.246 -33.532 -34.395 -4 ,32405 ,KEBNE ,16653492,Mon Nov 22 03:01:49 CET,Mon Nov 22 04:43:37 CET,0.0 0.857 1.079 1.185 1.284 1.37 1.459 1.545 1.657 1.705 1.752 1.746 1.867 1.9 1.974 2.055 2.127 2.155 2.21 2.263 2.329 2.372 2.406 2.467 2.527 2.573 2.619 2.65 2.685 2.71 2.715 2.718 2.718 2.713 2.703 2.681 2.647 2.602 2.556 2.483 2.374 2.222 1.988 1.7 1.322 0.823 0.141 -0.81 -2.082 -3.831 -6.723 -9.929 -12.33 -14.31 -15.998 -17.458 -18.682 -19.753 -20.638 -21.491 -22.214 -22.848 -23.442 -23.986 -24.458 -24.889 -25.343 -25.737 -26.081 -26.437 -26.795 -27.082 -27.383 -27.706 -27.959 -28.207 -28.442 -28.678 -28.932 -29.116 -29.308 -29.6 -29.79 -29.97 -30.059 -30.257 -30.479 -30.717 -30.848 -31.097 -31.237 -31.376 -31.514 -31.824 -32.006 -32.185 -32.344 -32.524 -32.756 -33.009 -33.873 -6 ,19912 ,KEBNE ,16653494,Mon Nov 22 03:02:52 CET,Mon Nov 22 04:46:24 CET,0.0 0.567 0.753 0.916 1.065 1.18 1.267 1.347 1.494 1.554 1.617 1.638 1.76 1.803 1.889 1.945 1.998 2.028 2.077 2.115 2.173 2.212 2.25 2.299 2.332 2.362 2.391 2.422 2.467 2.503 2.533 2.578 2.61 2.614 2.62 2.636 2.638 2.606 2.534 2.426 2.306 2.146 1.902 1.597 1.182 0.677 -0.029 -0.975 -2.25 -4.144 -7.187 -10.535 -13.187 -15.357 -17.116 -18.614 -19.836 -20.828 -21.638 -22.458 -23.15 -23.75 -24.308 -24.837 -25.341 -25.79 -26.228 -26.598 -26.906 -27.213 -27.558 -27.868 -28.175 -28.488 -28.731 -28.97 -29.216 -29.472 -29.735 -29.916 -30.114 -30.41 -30.588 -30.765 -30.857 -31.054 -31.266 -31.487 -31.605 -31.834 -31.961 -32.096 -32.238 -32.543 -32.681 -32.848 -33.045 -33.224 -33.45 -33.789 -34.615 -7 ,26311 ,KEBNE ,16653495,Mon Nov 22 03:02:52 CET,Mon Nov 22 04:45:47 CET,0.0 0.75 1.048 1.281 1.451 1.595 1.728 1.833 2.01 2.079 2.139 2.184 2.322 2.362 2.432 2.498 2.57 2.603 2.659 2.705 2.754 2.794 2.841 2.901 2.953 2.992 3.018 3.051 3.091 3.114 3.125 3.121 3.114 3.116 3.126 3.112 3.063 2.991 2.903 2.792 2.649 2.478 2.253 1.986 1.626 1.128 0.468 -0.434 -1.732 -3.571 -6.445 -9.634 -12.037 -13.933 -15.506 -16.874 -18.018 -19.064 -19.972 -20.85 -21.604 -22.25 -22.834 -23.379 -23.88 -24.328 -24.776 -25.172 -25.512 -25.853 -26.2 -26.494 -26.797 -27.098 -27.334 -27.573 -27.813 -28.069 -28.329 -28.505 -28.684 -28.948 -29.129 -29.321 -29.426 -29.643 -29.863 -30.096 -30.216 -30.451 -30.562 -30.694 -30.823 -31.088 -31.232 -31.381 -31.529 -31.723 -31.975 -32.27 -32.899 -8 ,9562 ,KEBNE ,16653496,Mon Nov 22 03:03:54 CET,Mon Nov 22 04:46:38 CET,0.0 0.722 0.873 0.997 1.114 1.2 1.258 1.31 1.432 1.489 1.549 1.568 1.69 1.725 1.781 1.838 1.889 1.915 1.961 2.002 2.063 2.092 2.12 2.154 2.181 2.201 2.218 2.235 2.267 2.297 2.309 2.306 2.297 2.281 2.25 2.209 2.169 2.118 2.028 1.896 1.74 1.546 1.28 0.968 0.57 0.075 -0.592 -1.523 -2.854 -4.757 -7.744 -10.96 -13.336 -15.26 -16.831 -18.149 -19.239 -20.203 -21.024 -21.881 -22.612 -23.217 -23.785 -24.319 -24.8 -25.221 -25.671 -26.063 -26.397 -26.744 -27.099 -27.386 -27.662 -27.961 -28.203 -28.446 -28.688 -28.92 -29.15 -29.316 -29.484 -29.736 -29.913 -30.105 -30.203 -30.386 -30.577 -30.789 -30.898 -31.131 -31.242 -31.369 -31.507 -31.791 -31.954 -32.123 -32.295 -32.5 -32.739 -33.002 -33.499 -9 ,17175 ,KEBNE ,16653497,Mon Nov 22 03:03:54 CET,Mon Nov 22 04:47:13 CET,0.0 0.482 0.674 0.839 0.944 1.045 1.155 1.243 1.376 1.433 1.484 1.516 1.655 1.716 1.823 1.906 1.986 2.019 2.071 2.121 2.176 2.209 2.232 2.27 2.316 2.371 2.417 2.445 2.478 2.518 2.565 2.599 2.611 2.614 2.603 2.582 2.562 2.539 2.49 2.403 2.277 2.09 1.814 1.514 1.124 0.581 -0.166 -1.137 -2.453 -4.361 -7.315 -10.509 -13.072 -15.169 -16.797 -18.175 -19.365 -20.409 -21.237 -22.025 -22.708 -23.301 -23.854 -24.375 -24.865 -25.289 -25.718 -26.114 -26.456 -26.812 -27.167 -27.461 -27.785 -28.113 -28.353 -28.589 -28.82 -29.055 -29.307 -29.485 -29.665 -29.949 -30.145 -30.34 -30.439 -30.644 -30.851 -31.065 -31.175 -31.406 -31.533 -31.664 -31.791 -32.041 -32.179 -32.331 -32.504 -32.689 -32.895 -33.174 -34.149 -10 ,2702 ,KEBNE ,16653498,Mon Nov 22 03:03:54 CET,Mon Nov 22 04:46:57 CET,0.0 0.5 0.668 0.799 0.926 1.062 1.173 1.263 1.434 1.504 1.561 1.598 1.751 1.807 1.895 1.972 2.043 2.076 2.144 2.211 2.283 2.33 2.379 2.447 2.52 2.576 2.611 2.637 2.68 2.725 2.749 2.764 2.783 2.797 2.79 2.773 2.739 2.699 2.645 2.565 2.475 2.35 2.144 1.864 1.457 0.966 0.361 -0.482 -1.747 -3.684 -6.723 -10.077 -12.641 -14.669 -16.352 -17.846 -19.092 -20.165 -21.082 -21.948 -22.65 -23.243 -23.787 -24.303 -24.804 -25.267 -25.741 -26.146 -26.483 -26.823 -27.169 -27.467 -27.767 -28.061 -28.29 -28.519 -28.76 -29.02 -29.279 -29.448 -29.616 -29.884 -30.072 -30.256 -30.348 -30.535 -30.739 -30.96 -31.074 -31.324 -31.446 -31.575 -31.728 -32.032 -32.184 -32.358 -32.542 -32.746 -32.997 -33.318 -34.199 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_21_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_21_32.txt deleted file mode 100644 index 88f626e3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_21_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2195 ,KEBNE ,17023445,Wed Dec 22 08:08:43 CET,Wed Dec 22 09:49:03 CET,0.0 0.476 0.64 0.747 0.828 0.906 0.991 1.073 1.205 1.257 1.299 1.304 1.44 1.481 1.553 1.631 1.704 1.735 1.797 1.856 1.942 1.996 2.045 2.125 2.195 2.253 2.312 2.366 2.43 2.487 2.533 2.586 2.643 2.701 2.754 2.797 2.835 2.871 2.907 2.931 2.93 2.921 2.858 2.763 2.648 2.489 2.255 1.893 1.357 0.529 -0.882 -2.507 -3.826 -4.976 -5.959 -6.829 -7.601 -8.267 -8.829 -9.42 -9.953 -10.448 -10.911 -11.33 -11.703 -12.032 -12.37 -12.671 -12.935 -13.204 -13.492 -13.74 -13.997 -14.256 -14.45 -14.654 -14.883 -15.125 -15.362 -15.53 -15.706 -15.979 -16.167 -16.36 -16.46 -16.659 -16.871 -17.095 -17.211 -17.435 -17.575 -17.702 -17.849 -18.224 -18.431 -18.645 -18.899 -19.188 -19.515 -20.046 -22.199 -2 ,1815 ,KEBNE ,17023446,Wed Dec 22 08:08:48 CET,Wed Dec 22 09:48:13 CET,0.0 0.194 0.33 0.414 0.504 0.596 0.671 0.741 0.865 0.92 0.968 0.961 1.08 1.121 1.194 1.267 1.332 1.359 1.411 1.469 1.552 1.596 1.638 1.706 1.77 1.822 1.869 1.914 1.966 2.018 2.056 2.092 2.146 2.196 2.24 2.28 2.313 2.36 2.406 2.428 2.436 2.441 2.425 2.376 2.293 2.165 1.952 1.613 1.12 0.402 -0.829 -2.422 -3.753 -4.815 -5.713 -6.582 -7.326 -7.945 -8.522 -9.124 -9.619 -10.035 -10.42 -10.808 -11.202 -11.58 -11.964 -12.318 -12.631 -12.959 -13.331 -13.64 -13.937 -14.229 -14.457 -14.681 -14.914 -15.178 -15.435 -15.612 -15.809 -16.126 -16.348 -16.571 -16.693 -16.948 -17.195 -17.473 -17.63 -17.879 -18.035 -18.199 -18.397 -18.839 -19.08 -19.32 -19.579 -19.895 -20.236 -20.798 -23.864 -3 ,12897 ,KEBNE ,17023447,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:48:09 CET,0.0 0.238 0.365 0.471 0.524 0.564 0.615 0.675 0.781 0.823 0.876 0.894 1.027 1.071 1.134 1.178 1.225 1.249 1.307 1.369 1.435 1.48 1.529 1.591 1.659 1.72 1.764 1.8 1.827 1.856 1.89 1.922 1.957 1.992 2.018 2.054 2.088 2.101 2.123 2.142 2.129 2.093 2.068 2.028 1.909 1.727 1.481 1.091 0.519 -0.301 -1.733 -3.446 -4.893 -6.143 -7.147 -8.019 -8.794 -9.474 -10.043 -10.686 -11.259 -11.746 -12.214 -12.634 -13.014 -13.352 -13.682 -14.005 -14.303 -14.603 -14.908 -15.181 -15.476 -15.787 -16.084 -16.422 -16.771 -17.142 -17.529 -17.793 -18.058 -18.441 -18.689 -18.934 -19.057 -19.302 -19.579 -19.901 -20.064 -20.344 -20.602 -20.782 -20.987 -21.502 -21.781 -22.053 -22.327 -22.642 -23.096 -23.824 -27.436 -4 ,2622 ,KEBNE ,17023448,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:47:37 CET,0.0 0.53 0.717 0.835 0.922 1.018 1.109 1.171 1.291 1.361 1.423 1.437 1.556 1.589 1.646 1.705 1.77 1.8 1.851 1.904 1.981 2.025 2.067 2.116 2.166 2.224 2.28 2.336 2.411 2.465 2.508 2.565 2.615 2.662 2.707 2.763 2.824 2.873 2.9 2.91 2.909 2.909 2.926 2.921 2.857 2.731 2.532 2.24 1.727 0.877 -0.558 -2.258 -3.564 -4.618 -5.494 -6.283 -7.003 -7.667 -8.25 -8.851 -9.358 -9.771 -10.171 -10.554 -10.903 -11.22 -11.566 -11.886 -12.147 -12.429 -12.746 -13.025 -13.314 -13.56 -13.732 -13.926 -14.126 -14.36 -14.673 -14.907 -15.134 -15.518 -15.795 -16.039 -16.151 -16.381 -16.627 -16.898 -17.042 -17.324 -17.627 -17.846 -18.083 -18.613 -18.87 -19.119 -19.399 -19.722 -20.163 -20.791 -23.17 -5 ,10183 ,KEBNE ,17023449,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:47:56 CET,0.0 0.214 0.389 0.5 0.601 0.69 0.762 0.812 0.906 0.958 1.007 1.003 1.137 1.187 1.271 1.345 1.411 1.443 1.505 1.562 1.642 1.691 1.736 1.795 1.861 1.928 1.994 2.05 2.11 2.18 2.241 2.292 2.34 2.389 2.458 2.525 2.567 2.614 2.649 2.667 2.68 2.689 2.698 2.679 2.617 2.498 2.292 1.998 1.545 0.846 -0.431 -2.011 -3.326 -4.454 -5.461 -6.35 -7.122 -7.806 -8.365 -8.919 -9.401 -9.821 -10.22 -10.597 -10.944 -11.276 -11.632 -11.943 -12.197 -12.45 -12.739 -12.999 -13.26 -13.521 -13.727 -13.993 -14.333 -14.665 -15.029 -15.298 -15.528 -15.84 -16.105 -16.445 -16.618 -16.932 -17.225 -17.546 -17.715 -17.995 -18.214 -18.372 -18.539 -18.961 -19.226 -19.519 -19.821 -20.145 -20.551 -21.107 -23.326 -6 ,27839 ,KEBNE ,17023450,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:48:37 CET,0.0 0.212 0.337 0.431 0.513 0.584 0.636 0.68 0.761 0.814 0.866 0.86 0.977 1.005 1.069 1.135 1.199 1.232 1.295 1.354 1.436 1.488 1.53 1.575 1.614 1.662 1.707 1.74 1.782 1.822 1.852 1.89 1.926 1.96 2.003 2.042 2.068 2.092 2.121 2.139 2.133 2.099 2.042 1.989 1.892 1.749 1.54 1.196 0.654 -0.218 -1.696 -3.416 -4.76 -5.875 -6.846 -7.7 -8.456 -9.107 -9.662 -10.223 -10.691 -11.102 -11.49 -11.855 -12.187 -12.49 -12.81 -13.098 -13.349 -13.608 -13.877 -14.094 -14.32 -14.575 -14.799 -15.013 -15.244 -15.51 -15.769 -15.949 -16.128 -16.433 -16.642 -16.847 -16.955 -17.173 -17.425 -17.682 -17.807 -18.041 -18.232 -18.399 -18.57 -18.901 -19.076 -19.342 -19.701 -20.057 -20.418 -20.919 -23.442 -7 ,5233 ,KEBNE ,17023451,Wed Dec 22 08:08:43 CET,Wed Dec 22 09:48:37 CET,0.0 0.395 0.54 0.668 0.764 0.849 0.946 1.023 1.151 1.207 1.259 1.272 1.402 1.442 1.512 1.595 1.68 1.713 1.77 1.826 1.915 1.977 2.033 2.118 2.197 2.255 2.31 2.375 2.453 2.516 2.565 2.619 2.678 2.732 2.788 2.867 2.938 3.008 3.069 3.114 3.177 3.251 3.294 3.284 3.243 3.176 3.042 2.784 2.37 1.665 0.359 -1.297 -2.685 -3.838 -4.797 -5.646 -6.386 -7.036 -7.609 -8.212 -8.742 -9.199 -9.608 -9.995 -10.347 -10.673 -11.034 -11.341 -11.589 -11.85 -12.14 -12.379 -12.625 -12.888 -13.085 -13.292 -13.52 -13.741 -13.964 -14.136 -14.313 -14.594 -14.804 -15.011 -15.113 -15.339 -15.633 -16.032 -16.258 -16.591 -16.923 -17.165 -17.449 -18.05 -18.353 -18.627 -18.962 -19.443 -20.04 -20.903 -24.159 -8 ,25521 ,KEBNE ,17023452,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:47:53 CET,0.0 0.317 0.429 0.523 0.606 0.69 0.803 0.914 1.043 1.086 1.14 1.179 1.319 1.362 1.43 1.493 1.551 1.572 1.602 1.644 1.71 1.75 1.79 1.832 1.861 1.894 1.932 1.967 2.015 2.069 2.116 2.164 2.211 2.246 2.278 2.313 2.354 2.381 2.381 2.377 2.364 2.358 2.331 2.276 2.185 2.031 1.796 1.481 0.957 0.096 -1.313 -2.96 -4.348 -5.556 -6.577 -7.448 -8.195 -8.893 -9.487 -10.045 -10.494 -10.894 -11.31 -11.717 -12.073 -12.389 -12.732 -13.051 -13.323 -13.598 -13.892 -14.156 -14.432 -14.741 -15.019 -15.344 -15.69 -15.999 -16.286 -16.508 -16.743 -17.07 -17.292 -17.528 -17.639 -17.871 -18.144 -18.383 -18.497 -18.723 -18.857 -18.988 -19.161 -19.628 -19.889 -20.144 -20.438 -20.806 -21.215 -21.722 -23.845 -9 ,28863 ,KEBNE ,17023453,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:47:50 CET,0.0 0.265 0.383 0.484 0.569 0.651 0.724 0.778 0.865 0.913 0.972 1.003 1.13 1.171 1.236 1.294 1.359 1.388 1.46 1.537 1.632 1.681 1.722 1.789 1.846 1.894 1.941 1.983 2.041 2.093 2.139 2.183 2.224 2.279 2.333 2.381 2.409 2.433 2.449 2.456 2.473 2.479 2.46 2.439 2.377 2.252 2.049 1.724 1.226 0.449 -0.896 -2.535 -3.959 -5.19 -6.215 -7.13 -7.928 -8.692 -9.357 -9.986 -10.543 -11.027 -11.491 -11.969 -12.417 -12.846 -13.313 -13.715 -14.064 -14.435 -14.817 -15.13 -15.447 -15.762 -16.007 -16.261 -16.525 -16.82 -17.142 -17.371 -17.606 -17.96 -18.219 -18.512 -18.663 -18.96 -19.257 -19.565 -19.733 -20.025 -20.281 -20.456 -20.63 -21.013 -21.228 -21.499 -21.87 -22.283 -22.774 -23.391 -26.495 -10 ,16401 ,KEBNE ,17023454,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:48:31 CET,0.0 0.307 0.438 0.561 0.662 0.742 0.825 0.896 1.029 1.095 1.145 1.161 1.296 1.341 1.433 1.505 1.571 1.599 1.657 1.707 1.785 1.843 1.895 1.957 2.011 2.061 2.108 2.15 2.198 2.242 2.273 2.322 2.383 2.43 2.458 2.476 2.512 2.545 2.562 2.581 2.596 2.593 2.567 2.535 2.477 2.356 2.157 1.867 1.377 0.575 -0.769 -2.429 -3.856 -5.038 -6.033 -6.9 -7.657 -8.372 -8.973 -9.565 -10.08 -10.542 -10.988 -11.378 -11.719 -12.029 -12.336 -12.615 -12.863 -13.102 -13.336 -13.529 -13.747 -13.994 -14.187 -14.372 -14.557 -14.764 -15.008 -15.198 -15.389 -15.678 -15.879 -16.067 -16.162 -16.377 -16.607 -16.839 -16.957 -17.181 -17.348 -17.498 -17.664 -18.055 -18.29 -18.538 -18.793 -19.107 -19.459 -19.943 -22.042 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_22_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_22_19.txt deleted file mode 100644 index a22c0a62..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_22_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23034 ,TETRA ,17605948,Sun Nov 28 19:50:41 CET,Sun Nov 28 22:03:32 CET,0.0 0.346 0.497 0.619 0.719 0.808 0.881 0.94 1.046 1.105 1.154 1.149 1.291 1.33 1.419 1.511 1.596 1.631 1.693 1.755 1.842 1.901 1.957 2.032 2.103 2.179 2.246 2.3 2.372 2.441 2.5 2.562 2.626 2.693 2.761 2.837 2.902 2.955 3.02 3.082 3.124 3.148 3.118 3.068 3.022 2.915 2.712 2.415 1.952 1.228 -0.041 -1.695 -3.073 -4.245 -5.283 -6.196 -6.967 -7.647 -8.228 -8.828 -9.338 -9.779 -10.209 -10.622 -11.022 -11.384 -11.743 -12.07 -12.358 -12.638 -12.924 -13.18 -13.453 -13.729 -13.943 -14.179 -14.433 -14.693 -14.941 -15.105 -15.276 -15.541 -15.727 -15.93 -16.04 -16.255 -16.487 -16.758 -16.891 -17.135 -17.295 -17.448 -17.604 -17.943 -18.112 -18.311 -18.544 -18.805 -19.125 -19.549 -20.992 -2 ,21458 ,TETRA ,17605949,Sun Nov 28 19:50:45 CET,Sun Nov 28 22:03:49 CET,0.0 0.451 0.629 0.751 0.861 0.941 1.014 1.08 1.208 1.267 1.318 1.308 1.459 1.515 1.61 1.696 1.782 1.817 1.884 1.947 2.032 2.081 2.135 2.205 2.257 2.318 2.379 2.433 2.494 2.562 2.634 2.704 2.768 2.826 2.877 2.931 2.98 3.023 3.052 3.064 3.065 3.062 3.045 2.987 2.882 2.758 2.553 2.204 1.656 0.774 -0.629 -2.294 -3.72 -4.963 -6.015 -6.902 -7.658 -8.364 -8.967 -9.543 -10.046 -10.508 -10.961 -11.387 -11.781 -12.131 -12.478 -12.788 -13.065 -13.376 -13.688 -13.938 -14.197 -14.46 -14.674 -14.889 -15.106 -15.329 -15.557 -15.717 -15.893 -16.168 -16.357 -16.56 -16.658 -16.859 -17.078 -17.296 -17.414 -17.654 -17.788 -17.932 -18.089 -18.415 -18.579 -18.777 -19.003 -19.239 -19.503 -19.846 -21.134 -3 ,29184 ,TETRA ,17605950,Sun Nov 28 19:50:41 CET,Sun Nov 28 22:04:08 CET,0.0 0.172 0.333 0.469 0.547 0.632 0.717 0.795 0.931 0.988 1.056 1.07 1.219 1.271 1.367 1.447 1.517 1.555 1.621 1.682 1.783 1.842 1.89 1.951 2.024 2.102 2.171 2.235 2.309 2.382 2.464 2.541 2.592 2.641 2.702 2.777 2.835 2.894 2.956 2.996 3.03 3.047 3.034 3.007 2.96 2.873 2.717 2.415 1.875 1.047 -0.396 -2.182 -3.627 -4.846 -5.92 -6.928 -7.773 -8.476 -9.069 -9.65 -10.155 -10.647 -11.123 -11.557 -11.939 -12.285 -12.656 -12.98 -13.27 -13.563 -13.86 -14.111 -14.367 -14.622 -14.814 -15.025 -15.252 -15.484 -15.725 -15.891 -16.057 -16.298 -16.474 -16.666 -16.759 -16.959 -17.185 -17.45 -17.587 -17.831 -17.963 -18.099 -18.253 -18.586 -18.762 -18.959 -19.207 -19.468 -19.736 -20.101 -21.127 -4 ,1268 ,TETRA ,17605951,Sun Nov 28 19:50:44 CET,Sun Nov 28 22:02:31 CET,0.0 0.537 0.687 0.814 0.904 0.968 1.046 1.135 1.287 1.34 1.395 1.395 1.537 1.576 1.649 1.723 1.793 1.827 1.892 1.954 2.043 2.091 2.13 2.199 2.268 2.326 2.372 2.42 2.481 2.532 2.581 2.632 2.677 2.714 2.756 2.819 2.878 2.93 2.989 3.023 3.047 3.075 3.076 3.054 2.969 2.799 2.517 2.082 1.466 0.554 -0.961 -2.752 -4.243 -5.497 -6.527 -7.457 -8.309 -9.06 -9.674 -10.296 -10.84 -11.356 -11.838 -12.267 -12.669 -13.024 -13.4 -13.742 -14.035 -14.328 -14.624 -14.862 -15.134 -15.424 -15.629 -15.828 -16.028 -16.237 -16.459 -16.612 -16.765 -16.989 -17.141 -17.312 -17.399 -17.579 -17.772 -17.995 -18.117 -18.368 -18.53 -18.67 -18.816 -19.131 -19.329 -19.535 -19.722 -19.942 -20.209 -20.568 -21.851 -5 ,7258 ,TETRA ,17605952,Sun Nov 28 19:50:42 CET,Sun Nov 28 22:03:17 CET,0.0 0.274 0.412 0.545 0.671 0.784 0.875 0.963 1.118 1.182 1.248 1.285 1.448 1.503 1.6 1.683 1.752 1.792 1.877 1.951 2.048 2.104 2.151 2.228 2.311 2.386 2.456 2.515 2.585 2.644 2.709 2.784 2.847 2.911 2.974 3.047 3.105 3.164 3.225 3.272 3.299 3.313 3.322 3.317 3.266 3.165 3.0 2.723 2.266 1.439 -0.089 -1.99 -3.547 -4.795 -5.801 -6.692 -7.489 -8.198 -8.796 -9.394 -9.918 -10.391 -10.841 -11.279 -11.697 -12.077 -12.468 -12.804 -13.082 -13.367 -13.677 -13.928 -14.169 -14.431 -14.644 -14.863 -15.082 -15.304 -15.564 -15.756 -15.93 -16.165 -16.335 -16.528 -16.625 -16.835 -17.068 -17.303 -17.432 -17.68 -17.842 -17.995 -18.14 -18.422 -18.578 -18.755 -18.943 -19.18 -19.497 -19.938 -21.123 -6 ,3680 ,TETRA ,17605953,Sun Nov 28 19:50:44 CET,Sun Nov 28 22:03:17 CET,0.0 0.425 0.635 0.774 0.891 0.988 1.059 1.119 1.238 1.295 1.353 1.361 1.512 1.557 1.648 1.725 1.782 1.815 1.906 1.994 2.092 2.152 2.203 2.265 2.325 2.384 2.438 2.494 2.569 2.638 2.703 2.774 2.834 2.892 2.964 3.044 3.104 3.16 3.224 3.276 3.302 3.339 3.386 3.419 3.383 3.284 3.167 2.917 2.43 1.645 0.217 -1.579 -3.067 -4.299 -5.335 -6.267 -7.067 -7.761 -8.372 -8.977 -9.51 -10.033 -10.533 -10.967 -11.347 -11.693 -12.046 -12.347 -12.617 -12.908 -13.213 -13.466 -13.735 -14.014 -14.224 -14.44 -14.678 -14.924 -15.165 -15.322 -15.476 -15.734 -15.915 -16.093 -16.185 -16.381 -16.581 -16.797 -16.921 -17.167 -17.295 -17.432 -17.58 -17.844 -17.999 -18.193 -18.369 -18.591 -18.879 -19.22 -20.169 -7 ,29802 ,TETRA ,17605954,Sun Nov 28 19:50:47 CET,Sun Nov 28 22:02:33 CET,0.0 0.266 0.468 0.604 0.689 0.768 0.843 0.91 1.021 1.076 1.134 1.141 1.301 1.352 1.433 1.505 1.581 1.62 1.689 1.754 1.851 1.909 1.953 2.015 2.079 2.146 2.209 2.264 2.336 2.416 2.485 2.567 2.646 2.707 2.769 2.832 2.879 2.92 2.972 3.025 3.044 3.034 3.041 3.03 2.971 2.888 2.714 2.41 1.921 1.151 -0.194 -1.83 -3.164 -4.303 -5.288 -6.203 -6.994 -7.691 -8.32 -8.99 -9.543 -10.018 -10.481 -10.932 -11.351 -11.724 -12.105 -12.439 -12.73 -13.023 -13.338 -13.635 -13.933 -14.22 -14.435 -14.648 -14.872 -15.109 -15.37 -15.545 -15.718 -15.989 -16.174 -16.374 -16.487 -16.726 -16.97 -17.224 -17.357 -17.616 -17.77 -17.91 -18.062 -18.384 -18.542 -18.725 -18.986 -19.27 -19.593 -20.084 -22.085 -8 ,19519 ,TETRA ,17605955,Sun Nov 28 19:50:45 CET,Sun Nov 28 22:03:28 CET,0.0 0.27 0.411 0.532 0.654 0.756 0.837 0.904 1.032 1.086 1.133 1.132 1.287 1.344 1.438 1.516 1.588 1.617 1.681 1.761 1.866 1.922 1.977 2.055 2.122 2.185 2.248 2.303 2.366 2.436 2.502 2.581 2.664 2.719 2.765 2.817 2.873 2.927 2.968 2.999 3.014 3.026 3.024 2.977 2.902 2.783 2.569 2.273 1.758 0.883 -0.563 -2.358 -3.796 -4.964 -6.006 -6.991 -7.828 -8.515 -9.095 -9.706 -10.232 -10.689 -11.11 -11.499 -11.865 -12.193 -12.536 -12.855 -13.148 -13.445 -13.729 -13.97 -14.226 -14.489 -14.688 -14.895 -15.121 -15.364 -15.613 -15.781 -15.962 -16.239 -16.418 -16.617 -16.72 -16.923 -17.147 -17.386 -17.511 -17.757 -17.918 -18.086 -18.251 -18.552 -18.723 -18.922 -19.142 -19.39 -19.717 -20.17 -21.369 -9 ,15822 ,TETRA ,17605956,Sun Nov 28 19:50:42 CET,Sun Nov 28 22:03:35 CET,0.0 0.348 0.504 0.631 0.776 0.902 0.998 1.076 1.219 1.277 1.333 1.357 1.511 1.566 1.677 1.763 1.83 1.865 1.935 1.994 2.079 2.136 2.187 2.256 2.324 2.389 2.446 2.496 2.551 2.613 2.683 2.75 2.815 2.883 2.954 3.026 3.082 3.145 3.208 3.258 3.302 3.322 3.29 3.229 3.152 3.011 2.786 2.496 2.027 1.221 -0.055 -1.576 -2.905 -4.14 -5.283 -6.286 -7.085 -7.788 -8.411 -9.045 -9.604 -10.099 -10.578 -11.051 -11.478 -11.834 -12.193 -12.52 -12.802 -13.096 -13.416 -13.674 -13.939 -14.227 -14.447 -14.671 -14.902 -15.135 -15.385 -15.556 -15.724 -15.988 -16.176 -16.37 -16.469 -16.684 -16.912 -17.143 -17.264 -17.509 -17.677 -17.836 -18.002 -18.35 -18.519 -18.706 -18.909 -19.131 -19.431 -19.778 -21.099 -10 ,11009 ,TETRA ,17605957,Sun Nov 28 19:50:44 CET,Sun Nov 28 22:02:55 CET,0.0 0.306 0.422 0.527 0.638 0.751 0.84 0.923 1.083 1.152 1.202 1.195 1.355 1.418 1.519 1.598 1.673 1.706 1.77 1.835 1.923 1.968 2.002 2.051 2.104 2.17 2.242 2.302 2.371 2.435 2.493 2.554 2.611 2.673 2.748 2.822 2.875 2.912 2.958 3.001 3.022 3.031 3.022 3.0 2.909 2.737 2.534 2.234 1.732 0.982 -0.436 -2.236 -3.656 -4.877 -5.904 -6.812 -7.673 -8.451 -9.129 -9.811 -10.391 -10.901 -11.356 -11.782 -12.163 -12.506 -12.886 -13.244 -13.553 -13.886 -14.209 -14.433 -14.657 -14.889 -15.077 -15.277 -15.49 -15.716 -15.963 -16.136 -16.306 -16.558 -16.726 -16.899 -16.99 -17.196 -17.428 -17.671 -17.789 -18.032 -18.162 -18.282 -18.425 -18.737 -18.899 -19.077 -19.306 -19.563 -19.853 -20.293 -21.413 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_22_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_22_21.txt deleted file mode 100644 index bf9fe294..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_22_21.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21206 ,KEBNE ,16836481,Sun Dec 5 16:29:42 CET,Sun Dec 5 18:10:00 CET,0.0 1.539 1.827 2.038 2.23 2.412 2.585 2.734 2.971 3.09 3.205 3.328 3.5 3.593 3.752 3.901 4.039 4.103 4.233 4.347 4.513 4.626 4.725 4.851 4.974 5.076 5.165 5.254 5.38 5.503 5.614 5.746 5.864 5.966 6.067 6.191 6.326 6.467 6.598 6.72 6.852 6.995 7.132 7.251 7.37 7.487 7.583 7.598 7.547 7.336 6.746 5.878 5.105 4.431 3.862 3.361 2.903 2.46 2.046 1.615 1.242 0.91 0.582 0.279 0.014 -0.245 -0.524 -0.751 -0.948 -1.16 -1.368 -1.561 -1.787 -2.025 -2.214 -2.415 -2.621 -2.837 -3.065 -3.217 -3.358 -3.577 -3.735 -3.902 -3.992 -4.192 -4.396 -4.593 -4.697 -4.892 -5.037 -5.165 -5.299 -5.597 -5.76 -5.932 -6.151 -6.391 -6.664 -6.997 -8.019 -2 ,23806 ,KEBNE ,16836482,Sun Dec 5 16:29:42 CET,Sun Dec 5 18:10:01 CET,0.0 1.488 1.751 1.967 2.156 2.325 2.478 2.619 2.884 2.999 3.114 3.241 3.397 3.481 3.65 3.823 3.983 4.048 4.169 4.282 4.43 4.511 4.587 4.699 4.79 4.877 4.978 5.07 5.175 5.274 5.365 5.48 5.585 5.678 5.787 5.916 6.06 6.216 6.341 6.457 6.584 6.728 6.894 7.041 7.187 7.319 7.42 7.437 7.335 7.03 6.352 5.35 4.439 3.717 3.086 2.503 1.998 1.535 1.132 0.713 0.349 0.031 -0.28 -0.563 -0.815 -1.056 -1.318 -1.551 -1.75 -1.959 -2.188 -2.383 -2.588 -2.8 -2.968 -3.153 -3.34 -3.526 -3.738 -3.898 -4.056 -4.288 -4.446 -4.615 -4.704 -4.895 -5.095 -5.307 -5.417 -5.611 -5.757 -5.876 -6.017 -6.331 -6.49 -6.654 -6.841 -7.071 -7.343 -7.696 -8.752 -3 ,18785 ,KEBNE ,16836483,Sun Dec 5 16:29:42 CET,Sun Dec 5 18:11:55 CET,0.0 1.116 1.402 1.6 1.778 1.915 2.023 2.133 2.315 2.399 2.482 2.574 2.725 2.798 2.929 3.035 3.134 3.18 3.29 3.4 3.545 3.642 3.734 3.868 4.003 4.134 4.267 4.392 4.539 4.683 4.817 4.963 5.082 5.186 5.315 5.461 5.591 5.739 5.892 6.023 6.183 6.37 6.57 6.744 6.898 7.043 7.149 7.191 7.104 6.885 6.472 5.771 5.038 4.347 3.738 3.175 2.645 2.181 1.792 1.353 0.965 0.652 0.358 0.068 -0.211 -0.459 -0.719 -0.977 -1.199 -1.42 -1.658 -1.853 -2.065 -2.288 -2.452 -2.621 -2.801 -3.009 -3.231 -3.375 -3.515 -3.765 -3.946 -4.115 -4.202 -4.396 -4.605 -4.827 -4.947 -5.159 -5.343 -5.475 -5.62 -5.938 -6.102 -6.277 -6.48 -6.709 -6.962 -7.31 -8.705 -4 ,10551 ,KEBNE ,16836484,Sun Dec 5 16:29:42 CET,Sun Dec 5 18:10:26 CET,0.0 1.311 1.746 2.041 2.299 2.532 2.731 2.875 3.132 3.254 3.359 3.453 3.597 3.672 3.818 3.962 4.099 4.154 4.266 4.381 4.538 4.639 4.747 4.904 5.036 5.159 5.285 5.402 5.539 5.676 5.805 5.953 6.108 6.245 6.389 6.543 6.672 6.786 6.913 7.066 7.222 7.385 7.556 7.701 7.827 7.921 7.983 8.016 7.97 7.74 7.173 6.337 5.523 4.822 4.227 3.694 3.194 2.714 2.304 1.903 1.564 1.246 0.944 0.676 0.408 0.168 -0.072 -0.301 -0.495 -0.69 -0.909 -1.098 -1.295 -1.506 -1.668 -1.836 -2.002 -2.176 -2.381 -2.525 -2.673 -2.915 -3.078 -3.261 -3.359 -3.555 -3.755 -3.964 -4.073 -4.265 -4.417 -4.537 -4.667 -4.974 -5.146 -5.339 -5.538 -5.754 -6.028 -6.427 -7.526 -5 ,26396 ,KEBNE ,16836485,Sun Dec 5 16:29:42 CET,Sun Dec 5 18:11:49 CET,0.0 1.457 1.839 2.092 2.286 2.463 2.626 2.792 3.086 3.206 3.313 3.415 3.574 3.653 3.807 3.971 4.128 4.209 4.354 4.466 4.64 4.757 4.864 5.004 5.121 5.232 5.335 5.425 5.541 5.659 5.772 5.897 6.01 6.123 6.249 6.362 6.459 6.566 6.678 6.807 6.941 7.071 7.21 7.327 7.436 7.523 7.577 7.58 7.505 7.324 6.802 5.998 5.302 4.686 4.133 3.593 3.101 2.664 2.289 1.885 1.496 1.158 0.852 0.572 0.304 0.047 -0.231 -0.475 -0.678 -0.91 -1.146 -1.342 -1.551 -1.755 -1.918 -2.091 -2.273 -2.469 -2.673 -2.813 -2.951 -3.159 -3.303 -3.463 -3.551 -3.72 -3.899 -4.108 -4.212 -4.396 -4.519 -4.629 -4.749 -5.027 -5.181 -5.349 -5.529 -5.723 -5.949 -6.275 -7.294 -6 ,11994 ,KEBNE ,16836486,Sun Dec 5 16:29:42 CET,Sun Dec 5 18:10:12 CET,0.0 0.914 1.217 1.418 1.549 1.679 1.815 1.927 2.115 2.206 2.31 2.404 2.555 2.631 2.775 2.9 3.019 3.078 3.197 3.317 3.494 3.602 3.702 3.842 3.95 4.045 4.152 4.255 4.382 4.489 4.577 4.703 4.83 4.941 5.083 5.267 5.435 5.587 5.756 5.951 6.128 6.289 6.454 6.604 6.764 6.939 7.105 7.242 7.332 7.307 6.93 6.207 5.529 4.909 4.321 3.79 3.317 2.867 2.467 2.048 1.677 1.342 1.019 0.715 0.442 0.185 -0.097 -0.35 -0.564 -0.79 -1.027 -1.208 -1.386 -1.586 -1.75 -1.928 -2.114 -2.292 -2.479 -2.612 -2.752 -2.991 -3.159 -3.343 -3.453 -3.695 -3.95 -4.224 -4.365 -4.594 -4.841 -5.011 -5.177 -5.549 -5.744 -5.94 -6.158 -6.417 -6.683 -7.009 -8.182 -7 ,24514 ,KEBNE ,16836487,Sun Dec 5 16:29:42 CET,Sun Dec 5 18:10:21 CET,0.0 1.156 1.486 1.712 1.858 1.975 2.093 2.198 2.372 2.452 2.543 2.635 2.774 2.837 2.981 3.123 3.238 3.291 3.397 3.486 3.6 3.684 3.763 3.876 3.977 4.064 4.151 4.237 4.353 4.456 4.537 4.646 4.782 4.908 5.028 5.149 5.261 5.384 5.501 5.622 5.749 5.87 6.003 6.122 6.211 6.296 6.401 6.485 6.492 6.293 5.742 4.959 4.246 3.602 3.05 2.53 2.049 1.616 1.243 0.859 0.52 0.212 -0.063 -0.311 -0.555 -0.785 -1.019 -1.222 -1.4 -1.589 -1.78 -1.941 -2.111 -2.283 -2.429 -2.587 -2.744 -2.904 -3.067 -3.184 -3.312 -3.506 -3.637 -3.764 -3.827 -3.973 -4.141 -4.306 -4.387 -4.558 -4.682 -4.787 -4.907 -5.175 -5.32 -5.483 -5.651 -5.827 -6.022 -6.313 -7.195 -8 ,12944 ,KEBNE ,16836488,Sun Dec 5 16:29:42 CET,Sun Dec 5 18:12:09 CET,0.0 0.965 1.257 1.486 1.66 1.797 1.915 2.025 2.216 2.308 2.402 2.501 2.641 2.71 2.89 3.049 3.155 3.207 3.315 3.411 3.553 3.64 3.714 3.826 3.944 4.064 4.173 4.269 4.382 4.488 4.582 4.701 4.824 4.924 5.036 5.156 5.272 5.405 5.548 5.691 5.835 5.99 6.141 6.267 6.4 6.519 6.577 6.622 6.636 6.485 6.011 5.159 4.31 3.539 2.878 2.3 1.774 1.276 0.877 0.497 0.16 -0.149 -0.458 -0.758 -1.031 -1.277 -1.546 -1.777 -1.98 -2.196 -2.409 -2.596 -2.817 -3.041 -3.196 -3.368 -3.565 -3.757 -3.954 -4.096 -4.242 -4.468 -4.622 -4.79 -4.88 -5.061 -5.275 -5.49 -5.594 -5.799 -5.964 -6.102 -6.246 -6.55 -6.727 -6.911 -7.103 -7.325 -7.597 -7.906 -8.791 -10 ,16045 ,KEBNE ,16836490,Sun Dec 5 16:29:54 CET,Sun Dec 5 18:06:20 CET,0.0 0.669 0.869 1.04 1.174 1.275 1.386 1.496 1.668 1.746 1.816 1.885 2.03 2.087 2.208 2.316 2.423 2.481 2.584 2.676 2.791 2.88 2.972 3.098 3.219 3.327 3.435 3.538 3.66 3.769 3.865 3.986 4.108 4.214 4.319 4.423 4.523 4.643 4.778 4.923 5.073 5.222 5.364 5.486 5.597 5.664 5.737 5.8 5.77 5.577 5.075 4.323 3.627 3.02 2.476 1.973 1.512 1.025 0.574 0.162 -0.19 -0.512 -0.817 -1.097 -1.34 -1.564 -1.816 -2.038 -2.227 -2.424 -2.629 -2.8 -2.974 -3.163 -3.314 -3.468 -3.624 -3.791 -3.975 -4.101 -4.231 -4.437 -4.581 -4.731 -4.807 -4.957 -5.118 -5.298 -5.389 -5.568 -5.668 -5.761 -5.858 -6.087 -6.236 -6.402 -6.566 -6.746 -6.966 -7.264 -8.274 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_23_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_23_21.txt deleted file mode 100644 index 392cb8a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_23_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7435 ,KEBNE ,17041993,Thu Dec 23 03:28:02 CET,Thu Dec 23 05:07:33 CET,0.0 0.669 0.944 1.194 1.398 1.571 1.737 1.884 2.182 2.316 2.438 2.553 2.798 2.922 3.152 3.359 3.555 3.648 3.834 4.032 4.323 4.497 4.663 4.925 5.176 5.411 5.645 5.873 6.174 6.466 6.743 7.075 7.396 7.705 8.071 8.503 8.931 9.408 9.974 10.599 11.253 12.019 12.868 13.733 14.78 15.962 17.454 19.237 21.354 23.917 27.267 30.254 32.156 33.466 34.389 35.068 35.568 35.975 36.283 36.555 36.768 36.934 37.053 37.134 37.19 37.225 37.259 37.289 37.305 37.309 37.319 37.318 37.301 37.287 37.28 37.264 37.24 37.212 37.156 37.114 37.078 37.002 36.956 36.919 36.884 36.786 36.695 36.607 36.562 36.428 36.402 36.333 36.269 36.127 36.04 35.961 35.865 35.76 35.629 35.403 34.632 -2 ,5496 ,KEBNE ,17041994,Thu Dec 23 03:28:02 CET,Thu Dec 23 05:07:52 CET,0.0 0.837 1.144 1.371 1.576 1.781 1.964 2.115 2.369 2.493 2.621 2.76 2.999 3.105 3.315 3.518 3.706 3.802 3.991 4.167 4.438 4.624 4.804 5.058 5.293 5.514 5.733 5.949 6.226 6.494 6.762 7.089 7.404 7.716 8.09 8.533 8.975 9.467 10.012 10.59 11.223 11.953 12.789 13.632 14.689 15.945 17.395 19.073 21.13 23.626 26.887 29.897 31.752 32.99 33.894 34.579 35.074 35.45 35.749 36.006 36.189 36.327 36.428 36.497 36.541 36.564 36.58 36.58 36.571 36.558 36.534 36.503 36.48 36.457 36.424 36.396 36.363 36.309 36.255 36.215 36.16 36.067 36.003 35.929 35.888 35.799 35.706 35.613 35.559 35.42 35.403 35.343 35.275 35.16 35.082 34.989 34.888 34.769 34.612 34.408 33.943 -3 ,27657 ,KEBNE ,17041995,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:08:09 CET,0.0 0.733 0.997 1.175 1.344 1.511 1.653 1.787 2.054 2.176 2.28 2.373 2.604 2.714 2.93 3.135 3.325 3.418 3.599 3.779 4.052 4.23 4.39 4.621 4.857 5.079 5.3 5.528 5.825 6.113 6.39 6.722 7.055 7.391 7.778 8.211 8.632 9.106 9.623 10.193 10.805 11.484 12.306 13.174 14.193 15.369 16.781 18.458 20.521 23.082 26.457 29.417 31.235 32.44 33.292 33.946 34.449 34.82 35.081 35.291 35.413 35.515 35.618 35.691 35.721 35.734 35.745 35.746 35.745 35.738 35.73 35.715 35.678 35.625 35.579 35.53 35.478 35.411 35.327 35.273 35.216 35.142 35.094 35.025 34.981 34.893 34.814 34.718 34.658 34.499 34.444 34.385 34.32 34.123 34.004 33.907 33.808 33.669 33.478 33.233 32.354 -4 ,5667 ,KEBNE ,17041996,Thu Dec 23 03:28:02 CET,Thu Dec 23 05:07:40 CET,0.0 0.506 0.729 0.925 1.109 1.272 1.437 1.587 1.878 2.017 2.149 2.268 2.505 2.633 2.866 3.08 3.283 3.381 3.564 3.741 4.015 4.213 4.408 4.676 4.927 5.155 5.376 5.603 5.9 6.183 6.449 6.784 7.122 7.455 7.853 8.309 8.746 9.227 9.74 10.28 10.853 11.529 12.356 13.214 14.214 15.343 16.726 18.395 20.421 22.896 26.186 29.15 30.993 32.26 33.126 33.738 34.192 34.514 34.713 34.883 35.013 35.095 35.164 35.239 35.279 35.272 35.246 35.227 35.211 35.189 35.177 35.156 35.1 35.04 34.999 34.956 34.91 34.854 34.784 34.72 34.653 34.543 34.459 34.369 34.32 34.221 34.106 33.977 33.91 33.756 33.696 33.612 33.512 33.315 33.212 33.074 32.933 32.768 32.594 32.464 32.06 -5 ,26178 ,KEBNE ,17041997,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:09:46 CET,0.0 0.871 1.201 1.412 1.582 1.742 1.888 2.014 2.274 2.415 2.556 2.698 2.945 3.069 3.293 3.509 3.723 3.832 4.034 4.218 4.502 4.691 4.867 5.127 5.388 5.631 5.848 6.052 6.32 6.603 6.871 7.176 7.468 7.753 8.1 8.488 8.887 9.358 9.872 10.426 11.011 11.683 12.488 13.303 14.306 15.508 16.904 18.485 20.429 22.859 26.047 28.897 30.667 31.915 32.827 33.529 34.045 34.435 34.715 34.939 35.125 35.272 35.383 35.485 35.56 35.613 35.653 35.671 35.676 35.687 35.702 35.694 35.669 35.637 35.614 35.581 35.536 35.476 35.408 35.367 35.327 35.266 35.215 35.162 35.134 35.058 34.986 34.901 34.856 34.732 34.72 34.656 34.577 34.408 34.308 34.21 34.105 33.979 33.84 33.663 33.347 -6 ,32689 ,KEBNE ,17041998,Thu Dec 23 03:28:02 CET,Thu Dec 23 05:09:19 CET,0.0 0.918 1.242 1.47 1.668 1.857 2.028 2.173 2.457 2.592 2.717 2.821 3.06 3.181 3.411 3.627 3.833 3.933 4.133 4.345 4.65 4.843 5.02 5.272 5.523 5.76 5.993 6.231 6.535 6.827 7.12 7.479 7.837 8.189 8.596 9.051 9.486 9.981 10.542 11.134 11.751 12.45 13.282 14.157 15.199 16.393 17.813 19.42 21.39 23.898 27.118 30.055 32.019 33.388 34.33 35.049 35.576 35.972 36.26 36.511 36.719 36.878 37.001 37.092 37.165 37.237 37.293 37.303 37.306 37.335 37.351 37.346 37.327 37.299 37.287 37.276 37.256 37.229 37.179 37.138 37.094 37.021 36.971 36.928 36.907 36.865 36.828 36.79 36.766 36.65 36.645 36.595 36.544 36.422 36.354 36.267 36.158 36.038 35.863 35.608 35.171 -7 ,5534 ,KEBNE ,17041999,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:10:04 CET,0.0 1.2 1.509 1.734 1.92 2.086 2.25 2.398 2.679 2.813 2.936 3.035 3.267 3.376 3.591 3.823 4.041 4.141 4.337 4.53 4.82 5.0 5.165 5.414 5.668 5.901 6.127 6.345 6.625 6.903 7.184 7.557 7.933 8.29 8.7 9.189 9.656 10.159 10.726 11.33 11.973 12.735 13.654 14.589 15.677 16.907 18.382 20.139 22.296 24.938 28.422 31.631 33.592 34.921 35.897 36.614 37.132 37.536 37.833 38.062 38.22 38.35 38.463 38.548 38.597 38.626 38.628 38.618 38.623 38.634 38.632 38.595 38.541 38.494 38.454 38.412 38.356 38.284 38.217 38.173 38.123 38.036 37.975 37.914 37.88 37.807 37.726 37.64 37.591 37.458 37.455 37.401 37.336 37.18 37.104 37.033 36.939 36.807 36.663 36.519 36.261 -8 ,22538 ,KEBNE ,17042000,Thu Dec 23 03:28:02 CET,Thu Dec 23 05:10:11 CET,0.0 0.527 0.749 0.937 1.12 1.336 1.567 1.774 2.107 2.24 2.357 2.471 2.714 2.835 3.047 3.233 3.41 3.503 3.687 3.856 4.098 4.26 4.425 4.673 4.917 5.149 5.381 5.609 5.888 6.163 6.444 6.787 7.127 7.463 7.859 8.304 8.719 9.174 9.689 10.267 10.888 11.57 12.372 13.241 14.279 15.439 16.82 18.462 20.486 22.998 26.356 29.366 31.244 32.569 33.535 34.287 34.849 35.297 35.639 35.902 36.081 36.219 36.342 36.447 36.535 36.609 36.672 36.725 36.763 36.789 36.801 36.801 36.796 36.785 36.772 36.75 36.723 36.685 36.638 36.605 36.557 36.464 36.398 36.308 36.263 36.189 36.108 36.021 35.973 35.84 35.823 35.764 35.69 35.487 35.38 35.279 35.161 35.053 34.935 34.745 34.12 -9 ,19116 ,KEBNE ,17042001,Thu Dec 23 03:28:00 CET,Thu Dec 23 05:09:32 CET,0.0 0.514 0.778 0.972 1.163 1.367 1.577 1.79 2.166 2.311 2.433 2.556 2.797 2.912 3.145 3.358 3.558 3.656 3.862 4.067 4.331 4.503 4.689 4.957 5.205 5.449 5.691 5.921 6.214 6.51 6.803 7.144 7.482 7.822 8.221 8.668 9.071 9.51 9.997 10.53 11.108 11.766 12.555 13.427 14.5 15.707 17.126 18.779 20.849 23.424 26.821 29.857 31.746 33.081 34.037 34.754 35.282 35.673 35.965 36.233 36.438 36.579 36.686 36.76 36.813 36.846 36.871 36.889 36.888 36.876 36.846 36.808 36.771 36.736 36.698 36.653 36.605 36.551 36.492 36.452 36.408 36.326 36.27 36.22 36.192 36.125 36.045 35.952 35.909 35.771 35.701 35.629 35.559 35.382 35.294 35.218 35.107 34.959 34.762 34.469 33.703 -10 ,18181 ,KEBNE ,17042002,Thu Dec 23 03:28:00 CET,Thu Dec 23 05:08:40 CET,0.0 0.639 0.957 1.212 1.444 1.666 1.846 2.007 2.32 2.464 2.594 2.725 2.97 3.097 3.33 3.532 3.727 3.823 4.019 4.217 4.499 4.669 4.834 5.08 5.325 5.563 5.801 6.043 6.345 6.633 6.915 7.255 7.596 7.94 8.354 8.834 9.281 9.764 10.309 10.894 11.485 12.156 12.975 13.826 14.839 15.989 17.37 19.079 21.279 23.97 27.516 30.857 33.093 34.632 35.689 36.491 37.091 37.536 37.834 38.104 38.345 38.541 38.702 38.839 38.945 39.031 39.095 39.132 39.153 39.168 39.174 39.167 39.162 39.152 39.149 39.144 39.12 39.07 39.014 38.979 38.946 38.898 38.867 38.833 38.814 38.78 38.739 38.669 38.621 38.482 38.46 38.402 38.347 38.231 38.156 38.063 37.952 37.782 37.588 37.394 36.964 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_23_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_23_22.txt deleted file mode 100644 index 6dfd13f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_23_22.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15180 ,KEBNE ,16653499,Mon Nov 22 03:03:58 CET,Mon Nov 22 04:43:12 CET,0.0 1.095 1.492 1.798 2.051 2.266 2.444 2.604 2.914 3.077 3.239 3.403 3.649 3.776 4.034 4.272 4.492 4.599 4.809 5.021 5.34 5.536 5.724 5.997 6.273 6.539 6.797 7.055 7.398 7.726 8.041 8.448 8.854 9.252 9.696 10.192 10.671 11.186 11.758 12.4 13.103 13.915 14.884 15.879 17.093 18.486 20.133 22.012 24.303 27.383 31.537 35.25 37.722 39.457 40.615 41.496 42.197 42.744 43.149 43.489 43.756 43.966 44.139 44.29 44.394 44.467 44.555 44.629 44.677 44.72 44.737 44.724 44.694 44.653 44.613 44.573 44.527 44.46 44.385 44.346 44.306 44.214 44.144 44.068 44.022 43.923 43.824 43.721 43.668 43.535 43.492 43.428 43.343 43.158 43.051 42.917 42.754 42.572 42.393 42.133 40.812 -2 ,25473 ,KEBNE ,16653500,Mon Nov 22 03:04:56 CET,Mon Nov 22 04:47:43 CET,0.0 1.19 1.554 1.83 2.06 2.274 2.464 2.637 2.958 3.121 3.278 3.44 3.692 3.827 4.079 4.306 4.535 4.651 4.869 5.077 5.388 5.588 5.777 6.061 6.334 6.596 6.855 7.11 7.447 7.766 8.078 8.466 8.842 9.225 9.664 10.138 10.605 11.133 11.738 12.418 13.147 13.984 14.993 16.027 17.259 18.637 20.201 22.054 24.372 27.276 31.112 34.641 36.922 38.54 39.755 40.707 41.426 42.057 42.552 42.951 43.258 43.495 43.683 43.824 43.944 44.046 44.139 44.196 44.224 44.263 44.304 44.315 44.317 44.324 44.32 44.308 44.288 44.259 44.231 44.203 44.176 44.137 44.115 44.087 44.059 43.983 43.908 43.818 43.767 43.656 43.668 43.638 43.59 43.452 43.365 43.257 43.108 42.922 42.739 42.517 41.44 -3 ,32747 ,KEBNE ,16653501,Mon Nov 22 03:04:56 CET,Mon Nov 22 04:48:23 CET,0.0 1.174 1.557 1.852 2.099 2.304 2.487 2.662 2.972 3.114 3.258 3.447 3.716 3.846 4.089 4.309 4.537 4.655 4.879 5.094 5.425 5.634 5.824 6.116 6.396 6.66 6.94 7.221 7.561 7.907 8.258 8.679 9.069 9.447 9.898 10.401 10.887 11.423 12.002 12.651 13.379 14.247 15.266 16.276 17.472 18.84 20.539 22.552 25.016 28.091 32.163 35.914 38.318 39.979 41.202 42.161 42.863 43.419 43.853 44.233 44.531 44.751 44.907 45.025 45.136 45.24 45.333 45.405 45.461 45.513 45.56 45.599 45.622 45.62 45.623 45.622 45.611 45.597 45.573 45.555 45.53 45.471 45.43 45.394 45.37 45.303 45.219 45.114 45.054 44.927 44.886 44.807 44.717 44.537 44.436 44.306 44.142 43.96 43.745 43.458 42.651 -5 ,20707 ,KEBNE ,16653503,Mon Nov 22 03:04:56 CET,Mon Nov 22 04:48:24 CET,0.0 1.002 1.397 1.735 1.996 2.205 2.406 2.603 2.967 3.141 3.303 3.489 3.765 3.906 4.175 4.428 4.666 4.78 5.011 5.245 5.569 5.765 5.957 6.255 6.552 6.833 7.1 7.374 7.745 8.101 8.454 8.88 9.274 9.661 10.116 10.624 11.11 11.65 12.244 12.883 13.571 14.348 15.272 16.238 17.413 18.794 20.461 22.449 24.904 27.968 31.97 35.669 38.052 39.734 40.964 41.83 42.456 42.942 43.31 43.654 43.902 44.105 44.31 44.491 44.632 44.739 44.842 44.917 44.96 44.988 45.002 45.004 45.009 45.012 45.001 44.985 44.964 44.931 44.888 44.865 44.85 44.82 44.788 44.743 44.721 44.672 44.615 44.55 44.518 44.41 44.388 44.327 44.265 44.106 44.003 43.901 43.792 43.657 43.429 43.178 42.565 -6 ,28206 ,KEBNE ,16653504,Mon Nov 22 03:04:56 CET,Mon Nov 22 04:47:34 CET,0.0 0.884 1.157 1.446 1.708 1.92 2.112 2.302 2.646 2.796 2.931 3.064 3.315 3.445 3.686 3.922 4.155 4.268 4.504 4.74 5.062 5.263 5.469 5.77 6.051 6.324 6.601 6.876 7.226 7.557 7.879 8.285 8.691 9.077 9.517 10.029 10.544 11.119 11.736 12.387 13.11 13.971 14.988 16.003 17.199 18.586 20.304 22.35 24.866 28.194 32.516 36.273 38.716 40.432 41.667 42.588 43.277 43.827 44.222 44.551 44.786 44.967 45.136 45.264 45.356 45.436 45.517 45.587 45.64 45.684 45.701 45.691 45.678 45.665 45.649 45.616 45.58 45.532 45.474 45.434 45.391 45.333 45.301 45.264 45.243 45.192 45.123 45.038 44.985 44.851 44.79 44.719 44.644 44.467 44.363 44.263 44.156 44.02 43.852 43.634 43.154 -7 ,25315 ,KEBNE ,16653505,Mon Nov 22 03:05:00 CET,Mon Nov 22 04:40:38 CET,0.0 0.943 1.295 1.601 1.927 2.227 2.481 2.712 3.086 3.227 3.362 3.513 3.771 3.895 4.147 4.396 4.627 4.737 4.948 5.162 5.467 5.658 5.861 6.155 6.436 6.724 6.992 7.233 7.549 7.86 8.173 8.574 8.961 9.324 9.759 10.281 10.8 11.382 12.014 12.684 13.408 14.251 15.207 16.149 17.311 18.686 20.307 22.159 24.425 27.298 31.105 34.584 36.8 38.383 39.577 40.452 41.11 41.633 42.026 42.38 42.658 42.864 43.028 43.156 43.247 43.325 43.373 43.396 43.414 43.428 43.437 43.444 43.462 43.463 43.446 43.433 43.416 43.377 43.327 43.305 43.284 43.237 43.181 43.112 43.085 43.037 42.98 42.91 42.874 42.754 42.722 42.672 42.623 42.489 42.395 42.273 42.154 42.014 41.812 41.513 40.583 -8 ,3313 ,KEBNE ,16653506,Mon Nov 22 03:08:02 CET,Mon Nov 22 04:49:08 CET,0.0 0.847 1.244 1.534 1.77 1.97 2.153 2.323 2.633 2.784 2.936 3.106 3.372 3.504 3.762 4.015 4.252 4.365 4.576 4.781 5.092 5.296 5.501 5.803 6.087 6.355 6.625 6.895 7.249 7.598 7.946 8.375 8.768 9.163 9.642 10.173 10.68 11.247 11.879 12.55 13.253 14.07 15.046 16.062 17.29 18.678 20.335 22.315 24.764 27.813 31.862 35.62 38.009 39.65 40.786 41.606 42.25 42.778 43.17 43.498 43.718 43.883 44.046 44.171 44.247 44.309 44.364 44.405 44.416 44.398 44.377 44.373 44.372 44.357 44.333 44.308 44.279 44.227 44.168 44.131 44.091 44.007 43.945 43.882 43.849 43.782 43.703 43.623 43.575 43.433 43.375 43.305 43.215 43.03 42.922 42.798 42.663 42.509 42.266 41.932 40.983 -9 ,14860 ,KEBNE ,16653507,Mon Nov 22 03:08:02 CET,Mon Nov 22 04:49:32 CET,0.0 1.3 1.67 1.972 2.231 2.485 2.711 2.898 3.255 3.421 3.579 3.752 4.029 4.177 4.441 4.691 4.941 5.065 5.301 5.531 5.883 6.111 6.332 6.643 6.962 7.265 7.534 7.797 8.136 8.467 8.791 9.198 9.596 9.992 10.47 10.998 11.507 12.069 12.693 13.368 14.041 14.808 15.749 16.721 17.948 19.394 21.04 22.928 25.24 28.171 32.079 35.698 38.117 39.827 41.02 41.91 42.606 43.19 43.634 44.013 44.286 44.506 44.709 44.86 44.99 45.11 45.221 45.311 45.377 45.43 45.478 45.51 45.517 45.512 45.495 45.469 45.457 45.456 45.442 45.422 45.404 45.35 45.314 45.293 45.275 45.218 45.148 45.054 45.006 44.883 44.845 44.787 44.724 44.572 44.491 44.397 44.29 44.172 44.019 43.802 43.024 -10 ,23578 ,KEBNE ,16653508,Mon Nov 22 03:08:02 CET,Mon Nov 22 04:49:28 CET,0.0 1.241 1.598 1.88 2.128 2.356 2.56 2.744 3.106 3.273 3.433 3.616 3.888 4.034 4.321 4.599 4.865 4.985 5.223 5.473 5.838 6.072 6.298 6.627 6.948 7.257 7.554 7.837 8.197 8.548 8.888 9.291 9.678 10.051 10.478 10.969 11.453 12.0 12.598 13.219 13.895 14.71 15.706 16.75 17.992 19.384 20.988 22.836 25.139 28.039 31.826 35.31 37.683 39.373 40.595 41.495 42.144 42.65 43.045 43.399 43.643 43.813 43.946 44.06 44.159 44.245 44.328 44.379 44.401 44.418 44.439 44.458 44.462 44.452 44.441 44.426 44.386 44.334 44.281 44.251 44.221 44.151 44.114 44.072 44.044 43.972 43.893 43.827 43.788 43.664 43.625 43.56 43.48 43.294 43.178 43.025 42.864 42.686 42.483 42.159 40.868 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_24_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_24_25.txt deleted file mode 100644 index af6af79e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_24_25.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,6840 ,KEBNE ,16653510,Mon Nov 22 03:10:05 CET,Mon Nov 22 04:51:38 CET,0.0 0.965 1.186 1.341 1.494 1.613 1.703 1.804 1.968 2.035 2.107 2.13 2.278 2.32 2.379 2.434 2.494 2.525 2.601 2.674 2.774 2.835 2.876 2.904 2.908 2.916 2.924 2.934 2.976 2.989 2.967 2.926 2.864 2.787 2.698 2.587 2.479 2.365 2.213 2.029 1.823 1.557 1.166 0.69 0.07 -0.737 -1.856 -3.321 -5.292 -8.087 -12.301 -16.846 -20.336 -23.152 -25.457 -27.385 -28.985 -30.366 -31.514 -32.637 -33.588 -34.407 -35.161 -35.849 -36.49 -37.067 -37.646 -38.154 -38.575 -39.004 -39.436 -39.777 -40.139 -40.513 -40.791 -41.078 -41.376 -41.688 -42.007 -42.221 -42.432 -42.777 -43.026 -43.284 -43.415 -43.662 -43.91 -44.174 -44.313 -44.602 -44.749 -44.906 -45.054 -45.371 -45.545 -45.749 -45.97 -46.193 -46.429 -46.679 -47.27 -3 ,5559 ,KEBNE ,16653511,Mon Nov 22 03:10:05 CET,Mon Nov 22 04:52:32 CET,0.0 1.095 1.429 1.652 1.838 1.978 2.081 2.158 2.314 2.391 2.46 2.459 2.58 2.616 2.694 2.749 2.792 2.819 2.87 2.9 2.938 2.963 2.965 2.948 2.933 2.921 2.903 2.882 2.859 2.819 2.767 2.69 2.62 2.543 2.414 2.251 2.102 1.925 1.695 1.433 1.138 0.774 0.318 -0.2 -0.912 -1.816 -2.973 -4.448 -6.487 -9.452 -14.085 -19.044 -22.73 -25.646 -27.976 -29.949 -31.619 -33.072 -34.273 -35.412 -36.375 -37.217 -37.972 -38.677 -39.347 -39.958 -40.581 -41.118 -41.57 -42.025 -42.486 -42.869 -43.27 -43.68 -43.987 -44.293 -44.605 -44.914 -45.237 -45.467 -45.694 -46.045 -46.286 -46.52 -46.64 -46.896 -47.166 -47.469 -47.622 -47.912 -48.081 -48.244 -48.401 -48.744 -48.93 -49.116 -49.323 -49.567 -49.843 -50.15 -50.777 -5 ,22381 ,KEBNE ,16653513,Mon Nov 22 03:10:05 CET,Mon Nov 22 04:51:38 CET,0.0 0.74 1.143 1.458 1.675 1.844 1.958 2.049 2.217 2.285 2.346 2.385 2.55 2.59 2.661 2.724 2.784 2.819 2.873 2.906 2.958 2.987 3.007 3.02 3.024 3.038 3.051 3.045 3.013 2.974 2.935 2.884 2.824 2.764 2.719 2.65 2.516 2.348 2.164 1.936 1.679 1.358 0.907 0.382 -0.225 -0.933 -2.007 -3.5 -5.512 -8.463 -13.141 -18.149 -21.911 -24.93 -27.425 -29.531 -31.259 -32.77 -34.027 -35.231 -36.227 -37.095 -37.918 -38.675 -39.359 -39.962 -40.576 -41.121 -41.57 -42.068 -42.625 -43.055 -43.475 -43.896 -44.225 -44.566 -44.931 -45.351 -45.775 -46.067 -46.366 -46.807 -47.116 -47.447 -47.619 -47.969 -48.314 -48.651 -48.813 -49.097 -49.257 -49.418 -49.589 -49.946 -50.172 -50.458 -50.738 -51.018 -51.347 -51.794 -52.686 -6 ,24063 ,KEBNE ,16653514,Mon Nov 22 03:10:05 CET,Mon Nov 22 04:50:25 CET,0.0 2.38 2.868 3.059 3.183 3.31 3.443 3.544 3.684 3.75 3.818 3.861 4.011 4.06 4.158 4.236 4.297 4.327 4.376 4.42 4.476 4.504 4.534 4.576 4.598 4.608 4.627 4.649 4.665 4.686 4.731 4.762 4.747 4.733 4.708 4.678 4.631 4.548 4.451 4.311 4.114 3.833 3.462 3.039 2.407 1.558 0.426 -1.112 -3.219 -6.129 -10.624 -15.604 -19.379 -22.488 -25.086 -27.269 -29.089 -30.643 -31.93 -33.173 -34.198 -35.097 -35.941 -36.707 -37.408 -38.037 -38.684 -39.253 -39.725 -40.21 -40.71 -41.104 -41.498 -41.889 -42.184 -42.484 -42.786 -43.107 -43.437 -43.665 -43.919 -44.3 -44.55 -44.802 -44.924 -45.172 -45.443 -45.723 -45.86 -46.148 -46.303 -46.464 -46.611 -46.944 -47.139 -47.349 -47.551 -47.758 -47.989 -48.254 -49.027 -7 ,1956 ,KEBNE ,16653515,Mon Nov 22 03:10:09 CET,Mon Nov 22 04:49:29 CET,0.0 1.829 2.189 2.455 2.692 2.883 3.001 3.102 3.306 3.381 3.447 3.468 3.606 3.647 3.707 3.756 3.798 3.811 3.827 3.859 3.924 3.958 3.978 3.991 3.999 4.0 3.981 3.949 3.922 3.9 3.866 3.813 3.749 3.665 3.543 3.393 3.238 3.076 2.855 2.564 2.237 1.846 1.354 0.768 -0.005 -0.99 -2.303 -3.974 -6.242 -9.369 -14.34 -19.822 -23.727 -26.73 -29.165 -31.293 -33.073 -34.581 -35.823 -37.032 -38.046 -38.93 -39.75 -40.482 -41.157 -41.772 -42.394 -42.929 -43.392 -43.872 -44.343 -44.736 -45.146 -45.555 -45.864 -46.169 -46.485 -46.808 -47.125 -47.348 -47.579 -47.926 -48.172 -48.424 -48.551 -48.816 -49.108 -49.403 -49.538 -49.816 -49.98 -50.143 -50.3 -50.629 -50.807 -50.994 -51.212 -51.448 -51.695 -51.982 -52.588 -9 ,754 ,KEBNE ,16653517,Mon Nov 22 03:10:05 CET,Mon Nov 22 04:51:49 CET,0.0 3.727 4.219 4.564 4.806 5.01 5.172 5.305 5.566 5.671 5.77 5.878 6.071 6.145 6.257 6.365 6.463 6.501 6.59 6.678 6.786 6.861 6.938 7.044 7.129 7.193 7.254 7.327 7.428 7.512 7.557 7.592 7.635 7.66 7.656 7.588 7.536 7.525 7.499 7.393 7.199 6.971 6.633 6.217 5.647 4.89 3.854 2.46 0.612 -2.064 -6.07 -10.414 -13.872 -16.642 -18.858 -20.755 -22.398 -23.85 -25.047 -26.219 -27.226 -28.094 -28.919 -29.713 -30.454 -31.127 -31.828 -32.449 -32.951 -33.424 -33.887 -34.262 -34.648 -35.045 -35.352 -35.662 -35.97 -36.292 -36.647 -36.888 -37.12 -37.469 -37.713 -37.965 -38.09 -38.345 -38.613 -38.881 -39.019 -39.305 -39.449 -39.62 -39.794 -40.129 -40.294 -40.472 -40.669 -40.869 -41.101 -41.412 -42.033 -10 ,27965 ,KEBNE ,16653518,Mon Nov 22 03:11:06 CET,Mon Nov 22 04:52:57 CET,0.0 1.167 1.463 1.655 1.791 1.913 1.993 2.065 2.182 2.222 2.276 2.273 2.401 2.446 2.511 2.572 2.632 2.65 2.685 2.72 2.758 2.776 2.787 2.796 2.814 2.82 2.784 2.744 2.699 2.648 2.597 2.523 2.442 2.355 2.237 2.073 1.915 1.735 1.482 1.192 0.874 0.474 -0.06 -0.671 -1.44 -2.414 -3.721 -5.391 -7.667 -10.905 -15.928 -21.405 -25.522 -28.835 -31.464 -33.615 -35.415 -37.012 -38.376 -39.692 -40.765 -41.669 -42.497 -43.255 -43.942 -44.559 -45.203 -45.769 -46.241 -46.721 -47.198 -47.581 -47.977 -48.377 -48.692 -49.022 -49.344 -49.676 -50.025 -50.254 -50.481 -50.845 -51.097 -51.359 -51.492 -51.759 -52.033 -52.321 -52.473 -52.769 -52.933 -53.088 -53.253 -53.603 -53.776 -53.948 -54.154 -54.399 -54.65 -54.981 -55.53 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_24_27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_24_27.txt deleted file mode 100644 index d5d7af25..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_24_27.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,6859 ,KEBNE ,16653520,Mon Nov 22 03:11:06 CET,Mon Nov 22 04:52:56 CET,0.0 4.378 5.1 5.539 5.845 6.103 6.33 6.559 6.95 7.109 7.259 7.397 7.594 7.707 7.939 8.173 8.401 8.516 8.717 8.89 9.135 9.276 9.423 9.614 9.75 9.867 9.997 10.136 10.307 10.434 10.524 10.642 10.768 10.904 11.036 11.159 11.268 11.35 11.429 11.478 11.481 11.488 11.488 11.44 11.307 11.031 10.605 9.939 8.996 7.577 4.946 1.828 -0.598 -2.596 -4.269 -5.693 -6.887 -7.933 -8.828 -9.694 -10.398 -11.034 -11.624 -12.154 -12.642 -13.078 -13.553 -13.996 -14.389 -14.784 -15.187 -15.516 -15.849 -16.194 -16.463 -16.739 -17.022 -17.326 -17.643 -17.867 -18.084 -18.375 -18.568 -18.775 -18.892 -19.129 -19.394 -19.673 -19.806 -20.08 -20.248 -20.402 -20.557 -20.88 -21.061 -21.252 -21.449 -21.674 -21.923 -22.214 -22.826 -3 ,8540 ,KEBNE ,16653521,Mon Nov 22 03:11:06 CET,Mon Nov 22 04:53:16 CET,0.0 5.276 6.358 7.213 7.827 8.276 8.695 9.081 9.667 9.914 10.175 10.542 10.833 11.011 11.326 11.585 11.807 11.911 12.081 12.223 12.383 12.47 12.569 12.689 12.792 12.909 13.01 13.101 13.228 13.356 13.455 13.539 13.619 13.698 13.784 13.88 13.969 14.049 14.121 14.194 14.283 14.383 14.481 14.533 14.477 14.292 13.95 13.267 12.051 10.193 7.149 3.755 1.191 -0.92 -2.692 -4.237 -5.566 -6.719 -7.664 -8.594 -9.395 -10.109 -10.782 -11.395 -11.939 -12.418 -12.909 -13.338 -13.712 -14.109 -14.506 -14.823 -15.141 -15.455 -15.701 -15.964 -16.248 -16.537 -16.825 -17.021 -17.208 -17.495 -17.695 -17.906 -18.013 -18.22 -18.446 -18.697 -18.824 -19.072 -19.198 -19.332 -19.474 -19.775 -19.947 -20.132 -20.332 -20.541 -20.735 -21.028 -21.771 -4 ,12799 ,KEBNE ,16653522,Mon Nov 22 03:11:10 CET,Mon Nov 22 04:50:08 CET,0.0 10.924 11.94 12.552 12.976 13.329 13.625 13.904 14.46 14.69 14.846 14.991 15.183 15.285 15.494 15.683 15.866 15.95 16.097 16.239 16.444 16.569 16.702 16.899 17.04 17.162 17.284 17.394 17.546 17.703 17.845 17.981 18.079 18.175 18.283 18.406 18.535 18.654 18.728 18.757 18.791 18.83 18.873 18.932 18.952 18.862 18.545 17.882 16.795 15.143 12.493 9.408 6.845 4.691 2.949 1.419 0.099 -1.06 -2.045 -3.009 -3.832 -4.545 -5.178 -5.782 -6.353 -6.865 -7.392 -7.856 -8.244 -8.638 -9.056 -9.382 -9.715 -10.06 -10.319 -10.585 -10.856 -11.137 -11.413 -11.59 -11.777 -12.071 -12.276 -12.489 -12.601 -12.831 -13.076 -13.322 -13.44 -13.685 -13.812 -13.949 -14.089 -14.367 -14.521 -14.703 -14.882 -15.052 -15.282 -15.632 -16.145 -5 ,7538 ,KEBNE ,16653523,Mon Nov 22 03:11:06 CET,Mon Nov 22 04:53:06 CET,0.0 6.547 7.289 7.79 8.186 8.531 8.843 9.106 9.53 9.727 9.922 10.187 10.442 10.601 10.904 11.179 11.434 11.568 11.848 12.101 12.411 12.59 12.785 13.075 13.326 13.548 13.731 13.871 14.01 14.157 14.297 14.439 14.573 14.696 14.867 15.09 15.266 15.413 15.539 15.613 15.663 15.741 15.797 15.787 15.738 15.596 15.279 14.793 13.989 12.536 10.007 7.014 4.617 2.658 1.046 -0.336 -1.503 -2.521 -3.383 -4.224 -4.933 -5.55 -6.126 -6.666 -7.147 -7.578 -8.021 -8.404 -8.732 -9.065 -9.396 -9.667 -9.963 -10.278 -10.516 -10.766 -11.038 -11.322 -11.607 -11.799 -11.985 -12.28 -12.485 -12.687 -12.796 -13.015 -13.239 -13.473 -13.591 -13.836 -13.958 -14.094 -14.237 -14.544 -14.708 -14.875 -15.051 -15.242 -15.462 -15.732 -16.613 -6 ,7833 ,KEBNE ,16653524,Mon Nov 22 03:11:06 CET,Mon Nov 22 04:54:45 CET,0.0 3.332 4.15 4.657 5.067 5.43 5.741 5.986 6.366 6.521 6.651 6.78 6.978 7.105 7.379 7.592 7.732 7.816 8.025 8.221 8.484 8.66 8.838 9.098 9.345 9.577 9.79 9.983 10.237 10.491 10.704 10.923 11.146 11.355 11.536 11.724 11.898 12.04 12.177 12.314 12.406 12.468 12.519 12.56 12.55 12.414 12.089 11.518 10.628 9.154 6.667 3.914 1.707 -0.208 -1.863 -3.257 -4.388 -5.365 -6.183 -6.974 -7.632 -8.206 -8.737 -9.234 -9.712 -10.168 -10.666 -11.124 -11.508 -11.888 -12.279 -12.591 -12.916 -13.255 -13.525 -13.802 -14.074 -14.356 -14.653 -14.858 -15.068 -15.401 -15.633 -15.869 -15.991 -16.229 -16.459 -16.702 -16.836 -17.12 -17.307 -17.455 -17.599 -17.921 -18.096 -18.283 -18.505 -18.751 -19.003 -19.32 -20.046 -7 ,17304 ,KEBNE ,16653525,Mon Nov 22 03:12:07 CET,Mon Nov 22 04:55:31 CET,0.0 2.809 3.641 4.16 4.493 4.835 5.134 5.362 5.766 5.964 6.158 6.404 6.644 6.772 6.979 7.151 7.291 7.351 7.49 7.644 7.842 7.951 8.058 8.21 8.342 8.47 8.587 8.684 8.786 8.876 8.954 9.039 9.132 9.231 9.313 9.374 9.409 9.448 9.518 9.568 9.599 9.575 9.497 9.385 9.149 8.809 8.309 7.6 6.656 5.204 2.698 -0.236 -2.474 -4.278 -5.755 -7.079 -8.237 -9.238 -10.081 -10.913 -11.616 -12.221 -12.786 -13.295 -13.764 -14.197 -14.621 -14.98 -15.305 -15.632 -15.954 -16.227 -16.511 -16.804 -17.029 -17.263 -17.505 -17.753 -18.009 -18.187 -18.365 -18.632 -18.819 -19.024 -19.129 -19.337 -19.55 -19.777 -19.901 -20.145 -20.299 -20.443 -20.591 -20.906 -21.072 -21.251 -21.448 -21.656 -21.888 -22.189 -22.751 -10 ,18695 ,KEBNE ,16653528,Mon Nov 22 03:12:08 CET,Mon Nov 22 04:54:23 CET,0.0 9.532 10.188 10.607 10.971 11.257 11.513 11.738 12.141 12.359 12.554 12.772 12.994 13.125 13.398 13.645 13.856 13.953 14.119 14.264 14.457 14.591 14.728 14.902 15.056 15.218 15.38 15.528 15.685 15.803 15.922 16.071 16.208 16.325 16.453 16.58 16.695 16.818 16.972 17.126 17.205 17.264 17.306 17.281 17.163 16.928 16.584 16.118 15.3 13.931 11.64 8.867 6.677 4.926 3.5 2.229 1.004 -0.219 -1.227 -2.145 -2.9 -3.574 -4.228 -4.842 -5.389 -5.876 -6.396 -6.838 -7.209 -7.598 -7.996 -8.323 -8.668 -9.028 -9.291 -9.554 -9.82 -10.075 -10.349 -10.537 -10.718 -11.003 -11.203 -11.414 -11.523 -11.748 -11.977 -12.202 -12.316 -12.559 -12.711 -12.862 -13.008 -13.295 -13.443 -13.611 -13.814 -14.024 -14.241 -14.505 -15.073 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_25_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_25_19.txt deleted file mode 100644 index 2b59053a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_25_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32606 ,KEBNE ,17023455,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:47:35 CET,0.0 0.582 0.932 1.201 1.44 1.65 1.853 2.039 2.4 2.557 2.703 2.852 3.138 3.29 3.608 3.924 4.208 4.343 4.609 4.855 5.205 5.44 5.668 6.002 6.343 6.685 7.02 7.348 7.769 8.178 8.59 9.1 9.598 10.095 10.688 11.362 12.016 12.757 13.59 14.486 15.444 16.549 17.834 19.094 20.523 22.18 24.264 26.77 29.877 33.667 38.492 43.014 46.028 48.139 49.732 50.999 51.931 52.588 53.073 53.553 53.91 54.152 54.312 54.421 54.501 54.56 54.608 54.644 54.665 54.691 54.725 54.739 54.72 54.682 54.662 54.648 54.632 54.622 54.597 54.568 54.534 54.478 54.442 54.402 54.384 54.346 54.293 54.22 54.175 54.039 54.02 53.955 53.887 53.706 53.606 53.516 53.4 53.252 53.067 52.778 51.491 -2 ,14632 ,KEBNE ,17023456,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:48:01 CET,0.0 0.929 1.229 1.505 1.743 1.954 2.147 2.317 2.64 2.806 2.981 3.162 3.443 3.58 3.868 4.144 4.399 4.527 4.795 5.06 5.434 5.687 5.949 6.321 6.658 6.979 7.302 7.626 8.054 8.478 8.895 9.414 9.932 10.44 11.045 11.738 12.377 13.072 13.863 14.736 15.677 16.784 18.109 19.373 20.804 22.497 24.59 27.121 30.212 34.031 38.942 43.425 46.451 48.623 50.223 51.494 52.481 53.27 53.862 54.334 54.672 54.94 55.182 55.398 55.597 55.773 55.921 56.03 56.122 56.202 56.257 56.292 56.33 56.359 56.376 56.385 56.368 56.334 56.299 56.288 56.279 56.246 56.228 56.209 56.192 56.137 56.056 55.962 55.906 55.767 55.775 55.732 55.693 55.59 55.504 55.395 55.255 55.074 54.886 54.647 53.408 -3 ,30304 ,KEBNE ,17023457,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:48:03 CET,0.0 0.881 1.222 1.477 1.693 1.903 2.096 2.276 2.606 2.76 2.911 3.081 3.39 3.541 3.825 4.107 4.371 4.5 4.75 4.992 5.343 5.576 5.814 6.166 6.51 6.847 7.183 7.51 7.938 8.369 8.788 9.292 9.793 10.28 10.857 11.522 12.161 12.878 13.672 14.539 15.474 16.59 17.939 19.277 20.764 22.424 24.448 26.822 29.741 33.398 38.386 43.146 46.353 48.67 50.316 51.579 52.574 53.338 53.947 54.517 54.887 55.129 55.33 55.516 55.671 55.79 55.924 56.044 56.13 56.215 56.303 56.342 56.351 56.349 56.343 56.336 56.332 56.321 56.298 56.275 56.255 56.215 56.169 56.124 56.11 56.083 56.031 55.957 55.918 55.788 55.772 55.728 55.681 55.573 55.511 55.438 55.325 55.214 55.057 54.789 53.615 -4 ,12413 ,KEBNE ,17023458,Wed Dec 22 08:08:44 CET,Wed Dec 22 09:47:50 CET,0.0 0.93 1.271 1.569 1.81 2.018 2.216 2.394 2.722 2.883 3.051 3.235 3.539 3.683 3.945 4.207 4.46 4.587 4.838 5.087 5.478 5.732 5.979 6.332 6.67 7.008 7.337 7.654 8.082 8.517 8.934 9.439 9.942 10.432 11.017 11.696 12.355 13.073 13.867 14.764 15.747 16.882 18.25 19.676 21.386 23.255 25.305 27.643 30.538 34.222 39.005 43.23 45.963 47.812 49.142 50.177 51.008 51.694 52.179 52.601 52.924 53.194 53.444 53.65 53.818 53.967 54.097 54.172 54.237 54.3 54.317 54.297 54.277 54.265 54.261 54.264 54.256 54.251 54.244 54.223 54.191 54.149 54.12 54.08 54.06 54.02 53.968 53.906 53.88 53.759 53.767 53.682 53.57 53.411 53.322 53.173 53.013 52.869 52.703 52.474 51.493 -5 ,32564 ,KEBNE ,17023459,Wed Dec 22 08:09:46 CET,Wed Dec 22 09:49:37 CET,0.0 0.66 0.835 1.013 1.195 1.365 1.535 1.692 1.985 2.133 2.27 2.389 2.673 2.802 3.05 3.311 3.558 3.674 3.902 4.122 4.432 4.629 4.824 5.12 5.428 5.72 5.995 6.269 6.625 6.968 7.306 7.736 8.176 8.599 9.099 9.662 10.201 10.822 11.498 12.218 13.007 13.924 15.043 16.266 17.771 19.527 21.692 24.293 27.553 31.715 37.392 42.535 45.88 48.228 49.922 51.249 52.253 53.088 53.737 54.31 54.696 54.951 55.184 55.401 55.601 55.785 55.951 56.053 56.125 56.196 56.25 56.259 56.228 56.19 56.166 56.145 56.11 56.065 56.007 55.956 55.91 55.834 55.774 55.714 55.68 55.603 55.53 55.444 55.407 55.276 55.253 55.191 55.126 54.97 54.879 54.768 54.641 54.496 54.298 54.005 52.425 -6 ,15654 ,KEBNE ,17023460,Wed Dec 22 08:09:45 CET,Wed Dec 22 09:49:18 CET,0.0 0.575 0.924 1.164 1.379 1.564 1.743 1.928 2.271 2.448 2.62 2.788 3.079 3.23 3.535 3.83 4.116 4.255 4.518 4.772 5.141 5.383 5.637 6.0 6.336 6.685 7.04 7.37 7.785 8.198 8.609 9.109 9.596 10.077 10.636 11.269 11.909 12.625 13.434 14.35 15.294 16.368 17.688 19.075 20.796 22.762 25.086 27.762 30.971 34.861 39.771 44.391 47.348 49.249 50.587 51.625 52.499 53.219 53.747 54.204 54.537 54.793 54.998 55.147 55.272 55.381 55.486 55.591 55.669 55.725 55.766 55.792 55.813 55.792 55.763 55.756 55.733 55.697 55.66 55.62 55.562 55.466 55.407 55.354 55.334 55.298 55.262 55.237 55.22 55.105 55.101 55.046 54.99 54.841 54.751 54.659 54.552 54.407 54.189 53.886 52.659 -7 ,27842 ,KEBNE ,17023461,Wed Dec 22 08:09:46 CET,Wed Dec 22 09:48:04 CET,0.0 0.803 1.161 1.424 1.619 1.811 1.992 2.157 2.46 2.596 2.732 2.854 3.139 3.287 3.563 3.819 4.057 4.176 4.416 4.641 4.957 5.157 5.349 5.65 5.964 6.271 6.568 6.861 7.231 7.583 7.942 8.401 8.846 9.273 9.787 10.383 10.977 11.642 12.358 13.137 14.035 15.106 16.329 17.588 19.127 20.912 23.076 25.644 28.701 32.445 37.338 41.737 44.555 46.494 47.905 49.043 49.952 50.631 51.073 51.429 51.683 51.887 52.073 52.234 52.359 52.451 52.53 52.59 52.643 52.683 52.712 52.739 52.74 52.709 52.67 52.627 52.609 52.578 52.521 52.482 52.439 52.354 52.292 52.233 52.2 52.124 52.03 51.935 51.893 51.754 51.752 51.712 51.672 51.55 51.457 51.357 51.245 51.074 50.884 50.639 49.247 -8 ,14628 ,KEBNE ,17023462,Wed Dec 22 08:10:47 CET,Wed Dec 22 09:52:10 CET,0.0 0.619 0.952 1.213 1.421 1.631 1.821 2.017 2.403 2.567 2.734 2.923 3.213 3.36 3.646 3.915 4.174 4.298 4.549 4.811 5.189 5.425 5.658 6.002 6.338 6.661 6.993 7.319 7.728 8.135 8.536 9.034 9.535 10.029 10.611 11.277 11.937 12.687 13.511 14.421 15.394 16.524 17.895 19.29 20.954 22.784 24.891 27.356 30.347 34.139 39.08 43.538 46.473 48.469 49.823 50.788 51.512 52.041 52.464 52.841 53.107 53.332 53.503 53.601 53.662 53.715 53.746 53.737 53.711 53.691 53.668 53.664 53.667 53.657 53.655 53.66 53.635 53.578 53.529 53.497 53.452 53.354 53.273 53.182 53.142 53.073 52.989 52.895 52.852 52.715 52.674 52.591 52.508 52.33 52.234 52.136 52.001 51.845 51.619 51.3 50.006 -9 ,19718 ,KEBNE ,17023463,Wed Dec 22 08:09:46 CET,Wed Dec 22 09:48:24 CET,0.0 0.789 1.118 1.371 1.579 1.797 2.012 2.195 2.539 2.706 2.864 3.025 3.314 3.456 3.725 3.994 4.255 4.38 4.634 4.902 5.3 5.548 5.798 6.18 6.543 6.888 7.23 7.559 7.986 8.405 8.826 9.37 9.906 10.414 11.0 11.69 12.368 13.096 13.875 14.744 15.732 16.877 18.245 19.653 21.331 23.238 25.35 27.683 30.526 34.086 39.082 43.908 47.129 49.497 51.264 52.555 53.436 54.079 54.585 55.057 55.42 55.709 55.942 56.084 56.182 56.28 56.382 56.477 56.554 56.627 56.687 56.7 56.696 56.723 56.74 56.728 56.712 56.691 56.655 56.628 56.594 56.532 56.51 56.476 56.451 56.389 56.282 56.154 56.087 55.941 55.921 55.835 55.734 55.512 55.403 55.308 55.208 55.081 54.88 54.564 53.035 -10 ,6169 ,KEBNE ,17023464,Wed Dec 22 08:09:46 CET,Wed Dec 22 09:49:07 CET,0.0 1.259 1.665 1.991 2.266 2.495 2.695 2.891 3.256 3.435 3.613 3.799 4.107 4.266 4.57 4.856 5.154 5.304 5.602 5.886 6.286 6.555 6.813 7.188 7.559 7.91 8.24 8.565 8.984 9.383 9.791 10.316 10.829 11.315 11.888 12.578 13.239 13.969 14.791 15.686 16.656 17.767 19.086 20.457 22.112 24.028 26.316 29.008 32.382 36.584 41.89 46.618 49.55 51.61 53.068 54.098 54.859 55.472 55.949 56.364 56.659 56.887 57.063 57.203 57.335 57.454 57.537 57.582 57.626 57.678 57.71 57.711 57.712 57.719 57.708 57.675 57.642 57.609 57.563 57.542 57.523 57.487 57.433 57.355 57.325 57.265 57.199 57.099 57.047 56.914 56.893 56.831 56.752 56.548 56.44 56.329 56.194 56.061 55.878 55.635 54.888 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_25_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_25_24.txt deleted file mode 100644 index 8d0c8cf8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_25_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22536 ,KEBNE ,17042003,Thu Dec 23 03:28:00 CET,Thu Dec 23 05:09:32 CET,0.0 0.828 1.149 1.383 1.605 1.812 1.977 2.155 2.513 2.682 2.854 3.021 3.307 3.446 3.714 3.972 4.219 4.341 4.584 4.814 5.16 5.383 5.595 5.905 6.216 6.518 6.803 7.097 7.481 7.841 8.187 8.606 9.02 9.428 9.901 10.446 11.006 11.624 12.29 13.027 13.839 14.777 15.873 17.005 18.357 19.905 21.769 23.933 26.618 30.141 34.885 39.286 42.17 44.222 45.749 46.978 47.924 48.645 49.209 49.715 50.08 50.383 50.661 50.864 51.022 51.177 51.329 51.448 51.536 51.632 51.706 51.728 51.746 51.756 51.751 51.736 51.716 51.692 51.647 51.616 51.588 51.527 51.471 51.397 51.354 51.274 51.178 51.072 51.016 50.853 50.799 50.709 50.621 50.46 50.345 50.201 50.049 49.893 49.688 49.359 48.341 -2 ,4637 ,KEBNE ,17042004,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:08:07 CET,0.0 0.606 0.899 1.189 1.458 1.703 1.911 2.105 2.468 2.635 2.798 2.963 3.253 3.385 3.654 3.916 4.18 4.316 4.567 4.803 5.158 5.385 5.607 5.936 6.273 6.625 6.959 7.28 7.706 8.114 8.504 8.969 9.427 9.89 10.435 11.049 11.641 12.292 13.022 13.831 14.694 15.697 16.871 18.093 19.629 21.392 23.482 25.949 28.98 32.8 37.709 42.232 45.35 47.522 49.017 50.16 51.044 51.749 52.295 52.785 53.155 53.438 53.691 53.92 54.1 54.257 54.424 54.562 54.662 54.749 54.834 54.904 54.963 55.002 55.02 55.022 55.016 55.009 54.998 54.965 54.933 54.905 54.881 54.853 54.827 54.77 54.706 54.625 54.589 54.466 54.464 54.398 54.328 54.194 54.119 53.997 53.857 53.724 53.554 53.233 51.99 -3 ,18798 ,KEBNE ,17042005,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:09:11 CET,0.0 0.856 1.142 1.372 1.573 1.754 1.926 2.1 2.465 2.638 2.79 2.918 3.199 3.328 3.573 3.812 4.065 4.196 4.443 4.672 5.003 5.213 5.421 5.725 6.01 6.298 6.587 6.865 7.24 7.614 7.967 8.388 8.809 9.225 9.703 10.243 10.766 11.374 12.096 12.893 13.735 14.665 15.696 16.78 18.141 19.71 21.604 23.841 26.458 29.564 33.878 37.876 40.359 42.181 43.5 44.433 45.107 45.648 46.031 46.332 46.569 46.742 46.855 46.949 47.019 47.049 47.065 47.091 47.111 47.127 47.101 47.046 47.014 46.963 46.899 46.83 46.755 46.684 46.605 46.544 46.483 46.386 46.298 46.191 46.143 46.054 45.973 45.886 45.839 45.688 45.646 45.566 45.485 45.321 45.23 45.13 45.019 44.907 44.742 44.464 43.646 -4 ,11281 ,KEBNE ,17042006,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:07:47 CET,0.0 1.929 2.574 3.039 3.406 3.749 4.06 4.339 4.853 5.093 5.322 5.601 5.937 6.125 6.49 6.839 7.169 7.329 7.652 7.948 8.353 8.613 8.851 9.192 9.523 9.837 10.15 10.466 10.883 11.288 11.681 12.183 12.692 13.174 13.714 14.323 14.918 15.579 16.337 17.169 18.042 19.017 20.168 21.363 22.778 24.434 26.422 28.678 31.31 34.717 39.339 43.501 46.231 48.179 49.625 50.725 51.438 51.932 52.329 52.708 53.009 53.222 53.39 53.528 53.616 53.703 53.808 53.888 53.941 53.978 54.019 54.04 54.054 54.075 54.097 54.105 54.089 54.076 54.057 54.039 54.017 53.95 53.899 53.857 53.828 53.77 53.712 53.633 53.584 53.432 53.419 53.356 53.274 53.101 53.023 52.896 52.747 52.594 52.384 52.093 50.911 -5 ,5753 ,KEBNE ,17042007,Thu Dec 23 03:28:01 CET,Thu Dec 23 05:09:03 CET,0.0 0.602 0.906 1.157 1.373 1.565 1.73 1.894 2.219 2.371 2.511 2.631 2.908 3.032 3.28 3.526 3.766 3.885 4.117 4.328 4.63 4.834 5.033 5.323 5.621 5.917 6.192 6.467 6.831 7.182 7.526 7.953 8.373 8.776 9.248 9.804 10.355 10.959 11.64 12.386 13.167 14.055 15.114 16.261 17.73 19.401 21.364 23.616 26.371 29.853 34.272 38.272 40.839 42.698 44.042 45.031 45.784 46.324 46.669 46.99 47.23 47.376 47.48 47.534 47.601 47.66 47.674 47.653 47.628 47.594 47.539 47.499 47.456 47.412 47.388 47.369 47.34 47.285 47.198 47.124 47.044 46.912 46.805 46.691 46.645 46.555 46.455 46.322 46.236 46.047 45.929 45.799 45.664 45.385 45.237 45.085 44.904 44.675 44.366 43.925 42.165 -6 ,16514 ,KEBNE ,17042008,Thu Dec 23 03:30:04 CET,Thu Dec 23 05:10:57 CET,0.0 0.401 0.66 0.899 1.106 1.319 1.504 1.691 2.056 2.237 2.416 2.575 2.883 3.039 3.333 3.603 3.867 4.003 4.257 4.493 4.85 5.074 5.298 5.632 5.945 6.246 6.534 6.817 7.196 7.565 7.922 8.385 8.838 9.273 9.79 10.381 10.974 11.634 12.343 13.104 13.912 14.826 15.946 17.133 18.567 20.209 22.134 24.41 27.233 30.453 34.424 37.895 39.899 41.233 42.259 43.126 43.818 44.345 44.721 45.07 45.346 45.538 45.671 45.759 45.848 45.933 45.984 46.018 46.03 46.052 46.065 46.043 46.018 45.994 45.987 45.979 45.971 45.945 45.899 45.872 45.843 45.792 45.749 45.692 45.651 45.561 45.466 45.347 45.263 45.057 44.941 44.845 44.749 44.488 44.338 44.204 44.042 43.775 43.346 42.705 38.056 -7 ,1020 ,KEBNE ,17042009,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:10:03 CET,0.0 0.947 1.234 1.484 1.695 1.898 2.09 2.26 2.569 2.729 2.892 3.052 3.333 3.474 3.765 4.03 4.279 4.408 4.652 4.888 5.241 5.47 5.696 6.026 6.34 6.645 6.957 7.261 7.658 8.062 8.495 9.049 9.568 10.06 10.63 11.273 11.896 12.592 13.344 14.167 15.061 16.075 17.276 18.514 19.972 21.65 23.668 26.026 28.901 32.543 37.364 41.808 44.634 46.56 48.022 49.112 49.883 50.471 50.902 51.267 51.544 51.767 51.935 52.028 52.085 52.16 52.244 52.299 52.322 52.345 52.368 52.377 52.374 52.342 52.318 52.286 52.233 52.171 52.109 52.054 51.996 51.945 51.908 51.859 51.832 51.761 51.662 51.552 51.494 51.342 51.322 51.261 51.197 51.044 50.953 50.828 50.665 50.482 50.292 50.076 48.882 -8 ,10372 ,KEBNE ,17042010,Thu Dec 23 03:30:04 CET,Thu Dec 23 05:11:03 CET,0.0 0.555 0.817 1.056 1.258 1.441 1.618 1.795 2.132 2.286 2.446 2.615 2.914 3.074 3.355 3.609 3.85 3.974 4.227 4.475 4.835 5.064 5.295 5.624 5.931 6.238 6.55 6.856 7.246 7.635 8.029 8.505 8.977 9.48 10.101 10.766 11.368 12.041 12.799 13.643 14.551 15.577 16.779 18.028 19.569 21.311 23.364 25.805 28.853 32.727 37.816 42.41 45.339 47.45 49.033 50.268 51.224 51.973 52.546 53.049 53.418 53.711 53.972 54.199 54.387 54.527 54.653 54.765 54.86 54.947 55.026 55.08 55.13 55.175 55.188 55.188 55.191 55.188 55.169 55.146 55.127 55.092 55.064 55.038 55.013 54.961 54.899 54.802 54.756 54.608 54.579 54.513 54.457 54.283 54.162 54.043 53.887 53.683 53.471 53.193 51.718 -9 ,12644 ,KEBNE ,17042011,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:10:04 CET,0.0 0.48 0.791 1.038 1.259 1.479 1.683 1.867 2.215 2.38 2.541 2.706 2.992 3.13 3.404 3.67 3.919 4.041 4.291 4.553 4.936 5.172 5.402 5.743 6.066 6.388 6.703 7.008 7.423 7.822 8.216 8.705 9.181 9.636 10.175 10.795 11.387 12.049 12.789 13.598 14.454 15.445 16.642 17.867 19.34 21.067 23.205 25.694 28.621 32.188 36.756 40.917 43.574 45.366 46.683 47.717 48.499 49.167 49.679 50.073 50.386 50.647 50.815 50.952 51.088 51.19 51.27 51.344 51.401 51.446 51.483 51.497 51.494 51.49 51.492 51.485 51.464 51.427 51.395 51.364 51.32 51.252 51.211 51.175 51.156 51.098 51.02 50.92 50.866 50.724 50.721 50.671 50.609 50.469 50.395 50.302 50.153 49.888 49.495 48.945 47.188 -10 ,3686 ,KEBNE ,17042012,Thu Dec 23 03:30:04 CET,Thu Dec 23 05:10:31 CET,0.0 0.341 0.63 0.883 1.104 1.31 1.485 1.632 1.926 2.074 2.216 2.336 2.614 2.735 2.989 3.247 3.484 3.596 3.82 4.047 4.387 4.598 4.802 5.107 5.408 5.698 5.985 6.279 6.658 7.006 7.343 7.769 8.201 8.619 9.093 9.624 10.14 10.719 11.381 12.134 12.929 13.824 14.905 16.04 17.411 19.014 20.958 23.235 25.977 29.384 33.981 38.262 41.046 42.994 44.374 45.434 46.222 46.844 47.321 47.742 48.072 48.35 48.599 48.791 48.943 49.043 49.115 49.186 49.248 49.288 49.319 49.347 49.37 49.375 49.364 49.353 49.346 49.342 49.319 49.284 49.242 49.182 49.12 49.03 48.997 48.934 48.85 48.764 48.717 48.554 48.518 48.465 48.4 48.269 48.191 48.088 47.958 47.776 47.579 47.369 46.553 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_25_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_25_29.txt deleted file mode 100644 index 9f736b1d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_25_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,932 ,KEBNE ,16653529,Mon Nov 22 03:12:07 CET,Mon Nov 22 04:54:43 CET,0.0 4.036 4.474 4.903 5.38 5.725 5.984 6.251 6.762 6.992 7.223 7.491 7.843 8.06 8.446 8.785 9.133 9.302 9.616 9.943 10.425 10.735 11.029 11.44 11.861 12.267 12.644 13.017 13.536 14.029 14.493 15.055 15.585 16.106 16.748 17.483 18.208 19.021 19.894 20.809 21.752 22.875 24.224 25.552 27.125 28.967 31.196 33.81 36.998 41.076 46.365 51.128 54.069 55.977 57.3 58.296 59.088 59.729 60.233 60.596 60.832 61.055 61.251 61.373 61.468 61.561 61.621 61.671 61.704 61.71 61.707 61.7 61.695 61.667 61.646 61.627 61.596 61.571 61.544 61.523 61.505 61.474 61.455 61.427 61.413 61.385 61.325 61.205 61.127 60.966 60.916 60.818 60.705 60.446 60.3 60.153 59.952 59.725 59.472 59.182 57.978 -2 ,10774 ,KEBNE ,16653530,Mon Nov 22 03:12:15 CET,Mon Nov 22 04:51:26 CET,0.0 2.556 3.072 3.49 3.848 4.158 4.46 4.75 5.287 5.525 5.747 6.017 6.347 6.537 6.922 7.291 7.622 7.784 8.102 8.417 8.879 9.167 9.449 9.875 10.284 10.689 11.093 11.472 11.939 12.385 12.829 13.413 13.985 14.533 15.188 15.932 16.651 17.442 18.305 19.224 20.209 21.367 22.714 24.095 25.77 27.641 29.83 32.408 35.577 39.56 44.801 49.696 52.945 55.219 56.895 58.207 59.21 60.007 60.621 61.167 61.585 61.92 62.195 62.375 62.548 62.734 62.877 62.955 63.036 63.159 63.268 63.331 63.396 63.454 63.474 63.471 63.474 63.493 63.503 63.503 63.496 63.46 63.415 63.361 63.333 63.26 63.163 63.064 63.023 62.894 62.872 62.811 62.76 62.654 62.602 62.535 62.447 62.344 62.205 62.054 61.211 -3 ,2314 ,KEBNE ,16653531,Mon Nov 22 03:12:15 CET,Mon Nov 22 04:48:08 CET,0.0 1.525 2.026 2.445 2.823 3.163 3.458 3.735 4.259 4.493 4.697 4.954 5.286 5.476 5.85 6.173 6.48 6.64 6.956 7.265 7.705 7.985 8.275 8.691 9.084 9.471 9.855 10.225 10.712 11.195 11.649 12.175 12.689 13.177 13.71 14.296 14.891 15.608 16.388 17.182 17.965 18.864 19.973 21.144 22.533 24.1 25.99 28.293 31.089 34.416 38.839 42.986 45.677 47.499 48.794 49.806 50.626 51.285 51.743 52.072 52.288 52.491 52.713 52.924 53.077 53.143 53.169 53.184 53.186 53.201 53.216 53.206 53.201 53.19 53.167 53.143 53.131 53.148 53.171 53.181 53.19 53.199 53.195 53.182 53.172 53.137 53.085 53.008 52.967 52.833 52.842 52.799 52.754 52.62 52.519 52.408 52.294 52.175 52.031 51.806 50.907 -4 ,21572 ,KEBNE ,16653532,Mon Nov 22 03:12:11 CET,Mon Nov 22 04:47:54 CET,0.0 2.452 2.975 3.361 3.699 4.007 4.294 4.553 4.991 5.21 5.42 5.638 5.927 6.075 6.367 6.641 6.915 7.06 7.342 7.615 8.007 8.262 8.506 8.847 9.209 9.565 9.889 10.242 10.705 11.114 11.505 11.969 12.419 12.841 13.343 13.937 14.515 15.171 15.915 16.744 17.65 18.704 19.941 21.226 22.774 24.542 26.676 29.045 31.69 34.816 38.837 42.818 45.526 47.368 48.734 49.795 50.547 51.138 51.598 52.002 52.304 52.557 52.774 52.962 53.125 53.228 53.307 53.378 53.426 53.472 53.506 53.517 53.515 53.503 53.498 53.49 53.467 53.425 53.368 53.327 53.287 53.222 53.179 53.104 53.063 53.0 52.909 52.788 52.727 52.572 52.512 52.425 52.323 52.105 51.983 51.856 51.707 51.516 51.266 50.892 48.674 -5 ,24041 ,KEBNE ,16653533,Mon Nov 22 03:13:08 CET,Mon Nov 22 04:54:10 CET,0.0 3.7 4.402 4.955 5.383 5.742 6.068 6.37 6.96 7.227 7.466 7.737 8.046 8.206 8.482 8.734 8.99 9.12 9.386 9.644 9.998 10.231 10.464 10.813 11.178 11.529 11.843 12.124 12.501 12.896 13.29 13.748 14.179 14.605 15.098 15.658 16.207 16.812 17.483 18.211 18.98 19.854 20.902 22.029 23.414 24.991 26.789 28.837 31.34 34.472 38.614 42.434 44.86 46.521 47.724 48.649 49.386 49.951 50.371 50.758 51.035 51.246 51.426 51.57 51.69 51.806 51.923 52.007 52.054 52.069 52.059 52.054 52.054 52.043 52.026 52.006 51.972 51.937 51.901 51.856 51.799 51.712 51.652 51.582 51.547 51.476 51.387 51.276 51.211 51.064 51.036 50.979 50.91 50.723 50.61 50.475 50.309 50.089 49.844 49.536 47.939 -6 ,8685 ,KEBNE ,16653534,Mon Nov 22 03:13:08 CET,Mon Nov 22 04:56:32 CET,0.0 2.419 2.921 3.313 3.63 3.89 4.136 4.389 4.866 5.08 5.288 5.527 5.871 6.067 6.419 6.738 7.045 7.198 7.516 7.82 8.24 8.516 8.789 9.181 9.552 9.902 10.243 10.563 10.95 11.32 11.693 12.177 12.647 13.07 13.561 14.157 14.752 15.41 16.127 16.88 17.7 18.682 19.838 20.988 22.376 24.04 26.016 28.283 31.083 34.66 39.251 43.371 46.14 48.121 49.53 50.542 51.316 51.944 52.418 52.86 53.207 53.47 53.684 53.863 53.983 54.073 54.156 54.198 54.217 54.245 54.291 54.327 54.342 54.32 54.314 54.322 54.301 54.257 54.2 54.158 54.114 54.038 53.988 53.946 53.919 53.852 53.758 53.638 53.569 53.402 53.368 53.295 53.221 53.075 52.968 52.824 52.682 52.509 52.246 51.933 50.265 -7 ,9638 ,KEBNE ,16653535,Mon Nov 22 03:14:10 CET,Mon Nov 22 04:55:26 CET,0.0 1.893 2.519 2.955 3.297 3.59 3.869 4.125 4.535 4.745 4.953 5.173 5.495 5.674 6.06 6.434 6.767 6.92 7.208 7.474 7.871 8.13 8.4 8.827 9.25 9.672 10.07 10.449 10.943 11.429 11.906 12.461 12.979 13.477 14.054 14.713 15.374 16.118 16.933 17.792 18.704 19.822 21.108 22.389 23.933 25.737 27.915 30.521 33.849 38.141 43.758 48.894 52.111 54.217 55.77 56.982 57.921 58.653 59.207 59.713 60.107 60.415 60.664 60.888 61.082 61.239 61.377 61.469 61.522 61.568 61.619 61.658 61.681 61.69 61.701 61.696 61.679 61.666 61.636 61.615 61.582 61.511 61.47 61.418 61.387 61.307 61.23 61.135 61.08 60.944 60.946 60.899 60.848 60.721 60.624 60.517 60.401 60.261 60.042 59.739 58.61 -8 ,24100 ,KEBNE ,16653536,Mon Nov 22 03:14:10 CET,Mon Nov 22 04:56:17 CET,0.0 2.261 2.772 3.161 3.507 3.813 4.083 4.334 4.79 5.039 5.296 5.605 5.944 6.139 6.51 6.824 7.138 7.303 7.622 7.909 8.307 8.582 8.846 9.228 9.615 9.989 10.337 10.693 11.187 11.666 12.128 12.683 13.229 13.757 14.362 15.048 15.728 16.468 17.304 18.254 19.256 20.418 21.788 23.118 24.7 26.549 28.709 31.298 34.542 38.528 43.746 48.529 51.543 53.61 55.136 56.321 57.202 57.878 58.346 58.718 59.015 59.294 59.513 59.664 59.775 59.861 59.963 60.058 60.1 60.094 60.116 60.133 60.124 60.116 60.109 60.094 60.095 60.102 60.08 60.061 60.034 59.961 59.892 59.827 59.801 59.732 59.659 59.586 59.546 59.399 59.361 59.297 59.222 59.064 58.972 58.836 58.691 58.547 58.368 58.114 56.584 -9 ,25204 ,KEBNE ,16653537,Mon Nov 22 03:14:10 CET,Mon Nov 22 04:54:54 CET,0.0 8.907 9.496 9.93 10.33 10.678 10.981 11.245 11.726 11.963 12.179 12.457 12.816 13.035 13.448 13.843 14.23 14.415 14.771 15.104 15.608 15.946 16.279 16.77 17.207 17.624 18.054 18.476 19.015 19.502 19.955 20.543 21.12 21.683 22.378 23.162 23.893 24.69 25.528 26.415 27.348 28.396 29.68 31.024 32.629 34.444 36.621 39.264 42.529 46.649 51.999 56.844 60.009 62.152 63.673 64.772 65.554 66.235 66.783 67.261 67.599 67.82 67.997 68.158 68.284 68.377 68.473 68.527 68.546 68.556 68.567 68.588 68.595 68.586 68.569 68.558 68.546 68.504 68.461 68.444 68.428 68.388 68.327 68.267 68.237 68.169 68.129 68.074 68.03 67.896 67.902 67.86 67.809 67.672 67.596 67.498 67.382 67.273 67.132 66.941 66.031 -10 ,2688 ,KEBNE ,16653538,Mon Nov 22 03:14:14 CET,Mon Nov 22 04:54:18 CET,0.0 3.015 3.552 3.97 4.321 4.592 4.829 5.062 5.487 5.693 5.894 6.085 6.394 6.572 6.921 7.211 7.462 7.579 7.814 8.049 8.41 8.652 8.9 9.267 9.61 9.949 10.282 10.592 10.975 11.366 11.75 12.208 12.661 13.095 13.628 14.243 14.807 15.408 16.076 16.803 17.567 18.499 19.637 20.812 22.194 23.71 25.473 27.544 30.169 33.533 38.06 42.141 44.76 46.669 48.081 49.141 49.932 50.5 50.92 51.331 51.667 51.944 52.196 52.416 52.611 52.772 52.906 53.005 53.073 53.143 53.198 53.241 53.282 53.273 53.265 53.286 53.301 53.287 53.271 53.26 53.226 53.171 53.134 53.096 53.072 53.0 52.915 52.813 52.759 52.61 52.599 52.544 52.479 52.349 52.273 52.17 52.076 51.972 51.823 51.637 50.905 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_27_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_27_24.txt deleted file mode 100644 index ce76515a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_27_24.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,10671 ,KEBNE ,17042014,Thu Dec 23 03:30:04 CET,Thu Dec 23 05:11:59 CET,0.0 0.796 1.077 1.304 1.505 1.689 1.861 2.037 2.348 2.481 2.619 2.752 3.008 3.125 3.335 3.546 3.758 3.863 4.077 4.286 4.589 4.785 4.974 5.247 5.52 5.787 6.052 6.313 6.638 6.961 7.287 7.69 8.084 8.455 8.892 9.416 9.936 10.496 11.089 11.733 12.428 13.23 14.212 15.258 16.487 17.826 19.371 21.157 23.315 25.988 29.462 32.537 34.282 35.352 36.035 36.474 36.764 36.937 37.025 37.046 37.026 36.991 36.94 36.876 36.789 36.657 36.495 36.374 36.281 36.186 36.077 35.973 35.84 35.709 35.606 35.456 35.293 35.145 34.976 34.842 34.707 34.477 34.294 34.099 33.998 33.813 33.635 33.442 33.334 33.129 32.976 32.844 32.697 32.342 32.153 31.951 31.678 31.314 30.825 30.098 17.255 -3 ,26199 ,KEBNE ,17042015,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:11:15 CET,0.0 0.725 1.054 1.329 1.55 1.755 1.943 2.114 2.448 2.596 2.73 2.86 3.113 3.229 3.45 3.654 3.855 3.96 4.166 4.375 4.689 4.886 5.078 5.355 5.618 5.875 6.114 6.342 6.649 6.955 7.262 7.631 7.986 8.333 8.744 9.223 9.71 10.259 10.854 11.488 12.157 12.919 13.811 14.742 15.853 17.078 18.52 20.243 22.351 24.886 28.127 30.872 32.351 33.219 33.855 34.293 34.543 34.65 34.677 34.668 34.634 34.59 34.538 34.476 34.403 34.319 34.185 34.021 33.853 33.702 33.547 33.39 33.151 32.822 32.569 32.323 32.086 31.82 31.52 31.327 31.142 30.829 30.589 30.314 30.153 29.808 29.468 29.128 28.936 28.636 28.265 28.017 27.772 27.197 26.845 26.456 26.016 25.54 25.03 24.275 13.963 -4 ,30347 ,KEBNE ,17042016,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:11:22 CET,0.0 0.441 0.66 0.847 1.022 1.183 1.33 1.479 1.736 1.856 1.982 2.11 2.358 2.47 2.688 2.902 3.116 3.216 3.409 3.605 3.877 4.047 4.213 4.454 4.691 4.914 5.13 5.356 5.65 5.954 6.262 6.624 6.986 7.328 7.724 8.165 8.583 9.048 9.562 10.133 10.729 11.406 12.231 13.079 14.078 15.234 16.573 18.074 19.939 22.253 25.165 27.706 29.254 30.285 31.025 31.514 31.829 32.064 32.169 32.199 32.182 32.16 32.144 32.072 31.977 31.877 31.738 31.616 31.514 31.392 31.244 31.131 31.029 30.91 30.836 30.764 30.681 30.607 30.519 30.431 30.314 30.117 29.979 29.826 29.747 29.588 29.395 29.185 29.067 28.855 28.676 28.522 28.372 28.009 27.792 27.534 27.214 26.895 26.58 26.11 23.385 -5 ,3575 ,KEBNE ,17042017,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:11:35 CET,0.0 0.795 1.046 1.254 1.451 1.626 1.793 1.945 2.219 2.353 2.485 2.61 2.859 2.98 3.214 3.442 3.654 3.759 3.958 4.146 4.425 4.604 4.785 5.054 5.315 5.576 5.83 6.093 6.434 6.754 7.073 7.467 7.845 8.223 8.674 9.16 9.634 10.181 10.777 11.418 12.104 12.868 13.771 14.683 15.749 17.012 18.524 20.173 22.09 24.643 27.92 30.672 32.383 33.452 34.16 34.638 34.939 35.167 35.322 35.464 35.592 35.65 35.621 35.573 35.539 35.463 35.337 35.216 35.099 34.986 34.87 34.759 34.638 34.506 34.392 34.24 34.062 33.888 33.712 33.591 33.461 33.272 33.157 33.038 32.947 32.746 32.534 32.285 32.164 31.945 31.756 31.608 31.444 31.075 30.857 30.627 30.372 30.016 29.568 28.947 25.44 -6 ,30485 ,KEBNE ,17042018,Thu Dec 23 03:30:04 CET,Thu Dec 23 05:11:29 CET,0.0 0.84 1.185 1.463 1.678 1.862 2.033 2.2 2.502 2.645 2.791 2.942 3.204 3.328 3.548 3.764 3.982 4.09 4.294 4.494 4.804 5.003 5.205 5.513 5.796 6.043 6.282 6.524 6.837 7.136 7.441 7.832 8.21 8.58 9.026 9.528 9.999 10.511 11.099 11.766 12.443 13.188 14.102 15.038 16.154 17.404 18.846 20.508 22.48 24.858 27.776 30.257 31.728 32.732 33.514 34.03 34.346 34.576 34.698 34.791 34.844 34.829 34.805 34.783 34.753 34.71 34.643 34.572 34.494 34.382 34.264 34.167 34.072 33.964 33.862 33.762 33.658 33.536 33.403 33.295 33.14 32.881 32.726 32.593 32.528 32.361 32.164 31.95 31.809 31.543 31.326 31.184 31.006 30.512 30.241 29.982 29.663 29.253 28.734 28.046 24.971 -7 ,19122 ,KEBNE ,17042019,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:10:44 CET,0.0 0.82 1.118 1.38 1.598 1.792 1.98 2.171 2.515 2.681 2.845 3.016 3.292 3.432 3.692 3.941 4.181 4.299 4.532 4.748 5.052 5.246 5.431 5.706 5.977 6.244 6.506 6.755 7.079 7.38 7.659 8.0 8.33 8.65 9.038 9.474 9.893 10.366 10.893 11.457 12.041 12.759 13.676 14.583 15.604 16.761 18.161 19.8 21.756 24.084 27.055 29.759 31.413 32.457 33.154 33.652 34.003 34.263 34.389 34.392 34.291 34.148 34.001 33.847 33.701 33.548 33.364 33.166 32.964 32.77 32.582 32.426 32.245 32.038 31.876 31.691 31.48 31.24 30.972 30.781 30.584 30.258 30.001 29.744 29.627 29.389 29.132 28.845 28.688 28.425 28.171 27.984 27.77 27.336 27.107 26.837 26.536 26.143 25.614 24.904 21.872 -8 ,8676 ,KEBNE ,17042020,Thu Dec 23 03:30:04 CET,Thu Dec 23 05:11:35 CET,0.0 0.502 0.789 1.031 1.233 1.397 1.559 1.719 2.012 2.143 2.271 2.385 2.647 2.765 2.999 3.233 3.441 3.546 3.76 3.955 4.239 4.427 4.61 4.882 5.158 5.433 5.691 5.944 6.299 6.66 7.009 7.432 7.832 8.22 8.683 9.212 9.716 10.273 10.877 11.522 12.226 13.029 13.96 14.914 16.035 17.298 18.776 20.532 22.667 25.246 28.541 31.294 32.916 33.937 34.603 35.047 35.281 35.354 35.367 35.38 35.371 35.321 35.25 35.189 35.091 34.927 34.747 34.586 34.421 34.258 34.055 33.851 33.657 33.462 33.286 33.079 32.873 32.67 32.445 32.278 32.121 31.918 31.79 31.656 31.586 31.43 31.244 31.068 30.964 30.739 30.538 30.378 30.217 29.793 29.503 29.206 28.904 28.598 28.241 27.767 23.705 -9 ,9445 ,KEBNE ,17042021,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:10:25 CET,0.0 1.152 1.49 1.762 1.999 2.186 2.361 2.534 2.856 3.001 3.142 3.295 3.554 3.687 3.948 4.187 4.403 4.512 4.73 4.94 5.237 5.433 5.639 5.94 6.227 6.505 6.774 7.052 7.403 7.734 8.08 8.497 8.883 9.252 9.696 10.213 10.715 11.262 11.845 12.475 13.161 13.963 14.938 15.935 17.071 18.364 19.933 21.721 23.769 26.08 28.866 31.199 32.624 33.645 34.377 34.909 35.291 35.52 35.609 35.67 35.698 35.696 35.673 35.622 35.55 35.434 35.302 35.192 35.084 34.966 34.841 34.725 34.579 34.398 34.242 34.07 33.922 33.791 33.643 33.551 33.447 33.271 33.15 32.992 32.902 32.702 32.486 32.294 32.201 32.012 31.884 31.763 31.605 31.179 30.956 30.736 30.473 30.176 29.822 29.325 25.049 -10 ,18124 ,KEBNE ,17042022,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:10:07 CET,0.0 1.784 2.278 2.581 2.814 3.041 3.263 3.463 3.849 4.023 4.181 4.383 4.65 4.793 5.046 5.269 5.485 5.596 5.813 6.023 6.346 6.566 6.782 7.092 7.383 7.667 7.935 8.196 8.542 8.876 9.201 9.587 9.961 10.328 10.75 11.214 11.659 12.159 12.709 13.306 13.953 14.698 15.571 16.451 17.472 18.645 20.05 21.627 23.531 25.914 28.914 31.451 32.951 33.922 34.552 34.961 35.248 35.48 35.544 35.503 35.445 35.374 35.305 35.209 35.104 35.007 34.907 34.801 34.688 34.563 34.399 34.258 34.115 33.941 33.81 33.664 33.501 33.359 33.222 33.108 32.975 32.758 32.599 32.436 32.358 32.194 32.016 31.835 31.732 31.533 31.396 31.274 31.141 30.849 30.649 30.39 30.119 29.799 29.358 28.811 26.479 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_27_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_27_25.txt deleted file mode 100644 index e8825dc0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_27_25.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,8476 ,KEBNE ,16653540,Mon Nov 22 03:15:12 CET,Mon Nov 22 04:57:27 CET,0.0 1.32 1.569 1.763 1.923 2.076 2.211 2.304 2.464 2.55 2.638 2.692 2.904 2.986 3.14 3.276 3.382 3.428 3.538 3.649 3.788 3.87 3.943 4.049 4.166 4.273 4.361 4.441 4.525 4.59 4.646 4.713 4.778 4.833 4.887 4.939 4.998 5.105 5.185 5.198 5.211 5.23 5.217 5.151 5.043 4.894 4.658 4.303 3.739 2.764 1.115 -0.923 -2.605 -3.939 -5.069 -6.122 -7.052 -7.847 -8.559 -9.32 -9.978 -10.562 -11.124 -11.625 -12.088 -12.556 -13.057 -13.48 -13.818 -14.165 -14.507 -14.782 -15.08 -15.399 -15.657 -15.927 -16.188 -16.445 -16.718 -16.913 -17.104 -17.399 -17.613 -17.858 -17.985 -18.216 -18.45 -18.679 -18.794 -19.061 -19.188 -19.332 -19.484 -19.842 -20.064 -20.302 -20.53 -20.793 -21.109 -21.462 -25.6 -3 ,4380 ,KEBNE ,16653541,Mon Nov 22 03:15:14 CET,Mon Nov 22 04:53:19 CET,0.0 1.339 1.593 1.749 1.914 2.069 2.172 2.261 2.454 2.548 2.624 2.631 2.82 2.872 2.99 3.114 3.23 3.28 3.37 3.467 3.601 3.683 3.757 3.866 3.971 4.05 4.128 4.204 4.28 4.369 4.468 4.561 4.642 4.703 4.758 4.864 4.998 5.155 5.294 5.385 5.439 5.515 5.559 5.504 5.493 5.472 5.322 5.027 4.556 3.721 2.155 -0.001 -1.998 -3.565 -4.835 -6.029 -7.11 -8.027 -8.755 -9.497 -10.188 -10.833 -11.425 -11.973 -12.495 -12.956 -13.414 -13.847 -14.228 -14.602 -14.964 -15.286 -15.635 -15.973 -16.248 -16.539 -16.849 -17.187 -17.532 -17.744 -17.977 -18.351 -18.6 -18.878 -19.022 -19.278 -19.515 -19.78 -19.943 -20.277 -20.484 -20.666 -20.867 -21.305 -21.549 -21.795 -22.071 -22.426 -22.859 -23.388 -25.549 -4 ,9001 ,KEBNE ,16653542,Mon Nov 22 03:15:15 CET,Mon Nov 22 04:57:57 CET,0.0 0.638 0.881 1.036 1.173 1.288 1.383 1.466 1.622 1.702 1.78 1.79 1.992 2.062 2.201 2.351 2.486 2.542 2.638 2.744 2.921 3.022 3.113 3.258 3.391 3.505 3.622 3.743 3.894 4.028 4.152 4.298 4.428 4.533 4.633 4.757 4.897 5.028 5.147 5.254 5.361 5.493 5.614 5.712 5.825 5.869 5.813 5.596 4.934 3.809 2.162 0.162 -1.572 -3.176 -4.619 -5.922 -7.093 -8.099 -8.931 -9.777 -10.488 -11.128 -11.717 -12.252 -12.748 -13.193 -13.648 -14.038 -14.39 -14.787 -15.217 -15.59 -15.944 -16.294 -16.583 -16.876 -17.175 -17.502 -17.852 -18.089 -18.326 -18.701 -18.953 -19.191 -19.299 -19.514 -19.75 -20.0 -20.16 -20.519 -20.816 -21.052 -21.313 -21.852 -22.134 -22.426 -22.707 -23.011 -23.36 -23.9 -31.209 -5 ,28822 ,KEBNE ,16653543,Mon Nov 22 03:16:13 CET,Mon Nov 22 04:57:31 CET,0.0 1.154 1.424 1.575 1.699 1.844 2.001 2.132 2.341 2.425 2.504 2.54 2.745 2.811 2.928 3.031 3.134 3.182 3.263 3.351 3.48 3.556 3.634 3.755 3.862 3.955 4.064 4.167 4.282 4.396 4.502 4.604 4.671 4.714 4.757 4.825 4.936 5.081 5.213 5.286 5.316 5.377 5.413 5.381 5.3 5.143 4.892 4.534 3.796 2.525 0.639 -1.578 -3.556 -5.284 -6.747 -8.019 -9.012 -9.83 -10.512 -11.21 -11.825 -12.348 -12.849 -13.316 -13.758 -14.175 -14.641 -15.105 -15.503 -15.906 -16.326 -16.668 -17.033 -17.425 -17.702 -17.985 -18.293 -18.592 -18.903 -19.118 -19.341 -19.702 -19.945 -20.195 -20.326 -20.6 -20.922 -21.264 -21.436 -21.752 -21.919 -22.099 -22.311 -22.802 -23.075 -23.358 -23.688 -24.067 -24.485 -25.149 -27.852 -6 ,3329 ,KEBNE ,16653544,Mon Nov 22 03:16:13 CET,Mon Nov 22 04:57:14 CET,0.0 0.751 0.929 1.097 1.267 1.4 1.495 1.577 1.766 1.869 1.956 1.987 2.204 2.277 2.398 2.529 2.665 2.723 2.827 2.915 3.049 3.151 3.242 3.363 3.493 3.622 3.739 3.833 3.945 4.051 4.157 4.291 4.415 4.504 4.574 4.654 4.714 4.782 4.868 4.934 4.985 5.029 5.086 5.117 5.054 4.906 4.629 4.194 3.567 2.597 0.888 -1.226 -3.107 -4.853 -6.374 -7.623 -8.7 -9.694 -10.543 -11.354 -12.036 -12.671 -13.265 -13.833 -14.356 -14.818 -15.318 -15.772 -16.142 -16.528 -16.941 -17.281 -17.662 -18.08 -18.41 -18.754 -19.102 -19.465 -19.836 -20.068 -20.288 -20.638 -20.891 -21.161 -21.303 -21.593 -21.905 -22.239 -22.413 -22.767 -23.088 -23.341 -23.604 -24.162 -24.467 -24.799 -25.173 -25.635 -26.126 -26.768 -29.741 -7 ,1472 ,KEBNE ,16653545,Mon Nov 22 03:16:12 CET,Mon Nov 22 04:58:46 CET,0.0 0.665 0.86 1.022 1.166 1.282 1.39 1.5 1.693 1.786 1.875 1.908 2.105 2.176 2.318 2.435 2.555 2.607 2.711 2.821 2.953 3.036 3.118 3.24 3.355 3.452 3.541 3.625 3.729 3.837 3.934 4.018 4.11 4.211 4.326 4.424 4.497 4.592 4.669 4.723 4.731 4.703 4.662 4.56 4.343 4.062 3.678 3.093 2.222 0.896 -1.36 -4.059 -6.29 -8.038 -9.368 -10.576 -11.614 -12.545 -13.37 -14.193 -14.846 -15.389 -15.877 -16.309 -16.737 -17.123 -17.541 -17.942 -18.295 -18.638 -18.984 -19.287 -19.583 -19.871 -20.085 -20.32 -20.557 -20.786 -21.049 -21.234 -21.425 -21.717 -21.925 -22.146 -22.246 -22.446 -22.685 -22.953 -23.099 -23.383 -23.486 -23.624 -23.784 -24.127 -24.295 -24.513 -24.778 -25.026 -25.323 -25.733 -29.292 -8 ,21767 ,KEBNE ,16653546,Mon Nov 22 03:16:12 CET,Mon Nov 22 04:58:23 CET,0.0 1.6 1.82 1.997 2.134 2.249 2.39 2.523 2.713 2.797 2.882 2.917 3.111 3.172 3.271 3.36 3.444 3.486 3.585 3.69 3.831 3.915 3.989 4.103 4.215 4.305 4.369 4.435 4.539 4.643 4.745 4.864 4.956 5.037 5.125 5.211 5.287 5.392 5.565 5.717 5.786 5.816 5.815 5.814 5.791 5.694 5.505 5.185 4.732 4.046 2.599 0.729 -0.773 -2.006 -3.05 -4.025 -4.881 -5.69 -6.411 -7.105 -7.759 -8.339 -8.878 -9.407 -9.892 -10.319 -10.742 -11.089 -11.371 -11.686 -12.019 -12.3 -12.591 -12.877 -13.104 -13.332 -13.567 -13.816 -14.062 -14.23 -14.399 -14.699 -14.927 -15.137 -15.243 -15.501 -15.793 -16.09 -16.24 -16.544 -16.766 -16.937 -17.112 -17.543 -17.773 -18.016 -18.293 -18.624 -19.043 -19.585 -24.423 -9 ,9436 ,KEBNE ,16653547,Mon Nov 22 03:16:12 CET,Mon Nov 22 04:58:04 CET,0.0 1.405 1.635 1.788 1.927 2.051 2.151 2.252 2.424 2.498 2.571 2.596 2.795 2.871 3.013 3.129 3.227 3.282 3.388 3.484 3.61 3.687 3.766 3.872 3.972 4.074 4.164 4.242 4.339 4.436 4.531 4.633 4.712 4.807 4.925 5.004 5.061 5.125 5.191 5.232 5.23 5.217 5.226 5.21 5.13 5.014 4.918 4.694 4.118 3.172 1.521 -0.476 -2.17 -3.616 -4.787 -5.84 -6.817 -7.714 -8.527 -9.346 -10.004 -10.535 -11.02 -11.499 -11.978 -12.442 -12.867 -13.229 -13.571 -13.934 -14.317 -14.637 -14.965 -15.316 -15.586 -15.861 -16.145 -16.433 -16.756 -16.989 -17.231 -17.621 -17.891 -18.168 -18.306 -18.584 -18.876 -19.189 -19.37 -19.715 -19.962 -20.159 -20.385 -20.889 -21.164 -21.464 -21.802 -22.199 -22.689 -23.383 -27.165 -10 ,14675 ,KEBNE ,16653548,Mon Nov 22 03:16:16 CET,Mon Nov 22 04:58:11 CET,0.0 0.908 1.125 1.284 1.458 1.619 1.734 1.848 2.079 2.182 2.272 2.305 2.499 2.556 2.685 2.806 2.912 2.965 3.076 3.184 3.329 3.418 3.507 3.628 3.732 3.823 3.908 3.999 4.126 4.249 4.364 4.494 4.612 4.726 4.865 5.021 5.152 5.296 5.436 5.557 5.697 5.836 5.928 5.969 6.008 6.067 6.043 5.786 5.256 4.184 2.076 -0.478 -2.565 -4.267 -5.753 -7.092 -8.246 -9.247 -10.06 -10.831 -11.489 -12.074 -12.564 -13.003 -13.445 -13.843 -14.255 -14.639 -14.974 -15.322 -15.679 -15.981 -16.291 -16.602 -16.853 -17.112 -17.365 -17.617 -17.883 -18.061 -18.249 -18.561 -18.762 -18.998 -19.131 -19.384 -19.632 -19.882 -20.028 -20.347 -20.586 -20.797 -20.988 -21.352 -21.58 -21.83 -22.114 -22.469 -22.92 -23.594 -27.464 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_28_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_28_21.txt deleted file mode 100644 index 2878739c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_28_21.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12246 ,KEBNE ,16653549,Mon Nov 22 03:17:14 CET,Mon Nov 22 04:59:33 CET,0.0 2.542 3.048 3.394 3.647 3.834 3.98 4.094 4.31 4.42 4.511 4.621 4.764 4.841 5.005 5.165 5.301 5.358 5.458 5.551 5.675 5.754 5.828 5.92 6.011 6.105 6.196 6.303 6.438 6.554 6.652 6.756 6.851 6.932 7.019 7.099 7.148 7.193 7.236 7.23 7.258 7.287 7.243 7.151 6.979 6.783 6.504 6.053 5.351 4.245 2.318 0.019 -1.841 -3.378 -4.716 -5.952 -7.003 -7.916 -8.726 -9.557 -10.257 -10.852 -11.388 -11.873 -12.338 -12.775 -13.2 -13.572 -13.889 -14.219 -14.571 -14.883 -15.206 -15.512 -15.745 -15.99 -16.242 -16.498 -16.761 -16.939 -17.134 -17.451 -17.671 -17.916 -18.045 -18.316 -18.595 -18.878 -19.022 -19.26 -19.52 -19.694 -19.865 -20.239 -20.44 -20.66 -20.91 -21.181 -21.479 -21.844 -22.97 -2 ,18619 ,KEBNE ,16653550,Mon Nov 22 03:16:13 CET,Mon Nov 22 04:59:30 CET,0.0 0.659 0.905 1.104 1.235 1.35 1.462 1.549 1.717 1.802 1.874 1.934 2.057 2.134 2.267 2.368 2.468 2.519 2.619 2.714 2.855 2.948 3.024 3.118 3.198 3.282 3.369 3.438 3.548 3.668 3.758 3.852 3.955 4.046 4.141 4.212 4.266 4.354 4.429 4.485 4.523 4.548 4.547 4.506 4.413 4.202 3.831 3.255 2.401 1.131 -0.999 -3.581 -5.643 -7.297 -8.682 -9.942 -11.052 -12.072 -12.96 -13.841 -14.573 -15.199 -15.784 -16.335 -16.849 -17.312 -17.792 -18.227 -18.606 -18.994 -19.394 -19.723 -20.057 -20.381 -20.628 -20.896 -21.17 -21.455 -21.757 -21.964 -22.173 -22.489 -22.698 -22.917 -23.028 -23.26 -23.512 -23.756 -23.884 -24.11 -24.329 -24.489 -24.651 -25.01 -25.203 -25.394 -25.608 -25.83 -26.077 -26.366 -26.882 -3 ,21206 ,KEBNE ,16653551,Mon Nov 22 03:16:13 CET,Mon Nov 22 04:57:35 CET,0.0 0.927 1.209 1.425 1.592 1.741 1.85 1.951 2.19 2.291 2.361 2.439 2.566 2.638 2.78 2.912 3.029 3.083 3.188 3.282 3.4 3.478 3.567 3.692 3.797 3.894 3.98 4.063 4.16 4.25 4.342 4.442 4.518 4.577 4.654 4.739 4.804 4.858 4.895 4.92 4.926 4.926 4.938 4.904 4.789 4.569 4.242 3.802 3.096 1.999 0.153 -2.215 -4.167 -5.748 -7.086 -8.242 -9.237 -10.148 -10.927 -11.704 -12.34 -12.88 -13.418 -13.953 -14.456 -14.894 -15.313 -15.683 -16.018 -16.365 -16.71 -16.982 -17.28 -17.589 -17.814 -18.06 -18.311 -18.563 -18.819 -18.987 -19.163 -19.444 -19.638 -19.848 -19.96 -20.191 -20.456 -20.75 -20.888 -21.097 -21.291 -21.445 -21.595 -21.891 -22.067 -22.248 -22.47 -22.745 -23.027 -23.352 -24.207 -5 ,5818 ,KEBNE ,16653553,Mon Nov 22 03:17:14 CET,Mon Nov 22 04:58:49 CET,0.0 0.957 1.301 1.517 1.672 1.824 1.976 2.121 2.365 2.471 2.572 2.684 2.819 2.894 3.041 3.185 3.317 3.382 3.483 3.549 3.644 3.715 3.783 3.865 3.958 4.06 4.149 4.221 4.304 4.39 4.468 4.561 4.63 4.675 4.743 4.851 4.961 5.048 5.102 5.115 5.1 5.084 5.074 5.084 5.039 4.868 4.557 4.103 3.352 2.15 0.115 -2.265 -4.144 -5.759 -7.139 -8.354 -9.411 -10.354 -11.112 -11.822 -12.414 -12.937 -13.468 -13.975 -14.421 -14.814 -15.235 -15.613 -15.932 -16.252 -16.569 -16.837 -17.122 -17.407 -17.622 -17.845 -18.076 -18.327 -18.587 -18.765 -18.942 -19.21 -19.422 -19.639 -19.741 -19.953 -20.162 -20.385 -20.518 -20.737 -20.928 -21.07 -21.22 -21.51 -21.66 -21.83 -22.029 -22.248 -22.491 -22.8 -23.448 -6 ,27032 ,KEBNE ,16653554,Mon Nov 22 03:17:14 CET,Mon Nov 22 04:59:41 CET,0.0 1.154 1.422 1.581 1.704 1.817 1.912 1.996 2.164 2.245 2.324 2.409 2.534 2.601 2.734 2.843 2.916 2.95 3.02 3.083 3.177 3.24 3.302 3.402 3.491 3.563 3.626 3.682 3.764 3.856 3.945 4.027 4.076 4.12 4.186 4.256 4.296 4.318 4.344 4.366 4.343 4.306 4.241 4.124 3.965 3.734 3.352 2.811 1.994 0.722 -1.366 -3.864 -5.865 -7.528 -8.907 -10.097 -11.112 -12.004 -12.746 -13.474 -14.108 -14.661 -15.215 -15.741 -16.204 -16.639 -17.097 -17.5 -17.861 -18.254 -18.642 -18.961 -19.302 -19.645 -19.91 -20.18 -20.444 -20.713 -21.016 -21.23 -21.441 -21.749 -21.963 -22.186 -22.294 -22.537 -22.82 -23.118 -23.272 -23.502 -23.773 -23.974 -24.165 -24.561 -24.77 -24.974 -25.205 -25.465 -25.781 -26.21 -27.63 -7 ,10283 ,KEBNE ,16653555,Mon Nov 22 03:17:14 CET,Mon Nov 22 04:59:17 CET,0.0 0.82 1.07 1.259 1.407 1.554 1.689 1.8 1.966 2.038 2.112 2.182 2.3 2.359 2.464 2.545 2.631 2.685 2.789 2.866 2.945 2.994 3.048 3.141 3.23 3.301 3.372 3.436 3.507 3.58 3.642 3.696 3.741 3.787 3.845 3.878 3.902 3.941 3.947 3.93 3.9 3.845 3.754 3.624 3.44 3.18 2.799 2.3 1.526 0.24 -1.862 -4.35 -6.382 -8.078 -9.507 -10.737 -11.804 -12.744 -13.528 -14.325 -15.044 -15.702 -16.288 -16.801 -17.276 -17.716 -18.179 -18.581 -18.92 -19.261 -19.616 -19.906 -20.197 -20.51 -20.761 -21.013 -21.284 -21.576 -21.863 -22.055 -22.26 -22.57 -22.767 -22.967 -23.072 -23.285 -23.53 -23.794 -23.931 -24.161 -24.354 -24.492 -24.638 -24.929 -25.074 -25.246 -25.442 -25.646 -25.899 -26.302 -27.924 -9 ,26473 ,KEBNE ,16653557,Mon Nov 22 03:17:14 CET,Mon Nov 22 04:58:27 CET,0.0 2.394 2.905 3.235 3.459 3.617 3.749 3.88 4.139 4.248 4.343 4.453 4.588 4.655 4.78 4.912 5.049 5.119 5.251 5.36 5.534 5.662 5.776 5.925 6.055 6.166 6.271 6.358 6.468 6.588 6.689 6.783 6.847 6.901 6.96 7.028 7.097 7.173 7.227 7.269 7.321 7.341 7.296 7.211 7.119 6.994 6.748 6.311 5.63 4.506 2.455 -0.055 -2.119 -3.84 -5.309 -6.642 -7.798 -8.803 -9.654 -10.507 -11.223 -11.845 -12.435 -12.993 -13.523 -13.98 -14.441 -14.858 -15.203 -15.56 -15.923 -16.232 -16.551 -16.853 -17.086 -17.334 -17.584 -17.842 -18.108 -18.295 -18.487 -18.789 -19.007 -19.23 -19.34 -19.574 -19.825 -20.088 -20.222 -20.445 -20.681 -20.844 -21.0 -21.348 -21.538 -21.739 -21.953 -22.168 -22.396 -22.765 -23.872 -10 ,28784 ,KEBNE ,16653558,Mon Nov 22 03:17:14 CET,Mon Nov 22 04:59:16 CET,0.0 0.798 1.07 1.274 1.432 1.573 1.706 1.823 2.029 2.113 2.182 2.259 2.385 2.45 2.569 2.686 2.791 2.838 2.934 3.018 3.14 3.229 3.306 3.412 3.514 3.595 3.651 3.71 3.8 3.871 3.909 3.962 4.027 4.074 4.12 4.151 4.187 4.222 4.24 4.24 4.219 4.179 4.107 3.988 3.826 3.651 3.341 2.891 2.184 0.991 -0.986 -3.277 -5.197 -6.849 -8.299 -9.569 -10.637 -11.579 -12.391 -13.213 -13.919 -14.554 -15.154 -15.705 -16.219 -16.694 -17.178 -17.603 -17.952 -18.293 -18.656 -18.961 -19.264 -19.575 -19.812 -20.06 -20.316 -20.584 -20.865 -21.057 -21.257 -21.577 -21.791 -21.998 -22.11 -22.331 -22.552 -22.78 -22.899 -23.097 -23.263 -23.392 -23.52 -23.837 -24.013 -24.187 -24.4 -24.648 -24.978 -25.453 -26.704 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_28_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_28_26.txt deleted file mode 100644 index 6cc1545e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_28_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7781 ,KEBNE ,16653559,Mon Nov 22 03:17:18 CET,Mon Nov 22 04:57:37 CET,0.0 0.582 0.814 1.054 1.281 1.456 1.62 1.792 2.099 2.24 2.37 2.516 2.682 2.791 3.009 3.201 3.367 3.451 3.616 3.765 3.975 4.099 4.215 4.397 4.589 4.762 4.922 5.084 5.291 5.501 5.699 5.922 6.142 6.355 6.599 6.863 7.089 7.33 7.586 7.831 8.081 8.386 8.717 8.959 9.159 9.279 9.277 9.129 8.804 8.321 7.351 5.982 4.66 3.452 2.428 1.515 0.727 0.001 -0.61 -1.212 -1.737 -2.203 -2.632 -3.039 -3.413 -3.748 -4.106 -4.415 -4.673 -4.95 -5.253 -5.492 -5.733 -5.991 -6.186 -6.382 -6.58 -6.787 -7.008 -7.156 -7.306 -7.535 -7.688 -7.85 -7.935 -8.099 -8.274 -8.479 -8.585 -8.758 -8.915 -9.045 -9.174 -9.441 -9.588 -9.751 -9.919 -10.105 -10.313 -10.526 -11.334 -2 ,8401 ,KEBNE ,16653560,Mon Nov 22 03:17:18 CET,Mon Nov 22 04:58:17 CET,0.0 0.906 1.133 1.303 1.47 1.632 1.778 1.918 2.179 2.288 2.393 2.535 2.697 2.777 2.923 3.066 3.184 3.246 3.376 3.493 3.651 3.743 3.826 3.948 4.062 4.179 4.293 4.396 4.531 4.66 4.794 4.952 5.092 5.237 5.425 5.641 5.829 6.006 6.166 6.348 6.541 6.714 6.903 7.085 7.258 7.389 7.481 7.408 7.098 6.454 5.146 3.49 2.088 0.867 -0.213 -1.217 -2.08 -2.826 -3.457 -4.074 -4.641 -5.166 -5.661 -6.119 -6.541 -6.926 -7.304 -7.643 -7.952 -8.272 -8.603 -8.878 -9.152 -9.43 -9.651 -9.879 -10.113 -10.352 -10.593 -10.757 -10.94 -11.231 -11.436 -11.659 -11.772 -11.994 -12.217 -12.447 -12.555 -12.734 -12.882 -13.012 -13.147 -13.408 -13.547 -13.692 -13.868 -14.068 -14.264 -14.497 -15.262 -3 ,2204 ,KEBNE ,16653561,Mon Nov 22 03:17:14 CET,Mon Nov 22 04:59:34 CET,0.0 0.515 0.724 0.882 1.013 1.119 1.231 1.342 1.541 1.623 1.708 1.837 1.98 2.054 2.191 2.307 2.42 2.485 2.62 2.747 2.922 3.015 3.104 3.245 3.376 3.495 3.612 3.73 3.871 4.001 4.125 4.271 4.419 4.552 4.712 4.9 5.05 5.209 5.39 5.573 5.729 5.859 5.969 6.062 6.124 6.176 6.208 6.12 5.832 5.116 3.649 1.731 0.177 -1.24 -2.518 -3.62 -4.551 -5.373 -6.076 -6.783 -7.376 -7.901 -8.445 -8.946 -9.389 -9.808 -10.219 -10.57 -10.871 -11.19 -11.537 -11.821 -12.106 -12.379 -12.575 -12.776 -12.98 -13.198 -13.453 -13.634 -13.81 -14.078 -14.26 -14.432 -14.522 -14.719 -14.938 -15.161 -15.272 -15.469 -15.63 -15.759 -15.896 -16.182 -16.341 -16.515 -16.73 -16.934 -17.122 -17.457 -18.417 -4 ,29463 ,KEBNE ,16653562,Mon Nov 22 03:17:14 CET,Mon Nov 22 05:00:56 CET,0.0 0.8 1.114 1.358 1.53 1.655 1.771 1.893 2.118 2.202 2.272 2.363 2.507 2.58 2.734 2.888 3.032 3.093 3.197 3.307 3.474 3.569 3.65 3.78 3.899 4.003 4.095 4.185 4.303 4.419 4.527 4.64 4.743 4.833 4.938 5.063 5.185 5.309 5.428 5.557 5.684 5.808 5.956 6.097 6.227 6.343 6.42 6.348 5.99 5.388 4.337 2.769 1.362 0.169 -0.862 -1.762 -2.524 -3.213 -3.806 -4.392 -4.89 -5.339 -5.769 -6.171 -6.564 -6.93 -7.31 -7.663 -7.969 -8.287 -8.608 -8.879 -9.157 -9.424 -9.633 -9.847 -10.07 -10.295 -10.524 -10.685 -10.86 -11.126 -11.297 -11.473 -11.554 -11.732 -11.949 -12.168 -12.273 -12.461 -12.623 -12.752 -12.868 -13.1 -13.221 -13.349 -13.496 -13.664 -13.832 -14.009 -14.5 -5 ,8927 ,KEBNE ,16653563,Mon Nov 22 03:17:14 CET,Mon Nov 22 05:00:24 CET,0.0 0.437 0.632 0.787 0.925 1.054 1.175 1.304 1.534 1.635 1.73 1.836 1.98 2.062 2.217 2.36 2.481 2.539 2.653 2.765 2.932 3.037 3.138 3.289 3.432 3.546 3.646 3.747 3.881 3.999 4.107 4.243 4.374 4.511 4.66 4.813 4.959 5.108 5.257 5.414 5.57 5.733 5.885 6.003 6.126 6.242 6.295 6.222 5.975 5.489 4.494 3.084 1.744 0.449 -0.703 -1.756 -2.717 -3.558 -4.232 -4.9 -5.475 -5.994 -6.478 -6.947 -7.397 -7.788 -8.179 -8.535 -8.858 -9.185 -9.508 -9.767 -10.028 -10.313 -10.548 -10.791 -11.033 -11.281 -11.54 -11.717 -11.899 -12.185 -12.383 -12.583 -12.685 -12.907 -13.159 -13.417 -13.553 -13.768 -13.968 -14.103 -14.227 -14.521 -14.699 -14.898 -15.098 -15.323 -15.614 -15.962 -16.703 -6 ,15186 ,KEBNE ,16653564,Mon Nov 22 03:17:14 CET,Mon Nov 22 04:59:31 CET,0.0 0.36 0.584 0.762 0.95 1.109 1.248 1.39 1.604 1.685 1.768 1.856 1.977 2.052 2.197 2.32 2.442 2.505 2.633 2.739 2.857 2.935 3.021 3.146 3.267 3.386 3.502 3.611 3.731 3.847 3.959 4.101 4.238 4.351 4.47 4.6 4.725 4.85 4.973 5.106 5.228 5.358 5.499 5.625 5.762 5.863 5.865 5.756 5.502 4.918 3.693 2.079 0.742 -0.429 -1.476 -2.377 -3.126 -3.785 -4.391 -5.036 -5.579 -6.057 -6.513 -6.933 -7.307 -7.635 -7.973 -8.29 -8.581 -8.898 -9.238 -9.507 -9.78 -10.065 -10.28 -10.506 -10.737 -10.979 -11.232 -11.402 -11.576 -11.845 -12.036 -12.239 -12.336 -12.529 -12.744 -12.956 -13.053 -13.247 -13.432 -13.571 -13.718 -14.056 -14.234 -14.421 -14.619 -14.821 -15.032 -15.331 -16.057 -7 ,15490 ,KEBNE ,16653565,Mon Nov 22 03:18:16 CET,Mon Nov 22 05:00:35 CET,0.0 0.586 0.758 0.889 1.02 1.126 1.224 1.319 1.502 1.6 1.695 1.822 1.975 2.06 2.185 2.282 2.382 2.431 2.528 2.628 2.787 2.878 2.959 3.076 3.194 3.313 3.437 3.572 3.748 3.92 4.082 4.257 4.411 4.535 4.669 4.829 4.962 5.103 5.263 5.415 5.556 5.697 5.823 5.915 6.029 6.12 6.116 5.967 5.535 4.766 3.444 1.74 0.386 -0.804 -1.961 -2.972 -3.805 -4.549 -5.187 -5.833 -6.41 -6.918 -7.4 -7.853 -8.262 -8.632 -9.01 -9.359 -9.668 -9.991 -10.321 -10.581 -10.845 -11.135 -11.356 -11.578 -11.819 -12.054 -12.292 -12.461 -12.628 -12.884 -13.076 -13.285 -13.394 -13.622 -13.869 -14.132 -14.269 -14.494 -14.717 -14.864 -15.017 -15.336 -15.512 -15.717 -15.944 -16.186 -16.448 -16.744 -17.46 -8 ,25767 ,KEBNE ,16653566,Mon Nov 22 03:18:16 CET,Mon Nov 22 05:00:44 CET,0.0 0.955 1.247 1.461 1.608 1.727 1.844 1.951 2.144 2.241 2.335 2.429 2.551 2.613 2.747 2.873 2.991 3.043 3.125 3.204 3.311 3.377 3.451 3.573 3.684 3.783 3.883 3.972 4.087 4.206 4.315 4.441 4.569 4.697 4.84 4.989 5.117 5.251 5.399 5.546 5.697 5.867 6.041 6.19 6.37 6.547 6.664 6.683 6.543 6.119 4.871 2.976 1.317 -0.123 -1.352 -2.461 -3.4 -4.271 -5.044 -5.788 -6.463 -7.089 -7.667 -8.173 -8.637 -9.064 -9.48 -9.842 -10.158 -10.475 -10.788 -11.042 -11.316 -11.619 -11.859 -12.115 -12.366 -12.593 -12.823 -12.991 -13.177 -13.452 -13.636 -13.826 -13.922 -14.12 -14.342 -14.577 -14.696 -14.883 -15.014 -15.135 -15.27 -15.555 -15.697 -15.858 -16.089 -16.373 -16.675 -17.013 -17.509 -9 ,20333 ,KEBNE ,16653567,Mon Nov 22 03:18:16 CET,Mon Nov 22 05:00:00 CET,0.0 0.645 0.887 1.066 1.196 1.333 1.461 1.576 1.783 1.886 1.983 2.069 2.197 2.262 2.384 2.5 2.625 2.69 2.792 2.879 3.024 3.123 3.221 3.357 3.471 3.572 3.676 3.786 3.908 4.017 4.136 4.285 4.421 4.55 4.695 4.843 4.961 5.081 5.252 5.442 5.593 5.715 5.837 5.92 5.95 5.901 5.81 5.621 5.108 4.207 2.616 0.536 -1.168 -2.548 -3.67 -4.72 -5.728 -6.66 -7.451 -8.215 -8.867 -9.442 -9.993 -10.513 -10.98 -11.392 -11.804 -12.169 -12.475 -12.789 -13.134 -13.425 -13.718 -14.01 -14.221 -14.441 -14.688 -14.935 -15.182 -15.351 -15.522 -15.815 -16.037 -16.246 -16.345 -16.56 -16.772 -16.996 -17.118 -17.315 -17.476 -17.598 -17.722 -17.984 -18.134 -18.306 -18.489 -18.67 -18.917 -19.304 -20.379 -10 ,18659 ,KEBNE ,16653568,Mon Nov 22 03:18:16 CET,Mon Nov 22 05:00:29 CET,0.0 0.74 1.053 1.292 1.478 1.629 1.767 1.901 2.163 2.288 2.404 2.559 2.738 2.841 3.042 3.245 3.409 3.483 3.635 3.77 3.968 4.088 4.2 4.358 4.507 4.66 4.803 4.958 5.167 5.337 5.487 5.676 5.858 6.028 6.221 6.418 6.599 6.788 6.96 7.134 7.317 7.53 7.776 7.98 8.135 8.163 8.05 7.854 7.507 6.839 5.534 3.82 2.424 1.226 0.199 -0.701 -1.518 -2.242 -2.852 -3.448 -3.973 -4.474 -4.977 -5.453 -5.898 -6.298 -6.714 -7.087 -7.385 -7.673 -7.981 -8.235 -8.493 -8.769 -8.978 -9.194 -9.415 -9.643 -9.892 -10.061 -10.23 -10.497 -10.685 -10.866 -10.956 -11.143 -11.328 -11.525 -11.626 -11.803 -11.952 -12.067 -12.18 -12.429 -12.567 -12.716 -12.876 -13.106 -13.367 -13.65 -14.411 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_29_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_29_25.txt deleted file mode 100644 index 2720b4a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_29_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,629 ,KEBNE ,17042023,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:09:34 CET,0.0 2.278 2.546 2.761 2.905 3.028 3.152 3.277 3.478 3.552 3.601 3.578 3.7 3.728 3.798 3.898 3.991 4.023 4.068 4.106 4.165 4.196 4.22 4.243 4.243 4.24 4.252 4.265 4.272 4.265 4.255 4.258 4.243 4.198 4.135 4.056 3.947 3.802 3.626 3.41 3.179 2.904 2.545 2.113 1.525 0.791 -0.31 -1.927 -4.186 -7.288 -11.722 -16.631 -20.514 -23.782 -26.453 -28.657 -30.552 -32.187 -33.488 -34.751 -35.82 -36.743 -37.583 -38.44 -39.286 -40.017 -40.746 -41.379 -41.936 -42.524 -43.122 -43.601 -44.099 -44.596 -44.959 -45.339 -45.713 -46.088 -46.496 -46.785 -47.085 -47.549 -47.864 -48.179 -48.348 -48.711 -49.085 -49.465 -49.663 -49.996 -50.242 -50.462 -50.689 -51.173 -51.423 -51.679 -51.969 -52.283 -52.646 -53.192 -56.642 -2 ,24728 ,KEBNE ,17042024,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:11:46 CET,0.0 1.75 2.082 2.294 2.46 2.616 2.742 2.845 3.014 3.09 3.159 3.208 3.357 3.397 3.477 3.564 3.639 3.672 3.733 3.806 3.874 3.887 3.902 3.945 3.986 4.016 4.035 4.033 4.019 4.02 4.032 4.027 4.005 3.963 3.908 3.83 3.717 3.643 3.592 3.441 3.184 2.823 2.347 1.809 1.106 0.253 -0.874 -2.332 -4.407 -7.568 -12.515 -17.979 -22.165 -25.461 -28.114 -30.422 -32.374 -34.045 -35.473 -36.896 -38.094 -39.156 -40.15 -41.053 -41.871 -42.591 -43.305 -43.896 -44.385 -44.906 -45.45 -45.906 -46.377 -46.853 -47.225 -47.59 -47.957 -48.34 -48.727 -48.985 -49.249 -49.676 -49.987 -50.337 -50.516 -50.877 -51.258 -51.63 -51.815 -52.156 -52.432 -52.666 -52.907 -53.399 -53.674 -53.974 -54.308 -54.681 -55.112 -55.693 -58.256 -3 ,14741 ,KEBNE ,17042025,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:12:01 CET,0.0 1.548 1.896 2.108 2.258 2.384 2.471 2.547 2.697 2.775 2.857 2.898 3.046 3.096 3.168 3.23 3.282 3.303 3.345 3.389 3.473 3.512 3.54 3.586 3.637 3.695 3.737 3.752 3.762 3.76 3.741 3.713 3.673 3.622 3.551 3.464 3.345 3.214 3.057 2.826 2.555 2.233 1.817 1.374 0.81 0.027 -1.06 -2.464 -4.426 -7.136 -11.264 -16.036 -19.645 -22.408 -24.609 -26.499 -28.05 -29.402 -30.548 -31.665 -32.616 -33.461 -34.249 -34.956 -35.582 -36.13 -36.702 -37.215 -37.659 -38.119 -38.574 -38.95 -39.359 -39.776 -40.1 -40.451 -40.803 -41.145 -41.497 -41.742 -41.997 -42.388 -42.658 -42.941 -43.084 -43.388 -43.699 -44.026 -44.202 -44.522 -44.737 -44.924 -45.122 -45.606 -45.883 -46.172 -46.456 -46.77 -47.169 -47.711 -50.144 -4 ,3346 ,KEBNE ,17042026,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:12:28 CET,0.0 4.169 4.473 4.665 4.851 5.049 5.197 5.292 5.466 5.547 5.613 5.636 5.787 5.84 5.914 5.979 6.053 6.093 6.164 6.233 6.331 6.389 6.435 6.465 6.479 6.497 6.516 6.539 6.545 6.528 6.511 6.474 6.442 6.414 6.356 6.276 6.211 6.132 6.009 5.827 5.561 5.154 4.649 4.122 3.389 2.456 1.204 -0.465 -2.713 -5.779 -10.396 -15.49 -19.369 -22.485 -25.079 -27.269 -29.105 -30.704 -32.039 -33.348 -34.439 -35.404 -36.341 -37.222 -38.019 -38.743 -39.494 -40.13 -40.657 -41.207 -41.774 -42.233 -42.708 -43.204 -43.588 -43.986 -44.381 -44.786 -45.219 -45.498 -45.791 -46.25 -46.558 -46.887 -47.06 -47.42 -47.798 -48.179 -48.369 -48.712 -48.973 -49.174 -49.375 -49.834 -50.103 -50.392 -50.733 -51.128 -51.557 -52.092 -54.279 -5 ,12554 ,KEBNE ,17042027,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:09:49 CET,0.0 1.338 1.623 1.84 2.005 2.14 2.24 2.333 2.496 2.57 2.652 2.689 2.832 2.885 2.964 3.031 3.089 3.113 3.163 3.206 3.241 3.254 3.278 3.333 3.372 3.387 3.406 3.426 3.442 3.444 3.434 3.421 3.415 3.395 3.356 3.279 3.17 3.045 2.886 2.683 2.45 2.188 1.856 1.441 0.855 0.055 -1.024 -2.344 -4.032 -6.465 -10.38 -14.723 -17.991 -20.559 -22.596 -24.434 -26.09 -27.533 -28.741 -29.951 -30.951 -31.824 -32.676 -33.438 -34.112 -34.724 -35.44 -36.14 -36.727 -37.317 -37.919 -38.4 -38.883 -39.413 -39.838 -40.263 -40.69 -41.128 -41.587 -41.91 -42.241 -42.75 -43.105 -43.479 -43.677 -44.082 -44.502 -44.948 -45.167 -45.541 -45.882 -46.128 -46.395 -46.964 -47.281 -47.629 -47.992 -48.417 -48.936 -49.551 -51.852 -6 ,3095 ,KEBNE ,17042028,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:11:43 CET,0.0 0.934 1.185 1.401 1.562 1.712 1.815 1.9 2.059 2.137 2.199 2.179 2.295 2.324 2.376 2.424 2.465 2.486 2.518 2.548 2.591 2.613 2.627 2.637 2.667 2.699 2.708 2.712 2.699 2.659 2.618 2.56 2.476 2.399 2.33 2.224 2.075 1.905 1.707 1.437 1.107 0.702 0.172 -0.405 -1.156 -2.093 -3.281 -4.818 -6.867 -9.757 -14.312 -19.306 -23.098 -26.187 -28.724 -30.886 -32.748 -34.433 -35.809 -37.12 -38.195 -39.098 -39.972 -40.807 -41.553 -42.187 -42.841 -43.449 -43.977 -44.506 -45.037 -45.471 -45.907 -46.351 -46.706 -47.065 -47.414 -47.765 -48.136 -48.395 -48.646 -49.033 -49.318 -49.616 -49.769 -50.08 -50.388 -50.733 -50.921 -51.251 -51.502 -51.707 -51.913 -52.384 -52.63 -52.856 -53.127 -53.45 -53.849 -54.398 -57.545 -7 ,8494 ,KEBNE ,17042029,Thu Dec 23 03:30:04 CET,Thu Dec 23 05:10:30 CET,0.0 0.986 1.187 1.376 1.582 1.766 1.869 1.94 2.109 2.194 2.249 2.25 2.391 2.442 2.535 2.61 2.663 2.683 2.73 2.774 2.841 2.874 2.89 2.9 2.91 2.929 2.941 2.953 2.965 2.967 2.963 2.935 2.888 2.838 2.781 2.672 2.533 2.366 2.173 1.943 1.671 1.324 0.868 0.336 -0.36 -1.203 -2.318 -3.842 -6.013 -9.04 -13.658 -18.647 -22.238 -24.923 -27.11 -29.012 -30.573 -31.921 -33.048 -34.168 -35.146 -35.961 -36.675 -37.345 -37.971 -38.578 -39.225 -39.776 -40.241 -40.711 -41.192 -41.611 -42.048 -42.488 -42.818 -43.159 -43.502 -43.83 -44.173 -44.411 -44.652 -45.03 -45.304 -45.586 -45.724 -46.017 -46.328 -46.683 -46.883 -47.242 -47.541 -47.764 -48.0 -48.46 -48.712 -49.019 -49.394 -49.809 -50.282 -50.85 -52.94 -8 ,4652 ,KEBNE ,17042030,Thu Dec 23 03:30:05 CET,Thu Dec 23 05:10:09 CET,0.0 1.913 2.289 2.543 2.74 2.91 3.057 3.181 3.371 3.439 3.509 3.566 3.725 3.777 3.878 3.956 4.027 4.054 4.092 4.126 4.179 4.213 4.248 4.297 4.337 4.363 4.352 4.336 4.321 4.303 4.284 4.244 4.183 4.113 4.033 3.933 3.81 3.68 3.545 3.365 3.132 2.81 2.378 1.928 1.368 0.654 -0.276 -1.565 -3.367 -5.848 -9.711 -13.843 -16.921 -19.371 -21.465 -23.294 -24.815 -26.204 -27.37 -28.452 -29.371 -30.178 -30.903 -31.578 -32.21 -32.777 -33.346 -33.867 -34.336 -34.805 -35.322 -35.781 -36.261 -36.758 -37.106 -37.448 -37.792 -38.135 -38.488 -38.726 -38.977 -39.38 -39.657 -39.939 -40.096 -40.43 -40.775 -41.145 -41.335 -41.656 -41.898 -42.119 -42.348 -42.796 -43.044 -43.337 -43.623 -43.962 -44.373 -44.897 -46.817 -9 ,27846 ,KEBNE ,17042031,Thu Dec 23 03:36:17 CET,Thu Dec 23 05:17:30 CET,0.0 1.673 2.0 2.277 2.477 2.62 2.746 2.857 3.038 3.122 3.198 3.236 3.383 3.432 3.504 3.579 3.664 3.696 3.749 3.786 3.834 3.877 3.901 3.918 3.953 3.977 3.984 3.998 4.01 3.984 3.958 3.933 3.891 3.845 3.786 3.68 3.524 3.34 3.133 2.907 2.644 2.302 1.887 1.349 0.553 -0.385 -1.6 -3.193 -5.325 -8.36 -13.033 -18.1 -21.986 -25.079 -27.631 -29.786 -31.61 -33.201 -34.545 -35.867 -36.959 -37.914 -38.793 -39.614 -40.38 -41.079 -41.82 -42.473 -43.025 -43.58 -44.129 -44.582 -45.046 -45.513 -45.872 -46.248 -46.621 -46.994 -47.39 -47.656 -47.931 -48.362 -48.662 -48.973 -49.125 -49.429 -49.737 -50.074 -50.264 -50.596 -50.832 -51.043 -51.265 -51.705 -51.941 -52.212 -52.526 -52.883 -53.265 -53.766 -57.22 -10 ,32632 ,KEBNE ,17042032,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:17:16 CET,0.0 1.191 1.448 1.6 1.713 1.809 1.918 2.044 2.225 2.286 2.338 2.338 2.48 2.523 2.598 2.672 2.744 2.775 2.823 2.879 2.959 3.004 3.04 3.068 3.102 3.127 3.133 3.132 3.128 3.122 3.114 3.088 3.049 3.005 2.947 2.863 2.756 2.656 2.545 2.399 2.238 2.004 1.658 1.287 0.776 0.09 -0.814 -2.007 -3.671 -6.058 -9.907 -14.11 -17.194 -19.742 -21.856 -23.744 -25.37 -26.762 -27.955 -29.122 -30.07 -30.932 -31.807 -32.642 -33.419 -34.126 -34.841 -35.446 -35.96 -36.498 -37.064 -37.535 -38.021 -38.512 -38.869 -39.23 -39.611 -40.018 -40.447 -40.736 -41.038 -41.527 -41.874 -42.223 -42.39 -42.729 -43.096 -43.493 -43.711 -44.081 -44.363 -44.581 -44.801 -45.282 -45.555 -45.842 -46.173 -46.56 -47.039 -47.645 -50.591 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_29_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_29_33.txt deleted file mode 100644 index 734ea42a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_29_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7929 ,KEBNE ,17042033,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:15:52 CET,0.0 0.855 1.061 1.221 1.361 1.469 1.584 1.69 1.843 1.918 1.989 2.054 2.219 2.293 2.437 2.554 2.68 2.744 2.855 2.961 3.116 3.218 3.325 3.474 3.607 3.736 3.853 3.967 4.113 4.247 4.386 4.547 4.695 4.854 5.056 5.292 5.513 5.756 6.04 6.337 6.616 6.939 7.318 7.677 8.095 8.567 9.106 9.721 10.399 11.08 11.838 12.377 12.637 12.686 12.587 12.426 12.248 12.034 11.824 11.635 11.476 11.309 11.142 10.995 10.854 10.717 10.556 10.394 10.261 10.122 9.948 9.8 9.653 9.496 9.383 9.266 9.135 9.008 8.88 8.773 8.655 8.479 8.359 8.247 8.186 8.051 7.911 7.739 7.647 7.481 7.391 7.297 7.196 6.967 6.815 6.652 6.481 6.275 6.019 5.719 4.734 -2 ,9712 ,KEBNE ,17042035,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:16:15 CET,0.0 1.165 1.409 1.619 1.792 1.927 2.059 2.171 2.36 2.472 2.583 2.685 2.858 2.928 3.079 3.24 3.385 3.451 3.578 3.703 3.88 3.994 4.111 4.281 4.435 4.569 4.706 4.844 5.024 5.202 5.365 5.552 5.729 5.919 6.173 6.46 6.721 6.997 7.293 7.602 7.919 8.301 8.748 9.169 9.681 10.281 10.94 11.702 12.58 13.536 14.6 15.267 15.513 15.536 15.452 15.335 15.211 15.09 14.972 14.784 14.592 14.424 14.257 14.11 13.956 13.815 13.659 13.514 13.394 13.273 13.146 13.033 12.917 12.779 12.667 12.55 12.432 12.319 12.19 12.094 12.002 11.859 11.745 11.609 11.536 11.388 11.241 11.114 11.046 10.877 10.787 10.679 10.553 10.352 10.242 10.096 9.947 9.775 9.554 9.186 8.285 -3 ,4999 ,KEBNE ,17042036,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:17:42 CET,0.0 1.095 1.342 1.505 1.654 1.791 1.902 2.033 2.281 2.371 2.448 2.488 2.645 2.708 2.834 2.971 3.105 3.167 3.289 3.401 3.564 3.666 3.764 3.911 4.048 4.176 4.286 4.388 4.538 4.694 4.839 5.005 5.174 5.344 5.533 5.748 5.966 6.201 6.441 6.696 6.952 7.241 7.596 7.95 8.356 8.816 9.386 10.062 10.793 11.59 12.524 13.052 13.108 13.03 12.886 12.709 12.502 12.3 12.118 11.906 11.713 11.526 11.333 11.157 11.003 10.858 10.699 10.542 10.403 10.261 10.106 9.981 9.853 9.71 9.596 9.476 9.35 9.21 9.054 8.948 8.832 8.659 8.535 8.394 8.322 8.18 8.038 7.878 7.788 7.614 7.514 7.423 7.317 7.022 6.862 6.681 6.511 6.353 6.145 5.88 5.102 -4 ,12789 ,KEBNE ,17042037,Thu Dec 23 03:36:17 CET,Thu Dec 23 05:16:15 CET,0.0 0.611 0.805 0.971 1.14 1.282 1.396 1.513 1.703 1.781 1.869 1.946 2.098 2.159 2.273 2.395 2.519 2.575 2.684 2.786 2.922 3.016 3.116 3.253 3.386 3.521 3.634 3.737 3.879 4.006 4.132 4.294 4.455 4.616 4.812 5.036 5.238 5.462 5.708 5.947 6.189 6.476 6.796 7.094 7.452 7.853 8.332 8.882 9.453 10.084 10.748 11.076 11.071 10.95 10.764 10.562 10.332 10.101 9.904 9.656 9.423 9.244 9.095 8.949 8.809 8.664 8.489 8.324 8.191 8.064 7.916 7.776 7.628 7.468 7.338 7.209 7.089 6.968 6.838 6.732 6.615 6.445 6.319 6.198 6.142 6.018 5.889 5.756 5.676 5.494 5.389 5.287 5.181 4.955 4.808 4.656 4.507 4.319 4.098 3.843 3.16 -5 ,925 ,KEBNE ,17042039,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:18:47 CET,0.0 0.329 0.532 0.699 0.849 0.982 1.125 1.257 1.454 1.537 1.621 1.689 1.859 1.933 2.073 2.194 2.3 2.36 2.485 2.605 2.761 2.851 2.944 3.094 3.231 3.351 3.468 3.582 3.728 3.861 3.996 4.161 4.301 4.442 4.604 4.799 4.994 5.184 5.391 5.623 5.868 6.152 6.511 6.864 7.231 7.644 8.1 8.606 9.209 9.869 10.482 10.896 11.072 11.07 10.958 10.792 10.575 10.344 10.146 9.95 9.774 9.6 9.442 9.278 9.125 8.983 8.81 8.655 8.526 8.402 8.252 8.114 7.983 7.845 7.737 7.623 7.507 7.385 7.252 7.154 7.054 6.922 6.821 6.698 6.632 6.496 6.348 6.198 6.128 5.963 5.883 5.796 5.699 5.496 5.375 5.238 5.093 4.932 4.754 4.548 3.913 -6 ,9495 ,KEBNE ,17042041,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:16:57 CET,0.0 0.422 0.711 0.881 1.026 1.182 1.35 1.487 1.697 1.793 1.886 1.957 2.141 2.223 2.374 2.526 2.682 2.751 2.885 3.029 3.23 3.358 3.47 3.609 3.736 3.864 3.981 4.094 4.244 4.395 4.545 4.713 4.869 5.025 5.207 5.396 5.576 5.776 5.989 6.241 6.519 6.811 7.14 7.457 7.809 8.195 8.603 9.045 9.544 10.106 10.816 11.315 11.461 11.425 11.377 11.289 11.112 10.947 10.804 10.648 10.504 10.328 10.134 9.969 9.829 9.688 9.518 9.366 9.229 9.077 8.918 8.781 8.643 8.498 8.379 8.256 8.115 7.968 7.822 7.712 7.601 7.423 7.296 7.168 7.104 6.957 6.791 6.632 6.552 6.385 6.314 6.226 6.115 5.866 5.741 5.579 5.403 5.218 4.997 4.696 3.724 -7 ,20760 ,KEBNE ,17042042,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:18:02 CET,0.0 0.655 0.9 1.069 1.241 1.399 1.519 1.636 1.859 1.953 2.045 2.143 2.33 2.411 2.565 2.714 2.861 2.932 3.07 3.212 3.426 3.57 3.702 3.879 4.063 4.252 4.441 4.622 4.834 5.038 5.25 5.514 5.727 5.885 6.063 6.261 6.462 6.681 6.9 7.14 7.398 7.685 8.032 8.384 8.787 9.235 9.748 10.293 10.937 11.672 12.472 13.011 13.093 12.992 12.847 12.662 12.446 12.234 12.043 11.828 11.631 11.435 11.244 11.082 10.932 10.803 10.671 10.541 10.416 10.285 10.149 10.03 9.894 9.745 9.623 9.5 9.369 9.211 9.056 8.963 8.859 8.683 8.546 8.385 8.304 8.157 8.014 7.851 7.762 7.583 7.464 7.351 7.232 6.989 6.851 6.708 6.533 6.353 6.164 5.891 5.097 -8 ,11391 ,KEBNE ,17042044,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:16:34 CET,0.0 0.645 0.827 0.984 1.112 1.204 1.297 1.394 1.554 1.629 1.709 1.775 1.939 2.005 2.116 2.23 2.348 2.403 2.508 2.614 2.767 2.863 2.963 3.121 3.264 3.387 3.506 3.623 3.795 3.968 4.127 4.319 4.492 4.644 4.814 5.004 5.189 5.394 5.614 5.852 6.117 6.42 6.733 7.038 7.402 7.837 8.324 8.845 9.45 10.081 10.721 11.083 11.147 11.047 10.823 10.58 10.392 10.194 9.985 9.763 9.566 9.387 9.202 9.026 8.859 8.681 8.503 8.334 8.181 8.034 7.883 7.753 7.598 7.439 7.312 7.186 7.054 6.913 6.761 6.64 6.516 6.329 6.186 6.035 5.964 5.831 5.707 5.578 5.509 5.346 5.256 5.151 5.04 4.819 4.683 4.513 4.307 4.075 3.806 3.489 2.754 -9 ,11984 ,KEBNE ,17042045,Thu Dec 23 03:36:17 CET,Thu Dec 23 05:16:31 CET,0.0 1.634 2.001 2.229 2.442 2.609 2.734 2.857 3.083 3.182 3.283 3.38 3.553 3.628 3.772 3.913 4.064 4.142 4.28 4.403 4.58 4.686 4.788 4.944 5.1 5.252 5.4 5.537 5.708 5.887 6.058 6.234 6.405 6.579 6.772 6.991 7.208 7.444 7.682 7.913 8.155 8.417 8.72 9.058 9.431 9.811 10.26 10.772 11.334 11.949 12.59 12.862 12.882 12.84 12.733 12.574 12.416 12.246 12.066 11.873 11.681 11.499 11.316 11.121 10.927 10.77 10.623 10.487 10.358 10.209 10.032 9.881 9.726 9.554 9.426 9.314 9.211 9.081 8.927 8.82 8.705 8.545 8.445 8.334 8.281 8.174 8.041 7.904 7.838 7.689 7.63 7.531 7.409 7.17 7.017 6.813 6.598 6.423 6.241 5.991 5.439 -10 ,11899 ,KEBNE ,17042047,Thu Dec 23 03:36:17 CET,Thu Dec 23 05:15:27 CET,0.0 0.634 0.9 1.096 1.269 1.416 1.543 1.665 1.912 2.021 2.114 2.176 2.339 2.413 2.56 2.703 2.834 2.897 3.008 3.111 3.266 3.371 3.479 3.639 3.785 3.916 4.052 4.185 4.347 4.497 4.641 4.801 4.962 5.123 5.296 5.479 5.669 5.889 6.111 6.353 6.61 6.895 7.236 7.569 7.953 8.352 8.795 9.331 9.909 10.472 10.998 11.32 11.376 11.342 11.251 11.09 10.911 10.719 10.546 10.346 10.159 9.99 9.821 9.65 9.475 9.319 9.135 8.967 8.826 8.648 8.45 8.303 8.159 8.007 7.896 7.783 7.653 7.506 7.359 7.268 7.168 6.992 6.872 6.747 6.679 6.538 6.404 6.255 6.166 5.99 5.868 5.765 5.678 5.457 5.324 5.187 5.044 4.85 4.602 4.245 3.29 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_30_13.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_30_13.txt deleted file mode 100644 index 491270eb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_30_13.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29886 ,KEBNE ,16653569,Mon Nov 22 03:18:16 CET,Mon Nov 22 05:00:39 CET,0.0 1.177 1.52 1.781 1.982 2.169 2.348 2.503 2.78 2.925 3.063 3.213 3.407 3.519 3.751 3.961 4.147 4.238 4.407 4.557 4.786 4.957 5.123 5.337 5.553 5.767 5.967 6.183 6.473 6.714 6.917 7.168 7.428 7.718 8.078 8.482 8.867 9.293 9.741 10.16 10.619 11.174 11.794 12.414 13.171 14.044 15.022 16.063 17.235 18.397 19.534 20.346 20.602 20.638 20.562 20.388 20.175 19.941 19.714 19.493 19.306 19.136 18.922 18.691 18.49 18.312 18.112 17.923 17.766 17.596 17.4 17.219 17.001 16.77 16.614 16.456 16.293 16.123 15.933 15.8 15.673 15.486 15.334 15.157 15.065 14.888 14.711 14.496 14.371 14.161 13.975 13.831 13.665 13.269 13.033 12.772 12.518 12.163 11.681 10.996 6.223 -2 ,22432 ,KEBNE ,16653570,Mon Nov 22 03:19:17 CET,Mon Nov 22 05:03:39 CET,0.0 1.372 1.737 1.988 2.209 2.392 2.572 2.745 3.06 3.192 3.306 3.457 3.657 3.763 3.976 4.182 4.377 4.472 4.665 4.852 5.107 5.273 5.439 5.685 5.92 6.124 6.327 6.534 6.795 7.04 7.279 7.568 7.839 8.108 8.393 8.694 9.002 9.326 9.695 10.142 10.622 11.16 11.825 12.515 13.29 14.115 15.004 15.927 16.949 18.142 19.293 19.788 19.919 19.909 19.872 19.804 19.664 19.497 19.314 19.121 18.959 18.776 18.572 18.383 18.195 17.992 17.748 17.516 17.306 17.086 16.879 16.706 16.507 16.27 16.095 15.907 15.692 15.473 15.249 15.091 14.94 14.718 14.549 14.347 14.237 14.023 13.796 13.551 13.41 13.185 12.952 12.769 12.587 12.179 11.919 11.623 11.333 10.998 10.517 9.778 6.458 -3 ,28575 ,KEBNE ,16653571,Mon Nov 22 03:19:17 CET,Mon Nov 22 05:01:53 CET,0.0 0.742 1.081 1.369 1.608 1.791 1.948 2.107 2.399 2.529 2.654 2.822 3.023 3.133 3.364 3.585 3.789 3.884 4.054 4.216 4.46 4.619 4.778 5.014 5.243 5.457 5.653 5.839 6.079 6.328 6.567 6.841 7.109 7.369 7.666 7.989 8.28 8.609 9.016 9.499 10.009 10.552 11.164 11.766 12.391 13.031 13.861 14.804 15.869 17.034 18.163 18.851 19.078 19.079 18.896 18.602 18.312 18.024 17.732 17.428 17.153 16.859 16.56 16.304 16.054 15.803 15.53 15.278 15.067 14.859 14.631 14.418 14.193 13.961 13.769 13.568 13.353 13.119 12.886 12.728 12.553 12.258 12.044 11.838 11.735 11.529 11.315 11.057 10.914 10.672 10.409 10.24 10.049 9.603 9.351 9.073 8.769 8.409 7.951 7.269 0.597 -4 ,17803 ,KEBNE ,16653572,Mon Nov 22 03:19:17 CET,Mon Nov 22 05:00:19 CET,0.0 1.34 1.664 1.904 2.126 2.311 2.473 2.632 2.898 3.022 3.159 3.333 3.529 3.636 3.838 4.028 4.202 4.289 4.468 4.64 4.898 5.066 5.224 5.451 5.679 5.904 6.124 6.342 6.611 6.861 7.109 7.39 7.664 7.934 8.231 8.565 8.889 9.259 9.658 10.078 10.525 10.995 11.558 12.181 12.882 13.637 14.531 15.561 16.702 17.872 19.065 19.723 19.916 19.947 19.804 19.566 19.331 19.044 18.754 18.471 18.189 17.91 17.65 17.406 17.152 16.875 16.569 16.319 16.12 15.907 15.683 15.484 15.273 15.059 14.889 14.72 14.541 14.34 14.117 13.95 13.795 13.568 13.406 13.24 13.143 12.932 12.685 12.396 12.256 12.037 11.779 11.621 11.447 11.028 10.777 10.516 10.235 9.88 9.342 8.625 4.976 -5 ,18724 ,KEBNE ,16653573,Mon Nov 22 03:19:18 CET,Mon Nov 22 05:02:00 CET,0.0 1.151 1.55 1.848 2.119 2.384 2.619 2.803 3.12 3.276 3.419 3.6 3.817 3.943 4.188 4.417 4.639 4.74 4.93 5.117 5.393 5.58 5.761 6.025 6.246 6.441 6.652 6.869 7.137 7.382 7.627 7.936 8.247 8.532 8.843 9.191 9.531 9.892 10.279 10.69 11.1 11.606 12.205 12.802 13.513 14.237 15.111 16.16 17.36 18.655 19.91 20.696 20.89 20.82 20.631 20.343 20.052 19.761 19.479 19.151 18.832 18.549 18.27 17.99 17.738 17.512 17.288 17.095 16.909 16.718 16.551 16.405 16.238 16.055 15.908 15.748 15.571 15.379 15.183 15.031 14.873 14.638 14.466 14.295 14.204 14.0 13.769 13.486 13.335 13.127 12.924 12.769 12.602 12.213 11.982 11.732 11.439 11.101 10.665 9.994 5.856 -8 ,32021 ,KEBNE ,16653576,Mon Nov 22 03:19:17 CET,Mon Nov 22 05:01:35 CET,0.0 0.745 1.05 1.295 1.525 1.732 1.891 2.024 2.274 2.387 2.498 2.611 2.786 2.886 3.087 3.272 3.442 3.533 3.722 3.898 4.154 4.309 4.459 4.69 4.913 5.136 5.348 5.545 5.794 6.03 6.245 6.511 6.778 7.039 7.336 7.665 7.988 8.349 8.759 9.206 9.69 10.229 10.833 11.461 12.152 12.859 13.677 14.527 15.471 16.631 17.767 18.324 18.384 18.241 18.086 17.872 17.584 17.292 17.038 16.761 16.484 16.211 15.893 15.57 15.286 15.023 14.76 14.506 14.277 14.049 13.809 13.606 13.405 13.19 13.004 12.819 12.634 12.439 12.245 12.103 11.95 11.706 11.527 11.333 11.234 11.035 10.807 10.555 10.428 10.228 9.987 9.803 9.602 9.165 8.931 8.659 8.316 7.923 7.465 6.769 0.964 -9 ,5925 ,KEBNE ,16653577,Mon Nov 22 03:19:21 CET,Mon Nov 22 05:00:10 CET,0.0 1.232 1.547 1.812 2.042 2.243 2.423 2.578 2.895 3.046 3.167 3.304 3.499 3.616 3.826 4.006 4.206 4.306 4.488 4.667 4.939 5.112 5.277 5.506 5.733 5.956 6.166 6.374 6.639 6.895 7.151 7.443 7.708 7.987 8.311 8.664 8.995 9.367 9.772 10.153 10.564 11.051 11.616 12.149 12.724 13.383 14.135 14.967 15.896 16.937 18.005 18.619 18.88 18.94 18.841 18.655 18.447 18.247 18.03 17.738 17.464 17.237 17.036 16.867 16.664 16.455 16.253 16.033 15.828 15.628 15.414 15.232 15.039 14.825 14.665 14.498 14.322 14.14 13.937 13.792 13.637 13.395 13.218 13.025 12.926 12.729 12.508 12.247 12.121 11.904 11.653 11.481 11.299 10.932 10.722 10.502 10.241 9.938 9.519 8.852 4.876 -10 ,25650 ,KEBNE ,16653578,Mon Nov 22 03:20:19 CET,Mon Nov 22 05:03:14 CET,0.0 0.835 1.137 1.38 1.593 1.781 1.949 2.101 2.384 2.519 2.647 2.813 3.026 3.142 3.35 3.539 3.708 3.788 3.958 4.136 4.386 4.547 4.711 4.946 5.174 5.4 5.623 5.838 6.116 6.395 6.649 6.943 7.237 7.524 7.867 8.253 8.609 8.974 9.368 9.8 10.272 10.792 11.372 11.943 12.592 13.302 14.055 14.945 15.992 17.036 18.076 18.729 18.975 19.05 19.011 18.917 18.737 18.483 18.239 17.999 17.791 17.565 17.322 17.095 16.884 16.684 16.456 16.245 16.046 15.833 15.612 15.432 15.262 15.088 14.948 14.794 14.633 14.48 14.324 14.199 14.065 13.856 13.708 13.553 13.468 13.274 13.009 12.724 12.611 12.425 12.207 12.048 11.875 11.511 11.328 11.125 10.884 10.5 9.963 9.057 5.619 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_30_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_30_35.txt deleted file mode 100644 index c1cc4262..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_30_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25040 ,KEBNE ,17042050,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:18:24 CET,0.0 0.638 0.818 0.958 1.061 1.169 1.286 1.392 1.578 1.659 1.741 1.85 2.022 2.092 2.228 2.354 2.471 2.527 2.633 2.752 2.939 3.054 3.154 3.29 3.436 3.585 3.723 3.859 4.037 4.219 4.409 4.635 4.831 5.019 5.253 5.501 5.71 5.95 6.221 6.495 6.773 7.1 7.472 7.841 8.27 8.719 9.207 9.747 10.296 10.743 10.979 10.747 10.313 9.883 9.418 8.836 8.299 7.842 7.425 6.977 6.605 6.283 5.955 5.668 5.43 5.194 4.92 4.665 4.439 4.205 3.97 3.756 3.513 3.262 3.067 2.863 2.639 2.403 2.163 1.998 1.821 1.525 1.31 1.102 1.006 0.803 0.579 0.328 0.19 -0.04 -0.218 -0.373 -0.548 -0.925 -1.126 -1.33 -1.546 -1.805 -2.156 -2.604 -4.303 -2 ,967 ,KEBNE ,17042051,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:16:59 CET,0.0 0.249 0.394 0.511 0.615 0.718 0.838 0.968 1.173 1.259 1.349 1.428 1.598 1.682 1.832 1.964 2.096 2.154 2.272 2.385 2.53 2.621 2.714 2.847 2.976 3.119 3.263 3.388 3.541 3.694 3.846 4.026 4.204 4.372 4.559 4.773 4.998 5.247 5.505 5.784 6.072 6.4 6.763 7.105 7.496 7.901 8.367 8.881 9.413 10.042 10.437 10.191 9.745 9.246 8.744 8.245 7.8 7.39 7.05 6.697 6.366 6.064 5.771 5.46 5.152 4.885 4.586 4.289 4.027 3.758 3.481 3.236 2.959 2.673 2.462 2.238 1.99 1.743 1.496 1.33 1.166 0.916 0.751 0.567 0.462 0.241 0.01 -0.244 -0.376 -0.587 -0.759 -0.903 -1.049 -1.391 -1.603 -1.826 -2.072 -2.365 -2.71 -3.128 -4.312 -3 ,27900 ,KEBNE ,17042052,Thu Dec 23 03:36:23 CET,Thu Dec 23 05:16:03 CET,0.0 0.509 0.664 0.79 0.902 1.013 1.129 1.244 1.446 1.53 1.608 1.672 1.831 1.903 2.037 2.153 2.27 2.328 2.447 2.563 2.732 2.84 2.94 3.086 3.228 3.372 3.515 3.653 3.824 3.986 4.149 4.352 4.539 4.717 4.926 5.156 5.405 5.696 5.973 6.247 6.531 6.842 7.192 7.525 7.904 8.329 8.785 9.211 9.621 9.932 9.975 9.647 9.099 8.519 7.952 7.389 6.904 6.436 6.001 5.532 5.111 4.708 4.304 3.951 3.623 3.312 2.984 2.702 2.469 2.222 1.964 1.748 1.534 1.316 1.126 0.921 0.725 0.551 0.375 0.245 0.125 -0.072 -0.234 -0.411 -0.503 -0.708 -0.923 -1.142 -1.266 -1.484 -1.659 -1.793 -1.929 -2.218 -2.372 -2.553 -2.803 -3.087 -3.423 -3.87 -5.373 -4 ,9408 ,KEBNE ,17042053,Thu Dec 23 03:36:22 CET,Thu Dec 23 05:15:47 CET,0.0 0.467 0.697 0.874 1.024 1.138 1.236 1.335 1.536 1.624 1.695 1.745 1.905 1.964 2.092 2.226 2.348 2.409 2.525 2.644 2.821 2.932 3.044 3.206 3.357 3.497 3.644 3.799 3.994 4.168 4.335 4.537 4.731 4.919 5.136 5.378 5.602 5.855 6.144 6.453 6.757 7.084 7.46 7.844 8.291 8.734 9.158 9.575 9.956 10.3 10.507 10.288 9.825 9.273 8.711 8.196 7.725 7.253 6.832 6.434 6.111 5.832 5.549 5.276 5.029 4.792 4.53 4.285 4.053 3.796 3.54 3.333 3.114 2.879 2.702 2.528 2.35 2.159 1.931 1.774 1.63 1.408 1.249 1.073 0.985 0.819 0.644 0.456 0.35 0.148 -0.011 -0.162 -0.316 -0.619 -0.796 -0.986 -1.18 -1.416 -1.713 -2.084 -3.461 -5 ,1411 ,KEBNE ,17042054,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:17:37 CET,0.0 0.501 0.741 0.914 1.049 1.162 1.27 1.382 1.605 1.705 1.801 1.891 2.055 2.123 2.251 2.386 2.521 2.584 2.704 2.825 2.993 3.102 3.205 3.355 3.503 3.645 3.785 3.922 4.089 4.238 4.381 4.555 4.736 4.908 5.09 5.288 5.473 5.675 5.907 6.167 6.406 6.646 6.934 7.217 7.529 7.867 8.218 8.542 8.846 9.079 9.042 8.542 7.874 7.193 6.518 5.781 5.123 4.567 4.089 3.604 3.216 2.889 2.552 2.234 1.904 1.571 1.218 0.908 0.668 0.407 0.106 -0.148 -0.418 -0.701 -0.913 -1.127 -1.355 -1.579 -1.797 -1.95 -2.109 -2.374 -2.568 -2.768 -2.865 -3.05 -3.258 -3.482 -3.597 -3.817 -3.989 -4.131 -4.287 -4.608 -4.777 -4.99 -5.252 -5.543 -5.949 -6.499 -8.157 -6 ,20305 ,KEBNE ,17042055,Thu Dec 23 03:36:17 CET,Thu Dec 23 05:18:11 CET,0.0 0.638 0.837 0.978 1.116 1.246 1.362 1.468 1.644 1.732 1.82 1.896 2.056 2.126 2.254 2.384 2.513 2.568 2.669 2.775 2.931 3.024 3.119 3.26 3.39 3.521 3.656 3.787 3.97 4.143 4.293 4.485 4.672 4.846 5.055 5.284 5.514 5.778 6.05 6.34 6.62 6.937 7.316 7.668 8.059 8.442 8.846 9.28 9.684 10.083 10.317 10.054 9.556 9.007 8.504 7.986 7.473 6.987 6.587 6.172 5.805 5.497 5.183 4.874 4.573 4.299 4.055 3.84 3.647 3.446 3.228 3.04 2.832 2.611 2.441 2.267 2.082 1.884 1.676 1.533 1.388 1.157 1.001 0.84 0.751 0.567 0.38 0.181 0.073 -0.139 -0.305 -0.424 -0.559 -0.844 -0.999 -1.168 -1.372 -1.622 -1.919 -2.291 -3.522 -7 ,18575 ,KEBNE ,17042056,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:18:13 CET,0.0 0.498 0.672 0.836 0.979 1.08 1.187 1.301 1.516 1.615 1.703 1.772 1.936 2.01 2.162 2.302 2.434 2.497 2.629 2.756 2.93 3.049 3.161 3.31 3.456 3.595 3.727 3.857 4.027 4.194 4.359 4.559 4.76 4.953 5.154 5.37 5.581 5.814 6.062 6.334 6.625 6.948 7.326 7.702 8.104 8.52 9.01 9.51 9.965 10.364 10.608 10.373 9.922 9.426 8.91 8.376 7.873 7.392 6.959 6.554 6.202 5.854 5.509 5.194 4.904 4.623 4.319 4.075 3.873 3.663 3.458 3.276 3.063 2.853 2.688 2.504 2.319 2.127 1.927 1.791 1.653 1.42 1.248 1.093 1.004 0.784 0.572 0.336 0.205 -0.016 -0.206 -0.356 -0.52 -0.869 -1.049 -1.235 -1.44 -1.676 -1.967 -2.409 -4.034 -8 ,11942 ,KEBNE ,17042057,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:16:33 CET,0.0 0.486 0.669 0.8 0.908 1.026 1.16 1.282 1.465 1.544 1.626 1.69 1.849 1.924 2.057 2.178 2.301 2.36 2.475 2.593 2.75 2.852 2.955 3.1 3.248 3.393 3.533 3.665 3.83 4.0 4.151 4.333 4.535 4.737 4.959 5.197 5.43 5.682 5.943 6.205 6.467 6.781 7.146 7.502 7.922 8.384 8.875 9.357 9.848 10.222 10.251 9.92 9.535 9.106 8.597 8.06 7.616 7.228 6.88 6.522 6.195 5.874 5.55 5.228 4.911 4.629 4.339 4.07 3.845 3.622 3.391 3.189 2.961 2.729 2.55 2.363 2.178 1.981 1.761 1.612 1.454 1.202 1.04 0.866 0.774 0.568 0.36 0.171 0.063 -0.138 -0.269 -0.402 -0.546 -0.85 -1.025 -1.222 -1.469 -1.758 -2.075 -2.553 -4.45 -9 ,29959 ,KEBNE ,17042058,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:17:06 CET,0.0 0.419 0.627 0.763 0.87 0.989 1.106 1.214 1.429 1.521 1.604 1.683 1.845 1.903 2.02 2.142 2.253 2.306 2.419 2.527 2.677 2.778 2.884 3.055 3.218 3.371 3.521 3.663 3.845 4.022 4.177 4.353 4.54 4.733 4.95 5.184 5.413 5.65 5.882 6.128 6.409 6.738 7.141 7.537 7.939 8.366 8.832 9.322 9.786 10.194 10.368 10.035 9.534 8.965 8.448 7.955 7.441 6.946 6.503 6.06 5.692 5.354 5.008 4.694 4.399 4.105 3.803 3.537 3.313 3.081 2.806 2.566 2.329 2.082 1.881 1.674 1.47 1.268 1.047 0.886 0.728 0.474 0.297 0.106 0.003 -0.192 -0.382 -0.593 -0.708 -0.921 -1.085 -1.232 -1.393 -1.759 -1.976 -2.191 -2.404 -2.65 -2.967 -3.425 -4.957 -10 ,29868 ,KEBNE ,17042059,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:17:30 CET,0.0 0.554 0.758 0.926 1.074 1.201 1.314 1.431 1.622 1.706 1.788 1.846 1.997 2.072 2.219 2.347 2.478 2.539 2.649 2.751 2.909 3.017 3.116 3.265 3.414 3.543 3.657 3.774 3.943 4.111 4.283 4.493 4.671 4.849 5.063 5.282 5.485 5.717 5.967 6.226 6.499 6.827 7.198 7.551 7.957 8.382 8.869 9.394 9.95 10.442 10.676 10.53 10.099 9.604 9.122 8.691 8.308 7.9 7.537 7.141 6.795 6.481 6.137 5.788 5.472 5.182 4.847 4.553 4.326 4.081 3.801 3.567 3.334 3.079 2.874 2.662 2.452 2.254 2.027 1.845 1.654 1.379 1.205 1.027 0.924 0.689 0.437 0.169 0.024 -0.21 -0.41 -0.58 -0.75 -1.087 -1.276 -1.472 -1.681 -1.925 -2.26 -2.751 -4.034 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_30_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_30_37.txt deleted file mode 100644 index cfdd63e3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_30_37.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25122 ,KEBNE ,17042060,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:17:09 CET,0.0 0.866 1.22 1.431 1.614 1.793 1.951 2.075 2.301 2.406 2.503 2.606 2.793 2.889 3.069 3.232 3.383 3.455 3.603 3.75 3.973 4.117 4.251 4.46 4.682 4.876 5.04 5.209 5.441 5.667 5.879 6.134 6.374 6.601 6.861 7.166 7.473 7.815 8.194 8.593 8.997 9.445 10.001 10.612 11.317 12.058 12.916 13.918 15.053 16.307 17.779 18.895 19.521 19.879 20.028 20.117 20.187 20.193 20.167 20.107 20.01 19.914 19.808 19.714 19.619 19.502 19.371 19.255 19.155 19.052 18.944 18.853 18.758 18.639 18.532 18.433 18.324 18.199 18.066 17.969 17.872 17.712 17.601 17.488 17.429 17.301 17.162 17.034 16.968 16.82 16.717 16.634 16.541 16.303 16.174 16.035 15.885 15.705 15.461 15.13 13.867 -2 ,1270 ,KEBNE ,17042061,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:16:50 CET,0.0 0.648 0.946 1.143 1.319 1.511 1.669 1.806 2.091 2.226 2.348 2.483 2.675 2.772 2.948 3.118 3.295 3.387 3.563 3.723 3.959 4.122 4.278 4.517 4.738 4.939 5.147 5.364 5.656 5.925 6.165 6.447 6.706 6.95 7.227 7.545 7.851 8.167 8.511 8.894 9.306 9.774 10.297 10.827 11.513 12.283 13.113 14.047 15.211 16.65 18.432 19.883 20.552 20.823 21.029 21.194 21.254 21.266 21.238 21.169 21.097 21.034 20.954 20.847 20.754 20.681 20.59 20.493 20.404 20.299 20.178 20.076 19.969 19.857 19.766 19.668 19.566 19.454 19.33 19.24 19.138 18.982 18.884 18.78 18.723 18.596 18.472 18.358 18.294 18.156 18.064 17.964 17.858 17.645 17.53 17.4 17.247 17.07 16.875 16.643 15.814 -3 ,13734 ,KEBNE ,17042062,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:18:03 CET,0.0 0.905 1.173 1.394 1.575 1.741 1.895 2.028 2.259 2.377 2.499 2.628 2.81 2.898 3.076 3.258 3.433 3.514 3.657 3.815 4.07 4.224 4.366 4.578 4.778 4.958 5.139 5.326 5.569 5.803 6.022 6.274 6.522 6.767 7.049 7.371 7.691 8.042 8.419 8.812 9.221 9.689 10.281 10.897 11.63 12.478 13.445 14.512 15.686 16.953 18.323 19.421 20.094 20.475 20.673 20.765 20.791 20.793 20.753 20.691 20.623 20.533 20.429 20.322 20.223 20.139 20.05 19.96 19.874 19.777 19.67 19.594 19.512 19.407 19.32 19.239 19.152 19.053 18.96 18.893 18.819 18.691 18.611 18.523 18.473 18.363 18.244 18.135 18.076 17.948 17.864 17.784 17.709 17.538 17.431 17.324 17.2 17.039 16.827 16.541 15.587 -4 ,2966 ,KEBNE ,17042063,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:18:13 CET,0.0 0.769 1.083 1.29 1.489 1.679 1.842 1.982 2.225 2.343 2.471 2.622 2.828 2.932 3.142 3.351 3.54 3.635 3.825 4.003 4.24 4.378 4.504 4.692 4.886 5.079 5.257 5.429 5.663 5.875 6.061 6.294 6.53 6.775 7.07 7.39 7.693 8.02 8.381 8.791 9.233 9.713 10.253 10.805 11.488 12.266 13.208 14.318 15.58 17.087 18.842 20.198 20.845 21.208 21.409 21.501 21.576 21.573 21.534 21.482 21.406 21.323 21.23 21.124 21.01 20.909 20.794 20.674 20.565 20.451 20.313 20.193 20.082 19.96 19.854 19.75 19.642 19.53 19.42 19.345 19.263 19.117 19.023 18.935 18.883 18.771 18.645 18.51 18.441 18.298 18.205 18.115 18.027 17.855 17.753 17.636 17.507 17.352 17.152 16.881 15.986 -5 ,30554 ,KEBNE ,17042064,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:17:28 CET,0.0 0.581 0.818 1.026 1.201 1.358 1.503 1.637 1.878 1.989 2.095 2.206 2.379 2.474 2.659 2.829 2.984 3.059 3.218 3.368 3.565 3.693 3.818 3.997 4.179 4.358 4.523 4.687 4.909 5.118 5.316 5.554 5.789 6.014 6.266 6.54 6.809 7.126 7.474 7.84 8.234 8.672 9.191 9.714 10.304 11.005 11.833 12.783 13.952 15.311 16.879 18.045 18.61 18.931 19.144 19.275 19.321 19.313 19.247 19.145 19.081 19.026 18.968 18.907 18.823 18.728 18.618 18.495 18.383 18.273 18.151 18.038 17.915 17.809 17.73 17.634 17.521 17.4 17.274 17.185 17.096 16.953 16.853 16.746 16.693 16.579 16.448 16.315 16.247 16.095 15.977 15.892 15.791 15.556 15.435 15.303 15.157 14.969 14.733 14.431 13.391 -7 ,8620 ,KEBNE ,17042066,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:17:12 CET,0.0 1.124 1.42 1.656 1.852 2.01 2.152 2.3 2.572 2.679 2.779 2.886 3.063 3.157 3.347 3.523 3.684 3.761 3.909 4.05 4.259 4.393 4.523 4.72 4.899 5.074 5.251 5.421 5.656 5.889 6.099 6.338 6.569 6.801 7.077 7.391 7.688 8.024 8.391 8.768 9.177 9.643 10.167 10.708 11.355 12.079 12.923 13.91 15.055 16.367 17.847 19.04 19.703 20.035 20.196 20.262 20.291 20.27 20.207 20.091 19.965 19.865 19.768 19.677 19.608 19.53 19.417 19.296 19.184 19.061 18.937 18.837 18.719 18.585 18.482 18.388 18.304 18.197 18.051 17.959 17.872 17.738 17.649 17.548 17.492 17.376 17.259 17.137 17.068 16.932 16.859 16.783 16.688 16.442 16.311 16.17 16.019 15.84 15.605 15.324 14.106 -8 ,23065 ,KEBNE ,17042067,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:17:27 CET,0.0 0.719 1.04 1.264 1.444 1.603 1.752 1.89 2.149 2.278 2.406 2.55 2.745 2.846 3.042 3.233 3.418 3.507 3.682 3.85 4.092 4.249 4.4 4.616 4.819 5.011 5.199 5.382 5.618 5.843 6.05 6.295 6.538 6.77 7.034 7.316 7.595 7.911 8.262 8.632 8.992 9.402 9.91 10.431 11.08 11.842 12.658 13.531 14.547 15.689 17.1 18.251 18.81 19.185 19.391 19.504 19.509 19.423 19.357 19.278 19.218 19.156 19.058 18.933 18.821 18.737 18.639 18.555 18.473 18.374 18.271 18.178 18.083 17.984 17.902 17.821 17.737 17.652 17.552 17.474 17.391 17.279 17.2 17.102 17.056 16.958 16.844 16.716 16.654 16.531 16.446 16.366 16.285 16.103 16.012 15.903 15.733 15.494 15.24 14.907 13.968 -9 ,29852 ,KEBNE ,17042068,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:18:38 CET,0.0 0.798 1.055 1.266 1.462 1.631 1.76 1.893 2.159 2.279 2.391 2.497 2.669 2.764 2.934 3.086 3.258 3.343 3.494 3.645 3.869 4.013 4.155 4.349 4.53 4.717 4.898 5.072 5.299 5.504 5.714 6.004 6.286 6.543 6.83 7.149 7.464 7.829 8.196 8.546 8.913 9.35 9.858 10.351 10.95 11.647 12.475 13.438 14.497 15.706 17.167 18.218 18.716 18.993 19.155 19.229 19.244 19.228 19.2 19.156 19.074 18.989 18.905 18.808 18.699 18.594 18.47 18.347 18.246 18.141 18.038 17.943 17.824 17.712 17.626 17.528 17.424 17.317 17.211 17.131 17.048 16.903 16.795 16.693 16.641 16.539 16.426 16.292 16.228 16.104 16.029 15.943 15.847 15.632 15.505 15.371 15.245 15.092 14.891 14.599 13.648 -10 ,19570 ,KEBNE ,17042069,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:17:57 CET,0.0 1.158 1.461 1.673 1.856 2.02 2.152 2.258 2.475 2.582 2.688 2.822 3.009 3.101 3.278 3.441 3.594 3.672 3.816 3.951 4.151 4.285 4.415 4.595 4.762 4.922 5.082 5.245 5.458 5.663 5.854 6.086 6.306 6.507 6.749 7.022 7.299 7.611 7.943 8.306 8.687 9.117 9.628 10.151 10.739 11.395 12.173 13.039 14.039 15.319 16.936 18.125 18.767 19.083 19.24 19.295 19.273 19.256 19.223 19.157 19.079 18.999 18.919 18.831 18.715 18.599 18.483 18.367 18.27 18.153 18.011 17.911 17.816 17.714 17.632 17.539 17.423 17.297 17.181 17.101 17.021 16.902 16.802 16.697 16.653 16.561 16.445 16.314 16.255 16.119 16.015 15.924 15.828 15.618 15.507 15.37 15.195 15.001 14.808 14.562 13.711 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_30_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_30_42.txt deleted file mode 100644 index 199b89e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_30_42.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19534 ,KEBNE ,16653579,Mon Nov 22 03:20:19 CET,Mon Nov 22 05:03:32 CET,0.0 0.926 1.271 1.547 1.802 2.007 2.173 2.326 2.593 2.724 2.864 3.031 3.231 3.334 3.542 3.752 3.936 4.017 4.193 4.37 4.607 4.763 4.919 5.152 5.366 5.551 5.725 5.908 6.162 6.391 6.607 6.873 7.153 7.441 7.769 8.16 8.529 8.905 9.293 9.691 10.113 10.588 11.142 11.707 12.351 13.067 13.87 14.699 15.585 16.614 17.865 18.714 19.014 19.066 18.971 18.77 18.581 18.343 18.077 17.768 17.455 17.196 16.958 16.701 16.43 16.193 15.973 15.77 15.546 15.321 15.121 14.943 14.769 14.584 14.426 14.262 14.083 13.907 13.728 13.59 13.455 13.252 13.1 12.944 12.858 12.672 12.46 12.23 12.127 11.944 11.748 11.61 11.472 11.136 10.939 10.699 10.42 10.101 9.738 9.318 6.67 -2 ,19903 ,KEBNE ,16653580,Mon Nov 22 03:20:19 CET,Mon Nov 22 05:01:16 CET,0.0 0.898 1.199 1.416 1.601 1.78 1.948 2.094 2.357 2.483 2.599 2.735 2.928 3.032 3.223 3.414 3.598 3.685 3.848 3.993 4.202 4.344 4.484 4.685 4.876 5.069 5.251 5.437 5.678 5.9 6.127 6.409 6.674 6.93 7.221 7.512 7.816 8.164 8.504 8.881 9.282 9.706 10.209 10.746 11.377 12.044 12.774 13.556 14.446 15.395 16.255 16.755 16.898 16.847 16.702 16.524 16.29 15.892 15.548 15.268 15.002 14.768 14.539 14.275 14.007 13.771 13.531 13.305 13.089 12.863 12.628 12.408 12.167 11.928 11.744 11.547 11.327 11.101 10.891 10.753 10.606 10.38 10.237 10.085 10.005 9.843 9.661 9.446 9.331 9.141 8.983 8.853 8.712 8.386 8.215 8.024 7.817 7.584 7.268 6.787 4.476 -4 ,30136 ,KEBNE ,16653582,Mon Nov 22 03:20:19 CET,Mon Nov 22 05:02:26 CET,0.0 1.047 1.379 1.623 1.835 2.033 2.214 2.379 2.68 2.824 2.964 3.109 3.308 3.416 3.623 3.827 4.034 4.129 4.309 4.488 4.749 4.926 5.097 5.316 5.516 5.71 5.916 6.121 6.379 6.64 6.899 7.2 7.45 7.67 7.931 8.238 8.559 8.894 9.226 9.603 10.021 10.459 10.957 11.459 11.997 12.641 13.373 14.168 15.097 16.047 16.929 17.363 17.492 17.431 17.25 17.026 16.814 16.584 16.327 16.018 15.749 15.528 15.255 14.917 14.599 14.35 14.129 13.921 13.708 13.469 13.219 13.019 12.821 12.618 12.452 12.265 12.085 11.916 11.714 11.576 11.449 11.23 11.06 10.87 10.774 10.579 10.395 10.221 10.122 9.932 9.769 9.649 9.5 9.08 8.867 8.638 8.357 8.032 7.595 7.037 5.05 -5 ,11712 ,KEBNE ,16653583,Mon Nov 22 03:20:19 CET,Mon Nov 22 05:03:38 CET,0.0 0.885 1.203 1.421 1.612 1.796 1.954 2.104 2.38 2.494 2.596 2.71 2.881 2.966 3.123 3.278 3.434 3.516 3.683 3.85 4.109 4.27 4.418 4.641 4.859 5.05 5.227 5.409 5.66 5.911 6.134 6.406 6.706 7.002 7.313 7.63 7.953 8.31 8.683 9.087 9.516 9.997 10.54 11.073 11.71 12.384 13.037 13.795 14.779 15.782 16.765 17.41 17.648 17.675 17.573 17.402 17.188 16.979 16.765 16.515 16.236 15.96 15.712 15.474 15.238 14.987 14.74 14.533 14.34 14.125 13.897 13.704 13.512 13.329 13.184 13.025 12.848 12.651 12.441 12.305 12.172 11.953 11.809 11.646 11.542 11.33 11.12 10.88 10.755 10.565 10.358 10.188 10.032 9.707 9.52 9.331 9.099 8.756 8.314 7.667 5.128 -6 ,24688 ,KEBNE ,16653584,Mon Nov 22 03:21:20 CET,Mon Nov 22 05:03:54 CET,0.0 0.987 1.272 1.48 1.649 1.804 1.966 2.105 2.362 2.491 2.62 2.785 2.99 3.089 3.29 3.485 3.681 3.774 3.942 4.11 4.362 4.515 4.657 4.867 5.075 5.277 5.456 5.633 5.886 6.111 6.316 6.581 6.848 7.111 7.414 7.737 8.046 8.388 8.736 9.093 9.458 9.86 10.359 10.902 11.528 12.223 12.961 13.752 14.745 15.757 16.614 17.012 17.084 16.971 16.782 16.511 16.197 15.955 15.714 15.418 15.138 14.88 14.614 14.359 14.144 13.915 13.673 13.454 13.248 13.035 12.806 12.6 12.39 12.179 12.007 11.806 11.59 11.378 11.178 11.049 10.912 10.666 10.473 10.275 10.181 10.005 9.816 9.606 9.485 9.282 9.129 8.982 8.803 8.454 8.271 8.032 7.765 7.469 7.115 6.607 4.671 -7 ,6345 ,KEBNE ,16653585,Mon Nov 22 03:20:19 CET,Mon Nov 22 05:02:13 CET,0.0 1.085 1.441 1.671 1.881 2.07 2.244 2.413 2.704 2.827 2.947 3.083 3.273 3.37 3.559 3.733 3.897 3.981 4.153 4.319 4.554 4.704 4.853 5.065 5.262 5.453 5.637 5.81 6.032 6.248 6.465 6.718 6.954 7.207 7.516 7.863 8.205 8.588 8.984 9.375 9.78 10.265 10.819 11.343 11.948 12.627 13.357 14.145 15.064 16.015 16.923 17.373 17.416 17.378 17.299 17.079 16.807 16.534 16.256 15.982 15.733 15.479 15.22 14.973 14.747 14.535 14.306 14.1 13.915 13.736 13.545 13.368 13.184 12.99 12.856 12.716 12.543 12.36 12.159 12.022 11.877 11.66 11.514 11.353 11.266 11.078 10.87 10.646 10.526 10.322 10.143 9.996 9.826 9.476 9.273 9.049 8.804 8.475 8.048 7.493 4.504 -8 ,22241 ,KEBNE ,16653586,Mon Nov 22 03:20:19 CET,Mon Nov 22 05:02:53 CET,0.0 0.687 0.951 1.159 1.327 1.479 1.642 1.808 2.084 2.204 2.321 2.471 2.67 2.788 3.012 3.199 3.373 3.462 3.645 3.823 4.065 4.221 4.377 4.602 4.82 5.028 5.227 5.434 5.713 5.964 6.203 6.477 6.732 6.991 7.299 7.655 8.017 8.415 8.822 9.259 9.713 10.215 10.775 11.297 11.927 12.653 13.442 14.206 15.016 16.113 17.18 17.656 17.767 17.696 17.501 17.276 17.084 16.846 16.614 16.365 16.094 15.809 15.542 15.285 15.025 14.776 14.516 14.28 14.061 13.835 13.615 13.445 13.26 13.036 12.85 12.676 12.492 12.294 12.073 11.917 11.76 11.495 11.311 11.128 11.035 10.819 10.583 10.325 10.19 9.982 9.777 9.627 9.467 9.148 8.944 8.711 8.444 8.075 7.696 7.171 4.497 -9 ,23310 ,KEBNE ,16653587,Mon Nov 22 03:20:19 CET,Mon Nov 22 05:01:52 CET,0.0 0.89 1.22 1.432 1.627 1.825 2.007 2.173 2.5 2.657 2.808 3.008 3.229 3.346 3.569 3.78 3.977 4.068 4.242 4.409 4.669 4.833 4.994 5.241 5.461 5.672 5.888 6.091 6.348 6.608 6.852 7.12 7.38 7.626 7.89 8.199 8.501 8.821 9.183 9.581 9.984 10.434 11.018 11.6 12.2 12.867 13.59 14.33 15.243 16.262 17.214 17.732 17.896 17.824 17.62 17.336 17.044 16.786 16.539 16.251 15.972 15.722 15.435 15.151 14.896 14.673 14.448 14.226 14.021 13.798 13.584 13.413 13.216 12.992 12.827 12.672 12.494 12.289 12.064 11.913 11.762 11.541 11.372 11.174 11.077 10.869 10.666 10.459 10.323 10.099 9.863 9.704 9.533 9.181 8.995 8.785 8.539 8.263 7.947 7.421 5.161 -10 ,11196 ,KEBNE ,16653588,Mon Nov 22 03:20:19 CET,Mon Nov 22 05:03:41 CET,0.0 0.944 1.214 1.401 1.587 1.751 1.917 2.074 2.331 2.449 2.566 2.689 2.896 3.016 3.22 3.399 3.583 3.672 3.838 3.994 4.229 4.387 4.536 4.756 4.977 5.18 5.369 5.561 5.803 6.029 6.253 6.539 6.805 7.04 7.315 7.648 7.968 8.298 8.653 9.043 9.465 9.933 10.475 11.005 11.622 12.282 13.008 13.84 14.703 15.542 16.444 16.994 17.103 16.969 16.73 16.421 16.088 15.794 15.557 15.291 15.012 14.751 14.476 14.222 13.995 13.778 13.54 13.324 13.141 12.933 12.705 12.519 12.309 12.089 11.931 11.767 11.605 11.427 11.238 11.107 10.965 10.74 10.57 10.381 10.29 10.096 9.891 9.682 9.566 9.361 9.195 9.066 8.922 8.604 8.433 8.246 8.001 7.697 7.31 6.695 4.435 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_31_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_31_35.txt deleted file mode 100644 index ff8458d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_31_35.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7379 ,KEBNE ,17042070,Thu Dec 23 03:36:17 CET,Thu Dec 23 05:18:14 CET,0.0 0.54 0.724 0.875 1.01 1.153 1.293 1.435 1.681 1.787 1.899 2.035 2.225 2.305 2.447 2.581 2.707 2.773 2.903 3.024 3.199 3.309 3.413 3.581 3.753 3.903 4.04 4.185 4.38 4.561 4.74 4.957 5.166 5.362 5.576 5.821 6.061 6.307 6.564 6.847 7.137 7.454 7.81 8.153 8.54 8.957 9.426 9.918 10.371 10.803 11.067 10.834 10.382 9.926 9.442 8.955 8.521 8.133 7.775 7.364 7.035 6.748 6.451 6.156 5.867 5.576 5.297 5.1 4.92 4.738 4.553 4.388 4.212 4.022 3.863 3.677 3.477 3.291 3.103 2.97 2.826 2.592 2.42 2.217 2.116 1.93 1.738 1.541 1.445 1.258 1.115 0.983 0.845 0.523 0.337 0.14 -0.072 -0.326 -0.599 -0.908 -1.955 -2 ,10283 ,KEBNE ,17042071,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:16:31 CET,0.0 0.329 0.497 0.637 0.751 0.869 0.996 1.116 1.33 1.42 1.5 1.569 1.739 1.824 1.973 2.105 2.239 2.308 2.446 2.585 2.784 2.914 3.032 3.187 3.34 3.497 3.658 3.817 4.011 4.189 4.368 4.582 4.778 4.961 5.181 5.44 5.704 5.986 6.25 6.527 6.824 7.164 7.573 7.979 8.454 9.002 9.556 10.038 10.521 10.969 11.293 11.241 10.961 10.575 10.147 9.723 9.336 8.93 8.54 8.186 7.872 7.552 7.228 6.931 6.666 6.438 6.201 5.987 5.79 5.564 5.321 5.129 4.94 4.713 4.526 4.34 4.16 3.97 3.754 3.618 3.474 3.246 3.1 2.936 2.842 2.633 2.428 2.206 2.084 1.871 1.689 1.549 1.415 1.129 0.964 0.78 0.583 0.337 0.024 -0.413 -1.956 -3 ,4486 ,KEBNE ,17042072,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:17:39 CET,0.0 0.319 0.513 0.697 0.857 0.991 1.125 1.251 1.496 1.613 1.72 1.827 1.996 2.082 2.276 2.441 2.586 2.659 2.816 2.976 3.197 3.337 3.465 3.65 3.826 4.003 4.178 4.342 4.562 4.785 4.991 5.215 5.432 5.643 5.891 6.18 6.458 6.752 7.067 7.406 7.777 8.196 8.619 9.006 9.45 9.935 10.468 11.012 11.578 12.132 12.373 12.066 11.617 11.072 10.542 10.084 9.661 9.255 8.889 8.495 8.14 7.831 7.533 7.242 6.958 6.705 6.445 6.183 5.945 5.688 5.41 5.177 4.953 4.737 4.567 4.374 4.172 3.979 3.774 3.617 3.453 3.205 3.033 2.842 2.74 2.542 2.336 2.114 1.988 1.766 1.603 1.446 1.275 0.949 0.751 0.528 0.29 0.017 -0.35 -0.888 -2.672 -4 ,22794 ,KEBNE ,17042073,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:15:44 CET,0.0 0.585 0.853 1.045 1.215 1.367 1.504 1.632 1.846 1.942 2.034 2.099 2.266 2.347 2.49 2.635 2.777 2.841 2.971 3.103 3.296 3.418 3.532 3.694 3.85 4.003 4.156 4.314 4.527 4.721 4.902 5.128 5.333 5.527 5.765 6.042 6.31 6.612 6.93 7.228 7.546 7.917 8.328 8.721 9.187 9.706 10.201 10.63 11.114 11.662 12.004 11.897 11.465 10.939 10.421 9.929 9.504 9.107 8.761 8.367 7.982 7.662 7.363 7.053 6.758 6.486 6.194 5.911 5.663 5.431 5.176 4.951 4.716 4.452 4.251 4.027 3.776 3.538 3.304 3.133 2.947 2.657 2.463 2.254 2.138 1.855 1.551 1.252 1.095 0.841 0.609 0.421 0.219 -0.202 -0.422 -0.668 -0.939 -1.234 -1.61 -2.128 -3.655 -5 ,17147 ,KEBNE ,17042074,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:17:54 CET,0.0 0.381 0.625 0.787 0.919 1.048 1.162 1.275 1.507 1.612 1.704 1.79 1.975 2.072 2.249 2.406 2.545 2.607 2.76 2.923 3.125 3.244 3.343 3.477 3.622 3.768 3.919 4.082 4.294 4.484 4.667 4.899 5.108 5.308 5.532 5.771 6.022 6.313 6.632 6.948 7.267 7.644 8.055 8.432 8.848 9.253 9.656 10.025 10.33 10.605 10.88 10.759 10.314 9.841 9.435 9.106 8.789 8.463 8.155 7.794 7.453 7.16 6.896 6.643 6.388 6.134 5.86 5.632 5.435 5.223 4.979 4.762 4.535 4.296 4.113 3.913 3.705 3.505 3.29 3.126 2.958 2.693 2.507 2.332 2.25 2.064 1.857 1.632 1.515 1.296 1.072 0.905 0.754 0.428 0.239 0.027 -0.212 -0.448 -0.748 -1.181 -2.412 -6 ,3107 ,KEBNE ,17042075,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:17:50 CET,0.0 0.638 0.837 0.991 1.121 1.251 1.38 1.505 1.732 1.827 1.927 2.041 2.231 2.321 2.489 2.65 2.802 2.88 3.029 3.176 3.4 3.533 3.657 3.835 4.01 4.167 4.303 4.441 4.634 4.827 5.011 5.242 5.481 5.706 5.941 6.206 6.469 6.759 7.093 7.457 7.831 8.252 8.721 9.164 9.662 10.172 10.695 11.249 11.79 12.257 12.529 12.445 12.027 11.44 10.95 10.495 10.069 9.651 9.239 8.808 8.436 8.09 7.766 7.496 7.238 6.978 6.695 6.428 6.208 6.006 5.785 5.592 5.41 5.221 5.068 4.903 4.714 4.51 4.3 4.16 4.021 3.783 3.603 3.43 3.343 3.164 2.98 2.772 2.66 2.45 2.262 2.118 1.978 1.672 1.486 1.276 1.052 0.828 0.526 0.046 -1.142 -7 ,8888 ,KEBNE ,17042076,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:17:51 CET,0.0 0.345 0.503 0.647 0.776 0.892 1.021 1.136 1.318 1.411 1.505 1.577 1.745 1.828 1.993 2.135 2.265 2.326 2.446 2.574 2.764 2.888 3.007 3.176 3.34 3.493 3.628 3.766 3.962 4.15 4.324 4.537 4.762 4.974 5.216 5.487 5.744 6.035 6.347 6.655 6.953 7.293 7.681 8.039 8.408 8.822 9.309 9.808 10.316 10.678 10.739 10.415 9.89 9.328 8.752 8.191 7.68 7.221 6.852 6.435 6.039 5.69 5.356 5.047 4.743 4.481 4.236 4.017 3.817 3.585 3.342 3.139 2.901 2.639 2.459 2.277 2.069 1.856 1.633 1.472 1.317 1.098 0.934 0.753 0.66 0.464 0.253 0.015 -0.12 -0.354 -0.537 -0.677 -0.829 -1.172 -1.347 -1.537 -1.741 -1.986 -2.276 -2.658 -3.417 -8 ,13940 ,KEBNE ,17042077,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:17:52 CET,0.0 0.403 0.618 0.781 0.935 1.076 1.197 1.307 1.503 1.592 1.671 1.733 1.902 1.992 2.16 2.311 2.45 2.513 2.64 2.769 2.935 3.033 3.134 3.29 3.435 3.572 3.71 3.842 4.016 4.195 4.357 4.549 4.739 4.907 5.093 5.312 5.526 5.748 5.992 6.254 6.534 6.873 7.217 7.524 7.882 8.256 8.725 9.274 9.791 10.303 10.65 10.433 9.992 9.512 9.078 8.662 8.218 7.778 7.419 7.066 6.72 6.395 6.064 5.72 5.412 5.154 4.866 4.586 4.339 4.092 3.842 3.62 3.391 3.172 3.004 2.82 2.622 2.432 2.214 2.048 1.882 1.627 1.449 1.228 1.102 0.863 0.629 0.356 0.213 -0.013 -0.204 -0.379 -0.573 -1.022 -1.266 -1.537 -1.842 -2.165 -2.591 -3.175 -4.588 -9 ,8069 ,KEBNE ,17042078,Thu Dec 23 03:36:17 CET,Thu Dec 23 05:16:25 CET,0.0 0.501 0.678 0.862 1.028 1.17 1.292 1.405 1.625 1.724 1.817 1.895 2.07 2.158 2.317 2.459 2.592 2.659 2.791 2.914 3.099 3.212 3.323 3.482 3.633 3.785 3.933 4.076 4.264 4.462 4.648 4.856 5.057 5.256 5.491 5.762 6.019 6.291 6.581 6.898 7.244 7.637 8.087 8.496 8.947 9.459 9.984 10.517 11.118 11.636 11.775 11.305 10.731 10.184 9.645 9.167 8.758 8.379 8.006 7.562 7.158 6.795 6.461 6.154 5.863 5.599 5.314 5.037 4.786 4.528 4.268 4.06 3.84 3.623 3.45 3.263 3.077 2.877 2.665 2.508 2.338 2.08 1.898 1.7 1.606 1.428 1.235 1.026 0.925 0.742 0.582 0.445 0.318 0.051 -0.095 -0.252 -0.44 -0.676 -0.967 -1.36 -2.38 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_31_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_31_37.txt deleted file mode 100644 index 82b6575c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_31_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30814 ,KEBNE ,17042080,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:17:13 CET,0.0 0.642 0.903 1.115 1.288 1.426 1.57 1.72 1.968 2.081 2.199 2.324 2.517 2.622 2.839 3.032 3.211 3.304 3.475 3.625 3.843 3.993 4.141 4.348 4.542 4.729 4.912 5.089 5.335 5.579 5.81 6.084 6.353 6.621 6.941 7.298 7.627 7.995 8.391 8.802 9.246 9.76 10.341 10.934 11.66 12.45 13.321 14.331 15.499 16.812 18.321 19.444 20.126 20.509 20.668 20.752 20.788 20.796 20.751 20.652 20.521 20.396 20.273 20.143 20.033 19.942 19.852 19.775 19.674 19.557 19.449 19.352 19.257 19.148 19.06 18.98 18.886 18.778 18.676 18.6 18.508 18.357 18.258 18.17 18.123 18.024 17.915 17.772 17.692 17.549 17.449 17.36 17.267 17.063 16.956 16.813 16.654 16.488 16.301 16.045 15.224 -2 ,3333 ,KEBNE ,17042081,Thu Dec 23 03:36:17 CET,Thu Dec 23 05:17:58 CET,0.0 1.088 1.373 1.594 1.781 1.928 2.053 2.188 2.455 2.559 2.663 2.783 2.967 3.068 3.265 3.448 3.631 3.715 3.866 4.007 4.204 4.332 4.462 4.654 4.848 5.045 5.226 5.387 5.614 5.853 6.083 6.359 6.617 6.873 7.187 7.556 7.907 8.274 8.667 9.079 9.505 9.982 10.545 11.12 11.82 12.62 13.573 14.647 15.853 17.274 19.05 20.597 21.431 21.85 22.065 22.195 22.243 22.214 22.167 22.113 22.037 21.932 21.829 21.735 21.637 21.544 21.45 21.354 21.265 21.173 21.076 20.991 20.883 20.773 20.703 20.628 20.543 20.448 20.335 20.251 20.168 20.063 19.995 19.907 19.852 19.727 19.603 19.49 19.43 19.294 19.199 19.118 19.02 18.788 18.674 18.545 18.403 18.244 18.061 17.821 17.156 -3 ,18197 ,KEBNE ,17042082,Thu Dec 23 03:36:17 CET,Thu Dec 23 05:16:55 CET,0.0 0.515 0.76 0.94 1.122 1.282 1.412 1.523 1.736 1.85 1.972 2.115 2.31 2.401 2.567 2.742 2.932 3.019 3.178 3.338 3.566 3.707 3.844 4.041 4.237 4.441 4.636 4.81 5.034 5.263 5.49 5.761 6.019 6.264 6.565 6.884 7.181 7.528 7.918 8.353 8.775 9.246 9.845 10.459 11.127 11.812 12.589 13.514 14.594 15.885 17.49 18.682 19.325 19.743 19.977 20.08 20.092 20.066 20.05 20.023 19.973 19.893 19.79 19.686 19.579 19.48 19.369 19.248 19.135 19.018 18.884 18.765 18.64 18.504 18.403 18.316 18.232 18.142 18.032 17.95 17.874 17.751 17.65 17.537 17.483 17.377 17.259 17.128 17.064 16.93 16.855 16.776 16.687 16.475 16.369 16.255 16.106 15.94 15.756 15.509 14.73 -4 ,1838 ,KEBNE ,17042083,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:17:52 CET,0.0 0.787 1.052 1.273 1.459 1.625 1.756 1.88 2.132 2.25 2.367 2.509 2.707 2.8 2.977 3.14 3.308 3.392 3.553 3.707 3.933 4.08 4.226 4.437 4.635 4.823 5.008 5.192 5.426 5.655 5.876 6.132 6.377 6.618 6.911 7.237 7.538 7.894 8.301 8.744 9.237 9.775 10.369 10.975 11.681 12.469 13.341 14.335 15.499 16.737 18.28 19.631 20.35 20.742 20.967 21.079 21.112 21.086 21.049 21.017 20.97 20.909 20.835 20.744 20.643 20.541 20.435 20.335 20.239 20.143 20.04 19.949 19.857 19.759 19.678 19.59 19.501 19.398 19.271 19.185 19.095 18.96 18.867 18.768 18.714 18.589 18.466 18.35 18.286 18.146 18.06 17.983 17.902 17.713 17.596 17.467 17.317 17.141 16.939 16.681 15.98 -5 ,22013 ,KEBNE ,17042084,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:17:46 CET,0.0 1.148 1.452 1.666 1.85 2.0 2.14 2.281 2.536 2.657 2.772 2.898 3.095 3.183 3.373 3.569 3.743 3.825 3.986 4.14 4.357 4.495 4.638 4.852 5.048 5.24 5.432 5.624 5.877 6.128 6.376 6.673 6.958 7.237 7.557 7.904 8.244 8.614 9.004 9.446 9.944 10.498 11.13 11.795 12.596 13.499 14.558 15.671 16.88 18.385 20.136 21.463 22.213 22.628 22.826 22.933 22.997 23.04 23.048 22.978 22.897 22.839 22.765 22.657 22.562 22.478 22.365 22.252 22.153 22.053 21.937 21.824 21.712 21.597 21.51 21.413 21.296 21.175 21.053 20.963 20.862 20.704 20.596 20.483 20.423 20.291 20.142 19.999 19.93 19.785 19.682 19.602 19.507 19.276 19.148 19.021 18.905 18.788 18.634 18.383 17.595 -6 ,13299 ,KEBNE ,17042085,Thu Dec 23 03:36:18 CET,Thu Dec 23 05:18:43 CET,0.0 0.735 0.972 1.172 1.373 1.555 1.705 1.845 2.127 2.257 2.37 2.497 2.686 2.776 2.957 3.139 3.326 3.421 3.587 3.743 3.976 4.134 4.289 4.503 4.707 4.911 5.113 5.309 5.561 5.797 6.024 6.297 6.551 6.8 7.092 7.418 7.744 8.098 8.473 8.888 9.329 9.84 10.459 11.087 11.838 12.685 13.652 14.747 15.983 17.426 19.259 20.822 21.691 22.153 22.422 22.603 22.694 22.733 22.724 22.67 22.611 22.55 22.471 22.379 22.276 22.183 22.069 21.96 21.88 21.793 21.698 21.623 21.547 21.454 21.37 21.278 21.179 21.081 20.982 20.913 20.843 20.723 20.645 20.548 20.487 20.367 20.263 20.156 20.091 19.955 19.885 19.82 19.739 19.545 19.436 19.295 19.146 19.012 18.8 18.551 18.009 -7 ,4548 ,KEBNE ,17042086,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:18:32 CET,0.0 0.856 1.142 1.403 1.642 1.847 2.012 2.165 2.456 2.585 2.698 2.822 3.015 3.114 3.293 3.463 3.635 3.724 3.907 4.079 4.309 4.46 4.618 4.828 5.02 5.217 5.413 5.599 5.837 6.068 6.304 6.586 6.853 7.126 7.441 7.797 8.14 8.517 8.933 9.374 9.846 10.378 11.004 11.651 12.413 13.314 14.394 15.643 17.068 18.663 20.386 21.73 22.634 23.128 23.393 23.596 23.694 23.706 23.697 23.675 23.63 23.577 23.518 23.439 23.35 23.283 23.211 23.138 23.075 22.998 22.904 22.824 22.75 22.667 22.596 22.518 22.435 22.337 22.221 22.138 22.06 21.944 21.847 21.746 21.687 21.565 21.458 21.349 21.29 21.15 21.048 20.963 20.882 20.713 20.612 20.493 20.359 20.204 20.003 19.7 18.687 -8 ,13345 ,KEBNE ,17042087,Thu Dec 23 03:36:19 CET,Thu Dec 23 05:19:29 CET,0.0 0.681 0.97 1.203 1.383 1.547 1.698 1.819 2.043 2.165 2.286 2.409 2.6 2.698 2.89 3.067 3.231 3.313 3.476 3.629 3.852 3.987 4.123 4.333 4.53 4.723 4.915 5.1 5.34 5.572 5.799 6.071 6.333 6.608 6.934 7.289 7.616 7.975 8.379 8.821 9.276 9.782 10.369 10.995 11.722 12.512 13.47 14.558 15.769 17.186 18.907 20.242 20.967 21.368 21.595 21.72 21.793 21.84 21.843 21.799 21.721 21.629 21.539 21.467 21.413 21.351 21.269 21.185 21.104 21.002 20.897 20.818 20.734 20.628 20.541 20.458 20.375 20.272 20.162 20.092 20.014 19.878 19.787 19.697 19.652 19.551 19.423 19.28 19.209 19.075 18.997 18.919 18.833 18.627 18.527 18.419 18.291 18.142 17.957 17.694 17.012 -9 ,3574 ,KEBNE ,17042088,Thu Dec 23 03:39:21 CET,Thu Dec 23 05:21:21 CET,0.0 0.715 0.974 1.18 1.343 1.506 1.668 1.811 2.055 2.178 2.301 2.426 2.614 2.709 2.882 3.043 3.209 3.294 3.465 3.634 3.881 4.052 4.211 4.425 4.635 4.848 5.057 5.26 5.516 5.756 6.009 6.327 6.63 6.919 7.223 7.551 7.88 8.244 8.637 9.079 9.561 10.085 10.702 11.328 12.065 12.927 13.938 15.108 16.479 17.947 19.443 20.676 21.429 21.832 21.984 22.027 22.064 22.063 22.046 22.015 21.952 21.898 21.831 21.744 21.661 21.562 21.441 21.343 21.246 21.144 21.054 20.972 20.881 20.782 20.697 20.608 20.514 20.411 20.305 20.232 20.15 20.008 19.906 19.794 19.735 19.611 19.478 19.353 19.29 19.155 19.075 18.993 18.909 18.744 18.637 18.508 18.377 18.225 18.032 17.825 17.392 -10 ,21011 ,KEBNE ,17042089,Thu Dec 23 03:39:22 CET,Thu Dec 23 05:21:38 CET,0.0 0.712 0.949 1.17 1.347 1.494 1.64 1.773 2.017 2.13 2.245 2.359 2.536 2.627 2.816 2.992 3.147 3.224 3.38 3.531 3.752 3.893 4.03 4.233 4.43 4.621 4.812 5.005 5.243 5.471 5.701 5.992 6.282 6.56 6.866 7.206 7.543 7.921 8.331 8.777 9.258 9.807 10.477 11.157 11.928 12.788 13.815 15.018 16.445 17.99 19.673 21.089 21.798 22.088 22.202 22.265 22.305 22.308 22.261 22.198 22.147 22.096 22.029 21.93 21.827 21.744 21.652 21.577 21.493 21.384 21.258 21.142 21.035 20.924 20.823 20.708 20.594 20.484 20.366 20.287 20.206 20.07 19.971 19.858 19.802 19.69 19.561 19.426 19.36 19.219 19.115 19.027 18.933 18.718 18.585 18.449 18.316 18.144 17.923 17.597 16.806 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_32_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_32_19.txt deleted file mode 100644 index 536d21f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_32_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30159 ,KEBNE ,16653589,Mon Nov 22 03:20:19 CET,Mon Nov 22 05:00:52 CET,0.0 0.304 0.511 0.682 0.808 0.935 1.082 1.222 1.45 1.565 1.695 1.83 2.05 2.154 2.359 2.556 2.731 2.802 2.929 3.077 3.288 3.415 3.533 3.716 3.906 4.079 4.244 4.412 4.627 4.841 5.05 5.289 5.511 5.751 6.03 6.333 6.657 7.039 7.428 7.784 8.157 8.599 9.141 9.707 10.375 11.161 12.058 13.04 14.199 15.64 17.459 18.993 19.909 20.471 20.814 21.064 21.271 21.411 21.485 21.532 21.561 21.564 21.552 21.54 21.516 21.481 21.442 21.411 21.378 21.329 21.267 21.21 21.152 21.084 21.031 20.984 20.936 20.894 20.827 20.776 20.733 20.65 20.588 20.523 20.49 20.419 20.341 20.266 20.225 20.088 20.071 20.02 19.974 19.88 19.821 19.737 19.638 19.527 19.399 19.238 18.975 -2 ,4200 ,KEBNE ,16653590,Mon Nov 22 03:20:19 CET,Mon Nov 22 05:00:50 CET,0.0 1.38 1.805 2.111 2.374 2.583 2.739 2.88 3.135 3.248 3.359 3.488 3.712 3.816 4.031 4.23 4.38 4.463 4.634 4.793 5.031 5.179 5.338 5.575 5.78 5.983 6.175 6.346 6.565 6.79 7.015 7.275 7.534 7.792 8.083 8.4 8.679 8.986 9.325 9.7 10.098 10.531 11.091 11.689 12.368 13.127 13.973 14.912 16.048 17.459 19.196 20.654 21.513 22.067 22.439 22.678 22.842 22.973 23.076 23.156 23.189 23.194 23.187 23.184 23.172 23.151 23.122 23.09 23.064 23.042 23.019 22.99 22.953 22.911 22.884 22.849 22.806 22.756 22.697 22.655 22.601 22.524 22.479 22.42 22.39 22.329 22.257 22.188 22.146 22.01 21.992 21.938 21.879 21.751 21.691 21.608 21.507 21.395 21.271 21.112 20.673 -3 ,19441 ,KEBNE ,16653591,Mon Nov 22 03:21:20 CET,Mon Nov 22 05:02:31 CET,0.0 0.621 0.861 1.081 1.302 1.514 1.664 1.793 2.065 2.192 2.329 2.471 2.68 2.779 2.967 3.153 3.315 3.395 3.552 3.685 3.89 4.028 4.15 4.34 4.532 4.71 4.866 5.021 5.234 5.439 5.633 5.857 6.093 6.333 6.597 6.882 7.16 7.473 7.816 8.174 8.562 9.007 9.541 10.13 10.798 11.513 12.345 13.304 14.446 15.817 17.506 18.93 19.825 20.402 20.767 21.012 21.172 21.306 21.391 21.443 21.471 21.489 21.504 21.503 21.498 21.489 21.468 21.444 21.413 21.382 21.346 21.315 21.275 21.22 21.185 21.148 21.096 21.04 20.993 20.963 20.93 20.867 20.827 20.792 20.765 20.699 20.644 20.593 20.557 20.426 20.426 20.389 20.349 20.261 20.211 20.145 20.08 19.995 19.854 19.677 19.445 -4 ,27408 ,KEBNE ,16653592,Mon Nov 22 03:21:24 CET,Mon Nov 22 05:00:11 CET,0.0 0.976 1.197 1.392 1.561 1.751 2.0 2.202 2.479 2.601 2.695 2.775 2.981 3.064 3.24 3.418 3.591 3.672 3.822 3.968 4.181 4.315 4.439 4.609 4.781 4.953 5.112 5.274 5.495 5.716 5.919 6.159 6.41 6.66 6.947 7.268 7.585 7.93 8.299 8.714 9.154 9.62 10.17 10.759 11.444 12.2 13.054 14.033 15.23 16.674 18.485 20.009 20.955 21.573 21.974 22.25 22.431 22.561 22.662 22.76 22.835 22.884 22.896 22.892 22.884 22.86 22.831 22.804 22.783 22.753 22.707 22.674 22.643 22.609 22.575 22.541 22.505 22.46 22.401 22.354 22.304 22.242 22.204 22.161 22.139 22.083 22.026 21.969 21.94 21.82 21.835 21.796 21.76 21.68 21.631 21.549 21.467 21.394 21.278 21.077 20.738 -5 ,28719 ,KEBNE ,16653593,Mon Nov 22 03:21:21 CET,Mon Nov 22 05:01:44 CET,0.0 0.852 1.139 1.356 1.521 1.669 1.795 1.912 2.139 2.25 2.364 2.502 2.727 2.823 3.002 3.166 3.33 3.411 3.566 3.73 3.973 4.12 4.258 4.448 4.631 4.805 4.978 5.146 5.343 5.524 5.716 5.959 6.197 6.44 6.725 7.04 7.341 7.694 8.097 8.504 8.902 9.352 9.883 10.407 11.033 11.753 12.629 13.661 14.839 16.201 17.965 19.579 20.536 21.131 21.534 21.834 22.024 22.141 22.219 22.268 22.296 22.314 22.319 22.309 22.288 22.269 22.236 22.191 22.155 22.117 22.072 22.037 21.999 21.945 21.894 21.845 21.803 21.762 21.708 21.668 21.626 21.548 21.488 21.428 21.39 21.321 21.265 21.212 21.186 21.064 21.075 21.027 20.974 20.876 20.832 20.784 20.699 20.59 20.47 20.323 20.071 -6 ,11193 ,KEBNE ,16653594,Mon Nov 22 03:21:20 CET,Mon Nov 22 05:02:16 CET,0.0 1.18 1.446 1.713 1.949 2.107 2.261 2.441 2.801 2.95 3.079 3.197 3.406 3.518 3.731 3.926 4.114 4.203 4.378 4.549 4.777 4.913 5.043 5.259 5.492 5.701 5.885 6.073 6.334 6.576 6.804 7.093 7.385 7.64 7.929 8.274 8.588 8.94 9.324 9.732 10.164 10.65 11.221 11.828 12.533 13.285 14.143 15.142 16.347 17.778 19.663 21.327 22.266 22.854 23.261 23.542 23.733 23.866 23.945 23.993 24.025 24.048 24.065 24.067 24.043 24.017 24.0 23.981 23.952 23.917 23.866 23.817 23.777 23.723 23.668 23.618 23.562 23.5 23.451 23.42 23.377 23.304 23.25 23.185 23.155 23.091 23.032 22.98 22.951 22.825 22.83 22.787 22.754 22.711 22.689 22.648 22.603 22.554 22.473 22.366 22.256 -7 ,25006 ,KEBNE ,16653595,Mon Nov 22 03:21:20 CET,Mon Nov 22 05:01:33 CET,0.0 1.782 2.145 2.382 2.587 2.799 2.973 3.123 3.382 3.493 3.606 3.701 3.896 3.984 4.178 4.372 4.55 4.632 4.801 4.949 5.155 5.297 5.425 5.614 5.788 5.937 6.092 6.246 6.431 6.612 6.796 7.027 7.253 7.482 7.773 8.089 8.388 8.725 9.081 9.453 9.833 10.26 10.765 11.271 11.857 12.525 13.309 14.21 15.31 16.681 18.449 19.896 20.725 21.314 21.724 22.011 22.213 22.348 22.432 22.485 22.516 22.539 22.569 22.589 22.574 22.547 22.513 22.473 22.435 22.395 22.354 22.32 22.276 22.225 22.189 22.147 22.093 22.037 21.981 21.939 21.896 21.828 21.78 21.725 21.7 21.662 21.602 21.524 21.48 21.353 21.351 21.302 21.247 21.109 21.043 20.976 20.898 20.825 20.745 20.573 20.262 -8 ,20347 ,KEBNE ,16653596,Mon Nov 22 03:21:20 CET,Mon Nov 22 05:01:47 CET,0.0 1.219 1.634 1.974 2.233 2.456 2.633 2.761 3.024 3.158 3.275 3.407 3.643 3.763 3.972 4.129 4.281 4.36 4.522 4.683 4.902 5.049 5.2 5.406 5.6 5.798 5.982 6.159 6.391 6.609 6.817 7.06 7.289 7.503 7.767 8.087 8.404 8.75 9.135 9.543 9.948 10.411 10.976 11.547 12.246 12.996 13.791 14.693 15.766 17.112 18.899 20.433 21.355 21.965 22.357 22.62 22.793 22.919 22.999 23.058 23.106 23.138 23.17 23.18 23.161 23.135 23.095 23.058 23.03 23.005 22.981 22.95 22.913 22.877 22.847 22.813 22.772 22.723 22.666 22.632 22.602 22.544 22.497 22.45 22.429 22.381 22.32 22.251 22.209 22.089 22.085 22.028 21.979 21.892 21.837 21.762 21.696 21.638 21.561 21.425 21.212 -9 ,24755 ,KEBNE ,16653597,Mon Nov 22 03:21:20 CET,Mon Nov 22 05:03:01 CET,0.0 1.6 2.026 2.311 2.562 2.78 2.961 3.141 3.477 3.621 3.751 3.876 4.113 4.247 4.472 4.693 4.904 5.002 5.194 5.387 5.67 5.82 5.955 6.195 6.454 6.695 6.929 7.147 7.41 7.687 7.942 8.214 8.486 8.761 9.079 9.448 9.785 10.131 10.517 10.925 11.33 11.784 12.341 12.897 13.509 14.211 15.044 16.003 17.156 18.501 20.123 21.469 22.288 22.793 23.155 23.452 23.633 23.747 23.819 23.856 23.887 23.902 23.901 23.902 23.889 23.864 23.841 23.812 23.776 23.735 23.691 23.653 23.603 23.551 23.511 23.461 23.409 23.368 23.317 23.27 23.224 23.158 23.114 23.064 23.037 22.975 22.898 22.814 22.78 22.664 22.678 22.641 22.6 22.494 22.424 22.347 22.292 22.237 22.141 21.989 21.543 -10 ,7921 ,KEBNE ,16653598,Mon Nov 22 03:21:23 CET,Mon Nov 22 04:59:01 CET,0.0 1.159 1.548 1.775 1.961 2.136 2.29 2.419 2.659 2.779 2.903 3.066 3.321 3.45 3.69 3.902 4.094 4.196 4.399 4.58 4.843 5.007 5.166 5.415 5.655 5.883 6.108 6.318 6.616 6.936 7.227 7.559 7.868 8.169 8.523 8.894 9.252 9.666 10.115 10.596 11.138 11.769 12.471 13.127 13.878 14.745 15.802 16.982 18.339 19.943 21.766 23.24 24.14 24.742 25.129 25.365 25.531 25.671 25.778 25.852 25.909 25.944 25.95 25.954 25.95 25.932 25.915 25.905 25.883 25.855 25.828 25.794 25.758 25.724 25.692 25.651 25.61 25.574 25.535 25.503 25.467 25.418 25.384 25.344 25.324 25.287 25.249 25.192 25.156 25.03 25.031 24.977 24.928 24.85 24.812 24.775 24.74 24.706 24.655 24.604 24.425 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_33_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_33_19.txt deleted file mode 100644 index 8412490d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_33_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21904 ,KEBNE ,17042090,Thu Dec 23 03:39:21 CET,Thu Dec 23 05:19:57 CET,0.0 0.355 0.485 0.629 0.76 0.851 0.941 1.02 1.144 1.208 1.269 1.278 1.416 1.469 1.566 1.655 1.747 1.792 1.874 1.947 2.056 2.135 2.207 2.3 2.389 2.475 2.555 2.64 2.754 2.861 2.967 3.092 3.209 3.32 3.454 3.605 3.742 3.876 4.019 4.171 4.319 4.491 4.674 4.844 5.034 5.236 5.453 5.652 5.855 6.012 6.028 5.769 5.379 5.011 4.632 4.278 3.995 3.705 3.43 3.177 2.952 2.719 2.5 2.305 2.119 1.953 1.778 1.614 1.469 1.303 1.124 0.984 0.848 0.703 0.591 0.488 0.375 0.251 0.116 0.013 -0.099 -0.283 -0.394 -0.527 -0.604 -0.75 -0.903 -1.062 -1.158 -1.347 -1.477 -1.593 -1.725 -2.043 -2.201 -2.339 -2.504 -2.716 -2.969 -3.267 -4.207 -2 ,2586 ,KEBNE ,17042091,Thu Dec 23 03:39:22 CET,Thu Dec 23 05:19:25 CET,0.0 0.273 0.414 0.545 0.648 0.744 0.832 0.915 1.058 1.125 1.189 1.227 1.372 1.432 1.536 1.629 1.728 1.776 1.863 1.946 2.053 2.121 2.188 2.287 2.389 2.482 2.564 2.644 2.74 2.829 2.927 3.051 3.154 3.257 3.385 3.529 3.654 3.788 3.949 4.107 4.25 4.404 4.588 4.783 4.995 5.218 5.452 5.687 5.93 6.118 6.136 5.91 5.596 5.255 4.961 4.667 4.377 4.125 3.906 3.668 3.464 3.249 3.031 2.831 2.632 2.447 2.239 2.051 1.916 1.793 1.638 1.493 1.349 1.211 1.102 0.982 0.852 0.725 0.603 0.519 0.422 0.257 0.146 0.032 -0.027 -0.15 -0.294 -0.462 -0.539 -0.711 -0.839 -0.955 -1.086 -1.399 -1.58 -1.803 -2.037 -2.329 -2.703 -3.13 -4.45 -3 ,12494 ,KEBNE ,17042092,Thu Dec 23 03:39:22 CET,Thu Dec 23 05:21:41 CET,0.0 0.309 0.465 0.595 0.718 0.813 0.892 0.963 1.091 1.152 1.208 1.243 1.394 1.448 1.552 1.658 1.762 1.81 1.892 1.97 2.084 2.157 2.221 2.311 2.413 2.512 2.596 2.668 2.768 2.87 2.965 3.09 3.207 3.328 3.465 3.602 3.749 3.924 4.094 4.248 4.414 4.61 4.818 5.016 5.24 5.472 5.708 5.912 6.072 6.171 6.105 5.802 5.487 5.162 4.791 4.422 4.116 3.849 3.615 3.355 3.093 2.865 2.651 2.438 2.234 2.047 1.85 1.652 1.473 1.292 1.101 0.955 0.816 0.672 0.552 0.419 0.281 0.124 -0.04 -0.149 -0.263 -0.453 -0.592 -0.729 -0.806 -0.976 -1.139 -1.295 -1.38 -1.555 -1.642 -1.742 -1.85 -2.111 -2.271 -2.438 -2.626 -2.81 -3.03 -3.354 -4.43 -4 ,9453 ,KEBNE ,17042093,Thu Dec 23 03:39:22 CET,Thu Dec 23 05:20:31 CET,0.0 0.139 0.263 0.383 0.474 0.561 0.639 0.714 0.872 0.941 1.003 1.029 1.162 1.207 1.301 1.388 1.461 1.493 1.555 1.627 1.731 1.807 1.889 1.992 2.088 2.181 2.268 2.353 2.457 2.553 2.647 2.765 2.871 2.97 3.092 3.234 3.362 3.489 3.625 3.775 3.945 4.13 4.32 4.508 4.731 4.954 5.151 5.334 5.511 5.616 5.516 5.133 4.701 4.291 3.891 3.52 3.175 2.869 2.605 2.344 2.116 1.883 1.668 1.466 1.271 1.053 0.81 0.613 0.442 0.236 0.021 -0.16 -0.355 -0.54 -0.684 -0.839 -1.002 -1.179 -1.344 -1.44 -1.544 -1.719 -1.856 -2.017 -2.1 -2.255 -2.416 -2.59 -2.685 -2.881 -3.02 -3.142 -3.274 -3.538 -3.682 -3.846 -4.036 -4.237 -4.454 -4.729 -5.524 -5 ,3868 ,KEBNE ,17042094,Thu Dec 23 03:39:21 CET,Thu Dec 23 05:19:17 CET,0.0 0.147 0.299 0.423 0.514 0.6 0.669 0.736 0.876 0.937 0.985 0.99 1.117 1.161 1.25 1.336 1.424 1.464 1.527 1.598 1.708 1.769 1.833 1.926 2.017 2.11 2.204 2.293 2.401 2.505 2.606 2.726 2.844 2.955 3.066 3.183 3.311 3.46 3.603 3.748 3.918 4.105 4.3 4.498 4.71 4.917 5.134 5.324 5.545 5.704 5.713 5.566 5.309 5.023 4.735 4.45 4.178 3.937 3.726 3.48 3.255 3.058 2.875 2.706 2.549 2.377 2.206 2.074 1.936 1.767 1.595 1.462 1.319 1.164 1.04 0.909 0.775 0.646 0.504 0.394 0.291 0.135 0.013 -0.117 -0.188 -0.32 -0.446 -0.579 -0.65 -0.808 -0.849 -0.928 -1.036 -1.242 -1.345 -1.447 -1.567 -1.754 -2.02 -2.346 -3.398 -6 ,28896 ,KEBNE ,17042095,Thu Dec 23 03:39:21 CET,Thu Dec 23 05:19:49 CET,0.0 0.248 0.39 0.526 0.646 0.732 0.819 0.899 1.027 1.091 1.153 1.187 1.327 1.378 1.481 1.59 1.69 1.732 1.806 1.871 1.957 2.013 2.074 2.182 2.293 2.388 2.475 2.548 2.634 2.731 2.831 2.946 3.048 3.146 3.265 3.405 3.547 3.691 3.823 3.958 4.096 4.245 4.417 4.618 4.856 5.084 5.31 5.538 5.774 5.976 6.052 5.832 5.515 5.167 4.779 4.43 4.133 3.857 3.626 3.381 3.146 2.933 2.734 2.538 2.337 2.133 1.914 1.74 1.604 1.456 1.297 1.167 1.034 0.894 0.768 0.64 0.518 0.383 0.246 0.156 0.043 -0.158 -0.312 -0.481 -0.562 -0.716 -0.868 -1.031 -1.122 -1.309 -1.423 -1.531 -1.645 -1.897 -2.032 -2.169 -2.326 -2.514 -2.718 -2.99 -4.232 -7 ,8436 ,KEBNE ,17042096,Thu Dec 23 03:39:21 CET,Thu Dec 23 05:19:29 CET,0.0 0.364 0.488 0.586 0.677 0.77 0.848 0.925 1.088 1.158 1.223 1.261 1.403 1.469 1.587 1.679 1.773 1.82 1.903 1.98 2.098 2.174 2.253 2.365 2.458 2.535 2.603 2.68 2.788 2.887 2.986 3.108 3.222 3.336 3.466 3.601 3.728 3.864 4.005 4.161 4.331 4.517 4.723 4.912 5.096 5.289 5.502 5.737 5.962 6.135 6.124 5.804 5.471 5.146 4.779 4.425 4.113 3.806 3.544 3.293 3.066 2.837 2.619 2.428 2.228 2.036 1.834 1.641 1.476 1.313 1.141 1.007 0.871 0.73 0.623 0.497 0.369 0.239 0.088 -0.014 -0.118 -0.301 -0.432 -0.565 -0.637 -0.787 -0.96 -1.16 -1.264 -1.455 -1.582 -1.696 -1.813 -2.058 -2.193 -2.345 -2.527 -2.752 -3.002 -3.364 -4.681 -8 ,6227 ,KEBNE ,17042097,Thu Dec 23 03:39:21 CET,Thu Dec 23 05:19:14 CET,0.0 0.332 0.421 0.533 0.659 0.755 0.823 0.889 1.034 1.1 1.165 1.209 1.354 1.419 1.526 1.614 1.708 1.75 1.821 1.895 2.004 2.071 2.134 2.238 2.341 2.437 2.532 2.612 2.728 2.847 2.96 3.095 3.203 3.305 3.425 3.553 3.681 3.839 4.012 4.188 4.366 4.541 4.732 4.931 5.136 5.332 5.574 5.843 6.106 6.335 6.391 6.176 5.838 5.483 5.159 4.825 4.501 4.211 3.935 3.647 3.408 3.181 2.969 2.763 2.545 2.331 2.114 1.943 1.787 1.612 1.431 1.263 1.08 0.887 0.731 0.566 0.395 0.209 0.007 -0.128 -0.282 -0.525 -0.676 -0.831 -0.906 -1.065 -1.244 -1.425 -1.52 -1.715 -1.839 -1.949 -2.077 -2.353 -2.5 -2.655 -2.843 -3.105 -3.425 -3.813 -5.103 -9 ,5263 ,KEBNE ,17042098,Thu Dec 23 03:39:22 CET,Thu Dec 23 05:20:51 CET,0.0 0.209 0.355 0.434 0.506 0.58 0.646 0.711 0.838 0.898 0.96 0.988 1.116 1.163 1.275 1.379 1.459 1.496 1.567 1.645 1.747 1.809 1.873 1.964 2.056 2.153 2.252 2.339 2.436 2.524 2.611 2.725 2.836 2.939 3.045 3.158 3.271 3.408 3.563 3.72 3.881 4.053 4.231 4.403 4.606 4.81 5.047 5.276 5.483 5.629 5.542 5.217 4.862 4.48 4.118 3.786 3.446 3.133 2.835 2.514 2.271 2.053 1.821 1.597 1.388 1.23 1.075 0.915 0.767 0.616 0.47 0.343 0.201 0.052 -0.056 -0.176 -0.324 -0.491 -0.673 -0.804 -0.926 -1.091 -1.212 -1.354 -1.427 -1.568 -1.708 -1.867 -1.968 -2.163 -2.285 -2.418 -2.564 -2.866 -3.035 -3.21 -3.396 -3.586 -3.827 -4.241 -5.486 -10 ,32335 ,KEBNE ,17042099,Thu Dec 23 03:39:22 CET,Thu Dec 23 05:19:44 CET,0.0 0.221 0.339 0.439 0.516 0.59 0.674 0.761 0.905 0.962 1.02 1.061 1.2 1.242 1.331 1.42 1.508 1.55 1.617 1.68 1.771 1.836 1.91 2.02 2.127 2.228 2.324 2.417 2.532 2.655 2.77 2.901 3.017 3.13 3.247 3.369 3.499 3.639 3.786 3.948 4.111 4.285 4.49 4.67 4.877 5.111 5.356 5.586 5.759 5.865 5.872 5.677 5.304 4.868 4.479 4.114 3.764 3.445 3.162 2.885 2.646 2.434 2.229 1.996 1.759 1.552 1.356 1.186 1.039 0.881 0.698 0.542 0.395 0.254 0.143 0.019 -0.11 -0.245 -0.384 -0.476 -0.583 -0.76 -0.876 -1.006 -1.088 -1.27 -1.446 -1.635 -1.739 -1.921 -2.005 -2.089 -2.177 -2.387 -2.514 -2.677 -2.859 -3.045 -3.285 -3.62 -4.595 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_33_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_33_20.txt deleted file mode 100644 index 5c3251cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_33_20.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8281 ,KEBNE ,16653599,Mon Nov 22 03:21:29 CET,Mon Nov 22 05:03:20 CET,0.0 2.243 2.808 3.208 3.54 3.832 4.105 4.342 4.723 4.922 5.118 5.372 5.623 5.775 6.034 6.293 6.543 6.637 6.803 6.976 7.234 7.405 7.563 7.748 7.888 8.026 8.178 8.342 8.548 8.756 8.984 9.248 9.481 9.679 9.867 10.074 10.275 10.481 10.705 10.941 11.177 11.435 11.668 11.853 12.091 12.328 12.484 12.571 12.604 12.398 11.686 10.579 9.555 8.621 7.781 7.035 6.422 5.915 5.483 5.09 4.754 4.427 4.098 3.788 3.525 3.273 2.999 2.766 2.569 2.366 2.146 1.964 1.787 1.611 1.481 1.335 1.189 1.04 0.867 0.75 0.642 0.483 0.363 0.224 0.157 0.026 -0.123 -0.275 -0.358 -0.542 -0.615 -0.708 -0.82 -1.051 -1.166 -1.291 -1.432 -1.627 -1.875 -2.182 -2.959 -2 ,5656 ,KEBNE ,16653600,Mon Nov 22 03:21:29 CET,Mon Nov 22 05:03:30 CET,0.0 2.296 2.85 3.265 3.587 3.862 4.118 4.344 4.715 4.878 5.046 5.259 5.444 5.541 5.775 5.962 6.126 6.23 6.439 6.606 6.826 6.981 7.129 7.316 7.495 7.67 7.837 7.991 8.175 8.362 8.55 8.775 8.973 9.163 9.385 9.605 9.818 10.049 10.27 10.51 10.768 11.043 11.348 11.62 11.871 12.088 12.305 12.497 12.555 12.495 12.186 11.453 10.719 9.949 9.162 8.441 7.858 7.297 6.749 6.219 5.778 5.407 5.067 4.738 4.434 4.142 3.822 3.548 3.318 3.07 2.821 2.62 2.416 2.204 2.029 1.836 1.652 1.472 1.257 1.092 0.929 0.706 0.559 0.419 0.349 0.181 -0.028 -0.243 -0.344 -0.546 -0.694 -0.822 -0.941 -1.236 -1.388 -1.555 -1.762 -1.979 -2.275 -2.678 -4.012 -3 ,30871 ,KEBNE ,16653601,Mon Nov 22 03:21:25 CET,Mon Nov 22 05:03:31 CET,0.0 2.203 2.882 3.338 3.763 4.108 4.416 4.683 5.12 5.316 5.488 5.711 5.941 6.062 6.311 6.569 6.799 6.918 7.114 7.273 7.49 7.633 7.779 7.966 8.122 8.274 8.42 8.561 8.75 8.931 9.118 9.35 9.553 9.733 9.927 10.124 10.315 10.516 10.717 10.942 11.168 11.397 11.637 11.844 12.079 12.331 12.603 12.827 12.902 12.694 12.029 11.109 10.311 9.612 8.974 8.336 7.728 7.136 6.631 6.151 5.752 5.393 5.027 4.698 4.407 4.147 3.894 3.651 3.422 3.183 2.941 2.757 2.572 2.365 2.191 2.012 1.843 1.672 1.485 1.358 1.232 1.028 0.887 0.737 0.653 0.464 0.272 0.082 -0.009 -0.197 -0.297 -0.401 -0.509 -0.76 -0.909 -1.066 -1.244 -1.449 -1.634 -1.861 -2.706 -4 ,10239 ,KEBNE ,16653602,Mon Nov 22 03:21:23 CET,Mon Nov 22 05:02:31 CET,0.0 2.177 2.716 3.075 3.339 3.587 3.81 4.023 4.398 4.538 4.676 4.874 5.077 5.187 5.403 5.608 5.789 5.867 6.028 6.181 6.399 6.546 6.693 6.885 7.061 7.219 7.355 7.503 7.709 7.893 8.063 8.271 8.469 8.642 8.838 9.059 9.27 9.494 9.735 9.968 10.159 10.377 10.65 10.912 11.201 11.461 11.67 11.837 12.005 11.932 11.397 10.567 9.649 8.84 8.127 7.453 6.847 6.28 5.797 5.308 4.891 4.553 4.255 3.963 3.683 3.42 3.13 2.863 2.622 2.365 2.114 1.906 1.67 1.434 1.265 1.09 0.895 0.677 0.44 0.273 0.112 -0.138 -0.319 -0.498 -0.588 -0.759 -0.95 -1.154 -1.25 -1.464 -1.608 -1.729 -1.859 -2.112 -2.253 -2.434 -2.635 -2.822 -3.032 -3.335 -4.257 -5 ,16785 ,KEBNE ,16653603,Mon Nov 22 03:22:22 CET,Mon Nov 22 05:04:47 CET,0.0 2.597 3.098 3.527 3.909 4.231 4.492 4.727 5.133 5.32 5.486 5.693 5.927 6.091 6.41 6.68 6.915 7.025 7.223 7.41 7.674 7.826 7.956 8.141 8.303 8.468 8.627 8.756 8.934 9.112 9.276 9.481 9.69 9.877 10.063 10.273 10.457 10.652 10.89 11.169 11.414 11.662 11.912 12.083 12.262 12.464 12.722 12.904 12.9 12.696 12.244 11.344 10.383 9.45 8.603 7.866 7.217 6.635 6.089 5.542 5.103 4.734 4.404 4.086 3.791 3.524 3.226 2.961 2.738 2.501 2.244 2.029 1.824 1.603 1.43 1.264 1.083 0.886 0.702 0.572 0.416 0.186 0.041 -0.117 -0.197 -0.36 -0.529 -0.708 -0.811 -1.011 -1.128 -1.247 -1.37 -1.632 -1.768 -1.927 -2.124 -2.349 -2.585 -2.884 -3.669 -6 ,193 ,KEBNE ,16653604,Mon Nov 22 03:22:21 CET,Mon Nov 22 05:05:57 CET,0.0 2.6 3.171 3.556 3.893 4.171 4.393 4.583 4.935 5.118 5.29 5.473 5.675 5.785 5.984 6.174 6.365 6.45 6.627 6.8 7.021 7.156 7.282 7.497 7.712 7.886 8.046 8.215 8.444 8.629 8.774 8.953 9.127 9.277 9.465 9.682 9.875 10.084 10.307 10.529 10.742 10.956 11.158 11.367 11.596 11.818 12.051 12.244 12.405 12.39 12.023 11.255 10.401 9.686 9.07 8.492 7.946 7.422 6.986 6.549 6.16 5.813 5.498 5.208 4.916 4.637 4.361 4.123 3.921 3.715 3.497 3.308 3.114 2.913 2.766 2.626 2.474 2.318 2.146 2.027 1.908 1.71 1.568 1.421 1.351 1.218 1.053 0.872 0.788 0.593 0.5 0.398 0.295 0.074 -0.05 -0.183 -0.328 -0.508 -0.757 -1.15 -2.3 -7 ,620 ,KEBNE ,16653605,Mon Nov 22 03:22:22 CET,Mon Nov 22 05:04:46 CET,0.0 3.072 3.497 3.816 4.102 4.362 4.581 4.797 5.156 5.315 5.467 5.644 5.845 5.961 6.159 6.334 6.544 6.659 6.847 7.016 7.287 7.456 7.613 7.84 8.046 8.214 8.349 8.471 8.642 8.804 8.966 9.179 9.361 9.536 9.734 9.927 10.099 10.271 10.472 10.711 10.932 11.153 11.389 11.614 11.877 12.082 12.26 12.452 12.56 12.512 12.071 11.262 10.461 9.702 9.011 8.359 7.792 7.279 6.816 6.372 5.998 5.631 5.28 4.972 4.67 4.39 4.117 3.882 3.658 3.408 3.147 2.922 2.683 2.434 2.258 2.09 1.918 1.734 1.529 1.379 1.233 1.0 0.828 0.646 0.556 0.387 0.21 0.018 -0.098 -0.327 -0.466 -0.596 -0.747 -1.082 -1.252 -1.429 -1.649 -1.9 -2.173 -2.525 -3.704 -9 ,16132 ,KEBNE ,16653607,Mon Nov 22 03:22:21 CET,Mon Nov 22 05:04:22 CET,0.0 3.052 3.568 3.974 4.312 4.567 4.785 4.991 5.344 5.492 5.648 5.869 6.09 6.23 6.485 6.713 6.931 7.038 7.24 7.415 7.656 7.812 7.972 8.22 8.449 8.658 8.866 9.044 9.238 9.423 9.615 9.849 10.063 10.247 10.462 10.712 10.942 11.178 11.432 11.692 11.955 12.208 12.445 12.678 12.959 13.217 13.43 13.644 13.869 13.878 13.404 12.516 11.585 10.755 10.0 9.317 8.721 8.213 7.768 7.272 6.83 6.419 6.001 5.611 5.259 4.944 4.637 4.396 4.209 3.991 3.715 3.488 3.278 3.057 2.875 2.688 2.484 2.275 2.083 1.947 1.801 1.582 1.437 1.276 1.195 1.031 0.836 0.618 0.504 0.296 0.153 0.01 -0.135 -0.444 -0.615 -0.802 -1.004 -1.234 -1.52 -1.999 -3.377 -10 ,11853 ,KEBNE ,16653608,Mon Nov 22 03:22:22 CET,Mon Nov 22 05:04:35 CET,0.0 2.403 3.073 3.565 3.933 4.225 4.481 4.752 5.204 5.372 5.528 5.745 5.966 6.092 6.299 6.449 6.592 6.67 6.841 7.014 7.23 7.371 7.517 7.702 7.875 8.034 8.177 8.331 8.527 8.714 8.896 9.084 9.273 9.464 9.644 9.837 10.038 10.246 10.461 10.675 10.893 11.124 11.39 11.625 11.855 12.129 12.402 12.658 12.824 12.655 11.942 10.81 9.808 8.874 7.993 7.197 6.524 5.96 5.482 4.968 4.536 4.145 3.782 3.451 3.141 2.861 2.547 2.272 2.037 1.783 1.511 1.292 1.094 0.885 0.714 0.53 0.326 0.126 -0.063 -0.201 -0.356 -0.604 -0.775 -0.945 -1.03 -1.206 -1.4 -1.597 -1.689 -1.883 -1.981 -2.092 -2.217 -2.475 -2.612 -2.782 -2.972 -3.159 -3.365 -3.666 -4.999 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_33_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_33_29.txt deleted file mode 100644 index 2032c8d4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_33_29.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24143 ,KEBNE ,16653609,Mon Nov 22 03:23:23 CET,Mon Nov 22 05:06:30 CET,0.0 1.087 1.401 1.646 1.841 2.004 2.154 2.281 2.48 2.576 2.676 2.768 2.93 3.013 3.186 3.356 3.497 3.565 3.72 3.847 4.027 4.15 4.249 4.377 4.521 4.66 4.779 4.89 5.035 5.18 5.321 5.488 5.648 5.797 5.943 6.114 6.279 6.452 6.627 6.797 6.986 7.193 7.408 7.592 7.801 8.068 8.34 8.562 8.708 8.728 8.484 7.93 7.358 6.774 6.263 5.816 5.397 5.009 4.672 4.347 4.08 3.838 3.617 3.411 3.196 3.007 2.832 2.678 2.544 2.399 2.248 2.114 1.971 1.83 1.727 1.621 1.501 1.376 1.251 1.16 1.07 0.928 0.818 0.711 0.663 0.56 0.457 0.339 0.267 0.105 0.041 -0.044 -0.131 -0.3 -0.394 -0.481 -0.59 -0.723 -0.869 -1.085 -1.731 -2 ,30256 ,KEBNE ,16653610,Mon Nov 22 03:23:23 CET,Mon Nov 22 05:04:56 CET,0.0 0.858 1.102 1.31 1.506 1.695 1.87 2.024 2.327 2.463 2.578 2.7 2.881 2.974 3.166 3.366 3.55 3.63 3.751 3.857 4.025 4.138 4.247 4.394 4.533 4.662 4.797 4.942 5.108 5.247 5.367 5.505 5.652 5.803 5.986 6.179 6.354 6.531 6.697 6.863 7.053 7.251 7.465 7.701 7.934 8.127 8.271 8.335 8.337 8.211 7.737 7.013 6.341 5.684 5.084 4.537 4.031 3.586 3.245 2.92 2.623 2.351 2.097 1.862 1.631 1.419 1.205 1.018 0.855 0.679 0.482 0.315 0.153 -0.006 -0.134 -0.269 -0.402 -0.551 -0.714 -0.826 -0.937 -1.094 -1.197 -1.304 -1.357 -1.476 -1.623 -1.776 -1.851 -2.016 -2.08 -2.16 -2.246 -2.434 -2.535 -2.651 -2.782 -2.942 -3.125 -3.336 -4.227 -3 ,8924 ,KEBNE ,16653611,Mon Nov 22 03:23:23 CET,Mon Nov 22 05:05:23 CET,0.0 1.141 1.449 1.68 1.872 2.048 2.208 2.328 2.539 2.654 2.767 2.891 3.08 3.175 3.344 3.5 3.652 3.732 3.88 3.993 4.136 4.229 4.312 4.449 4.594 4.719 4.825 4.928 5.076 5.198 5.312 5.458 5.587 5.7 5.837 6.0 6.14 6.288 6.449 6.609 6.768 6.931 7.116 7.298 7.501 7.697 7.865 8.006 8.08 7.997 7.648 7.007 6.398 5.802 5.258 4.781 4.369 4.0 3.662 3.309 3.014 2.751 2.483 2.231 2.013 1.829 1.64 1.457 1.293 1.124 0.955 0.806 0.64 0.489 0.374 0.24 0.101 -0.035 -0.166 -0.259 -0.346 -0.473 -0.569 -0.672 -0.725 -0.847 -0.985 -1.113 -1.183 -1.351 -1.399 -1.473 -1.557 -1.775 -1.901 -2.031 -2.168 -2.328 -2.557 -2.871 -4.018 -4 ,7929 ,KEBNE ,16653612,Mon Nov 22 03:23:24 CET,Mon Nov 22 05:03:50 CET,0.0 1.011 1.298 1.535 1.72 1.883 2.039 2.174 2.406 2.523 2.643 2.766 2.935 3.014 3.174 3.318 3.441 3.499 3.623 3.752 3.929 4.026 4.114 4.247 4.381 4.537 4.689 4.81 4.956 5.098 5.246 5.418 5.568 5.689 5.811 5.951 6.101 6.262 6.418 6.582 6.75 6.921 7.13 7.319 7.483 7.636 7.728 7.754 7.714 7.478 6.844 5.931 5.106 4.381 3.737 3.151 2.65 2.202 1.794 1.398 1.068 0.768 0.482 0.218 -0.009 -0.215 -0.445 -0.651 -0.821 -0.994 -1.178 -1.333 -1.497 -1.671 -1.801 -1.938 -2.08 -2.221 -2.367 -2.464 -2.571 -2.74 -2.859 -2.981 -3.039 -3.156 -3.291 -3.444 -3.52 -3.694 -3.786 -3.868 -3.95 -4.125 -4.235 -4.37 -4.502 -4.634 -4.795 -5.025 -6.125 -5 ,30823 ,KEBNE ,16653613,Mon Nov 22 03:23:23 CET,Mon Nov 22 05:05:49 CET,0.0 0.814 1.093 1.295 1.47 1.601 1.732 1.881 2.151 2.257 2.357 2.462 2.636 2.721 2.875 3.007 3.134 3.19 3.297 3.405 3.562 3.658 3.761 3.916 4.057 4.199 4.335 4.46 4.609 4.749 4.895 5.073 5.24 5.401 5.588 5.786 5.959 6.146 6.341 6.533 6.732 6.956 7.197 7.414 7.648 7.885 8.119 8.318 8.447 8.378 7.941 7.188 6.486 5.897 5.371 4.899 4.487 4.097 3.71 3.33 3.04 2.796 2.558 2.319 2.112 1.929 1.734 1.565 1.418 1.267 1.101 0.964 0.829 0.689 0.579 0.467 0.356 0.246 0.141 0.056 -0.046 -0.202 -0.3 -0.403 -0.46 -0.579 -0.707 -0.843 -0.911 -1.066 -1.139 -1.241 -1.335 -1.498 -1.596 -1.726 -1.869 -2.021 -2.179 -2.385 -2.976 -6 ,23724 ,KEBNE ,16653614,Mon Nov 22 03:23:27 CET,Mon Nov 22 05:07:05 CET,0.0 1.212 1.571 1.806 2.001 2.197 2.368 2.527 2.794 2.9 3.0 3.088 3.253 3.333 3.504 3.663 3.81 3.877 4.011 4.149 4.329 4.439 4.536 4.675 4.838 4.981 5.099 5.215 5.35 5.496 5.647 5.806 5.957 6.084 6.236 6.406 6.54 6.677 6.83 6.992 7.136 7.296 7.49 7.675 7.877 8.063 8.212 8.357 8.484 8.452 8.093 7.448 6.797 6.205 5.695 5.215 4.774 4.387 4.04 3.71 3.445 3.183 2.928 2.697 2.474 2.274 2.083 1.9 1.74 1.578 1.393 1.231 1.069 0.917 0.794 0.663 0.539 0.419 0.284 0.173 0.049 -0.143 -0.266 -0.395 -0.463 -0.584 -0.714 -0.885 -0.972 -1.148 -1.24 -1.343 -1.451 -1.694 -1.835 -1.988 -2.141 -2.33 -2.553 -2.854 -4.194 -8 ,13852 ,KEBNE ,16653616,Mon Nov 22 03:23:24 CET,Mon Nov 22 05:04:10 CET,0.0 0.977 1.238 1.458 1.656 1.842 1.994 2.121 2.364 2.462 2.557 2.653 2.811 2.886 3.035 3.166 3.282 3.335 3.449 3.57 3.736 3.836 3.933 4.086 4.246 4.393 4.524 4.64 4.777 4.914 5.053 5.234 5.412 5.566 5.734 5.914 6.057 6.217 6.381 6.529 6.692 6.878 7.072 7.256 7.421 7.558 7.717 7.868 7.955 7.886 7.544 6.985 6.463 5.92 5.373 4.893 4.456 4.025 3.637 3.255 2.941 2.683 2.445 2.205 1.991 1.79 1.576 1.398 1.238 1.065 0.885 0.736 0.58 0.425 0.306 0.185 0.074 -0.037 -0.163 -0.255 -0.356 -0.513 -0.625 -0.736 -0.794 -0.95 -1.131 -1.302 -1.386 -1.564 -1.654 -1.741 -1.843 -2.08 -2.205 -2.344 -2.488 -2.649 -2.828 -3.098 -4.328 -9 ,4467 ,KEBNE ,16653617,Mon Nov 22 03:23:24 CET,Mon Nov 22 05:05:32 CET,0.0 1.174 1.471 1.698 1.875 2.049 2.223 2.392 2.659 2.76 2.858 2.956 3.124 3.201 3.348 3.5 3.639 3.699 3.823 3.953 4.129 4.236 4.333 4.457 4.582 4.703 4.815 4.929 5.08 5.217 5.338 5.479 5.616 5.732 5.873 6.052 6.216 6.384 6.553 6.732 6.937 7.15 7.372 7.59 7.826 8.07 8.29 8.484 8.653 8.642 8.258 7.619 7.013 6.519 6.073 5.658 5.293 4.946 4.645 4.319 4.027 3.779 3.534 3.31 3.117 2.933 2.729 2.544 2.396 2.245 2.079 1.927 1.753 1.567 1.429 1.293 1.153 1.013 0.867 0.771 0.681 0.51 0.393 0.28 0.219 0.101 -0.025 -0.165 -0.239 -0.414 -0.512 -0.609 -0.697 -0.878 -0.995 -1.129 -1.265 -1.401 -1.543 -1.734 -2.271 -10 ,12989 ,KEBNE ,16653618,Mon Nov 22 03:23:24 CET,Mon Nov 22 05:05:07 CET,0.0 0.581 0.888 1.084 1.258 1.411 1.542 1.67 1.91 2.02 2.126 2.234 2.396 2.477 2.651 2.801 2.939 3.002 3.119 3.227 3.363 3.469 3.58 3.728 3.872 4.005 4.126 4.234 4.375 4.513 4.633 4.775 4.902 5.035 5.199 5.365 5.518 5.688 5.864 6.043 6.238 6.435 6.635 6.811 7.0 7.19 7.338 7.469 7.53 7.365 6.778 5.972 5.257 4.612 4.017 3.482 3.032 2.633 2.279 1.922 1.642 1.377 1.124 0.9 0.679 0.465 0.239 0.051 -0.117 -0.312 -0.529 -0.708 -0.874 -1.037 -1.171 -1.317 -1.47 -1.628 -1.784 -1.894 -2.01 -2.183 -2.314 -2.466 -2.541 -2.693 -2.849 -3.021 -3.115 -3.297 -3.387 -3.49 -3.602 -3.823 -3.942 -4.085 -4.249 -4.429 -4.643 -4.966 -6.46 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_34_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_34_37.txt deleted file mode 100644 index ebf1d593..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_34_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26357 ,KEBNE ,17042101,Thu Dec 23 03:41:27 CET,Thu Dec 23 05:21:52 CET,0.0 1.541 1.958 2.245 2.463 2.642 2.784 2.91 3.171 3.3 3.42 3.559 3.748 3.857 4.064 4.262 4.451 4.541 4.716 4.878 5.103 5.245 5.375 5.562 5.757 5.947 6.124 6.304 6.531 6.743 6.951 7.192 7.424 7.651 7.901 8.19 8.508 8.863 9.217 9.599 10.001 10.442 10.964 11.505 12.132 12.83 13.654 14.554 15.625 16.906 18.455 19.724 20.435 20.843 21.056 21.153 21.218 21.275 21.281 21.244 21.199 21.152 21.085 21.017 20.946 20.879 20.812 20.743 20.668 20.573 20.474 20.388 20.306 20.202 20.118 20.053 19.985 19.908 19.822 19.757 19.684 19.58 19.517 19.456 19.405 19.279 19.164 19.056 19.0 18.867 18.802 18.732 18.655 18.493 18.401 18.314 18.225 18.106 17.926 17.738 17.472 -2 ,13817 ,KEBNE ,17042102,Thu Dec 23 03:41:27 CET,Thu Dec 23 05:23:04 CET,0.0 1.525 1.958 2.26 2.525 2.75 2.954 3.13 3.425 3.556 3.678 3.858 4.055 4.155 4.358 4.53 4.694 4.783 4.956 5.117 5.363 5.518 5.663 5.869 6.065 6.251 6.421 6.576 6.794 7.018 7.227 7.488 7.744 7.991 8.273 8.574 8.87 9.187 9.527 9.906 10.314 10.744 11.218 11.717 12.319 12.96 13.698 14.558 15.511 16.6 17.984 19.146 19.765 20.13 20.361 20.518 20.61 20.639 20.641 20.635 20.605 20.547 20.49 20.424 20.353 20.296 20.238 20.182 20.125 20.052 19.97 19.912 19.849 19.779 19.725 19.675 19.628 19.558 19.482 19.43 19.363 19.246 19.171 19.101 19.065 18.98 18.885 18.793 18.746 18.627 18.583 18.526 18.458 18.287 18.196 18.087 17.949 17.802 17.666 17.462 16.823 -3 ,30876 ,KEBNE ,17042104,Thu Dec 23 03:41:27 CET,Thu Dec 23 05:22:41 CET,0.0 1.458 1.891 2.237 2.511 2.754 2.953 3.117 3.409 3.539 3.665 3.821 4.01 4.121 4.333 4.517 4.714 4.811 4.979 5.137 5.346 5.485 5.632 5.85 6.057 6.244 6.417 6.586 6.806 7.016 7.206 7.451 7.719 7.978 8.27 8.592 8.879 9.188 9.532 9.89 10.282 10.754 11.285 11.801 12.392 13.058 13.815 14.678 15.706 16.873 18.294 19.489 20.178 20.561 20.789 20.957 21.06 21.103 21.113 21.079 21.015 20.944 20.887 20.837 20.773 20.706 20.629 20.562 20.51 20.448 20.379 20.318 20.246 20.162 20.094 20.023 19.946 19.868 19.784 19.721 19.655 19.552 19.488 19.409 19.36 19.266 19.171 19.043 18.977 18.851 18.784 18.712 18.62 18.432 18.339 18.252 18.145 17.996 17.8 17.545 17.09 -4 ,10032 ,KEBNE ,17042105,Thu Dec 23 03:41:27 CET,Thu Dec 23 05:23:31 CET,0.0 1.479 1.961 2.28 2.546 2.796 3.017 3.201 3.535 3.689 3.822 3.991 4.2 4.31 4.506 4.691 4.865 4.952 5.119 5.277 5.503 5.646 5.788 5.988 6.17 6.351 6.531 6.707 6.943 7.18 7.404 7.661 7.899 8.13 8.406 8.707 8.98 9.283 9.615 9.98 10.363 10.784 11.293 11.819 12.435 13.128 13.98 14.94 15.982 17.179 18.598 19.747 20.413 20.8 20.998 21.088 21.117 21.111 21.063 20.973 20.881 20.814 20.743 20.648 20.548 20.454 20.349 20.268 20.195 20.109 20.014 19.934 19.847 19.745 19.668 19.591 19.512 19.423 19.306 19.217 19.138 19.014 18.919 18.825 18.776 18.666 18.531 18.4 18.344 18.221 18.149 18.066 17.986 17.848 17.758 17.627 17.503 17.368 17.177 16.953 16.342 -5 ,21626 ,KEBNE ,17042107,Thu Dec 23 03:41:27 CET,Thu Dec 23 05:22:39 CET,0.0 1.57 1.986 2.244 2.477 2.696 2.88 3.032 3.301 3.427 3.546 3.687 3.873 3.983 4.217 4.429 4.606 4.692 4.87 5.035 5.265 5.421 5.569 5.781 5.992 6.182 6.355 6.518 6.748 6.973 7.176 7.406 7.63 7.847 8.11 8.429 8.721 9.029 9.372 9.752 10.143 10.59 11.141 11.679 12.299 13.003 13.827 14.791 15.865 17.059 18.537 19.766 20.423 20.832 21.105 21.266 21.358 21.403 21.4 21.351 21.289 21.22 21.135 21.041 20.95 20.864 20.775 20.694 20.614 20.533 20.445 20.371 20.293 20.201 20.139 20.086 20.02 19.955 19.882 19.815 19.747 19.655 19.593 19.533 19.503 19.434 19.346 19.247 19.196 19.075 19.032 18.975 18.921 18.792 18.71 18.621 18.531 18.413 18.249 18.067 17.707 -6 ,24158 ,KEBNE ,17042108,Thu Dec 23 03:41:27 CET,Thu Dec 23 05:22:56 CET,0.0 1.867 2.362 2.697 2.961 3.209 3.426 3.602 3.925 4.101 4.259 4.429 4.642 4.76 4.984 5.195 5.385 5.479 5.665 5.833 6.067 6.204 6.34 6.562 6.758 6.928 7.109 7.3 7.542 7.768 7.991 8.258 8.517 8.769 9.054 9.379 9.685 9.998 10.334 10.708 11.095 11.525 12.036 12.537 13.171 13.937 14.768 15.669 16.754 17.977 19.376 20.455 20.991 21.296 21.501 21.594 21.619 21.611 21.582 21.551 21.525 21.473 21.392 21.321 21.261 21.187 21.099 21.017 20.941 20.869 20.786 20.706 20.617 20.522 20.459 20.39 20.314 20.234 20.139 20.07 19.998 19.88 19.804 19.733 19.686 19.577 19.473 19.353 19.284 19.155 19.075 18.983 18.889 18.682 18.577 18.47 18.356 18.216 18.015 17.774 17.257 -7 ,9507 ,KEBNE ,17042109,Thu Dec 23 03:41:27 CET,Thu Dec 23 05:22:37 CET,0.0 1.562 2.021 2.302 2.509 2.721 2.934 3.138 3.507 3.668 3.798 3.931 4.123 4.233 4.445 4.64 4.841 4.936 5.1 5.259 5.483 5.623 5.761 5.978 6.202 6.413 6.609 6.793 7.023 7.24 7.446 7.674 7.903 8.136 8.397 8.698 8.982 9.297 9.641 10.004 10.391 10.826 11.358 11.888 12.503 13.181 13.955 14.807 15.731 16.838 18.167 19.263 19.906 20.295 20.555 20.72 20.787 20.81 20.832 20.84 20.819 20.797 20.768 20.716 20.639 20.569 20.493 20.403 20.319 20.232 20.144 20.077 20.007 19.922 19.851 19.774 19.687 19.598 19.508 19.451 19.392 19.285 19.192 19.089 19.04 18.95 18.862 18.758 18.707 18.593 18.546 18.481 18.413 18.251 18.158 18.078 17.973 17.844 17.692 17.477 16.662 -8 ,12055 ,KEBNE ,17042111,Thu Dec 23 03:41:27 CET,Thu Dec 23 05:22:07 CET,0.0 1.35 1.748 2.044 2.322 2.579 2.777 2.932 3.243 3.398 3.548 3.723 3.919 4.027 4.241 4.433 4.607 4.691 4.866 5.038 5.28 5.431 5.574 5.789 5.987 6.165 6.341 6.523 6.764 6.999 7.219 7.475 7.733 7.98 8.259 8.573 8.881 9.237 9.625 10.03 10.452 10.932 11.512 12.096 12.738 13.442 14.267 15.189 16.285 17.512 18.94 20.153 20.805 21.158 21.382 21.499 21.535 21.532 21.512 21.48 21.451 21.42 21.356 21.283 21.223 21.171 21.107 21.032 20.963 20.893 20.822 20.767 20.705 20.617 20.544 20.476 20.402 20.313 20.223 20.166 20.096 19.972 19.895 19.812 19.763 19.669 19.579 19.487 19.433 19.306 19.27 19.196 19.101 18.919 18.826 18.718 18.611 18.504 18.358 18.187 17.642 -9 ,8309 ,KEBNE ,17042112,Thu Dec 23 03:44:34 CET,Thu Dec 23 05:25:18 CET,0.0 2.005 2.52 2.862 3.092 3.278 3.473 3.653 3.944 4.075 4.197 4.349 4.533 4.637 4.833 5.007 5.175 5.257 5.412 5.563 5.792 5.934 6.068 6.27 6.457 6.637 6.818 6.987 7.197 7.416 7.631 7.877 8.124 8.371 8.661 8.977 9.284 9.62 9.979 10.361 10.757 11.206 11.728 12.261 12.864 13.501 14.277 15.206 16.276 17.499 18.898 19.957 20.543 20.88 21.043 21.13 21.17 21.182 21.145 21.098 21.063 20.983 20.888 20.802 20.72 20.651 20.571 20.472 20.382 20.3 20.206 20.123 20.034 19.95 19.889 19.816 19.724 19.628 19.529 19.449 19.368 19.248 19.178 19.122 19.091 18.997 18.875 18.759 18.706 18.582 18.528 18.454 18.367 18.184 18.102 18.019 17.913 17.798 17.672 17.497 16.943 -10 ,29171 ,KEBNE ,17042113,Thu Dec 23 03:44:34 CET,Thu Dec 23 05:26:11 CET,0.0 2.036 2.54 2.92 3.227 3.472 3.676 3.861 4.197 4.34 4.474 4.643 4.848 4.959 5.155 5.336 5.509 5.592 5.757 5.924 6.154 6.3 6.448 6.658 6.851 7.025 7.196 7.381 7.614 7.821 8.028 8.282 8.525 8.776 9.061 9.361 9.637 9.939 10.288 10.644 11.021 11.455 11.947 12.445 13.027 13.703 14.545 15.523 16.601 17.787 19.195 20.379 21.077 21.518 21.768 21.885 21.913 21.884 21.843 21.788 21.731 21.689 21.658 21.609 21.54 21.469 21.389 21.305 21.224 21.149 21.079 21.007 20.919 20.82 20.743 20.665 20.58 20.493 20.411 20.352 20.292 20.202 20.128 20.047 20.004 19.905 19.812 19.715 19.661 19.537 19.476 19.41 19.341 19.19 19.1 18.994 18.872 18.711 18.546 18.29 17.503 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_34_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_34_38.txt deleted file mode 100644 index 635a668a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_34_38.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,19921 ,KEBNE ,16653621,Mon Nov 22 03:23:23 CET,Mon Nov 22 05:05:21 CET,0.0 1.472 1.841 2.058 2.263 2.44 2.593 2.742 2.998 3.104 3.207 3.334 3.514 3.616 3.819 4.018 4.192 4.26 4.394 4.535 4.728 4.837 4.957 5.129 5.276 5.413 5.552 5.694 5.86 6.027 6.197 6.391 6.575 6.762 6.972 7.202 7.397 7.595 7.808 8.033 8.28 8.548 8.88 9.216 9.598 9.981 10.342 10.742 11.133 11.398 11.572 11.574 11.361 11.099 10.873 10.639 10.384 10.113 9.871 9.622 9.415 9.234 9.043 8.83 8.637 8.474 8.29 8.127 7.992 7.837 7.682 7.558 7.431 7.303 7.194 7.08 6.97 6.866 6.748 6.643 6.514 6.329 6.223 6.118 6.066 5.97 5.871 5.764 5.708 5.574 5.52 5.454 5.383 5.245 5.163 5.054 4.932 4.775 4.593 4.394 4.037 -4 ,31432 ,KEBNE ,16653622,Mon Nov 22 03:23:24 CET,Mon Nov 22 05:07:40 CET,0.0 2.035 2.439 2.764 3.035 3.238 3.406 3.563 3.864 4.005 4.133 4.287 4.482 4.589 4.788 5.002 5.2 5.288 5.463 5.63 5.849 5.978 6.099 6.278 6.444 6.604 6.756 6.896 7.073 7.237 7.389 7.58 7.785 7.991 8.212 8.454 8.689 8.947 9.198 9.438 9.69 9.973 10.297 10.593 10.915 11.276 11.678 12.132 12.608 13.03 13.386 13.434 13.279 13.043 12.78 12.532 12.308 12.107 11.907 11.658 11.435 11.23 11.025 10.842 10.667 10.511 10.355 10.202 10.069 9.929 9.786 9.672 9.553 9.43 9.335 9.226 9.106 9.002 8.901 8.817 8.724 8.586 8.494 8.391 8.341 8.248 8.145 8.037 7.976 7.823 7.748 7.658 7.562 7.367 7.242 7.11 6.984 6.824 6.605 6.388 6.102 -5 ,23274 ,KEBNE ,16653623,Mon Nov 22 03:23:23 CET,Mon Nov 22 05:06:43 CET,0.0 1.988 2.428 2.727 2.975 3.197 3.415 3.621 3.957 4.088 4.217 4.375 4.558 4.655 4.822 4.988 5.154 5.232 5.379 5.519 5.713 5.826 5.932 6.105 6.267 6.416 6.557 6.69 6.859 7.023 7.172 7.338 7.511 7.681 7.866 8.089 8.307 8.54 8.81 9.097 9.385 9.707 10.058 10.397 10.765 11.096 11.422 11.82 12.304 12.784 13.193 13.322 13.22 13.04 12.819 12.572 12.356 12.15 11.943 11.743 11.585 11.425 11.246 11.062 10.883 10.721 10.557 10.399 10.256 10.11 9.96 9.835 9.703 9.578 9.487 9.392 9.286 9.168 9.039 8.953 8.863 8.724 8.63 8.509 8.449 8.35 8.244 8.134 8.081 7.945 7.872 7.792 7.719 7.572 7.483 7.368 7.246 7.134 6.972 6.768 6.407 -6 ,961 ,KEBNE ,16653624,Mon Nov 22 03:23:23 CET,Mon Nov 22 05:07:27 CET,0.0 2.1 2.609 2.905 3.121 3.336 3.551 3.735 4.049 4.176 4.301 4.459 4.639 4.735 4.914 5.073 5.22 5.291 5.436 5.577 5.779 5.913 6.028 6.177 6.32 6.458 6.588 6.715 6.868 7.008 7.162 7.368 7.552 7.714 7.904 8.122 8.331 8.552 8.808 9.081 9.346 9.626 9.95 10.266 10.649 11.091 11.566 12.064 12.575 13.134 13.723 13.958 13.859 13.643 13.413 13.189 12.994 12.807 12.609 12.395 12.216 12.061 11.893 11.725 11.574 11.438 11.297 11.164 11.046 10.932 10.816 10.709 10.583 10.444 10.329 10.208 10.093 9.974 9.849 9.764 9.677 9.525 9.415 9.299 9.246 9.14 9.019 8.892 8.828 8.673 8.584 8.496 8.415 8.248 8.161 8.063 7.957 7.846 7.71 7.514 7.149 -7 ,16635 ,KEBNE ,16653625,Mon Nov 22 03:23:24 CET,Mon Nov 22 05:05:44 CET,0.0 1.945 2.485 2.828 3.078 3.317 3.541 3.729 4.032 4.162 4.294 4.449 4.644 4.751 4.937 5.119 5.307 5.394 5.537 5.678 5.908 6.047 6.175 6.367 6.543 6.716 6.887 7.045 7.246 7.425 7.587 7.786 7.972 8.153 8.369 8.607 8.833 9.058 9.297 9.552 9.807 10.098 10.413 10.71 11.045 11.421 11.828 12.219 12.607 12.967 13.251 13.316 13.165 12.9 12.649 12.443 12.239 12.026 11.856 11.67 11.482 11.294 11.086 10.899 10.723 10.553 10.39 10.239 10.102 9.957 9.81 9.681 9.534 9.401 9.306 9.203 9.1 8.983 8.865 8.778 8.675 8.525 8.426 8.324 8.269 8.161 8.061 7.957 7.9 7.75 7.688 7.621 7.53 7.314 7.209 7.106 6.979 6.829 6.663 6.455 5.959 -8 ,19751 ,KEBNE ,16653626,Mon Nov 22 03:23:24 CET,Mon Nov 22 05:05:48 CET,0.0 1.926 2.348 2.587 2.805 3.043 3.246 3.401 3.673 3.81 3.937 4.101 4.311 4.414 4.591 4.77 4.942 5.021 5.179 5.324 5.526 5.667 5.8 5.975 6.136 6.286 6.449 6.616 6.813 6.997 7.184 7.401 7.587 7.762 7.96 8.181 8.408 8.653 8.903 9.165 9.427 9.709 10.03 10.341 10.661 10.981 11.37 11.833 12.325 12.794 13.17 13.169 12.948 12.691 12.44 12.152 11.862 11.599 11.38 11.163 10.98 10.82 10.652 10.48 10.314 10.157 9.994 9.841 9.705 9.559 9.401 9.271 9.13 8.989 8.888 8.781 8.667 8.549 8.419 8.324 8.228 8.082 7.966 7.852 7.802 7.687 7.565 7.438 7.368 7.211 7.125 7.043 6.97 6.808 6.717 6.618 6.504 6.353 6.178 5.956 5.53 -9 ,24112 ,KEBNE ,16653627,Mon Nov 22 03:24:24 CET,Mon Nov 22 05:07:43 CET,0.0 2.364 2.814 3.112 3.34 3.566 3.778 3.964 4.267 4.392 4.511 4.645 4.818 4.91 5.079 5.233 5.38 5.454 5.605 5.748 5.952 6.078 6.186 6.329 6.478 6.622 6.76 6.899 7.072 7.245 7.424 7.627 7.816 7.998 8.21 8.44 8.646 8.867 9.137 9.437 9.724 10.032 10.392 10.73 11.119 11.543 11.98 12.464 13.042 13.584 13.937 13.992 13.881 13.747 13.555 13.315 13.096 12.885 12.683 12.491 12.342 12.194 12.032 11.87 11.71 11.572 11.437 11.307 11.192 11.08 10.953 10.828 10.694 10.568 10.477 10.388 10.283 10.151 10.014 9.924 9.84 9.71 9.617 9.521 9.472 9.357 9.234 9.122 9.063 8.923 8.869 8.799 8.719 8.535 8.437 8.34 8.227 8.095 7.943 7.729 7.199 -10 ,5175 ,KEBNE ,16653628,Mon Nov 22 03:24:24 CET,Mon Nov 22 05:07:13 CET,0.0 1.227 1.587 1.867 2.109 2.304 2.47 2.633 2.938 3.064 3.17 3.301 3.51 3.628 3.806 3.981 4.152 4.23 4.361 4.494 4.688 4.813 4.931 5.095 5.256 5.407 5.544 5.669 5.829 5.971 6.109 6.295 6.472 6.642 6.847 7.075 7.293 7.519 7.744 7.986 8.236 8.495 8.81 9.111 9.43 9.785 10.176 10.588 11.026 11.402 11.66 11.691 11.51 11.255 11.021 10.787 10.551 10.319 10.099 9.85 9.616 9.404 9.199 9.027 8.866 8.711 8.567 8.433 8.301 8.153 7.992 7.855 7.714 7.569 7.451 7.33 7.205 7.086 6.956 6.857 6.762 6.62 6.528 6.431 6.383 6.261 6.116 5.99 5.924 5.769 5.701 5.606 5.507 5.321 5.22 5.105 4.983 4.841 4.686 4.452 3.995 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_19.txt deleted file mode 100644 index 36c447de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,357 ,KEBNE ,17069334,Fri Dec 24 00:48:48 CET,Fri Dec 24 02:29:58 CET,0.0 0.201 0.37 0.492 0.599 0.71 0.799 0.868 0.987 1.048 1.115 1.147 1.289 1.34 1.446 1.55 1.633 1.673 1.758 1.844 1.986 2.077 2.164 2.302 2.427 2.535 2.646 2.772 2.941 3.095 3.232 3.382 3.523 3.659 3.816 3.988 4.144 4.318 4.531 4.773 4.987 5.188 5.414 5.631 5.882 6.137 6.412 6.689 6.973 7.231 7.18 6.581 5.894 5.27 4.696 4.109 3.581 3.114 2.692 2.268 1.922 1.604 1.288 1.003 0.753 0.519 0.252 -0.001 -0.231 -0.482 -0.748 -0.952 -1.153 -1.382 -1.562 -1.727 -1.888 -2.075 -2.291 -2.432 -2.571 -2.789 -2.945 -3.111 -3.192 -3.365 -3.585 -3.814 -3.914 -4.106 -4.217 -4.32 -4.441 -4.723 -4.868 -5.018 -5.176 -5.35 -5.565 -5.939 -7.612 -2 ,992 ,KEBNE ,17069335,Fri Dec 24 00:49:52 CET,Fri Dec 24 02:30:40 CET,0.0 0.293 0.48 0.639 0.777 0.895 1.0 1.111 1.32 1.401 1.465 1.511 1.67 1.732 1.844 1.944 2.044 2.097 2.199 2.292 2.427 2.506 2.587 2.721 2.843 2.966 3.09 3.208 3.355 3.485 3.613 3.766 3.911 4.057 4.238 4.435 4.618 4.826 5.043 5.275 5.528 5.794 6.092 6.404 6.753 7.112 7.497 7.925 8.391 8.791 9.057 8.85 8.35 7.755 7.215 6.766 6.329 5.883 5.478 5.072 4.7 4.342 3.991 3.639 3.298 2.994 2.674 2.392 2.156 1.911 1.657 1.443 1.215 0.982 0.797 0.616 0.433 0.229 0.013 -0.14 -0.298 -0.526 -0.674 -0.815 -0.89 -1.051 -1.216 -1.398 -1.505 -1.709 -1.851 -1.984 -2.13 -2.407 -2.567 -2.751 -2.932 -3.147 -3.433 -3.878 -5.231 -3 ,28334 ,KEBNE ,17069336,Fri Dec 24 00:50:57 CET,Fri Dec 24 02:33:21 CET,0.0 0.337 0.48 0.585 0.684 0.763 0.84 0.911 1.035 1.105 1.173 1.196 1.336 1.387 1.481 1.56 1.64 1.688 1.784 1.866 1.985 2.068 2.153 2.281 2.409 2.532 2.647 2.757 2.897 3.046 3.196 3.374 3.555 3.732 3.915 4.116 4.318 4.551 4.798 5.047 5.301 5.568 5.864 6.155 6.507 6.933 7.4 7.838 8.293 8.742 9.027 8.837 8.379 7.81 7.21 6.668 6.198 5.744 5.324 4.898 4.549 4.246 3.939 3.619 3.309 3.037 2.771 2.535 2.325 2.096 1.79 1.498 1.228 0.984 0.805 0.621 0.423 0.195 -0.047 -0.199 -0.332 -0.533 -0.682 -0.83 -0.908 -1.072 -1.253 -1.446 -1.546 -1.744 -1.878 -2.008 -2.165 -2.52 -2.715 -2.925 -3.154 -3.4 -3.685 -4.035 -5.729 -4 ,21362 ,KEBNE ,17069337,Fri Dec 24 00:51:59 CET,Fri Dec 24 02:33:19 CET,0.0 0.262 0.392 0.516 0.621 0.707 0.788 0.878 1.069 1.158 1.232 1.249 1.398 1.463 1.586 1.7 1.806 1.862 1.961 2.049 2.179 2.268 2.355 2.493 2.619 2.723 2.814 2.896 3.007 3.122 3.24 3.383 3.526 3.676 3.841 4.021 4.201 4.402 4.624 4.874 5.128 5.404 5.698 5.951 6.217 6.473 6.731 7.003 7.29 7.406 7.044 6.284 5.509 4.811 4.188 3.612 3.13 2.695 2.272 1.84 1.48 1.145 0.811 0.499 0.219 -0.038 -0.305 -0.555 -0.771 -1.001 -1.256 -1.462 -1.671 -1.889 -2.066 -2.246 -2.439 -2.646 -2.85 -3.002 -3.171 -3.42 -3.588 -3.769 -3.862 -4.053 -4.275 -4.525 -4.65 -4.867 -5.062 -5.214 -5.384 -5.772 -5.966 -6.163 -6.38 -6.658 -7.007 -7.496 -9.308 -5 ,20516 ,KEBNE ,17069338,Fri Dec 24 00:51:59 CET,Fri Dec 24 02:32:18 CET,0.0 0.271 0.443 0.538 0.624 0.713 0.795 0.892 1.068 1.135 1.2 1.229 1.369 1.415 1.52 1.625 1.714 1.756 1.846 1.939 2.077 2.157 2.229 2.339 2.447 2.548 2.648 2.75 2.874 2.991 3.117 3.284 3.446 3.592 3.751 3.934 4.113 4.301 4.5 4.71 4.932 5.192 5.484 5.778 6.129 6.522 6.939 7.344 7.76 8.2 8.462 8.254 7.884 7.455 7.005 6.525 6.08 5.675 5.272 4.853 4.502 4.188 3.88 3.56 3.254 2.972 2.671 2.412 2.198 1.97 1.743 1.554 1.359 1.166 1.004 0.835 0.661 0.494 0.329 0.206 0.082 -0.121 -0.273 -0.424 -0.506 -0.68 -0.849 -1.023 -1.12 -1.311 -1.419 -1.52 -1.657 -1.954 -2.096 -2.241 -2.401 -2.576 -2.795 -3.118 -4.226 -6 ,24918 ,KEBNE ,17069339,Fri Dec 24 00:51:59 CET,Fri Dec 24 02:31:52 CET,0.0 0.198 0.32 0.431 0.553 0.648 0.722 0.81 0.997 1.077 1.143 1.176 1.345 1.418 1.544 1.649 1.741 1.786 1.873 1.956 2.082 2.168 2.245 2.352 2.455 2.564 2.687 2.809 2.953 3.098 3.241 3.409 3.585 3.758 3.939 4.144 4.346 4.565 4.789 5.011 5.26 5.527 5.834 6.144 6.503 6.915 7.393 7.922 8.416 8.846 9.381 9.497 9.136 8.691 8.27 7.83 7.407 7.022 6.67 6.318 6.007 5.7 5.393 5.081 4.782 4.517 4.24 4.002 3.794 3.566 3.323 3.119 2.916 2.693 2.505 2.319 2.124 1.905 1.68 1.527 1.372 1.146 0.989 0.804 0.709 0.538 0.364 0.168 0.067 -0.137 -0.302 -0.43 -0.598 -1.02 -1.231 -1.431 -1.638 -1.858 -2.106 -2.473 -3.439 -7 ,28046 ,KEBNE ,17069340,Fri Dec 24 00:51:59 CET,Fri Dec 24 02:31:35 CET,0.0 0.275 0.443 0.565 0.663 0.746 0.838 0.937 1.095 1.163 1.227 1.254 1.398 1.45 1.554 1.659 1.772 1.831 1.941 2.037 2.173 2.261 2.345 2.452 2.547 2.644 2.754 2.867 3.012 3.157 3.307 3.48 3.63 3.773 3.94 4.122 4.284 4.468 4.667 4.865 5.083 5.345 5.64 5.918 6.216 6.533 6.892 7.281 7.548 7.642 7.621 7.271 6.735 6.202 5.761 5.343 4.916 4.482 4.081 3.683 3.333 3.021 2.726 2.442 2.18 1.938 1.695 1.472 1.271 1.072 0.854 0.656 0.454 0.257 0.111 -0.043 -0.203 -0.353 -0.509 -0.638 -0.784 -1.021 -1.195 -1.383 -1.474 -1.663 -1.863 -2.065 -2.173 -2.367 -2.525 -2.659 -2.793 -3.093 -3.274 -3.458 -3.629 -3.827 -4.061 -4.382 -5.711 -8 ,20114 ,KEBNE ,17069341,Fri Dec 24 00:54:09 CET,Fri Dec 24 02:35:17 CET,0.0 0.405 0.58 0.7 0.806 0.905 0.992 1.073 1.237 1.315 1.384 1.422 1.581 1.64 1.75 1.861 1.973 2.029 2.132 2.224 2.361 2.446 2.534 2.67 2.782 2.875 2.98 3.097 3.254 3.404 3.541 3.705 3.843 3.962 4.11 4.276 4.451 4.656 4.87 5.079 5.287 5.524 5.791 6.091 6.473 6.864 7.315 7.803 8.228 8.523 8.643 8.306 7.685 7.069 6.517 5.971 5.462 4.997 4.593 4.179 3.819 3.495 3.194 2.921 2.65 2.387 2.117 1.874 1.661 1.448 1.227 1.041 0.855 0.663 0.505 0.344 0.185 0.012 -0.171 -0.3 -0.436 -0.655 -0.803 -0.958 -1.046 -1.228 -1.42 -1.608 -1.7 -1.902 -2.063 -2.211 -2.371 -2.712 -2.899 -3.092 -3.313 -3.566 -3.887 -4.323 -5.855 -9 ,31626 ,KEBNE ,17069342,Fri Dec 24 00:54:09 CET,Fri Dec 24 02:37:04 CET,0.0 0.42 0.596 0.719 0.818 0.905 0.995 1.095 1.266 1.332 1.401 1.439 1.587 1.641 1.754 1.87 1.962 2.005 2.091 2.173 2.294 2.387 2.481 2.599 2.707 2.817 2.925 3.021 3.137 3.257 3.375 3.503 3.636 3.773 3.927 4.084 4.239 4.406 4.595 4.826 5.077 5.342 5.603 5.846 6.119 6.44 6.791 7.129 7.486 7.821 7.957 7.68 7.188 6.611 6.122 5.638 5.188 4.771 4.397 4.026 3.706 3.411 3.111 2.826 2.568 2.325 2.061 1.825 1.619 1.399 1.171 0.983 0.776 0.548 0.369 0.186 0.009 -0.172 -0.38 -0.511 -0.625 -0.814 -0.948 -1.098 -1.175 -1.329 -1.489 -1.649 -1.738 -1.912 -2.029 -2.138 -2.257 -2.524 -2.656 -2.826 -3.01 -3.171 -3.399 -3.769 -5.092 -10 ,11179 ,KEBNE ,17069343,Fri Dec 24 00:54:09 CET,Fri Dec 24 02:33:12 CET,0.0 0.256 0.409 0.537 0.655 0.741 0.818 0.902 1.06 1.119 1.179 1.203 1.348 1.399 1.496 1.591 1.691 1.742 1.838 1.927 2.054 2.141 2.226 2.335 2.44 2.548 2.651 2.746 2.858 2.982 3.106 3.242 3.387 3.53 3.682 3.851 4.022 4.212 4.404 4.613 4.837 5.113 5.445 5.777 6.155 6.531 6.965 7.47 8.018 8.511 8.805 8.652 8.26 7.83 7.416 6.957 6.5 6.077 5.701 5.301 4.901 4.525 4.18 3.838 3.509 3.221 2.921 2.65 2.416 2.181 1.956 1.781 1.587 1.379 1.22 1.058 0.886 0.707 0.517 0.377 0.238 0.022 -0.122 -0.269 -0.348 -0.52 -0.714 -0.916 -1.025 -1.229 -1.375 -1.5 -1.619 -1.897 -2.064 -2.235 -2.414 -2.596 -2.799 -3.09 -4.156 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_30.txt deleted file mode 100644 index 9f4f3fd5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8663 ,KEBNE ,16653629,Mon Nov 22 03:24:24 CET,Mon Nov 22 05:07:06 CET,0.0 1.505 1.979 2.33 2.655 2.92 3.118 3.303 3.641 3.789 3.921 4.077 4.291 4.419 4.665 4.879 5.089 5.198 5.411 5.61 5.919 6.105 6.254 6.457 6.654 6.844 7.038 7.225 7.458 7.681 7.899 8.184 8.433 8.66 8.939 9.235 9.515 9.836 10.17 10.518 10.884 11.274 11.68 12.054 12.475 12.939 13.476 13.985 14.442 14.864 15.005 14.663 14.193 13.697 13.2 12.724 12.301 11.909 11.559 11.21 10.898 10.619 10.355 10.08 9.821 9.594 9.363 9.154 8.968 8.775 8.57 8.399 8.221 8.039 7.897 7.742 7.583 7.417 7.24 7.127 7.027 6.868 6.752 6.636 6.577 6.448 6.301 6.146 6.066 5.901 5.812 5.733 5.661 5.488 5.388 5.274 5.154 5.025 4.862 4.626 4.2 -2 ,23974 ,KEBNE ,16653630,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:06:39 CET,0.0 1.251 1.678 1.983 2.245 2.479 2.689 2.868 3.183 3.336 3.478 3.659 3.879 4.001 4.249 4.497 4.729 4.835 5.041 5.244 5.535 5.712 5.88 6.121 6.343 6.547 6.746 6.929 7.16 7.397 7.611 7.86 8.093 8.307 8.532 8.737 8.95 9.216 9.467 9.716 10.013 10.356 10.7 11.0 11.35 11.727 12.18 12.651 13.004 13.256 13.201 12.688 12.155 11.582 10.987 10.47 10.024 9.615 9.283 8.929 8.599 8.315 8.046 7.78 7.522 7.286 7.064 6.863 6.68 6.496 6.302 6.149 5.99 5.822 5.688 5.542 5.393 5.238 5.076 4.966 4.852 4.687 4.58 4.463 4.398 4.262 4.117 3.959 3.88 3.706 3.622 3.529 3.428 3.184 3.054 2.934 2.794 2.646 2.482 2.231 1.844 -3 ,6607 ,KEBNE ,16653631,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:08:52 CET,0.0 1.477 1.921 2.253 2.524 2.733 2.899 3.032 3.268 3.4 3.531 3.657 3.833 3.932 4.139 4.321 4.502 4.585 4.753 4.919 5.133 5.259 5.372 5.537 5.713 5.885 6.047 6.215 6.421 6.613 6.812 7.048 7.266 7.482 7.722 7.981 8.225 8.491 8.809 9.148 9.49 9.89 10.339 10.732 11.161 11.588 12.017 12.453 12.959 13.461 13.776 13.623 13.169 12.658 12.169 11.703 11.266 10.868 10.51 10.159 9.859 9.575 9.288 9.01 8.763 8.54 8.309 8.096 7.912 7.724 7.528 7.363 7.201 7.039 6.907 6.759 6.608 6.458 6.302 6.197 6.085 5.894 5.775 5.666 5.604 5.472 5.325 5.176 5.101 4.936 4.872 4.793 4.711 4.544 4.446 4.342 4.235 4.121 3.992 3.846 3.586 -4 ,5892 ,KEBNE ,16653632,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:07:29 CET,0.0 1.117 1.464 1.747 2.037 2.294 2.495 2.681 3.047 3.215 3.367 3.56 3.782 3.911 4.162 4.394 4.607 4.708 4.913 5.112 5.385 5.553 5.714 5.943 6.158 6.35 6.531 6.706 6.939 7.189 7.425 7.689 7.929 8.158 8.439 8.764 9.078 9.414 9.771 10.121 10.477 10.885 11.348 11.794 12.252 12.742 13.269 13.802 14.349 14.902 15.288 15.202 14.756 14.161 13.603 13.074 12.604 12.183 11.83 11.471 11.136 10.816 10.502 10.228 9.974 9.729 9.484 9.272 9.088 8.888 8.678 8.504 8.315 8.126 7.983 7.834 7.69 7.547 7.39 7.282 7.179 7.03 6.924 6.791 6.72 6.584 6.435 6.286 6.204 6.035 5.963 5.879 5.798 5.638 5.549 5.45 5.324 5.188 5.039 4.821 4.303 -5 ,26299 ,KEBNE ,16653633,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:07:39 CET,0.0 1.353 1.795 2.108 2.345 2.545 2.708 2.866 3.18 3.327 3.469 3.667 3.886 4.0 4.239 4.475 4.708 4.82 5.032 5.234 5.527 5.712 5.883 6.118 6.333 6.549 6.754 6.937 7.172 7.4 7.617 7.88 8.132 8.385 8.668 8.951 9.197 9.462 9.733 10.004 10.297 10.606 10.985 11.386 11.781 12.171 12.597 13.042 13.511 13.957 14.064 13.684 13.118 12.469 11.897 11.369 10.895 10.461 10.094 9.729 9.396 9.084 8.789 8.52 8.267 8.018 7.757 7.523 7.328 7.146 6.948 6.768 6.589 6.425 6.291 6.155 6.025 5.875 5.712 5.595 5.48 5.31 5.192 5.066 5.003 4.883 4.755 4.617 4.543 4.386 4.334 4.259 4.184 4.025 3.929 3.817 3.687 3.556 3.423 3.246 2.806 -6 ,25938 ,KEBNE ,16653634,Mon Nov 22 03:25:25 CET,Mon Nov 22 05:06:59 CET,0.0 1.216 1.501 1.767 2.038 2.274 2.488 2.674 2.964 3.1 3.227 3.392 3.61 3.728 3.937 4.144 4.341 4.434 4.619 4.79 5.047 5.201 5.346 5.549 5.73 5.91 6.072 6.219 6.416 6.623 6.818 7.048 7.278 7.495 7.737 8.018 8.288 8.587 8.949 9.323 9.675 10.072 10.508 10.912 11.393 11.907 12.414 12.948 13.409 13.753 13.97 13.692 13.255 12.864 12.45 11.953 11.494 11.043 10.634 10.251 9.901 9.581 9.293 9.027 8.783 8.558 8.315 8.104 7.921 7.717 7.514 7.35 7.178 7.008 6.874 6.732 6.587 6.445 6.299 6.194 6.084 5.908 5.784 5.666 5.61 5.488 5.355 5.224 5.159 5.0 4.92 4.844 4.759 4.555 4.449 4.351 4.24 4.099 3.938 3.784 3.505 -7 ,31957 ,KEBNE ,16653635,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:09:24 CET,0.0 1.894 2.429 2.828 3.107 3.32 3.507 3.7 4.08 4.254 4.413 4.574 4.795 4.933 5.182 5.405 5.61 5.713 5.914 6.096 6.357 6.523 6.693 6.934 7.17 7.4 7.601 7.783 8.013 8.259 8.521 8.831 9.113 9.387 9.708 10.053 10.404 10.788 11.17 11.564 11.971 12.451 12.963 13.382 13.828 14.35 14.904 15.4 15.839 16.282 16.469 16.126 15.63 15.099 14.565 14.039 13.582 13.189 12.85 12.48 12.144 11.851 11.558 11.282 11.032 10.795 10.559 10.355 10.171 9.974 9.762 9.582 9.376 9.168 9.019 8.866 8.705 8.552 8.407 8.297 8.183 8.011 7.886 7.763 7.704 7.554 7.397 7.248 7.167 7.0 6.914 6.826 6.731 6.53 6.421 6.29 6.153 6.01 5.831 5.61 5.247 -8 ,31464 ,KEBNE ,16653636,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:09:03 CET,0.0 1.98 2.495 2.845 3.111 3.354 3.602 3.836 4.247 4.457 4.641 4.835 5.056 5.184 5.428 5.65 5.868 5.974 6.179 6.367 6.616 6.776 6.929 7.149 7.378 7.593 7.785 7.972 8.208 8.44 8.663 8.926 9.177 9.419 9.698 9.997 10.292 10.639 11.032 11.426 11.802 12.234 12.744 13.231 13.78 14.399 15.069 15.728 16.336 16.748 17.006 16.832 16.326 15.761 15.24 14.765 14.336 13.944 13.609 13.266 12.945 12.636 12.372 12.14 11.908 11.685 11.443 11.224 11.038 10.851 10.654 10.479 10.3 10.109 9.951 9.788 9.625 9.467 9.302 9.194 9.091 8.92 8.796 8.662 8.592 8.466 8.323 8.17 8.09 7.914 7.835 7.749 7.661 7.5 7.407 7.303 7.206 7.101 6.959 6.764 6.432 -9 ,4644 ,KEBNE ,16653637,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:07:37 CET,0.0 1.755 2.267 2.616 2.929 3.226 3.482 3.667 3.996 4.151 4.284 4.438 4.65 4.763 4.967 5.176 5.364 5.45 5.62 5.785 6.033 6.2 6.367 6.596 6.806 7.009 7.216 7.407 7.634 7.845 8.041 8.294 8.542 8.775 9.031 9.297 9.551 9.838 10.143 10.455 10.763 11.111 11.509 11.889 12.37 12.894 13.386 13.936 14.515 14.92 14.964 14.556 13.948 13.354 12.829 12.322 11.862 11.45 11.089 10.679 10.326 10.044 9.768 9.511 9.283 9.077 8.847 8.63 8.456 8.285 8.101 7.944 7.785 7.617 7.489 7.357 7.203 7.051 6.907 6.798 6.67 6.48 6.359 6.229 6.163 6.024 5.884 5.74 5.663 5.497 5.42 5.332 5.248 5.057 4.952 4.829 4.672 4.504 4.34 4.166 3.808 -10 ,6832 ,KEBNE ,16653638,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:08:13 CET,0.0 1.786 2.166 2.448 2.69 2.906 3.096 3.274 3.597 3.745 3.877 4.038 4.253 4.372 4.602 4.819 5.013 5.109 5.288 5.454 5.708 5.874 6.04 6.283 6.502 6.708 6.906 7.111 7.387 7.622 7.816 8.055 8.308 8.556 8.823 9.082 9.332 9.623 9.901 10.158 10.444 10.77 11.133 11.519 11.941 12.382 12.894 13.436 13.881 14.169 14.302 13.998 13.688 13.315 12.875 12.508 12.158 11.799 11.471 11.149 10.904 10.667 10.415 10.183 9.962 9.747 9.515 9.302 9.114 8.925 8.731 8.572 8.416 8.256 8.128 7.998 7.846 7.688 7.548 7.45 7.34 7.174 7.076 6.969 6.91 6.791 6.66 6.525 6.455 6.296 6.237 6.155 6.072 5.882 5.778 5.676 5.558 5.42 5.243 4.979 4.528 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_31.txt deleted file mode 100644 index ecefc425..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_31.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22797 ,KEBNE ,16653639,Mon Nov 22 03:26:27 CET,Mon Nov 22 05:08:24 CET,0.0 1.049 1.432 1.76 2.044 2.284 2.491 2.664 2.946 3.066 3.172 3.293 3.483 3.57 3.757 3.959 4.162 4.26 4.442 4.609 4.856 5.019 5.174 5.387 5.577 5.748 5.905 6.056 6.258 6.451 6.628 6.842 7.058 7.274 7.524 7.77 7.986 8.217 8.448 8.704 8.987 9.277 9.612 9.965 10.333 10.701 11.127 11.642 12.232 12.725 12.912 12.552 11.954 11.269 10.576 9.912 9.303 8.747 8.274 7.828 7.459 7.137 6.822 6.505 6.219 5.962 5.673 5.393 5.157 4.926 4.69 4.508 4.317 4.098 3.931 3.775 3.615 3.435 3.252 3.133 3.005 2.797 2.64 2.475 2.399 2.245 2.081 1.916 1.835 1.651 1.531 1.424 1.317 1.081 0.951 0.819 0.684 0.52 0.329 0.114 -0.255 -4 ,28136 ,KEBNE ,16653642,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:07:13 CET,0.0 1.132 1.524 1.82 2.064 2.251 2.419 2.589 2.915 3.07 3.205 3.333 3.534 3.646 3.86 4.064 4.274 4.374 4.529 4.667 4.877 5.015 5.161 5.385 5.591 5.786 5.981 6.151 6.339 6.533 6.731 6.949 7.178 7.412 7.662 7.96 8.243 8.523 8.806 9.113 9.472 9.89 10.376 10.859 11.328 11.714 12.119 12.592 13.108 13.636 14.149 14.144 13.71 13.178 12.577 11.937 11.385 10.907 10.495 10.068 9.686 9.349 9.012 8.701 8.435 8.173 7.879 7.617 7.382 7.137 6.891 6.697 6.504 6.299 6.144 5.988 5.818 5.641 5.448 5.323 5.206 5.02 4.894 4.759 4.686 4.528 4.349 4.173 4.086 3.909 3.815 3.722 3.636 3.43 3.313 3.196 3.073 2.944 2.796 2.605 2.139 -5 ,12126 ,KEBNE ,16653643,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:06:52 CET,0.0 1.146 1.575 1.944 2.255 2.519 2.742 2.938 3.294 3.446 3.582 3.765 4.0 4.133 4.369 4.602 4.826 4.932 5.133 5.315 5.554 5.705 5.864 6.09 6.303 6.488 6.653 6.831 7.056 7.267 7.472 7.706 7.943 8.161 8.403 8.673 8.933 9.209 9.5 9.814 10.105 10.403 10.772 11.16 11.583 11.974 12.33 12.659 12.963 13.298 13.6 13.35 12.817 12.225 11.609 11.034 10.503 9.959 9.497 9.054 8.671 8.333 8.016 7.722 7.435 7.15 6.854 6.603 6.384 6.159 5.924 5.713 5.494 5.279 5.112 4.939 4.758 4.571 4.383 4.253 4.112 3.896 3.753 3.609 3.539 3.398 3.258 3.114 3.039 2.875 2.787 2.684 2.581 2.387 2.282 2.16 2.033 1.893 1.71 1.449 1.07 -6 ,24419 ,KEBNE ,16653644,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:08:06 CET,0.0 0.995 1.347 1.624 1.889 2.138 2.355 2.551 2.905 3.063 3.221 3.42 3.644 3.772 3.985 4.175 4.383 4.493 4.683 4.857 5.112 5.28 5.448 5.703 5.938 6.132 6.297 6.451 6.662 6.881 7.098 7.356 7.588 7.812 8.057 8.306 8.567 8.857 9.148 9.466 9.796 10.129 10.518 10.901 11.324 11.744 12.142 12.547 12.971 13.273 13.327 13.159 12.848 12.409 11.966 11.53 11.11 10.72 10.358 9.994 9.686 9.426 9.187 8.944 8.717 8.514 8.289 8.089 7.923 7.749 7.551 7.374 7.192 7.002 6.844 6.685 6.527 6.37 6.208 6.091 5.97 5.774 5.641 5.509 5.438 5.284 5.127 4.973 4.886 4.7 4.587 4.469 4.347 4.11 3.988 3.85 3.676 3.468 3.215 2.928 2.134 -8 ,1122 ,KEBNE ,16653646,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:07:25 CET,0.0 1.049 1.534 1.827 2.082 2.327 2.535 2.717 3.047 3.212 3.37 3.552 3.775 3.892 4.11 4.328 4.533 4.628 4.817 5.003 5.262 5.438 5.594 5.8 5.991 6.159 6.324 6.487 6.697 6.914 7.13 7.388 7.632 7.844 8.061 8.318 8.585 8.849 9.144 9.505 9.851 10.197 10.584 10.977 11.427 11.901 12.427 12.949 13.406 13.729 13.74 13.184 12.454 11.691 10.973 10.319 9.721 9.15 8.663 8.196 7.815 7.458 7.119 6.818 6.501 6.21 5.927 5.669 5.453 5.229 5.009 4.832 4.642 4.445 4.279 4.105 3.935 3.769 3.601 3.486 3.361 3.167 3.037 2.9 2.832 2.685 2.53 2.354 2.254 2.068 1.984 1.884 1.784 1.555 1.409 1.26 1.122 0.979 0.824 0.592 0.116 -9 ,27726 ,KEBNE ,16653647,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:07:52 CET,0.0 1.366 1.836 2.157 2.396 2.635 2.846 3.04 3.395 3.543 3.696 3.874 4.074 4.173 4.361 4.549 4.726 4.802 4.96 5.117 5.343 5.48 5.607 5.797 5.979 6.156 6.328 6.495 6.699 6.893 7.082 7.315 7.537 7.773 8.057 8.334 8.578 8.831 9.092 9.357 9.62 9.908 10.27 10.643 11.051 11.503 11.917 12.257 12.656 13.063 13.112 12.591 11.921 11.281 10.72 10.189 9.637 9.107 8.661 8.206 7.814 7.439 7.077 6.749 6.44 6.156 5.871 5.619 5.401 5.177 4.945 4.763 4.565 4.371 4.238 4.108 3.97 3.824 3.666 3.543 3.414 3.219 3.089 2.95 2.878 2.724 2.568 2.407 2.322 2.144 2.03 1.932 1.842 1.637 1.517 1.373 1.235 1.108 0.951 0.747 0.149 -10 ,28530 ,KEBNE ,16653648,Mon Nov 22 03:25:26 CET,Mon Nov 22 05:07:43 CET,0.0 1.177 1.591 1.899 2.16 2.376 2.557 2.729 3.031 3.172 3.314 3.49 3.708 3.825 4.031 4.231 4.442 4.55 4.737 4.907 5.147 5.289 5.436 5.642 5.832 6.008 6.178 6.347 6.551 6.756 6.972 7.228 7.468 7.694 7.935 8.194 8.451 8.729 9.003 9.314 9.634 9.984 10.434 10.87 11.377 11.931 12.457 12.981 13.501 13.88 14.011 13.696 13.123 12.508 12.005 11.473 10.938 10.493 10.122 9.742 9.394 9.076 8.778 8.483 8.207 7.941 7.661 7.426 7.218 6.996 6.758 6.568 6.374 6.173 6.034 5.887 5.733 5.583 5.425 5.317 5.211 5.039 4.912 4.792 4.733 4.6 4.469 4.333 4.264 4.108 4.034 3.946 3.856 3.694 3.61 3.523 3.418 3.281 3.142 2.994 2.772 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_36.txt deleted file mode 100644 index 43b58dc7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_36.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18019 ,KEBNE ,16653649,Mon Nov 22 03:26:27 CET,Mon Nov 22 05:08:41 CET,0.0 0.666 0.99 1.291 1.564 1.798 1.982 2.143 2.463 2.607 2.747 2.945 3.166 3.284 3.502 3.702 3.876 3.961 4.12 4.273 4.528 4.682 4.802 4.971 5.147 5.331 5.52 5.702 5.943 6.165 6.348 6.555 6.763 6.996 7.294 7.596 7.854 8.14 8.439 8.746 9.061 9.389 9.752 10.119 10.515 10.851 11.12 11.339 11.616 11.875 11.796 11.47 11.057 10.562 10.039 9.546 9.129 8.757 8.434 8.093 7.798 7.537 7.281 7.05 6.838 6.622 6.392 6.196 6.023 5.84 5.661 5.513 5.35 5.19 5.065 4.933 4.808 4.669 4.511 4.403 4.3 4.15 4.032 3.902 3.842 3.73 3.584 3.421 3.355 3.209 3.143 3.045 2.95 2.786 2.699 2.606 2.502 2.39 2.245 2.066 1.541 -2 ,21148 ,KEBNE ,16653650,Mon Nov 22 03:26:27 CET,Mon Nov 22 05:09:02 CET,0.0 1.168 1.605 1.928 2.227 2.483 2.725 2.974 3.459 3.674 3.873 4.133 4.382 4.52 4.786 5.051 5.3 5.414 5.638 5.846 6.085 6.226 6.369 6.57 6.77 6.978 7.174 7.374 7.643 7.904 8.118 8.322 8.52 8.705 8.921 9.171 9.41 9.66 9.927 10.22 10.499 10.804 11.157 11.498 11.886 12.306 12.765 13.218 13.655 14.067 14.225 13.978 13.51 12.986 12.531 12.091 11.691 11.313 10.972 10.623 10.298 10.01 9.733 9.471 9.246 9.042 8.833 8.641 8.467 8.292 8.115 7.961 7.796 7.626 7.497 7.376 7.245 7.097 6.953 6.85 6.747 6.593 6.494 6.399 6.333 6.196 6.068 5.93 5.861 5.708 5.663 5.593 5.511 5.322 5.216 5.116 5.017 4.91 4.755 4.578 4.252 -4 ,22351 ,KEBNE ,16653652,Mon Nov 22 03:26:27 CET,Mon Nov 22 05:09:50 CET,0.0 1.204 1.607 1.874 2.119 2.358 2.557 2.739 3.107 3.281 3.436 3.589 3.792 3.916 4.168 4.402 4.593 4.675 4.831 4.995 5.239 5.378 5.51 5.706 5.895 6.089 6.276 6.447 6.686 6.928 7.136 7.366 7.572 7.778 8.03 8.291 8.534 8.813 9.09 9.335 9.589 9.893 10.186 10.433 10.72 11.02 11.391 11.848 12.184 12.349 12.309 11.972 11.473 10.907 10.389 9.925 9.511 9.108 8.752 8.392 8.067 7.771 7.501 7.262 7.019 6.78 6.545 6.344 6.151 5.937 5.721 5.536 5.347 5.16 5.001 4.843 4.689 4.533 4.377 4.264 4.147 3.964 3.842 3.712 3.648 3.52 3.365 3.199 3.116 2.944 2.871 2.789 2.698 2.493 2.39 2.266 2.134 2.01 1.822 1.577 1.046 -5 ,5910 ,KEBNE ,16653653,Mon Nov 22 03:26:27 CET,Mon Nov 22 05:08:12 CET,0.0 1.218 1.631 1.991 2.31 2.604 2.859 3.092 3.535 3.745 3.938 4.219 4.471 4.606 4.856 5.105 5.337 5.445 5.664 5.881 6.19 6.399 6.574 6.793 7.016 7.224 7.413 7.581 7.792 8.006 8.21 8.443 8.68 8.922 9.199 9.492 9.774 10.123 10.475 10.782 11.098 11.453 11.847 12.239 12.642 13.04 13.456 13.812 14.228 14.648 14.755 14.425 13.994 13.559 13.124 12.698 12.3 11.901 11.542 11.169 10.827 10.517 10.229 9.962 9.715 9.506 9.299 9.114 8.948 8.769 8.593 8.438 8.274 8.119 8.004 7.881 7.755 7.627 7.478 7.367 7.25 7.093 6.995 6.879 6.819 6.698 6.564 6.434 6.368 6.21 6.143 6.06 5.97 5.775 5.672 5.564 5.452 5.317 5.142 4.949 4.595 -6 ,25860 ,KEBNE ,16653654,Mon Nov 22 03:26:29 CET,Mon Nov 22 05:05:47 CET,0.0 0.823 1.292 1.648 1.909 2.155 2.37 2.579 2.938 3.091 3.256 3.457 3.679 3.801 4.031 4.244 4.423 4.523 4.738 4.93 5.197 5.361 5.494 5.717 5.946 6.125 6.319 6.518 6.75 6.972 7.169 7.384 7.612 7.836 8.077 8.334 8.562 8.802 9.069 9.336 9.635 9.984 10.339 10.648 10.998 11.394 11.799 12.205 12.536 12.777 12.842 12.467 11.954 11.396 10.875 10.411 9.967 9.556 9.209 8.854 8.55 8.285 8.015 7.76 7.521 7.295 7.048 6.824 6.642 6.451 6.267 6.125 5.965 5.795 5.656 5.512 5.367 5.219 5.065 4.95 4.837 4.663 4.533 4.394 4.327 4.195 4.061 3.92 3.832 3.655 3.581 3.498 3.409 3.196 3.082 2.964 2.823 2.677 2.509 2.3 1.977 -7 ,18599 ,KEBNE ,16653655,Mon Nov 22 03:26:28 CET,Mon Nov 22 05:08:12 CET,0.0 0.737 1.03 1.277 1.533 1.759 1.946 2.121 2.448 2.592 2.723 2.878 3.077 3.188 3.417 3.627 3.813 3.893 4.04 4.187 4.389 4.506 4.604 4.753 4.903 5.061 5.228 5.386 5.595 5.797 6.022 6.309 6.547 6.765 7.007 7.278 7.536 7.809 8.096 8.401 8.716 9.059 9.459 9.858 10.312 10.767 11.228 11.683 12.146 12.535 12.752 12.715 12.458 12.155 11.825 11.46 11.09 10.701 10.394 10.091 9.801 9.556 9.32 9.087 8.865 8.671 8.477 8.299 8.139 7.97 7.79 7.646 7.503 7.352 7.238 7.111 6.986 6.87 6.733 6.625 6.517 6.349 6.223 6.094 6.035 5.923 5.8 5.665 5.597 5.443 5.372 5.282 5.19 4.998 4.878 4.753 4.65 4.556 4.43 4.238 3.861 -8 ,31749 ,KEBNE ,16653656,Mon Nov 22 03:26:28 CET,Mon Nov 22 05:08:08 CET,0.0 1.271 1.653 1.937 2.186 2.408 2.603 2.79 3.105 3.234 3.36 3.544 3.787 3.928 4.165 4.387 4.605 4.703 4.888 5.07 5.307 5.448 5.59 5.806 6.016 6.216 6.407 6.585 6.825 7.06 7.266 7.509 7.765 8.04 8.338 8.608 8.841 9.13 9.469 9.806 10.119 10.477 10.949 11.46 12.04 12.615 13.214 13.736 14.181 14.648 14.845 14.546 14.093 13.591 13.117 12.667 12.257 11.883 11.557 11.218 10.908 10.614 10.327 10.06 9.809 9.574 9.33 9.125 8.947 8.755 8.566 8.411 8.251 8.094 7.968 7.823 7.676 7.527 7.371 7.261 7.142 6.969 6.842 6.712 6.647 6.501 6.355 6.211 6.138 5.971 5.892 5.81 5.725 5.542 5.444 5.34 5.222 5.074 4.881 4.645 4.154 -9 ,28636 ,KEBNE ,16653657,Mon Nov 22 03:26:27 CET,Mon Nov 22 05:09:36 CET,0.0 1.318 1.643 1.925 2.159 2.357 2.565 2.774 3.088 3.234 3.38 3.545 3.767 3.894 4.125 4.323 4.49 4.568 4.741 4.92 5.161 5.317 5.474 5.689 5.884 6.076 6.264 6.425 6.578 6.755 6.965 7.205 7.482 7.77 8.074 8.375 8.618 8.847 9.09 9.348 9.605 9.903 10.239 10.569 10.927 11.275 11.697 12.124 12.582 13.08 13.342 13.021 12.548 12.074 11.613 11.136 10.699 10.302 9.928 9.514 9.16 8.869 8.601 8.349 8.114 7.899 7.669 7.453 7.264 7.067 6.862 6.691 6.513 6.329 6.193 6.065 5.919 5.763 5.606 5.503 5.398 5.232 5.105 4.969 4.908 4.781 4.639 4.496 4.421 4.261 4.201 4.129 4.055 3.869 3.759 3.645 3.529 3.4 3.245 3.05 2.68 -10 ,21798 ,KEBNE ,16653658,Mon Nov 22 03:26:27 CET,Mon Nov 22 05:08:19 CET,0.0 1.033 1.43 1.745 2.026 2.264 2.485 2.696 3.021 3.165 3.306 3.488 3.707 3.825 4.086 4.376 4.652 4.782 5.012 5.229 5.532 5.72 5.909 6.177 6.417 6.621 6.797 6.966 7.193 7.424 7.641 7.879 8.104 8.312 8.56 8.821 9.048 9.314 9.585 9.853 10.139 10.459 10.814 11.158 11.567 11.968 12.333 12.728 13.118 13.303 13.211 12.741 12.2 11.69 11.222 10.758 10.331 9.945 9.584 9.207 8.893 8.621 8.366 8.116 7.88 7.665 7.435 7.235 7.07 6.894 6.702 6.54 6.37 6.196 6.064 5.929 5.774 5.605 5.448 5.343 5.234 5.074 4.969 4.857 4.802 4.69 4.569 4.44 4.37 4.208 4.137 4.05 3.965 3.794 3.689 3.578 3.472 3.35 3.21 3.04 2.442 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_44.txt deleted file mode 100644 index a1e89f7b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_35_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24933 ,KEBNE ,17023465,Wed Dec 22 08:09:45 CET,Wed Dec 22 09:50:28 CET,0.0 0.878 1.185 1.423 1.678 1.879 2.032 2.186 2.477 2.611 2.746 2.888 3.093 3.194 3.382 3.561 3.737 3.826 4.006 4.175 4.407 4.549 4.682 4.878 5.08 5.28 5.467 5.643 5.87 6.104 6.324 6.591 6.847 7.079 7.359 7.687 7.993 8.317 8.678 9.09 9.517 9.998 10.584 11.172 11.781 12.344 12.991 13.785 14.719 15.759 16.85 17.384 17.434 17.265 16.992 16.718 16.423 16.097 15.754 15.389 15.099 14.82 14.501 14.209 13.975 13.764 13.536 13.308 13.096 12.887 12.656 12.452 12.242 12.011 11.834 11.662 11.474 11.275 11.076 10.932 10.78 10.535 10.366 10.198 10.12 9.939 9.721 9.507 9.404 9.196 9.009 8.866 8.705 8.422 8.262 8.046 7.822 7.584 7.242 6.794 3.986 -2 ,9562 ,KEBNE ,17023466,Wed Dec 22 08:09:45 CET,Wed Dec 22 09:50:17 CET,0.0 0.976 1.256 1.458 1.615 1.751 1.892 2.022 2.242 2.355 2.461 2.566 2.755 2.846 3.024 3.185 3.333 3.405 3.549 3.686 3.892 4.035 4.181 4.402 4.591 4.755 4.923 5.102 5.332 5.54 5.744 5.998 6.234 6.478 6.794 7.163 7.496 7.859 8.296 8.743 9.18 9.684 10.228 10.741 11.361 12.062 12.845 13.608 14.379 15.185 16.055 16.581 16.649 16.466 16.158 15.851 15.534 15.245 14.963 14.64 14.383 14.145 13.898 13.626 13.346 13.089 12.818 12.586 12.387 12.169 11.96 11.802 11.611 11.377 11.205 11.037 10.852 10.672 10.473 10.317 10.166 9.946 9.784 9.615 9.534 9.361 9.158 8.938 8.824 8.618 8.44 8.315 8.194 7.916 7.751 7.551 7.348 7.125 6.782 6.251 4.174 -3 ,26311 ,KEBNE ,17023467,Wed Dec 22 08:09:45 CET,Wed Dec 22 09:50:25 CET,0.0 0.747 1.09 1.36 1.578 1.761 1.925 2.088 2.34 2.457 2.568 2.681 2.886 2.99 3.191 3.376 3.563 3.661 3.849 4.017 4.265 4.427 4.564 4.767 4.974 5.17 5.36 5.547 5.807 6.082 6.35 6.661 6.958 7.234 7.545 7.878 8.204 8.56 8.914 9.287 9.668 10.091 10.577 11.052 11.606 12.228 12.898 13.668 14.548 15.419 16.348 16.804 16.723 16.479 16.204 15.898 15.57 15.213 14.857 14.494 14.182 13.884 13.586 13.294 13.019 12.771 12.498 12.249 12.036 11.812 11.559 11.325 11.091 10.865 10.689 10.49 10.277 10.068 9.839 9.673 9.498 9.229 9.058 8.901 8.821 8.624 8.402 8.179 8.075 7.877 7.7 7.566 7.391 7.012 6.831 6.616 6.385 6.136 5.779 5.288 3.182 -4 ,17057 ,KEBNE ,17023468,Wed Dec 22 08:09:46 CET,Wed Dec 22 09:51:02 CET,0.0 1.296 1.614 1.858 2.062 2.223 2.381 2.528 2.765 2.864 2.967 3.097 3.296 3.399 3.581 3.749 3.924 4.016 4.21 4.395 4.646 4.792 4.924 5.127 5.331 5.508 5.674 5.847 6.086 6.318 6.51 6.74 6.965 7.186 7.467 7.772 8.051 8.367 8.696 9.051 9.458 9.886 10.35 10.878 11.48 12.134 12.937 13.798 14.714 15.697 16.526 16.841 16.846 16.504 15.993 15.549 15.221 14.881 14.551 14.232 13.915 13.637 13.356 13.07 12.798 12.54 12.268 12.004 11.787 11.568 11.322 11.125 10.914 10.676 10.492 10.302 10.099 9.878 9.645 9.496 9.352 9.135 8.981 8.823 8.738 8.543 8.344 8.152 8.04 7.833 7.636 7.478 7.321 7.009 6.83 6.628 6.416 6.163 5.867 5.414 3.136 -5 ,1624 ,KEBNE ,17023469,Wed Dec 22 08:09:46 CET,Wed Dec 22 09:48:46 CET,0.0 0.926 1.175 1.365 1.555 1.734 1.893 2.043 2.332 2.461 2.573 2.679 2.876 2.967 3.145 3.335 3.511 3.591 3.743 3.883 4.077 4.202 4.328 4.515 4.696 4.868 5.039 5.199 5.406 5.627 5.837 6.081 6.324 6.553 6.81 7.104 7.397 7.728 8.092 8.469 8.84 9.232 9.682 10.165 10.782 11.467 12.214 12.959 13.756 14.664 15.553 16.027 16.032 15.811 15.511 15.198 14.829 14.462 14.133 13.771 13.482 13.217 12.961 12.71 12.452 12.213 11.97 11.746 11.54 11.321 11.098 10.91 10.701 10.483 10.317 10.131 9.943 9.754 9.525 9.36 9.186 8.923 8.761 8.621 8.544 8.384 8.226 8.029 7.911 7.727 7.608 7.482 7.34 7.052 6.888 6.715 6.499 6.223 5.918 5.526 3.929 -6 ,17307 ,KEBNE ,17023470,Wed Dec 22 08:09:46 CET,Wed Dec 22 09:49:41 CET,0.0 0.612 0.836 0.986 1.111 1.254 1.386 1.501 1.706 1.802 1.898 1.985 2.164 2.25 2.407 2.557 2.716 2.795 2.934 3.061 3.232 3.353 3.491 3.684 3.857 4.028 4.197 4.357 4.563 4.768 4.976 5.21 5.419 5.632 5.896 6.206 6.498 6.791 7.1 7.468 7.872 8.299 8.773 9.226 9.758 10.405 11.131 11.916 12.761 13.559 14.393 14.867 14.89 14.737 14.517 14.213 13.867 13.518 13.225 12.932 12.629 12.331 12.037 11.753 11.491 11.233 10.971 10.746 10.526 10.311 10.117 9.946 9.751 9.514 9.323 9.138 8.914 8.674 8.455 8.312 8.163 7.92 7.753 7.569 7.48 7.32 7.137 6.922 6.814 6.625 6.441 6.309 6.172 5.811 5.601 5.405 5.184 4.913 4.556 4.124 2.481 -7 ,1570 ,KEBNE ,17023471,Wed Dec 22 08:10:47 CET,Wed Dec 22 09:51:52 CET,0.0 0.844 1.069 1.236 1.432 1.618 1.774 1.914 2.153 2.268 2.387 2.506 2.702 2.805 2.998 3.179 3.349 3.43 3.594 3.756 3.984 4.129 4.266 4.46 4.635 4.799 4.966 5.121 5.327 5.553 5.76 5.993 6.232 6.484 6.766 7.04 7.293 7.588 7.91 8.254 8.637 9.077 9.597 10.11 10.733 11.44 12.232 13.089 14.113 15.307 16.427 17.001 17.119 16.972 16.712 16.451 16.143 15.829 15.523 15.11 14.752 14.452 14.155 13.896 13.635 13.388 13.116 12.85 12.63 12.392 12.143 11.937 11.698 11.461 11.285 11.105 10.935 10.745 10.532 10.383 10.231 9.962 9.759 9.586 9.496 9.291 9.053 8.808 8.696 8.487 8.297 8.171 8.038 7.739 7.581 7.382 7.146 6.862 6.506 6.006 3.445 -8 ,2601 ,KEBNE ,17023472,Wed Dec 22 08:10:47 CET,Wed Dec 22 09:51:08 CET,0.0 0.586 0.817 0.979 1.132 1.273 1.396 1.512 1.768 1.911 2.029 2.136 2.324 2.412 2.581 2.743 2.903 2.984 3.152 3.324 3.569 3.724 3.872 4.083 4.281 4.467 4.643 4.825 5.077 5.319 5.552 5.824 6.089 6.354 6.643 6.952 7.24 7.547 7.896 8.294 8.694 9.118 9.619 10.139 10.807 11.56 12.314 13.051 13.913 14.892 15.817 16.22 16.231 16.072 15.82 15.51 15.178 14.824 14.498 14.197 13.924 13.655 13.388 13.119 12.859 12.595 12.287 12.024 11.808 11.593 11.382 11.191 10.982 10.762 10.586 10.415 10.245 10.058 9.864 9.726 9.58 9.356 9.196 9.028 8.94 8.768 8.588 8.37 8.255 8.072 7.939 7.829 7.711 7.432 7.264 7.081 6.85 6.584 6.278 5.918 4.438 -9 ,28539 ,KEBNE ,17023473,Wed Dec 22 08:10:47 CET,Wed Dec 22 09:51:41 CET,0.0 0.637 0.964 1.23 1.444 1.64 1.823 1.974 2.243 2.372 2.492 2.645 2.853 2.964 3.168 3.353 3.534 3.619 3.776 3.927 4.137 4.272 4.426 4.672 4.903 5.122 5.327 5.527 5.759 5.967 6.176 6.44 6.698 6.939 7.223 7.545 7.834 8.146 8.473 8.803 9.172 9.588 10.055 10.556 11.166 11.844 12.605 13.442 14.412 15.463 16.526 16.984 16.974 16.813 16.551 16.219 15.89 15.577 15.281 14.97 14.669 14.4 14.15 13.905 13.692 13.492 13.257 13.027 12.808 12.569 12.325 12.14 11.955 11.736 11.547 11.342 11.11 10.882 10.661 10.501 10.331 10.089 9.919 9.725 9.635 9.458 9.26 9.056 8.954 8.756 8.554 8.408 8.247 7.867 7.693 7.542 7.345 7.106 6.848 6.379 3.952 -10 ,11895 ,KEBNE ,17023474,Wed Dec 22 08:10:47 CET,Wed Dec 22 09:52:26 CET,0.0 0.521 0.734 0.92 1.093 1.27 1.414 1.563 1.843 1.962 2.074 2.178 2.366 2.464 2.647 2.81 2.981 3.072 3.235 3.389 3.6 3.731 3.87 4.089 4.297 4.485 4.672 4.858 5.096 5.326 5.544 5.8 6.072 6.355 6.688 7.053 7.392 7.728 8.091 8.5 8.891 9.284 9.773 10.331 10.986 11.685 12.468 13.348 14.305 15.22 16.103 16.579 16.525 16.207 15.832 15.464 15.145 14.844 14.507 14.113 13.785 13.477 13.165 12.881 12.612 12.375 12.136 11.9 11.683 11.468 11.252 11.074 10.888 10.676 10.511 10.347 10.172 9.98 9.782 9.656 9.52 9.297 9.139 8.973 8.898 8.736 8.55 8.364 8.265 8.072 7.879 7.731 7.594 7.309 7.147 6.963 6.722 6.428 6.121 5.702 2.777 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_36_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_36_35.txt deleted file mode 100644 index e0dff820..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_36_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10385 ,KEBNE ,17042116,Thu Dec 23 03:44:34 CET,Thu Dec 23 05:25:04 CET,0.0 0.572 0.746 0.885 1.026 1.16 1.272 1.371 1.539 1.623 1.715 1.786 1.938 2.004 2.125 2.24 2.363 2.426 2.553 2.677 2.849 2.956 3.068 3.217 3.352 3.484 3.611 3.732 3.888 4.046 4.199 4.372 4.539 4.702 4.893 5.116 5.328 5.549 5.778 6.02 6.272 6.537 6.86 7.193 7.556 7.934 8.388 8.926 9.462 9.943 10.317 10.246 9.97 9.621 9.22 8.811 8.439 8.101 7.796 7.455 7.149 6.906 6.677 6.425 6.157 5.91 5.675 5.461 5.272 5.06 4.835 4.66 4.48 4.294 4.132 3.963 3.799 3.63 3.43 3.26 3.072 2.793 2.601 2.394 2.278 2.025 1.769 1.501 1.363 1.125 0.885 0.714 0.547 0.145 -0.078 -0.285 -0.497 -0.777 -1.069 -1.377 -2.71 -2 ,13620 ,KEBNE ,17042118,Thu Dec 23 03:44:34 CET,Thu Dec 23 05:24:48 CET,0.0 0.412 0.581 0.728 0.843 0.943 1.042 1.147 1.345 1.429 1.504 1.571 1.735 1.812 1.974 2.126 2.258 2.318 2.431 2.529 2.673 2.773 2.869 3.012 3.161 3.297 3.436 3.575 3.749 3.918 4.075 4.278 4.475 4.649 4.856 5.101 5.33 5.561 5.81 6.083 6.354 6.653 7.007 7.346 7.717 8.12 8.589 9.112 9.608 10.053 10.397 10.327 10.042 9.672 9.284 8.915 8.558 8.179 7.832 7.463 7.055 6.683 6.405 6.149 5.904 5.688 5.444 5.22 5.024 4.781 4.503 4.275 4.021 3.748 3.562 3.399 3.249 3.115 2.952 2.829 2.706 2.493 2.348 2.193 2.105 1.918 1.711 1.486 1.374 1.159 0.976 0.818 0.655 0.33 0.144 -0.052 -0.256 -0.468 -0.734 -1.206 -2.348 -3 ,28339 ,KEBNE ,17042119,Thu Dec 23 03:44:34 CET,Thu Dec 23 05:26:20 CET,0.0 0.471 0.646 0.773 0.902 1.022 1.13 1.233 1.429 1.523 1.611 1.692 1.854 1.918 2.044 2.179 2.328 2.396 2.512 2.631 2.814 2.942 3.065 3.217 3.367 3.522 3.666 3.801 3.974 4.145 4.298 4.472 4.643 4.808 4.999 5.217 5.432 5.673 5.924 6.174 6.433 6.722 7.06 7.4 7.77 8.155 8.595 9.033 9.477 9.957 10.361 10.377 10.139 9.865 9.597 9.267 8.927 8.601 8.3 7.974 7.689 7.448 7.211 6.978 6.723 6.443 6.153 5.913 5.716 5.508 5.267 5.075 4.904 4.723 4.57 4.403 4.235 4.061 3.851 3.706 3.554 3.292 3.108 2.92 2.821 2.612 2.408 2.187 2.072 1.864 1.682 1.541 1.377 0.978 0.792 0.593 0.369 0.1 -0.203 -0.538 -1.294 -4 ,8401 ,KEBNE ,17042120,Thu Dec 23 03:44:34 CET,Thu Dec 23 05:27:12 CET,0.0 0.36 0.56 0.725 0.854 0.991 1.126 1.24 1.438 1.526 1.61 1.684 1.856 1.937 2.071 2.185 2.293 2.351 2.467 2.571 2.717 2.824 2.933 3.079 3.222 3.36 3.504 3.655 3.857 4.038 4.205 4.417 4.617 4.808 5.029 5.257 5.47 5.714 5.978 6.243 6.529 6.845 7.187 7.533 7.933 8.343 8.757 9.171 9.565 9.92 10.283 10.352 10.12 9.806 9.462 9.107 8.713 8.274 7.95 7.657 7.344 7.015 6.694 6.416 6.182 5.983 5.785 5.573 5.345 5.092 4.845 4.646 4.446 4.256 4.101 3.921 3.739 3.57 3.391 3.247 3.082 2.815 2.623 2.431 2.333 2.127 1.925 1.73 1.633 1.437 1.286 1.159 1.019 0.703 0.52 0.315 0.09 -0.155 -0.447 -0.842 -2.09 -5 ,17365 ,KEBNE ,17042121,Thu Dec 23 03:44:34 CET,Thu Dec 23 05:24:53 CET,0.0 0.394 0.614 0.785 0.939 1.079 1.203 1.335 1.548 1.637 1.728 1.797 1.96 2.037 2.187 2.327 2.46 2.526 2.649 2.762 2.944 3.065 3.18 3.336 3.471 3.601 3.739 3.871 4.043 4.218 4.388 4.591 4.769 4.933 5.123 5.336 5.553 5.811 6.069 6.325 6.588 6.86 7.193 7.547 7.936 8.308 8.681 9.115 9.6 10.09 10.556 10.64 10.42 10.069 9.699 9.339 8.975 8.636 8.296 7.935 7.66 7.397 7.1 6.836 6.591 6.342 6.09 5.836 5.602 5.358 5.088 4.89 4.701 4.487 4.323 4.174 4.022 3.846 3.668 3.539 3.384 3.15 2.98 2.804 2.72 2.534 2.326 2.101 1.977 1.749 1.547 1.406 1.254 0.924 0.75 0.548 0.317 0.05 -0.258 -0.606 -2.149 -6 ,27389 ,KEBNE ,17042122,Thu Dec 23 03:44:38 CET,Thu Dec 23 05:24:58 CET,0.0 0.35 0.55 0.715 0.838 0.938 1.025 1.12 1.31 1.393 1.475 1.553 1.722 1.806 1.962 2.099 2.237 2.299 2.415 2.537 2.711 2.816 2.921 3.074 3.215 3.357 3.507 3.651 3.832 4.005 4.165 4.346 4.522 4.704 4.908 5.129 5.336 5.554 5.802 6.079 6.357 6.662 7.032 7.391 7.816 8.257 8.694 9.204 9.761 10.25 10.502 10.251 9.791 9.282 8.803 8.371 7.942 7.533 7.183 6.771 6.391 6.066 5.75 5.419 5.093 4.807 4.5 4.225 3.992 3.754 3.481 3.249 3.007 2.713 2.512 2.342 2.165 1.962 1.733 1.579 1.425 1.177 0.985 0.775 0.659 0.412 0.172 -0.084 -0.211 -0.429 -0.647 -0.805 -0.955 -1.293 -1.478 -1.687 -1.93 -2.221 -2.565 -3.011 -3.895 -7 ,567 ,KEBNE ,17042123,Thu Dec 23 03:44:34 CET,Thu Dec 23 05:25:54 CET,0.0 0.395 0.571 0.711 0.851 0.993 1.121 1.232 1.437 1.534 1.618 1.697 1.855 1.931 2.092 2.222 2.352 2.419 2.543 2.658 2.827 2.935 3.032 3.186 3.338 3.482 3.618 3.739 3.896 4.051 4.21 4.412 4.599 4.787 5.015 5.254 5.48 5.736 5.991 6.261 6.56 6.877 7.241 7.613 8.026 8.418 8.857 9.343 9.766 10.132 10.397 10.39 10.156 9.826 9.448 9.053 8.675 8.294 7.944 7.594 7.284 6.98 6.681 6.372 6.061 5.78 5.499 5.241 5.001 4.759 4.534 4.34 4.111 3.87 3.692 3.508 3.312 3.082 2.838 2.673 2.491 2.226 2.056 1.861 1.751 1.534 1.328 1.092 0.947 0.7 0.478 0.301 0.12 -0.253 -0.443 -0.65 -0.906 -1.182 -1.53 -1.994 -3.587 -8 ,17453 ,KEBNE ,17042124,Thu Dec 23 03:44:34 CET,Thu Dec 23 05:24:32 CET,0.0 0.452 0.634 0.782 0.905 1.011 1.116 1.224 1.42 1.507 1.594 1.656 1.81 1.88 2.015 2.148 2.264 2.32 2.428 2.538 2.7 2.795 2.891 3.036 3.163 3.284 3.404 3.522 3.679 3.836 3.988 4.164 4.329 4.491 4.666 4.855 5.058 5.304 5.566 5.824 6.089 6.404 6.797 7.176 7.584 7.986 8.467 9.006 9.488 9.962 10.269 10.15 9.821 9.466 9.09 8.674 8.268 7.888 7.531 7.131 6.804 6.53 6.258 5.97 5.706 5.458 5.179 4.935 4.722 4.497 4.286 4.134 3.969 3.758 3.604 3.457 3.293 3.111 2.928 2.819 2.693 2.473 2.334 2.203 2.13 1.981 1.834 1.66 1.566 1.366 1.175 1.042 0.908 0.642 0.501 0.323 0.09 -0.17 -0.442 -0.75 -1.85 -9 ,31328 ,KEBNE ,17042125,Thu Dec 23 03:44:34 CET,Thu Dec 23 05:25:18 CET,0.0 0.462 0.649 0.796 0.928 1.073 1.215 1.34 1.557 1.663 1.76 1.83 1.994 2.075 2.218 2.347 2.48 2.542 2.667 2.796 2.992 3.119 3.23 3.384 3.535 3.682 3.835 3.98 4.141 4.287 4.438 4.616 4.79 4.974 5.188 5.432 5.665 5.913 6.16 6.422 6.705 7.016 7.378 7.728 8.121 8.531 8.95 9.402 9.893 10.348 10.698 10.622 10.234 9.797 9.373 8.948 8.517 8.067 7.697 7.346 7.024 6.741 6.453 6.15 5.839 5.549 5.273 4.992 4.755 4.538 4.294 4.089 3.883 3.669 3.498 3.326 3.162 2.988 2.797 2.646 2.486 2.229 2.049 1.868 1.772 1.57 1.339 1.063 0.924 0.692 0.472 0.321 0.155 -0.239 -0.43 -0.641 -0.881 -1.196 -1.63 -2.054 -3.162 -10 ,13224 ,KEBNE ,17042126,Thu Dec 23 03:44:34 CET,Thu Dec 23 05:25:43 CET,0.0 0.431 0.651 0.812 0.938 1.051 1.155 1.244 1.412 1.506 1.603 1.681 1.833 1.9 2.037 2.172 2.311 2.382 2.514 2.638 2.82 2.932 3.044 3.205 3.353 3.487 3.624 3.764 3.931 4.09 4.249 4.444 4.623 4.781 4.964 5.177 5.389 5.633 5.888 6.12 6.349 6.628 6.953 7.263 7.615 7.992 8.415 8.836 9.221 9.617 9.894 9.894 9.67 9.256 8.867 8.514 8.137 7.75 7.376 6.972 6.618 6.288 5.952 5.603 5.267 4.956 4.635 4.338 4.09 3.852 3.589 3.383 3.16 2.911 2.721 2.526 2.304 2.073 1.829 1.654 1.488 1.228 1.046 0.861 0.761 0.554 0.35 0.115 -0.013 -0.216 -0.346 -0.475 -0.635 -0.974 -1.143 -1.327 -1.537 -1.789 -2.085 -2.457 -3.735 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_36_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_36_37.txt deleted file mode 100644 index 89a3d191..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_36_37.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30130 ,KEBNE ,17042127,Thu Dec 23 03:44:34 CET,Thu Dec 23 05:25:15 CET,0.0 1.95 2.439 2.749 3.012 3.222 3.393 3.551 3.823 3.946 4.065 4.215 4.42 4.527 4.732 4.923 5.114 5.203 5.36 5.521 5.746 5.898 6.058 6.267 6.462 6.663 6.864 7.058 7.292 7.518 7.749 8.021 8.285 8.557 8.876 9.224 9.56 9.93 10.336 10.768 11.219 11.748 12.383 13.021 13.768 14.653 15.688 16.755 17.923 19.275 20.891 22.168 22.853 23.228 23.441 23.563 23.601 23.616 23.618 23.592 23.55 23.521 23.477 23.427 23.363 23.287 23.191 23.074 22.969 22.864 22.736 22.641 22.563 22.473 22.402 22.338 22.268 22.171 22.084 22.03 21.961 21.859 21.781 21.676 21.614 21.47 21.319 21.185 21.117 20.97 20.875 20.777 20.654 20.404 20.29 20.143 19.975 19.809 19.549 19.185 18.581 -3 ,25750 ,KEBNE ,17042129,Thu Dec 23 03:50:47 CET,Thu Dec 23 05:30:20 CET,0.0 1.841 2.303 2.636 2.905 3.13 3.313 3.471 3.753 3.883 4.01 4.154 4.348 4.457 4.666 4.86 5.047 5.14 5.319 5.494 5.737 5.894 6.047 6.259 6.466 6.672 6.867 7.051 7.301 7.559 7.816 8.115 8.389 8.653 8.962 9.312 9.64 10.001 10.394 10.83 11.298 11.809 12.429 13.086 13.784 14.48 15.261 16.139 17.218 18.501 19.928 20.93 21.404 21.63 21.739 21.78 21.77 21.695 21.622 21.547 21.473 21.38 21.257 21.124 20.989 20.862 20.731 20.619 20.529 20.431 20.318 20.223 20.123 20.0 19.9 19.808 19.713 19.613 19.512 19.443 19.366 19.225 19.125 19.008 18.939 18.819 18.708 18.573 18.491 18.344 18.24 18.162 18.062 17.834 17.714 17.552 17.382 17.209 17.009 16.741 16.095 -4 ,25854 ,KEBNE ,17042130,Thu Dec 23 03:50:47 CET,Thu Dec 23 05:31:07 CET,0.0 1.905 2.368 2.69 2.934 3.137 3.311 3.478 3.763 3.901 4.045 4.215 4.414 4.523 4.723 4.902 5.073 5.163 5.332 5.516 5.797 5.966 6.119 6.338 6.567 6.778 6.977 7.165 7.427 7.697 7.952 8.237 8.501 8.753 9.052 9.408 9.738 10.094 10.506 10.944 11.399 11.932 12.56 13.201 13.995 14.887 15.886 16.902 18.033 19.42 21.006 22.255 22.908 23.241 23.427 23.534 23.574 23.583 23.569 23.51 23.415 23.306 23.197 23.079 22.974 22.865 22.711 22.573 22.457 22.34 22.221 22.113 22.005 21.897 21.804 21.704 21.609 21.507 21.388 21.287 21.183 21.058 20.975 20.875 20.804 20.628 20.445 20.266 20.177 20.017 19.846 19.73 19.624 19.379 19.234 19.074 18.91 18.719 18.51 18.252 16.751 -5 ,3694 ,KEBNE ,17042131,Thu Dec 23 03:50:47 CET,Thu Dec 23 05:30:11 CET,0.0 1.583 2.007 2.324 2.57 2.77 2.955 3.131 3.465 3.609 3.739 3.895 4.093 4.202 4.411 4.607 4.8 4.89 5.054 5.214 5.449 5.609 5.771 5.997 6.217 6.432 6.631 6.823 7.075 7.329 7.585 7.884 8.169 8.449 8.767 9.118 9.464 9.858 10.275 10.718 11.206 11.753 12.377 13.008 13.732 14.54 15.46 16.505 17.684 18.954 20.382 21.517 22.114 22.402 22.51 22.505 22.488 22.47 22.396 22.279 22.167 22.039 21.909 21.782 21.657 21.52 21.351 21.174 21.015 20.861 20.709 20.594 20.484 20.366 20.265 20.145 20.006 19.844 19.674 19.574 19.481 19.331 19.208 19.08 19.02 18.884 18.711 18.515 18.414 18.235 18.053 17.939 17.838 17.622 17.517 17.402 17.243 17.021 16.777 16.478 15.859 -6 ,14389 ,KEBNE ,17042132,Thu Dec 23 03:50:47 CET,Thu Dec 23 05:30:28 CET,0.0 2.007 2.558 2.955 3.237 3.491 3.697 3.872 4.198 4.363 4.53 4.725 4.939 5.061 5.293 5.506 5.705 5.802 5.992 6.173 6.428 6.587 6.741 6.972 7.196 7.411 7.62 7.823 8.085 8.339 8.585 8.891 9.175 9.443 9.761 10.135 10.486 10.846 11.241 11.663 12.109 12.614 13.202 13.822 14.558 15.358 16.293 17.371 18.619 20.095 21.936 23.36 24.118 24.529 24.731 24.769 24.722 24.655 24.562 24.452 24.324 24.187 24.043 23.919 23.799 23.667 23.529 23.403 23.29 23.158 23.033 22.933 22.825 22.695 22.567 22.449 22.341 22.225 22.084 21.99 21.902 21.747 21.62 21.469 21.403 21.288 21.131 20.949 20.849 20.666 20.482 20.365 20.235 19.951 19.808 19.638 19.467 19.282 19.002 18.653 17.322 -7 ,9003 ,KEBNE ,17042133,Thu Dec 23 03:50:47 CET,Thu Dec 23 05:30:59 CET,0.0 1.595 2.066 2.388 2.659 2.901 3.121 3.3 3.608 3.765 3.908 4.084 4.303 4.429 4.647 4.842 5.023 5.112 5.288 5.455 5.689 5.833 5.978 6.18 6.381 6.597 6.802 6.999 7.255 7.509 7.753 8.03 8.307 8.591 8.922 9.286 9.637 10.022 10.429 10.87 11.345 11.863 12.482 13.125 13.826 14.545 15.351 16.256 17.281 18.511 19.987 21.129 21.769 22.201 22.455 22.555 22.563 22.54 22.519 22.417 22.277 22.146 21.981 21.848 21.77 21.693 21.601 21.504 21.405 21.277 21.131 21.011 20.894 20.789 20.711 20.61 20.485 20.371 20.267 20.178 20.079 19.945 19.848 19.746 19.695 19.604 19.508 19.391 19.322 19.183 19.076 18.983 18.886 18.606 18.433 18.247 18.032 17.795 17.542 17.207 15.72 -8 ,9324 ,KEBNE ,17042134,Thu Dec 23 03:50:47 CET,Thu Dec 23 05:31:56 CET,0.0 1.735 2.3 2.657 2.903 3.105 3.312 3.494 3.778 3.908 4.036 4.191 4.387 4.495 4.696 4.882 5.069 5.162 5.329 5.482 5.707 5.857 6.011 6.253 6.479 6.682 6.883 7.073 7.311 7.545 7.778 8.058 8.332 8.609 8.923 9.301 9.658 10.004 10.396 10.845 11.29 11.785 12.392 13.009 13.723 14.516 15.387 16.412 17.659 19.137 21.034 22.543 23.312 23.787 24.074 24.225 24.295 24.322 24.359 24.371 24.319 24.251 24.19 24.117 24.027 23.938 23.842 23.719 23.606 23.521 23.434 23.348 23.253 23.15 23.056 22.956 22.843 22.721 22.594 22.487 22.372 22.213 22.102 21.976 21.909 21.776 21.61 21.419 21.337 21.178 21.024 20.909 20.775 20.493 20.335 20.159 19.954 19.758 19.566 19.221 18.369 -9 ,29803 ,KEBNE ,17042135,Thu Dec 23 03:50:47 CET,Thu Dec 23 05:31:37 CET,0.0 1.757 2.185 2.487 2.735 2.93 3.154 3.379 3.717 3.853 3.975 4.147 4.354 4.465 4.675 4.861 5.046 5.138 5.304 5.46 5.686 5.834 5.979 6.19 6.397 6.599 6.802 7.0 7.231 7.456 7.674 7.929 8.183 8.422 8.7 9.032 9.349 9.679 10.038 10.443 10.87 11.345 11.929 12.535 13.221 14.002 14.886 15.874 17.097 18.567 20.377 21.924 22.811 23.299 23.628 23.857 23.947 23.951 23.901 23.81 23.737 23.684 23.642 23.568 23.454 23.371 23.301 23.22 23.122 23.007 22.89 22.798 22.715 22.588 22.468 22.363 22.267 22.165 22.012 21.889 21.785 21.634 21.521 21.411 21.361 21.258 21.13 21.0 20.926 20.762 20.66 20.596 20.509 20.307 20.201 20.063 19.89 19.683 19.445 19.146 18.191 -10 ,17318 ,KEBNE ,17042136,Thu Dec 23 03:50:47 CET,Thu Dec 23 05:31:14 CET,0.0 1.666 2.105 2.452 2.74 2.971 3.156 3.318 3.625 3.769 3.905 4.07 4.266 4.371 4.581 4.799 4.998 5.082 5.255 5.443 5.71 5.878 6.042 6.275 6.506 6.717 6.91 7.098 7.338 7.58 7.806 8.064 8.314 8.551 8.847 9.189 9.514 9.857 10.215 10.62 11.053 11.53 12.08 12.633 13.28 13.988 14.79 15.762 16.913 18.225 19.825 21.152 21.848 22.212 22.444 22.573 22.602 22.559 22.535 22.531 22.491 22.428 22.359 22.298 22.249 22.194 22.131 22.064 21.995 21.922 21.802 21.698 21.59 21.473 21.388 21.286 21.173 21.063 20.945 20.865 20.788 20.645 20.516 20.386 20.325 20.206 20.103 19.985 19.917 19.77 19.659 19.555 19.436 19.182 19.044 18.901 18.728 18.498 18.25 17.992 16.986 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_19.txt deleted file mode 100644 index ad99c669..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_19.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2606 ,KEBNE ,16653659,Mon Nov 22 03:26:27 CET,Mon Nov 22 05:07:50 CET,0.0 0.24 0.32 0.38 0.456 0.528 0.586 0.638 0.756 0.802 0.834 0.851 0.963 1.007 1.089 1.151 1.211 1.24 1.286 1.331 1.392 1.428 1.463 1.52 1.576 1.619 1.651 1.678 1.722 1.766 1.812 1.859 1.9 1.933 1.971 2.021 2.037 2.036 2.04 2.031 2.029 2.024 1.98 1.906 1.767 1.566 1.294 0.87 0.225 -0.714 -2.242 -4.071 -5.558 -6.794 -7.835 -8.743 -9.535 -10.244 -10.828 -11.416 -11.955 -12.423 -12.853 -13.274 -13.659 -14.004 -14.362 -14.678 -14.959 -15.249 -15.563 -15.841 -16.135 -16.441 -16.673 -16.908 -17.151 -17.409 -17.69 -17.873 -18.047 -18.336 -18.556 -18.776 -18.885 -19.131 -19.387 -19.66 -19.809 -20.04 -20.25 -20.412 -20.595 -21.024 -21.245 -21.503 -21.806 -22.147 -22.56 -23.112 -25.365 -2 ,15769 ,KEBNE ,16653660,Mon Nov 22 03:26:27 CET,Mon Nov 22 05:08:27 CET,0.0 0.278 0.372 0.444 0.52 0.575 0.614 0.654 0.728 0.769 0.812 0.826 0.93 0.962 1.012 1.055 1.092 1.111 1.154 1.199 1.257 1.288 1.318 1.36 1.396 1.436 1.472 1.506 1.547 1.583 1.619 1.65 1.673 1.701 1.722 1.744 1.76 1.753 1.743 1.731 1.713 1.683 1.601 1.481 1.34 1.14 0.825 0.397 -0.227 -1.196 -2.828 -4.817 -6.389 -7.662 -8.76 -9.744 -10.573 -11.297 -11.886 -12.469 -13.02 -13.521 -13.99 -14.434 -14.842 -15.229 -15.657 -16.036 -16.354 -16.677 -16.999 -17.261 -17.551 -17.85 -18.074 -18.31 -18.561 -18.815 -19.086 -19.283 -19.479 -19.779 -19.993 -20.224 -20.337 -20.578 -20.839 -21.12 -21.266 -21.5 -21.709 -21.87 -22.053 -22.444 -22.647 -22.881 -23.19 -23.57 -24.014 -24.621 -26.824 -3 ,5710 ,KEBNE ,16653661,Mon Nov 22 03:26:27 CET,Mon Nov 22 05:07:53 CET,0.0 0.176 0.336 0.438 0.501 0.562 0.616 0.663 0.734 0.769 0.808 0.817 0.92 0.956 1.012 1.061 1.105 1.123 1.157 1.193 1.246 1.281 1.312 1.355 1.398 1.422 1.456 1.499 1.545 1.584 1.608 1.636 1.66 1.688 1.721 1.726 1.73 1.74 1.753 1.764 1.748 1.71 1.655 1.585 1.457 1.265 0.963 0.525 -0.089 -1.039 -2.607 -4.433 -5.889 -7.116 -8.195 -9.163 -10.002 -10.757 -11.385 -12.022 -12.553 -13.018 -13.48 -13.922 -14.313 -14.643 -14.98 -15.288 -15.562 -15.842 -16.138 -16.382 -16.627 -16.893 -17.101 -17.319 -17.539 -17.782 -18.05 -18.224 -18.396 -18.665 -18.851 -19.036 -19.128 -19.344 -19.569 -19.79 -19.923 -20.147 -20.332 -20.486 -20.642 -20.971 -21.175 -21.402 -21.652 -21.996 -22.365 -22.869 -25.124 -4 ,32109 ,KEBNE ,16653662,Mon Nov 22 03:26:27 CET,Mon Nov 22 05:07:48 CET,0.0 0.337 0.446 0.524 0.595 0.663 0.722 0.764 0.84 0.88 0.923 0.932 1.03 1.06 1.111 1.165 1.216 1.24 1.29 1.34 1.403 1.429 1.452 1.503 1.555 1.596 1.627 1.649 1.677 1.715 1.761 1.793 1.832 1.873 1.893 1.913 1.926 1.945 1.958 1.953 1.933 1.887 1.807 1.704 1.551 1.312 0.981 0.582 -0.043 -1.057 -2.669 -4.577 -6.152 -7.426 -8.438 -9.325 -10.09 -10.761 -11.356 -11.964 -12.485 -12.933 -13.372 -13.787 -14.16 -14.489 -14.816 -15.127 -15.401 -15.687 -15.989 -16.235 -16.476 -16.717 -16.923 -17.152 -17.392 -17.637 -17.878 -18.045 -18.205 -18.438 -18.617 -18.806 -18.908 -19.14 -19.362 -19.579 -19.705 -19.928 -20.138 -20.305 -20.472 -20.839 -21.044 -21.28 -21.583 -21.959 -22.415 -23.008 -25.178 -5 ,19061 ,KEBNE ,16653663,Mon Nov 22 03:27:28 CET,Mon Nov 22 05:07:56 CET,0.0 0.231 0.347 0.417 0.485 0.539 0.606 0.69 0.827 0.883 0.934 0.943 1.033 1.062 1.113 1.164 1.22 1.248 1.298 1.345 1.409 1.453 1.495 1.547 1.594 1.633 1.665 1.692 1.731 1.774 1.822 1.871 1.911 1.945 1.98 2.022 2.042 2.057 2.066 2.066 2.051 2.021 1.987 1.92 1.818 1.685 1.472 1.135 0.569 -0.313 -1.843 -3.631 -5.104 -6.352 -7.31 -8.149 -8.907 -9.574 -10.116 -10.644 -11.104 -11.525 -11.956 -12.374 -12.758 -13.11 -13.485 -13.838 -14.135 -14.423 -14.7 -14.934 -15.18 -15.434 -15.638 -15.839 -16.038 -16.257 -16.495 -16.654 -16.808 -17.096 -17.321 -17.553 -17.667 -17.9 -18.136 -18.385 -18.531 -18.755 -18.981 -19.159 -19.327 -19.694 -19.9 -20.137 -20.434 -20.84 -21.315 -21.88 -24.138 -6 ,7564 ,KEBNE ,16653664,Mon Nov 22 03:27:28 CET,Mon Nov 22 05:09:36 CET,0.0 0.122 0.211 0.311 0.398 0.463 0.522 0.583 0.692 0.728 0.764 0.772 0.873 0.91 0.97 1.02 1.074 1.103 1.173 1.23 1.285 1.315 1.34 1.38 1.427 1.476 1.52 1.55 1.587 1.633 1.671 1.71 1.743 1.785 1.841 1.869 1.874 1.877 1.878 1.873 1.859 1.823 1.759 1.659 1.514 1.316 1.023 0.615 -0.001 -0.901 -2.38 -4.199 -5.671 -6.876 -7.963 -8.923 -9.696 -10.415 -11.04 -11.646 -12.174 -12.672 -13.175 -13.676 -14.155 -14.579 -15.001 -15.354 -15.671 -16.016 -16.355 -16.615 -16.892 -17.18 -17.386 -17.609 -17.851 -18.09 -18.342 -18.527 -18.72 -19.033 -19.247 -19.466 -19.586 -19.827 -20.097 -20.383 -20.533 -20.791 -21.064 -21.278 -21.51 -21.962 -22.203 -22.476 -22.807 -23.165 -23.626 -24.305 -26.364 -7 ,1958 ,KEBNE ,16653665,Mon Nov 22 03:27:28 CET,Mon Nov 22 05:09:01 CET,0.0 0.245 0.378 0.461 0.529 0.596 0.653 0.713 0.82 0.86 0.9 0.937 1.057 1.102 1.178 1.25 1.322 1.359 1.428 1.485 1.568 1.625 1.674 1.745 1.818 1.877 1.92 1.956 1.99 2.019 2.044 2.069 2.095 2.115 2.135 2.151 2.162 2.192 2.219 2.214 2.181 2.129 2.064 2.003 1.921 1.781 1.561 1.223 0.692 -0.153 -1.684 -3.61 -5.112 -6.324 -7.359 -8.306 -9.157 -9.917 -10.555 -11.172 -11.694 -12.146 -12.566 -12.99 -13.382 -13.74 -14.129 -14.468 -14.758 -15.057 -15.369 -15.634 -15.905 -16.188 -16.432 -16.693 -16.947 -17.19 -17.429 -17.594 -17.76 -18.041 -18.258 -18.484 -18.6 -18.82 -19.037 -19.265 -19.385 -19.608 -19.848 -20.018 -20.191 -20.596 -20.827 -21.087 -21.376 -21.692 -22.073 -22.632 -24.464 -8 ,32320 ,KEBNE ,16653666,Mon Nov 22 03:27:28 CET,Mon Nov 22 05:09:43 CET,0.0 0.154 0.261 0.327 0.406 0.47 0.523 0.591 0.697 0.733 0.768 0.787 0.896 0.932 0.98 1.026 1.085 1.112 1.162 1.21 1.276 1.316 1.348 1.392 1.437 1.47 1.496 1.519 1.549 1.572 1.59 1.615 1.64 1.657 1.669 1.685 1.695 1.69 1.674 1.652 1.63 1.588 1.527 1.426 1.272 1.095 0.838 0.436 -0.217 -1.196 -2.781 -4.639 -6.173 -7.422 -8.423 -9.317 -10.072 -10.744 -11.353 -11.976 -12.479 -12.908 -13.331 -13.747 -14.121 -14.444 -14.789 -15.091 -15.342 -15.602 -15.866 -16.08 -16.305 -16.554 -16.745 -16.944 -17.147 -17.358 -17.611 -17.791 -17.97 -18.276 -18.495 -18.693 -18.798 -19.041 -19.287 -19.536 -19.662 -19.874 -20.066 -20.215 -20.386 -20.774 -20.966 -21.186 -21.456 -21.808 -22.194 -22.643 -24.449 -9 ,12691 ,KEBNE ,16653667,Mon Nov 22 03:27:28 CET,Mon Nov 22 05:08:38 CET,0.0 0.163 0.257 0.366 0.474 0.546 0.601 0.661 0.769 0.805 0.84 0.839 0.942 0.984 1.06 1.108 1.149 1.17 1.202 1.237 1.289 1.323 1.369 1.443 1.493 1.533 1.573 1.609 1.652 1.687 1.715 1.741 1.764 1.788 1.809 1.826 1.842 1.844 1.833 1.806 1.773 1.747 1.711 1.623 1.464 1.248 0.948 0.569 0.022 -0.866 -2.391 -4.148 -5.523 -6.732 -7.777 -8.659 -9.413 -10.093 -10.689 -11.292 -11.801 -12.238 -12.663 -13.076 -13.451 -13.803 -14.179 -14.51 -14.79 -15.075 -15.388 -15.633 -15.872 -16.137 -16.342 -16.559 -16.787 -17.02 -17.251 -17.406 -17.571 -17.855 -18.072 -18.282 -18.383 -18.595 -18.827 -19.07 -19.198 -19.425 -19.616 -19.766 -19.928 -20.286 -20.491 -20.698 -20.929 -21.252 -21.634 -22.093 -23.742 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_26.txt deleted file mode 100644 index a398f5cf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_26.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,17733 ,KEBNE ,16653671,Mon Nov 22 03:27:32 CET,Mon Nov 22 05:09:55 CET,0.0 0.889 1.172 1.38 1.567 1.74 1.877 1.989 2.225 2.337 2.437 2.567 2.724 2.809 2.967 3.121 3.277 3.349 3.473 3.587 3.748 3.848 3.942 4.076 4.212 4.343 4.474 4.615 4.78 4.921 5.06 5.22 5.384 5.548 5.73 5.926 6.105 6.277 6.448 6.635 6.837 7.049 7.259 7.449 7.665 7.879 8.052 8.17 8.216 8.024 7.33 6.388 5.553 4.704 3.934 3.255 2.639 2.104 1.63 1.112 0.691 0.319 -0.021 -0.324 -0.619 -0.89 -1.188 -1.473 -1.712 -1.948 -2.192 -2.399 -2.619 -2.846 -3.019 -3.198 -3.391 -3.583 -3.772 -3.901 -4.037 -4.268 -4.439 -4.609 -4.696 -4.877 -5.064 -5.268 -5.373 -5.566 -5.73 -5.859 -6.001 -6.326 -6.494 -6.672 -6.887 -7.142 -7.497 -8.03 -10.092 -4 ,15110 ,KEBNE ,16653672,Mon Nov 22 03:27:28 CET,Mon Nov 22 05:10:04 CET,0.0 0.988 1.3 1.51 1.708 1.9 2.074 2.232 2.51 2.625 2.73 2.864 3.037 3.15 3.349 3.526 3.686 3.757 3.897 4.035 4.23 4.35 4.471 4.643 4.792 4.929 5.067 5.202 5.374 5.527 5.664 5.846 6.035 6.203 6.379 6.573 6.754 6.927 7.092 7.255 7.431 7.639 7.838 7.993 8.16 8.307 8.403 8.408 8.29 7.98 7.202 6.03 5.007 4.133 3.386 2.721 2.144 1.646 1.225 0.814 0.467 0.151 -0.155 -0.438 -0.71 -0.963 -1.212 -1.43 -1.639 -1.871 -2.097 -2.267 -2.441 -2.629 -2.784 -2.955 -3.121 -3.29 -3.477 -3.62 -3.771 -3.996 -4.155 -4.31 -4.386 -4.566 -4.784 -5.022 -5.138 -5.336 -5.553 -5.71 -5.877 -6.247 -6.448 -6.695 -6.982 -7.297 -7.646 -8.088 -9.794 -5 ,16855 ,KEBNE ,16653673,Mon Nov 22 03:27:28 CET,Mon Nov 22 05:09:07 CET,0.0 1.187 1.489 1.724 1.91 2.056 2.181 2.314 2.579 2.701 2.818 2.974 3.137 3.229 3.392 3.54 3.687 3.76 3.913 4.052 4.225 4.333 4.444 4.604 4.749 4.884 5.022 5.158 5.334 5.506 5.679 5.876 6.036 6.193 6.387 6.591 6.786 7.01 7.257 7.507 7.739 7.994 8.287 8.533 8.791 9.059 9.307 9.53 9.694 9.735 9.503 8.789 8.003 7.31 6.691 6.12 5.6 5.115 4.704 4.267 3.89 3.575 3.271 2.995 2.715 2.44 2.158 1.902 1.677 1.425 1.17 0.969 0.756 0.529 0.351 0.171 -0.019 -0.222 -0.429 -0.577 -0.737 -0.983 -1.146 -1.324 -1.437 -1.66 -1.858 -2.09 -2.211 -2.408 -2.592 -2.723 -2.856 -3.19 -3.395 -3.592 -3.828 -4.177 -4.569 -5.106 -6.916 -6 ,31429 ,KEBNE ,16653674,Mon Nov 22 03:27:28 CET,Mon Nov 22 05:11:02 CET,0.0 0.915 1.274 1.579 1.834 2.035 2.211 2.363 2.626 2.759 2.885 3.056 3.227 3.323 3.504 3.652 3.801 3.874 4.01 4.143 4.337 4.463 4.584 4.756 4.915 5.062 5.194 5.333 5.511 5.672 5.824 5.997 6.161 6.312 6.486 6.681 6.857 7.033 7.203 7.385 7.56 7.716 7.888 8.069 8.255 8.412 8.507 8.535 8.443 8.185 7.624 6.677 5.837 5.115 4.42 3.772 3.203 2.69 2.238 1.76 1.35 0.996 0.659 0.342 0.059 -0.207 -0.471 -0.68 -0.864 -1.066 -1.288 -1.506 -1.74 -1.976 -2.159 -2.344 -2.54 -2.754 -2.981 -3.129 -3.274 -3.493 -3.641 -3.792 -3.871 -4.048 -4.242 -4.447 -4.563 -4.769 -4.993 -5.163 -5.317 -5.694 -5.911 -6.13 -6.401 -6.718 -7.107 -7.671 -9.753 -7 ,32568 ,KEBNE ,16653675,Mon Nov 22 03:28:30 CET,Mon Nov 22 05:12:43 CET,0.0 0.925 1.193 1.352 1.493 1.642 1.789 1.921 2.145 2.245 2.339 2.449 2.616 2.709 2.867 3.012 3.143 3.209 3.342 3.459 3.615 3.712 3.803 3.934 4.068 4.201 4.341 4.474 4.627 4.772 4.906 5.072 5.232 5.375 5.55 5.742 5.899 6.057 6.229 6.404 6.576 6.754 6.917 7.066 7.222 7.331 7.445 7.546 7.576 7.442 6.889 5.925 5.045 4.264 3.573 2.912 2.323 1.815 1.395 0.972 0.575 0.221 -0.12 -0.453 -0.762 -1.034 -1.31 -1.572 -1.802 -2.042 -2.293 -2.479 -2.67 -2.898 -3.072 -3.251 -3.447 -3.648 -3.854 -3.997 -4.132 -4.339 -4.5 -4.675 -4.768 -4.964 -5.176 -5.397 -5.522 -5.737 -5.961 -6.116 -6.267 -6.601 -6.787 -6.998 -7.242 -7.55 -7.918 -8.361 -10.524 -8 ,11178 ,KEBNE ,16653676,Mon Nov 22 03:28:30 CET,Mon Nov 22 05:11:19 CET,0.0 0.89 1.165 1.37 1.553 1.72 1.859 1.99 2.246 2.359 2.468 2.619 2.774 2.855 3.031 3.198 3.349 3.416 3.54 3.662 3.842 3.965 4.082 4.232 4.371 4.504 4.634 4.762 4.925 5.068 5.221 5.402 5.561 5.717 5.887 6.091 6.277 6.461 6.659 6.85 7.027 7.216 7.437 7.649 7.845 8.006 8.124 8.211 8.241 8.011 7.35 6.377 5.514 4.769 4.105 3.493 2.941 2.435 2.009 1.592 1.214 0.868 0.557 0.26 -0.026 -0.292 -0.57 -0.824 -1.04 -1.262 -1.497 -1.714 -1.954 -2.176 -2.333 -2.505 -2.697 -2.898 -3.09 -3.216 -3.356 -3.579 -3.745 -3.949 -4.063 -4.284 -4.509 -4.745 -4.861 -5.053 -5.255 -5.415 -5.57 -5.899 -6.09 -6.288 -6.502 -6.785 -7.15 -7.642 -9.351 -9 ,32568 ,KEBNE ,16653677,Mon Nov 22 03:28:30 CET,Mon Nov 22 05:11:24 CET,0.0 0.925 1.193 1.352 1.493 1.642 1.789 1.921 2.145 2.245 2.339 2.449 2.616 2.709 2.867 3.012 3.143 3.209 3.342 3.459 3.615 3.712 3.803 3.934 4.068 4.201 4.341 4.474 4.627 4.772 4.906 5.072 5.232 5.375 5.55 5.742 5.899 6.057 6.229 6.404 6.576 6.754 6.917 7.066 7.222 7.331 7.445 7.546 7.576 7.442 6.889 5.925 5.045 4.264 3.573 2.912 2.323 1.815 1.395 0.972 0.575 0.221 -0.12 -0.453 -0.762 -1.034 -1.31 -1.572 -1.802 -2.042 -2.293 -2.479 -2.67 -2.898 -3.072 -3.251 -3.447 -3.648 -3.854 -3.997 -4.132 -4.339 -4.5 -4.675 -4.768 -4.964 -5.176 -5.397 -5.522 -5.737 -5.961 -6.116 -6.267 -6.601 -6.787 -6.998 -7.242 -7.55 -7.918 -8.361 -10.524 -10 ,28155 ,KEBNE ,16653678,Mon Nov 22 03:28:30 CET,Mon Nov 22 05:10:30 CET,0.0 1.048 1.368 1.586 1.755 1.89 2.005 2.141 2.401 2.503 2.604 2.715 2.875 2.971 3.134 3.274 3.406 3.468 3.587 3.71 3.901 4.024 4.136 4.291 4.433 4.557 4.685 4.817 4.995 5.147 5.276 5.441 5.603 5.743 5.892 6.07 6.221 6.359 6.504 6.659 6.805 6.95 7.111 7.251 7.402 7.553 7.671 7.772 7.78 7.511 6.794 5.65 4.578 3.722 2.99 2.313 1.7 1.163 0.739 0.302 -0.093 -0.442 -0.785 -1.109 -1.413 -1.696 -1.996 -2.273 -2.516 -2.75 -2.995 -3.214 -3.436 -3.657 -3.828 -4.008 -4.205 -4.403 -4.584 -4.721 -4.907 -5.241 -5.439 -5.592 -5.675 -5.869 -6.103 -6.34 -6.453 -6.648 -6.872 -7.036 -7.201 -7.575 -7.783 -8.009 -8.267 -8.56 -8.917 -9.414 -11.19 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_30.txt deleted file mode 100644 index 67ff20a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_30.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27099 ,KEBNE ,16653679,Mon Nov 22 03:28:34 CET,Mon Nov 22 05:04:58 CET,0.0 0.891 1.168 1.393 1.564 1.714 1.836 1.941 2.159 2.256 2.347 2.449 2.584 2.649 2.788 2.918 3.027 3.086 3.193 3.283 3.411 3.497 3.577 3.677 3.777 3.871 3.956 4.049 4.167 4.268 4.363 4.457 4.537 4.623 4.732 4.866 4.962 5.046 5.149 5.254 5.355 5.449 5.531 5.585 5.609 5.592 5.526 5.389 5.105 4.57 3.514 2.04 0.7 -0.4 -1.347 -2.214 -2.917 -3.496 -3.98 -4.505 -4.973 -5.36 -5.711 -6.05 -6.379 -6.662 -6.956 -7.212 -7.425 -7.648 -7.877 -8.078 -8.287 -8.497 -8.653 -8.813 -8.981 -9.168 -9.385 -9.545 -9.715 -9.958 -10.119 -10.287 -10.365 -10.531 -10.717 -10.899 -11.007 -11.21 -11.348 -11.461 -11.58 -11.837 -11.989 -12.156 -12.348 -12.569 -12.8 -13.1 -13.78 -2 ,30263 ,KEBNE ,16653680,Mon Nov 22 03:28:30 CET,Mon Nov 22 05:11:31 CET,0.0 1.161 1.493 1.712 1.892 2.028 2.142 2.257 2.473 2.576 2.677 2.782 2.925 2.993 3.119 3.238 3.345 3.396 3.493 3.591 3.736 3.831 3.927 4.045 4.155 4.259 4.359 4.458 4.568 4.665 4.765 4.886 5.006 5.128 5.262 5.406 5.528 5.637 5.724 5.838 5.95 6.014 6.066 6.118 6.144 6.109 6.009 5.782 5.371 4.706 3.465 1.945 0.675 -0.426 -1.41 -2.284 -2.999 -3.636 -4.169 -4.692 -5.15 -5.54 -5.889 -6.232 -6.553 -6.836 -7.12 -7.384 -7.623 -7.857 -8.086 -8.287 -8.513 -8.76 -8.943 -9.113 -9.282 -9.466 -9.66 -9.787 -9.916 -10.125 -10.276 -10.434 -10.515 -10.679 -10.855 -11.044 -11.136 -11.312 -11.436 -11.545 -11.673 -11.943 -12.082 -12.237 -12.405 -12.594 -12.814 -13.117 -14.062 -3 ,5798 ,KEBNE ,16653681,Mon Nov 22 03:28:29 CET,Mon Nov 22 05:11:46 CET,0.0 0.822 1.069 1.274 1.437 1.572 1.694 1.81 2.01 2.092 2.169 2.263 2.405 2.486 2.633 2.745 2.845 2.894 2.992 3.087 3.208 3.279 3.352 3.464 3.565 3.646 3.723 3.804 3.904 3.992 4.069 4.164 4.262 4.37 4.479 4.576 4.673 4.779 4.897 5.019 5.113 5.184 5.243 5.263 5.238 5.216 5.149 4.931 4.536 3.858 2.529 0.881 -0.356 -1.429 -2.391 -3.226 -3.94 -4.586 -5.115 -5.629 -6.072 -6.459 -6.814 -7.147 -7.476 -7.777 -8.089 -8.369 -8.604 -8.877 -9.184 -9.423 -9.646 -9.848 -10.0 -10.169 -10.351 -10.543 -10.742 -10.877 -11.014 -11.239 -11.391 -11.542 -11.621 -11.788 -11.968 -12.159 -12.257 -12.444 -12.565 -12.687 -12.81 -13.042 -13.166 -13.308 -13.464 -13.647 -13.875 -14.179 -14.973 -4 ,14441 ,KEBNE ,16653682,Mon Nov 22 03:28:29 CET,Mon Nov 22 05:10:56 CET,0.0 0.999 1.283 1.505 1.685 1.808 1.918 2.021 2.21 2.301 2.382 2.46 2.586 2.655 2.793 2.93 3.07 3.13 3.229 3.318 3.447 3.547 3.644 3.764 3.865 3.952 4.039 4.126 4.231 4.322 4.405 4.516 4.636 4.724 4.811 4.926 5.019 5.1 5.169 5.23 5.304 5.359 5.383 5.39 5.346 5.278 5.174 4.911 4.473 3.738 2.44 0.876 -0.466 -1.609 -2.602 -3.472 -4.223 -4.895 -5.439 -5.957 -6.413 -6.833 -7.236 -7.61 -7.941 -8.234 -8.533 -8.795 -9.016 -9.25 -9.509 -9.721 -9.932 -10.137 -10.292 -10.453 -10.624 -10.802 -10.992 -11.131 -11.271 -11.476 -11.616 -11.766 -11.849 -12.019 -12.186 -12.361 -12.453 -12.639 -12.785 -12.899 -13.004 -13.233 -13.354 -13.473 -13.608 -13.778 -14.019 -14.329 -14.878 -5 ,9660 ,KEBNE ,16653683,Mon Nov 22 03:28:30 CET,Mon Nov 22 05:10:25 CET,0.0 0.978 1.234 1.418 1.569 1.702 1.836 1.961 2.156 2.237 2.319 2.42 2.57 2.649 2.791 2.92 3.032 3.081 3.186 3.295 3.449 3.541 3.625 3.739 3.838 3.926 4.014 4.115 4.228 4.318 4.404 4.497 4.599 4.7 4.802 4.911 5.008 5.112 5.201 5.265 5.335 5.393 5.432 5.454 5.48 5.473 5.4 5.236 4.887 4.199 2.945 1.384 0.072 -1.023 -1.996 -2.889 -3.612 -4.248 -4.797 -5.324 -5.793 -6.217 -6.621 -7.009 -7.384 -7.742 -8.098 -8.407 -8.659 -8.905 -9.154 -9.344 -9.542 -9.758 -9.926 -10.105 -10.28 -10.46 -10.661 -10.796 -10.938 -11.164 -11.318 -11.477 -11.56 -11.727 -11.893 -12.076 -12.169 -12.351 -12.48 -12.6 -12.717 -12.943 -13.067 -13.212 -13.375 -13.561 -13.8 -14.119 -15.133 -7 ,22249 ,KEBNE ,16653685,Mon Nov 22 03:29:31 CET,Mon Nov 22 05:12:05 CET,0.0 0.69 0.933 1.144 1.306 1.438 1.56 1.685 1.903 1.998 2.097 2.214 2.362 2.442 2.574 2.682 2.786 2.838 2.94 3.032 3.165 3.263 3.355 3.47 3.568 3.654 3.736 3.809 3.902 3.991 4.075 4.182 4.281 4.361 4.459 4.574 4.673 4.754 4.804 4.843 4.857 4.839 4.78 4.69 4.579 4.438 4.231 3.937 3.51 2.848 1.466 -0.405 -1.989 -3.319 -4.454 -5.428 -6.24 -6.968 -7.578 -8.17 -8.672 -9.109 -9.524 -9.919 -10.263 -10.566 -10.87 -11.148 -11.4 -11.66 -11.916 -12.125 -12.353 -12.608 -12.817 -13.02 -13.215 -13.427 -13.652 -13.808 -13.961 -14.203 -14.37 -14.53 -14.612 -14.78 -14.954 -15.134 -15.227 -15.415 -15.532 -15.642 -15.765 -16.021 -16.159 -16.298 -16.44 -16.616 -16.831 -17.095 -17.881 -8 ,27307 ,KEBNE ,16653686,Mon Nov 22 03:29:31 CET,Mon Nov 22 05:13:18 CET,0.0 1.267 1.56 1.763 1.941 2.099 2.22 2.317 2.494 2.586 2.672 2.764 2.903 2.968 3.102 3.245 3.371 3.423 3.519 3.611 3.747 3.831 3.916 4.041 4.154 4.254 4.332 4.412 4.528 4.632 4.727 4.843 4.943 5.017 5.098 5.194 5.282 5.366 5.439 5.518 5.593 5.653 5.703 5.712 5.689 5.657 5.563 5.345 4.978 4.365 3.239 1.813 0.577 -0.531 -1.472 -2.28 -2.969 -3.563 -4.066 -4.594 -5.056 -5.475 -5.889 -6.269 -6.598 -6.885 -7.18 -7.455 -7.698 -7.946 -8.195 -8.404 -8.627 -8.848 -9.014 -9.188 -9.367 -9.557 -9.748 -9.879 -10.017 -10.233 -10.376 -10.52 -10.598 -10.764 -10.938 -11.123 -11.224 -11.414 -11.529 -11.659 -11.801 -12.066 -12.209 -12.373 -12.546 -12.752 -12.967 -13.19 -13.833 -9 ,26577 ,KEBNE ,16653687,Mon Nov 22 03:29:31 CET,Mon Nov 22 05:13:19 CET,0.0 1.017 1.262 1.475 1.645 1.792 1.934 2.067 2.287 2.378 2.46 2.532 2.662 2.736 2.876 2.999 3.103 3.149 3.248 3.346 3.472 3.55 3.627 3.741 3.848 3.945 4.04 4.122 4.218 4.307 4.386 4.469 4.551 4.649 4.763 4.882 4.985 5.078 5.142 5.214 5.296 5.349 5.365 5.357 5.355 5.34 5.28 5.111 4.712 3.909 2.358 0.445 -1.063 -2.29 -3.367 -4.328 -5.179 -5.941 -6.563 -7.171 -7.676 -8.122 -8.55 -8.957 -9.338 -9.674 -10.011 -10.315 -10.585 -10.861 -11.144 -11.369 -11.589 -11.825 -12.017 -12.21 -12.394 -12.589 -12.8 -12.949 -13.093 -13.298 -13.447 -13.606 -13.686 -13.846 -14.028 -14.229 -14.322 -14.497 -14.603 -14.709 -14.821 -15.057 -15.186 -15.336 -15.505 -15.697 -15.933 -16.237 -17.146 -10 ,11644 ,KEBNE ,16653688,Mon Nov 22 03:29:31 CET,Mon Nov 22 05:13:44 CET,0.0 1.073 1.353 1.532 1.678 1.798 1.901 2.007 2.211 2.306 2.4 2.511 2.653 2.718 2.843 2.954 3.05 3.097 3.205 3.318 3.469 3.555 3.638 3.753 3.851 3.947 4.042 4.132 4.24 4.325 4.403 4.514 4.619 4.699 4.796 4.906 4.997 5.095 5.204 5.307 5.388 5.441 5.496 5.549 5.543 5.501 5.422 5.217 4.856 4.256 3.055 1.57 0.319 -0.759 -1.691 -2.497 -3.207 -3.922 -4.509 -5.068 -5.552 -5.974 -6.381 -6.772 -7.125 -7.44 -7.78 -8.083 -8.333 -8.59 -8.851 -9.082 -9.327 -9.564 -9.756 -9.955 -10.151 -10.341 -10.537 -10.67 -10.802 -11.019 -11.175 -11.33 -11.404 -11.561 -11.726 -11.9 -11.988 -12.167 -12.282 -12.4 -12.521 -12.765 -12.907 -13.069 -13.256 -13.466 -13.673 -13.925 -14.618 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_31.txt deleted file mode 100644 index e06cb488..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_31.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20305 ,KEBNE ,16653689,Mon Nov 22 03:30:32 CET,Mon Nov 22 05:12:44 CET,0.0 0.741 1.028 1.227 1.375 1.504 1.634 1.766 1.971 2.047 2.116 2.194 2.347 2.422 2.559 2.698 2.819 2.876 2.976 3.069 3.203 3.278 3.349 3.451 3.564 3.685 3.795 3.894 4.014 4.123 4.221 4.331 4.432 4.527 4.621 4.71 4.786 4.865 4.929 4.983 5.053 5.128 5.194 5.232 5.24 5.183 5.017 4.738 4.309 3.511 2.064 0.328 -1.144 -2.431 -3.531 -4.54 -5.408 -6.142 -6.781 -7.421 -7.976 -8.468 -8.916 -9.324 -9.712 -10.068 -10.434 -10.757 -11.035 -11.316 -11.6 -11.84 -12.074 -12.31 -12.509 -12.709 -12.905 -13.122 -13.356 -13.516 -13.678 -13.927 -14.101 -14.273 -14.358 -14.536 -14.723 -14.923 -15.021 -15.214 -15.343 -15.46 -15.577 -15.822 -15.955 -16.108 -16.274 -16.453 -16.651 -16.887 -17.656 -2 ,31046 ,KEBNE ,16653690,Mon Nov 22 03:30:32 CET,Mon Nov 22 05:12:44 CET,0.0 0.699 0.95 1.141 1.307 1.464 1.61 1.725 1.93 2.037 2.129 2.209 2.346 2.413 2.535 2.646 2.76 2.813 2.917 3.019 3.143 3.215 3.285 3.384 3.478 3.574 3.66 3.743 3.853 3.957 4.062 4.184 4.271 4.346 4.437 4.537 4.63 4.732 4.839 4.922 4.991 5.049 5.082 5.098 5.113 5.135 5.08 4.748 4.028 3.03 1.251 -1.043 -2.773 -4.209 -5.468 -6.564 -7.475 -8.258 -8.928 -9.6 -10.127 -10.581 -11.022 -11.429 -11.805 -12.134 -12.466 -12.776 -13.045 -13.329 -13.618 -13.843 -14.079 -14.318 -14.493 -14.677 -14.868 -15.059 -15.259 -15.41 -15.57 -15.807 -15.977 -16.151 -16.236 -16.412 -16.601 -16.802 -16.899 -17.081 -17.199 -17.329 -17.465 -17.726 -17.866 -18.018 -18.177 -18.365 -18.608 -18.864 -19.512 -3 ,17970 ,KEBNE ,16653691,Mon Nov 22 03:30:32 CET,Mon Nov 22 05:14:19 CET,0.0 0.698 0.986 1.194 1.334 1.465 1.594 1.706 1.903 1.988 2.066 2.145 2.28 2.348 2.48 2.615 2.737 2.804 2.94 3.057 3.203 3.283 3.364 3.484 3.601 3.71 3.803 3.879 3.981 4.092 4.184 4.293 4.397 4.491 4.601 4.714 4.814 4.907 4.989 5.051 5.109 5.161 5.218 5.271 5.289 5.253 5.153 4.979 4.622 3.957 2.679 0.985 -0.652 -2.076 -3.176 -4.158 -5.018 -5.774 -6.376 -6.935 -7.429 -7.859 -8.252 -8.606 -8.924 -9.22 -9.526 -9.797 -10.03 -10.279 -10.535 -10.746 -10.974 -11.204 -11.374 -11.553 -11.747 -11.953 -12.166 -12.313 -12.464 -12.693 -12.847 -12.991 -13.065 -13.228 -13.41 -13.611 -13.712 -13.9 -14.019 -14.133 -14.248 -14.499 -14.628 -14.767 -14.92 -15.087 -15.278 -15.558 -16.206 -4 ,30222 ,KEBNE ,16653692,Mon Nov 22 03:31:33 CET,Mon Nov 22 05:15:52 CET,0.0 0.68 0.928 1.112 1.256 1.395 1.535 1.672 1.905 1.992 2.064 2.118 2.242 2.312 2.46 2.581 2.678 2.728 2.826 2.922 3.069 3.161 3.24 3.341 3.437 3.527 3.601 3.674 3.771 3.863 3.956 4.064 4.16 4.241 4.318 4.412 4.509 4.595 4.668 4.779 4.901 4.974 5.021 5.073 5.089 5.031 4.859 4.555 4.052 3.178 1.726 0.091 -1.367 -2.729 -3.812 -4.729 -5.536 -6.282 -6.923 -7.545 -8.058 -8.514 -8.959 -9.381 -9.783 -10.152 -10.524 -10.847 -11.122 -11.387 -11.647 -11.873 -12.109 -12.345 -12.519 -12.695 -12.87 -13.043 -13.235 -13.375 -13.522 -13.749 -13.905 -14.076 -14.17 -14.355 -14.533 -14.729 -14.827 -15.015 -15.139 -15.259 -15.389 -15.667 -15.803 -15.944 -16.105 -16.296 -16.547 -16.848 -17.597 -5 ,27140 ,KEBNE ,16653693,Mon Nov 22 03:31:33 CET,Mon Nov 22 05:14:49 CET,0.0 0.76 1.058 1.285 1.48 1.639 1.76 1.876 2.091 2.196 2.301 2.43 2.587 2.664 2.811 2.958 3.088 3.142 3.245 3.342 3.49 3.579 3.653 3.759 3.859 3.951 4.034 4.116 4.219 4.309 4.396 4.504 4.6 4.686 4.772 4.864 4.967 5.076 5.168 5.237 5.283 5.333 5.397 5.424 5.41 5.357 5.22 4.99 4.602 3.813 2.264 0.195 -1.53 -2.887 -4.078 -5.142 -6.011 -6.757 -7.38 -7.982 -8.503 -8.975 -9.401 -9.79 -10.159 -10.489 -10.83 -11.129 -11.396 -11.679 -11.96 -12.193 -12.427 -12.659 -12.846 -13.049 -13.264 -13.482 -13.689 -13.829 -13.979 -14.209 -14.363 -14.52 -14.606 -14.788 -14.983 -15.178 -15.279 -15.479 -15.592 -15.703 -15.835 -16.139 -16.292 -16.432 -16.582 -16.777 -17.051 -17.405 -18.328 -7 ,5116 ,KEBNE ,16653695,Mon Nov 22 03:31:34 CET,Mon Nov 22 05:14:26 CET,0.0 0.907 1.217 1.393 1.511 1.647 1.787 1.898 2.075 2.154 2.242 2.353 2.501 2.585 2.732 2.856 2.962 3.005 3.095 3.184 3.304 3.386 3.471 3.588 3.703 3.803 3.882 3.957 4.061 4.165 4.26 4.376 4.483 4.572 4.679 4.796 4.901 5.016 5.13 5.238 5.326 5.398 5.459 5.495 5.497 5.443 5.295 5.032 4.629 3.867 2.326 0.454 -1.048 -2.246 -3.294 -4.274 -5.137 -5.916 -6.537 -7.129 -7.649 -8.108 -8.552 -8.965 -9.317 -9.649 -10.001 -10.299 -10.565 -10.841 -11.124 -11.354 -11.6 -11.866 -12.063 -12.262 -12.475 -12.685 -12.899 -13.045 -13.194 -13.44 -13.616 -13.8 -13.886 -14.062 -14.265 -14.475 -14.582 -14.79 -14.94 -15.057 -15.19 -15.463 -15.609 -15.771 -15.956 -16.155 -16.394 -16.747 -17.447 -8 ,392 ,KEBNE ,16653696,Mon Nov 22 03:31:33 CET,Mon Nov 22 05:14:42 CET,0.0 0.793 1.11 1.328 1.493 1.617 1.716 1.814 2.0 2.087 2.184 2.314 2.457 2.517 2.652 2.781 2.897 2.947 3.039 3.13 3.243 3.315 3.381 3.48 3.585 3.693 3.79 3.872 3.986 4.086 4.162 4.258 4.348 4.44 4.554 4.679 4.778 4.864 4.959 5.034 5.111 5.206 5.301 5.403 5.517 5.505 5.368 5.166 4.808 4.184 3.041 1.426 -0.173 -1.645 -2.783 -3.721 -4.555 -5.296 -5.951 -6.607 -7.149 -7.618 -8.054 -8.47 -8.87 -9.218 -9.577 -9.893 -10.147 -10.402 -10.675 -10.899 -11.132 -11.379 -11.577 -11.773 -11.963 -12.159 -12.357 -12.499 -12.652 -12.886 -13.047 -13.214 -13.302 -13.5 -13.706 -13.909 -14.014 -14.212 -14.329 -14.451 -14.586 -14.879 -15.04 -15.194 -15.353 -15.538 -15.774 -16.112 -16.832 -9 ,8413 ,KEBNE ,16653697,Mon Nov 22 03:31:38 CET,Mon Nov 22 05:13:43 CET,0.0 0.643 0.905 1.09 1.247 1.403 1.548 1.666 1.863 1.965 2.064 2.163 2.312 2.386 2.505 2.619 2.734 2.787 2.883 2.988 3.133 3.22 3.315 3.45 3.573 3.681 3.789 3.894 4.022 4.138 4.241 4.355 4.459 4.558 4.663 4.771 4.872 4.977 5.079 5.208 5.325 5.407 5.495 5.518 5.472 5.419 5.32 5.06 4.584 3.805 2.238 0.257 -1.47 -3.007 -4.193 -5.238 -6.195 -7.023 -7.749 -8.475 -9.067 -9.582 -10.065 -10.501 -10.888 -11.227 -11.586 -11.91 -12.192 -12.499 -12.806 -13.039 -13.282 -13.546 -13.747 -13.954 -14.164 -14.373 -14.597 -14.761 -14.929 -15.172 -15.336 -15.502 -15.589 -15.768 -15.947 -16.148 -16.257 -16.454 -16.576 -16.704 -16.838 -17.095 -17.242 -17.403 -17.571 -17.752 -17.973 -18.242 -18.962 -10 ,21392 ,KEBNE ,16653698,Mon Nov 22 03:31:33 CET,Mon Nov 22 05:14:24 CET,0.0 0.641 0.842 1.014 1.186 1.337 1.476 1.608 1.814 1.908 2.009 2.122 2.265 2.335 2.482 2.607 2.719 2.776 2.881 2.979 3.108 3.187 3.262 3.392 3.524 3.629 3.714 3.792 3.897 3.984 4.085 4.227 4.349 4.476 4.605 4.725 4.83 4.908 4.97 5.027 5.078 5.127 5.164 5.179 5.15 5.059 4.883 4.58 4.057 3.175 1.636 -0.303 -1.995 -3.377 -4.518 -5.567 -6.449 -7.202 -7.835 -8.449 -8.979 -9.448 -9.888 -10.296 -10.676 -11.043 -11.409 -11.709 -11.975 -12.245 -12.525 -12.765 -13.006 -13.25 -13.436 -13.636 -13.861 -14.091 -14.307 -14.455 -14.607 -14.821 -14.979 -15.153 -15.238 -15.42 -15.614 -15.808 -15.903 -16.094 -16.225 -16.348 -16.475 -16.74 -16.89 -17.046 -17.209 -17.416 -17.638 -17.918 -18.867 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_32.txt deleted file mode 100644 index 87d88834..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,234 ,KEBNE ,16653699,Mon Nov 22 03:32:35 CET,Mon Nov 22 05:14:31 CET,0.0 0.112 0.199 0.271 0.321 0.354 0.394 0.437 0.499 0.534 0.568 0.531 0.611 0.628 0.647 0.672 0.693 0.703 0.722 0.735 0.756 0.76 0.761 0.768 0.761 0.748 0.734 0.712 0.669 0.628 0.584 0.526 0.473 0.411 0.321 0.195 0.079 -0.058 -0.237 -0.445 -0.652 -0.878 -1.194 -1.555 -2.004 -2.573 -3.361 -4.417 -5.845 -7.822 -10.845 -14.147 -16.685 -18.689 -20.295 -21.681 -22.857 -23.912 -24.82 -25.7 -26.442 -27.092 -27.679 -28.219 -28.73 -29.195 -29.689 -30.131 -30.499 -30.866 -31.236 -31.547 -31.885 -32.238 -32.517 -32.815 -33.143 -33.473 -33.783 -34.013 -34.293 -34.733 -35.031 -35.347 -35.51 -35.863 -36.207 -36.54 -36.723 -37.018 -37.322 -37.545 -37.783 -38.267 -38.564 -38.997 -39.519 -40.036 -40.586 -41.334 -44.172 -2 ,30734 ,KEBNE ,16653700,Mon Nov 22 03:32:35 CET,Mon Nov 22 05:14:17 CET,0.0 0.226 0.312 0.381 0.432 0.471 0.52 0.569 0.629 0.653 0.681 0.661 0.74 0.761 0.799 0.816 0.836 0.848 0.869 0.895 0.915 0.914 0.909 0.898 0.878 0.846 0.819 0.797 0.761 0.715 0.673 0.636 0.59 0.54 0.456 0.343 0.24 0.112 -0.037 -0.212 -0.427 -0.692 -1.004 -1.365 -1.856 -2.461 -3.249 -4.227 -5.595 -7.621 -10.777 -14.193 -16.776 -18.911 -20.677 -22.141 -23.41 -24.569 -25.53 -26.457 -27.255 -27.965 -28.611 -29.196 -29.736 -30.229 -30.74 -31.195 -31.576 -31.963 -32.373 -32.718 -33.063 -33.418 -33.71 -34.015 -34.337 -34.662 -34.975 -35.193 -35.441 -35.817 -36.057 -36.304 -36.438 -36.77 -37.127 -37.502 -37.692 -37.973 -38.237 -38.414 -38.624 -39.158 -39.478 -39.879 -40.311 -40.777 -41.388 -42.299 -46.806 -3 ,7264 ,KEBNE ,16653701,Mon Nov 22 03:32:35 CET,Mon Nov 22 05:15:57 CET,0.0 0.259 0.349 0.405 0.446 0.477 0.507 0.538 0.573 0.587 0.602 0.568 0.646 0.662 0.696 0.708 0.721 0.73 0.741 0.743 0.743 0.743 0.733 0.715 0.7 0.681 0.666 0.644 0.599 0.558 0.521 0.47 0.402 0.326 0.232 0.109 -0.007 -0.126 -0.275 -0.456 -0.663 -0.934 -1.295 -1.686 -2.162 -2.777 -3.622 -4.7 -6.173 -8.228 -11.399 -14.81 -17.418 -19.52 -21.198 -22.633 -23.831 -24.899 -25.808 -26.682 -27.407 -28.042 -28.626 -29.185 -29.737 -30.235 -30.756 -31.241 -31.66 -32.059 -32.45 -32.792 -33.173 -33.552 -33.82 -34.106 -34.404 -34.709 -35.016 -35.218 -35.447 -35.851 -36.139 -36.454 -36.616 -36.935 -37.268 -37.613 -37.796 -38.082 -38.398 -38.63 -38.866 -39.385 -39.705 -40.096 -40.56 -41.101 -41.721 -42.594 -46.853 -4 ,8874 ,KEBNE ,16653702,Mon Nov 22 03:32:35 CET,Mon Nov 22 05:15:21 CET,0.0 0.164 0.246 0.305 0.371 0.418 0.454 0.485 0.533 0.55 0.566 0.522 0.6 0.617 0.646 0.659 0.66 0.66 0.659 0.655 0.642 0.632 0.636 0.645 0.651 0.655 0.643 0.626 0.599 0.567 0.528 0.475 0.417 0.353 0.274 0.177 0.066 -0.068 -0.212 -0.389 -0.625 -0.898 -1.231 -1.613 -2.11 -2.729 -3.532 -4.607 -6.06 -8.089 -11.218 -14.638 -17.216 -19.264 -20.904 -22.309 -23.526 -24.579 -25.461 -26.351 -27.105 -27.771 -28.399 -28.957 -29.46 -29.924 -30.4 -30.825 -31.2 -31.602 -32.039 -32.405 -32.778 -33.152 -33.438 -33.732 -34.049 -34.381 -34.719 -34.958 -35.196 -35.579 -35.87 -36.18 -36.334 -36.651 -37.008 -37.384 -37.609 -37.987 -38.473 -38.801 -39.144 -39.855 -40.245 -40.731 -41.272 -41.864 -42.61 -43.717 -48.485 -5 ,9695 ,KEBNE ,16653703,Mon Nov 22 03:32:35 CET,Mon Nov 22 05:13:49 CET,0.0 0.283 0.387 0.435 0.487 0.528 0.569 0.606 0.679 0.71 0.733 0.717 0.798 0.817 0.863 0.895 0.91 0.917 0.922 0.927 0.933 0.929 0.929 0.93 0.929 0.917 0.895 0.876 0.86 0.836 0.797 0.74 0.673 0.599 0.503 0.394 0.281 0.137 -0.032 -0.217 -0.435 -0.715 -1.059 -1.439 -1.934 -2.526 -3.32 -4.401 -5.9 -7.974 -11.116 -14.554 -17.198 -19.343 -21.092 -22.542 -23.752 -24.856 -25.778 -26.689 -27.487 -28.172 -28.807 -29.415 -30.013 -30.521 -31.027 -31.491 -31.889 -32.337 -32.835 -33.202 -33.545 -33.896 -34.165 -34.445 -34.721 -35.011 -35.309 -35.521 -35.777 -36.214 -36.515 -36.837 -36.994 -37.302 -37.616 -37.954 -38.133 -38.431 -38.737 -38.954 -39.206 -39.769 -40.067 -40.398 -40.772 -41.165 -41.686 -42.541 -45.234 -6 ,18821 ,KEBNE ,16653704,Mon Nov 22 03:32:35 CET,Mon Nov 22 05:14:18 CET,0.0 0.148 0.221 0.292 0.365 0.413 0.448 0.481 0.515 0.524 0.535 0.487 0.575 0.601 0.632 0.644 0.645 0.642 0.647 0.659 0.661 0.656 0.654 0.662 0.666 0.659 0.65 0.642 0.629 0.605 0.569 0.516 0.453 0.387 0.298 0.195 0.092 -0.043 -0.197 -0.368 -0.57 -0.836 -1.195 -1.579 -2.054 -2.661 -3.485 -4.541 -5.965 -7.913 -10.865 -14.108 -16.664 -18.726 -20.395 -21.867 -23.137 -24.275 -25.218 -26.142 -26.922 -27.612 -28.262 -28.844 -29.38 -29.885 -30.386 -30.807 -31.184 -31.571 -31.974 -32.309 -32.649 -33.015 -33.317 -33.649 -33.998 -34.344 -34.683 -34.901 -35.124 -35.474 -35.716 -35.984 -36.122 -36.39 -36.67 -36.979 -37.176 -37.539 -37.981 -38.241 -38.51 -39.128 -39.491 -39.95 -40.51 -41.148 -41.89 -42.897 -48.724 -7 ,22630 ,KEBNE ,16653705,Mon Nov 22 03:32:35 CET,Mon Nov 22 05:15:20 CET,0.0 0.076 0.128 0.184 0.236 0.278 0.309 0.339 0.381 0.39 0.402 0.361 0.445 0.457 0.468 0.47 0.464 0.459 0.459 0.458 0.44 0.426 0.418 0.407 0.385 0.359 0.338 0.32 0.292 0.257 0.217 0.157 0.082 -0.003 -0.099 -0.196 -0.303 -0.451 -0.629 -0.834 -1.064 -1.334 -1.669 -2.012 -2.44 -3.001 -3.752 -4.744 -6.124 -8.173 -11.325 -14.723 -17.334 -19.468 -21.222 -22.692 -23.911 -24.97 -25.866 -26.75 -27.492 -28.115 -28.7 -29.249 -29.742 -30.188 -30.655 -31.061 -31.414 -31.784 -32.147 -32.446 -32.774 -33.105 -33.344 -33.585 -33.833 -34.09 -34.356 -34.553 -34.754 -35.056 -35.277 -35.507 -35.62 -35.846 -36.119 -36.417 -36.561 -36.807 -37.027 -37.269 -37.575 -38.284 -38.673 -39.117 -39.65 -40.25 -40.97 -41.772 -45.101 -8 ,25052 ,KEBNE ,16653706,Mon Nov 22 03:32:35 CET,Mon Nov 22 05:13:49 CET,0.0 0.358 0.434 0.493 0.55 0.59 0.62 0.642 0.693 0.728 0.758 0.743 0.825 0.841 0.866 0.884 0.908 0.918 0.934 0.954 0.97 0.98 0.991 1.001 1.006 0.999 0.992 0.982 0.953 0.926 0.906 0.876 0.824 0.757 0.674 0.593 0.501 0.37 0.231 0.069 -0.133 -0.396 -0.736 -1.108 -1.591 -2.187 -2.957 -3.93 -5.273 -7.217 -10.232 -13.434 -15.905 -17.914 -19.548 -20.97 -22.178 -23.203 -24.061 -24.9 -25.602 -26.214 -26.792 -27.344 -27.85 -28.322 -28.835 -29.312 -29.724 -30.131 -30.544 -30.878 -31.207 -31.545 -31.813 -32.09 -32.378 -32.679 -33.009 -33.235 -33.474 -33.965 -34.389 -34.787 -34.954 -35.275 -35.598 -35.956 -36.147 -36.442 -36.775 -37.017 -37.262 -37.891 -38.265 -38.636 -39.005 -39.409 -39.908 -40.726 -44.212 -9 ,2988 ,KEBNE ,16653707,Mon Nov 22 03:32:35 CET,Mon Nov 22 05:14:38 CET,0.0 0.15 0.312 0.422 0.484 0.524 0.578 0.634 0.699 0.741 0.785 0.767 0.847 0.864 0.888 0.911 0.926 0.931 0.939 0.947 0.945 0.937 0.936 0.933 0.92 0.904 0.882 0.856 0.822 0.786 0.74 0.683 0.63 0.572 0.497 0.382 0.266 0.158 0.035 -0.113 -0.309 -0.581 -0.935 -1.316 -1.781 -2.365 -3.13 -4.122 -5.501 -7.423 -10.351 -13.571 -16.085 -18.12 -19.812 -21.281 -22.528 -23.585 -24.437 -25.299 -26.036 -26.691 -27.342 -27.922 -28.397 -28.845 -29.363 -29.816 -30.178 -30.557 -30.971 -31.31 -31.646 -31.997 -32.278 -32.56 -32.866 -33.182 -33.495 -33.709 -33.93 -34.279 -34.526 -34.78 -34.904 -35.174 -35.458 -35.762 -35.932 -36.226 -36.511 -36.711 -36.924 -37.403 -37.67 -37.97 -38.313 -38.733 -39.376 -40.185 -43.478 -10 ,28568 ,KEBNE ,16653708,Mon Nov 22 03:32:35 CET,Mon Nov 22 05:14:46 CET,0.0 0.176 0.253 0.304 0.345 0.384 0.402 0.416 0.459 0.477 0.496 0.444 0.515 0.519 0.53 0.537 0.546 0.557 0.57 0.583 0.619 0.633 0.633 0.63 0.62 0.599 0.581 0.57 0.552 0.525 0.495 0.445 0.403 0.352 0.259 0.156 0.044 -0.113 -0.285 -0.47 -0.683 -0.943 -1.273 -1.633 -2.101 -2.679 -3.436 -4.436 -5.832 -7.86 -11.006 -14.496 -17.149 -19.273 -20.973 -22.381 -23.562 -24.617 -25.502 -26.394 -27.159 -27.801 -28.403 -28.962 -29.477 -29.937 -30.42 -30.865 -31.24 -31.619 -32.005 -32.324 -32.659 -33.016 -33.309 -33.617 -33.934 -34.287 -34.651 -34.873 -35.077 -35.426 -35.731 -36.081 -36.257 -36.608 -36.938 -37.302 -37.521 -37.844 -38.205 -38.471 -38.763 -39.38 -39.73 -40.133 -40.591 -41.101 -41.753 -42.8 -46.314 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_34.txt deleted file mode 100644 index 70edf559..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_34.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5954 ,KEBNE ,16653709,Mon Nov 22 03:32:35 CET,Mon Nov 22 05:15:12 CET,0.0 1.385 1.582 1.72 1.852 1.962 2.053 2.133 2.285 2.369 2.446 2.496 2.615 2.669 2.745 2.815 2.898 2.934 2.997 3.063 3.175 3.246 3.306 3.394 3.483 3.564 3.637 3.711 3.811 3.906 3.995 4.089 4.164 4.214 4.269 4.336 4.401 4.464 4.516 4.56 4.605 4.661 4.69 4.689 4.694 4.65 4.548 4.35 3.984 3.314 2.141 0.666 -0.611 -1.648 -2.538 -3.366 -4.063 -4.675 -5.202 -5.729 -6.179 -6.584 -6.979 -7.338 -7.672 -7.977 -8.29 -8.579 -8.835 -9.09 -9.352 -9.584 -9.831 -10.079 -10.259 -10.45 -10.655 -10.866 -11.078 -11.222 -11.382 -11.638 -11.808 -11.982 -12.072 -12.247 -12.442 -12.659 -12.761 -12.951 -13.107 -13.23 -13.367 -13.647 -13.792 -13.958 -14.156 -14.411 -14.758 -15.234 -16.396 -3 ,32684 ,KEBNE ,16653711,Mon Nov 22 03:34:38 CET,Mon Nov 22 05:18:02 CET,0.0 0.439 0.681 0.906 1.059 1.193 1.314 1.415 1.582 1.654 1.731 1.831 1.969 2.036 2.146 2.231 2.325 2.371 2.454 2.526 2.618 2.673 2.734 2.835 2.923 2.998 3.07 3.137 3.22 3.302 3.391 3.493 3.581 3.663 3.756 3.856 3.936 4.033 4.139 4.238 4.329 4.398 4.426 4.431 4.415 4.33 4.158 3.92 3.555 2.877 1.628 0.074 -1.263 -2.351 -3.248 -4.047 -4.72 -5.316 -5.841 -6.366 -6.796 -7.163 -7.515 -7.858 -8.18 -8.483 -8.802 -9.081 -9.313 -9.545 -9.792 -9.982 -10.168 -10.365 -10.524 -10.701 -10.897 -11.098 -11.29 -11.425 -11.578 -11.813 -11.974 -12.148 -12.239 -12.421 -12.603 -12.808 -12.922 -13.116 -13.261 -13.38 -13.512 -13.82 -13.994 -14.176 -14.382 -14.647 -14.988 -15.509 -17.088 -4 ,3269 ,KEBNE ,16653712,Mon Nov 22 03:33:36 CET,Mon Nov 22 05:17:31 CET,0.0 0.71 0.914 1.058 1.183 1.298 1.409 1.502 1.65 1.731 1.815 1.915 2.063 2.133 2.251 2.355 2.453 2.497 2.573 2.654 2.771 2.836 2.902 2.998 3.089 3.171 3.244 3.316 3.416 3.504 3.571 3.65 3.743 3.823 3.894 3.975 4.051 4.135 4.217 4.283 4.324 4.355 4.392 4.397 4.388 4.362 4.263 4.084 3.755 3.158 2.018 0.51 -0.797 -1.849 -2.704 -3.506 -4.227 -4.898 -5.476 -6.027 -6.497 -6.897 -7.284 -7.663 -7.99 -8.291 -8.631 -8.936 -9.194 -9.465 -9.742 -9.975 -10.232 -10.504 -10.709 -10.896 -11.088 -11.312 -11.54 -11.687 -11.843 -12.096 -12.27 -12.446 -12.539 -12.73 -12.937 -13.152 -13.264 -13.46 -13.631 -13.774 -13.917 -14.245 -14.439 -14.652 -14.873 -15.151 -15.508 -15.998 -17.62 -5 ,32604 ,KEBNE ,16653713,Mon Nov 22 03:33:36 CET,Mon Nov 22 05:17:29 CET,0.0 0.437 0.582 0.721 0.845 0.962 1.064 1.128 1.248 1.321 1.388 1.436 1.553 1.6 1.703 1.804 1.899 1.946 2.043 2.117 2.212 2.278 2.342 2.426 2.513 2.59 2.655 2.728 2.816 2.879 2.934 3.019 3.106 3.172 3.237 3.316 3.376 3.451 3.545 3.618 3.67 3.691 3.68 3.651 3.612 3.521 3.353 3.075 2.598 1.851 0.521 -1.163 -2.576 -3.801 -4.824 -5.69 -6.456 -7.163 -7.726 -8.258 -8.731 -9.146 -9.521 -9.881 -10.231 -10.548 -10.877 -11.173 -11.431 -11.701 -11.978 -12.185 -12.394 -12.62 -12.803 -13.001 -13.193 -13.402 -13.626 -13.769 -13.915 -14.146 -14.312 -14.487 -14.573 -14.751 -14.948 -15.158 -15.262 -15.458 -15.629 -15.794 -15.951 -16.292 -16.517 -16.719 -16.916 -17.171 -17.54 -18.055 -20.015 -6 ,23498 ,KEBNE ,16653714,Mon Nov 22 03:33:36 CET,Mon Nov 22 05:16:42 CET,0.0 0.532 0.716 0.865 0.983 1.086 1.174 1.257 1.428 1.502 1.557 1.589 1.699 1.74 1.843 1.948 2.056 2.104 2.176 2.231 2.336 2.413 2.483 2.593 2.684 2.779 2.894 2.993 3.098 3.196 3.278 3.354 3.431 3.503 3.577 3.653 3.713 3.767 3.818 3.856 3.896 3.94 3.962 3.968 3.931 3.857 3.74 3.519 3.104 2.409 1.202 -0.281 -1.504 -2.552 -3.504 -4.345 -5.062 -5.696 -6.23 -6.769 -7.225 -7.614 -8.001 -8.384 -8.718 -9.025 -9.337 -9.606 -9.841 -10.077 -10.332 -10.545 -10.776 -11.036 -11.239 -11.435 -11.634 -11.85 -12.074 -12.225 -12.375 -12.619 -12.795 -12.978 -13.077 -13.271 -13.476 -13.694 -13.806 -14.003 -14.173 -14.31 -14.452 -14.774 -14.948 -15.164 -15.461 -15.769 -16.093 -16.564 -18.325 -7 ,25399 ,KEBNE ,16653715,Mon Nov 22 03:33:36 CET,Mon Nov 22 05:17:35 CET,0.0 0.39 0.58 0.745 0.885 0.988 1.087 1.178 1.337 1.402 1.465 1.53 1.657 1.718 1.824 1.919 2.006 2.043 2.116 2.194 2.305 2.374 2.435 2.524 2.609 2.683 2.75 2.809 2.9 2.986 3.047 3.106 3.18 3.261 3.339 3.422 3.502 3.594 3.679 3.737 3.793 3.85 3.875 3.868 3.815 3.691 3.505 3.292 2.913 2.198 1.086 -0.279 -1.443 -2.447 -3.308 -4.066 -4.722 -5.294 -5.764 -6.234 -6.672 -7.067 -7.425 -7.749 -8.061 -8.355 -8.647 -8.903 -9.137 -9.373 -9.61 -9.811 -10.025 -10.251 -10.44 -10.63 -10.814 -11.008 -11.218 -11.367 -11.509 -11.73 -11.894 -12.06 -12.142 -12.295 -12.469 -12.676 -12.78 -12.968 -13.112 -13.23 -13.359 -13.638 -13.78 -13.971 -14.203 -14.436 -14.71 -15.127 -16.739 -8 ,3431 ,KEBNE ,16653716,Mon Nov 22 03:33:36 CET,Mon Nov 22 05:17:05 CET,0.0 0.733 0.877 0.999 1.113 1.214 1.316 1.416 1.57 1.639 1.711 1.756 1.873 1.921 2.028 2.131 2.229 2.279 2.365 2.44 2.558 2.645 2.729 2.838 2.925 3.009 3.086 3.158 3.258 3.346 3.423 3.512 3.587 3.65 3.721 3.809 3.9 3.979 4.057 4.147 4.222 4.278 4.322 4.353 4.341 4.286 4.168 3.94 3.568 2.943 1.737 0.225 -1.035 -2.13 -3.092 -3.949 -4.685 -5.336 -5.898 -6.486 -6.985 -7.414 -7.816 -8.207 -8.569 -8.901 -9.261 -9.573 -9.83 -10.101 -10.389 -10.63 -10.868 -11.113 -11.305 -11.498 -11.7 -11.901 -12.117 -12.274 -12.437 -12.677 -12.839 -13.006 -13.086 -13.266 -13.477 -13.678 -13.782 -13.99 -14.155 -14.269 -14.397 -14.702 -14.873 -15.069 -15.271 -15.502 -15.8 -16.211 -17.561 -9 ,32662 ,KEBNE ,16653717,Mon Nov 22 03:33:36 CET,Mon Nov 22 05:16:57 CET,0.0 0.536 0.715 0.881 1.015 1.11 1.201 1.287 1.422 1.486 1.551 1.61 1.733 1.793 1.91 2.012 2.104 2.148 2.223 2.294 2.389 2.445 2.503 2.589 2.67 2.735 2.787 2.852 2.935 2.993 3.056 3.149 3.235 3.311 3.399 3.48 3.55 3.635 3.723 3.796 3.853 3.909 3.933 3.936 3.94 3.878 3.736 3.52 3.158 2.507 1.247 -0.349 -1.669 -2.805 -3.75 -4.559 -5.239 -5.876 -6.433 -6.976 -7.46 -7.874 -8.258 -8.622 -8.949 -9.247 -9.564 -9.85 -10.09 -10.343 -10.608 -10.827 -11.051 -11.274 -11.455 -11.653 -11.861 -12.08 -12.293 -12.436 -12.585 -12.813 -12.974 -13.151 -13.246 -13.439 -13.63 -13.857 -13.977 -14.173 -14.341 -14.47 -14.626 -15.025 -15.23 -15.43 -15.654 -15.919 -16.269 -16.711 -18.343 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_35.txt deleted file mode 100644 index 6b2226b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25418 ,KEBNE ,16653719,Mon Nov 22 03:34:38 CET,Mon Nov 22 05:18:45 CET,0.0 0.494 0.667 0.789 0.892 0.997 1.107 1.208 1.38 1.466 1.552 1.627 1.753 1.816 1.926 2.025 2.123 2.169 2.251 2.323 2.41 2.467 2.531 2.628 2.713 2.791 2.865 2.937 3.026 3.109 3.188 3.287 3.381 3.461 3.546 3.628 3.706 3.799 3.9 3.999 4.1 4.195 4.274 4.334 4.344 4.328 4.286 4.166 3.868 3.243 1.992 0.315 -1.138 -2.401 -3.452 -4.303 -5.021 -5.75 -6.393 -7.039 -7.629 -8.187 -8.725 -9.217 -9.631 -9.961 -10.316 -10.629 -10.89 -11.166 -11.459 -11.697 -11.939 -12.196 -12.405 -12.631 -12.862 -13.088 -13.322 -13.491 -13.663 -13.924 -14.099 -14.274 -14.371 -14.572 -14.779 -14.982 -15.09 -15.292 -15.443 -15.571 -15.711 -16.0 -16.156 -16.328 -16.512 -16.711 -16.941 -17.217 -18.077 -2 ,1829 ,KEBNE ,16653720,Mon Nov 22 03:34:42 CET,Mon Nov 22 05:16:10 CET,0.0 0.232 0.436 0.582 0.685 0.786 0.875 0.948 1.08 1.143 1.206 1.264 1.393 1.456 1.569 1.67 1.767 1.809 1.888 1.963 2.075 2.146 2.215 2.312 2.386 2.456 2.526 2.601 2.704 2.803 2.905 3.011 3.1 3.188 3.285 3.385 3.475 3.575 3.686 3.789 3.887 3.974 4.043 4.117 4.16 4.106 3.98 3.777 3.386 2.645 1.359 -0.238 -1.703 -2.938 -3.995 -4.946 -5.78 -6.513 -7.14 -7.781 -8.329 -8.814 -9.269 -9.707 -10.127 -10.51 -10.892 -11.236 -11.532 -11.836 -12.158 -12.418 -12.68 -12.943 -13.147 -13.364 -13.595 -13.847 -14.107 -14.278 -14.45 -14.724 -14.923 -15.122 -15.22 -15.414 -15.611 -15.831 -15.947 -16.16 -16.325 -16.461 -16.601 -16.893 -17.038 -17.2 -17.398 -17.612 -17.856 -18.156 -19.087 -3 ,11023 ,KEBNE ,16653721,Mon Nov 22 03:34:38 CET,Mon Nov 22 05:18:03 CET,0.0 0.566 0.781 0.903 0.99 1.098 1.229 1.357 1.565 1.649 1.733 1.825 1.955 2.012 2.112 2.201 2.289 2.333 2.426 2.516 2.653 2.746 2.828 2.937 3.038 3.135 3.233 3.326 3.446 3.57 3.691 3.825 3.942 4.05 4.166 4.293 4.423 4.551 4.674 4.791 4.886 4.986 5.089 5.165 5.212 5.187 5.056 4.873 4.477 3.608 2.082 0.194 -1.449 -2.83 -4.03 -5.119 -5.988 -6.698 -7.332 -7.999 -8.539 -9.029 -9.507 -9.934 -10.34 -10.738 -11.15 -11.497 -11.779 -12.078 -12.384 -12.621 -12.867 -13.124 -13.313 -13.507 -13.716 -13.93 -14.154 -14.318 -14.486 -14.736 -14.901 -15.076 -15.167 -15.345 -15.523 -15.719 -15.831 -16.032 -16.201 -16.328 -16.448 -16.703 -16.847 -17.014 -17.207 -17.457 -17.751 -18.096 -18.9 -4 ,7556 ,KEBNE ,16653722,Mon Nov 22 03:34:38 CET,Mon Nov 22 05:18:27 CET,0.0 0.495 0.68 0.819 0.927 1.027 1.121 1.207 1.39 1.475 1.548 1.611 1.728 1.78 1.893 1.99 2.079 2.127 2.224 2.311 2.437 2.519 2.592 2.699 2.8 2.896 2.999 3.105 3.23 3.346 3.448 3.553 3.657 3.763 3.876 3.989 4.093 4.199 4.292 4.37 4.455 4.548 4.637 4.685 4.709 4.719 4.624 4.403 4.094 3.515 2.27 0.656 -0.703 -1.924 -2.971 -3.872 -4.668 -5.405 -6.031 -6.654 -7.189 -7.675 -8.149 -8.589 -9.022 -9.425 -9.835 -10.198 -10.513 -10.845 -11.167 -11.41 -11.669 -11.936 -12.131 -12.339 -12.562 -12.796 -13.044 -13.202 -13.36 -13.615 -13.793 -13.981 -14.076 -14.266 -14.47 -14.691 -14.807 -15.022 -15.201 -15.324 -15.438 -15.724 -15.887 -16.054 -16.226 -16.445 -16.714 -17.022 -17.851 -5 ,11500 ,KEBNE ,16653723,Mon Nov 22 03:34:38 CET,Mon Nov 22 05:18:26 CET,0.0 0.778 0.974 1.093 1.216 1.333 1.434 1.534 1.699 1.763 1.837 1.909 2.024 2.073 2.174 2.275 2.365 2.404 2.49 2.575 2.686 2.764 2.845 2.948 3.05 3.136 3.208 3.279 3.366 3.45 3.526 3.624 3.728 3.813 3.895 3.984 4.067 4.145 4.232 4.323 4.396 4.482 4.544 4.56 4.579 4.604 4.59 4.499 4.201 3.534 2.282 0.695 -0.632 -1.878 -3.073 -4.127 -5.019 -5.816 -6.497 -7.166 -7.749 -8.268 -8.751 -9.188 -9.571 -9.933 -10.318 -10.662 -10.957 -11.262 -11.586 -11.862 -12.145 -12.431 -12.657 -12.905 -13.156 -13.402 -13.658 -13.833 -14.025 -14.317 -14.521 -14.738 -14.851 -15.095 -15.337 -15.582 -15.711 -15.941 -16.121 -16.262 -16.411 -16.735 -16.916 -17.143 -17.383 -17.625 -17.942 -18.36 -19.862 -6 ,18083 ,KEBNE ,16653724,Mon Nov 22 03:34:38 CET,Mon Nov 22 05:17:51 CET,0.0 0.39 0.536 0.651 0.753 0.869 0.976 1.076 1.267 1.341 1.405 1.467 1.596 1.659 1.786 1.894 1.977 2.018 2.116 2.202 2.307 2.374 2.443 2.537 2.616 2.694 2.765 2.833 2.916 2.997 3.076 3.169 3.258 3.338 3.441 3.56 3.665 3.773 3.872 3.955 4.064 4.187 4.298 4.377 4.423 4.409 4.272 4.057 3.666 2.877 1.331 -0.66 -2.339 -3.776 -5.032 -6.122 -7.019 -7.846 -8.547 -9.241 -9.868 -10.418 -10.938 -11.412 -11.822 -12.208 -12.607 -12.942 -13.229 -13.532 -13.848 -14.112 -14.386 -14.657 -14.875 -15.104 -15.327 -15.55 -15.786 -15.947 -16.109 -16.363 -16.546 -16.745 -16.845 -17.052 -17.275 -17.507 -17.626 -17.826 -17.969 -18.117 -18.276 -18.618 -18.805 -18.999 -19.206 -19.468 -19.778 -20.149 -21.034 -7 ,30562 ,KEBNE ,16653725,Mon Nov 22 03:34:38 CET,Mon Nov 22 05:18:33 CET,0.0 0.387 0.603 0.786 0.937 1.054 1.159 1.242 1.396 1.465 1.522 1.575 1.702 1.756 1.857 1.964 2.064 2.113 2.207 2.284 2.391 2.463 2.543 2.659 2.749 2.834 2.918 2.993 3.082 3.176 3.269 3.365 3.454 3.55 3.664 3.77 3.86 3.962 4.06 4.145 4.237 4.337 4.446 4.527 4.568 4.56 4.5 4.376 4.071 3.454 2.275 0.775 -0.491 -1.647 -2.592 -3.422 -4.173 -4.826 -5.367 -5.889 -6.339 -6.749 -7.132 -7.489 -7.827 -8.142 -8.462 -8.735 -8.978 -9.224 -9.481 -9.715 -9.959 -10.202 -10.398 -10.607 -10.826 -11.057 -11.294 -11.45 -11.614 -11.866 -12.021 -12.186 -12.279 -12.485 -12.692 -12.889 -13.001 -13.207 -13.343 -13.464 -13.61 -13.907 -14.057 -14.231 -14.414 -14.614 -14.865 -15.186 -15.818 -8 ,13472 ,KEBNE ,16653726,Mon Nov 22 03:34:38 CET,Mon Nov 22 05:18:44 CET,0.0 0.296 0.534 0.678 0.796 0.897 0.982 1.084 1.28 1.357 1.435 1.515 1.645 1.708 1.831 1.921 2.007 2.057 2.152 2.235 2.352 2.427 2.499 2.604 2.699 2.784 2.87 2.956 3.061 3.158 3.241 3.344 3.45 3.545 3.647 3.753 3.851 3.955 4.065 4.185 4.311 4.434 4.54 4.602 4.633 4.669 4.677 4.569 4.25 3.558 2.228 0.558 -0.916 -2.206 -3.287 -4.206 -4.997 -5.744 -6.383 -7.015 -7.572 -8.059 -8.51 -8.929 -9.34 -9.722 -10.113 -10.46 -10.774 -11.106 -11.42 -11.663 -11.908 -12.17 -12.391 -12.612 -12.825 -13.048 -13.304 -13.484 -13.65 -13.885 -14.052 -14.241 -14.336 -14.522 -14.731 -14.958 -15.084 -15.3 -15.468 -15.603 -15.739 -16.03 -16.184 -16.348 -16.544 -16.768 -17.011 -17.304 -18.094 -9 ,6946 ,KEBNE ,16653727,Mon Nov 22 03:34:38 CET,Mon Nov 22 05:18:06 CET,0.0 0.561 0.726 0.863 0.979 1.085 1.187 1.287 1.457 1.519 1.58 1.644 1.771 1.827 1.936 2.044 2.15 2.194 2.264 2.342 2.463 2.536 2.61 2.726 2.833 2.925 3.017 3.101 3.195 3.283 3.366 3.457 3.552 3.642 3.734 3.831 3.916 4.003 4.089 4.17 4.268 4.359 4.412 4.46 4.516 4.541 4.492 4.329 3.981 3.346 2.146 0.576 -0.745 -1.897 -2.914 -3.773 -4.524 -5.206 -5.79 -6.373 -6.87 -7.321 -7.747 -8.146 -8.513 -8.853 -9.194 -9.485 -9.732 -9.986 -10.269 -10.51 -10.749 -10.987 -11.171 -11.366 -11.572 -11.786 -11.998 -12.132 -12.272 -12.506 -12.669 -12.838 -12.926 -13.108 -13.295 -13.49 -13.583 -13.767 -13.92 -14.047 -14.173 -14.435 -14.57 -14.719 -14.883 -15.069 -15.311 -15.616 -16.384 -10 ,8413 ,KEBNE ,16653728,Mon Nov 22 03:34:38 CET,Mon Nov 22 05:17:49 CET,0.0 0.33 0.502 0.653 0.777 0.868 0.955 1.038 1.19 1.255 1.316 1.373 1.499 1.558 1.661 1.756 1.85 1.896 1.984 2.067 2.184 2.262 2.337 2.434 2.515 2.588 2.662 2.732 2.815 2.897 2.967 3.045 3.125 3.199 3.273 3.355 3.44 3.525 3.598 3.66 3.704 3.736 3.73 3.708 3.682 3.627 3.5 3.248 2.835 2.153 0.946 -0.713 -2.127 -3.307 -4.304 -5.181 -5.963 -6.659 -7.237 -7.807 -8.335 -8.807 -9.235 -9.657 -10.055 -10.424 -10.804 -11.134 -11.416 -11.714 -12.041 -12.323 -12.602 -12.858 -13.044 -13.23 -13.419 -13.629 -13.851 -14.003 -14.156 -14.394 -14.573 -14.756 -14.839 -15.015 -15.214 -15.407 -15.508 -15.718 -15.869 -15.992 -16.124 -16.393 -16.532 -16.687 -16.885 -17.094 -17.362 -17.761 -18.904 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_36.txt deleted file mode 100644 index 196f2598..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_36.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12222 ,KEBNE ,16653729,Mon Nov 22 03:34:38 CET,Mon Nov 22 05:18:56 CET,0.0 1.075 1.354 1.568 1.744 1.914 2.072 2.215 2.465 2.55 2.635 2.728 2.881 2.975 3.147 3.267 3.374 3.432 3.54 3.636 3.787 3.886 3.975 4.108 4.221 4.313 4.399 4.484 4.602 4.724 4.836 4.959 5.07 5.17 5.267 5.361 5.459 5.569 5.658 5.734 5.803 5.882 5.967 6.035 6.106 6.158 6.146 5.981 5.6 4.979 3.888 2.268 0.811 -0.418 -1.44 -2.301 -3.069 -3.772 -4.364 -4.933 -5.423 -5.864 -6.288 -6.695 -7.068 -7.42 -7.795 -8.108 -8.375 -8.647 -8.924 -9.165 -9.407 -9.653 -9.857 -10.068 -10.268 -10.48 -10.704 -10.867 -11.04 -11.294 -11.455 -11.624 -11.716 -11.913 -12.122 -12.317 -12.441 -12.657 -12.815 -12.948 -13.1 -13.433 -13.629 -13.86 -14.094 -14.316 -14.637 -15.148 -16.899 -2 ,7724 ,KEBNE ,16653730,Mon Nov 22 03:34:38 CET,Mon Nov 22 05:18:48 CET,0.0 0.934 1.303 1.505 1.664 1.841 2.018 2.176 2.449 2.559 2.651 2.754 2.892 2.967 3.12 3.248 3.369 3.426 3.528 3.634 3.786 3.888 3.986 4.122 4.255 4.378 4.506 4.627 4.745 4.845 4.941 5.054 5.157 5.268 5.409 5.538 5.633 5.708 5.769 5.83 5.888 5.971 6.045 6.05 6.011 5.968 5.887 5.701 5.35 4.757 3.629 2.136 0.882 -0.219 -1.253 -2.191 -2.981 -3.621 -4.127 -4.648 -5.114 -5.545 -5.946 -6.307 -6.656 -6.981 -7.311 -7.596 -7.852 -8.118 -8.384 -8.616 -8.87 -9.136 -9.328 -9.532 -9.757 -9.982 -10.235 -10.409 -10.576 -10.825 -10.993 -11.17 -11.265 -11.462 -11.688 -11.943 -12.07 -12.283 -12.449 -12.584 -12.744 -13.131 -13.342 -13.576 -13.834 -14.125 -14.476 -14.933 -16.289 -5 ,30535 ,KEBNE ,16653733,Mon Nov 22 03:35:39 CET,Mon Nov 22 05:19:43 CET,0.0 0.702 0.99 1.226 1.442 1.615 1.755 1.876 2.072 2.151 2.226 2.319 2.454 2.518 2.66 2.783 2.905 2.968 3.079 3.186 3.308 3.379 3.462 3.582 3.67 3.753 3.845 3.94 4.064 4.156 4.232 4.32 4.398 4.473 4.555 4.653 4.725 4.767 4.817 4.87 4.917 4.961 4.983 4.957 4.889 4.783 4.592 4.317 3.91 3.212 1.84 0.068 -1.395 -2.631 -3.664 -4.509 -5.264 -5.962 -6.535 -7.118 -7.61 -8.023 -8.42 -8.817 -9.164 -9.47 -9.8 -10.076 -10.313 -10.578 -10.861 -11.096 -11.345 -11.595 -11.778 -11.973 -12.173 -12.379 -12.593 -12.736 -12.895 -13.142 -13.302 -13.479 -13.571 -13.765 -13.963 -14.16 -14.263 -14.462 -14.611 -14.747 -14.888 -15.184 -15.366 -15.555 -15.767 -16.007 -16.276 -16.749 -18.582 -6 ,30215 ,KEBNE ,16653734,Mon Nov 22 03:36:41 CET,Mon Nov 22 05:21:31 CET,0.0 1.06 1.409 1.67 1.849 1.969 2.101 2.224 2.388 2.48 2.574 2.677 2.819 2.887 2.998 3.126 3.249 3.287 3.366 3.454 3.564 3.618 3.679 3.8 3.926 4.06 4.17 4.244 4.35 4.447 4.526 4.62 4.702 4.767 4.839 4.928 4.997 5.05 5.119 5.188 5.238 5.273 5.299 5.304 5.225 5.097 4.936 4.67 4.221 3.477 2.136 0.477 -0.918 -2.127 -3.132 -4.008 -4.797 -5.507 -6.104 -6.685 -7.179 -7.651 -8.123 -8.574 -8.99 -9.358 -9.742 -10.084 -10.372 -10.676 -10.99 -11.242 -11.518 -11.812 -12.029 -12.244 -12.464 -12.697 -12.936 -13.103 -13.285 -13.576 -13.775 -13.975 -14.077 -14.294 -14.522 -14.766 -14.899 -15.123 -15.33 -15.496 -15.663 -16.018 -16.204 -16.441 -16.728 -17.034 -17.441 -18.024 -20.139 -7 ,28269 ,KEBNE ,16653735,Mon Nov 22 03:36:41 CET,Mon Nov 22 05:20:05 CET,0.0 1.21 1.504 1.726 1.948 2.155 2.341 2.496 2.782 2.918 3.03 3.161 3.308 3.363 3.48 3.616 3.744 3.814 3.97 4.109 4.269 4.358 4.439 4.575 4.707 4.82 4.933 5.039 5.167 5.273 5.368 5.507 5.646 5.756 5.871 5.989 6.095 6.217 6.346 6.467 6.579 6.684 6.766 6.832 6.896 6.939 6.895 6.764 6.548 5.988 4.773 3.195 1.877 0.651 -0.482 -1.488 -2.313 -2.983 -3.545 -4.084 -4.58 -5.07 -5.533 -5.949 -6.322 -6.682 -7.064 -7.391 -7.665 -7.944 -8.227 -8.458 -8.701 -8.952 -9.144 -9.338 -9.547 -9.761 -9.968 -10.122 -10.29 -10.549 -10.727 -10.924 -11.023 -11.23 -11.45 -11.674 -11.786 -11.99 -12.149 -12.286 -12.44 -12.792 -12.996 -13.198 -13.408 -13.636 -13.914 -14.325 -15.997 -9 ,719 ,KEBNE ,16653737,Mon Nov 22 03:36:41 CET,Mon Nov 22 05:20:13 CET,0.0 0.988 1.326 1.631 1.833 1.963 2.085 2.202 2.369 2.44 2.508 2.584 2.712 2.773 2.893 3.007 3.118 3.175 3.299 3.429 3.61 3.731 3.843 3.979 4.084 4.178 4.272 4.359 4.465 4.551 4.62 4.697 4.776 4.853 4.941 5.031 5.094 5.183 5.287 5.388 5.475 5.51 5.54 5.571 5.542 5.409 5.141 4.714 4.12 3.228 1.648 -0.259 -1.855 -3.175 -4.262 -5.223 -6.089 -6.859 -7.522 -8.192 -8.749 -9.244 -9.714 -10.166 -10.573 -10.911 -11.253 -11.555 -11.829 -12.129 -12.443 -12.703 -12.972 -13.249 -13.466 -13.694 -13.924 -14.153 -14.376 -14.524 -14.684 -14.946 -15.13 -15.325 -15.428 -15.624 -15.81 -16.011 -16.111 -16.298 -16.433 -16.563 -16.697 -16.981 -17.145 -17.324 -17.533 -17.773 -18.095 -18.613 -19.972 -10 ,9340 ,KEBNE ,16653738,Mon Nov 22 03:36:41 CET,Mon Nov 22 05:20:54 CET,0.0 1.133 1.473 1.735 1.971 2.177 2.383 2.559 2.786 2.883 2.974 3.045 3.165 3.22 3.334 3.433 3.533 3.597 3.725 3.831 3.974 4.069 4.157 4.268 4.374 4.463 4.541 4.629 4.746 4.856 4.955 5.048 5.13 5.236 5.349 5.437 5.518 5.589 5.643 5.688 5.721 5.769 5.843 5.902 5.91 5.859 5.759 5.609 5.361 4.826 3.586 1.896 0.414 -0.823 -1.756 -2.593 -3.382 -4.105 -4.692 -5.268 -5.764 -6.205 -6.616 -6.978 -7.318 -7.625 -7.958 -8.265 -8.523 -8.791 -9.08 -9.325 -9.565 -9.809 -10.002 -10.2 -10.403 -10.615 -10.835 -10.977 -11.12 -11.348 -11.508 -11.67 -11.755 -11.937 -12.131 -12.361 -12.487 -12.693 -12.845 -12.968 -13.095 -13.405 -13.575 -13.754 -13.955 -14.192 -14.512 -14.996 -16.445 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_39.txt deleted file mode 100644 index d9d5ab55..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_39.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31800 ,KEBNE ,16653739,Mon Nov 22 03:36:41 CET,Mon Nov 22 05:20:05 CET,0.0 1.032 1.438 1.713 1.913 2.069 2.214 2.366 2.621 2.735 2.852 3.003 3.163 3.248 3.417 3.574 3.712 3.78 3.924 4.052 4.212 4.32 4.424 4.572 4.713 4.854 4.994 5.126 5.292 5.442 5.577 5.733 5.88 6.021 6.185 6.367 6.527 6.695 6.872 7.061 7.246 7.417 7.602 7.781 7.978 8.141 8.275 8.37 8.394 8.304 7.812 6.9 6.038 5.291 4.648 4.052 3.515 3.031 2.589 2.129 1.744 1.411 1.083 0.776 0.498 0.227 -0.054 -0.336 -0.589 -0.802 -1.013 -1.196 -1.39 -1.591 -1.742 -1.896 -2.055 -2.225 -2.406 -2.518 -2.629 -2.816 -2.949 -3.078 -3.148 -3.301 -3.447 -3.614 -3.715 -3.895 -4.011 -4.13 -4.239 -4.462 -4.603 -4.754 -4.905 -5.087 -5.307 -5.59 -6.125 -2 ,24405 ,KEBNE ,16653740,Mon Nov 22 03:37:42 CET,Mon Nov 22 05:22:04 CET,0.0 0.913 1.227 1.449 1.642 1.842 2.007 2.147 2.397 2.507 2.62 2.776 2.945 3.029 3.176 3.329 3.478 3.546 3.677 3.796 3.965 4.069 4.164 4.309 4.448 4.572 4.689 4.797 4.927 5.046 5.159 5.301 5.439 5.568 5.717 5.874 6.022 6.17 6.309 6.447 6.608 6.782 6.941 7.088 7.232 7.347 7.434 7.443 7.364 7.104 6.472 5.506 4.568 3.742 3.031 2.42 1.857 1.355 0.922 0.453 0.052 -0.302 -0.632 -0.923 -1.202 -1.465 -1.737 -1.979 -2.193 -2.419 -2.637 -2.822 -3.023 -3.216 -3.358 -3.514 -3.69 -3.871 -4.046 -4.168 -4.298 -4.501 -4.64 -4.781 -4.853 -5.0 -5.152 -5.331 -5.434 -5.611 -5.741 -5.853 -5.97 -6.227 -6.365 -6.506 -6.655 -6.822 -7.029 -7.323 -8.229 -3 ,30163 ,KEBNE ,16653741,Mon Nov 22 03:37:43 CET,Mon Nov 22 05:21:08 CET,0.0 1.202 1.455 1.649 1.824 1.962 2.097 2.229 2.438 2.528 2.608 2.71 2.864 2.945 3.09 3.231 3.356 3.416 3.542 3.653 3.807 3.906 4.006 4.155 4.29 4.419 4.53 4.635 4.773 4.893 5.0 5.133 5.273 5.409 5.559 5.725 5.878 6.05 6.24 6.418 6.612 6.84 7.062 7.263 7.475 7.665 7.886 8.071 8.172 8.149 7.689 6.881 6.151 5.437 4.791 4.212 3.671 3.172 2.761 2.361 2.039 1.746 1.448 1.153 0.864 0.592 0.309 0.067 -0.14 -0.343 -0.545 -0.712 -0.883 -1.071 -1.219 -1.378 -1.558 -1.734 -1.89 -1.997 -2.117 -2.307 -2.435 -2.575 -2.651 -2.802 -2.957 -3.127 -3.207 -3.378 -3.502 -3.594 -3.689 -3.919 -4.056 -4.2 -4.343 -4.5 -4.7 -4.962 -5.628 -4 ,12886 ,KEBNE ,16653742,Mon Nov 22 03:40:48 CET,Mon Nov 22 05:23:48 CET,0.0 1.113 1.43 1.637 1.818 1.989 2.132 2.259 2.514 2.628 2.739 2.876 3.026 3.104 3.264 3.412 3.553 3.62 3.742 3.865 4.046 4.156 4.25 4.386 4.525 4.652 4.767 4.874 5.004 5.124 5.249 5.416 5.579 5.723 5.874 6.046 6.2 6.367 6.56 6.735 6.894 7.099 7.363 7.599 7.791 7.976 8.163 8.282 8.286 8.1 7.559 6.692 5.857 5.104 4.456 3.855 3.308 2.82 2.399 1.978 1.631 1.3 0.97 0.642 0.34 0.077 -0.198 -0.448 -0.668 -0.892 -1.127 -1.316 -1.507 -1.712 -1.86 -2.006 -2.158 -2.331 -2.519 -2.643 -2.766 -2.96 -3.1 -3.242 -3.317 -3.482 -3.661 -3.838 -3.924 -4.092 -4.207 -4.309 -4.421 -4.663 -4.791 -4.928 -5.093 -5.3 -5.541 -5.826 -6.76 -5 ,25127 ,KEBNE ,16653743,Mon Nov 22 03:40:48 CET,Mon Nov 22 05:24:03 CET,0.0 0.976 1.291 1.508 1.718 1.893 2.039 2.164 2.385 2.491 2.587 2.688 2.829 2.907 3.069 3.22 3.351 3.421 3.551 3.662 3.821 3.917 4.011 4.154 4.291 4.42 4.546 4.669 4.806 4.942 5.085 5.25 5.401 5.539 5.685 5.846 6.002 6.17 6.341 6.51 6.68 6.86 7.053 7.226 7.397 7.553 7.69 7.74 7.667 7.422 6.803 5.954 5.159 4.391 3.694 3.067 2.53 2.027 1.581 1.181 0.851 0.55 0.255 -0.031 -0.306 -0.567 -0.841 -1.084 -1.29 -1.492 -1.703 -1.886 -2.076 -2.272 -2.42 -2.571 -2.72 -2.873 -3.046 -3.177 -3.321 -3.543 -3.68 -3.824 -3.907 -4.079 -4.264 -4.449 -4.539 -4.711 -4.833 -4.936 -5.041 -5.248 -5.359 -5.489 -5.63 -5.802 -6.014 -6.231 -6.758 -6 ,21065 ,KEBNE ,16653744,Mon Nov 22 03:40:48 CET,Mon Nov 22 05:23:04 CET,0.0 1.136 1.489 1.727 1.93 2.112 2.271 2.422 2.697 2.812 2.923 3.081 3.245 3.331 3.488 3.653 3.819 3.89 4.026 4.153 4.328 4.451 4.574 4.727 4.863 5.0 5.131 5.246 5.389 5.521 5.642 5.788 5.935 6.087 6.263 6.448 6.611 6.777 6.941 7.1 7.262 7.422 7.593 7.734 7.854 7.981 8.109 8.19 8.177 8.038 7.48 6.586 5.748 4.949 4.301 3.753 3.274 2.82 2.413 2.015 1.675 1.363 1.075 0.805 0.53 0.294 0.052 -0.178 -0.376 -0.586 -0.806 -0.98 -1.153 -1.338 -1.485 -1.631 -1.786 -1.958 -2.149 -2.281 -2.409 -2.592 -2.724 -2.867 -2.934 -3.07 -3.223 -3.392 -3.481 -3.642 -3.733 -3.828 -3.933 -4.189 -4.339 -4.486 -4.643 -4.82 -5.041 -5.341 -6.171 -7 ,25623 ,KEBNE ,16653745,Mon Nov 22 03:50:02 CET,Mon Nov 22 05:33:31 CET,0.0 1.051 1.35 1.559 1.76 1.944 2.103 2.249 2.489 2.59 2.694 2.816 2.965 3.052 3.218 3.357 3.486 3.544 3.665 3.782 3.941 4.034 4.123 4.262 4.401 4.536 4.66 4.771 4.907 5.044 5.183 5.343 5.501 5.646 5.803 5.976 6.137 6.307 6.466 6.613 6.767 6.952 7.152 7.338 7.526 7.674 7.819 7.947 7.968 7.783 7.142 6.105 5.238 4.45 3.763 3.162 2.598 2.071 1.615 1.185 0.832 0.521 0.22 -0.086 -0.39 -0.673 -0.957 -1.223 -1.453 -1.687 -1.939 -2.136 -2.346 -2.561 -2.716 -2.878 -3.041 -3.208 -3.386 -3.513 -3.648 -3.868 -4.026 -4.189 -4.274 -4.435 -4.597 -4.773 -4.861 -5.032 -5.144 -5.249 -5.361 -5.603 -5.734 -5.878 -6.05 -6.262 -6.517 -6.818 -7.785 -8 ,1794 ,KEBNE ,16653746,Mon Nov 22 03:51:07 CET,Mon Nov 22 05:30:58 CET,0.0 1.066 1.416 1.631 1.824 2.013 2.184 2.336 2.59 2.701 2.79 2.88 3.034 3.113 3.256 3.404 3.545 3.611 3.745 3.869 4.037 4.138 4.231 4.363 4.49 4.615 4.746 4.874 5.026 5.155 5.275 5.435 5.592 5.746 5.921 6.098 6.251 6.408 6.564 6.732 6.923 7.114 7.302 7.482 7.652 7.808 7.912 7.966 7.986 7.844 7.472 6.705 5.79 4.952 4.269 3.682 3.137 2.61 2.191 1.799 1.453 1.153 0.857 0.565 0.306 0.064 -0.203 -0.437 -0.633 -0.827 -1.031 -1.194 -1.349 -1.52 -1.665 -1.822 -1.995 -2.169 -2.339 -2.454 -2.577 -2.77 -2.9 -3.04 -3.109 -3.244 -3.379 -3.52 -3.611 -3.791 -3.905 -4.007 -4.125 -4.367 -4.488 -4.61 -4.734 -4.886 -5.08 -5.325 -6.16 -10 ,10048 ,KEBNE ,16653748,Mon Nov 22 03:54:08 CET,Mon Nov 22 05:37:24 CET,0.0 1.454 1.846 2.143 2.363 2.536 2.68 2.807 3.02 3.118 3.227 3.358 3.522 3.616 3.798 3.98 4.137 4.197 4.313 4.431 4.595 4.702 4.802 4.958 5.101 5.225 5.347 5.452 5.591 5.737 5.87 6.026 6.181 6.323 6.495 6.679 6.829 6.99 7.136 7.28 7.437 7.604 7.795 7.985 8.163 8.306 8.427 8.515 8.516 8.354 7.83 6.979 6.155 5.387 4.7 4.055 3.502 3.027 2.612 2.215 1.876 1.567 1.272 0.989 0.729 0.488 0.249 0.031 -0.16 -0.356 -0.569 -0.744 -0.921 -1.098 -1.243 -1.39 -1.536 -1.688 -1.844 -1.952 -2.07 -2.249 -2.38 -2.532 -2.604 -2.745 -2.905 -3.077 -3.169 -3.351 -3.485 -3.595 -3.706 -3.939 -4.077 -4.242 -4.45 -4.669 -4.876 -5.174 -6.266 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_40.txt deleted file mode 100644 index 30b23ada..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_40.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29477 ,KEBNE ,16653749,Mon Nov 22 03:55:10 CET,Mon Nov 22 05:39:55 CET,0.0 0.964 1.275 1.505 1.698 1.866 2.011 2.154 2.427 2.541 2.651 2.8 2.957 3.05 3.224 3.372 3.502 3.572 3.709 3.843 4.039 4.163 4.29 4.461 4.615 4.763 4.91 5.057 5.241 5.414 5.58 5.768 5.943 6.114 6.314 6.532 6.723 6.93 7.167 7.4 7.628 7.905 8.238 8.536 8.842 9.177 9.532 9.878 10.264 10.655 10.971 11.037 10.857 10.566 10.263 9.995 9.736 9.425 9.131 8.831 8.568 8.336 8.104 7.886 7.682 7.487 7.286 7.104 6.947 6.792 6.62 6.469 6.311 6.158 6.045 5.923 5.79 5.646 5.505 5.409 5.307 5.144 5.024 4.888 4.819 4.689 4.543 4.38 4.293 4.145 4.047 3.952 3.849 3.614 3.49 3.365 3.202 3.007 2.815 2.556 1.803 -2 ,9759 ,KEBNE ,16653750,Mon Nov 22 03:55:10 CET,Mon Nov 22 05:37:59 CET,0.0 1.146 1.491 1.73 1.938 2.117 2.266 2.412 2.684 2.813 2.929 3.045 3.197 3.286 3.457 3.62 3.788 3.872 4.032 4.188 4.395 4.522 4.647 4.824 4.982 5.126 5.272 5.416 5.604 5.798 5.985 6.214 6.425 6.62 6.852 7.1 7.335 7.616 7.92 8.212 8.536 8.901 9.282 9.64 10.026 10.431 10.858 11.273 11.733 12.159 12.406 12.339 12.101 11.819 11.521 11.209 10.911 10.598 10.298 10.0 9.724 9.45 9.203 8.993 8.767 8.541 8.324 8.141 7.991 7.84 7.666 7.506 7.337 7.167 7.026 6.884 6.74 6.58 6.414 6.308 6.195 6.006 5.878 5.742 5.675 5.541 5.393 5.241 5.169 5.017 4.921 4.826 4.716 4.46 4.325 4.196 4.045 3.859 3.644 3.341 2.347 -3 ,11829 ,KEBNE ,16653751,Mon Nov 22 03:55:10 CET,Mon Nov 22 05:39:27 CET,0.0 1.146 1.446 1.707 1.922 2.087 2.246 2.392 2.659 2.785 2.901 3.039 3.197 3.279 3.449 3.62 3.776 3.851 3.991 4.121 4.308 4.43 4.541 4.708 4.874 5.023 5.175 5.329 5.521 5.697 5.87 6.073 6.259 6.439 6.648 6.879 7.08 7.293 7.521 7.766 8.024 8.298 8.592 8.909 9.289 9.673 10.098 10.546 10.983 11.354 11.656 11.51 11.097 10.675 10.236 9.789 9.358 8.942 8.597 8.262 7.966 7.705 7.45 7.221 7.044 6.899 6.728 6.563 6.417 6.266 6.101 5.955 5.798 5.636 5.51 5.378 5.235 5.091 4.947 4.836 4.724 4.563 4.449 4.327 4.261 4.127 3.984 3.817 3.728 3.568 3.467 3.376 3.29 3.072 2.931 2.787 2.65 2.48 2.233 1.922 0.472 -4 ,7541 ,KEBNE ,16653752,Mon Nov 22 03:55:10 CET,Mon Nov 22 05:39:23 CET,0.0 1.36 1.754 2.038 2.248 2.44 2.62 2.791 3.052 3.156 3.261 3.396 3.558 3.65 3.841 4.021 4.181 4.255 4.39 4.516 4.713 4.844 4.979 5.173 5.348 5.517 5.665 5.804 5.988 6.175 6.355 6.564 6.77 6.967 7.198 7.457 7.689 7.942 8.202 8.468 8.77 9.103 9.469 9.827 10.209 10.592 11.023 11.444 11.815 12.121 12.244 11.973 11.527 11.028 10.469 9.994 9.609 9.245 8.92 8.585 8.286 8.016 7.756 7.494 7.259 7.045 6.823 6.63 6.46 6.276 6.075 5.909 5.745 5.588 5.471 5.343 5.207 5.051 4.877 4.767 4.661 4.495 4.376 4.252 4.19 4.062 3.927 3.777 3.691 3.528 3.405 3.295 3.189 2.959 2.834 2.71 2.574 2.411 2.211 1.935 1.102 -5 ,21120 ,KEBNE ,16653753,Mon Nov 22 03:56:15 CET,Mon Nov 22 05:40:23 CET,0.0 1.157 1.458 1.674 1.852 2.009 2.158 2.31 2.577 2.697 2.814 2.954 3.109 3.191 3.352 3.509 3.651 3.72 3.854 3.986 4.186 4.312 4.426 4.584 4.755 4.923 5.069 5.205 5.378 5.539 5.683 5.877 6.066 6.218 6.395 6.615 6.835 7.062 7.293 7.529 7.776 8.056 8.376 8.687 9.038 9.425 9.808 10.153 10.49 10.774 10.84 10.617 10.305 9.929 9.527 9.133 8.811 8.53 8.258 7.952 7.661 7.399 7.158 6.926 6.706 6.499 6.282 6.105 5.957 5.801 5.634 5.484 5.331 5.169 5.036 4.894 4.746 4.595 4.426 4.302 4.169 3.962 3.822 3.681 3.611 3.473 3.326 3.167 3.074 2.9 2.757 2.646 2.533 2.268 2.125 1.971 1.78 1.558 1.334 1.037 0.275 -6 ,28800 ,KEBNE ,16653754,Mon Nov 22 03:56:11 CET,Mon Nov 22 05:38:51 CET,0.0 1.452 1.828 2.156 2.447 2.661 2.823 2.962 3.207 3.315 3.42 3.566 3.727 3.82 3.995 4.151 4.299 4.371 4.509 4.635 4.807 4.924 5.04 5.222 5.402 5.556 5.695 5.832 6.021 6.19 6.348 6.554 6.748 6.931 7.132 7.34 7.536 7.758 7.992 8.22 8.46 8.735 9.025 9.317 9.689 10.08 10.522 10.997 11.469 11.865 12.114 12.063 11.748 11.291 10.783 10.337 10.002 9.696 9.41 9.12 8.866 8.624 8.403 8.216 8.022 7.81 7.584 7.376 7.192 7.012 6.84 6.701 6.541 6.369 6.236 6.091 5.942 5.785 5.617 5.507 5.4 5.24 5.127 5.012 4.954 4.832 4.71 4.586 4.514 4.364 4.253 4.157 4.063 3.841 3.719 3.576 3.413 3.244 3.053 2.781 2.18 -7 ,22621 ,KEBNE ,16653755,Mon Nov 22 03:56:11 CET,Mon Nov 22 05:41:05 CET,0.0 0.919 1.248 1.495 1.702 1.861 2.003 2.137 2.375 2.488 2.597 2.72 2.876 2.971 3.155 3.318 3.467 3.538 3.676 3.808 3.991 4.112 4.226 4.381 4.53 4.686 4.845 4.996 5.18 5.349 5.505 5.69 5.868 6.046 6.246 6.486 6.729 6.971 7.237 7.529 7.798 8.082 8.399 8.714 9.096 9.482 9.862 10.243 10.572 10.801 10.948 10.84 10.497 10.014 9.488 9.096 8.789 8.458 8.142 7.799 7.524 7.28 7.011 6.739 6.496 6.293 6.081 5.875 5.696 5.52 5.333 5.168 4.98 4.788 4.655 4.518 4.366 4.203 4.036 3.928 3.81 3.63 3.509 3.378 3.314 3.191 3.05 2.9 2.823 2.66 2.534 2.427 2.321 2.084 1.952 1.794 1.618 1.442 1.239 0.983 0.136 -8 ,21363 ,KEBNE ,16653756,Mon Nov 22 03:56:15 CET,Mon Nov 22 05:36:57 CET,0.0 0.894 1.171 1.422 1.619 1.782 1.928 2.064 2.294 2.403 2.506 2.636 2.788 2.869 3.032 3.185 3.327 3.393 3.523 3.651 3.823 3.934 4.048 4.212 4.372 4.524 4.661 4.791 4.961 5.12 5.263 5.443 5.626 5.799 5.987 6.203 6.417 6.652 6.906 7.166 7.438 7.736 8.079 8.414 8.784 9.207 9.628 10.018 10.485 10.964 11.199 11.103 10.903 10.577 10.161 9.719 9.341 9.03 8.726 8.354 8.021 7.744 7.494 7.24 7.009 6.809 6.574 6.369 6.202 6.025 5.84 5.684 5.518 5.352 5.23 5.1 4.948 4.802 4.674 4.57 4.449 4.265 4.141 4.01 3.949 3.833 3.7 3.54 3.455 3.303 3.193 3.096 2.998 2.777 2.655 2.523 2.383 2.215 1.998 1.748 1.078 -9 ,1167 ,KEBNE ,16653757,Mon Nov 22 03:56:11 CET,Mon Nov 22 05:38:51 CET,0.0 0.985 1.322 1.555 1.756 1.973 2.183 2.356 2.607 2.71 2.817 2.964 3.124 3.217 3.395 3.563 3.721 3.797 3.947 4.084 4.291 4.417 4.523 4.683 4.863 5.035 5.174 5.31 5.49 5.657 5.818 6.021 6.212 6.381 6.554 6.747 6.94 7.157 7.396 7.656 7.922 8.193 8.49 8.796 9.155 9.523 9.926 10.373 10.852 11.274 11.542 11.45 11.088 10.647 10.229 9.881 9.558 9.227 8.928 8.633 8.359 8.108 7.884 7.66 7.448 7.259 7.042 6.829 6.654 6.489 6.314 6.154 5.979 5.805 5.686 5.571 5.45 5.313 5.156 5.047 4.947 4.803 4.693 4.57 4.505 4.358 4.203 4.053 3.976 3.82 3.705 3.596 3.485 3.256 3.128 2.998 2.854 2.692 2.482 2.18 1.185 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_41.txt deleted file mode 100644 index 202503e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_37_41.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21550 ,KEBNE ,16653759,Mon Nov 22 03:57:13 CET,Mon Nov 22 05:41:07 CET,0.0 1.063 1.406 1.678 1.928 2.151 2.346 2.513 2.827 2.975 3.11 3.291 3.481 3.598 3.805 3.996 4.193 4.29 4.466 4.628 4.854 5.003 5.147 5.349 5.544 5.742 5.933 6.111 6.326 6.519 6.7 6.902 7.083 7.28 7.53 7.806 8.064 8.339 8.635 8.938 9.25 9.606 10.001 10.383 10.821 11.256 11.729 12.272 12.875 13.503 14.099 14.37 14.306 14.129 13.918 13.709 13.497 13.284 13.107 12.919 12.739 12.576 12.416 12.259 12.109 11.959 11.801 11.666 11.546 11.412 11.264 11.15 11.037 10.905 10.8 10.702 10.6 10.479 10.352 10.265 10.178 10.048 9.955 9.861 9.809 9.698 9.572 9.428 9.352 9.213 9.115 9.038 8.949 8.729 8.612 8.491 8.361 8.207 8.024 7.818 7.151 -2 ,30693 ,KEBNE ,16653760,Mon Nov 22 03:57:13 CET,Mon Nov 22 05:41:11 CET,0.0 1.464 1.862 2.146 2.387 2.605 2.801 2.964 3.232 3.374 3.517 3.704 3.889 4.001 4.209 4.402 4.566 4.647 4.809 4.961 5.182 5.317 5.448 5.634 5.816 5.991 6.156 6.32 6.532 6.726 6.909 7.123 7.316 7.501 7.725 7.982 8.221 8.497 8.815 9.143 9.48 9.864 10.257 10.602 11.006 11.452 11.945 12.429 12.922 13.448 13.957 14.233 14.229 14.055 13.849 13.649 13.457 13.261 13.073 12.855 12.655 12.485 12.307 12.127 11.964 11.816 11.659 11.509 11.367 11.229 11.084 10.943 10.797 10.642 10.526 10.411 10.29 10.173 10.055 9.965 9.861 9.712 9.604 9.484 9.422 9.298 9.166 9.015 8.937 8.8 8.731 8.655 8.566 8.363 8.25 8.137 8.019 7.878 7.686 7.382 6.403 -3 ,18872 ,KEBNE ,16653761,Mon Nov 22 03:58:15 CET,Mon Nov 22 05:39:58 CET,0.0 1.351 1.74 2.049 2.301 2.509 2.706 2.902 3.241 3.381 3.507 3.675 3.86 3.973 4.193 4.401 4.591 4.68 4.851 5.004 5.215 5.366 5.527 5.753 5.966 6.162 6.337 6.516 6.757 6.983 7.193 7.44 7.664 7.894 8.179 8.483 8.759 9.062 9.401 9.753 10.103 10.489 10.927 11.362 11.852 12.367 12.936 13.546 14.157 14.761 15.357 15.651 15.62 15.494 15.333 15.121 14.875 14.609 14.395 14.184 13.976 13.781 13.6 13.435 13.28 13.145 13.011 12.888 12.768 12.636 12.503 12.387 12.253 12.113 12.008 11.892 11.768 11.642 11.504 11.409 11.318 11.177 11.076 10.979 10.924 10.8 10.67 10.538 10.464 10.318 10.22 10.131 10.02 9.788 9.666 9.531 9.394 9.234 9.05 8.817 7.952 -4 ,19602 ,KEBNE ,16653762,Mon Nov 22 03:58:15 CET,Mon Nov 22 05:42:49 CET,0.0 1.462 1.811 2.098 2.375 2.599 2.776 2.937 3.237 3.374 3.506 3.673 3.853 3.97 4.166 4.339 4.515 4.601 4.75 4.905 5.132 5.278 5.431 5.658 5.871 6.067 6.255 6.437 6.669 6.882 7.078 7.317 7.553 7.773 8.015 8.272 8.509 8.775 9.071 9.378 9.704 10.068 10.478 10.876 11.314 11.788 12.309 12.825 13.368 13.955 14.556 14.806 14.74 14.527 14.262 14.008 13.761 13.512 13.279 13.026 12.811 12.632 12.459 12.295 12.13 11.976 11.822 11.674 11.537 11.397 11.25 11.116 10.976 10.824 10.692 10.564 10.44 10.311 10.17 10.073 9.984 9.84 9.739 9.628 9.567 9.438 9.298 9.161 9.092 8.957 8.863 8.773 8.679 8.452 8.324 8.194 8.061 7.933 7.773 7.482 6.301 -6 ,29430 ,KEBNE ,16653764,Mon Nov 22 03:59:16 CET,Mon Nov 22 05:43:58 CET,0.0 1.878 2.258 2.563 2.806 3.002 3.165 3.328 3.663 3.816 3.954 4.137 4.322 4.439 4.659 4.856 5.035 5.119 5.297 5.475 5.714 5.86 6.004 6.214 6.412 6.607 6.797 6.975 7.2 7.425 7.64 7.89 8.131 8.354 8.616 8.916 9.197 9.499 9.817 10.137 10.446 10.78 11.192 11.603 12.035 12.486 12.995 13.562 14.176 14.821 15.417 15.657 15.644 15.543 15.383 15.172 14.977 14.771 14.547 14.32 14.13 13.961 13.792 13.618 13.461 13.324 13.164 13.013 12.895 12.769 12.618 12.494 12.366 12.233 12.138 12.042 11.934 11.814 11.688 11.604 11.516 11.368 11.264 11.15 11.09 10.973 10.842 10.695 10.622 10.485 10.387 10.302 10.212 10.021 9.916 9.793 9.667 9.525 9.338 9.101 8.172 -7 ,6487 ,KEBNE ,16653765,Mon Nov 22 03:59:16 CET,Mon Nov 22 05:42:13 CET,0.0 1.428 1.847 2.158 2.422 2.626 2.805 2.975 3.31 3.463 3.596 3.766 3.943 4.05 4.238 4.426 4.617 4.702 4.86 5.021 5.273 5.441 5.59 5.785 5.985 6.186 6.373 6.547 6.768 6.97 7.159 7.4 7.654 7.891 8.143 8.432 8.713 9.012 9.324 9.645 9.985 10.369 10.808 11.233 11.732 12.289 12.854 13.393 13.984 14.653 15.259 15.544 15.579 15.478 15.338 15.151 14.935 14.75 14.564 14.337 14.138 13.958 13.794 13.649 13.509 13.365 13.21 13.073 12.953 12.823 12.689 12.583 12.475 12.346 12.239 12.138 12.023 11.901 11.787 11.707 11.614 11.475 11.38 11.273 11.221 11.109 10.977 10.843 10.775 10.642 10.57 10.499 10.415 10.228 10.124 10.011 9.896 9.758 9.575 9.325 8.416 -8 ,6261 ,KEBNE ,16653766,Mon Nov 22 03:59:16 CET,Mon Nov 22 05:41:45 CET,0.0 1.479 1.883 2.177 2.423 2.644 2.823 2.975 3.23 3.347 3.466 3.618 3.794 3.895 4.081 4.26 4.432 4.516 4.681 4.84 5.06 5.203 5.344 5.553 5.755 5.942 6.103 6.247 6.44 6.618 6.797 7.02 7.23 7.431 7.657 7.911 8.147 8.391 8.657 8.947 9.265 9.625 10.045 10.453 10.889 11.349 11.865 12.46 13.11 13.732 14.318 14.524 14.392 14.203 13.986 13.758 13.55 13.325 13.113 12.888 12.672 12.476 12.297 12.105 11.917 11.749 11.583 11.44 11.306 11.16 11.009 10.888 10.744 10.592 10.485 10.38 10.277 10.164 10.043 9.96 9.867 9.728 9.634 9.523 9.466 9.35 9.232 9.103 9.034 8.892 8.765 8.668 8.568 8.363 8.254 8.135 8.015 7.873 7.686 7.422 6.618 -9 ,11594 ,KEBNE ,16653767,Mon Nov 22 04:00:18 CET,Mon Nov 22 05:44:18 CET,0.0 1.412 1.792 2.052 2.298 2.521 2.713 2.887 3.163 3.284 3.404 3.563 3.732 3.833 4.008 4.166 4.324 4.401 4.551 4.704 4.936 5.087 5.225 5.408 5.577 5.741 5.897 6.051 6.248 6.428 6.603 6.825 7.04 7.244 7.471 7.718 7.958 8.221 8.502 8.796 9.094 9.425 9.794 10.147 10.561 11.02 11.549 12.084 12.612 13.183 13.797 14.071 14.026 13.896 13.707 13.467 13.234 13.016 12.84 12.654 12.464 12.281 12.118 11.977 11.838 11.7 11.546 11.399 11.264 11.113 10.961 10.843 10.71 10.567 10.46 10.34 10.221 10.107 9.961 9.863 9.775 9.635 9.533 9.436 9.39 9.286 9.173 9.046 8.977 8.837 8.761 8.68 8.589 8.413 8.302 8.17 8.049 7.92 7.737 7.491 6.983 -10 ,22650 ,KEBNE ,16653768,Mon Nov 22 04:01:19 CET,Mon Nov 22 05:44:44 CET,0.0 1.391 1.726 1.98 2.197 2.37 2.538 2.698 2.983 3.123 3.254 3.422 3.594 3.694 3.883 4.073 4.246 4.325 4.471 4.621 4.848 4.991 5.124 5.316 5.493 5.669 5.86 6.041 6.257 6.455 6.655 6.891 7.111 7.329 7.579 7.864 8.125 8.407 8.707 9.015 9.343 9.712 10.144 10.576 11.048 11.519 12.005 12.509 13.033 13.546 14.053 14.258 14.135 13.874 13.648 13.455 13.236 13.013 12.801 12.569 12.379 12.202 12.034 11.874 11.713 11.56 11.39 11.231 11.092 10.959 10.823 10.697 10.56 10.42 10.299 10.171 10.052 9.931 9.801 9.715 9.631 9.489 9.376 9.267 9.217 9.104 8.985 8.867 8.793 8.651 8.553 8.47 8.381 8.168 8.05 7.92 7.777 7.617 7.434 7.163 6.047 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_38_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_38_34.txt deleted file mode 100644 index 08fa418c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_38_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6611 ,KEBNE ,17042137,Thu Dec 23 03:50:47 CET,Thu Dec 23 05:32:28 CET,0.0 0.44 0.606 0.727 0.837 0.949 1.049 1.15 1.341 1.425 1.503 1.58 1.737 1.808 1.933 2.056 2.178 2.231 2.332 2.437 2.58 2.669 2.758 2.882 2.991 3.094 3.194 3.305 3.454 3.578 3.7 3.862 4.016 4.151 4.303 4.48 4.634 4.797 4.973 5.15 5.325 5.517 5.733 5.95 6.199 6.446 6.717 6.994 7.242 7.435 7.46 7.099 6.652 6.212 5.815 5.429 5.066 4.722 4.429 4.128 3.819 3.551 3.31 3.057 2.81 2.59 2.364 2.179 2.013 1.822 1.641 1.489 1.32 1.145 1.003 0.85 0.695 0.536 0.363 0.241 0.11 -0.083 -0.214 -0.348 -0.42 -0.602 -0.811 -1.018 -1.112 -1.294 -1.457 -1.584 -1.719 -2.005 -2.157 -2.328 -2.522 -2.764 -3.083 -3.512 -5.55 -2 ,19746 ,KEBNE ,17042138,Thu Dec 23 03:50:47 CET,Thu Dec 23 05:32:12 CET,0.0 0.552 0.722 0.869 0.997 1.112 1.208 1.301 1.487 1.576 1.654 1.708 1.843 1.905 2.03 2.146 2.264 2.322 2.434 2.542 2.69 2.79 2.897 3.04 3.161 3.276 3.391 3.499 3.631 3.757 3.87 4.005 4.146 4.281 4.437 4.601 4.762 4.945 5.133 5.325 5.52 5.739 5.982 6.205 6.447 6.71 6.996 7.296 7.571 7.754 7.7 7.378 6.976 6.535 6.144 5.782 5.428 5.087 4.757 4.415 4.121 3.857 3.613 3.377 3.151 2.937 2.685 2.451 2.265 2.073 1.865 1.682 1.488 1.297 1.156 1.005 0.839 0.671 0.5 0.365 0.215 -0.035 -0.185 -0.317 -0.4 -0.565 -0.734 -0.905 -0.99 -1.178 -1.316 -1.421 -1.53 -1.77 -1.906 -2.052 -2.234 -2.487 -2.81 -3.236 -4.613 -3 ,24330 ,KEBNE ,17042139,Thu Dec 23 03:50:47 CET,Thu Dec 23 05:31:26 CET,0.0 0.431 0.625 0.772 0.906 1.022 1.124 1.225 1.421 1.509 1.592 1.674 1.827 1.889 2.008 2.127 2.238 2.292 2.409 2.516 2.641 2.731 2.826 2.955 3.078 3.192 3.291 3.383 3.503 3.635 3.776 3.925 4.053 4.18 4.329 4.486 4.635 4.798 4.964 5.152 5.34 5.526 5.719 5.907 6.132 6.352 6.554 6.716 6.845 6.928 6.789 6.418 5.995 5.557 5.109 4.651 4.22 3.819 3.446 3.053 2.724 2.415 2.124 1.855 1.593 1.349 1.095 0.855 0.646 0.431 0.187 -0.007 -0.203 -0.423 -0.593 -0.76 -0.929 -1.11 -1.297 -1.432 -1.571 -1.774 -1.919 -2.073 -2.154 -2.324 -2.504 -2.691 -2.784 -2.962 -3.094 -3.218 -3.358 -3.667 -3.821 -3.976 -4.151 -4.352 -4.622 -5.005 -6.578 -4 ,2930 ,KEBNE ,17042140,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:38:01 CET,0.0 0.464 0.675 0.867 1.019 1.156 1.281 1.379 1.526 1.595 1.662 1.689 1.821 1.887 2.011 2.12 2.227 2.281 2.382 2.483 2.635 2.732 2.82 2.943 3.053 3.16 3.272 3.371 3.513 3.651 3.772 3.907 4.043 4.181 4.334 4.508 4.679 4.857 5.047 5.231 5.389 5.588 5.834 6.078 6.347 6.587 6.813 7.028 7.253 7.336 7.178 6.806 6.385 5.985 5.577 5.176 4.805 4.436 4.066 3.687 3.374 3.117 2.889 2.643 2.388 2.164 1.922 1.706 1.522 1.316 1.1 0.93 0.76 0.583 0.447 0.312 0.161 -0.009 -0.177 -0.294 -0.419 -0.6 -0.73 -0.869 -0.961 -1.164 -1.329 -1.512 -1.612 -1.798 -1.941 -2.053 -2.172 -2.455 -2.631 -2.8 -3.0 -3.277 -3.603 -4.022 -5.486 -5 ,21532 ,KEBNE ,17042141,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:38:14 CET,0.0 0.375 0.613 0.827 0.983 1.116 1.219 1.315 1.518 1.612 1.69 1.741 1.885 1.955 2.077 2.201 2.338 2.399 2.505 2.616 2.763 2.851 2.939 3.056 3.185 3.311 3.426 3.537 3.679 3.812 3.923 4.06 4.199 4.341 4.487 4.625 4.76 4.908 5.089 5.277 5.466 5.69 5.936 6.17 6.42 6.669 6.921 7.186 7.455 7.581 7.472 7.168 6.75 6.238 5.768 5.341 4.932 4.537 4.194 3.837 3.518 3.23 2.943 2.664 2.419 2.197 1.948 1.726 1.527 1.312 1.098 0.915 0.718 0.514 0.355 0.185 -0.002 -0.183 -0.361 -0.488 -0.631 -0.863 -1.015 -1.167 -1.254 -1.442 -1.634 -1.829 -1.927 -2.116 -2.247 -2.37 -2.513 -2.812 -2.971 -3.152 -3.348 -3.566 -3.861 -4.289 -5.664 -6 ,4550 ,KEBNE ,17042142,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:37:27 CET,0.0 0.442 0.619 0.771 0.92 1.051 1.181 1.306 1.546 1.654 1.738 1.821 1.987 2.067 2.216 2.352 2.462 2.516 2.625 2.726 2.881 2.977 3.058 3.187 3.318 3.433 3.537 3.635 3.776 3.908 4.018 4.133 4.251 4.381 4.528 4.682 4.819 4.976 5.145 5.328 5.512 5.708 5.95 6.177 6.399 6.601 6.835 7.088 7.3 7.458 7.414 6.916 6.345 5.798 5.296 4.824 4.41 4.037 3.688 3.325 2.997 2.715 2.465 2.231 2.007 1.799 1.576 1.374 1.199 1.015 0.812 0.638 0.454 0.26 0.115 -0.036 -0.193 -0.363 -0.542 -0.656 -0.772 -0.975 -1.131 -1.297 -1.379 -1.55 -1.742 -1.938 -2.034 -2.226 -2.375 -2.491 -2.624 -2.938 -3.102 -3.272 -3.495 -3.792 -4.136 -4.623 -6.276 -7 ,6980 ,KEBNE ,17042143,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:37:55 CET,0.0 0.437 0.658 0.806 0.952 1.099 1.212 1.305 1.482 1.561 1.635 1.699 1.851 1.918 2.045 2.184 2.317 2.377 2.488 2.587 2.727 2.809 2.884 3.008 3.151 3.273 3.381 3.497 3.637 3.77 3.904 4.071 4.224 4.362 4.531 4.71 4.864 5.047 5.242 5.443 5.645 5.868 6.147 6.418 6.714 7.02 7.31 7.58 7.837 7.992 7.959 7.714 7.33 6.861 6.403 5.972 5.579 5.226 4.926 4.623 4.349 4.091 3.841 3.589 3.327 3.09 2.857 2.634 2.434 2.216 1.956 1.734 1.513 1.311 1.162 0.99 0.805 0.614 0.417 0.274 0.131 -0.09 -0.254 -0.433 -0.52 -0.688 -0.879 -1.08 -1.192 -1.396 -1.581 -1.718 -1.845 -2.142 -2.329 -2.555 -2.837 -3.142 -3.471 -3.999 -6.245 -8 ,22295 ,KEBNE ,17042144,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:37:24 CET,0.0 0.429 0.645 0.788 0.904 0.996 1.097 1.182 1.312 1.388 1.46 1.512 1.658 1.729 1.872 2.015 2.143 2.202 2.313 2.418 2.578 2.679 2.774 2.904 3.02 3.147 3.268 3.37 3.489 3.598 3.721 3.868 4.001 4.133 4.27 4.423 4.576 4.737 4.903 5.083 5.27 5.464 5.687 5.898 6.142 6.403 6.644 6.883 7.067 7.096 6.874 6.391 5.85 5.309 4.807 4.311 3.87 3.483 3.143 2.795 2.491 2.203 1.937 1.685 1.437 1.214 0.957 0.727 0.544 0.343 0.135 -0.038 -0.214 -0.383 -0.526 -0.679 -0.839 -1.014 -1.205 -1.35 -1.491 -1.693 -1.845 -1.989 -2.059 -2.232 -2.417 -2.607 -2.712 -2.899 -3.054 -3.172 -3.303 -3.602 -3.783 -3.994 -4.205 -4.418 -4.68 -5.085 -6.671 -9 ,22732 ,KEBNE ,17042145,Thu Dec 23 03:56:59 CET,Thu Dec 23 05:37:15 CET,0.0 0.521 0.68 0.785 0.897 0.992 1.086 1.201 1.39 1.459 1.535 1.592 1.737 1.809 1.926 2.029 2.134 2.183 2.282 2.375 2.514 2.613 2.7 2.82 2.923 3.02 3.122 3.223 3.351 3.477 3.607 3.777 3.925 4.059 4.233 4.413 4.577 4.752 4.932 5.125 5.324 5.538 5.77 6.01 6.307 6.601 6.899 7.224 7.473 7.634 7.603 7.227 6.757 6.285 5.803 5.347 4.885 4.435 4.099 3.765 3.458 3.2 2.951 2.691 2.435 2.186 1.935 1.729 1.55 1.366 1.169 1.01 0.846 0.663 0.517 0.358 0.194 0.033 -0.124 -0.24 -0.369 -0.555 -0.691 -0.846 -0.934 -1.106 -1.278 -1.474 -1.577 -1.764 -1.896 -2.017 -2.15 -2.447 -2.614 -2.79 -3.001 -3.24 -3.529 -3.945 -5.504 -10 ,2623 ,KEBNE ,17042146,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:37:53 CET,0.0 0.525 0.746 0.901 1.061 1.189 1.291 1.399 1.613 1.705 1.787 1.878 2.032 2.094 2.222 2.34 2.447 2.503 2.606 2.698 2.832 2.917 3.004 3.136 3.247 3.345 3.453 3.559 3.68 3.791 3.894 4.025 4.151 4.271 4.418 4.569 4.721 4.896 5.07 5.243 5.428 5.631 5.848 6.09 6.359 6.626 6.908 7.158 7.388 7.527 7.407 6.877 6.329 5.827 5.373 4.925 4.509 4.149 3.836 3.504 3.207 2.916 2.627 2.382 2.145 1.907 1.669 1.456 1.261 1.061 0.856 0.682 0.496 0.296 0.137 -0.038 -0.218 -0.395 -0.584 -0.726 -0.869 -1.063 -1.21 -1.368 -1.442 -1.598 -1.77 -1.981 -2.09 -2.287 -2.458 -2.593 -2.727 -3.025 -3.196 -3.383 -3.602 -3.874 -4.186 -4.604 -6.554 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_38_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_38_37.txt deleted file mode 100644 index 99d7240f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_38_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29495 ,TETRA ,17667797,Fri Dec 3 06:01:46 CET,Fri Dec 3 08:15:58 CET,0.0 0.78 1.039 1.22 1.365 1.519 1.657 1.773 2.005 2.116 2.219 2.336 2.498 2.573 2.719 2.88 3.038 3.116 3.27 3.409 3.606 3.737 3.865 4.041 4.207 4.363 4.521 4.673 4.867 5.072 5.257 5.467 5.681 5.883 6.107 6.354 6.604 6.879 7.17 7.485 7.819 8.185 8.627 9.062 9.534 10.086 10.75 11.479 12.344 13.388 14.645 15.567 16.044 16.294 16.4 16.443 16.422 16.361 16.288 16.2 16.101 15.986 15.879 15.767 15.652 15.556 15.452 15.357 15.268 15.165 15.037 14.928 14.826 14.726 14.652 14.571 14.476 14.369 14.256 14.178 14.097 13.955 13.842 13.709 13.647 13.54 13.438 13.33 13.275 13.154 13.082 13.001 12.908 12.714 12.604 12.47 12.327 12.199 12.06 11.769 10.899 -2 ,4351 ,TETRA ,17667798,Fri Dec 3 06:01:47 CET,Fri Dec 3 08:13:42 CET,0.0 0.637 0.901 1.079 1.245 1.396 1.522 1.638 1.851 1.952 2.056 2.166 2.33 2.411 2.573 2.72 2.857 2.925 3.067 3.199 3.382 3.504 3.62 3.789 3.956 4.112 4.258 4.402 4.583 4.761 4.94 5.162 5.367 5.568 5.811 6.076 6.331 6.617 6.927 7.255 7.61 8.012 8.48 8.958 9.501 10.068 10.727 11.506 12.357 13.324 14.498 15.385 15.882 16.173 16.339 16.396 16.353 16.318 16.248 16.149 16.08 16.009 15.932 15.843 15.743 15.627 15.508 15.413 15.33 15.234 15.115 15.009 14.917 14.825 14.742 14.663 14.572 14.466 14.378 14.327 14.267 14.165 14.081 13.973 13.922 13.827 13.712 13.573 13.501 13.358 13.251 13.173 13.095 12.891 12.774 12.662 12.524 12.322 12.089 11.81 11.095 -3 ,29149 ,TETRA ,17667799,Fri Dec 3 06:01:44 CET,Fri Dec 3 08:16:33 CET,0.0 0.738 1.02 1.214 1.382 1.536 1.682 1.823 2.058 2.167 2.269 2.38 2.547 2.629 2.789 2.942 3.079 3.144 3.277 3.409 3.597 3.723 3.846 4.008 4.167 4.328 4.481 4.631 4.825 5.008 5.178 5.375 5.56 5.757 5.999 6.265 6.52 6.79 7.081 7.379 7.706 8.085 8.511 8.946 9.459 10.03 10.7 11.449 12.35 13.445 14.718 15.67 16.09 16.289 16.383 16.377 16.333 16.282 16.195 16.078 15.973 15.871 15.753 15.645 15.558 15.464 15.372 15.287 15.201 15.116 15.017 14.932 14.845 14.764 14.702 14.623 14.524 14.422 14.321 14.243 14.162 14.053 13.958 13.845 13.798 13.707 13.606 13.479 13.408 13.279 13.202 13.127 13.047 12.874 12.785 12.679 12.539 12.374 12.182 11.946 10.894 -4 ,17010 ,TETRA ,17667800,Fri Dec 3 06:01:47 CET,Fri Dec 3 08:17:38 CET,0.0 0.577 0.772 0.955 1.13 1.28 1.406 1.517 1.731 1.837 1.938 2.04 2.202 2.287 2.452 2.594 2.725 2.793 2.934 3.071 3.257 3.39 3.525 3.696 3.855 4.017 4.172 4.323 4.524 4.708 4.881 5.11 5.335 5.542 5.778 6.032 6.28 6.563 6.876 7.229 7.602 7.98 8.409 8.858 9.407 10.043 10.761 11.567 12.527 13.618 14.908 15.933 16.459 16.746 16.894 16.94 16.926 16.887 16.824 16.723 16.633 16.565 16.488 16.406 16.326 16.235 16.138 16.048 15.961 15.88 15.802 15.722 15.639 15.566 15.491 15.405 15.326 15.243 15.152 15.091 15.023 14.893 14.794 14.688 14.627 14.491 14.369 14.252 14.193 14.074 13.989 13.901 13.809 13.608 13.497 13.394 13.275 13.102 12.877 12.578 11.656 -5 ,16029 ,TETRA ,17667801,Fri Dec 3 06:01:49 CET,Fri Dec 3 08:16:32 CET,0.0 0.675 0.968 1.206 1.416 1.571 1.692 1.809 2.021 2.122 2.221 2.336 2.509 2.592 2.747 2.899 3.048 3.118 3.252 3.383 3.557 3.666 3.777 3.932 4.083 4.237 4.388 4.536 4.729 4.916 5.1 5.318 5.522 5.724 5.955 6.218 6.484 6.776 7.092 7.424 7.759 8.151 8.633 9.097 9.613 10.182 10.826 11.55 12.379 13.375 14.537 15.429 15.936 16.215 16.357 16.414 16.428 16.4 16.33 16.253 16.191 16.124 16.049 15.974 15.892 15.81 15.728 15.63 15.536 15.443 15.347 15.262 15.156 15.039 14.952 14.859 14.753 14.648 14.546 14.472 14.389 14.259 14.168 14.067 14.02 13.926 13.801 13.661 13.595 13.458 13.357 13.258 13.161 12.964 12.861 12.741 12.596 12.437 12.217 11.891 10.93 -6 ,12247 ,TETRA ,17667802,Fri Dec 3 06:01:44 CET,Fri Dec 3 08:17:28 CET,0.0 0.798 1.017 1.197 1.392 1.563 1.729 1.876 2.104 2.206 2.311 2.422 2.585 2.665 2.816 2.969 3.128 3.204 3.34 3.467 3.655 3.781 3.906 4.09 4.271 4.439 4.597 4.741 4.914 5.082 5.25 5.456 5.658 5.845 6.069 6.337 6.591 6.859 7.153 7.489 7.834 8.22 8.678 9.121 9.632 10.223 10.956 11.762 12.644 13.696 14.918 15.985 16.57 16.833 16.976 17.026 17.014 16.991 16.961 16.899 16.817 16.728 16.644 16.561 16.486 16.418 16.316 16.205 16.111 16.011 15.895 15.793 15.689 15.578 15.486 15.399 15.317 15.233 15.143 15.072 14.998 14.895 14.817 14.728 14.682 14.583 14.463 14.319 14.245 14.11 14.012 13.92 13.826 13.647 13.55 13.424 13.264 13.092 12.872 12.551 11.542 -7 ,7339 ,TETRA ,17667803,Fri Dec 3 06:01:49 CET,Fri Dec 3 08:17:24 CET,0.0 0.539 0.812 1.03 1.22 1.377 1.515 1.646 1.854 1.963 2.07 2.185 2.359 2.443 2.616 2.785 2.941 3.016 3.154 3.287 3.48 3.599 3.706 3.868 4.037 4.214 4.378 4.532 4.733 4.918 5.09 5.3 5.499 5.689 5.923 6.2 6.471 6.771 7.099 7.448 7.819 8.231 8.693 9.166 9.725 10.341 11.022 11.725 12.539 13.544 14.718 15.628 16.099 16.333 16.428 16.45 16.442 16.4 16.325 16.241 16.159 16.066 15.955 15.851 15.769 15.689 15.584 15.487 15.413 15.326 15.227 15.144 15.053 14.952 14.869 14.783 14.682 14.583 14.491 14.416 14.336 14.2 14.104 14.004 13.953 13.857 13.748 13.634 13.579 13.446 13.337 13.249 13.18 13.031 12.933 12.823 12.686 12.526 12.356 12.126 11.504 -8 ,28847 ,TETRA ,17667804,Fri Dec 3 06:01:47 CET,Fri Dec 3 08:17:30 CET,0.0 0.668 0.932 1.132 1.296 1.43 1.552 1.68 1.913 2.018 2.126 2.231 2.389 2.465 2.628 2.785 2.937 3.013 3.154 3.291 3.488 3.617 3.741 3.917 4.091 4.25 4.386 4.524 4.714 4.889 5.057 5.267 5.469 5.664 5.892 6.151 6.402 6.667 6.966 7.296 7.633 8.017 8.476 8.929 9.458 10.08 10.771 11.542 12.43 13.497 14.844 15.932 16.426 16.659 16.812 16.856 16.81 16.736 16.633 16.512 16.426 16.349 16.261 16.149 16.045 15.965 15.861 15.763 15.683 15.591 15.487 15.386 15.28 15.185 15.11 15.023 14.93 14.823 14.709 14.622 14.524 14.378 14.279 14.178 14.126 14.011 13.867 13.715 13.643 13.494 13.392 13.308 13.221 13.033 12.923 12.804 12.658 12.491 12.279 11.997 11.214 -9 ,14375 ,TETRA ,17667805,Fri Dec 3 06:01:51 CET,Fri Dec 3 08:17:48 CET,0.0 0.418 0.638 0.843 1.019 1.171 1.31 1.439 1.679 1.791 1.9 2.017 2.178 2.26 2.416 2.562 2.699 2.765 2.895 3.017 3.192 3.308 3.415 3.574 3.74 3.904 4.064 4.222 4.41 4.589 4.767 4.975 5.156 5.348 5.601 5.871 6.118 6.395 6.714 7.049 7.38 7.758 8.228 8.714 9.298 9.954 10.67 11.43 12.308 13.393 14.716 15.71 16.224 16.555 16.736 16.793 16.807 16.801 16.765 16.692 16.578 16.479 16.383 16.276 16.177 16.078 15.968 15.871 15.786 15.696 15.592 15.495 15.397 15.295 15.208 15.11 14.997 14.885 14.764 14.683 14.604 14.47 14.38 14.287 14.239 14.127 14.018 13.907 13.84 13.705 13.623 13.537 13.443 13.24 13.136 13.019 12.88 12.719 12.494 12.189 11.106 -10 ,17594 ,TETRA ,17667806,Fri Dec 3 06:01:45 CET,Fri Dec 3 08:18:11 CET,0.0 0.962 1.249 1.483 1.651 1.786 1.91 2.028 2.247 2.338 2.422 2.501 2.672 2.772 2.96 3.136 3.301 3.374 3.509 3.643 3.839 3.963 4.082 4.258 4.431 4.599 4.761 4.921 5.125 5.32 5.509 5.725 5.934 6.148 6.39 6.637 6.881 7.167 7.488 7.832 8.206 8.626 9.084 9.538 10.072 10.654 11.342 12.121 12.991 13.957 15.052 15.887 16.269 16.388 16.398 16.377 16.353 16.318 16.252 16.174 16.093 16.005 15.911 15.833 15.761 15.68 15.583 15.486 15.397 15.304 15.207 15.128 15.043 14.95 14.884 14.817 14.728 14.628 14.535 14.467 14.385 14.267 14.186 14.095 14.045 13.937 13.82 13.696 13.634 13.506 13.414 13.337 13.261 13.067 12.955 12.846 12.721 12.554 12.351 12.113 11.468 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_38_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_38_43.txt deleted file mode 100644 index 268e3025..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_38_43.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24414 ,KEBNE ,16653769,Mon Nov 22 04:02:21 CET,Mon Nov 22 05:44:38 CET,0.0 0.495 0.709 0.885 1.061 1.24 1.401 1.535 1.781 1.897 2.002 2.13 2.322 2.428 2.611 2.79 2.952 3.041 3.228 3.389 3.606 3.75 3.889 4.091 4.285 4.475 4.661 4.843 5.066 5.259 5.442 5.673 5.905 6.137 6.409 6.705 7.004 7.352 7.718 8.062 8.417 8.839 9.322 9.812 10.42 11.096 11.764 12.439 13.17 13.946 14.831 15.336 15.492 15.504 15.399 15.25 15.073 14.863 14.695 14.518 14.316 14.131 13.953 13.764 13.598 13.449 13.282 13.121 12.962 12.791 12.597 12.424 12.244 12.056 11.934 11.808 11.665 11.525 11.38 11.264 11.148 10.979 10.844 10.693 10.621 10.456 10.267 10.047 9.905 9.709 9.517 9.39 9.286 9.054 8.886 8.662 8.412 8.161 7.861 7.435 5.701 -2 ,11314 ,KEBNE ,16653770,Mon Nov 22 04:02:22 CET,Mon Nov 22 05:47:37 CET,0.0 0.607 0.802 0.98 1.162 1.32 1.448 1.582 1.812 1.908 2.009 2.147 2.32 2.408 2.576 2.741 2.903 2.985 3.134 3.266 3.465 3.606 3.746 3.952 4.143 4.327 4.51 4.684 4.919 5.133 5.333 5.575 5.8 6.024 6.286 6.586 6.876 7.181 7.499 7.83 8.174 8.575 9.042 9.49 10.007 10.582 11.257 11.998 12.785 13.642 14.487 15.022 15.241 15.246 15.163 15.015 14.829 14.627 14.426 14.231 14.057 13.851 13.628 13.448 13.294 13.128 12.927 12.736 12.548 12.347 12.165 12.04 11.915 11.759 11.632 11.495 11.336 11.17 10.996 10.883 10.756 10.534 10.389 10.252 10.183 10.033 9.861 9.667 9.565 9.401 9.278 9.165 9.035 8.746 8.586 8.405 8.201 7.951 7.669 7.278 4.301 -3 ,18628 ,KEBNE ,16653771,Mon Nov 22 04:03:23 CET,Mon Nov 22 05:47:06 CET,0.0 0.516 0.832 1.086 1.263 1.409 1.558 1.697 1.942 2.06 2.171 2.295 2.467 2.554 2.734 2.926 3.113 3.2 3.354 3.497 3.699 3.827 3.952 4.124 4.287 4.453 4.607 4.75 4.947 5.144 5.322 5.523 5.722 5.93 6.17 6.432 6.698 6.993 7.301 7.623 7.954 8.304 8.723 9.151 9.634 10.19 10.864 11.635 12.531 13.467 14.437 14.908 15.003 15.011 14.886 14.613 14.338 14.133 13.946 13.675 13.411 13.2 12.98 12.761 12.562 12.381 12.197 12.011 11.837 11.678 11.492 11.336 11.192 11.024 10.887 10.753 10.621 10.472 10.307 10.194 10.071 9.869 9.723 9.563 9.48 9.305 9.121 8.922 8.809 8.614 8.445 8.335 8.215 7.92 7.74 7.543 7.282 6.973 6.662 6.135 3.814 -4 ,17724 ,KEBNE ,16653772,Mon Nov 22 04:03:27 CET,Mon Nov 22 05:39:22 CET,0.0 0.927 1.269 1.495 1.701 1.844 1.958 2.083 2.293 2.386 2.48 2.582 2.747 2.837 3.003 3.16 3.308 3.383 3.533 3.665 3.849 3.967 4.088 4.267 4.44 4.606 4.761 4.924 5.135 5.321 5.498 5.717 5.939 6.16 6.415 6.685 6.944 7.243 7.563 7.894 8.237 8.62 9.078 9.555 10.11 10.74 11.492 12.302 13.213 14.259 15.343 15.985 16.21 16.266 16.2 16.05 15.866 15.61 15.348 15.122 14.933 14.744 14.539 14.338 14.156 14.006 13.836 13.664 13.506 13.341 13.183 13.042 12.903 12.75 12.612 12.456 12.287 12.128 11.963 11.843 11.718 11.515 11.371 11.212 11.127 10.963 10.79 10.599 10.509 10.347 10.18 10.059 9.935 9.616 9.436 9.233 9.023 8.802 8.493 8.101 6.424 -8 ,23812 ,KEBNE ,16653776,Mon Nov 22 04:06:28 CET,Mon Nov 22 05:48:52 CET,0.0 0.781 1.065 1.26 1.459 1.636 1.79 1.932 2.176 2.279 2.382 2.51 2.682 2.779 2.961 3.127 3.29 3.362 3.492 3.626 3.826 3.945 4.065 4.237 4.407 4.576 4.725 4.868 5.059 5.261 5.456 5.678 5.902 6.126 6.387 6.673 6.949 7.249 7.564 7.927 8.321 8.741 9.226 9.719 10.306 10.973 11.719 12.589 13.586 14.534 15.441 16.039 16.283 16.374 16.321 16.148 15.956 15.722 15.484 15.264 15.1 14.938 14.758 14.602 14.456 14.321 14.154 13.984 13.835 13.666 13.504 13.382 13.247 13.103 12.984 12.851 12.712 12.568 12.407 12.283 12.154 11.948 11.812 11.691 11.617 11.445 11.288 11.128 11.034 10.863 10.686 10.555 10.418 10.09 9.925 9.753 9.525 9.255 8.993 8.613 6.97 -9 ,22640 ,KEBNE ,16653777,Mon Nov 22 04:07:30 CET,Mon Nov 22 05:52:03 CET,0.0 0.504 0.706 0.905 1.114 1.27 1.406 1.549 1.805 1.91 2.004 2.125 2.301 2.383 2.556 2.73 2.894 2.98 3.139 3.289 3.505 3.647 3.792 3.999 4.178 4.351 4.53 4.701 4.913 5.112 5.315 5.573 5.812 6.036 6.285 6.568 6.843 7.147 7.48 7.839 8.23 8.642 9.087 9.569 10.136 10.72 11.448 12.27 13.14 14.097 15.103 15.774 16.084 16.214 16.201 16.104 15.915 15.705 15.52 15.293 15.06 14.858 14.681 14.484 14.296 14.118 13.925 13.761 13.609 13.442 13.277 13.152 13.009 12.844 12.714 12.575 12.429 12.27 12.111 12.001 11.877 11.699 11.576 11.44 11.364 11.196 11.035 10.838 10.731 10.564 10.417 10.295 10.165 9.875 9.712 9.512 9.277 9.004 8.684 8.228 4.898 -10 ,8365 ,KEBNE ,16653778,Mon Nov 22 04:09:33 CET,Mon Nov 22 05:52:20 CET,0.0 0.591 0.779 0.933 1.084 1.225 1.348 1.456 1.677 1.792 1.897 2.003 2.172 2.26 2.432 2.604 2.771 2.845 2.986 3.117 3.3 3.423 3.54 3.717 3.895 4.068 4.232 4.381 4.566 4.738 4.911 5.132 5.353 5.582 5.831 6.089 6.354 6.643 6.932 7.248 7.592 7.977 8.42 8.899 9.499 10.155 10.893 11.672 12.596 13.535 14.348 14.913 15.001 14.86 14.652 14.396 14.138 13.902 13.715 13.527 13.331 13.124 12.918 12.715 12.507 12.317 12.129 11.93 11.77 11.619 11.429 11.246 11.053 10.861 10.7 10.526 10.36 10.205 10.021 9.908 9.799 9.624 9.499 9.347 9.277 9.14 8.969 8.791 8.701 8.527 8.353 8.231 8.105 7.817 7.644 7.451 7.251 7.017 6.701 6.2 4.414 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_39_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_39_19.txt deleted file mode 100644 index dd6b3b5a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_39_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25617 ,KEBNE ,17023475,Wed Dec 22 08:10:47 CET,Wed Dec 22 09:51:50 CET,0.0 0.23 0.329 0.412 0.49 0.55 0.621 0.709 0.85 0.904 0.951 0.965 1.08 1.117 1.198 1.292 1.38 1.42 1.496 1.566 1.665 1.723 1.775 1.866 1.951 2.032 2.111 2.178 2.257 2.33 2.399 2.485 2.578 2.676 2.777 2.874 2.964 3.057 3.164 3.279 3.401 3.504 3.578 3.645 3.703 3.752 3.796 3.814 3.664 3.207 2.253 0.901 -0.27 -1.306 -2.221 -3.024 -3.713 -4.351 -4.92 -5.496 -6.011 -6.461 -6.876 -7.254 -7.605 -7.935 -8.275 -8.573 -8.828 -9.091 -9.38 -9.624 -9.886 -10.188 -10.427 -10.67 -10.917 -11.175 -11.442 -11.613 -11.782 -12.052 -12.26 -12.49 -12.608 -12.852 -13.115 -13.397 -13.54 -13.778 -14.028 -14.217 -14.419 -14.849 -15.085 -15.344 -15.647 -16.014 -16.436 -17.015 -20.264 -2 ,13720 ,KEBNE ,17023476,Wed Dec 22 08:10:47 CET,Wed Dec 22 09:52:18 CET,0.0 0.247 0.377 0.463 0.561 0.644 0.708 0.783 0.953 1.029 1.093 1.147 1.295 1.363 1.474 1.571 1.661 1.702 1.791 1.871 1.982 2.054 2.113 2.189 2.266 2.343 2.411 2.472 2.562 2.651 2.728 2.811 2.894 2.984 3.083 3.184 3.274 3.372 3.483 3.593 3.697 3.809 3.922 4.027 4.129 4.193 4.232 4.234 4.168 4.049 3.635 2.743 1.763 0.908 0.206 -0.424 -0.952 -1.437 -1.912 -2.419 -2.851 -3.255 -3.659 -4.053 -4.443 -4.797 -5.155 -5.487 -5.771 -6.056 -6.346 -6.593 -6.852 -7.115 -7.327 -7.556 -7.809 -8.073 -8.353 -8.561 -8.759 -9.071 -9.306 -9.535 -9.65 -9.907 -10.183 -10.448 -10.589 -10.833 -11.069 -11.238 -11.423 -11.826 -12.045 -12.294 -12.584 -12.924 -13.32 -13.88 -17.17 -3 ,1226 ,KEBNE ,17023477,Wed Dec 22 08:10:47 CET,Wed Dec 22 09:52:44 CET,0.0 0.238 0.374 0.479 0.575 0.662 0.738 0.806 0.922 0.974 1.03 1.061 1.196 1.251 1.361 1.467 1.566 1.606 1.659 1.714 1.805 1.861 1.918 1.998 2.077 2.154 2.223 2.291 2.369 2.441 2.518 2.622 2.716 2.804 2.918 3.042 3.152 3.265 3.371 3.483 3.605 3.735 3.862 3.957 4.047 4.129 4.198 4.229 4.199 3.981 3.235 2.1 1.065 0.118 -0.735 -1.506 -2.185 -2.822 -3.386 -3.931 -4.396 -4.82 -5.206 -5.593 -5.968 -6.303 -6.706 -7.104 -7.436 -7.779 -8.153 -8.447 -8.733 -9.057 -9.3 -9.519 -9.753 -10.03 -10.321 -10.506 -10.703 -11.01 -11.219 -11.451 -11.579 -11.847 -12.12 -12.401 -12.547 -12.793 -13.047 -13.215 -13.402 -13.833 -14.073 -14.318 -14.584 -14.89 -15.276 -15.846 -18.998 -4 ,31057 ,KEBNE ,17023478,Wed Dec 22 08:10:47 CET,Wed Dec 22 09:51:54 CET,0.0 0.388 0.526 0.616 0.706 0.796 0.887 0.975 1.122 1.185 1.257 1.313 1.448 1.516 1.655 1.753 1.827 1.872 1.965 2.044 2.161 2.233 2.305 2.421 2.516 2.598 2.678 2.745 2.828 2.911 2.989 3.086 3.173 3.249 3.352 3.474 3.588 3.702 3.809 3.935 4.053 4.162 4.281 4.386 4.497 4.602 4.64 4.63 4.576 4.399 3.828 2.911 2.017 1.099 0.295 -0.429 -1.121 -1.741 -2.258 -2.762 -3.173 -3.563 -3.959 -4.322 -4.677 -5.013 -5.356 -5.674 -5.945 -6.225 -6.522 -6.764 -7.009 -7.256 -7.457 -7.68 -7.91 -8.152 -8.423 -8.623 -8.82 -9.121 -9.334 -9.539 -9.642 -9.868 -10.114 -10.405 -10.553 -10.773 -10.991 -11.151 -11.322 -11.725 -11.956 -12.192 -12.438 -12.724 -13.089 -13.597 -15.878 -5 ,1931 ,KEBNE ,17023479,Wed Dec 22 08:11:49 CET,Wed Dec 22 09:52:40 CET,0.0 0.361 0.536 0.672 0.793 0.889 0.984 1.07 1.209 1.266 1.319 1.367 1.51 1.568 1.674 1.779 1.878 1.928 2.024 2.106 2.216 2.284 2.36 2.476 2.581 2.687 2.789 2.885 3.025 3.157 3.285 3.441 3.571 3.689 3.819 3.964 4.106 4.256 4.415 4.56 4.688 4.824 4.96 5.051 5.129 5.198 5.241 5.215 5.066 4.782 4.1 3.079 2.193 1.414 0.626 -0.138 -0.796 -1.388 -1.899 -2.42 -2.865 -3.272 -3.693 -4.108 -4.463 -4.777 -5.137 -5.449 -5.705 -6.003 -6.326 -6.582 -6.828 -7.088 -7.306 -7.53 -7.76 -7.998 -8.251 -8.42 -8.599 -8.903 -9.114 -9.33 -9.44 -9.661 -9.9 -10.157 -10.306 -10.553 -10.775 -10.943 -11.118 -11.49 -11.684 -11.882 -12.119 -12.404 -12.757 -13.279 -15.268 -6 ,11624 ,KEBNE ,17023480,Wed Dec 22 08:11:48 CET,Wed Dec 22 09:53:21 CET,0.0 0.666 0.837 0.949 1.035 1.127 1.216 1.292 1.42 1.486 1.553 1.586 1.716 1.764 1.851 1.922 2.003 2.041 2.107 2.19 2.309 2.371 2.432 2.519 2.605 2.688 2.773 2.86 2.966 3.069 3.168 3.283 3.403 3.515 3.62 3.726 3.84 3.955 4.043 4.123 4.225 4.369 4.527 4.644 4.738 4.786 4.754 4.633 4.395 3.955 3.105 1.851 0.71 -0.282 -1.228 -2.128 -2.893 -3.59 -4.188 -4.762 -5.249 -5.677 -6.083 -6.465 -6.827 -7.175 -7.552 -7.897 -8.201 -8.51 -8.818 -9.062 -9.315 -9.581 -9.792 -10.027 -10.271 -10.523 -10.797 -10.99 -11.192 -11.499 -11.699 -11.893 -12.005 -12.254 -12.48 -12.719 -12.851 -13.082 -13.354 -13.549 -13.745 -14.169 -14.4 -14.644 -14.906 -15.241 -15.677 -16.206 -18.565 -7 ,28155 ,KEBNE ,17023481,Wed Dec 22 08:11:52 CET,Wed Dec 22 09:51:51 CET,0.0 0.21 0.319 0.41 0.505 0.581 0.646 0.711 0.832 0.891 0.951 0.962 1.077 1.12 1.21 1.292 1.368 1.407 1.476 1.536 1.626 1.692 1.754 1.835 1.914 2.027 2.174 2.31 2.47 2.598 2.689 2.789 2.896 2.998 3.112 3.237 3.362 3.496 3.628 3.759 3.894 4.031 4.177 4.27 4.362 4.483 4.514 4.487 4.395 4.071 3.176 1.89 0.766 -0.251 -1.167 -1.992 -2.699 -3.37 -3.969 -4.577 -5.109 -5.586 -6.029 -6.423 -6.797 -7.157 -7.538 -7.863 -8.14 -8.438 -8.755 -9.021 -9.3 -9.596 -9.82 -10.048 -10.286 -10.531 -10.797 -10.982 -11.164 -11.466 -11.675 -11.88 -11.994 -12.24 -12.497 -12.761 -12.896 -13.129 -13.346 -13.501 -13.669 -14.036 -14.256 -14.502 -14.753 -15.1 -15.625 -16.337 -25.902 -8 ,2199 ,KEBNE ,17023482,Wed Dec 22 08:11:51 CET,Wed Dec 22 09:51:43 CET,0.0 0.221 0.308 0.371 0.434 0.498 0.559 0.62 0.742 0.793 0.837 0.846 0.967 1.012 1.105 1.197 1.272 1.305 1.368 1.433 1.539 1.6 1.652 1.729 1.806 1.876 1.939 2.003 2.085 2.162 2.235 2.327 2.407 2.479 2.585 2.704 2.806 2.903 3.018 3.146 3.255 3.371 3.492 3.595 3.684 3.751 3.829 3.813 3.61 3.273 2.63 1.742 0.943 0.207 -0.561 -1.43 -2.269 -3.018 -3.655 -4.295 -4.836 -5.305 -5.752 -6.147 -6.496 -6.823 -7.181 -7.518 -7.83 -8.153 -8.487 -8.8 -9.119 -9.416 -9.639 -9.874 -10.118 -10.383 -10.673 -10.872 -11.08 -11.379 -11.577 -11.793 -11.905 -12.148 -12.411 -12.671 -12.805 -13.041 -13.249 -13.408 -13.595 -14.009 -14.228 -14.495 -14.816 -15.171 -15.601 -16.203 -18.375 -9 ,31462 ,KEBNE ,17023483,Wed Dec 22 08:12:50 CET,Wed Dec 22 09:53:41 CET,0.0 0.142 0.224 0.302 0.378 0.445 0.511 0.574 0.664 0.715 0.777 0.807 0.936 0.986 1.087 1.177 1.254 1.291 1.361 1.434 1.543 1.608 1.666 1.753 1.843 1.921 2.008 2.093 2.193 2.292 2.382 2.483 2.59 2.708 2.819 2.91 3.005 3.104 3.199 3.3 3.405 3.538 3.677 3.803 3.921 3.999 4.035 4.024 3.938 3.691 3.039 1.996 1.031 0.17 -0.594 -1.346 -2.037 -2.641 -3.154 -3.675 -4.146 -4.584 -5.017 -5.421 -5.781 -6.109 -6.454 -6.769 -7.036 -7.31 -7.61 -7.86 -8.112 -8.384 -8.596 -8.807 -9.03 -9.262 -9.494 -9.664 -9.839 -10.086 -10.266 -10.489 -10.611 -10.86 -11.12 -11.384 -11.521 -11.751 -11.972 -12.147 -12.343 -12.756 -12.99 -13.243 -13.507 -13.826 -14.281 -14.89 -17.664 -10 ,22993 ,KEBNE ,17023484,Wed Dec 22 08:12:50 CET,Wed Dec 22 09:52:41 CET,0.0 0.214 0.357 0.477 0.556 0.629 0.715 0.791 0.905 0.958 1.014 1.034 1.152 1.189 1.266 1.353 1.428 1.462 1.523 1.58 1.668 1.722 1.778 1.87 1.959 2.044 2.12 2.189 2.278 2.354 2.43 2.522 2.614 2.705 2.798 2.893 2.972 3.06 3.167 3.287 3.404 3.519 3.663 3.789 3.894 3.983 4.059 4.073 3.923 3.583 2.84 1.856 0.942 -0.012 -0.927 -1.744 -2.45 -3.074 -3.63 -4.23 -4.731 -5.147 -5.526 -5.87 -6.192 -6.507 -6.847 -7.162 -7.453 -7.758 -8.063 -8.313 -8.57 -8.841 -9.054 -9.277 -9.518 -9.766 -10.021 -10.192 -10.367 -10.639 -10.834 -11.047 -11.162 -11.416 -11.689 -11.964 -12.11 -12.35 -12.599 -12.772 -12.943 -13.304 -13.501 -13.715 -13.968 -14.26 -14.628 -15.237 -17.853 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_39_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_39_28.txt deleted file mode 100644 index 32fb4fb9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_39_28.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8755 ,KEBNE ,16653779,Mon Nov 22 04:12:42 CET,Mon Nov 22 05:53:08 CET,0.0 1.506 1.923 2.18 2.376 2.549 2.719 2.879 3.179 3.323 3.455 3.635 3.846 3.974 4.184 4.384 4.583 4.679 4.872 5.06 5.32 5.491 5.663 5.937 6.212 6.462 6.706 6.94 7.224 7.497 7.769 8.091 8.406 8.71 9.077 9.496 9.881 10.305 10.761 11.258 11.774 12.351 13.033 13.717 14.533 15.448 16.526 17.755 19.153 20.733 22.383 23.57 24.014 24.173 24.267 24.263 24.162 23.982 23.779 23.582 23.382 23.182 23.0 22.817 22.637 22.477 22.306 22.112 21.943 21.764 21.538 21.363 21.211 21.062 20.936 20.8 20.667 20.532 20.389 20.284 20.159 19.946 19.785 19.613 19.521 19.32 19.108 18.882 18.757 18.566 18.322 18.167 18.018 17.654 17.446 17.228 16.981 16.688 16.272 15.646 11.472 -2 ,22513 ,KEBNE ,16653780,Mon Nov 22 04:14:45 CET,Mon Nov 22 05:56:04 CET,0.0 0.848 1.139 1.35 1.531 1.714 1.868 2.009 2.274 2.4 2.529 2.712 2.916 3.04 3.269 3.473 3.674 3.773 3.971 4.175 4.481 4.671 4.847 5.113 5.371 5.617 5.86 6.093 6.389 6.677 6.965 7.312 7.635 7.953 8.32 8.727 9.11 9.526 9.989 10.487 11.007 11.586 12.29 12.99 13.785 14.702 15.749 16.863 18.085 19.476 21.144 22.366 22.98 23.282 23.339 23.277 23.168 23.016 22.857 22.679 22.486 22.302 22.145 22.008 21.879 21.732 21.55 21.378 21.236 21.064 20.849 20.676 20.513 20.334 20.188 20.045 19.899 19.732 19.548 19.42 19.291 19.102 18.957 18.778 18.682 18.481 18.263 18.031 17.904 17.703 17.459 17.31 17.167 16.839 16.648 16.439 16.205 15.889 15.512 15.039 12.823 -3 ,15691 ,KEBNE ,16653781,Mon Nov 22 04:15:43 CET,Mon Nov 22 05:56:55 CET,0.0 0.981 1.335 1.573 1.766 1.963 2.162 2.371 2.749 2.899 3.027 3.189 3.388 3.521 3.759 3.979 4.22 4.339 4.554 4.752 5.038 5.222 5.395 5.646 5.887 6.112 6.326 6.537 6.812 7.076 7.34 7.65 7.936 8.214 8.54 8.908 9.268 9.678 10.126 10.603 11.103 11.669 12.347 13.023 13.788 14.613 15.547 16.587 17.769 19.143 20.638 21.715 22.167 22.259 22.224 22.161 22.076 21.963 21.842 21.696 21.554 21.412 21.255 21.075 20.869 20.645 20.398 20.189 20.017 19.824 19.6 19.415 19.224 19.039 18.906 18.762 18.586 18.387 18.177 18.015 17.845 17.585 17.404 17.201 17.088 16.862 16.63 16.393 16.257 16.044 15.823 15.662 15.497 15.149 14.957 14.737 14.467 14.141 13.733 13.239 8.993 -4 ,3831 ,KEBNE ,16653782,Mon Nov 22 04:16:44 CET,Mon Nov 22 05:58:35 CET,0.0 1.107 1.347 1.539 1.725 1.907 2.071 2.238 2.545 2.666 2.785 2.936 3.118 3.218 3.422 3.642 3.861 3.956 4.119 4.279 4.517 4.671 4.819 5.033 5.242 5.441 5.635 5.823 6.061 6.297 6.53 6.814 7.087 7.358 7.675 8.032 8.378 8.748 9.141 9.566 10.022 10.534 11.136 11.74 12.45 13.275 14.204 15.225 16.416 17.739 19.175 20.22 20.684 20.813 20.797 20.726 20.604 20.444 20.285 20.118 19.959 19.801 19.644 19.465 19.285 19.13 18.955 18.777 18.602 18.409 18.197 18.012 17.839 17.661 17.519 17.355 17.164 16.973 16.787 16.644 16.484 16.245 16.078 15.894 15.802 15.604 15.385 15.148 15.015 14.803 14.554 14.404 14.244 13.837 13.596 13.324 13.018 12.721 12.358 11.791 8.47 -5 ,10295 ,KEBNE ,16653783,Mon Nov 22 04:18:47 CET,Mon Nov 22 06:00:27 CET,0.0 1.016 1.388 1.639 1.856 2.062 2.25 2.446 2.879 3.08 3.252 3.463 3.669 3.787 4.004 4.209 4.404 4.506 4.729 4.953 5.26 5.451 5.638 5.911 6.178 6.43 6.658 6.871 7.159 7.438 7.704 8.032 8.342 8.628 8.961 9.355 9.743 10.188 10.682 11.192 11.73 12.33 13.015 13.703 14.495 15.402 16.457 17.611 18.937 20.515 22.257 23.409 23.946 24.176 24.251 24.254 24.213 24.141 24.082 24.0 23.866 23.712 23.554 23.408 23.277 23.145 22.972 22.816 22.696 22.563 22.387 22.232 22.074 21.903 21.766 21.621 21.48 21.325 21.134 21.002 20.858 20.629 20.485 20.323 20.233 20.045 19.855 19.64 19.523 19.35 19.135 18.982 18.83 18.515 18.319 18.086 17.83 17.528 17.159 16.656 13.917 -6 ,4916 ,KEBNE ,16653784,Mon Nov 22 04:19:53 CET,Mon Nov 22 05:59:36 CET,0.0 1.212 1.589 1.883 2.113 2.339 2.55 2.747 3.1 3.249 3.39 3.585 3.785 3.909 4.148 4.362 4.573 4.677 4.879 5.079 5.359 5.532 5.701 5.935 6.16 6.39 6.607 6.815 7.095 7.37 7.636 7.943 8.252 8.577 8.952 9.375 9.763 10.165 10.603 11.087 11.61 12.225 12.954 13.64 14.415 15.272 16.298 17.419 18.643 20.029 21.624 22.792 23.365 23.598 23.628 23.582 23.487 23.339 23.167 22.987 22.81 22.63 22.453 22.263 22.068 21.9 21.723 21.535 21.355 21.168 20.976 20.819 20.666 20.493 20.362 20.217 20.049 19.875 19.697 19.576 19.452 19.262 19.13 18.973 18.887 18.719 18.527 18.318 18.209 18.044 17.891 17.761 17.629 17.331 17.154 16.967 16.743 16.483 16.171 15.729 13.725 -7 ,10151 ,KEBNE ,16653785,Mon Nov 22 04:20:51 CET,Mon Nov 22 06:03:21 CET,0.0 1.381 1.622 1.818 2.013 2.201 2.354 2.503 2.788 2.922 3.059 3.238 3.444 3.572 3.801 4.007 4.2 4.296 4.482 4.67 4.954 5.126 5.291 5.529 5.755 5.98 6.203 6.425 6.722 6.999 7.255 7.567 7.878 8.198 8.578 8.984 9.361 9.756 10.176 10.633 11.107 11.627 12.221 12.852 13.586 14.375 15.334 16.385 17.552 18.866 20.424 21.625 22.124 22.292 22.341 22.318 22.225 22.032 21.791 21.538 21.344 21.189 21.048 20.921 20.773 20.612 20.422 20.241 20.079 19.905 19.703 19.519 19.346 19.188 19.047 18.88 18.721 18.553 18.356 18.22 18.083 17.869 17.714 17.535 17.442 17.273 17.104 16.912 16.785 16.591 16.395 16.25 16.096 15.764 15.573 15.341 15.071 14.776 14.419 13.833 11.054 -8 ,6537 ,KEBNE ,16653786,Mon Nov 22 04:21:52 CET,Mon Nov 22 06:04:44 CET,0.0 1.635 2.043 2.366 2.619 2.787 2.927 3.062 3.29 3.411 3.55 3.727 3.911 4.01 4.19 4.369 4.537 4.626 4.83 5.038 5.338 5.506 5.643 5.859 6.085 6.301 6.517 6.734 7.017 7.277 7.521 7.808 8.087 8.382 8.726 9.078 9.418 9.815 10.252 10.726 11.223 11.77 12.399 13.017 13.73 14.508 15.385 16.363 17.421 18.684 20.116 21.116 21.39 21.436 21.511 21.515 21.44 21.344 21.212 21.039 20.889 20.716 20.522 20.34 20.141 19.941 19.749 19.566 19.388 19.213 19.024 18.846 18.655 18.451 18.292 18.129 17.961 17.766 17.561 17.438 17.306 17.073 16.918 16.77 16.693 16.513 16.312 16.103 15.996 15.817 15.6 15.455 15.316 14.992 14.811 14.618 14.394 14.11 13.733 13.212 10.401 -9 ,18323 ,KEBNE ,16653787,Mon Nov 22 04:21:52 CET,Mon Nov 22 06:03:33 CET,0.0 1.183 1.536 1.803 2.07 2.323 2.539 2.742 3.123 3.292 3.45 3.67 3.878 3.996 4.227 4.451 4.668 4.769 4.955 5.142 5.432 5.606 5.771 6.022 6.272 6.52 6.757 6.98 7.28 7.558 7.809 8.104 8.386 8.683 9.032 9.398 9.742 10.134 10.587 11.067 11.561 12.123 12.761 13.39 14.127 14.93 15.804 16.815 18.09 19.612 21.107 21.951 22.329 22.551 22.707 22.765 22.712 22.558 22.4 22.241 22.054 21.872 21.702 21.534 21.374 21.226 21.06 20.901 20.753 20.577 20.381 20.208 20.028 19.841 19.687 19.523 19.354 19.187 19.012 18.891 18.771 18.574 18.424 18.264 18.171 17.974 17.77 17.556 17.444 17.252 17.054 16.907 16.731 16.301 16.052 15.8 15.529 15.224 14.829 14.202 10.608 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_39_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_39_37.txt deleted file mode 100644 index 98185988..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_39_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24015 ,KEBNE ,17042147,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:37:32 CET,0.0 0.847 1.101 1.307 1.489 1.656 1.785 1.904 2.119 2.218 2.322 2.454 2.621 2.706 2.892 3.061 3.205 3.28 3.429 3.568 3.777 3.902 4.016 4.191 4.367 4.534 4.693 4.853 5.048 5.239 5.432 5.673 5.903 6.113 6.353 6.635 6.912 7.207 7.527 7.871 8.237 8.658 9.15 9.63 10.161 10.742 11.415 12.168 13.019 14.026 15.146 15.839 16.066 16.111 16.053 15.927 15.759 15.575 15.398 15.196 15.008 14.83 14.658 14.482 14.296 14.125 13.951 13.794 13.654 13.498 13.323 13.18 13.03 12.865 12.744 12.623 12.486 12.331 12.177 12.072 11.966 11.792 11.651 11.496 11.417 11.274 11.122 10.935 10.837 10.677 10.545 10.423 10.308 10.107 9.995 9.854 9.686 9.494 9.289 9.037 8.182 -2 ,25157 ,KEBNE ,17042148,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:37:22 CET,0.0 1.167 1.478 1.694 1.859 2.005 2.145 2.274 2.526 2.654 2.769 2.898 3.078 3.177 3.373 3.551 3.714 3.793 3.933 4.061 4.265 4.404 4.53 4.704 4.871 5.034 5.189 5.333 5.519 5.7 5.885 6.107 6.321 6.529 6.763 7.016 7.256 7.519 7.801 8.117 8.463 8.847 9.281 9.716 10.242 10.845 11.494 12.174 12.961 13.811 14.676 15.345 15.653 15.737 15.789 15.772 15.698 15.619 15.507 15.37 15.253 15.125 14.985 14.836 14.676 14.528 14.365 14.211 14.072 13.917 13.742 13.595 13.447 13.299 13.184 13.061 12.914 12.76 12.628 12.53 12.421 12.262 12.15 12.037 11.984 11.871 11.738 11.596 11.515 11.361 11.255 11.158 11.048 10.801 10.665 10.515 10.349 10.168 9.919 9.549 8.006 -3 ,13439 ,KEBNE ,17042149,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:37:56 CET,0.0 1.138 1.482 1.751 1.966 2.144 2.288 2.416 2.681 2.808 2.919 3.035 3.206 3.29 3.449 3.602 3.739 3.811 3.955 4.093 4.292 4.416 4.538 4.713 4.878 5.046 5.206 5.351 5.537 5.717 5.902 6.138 6.365 6.57 6.805 7.092 7.372 7.676 7.99 8.299 8.648 9.055 9.503 9.971 10.518 11.13 11.779 12.433 13.172 13.981 14.901 15.519 15.752 15.788 15.717 15.584 15.369 15.123 14.885 14.622 14.401 14.19 13.983 13.795 13.609 13.436 13.258 13.088 12.945 12.792 12.63 12.497 12.357 12.212 12.09 11.955 11.825 11.692 11.549 11.446 11.333 11.165 11.059 10.939 10.867 10.726 10.583 10.408 10.314 10.156 10.023 9.917 9.809 9.544 9.377 9.193 9.013 8.821 8.577 8.251 7.056 -4 ,26505 ,KEBNE ,17042150,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:36:53 CET,0.0 0.703 0.998 1.222 1.423 1.591 1.739 1.879 2.122 2.24 2.361 2.515 2.704 2.804 3.004 3.202 3.374 3.446 3.59 3.726 3.917 4.033 4.143 4.321 4.5 4.668 4.821 4.97 5.175 5.374 5.56 5.784 6.002 6.211 6.443 6.702 6.951 7.219 7.51 7.833 8.179 8.569 9.022 9.477 10.002 10.58 11.236 11.909 12.619 13.37 14.176 14.759 14.995 15.052 15.0 14.899 14.781 14.624 14.444 14.232 14.056 13.889 13.701 13.529 13.37 13.208 13.025 12.851 12.698 12.54 12.362 12.218 12.081 11.938 11.817 11.69 11.556 11.4 11.232 11.117 10.998 10.817 10.691 10.561 10.497 10.348 10.169 9.987 9.897 9.729 9.553 9.432 9.314 9.058 8.923 8.776 8.609 8.415 8.157 7.831 6.773 -5 ,16801 ,KEBNE ,17042151,Thu Dec 23 03:57:02 CET,Thu Dec 23 05:36:25 CET,0.0 0.695 0.95 1.167 1.348 1.505 1.651 1.777 2.001 2.118 2.229 2.341 2.51 2.601 2.776 2.935 3.1 3.181 3.335 3.49 3.701 3.819 3.938 4.119 4.285 4.442 4.598 4.758 4.966 5.154 5.329 5.535 5.72 5.901 6.121 6.356 6.581 6.841 7.126 7.423 7.738 8.102 8.525 8.942 9.412 9.942 10.526 11.158 11.934 12.806 13.681 14.109 14.17 14.143 14.071 13.91 13.719 13.528 13.322 13.096 12.892 12.716 12.549 12.382 12.214 12.05 11.87 11.701 11.544 11.38 11.228 11.109 10.988 10.856 10.743 10.62 10.484 10.342 10.201 10.093 9.98 9.822 9.703 9.567 9.494 9.335 9.173 9.013 8.926 8.775 8.665 8.565 8.453 8.209 8.071 7.918 7.745 7.548 7.307 7.004 5.857 -6 ,5663 ,KEBNE ,17042152,Thu Dec 23 03:57:02 CET,Thu Dec 23 05:48:01 CET,0.0 1.147 1.421 1.639 1.873 2.06 2.196 2.318 2.526 2.624 2.727 2.877 3.058 3.151 3.331 3.492 3.643 3.716 3.868 4.009 4.218 4.357 4.478 4.64 4.794 4.956 5.113 5.258 5.437 5.6 5.761 5.962 6.161 6.351 6.571 6.821 7.039 7.265 7.542 7.859 8.174 8.54 8.986 9.398 9.864 10.389 10.99 11.655 12.418 13.262 14.181 14.702 14.829 14.815 14.736 14.611 14.445 14.273 14.093 13.877 13.681 13.512 13.354 13.199 13.06 12.941 12.803 12.653 12.523 12.386 12.233 12.099 11.954 11.812 11.692 11.555 11.421 11.275 11.105 10.987 10.878 10.707 10.574 10.44 10.37 10.23 10.083 9.923 9.846 9.706 9.584 9.488 9.39 9.17 9.036 8.901 8.753 8.556 8.312 8.018 7.125 -7 ,4160 ,KEBNE ,17042153,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:37:25 CET,0.0 0.752 1.042 1.273 1.459 1.609 1.741 1.858 2.084 2.203 2.311 2.421 2.596 2.686 2.859 3.03 3.181 3.251 3.383 3.513 3.709 3.823 3.932 4.089 4.236 4.385 4.536 4.678 4.857 5.023 5.19 5.402 5.604 5.79 6.006 6.281 6.539 6.793 7.063 7.351 7.649 7.997 8.415 8.859 9.409 9.974 10.569 11.243 12.002 12.771 13.551 14.176 14.386 14.349 14.247 14.093 13.907 13.673 13.473 13.3 13.096 12.889 12.685 12.476 12.3 12.153 11.996 11.844 11.701 11.538 11.364 11.215 11.061 10.901 10.777 10.635 10.473 10.316 10.165 10.046 9.913 9.714 9.566 9.411 9.335 9.177 9.008 8.819 8.72 8.554 8.411 8.28 8.144 7.876 7.72 7.534 7.303 7.07 6.826 6.449 5.11 -8 ,6505 ,KEBNE ,17042154,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:37:25 CET,0.0 0.67 0.925 1.126 1.286 1.408 1.53 1.66 1.903 2.021 2.122 2.228 2.397 2.483 2.635 2.779 2.923 2.99 3.119 3.251 3.453 3.583 3.702 3.874 4.03 4.175 4.331 4.482 4.672 4.848 5.018 5.233 5.448 5.647 5.869 6.131 6.383 6.666 7.002 7.358 7.703 8.067 8.452 8.844 9.304 9.796 10.349 10.994 11.802 12.759 13.844 14.616 14.901 14.921 14.851 14.739 14.608 14.442 14.284 14.113 13.938 13.782 13.613 13.438 13.263 13.092 12.925 12.773 12.642 12.501 12.352 12.221 12.078 11.928 11.814 11.701 11.58 11.453 11.311 11.208 11.094 10.908 10.775 10.641 10.577 10.433 10.28 10.12 10.036 9.88 9.75 9.641 9.529 9.287 9.144 8.986 8.818 8.645 8.416 8.048 6.68 -9 ,31557 ,KEBNE ,17042155,Thu Dec 23 03:56:58 CET,Thu Dec 23 05:37:12 CET,0.0 0.818 1.031 1.234 1.427 1.585 1.72 1.84 2.083 2.204 2.317 2.447 2.632 2.725 2.892 3.054 3.21 3.282 3.414 3.538 3.717 3.828 3.935 4.102 4.263 4.42 4.581 4.727 4.907 5.088 5.266 5.474 5.665 5.847 6.055 6.293 6.532 6.783 7.049 7.344 7.637 7.957 8.347 8.742 9.198 9.698 10.266 10.906 11.639 12.432 13.348 14.011 14.228 14.224 14.11 13.995 13.851 13.68 13.509 13.331 13.184 13.058 12.934 12.792 12.651 12.5 12.314 12.138 11.986 11.851 11.706 11.577 11.444 11.296 11.18 11.068 10.956 10.836 10.708 10.622 10.527 10.376 10.275 10.163 10.104 9.976 9.838 9.687 9.606 9.457 9.337 9.226 9.108 8.874 8.75 8.599 8.43 8.25 8.019 7.688 6.472 -10 ,29779 ,KEBNE ,17042156,Thu Dec 23 03:58:01 CET,Thu Dec 23 05:37:40 CET,0.0 0.965 1.332 1.588 1.794 1.969 2.12 2.263 2.525 2.631 2.73 2.845 3.017 3.104 3.262 3.421 3.58 3.655 3.805 3.95 4.155 4.281 4.396 4.572 4.741 4.891 5.03 5.165 5.357 5.554 5.735 5.952 6.169 6.381 6.628 6.9 7.163 7.453 7.773 8.106 8.451 8.846 9.256 9.666 10.17 10.739 11.393 12.1 12.84 13.681 14.674 15.225 15.342 15.245 15.03 14.789 14.548 14.292 14.064 13.832 13.612 13.413 13.217 13.024 12.861 12.711 12.555 12.42 12.285 12.122 11.943 11.801 11.643 11.483 11.368 11.238 11.092 10.931 10.763 10.644 10.517 10.303 10.166 10.028 9.954 9.809 9.656 9.499 9.413 9.25 9.11 9.001 8.891 8.645 8.507 8.363 8.175 7.959 7.702 7.369 6.507 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_40_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_40_37.txt deleted file mode 100644 index cc3d4a88..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_40_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17873 ,KEBNE ,17042157,Thu Dec 23 03:58:00 CET,Thu Dec 23 05:37:47 CET,0.0 0.796 1.073 1.269 1.43 1.558 1.667 1.775 1.998 2.089 2.171 2.277 2.434 2.513 2.674 2.821 2.951 3.017 3.145 3.268 3.449 3.558 3.666 3.836 3.99 4.124 4.253 4.375 4.529 4.669 4.798 4.981 5.168 5.335 5.529 5.73 5.915 6.124 6.355 6.609 6.868 7.158 7.478 7.777 8.121 8.467 8.79 9.149 9.511 9.721 9.686 9.244 8.74 8.249 7.771 7.294 6.845 6.429 6.093 5.76 5.436 5.145 4.874 4.62 4.378 4.141 3.899 3.697 3.515 3.313 3.106 2.928 2.736 2.541 2.402 2.259 2.086 1.906 1.735 1.612 1.471 1.238 1.071 0.908 0.829 0.65 0.463 0.269 0.163 -0.014 -0.164 -0.28 -0.412 -0.73 -0.889 -1.053 -1.244 -1.473 -1.757 -2.179 -3.607 -2 ,23925 ,KEBNE ,17042158,Thu Dec 23 03:58:00 CET,Thu Dec 23 05:38:58 CET,0.0 0.888 1.167 1.41 1.594 1.752 1.902 2.027 2.262 2.381 2.486 2.6 2.765 2.845 2.992 3.14 3.278 3.342 3.459 3.57 3.739 3.854 3.958 4.098 4.24 4.38 4.506 4.627 4.788 4.937 5.071 5.24 5.413 5.576 5.746 5.943 6.152 6.369 6.582 6.829 7.111 7.396 7.712 8.028 8.327 8.618 8.972 9.374 9.827 10.161 10.187 9.836 9.31 8.804 8.333 7.899 7.492 7.074 6.692 6.302 5.983 5.702 5.412 5.139 4.893 4.656 4.396 4.161 3.964 3.768 3.566 3.391 3.202 3.017 2.881 2.728 2.566 2.397 2.209 2.075 1.939 1.732 1.584 1.431 1.348 1.171 0.995 0.818 0.726 0.558 0.403 0.279 0.139 -0.138 -0.275 -0.439 -0.608 -0.794 -1.045 -1.362 -2.201 -3 ,32333 ,KEBNE ,17042159,Thu Dec 23 03:58:00 CET,Thu Dec 23 05:38:51 CET,0.0 0.811 1.089 1.303 1.485 1.665 1.836 1.966 2.187 2.302 2.408 2.522 2.68 2.763 2.935 3.083 3.209 3.266 3.383 3.502 3.685 3.797 3.903 4.058 4.208 4.352 4.49 4.627 4.796 4.947 5.089 5.27 5.443 5.595 5.765 5.963 6.171 6.404 6.633 6.846 7.07 7.367 7.714 7.975 8.241 8.558 8.892 9.238 9.588 9.856 9.912 9.621 9.227 8.82 8.395 7.946 7.514 7.139 6.83 6.511 6.244 5.99 5.729 5.479 5.246 5.042 4.844 4.667 4.487 4.288 4.082 3.908 3.733 3.536 3.384 3.243 3.096 2.934 2.764 2.641 2.506 2.302 2.157 2.011 1.936 1.771 1.599 1.417 1.324 1.164 0.999 0.89 0.778 0.483 0.309 0.125 -0.091 -0.349 -0.608 -0.946 -2.086 -4 ,12738 ,KEBNE ,17042160,Thu Dec 23 03:58:00 CET,Thu Dec 23 05:39:38 CET,0.0 0.712 0.993 1.212 1.383 1.521 1.659 1.773 1.986 2.098 2.21 2.351 2.518 2.602 2.745 2.888 3.036 3.11 3.239 3.355 3.526 3.633 3.739 3.89 4.048 4.209 4.351 4.484 4.671 4.862 5.018 5.197 5.393 5.577 5.784 6.006 6.205 6.412 6.634 6.893 7.17 7.45 7.775 8.11 8.437 8.758 9.102 9.488 9.882 10.132 10.083 9.607 9.056 8.503 7.945 7.408 6.901 6.432 6.042 5.669 5.349 5.058 4.768 4.485 4.222 3.958 3.677 3.444 3.227 2.98 2.732 2.546 2.354 2.133 1.966 1.8 1.622 1.425 1.227 1.098 0.958 0.754 0.614 0.466 0.381 0.196 0.016 -0.162 -0.257 -0.43 -0.576 -0.686 -0.809 -1.105 -1.256 -1.407 -1.585 -1.795 -2.04 -2.354 -3.395 -5 ,19404 ,KEBNE ,17042161,Thu Dec 23 03:58:01 CET,Thu Dec 23 05:38:41 CET,0.0 1.189 1.559 1.884 2.107 2.275 2.427 2.564 2.814 2.925 3.033 3.163 3.331 3.428 3.613 3.768 3.918 3.99 4.133 4.266 4.441 4.556 4.67 4.844 5.011 5.164 5.314 5.469 5.668 5.853 6.016 6.202 6.383 6.568 6.776 7.015 7.243 7.472 7.705 7.96 8.234 8.529 8.893 9.287 9.696 10.098 10.562 11.064 11.551 12.043 12.566 12.755 12.628 12.391 12.077 11.749 11.44 11.132 10.866 10.587 10.337 10.125 9.909 9.689 9.479 9.273 9.076 8.914 8.749 8.533 8.288 8.077 7.872 7.676 7.516 7.371 7.239 7.084 6.911 6.795 6.68 6.499 6.377 6.248 6.177 6.036 5.883 5.723 5.63 5.462 5.33 5.225 5.114 4.853 4.716 4.573 4.404 4.214 3.971 3.629 2.348 -6 ,10006 ,KEBNE ,17042162,Thu Dec 23 03:58:00 CET,Thu Dec 23 05:38:43 CET,0.0 0.756 0.975 1.185 1.377 1.521 1.648 1.753 1.958 2.054 2.154 2.286 2.441 2.52 2.66 2.794 2.923 2.987 3.114 3.221 3.371 3.468 3.565 3.713 3.861 4.002 4.137 4.27 4.419 4.558 4.697 4.862 5.023 5.18 5.367 5.583 5.796 6.022 6.266 6.533 6.807 7.105 7.452 7.799 8.202 8.637 9.058 9.435 9.788 10.145 10.345 10.111 9.752 9.412 9.042 8.628 8.242 7.879 7.552 7.229 6.93 6.645 6.379 6.115 5.87 5.662 5.433 5.21 5.008 4.79 4.564 4.399 4.239 4.061 3.916 3.763 3.606 3.446 3.28 3.165 3.037 2.832 2.691 2.546 2.471 2.306 2.131 1.953 1.863 1.714 1.584 1.468 1.351 1.106 0.967 0.804 0.61 0.384 0.093 -0.285 -1.321 -7 ,25187 ,KEBNE ,17042163,Thu Dec 23 03:58:00 CET,Thu Dec 23 05:39:00 CET,0.0 0.697 0.931 1.122 1.276 1.435 1.587 1.708 1.902 2.002 2.115 2.255 2.414 2.501 2.655 2.791 2.915 2.973 3.096 3.216 3.387 3.488 3.583 3.724 3.859 3.995 4.131 4.257 4.415 4.565 4.713 4.896 5.067 5.233 5.404 5.583 5.764 5.958 6.149 6.357 6.593 6.835 7.096 7.374 7.711 8.071 8.482 8.861 9.16 9.372 9.333 8.936 8.38 7.822 7.362 6.976 6.624 6.304 6.009 5.683 5.386 5.115 4.833 4.569 4.355 4.164 3.945 3.748 3.578 3.386 3.178 3.007 2.839 2.667 2.522 2.358 2.189 2.019 1.849 1.726 1.598 1.396 1.246 1.093 1.017 0.862 0.683 0.49 0.393 0.216 0.043 -0.082 -0.218 -0.544 -0.731 -0.916 -1.105 -1.322 -1.581 -1.915 -3.003 -8 ,4479 ,KEBNE ,17042164,Thu Dec 23 03:58:00 CET,Thu Dec 23 05:38:51 CET,0.0 0.979 1.334 1.568 1.73 1.884 2.025 2.148 2.364 2.472 2.58 2.702 2.856 2.93 3.082 3.238 3.389 3.461 3.594 3.714 3.9 4.028 4.142 4.3 4.456 4.604 4.742 4.877 5.047 5.224 5.393 5.591 5.787 5.972 6.185 6.431 6.656 6.895 7.166 7.452 7.773 8.133 8.48 8.773 9.132 9.549 10.042 10.506 10.844 11.114 11.251 11.106 10.842 10.552 10.238 9.903 9.606 9.318 9.042 8.766 8.497 8.218 7.96 7.726 7.508 7.309 7.098 6.906 6.727 6.524 6.312 6.141 5.967 5.796 5.666 5.529 5.379 5.223 5.071 4.965 4.849 4.656 4.517 4.368 4.29 4.123 3.942 3.751 3.651 3.481 3.314 3.192 3.076 2.815 2.663 2.492 2.309 2.086 1.794 1.424 0.353 -9 ,17696 ,KEBNE ,17042165,Thu Dec 23 03:58:01 CET,Thu Dec 23 05:39:24 CET,0.0 0.989 1.328 1.551 1.738 1.91 2.074 2.22 2.471 2.584 2.689 2.813 2.974 3.058 3.223 3.387 3.549 3.623 3.764 3.898 4.111 4.251 4.386 4.585 4.768 4.938 5.106 5.261 5.452 5.644 5.827 6.05 6.256 6.453 6.693 6.944 7.184 7.443 7.68 7.913 8.142 8.407 8.707 8.947 9.201 9.504 9.842 10.141 10.381 10.477 10.376 9.995 9.6 9.278 8.957 8.643 8.351 8.02 7.681 7.329 7.045 6.786 6.528 6.294 6.075 5.868 5.655 5.449 5.248 5.027 4.806 4.631 4.439 4.23 4.062 3.891 3.714 3.526 3.332 3.199 3.068 2.856 2.698 2.542 2.463 2.294 2.116 1.922 1.821 1.65 1.5 1.39 1.277 1.022 0.889 0.744 0.55 0.322 0.069 -0.257 -1.506 -10 ,2544 ,KEBNE ,17042166,Thu Dec 23 03:58:01 CET,Thu Dec 23 05:38:40 CET,0.0 0.845 1.135 1.372 1.602 1.791 1.944 2.073 2.336 2.453 2.561 2.702 2.866 2.952 3.113 3.272 3.435 3.518 3.673 3.813 4.001 4.12 4.239 4.402 4.559 4.723 4.886 5.025 5.195 5.362 5.503 5.687 5.867 6.022 6.201 6.404 6.606 6.82 7.043 7.292 7.553 7.827 8.13 8.41 8.699 9.006 9.378 9.758 10.091 10.344 10.316 9.925 9.456 8.89 8.302 7.797 7.371 6.963 6.598 6.229 5.908 5.608 5.308 5.018 4.78 4.587 4.383 4.196 4.026 3.833 3.625 3.455 3.268 3.066 2.91 2.748 2.58 2.412 2.237 2.108 1.966 1.762 1.616 1.456 1.377 1.204 1.023 0.854 0.762 0.6 0.459 0.337 0.213 -0.043 -0.189 -0.351 -0.538 -0.767 -1.039 -1.408 -3.281 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_41_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_41_37.txt deleted file mode 100644 index 62a18444..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_41_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31959 ,TETRA ,17606236,Sun Nov 28 19:55:21 CET,Sun Nov 28 22:12:41 CET,0.0 0.836 1.191 1.416 1.61 1.772 1.908 2.047 2.304 2.408 2.498 2.555 2.744 2.824 2.988 3.139 3.279 3.347 3.478 3.599 3.771 3.876 3.97 4.113 4.248 4.378 4.5 4.619 4.764 4.896 5.03 5.177 5.313 5.458 5.625 5.805 5.967 6.13 6.298 6.487 6.667 6.839 7.037 7.233 7.462 7.706 7.951 8.182 8.386 8.519 8.389 7.921 7.396 6.864 6.376 5.931 5.492 5.049 4.619 4.157 3.784 3.455 3.142 2.856 2.57 2.294 2.026 1.8 1.595 1.378 1.14 0.937 0.726 0.504 0.335 0.164 -0.025 -0.226 -0.435 -0.59 -0.747 -0.969 -1.121 -1.282 -1.363 -1.542 -1.757 -1.989 -2.109 -2.336 -2.468 -2.589 -2.721 -3.022 -3.187 -3.37 -3.592 -3.845 -4.165 -4.634 -6.561 -2 ,21364 ,TETRA ,17606237,Sun Nov 28 19:55:22 CET,Sun Nov 28 22:12:25 CET,0.0 0.783 1.095 1.342 1.558 1.726 1.884 2.037 2.3 2.404 2.508 2.608 2.807 2.895 3.044 3.175 3.3 3.362 3.488 3.606 3.771 3.876 3.97 4.113 4.256 4.378 4.495 4.614 4.772 4.916 5.055 5.206 5.348 5.488 5.647 5.813 5.967 6.166 6.367 6.548 6.744 6.973 7.212 7.441 7.701 7.962 8.26 8.556 8.806 8.964 8.88 8.42 7.88 7.336 6.809 6.348 5.924 5.49 5.1 4.711 4.373 4.047 3.734 3.445 3.171 2.928 2.677 2.454 2.262 2.032 1.771 1.569 1.349 1.12 0.964 0.806 0.642 0.445 0.229 0.089 -0.047 -0.256 -0.409 -0.577 -0.666 -0.859 -1.067 -1.275 -1.384 -1.616 -1.754 -1.873 -2.007 -2.321 -2.488 -2.676 -2.875 -3.079 -3.318 -3.657 -5.643 -3 ,23641 ,TETRA ,17606238,Sun Nov 28 19:55:24 CET,Sun Nov 28 22:12:42 CET,0.0 1.106 1.412 1.646 1.858 2.051 2.228 2.379 2.64 2.759 2.862 2.935 3.136 3.215 3.371 3.527 3.669 3.732 3.85 3.959 4.119 4.223 4.327 4.47 4.597 4.718 4.831 4.948 5.102 5.248 5.382 5.548 5.71 5.869 6.039 6.205 6.383 6.578 6.765 6.957 7.151 7.356 7.583 7.805 8.053 8.349 8.629 8.848 9.081 9.248 9.121 8.578 7.961 7.396 6.879 6.398 5.994 5.616 5.256 4.853 4.501 4.196 3.887 3.605 3.351 3.096 2.816 2.568 2.354 2.134 1.903 1.69 1.466 1.234 1.058 0.892 0.721 0.539 0.353 0.226 0.089 -0.145 -0.322 -0.494 -0.58 -0.778 -0.985 -1.209 -1.328 -1.566 -1.722 -1.85 -1.979 -2.267 -2.436 -2.633 -2.855 -3.099 -3.396 -3.848 -6.137 -4 ,8451 ,TETRA ,17606239,Sun Nov 28 19:55:19 CET,Sun Nov 28 22:04:20 CET,0.0 0.899 1.242 1.494 1.686 1.84 1.98 2.11 2.348 2.458 2.564 2.641 2.834 2.909 3.061 3.204 3.337 3.405 3.538 3.662 3.827 3.931 4.027 4.169 4.312 4.431 4.546 4.668 4.823 4.963 5.091 5.244 5.39 5.52 5.665 5.835 6.002 6.202 6.409 6.61 6.811 7.018 7.267 7.512 7.784 8.067 8.338 8.6 8.831 8.945 8.819 8.405 7.906 7.369 6.852 6.334 5.904 5.553 5.23 4.877 4.561 4.276 3.993 3.731 3.494 3.276 3.024 2.794 2.599 2.387 2.163 1.989 1.794 1.59 1.448 1.29 1.106 0.913 0.715 0.583 0.45 0.221 0.059 -0.114 -0.205 -0.384 -0.584 -0.802 -0.912 -1.134 -1.268 -1.4 -1.535 -1.849 -2.019 -2.194 -2.416 -2.688 -2.988 -3.39 -5.215 -5 ,2473 ,TETRA ,17606240,Sun Nov 28 19:55:19 CET,Sun Nov 28 22:14:15 CET,0.0 0.652 0.937 1.124 1.281 1.447 1.599 1.725 1.963 2.08 2.19 2.276 2.475 2.561 2.715 2.848 2.979 3.041 3.155 3.267 3.429 3.535 3.643 3.783 3.903 4.019 4.133 4.247 4.4 4.538 4.665 4.824 4.98 5.121 5.282 5.461 5.622 5.796 5.984 6.167 6.345 6.533 6.753 6.964 7.182 7.417 7.632 7.832 8.021 8.139 8.051 7.596 7.051 6.493 5.979 5.498 5.019 4.548 4.14 3.76 3.426 3.102 2.794 2.506 2.239 1.993 1.739 1.503 1.292 1.079 0.86 0.674 0.473 0.269 0.11 -0.06 -0.239 -0.427 -0.616 -0.748 -0.886 -1.086 -1.237 -1.414 -1.503 -1.691 -1.885 -2.102 -2.225 -2.46 -2.636 -2.786 -2.929 -3.248 -3.419 -3.593 -3.784 -4.011 -4.28 -4.659 -6.19 -6 ,32211 ,TETRA ,17606241,Sun Nov 28 19:55:20 CET,Sun Nov 28 22:14:16 CET,0.0 1.143 1.54 1.795 2.001 2.172 2.315 2.444 2.657 2.754 2.843 2.89 3.072 3.15 3.304 3.455 3.602 3.673 3.801 3.925 4.109 4.217 4.321 4.476 4.621 4.754 4.882 4.995 5.144 5.289 5.429 5.601 5.768 5.925 6.089 6.271 6.442 6.638 6.849 7.06 7.273 7.482 7.69 7.893 8.128 8.378 8.664 8.928 9.141 9.277 9.157 8.736 8.248 7.763 7.29 6.811 6.374 5.955 5.573 5.197 4.881 4.581 4.274 3.988 3.726 3.478 3.213 2.97 2.759 2.527 2.275 2.067 1.847 1.62 1.454 1.273 1.077 0.884 0.675 0.534 0.396 0.164 -0.007 -0.193 -0.283 -0.461 -0.649 -0.858 -0.971 -1.19 -1.302 -1.432 -1.576 -1.906 -2.079 -2.267 -2.488 -2.706 -2.991 -3.399 -5.341 -7 ,26175 ,TETRA ,17606242,Sun Nov 28 19:55:22 CET,Sun Nov 28 22:13:02 CET,0.0 0.851 1.196 1.456 1.69 1.889 2.05 2.187 2.421 2.526 2.621 2.695 2.886 2.963 3.115 3.258 3.39 3.464 3.61 3.736 3.912 4.028 4.136 4.277 4.409 4.527 4.633 4.749 4.896 5.034 5.166 5.324 5.48 5.628 5.787 5.949 6.097 6.272 6.475 6.687 6.88 7.063 7.283 7.488 7.711 7.955 8.181 8.392 8.584 8.66 8.548 8.053 7.47 6.96 6.475 6.016 5.587 5.173 4.822 4.466 4.148 3.867 3.583 3.289 3.003 2.74 2.469 2.232 2.03 1.823 1.604 1.394 1.171 0.956 0.792 0.619 0.433 0.229 0.021 -0.116 -0.255 -0.47 -0.614 -0.764 -0.846 -1.031 -1.237 -1.444 -1.543 -1.765 -1.882 -1.994 -2.127 -2.449 -2.617 -2.805 -3.043 -3.302 -3.588 -4.001 -5.843 -8 ,12776 ,TETRA ,17606243,Sun Nov 28 19:55:23 CET,Sun Nov 28 22:13:03 CET,0.0 0.725 1.048 1.301 1.493 1.647 1.795 1.936 2.17 2.277 2.375 2.457 2.664 2.746 2.89 3.028 3.17 3.237 3.363 3.487 3.672 3.78 3.884 4.043 4.182 4.31 4.445 4.566 4.702 4.835 4.973 5.142 5.303 5.456 5.631 5.83 6.028 6.237 6.434 6.632 6.844 7.074 7.323 7.587 7.874 8.142 8.459 8.779 9.016 9.117 9.065 8.719 8.199 7.635 7.129 6.66 6.224 5.824 5.461 5.085 4.749 4.433 4.128 3.868 3.635 3.413 3.187 2.981 2.78 2.559 2.334 2.145 1.951 1.752 1.596 1.435 1.259 1.078 0.898 0.759 0.607 0.371 0.208 0.05 -0.033 -0.225 -0.417 -0.607 -0.714 -0.944 -1.064 -1.179 -1.292 -1.552 -1.712 -1.896 -2.111 -2.373 -2.683 -3.098 -4.703 -9 ,10994 ,TETRA ,17606244,Sun Nov 28 19:55:20 CET,Sun Nov 28 22:11:56 CET,0.0 0.77 1.113 1.361 1.575 1.765 1.936 2.077 2.309 2.41 2.498 2.545 2.726 2.799 2.937 3.065 3.188 3.25 3.381 3.507 3.686 3.797 3.891 4.024 4.152 4.272 4.397 4.527 4.692 4.845 4.979 5.128 5.263 5.394 5.541 5.702 5.859 6.016 6.188 6.373 6.543 6.734 6.958 7.151 7.348 7.564 7.819 8.06 8.192 8.203 8.021 7.495 6.954 6.428 5.914 5.435 5.004 4.585 4.209 3.795 3.41 3.093 2.797 2.497 2.221 1.991 1.753 1.519 1.312 1.097 0.875 0.704 0.527 0.339 0.191 0.02 -0.163 -0.347 -0.544 -0.684 -0.825 -1.043 -1.202 -1.374 -1.465 -1.642 -1.829 -2.059 -2.176 -2.408 -2.558 -2.696 -2.839 -3.119 -3.297 -3.536 -3.771 -4.011 -4.286 -4.647 -6.373 -10 ,18423 ,TETRA ,17606245,Sun Nov 28 19:55:23 CET,Sun Nov 28 22:11:40 CET,0.0 0.875 1.2 1.451 1.662 1.836 1.983 2.114 2.368 2.493 2.6 2.674 2.869 2.942 3.079 3.212 3.347 3.41 3.521 3.629 3.793 3.894 3.99 4.132 4.267 4.397 4.511 4.621 4.764 4.912 5.05 5.208 5.365 5.515 5.682 5.854 6.024 6.225 6.433 6.641 6.873 7.118 7.349 7.566 7.825 8.082 8.336 8.607 8.82 8.962 8.957 8.664 8.237 7.754 7.262 6.792 6.352 5.913 5.513 5.116 4.753 4.419 4.113 3.818 3.546 3.301 3.058 2.836 2.635 2.428 2.21 2.01 1.809 1.614 1.456 1.296 1.133 0.969 0.79 0.668 0.54 0.331 0.181 0.016 -0.06 -0.209 -0.4 -0.607 -0.71 -0.934 -1.071 -1.198 -1.329 -1.616 -1.772 -1.939 -2.124 -2.349 -2.633 -3.09 -4.97 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_41_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_41_40.txt deleted file mode 100644 index 8da6b7d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_41_40.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12777 ,KEBNE ,16653789,Mon Nov 22 04:21:53 CET,Mon Nov 22 06:04:49 CET,0.0 0.866 1.175 1.39 1.56 1.695 1.827 1.951 2.153 2.26 2.366 2.475 2.614 2.689 2.856 3.005 3.126 3.183 3.294 3.391 3.537 3.641 3.746 3.897 4.039 4.187 4.334 4.463 4.612 4.757 4.908 5.089 5.262 5.434 5.632 5.839 6.023 6.226 6.435 6.656 6.896 7.133 7.385 7.615 7.864 8.125 8.403 8.73 9.016 9.176 9.052 8.408 7.71 7.06 6.401 5.782 5.22 4.713 4.297 3.842 3.451 3.102 2.73 2.393 2.096 1.825 1.544 1.297 1.091 0.87 0.622 0.422 0.228 0.027 -0.13 -0.297 -0.471 -0.658 -0.864 -1.011 -1.162 -1.394 -1.555 -1.724 -1.815 -1.998 -2.198 -2.413 -2.52 -2.699 -2.857 -2.986 -3.12 -3.392 -3.55 -3.726 -3.903 -4.117 -4.39 -4.735 -5.888 -4 ,2845 ,KEBNE ,16653792,Mon Nov 22 04:22:53 CET,Mon Nov 22 06:06:09 CET,0.0 0.896 1.18 1.403 1.6 1.777 1.931 2.06 2.296 2.403 2.506 2.664 2.829 2.916 3.071 3.209 3.339 3.403 3.524 3.645 3.812 3.915 4.027 4.188 4.333 4.489 4.629 4.751 4.914 5.075 5.221 5.386 5.55 5.726 5.918 6.107 6.295 6.494 6.684 6.895 7.102 7.306 7.542 7.743 7.96 8.207 8.454 8.692 8.906 9.036 8.822 8.139 7.379 6.642 6.0 5.385 4.809 4.303 3.902 3.506 3.168 2.87 2.556 2.24 1.926 1.642 1.367 1.122 0.914 0.7 0.473 0.274 0.06 -0.167 -0.344 -0.526 -0.708 -0.883 -1.064 -1.198 -1.351 -1.601 -1.766 -1.933 -2.018 -2.193 -2.393 -2.6 -2.698 -2.881 -3.041 -3.161 -3.294 -3.59 -3.762 -3.962 -4.172 -4.385 -4.648 -4.976 -5.978 -5 ,22306 ,KEBNE ,16653793,Mon Nov 22 04:22:54 CET,Mon Nov 22 06:05:42 CET,0.0 0.859 1.142 1.359 1.549 1.728 1.875 2.005 2.246 2.347 2.444 2.553 2.699 2.776 2.921 3.067 3.219 3.291 3.412 3.519 3.674 3.771 3.867 4.005 4.131 4.261 4.395 4.51 4.64 4.765 4.892 5.057 5.233 5.41 5.611 5.836 6.033 6.236 6.455 6.712 6.981 7.239 7.528 7.793 8.068 8.375 8.693 8.997 9.251 9.44 9.417 8.926 8.328 7.751 7.176 6.608 6.125 5.674 5.26 4.862 4.521 4.174 3.825 3.499 3.206 2.946 2.647 2.355 2.113 1.879 1.637 1.438 1.221 0.992 0.82 0.653 0.481 0.29 0.085 -0.051 -0.183 -0.414 -0.589 -0.757 -0.842 -1.03 -1.231 -1.427 -1.536 -1.715 -1.878 -2.009 -2.143 -2.428 -2.579 -2.734 -2.899 -3.091 -3.335 -3.67 -4.688 -6 ,23863 ,KEBNE ,16653794,Mon Nov 22 04:23:55 CET,Mon Nov 22 06:08:20 CET,0.0 0.929 1.243 1.434 1.605 1.764 1.901 2.016 2.214 2.305 2.4 2.527 2.674 2.748 2.89 3.032 3.182 3.253 3.387 3.523 3.717 3.831 3.933 4.077 4.224 4.356 4.466 4.581 4.74 4.891 5.032 5.207 5.377 5.527 5.686 5.866 6.041 6.248 6.475 6.69 6.911 7.145 7.412 7.681 7.949 8.207 8.465 8.684 8.893 9.043 9.033 8.645 8.084 7.534 6.967 6.428 5.967 5.544 5.152 4.739 4.375 4.043 3.705 3.365 3.051 2.77 2.492 2.252 2.05 1.836 1.601 1.403 1.195 0.977 0.803 0.616 0.431 0.248 0.049 -0.094 -0.239 -0.478 -0.65 -0.823 -0.914 -1.095 -1.267 -1.442 -1.538 -1.717 -1.887 -2.01 -2.132 -2.404 -2.561 -2.735 -2.915 -3.12 -3.361 -3.641 -4.686 -7 ,32729 ,KEBNE ,16653795,Mon Nov 22 04:24:58 CET,Mon Nov 22 06:09:16 CET,0.0 0.613 0.92 1.187 1.38 1.547 1.691 1.821 2.063 2.174 2.276 2.403 2.556 2.642 2.8 2.943 3.087 3.155 3.289 3.417 3.582 3.691 3.807 3.968 4.117 4.259 4.392 4.523 4.686 4.831 4.965 5.127 5.293 5.45 5.606 5.774 5.946 6.132 6.313 6.518 6.736 6.944 7.175 7.402 7.678 7.953 8.187 8.403 8.56 8.641 8.483 7.901 7.219 6.519 5.871 5.277 4.71 4.19 3.738 3.285 2.907 2.548 2.2 1.875 1.56 1.273 0.97 0.704 0.473 0.222 -0.033 -0.24 -0.459 -0.688 -0.867 -1.06 -1.253 -1.456 -1.67 -1.817 -1.968 -2.191 -2.353 -2.527 -2.614 -2.795 -2.98 -3.172 -3.279 -3.455 -3.621 -3.756 -3.896 -4.195 -4.366 -4.559 -4.776 -5.002 -5.258 -5.599 -6.727 -8 ,3071 ,KEBNE ,16653796,Mon Nov 22 04:24:58 CET,Mon Nov 22 06:07:26 CET,0.0 0.958 1.261 1.474 1.653 1.803 1.934 2.061 2.309 2.417 2.522 2.657 2.811 2.898 3.058 3.2 3.323 3.386 3.511 3.642 3.833 3.949 4.062 4.214 4.36 4.497 4.628 4.757 4.924 5.08 5.223 5.388 5.538 5.674 5.834 6.01 6.185 6.375 6.579 6.799 7.002 7.229 7.489 7.723 8.0 8.296 8.567 8.809 8.962 8.925 8.618 7.841 6.954 6.124 5.333 4.659 4.134 3.652 3.18 2.696 2.281 1.875 1.484 1.138 0.835 0.546 0.245 0.003 -0.211 -0.439 -0.686 -0.898 -1.116 -1.352 -1.537 -1.731 -1.931 -2.141 -2.343 -2.469 -2.61 -2.84 -2.996 -3.153 -3.237 -3.421 -3.6 -3.772 -3.867 -4.034 -4.174 -4.291 -4.416 -4.708 -4.88 -5.082 -5.289 -5.503 -5.743 -6.037 -6.964 -9 ,9678 ,KEBNE ,16653798,Mon Nov 22 04:25:59 CET,Mon Nov 22 06:08:32 CET,0.0 1.05 1.327 1.556 1.734 1.903 2.063 2.19 2.418 2.529 2.636 2.751 2.89 2.967 3.121 3.254 3.386 3.459 3.578 3.676 3.836 3.95 4.052 4.202 4.351 4.49 4.624 4.751 4.896 5.031 5.166 5.334 5.5 5.667 5.85 6.045 6.228 6.405 6.591 6.777 6.96 7.165 7.382 7.587 7.821 8.074 8.333 8.54 8.696 8.779 8.531 7.832 7.142 6.515 5.909 5.325 4.794 4.308 3.88 3.395 2.97 2.614 2.248 1.893 1.57 1.295 1.011 0.746 0.511 0.264 -0.001 -0.222 -0.452 -0.696 -0.882 -1.067 -1.25 -1.448 -1.669 -1.825 -1.977 -2.206 -2.368 -2.546 -2.637 -2.842 -3.066 -3.296 -3.413 -3.6 -3.769 -3.902 -4.036 -4.318 -4.474 -4.634 -4.821 -5.077 -5.362 -5.767 -7.173 -10 ,5306 ,KEBNE ,16653799,Mon Nov 22 04:27:01 CET,Mon Nov 22 06:09:42 CET,0.0 0.961 1.281 1.505 1.681 1.834 1.982 2.11 2.342 2.449 2.554 2.69 2.852 2.939 3.088 3.241 3.397 3.468 3.598 3.717 3.879 3.98 4.083 4.245 4.389 4.517 4.645 4.775 4.942 5.092 5.224 5.377 5.529 5.676 5.847 6.057 6.262 6.48 6.697 6.908 7.124 7.385 7.673 7.943 8.234 8.498 8.754 8.963 9.127 9.209 9.108 8.56 7.806 7.138 6.581 6.066 5.512 4.949 4.485 4.026 3.621 3.272 2.916 2.568 2.271 1.983 1.673 1.421 1.21 0.978 0.713 0.5 0.295 0.077 -0.101 -0.302 -0.508 -0.699 -0.902 -1.045 -1.183 -1.401 -1.564 -1.728 -1.809 -1.997 -2.196 -2.397 -2.498 -2.671 -2.844 -2.97 -3.098 -3.404 -3.575 -3.766 -3.959 -4.159 -4.471 -4.886 -6.116 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_42_13.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_42_13.txt deleted file mode 100644 index c469db5f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_42_13.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5264 ,KEBNE ,16653800,Mon Nov 22 04:27:01 CET,Mon Nov 22 06:09:20 CET,0.0 0.821 1.104 1.328 1.51 1.676 1.821 1.96 2.204 2.309 2.41 2.514 2.671 2.764 2.936 3.106 3.254 3.32 3.459 3.599 3.809 3.936 4.056 4.246 4.42 4.575 4.728 4.881 5.083 5.28 5.458 5.677 5.907 6.122 6.349 6.633 6.924 7.221 7.547 7.915 8.272 8.659 9.147 9.625 10.127 10.69 11.313 11.853 12.335 12.84 13.131 12.938 12.492 11.946 11.362 10.767 10.284 9.853 9.445 9.062 8.752 8.431 8.107 7.831 7.552 7.267 7.002 6.77 6.558 6.336 6.093 5.892 5.694 5.481 5.303 5.118 4.935 4.744 4.539 4.39 4.233 3.992 3.819 3.642 3.55 3.339 3.115 2.885 2.762 2.563 2.371 2.226 2.069 1.74 1.566 1.352 1.095 0.798 0.491 0.045 -1.664 -2 ,24682 ,KEBNE ,16653801,Mon Nov 22 04:27:01 CET,Mon Nov 22 06:08:58 CET,0.0 0.888 1.211 1.485 1.695 1.856 1.987 2.105 2.346 2.464 2.574 2.704 2.868 2.961 3.127 3.28 3.427 3.489 3.601 3.725 3.922 4.04 4.146 4.308 4.461 4.603 4.74 4.883 5.096 5.297 5.471 5.669 5.858 6.043 6.278 6.563 6.822 7.113 7.432 7.744 8.073 8.464 8.888 9.289 9.734 10.199 10.768 11.325 11.819 12.291 12.555 12.491 12.303 12.054 11.72 11.33 10.992 10.66 10.318 9.986 9.712 9.479 9.27 9.032 8.771 8.533 8.298 8.086 7.885 7.667 7.441 7.266 7.102 6.93 6.793 6.64 6.465 6.277 6.085 5.954 5.812 5.614 5.494 5.363 5.295 5.145 4.977 4.797 4.709 4.543 4.407 4.305 4.191 3.929 3.796 3.646 3.435 3.132 2.804 2.418 1.199 -3 ,21116 ,KEBNE ,16653802,Mon Nov 22 04:28:02 CET,Mon Nov 22 06:10:20 CET,0.0 0.774 1.076 1.342 1.531 1.688 1.837 1.966 2.196 2.305 2.402 2.519 2.682 2.767 2.934 3.096 3.26 3.339 3.495 3.631 3.814 3.943 4.072 4.263 4.443 4.61 4.76 4.893 5.077 5.255 5.425 5.658 5.885 6.081 6.296 6.559 6.811 7.068 7.323 7.584 7.887 8.251 8.697 9.139 9.596 10.08 10.64 11.194 11.721 12.28 12.722 12.709 12.417 12.032 11.619 11.237 10.89 10.58 10.306 10.02 9.778 9.524 9.23 8.954 8.729 8.519 8.294 8.105 7.916 7.693 7.468 7.266 7.052 6.849 6.696 6.538 6.362 6.177 5.995 5.853 5.691 5.45 5.3 5.157 5.074 4.872 4.655 4.422 4.298 4.101 3.923 3.795 3.661 3.35 3.168 2.934 2.67 2.401 2.07 1.545 -0.81 -4 ,9330 ,KEBNE ,16653803,Mon Nov 22 04:28:02 CET,Mon Nov 22 06:09:51 CET,0.0 0.824 1.141 1.381 1.571 1.736 1.884 2.01 2.238 2.346 2.451 2.571 2.744 2.838 3.016 3.196 3.371 3.455 3.615 3.759 3.974 4.115 4.25 4.439 4.621 4.794 4.96 5.117 5.323 5.537 5.73 5.96 6.181 6.385 6.631 6.918 7.206 7.511 7.825 8.173 8.514 8.869 9.299 9.741 10.198 10.666 11.213 11.723 12.265 12.791 13.038 12.952 12.695 12.35 11.917 11.517 11.212 10.911 10.617 10.301 9.997 9.725 9.456 9.189 8.971 8.775 8.552 8.338 8.142 7.931 7.71 7.516 7.304 7.095 6.943 6.781 6.616 6.452 6.266 6.139 6.006 5.801 5.66 5.495 5.412 5.263 5.108 4.926 4.818 4.62 4.418 4.282 4.144 3.853 3.683 3.49 3.28 3.031 2.738 2.327 1.106 -5 ,709 ,KEBNE ,16653804,Mon Nov 22 04:29:05 CET,Mon Nov 22 06:12:34 CET,0.0 0.777 1.048 1.291 1.484 1.645 1.786 1.922 2.172 2.298 2.425 2.559 2.725 2.816 2.991 3.151 3.3 3.374 3.538 3.716 3.974 4.136 4.289 4.508 4.725 4.929 5.116 5.307 5.55 5.79 6.023 6.295 6.559 6.806 7.071 7.36 7.631 7.928 8.261 8.604 8.991 9.435 9.896 10.344 10.828 11.337 11.874 12.436 13.071 13.652 14.118 14.129 13.881 13.605 13.287 12.955 12.634 12.353 12.122 11.841 11.551 11.276 11.032 10.792 10.56 10.351 10.115 9.884 9.664 9.438 9.204 8.999 8.797 8.59 8.407 8.223 8.046 7.858 7.663 7.539 7.413 7.177 7.0 6.825 6.737 6.559 6.377 6.179 6.074 5.892 5.736 5.603 5.453 5.127 4.949 4.733 4.49 4.236 3.916 3.449 2.023 -6 ,15244 ,KEBNE ,16653805,Mon Nov 22 04:30:06 CET,Mon Nov 22 06:14:22 CET,0.0 0.914 1.22 1.423 1.59 1.738 1.87 1.995 2.239 2.344 2.45 2.597 2.769 2.854 3.013 3.172 3.316 3.391 3.543 3.682 3.867 3.99 4.116 4.283 4.445 4.61 4.776 4.942 5.157 5.357 5.53 5.737 5.969 6.196 6.429 6.682 6.911 7.188 7.514 7.813 8.136 8.543 8.958 9.336 9.771 10.206 10.668 11.293 12.01 12.595 13.015 12.949 12.626 12.174 11.736 11.339 10.951 10.58 10.223 9.843 9.546 9.274 8.979 8.685 8.419 8.176 7.912 7.678 7.467 7.236 7.015 6.841 6.632 6.389 6.209 6.03 5.842 5.655 5.442 5.281 5.109 4.83 4.637 4.432 4.328 4.12 3.909 3.693 3.567 3.361 3.205 3.081 2.947 2.65 2.494 2.328 2.094 1.791 1.442 0.92 -0.519 -7 ,22730 ,KEBNE ,16653806,Mon Nov 22 04:30:06 CET,Mon Nov 22 06:13:51 CET,0.0 0.727 1.033 1.237 1.424 1.573 1.699 1.817 2.042 2.151 2.255 2.377 2.544 2.635 2.789 2.937 3.088 3.159 3.298 3.43 3.617 3.744 3.86 4.026 4.191 4.345 4.497 4.651 4.839 5.002 5.18 5.414 5.633 5.824 6.034 6.285 6.53 6.767 7.015 7.305 7.609 7.938 8.319 8.715 9.181 9.674 10.188 10.735 11.291 11.79 12.175 12.281 12.021 11.56 11.118 10.702 10.328 9.99 9.647 9.287 8.992 8.726 8.46 8.213 7.99 7.767 7.528 7.31 7.103 6.885 6.671 6.508 6.337 6.154 6.008 5.838 5.657 5.467 5.269 5.128 4.978 4.762 4.605 4.436 4.349 4.165 3.963 3.742 3.63 3.43 3.207 3.053 2.896 2.575 2.386 2.152 1.875 1.566 1.218 0.77 -1.009 -8 ,3934 ,KEBNE ,16653807,Mon Nov 22 04:30:06 CET,Mon Nov 22 06:12:04 CET,0.0 0.683 0.944 1.139 1.299 1.442 1.576 1.714 1.972 2.083 2.184 2.303 2.478 2.583 2.77 2.926 3.072 3.141 3.275 3.404 3.594 3.716 3.824 3.972 4.113 4.253 4.392 4.527 4.701 4.878 5.042 5.242 5.444 5.626 5.837 6.075 6.32 6.6 6.899 7.188 7.461 7.779 8.144 8.487 8.842 9.273 9.783 10.218 10.626 10.99 11.153 10.862 10.337 9.799 9.322 8.839 8.348 7.907 7.514 7.111 6.751 6.378 6.006 5.69 5.421 5.145 4.839 4.566 4.337 4.106 3.846 3.629 3.409 3.168 2.973 2.775 2.579 2.392 2.193 2.046 1.895 1.66 1.508 1.337 1.236 1.021 0.788 0.542 0.402 0.189 -0.007 -0.16 -0.318 -0.672 -0.898 -1.139 -1.413 -1.767 -2.192 -2.73 -4.312 -9 ,27949 ,KEBNE ,16653808,Mon Nov 22 04:30:06 CET,Mon Nov 22 06:11:52 CET,0.0 0.758 1.046 1.262 1.456 1.652 1.826 1.964 2.204 2.321 2.43 2.572 2.763 2.861 3.036 3.21 3.384 3.459 3.586 3.721 3.931 4.065 4.19 4.36 4.521 4.679 4.833 4.99 5.192 5.368 5.532 5.736 5.931 6.118 6.352 6.628 6.876 7.13 7.411 7.688 7.961 8.275 8.616 8.991 9.418 9.788 10.169 10.647 11.275 11.874 12.191 12.078 11.645 11.06 10.501 9.976 9.559 9.224 8.912 8.552 8.224 7.93 7.657 7.392 7.121 6.883 6.632 6.39 6.184 5.98 5.764 5.576 5.384 5.176 4.994 4.795 4.616 4.435 4.231 4.078 3.903 3.653 3.503 3.337 3.238 3.024 2.819 2.607 2.492 2.306 2.139 2.021 1.877 1.555 1.383 1.172 0.944 0.683 0.372 -0.005 -1.699 -10 ,1928 ,KEBNE ,16653809,Mon Nov 22 04:30:06 CET,Mon Nov 22 06:11:45 CET,0.0 0.915 1.222 1.438 1.601 1.759 1.896 2.017 2.217 2.317 2.435 2.573 2.746 2.838 3.011 3.194 3.378 3.468 3.643 3.819 4.056 4.183 4.304 4.48 4.659 4.841 5.017 5.174 5.361 5.557 5.758 5.984 6.201 6.42 6.671 6.96 7.233 7.501 7.778 8.101 8.485 8.909 9.355 9.807 10.33 10.898 11.51 12.02 12.402 12.783 12.976 12.715 12.297 11.846 11.344 10.854 10.442 10.065 9.718 9.356 9.057 8.761 8.451 8.138 7.843 7.587 7.31 7.066 6.855 6.639 6.411 6.22 6.013 5.778 5.6 5.436 5.27 5.086 4.895 4.771 4.649 4.438 4.268 4.089 3.998 3.802 3.583 3.34 3.207 3.011 2.858 2.736 2.599 2.277 2.116 1.942 1.728 1.452 1.113 0.696 -0.782 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_42_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_42_44.txt deleted file mode 100644 index 02473036..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_42_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5523 ,KEBNE ,16653810,Mon Nov 22 04:31:09 CET,Mon Nov 22 06:13:16 CET,0.0 0.509 0.697 0.854 0.978 1.067 1.181 1.304 1.497 1.584 1.653 1.698 1.837 1.902 2.021 2.134 2.241 2.293 2.402 2.509 2.656 2.749 2.844 2.984 3.118 3.246 3.366 3.48 3.621 3.743 3.864 4.026 4.186 4.337 4.513 4.705 4.888 5.085 5.296 5.521 5.75 6.003 6.277 6.548 6.858 7.134 7.428 7.726 8.001 8.249 8.226 7.732 7.065 6.273 5.455 4.787 4.27 3.74 3.222 2.743 2.352 1.987 1.634 1.295 0.971 0.69 0.385 0.1 -0.132 -0.362 -0.591 -0.79 -1.003 -1.217 -1.387 -1.576 -1.768 -1.963 -2.187 -2.348 -2.509 -2.754 -2.923 -3.102 -3.195 -3.373 -3.546 -3.742 -3.85 -4.055 -4.242 -4.374 -4.503 -4.824 -5.013 -5.247 -5.493 -5.722 -6.037 -6.553 -8.792 -2 ,4155 ,KEBNE ,16653811,Mon Nov 22 04:31:08 CET,Mon Nov 22 06:13:04 CET,0.0 0.496 0.681 0.815 0.917 1.02 1.141 1.244 1.436 1.536 1.628 1.708 1.846 1.903 2.013 2.128 2.231 2.289 2.41 2.514 2.676 2.786 2.881 3.0 3.122 3.262 3.379 3.477 3.605 3.747 3.892 4.048 4.193 4.33 4.491 4.677 4.837 4.997 5.184 5.395 5.632 5.885 6.182 6.492 6.812 7.153 7.531 7.888 8.239 8.526 8.512 8.168 7.648 7.114 6.681 6.255 5.759 5.198 4.707 4.204 3.738 3.295 2.875 2.519 2.198 1.896 1.551 1.248 0.996 0.73 0.444 0.207 -0.027 -0.288 -0.488 -0.686 -0.904 -1.125 -1.356 -1.514 -1.681 -1.946 -2.126 -2.307 -2.402 -2.611 -2.827 -3.048 -3.164 -3.369 -3.537 -3.673 -3.826 -4.181 -4.382 -4.606 -4.83 -5.115 -5.535 -6.042 -8.488 -3 ,19638 ,KEBNE ,16653812,Mon Nov 22 04:31:08 CET,Mon Nov 22 06:13:26 CET,0.0 0.442 0.628 0.746 0.873 0.981 1.082 1.184 1.392 1.482 1.572 1.682 1.826 1.88 1.997 2.115 2.248 2.316 2.437 2.553 2.7 2.795 2.897 3.047 3.178 3.303 3.433 3.553 3.702 3.861 4.002 4.151 4.311 4.475 4.646 4.811 4.971 5.158 5.36 5.577 5.788 6.027 6.308 6.548 6.802 7.062 7.314 7.59 7.863 8.069 8.085 7.627 7.04 6.441 5.849 5.214 4.582 4.014 3.522 3.062 2.635 2.228 1.868 1.546 1.237 0.952 0.664 0.406 0.165 -0.096 -0.37 -0.61 -0.862 -1.1 -1.279 -1.473 -1.665 -1.875 -2.096 -2.248 -2.404 -2.64 -2.816 -3.004 -3.099 -3.293 -3.489 -3.711 -3.831 -4.032 -4.203 -4.337 -4.482 -4.818 -5.04 -5.287 -5.517 -5.791 -6.165 -6.667 -9.066 -4 ,17653 ,KEBNE ,16653814,Mon Nov 22 04:31:08 CET,Mon Nov 22 06:13:14 CET,0.0 0.58 0.776 0.958 1.102 1.223 1.325 1.423 1.602 1.691 1.777 1.87 2.013 2.083 2.216 2.338 2.469 2.529 2.626 2.719 2.855 2.94 3.021 3.146 3.269 3.383 3.498 3.612 3.759 3.9 4.023 4.163 4.313 4.451 4.607 4.788 4.973 5.164 5.352 5.563 5.788 6.014 6.259 6.504 6.803 7.137 7.484 7.802 8.111 8.367 8.397 8.094 7.486 6.762 6.045 5.362 4.783 4.317 3.914 3.454 3.037 2.637 2.226 1.863 1.536 1.229 0.924 0.643 0.406 0.16 -0.105 -0.314 -0.531 -0.77 -0.971 -1.189 -1.421 -1.648 -1.882 -2.037 -2.188 -2.444 -2.634 -2.828 -2.921 -3.123 -3.368 -3.605 -3.713 -3.902 -4.062 -4.195 -4.347 -4.706 -4.893 -5.083 -5.313 -5.612 -5.962 -6.437 -8.322 -5 ,10254 ,KEBNE ,16653815,Mon Nov 22 04:31:08 CET,Mon Nov 22 06:12:53 CET,0.0 0.42 0.563 0.672 0.794 0.902 0.994 1.076 1.24 1.33 1.411 1.471 1.613 1.68 1.805 1.905 1.999 2.049 2.142 2.232 2.37 2.458 2.543 2.677 2.803 2.926 3.037 3.127 3.245 3.367 3.498 3.664 3.829 3.989 4.152 4.316 4.468 4.652 4.858 5.061 5.274 5.504 5.764 6.016 6.299 6.602 6.93 7.263 7.541 7.735 7.788 7.368 6.734 6.009 5.265 4.598 3.995 3.416 2.916 2.422 1.998 1.642 1.298 0.949 0.63 0.342 0.031 -0.252 -0.469 -0.68 -0.913 -1.116 -1.326 -1.54 -1.717 -1.904 -2.086 -2.275 -2.479 -2.629 -2.789 -3.034 -3.198 -3.365 -3.456 -3.656 -3.877 -4.103 -4.219 -4.432 -4.614 -4.757 -4.89 -5.213 -5.417 -5.651 -5.899 -6.177 -6.579 -7.14 -8.944 -6 ,30983 ,KEBNE ,16653816,Mon Nov 22 04:31:09 CET,Mon Nov 22 06:13:32 CET,0.0 0.564 0.824 1.015 1.174 1.31 1.414 1.511 1.703 1.785 1.862 1.948 2.084 2.142 2.257 2.364 2.459 2.51 2.611 2.706 2.833 2.919 3.015 3.147 3.274 3.409 3.529 3.644 3.792 3.94 4.063 4.201 4.343 4.472 4.625 4.789 4.937 5.112 5.324 5.568 5.817 6.059 6.312 6.557 6.853 7.164 7.494 7.82 8.09 8.331 8.339 7.916 7.386 6.793 6.236 5.72 5.235 4.756 4.299 3.829 3.411 3.006 2.598 2.217 1.891 1.607 1.278 0.967 0.709 0.446 0.199 0.003 -0.216 -0.431 -0.608 -0.813 -1.009 -1.219 -1.434 -1.568 -1.713 -1.949 -2.119 -2.31 -2.401 -2.579 -2.767 -2.972 -3.081 -3.272 -3.44 -3.571 -3.715 -4.04 -4.211 -4.397 -4.602 -4.837 -5.107 -5.465 -7.664 -7 ,10412 ,KEBNE ,16653817,Mon Nov 22 04:31:09 CET,Mon Nov 22 06:14:01 CET,0.0 0.62 0.828 0.986 1.116 1.252 1.372 1.476 1.67 1.752 1.843 1.934 2.06 2.12 2.255 2.367 2.45 2.494 2.596 2.701 2.852 2.94 3.023 3.138 3.243 3.364 3.489 3.603 3.745 3.882 4.016 4.164 4.309 4.452 4.618 4.811 4.977 5.146 5.329 5.529 5.736 5.976 6.275 6.544 6.818 7.1 7.414 7.752 8.059 8.34 8.465 8.221 7.599 6.844 6.24 5.589 4.961 4.401 3.961 3.565 3.17 2.798 2.438 2.091 1.77 1.465 1.143 0.847 0.57 0.283 -0.026 -0.287 -0.541 -0.809 -1.018 -1.235 -1.471 -1.722 -1.986 -2.168 -2.343 -2.612 -2.798 -2.992 -3.092 -3.29 -3.502 -3.738 -3.854 -4.041 -4.2 -4.337 -4.499 -4.857 -5.048 -5.244 -5.452 -5.718 -6.047 -6.494 -9.191 -8 ,12834 ,KEBNE ,16653818,Mon Nov 22 04:32:10 CET,Mon Nov 22 06:14:57 CET,0.0 0.431 0.69 0.853 0.95 1.048 1.156 1.251 1.43 1.505 1.58 1.659 1.794 1.864 1.997 2.107 2.205 2.252 2.339 2.426 2.563 2.66 2.747 2.864 2.983 3.108 3.223 3.319 3.444 3.571 3.695 3.845 3.995 4.126 4.262 4.428 4.611 4.808 5.008 5.218 5.454 5.724 5.987 6.242 6.547 6.884 7.239 7.567 7.905 8.211 8.338 8.084 7.642 7.088 6.437 5.853 5.388 4.92 4.512 4.128 3.792 3.48 3.158 2.855 2.55 2.27 1.985 1.709 1.448 1.162 0.861 0.616 0.362 0.103 -0.108 -0.343 -0.586 -0.837 -1.088 -1.269 -1.465 -1.751 -1.94 -2.136 -2.239 -2.455 -2.679 -2.919 -3.043 -3.264 -3.503 -3.667 -3.824 -4.157 -4.364 -4.596 -4.834 -5.119 -5.465 -5.969 -8.27 -9 ,31212 ,KEBNE ,16653819,Mon Nov 22 04:32:11 CET,Mon Nov 22 06:14:06 CET,0.0 0.76 0.975 1.127 1.239 1.35 1.465 1.566 1.727 1.797 1.862 1.904 2.041 2.102 2.203 2.296 2.397 2.455 2.56 2.649 2.79 2.88 2.96 3.078 3.187 3.297 3.395 3.487 3.618 3.748 3.866 3.999 4.125 4.249 4.389 4.548 4.69 4.839 5.011 5.195 5.394 5.598 5.839 6.117 6.435 6.796 7.171 7.532 7.883 8.117 7.954 7.461 6.795 6.08 5.519 5.013 4.537 4.015 3.532 3.082 2.694 2.342 2.008 1.696 1.412 1.158 0.882 0.611 0.353 0.077 -0.202 -0.432 -0.68 -0.917 -1.088 -1.268 -1.459 -1.669 -1.884 -2.02 -2.158 -2.388 -2.59 -2.804 -2.898 -3.088 -3.286 -3.495 -3.606 -3.804 -3.986 -4.133 -4.284 -4.63 -4.828 -5.048 -5.298 -5.578 -5.945 -6.396 -9.021 -10 ,18614 ,KEBNE ,16653820,Mon Nov 22 04:32:11 CET,Mon Nov 22 06:14:30 CET,0.0 0.47 0.623 0.743 0.84 0.922 1.018 1.109 1.264 1.345 1.411 1.456 1.592 1.66 1.802 1.932 2.06 2.12 2.22 2.309 2.444 2.537 2.628 2.772 2.919 3.049 3.165 3.264 3.377 3.484 3.592 3.746 3.908 4.063 4.224 4.379 4.529 4.708 4.897 5.089 5.288 5.556 5.884 6.174 6.492 6.865 7.266 7.645 8.037 8.311 8.239 7.704 7.024 6.394 5.897 5.348 4.802 4.338 3.919 3.473 3.096 2.766 2.432 2.071 1.732 1.434 1.122 0.856 0.63 0.405 0.171 -0.019 -0.214 -0.435 -0.613 -0.791 -0.983 -1.196 -1.417 -1.563 -1.72 -1.982 -2.171 -2.361 -2.455 -2.664 -2.879 -3.099 -3.225 -3.436 -3.603 -3.72 -3.856 -4.177 -4.353 -4.577 -4.867 -5.164 -5.504 -5.949 -7.727 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_42_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_42_45.txt deleted file mode 100644 index 5924b91e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_42_45.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16265 ,KEBNE ,16653821,Mon Nov 22 04:32:10 CET,Mon Nov 22 06:15:43 CET,0.0 0.716 1.055 1.323 1.525 1.746 1.92 2.054 2.318 2.439 2.546 2.665 2.832 2.919 3.094 3.273 3.472 3.571 3.745 3.901 4.127 4.275 4.418 4.628 4.809 4.982 5.171 5.348 5.555 5.755 5.937 6.134 6.338 6.529 6.728 6.965 7.204 7.459 7.753 8.076 8.378 8.705 9.097 9.469 9.859 10.25 10.687 11.178 11.71 12.19 12.447 12.488 12.294 11.908 11.487 11.065 10.648 10.286 9.984 9.632 9.33 9.046 8.776 8.557 8.343 8.13 7.891 7.679 7.497 7.315 7.131 6.972 6.803 6.622 6.493 6.35 6.17 5.985 5.799 5.674 5.56 5.389 5.253 5.104 5.034 4.887 4.737 4.588 4.506 4.348 4.251 4.153 4.035 3.776 3.644 3.488 3.32 3.112 2.863 2.489 0.881 -2 ,20457 ,KEBNE ,16653822,Mon Nov 22 04:33:13 CET,Mon Nov 22 06:15:39 CET,0.0 1.411 1.749 1.979 2.139 2.299 2.442 2.59 2.874 2.982 3.085 3.218 3.385 3.481 3.658 3.827 3.98 4.054 4.205 4.352 4.574 4.718 4.85 5.049 5.241 5.437 5.608 5.75 5.945 6.137 6.325 6.55 6.765 6.984 7.245 7.508 7.741 8.021 8.318 8.623 8.945 9.275 9.627 10.017 10.481 10.962 11.529 12.135 12.707 13.185 13.617 13.654 13.489 13.151 12.67 12.215 11.8 11.433 11.115 10.805 10.507 10.236 10.016 9.794 9.574 9.382 9.166 8.954 8.78 8.597 8.399 8.241 8.073 7.887 7.751 7.612 7.461 7.305 7.144 7.033 6.916 6.729 6.606 6.471 6.394 6.235 6.081 5.927 5.842 5.678 5.553 5.447 5.331 5.055 4.902 4.744 4.577 4.374 4.089 3.733 1.914 -3 ,13443 ,KEBNE ,16653823,Mon Nov 22 04:33:12 CET,Mon Nov 22 06:17:14 CET,0.0 0.72 0.966 1.158 1.348 1.522 1.673 1.821 2.098 2.219 2.331 2.504 2.7 2.807 3.019 3.214 3.379 3.455 3.607 3.758 3.975 4.126 4.269 4.462 4.633 4.804 4.977 5.141 5.354 5.562 5.752 5.963 6.173 6.402 6.671 6.941 7.199 7.501 7.827 8.182 8.54 8.89 9.299 9.727 10.146 10.523 10.874 11.258 11.768 12.255 12.513 12.258 11.748 11.224 10.736 10.25 9.815 9.425 9.078 8.736 8.428 8.135 7.851 7.572 7.313 7.079 6.846 6.632 6.433 6.22 6.002 5.823 5.624 5.401 5.23 5.058 4.888 4.692 4.482 4.35 4.217 4.011 3.868 3.713 3.63 3.454 3.266 3.073 2.974 2.797 2.651 2.534 2.412 2.12 1.961 1.804 1.635 1.44 1.191 0.832 -0.851 -4 ,22789 ,KEBNE ,16653824,Mon Nov 22 04:33:13 CET,Mon Nov 22 06:16:38 CET,0.0 0.658 0.936 1.116 1.283 1.474 1.635 1.763 1.994 2.107 2.21 2.327 2.51 2.613 2.829 3.028 3.205 3.291 3.447 3.584 3.774 3.921 4.069 4.257 4.422 4.571 4.719 4.866 5.063 5.252 5.435 5.648 5.849 6.054 6.288 6.539 6.773 7.054 7.369 7.686 8.02 8.382 8.811 9.243 9.725 10.238 10.815 11.42 12.046 12.59 12.867 12.717 12.287 11.805 11.383 10.976 10.58 10.19 9.818 9.433 9.095 8.817 8.578 8.354 8.144 7.933 7.721 7.534 7.351 7.135 6.904 6.721 6.527 6.341 6.207 6.061 5.919 5.777 5.619 5.5 5.368 5.161 5.031 4.902 4.834 4.687 4.514 4.324 4.222 4.043 3.89 3.778 3.678 3.448 3.308 3.144 2.94 2.687 2.392 2.018 0.706 -5 ,15560 ,KEBNE ,16653825,Mon Nov 22 04:34:15 CET,Mon Nov 22 06:17:18 CET,0.0 0.955 1.339 1.632 1.863 2.055 2.227 2.376 2.622 2.731 2.841 3.026 3.227 3.326 3.508 3.698 3.887 3.965 4.114 4.266 4.431 4.521 4.632 4.821 5.022 5.211 5.357 5.492 5.675 5.823 5.969 6.158 6.362 6.564 6.77 7.007 7.244 7.489 7.708 7.919 8.148 8.402 8.691 8.984 9.317 9.645 9.966 10.299 10.631 10.909 11.029 10.626 10.086 9.514 8.969 8.478 8.024 7.583 7.193 6.823 6.463 6.101 5.77 5.48 5.211 4.953 4.682 4.443 4.239 4.016 3.785 3.594 3.387 3.178 3.013 2.847 2.684 2.522 2.358 2.233 2.102 1.897 1.741 1.58 1.491 1.302 1.124 0.914 0.799 0.606 0.449 0.343 0.23 -0.016 -0.151 -0.323 -0.507 -0.71 -0.954 -1.286 -2.657 -6 ,15476 ,KEBNE ,16653826,Mon Nov 22 04:34:15 CET,Mon Nov 22 06:17:34 CET,0.0 1.068 1.418 1.658 1.805 1.974 2.153 2.317 2.619 2.757 2.892 3.053 3.221 3.3 3.462 3.636 3.809 3.893 4.039 4.177 4.397 4.531 4.653 4.828 4.995 5.156 5.313 5.469 5.668 5.881 6.096 6.328 6.562 6.806 7.072 7.354 7.619 7.913 8.245 8.586 8.906 9.242 9.639 10.039 10.447 10.864 11.371 11.888 12.364 12.842 13.151 13.011 12.685 12.286 11.871 11.421 11.009 10.658 10.33 9.978 9.675 9.432 9.187 8.92 8.702 8.502 8.273 8.074 7.912 7.748 7.583 7.439 7.269 7.091 6.95 6.795 6.641 6.489 6.324 6.2 6.076 5.887 5.73 5.569 5.497 5.343 5.171 4.974 4.867 4.681 4.53 4.418 4.287 3.973 3.807 3.639 3.444 3.19 2.899 2.466 0.761 -7 ,110 ,KEBNE ,16653827,Mon Nov 22 04:34:15 CET,Mon Nov 22 06:17:41 CET,0.0 0.745 1.066 1.308 1.501 1.645 1.797 1.939 2.181 2.286 2.378 2.474 2.638 2.743 2.943 3.146 3.337 3.422 3.586 3.731 3.934 4.058 4.173 4.345 4.511 4.682 4.858 5.029 5.252 5.468 5.674 5.908 6.115 6.306 6.55 6.86 7.138 7.417 7.717 8.011 8.293 8.618 9.008 9.383 9.795 10.214 10.73 11.334 11.854 12.318 12.621 12.543 12.267 11.973 11.709 11.377 10.988 10.577 10.213 9.861 9.562 9.271 8.983 8.714 8.445 8.193 7.932 7.701 7.51 7.319 7.114 6.934 6.75 6.553 6.391 6.228 6.068 5.898 5.715 5.598 5.485 5.298 5.159 5.013 4.935 4.745 4.547 4.351 4.244 4.054 3.911 3.791 3.649 3.329 3.168 2.998 2.811 2.601 2.344 1.984 0.237 -8 ,628 ,KEBNE ,16653828,Mon Nov 22 04:35:16 CET,Mon Nov 22 06:18:08 CET,0.0 0.641 0.864 1.037 1.219 1.4 1.567 1.731 2.033 2.171 2.316 2.508 2.677 2.778 2.991 3.173 3.342 3.429 3.607 3.779 4.014 4.153 4.277 4.47 4.668 4.862 5.036 5.2 5.42 5.629 5.831 6.067 6.297 6.524 6.774 7.041 7.282 7.562 7.884 8.214 8.56 8.939 9.393 9.825 10.311 10.819 11.342 11.914 12.484 12.922 13.127 12.997 12.591 12.136 11.7 11.263 10.901 10.576 10.295 10.014 9.75 9.492 9.252 9.039 8.821 8.604 8.384 8.198 8.029 7.832 7.627 7.451 7.257 7.057 6.915 6.775 6.623 6.461 6.292 6.175 6.059 5.873 5.735 5.592 5.517 5.356 5.18 5.01 4.921 4.747 4.621 4.515 4.401 4.169 4.035 3.884 3.712 3.517 3.305 3.006 1.58 -9 ,4493 ,KEBNE ,16653829,Mon Nov 22 04:36:19 CET,Mon Nov 22 06:20:15 CET,0.0 0.894 1.17 1.404 1.621 1.811 1.959 2.11 2.383 2.501 2.611 2.731 2.9 2.993 3.188 3.377 3.55 3.644 3.82 3.984 4.234 4.377 4.506 4.695 4.877 5.05 5.217 5.379 5.581 5.784 5.972 6.19 6.416 6.623 6.871 7.184 7.465 7.753 8.076 8.429 8.768 9.111 9.457 9.76 10.104 10.472 10.914 11.418 11.933 12.396 12.676 12.544 12.087 11.579 11.212 10.904 10.572 10.206 9.865 9.464 9.112 8.837 8.598 8.373 8.144 7.938 7.73 7.549 7.392 7.216 7.023 6.865 6.682 6.482 6.327 6.17 6.01 5.839 5.669 5.555 5.44 5.26 5.115 4.941 4.852 4.675 4.492 4.309 4.211 4.042 3.913 3.779 3.642 3.361 3.211 3.037 2.837 2.577 2.247 1.803 0.464 -10 ,11863 ,KEBNE ,16653830,Mon Nov 22 04:36:19 CET,Mon Nov 22 06:20:22 CET,0.0 1.498 1.887 2.138 2.352 2.548 2.73 2.883 3.19 3.344 3.487 3.674 3.863 3.959 4.132 4.309 4.499 4.594 4.773 4.932 5.149 5.305 5.453 5.641 5.827 5.994 6.149 6.308 6.511 6.72 6.928 7.167 7.395 7.636 7.939 8.27 8.563 8.869 9.212 9.563 9.934 10.342 10.744 11.128 11.588 12.142 12.792 13.477 14.124 14.668 15.004 14.828 14.39 13.938 13.538 13.136 12.756 12.396 12.05 11.663 11.325 11.031 10.766 10.498 10.228 9.985 9.735 9.512 9.312 9.1 8.885 8.71 8.53 8.356 8.22 8.063 7.903 7.757 7.606 7.492 7.368 7.181 7.049 6.898 6.816 6.622 6.426 6.237 6.136 5.978 5.867 5.75 5.628 5.392 5.238 5.052 4.87 4.632 4.293 3.91 2.482 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_43_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_43_42.txt deleted file mode 100644 index 380bf6c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_43_42.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17377 ,KEBNE ,16653831,Mon Nov 22 04:36:19 CET,Mon Nov 22 06:18:02 CET,0.0 0.985 1.259 1.433 1.573 1.706 1.831 1.946 2.148 2.242 2.338 2.439 2.579 2.655 2.809 2.949 3.073 3.132 3.247 3.352 3.494 3.582 3.665 3.787 3.907 4.024 4.144 4.265 4.415 4.552 4.681 4.827 4.976 5.123 5.264 5.415 5.565 5.729 5.902 6.072 6.238 6.431 6.641 6.842 7.081 7.355 7.59 7.767 7.932 7.989 7.778 7.2 6.565 5.971 5.455 5.025 4.644 4.286 3.972 3.645 3.352 3.077 2.794 2.503 2.245 2.02 1.765 1.531 1.323 1.102 0.887 0.724 0.549 0.361 0.217 0.056 -0.119 -0.3 -0.474 -0.593 -0.717 -0.892 -1.012 -1.145 -1.206 -1.32 -1.446 -1.599 -1.675 -1.838 -1.943 -2.039 -2.143 -2.36 -2.469 -2.601 -2.742 -2.896 -3.086 -3.355 -4.091 -2 ,11279 ,KEBNE ,16653832,Mon Nov 22 04:36:19 CET,Mon Nov 22 06:19:36 CET,0.0 0.996 1.262 1.444 1.584 1.71 1.829 1.942 2.137 2.224 2.316 2.422 2.562 2.636 2.78 2.897 3.01 3.069 3.182 3.284 3.431 3.521 3.615 3.755 3.877 3.997 4.118 4.233 4.365 4.497 4.626 4.773 4.917 5.048 5.195 5.367 5.517 5.681 5.859 6.034 6.219 6.422 6.647 6.858 7.09 7.331 7.552 7.694 7.838 7.997 7.854 7.413 6.97 6.467 5.959 5.499 5.115 4.733 4.391 4.076 3.806 3.57 3.319 3.066 2.848 2.666 2.477 2.305 2.157 1.996 1.815 1.655 1.491 1.299 1.158 1.042 0.925 0.801 0.677 0.587 0.486 0.327 0.22 0.115 0.053 -0.084 -0.23 -0.389 -0.464 -0.61 -0.712 -0.802 -0.899 -1.132 -1.276 -1.443 -1.623 -1.83 -2.102 -2.444 -3.512 -3 ,29186 ,KEBNE ,16653833,Mon Nov 22 04:36:19 CET,Mon Nov 22 06:19:52 CET,0.0 0.662 0.875 1.058 1.21 1.327 1.429 1.524 1.71 1.806 1.891 1.971 2.111 2.18 2.312 2.434 2.558 2.613 2.705 2.807 2.968 3.067 3.151 3.272 3.395 3.514 3.628 3.728 3.851 3.982 4.11 4.253 4.386 4.516 4.671 4.85 5.019 5.181 5.344 5.497 5.65 5.853 6.109 6.346 6.613 6.903 7.183 7.42 7.625 7.718 7.467 6.952 6.389 5.812 5.315 4.84 4.398 4.015 3.687 3.348 3.062 2.814 2.578 2.349 2.115 1.902 1.683 1.485 1.32 1.152 0.974 0.814 0.643 0.469 0.332 0.191 0.051 -0.095 -0.239 -0.334 -0.436 -0.609 -0.728 -0.848 -0.91 -1.034 -1.169 -1.328 -1.414 -1.58 -1.685 -1.794 -1.92 -2.182 -2.33 -2.515 -2.695 -2.867 -3.098 -3.4 -4.342 -4 ,8785 ,KEBNE ,16653834,Mon Nov 22 04:36:19 CET,Mon Nov 22 06:19:29 CET,0.0 1.011 1.252 1.445 1.611 1.75 1.877 1.996 2.191 2.282 2.372 2.461 2.6 2.678 2.82 2.961 3.104 3.166 3.283 3.387 3.544 3.648 3.736 3.855 3.975 4.099 4.222 4.334 4.461 4.591 4.717 4.864 5.006 5.138 5.296 5.463 5.6 5.734 5.895 6.077 6.251 6.435 6.66 6.921 7.204 7.471 7.756 8.003 8.193 8.282 8.147 7.722 7.25 6.819 6.394 5.942 5.492 5.071 4.685 4.296 3.988 3.719 3.459 3.204 2.958 2.758 2.57 2.381 2.205 2.025 1.842 1.689 1.526 1.371 1.249 1.102 0.955 0.81 0.66 0.554 0.444 0.274 0.15 0.007 -0.072 -0.238 -0.399 -0.55 -0.631 -0.804 -0.91 -0.996 -1.082 -1.306 -1.441 -1.575 -1.732 -1.926 -2.175 -2.531 -3.267 -6 ,26542 ,KEBNE ,16653836,Mon Nov 22 04:38:23 CET,Mon Nov 22 06:20:16 CET,0.0 0.975 1.264 1.473 1.654 1.799 1.929 2.051 2.242 2.327 2.411 2.51 2.651 2.722 2.869 3.011 3.137 3.196 3.304 3.421 3.597 3.689 3.777 3.907 4.028 4.155 4.278 4.404 4.562 4.693 4.819 4.975 5.113 5.254 5.435 5.63 5.802 5.98 6.179 6.385 6.587 6.788 7.006 7.209 7.421 7.666 7.919 8.123 8.245 8.18 7.827 7.281 6.711 6.137 5.645 5.192 4.797 4.436 4.078 3.74 3.486 3.239 2.982 2.758 2.551 2.366 2.183 2.01 1.855 1.694 1.522 1.367 1.202 1.044 0.933 0.811 0.657 0.473 0.278 0.14 -0.001 -0.208 -0.358 -0.525 -0.6 -0.732 -0.873 -1.018 -1.095 -1.248 -1.328 -1.416 -1.51 -1.702 -1.827 -1.96 -2.103 -2.285 -2.531 -2.863 -3.841 -7 ,30256 ,KEBNE ,16653837,Mon Nov 22 04:38:23 CET,Mon Nov 22 06:21:54 CET,0.0 0.912 1.2 1.389 1.53 1.648 1.767 1.885 2.086 2.181 2.274 2.364 2.506 2.588 2.722 2.825 2.928 2.986 3.104 3.211 3.356 3.451 3.54 3.675 3.807 3.926 4.039 4.146 4.29 4.433 4.561 4.707 4.843 4.981 5.14 5.298 5.44 5.593 5.776 5.978 6.173 6.388 6.632 6.812 7.039 7.317 7.542 7.757 7.942 7.996 7.892 7.57 7.16 6.728 6.309 5.925 5.564 5.207 4.888 4.571 4.326 4.108 3.877 3.648 3.441 3.256 3.05 2.867 2.708 2.539 2.37 2.232 2.086 1.938 1.828 1.719 1.598 1.473 1.346 1.255 1.157 0.987 0.863 0.734 0.668 0.53 0.384 0.244 0.171 0.019 -0.1 -0.209 -0.327 -0.544 -0.651 -0.76 -0.883 -1.019 -1.179 -1.413 -2.103 -8 ,5616 ,KEBNE ,16653838,Mon Nov 22 04:39:25 CET,Mon Nov 22 06:21:19 CET,0.0 0.846 1.121 1.31 1.448 1.577 1.705 1.821 2.009 2.099 2.19 2.279 2.416 2.485 2.627 2.765 2.894 2.948 3.049 3.149 3.279 3.37 3.467 3.592 3.702 3.814 3.925 4.024 4.141 4.262 4.384 4.525 4.663 4.802 4.965 5.149 5.325 5.516 5.704 5.9 6.112 6.313 6.514 6.683 6.844 7.026 7.223 7.433 7.637 7.693 7.433 6.928 6.306 5.706 5.255 4.818 4.364 3.946 3.619 3.293 3.001 2.734 2.473 2.238 2.018 1.814 1.604 1.418 1.253 1.072 0.887 0.727 0.541 0.348 0.208 0.067 -0.068 -0.204 -0.359 -0.464 -0.567 -0.723 -0.835 -0.963 -1.039 -1.215 -1.404 -1.592 -1.671 -1.824 -1.933 -2.029 -2.142 -2.384 -2.509 -2.651 -2.819 -3.053 -3.344 -3.648 -4.36 -9 ,2058 ,KEBNE ,16653839,Mon Nov 22 04:39:25 CET,Mon Nov 22 06:21:14 CET,0.0 0.98 1.242 1.417 1.552 1.687 1.815 1.926 2.122 2.205 2.293 2.398 2.532 2.604 2.743 2.882 3.016 3.08 3.202 3.316 3.479 3.578 3.675 3.816 3.947 4.069 4.19 4.306 4.461 4.62 4.762 4.901 5.035 5.188 5.351 5.511 5.683 5.88 6.073 6.258 6.45 6.658 6.9 7.123 7.33 7.544 7.793 7.994 8.155 8.298 8.137 7.623 7.118 6.594 6.108 5.657 5.278 4.94 4.622 4.28 3.99 3.75 3.504 3.262 3.042 2.832 2.614 2.423 2.259 2.092 1.914 1.763 1.609 1.442 1.312 1.171 1.024 0.872 0.71 0.608 0.503 0.338 0.222 0.09 0.023 -0.11 -0.246 -0.396 -0.476 -0.628 -0.74 -0.842 -0.939 -1.145 -1.26 -1.404 -1.557 -1.722 -1.914 -2.148 -3.223 -10 ,31324 ,KEBNE ,16653840,Mon Nov 22 04:40:27 CET,Mon Nov 22 06:22:48 CET,0.0 1.247 1.59 1.798 1.945 2.074 2.178 2.276 2.483 2.58 2.675 2.787 2.926 2.998 3.136 3.268 3.396 3.454 3.563 3.664 3.802 3.894 3.983 4.108 4.234 4.356 4.472 4.584 4.728 4.876 5.016 5.166 5.325 5.48 5.637 5.799 5.941 6.113 6.309 6.494 6.675 6.899 7.161 7.4 7.647 7.884 8.139 8.406 8.672 8.864 8.756 8.34 7.925 7.511 7.062 6.622 6.243 5.914 5.64 5.339 5.064 4.82 4.583 4.357 4.165 3.978 3.773 3.603 3.447 3.292 3.123 2.973 2.829 2.691 2.58 2.464 2.35 2.235 2.114 2.027 1.928 1.765 1.661 1.556 1.5 1.369 1.226 1.085 1.009 0.857 0.761 0.674 0.568 0.348 0.228 0.089 -0.068 -0.252 -0.473 -0.827 -2.29 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_43_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_43_44.txt deleted file mode 100644 index 5b522973..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_43_44.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,9229 ,KEBNE ,17042169,Thu Dec 23 03:58:00 CET,Thu Dec 23 05:37:56 CET,0.0 0.53 0.742 0.936 1.087 1.203 1.317 1.417 1.599 1.698 1.787 1.85 1.967 2.014 2.12 2.241 2.359 2.408 2.49 2.57 2.687 2.766 2.843 2.964 3.071 3.16 3.245 3.331 3.435 3.541 3.65 3.769 3.884 3.99 4.116 4.265 4.393 4.513 4.641 4.774 4.904 5.049 5.228 5.407 5.585 5.779 5.959 6.053 6.083 6.045 5.859 5.281 4.558 3.771 2.98 2.287 1.656 1.059 0.557 0.065 -0.379 -0.789 -1.174 -1.522 -1.856 -2.169 -2.475 -2.743 -2.974 -3.212 -3.439 -3.612 -3.801 -4.019 -4.192 -4.365 -4.554 -4.764 -4.976 -5.12 -5.272 -5.517 -5.686 -5.852 -5.932 -6.096 -6.273 -6.461 -6.559 -6.74 -6.891 -7.018 -7.154 -7.435 -7.596 -7.783 -8.015 -8.281 -8.603 -9.069 -10.901 -3 ,6436 ,KEBNE ,17042170,Thu Dec 23 03:58:00 CET,Thu Dec 23 05:38:09 CET,0.0 0.494 0.64 0.747 0.857 0.96 1.05 1.124 1.261 1.337 1.403 1.462 1.594 1.644 1.738 1.828 1.919 1.966 2.057 2.137 2.256 2.335 2.403 2.497 2.584 2.686 2.795 2.881 2.997 3.115 3.22 3.338 3.455 3.571 3.696 3.84 3.974 4.121 4.275 4.422 4.564 4.738 4.951 5.129 5.317 5.52 5.72 5.876 5.951 5.897 5.437 4.648 3.923 3.232 2.593 1.992 1.402 0.817 0.303 -0.227 -0.627 -0.974 -1.332 -1.668 -1.995 -2.291 -2.613 -2.9 -3.133 -3.382 -3.659 -3.887 -4.137 -4.394 -4.582 -4.771 -4.965 -5.181 -5.421 -5.577 -5.724 -5.966 -6.139 -6.319 -6.408 -6.58 -6.767 -6.975 -7.098 -7.313 -7.514 -7.662 -7.805 -8.135 -8.318 -8.499 -8.748 -9.08 -9.414 -9.783 -11.363 -4 ,15126 ,KEBNE ,17042172,Thu Dec 23 03:58:00 CET,Thu Dec 23 05:38:27 CET,0.0 0.418 0.636 0.786 0.909 1.026 1.148 1.274 1.505 1.605 1.683 1.748 1.876 1.934 2.036 2.138 2.243 2.298 2.405 2.503 2.643 2.724 2.806 2.929 3.04 3.157 3.265 3.36 3.479 3.592 3.7 3.822 3.937 4.052 4.181 4.319 4.461 4.614 4.76 4.919 5.102 5.28 5.449 5.62 5.791 5.959 6.153 6.303 6.378 6.288 5.645 4.452 3.36 2.473 1.756 1.113 0.489 -0.082 -0.539 -1.007 -1.442 -1.828 -2.183 -2.528 -2.865 -3.164 -3.453 -3.707 -3.93 -4.17 -4.436 -4.652 -4.865 -5.087 -5.259 -5.44 -5.641 -5.859 -6.061 -6.201 -6.368 -6.607 -6.755 -6.911 -6.993 -7.172 -7.365 -7.548 -7.638 -7.809 -7.95 -8.077 -8.208 -8.481 -8.648 -8.826 -9.029 -9.296 -9.583 -9.933 -11.522 -5 ,2494 ,KEBNE ,17042173,Thu Dec 23 03:58:00 CET,Thu Dec 23 05:38:02 CET,0.0 0.542 0.792 0.983 1.101 1.173 1.245 1.319 1.443 1.511 1.58 1.614 1.736 1.786 1.888 1.985 2.071 2.111 2.195 2.279 2.406 2.487 2.562 2.664 2.754 2.854 2.961 3.052 3.168 3.295 3.409 3.537 3.656 3.763 3.876 3.997 4.125 4.28 4.443 4.605 4.765 4.935 5.142 5.327 5.498 5.684 5.868 6.019 6.164 6.191 5.874 5.278 4.696 4.053 3.331 2.677 2.14 1.628 1.162 0.662 0.218 -0.173 -0.538 -0.867 -1.166 -1.453 -1.762 -2.032 -2.247 -2.479 -2.73 -2.938 -3.17 -3.418 -3.607 -3.798 -3.992 -4.186 -4.399 -4.548 -4.715 -5.012 -5.206 -5.387 -5.487 -5.683 -5.878 -6.084 -6.188 -6.382 -6.528 -6.645 -6.775 -7.083 -7.261 -7.458 -7.667 -7.894 -8.207 -8.687 -10.335 -6 ,16768 ,KEBNE ,17042175,Thu Dec 23 03:58:00 CET,Thu Dec 23 05:37:52 CET,0.0 0.521 0.722 0.858 0.976 1.093 1.196 1.285 1.46 1.536 1.611 1.686 1.815 1.881 1.989 2.08 2.161 2.206 2.305 2.403 2.541 2.629 2.717 2.843 2.953 3.052 3.151 3.252 3.389 3.516 3.629 3.759 3.877 3.991 4.132 4.304 4.454 4.598 4.745 4.902 5.066 5.217 5.392 5.575 5.752 5.923 6.084 6.222 6.358 6.426 6.204 5.215 4.17 3.441 2.814 2.247 1.735 1.242 0.769 0.316 -0.044 -0.42 -0.827 -1.212 -1.525 -1.794 -2.121 -2.421 -2.665 -2.918 -3.171 -3.363 -3.569 -3.807 -3.986 -4.167 -4.36 -4.561 -4.783 -4.943 -5.099 -5.344 -5.52 -5.705 -5.797 -5.974 -6.169 -6.398 -6.517 -6.719 -6.891 -7.02 -7.179 -7.566 -7.761 -7.938 -8.105 -8.353 -8.659 -9.08 -11.421 -7 ,32048 ,KEBNE ,17042176,Thu Dec 23 04:00:06 CET,Thu Dec 23 05:39:58 CET,0.0 0.286 0.451 0.607 0.729 0.815 0.895 0.978 1.135 1.209 1.28 1.334 1.464 1.534 1.664 1.786 1.892 1.94 2.034 2.117 2.253 2.337 2.406 2.509 2.614 2.718 2.818 2.917 3.047 3.169 3.275 3.393 3.508 3.611 3.728 3.86 3.995 4.15 4.293 4.433 4.596 4.792 5.013 5.223 5.456 5.677 5.903 6.086 6.159 6.057 5.714 5.051 4.288 3.449 2.649 1.938 1.315 0.763 0.255 -0.267 -0.723 -1.119 -1.48 -1.827 -2.157 -2.459 -2.778 -3.046 -3.273 -3.517 -3.787 -4.018 -4.265 -4.524 -4.698 -4.874 -5.062 -5.256 -5.454 -5.597 -5.751 -5.975 -6.13 -6.305 -6.399 -6.617 -6.84 -7.083 -7.223 -7.447 -7.654 -7.792 -7.949 -8.311 -8.487 -8.667 -8.891 -9.14 -9.409 -9.856 -12.026 -8 ,5966 ,KEBNE ,17042178,Thu Dec 23 04:00:05 CET,Thu Dec 23 05:40:25 CET,0.0 0.458 0.703 0.872 1.017 1.155 1.252 1.336 1.509 1.59 1.676 1.762 1.882 1.936 2.052 2.171 2.283 2.329 2.413 2.496 2.62 2.713 2.81 2.934 3.046 3.153 3.265 3.371 3.487 3.598 3.71 3.843 3.961 4.073 4.197 4.331 4.455 4.59 4.739 4.905 5.076 5.256 5.471 5.687 5.919 6.15 6.378 6.556 6.72 6.813 6.406 5.517 4.661 3.845 3.212 2.717 2.215 1.712 1.225 0.682 0.226 -0.171 -0.551 -0.902 -1.231 -1.543 -1.843 -2.109 -2.358 -2.625 -2.924 -3.153 -3.381 -3.658 -3.873 -4.075 -4.276 -4.476 -4.692 -4.845 -5.001 -5.253 -5.437 -5.628 -5.719 -5.899 -6.097 -6.327 -6.449 -6.651 -6.824 -6.959 -7.102 -7.429 -7.63 -7.839 -8.079 -8.364 -8.713 -9.211 -11.479 -9 ,7507 ,KEBNE ,17042179,Thu Dec 23 04:00:06 CET,Thu Dec 23 05:40:44 CET,0.0 0.408 0.641 0.843 1.011 1.136 1.24 1.33 1.481 1.551 1.629 1.718 1.835 1.882 1.983 2.094 2.189 2.229 2.323 2.417 2.55 2.647 2.739 2.853 2.952 3.051 3.154 3.246 3.359 3.477 3.577 3.683 3.796 3.903 4.013 4.137 4.253 4.379 4.526 4.688 4.843 5.001 5.185 5.361 5.554 5.753 5.937 6.042 6.053 5.891 5.217 4.044 2.995 2.046 1.234 0.627 0.1 -0.46 -0.973 -1.492 -1.962 -2.386 -2.794 -3.199 -3.57 -3.887 -4.192 -4.461 -4.707 -4.979 -5.256 -5.469 -5.685 -5.905 -6.081 -6.293 -6.518 -6.73 -6.936 -7.07 -7.223 -7.486 -7.652 -7.803 -7.885 -8.069 -8.272 -8.476 -8.578 -8.762 -8.897 -9.023 -9.162 -9.46 -9.626 -9.809 -10.043 -10.337 -10.636 -11.082 -13.439 -10 ,22522 ,KEBNE ,17042181,Thu Dec 23 04:00:06 CET,Thu Dec 23 05:41:48 CET,0.0 0.433 0.592 0.706 0.812 0.901 0.988 1.076 1.231 1.294 1.351 1.399 1.524 1.583 1.687 1.793 1.899 1.942 2.026 2.108 2.221 2.292 2.359 2.465 2.573 2.671 2.759 2.84 2.937 3.032 3.128 3.247 3.36 3.467 3.593 3.735 3.858 3.977 4.121 4.274 4.42 4.573 4.733 4.897 5.082 5.262 5.456 5.656 5.81 5.851 5.583 4.933 4.172 3.501 2.914 2.328 1.74 1.163 0.683 0.186 -0.22 -0.554 -0.887 -1.235 -1.599 -1.938 -2.287 -2.615 -2.899 -3.18 -3.46 -3.688 -3.928 -4.174 -4.37 -4.562 -4.757 -4.98 -5.22 -5.383 -5.556 -5.819 -6.014 -6.228 -6.329 -6.522 -6.72 -6.931 -7.054 -7.277 -7.485 -7.633 -7.783 -8.112 -8.288 -8.49 -8.708 -8.941 -9.217 -9.643 -11.974 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_44_18.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_44_18.txt deleted file mode 100644 index 0b09513e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_44_18.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,1336 ,KEBNE ,16653842,Mon Nov 22 04:41:29 CET,Mon Nov 22 06:21:08 CET,0.0 0.211 0.312 0.416 0.5 0.564 0.643 0.734 0.875 0.93 0.982 0.998 1.141 1.194 1.291 1.382 1.49 1.546 1.656 1.773 1.94 2.045 2.145 2.288 2.429 2.551 2.657 2.762 2.895 3.034 3.177 3.356 3.525 3.694 3.901 4.137 4.375 4.635 4.896 5.168 5.449 5.744 6.097 6.421 6.752 7.178 7.702 8.19 8.558 8.841 8.94 8.609 8.209 7.799 7.395 7.033 6.718 6.404 6.131 5.87 5.638 5.4 5.164 4.959 4.757 4.571 4.386 4.21 4.037 3.835 3.628 3.477 3.312 3.148 3.033 2.901 2.776 2.645 2.495 2.389 2.274 2.088 1.954 1.825 1.763 1.621 1.476 1.332 1.25 1.082 1.004 0.927 0.832 0.538 0.36 0.187 -0.002 -0.222 -0.465 -0.771 -1.932 -3 ,15667 ,KEBNE ,16653843,Mon Nov 22 04:41:30 CET,Mon Nov 22 06:21:56 CET,0.0 0.326 0.452 0.508 0.571 0.658 0.759 0.834 0.951 1.012 1.072 1.105 1.25 1.302 1.388 1.496 1.599 1.639 1.73 1.819 1.94 2.023 2.112 2.232 2.338 2.444 2.547 2.645 2.779 2.92 3.057 3.22 3.388 3.56 3.741 3.934 4.132 4.352 4.595 4.853 5.096 5.355 5.675 5.977 6.286 6.623 7.011 7.456 7.909 8.263 8.418 8.348 8.205 7.914 7.536 7.17 6.852 6.568 6.295 6.005 5.733 5.474 5.236 5.006 4.797 4.61 4.42 4.245 4.101 3.939 3.734 3.571 3.408 3.229 3.081 2.936 2.813 2.691 2.556 2.447 2.327 2.124 1.966 1.821 1.758 1.623 1.489 1.347 1.262 1.103 1.01 0.915 0.809 0.552 0.398 0.244 0.056 -0.199 -0.456 -0.715 -1.503 -4 ,21329 ,KEBNE ,16653844,Mon Nov 22 04:41:34 CET,Mon Nov 22 06:15:38 CET,0.0 0.089 0.173 0.259 0.335 0.403 0.466 0.534 0.685 0.761 0.835 0.89 1.037 1.091 1.191 1.299 1.412 1.468 1.568 1.654 1.787 1.879 1.966 2.082 2.194 2.312 2.43 2.544 2.696 2.837 2.972 3.134 3.309 3.48 3.666 3.874 4.076 4.302 4.547 4.819 5.12 5.412 5.681 5.932 6.271 6.695 7.181 7.701 8.237 8.806 9.252 9.255 8.984 8.65 8.326 8.0 7.711 7.4 7.137 6.888 6.641 6.43 6.241 6.045 5.858 5.704 5.552 5.408 5.273 5.115 4.958 4.833 4.695 4.558 4.43 4.293 4.163 4.023 3.88 3.773 3.646 3.453 3.34 3.224 3.159 3.027 2.887 2.731 2.649 2.492 2.412 2.31 2.19 1.89 1.701 1.511 1.294 1.032 0.64 0.146 -0.669 -5 ,6599 ,KEBNE ,16653845,Mon Nov 22 04:42:31 CET,Mon Nov 22 06:22:59 CET,0.0 0.171 0.262 0.356 0.443 0.516 0.586 0.663 0.816 0.879 0.938 0.979 1.113 1.166 1.273 1.369 1.46 1.51 1.613 1.708 1.838 1.92 2.0 2.109 2.21 2.308 2.408 2.508 2.637 2.749 2.851 2.993 3.14 3.275 3.43 3.606 3.764 3.938 4.136 4.334 4.526 4.743 5.003 5.276 5.601 5.922 6.253 6.581 6.889 7.297 7.728 7.768 7.503 7.155 6.8 6.427 6.076 5.706 5.389 5.092 4.807 4.554 4.324 4.095 3.865 3.639 3.403 3.198 3.029 2.858 2.665 2.506 2.348 2.181 2.047 1.905 1.766 1.635 1.497 1.387 1.269 1.109 0.986 0.859 0.794 0.641 0.485 0.323 0.242 0.073 -0.035 -0.134 -0.236 -0.457 -0.583 -0.714 -0.862 -1.025 -1.266 -1.559 -1.965 -6 ,23193 ,KEBNE ,16653846,Mon Nov 22 04:42:32 CET,Mon Nov 22 06:23:13 CET,0.0 0.414 0.587 0.705 0.787 0.858 0.935 1.014 1.155 1.22 1.278 1.31 1.459 1.521 1.633 1.739 1.833 1.883 1.987 2.083 2.219 2.3 2.381 2.499 2.605 2.71 2.822 2.936 3.081 3.226 3.371 3.545 3.705 3.85 4.016 4.212 4.399 4.619 4.868 5.133 5.395 5.687 6.053 6.394 6.787 7.245 7.767 8.35 9.051 9.787 10.344 10.572 10.657 10.581 10.299 9.909 9.553 9.222 8.944 8.665 8.408 8.175 7.952 7.706 7.469 7.25 7.008 6.79 6.605 6.41 6.204 6.03 5.842 5.633 5.458 5.276 5.098 4.907 4.68 4.526 4.38 4.155 3.999 3.831 3.744 3.557 3.356 3.16 3.057 2.871 2.694 2.562 2.426 2.148 1.997 1.817 1.615 1.402 1.162 0.831 -0.16 -7 ,29529 ,KEBNE ,16653847,Mon Nov 22 04:42:32 CET,Mon Nov 22 06:22:37 CET,0.0 0.246 0.358 0.443 0.518 0.584 0.651 0.722 0.852 0.908 0.961 0.981 1.116 1.173 1.285 1.397 1.511 1.561 1.649 1.729 1.85 1.936 2.022 2.153 2.269 2.375 2.477 2.576 2.708 2.845 2.992 3.162 3.317 3.47 3.642 3.84 4.04 4.267 4.513 4.767 5.034 5.353 5.748 6.143 6.572 7.007 7.508 8.026 8.532 8.951 9.111 8.951 8.68 8.347 7.958 7.607 7.321 7.02 6.711 6.402 6.114 5.833 5.551 5.28 5.044 4.844 4.623 4.432 4.283 4.126 3.962 3.819 3.671 3.503 3.347 3.187 3.039 2.891 2.724 2.599 2.47 2.241 2.078 1.929 1.863 1.733 1.577 1.4 1.302 1.115 0.96 0.852 0.747 0.508 0.357 0.179 -0.003 -0.197 -0.426 -0.687 -1.724 -8 ,24399 ,KEBNE ,16653848,Mon Nov 22 04:43:34 CET,Mon Nov 22 06:23:27 CET,0.0 0.655 0.816 0.934 1.043 1.131 1.204 1.267 1.4 1.461 1.517 1.554 1.694 1.755 1.865 1.957 2.064 2.116 2.202 2.278 2.396 2.474 2.55 2.662 2.768 2.881 2.992 3.103 3.246 3.38 3.512 3.682 3.84 3.972 4.118 4.291 4.463 4.659 4.867 5.103 5.338 5.599 5.947 6.281 6.651 7.051 7.495 7.938 8.292 8.563 8.762 8.614 8.227 7.884 7.563 7.234 6.897 6.54 6.197 5.85 5.553 5.26 4.989 4.745 4.515 4.304 4.092 3.899 3.729 3.555 3.366 3.222 3.078 2.911 2.763 2.626 2.501 2.372 2.242 2.137 2.023 1.831 1.709 1.594 1.534 1.406 1.256 1.108 1.04 0.882 0.754 0.642 0.527 0.241 0.091 -0.028 -0.149 -0.29 -0.467 -0.707 -1.354 -9 ,5482 ,KEBNE ,16653849,Mon Nov 22 04:43:34 CET,Mon Nov 22 06:24:05 CET,0.0 0.123 0.213 0.304 0.387 0.468 0.555 0.636 0.783 0.85 0.911 0.937 1.077 1.138 1.27 1.391 1.485 1.527 1.608 1.693 1.819 1.898 1.976 2.095 2.209 2.324 2.431 2.537 2.684 2.815 2.941 3.091 3.23 3.375 3.548 3.721 3.87 4.041 4.241 4.471 4.727 5.018 5.357 5.662 5.971 6.311 6.725 7.18 7.613 7.963 8.098 7.95 7.65 7.303 6.972 6.63 6.294 5.975 5.709 5.425 5.16 4.928 4.703 4.472 4.267 4.086 3.894 3.728 3.589 3.449 3.301 3.147 2.968 2.799 2.673 2.526 2.376 2.243 2.094 1.978 1.858 1.679 1.542 1.386 1.307 1.136 0.954 0.781 0.696 0.524 0.402 0.287 0.171 -0.033 -0.126 -0.233 -0.407 -0.638 -0.906 -1.177 -1.755 -10 ,17167 ,KEBNE ,16653850,Mon Nov 22 04:43:34 CET,Mon Nov 22 06:25:48 CET,0.0 0.226 0.35 0.448 0.553 0.652 0.737 0.811 0.941 0.997 1.055 1.079 1.222 1.285 1.394 1.506 1.604 1.646 1.731 1.817 1.948 2.032 2.114 2.231 2.337 2.44 2.546 2.655 2.799 2.931 3.059 3.208 3.356 3.503 3.669 3.861 4.044 4.242 4.469 4.729 5.009 5.32 5.673 6.021 6.442 6.921 7.471 8.033 8.63 9.163 9.345 9.205 8.963 8.597 8.221 7.886 7.542 7.206 6.908 6.609 6.351 6.122 5.899 5.671 5.45 5.247 5.025 4.829 4.667 4.508 4.34 4.185 4.021 3.836 3.682 3.524 3.364 3.188 2.995 2.868 2.739 2.543 2.425 2.31 2.228 2.033 1.854 1.69 1.614 1.469 1.397 1.314 1.236 1.059 0.951 0.823 0.672 0.48 0.241 -0.073 -1.097 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_44_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_44_43.txt deleted file mode 100644 index c58cab97..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_44_43.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19901 ,TETRA ,17698020,Sat Dec 4 16:32:47 CET,Sat Dec 4 18:21:56 CET,0.0 1.512 1.994 2.273 2.506 2.706 2.873 3.025 3.303 3.432 3.574 3.766 3.957 4.077 4.311 4.514 4.712 4.803 4.984 5.174 5.437 5.587 5.739 5.954 6.161 6.361 6.557 6.766 7.034 7.272 7.499 7.78 8.063 8.323 8.618 8.961 9.253 9.547 9.861 10.199 10.589 11.037 11.533 12.057 12.626 13.21 13.919 14.65 15.565 16.668 17.649 17.992 18.058 17.997 17.83 17.684 17.524 17.352 17.19 16.982 16.788 16.624 16.483 16.352 16.211 16.081 15.942 15.823 15.724 15.603 15.468 15.363 15.262 15.158 15.073 14.983 14.885 14.776 14.654 14.573 14.501 14.397 14.324 14.241 14.197 14.105 14.012 13.904 13.844 13.71 13.619 13.533 13.435 13.227 13.109 12.969 12.827 12.697 12.565 12.377 11.912 -2 ,13460 ,TETRA ,17698021,Sat Dec 4 16:32:50 CET,Sat Dec 4 18:27:07 CET,0.0 1.961 2.583 2.885 3.139 3.386 3.608 3.794 4.094 4.231 4.376 4.577 4.784 4.896 5.122 5.336 5.544 5.646 5.843 6.023 6.262 6.406 6.547 6.76 6.969 7.18 7.381 7.568 7.822 8.068 8.287 8.531 8.782 9.038 9.322 9.65 9.969 10.307 10.679 11.049 11.446 11.929 12.45 12.925 13.509 14.185 14.901 15.721 16.691 17.601 18.364 18.789 18.903 18.892 18.753 18.538 18.309 18.1 17.95 17.79 17.638 17.488 17.332 17.197 17.073 16.957 16.833 16.714 16.605 16.491 16.363 16.25 16.141 16.036 15.939 15.839 15.752 15.655 15.554 15.486 15.413 15.293 15.207 15.118 15.076 15.0 14.914 14.799 14.74 14.615 14.547 14.463 14.371 14.217 14.144 14.048 13.947 13.784 13.563 13.371 12.943 -3 ,9765 ,TETRA ,17698022,Sat Dec 4 16:33:55 CET,Sat Dec 4 18:25:14 CET,0.0 1.715 2.261 2.642 2.885 3.124 3.336 3.508 3.826 3.977 4.126 4.324 4.537 4.659 4.87 5.068 5.254 5.34 5.529 5.721 5.972 6.139 6.3 6.512 6.723 6.931 7.131 7.315 7.534 7.75 7.962 8.218 8.468 8.699 8.974 9.298 9.596 9.919 10.268 10.648 11.047 11.493 12.016 12.529 13.119 13.763 14.447 15.166 15.973 16.777 17.451 17.803 17.873 17.792 17.635 17.472 17.321 17.152 16.988 16.835 16.683 16.537 16.408 16.284 16.147 16.0 15.847 15.708 15.585 15.451 15.308 15.19 15.078 14.962 14.856 14.747 14.648 14.537 14.421 14.342 14.259 14.132 14.053 13.975 13.93 13.837 13.746 13.658 13.609 13.482 13.439 13.384 13.322 13.197 13.133 13.054 12.956 12.833 12.671 12.45 11.963 -4 ,21761 ,TETRA ,17675101,Sat Dec 4 16:08:49 CET,Sat Dec 4 18:22:11 CET,0.0 1.838 2.313 2.609 2.865 3.093 3.269 3.421 3.723 3.859 3.99 4.136 4.327 4.427 4.613 4.802 4.997 5.087 5.25 5.405 5.622 5.765 5.914 6.121 6.322 6.523 6.709 6.884 7.104 7.325 7.535 7.774 8.002 8.218 8.464 8.763 9.069 9.396 9.74 10.088 10.44 10.854 11.403 11.959 12.568 13.228 13.953 14.775 15.676 16.508 17.236 17.65 17.726 17.637 17.495 17.318 17.135 16.954 16.778 16.612 16.469 16.319 16.183 16.045 15.913 15.787 15.643 15.514 15.398 15.286 15.174 15.079 14.975 14.872 14.789 14.699 14.613 14.524 14.425 14.353 14.276 14.169 14.091 13.991 13.939 13.835 13.719 13.609 13.557 13.432 13.383 13.325 13.267 13.139 13.068 12.996 12.918 12.833 12.736 12.585 11.841 -6 ,15600 ,TETRA ,17698025,Sat Dec 4 16:33:56 CET,Sat Dec 4 18:26:14 CET,0.0 1.718 2.173 2.496 2.802 3.053 3.254 3.423 3.758 3.932 4.082 4.264 4.472 4.599 4.833 5.031 5.21 5.298 5.469 5.64 5.895 6.052 6.197 6.407 6.612 6.81 6.994 7.178 7.412 7.632 7.853 8.117 8.366 8.592 8.843 9.127 9.419 9.765 10.121 10.474 10.871 11.339 11.858 12.358 12.954 13.578 14.302 15.11 15.954 16.839 17.672 18.006 17.929 17.755 17.592 17.414 17.198 16.973 16.763 16.555 16.359 16.16 15.967 15.801 15.641 15.494 15.344 15.199 15.088 14.971 14.842 14.726 14.6 14.472 14.372 14.275 14.181 14.09 13.983 13.901 13.83 13.72 13.631 13.54 13.494 13.398 13.308 13.213 13.156 13.024 12.954 12.885 12.806 12.634 12.553 12.467 12.359 12.214 12.038 11.803 11.311 -7 ,5768 ,TETRA ,17698026,Sat Dec 4 16:33:58 CET,Sat Dec 4 18:11:24 CET,0.0 1.507 2.011 2.377 2.644 2.867 3.049 3.205 3.486 3.619 3.741 3.89 4.067 4.158 4.337 4.518 4.704 4.809 5.005 5.183 5.436 5.599 5.76 5.985 6.192 6.376 6.567 6.773 7.024 7.249 7.46 7.714 7.96 8.185 8.434 8.684 8.941 9.263 9.618 9.989 10.332 10.724 11.21 11.664 12.183 12.78 13.396 13.993 14.651 15.376 16.005 16.305 16.336 16.209 16.082 15.949 15.76 15.546 15.353 15.175 15.001 14.834 14.696 14.543 14.391 14.254 14.117 13.991 13.878 13.762 13.626 13.508 13.388 13.269 13.177 13.077 12.978 12.872 12.763 12.699 12.638 12.509 12.417 12.332 12.287 12.186 12.085 11.989 11.928 11.79 11.715 11.637 11.562 11.403 11.309 11.211 11.117 11.002 10.867 10.7 10.342 -8 ,18088 ,TETRA ,17675105,Sat Dec 4 16:11:48 CET,Sat Dec 4 18:24:50 CET,0.0 2.341 2.885 3.257 3.522 3.74 3.927 4.098 4.396 4.529 4.656 4.828 5.04 5.147 5.335 5.514 5.683 5.766 5.921 6.072 6.305 6.453 6.586 6.779 6.968 7.154 7.338 7.517 7.742 7.959 8.174 8.437 8.692 8.936 9.214 9.516 9.802 10.129 10.487 10.849 11.228 11.686 12.228 12.784 13.419 14.073 14.745 15.416 16.141 16.845 17.461 17.69 17.688 17.571 17.427 17.275 17.1 16.935 16.788 16.627 16.482 16.342 16.2 16.051 15.904 15.761 15.626 15.517 15.417 15.305 15.18 15.068 14.953 14.836 14.743 14.654 14.557 14.457 14.363 14.291 14.208 14.079 13.996 13.913 13.871 13.78 13.672 13.55 13.492 13.355 13.291 13.229 13.163 13.022 12.935 12.827 12.73 12.632 12.502 12.35 11.974 -9 ,16336 ,TETRA ,17698028,Sat Dec 4 16:34:51 CET,Sat Dec 4 18:25:27 CET,0.0 2.401 2.976 3.349 3.649 3.9 4.08 4.233 4.532 4.677 4.805 4.958 5.155 5.258 5.465 5.658 5.829 5.91 6.058 6.201 6.414 6.565 6.7 6.886 7.066 7.238 7.412 7.578 7.802 8.025 8.248 8.523 8.788 9.047 9.338 9.652 9.958 10.311 10.698 11.103 11.49 11.924 12.463 12.995 13.606 14.262 15.004 15.852 16.807 17.766 18.65 19.07 19.105 19.041 18.905 18.707 18.52 18.349 18.193 18.028 17.848 17.676 17.519 17.374 17.25 17.141 17.021 16.916 16.824 16.707 16.572 16.477 16.385 16.278 16.197 16.117 16.028 15.933 15.829 15.756 15.687 15.587 15.506 15.411 15.365 15.273 15.173 15.069 15.01 14.879 14.806 14.73 14.653 14.485 14.386 14.28 14.184 14.091 13.962 13.776 13.239 -10 ,4439 ,TETRA ,17675107,Sat Dec 4 16:10:53 CET,Sat Dec 4 18:25:23 CET,0.0 2.551 3.024 3.359 3.615 3.848 4.055 4.225 4.5 4.633 4.777 4.964 5.172 5.286 5.502 5.698 5.869 5.957 6.119 6.266 6.502 6.65 6.785 6.977 7.158 7.34 7.52 7.703 7.946 8.17 8.375 8.63 8.887 9.114 9.383 9.696 9.978 10.292 10.658 11.042 11.438 11.868 12.34 12.849 13.473 14.161 14.94 15.727 16.502 17.273 17.944 18.228 18.236 18.127 17.961 17.774 17.564 17.358 17.194 17.025 16.857 16.705 16.557 16.395 16.233 16.095 15.956 15.82 15.697 15.572 15.45 15.348 15.237 15.112 15.007 14.904 14.798 14.687 14.563 14.476 14.392 14.263 14.176 14.08 14.029 13.933 13.835 13.729 13.672 13.541 13.471 13.389 13.308 13.136 13.051 12.975 12.886 12.776 12.639 12.474 12.015 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_44_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_44_45.txt deleted file mode 100644 index d190ba23..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_44_45.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,429 ,KEBNE ,16653851,Mon Nov 22 04:43:38 CET,Mon Nov 22 06:21:39 CET,0.0 1.179 1.529 1.824 2.051 2.249 2.412 2.566 2.835 2.936 3.039 3.162 3.339 3.432 3.605 3.761 3.914 3.997 4.157 4.305 4.514 4.639 4.762 4.973 5.172 5.367 5.568 5.743 5.963 6.181 6.377 6.622 6.89 7.132 7.385 7.67 7.973 8.283 8.573 8.884 9.212 9.564 9.95 10.349 10.823 11.316 11.907 12.676 13.537 14.268 14.803 14.946 14.778 14.467 14.128 13.863 13.664 13.445 13.236 13.02 12.825 12.653 12.47 12.292 12.142 12.0 11.853 11.718 11.598 11.481 11.365 11.264 11.153 11.04 10.953 10.855 10.754 10.654 10.558 10.492 10.423 10.31 10.237 10.155 10.104 10.01 9.911 9.813 9.768 9.644 9.58 9.51 9.439 9.275 9.197 9.095 8.98 8.884 8.79 8.686 8.44 -2 ,6426 ,KEBNE ,16653852,Mon Nov 22 04:43:34 CET,Mon Nov 22 06:25:08 CET,0.0 1.277 1.656 1.912 2.135 2.339 2.556 2.754 3.076 3.212 3.332 3.491 3.695 3.805 4.0 4.193 4.394 4.492 4.673 4.85 5.127 5.317 5.499 5.741 5.956 6.157 6.354 6.547 6.802 7.06 7.32 7.64 7.939 8.192 8.465 8.77 9.058 9.395 9.75 10.092 10.439 10.81 11.226 11.627 12.058 12.549 13.081 13.658 14.307 14.935 15.51 15.637 15.557 15.357 15.066 14.775 14.496 14.223 13.991 13.742 13.521 13.314 13.103 12.92 12.748 12.563 12.375 12.219 12.079 11.927 11.769 11.648 11.533 11.409 11.31 11.213 11.12 11.016 10.885 10.791 10.701 10.553 10.451 10.35 10.301 10.21 10.095 9.951 9.881 9.746 9.705 9.643 9.566 9.385 9.301 9.223 9.136 9.03 8.903 8.749 8.493 -3 ,6818 ,KEBNE ,16653853,Mon Nov 22 04:43:34 CET,Mon Nov 22 06:26:23 CET,0.0 0.954 1.286 1.554 1.793 2.005 2.2 2.39 2.708 2.847 2.983 3.131 3.323 3.435 3.681 3.913 4.136 4.243 4.432 4.625 4.901 5.06 5.207 5.418 5.629 5.83 6.018 6.227 6.495 6.723 6.919 7.131 7.342 7.564 7.83 8.132 8.403 8.688 9.003 9.309 9.62 10.005 10.509 10.996 11.536 12.143 12.73 13.319 13.955 14.439 14.664 14.596 14.413 14.106 13.798 13.464 13.136 12.871 12.639 12.391 12.175 11.977 11.79 11.613 11.445 11.284 11.113 10.958 10.83 10.693 10.537 10.411 10.283 10.165 10.072 9.955 9.826 9.693 9.558 9.472 9.392 9.273 9.2 9.121 9.069 8.943 8.82 8.716 8.67 8.55 8.509 8.444 8.369 8.23 8.154 8.067 7.984 7.895 7.757 7.59 7.352 -4 ,16386 ,KEBNE ,16653854,Mon Nov 22 04:44:37 CET,Mon Nov 22 06:25:15 CET,0.0 1.266 1.554 1.825 2.089 2.304 2.48 2.639 2.922 3.049 3.189 3.377 3.573 3.68 3.931 4.164 4.337 4.423 4.619 4.807 5.065 5.246 5.415 5.632 5.835 6.019 6.187 6.358 6.59 6.829 7.067 7.34 7.602 7.85 8.143 8.473 8.768 9.086 9.405 9.703 10.051 10.51 11.061 11.575 12.078 12.551 13.032 13.531 14.06 14.683 15.277 15.442 15.351 15.122 14.832 14.525 14.246 14.003 13.791 13.545 13.324 13.148 12.961 12.761 12.586 12.443 12.289 12.138 12.012 11.885 11.75 11.628 11.498 11.374 11.279 11.18 11.074 10.959 10.841 10.755 10.672 10.554 10.465 10.372 10.324 10.221 10.115 10.013 9.965 9.84 9.799 9.734 9.652 9.457 9.354 9.252 9.152 9.053 8.939 8.773 8.451 -6 ,23490 ,KEBNE ,16653856,Mon Nov 22 04:46:40 CET,Mon Nov 22 06:28:18 CET,0.0 0.885 1.235 1.466 1.683 1.882 2.067 2.262 2.617 2.777 2.929 3.119 3.344 3.46 3.658 3.871 4.082 4.174 4.345 4.507 4.729 4.88 5.024 5.239 5.448 5.634 5.821 6.022 6.273 6.485 6.686 6.931 7.162 7.386 7.642 7.925 8.182 8.453 8.72 9.014 9.352 9.717 10.126 10.54 11.023 11.573 12.16 12.738 13.344 13.881 14.272 14.322 14.208 14.001 13.727 13.464 13.238 12.998 12.779 12.547 12.329 12.136 11.951 11.777 11.603 11.43 11.259 11.114 10.979 10.839 10.698 10.574 10.452 10.322 10.212 10.105 9.995 9.873 9.752 9.667 9.578 9.448 9.36 9.265 9.207 9.087 8.971 8.858 8.801 8.659 8.599 8.537 8.478 8.323 8.248 8.174 8.081 7.977 7.868 7.716 7.47 -7 ,7548 ,KEBNE ,16653857,Mon Nov 22 04:46:40 CET,Mon Nov 22 06:29:00 CET,0.0 1.499 1.881 2.149 2.433 2.656 2.817 2.948 3.178 3.305 3.438 3.636 3.848 3.965 4.193 4.407 4.594 4.68 4.852 5.022 5.271 5.433 5.592 5.84 6.062 6.255 6.425 6.582 6.785 6.998 7.203 7.451 7.712 7.952 8.219 8.518 8.79 9.064 9.347 9.663 10.007 10.385 10.814 11.267 11.819 12.393 12.983 13.641 14.362 15.088 15.788 16.109 15.992 15.695 15.439 15.189 14.958 14.744 14.531 14.303 14.101 13.903 13.717 13.533 13.355 13.199 13.035 12.895 12.776 12.644 12.512 12.406 12.294 12.181 12.095 11.997 11.89 11.776 11.659 11.589 11.521 11.413 11.335 11.248 11.202 11.103 11.0 10.893 10.835 10.699 10.635 10.571 10.506 10.36 10.29 10.212 10.106 9.978 9.862 9.758 9.501 -8 ,24882 ,KEBNE ,16653858,Mon Nov 22 04:47:43 CET,Mon Nov 22 06:28:49 CET,0.0 1.42 1.771 2.058 2.326 2.559 2.737 2.88 3.15 3.29 3.429 3.6 3.793 3.905 4.137 4.356 4.573 4.678 4.873 5.048 5.286 5.439 5.591 5.823 6.029 6.214 6.402 6.588 6.822 7.031 7.223 7.447 7.665 7.877 8.103 8.361 8.62 8.889 9.186 9.512 9.858 10.243 10.667 11.06 11.538 12.114 12.767 13.438 14.03 14.525 14.927 14.91 14.676 14.418 14.11 13.82 13.569 13.32 13.107 12.875 12.654 12.47 12.283 12.093 11.911 11.744 11.576 11.429 11.303 11.159 11.003 10.887 10.766 10.633 10.533 10.434 10.326 10.215 10.094 10.001 9.914 9.785 9.69 9.59 9.536 9.429 9.323 9.212 9.151 9.01 8.969 8.899 8.83 8.677 8.584 8.493 8.381 8.255 8.108 7.907 7.489 -9 ,16045 ,KEBNE ,16653859,Mon Nov 22 04:47:43 CET,Mon Nov 22 06:29:40 CET,0.0 0.535 0.866 1.089 1.305 1.517 1.687 1.837 2.117 2.241 2.356 2.54 2.745 2.857 3.084 3.296 3.5 3.6 3.802 3.994 4.278 4.448 4.583 4.768 4.951 5.133 5.332 5.515 5.706 5.898 6.094 6.326 6.548 6.765 7.021 7.306 7.586 7.917 8.289 8.703 9.146 9.632 10.202 10.792 11.418 12.016 12.568 13.036 13.545 14.018 14.377 14.474 14.291 14.006 13.748 13.484 13.201 12.933 12.695 12.445 12.225 12.031 11.836 11.652 11.479 11.317 11.147 10.99 10.858 10.719 10.567 10.438 10.31 10.174 10.072 9.971 9.864 9.758 9.652 9.577 9.493 9.359 9.279 9.201 9.155 9.052 8.952 8.86 8.814 8.686 8.66 8.601 8.53 8.396 8.324 8.239 8.132 8.028 7.929 7.763 7.295 -10 ,24403 ,KEBNE ,16653860,Mon Nov 22 04:47:43 CET,Mon Nov 22 06:29:45 CET,0.0 1.038 1.334 1.557 1.745 1.913 2.048 2.176 2.469 2.625 2.763 2.918 3.107 3.197 3.376 3.545 3.71 3.8 3.988 4.148 4.375 4.532 4.682 4.889 5.086 5.286 5.478 5.664 5.928 6.198 6.436 6.692 6.943 7.202 7.495 7.801 8.077 8.379 8.711 9.079 9.429 9.811 10.31 10.8 11.406 12.034 12.556 13.102 13.821 14.613 15.106 15.129 14.981 14.701 14.468 14.273 14.031 13.796 13.579 13.334 13.125 12.933 12.741 12.533 12.325 12.164 12.001 11.848 11.721 11.586 11.442 11.329 11.213 11.094 11.004 10.91 10.806 10.696 10.58 10.496 10.411 10.264 10.153 10.047 9.999 9.894 9.781 9.672 9.613 9.479 9.416 9.33 9.241 9.074 8.984 8.888 8.789 8.671 8.527 8.351 8.064 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_45_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_45_44.txt deleted file mode 100644 index 198b00a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/protein/Summary_FEP_45_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5873 ,KEBNE ,17042184,Thu Dec 23 04:00:06 CET,Thu Dec 23 05:39:52 CET,0.0 0.264 0.455 0.631 0.797 0.923 1.03 1.134 1.338 1.426 1.503 1.559 1.703 1.772 1.914 2.037 2.139 2.192 2.303 2.421 2.583 2.679 2.772 2.906 3.036 3.151 3.259 3.362 3.509 3.654 3.78 3.92 4.048 4.188 4.349 4.495 4.624 4.775 4.945 5.125 5.316 5.523 5.74 5.941 6.185 6.461 6.724 6.971 7.257 7.549 7.586 7.101 6.46 5.843 5.277 4.755 4.307 3.858 3.453 3.013 2.615 2.262 1.928 1.614 1.292 0.986 0.682 0.422 0.193 -0.062 -0.313 -0.501 -0.726 -0.977 -1.182 -1.399 -1.618 -1.854 -2.092 -2.246 -2.413 -2.687 -2.859 -3.016 -3.106 -3.305 -3.508 -3.719 -3.827 -4.034 -4.212 -4.345 -4.491 -4.844 -5.028 -5.212 -5.379 -5.568 -5.822 -6.138 -7.248 -2 ,22881 ,KEBNE ,17042185,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:45:42 CET,0.0 0.606 0.804 0.916 1.02 1.116 1.203 1.291 1.444 1.502 1.561 1.601 1.727 1.788 1.897 1.998 2.1 2.153 2.251 2.327 2.439 2.519 2.595 2.7 2.802 2.893 2.977 3.065 3.182 3.299 3.407 3.536 3.661 3.779 3.922 4.082 4.245 4.437 4.621 4.824 5.061 5.323 5.596 5.841 6.097 6.377 6.726 7.084 7.35 7.512 7.43 7.018 6.467 5.922 5.355 4.725 4.102 3.526 3.101 2.709 2.354 2.002 1.653 1.342 1.036 0.748 0.465 0.217 0.008 -0.203 -0.414 -0.616 -0.853 -1.106 -1.321 -1.554 -1.791 -2.023 -2.249 -2.405 -2.579 -2.853 -3.033 -3.229 -3.339 -3.563 -3.775 -3.969 -4.073 -4.266 -4.406 -4.513 -4.615 -4.846 -4.956 -5.089 -5.272 -5.496 -5.754 -6.079 -6.874 -3 ,9386 ,KEBNE ,17042186,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:45:36 CET,0.0 0.378 0.608 0.797 0.926 1.043 1.153 1.25 1.415 1.484 1.555 1.609 1.74 1.798 1.908 2.012 2.106 2.149 2.247 2.346 2.478 2.566 2.653 2.774 2.901 3.019 3.114 3.2 3.308 3.411 3.521 3.658 3.772 3.886 4.03 4.195 4.356 4.527 4.706 4.884 5.061 5.249 5.47 5.697 5.929 6.114 6.312 6.506 6.607 6.624 6.337 5.743 5.14 4.564 4.034 3.518 3.016 2.49 2.028 1.582 1.198 0.843 0.498 0.174 -0.125 -0.384 -0.643 -0.884 -1.102 -1.34 -1.599 -1.81 -2.033 -2.278 -2.461 -2.629 -2.807 -2.994 -3.177 -3.305 -3.441 -3.66 -3.812 -3.967 -4.056 -4.272 -4.506 -4.736 -4.847 -5.047 -5.206 -5.315 -5.435 -5.732 -5.887 -6.029 -6.199 -6.421 -6.662 -7.03 -8.489 -4 ,3927 ,KEBNE ,17042187,Thu Dec 23 04:04:14 CET,Thu Dec 23 05:44:57 CET,0.0 0.209 0.304 0.388 0.474 0.565 0.641 0.725 0.917 0.993 1.057 1.116 1.261 1.317 1.42 1.535 1.65 1.703 1.812 1.913 2.062 2.162 2.247 2.36 2.478 2.588 2.684 2.774 2.896 3.015 3.13 3.268 3.398 3.526 3.686 3.867 4.023 4.189 4.363 4.551 4.746 4.963 5.21 5.456 5.694 5.919 6.187 6.451 6.717 6.914 6.903 6.408 5.75 5.184 4.617 3.971 3.363 2.797 2.355 1.921 1.471 1.055 0.66 0.302 -0.004 -0.287 -0.601 -0.899 -1.161 -1.439 -1.706 -1.898 -2.102 -2.318 -2.489 -2.676 -2.873 -3.08 -3.284 -3.429 -3.585 -3.828 -3.99 -4.17 -4.27 -4.463 -4.666 -4.904 -5.032 -5.238 -5.457 -5.611 -5.755 -6.099 -6.276 -6.42 -6.565 -6.731 -6.942 -7.237 -8.115 -5 ,5716 ,KEBNE ,17042188,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:44:57 CET,0.0 0.499 0.693 0.843 0.974 1.11 1.248 1.354 1.516 1.589 1.652 1.724 1.878 1.942 2.055 2.164 2.279 2.331 2.423 2.526 2.669 2.742 2.806 2.906 3.002 3.09 3.184 3.281 3.405 3.524 3.643 3.796 3.936 4.065 4.224 4.391 4.541 4.711 4.884 5.085 5.311 5.555 5.83 6.078 6.345 6.635 6.975 7.321 7.59 7.724 7.519 6.891 6.243 5.623 5.02 4.446 3.934 3.435 2.999 2.564 2.179 1.822 1.435 1.058 0.731 0.443 0.13 -0.155 -0.404 -0.677 -0.968 -1.194 -1.421 -1.656 -1.835 -2.021 -2.208 -2.399 -2.61 -2.752 -2.89 -3.114 -3.267 -3.425 -3.516 -3.72 -3.943 -4.158 -4.259 -4.464 -4.638 -4.759 -4.883 -5.171 -5.341 -5.506 -5.676 -5.84 -6.021 -6.297 -7.04 -6 ,5209 ,KEBNE ,17042189,Thu Dec 23 04:04:18 CET,Thu Dec 23 05:53:56 CET,0.0 0.39 0.553 0.701 0.834 0.962 1.075 1.165 1.351 1.439 1.517 1.589 1.737 1.805 1.938 2.065 2.178 2.231 2.343 2.448 2.599 2.689 2.774 2.897 3.019 3.139 3.245 3.359 3.509 3.639 3.75 3.878 4.01 4.139 4.28 4.442 4.606 4.787 4.988 5.197 5.394 5.624 5.889 6.128 6.397 6.684 6.969 7.213 7.464 7.652 7.53 7.063 6.551 5.895 5.14 4.415 3.865 3.416 2.992 2.58 2.242 1.935 1.631 1.328 1.052 0.805 0.544 0.284 0.025 -0.237 -0.476 -0.654 -0.859 -1.086 -1.249 -1.41 -1.583 -1.771 -1.957 -2.094 -2.254 -2.499 -2.657 -2.812 -2.895 -3.086 -3.283 -3.46 -3.565 -3.773 -3.928 -4.048 -4.161 -4.399 -4.532 -4.691 -4.87 -5.045 -5.262 -5.584 -6.684 -7 ,31486 ,KEBNE ,17042190,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:45:17 CET,0.0 0.226 0.422 0.573 0.685 0.791 0.889 0.977 1.143 1.213 1.277 1.324 1.461 1.528 1.649 1.751 1.849 1.903 2.014 2.111 2.251 2.341 2.422 2.543 2.667 2.786 2.892 3.007 3.16 3.285 3.418 3.588 3.739 3.878 4.052 4.247 4.408 4.601 4.8 4.979 5.151 5.34 5.569 5.803 6.06 6.269 6.426 6.604 6.771 6.74 6.426 5.753 5.035 4.33 3.594 2.855 2.208 1.653 1.149 0.621 0.165 -0.243 -0.621 -0.982 -1.336 -1.658 -1.98 -2.259 -2.52 -2.816 -3.12 -3.361 -3.609 -3.867 -4.069 -4.281 -4.492 -4.699 -4.912 -5.063 -5.217 -5.451 -5.608 -5.765 -5.85 -6.002 -6.144 -6.32 -6.428 -6.61 -6.752 -6.884 -7.03 -7.34 -7.492 -7.658 -7.863 -8.084 -8.33 -8.648 -9.642 -8 ,23634 ,KEBNE ,17042191,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:45:13 CET,0.0 0.19 0.314 0.443 0.575 0.683 0.783 0.875 1.023 1.087 1.154 1.213 1.35 1.404 1.52 1.647 1.785 1.853 1.964 2.059 2.208 2.296 2.378 2.501 2.615 2.723 2.82 2.916 3.042 3.166 3.282 3.414 3.539 3.663 3.815 3.984 4.146 4.328 4.502 4.67 4.858 5.067 5.323 5.585 5.865 6.161 6.479 6.742 6.988 7.267 7.43 7.18 6.667 6.102 5.564 5.048 4.554 4.045 3.581 3.131 2.759 2.408 2.048 1.73 1.444 1.169 0.893 0.651 0.434 0.208 -0.029 -0.222 -0.423 -0.633 -0.798 -0.969 -1.139 -1.305 -1.508 -1.66 -1.819 -2.081 -2.266 -2.464 -2.562 -2.758 -2.975 -3.215 -3.343 -3.56 -3.765 -3.908 -4.05 -4.392 -4.586 -4.787 -5.004 -5.237 -5.485 -5.814 -6.853 -9 ,23437 ,KEBNE ,17042192,Thu Dec 23 04:04:14 CET,Thu Dec 23 05:45:10 CET,0.0 0.229 0.396 0.522 0.617 0.702 0.785 0.859 1.011 1.088 1.158 1.198 1.324 1.38 1.499 1.616 1.729 1.783 1.879 1.969 2.087 2.167 2.251 2.373 2.487 2.588 2.684 2.776 2.895 3.026 3.159 3.301 3.434 3.566 3.722 3.888 4.046 4.222 4.415 4.608 4.79 5.009 5.25 5.457 5.723 6.026 6.312 6.638 6.963 7.177 7.102 6.794 6.357 5.801 5.21 4.571 4.069 3.654 3.249 2.823 2.466 2.167 1.883 1.596 1.347 1.125 0.88 0.66 0.44 0.175 -0.127 -0.354 -0.557 -0.787 -0.985 -1.188 -1.382 -1.584 -1.802 -1.951 -2.084 -2.294 -2.453 -2.631 -2.733 -2.949 -3.157 -3.366 -3.487 -3.689 -3.813 -3.947 -4.107 -4.374 -4.495 -4.642 -4.84 -5.095 -5.353 -5.637 -6.426 -10 ,3389 ,KEBNE ,17042193,Thu Dec 23 04:04:14 CET,Thu Dec 23 05:44:50 CET,0.0 0.35 0.557 0.716 0.84 0.965 1.077 1.176 1.369 1.455 1.54 1.64 1.793 1.862 2.003 2.128 2.258 2.326 2.449 2.553 2.695 2.795 2.899 3.048 3.191 3.325 3.44 3.543 3.681 3.809 3.926 4.085 4.247 4.413 4.6 4.794 4.979 5.198 5.441 5.672 5.906 6.161 6.421 6.67 6.955 7.262 7.592 7.935 8.25 8.481 8.477 8.155 7.605 6.907 6.27 5.669 5.126 4.652 4.23 3.784 3.399 3.05 2.726 2.434 2.154 1.89 1.612 1.326 1.061 0.803 0.547 0.351 0.156 -0.075 -0.269 -0.449 -0.625 -0.824 -1.043 -1.194 -1.341 -1.563 -1.708 -1.856 -1.955 -2.167 -2.375 -2.608 -2.732 -2.942 -3.142 -3.276 -3.395 -3.666 -3.816 -3.975 -4.169 -4.387 -4.672 -5.005 -5.812 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_15_14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_15_14.txt deleted file mode 100644 index 69b61549..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_15_14.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,17585 ,KEBNE ,16653862,Mon Nov 22 04:47:43 CET,Mon Nov 22 06:11:23 CET,0.0 0.363 0.514 0.63 0.715 0.794 0.884 0.97 1.127 1.193 1.25 1.301 1.43 1.489 1.601 1.719 1.836 1.891 1.991 2.075 2.205 2.294 2.373 2.484 2.595 2.705 2.819 2.932 3.075 3.207 3.331 3.495 3.657 3.819 4.014 4.242 4.466 4.693 4.943 5.223 5.508 5.815 6.167 6.514 6.914 7.35 7.823 8.318 8.831 9.305 9.639 9.509 9.075 8.614 8.159 7.689 7.265 6.846 6.442 6.002 5.595 5.23 4.872 4.519 4.189 3.894 3.582 3.279 2.998 2.697 2.412 2.178 1.919 1.64 1.421 1.212 1.008 0.797 0.54 0.352 0.175 -0.106 -0.293 -0.484 -0.593 -0.844 -1.107 -1.376 -1.529 -1.74 -1.974 -2.142 -2.336 -2.739 -2.942 -3.184 -3.467 -3.845 -4.326 -4.96 -8.018 -3 ,15215 ,KEBNE ,16653863,Mon Nov 22 04:47:42 CET,Mon Nov 22 06:10:58 CET,0.0 0.374 0.514 0.618 0.718 0.817 0.921 1.01 1.154 1.222 1.286 1.337 1.461 1.524 1.64 1.757 1.871 1.926 2.029 2.123 2.263 2.355 2.452 2.591 2.73 2.868 2.992 3.109 3.263 3.416 3.562 3.742 3.916 4.079 4.247 4.439 4.634 4.86 5.116 5.385 5.673 5.98 6.321 6.662 7.033 7.419 7.869 8.354 8.827 9.249 9.422 9.217 8.803 8.284 7.768 7.246 6.77 6.346 5.953 5.548 5.178 4.831 4.479 4.133 3.81 3.523 3.219 2.921 2.663 2.413 2.151 1.918 1.668 1.392 1.178 0.96 0.729 0.488 0.247 0.07 -0.123 -0.444 -0.665 -0.891 -1.014 -1.271 -1.517 -1.764 -1.908 -2.116 -2.38 -2.557 -2.744 -3.201 -3.458 -3.712 -4.036 -4.489 -4.96 -5.558 -8.502 -4 ,26490 ,KEBNE ,16653864,Mon Nov 22 04:48:45 CET,Mon Nov 22 06:12:28 CET,0.0 0.157 0.278 0.401 0.506 0.603 0.686 0.765 0.896 0.95 1.007 1.06 1.173 1.221 1.329 1.441 1.55 1.598 1.681 1.765 1.889 1.971 2.049 2.173 2.298 2.416 2.526 2.63 2.78 2.924 3.056 3.204 3.34 3.479 3.644 3.85 4.066 4.29 4.54 4.8 5.059 5.364 5.706 6.009 6.355 6.723 7.139 7.602 8.065 8.513 8.816 8.668 8.237 7.719 7.19 6.689 6.228 5.753 5.325 4.9 4.504 4.137 3.774 3.413 3.079 2.76 2.429 2.151 1.921 1.665 1.383 1.145 0.89 0.625 0.411 0.191 -0.06 -0.318 -0.574 -0.759 -0.95 -1.252 -1.457 -1.682 -1.812 -2.077 -2.356 -2.645 -2.787 -2.985 -3.247 -3.415 -3.595 -3.971 -4.178 -4.418 -4.739 -5.126 -5.597 -6.342 -12.03 -5 ,20839 ,KEBNE ,16653865,Mon Nov 22 04:48:45 CET,Mon Nov 22 06:12:22 CET,0.0 0.424 0.596 0.74 0.866 0.972 1.058 1.129 1.254 1.314 1.376 1.426 1.545 1.595 1.697 1.803 1.897 1.944 2.04 2.126 2.252 2.339 2.418 2.525 2.632 2.743 2.863 2.985 3.142 3.3 3.448 3.6 3.743 3.899 4.075 4.268 4.46 4.685 4.926 5.15 5.397 5.696 6.042 6.372 6.721 7.133 7.599 8.048 8.506 8.926 9.115 8.953 8.611 8.124 7.587 7.076 6.61 6.163 5.763 5.354 4.992 4.657 4.306 3.96 3.654 3.383 3.077 2.778 2.525 2.267 1.991 1.746 1.475 1.209 1.017 0.8 0.558 0.311 0.054 -0.129 -0.325 -0.628 -0.839 -1.073 -1.192 -1.44 -1.712 -2.006 -2.166 -2.38 -2.644 -2.805 -2.98 -3.372 -3.574 -3.813 -4.098 -4.424 -4.871 -5.543 -9.291 -6 ,18535 ,KEBNE ,16653866,Mon Nov 22 04:48:45 CET,Mon Nov 22 06:12:10 CET,0.0 0.424 0.555 0.676 0.784 0.881 0.952 1.022 1.171 1.23 1.282 1.327 1.45 1.505 1.608 1.714 1.815 1.864 1.967 2.075 2.223 2.318 2.418 2.556 2.676 2.799 2.925 3.042 3.19 3.34 3.476 3.643 3.809 3.976 4.17 4.374 4.564 4.779 5.004 5.227 5.479 5.762 6.096 6.425 6.785 7.145 7.522 7.934 8.39 8.812 9.051 8.901 8.52 8.091 7.639 7.174 6.71 6.249 5.811 5.362 4.971 4.62 4.284 3.974 3.682 3.389 3.073 2.793 2.554 2.309 2.052 1.839 1.612 1.372 1.184 0.984 0.771 0.547 0.296 0.12 -0.06 -0.36 -0.564 -0.785 -0.903 -1.122 -1.343 -1.586 -1.714 -1.9 -2.127 -2.29 -2.457 -2.803 -3.024 -3.3 -3.633 -3.976 -4.42 -5.091 -7.746 -7 ,5908 ,KEBNE ,16653867,Mon Nov 22 04:48:49 CET,Mon Nov 22 06:04:38 CET,0.0 0.305 0.471 0.585 0.677 0.766 0.847 0.918 1.062 1.123 1.182 1.25 1.382 1.448 1.564 1.671 1.781 1.837 1.948 2.053 2.198 2.301 2.4 2.537 2.666 2.786 2.906 3.026 3.182 3.324 3.461 3.62 3.764 3.908 4.087 4.297 4.499 4.723 4.949 5.184 5.434 5.71 6.023 6.334 6.693 7.063 7.453 7.896 8.394 8.831 9.13 9.029 8.668 8.223 7.747 7.323 6.924 6.483 6.066 5.644 5.273 4.906 4.549 4.225 3.921 3.634 3.325 3.046 2.794 2.527 2.226 1.966 1.719 1.469 1.266 1.054 0.839 0.624 0.398 0.241 0.066 -0.223 -0.422 -0.643 -0.761 -0.992 -1.233 -1.496 -1.637 -1.833 -2.123 -2.318 -2.513 -2.947 -3.182 -3.399 -3.657 -3.974 -4.452 -5.234 -10.972 -8 ,32299 ,KEBNE ,16653868,Mon Nov 22 04:48:49 CET,Mon Nov 22 06:04:37 CET,0.0 0.215 0.333 0.448 0.558 0.657 0.745 0.821 0.974 1.048 1.115 1.177 1.299 1.355 1.467 1.572 1.672 1.722 1.823 1.938 2.106 2.208 2.315 2.471 2.608 2.739 2.866 2.984 3.126 3.252 3.388 3.556 3.719 3.872 4.035 4.22 4.407 4.621 4.85 5.105 5.375 5.661 5.989 6.31 6.668 7.059 7.465 7.866 8.371 8.853 9.091 8.885 8.498 8.051 7.543 7.044 6.565 6.092 5.672 5.265 4.882 4.514 4.173 3.863 3.565 3.276 2.987 2.723 2.483 2.218 1.927 1.696 1.456 1.191 0.986 0.794 0.604 0.404 0.164 -0.019 -0.218 -0.535 -0.728 -0.922 -1.032 -1.267 -1.504 -1.792 -1.94 -2.121 -2.396 -2.59 -2.774 -3.22 -3.5 -3.779 -4.077 -4.416 -4.823 -5.446 -9.386 -9 ,26920 ,KEBNE ,16653869,Mon Nov 22 04:49:47 CET,Mon Nov 22 06:11:25 CET,0.0 0.238 0.398 0.537 0.647 0.756 0.858 0.937 1.07 1.138 1.206 1.265 1.393 1.457 1.562 1.666 1.77 1.826 1.947 2.078 2.273 2.394 2.504 2.662 2.825 2.975 3.097 3.207 3.357 3.488 3.623 3.808 3.992 4.154 4.33 4.537 4.73 4.936 5.152 5.384 5.619 5.883 6.204 6.534 6.915 7.331 7.814 8.286 8.717 9.094 9.281 9.063 8.615 8.107 7.622 7.162 6.672 6.2 5.789 5.332 4.911 4.55 4.23 3.93 3.653 3.383 3.09 2.826 2.578 2.315 2.052 1.829 1.587 1.343 1.156 0.946 0.727 0.49 0.226 0.057 -0.123 -0.425 -0.623 -0.829 -0.944 -1.191 -1.447 -1.703 -1.849 -2.069 -2.349 -2.521 -2.697 -3.123 -3.369 -3.649 -3.975 -4.299 -4.715 -5.404 -12.693 -10 ,31638 ,KEBNE ,16653870,Mon Nov 22 04:49:47 CET,Mon Nov 22 06:11:29 CET,0.0 0.296 0.451 0.577 0.688 0.792 0.879 0.951 1.081 1.149 1.218 1.273 1.397 1.452 1.56 1.67 1.77 1.818 1.912 2.0 2.122 2.202 2.288 2.411 2.532 2.651 2.773 2.89 3.033 3.184 3.329 3.49 3.653 3.812 4.0 4.213 4.408 4.624 4.857 5.085 5.314 5.589 5.915 6.266 6.663 7.06 7.482 7.894 8.322 8.679 8.905 8.848 8.531 8.121 7.705 7.256 6.793 6.332 5.897 5.461 5.075 4.719 4.376 4.046 3.759 3.501 3.214 2.936 2.695 2.445 2.179 1.962 1.725 1.478 1.29 1.082 0.864 0.648 0.408 0.238 0.063 -0.221 -0.428 -0.658 -0.77 -0.983 -1.222 -1.481 -1.626 -1.834 -2.098 -2.289 -2.484 -2.878 -3.112 -3.389 -3.712 -4.082 -4.527 -5.179 -11.841 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_15_16.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_15_16.txt deleted file mode 100644 index ba2df05f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_15_16.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25007 ,KEBNE ,17042194,Thu Dec 23 04:04:16 CET,Thu Dec 23 05:32:11 CET,0.0 0.347 0.515 0.658 0.766 0.853 0.931 1.004 1.144 1.218 1.291 1.384 1.522 1.582 1.693 1.812 1.932 1.991 2.107 2.227 2.385 2.47 2.555 2.677 2.785 2.898 3.022 3.132 3.267 3.398 3.525 3.684 3.844 3.992 4.159 4.361 4.546 4.745 4.961 5.184 5.406 5.652 5.944 6.243 6.575 6.882 7.189 7.562 7.976 8.297 8.418 8.139 7.712 7.22 6.704 6.186 5.705 5.269 4.862 4.457 4.113 3.794 3.477 3.148 2.843 2.574 2.297 2.041 1.809 1.572 1.32 1.1 0.875 0.648 0.47 0.284 0.086 -0.13 -0.344 -0.482 -0.628 -0.86 -1.025 -1.201 -1.289 -1.48 -1.679 -1.881 -1.993 -2.167 -2.36 -2.493 -2.642 -2.974 -3.162 -3.365 -3.584 -3.822 -4.104 -4.542 -6.132 -2 ,23942 ,KEBNE ,17042195,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:31:36 CET,0.0 0.396 0.535 0.649 0.756 0.835 0.907 0.978 1.121 1.194 1.267 1.346 1.477 1.547 1.668 1.759 1.86 1.91 2.006 2.108 2.252 2.332 2.41 2.532 2.647 2.76 2.868 2.965 3.097 3.25 3.397 3.563 3.715 3.864 4.037 4.225 4.411 4.618 4.831 5.057 5.294 5.537 5.832 6.142 6.477 6.81 7.201 7.618 7.97 8.324 8.541 8.249 7.757 7.225 6.7 6.184 5.701 5.245 4.846 4.455 4.091 3.746 3.417 3.1 2.801 2.525 2.234 1.971 1.746 1.499 1.232 1.013 0.79 0.557 0.35 0.133 -0.079 -0.306 -0.537 -0.689 -0.859 -1.127 -1.306 -1.506 -1.607 -1.804 -2.013 -2.221 -2.325 -2.495 -2.652 -2.776 -2.917 -3.238 -3.427 -3.627 -3.838 -4.075 -4.367 -4.757 -6.24 -3 ,14260 ,KEBNE ,17042196,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:31:45 CET,0.0 0.671 0.847 0.992 1.119 1.216 1.303 1.387 1.542 1.616 1.688 1.744 1.864 1.92 2.026 2.118 2.211 2.258 2.346 2.437 2.565 2.635 2.7 2.804 2.908 3.008 3.105 3.201 3.328 3.448 3.574 3.75 3.918 4.075 4.248 4.433 4.615 4.833 5.054 5.268 5.5 5.75 6.033 6.321 6.648 7.003 7.422 7.838 8.23 8.548 8.666 8.399 7.939 7.447 6.954 6.428 5.947 5.492 5.06 4.627 4.259 3.922 3.597 3.28 2.979 2.701 2.412 2.158 1.938 1.703 1.454 1.256 1.049 0.824 0.654 0.49 0.306 0.097 -0.115 -0.263 -0.415 -0.654 -0.826 -1.02 -1.12 -1.316 -1.515 -1.714 -1.825 -1.995 -2.178 -2.317 -2.462 -2.763 -2.944 -3.188 -3.461 -3.742 -4.061 -4.497 -6.213 -4 ,23651 ,KEBNE ,17042197,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:30:48 CET,0.0 0.526 0.679 0.804 0.908 1.004 1.106 1.197 1.333 1.393 1.454 1.51 1.632 1.686 1.796 1.913 2.027 2.074 2.167 2.26 2.385 2.476 2.572 2.714 2.843 2.964 3.082 3.192 3.332 3.463 3.586 3.75 3.919 4.078 4.263 4.469 4.661 4.864 5.069 5.29 5.522 5.776 6.075 6.38 6.718 7.055 7.414 7.811 8.167 8.467 8.614 8.293 7.798 7.253 6.719 6.234 5.784 5.365 4.968 4.553 4.189 3.853 3.533 3.216 2.907 2.633 2.339 2.07 1.847 1.604 1.358 1.173 0.978 0.751 0.563 0.373 0.19 -0.013 -0.235 -0.378 -0.522 -0.761 -0.928 -1.084 -1.173 -1.37 -1.566 -1.764 -1.864 -2.044 -2.239 -2.376 -2.518 -2.818 -2.976 -3.151 -3.362 -3.617 -3.943 -4.334 -5.79 -5 ,31740 ,KEBNE ,17042198,Thu Dec 23 04:04:16 CET,Thu Dec 23 05:31:41 CET,0.0 0.329 0.489 0.61 0.7 0.77 0.848 0.927 1.06 1.118 1.172 1.242 1.375 1.435 1.536 1.632 1.729 1.772 1.854 1.939 2.057 2.134 2.213 2.318 2.414 2.512 2.616 2.725 2.872 3.012 3.13 3.268 3.413 3.561 3.733 3.93 4.109 4.292 4.5 4.708 4.921 5.166 5.453 5.729 6.041 6.382 6.745 7.158 7.586 7.902 8.058 7.845 7.393 6.906 6.408 5.88 5.39 4.949 4.568 4.175 3.832 3.499 3.154 2.82 2.503 2.226 1.931 1.647 1.405 1.158 0.903 0.685 0.454 0.215 0.016 -0.2 -0.432 -0.672 -0.91 -1.073 -1.246 -1.514 -1.692 -1.875 -1.968 -2.156 -2.348 -2.543 -2.656 -2.835 -2.987 -3.116 -3.26 -3.558 -3.744 -3.97 -4.219 -4.514 -4.865 -5.344 -7.026 -6 ,22734 ,KEBNE ,17042199,Thu Dec 23 04:04:14 CET,Thu Dec 23 05:31:35 CET,0.0 0.346 0.487 0.598 0.703 0.787 0.858 0.93 1.05 1.11 1.176 1.231 1.352 1.411 1.52 1.622 1.713 1.756 1.852 1.953 2.087 2.161 2.239 2.358 2.471 2.576 2.673 2.775 2.912 3.041 3.164 3.313 3.472 3.631 3.813 4.006 4.187 4.389 4.589 4.809 5.045 5.31 5.598 5.867 6.193 6.561 6.952 7.338 7.66 7.898 8.012 7.73 7.283 6.777 6.261 5.762 5.296 4.83 4.431 4.035 3.672 3.338 3.015 2.7 2.405 2.149 1.87 1.619 1.407 1.183 0.955 0.766 0.561 0.352 0.186 0.01 -0.173 -0.362 -0.554 -0.686 -0.821 -1.05 -1.213 -1.38 -1.466 -1.648 -1.846 -2.057 -2.173 -2.351 -2.505 -2.633 -2.782 -3.113 -3.288 -3.459 -3.682 -3.957 -4.266 -4.713 -6.117 -7 ,2586 ,KEBNE ,17042200,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:31:30 CET,0.0 0.31 0.461 0.568 0.667 0.77 0.864 0.945 1.092 1.155 1.211 1.26 1.382 1.435 1.55 1.651 1.738 1.786 1.887 1.976 2.099 2.18 2.261 2.377 2.481 2.581 2.686 2.783 2.898 3.017 3.132 3.278 3.428 3.578 3.755 3.946 4.142 4.351 4.55 4.765 4.995 5.244 5.522 5.792 6.098 6.418 6.773 7.152 7.539 7.886 8.046 7.832 7.349 6.781 6.244 5.741 5.26 4.815 4.427 4.001 3.615 3.254 2.897 2.546 2.203 1.879 1.54 1.243 0.984 0.71 0.418 0.156 -0.116 -0.393 -0.615 -0.832 -1.037 -1.238 -1.445 -1.586 -1.732 -1.956 -2.112 -2.286 -2.376 -2.563 -2.774 -2.987 -3.094 -3.273 -3.464 -3.605 -3.757 -4.094 -4.279 -4.468 -4.671 -4.921 -5.235 -5.665 -7.274 -8 ,5283 ,KEBNE ,17042201,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:29:40 CET,0.0 0.419 0.573 0.699 0.81 0.901 0.98 1.065 1.21 1.266 1.325 1.377 1.498 1.559 1.672 1.772 1.862 1.905 1.993 2.077 2.201 2.28 2.351 2.466 2.584 2.685 2.778 2.883 3.023 3.148 3.256 3.389 3.535 3.672 3.829 4.009 4.193 4.39 4.602 4.836 5.072 5.332 5.63 5.928 6.251 6.585 6.966 7.329 7.685 7.983 8.03 7.708 7.209 6.678 6.165 5.668 5.211 4.789 4.406 3.993 3.638 3.333 3.035 2.732 2.456 2.205 1.92 1.675 1.463 1.23 0.985 0.782 0.565 0.329 0.145 -0.041 -0.231 -0.422 -0.62 -0.759 -0.9 -1.111 -1.267 -1.44 -1.528 -1.722 -1.933 -2.144 -2.261 -2.436 -2.637 -2.783 -2.928 -3.249 -3.413 -3.597 -3.81 -4.04 -4.374 -4.825 -6.111 -9 ,5023 ,KEBNE ,17042202,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:31:03 CET,0.0 0.345 0.534 0.668 0.772 0.871 0.949 1.024 1.17 1.242 1.313 1.384 1.509 1.564 1.661 1.747 1.832 1.879 1.974 2.067 2.2 2.279 2.349 2.451 2.566 2.681 2.78 2.874 2.999 3.132 3.256 3.398 3.54 3.667 3.82 3.998 4.163 4.346 4.545 4.759 4.986 5.244 5.549 5.836 6.14 6.491 6.881 7.281 7.674 7.972 8.081 7.871 7.432 6.892 6.365 5.862 5.391 4.942 4.53 4.111 3.754 3.402 3.068 2.763 2.461 2.181 1.884 1.605 1.353 1.076 0.783 0.551 0.305 0.051 -0.151 -0.356 -0.555 -0.766 -0.99 -1.152 -1.327 -1.601 -1.786 -1.968 -2.056 -2.236 -2.416 -2.626 -2.741 -2.908 -3.095 -3.226 -3.361 -3.637 -3.797 -3.971 -4.184 -4.481 -4.813 -5.248 -7.855 -10 ,23724 ,KEBNE ,17042203,Thu Dec 23 04:04:16 CET,Thu Dec 23 05:30:10 CET,0.0 0.332 0.482 0.61 0.715 0.803 0.88 0.953 1.075 1.132 1.191 1.232 1.348 1.405 1.53 1.635 1.732 1.784 1.877 1.965 2.091 2.176 2.265 2.385 2.5 2.615 2.727 2.831 2.965 3.094 3.218 3.363 3.505 3.649 3.8 3.962 4.129 4.309 4.507 4.715 4.941 5.208 5.515 5.827 6.162 6.498 6.88 7.285 7.635 7.897 7.946 7.625 7.168 6.635 6.1 5.605 5.15 4.717 4.325 3.925 3.566 3.234 2.92 2.62 2.343 2.088 1.81 1.551 1.318 1.058 0.783 0.572 0.36 0.143 -0.016 -0.185 -0.369 -0.562 -0.766 -0.906 -1.053 -1.294 -1.451 -1.62 -1.71 -1.894 -2.093 -2.326 -2.453 -2.632 -2.825 -2.959 -3.099 -3.412 -3.568 -3.735 -3.948 -4.218 -4.512 -4.95 -6.52 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_16_14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_16_14.txt deleted file mode 100644 index 32040c52..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_16_14.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9274 ,KEBNE ,16653871,Mon Nov 22 04:49:47 CET,Mon Nov 22 06:10:55 CET,0.0 0.474 0.664 0.787 0.893 0.982 1.067 1.154 1.312 1.374 1.434 1.497 1.616 1.678 1.795 1.898 1.999 2.049 2.144 2.232 2.359 2.439 2.517 2.626 2.732 2.829 2.925 3.026 3.159 3.286 3.415 3.576 3.719 3.859 4.037 4.232 4.412 4.594 4.777 4.976 5.186 5.432 5.694 5.917 6.175 6.46 6.788 7.093 7.354 7.578 7.688 7.529 7.252 6.949 6.619 6.297 6.017 5.728 5.477 5.22 4.986 4.792 4.615 4.443 4.264 4.078 3.874 3.7 3.544 3.385 3.226 3.085 2.935 2.781 2.659 2.531 2.391 2.211 2.014 1.902 1.799 1.622 1.488 1.351 1.28 1.13 0.98 0.84 0.76 0.606 0.444 0.326 0.211 -0.038 -0.18 -0.325 -0.516 -0.761 -1.036 -1.417 -4.374 -2 ,19968 ,KEBNE ,16653872,Mon Nov 22 04:49:50 CET,Mon Nov 22 06:09:39 CET,0.0 0.426 0.579 0.691 0.781 0.871 0.957 1.037 1.176 1.24 1.308 1.378 1.498 1.556 1.655 1.743 1.834 1.88 1.965 2.051 2.168 2.247 2.332 2.446 2.554 2.666 2.783 2.887 3.014 3.139 3.253 3.396 3.53 3.658 3.805 3.965 4.136 4.321 4.508 4.692 4.88 5.101 5.342 5.556 5.814 6.12 6.418 6.684 6.988 7.25 7.387 7.274 7.052 6.771 6.493 6.205 5.912 5.641 5.358 5.073 4.86 4.664 4.464 4.269 4.08 3.899 3.713 3.54 3.38 3.213 3.026 2.89 2.76 2.605 2.487 2.362 2.221 2.085 1.945 1.847 1.755 1.613 1.51 1.391 1.327 1.185 1.024 0.863 0.775 0.63 0.489 0.378 0.266 0.004 -0.14 -0.289 -0.451 -0.655 -0.901 -1.233 -3.578 -3 ,24029 ,KEBNE ,16653873,Mon Nov 22 04:50:49 CET,Mon Nov 22 06:11:59 CET,0.0 0.406 0.538 0.642 0.747 0.842 0.938 1.028 1.164 1.22 1.276 1.334 1.452 1.505 1.599 1.686 1.772 1.816 1.899 1.986 2.128 2.214 2.286 2.405 2.524 2.632 2.732 2.822 2.936 3.051 3.172 3.311 3.442 3.571 3.727 3.899 4.076 4.274 4.462 4.653 4.855 5.084 5.36 5.625 5.918 6.215 6.513 6.849 7.194 7.476 7.612 7.527 7.261 6.937 6.626 6.331 6.045 5.773 5.533 5.277 5.059 4.876 4.698 4.499 4.307 4.157 3.996 3.831 3.672 3.512 3.355 3.228 3.077 2.913 2.795 2.668 2.539 2.405 2.267 2.167 2.056 1.894 1.781 1.663 1.603 1.47 1.311 1.146 1.063 0.917 0.783 0.685 0.573 0.284 0.128 -0.027 -0.185 -0.362 -0.587 -0.945 -2.803 -4 ,11684 ,KEBNE ,16653874,Mon Nov 22 04:50:53 CET,Mon Nov 22 06:08:01 CET,0.0 0.598 0.748 0.852 0.943 1.024 1.106 1.194 1.345 1.404 1.47 1.548 1.667 1.729 1.858 1.974 2.078 2.123 2.212 2.302 2.433 2.522 2.61 2.733 2.847 2.951 3.047 3.135 3.246 3.365 3.488 3.632 3.776 3.91 4.054 4.215 4.369 4.542 4.738 4.934 5.128 5.348 5.595 5.818 6.093 6.425 6.774 7.092 7.371 7.708 7.885 7.7 7.423 7.118 6.839 6.554 6.245 5.939 5.674 5.424 5.207 5.008 4.825 4.629 4.431 4.259 4.09 3.941 3.794 3.627 3.477 3.351 3.202 3.052 2.937 2.815 2.692 2.567 2.414 2.304 2.201 2.035 1.923 1.805 1.743 1.623 1.475 1.302 1.22 1.08 0.931 0.823 0.712 0.485 0.374 0.23 0.061 -0.125 -0.388 -0.843 -3.032 -5 ,22445 ,KEBNE ,16653875,Mon Nov 22 04:51:51 CET,Mon Nov 22 06:13:11 CET,0.0 0.467 0.659 0.807 0.919 1.022 1.129 1.224 1.396 1.472 1.554 1.665 1.79 1.863 2.004 2.121 2.238 2.293 2.39 2.486 2.617 2.7 2.788 2.908 3.019 3.129 3.237 3.345 3.478 3.6 3.721 3.866 4.011 4.165 4.332 4.495 4.648 4.82 5.004 5.205 5.417 5.635 5.892 6.158 6.443 6.706 6.991 7.303 7.627 7.965 8.136 7.994 7.737 7.432 7.1 6.762 6.441 6.156 5.925 5.661 5.407 5.191 4.999 4.808 4.619 4.437 4.242 4.075 3.928 3.766 3.595 3.431 3.262 3.098 2.959 2.816 2.67 2.514 2.36 2.262 2.161 1.979 1.839 1.717 1.661 1.526 1.387 1.247 1.16 1.004 0.863 0.767 0.668 0.444 0.304 0.138 -0.045 -0.259 -0.525 -0.931 -2.169 -6 ,16086 ,KEBNE ,16653876,Mon Nov 22 04:51:51 CET,Mon Nov 22 06:13:11 CET,0.0 0.473 0.621 0.746 0.866 0.963 1.062 1.156 1.309 1.38 1.459 1.563 1.694 1.762 1.889 2.02 2.138 2.186 2.289 2.397 2.548 2.644 2.745 2.887 3.01 3.139 3.273 3.396 3.544 3.671 3.79 3.949 4.1 4.235 4.385 4.558 4.739 4.944 5.151 5.367 5.609 5.88 6.186 6.473 6.762 7.01 7.304 7.656 7.975 8.221 8.346 8.193 7.912 7.621 7.323 6.988 6.668 6.375 6.11 5.819 5.538 5.291 5.071 4.858 4.64 4.449 4.263 4.084 3.927 3.753 3.569 3.426 3.281 3.134 3.016 2.889 2.757 2.613 2.451 2.35 2.252 2.098 1.99 1.877 1.813 1.668 1.519 1.363 1.28 1.135 1.023 0.938 0.846 0.611 0.477 0.317 0.117 -0.084 -0.303 -0.66 -2.793 -7 ,30320 ,KEBNE ,16653877,Mon Nov 22 04:51:55 CET,Mon Nov 22 06:10:38 CET,0.0 0.372 0.541 0.663 0.753 0.827 0.901 0.975 1.115 1.183 1.246 1.304 1.416 1.464 1.574 1.676 1.764 1.81 1.898 1.983 2.113 2.199 2.276 2.385 2.497 2.603 2.703 2.805 2.943 3.071 3.19 3.341 3.479 3.596 3.743 3.921 4.083 4.262 4.45 4.635 4.835 5.054 5.324 5.615 5.906 6.216 6.588 6.983 7.34 7.583 7.653 7.478 7.243 6.942 6.583 6.241 5.934 5.64 5.381 5.128 4.912 4.708 4.493 4.284 4.076 3.877 3.69 3.53 3.396 3.26 3.082 2.922 2.773 2.631 2.506 2.378 2.256 2.119 1.966 1.863 1.761 1.601 1.487 1.368 1.305 1.184 1.053 0.89 0.802 0.66 0.528 0.423 0.313 0.065 -0.08 -0.219 -0.379 -0.584 -0.825 -1.262 -2.814 -8 ,887 ,KEBNE ,16653878,Mon Nov 22 04:52:54 CET,Mon Nov 22 06:15:34 CET,0.0 0.275 0.412 0.551 0.66 0.742 0.829 0.915 1.039 1.098 1.167 1.235 1.351 1.413 1.53 1.63 1.727 1.771 1.85 1.938 2.071 2.16 2.241 2.35 2.458 2.563 2.676 2.792 2.941 3.076 3.201 3.339 3.469 3.601 3.748 3.918 4.069 4.227 4.391 4.57 4.77 4.978 5.222 5.463 5.745 6.032 6.323 6.673 7.049 7.363 7.594 7.529 7.264 6.928 6.601 6.306 6.03 5.759 5.517 5.244 4.994 4.775 4.566 4.373 4.201 4.027 3.838 3.679 3.534 3.384 3.22 3.087 2.953 2.805 2.69 2.568 2.441 2.305 2.165 2.066 1.961 1.791 1.665 1.541 1.476 1.347 1.211 1.062 0.983 0.838 0.707 0.614 0.506 0.246 0.095 -0.071 -0.24 -0.447 -0.714 -1.099 -3.02 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_16_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_16_15.txt deleted file mode 100644 index a2639582..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_16_15.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11224 ,KEBNE ,16838603,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:32:08 CET,0.0 1.33 1.799 2.142 2.383 2.579 2.759 2.912 3.193 3.333 3.463 3.66 3.841 3.946 4.138 4.315 4.487 4.575 4.751 4.931 5.17 5.321 5.461 5.643 5.842 6.039 6.212 6.387 6.625 6.851 7.058 7.293 7.508 7.732 8.005 8.294 8.564 8.856 9.175 9.502 9.839 10.237 10.696 11.115 11.547 11.967 12.388 12.847 13.387 13.925 14.249 14.13 13.827 13.461 13.064 12.706 12.361 12.023 11.725 11.405 11.154 10.946 10.738 10.531 10.345 10.197 10.039 9.883 9.74 9.601 9.454 9.329 9.211 9.087 8.978 8.869 8.767 8.657 8.539 8.458 8.381 8.253 8.159 8.07 8.024 7.924 7.827 7.735 7.685 7.564 7.502 7.442 7.384 7.262 7.188 7.097 6.998 6.894 6.783 6.637 6.33 -3 ,13237 ,KEBNE ,16838605,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:33:42 CET,0.0 1.872 2.261 2.586 2.815 3.015 3.24 3.437 3.752 3.89 4.021 4.222 4.396 4.5 4.706 4.915 5.114 5.207 5.381 5.541 5.76 5.898 6.043 6.256 6.456 6.657 6.855 7.043 7.283 7.507 7.727 7.989 8.228 8.461 8.737 9.058 9.362 9.664 9.985 10.311 10.635 11.019 11.44 11.824 12.256 12.707 13.167 13.642 14.159 14.581 14.79 14.684 14.364 13.962 13.536 13.096 12.703 12.355 12.059 11.75 11.483 11.25 11.028 10.832 10.632 10.44 10.258 10.101 9.97 9.835 9.696 9.586 9.47 9.345 9.248 9.144 9.04 8.937 8.828 8.751 8.675 8.548 8.454 8.358 8.31 8.216 8.12 8.029 7.976 7.854 7.801 7.734 7.669 7.552 7.485 7.399 7.305 7.201 7.085 6.941 6.611 -4 ,20046 ,KEBNE ,16838606,Sun Dec 5 19:06:53 CET,Sun Dec 5 20:32:05 CET,0.0 1.26 1.656 1.995 2.261 2.458 2.638 2.819 3.126 3.27 3.41 3.621 3.801 3.912 4.116 4.297 4.482 4.573 4.742 4.902 5.143 5.304 5.459 5.661 5.852 6.044 6.236 6.429 6.687 6.934 7.165 7.437 7.685 7.922 8.206 8.517 8.797 9.109 9.416 9.704 10.033 10.413 10.837 11.236 11.67 12.127 12.578 13.041 13.568 14.109 14.549 14.549 14.241 13.876 13.504 13.126 12.79 12.455 12.166 11.866 11.602 11.386 11.181 10.967 10.77 10.596 10.403 10.233 10.098 9.949 9.796 9.68 9.555 9.431 9.344 9.252 9.142 9.027 8.915 8.836 8.752 8.623 8.54 8.455 8.412 8.317 8.213 8.105 8.046 7.918 7.855 7.789 7.714 7.552 7.467 7.377 7.272 7.158 7.031 6.875 6.425 -5 ,14770 ,KEBNE ,16838607,Sun Dec 5 19:06:53 CET,Sun Dec 5 20:33:29 CET,0.0 1.223 1.699 2.081 2.359 2.606 2.844 3.048 3.408 3.562 3.709 3.938 4.129 4.259 4.503 4.729 4.939 5.044 5.25 5.458 5.742 5.916 6.082 6.318 6.548 6.751 6.939 7.127 7.365 7.601 7.825 8.076 8.309 8.53 8.786 9.096 9.401 9.709 10.04 10.388 10.722 11.085 11.494 11.913 12.391 12.864 13.344 13.8 14.326 14.861 15.151 14.964 14.613 14.223 13.791 13.377 13.026 12.706 12.422 12.119 11.865 11.641 11.415 11.21 11.022 10.847 10.675 10.523 10.376 10.228 10.089 9.975 9.849 9.716 9.617 9.509 9.404 9.305 9.19 9.103 9.022 8.901 8.816 8.737 8.692 8.586 8.477 8.365 8.313 8.196 8.161 8.109 8.051 7.923 7.848 7.76 7.663 7.567 7.454 7.317 6.844 -6 ,22161 ,KEBNE ,16838608,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:32:39 CET,0.0 0.91 1.33 1.633 1.906 2.116 2.324 2.528 2.864 3.018 3.158 3.342 3.508 3.603 3.803 4.002 4.178 4.263 4.437 4.597 4.825 4.978 5.119 5.326 5.523 5.705 5.882 6.05 6.264 6.468 6.661 6.896 7.131 7.358 7.613 7.913 8.2 8.509 8.83 9.148 9.469 9.828 10.244 10.638 11.086 11.559 12.058 12.57 13.103 13.603 13.931 13.849 13.489 13.095 12.723 12.372 12.027 11.673 11.378 11.103 10.857 10.624 10.417 10.224 10.02 9.835 9.656 9.5 9.361 9.204 9.041 8.906 8.761 8.609 8.497 8.389 8.281 8.17 8.054 7.973 7.882 7.741 7.653 7.563 7.515 7.412 7.303 7.191 7.137 7.014 6.953 6.89 6.821 6.684 6.6 6.496 6.404 6.313 6.193 6.01 5.139 -7 ,6464 ,KEBNE ,16838609,Sun Dec 5 19:06:53 CET,Sun Dec 5 20:32:01 CET,0.0 1.495 1.951 2.283 2.584 2.842 3.041 3.213 3.542 3.694 3.849 4.101 4.307 4.447 4.697 4.926 5.141 5.245 5.451 5.643 5.926 6.111 6.282 6.503 6.727 6.959 7.176 7.375 7.635 7.891 8.127 8.393 8.643 8.895 9.2 9.538 9.837 10.145 10.473 10.813 11.187 11.603 12.046 12.444 12.865 13.347 13.861 14.338 14.809 15.209 15.429 15.266 14.933 14.554 14.133 13.713 13.337 13.011 12.727 12.427 12.186 11.975 11.761 11.563 11.367 11.179 10.989 10.825 10.682 10.537 10.384 10.257 10.132 10.009 9.913 9.806 9.701 9.6 9.479 9.39 9.3 9.168 9.087 8.996 8.948 8.855 8.755 8.644 8.584 8.457 8.386 8.319 8.26 8.135 8.064 7.986 7.899 7.791 7.681 7.544 7.257 -8 ,30039 ,KEBNE ,16838610,Sun Dec 5 19:06:53 CET,Sun Dec 5 20:33:52 CET,0.0 1.587 2.055 2.368 2.622 2.863 3.09 3.268 3.587 3.743 3.892 4.094 4.265 4.376 4.596 4.804 4.981 5.065 5.248 5.427 5.663 5.819 5.965 6.169 6.354 6.524 6.695 6.872 7.097 7.296 7.491 7.734 7.956 8.159 8.404 8.679 8.947 9.238 9.531 9.849 10.181 10.551 10.976 11.395 11.841 12.292 12.78 13.29 13.828 14.309 14.601 14.538 14.2 13.795 13.371 12.99 12.673 12.337 12.053 11.765 11.49 11.253 11.041 10.841 10.651 10.482 10.305 10.143 10.009 9.865 9.713 9.581 9.439 9.303 9.196 9.078 8.958 8.838 8.725 8.646 8.562 8.439 8.353 8.271 8.229 8.135 8.031 7.925 7.866 7.742 7.695 7.633 7.567 7.434 7.367 7.285 7.189 7.097 7.002 6.847 6.496 -9 ,32598 ,KEBNE ,16838611,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:32:56 CET,0.0 1.409 1.76 2.052 2.307 2.532 2.716 2.888 3.197 3.336 3.474 3.661 3.826 3.932 4.148 4.337 4.518 4.609 4.772 4.924 5.152 5.299 5.442 5.646 5.838 6.026 6.209 6.395 6.637 6.861 7.08 7.328 7.562 7.782 8.039 8.341 8.618 8.903 9.215 9.561 9.921 10.316 10.745 11.148 11.611 12.093 12.597 13.107 13.629 14.107 14.431 14.315 13.99 13.651 13.274 12.876 12.521 12.191 11.916 11.638 11.363 11.116 10.881 10.658 10.453 10.28 10.119 9.964 9.826 9.677 9.51 9.375 9.241 9.107 9.013 8.921 8.824 8.724 8.616 8.541 8.465 8.339 8.247 8.153 8.106 8.0 7.894 7.791 7.739 7.62 7.561 7.496 7.431 7.304 7.233 7.153 7.07 6.98 6.864 6.686 6.282 -10 ,6496 ,KEBNE ,16838612,Sun Dec 5 19:06:54 CET,Sun Dec 5 20:31:54 CET,0.0 1.155 1.65 1.977 2.247 2.457 2.635 2.806 3.089 3.218 3.342 3.519 3.694 3.804 4.017 4.233 4.418 4.499 4.668 4.831 5.07 5.222 5.358 5.549 5.736 5.926 6.112 6.289 6.519 6.741 6.943 7.176 7.406 7.629 7.88 8.149 8.395 8.67 8.98 9.32 9.665 10.02 10.424 10.811 11.212 11.629 12.094 12.585 13.105 13.563 13.866 13.756 13.433 13.045 12.652 12.286 11.955 11.651 11.378 11.088 10.837 10.617 10.383 10.175 9.999 9.815 9.624 9.465 9.326 9.183 9.031 8.906 8.774 8.635 8.535 8.436 8.321 8.189 8.048 7.95 7.855 7.709 7.605 7.505 7.462 7.375 7.27 7.16 7.11 6.988 6.921 6.851 6.785 6.641 6.546 6.436 6.326 6.209 6.075 5.897 5.116 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_17_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_17_15.txt deleted file mode 100644 index 70d2c865..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_17_15.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15137 ,KEBNE ,16653881,Mon Nov 22 04:52:54 CET,Mon Nov 22 06:15:56 CET,0.0 0.852 1.168 1.4 1.61 1.807 1.971 2.119 2.401 2.528 2.649 2.825 3.008 3.126 3.359 3.585 3.799 3.898 4.083 4.268 4.513 4.659 4.801 5.011 5.216 5.415 5.604 5.774 5.991 6.219 6.443 6.723 6.999 7.259 7.574 7.925 8.248 8.612 8.987 9.358 9.731 10.127 10.536 10.929 11.37 11.843 12.373 12.911 13.45 13.927 14.286 14.308 14.114 13.851 13.555 13.242 12.941 12.677 12.436 12.155 11.897 11.671 11.461 11.256 11.046 10.841 10.647 10.492 10.354 10.203 10.042 9.902 9.756 9.607 9.492 9.378 9.248 9.098 8.959 8.871 8.781 8.635 8.532 8.428 8.372 8.256 8.131 7.991 7.924 7.788 7.711 7.644 7.56 7.354 7.25 7.132 7.001 6.845 6.658 6.427 5.624 -2 ,26458 ,KEBNE ,16653882,Mon Nov 22 04:53:56 CET,Mon Nov 22 06:17:10 CET,0.0 1.413 1.8 2.063 2.265 2.456 2.624 2.774 3.047 3.183 3.316 3.5 3.678 3.781 3.959 4.138 4.315 4.393 4.544 4.696 4.904 5.033 5.157 5.334 5.514 5.692 5.869 6.031 6.231 6.426 6.618 6.861 7.084 7.296 7.554 7.85 8.135 8.441 8.76 9.089 9.428 9.8 10.229 10.641 11.068 11.505 12.033 12.61 13.198 13.713 14.115 14.195 13.997 13.736 13.438 13.131 12.842 12.568 12.3 12.013 11.776 11.556 11.352 11.177 11.002 10.829 10.644 10.474 10.339 10.203 10.05 9.927 9.805 9.679 9.581 9.478 9.367 9.238 9.097 9.004 8.912 8.774 8.68 8.574 8.518 8.396 8.272 8.141 8.074 7.944 7.86 7.784 7.697 7.482 7.365 7.261 7.143 6.991 6.807 6.564 5.804 -3 ,12192 ,KEBNE ,16653883,Mon Nov 22 04:53:56 CET,Mon Nov 22 06:16:37 CET,0.0 1.26 1.622 1.893 2.119 2.316 2.501 2.665 2.977 3.114 3.227 3.382 3.549 3.655 3.858 4.042 4.221 4.31 4.476 4.639 4.865 4.996 5.115 5.298 5.483 5.659 5.82 5.984 6.19 6.381 6.563 6.778 6.997 7.205 7.425 7.656 7.892 8.167 8.435 8.709 9.013 9.364 9.785 10.21 10.676 11.155 11.658 12.169 12.715 13.24 13.643 13.721 13.56 13.309 13.026 12.742 12.482 12.222 11.975 11.734 11.522 11.321 11.123 10.921 10.741 10.572 10.381 10.205 10.053 9.901 9.748 9.635 9.508 9.367 9.266 9.151 9.022 8.903 8.782 8.692 8.6 8.461 8.355 8.237 8.181 8.07 7.966 7.859 7.798 7.668 7.588 7.511 7.419 7.235 7.139 7.025 6.901 6.77 6.613 6.363 5.499 -4 ,1935 ,KEBNE ,16653884,Mon Nov 22 04:53:56 CET,Mon Nov 22 06:16:34 CET,0.0 1.393 1.702 1.925 2.14 2.345 2.505 2.645 2.93 3.051 3.164 3.316 3.476 3.579 3.778 3.954 4.118 4.197 4.35 4.494 4.7 4.831 4.953 5.141 5.327 5.507 5.679 5.848 6.069 6.272 6.465 6.686 6.893 7.092 7.313 7.562 7.798 8.058 8.343 8.653 8.983 9.339 9.724 10.098 10.549 11.028 11.563 12.114 12.67 13.242 13.685 13.708 13.511 13.239 12.943 12.65 12.324 12.038 11.815 11.564 11.336 11.145 10.96 10.749 10.539 10.355 10.157 9.991 9.851 9.7 9.551 9.408 9.248 9.107 8.996 8.871 8.744 8.617 8.481 8.382 8.282 8.117 8.003 7.891 7.833 7.717 7.591 7.456 7.383 7.242 7.13 7.04 6.952 6.752 6.637 6.519 6.407 6.283 6.146 5.981 5.15 -5 ,18443 ,KEBNE ,16653885,Mon Nov 22 04:53:56 CET,Mon Nov 22 06:16:34 CET,0.0 1.122 1.457 1.749 1.999 2.187 2.361 2.502 2.75 2.876 3.005 3.182 3.348 3.445 3.628 3.8 3.969 4.05 4.196 4.34 4.547 4.678 4.815 5.004 5.166 5.329 5.496 5.663 5.886 6.091 6.281 6.521 6.75 6.971 7.227 7.502 7.767 8.052 8.363 8.703 9.041 9.394 9.782 10.172 10.653 11.151 11.656 12.186 12.765 13.333 13.766 13.806 13.557 13.259 12.981 12.668 12.353 12.089 11.856 11.606 11.381 11.151 10.924 10.726 10.541 10.366 10.179 10.014 9.87 9.718 9.566 9.439 9.31 9.173 9.063 8.955 8.842 8.712 8.578 8.489 8.394 8.24 8.137 8.045 7.997 7.88 7.757 7.634 7.563 7.425 7.345 7.267 7.186 7.004 6.892 6.767 6.612 6.426 6.214 5.945 5.258 -6 ,17556 ,KEBNE ,16653886,Mon Nov 22 04:53:58 CET,Mon Nov 22 06:12:59 CET,0.0 0.916 1.273 1.568 1.794 1.988 2.169 2.347 2.673 2.802 2.924 3.078 3.243 3.345 3.542 3.732 3.911 3.989 4.148 4.311 4.547 4.697 4.85 5.083 5.3 5.499 5.691 5.877 6.114 6.341 6.558 6.812 7.048 7.279 7.542 7.816 8.076 8.367 8.678 9.012 9.353 9.71 10.123 10.536 10.972 11.434 11.945 12.453 13.002 13.527 13.905 13.908 13.681 13.413 13.115 12.788 12.491 12.228 11.992 11.741 11.523 11.314 11.107 10.9 10.714 10.567 10.395 10.24 10.11 9.974 9.831 9.706 9.58 9.446 9.347 9.241 9.121 9.005 8.878 8.796 8.716 8.578 8.488 8.391 8.339 8.231 8.116 7.986 7.913 7.779 7.698 7.615 7.531 7.348 7.248 7.145 7.02 6.866 6.688 6.433 5.507 -8 ,5045 ,KEBNE ,16653888,Mon Nov 22 04:54:57 CET,Mon Nov 22 06:17:52 CET,0.0 1.131 1.5 1.766 1.982 2.197 2.383 2.538 2.812 2.939 3.059 3.23 3.399 3.504 3.728 3.932 4.121 4.213 4.388 4.547 4.774 4.93 5.087 5.31 5.518 5.715 5.908 6.087 6.305 6.528 6.745 7.018 7.275 7.496 7.742 7.998 8.254 8.552 8.863 9.179 9.495 9.856 10.278 10.68 11.12 11.567 12.058 12.575 13.154 13.749 14.118 14.097 13.861 13.556 13.251 12.929 12.641 12.361 12.08 11.802 11.575 11.369 11.174 10.978 10.788 10.61 10.423 10.26 10.116 9.965 9.811 9.684 9.556 9.426 9.325 9.221 9.113 8.999 8.883 8.806 8.728 8.604 8.51 8.399 8.344 8.233 8.098 7.956 7.887 7.75 7.666 7.588 7.504 7.323 7.225 7.11 6.965 6.806 6.645 6.458 6.107 -9 ,24610 ,KEBNE ,16653889,Mon Nov 22 04:54:58 CET,Mon Nov 22 06:17:37 CET,0.0 0.852 1.193 1.48 1.727 1.905 2.07 2.222 2.513 2.644 2.756 2.913 3.086 3.199 3.388 3.555 3.732 3.81 3.965 4.128 4.359 4.494 4.625 4.827 5.012 5.184 5.353 5.513 5.71 5.906 6.096 6.317 6.541 6.777 7.051 7.349 7.63 7.927 8.217 8.527 8.844 9.178 9.576 9.967 10.404 10.854 11.327 11.838 12.398 12.955 13.383 13.475 13.321 13.085 12.847 12.574 12.277 11.996 11.782 11.565 11.353 11.149 10.952 10.768 10.595 10.434 10.27 10.116 9.972 9.823 9.678 9.555 9.425 9.298 9.2 9.095 8.978 8.853 8.719 8.629 8.536 8.384 8.287 8.189 8.136 8.019 7.892 7.769 7.705 7.568 7.484 7.403 7.313 7.128 7.016 6.889 6.763 6.629 6.463 6.228 5.502 -10 ,19944 ,KEBNE ,16653890,Mon Nov 22 04:55:01 CET,Mon Nov 22 06:15:51 CET,0.0 1.037 1.413 1.674 1.879 2.044 2.213 2.383 2.679 2.818 2.944 3.117 3.295 3.393 3.582 3.765 3.927 4.002 4.149 4.31 4.535 4.658 4.777 4.971 5.167 5.347 5.522 5.697 5.904 6.104 6.298 6.534 6.77 6.987 7.236 7.519 7.793 8.098 8.404 8.703 9.004 9.352 9.769 10.154 10.597 11.077 11.575 12.08 12.633 13.182 13.557 13.62 13.474 13.225 12.965 12.699 12.43 12.145 11.893 11.654 11.433 11.215 11.001 10.799 10.609 10.443 10.284 10.135 9.992 9.842 9.689 9.559 9.421 9.267 9.139 9.006 8.875 8.754 8.638 8.553 8.454 8.292 8.181 8.064 8.003 7.878 7.753 7.63 7.564 7.432 7.366 7.296 7.215 7.017 6.913 6.805 6.683 6.537 6.353 6.12 5.493 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_18_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_18_15.txt deleted file mode 100644 index 1aeb8079..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_18_15.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7626 ,KEBNE ,17023485,Wed Dec 22 08:12:50 CET,Wed Dec 22 09:39:06 CET,0.0 0.874 1.207 1.466 1.691 1.881 2.061 2.237 2.533 2.678 2.824 3.021 3.208 3.323 3.55 3.76 3.962 4.062 4.251 4.428 4.675 4.831 4.986 5.213 5.429 5.628 5.82 6.008 6.254 6.503 6.757 7.056 7.345 7.626 7.937 8.29 8.65 9.013 9.344 9.67 10.015 10.402 10.82 11.227 11.689 12.2 12.816 13.483 14.119 14.747 15.303 15.484 15.377 15.173 14.946 14.692 14.473 14.254 14.039 13.827 13.638 13.466 13.306 13.161 13.014 12.853 12.685 12.538 12.413 12.284 12.14 12.023 11.895 11.763 11.669 11.579 11.481 11.375 11.269 11.195 11.108 10.978 10.895 10.797 10.744 10.63 10.522 10.41 10.338 10.203 10.127 10.05 9.966 9.79 9.703 9.606 9.478 9.326 9.184 8.987 8.362 -2 ,30059 ,KEBNE ,17023486,Wed Dec 22 08:12:50 CET,Wed Dec 22 09:39:02 CET,0.0 1.512 1.888 2.162 2.364 2.551 2.734 2.902 3.205 3.328 3.447 3.617 3.788 3.886 4.072 4.25 4.421 4.506 4.668 4.82 5.04 5.181 5.314 5.494 5.671 5.86 6.038 6.204 6.415 6.616 6.814 7.054 7.276 7.49 7.752 8.05 8.322 8.617 8.933 9.271 9.625 10.003 10.414 10.801 11.247 11.714 12.224 12.781 13.429 14.15 14.762 14.979 14.889 14.71 14.511 14.274 14.049 13.854 13.663 13.455 13.255 13.047 12.839 12.64 12.467 12.314 12.141 11.992 11.869 11.746 11.62 11.513 11.397 11.277 11.179 11.075 10.968 10.858 10.753 10.684 10.611 10.479 10.38 10.287 10.237 10.126 10.018 9.907 9.855 9.731 9.649 9.569 9.477 9.285 9.194 9.094 8.988 8.865 8.711 8.484 7.967 -3 ,2156 ,KEBNE ,17023487,Wed Dec 22 08:12:50 CET,Wed Dec 22 09:39:21 CET,0.0 1.369 1.674 1.894 2.097 2.266 2.43 2.583 2.839 2.954 3.068 3.227 3.397 3.49 3.66 3.829 3.991 4.07 4.215 4.359 4.586 4.731 4.859 5.046 5.232 5.419 5.603 5.779 6.009 6.229 6.442 6.694 6.932 7.163 7.417 7.707 7.984 8.276 8.608 8.947 9.286 9.671 10.111 10.55 11.041 11.565 12.124 12.744 13.412 14.072 14.699 14.963 14.923 14.766 14.569 14.33 14.06 13.79 13.557 13.342 13.156 12.973 12.794 12.63 12.465 12.306 12.144 11.994 11.859 11.724 11.579 11.457 11.333 11.183 11.07 10.966 10.855 10.735 10.616 10.521 10.42 10.288 10.193 10.093 10.048 9.954 9.856 9.748 9.69 9.569 9.505 9.431 9.352 9.178 9.078 8.972 8.862 8.724 8.554 8.349 7.885 -4 ,10438 ,KEBNE ,17023488,Wed Dec 22 08:12:50 CET,Wed Dec 22 09:39:08 CET,0.0 1.185 1.575 1.865 2.1 2.291 2.455 2.611 2.896 3.017 3.124 3.274 3.445 3.551 3.747 3.909 4.068 4.152 4.323 4.477 4.68 4.818 4.95 5.134 5.314 5.488 5.67 5.856 6.097 6.333 6.55 6.791 7.037 7.283 7.563 7.864 8.139 8.451 8.784 9.124 9.481 9.876 10.332 10.786 11.287 11.789 12.319 12.91 13.544 14.167 14.736 15.022 14.999 14.841 14.647 14.42 14.214 14.009 13.806 13.59 13.392 13.203 13.013 12.839 12.676 12.52 12.345 12.197 12.081 11.95 11.817 11.71 11.592 11.473 11.376 11.259 11.139 11.019 10.888 10.8 10.714 10.582 10.49 10.398 10.35 10.252 10.144 10.032 9.976 9.845 9.765 9.692 9.614 9.456 9.373 9.274 9.171 9.043 8.877 8.705 8.355 -5 ,8514 ,KEBNE ,17023489,Wed Dec 22 08:12:51 CET,Wed Dec 22 09:39:27 CET,0.0 0.947 1.272 1.553 1.8 2.019 2.204 2.356 2.613 2.745 2.88 3.066 3.244 3.345 3.528 3.692 3.85 3.93 4.087 4.235 4.447 4.59 4.735 4.953 5.176 5.397 5.596 5.783 6.01 6.227 6.447 6.698 6.939 7.185 7.462 7.757 8.041 8.342 8.663 9.012 9.353 9.745 10.212 10.653 11.148 11.677 12.254 12.858 13.509 14.213 14.843 15.017 14.938 14.796 14.586 14.355 14.132 13.903 13.702 13.49 13.279 13.088 12.898 12.72 12.559 12.395 12.217 12.057 11.926 11.796 11.652 11.53 11.401 11.26 11.143 11.027 10.911 10.784 10.65 10.558 10.469 10.326 10.219 10.114 10.064 9.964 9.863 9.754 9.696 9.565 9.487 9.416 9.339 9.16 9.059 8.953 8.844 8.721 8.559 8.379 8.046 -6 ,10368 ,KEBNE ,17023490,Wed Dec 22 08:12:50 CET,Wed Dec 22 09:39:34 CET,0.0 1.104 1.443 1.696 1.899 2.071 2.225 2.383 2.67 2.794 2.908 3.058 3.225 3.332 3.533 3.717 3.897 3.982 4.14 4.295 4.515 4.649 4.786 4.993 5.188 5.379 5.578 5.775 6.018 6.244 6.456 6.71 6.959 7.193 7.456 7.757 8.044 8.358 8.689 9.036 9.397 9.783 10.217 10.639 11.13 11.631 12.188 12.797 13.447 14.152 14.821 15.055 14.991 14.835 14.605 14.359 14.137 13.911 13.698 13.481 13.272 13.084 12.915 12.755 12.601 12.449 12.289 12.148 12.021 11.893 11.769 11.666 11.552 11.428 11.33 11.233 11.134 11.029 10.916 10.839 10.763 10.637 10.532 10.428 10.381 10.284 10.174 10.054 9.996 9.872 9.802 9.73 9.651 9.47 9.36 9.251 9.15 9.016 8.845 8.654 8.111 -7 ,21135 ,KEBNE ,17023491,Wed Dec 22 08:12:51 CET,Wed Dec 22 09:39:08 CET,0.0 1.185 1.505 1.733 1.913 2.068 2.211 2.35 2.591 2.705 2.813 2.967 3.139 3.24 3.435 3.623 3.815 3.909 4.084 4.263 4.519 4.671 4.821 5.041 5.243 5.435 5.626 5.805 6.026 6.239 6.444 6.695 6.934 7.162 7.432 7.735 8.023 8.325 8.647 8.988 9.328 9.71 10.154 10.592 11.088 11.623 12.191 12.749 13.381 14.013 14.554 14.786 14.765 14.62 14.426 14.218 13.973 13.748 13.544 13.311 13.108 12.922 12.74 12.559 12.382 12.229 12.074 11.93 11.811 11.686 11.541 11.416 11.283 11.129 11.009 10.901 10.796 10.683 10.557 10.469 10.375 10.225 10.13 10.042 9.995 9.896 9.801 9.7 9.639 9.508 9.421 9.339 9.261 9.089 8.974 8.857 8.742 8.618 8.494 8.321 7.674 -8 ,31619 ,KEBNE ,17023492,Wed Dec 22 08:12:51 CET,Wed Dec 22 09:39:08 CET,0.0 1.191 1.524 1.773 2.001 2.205 2.378 2.531 2.791 2.902 3.005 3.137 3.31 3.42 3.611 3.794 3.976 4.059 4.219 4.37 4.584 4.725 4.867 5.072 5.261 5.455 5.655 5.845 6.077 6.302 6.52 6.768 7.005 7.246 7.526 7.826 8.108 8.419 8.744 9.08 9.425 9.793 10.216 10.654 11.126 11.593 12.138 12.739 13.373 14.056 14.718 14.992 14.891 14.684 14.477 14.259 14.016 13.767 13.567 13.381 13.217 13.063 12.9 12.742 12.588 12.442 12.284 12.134 12.011 11.89 11.767 11.656 11.54 11.435 11.349 11.24 11.127 11.016 10.904 10.829 10.75 10.623 10.537 10.44 10.387 10.285 10.169 10.047 9.987 9.858 9.766 9.692 9.617 9.455 9.371 9.282 9.174 9.033 8.881 8.7 8.27 -9 ,1406 ,KEBNE ,17023493,Wed Dec 22 08:12:50 CET,Wed Dec 22 09:39:00 CET,0.0 0.964 1.301 1.563 1.778 1.973 2.151 2.323 2.626 2.75 2.874 3.032 3.198 3.302 3.492 3.675 3.869 3.97 4.174 4.356 4.593 4.746 4.894 5.102 5.306 5.507 5.711 5.919 6.171 6.402 6.615 6.87 7.127 7.359 7.613 7.909 8.188 8.482 8.804 9.148 9.505 9.902 10.352 10.779 11.237 11.745 12.323 12.942 13.608 14.264 14.887 15.239 15.252 15.119 14.938 14.739 14.529 14.314 14.113 13.88 13.661 13.454 13.275 13.111 12.95 12.802 12.637 12.484 12.361 12.235 12.086 11.967 11.847 11.724 11.631 11.528 11.424 11.322 11.217 11.151 11.08 10.949 10.857 10.76 10.707 10.597 10.482 10.365 10.308 10.187 10.12 10.052 9.975 9.797 9.693 9.582 9.479 9.365 9.2 8.973 8.59 -10 ,3866 ,KEBNE ,17023494,Wed Dec 22 08:12:51 CET,Wed Dec 22 09:39:29 CET,0.0 1.455 1.813 2.04 2.224 2.391 2.547 2.711 3.031 3.166 3.282 3.453 3.639 3.749 3.962 4.155 4.322 4.403 4.555 4.7 4.924 5.066 5.201 5.405 5.585 5.747 5.915 6.086 6.297 6.489 6.686 6.931 7.156 7.376 7.62 7.886 8.15 8.437 8.743 9.068 9.411 9.796 10.237 10.676 11.169 11.695 12.265 12.881 13.548 14.183 14.732 14.959 14.931 14.78 14.559 14.333 14.111 13.895 13.689 13.463 13.257 13.069 12.888 12.709 12.536 12.38 12.217 12.058 11.924 11.789 11.664 11.568 11.466 11.35 11.248 11.143 11.036 10.93 10.816 10.731 10.649 10.526 10.43 10.329 10.279 10.176 10.06 9.928 9.862 9.728 9.643 9.571 9.498 9.319 9.223 9.131 9.003 8.847 8.707 8.521 8.058 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_18_16.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_18_16.txt deleted file mode 100644 index 8d84567c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_18_16.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4751 ,KEBNE ,16653891,Mon Nov 22 04:54:57 CET,Mon Nov 22 06:18:23 CET,0.0 0.228 0.361 0.472 0.582 0.688 0.766 0.833 0.96 1.017 1.068 1.105 1.224 1.275 1.373 1.479 1.578 1.622 1.709 1.803 1.939 2.013 2.085 2.197 2.311 2.427 2.546 2.663 2.804 2.938 3.075 3.237 3.384 3.529 3.705 3.912 4.099 4.3 4.533 4.79 5.055 5.346 5.656 5.941 6.311 6.722 7.123 7.583 8.134 8.643 9.058 9.23 9.211 9.089 8.933 8.757 8.538 8.321 8.134 7.939 7.755 7.567 7.378 7.202 7.042 6.91 6.757 6.599 6.468 6.332 6.186 6.062 5.937 5.807 5.703 5.596 5.49 5.386 5.274 5.194 5.111 4.986 4.9 4.802 4.75 4.646 4.531 4.402 4.338 4.218 4.133 4.052 3.952 3.695 3.573 3.452 3.32 3.171 2.982 2.685 1.398 -2 ,29050 ,KEBNE ,16653892,Mon Nov 22 04:54:58 CET,Mon Nov 22 06:18:26 CET,0.0 0.316 0.445 0.531 0.593 0.656 0.715 0.776 0.903 0.96 1.019 1.089 1.215 1.271 1.377 1.469 1.556 1.6 1.682 1.757 1.865 1.935 2.006 2.112 2.215 2.318 2.423 2.529 2.662 2.791 2.916 3.067 3.215 3.355 3.532 3.732 3.92 4.133 4.359 4.591 4.823 5.085 5.405 5.717 6.074 6.474 6.934 7.45 8.004 8.541 8.993 9.16 9.109 8.926 8.711 8.499 8.29 8.077 7.886 7.674 7.464 7.276 7.097 6.927 6.762 6.596 6.425 6.284 6.167 6.034 5.889 5.77 5.635 5.487 5.375 5.272 5.157 5.041 4.937 4.859 4.768 4.627 4.54 4.433 4.376 4.262 4.138 4.008 3.944 3.815 3.728 3.647 3.555 3.359 3.249 3.127 3.006 2.862 2.657 2.382 0.79 -3 ,17829 ,KEBNE ,16653893,Mon Nov 22 04:56:00 CET,Mon Nov 22 06:17:56 CET,0.0 0.243 0.445 0.59 0.694 0.797 0.884 0.948 1.076 1.14 1.196 1.245 1.367 1.413 1.505 1.599 1.693 1.741 1.831 1.918 2.044 2.128 2.209 2.311 2.415 2.524 2.623 2.717 2.85 2.981 3.095 3.243 3.395 3.524 3.674 3.849 4.011 4.195 4.395 4.609 4.825 5.07 5.378 5.691 6.037 6.42 6.869 7.349 7.899 8.49 8.973 9.174 9.175 9.033 8.822 8.609 8.393 8.166 7.96 7.75 7.573 7.421 7.261 7.098 6.937 6.785 6.623 6.482 6.375 6.26 6.124 6.004 5.881 5.763 5.672 5.571 5.46 5.349 5.239 5.151 5.054 4.909 4.829 4.747 4.694 4.585 4.457 4.316 4.248 4.114 4.033 3.958 3.875 3.672 3.551 3.418 3.268 3.079 2.866 2.619 1.595 -4 ,7446 ,KEBNE ,16653894,Mon Nov 22 04:56:00 CET,Mon Nov 22 06:17:47 CET,0.0 0.246 0.379 0.477 0.563 0.64 0.717 0.796 0.929 0.989 1.054 1.106 1.222 1.278 1.388 1.484 1.58 1.625 1.712 1.803 1.933 2.007 2.084 2.204 2.318 2.43 2.547 2.662 2.801 2.929 3.062 3.231 3.378 3.523 3.69 3.872 4.068 4.29 4.524 4.769 5.016 5.299 5.611 5.913 6.276 6.669 7.109 7.593 8.127 8.688 9.246 9.436 9.375 9.232 9.034 8.836 8.615 8.401 8.215 8.013 7.826 7.657 7.492 7.317 7.166 7.025 6.863 6.719 6.592 6.46 6.324 6.202 6.076 5.949 5.838 5.725 5.613 5.497 5.387 5.305 5.216 5.08 4.985 4.889 4.837 4.723 4.603 4.473 4.401 4.262 4.173 4.096 4.014 3.843 3.739 3.61 3.469 3.312 3.12 2.88 1.733 -5 ,26625 ,KEBNE ,16653895,Mon Nov 22 04:56:00 CET,Mon Nov 22 06:19:37 CET,0.0 0.319 0.492 0.615 0.704 0.79 0.867 0.93 1.041 1.097 1.152 1.199 1.32 1.37 1.458 1.546 1.636 1.678 1.76 1.843 1.976 2.068 2.149 2.256 2.359 2.457 2.555 2.649 2.767 2.891 3.011 3.155 3.291 3.416 3.566 3.742 3.914 4.103 4.316 4.56 4.813 5.093 5.429 5.74 6.085 6.472 6.898 7.366 7.856 8.346 8.865 9.154 9.178 9.036 8.861 8.662 8.434 8.209 7.983 7.756 7.58 7.402 7.22 7.068 6.926 6.77 6.594 6.443 6.317 6.184 6.036 5.908 5.771 5.624 5.513 5.408 5.298 5.172 5.044 4.963 4.874 4.731 4.634 4.521 4.466 4.353 4.229 4.099 4.03 3.903 3.818 3.737 3.637 3.389 3.267 3.155 3.023 2.872 2.647 2.308 1.057 -6 ,25567 ,KEBNE ,16653896,Mon Nov 22 04:57:02 CET,Mon Nov 22 06:20:23 CET,0.0 0.375 0.466 0.549 0.64 0.733 0.825 0.901 1.038 1.104 1.159 1.201 1.328 1.385 1.487 1.585 1.674 1.717 1.806 1.892 2.006 2.087 2.169 2.286 2.408 2.525 2.621 2.708 2.833 2.964 3.088 3.229 3.355 3.48 3.641 3.828 4.0 4.179 4.375 4.598 4.843 5.103 5.403 5.713 6.071 6.449 6.861 7.336 7.87 8.428 8.92 9.118 9.086 8.934 8.752 8.518 8.294 8.094 7.908 7.699 7.495 7.313 7.125 6.936 6.759 6.597 6.429 6.278 6.143 6.005 5.859 5.736 5.609 5.474 5.381 5.288 5.189 5.088 4.973 4.889 4.806 4.667 4.561 4.458 4.402 4.286 4.181 4.07 4.014 3.893 3.815 3.742 3.668 3.496 3.382 3.244 3.106 2.918 2.699 2.463 1.564 -7 ,22510 ,KEBNE ,16653897,Mon Nov 22 04:57:02 CET,Mon Nov 22 06:20:28 CET,0.0 0.248 0.385 0.486 0.575 0.655 0.722 0.787 0.899 0.948 1.005 1.048 1.164 1.219 1.317 1.412 1.52 1.57 1.667 1.761 1.888 1.965 2.044 2.179 2.309 2.43 2.54 2.644 2.786 2.927 3.064 3.224 3.375 3.518 3.677 3.854 4.041 4.251 4.47 4.7 4.944 5.224 5.537 5.854 6.214 6.594 7.026 7.473 7.92 8.432 8.929 9.125 9.106 8.96 8.724 8.467 8.252 8.06 7.851 7.619 7.44 7.275 7.105 6.938 6.769 6.609 6.438 6.293 6.183 6.071 5.957 5.853 5.735 5.613 5.52 5.431 5.333 5.217 5.102 5.022 4.925 4.778 4.684 4.588 4.531 4.41 4.287 4.15 4.081 3.949 3.857 3.782 3.704 3.515 3.395 3.245 3.105 2.955 2.757 2.511 1.895 -8 ,25773 ,KEBNE ,16653898,Mon Nov 22 04:57:02 CET,Mon Nov 22 06:20:43 CET,0.0 0.283 0.41 0.504 0.585 0.654 0.722 0.79 0.921 0.98 1.042 1.097 1.219 1.273 1.383 1.484 1.571 1.616 1.709 1.79 1.905 1.981 2.051 2.16 2.267 2.364 2.461 2.566 2.699 2.815 2.922 3.063 3.213 3.358 3.531 3.724 3.901 4.102 4.314 4.547 4.79 5.037 5.362 5.693 6.045 6.434 6.864 7.337 7.841 8.367 8.851 9.063 9.063 8.944 8.76 8.534 8.291 8.066 7.877 7.672 7.487 7.328 7.141 6.962 6.809 6.65 6.484 6.343 6.23 6.127 6.012 5.903 5.785 5.656 5.563 5.471 5.378 5.271 5.151 5.062 4.964 4.828 4.74 4.647 4.592 4.467 4.349 4.24 4.188 4.074 3.991 3.912 3.829 3.635 3.516 3.377 3.245 3.103 2.931 2.644 1.021 -10 ,5722 ,KEBNE ,16653900,Mon Nov 22 04:57:02 CET,Mon Nov 22 06:21:04 CET,0.0 0.343 0.495 0.604 0.721 0.82 0.898 0.973 1.105 1.166 1.226 1.282 1.404 1.459 1.554 1.644 1.741 1.789 1.882 1.971 2.099 2.18 2.257 2.372 2.483 2.585 2.681 2.776 2.903 3.014 3.123 3.267 3.411 3.55 3.707 3.907 4.107 4.312 4.534 4.754 4.99 5.276 5.6 5.921 6.3 6.681 7.124 7.622 8.121 8.639 9.14 9.333 9.289 9.172 8.99 8.796 8.618 8.439 8.24 8.024 7.826 7.637 7.459 7.29 7.142 7.007 6.857 6.722 6.593 6.443 6.303 6.184 6.049 5.906 5.793 5.68 5.557 5.438 5.318 5.229 5.134 4.99 4.895 4.802 4.752 4.627 4.491 4.354 4.29 4.173 4.086 4.002 3.901 3.682 3.572 3.446 3.3 3.12 2.914 2.683 1.345 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_18_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_18_17.txt deleted file mode 100644 index 511111a4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_18_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24602 ,KEBNE ,16653901,Mon Nov 22 04:58:04 CET,Mon Nov 22 06:20:42 CET,0.0 0.546 0.72 0.844 0.952 1.083 1.198 1.291 1.462 1.539 1.616 1.689 1.821 1.884 1.991 2.105 2.211 2.258 2.365 2.468 2.606 2.694 2.771 2.885 3.0 3.106 3.209 3.305 3.423 3.545 3.665 3.8 3.931 4.062 4.211 4.377 4.534 4.705 4.893 5.097 5.301 5.539 5.833 6.106 6.404 6.727 7.075 7.458 7.892 8.315 8.628 8.729 8.65 8.459 8.257 8.061 7.857 7.657 7.482 7.301 7.118 6.932 6.756 6.596 6.452 6.31 6.136 5.972 5.853 5.733 5.599 5.486 5.371 5.255 5.158 5.058 4.959 4.848 4.743 4.676 4.605 4.489 4.414 4.331 4.285 4.184 4.066 3.951 3.899 3.784 3.736 3.665 3.587 3.434 3.353 3.257 3.15 3.035 2.886 2.681 1.88 -2 ,14563 ,KEBNE ,16653902,Mon Nov 22 04:58:04 CET,Mon Nov 22 06:20:42 CET,0.0 0.785 0.938 1.059 1.157 1.261 1.362 1.448 1.612 1.698 1.771 1.813 1.934 1.994 2.107 2.212 2.32 2.372 2.471 2.567 2.708 2.803 2.893 3.0 3.099 3.217 3.332 3.432 3.556 3.684 3.811 3.947 4.08 4.211 4.363 4.536 4.688 4.844 5.018 5.211 5.414 5.637 5.882 6.141 6.445 6.75 7.109 7.492 7.859 8.198 8.507 8.579 8.479 8.329 8.119 7.886 7.671 7.455 7.252 7.068 6.899 6.735 6.573 6.428 6.297 6.166 6.014 5.876 5.765 5.653 5.535 5.429 5.314 5.191 5.092 4.987 4.881 4.775 4.651 4.55 4.456 4.329 4.23 4.121 4.069 3.96 3.851 3.741 3.686 3.563 3.498 3.431 3.357 3.22 3.149 3.067 2.962 2.846 2.718 2.514 1.78 -3 ,18296 ,KEBNE ,16653903,Mon Nov 22 04:58:04 CET,Mon Nov 22 06:20:21 CET,0.0 0.613 0.804 0.951 1.07 1.183 1.288 1.383 1.542 1.609 1.674 1.736 1.86 1.919 2.033 2.147 2.256 2.302 2.391 2.486 2.617 2.698 2.775 2.893 3.009 3.108 3.204 3.302 3.423 3.538 3.654 3.792 3.915 4.03 4.177 4.361 4.546 4.744 4.946 5.155 5.374 5.609 5.865 6.122 6.422 6.755 7.116 7.493 7.917 8.347 8.768 8.918 8.869 8.725 8.517 8.317 8.094 7.849 7.637 7.444 7.276 7.118 6.943 6.767 6.631 6.506 6.363 6.23 6.112 6.0 5.89 5.803 5.705 5.594 5.515 5.427 5.327 5.216 5.1 5.031 4.96 4.849 4.767 4.687 4.646 4.555 4.453 4.335 4.279 4.158 4.1 4.033 3.958 3.796 3.705 3.598 3.484 3.339 3.169 2.978 2.528 -4 ,11485 ,KEBNE ,16653904,Mon Nov 22 04:58:04 CET,Mon Nov 22 06:21:54 CET,0.0 1.08 1.255 1.416 1.555 1.68 1.785 1.882 2.058 2.142 2.217 2.277 2.406 2.467 2.589 2.705 2.813 2.863 2.953 3.052 3.198 3.29 3.388 3.523 3.647 3.766 3.878 3.985 4.126 4.27 4.404 4.569 4.727 4.867 5.023 5.197 5.36 5.536 5.732 5.944 6.149 6.373 6.629 6.892 7.223 7.549 7.886 8.265 8.658 9.027 9.344 9.435 9.307 9.1 8.873 8.627 8.399 8.194 7.998 7.811 7.639 7.463 7.291 7.134 6.981 6.822 6.653 6.511 6.385 6.248 6.106 5.995 5.88 5.748 5.651 5.553 5.447 5.338 5.218 5.136 5.05 4.917 4.827 4.732 4.683 4.581 4.474 4.366 4.312 4.197 4.157 4.096 4.02 3.843 3.754 3.664 3.553 3.435 3.302 3.133 2.827 -5 ,14062 ,KEBNE ,16653905,Mon Nov 22 04:59:06 CET,Mon Nov 22 06:21:32 CET,0.0 0.502 0.697 0.839 0.964 1.08 1.172 1.258 1.426 1.496 1.556 1.615 1.748 1.809 1.927 2.035 2.133 2.18 2.272 2.361 2.499 2.589 2.671 2.78 2.887 2.997 3.107 3.207 3.327 3.441 3.561 3.711 3.848 3.974 4.114 4.277 4.441 4.619 4.809 5.015 5.227 5.469 5.76 6.04 6.34 6.67 7.033 7.425 7.838 8.235 8.606 8.73 8.673 8.5 8.293 8.085 7.845 7.611 7.409 7.211 7.051 6.9 6.758 6.609 6.459 6.331 6.189 6.06 5.95 5.826 5.689 5.564 5.43 5.302 5.204 5.102 4.996 4.885 4.757 4.662 4.575 4.441 4.336 4.22 4.161 4.042 3.921 3.792 3.719 3.587 3.502 3.418 3.341 3.194 3.105 3.006 2.906 2.816 2.695 2.514 2.077 -6 ,1353 ,KEBNE ,16653906,Mon Nov 22 04:58:06 CET,Mon Nov 22 06:16:51 CET,0.0 0.5 0.656 0.772 0.876 0.981 1.076 1.168 1.369 1.458 1.526 1.567 1.693 1.757 1.87 1.97 2.07 2.124 2.235 2.34 2.483 2.57 2.655 2.78 2.894 2.996 3.089 3.183 3.31 3.432 3.547 3.695 3.847 3.99 4.153 4.327 4.497 4.68 4.882 5.1 5.312 5.552 5.817 6.075 6.363 6.662 6.973 7.293 7.668 8.087 8.449 8.56 8.476 8.322 8.149 7.96 7.779 7.589 7.395 7.179 6.991 6.825 6.658 6.501 6.362 6.233 6.095 5.968 5.857 5.743 5.625 5.525 5.415 5.301 5.215 5.123 5.026 4.932 4.843 4.78 4.708 4.594 4.513 4.427 4.385 4.282 4.167 4.054 3.994 3.869 3.792 3.721 3.656 3.508 3.41 3.306 3.189 3.05 2.902 2.701 1.942 -7 ,1487 ,KEBNE ,16653907,Mon Nov 22 04:59:05 CET,Mon Nov 22 06:21:28 CET,0.0 0.622 0.813 0.957 1.064 1.148 1.241 1.341 1.523 1.605 1.685 1.764 1.893 1.952 2.072 2.189 2.295 2.344 2.434 2.524 2.661 2.752 2.839 2.964 3.083 3.199 3.311 3.419 3.563 3.702 3.832 3.98 4.127 4.274 4.435 4.616 4.792 4.989 5.197 5.402 5.627 5.891 6.168 6.432 6.757 7.093 7.447 7.826 8.214 8.592 8.928 9.012 8.906 8.741 8.552 8.347 8.145 7.945 7.762 7.567 7.378 7.212 7.058 6.892 6.734 6.583 6.428 6.299 6.178 6.055 5.927 5.819 5.715 5.601 5.512 5.42 5.317 5.217 5.112 5.039 4.963 4.843 4.765 4.691 4.652 4.56 4.465 4.369 4.313 4.19 4.146 4.083 4.014 3.885 3.81 3.717 3.605 3.487 3.362 3.194 2.825 -8 ,32146 ,KEBNE ,16653908,Mon Nov 22 04:59:06 CET,Mon Nov 22 06:21:34 CET,0.0 0.924 1.27 1.484 1.655 1.794 1.924 2.033 2.23 2.321 2.403 2.513 2.653 2.72 2.865 3.005 3.125 3.177 3.284 3.395 3.551 3.659 3.755 3.892 4.019 4.144 4.271 4.381 4.534 4.688 4.827 4.987 5.144 5.302 5.48 5.668 5.856 6.055 6.257 6.474 6.681 6.901 7.169 7.427 7.715 8.042 8.444 8.849 9.235 9.598 9.926 10.019 9.923 9.784 9.62 9.426 9.215 9.017 8.846 8.669 8.503 8.34 8.191 8.039 7.89 7.747 7.593 7.452 7.328 7.206 7.076 6.958 6.838 6.712 6.608 6.513 6.416 6.308 6.2 6.126 6.051 5.938 5.855 5.776 5.733 5.633 5.535 5.426 5.367 5.253 5.214 5.16 5.077 4.86 4.732 4.584 4.449 4.296 4.088 3.89 3.215 -9 ,31773 ,KEBNE ,16653909,Mon Nov 22 04:59:06 CET,Mon Nov 22 06:21:44 CET,0.0 0.571 0.761 0.895 1.024 1.144 1.239 1.327 1.482 1.554 1.625 1.695 1.826 1.885 2.005 2.112 2.204 2.253 2.345 2.432 2.57 2.662 2.743 2.864 2.977 3.075 3.174 3.271 3.388 3.491 3.601 3.741 3.869 3.995 4.153 4.326 4.487 4.653 4.84 5.059 5.287 5.527 5.796 6.061 6.35 6.653 7.002 7.394 7.807 8.245 8.666 8.758 8.64 8.46 8.251 8.039 7.829 7.636 7.458 7.258 7.076 6.906 6.739 6.575 6.429 6.297 6.152 6.021 5.916 5.818 5.715 5.627 5.522 5.416 5.338 5.259 5.165 5.062 4.959 4.885 4.815 4.702 4.621 4.543 4.5 4.4 4.302 4.202 4.145 4.016 3.931 3.857 3.784 3.646 3.565 3.472 3.381 3.269 3.116 2.919 2.301 -10 ,22084 ,KEBNE ,16653910,Mon Nov 22 04:59:06 CET,Mon Nov 22 06:21:35 CET,0.0 0.419 0.621 0.78 0.92 1.038 1.145 1.232 1.359 1.426 1.502 1.581 1.706 1.765 1.889 2.012 2.121 2.173 2.275 2.375 2.511 2.59 2.663 2.763 2.875 2.987 3.087 3.191 3.335 3.456 3.572 3.716 3.862 4.016 4.195 4.387 4.572 4.78 4.998 5.217 5.436 5.672 5.931 6.182 6.477 6.82 7.2 7.582 7.961 8.304 8.571 8.583 8.477 8.338 8.154 7.95 7.762 7.58 7.399 7.199 7.019 6.853 6.685 6.528 6.385 6.238 6.077 5.94 5.821 5.691 5.558 5.454 5.348 5.247 5.169 5.079 4.977 4.873 4.77 4.701 4.629 4.514 4.432 4.338 4.292 4.208 4.111 4.001 3.936 3.8 3.745 3.682 3.609 3.432 3.328 3.234 3.149 3.03 2.88 2.715 2.241 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_17.txt deleted file mode 100644 index dda9f430..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_17.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,18680 ,KEBNE ,16653913,Mon Nov 22 05:00:08 CET,Mon Nov 22 06:23:21 CET,0.0 1.408 1.671 1.879 2.046 2.175 2.294 2.404 2.605 2.697 2.782 2.881 3.042 3.121 3.279 3.423 3.558 3.624 3.743 3.861 4.036 4.133 4.233 4.397 4.552 4.691 4.823 4.96 5.154 5.346 5.529 5.746 5.962 6.182 6.425 6.683 6.933 7.208 7.503 7.811 8.146 8.539 8.99 9.457 9.996 10.572 11.258 12.031 12.889 13.837 14.911 15.655 15.99 16.098 16.041 15.933 15.814 15.693 15.534 15.343 15.188 15.044 14.897 14.73 14.567 14.421 14.267 14.132 13.999 13.857 13.712 13.579 13.44 13.295 13.178 13.069 12.959 12.832 12.692 12.591 12.484 12.311 12.197 12.072 12.001 11.859 11.724 11.564 11.463 11.307 11.185 11.074 10.96 10.712 10.549 10.385 10.22 9.995 9.679 9.189 6.196 -4 ,3207 ,KEBNE ,16653914,Mon Nov 22 04:59:12 CET,Mon Nov 22 06:20:24 CET,0.0 0.786 1.04 1.248 1.404 1.543 1.671 1.791 1.993 2.087 2.185 2.288 2.446 2.529 2.701 2.864 3.001 3.07 3.212 3.344 3.54 3.665 3.784 3.952 4.114 4.272 4.428 4.576 4.769 4.963 5.147 5.374 5.597 5.817 6.092 6.403 6.678 6.974 7.304 7.662 8.029 8.427 8.905 9.407 10.002 10.654 11.353 12.159 13.058 14.039 15.165 15.908 16.275 16.421 16.389 16.234 16.04 15.856 15.704 15.524 15.345 15.174 14.995 14.822 14.645 14.428 14.165 13.949 13.786 13.631 13.452 13.291 13.125 12.953 12.816 12.683 12.539 12.377 12.209 12.093 11.98 11.801 11.683 11.564 11.493 11.345 11.198 11.041 10.96 10.806 10.646 10.513 10.378 10.141 9.998 9.811 9.607 9.361 9.004 8.575 5.438 -5 ,19511 ,KEBNE ,16653915,Mon Nov 22 04:59:12 CET,Mon Nov 22 06:21:31 CET,0.0 0.938 1.199 1.424 1.607 1.748 1.875 1.988 2.211 2.309 2.4 2.491 2.643 2.729 2.878 3.015 3.147 3.219 3.351 3.471 3.679 3.821 3.933 4.078 4.229 4.384 4.537 4.68 4.867 5.051 5.231 5.447 5.655 5.864 6.121 6.399 6.665 6.96 7.247 7.547 7.884 8.285 8.746 9.186 9.707 10.288 10.954 11.697 12.548 13.483 14.525 15.32 15.644 15.729 15.687 15.576 15.454 15.297 15.128 14.968 14.813 14.669 14.522 14.359 14.198 14.05 13.908 13.775 13.638 13.487 13.341 13.216 13.075 12.934 12.83 12.727 12.622 12.504 12.365 12.258 12.152 11.982 11.858 11.732 11.666 11.524 11.358 11.196 11.112 10.947 10.792 10.676 10.549 10.28 10.143 9.982 9.795 9.58 9.281 8.795 4.421 -6 ,12631 ,KEBNE ,16653916,Mon Nov 22 04:59:08 CET,Mon Nov 22 06:20:24 CET,0.0 1.455 1.681 1.86 2.021 2.147 2.28 2.414 2.627 2.724 2.817 2.919 3.08 3.159 3.315 3.476 3.617 3.684 3.819 3.952 4.13 4.236 4.35 4.533 4.701 4.849 5.0 5.158 5.353 5.546 5.736 5.972 6.201 6.401 6.647 6.934 7.202 7.496 7.805 8.153 8.531 8.943 9.434 9.948 10.545 11.174 11.889 12.737 13.636 14.602 15.793 16.625 16.906 16.931 16.869 16.765 16.636 16.472 16.294 16.064 15.864 15.689 15.511 15.345 15.185 15.022 14.849 14.685 14.545 14.401 14.236 14.105 13.981 13.847 13.727 13.592 13.452 13.303 13.146 13.034 12.912 12.718 12.58 12.454 12.383 12.219 12.056 11.884 11.787 11.628 11.474 11.348 11.222 10.952 10.794 10.626 10.44 10.205 9.917 9.457 7.074 -7 ,30670 ,KEBNE ,16653917,Mon Nov 22 05:00:09 CET,Mon Nov 22 06:23:01 CET,0.0 0.947 1.183 1.373 1.562 1.714 1.855 1.983 2.185 2.278 2.379 2.479 2.639 2.723 2.87 3.01 3.16 3.227 3.351 3.486 3.678 3.799 3.92 4.093 4.26 4.429 4.593 4.751 4.967 5.18 5.374 5.603 5.812 6.017 6.252 6.53 6.815 7.104 7.402 7.71 8.028 8.401 8.851 9.306 9.841 10.458 11.156 11.958 12.894 13.908 14.966 15.642 15.959 16.053 16.019 15.919 15.78 15.637 15.489 15.328 15.166 15.008 14.844 14.684 14.536 14.391 14.236 14.111 13.991 13.857 13.735 13.627 13.498 13.35 13.231 13.111 12.989 12.863 12.724 12.624 12.522 12.36 12.247 12.139 12.079 11.938 11.765 11.572 11.488 11.35 11.238 11.123 11.002 10.757 10.604 10.435 10.219 9.944 9.605 9.106 6.782 -8 ,10114 ,KEBNE ,16653918,Mon Nov 22 05:00:09 CET,Mon Nov 22 06:23:07 CET,0.0 0.973 1.263 1.441 1.603 1.736 1.84 1.948 2.18 2.285 2.378 2.496 2.67 2.751 2.879 3.008 3.143 3.205 3.342 3.479 3.666 3.787 3.902 4.073 4.229 4.374 4.518 4.655 4.831 5.008 5.184 5.405 5.621 5.83 6.079 6.356 6.622 6.906 7.216 7.556 7.916 8.332 8.82 9.29 9.832 10.452 11.161 11.924 12.822 13.834 14.979 15.741 15.985 16.034 16.023 15.917 15.736 15.515 15.279 15.054 14.878 14.705 14.512 14.318 14.144 13.973 13.78 13.603 13.455 13.294 13.123 12.977 12.814 12.646 12.516 12.39 12.246 12.083 11.908 11.79 11.687 11.518 11.38 11.246 11.191 11.066 10.913 10.739 10.646 10.485 10.358 10.247 10.12 9.867 9.702 9.519 9.297 9.019 8.665 8.153 4.914 -9 ,1229 ,KEBNE ,16653919,Mon Nov 22 05:00:10 CET,Mon Nov 22 06:22:59 CET,0.0 1.023 1.301 1.473 1.644 1.794 1.924 2.051 2.27 2.375 2.474 2.579 2.731 2.817 2.981 3.12 3.249 3.318 3.461 3.606 3.828 3.97 4.1 4.277 4.449 4.612 4.767 4.922 5.122 5.31 5.488 5.719 5.954 6.177 6.439 6.729 7.0 7.294 7.601 7.933 8.298 8.714 9.202 9.704 10.285 10.932 11.659 12.422 13.31 14.35 15.497 16.189 16.398 16.385 16.31 16.223 16.088 15.902 15.711 15.526 15.345 15.146 14.945 14.768 14.624 14.483 14.304 14.13 13.977 13.815 13.667 13.561 13.428 13.271 13.152 13.032 12.908 12.772 12.631 12.536 12.429 12.247 12.117 11.985 11.92 11.794 11.658 11.478 11.377 11.225 11.1 10.985 10.863 10.625 10.486 10.302 10.091 9.849 9.504 9.054 7.08 -10 ,25267 ,KEBNE ,16653920,Mon Nov 22 05:00:09 CET,Mon Nov 22 06:22:56 CET,0.0 1.535 1.785 1.975 2.136 2.28 2.406 2.532 2.766 2.859 2.947 3.045 3.207 3.29 3.438 3.59 3.73 3.793 3.927 4.056 4.241 4.363 4.48 4.665 4.858 5.033 5.19 5.352 5.559 5.753 5.945 6.177 6.408 6.626 6.867 7.155 7.441 7.748 8.082 8.441 8.796 9.21 9.721 10.217 10.776 11.374 12.099 12.915 13.811 14.854 16.05 16.803 17.077 17.147 17.076 16.958 16.843 16.712 16.562 16.402 16.249 16.085 15.918 15.761 15.607 15.47 15.322 15.187 15.061 14.915 14.769 14.658 14.547 14.413 14.297 14.173 14.046 13.913 13.765 13.672 13.574 13.411 13.296 13.167 13.099 12.954 12.809 12.646 12.552 12.401 12.278 12.164 12.044 11.781 11.618 11.456 11.261 10.992 10.668 10.214 7.768 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_20.txt deleted file mode 100644 index 7287c165..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_20.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8127 ,KEBNE ,16653921,Mon Nov 22 05:00:09 CET,Mon Nov 22 06:26:17 CET,0.0 2.725 3.242 3.556 3.819 4.081 4.323 4.542 4.924 5.085 5.234 5.443 5.64 5.752 5.972 6.173 6.363 6.455 6.62 6.779 7.031 7.191 7.33 7.517 7.702 7.883 8.061 8.241 8.452 8.626 8.789 8.995 9.205 9.403 9.608 9.848 10.082 10.316 10.559 10.818 11.082 11.378 11.718 12.008 12.285 12.577 12.877 13.124 13.331 13.439 13.265 12.703 12.021 11.354 10.803 10.271 9.772 9.335 8.943 8.558 8.24 7.955 7.671 7.411 7.168 6.934 6.7 6.508 6.36 6.199 6.017 5.868 5.72 5.57 5.45 5.334 5.22 5.089 4.947 4.854 4.768 4.634 4.538 4.429 4.373 4.265 4.15 4.033 3.971 3.822 3.79 3.732 3.667 3.531 3.463 3.393 3.298 3.186 3.096 2.947 2.712 -2 ,10326 ,KEBNE ,16653922,Mon Nov 22 05:00:09 CET,Mon Nov 22 06:24:54 CET,0.0 2.925 3.394 3.745 4.029 4.25 4.466 4.671 5.007 5.158 5.306 5.482 5.687 5.832 6.066 6.253 6.424 6.507 6.692 6.863 7.085 7.247 7.397 7.592 7.759 7.919 8.081 8.218 8.394 8.565 8.724 8.932 9.123 9.298 9.526 9.778 10.009 10.258 10.48 10.679 10.917 11.18 11.434 11.697 11.972 12.229 12.482 12.693 12.846 12.894 12.616 12.021 11.371 10.659 10.024 9.423 8.912 8.456 8.049 7.675 7.357 7.066 6.805 6.564 6.336 6.123 5.908 5.714 5.54 5.369 5.201 5.064 4.929 4.789 4.673 4.544 4.41 4.283 4.156 4.072 3.985 3.85 3.761 3.667 3.616 3.515 3.415 3.308 3.247 3.099 3.062 2.999 2.928 2.749 2.664 2.591 2.512 2.423 2.333 2.226 1.989 -3 ,22828 ,KEBNE ,16653923,Mon Nov 22 05:00:10 CET,Mon Nov 22 06:24:50 CET,0.0 1.705 2.216 2.615 2.944 3.195 3.409 3.609 3.982 4.141 4.276 4.451 4.645 4.773 5.019 5.241 5.455 5.544 5.698 5.854 6.071 6.215 6.356 6.538 6.703 6.877 7.059 7.224 7.424 7.615 7.813 8.041 8.242 8.424 8.629 8.852 9.065 9.307 9.549 9.804 10.074 10.362 10.691 10.986 11.283 11.589 11.889 12.142 12.392 12.573 12.436 11.87 11.182 10.56 9.975 9.446 8.983 8.534 8.129 7.733 7.393 7.096 6.842 6.613 6.386 6.179 5.974 5.784 5.621 5.463 5.292 5.153 5.021 4.878 4.769 4.656 4.531 4.405 4.274 4.187 4.097 3.951 3.853 3.753 3.701 3.595 3.481 3.37 3.319 3.174 3.128 3.064 3.0 2.857 2.782 2.707 2.629 2.547 2.459 2.342 2.196 -4 ,11107 ,KEBNE ,16653924,Mon Nov 22 05:00:11 CET,Mon Nov 22 06:23:05 CET,0.0 2.713 3.242 3.591 3.915 4.221 4.452 4.639 4.952 5.09 5.23 5.418 5.612 5.725 5.922 6.129 6.347 6.449 6.635 6.807 7.042 7.181 7.314 7.499 7.681 7.852 8.002 8.138 8.316 8.489 8.656 8.833 9.006 9.197 9.412 9.64 9.847 10.054 10.254 10.47 10.713 10.983 11.25 11.479 11.716 11.928 12.166 12.35 12.463 12.464 12.119 11.454 10.721 10.045 9.455 8.916 8.424 7.957 7.575 7.195 6.86 6.591 6.33 6.06 5.824 5.601 5.371 5.18 5.012 4.829 4.651 4.509 4.356 4.207 4.095 3.978 3.858 3.733 3.607 3.522 3.432 3.296 3.207 3.111 3.058 2.956 2.85 2.738 2.681 2.529 2.493 2.432 2.373 2.234 2.157 2.086 2.005 1.903 1.791 1.674 1.467 -5 ,21759 ,KEBNE ,16653925,Mon Nov 22 05:01:11 CET,Mon Nov 22 06:25:52 CET,0.0 1.713 2.269 2.676 2.983 3.268 3.521 3.721 4.035 4.185 4.334 4.524 4.715 4.823 5.022 5.205 5.386 5.474 5.642 5.795 5.997 6.129 6.266 6.464 6.643 6.817 7.003 7.187 7.411 7.608 7.786 7.991 8.191 8.39 8.619 8.881 9.116 9.371 9.638 9.906 10.173 10.452 10.772 11.096 11.475 11.823 12.129 12.44 12.746 12.86 12.607 11.995 11.316 10.655 10.023 9.427 8.886 8.419 8.021 7.617 7.275 6.975 6.702 6.446 6.203 5.974 5.723 5.493 5.294 5.092 4.893 4.741 4.58 4.424 4.311 4.194 4.068 3.933 3.802 3.712 3.619 3.483 3.386 3.28 3.23 3.12 3.002 2.878 2.813 2.661 2.629 2.565 2.496 2.343 2.263 2.188 2.103 2.002 1.862 1.637 1.177 -6 ,31151 ,KEBNE ,16653926,Mon Nov 22 05:01:11 CET,Mon Nov 22 06:27:15 CET,0.0 2.493 2.987 3.373 3.667 3.931 4.179 4.395 4.736 4.884 5.032 5.223 5.414 5.529 5.752 5.957 6.115 6.196 6.365 6.511 6.73 6.877 7.014 7.203 7.39 7.562 7.72 7.878 8.075 8.253 8.424 8.624 8.805 8.98 9.186 9.392 9.574 9.776 9.998 10.237 10.458 10.679 10.904 11.111 11.378 11.652 11.896 12.121 12.285 12.325 12.06 11.378 10.644 9.952 9.358 8.8 8.27 7.798 7.426 7.078 6.774 6.51 6.246 5.993 5.755 5.538 5.319 5.122 4.951 4.77 4.598 4.467 4.325 4.174 4.052 3.931 3.812 3.693 3.569 3.48 3.39 3.242 3.137 3.035 2.985 2.884 2.777 2.67 2.613 2.465 2.436 2.379 2.315 2.181 2.112 2.02 1.909 1.795 1.683 1.567 1.427 -7 ,26393 ,KEBNE ,16653927,Mon Nov 22 05:01:12 CET,Mon Nov 22 06:26:31 CET,0.0 2.254 2.73 3.092 3.413 3.69 3.905 4.101 4.478 4.643 4.791 5.0 5.191 5.307 5.548 5.78 5.982 6.075 6.246 6.4 6.642 6.805 6.961 7.164 7.337 7.52 7.706 7.868 8.048 8.232 8.419 8.633 8.823 9.004 9.23 9.49 9.724 9.955 10.196 10.462 10.743 11.039 11.358 11.669 12.02 12.374 12.717 13.029 13.273 13.365 13.128 12.515 11.88 11.207 10.547 9.988 9.483 9.006 8.623 8.256 7.933 7.657 7.401 7.154 6.923 6.706 6.482 6.283 6.115 5.95 5.776 5.63 5.478 5.321 5.206 5.086 4.968 4.849 4.703 4.606 4.514 4.379 4.286 4.188 4.138 4.029 3.919 3.806 3.748 3.608 3.576 3.506 3.429 3.277 3.2 3.117 3.032 2.941 2.84 2.74 2.507 -8 ,31068 ,KEBNE ,16653928,Mon Nov 22 05:01:11 CET,Mon Nov 22 06:25:57 CET,0.0 2.559 3.095 3.472 3.818 4.089 4.348 4.578 4.944 5.113 5.272 5.502 5.711 5.841 6.083 6.295 6.498 6.596 6.781 6.956 7.206 7.367 7.525 7.752 7.941 8.109 8.271 8.423 8.627 8.807 8.96 9.166 9.357 9.529 9.733 9.94 10.122 10.331 10.565 10.803 11.039 11.275 11.504 11.735 11.988 12.236 12.511 12.768 12.959 13.014 12.76 12.116 11.414 10.707 10.058 9.479 9.002 8.593 8.23 7.869 7.571 7.293 7.026 6.789 6.572 6.375 6.163 5.97 5.803 5.639 5.467 5.325 5.174 5.01 4.884 4.766 4.653 4.532 4.412 4.33 4.237 4.092 3.992 3.897 3.845 3.735 3.635 3.524 3.47 3.324 3.272 3.198 3.131 2.994 2.915 2.832 2.741 2.646 2.546 2.403 2.121 -10 ,32610 ,KEBNE ,16653930,Mon Nov 22 05:01:16 CET,Mon Nov 22 06:22:29 CET,0.0 1.98 2.552 2.954 3.273 3.532 3.761 3.981 4.368 4.525 4.676 4.878 5.069 5.17 5.4 5.625 5.821 5.915 6.086 6.254 6.488 6.626 6.762 6.962 7.177 7.385 7.569 7.74 7.948 8.136 8.311 8.516 8.726 8.933 9.152 9.376 9.584 9.824 10.089 10.348 10.598 10.875 11.178 11.477 11.814 12.128 12.457 12.803 13.066 13.181 12.999 12.378 11.7 11.04 10.465 9.965 9.518 9.111 8.745 8.378 8.055 7.758 7.488 7.24 7.012 6.795 6.574 6.389 6.207 6.016 5.835 5.688 5.546 5.394 5.266 5.14 5.011 4.872 4.719 4.614 4.515 4.376 4.282 4.177 4.124 4.019 3.91 3.801 3.744 3.596 3.556 3.492 3.427 3.288 3.207 3.119 3.035 2.934 2.827 2.722 2.532 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_22.txt deleted file mode 100644 index 5059f8c3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30562 ,KEBNE ,16653931,Mon Nov 22 05:01:15 CET,Mon Nov 22 06:23:17 CET,0.0 1.416 1.897 2.229 2.446 2.638 2.81 2.973 3.278 3.415 3.549 3.734 3.925 4.04 4.267 4.475 4.677 4.778 4.969 5.141 5.389 5.55 5.7 5.927 6.148 6.353 6.56 6.765 7.004 7.216 7.438 7.709 7.957 8.184 8.429 8.712 8.994 9.337 9.679 9.989 10.383 10.844 11.317 11.781 12.284 12.788 13.391 14.051 14.773 15.61 16.482 17.042 17.258 17.298 17.245 17.098 16.942 16.807 16.661 16.519 16.387 16.254 16.113 15.964 15.829 15.712 15.59 15.476 15.369 15.266 15.162 15.065 14.962 14.842 14.731 14.61 14.498 14.386 14.255 14.168 14.089 13.965 13.873 13.782 13.737 13.65 13.561 13.475 13.43 13.313 13.264 13.206 13.146 13.018 12.948 12.871 12.772 12.658 12.541 12.417 11.834 -2 ,15103 ,KEBNE ,16653932,Mon Nov 22 05:01:12 CET,Mon Nov 22 06:24:57 CET,0.0 1.45 1.873 2.171 2.401 2.605 2.793 2.969 3.311 3.474 3.619 3.792 3.984 4.084 4.276 4.477 4.661 4.75 4.923 5.085 5.319 5.473 5.627 5.851 6.054 6.241 6.434 6.627 6.877 7.123 7.371 7.668 7.916 8.143 8.416 8.713 8.986 9.273 9.593 9.959 10.369 10.815 11.253 11.65 12.118 12.637 13.234 13.903 14.612 15.428 16.341 16.874 16.998 16.963 16.88 16.763 16.628 16.525 16.384 16.227 16.1 15.922 15.763 15.645 15.531 15.42 15.288 15.16 15.059 14.954 14.823 14.715 14.615 14.517 14.434 14.35 14.282 14.213 14.133 14.075 14.004 13.881 13.787 13.682 13.637 13.559 13.463 13.349 13.287 13.164 13.118 13.063 13.007 12.897 12.841 12.772 12.681 12.567 12.432 12.27 11.959 -3 ,27771 ,KEBNE ,16653933,Mon Nov 22 05:01:12 CET,Mon Nov 22 06:24:57 CET,0.0 1.583 2.004 2.305 2.56 2.785 2.969 3.152 3.503 3.659 3.808 3.976 4.17 4.29 4.498 4.676 4.853 4.947 5.129 5.293 5.541 5.7 5.846 6.055 6.247 6.447 6.662 6.866 7.111 7.353 7.586 7.862 8.144 8.401 8.672 8.975 9.263 9.584 9.943 10.288 10.609 11.0 11.466 11.892 12.361 12.943 13.609 14.235 14.92 15.71 16.577 17.133 17.344 17.392 17.399 17.329 17.181 17.05 16.919 16.751 16.616 16.482 16.337 16.213 16.085 15.951 15.816 15.706 15.614 15.506 15.372 15.267 15.172 15.06 14.971 14.885 14.795 14.694 14.591 14.525 14.457 14.354 14.279 14.204 14.163 14.069 13.981 13.9 13.856 13.739 13.691 13.63 13.573 13.446 13.37 13.291 13.204 13.124 13.025 12.909 12.718 -4 ,62 ,KEBNE ,16653934,Mon Nov 22 05:01:11 CET,Mon Nov 22 06:25:05 CET,0.0 1.341 1.723 2.023 2.289 2.528 2.743 2.947 3.293 3.448 3.584 3.743 3.923 4.031 4.256 4.474 4.671 4.761 4.938 5.103 5.334 5.482 5.622 5.821 6.009 6.205 6.416 6.605 6.827 7.038 7.248 7.512 7.769 8.012 8.267 8.535 8.78 9.071 9.393 9.745 10.139 10.565 10.983 11.352 11.817 12.373 13.018 13.724 14.467 15.235 16.085 16.646 16.848 16.832 16.751 16.659 16.525 16.371 16.223 16.067 15.933 15.808 15.685 15.576 15.473 15.366 15.253 15.161 15.07 14.976 14.894 14.821 14.745 14.665 14.592 14.51 14.427 14.351 14.266 14.202 14.128 14.004 13.926 13.856 13.82 13.742 13.663 13.578 13.534 13.416 13.372 13.315 13.253 13.122 13.055 12.976 12.882 12.785 12.687 12.571 12.318 -5 ,12429 ,KEBNE ,16653935,Mon Nov 22 05:01:11 CET,Mon Nov 22 06:25:32 CET,0.0 1.301 1.687 1.97 2.214 2.427 2.608 2.792 3.146 3.301 3.45 3.662 3.867 3.978 4.193 4.411 4.611 4.7 4.868 5.025 5.254 5.404 5.558 5.786 5.992 6.184 6.376 6.563 6.805 7.032 7.233 7.455 7.662 7.875 8.132 8.405 8.653 8.92 9.229 9.554 9.852 10.184 10.602 11.089 11.664 12.209 12.801 13.463 14.195 14.982 15.848 16.474 16.699 16.746 16.696 16.596 16.418 16.241 16.113 15.968 15.832 15.695 15.551 15.42 15.3 15.16 15.006 14.891 14.795 14.698 14.588 14.486 14.373 14.252 14.167 14.078 13.981 13.885 13.786 13.709 13.627 13.5 13.408 13.303 13.246 13.151 13.057 12.949 12.892 12.765 12.696 12.644 12.587 12.446 12.378 12.287 12.182 12.099 11.972 11.818 11.164 -6 ,19673 ,KEBNE ,16653936,Mon Nov 22 05:01:12 CET,Mon Nov 22 06:24:59 CET,0.0 1.241 1.658 1.983 2.247 2.474 2.671 2.858 3.173 3.303 3.433 3.61 3.808 3.918 4.127 4.328 4.515 4.602 4.769 4.929 5.148 5.291 5.431 5.632 5.821 5.985 6.144 6.309 6.523 6.737 6.961 7.223 7.465 7.696 7.944 8.238 8.538 8.842 9.174 9.514 9.853 10.218 10.648 11.127 11.644 12.174 12.771 13.444 14.24 15.085 15.934 16.467 16.686 16.748 16.677 16.547 16.399 16.211 16.055 15.885 15.743 15.632 15.489 15.337 15.222 15.132 15.031 14.95 14.873 14.777 14.675 14.59 14.515 14.42 14.331 14.239 14.135 14.025 13.919 13.852 13.785 13.674 13.588 13.504 13.459 13.361 13.266 13.169 13.122 13.003 12.941 12.872 12.809 12.684 12.607 12.532 12.452 12.36 12.256 12.101 11.678 -7 ,28833 ,KEBNE ,16653937,Mon Nov 22 05:02:14 CET,Mon Nov 22 06:25:55 CET,0.0 2.184 2.68 3.033 3.299 3.53 3.733 3.906 4.236 4.381 4.515 4.689 4.884 5.0 5.216 5.427 5.621 5.708 5.893 6.082 6.343 6.496 6.635 6.847 7.062 7.257 7.445 7.633 7.871 8.101 8.319 8.579 8.835 9.063 9.323 9.655 9.99 10.321 10.655 10.998 11.338 11.705 12.141 12.574 13.031 13.592 14.255 14.896 15.602 16.412 17.313 17.864 18.054 18.101 18.077 17.991 17.878 17.77 17.662 17.539 17.419 17.305 17.188 17.086 17.003 16.914 16.801 16.68 16.588 16.505 16.412 16.335 16.251 16.153 16.078 16.008 15.933 15.854 15.759 15.685 15.613 15.502 15.432 15.36 15.316 15.231 15.15 15.055 15.007 14.891 14.831 14.768 14.701 14.552 14.476 14.392 14.296 14.208 14.106 13.969 13.603 -8 ,18347 ,KEBNE ,16653938,Mon Nov 22 05:02:14 CET,Mon Nov 22 06:26:05 CET,0.0 1.852 2.3 2.621 2.879 3.117 3.332 3.513 3.816 3.962 4.1 4.313 4.528 4.664 4.91 5.123 5.319 5.422 5.626 5.831 6.133 6.3 6.453 6.674 6.88 7.087 7.296 7.5 7.757 8.016 8.281 8.589 8.876 9.126 9.394 9.716 10.01 10.328 10.678 11.021 11.389 11.812 12.261 12.688 13.167 13.682 14.263 14.885 15.541 16.284 17.11 17.676 17.917 17.96 17.917 17.787 17.643 17.519 17.376 17.195 17.04 16.927 16.812 16.698 16.591 16.475 16.335 16.206 16.099 15.991 15.878 15.777 15.671 15.567 15.48 15.399 15.324 15.245 15.167 15.109 15.047 14.945 14.878 14.804 14.763 14.684 14.616 14.54 14.49 14.372 14.324 14.259 14.186 14.036 13.966 13.891 13.797 13.701 13.583 13.385 13.049 -9 ,15284 ,KEBNE ,16653939,Mon Nov 22 05:02:14 CET,Mon Nov 22 06:26:03 CET,0.0 1.799 2.201 2.517 2.8 3.052 3.253 3.423 3.758 3.921 4.064 4.245 4.437 4.556 4.779 4.975 5.152 5.239 5.42 5.595 5.837 5.99 6.137 6.347 6.551 6.746 6.937 7.119 7.334 7.546 7.751 7.987 8.204 8.416 8.655 8.929 9.214 9.536 9.879 10.264 10.692 11.114 11.576 12.03 12.522 13.065 13.676 14.355 15.135 15.994 16.942 17.552 17.768 17.791 17.717 17.596 17.461 17.322 17.197 17.052 16.889 16.735 16.6 16.47 16.331 16.188 16.048 15.932 15.832 15.744 15.652 15.55 15.439 15.317 15.218 15.12 15.025 14.942 14.853 14.789 14.73 14.631 14.55 14.461 14.416 14.332 14.244 14.15 14.106 13.999 13.953 13.895 13.834 13.702 13.634 13.55 13.462 13.381 13.285 13.104 12.699 -10 ,14476 ,KEBNE ,16653940,Mon Nov 22 05:02:14 CET,Mon Nov 22 06:27:22 CET,0.0 1.57 1.922 2.228 2.496 2.717 2.908 3.091 3.426 3.573 3.708 3.906 4.121 4.248 4.489 4.721 4.945 5.054 5.261 5.458 5.726 5.893 6.05 6.269 6.47 6.663 6.856 7.052 7.328 7.582 7.797 8.028 8.229 8.44 8.703 8.982 9.266 9.597 9.93 10.28 10.608 10.978 11.429 11.836 12.283 12.801 13.429 14.079 14.772 15.554 16.349 16.864 17.036 17.082 17.066 16.973 16.863 16.739 16.602 16.455 16.302 16.119 15.929 15.779 15.661 15.542 15.407 15.295 15.198 15.094 14.984 14.884 14.775 14.67 14.591 14.491 14.385 14.274 14.152 14.076 13.996 13.868 13.782 13.684 13.635 13.534 13.428 13.315 13.247 13.113 13.041 12.971 12.902 12.745 12.66 12.555 12.444 12.326 12.177 12.026 11.747 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_24.txt deleted file mode 100644 index 8fe68c72..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29616 ,KEBNE ,16653941,Mon Nov 22 05:02:14 CET,Mon Nov 22 06:25:36 CET,0.0 1.287 1.57 1.792 1.979 2.13 2.261 2.38 2.618 2.731 2.829 2.944 3.107 3.188 3.339 3.486 3.629 3.694 3.828 3.965 4.147 4.257 4.362 4.511 4.659 4.803 4.944 5.078 5.235 5.384 5.527 5.692 5.846 5.986 6.144 6.327 6.496 6.683 6.88 7.072 7.257 7.467 7.693 7.881 8.087 8.29 8.467 8.636 8.757 8.674 8.255 7.501 6.793 6.145 5.579 5.038 4.545 4.088 3.675 3.306 2.989 2.695 2.433 2.194 1.971 1.761 1.537 1.322 1.138 0.966 0.792 0.644 0.485 0.33 0.206 0.061 -0.096 -0.273 -0.456 -0.578 -0.707 -0.943 -1.1 -1.256 -1.346 -1.52 -1.682 -1.834 -1.904 -2.055 -2.113 -2.19 -2.275 -2.507 -2.629 -2.739 -2.864 -2.993 -3.16 -3.423 -4.511 -2 ,22504 ,KEBNE ,16653942,Mon Nov 22 05:02:14 CET,Mon Nov 22 06:25:39 CET,0.0 1.443 1.716 1.913 2.077 2.226 2.371 2.509 2.747 2.847 2.942 3.058 3.231 3.328 3.515 3.692 3.858 3.93 4.066 4.209 4.419 4.548 4.665 4.825 4.965 5.08 5.192 5.306 5.457 5.592 5.71 5.863 6.005 6.132 6.274 6.438 6.604 6.785 6.985 7.186 7.377 7.576 7.804 8.009 8.192 8.39 8.587 8.709 8.755 8.662 8.201 7.365 6.594 5.887 5.269 4.722 4.24 3.812 3.44 3.061 2.735 2.428 2.115 1.828 1.592 1.341 1.066 0.85 0.64 0.4 0.148 -0.059 -0.278 -0.499 -0.669 -0.84 -1.017 -1.21 -1.37 -1.464 -1.571 -1.733 -1.842 -1.964 -2.032 -2.169 -2.3 -2.444 -2.53 -2.716 -2.84 -2.938 -3.045 -3.28 -3.404 -3.544 -3.685 -3.857 -4.086 -4.332 -5.066 -3 ,519 ,KEBNE ,16653943,Mon Nov 22 05:02:14 CET,Mon Nov 22 06:25:41 CET,0.0 1.068 1.339 1.529 1.698 1.848 1.977 2.105 2.331 2.423 2.514 2.631 2.789 2.872 3.023 3.167 3.305 3.369 3.493 3.611 3.792 3.896 3.985 4.125 4.256 4.374 4.484 4.599 4.758 4.905 5.048 5.226 5.392 5.543 5.71 5.895 6.059 6.233 6.411 6.611 6.84 7.072 7.307 7.505 7.728 7.946 8.099 8.215 8.286 8.194 7.815 7.098 6.362 5.712 5.125 4.568 4.066 3.619 3.24 2.856 2.519 2.228 1.945 1.667 1.408 1.181 0.95 0.727 0.513 0.285 0.029 -0.198 -0.415 -0.629 -0.777 -0.907 -1.038 -1.191 -1.343 -1.439 -1.54 -1.7 -1.82 -1.956 -2.023 -2.166 -2.331 -2.493 -2.568 -2.73 -2.815 -2.899 -2.977 -3.164 -3.286 -3.423 -3.581 -3.748 -3.938 -4.172 -5.307 -4 ,26609 ,KEBNE ,16653944,Mon Nov 22 05:02:14 CET,Mon Nov 22 06:26:06 CET,0.0 0.906 1.204 1.417 1.562 1.699 1.838 1.952 2.15 2.257 2.356 2.472 2.646 2.745 2.929 3.101 3.277 3.36 3.516 3.661 3.862 3.978 4.08 4.215 4.357 4.514 4.656 4.793 4.978 5.164 5.353 5.581 5.808 6.023 6.263 6.529 6.785 7.051 7.335 7.646 7.899 8.104 8.323 8.509 8.681 8.846 8.999 9.118 9.162 9.097 8.735 8.015 7.266 6.584 5.991 5.461 4.99 4.547 4.175 3.795 3.476 3.196 2.9 2.575 2.269 2.033 1.813 1.624 1.46 1.286 1.11 0.957 0.784 0.595 0.443 0.276 0.125 -0.008 -0.151 -0.254 -0.363 -0.546 -0.685 -0.83 -0.906 -1.058 -1.215 -1.386 -1.474 -1.646 -1.763 -1.873 -1.977 -2.211 -2.34 -2.485 -2.671 -2.864 -3.056 -3.285 -4.031 -5 ,21316 ,KEBNE ,16653945,Mon Nov 22 05:02:14 CET,Mon Nov 22 06:25:43 CET,0.0 0.826 1.141 1.33 1.496 1.65 1.786 1.911 2.131 2.235 2.338 2.443 2.612 2.708 2.876 3.014 3.146 3.212 3.336 3.456 3.627 3.727 3.82 3.967 4.117 4.255 4.377 4.496 4.659 4.801 4.93 5.085 5.23 5.369 5.524 5.695 5.864 6.043 6.228 6.419 6.608 6.819 7.052 7.26 7.472 7.699 7.933 8.092 8.167 8.077 7.605 6.842 6.125 5.491 4.919 4.397 3.917 3.481 3.118 2.733 2.391 2.097 1.828 1.582 1.345 1.109 0.856 0.646 0.47 0.283 0.082 -0.087 -0.273 -0.467 -0.601 -0.739 -0.889 -1.047 -1.224 -1.355 -1.488 -1.703 -1.857 -2.012 -2.093 -2.265 -2.447 -2.635 -2.738 -2.925 -3.05 -3.159 -3.276 -3.527 -3.679 -3.842 -4.026 -4.222 -4.431 -4.73 -6.136 -6 ,5662 ,KEBNE ,16653946,Mon Nov 22 05:03:15 CET,Mon Nov 22 06:26:46 CET,0.0 0.864 1.193 1.446 1.661 1.866 2.037 2.184 2.446 2.564 2.672 2.801 2.971 3.064 3.225 3.384 3.537 3.603 3.73 3.866 4.059 4.176 4.305 4.51 4.691 4.854 5.0 5.125 5.279 5.423 5.561 5.717 5.874 6.033 6.205 6.396 6.566 6.752 6.966 7.189 7.383 7.574 7.794 7.987 8.196 8.404 8.597 8.774 8.886 8.817 8.374 7.557 6.743 6.028 5.419 4.866 4.366 3.898 3.506 3.146 2.85 2.58 2.318 2.077 1.858 1.663 1.467 1.282 1.113 0.947 0.74 0.537 0.334 0.117 -0.049 -0.21 -0.388 -0.578 -0.773 -0.902 -1.029 -1.224 -1.361 -1.495 -1.562 -1.699 -1.84 -1.987 -2.056 -2.208 -2.272 -2.349 -2.438 -2.657 -2.78 -2.913 -3.063 -3.222 -3.376 -3.565 -4.253 -7 ,2404 ,KEBNE ,16653947,Mon Nov 22 05:03:16 CET,Mon Nov 22 06:26:46 CET,0.0 1.106 1.472 1.704 1.887 2.046 2.184 2.315 2.546 2.647 2.747 2.864 3.023 3.111 3.281 3.425 3.555 3.619 3.736 3.844 4.003 4.11 4.213 4.356 4.487 4.607 4.726 4.847 4.992 5.132 5.261 5.407 5.551 5.691 5.848 6.007 6.157 6.333 6.521 6.702 6.89 7.111 7.349 7.555 7.76 7.953 8.136 8.275 8.339 8.251 7.824 7.121 6.485 5.859 5.264 4.728 4.24 3.786 3.382 2.983 2.659 2.382 2.1 1.815 1.555 1.324 1.086 0.877 0.691 0.491 0.29 0.133 -0.023 -0.175 -0.298 -0.432 -0.562 -0.699 -0.848 -0.944 -1.043 -1.214 -1.324 -1.438 -1.504 -1.631 -1.766 -1.916 -1.995 -2.169 -2.287 -2.388 -2.493 -2.697 -2.808 -2.937 -3.124 -3.369 -3.623 -3.886 -4.641 -8 ,31892 ,KEBNE ,16653948,Mon Nov 22 05:03:18 CET,Mon Nov 22 06:24:58 CET,0.0 1.119 1.38 1.583 1.761 1.941 2.105 2.239 2.475 2.579 2.677 2.787 2.946 3.022 3.168 3.311 3.451 3.515 3.625 3.727 3.888 3.992 4.09 4.226 4.355 4.482 4.603 4.712 4.853 4.99 5.118 5.269 5.409 5.548 5.71 5.858 6.001 6.181 6.373 6.564 6.742 6.93 7.134 7.304 7.465 7.633 7.792 7.907 7.94 7.824 7.456 6.819 6.161 5.538 4.97 4.429 3.938 3.512 3.122 2.72 2.39 2.091 1.811 1.56 1.308 1.089 0.873 0.675 0.503 0.325 0.146 -0.007 -0.171 -0.338 -0.468 -0.604 -0.74 -0.886 -1.041 -1.143 -1.24 -1.395 -1.518 -1.645 -1.707 -1.835 -1.954 -2.084 -2.158 -2.314 -2.371 -2.455 -2.55 -2.759 -2.87 -2.976 -3.109 -3.274 -3.465 -3.71 -4.458 -9 ,19004 ,KEBNE ,16653949,Mon Nov 22 05:03:15 CET,Mon Nov 22 06:26:39 CET,0.0 0.825 1.113 1.341 1.51 1.676 1.835 1.981 2.257 2.379 2.488 2.611 2.777 2.866 3.048 3.217 3.379 3.461 3.607 3.756 3.975 4.098 4.224 4.416 4.585 4.74 4.895 5.046 5.236 5.42 5.601 5.826 6.034 6.214 6.391 6.562 6.724 6.896 7.084 7.28 7.473 7.683 7.91 8.091 8.282 8.49 8.693 8.837 8.922 8.863 8.437 7.713 6.956 6.237 5.61 5.081 4.62 4.186 3.784 3.398 3.087 2.797 2.514 2.237 1.978 1.756 1.532 1.335 1.171 0.993 0.787 0.591 0.362 0.11 -0.071 -0.232 -0.418 -0.632 -0.842 -0.988 -1.134 -1.344 -1.492 -1.656 -1.741 -1.92 -2.099 -2.28 -2.374 -2.551 -2.669 -2.776 -2.877 -3.095 -3.22 -3.367 -3.521 -3.67 -3.829 -4.071 -4.849 -10 ,9790 ,KEBNE ,16653950,Mon Nov 22 05:03:16 CET,Mon Nov 22 06:26:50 CET,0.0 0.688 0.988 1.216 1.405 1.559 1.693 1.819 2.079 2.194 2.299 2.419 2.595 2.693 2.87 3.046 3.22 3.298 3.441 3.578 3.769 3.892 4.011 4.189 4.369 4.531 4.688 4.819 4.958 5.096 5.232 5.384 5.529 5.666 5.813 5.976 6.135 6.318 6.526 6.739 6.936 7.144 7.377 7.568 7.75 7.968 8.198 8.357 8.419 8.319 7.807 6.955 6.199 5.542 4.967 4.405 3.91 3.475 3.074 2.67 2.341 2.055 1.79 1.538 1.297 1.074 0.847 0.632 0.439 0.25 0.05 -0.131 -0.312 -0.491 -0.634 -0.778 -0.912 -1.066 -1.259 -1.396 -1.534 -1.731 -1.86 -1.992 -2.063 -2.226 -2.393 -2.572 -2.665 -2.836 -2.938 -3.023 -3.102 -3.28 -3.372 -3.489 -3.631 -3.765 -3.922 -4.157 -4.92 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_32.txt deleted file mode 100644 index f45cd860..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26062 ,KEBNE ,17042204,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:31:22 CET,0.0 0.141 0.208 0.263 0.31 0.354 0.397 0.439 0.508 0.54 0.572 0.564 0.67 0.698 0.762 0.817 0.864 0.887 0.932 0.978 1.038 1.064 1.085 1.13 1.176 1.211 1.241 1.264 1.29 1.304 1.311 1.332 1.347 1.348 1.355 1.368 1.375 1.375 1.359 1.331 1.292 1.241 1.177 1.073 0.913 0.697 0.377 -0.094 -0.822 -1.879 -3.56 -5.447 -6.932 -8.155 -9.199 -10.124 -10.887 -11.551 -12.116 -12.678 -13.165 -13.591 -13.971 -14.318 -14.643 -14.935 -15.236 -15.503 -15.738 -15.983 -16.239 -16.435 -16.638 -16.868 -17.045 -17.229 -17.42 -17.612 -17.815 -17.952 -18.09 -18.324 -18.486 -18.64 -18.716 -18.882 -19.063 -19.255 -19.351 -19.543 -19.646 -19.761 -19.89 -20.158 -20.297 -20.444 -20.611 -20.802 -21.039 -21.397 -22.545 -2 ,25192 ,KEBNE ,17042205,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:33:22 CET,0.0 0.172 0.254 0.319 0.37 0.424 0.474 0.515 0.59 0.629 0.661 0.643 0.746 0.769 0.817 0.865 0.913 0.935 0.97 0.995 1.031 1.061 1.093 1.127 1.157 1.179 1.2 1.224 1.255 1.289 1.315 1.338 1.348 1.356 1.377 1.403 1.415 1.41 1.391 1.371 1.34 1.285 1.194 1.076 0.915 0.69 0.353 -0.083 -0.674 -1.63 -3.234 -5.093 -6.567 -7.772 -8.793 -9.693 -10.472 -11.177 -11.763 -12.342 -12.838 -13.278 -13.706 -14.087 -14.431 -14.735 -15.053 -15.34 -15.579 -15.822 -16.068 -16.277 -16.494 -16.715 -16.895 -17.088 -17.279 -17.467 -17.658 -17.792 -17.931 -18.14 -18.292 -18.446 -18.522 -18.685 -18.866 -19.067 -19.166 -19.359 -19.481 -19.602 -19.727 -20.005 -20.166 -20.333 -20.51 -20.729 -21.006 -21.317 -22.531 -3 ,24593 ,KEBNE ,17042206,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:31:17 CET,0.0 0.143 0.241 0.297 0.339 0.386 0.435 0.477 0.544 0.585 0.626 0.602 0.7 0.729 0.784 0.824 0.864 0.883 0.918 0.946 0.988 1.019 1.043 1.07 1.099 1.127 1.154 1.176 1.198 1.216 1.233 1.252 1.257 1.26 1.275 1.283 1.273 1.247 1.199 1.154 1.119 1.044 0.917 0.77 0.56 0.291 -0.055 -0.513 -1.176 -2.17 -3.764 -5.574 -7.034 -8.266 -9.279 -10.168 -10.962 -11.68 -12.278 -12.869 -13.368 -13.804 -14.228 -14.625 -14.977 -15.302 -15.655 -15.958 -16.202 -16.444 -16.69 -16.893 -17.094 -17.322 -17.505 -17.687 -17.875 -18.07 -18.278 -18.419 -18.562 -18.784 -18.938 -19.113 -19.2 -19.351 -19.518 -19.702 -19.791 -19.987 -20.114 -20.242 -20.371 -20.643 -20.795 -20.966 -21.148 -21.326 -21.581 -21.9 -22.847 -4 ,8395 ,KEBNE ,17042207,Thu Dec 23 04:04:16 CET,Thu Dec 23 05:31:12 CET,0.0 0.207 0.294 0.363 0.427 0.472 0.508 0.544 0.608 0.637 0.666 0.661 0.762 0.787 0.834 0.876 0.917 0.935 0.965 0.997 1.042 1.07 1.093 1.135 1.173 1.196 1.224 1.249 1.272 1.3 1.329 1.342 1.355 1.385 1.407 1.411 1.409 1.393 1.368 1.34 1.289 1.232 1.145 1.026 0.886 0.678 0.365 -0.062 -0.663 -1.595 -3.197 -5.085 -6.606 -7.85 -8.89 -9.799 -10.533 -11.164 -11.73 -12.296 -12.773 -13.187 -13.573 -13.935 -14.278 -14.578 -14.882 -15.163 -15.403 -15.648 -15.888 -16.088 -16.313 -16.554 -16.733 -16.906 -17.09 -17.288 -17.489 -17.63 -17.773 -18.006 -18.164 -18.315 -18.398 -18.572 -18.734 -18.894 -18.983 -19.177 -19.274 -19.382 -19.504 -19.781 -19.928 -20.092 -20.265 -20.478 -20.758 -21.078 -22.209 -5 ,26453 ,KEBNE ,17042208,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:31:13 CET,0.0 0.201 0.283 0.336 0.373 0.426 0.479 0.525 0.628 0.672 0.699 0.676 0.779 0.803 0.852 0.898 0.939 0.958 0.992 1.021 1.074 1.11 1.142 1.181 1.209 1.234 1.266 1.295 1.324 1.345 1.357 1.368 1.379 1.393 1.401 1.41 1.418 1.413 1.402 1.384 1.367 1.325 1.245 1.145 1.001 0.818 0.539 0.114 -0.558 -1.569 -3.182 -5.078 -6.617 -7.876 -8.935 -9.883 -10.687 -11.415 -12.039 -12.63 -13.113 -13.535 -13.973 -14.444 -14.906 -15.323 -15.74 -16.089 -16.388 -16.666 -16.946 -17.182 -17.407 -17.63 -17.803 -17.986 -18.174 -18.37 -18.562 -18.692 -18.84 -19.064 -19.208 -19.371 -19.456 -19.621 -19.793 -19.969 -20.069 -20.277 -20.405 -20.512 -20.625 -20.886 -21.028 -21.17 -21.34 -21.541 -21.773 -22.076 -23.297 -6 ,4063 ,KEBNE ,17042209,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:33:15 CET,0.0 0.36 0.473 0.53 0.583 0.626 0.66 0.698 0.785 0.825 0.858 0.843 0.955 0.983 1.033 1.082 1.126 1.148 1.181 1.205 1.246 1.276 1.298 1.323 1.351 1.371 1.386 1.406 1.443 1.479 1.504 1.53 1.551 1.551 1.545 1.549 1.55 1.555 1.562 1.569 1.559 1.534 1.48 1.373 1.217 1.005 0.694 0.246 -0.409 -1.394 -3.012 -4.942 -6.474 -7.73 -8.778 -9.652 -10.422 -11.131 -11.725 -12.315 -12.804 -13.23 -13.646 -14.037 -14.404 -14.731 -15.053 -15.341 -15.603 -15.88 -16.169 -16.397 -16.636 -16.895 -17.086 -17.269 -17.465 -17.677 -17.887 -18.032 -18.18 -18.408 -18.566 -18.73 -18.811 -18.972 -19.143 -19.321 -19.418 -19.619 -19.743 -19.852 -19.966 -20.227 -20.376 -20.553 -20.749 -20.95 -21.2 -21.575 -22.875 -7 ,4971 ,KEBNE ,17042210,Thu Dec 23 04:04:14 CET,Thu Dec 23 05:32:50 CET,0.0 0.17 0.28 0.374 0.451 0.514 0.559 0.598 0.662 0.686 0.717 0.707 0.812 0.836 0.877 0.921 0.969 0.988 1.013 1.045 1.097 1.124 1.149 1.183 1.209 1.229 1.25 1.278 1.307 1.326 1.339 1.357 1.378 1.392 1.402 1.397 1.384 1.368 1.348 1.31 1.255 1.175 1.059 0.95 0.808 0.599 0.277 -0.179 -0.819 -1.758 -3.352 -5.26 -6.802 -8.057 -9.115 -10.037 -10.817 -11.483 -12.054 -12.632 -13.112 -13.526 -13.913 -14.271 -14.595 -14.902 -15.22 -15.504 -15.75 -15.999 -16.251 -16.459 -16.682 -16.933 -17.124 -17.305 -17.497 -17.699 -17.913 -18.048 -18.189 -18.425 -18.575 -18.732 -18.815 -18.989 -19.166 -19.343 -19.441 -19.633 -19.73 -19.841 -19.955 -20.162 -20.278 -20.431 -20.608 -20.82 -21.067 -21.423 -22.683 -8 ,22075 ,KEBNE ,17042211,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:31:15 CET,0.0 0.098 0.17 0.216 0.282 0.35 0.396 0.442 0.513 0.544 0.574 0.553 0.648 0.667 0.712 0.756 0.794 0.812 0.856 0.908 0.976 1.015 1.056 1.109 1.158 1.204 1.241 1.277 1.338 1.393 1.422 1.454 1.489 1.523 1.562 1.582 1.583 1.584 1.565 1.542 1.518 1.463 1.395 1.316 1.166 0.94 0.642 0.225 -0.41 -1.409 -3.066 -4.972 -6.474 -7.718 -8.776 -9.683 -10.448 -11.134 -11.726 -12.294 -12.777 -13.226 -13.624 -13.977 -14.336 -14.658 -14.966 -15.234 -15.475 -15.722 -15.963 -16.17 -16.388 -16.619 -16.794 -16.97 -17.147 -17.327 -17.522 -17.657 -17.798 -18.019 -18.181 -18.349 -18.43 -18.6 -18.792 -18.983 -19.084 -19.286 -19.393 -19.506 -19.634 -19.913 -20.061 -20.226 -20.425 -20.663 -20.937 -21.284 -22.318 -9 ,32283 ,KEBNE ,17042212,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:31:26 CET,0.0 0.21 0.294 0.348 0.41 0.468 0.515 0.56 0.639 0.668 0.693 0.676 0.782 0.809 0.863 0.912 0.954 0.971 0.997 1.026 1.079 1.109 1.131 1.167 1.195 1.219 1.249 1.279 1.306 1.329 1.354 1.374 1.387 1.399 1.416 1.44 1.454 1.474 1.488 1.476 1.448 1.406 1.332 1.236 1.093 0.874 0.576 0.149 -0.505 -1.505 -3.167 -5.074 -6.598 -7.83 -8.836 -9.735 -10.518 -11.191 -11.783 -12.416 -12.945 -13.379 -13.794 -14.19 -14.549 -14.872 -15.22 -15.524 -15.777 -16.053 -16.333 -16.559 -16.798 -17.043 -17.232 -17.425 -17.634 -17.855 -18.083 -18.242 -18.4 -18.641 -18.816 -18.998 -19.085 -19.264 -19.443 -19.633 -19.74 -19.934 -20.031 -20.148 -20.275 -20.548 -20.697 -20.853 -21.02 -21.19 -21.418 -21.761 -22.838 -10 ,14937 ,KEBNE ,17042213,Thu Dec 23 04:04:16 CET,Thu Dec 23 05:32:28 CET,0.0 0.103 0.191 0.265 0.328 0.374 0.414 0.449 0.514 0.552 0.59 0.576 0.681 0.707 0.744 0.78 0.816 0.831 0.862 0.898 0.944 0.975 1.006 1.038 1.091 1.18 1.258 1.324 1.39 1.417 1.434 1.445 1.442 1.448 1.455 1.467 1.475 1.471 1.465 1.445 1.41 1.364 1.304 1.209 1.043 0.813 0.496 0.046 -0.596 -1.604 -3.275 -5.164 -6.653 -7.918 -8.981 -9.863 -10.621 -11.312 -11.919 -12.508 -12.989 -13.423 -13.841 -14.228 -14.579 -14.891 -15.216 -15.514 -15.756 -15.991 -16.232 -16.435 -16.651 -16.864 -17.029 -17.214 -17.408 -17.597 -17.789 -17.926 -18.072 -18.284 -18.422 -18.578 -18.661 -18.834 -19.012 -19.183 -19.272 -19.46 -19.568 -19.676 -19.786 -20.032 -20.175 -20.334 -20.511 -20.74 -21.025 -21.33 -22.669 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_33.txt deleted file mode 100644 index d14e71a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_19_33.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16938 ,KEBNE ,16653951,Mon Nov 22 05:03:16 CET,Mon Nov 22 06:27:25 CET,0.0 0.82 1.058 1.24 1.421 1.577 1.71 1.823 2.035 2.134 2.225 2.319 2.476 2.553 2.709 2.869 3.009 3.079 3.213 3.323 3.466 3.561 3.649 3.787 3.935 4.085 4.227 4.356 4.514 4.666 4.82 5.009 5.181 5.341 5.538 5.764 5.972 6.207 6.472 6.741 7.001 7.279 7.586 7.886 8.244 8.648 9.075 9.496 10.004 10.574 11.067 11.288 11.267 11.112 10.925 10.732 10.564 10.401 10.246 10.078 9.911 9.762 9.617 9.459 9.306 9.175 9.042 8.915 8.813 8.717 8.617 8.541 8.462 8.377 8.313 8.24 8.155 8.073 7.991 7.94 7.883 7.787 7.717 7.64 7.601 7.519 7.438 7.361 7.321 7.206 7.201 7.16 7.111 7.009 6.953 6.882 6.803 6.72 6.622 6.513 6.366 -2 ,25122 ,KEBNE ,16653952,Mon Nov 22 05:03:15 CET,Mon Nov 22 06:28:48 CET,0.0 0.951 1.281 1.471 1.626 1.746 1.869 1.991 2.217 2.323 2.415 2.497 2.651 2.732 2.886 3.033 3.168 3.229 3.337 3.436 3.581 3.678 3.773 3.905 4.043 4.182 4.325 4.477 4.655 4.81 4.97 5.165 5.337 5.498 5.678 5.875 6.077 6.309 6.562 6.818 7.054 7.309 7.624 7.96 8.335 8.698 9.116 9.594 10.105 10.596 11.001 11.172 11.16 11.066 10.912 10.758 10.609 10.459 10.326 10.173 10.03 9.902 9.776 9.656 9.55 9.455 9.345 9.241 9.158 9.062 8.945 8.855 8.763 8.659 8.579 8.502 8.43 8.363 8.281 8.219 8.16 8.068 8.003 7.943 7.911 7.837 7.755 7.668 7.625 7.513 7.497 7.449 7.394 7.279 7.221 7.164 7.095 7.002 6.895 6.791 6.67 -3 ,22698 ,KEBNE ,16653953,Mon Nov 22 05:04:18 CET,Mon Nov 22 06:30:05 CET,0.0 0.964 1.249 1.45 1.608 1.746 1.872 1.988 2.207 2.302 2.393 2.486 2.647 2.736 2.882 3.014 3.138 3.205 3.337 3.453 3.619 3.726 3.829 3.98 4.126 4.267 4.408 4.54 4.707 4.857 4.997 5.168 5.338 5.493 5.679 5.907 6.106 6.319 6.543 6.769 7.006 7.265 7.564 7.877 8.238 8.611 9.015 9.434 9.856 10.28 10.678 10.811 10.746 10.62 10.454 10.3 10.16 10.0 9.849 9.697 9.558 9.421 9.281 9.15 9.035 8.926 8.81 8.716 8.634 8.54 8.446 8.367 8.281 8.192 8.123 8.054 7.986 7.912 7.836 7.782 7.727 7.638 7.567 7.499 7.465 7.398 7.332 7.259 7.22 7.104 7.098 7.053 7.0 6.901 6.85 6.778 6.697 6.611 6.508 6.403 6.154 -4 ,17901 ,KEBNE ,16653954,Mon Nov 22 05:04:18 CET,Mon Nov 22 06:29:37 CET,0.0 1.088 1.378 1.583 1.773 1.932 2.072 2.193 2.413 2.513 2.594 2.672 2.831 2.917 3.091 3.245 3.384 3.458 3.6 3.728 3.941 4.076 4.192 4.351 4.505 4.644 4.772 4.905 5.078 5.246 5.404 5.59 5.77 5.933 6.121 6.336 6.542 6.758 6.983 7.224 7.472 7.755 8.08 8.381 8.699 9.034 9.446 9.933 10.432 10.884 11.262 11.311 11.2 11.02 10.797 10.579 10.391 10.222 10.044 9.855 9.704 9.575 9.444 9.321 9.223 9.131 9.025 8.923 8.836 8.753 8.658 8.57 8.481 8.379 8.303 8.233 8.152 8.064 7.98 7.922 7.859 7.764 7.695 7.621 7.58 7.497 7.415 7.322 7.271 7.143 7.108 7.052 6.998 6.883 6.819 6.759 6.693 6.614 6.522 6.407 6.227 -5 ,11979 ,KEBNE ,16653955,Mon Nov 22 05:04:18 CET,Mon Nov 22 06:28:09 CET,0.0 0.955 1.232 1.463 1.64 1.789 1.904 2.005 2.199 2.288 2.38 2.484 2.643 2.719 2.877 3.026 3.167 3.227 3.323 3.427 3.599 3.707 3.8 3.935 4.064 4.18 4.296 4.422 4.596 4.767 4.926 5.115 5.3 5.485 5.687 5.909 6.134 6.386 6.641 6.892 7.162 7.464 7.785 8.092 8.46 8.851 9.249 9.65 10.078 10.571 11.08 11.298 11.29 11.195 11.068 10.928 10.798 10.682 10.572 10.428 10.268 10.135 10.016 9.898 9.775 9.668 9.55 9.434 9.348 9.255 9.154 9.071 8.98 8.876 8.8 8.732 8.664 8.589 8.504 8.445 8.377 8.261 8.191 8.122 8.085 7.998 7.909 7.828 7.783 7.665 7.635 7.581 7.529 7.413 7.338 7.268 7.205 7.131 7.053 6.96 6.817 -6 ,31884 ,KEBNE ,16653956,Mon Nov 22 05:04:18 CET,Mon Nov 22 06:28:08 CET,0.0 0.886 1.173 1.35 1.49 1.624 1.752 1.868 2.102 2.21 2.31 2.415 2.569 2.639 2.783 2.922 3.049 3.112 3.232 3.348 3.512 3.624 3.742 3.905 4.051 4.187 4.313 4.423 4.579 4.733 4.877 5.05 5.22 5.382 5.577 5.784 5.969 6.184 6.406 6.639 6.886 7.168 7.52 7.887 8.27 8.657 9.095 9.561 10.08 10.621 11.156 11.389 11.342 11.238 11.096 10.908 10.712 10.516 10.339 10.169 10.004 9.846 9.694 9.546 9.415 9.29 9.157 9.045 8.934 8.807 8.69 8.593 8.487 8.387 8.313 8.237 8.159 8.078 7.996 7.941 7.879 7.774 7.706 7.636 7.596 7.523 7.449 7.366 7.323 7.201 7.176 7.125 7.073 6.976 6.921 6.851 6.772 6.682 6.589 6.494 6.302 -9 ,24329 ,KEBNE ,16653959,Mon Nov 22 05:04:18 CET,Mon Nov 22 06:29:51 CET,0.0 0.829 1.074 1.26 1.433 1.582 1.698 1.808 2.0 2.093 2.188 2.282 2.431 2.5 2.651 2.795 2.927 2.993 3.121 3.238 3.409 3.517 3.613 3.742 3.874 4.002 4.118 4.239 4.416 4.571 4.709 4.891 5.056 5.198 5.35 5.54 5.757 5.996 6.244 6.488 6.744 7.018 7.348 7.691 8.064 8.465 8.926 9.421 9.918 10.413 10.879 11.102 11.058 10.904 10.742 10.562 10.384 10.198 10.021 9.866 9.721 9.569 9.43 9.303 9.168 9.041 8.921 8.807 8.711 8.625 8.519 8.433 8.355 8.262 8.181 8.102 8.036 7.965 7.878 7.82 7.759 7.653 7.579 7.506 7.473 7.408 7.335 7.251 7.206 7.095 7.071 7.023 6.981 6.885 6.822 6.751 6.683 6.615 6.546 6.459 6.199 -10 ,10995 ,KEBNE ,16653960,Mon Nov 22 05:04:18 CET,Mon Nov 22 06:29:48 CET,0.0 0.927 1.178 1.358 1.519 1.676 1.84 2.002 2.245 2.342 2.432 2.529 2.688 2.766 2.916 3.066 3.201 3.261 3.39 3.515 3.681 3.784 3.881 4.023 4.16 4.282 4.399 4.526 4.7 4.862 5.015 5.207 5.38 5.538 5.733 5.95 6.146 6.36 6.586 6.815 7.071 7.382 7.711 8.03 8.404 8.8 9.216 9.651 10.156 10.679 11.181 11.45 11.457 11.362 11.236 11.086 10.94 10.777 10.592 10.42 10.276 10.127 9.978 9.829 9.697 9.572 9.42 9.3 9.211 9.121 9.026 8.943 8.853 8.763 8.699 8.628 8.562 8.483 8.387 8.324 8.256 8.163 8.098 8.024 7.986 7.916 7.849 7.772 7.729 7.612 7.583 7.53 7.488 7.392 7.335 7.261 7.174 7.082 6.937 6.787 6.635 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_20_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_20_19.txt deleted file mode 100644 index cd8e2317..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_20_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28860 ,KEBNE ,17042214,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:33:21 CET,0.0 0.238 0.355 0.447 0.535 0.617 0.69 0.762 0.89 0.947 1.01 1.049 1.193 1.247 1.356 1.457 1.553 1.603 1.705 1.803 1.939 2.033 2.126 2.259 2.39 2.523 2.647 2.754 2.896 3.037 3.173 3.34 3.503 3.665 3.851 4.069 4.296 4.536 4.776 5.039 5.312 5.618 5.989 6.351 6.783 7.272 7.841 8.462 9.13 9.888 10.575 10.729 10.526 10.196 9.881 9.55 9.226 8.909 8.614 8.328 8.064 7.81 7.557 7.309 7.071 6.827 6.555 6.323 6.112 5.891 5.673 5.49 5.3 5.099 4.926 4.734 4.545 4.354 4.143 3.988 3.826 3.572 3.387 3.209 3.125 2.945 2.744 2.511 2.383 2.174 1.994 1.86 1.704 1.39 1.208 0.969 0.717 0.454 0.078 -0.483 -2.907 -2 ,19872 ,KEBNE ,17042215,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:33:23 CET,0.0 0.257 0.405 0.521 0.612 0.691 0.76 0.834 0.97 1.035 1.102 1.131 1.275 1.33 1.432 1.536 1.637 1.686 1.778 1.87 2.008 2.094 2.175 2.29 2.41 2.531 2.646 2.762 2.919 3.073 3.22 3.41 3.59 3.745 3.93 4.144 4.346 4.563 4.806 5.087 5.38 5.685 6.034 6.394 6.804 7.275 7.841 8.455 9.092 9.782 10.47 10.741 10.721 10.542 10.28 10.014 9.768 9.476 9.211 8.96 8.728 8.521 8.306 8.093 7.885 7.674 7.457 7.269 7.092 6.903 6.707 6.531 6.351 6.165 6.018 5.842 5.647 5.461 5.265 5.138 5.005 4.78 4.632 4.454 4.357 4.167 3.97 3.77 3.674 3.491 3.293 3.138 2.955 2.548 2.334 2.097 1.827 1.528 1.099 0.46 -2.026 -3 ,26448 ,KEBNE ,17042216,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:35:06 CET,0.0 0.18 0.304 0.397 0.491 0.578 0.651 0.721 0.853 0.923 0.992 1.022 1.165 1.221 1.324 1.423 1.528 1.582 1.678 1.776 1.924 2.007 2.088 2.216 2.344 2.475 2.593 2.705 2.859 3.004 3.146 3.315 3.484 3.654 3.836 4.047 4.27 4.507 4.737 4.998 5.288 5.608 5.994 6.386 6.827 7.307 7.87 8.489 9.175 9.99 10.764 11.04 10.968 10.82 10.65 10.417 10.105 9.78 9.487 9.168 8.913 8.697 8.494 8.292 8.084 7.881 7.655 7.455 7.29 7.103 6.897 6.733 6.556 6.377 6.243 6.096 5.931 5.734 5.52 5.378 5.231 4.997 4.836 4.651 4.553 4.369 4.166 3.924 3.806 3.612 3.401 3.253 3.09 2.746 2.559 2.339 2.101 1.832 1.512 0.955 -1.588 -4 ,22236 ,KEBNE ,17042217,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:33:27 CET,0.0 0.244 0.385 0.492 0.591 0.692 0.784 0.863 1.036 1.119 1.193 1.246 1.404 1.467 1.593 1.712 1.816 1.872 1.98 2.087 2.24 2.335 2.426 2.551 2.678 2.812 2.947 3.066 3.202 3.337 3.48 3.658 3.832 4.009 4.217 4.437 4.653 4.893 5.144 5.424 5.723 6.046 6.389 6.741 7.211 7.742 8.268 8.856 9.594 10.334 11.047 11.431 11.478 11.326 11.067 10.81 10.53 10.257 10.014 9.756 9.537 9.326 9.107 8.881 8.663 8.46 8.227 8.011 7.823 7.645 7.465 7.305 7.129 6.915 6.754 6.605 6.437 6.248 6.054 5.918 5.774 5.559 5.402 5.231 5.144 4.958 4.753 4.514 4.385 4.19 4.029 3.892 3.74 3.403 3.212 2.993 2.735 2.427 2.032 1.455 -1.049 -5 ,6734 ,KEBNE ,17042218,Thu Dec 23 04:04:14 CET,Thu Dec 23 05:34:21 CET,0.0 0.168 0.279 0.378 0.461 0.541 0.612 0.681 0.815 0.884 0.943 0.971 1.113 1.167 1.274 1.38 1.487 1.541 1.643 1.747 1.896 1.984 2.078 2.223 2.345 2.46 2.579 2.694 2.843 2.986 3.132 3.312 3.475 3.629 3.828 4.055 4.271 4.511 4.766 5.044 5.324 5.625 5.999 6.377 6.827 7.358 7.927 8.531 9.2 9.897 10.568 10.832 10.738 10.574 10.364 10.082 9.757 9.417 9.134 8.849 8.584 8.329 8.062 7.807 7.589 7.375 7.137 6.93 6.736 6.515 6.282 6.075 5.865 5.651 5.5 5.34 5.151 4.976 4.798 4.658 4.508 4.274 4.101 3.927 3.842 3.655 3.462 3.253 3.122 2.912 2.688 2.531 2.394 2.047 1.825 1.592 1.3 0.956 0.584 0.093 -3.642 -6 ,3025 ,KEBNE ,17042219,Thu Dec 23 04:04:16 CET,Thu Dec 23 05:33:24 CET,0.0 0.209 0.332 0.414 0.501 0.585 0.656 0.727 0.859 0.925 0.994 1.042 1.196 1.251 1.353 1.456 1.554 1.601 1.689 1.775 1.902 1.984 2.067 2.193 2.317 2.441 2.568 2.686 2.826 2.966 3.113 3.288 3.444 3.594 3.781 3.996 4.206 4.447 4.713 4.994 5.271 5.572 5.942 6.314 6.761 7.257 7.802 8.433 9.109 9.862 10.672 10.963 10.944 10.805 10.577 10.344 10.094 9.845 9.635 9.41 9.194 8.985 8.755 8.513 8.307 8.099 7.864 7.655 7.458 7.261 7.065 6.894 6.697 6.485 6.335 6.177 6.007 5.844 5.676 5.544 5.397 5.18 5.026 4.857 4.763 4.564 4.354 4.113 3.994 3.806 3.654 3.52 3.364 3.005 2.817 2.633 2.428 2.155 1.788 1.277 -1.706 -7 ,26912 ,KEBNE ,17042220,Thu Dec 23 04:04:16 CET,Thu Dec 23 05:33:37 CET,0.0 0.269 0.394 0.519 0.624 0.715 0.788 0.86 0.987 1.042 1.1 1.134 1.282 1.341 1.459 1.565 1.657 1.705 1.802 1.893 2.028 2.115 2.201 2.33 2.452 2.568 2.683 2.8 2.945 3.075 3.209 3.392 3.567 3.725 3.912 4.124 4.329 4.57 4.837 5.118 5.426 5.786 6.209 6.618 7.083 7.587 8.137 8.724 9.42 10.222 10.982 11.308 11.223 10.953 10.656 10.377 10.063 9.718 9.421 9.107 8.816 8.555 8.283 7.993 7.742 7.52 7.282 7.067 6.883 6.687 6.462 6.283 6.089 5.869 5.705 5.538 5.349 5.149 4.953 4.817 4.667 4.436 4.273 4.084 3.989 3.79 3.575 3.337 3.219 3.019 2.789 2.639 2.48 2.124 1.924 1.669 1.367 1.046 0.685 0.137 -1.836 -8 ,21543 ,KEBNE ,17042221,Thu Dec 23 04:04:16 CET,Thu Dec 23 05:34:24 CET,0.0 0.242 0.389 0.497 0.582 0.67 0.758 0.83 0.963 1.027 1.085 1.116 1.26 1.316 1.423 1.524 1.622 1.674 1.775 1.867 2.004 2.09 2.172 2.298 2.426 2.544 2.659 2.77 2.917 3.066 3.216 3.401 3.574 3.742 3.936 4.16 4.367 4.59 4.827 5.072 5.34 5.659 6.036 6.381 6.794 7.305 7.881 8.533 9.25 9.977 10.688 10.983 10.951 10.806 10.571 10.285 9.997 9.696 9.431 9.157 8.893 8.671 8.462 8.231 8.003 7.807 7.612 7.414 7.223 7.023 6.83 6.688 6.532 6.35 6.208 6.057 5.902 5.734 5.537 5.407 5.272 5.043 4.87 4.694 4.607 4.422 4.23 4.022 3.907 3.714 3.52 3.371 3.206 2.841 2.652 2.447 2.197 1.914 1.527 0.926 -1.913 -9 ,10455 ,KEBNE ,17042222,Thu Dec 23 04:04:16 CET,Thu Dec 23 05:34:43 CET,0.0 0.239 0.368 0.466 0.547 0.625 0.698 0.769 0.893 0.96 1.032 1.066 1.213 1.275 1.398 1.505 1.606 1.655 1.754 1.853 1.995 2.091 2.188 2.325 2.453 2.577 2.699 2.805 2.939 3.085 3.227 3.399 3.569 3.727 3.908 4.124 4.341 4.586 4.843 5.102 5.374 5.686 6.049 6.419 6.855 7.342 7.912 8.531 9.222 9.988 10.72 10.962 10.86 10.665 10.384 10.036 9.686 9.351 9.048 8.727 8.45 8.195 7.924 7.67 7.419 7.172 6.92 6.702 6.509 6.313 6.098 5.908 5.716 5.51 5.353 5.186 5.005 4.812 4.621 4.487 4.327 4.082 3.913 3.731 3.64 3.445 3.24 3.017 2.906 2.727 2.559 2.417 2.254 1.846 1.636 1.432 1.182 0.87 0.45 -0.129 -2.705 -10 ,31345 ,KEBNE ,17042223,Thu Dec 23 04:04:16 CET,Thu Dec 23 05:33:57 CET,0.0 0.133 0.245 0.329 0.406 0.481 0.547 0.616 0.754 0.826 0.897 0.935 1.084 1.146 1.264 1.37 1.479 1.536 1.642 1.744 1.895 1.982 2.067 2.196 2.325 2.449 2.567 2.68 2.838 2.997 3.137 3.306 3.474 3.635 3.826 4.037 4.23 4.456 4.721 5.005 5.307 5.647 6.046 6.452 6.937 7.468 7.993 8.593 9.317 10.029 10.734 11.056 11.022 10.869 10.611 10.301 10.003 9.716 9.473 9.212 8.944 8.702 8.468 8.24 8.03 7.827 7.607 7.41 7.223 7.039 6.856 6.691 6.511 6.309 6.15 5.984 5.814 5.658 5.482 5.342 5.21 5.004 4.851 4.686 4.598 4.407 4.194 3.966 3.844 3.643 3.442 3.297 3.146 2.798 2.606 2.403 2.159 1.854 1.503 1.01 -0.821 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_20_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_20_33.txt deleted file mode 100644 index 7de737bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_20_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28640 ,KEBNE ,17042224,Thu Dec 23 04:04:14 CET,Thu Dec 23 05:34:05 CET,0.0 0.8 1.045 1.265 1.457 1.606 1.745 1.87 2.098 2.212 2.311 2.411 2.59 2.678 2.854 3.026 3.184 3.261 3.407 3.538 3.741 3.873 3.995 4.164 4.335 4.496 4.653 4.808 4.997 5.182 5.359 5.578 5.801 6.005 6.237 6.51 6.772 7.064 7.377 7.704 8.035 8.407 8.859 9.323 9.901 10.548 11.243 12.019 12.901 13.779 14.694 15.124 15.121 15.013 14.849 14.613 14.358 14.102 13.84 13.541 13.258 13.009 12.759 12.497 12.229 12.0 11.781 11.565 11.364 11.147 10.927 10.757 10.593 10.424 10.295 10.142 9.964 9.788 9.596 9.467 9.344 9.135 8.99 8.845 8.765 8.588 8.403 8.202 8.097 7.915 7.742 7.598 7.434 7.082 6.891 6.672 6.397 6.099 5.728 5.183 2.992 -2 ,8691 ,KEBNE ,17042225,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:35:27 CET,0.0 1.108 1.399 1.593 1.752 1.905 2.058 2.193 2.419 2.524 2.627 2.728 2.906 2.987 3.145 3.307 3.452 3.524 3.659 3.799 4.004 4.132 4.265 4.443 4.605 4.766 4.92 5.084 5.294 5.491 5.691 5.93 6.164 6.388 6.63 6.921 7.218 7.531 7.872 8.246 8.649 9.104 9.612 10.109 10.697 11.349 12.069 12.905 13.861 14.858 15.94 16.546 16.644 16.543 16.349 16.115 15.885 15.633 15.352 15.069 14.836 14.615 14.396 14.193 14.001 13.78 13.529 13.336 13.184 13.009 12.815 12.654 12.502 12.338 12.181 12.014 11.839 11.674 11.517 11.394 11.251 11.007 10.843 10.672 10.584 10.407 10.207 9.989 9.881 9.703 9.55 9.418 9.262 8.93 8.76 8.568 8.331 8.051 7.662 7.113 5.397 -3 ,17075 ,KEBNE ,17042226,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:34:10 CET,0.0 0.946 1.261 1.455 1.613 1.764 1.893 2.023 2.261 2.373 2.48 2.587 2.764 2.855 3.034 3.202 3.355 3.428 3.583 3.72 3.898 4.02 4.143 4.312 4.47 4.629 4.796 4.959 5.156 5.35 5.533 5.75 5.966 6.166 6.405 6.689 6.962 7.272 7.608 7.948 8.306 8.729 9.219 9.716 10.299 10.966 11.738 12.525 13.428 14.44 15.441 15.948 16.05 16.004 15.863 15.631 15.384 15.123 14.89 14.688 14.48 14.267 14.047 13.82 13.594 13.389 13.172 12.963 12.771 12.553 12.338 12.171 11.99 11.791 11.637 11.485 11.318 11.149 10.984 10.866 10.734 10.518 10.364 10.2 10.112 9.916 9.695 9.47 9.364 9.177 9.003 8.864 8.714 8.405 8.233 8.034 7.81 7.528 7.179 6.685 4.775 -4 ,17738 ,KEBNE ,17042227,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:35:12 CET,0.0 0.864 1.144 1.336 1.51 1.651 1.772 1.9 2.146 2.256 2.362 2.46 2.634 2.72 2.888 3.048 3.194 3.266 3.409 3.544 3.731 3.853 3.98 4.166 4.344 4.506 4.664 4.824 5.03 5.235 5.419 5.638 5.853 6.065 6.32 6.609 6.876 7.169 7.496 7.843 8.227 8.636 9.109 9.616 10.174 10.769 11.451 12.242 13.161 14.15 15.162 15.729 15.862 15.797 15.669 15.515 15.323 15.114 14.93 14.738 14.556 14.38 14.21 14.031 13.846 13.663 13.469 13.295 13.153 13.01 12.831 12.675 12.521 12.349 12.212 12.08 11.933 11.755 11.551 11.403 11.256 11.034 10.879 10.72 10.638 10.457 10.265 10.068 9.96 9.779 9.608 9.463 9.305 8.952 8.749 8.51 8.247 7.962 7.59 7.062 5.056 -5 ,6091 ,KEBNE ,17042228,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:35:03 CET,0.0 0.856 1.092 1.277 1.427 1.567 1.697 1.815 2.038 2.135 2.241 2.366 2.543 2.638 2.808 2.959 3.111 3.179 3.312 3.438 3.619 3.743 3.866 4.041 4.202 4.366 4.52 4.665 4.864 5.067 5.274 5.524 5.745 5.957 6.203 6.478 6.77 7.091 7.421 7.777 8.15 8.576 9.093 9.596 10.159 10.814 11.604 12.481 13.425 14.447 15.49 15.99 16.088 16.033 15.874 15.659 15.424 15.184 14.945 14.691 14.451 14.226 14.008 13.792 13.583 13.393 13.185 12.976 12.785 12.605 12.41 12.233 12.06 11.872 11.721 11.57 11.41 11.244 11.066 10.952 10.836 10.63 10.493 10.356 10.277 10.108 9.932 9.719 9.603 9.416 9.241 9.113 8.965 8.637 8.457 8.246 8.03 7.77 7.415 6.948 4.688 -6 ,13860 ,KEBNE ,17042229,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:33:38 CET,0.0 0.605 0.88 1.09 1.264 1.411 1.541 1.668 1.897 1.992 2.093 2.195 2.376 2.468 2.648 2.822 2.993 3.066 3.2 3.33 3.507 3.626 3.74 3.917 4.084 4.237 4.396 4.56 4.771 4.984 5.182 5.418 5.648 5.866 6.124 6.405 6.67 6.96 7.256 7.577 7.928 8.326 8.819 9.308 9.855 10.44 11.097 11.86 12.678 13.624 14.682 15.223 15.351 15.359 15.268 15.072 14.847 14.61 14.379 14.16 13.982 13.782 13.597 13.453 13.295 13.127 12.969 12.817 12.656 12.479 12.295 12.148 11.995 11.84 11.715 11.575 11.415 11.246 11.08 10.974 10.864 10.672 10.53 10.378 10.296 10.125 9.952 9.768 9.659 9.465 9.293 9.148 8.996 8.662 8.473 8.277 8.033 7.71 7.33 6.871 4.674 -7 ,6175 ,KEBNE ,17042230,Thu Dec 23 04:04:14 CET,Thu Dec 23 05:33:45 CET,0.0 0.835 1.184 1.432 1.596 1.731 1.857 1.978 2.194 2.291 2.393 2.517 2.712 2.809 2.982 3.155 3.31 3.387 3.539 3.681 3.88 4.015 4.141 4.309 4.465 4.618 4.771 4.926 5.139 5.333 5.516 5.728 5.932 6.147 6.414 6.712 6.981 7.282 7.604 7.947 8.313 8.727 9.226 9.74 10.303 10.892 11.595 12.426 13.348 14.274 15.34 16.075 16.362 16.438 16.375 16.226 16.051 15.846 15.643 15.422 15.197 14.989 14.77 14.529 14.322 14.153 13.961 13.779 13.628 13.475 13.297 13.144 12.982 12.799 12.645 12.489 12.339 12.182 12.0 11.867 11.73 11.481 11.298 11.13 11.039 10.846 10.65 10.45 10.344 10.162 10.005 9.866 9.723 9.422 9.247 9.048 8.786 8.461 8.075 7.545 5.227 -8 ,9980 ,KEBNE ,17042231,Thu Dec 23 04:04:14 CET,Thu Dec 23 05:35:15 CET,0.0 0.614 0.883 1.051 1.196 1.324 1.457 1.585 1.806 1.905 1.998 2.099 2.28 2.378 2.555 2.725 2.884 2.957 3.111 3.259 3.461 3.586 3.709 3.886 4.048 4.217 4.382 4.532 4.724 4.912 5.105 5.34 5.554 5.764 6.007 6.276 6.542 6.836 7.16 7.506 7.867 8.278 8.744 9.194 9.779 10.453 11.18 11.98 12.821 13.785 14.838 15.334 15.369 15.295 15.167 14.944 14.678 14.414 14.152 13.861 13.617 13.396 13.172 12.956 12.741 12.532 12.292 12.068 11.881 11.673 11.466 11.289 11.098 10.899 10.744 10.576 10.396 10.212 10.003 9.862 9.731 9.525 9.369 9.198 9.108 8.917 8.714 8.503 8.403 8.224 8.064 7.934 7.785 7.456 7.241 7.007 6.775 6.487 6.123 5.577 2.812 -9 ,13931 ,KEBNE ,17042232,Thu Dec 23 04:04:15 CET,Thu Dec 23 05:34:22 CET,0.0 0.827 1.087 1.286 1.452 1.603 1.75 1.879 2.104 2.214 2.314 2.413 2.593 2.682 2.833 2.99 3.138 3.206 3.362 3.512 3.711 3.831 3.95 4.134 4.308 4.465 4.618 4.777 4.981 5.162 5.348 5.594 5.831 6.057 6.317 6.604 6.873 7.165 7.472 7.82 8.192 8.606 9.113 9.61 10.173 10.825 11.585 12.408 13.304 14.171 15.045 15.538 15.581 15.479 15.291 15.058 14.833 14.617 14.409 14.189 13.978 13.775 13.559 13.35 13.187 13.027 12.839 12.686 12.55 12.371 12.194 12.048 11.874 11.702 11.57 11.426 11.276 11.122 10.968 10.859 10.736 10.548 10.417 10.265 10.185 10.001 9.805 9.615 9.499 9.316 9.16 9.038 8.899 8.597 8.426 8.222 8.005 7.726 7.379 6.889 3.433 -10 ,20295 ,KEBNE ,17042233,Thu Dec 23 04:04:16 CET,Thu Dec 23 05:34:09 CET,0.0 0.743 1.004 1.197 1.335 1.469 1.6 1.722 1.956 2.062 2.155 2.257 2.438 2.528 2.689 2.829 2.97 3.047 3.197 3.333 3.522 3.637 3.754 3.932 4.111 4.285 4.451 4.607 4.802 4.992 5.179 5.405 5.622 5.827 6.072 6.348 6.608 6.897 7.218 7.568 7.943 8.377 8.882 9.39 9.986 10.605 11.297 12.083 12.987 13.955 14.873 15.403 15.535 15.507 15.367 15.167 14.962 14.742 14.511 14.247 14.023 13.834 13.624 13.412 13.217 13.049 12.866 12.687 12.525 12.342 12.136 11.966 11.804 11.645 11.51 11.346 11.182 11.027 10.86 10.741 10.616 10.397 10.241 10.085 9.998 9.802 9.602 9.396 9.298 9.126 8.951 8.812 8.667 8.337 8.142 7.932 7.703 7.437 7.133 6.652 4.486 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_21_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_21_22.txt deleted file mode 100644 index bca940f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_21_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9516 ,KEBNE ,17042234,Thu Dec 23 04:04:14 CET,Thu Dec 23 05:32:33 CET,0.0 1.041 1.408 1.698 1.903 2.062 2.208 2.345 2.601 2.717 2.825 2.942 3.104 3.2 3.402 3.576 3.719 3.79 3.94 4.074 4.249 4.363 4.475 4.645 4.812 4.973 5.131 5.282 5.471 5.662 5.855 6.085 6.304 6.515 6.765 7.036 7.291 7.562 7.844 8.153 8.484 8.834 9.219 9.635 10.11 10.587 11.117 11.709 12.394 13.19 14.089 14.642 14.846 14.893 14.889 14.829 14.734 14.642 14.526 14.373 14.23 14.092 13.966 13.845 13.714 13.587 13.455 13.337 13.229 13.106 12.97 12.865 12.759 12.642 12.549 12.447 12.344 12.241 12.126 12.043 11.957 11.841 11.754 11.663 11.612 11.479 11.352 11.221 11.158 11.035 10.973 10.899 10.816 10.634 10.536 10.432 10.318 10.185 9.987 9.684 8.643 -2 ,19851 ,KEBNE ,17042236,Thu Dec 23 04:05:17 CET,Thu Dec 23 05:34:00 CET,0.0 1.517 1.849 2.099 2.292 2.462 2.632 2.775 2.996 3.104 3.215 3.348 3.516 3.607 3.771 3.925 4.073 4.142 4.277 4.414 4.61 4.736 4.857 5.032 5.213 5.382 5.539 5.694 5.897 6.087 6.264 6.48 6.692 6.891 7.122 7.395 7.654 7.938 8.257 8.576 8.89 9.237 9.657 10.064 10.498 10.99 11.578 12.23 12.961 13.824 14.729 15.254 15.466 15.512 15.478 15.376 15.263 15.143 15.015 14.88 14.745 14.621 14.49 14.357 14.252 14.145 14.001 13.87 13.759 13.645 13.516 13.403 13.287 13.163 13.072 12.974 12.861 12.747 12.632 12.547 12.455 12.309 12.212 12.111 12.051 11.922 11.787 11.627 11.543 11.415 11.348 11.274 11.198 11.027 10.926 10.808 10.654 10.471 10.236 9.925 9.042 -3 ,24307 ,KEBNE ,17042237,Thu Dec 23 04:05:17 CET,Thu Dec 23 05:35:25 CET,0.0 1.267 1.565 1.803 2.043 2.258 2.433 2.582 2.851 2.985 3.117 3.295 3.48 3.589 3.79 3.991 4.186 4.277 4.432 4.578 4.8 4.936 5.064 5.258 5.446 5.625 5.794 5.954 6.154 6.35 6.548 6.786 7.003 7.204 7.44 7.706 7.946 8.205 8.491 8.801 9.135 9.521 9.94 10.334 10.808 11.337 11.95 12.587 13.289 14.093 14.9 15.359 15.562 15.653 15.629 15.533 15.388 15.242 15.12 15.01 14.901 14.791 14.691 14.599 14.497 14.388 14.262 14.146 14.052 13.955 13.856 13.768 13.673 13.587 13.518 13.443 13.359 13.263 13.169 13.096 13.005 12.874 12.787 12.684 12.628 12.522 12.425 12.317 12.252 12.125 12.064 11.997 11.924 11.747 11.63 11.501 11.382 11.253 11.083 10.804 9.823 -4 ,20525 ,KEBNE ,17042238,Thu Dec 23 04:05:18 CET,Thu Dec 23 05:35:34 CET,0.0 0.986 1.28 1.52 1.697 1.847 2.011 2.16 2.44 2.567 2.676 2.798 2.964 3.057 3.242 3.418 3.585 3.664 3.807 3.943 4.138 4.258 4.382 4.573 4.742 4.89 5.028 5.178 5.396 5.609 5.81 6.05 6.282 6.498 6.74 7.008 7.263 7.55 7.865 8.174 8.499 8.878 9.314 9.737 10.202 10.691 11.228 11.839 12.52 13.278 14.149 14.67 14.866 14.921 14.889 14.797 14.704 14.606 14.487 14.366 14.242 14.115 13.987 13.829 13.685 13.575 13.441 13.311 13.198 13.079 12.936 12.826 12.724 12.609 12.524 12.44 12.351 12.258 12.164 12.099 12.033 11.92 11.836 11.75 11.706 11.605 11.495 11.365 11.292 11.156 11.085 11.013 10.934 10.737 10.634 10.516 10.359 10.163 9.961 9.734 9.068 -5 ,19980 ,KEBNE ,17042240,Thu Dec 23 04:07:22 CET,Thu Dec 23 05:35:52 CET,0.0 1.148 1.454 1.694 1.902 2.075 2.219 2.354 2.606 2.723 2.834 2.971 3.144 3.248 3.45 3.62 3.776 3.853 4.001 4.145 4.36 4.494 4.618 4.791 4.949 5.093 5.242 5.399 5.593 5.778 5.962 6.177 6.376 6.576 6.796 7.041 7.3 7.588 7.88 8.192 8.516 8.862 9.254 9.636 10.115 10.66 11.281 11.963 12.689 13.509 14.394 15.021 15.288 15.349 15.328 15.246 15.124 15.014 14.918 14.811 14.709 14.612 14.509 14.393 14.287 14.169 14.036 13.926 13.83 13.74 13.642 13.562 13.474 13.365 13.28 13.186 13.087 12.987 12.877 12.797 12.702 12.549 12.433 12.315 12.26 12.159 12.044 11.905 11.834 11.672 11.511 11.423 11.36 11.202 11.096 10.971 10.835 10.689 10.513 10.242 9.402 -6 ,4392 ,KEBNE ,17042241,Thu Dec 23 04:08:25 CET,Thu Dec 23 05:37:05 CET,0.0 1.046 1.292 1.494 1.687 1.842 1.97 2.1 2.363 2.478 2.582 2.706 2.87 2.958 3.124 3.279 3.441 3.517 3.665 3.815 4.022 4.14 4.25 4.413 4.577 4.741 4.894 5.034 5.228 5.408 5.574 5.78 5.975 6.17 6.389 6.618 6.849 7.11 7.387 7.694 8.02 8.395 8.847 9.283 9.774 10.262 10.8 11.46 12.174 12.952 13.823 14.382 14.624 14.725 14.779 14.777 14.712 14.61 14.521 14.421 14.303 14.195 14.099 14.001 13.91 13.832 13.738 13.651 13.57 13.487 13.405 13.324 13.227 13.119 13.037 12.95 12.868 12.779 12.666 12.592 12.525 12.424 12.348 12.262 12.221 12.133 12.033 11.921 11.855 11.718 11.638 11.567 11.494 11.283 11.156 11.053 10.937 10.788 10.594 10.356 9.428 -7 ,23887 ,KEBNE ,17042243,Thu Dec 23 04:08:25 CET,Thu Dec 23 05:38:43 CET,0.0 0.973 1.291 1.519 1.712 1.89 2.047 2.2 2.501 2.641 2.761 2.924 3.109 3.212 3.416 3.599 3.768 3.852 4.014 4.164 4.377 4.517 4.653 4.859 5.055 5.23 5.401 5.574 5.79 5.987 6.166 6.371 6.576 6.782 7.013 7.258 7.519 7.814 8.11 8.427 8.76 9.127 9.557 9.984 10.472 11.008 11.602 12.272 13.028 13.887 14.846 15.421 15.634 15.703 15.665 15.596 15.535 15.444 15.312 15.165 15.051 14.961 14.877 14.786 14.693 14.596 14.489 14.408 14.335 14.243 14.141 14.061 13.978 13.891 13.817 13.735 13.643 13.55 13.468 13.406 13.328 13.209 13.126 13.033 12.986 12.88 12.755 12.612 12.543 12.405 12.335 12.27 12.19 12.004 11.913 11.805 11.669 11.509 11.29 11.017 10.342 -8 ,25808 ,KEBNE ,17042244,Thu Dec 23 04:08:25 CET,Thu Dec 23 05:37:01 CET,0.0 1.086 1.381 1.603 1.761 1.899 2.047 2.184 2.42 2.541 2.654 2.782 2.943 3.03 3.209 3.376 3.529 3.6 3.734 3.886 4.112 4.25 4.383 4.559 4.725 4.887 5.046 5.191 5.374 5.542 5.699 5.896 6.091 6.291 6.519 6.768 7.002 7.262 7.531 7.808 8.104 8.434 8.822 9.21 9.669 10.182 10.735 11.35 12.074 12.895 13.784 14.341 14.476 14.479 14.434 14.357 14.233 14.086 13.969 13.853 13.741 13.617 13.496 13.385 13.252 13.114 12.984 12.87 12.767 12.653 12.541 12.45 12.343 12.242 12.169 12.089 12.004 11.91 11.804 11.727 11.655 11.542 11.455 11.374 11.33 11.229 11.134 11.041 10.988 10.858 10.792 10.719 10.636 10.475 10.381 10.271 10.146 9.996 9.835 9.575 8.625 -9 ,31191 ,KEBNE ,17042246,Thu Dec 23 04:08:25 CET,Thu Dec 23 05:36:35 CET,0.0 0.959 1.223 1.475 1.681 1.827 1.969 2.118 2.398 2.52 2.626 2.751 2.914 3.011 3.188 3.353 3.523 3.604 3.761 3.916 4.145 4.284 4.412 4.608 4.801 4.977 5.137 5.294 5.496 5.677 5.855 6.091 6.317 6.523 6.756 7.023 7.277 7.541 7.817 8.122 8.441 8.798 9.201 9.604 10.071 10.565 11.127 11.77 12.494 13.276 14.078 14.52 14.652 14.627 14.575 14.519 14.422 14.305 14.18 14.044 13.914 13.758 13.595 13.468 13.361 13.246 13.122 13.004 12.888 12.768 12.653 12.554 12.447 12.342 12.248 12.147 12.033 11.894 11.765 11.684 11.605 11.488 11.416 11.339 11.29 11.187 11.078 10.964 10.905 10.788 10.722 10.65 10.572 10.394 10.304 10.188 10.019 9.828 9.613 9.355 8.658 -10 ,16506 ,KEBNE ,17042247,Thu Dec 23 04:08:25 CET,Thu Dec 23 05:38:33 CET,0.0 1.288 1.609 1.881 2.137 2.351 2.539 2.742 3.098 3.24 3.371 3.539 3.724 3.842 4.047 4.246 4.444 4.539 4.718 4.888 5.139 5.294 5.436 5.639 5.841 6.046 6.254 6.446 6.658 6.874 7.101 7.382 7.644 7.895 8.201 8.521 8.793 9.071 9.371 9.695 10.022 10.365 10.768 11.192 11.676 12.201 12.786 13.425 14.17 14.952 15.804 16.364 16.567 16.621 16.578 16.49 16.368 16.24 16.129 15.99 15.848 15.714 15.584 15.45 15.311 15.184 15.05 14.93 14.822 14.703 14.563 14.443 14.319 14.183 14.075 13.963 13.851 13.72 13.566 13.467 13.371 13.228 13.122 13.009 12.951 12.827 12.703 12.558 12.476 12.337 12.24 12.16 12.072 11.869 11.763 11.631 11.464 11.265 11.001 10.655 9.59 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_21_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_21_23.txt deleted file mode 100644 index 36be51af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_21_23.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9382 ,KEBNE ,16653961,Mon Nov 22 05:04:18 CET,Mon Nov 22 06:30:34 CET,0.0 0.567 0.729 0.827 0.89 0.944 1.003 1.057 1.138 1.183 1.23 1.237 1.333 1.358 1.417 1.466 1.513 1.539 1.59 1.643 1.716 1.75 1.775 1.816 1.848 1.875 1.898 1.924 1.941 1.94 1.94 1.936 1.932 1.908 1.88 1.844 1.778 1.688 1.593 1.474 1.311 1.094 0.789 0.436 -0.004 -0.571 -1.346 -2.311 -3.655 -5.632 -8.615 -11.841 -14.364 -16.368 -18.012 -19.43 -20.644 -21.692 -22.511 -23.273 -23.929 -24.528 -25.078 -25.593 -26.057 -26.457 -26.874 -27.244 -27.556 -27.863 -28.173 -28.427 -28.696 -28.974 -29.181 -29.396 -29.613 -29.845 -30.078 -30.225 -30.375 -30.607 -30.764 -30.929 -31.011 -31.188 -31.375 -31.562 -31.652 -31.851 -31.937 -32.042 -32.148 -32.381 -32.509 -32.626 -32.751 -32.921 -33.114 -33.344 -33.712 -2 ,11152 ,KEBNE ,16653962,Mon Nov 22 05:04:18 CET,Mon Nov 22 06:28:42 CET,0.0 0.32 0.435 0.51 0.583 0.649 0.708 0.767 0.868 0.914 0.956 0.965 1.076 1.119 1.2 1.257 1.305 1.33 1.385 1.428 1.483 1.513 1.535 1.566 1.591 1.608 1.634 1.658 1.669 1.678 1.679 1.664 1.633 1.601 1.561 1.503 1.443 1.359 1.247 1.116 0.964 0.771 0.505 0.197 -0.24 -0.813 -1.555 -2.507 -3.788 -5.69 -8.606 -11.831 -14.315 -16.284 -17.937 -19.347 -20.513 -21.507 -22.306 -23.109 -23.789 -24.364 -24.903 -25.397 -25.845 -26.245 -26.651 -27.019 -27.349 -27.678 -28.019 -28.306 -28.582 -28.854 -29.057 -29.261 -29.47 -29.685 -29.909 -30.062 -30.21 -30.43 -30.588 -30.756 -30.838 -31.006 -31.191 -31.374 -31.473 -31.692 -31.813 -31.936 -32.051 -32.262 -32.381 -32.507 -32.641 -32.794 -32.965 -33.18 -33.578 -3 ,11775 ,KEBNE ,16653963,Mon Nov 22 05:04:26 CET,Mon Nov 22 06:25:39 CET,0.0 0.348 0.492 0.586 0.651 0.709 0.766 0.813 0.888 0.93 0.968 0.962 1.064 1.085 1.128 1.172 1.219 1.245 1.301 1.35 1.41 1.44 1.459 1.482 1.508 1.531 1.546 1.559 1.57 1.574 1.578 1.572 1.541 1.506 1.471 1.425 1.366 1.295 1.201 1.071 0.919 0.72 0.44 0.12 -0.301 -0.818 -1.525 -2.477 -3.763 -5.605 -8.519 -11.796 -14.323 -16.381 -18.05 -19.449 -20.622 -21.659 -22.537 -23.392 -24.088 -24.685 -25.23 -25.729 -26.198 -26.618 -27.047 -27.417 -27.732 -28.063 -28.407 -28.681 -28.972 -29.284 -29.513 -29.752 -29.996 -30.226 -30.466 -30.638 -30.811 -31.051 -31.205 -31.362 -31.441 -31.618 -31.809 -32.008 -32.107 -32.306 -32.4 -32.505 -32.613 -32.847 -32.957 -33.075 -33.214 -33.358 -33.533 -33.793 -34.461 -4 ,28145 ,KEBNE ,16653964,Mon Nov 22 05:04:26 CET,Mon Nov 22 06:27:39 CET,0.0 0.391 0.577 0.711 0.787 0.859 0.921 0.971 1.048 1.086 1.126 1.118 1.219 1.243 1.278 1.313 1.346 1.357 1.374 1.397 1.428 1.442 1.451 1.459 1.476 1.489 1.491 1.493 1.481 1.464 1.448 1.42 1.372 1.309 1.24 1.164 1.082 0.975 0.84 0.681 0.5 0.265 -0.061 -0.419 -0.845 -1.37 -2.078 -3.004 -4.299 -6.18 -9.164 -12.373 -14.871 -16.989 -18.688 -20.022 -21.149 -22.142 -22.943 -23.748 -24.443 -25.042 -25.587 -26.089 -26.548 -26.954 -27.381 -27.766 -28.084 -28.406 -28.742 -29.007 -29.278 -29.575 -29.797 -30.009 -30.235 -30.473 -30.7 -30.85 -31.008 -31.276 -31.464 -31.647 -31.738 -31.913 -32.086 -32.265 -32.358 -32.569 -32.667 -32.769 -32.867 -33.074 -33.203 -33.33 -33.453 -33.594 -33.747 -33.945 -34.392 -5 ,4421 ,KEBNE ,16653965,Mon Nov 22 05:04:22 CET,Mon Nov 22 06:26:47 CET,0.0 0.23 0.345 0.454 0.533 0.598 0.65 0.704 0.807 0.853 0.897 0.905 1.003 1.03 1.07 1.111 1.161 1.181 1.208 1.219 1.235 1.25 1.266 1.277 1.28 1.277 1.272 1.27 1.266 1.263 1.249 1.226 1.203 1.164 1.117 1.068 1.008 0.912 0.796 0.662 0.502 0.298 0.019 -0.305 -0.711 -1.221 -1.925 -2.871 -4.185 -6.125 -9.178 -12.526 -15.036 -17.037 -18.702 -20.11 -21.278 -22.304 -23.168 -24.003 -24.694 -25.285 -25.841 -26.362 -26.833 -27.247 -27.656 -28.016 -28.331 -28.643 -28.961 -29.229 -29.494 -29.768 -29.977 -30.189 -30.418 -30.647 -30.876 -31.028 -31.18 -31.42 -31.583 -31.743 -31.833 -32.018 -32.204 -32.404 -32.504 -32.709 -32.784 -32.881 -32.985 -33.207 -33.32 -33.439 -33.572 -33.721 -33.895 -34.1 -34.718 -6 ,31615 ,KEBNE ,16653966,Mon Nov 22 05:05:19 CET,Mon Nov 22 06:29:36 CET,0.0 0.374 0.518 0.604 0.679 0.744 0.783 0.824 0.907 0.94 0.968 0.951 1.042 1.059 1.098 1.129 1.154 1.168 1.203 1.234 1.263 1.27 1.276 1.294 1.306 1.308 1.304 1.294 1.267 1.238 1.21 1.172 1.127 1.075 1.006 0.926 0.846 0.74 0.616 0.476 0.313 0.108 -0.157 -0.47 -0.896 -1.438 -2.159 -3.115 -4.442 -6.375 -9.4 -12.646 -15.153 -17.167 -18.812 -20.195 -21.343 -22.356 -23.204 -24.023 -24.683 -25.236 -25.768 -26.268 -26.706 -27.091 -27.493 -27.848 -28.147 -28.451 -28.748 -29.002 -29.265 -29.528 -29.738 -29.946 -30.15 -30.366 -30.597 -30.764 -30.927 -31.157 -31.313 -31.475 -31.556 -31.724 -31.908 -32.093 -32.186 -32.396 -32.473 -32.565 -32.662 -32.871 -32.983 -33.119 -33.276 -33.43 -33.604 -33.82 -34.312 -8 ,11428 ,KEBNE ,16653968,Mon Nov 22 05:05:20 CET,Mon Nov 22 06:29:42 CET,0.0 0.399 0.54 0.629 0.698 0.768 0.84 0.905 1.002 1.039 1.077 1.077 1.181 1.202 1.242 1.285 1.326 1.347 1.377 1.399 1.42 1.429 1.441 1.454 1.457 1.463 1.477 1.487 1.493 1.481 1.467 1.446 1.407 1.366 1.311 1.24 1.166 1.081 0.979 0.85 0.706 0.503 0.214 -0.111 -0.545 -1.075 -1.768 -2.724 -4.073 -5.955 -8.814 -12.022 -14.542 -16.58 -18.235 -19.616 -20.74 -21.709 -22.54 -23.356 -24.032 -24.61 -25.152 -25.658 -26.117 -26.536 -26.964 -27.338 -27.646 -27.959 -28.279 -28.533 -28.792 -29.056 -29.265 -29.478 -29.696 -29.925 -30.152 -30.303 -30.458 -30.693 -30.845 -30.999 -31.081 -31.249 -31.42 -31.594 -31.686 -31.895 -31.984 -32.09 -32.199 -32.432 -32.554 -32.681 -32.815 -32.971 -33.155 -33.354 -33.814 -9 ,2943 ,KEBNE ,16653969,Mon Nov 22 05:05:20 CET,Mon Nov 22 06:29:34 CET,0.0 0.29 0.41 0.506 0.592 0.647 0.688 0.739 0.845 0.896 0.936 0.918 1.009 1.033 1.074 1.107 1.133 1.147 1.165 1.184 1.219 1.241 1.265 1.288 1.298 1.299 1.292 1.285 1.271 1.248 1.221 1.183 1.142 1.09 1.027 0.963 0.882 0.773 0.651 0.498 0.323 0.096 -0.22 -0.566 -1.024 -1.581 -2.283 -3.191 -4.483 -6.363 -9.268 -12.5 -14.944 -16.917 -18.568 -19.991 -21.175 -22.2 -23.049 -23.87 -24.55 -25.138 -25.677 -26.186 -26.655 -27.062 -27.485 -27.846 -28.154 -28.478 -28.791 -29.042 -29.309 -29.593 -29.814 -30.029 -30.236 -30.439 -30.647 -30.793 -30.95 -31.208 -31.376 -31.538 -31.627 -31.801 -31.973 -32.161 -32.253 -32.452 -32.53 -32.632 -32.739 -32.988 -33.126 -33.261 -33.389 -33.529 -33.711 -33.923 -34.446 -10 ,5722 ,KEBNE ,16653970,Mon Nov 22 05:05:20 CET,Mon Nov 22 06:29:47 CET,0.0 0.449 0.595 0.68 0.749 0.811 0.866 0.909 0.979 1.019 1.053 1.025 1.121 1.143 1.185 1.235 1.276 1.293 1.319 1.343 1.369 1.374 1.397 1.436 1.462 1.484 1.505 1.523 1.527 1.522 1.522 1.511 1.471 1.434 1.394 1.337 1.27 1.181 1.068 0.929 0.779 0.586 0.31 -0.003 -0.419 -0.967 -1.691 -2.61 -3.892 -5.79 -8.728 -11.998 -14.522 -16.524 -18.154 -19.54 -20.71 -21.77 -22.644 -23.475 -24.172 -24.762 -25.318 -25.835 -26.281 -26.683 -27.107 -27.484 -27.798 -28.105 -28.43 -28.701 -28.975 -29.265 -29.485 -29.711 -29.954 -30.193 -30.421 -30.573 -30.733 -30.985 -31.171 -31.355 -31.441 -31.629 -31.829 -32.034 -32.148 -32.366 -32.441 -32.539 -32.65 -32.894 -33.02 -33.147 -33.296 -33.458 -33.645 -33.898 -34.472 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_21_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_21_32.txt deleted file mode 100644 index 49057861..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_21_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,224 ,KEBNE ,17023495,Wed Dec 22 08:12:51 CET,Wed Dec 22 09:40:28 CET,0.0 0.246 0.35 0.423 0.492 0.551 0.604 0.64 0.703 0.742 0.774 0.745 0.848 0.878 0.931 0.972 1.009 1.028 1.066 1.099 1.141 1.172 1.209 1.263 1.305 1.33 1.349 1.369 1.392 1.409 1.431 1.455 1.476 1.498 1.514 1.526 1.534 1.544 1.565 1.584 1.561 1.493 1.402 1.319 1.2 1.028 0.75 0.334 -0.275 -1.273 -2.925 -4.855 -6.404 -7.696 -8.807 -9.781 -10.637 -11.408 -12.058 -12.689 -13.225 -13.696 -14.134 -14.536 -14.925 -15.279 -15.646 -15.967 -16.238 -16.526 -16.812 -17.046 -17.298 -17.577 -17.794 -18.008 -18.228 -18.465 -18.745 -18.95 -19.148 -19.439 -19.645 -19.866 -19.982 -20.23 -20.494 -20.764 -20.9 -21.122 -21.301 -21.475 -21.65 -22.01 -22.24 -22.531 -22.815 -23.126 -23.512 -24.076 -26.472 -2 ,27877 ,KEBNE ,17023496,Wed Dec 22 08:12:51 CET,Wed Dec 22 09:40:49 CET,0.0 0.304 0.406 0.483 0.561 0.64 0.704 0.765 0.884 0.945 1.003 1.029 1.152 1.195 1.274 1.346 1.413 1.45 1.517 1.57 1.649 1.697 1.74 1.783 1.821 1.858 1.897 1.942 1.987 2.019 2.043 2.064 2.101 2.147 2.192 2.239 2.272 2.301 2.327 2.336 2.33 2.325 2.307 2.239 2.115 1.967 1.729 1.364 0.819 -0.072 -1.56 -3.354 -4.873 -6.117 -7.167 -8.142 -8.98 -9.71 -10.326 -10.941 -11.467 -11.907 -12.317 -12.722 -13.129 -13.519 -13.909 -14.253 -14.549 -14.848 -15.156 -15.398 -15.638 -15.901 -16.111 -16.348 -16.602 -16.836 -17.075 -17.245 -17.411 -17.653 -17.835 -18.023 -18.121 -18.353 -18.602 -18.85 -18.983 -19.223 -19.434 -19.608 -19.784 -20.202 -20.421 -20.638 -20.928 -21.284 -21.685 -22.217 -24.908 -3 ,8145 ,KEBNE ,17023497,Wed Dec 22 08:12:51 CET,Wed Dec 22 09:40:55 CET,0.0 0.275 0.388 0.469 0.551 0.615 0.669 0.726 0.82 0.851 0.88 0.887 0.992 1.02 1.087 1.152 1.203 1.224 1.262 1.293 1.339 1.372 1.406 1.448 1.476 1.507 1.549 1.586 1.63 1.664 1.689 1.71 1.732 1.758 1.768 1.763 1.755 1.746 1.733 1.727 1.71 1.689 1.638 1.541 1.415 1.24 0.997 0.621 0.024 -0.903 -2.493 -4.435 -6.1 -7.514 -8.666 -9.677 -10.548 -11.316 -11.996 -12.698 -13.267 -13.769 -14.273 -14.739 -15.154 -15.511 -15.865 -16.181 -16.46 -16.754 -17.058 -17.32 -17.586 -17.858 -18.089 -18.331 -18.558 -18.803 -19.081 -19.262 -19.434 -19.707 -19.913 -20.111 -20.211 -20.438 -20.68 -20.928 -21.058 -21.282 -21.444 -21.604 -21.757 -22.096 -22.318 -22.554 -22.83 -23.173 -23.568 -24.106 -27.373 -4 ,3568 ,KEBNE ,17023498,Wed Dec 22 08:12:50 CET,Wed Dec 22 09:40:27 CET,0.0 0.154 0.22 0.288 0.368 0.438 0.493 0.565 0.687 0.731 0.773 0.762 0.862 0.895 0.955 0.993 1.022 1.036 1.07 1.108 1.169 1.206 1.241 1.299 1.348 1.391 1.448 1.499 1.554 1.598 1.634 1.677 1.716 1.753 1.79 1.821 1.852 1.874 1.875 1.881 1.892 1.89 1.858 1.795 1.687 1.524 1.259 0.851 0.227 -0.732 -2.311 -4.241 -5.809 -7.141 -8.285 -9.282 -10.114 -10.837 -11.449 -12.085 -12.66 -13.139 -13.57 -13.974 -14.34 -14.687 -15.065 -15.4 -15.682 -15.958 -16.241 -16.489 -16.751 -17.02 -17.228 -17.429 -17.632 -17.856 -18.089 -18.254 -18.429 -18.701 -18.882 -19.069 -19.174 -19.383 -19.592 -19.805 -19.921 -20.152 -20.355 -20.525 -20.699 -21.046 -21.224 -21.424 -21.645 -21.943 -22.379 -22.912 -25.16 -5 ,8090 ,KEBNE ,17023499,Wed Dec 22 08:12:50 CET,Wed Dec 22 09:40:36 CET,0.0 0.246 0.393 0.499 0.576 0.65 0.699 0.74 0.821 0.857 0.898 0.907 1.009 1.035 1.091 1.15 1.209 1.233 1.279 1.321 1.378 1.413 1.443 1.476 1.511 1.539 1.554 1.573 1.596 1.612 1.644 1.704 1.748 1.775 1.795 1.808 1.824 1.829 1.829 1.822 1.806 1.802 1.769 1.698 1.579 1.399 1.133 0.717 0.089 -0.853 -2.509 -4.463 -6.03 -7.398 -8.53 -9.493 -10.329 -11.068 -11.709 -12.341 -12.867 -13.343 -13.813 -14.259 -14.689 -15.069 -15.441 -15.782 -16.08 -16.398 -16.739 -17.022 -17.31 -17.602 -17.831 -18.072 -18.328 -18.593 -18.844 -19.008 -19.184 -19.456 -19.645 -19.858 -19.968 -20.18 -20.4 -20.639 -20.773 -21.012 -21.184 -21.338 -21.517 -21.894 -22.105 -22.319 -22.574 -22.944 -23.356 -23.85 -26.846 -6 ,1133 ,KEBNE ,17023500,Wed Dec 22 08:12:51 CET,Wed Dec 22 09:40:40 CET,0.0 0.171 0.278 0.356 0.427 0.492 0.551 0.611 0.713 0.755 0.797 0.802 0.911 0.946 1.0 1.046 1.089 1.109 1.144 1.172 1.22 1.257 1.283 1.316 1.351 1.38 1.401 1.421 1.46 1.503 1.529 1.547 1.56 1.582 1.604 1.609 1.62 1.645 1.667 1.675 1.669 1.633 1.569 1.485 1.337 1.12 0.814 0.399 -0.2 -1.146 -2.849 -4.868 -6.445 -7.775 -8.918 -9.925 -10.787 -11.551 -12.178 -12.767 -13.273 -13.732 -14.187 -14.615 -15.006 -15.361 -15.722 -16.038 -16.316 -16.615 -16.918 -17.154 -17.396 -17.659 -17.861 -18.089 -18.335 -18.572 -18.814 -18.976 -19.128 -19.381 -19.586 -19.792 -19.893 -20.122 -20.361 -20.579 -20.7 -20.929 -21.117 -21.27 -21.425 -21.785 -22.004 -22.235 -22.495 -22.802 -23.145 -23.66 -27.623 -7 ,15394 ,KEBNE ,17023501,Wed Dec 22 08:12:51 CET,Wed Dec 22 09:40:22 CET,0.0 0.227 0.369 0.468 0.556 0.639 0.707 0.775 0.9 0.948 0.998 1.029 1.153 1.196 1.277 1.351 1.421 1.456 1.524 1.581 1.673 1.738 1.795 1.886 1.974 2.065 2.146 2.218 2.309 2.398 2.477 2.562 2.653 2.737 2.835 2.917 2.978 3.04 3.111 3.201 3.3 3.388 3.431 3.438 3.356 3.14 2.821 2.42 1.836 0.878 -0.696 -2.613 -4.232 -5.64 -6.812 -7.792 -8.621 -9.385 -10.034 -10.661 -11.204 -11.695 -12.188 -12.642 -13.033 -13.394 -13.775 -14.116 -14.405 -14.691 -14.983 -15.227 -15.479 -15.737 -15.939 -16.148 -16.362 -16.58 -16.806 -16.969 -17.139 -17.398 -17.576 -17.762 -17.859 -18.069 -18.309 -18.57 -18.69 -18.911 -19.115 -19.269 -19.445 -19.854 -20.08 -20.34 -20.636 -20.975 -21.385 -21.878 -24.03 -8 ,5461 ,KEBNE ,17023502,Wed Dec 22 08:12:51 CET,Wed Dec 22 09:40:34 CET,0.0 0.17 0.271 0.37 0.462 0.542 0.632 0.715 0.83 0.879 0.925 0.935 1.041 1.067 1.118 1.171 1.212 1.23 1.27 1.311 1.363 1.394 1.421 1.459 1.521 1.588 1.634 1.67 1.715 1.756 1.793 1.839 1.881 1.904 1.921 1.941 1.957 1.969 1.977 1.971 1.937 1.89 1.822 1.736 1.582 1.384 1.13 0.708 0.094 -0.824 -2.486 -4.491 -6.124 -7.494 -8.62 -9.579 -10.408 -11.14 -11.732 -12.344 -12.903 -13.394 -13.856 -14.28 -14.668 -15.033 -15.427 -15.742 -16.007 -16.304 -16.604 -16.869 -17.16 -17.441 -17.649 -17.88 -18.118 -18.341 -18.576 -18.752 -18.934 -19.233 -19.454 -19.66 -19.748 -19.941 -20.165 -20.408 -20.536 -20.753 -20.918 -21.071 -21.235 -21.6 -21.8 -22.03 -22.299 -22.634 -23.034 -23.507 -27.512 -9 ,5680 ,KEBNE ,17023503,Wed Dec 22 08:12:51 CET,Wed Dec 22 09:40:34 CET,0.0 0.118 0.203 0.272 0.353 0.425 0.476 0.529 0.616 0.653 0.689 0.675 0.778 0.806 0.851 0.893 0.939 0.962 1.005 1.043 1.09 1.121 1.152 1.213 1.286 1.363 1.431 1.493 1.583 1.643 1.671 1.707 1.735 1.753 1.767 1.765 1.762 1.749 1.727 1.702 1.669 1.609 1.499 1.366 1.201 1.006 0.731 0.319 -0.28 -1.227 -2.829 -4.723 -6.338 -7.702 -8.851 -9.864 -10.73 -11.484 -12.132 -12.802 -13.36 -13.843 -14.29 -14.685 -15.061 -15.408 -15.777 -16.109 -16.377 -16.669 -16.973 -17.21 -17.449 -17.691 -17.882 -18.081 -18.305 -18.533 -18.754 -18.906 -19.077 -19.374 -19.589 -19.809 -19.915 -20.145 -20.399 -20.648 -20.778 -21.02 -21.194 -21.329 -21.487 -21.857 -22.047 -22.253 -22.487 -22.778 -23.163 -23.708 -26.176 -10 ,7166 ,KEBNE ,17023504,Wed Dec 22 08:12:51 CET,Wed Dec 22 09:40:43 CET,0.0 0.309 0.387 0.468 0.537 0.598 0.644 0.677 0.755 0.801 0.838 0.824 0.937 0.974 1.018 1.064 1.123 1.148 1.183 1.215 1.261 1.289 1.316 1.361 1.41 1.449 1.478 1.512 1.558 1.588 1.608 1.629 1.654 1.678 1.694 1.709 1.703 1.693 1.692 1.669 1.618 1.559 1.508 1.437 1.32 1.134 0.861 0.476 -0.134 -1.071 -2.641 -4.57 -6.2 -7.557 -8.671 -9.632 -10.507 -11.303 -11.953 -12.592 -13.113 -13.597 -14.075 -14.497 -14.871 -15.207 -15.566 -15.898 -16.203 -16.51 -16.822 -17.082 -17.351 -17.63 -17.835 -18.042 -18.264 -18.504 -18.745 -18.909 -19.075 -19.345 -19.537 -19.741 -19.852 -20.071 -20.298 -20.547 -20.687 -20.928 -21.094 -21.24 -21.409 -21.74 -21.913 -22.147 -22.426 -22.709 -23.099 -23.757 -26.587 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_22_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_22_19.txt deleted file mode 100644 index 2cb29ef7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_22_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2090 ,TETRA ,17606429,Sun Nov 28 20:12:54 CET,Sun Nov 28 22:06:05 CET,0.0 0.283 0.44 0.6 0.735 0.855 0.973 1.066 1.22 1.29 1.364 1.416 1.564 1.631 1.743 1.82 1.898 1.936 2.0 2.068 2.182 2.253 2.323 2.438 2.555 2.66 2.75 2.84 2.947 3.051 3.167 3.306 3.432 3.546 3.672 3.762 3.811 3.86 3.89 3.927 3.966 3.98 3.956 3.884 3.778 3.626 3.381 3.019 2.479 1.608 0.122 -1.655 -3.132 -4.398 -5.448 -6.357 -7.17 -7.914 -8.51 -9.092 -9.632 -10.111 -10.552 -10.973 -11.352 -11.682 -12.033 -12.36 -12.644 -12.926 -13.223 -13.486 -13.734 -13.987 -14.202 -14.412 -14.626 -14.851 -15.088 -15.27 -15.454 -15.73 -15.931 -16.134 -16.24 -16.458 -16.702 -16.961 -17.093 -17.344 -17.524 -17.675 -17.835 -18.193 -18.401 -18.621 -18.836 -19.046 -19.306 -19.781 -21.152 -2 ,20538 ,TETRA ,17606430,Sun Nov 28 20:12:55 CET,Sun Nov 28 22:00:59 CET,0.0 0.513 0.638 0.738 0.84 0.95 1.044 1.12 1.249 1.308 1.361 1.358 1.482 1.516 1.584 1.648 1.702 1.727 1.774 1.811 1.869 1.907 1.938 1.997 2.062 2.115 2.156 2.192 2.236 2.27 2.297 2.326 2.358 2.388 2.412 2.444 2.462 2.486 2.519 2.526 2.53 2.52 2.492 2.445 2.333 2.157 1.868 1.476 0.944 0.062 -1.429 -3.155 -4.627 -5.87 -6.92 -7.829 -8.589 -9.3 -9.907 -10.49 -11.002 -11.453 -11.882 -12.307 -12.701 -13.053 -13.407 -13.724 -14.005 -14.302 -14.617 -14.863 -15.117 -15.382 -15.597 -15.821 -16.04 -16.283 -16.534 -16.696 -16.875 -17.152 -17.347 -17.549 -17.648 -17.849 -18.066 -18.298 -18.423 -18.663 -18.841 -19.01 -19.185 -19.563 -19.767 -19.987 -20.247 -20.557 -20.907 -21.283 -22.552 -3 ,20066 ,TETRA ,17606431,Sun Nov 28 20:13:59 CET,Sun Nov 28 22:09:21 CET,0.0 0.283 0.383 0.452 0.519 0.586 0.653 0.705 0.783 0.827 0.871 0.863 0.989 1.03 1.105 1.18 1.247 1.273 1.319 1.361 1.429 1.472 1.507 1.557 1.607 1.648 1.688 1.748 1.834 1.911 1.997 2.083 2.145 2.211 2.283 2.353 2.411 2.467 2.52 2.573 2.631 2.666 2.65 2.595 2.506 2.363 2.154 1.851 1.331 0.477 -1.004 -2.816 -4.324 -5.595 -6.675 -7.604 -8.381 -9.1 -9.727 -10.35 -10.875 -11.338 -11.771 -12.164 -12.522 -12.869 -13.249 -13.566 -13.83 -14.118 -14.431 -14.673 -14.925 -15.19 -15.389 -15.609 -15.845 -16.084 -16.34 -16.524 -16.695 -16.962 -17.154 -17.346 -17.45 -17.674 -17.917 -18.192 -18.339 -18.584 -18.758 -18.914 -19.079 -19.433 -19.617 -19.835 -20.092 -20.375 -20.715 -21.189 -22.873 -4 ,12529 ,TETRA ,17606432,Sun Nov 28 20:14:01 CET,Sun Nov 28 22:06:43 CET,0.0 0.304 0.421 0.538 0.648 0.74 0.814 0.877 1.007 1.069 1.122 1.129 1.259 1.295 1.352 1.414 1.484 1.522 1.603 1.685 1.786 1.848 1.912 1.999 2.082 2.156 2.223 2.286 2.369 2.444 2.513 2.602 2.666 2.73 2.805 2.89 2.974 3.042 3.094 3.13 3.148 3.17 3.189 3.175 3.114 2.989 2.79 2.459 1.921 1.056 -0.384 -2.092 -3.469 -4.653 -5.663 -6.551 -7.312 -7.988 -8.611 -9.24 -9.755 -10.2 -10.639 -11.045 -11.405 -11.74 -12.092 -12.397 -12.675 -12.974 -13.281 -13.533 -13.781 -14.047 -14.26 -14.465 -14.678 -14.92 -15.179 -15.352 -15.526 -15.791 -15.976 -16.169 -16.271 -16.483 -16.702 -16.954 -17.085 -17.329 -17.511 -17.671 -17.848 -18.237 -18.438 -18.674 -18.943 -19.224 -19.559 -20.009 -21.627 -5 ,1739 ,TETRA ,17606433,Sun Nov 28 20:14:57 CET,Sun Nov 28 22:07:08 CET,0.0 0.497 0.798 0.989 1.121 1.251 1.366 1.456 1.604 1.667 1.734 1.775 1.917 1.971 2.072 2.158 2.245 2.289 2.362 2.438 2.539 2.595 2.646 2.725 2.805 2.874 2.951 3.024 3.105 3.178 3.246 3.33 3.402 3.464 3.539 3.628 3.695 3.748 3.809 3.87 3.916 3.956 3.996 4.01 3.967 3.886 3.735 3.49 3.049 2.303 0.922 -0.949 -2.437 -3.63 -4.622 -5.504 -6.29 -7.029 -7.668 -8.282 -8.813 -9.278 -9.729 -10.173 -10.576 -10.924 -11.285 -11.608 -11.892 -12.173 -12.432 -12.66 -12.94 -13.235 -13.451 -13.677 -13.906 -14.137 -14.37 -14.538 -14.719 -14.999 -15.2 -15.407 -15.51 -15.713 -15.931 -16.17 -16.3 -16.54 -16.669 -16.828 -17.019 -17.386 -17.583 -17.79 -18.045 -18.351 -18.698 -19.205 -21.026 -6 ,31251 ,TETRA ,17606434,Sun Nov 28 20:14:58 CET,Sun Nov 28 22:09:03 CET,0.0 0.222 0.326 0.43 0.524 0.607 0.672 0.714 0.813 0.868 0.92 0.922 1.051 1.087 1.163 1.233 1.287 1.317 1.39 1.458 1.546 1.587 1.627 1.697 1.762 1.818 1.87 1.929 2.001 2.062 2.128 2.213 2.279 2.334 2.391 2.435 2.479 2.519 2.56 2.592 2.609 2.633 2.631 2.595 2.528 2.413 2.212 1.932 1.476 0.725 -0.593 -2.251 -3.636 -4.842 -5.85 -6.797 -7.641 -8.364 -8.995 -9.629 -10.172 -10.651 -11.113 -11.536 -11.913 -12.256 -12.616 -12.955 -13.244 -13.533 -13.834 -14.098 -14.394 -14.683 -14.891 -15.116 -15.341 -15.583 -15.848 -16.024 -16.2 -16.494 -16.695 -16.886 -16.995 -17.23 -17.482 -17.742 -17.885 -18.148 -18.307 -18.458 -18.633 -19.022 -19.23 -19.444 -19.695 -19.965 -20.262 -20.675 -22.065 -7 ,15364 ,TETRA ,17606435,Sun Nov 28 20:14:59 CET,Sun Nov 28 22:11:11 CET,0.0 0.293 0.403 0.481 0.564 0.635 0.697 0.752 0.839 0.882 0.925 0.906 1.024 1.057 1.126 1.188 1.245 1.274 1.321 1.363 1.423 1.461 1.505 1.557 1.602 1.659 1.71 1.747 1.79 1.838 1.874 1.901 1.935 1.971 2.006 2.046 2.075 2.086 2.086 2.074 2.054 2.026 1.969 1.876 1.75 1.605 1.398 1.044 0.522 -0.303 -1.812 -3.574 -5.008 -6.232 -7.281 -8.221 -9.033 -9.759 -10.401 -11.041 -11.583 -12.058 -12.515 -12.946 -13.345 -13.715 -14.107 -14.458 -14.757 -15.061 -15.372 -15.635 -15.902 -16.194 -16.433 -16.677 -16.922 -17.157 -17.41 -17.6 -17.789 -18.096 -18.323 -18.551 -18.661 -18.895 -19.146 -19.394 -19.521 -19.765 -19.937 -20.087 -20.245 -20.589 -20.804 -21.052 -21.304 -21.621 -21.99 -22.428 -24.119 -8 ,922 ,TETRA ,17606436,Sun Nov 28 20:14:59 CET,Sun Nov 28 22:07:39 CET,0.0 0.421 0.61 0.76 0.894 1.006 1.099 1.196 1.364 1.435 1.516 1.589 1.75 1.821 1.931 2.021 2.11 2.153 2.244 2.339 2.475 2.559 2.634 2.753 2.864 2.954 3.039 3.126 3.253 3.375 3.488 3.627 3.755 3.862 3.988 4.14 4.284 4.438 4.589 4.748 4.887 4.966 4.971 4.926 4.847 4.723 4.494 4.144 3.674 2.908 1.433 -0.337 -1.739 -2.925 -3.95 -4.833 -5.63 -6.352 -6.954 -7.554 -8.074 -8.553 -8.996 -9.404 -9.785 -10.134 -10.492 -10.814 -11.1 -11.389 -11.684 -11.929 -12.185 -12.452 -12.654 -12.867 -13.097 -13.337 -13.575 -13.738 -13.911 -14.185 -14.383 -14.573 -14.674 -14.903 -15.135 -15.369 -15.489 -15.732 -15.922 -16.076 -16.244 -16.632 -16.829 -17.055 -17.305 -17.592 -17.979 -18.464 -20.31 -9 ,4083 ,TETRA ,17606437,Sun Nov 28 20:14:59 CET,Sun Nov 28 22:06:30 CET,0.0 0.463 0.559 0.644 0.74 0.83 0.902 0.966 1.112 1.171 1.212 1.205 1.328 1.359 1.429 1.489 1.546 1.575 1.626 1.676 1.759 1.814 1.866 1.941 2.001 2.047 2.101 2.161 2.232 2.29 2.339 2.393 2.434 2.471 2.521 2.573 2.602 2.616 2.638 2.667 2.686 2.692 2.678 2.669 2.647 2.56 2.371 2.064 1.576 0.772 -0.687 -2.463 -3.943 -5.201 -6.24 -7.172 -7.995 -8.72 -9.319 -9.894 -10.399 -10.856 -11.29 -11.703 -12.092 -12.45 -12.818 -13.146 -13.425 -13.706 -14.01 -14.27 -14.537 -14.811 -15.02 -15.228 -15.445 -15.683 -15.937 -16.108 -16.293 -16.584 -16.772 -16.976 -17.087 -17.322 -17.565 -17.798 -17.927 -18.173 -18.35 -18.505 -18.665 -19.04 -19.241 -19.447 -19.688 -19.98 -20.313 -20.741 -22.273 -10 ,12523 ,TETRA ,17606438,Sun Nov 28 20:16:02 CET,Sun Nov 28 22:07:04 CET,0.0 0.221 0.345 0.451 0.523 0.573 0.627 0.68 0.776 0.823 0.871 0.885 1.017 1.056 1.136 1.202 1.266 1.293 1.35 1.418 1.516 1.575 1.629 1.708 1.78 1.849 1.913 1.961 2.012 2.072 2.153 2.256 2.345 2.416 2.476 2.548 2.612 2.68 2.747 2.788 2.827 2.87 2.891 2.881 2.822 2.69 2.47 2.142 1.647 0.82 -0.594 -2.33 -3.765 -5.022 -6.091 -7.003 -7.79 -8.486 -9.083 -9.655 -10.152 -10.617 -11.039 -11.438 -11.83 -12.171 -12.532 -12.869 -13.148 -13.425 -13.717 -13.963 -14.216 -14.484 -14.692 -14.892 -15.104 -15.352 -15.616 -15.784 -15.943 -16.22 -16.424 -16.637 -16.744 -16.954 -17.193 -17.463 -17.608 -17.857 -18.014 -18.168 -18.34 -18.706 -18.911 -19.125 -19.382 -19.676 -20.002 -20.436 -22.45 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_22_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_22_21.txt deleted file mode 100644 index 54a3331c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_22_21.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19313 ,KEBNE ,16836491,Sun Dec 5 16:29:54 CET,Sun Dec 5 17:56:13 CET,0.0 0.697 0.961 1.151 1.315 1.479 1.612 1.731 1.946 2.028 2.115 2.206 2.338 2.404 2.543 2.671 2.79 2.841 2.926 3.018 3.139 3.206 3.274 3.379 3.47 3.555 3.64 3.72 3.822 3.92 4.007 4.107 4.204 4.293 4.398 4.522 4.645 4.775 4.896 5.008 5.123 5.234 5.342 5.457 5.556 5.614 5.636 5.585 5.435 5.137 4.528 3.588 2.756 2.018 1.387 0.844 0.371 -0.053 -0.436 -0.823 -1.15 -1.441 -1.73 -2.014 -2.278 -2.524 -2.775 -2.984 -3.163 -3.352 -3.557 -3.727 -3.898 -4.071 -4.213 -4.368 -4.523 -4.684 -4.853 -4.977 -5.101 -5.277 -5.404 -5.548 -5.626 -5.795 -5.964 -6.154 -6.254 -6.413 -6.523 -6.625 -6.737 -6.982 -7.12 -7.283 -7.447 -7.637 -7.894 -8.209 -9.292 -2 ,21393 ,KEBNE ,16836492,Sun Dec 5 16:29:54 CET,Sun Dec 5 17:53:08 CET,0.0 1.01 1.338 1.566 1.756 1.898 2.025 2.137 2.335 2.426 2.501 2.559 2.687 2.75 2.872 2.976 3.065 3.107 3.202 3.293 3.405 3.478 3.556 3.67 3.771 3.867 3.959 4.048 4.143 4.222 4.307 4.399 4.482 4.566 4.67 4.794 4.907 5.019 5.139 5.269 5.401 5.522 5.661 5.793 5.901 5.978 6.09 6.181 6.12 5.896 5.298 4.395 3.59 2.844 2.178 1.586 1.064 0.573 0.15 -0.278 -0.667 -1.01 -1.326 -1.616 -1.879 -2.114 -2.365 -2.601 -2.802 -3.013 -3.245 -3.434 -3.625 -3.833 -3.994 -4.146 -4.304 -4.465 -4.611 -4.708 -4.822 -5.015 -5.163 -5.318 -5.397 -5.557 -5.713 -5.881 -5.973 -6.147 -6.275 -6.381 -6.506 -6.777 -6.924 -7.089 -7.275 -7.462 -7.682 -8.012 -9.042 -3 ,24404 ,KEBNE ,16836493,Sun Dec 5 16:29:50 CET,Sun Dec 5 17:54:07 CET,0.0 0.898 1.159 1.354 1.498 1.619 1.736 1.846 2.045 2.125 2.203 2.281 2.411 2.467 2.591 2.714 2.827 2.879 2.968 3.057 3.174 3.243 3.319 3.432 3.525 3.611 3.702 3.79 3.894 3.988 4.08 4.204 4.328 4.427 4.54 4.677 4.81 4.96 5.105 5.24 5.361 5.477 5.621 5.728 5.807 5.885 5.911 5.892 5.791 5.522 4.882 3.924 3.088 2.329 1.681 1.099 0.537 0.035 -0.402 -0.836 -1.2 -1.537 -1.846 -2.129 -2.391 -2.63 -2.873 -3.092 -3.292 -3.49 -3.698 -3.877 -4.055 -4.234 -4.374 -4.527 -4.687 -4.856 -5.029 -5.141 -5.263 -5.464 -5.607 -5.752 -5.824 -5.978 -6.134 -6.294 -6.377 -6.546 -6.678 -6.784 -6.894 -7.138 -7.277 -7.422 -7.582 -7.77 -7.997 -8.286 -9.328 -4 ,8330 ,KEBNE ,16836494,Sun Dec 5 16:29:50 CET,Sun Dec 5 17:55:16 CET,0.0 0.875 1.139 1.333 1.465 1.589 1.695 1.801 2.002 2.082 2.151 2.211 2.339 2.401 2.533 2.658 2.756 2.809 2.911 3.0 3.119 3.181 3.243 3.34 3.435 3.531 3.613 3.688 3.804 3.915 4.011 4.124 4.224 4.305 4.407 4.523 4.628 4.73 4.842 4.973 5.099 5.224 5.356 5.473 5.59 5.67 5.711 5.709 5.605 5.336 4.688 3.728 2.916 2.192 1.564 0.991 0.487 0.022 -0.402 -0.834 -1.202 -1.51 -1.816 -2.106 -2.372 -2.61 -2.853 -3.082 -3.28 -3.486 -3.697 -3.861 -4.024 -4.198 -4.35 -4.508 -4.669 -4.846 -5.021 -5.138 -5.261 -5.46 -5.601 -5.744 -5.813 -5.966 -6.135 -6.304 -6.391 -6.559 -6.703 -6.81 -6.919 -7.178 -7.318 -7.483 -7.659 -7.831 -8.044 -8.347 -9.295 -5 ,16988 ,KEBNE ,16836495,Sun Dec 5 16:29:46 CET,Sun Dec 5 17:54:54 CET,0.0 0.861 1.138 1.339 1.502 1.652 1.765 1.878 2.112 2.205 2.273 2.336 2.478 2.557 2.696 2.829 2.946 3.0 3.106 3.205 3.343 3.431 3.521 3.651 3.755 3.843 3.929 4.015 4.115 4.21 4.31 4.426 4.543 4.661 4.78 4.894 5.004 5.129 5.254 5.38 5.51 5.645 5.779 5.88 5.981 6.054 6.064 6.027 5.903 5.584 4.946 4.055 3.299 2.666 2.038 1.461 0.984 0.511 0.098 -0.272 -0.6 -0.911 -1.216 -1.501 -1.768 -2.021 -2.293 -2.532 -2.723 -2.912 -3.13 -3.315 -3.492 -3.676 -3.827 -3.98 -4.134 -4.299 -4.482 -4.61 -4.741 -4.941 -5.078 -5.213 -5.283 -5.438 -5.601 -5.771 -5.857 -6.019 -6.139 -6.239 -6.357 -6.613 -6.752 -6.921 -7.114 -7.3 -7.519 -7.809 -8.957 -6 ,17702 ,KEBNE ,16836496,Sun Dec 5 16:29:42 CET,Sun Dec 5 17:58:30 CET,0.0 0.921 1.201 1.409 1.564 1.684 1.785 1.872 2.053 2.145 2.222 2.287 2.419 2.486 2.632 2.778 2.897 2.956 3.071 3.183 3.339 3.431 3.514 3.622 3.729 3.832 3.924 4.014 4.126 4.226 4.33 4.456 4.568 4.671 4.789 4.915 5.028 5.144 5.264 5.39 5.513 5.645 5.787 5.904 6.019 6.132 6.245 6.269 6.155 5.91 5.315 4.413 3.643 2.96 2.338 1.773 1.28 0.848 0.466 0.083 -0.258 -0.562 -0.849 -1.123 -1.382 -1.616 -1.855 -2.082 -2.283 -2.49 -2.712 -2.892 -3.077 -3.275 -3.419 -3.566 -3.722 -3.889 -4.071 -4.198 -4.34 -4.563 -4.706 -4.853 -4.923 -5.062 -5.228 -5.412 -5.503 -5.67 -5.818 -5.938 -6.063 -6.304 -6.426 -6.57 -6.742 -6.929 -7.143 -7.421 -8.354 -7 ,8547 ,KEBNE ,16836497,Sun Dec 5 16:29:42 CET,Sun Dec 5 17:58:33 CET,0.0 0.862 1.147 1.322 1.486 1.617 1.712 1.799 1.965 2.034 2.103 2.19 2.328 2.391 2.511 2.625 2.719 2.767 2.863 2.954 3.092 3.174 3.245 3.343 3.428 3.514 3.603 3.677 3.775 3.877 3.975 4.093 4.215 4.328 4.45 4.577 4.7 4.839 4.959 5.081 5.21 5.331 5.444 5.552 5.673 5.763 5.833 5.888 5.859 5.701 5.235 4.438 3.635 2.872 2.248 1.71 1.213 0.75 0.332 -0.094 -0.457 -0.772 -1.081 -1.376 -1.649 -1.904 -2.167 -2.385 -2.574 -2.788 -3.004 -3.179 -3.361 -3.55 -3.69 -3.83 -3.982 -4.137 -4.299 -4.418 -4.548 -4.748 -4.883 -5.032 -5.107 -5.267 -5.435 -5.606 -5.694 -5.859 -5.983 -6.086 -6.196 -6.445 -6.584 -6.733 -6.914 -7.121 -7.343 -7.66 -8.807 -9 ,10151 ,KEBNE ,16836499,Sun Dec 5 16:29:42 CET,Sun Dec 5 17:58:35 CET,0.0 1.118 1.398 1.576 1.729 1.859 1.965 2.058 2.234 2.322 2.402 2.468 2.593 2.654 2.777 2.897 2.992 3.033 3.127 3.213 3.324 3.391 3.458 3.554 3.658 3.753 3.825 3.902 4.008 4.11 4.201 4.31 4.431 4.547 4.68 4.806 4.921 5.085 5.273 5.434 5.562 5.696 5.822 5.916 6.004 6.086 6.156 6.207 6.156 5.902 5.303 4.43 3.686 3.023 2.407 1.811 1.279 0.842 0.466 0.056 -0.268 -0.545 -0.826 -1.11 -1.385 -1.628 -1.874 -2.094 -2.288 -2.488 -2.702 -2.88 -3.061 -3.251 -3.396 -3.55 -3.713 -3.883 -4.049 -4.162 -4.286 -4.472 -4.604 -4.742 -4.81 -4.954 -5.106 -5.291 -5.406 -5.595 -5.768 -5.903 -6.041 -6.32 -6.498 -6.727 -6.96 -7.2 -7.516 -7.864 -8.93 -10 ,22569 ,KEBNE ,16836500,Sun Dec 5 16:29:42 CET,Sun Dec 5 17:59:57 CET,0.0 0.886 1.124 1.275 1.401 1.523 1.634 1.737 1.906 1.983 2.062 2.145 2.272 2.329 2.437 2.539 2.629 2.675 2.77 2.874 3.023 3.109 3.192 3.315 3.44 3.544 3.643 3.744 3.872 3.992 4.107 4.234 4.354 4.475 4.604 4.734 4.85 4.978 5.108 5.243 5.378 5.504 5.614 5.713 5.813 5.887 5.908 5.858 5.759 5.482 4.823 3.979 3.188 2.455 1.834 1.248 0.736 0.285 -0.095 -0.469 -0.813 -1.124 -1.412 -1.708 -1.984 -2.229 -2.482 -2.689 -2.882 -3.096 -3.315 -3.498 -3.677 -3.854 -3.999 -4.15 -4.308 -4.482 -4.664 -4.785 -4.903 -5.094 -5.242 -5.4 -5.48 -5.655 -5.822 -5.987 -6.082 -6.255 -6.397 -6.504 -6.619 -6.873 -7.011 -7.156 -7.321 -7.524 -7.761 -8.048 -8.988 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_23_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_23_21.txt deleted file mode 100644 index dbc6dee1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_23_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9674 ,KEBNE ,17042250,Thu Dec 23 04:08:25 CET,Thu Dec 23 05:37:04 CET,0.0 0.406 0.579 0.756 0.905 1.04 1.172 1.299 1.513 1.613 1.711 1.791 2.001 2.094 2.273 2.449 2.616 2.696 2.854 3.009 3.237 3.386 3.535 3.751 3.962 4.172 4.377 4.578 4.859 5.135 5.41 5.753 6.068 6.378 6.756 7.179 7.581 8.02 8.514 9.1 9.758 10.47 11.284 12.14 13.16 14.338 15.754 17.404 19.431 21.968 25.176 28.053 29.934 31.273 32.24 32.972 33.532 33.978 34.314 34.606 34.815 34.973 35.108 35.206 35.292 35.368 35.432 35.485 35.517 35.538 35.545 35.548 35.546 35.543 35.545 35.54 35.528 35.501 35.466 35.443 35.422 35.394 35.369 35.328 35.303 35.245 35.169 35.094 35.05 34.936 34.937 34.899 34.863 34.78 34.73 34.672 34.602 34.522 34.437 34.332 34.074 -2 ,14190 ,KEBNE ,17042251,Thu Dec 23 04:08:24 CET,Thu Dec 23 05:37:38 CET,0.0 0.488 0.702 0.881 1.033 1.172 1.299 1.423 1.652 1.759 1.871 1.971 2.178 2.271 2.442 2.603 2.766 2.848 3.007 3.162 3.391 3.543 3.701 3.934 4.147 4.356 4.565 4.772 5.042 5.305 5.562 5.877 6.183 6.484 6.853 7.291 7.717 8.186 8.716 9.282 9.866 10.553 11.409 12.286 13.299 14.446 15.847 17.521 19.566 22.079 25.355 28.326 30.212 31.53 32.479 33.222 33.794 34.232 34.548 34.814 34.994 35.129 35.249 35.35 35.421 35.47 35.519 35.558 35.582 35.609 35.642 35.665 35.67 35.667 35.673 35.671 35.664 35.655 35.637 35.621 35.6 35.573 35.553 35.522 35.506 35.466 35.415 35.37 35.349 35.25 35.251 35.207 35.167 35.082 35.03 34.969 34.898 34.813 34.725 34.615 34.294 -3 ,15558 ,KEBNE ,17042252,Thu Dec 23 04:08:24 CET,Thu Dec 23 05:37:08 CET,0.0 0.331 0.53 0.73 0.871 0.998 1.129 1.251 1.483 1.584 1.681 1.781 1.994 2.089 2.281 2.464 2.639 2.722 2.888 3.062 3.308 3.467 3.631 3.874 4.107 4.333 4.567 4.798 5.091 5.384 5.663 5.984 6.309 6.642 7.024 7.442 7.862 8.332 8.841 9.415 10.029 10.726 11.56 12.428 13.436 14.563 15.945 17.578 19.614 22.173 25.456 28.435 30.328 31.631 32.552 33.251 33.765 34.17 34.482 34.764 34.977 35.155 35.31 35.427 35.524 35.599 35.676 35.748 35.799 35.831 35.851 35.868 35.879 35.876 35.873 35.87 35.871 35.862 35.84 35.829 35.818 35.797 35.78 35.755 35.743 35.718 35.684 35.642 35.623 35.533 35.552 35.527 35.495 35.407 35.354 35.302 35.251 35.172 35.057 34.92 34.398 -4 ,24234 ,KEBNE ,17042254,Thu Dec 23 04:10:30 CET,Thu Dec 23 05:39:18 CET,0.0 0.536 0.849 1.09 1.275 1.436 1.588 1.743 2.045 2.171 2.28 2.396 2.617 2.733 2.966 3.185 3.394 3.491 3.683 3.869 4.126 4.294 4.465 4.71 4.953 5.193 5.42 5.642 5.932 6.209 6.47 6.793 7.123 7.452 7.82 8.254 8.687 9.164 9.696 10.265 10.87 11.577 12.421 13.267 14.266 15.427 16.815 18.525 20.622 23.117 26.398 29.398 31.284 32.558 33.48 34.188 34.723 35.145 35.468 35.728 35.918 36.08 36.226 36.354 36.451 36.515 36.576 36.63 36.672 36.713 36.749 36.769 36.78 36.79 36.794 36.799 36.802 36.787 36.769 36.757 36.736 36.716 36.712 36.698 36.685 36.65 36.602 36.556 36.53 36.43 36.439 36.404 36.363 36.286 36.244 36.194 36.124 36.043 35.953 35.796 35.506 -5 ,13701 ,KEBNE ,17042255,Thu Dec 23 04:10:29 CET,Thu Dec 23 05:39:15 CET,0.0 0.361 0.578 0.741 0.881 1.013 1.137 1.255 1.481 1.59 1.694 1.798 2.003 2.098 2.299 2.486 2.662 2.746 2.919 3.09 3.333 3.489 3.651 3.894 4.121 4.335 4.545 4.755 5.037 5.324 5.612 5.956 6.264 6.558 6.908 7.326 7.732 8.167 8.646 9.174 9.743 10.399 11.203 12.045 13.058 14.234 15.668 17.308 19.255 21.742 25.06 28.059 29.988 31.354 32.32 33.02 33.57 34.032 34.371 34.65 34.853 35.012 35.149 35.261 35.338 35.398 35.455 35.493 35.519 35.539 35.551 35.552 35.555 35.561 35.551 35.534 35.506 35.472 35.437 35.408 35.385 35.347 35.312 35.267 35.24 35.195 35.146 35.067 35.026 34.913 34.884 34.82 34.747 34.609 34.54 34.48 34.408 34.329 34.238 34.111 33.889 -6 ,22161 ,KEBNE ,17042256,Thu Dec 23 04:10:29 CET,Thu Dec 23 05:39:31 CET,0.0 0.364 0.528 0.676 0.823 0.965 1.091 1.211 1.43 1.533 1.637 1.726 1.927 2.017 2.196 2.378 2.557 2.642 2.804 2.981 3.252 3.418 3.577 3.814 4.06 4.301 4.532 4.754 5.036 5.307 5.564 5.874 6.192 6.511 6.878 7.299 7.713 8.189 8.702 9.246 9.845 10.561 11.439 12.331 13.363 14.517 15.937 17.618 19.689 22.311 25.638 28.549 30.413 31.71 32.62 33.286 33.788 34.212 34.541 34.838 35.069 35.237 35.381 35.513 35.635 35.735 35.814 35.875 35.919 35.955 35.991 36.011 36.016 36.015 36.016 36.011 36.001 36.003 36.003 36.004 35.997 35.969 35.951 35.924 35.907 35.87 35.825 35.773 35.745 35.653 35.672 35.638 35.608 35.522 35.466 35.413 35.358 35.288 35.201 35.1 34.728 -7 ,31891 ,KEBNE ,17042257,Thu Dec 23 04:10:29 CET,Thu Dec 23 05:39:17 CET,0.0 0.425 0.651 0.842 1.004 1.14 1.259 1.375 1.602 1.712 1.823 1.917 2.131 2.229 2.415 2.602 2.781 2.867 3.036 3.2 3.43 3.578 3.726 3.952 4.171 4.375 4.584 4.786 5.048 5.309 5.569 5.897 6.234 6.557 6.922 7.328 7.721 8.172 8.69 9.263 9.86 10.532 11.337 12.158 13.125 14.281 15.703 17.34 19.349 21.874 25.161 28.078 29.988 31.385 32.394 33.141 33.691 34.124 34.461 34.758 34.976 35.15 35.318 35.454 35.558 35.651 35.736 35.801 35.856 35.903 35.934 35.957 35.983 35.999 35.998 35.994 35.987 35.967 35.944 35.927 35.903 35.87 35.847 35.814 35.796 35.757 35.718 35.675 35.656 35.559 35.547 35.505 35.467 35.38 35.334 35.286 35.209 35.126 35.019 34.897 34.683 -8 ,17360 ,KEBNE ,17042258,Thu Dec 23 04:10:30 CET,Thu Dec 23 05:39:34 CET,0.0 0.415 0.61 0.777 0.945 1.101 1.225 1.34 1.557 1.654 1.751 1.835 2.043 2.141 2.334 2.518 2.696 2.776 2.935 3.108 3.366 3.529 3.684 3.913 4.146 4.373 4.593 4.809 5.095 5.378 5.659 5.998 6.32 6.653 7.058 7.494 7.893 8.348 8.866 9.424 10.024 10.712 11.546 12.402 13.396 14.561 15.969 17.63 19.694 22.245 25.517 28.569 30.525 31.831 32.739 33.439 33.978 34.401 34.728 34.999 35.193 35.352 35.481 35.585 35.671 35.748 35.814 35.84 35.864 35.895 35.916 35.918 35.914 35.907 35.895 35.888 35.873 35.848 35.827 35.806 35.78 35.753 35.738 35.729 35.722 35.693 35.651 35.61 35.588 35.486 35.497 35.468 35.432 35.335 35.285 35.229 35.165 35.094 34.991 34.783 34.279 -9 ,31845 ,KEBNE ,17042259,Thu Dec 23 04:10:30 CET,Thu Dec 23 05:39:31 CET,0.0 0.483 0.661 0.834 0.987 1.125 1.268 1.41 1.68 1.801 1.905 1.991 2.201 2.297 2.48 2.646 2.809 2.888 3.06 3.23 3.453 3.6 3.753 3.985 4.205 4.415 4.619 4.818 5.083 5.354 5.612 5.923 6.248 6.57 6.935 7.343 7.734 8.18 8.664 9.191 9.767 10.417 11.207 12.038 13.046 14.19 15.531 17.125 19.156 21.719 24.989 27.969 29.89 31.219 32.187 32.931 33.507 33.981 34.331 34.626 34.851 35.029 35.176 35.284 35.371 35.438 35.499 35.541 35.561 35.581 35.594 35.598 35.607 35.6 35.584 35.561 35.528 35.506 35.49 35.476 35.461 35.435 35.413 35.386 35.368 35.337 35.305 35.261 35.238 35.142 35.157 35.114 35.068 34.973 34.918 34.848 34.763 34.667 34.577 34.429 34.217 -10 ,5785 ,KEBNE ,17042260,Thu Dec 23 04:10:30 CET,Thu Dec 23 05:39:26 CET,0.0 0.482 0.692 0.848 1.0 1.153 1.291 1.418 1.661 1.772 1.876 1.96 2.164 2.255 2.442 2.621 2.794 2.883 3.051 3.206 3.428 3.569 3.716 3.95 4.165 4.375 4.584 4.786 5.057 5.321 5.574 5.883 6.194 6.512 6.878 7.296 7.701 8.155 8.644 9.168 9.761 10.443 11.23 12.044 13.047 14.214 15.624 17.284 19.287 21.756 24.991 27.94 29.801 31.126 32.106 32.859 33.404 33.825 34.151 34.431 34.639 34.805 34.935 35.033 35.114 35.186 35.245 35.283 35.309 35.326 35.352 35.365 35.371 35.38 35.376 35.367 35.359 35.351 35.332 35.318 35.307 35.294 35.289 35.282 35.276 35.248 35.209 35.17 35.152 35.058 35.074 35.037 35.004 34.917 34.857 34.803 34.742 34.675 34.596 34.4 34.07 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_23_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_23_22.txt deleted file mode 100644 index d0c992e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_23_22.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25436 ,KEBNE ,16653971,Mon Nov 22 05:05:24 CET,Mon Nov 22 06:23:51 CET,0.0 1.22 1.559 1.794 1.998 2.182 2.348 2.51 2.807 2.947 3.081 3.235 3.478 3.608 3.857 4.088 4.31 4.421 4.64 4.851 5.155 5.352 5.549 5.837 6.103 6.365 6.632 6.888 7.222 7.547 7.857 8.254 8.647 9.035 9.496 10.024 10.544 11.117 11.736 12.413 13.137 13.954 14.942 16.001 17.289 18.751 20.475 22.52 25.001 28.0 31.996 35.716 38.144 39.892 41.172 42.147 42.894 43.493 43.93 44.312 44.621 44.865 45.057 45.227 45.379 45.491 45.595 45.682 45.745 45.808 45.865 45.9 45.933 45.948 45.955 45.962 45.953 45.944 45.934 45.925 45.92 45.893 45.858 45.815 45.791 45.738 45.668 45.594 45.558 45.465 45.47 45.434 45.386 45.237 45.152 45.067 44.966 44.847 44.687 44.505 43.625 -3 ,29174 ,KEBNE ,16653973,Mon Nov 22 05:05:20 CET,Mon Nov 22 06:29:38 CET,0.0 1.12 1.432 1.695 1.924 2.129 2.313 2.492 2.831 2.976 3.113 3.279 3.526 3.649 3.885 4.128 4.354 4.464 4.681 4.89 5.193 5.388 5.573 5.845 6.116 6.376 6.63 6.89 7.217 7.534 7.854 8.244 8.621 8.994 9.44 9.939 10.429 10.987 11.6 12.265 12.983 13.84 14.879 15.944 17.215 18.641 20.308 22.269 24.697 27.761 31.788 35.455 37.835 39.49 40.727 41.726 42.503 43.13 43.595 43.982 44.282 44.522 44.727 44.915 45.071 45.202 45.327 45.419 45.489 45.553 45.603 45.63 45.663 45.703 45.722 45.731 45.743 45.746 45.737 45.734 45.713 45.664 45.641 45.621 45.61 45.579 45.539 45.49 45.461 45.361 45.358 45.315 45.261 45.148 45.078 44.984 44.882 44.772 44.612 44.392 43.878 -4 ,11306 ,KEBNE ,16653974,Mon Nov 22 05:05:20 CET,Mon Nov 22 06:29:40 CET,0.0 1.063 1.38 1.63 1.858 2.069 2.28 2.465 2.765 2.904 3.039 3.189 3.417 3.536 3.77 4.009 4.239 4.35 4.562 4.768 5.074 5.271 5.46 5.739 6.008 6.273 6.54 6.806 7.15 7.473 7.792 8.186 8.57 8.968 9.439 9.943 10.447 11.022 11.643 12.324 13.066 13.907 14.892 15.918 17.164 18.6 20.31 22.285 24.72 27.834 31.901 35.643 38.125 39.856 41.106 42.07 42.788 43.366 43.774 44.088 44.347 44.57 44.746 44.897 45.035 45.147 45.25 45.321 45.383 45.443 45.503 45.548 45.574 45.585 45.567 45.552 45.549 45.53 45.507 45.498 45.492 45.477 45.465 45.444 45.428 45.38 45.311 45.234 45.198 45.097 45.067 45.015 44.96 44.838 44.759 44.681 44.601 44.511 44.396 44.184 43.159 -5 ,9987 ,KEBNE ,16653975,Mon Nov 22 05:06:22 CET,Mon Nov 22 06:30:40 CET,0.0 1.232 1.566 1.829 2.066 2.262 2.439 2.6 2.897 3.042 3.187 3.36 3.603 3.736 3.986 4.236 4.479 4.591 4.818 5.037 5.337 5.534 5.734 6.019 6.298 6.575 6.849 7.121 7.468 7.792 8.11 8.508 8.907 9.297 9.749 10.262 10.786 11.368 11.995 12.687 13.442 14.305 15.293 16.301 17.549 18.99 20.646 22.6 25.01 28.044 32.124 35.892 38.35 40.124 41.415 42.395 43.137 43.751 44.222 44.617 44.922 45.174 45.385 45.566 45.723 45.827 45.919 46.017 46.095 46.152 46.195 46.228 46.261 46.289 46.306 46.32 46.328 46.319 46.311 46.313 46.301 46.266 46.247 46.229 46.212 46.167 46.107 46.041 46.014 45.926 45.916 45.867 45.811 45.689 45.627 45.537 45.444 45.349 45.182 44.942 44.222 -6 ,403 ,KEBNE ,16653976,Mon Nov 22 05:06:22 CET,Mon Nov 22 06:30:53 CET,0.0 0.999 1.327 1.584 1.81 2.007 2.194 2.36 2.658 2.799 2.938 3.105 3.35 3.484 3.759 4.02 4.253 4.364 4.576 4.794 5.123 5.328 5.526 5.823 6.12 6.403 6.672 6.935 7.287 7.623 7.958 8.384 8.802 9.194 9.642 10.161 10.675 11.278 11.928 12.615 13.349 14.192 15.208 16.239 17.452 18.857 20.565 22.575 25.045 28.115 32.144 35.913 38.4 40.132 41.376 42.344 43.09 43.654 44.068 44.444 44.723 44.942 45.139 45.303 45.435 45.545 45.635 45.691 45.739 45.787 45.832 45.859 45.876 45.884 45.885 45.889 45.886 45.864 45.852 45.853 45.846 45.829 45.808 45.782 45.765 45.718 45.656 45.581 45.55 45.46 45.455 45.411 45.364 45.231 45.154 45.07 44.978 44.862 44.686 44.473 43.928 -7 ,8481 ,KEBNE ,16653977,Mon Nov 22 05:06:22 CET,Mon Nov 22 06:32:03 CET,0.0 0.83 1.14 1.396 1.63 1.843 2.036 2.197 2.504 2.652 2.793 2.952 3.19 3.314 3.554 3.788 4.017 4.128 4.347 4.555 4.852 5.057 5.255 5.539 5.818 6.092 6.37 6.652 7.014 7.355 7.683 8.095 8.506 8.899 9.357 9.882 10.399 10.968 11.597 12.292 13.038 13.891 14.904 15.954 17.232 18.692 20.4 22.372 24.792 27.868 31.962 35.65 37.992 39.684 40.925 41.86 42.583 43.137 43.55 43.907 44.184 44.418 44.614 44.769 44.908 45.018 45.104 45.178 45.239 45.277 45.297 45.32 45.342 45.363 45.381 45.4 45.396 45.37 45.356 45.35 45.343 45.331 45.317 45.299 45.285 45.252 45.209 45.143 45.103 44.993 44.975 44.938 44.888 44.742 44.662 44.578 44.487 44.381 44.264 44.088 43.611 -8 ,15735 ,KEBNE ,16653978,Mon Nov 22 05:06:24 CET,Mon Nov 22 06:28:36 CET,0.0 1.02 1.328 1.565 1.745 1.913 2.075 2.235 2.543 2.689 2.83 2.988 3.228 3.349 3.58 3.83 4.062 4.171 4.395 4.614 4.917 5.113 5.312 5.607 5.886 6.16 6.445 6.725 7.078 7.414 7.739 8.146 8.55 8.947 9.417 9.963 10.498 11.084 11.714 12.381 13.086 13.913 14.923 15.952 17.161 18.54 20.228 22.253 24.692 27.743 31.85 35.592 38.042 39.774 41.05 42.038 42.778 43.369 43.825 44.231 44.54 44.784 44.99 45.174 45.326 45.441 45.546 45.617 45.673 45.734 45.78 45.808 45.84 45.874 45.888 45.897 45.908 45.919 45.919 45.909 45.898 45.866 45.837 45.8 45.774 45.718 45.66 45.598 45.561 45.46 45.451 45.403 45.355 45.255 45.181 45.087 44.986 44.861 44.702 44.446 43.742 -9 ,18483 ,KEBNE ,16653979,Mon Nov 22 05:06:22 CET,Mon Nov 22 06:30:44 CET,0.0 0.93 1.273 1.524 1.759 1.97 2.148 2.309 2.62 2.773 2.918 3.076 3.318 3.443 3.675 3.898 4.122 4.238 4.46 4.662 4.961 5.159 5.361 5.656 5.933 6.2 6.452 6.708 7.063 7.401 7.716 8.114 8.518 8.904 9.351 9.883 10.402 10.953 11.565 12.261 13.003 13.816 14.782 15.785 16.992 18.425 20.156 22.234 24.755 27.841 31.933 35.71 38.191 39.944 41.234 42.212 42.947 43.532 43.976 44.376 44.674 44.9 45.083 45.247 45.392 45.508 45.609 45.68 45.733 45.789 45.832 45.854 45.868 45.881 45.9 45.905 45.907 45.912 45.91 45.908 45.906 45.896 45.875 45.844 45.825 45.777 45.733 45.677 45.637 45.535 45.528 45.482 45.432 45.296 45.22 45.146 45.051 44.946 44.811 44.591 43.464 -10 ,6058 ,KEBNE ,16653980,Mon Nov 22 05:06:22 CET,Mon Nov 22 06:30:46 CET,0.0 0.912 1.237 1.519 1.752 1.947 2.121 2.276 2.576 2.719 2.862 3.038 3.276 3.401 3.658 3.897 4.121 4.236 4.464 4.676 4.965 5.151 5.343 5.628 5.897 6.165 6.422 6.673 7.005 7.327 7.648 8.054 8.448 8.829 9.285 9.803 10.292 10.842 11.467 12.14 12.856 13.678 14.647 15.7 16.998 18.454 20.161 22.138 24.554 27.576 31.678 35.479 37.945 39.743 41.068 42.042 42.787 43.409 43.881 44.284 44.595 44.856 45.072 45.266 45.445 45.575 45.674 45.751 45.816 45.877 45.931 45.962 45.995 46.021 46.03 46.036 46.03 46.022 46.005 45.993 45.979 45.951 45.937 45.914 45.894 45.859 45.808 45.726 45.692 45.606 45.622 45.58 45.534 45.436 45.363 45.284 45.175 45.035 44.876 44.61 44.002 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_24_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_24_25.txt deleted file mode 100644 index da10f816..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_24_25.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20028 ,KEBNE ,16653981,Mon Nov 22 05:06:22 CET,Mon Nov 22 06:29:59 CET,0.0 2.152 2.499 2.731 2.92 3.044 3.135 3.218 3.345 3.392 3.441 3.486 3.621 3.654 3.696 3.713 3.741 3.759 3.786 3.801 3.82 3.828 3.827 3.835 3.842 3.833 3.807 3.786 3.762 3.725 3.675 3.595 3.515 3.43 3.307 3.163 3.029 2.86 2.645 2.395 2.09 1.707 1.243 0.735 0.068 -0.782 -1.898 -3.339 -5.328 -8.222 -12.607 -17.311 -20.871 -23.681 -25.939 -27.833 -29.413 -30.784 -31.939 -33.082 -34.044 -34.874 -35.638 -36.353 -37.007 -37.591 -38.186 -38.688 -39.106 -39.526 -39.946 -40.288 -40.628 -40.968 -41.231 -41.504 -41.793 -42.091 -42.405 -42.624 -42.844 -43.183 -43.413 -43.65 -43.768 -44.007 -44.254 -44.503 -44.634 -44.903 -45.057 -45.21 -45.373 -45.715 -45.875 -46.041 -46.235 -46.446 -46.664 -46.967 -47.354 -2 ,5694 ,KEBNE ,16653982,Mon Nov 22 05:06:22 CET,Mon Nov 22 06:29:59 CET,0.0 1.754 2.002 2.141 2.269 2.369 2.462 2.545 2.7 2.768 2.818 2.816 2.935 2.965 3.018 3.055 3.092 3.119 3.163 3.193 3.25 3.29 3.321 3.355 3.367 3.36 3.351 3.338 3.317 3.295 3.252 3.188 3.124 3.061 2.978 2.861 2.732 2.561 2.352 2.118 1.843 1.49 1.022 0.495 -0.177 -1.047 -2.216 -3.702 -5.694 -8.522 -12.928 -17.694 -21.324 -24.192 -26.47 -28.42 -30.042 -31.426 -32.59 -33.738 -34.693 -35.486 -36.206 -36.896 -37.524 -38.06 -38.602 -39.081 -39.489 -39.913 -40.346 -40.693 -41.037 -41.39 -41.655 -41.92 -42.197 -42.485 -42.781 -42.992 -43.207 -43.536 -43.765 -43.998 -44.119 -44.353 -44.575 -44.813 -44.937 -45.194 -45.317 -45.458 -45.6 -45.896 -46.058 -46.232 -46.416 -46.59 -46.761 -46.949 -47.321 -3 ,24386 ,KEBNE ,16653983,Mon Nov 22 05:07:23 CET,Mon Nov 22 06:30:48 CET,0.0 0.949 1.198 1.379 1.516 1.614 1.69 1.768 1.9 1.959 2.007 1.996 2.116 2.149 2.214 2.26 2.293 2.311 2.34 2.365 2.402 2.416 2.424 2.449 2.481 2.495 2.497 2.497 2.472 2.436 2.396 2.351 2.301 2.228 2.129 2.002 1.864 1.691 1.492 1.256 0.958 0.588 0.107 -0.433 -1.121 -1.985 -3.104 -4.572 -6.6 -9.449 -13.832 -18.514 -22.052 -24.855 -27.104 -29.002 -30.581 -31.956 -33.098 -34.182 -35.078 -35.859 -36.591 -37.268 -37.881 -38.431 -38.998 -39.505 -39.93 -40.36 -40.803 -41.163 -41.53 -41.916 -42.215 -42.511 -42.819 -43.131 -43.439 -43.659 -43.878 -44.203 -44.435 -44.675 -44.797 -45.048 -45.301 -45.54 -45.659 -45.925 -46.056 -46.18 -46.308 -46.587 -46.746 -46.928 -47.124 -47.312 -47.52 -47.781 -48.165 -5 ,15180 ,KEBNE ,16653985,Mon Nov 22 05:07:23 CET,Mon Nov 22 06:30:59 CET,0.0 1.032 1.285 1.422 1.547 1.673 1.767 1.839 1.968 2.024 2.088 2.136 2.271 2.311 2.382 2.45 2.518 2.545 2.594 2.631 2.671 2.694 2.71 2.735 2.746 2.764 2.776 2.761 2.731 2.706 2.696 2.681 2.63 2.588 2.524 2.397 2.264 2.099 1.903 1.664 1.376 1.014 0.552 0.056 -0.608 -1.463 -2.578 -4.075 -6.136 -8.986 -13.322 -18.041 -21.602 -24.434 -26.753 -28.729 -30.346 -31.716 -32.841 -33.95 -34.902 -35.724 -36.479 -37.163 -37.775 -38.319 -38.881 -39.39 -39.824 -40.253 -40.686 -41.043 -41.416 -41.792 -42.086 -42.395 -42.717 -43.045 -43.372 -43.607 -43.838 -44.164 -44.391 -44.626 -44.75 -45.017 -45.286 -45.55 -45.682 -45.956 -46.127 -46.274 -46.421 -46.744 -46.92 -47.102 -47.293 -47.491 -47.688 -47.894 -48.355 -6 ,10293 ,KEBNE ,16653986,Mon Nov 22 05:07:23 CET,Mon Nov 22 06:32:18 CET,0.0 1.737 1.991 2.126 2.213 2.305 2.398 2.479 2.635 2.698 2.738 2.705 2.818 2.856 2.909 2.954 2.998 3.011 3.033 3.058 3.096 3.129 3.151 3.154 3.16 3.146 3.118 3.091 3.058 3.045 3.027 2.969 2.893 2.813 2.707 2.563 2.416 2.257 2.057 1.808 1.502 1.104 0.599 0.057 -0.626 -1.492 -2.651 -4.17 -6.25 -9.209 -13.696 -18.477 -22.019 -24.82 -27.094 -28.999 -30.592 -31.958 -33.085 -34.167 -35.06 -35.837 -36.564 -37.226 -37.815 -38.339 -38.893 -39.395 -39.804 -40.21 -40.641 -40.985 -41.328 -41.686 -41.956 -42.229 -42.503 -42.785 -43.083 -43.283 -43.484 -43.799 -44.01 -44.231 -44.348 -44.573 -44.806 -45.047 -45.176 -45.449 -45.603 -45.753 -45.905 -46.223 -46.393 -46.566 -46.752 -46.957 -47.185 -47.405 -47.774 -7 ,11743 ,KEBNE ,16653987,Mon Nov 22 05:07:23 CET,Mon Nov 22 06:30:49 CET,0.0 1.056 1.281 1.447 1.569 1.662 1.737 1.806 1.93 1.983 2.029 2.023 2.138 2.167 2.216 2.248 2.288 2.304 2.314 2.324 2.352 2.362 2.356 2.342 2.324 2.296 2.272 2.26 2.229 2.18 2.126 2.046 1.954 1.865 1.76 1.628 1.483 1.327 1.131 0.882 0.619 0.268 -0.213 -0.72 -1.361 -2.185 -3.314 -4.766 -6.753 -9.627 -14.074 -18.827 -22.407 -25.272 -27.557 -29.487 -31.148 -32.557 -33.696 -34.807 -35.728 -36.53 -37.286 -37.96 -38.563 -39.124 -39.706 -40.202 -40.619 -41.053 -41.483 -41.822 -42.174 -42.538 -42.815 -43.097 -43.382 -43.669 -43.956 -44.158 -44.372 -44.692 -44.908 -45.13 -45.24 -45.453 -45.674 -45.911 -46.033 -46.288 -46.402 -46.535 -46.671 -46.963 -47.112 -47.249 -47.413 -47.612 -47.827 -48.068 -48.594 -8 ,1111 ,KEBNE ,16653988,Mon Nov 22 05:07:23 CET,Mon Nov 22 06:32:19 CET,0.0 0.98 1.216 1.36 1.488 1.584 1.656 1.748 1.955 2.042 2.113 2.137 2.26 2.296 2.362 2.426 2.474 2.484 2.534 2.601 2.667 2.691 2.705 2.735 2.766 2.787 2.793 2.792 2.827 2.863 2.882 2.881 2.847 2.782 2.67 2.52 2.375 2.206 1.99 1.744 1.444 1.069 0.608 0.068 -0.649 -1.57 -2.727 -4.161 -6.156 -9.073 -13.521 -18.278 -21.881 -24.756 -27.077 -29.016 -30.619 -31.998 -33.144 -34.254 -35.221 -36.075 -36.855 -37.58 -38.236 -38.816 -39.41 -39.936 -40.395 -40.845 -41.279 -41.638 -42.005 -42.376 -42.666 -42.964 -43.268 -43.578 -43.889 -44.101 -44.32 -44.654 -44.877 -45.102 -45.213 -45.434 -45.669 -45.908 -46.029 -46.284 -46.394 -46.536 -46.682 -46.971 -47.126 -47.282 -47.446 -47.63 -47.847 -48.147 -48.598 -9 ,9165 ,KEBNE ,16653989,Mon Nov 22 05:07:23 CET,Mon Nov 22 06:30:57 CET,0.0 1.037 1.322 1.525 1.652 1.727 1.801 1.879 2.005 2.054 2.102 2.127 2.253 2.282 2.324 2.372 2.423 2.439 2.461 2.479 2.493 2.497 2.497 2.499 2.494 2.477 2.466 2.448 2.42 2.388 2.344 2.272 2.194 2.118 2.001 1.845 1.69 1.505 1.292 1.019 0.69 0.319 -0.16 -0.711 -1.45 -2.372 -3.547 -5.07 -7.148 -10.048 -14.353 -18.93 -22.342 -25.06 -27.313 -29.242 -30.869 -32.271 -33.421 -34.546 -35.484 -36.283 -37.025 -37.712 -38.339 -38.9 -39.48 -40.001 -40.459 -40.944 -41.447 -41.838 -42.221 -42.608 -42.911 -43.224 -43.525 -43.826 -44.138 -44.349 -44.569 -44.924 -45.16 -45.395 -45.513 -45.743 -45.984 -46.242 -46.374 -46.645 -46.799 -46.942 -47.08 -47.398 -47.58 -47.77 -47.974 -48.188 -48.414 -48.693 -49.304 -10 ,1149 ,KEBNE ,16653990,Mon Nov 22 05:07:27 CET,Mon Nov 22 06:30:37 CET,0.0 1.573 1.854 2.017 2.132 2.237 2.331 2.402 2.505 2.543 2.588 2.603 2.727 2.765 2.821 2.856 2.884 2.902 2.94 2.97 2.999 3.0 2.991 2.987 2.978 2.958 2.94 2.914 2.878 2.838 2.785 2.718 2.662 2.604 2.527 2.412 2.276 2.103 1.891 1.642 1.335 0.971 0.517 -0.005 -0.717 -1.6 -2.714 -4.177 -6.197 -9.114 -13.482 -18.128 -21.641 -24.436 -26.689 -28.603 -30.237 -31.642 -32.788 -33.885 -34.793 -35.575 -36.3 -36.968 -37.565 -38.094 -38.651 -39.135 -39.54 -39.96 -40.386 -40.731 -41.08 -41.431 -41.7 -41.978 -42.271 -42.58 -42.9 -43.12 -43.342 -43.684 -43.923 -44.168 -44.288 -44.537 -44.802 -45.069 -45.207 -45.478 -45.607 -45.749 -45.893 -46.189 -46.356 -46.53 -46.718 -46.951 -47.19 -47.421 -47.974 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_24_27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_24_27.txt deleted file mode 100644 index 4864195d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_24_27.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3799 ,KEBNE ,16653991,Mon Nov 22 05:07:23 CET,Mon Nov 22 06:32:02 CET,0.0 4.253 4.84 5.222 5.498 5.723 5.918 6.113 6.458 6.603 6.736 6.905 7.104 7.223 7.435 7.608 7.763 7.835 7.975 8.121 8.334 8.464 8.585 8.754 8.92 9.061 9.199 9.336 9.497 9.665 9.813 9.97 10.128 10.273 10.424 10.578 10.707 10.827 10.942 11.041 11.111 11.188 11.265 11.261 11.163 11.003 10.745 10.303 9.517 8.218 6.011 3.265 0.974 -0.917 -2.523 -3.936 -5.203 -6.327 -7.222 -8.093 -8.812 -9.441 -10.067 -10.665 -11.213 -11.695 -12.183 -12.617 -12.995 -13.39 -13.798 -14.132 -14.479 -14.843 -15.114 -15.376 -15.635 -15.903 -16.184 -16.373 -16.563 -16.855 -17.059 -17.28 -17.395 -17.622 -17.846 -18.065 -18.175 -18.418 -18.575 -18.718 -18.856 -19.136 -19.303 -19.486 -19.662 -19.833 -20.043 -20.329 -20.999 -3 ,10981 ,KEBNE ,16653993,Mon Nov 22 05:07:24 CET,Mon Nov 22 06:31:56 CET,0.0 3.663 4.185 4.516 4.78 5.007 5.204 5.388 5.696 5.805 5.917 6.1 6.307 6.408 6.567 6.717 6.857 6.928 7.067 7.194 7.365 7.475 7.595 7.774 7.913 8.022 8.128 8.212 8.322 8.431 8.541 8.687 8.808 8.92 9.061 9.197 9.31 9.441 9.54 9.598 9.656 9.716 9.759 9.785 9.777 9.67 9.436 9.022 8.321 7.116 4.854 2.059 -0.281 -2.136 -3.746 -5.334 -6.677 -7.796 -8.744 -9.701 -10.488 -11.143 -11.758 -12.342 -12.872 -13.358 -13.851 -14.269 -14.61 -14.951 -15.321 -15.639 -15.957 -16.278 -16.531 -16.79 -17.055 -17.328 -17.6 -17.789 -17.988 -18.287 -18.497 -18.711 -18.818 -19.035 -19.256 -19.492 -19.612 -19.846 -19.972 -20.1 -20.236 -20.507 -20.646 -20.805 -20.976 -21.156 -21.36 -21.643 -22.187 -4 ,82 ,KEBNE ,16653994,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:34:38 CET,0.0 12.976 13.722 14.139 14.387 14.615 14.806 14.973 15.252 15.379 15.499 15.652 15.849 15.947 16.12 16.283 16.428 16.493 16.617 16.739 16.95 17.083 17.201 17.365 17.515 17.657 17.803 17.939 18.1 18.245 18.379 18.545 18.686 18.806 18.949 19.095 19.215 19.328 19.426 19.513 19.562 19.575 19.597 19.644 19.61 19.427 19.15 18.683 17.851 16.504 14.331 11.711 9.546 7.686 6.088 4.76 3.628 2.563 1.609 0.658 -0.15 -0.839 -1.486 -2.097 -2.65 -3.141 -3.604 -4.013 -4.376 -4.749 -5.155 -5.492 -5.831 -6.167 -6.425 -6.699 -6.967 -7.217 -7.47 -7.65 -7.838 -8.124 -8.319 -8.519 -8.62 -8.82 -9.032 -9.265 -9.38 -9.605 -9.725 -9.849 -9.985 -10.29 -10.459 -10.614 -10.758 -10.927 -11.121 -11.339 -11.661 -5 ,32764 ,KEBNE ,16653995,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:32:46 CET,0.0 3.09 3.584 3.98 4.299 4.579 4.775 4.93 5.219 5.352 5.491 5.642 5.825 5.929 6.092 6.226 6.375 6.455 6.597 6.736 6.942 7.058 7.17 7.331 7.488 7.634 7.77 7.886 8.018 8.148 8.261 8.408 8.544 8.671 8.824 8.958 9.049 9.134 9.219 9.294 9.328 9.371 9.388 9.359 9.306 9.163 8.937 8.563 7.849 6.645 4.456 1.637 -0.636 -2.503 -4.066 -5.429 -6.597 -7.626 -8.572 -9.555 -10.355 -11.052 -11.695 -12.284 -12.815 -13.277 -13.754 -14.17 -14.52 -14.882 -15.262 -15.583 -15.921 -16.259 -16.506 -16.756 -17.015 -17.287 -17.556 -17.739 -17.928 -18.213 -18.413 -18.623 -18.728 -18.943 -19.167 -19.392 -19.507 -19.746 -19.918 -20.069 -20.218 -20.523 -20.681 -20.836 -21.023 -21.236 -21.458 -21.713 -22.257 -6 ,9918 ,KEBNE ,16653996,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:33:08 CET,0.0 8.918 9.413 9.773 10.054 10.307 10.506 10.688 11.013 11.148 11.265 11.405 11.587 11.667 11.842 12.013 12.153 12.219 12.348 12.462 12.631 12.755 12.871 13.015 13.139 13.259 13.37 13.462 13.584 13.703 13.812 13.943 14.075 14.193 14.301 14.408 14.511 14.623 14.755 14.874 14.961 15.026 15.085 15.157 15.165 15.013 14.754 14.307 13.612 12.482 10.341 7.68 5.499 3.674 2.167 0.848 -0.314 -1.324 -2.169 -3.019 -3.794 -4.511 -5.171 -5.738 -6.256 -6.731 -7.197 -7.611 -7.972 -8.335 -8.704 -9.028 -9.38 -9.724 -9.974 -10.242 -10.528 -10.818 -11.122 -11.32 -11.509 -11.812 -12.018 -12.216 -12.315 -12.519 -12.734 -12.977 -13.11 -13.364 -13.533 -13.679 -13.824 -14.101 -14.256 -14.447 -14.659 -14.884 -15.132 -15.495 -16.672 -7 ,15537 ,KEBNE ,16653997,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:33:09 CET,0.0 2.579 3.14 3.499 3.754 3.971 4.197 4.37 4.69 4.844 4.961 5.101 5.286 5.386 5.592 5.787 5.95 6.021 6.174 6.334 6.528 6.645 6.755 6.91 7.069 7.216 7.334 7.432 7.553 7.677 7.819 7.972 8.098 8.21 8.332 8.463 8.592 8.745 8.899 9.022 9.111 9.174 9.196 9.202 9.179 9.076 8.888 8.539 7.865 6.542 3.993 0.982 -1.291 -3.209 -4.806 -6.16 -7.38 -8.425 -9.271 -10.14 -10.878 -11.51 -12.105 -12.653 -13.146 -13.589 -14.039 -14.434 -14.784 -15.149 -15.517 -15.821 -16.137 -16.452 -16.699 -16.952 -17.208 -17.48 -17.749 -17.931 -18.122 -18.414 -18.611 -18.816 -18.92 -19.128 -19.347 -19.571 -19.684 -19.918 -20.055 -20.187 -20.325 -20.606 -20.751 -20.909 -21.078 -21.285 -21.519 -21.798 -22.329 -8 ,30290 ,KEBNE ,16653998,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:32:56 CET,0.0 3.361 3.914 4.205 4.479 4.746 4.979 5.172 5.465 5.568 5.686 5.84 6.017 6.105 6.269 6.415 6.562 6.639 6.763 6.871 7.021 7.119 7.223 7.355 7.474 7.608 7.734 7.831 7.95 8.068 8.15 8.275 8.441 8.58 8.709 8.862 8.996 9.084 9.164 9.254 9.327 9.389 9.467 9.482 9.403 9.292 9.061 8.665 7.994 6.758 4.475 1.724 -0.609 -2.604 -4.202 -5.623 -6.826 -7.873 -8.789 -9.69 -10.446 -11.094 -11.716 -12.305 -12.822 -13.286 -13.763 -14.184 -14.547 -14.914 -15.286 -15.584 -15.897 -16.237 -16.498 -16.76 -17.032 -17.308 -17.581 -17.765 -17.947 -18.231 -18.429 -18.625 -18.726 -18.937 -19.159 -19.399 -19.529 -19.778 -19.974 -20.143 -20.306 -20.653 -20.844 -21.055 -21.283 -21.502 -21.772 -22.139 -22.85 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_25_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_25_19.txt deleted file mode 100644 index 316dbaa2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_25_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25244 ,KEBNE ,17023505,Wed Dec 22 08:14:58 CET,Wed Dec 22 09:42:25 CET,0.0 0.678 0.954 1.187 1.412 1.62 1.809 1.997 2.35 2.509 2.65 2.795 3.065 3.197 3.469 3.747 4.006 4.129 4.38 4.634 5.004 5.242 5.465 5.784 6.102 6.417 6.72 7.017 7.403 7.793 8.198 8.702 9.179 9.649 10.214 10.87 11.517 12.229 13.026 13.899 14.803 15.833 17.081 18.395 19.976 21.767 23.914 26.442 29.596 33.613 38.895 43.774 46.988 49.253 50.892 52.19 53.238 54.086 54.745 55.331 55.763 56.124 56.452 56.723 56.944 57.127 57.301 57.417 57.47 57.507 57.563 57.608 57.647 57.673 57.686 57.695 57.689 57.673 57.658 57.653 57.645 57.615 57.585 57.551 57.527 57.449 57.381 57.316 57.276 57.154 57.134 57.089 57.023 56.875 56.79 56.689 56.566 56.42 56.264 55.976 54.484 -2 ,703 ,KEBNE ,17023506,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:41:22 CET,0.0 0.736 1.025 1.275 1.488 1.683 1.867 2.047 2.399 2.572 2.727 2.897 3.181 3.322 3.598 3.865 4.128 4.255 4.5 4.744 5.101 5.335 5.578 5.931 6.265 6.613 6.962 7.296 7.727 8.141 8.534 9.011 9.51 10.015 10.611 11.273 11.889 12.591 13.387 14.278 15.224 16.307 17.618 18.979 20.621 22.506 24.75 27.338 30.526 34.505 39.794 44.719 47.964 50.298 52.014 53.385 54.387 55.163 55.719 56.198 56.617 56.947 57.238 57.489 57.688 57.86 58.027 58.157 58.257 58.346 58.432 58.499 58.555 58.602 58.631 58.651 58.676 58.709 58.718 58.705 58.69 58.663 58.642 58.605 58.579 58.528 58.456 58.371 58.328 58.199 58.153 58.085 58.012 57.862 57.78 57.671 57.518 57.333 57.113 56.809 55.316 -3 ,20717 ,KEBNE ,17023507,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:44:15 CET,0.0 0.663 0.946 1.149 1.34 1.518 1.686 1.853 2.157 2.303 2.453 2.613 2.883 3.023 3.312 3.588 3.847 3.971 4.205 4.434 4.788 5.022 5.257 5.618 5.965 6.303 6.632 6.95 7.33 7.683 8.043 8.476 8.902 9.338 9.859 10.454 11.036 11.679 12.382 13.171 14.073 15.137 16.408 17.729 19.316 21.117 23.264 25.833 29.056 33.123 38.478 43.392 46.566 48.809 50.465 51.748 52.732 53.534 54.157 54.695 55.108 55.435 55.729 55.989 56.202 56.383 56.558 56.7 56.809 56.904 57.0 57.078 57.139 57.19 57.227 57.252 57.268 57.265 57.248 57.235 57.223 57.222 57.216 57.182 57.155 57.098 57.026 56.943 56.899 56.775 56.748 56.685 56.612 56.427 56.315 56.193 56.053 55.896 55.722 55.429 54.47 -4 ,17422 ,KEBNE ,17023508,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:42:52 CET,0.0 0.952 1.23 1.475 1.692 1.882 2.064 2.222 2.499 2.628 2.758 2.871 3.126 3.251 3.491 3.715 3.933 4.04 4.251 4.468 4.776 4.976 5.176 5.468 5.763 6.063 6.354 6.631 6.992 7.343 7.694 8.137 8.59 9.047 9.591 10.22 10.857 11.574 12.327 13.132 14.014 15.033 16.259 17.528 19.073 20.879 23.001 25.515 28.692 32.71 38.033 42.996 46.308 48.657 50.371 51.687 52.669 53.46 54.089 54.643 55.059 55.394 55.681 55.924 56.114 56.251 56.398 56.521 56.603 56.675 56.726 56.76 56.796 56.829 56.854 56.882 56.914 56.929 56.929 56.92 56.911 56.899 56.874 56.851 56.837 56.782 56.724 56.669 56.633 56.509 56.473 56.416 56.36 56.208 56.114 55.998 55.86 55.702 55.488 55.146 53.834 -5 ,29808 ,KEBNE ,17023509,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:41:21 CET,0.0 1.05 1.4 1.643 1.853 2.054 2.241 2.42 2.73 2.866 3.004 3.144 3.411 3.549 3.833 4.109 4.372 4.497 4.746 4.994 5.349 5.575 5.805 6.154 6.497 6.839 7.169 7.498 7.922 8.322 8.706 9.189 9.672 10.137 10.673 11.277 11.883 12.565 13.321 14.132 14.994 15.997 17.216 18.492 19.996 21.721 23.859 26.497 29.835 33.985 39.462 44.556 47.813 49.915 51.389 52.632 53.626 54.39 54.959 55.509 55.949 56.288 56.58 56.843 57.069 57.244 57.412 57.551 57.644 57.731 57.812 57.863 57.902 57.913 57.922 57.939 57.946 57.929 57.88 57.848 57.826 57.809 57.798 57.769 57.746 57.69 57.61 57.515 57.467 57.339 57.292 57.223 57.153 57.002 56.904 56.784 56.664 56.518 56.333 56.087 55.407 -6 ,16935 ,KEBNE ,17023510,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:41:35 CET,0.0 1.191 1.472 1.719 1.951 2.151 2.335 2.518 2.862 3.02 3.175 3.347 3.621 3.75 3.984 4.207 4.424 4.535 4.755 4.969 5.274 5.485 5.697 6.015 6.339 6.648 6.961 7.285 7.723 8.158 8.568 9.064 9.557 10.044 10.616 11.272 11.915 12.659 13.476 14.342 15.274 16.351 17.639 19.0 20.669 22.594 24.915 27.636 30.942 35.102 40.671 45.695 48.915 51.187 52.824 54.042 54.976 55.74 56.303 56.804 57.155 57.426 57.691 57.922 58.117 58.266 58.376 58.468 58.555 58.635 58.707 58.747 58.785 58.821 58.841 58.867 58.892 58.906 58.91 58.909 58.918 58.926 58.906 58.882 58.872 58.832 58.752 58.654 58.61 58.487 58.438 58.376 58.314 58.161 58.073 57.966 57.855 57.714 57.504 57.167 55.763 -7 ,26458 ,KEBNE ,17023511,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:41:44 CET,0.0 0.663 0.983 1.234 1.476 1.687 1.879 2.048 2.354 2.506 2.655 2.791 3.05 3.167 3.407 3.654 3.885 3.994 4.211 4.425 4.74 4.952 5.171 5.487 5.804 6.118 6.413 6.711 7.098 7.475 7.851 8.316 8.779 9.234 9.76 10.354 10.95 11.619 12.346 13.149 14.041 15.07 16.269 17.505 19.027 20.801 22.934 25.468 28.649 32.693 38.071 43.098 46.421 48.767 50.43 51.704 52.682 53.422 53.978 54.462 54.846 55.179 55.473 55.724 55.898 56.04 56.196 56.316 56.412 56.514 56.618 56.684 56.739 56.793 56.835 56.875 56.904 56.912 56.909 56.9 56.879 56.833 56.796 56.749 56.722 56.654 56.564 56.474 56.436 56.319 56.307 56.252 56.186 56.043 55.954 55.846 55.716 55.565 55.388 55.042 53.774 -8 ,26993 ,KEBNE ,17023512,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:41:29 CET,0.0 1.101 1.357 1.59 1.778 1.948 2.125 2.282 2.6 2.77 2.937 3.133 3.434 3.587 3.869 4.132 4.388 4.518 4.77 5.011 5.363 5.583 5.79 6.109 6.432 6.74 7.037 7.324 7.704 8.08 8.443 8.896 9.351 9.792 10.316 10.93 11.522 12.17 12.888 13.718 14.633 15.67 16.883 18.129 19.661 21.415 23.522 26.035 29.193 33.225 38.534 43.393 46.634 49.0 50.728 52.035 53.035 53.833 54.469 55.039 55.474 55.856 56.187 56.435 56.628 56.781 56.926 57.056 57.162 57.264 57.351 57.413 57.474 57.53 57.559 57.572 57.571 57.549 57.514 57.49 57.464 57.434 57.419 57.393 57.375 57.33 57.274 57.21 57.171 57.06 57.066 57.021 56.958 56.804 56.725 56.612 56.461 56.318 56.156 55.829 54.477 -9 ,32539 ,KEBNE ,17023513,Wed Dec 22 08:13:53 CET,Wed Dec 22 09:41:25 CET,0.0 0.558 0.851 1.093 1.308 1.505 1.669 1.822 2.111 2.257 2.4 2.554 2.831 2.977 3.289 3.576 3.835 3.966 4.224 4.471 4.831 5.062 5.293 5.645 5.994 6.33 6.661 6.986 7.409 7.815 8.209 8.718 9.228 9.715 10.263 10.89 11.525 12.219 12.993 13.868 14.809 15.882 17.175 18.508 20.09 21.934 24.159 26.809 30.142 34.334 39.739 44.685 47.802 49.933 51.537 52.8 53.737 54.456 54.971 55.398 55.72 55.975 56.181 56.363 56.505 56.626 56.743 56.805 56.851 56.88 56.9 56.924 56.932 56.928 56.924 56.901 56.866 56.822 56.779 56.755 56.728 56.688 56.653 56.597 56.567 56.507 56.429 56.343 56.301 56.173 56.108 56.031 55.937 55.713 55.58 55.42 55.249 55.082 54.844 54.455 53.123 -10 ,23738 ,KEBNE ,17023514,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:41:21 CET,0.0 0.38 0.629 0.867 1.086 1.281 1.479 1.658 1.963 2.107 2.252 2.415 2.688 2.822 3.079 3.333 3.583 3.706 3.943 4.178 4.518 4.738 4.951 5.272 5.595 5.902 6.205 6.507 6.912 7.33 7.745 8.253 8.729 9.189 9.744 10.393 11.033 11.74 12.527 13.366 14.266 15.309 16.549 17.851 19.469 21.363 23.617 26.335 29.668 33.805 39.319 44.337 47.547 49.801 51.472 52.722 53.64 54.327 54.821 55.239 55.574 55.84 56.057 56.257 56.409 56.518 56.609 56.703 56.797 56.879 56.963 57.036 57.105 57.163 57.193 57.216 57.233 57.212 57.169 57.147 57.131 57.093 57.046 57.006 56.981 56.898 56.813 56.726 56.68 56.56 56.529 56.452 56.375 56.229 56.144 56.063 55.97 55.835 55.63 55.329 54.34 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_25_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_25_24.txt deleted file mode 100644 index fb9871ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_25_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14296 ,KEBNE ,17042261,Thu Dec 23 04:10:30 CET,Thu Dec 23 05:38:08 CET,0.0 0.375 0.6 0.803 0.995 1.177 1.348 1.52 1.839 1.979 2.118 2.253 2.52 2.655 2.909 3.157 3.404 3.53 3.775 3.996 4.306 4.51 4.71 5.002 5.29 5.571 5.855 6.134 6.488 6.831 7.169 7.59 8.005 8.423 8.927 9.492 10.069 10.751 11.504 12.301 13.123 14.029 15.122 16.278 17.676 19.296 21.223 23.496 26.285 29.808 34.505 38.91 41.804 43.822 45.327 46.516 47.373 48.059 48.614 49.088 49.43 49.701 49.953 50.173 50.351 50.493 50.608 50.702 50.778 50.852 50.91 50.944 50.938 50.925 50.931 50.938 50.954 50.957 50.945 50.941 50.939 50.939 50.918 50.88 50.858 50.809 50.767 50.711 50.673 50.546 50.558 50.523 50.481 50.369 50.299 50.217 50.113 49.981 49.804 49.515 48.232 -2 ,31312 ,KEBNE ,17042262,Thu Dec 23 04:10:30 CET,Thu Dec 23 05:38:13 CET,0.0 0.371 0.608 0.831 1.028 1.207 1.369 1.513 1.806 1.956 2.103 2.243 2.5 2.62 2.878 3.155 3.413 3.53 3.741 3.949 4.262 4.462 4.658 4.95 5.244 5.529 5.819 6.12 6.5 6.881 7.271 7.735 8.169 8.585 9.082 9.67 10.251 10.912 11.651 12.45 13.272 14.204 15.327 16.49 17.894 19.51 21.462 23.751 26.533 30.038 34.72 39.054 41.881 43.913 45.397 46.547 47.467 48.226 48.795 49.296 49.693 50.016 50.29 50.516 50.706 50.866 51.023 51.15 51.236 51.32 51.39 51.427 51.474 51.527 51.556 51.567 51.569 51.58 51.59 51.589 51.586 51.572 51.55 51.527 51.51 51.454 51.402 51.364 51.338 51.226 51.226 51.171 51.121 50.983 50.912 50.832 50.735 50.585 50.363 50.125 49.215 -3 ,13531 ,KEBNE ,17042263,Thu Dec 23 04:10:30 CET,Thu Dec 23 05:37:54 CET,0.0 0.481 0.797 1.063 1.259 1.432 1.586 1.735 2.033 2.174 2.308 2.433 2.701 2.825 3.058 3.291 3.525 3.637 3.856 4.071 4.379 4.582 4.784 5.075 5.37 5.652 5.92 6.187 6.532 6.868 7.205 7.625 8.042 8.457 8.948 9.51 10.063 10.675 11.358 12.107 12.917 13.86 14.987 16.15 17.537 19.137 21.063 23.316 26.118 29.698 34.447 38.849 41.765 43.789 45.271 46.465 47.375 48.065 48.591 49.064 49.409 49.682 49.92 50.129 50.32 50.475 50.603 50.695 50.766 50.828 50.886 50.919 50.947 50.982 51.003 51.015 51.022 51.033 51.039 51.038 51.037 51.035 51.022 51.011 51.005 50.99 50.962 50.909 50.877 50.757 50.758 50.716 50.682 50.568 50.498 50.409 50.288 50.154 50.004 49.795 48.109 -4 ,16528 ,KEBNE ,17042264,Thu Dec 23 04:10:30 CET,Thu Dec 23 05:38:01 CET,0.0 0.446 0.7 0.918 1.12 1.291 1.465 1.645 1.973 2.12 2.26 2.389 2.652 2.777 3.007 3.237 3.469 3.579 3.797 4.029 4.361 4.565 4.767 5.052 5.34 5.633 5.914 6.186 6.55 6.908 7.248 7.656 8.057 8.454 8.926 9.469 9.999 10.597 11.251 11.955 12.73 13.646 14.744 15.856 17.205 18.803 20.715 22.949 25.689 29.185 33.895 38.211 41.101 43.19 44.667 45.804 46.671 47.335 47.824 48.272 48.617 48.882 49.111 49.305 49.463 49.582 49.68 49.76 49.828 49.896 49.958 49.977 50.002 50.046 50.072 50.102 50.118 50.127 50.143 50.148 50.153 50.156 50.143 50.122 50.101 50.063 50.043 50.016 49.995 49.885 49.9 49.858 49.815 49.714 49.652 49.574 49.475 49.365 49.202 48.988 48.154 -5 ,15314 ,KEBNE ,17042265,Thu Dec 23 04:11:32 CET,Thu Dec 23 05:40:29 CET,0.0 0.426 0.705 0.932 1.131 1.315 1.479 1.638 1.949 2.109 2.262 2.401 2.671 2.81 3.079 3.329 3.58 3.702 3.938 4.166 4.486 4.689 4.884 5.177 5.47 5.754 6.029 6.295 6.646 6.992 7.336 7.754 8.163 8.573 9.045 9.574 10.097 10.695 11.359 12.076 12.849 13.753 14.838 15.954 17.317 18.895 20.804 23.112 25.96 29.556 34.309 38.711 41.637 43.706 45.215 46.389 47.268 47.94 48.453 48.917 49.274 49.55 49.811 50.032 50.191 50.339 50.47 50.574 50.648 50.71 50.774 50.824 50.872 50.903 50.93 50.963 50.972 50.977 50.99 50.991 50.996 50.989 50.976 50.963 50.952 50.927 50.907 50.86 50.827 50.713 50.717 50.675 50.623 50.484 50.412 50.331 50.243 50.151 50.027 49.791 48.861 -6 ,29317 ,KEBNE ,17042266,Thu Dec 23 04:11:32 CET,Thu Dec 23 05:40:37 CET,0.0 0.642 0.886 1.11 1.306 1.493 1.676 1.853 2.174 2.319 2.468 2.643 2.923 3.064 3.337 3.596 3.839 3.963 4.215 4.45 4.782 4.996 5.21 5.517 5.8 6.076 6.348 6.616 6.973 7.35 7.722 8.146 8.555 8.957 9.428 9.967 10.502 11.128 11.811 12.527 13.311 14.231 15.358 16.577 18.058 19.684 21.573 23.804 26.603 30.162 34.849 39.204 42.07 44.11 45.574 46.69 47.565 48.243 48.77 49.257 49.627 49.919 50.181 50.419 50.594 50.709 50.809 50.904 50.986 51.064 51.139 51.177 51.199 51.228 51.25 51.259 51.257 51.252 51.253 51.242 51.229 51.216 51.199 51.182 51.175 51.149 51.116 51.072 51.044 50.927 50.935 50.905 50.863 50.749 50.687 50.595 50.495 50.383 50.222 49.959 49.301 -7 ,29291 ,KEBNE ,17042267,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:49:13 CET,0.0 0.488 0.707 0.899 1.065 1.218 1.378 1.529 1.8 1.941 2.085 2.251 2.539 2.685 2.962 3.234 3.501 3.64 3.919 4.178 4.543 4.78 5.01 5.335 5.647 5.955 6.258 6.558 6.958 7.349 7.735 8.195 8.632 9.068 9.614 10.282 10.927 11.625 12.348 13.088 13.908 14.851 15.957 17.129 18.554 20.192 22.141 24.41 27.249 30.859 35.586 40.0 42.884 44.9 46.399 47.554 48.442 49.144 49.671 50.155 50.505 50.768 50.995 51.194 51.38 51.537 51.687 51.816 51.918 52.001 52.074 52.12 52.162 52.202 52.226 52.23 52.23 52.243 52.244 52.237 52.227 52.206 52.186 52.158 52.142 52.114 52.079 52.035 52.005 51.885 51.886 51.841 51.801 51.69 51.629 51.547 51.43 51.308 51.145 50.91 49.854 -8 ,32524 ,KEBNE ,17042268,Thu Dec 23 04:21:51 CET,Thu Dec 23 05:51:12 CET,0.0 0.411 0.626 0.828 1.0 1.175 1.358 1.533 1.847 1.986 2.125 2.277 2.543 2.665 2.919 3.175 3.428 3.549 3.779 4.012 4.367 4.599 4.825 5.128 5.404 5.687 5.983 6.276 6.659 7.033 7.395 7.829 8.258 8.69 9.211 9.817 10.399 11.036 11.739 12.498 13.294 14.224 15.343 16.507 17.888 19.505 21.491 23.831 26.685 30.241 34.934 39.322 42.198 44.188 45.668 46.809 47.697 48.43 49.007 49.539 49.94 50.253 50.551 50.808 51.011 51.175 51.297 51.36 51.392 51.427 51.483 51.537 51.593 51.649 51.677 51.697 51.717 51.72 51.711 51.711 51.707 51.689 51.678 51.661 51.643 51.594 51.545 51.504 51.487 51.377 51.387 51.352 51.309 51.185 51.118 51.034 50.908 50.766 50.598 50.374 49.43 -9 ,203 ,KEBNE ,17042269,Thu Dec 23 04:21:55 CET,Thu Dec 23 05:47:17 CET,0.0 0.656 0.899 1.105 1.295 1.459 1.607 1.756 2.052 2.189 2.323 2.462 2.731 2.87 3.141 3.378 3.594 3.7 3.918 4.135 4.466 4.692 4.91 5.224 5.536 5.843 6.143 6.438 6.802 7.137 7.475 7.898 8.311 8.712 9.182 9.722 10.241 10.829 11.485 12.192 12.965 13.862 14.944 16.084 17.463 19.049 20.947 23.186 25.994 29.578 34.279 38.603 41.441 43.413 44.853 45.969 46.801 47.467 47.998 48.486 48.858 49.143 49.388 49.608 49.79 49.942 50.063 50.146 50.216 50.287 50.354 50.401 50.446 50.467 50.476 50.467 50.46 50.47 50.471 50.46 50.45 50.444 50.415 50.372 50.355 50.324 50.272 50.201 50.172 50.059 50.069 50.02 49.963 49.842 49.779 49.701 49.582 49.452 49.305 49.069 48.226 -10 ,31926 ,KEBNE ,17042270,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:51:05 CET,0.0 0.369 0.608 0.836 1.062 1.26 1.44 1.606 1.924 2.075 2.218 2.369 2.649 2.789 3.064 3.348 3.626 3.761 4.02 4.279 4.643 4.872 5.102 5.448 5.801 6.14 6.451 6.755 7.166 7.572 7.952 8.426 8.909 9.39 9.946 10.544 11.138 11.824 12.567 13.373 14.245 15.247 16.471 17.714 19.147 20.785 22.782 25.152 27.995 31.513 36.188 40.509 43.312 45.251 46.672 47.797 48.67 49.359 49.904 50.387 50.735 50.998 51.23 51.439 51.618 51.766 51.9 52.008 52.101 52.195 52.268 52.325 52.369 52.394 52.416 52.439 52.448 52.446 52.448 52.441 52.435 52.437 52.435 52.424 52.411 52.358 52.264 52.141 52.077 51.929 51.883 51.824 51.766 51.657 51.605 51.526 51.428 51.307 51.148 50.915 48.42 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_25_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_25_29.txt deleted file mode 100644 index 502f85ea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_25_29.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19699 ,KEBNE ,16654001,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:33:10 CET,0.0 3.04 3.571 3.952 4.245 4.53 4.792 5.035 5.493 5.708 5.913 6.144 6.451 6.638 6.986 7.305 7.606 7.754 8.052 8.346 8.775 9.049 9.294 9.632 9.978 10.324 10.661 11.001 11.455 11.902 12.325 12.82 13.297 13.762 14.306 14.922 15.543 16.245 16.994 17.81 18.679 19.665 20.874 22.154 23.707 25.482 27.569 30.029 33.076 36.882 41.855 46.332 49.137 51.074 52.486 53.552 54.359 54.949 55.417 55.858 56.131 56.305 56.452 56.606 56.737 56.819 56.892 56.951 56.992 57.02 57.037 57.058 57.085 57.096 57.095 57.074 57.059 57.046 57.012 56.984 56.955 56.903 56.859 56.818 56.786 56.7 56.604 56.5 56.444 56.307 56.276 56.204 56.144 55.98 55.86 55.758 55.652 55.509 55.321 55.057 53.842 -2 ,13925 ,KEBNE ,16654002,Mon Nov 22 05:08:26 CET,Mon Nov 22 06:32:40 CET,0.0 4.06 4.625 5.031 5.377 5.648 5.938 6.199 6.618 6.813 7.012 7.296 7.633 7.821 8.179 8.505 8.801 8.937 9.201 9.462 9.846 10.09 10.318 10.67 11.028 11.362 11.685 12.003 12.404 12.793 13.192 13.686 14.156 14.617 15.163 15.773 16.362 17.024 17.766 18.585 19.453 20.439 21.615 22.843 24.313 25.99 27.95 30.281 33.243 36.948 41.775 46.157 48.98 50.986 52.424 53.509 54.347 55.023 55.516 55.938 56.278 56.562 56.813 56.986 57.138 57.278 57.388 57.471 57.535 57.587 57.617 57.636 57.659 57.677 57.695 57.713 57.716 57.683 57.633 57.602 57.576 57.535 57.498 57.452 57.426 57.383 57.323 57.232 57.187 57.069 57.051 56.981 56.898 56.746 56.645 56.529 56.433 56.323 56.153 55.871 54.229 -3 ,15072 ,KEBNE ,16654003,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:32:30 CET,0.0 1.733 2.206 2.592 2.899 3.159 3.412 3.663 4.116 4.323 4.522 4.765 5.088 5.255 5.564 5.882 6.206 6.361 6.661 6.957 7.399 7.698 7.982 8.382 8.772 9.145 9.482 9.799 10.218 10.63 11.023 11.498 11.976 12.459 13.036 13.728 14.419 15.168 15.951 16.765 17.621 18.594 19.776 21.02 22.511 24.205 26.214 28.533 31.398 35.087 39.91 44.288 47.125 49.121 50.602 51.742 52.588 53.229 53.674 54.012 54.295 54.538 54.74 54.929 55.085 55.202 55.329 55.428 55.495 55.526 55.539 55.563 55.587 55.585 55.569 55.573 55.587 55.586 55.562 55.538 55.511 55.449 55.397 55.344 55.316 55.248 55.181 55.112 55.063 54.928 54.899 54.839 54.772 54.627 54.553 54.463 54.353 54.234 54.055 53.8 53.204 -4 ,27225 ,KEBNE ,16654004,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:32:56 CET,0.0 2.279 2.816 3.189 3.503 3.815 4.102 4.352 4.807 5.011 5.21 5.435 5.73 5.9 6.208 6.506 6.815 6.967 7.256 7.534 7.931 8.186 8.433 8.79 9.153 9.51 9.874 10.24 10.695 11.15 11.601 12.147 12.667 13.146 13.725 14.388 15.018 15.736 16.52 17.357 18.251 19.299 20.526 21.81 23.373 25.134 27.218 29.703 32.794 36.667 41.679 46.122 48.955 50.992 52.505 53.602 54.422 55.105 55.613 56.02 56.304 56.544 56.762 56.924 57.051 57.165 57.27 57.343 57.387 57.428 57.474 57.509 57.527 57.516 57.498 57.487 57.474 57.449 57.423 57.401 57.384 57.358 57.315 57.266 57.239 57.191 57.134 57.041 56.994 56.858 56.786 56.697 56.598 56.377 56.25 56.105 55.939 55.742 55.511 55.212 53.413 -6 ,25159 ,KEBNE ,16654006,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:32:46 CET,0.0 2.241 2.774 3.262 3.667 3.971 4.22 4.468 4.979 5.201 5.385 5.565 5.848 6.01 6.334 6.63 6.921 7.067 7.359 7.634 8.008 8.238 8.475 8.848 9.212 9.563 9.891 10.203 10.607 10.991 11.364 11.828 12.293 12.764 13.314 13.92 14.528 15.233 16.029 16.887 17.795 18.846 20.073 21.326 22.821 24.571 26.738 29.257 32.328 36.17 41.199 45.84 48.743 50.663 52.025 53.095 53.932 54.585 55.085 55.555 55.912 56.169 56.364 56.542 56.71 56.862 56.984 57.062 57.14 57.209 57.271 57.312 57.345 57.36 57.365 57.387 57.399 57.383 57.351 57.325 57.315 57.293 57.262 57.225 57.207 57.189 57.158 57.097 57.057 56.925 56.908 56.869 56.827 56.701 56.62 56.526 56.431 56.343 56.215 56.026 55.388 -7 ,27173 ,KEBNE ,16654007,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:34:02 CET,0.0 3.326 3.91 4.346 4.694 4.976 5.267 5.537 6.013 6.234 6.432 6.676 6.985 7.163 7.497 7.826 8.159 8.308 8.593 8.883 9.288 9.546 9.812 10.192 10.546 10.907 11.264 11.596 12.027 12.458 12.872 13.349 13.804 14.261 14.798 15.411 16.009 16.701 17.486 18.305 19.156 20.143 21.357 22.605 24.053 25.724 27.721 30.099 33.067 36.686 41.441 45.757 48.583 50.592 52.005 53.081 53.943 54.623 55.12 55.565 55.911 56.17 56.391 56.585 56.736 56.851 56.937 56.996 57.061 57.127 57.178 57.211 57.219 57.204 57.196 57.195 57.183 57.159 57.117 57.073 57.018 56.93 56.874 56.806 56.77 56.699 56.624 56.547 56.509 56.38 56.354 56.284 56.205 56.079 55.991 55.879 55.759 55.602 55.437 55.194 53.823 -8 ,1583 ,KEBNE ,16654008,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:34:33 CET,0.0 3.905 4.445 4.828 5.134 5.443 5.732 5.957 6.344 6.529 6.719 6.952 7.257 7.425 7.754 8.073 8.4 8.561 8.862 9.132 9.495 9.736 9.974 10.322 10.662 10.997 11.333 11.652 12.058 12.468 12.871 13.349 13.815 14.269 14.81 15.424 16.011 16.669 17.41 18.222 19.093 20.131 21.344 22.541 24.008 25.685 27.675 30.064 32.923 36.457 41.266 45.698 48.57 50.594 52.011 53.066 53.881 54.511 55.013 55.486 55.811 56.053 56.268 56.453 56.614 56.727 56.814 56.893 56.958 57.025 57.055 57.064 57.08 57.084 57.092 57.088 57.067 57.033 56.991 56.963 56.916 56.823 56.762 56.686 56.641 56.56 56.482 56.39 56.342 56.211 56.19 56.135 56.072 55.908 55.786 55.635 55.495 55.351 55.153 54.863 53.853 -9 ,30261 ,KEBNE ,16654009,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:32:37 CET,0.0 6.002 6.473 6.878 7.231 7.564 7.869 8.141 8.635 8.869 9.092 9.351 9.662 9.854 10.215 10.543 10.868 11.017 11.319 11.633 12.08 12.355 12.604 12.935 13.261 13.583 13.898 14.218 14.628 15.032 15.435 15.949 16.46 16.937 17.484 18.103 18.706 19.396 20.147 20.945 21.797 22.782 23.988 25.236 26.746 28.457 30.441 32.806 35.771 39.473 44.358 48.848 51.772 53.754 55.185 56.365 57.266 57.956 58.413 58.727 58.977 59.217 59.392 59.517 59.651 59.751 59.832 59.9 59.961 60.008 60.038 60.057 60.063 60.072 60.075 60.051 59.995 59.922 59.874 59.849 59.806 59.727 59.669 59.622 59.601 59.555 59.498 59.404 59.34 59.179 59.119 59.049 58.971 58.811 58.718 58.592 58.441 58.285 58.091 57.844 56.575 -10 ,13875 ,KEBNE ,16654010,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:32:50 CET,0.0 6.497 6.997 7.351 7.676 7.979 8.255 8.509 8.958 9.165 9.359 9.613 9.933 10.117 10.441 10.726 11.019 11.176 11.483 11.757 12.143 12.399 12.651 13.012 13.375 13.727 14.054 14.384 14.823 15.242 15.656 16.169 16.654 17.119 17.667 18.311 18.928 19.608 20.366 21.206 22.143 23.213 24.432 25.649 27.118 28.847 30.97 33.483 36.511 40.265 45.12 49.522 52.41 54.451 55.913 57.044 57.918 58.604 59.138 59.624 59.963 60.234 60.492 60.685 60.834 60.973 61.111 61.215 61.287 61.336 61.38 61.425 61.451 61.458 61.457 61.46 61.471 61.463 61.416 61.379 61.356 61.331 61.311 61.289 61.279 61.24 61.165 61.066 61.025 60.912 60.911 60.866 60.813 60.653 60.574 60.504 60.419 60.317 60.122 59.873 58.324 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_27_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_27_24.txt deleted file mode 100644 index f28f2460..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_27_24.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,25554 ,KEBNE ,17042272,Thu Dec 23 04:21:51 CET,Thu Dec 23 05:51:15 CET,0.0 0.597 0.896 1.101 1.274 1.432 1.593 1.746 2.024 2.159 2.293 2.453 2.692 2.815 3.052 3.266 3.462 3.562 3.762 3.961 4.244 4.423 4.617 4.903 5.162 5.415 5.667 5.922 6.257 6.59 6.912 7.289 7.649 8.0 8.426 8.916 9.37 9.878 10.443 11.03 11.661 12.408 13.294 14.191 15.287 16.542 17.943 19.532 21.407 23.658 26.345 28.442 29.604 30.304 30.767 31.033 31.121 31.151 31.142 31.097 31.005 30.875 30.743 30.61 30.49 30.363 30.204 30.076 29.976 29.852 29.701 29.566 29.424 29.269 29.144 29.016 28.883 28.74 28.576 28.454 28.327 28.136 27.992 27.837 27.757 27.588 27.423 27.23 27.121 26.936 26.761 26.621 26.484 26.168 25.999 25.824 25.63 25.366 24.995 24.45 19.025 -3 ,7349 ,KEBNE ,17042273,Thu Dec 23 04:21:53 CET,Thu Dec 23 05:53:14 CET,0.0 0.545 0.782 0.979 1.17 1.36 1.549 1.713 2.0 2.139 2.271 2.409 2.65 2.764 2.989 3.21 3.418 3.525 3.735 3.929 4.202 4.381 4.558 4.823 5.085 5.342 5.582 5.809 6.108 6.408 6.7 7.057 7.416 7.771 8.188 8.668 9.135 9.643 10.2 10.786 11.418 12.167 13.03 13.884 14.907 16.04 17.346 18.883 20.75 22.993 25.685 27.956 29.27 30.104 30.637 30.972 31.141 31.182 31.185 31.163 31.078 30.981 30.892 30.785 30.682 30.576 30.453 30.317 30.177 30.044 29.9 29.766 29.617 29.457 29.339 29.219 29.077 28.928 28.796 28.7 28.591 28.422 28.289 28.124 28.044 27.875 27.685 27.505 27.398 27.203 27.044 26.878 26.704 26.345 26.148 25.931 25.698 25.455 25.157 24.722 21.295 -4 ,3771 ,KEBNE ,17042274,Thu Dec 23 04:21:53 CET,Thu Dec 23 05:50:18 CET,0.0 0.787 1.032 1.241 1.427 1.597 1.768 1.925 2.208 2.334 2.453 2.576 2.81 2.927 3.152 3.366 3.596 3.714 3.93 4.132 4.43 4.621 4.799 5.066 5.331 5.584 5.829 6.066 6.381 6.684 6.973 7.346 7.723 8.08 8.491 8.962 9.428 9.944 10.517 11.14 11.788 12.522 13.389 14.284 15.305 16.454 17.841 19.428 21.282 23.533 26.352 28.676 30.043 30.959 31.494 31.769 31.882 31.917 31.928 31.949 31.949 31.922 31.85 31.742 31.644 31.53 31.398 31.27 31.131 30.998 30.856 30.735 30.609 30.475 30.388 30.288 30.165 30.05 29.942 29.846 29.724 29.525 29.394 29.248 29.169 29.006 28.834 28.644 28.539 28.361 28.247 28.13 27.999 27.727 27.565 27.353 27.103 26.803 26.437 25.909 22.058 -5 ,14922 ,KEBNE ,17042275,Thu Dec 23 04:21:53 CET,Thu Dec 23 05:50:02 CET,0.0 0.555 0.802 0.998 1.184 1.365 1.529 1.69 1.998 2.144 2.285 2.432 2.678 2.798 3.023 3.244 3.446 3.545 3.753 3.959 4.254 4.443 4.631 4.924 5.204 5.465 5.724 5.979 6.319 6.651 6.972 7.359 7.738 8.117 8.557 9.059 9.557 10.111 10.71 11.335 11.989 12.77 13.689 14.626 15.746 16.928 18.277 19.854 21.723 24.043 26.944 29.27 30.548 31.328 31.826 32.106 32.231 32.22 32.14 32.051 31.959 31.869 31.761 31.636 31.528 31.432 31.32 31.203 31.085 30.953 30.788 30.64 30.491 30.333 30.207 30.083 29.943 29.786 29.614 29.488 29.366 29.17 29.038 28.896 28.817 28.638 28.438 28.241 28.129 27.92 27.734 27.584 27.438 27.146 26.961 26.749 26.511 26.177 25.806 25.362 20.34 -6 ,26669 ,KEBNE ,17042276,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:52:12 CET,0.0 0.995 1.376 1.681 1.928 2.127 2.291 2.435 2.757 2.915 3.063 3.228 3.475 3.602 3.853 4.093 4.324 4.438 4.652 4.859 5.186 5.404 5.598 5.852 6.103 6.362 6.612 6.853 7.176 7.49 7.795 8.181 8.558 8.928 9.356 9.841 10.302 10.802 11.363 11.967 12.631 13.435 14.359 15.223 16.247 17.44 18.817 20.444 22.432 24.832 27.852 30.171 31.45 32.355 32.844 33.034 33.057 33.007 32.94 32.896 32.864 32.783 32.695 32.603 32.495 32.398 32.298 32.207 32.119 32.012 31.905 31.791 31.643 31.504 31.398 31.269 31.133 30.995 30.83 30.721 30.626 30.463 30.34 30.213 30.151 30.011 29.838 29.67 29.572 29.364 29.194 29.072 28.95 28.647 28.457 28.254 28.021 27.711 27.276 26.622 22.565 -7 ,8799 ,KEBNE ,17042277,Thu Dec 23 04:21:51 CET,Thu Dec 23 05:52:27 CET,0.0 0.626 0.928 1.142 1.344 1.538 1.705 1.856 2.145 2.28 2.404 2.544 2.783 2.898 3.127 3.35 3.563 3.662 3.86 4.069 4.385 4.586 4.778 5.053 5.326 5.598 5.864 6.123 6.453 6.781 7.107 7.489 7.854 8.216 8.638 9.124 9.598 10.132 10.736 11.382 12.073 12.887 13.876 14.853 15.997 17.335 18.868 20.563 22.518 24.802 27.496 29.709 30.97 31.677 32.113 32.405 32.594 32.699 32.722 32.713 32.689 32.648 32.566 32.46 32.335 32.2 32.074 31.948 31.823 31.682 31.538 31.41 31.27 31.13 31.011 30.891 30.763 30.608 30.444 30.335 30.234 30.068 29.926 29.778 29.71 29.561 29.397 29.23 29.129 28.932 28.784 28.643 28.477 28.154 27.976 27.767 27.512 27.229 26.895 26.394 24.174 -8 ,16226 ,KEBNE ,17042278,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:50:25 CET,0.0 0.635 0.92 1.109 1.302 1.477 1.624 1.77 2.056 2.193 2.345 2.524 2.762 2.884 3.104 3.309 3.521 3.623 3.81 3.996 4.266 4.443 4.621 4.877 5.122 5.35 5.582 5.824 6.143 6.459 6.777 7.177 7.584 7.98 8.437 8.95 9.44 9.996 10.614 11.292 12.004 12.821 13.765 14.653 15.689 16.883 18.289 19.918 21.932 24.245 26.946 29.324 30.632 31.298 31.735 32.079 32.193 32.189 32.169 32.135 32.123 32.096 32.029 31.938 31.844 31.771 31.683 31.571 31.447 31.311 31.173 31.056 30.93 30.818 30.731 30.624 30.494 30.353 30.215 30.114 30.009 29.827 29.687 29.543 29.47 29.322 29.141 28.897 28.766 28.568 28.44 28.314 28.158 27.8 27.618 27.429 27.209 26.947 26.638 26.174 21.38 -9 ,11635 ,KEBNE ,17042279,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:50:38 CET,0.0 0.613 0.856 1.046 1.228 1.41 1.577 1.718 1.981 2.123 2.266 2.406 2.637 2.76 3.001 3.221 3.437 3.534 3.734 3.936 4.219 4.411 4.598 4.858 5.098 5.336 5.581 5.822 6.14 6.43 6.701 7.039 7.368 7.708 8.132 8.59 9.037 9.563 10.127 10.733 11.387 12.142 13.044 13.943 14.977 16.147 17.563 19.18 21.054 23.294 26.044 28.162 29.274 29.989 30.42 30.65 30.75 30.782 30.789 30.76 30.708 30.646 30.552 30.448 30.357 30.263 30.151 30.044 29.955 29.846 29.701 29.578 29.465 29.354 29.241 29.098 28.956 28.789 28.596 28.46 28.331 28.147 28.012 27.881 27.81 27.649 27.479 27.314 27.225 27.041 26.896 26.771 26.626 26.304 26.108 25.907 25.688 25.403 25.053 24.518 19.806 -10 ,5480 ,KEBNE ,17042280,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:51:55 CET,0.0 0.57 0.79 0.969 1.161 1.346 1.514 1.672 1.957 2.086 2.209 2.344 2.575 2.696 2.938 3.167 3.383 3.488 3.696 3.898 4.183 4.36 4.534 4.778 5.013 5.256 5.506 5.746 6.05 6.348 6.644 7.006 7.364 7.726 8.149 8.634 9.109 9.631 10.221 10.886 11.598 12.407 13.338 14.254 15.355 16.623 18.127 19.808 21.803 24.172 26.923 29.09 30.299 31.06 31.509 31.752 31.862 31.923 31.955 31.892 31.816 31.791 31.735 31.629 31.53 31.431 31.325 31.222 31.122 31.009 30.885 30.782 30.646 30.494 30.378 30.259 30.129 29.995 29.849 29.744 29.629 29.425 29.287 29.158 29.089 28.947 28.775 28.565 28.454 28.258 28.112 27.98 27.823 27.506 27.365 27.191 26.949 26.681 26.396 25.934 21.009 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_27_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_27_25.txt deleted file mode 100644 index 4ba646a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_27_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1149 ,KEBNE ,16654011,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:34:22 CET,0.0 0.882 1.086 1.208 1.304 1.397 1.511 1.636 1.86 1.959 2.06 2.12 2.31 2.379 2.519 2.639 2.744 2.796 2.906 3.013 3.165 3.266 3.36 3.473 3.577 3.685 3.779 3.872 3.978 4.06 4.149 4.265 4.379 4.48 4.571 4.668 4.762 4.868 4.989 5.096 5.174 5.206 5.209 5.208 5.163 5.043 4.872 4.557 3.906 2.829 0.835 -1.781 -3.929 -5.722 -7.242 -8.535 -9.602 -10.53 -11.342 -12.141 -12.821 -13.439 -14.013 -14.532 -15.016 -15.451 -15.896 -16.281 -16.595 -16.95 -17.348 -17.677 -18.007 -18.338 -18.595 -18.864 -19.145 -19.431 -19.719 -19.914 -20.131 -20.494 -20.731 -20.964 -21.076 -21.321 -21.592 -21.871 -22.017 -22.297 -22.504 -22.675 -22.84 -23.216 -23.429 -23.668 -23.939 -24.233 -24.621 -25.151 -27.66 -2 ,12574 ,KEBNE ,16654012,Mon Nov 22 05:08:25 CET,Mon Nov 22 06:33:22 CET,0.0 0.825 1.126 1.302 1.461 1.633 1.786 1.9 2.122 2.221 2.298 2.344 2.547 2.622 2.756 2.88 2.995 3.043 3.126 3.217 3.365 3.445 3.529 3.658 3.778 3.891 3.982 4.07 4.196 4.326 4.453 4.61 4.74 4.854 4.998 5.148 5.281 5.434 5.598 5.74 5.877 5.983 5.999 5.994 6.022 6.043 5.936 5.65 5.083 4.088 2.399 0.147 -1.924 -3.695 -5.166 -6.443 -7.503 -8.462 -9.288 -10.11 -10.805 -11.407 -11.96 -12.477 -12.986 -13.434 -13.903 -14.326 -14.687 -15.053 -15.439 -15.777 -16.126 -16.476 -16.746 -17.015 -17.274 -17.553 -17.856 -18.071 -18.298 -18.643 -18.874 -19.138 -19.269 -19.516 -19.79 -20.044 -20.179 -20.462 -20.653 -20.83 -21.013 -21.382 -21.586 -21.815 -22.075 -22.376 -22.718 -23.258 -25.433 -3 ,22233 ,KEBNE ,16654013,Mon Nov 22 05:08:26 CET,Mon Nov 22 06:32:52 CET,0.0 1.084 1.305 1.45 1.586 1.717 1.832 1.927 2.08 2.139 2.196 2.227 2.403 2.461 2.589 2.707 2.815 2.868 2.96 3.04 3.174 3.264 3.342 3.45 3.554 3.665 3.765 3.847 3.953 4.05 4.143 4.251 4.371 4.476 4.589 4.751 4.86 4.94 5.033 5.112 5.152 5.186 5.235 5.237 5.193 5.089 4.874 4.514 3.878 2.774 0.772 -1.747 -3.867 -5.634 -7.117 -8.422 -9.547 -10.607 -11.506 -12.345 -13.059 -13.69 -14.277 -14.83 -15.369 -15.848 -16.321 -16.75 -17.104 -17.457 -17.842 -18.178 -18.509 -18.851 -19.127 -19.396 -19.676 -19.97 -20.262 -20.465 -20.68 -21.021 -21.262 -21.517 -21.645 -21.905 -22.198 -22.531 -22.696 -22.988 -23.224 -23.429 -23.651 -24.092 -24.306 -24.548 -24.828 -25.126 -25.481 -25.921 -28.274 -4 ,8430 ,KEBNE ,16654014,Mon Nov 22 05:08:26 CET,Mon Nov 22 06:33:09 CET,0.0 1.264 1.543 1.777 1.961 2.081 2.179 2.284 2.502 2.595 2.68 2.736 2.935 3.018 3.167 3.302 3.427 3.486 3.612 3.742 3.922 4.029 4.126 4.269 4.409 4.534 4.636 4.731 4.872 5.004 5.133 5.285 5.42 5.55 5.684 5.829 5.979 6.132 6.283 6.438 6.592 6.747 6.927 7.047 7.027 6.892 6.662 6.309 5.694 4.586 2.647 0.237 -1.827 -3.56 -5.007 -6.284 -7.371 -8.37 -9.234 -10.092 -10.798 -11.425 -12.032 -12.576 -13.066 -13.537 -14.036 -14.469 -14.833 -15.209 -15.619 -15.937 -16.251 -16.596 -16.883 -17.173 -17.458 -17.763 -18.08 -18.292 -18.508 -18.826 -19.046 -19.277 -19.389 -19.626 -19.885 -20.176 -20.339 -20.646 -20.887 -21.079 -21.29 -21.736 -21.992 -22.295 -22.624 -22.954 -23.311 -23.757 -25.61 -5 ,32128 ,KEBNE ,16654015,Mon Nov 22 05:08:26 CET,Mon Nov 22 06:32:52 CET,0.0 1.433 1.745 1.947 2.111 2.277 2.425 2.564 2.826 2.926 3.017 3.072 3.271 3.356 3.501 3.641 3.782 3.85 3.97 4.071 4.218 4.316 4.419 4.562 4.688 4.819 4.94 5.049 5.177 5.303 5.427 5.557 5.68 5.801 5.937 6.103 6.256 6.388 6.515 6.654 6.787 6.951 7.131 7.287 7.464 7.553 7.545 7.437 7.108 6.277 4.476 2.192 0.284 -1.35 -2.765 -4.021 -5.113 -6.085 -6.899 -7.709 -8.412 -9.045 -9.635 -10.175 -10.673 -11.111 -11.576 -11.985 -12.319 -12.652 -13.002 -13.295 -13.596 -13.921 -14.177 -14.445 -14.715 -14.984 -15.28 -15.503 -15.724 -16.044 -16.267 -16.501 -16.617 -16.841 -17.098 -17.392 -17.549 -17.852 -18.057 -18.223 -18.386 -18.735 -18.952 -19.223 -19.54 -19.881 -20.261 -20.829 -23.659 -6 ,25059 ,KEBNE ,16654016,Mon Nov 22 05:09:27 CET,Mon Nov 22 06:33:57 CET,0.0 1.391 1.621 1.816 1.978 2.129 2.262 2.377 2.584 2.664 2.734 2.765 2.94 2.99 3.089 3.197 3.302 3.353 3.463 3.558 3.65 3.706 3.763 3.859 3.959 4.058 4.156 4.244 4.351 4.435 4.508 4.613 4.714 4.819 4.938 5.055 5.171 5.296 5.412 5.519 5.64 5.773 5.891 5.947 5.939 5.891 5.693 5.302 4.665 3.575 1.597 -0.856 -2.871 -4.603 -6.08 -7.311 -8.365 -9.327 -10.129 -10.923 -11.624 -12.267 -12.867 -13.411 -13.908 -14.363 -14.877 -15.341 -15.728 -16.11 -16.478 -16.803 -17.141 -17.477 -17.74 -18.008 -18.274 -18.536 -18.811 -19.004 -19.204 -19.514 -19.732 -19.955 -20.071 -20.328 -20.61 -20.907 -21.054 -21.346 -21.594 -21.779 -21.951 -22.298 -22.504 -22.777 -23.072 -23.333 -23.66 -24.214 -26.793 -7 ,23173 ,KEBNE ,16654017,Mon Nov 22 05:09:27 CET,Mon Nov 22 06:35:23 CET,0.0 1.077 1.323 1.465 1.592 1.706 1.814 1.909 2.076 2.154 2.229 2.262 2.447 2.522 2.677 2.817 2.948 3.026 3.168 3.286 3.445 3.539 3.627 3.749 3.868 3.981 4.091 4.2 4.329 4.457 4.585 4.745 4.893 5.018 5.144 5.278 5.391 5.475 5.557 5.639 5.686 5.741 5.815 5.829 5.801 5.696 5.477 5.193 4.696 3.657 1.774 -0.659 -2.706 -4.473 -5.952 -7.253 -8.387 -9.407 -10.261 -11.037 -11.746 -12.391 -12.959 -13.522 -14.052 -14.516 -15.0 -15.415 -15.77 -16.154 -16.556 -16.888 -17.217 -17.534 -17.767 -18.015 -18.283 -18.557 -18.822 -19.003 -19.196 -19.502 -19.718 -19.936 -20.057 -20.331 -20.603 -20.875 -21.009 -21.281 -21.476 -21.643 -21.808 -22.167 -22.384 -22.619 -22.863 -23.169 -23.523 -23.982 -26.507 -8 ,24563 ,KEBNE ,16654018,Mon Nov 22 05:09:27 CET,Mon Nov 22 06:34:10 CET,0.0 0.583 0.854 1.051 1.229 1.381 1.501 1.598 1.77 1.848 1.916 1.944 2.125 2.183 2.307 2.445 2.568 2.629 2.757 2.872 3.017 3.118 3.213 3.344 3.478 3.596 3.709 3.823 3.958 4.09 4.204 4.326 4.455 4.576 4.716 4.875 5.021 5.176 5.322 5.448 5.523 5.553 5.583 5.623 5.679 5.634 5.4 4.964 4.25 3.136 1.262 -1.079 -3.048 -4.714 -6.143 -7.427 -8.528 -9.48 -10.332 -11.181 -11.869 -12.478 -13.062 -13.62 -14.127 -14.578 -15.055 -15.489 -15.851 -16.206 -16.568 -16.874 -17.189 -17.511 -17.745 -17.979 -18.243 -18.519 -18.787 -18.979 -19.188 -19.517 -19.742 -19.983 -20.113 -20.375 -20.608 -20.851 -20.992 -21.26 -21.404 -21.543 -21.691 -22.049 -22.27 -22.522 -22.789 -23.057 -23.39 -23.965 -26.958 -9 ,4071 ,KEBNE ,16654019,Mon Nov 22 05:09:27 CET,Mon Nov 22 06:34:09 CET,0.0 1.26 1.458 1.624 1.782 1.923 2.038 2.143 2.309 2.379 2.453 2.481 2.663 2.729 2.847 2.965 3.081 3.137 3.246 3.347 3.485 3.573 3.664 3.796 3.909 4.028 4.154 4.27 4.401 4.516 4.631 4.78 4.911 5.01 5.106 5.197 5.276 5.338 5.403 5.499 5.609 5.695 5.726 5.724 5.67 5.561 5.398 5.107 4.487 3.357 1.303 -1.268 -3.357 -5.095 -6.551 -7.881 -9.085 -10.107 -10.913 -11.712 -12.392 -12.977 -13.547 -14.098 -14.613 -15.076 -15.546 -15.97 -16.339 -16.714 -17.091 -17.401 -17.709 -18.028 -18.263 -18.5 -18.781 -19.065 -19.326 -19.507 -19.71 -20.037 -20.265 -20.487 -20.599 -20.832 -21.063 -21.322 -21.478 -21.777 -21.953 -22.108 -22.281 -22.684 -22.903 -23.121 -23.36 -23.654 -24.046 -24.565 -27.023 -10 ,28462 ,KEBNE ,16654020,Mon Nov 22 05:09:27 CET,Mon Nov 22 06:33:53 CET,0.0 1.127 1.404 1.58 1.719 1.868 2.027 2.182 2.448 2.553 2.647 2.711 2.902 2.974 3.114 3.258 3.386 3.449 3.592 3.721 3.876 3.982 4.084 4.22 4.335 4.437 4.531 4.624 4.768 4.907 5.039 5.188 5.312 5.433 5.575 5.721 5.85 5.958 6.053 6.15 6.213 6.245 6.28 6.293 6.251 6.146 5.897 5.529 4.938 3.882 2.029 -0.366 -2.461 -4.258 -5.741 -6.979 -8.053 -9.003 -9.851 -10.727 -11.434 -12.033 -12.646 -13.227 -13.709 -14.146 -14.618 -15.025 -15.356 -15.701 -16.057 -16.359 -16.67 -16.984 -17.244 -17.504 -17.772 -18.052 -18.343 -18.533 -18.718 -19.035 -19.271 -19.505 -19.616 -19.852 -20.107 -20.373 -20.512 -20.792 -20.96 -21.118 -21.298 -21.711 -21.932 -22.18 -22.467 -22.787 -23.152 -23.652 -25.815 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_28_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_28_21.txt deleted file mode 100644 index 7a00d0da..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_28_21.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5543 ,KEBNE ,16654021,Mon Nov 22 05:09:27 CET,Mon Nov 22 06:35:32 CET,0.0 0.955 1.184 1.349 1.486 1.6 1.719 1.83 1.995 2.068 2.146 2.24 2.367 2.434 2.554 2.668 2.774 2.822 2.904 2.989 3.117 3.195 3.27 3.375 3.469 3.556 3.644 3.731 3.834 3.921 3.988 4.067 4.156 4.236 4.324 4.418 4.504 4.603 4.698 4.788 4.868 4.908 4.937 4.959 4.928 4.837 4.686 4.446 4.002 3.18 1.567 -0.485 -2.176 -3.62 -4.868 -5.986 -6.948 -7.788 -8.525 -9.284 -9.918 -10.473 -10.996 -11.485 -11.93 -12.328 -12.725 -13.081 -13.405 -13.765 -14.13 -14.417 -14.725 -15.033 -15.263 -15.486 -15.732 -15.985 -16.244 -16.422 -16.597 -16.9 -17.126 -17.349 -17.454 -17.653 -17.848 -18.047 -18.145 -18.32 -18.475 -18.592 -18.713 -18.968 -19.116 -19.271 -19.429 -19.621 -19.884 -20.273 -21.679 -2 ,22885 ,KEBNE ,16654022,Mon Nov 22 05:09:27 CET,Mon Nov 22 06:34:13 CET,0.0 1.136 1.353 1.535 1.684 1.79 1.873 1.962 2.142 2.214 2.287 2.371 2.478 2.529 2.633 2.734 2.822 2.861 2.956 3.048 3.154 3.218 3.281 3.364 3.439 3.511 3.573 3.631 3.713 3.794 3.868 3.947 4.014 4.074 4.159 4.264 4.345 4.418 4.48 4.532 4.591 4.644 4.653 4.628 4.575 4.504 4.404 4.115 3.516 2.616 1.037 -1.081 -2.844 -4.324 -5.635 -6.764 -7.703 -8.55 -9.294 -10.049 -10.687 -11.246 -11.772 -12.263 -12.73 -13.158 -13.583 -13.941 -14.257 -14.593 -14.931 -15.201 -15.489 -15.79 -16.006 -16.216 -16.425 -16.649 -16.882 -17.047 -17.215 -17.464 -17.631 -17.803 -17.897 -18.088 -18.282 -18.498 -18.624 -18.831 -19.056 -19.201 -19.324 -19.578 -19.712 -19.845 -19.995 -20.151 -20.337 -20.649 -22.107 -3 ,29245 ,KEBNE ,16654023,Mon Nov 22 05:09:27 CET,Mon Nov 22 06:34:02 CET,0.0 0.611 0.819 0.98 1.14 1.267 1.367 1.448 1.592 1.669 1.744 1.818 1.928 1.993 2.116 2.211 2.301 2.35 2.435 2.498 2.598 2.659 2.717 2.812 2.907 2.993 3.069 3.15 3.256 3.353 3.437 3.526 3.605 3.687 3.774 3.861 3.958 4.054 4.14 4.204 4.257 4.308 4.353 4.366 4.334 4.251 4.085 3.832 3.389 2.573 1.077 -0.872 -2.568 -4.032 -5.313 -6.461 -7.46 -8.336 -9.086 -9.841 -10.489 -11.051 -11.553 -12.025 -12.467 -12.855 -13.251 -13.607 -13.92 -14.255 -14.602 -14.889 -15.187 -15.483 -15.703 -15.946 -16.226 -16.519 -16.799 -16.978 -17.162 -17.449 -17.654 -17.86 -17.966 -18.194 -18.425 -18.684 -18.807 -18.995 -19.184 -19.314 -19.438 -19.711 -19.885 -20.102 -20.342 -20.611 -20.909 -21.251 -22.471 -4 ,30153 ,KEBNE ,16654024,Mon Nov 22 05:09:27 CET,Mon Nov 22 06:34:02 CET,0.0 1.151 1.46 1.627 1.747 1.862 1.96 2.049 2.189 2.253 2.326 2.407 2.522 2.577 2.68 2.786 2.882 2.931 3.024 3.113 3.237 3.301 3.36 3.448 3.533 3.632 3.724 3.802 3.9 3.985 4.065 4.157 4.227 4.287 4.368 4.456 4.536 4.614 4.692 4.769 4.834 4.877 4.916 4.93 4.882 4.769 4.604 4.32 3.774 2.859 1.16 -0.997 -2.783 -4.25 -5.476 -6.573 -7.494 -8.276 -8.969 -9.693 -10.291 -10.802 -11.298 -11.763 -12.195 -12.587 -12.987 -13.328 -13.626 -13.937 -14.248 -14.507 -14.779 -15.056 -15.273 -15.501 -15.725 -15.954 -16.199 -16.357 -16.518 -16.779 -16.96 -17.137 -17.226 -17.412 -17.601 -17.81 -17.938 -18.161 -18.357 -18.476 -18.604 -18.856 -18.997 -19.148 -19.303 -19.49 -19.707 -19.952 -20.878 -6 ,19496 ,KEBNE ,16654026,Mon Nov 22 05:10:29 CET,Mon Nov 22 06:35:12 CET,0.0 0.769 0.999 1.162 1.284 1.404 1.525 1.64 1.823 1.891 1.958 2.021 2.126 2.179 2.286 2.381 2.474 2.524 2.619 2.697 2.801 2.877 2.952 3.055 3.151 3.245 3.335 3.409 3.491 3.566 3.642 3.731 3.817 3.909 3.996 4.081 4.165 4.227 4.294 4.366 4.409 4.456 4.502 4.502 4.46 4.342 4.151 3.88 3.403 2.55 0.985 -1.075 -2.846 -4.365 -5.637 -6.755 -7.722 -8.559 -9.279 -10.002 -10.621 -11.175 -11.703 -12.185 -12.631 -13.039 -13.455 -13.816 -14.132 -14.475 -14.826 -15.108 -15.392 -15.693 -15.928 -16.158 -16.386 -16.629 -16.907 -17.097 -17.277 -17.545 -17.727 -17.924 -18.025 -18.23 -18.455 -18.705 -18.827 -19.014 -19.187 -19.311 -19.435 -19.706 -19.856 -20.022 -20.205 -20.393 -20.617 -20.895 -21.702 -7 ,18806 ,KEBNE ,16654027,Mon Nov 22 05:10:29 CET,Mon Nov 22 06:35:28 CET,0.0 1.02 1.208 1.36 1.487 1.603 1.709 1.808 1.999 2.088 2.172 2.258 2.375 2.421 2.504 2.591 2.679 2.725 2.805 2.874 2.986 3.06 3.13 3.234 3.329 3.422 3.509 3.588 3.701 3.792 3.871 3.975 4.083 4.175 4.248 4.314 4.375 4.449 4.516 4.555 4.599 4.631 4.652 4.654 4.59 4.471 4.294 3.992 3.475 2.612 1.056 -0.956 -2.689 -4.112 -5.31 -6.419 -7.372 -8.195 -8.882 -9.57 -10.173 -10.716 -11.21 -11.656 -12.084 -12.481 -12.906 -13.264 -13.539 -13.828 -14.134 -14.379 -14.631 -14.903 -15.115 -15.328 -15.547 -15.767 -15.994 -16.151 -16.308 -16.563 -16.746 -16.929 -17.017 -17.194 -17.381 -17.577 -17.697 -17.906 -18.145 -18.307 -18.461 -18.803 -18.978 -19.137 -19.32 -19.527 -19.745 -20.106 -21.292 -9 ,13741 ,KEBNE ,16654029,Mon Nov 22 05:10:29 CET,Mon Nov 22 06:35:20 CET,0.0 0.914 1.219 1.453 1.637 1.788 1.925 2.056 2.278 2.368 2.462 2.573 2.692 2.757 2.877 2.986 3.09 3.137 3.224 3.314 3.443 3.523 3.605 3.718 3.815 3.91 3.99 4.059 4.149 4.234 4.312 4.4 4.491 4.571 4.654 4.755 4.844 4.932 5.01 5.071 5.134 5.196 5.226 5.236 5.214 5.102 4.909 4.639 4.145 3.234 1.583 -0.516 -2.263 -3.743 -4.996 -6.114 -7.09 -7.935 -8.643 -9.366 -9.991 -10.535 -11.059 -11.538 -11.983 -12.402 -12.817 -13.171 -13.484 -13.795 -14.099 -14.36 -14.637 -14.931 -15.166 -15.421 -15.67 -15.917 -16.187 -16.366 -16.53 -16.772 -16.944 -17.128 -17.226 -17.418 -17.607 -17.797 -17.892 -18.073 -18.219 -18.338 -18.468 -18.724 -18.852 -19.001 -19.161 -19.338 -19.577 -19.872 -20.734 -10 ,3636 ,KEBNE ,16654030,Mon Nov 22 05:10:29 CET,Mon Nov 22 06:37:07 CET,0.0 0.98 1.284 1.449 1.579 1.701 1.803 1.907 2.085 2.156 2.232 2.305 2.415 2.478 2.593 2.696 2.785 2.824 2.904 2.986 3.089 3.142 3.203 3.312 3.409 3.485 3.552 3.61 3.671 3.724 3.79 3.892 3.977 4.044 4.112 4.187 4.275 4.368 4.465 4.537 4.594 4.617 4.598 4.573 4.511 4.415 4.253 3.967 3.49 2.624 0.929 -1.179 -2.908 -4.362 -5.628 -6.79 -7.803 -8.711 -9.474 -10.18 -10.768 -11.326 -11.865 -12.349 -12.783 -13.172 -13.581 -13.941 -14.239 -14.549 -14.871 -15.138 -15.422 -15.723 -15.956 -16.176 -16.385 -16.609 -16.862 -17.033 -17.2 -17.462 -17.64 -17.815 -17.907 -18.097 -18.278 -18.472 -18.578 -18.758 -18.92 -19.04 -19.164 -19.431 -19.57 -19.726 -19.902 -20.102 -20.306 -20.566 -21.15 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_28_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_28_26.txt deleted file mode 100644 index b7c774ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_28_26.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,18364 ,KEBNE ,16654032,Mon Nov 22 05:10:29 CET,Mon Nov 22 06:35:32 CET,0.0 0.402 0.578 0.723 0.842 0.951 1.049 1.149 1.355 1.437 1.52 1.617 1.74 1.802 1.923 2.049 2.162 2.212 2.319 2.422 2.564 2.651 2.738 2.876 3.023 3.164 3.296 3.43 3.59 3.736 3.895 4.081 4.245 4.397 4.562 4.749 4.924 5.111 5.307 5.512 5.724 5.967 6.234 6.474 6.685 6.855 7.034 7.127 7.115 6.946 6.155 4.678 3.382 2.28 1.268 0.319 -0.506 -1.251 -1.888 -2.53 -3.071 -3.534 -3.96 -4.381 -4.785 -5.116 -5.453 -5.756 -6.007 -6.268 -6.541 -6.761 -6.985 -7.221 -7.403 -7.589 -7.789 -7.994 -8.194 -8.328 -8.466 -8.693 -8.844 -8.992 -9.07 -9.256 -9.461 -9.679 -9.801 -9.994 -10.16 -10.274 -10.387 -10.589 -10.682 -10.801 -10.952 -11.118 -11.302 -11.488 -11.928 -3 ,25881 ,KEBNE ,16654033,Mon Nov 22 05:10:33 CET,Mon Nov 22 06:35:41 CET,0.0 0.366 0.545 0.736 0.902 1.027 1.125 1.221 1.387 1.476 1.575 1.715 1.857 1.936 2.09 2.231 2.362 2.429 2.548 2.656 2.804 2.895 2.983 3.115 3.234 3.342 3.455 3.561 3.689 3.824 3.957 4.111 4.259 4.401 4.559 4.725 4.886 5.069 5.257 5.468 5.684 5.889 6.112 6.316 6.541 6.764 6.981 7.154 7.184 6.926 6.067 4.589 3.212 1.996 0.96 0.049 -0.779 -1.531 -2.17 -2.798 -3.347 -3.824 -4.258 -4.674 -5.065 -5.416 -5.777 -6.099 -6.371 -6.644 -6.929 -7.173 -7.425 -7.674 -7.863 -8.066 -8.273 -8.486 -8.718 -8.883 -9.052 -9.324 -9.509 -9.687 -9.773 -9.931 -10.09 -10.256 -10.341 -10.509 -10.712 -10.84 -10.974 -11.256 -11.398 -11.56 -11.744 -11.941 -12.14 -12.376 -13.163 -4 ,29626 ,KEBNE ,16654034,Mon Nov 22 05:10:29 CET,Mon Nov 22 06:35:27 CET,0.0 0.48 0.695 0.868 0.997 1.117 1.225 1.325 1.493 1.568 1.647 1.751 1.877 1.951 2.098 2.223 2.342 2.401 2.506 2.604 2.755 2.848 2.933 3.062 3.186 3.303 3.428 3.559 3.711 3.854 3.998 4.169 4.331 4.486 4.665 4.862 5.027 5.206 5.419 5.642 5.853 6.059 6.276 6.476 6.674 6.853 7.024 7.129 7.083 6.821 6.078 4.688 3.38 2.245 1.217 0.268 -0.557 -1.276 -1.889 -2.518 -3.084 -3.58 -4.046 -4.48 -4.845 -5.167 -5.508 -5.804 -6.06 -6.322 -6.59 -6.815 -7.035 -7.262 -7.439 -7.619 -7.807 -8.002 -8.202 -8.333 -8.465 -8.675 -8.835 -9.013 -9.105 -9.274 -9.434 -9.597 -9.679 -9.831 -9.955 -10.049 -10.142 -10.342 -10.448 -10.557 -10.677 -10.827 -10.988 -11.169 -11.526 -5 ,6514 ,KEBNE ,16654035,Mon Nov 22 05:11:30 CET,Mon Nov 22 06:36:42 CET,0.0 0.493 0.688 0.822 0.947 1.063 1.17 1.268 1.446 1.526 1.6 1.689 1.813 1.881 1.996 2.105 2.213 2.273 2.384 2.479 2.625 2.716 2.799 2.93 3.064 3.188 3.305 3.416 3.562 3.708 3.829 3.985 4.147 4.285 4.432 4.604 4.767 4.929 5.11 5.297 5.492 5.723 5.999 6.245 6.451 6.65 6.868 7.001 7.001 6.795 6.019 4.651 3.376 2.166 1.094 0.202 -0.571 -1.294 -1.898 -2.503 -3.042 -3.531 -4.015 -4.462 -4.841 -5.179 -5.532 -5.843 -6.114 -6.388 -6.664 -6.899 -7.162 -7.453 -7.675 -7.899 -8.133 -8.377 -8.637 -8.817 -8.983 -9.232 -9.417 -9.6 -9.688 -9.87 -10.08 -10.318 -10.431 -10.603 -10.744 -10.84 -10.932 -11.124 -11.238 -11.362 -11.482 -11.612 -11.769 -11.969 -12.398 -6 ,15197 ,KEBNE ,16654036,Mon Nov 22 05:11:31 CET,Mon Nov 22 06:36:24 CET,0.0 0.935 1.233 1.491 1.688 1.866 2.014 2.143 2.42 2.548 2.664 2.816 2.964 3.052 3.206 3.357 3.506 3.572 3.687 3.8 3.969 4.08 4.186 4.339 4.488 4.635 4.776 4.903 5.067 5.214 5.339 5.494 5.658 5.826 6.015 6.221 6.41 6.614 6.821 7.031 7.269 7.526 7.787 8.008 8.243 8.504 8.73 8.83 8.798 8.622 7.889 6.517 5.212 4.025 3.025 2.088 1.241 0.503 -0.126 -0.753 -1.288 -1.747 -2.186 -2.615 -3.0 -3.344 -3.71 -4.026 -4.298 -4.604 -4.911 -5.152 -5.407 -5.654 -5.841 -6.043 -6.254 -6.469 -6.667 -6.793 -6.933 -7.152 -7.302 -7.457 -7.536 -7.701 -7.885 -8.091 -8.188 -8.341 -8.468 -8.582 -8.705 -8.985 -9.132 -9.28 -9.434 -9.626 -9.864 -10.164 -11.035 -7 ,1826 ,KEBNE ,16654037,Mon Nov 22 05:11:30 CET,Mon Nov 22 06:36:24 CET,0.0 0.522 0.67 0.812 0.938 1.051 1.167 1.279 1.501 1.604 1.69 1.776 1.897 1.966 2.103 2.224 2.333 2.39 2.503 2.61 2.759 2.861 2.956 3.076 3.195 3.32 3.439 3.552 3.703 3.846 3.982 4.139 4.28 4.421 4.575 4.738 4.91 5.105 5.322 5.543 5.738 5.947 6.184 6.375 6.567 6.764 6.903 6.954 6.902 6.572 5.635 4.33 3.036 1.835 0.811 -0.111 -0.936 -1.682 -2.301 -2.933 -3.503 -4.002 -4.462 -4.869 -5.24 -5.598 -5.977 -6.307 -6.59 -6.871 -7.147 -7.368 -7.589 -7.818 -8.004 -8.192 -8.38 -8.572 -8.771 -8.912 -9.051 -9.262 -9.402 -9.552 -9.633 -9.808 -9.995 -10.167 -10.253 -10.404 -10.527 -10.623 -10.723 -10.948 -11.07 -11.194 -11.319 -11.465 -11.624 -11.799 -12.23 -8 ,21691 ,KEBNE ,16654038,Mon Nov 22 05:11:30 CET,Mon Nov 22 06:36:36 CET,0.0 0.293 0.439 0.58 0.724 0.858 0.977 1.083 1.253 1.333 1.414 1.511 1.634 1.707 1.846 1.967 2.086 2.144 2.249 2.35 2.493 2.59 2.684 2.831 2.978 3.121 3.266 3.403 3.567 3.711 3.856 4.041 4.207 4.355 4.527 4.717 4.895 5.076 5.267 5.469 5.679 5.911 6.165 6.369 6.604 6.832 6.95 7.034 7.046 6.785 5.814 4.304 3.013 1.831 0.765 -0.206 -1.028 -1.767 -2.407 -3.026 -3.587 -4.095 -4.553 -4.97 -5.352 -5.701 -6.046 -6.33 -6.572 -6.836 -7.118 -7.361 -7.598 -7.823 -8.0 -8.189 -8.395 -8.596 -8.785 -8.914 -9.047 -9.258 -9.404 -9.554 -9.633 -9.787 -9.942 -10.115 -10.206 -10.363 -10.49 -10.596 -10.703 -10.923 -11.033 -11.148 -11.283 -11.421 -11.585 -11.766 -12.073 -9 ,26794 ,KEBNE ,16654039,Mon Nov 22 05:11:30 CET,Mon Nov 22 06:36:24 CET,0.0 0.465 0.666 0.841 0.974 1.09 1.2 1.301 1.486 1.568 1.636 1.717 1.849 1.918 2.04 2.154 2.264 2.319 2.429 2.53 2.667 2.756 2.847 2.978 3.098 3.218 3.33 3.438 3.579 3.717 3.859 4.025 4.165 4.299 4.452 4.627 4.814 5.009 5.186 5.365 5.554 5.774 6.007 6.213 6.449 6.678 6.859 6.948 6.975 6.809 6.075 4.685 3.412 2.299 1.313 0.409 -0.412 -1.133 -1.732 -2.348 -2.89 -3.368 -3.797 -4.188 -4.555 -4.892 -5.231 -5.533 -5.814 -6.116 -6.437 -6.682 -6.911 -7.153 -7.354 -7.578 -7.802 -7.999 -8.207 -8.362 -8.516 -8.766 -8.94 -9.118 -9.206 -9.362 -9.511 -9.67 -9.757 -9.91 -10.026 -10.126 -10.226 -10.437 -10.554 -10.684 -10.83 -10.985 -11.17 -11.45 -12.317 -10 ,8676 ,KEBNE ,16654040,Mon Nov 22 05:11:30 CET,Mon Nov 22 06:36:24 CET,0.0 0.424 0.601 0.758 0.918 1.043 1.138 1.234 1.423 1.513 1.601 1.704 1.83 1.904 2.048 2.186 2.317 2.368 2.466 2.572 2.725 2.821 2.92 3.059 3.184 3.303 3.41 3.515 3.656 3.788 3.921 4.085 4.24 4.396 4.572 4.756 4.945 5.145 5.346 5.567 5.798 6.023 6.255 6.508 6.78 6.995 7.165 7.307 7.357 7.121 6.227 4.84 3.564 2.412 1.402 0.455 -0.384 -1.121 -1.749 -2.377 -2.912 -3.385 -3.833 -4.247 -4.628 -4.975 -5.348 -5.676 -5.947 -6.222 -6.489 -6.701 -6.925 -7.153 -7.327 -7.52 -7.71 -7.906 -8.121 -8.261 -8.408 -8.624 -8.763 -8.911 -8.981 -9.123 -9.283 -9.447 -9.534 -9.687 -9.789 -9.89 -9.999 -10.215 -10.327 -10.444 -10.58 -10.77 -10.979 -11.231 -12.078 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_29_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_29_25.txt deleted file mode 100644 index 06820a6d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_29_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23710 ,KEBNE ,17042281,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:52:06 CET,0.0 1.475 1.72 1.904 2.05 2.197 2.346 2.482 2.72 2.795 2.863 2.916 3.047 3.095 3.176 3.25 3.317 3.352 3.428 3.489 3.552 3.578 3.605 3.652 3.671 3.679 3.688 3.677 3.663 3.655 3.654 3.653 3.616 3.558 3.493 3.388 3.266 3.119 2.916 2.689 2.448 2.136 1.713 1.219 0.569 -0.226 -1.289 -2.737 -4.747 -7.616 -12.067 -16.967 -20.717 -23.704 -26.109 -28.115 -29.786 -31.236 -32.436 -33.591 -34.596 -35.499 -36.326 -37.075 -37.762 -38.393 -39.023 -39.572 -40.042 -40.533 -41.033 -41.434 -41.849 -42.262 -42.576 -42.906 -43.243 -43.565 -43.889 -44.123 -44.359 -44.721 -44.973 -45.231 -45.375 -45.684 -45.99 -46.286 -46.446 -46.749 -46.971 -47.166 -47.37 -47.795 -48.031 -48.315 -48.623 -48.969 -49.387 -49.934 -53.358 -2 ,14471 ,KEBNE ,17042282,Thu Dec 23 04:21:53 CET,Thu Dec 23 05:52:27 CET,0.0 1.04 1.279 1.461 1.621 1.728 1.838 1.981 2.237 2.339 2.426 2.503 2.653 2.719 2.81 2.875 2.936 2.965 3.036 3.101 3.152 3.169 3.191 3.227 3.252 3.269 3.271 3.259 3.262 3.252 3.214 3.176 3.133 3.073 3.003 2.913 2.802 2.649 2.46 2.247 2.001 1.678 1.237 0.756 0.142 -0.624 -1.655 -3.08 -5.132 -8.037 -12.57 -17.502 -21.231 -24.25 -26.686 -28.754 -30.485 -32.002 -33.243 -34.448 -35.465 -36.374 -37.222 -38.026 -38.778 -39.421 -40.071 -40.617 -41.077 -41.566 -42.088 -42.512 -42.937 -43.375 -43.709 -44.054 -44.404 -44.765 -45.15 -45.412 -45.685 -46.136 -46.437 -46.737 -46.888 -47.197 -47.534 -47.881 -48.054 -48.37 -48.623 -48.818 -49.027 -49.479 -49.738 -50.009 -50.295 -50.636 -51.051 -51.589 -53.252 -3 ,13097 ,KEBNE ,17042283,Thu Dec 23 04:21:51 CET,Thu Dec 23 05:51:37 CET,0.0 1.519 1.83 2.067 2.256 2.39 2.487 2.578 2.744 2.809 2.854 2.846 2.965 3.003 3.081 3.153 3.198 3.211 3.233 3.244 3.259 3.272 3.287 3.302 3.299 3.302 3.312 3.318 3.323 3.312 3.295 3.263 3.221 3.181 3.118 3.04 2.976 2.863 2.696 2.508 2.273 1.966 1.615 1.215 0.607 -0.167 -1.116 -2.412 -4.344 -7.217 -11.802 -16.793 -20.544 -23.498 -25.889 -27.943 -29.664 -31.154 -32.424 -33.652 -34.671 -35.553 -36.395 -37.167 -37.883 -38.551 -39.227 -39.811 -40.295 -40.78 -41.288 -41.727 -42.153 -42.567 -42.893 -43.219 -43.546 -43.889 -44.251 -44.499 -44.739 -45.108 -45.367 -45.63 -45.772 -46.071 -46.369 -46.695 -46.878 -47.188 -47.413 -47.594 -47.772 -48.168 -48.405 -48.673 -48.96 -49.267 -49.627 -50.156 -52.599 -4 ,21998 ,KEBNE ,17042284,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:50:18 CET,0.0 1.225 1.528 1.721 1.856 1.947 2.035 2.117 2.244 2.298 2.363 2.395 2.519 2.574 2.681 2.759 2.834 2.873 2.944 2.994 3.044 3.083 3.123 3.176 3.221 3.261 3.285 3.288 3.318 3.344 3.339 3.337 3.335 3.312 3.249 3.154 3.054 2.939 2.81 2.67 2.461 2.155 1.74 1.25 0.597 -0.235 -1.347 -2.816 -4.804 -7.656 -12.161 -17.078 -20.828 -23.814 -26.245 -28.283 -29.954 -31.387 -32.607 -33.811 -34.791 -35.657 -36.479 -37.222 -37.895 -38.485 -39.072 -39.597 -40.047 -40.515 -40.983 -41.35 -41.739 -42.139 -42.453 -42.777 -43.095 -43.44 -43.808 -44.044 -44.28 -44.647 -44.901 -45.147 -45.277 -45.577 -45.887 -46.196 -46.364 -46.677 -46.892 -47.069 -47.272 -47.698 -47.928 -48.201 -48.5 -48.826 -49.176 -49.738 -52.145 -5 ,26255 ,KEBNE ,17042285,Thu Dec 23 04:21:53 CET,Thu Dec 23 05:50:50 CET,0.0 1.136 1.401 1.598 1.752 1.875 1.961 2.014 2.111 2.171 2.237 2.248 2.363 2.398 2.462 2.516 2.558 2.572 2.603 2.636 2.657 2.66 2.664 2.673 2.685 2.709 2.711 2.702 2.694 2.672 2.634 2.574 2.511 2.438 2.339 2.212 2.077 1.915 1.73 1.51 1.252 0.933 0.522 0.054 -0.577 -1.384 -2.447 -3.893 -5.882 -8.676 -13.042 -17.851 -21.594 -24.605 -27.042 -29.145 -30.908 -32.4 -33.64 -34.827 -35.865 -36.811 -37.626 -38.36 -39.065 -39.724 -40.412 -41.023 -41.536 -42.023 -42.514 -42.926 -43.358 -43.815 -44.166 -44.504 -44.84 -45.19 -45.553 -45.817 -46.104 -46.548 -46.84 -47.124 -47.267 -47.595 -47.93 -48.27 -48.447 -48.761 -49.013 -49.216 -49.432 -49.905 -50.175 -50.464 -50.756 -51.069 -51.46 -51.985 -54.307 -6 ,9927 ,KEBNE ,17042286,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:50:24 CET,0.0 0.863 1.085 1.277 1.459 1.633 1.79 1.908 2.127 2.225 2.299 2.359 2.495 2.545 2.643 2.712 2.75 2.772 2.821 2.866 2.911 2.925 2.95 2.986 3.003 3.018 3.048 3.086 3.107 3.093 3.08 3.059 3.007 2.959 2.897 2.798 2.708 2.61 2.466 2.282 2.052 1.767 1.429 1.025 0.491 -0.187 -1.121 -2.477 -4.488 -7.402 -11.815 -16.562 -20.187 -23.063 -25.404 -27.399 -29.059 -30.495 -31.673 -32.83 -33.829 -34.682 -35.475 -36.217 -36.903 -37.511 -38.135 -38.67 -39.103 -39.556 -40.03 -40.406 -40.787 -41.193 -41.505 -41.821 -42.145 -42.489 -42.869 -43.133 -43.4 -43.83 -44.132 -44.439 -44.598 -44.923 -45.263 -45.632 -45.843 -46.194 -46.459 -46.666 -46.876 -47.285 -47.516 -47.779 -48.063 -48.408 -48.815 -49.346 -51.306 -7 ,8811 ,KEBNE ,17042287,Thu Dec 23 04:21:51 CET,Thu Dec 23 05:50:23 CET,0.0 0.96 1.195 1.343 1.466 1.583 1.675 1.759 1.949 2.02 2.066 2.058 2.174 2.205 2.251 2.294 2.332 2.344 2.374 2.409 2.448 2.468 2.476 2.486 2.483 2.474 2.469 2.455 2.422 2.386 2.344 2.281 2.215 2.132 2.039 1.923 1.775 1.607 1.398 1.135 0.858 0.537 0.101 -0.421 -1.088 -1.916 -2.949 -4.286 -6.263 -9.127 -13.538 -18.374 -22.047 -24.948 -27.307 -29.322 -31.045 -32.558 -33.801 -34.977 -35.959 -36.803 -37.606 -38.364 -39.046 -39.646 -40.254 -40.783 -41.235 -41.719 -42.222 -42.624 -43.042 -43.481 -43.837 -44.223 -44.602 -44.983 -45.367 -45.622 -45.878 -46.267 -46.541 -46.828 -46.981 -47.28 -47.594 -47.952 -48.13 -48.446 -48.703 -48.905 -49.124 -49.568 -49.837 -50.153 -50.49 -50.889 -51.368 -52.018 -54.647 -8 ,7408 ,KEBNE ,17042288,Thu Dec 23 04:21:51 CET,Thu Dec 23 05:50:31 CET,0.0 1.571 1.938 2.165 2.357 2.529 2.653 2.764 2.972 3.057 3.13 3.194 3.33 3.375 3.482 3.575 3.655 3.685 3.708 3.722 3.749 3.762 3.774 3.787 3.791 3.787 3.784 3.771 3.757 3.747 3.716 3.655 3.582 3.515 3.429 3.336 3.242 3.087 2.894 2.661 2.389 2.073 1.646 1.161 0.534 -0.284 -1.396 -2.865 -4.885 -7.826 -12.433 -17.471 -21.293 -24.335 -26.834 -28.966 -30.696 -32.168 -33.389 -34.551 -35.524 -36.373 -37.154 -37.875 -38.539 -39.155 -39.771 -40.291 -40.745 -41.229 -41.732 -42.131 -42.531 -42.931 -43.229 -43.531 -43.855 -44.197 -44.554 -44.797 -45.056 -45.477 -45.781 -46.094 -46.237 -46.515 -46.818 -47.172 -47.353 -47.66 -47.9 -48.113 -48.339 -48.796 -49.059 -49.352 -49.647 -49.958 -50.369 -50.911 -54.199 -9 ,14481 ,KEBNE ,17042289,Thu Dec 23 04:21:53 CET,Thu Dec 23 05:50:31 CET,0.0 0.928 1.181 1.419 1.615 1.723 1.819 1.912 2.03 2.078 2.122 2.105 2.212 2.244 2.314 2.363 2.406 2.425 2.455 2.493 2.549 2.584 2.617 2.641 2.662 2.685 2.708 2.721 2.701 2.665 2.625 2.577 2.513 2.428 2.338 2.219 2.092 1.94 1.747 1.518 1.222 0.845 0.385 -0.123 -0.775 -1.605 -2.757 -4.248 -6.244 -9.105 -13.498 -18.326 -21.991 -24.932 -27.352 -29.367 -31.026 -32.443 -33.611 -34.795 -35.784 -36.605 -37.388 -38.119 -38.781 -39.39 -40.023 -40.576 -41.051 -41.548 -42.066 -42.472 -42.874 -43.303 -43.626 -43.954 -44.308 -44.675 -45.036 -45.284 -45.557 -45.988 -46.275 -46.576 -46.737 -47.069 -47.391 -47.71 -47.889 -48.21 -48.467 -48.676 -48.886 -49.319 -49.545 -49.806 -50.12 -50.491 -50.903 -51.425 -53.742 -10 ,15343 ,KEBNE ,17042290,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:51:44 CET,0.0 1.412 1.696 1.887 2.044 2.164 2.259 2.341 2.464 2.51 2.553 2.551 2.67 2.711 2.772 2.812 2.853 2.876 2.908 2.942 2.985 2.998 3.015 3.042 3.052 3.05 3.035 3.024 3.019 2.999 2.972 2.931 2.889 2.841 2.758 2.663 2.556 2.405 2.224 1.993 1.725 1.41 1.037 0.66 0.176 -0.465 -1.431 -2.793 -4.731 -7.537 -12.015 -17.012 -20.729 -23.65 -26.047 -28.07 -29.742 -31.208 -32.408 -33.587 -34.597 -35.478 -36.297 -37.025 -37.702 -38.303 -38.922 -39.484 -39.964 -40.461 -40.952 -41.355 -41.771 -42.173 -42.46 -42.758 -43.083 -43.439 -43.814 -44.055 -44.296 -44.679 -44.944 -45.214 -45.351 -45.625 -45.91 -46.224 -46.387 -46.692 -46.923 -47.1 -47.3 -47.767 -48.01 -48.275 -48.57 -48.909 -49.344 -49.929 -51.613 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_29_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_29_33.txt deleted file mode 100644 index 57b3a133..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_29_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16949 ,KEBNE ,17042291,Thu Dec 23 04:21:53 CET,Thu Dec 23 05:50:43 CET,0.0 0.395 0.564 0.716 0.845 0.954 1.058 1.166 1.373 1.458 1.539 1.619 1.777 1.855 1.997 2.135 2.262 2.317 2.435 2.556 2.725 2.832 2.94 3.103 3.254 3.401 3.547 3.685 3.871 4.057 4.239 4.449 4.629 4.806 5.03 5.289 5.537 5.807 6.12 6.453 6.786 7.172 7.608 8.037 8.559 9.193 9.904 10.653 11.551 12.572 13.692 14.46 14.727 14.824 14.839 14.706 14.497 14.316 14.186 14.029 13.861 13.675 13.49 13.323 13.151 12.984 12.798 12.624 12.483 12.339 12.179 12.03 11.878 11.716 11.578 11.433 11.276 11.119 10.974 10.874 10.762 10.602 10.483 10.343 10.268 10.118 9.96 9.777 9.683 9.511 9.359 9.24 9.104 8.8 8.623 8.424 8.22 8.023 7.795 7.468 6.367 -2 ,32454 ,KEBNE ,17042292,Thu Dec 23 04:21:53 CET,Thu Dec 23 05:51:06 CET,0.0 0.536 0.75 0.886 1.009 1.128 1.23 1.324 1.484 1.563 1.658 1.77 1.93 1.998 2.128 2.263 2.396 2.46 2.589 2.73 2.918 3.03 3.146 3.312 3.473 3.639 3.794 3.936 4.126 4.318 4.499 4.717 4.915 5.104 5.333 5.584 5.827 6.11 6.412 6.723 7.061 7.456 7.932 8.421 9.007 9.688 10.406 11.076 11.844 12.821 13.972 14.641 14.854 14.894 14.786 14.629 14.436 14.222 14.019 13.813 13.646 13.491 13.346 13.19 13.015 12.85 12.676 12.51 12.366 12.222 12.058 11.915 11.778 11.634 11.515 11.397 11.255 11.094 10.941 10.835 10.718 10.508 10.365 10.233 10.17 10.023 9.857 9.696 9.609 9.457 9.344 9.224 9.101 8.852 8.716 8.565 8.381 8.153 7.9 7.545 6.31 -3 ,25799 ,KEBNE ,17042293,Thu Dec 23 04:21:53 CET,Thu Dec 23 05:52:10 CET,0.0 0.394 0.612 0.768 0.873 0.972 1.075 1.183 1.378 1.462 1.553 1.657 1.822 1.893 2.032 2.18 2.316 2.38 2.506 2.629 2.81 2.923 3.043 3.208 3.368 3.521 3.657 3.786 3.96 4.137 4.313 4.53 4.735 4.935 5.176 5.444 5.696 5.96 6.254 6.609 6.994 7.401 7.845 8.273 8.806 9.458 10.185 10.967 11.88 12.885 13.902 14.646 15.053 15.2 15.18 15.07 14.923 14.726 14.51 14.313 14.141 13.967 13.798 13.639 13.476 13.33 13.171 13.011 12.862 12.716 12.563 12.421 12.27 12.116 12.005 11.891 11.76 11.608 11.453 11.352 11.232 11.025 10.886 10.756 10.697 10.581 10.454 10.315 10.243 10.097 9.998 9.905 9.806 9.621 9.517 9.396 9.23 9.01 8.759 8.446 7.232 -4 ,30708 ,KEBNE ,17042294,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:52:53 CET,0.0 0.499 0.705 0.848 0.957 1.055 1.152 1.253 1.422 1.507 1.592 1.659 1.806 1.869 1.997 2.119 2.241 2.297 2.406 2.516 2.678 2.786 2.891 3.046 3.192 3.321 3.441 3.567 3.735 3.903 4.084 4.314 4.522 4.718 4.94 5.188 5.446 5.738 6.067 6.416 6.771 7.17 7.64 8.129 8.71 9.37 10.124 10.942 11.868 12.798 13.735 14.313 14.483 14.481 14.407 14.245 14.066 13.907 13.731 13.549 13.403 13.268 13.113 12.938 12.779 12.633 12.473 12.326 12.203 12.084 11.943 11.812 11.662 11.509 11.4 11.282 11.148 11.01 10.862 10.749 10.631 10.461 10.341 10.221 10.16 10.031 9.903 9.767 9.693 9.542 9.424 9.312 9.205 8.983 8.858 8.721 8.56 8.362 8.112 7.746 6.312 -5 ,19879 ,KEBNE ,17042295,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:52:13 CET,0.0 0.436 0.595 0.727 0.854 0.974 1.07 1.161 1.384 1.49 1.574 1.649 1.801 1.882 2.039 2.177 2.301 2.36 2.48 2.598 2.784 2.909 3.033 3.223 3.402 3.567 3.736 3.898 4.1 4.295 4.489 4.716 4.939 5.175 5.434 5.701 5.962 6.264 6.593 6.919 7.276 7.69 8.157 8.649 9.227 9.892 10.682 11.524 12.452 13.508 14.675 15.37 15.567 15.604 15.543 15.383 15.255 15.132 14.983 14.806 14.646 14.487 14.315 14.15 13.983 13.829 13.668 13.499 13.359 13.218 13.066 12.928 12.77 12.61 12.483 12.344 12.2 12.048 11.887 11.774 11.651 11.465 11.337 11.201 11.131 10.992 10.848 10.702 10.631 10.483 10.387 10.286 10.171 9.933 9.792 9.637 9.467 9.252 8.982 8.655 7.756 -6 ,23537 ,KEBNE ,17042296,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:52:41 CET,0.0 0.484 0.782 1.003 1.169 1.302 1.411 1.517 1.732 1.822 1.904 1.984 2.141 2.214 2.363 2.509 2.633 2.692 2.814 2.936 3.109 3.227 3.342 3.497 3.647 3.799 3.951 4.1 4.294 4.479 4.662 4.891 5.1 5.302 5.552 5.836 6.11 6.421 6.757 7.105 7.457 7.865 8.357 8.854 9.447 10.094 10.815 11.623 12.52 13.474 14.615 15.459 15.71 15.7 15.564 15.43 15.319 15.163 15.005 14.827 14.662 14.497 14.324 14.153 13.981 13.823 13.675 13.537 13.393 13.241 13.106 13.003 12.883 12.754 12.661 12.556 12.434 12.318 12.196 12.107 12.018 11.86 11.749 11.64 11.575 11.43 11.275 11.129 11.045 10.876 10.763 10.66 10.551 10.31 10.179 10.017 9.775 9.532 9.295 8.989 7.591 -7 ,23375 ,KEBNE ,17042297,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:52:17 CET,0.0 0.68 0.832 0.97 1.119 1.246 1.352 1.444 1.629 1.735 1.83 1.906 2.061 2.136 2.299 2.441 2.558 2.62 2.74 2.86 3.035 3.148 3.259 3.407 3.547 3.685 3.828 3.971 4.151 4.321 4.49 4.699 4.906 5.117 5.363 5.623 5.869 6.14 6.455 6.806 7.161 7.558 8.029 8.509 9.075 9.706 10.446 11.26 12.087 12.99 14.042 14.742 15.006 15.027 14.938 14.817 14.673 14.508 14.339 14.148 13.955 13.775 13.601 13.448 13.314 13.173 13.021 12.883 12.757 12.639 12.5 12.367 12.231 12.085 11.988 11.895 11.779 11.662 11.549 11.462 11.366 11.209 11.086 10.963 10.898 10.754 10.6 10.437 10.348 10.178 10.052 9.959 9.866 9.623 9.486 9.336 9.162 8.954 8.691 8.334 7.295 -8 ,23924 ,KEBNE ,17042298,Thu Dec 23 04:21:53 CET,Thu Dec 23 05:51:03 CET,0.0 0.596 0.767 0.902 1.011 1.141 1.28 1.404 1.636 1.74 1.85 1.965 2.12 2.201 2.375 2.536 2.688 2.759 2.894 3.025 3.201 3.31 3.432 3.619 3.796 3.967 4.13 4.289 4.498 4.698 4.894 5.135 5.366 5.594 5.861 6.154 6.434 6.757 7.101 7.427 7.768 8.161 8.622 9.08 9.622 10.241 10.925 11.709 12.624 13.657 14.888 15.649 15.857 15.916 15.896 15.812 15.679 15.533 15.409 15.238 15.045 14.864 14.694 14.541 14.397 14.244 14.076 13.934 13.808 13.675 13.546 13.43 13.302 13.159 13.021 12.885 12.757 12.62 12.477 12.376 12.269 12.11 12.001 11.878 11.811 11.665 11.5 11.335 11.252 11.094 10.984 10.884 10.792 10.565 10.418 10.258 10.076 9.892 9.68 9.37 8.393 -9 ,22798 ,KEBNE ,17042299,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:50:59 CET,0.0 0.82 1.042 1.211 1.351 1.471 1.582 1.677 1.846 1.925 2.002 2.065 2.215 2.291 2.446 2.592 2.742 2.81 2.937 3.069 3.247 3.36 3.475 3.641 3.792 3.933 4.065 4.203 4.397 4.583 4.77 4.991 5.194 5.394 5.638 5.91 6.177 6.483 6.823 7.192 7.575 7.988 8.456 8.956 9.559 10.2 10.909 11.734 12.723 13.826 14.99 15.747 16.049 16.139 16.087 15.962 15.805 15.613 15.422 15.207 15.007 14.839 14.674 14.502 14.332 14.186 14.041 13.887 13.765 13.649 13.518 13.406 13.29 13.176 13.079 12.96 12.833 12.71 12.588 12.499 12.396 12.22 12.1 11.98 11.914 11.774 11.643 11.493 11.41 11.263 11.186 11.096 10.988 10.729 10.58 10.399 10.183 9.946 9.67 9.348 8.059 -10 ,24290 ,KEBNE ,17042300,Thu Dec 23 04:21:51 CET,Thu Dec 23 05:52:58 CET,0.0 0.362 0.567 0.72 0.83 0.931 1.033 1.129 1.318 1.401 1.48 1.554 1.71 1.782 1.911 2.033 2.164 2.223 2.333 2.441 2.6 2.709 2.809 2.954 3.113 3.261 3.384 3.505 3.675 3.865 4.043 4.234 4.426 4.618 4.836 5.078 5.33 5.619 5.911 6.196 6.482 6.821 7.272 7.756 8.343 8.959 9.609 10.384 11.276 12.291 13.535 14.375 14.654 14.693 14.627 14.551 14.459 14.292 14.119 13.936 13.751 13.563 13.388 13.223 13.066 12.909 12.728 12.573 12.434 12.292 12.14 11.998 11.845 11.677 11.549 11.42 11.281 11.127 10.949 10.835 10.723 10.536 10.408 10.264 10.181 10.014 9.858 9.71 9.632 9.477 9.349 9.243 9.127 8.856 8.706 8.534 8.321 8.101 7.873 7.568 6.623 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_30_13.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_30_13.txt deleted file mode 100644 index ec34b6cf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_30_13.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31547 ,KEBNE ,16654041,Mon Nov 22 05:12:33 CET,Mon Nov 22 06:37:24 CET,0.0 1.672 2.115 2.478 2.741 2.954 3.15 3.32 3.64 3.793 3.933 4.13 4.322 4.437 4.67 4.895 5.116 5.224 5.416 5.591 5.853 6.019 6.183 6.432 6.667 6.889 7.108 7.314 7.574 7.821 8.074 8.392 8.685 8.968 9.296 9.655 9.991 10.366 10.777 11.218 11.697 12.235 12.824 13.397 14.058 14.813 15.66 16.532 17.503 18.592 19.554 19.967 20.039 19.885 19.607 19.26 18.897 18.5 18.103 17.74 17.433 17.117 16.82 16.556 16.266 15.983 15.719 15.475 15.249 15.006 14.73 14.49 14.251 14.013 13.835 13.637 13.421 13.21 12.971 12.81 12.65 12.393 12.224 12.039 11.941 11.718 11.478 11.231 11.109 10.911 10.663 10.479 10.3 9.928 9.702 9.449 9.131 8.761 8.315 7.729 2.978 -2 ,14819 ,KEBNE ,16654042,Mon Nov 22 05:12:33 CET,Mon Nov 22 06:37:19 CET,0.0 1.909 2.376 2.704 2.957 3.162 3.353 3.53 3.852 4.007 4.154 4.354 4.559 4.692 4.936 5.152 5.354 5.452 5.642 5.821 6.081 6.256 6.427 6.662 6.883 7.112 7.33 7.53 7.795 8.051 8.303 8.604 8.886 9.173 9.496 9.84 10.181 10.562 10.981 11.425 11.859 12.336 12.92 13.522 14.2 14.921 15.678 16.473 17.387 18.452 19.529 19.94 19.873 19.631 19.284 18.912 18.574 18.255 17.951 17.621 17.318 17.022 16.726 16.455 16.199 15.935 15.64 15.385 15.157 14.905 14.628 14.39 14.129 13.855 13.663 13.465 13.245 13.016 12.78 12.62 12.458 12.205 12.025 11.83 11.722 11.496 11.271 11.022 10.885 10.665 10.412 10.243 10.047 9.632 9.417 9.137 8.83 8.489 8.022 7.375 4.151 -3 ,845 ,KEBNE ,16654043,Mon Nov 22 05:12:33 CET,Mon Nov 22 06:37:19 CET,0.0 1.106 1.475 1.759 1.992 2.207 2.415 2.605 2.924 3.071 3.222 3.435 3.638 3.761 4.006 4.234 4.435 4.532 4.731 4.925 5.203 5.381 5.561 5.818 6.042 6.267 6.499 6.733 7.044 7.319 7.569 7.868 8.157 8.441 8.748 9.093 9.437 9.818 10.242 10.68 11.134 11.637 12.184 12.732 13.385 14.095 14.9 15.838 16.884 17.965 18.938 19.43 19.589 19.483 19.243 18.904 18.558 18.221 17.899 17.574 17.279 16.993 16.717 16.442 16.168 15.912 15.636 15.391 15.17 14.922 14.682 14.48 14.239 14.007 13.83 13.634 13.429 13.223 13.004 12.84 12.682 12.437 12.253 12.06 11.965 11.765 11.527 11.271 11.135 10.918 10.672 10.514 10.343 9.93 9.71 9.415 9.055 8.701 8.3 7.659 3.856 -4 ,28065 ,KEBNE ,16654044,Mon Nov 22 05:13:34 CET,Mon Nov 22 06:38:14 CET,0.0 1.372 1.743 2.075 2.34 2.544 2.728 2.909 3.211 3.358 3.505 3.691 3.879 3.992 4.233 4.459 4.66 4.763 4.969 5.166 5.443 5.621 5.791 6.034 6.266 6.475 6.676 6.881 7.158 7.412 7.648 7.952 8.235 8.506 8.835 9.207 9.555 9.937 10.342 10.747 11.19 11.681 12.238 12.781 13.382 14.016 14.745 15.579 16.469 17.392 18.253 18.56 18.404 18.108 17.772 17.38 16.998 16.621 16.285 15.943 15.633 15.31 14.97 14.665 14.4 14.165 13.913 13.671 13.45 13.223 12.973 12.757 12.55 12.346 12.18 12.005 11.816 11.614 11.393 11.223 11.058 10.789 10.596 10.397 10.291 10.065 9.822 9.563 9.425 9.225 8.958 8.745 8.544 8.121 7.883 7.638 7.347 7.006 6.473 5.65 -3.018 -5 ,16162 ,KEBNE ,16654045,Mon Nov 22 05:13:35 CET,Mon Nov 22 06:39:51 CET,0.0 1.324 1.777 2.092 2.381 2.628 2.831 3.011 3.369 3.54 3.682 3.879 4.099 4.238 4.489 4.717 4.925 5.026 5.227 5.411 5.672 5.83 5.972 6.189 6.41 6.615 6.802 6.989 7.247 7.495 7.721 7.987 8.255 8.529 8.85 9.203 9.512 9.834 10.193 10.607 11.072 11.585 12.141 12.686 13.348 14.079 14.893 15.766 16.763 17.921 19.046 19.53 19.451 19.163 18.841 18.514 18.156 17.774 17.442 17.088 16.757 16.459 16.173 15.907 15.64 15.382 15.128 14.897 14.681 14.461 14.25 14.06 13.829 13.575 13.388 13.197 12.989 12.783 12.568 12.409 12.244 11.982 11.8 11.618 11.523 11.306 11.053 10.788 10.654 10.447 10.215 10.047 9.844 9.381 9.13 8.864 8.582 8.251 7.718 6.873 3.883 -6 ,9619 ,KEBNE ,16654046,Mon Nov 22 05:13:34 CET,Mon Nov 22 06:38:08 CET,0.0 1.251 1.639 1.876 2.091 2.321 2.521 2.683 2.988 3.142 3.294 3.487 3.686 3.804 4.034 4.253 4.466 4.572 4.77 4.96 5.238 5.425 5.607 5.863 6.091 6.309 6.536 6.755 7.038 7.306 7.57 7.885 8.171 8.442 8.754 9.118 9.476 9.84 10.221 10.64 11.076 11.55 12.117 12.704 13.389 14.139 14.969 15.858 16.857 17.901 18.833 19.168 19.054 18.835 18.569 18.242 17.911 17.545 17.203 16.873 16.568 16.279 15.981 15.675 15.388 15.134 14.853 14.604 14.392 14.158 13.902 13.673 13.451 13.21 13.002 12.786 12.555 12.338 12.134 11.979 11.809 11.543 11.369 11.196 11.099 10.876 10.629 10.362 10.222 10.009 9.732 9.545 9.363 8.988 8.77 8.527 8.278 7.967 7.487 6.849 1.919 -7 ,4322 ,KEBNE ,16654047,Mon Nov 22 05:13:34 CET,Mon Nov 22 06:39:31 CET,0.0 1.433 1.906 2.204 2.43 2.62 2.793 2.968 3.313 3.475 3.621 3.82 4.025 4.152 4.386 4.6 4.808 4.912 5.125 5.325 5.594 5.773 5.944 6.188 6.427 6.659 6.88 7.078 7.308 7.534 7.77 8.068 8.345 8.617 8.941 9.298 9.651 10.03 10.417 10.812 11.241 11.729 12.312 12.932 13.607 14.308 15.113 15.96 16.888 17.916 18.998 19.518 19.488 19.302 19.067 18.768 18.412 18.055 17.743 17.371 17.004 16.688 16.4 16.13 15.867 15.627 15.376 15.146 14.924 14.674 14.424 14.227 14.003 13.748 13.543 13.33 13.111 12.89 12.659 12.485 12.292 12.013 11.817 11.607 11.499 11.264 11.028 10.765 10.624 10.419 10.187 10.039 9.88 9.493 9.256 8.993 8.701 8.381 7.955 7.324 1.476 -8 ,23039 ,KEBNE ,16654048,Mon Nov 22 05:13:34 CET,Mon Nov 22 06:39:50 CET,0.0 1.611 2.013 2.344 2.634 2.863 3.069 3.254 3.574 3.724 3.854 4.046 4.255 4.383 4.615 4.835 5.039 5.135 5.325 5.512 5.791 5.967 6.139 6.405 6.661 6.893 7.102 7.308 7.591 7.845 8.085 8.386 8.684 8.967 9.287 9.649 9.993 10.361 10.755 11.18 11.623 12.105 12.644 13.218 13.9 14.641 15.441 16.311 17.297 18.341 19.364 19.842 19.907 19.732 19.41 19.046 18.723 18.363 17.997 17.632 17.32 17.03 16.721 16.429 16.168 15.919 15.645 15.394 15.182 14.956 14.712 14.515 14.299 14.049 13.865 13.687 13.487 13.258 13.01 12.841 12.675 12.399 12.197 11.994 11.89 11.669 11.422 11.154 11.013 10.81 10.609 10.451 10.266 9.846 9.607 9.331 9.007 8.644 8.164 7.517 3.733 -9 ,16409 ,KEBNE ,16654049,Mon Nov 22 05:14:36 CET,Mon Nov 22 06:39:17 CET,0.0 1.373 1.756 2.038 2.301 2.535 2.729 2.902 3.229 3.371 3.506 3.717 3.917 4.048 4.297 4.526 4.729 4.827 5.024 5.21 5.476 5.648 5.825 6.089 6.331 6.55 6.753 6.948 7.214 7.478 7.729 8.018 8.297 8.565 8.869 9.217 9.547 9.909 10.294 10.703 11.126 11.559 12.059 12.623 13.27 13.958 14.725 15.541 16.435 17.354 18.243 18.563 18.502 18.333 18.074 17.731 17.359 16.987 16.657 16.325 16.013 15.738 15.463 15.188 14.935 14.686 14.396 14.126 13.903 13.678 13.437 13.216 12.971 12.719 12.528 12.329 12.107 11.879 11.662 11.503 11.339 11.089 10.905 10.713 10.609 10.387 10.165 9.911 9.768 9.547 9.264 9.081 8.902 8.488 8.228 7.964 7.684 7.314 6.809 5.971 1.985 -10 ,31523 ,KEBNE ,16654050,Mon Nov 22 05:15:38 CET,Mon Nov 22 06:40:16 CET,0.0 1.111 1.598 1.959 2.243 2.49 2.699 2.879 3.181 3.319 3.455 3.647 3.85 3.977 4.214 4.428 4.624 4.722 4.908 5.083 5.338 5.507 5.682 5.937 6.164 6.371 6.583 6.788 7.062 7.343 7.61 7.926 8.224 8.505 8.807 9.131 9.462 9.837 10.215 10.575 10.972 11.445 11.971 12.517 13.186 13.904 14.71 15.61 16.59 17.606 18.598 19.059 19.047 18.881 18.549 18.164 17.78 17.38 17.009 16.63 16.29 15.972 15.672 15.399 15.156 14.906 14.601 14.323 14.105 13.887 13.65 13.448 13.227 13.005 12.84 12.661 12.466 12.246 12.015 11.86 11.693 11.422 11.228 11.017 10.912 10.703 10.474 10.222 10.085 9.884 9.64 9.458 9.263 8.851 8.635 8.396 8.123 7.762 7.302 6.702 3.004 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_30_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_30_35.txt deleted file mode 100644 index e19b56ad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_30_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19002 ,KEBNE ,17042301,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:53:22 CET,0.0 0.568 0.908 1.164 1.376 1.563 1.727 1.864 2.088 2.195 2.307 2.442 2.613 2.712 2.9 3.07 3.234 3.311 3.451 3.589 3.816 3.96 4.087 4.259 4.421 4.573 4.722 4.869 5.061 5.247 5.418 5.618 5.816 6.02 6.255 6.523 6.778 7.046 7.34 7.649 7.945 8.273 8.698 9.153 9.642 10.101 10.612 11.16 11.7 12.159 12.329 12.071 11.626 11.152 10.637 10.087 9.569 9.113 8.717 8.318 7.975 7.67 7.369 7.067 6.768 6.48 6.182 5.922 5.694 5.448 5.189 4.977 4.754 4.517 4.336 4.148 3.957 3.753 3.549 3.427 3.301 3.1 2.959 2.801 2.716 2.532 2.351 2.183 2.085 1.911 1.786 1.676 1.56 1.318 1.182 0.996 0.747 0.473 0.175 -0.188 -1.487 -2 ,12989 ,KEBNE ,17042302,Thu Dec 23 04:21:53 CET,Thu Dec 23 05:53:02 CET,0.0 0.409 0.585 0.716 0.848 0.973 1.078 1.178 1.361 1.445 1.526 1.616 1.774 1.847 1.988 2.127 2.257 2.322 2.448 2.567 2.735 2.842 2.947 3.101 3.248 3.387 3.53 3.674 3.867 4.049 4.215 4.42 4.631 4.838 5.071 5.345 5.595 5.855 6.154 6.46 6.75 7.085 7.475 7.868 8.331 8.809 9.336 9.9 10.405 10.752 10.939 10.769 10.316 9.768 9.245 8.753 8.279 7.774 7.334 6.91 6.501 6.129 5.795 5.476 5.189 4.938 4.649 4.377 4.14 3.889 3.646 3.448 3.244 3.042 2.883 2.702 2.503 2.319 2.129 1.998 1.873 1.674 1.516 1.349 1.262 1.066 0.866 0.678 0.582 0.392 0.233 0.104 -0.025 -0.278 -0.429 -0.602 -0.785 -1.013 -1.282 -1.596 -2.593 -3 ,5112 ,KEBNE ,17042304,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:53:31 CET,0.0 0.181 0.333 0.463 0.577 0.696 0.823 0.946 1.159 1.259 1.356 1.482 1.65 1.734 1.891 2.06 2.214 2.281 2.415 2.553 2.744 2.858 2.961 3.111 3.268 3.417 3.558 3.685 3.85 4.01 4.167 4.383 4.595 4.781 4.974 5.186 5.403 5.64 5.89 6.16 6.435 6.718 7.055 7.412 7.765 8.132 8.573 9.019 9.424 9.722 9.925 9.753 9.294 8.705 8.112 7.591 7.102 6.622 6.214 5.814 5.445 5.097 4.774 4.475 4.204 3.943 3.661 3.413 3.2 2.987 2.766 2.585 2.398 2.183 2.011 1.834 1.652 1.471 1.276 1.141 1.0 0.776 0.619 0.451 0.36 0.179 -0.015 -0.227 -0.332 -0.512 -0.683 -0.815 -0.944 -1.249 -1.431 -1.629 -1.85 -2.125 -2.474 -2.943 -4.136 -4 ,2109 ,KEBNE ,17042305,Thu Dec 23 04:21:52 CET,Thu Dec 23 05:52:54 CET,0.0 0.333 0.478 0.612 0.747 0.868 0.98 1.082 1.284 1.39 1.482 1.579 1.747 1.832 1.995 2.14 2.27 2.333 2.449 2.559 2.722 2.834 2.946 3.106 3.248 3.38 3.521 3.664 3.834 4.011 4.195 4.425 4.642 4.844 5.083 5.339 5.576 5.841 6.115 6.401 6.708 7.04 7.419 7.801 8.226 8.672 9.196 9.742 10.269 10.688 10.854 10.673 10.272 9.784 9.327 8.803 8.232 7.68 7.206 6.749 6.381 6.08 5.793 5.499 5.224 4.989 4.741 4.502 4.29 4.065 3.827 3.627 3.423 3.214 3.041 2.869 2.707 2.529 2.337 2.205 2.067 1.849 1.692 1.529 1.448 1.277 1.089 0.896 0.783 0.586 0.42 0.292 0.162 -0.144 -0.31 -0.487 -0.69 -0.923 -1.189 -1.524 -2.566 -5 ,11237 ,KEBNE ,17042307,Thu Dec 23 04:21:56 CET,Thu Dec 23 05:47:04 CET,0.0 0.479 0.637 0.776 0.891 1.008 1.127 1.245 1.478 1.57 1.656 1.764 1.922 1.998 2.148 2.288 2.426 2.492 2.618 2.74 2.908 3.015 3.114 3.251 3.405 3.555 3.687 3.811 3.979 4.14 4.295 4.491 4.676 4.856 5.078 5.345 5.595 5.853 6.142 6.46 6.772 7.113 7.539 7.972 8.465 9.001 9.562 10.093 10.581 11.056 11.415 11.217 10.767 10.329 9.867 9.346 8.869 8.43 8.023 7.595 7.23 6.904 6.559 6.224 5.929 5.653 5.351 5.075 4.821 4.565 4.291 4.063 3.849 3.631 3.466 3.286 3.097 2.907 2.697 2.541 2.368 2.092 1.886 1.668 1.564 1.363 1.175 0.991 0.888 0.715 0.583 0.466 0.343 0.067 -0.096 -0.27 -0.461 -0.686 -0.942 -1.294 -2.608 -6 ,2634 ,KEBNE ,17042308,Thu Dec 23 04:21:55 CET,Thu Dec 23 05:47:16 CET,0.0 0.276 0.433 0.571 0.706 0.828 0.933 1.019 1.196 1.292 1.386 1.486 1.634 1.705 1.851 1.996 2.135 2.195 2.307 2.416 2.583 2.7 2.819 2.988 3.142 3.293 3.435 3.568 3.743 3.908 4.066 4.254 4.435 4.62 4.832 5.058 5.279 5.528 5.778 6.05 6.332 6.648 7.024 7.363 7.759 8.181 8.633 9.166 9.744 10.216 10.394 10.162 9.719 9.209 8.693 8.175 7.688 7.245 6.858 6.442 6.063 5.713 5.373 5.058 4.777 4.512 4.199 3.917 3.702 3.492 3.274 3.095 2.905 2.713 2.566 2.405 2.242 2.071 1.885 1.757 1.628 1.423 1.28 1.128 1.035 0.828 0.634 0.446 0.353 0.176 0.021 -0.101 -0.231 -0.495 -0.637 -0.795 -1.0 -1.248 -1.527 -1.9 -2.934 -7 ,20776 ,KEBNE ,17042309,Thu Dec 23 04:21:56 CET,Thu Dec 23 05:44:40 CET,0.0 0.419 0.633 0.802 0.93 1.045 1.165 1.277 1.473 1.567 1.651 1.724 1.869 1.937 2.07 2.204 2.345 2.413 2.537 2.651 2.81 2.917 3.022 3.178 3.33 3.469 3.607 3.744 3.92 4.094 4.264 4.465 4.646 4.825 5.052 5.315 5.563 5.826 6.114 6.43 6.769 7.137 7.52 7.918 8.355 8.822 9.364 9.836 10.285 10.706 10.928 10.777 10.422 9.934 9.41 8.877 8.39 7.943 7.535 7.133 6.769 6.426 6.099 5.785 5.483 5.213 4.936 4.684 4.457 4.215 3.97 3.781 3.568 3.339 3.171 2.986 2.792 2.594 2.375 2.215 2.058 1.834 1.66 1.473 1.384 1.198 0.999 0.781 0.661 0.443 0.199 0.047 -0.106 -0.426 -0.594 -0.773 -0.98 -1.229 -1.539 -1.91 -2.774 -8 ,31363 ,KEBNE ,17042311,Thu Dec 23 04:21:56 CET,Thu Dec 23 05:47:36 CET,0.0 0.473 0.668 0.851 1.015 1.16 1.298 1.433 1.683 1.805 1.921 2.063 2.243 2.337 2.51 2.687 2.845 2.918 3.063 3.216 3.455 3.597 3.727 3.91 4.087 4.255 4.421 4.576 4.767 4.965 5.151 5.366 5.573 5.776 6.018 6.281 6.526 6.796 7.089 7.379 7.672 8.016 8.42 8.789 9.227 9.692 10.18 10.724 11.218 11.603 11.856 11.85 11.475 10.811 10.166 9.642 9.198 8.781 8.409 8.019 7.663 7.32 6.991 6.692 6.4 6.128 5.869 5.639 5.426 5.193 4.936 4.712 4.46 4.224 4.058 3.859 3.656 3.456 3.236 3.09 2.93 2.671 2.498 2.331 2.248 2.074 1.901 1.719 1.623 1.45 1.321 1.207 1.085 0.837 0.684 0.507 0.32 0.122 -0.125 -0.49 -1.49 -9 ,24527 ,KEBNE ,17042312,Thu Dec 23 04:22:00 CET,Thu Dec 23 05:46:33 CET,0.0 0.37 0.564 0.712 0.851 0.979 1.099 1.226 1.455 1.566 1.678 1.815 1.985 2.077 2.25 2.404 2.548 2.623 2.777 2.922 3.135 3.275 3.392 3.55 3.706 3.861 4.017 4.176 4.381 4.587 4.79 5.02 5.236 5.448 5.686 5.951 6.203 6.462 6.713 6.971 7.256 7.582 7.968 8.378 8.824 9.284 9.811 10.36 10.949 11.557 11.895 11.77 11.417 10.903 10.315 9.775 9.333 8.908 8.511 8.101 7.752 7.438 7.146 6.868 6.603 6.365 6.113 5.892 5.682 5.453 5.222 5.025 4.815 4.595 4.433 4.259 4.073 3.897 3.722 3.6 3.475 3.27 3.113 2.964 2.878 2.685 2.505 2.327 2.228 2.042 1.894 1.775 1.64 1.371 1.222 1.048 0.863 0.663 0.422 0.051 -1.273 -10 ,31237 ,KEBNE ,17042314,Thu Dec 23 04:22:00 CET,Thu Dec 23 05:44:44 CET,0.0 0.334 0.536 0.711 0.831 0.923 1.015 1.115 1.328 1.42 1.5 1.582 1.729 1.795 1.925 2.061 2.192 2.253 2.369 2.481 2.641 2.742 2.839 2.997 3.148 3.283 3.415 3.547 3.738 3.928 4.11 4.328 4.545 4.746 4.963 5.23 5.508 5.789 6.091 6.41 6.729 7.095 7.503 7.909 8.375 8.856 9.379 9.913 10.457 10.937 11.141 10.847 10.319 9.674 9.027 8.506 8.063 7.558 7.106 6.716 6.36 6.009 5.676 5.365 5.064 4.787 4.502 4.226 3.992 3.763 3.519 3.314 3.095 2.861 2.681 2.502 2.314 2.115 1.91 1.758 1.592 1.342 1.178 1.006 0.916 0.725 0.517 0.296 0.174 -0.028 -0.197 -0.31 -0.423 -0.687 -0.835 -0.992 -1.17 -1.375 -1.621 -1.983 -3.314 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_30_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_30_37.txt deleted file mode 100644 index 068e605b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_30_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20616 ,KEBNE ,17042316,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:58:09 CET,0.0 0.761 1.091 1.341 1.513 1.644 1.767 1.889 2.123 2.24 2.354 2.48 2.649 2.746 2.932 3.106 3.268 3.345 3.496 3.643 3.847 3.976 4.101 4.285 4.469 4.644 4.823 5.001 5.226 5.449 5.67 5.941 6.189 6.437 6.744 7.079 7.403 7.767 8.16 8.588 9.042 9.561 10.197 10.852 11.619 12.445 13.364 14.392 15.618 17.121 19.026 20.461 21.191 21.625 21.871 22.001 22.071 22.104 22.074 22.002 21.937 21.868 21.778 21.68 21.592 21.515 21.432 21.339 21.254 21.173 21.078 20.989 20.893 20.801 20.735 20.669 20.595 20.507 20.417 20.352 20.278 20.167 20.087 20.003 19.957 19.864 19.77 19.659 19.606 19.497 19.412 19.328 19.245 19.071 18.97 18.856 18.735 18.601 18.411 18.13 17.129 -2 ,8084 ,KEBNE ,17042318,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:58:34 CET,0.0 1.049 1.304 1.533 1.725 1.917 2.109 2.269 2.55 2.678 2.812 2.998 3.181 3.29 3.51 3.723 3.908 3.992 4.165 4.343 4.601 4.76 4.909 5.135 5.348 5.548 5.745 5.938 6.198 6.459 6.712 7.003 7.278 7.551 7.867 8.212 8.539 8.918 9.339 9.774 10.237 10.758 11.36 11.995 12.759 13.624 14.658 15.792 17.073 18.574 20.356 21.784 22.56 23.011 23.237 23.351 23.42 23.435 23.402 23.354 23.308 23.245 23.175 23.089 23.01 22.937 22.839 22.748 22.666 22.568 22.464 22.38 22.288 22.183 22.094 22.005 21.91 21.813 21.714 21.638 21.552 21.41 21.304 21.197 21.145 21.03 20.904 20.762 20.69 20.568 20.47 20.393 20.31 20.142 20.047 19.935 19.81 19.678 19.526 19.273 18.406 -3 ,26657 ,KEBNE ,17042319,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:58:20 CET,0.0 0.538 0.778 0.961 1.136 1.305 1.45 1.585 1.843 1.958 2.068 2.19 2.36 2.447 2.626 2.802 2.972 3.054 3.211 3.369 3.593 3.736 3.867 4.055 4.246 4.436 4.622 4.807 5.038 5.262 5.486 5.753 6.014 6.274 6.569 6.894 7.213 7.567 7.944 8.355 8.804 9.341 9.977 10.625 11.391 12.247 13.251 14.385 15.723 17.241 19.033 20.522 21.299 21.752 22.007 22.139 22.199 22.191 22.152 22.093 22.054 22.012 21.949 21.883 21.826 21.769 21.687 21.61 21.552 21.494 21.43 21.365 21.293 21.222 21.163 21.098 21.028 20.953 20.871 20.805 20.739 20.636 20.562 20.488 20.452 20.366 20.261 20.157 20.098 19.992 19.926 19.862 19.793 19.614 19.508 19.405 19.284 19.149 18.986 18.737 17.577 -4 ,13551 ,KEBNE ,17042320,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:59:15 CET,0.0 1.411 1.731 1.937 2.09 2.239 2.383 2.51 2.755 2.877 2.983 3.106 3.282 3.376 3.56 3.735 3.894 3.97 4.118 4.272 4.508 4.654 4.8 5.02 5.231 5.434 5.629 5.826 6.08 6.33 6.57 6.851 7.13 7.399 7.709 8.053 8.388 8.767 9.179 9.611 10.07 10.604 11.219 11.831 12.569 13.403 14.335 15.342 16.55 18.075 19.88 21.228 21.949 22.348 22.563 22.661 22.688 22.665 22.628 22.592 22.542 22.492 22.43 22.35 22.256 22.151 22.045 21.95 21.861 21.777 21.69 21.613 21.524 21.418 21.329 21.242 21.153 21.058 20.961 20.882 20.787 20.65 20.547 20.426 20.367 20.253 20.129 19.973 19.885 19.757 19.633 19.533 19.426 19.185 19.044 18.884 18.708 18.503 18.262 17.94 16.987 -5 ,2620 ,KEBNE ,17042322,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:57:15 CET,0.0 1.06 1.34 1.551 1.734 1.902 2.056 2.188 2.419 2.527 2.633 2.766 2.944 3.038 3.227 3.408 3.572 3.657 3.818 3.962 4.172 4.306 4.44 4.643 4.839 5.023 5.209 5.388 5.622 5.864 6.104 6.394 6.676 6.953 7.267 7.607 7.94 8.324 8.728 9.156 9.62 10.139 10.744 11.375 12.128 12.962 13.882 14.968 16.34 17.908 19.758 21.238 21.983 22.404 22.651 22.779 22.822 22.807 22.79 22.754 22.693 22.621 22.536 22.453 22.366 22.273 22.173 22.075 21.985 21.894 21.776 21.674 21.577 21.473 21.391 21.3 21.202 21.109 21.012 20.937 20.857 20.724 20.618 20.505 20.442 20.317 20.191 20.05 19.975 19.846 19.718 19.613 19.504 19.251 19.109 18.952 18.777 18.577 18.343 18.035 17.26 -6 ,24882 ,KEBNE ,17042323,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:58:48 CET,0.0 0.577 0.841 1.063 1.242 1.396 1.533 1.664 1.915 2.035 2.155 2.304 2.483 2.579 2.78 2.967 3.126 3.203 3.351 3.505 3.715 3.841 3.971 4.172 4.365 4.551 4.735 4.916 5.149 5.368 5.582 5.851 6.102 6.339 6.632 6.966 7.29 7.658 8.051 8.473 8.937 9.465 10.084 10.71 11.423 12.232 13.247 14.388 15.611 17.085 18.876 20.194 20.937 21.346 21.559 21.676 21.757 21.804 21.803 21.761 21.688 21.603 21.508 21.408 21.314 21.232 21.142 21.059 20.98 20.885 20.779 20.683 20.574 20.465 20.38 20.283 20.172 20.071 19.972 19.894 19.806 19.668 19.568 19.464 19.41 19.291 19.158 19.013 18.937 18.821 18.745 18.669 18.582 18.408 18.314 18.225 18.123 17.997 17.832 17.562 16.682 -7 ,7132 ,KEBNE ,17042324,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:58:54 CET,0.0 1.005 1.29 1.512 1.679 1.827 1.959 2.087 2.318 2.435 2.553 2.691 2.87 2.968 3.14 3.306 3.469 3.543 3.675 3.814 4.028 4.16 4.288 4.481 4.67 4.853 5.034 5.206 5.428 5.653 5.877 6.151 6.421 6.7 7.032 7.395 7.733 8.093 8.473 8.893 9.354 9.898 10.54 11.182 11.919 12.725 13.677 14.813 16.12 17.599 19.408 20.853 21.616 22.065 22.316 22.422 22.463 22.471 22.459 22.433 22.385 22.328 22.268 22.194 22.109 22.032 21.948 21.855 21.755 21.652 21.553 21.465 21.365 21.263 21.185 21.095 20.998 20.9 20.781 20.698 20.619 20.494 20.394 20.281 20.229 20.133 20.037 19.93 19.869 19.76 19.677 19.604 19.533 19.377 19.284 19.183 19.074 18.952 18.752 18.473 17.581 -8 ,11927 ,KEBNE ,17042325,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:57:10 CET,0.0 0.435 0.66 0.853 1.023 1.185 1.326 1.455 1.665 1.762 1.863 1.993 2.164 2.26 2.449 2.622 2.786 2.87 3.036 3.192 3.408 3.552 3.69 3.883 4.067 4.249 4.431 4.613 4.85 5.075 5.291 5.561 5.823 6.09 6.402 6.727 7.037 7.387 7.777 8.197 8.637 9.145 9.752 10.38 11.14 11.983 12.953 14.046 15.312 16.812 18.586 19.977 20.734 21.202 21.482 21.592 21.609 21.59 21.562 21.51 21.435 21.346 21.247 21.159 21.09 21.007 20.904 20.811 20.722 20.628 20.526 20.433 20.332 20.227 20.145 20.053 19.949 19.846 19.749 19.677 19.596 19.473 19.378 19.262 19.205 19.091 18.967 18.827 18.754 18.635 18.556 18.478 18.386 18.19 18.093 17.982 17.847 17.673 17.475 17.25 16.455 -9 ,15243 ,KEBNE ,17042326,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:57:40 CET,0.0 0.777 1.189 1.468 1.698 1.928 2.127 2.295 2.57 2.702 2.844 3.029 3.218 3.332 3.532 3.717 3.904 3.999 4.176 4.349 4.6 4.743 4.889 5.114 5.327 5.546 5.757 5.952 6.204 6.443 6.681 6.967 7.224 7.475 7.779 8.121 8.453 8.827 9.262 9.714 10.173 10.7 11.308 11.931 12.678 13.485 14.407 15.508 16.759 18.17 19.902 21.342 22.105 22.53 22.78 22.917 22.989 23.016 23.024 23.007 22.962 22.908 22.855 22.786 22.702 22.637 22.568 22.491 22.423 22.347 22.258 22.191 22.12 22.03 21.958 21.884 21.802 21.718 21.62 21.556 21.497 21.389 21.311 21.226 21.179 21.09 20.996 20.885 20.826 20.705 20.613 20.539 20.459 20.299 20.207 20.102 19.983 19.832 19.663 19.442 18.785 -10 ,11374 ,KEBNE ,17042327,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:59:25 CET,0.0 0.568 0.843 1.06 1.239 1.395 1.542 1.676 1.919 2.034 2.135 2.261 2.436 2.529 2.706 2.877 3.044 3.117 3.266 3.414 3.627 3.764 3.892 4.084 4.273 4.455 4.635 4.805 5.03 5.246 5.458 5.715 5.964 6.218 6.504 6.822 7.132 7.48 7.864 8.274 8.712 9.218 9.831 10.432 11.115 11.928 12.901 13.983 15.252 16.76 18.621 20.108 20.85 21.278 21.596 21.787 21.882 21.926 21.92 21.877 21.831 21.775 21.691 21.592 21.495 21.418 21.337 21.248 21.155 21.051 20.931 20.831 20.724 20.608 20.52 20.429 20.319 20.197 20.088 20.022 19.94 19.787 19.679 19.568 19.513 19.397 19.267 19.132 19.054 18.919 18.787 18.702 18.606 18.372 18.229 18.051 17.852 17.633 17.374 17.114 16.302 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_30_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_30_42.txt deleted file mode 100644 index 7054e2f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_30_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14574 ,KEBNE ,16654051,Mon Nov 22 05:14:36 CET,Mon Nov 22 06:40:19 CET,0.0 0.779 1.089 1.34 1.532 1.701 1.853 1.994 2.229 2.334 2.44 2.574 2.751 2.845 3.013 3.168 3.325 3.403 3.559 3.712 3.925 4.062 4.199 4.394 4.582 4.784 4.985 5.175 5.415 5.654 5.894 6.175 6.452 6.711 6.984 7.307 7.645 8.006 8.368 8.765 9.196 9.648 10.155 10.687 11.337 12.047 12.79 13.583 14.481 15.471 16.458 16.85 16.846 16.671 16.34 16.023 15.743 15.418 15.103 14.815 14.54 14.223 13.896 13.621 13.372 13.12 12.856 12.611 12.389 12.156 11.909 11.695 11.468 11.237 11.077 10.915 10.725 10.513 10.296 10.149 9.993 9.754 9.588 9.408 9.308 9.099 8.874 8.638 8.519 8.316 8.047 7.877 7.713 7.355 7.152 6.913 6.637 6.33 5.928 5.319 3.087 -2 ,6605 ,KEBNE ,16654052,Mon Nov 22 05:14:37 CET,Mon Nov 22 06:39:50 CET,0.0 0.916 1.267 1.502 1.701 1.87 2.008 2.146 2.409 2.53 2.644 2.776 2.944 3.04 3.234 3.42 3.609 3.702 3.86 4.003 4.21 4.344 4.482 4.688 4.883 5.065 5.246 5.432 5.653 5.873 6.11 6.388 6.648 6.907 7.217 7.56 7.879 8.223 8.593 8.987 9.372 9.792 10.311 10.844 11.433 12.069 12.786 13.574 14.484 15.471 16.502 16.958 16.935 16.803 16.555 16.251 15.925 15.582 15.269 14.951 14.673 14.399 14.116 13.823 13.567 13.356 13.093 12.851 12.657 12.444 12.201 12.001 11.813 11.595 11.411 11.215 10.996 10.78 10.557 10.397 10.237 10.008 9.847 9.664 9.564 9.361 9.163 8.956 8.841 8.652 8.419 8.255 8.079 7.714 7.511 7.252 6.969 6.668 6.304 5.794 3.364 -3 ,3891 ,KEBNE ,16654053,Mon Nov 22 05:14:36 CET,Mon Nov 22 06:39:50 CET,0.0 0.753 1.066 1.301 1.514 1.705 1.861 1.999 2.25 2.363 2.475 2.624 2.817 2.932 3.124 3.299 3.462 3.543 3.705 3.848 4.066 4.206 4.343 4.552 4.731 4.908 5.083 5.249 5.477 5.711 5.934 6.189 6.422 6.649 6.925 7.235 7.514 7.821 8.153 8.487 8.83 9.216 9.651 10.093 10.602 11.169 11.863 12.648 13.547 14.558 15.557 16.076 16.112 15.945 15.718 15.468 15.197 14.92 14.656 14.365 14.086 13.834 13.588 13.328 13.079 12.832 12.533 12.281 12.068 11.832 11.605 11.412 11.207 11.003 10.834 10.645 10.435 10.208 9.986 9.819 9.644 9.391 9.204 9.01 8.914 8.719 8.493 8.244 8.118 7.921 7.68 7.527 7.375 7.021 6.815 6.564 6.284 5.96 5.553 4.952 2.635 -4 ,14141 ,KEBNE ,16654054,Mon Nov 22 05:14:36 CET,Mon Nov 22 06:41:07 CET,0.0 0.674 0.958 1.184 1.387 1.564 1.717 1.848 2.083 2.199 2.31 2.441 2.618 2.718 2.916 3.092 3.247 3.322 3.482 3.65 3.89 4.035 4.173 4.37 4.553 4.727 4.897 5.07 5.29 5.513 5.731 5.965 6.178 6.392 6.655 6.951 7.228 7.523 7.836 8.182 8.567 8.993 9.484 10.0 10.618 11.324 12.115 12.94 13.861 14.838 15.773 16.314 16.403 16.239 15.989 15.718 15.411 15.101 14.811 14.479 14.175 13.896 13.636 13.411 13.195 12.983 12.738 12.487 12.264 12.038 11.805 11.617 11.41 11.182 11.002 10.815 10.632 10.442 10.239 10.094 9.942 9.692 9.501 9.294 9.189 8.97 8.72 8.456 8.322 8.128 7.9 7.743 7.587 7.218 7.011 6.78 6.516 6.201 5.787 5.315 2.581 -5 ,20001 ,KEBNE ,16654055,Mon Nov 22 05:14:40 CET,Mon Nov 22 06:39:36 CET,0.0 1.077 1.36 1.597 1.791 1.949 2.1 2.255 2.542 2.659 2.772 2.922 3.1 3.191 3.362 3.524 3.676 3.747 3.9 4.066 4.287 4.419 4.546 4.725 4.921 5.128 5.31 5.474 5.694 5.922 6.132 6.361 6.585 6.828 7.106 7.401 7.712 8.049 8.42 8.821 9.219 9.674 10.214 10.767 11.389 12.06 12.841 13.702 14.62 15.508 16.328 16.708 16.695 16.506 16.268 15.964 15.583 15.237 14.954 14.626 14.328 14.039 13.744 13.463 13.185 12.952 12.697 12.448 12.234 12.015 11.769 11.536 11.31 11.097 10.919 10.723 10.534 10.335 10.106 9.964 9.819 9.558 9.368 9.174 9.071 8.839 8.609 8.377 8.248 8.048 7.816 7.669 7.517 7.126 6.915 6.676 6.393 6.084 5.71 5.135 2.056 -6 ,5367 ,KEBNE ,16654056,Mon Nov 22 05:14:36 CET,Mon Nov 22 06:39:46 CET,0.0 1.257 1.602 1.864 2.071 2.254 2.429 2.584 2.839 2.961 3.091 3.265 3.452 3.562 3.759 3.928 4.098 4.187 4.35 4.502 4.734 4.882 5.022 5.233 5.451 5.653 5.821 5.979 6.181 6.371 6.551 6.772 6.979 7.186 7.437 7.735 8.042 8.37 8.707 9.06 9.442 9.872 10.371 10.847 11.405 12.03 12.695 13.4 14.233 15.167 16.175 16.726 16.737 16.538 16.247 15.953 15.696 15.391 15.065 14.709 14.411 14.153 13.875 13.598 13.356 13.137 12.884 12.655 12.454 12.232 11.985 11.773 11.573 11.369 11.206 11.033 10.85 10.649 10.43 10.282 10.122 9.867 9.69 9.502 9.398 9.191 8.982 8.739 8.602 8.396 8.173 8.021 7.85 7.473 7.266 7.028 6.736 6.416 6.059 5.449 3.337 -7 ,21378 ,KEBNE ,16654057,Mon Nov 22 05:14:37 CET,Mon Nov 22 06:39:33 CET,0.0 0.99 1.3 1.528 1.718 1.898 2.064 2.208 2.455 2.58 2.702 2.842 3.021 3.124 3.328 3.504 3.657 3.74 3.926 4.098 4.335 4.493 4.628 4.825 5.029 5.221 5.415 5.615 5.85 6.062 6.276 6.534 6.783 7.026 7.31 7.641 7.967 8.312 8.692 9.107 9.504 9.925 10.435 10.953 11.566 12.224 12.955 13.738 14.616 15.663 16.675 17.124 17.153 17.022 16.813 16.52 16.202 15.87 15.542 15.194 14.908 14.643 14.379 14.127 13.886 13.652 13.395 13.158 12.92 12.671 12.448 12.261 12.055 11.848 11.668 11.478 11.279 11.057 10.831 10.681 10.538 10.316 10.147 9.965 9.863 9.638 9.408 9.135 8.993 8.8 8.591 8.436 8.267 7.879 7.654 7.394 7.102 6.781 6.416 5.857 3.783 -8 ,30616 ,KEBNE ,16654058,Mon Nov 22 05:14:36 CET,Mon Nov 22 06:41:13 CET,0.0 1.116 1.491 1.756 1.964 2.154 2.313 2.453 2.725 2.859 2.98 3.122 3.301 3.396 3.559 3.712 3.871 3.945 4.084 4.236 4.478 4.623 4.753 4.944 5.134 5.336 5.546 5.746 5.981 6.201 6.442 6.739 7.01 7.271 7.565 7.893 8.21 8.558 8.937 9.346 9.772 10.227 10.74 11.254 11.841 12.502 13.247 14.045 14.94 15.872 16.857 17.392 17.464 17.362 17.156 16.917 16.675 16.372 16.067 15.74 15.445 15.202 14.935 14.653 14.405 14.177 13.939 13.71 13.503 13.315 13.115 12.936 12.745 12.534 12.373 12.206 12.038 11.859 11.661 11.527 11.372 11.125 10.959 10.771 10.67 10.466 10.264 10.039 9.919 9.74 9.537 9.385 9.22 8.843 8.637 8.411 8.143 7.824 7.413 6.823 4.65 -9 ,11500 ,KEBNE ,16654059,Mon Nov 22 05:15:38 CET,Mon Nov 22 06:41:57 CET,0.0 1.338 1.707 1.94 2.133 2.324 2.51 2.671 2.958 3.075 3.17 3.278 3.441 3.537 3.718 3.882 4.034 4.11 4.256 4.394 4.6 4.731 4.857 5.032 5.22 5.418 5.593 5.757 5.972 6.183 6.387 6.626 6.859 7.074 7.303 7.569 7.863 8.184 8.484 8.797 9.153 9.558 10.019 10.474 10.996 11.566 12.193 12.921 13.784 14.716 15.635 16.088 16.137 16.001 15.799 15.535 15.212 14.87 14.541 14.215 13.971 13.728 13.451 13.181 12.911 12.645 12.373 12.146 11.947 11.74 11.521 11.338 11.141 10.912 10.73 10.542 10.337 10.143 9.951 9.794 9.634 9.391 9.222 9.033 8.931 8.747 8.556 8.335 8.208 8.002 7.759 7.603 7.442 7.099 6.914 6.699 6.411 6.094 5.733 5.142 1.887 -10 ,13146 ,KEBNE ,16654060,Mon Nov 22 05:15:38 CET,Mon Nov 22 06:42:07 CET,0.0 0.701 1.013 1.229 1.415 1.592 1.747 1.887 2.147 2.275 2.402 2.555 2.742 2.855 3.064 3.258 3.445 3.535 3.692 3.84 4.056 4.193 4.339 4.546 4.735 4.935 5.127 5.298 5.517 5.721 5.914 6.15 6.387 6.618 6.871 7.154 7.421 7.72 8.072 8.48 8.877 9.273 9.735 10.201 10.751 11.344 12.005 12.761 13.622 14.63 15.628 16.168 16.281 16.105 15.877 15.693 15.452 15.122 14.81 14.466 14.17 13.929 13.682 13.43 13.18 12.948 12.696 12.459 12.256 12.038 11.798 11.603 11.418 11.211 11.017 10.824 10.63 10.428 10.225 10.08 9.918 9.661 9.471 9.289 9.195 8.988 8.79 8.587 8.469 8.274 8.073 7.932 7.771 7.374 7.161 6.936 6.672 6.338 5.967 5.499 3.093 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_31_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_31_35.txt deleted file mode 100644 index 345fd92b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_31_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,99 ,KEBNE ,17042328,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:57:08 CET,0.0 0.568 0.772 0.915 1.055 1.169 1.267 1.356 1.547 1.649 1.758 1.877 2.021 2.091 2.224 2.349 2.487 2.555 2.669 2.774 2.925 3.029 3.14 3.301 3.451 3.602 3.744 3.883 4.075 4.256 4.432 4.66 4.877 5.092 5.34 5.59 5.825 6.085 6.358 6.64 6.945 7.311 7.75 8.153 8.591 9.089 9.627 10.166 10.705 11.117 11.345 11.178 10.677 10.11 9.638 9.213 8.776 8.342 7.952 7.526 7.15 6.799 6.454 6.144 5.842 5.55 5.244 4.983 4.775 4.542 4.288 4.079 3.852 3.622 3.444 3.258 3.058 2.847 2.642 2.51 2.371 2.137 1.98 1.822 1.742 1.569 1.392 1.213 1.113 0.936 0.76 0.612 0.477 0.227 0.092 -0.072 -0.291 -0.537 -0.822 -1.251 -2.753 -2 ,28062 ,KEBNE ,17042329,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:58:17 CET,0.0 0.392 0.587 0.776 0.949 1.108 1.257 1.4 1.676 1.806 1.946 2.124 2.293 2.384 2.549 2.696 2.857 2.931 3.063 3.2 3.406 3.547 3.669 3.839 4.013 4.186 4.345 4.495 4.693 4.877 5.053 5.27 5.476 5.676 5.916 6.178 6.413 6.689 6.995 7.299 7.602 7.949 8.359 8.745 9.202 9.691 10.184 10.666 11.203 11.741 12.033 11.944 11.592 11.086 10.548 10.007 9.488 9.023 8.596 8.147 7.782 7.452 7.136 6.834 6.55 6.284 5.997 5.745 5.516 5.267 5.009 4.802 4.585 4.364 4.195 4.015 3.806 3.595 3.403 3.27 3.121 2.874 2.711 2.548 2.466 2.297 2.104 1.904 1.79 1.595 1.437 1.309 1.179 0.881 0.725 0.561 0.38 0.17 -0.098 -0.467 -1.474 -3 ,3357 ,KEBNE ,17042330,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:56:56 CET,0.0 0.444 0.643 0.811 0.94 1.047 1.157 1.258 1.457 1.555 1.639 1.714 1.866 1.939 2.073 2.198 2.327 2.393 2.517 2.639 2.811 2.921 3.035 3.199 3.346 3.487 3.63 3.774 3.966 4.16 4.356 4.582 4.786 4.981 5.213 5.474 5.719 5.993 6.297 6.613 6.952 7.327 7.734 8.154 8.611 9.078 9.573 10.102 10.655 11.193 11.647 11.675 11.329 10.816 10.349 9.894 9.44 8.987 8.566 8.141 7.798 7.491 7.172 6.859 6.561 6.293 6.012 5.751 5.52 5.279 5.019 4.797 4.575 4.342 4.164 3.984 3.799 3.597 3.37 3.209 3.048 2.82 2.658 2.475 2.381 2.188 1.971 1.731 1.606 1.407 1.212 1.054 0.891 0.563 0.371 0.13 -0.177 -0.496 -0.857 -1.309 -2.622 -4 ,17057 ,KEBNE ,17042331,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:57:10 CET,0.0 0.621 0.822 0.999 1.183 1.351 1.493 1.613 1.828 1.935 2.045 2.156 2.316 2.399 2.552 2.71 2.869 2.942 3.068 3.19 3.38 3.511 3.636 3.806 3.964 4.11 4.255 4.396 4.578 4.758 4.916 5.099 5.295 5.475 5.665 5.883 6.085 6.31 6.569 6.846 7.105 7.385 7.723 8.029 8.376 8.747 9.128 9.476 9.816 10.145 10.298 10.034 9.616 9.157 8.667 8.153 7.656 7.199 6.793 6.377 6.013 5.67 5.354 5.041 4.725 4.446 4.165 3.9 3.664 3.431 3.184 2.991 2.792 2.565 2.385 2.205 2.012 1.806 1.615 1.488 1.353 1.126 0.969 0.806 0.718 0.543 0.373 0.178 0.069 -0.115 -0.269 -0.402 -0.549 -0.885 -1.067 -1.237 -1.412 -1.624 -1.902 -2.328 -3.976 -5 ,5613 ,KEBNE ,17042332,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:58:22 CET,0.0 0.378 0.561 0.72 0.857 0.979 1.082 1.176 1.359 1.442 1.518 1.594 1.743 1.811 1.936 2.053 2.164 2.22 2.334 2.443 2.591 2.689 2.791 2.935 3.066 3.2 3.33 3.464 3.64 3.796 3.941 4.118 4.285 4.439 4.624 4.83 5.032 5.254 5.49 5.751 6.023 6.317 6.668 7.007 7.357 7.745 8.191 8.619 9.033 9.368 9.385 8.997 8.484 7.862 7.26 6.688 6.189 5.747 5.358 4.949 4.575 4.234 3.899 3.594 3.307 3.025 2.709 2.422 2.184 1.939 1.684 1.48 1.28 1.068 0.886 0.704 0.517 0.326 0.148 0.017 -0.123 -0.335 -0.485 -0.652 -0.744 -0.922 -1.097 -1.282 -1.383 -1.564 -1.714 -1.837 -1.954 -2.242 -2.412 -2.59 -2.784 -3.013 -3.279 -3.666 -5.084 -6 ,25509 ,KEBNE ,17042333,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:56:57 CET,0.0 0.414 0.582 0.718 0.829 0.934 1.039 1.131 1.29 1.365 1.443 1.523 1.669 1.742 1.883 2.017 2.141 2.2 2.32 2.443 2.623 2.732 2.834 2.984 3.127 3.273 3.416 3.56 3.763 3.947 4.106 4.298 4.481 4.652 4.855 5.087 5.318 5.563 5.81 6.088 6.389 6.719 7.066 7.427 7.873 8.347 8.873 9.368 9.828 10.26 10.546 10.461 10.076 9.574 9.053 8.585 8.191 7.796 7.437 7.045 6.684 6.382 6.08 5.788 5.51 5.222 4.924 4.679 4.451 4.219 3.988 3.777 3.567 3.352 3.167 2.974 2.764 2.547 2.346 2.201 2.055 1.832 1.66 1.475 1.381 1.182 0.967 0.727 0.608 0.415 0.21 0.07 -0.074 -0.406 -0.59 -0.827 -1.127 -1.435 -1.778 -2.285 -3.595 -7 ,28493 ,KEBNE ,17042334,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:56:45 CET,0.0 0.622 0.881 1.082 1.23 1.38 1.531 1.661 1.914 2.042 2.163 2.314 2.489 2.576 2.747 2.913 3.068 3.143 3.29 3.437 3.651 3.779 3.906 4.084 4.246 4.4 4.57 4.751 4.963 5.157 5.34 5.557 5.765 5.971 6.213 6.479 6.746 7.062 7.393 7.733 8.068 8.421 8.837 9.275 9.742 10.185 10.664 11.142 11.64 12.116 12.454 12.242 11.827 11.39 10.891 10.428 9.993 9.554 9.174 8.795 8.452 8.126 7.807 7.504 7.227 6.977 6.722 6.488 6.266 6.032 5.784 5.57 5.36 5.147 4.969 4.779 4.595 4.409 4.202 4.069 3.937 3.73 3.574 3.402 3.312 3.129 2.949 2.759 2.665 2.493 2.334 2.204 2.058 1.751 1.595 1.425 1.213 0.935 0.594 0.186 -1.067 -8 ,28084 ,KEBNE ,17042335,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:57:08 CET,0.0 0.289 0.465 0.6 0.723 0.826 0.93 1.029 1.211 1.289 1.359 1.433 1.583 1.662 1.81 1.952 2.086 2.149 2.275 2.398 2.571 2.68 2.787 2.937 3.084 3.229 3.371 3.504 3.662 3.813 3.977 4.183 4.396 4.601 4.822 5.065 5.293 5.549 5.828 6.119 6.422 6.791 7.232 7.64 8.072 8.529 9.026 9.507 9.974 10.45 10.763 10.643 10.304 9.852 9.341 8.792 8.251 7.778 7.376 6.925 6.552 6.253 5.95 5.641 5.326 5.042 4.769 4.527 4.311 4.085 3.835 3.614 3.402 3.197 3.044 2.878 2.698 2.509 2.307 2.172 2.037 1.829 1.681 1.513 1.428 1.268 1.099 0.909 0.809 0.631 0.481 0.355 0.224 -0.042 -0.187 -0.344 -0.522 -0.747 -1.059 -1.492 -2.657 -9 ,16474 ,KEBNE ,17042336,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:58:15 CET,0.0 0.629 0.85 0.992 1.12 1.235 1.339 1.436 1.635 1.748 1.863 1.991 2.158 2.256 2.427 2.583 2.727 2.8 2.948 3.091 3.29 3.408 3.527 3.704 3.884 4.056 4.221 4.378 4.564 4.75 4.935 5.154 5.373 5.577 5.799 6.05 6.303 6.579 6.865 7.161 7.479 7.848 8.249 8.658 9.113 9.555 10.049 10.573 11.051 11.477 11.798 11.622 11.183 10.704 10.24 9.772 9.313 8.886 8.495 8.066 7.682 7.335 6.989 6.683 6.414 6.142 5.847 5.6 5.393 5.171 4.921 4.713 4.493 4.256 4.083 3.908 3.714 3.506 3.301 3.151 2.99 2.758 2.608 2.457 2.382 2.234 2.075 1.897 1.803 1.631 1.505 1.386 1.25 0.981 0.825 0.65 0.45 0.203 -0.112 -0.481 -1.851 -10 ,17931 ,KEBNE ,17042337,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:58:49 CET,0.0 0.292 0.464 0.622 0.749 0.88 1.016 1.145 1.386 1.501 1.614 1.759 1.936 2.041 2.238 2.409 2.569 2.647 2.803 2.953 3.146 3.272 3.397 3.578 3.751 3.912 4.06 4.207 4.415 4.613 4.807 5.032 5.242 5.439 5.669 5.941 6.183 6.447 6.738 7.041 7.344 7.669 8.064 8.454 8.86 9.28 9.783 10.367 10.957 11.461 11.711 11.514 11.142 10.755 10.357 9.889 9.393 8.916 8.505 8.067 7.675 7.346 7.021 6.695 6.393 6.125 5.867 5.646 5.443 5.217 4.973 4.777 4.579 4.373 4.22 4.068 3.9 3.723 3.513 3.351 3.19 2.939 2.761 2.59 2.503 2.314 2.12 1.908 1.803 1.631 1.491 1.371 1.234 0.916 0.747 0.568 0.356 0.135 -0.113 -0.457 -1.775 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_31_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_31_37.txt deleted file mode 100644 index 3025617f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_31_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5279 ,KEBNE ,17042338,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:58:33 CET,0.0 0.599 0.854 1.055 1.223 1.354 1.484 1.619 1.861 1.968 2.076 2.201 2.379 2.473 2.65 2.812 2.969 3.049 3.205 3.363 3.597 3.744 3.884 4.098 4.308 4.518 4.721 4.912 5.175 5.42 5.649 5.936 6.217 6.505 6.836 7.186 7.522 7.897 8.302 8.733 9.195 9.717 10.339 10.998 11.758 12.586 13.556 14.627 15.894 17.39 19.147 20.592 21.38 21.825 22.065 22.18 22.216 22.206 22.172 22.123 22.053 21.981 21.907 21.807 21.699 21.607 21.503 21.405 21.317 21.225 21.12 21.017 20.921 20.827 20.748 20.656 20.55 20.437 20.312 20.228 20.155 20.054 19.979 19.903 19.857 19.751 19.643 19.525 19.467 19.362 19.299 19.228 19.152 19.0 18.911 18.811 18.689 18.558 18.414 18.218 17.734 -2 ,22801 ,KEBNE ,17042339,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:57:30 CET,0.0 0.864 1.174 1.404 1.586 1.743 1.88 2.006 2.231 2.33 2.43 2.566 2.74 2.835 3.02 3.201 3.363 3.443 3.603 3.759 3.977 4.108 4.237 4.425 4.607 4.79 4.965 5.137 5.372 5.611 5.839 6.104 6.358 6.598 6.881 7.211 7.528 7.892 8.281 8.706 9.169 9.689 10.303 10.919 11.641 12.44 13.394 14.484 15.711 17.186 19.02 20.396 21.078 21.5 21.742 21.891 21.957 21.972 21.971 21.935 21.876 21.798 21.714 21.614 21.517 21.432 21.343 21.26 21.184 21.108 21.025 20.959 20.889 20.811 20.749 20.68 20.602 20.514 20.416 20.348 20.28 20.171 20.097 20.021 19.978 19.881 19.781 19.681 19.628 19.526 19.448 19.365 19.279 19.107 19.016 18.922 18.815 18.685 18.539 18.321 17.732 -3 ,32232 ,KEBNE ,17042340,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:57:30 CET,0.0 0.617 0.845 1.032 1.191 1.326 1.465 1.601 1.847 1.965 2.08 2.209 2.382 2.477 2.66 2.835 3.002 3.082 3.237 3.389 3.608 3.75 3.883 4.07 4.256 4.442 4.611 4.778 5.014 5.238 5.459 5.726 5.987 6.231 6.516 6.854 7.187 7.561 7.981 8.416 8.852 9.34 9.93 10.573 11.325 12.156 13.148 14.265 15.546 17.068 18.859 20.206 20.933 21.365 21.586 21.716 21.773 21.756 21.715 21.645 21.563 21.489 21.41 21.315 21.211 21.113 21.006 20.899 20.811 20.724 20.63 20.543 20.448 20.347 20.266 20.173 20.069 19.964 19.85 19.762 19.671 19.542 19.463 19.385 19.343 19.253 19.154 19.046 18.992 18.886 18.805 18.733 18.657 18.486 18.382 18.271 18.154 18.028 17.87 17.63 17.11 -4 ,10101 ,KEBNE ,17042341,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:58:43 CET,0.0 0.941 1.303 1.618 1.884 2.108 2.324 2.485 2.768 2.913 3.06 3.257 3.448 3.562 3.773 3.967 4.146 4.236 4.413 4.569 4.801 4.958 5.103 5.327 5.567 5.798 5.996 6.183 6.43 6.672 6.904 7.188 7.475 7.755 8.067 8.418 8.767 9.14 9.547 9.994 10.465 10.991 11.603 12.254 12.994 13.801 14.757 15.805 17.061 18.603 20.418 21.837 22.59 22.993 23.231 23.346 23.389 23.391 23.366 23.313 23.242 23.186 23.14 23.086 23.026 22.963 22.89 22.81 22.732 22.647 22.555 22.483 22.407 22.325 22.254 22.169 22.086 22.006 21.915 21.845 21.78 21.675 21.588 21.493 21.449 21.362 21.261 21.156 21.096 20.971 20.868 20.789 20.706 20.509 20.405 20.289 20.152 19.998 19.802 19.541 18.727 -5 ,21419 ,KEBNE ,17042342,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:58:30 CET,0.0 1.022 1.308 1.514 1.687 1.82 1.949 2.08 2.317 2.422 2.529 2.651 2.815 2.906 3.088 3.266 3.437 3.526 3.699 3.859 4.075 4.215 4.358 4.574 4.796 5.012 5.213 5.405 5.666 5.927 6.172 6.458 6.732 6.999 7.304 7.648 7.992 8.374 8.792 9.227 9.69 10.236 10.881 11.515 12.266 13.086 14.023 15.136 16.386 17.839 19.673 21.088 21.799 22.196 22.405 22.553 22.611 22.609 22.582 22.517 22.448 22.384 22.317 22.239 22.163 22.082 21.975 21.873 21.782 21.683 21.587 21.502 21.409 21.321 21.249 21.164 21.08 20.996 20.901 20.837 20.774 20.669 20.592 20.506 20.456 20.359 20.263 20.161 20.102 19.988 19.896 19.824 19.745 19.559 19.46 19.344 19.212 19.084 18.904 18.661 18.051 -6 ,30414 ,KEBNE ,17042343,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:56:56 CET,0.0 0.701 0.959 1.185 1.342 1.483 1.619 1.754 1.989 2.096 2.202 2.315 2.495 2.593 2.759 2.915 3.075 3.159 3.324 3.478 3.694 3.829 3.963 4.167 4.357 4.547 4.742 4.94 5.196 5.44 5.678 5.96 6.23 6.491 6.791 7.131 7.462 7.825 8.238 8.69 9.157 9.691 10.327 10.962 11.717 12.551 13.502 14.559 15.785 17.309 19.141 20.546 21.286 21.701 21.953 22.066 22.115 22.127 22.099 22.016 21.915 21.839 21.752 21.646 21.549 21.464 21.368 21.277 21.197 21.103 20.983 20.891 20.799 20.691 20.606 20.512 20.411 20.312 20.208 20.126 20.042 19.916 19.823 19.734 19.687 19.591 19.493 19.382 19.324 19.212 19.138 19.069 18.998 18.838 18.746 18.648 18.532 18.386 18.205 17.921 16.842 -7 ,29088 ,KEBNE ,17042344,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:57:09 CET,0.0 0.664 0.93 1.126 1.284 1.436 1.585 1.716 1.943 2.046 2.14 2.252 2.417 2.507 2.686 2.858 3.021 3.098 3.251 3.401 3.613 3.744 3.87 4.06 4.244 4.416 4.585 4.762 5.002 5.226 5.442 5.702 5.948 6.192 6.483 6.8 7.089 7.418 7.791 8.211 8.668 9.209 9.871 10.532 11.3 12.157 13.125 14.204 15.531 17.1 18.867 20.218 20.965 21.375 21.592 21.722 21.787 21.818 21.795 21.73 21.663 21.583 21.505 21.425 21.328 21.241 21.147 21.052 20.976 20.897 20.812 20.739 20.656 20.565 20.489 20.402 20.323 20.241 20.157 20.101 20.038 19.927 19.85 19.77 19.726 19.63 19.527 19.42 19.36 19.251 19.172 19.104 19.03 18.843 18.738 18.615 18.476 18.33 18.16 17.931 17.346 -8 ,26550 ,KEBNE ,17042345,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:56:56 CET,0.0 0.684 0.959 1.184 1.375 1.519 1.637 1.762 2.013 2.129 2.237 2.355 2.53 2.633 2.826 2.997 3.161 3.242 3.397 3.542 3.747 3.877 4.005 4.188 4.367 4.557 4.736 4.908 5.144 5.369 5.585 5.851 6.112 6.37 6.667 7.017 7.353 7.713 8.121 8.578 9.054 9.571 10.19 10.825 11.571 12.409 13.354 14.432 15.716 17.204 19.037 20.508 21.254 21.671 21.921 22.013 22.031 22.035 22.019 21.982 21.91 21.835 21.757 21.663 21.569 21.48 21.376 21.28 21.188 21.095 21.008 20.925 20.839 20.752 20.681 20.602 20.52 20.43 20.342 20.282 20.214 20.101 20.031 19.96 19.919 19.822 19.71 19.585 19.517 19.401 19.312 19.235 19.156 18.991 18.894 18.779 18.651 18.513 18.355 18.142 17.701 -9 ,16251 ,KEBNE ,17042346,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:58:39 CET,0.0 1.107 1.494 1.786 2.04 2.265 2.46 2.634 2.938 3.082 3.216 3.381 3.572 3.684 3.88 4.074 4.268 4.361 4.54 4.708 4.94 5.09 5.241 5.462 5.675 5.878 6.08 6.277 6.534 6.773 7.001 7.275 7.535 7.798 8.106 8.453 8.788 9.156 9.567 10.006 10.478 11.017 11.636 12.259 13.002 13.817 14.744 15.821 17.077 18.562 20.353 21.662 22.353 22.772 23.003 23.128 23.189 23.191 23.16 23.13 23.08 23.002 22.916 22.828 22.734 22.648 22.565 22.487 22.4 22.293 22.185 22.099 22.007 21.904 21.829 21.756 21.672 21.582 21.495 21.429 21.357 21.248 21.176 21.092 21.044 20.949 20.839 20.726 20.67 20.559 20.49 20.421 20.344 20.183 20.081 19.966 19.835 19.698 19.552 19.318 18.679 -10 ,1047 ,KEBNE ,17042347,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:57:11 CET,0.0 1.145 1.498 1.793 2.019 2.211 2.386 2.553 2.874 3.013 3.143 3.305 3.489 3.596 3.813 4.018 4.215 4.315 4.509 4.682 4.918 5.072 5.215 5.427 5.641 5.856 6.066 6.258 6.512 6.771 7.017 7.295 7.566 7.835 8.141 8.487 8.842 9.227 9.627 10.059 10.511 11.031 11.643 12.273 13.029 13.881 14.853 15.94 17.217 18.687 20.391 21.737 22.506 22.972 23.23 23.355 23.42 23.433 23.396 23.344 23.287 23.214 23.134 23.054 22.973 22.877 22.763 22.673 22.588 22.491 22.387 22.281 22.171 22.075 21.997 21.904 21.798 21.68 21.56 21.486 21.406 21.281 21.2 21.113 21.069 20.972 20.863 20.739 20.669 20.553 20.483 20.416 20.343 20.183 20.096 19.991 19.865 19.711 19.518 19.244 18.221 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_32_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_32_19.txt deleted file mode 100644 index 5bfb9dba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_32_19.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,19185 ,KEBNE ,16654062,Mon Nov 22 05:15:38 CET,Mon Nov 22 06:40:06 CET,0.0 1.197 1.539 1.77 1.969 2.155 2.326 2.482 2.746 2.86 2.986 3.104 3.3 3.4 3.602 3.805 3.996 4.081 4.236 4.384 4.595 4.719 4.849 5.048 5.233 5.406 5.57 5.742 5.967 6.175 6.377 6.627 6.86 7.074 7.354 7.697 8.007 8.35 8.721 9.13 9.568 10.041 10.592 11.166 11.863 12.629 13.533 14.599 15.893 17.447 19.335 20.984 21.977 22.582 22.998 23.322 23.535 23.689 23.807 23.889 23.924 23.942 23.957 23.952 23.934 23.923 23.902 23.873 23.845 23.797 23.749 23.715 23.679 23.647 23.612 23.563 23.511 23.462 23.419 23.382 23.339 23.269 23.221 23.178 23.148 23.064 22.982 22.899 22.862 22.761 22.766 22.731 22.7 22.632 22.591 22.536 22.478 22.416 22.336 22.264 22.129 -3 ,9414 ,KEBNE ,16654063,Mon Nov 22 05:15:38 CET,Mon Nov 22 06:38:55 CET,0.0 1.201 1.565 1.828 2.051 2.224 2.395 2.555 2.818 2.941 3.05 3.157 3.359 3.453 3.636 3.811 3.977 4.054 4.201 4.35 4.576 4.723 4.866 5.075 5.272 5.457 5.636 5.811 6.034 6.252 6.462 6.705 6.953 7.211 7.504 7.831 8.17 8.536 8.928 9.354 9.795 10.298 10.897 11.511 12.218 12.981 13.864 14.919 16.18 17.686 19.58 21.198 22.174 22.831 23.28 23.584 23.795 23.962 24.082 24.189 24.275 24.325 24.358 24.385 24.398 24.41 24.417 24.414 24.405 24.39 24.372 24.354 24.33 24.301 24.278 24.246 24.216 24.19 24.16 24.141 24.115 24.065 24.025 23.987 23.968 23.925 23.877 23.817 23.784 23.679 23.694 23.653 23.609 23.522 23.476 23.429 23.389 23.341 23.253 23.136 22.934 -4 ,21272 ,KEBNE ,16654064,Mon Nov 22 05:15:38 CET,Mon Nov 22 06:38:44 CET,0.0 1.151 1.464 1.698 1.921 2.128 2.313 2.471 2.714 2.821 2.935 3.042 3.236 3.329 3.509 3.694 3.864 3.946 4.098 4.245 4.465 4.6 4.734 4.944 5.14 5.313 5.487 5.671 5.9 6.104 6.304 6.56 6.798 7.028 7.317 7.657 7.971 8.3 8.66 9.059 9.482 9.959 10.529 11.103 11.807 12.625 13.565 14.614 15.847 17.341 19.21 20.84 21.831 22.502 22.978 23.289 23.467 23.582 23.672 23.743 23.8 23.846 23.857 23.855 23.851 23.831 23.797 23.763 23.737 23.711 23.68 23.649 23.612 23.582 23.557 23.516 23.477 23.443 23.407 23.382 23.351 23.309 23.28 23.237 23.211 23.161 23.12 23.074 23.044 22.942 22.962 22.931 22.901 22.832 22.794 22.749 22.694 22.623 22.541 22.43 22.274 -5 ,16871 ,KEBNE ,16654065,Mon Nov 22 05:15:38 CET,Mon Nov 22 06:38:50 CET,0.0 1.092 1.413 1.636 1.833 2.021 2.175 2.319 2.595 2.722 2.84 2.971 3.177 3.279 3.469 3.646 3.815 3.895 4.044 4.188 4.395 4.524 4.667 4.873 5.058 5.243 5.422 5.597 5.81 6.016 6.226 6.506 6.802 7.075 7.368 7.696 8.013 8.367 8.76 9.184 9.624 10.102 10.659 11.226 11.897 12.672 13.591 14.67 15.984 17.526 19.462 21.09 22.032 22.654 23.082 23.397 23.607 23.76 23.893 23.992 24.044 24.078 24.107 24.134 24.158 24.16 24.135 24.114 24.1 24.088 24.061 24.038 24.029 24.01 23.988 23.971 23.957 23.929 23.889 23.864 23.837 23.788 23.755 23.725 23.711 23.674 23.618 23.565 23.546 23.445 23.456 23.423 23.392 23.324 23.277 23.226 23.181 23.125 23.054 22.965 22.753 -6 ,27796 ,KEBNE ,16654066,Mon Nov 22 05:15:38 CET,Mon Nov 22 06:39:00 CET,0.0 0.961 1.276 1.519 1.691 1.849 1.989 2.127 2.395 2.512 2.622 2.736 2.94 3.044 3.247 3.435 3.616 3.698 3.848 3.996 4.201 4.331 4.462 4.653 4.843 5.031 5.212 5.391 5.624 5.841 6.05 6.321 6.578 6.805 7.076 7.384 7.696 8.052 8.426 8.84 9.278 9.761 10.337 10.918 11.599 12.381 13.323 14.385 15.643 17.181 19.042 20.638 21.608 22.211 22.639 22.944 23.126 23.264 23.36 23.434 23.485 23.521 23.556 23.585 23.602 23.61 23.61 23.601 23.591 23.576 23.561 23.545 23.525 23.503 23.481 23.456 23.429 23.401 23.368 23.337 23.3 23.25 23.223 23.194 23.175 23.134 23.088 23.036 23.008 22.904 22.923 22.893 22.865 22.806 22.767 22.717 22.665 22.607 22.511 22.393 22.232 -7 ,11411 ,KEBNE ,16654067,Mon Nov 22 05:16:40 CET,Mon Nov 22 06:41:20 CET,0.0 1.216 1.561 1.797 1.985 2.125 2.267 2.405 2.641 2.756 2.876 2.997 3.194 3.292 3.503 3.7 3.889 3.987 4.183 4.36 4.6 4.756 4.906 5.126 5.335 5.541 5.736 5.931 6.186 6.427 6.672 6.989 7.27 7.527 7.832 8.162 8.485 8.845 9.22 9.604 10.042 10.559 11.13 11.702 12.387 13.157 14.07 15.131 16.374 17.851 19.742 21.363 22.316 22.972 23.425 23.753 23.992 24.171 24.287 24.348 24.382 24.408 24.419 24.404 24.385 24.376 24.372 24.366 24.355 24.336 24.312 24.299 24.28 24.246 24.219 24.195 24.17 24.141 24.106 24.075 24.03 23.972 23.933 23.893 23.876 23.823 23.764 23.712 23.686 23.582 23.594 23.558 23.516 23.431 23.387 23.348 23.308 23.258 23.198 23.114 22.948 -8 ,26910 ,KEBNE ,16654068,Mon Nov 22 05:16:40 CET,Mon Nov 22 06:41:09 CET,0.0 1.115 1.419 1.649 1.874 2.06 2.214 2.362 2.648 2.771 2.892 3.04 3.256 3.361 3.549 3.728 3.898 3.987 4.153 4.301 4.513 4.646 4.777 4.973 5.162 5.341 5.519 5.697 5.931 6.159 6.382 6.659 6.93 7.178 7.462 7.782 8.088 8.453 8.846 9.248 9.673 10.153 10.719 11.281 11.935 12.72 13.648 14.655 15.854 17.344 19.247 20.857 21.799 22.423 22.882 23.212 23.443 23.606 23.72 23.791 23.817 23.841 23.863 23.885 23.899 23.888 23.857 23.834 23.811 23.784 23.751 23.717 23.677 23.63 23.584 23.542 23.502 23.454 23.401 23.354 23.305 23.234 23.189 23.146 23.124 23.079 23.036 22.995 22.962 22.847 22.853 22.813 22.766 22.683 22.635 22.587 22.546 22.487 22.406 22.311 22.207 -10 ,13101 ,KEBNE ,16654070,Mon Nov 22 05:16:44 CET,Mon Nov 22 06:38:25 CET,0.0 0.945 1.291 1.568 1.799 1.986 2.145 2.285 2.534 2.652 2.767 2.876 3.073 3.18 3.39 3.6 3.79 3.88 4.061 4.233 4.485 4.642 4.788 5.011 5.221 5.417 5.611 5.802 6.038 6.254 6.467 6.741 7.011 7.262 7.555 7.894 8.21 8.564 8.957 9.362 9.79 10.273 10.824 11.397 12.059 12.805 13.713 14.739 15.997 17.562 19.505 21.17 22.224 22.896 23.347 23.669 23.894 24.051 24.159 24.233 24.269 24.307 24.321 24.313 24.304 24.286 24.265 24.244 24.228 24.219 24.205 24.188 24.166 24.132 24.105 24.079 24.047 24.015 23.988 23.967 23.944 23.898 23.863 23.822 23.802 23.767 23.723 23.673 23.647 23.545 23.568 23.537 23.497 23.398 23.339 23.264 23.185 23.105 23.026 22.935 22.58 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_33_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_33_19.txt deleted file mode 100644 index dc1bf5e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_33_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16617 ,KEBNE ,17042348,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:56:15 CET,0.0 0.195 0.331 0.419 0.481 0.539 0.598 0.649 0.759 0.836 0.907 0.951 1.075 1.127 1.222 1.307 1.384 1.421 1.483 1.544 1.65 1.714 1.773 1.859 1.951 2.038 2.114 2.188 2.274 2.354 2.442 2.568 2.692 2.802 2.922 3.051 3.174 3.306 3.451 3.608 3.761 3.905 4.073 4.255 4.437 4.612 4.779 4.908 5.028 5.035 4.8 4.361 3.892 3.403 2.887 2.426 2.042 1.657 1.329 1.014 0.725 0.469 0.222 -0.016 -0.231 -0.416 -0.622 -0.828 -1.002 -1.183 -1.365 -1.505 -1.651 -1.804 -1.915 -2.037 -2.173 -2.307 -2.444 -2.543 -2.64 -2.788 -2.894 -3.002 -3.059 -3.179 -3.307 -3.448 -3.523 -3.67 -3.755 -3.857 -3.951 -4.141 -4.262 -4.394 -4.523 -4.684 -4.915 -5.192 -5.829 -2 ,28701 ,KEBNE ,17042349,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:55:16 CET,0.0 0.149 0.268 0.37 0.446 0.514 0.581 0.649 0.771 0.818 0.867 0.89 1.005 1.043 1.115 1.183 1.252 1.289 1.361 1.425 1.52 1.587 1.653 1.744 1.827 1.903 1.982 2.061 2.156 2.24 2.322 2.418 2.514 2.609 2.714 2.835 2.952 3.085 3.224 3.368 3.526 3.693 3.864 4.013 4.183 4.362 4.533 4.688 4.804 4.85 4.712 4.296 3.788 3.292 2.816 2.378 1.994 1.654 1.344 1.021 0.759 0.529 0.307 0.088 -0.113 -0.304 -0.513 -0.697 -0.866 -1.052 -1.239 -1.389 -1.542 -1.714 -1.836 -1.96 -2.104 -2.246 -2.399 -2.515 -2.641 -2.82 -2.921 -3.032 -3.096 -3.233 -3.379 -3.531 -3.607 -3.768 -3.888 -3.994 -4.095 -4.31 -4.426 -4.551 -4.712 -4.881 -5.068 -5.333 -6.139 -3 ,19451 ,KEBNE ,17042350,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:54:47 CET,0.0 0.304 0.436 0.523 0.61 0.701 0.779 0.829 0.923 0.974 1.016 1.033 1.142 1.178 1.248 1.331 1.423 1.461 1.526 1.6 1.717 1.789 1.86 1.956 2.044 2.128 2.203 2.272 2.359 2.453 2.548 2.653 2.734 2.814 2.906 3.008 3.127 3.265 3.408 3.555 3.711 3.877 4.055 4.231 4.433 4.654 4.847 5.008 5.125 5.137 4.995 4.609 4.095 3.555 3.058 2.607 2.194 1.816 1.488 1.151 0.845 0.566 0.314 0.084 -0.145 -0.359 -0.583 -0.757 -0.913 -1.096 -1.262 -1.4 -1.551 -1.702 -1.819 -1.952 -2.089 -2.238 -2.392 -2.485 -2.585 -2.745 -2.853 -2.964 -3.02 -3.152 -3.308 -3.462 -3.547 -3.71 -3.795 -3.894 -4.004 -4.262 -4.406 -4.548 -4.691 -4.842 -5.059 -5.329 -5.931 -4 ,28832 ,KEBNE ,17042351,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:54:56 CET,0.0 0.236 0.323 0.426 0.519 0.589 0.64 0.686 0.799 0.849 0.9 0.92 1.036 1.08 1.155 1.226 1.294 1.323 1.382 1.447 1.544 1.611 1.677 1.764 1.848 1.931 2.017 2.096 2.186 2.269 2.348 2.449 2.546 2.638 2.737 2.847 2.95 3.055 3.176 3.311 3.46 3.622 3.794 3.951 4.119 4.303 4.492 4.675 4.822 4.835 4.565 4.096 3.6 3.093 2.632 2.216 1.84 1.494 1.186 0.882 0.613 0.359 0.122 -0.11 -0.322 -0.502 -0.693 -0.884 -1.051 -1.22 -1.397 -1.54 -1.686 -1.841 -1.961 -2.088 -2.221 -2.352 -2.496 -2.593 -2.689 -2.841 -2.947 -3.057 -3.112 -3.236 -3.369 -3.518 -3.601 -3.757 -3.859 -3.955 -4.055 -4.293 -4.43 -4.563 -4.708 -4.878 -5.067 -5.321 -6.262 -5 ,6470 ,KEBNE ,17042352,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:56:28 CET,0.0 0.164 0.242 0.311 0.386 0.459 0.529 0.596 0.708 0.76 0.815 0.848 0.968 1.011 1.095 1.182 1.268 1.307 1.378 1.442 1.53 1.595 1.657 1.751 1.844 1.92 1.995 2.073 2.164 2.251 2.336 2.429 2.511 2.601 2.719 2.845 2.952 3.068 3.208 3.356 3.493 3.641 3.804 3.964 4.157 4.325 4.474 4.647 4.783 4.809 4.611 4.125 3.591 3.094 2.638 2.218 1.849 1.528 1.251 0.952 0.708 0.496 0.268 0.056 -0.13 -0.318 -0.518 -0.694 -0.854 -1.027 -1.213 -1.374 -1.534 -1.676 -1.786 -1.902 -2.02 -2.147 -2.269 -2.364 -2.48 -2.663 -2.784 -2.898 -2.959 -3.095 -3.236 -3.39 -3.468 -3.626 -3.717 -3.813 -3.915 -4.124 -4.244 -4.385 -4.539 -4.702 -4.91 -5.202 -6.19 -6 ,4377 ,KEBNE ,17042353,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:56:30 CET,0.0 0.416 0.609 0.733 0.854 0.939 1.005 1.062 1.173 1.231 1.285 1.317 1.426 1.465 1.539 1.617 1.696 1.731 1.795 1.856 1.946 2.009 2.062 2.148 2.243 2.325 2.392 2.458 2.557 2.652 2.739 2.847 2.954 3.046 3.149 3.263 3.369 3.475 3.582 3.709 3.833 3.954 4.096 4.233 4.366 4.489 4.623 4.748 4.83 4.868 4.732 4.312 3.832 3.303 2.809 2.389 2.015 1.647 1.325 1.014 0.732 0.468 0.212 -0.045 -0.293 -0.525 -0.765 -0.976 -1.156 -1.341 -1.532 -1.694 -1.866 -2.045 -2.186 -2.322 -2.461 -2.619 -2.788 -2.906 -3.017 -3.191 -3.319 -3.45 -3.516 -3.643 -3.779 -3.924 -4.004 -4.169 -4.267 -4.367 -4.477 -4.681 -4.788 -4.919 -5.079 -5.253 -5.494 -5.782 -6.636 -7 ,19143 ,KEBNE ,17042354,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:56:30 CET,0.0 0.167 0.283 0.371 0.452 0.528 0.593 0.652 0.76 0.812 0.854 0.854 0.966 1.012 1.109 1.189 1.257 1.295 1.371 1.437 1.538 1.606 1.666 1.746 1.824 1.902 1.984 2.062 2.161 2.253 2.334 2.43 2.527 2.629 2.742 2.851 2.947 3.059 3.194 3.332 3.457 3.597 3.761 3.902 4.041 4.19 4.347 4.505 4.627 4.623 4.412 3.901 3.342 2.833 2.355 1.933 1.568 1.233 0.931 0.601 0.299 0.026 -0.234 -0.473 -0.687 -0.895 -1.131 -1.332 -1.5 -1.684 -1.885 -2.046 -2.204 -2.382 -2.525 -2.671 -2.819 -2.97 -3.142 -3.269 -3.384 -3.556 -3.68 -3.807 -3.871 -4.003 -4.14 -4.289 -4.369 -4.515 -4.588 -4.664 -4.748 -4.943 -5.053 -5.167 -5.293 -5.464 -5.67 -5.915 -7.015 -8 ,8703 ,KEBNE ,17042355,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:55:21 CET,0.0 0.176 0.287 0.383 0.469 0.542 0.595 0.655 0.781 0.839 0.893 0.935 1.058 1.1 1.181 1.258 1.328 1.362 1.429 1.495 1.591 1.651 1.713 1.799 1.877 1.956 2.033 2.1 2.192 2.292 2.376 2.468 2.558 2.647 2.751 2.874 2.985 3.085 3.193 3.31 3.449 3.608 3.772 3.926 4.103 4.292 4.486 4.657 4.804 4.854 4.614 4.134 3.593 3.042 2.563 2.124 1.713 1.341 1.027 0.702 0.414 0.161 -0.064 -0.272 -0.478 -0.665 -0.867 -1.054 -1.199 -1.347 -1.517 -1.659 -1.798 -1.945 -2.074 -2.201 -2.322 -2.457 -2.604 -2.712 -2.823 -2.988 -3.103 -3.223 -3.286 -3.415 -3.553 -3.705 -3.788 -3.951 -4.071 -4.176 -4.289 -4.529 -4.676 -4.827 -4.972 -5.159 -5.394 -5.687 -6.394 -9 ,19355 ,KEBNE ,17042356,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:55:10 CET,0.0 0.205 0.351 0.433 0.507 0.574 0.637 0.696 0.795 0.846 0.905 0.944 1.051 1.09 1.165 1.237 1.309 1.342 1.407 1.471 1.557 1.608 1.659 1.735 1.812 1.893 1.975 2.051 2.144 2.233 2.32 2.442 2.561 2.663 2.779 2.913 3.043 3.174 3.314 3.456 3.596 3.757 3.946 4.125 4.285 4.431 4.591 4.747 4.883 4.926 4.762 4.302 3.814 3.352 2.931 2.519 2.127 1.754 1.446 1.143 0.866 0.598 0.346 0.136 -0.077 -0.291 -0.507 -0.701 -0.884 -1.076 -1.266 -1.423 -1.589 -1.77 -1.911 -2.046 -2.173 -2.304 -2.447 -2.547 -2.653 -2.809 -2.916 -3.033 -3.096 -3.226 -3.371 -3.527 -3.609 -3.765 -3.849 -3.943 -4.032 -4.222 -4.34 -4.473 -4.625 -4.812 -5.036 -5.313 -6.204 -10 ,16720 ,KEBNE ,17042357,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:54:50 CET,0.0 0.262 0.384 0.49 0.576 0.641 0.695 0.748 0.863 0.922 0.969 0.993 1.11 1.154 1.237 1.314 1.392 1.43 1.497 1.559 1.654 1.715 1.771 1.854 1.927 1.993 2.06 2.125 2.212 2.298 2.378 2.472 2.563 2.653 2.75 2.876 3.005 3.132 3.271 3.416 3.569 3.731 3.901 4.058 4.216 4.406 4.607 4.752 4.864 4.907 4.693 4.233 3.74 3.246 2.779 2.338 1.93 1.534 1.179 0.835 0.559 0.312 0.067 -0.164 -0.385 -0.598 -0.815 -1.005 -1.171 -1.349 -1.54 -1.695 -1.853 -2.022 -2.166 -2.318 -2.453 -2.604 -2.767 -2.868 -2.972 -3.137 -3.25 -3.367 -3.43 -3.56 -3.701 -3.849 -3.927 -4.084 -4.195 -4.292 -4.384 -4.598 -4.714 -4.821 -4.962 -5.129 -5.297 -5.542 -6.056 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_33_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_33_20.txt deleted file mode 100644 index 464429e2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_33_20.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,28509 ,KEBNE ,16654072,Mon Nov 22 05:17:43 CET,Mon Nov 22 06:44:21 CET,0.0 2.717 3.144 3.46 3.719 3.967 4.188 4.384 4.723 4.87 5.006 5.187 5.367 5.472 5.683 5.872 6.046 6.133 6.297 6.466 6.718 6.875 7.034 7.249 7.426 7.585 7.742 7.901 8.097 8.273 8.437 8.637 8.845 9.032 9.24 9.466 9.663 9.884 10.098 10.308 10.536 10.781 11.037 11.262 11.504 11.781 12.039 12.246 12.406 12.311 11.671 10.736 9.932 9.106 8.332 7.652 7.018 6.466 6.0 5.529 5.128 4.76 4.418 4.092 3.805 3.556 3.281 3.023 2.815 2.62 2.412 2.237 2.052 1.864 1.722 1.578 1.425 1.258 1.079 0.951 0.827 0.655 0.545 0.418 0.341 0.18 0.021 -0.148 -0.232 -0.403 -0.506 -0.611 -0.719 -0.944 -1.063 -1.196 -1.367 -1.569 -1.78 -2.041 -2.567 -3 ,19585 ,KEBNE ,16654073,Mon Nov 22 05:17:43 CET,Mon Nov 22 06:44:38 CET,0.0 2.247 2.693 3.015 3.284 3.55 3.792 4.019 4.377 4.526 4.671 4.833 5.024 5.139 5.326 5.515 5.719 5.799 5.931 6.079 6.317 6.471 6.597 6.768 6.934 7.075 7.219 7.369 7.538 7.704 7.862 8.035 8.209 8.393 8.601 8.81 8.997 9.189 9.402 9.616 9.83 10.073 10.328 10.557 10.802 11.035 11.229 11.341 11.406 11.348 10.849 9.877 8.893 7.993 7.229 6.546 5.926 5.38 4.911 4.429 4.003 3.627 3.266 2.921 2.603 2.309 2.017 1.766 1.542 1.311 1.068 0.876 0.669 0.453 0.295 0.13 -0.039 -0.215 -0.394 -0.516 -0.645 -0.852 -1.011 -1.184 -1.267 -1.418 -1.585 -1.767 -1.852 -2.024 -2.14 -2.249 -2.357 -2.593 -2.718 -2.855 -3.009 -3.185 -3.41 -3.645 -4.272 -4 ,15122 ,KEBNE ,16654074,Mon Nov 22 05:17:43 CET,Mon Nov 22 06:44:26 CET,0.0 2.775 3.35 3.734 4.034 4.282 4.497 4.69 5.005 5.125 5.259 5.465 5.64 5.745 5.95 6.139 6.321 6.403 6.552 6.69 6.899 7.028 7.154 7.342 7.501 7.64 7.785 7.932 8.108 8.278 8.435 8.613 8.792 8.953 9.137 9.343 9.511 9.691 9.889 10.097 10.291 10.498 10.727 10.914 11.115 11.299 11.44 11.579 11.657 11.479 10.858 9.848 8.912 8.05 7.248 6.553 5.949 5.369 4.848 4.345 3.923 3.562 3.232 2.905 2.606 2.345 2.066 1.819 1.615 1.409 1.187 0.99 0.79 0.587 0.434 0.273 0.096 -0.071 -0.237 -0.354 -0.475 -0.675 -0.813 -0.96 -1.039 -1.191 -1.348 -1.506 -1.586 -1.764 -1.871 -1.976 -2.093 -2.325 -2.453 -2.613 -2.794 -2.98 -3.203 -3.482 -4.208 -5 ,18276 ,KEBNE ,16654075,Mon Nov 22 05:17:42 CET,Mon Nov 22 06:44:16 CET,0.0 2.822 3.348 3.679 3.932 4.159 4.376 4.559 4.854 4.99 5.121 5.276 5.436 5.537 5.758 5.965 6.143 6.225 6.38 6.522 6.725 6.867 6.994 7.166 7.334 7.493 7.654 7.813 8.009 8.197 8.369 8.566 8.763 8.947 9.139 9.352 9.551 9.761 9.976 10.189 10.392 10.617 10.906 11.172 11.426 11.685 11.926 12.135 12.245 12.197 11.775 10.738 9.66 8.795 8.055 7.328 6.676 6.076 5.575 5.091 4.67 4.306 3.959 3.638 3.348 3.073 2.777 2.513 2.29 2.066 1.834 1.641 1.447 1.234 1.07 0.917 0.756 0.58 0.401 0.279 0.151 -0.047 -0.18 -0.327 -0.406 -0.557 -0.696 -0.85 -0.942 -1.127 -1.233 -1.333 -1.433 -1.655 -1.784 -1.924 -2.075 -2.256 -2.457 -2.711 -3.582 -6 ,4786 ,KEBNE ,16654076,Mon Nov 22 05:17:42 CET,Mon Nov 22 06:44:20 CET,0.0 2.665 3.252 3.597 3.872 4.118 4.34 4.529 4.841 4.986 5.114 5.275 5.457 5.567 5.794 6.008 6.188 6.271 6.427 6.569 6.805 6.958 7.091 7.28 7.453 7.62 7.785 7.931 8.108 8.293 8.467 8.659 8.83 8.991 9.192 9.417 9.633 9.858 10.063 10.264 10.463 10.685 10.94 11.159 11.377 11.58 11.758 11.903 11.924 11.681 11.094 10.137 9.125 8.159 7.305 6.558 5.896 5.3 4.824 4.335 3.915 3.566 3.228 2.904 2.591 2.306 2.022 1.766 1.547 1.325 1.101 0.918 0.73 0.544 0.383 0.21 0.041 -0.133 -0.305 -0.426 -0.554 -0.751 -0.89 -1.026 -1.099 -1.261 -1.42 -1.58 -1.663 -1.84 -1.938 -2.031 -2.129 -2.352 -2.473 -2.603 -2.748 -2.911 -3.123 -3.38 -4.607 -7 ,21573 ,KEBNE ,16654077,Mon Nov 22 05:17:43 CET,Mon Nov 22 06:44:13 CET,0.0 2.565 3.138 3.511 3.807 4.048 4.251 4.43 4.742 4.884 5.03 5.217 5.385 5.499 5.708 5.887 6.061 6.137 6.277 6.429 6.63 6.748 6.872 7.038 7.178 7.314 7.459 7.59 7.75 7.91 8.06 8.248 8.449 8.63 8.816 9.021 9.206 9.396 9.587 9.794 10.024 10.245 10.469 10.663 10.867 11.107 11.343 11.537 11.632 11.432 10.769 9.866 8.978 8.138 7.405 6.724 6.143 5.612 5.147 4.694 4.294 3.928 3.583 3.271 2.973 2.696 2.413 2.165 1.948 1.703 1.453 1.257 1.065 0.871 0.706 0.538 0.372 0.204 0.03 -0.099 -0.233 -0.444 -0.592 -0.736 -0.804 -0.948 -1.108 -1.276 -1.362 -1.531 -1.63 -1.74 -1.849 -2.065 -2.189 -2.33 -2.48 -2.649 -2.84 -3.083 -3.836 -8 ,7695 ,KEBNE ,16654078,Mon Nov 22 05:18:45 CET,Mon Nov 22 06:45:45 CET,0.0 1.774 2.329 2.735 2.989 3.198 3.401 3.61 3.962 4.085 4.198 4.358 4.527 4.633 4.86 5.054 5.246 5.344 5.517 5.683 5.915 6.054 6.187 6.372 6.538 6.681 6.828 6.986 7.189 7.382 7.542 7.726 7.904 8.06 8.247 8.461 8.649 8.843 9.056 9.289 9.496 9.691 9.945 10.196 10.438 10.665 10.856 10.975 10.982 10.811 10.327 9.419 8.49 7.658 6.887 6.207 5.602 4.995 4.462 3.957 3.512 3.117 2.77 2.453 2.163 1.909 1.643 1.405 1.192 0.955 0.717 0.528 0.345 0.161 0.01 -0.15 -0.317 -0.489 -0.671 -0.797 -0.928 -1.134 -1.284 -1.436 -1.511 -1.678 -1.852 -2.038 -2.139 -2.325 -2.428 -2.528 -2.639 -2.897 -3.041 -3.173 -3.318 -3.488 -3.685 -3.955 -4.832 -9 ,13085 ,KEBNE ,16654079,Mon Nov 22 05:18:45 CET,Mon Nov 22 06:45:23 CET,0.0 2.004 2.47 2.831 3.106 3.337 3.54 3.741 4.099 4.244 4.389 4.584 4.782 4.893 5.1 5.29 5.475 5.571 5.727 5.865 6.08 6.219 6.353 6.549 6.725 6.88 7.012 7.135 7.319 7.494 7.649 7.834 8.018 8.184 8.358 8.561 8.752 8.947 9.132 9.33 9.564 9.824 10.11 10.373 10.628 10.851 11.048 11.207 11.288 11.235 10.795 9.915 9.048 8.186 7.406 6.732 6.131 5.565 5.119 4.678 4.271 3.911 3.574 3.259 2.939 2.631 2.323 2.065 1.852 1.632 1.402 1.216 1.02 0.804 0.638 0.48 0.319 0.139 -0.043 -0.168 -0.301 -0.501 -0.638 -0.779 -0.852 -1.006 -1.175 -1.343 -1.427 -1.6 -1.685 -1.782 -1.887 -2.098 -2.214 -2.355 -2.514 -2.698 -2.886 -3.115 -3.954 -10 ,13608 ,KEBNE ,16654080,Mon Nov 22 05:18:45 CET,Mon Nov 22 06:45:22 CET,0.0 3.065 3.643 4.047 4.345 4.609 4.844 5.023 5.326 5.47 5.607 5.789 5.986 6.107 6.304 6.501 6.71 6.795 6.944 7.095 7.297 7.419 7.535 7.702 7.891 8.071 8.217 8.347 8.511 8.689 8.86 9.049 9.233 9.416 9.623 9.824 10.013 10.236 10.463 10.691 10.93 11.226 11.535 11.769 12.025 12.278 12.474 12.595 12.652 12.487 11.824 10.704 9.75 8.945 8.2 7.529 6.905 6.321 5.832 5.33 4.872 4.455 4.073 3.715 3.372 3.074 2.774 2.507 2.273 2.016 1.766 1.576 1.363 1.133 0.967 0.792 0.61 0.416 0.205 0.075 -0.047 -0.245 -0.379 -0.511 -0.585 -0.755 -0.938 -1.111 -1.195 -1.372 -1.479 -1.577 -1.672 -1.878 -1.998 -2.13 -2.29 -2.469 -2.655 -2.973 -3.946 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_33_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_33_29.txt deleted file mode 100644 index 875baa35..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_33_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4432 ,KEBNE ,16654081,Mon Nov 22 05:18:45 CET,Mon Nov 22 06:44:50 CET,0.0 1.105 1.378 1.607 1.8 1.966 2.114 2.262 2.525 2.637 2.748 2.876 3.036 3.118 3.272 3.411 3.545 3.613 3.748 3.87 4.027 4.131 4.237 4.389 4.529 4.662 4.799 4.932 5.077 5.214 5.353 5.52 5.678 5.842 6.02 6.198 6.362 6.538 6.716 6.894 7.074 7.26 7.466 7.623 7.779 7.931 8.005 8.065 8.096 7.867 7.169 6.128 5.094 4.18 3.398 2.691 2.099 1.56 1.112 0.685 0.3 -0.05 -0.382 -0.7 -0.994 -1.263 -1.549 -1.796 -1.997 -2.207 -2.438 -2.629 -2.825 -3.043 -3.208 -3.377 -3.546 -3.72 -3.904 -4.023 -4.14 -4.313 -4.443 -4.592 -4.664 -4.802 -4.942 -5.088 -5.175 -5.337 -5.426 -5.519 -5.614 -5.811 -5.926 -6.042 -6.17 -6.324 -6.483 -6.656 -7.134 -2 ,24327 ,KEBNE ,16654082,Mon Nov 22 05:18:45 CET,Mon Nov 22 06:44:45 CET,0.0 1.053 1.386 1.647 1.84 1.986 2.121 2.256 2.494 2.603 2.709 2.834 3.0 3.093 3.258 3.414 3.574 3.654 3.806 3.945 4.128 4.248 4.366 4.517 4.657 4.798 4.932 5.051 5.218 5.386 5.536 5.714 5.877 6.027 6.197 6.375 6.551 6.728 6.894 7.07 7.237 7.42 7.639 7.858 8.076 8.255 8.385 8.415 8.336 8.06 7.333 6.184 5.074 4.114 3.354 2.679 2.057 1.45 0.925 0.432 0.028 -0.341 -0.696 -1.013 -1.296 -1.543 -1.808 -2.055 -2.27 -2.494 -2.729 -2.918 -3.109 -3.304 -3.454 -3.617 -3.792 -3.965 -4.147 -4.278 -4.411 -4.606 -4.743 -4.886 -4.954 -5.078 -5.217 -5.369 -5.444 -5.593 -5.651 -5.728 -5.812 -5.997 -6.108 -6.23 -6.363 -6.509 -6.673 -6.875 -7.449 -3 ,29469 ,KEBNE ,16654083,Mon Nov 22 05:18:45 CET,Mon Nov 22 06:44:44 CET,0.0 0.964 1.306 1.547 1.732 1.882 2.009 2.131 2.392 2.507 2.6 2.692 2.849 2.936 3.093 3.239 3.391 3.462 3.581 3.696 3.863 3.957 4.037 4.143 4.25 4.357 4.468 4.575 4.71 4.842 4.953 5.086 5.219 5.323 5.43 5.542 5.657 5.78 5.895 6.04 6.177 6.34 6.548 6.695 6.853 7.042 7.19 7.262 7.221 6.99 6.363 5.321 4.311 3.399 2.596 1.897 1.316 0.776 0.296 -0.163 -0.558 -0.916 -1.26 -1.568 -1.836 -2.083 -2.324 -2.542 -2.744 -2.946 -3.15 -3.332 -3.526 -3.711 -3.853 -3.998 -4.144 -4.286 -4.444 -4.556 -4.657 -4.82 -4.942 -5.069 -5.134 -5.256 -5.382 -5.534 -5.614 -5.764 -5.827 -5.913 -6.009 -6.21 -6.315 -6.428 -6.543 -6.669 -6.831 -7.055 -7.585 -4 ,14198 ,KEBNE ,16654084,Mon Nov 22 05:18:45 CET,Mon Nov 22 06:44:44 CET,0.0 1.043 1.361 1.599 1.805 1.985 2.14 2.279 2.532 2.652 2.776 2.928 3.096 3.176 3.313 3.437 3.557 3.62 3.752 3.88 4.075 4.204 4.312 4.45 4.583 4.708 4.834 4.962 5.115 5.251 5.376 5.517 5.675 5.83 5.988 6.17 6.326 6.494 6.688 6.867 7.029 7.208 7.409 7.588 7.76 7.924 8.084 8.177 8.134 7.903 7.185 6.113 5.117 4.238 3.496 2.825 2.218 1.649 1.152 0.648 0.219 -0.17 -0.538 -0.866 -1.165 -1.434 -1.709 -1.956 -2.169 -2.388 -2.613 -2.799 -2.99 -3.184 -3.336 -3.499 -3.673 -3.852 -4.035 -4.161 -4.288 -4.491 -4.638 -4.787 -4.861 -5.014 -5.171 -5.347 -5.439 -5.608 -5.712 -5.819 -5.934 -6.16 -6.307 -6.456 -6.612 -6.788 -6.991 -7.28 -8.18 -5 ,3897 ,KEBNE ,16654085,Mon Nov 22 05:18:45 CET,Mon Nov 22 06:44:53 CET,0.0 0.852 1.187 1.412 1.596 1.79 1.951 2.079 2.339 2.449 2.562 2.714 2.885 2.971 3.122 3.257 3.367 3.423 3.537 3.653 3.835 3.945 4.044 4.176 4.308 4.435 4.556 4.666 4.808 4.945 5.074 5.242 5.395 5.522 5.668 5.839 5.997 6.144 6.293 6.459 6.62 6.798 6.973 7.144 7.334 7.501 7.621 7.701 7.754 7.6 7.102 6.22 5.237 4.353 3.572 2.84 2.185 1.615 1.131 0.641 0.235 -0.119 -0.459 -0.785 -1.079 -1.347 -1.628 -1.871 -2.083 -2.31 -2.559 -2.762 -2.967 -3.173 -3.331 -3.51 -3.69 -3.873 -4.057 -4.178 -4.305 -4.498 -4.628 -4.757 -4.825 -4.973 -5.126 -5.287 -5.368 -5.533 -5.647 -5.734 -5.821 -6.03 -6.156 -6.282 -6.396 -6.507 -6.643 -6.837 -7.187 -6 ,5506 ,KEBNE ,16654086,Mon Nov 22 05:19:47 CET,Mon Nov 22 06:45:50 CET,0.0 2.526 2.815 3.059 3.285 3.468 3.625 3.764 4.024 4.134 4.237 4.371 4.534 4.616 4.784 4.924 5.056 5.121 5.242 5.363 5.538 5.654 5.753 5.893 6.044 6.178 6.297 6.426 6.573 6.674 6.769 6.889 7.013 7.144 7.291 7.44 7.58 7.713 7.837 7.979 8.123 8.267 8.418 8.557 8.678 8.789 8.851 8.867 8.816 8.582 7.912 6.837 5.854 4.957 4.207 3.492 2.849 2.318 1.836 1.332 0.911 0.534 0.18 -0.147 -0.468 -0.742 -0.994 -1.213 -1.39 -1.586 -1.8 -1.972 -2.147 -2.33 -2.474 -2.63 -2.786 -2.936 -3.098 -3.214 -3.336 -3.522 -3.645 -3.769 -3.832 -3.969 -4.121 -4.271 -4.344 -4.5 -4.584 -4.67 -4.754 -4.934 -5.025 -5.127 -5.249 -5.376 -5.498 -5.639 -5.959 -7 ,8154 ,KEBNE ,16654087,Mon Nov 22 05:19:47 CET,Mon Nov 22 06:46:03 CET,0.0 1.506 1.877 2.102 2.299 2.458 2.592 2.701 2.91 3.016 3.116 3.237 3.389 3.474 3.622 3.747 3.883 3.944 4.053 4.159 4.299 4.387 4.472 4.58 4.692 4.821 4.945 5.057 5.202 5.338 5.463 5.62 5.753 5.875 6.021 6.162 6.275 6.396 6.528 6.66 6.792 6.946 7.127 7.275 7.411 7.555 7.68 7.738 7.758 7.528 6.829 5.88 4.9 3.946 3.112 2.385 1.776 1.233 0.766 0.297 -0.113 -0.465 -0.789 -1.082 -1.355 -1.617 -1.886 -2.129 -2.344 -2.56 -2.788 -2.976 -3.161 -3.363 -3.52 -3.677 -3.832 -4.0 -4.167 -4.281 -4.408 -4.605 -4.742 -4.875 -4.939 -5.073 -5.212 -5.352 -5.423 -5.583 -5.677 -5.759 -5.847 -6.03 -6.127 -6.226 -6.343 -6.477 -6.623 -6.831 -7.31 -8 ,26911 ,KEBNE ,16654088,Mon Nov 22 05:19:47 CET,Mon Nov 22 06:45:50 CET,0.0 1.221 1.505 1.73 1.926 2.098 2.256 2.392 2.631 2.741 2.846 2.963 3.117 3.199 3.36 3.52 3.669 3.735 3.849 3.958 4.12 4.218 4.316 4.467 4.613 4.748 4.885 5.015 5.171 5.317 5.458 5.612 5.747 5.888 6.052 6.217 6.367 6.539 6.721 6.895 7.055 7.215 7.397 7.591 7.781 7.915 8.019 8.071 7.988 7.688 6.951 5.696 4.483 3.543 2.818 2.195 1.607 1.019 0.508 0.033 -0.353 -0.7 -1.021 -1.328 -1.617 -1.855 -2.082 -2.286 -2.465 -2.652 -2.861 -3.039 -3.21 -3.377 -3.509 -3.653 -3.802 -3.944 -4.089 -4.191 -4.295 -4.479 -4.611 -4.737 -4.805 -4.943 -5.088 -5.234 -5.313 -5.488 -5.604 -5.694 -5.783 -5.963 -6.059 -6.163 -6.27 -6.39 -6.513 -6.678 -7.053 -9 ,15768 ,KEBNE ,16654089,Mon Nov 22 05:19:47 CET,Mon Nov 22 06:45:47 CET,0.0 1.308 1.563 1.749 1.92 2.045 2.183 2.304 2.497 2.596 2.693 2.797 2.949 3.036 3.187 3.318 3.438 3.497 3.617 3.723 3.867 3.966 4.068 4.212 4.349 4.482 4.604 4.724 4.882 5.029 5.161 5.317 5.466 5.61 5.765 5.927 6.084 6.267 6.469 6.672 6.891 7.112 7.305 7.497 7.713 7.92 8.097 8.177 8.163 7.907 7.205 6.189 5.178 4.255 3.487 2.769 2.11 1.508 1.003 0.508 0.065 -0.327 -0.679 -0.998 -1.291 -1.547 -1.811 -2.063 -2.279 -2.485 -2.708 -2.894 -3.081 -3.28 -3.433 -3.588 -3.752 -3.931 -4.117 -4.232 -4.348 -4.538 -4.662 -4.787 -4.849 -4.974 -5.11 -5.254 -5.33 -5.482 -5.554 -5.642 -5.731 -5.916 -6.011 -6.119 -6.259 -6.397 -6.57 -6.786 -7.269 -10 ,9662 ,KEBNE ,16654090,Mon Nov 22 05:20:50 CET,Mon Nov 22 06:46:43 CET,0.0 1.757 2.179 2.402 2.602 2.789 2.952 3.104 3.333 3.437 3.552 3.675 3.83 3.921 4.094 4.27 4.427 4.493 4.628 4.749 4.912 5.018 5.121 5.277 5.424 5.563 5.685 5.799 5.956 6.106 6.237 6.387 6.529 6.671 6.831 7.013 7.194 7.375 7.556 7.755 7.943 8.112 8.299 8.493 8.693 8.836 8.957 9.047 9.006 8.724 7.93 6.756 5.696 4.721 3.882 3.168 2.571 2.024 1.558 1.119 0.742 0.399 0.061 -0.276 -0.577 -0.836 -1.113 -1.368 -1.594 -1.825 -2.054 -2.233 -2.409 -2.587 -2.724 -2.861 -3.012 -3.174 -3.328 -3.435 -3.55 -3.72 -3.835 -3.955 -4.019 -4.153 -4.289 -4.435 -4.509 -4.669 -4.774 -4.871 -4.963 -5.153 -5.264 -5.378 -5.504 -5.648 -5.845 -6.077 -6.675 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_34_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_34_37.txt deleted file mode 100644 index 80f0ca1a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_34_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30429 ,KEBNE ,17042358,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:57:55 CET,0.0 1.432 1.843 2.13 2.348 2.54 2.718 2.878 3.139 3.256 3.372 3.527 3.692 3.791 3.975 4.142 4.306 4.391 4.576 4.743 4.955 5.09 5.222 5.416 5.606 5.8 5.993 6.166 6.381 6.584 6.79 7.052 7.294 7.515 7.77 8.061 8.338 8.639 8.985 9.356 9.74 10.182 10.691 11.202 11.836 12.564 13.389 14.311 15.397 16.726 18.382 19.725 20.484 20.929 21.205 21.393 21.483 21.51 21.529 21.55 21.543 21.514 21.469 21.423 21.38 21.334 21.286 21.243 21.201 21.151 21.092 21.044 20.984 20.92 20.871 20.81 20.745 20.687 20.631 20.588 20.544 20.478 20.424 20.363 20.327 20.241 20.152 20.064 20.023 19.924 19.861 19.811 19.756 19.612 19.535 19.464 19.371 19.262 19.12 18.936 18.44 -2 ,29330 ,KEBNE ,17042359,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:57:01 CET,0.0 1.592 2.041 2.325 2.551 2.752 2.914 3.064 3.339 3.466 3.579 3.735 3.915 4.02 4.21 4.398 4.563 4.638 4.794 4.956 5.173 5.301 5.424 5.596 5.769 5.934 6.109 6.282 6.498 6.712 6.916 7.153 7.375 7.59 7.861 8.159 8.439 8.76 9.112 9.489 9.901 10.36 10.899 11.465 12.126 12.838 13.683 14.67 15.807 17.123 18.713 20.064 20.862 21.298 21.536 21.695 21.805 21.859 21.847 21.813 21.793 21.763 21.721 21.676 21.618 21.56 21.496 21.427 21.368 21.307 21.216 21.129 21.04 20.935 20.858 20.78 20.685 20.584 20.483 20.418 20.362 20.284 20.229 20.158 20.119 20.048 19.968 19.88 19.837 19.735 19.676 19.621 19.544 19.382 19.309 19.233 19.142 19.027 18.876 18.672 18.122 -3 ,18728 ,KEBNE ,17042360,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:58:37 CET,0.0 1.359 1.682 1.945 2.181 2.383 2.574 2.742 3.012 3.136 3.257 3.415 3.578 3.67 3.842 4.006 4.18 4.266 4.412 4.559 4.799 4.95 5.083 5.274 5.464 5.651 5.83 5.998 6.211 6.42 6.623 6.862 7.093 7.321 7.584 7.879 8.166 8.486 8.843 9.228 9.617 10.051 10.582 11.122 11.743 12.466 13.325 14.282 15.416 16.774 18.382 19.672 20.452 20.969 21.275 21.472 21.587 21.666 21.725 21.767 21.765 21.737 21.714 21.683 21.641 21.593 21.534 21.484 21.446 21.398 21.345 21.294 21.234 21.173 21.128 21.078 21.014 20.939 20.868 20.822 20.769 20.681 20.615 20.537 20.494 20.392 20.276 20.162 20.109 20.005 19.932 19.87 19.814 19.692 19.615 19.513 19.405 19.302 19.176 19.007 18.396 -4 ,898 ,KEBNE ,17042361,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:57:53 CET,0.0 1.34 1.729 2.02 2.278 2.485 2.642 2.79 3.08 3.217 3.338 3.485 3.646 3.737 3.918 4.112 4.296 4.381 4.554 4.715 4.918 5.046 5.18 5.364 5.555 5.742 5.912 6.079 6.299 6.511 6.714 6.952 7.175 7.394 7.653 7.958 8.259 8.6 8.971 9.358 9.744 10.183 10.722 11.273 11.912 12.625 13.479 14.464 15.606 16.92 18.517 19.844 20.587 21.043 21.356 21.541 21.634 21.676 21.671 21.646 21.623 21.579 21.523 21.462 21.402 21.348 21.264 21.198 21.15 21.083 21.0 20.937 20.88 20.819 20.772 20.717 20.66 20.599 20.526 20.478 20.426 20.343 20.277 20.216 20.19 20.119 20.036 19.942 19.888 19.789 19.736 19.676 19.615 19.488 19.419 19.343 19.266 19.184 19.079 18.921 18.28 -5 ,3850 ,KEBNE ,17042362,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:58:00 CET,0.0 1.549 1.983 2.269 2.497 2.687 2.855 3.011 3.292 3.413 3.527 3.666 3.83 3.928 4.109 4.278 4.438 4.518 4.677 4.825 5.059 5.218 5.362 5.557 5.747 5.936 6.126 6.313 6.549 6.78 6.999 7.245 7.495 7.742 8.026 8.344 8.663 9.017 9.383 9.778 10.192 10.659 11.206 11.746 12.373 13.091 13.901 14.813 15.93 17.263 18.904 20.19 20.907 21.381 21.682 21.884 21.978 22.009 22.029 22.031 21.995 21.958 21.922 21.873 21.82 21.76 21.688 21.605 21.525 21.439 21.342 21.259 21.173 21.084 21.013 20.943 20.873 20.804 20.736 20.678 20.615 20.527 20.475 20.419 20.386 20.325 20.243 20.147 20.102 19.999 19.935 19.881 19.82 19.674 19.592 19.511 19.414 19.293 19.129 18.939 18.632 -6 ,6942 ,KEBNE ,17042363,Thu Dec 23 04:27:03 CET,Thu Dec 23 05:59:01 CET,0.0 1.653 2.07 2.37 2.602 2.805 2.987 3.148 3.443 3.568 3.681 3.839 4.014 4.108 4.28 4.444 4.597 4.68 4.853 5.013 5.246 5.394 5.529 5.713 5.891 6.07 6.25 6.422 6.628 6.846 7.071 7.337 7.591 7.831 8.105 8.421 8.735 9.077 9.429 9.797 10.213 10.697 11.248 11.771 12.375 13.078 13.871 14.766 15.869 17.218 18.84 20.199 20.946 21.354 21.626 21.786 21.885 21.967 22.006 22.003 21.976 21.96 21.938 21.9 21.858 21.814 21.772 21.724 21.674 21.633 21.575 21.516 21.466 21.411 21.356 21.298 21.243 21.188 21.12 21.071 21.02 20.921 20.852 20.794 20.765 20.694 20.611 20.509 20.453 20.354 20.302 20.246 20.183 20.033 19.95 19.867 19.778 19.68 19.559 19.39 18.808 -7 ,9787 ,KEBNE ,17042364,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:56:57 CET,0.0 1.549 1.992 2.259 2.49 2.691 2.855 3.009 3.295 3.424 3.538 3.679 3.841 3.942 4.152 4.342 4.526 4.618 4.789 4.956 5.191 5.344 5.499 5.709 5.904 6.101 6.301 6.495 6.741 6.964 7.18 7.443 7.699 7.945 8.224 8.549 8.88 9.244 9.621 10.001 10.401 10.858 11.419 11.988 12.615 13.322 14.181 15.187 16.347 17.678 19.29 20.59 21.317 21.784 22.087 22.288 22.405 22.477 22.525 22.558 22.559 22.534 22.501 22.47 22.433 22.375 22.304 22.253 22.201 22.139 22.078 22.025 21.976 21.925 21.876 21.816 21.748 21.659 21.557 21.486 21.415 21.312 21.236 21.16 21.122 21.038 20.955 20.88 20.84 20.742 20.692 20.634 20.566 20.415 20.331 20.242 20.135 20.009 19.876 19.653 18.827 -8 ,4259 ,KEBNE ,17042365,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:58:32 CET,0.0 1.804 2.237 2.547 2.806 3.028 3.199 3.348 3.641 3.767 3.872 4.023 4.188 4.28 4.459 4.625 4.773 4.846 4.994 5.14 5.359 5.502 5.64 5.841 6.031 6.221 6.409 6.586 6.826 7.068 7.298 7.562 7.812 8.058 8.344 8.65 8.935 9.263 9.634 10.043 10.463 10.915 11.439 11.97 12.605 13.323 14.164 15.101 16.192 17.465 19.027 20.351 21.088 21.541 21.826 21.984 22.06 22.115 22.151 22.162 22.14 22.105 22.051 21.97 21.889 21.802 21.708 21.631 21.568 21.498 21.415 21.336 21.252 21.154 21.077 21.003 20.922 20.825 20.703 20.625 20.549 20.43 20.346 20.259 20.215 20.094 19.964 19.846 19.78 19.664 19.557 19.475 19.393 19.215 19.109 18.994 18.843 18.658 18.444 18.16 16.56 -9 ,25876 ,KEBNE ,17042367,Thu Dec 23 04:27:02 CET,Thu Dec 23 05:56:34 CET,0.0 1.197 1.657 1.977 2.205 2.394 2.568 2.715 2.969 3.093 3.211 3.357 3.52 3.616 3.791 3.959 4.116 4.192 4.343 4.493 4.715 4.865 5.009 5.196 5.373 5.553 5.723 5.89 6.103 6.311 6.519 6.76 6.992 7.229 7.5 7.805 8.106 8.44 8.81 9.203 9.614 10.073 10.61 11.135 11.768 12.495 13.36 14.383 15.57 16.96 18.601 19.941 20.717 21.147 21.389 21.532 21.629 21.677 21.679 21.666 21.632 21.586 21.545 21.491 21.423 21.363 21.288 21.201 21.119 21.047 20.966 20.887 20.816 20.738 20.66 20.584 20.521 20.437 20.339 20.286 20.238 20.162 20.109 20.042 20.006 19.941 19.864 19.775 19.73 19.642 19.598 19.544 19.481 19.334 19.255 19.176 19.09 18.975 18.839 18.658 18.212 -10 ,17470 ,KEBNE ,17042368,Thu Dec 23 04:27:01 CET,Thu Dec 23 05:56:33 CET,0.0 1.842 2.261 2.561 2.787 2.973 3.133 3.282 3.562 3.695 3.825 4.014 4.183 4.269 4.439 4.616 4.783 4.858 5.009 5.157 5.365 5.495 5.621 5.812 5.993 6.162 6.331 6.5 6.715 6.919 7.121 7.357 7.575 7.793 8.067 8.387 8.694 9.029 9.373 9.733 10.119 10.577 11.128 11.658 12.299 13.019 13.796 14.673 15.717 16.994 18.623 19.966 20.791 21.32 21.631 21.852 21.988 22.046 22.072 22.083 22.088 22.091 22.082 22.046 22.005 21.974 21.934 21.897 21.851 21.792 21.734 21.676 21.606 21.531 21.482 21.435 21.364 21.283 21.208 21.149 21.089 20.998 20.936 20.873 20.844 20.786 20.718 20.645 20.607 20.508 20.452 20.393 20.323 20.191 20.116 20.03 19.946 19.84 19.675 19.469 18.888 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_34_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_34_38.txt deleted file mode 100644 index c10058f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_34_38.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,9980 ,KEBNE ,16654092,Mon Nov 22 05:20:50 CET,Mon Nov 22 06:47:31 CET,0.0 1.601 2.086 2.459 2.713 2.912 3.104 3.262 3.544 3.689 3.818 3.975 4.143 4.243 4.435 4.604 4.769 4.854 5.014 5.168 5.408 5.556 5.681 5.866 6.046 6.216 6.385 6.55 6.742 6.918 7.092 7.296 7.481 7.659 7.88 8.12 8.337 8.564 8.809 9.072 9.336 9.63 9.97 10.301 10.669 11.053 11.479 11.918 12.387 12.837 13.216 13.297 13.18 12.931 12.635 12.343 12.051 11.775 11.52 11.254 11.038 10.843 10.645 10.459 10.29 10.127 9.95 9.788 9.649 9.511 9.347 9.198 9.053 8.911 8.789 8.656 8.531 8.404 8.26 8.162 8.077 7.956 7.86 7.754 7.705 7.608 7.509 7.39 7.328 7.207 7.141 7.073 7.005 6.856 6.768 6.671 6.581 6.489 6.381 6.234 5.917 -3 ,31 ,KEBNE ,16654093,Mon Nov 22 05:20:50 CET,Mon Nov 22 06:47:10 CET,0.0 1.647 2.034 2.275 2.506 2.738 2.905 3.052 3.331 3.441 3.547 3.684 3.841 3.93 4.1 4.256 4.411 4.485 4.618 4.733 4.887 4.996 5.112 5.289 5.463 5.625 5.781 5.931 6.127 6.319 6.49 6.671 6.852 7.047 7.281 7.524 7.733 7.953 8.182 8.429 8.694 8.992 9.326 9.646 10.0 10.365 10.787 11.274 11.756 12.203 12.58 12.608 12.432 12.205 11.957 11.668 11.383 11.118 10.9 10.654 10.418 10.219 10.023 9.843 9.661 9.48 9.31 9.161 9.018 8.861 8.688 8.555 8.433 8.307 8.2 8.092 7.99 7.878 7.755 7.667 7.583 7.461 7.37 7.272 7.223 7.128 7.025 6.909 6.856 6.735 6.682 6.623 6.55 6.39 6.301 6.201 6.084 5.96 5.807 5.618 5.034 -4 ,23757 ,KEBNE ,16654094,Mon Nov 22 05:20:50 CET,Mon Nov 22 06:47:09 CET,0.0 1.629 2.003 2.239 2.45 2.632 2.783 2.916 3.19 3.33 3.442 3.556 3.708 3.795 3.961 4.115 4.26 4.328 4.459 4.59 4.776 4.897 5.008 5.169 5.327 5.462 5.597 5.727 5.882 6.039 6.192 6.381 6.556 6.712 6.883 7.056 7.233 7.457 7.709 7.976 8.251 8.549 8.883 9.204 9.563 9.972 10.393 10.829 11.291 11.708 11.991 11.947 11.748 11.472 11.19 10.92 10.659 10.41 10.179 9.924 9.696 9.496 9.307 9.13 8.957 8.798 8.625 8.458 8.312 8.16 8.017 7.906 7.787 7.67 7.58 7.481 7.381 7.277 7.168 7.097 7.019 6.886 6.798 6.707 6.654 6.54 6.436 6.326 6.264 6.14 6.077 6.01 5.945 5.798 5.71 5.611 5.501 5.387 5.253 5.076 4.435 -5 ,2057 ,KEBNE ,16654095,Mon Nov 22 05:21:51 CET,Mon Nov 22 06:48:27 CET,0.0 1.649 2.09 2.4 2.667 2.927 3.129 3.293 3.601 3.736 3.864 4.045 4.224 4.339 4.546 4.744 4.93 5.009 5.162 5.318 5.547 5.703 5.839 6.015 6.183 6.348 6.511 6.659 6.838 7.012 7.178 7.383 7.579 7.759 7.968 8.196 8.408 8.633 8.876 9.141 9.409 9.703 10.032 10.364 10.737 11.144 11.598 12.018 12.473 12.946 13.324 13.426 13.352 13.177 12.928 12.684 12.453 12.213 11.999 11.789 11.6 11.425 11.259 11.098 10.966 10.84 10.691 10.567 10.457 10.325 10.188 10.085 9.966 9.827 9.721 9.618 9.516 9.408 9.293 9.215 9.141 9.023 8.937 8.851 8.809 8.719 8.606 8.492 8.437 8.318 8.263 8.192 8.118 7.961 7.873 7.764 7.657 7.547 7.423 7.25 6.737 -6 ,24317 ,KEBNE ,16654096,Mon Nov 22 05:21:51 CET,Mon Nov 22 06:48:43 CET,0.0 1.526 1.904 2.189 2.4 2.585 2.733 2.866 3.119 3.234 3.355 3.524 3.69 3.78 3.938 4.086 4.224 4.289 4.428 4.566 4.757 4.875 4.998 5.175 5.334 5.496 5.664 5.815 5.992 6.171 6.35 6.55 6.737 6.92 7.122 7.345 7.565 7.817 8.06 8.306 8.576 8.873 9.223 9.552 9.92 10.348 10.818 11.292 11.761 12.227 12.559 12.47 12.255 12.039 11.76 11.505 11.261 10.995 10.789 10.591 10.386 10.204 10.046 9.888 9.733 9.598 9.469 9.343 9.223 9.095 8.962 8.86 8.747 8.62 8.522 8.425 8.32 8.204 8.095 8.022 7.938 7.809 7.726 7.635 7.59 7.502 7.391 7.273 7.21 7.08 7.02 6.951 6.878 6.717 6.629 6.533 6.422 6.308 6.175 5.984 5.513 -7 ,21146 ,KEBNE ,16654097,Mon Nov 22 05:21:51 CET,Mon Nov 22 06:48:01 CET,0.0 1.165 1.565 1.824 2.025 2.212 2.375 2.528 2.803 2.926 3.039 3.179 3.338 3.421 3.577 3.736 3.893 3.969 4.117 4.249 4.424 4.542 4.654 4.805 4.959 5.114 5.261 5.407 5.586 5.772 5.954 6.159 6.36 6.528 6.7 6.898 7.099 7.317 7.55 7.785 8.042 8.339 8.674 9.01 9.36 9.727 10.143 10.626 11.117 11.528 11.872 11.956 11.8 11.533 11.225 10.914 10.632 10.381 10.159 9.928 9.723 9.506 9.292 9.083 8.894 8.762 8.619 8.46 8.338 8.228 8.093 7.975 7.852 7.731 7.642 7.549 7.446 7.337 7.221 7.139 7.058 6.941 6.86 6.772 6.725 6.63 6.531 6.419 6.357 6.235 6.192 6.13 6.054 5.885 5.782 5.677 5.565 5.421 5.262 5.092 4.663 -9 ,1190 ,KEBNE ,16654099,Mon Nov 22 05:22:53 CET,Mon Nov 22 06:49:34 CET,0.0 1.238 1.592 1.841 2.059 2.265 2.459 2.614 2.866 2.988 3.107 3.264 3.422 3.518 3.711 3.882 4.053 4.141 4.302 4.453 4.671 4.81 4.94 5.129 5.312 5.469 5.613 5.753 5.93 6.092 6.243 6.433 6.624 6.804 7.014 7.262 7.492 7.72 7.961 8.228 8.501 8.787 9.099 9.412 9.768 10.152 10.569 10.976 11.423 11.875 12.242 12.305 12.15 11.874 11.608 11.377 11.114 10.828 10.564 10.302 10.072 9.878 9.693 9.509 9.338 9.188 9.037 8.899 8.777 8.647 8.505 8.388 8.26 8.121 8.012 7.904 7.798 7.693 7.585 7.508 7.433 7.312 7.222 7.128 7.079 6.984 6.89 6.783 6.718 6.587 6.505 6.432 6.356 6.211 6.134 6.04 5.943 5.851 5.728 5.546 5.059 -10 ,4754 ,KEBNE ,16654100,Mon Nov 22 05:23:56 CET,Mon Nov 22 06:48:56 CET,0.0 1.602 2.125 2.507 2.806 3.045 3.254 3.465 3.794 3.932 4.059 4.227 4.396 4.511 4.708 4.892 5.084 5.182 5.366 5.522 5.727 5.854 5.979 6.156 6.333 6.506 6.667 6.821 7.021 7.201 7.375 7.585 7.774 7.96 8.166 8.394 8.607 8.84 9.099 9.364 9.634 9.941 10.282 10.593 10.947 11.339 11.747 12.173 12.643 13.029 13.328 13.401 13.302 13.085 12.772 12.501 12.266 12.005 11.75 11.497 11.281 11.073 10.884 10.698 10.499 10.319 10.128 9.955 9.811 9.67 9.523 9.402 9.283 9.163 9.079 8.994 8.899 8.795 8.683 8.607 8.531 8.417 8.335 8.239 8.193 8.097 7.987 7.875 7.817 7.693 7.628 7.56 7.485 7.289 7.187 7.091 6.984 6.853 6.7 6.503 5.933 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_19.txt deleted file mode 100644 index 6523a068..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14207 ,KEBNE ,17069344,Fri Dec 24 00:55:16 CET,Fri Dec 24 02:23:58 CET,0.0 0.159 0.277 0.365 0.442 0.515 0.585 0.656 0.8 0.861 0.911 0.936 1.06 1.104 1.19 1.278 1.384 1.436 1.523 1.606 1.72 1.79 1.855 1.957 2.054 2.152 2.25 2.352 2.478 2.583 2.688 2.821 2.957 3.087 3.225 3.39 3.561 3.738 3.915 4.095 4.306 4.559 4.842 5.115 5.399 5.716 6.041 6.36 6.724 7.002 6.923 6.409 5.833 5.238 4.667 4.124 3.598 3.088 2.631 2.167 1.788 1.456 1.132 0.812 0.51 0.23 -0.056 -0.315 -0.558 -0.796 -1.049 -1.263 -1.462 -1.677 -1.864 -2.046 -2.222 -2.411 -2.623 -2.777 -2.938 -3.191 -3.369 -3.562 -3.659 -3.851 -4.064 -4.281 -4.388 -4.578 -4.761 -4.887 -5.013 -5.291 -5.45 -5.632 -5.824 -6.042 -6.313 -6.651 -7.793 -2 ,10608 ,KEBNE ,17069345,Fri Dec 24 00:56:21 CET,Fri Dec 24 02:26:55 CET,0.0 0.248 0.374 0.478 0.557 0.63 0.697 0.762 0.887 0.951 1.009 1.029 1.151 1.196 1.285 1.387 1.478 1.515 1.599 1.688 1.812 1.888 1.962 2.072 2.183 2.301 2.407 2.498 2.614 2.727 2.846 2.994 3.128 3.259 3.415 3.579 3.734 3.917 4.138 4.38 4.63 4.88 5.152 5.446 5.794 6.14 6.484 6.859 7.223 7.446 7.456 7.179 6.74 6.199 5.663 5.193 4.729 4.293 3.925 3.564 3.244 2.929 2.619 2.318 2.028 1.777 1.518 1.306 1.129 0.913 0.692 0.518 0.339 0.149 0.003 -0.14 -0.285 -0.435 -0.606 -0.728 -0.858 -1.091 -1.249 -1.4 -1.476 -1.625 -1.81 -2.015 -2.115 -2.304 -2.471 -2.599 -2.734 -3.002 -3.146 -3.305 -3.497 -3.737 -4.03 -4.368 -5.929 -3 ,26094 ,KEBNE ,17069346,Fri Dec 24 00:56:20 CET,Fri Dec 24 02:25:07 CET,0.0 0.353 0.454 0.536 0.616 0.711 0.815 0.894 0.999 1.049 1.098 1.132 1.268 1.323 1.415 1.509 1.6 1.64 1.73 1.823 1.955 2.041 2.115 2.219 2.324 2.428 2.533 2.628 2.747 2.853 2.955 3.089 3.207 3.32 3.457 3.617 3.771 3.94 4.113 4.302 4.531 4.79 5.072 5.334 5.645 5.974 6.305 6.679 7.023 7.182 7.115 6.672 6.078 5.449 4.817 4.229 3.692 3.21 2.79 2.344 1.947 1.584 1.254 0.946 0.659 0.383 0.092 -0.159 -0.393 -0.644 -0.896 -1.097 -1.31 -1.541 -1.718 -1.898 -2.083 -2.288 -2.513 -2.658 -2.803 -3.047 -3.23 -3.408 -3.497 -3.69 -3.884 -4.081 -4.183 -4.36 -4.515 -4.644 -4.786 -5.104 -5.271 -5.441 -5.638 -5.867 -6.183 -6.571 -7.773 -4 ,18196 ,KEBNE ,17069347,Fri Dec 24 00:56:20 CET,Fri Dec 24 02:26:50 CET,0.0 0.13 0.237 0.359 0.459 0.542 0.623 0.693 0.823 0.885 0.937 0.949 1.075 1.127 1.223 1.322 1.411 1.45 1.535 1.62 1.731 1.801 1.866 1.971 2.081 2.182 2.277 2.374 2.49 2.592 2.702 2.841 2.971 3.087 3.223 3.385 3.532 3.687 3.863 4.044 4.234 4.462 4.708 4.955 5.239 5.514 5.808 6.131 6.443 6.628 6.601 6.184 5.619 5.006 4.383 3.826 3.303 2.815 2.421 2.019 1.667 1.361 1.074 0.804 0.541 0.3 0.057 -0.173 -0.383 -0.605 -0.83 -1.019 -1.227 -1.436 -1.606 -1.797 -1.992 -2.185 -2.377 -2.514 -2.656 -2.874 -3.031 -3.204 -3.297 -3.484 -3.681 -3.903 -4.014 -4.194 -4.344 -4.467 -4.587 -4.855 -4.999 -5.138 -5.296 -5.501 -5.757 -6.055 -7.673 -5 ,30056 ,KEBNE ,17069348,Fri Dec 24 00:56:20 CET,Fri Dec 24 02:26:34 CET,0.0 0.658 0.808 0.916 1.019 1.108 1.181 1.252 1.389 1.446 1.501 1.531 1.657 1.707 1.806 1.904 1.998 2.037 2.105 2.177 2.295 2.373 2.441 2.548 2.657 2.757 2.857 2.95 3.064 3.172 3.279 3.412 3.533 3.649 3.795 3.955 4.102 4.276 4.464 4.665 4.881 5.099 5.342 5.585 5.863 6.166 6.509 6.834 7.13 7.415 7.436 6.91 6.238 5.533 4.887 4.298 3.745 3.247 2.809 2.351 1.967 1.623 1.279 0.942 0.627 0.345 0.052 -0.215 -0.459 -0.725 -0.997 -1.219 -1.444 -1.682 -1.869 -2.06 -2.261 -2.466 -2.668 -2.802 -2.948 -3.185 -3.35 -3.52 -3.603 -3.767 -3.947 -4.147 -4.254 -4.439 -4.608 -4.737 -4.866 -5.161 -5.322 -5.503 -5.697 -5.927 -6.218 -6.647 -7.977 -6 ,28913 ,KEBNE ,17069349,Fri Dec 24 00:57:27 CET,Fri Dec 24 02:28:10 CET,0.0 0.221 0.343 0.454 0.555 0.634 0.716 0.795 0.919 0.98 1.038 1.075 1.205 1.257 1.351 1.44 1.528 1.567 1.639 1.709 1.821 1.897 1.97 2.066 2.157 2.254 2.349 2.444 2.568 2.678 2.783 2.931 3.079 3.22 3.38 3.576 3.765 3.942 4.137 4.34 4.559 4.798 5.048 5.317 5.63 5.929 6.227 6.516 6.767 6.903 6.834 6.393 5.796 5.161 4.524 3.925 3.38 2.875 2.42 1.954 1.56 1.205 0.863 0.539 0.23 -0.051 -0.35 -0.617 -0.831 -1.056 -1.313 -1.535 -1.749 -1.98 -2.172 -2.369 -2.57 -2.767 -2.978 -3.139 -3.298 -3.514 -3.664 -3.825 -3.909 -4.061 -4.239 -4.454 -4.564 -4.748 -4.917 -5.048 -5.187 -5.465 -5.617 -5.795 -6.012 -6.275 -6.585 -6.951 -8.259 -7 ,11718 ,KEBNE ,17069350,Fri Dec 24 00:57:27 CET,Fri Dec 24 02:28:35 CET,0.0 0.242 0.342 0.441 0.526 0.603 0.673 0.737 0.858 0.918 0.98 1.021 1.148 1.2 1.301 1.393 1.481 1.528 1.617 1.697 1.818 1.893 1.965 2.069 2.162 2.261 2.368 2.464 2.581 2.691 2.807 2.951 3.072 3.191 3.325 3.475 3.635 3.809 3.993 4.18 4.374 4.584 4.838 5.103 5.41 5.779 6.203 6.59 6.872 7.034 6.931 6.385 5.76 5.152 4.52 3.923 3.428 2.955 2.519 2.071 1.674 1.335 1.01 0.694 0.393 0.131 -0.142 -0.396 -0.627 -0.872 -1.116 -1.319 -1.526 -1.728 -1.882 -2.049 -2.226 -2.414 -2.625 -2.768 -2.908 -3.113 -3.263 -3.415 -3.488 -3.669 -3.873 -4.089 -4.196 -4.376 -4.521 -4.633 -4.761 -5.057 -5.223 -5.429 -5.652 -5.886 -6.158 -6.499 -8.02 -8 ,31647 ,KEBNE ,17069351,Fri Dec 24 01:14:44 CET,Fri Dec 24 02:43:12 CET,0.0 0.339 0.512 0.61 0.695 0.792 0.883 0.953 1.078 1.137 1.197 1.224 1.348 1.4 1.512 1.607 1.688 1.729 1.815 1.895 2.003 2.078 2.152 2.269 2.388 2.499 2.599 2.692 2.818 2.941 3.059 3.205 3.351 3.494 3.642 3.802 3.963 4.145 4.342 4.528 4.741 4.989 5.25 5.51 5.816 6.126 6.414 6.682 6.95 7.127 6.977 6.423 5.781 5.149 4.571 4.007 3.495 3.006 2.58 2.139 1.763 1.436 1.115 0.827 0.55 0.288 -0.001 -0.266 -0.472 -0.669 -0.884 -1.072 -1.266 -1.464 -1.622 -1.79 -1.978 -2.175 -2.375 -2.51 -2.656 -2.884 -3.033 -3.188 -3.269 -3.445 -3.637 -3.848 -3.96 -4.145 -4.306 -4.425 -4.55 -4.837 -4.999 -5.167 -5.351 -5.562 -5.793 -6.14 -7.599 -9 ,27566 ,KEBNE ,17069352,Fri Dec 24 01:16:51 CET,Fri Dec 24 02:45:29 CET,0.0 0.164 0.261 0.356 0.439 0.534 0.639 0.733 0.874 0.937 1.0 1.036 1.16 1.208 1.295 1.376 1.462 1.506 1.601 1.696 1.829 1.907 1.978 2.077 2.176 2.277 2.379 2.474 2.596 2.718 2.842 2.988 3.115 3.229 3.37 3.541 3.699 3.872 4.06 4.243 4.432 4.673 4.943 5.194 5.485 5.767 6.085 6.417 6.702 6.936 6.952 6.472 5.873 5.19 4.517 3.926 3.389 2.862 2.406 1.978 1.615 1.28 0.951 0.636 0.331 0.039 -0.255 -0.502 -0.721 -0.948 -1.169 -1.359 -1.566 -1.771 -1.937 -2.121 -2.31 -2.504 -2.696 -2.842 -3.009 -3.246 -3.403 -3.568 -3.648 -3.812 -3.998 -4.23 -4.358 -4.555 -4.699 -4.806 -4.921 -5.175 -5.331 -5.49 -5.658 -5.886 -6.175 -6.528 -8.031 -10 ,439 ,KEBNE ,17069353,Fri Dec 24 01:16:51 CET,Fri Dec 24 02:47:25 CET,0.0 0.192 0.313 0.403 0.476 0.557 0.632 0.699 0.821 0.884 0.946 0.985 1.114 1.167 1.263 1.368 1.469 1.514 1.611 1.711 1.844 1.925 1.999 2.104 2.209 2.317 2.435 2.554 2.703 2.845 2.979 3.131 3.28 3.435 3.613 3.8 3.982 4.199 4.42 4.649 4.891 5.151 5.44 5.705 6.016 6.353 6.691 6.984 7.196 7.349 7.324 6.867 6.213 5.562 4.956 4.359 3.844 3.388 2.996 2.584 2.205 1.859 1.53 1.233 0.957 0.689 0.405 0.162 -0.051 -0.284 -0.526 -0.727 -0.935 -1.145 -1.305 -1.472 -1.65 -1.846 -2.061 -2.199 -2.336 -2.554 -2.71 -2.875 -2.95 -3.114 -3.295 -3.462 -3.56 -3.746 -3.865 -3.974 -4.11 -4.399 -4.55 -4.73 -4.938 -5.156 -5.385 -5.721 -6.907 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_30.txt deleted file mode 100644 index c25fad20..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_30.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30867 ,KEBNE ,16654101,Mon Nov 22 05:23:56 CET,Mon Nov 22 06:49:12 CET,0.0 1.348 1.818 2.077 2.284 2.463 2.622 2.757 3.009 3.134 3.254 3.419 3.607 3.721 3.952 4.16 4.373 4.471 4.641 4.813 5.054 5.198 5.343 5.56 5.761 5.957 6.147 6.317 6.531 6.748 6.963 7.217 7.45 7.674 7.923 8.227 8.542 8.875 9.206 9.549 9.924 10.337 10.765 11.126 11.553 12.037 12.545 13.093 13.655 14.149 14.298 13.874 13.417 12.957 12.402 11.874 11.412 10.971 10.599 10.223 9.889 9.58 9.28 8.977 8.69 8.444 8.179 7.942 7.762 7.591 7.41 7.251 7.09 6.909 6.767 6.627 6.465 6.306 6.155 6.051 5.941 5.768 5.65 5.527 5.459 5.31 5.172 5.035 4.964 4.815 4.742 4.665 4.583 4.406 4.295 4.174 4.065 3.933 3.777 3.598 3.252 -2 ,3715 ,KEBNE ,16654102,Mon Nov 22 05:24:59 CET,Mon Nov 22 06:51:34 CET,0.0 0.949 1.301 1.553 1.774 1.963 2.117 2.277 2.59 2.725 2.84 2.987 3.184 3.298 3.515 3.703 3.857 3.934 4.085 4.221 4.434 4.579 4.72 4.926 5.123 5.316 5.513 5.704 5.942 6.167 6.372 6.604 6.828 7.05 7.309 7.603 7.892 8.197 8.499 8.802 9.125 9.491 9.908 10.318 10.76 11.204 11.695 12.204 12.726 13.199 13.418 13.211 12.753 12.241 11.748 11.196 10.709 10.317 9.918 9.461 9.102 8.816 8.55 8.296 8.049 7.822 7.595 7.395 7.217 7.031 6.835 6.679 6.518 6.34 6.208 6.08 5.939 5.781 5.613 5.504 5.391 5.213 5.096 4.972 4.909 4.786 4.65 4.5 4.425 4.27 4.186 4.1 4.007 3.817 3.713 3.584 3.448 3.325 3.178 2.993 2.594 -3 ,19551 ,KEBNE ,16654103,Mon Nov 22 05:31:16 CET,Mon Nov 22 06:54:02 CET,0.0 1.374 1.766 2.086 2.318 2.503 2.697 2.877 3.167 3.309 3.442 3.614 3.804 3.906 4.078 4.246 4.418 4.503 4.67 4.819 5.01 5.142 5.273 5.455 5.63 5.798 5.967 6.133 6.349 6.555 6.749 6.975 7.196 7.416 7.671 7.938 8.178 8.459 8.791 9.145 9.483 9.829 10.228 10.67 11.161 11.614 12.086 12.618 13.168 13.671 13.985 13.824 13.409 12.878 12.356 11.791 11.258 10.8 10.386 9.984 9.64 9.324 9.02 8.731 8.462 8.209 7.944 7.708 7.513 7.308 7.085 6.899 6.714 6.529 6.382 6.237 6.087 5.929 5.775 5.669 5.548 5.368 5.248 5.125 5.061 4.933 4.806 4.667 4.595 4.448 4.365 4.273 4.19 4.007 3.898 3.779 3.657 3.536 3.392 3.179 2.671 -5 ,17226 ,KEBNE ,16654105,Mon Nov 22 05:34:20 CET,Mon Nov 22 07:00:48 CET,0.0 0.874 1.199 1.482 1.72 1.912 2.088 2.26 2.566 2.697 2.804 2.94 3.128 3.236 3.449 3.645 3.818 3.904 4.076 4.241 4.479 4.628 4.777 4.996 5.185 5.352 5.512 5.656 5.827 5.994 6.161 6.371 6.583 6.794 7.038 7.313 7.565 7.828 8.118 8.424 8.736 9.095 9.482 9.83 10.272 10.787 11.312 11.771 12.167 12.58 12.846 12.618 12.069 11.512 11.005 10.509 10.043 9.601 9.217 8.837 8.524 8.245 7.971 7.719 7.477 7.257 7.023 6.8 6.619 6.435 6.244 6.088 5.93 5.767 5.646 5.515 5.368 5.218 5.066 4.96 4.856 4.703 4.595 4.485 4.425 4.289 4.156 4.021 3.945 3.791 3.716 3.637 3.543 3.349 3.255 3.155 3.044 2.933 2.795 2.617 2.294 -6 ,6587 ,KEBNE ,16654106,Mon Nov 22 05:37:30 CET,Mon Nov 22 06:58:39 CET,0.0 1.151 1.494 1.775 2.033 2.234 2.406 2.576 2.909 3.075 3.24 3.45 3.638 3.74 3.946 4.142 4.32 4.401 4.557 4.713 4.93 5.061 5.196 5.382 5.55 5.725 5.897 6.052 6.251 6.451 6.641 6.869 7.083 7.288 7.524 7.798 8.074 8.367 8.668 9.014 9.389 9.76 10.164 10.589 11.069 11.581 12.135 12.681 13.242 13.749 14.066 13.896 13.462 12.989 12.576 12.181 11.79 11.412 11.109 10.794 10.512 10.259 10.01 9.778 9.578 9.391 9.185 9.008 8.855 8.691 8.517 8.39 8.268 8.135 8.03 7.907 7.773 7.648 7.516 7.414 7.324 7.189 7.077 6.974 6.925 6.815 6.699 6.565 6.497 6.356 6.287 6.209 6.136 5.98 5.888 5.795 5.701 5.609 5.51 5.357 5.016 -7 ,24061 ,KEBNE ,16654107,Mon Nov 22 05:38:27 CET,Mon Nov 22 07:04:50 CET,0.0 1.363 1.744 2.02 2.27 2.475 2.643 2.788 3.064 3.2 3.322 3.472 3.65 3.743 3.919 4.088 4.263 4.349 4.508 4.658 4.88 5.033 5.187 5.401 5.59 5.757 5.927 6.092 6.295 6.479 6.655 6.89 7.11 7.309 7.556 7.834 8.081 8.363 8.659 8.947 9.238 9.563 9.962 10.403 10.902 11.392 11.913 12.445 13.057 13.665 14.049 14.118 13.9 13.543 13.143 12.79 12.476 12.164 11.877 11.561 11.269 11.003 10.737 10.493 10.267 10.05 9.817 9.609 9.435 9.261 9.084 8.934 8.789 8.656 8.556 8.445 8.329 8.206 8.074 7.982 7.884 7.742 7.643 7.531 7.475 7.364 7.242 7.104 7.027 6.882 6.835 6.758 6.678 6.507 6.402 6.288 6.173 6.055 5.932 5.788 5.529 -8 ,28830 ,KEBNE ,16654108,Mon Nov 22 05:38:27 CET,Mon Nov 22 07:03:22 CET,0.0 1.015 1.428 1.73 1.956 2.143 2.341 2.517 2.799 2.929 3.05 3.192 3.37 3.473 3.644 3.799 3.965 4.06 4.254 4.438 4.698 4.868 5.023 5.239 5.449 5.639 5.821 5.999 6.221 6.427 6.64 6.898 7.138 7.378 7.656 7.956 8.254 8.544 8.814 9.116 9.457 9.839 10.242 10.63 11.061 11.561 12.1 12.581 13.095 13.547 13.786 13.574 13.057 12.51 11.989 11.478 11.014 10.571 10.179 9.781 9.411 9.071 8.775 8.5 8.221 7.95 7.677 7.453 7.261 7.066 6.866 6.705 6.541 6.364 6.235 6.106 5.963 5.817 5.666 5.561 5.446 5.268 5.145 5.008 4.942 4.808 4.675 4.535 4.453 4.3 4.203 4.114 4.026 3.844 3.728 3.604 3.497 3.356 3.18 3.016 2.673 -9 ,5740 ,KEBNE ,16654109,Mon Nov 22 05:39:30 CET,Mon Nov 22 07:04:33 CET,0.0 1.049 1.403 1.681 1.902 2.099 2.276 2.423 2.683 2.805 2.928 3.096 3.292 3.401 3.598 3.779 3.947 4.024 4.197 4.374 4.616 4.772 4.919 5.137 5.351 5.553 5.743 5.914 6.124 6.332 6.542 6.806 7.059 7.297 7.565 7.856 8.148 8.467 8.799 9.13 9.463 9.861 10.32 10.742 11.216 11.747 12.333 12.946 13.488 13.933 14.151 13.918 13.475 12.944 12.466 12.038 11.662 11.296 10.925 10.549 10.254 10.001 9.753 9.497 9.26 9.061 8.847 8.641 8.45 8.263 8.072 7.912 7.749 7.566 7.429 7.293 7.14 6.979 6.81 6.692 6.575 6.407 6.293 6.17 6.105 5.967 5.826 5.694 5.631 5.498 5.459 5.389 5.308 5.136 5.044 4.947 4.845 4.742 4.63 4.465 4.093 -10 ,1883 ,KEBNE ,16654110,Mon Nov 22 05:39:31 CET,Mon Nov 22 07:04:31 CET,0.0 1.03 1.357 1.619 1.878 2.11 2.279 2.42 2.676 2.798 2.911 3.079 3.275 3.372 3.562 3.743 3.92 4.018 4.2 4.372 4.628 4.785 4.937 5.153 5.346 5.522 5.698 5.879 6.114 6.326 6.536 6.81 7.065 7.311 7.593 7.869 8.127 8.44 8.785 9.14 9.466 9.851 10.301 10.703 11.165 11.652 12.173 12.65 13.102 13.522 13.752 13.604 13.132 12.627 12.135 11.646 11.181 10.697 10.287 9.895 9.558 9.255 8.95 8.649 8.378 8.139 7.883 7.649 7.442 7.229 7.01 6.825 6.632 6.426 6.27 6.116 5.949 5.772 5.582 5.457 5.333 5.15 5.037 4.926 4.868 4.752 4.632 4.498 4.431 4.28 4.192 4.115 4.033 3.847 3.742 3.631 3.508 3.364 3.203 3.029 2.618 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_31.txt deleted file mode 100644 index 9e6afa30..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_31.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6308 ,KEBNE ,16654111,Mon Nov 22 05:39:31 CET,Mon Nov 22 07:06:46 CET,0.0 1.313 1.733 2.015 2.229 2.415 2.583 2.737 3.019 3.156 3.302 3.492 3.677 3.778 3.985 4.185 4.373 4.468 4.65 4.822 5.074 5.219 5.356 5.573 5.786 5.983 6.163 6.337 6.561 6.79 7.01 7.253 7.488 7.724 8.001 8.27 8.511 8.781 9.075 9.388 9.727 10.118 10.55 10.972 11.457 11.951 12.482 12.996 13.412 13.738 13.754 13.401 12.888 12.333 11.847 11.363 10.911 10.507 10.138 9.727 9.378 9.065 8.754 8.457 8.184 7.953 7.711 7.487 7.297 7.109 6.906 6.741 6.575 6.395 6.266 6.131 5.984 5.841 5.692 5.585 5.473 5.291 5.167 5.049 4.984 4.848 4.711 4.559 4.48 4.329 4.257 4.181 4.092 3.912 3.821 3.709 3.564 3.407 3.255 3.074 2.716 -4 ,29407 ,KEBNE ,16654114,Mon Nov 22 05:40:37 CET,Mon Nov 22 07:07:20 CET,0.0 1.529 2.015 2.389 2.644 2.817 2.98 3.141 3.419 3.559 3.688 3.832 4.002 4.092 4.267 4.428 4.589 4.672 4.832 4.995 5.242 5.382 5.507 5.692 5.864 6.028 6.192 6.352 6.566 6.776 6.961 7.173 7.377 7.584 7.824 8.086 8.328 8.593 8.886 9.203 9.531 9.897 10.341 10.763 11.227 11.723 12.237 12.81 13.351 13.723 13.85 13.378 12.755 12.198 11.689 11.18 10.683 10.237 9.868 9.47 9.107 8.782 8.484 8.2 7.936 7.69 7.421 7.175 6.966 6.761 6.553 6.373 6.185 5.987 5.827 5.667 5.498 5.318 5.13 5.003 4.878 4.697 4.567 4.425 4.357 4.202 4.039 3.893 3.822 3.665 3.576 3.491 3.406 3.234 3.13 3.01 2.887 2.755 2.589 2.383 1.859 -5 ,31204 ,KEBNE ,16654115,Mon Nov 22 05:40:33 CET,Mon Nov 22 07:07:18 CET,0.0 1.349 1.721 2.027 2.291 2.514 2.722 2.895 3.18 3.331 3.471 3.607 3.789 3.9 4.11 4.303 4.484 4.567 4.729 4.883 5.107 5.252 5.395 5.608 5.811 6.013 6.212 6.401 6.635 6.847 7.056 7.309 7.537 7.745 7.998 8.288 8.563 8.856 9.162 9.485 9.812 10.189 10.632 11.056 11.51 11.99 12.493 12.963 13.428 13.853 14.029 13.733 13.301 12.8 12.264 11.721 11.22 10.783 10.394 9.982 9.624 9.293 8.992 8.719 8.459 8.206 7.941 7.709 7.5 7.281 7.051 6.862 6.67 6.48 6.33 6.175 6.008 5.825 5.63 5.501 5.371 5.161 5.014 4.867 4.797 4.657 4.512 4.356 4.281 4.133 4.047 3.961 3.869 3.685 3.6 3.502 3.382 3.258 3.119 2.926 2.416 -6 ,30027 ,KEBNE ,16654116,Mon Nov 22 05:40:33 CET,Mon Nov 22 07:05:29 CET,0.0 1.45 1.798 2.047 2.26 2.446 2.616 2.779 3.072 3.201 3.314 3.444 3.618 3.717 3.887 4.054 4.217 4.297 4.473 4.634 4.865 5.012 5.138 5.325 5.515 5.716 5.898 6.051 6.263 6.47 6.658 6.902 7.142 7.359 7.603 7.862 8.112 8.394 8.691 9.016 9.353 9.723 10.114 10.454 10.87 11.315 11.794 12.303 12.87 13.4 13.619 13.419 12.966 12.381 11.86 11.376 10.931 10.51 10.136 9.74 9.412 9.13 8.858 8.602 8.359 8.139 7.91 7.7 7.524 7.346 7.154 6.996 6.829 6.661 6.529 6.387 6.258 6.112 5.952 5.848 5.732 5.556 5.433 5.305 5.241 5.11 4.965 4.81 4.738 4.591 4.489 4.399 4.306 4.116 4.019 3.906 3.791 3.661 3.485 3.26 2.943 -7 ,18462 ,KEBNE ,16654117,Mon Nov 22 05:40:33 CET,Mon Nov 22 07:07:31 CET,0.0 1.507 1.901 2.216 2.464 2.671 2.86 3.022 3.322 3.454 3.572 3.744 3.936 4.039 4.222 4.401 4.579 4.673 4.855 5.024 5.263 5.413 5.573 5.8 6.02 6.235 6.437 6.631 6.875 7.098 7.311 7.558 7.794 8.028 8.286 8.562 8.827 9.124 9.452 9.807 10.156 10.505 10.88 11.282 11.722 12.159 12.623 13.091 13.583 13.972 14.124 13.804 13.268 12.714 12.169 11.667 11.233 10.804 10.433 10.05 9.711 9.403 9.096 8.799 8.497 8.222 7.956 7.723 7.523 7.306 7.074 6.894 6.715 6.541 6.407 6.267 6.127 5.985 5.836 5.733 5.632 5.465 5.335 5.205 5.143 5.011 4.874 4.729 4.652 4.504 4.417 4.332 4.242 4.057 3.958 3.841 3.718 3.597 3.463 3.285 2.97 -8 ,22032 ,KEBNE ,16654118,Mon Nov 22 05:40:37 CET,Mon Nov 22 06:59:48 CET,0.0 1.42 1.766 2.024 2.249 2.469 2.669 2.824 3.095 3.239 3.382 3.561 3.746 3.848 4.043 4.223 4.388 4.476 4.674 4.872 5.135 5.299 5.455 5.679 5.89 6.085 6.272 6.449 6.678 6.915 7.138 7.385 7.616 7.837 8.089 8.364 8.613 8.895 9.23 9.568 9.89 10.25 10.692 11.152 11.662 12.138 12.608 13.106 13.545 13.877 13.955 13.645 13.211 12.728 12.234 11.736 11.255 10.816 10.434 10.003 9.633 9.324 9.042 8.787 8.541 8.311 8.071 7.859 7.679 7.494 7.295 7.129 6.959 6.773 6.63 6.49 6.347 6.209 6.066 5.962 5.857 5.697 5.574 5.445 5.381 5.253 5.125 4.975 4.896 4.742 4.645 4.555 4.464 4.294 4.205 4.092 3.961 3.818 3.654 3.468 2.964 -9 ,20538 ,KEBNE ,16654119,Mon Nov 22 05:41:35 CET,Mon Nov 22 07:08:19 CET,0.0 1.352 1.849 2.248 2.577 2.847 3.082 3.313 3.698 3.853 4.019 4.242 4.435 4.541 4.771 5.013 5.221 5.322 5.508 5.671 5.9 6.051 6.208 6.415 6.621 6.823 7.01 7.201 7.443 7.664 7.871 8.112 8.353 8.599 8.885 9.192 9.47 9.757 10.078 10.439 10.786 11.15 11.569 11.979 12.456 12.925 13.433 14.007 14.494 14.933 15.292 15.147 14.734 14.225 13.684 13.163 12.71 12.303 11.926 11.544 11.233 10.937 10.648 10.392 10.152 9.932 9.694 9.485 9.315 9.123 8.92 8.772 8.62 8.439 8.294 8.157 8.017 7.866 7.707 7.6 7.496 7.332 7.215 7.093 7.03 6.907 6.778 6.636 6.561 6.408 6.324 6.238 6.154 5.974 5.882 5.778 5.665 5.544 5.4 5.22 4.707 -10 ,18222 ,KEBNE ,16654120,Mon Nov 22 05:41:35 CET,Mon Nov 22 07:08:28 CET,0.0 1.38 1.766 2.11 2.392 2.61 2.804 2.981 3.274 3.403 3.528 3.699 3.891 3.991 4.198 4.4 4.579 4.659 4.808 4.958 5.187 5.329 5.461 5.664 5.854 6.031 6.198 6.359 6.579 6.781 6.968 7.19 7.388 7.575 7.807 8.078 8.332 8.601 8.876 9.169 9.496 9.865 10.282 10.675 11.103 11.588 12.141 12.696 13.246 13.752 14.054 13.984 13.674 13.224 12.703 12.196 11.757 11.367 11.053 10.737 10.457 10.206 9.941 9.672 9.416 9.178 8.951 8.749 8.553 8.345 8.125 7.95 7.775 7.59 7.45 7.309 7.164 7.017 6.856 6.738 6.617 6.434 6.307 6.178 6.112 5.975 5.82 5.636 5.543 5.383 5.296 5.216 5.141 4.978 4.885 4.784 4.674 4.545 4.406 4.239 3.839 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_36.txt deleted file mode 100644 index d68f83ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_36.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15581 ,KEBNE ,16654121,Mon Nov 22 05:41:35 CET,Mon Nov 22 07:08:54 CET,0.0 1.328 1.73 2.04 2.29 2.483 2.65 2.804 3.079 3.2 3.301 3.418 3.577 3.663 3.836 3.998 4.164 4.256 4.418 4.568 4.791 4.925 5.054 5.227 5.411 5.594 5.744 5.884 6.071 6.261 6.444 6.651 6.87 7.112 7.39 7.677 7.933 8.212 8.5 8.784 9.095 9.406 9.714 10.063 10.48 10.893 11.321 11.759 12.182 12.537 12.627 12.29 11.814 11.336 10.901 10.485 10.089 9.718 9.41 9.077 8.757 8.48 8.221 7.978 7.754 7.531 7.293 7.093 6.924 6.743 6.554 6.403 6.245 6.081 5.954 5.815 5.669 5.511 5.341 5.235 5.129 4.95 4.831 4.71 4.642 4.49 4.338 4.176 4.087 3.935 3.811 3.695 3.572 3.324 3.195 3.056 2.903 2.749 2.563 2.36 2.07 -2 ,11179 ,KEBNE ,16654122,Mon Nov 22 05:43:39 CET,Mon Nov 22 07:11:19 CET,0.0 0.903 1.375 1.731 2.024 2.288 2.532 2.725 3.029 3.182 3.332 3.537 3.743 3.864 4.075 4.288 4.487 4.575 4.757 4.937 5.168 5.311 5.453 5.68 5.903 6.089 6.258 6.431 6.663 6.887 7.09 7.32 7.543 7.764 8.021 8.283 8.533 8.798 9.07 9.35 9.618 9.933 10.319 10.66 11.008 11.37 11.794 12.255 12.69 12.977 13.112 12.963 12.563 12.122 11.631 11.152 10.77 10.416 10.088 9.727 9.414 9.132 8.861 8.608 8.375 8.163 7.945 7.747 7.568 7.391 7.21 7.04 6.862 6.691 6.56 6.424 6.291 6.156 6.007 5.898 5.772 5.588 5.47 5.339 5.271 5.142 5.014 4.889 4.829 4.689 4.597 4.519 4.44 4.262 4.174 4.091 3.993 3.874 3.742 3.566 3.224 -3 ,28571 ,KEBNE ,16654123,Mon Nov 22 05:44:41 CET,Mon Nov 22 07:11:04 CET,0.0 0.632 0.922 1.159 1.351 1.537 1.685 1.822 2.121 2.271 2.394 2.526 2.699 2.796 2.969 3.148 3.316 3.396 3.562 3.709 3.935 4.099 4.241 4.416 4.588 4.757 4.913 5.073 5.282 5.477 5.68 5.904 6.112 6.336 6.595 6.876 7.137 7.41 7.7 7.985 8.282 8.64 9.042 9.423 9.859 10.302 10.742 11.155 11.538 11.827 11.914 11.691 11.36 10.987 10.601 10.235 9.881 9.527 9.201 8.861 8.573 8.312 8.045 7.776 7.534 7.342 7.157 6.991 6.845 6.692 6.527 6.397 6.265 6.107 5.978 5.853 5.726 5.591 5.453 5.359 5.262 5.114 5.012 4.902 4.849 4.75 4.634 4.509 4.445 4.315 4.237 4.152 4.067 3.874 3.774 3.67 3.548 3.426 3.301 3.125 2.636 -7 ,2359 ,KEBNE ,16654127,Mon Nov 22 05:44:41 CET,Mon Nov 22 07:09:58 CET,0.0 0.966 1.341 1.587 1.788 1.969 2.126 2.276 2.608 2.763 2.896 3.042 3.221 3.339 3.558 3.768 3.962 4.054 4.24 4.421 4.66 4.812 4.976 5.22 5.44 5.631 5.808 5.964 6.161 6.383 6.605 6.877 7.133 7.342 7.599 7.887 8.124 8.382 8.678 8.97 9.254 9.577 9.954 10.353 10.782 11.168 11.599 12.063 12.474 12.823 12.949 12.647 12.202 11.754 11.331 10.902 10.504 10.148 9.841 9.526 9.261 9.01 8.764 8.538 8.316 8.109 7.896 7.698 7.527 7.358 7.161 6.996 6.839 6.674 6.543 6.407 6.264 6.116 5.983 5.899 5.81 5.664 5.563 5.468 5.418 5.306 5.177 5.048 4.986 4.842 4.757 4.682 4.591 4.388 4.284 4.183 4.083 3.969 3.816 3.618 3.32 -8 ,667 ,KEBNE ,16654128,Mon Nov 22 05:44:41 CET,Mon Nov 22 07:09:50 CET,0.0 0.927 1.284 1.544 1.758 1.946 2.125 2.281 2.552 2.682 2.803 2.955 3.136 3.249 3.454 3.649 3.82 3.897 4.05 4.206 4.441 4.599 4.75 4.959 5.158 5.343 5.51 5.665 5.872 6.076 6.257 6.466 6.682 6.901 7.141 7.395 7.639 7.916 8.213 8.515 8.834 9.21 9.625 10.044 10.524 11.003 11.535 12.116 12.7 13.221 13.501 13.292 13.012 12.668 12.271 11.909 11.52 11.156 10.862 10.524 10.229 9.957 9.672 9.398 9.15 8.923 8.682 8.486 8.332 8.168 7.987 7.839 7.685 7.501 7.352 7.211 7.072 6.934 6.799 6.708 6.613 6.45 6.334 6.209 6.142 6.013 5.88 5.729 5.65 5.495 5.379 5.287 5.196 4.993 4.867 4.738 4.621 4.477 4.318 4.121 3.587 -9 ,23566 ,KEBNE ,16654129,Mon Nov 22 05:44:41 CET,Mon Nov 22 07:09:56 CET,0.0 1.323 1.671 1.932 2.13 2.311 2.48 2.633 2.893 3.002 3.11 3.241 3.406 3.5 3.689 3.864 4.04 4.125 4.291 4.452 4.669 4.812 4.945 5.138 5.337 5.518 5.696 5.871 6.068 6.251 6.452 6.694 6.909 7.123 7.384 7.661 7.91 8.171 8.446 8.758 9.095 9.474 9.883 10.264 10.691 11.145 11.644 12.147 12.629 13.062 13.435 13.376 13.08 12.704 12.312 11.923 11.544 11.182 10.864 10.549 10.267 10.003 9.724 9.46 9.216 8.975 8.739 8.542 8.361 8.162 7.951 7.779 7.608 7.427 7.284 7.139 6.982 6.822 6.658 6.546 6.433 6.27 6.158 6.038 5.975 5.843 5.708 5.573 5.507 5.364 5.255 5.161 5.072 4.88 4.775 4.662 4.541 4.4 4.235 4.004 3.288 -10 ,27628 ,KEBNE ,16654130,Mon Nov 22 05:44:41 CET,Mon Nov 22 07:11:17 CET,0.0 0.907 1.291 1.561 1.781 1.977 2.152 2.301 2.594 2.727 2.84 2.963 3.128 3.235 3.446 3.637 3.84 3.941 4.13 4.299 4.527 4.693 4.856 5.085 5.295 5.479 5.666 5.84 6.06 6.285 6.494 6.735 6.966 7.182 7.423 7.701 7.962 8.247 8.536 8.803 9.081 9.386 9.751 10.103 10.451 10.839 11.279 11.676 12.106 12.492 12.64 12.35 11.905 11.488 11.097 10.717 10.365 10.028 9.729 9.429 9.152 8.898 8.663 8.435 8.208 7.994 7.781 7.609 7.471 7.32 7.153 7.02 6.885 6.743 6.625 6.499 6.374 6.25 6.118 6.026 5.936 5.788 5.687 5.594 5.544 5.439 5.327 5.196 5.128 4.996 4.928 4.855 4.781 4.617 4.528 4.434 4.331 4.225 4.076 3.865 3.561 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_44.txt deleted file mode 100644 index 7cd160d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_35_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5601 ,KEBNE ,17023515,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:42:12 CET,0.0 0.617 0.852 1.02 1.192 1.34 1.48 1.606 1.82 1.916 2.015 2.169 2.34 2.422 2.578 2.737 2.904 2.98 3.11 3.248 3.449 3.575 3.708 3.884 4.061 4.238 4.407 4.571 4.767 4.965 5.152 5.372 5.582 5.789 6.05 6.349 6.647 6.967 7.304 7.672 8.061 8.518 9.032 9.516 10.106 10.767 11.445 12.146 12.964 13.853 14.627 14.852 14.732 14.551 14.29 13.894 13.452 13.001 12.607 12.229 11.862 11.515 11.179 10.853 10.567 10.301 10.0 9.717 9.476 9.248 9.011 8.796 8.554 8.297 8.117 7.932 7.73 7.507 7.263 7.092 6.923 6.678 6.505 6.322 6.222 6.009 5.795 5.573 5.436 5.234 5.03 4.878 4.709 4.332 4.125 3.903 3.665 3.351 2.957 2.351 -0.13 -2 ,14929 ,KEBNE ,17023516,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:42:11 CET,0.0 0.585 0.914 1.105 1.252 1.383 1.521 1.664 1.9 2.006 2.117 2.278 2.467 2.578 2.783 2.97 3.149 3.239 3.415 3.59 3.832 3.979 4.12 4.317 4.521 4.732 4.932 5.122 5.366 5.596 5.827 6.103 6.353 6.608 6.9 7.224 7.527 7.836 8.185 8.557 8.931 9.376 9.901 10.397 10.973 11.624 12.343 13.163 14.09 15.052 15.866 16.142 16.012 15.719 15.352 14.924 14.498 14.122 13.786 13.398 13.057 12.753 12.428 12.11 11.809 11.512 11.2 10.915 10.676 10.436 10.176 9.956 9.737 9.513 9.331 9.13 8.909 8.693 8.495 8.345 8.169 7.887 7.684 7.466 7.36 7.151 6.932 6.712 6.586 6.387 6.171 6.021 5.849 5.472 5.275 5.046 4.787 4.49 4.123 3.58 1.446 -3 ,18247 ,KEBNE ,17023517,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:42:31 CET,0.0 0.543 0.832 1.053 1.221 1.38 1.54 1.682 1.914 2.015 2.119 2.253 2.422 2.516 2.704 2.894 3.074 3.154 3.296 3.432 3.62 3.751 3.886 4.076 4.265 4.449 4.627 4.806 5.033 5.243 5.446 5.708 5.959 6.196 6.493 6.827 7.131 7.461 7.806 8.16 8.537 8.962 9.482 10.012 10.592 11.255 11.999 12.762 13.671 14.728 15.681 15.959 15.799 15.449 15.029 14.556 14.136 13.747 13.389 13.004 12.647 12.349 12.054 11.756 11.483 11.227 10.943 10.678 10.431 10.181 9.94 9.727 9.488 9.245 9.065 8.873 8.665 8.446 8.223 8.072 7.904 7.623 7.424 7.219 7.114 6.908 6.683 6.434 6.308 6.118 5.913 5.759 5.584 5.218 5.021 4.8 4.559 4.25 3.869 3.37 1.382 -4 ,9490 ,KEBNE ,17023518,Wed Dec 22 08:13:53 CET,Wed Dec 22 09:42:26 CET,0.0 0.455 0.691 0.875 1.03 1.173 1.303 1.424 1.654 1.759 1.86 1.982 2.151 2.247 2.427 2.609 2.785 2.87 3.026 3.156 3.336 3.46 3.583 3.762 3.928 4.09 4.255 4.419 4.64 4.867 5.094 5.362 5.625 5.882 6.175 6.483 6.788 7.146 7.524 7.93 8.343 8.786 9.329 9.909 10.556 11.227 11.964 12.726 13.592 14.518 15.386 15.783 15.711 15.432 15.028 14.59 14.183 13.771 13.367 12.951 12.578 12.228 11.918 11.632 11.317 11.015 10.727 10.47 10.251 10.018 9.754 9.539 9.32 9.074 8.867 8.649 8.435 8.236 8.024 7.859 7.697 7.458 7.287 7.105 7.015 6.816 6.596 6.361 6.238 6.062 5.86 5.714 5.562 5.178 4.94 4.684 4.432 4.141 3.767 3.257 1.033 -5 ,31010 ,KEBNE ,17023519,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:42:12 CET,0.0 0.448 0.775 0.982 1.123 1.258 1.377 1.494 1.73 1.838 1.946 2.059 2.226 2.322 2.491 2.631 2.772 2.848 3.019 3.181 3.401 3.546 3.695 3.915 4.123 4.323 4.511 4.702 4.951 5.176 5.394 5.673 5.93 6.173 6.469 6.79 7.084 7.419 7.791 8.17 8.564 9.028 9.577 10.128 10.776 11.471 12.228 12.976 13.814 14.783 15.595 15.766 15.531 15.197 14.837 14.419 13.974 13.558 13.2 12.809 12.447 12.127 11.802 11.498 11.232 10.975 10.703 10.46 10.24 9.993 9.724 9.505 9.284 9.049 8.857 8.66 8.456 8.226 7.98 7.815 7.657 7.412 7.227 7.031 6.929 6.715 6.49 6.258 6.136 5.935 5.697 5.543 5.389 5.021 4.812 4.571 4.288 3.968 3.612 3.134 0.614 -6 ,20941 ,KEBNE ,17023520,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:42:26 CET,0.0 0.652 0.945 1.173 1.347 1.503 1.648 1.801 2.071 2.179 2.292 2.435 2.608 2.703 2.877 3.047 3.21 3.286 3.45 3.606 3.811 3.938 4.064 4.261 4.45 4.63 4.799 4.964 5.174 5.386 5.598 5.839 6.078 6.303 6.553 6.828 7.089 7.389 7.715 8.081 8.467 8.859 9.304 9.752 10.281 10.899 11.542 12.203 12.965 13.782 14.496 14.692 14.578 14.337 13.998 13.626 13.281 12.95 12.626 12.25 11.886 11.524 11.174 10.874 10.595 10.33 10.048 9.786 9.563 9.329 9.068 8.844 8.603 8.355 8.168 7.977 7.778 7.558 7.33 7.173 7.003 6.74 6.567 6.386 6.285 6.083 5.872 5.647 5.526 5.32 5.094 4.939 4.776 4.376 4.159 3.944 3.672 3.393 3.062 2.578 -0.083 -7 ,11280 ,KEBNE ,17023521,Wed Dec 22 08:13:52 CET,Wed Dec 22 09:42:39 CET,0.0 0.941 1.25 1.475 1.652 1.815 1.978 2.13 2.401 2.521 2.627 2.756 2.936 3.027 3.192 3.351 3.512 3.596 3.747 3.885 4.085 4.221 4.356 4.547 4.735 4.922 5.118 5.298 5.511 5.729 5.959 6.231 6.476 6.723 7.026 7.358 7.676 8.016 8.385 8.793 9.224 9.699 10.233 10.772 11.414 12.069 12.778 13.574 14.465 15.419 16.158 16.433 16.341 16.027 15.676 15.297 14.845 14.378 13.99 13.617 13.281 12.955 12.646 12.351 12.027 11.732 11.451 11.186 10.943 10.688 10.435 10.22 9.988 9.743 9.554 9.361 9.157 8.923 8.675 8.504 8.336 8.098 7.923 7.724 7.624 7.424 7.209 6.968 6.84 6.646 6.422 6.277 6.112 5.735 5.539 5.294 5.005 4.693 4.33 3.834 0.942 -8 ,2932 ,KEBNE ,17023522,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:43:23 CET,0.0 0.522 0.846 1.052 1.209 1.348 1.474 1.603 1.839 1.934 2.035 2.17 2.342 2.441 2.636 2.816 2.983 3.061 3.209 3.353 3.566 3.714 3.859 4.057 4.248 4.437 4.609 4.776 5.007 5.239 5.45 5.69 5.932 6.162 6.415 6.712 6.999 7.318 7.662 8.04 8.457 8.908 9.41 9.89 10.461 11.076 11.804 12.633 13.499 14.437 15.285 15.618 15.48 15.149 14.789 14.417 14.016 13.625 13.277 12.9 12.532 12.175 11.836 11.519 11.233 10.953 10.652 10.396 10.174 9.94 9.689 9.484 9.269 9.032 8.857 8.673 8.466 8.248 8.025 7.869 7.709 7.472 7.304 7.108 7.004 6.807 6.584 6.33 6.202 6.007 5.771 5.617 5.456 5.077 4.854 4.608 4.345 4.035 3.696 3.209 0.301 -9 ,3644 ,KEBNE ,17023523,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:43:22 CET,0.0 0.564 0.833 1.079 1.28 1.457 1.604 1.735 1.963 2.072 2.181 2.305 2.476 2.578 2.77 2.943 3.111 3.187 3.338 3.488 3.697 3.827 3.95 4.131 4.309 4.481 4.656 4.82 5.035 5.247 5.441 5.671 5.893 6.116 6.367 6.645 6.911 7.2 7.516 7.863 8.236 8.639 9.107 9.608 10.16 10.755 11.449 12.214 13.066 13.92 14.67 14.922 14.911 14.675 14.231 13.774 13.384 12.99 12.61 12.22 11.863 11.526 11.197 10.903 10.609 10.314 10.009 9.739 9.509 9.265 9.018 8.812 8.578 8.32 8.118 7.914 7.715 7.512 7.29 7.143 6.985 6.713 6.522 6.33 6.23 6.023 5.807 5.564 5.436 5.249 5.037 4.882 4.722 4.402 4.211 3.99 3.728 3.453 3.119 2.56 -0.112 -10 ,20633 ,KEBNE ,17023524,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:43:02 CET,0.0 0.756 1.061 1.254 1.404 1.548 1.7 1.826 2.042 2.153 2.257 2.375 2.545 2.626 2.774 2.926 3.087 3.159 3.289 3.432 3.641 3.766 3.896 4.111 4.299 4.46 4.618 4.765 4.965 5.174 5.372 5.605 5.837 6.058 6.327 6.646 6.939 7.251 7.585 7.944 8.281 8.657 9.123 9.57 10.104 10.693 11.343 12.065 12.858 13.662 14.392 14.664 14.494 14.198 13.873 13.49 13.097 12.732 12.399 12.03 11.668 11.333 11.019 10.706 10.414 10.145 9.847 9.586 9.369 9.132 8.878 8.673 8.44 8.213 8.046 7.869 7.671 7.443 7.218 7.069 6.924 6.687 6.502 6.312 6.213 5.993 5.775 5.549 5.413 5.213 5.006 4.859 4.7 4.33 4.094 3.822 3.55 3.244 2.858 2.341 0.619 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_36_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_36_35.txt deleted file mode 100644 index 3aa63949..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_36_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28427 ,KEBNE ,17042371,Thu Dec 23 04:29:05 CET,Thu Dec 23 05:58:49 CET,0.0 0.437 0.628 0.751 0.859 0.971 1.074 1.161 1.32 1.396 1.471 1.557 1.707 1.776 1.9 2.009 2.11 2.16 2.259 2.356 2.502 2.595 2.681 2.811 2.947 3.067 3.177 3.299 3.445 3.57 3.699 3.855 4.01 4.163 4.335 4.54 4.745 4.99 5.241 5.476 5.719 6.0 6.348 6.684 7.034 7.441 7.9 8.309 8.705 9.093 9.329 9.169 8.793 8.387 7.974 7.568 7.172 6.777 6.414 6.01 5.675 5.403 5.137 4.883 4.608 4.323 4.052 3.827 3.626 3.389 3.124 2.916 2.705 2.476 2.313 2.147 1.968 1.785 1.598 1.474 1.343 1.123 0.957 0.798 0.722 0.529 0.32 0.112 0.004 -0.181 -0.375 -0.518 -0.646 -0.902 -1.054 -1.233 -1.437 -1.666 -1.952 -2.269 -3.459 -2 ,23073 ,KEBNE ,17042372,Thu Dec 23 04:29:05 CET,Thu Dec 23 06:00:56 CET,0.0 0.64 0.854 1.004 1.12 1.216 1.31 1.4 1.555 1.626 1.703 1.793 1.936 2.008 2.133 2.249 2.367 2.423 2.523 2.626 2.773 2.859 2.95 3.101 3.241 3.363 3.482 3.603 3.763 3.895 4.02 4.196 4.376 4.55 4.745 4.953 5.147 5.361 5.597 5.846 6.107 6.4 6.706 7.0 7.366 7.761 8.183 8.608 9.057 9.468 9.692 9.638 9.354 8.978 8.565 8.084 7.635 7.246 6.912 6.551 6.23 5.936 5.624 5.325 5.052 4.78 4.507 4.279 4.057 3.817 3.594 3.431 3.225 2.982 2.829 2.661 2.47 2.267 2.044 1.896 1.739 1.492 1.324 1.15 1.058 0.855 0.642 0.425 0.31 0.115 -0.069 -0.196 -0.328 -0.62 -0.76 -0.905 -1.088 -1.318 -1.582 -1.937 -3.117 -3 ,13831 ,KEBNE ,17042373,Thu Dec 23 04:29:09 CET,Thu Dec 23 05:55:30 CET,0.0 0.588 0.806 0.94 1.055 1.182 1.284 1.378 1.568 1.65 1.731 1.821 1.955 2.017 2.143 2.257 2.37 2.43 2.545 2.649 2.794 2.886 2.976 3.101 3.227 3.357 3.479 3.596 3.741 3.873 4.0 4.162 4.321 4.483 4.696 4.92 5.125 5.377 5.655 5.912 6.167 6.471 6.815 7.141 7.499 7.859 8.252 8.674 9.096 9.478 9.719 9.635 9.331 8.904 8.45 8.005 7.593 7.194 6.845 6.434 6.087 5.821 5.542 5.272 4.985 4.718 4.457 4.219 4.003 3.763 3.521 3.327 3.118 2.9 2.73 2.551 2.35 2.132 1.931 1.794 1.631 1.373 1.189 0.995 0.909 0.741 0.555 0.344 0.227 0.024 -0.204 -0.379 -0.57 -0.93 -1.111 -1.33 -1.581 -1.86 -2.205 -2.656 -3.909 -4 ,17830 ,KEBNE ,17042375,Thu Dec 23 04:32:13 CET,Thu Dec 23 06:03:39 CET,0.0 0.48 0.677 0.84 0.961 1.065 1.167 1.267 1.455 1.537 1.612 1.683 1.813 1.881 2.017 2.141 2.258 2.31 2.411 2.512 2.65 2.742 2.838 2.966 3.086 3.206 3.321 3.431 3.584 3.728 3.853 4.012 4.165 4.318 4.524 4.766 4.992 5.228 5.479 5.745 6.014 6.312 6.673 7.012 7.364 7.763 8.216 8.683 9.146 9.611 9.954 9.864 9.575 9.117 8.618 8.135 7.689 7.266 6.862 6.458 6.094 5.746 5.413 5.102 4.818 4.572 4.298 4.046 3.849 3.624 3.354 3.133 2.924 2.72 2.541 2.351 2.17 1.986 1.784 1.616 1.448 1.194 1.011 0.826 0.734 0.562 0.389 0.204 0.098 -0.075 -0.18 -0.275 -0.403 -0.709 -0.852 -0.997 -1.177 -1.383 -1.611 -1.914 -2.578 -5 ,25392 ,KEBNE ,17042376,Thu Dec 23 04:32:13 CET,Thu Dec 23 06:02:00 CET,0.0 0.432 0.611 0.741 0.864 0.979 1.082 1.172 1.327 1.405 1.475 1.546 1.685 1.744 1.861 1.97 2.071 2.127 2.236 2.336 2.478 2.567 2.66 2.812 2.943 3.067 3.191 3.307 3.459 3.605 3.756 3.951 4.136 4.322 4.53 4.746 4.954 5.183 5.43 5.694 5.967 6.267 6.609 6.934 7.296 7.67 8.098 8.541 8.998 9.43 9.66 9.594 9.262 8.826 8.435 8.045 7.706 7.4 7.124 6.821 6.487 6.148 5.842 5.572 5.332 5.118 4.876 4.646 4.455 4.269 4.068 3.889 3.694 3.483 3.325 3.174 3.018 2.843 2.663 2.534 2.386 2.143 1.968 1.793 1.708 1.526 1.327 1.119 1.011 0.831 0.688 0.577 0.46 0.198 0.044 -0.136 -0.32 -0.499 -0.708 -1.0 -1.671 -6 ,2382 ,KEBNE ,17042378,Thu Dec 23 04:32:14 CET,Thu Dec 23 06:02:04 CET,0.0 0.281 0.446 0.566 0.688 0.811 0.918 1.014 1.176 1.252 1.322 1.391 1.525 1.592 1.719 1.83 1.942 2.002 2.111 2.203 2.341 2.435 2.522 2.643 2.759 2.877 2.994 3.108 3.255 3.396 3.54 3.71 3.873 4.026 4.195 4.389 4.579 4.779 4.974 5.186 5.422 5.67 5.937 6.215 6.558 6.932 7.357 7.818 8.256 8.627 8.887 8.761 8.331 7.884 7.431 6.926 6.472 6.026 5.636 5.256 4.922 4.616 4.297 3.971 3.682 3.449 3.213 2.986 2.776 2.567 2.345 2.154 1.94 1.711 1.534 1.35 1.159 0.961 0.748 0.605 0.478 0.268 0.122 -0.048 -0.146 -0.319 -0.492 -0.702 -0.826 -1.017 -1.137 -1.24 -1.353 -1.633 -1.815 -2.012 -2.218 -2.444 -2.685 -3.013 -4.064 -7 ,8969 ,KEBNE ,17042379,Thu Dec 23 04:32:13 CET,Thu Dec 23 06:01:21 CET,0.0 0.358 0.545 0.71 0.828 0.937 1.036 1.125 1.3 1.383 1.457 1.508 1.64 1.701 1.837 1.975 2.097 2.154 2.261 2.364 2.514 2.612 2.7 2.818 2.929 3.041 3.162 3.29 3.468 3.631 3.779 3.963 4.138 4.307 4.501 4.704 4.92 5.162 5.409 5.671 5.933 6.231 6.563 6.888 7.249 7.618 8.026 8.414 8.825 9.236 9.403 9.199 8.823 8.389 8.01 7.595 7.18 6.826 6.509 6.169 5.859 5.589 5.346 5.132 4.913 4.687 4.439 4.221 4.052 3.855 3.618 3.433 3.257 3.073 2.928 2.771 2.593 2.388 2.181 2.049 1.912 1.672 1.488 1.31 1.226 1.057 0.88 0.681 0.577 0.406 0.292 0.168 0.031 -0.235 -0.387 -0.565 -0.746 -0.952 -1.233 -1.573 -2.666 -8 ,1176 ,KEBNE ,17042380,Thu Dec 23 04:32:13 CET,Thu Dec 23 06:01:45 CET,0.0 0.599 0.775 0.915 1.04 1.151 1.257 1.349 1.522 1.606 1.681 1.748 1.887 1.951 2.071 2.195 2.305 2.356 2.467 2.587 2.768 2.885 2.993 3.145 3.292 3.44 3.588 3.729 3.921 4.108 4.269 4.449 4.639 4.832 5.044 5.281 5.495 5.716 5.967 6.229 6.491 6.798 7.146 7.481 7.848 8.222 8.624 9.052 9.493 9.881 10.144 10.026 9.649 9.255 8.864 8.48 8.095 7.702 7.401 7.087 6.772 6.478 6.187 5.897 5.63 5.365 5.083 4.829 4.611 4.393 4.156 3.965 3.769 3.581 3.431 3.25 3.05 2.859 2.671 2.538 2.399 2.184 2.042 1.889 1.804 1.626 1.45 1.259 1.16 0.983 0.806 0.671 0.541 0.256 0.097 -0.065 -0.226 -0.396 -0.613 -0.914 -2.066 -9 ,19772 ,KEBNE ,17042382,Thu Dec 23 04:32:17 CET,Thu Dec 23 05:57:34 CET,0.0 0.244 0.414 0.556 0.664 0.767 0.87 0.959 1.12 1.201 1.281 1.365 1.501 1.57 1.698 1.81 1.921 1.974 2.077 2.175 2.318 2.415 2.518 2.661 2.797 2.932 3.058 3.178 3.323 3.455 3.582 3.756 3.928 4.071 4.228 4.416 4.612 4.815 5.031 5.275 5.518 5.78 6.085 6.393 6.724 7.071 7.459 7.866 8.291 8.721 9.054 9.047 8.857 8.535 8.172 7.777 7.373 7.016 6.665 6.263 5.967 5.709 5.439 5.192 4.948 4.702 4.455 4.233 4.048 3.862 3.645 3.447 3.254 3.074 2.922 2.756 2.583 2.415 2.249 2.127 2.008 1.84 1.719 1.581 1.499 1.324 1.142 0.932 0.835 0.683 0.559 0.428 0.283 -0.046 -0.202 -0.352 -0.522 -0.688 -0.926 -1.281 -2.075 -10 ,5044 ,KEBNE ,17042383,Thu Dec 23 04:32:13 CET,Thu Dec 23 06:01:38 CET,0.0 0.455 0.614 0.756 0.874 0.981 1.077 1.163 1.34 1.436 1.537 1.673 1.833 1.925 2.09 2.23 2.363 2.427 2.553 2.67 2.851 2.968 3.08 3.235 3.382 3.527 3.663 3.802 3.986 4.166 4.338 4.53 4.704 4.866 5.055 5.275 5.482 5.713 5.963 6.239 6.535 6.841 7.179 7.521 7.891 8.287 8.719 9.196 9.707 10.143 10.423 10.273 9.936 9.549 9.123 8.699 8.292 7.908 7.57 7.212 6.896 6.592 6.272 5.964 5.705 5.48 5.227 5.008 4.826 4.638 4.449 4.28 4.103 3.894 3.71 3.538 3.379 3.215 3.041 2.922 2.798 2.595 2.457 2.32 2.237 2.046 1.866 1.694 1.605 1.444 1.323 1.221 1.118 0.874 0.741 0.594 0.402 0.184 -0.042 -0.38 -1.294 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_36_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_36_37.txt deleted file mode 100644 index f1aeba48..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_36_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7579 ,KEBNE ,17042385,Thu Dec 23 04:32:13 CET,Thu Dec 23 06:02:12 CET,0.0 1.593 2.073 2.396 2.65 2.886 3.114 3.307 3.616 3.755 3.907 4.136 4.345 4.479 4.709 4.912 5.112 5.206 5.383 5.56 5.823 5.993 6.156 6.371 6.579 6.803 7.008 7.207 7.464 7.703 7.933 8.217 8.489 8.755 9.081 9.437 9.77 10.14 10.516 10.906 11.352 11.862 12.436 12.998 13.672 14.458 15.331 16.344 17.57 19.015 20.796 22.159 22.894 23.325 23.555 23.695 23.763 23.78 23.771 23.725 23.661 23.603 23.538 23.451 23.363 23.286 23.198 23.106 23.011 22.912 22.814 22.711 22.586 22.462 22.37 22.276 22.181 22.075 21.958 21.876 21.787 21.621 21.5 21.394 21.343 21.243 21.12 20.965 20.89 20.762 20.651 20.583 20.507 20.301 20.176 20.042 19.889 19.715 19.528 19.314 18.46 -2 ,31979 ,KEBNE ,17042386,Thu Dec 23 04:32:14 CET,Thu Dec 23 06:01:48 CET,0.0 1.289 1.672 1.978 2.238 2.448 2.612 2.753 3.002 3.118 3.247 3.407 3.57 3.667 3.864 4.071 4.272 4.358 4.518 4.685 4.929 5.091 5.252 5.474 5.675 5.868 6.065 6.259 6.495 6.73 6.965 7.241 7.512 7.781 8.098 8.447 8.782 9.141 9.528 9.937 10.349 10.826 11.406 11.983 12.674 13.461 14.353 15.403 16.648 18.026 19.678 20.999 21.678 22.07 22.324 22.444 22.5 22.516 22.487 22.446 22.382 22.325 22.259 22.186 22.108 22.001 21.879 21.77 21.668 21.559 21.447 21.36 21.277 21.186 21.1 21.005 20.916 20.835 20.746 20.68 20.61 20.49 20.395 20.291 20.248 20.162 20.055 19.936 19.874 19.754 19.655 19.57 19.459 19.211 19.075 18.936 18.796 18.653 18.479 18.213 17.723 -3 ,9216 ,KEBNE ,17042387,Thu Dec 23 04:32:13 CET,Thu Dec 23 06:02:28 CET,0.0 1.263 1.618 1.868 2.072 2.269 2.439 2.582 2.852 2.985 3.104 3.257 3.428 3.522 3.716 3.901 4.063 4.142 4.298 4.449 4.681 4.823 4.962 5.167 5.352 5.531 5.712 5.891 6.117 6.338 6.548 6.809 7.078 7.332 7.614 7.929 8.236 8.57 8.925 9.332 9.771 10.234 10.777 11.336 11.991 12.713 13.551 14.544 15.743 17.14 18.847 20.272 21.062 21.488 21.794 22.014 22.127 22.18 22.18 22.156 22.083 21.998 21.924 21.838 21.747 21.661 21.55 21.455 21.384 21.298 21.196 21.089 20.967 20.857 20.774 20.681 20.581 20.473 20.373 20.311 20.244 20.137 20.054 19.962 19.917 19.828 19.726 19.592 19.522 19.396 19.282 19.197 19.103 18.914 18.811 18.669 18.489 18.313 18.141 17.89 17.115 -4 ,23146 ,KEBNE ,17042388,Thu Dec 23 04:32:13 CET,Thu Dec 23 06:02:02 CET,0.0 1.794 2.128 2.378 2.596 2.784 2.978 3.169 3.463 3.591 3.707 3.855 4.025 4.124 4.318 4.499 4.668 4.747 4.897 5.048 5.263 5.398 5.531 5.729 5.93 6.12 6.297 6.468 6.703 6.929 7.143 7.401 7.643 7.882 8.168 8.48 8.772 9.116 9.493 9.882 10.309 10.791 11.364 11.945 12.598 13.349 14.252 15.264 16.398 17.781 19.498 20.817 21.524 21.922 22.157 22.293 22.338 22.348 22.332 22.264 22.162 22.073 21.996 21.896 21.78 21.674 21.562 21.42 21.288 21.177 21.058 20.965 20.877 20.759 20.662 20.57 20.481 20.375 20.256 20.183 20.112 19.994 19.904 19.806 19.753 19.647 19.537 19.413 19.348 19.231 19.145 19.065 18.983 18.799 18.673 18.527 18.375 18.222 18.037 17.79 17.125 -5 ,24161 ,KEBNE ,17042389,Thu Dec 23 04:32:18 CET,Thu Dec 23 05:58:58 CET,0.0 1.738 2.203 2.561 2.838 3.078 3.3 3.498 3.824 3.972 4.12 4.309 4.488 4.594 4.808 5.021 5.222 5.312 5.488 5.676 5.936 6.089 6.235 6.45 6.654 6.861 7.076 7.274 7.52 7.757 7.982 8.256 8.524 8.785 9.094 9.435 9.763 10.114 10.472 10.876 11.316 11.818 12.422 13.017 13.678 14.406 15.307 16.351 17.555 19.013 20.73 22.099 22.833 23.214 23.458 23.607 23.672 23.663 23.593 23.519 23.462 23.397 23.317 23.213 23.108 23.021 22.915 22.81 22.712 22.593 22.472 22.387 22.287 22.156 22.047 21.942 21.826 21.706 21.573 21.474 21.377 21.235 21.116 20.978 20.913 20.789 20.664 20.535 20.472 20.354 20.252 20.173 20.079 19.855 19.739 19.632 19.513 19.369 19.202 18.994 18.184 -6 ,21256 ,KEBNE ,17042390,Thu Dec 23 04:32:18 CET,Thu Dec 23 05:58:04 CET,0.0 1.58 1.985 2.225 2.448 2.662 2.841 3.013 3.312 3.438 3.565 3.748 3.933 4.04 4.226 4.4 4.587 4.68 4.837 4.981 5.188 5.322 5.457 5.657 5.855 6.059 6.263 6.462 6.708 6.945 7.175 7.444 7.721 7.987 8.285 8.612 8.937 9.303 9.689 10.113 10.575 11.076 11.659 12.245 12.9 13.672 14.583 15.647 16.912 18.358 20.074 21.409 22.163 22.588 22.798 22.899 22.96 22.969 22.924 22.846 22.772 22.664 22.544 22.443 22.348 22.251 22.139 22.048 21.972 21.88 21.771 21.686 21.589 21.478 21.388 21.297 21.203 21.095 20.988 20.919 20.841 20.718 20.633 20.549 20.505 20.397 20.277 20.159 20.099 19.98 19.89 19.817 19.724 19.482 19.348 19.197 19.029 18.841 18.605 18.285 17.39 -7 ,685 ,KEBNE ,17042391,Thu Dec 23 04:32:14 CET,Thu Dec 23 06:02:33 CET,0.0 1.752 2.215 2.496 2.726 2.935 3.124 3.28 3.552 3.69 3.816 3.963 4.13 4.235 4.444 4.633 4.806 4.893 5.063 5.217 5.443 5.585 5.719 5.92 6.118 6.31 6.495 6.674 6.905 7.128 7.342 7.594 7.838 8.071 8.34 8.65 8.962 9.3 9.658 10.052 10.472 10.95 11.509 12.078 12.757 13.521 14.412 15.445 16.683 18.082 19.721 21.016 21.73 22.16 22.408 22.55 22.624 22.634 22.606 22.562 22.504 22.428 22.333 22.242 22.15 22.041 21.918 21.82 21.737 21.63 21.51 21.418 21.314 21.191 21.09 20.966 20.831 20.701 20.576 20.488 20.401 20.238 20.104 19.969 19.904 19.788 19.665 19.512 19.428 19.297 19.143 19.045 18.926 18.627 18.499 18.354 18.18 18.018 17.787 17.442 16.012 -8 ,14791 ,KEBNE ,17042392,Thu Dec 23 04:32:13 CET,Thu Dec 23 06:02:13 CET,0.0 1.405 1.756 1.996 2.208 2.411 2.591 2.765 3.111 3.264 3.391 3.535 3.704 3.808 4.011 4.198 4.366 4.445 4.594 4.741 4.966 5.117 5.265 5.476 5.675 5.866 6.062 6.26 6.504 6.74 6.965 7.245 7.518 7.767 8.061 8.399 8.737 9.099 9.479 9.888 10.318 10.797 11.361 11.945 12.62 13.386 14.273 15.234 16.402 17.78 19.399 20.744 21.493 21.923 22.186 22.384 22.517 22.558 22.539 22.511 22.48 22.453 22.414 22.352 22.294 22.227 22.148 22.068 21.983 21.893 21.794 21.725 21.658 21.563 21.493 21.426 21.337 21.241 21.15 21.08 21.01 20.899 20.806 20.706 20.659 20.573 20.475 20.36 20.291 20.176 20.094 20.015 19.916 19.69 19.564 19.405 19.245 19.092 18.901 18.649 17.78 -9 ,7761 ,KEBNE ,17042393,Thu Dec 23 04:32:13 CET,Thu Dec 23 06:02:27 CET,0.0 1.165 1.561 1.852 2.08 2.267 2.432 2.604 2.905 3.03 3.153 3.307 3.472 3.567 3.758 3.944 4.128 4.214 4.382 4.542 4.767 4.915 5.053 5.252 5.441 5.626 5.822 6.022 6.279 6.518 6.763 7.079 7.368 7.643 7.956 8.312 8.666 9.038 9.423 9.824 10.249 10.741 11.322 11.9 12.605 13.413 14.336 15.354 16.518 17.914 19.592 20.973 21.722 22.126 22.353 22.474 22.538 22.56 22.532 22.46 22.385 22.299 22.207 22.118 22.013 21.902 21.779 21.676 21.584 21.489 21.387 21.294 21.199 21.081 20.972 20.876 20.781 20.668 20.548 20.457 20.366 20.223 20.108 19.983 19.924 19.778 19.602 19.432 19.351 19.229 19.142 19.062 18.97 18.789 18.684 18.575 18.449 18.31 18.14 17.856 17.034 -10 ,21459 ,KEBNE ,17042394,Thu Dec 23 04:36:20 CET,Thu Dec 23 06:06:02 CET,0.0 1.375 1.756 2.032 2.235 2.423 2.608 2.781 3.059 3.179 3.299 3.461 3.641 3.755 3.946 4.113 4.298 4.384 4.539 4.691 4.907 5.05 5.187 5.383 5.572 5.761 5.944 6.118 6.346 6.563 6.781 7.049 7.293 7.54 7.837 8.159 8.466 8.805 9.169 9.56 9.994 10.463 10.981 11.541 12.224 12.991 13.891 14.919 16.124 17.53 19.265 20.725 21.551 22.045 22.292 22.438 22.552 22.594 22.582 22.535 22.454 22.364 22.272 22.174 22.066 21.965 21.855 21.745 21.649 21.533 21.403 21.3 21.202 21.107 21.024 20.934 20.851 20.757 20.645 20.569 20.495 20.383 20.3 20.208 20.154 20.027 19.895 19.769 19.706 19.584 19.45 19.341 19.226 18.981 18.854 18.723 18.572 18.391 18.2 17.931 17.121 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_19.txt deleted file mode 100644 index 818439df..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_19.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32240 ,KEBNE ,16654131,Mon Nov 22 05:44:41 CET,Mon Nov 22 07:08:54 CET,0.0 0.216 0.332 0.417 0.491 0.552 0.606 0.653 0.739 0.774 0.805 0.825 0.906 0.93 0.971 1.023 1.074 1.094 1.129 1.157 1.197 1.224 1.249 1.28 1.302 1.326 1.351 1.37 1.392 1.41 1.429 1.454 1.468 1.485 1.51 1.521 1.509 1.485 1.458 1.429 1.391 1.329 1.219 1.076 0.884 0.644 0.351 -0.069 -0.719 -1.712 -3.414 -5.434 -7.031 -8.356 -9.491 -10.5 -11.371 -12.112 -12.754 -13.409 -13.963 -14.468 -14.955 -15.404 -15.81 -16.178 -16.573 -16.921 -17.224 -17.547 -17.876 -18.146 -18.426 -18.721 -18.965 -19.239 -19.515 -19.773 -20.057 -20.27 -20.483 -20.799 -21.024 -21.252 -21.363 -21.6 -21.865 -22.147 -22.286 -22.506 -22.767 -22.939 -23.123 -23.527 -23.762 -24.036 -24.349 -24.724 -25.187 -25.802 -27.853 -5 ,7250 ,KEBNE ,16654135,Mon Nov 22 05:44:41 CET,Mon Nov 22 07:10:32 CET,0.0 0.223 0.307 0.372 0.436 0.487 0.522 0.557 0.646 0.69 0.734 0.771 0.857 0.886 0.924 0.963 1.009 1.03 1.069 1.104 1.153 1.187 1.219 1.268 1.308 1.335 1.363 1.384 1.407 1.431 1.448 1.46 1.466 1.474 1.485 1.487 1.475 1.457 1.434 1.403 1.363 1.288 1.19 1.078 0.914 0.699 0.37 -0.089 -0.78 -1.827 -3.546 -5.553 -7.139 -8.515 -9.673 -10.653 -11.502 -12.262 -12.929 -13.592 -14.145 -14.628 -15.083 -15.52 -15.934 -16.302 -16.684 -17.037 -17.357 -17.702 -18.046 -18.331 -18.625 -18.942 -19.205 -19.472 -19.736 -20.001 -20.296 -20.503 -20.705 -21.019 -21.232 -21.451 -21.561 -21.795 -22.052 -22.309 -22.438 -22.652 -22.902 -23.076 -23.256 -23.662 -23.875 -24.117 -24.443 -24.819 -25.27 -25.926 -29.216 -6 ,555 ,KEBNE ,16654136,Mon Nov 22 05:45:42 CET,Mon Nov 22 07:09:55 CET,0.0 0.107 0.194 0.252 0.305 0.371 0.418 0.455 0.528 0.562 0.608 0.649 0.737 0.766 0.827 0.889 0.934 0.954 0.993 1.023 1.06 1.083 1.101 1.126 1.155 1.173 1.185 1.208 1.232 1.252 1.278 1.304 1.315 1.314 1.317 1.312 1.312 1.306 1.281 1.239 1.195 1.155 1.066 0.926 0.747 0.542 0.261 -0.163 -0.858 -1.939 -3.725 -5.782 -7.429 -8.787 -9.944 -10.943 -11.82 -12.635 -13.327 -13.99 -14.556 -15.04 -15.482 -15.902 -16.287 -16.649 -17.027 -17.362 -17.657 -17.969 -18.293 -18.561 -18.827 -19.112 -19.337 -19.55 -19.772 -20.013 -20.269 -20.453 -20.647 -20.948 -21.153 -21.374 -21.492 -21.718 -21.967 -22.226 -22.348 -22.55 -22.76 -22.927 -23.119 -23.494 -23.702 -23.95 -24.24 -24.565 -24.946 -25.457 -27.731 -7 ,21278 ,KEBNE ,16654137,Mon Nov 22 05:45:42 CET,Mon Nov 22 07:10:16 CET,0.0 0.216 0.305 0.394 0.458 0.51 0.575 0.631 0.712 0.76 0.8 0.805 0.89 0.925 0.981 1.016 1.045 1.06 1.092 1.127 1.176 1.202 1.227 1.266 1.299 1.324 1.342 1.357 1.385 1.424 1.455 1.477 1.491 1.499 1.498 1.481 1.466 1.438 1.401 1.38 1.357 1.308 1.219 1.087 0.902 0.639 0.238 -0.312 -1.106 -2.274 -4.125 -6.243 -7.915 -9.329 -10.519 -11.518 -12.387 -13.191 -13.875 -14.539 -15.091 -15.581 -16.061 -16.513 -16.928 -17.304 -17.715 -18.09 -18.391 -18.728 -19.102 -19.405 -19.718 -20.023 -20.27 -20.532 -20.793 -21.077 -21.367 -21.562 -21.767 -22.083 -22.302 -22.548 -22.68 -22.952 -23.253 -23.556 -23.699 -23.924 -24.178 -24.366 -24.549 -24.933 -25.178 -25.473 -25.8 -26.179 -26.634 -27.26 -29.636 -10 ,18052 ,KEBNE ,16654140,Mon Nov 22 05:47:46 CET,Mon Nov 22 07:13:53 CET,0.0 0.12 0.195 0.268 0.335 0.385 0.441 0.496 0.597 0.636 0.662 0.671 0.749 0.774 0.825 0.874 0.909 0.922 0.953 0.993 1.051 1.081 1.106 1.143 1.181 1.216 1.247 1.269 1.289 1.314 1.337 1.358 1.374 1.375 1.373 1.369 1.352 1.327 1.301 1.271 1.232 1.188 1.124 1.009 0.831 0.592 0.243 -0.237 -0.899 -1.889 -3.578 -5.616 -7.332 -8.754 -9.929 -10.934 -11.778 -12.556 -13.242 -13.917 -14.48 -14.981 -15.47 -15.925 -16.342 -16.716 -17.095 -17.444 -17.75 -18.058 -18.377 -18.64 -18.905 -19.19 -19.419 -19.661 -19.897 -20.13 -20.369 -20.532 -20.708 -21.011 -21.227 -21.461 -21.588 -21.827 -22.073 -22.347 -22.501 -22.738 -22.979 -23.154 -23.34 -23.771 -24.021 -24.293 -24.623 -25.014 -25.459 -26.08 -28.656 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_26.txt deleted file mode 100644 index 6cd5b861..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_26.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5402 ,KEBNE ,16654141,Mon Nov 22 05:47:46 CET,Mon Nov 22 07:15:55 CET,0.0 0.862 1.151 1.341 1.511 1.657 1.79 1.903 2.086 2.176 2.26 2.364 2.496 2.568 2.689 2.806 2.919 2.977 3.095 3.202 3.35 3.453 3.56 3.691 3.814 3.943 4.059 4.163 4.295 4.437 4.568 4.701 4.821 4.923 5.036 5.162 5.301 5.46 5.595 5.724 5.864 6.013 6.159 6.282 6.395 6.447 6.469 6.415 6.185 5.732 4.742 3.421 2.312 1.305 0.426 -0.349 -0.997 -1.588 -2.118 -2.642 -3.103 -3.515 -3.88 -4.232 -4.576 -4.887 -5.224 -5.52 -5.763 -6.032 -6.334 -6.577 -6.822 -7.079 -7.274 -7.466 -7.658 -7.87 -8.115 -8.29 -8.464 -8.728 -8.915 -9.118 -9.224 -9.446 -9.702 -9.959 -10.067 -10.25 -10.463 -10.624 -10.789 -11.113 -11.31 -11.539 -11.784 -12.104 -12.503 -13.041 -15.355 -3 ,17067 ,KEBNE ,16654143,Mon Nov 22 05:49:49 CET,Mon Nov 22 07:16:00 CET,0.0 0.641 0.877 1.049 1.187 1.306 1.424 1.534 1.736 1.822 1.899 1.996 2.116 2.176 2.299 2.43 2.564 2.627 2.736 2.844 2.988 3.08 3.166 3.283 3.401 3.506 3.603 3.699 3.83 3.965 4.092 4.243 4.401 4.546 4.696 4.86 5.007 5.162 5.332 5.495 5.667 5.866 6.052 6.215 6.344 6.381 6.354 6.237 5.95 5.424 4.355 2.913 1.676 0.583 -0.32 -1.114 -1.839 -2.461 -2.982 -3.522 -3.972 -4.36 -4.723 -5.076 -5.415 -5.723 -6.05 -6.355 -6.619 -6.892 -7.171 -7.403 -7.653 -7.903 -8.097 -8.29 -8.495 -8.73 -8.962 -9.118 -9.296 -9.584 -9.774 -9.965 -10.065 -10.274 -10.498 -10.74 -10.869 -11.083 -11.33 -11.484 -11.642 -11.956 -12.129 -12.342 -12.615 -12.926 -13.254 -13.697 -15.507 -4 ,12198 ,KEBNE ,16654144,Mon Nov 22 05:52:55 CET,Mon Nov 22 07:19:21 CET,0.0 0.715 0.896 1.054 1.219 1.356 1.454 1.541 1.734 1.829 1.914 2.029 2.146 2.207 2.33 2.451 2.566 2.623 2.736 2.841 2.977 3.065 3.157 3.285 3.406 3.52 3.626 3.721 3.846 3.974 4.09 4.211 4.32 4.434 4.576 4.737 4.876 5.013 5.139 5.275 5.407 5.533 5.658 5.751 5.839 5.895 5.893 5.81 5.606 5.132 4.089 2.65 1.443 0.444 -0.42 -1.205 -1.896 -2.514 -3.077 -3.641 -4.105 -4.528 -4.942 -5.323 -5.668 -5.985 -6.311 -6.615 -6.875 -7.167 -7.505 -7.774 -8.048 -8.328 -8.526 -8.736 -8.97 -9.179 -9.379 -9.522 -9.662 -9.886 -10.049 -10.22 -10.305 -10.494 -10.702 -10.911 -11.041 -11.246 -11.43 -11.56 -11.705 -12.052 -12.246 -12.461 -12.698 -12.986 -13.404 -13.982 -16.515 -5 ,1675 ,KEBNE ,16654145,Mon Nov 22 05:52:57 CET,Mon Nov 22 07:21:04 CET,0.0 0.602 0.81 0.981 1.128 1.243 1.35 1.466 1.681 1.783 1.876 1.98 2.098 2.164 2.288 2.399 2.503 2.551 2.648 2.744 2.88 2.969 3.053 3.18 3.297 3.402 3.506 3.608 3.763 3.907 4.012 4.142 4.282 4.41 4.555 4.687 4.794 4.922 5.062 5.2 5.34 5.5 5.667 5.79 5.88 5.921 5.93 5.893 5.698 5.21 4.205 2.891 1.778 0.813 -0.044 -0.79 -1.432 -2.024 -2.554 -3.091 -3.561 -3.994 -4.418 -4.816 -5.173 -5.51 -5.875 -6.185 -6.438 -6.708 -7.004 -7.247 -7.485 -7.726 -7.909 -8.095 -8.287 -8.495 -8.709 -8.852 -9.014 -9.267 -9.428 -9.609 -9.704 -9.903 -10.106 -10.307 -10.425 -10.629 -10.854 -10.992 -11.152 -11.502 -11.684 -11.886 -12.106 -12.406 -12.828 -13.388 -14.975 -6 ,28027 ,KEBNE ,16654146,Mon Nov 22 05:54:02 CET,Mon Nov 22 07:14:51 CET,0.0 0.713 0.969 1.119 1.248 1.369 1.491 1.609 1.824 1.915 1.994 2.093 2.219 2.294 2.428 2.548 2.651 2.7 2.804 2.909 3.062 3.163 3.253 3.364 3.469 3.573 3.665 3.763 3.896 4.029 4.162 4.295 4.411 4.523 4.643 4.766 4.892 5.035 5.174 5.312 5.428 5.542 5.669 5.792 5.927 6.016 6.061 5.993 5.749 5.299 4.327 3.061 1.986 1.079 0.291 -0.429 -1.042 -1.603 -2.08 -2.555 -2.979 -3.356 -3.715 -4.08 -4.431 -4.743 -5.063 -5.33 -5.573 -5.833 -6.079 -6.291 -6.519 -6.749 -6.921 -7.097 -7.289 -7.487 -7.688 -7.831 -7.983 -8.222 -8.391 -8.573 -8.666 -8.856 -9.066 -9.301 -9.429 -9.619 -9.816 -9.956 -10.097 -10.422 -10.622 -10.858 -11.126 -11.436 -11.86 -12.371 -14.441 -8 ,32606 ,KEBNE ,16654148,Mon Nov 22 05:56:03 CET,Mon Nov 22 07:21:09 CET,0.0 0.927 1.177 1.37 1.508 1.639 1.751 1.842 2.026 2.117 2.198 2.306 2.423 2.484 2.603 2.721 2.835 2.889 2.995 3.097 3.237 3.321 3.407 3.524 3.637 3.754 3.856 3.96 4.097 4.213 4.318 4.449 4.584 4.714 4.856 5.005 5.131 5.249 5.37 5.504 5.631 5.752 5.881 6.022 6.175 6.269 6.275 6.184 5.981 5.557 4.641 3.366 2.223 1.251 0.432 -0.325 -0.984 -1.576 -2.107 -2.631 -3.071 -3.475 -3.852 -4.202 -4.544 -4.862 -5.192 -5.487 -5.733 -6.012 -6.305 -6.527 -6.755 -6.995 -7.194 -7.392 -7.584 -7.809 -8.063 -8.233 -8.408 -8.691 -8.882 -9.086 -9.191 -9.392 -9.595 -9.818 -9.945 -10.141 -10.371 -10.523 -10.68 -11.031 -11.232 -11.461 -11.706 -11.966 -12.285 -12.78 -14.609 -9 ,16475 ,KEBNE ,16654149,Mon Nov 22 05:57:05 CET,Mon Nov 22 07:21:40 CET,0.0 0.835 1.054 1.209 1.369 1.521 1.648 1.763 1.97 2.057 2.141 2.259 2.393 2.472 2.622 2.759 2.88 2.935 3.031 3.129 3.274 3.361 3.455 3.595 3.722 3.841 3.962 4.079 4.224 4.37 4.516 4.684 4.824 4.941 5.093 5.258 5.392 5.552 5.721 5.888 6.05 6.214 6.414 6.602 6.742 6.823 6.862 6.822 6.646 6.188 5.189 3.868 2.699 1.669 0.792 0.027 -0.629 -1.233 -1.755 -2.274 -2.75 -3.179 -3.562 -3.946 -4.321 -4.617 -4.914 -5.193 -5.441 -5.741 -6.052 -6.305 -6.587 -6.872 -7.087 -7.326 -7.558 -7.782 -8.027 -8.179 -8.331 -8.583 -8.75 -8.915 -9.003 -9.201 -9.415 -9.645 -9.772 -9.963 -10.153 -10.296 -10.449 -10.802 -10.979 -11.157 -11.384 -11.693 -12.066 -12.583 -14.359 -10 ,3581 ,KEBNE ,16654150,Mon Nov 22 05:57:08 CET,Mon Nov 22 07:19:05 CET,0.0 0.682 0.918 1.105 1.28 1.418 1.547 1.665 1.874 1.974 2.064 2.191 2.326 2.395 2.52 2.641 2.765 2.825 2.935 3.035 3.176 3.271 3.367 3.492 3.602 3.713 3.817 3.924 4.068 4.19 4.299 4.43 4.557 4.681 4.823 4.964 5.096 5.234 5.383 5.57 5.743 5.881 6.005 6.129 6.264 6.36 6.403 6.374 6.209 5.754 4.808 3.513 2.405 1.469 0.607 -0.176 -0.866 -1.479 -2.023 -2.564 -3.013 -3.43 -3.834 -4.228 -4.57 -4.872 -5.196 -5.479 -5.72 -5.979 -6.259 -6.488 -6.728 -6.983 -7.177 -7.383 -7.597 -7.804 -8.024 -8.187 -8.356 -8.599 -8.776 -8.963 -9.059 -9.291 -9.539 -9.794 -9.934 -10.143 -10.36 -10.507 -10.654 -10.987 -11.18 -11.384 -11.61 -11.894 -12.238 -12.695 -14.266 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_30.txt deleted file mode 100644 index b63ff02f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_30.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12361 ,KEBNE ,16654151,Mon Nov 22 05:59:08 CET,Mon Nov 22 07:24:32 CET,0.0 0.847 1.123 1.347 1.516 1.644 1.75 1.839 1.993 2.064 2.126 2.197 2.303 2.351 2.447 2.538 2.62 2.665 2.758 2.839 2.932 2.997 3.064 3.148 3.226 3.305 3.385 3.452 3.525 3.597 3.662 3.736 3.812 3.88 3.941 4.023 4.107 4.181 4.256 4.332 4.393 4.441 4.48 4.482 4.422 4.324 4.169 3.937 3.532 2.82 1.489 -0.207 -1.677 -2.958 -4.094 -5.119 -5.954 -6.695 -7.319 -7.913 -8.421 -8.898 -9.346 -9.746 -10.126 -10.465 -10.818 -11.131 -11.392 -11.672 -11.955 -12.18 -12.416 -12.657 -12.845 -13.031 -13.217 -13.405 -13.596 -13.728 -13.868 -14.101 -14.252 -14.396 -14.476 -14.651 -14.822 -15.001 -15.094 -15.262 -15.388 -15.487 -15.588 -15.818 -15.939 -16.08 -16.234 -16.382 -16.552 -16.794 -17.388 -2 ,29435 ,KEBNE ,16654152,Mon Nov 22 06:00:14 CET,Mon Nov 22 07:23:28 CET,0.0 0.756 1.004 1.211 1.373 1.505 1.621 1.726 1.894 1.96 2.023 2.097 2.208 2.262 2.357 2.447 2.546 2.591 2.67 2.745 2.848 2.915 2.975 3.053 3.136 3.217 3.289 3.354 3.44 3.521 3.591 3.68 3.767 3.842 3.915 3.99 4.069 4.154 4.222 4.274 4.316 4.367 4.427 4.466 4.472 4.409 4.246 3.957 3.477 2.707 1.376 -0.313 -1.775 -3.045 -4.173 -5.143 -5.991 -6.756 -7.366 -7.972 -8.507 -9.006 -9.469 -9.875 -10.248 -10.599 -10.97 -11.275 -11.532 -11.804 -12.081 -12.313 -12.545 -12.798 -13.002 -13.2 -13.403 -13.617 -13.844 -14.006 -14.158 -14.38 -14.543 -14.713 -14.802 -14.993 -15.189 -15.401 -15.514 -15.699 -15.86 -15.97 -16.078 -16.324 -16.453 -16.583 -16.723 -16.876 -17.053 -17.3 -17.829 -3 ,6836 ,KEBNE ,16654153,Mon Nov 22 06:01:12 CET,Mon Nov 22 07:26:30 CET,0.0 0.844 1.122 1.309 1.443 1.57 1.682 1.774 1.936 2.011 2.077 2.157 2.274 2.334 2.449 2.561 2.659 2.704 2.789 2.866 2.972 3.038 3.095 3.191 3.284 3.369 3.446 3.514 3.601 3.684 3.759 3.845 3.926 3.999 4.081 4.167 4.233 4.295 4.363 4.433 4.501 4.565 4.61 4.643 4.663 4.611 4.459 4.159 3.708 3.017 1.593 -0.364 -1.967 -3.241 -4.302 -5.259 -6.107 -6.832 -7.448 -8.063 -8.59 -9.06 -9.49 -9.887 -10.258 -10.59 -10.929 -11.235 -11.502 -11.779 -12.075 -12.32 -12.567 -12.811 -12.99 -13.18 -13.367 -13.55 -13.745 -13.884 -14.027 -14.247 -14.403 -14.567 -14.647 -14.804 -14.977 -15.156 -15.244 -15.412 -15.533 -15.633 -15.744 -15.965 -16.09 -16.24 -16.404 -16.572 -16.756 -17.0 -17.639 -4 ,7122 ,KEBNE ,16654154,Mon Nov 22 06:01:12 CET,Mon Nov 22 07:26:26 CET,0.0 1.012 1.28 1.483 1.628 1.753 1.85 1.943 2.13 2.205 2.272 2.345 2.45 2.519 2.653 2.758 2.853 2.893 2.968 3.056 3.178 3.253 3.33 3.448 3.556 3.641 3.724 3.805 3.895 3.984 4.082 4.198 4.297 4.389 4.487 4.588 4.682 4.772 4.855 4.94 5.01 5.054 5.079 5.099 5.087 5.054 4.996 4.796 4.382 3.625 2.204 0.361 -1.237 -2.547 -3.632 -4.623 -5.487 -6.244 -6.899 -7.544 -8.066 -8.53 -8.973 -9.385 -9.759 -10.094 -10.442 -10.75 -11.022 -11.302 -11.581 -11.81 -12.041 -12.267 -12.441 -12.62 -12.799 -12.991 -13.195 -13.325 -13.454 -13.655 -13.8 -13.958 -14.038 -14.198 -14.36 -14.534 -14.624 -14.791 -14.923 -15.033 -15.149 -15.426 -15.574 -15.713 -15.866 -16.03 -16.207 -16.441 -16.957 -5 ,32095 ,KEBNE ,16654155,Mon Nov 22 06:04:18 CET,Mon Nov 22 07:29:40 CET,0.0 0.961 1.244 1.437 1.608 1.744 1.844 1.937 2.094 2.162 2.24 2.335 2.443 2.504 2.612 2.705 2.791 2.836 2.921 2.989 3.088 3.16 3.23 3.332 3.43 3.518 3.61 3.701 3.804 3.904 3.988 4.093 4.204 4.302 4.403 4.508 4.596 4.677 4.755 4.832 4.909 4.99 5.072 5.13 5.131 5.059 4.901 4.648 4.218 3.464 2.088 0.24 -1.348 -2.674 -3.765 -4.72 -5.568 -6.333 -6.981 -7.615 -8.153 -8.638 -9.092 -9.494 -9.867 -10.222 -10.584 -10.888 -11.134 -11.389 -11.663 -11.877 -12.094 -12.329 -12.507 -12.68 -12.858 -13.046 -13.244 -13.381 -13.53 -13.76 -13.916 -14.078 -14.16 -14.329 -14.498 -14.679 -14.775 -14.946 -15.085 -15.201 -15.313 -15.544 -15.678 -15.825 -15.976 -16.14 -16.314 -16.541 -17.22 -6 ,28189 ,KEBNE ,16654156,Mon Nov 22 06:04:18 CET,Mon Nov 22 07:29:34 CET,0.0 0.81 1.07 1.269 1.422 1.548 1.659 1.76 1.938 2.018 2.09 2.173 2.278 2.331 2.442 2.55 2.643 2.685 2.765 2.841 2.957 3.031 3.099 3.2 3.291 3.37 3.443 3.511 3.603 3.687 3.767 3.857 3.93 4.001 4.079 4.153 4.208 4.259 4.322 4.385 4.423 4.458 4.481 4.483 4.473 4.407 4.255 4.006 3.581 2.772 1.32 -0.426 -1.924 -3.193 -4.308 -5.274 -6.045 -6.737 -7.352 -7.962 -8.485 -8.96 -9.389 -9.792 -10.173 -10.494 -10.814 -11.102 -11.345 -11.593 -11.85 -12.065 -12.284 -12.502 -12.676 -12.858 -13.049 -13.242 -13.435 -13.57 -13.72 -13.943 -14.086 -14.234 -14.316 -14.5 -14.676 -14.856 -14.951 -15.123 -15.243 -15.341 -15.455 -15.718 -15.843 -15.97 -16.107 -16.264 -16.448 -16.688 -17.473 -8 ,32479 ,KEBNE ,16654158,Mon Nov 22 06:05:20 CET,Mon Nov 22 07:30:40 CET,0.0 0.744 0.997 1.189 1.352 1.491 1.619 1.732 1.908 1.986 2.061 2.149 2.27 2.331 2.437 2.531 2.625 2.675 2.77 2.871 3.01 3.09 3.174 3.298 3.409 3.507 3.603 3.695 3.81 3.922 4.016 4.108 4.198 4.275 4.368 4.46 4.526 4.61 4.696 4.763 4.82 4.877 4.937 4.978 4.989 4.947 4.817 4.582 4.133 3.351 1.849 -0.068 -1.557 -2.775 -3.834 -4.786 -5.605 -6.319 -6.948 -7.566 -8.081 -8.549 -8.989 -9.394 -9.769 -10.11 -10.474 -10.797 -11.061 -11.334 -11.607 -11.822 -12.037 -12.256 -12.426 -12.603 -12.782 -12.962 -13.153 -13.279 -13.406 -13.619 -13.771 -13.936 -14.02 -14.183 -14.357 -14.538 -14.63 -14.797 -14.919 -15.026 -15.141 -15.382 -15.504 -15.631 -15.768 -15.921 -16.133 -16.434 -17.191 -9 ,23198 ,KEBNE ,16654159,Mon Nov 22 06:05:20 CET,Mon Nov 22 07:31:04 CET,0.0 0.839 1.127 1.319 1.474 1.601 1.716 1.826 2.012 2.088 2.159 2.241 2.354 2.412 2.512 2.612 2.706 2.747 2.826 2.901 3.016 3.086 3.143 3.231 3.325 3.407 3.479 3.545 3.625 3.699 3.776 3.865 3.932 3.994 4.063 4.118 4.175 4.258 4.338 4.397 4.445 4.475 4.475 4.45 4.382 4.284 4.133 3.885 3.456 2.731 1.352 -0.506 -2.022 -3.293 -4.406 -5.417 -6.272 -7.012 -7.638 -8.255 -8.785 -9.247 -9.685 -10.109 -10.495 -10.842 -11.216 -11.532 -11.794 -12.064 -12.348 -12.583 -12.816 -13.06 -13.255 -13.454 -13.659 -13.871 -14.081 -14.22 -14.365 -14.593 -14.75 -14.906 -14.983 -15.139 -15.299 -15.463 -15.546 -15.709 -15.835 -15.937 -16.046 -16.299 -16.43 -16.572 -16.721 -16.869 -17.031 -17.264 -17.813 -10 ,22831 ,KEBNE ,16654160,Mon Nov 22 06:05:24 CET,Mon Nov 22 07:24:53 CET,0.0 1.029 1.271 1.435 1.564 1.688 1.802 1.892 2.061 2.148 2.226 2.307 2.422 2.486 2.588 2.683 2.772 2.812 2.899 2.98 3.079 3.141 3.201 3.289 3.369 3.443 3.521 3.595 3.669 3.734 3.805 3.889 3.966 4.033 4.096 4.167 4.237 4.309 4.371 4.414 4.442 4.458 4.461 4.447 4.407 4.326 4.201 3.958 3.551 2.853 1.45 -0.263 -1.712 -3.011 -4.077 -5.046 -5.892 -6.62 -7.253 -7.876 -8.398 -8.877 -9.327 -9.739 -10.104 -10.433 -10.787 -11.092 -11.345 -11.597 -11.855 -12.068 -12.283 -12.505 -12.679 -12.866 -13.057 -13.247 -13.445 -13.583 -13.731 -13.959 -14.107 -14.258 -14.337 -14.501 -14.676 -14.86 -14.955 -15.129 -15.25 -15.354 -15.46 -15.696 -15.832 -15.987 -16.163 -16.334 -16.514 -16.744 -17.196 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_31.txt deleted file mode 100644 index 429e649a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_31.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10982 ,KEBNE ,16654161,Mon Nov 22 06:05:24 CET,Mon Nov 22 07:24:55 CET,0.0 0.662 0.936 1.146 1.335 1.489 1.633 1.775 2.013 2.114 2.218 2.354 2.48 2.551 2.683 2.807 2.931 2.986 3.095 3.209 3.364 3.458 3.54 3.642 3.731 3.811 3.883 3.97 4.097 4.198 4.278 4.387 4.497 4.594 4.694 4.795 4.893 4.99 5.08 5.167 5.249 5.332 5.375 5.376 5.381 5.359 5.261 5.038 4.621 3.831 2.397 0.677 -0.805 -2.136 -3.237 -4.186 -5.028 -5.814 -6.483 -7.105 -7.624 -8.082 -8.52 -8.916 -9.274 -9.611 -9.965 -10.274 -10.548 -10.836 -11.119 -11.344 -11.584 -11.844 -12.054 -12.269 -12.483 -12.697 -12.922 -13.078 -13.233 -13.473 -13.636 -13.797 -13.878 -14.042 -14.202 -14.369 -14.453 -14.615 -14.735 -14.841 -14.949 -15.181 -15.303 -15.429 -15.585 -15.77 -15.972 -16.22 -16.707 -3 ,6593 ,KEBNE ,16654163,Mon Nov 22 06:06:21 CET,Mon Nov 22 07:31:57 CET,0.0 0.583 0.814 1.003 1.145 1.258 1.367 1.462 1.604 1.682 1.764 1.851 1.958 2.016 2.133 2.245 2.347 2.392 2.484 2.564 2.666 2.73 2.799 2.896 2.98 3.06 3.132 3.211 3.314 3.404 3.482 3.564 3.639 3.712 3.8 3.897 3.974 4.058 4.158 4.254 4.346 4.425 4.497 4.529 4.511 4.429 4.28 4.051 3.619 2.908 1.646 -0.066 -1.535 -2.795 -3.882 -4.843 -5.671 -6.425 -7.072 -7.703 -8.242 -8.708 -9.132 -9.528 -9.886 -10.211 -10.553 -10.871 -11.147 -11.417 -11.687 -11.919 -12.168 -12.423 -12.613 -12.809 -13.008 -13.205 -13.396 -13.52 -13.656 -13.867 -14.02 -14.175 -14.252 -14.418 -14.59 -14.775 -14.87 -15.04 -15.172 -15.289 -15.405 -15.63 -15.76 -15.897 -16.04 -16.208 -16.414 -16.688 -17.534 -4 ,2008 ,KEBNE ,16654164,Mon Nov 22 06:06:22 CET,Mon Nov 22 07:32:00 CET,0.0 0.547 0.743 0.893 1.022 1.151 1.272 1.377 1.552 1.621 1.687 1.761 1.874 1.936 2.042 2.135 2.222 2.266 2.348 2.426 2.534 2.598 2.659 2.753 2.844 2.935 3.016 3.08 3.174 3.284 3.391 3.505 3.605 3.693 3.793 3.901 3.985 4.074 4.152 4.219 4.284 4.335 4.391 4.443 4.454 4.396 4.252 3.997 3.576 2.866 1.545 -0.207 -1.767 -3.075 -4.157 -5.14 -5.992 -6.738 -7.365 -7.984 -8.504 -8.962 -9.412 -9.815 -10.188 -10.551 -10.924 -11.233 -11.49 -11.766 -12.05 -12.28 -12.507 -12.731 -12.904 -13.083 -13.265 -13.463 -13.674 -13.816 -13.959 -14.183 -14.339 -14.489 -14.57 -14.744 -14.92 -15.099 -15.189 -15.36 -15.495 -15.603 -15.712 -15.951 -16.088 -16.233 -16.381 -16.549 -16.758 -17.003 -17.622 -5 ,2566 ,KEBNE ,16654165,Mon Nov 22 06:08:26 CET,Mon Nov 22 07:35:10 CET,0.0 0.615 0.789 0.951 1.087 1.202 1.302 1.388 1.56 1.637 1.709 1.804 1.913 1.972 2.085 2.186 2.281 2.324 2.416 2.507 2.622 2.694 2.764 2.849 2.917 2.992 3.065 3.132 3.214 3.292 3.368 3.466 3.558 3.647 3.744 3.827 3.907 3.983 4.048 4.122 4.19 4.24 4.293 4.317 4.304 4.253 4.143 3.924 3.489 2.755 1.445 -0.357 -1.932 -3.239 -4.359 -5.347 -6.176 -6.929 -7.566 -8.176 -8.714 -9.191 -9.619 -10.02 -10.412 -10.758 -11.107 -11.426 -11.707 -11.987 -12.25 -12.464 -12.691 -12.93 -13.108 -13.276 -13.453 -13.629 -13.809 -13.944 -14.089 -14.315 -14.467 -14.618 -14.689 -14.845 -15.007 -15.174 -15.263 -15.434 -15.568 -15.678 -15.802 -16.056 -16.187 -16.322 -16.465 -16.65 -16.878 -17.178 -17.978 -6 ,14240 ,KEBNE ,16654166,Mon Nov 22 06:08:28 CET,Mon Nov 22 07:33:58 CET,0.0 0.385 0.566 0.711 0.858 0.983 1.074 1.155 1.319 1.396 1.463 1.551 1.666 1.725 1.834 1.94 2.043 2.086 2.168 2.258 2.371 2.434 2.499 2.583 2.659 2.74 2.822 2.892 2.961 3.021 3.083 3.165 3.249 3.322 3.387 3.459 3.533 3.614 3.704 3.782 3.852 3.907 3.942 3.958 3.938 3.866 3.735 3.522 3.126 2.424 1.007 -0.864 -2.402 -3.753 -4.897 -5.875 -6.689 -7.412 -8.038 -8.656 -9.189 -9.671 -10.119 -10.528 -10.917 -11.253 -11.601 -11.924 -12.189 -12.461 -12.755 -12.986 -13.213 -13.447 -13.619 -13.787 -13.968 -14.151 -14.336 -14.472 -14.613 -14.826 -14.968 -15.116 -15.197 -15.371 -15.551 -15.732 -15.819 -15.983 -16.11 -16.217 -16.329 -16.571 -16.705 -16.851 -16.996 -17.168 -17.386 -17.646 -18.346 -7 ,31177 ,KEBNE ,16654167,Mon Nov 22 06:08:31 CET,Mon Nov 22 07:30:07 CET,0.0 0.531 0.729 0.883 1.01 1.117 1.224 1.339 1.522 1.598 1.674 1.772 1.888 1.951 2.062 2.151 2.228 2.266 2.35 2.43 2.544 2.621 2.699 2.823 2.937 3.036 3.129 3.214 3.321 3.427 3.514 3.608 3.709 3.796 3.885 3.999 4.101 4.188 4.277 4.366 4.439 4.497 4.533 4.56 4.566 4.518 4.394 4.133 3.645 2.845 1.393 -0.518 -2.044 -3.281 -4.38 -5.311 -6.093 -6.803 -7.394 -7.981 -8.469 -8.892 -9.31 -9.695 -10.043 -10.368 -10.688 -10.967 -11.214 -11.466 -11.728 -11.944 -12.169 -12.406 -12.583 -12.763 -12.947 -13.131 -13.323 -13.462 -13.607 -13.828 -13.976 -14.126 -14.201 -14.35 -14.509 -14.68 -14.77 -14.946 -15.083 -15.188 -15.293 -15.505 -15.626 -15.755 -15.895 -16.041 -16.232 -16.524 -17.201 -8 ,5748 ,KEBNE ,16654168,Mon Nov 22 06:09:30 CET,Mon Nov 22 07:37:08 CET,0.0 1.007 1.237 1.411 1.559 1.697 1.823 1.93 2.115 2.199 2.277 2.385 2.509 2.575 2.708 2.833 2.947 3.001 3.103 3.205 3.353 3.44 3.518 3.638 3.743 3.836 3.922 4.005 4.109 4.197 4.277 4.376 4.472 4.559 4.65 4.737 4.814 4.91 5.008 5.098 5.193 5.262 5.306 5.348 5.366 5.337 5.265 5.083 4.668 3.969 2.646 0.868 -0.62 -1.876 -2.938 -3.9 -4.738 -5.49 -6.12 -6.745 -7.286 -7.746 -8.183 -8.598 -8.964 -9.283 -9.622 -9.931 -10.189 -10.459 -10.742 -10.979 -11.222 -11.468 -11.666 -11.878 -12.09 -12.3 -12.536 -12.696 -12.852 -13.118 -13.299 -13.484 -13.577 -13.764 -13.963 -14.185 -14.3 -14.491 -14.666 -14.805 -14.957 -15.271 -15.428 -15.587 -15.744 -15.909 -16.099 -16.352 -16.86 -9 ,14741 ,KEBNE ,16654169,Mon Nov 22 06:09:30 CET,Mon Nov 22 07:34:50 CET,0.0 0.484 0.691 0.869 1.008 1.128 1.237 1.343 1.523 1.609 1.691 1.789 1.906 1.971 2.09 2.213 2.345 2.41 2.536 2.65 2.796 2.889 2.98 3.099 3.216 3.322 3.412 3.501 3.608 3.709 3.804 3.909 4.017 4.11 4.208 4.305 4.373 4.448 4.54 4.632 4.714 4.796 4.86 4.874 4.836 4.754 4.601 4.338 3.901 3.168 1.772 -0.018 -1.46 -2.718 -3.819 -4.783 -5.605 -6.35 -7.006 -7.648 -8.196 -8.669 -9.117 -9.529 -9.901 -10.238 -10.588 -10.909 -11.191 -11.482 -11.77 -12.008 -12.245 -12.481 -12.672 -12.87 -13.073 -13.297 -13.527 -13.674 -13.829 -14.077 -14.248 -14.427 -14.514 -14.682 -14.844 -15.021 -15.112 -15.273 -15.397 -15.504 -15.613 -15.845 -15.962 -16.094 -16.253 -16.415 -16.608 -16.849 -17.537 -10 ,26188 ,KEBNE ,16654170,Mon Nov 22 06:10:31 CET,Mon Nov 22 07:36:09 CET,0.0 0.55 0.802 0.961 1.112 1.241 1.336 1.428 1.628 1.72 1.797 1.876 1.983 2.042 2.151 2.251 2.35 2.401 2.495 2.57 2.676 2.751 2.826 2.931 3.027 3.115 3.186 3.255 3.346 3.424 3.497 3.586 3.683 3.779 3.87 3.962 4.048 4.137 4.22 4.302 4.377 4.451 4.524 4.573 4.582 4.518 4.374 4.132 3.73 3.016 1.651 -0.132 -1.66 -2.996 -4.197 -5.193 -6.009 -6.744 -7.398 -8.06 -8.603 -9.064 -9.496 -9.902 -10.283 -10.634 -10.996 -11.324 -11.601 -11.879 -12.16 -12.388 -12.621 -12.863 -13.057 -13.241 -13.424 -13.616 -13.813 -13.946 -14.079 -14.287 -14.429 -14.585 -14.666 -14.835 -15.008 -15.185 -15.284 -15.461 -15.576 -15.673 -15.789 -16.059 -16.191 -16.314 -16.461 -16.627 -16.828 -17.079 -17.764 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_32.txt deleted file mode 100644 index 9b10441e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25905 ,KEBNE ,16654171,Mon Nov 22 06:10:35 CET,Mon Nov 22 07:33:04 CET,0.0 0.136 0.234 0.34 0.386 0.404 0.419 0.441 0.477 0.492 0.508 0.48 0.539 0.549 0.565 0.571 0.568 0.569 0.564 0.551 0.528 0.514 0.498 0.471 0.44 0.407 0.37 0.334 0.29 0.249 0.195 0.109 0.027 -0.062 -0.183 -0.316 -0.453 -0.617 -0.793 -0.995 -1.246 -1.557 -1.951 -2.403 -2.982 -3.682 -4.597 -5.799 -7.392 -9.593 -12.982 -16.677 -19.509 -21.798 -23.689 -25.299 -26.658 -27.824 -28.797 -29.803 -30.685 -31.426 -32.096 -32.711 -33.283 -33.799 -34.358 -34.877 -35.312 -35.766 -36.241 -36.62 -37.014 -37.44 -37.777 -38.123 -38.457 -38.789 -39.133 -39.38 -39.639 -40.032 -40.311 -40.609 -40.774 -41.095 -41.425 -41.822 -42.029 -42.328 -42.658 -42.888 -43.149 -43.735 -44.057 -44.391 -44.793 -45.255 -45.814 -46.639 -50.059 -2 ,25587 ,KEBNE ,16654172,Mon Nov 22 06:11:36 CET,Mon Nov 22 07:35:25 CET,0.0 0.183 0.26 0.335 0.385 0.42 0.442 0.458 0.494 0.51 0.521 0.486 0.55 0.558 0.56 0.565 0.57 0.564 0.559 0.57 0.589 0.591 0.581 0.556 0.522 0.486 0.459 0.436 0.393 0.344 0.3 0.232 0.149 0.064 -0.049 -0.181 -0.301 -0.444 -0.626 -0.831 -1.063 -1.342 -1.699 -2.098 -2.617 -3.295 -4.189 -5.362 -6.95 -9.204 -12.673 -16.416 -19.337 -21.701 -23.637 -25.286 -26.646 -27.826 -28.806 -29.762 -30.601 -31.333 -31.989 -32.64 -33.271 -33.842 -34.421 -34.901 -35.323 -35.771 -36.235 -36.624 -37.023 -37.426 -37.735 -38.065 -38.4 -38.729 -39.082 -39.344 -39.611 -40.017 -40.317 -40.614 -40.768 -41.105 -41.466 -41.869 -42.07 -42.359 -42.648 -42.852 -43.092 -43.64 -43.919 -44.247 -44.632 -45.057 -45.616 -46.476 -50.304 -3 ,11128 ,KEBNE ,16654173,Mon Nov 22 06:11:36 CET,Mon Nov 22 07:36:49 CET,0.0 0.159 0.215 0.265 0.305 0.33 0.351 0.378 0.436 0.452 0.463 0.446 0.511 0.529 0.569 0.592 0.607 0.614 0.633 0.643 0.645 0.645 0.649 0.646 0.627 0.603 0.58 0.554 0.513 0.481 0.447 0.393 0.337 0.266 0.172 0.061 -0.06 -0.197 -0.355 -0.549 -0.781 -1.062 -1.444 -1.874 -2.42 -3.097 -3.969 -5.12 -6.708 -8.988 -12.509 -16.297 -19.181 -21.481 -23.349 -24.987 -26.385 -27.612 -28.634 -29.604 -30.429 -31.185 -31.891 -32.545 -33.144 -33.668 -34.216 -34.72 -35.172 -35.634 -36.101 -36.488 -36.894 -37.299 -37.599 -37.918 -38.25 -38.596 -38.94 -39.175 -39.426 -39.849 -40.17 -40.482 -40.636 -40.951 -41.286 -41.646 -41.841 -42.126 -42.447 -42.685 -42.947 -43.629 -43.972 -44.316 -44.703 -45.131 -45.592 -46.291 -49.873 -4 ,24519 ,KEBNE ,16654174,Mon Nov 22 06:11:40 CET,Mon Nov 22 07:32:56 CET,0.0 0.16 0.221 0.264 0.31 0.345 0.368 0.387 0.411 0.419 0.429 0.412 0.475 0.485 0.499 0.511 0.514 0.512 0.505 0.498 0.491 0.482 0.471 0.456 0.44 0.41 0.375 0.339 0.292 0.242 0.185 0.114 0.027 -0.063 -0.163 -0.303 -0.444 -0.587 -0.759 -0.977 -1.23 -1.558 -1.977 -2.438 -3.033 -3.745 -4.619 -5.756 -7.329 -9.54 -12.997 -16.709 -19.671 -22.07 -23.933 -25.543 -26.927 -28.136 -29.157 -30.156 -30.989 -31.725 -32.397 -33.019 -33.606 -34.112 -34.623 -35.096 -35.525 -35.97 -36.406 -36.756 -37.119 -37.515 -37.814 -38.115 -38.426 -38.735 -39.063 -39.311 -39.561 -39.924 -40.188 -40.484 -40.649 -40.986 -41.322 -41.685 -41.879 -42.183 -42.587 -42.83 -43.054 -43.584 -43.865 -44.193 -44.593 -45.118 -45.782 -46.641 -52.04 -5 ,1884 ,KEBNE ,16654175,Mon Nov 22 06:12:38 CET,Mon Nov 22 07:36:20 CET,0.0 0.13 0.208 0.272 0.32 0.356 0.385 0.405 0.433 0.45 0.463 0.42 0.473 0.481 0.49 0.491 0.492 0.489 0.478 0.472 0.472 0.464 0.448 0.429 0.422 0.406 0.373 0.331 0.294 0.282 0.254 0.197 0.138 0.069 -0.031 -0.148 -0.264 -0.415 -0.599 -0.808 -1.046 -1.341 -1.72 -2.136 -2.679 -3.359 -4.22 -5.336 -6.901 -9.1 -12.499 -16.214 -19.052 -21.331 -23.192 -24.836 -26.213 -27.431 -28.51 -29.561 -30.435 -31.208 -31.909 -32.528 -33.09 -33.652 -34.234 -34.705 -35.111 -35.556 -36.021 -36.4 -36.79 -37.197 -37.51 -37.837 -38.183 -38.529 -38.893 -39.135 -39.381 -39.801 -40.089 -40.383 -40.537 -40.834 -41.161 -41.531 -41.721 -42.019 -42.352 -42.578 -42.824 -43.328 -43.605 -43.959 -44.395 -44.95 -45.69 -46.647 -51.05 -6 ,30916 ,KEBNE ,16654176,Mon Nov 22 06:13:40 CET,Mon Nov 22 07:37:47 CET,0.0 0.171 0.226 0.27 0.313 0.357 0.389 0.407 0.441 0.457 0.462 0.413 0.468 0.474 0.488 0.485 0.48 0.48 0.482 0.48 0.462 0.447 0.434 0.409 0.373 0.338 0.307 0.284 0.241 0.177 0.119 0.065 -0.007 -0.091 -0.186 -0.326 -0.479 -0.63 -0.805 -1.034 -1.288 -1.6 -2.024 -2.484 -3.079 -3.83 -4.784 -5.987 -7.616 -9.942 -13.446 -17.234 -20.097 -22.324 -24.173 -25.789 -27.146 -28.355 -29.361 -30.348 -31.219 -31.985 -32.692 -33.36 -33.974 -34.495 -35.028 -35.521 -35.95 -36.393 -36.878 -37.274 -37.663 -38.086 -38.417 -38.749 -39.097 -39.448 -39.811 -40.064 -40.316 -40.703 -40.992 -41.305 -41.459 -41.781 -42.121 -42.49 -42.691 -43.009 -43.402 -43.629 -43.863 -44.427 -44.744 -45.073 -45.438 -45.895 -46.574 -47.6 -53.203 -7 ,22564 ,KEBNE ,16654177,Mon Nov 22 06:13:40 CET,Mon Nov 22 07:37:28 CET,0.0 0.081 0.138 0.196 0.248 0.289 0.317 0.334 0.372 0.397 0.418 0.391 0.454 0.468 0.489 0.503 0.503 0.503 0.51 0.51 0.498 0.485 0.47 0.44 0.413 0.38 0.339 0.303 0.259 0.213 0.164 0.101 0.028 -0.042 -0.12 -0.232 -0.362 -0.493 -0.644 -0.843 -1.075 -1.372 -1.765 -2.167 -2.671 -3.341 -4.236 -5.401 -7.001 -9.262 -12.661 -16.334 -19.213 -21.557 -23.416 -24.98 -26.31 -27.467 -28.455 -29.429 -30.246 -30.977 -31.729 -32.425 -33.03 -33.587 -34.161 -34.658 -35.089 -35.539 -35.985 -36.361 -36.745 -37.135 -37.443 -37.759 -38.076 -38.388 -38.734 -38.975 -39.205 -39.573 -39.845 -40.135 -40.286 -40.576 -40.88 -41.22 -41.389 -41.663 -41.991 -42.218 -42.443 -42.995 -43.303 -43.634 -44.013 -44.436 -45.002 -45.726 -51.378 -8 ,11066 ,KEBNE ,16654178,Mon Nov 22 06:13:40 CET,Mon Nov 22 07:39:04 CET,0.0 0.084 0.138 0.196 0.238 0.268 0.294 0.315 0.357 0.378 0.394 0.365 0.422 0.43 0.445 0.466 0.484 0.489 0.499 0.509 0.531 0.546 0.551 0.557 0.553 0.538 0.522 0.497 0.471 0.454 0.42 0.362 0.297 0.228 0.142 0.029 -0.091 -0.228 -0.393 -0.584 -0.803 -1.098 -1.486 -1.91 -2.463 -3.142 -4.034 -5.23 -6.84 -9.117 -12.642 -16.483 -19.386 -21.675 -23.554 -25.157 -26.537 -27.768 -28.752 -29.673 -30.507 -31.26 -31.936 -32.563 -33.167 -33.744 -34.343 -34.879 -35.33 -35.764 -36.209 -36.601 -37.017 -37.419 -37.715 -38.034 -38.363 -38.682 -39.031 -39.285 -39.547 -39.961 -40.251 -40.545 -40.694 -41.027 -41.388 -41.769 -41.964 -42.252 -42.62 -42.864 -43.115 -43.701 -44.037 -44.425 -44.856 -45.375 -45.985 -46.902 -50.878 -9 ,878 ,KEBNE ,16654179,Mon Nov 22 06:13:40 CET,Mon Nov 22 07:37:38 CET,0.0 0.192 0.28 0.324 0.349 0.37 0.398 0.423 0.446 0.457 0.464 0.421 0.482 0.493 0.491 0.492 0.493 0.493 0.489 0.48 0.459 0.442 0.421 0.395 0.376 0.349 0.319 0.283 0.231 0.184 0.127 0.057 -0.016 -0.096 -0.202 -0.339 -0.481 -0.651 -0.839 -1.05 -1.308 -1.626 -2.031 -2.48 -3.037 -3.724 -4.605 -5.748 -7.343 -9.545 -12.902 -16.646 -19.509 -21.8 -23.695 -25.319 -26.74 -28.025 -29.086 -30.093 -30.914 -31.623 -32.298 -32.949 -33.558 -34.079 -34.617 -35.106 -35.542 -35.987 -36.437 -36.816 -37.188 -37.571 -37.869 -38.169 -38.502 -38.856 -39.2 -39.432 -39.691 -40.103 -40.389 -40.694 -40.84 -41.127 -41.421 -41.76 -41.944 -42.214 -42.511 -42.749 -42.995 -43.461 -43.729 -44.065 -44.489 -44.996 -45.634 -46.613 -51.573 -10 ,1544 ,KEBNE ,16654180,Mon Nov 22 06:13:42 CET,Mon Nov 22 07:33:34 CET,0.0 0.107 0.15 0.189 0.233 0.276 0.309 0.338 0.383 0.4 0.413 0.396 0.46 0.475 0.489 0.492 0.492 0.492 0.486 0.478 0.476 0.471 0.468 0.459 0.437 0.411 0.386 0.362 0.314 0.268 0.23 0.176 0.12 0.055 -0.036 -0.128 -0.227 -0.377 -0.563 -0.778 -1.022 -1.325 -1.72 -2.165 -2.757 -3.496 -4.446 -5.675 -7.302 -9.577 -13.045 -16.866 -19.814 -22.187 -24.111 -25.83 -27.26 -28.439 -29.425 -30.366 -31.207 -31.947 -32.625 -33.282 -33.878 -34.429 -35.0 -35.491 -35.919 -36.377 -36.865 -37.262 -37.661 -38.072 -38.41 -38.754 -39.103 -39.468 -39.841 -40.102 -40.37 -40.792 -41.077 -41.359 -41.505 -41.831 -42.186 -42.575 -42.79 -43.098 -43.466 -43.713 -43.977 -44.562 -44.857 -45.2 -45.65 -46.179 -46.779 -47.617 -53.038 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_34.txt deleted file mode 100644 index cccad4ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_34.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2377 ,KEBNE ,16654181,Mon Nov 22 06:14:41 CET,Mon Nov 22 07:41:27 CET,0.0 0.709 0.95 1.12 1.234 1.329 1.431 1.52 1.651 1.707 1.768 1.834 1.93 1.974 2.077 2.184 2.284 2.327 2.39 2.443 2.516 2.56 2.605 2.677 2.757 2.836 2.912 2.986 3.066 3.151 3.243 3.339 3.421 3.5 3.587 3.681 3.752 3.811 3.869 3.915 3.946 3.97 3.992 4.0 3.986 3.898 3.723 3.435 2.967 2.236 0.916 -0.684 -2.003 -3.126 -4.069 -4.9 -5.625 -6.258 -6.789 -7.305 -7.737 -8.132 -8.513 -8.872 -9.207 -9.519 -9.843 -10.123 -10.358 -10.603 -10.876 -11.111 -11.348 -11.584 -11.773 -11.977 -12.177 -12.381 -12.594 -12.732 -12.873 -13.102 -13.258 -13.428 -13.521 -13.71 -13.918 -14.133 -14.242 -14.427 -14.627 -14.762 -14.891 -15.182 -15.349 -15.529 -15.724 -15.941 -16.206 -16.54 -18.025 -2 ,9529 ,KEBNE ,16654182,Mon Nov 22 06:14:41 CET,Mon Nov 22 07:39:45 CET,0.0 0.883 1.14 1.345 1.492 1.636 1.753 1.845 2.008 2.088 2.183 2.315 2.428 2.496 2.613 2.715 2.82 2.866 2.948 3.04 3.174 3.247 3.313 3.407 3.499 3.574 3.642 3.714 3.811 3.907 3.987 4.076 4.157 4.229 4.308 4.387 4.45 4.51 4.565 4.613 4.65 4.68 4.704 4.723 4.695 4.576 4.378 4.096 3.642 2.86 1.503 -0.089 -1.422 -2.593 -3.548 -4.379 -5.12 -5.766 -6.309 -6.846 -7.3 -7.69 -8.045 -8.365 -8.657 -8.931 -9.223 -9.486 -9.699 -9.914 -10.142 -10.328 -10.53 -10.747 -10.91 -11.081 -11.26 -11.438 -11.617 -11.74 -11.869 -12.076 -12.235 -12.4 -12.478 -12.641 -12.809 -12.984 -13.084 -13.247 -13.392 -13.508 -13.628 -13.903 -14.062 -14.241 -14.443 -14.698 -15.029 -15.45 -17.026 -3 ,21373 ,KEBNE ,16654183,Mon Nov 22 06:14:41 CET,Mon Nov 22 07:39:28 CET,0.0 0.826 1.027 1.137 1.226 1.319 1.41 1.483 1.635 1.728 1.816 1.915 2.026 2.092 2.211 2.321 2.434 2.489 2.584 2.666 2.781 2.85 2.922 3.025 3.118 3.204 3.283 3.353 3.448 3.542 3.616 3.706 3.796 3.88 3.964 4.043 4.114 4.173 4.222 4.283 4.331 4.344 4.35 4.345 4.296 4.186 3.996 3.691 3.184 2.402 1.064 -0.58 -1.925 -3.061 -4.031 -4.882 -5.61 -6.252 -6.793 -7.321 -7.773 -8.17 -8.537 -8.888 -9.21 -9.487 -9.766 -10.019 -10.234 -10.456 -10.697 -10.89 -11.089 -11.297 -11.451 -11.61 -11.778 -11.974 -12.202 -12.35 -12.487 -12.693 -12.843 -13.009 -13.09 -13.251 -13.438 -13.651 -13.761 -13.944 -14.147 -14.283 -14.403 -14.662 -14.823 -14.998 -15.191 -15.446 -15.756 -16.185 -17.475 -5 ,19904 ,KEBNE ,16654185,Mon Nov 22 06:15:45 CET,Mon Nov 22 07:42:18 CET,0.0 0.537 0.733 0.878 0.988 1.082 1.176 1.253 1.373 1.43 1.485 1.533 1.632 1.677 1.752 1.825 1.901 1.934 1.999 2.073 2.18 2.249 2.316 2.413 2.506 2.578 2.646 2.722 2.811 2.887 2.955 3.033 3.111 3.183 3.255 3.318 3.384 3.455 3.505 3.557 3.608 3.637 3.645 3.635 3.589 3.48 3.277 2.986 2.512 1.726 0.392 -1.239 -2.584 -3.71 -4.646 -5.476 -6.18 -6.799 -7.351 -7.902 -8.363 -8.767 -9.135 -9.463 -9.769 -10.053 -10.339 -10.591 -10.809 -11.033 -11.258 -11.441 -11.634 -11.835 -11.993 -12.148 -12.31 -12.48 -12.659 -12.79 -12.926 -13.136 -13.278 -13.427 -13.51 -13.69 -13.877 -14.061 -14.15 -14.314 -14.463 -14.588 -14.723 -15.04 -15.212 -15.38 -15.553 -15.77 -16.052 -16.466 -18.0 -6 ,4668 ,KEBNE ,16654186,Mon Nov 22 06:15:45 CET,Mon Nov 22 07:40:47 CET,0.0 0.703 0.917 1.037 1.133 1.223 1.307 1.38 1.518 1.573 1.616 1.661 1.754 1.801 1.899 1.987 2.067 2.104 2.177 2.262 2.379 2.441 2.507 2.593 2.662 2.737 2.821 2.902 3.0 3.083 3.15 3.228 3.301 3.367 3.437 3.515 3.581 3.637 3.69 3.737 3.782 3.826 3.847 3.837 3.788 3.666 3.453 3.125 2.663 1.949 0.604 -1.055 -2.364 -3.475 -4.464 -5.328 -6.054 -6.687 -7.2 -7.73 -8.199 -8.598 -8.97 -9.336 -9.667 -9.953 -10.278 -10.566 -10.801 -11.036 -11.29 -11.508 -11.743 -11.994 -12.184 -12.373 -12.574 -12.787 -12.994 -13.139 -13.293 -13.53 -13.694 -13.87 -13.967 -14.156 -14.33 -14.505 -14.601 -14.768 -14.931 -15.056 -15.173 -15.437 -15.6 -15.767 -15.932 -16.16 -16.45 -16.881 -18.198 -7 ,28215 ,KEBNE ,16654187,Mon Nov 22 06:16:48 CET,Mon Nov 22 07:41:34 CET,0.0 0.424 0.581 0.701 0.812 0.905 0.98 1.042 1.151 1.208 1.27 1.349 1.454 1.501 1.582 1.646 1.701 1.729 1.787 1.836 1.899 1.942 1.99 2.046 2.101 2.163 2.223 2.287 2.36 2.414 2.451 2.489 2.53 2.576 2.626 2.682 2.731 2.781 2.832 2.853 2.854 2.846 2.817 2.764 2.677 2.56 2.345 1.998 1.528 0.772 -0.569 -2.109 -3.369 -4.422 -5.315 -6.137 -6.86 -7.483 -8.011 -8.553 -9.019 -9.411 -9.784 -10.143 -10.49 -10.797 -11.1 -11.372 -11.594 -11.814 -12.051 -12.249 -12.464 -12.686 -12.846 -13.014 -13.193 -13.375 -13.552 -13.673 -13.806 -14.019 -14.164 -14.316 -14.398 -14.574 -14.757 -14.947 -15.049 -15.23 -15.419 -15.549 -15.688 -15.97 -16.109 -16.275 -16.458 -16.686 -16.975 -17.357 -18.596 -8 ,4533 ,KEBNE ,16654188,Mon Nov 22 06:16:48 CET,Mon Nov 22 07:43:14 CET,0.0 0.931 1.105 1.239 1.346 1.456 1.556 1.63 1.78 1.841 1.908 2.022 2.141 2.203 2.328 2.442 2.546 2.598 2.686 2.77 2.9 2.974 3.037 3.13 3.223 3.301 3.372 3.444 3.538 3.635 3.731 3.813 3.876 3.945 4.025 4.092 4.143 4.199 4.245 4.29 4.347 4.413 4.444 4.444 4.43 4.347 4.193 3.961 3.539 2.822 1.558 -0.084 -1.463 -2.657 -3.623 -4.44 -5.158 -5.806 -6.372 -6.925 -7.401 -7.826 -8.214 -8.555 -8.871 -9.155 -9.436 -9.692 -9.919 -10.156 -10.391 -10.581 -10.776 -10.978 -11.152 -11.327 -11.495 -11.693 -11.894 -12.023 -12.159 -12.383 -12.542 -12.696 -12.773 -12.936 -13.103 -13.278 -13.375 -13.541 -13.687 -13.798 -13.927 -14.216 -14.372 -14.54 -14.724 -14.955 -15.268 -15.671 -17.804 -9 ,31212 ,KEBNE ,16654189,Mon Nov 22 06:16:52 CET,Mon Nov 22 07:35:57 CET,0.0 0.476 0.677 0.815 0.915 0.993 1.057 1.118 1.228 1.284 1.346 1.405 1.5 1.547 1.621 1.695 1.776 1.812 1.886 1.952 2.038 2.097 2.153 2.233 2.304 2.36 2.409 2.464 2.537 2.611 2.691 2.768 2.819 2.864 2.924 2.998 3.066 3.133 3.191 3.243 3.278 3.311 3.322 3.29 3.239 3.136 2.947 2.653 2.199 1.505 0.234 -1.381 -2.719 -3.849 -4.781 -5.608 -6.34 -6.973 -7.505 -8.033 -8.481 -8.876 -9.252 -9.603 -9.908 -10.182 -10.47 -10.717 -10.94 -11.164 -11.391 -11.586 -11.78 -11.981 -12.136 -12.301 -12.467 -12.634 -12.817 -12.947 -13.086 -13.305 -13.458 -13.614 -13.69 -13.839 -13.999 -14.182 -14.28 -14.446 -14.602 -14.731 -14.863 -15.156 -15.312 -15.496 -15.716 -15.955 -16.259 -16.753 -19.029 -10 ,9468 ,KEBNE ,16654190,Mon Nov 22 06:16:48 CET,Mon Nov 22 07:43:01 CET,0.0 0.593 0.756 0.882 0.973 1.062 1.142 1.216 1.346 1.4 1.459 1.525 1.632 1.694 1.807 1.917 2.022 2.072 2.152 2.218 2.335 2.413 2.477 2.574 2.66 2.743 2.818 2.89 2.982 3.051 3.113 3.196 3.284 3.371 3.46 3.534 3.595 3.666 3.719 3.752 3.799 3.837 3.857 3.846 3.782 3.68 3.487 3.245 2.85 2.071 0.702 -0.953 -2.266 -3.336 -4.292 -5.147 -5.886 -6.528 -7.058 -7.591 -8.051 -8.487 -8.909 -9.281 -9.633 -9.96 -10.288 -10.571 -10.811 -11.056 -11.315 -11.534 -11.767 -12.011 -12.194 -12.383 -12.574 -12.791 -13.033 -13.183 -13.329 -13.569 -13.747 -13.933 -14.032 -14.239 -14.437 -14.62 -14.717 -14.885 -15.046 -15.168 -15.305 -15.605 -15.761 -15.926 -16.099 -16.3 -16.557 -16.915 -18.105 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_35.txt deleted file mode 100644 index e851bacc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_35.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4629 ,KEBNE ,16654191,Mon Nov 22 06:16:48 CET,Mon Nov 22 07:42:07 CET,0.0 0.27 0.412 0.532 0.63 0.706 0.778 0.848 0.965 1.021 1.072 1.126 1.229 1.284 1.393 1.483 1.565 1.607 1.688 1.764 1.867 1.932 2.001 2.092 2.169 2.241 2.298 2.356 2.44 2.512 2.58 2.661 2.74 2.825 2.913 2.996 3.074 3.174 3.274 3.358 3.426 3.483 3.539 3.556 3.547 3.54 3.48 3.254 2.803 2.031 0.625 -1.206 -2.71 -4.015 -5.229 -6.25 -7.093 -7.881 -8.555 -9.208 -9.758 -10.24 -10.701 -11.143 -11.554 -11.916 -12.277 -12.598 -12.874 -13.158 -13.46 -13.709 -13.959 -14.226 -14.433 -14.641 -14.851 -15.059 -15.28 -15.433 -15.588 -15.842 -16.008 -16.174 -16.265 -16.459 -16.655 -16.85 -16.952 -17.139 -17.301 -17.425 -17.552 -17.85 -18.016 -18.186 -18.367 -18.58 -18.828 -19.13 -20.233 -2 ,28761 ,KEBNE ,16654192,Mon Nov 22 06:17:50 CET,Mon Nov 22 07:44:02 CET,0.0 0.302 0.453 0.557 0.641 0.735 0.82 0.897 1.036 1.097 1.152 1.209 1.309 1.36 1.458 1.549 1.629 1.668 1.751 1.826 1.93 1.994 2.049 2.131 2.217 2.303 2.378 2.445 2.522 2.591 2.664 2.752 2.828 2.895 2.975 3.07 3.156 3.253 3.362 3.456 3.543 3.625 3.703 3.756 3.747 3.678 3.543 3.295 2.798 1.959 0.542 -1.243 -2.78 -4.066 -5.106 -6.076 -6.958 -7.734 -8.382 -9.011 -9.55 -10.029 -10.484 -10.922 -11.339 -11.698 -12.057 -12.382 -12.66 -12.949 -13.252 -13.493 -13.74 -14.011 -14.213 -14.416 -14.635 -14.855 -15.08 -15.239 -15.403 -15.657 -15.814 -15.981 -16.082 -16.298 -16.504 -16.721 -16.829 -17.008 -17.175 -17.301 -17.428 -17.709 -17.884 -18.079 -18.278 -18.478 -18.699 -19.015 -20.174 -3 ,4330 ,KEBNE ,16654193,Mon Nov 22 06:17:50 CET,Mon Nov 22 07:43:59 CET,0.0 0.372 0.529 0.657 0.765 0.845 0.923 0.992 1.114 1.171 1.226 1.266 1.357 1.396 1.465 1.529 1.592 1.62 1.671 1.726 1.823 1.886 1.932 1.981 2.028 2.08 2.127 2.172 2.242 2.321 2.385 2.447 2.522 2.591 2.657 2.725 2.777 2.829 2.88 2.927 2.959 2.969 2.973 2.953 2.874 2.723 2.495 2.16 1.632 0.779 -0.723 -2.554 -4.206 -5.652 -6.833 -7.845 -8.686 -9.46 -10.123 -10.757 -11.303 -11.786 -12.236 -12.661 -13.046 -13.398 -13.768 -14.075 -14.331 -14.616 -14.91 -15.144 -15.397 -15.66 -15.861 -16.074 -16.287 -16.496 -16.714 -16.862 -17.026 -17.299 -17.476 -17.651 -17.745 -17.963 -18.194 -18.417 -18.527 -18.708 -18.85 -18.96 -19.077 -19.347 -19.491 -19.66 -19.858 -20.089 -20.369 -20.772 -22.057 -4 ,24909 ,KEBNE ,16654194,Mon Nov 22 06:18:52 CET,Mon Nov 22 07:44:04 CET,0.0 0.371 0.547 0.699 0.829 0.925 1.014 1.09 1.218 1.274 1.332 1.395 1.49 1.529 1.603 1.685 1.77 1.81 1.882 1.953 2.052 2.11 2.17 2.272 2.372 2.464 2.545 2.627 2.736 2.83 2.938 3.065 3.178 3.283 3.392 3.51 3.6 3.691 3.787 3.865 3.939 4.001 4.048 4.091 4.125 4.117 4.026 3.834 3.46 2.778 1.506 -0.191 -1.693 -3.043 -4.215 -5.246 -6.115 -6.872 -7.532 -8.219 -8.807 -9.302 -9.774 -10.223 -10.636 -11.001 -11.383 -11.726 -12.013 -12.327 -12.654 -12.915 -13.186 -13.463 -13.67 -13.896 -14.137 -14.382 -14.643 -14.818 -14.984 -15.248 -15.443 -15.656 -15.771 -16.01 -16.253 -16.49 -16.606 -16.793 -16.971 -17.094 -17.211 -17.478 -17.636 -17.808 -17.999 -18.209 -18.453 -18.785 -19.536 -5 ,21792 ,KEBNE ,16654195,Mon Nov 22 06:18:52 CET,Mon Nov 22 07:44:25 CET,0.0 0.812 1.049 1.193 1.302 1.383 1.44 1.495 1.613 1.676 1.732 1.769 1.86 1.9 1.971 2.034 2.096 2.129 2.192 2.244 2.32 2.373 2.417 2.473 2.535 2.595 2.648 2.699 2.769 2.825 2.86 2.897 2.947 2.998 3.055 3.109 3.158 3.209 3.251 3.292 3.335 3.365 3.372 3.362 3.312 3.208 3.059 2.807 2.314 1.462 -0.085 -2.063 -3.715 -5.102 -6.268 -7.275 -8.15 -8.941 -9.626 -10.273 -10.819 -11.325 -11.803 -12.238 -12.639 -13.005 -13.389 -13.732 -14.013 -14.304 -14.61 -14.86 -15.11 -15.363 -15.547 -15.729 -15.926 -16.136 -16.353 -16.507 -16.663 -16.904 -17.079 -17.249 -17.334 -17.522 -17.728 -17.938 -18.046 -18.24 -18.403 -18.521 -18.649 -18.911 -19.042 -19.183 -19.352 -19.574 -19.817 -20.116 -21.172 -6 ,5151 ,KEBNE ,16654196,Mon Nov 22 06:18:53 CET,Mon Nov 22 07:43:45 CET,0.0 0.216 0.326 0.4 0.47 0.54 0.618 0.689 0.801 0.85 0.903 0.949 1.04 1.081 1.167 1.239 1.299 1.326 1.379 1.439 1.525 1.577 1.634 1.705 1.767 1.829 1.887 1.936 1.988 2.041 2.097 2.156 2.211 2.26 2.313 2.377 2.44 2.516 2.584 2.623 2.661 2.687 2.685 2.65 2.573 2.457 2.265 1.93 1.402 0.577 -0.882 -2.784 -4.462 -5.874 -7.078 -8.108 -8.986 -9.773 -10.416 -11.059 -11.623 -12.116 -12.591 -13.032 -13.415 -13.765 -14.132 -14.452 -14.726 -15.005 -15.295 -15.534 -15.791 -16.058 -16.263 -16.486 -16.711 -16.928 -17.156 -17.313 -17.473 -17.716 -17.885 -18.073 -18.168 -18.345 -18.521 -18.721 -18.839 -19.03 -19.187 -19.308 -19.442 -19.724 -19.87 -20.033 -20.197 -20.388 -20.627 -20.922 -21.846 -7 ,8032 ,KEBNE ,16654197,Mon Nov 22 06:18:53 CET,Mon Nov 22 07:43:56 CET,0.0 0.285 0.481 0.64 0.755 0.854 0.947 1.023 1.158 1.217 1.278 1.35 1.452 1.499 1.592 1.696 1.787 1.82 1.887 1.952 2.043 2.101 2.156 2.241 2.32 2.392 2.463 2.528 2.607 2.684 2.762 2.857 2.951 3.048 3.151 3.255 3.338 3.424 3.521 3.61 3.692 3.761 3.815 3.843 3.846 3.807 3.684 3.45 3.04 2.312 0.99 -0.77 -2.273 -3.589 -4.686 -5.603 -6.459 -7.27 -7.928 -8.561 -9.12 -9.619 -10.095 -10.535 -10.934 -11.325 -11.733 -12.077 -12.385 -12.7 -13.004 -13.263 -13.545 -13.825 -14.048 -14.28 -14.506 -14.726 -14.962 -15.134 -15.309 -15.573 -15.745 -15.919 -16.01 -16.209 -16.417 -16.626 -16.735 -16.924 -17.074 -17.192 -17.317 -17.604 -17.77 -17.942 -18.132 -18.36 -18.65 -19.02 -20.191 -8 ,20201 ,KEBNE ,16654198,Mon Nov 22 06:18:57 CET,Mon Nov 22 07:42:03 CET,0.0 0.437 0.598 0.718 0.822 0.919 1.004 1.077 1.213 1.275 1.34 1.414 1.518 1.568 1.659 1.749 1.84 1.883 1.964 2.035 2.13 2.192 2.253 2.337 2.411 2.482 2.548 2.607 2.677 2.752 2.825 2.897 2.974 3.049 3.127 3.215 3.289 3.356 3.419 3.48 3.534 3.588 3.625 3.624 3.616 3.576 3.454 3.214 2.791 2.022 0.58 -1.098 -2.568 -3.966 -5.179 -6.224 -7.11 -7.885 -8.544 -9.21 -9.774 -10.268 -10.735 -11.172 -11.583 -11.954 -12.352 -12.718 -13.022 -13.315 -13.627 -13.921 -14.205 -14.476 -14.698 -14.921 -15.149 -15.388 -15.645 -15.827 -16.0 -16.264 -16.45 -16.65 -16.756 -16.966 -17.191 -17.438 -17.564 -17.76 -17.97 -18.128 -18.299 -18.663 -18.863 -19.062 -19.244 -19.455 -19.718 -20.031 -21.317 -9 ,14712 ,KEBNE ,16654199,Mon Nov 22 06:18:55 CET,Mon Nov 22 07:40:28 CET,0.0 0.28 0.404 0.53 0.638 0.713 0.774 0.831 0.935 0.989 1.045 1.101 1.202 1.243 1.325 1.399 1.464 1.496 1.555 1.608 1.681 1.728 1.778 1.838 1.89 1.951 2.014 2.073 2.141 2.211 2.28 2.354 2.42 2.477 2.537 2.597 2.653 2.707 2.756 2.801 2.836 2.851 2.841 2.794 2.714 2.602 2.407 2.108 1.626 0.785 -0.705 -2.606 -4.195 -5.48 -6.57 -7.557 -8.437 -9.229 -9.898 -10.531 -11.073 -11.559 -12.015 -12.443 -12.828 -13.168 -13.512 -13.82 -14.08 -14.34 -14.615 -14.859 -15.116 -15.36 -15.548 -15.749 -15.955 -16.181 -16.421 -16.578 -16.729 -16.964 -17.134 -17.308 -17.397 -17.579 -17.763 -17.95 -18.046 -18.23 -18.383 -18.504 -18.646 -19.004 -19.194 -19.366 -19.55 -19.775 -20.039 -20.403 -21.253 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_36.txt deleted file mode 100644 index 1fa42948..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_36.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2322 ,KEBNE ,16654201,Mon Nov 22 06:19:55 CET,Mon Nov 22 07:45:17 CET,0.0 1.065 1.396 1.647 1.852 2.016 2.159 2.288 2.518 2.626 2.737 2.908 3.038 3.105 3.254 3.413 3.563 3.639 3.782 3.905 4.04 4.121 4.206 4.321 4.425 4.54 4.657 4.757 4.869 4.957 5.051 5.174 5.282 5.385 5.486 5.593 5.694 5.782 5.858 5.936 6.008 6.06 6.104 6.129 6.122 6.069 5.961 5.729 5.285 4.56 3.226 1.545 0.104 -1.127 -2.134 -3.029 -3.789 -4.459 -5.035 -5.598 -6.097 -6.555 -6.978 -7.363 -7.722 -8.038 -8.38 -8.698 -8.968 -9.236 -9.501 -9.721 -9.958 -10.205 -10.4 -10.615 -10.828 -11.047 -11.275 -11.427 -11.587 -11.837 -12.012 -12.183 -12.274 -12.468 -12.689 -12.914 -13.028 -13.218 -13.422 -13.576 -13.738 -14.076 -14.279 -14.517 -14.775 -15.029 -15.288 -15.713 -17.293 -2 ,31819 ,KEBNE ,16654202,Mon Nov 22 06:19:55 CET,Mon Nov 22 07:45:18 CET,0.0 0.799 0.972 1.116 1.242 1.356 1.481 1.596 1.78 1.873 1.95 2.018 2.13 2.195 2.305 2.402 2.505 2.556 2.646 2.728 2.834 2.897 2.955 3.048 3.141 3.207 3.272 3.344 3.432 3.514 3.591 3.669 3.743 3.806 3.883 3.971 4.04 4.116 4.206 4.297 4.355 4.405 4.45 4.468 4.459 4.382 4.257 4.039 3.631 2.898 1.573 -0.05 -1.437 -2.62 -3.654 -4.543 -5.329 -6.043 -6.621 -7.189 -7.687 -8.128 -8.538 -8.923 -9.286 -9.616 -9.939 -10.236 -10.507 -10.787 -11.078 -11.3 -11.525 -11.777 -11.977 -12.178 -12.387 -12.614 -12.837 -12.976 -13.118 -13.343 -13.494 -13.643 -13.724 -13.889 -14.079 -14.295 -14.406 -14.602 -14.789 -14.904 -15.031 -15.31 -15.452 -15.605 -15.829 -16.093 -16.365 -16.74 -18.064 -4 ,4499 ,KEBNE ,16654204,Mon Nov 22 06:20:58 CET,Mon Nov 22 07:47:44 CET,0.0 1.411 1.793 2.085 2.276 2.435 2.576 2.711 2.965 3.073 3.168 3.308 3.444 3.524 3.683 3.83 3.959 4.021 4.134 4.234 4.377 4.472 4.55 4.657 4.769 4.87 4.964 5.066 5.188 5.282 5.375 5.475 5.568 5.654 5.761 5.879 5.965 6.045 6.128 6.224 6.3 6.361 6.424 6.461 6.463 6.412 6.249 5.942 5.468 4.758 3.485 1.822 0.403 -0.822 -1.831 -2.692 -3.47 -4.178 -4.779 -5.365 -5.844 -6.263 -6.678 -7.076 -7.468 -7.83 -8.188 -8.502 -8.766 -9.031 -9.309 -9.538 -9.776 -10.028 -10.22 -10.433 -10.66 -10.893 -11.135 -11.289 -11.44 -11.682 -11.859 -12.048 -12.144 -12.339 -12.569 -12.824 -12.949 -13.134 -13.326 -13.462 -13.621 -13.97 -14.147 -14.378 -14.642 -14.912 -15.198 -15.6 -17.352 -5 ,16554 ,KEBNE ,16654205,Mon Nov 22 06:20:58 CET,Mon Nov 22 07:46:46 CET,0.0 0.747 0.998 1.188 1.349 1.477 1.596 1.698 1.903 2.001 2.089 2.196 2.31 2.367 2.48 2.586 2.682 2.74 2.863 2.97 3.096 3.166 3.236 3.335 3.417 3.493 3.565 3.629 3.707 3.785 3.877 4.001 4.109 4.198 4.297 4.396 4.49 4.591 4.677 4.753 4.831 4.91 4.963 5.006 5.024 4.963 4.815 4.565 4.149 3.455 2.113 0.371 -1.021 -2.156 -3.138 -4.004 -4.77 -5.477 -6.064 -6.626 -7.114 -7.537 -7.918 -8.267 -8.595 -8.903 -9.217 -9.496 -9.745 -10.01 -10.271 -10.476 -10.692 -10.916 -11.088 -11.267 -11.455 -11.664 -11.88 -12.02 -12.159 -12.384 -12.546 -12.711 -12.799 -12.986 -13.182 -13.384 -13.49 -13.673 -13.874 -14.005 -14.125 -14.396 -14.545 -14.726 -14.966 -15.22 -15.47 -15.803 -17.183 -6 ,16906 ,KEBNE ,16654206,Mon Nov 22 06:20:58 CET,Mon Nov 22 07:46:40 CET,0.0 0.529 0.793 0.956 1.093 1.234 1.372 1.498 1.704 1.789 1.859 1.929 2.036 2.093 2.207 2.306 2.4 2.451 2.544 2.614 2.706 2.775 2.869 3.019 3.138 3.241 3.333 3.426 3.538 3.634 3.739 3.857 3.941 4.014 4.105 4.207 4.316 4.431 4.522 4.596 4.669 4.737 4.779 4.812 4.815 4.766 4.664 4.435 4.028 3.303 1.913 0.218 -1.176 -2.395 -3.473 -4.428 -5.18 -5.837 -6.424 -7.024 -7.535 -7.964 -8.374 -8.777 -9.156 -9.491 -9.825 -10.113 -10.365 -10.633 -10.902 -11.123 -11.364 -11.615 -11.809 -12.01 -12.216 -12.42 -12.626 -12.768 -12.922 -13.179 -13.356 -13.536 -13.631 -13.843 -14.059 -14.29 -14.409 -14.587 -14.74 -14.853 -14.981 -15.262 -15.417 -15.589 -15.783 -16.018 -16.361 -16.79 -18.149 -7 ,17846 ,KEBNE ,16654207,Mon Nov 22 06:20:58 CET,Mon Nov 22 07:46:58 CET,0.0 0.561 0.806 0.953 1.09 1.232 1.372 1.497 1.682 1.756 1.836 1.957 2.079 2.143 2.256 2.348 2.427 2.473 2.564 2.653 2.773 2.845 2.919 3.011 3.091 3.163 3.232 3.301 3.381 3.457 3.526 3.604 3.677 3.745 3.808 3.874 3.979 4.091 4.174 4.269 4.355 4.4 4.413 4.416 4.404 4.333 4.171 3.903 3.438 2.671 1.352 -0.313 -1.675 -2.811 -3.807 -4.689 -5.457 -6.153 -6.745 -7.338 -7.868 -8.345 -8.766 -9.156 -9.512 -9.825 -10.157 -10.456 -10.729 -11.01 -11.286 -11.504 -11.721 -11.943 -12.121 -12.304 -12.485 -12.677 -12.875 -13.016 -13.168 -13.399 -13.554 -13.716 -13.799 -13.976 -14.159 -14.355 -14.462 -14.634 -14.797 -14.919 -15.049 -15.308 -15.457 -15.653 -15.861 -16.115 -16.436 -16.845 -18.58 -8 ,13966 ,KEBNE ,16654208,Mon Nov 22 06:20:58 CET,Mon Nov 22 07:48:00 CET,0.0 0.501 0.767 0.961 1.119 1.26 1.398 1.523 1.728 1.819 1.895 1.966 2.085 2.154 2.269 2.37 2.454 2.498 2.583 2.667 2.789 2.858 2.919 3.001 3.084 3.179 3.259 3.325 3.401 3.474 3.554 3.633 3.705 3.78 3.872 3.975 4.052 4.119 4.168 4.198 4.227 4.259 4.283 4.286 4.277 4.23 4.083 3.811 3.327 2.505 1.142 -0.432 -1.778 -2.939 -3.924 -4.811 -5.583 -6.278 -6.872 -7.44 -7.94 -8.388 -8.803 -9.204 -9.565 -9.886 -10.214 -10.497 -10.732 -10.963 -11.209 -11.417 -11.643 -11.88 -12.055 -12.233 -12.42 -12.623 -12.831 -12.964 -13.094 -13.315 -13.482 -13.656 -13.74 -13.908 -14.092 -14.284 -14.383 -14.554 -14.734 -14.877 -15.029 -15.345 -15.504 -15.681 -15.881 -16.088 -16.306 -16.644 -18.01 -9 ,4701 ,KEBNE ,16654209,Mon Nov 22 06:21:00 CET,Mon Nov 22 07:44:59 CET,0.0 0.898 1.117 1.301 1.471 1.609 1.735 1.858 2.112 2.235 2.356 2.535 2.681 2.771 2.955 3.12 3.249 3.311 3.423 3.536 3.702 3.802 3.903 4.039 4.155 4.26 4.356 4.443 4.557 4.659 4.756 4.874 4.976 5.064 5.155 5.262 5.365 5.463 5.56 5.661 5.735 5.777 5.8 5.794 5.755 5.654 5.509 5.27 4.833 4.115 2.76 1.069 -0.386 -1.635 -2.63 -3.507 -4.275 -4.939 -5.52 -6.107 -6.608 -7.046 -7.453 -7.839 -8.176 -8.483 -8.805 -9.086 -9.339 -9.595 -9.844 -10.045 -10.261 -10.493 -10.672 -10.857 -11.04 -11.233 -11.448 -11.591 -11.73 -11.945 -12.1 -12.263 -12.345 -12.517 -12.702 -12.896 -13.0 -13.179 -13.333 -13.447 -13.579 -13.87 -14.014 -14.188 -14.423 -14.693 -14.985 -15.385 -16.656 -10 ,16369 ,KEBNE ,16654210,Mon Nov 22 06:22:00 CET,Mon Nov 22 07:47:20 CET,0.0 1.037 1.31 1.465 1.599 1.744 1.876 1.973 2.141 2.227 2.311 2.397 2.506 2.56 2.657 2.775 2.913 2.975 3.069 3.155 3.284 3.371 3.446 3.532 3.608 3.681 3.758 3.836 3.932 4.031 4.136 4.251 4.343 4.431 4.525 4.608 4.678 4.762 4.851 4.933 5.018 5.079 5.094 5.099 5.078 5.029 4.906 4.63 4.161 3.4 2.087 0.487 -0.844 -2.0 -3.021 -3.907 -4.66 -5.341 -5.908 -6.486 -7.007 -7.457 -7.879 -8.272 -8.632 -8.957 -9.305 -9.611 -9.865 -10.139 -10.432 -10.676 -10.927 -11.177 -11.369 -11.575 -11.788 -12.012 -12.238 -12.382 -12.532 -12.766 -12.928 -13.099 -13.179 -13.35 -13.53 -13.722 -13.826 -14.008 -14.197 -14.332 -14.463 -14.736 -14.911 -15.125 -15.349 -15.594 -15.88 -16.266 -18.061 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_39.txt deleted file mode 100644 index 3b81d399..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_39.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,51 ,KEBNE ,16654211,Mon Nov 22 06:22:00 CET,Mon Nov 22 07:47:34 CET,0.0 1.002 1.259 1.45 1.599 1.736 1.863 1.991 2.226 2.321 2.417 2.53 2.657 2.727 2.858 2.988 3.118 3.18 3.292 3.393 3.559 3.666 3.759 3.905 4.041 4.161 4.279 4.398 4.54 4.668 4.797 4.948 5.096 5.232 5.376 5.543 5.708 5.87 6.019 6.169 6.304 6.429 6.571 6.709 6.845 6.97 7.067 7.079 7.014 6.824 6.302 5.377 4.436 3.604 2.88 2.199 1.621 1.087 0.605 0.123 -0.295 -0.659 -1.003 -1.326 -1.634 -1.917 -2.223 -2.497 -2.719 -2.945 -3.181 -3.378 -3.585 -3.806 -3.983 -4.158 -4.333 -4.516 -4.707 -4.837 -4.979 -5.212 -5.364 -5.518 -5.598 -5.775 -5.958 -6.141 -6.24 -6.405 -6.563 -6.688 -6.815 -7.083 -7.233 -7.41 -7.628 -7.887 -8.192 -8.638 -10.141 -2 ,9478 ,KEBNE ,16654212,Mon Nov 22 06:22:00 CET,Mon Nov 22 07:47:39 CET,0.0 0.901 1.198 1.404 1.575 1.723 1.85 1.97 2.184 2.281 2.38 2.537 2.683 2.775 2.936 3.102 3.26 3.33 3.458 3.585 3.77 3.883 3.994 4.132 4.258 4.38 4.492 4.606 4.767 4.912 5.043 5.196 5.336 5.462 5.601 5.756 5.899 6.057 6.222 6.377 6.521 6.673 6.827 6.971 7.13 7.259 7.364 7.438 7.374 7.065 6.391 5.43 4.471 3.594 2.859 2.207 1.61 1.033 0.551 0.098 -0.297 -0.649 -0.984 -1.307 -1.588 -1.821 -2.077 -2.3 -2.491 -2.68 -2.873 -3.045 -3.219 -3.405 -3.54 -3.674 -3.821 -3.98 -4.149 -4.26 -4.375 -4.557 -4.688 -4.824 -4.893 -5.033 -5.185 -5.359 -5.452 -5.616 -5.762 -5.871 -5.989 -6.248 -6.393 -6.54 -6.688 -6.874 -7.1 -7.417 -8.69 -3 ,26754 ,KEBNE ,16654213,Mon Nov 22 06:22:04 CET,Mon Nov 22 07:43:37 CET,0.0 0.903 1.185 1.388 1.549 1.682 1.823 1.944 2.144 2.239 2.324 2.413 2.531 2.601 2.732 2.861 2.989 3.049 3.158 3.262 3.408 3.499 3.58 3.689 3.813 3.933 4.047 4.15 4.266 4.386 4.509 4.658 4.786 4.915 5.068 5.228 5.377 5.525 5.684 5.857 6.019 6.16 6.302 6.445 6.589 6.694 6.778 6.894 6.929 6.754 6.158 5.187 4.229 3.336 2.582 1.915 1.324 0.778 0.316 -0.143 -0.546 -0.9 -1.215 -1.514 -1.813 -2.085 -2.362 -2.602 -2.812 -3.036 -3.264 -3.454 -3.655 -3.862 -4.023 -4.19 -4.357 -4.537 -4.731 -4.86 -4.987 -5.18 -5.302 -5.427 -5.496 -5.634 -5.779 -5.935 -6.019 -6.169 -6.304 -6.406 -6.499 -6.737 -6.871 -7.008 -7.156 -7.313 -7.515 -7.756 -8.436 -4 ,20005 ,KEBNE ,16654214,Mon Nov 22 06:22:00 CET,Mon Nov 22 07:49:18 CET,0.0 1.069 1.333 1.536 1.694 1.824 1.96 2.089 2.307 2.398 2.482 2.594 2.72 2.8 2.945 3.066 3.188 3.249 3.355 3.453 3.604 3.71 3.82 3.975 4.114 4.245 4.372 4.491 4.636 4.768 4.895 5.042 5.182 5.319 5.473 5.632 5.776 5.942 6.099 6.245 6.385 6.538 6.705 6.846 6.989 7.107 7.19 7.218 7.142 6.893 6.248 5.256 4.324 3.422 2.654 1.984 1.376 0.824 0.351 -0.126 -0.538 -0.908 -1.257 -1.58 -1.89 -2.175 -2.467 -2.717 -2.936 -3.16 -3.391 -3.588 -3.8 -4.023 -4.193 -4.374 -4.564 -4.761 -4.96 -5.091 -5.224 -5.433 -5.563 -5.689 -5.757 -5.906 -6.065 -6.224 -6.308 -6.471 -6.603 -6.701 -6.807 -7.017 -7.129 -7.262 -7.411 -7.575 -7.774 -8.035 -9.048 -5 ,9879 ,KEBNE ,16654215,Mon Nov 22 06:22:00 CET,Mon Nov 22 07:47:25 CET,0.0 0.978 1.257 1.447 1.607 1.747 1.876 1.988 2.173 2.261 2.338 2.432 2.555 2.631 2.774 2.895 3.011 3.071 3.181 3.278 3.403 3.489 3.577 3.693 3.793 3.891 3.997 4.116 4.26 4.386 4.524 4.697 4.85 4.99 5.141 5.304 5.455 5.605 5.755 5.926 6.108 6.287 6.46 6.618 6.774 6.909 7.059 7.158 7.137 6.929 6.271 5.211 4.216 3.338 2.609 1.959 1.37 0.838 0.39 -0.079 -0.483 -0.81 -1.118 -1.413 -1.68 -1.919 -2.172 -2.402 -2.596 -2.804 -3.031 -3.222 -3.411 -3.61 -3.763 -3.927 -4.103 -4.275 -4.454 -4.579 -4.703 -4.897 -5.033 -5.171 -5.242 -5.394 -5.567 -5.745 -5.832 -5.992 -6.123 -6.221 -6.323 -6.567 -6.713 -6.858 -7.009 -7.185 -7.407 -7.714 -8.879 -6 ,32423 ,KEBNE ,16654216,Mon Nov 22 06:23:05 CET,Mon Nov 22 07:44:57 CET,0.0 1.203 1.494 1.702 1.885 2.035 2.16 2.276 2.473 2.557 2.64 2.742 2.877 2.969 3.14 3.285 3.423 3.494 3.629 3.75 3.919 4.028 4.122 4.256 4.391 4.52 4.635 4.749 4.883 5.011 5.146 5.295 5.423 5.535 5.663 5.816 5.971 6.118 6.251 6.405 6.566 6.723 6.903 7.079 7.242 7.377 7.453 7.461 7.408 7.129 6.359 5.257 4.32 3.535 2.844 2.204 1.604 1.034 0.556 0.08 -0.335 -0.689 -1.032 -1.362 -1.654 -1.913 -2.192 -2.452 -2.68 -2.93 -3.186 -3.387 -3.587 -3.792 -3.972 -4.167 -4.349 -4.529 -4.719 -4.85 -4.986 -5.187 -5.334 -5.489 -5.574 -5.766 -5.965 -6.172 -6.281 -6.45 -6.618 -6.74 -6.859 -7.084 -7.199 -7.327 -7.486 -7.673 -7.894 -8.145 -8.757 -7 ,26455 ,KEBNE ,16654217,Mon Nov 22 06:23:02 CET,Mon Nov 22 07:48:51 CET,0.0 1.031 1.31 1.519 1.676 1.807 1.933 2.049 2.272 2.392 2.506 2.657 2.795 2.887 3.068 3.217 3.343 3.412 3.546 3.667 3.83 3.939 4.056 4.216 4.361 4.497 4.62 4.75 4.919 5.058 5.182 5.334 5.473 5.594 5.74 5.894 6.031 6.184 6.351 6.525 6.68 6.823 6.984 7.134 7.263 7.354 7.43 7.459 7.373 7.132 6.56 5.599 4.641 3.809 3.061 2.348 1.735 1.223 0.78 0.317 -0.083 -0.438 -0.775 -1.085 -1.364 -1.609 -1.872 -2.127 -2.341 -2.555 -2.77 -2.944 -3.117 -3.295 -3.439 -3.595 -3.753 -3.923 -4.106 -4.223 -4.344 -4.539 -4.671 -4.813 -4.888 -5.039 -5.199 -5.36 -5.438 -5.585 -5.709 -5.812 -5.912 -6.132 -6.261 -6.392 -6.524 -6.692 -6.894 -7.158 -7.814 -8 ,1252 ,KEBNE ,16654218,Mon Nov 22 06:23:02 CET,Mon Nov 22 07:48:24 CET,0.0 0.78 1.065 1.278 1.483 1.647 1.775 1.886 2.082 2.181 2.273 2.38 2.502 2.572 2.698 2.819 2.939 2.996 3.102 3.208 3.367 3.458 3.545 3.669 3.785 3.899 4.01 4.116 4.241 4.359 4.472 4.597 4.713 4.829 4.964 5.112 5.226 5.333 5.445 5.556 5.678 5.82 5.967 6.072 6.189 6.288 6.322 6.328 6.239 5.955 5.29 4.303 3.384 2.573 1.869 1.238 0.689 0.191 -0.236 -0.676 -1.063 -1.413 -1.754 -2.067 -2.348 -2.606 -2.881 -3.124 -3.336 -3.566 -3.812 -4.011 -4.214 -4.417 -4.571 -4.729 -4.888 -5.052 -5.221 -5.332 -5.443 -5.619 -5.736 -5.856 -5.928 -6.074 -6.213 -6.36 -6.441 -6.589 -6.713 -6.809 -6.906 -7.137 -7.269 -7.408 -7.566 -7.736 -7.926 -8.176 -8.776 -9 ,11358 ,KEBNE ,16654219,Mon Nov 22 06:23:02 CET,Mon Nov 22 07:50:26 CET,0.0 0.883 1.139 1.345 1.522 1.676 1.805 1.92 2.158 2.28 2.389 2.543 2.689 2.771 2.932 3.085 3.221 3.287 3.412 3.53 3.696 3.813 3.931 4.09 4.228 4.359 4.485 4.602 4.757 4.907 5.049 5.201 5.346 5.486 5.643 5.797 5.924 6.075 6.234 6.398 6.554 6.695 6.862 7.004 7.128 7.21 7.264 7.268 7.208 6.987 6.311 5.276 4.293 3.377 2.572 1.843 1.187 0.611 0.109 -0.383 -0.778 -1.12 -1.459 -1.797 -2.116 -2.397 -2.673 -2.922 -3.139 -3.38 -3.645 -3.856 -4.059 -4.258 -4.415 -4.58 -4.758 -4.94 -5.125 -5.256 -5.388 -5.583 -5.718 -5.859 -5.929 -6.069 -6.221 -6.393 -6.48 -6.632 -6.767 -6.88 -7.0 -7.251 -7.389 -7.54 -7.692 -7.853 -8.038 -8.315 -9.165 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_40.txt deleted file mode 100644 index 5f0b94b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_40.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,283 ,KEBNE ,16654221,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:51:29 CET,0.0 1.134 1.436 1.652 1.827 1.989 2.132 2.265 2.517 2.63 2.732 2.862 3.0 3.087 3.244 3.398 3.547 3.613 3.732 3.847 4.02 4.132 4.238 4.386 4.534 4.673 4.8 4.932 5.098 5.253 5.398 5.563 5.735 5.911 6.117 6.339 6.54 6.762 7.003 7.251 7.511 7.821 8.161 8.463 8.774 9.09 9.481 9.917 10.324 10.623 10.698 10.43 10.04 9.623 9.16 8.648 8.185 7.786 7.433 7.059 6.74 6.455 6.182 5.925 5.685 5.458 5.229 5.02 4.833 4.645 4.458 4.298 4.114 3.941 3.824 3.695 3.548 3.399 3.24 3.127 3.01 2.837 2.725 2.594 2.521 2.377 2.237 2.082 1.996 1.853 1.726 1.637 1.538 1.307 1.182 1.044 0.884 0.725 0.546 0.276 -0.381 -2 ,20328 ,KEBNE ,16654222,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:49:48 CET,0.0 0.779 1.046 1.246 1.412 1.562 1.704 1.848 2.098 2.203 2.313 2.474 2.615 2.708 2.892 3.056 3.221 3.3 3.443 3.578 3.77 3.905 4.037 4.204 4.367 4.528 4.673 4.808 4.991 5.165 5.322 5.508 5.693 5.878 6.078 6.298 6.5 6.722 6.967 7.208 7.463 7.744 8.054 8.36 8.697 9.059 9.439 9.846 10.264 10.567 10.688 10.358 9.763 9.2 8.721 8.261 7.884 7.55 7.204 6.821 6.49 6.187 5.909 5.657 5.417 5.198 4.957 4.734 4.542 4.333 4.126 3.952 3.759 3.557 3.401 3.249 3.096 2.931 2.756 2.634 2.501 2.303 2.169 2.02 1.944 1.793 1.632 1.44 1.336 1.183 1.03 0.914 0.792 0.554 0.432 0.297 0.134 -0.058 -0.266 -0.537 -1.206 -5 ,32714 ,KEBNE ,16654225,Mon Nov 22 06:24:08 CET,Mon Nov 22 07:47:21 CET,0.0 0.808 1.061 1.276 1.47 1.63 1.767 1.889 2.111 2.221 2.323 2.463 2.604 2.7 2.891 3.036 3.164 3.23 3.357 3.477 3.655 3.78 3.905 4.078 4.247 4.413 4.565 4.702 4.877 5.055 5.222 5.416 5.604 5.786 5.985 6.197 6.4 6.621 6.858 7.108 7.367 7.66 7.995 8.319 8.656 8.979 9.328 9.687 10.092 10.452 10.579 10.247 9.743 9.256 8.801 8.387 8.021 7.636 7.264 6.881 6.536 6.226 5.938 5.662 5.41 5.184 4.942 4.716 4.523 4.327 4.113 3.931 3.743 3.533 3.371 3.212 3.057 2.906 2.745 2.638 2.518 2.322 2.188 2.052 1.987 1.853 1.699 1.525 1.439 1.297 1.173 1.071 0.973 0.772 0.648 0.506 0.346 0.166 -0.027 -0.265 -0.792 -9 ,1481 ,KEBNE ,16654229,Mon Nov 22 06:24:03 CET,Mon Nov 22 07:49:57 CET,0.0 0.83 1.103 1.329 1.549 1.74 1.922 2.102 2.416 2.548 2.657 2.833 2.985 3.085 3.272 3.441 3.605 3.684 3.838 3.984 4.189 4.321 4.438 4.608 4.777 4.941 5.097 5.238 5.422 5.597 5.762 5.957 6.135 6.303 6.506 6.753 6.986 7.221 7.47 7.738 7.993 8.277 8.587 8.863 9.185 9.541 9.911 10.252 10.601 10.914 11.061 10.884 10.488 10.006 9.524 9.064 8.655 8.274 7.912 7.526 7.212 6.935 6.657 6.408 6.181 5.963 5.743 5.556 5.383 5.194 5.008 4.868 4.727 4.572 4.45 4.323 4.195 4.063 3.912 3.804 3.69 3.508 3.381 3.25 3.186 3.049 2.898 2.739 2.658 2.519 2.399 2.296 2.186 1.954 1.819 1.688 1.546 1.359 1.135 0.862 0.153 -10 ,2154 ,KEBNE ,16654230,Mon Nov 22 06:24:03 CET,Mon Nov 22 07:51:17 CET,0.0 0.835 1.114 1.328 1.504 1.664 1.814 1.952 2.187 2.294 2.4 2.536 2.672 2.75 2.9 3.037 3.17 3.237 3.365 3.488 3.667 3.772 3.868 4.013 4.154 4.292 4.425 4.545 4.699 4.849 4.996 5.171 5.339 5.503 5.686 5.894 6.105 6.332 6.575 6.824 7.079 7.363 7.657 7.942 8.301 8.686 9.085 9.515 9.919 10.241 10.349 10.021 9.511 8.996 8.56 8.125 7.689 7.284 6.94 6.609 6.317 6.045 5.788 5.546 5.306 5.071 4.818 4.599 4.42 4.241 4.059 3.904 3.742 3.574 3.443 3.306 3.164 3.014 2.852 2.739 2.624 2.451 2.317 2.172 2.104 1.965 1.813 1.655 1.58 1.444 1.334 1.244 1.137 0.907 0.781 0.633 0.482 0.31 0.111 -0.144 -1.144 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_41.txt deleted file mode 100644 index 17fa069a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_37_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20271 ,KEBNE ,16654231,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:49:57 CET,0.0 0.926 1.228 1.485 1.719 1.902 2.066 2.22 2.499 2.625 2.73 2.877 3.024 3.115 3.294 3.463 3.623 3.695 3.838 3.982 4.18 4.306 4.426 4.597 4.76 4.92 5.069 5.208 5.394 5.567 5.739 5.962 6.181 6.385 6.606 6.852 7.084 7.341 7.645 7.957 8.246 8.563 8.932 9.292 9.713 10.16 10.643 11.152 11.682 12.215 12.686 12.826 12.775 12.628 12.431 12.23 12.022 11.798 11.583 11.372 11.192 11.001 10.81 10.639 10.459 10.294 10.126 9.972 9.842 9.71 9.582 9.479 9.378 9.264 9.165 9.066 8.971 8.874 8.766 8.691 8.617 8.504 8.419 8.33 8.279 8.167 8.057 7.947 7.887 7.771 7.676 7.604 7.524 7.347 7.245 7.13 7.009 6.875 6.709 6.479 5.681 -2 ,8040 ,KEBNE ,16654232,Mon Nov 22 06:24:05 CET,Mon Nov 22 07:49:57 CET,0.0 1.227 1.597 1.856 2.049 2.217 2.375 2.523 2.793 2.915 3.025 3.18 3.325 3.416 3.586 3.743 3.901 3.977 4.115 4.243 4.43 4.55 4.668 4.849 5.015 5.171 5.334 5.486 5.668 5.85 6.037 6.248 6.447 6.645 6.866 7.112 7.358 7.629 7.914 8.2 8.496 8.813 9.159 9.504 9.871 10.263 10.725 11.224 11.74 12.271 12.757 12.922 12.874 12.736 12.552 12.343 12.125 11.883 11.661 11.462 11.291 11.124 10.948 10.778 10.621 10.464 10.302 10.163 10.039 9.902 9.767 9.653 9.527 9.402 9.3 9.191 9.084 8.98 8.866 8.786 8.705 8.57 8.479 8.388 8.341 8.241 8.128 8.007 7.94 7.824 7.73 7.658 7.59 7.423 7.322 7.212 7.085 6.944 6.778 6.537 5.931 -3 ,24481 ,KEBNE ,16654233,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:50:12 CET,0.0 0.743 1.082 1.338 1.526 1.696 1.854 1.993 2.237 2.346 2.453 2.6 2.744 2.842 3.036 3.22 3.394 3.48 3.65 3.81 4.037 4.182 4.321 4.514 4.692 4.862 5.023 5.184 5.383 5.566 5.742 5.958 6.165 6.358 6.585 6.832 7.064 7.317 7.586 7.865 8.149 8.475 8.839 9.19 9.611 10.074 10.586 11.086 11.581 12.1 12.532 12.682 12.63 12.469 12.29 12.098 11.906 11.727 11.56 11.392 11.221 11.06 10.902 10.747 10.611 10.49 10.351 10.226 10.125 10.01 9.895 9.809 9.704 9.585 9.497 9.399 9.285 9.173 9.053 8.969 8.887 8.761 8.673 8.581 8.532 8.428 8.324 8.207 8.148 8.038 7.948 7.873 7.791 7.619 7.527 7.426 7.303 7.162 6.97 6.701 6.082 -4 ,21879 ,KEBNE ,16654234,Mon Nov 22 06:24:03 CET,Mon Nov 22 07:51:23 CET,0.0 1.103 1.427 1.68 1.878 2.055 2.208 2.341 2.581 2.691 2.799 2.948 3.091 3.184 3.378 3.565 3.725 3.8 3.947 4.086 4.28 4.401 4.526 4.716 4.889 5.055 5.223 5.381 5.589 5.777 5.946 6.159 6.362 6.554 6.765 6.99 7.217 7.48 7.751 8.036 8.328 8.636 8.984 9.326 9.719 10.161 10.649 11.174 11.737 12.26 12.675 12.798 12.729 12.513 12.271 12.03 11.775 11.512 11.274 11.027 10.797 10.589 10.391 10.195 10.013 9.858 9.693 9.546 9.415 9.271 9.12 8.997 8.867 8.729 8.626 8.522 8.417 8.305 8.181 8.096 8.012 7.881 7.782 7.68 7.627 7.508 7.39 7.266 7.201 7.078 6.975 6.894 6.806 6.612 6.507 6.394 6.268 6.134 5.976 5.784 5.361 -5 ,16417 ,KEBNE ,16654235,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:51:41 CET,0.0 2.223 2.669 2.989 3.27 3.478 3.656 3.834 4.136 4.271 4.408 4.605 4.763 4.871 5.073 5.26 5.437 5.523 5.698 5.869 6.096 6.238 6.373 6.572 6.771 6.956 7.126 7.286 7.49 7.677 7.85 8.055 8.26 8.468 8.7 8.953 9.196 9.456 9.73 10.023 10.309 10.601 10.958 11.34 11.737 12.145 12.61 13.06 13.532 14.031 14.474 14.606 14.502 14.358 14.199 14.012 13.806 13.616 13.436 13.242 13.082 12.925 12.758 12.588 12.432 12.296 12.153 12.024 11.914 11.805 11.689 11.589 11.487 11.382 11.288 11.183 11.079 10.973 10.862 10.783 10.702 10.561 10.459 10.36 10.308 10.198 10.09 9.967 9.905 9.803 9.709 9.633 9.558 9.379 9.279 9.168 9.032 8.869 8.695 8.503 7.776 -6 ,31187 ,KEBNE ,16654236,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:50:03 CET,0.0 0.769 1.047 1.253 1.44 1.605 1.767 1.916 2.148 2.258 2.367 2.514 2.649 2.732 2.906 3.066 3.219 3.291 3.43 3.566 3.755 3.871 3.981 4.148 4.305 4.449 4.599 4.751 4.941 5.114 5.278 5.467 5.654 5.839 6.049 6.288 6.524 6.784 7.059 7.345 7.629 7.945 8.305 8.649 9.029 9.399 9.811 10.305 10.83 11.359 11.869 12.092 12.046 11.885 11.679 11.477 11.299 11.101 10.893 10.672 10.477 10.315 10.167 10.009 9.845 9.694 9.531 9.375 9.243 9.114 8.974 8.859 8.732 8.589 8.48 8.363 8.245 8.112 7.959 7.855 7.751 7.582 7.466 7.347 7.282 7.132 6.971 6.815 6.729 6.584 6.407 6.295 6.197 5.963 5.842 5.733 5.602 5.475 5.331 5.068 4.225 -7 ,4191 ,KEBNE ,16654237,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:51:39 CET,0.0 1.229 1.61 1.86 2.063 2.238 2.404 2.549 2.802 2.914 3.019 3.18 3.33 3.419 3.58 3.732 3.883 3.957 4.101 4.244 4.443 4.565 4.683 4.848 5.01 5.171 5.319 5.461 5.649 5.824 5.986 6.191 6.404 6.616 6.85 7.097 7.342 7.623 7.917 8.2 8.47 8.768 9.129 9.496 9.906 10.335 10.793 11.291 11.883 12.495 13.044 13.244 13.173 13.027 12.849 12.647 12.435 12.217 12.016 11.815 11.633 11.468 11.305 11.153 11.017 10.891 10.752 10.624 10.514 10.393 10.262 10.168 10.075 9.956 9.853 9.748 9.646 9.538 9.423 9.344 9.263 9.142 9.062 8.975 8.926 8.823 8.696 8.553 8.485 8.371 8.274 8.201 8.127 7.96 7.867 7.766 7.645 7.498 7.331 7.106 6.495 -8 ,13027 ,KEBNE ,16654238,Mon Nov 22 06:24:05 CET,Mon Nov 22 07:50:07 CET,0.0 0.983 1.288 1.519 1.717 1.905 2.065 2.204 2.456 2.565 2.671 2.811 2.948 3.037 3.212 3.372 3.514 3.584 3.73 3.871 4.068 4.19 4.314 4.498 4.671 4.83 4.979 5.121 5.31 5.496 5.678 5.909 6.123 6.322 6.561 6.834 7.087 7.339 7.601 7.875 8.151 8.459 8.828 9.205 9.619 10.05 10.518 10.995 11.533 12.111 12.649 12.841 12.766 12.615 12.397 12.15 11.932 11.743 11.574 11.371 11.169 10.968 10.77 10.574 10.396 10.233 10.048 9.879 9.734 9.595 9.444 9.312 9.174 9.037 8.938 8.826 8.705 8.581 8.45 8.362 8.273 8.13 8.031 7.93 7.876 7.764 7.648 7.515 7.445 7.331 7.244 7.165 7.078 6.892 6.779 6.655 6.532 6.389 6.212 5.948 5.21 -9 ,19507 ,KEBNE ,16654239,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:50:01 CET,0.0 1.094 1.453 1.714 1.926 2.109 2.271 2.417 2.669 2.792 2.906 3.056 3.189 3.269 3.446 3.613 3.752 3.816 3.951 4.079 4.25 4.36 4.465 4.615 4.776 4.937 5.091 5.25 5.456 5.653 5.844 6.063 6.256 6.426 6.631 6.86 7.065 7.3 7.568 7.836 8.098 8.398 8.734 9.068 9.477 9.945 10.413 10.83 11.282 11.733 12.053 12.072 11.904 11.664 11.408 11.143 10.896 10.64 10.407 10.176 9.942 9.718 9.511 9.326 9.149 8.977 8.788 8.618 8.471 8.319 8.163 8.033 7.895 7.754 7.646 7.533 7.408 7.265 7.119 7.024 6.917 6.737 6.621 6.5 6.44 6.327 6.206 6.081 6.016 5.896 5.799 5.719 5.633 5.447 5.341 5.223 5.106 4.971 4.756 4.466 3.686 -10 ,19507 ,KEBNE ,16654240,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:49:44 CET,0.0 1.094 1.453 1.714 1.926 2.109 2.271 2.417 2.669 2.792 2.906 3.056 3.189 3.269 3.446 3.613 3.752 3.816 3.951 4.079 4.25 4.36 4.465 4.615 4.776 4.937 5.091 5.25 5.456 5.653 5.844 6.063 6.256 6.426 6.631 6.86 7.065 7.3 7.568 7.836 8.098 8.398 8.734 9.068 9.477 9.945 10.413 10.83 11.282 11.733 12.053 12.072 11.904 11.664 11.408 11.143 10.896 10.64 10.407 10.176 9.942 9.718 9.511 9.326 9.149 8.977 8.788 8.618 8.471 8.319 8.163 8.033 7.895 7.754 7.646 7.533 7.408 7.265 7.119 7.024 6.917 6.737 6.621 6.5 6.44 6.327 6.206 6.081 6.016 5.896 5.799 5.719 5.633 5.447 5.341 5.223 5.106 4.971 4.756 4.466 3.686 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_38_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_38_34.txt deleted file mode 100644 index 85028bdb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_38_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11118 ,KEBNE ,17042395,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:10 CET,0.0 0.539 0.722 0.873 1.014 1.134 1.225 1.306 1.454 1.525 1.604 1.69 1.832 1.897 2.009 2.117 2.221 2.276 2.383 2.48 2.608 2.688 2.775 2.898 3.012 3.126 3.234 3.329 3.442 3.552 3.665 3.804 3.938 4.066 4.223 4.398 4.567 4.755 4.952 5.155 5.352 5.559 5.799 6.038 6.299 6.603 6.916 7.174 7.4 7.547 7.516 7.187 6.736 6.271 5.867 5.455 5.043 4.68 4.352 4.006 3.706 3.433 3.171 2.91 2.673 2.472 2.248 2.045 1.874 1.681 1.47 1.284 1.096 0.913 0.753 0.578 0.402 0.231 0.048 -0.092 -0.23 -0.428 -0.568 -0.723 -0.804 -0.968 -1.128 -1.286 -1.376 -1.532 -1.665 -1.784 -1.913 -2.2 -2.365 -2.549 -2.743 -2.958 -3.219 -3.531 -5.966 -2 ,3305 ,KEBNE ,17042396,Thu Dec 23 04:36:24 CET,Thu Dec 23 06:01:08 CET,0.0 0.642 0.824 0.974 1.082 1.168 1.257 1.337 1.484 1.556 1.615 1.667 1.793 1.854 1.969 2.074 2.171 2.222 2.34 2.453 2.616 2.722 2.818 2.95 3.078 3.201 3.318 3.435 3.592 3.754 3.907 4.069 4.213 4.364 4.545 4.732 4.891 5.051 5.232 5.429 5.636 5.864 6.12 6.357 6.623 6.9 7.182 7.455 7.672 7.852 7.857 7.487 7.055 6.62 6.207 5.779 5.392 5.071 4.777 4.456 4.162 3.88 3.61 3.356 3.109 2.89 2.682 2.487 2.31 2.129 1.94 1.787 1.634 1.476 1.358 1.231 1.086 0.932 0.765 0.643 0.527 0.355 0.227 0.095 0.022 -0.127 -0.272 -0.427 -0.518 -0.681 -0.808 -0.913 -1.039 -1.313 -1.47 -1.649 -1.842 -2.074 -2.356 -2.782 -4.427 -3 ,29028 ,KEBNE ,17042397,Thu Dec 23 04:36:20 CET,Thu Dec 23 06:06:13 CET,0.0 0.662 0.871 1.012 1.104 1.194 1.285 1.372 1.54 1.618 1.689 1.759 1.89 1.949 2.056 2.151 2.238 2.282 2.366 2.459 2.596 2.673 2.749 2.857 2.958 3.058 3.145 3.23 3.344 3.459 3.576 3.705 3.831 3.943 4.061 4.225 4.399 4.586 4.78 4.984 5.199 5.419 5.681 5.958 6.225 6.508 6.818 7.08 7.348 7.575 7.578 7.266 6.828 6.351 5.93 5.513 5.115 4.751 4.416 4.077 3.754 3.431 3.119 2.826 2.57 2.352 2.138 1.933 1.738 1.541 1.338 1.173 1.002 0.813 0.662 0.496 0.318 0.142 -0.051 -0.18 -0.3 -0.503 -0.662 -0.832 -0.915 -1.088 -1.28 -1.464 -1.562 -1.73 -1.952 -2.107 -2.249 -2.55 -2.72 -2.909 -3.089 -3.291 -3.58 -3.998 -5.749 -4 ,5558 ,KEBNE ,17042398,Thu Dec 23 04:36:20 CET,Thu Dec 23 06:06:14 CET,0.0 0.645 0.827 0.958 1.056 1.148 1.24 1.328 1.501 1.595 1.689 1.797 1.946 2.034 2.177 2.305 2.435 2.496 2.605 2.715 2.876 2.974 3.071 3.206 3.331 3.448 3.56 3.67 3.816 3.95 4.072 4.229 4.385 4.529 4.683 4.856 5.026 5.211 5.406 5.613 5.827 6.073 6.333 6.564 6.822 7.081 7.356 7.623 7.836 8.028 8.027 7.672 7.203 6.762 6.336 5.901 5.52 5.152 4.835 4.522 4.26 4.031 3.803 3.576 3.37 3.183 2.963 2.766 2.604 2.441 2.268 2.113 1.966 1.798 1.643 1.486 1.336 1.191 1.055 0.955 0.841 0.662 0.538 0.408 0.336 0.196 0.04 -0.141 -0.23 -0.385 -0.513 -0.624 -0.739 -0.971 -1.105 -1.256 -1.439 -1.662 -1.946 -2.434 -4.247 -5 ,14410 ,KEBNE ,17042399,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:19 CET,0.0 0.585 0.782 0.92 1.031 1.122 1.211 1.289 1.422 1.485 1.545 1.603 1.727 1.787 1.893 1.985 2.088 2.139 2.227 2.316 2.453 2.53 2.601 2.705 2.803 2.901 2.996 3.081 3.191 3.302 3.41 3.533 3.646 3.757 3.9 4.052 4.177 4.326 4.492 4.656 4.828 5.008 5.229 5.442 5.678 5.952 6.234 6.501 6.744 6.942 6.971 6.596 6.107 5.667 5.243 4.824 4.436 4.068 3.75 3.427 3.133 2.858 2.581 2.323 2.101 1.892 1.659 1.451 1.27 1.086 0.881 0.711 0.553 0.378 0.241 0.097 -0.064 -0.235 -0.417 -0.543 -0.676 -0.887 -1.023 -1.166 -1.257 -1.437 -1.61 -1.794 -1.895 -2.072 -2.279 -2.411 -2.534 -2.799 -2.958 -3.144 -3.341 -3.555 -3.806 -4.171 -5.798 -6 ,16933 ,KEBNE ,17042400,Thu Dec 23 04:36:20 CET,Thu Dec 23 06:06:07 CET,0.0 0.475 0.67 0.807 0.94 1.052 1.15 1.246 1.429 1.509 1.58 1.666 1.799 1.857 1.96 2.063 2.167 2.216 2.319 2.424 2.572 2.66 2.747 2.882 3.005 3.119 3.224 3.341 3.5 3.646 3.777 3.933 4.103 4.255 4.42 4.598 4.754 4.92 5.103 5.295 5.499 5.733 5.982 6.228 6.501 6.782 7.076 7.325 7.565 7.731 7.606 7.229 6.821 6.367 5.93 5.508 5.127 4.764 4.415 4.035 3.709 3.418 3.151 2.911 2.674 2.443 2.191 1.964 1.76 1.544 1.329 1.144 0.951 0.765 0.628 0.483 0.321 0.154 -0.023 -0.144 -0.262 -0.435 -0.554 -0.701 -0.777 -0.926 -1.081 -1.251 -1.351 -1.518 -1.652 -1.76 -1.88 -2.147 -2.294 -2.468 -2.656 -2.876 -3.192 -3.667 -5.268 -7 ,25516 ,KEBNE ,17042401,Thu Dec 23 04:36:20 CET,Thu Dec 23 06:07:03 CET,0.0 0.723 0.908 1.032 1.155 1.283 1.427 1.537 1.703 1.793 1.889 2.018 2.173 2.253 2.396 2.528 2.644 2.699 2.797 2.88 2.998 3.072 3.143 3.251 3.379 3.506 3.594 3.67 3.793 3.922 4.038 4.174 4.287 4.392 4.542 4.707 4.845 5.002 5.174 5.359 5.559 5.761 5.961 6.147 6.357 6.598 6.846 7.089 7.319 7.475 7.496 7.23 6.842 6.406 5.992 5.636 5.286 4.906 4.572 4.26 3.987 3.74 3.483 3.231 3.007 2.807 2.608 2.427 2.255 2.07 1.885 1.732 1.567 1.398 1.269 1.136 1.0 0.856 0.701 0.598 0.489 0.309 0.185 0.052 -0.022 -0.171 -0.325 -0.502 -0.597 -0.752 -0.887 -0.992 -1.102 -1.35 -1.483 -1.648 -1.846 -2.066 -2.339 -2.694 -4.091 -8 ,31033 ,KEBNE ,17042402,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:38 CET,0.0 0.49 0.654 0.802 0.936 1.046 1.14 1.222 1.373 1.446 1.518 1.583 1.713 1.783 1.912 2.023 2.122 2.171 2.257 2.342 2.463 2.536 2.604 2.712 2.827 2.93 3.032 3.135 3.271 3.41 3.533 3.682 3.828 3.971 4.126 4.288 4.449 4.637 4.834 5.031 5.228 5.437 5.702 5.958 6.228 6.54 6.843 7.14 7.449 7.658 7.679 7.417 6.973 6.466 6.006 5.588 5.204 4.85 4.522 4.173 3.872 3.586 3.313 3.059 2.818 2.592 2.337 2.116 1.937 1.747 1.542 1.373 1.2 1.021 0.881 0.73 0.577 0.406 0.215 0.083 -0.053 -0.279 -0.426 -0.565 -0.635 -0.769 -0.922 -1.094 -1.182 -1.339 -1.488 -1.592 -1.713 -2.016 -2.177 -2.355 -2.559 -2.79 -3.058 -3.413 -4.731 -9 ,11266 ,KEBNE ,17042403,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:47 CET,0.0 0.449 0.648 0.796 0.923 1.029 1.129 1.215 1.38 1.46 1.538 1.6 1.73 1.788 1.906 2.022 2.131 2.192 2.295 2.378 2.513 2.603 2.682 2.789 2.909 3.025 3.131 3.234 3.36 3.484 3.6 3.74 3.882 4.014 4.164 4.322 4.471 4.657 4.843 5.023 5.221 5.445 5.686 5.924 6.194 6.481 6.778 7.046 7.278 7.463 7.536 7.296 6.867 6.38 5.938 5.512 5.116 4.75 4.4 4.045 3.739 3.463 3.203 2.953 2.722 2.519 2.288 2.066 1.888 1.696 1.47 1.284 1.106 0.927 0.79 0.642 0.487 0.323 0.128 -0.007 -0.13 -0.313 -0.444 -0.586 -0.664 -0.827 -0.995 -1.167 -1.256 -1.419 -1.561 -1.678 -1.8 -2.05 -2.19 -2.352 -2.528 -2.722 -2.982 -3.38 -5.135 -10 ,5488 ,KEBNE ,17042404,Thu Dec 23 04:36:20 CET,Thu Dec 23 06:07:36 CET,0.0 0.661 0.864 1.029 1.162 1.262 1.359 1.441 1.582 1.65 1.723 1.792 1.913 1.968 2.075 2.182 2.285 2.331 2.423 2.51 2.632 2.712 2.793 2.906 3.017 3.12 3.209 3.302 3.419 3.53 3.648 3.789 3.919 4.044 4.209 4.4 4.571 4.757 4.943 5.132 5.324 5.544 5.792 6.003 6.237 6.498 6.77 7.066 7.368 7.581 7.619 7.339 6.96 6.527 6.045 5.616 5.258 4.921 4.601 4.233 3.917 3.64 3.384 3.149 2.92 2.702 2.469 2.256 2.07 1.88 1.691 1.531 1.352 1.163 1.014 0.862 0.708 0.539 0.369 0.25 0.118 -0.076 -0.207 -0.347 -0.42 -0.582 -0.753 -0.934 -1.031 -1.196 -1.344 -1.469 -1.614 -1.902 -2.058 -2.233 -2.43 -2.644 -2.903 -3.322 -5.484 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_38_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_38_37.txt deleted file mode 100644 index 660b7559..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_38_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2153 ,TETRA ,17667817,Fri Dec 3 06:02:49 CET,Fri Dec 3 07:51:13 CET,0.0 0.556 0.805 0.987 1.14 1.277 1.397 1.501 1.702 1.797 1.885 1.993 2.143 2.225 2.375 2.512 2.646 2.714 2.857 3.002 3.21 3.34 3.464 3.642 3.82 3.989 4.148 4.306 4.515 4.712 4.902 5.147 5.372 5.578 5.823 6.1 6.38 6.68 6.995 7.355 7.752 8.202 8.702 9.197 9.771 10.425 11.218 12.107 13.12 14.289 15.695 16.804 17.381 17.723 17.904 17.977 17.989 17.953 17.89 17.818 17.761 17.697 17.603 17.514 17.432 17.341 17.237 17.141 17.04 16.926 16.811 16.721 16.618 16.495 16.403 16.316 16.228 16.141 16.043 15.972 15.892 15.761 15.664 15.555 15.503 15.402 15.298 15.182 15.125 15.02 14.94 14.868 14.778 14.556 14.441 14.328 14.211 14.068 13.902 13.678 13.059 -2 ,5109 ,TETRA ,17667818,Fri Dec 3 06:02:44 CET,Fri Dec 3 07:47:43 CET,0.0 0.548 0.759 0.922 1.073 1.207 1.329 1.432 1.614 1.702 1.795 1.916 2.066 2.142 2.283 2.418 2.552 2.619 2.751 2.878 3.06 3.18 3.304 3.485 3.653 3.81 3.957 4.098 4.293 4.5 4.699 4.934 5.154 5.364 5.615 5.898 6.178 6.475 6.792 7.146 7.514 7.93 8.416 8.903 9.497 10.15 10.913 11.791 12.777 13.949 15.298 16.37 17.011 17.374 17.578 17.698 17.721 17.714 17.689 17.602 17.518 17.451 17.37 17.275 17.184 17.106 17.009 16.909 16.822 16.725 16.616 16.517 16.405 16.28 16.188 16.099 16.005 15.91 15.793 15.699 15.61 15.479 15.378 15.261 15.197 15.071 14.933 14.771 14.687 14.556 14.435 14.358 14.276 14.084 13.985 13.883 13.761 13.619 13.444 13.175 12.227 -3 ,6214 ,TETRA ,17667819,Fri Dec 3 06:02:49 CET,Fri Dec 3 07:47:21 CET,0.0 0.565 0.826 1.013 1.166 1.308 1.435 1.548 1.752 1.848 1.947 2.067 2.22 2.318 2.508 2.674 2.841 2.922 3.082 3.237 3.436 3.564 3.688 3.87 4.066 4.25 4.416 4.579 4.791 4.988 5.185 5.425 5.657 5.879 6.137 6.432 6.704 7.005 7.341 7.701 8.062 8.454 8.933 9.433 10.003 10.646 11.412 12.267 13.283 14.553 16.04 17.153 17.751 18.099 18.287 18.363 18.403 18.408 18.372 18.301 18.225 18.149 18.055 17.949 17.86 17.777 17.67 17.577 17.494 17.392 17.285 17.198 17.106 17.015 16.942 16.863 16.787 16.7 16.606 16.541 16.461 16.341 16.261 16.176 16.135 16.04 15.931 15.82 15.764 15.651 15.563 15.494 15.421 15.24 15.14 15.031 14.909 14.776 14.606 14.388 13.882 -4 ,30024 ,TETRA ,17667820,Fri Dec 3 06:02:49 CET,Fri Dec 3 07:47:58 CET,0.0 0.595 0.803 0.97 1.112 1.247 1.368 1.473 1.661 1.755 1.846 1.959 2.104 2.182 2.342 2.499 2.636 2.699 2.824 2.951 3.142 3.267 3.389 3.556 3.72 3.879 4.038 4.206 4.419 4.619 4.814 5.053 5.286 5.502 5.758 6.04 6.303 6.604 6.932 7.293 7.679 8.112 8.597 9.078 9.652 10.305 11.073 11.963 12.993 14.16 15.532 16.607 17.226 17.613 17.831 17.947 17.998 17.999 17.96 17.897 17.845 17.791 17.73 17.672 17.594 17.501 17.407 17.328 17.245 17.155 17.048 16.951 16.846 16.735 16.66 16.578 16.485 16.391 16.287 16.209 16.125 15.979 15.871 15.764 15.708 15.593 15.464 15.313 15.237 15.11 14.991 14.901 14.791 14.532 14.385 14.241 14.08 13.863 13.583 13.124 11.799 -5 ,24494 ,TETRA ,17667821,Fri Dec 3 06:02:49 CET,Fri Dec 3 07:47:52 CET,0.0 0.91 1.276 1.57 1.794 1.981 2.144 2.288 2.547 2.665 2.767 2.906 3.078 3.182 3.377 3.576 3.75 3.828 3.976 4.11 4.315 4.447 4.581 4.783 4.972 5.157 5.338 5.512 5.714 5.91 6.112 6.348 6.561 6.767 7.018 7.3 7.568 7.884 8.232 8.579 8.95 9.37 9.857 10.356 10.934 11.588 12.366 13.229 14.23 15.446 16.928 18.134 18.813 19.17 19.349 19.458 19.521 19.521 19.479 19.42 19.343 19.258 19.177 19.093 19.002 18.908 18.809 18.726 18.652 18.564 18.46 18.38 18.29 18.182 18.095 18.009 17.926 17.823 17.7 17.616 17.532 17.407 17.318 17.227 17.182 17.087 16.981 16.86 16.797 16.682 16.591 16.518 16.44 16.245 16.147 16.035 15.901 15.762 15.591 15.363 14.512 -6 ,5927 ,TETRA ,17667822,Fri Dec 3 06:02:49 CET,Fri Dec 3 07:48:09 CET,0.0 0.5 0.716 0.897 1.055 1.197 1.329 1.456 1.696 1.792 1.874 1.962 2.106 2.181 2.323 2.47 2.607 2.671 2.796 2.915 3.088 3.198 3.305 3.457 3.608 3.75 3.893 4.046 4.245 4.431 4.607 4.817 5.024 5.222 5.443 5.702 5.953 6.225 6.511 6.821 7.166 7.573 8.057 8.525 9.066 9.685 10.42 11.281 12.268 13.405 14.858 16.07 16.772 17.18 17.398 17.514 17.539 17.533 17.508 17.439 17.368 17.291 17.195 17.086 16.981 16.878 16.766 16.674 16.59 16.498 16.393 16.302 16.211 16.105 16.012 15.909 15.809 15.71 15.603 15.519 15.428 15.277 15.166 15.058 15.003 14.893 14.788 14.681 14.621 14.503 14.388 14.309 14.24 14.07 13.963 13.857 13.738 13.587 13.398 13.176 12.658 -7 ,12191 ,TETRA ,17667823,Fri Dec 3 06:02:48 CET,Fri Dec 3 07:48:14 CET,0.0 0.559 0.757 0.898 1.028 1.158 1.285 1.403 1.599 1.695 1.786 1.887 2.036 2.114 2.253 2.387 2.523 2.59 2.719 2.838 3.001 3.113 3.234 3.403 3.555 3.7 3.843 3.986 4.175 4.366 4.547 4.76 4.962 5.147 5.371 5.636 5.886 6.156 6.457 6.778 7.12 7.526 7.999 8.47 9.02 9.614 10.334 11.181 12.168 13.339 14.751 15.957 16.659 17.07 17.274 17.367 17.413 17.419 17.39 17.336 17.287 17.215 17.134 17.064 16.98 16.891 16.789 16.689 16.606 16.524 16.437 16.362 16.275 16.191 16.125 16.052 15.979 15.892 15.803 15.747 15.683 15.583 15.512 15.431 15.387 15.291 15.188 15.086 15.035 14.928 14.834 14.764 14.693 14.5 14.391 14.281 14.155 14.005 13.826 13.607 12.937 -8 ,3844 ,TETRA ,17667824,Fri Dec 3 06:02:49 CET,Fri Dec 3 07:48:21 CET,0.0 0.498 0.723 0.915 1.074 1.207 1.335 1.462 1.688 1.789 1.883 2.009 2.166 2.253 2.416 2.561 2.696 2.764 2.893 3.01 3.184 3.295 3.404 3.581 3.754 3.907 4.059 4.21 4.394 4.576 4.764 4.991 5.195 5.392 5.627 5.883 6.131 6.426 6.732 7.051 7.394 7.79 8.281 8.754 9.296 9.926 10.671 11.504 12.447 13.566 14.982 16.151 16.808 17.18 17.389 17.516 17.566 17.564 17.53 17.487 17.433 17.365 17.307 17.253 17.193 17.137 17.073 17.002 16.936 16.871 16.789 16.701 16.603 16.512 16.441 16.37 16.3 16.214 16.122 16.058 15.996 15.898 15.827 15.751 15.706 15.615 15.517 15.404 15.346 15.241 15.168 15.094 15.013 14.841 14.747 14.657 14.556 14.424 14.253 14.047 13.582 -9 ,27926 ,TETRA ,17667825,Fri Dec 3 06:02:49 CET,Fri Dec 3 07:48:15 CET,0.0 0.603 0.837 1.015 1.167 1.304 1.434 1.546 1.738 1.83 1.923 2.036 2.183 2.259 2.396 2.536 2.671 2.732 2.849 2.963 3.138 3.253 3.362 3.519 3.673 3.826 3.971 4.109 4.292 4.469 4.651 4.871 5.068 5.254 5.478 5.739 6.001 6.287 6.578 6.899 7.244 7.622 8.073 8.537 9.092 9.734 10.485 11.347 12.353 13.549 14.994 16.171 16.847 17.235 17.425 17.515 17.57 17.582 17.536 17.46 17.4 17.344 17.27 17.162 17.06 16.98 16.877 16.778 16.705 16.614 16.497 16.41 16.323 16.224 16.138 16.057 15.973 15.861 15.735 15.653 15.572 15.43 15.327 15.22 15.164 15.064 14.951 14.825 14.764 14.653 14.584 14.51 14.435 14.289 14.206 14.117 14.018 13.892 13.733 13.518 12.706 -10 ,75 ,TETRA ,17667826,Fri Dec 3 06:02:49 CET,Fri Dec 3 07:48:09 CET,0.0 0.918 1.172 1.36 1.514 1.654 1.798 1.92 2.114 2.211 2.305 2.415 2.569 2.658 2.825 2.972 3.104 3.167 3.296 3.42 3.602 3.72 3.831 3.994 4.155 4.316 4.467 4.609 4.801 4.995 5.191 5.434 5.667 5.888 6.149 6.444 6.722 7.033 7.369 7.717 8.084 8.51 9.012 9.528 10.128 10.798 11.597 12.479 13.48 14.672 16.11 17.261 17.862 18.142 18.312 18.403 18.436 18.461 18.448 18.4 18.321 18.237 18.161 18.073 17.984 17.902 17.801 17.694 17.598 17.5 17.395 17.309 17.204 17.083 16.994 16.906 16.814 16.699 16.581 16.495 16.404 16.271 16.18 16.079 16.022 15.9 15.772 15.652 15.597 15.488 15.418 15.357 15.283 15.106 15.011 14.9 14.773 14.623 14.447 14.189 13.177 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_38_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_38_43.txt deleted file mode 100644 index 38020505..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_38_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,950 ,KEBNE ,16654241,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:48:59 CET,0.0 0.531 0.782 0.962 1.117 1.269 1.399 1.523 1.746 1.844 1.937 2.049 2.209 2.297 2.45 2.608 2.767 2.842 2.971 3.096 3.29 3.416 3.533 3.707 3.875 4.033 4.187 4.335 4.52 4.702 4.885 5.119 5.342 5.546 5.781 6.056 6.339 6.641 6.965 7.322 7.689 8.106 8.61 9.105 9.653 10.224 10.838 11.563 12.436 13.358 14.259 14.714 14.744 14.609 14.422 14.219 14.01 13.767 13.515 13.228 12.972 12.759 12.549 12.345 12.166 12.0 11.817 11.633 11.45 11.26 11.055 10.885 10.725 10.554 10.411 10.258 10.098 9.921 9.733 9.6 9.466 9.25 9.088 8.915 8.816 8.622 8.432 8.211 8.102 7.942 7.749 7.611 7.45 7.07 6.867 6.653 6.404 6.101 5.719 5.174 2.346 -2 ,7208 ,KEBNE ,16654242,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:50:21 CET,0.0 0.848 1.109 1.31 1.466 1.612 1.742 1.854 2.048 2.148 2.246 2.366 2.526 2.613 2.778 2.938 3.075 3.142 3.277 3.406 3.596 3.715 3.833 4.012 4.186 4.352 4.513 4.686 4.907 5.112 5.302 5.527 5.745 5.952 6.205 6.484 6.752 7.041 7.347 7.702 8.074 8.496 8.983 9.427 9.952 10.561 11.238 12.001 12.863 13.752 14.705 15.198 15.279 15.193 15.027 14.819 14.564 14.29 14.041 13.801 13.596 13.395 13.179 12.941 12.696 12.475 12.248 12.058 11.908 11.739 11.543 11.373 11.203 11.02 10.879 10.734 10.569 10.392 10.199 10.062 9.935 9.743 9.599 9.44 9.356 9.174 8.973 8.759 8.645 8.482 8.305 8.181 8.042 7.69 7.49 7.273 7.026 6.726 6.35 5.807 3.597 -3 ,18093 ,KEBNE ,16654243,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:48:52 CET,0.0 0.493 0.71 0.895 1.06 1.21 1.36 1.493 1.725 1.835 1.939 2.045 2.192 2.271 2.431 2.582 2.715 2.777 2.899 3.034 3.222 3.334 3.449 3.617 3.783 3.949 4.106 4.243 4.42 4.606 4.793 5.035 5.276 5.507 5.775 6.062 6.321 6.606 6.914 7.249 7.609 7.997 8.454 8.926 9.465 10.05 10.711 11.448 12.296 13.19 14.142 14.715 14.81 14.763 14.613 14.387 14.196 14.034 13.82 13.561 13.321 13.084 12.843 12.616 12.403 12.218 12.017 11.805 11.621 11.428 11.239 11.083 10.901 10.721 10.584 10.436 10.261 10.069 9.886 9.764 9.636 9.443 9.304 9.142 9.057 8.887 8.708 8.5 8.378 8.205 8.008 7.869 7.715 7.345 7.151 6.948 6.675 6.387 6.061 5.539 3.205 -4 ,8336 ,KEBNE ,16654244,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:48:55 CET,0.0 0.796 1.09 1.284 1.447 1.57 1.675 1.781 2.001 2.102 2.192 2.296 2.437 2.52 2.682 2.822 2.957 3.024 3.153 3.278 3.453 3.564 3.67 3.833 3.996 4.15 4.3 4.453 4.647 4.819 4.983 5.192 5.396 5.589 5.827 6.097 6.347 6.639 6.952 7.265 7.62 8.027 8.488 8.96 9.496 10.096 10.789 11.53 12.359 13.25 14.164 14.635 14.707 14.626 14.461 14.251 14.006 13.741 13.53 13.299 13.049 12.811 12.556 12.328 12.129 11.941 11.745 11.546 11.368 11.187 11.004 10.844 10.673 10.487 10.333 10.174 10.009 9.845 9.68 9.55 9.411 9.203 9.052 8.902 8.823 8.637 8.439 8.229 8.12 7.964 7.789 7.657 7.513 7.207 7.028 6.82 6.583 6.313 5.946 5.413 3.299 -5 ,12120 ,KEBNE ,16654245,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:50:30 CET,0.0 0.552 0.769 0.925 1.061 1.189 1.317 1.444 1.664 1.761 1.86 1.983 2.13 2.214 2.38 2.532 2.673 2.74 2.879 3.012 3.198 3.317 3.435 3.604 3.759 3.914 4.06 4.194 4.37 4.551 4.741 4.983 5.217 5.433 5.672 5.94 6.19 6.464 6.789 7.148 7.503 7.898 8.37 8.831 9.364 9.972 10.662 11.465 12.382 13.317 14.213 14.58 14.638 14.595 14.437 14.194 13.922 13.649 13.417 13.165 12.928 12.708 12.487 12.273 12.055 11.843 11.625 11.425 11.247 11.041 10.813 10.637 10.46 10.277 10.124 9.947 9.772 9.616 9.442 9.306 9.163 8.942 8.793 8.634 8.545 8.359 8.173 7.974 7.865 7.686 7.482 7.339 7.189 6.877 6.712 6.52 6.276 6.006 5.711 5.266 3.527 -6 ,5581 ,KEBNE ,16654246,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:48:55 CET,0.0 0.667 0.912 1.089 1.244 1.381 1.508 1.631 1.858 1.961 2.062 2.187 2.348 2.441 2.598 2.737 2.873 2.939 3.076 3.217 3.406 3.523 3.646 3.825 3.984 4.134 4.297 4.472 4.684 4.876 5.059 5.278 5.495 5.707 5.957 6.231 6.486 6.765 7.09 7.445 7.773 8.144 8.607 9.083 9.635 10.25 10.941 11.712 12.588 13.502 14.463 14.942 15.013 14.916 14.686 14.448 14.219 13.952 13.691 13.458 13.245 13.016 12.803 12.603 12.414 12.235 12.04 11.84 11.65 11.466 11.283 11.111 10.916 10.721 10.579 10.439 10.281 10.106 9.929 9.806 9.663 9.419 9.255 9.086 8.999 8.813 8.616 8.402 8.288 8.126 7.936 7.789 7.636 7.265 7.066 6.888 6.668 6.379 6.006 5.458 3.524 -7 ,31004 ,KEBNE ,16654247,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:49:01 CET,0.0 0.714 0.99 1.176 1.35 1.519 1.647 1.755 1.982 2.097 2.195 2.301 2.454 2.547 2.733 2.91 3.078 3.15 3.286 3.425 3.614 3.738 3.859 4.031 4.201 4.372 4.532 4.678 4.871 5.062 5.255 5.481 5.698 5.91 6.158 6.441 6.71 6.995 7.303 7.648 8.025 8.437 8.892 9.36 9.921 10.554 11.268 12.033 12.858 13.742 14.764 15.318 15.391 15.277 15.109 14.839 14.513 14.259 14.04 13.776 13.526 13.289 13.039 12.802 12.581 12.393 12.187 11.978 11.788 11.588 11.394 11.22 11.031 10.836 10.686 10.529 10.359 10.191 10.009 9.883 9.753 9.545 9.401 9.251 9.167 8.986 8.816 8.637 8.53 8.357 8.156 8.023 7.883 7.567 7.396 7.193 6.944 6.671 6.347 5.829 4.051 -8 ,26531 ,KEBNE ,16654248,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:48:57 CET,0.0 0.658 0.916 1.148 1.345 1.518 1.684 1.843 2.101 2.214 2.327 2.487 2.657 2.768 2.969 3.139 3.31 3.39 3.54 3.685 3.892 4.028 4.159 4.352 4.545 4.737 4.916 5.085 5.305 5.506 5.693 5.93 6.157 6.375 6.638 6.925 7.2 7.496 7.806 8.154 8.512 8.916 9.38 9.837 10.377 10.952 11.593 12.317 13.15 14.059 15.025 15.546 15.565 15.443 15.266 15.042 14.798 14.552 14.336 14.102 13.874 13.634 13.384 13.165 12.96 12.755 12.551 12.369 12.198 12.005 11.797 11.632 11.471 11.309 11.171 11.021 10.862 10.691 10.5 10.365 10.221 10.004 9.864 9.702 9.61 9.419 9.233 9.043 8.941 8.775 8.566 8.42 8.268 7.955 7.759 7.517 7.281 7.035 6.743 6.244 4.079 -9 ,3802 ,KEBNE ,16654249,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:50:12 CET,0.0 0.666 0.974 1.176 1.347 1.499 1.629 1.751 1.964 2.057 2.157 2.271 2.424 2.507 2.658 2.811 2.957 3.025 3.152 3.283 3.484 3.609 3.727 3.894 4.064 4.228 4.388 4.55 4.747 4.926 5.108 5.33 5.541 5.748 5.981 6.247 6.509 6.79 7.089 7.418 7.768 8.158 8.624 9.123 9.718 10.368 11.078 11.834 12.638 13.497 14.454 14.959 14.983 14.879 14.73 14.509 14.279 14.065 13.837 13.578 13.352 13.134 12.932 12.737 12.513 12.306 12.098 11.907 11.747 11.581 11.4 11.247 11.089 10.914 10.765 10.603 10.439 10.269 10.079 9.951 9.821 9.611 9.448 9.269 9.176 8.999 8.808 8.591 8.489 8.329 8.118 7.972 7.806 7.445 7.25 7.029 6.769 6.453 6.073 5.546 2.652 -10 ,20071 ,KEBNE ,16654250,Mon Nov 22 06:24:05 CET,Mon Nov 22 07:48:51 CET,0.0 0.45 0.656 0.829 0.991 1.132 1.27 1.392 1.595 1.697 1.792 1.908 2.055 2.128 2.272 2.427 2.567 2.633 2.768 2.894 3.065 3.178 3.288 3.46 3.636 3.798 3.963 4.124 4.33 4.548 4.768 5.012 5.239 5.461 5.715 6.0 6.266 6.553 6.863 7.216 7.615 8.035 8.512 8.99 9.557 10.182 10.862 11.634 12.531 13.554 14.531 14.969 15.052 14.952 14.798 14.6 14.369 14.136 13.925 13.708 13.482 13.264 13.058 12.819 12.59 12.413 12.213 12.021 11.856 11.667 11.465 11.305 11.127 10.932 10.777 10.618 10.455 10.273 10.073 9.925 9.772 9.54 9.376 9.218 9.143 8.974 8.785 8.591 8.486 8.316 8.103 7.976 7.839 7.526 7.356 7.157 6.928 6.652 6.286 5.735 2.326 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_39_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_39_19.txt deleted file mode 100644 index 53b02884..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_39_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21951 ,KEBNE ,17023525,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:43:40 CET,0.0 0.347 0.454 0.559 0.649 0.714 0.762 0.804 0.902 0.953 1.004 1.03 1.142 1.186 1.27 1.35 1.425 1.459 1.523 1.586 1.674 1.726 1.78 1.863 1.942 2.015 2.077 2.142 2.224 2.29 2.356 2.443 2.524 2.602 2.687 2.775 2.871 2.98 3.084 3.194 3.316 3.459 3.605 3.683 3.739 3.791 3.819 3.763 3.615 3.302 2.571 1.508 0.506 -0.429 -1.304 -2.111 -2.832 -3.489 -4.047 -4.611 -5.078 -5.5 -5.919 -6.296 -6.651 -6.974 -7.308 -7.625 -7.913 -8.21 -8.517 -8.773 -9.047 -9.34 -9.592 -9.863 -10.144 -10.448 -10.747 -10.944 -11.139 -11.43 -11.634 -11.834 -11.943 -12.188 -12.435 -12.707 -12.853 -13.092 -13.373 -13.55 -13.737 -14.159 -14.414 -14.694 -15.005 -15.372 -15.824 -16.468 -21.409 -2 ,20274 ,KEBNE ,17023526,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:43:44 CET,0.0 0.24 0.356 0.431 0.489 0.554 0.614 0.668 0.775 0.821 0.862 0.888 0.993 1.032 1.104 1.171 1.233 1.264 1.335 1.405 1.493 1.549 1.599 1.67 1.746 1.817 1.886 1.953 2.029 2.107 2.192 2.293 2.392 2.476 2.562 2.664 2.756 2.848 2.943 3.026 3.102 3.194 3.298 3.375 3.45 3.513 3.543 3.514 3.36 3.057 2.293 1.164 0.181 -0.662 -1.423 -2.142 -2.802 -3.416 -3.926 -4.419 -4.858 -5.255 -5.642 -6.0 -6.335 -6.657 -6.987 -7.272 -7.542 -7.839 -8.134 -8.367 -8.609 -8.875 -9.081 -9.312 -9.565 -9.821 -10.083 -10.259 -10.445 -10.769 -10.991 -11.209 -11.321 -11.529 -11.759 -12.021 -12.167 -12.412 -12.708 -12.904 -13.101 -13.53 -13.777 -14.05 -14.368 -14.727 -15.155 -15.768 -18.522 -3 ,17569 ,KEBNE ,17023527,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:43:21 CET,0.0 0.23 0.331 0.418 0.498 0.567 0.624 0.681 0.797 0.848 0.892 0.929 1.036 1.07 1.144 1.22 1.284 1.316 1.382 1.445 1.533 1.583 1.635 1.72 1.797 1.873 1.944 2.007 2.089 2.165 2.235 2.322 2.399 2.469 2.551 2.643 2.731 2.834 2.948 3.044 3.132 3.218 3.305 3.393 3.485 3.571 3.632 3.619 3.481 3.188 2.507 1.403 0.339 -0.59 -1.412 -2.153 -2.823 -3.46 -4.0 -4.537 -5.032 -5.507 -5.942 -6.339 -6.729 -7.093 -7.473 -7.825 -8.129 -8.441 -8.755 -8.997 -9.247 -9.519 -9.745 -9.986 -10.229 -10.467 -10.703 -10.878 -11.071 -11.387 -11.603 -11.817 -11.927 -12.187 -12.48 -12.761 -12.9 -13.123 -13.393 -13.576 -13.752 -14.205 -14.473 -14.726 -15.026 -15.41 -15.914 -16.598 -19.83 -4 ,15198 ,KEBNE ,17023528,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:43:51 CET,0.0 0.213 0.322 0.408 0.482 0.553 0.616 0.679 0.795 0.849 0.895 0.92 1.028 1.067 1.141 1.21 1.276 1.313 1.385 1.448 1.535 1.592 1.646 1.715 1.782 1.85 1.912 1.966 2.038 2.109 2.175 2.263 2.353 2.434 2.525 2.623 2.707 2.785 2.868 2.958 3.041 3.142 3.265 3.371 3.441 3.484 3.514 3.498 3.375 3.033 2.254 1.228 0.274 -0.607 -1.345 -2.066 -2.763 -3.386 -3.951 -4.537 -5.037 -5.477 -5.887 -6.293 -6.675 -7.014 -7.385 -7.736 -8.036 -8.35 -8.673 -8.936 -9.198 -9.461 -9.663 -9.879 -10.107 -10.345 -10.595 -10.777 -10.97 -11.264 -11.463 -11.673 -11.783 -12.02 -12.266 -12.544 -12.701 -12.939 -13.198 -13.368 -13.557 -14.0 -14.248 -14.524 -14.832 -15.181 -15.637 -16.291 -21.899 -5 ,4409 ,KEBNE ,17023529,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:43:45 CET,0.0 0.291 0.373 0.455 0.534 0.597 0.667 0.734 0.842 0.893 0.939 0.968 1.074 1.115 1.198 1.269 1.334 1.37 1.444 1.509 1.597 1.659 1.72 1.8 1.873 1.944 2.016 2.084 2.173 2.273 2.363 2.463 2.561 2.647 2.743 2.859 2.978 3.102 3.225 3.346 3.455 3.579 3.713 3.804 3.898 3.973 4.01 4.005 3.922 3.659 2.911 1.644 0.503 -0.526 -1.46 -2.316 -3.041 -3.642 -4.16 -4.683 -5.143 -5.554 -5.953 -6.332 -6.67 -6.993 -7.321 -7.589 -7.827 -8.096 -8.388 -8.635 -8.904 -9.161 -9.339 -9.549 -9.793 -10.048 -10.303 -10.475 -10.662 -10.972 -11.191 -11.417 -11.532 -11.765 -12.012 -12.271 -12.409 -12.637 -12.898 -13.085 -13.296 -13.738 -13.987 -14.259 -14.544 -14.884 -15.333 -15.974 -20.228 -6 ,28175 ,KEBNE ,17023530,Wed Dec 22 08:14:55 CET,Wed Dec 22 09:43:36 CET,0.0 0.294 0.416 0.514 0.578 0.641 0.704 0.753 0.854 0.902 0.95 0.986 1.095 1.139 1.227 1.308 1.377 1.411 1.481 1.546 1.624 1.671 1.726 1.817 1.903 1.98 2.048 2.111 2.186 2.251 2.327 2.418 2.499 2.572 2.648 2.739 2.837 2.944 3.031 3.118 3.211 3.311 3.427 3.526 3.61 3.679 3.735 3.702 3.526 3.188 2.507 1.423 0.408 -0.462 -1.208 -1.871 -2.45 -3.0 -3.499 -4.003 -4.442 -4.874 -5.296 -5.695 -6.08 -6.406 -6.734 -7.055 -7.35 -7.643 -7.961 -8.239 -8.513 -8.787 -9.0 -9.217 -9.434 -9.679 -9.94 -10.099 -10.274 -10.569 -10.767 -10.967 -11.068 -11.289 -11.548 -11.832 -11.978 -12.19 -12.415 -12.587 -12.781 -13.261 -13.534 -13.808 -14.108 -14.463 -14.893 -15.462 -18.754 -7 ,10774 ,KEBNE ,17023531,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:43:37 CET,0.0 0.17 0.27 0.364 0.456 0.534 0.612 0.682 0.779 0.827 0.877 0.895 0.997 1.037 1.121 1.196 1.268 1.303 1.368 1.43 1.535 1.607 1.679 1.774 1.846 1.92 1.995 2.058 2.13 2.2 2.268 2.351 2.436 2.519 2.605 2.691 2.78 2.881 2.979 3.073 3.175 3.274 3.362 3.46 3.544 3.572 3.568 3.512 3.352 3.019 2.216 1.063 0.054 -0.842 -1.64 -2.395 -3.091 -3.734 -4.295 -4.873 -5.375 -5.807 -6.189 -6.561 -6.925 -7.236 -7.567 -7.869 -8.129 -8.408 -8.698 -8.935 -9.185 -9.462 -9.681 -9.922 -10.167 -10.42 -10.666 -10.828 -11.008 -11.296 -11.504 -11.714 -11.823 -12.062 -12.326 -12.618 -12.769 -12.989 -13.246 -13.421 -13.59 -14.024 -14.287 -14.576 -14.903 -15.302 -15.819 -16.469 -21.131 -8 ,7440 ,KEBNE ,17023532,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:44:00 CET,0.0 0.167 0.261 0.337 0.409 0.484 0.56 0.623 0.725 0.78 0.832 0.853 0.962 1.008 1.085 1.152 1.234 1.271 1.321 1.378 1.472 1.53 1.58 1.651 1.728 1.807 1.865 1.921 2.005 2.079 2.147 2.233 2.315 2.384 2.47 2.577 2.688 2.823 2.946 3.049 3.155 3.295 3.45 3.555 3.642 3.72 3.794 3.773 3.63 3.337 2.614 1.598 0.575 -0.414 -1.251 -2.002 -2.659 -3.246 -3.759 -4.274 -4.721 -5.114 -5.487 -5.832 -6.157 -6.465 -6.807 -7.137 -7.417 -7.698 -8.004 -8.25 -8.513 -8.832 -9.071 -9.298 -9.523 -9.751 -10.0 -10.181 -10.369 -10.671 -10.893 -11.115 -11.231 -11.47 -11.701 -11.96 -12.1 -12.315 -12.577 -12.764 -12.952 -13.327 -13.538 -13.777 -14.059 -14.394 -14.788 -15.353 -18.006 -9 ,16325 ,KEBNE ,17023533,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:43:32 CET,0.0 0.243 0.352 0.417 0.488 0.559 0.618 0.665 0.757 0.801 0.849 0.878 0.978 1.019 1.099 1.174 1.24 1.274 1.34 1.398 1.477 1.53 1.581 1.655 1.724 1.792 1.861 1.923 1.997 2.072 2.156 2.262 2.351 2.423 2.513 2.615 2.706 2.812 2.92 3.033 3.148 3.276 3.423 3.561 3.7 3.774 3.816 3.827 3.702 3.373 2.578 1.398 0.367 -0.582 -1.467 -2.249 -2.895 -3.5 -4.029 -4.567 -5.051 -5.479 -5.868 -6.23 -6.589 -6.932 -7.275 -7.566 -7.833 -8.122 -8.425 -8.68 -8.944 -9.213 -9.431 -9.674 -9.925 -10.165 -10.398 -10.559 -10.725 -10.992 -11.19 -11.405 -11.509 -11.726 -11.983 -12.267 -12.412 -12.639 -12.882 -13.057 -13.261 -13.705 -13.933 -14.194 -14.528 -14.915 -15.353 -16.009 -19.298 -10 ,420 ,KEBNE ,17023534,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 09:43:31 CET,0.0 0.14 0.242 0.34 0.408 0.471 0.531 0.592 0.711 0.758 0.805 0.839 0.949 0.996 1.079 1.157 1.234 1.276 1.361 1.444 1.569 1.644 1.716 1.833 1.943 2.031 2.11 2.199 2.315 2.418 2.508 2.609 2.713 2.806 2.907 3.026 3.139 3.27 3.404 3.514 3.618 3.751 3.901 4.01 4.109 4.195 4.217 4.17 4.032 3.711 2.902 1.692 0.572 -0.372 -1.193 -1.976 -2.635 -3.251 -3.804 -4.336 -4.77 -5.158 -5.541 -5.91 -6.259 -6.585 -6.928 -7.227 -7.493 -7.775 -8.048 -8.269 -8.517 -8.78 -8.975 -9.182 -9.415 -9.656 -9.919 -10.101 -10.266 -10.524 -10.717 -10.914 -11.024 -11.274 -11.531 -11.798 -11.94 -12.158 -12.403 -12.588 -12.772 -13.22 -13.483 -13.736 -14.048 -14.446 -14.926 -15.539 -19.306 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_39_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_39_28.txt deleted file mode 100644 index b7e64cf5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_39_28.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16444 ,KEBNE ,16654251,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:49:11 CET,0.0 0.961 1.281 1.544 1.761 1.95 2.133 2.316 2.637 2.774 2.902 3.059 3.216 3.303 3.482 3.678 3.897 4.006 4.225 4.438 4.704 4.855 5.003 5.221 5.438 5.645 5.841 6.043 6.302 6.546 6.784 7.064 7.343 7.615 7.929 8.28 8.607 8.978 9.373 9.791 10.239 10.763 11.384 11.985 12.698 13.472 14.313 15.267 16.402 17.609 18.881 19.701 19.971 19.982 19.813 19.615 19.364 19.084 18.81 18.525 18.29 18.063 17.835 17.573 17.295 17.056 16.838 16.648 16.466 16.249 16.009 15.817 15.613 15.385 15.21 15.039 14.871 14.702 14.509 14.366 14.215 13.957 13.779 13.594 13.492 13.291 13.076 12.837 12.711 12.53 12.296 12.141 11.987 11.634 11.424 11.208 10.986 10.71 10.356 9.832 7.606 -2 ,1784 ,KEBNE ,16654252,Mon Nov 22 06:24:06 CET,Mon Nov 22 07:47:16 CET,0.0 0.542 0.779 0.951 1.124 1.281 1.412 1.539 1.773 1.879 1.985 2.132 2.291 2.376 2.555 2.728 2.885 2.959 3.098 3.247 3.477 3.616 3.747 3.939 4.129 4.32 4.508 4.691 4.924 5.141 5.346 5.613 5.906 6.202 6.517 6.86 7.198 7.573 7.977 8.403 8.836 9.322 9.917 10.531 11.279 12.114 13.019 14.005 15.153 16.474 17.865 18.67 18.935 18.878 18.688 18.399 18.109 17.867 17.583 17.256 16.981 16.722 16.436 16.146 15.891 15.672 15.429 15.218 15.031 14.812 14.597 14.421 14.234 14.04 13.873 13.678 13.478 13.282 13.074 12.919 12.76 12.505 12.326 12.14 12.045 11.851 11.641 11.404 11.261 11.046 10.769 10.6 10.433 10.1 9.916 9.694 9.45 9.162 8.769 8.172 3.454 -3 ,7325 ,KEBNE ,16654253,Mon Nov 22 06:24:08 CET,Mon Nov 22 07:43:32 CET,0.0 1.674 2.037 2.307 2.522 2.708 2.872 3.011 3.252 3.36 3.465 3.618 3.785 3.895 4.113 4.309 4.48 4.563 4.727 4.899 5.17 5.343 5.494 5.7 5.913 6.128 6.333 6.529 6.787 7.038 7.279 7.561 7.829 8.098 8.431 8.799 9.141 9.53 9.957 10.404 10.861 11.351 11.898 12.48 13.195 13.987 14.894 15.847 16.899 18.08 19.271 19.996 20.254 20.24 20.124 19.956 19.738 19.51 19.275 18.992 18.702 18.428 18.168 17.905 17.634 17.367 17.088 16.832 16.602 16.355 16.098 15.884 15.671 15.456 15.284 15.087 14.878 14.667 14.427 14.252 14.064 13.766 13.557 13.347 13.244 13.016 12.763 12.485 12.341 12.144 11.869 11.681 11.478 11.01 10.762 10.513 10.225 9.883 9.483 8.989 6.295 -4 ,25837 ,KEBNE ,16654254,Mon Nov 22 06:24:12 CET,Mon Nov 22 07:47:44 CET,0.0 0.817 1.09 1.301 1.494 1.647 1.779 1.907 2.153 2.268 2.385 2.555 2.731 2.839 3.055 3.263 3.457 3.556 3.754 3.943 4.208 4.378 4.544 4.774 4.998 5.223 5.438 5.641 5.904 6.174 6.438 6.74 7.023 7.3 7.631 8.005 8.363 8.75 9.169 9.626 10.103 10.651 11.29 11.919 12.642 13.424 14.355 15.462 16.742 18.073 19.416 20.337 20.693 20.775 20.698 20.549 20.376 20.176 19.968 19.676 19.384 19.097 18.819 18.585 18.343 18.093 17.858 17.626 17.41 17.193 16.97 16.782 16.574 16.363 16.185 15.993 15.801 15.599 15.38 15.225 15.061 14.784 14.585 14.39 14.291 14.088 13.858 13.592 13.455 13.262 13.028 12.87 12.699 12.326 12.113 11.855 11.539 11.177 10.748 10.199 6.818 -5 ,19237 ,KEBNE ,16654255,Mon Nov 22 06:24:12 CET,Mon Nov 22 07:48:42 CET,0.0 0.858 1.112 1.315 1.501 1.676 1.861 2.025 2.291 2.408 2.521 2.659 2.813 2.907 3.106 3.297 3.47 3.561 3.736 3.889 4.125 4.28 4.423 4.634 4.846 5.047 5.239 5.425 5.669 5.908 6.128 6.394 6.655 6.909 7.219 7.562 7.892 8.261 8.641 9.052 9.508 10.026 10.611 11.198 11.911 12.686 13.528 14.481 15.596 16.816 18.101 18.864 19.099 19.146 19.03 18.741 18.443 18.125 17.787 17.467 17.206 16.934 16.633 16.347 16.095 15.855 15.594 15.356 15.13 14.904 14.686 14.507 14.332 14.12 13.915 13.706 13.509 13.3 13.083 12.933 12.767 12.509 12.334 12.138 12.028 11.812 11.576 11.322 11.204 11.02 10.762 10.595 10.417 10.021 9.821 9.589 9.314 9.014 8.656 8.159 5.327 -7 ,18091 ,KEBNE ,16654257,Mon Nov 22 06:24:05 CET,Mon Nov 22 07:49:16 CET,0.0 0.776 1.062 1.268 1.432 1.573 1.712 1.85 2.078 2.187 2.302 2.459 2.627 2.728 2.923 3.107 3.28 3.36 3.516 3.667 3.889 4.038 4.181 4.384 4.59 4.798 4.998 5.196 5.453 5.69 5.918 6.198 6.466 6.719 7.016 7.354 7.683 8.049 8.454 8.891 9.368 9.917 10.526 11.143 11.867 12.652 13.584 14.594 15.677 16.925 18.223 19.01 19.366 19.442 19.278 19.006 18.795 18.561 18.258 17.975 17.764 17.537 17.289 17.053 16.809 16.564 16.307 16.075 15.861 15.628 15.387 15.187 14.967 14.736 14.569 14.385 14.171 13.939 13.713 13.551 13.369 13.074 12.867 12.654 12.544 12.321 12.067 11.804 11.658 11.453 11.198 11.031 10.867 10.443 10.188 9.954 9.695 9.394 9.023 8.41 5.527 -8 ,13537 ,KEBNE ,16654258,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:51:13 CET,0.0 0.649 0.931 1.144 1.317 1.479 1.628 1.76 1.998 2.119 2.236 2.389 2.562 2.684 2.929 3.161 3.378 3.48 3.671 3.85 4.101 4.267 4.434 4.68 4.903 5.112 5.32 5.512 5.753 6.011 6.27 6.566 6.854 7.137 7.448 7.794 8.132 8.511 8.927 9.364 9.805 10.302 10.916 11.533 12.247 13.04 13.909 14.867 15.956 17.157 18.529 19.382 19.565 19.523 19.407 19.225 18.972 18.647 18.323 17.987 17.671 17.41 17.169 16.922 16.673 16.423 16.167 15.944 15.735 15.502 15.253 15.04 14.806 14.561 14.389 14.213 14.023 13.835 13.639 13.489 13.328 13.051 12.854 12.659 12.553 12.316 12.097 11.904 11.793 11.614 11.375 11.231 11.088 10.782 10.593 10.378 10.149 9.841 9.454 8.901 4.089 -9 ,10379 ,KEBNE ,16654259,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:49:23 CET,0.0 0.888 1.146 1.386 1.598 1.76 1.915 2.06 2.313 2.43 2.54 2.692 2.862 2.967 3.164 3.346 3.528 3.617 3.789 3.961 4.207 4.356 4.499 4.701 4.899 5.102 5.316 5.539 5.819 6.083 6.333 6.624 6.918 7.201 7.518 7.878 8.234 8.627 9.065 9.52 9.995 10.538 11.159 11.76 12.448 13.247 14.152 15.131 16.259 17.504 18.817 19.598 19.87 19.871 19.68 19.389 19.096 18.805 18.523 18.226 17.931 17.645 17.374 17.123 16.9 16.692 16.473 16.284 16.089 15.861 15.637 15.453 15.256 15.038 14.861 14.683 14.498 14.296 14.078 13.93 13.775 13.531 13.357 13.175 13.085 12.909 12.698 12.463 12.337 12.146 11.927 11.77 11.593 11.229 11.04 10.829 10.606 10.315 9.914 9.431 6.514 -10 ,8495 ,KEBNE ,16654260,Mon Nov 22 06:24:04 CET,Mon Nov 22 07:50:56 CET,0.0 0.654 0.879 1.094 1.308 1.495 1.668 1.839 2.131 2.254 2.37 2.521 2.687 2.785 2.976 3.164 3.352 3.444 3.62 3.791 4.041 4.207 4.366 4.589 4.808 5.027 5.237 5.44 5.715 5.982 6.239 6.54 6.831 7.115 7.43 7.784 8.118 8.481 8.882 9.31 9.768 10.284 10.887 11.496 12.235 13.042 13.897 14.872 16.026 17.292 18.664 19.509 19.772 19.819 19.711 19.516 19.289 19.044 18.787 18.444 18.114 17.826 17.535 17.244 16.975 16.724 16.459 16.224 16.023 15.822 15.618 15.434 15.23 15.01 14.832 14.648 14.467 14.291 14.109 13.968 13.819 13.591 13.422 13.25 13.161 12.96 12.741 12.51 12.386 12.2 11.961 11.807 11.629 11.242 11.048 10.831 10.571 10.295 9.955 9.454 6.683 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_39_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_39_37.txt deleted file mode 100644 index 81a84675..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_39_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28073 ,KEBNE ,17042405,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:08:15 CET,0.0 0.695 0.933 1.116 1.293 1.449 1.588 1.718 1.936 2.028 2.117 2.217 2.359 2.438 2.586 2.728 2.87 2.94 3.069 3.19 3.372 3.492 3.61 3.78 3.929 4.071 4.213 4.359 4.564 4.752 4.928 5.15 5.358 5.551 5.764 6.004 6.251 6.533 6.842 7.182 7.542 7.932 8.383 8.866 9.414 9.98 10.641 11.419 12.312 13.322 14.303 14.86 15.066 15.114 15.075 14.957 14.799 14.633 14.49 14.322 14.154 13.994 13.83 13.662 13.478 13.317 13.169 13.027 12.905 12.784 12.661 12.555 12.441 12.321 12.224 12.132 12.035 11.919 11.782 11.686 11.598 11.46 11.359 11.247 11.187 11.066 10.947 10.819 10.753 10.636 10.529 10.426 10.309 10.065 9.936 9.809 9.667 9.509 9.306 9.024 8.084 -2 ,17094 ,KEBNE ,17042406,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:45 CET,0.0 0.823 1.065 1.254 1.413 1.561 1.698 1.815 2.011 2.104 2.203 2.323 2.469 2.554 2.716 2.865 3.004 3.073 3.202 3.319 3.508 3.638 3.761 3.942 4.115 4.285 4.456 4.628 4.851 5.06 5.257 5.498 5.739 5.962 6.222 6.524 6.812 7.124 7.467 7.835 8.207 8.626 9.111 9.586 10.14 10.735 11.37 12.091 12.946 13.935 15.044 15.76 16.042 16.147 16.169 16.115 16.001 15.847 15.683 15.509 15.343 15.187 15.027 14.868 14.726 14.58 14.428 14.295 14.167 14.032 13.881 13.74 13.592 13.446 13.332 13.202 13.069 12.937 12.797 12.7 12.601 12.453 12.352 12.242 12.185 12.064 11.941 11.813 11.738 11.597 11.476 11.386 11.286 11.077 10.96 10.828 10.682 10.513 10.313 10.047 9.161 -3 ,17757 ,KEBNE ,17042407,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:08:22 CET,0.0 0.701 0.944 1.137 1.291 1.431 1.554 1.659 1.86 1.957 2.047 2.163 2.314 2.4 2.56 2.712 2.85 2.918 3.052 3.179 3.345 3.452 3.565 3.726 3.877 4.027 4.181 4.329 4.511 4.677 4.844 5.054 5.252 5.447 5.681 5.943 6.185 6.469 6.786 7.119 7.459 7.833 8.266 8.707 9.205 9.785 10.481 11.231 12.029 12.877 13.842 14.502 14.764 14.843 14.839 14.785 14.696 14.578 14.449 14.296 14.163 14.046 13.902 13.755 13.627 13.5 13.363 13.237 13.121 12.999 12.86 12.749 12.627 12.481 12.381 12.288 12.183 12.07 11.957 11.874 11.786 11.635 11.519 11.406 11.349 11.225 11.099 10.956 10.878 10.758 10.648 10.562 10.471 10.258 10.134 9.989 9.837 9.683 9.511 9.247 8.12 -4 ,12401 ,KEBNE ,17042408,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:53 CET,0.0 0.839 1.065 1.27 1.438 1.584 1.725 1.864 2.104 2.205 2.297 2.402 2.551 2.638 2.807 2.95 3.08 3.149 3.285 3.414 3.61 3.732 3.847 4.025 4.2 4.37 4.524 4.662 4.854 5.044 5.233 5.465 5.678 5.883 6.14 6.428 6.704 7.02 7.344 7.683 8.053 8.463 8.932 9.409 9.941 10.526 11.195 11.925 12.792 13.762 14.804 15.524 15.827 15.897 15.829 15.736 15.63 15.483 15.338 15.162 14.974 14.809 14.646 14.473 14.311 14.158 13.991 13.851 13.719 13.566 13.405 13.275 13.142 12.998 12.888 12.779 12.676 12.57 12.453 12.367 12.28 12.144 12.032 11.917 11.864 11.756 11.637 11.51 11.439 11.307 11.178 11.089 10.994 10.782 10.67 10.563 10.43 10.26 10.062 9.777 8.827 -5 ,18144 ,KEBNE ,17042409,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:08 CET,0.0 0.648 0.906 1.118 1.298 1.452 1.582 1.7 1.922 2.024 2.116 2.214 2.356 2.435 2.582 2.723 2.868 2.941 3.08 3.205 3.38 3.496 3.61 3.774 3.936 4.083 4.224 4.359 4.54 4.71 4.874 5.093 5.305 5.506 5.745 6.007 6.248 6.513 6.796 7.11 7.464 7.864 8.335 8.79 9.278 9.806 10.432 11.166 11.983 12.867 13.89 14.61 14.91 15.059 15.073 14.997 14.898 14.776 14.655 14.509 14.375 14.255 14.129 14.002 13.87 13.746 13.613 13.484 13.373 13.264 13.145 13.047 12.94 12.814 12.714 12.608 12.499 12.387 12.262 12.171 12.072 11.922 11.815 11.699 11.644 11.53 11.411 11.282 11.209 11.09 10.984 10.895 10.802 10.599 10.488 10.358 10.195 10.008 9.8 9.542 8.314 -6 ,24797 ,KEBNE ,17042410,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:29 CET,0.0 0.747 1.064 1.347 1.6 1.804 1.965 2.113 2.388 2.517 2.642 2.784 2.95 3.058 3.25 3.434 3.606 3.685 3.832 3.982 4.208 4.353 4.486 4.675 4.863 5.051 5.23 5.392 5.601 5.811 6.01 6.244 6.483 6.726 7.005 7.305 7.578 7.88 8.225 8.591 8.967 9.392 9.891 10.377 10.918 11.514 12.188 12.939 13.808 14.833 15.969 16.663 16.887 16.97 16.971 16.876 16.755 16.627 16.461 16.266 16.098 15.939 15.777 15.61 15.448 15.295 15.144 15.011 14.892 14.766 14.632 14.517 14.395 14.273 14.177 14.071 13.954 13.835 13.709 13.618 13.527 13.377 13.265 13.155 13.1 12.976 12.846 12.705 12.632 12.509 12.4 12.313 12.222 12.01 11.885 11.749 11.599 11.427 11.224 10.925 9.754 -7 ,8934 ,KEBNE ,17042411,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:20 CET,0.0 1.005 1.295 1.492 1.658 1.788 1.91 2.03 2.248 2.345 2.44 2.568 2.727 2.81 2.965 3.116 3.257 3.324 3.456 3.582 3.771 3.892 4.007 4.184 4.351 4.499 4.645 4.788 4.985 5.175 5.353 5.572 5.783 5.994 6.235 6.495 6.748 7.036 7.349 7.679 8.025 8.392 8.815 9.253 9.755 10.317 10.965 11.709 12.535 13.442 14.566 15.366 15.691 15.844 15.851 15.755 15.633 15.48 15.325 15.153 14.989 14.834 14.686 14.528 14.37 14.232 14.083 13.948 13.826 13.684 13.518 13.389 13.268 13.135 13.021 12.894 12.772 12.658 12.521 12.425 12.331 12.186 12.08 11.96 11.9 11.774 11.638 11.494 11.421 11.292 11.167 11.069 10.976 10.764 10.644 10.529 10.393 10.204 9.98 9.713 8.809 -8 ,2264 ,KEBNE ,17042412,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:06:30 CET,0.0 0.821 1.08 1.272 1.44 1.588 1.731 1.867 2.106 2.213 2.32 2.475 2.637 2.735 2.926 3.102 3.264 3.347 3.512 3.663 3.886 4.021 4.137 4.324 4.509 4.685 4.854 5.013 5.227 5.439 5.636 5.868 6.099 6.316 6.561 6.853 7.138 7.439 7.751 8.088 8.443 8.836 9.307 9.776 10.324 10.956 11.656 12.42 13.263 14.184 15.206 15.962 16.356 16.526 16.576 16.568 16.507 16.429 16.351 16.242 16.127 16.02 15.914 15.798 15.681 15.575 15.46 15.341 15.227 15.113 14.995 14.895 14.795 14.684 14.582 14.467 14.353 14.24 14.131 14.055 13.965 13.821 13.709 13.595 13.543 13.429 13.306 13.179 13.111 12.99 12.879 12.793 12.708 12.507 12.395 12.265 12.108 11.926 11.715 11.441 10.51 -9 ,12154 ,KEBNE ,17042413,Thu Dec 23 04:36:22 CET,Thu Dec 23 06:06:09 CET,0.0 0.744 1.086 1.328 1.51 1.687 1.848 2.009 2.31 2.433 2.556 2.735 2.911 3.024 3.215 3.394 3.562 3.64 3.795 3.942 4.157 4.305 4.448 4.657 4.849 5.03 5.209 5.385 5.611 5.818 6.026 6.279 6.514 6.742 6.998 7.3 7.593 7.898 8.232 8.585 8.953 9.365 9.838 10.323 10.876 11.504 12.239 13.047 14.0 15.038 16.061 16.761 17.08 17.209 17.231 17.164 17.041 16.889 16.732 16.56 16.411 16.257 16.104 15.948 15.784 15.629 15.463 15.3 15.15 15.014 14.883 14.759 14.612 14.457 14.346 14.228 14.106 13.972 13.828 13.731 13.623 13.445 13.319 13.189 13.118 12.97 12.832 12.689 12.607 12.468 12.299 12.187 12.067 11.805 11.645 11.463 11.277 11.046 10.781 10.419 9.434 -10 ,13132 ,KEBNE ,17042414,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:39 CET,0.0 1.332 1.625 1.809 1.962 2.109 2.25 2.379 2.628 2.743 2.856 3.006 3.168 3.26 3.443 3.604 3.752 3.821 3.95 4.08 4.263 4.38 4.496 4.664 4.821 4.976 5.118 5.258 5.456 5.64 5.812 6.015 6.213 6.403 6.632 6.891 7.141 7.416 7.722 8.064 8.424 8.827 9.284 9.727 10.206 10.743 11.392 12.117 12.931 13.834 14.793 15.465 15.76 15.87 15.906 15.876 15.812 15.714 15.614 15.506 15.383 15.254 15.12 14.987 14.866 14.754 14.62 14.488 14.371 14.242 14.107 13.991 13.869 13.754 13.663 13.57 13.474 13.368 13.251 13.165 13.078 12.945 12.844 12.731 12.668 12.54 12.403 12.262 12.189 12.067 11.964 11.88 11.784 11.568 11.456 11.341 11.198 11.029 10.826 10.522 9.632 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_40_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_40_37.txt deleted file mode 100644 index fe47cec3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_40_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17869 ,KEBNE ,17042415,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:54 CET,0.0 0.71 0.994 1.195 1.378 1.541 1.682 1.813 2.058 2.172 2.278 2.407 2.547 2.625 2.778 2.92 3.047 3.112 3.233 3.333 3.493 3.605 3.705 3.851 3.994 4.13 4.27 4.405 4.576 4.74 4.897 5.085 5.274 5.467 5.706 5.97 6.204 6.459 6.712 7.0 7.331 7.682 8.082 8.472 8.894 9.332 9.867 10.391 10.848 11.326 11.678 11.655 11.382 10.982 10.522 10.118 9.766 9.39 9.059 8.737 8.44 8.174 7.921 7.68 7.475 7.282 7.07 6.88 6.724 6.567 6.388 6.231 6.074 5.902 5.766 5.62 5.463 5.316 5.171 5.062 4.942 4.763 4.646 4.523 4.458 4.316 4.166 4.003 3.916 3.778 3.663 3.578 3.484 3.252 3.121 2.987 2.839 2.653 2.414 2.126 1.288 -2 ,11337 ,KEBNE ,17042416,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:08:04 CET,0.0 0.72 0.98 1.179 1.333 1.464 1.584 1.706 1.913 2.007 2.105 2.225 2.361 2.433 2.572 2.718 2.856 2.918 3.032 3.149 3.328 3.44 3.554 3.729 3.904 4.067 4.21 4.349 4.535 4.723 4.909 5.12 5.309 5.489 5.693 5.926 6.146 6.368 6.62 6.889 7.165 7.477 7.829 8.183 8.594 9.007 9.409 9.84 10.344 10.745 10.881 10.663 10.356 9.978 9.562 9.163 8.817 8.478 8.16 7.836 7.548 7.279 7.02 6.771 6.519 6.296 6.066 5.866 5.702 5.533 5.363 5.223 5.067 4.892 4.755 4.612 4.47 4.326 4.178 4.078 3.975 3.805 3.68 3.548 3.483 3.343 3.184 3.028 2.95 2.815 2.678 2.579 2.475 2.244 2.115 1.983 1.84 1.668 1.457 1.162 0.258 -3 ,32361 ,KEBNE ,17042417,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:06:45 CET,0.0 0.791 1.081 1.279 1.466 1.632 1.761 1.892 2.136 2.247 2.356 2.495 2.649 2.736 2.899 3.073 3.249 3.332 3.494 3.65 3.862 3.993 4.113 4.291 4.458 4.607 4.749 4.889 5.09 5.291 5.486 5.706 5.911 6.104 6.314 6.552 6.789 7.049 7.305 7.59 7.899 8.202 8.524 8.83 9.165 9.528 9.952 10.39 10.834 11.309 11.579 11.399 11.087 10.77 10.412 10.024 9.646 9.284 8.967 8.621 8.315 8.053 7.809 7.579 7.352 7.135 6.894 6.675 6.501 6.32 6.124 5.951 5.773 5.591 5.435 5.278 5.136 4.983 4.821 4.717 4.611 4.446 4.329 4.208 4.148 4.018 3.874 3.719 3.632 3.49 3.356 3.259 3.159 2.925 2.794 2.66 2.51 2.329 2.095 1.758 0.807 -4 ,23111 ,KEBNE ,17042418,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:52 CET,0.0 0.739 1.034 1.252 1.425 1.577 1.722 1.855 2.091 2.196 2.299 2.439 2.596 2.683 2.842 3.003 3.152 3.222 3.345 3.468 3.651 3.757 3.867 4.029 4.181 4.323 4.454 4.581 4.756 4.928 5.095 5.292 5.479 5.665 5.868 6.085 6.306 6.559 6.816 7.081 7.358 7.684 8.055 8.378 8.746 9.156 9.618 10.099 10.612 11.173 11.626 11.722 11.463 11.096 10.747 10.382 10.014 9.658 9.367 9.07 8.802 8.559 8.319 8.094 7.897 7.713 7.495 7.294 7.13 6.958 6.78 6.634 6.483 6.323 6.194 6.058 5.916 5.771 5.623 5.515 5.403 5.222 5.096 4.966 4.897 4.753 4.603 4.443 4.356 4.221 4.078 3.975 3.871 3.645 3.525 3.387 3.235 3.057 2.815 2.536 1.498 -5 ,1763 ,KEBNE ,17042419,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:06:22 CET,0.0 0.78 1.087 1.306 1.478 1.629 1.766 1.9 2.147 2.245 2.338 2.453 2.593 2.67 2.823 2.972 3.113 3.18 3.319 3.456 3.647 3.764 3.873 4.036 4.194 4.354 4.508 4.645 4.815 4.988 5.168 5.375 5.563 5.757 5.986 6.241 6.49 6.758 7.039 7.315 7.591 7.915 8.304 8.666 9.06 9.467 9.891 10.339 10.809 11.22 11.434 11.273 10.913 10.503 10.088 9.687 9.336 8.991 8.674 8.344 8.063 7.805 7.549 7.302 7.075 6.877 6.645 6.418 6.24 6.069 5.878 5.706 5.529 5.347 5.199 5.03 4.859 4.702 4.545 4.433 4.308 4.104 3.956 3.802 3.723 3.557 3.386 3.202 3.101 2.944 2.739 2.61 2.479 2.176 2.023 1.871 1.699 1.512 1.298 1.028 0.17 -6 ,20699 ,KEBNE ,17042420,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:08:20 CET,0.0 0.753 1.024 1.258 1.455 1.604 1.732 1.864 2.11 2.216 2.323 2.465 2.617 2.706 2.878 3.046 3.193 3.258 3.386 3.513 3.699 3.821 3.94 4.111 4.265 4.411 4.55 4.687 4.873 5.039 5.195 5.393 5.578 5.752 5.947 6.165 6.382 6.605 6.863 7.144 7.408 7.715 8.106 8.493 8.884 9.279 9.725 10.196 10.658 11.081 11.372 11.24 10.888 10.506 10.153 9.786 9.459 9.15 8.846 8.51 8.202 7.921 7.65 7.396 7.154 6.936 6.72 6.522 6.351 6.169 5.949 5.76 5.581 5.402 5.262 5.121 4.984 4.851 4.714 4.609 4.498 4.335 4.224 4.103 4.041 3.912 3.771 3.621 3.539 3.402 3.262 3.162 3.059 2.829 2.701 2.566 2.414 2.228 2.004 1.697 0.738 -7 ,20360 ,KEBNE ,17042421,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:06:28 CET,0.0 0.868 1.23 1.467 1.664 1.837 1.992 2.128 2.379 2.494 2.595 2.733 2.891 2.983 3.154 3.312 3.458 3.528 3.672 3.802 3.97 4.084 4.202 4.38 4.552 4.717 4.878 5.034 5.231 5.415 5.598 5.832 6.037 6.228 6.475 6.747 6.985 7.24 7.503 7.782 8.076 8.404 8.762 9.114 9.519 9.899 10.345 10.885 11.387 11.767 12.05 11.987 11.661 11.254 10.873 10.52 10.189 9.854 9.53 9.193 8.912 8.662 8.418 8.189 7.988 7.812 7.621 7.453 7.298 7.124 6.942 6.796 6.643 6.475 6.35 6.225 6.085 5.938 5.784 5.682 5.584 5.418 5.302 5.185 5.122 4.986 4.84 4.687 4.607 4.464 4.317 4.215 4.109 3.864 3.724 3.566 3.388 3.19 2.958 2.67 1.759 -8 ,13088 ,KEBNE ,17042422,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:57 CET,0.0 0.765 1.038 1.272 1.479 1.639 1.769 1.898 2.136 2.243 2.342 2.491 2.652 2.754 2.939 3.116 3.284 3.361 3.495 3.621 3.821 3.952 4.071 4.245 4.405 4.556 4.707 4.84 5.012 5.192 5.363 5.561 5.748 5.93 6.144 6.379 6.591 6.813 7.064 7.325 7.588 7.889 8.229 8.569 8.975 9.382 9.786 10.217 10.672 11.066 11.294 11.086 10.673 10.247 9.826 9.45 9.101 8.736 8.415 8.082 7.789 7.514 7.242 6.995 6.771 6.571 6.359 6.153 5.971 5.786 5.582 5.409 5.246 5.08 4.945 4.8 4.638 4.463 4.283 4.158 4.032 3.838 3.696 3.554 3.479 3.316 3.136 2.945 2.85 2.704 2.528 2.404 2.276 2.014 1.877 1.718 1.526 1.319 1.096 0.809 -0.193 -9 ,21749 ,KEBNE ,17042423,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:08:16 CET,0.0 0.857 1.153 1.361 1.522 1.671 1.816 1.956 2.212 2.327 2.442 2.614 2.769 2.865 3.044 3.212 3.376 3.45 3.603 3.765 3.986 4.118 4.253 4.44 4.603 4.765 4.925 5.085 5.293 5.494 5.681 5.891 6.09 6.271 6.474 6.724 6.982 7.253 7.533 7.832 8.139 8.468 8.851 9.248 9.691 10.151 10.623 11.135 11.679 12.211 12.498 12.273 11.932 11.556 11.173 10.79 10.427 10.086 9.787 9.461 9.167 8.891 8.626 8.388 8.155 7.939 7.702 7.479 7.292 7.1 6.913 6.767 6.617 6.462 6.34 6.21 6.067 5.926 5.781 5.684 5.577 5.396 5.27 5.139 5.074 4.941 4.792 4.627 4.541 4.406 4.278 4.18 4.076 3.85 3.712 3.563 3.402 3.204 2.977 2.702 1.722 -10 ,31821 ,KEBNE ,17042424,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:07:57 CET,0.0 0.797 1.083 1.338 1.547 1.705 1.836 1.956 2.189 2.286 2.371 2.474 2.616 2.701 2.871 3.031 3.176 3.243 3.37 3.499 3.686 3.795 3.901 4.055 4.198 4.343 4.496 4.643 4.826 4.999 5.16 5.347 5.533 5.728 5.942 6.177 6.395 6.629 6.898 7.193 7.506 7.846 8.225 8.597 9.032 9.518 10.042 10.561 11.054 11.559 11.976 11.905 11.614 11.227 10.806 10.404 10.048 9.706 9.4 9.085 8.795 8.553 8.324 8.095 7.881 7.687 7.481 7.287 7.12 6.954 6.782 6.629 6.472 6.306 6.17 6.034 5.893 5.747 5.585 5.475 5.362 5.18 5.057 4.927 4.863 4.724 4.572 4.418 4.338 4.2 4.061 3.961 3.849 3.61 3.483 3.347 3.203 3.033 2.824 2.552 1.6 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_41_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_41_37.txt deleted file mode 100644 index 7004d8b4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_41_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14486 ,TETRA ,17606717,Sun Nov 28 20:52:33 CET,Sun Nov 28 22:46:26 CET,0.0 1.142 1.505 1.768 1.987 2.179 2.343 2.478 2.727 2.846 2.962 3.096 3.292 3.394 3.572 3.746 3.923 4.003 4.146 4.27 4.433 4.546 4.657 4.807 4.943 5.082 5.23 5.364 5.509 5.647 5.791 5.967 6.132 6.289 6.47 6.667 6.841 7.023 7.215 7.424 7.633 7.848 8.09 8.325 8.58 8.833 9.09 9.323 9.52 9.645 9.531 9.134 8.674 8.168 7.669 7.185 6.74 6.34 5.998 5.633 5.292 4.994 4.726 4.463 4.213 3.979 3.722 3.495 3.292 3.078 2.845 2.652 2.461 2.259 2.101 1.931 1.746 1.552 1.355 1.229 1.104 0.897 0.755 0.613 0.536 0.374 0.194 -0.006 -0.108 -0.313 -0.445 -0.566 -0.699 -0.987 -1.142 -1.311 -1.499 -1.735 -2.031 -2.431 -4.413 -2 ,16153 ,TETRA ,17606718,Sun Nov 28 20:52:34 CET,Sun Nov 28 22:40:24 CET,0.0 0.607 0.921 1.152 1.332 1.472 1.599 1.715 1.916 2.013 2.102 2.166 2.333 2.415 2.567 2.693 2.812 2.871 2.993 3.122 3.321 3.445 3.556 3.716 3.864 4.001 4.139 4.264 4.411 4.56 4.717 4.892 5.054 5.213 5.386 5.574 5.747 5.935 6.135 6.336 6.538 6.726 6.931 7.138 7.37 7.597 7.801 7.993 8.174 8.319 8.218 7.78 7.264 6.745 6.25 5.745 5.286 4.89 4.556 4.194 3.868 3.583 3.287 3.008 2.747 2.487 2.225 1.991 1.789 1.59 1.388 1.216 1.029 0.838 0.69 0.526 0.356 0.188 0.017 -0.107 -0.243 -0.443 -0.583 -0.748 -0.832 -1.001 -1.188 -1.38 -1.481 -1.68 -1.813 -1.938 -2.075 -2.378 -2.535 -2.709 -2.899 -3.119 -3.404 -3.807 -5.306 -3 ,23802 ,TETRA ,17606719,Sun Nov 28 20:52:34 CET,Sun Nov 28 22:46:22 CET,0.0 0.855 1.167 1.388 1.569 1.727 1.874 2.021 2.279 2.39 2.491 2.603 2.79 2.884 3.068 3.23 3.386 3.464 3.618 3.755 3.935 4.047 4.159 4.315 4.458 4.607 4.75 4.879 5.043 5.209 5.361 5.531 5.692 5.841 6.018 6.22 6.396 6.577 6.778 6.977 7.179 7.403 7.64 7.844 8.07 8.323 8.58 8.819 9.024 9.157 9.035 8.537 7.941 7.364 6.861 6.403 5.95 5.533 5.195 4.84 4.511 4.194 3.892 3.635 3.397 3.156 2.894 2.663 2.45 2.225 1.999 1.815 1.627 1.427 1.278 1.126 0.96 0.783 0.599 0.469 0.331 0.114 -0.035 -0.191 -0.27 -0.428 -0.592 -0.765 -0.862 -1.06 -1.185 -1.302 -1.427 -1.695 -1.844 -2.014 -2.204 -2.417 -2.701 -3.122 -4.991 -4 ,1667 ,TETRA ,17606720,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:46:26 CET,0.0 0.565 0.818 1.013 1.173 1.316 1.449 1.567 1.787 1.894 1.993 2.078 2.255 2.335 2.491 2.647 2.785 2.848 2.966 3.081 3.248 3.352 3.45 3.594 3.728 3.846 3.956 4.063 4.206 4.35 4.482 4.632 4.778 4.918 5.068 5.223 5.376 5.552 5.737 5.924 6.131 6.356 6.591 6.814 7.056 7.296 7.542 7.785 7.969 8.061 7.902 7.441 6.913 6.39 5.93 5.464 5.036 4.642 4.289 3.921 3.592 3.294 3.002 2.713 2.445 2.207 1.942 1.715 1.527 1.325 1.104 0.916 0.724 0.51 0.339 0.176 0.0 -0.192 -0.398 -0.549 -0.705 -0.944 -1.115 -1.297 -1.387 -1.572 -1.78 -2.002 -2.118 -2.331 -2.492 -2.63 -2.782 -3.122 -3.318 -3.53 -3.741 -4.009 -4.346 -4.812 -6.527 -5 ,19617 ,TETRA ,17606721,Sun Nov 28 20:52:34 CET,Sun Nov 28 22:42:40 CET,0.0 0.767 1.034 1.269 1.471 1.649 1.812 1.949 2.189 2.3 2.406 2.527 2.73 2.829 3.007 3.18 3.341 3.426 3.585 3.723 3.915 4.022 4.127 4.297 4.46 4.594 4.722 4.855 5.023 5.185 5.332 5.498 5.654 5.804 5.978 6.168 6.342 6.528 6.726 6.928 7.143 7.376 7.626 7.86 8.103 8.359 8.63 8.868 9.091 9.222 9.121 8.739 8.242 7.72 7.25 6.827 6.409 5.996 5.65 5.316 5.01 4.72 4.453 4.192 3.935 3.705 3.482 3.272 3.078 2.877 2.668 2.489 2.303 2.129 1.989 1.829 1.66 1.49 1.308 1.175 1.043 0.838 0.689 0.532 0.449 0.275 0.092 -0.098 -0.204 -0.414 -0.545 -0.657 -0.779 -1.062 -1.217 -1.381 -1.574 -1.799 -2.059 -2.463 -4.219 -6 ,31564 ,TETRA ,17606722,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:47:35 CET,0.0 0.659 0.914 1.126 1.319 1.489 1.634 1.762 2.018 2.147 2.267 2.376 2.565 2.666 2.839 2.99 3.13 3.201 3.334 3.457 3.632 3.734 3.84 4.001 4.15 4.291 4.426 4.561 4.739 4.908 5.066 5.252 5.423 5.58 5.752 5.938 6.13 6.323 6.517 6.726 6.95 7.201 7.461 7.695 7.935 8.184 8.449 8.711 8.979 9.158 9.046 8.564 8.031 7.517 7.02 6.528 6.088 5.668 5.31 4.97 4.644 4.346 4.07 3.815 3.584 3.374 3.148 2.94 2.758 2.572 2.381 2.215 2.037 1.848 1.698 1.54 1.376 1.215 1.053 0.938 0.803 0.587 0.442 0.29 0.214 0.051 -0.13 -0.332 -0.437 -0.641 -0.775 -0.905 -1.045 -1.341 -1.506 -1.7 -1.925 -2.158 -2.422 -2.835 -5.161 -7 ,14318 ,TETRA ,17606723,Sun Nov 28 20:52:35 CET,Sun Nov 28 22:47:31 CET,0.0 0.593 0.893 1.118 1.311 1.467 1.604 1.733 1.964 2.067 2.159 2.24 2.419 2.497 2.652 2.808 2.962 3.036 3.172 3.302 3.489 3.609 3.731 3.899 4.047 4.191 4.327 4.456 4.62 4.785 4.936 5.103 5.269 5.422 5.592 5.787 5.968 6.162 6.387 6.62 6.832 7.067 7.35 7.611 7.885 8.149 8.433 8.692 8.87 8.965 8.865 8.404 7.821 7.281 6.788 6.293 5.854 5.422 5.035 4.681 4.361 4.074 3.802 3.535 3.273 3.021 2.755 2.503 2.293 2.08 1.835 1.629 1.434 1.241 1.085 0.914 0.737 0.547 0.337 0.194 0.056 -0.172 -0.348 -0.535 -0.627 -0.829 -1.05 -1.273 -1.387 -1.592 -1.718 -1.841 -1.973 -2.236 -2.392 -2.569 -2.756 -2.973 -3.241 -3.628 -5.171 -8 ,22892 ,TETRA ,17606724,Sun Nov 28 20:52:35 CET,Sun Nov 28 22:43:40 CET,0.0 0.527 0.81 1.024 1.198 1.358 1.495 1.61 1.836 1.944 2.038 2.126 2.313 2.404 2.571 2.707 2.827 2.888 3.014 3.134 3.297 3.4 3.5 3.657 3.817 3.971 4.124 4.275 4.457 4.617 4.766 4.941 5.115 5.274 5.436 5.611 5.783 5.963 6.146 6.342 6.549 6.773 7.018 7.247 7.489 7.738 8.016 8.296 8.552 8.713 8.599 8.116 7.625 7.126 6.633 6.154 5.683 5.271 4.929 4.579 4.275 3.986 3.703 3.419 3.139 2.905 2.674 2.469 2.294 2.108 1.904 1.732 1.565 1.386 1.24 1.093 0.932 0.764 0.598 0.476 0.342 0.136 -0.004 -0.154 -0.229 -0.385 -0.545 -0.728 -0.827 -1.027 -1.167 -1.284 -1.404 -1.677 -1.848 -2.033 -2.213 -2.415 -2.685 -3.075 -5.856 -9 ,21913 ,TETRA ,17606725,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:46:26 CET,0.0 0.527 0.78 0.988 1.174 1.32 1.451 1.577 1.8 1.901 1.99 2.066 2.236 2.32 2.492 2.64 2.762 2.823 2.955 3.088 3.273 3.387 3.497 3.657 3.811 3.953 4.083 4.207 4.36 4.511 4.657 4.827 4.975 5.12 5.297 5.493 5.678 5.883 6.106 6.331 6.547 6.778 7.032 7.258 7.503 7.752 8.019 8.28 8.507 8.666 8.602 8.173 7.643 7.125 6.634 6.159 5.71 5.283 4.927 4.563 4.22 3.922 3.629 3.328 3.052 2.804 2.537 2.293 2.089 1.871 1.644 1.448 1.245 1.051 0.906 0.757 0.594 0.424 0.249 0.124 -0.005 -0.203 -0.352 -0.513 -0.596 -0.755 -0.917 -1.103 -1.203 -1.407 -1.549 -1.687 -1.823 -2.094 -2.243 -2.412 -2.621 -2.865 -3.158 -3.563 -5.41 -10 ,1957 ,TETRA ,17606726,Sun Nov 28 20:52:40 CET,Sun Nov 28 22:46:19 CET,0.0 0.486 0.758 0.988 1.185 1.347 1.477 1.59 1.798 1.893 1.985 2.071 2.251 2.329 2.475 2.621 2.765 2.831 2.953 3.063 3.215 3.316 3.414 3.536 3.649 3.761 3.873 3.986 4.127 4.262 4.382 4.52 4.659 4.799 4.964 5.144 5.321 5.516 5.728 5.955 6.171 6.39 6.655 6.906 7.146 7.38 7.65 7.923 8.151 8.274 8.177 7.746 7.22 6.706 6.225 5.764 5.339 4.947 4.577 4.198 3.871 3.573 3.295 3.013 2.74 2.494 2.235 2.006 1.797 1.565 1.314 1.119 0.925 0.714 0.547 0.387 0.221 0.036 -0.157 -0.283 -0.407 -0.63 -0.782 -0.93 -1.012 -1.181 -1.346 -1.524 -1.623 -1.825 -1.96 -2.091 -2.226 -2.52 -2.691 -2.872 -3.062 -3.317 -3.654 -4.135 -6.174 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_41_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_41_40.txt deleted file mode 100644 index 657941a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_41_40.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28458 ,KEBNE ,16654261,Mon Nov 22 06:25:05 CET,Mon Nov 22 07:51:04 CET,0.0 1.041 1.31 1.506 1.642 1.764 1.883 1.993 2.193 2.283 2.372 2.495 2.629 2.704 2.859 3.016 3.167 3.241 3.39 3.535 3.72 3.828 3.94 4.119 4.279 4.424 4.558 4.684 4.848 5.0 5.143 5.298 5.444 5.593 5.766 5.959 6.138 6.331 6.529 6.734 6.936 7.15 7.408 7.645 7.89 8.129 8.347 8.541 8.685 8.714 8.484 7.826 7.127 6.481 5.89 5.328 4.817 4.346 3.928 3.504 3.115 2.763 2.438 2.131 1.837 1.579 1.31 1.069 0.852 0.634 0.406 0.211 0.002 -0.228 -0.398 -0.568 -0.744 -0.927 -1.123 -1.255 -1.391 -1.611 -1.758 -1.913 -1.995 -2.168 -2.349 -2.541 -2.643 -2.805 -2.977 -3.096 -3.217 -3.484 -3.628 -3.811 -4.029 -4.236 -4.458 -4.804 -5.861 -2 ,11884 ,KEBNE ,16654262,Mon Nov 22 06:25:05 CET,Mon Nov 22 07:51:25 CET,0.0 1.193 1.521 1.793 2.026 2.213 2.373 2.514 2.769 2.877 2.972 3.126 3.281 3.379 3.547 3.697 3.84 3.906 4.028 4.151 4.324 4.428 4.531 4.686 4.829 4.953 5.074 5.197 5.356 5.51 5.653 5.825 5.986 6.128 6.287 6.46 6.618 6.796 6.992 7.195 7.39 7.601 7.851 8.094 8.329 8.54 8.756 8.956 9.099 9.107 8.872 8.26 7.63 7.014 6.421 5.834 5.303 4.826 4.401 3.985 3.597 3.254 2.96 2.667 2.377 2.11 1.831 1.58 1.37 1.156 0.921 0.717 0.508 0.298 0.138 -0.027 -0.194 -0.365 -0.554 -0.685 -0.818 -1.041 -1.201 -1.368 -1.457 -1.639 -1.824 -2.025 -2.125 -2.29 -2.464 -2.584 -2.704 -2.963 -3.099 -3.264 -3.443 -3.632 -3.861 -4.166 -5.315 -3 ,22159 ,KEBNE ,16654263,Mon Nov 22 06:25:05 CET,Mon Nov 22 07:51:04 CET,0.0 0.686 0.912 1.115 1.274 1.407 1.531 1.635 1.837 1.929 2.011 2.117 2.236 2.306 2.439 2.562 2.678 2.732 2.842 2.948 3.093 3.18 3.268 3.411 3.55 3.683 3.816 3.941 4.091 4.232 4.367 4.535 4.696 4.846 5.006 5.172 5.331 5.507 5.695 5.884 6.07 6.286 6.537 6.756 7.015 7.295 7.508 7.678 7.824 7.854 7.616 6.999 6.29 5.637 5.051 4.483 3.97 3.483 3.043 2.627 2.268 1.92 1.585 1.279 0.99 0.732 0.467 0.217 0.003 -0.213 -0.443 -0.643 -0.853 -1.07 -1.243 -1.423 -1.604 -1.789 -1.991 -2.125 -2.259 -2.476 -2.623 -2.775 -2.854 -3.019 -3.194 -3.38 -3.48 -3.644 -3.789 -3.905 -4.033 -4.313 -4.462 -4.624 -4.8 -5.007 -5.245 -5.564 -6.581 -4 ,17337 ,KEBNE ,16654264,Mon Nov 22 06:25:05 CET,Mon Nov 22 07:51:17 CET,0.0 0.698 0.934 1.124 1.278 1.4 1.513 1.624 1.82 1.905 1.989 2.113 2.236 2.304 2.438 2.567 2.681 2.737 2.846 2.946 3.089 3.184 3.281 3.418 3.546 3.665 3.777 3.889 4.034 4.169 4.301 4.47 4.629 4.791 4.986 5.193 5.391 5.607 5.851 6.102 6.355 6.642 6.959 7.264 7.579 7.854 8.099 8.318 8.484 8.512 8.357 7.808 7.108 6.403 5.755 5.137 4.57 4.048 3.598 3.158 2.774 2.436 2.087 1.733 1.407 1.125 0.855 0.604 0.365 0.119 -0.127 -0.325 -0.542 -0.78 -0.956 -1.144 -1.341 -1.534 -1.741 -1.886 -2.042 -2.291 -2.467 -2.663 -2.759 -2.944 -3.14 -3.351 -3.467 -3.657 -3.908 -4.06 -4.207 -4.538 -4.721 -4.923 -5.156 -5.399 -5.647 -5.978 -6.921 -5 ,25055 ,KEBNE ,16654265,Mon Nov 22 06:26:08 CET,Mon Nov 22 07:53:40 CET,0.0 0.641 0.883 1.059 1.207 1.344 1.473 1.589 1.792 1.884 1.976 2.083 2.198 2.263 2.389 2.513 2.638 2.698 2.825 2.955 3.131 3.238 3.339 3.485 3.622 3.756 3.888 4.015 4.167 4.3 4.432 4.601 4.764 4.912 5.075 5.26 5.44 5.624 5.821 6.021 6.209 6.398 6.611 6.81 7.035 7.289 7.525 7.703 7.818 7.847 7.577 6.858 6.175 5.617 5.099 4.578 4.082 3.584 3.153 2.737 2.369 2.041 1.721 1.397 1.087 0.814 0.531 0.288 0.08 -0.132 -0.358 -0.559 -0.761 -0.969 -1.127 -1.295 -1.48 -1.673 -1.869 -1.998 -2.124 -2.322 -2.469 -2.621 -2.704 -2.883 -3.061 -3.248 -3.353 -3.525 -3.704 -3.827 -3.951 -4.217 -4.37 -4.542 -4.715 -4.911 -5.166 -5.535 -6.848 -6 ,15686 ,KEBNE ,16654266,Mon Nov 22 06:25:05 CET,Mon Nov 22 07:51:10 CET,0.0 1.204 1.492 1.718 1.907 2.056 2.203 2.341 2.566 2.67 2.774 2.945 3.098 3.192 3.366 3.533 3.698 3.776 3.933 4.086 4.297 4.42 4.533 4.695 4.857 5.009 5.158 5.31 5.491 5.663 5.823 5.991 6.149 6.301 6.471 6.663 6.854 7.065 7.266 7.474 7.691 7.917 8.19 8.449 8.72 8.99 9.232 9.459 9.648 9.73 9.522 8.892 8.267 7.65 7.015 6.432 5.926 5.44 5.033 4.635 4.275 3.94 3.61 3.302 3.02 2.767 2.497 2.243 2.026 1.811 1.581 1.386 1.181 0.957 0.785 0.603 0.412 0.221 0.029 -0.096 -0.237 -0.473 -0.635 -0.799 -0.883 -1.054 -1.231 -1.422 -1.523 -1.684 -1.846 -1.969 -2.103 -2.389 -2.554 -2.732 -2.93 -3.146 -3.373 -3.691 -4.973 -7 ,4657 ,KEBNE ,16654267,Mon Nov 22 06:25:05 CET,Mon Nov 22 07:51:04 CET,0.0 0.845 1.065 1.247 1.393 1.534 1.669 1.785 1.988 2.082 2.169 2.277 2.397 2.468 2.612 2.749 2.868 2.927 3.04 3.14 3.279 3.367 3.455 3.585 3.709 3.835 3.953 4.059 4.195 4.335 4.473 4.63 4.784 4.937 5.118 5.307 5.481 5.673 5.866 6.056 6.244 6.469 6.744 6.987 7.251 7.538 7.802 8.072 8.33 8.474 8.336 7.738 7.011 6.306 5.674 5.126 4.615 4.091 3.642 3.196 2.819 2.472 2.119 1.788 1.487 1.228 0.954 0.687 0.451 0.204 -0.059 -0.273 -0.49 -0.714 -0.881 -1.043 -1.214 -1.402 -1.598 -1.736 -1.888 -2.115 -2.258 -2.401 -2.477 -2.642 -2.819 -3.005 -3.107 -3.276 -3.462 -3.589 -3.71 -3.978 -4.13 -4.281 -4.453 -4.672 -4.934 -5.272 -6.167 -8 ,8625 ,KEBNE ,16654268,Mon Nov 22 06:26:08 CET,Mon Nov 22 07:52:09 CET,0.0 0.828 1.041 1.217 1.374 1.516 1.644 1.747 1.935 2.037 2.142 2.301 2.442 2.535 2.708 2.862 3.004 3.07 3.198 3.325 3.513 3.626 3.73 3.886 4.033 4.162 4.28 4.397 4.559 4.714 4.85 5.005 5.165 5.326 5.504 5.688 5.867 6.058 6.266 6.479 6.67 6.866 7.109 7.369 7.642 7.906 8.157 8.362 8.509 8.568 8.361 7.823 7.226 6.598 5.969 5.358 4.796 4.281 3.824 3.351 2.941 2.562 2.189 1.866 1.573 1.287 0.973 0.703 0.487 0.256 0.007 -0.206 -0.423 -0.657 -0.846 -1.034 -1.237 -1.448 -1.662 -1.82 -1.99 -2.26 -2.443 -2.623 -2.715 -2.897 -3.095 -3.318 -3.437 -3.612 -3.757 -3.866 -3.989 -4.253 -4.4 -4.555 -4.719 -4.9 -5.127 -5.426 -6.286 -9 ,25941 ,KEBNE ,16654269,Mon Nov 22 06:26:08 CET,Mon Nov 22 07:52:18 CET,0.0 0.726 0.949 1.121 1.271 1.411 1.533 1.649 1.859 1.946 2.032 2.144 2.268 2.35 2.493 2.617 2.737 2.796 2.918 3.029 3.177 3.271 3.36 3.487 3.609 3.725 3.834 3.936 4.061 4.18 4.301 4.459 4.603 4.732 4.877 5.045 5.211 5.397 5.601 5.81 6.025 6.267 6.52 6.748 7.004 7.257 7.481 7.669 7.818 7.827 7.519 6.846 6.166 5.501 4.827 4.219 3.717 3.253 2.827 2.408 2.051 1.73 1.424 1.115 0.816 0.547 0.275 0.037 -0.17 -0.39 -0.617 -0.808 -1.022 -1.241 -1.41 -1.587 -1.771 -1.96 -2.147 -2.278 -2.413 -2.623 -2.772 -2.934 -3.017 -3.185 -3.355 -3.533 -3.632 -3.799 -3.972 -4.095 -4.227 -4.5 -4.653 -4.83 -5.027 -5.247 -5.507 -5.831 -6.85 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_42_13.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_42_13.txt deleted file mode 100644 index 98fdcfd3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_42_13.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19658 ,KEBNE ,16654271,Mon Nov 22 06:26:08 CET,Mon Nov 22 07:50:24 CET,0.0 1.016 1.35 1.572 1.764 1.927 2.079 2.21 2.438 2.546 2.652 2.771 2.933 3.032 3.2 3.357 3.514 3.594 3.761 3.931 4.175 4.325 4.468 4.663 4.849 5.033 5.214 5.389 5.62 5.851 6.08 6.343 6.58 6.818 7.085 7.378 7.663 7.968 8.281 8.607 8.924 9.275 9.695 10.108 10.586 11.089 11.632 12.194 12.771 13.331 13.708 13.617 13.211 12.646 12.11 11.608 11.147 10.735 10.333 9.898 9.518 9.185 8.857 8.546 8.267 8.009 7.741 7.48 7.242 7.007 6.747 6.512 6.268 6.01 5.816 5.615 5.406 5.174 4.921 4.77 4.616 4.353 4.163 3.972 3.877 3.667 3.463 3.25 3.126 2.922 2.721 2.582 2.423 2.055 1.864 1.672 1.451 1.192 0.889 0.451 -1.294 -2 ,31938 ,KEBNE ,16654272,Mon Nov 22 06:26:12 CET,Mon Nov 22 07:47:17 CET,0.0 1.159 1.525 1.807 2.039 2.228 2.405 2.565 2.859 2.986 3.102 3.27 3.445 3.559 3.777 3.974 4.157 4.241 4.407 4.579 4.82 4.967 5.11 5.324 5.534 5.73 5.92 6.097 6.317 6.535 6.737 6.968 7.206 7.45 7.721 8.01 8.271 8.56 8.891 9.24 9.594 9.968 10.371 10.762 11.208 11.68 12.234 12.856 13.432 13.903 14.234 14.011 13.442 12.851 12.309 11.818 11.36 10.89 10.479 10.089 9.72 9.352 9.005 8.682 8.411 8.152 7.844 7.577 7.359 7.124 6.851 6.632 6.418 6.181 6.003 5.829 5.627 5.401 5.157 4.993 4.826 4.56 4.377 4.177 4.07 3.86 3.648 3.425 3.297 3.095 2.878 2.726 2.564 2.172 1.939 1.682 1.406 1.122 0.808 0.371 -0.816 -3 ,5156 ,KEBNE ,16654273,Mon Nov 22 06:26:10 CET,Mon Nov 22 07:48:32 CET,0.0 1.211 1.551 1.809 2.025 2.205 2.374 2.532 2.812 2.928 3.033 3.175 3.351 3.45 3.634 3.807 3.952 4.023 4.176 4.337 4.545 4.683 4.829 5.023 5.203 5.381 5.556 5.727 5.96 6.175 6.372 6.605 6.837 7.055 7.305 7.585 7.853 8.143 8.438 8.77 9.145 9.561 10.011 10.413 10.854 11.336 11.852 12.342 12.838 13.31 13.534 13.326 12.948 12.467 11.936 11.435 10.994 10.566 10.138 9.689 9.323 9.001 8.682 8.376 8.086 7.812 7.522 7.257 7.02 6.787 6.552 6.349 6.135 5.91 5.733 5.541 5.33 5.102 4.871 4.709 4.546 4.274 4.075 3.882 3.784 3.588 3.363 3.122 3.003 2.801 2.59 2.446 2.292 1.971 1.787 1.566 1.32 1.008 0.628 0.206 -1.454 -4 ,25675 ,KEBNE ,16654274,Mon Nov 22 06:26:08 CET,Mon Nov 22 07:50:30 CET,0.0 1.365 1.727 2.003 2.228 2.401 2.557 2.699 2.956 3.079 3.19 3.344 3.514 3.62 3.821 4.004 4.171 4.256 4.425 4.591 4.837 4.988 5.125 5.323 5.513 5.705 5.899 6.079 6.304 6.515 6.716 6.964 7.204 7.408 7.646 7.936 8.205 8.483 8.798 9.127 9.447 9.827 10.274 10.696 11.159 11.632 12.108 12.617 13.224 13.839 14.259 14.171 13.799 13.373 12.88 12.352 11.909 11.498 11.088 10.672 10.312 9.979 9.663 9.36 9.069 8.806 8.54 8.283 8.06 7.829 7.584 7.383 7.165 6.944 6.777 6.589 6.381 6.179 5.975 5.811 5.632 5.369 5.193 5.017 4.928 4.741 4.525 4.287 4.163 3.975 3.798 3.66 3.499 3.15 2.963 2.752 2.518 2.236 1.856 1.322 -0.797 -5 ,12155 ,KEBNE ,16654275,Mon Nov 22 06:26:08 CET,Mon Nov 22 07:50:29 CET,0.0 0.923 1.293 1.582 1.815 2.003 2.192 2.388 2.695 2.822 2.947 3.119 3.289 3.384 3.553 3.73 3.904 3.982 4.126 4.263 4.479 4.62 4.755 4.95 5.119 5.275 5.429 5.594 5.812 6.01 6.197 6.401 6.613 6.843 7.117 7.418 7.673 7.929 8.233 8.564 8.893 9.257 9.676 10.067 10.512 11.006 11.535 12.101 12.659 13.137 13.494 13.31 12.842 12.373 11.857 11.351 10.902 10.44 9.998 9.549 9.166 8.832 8.513 8.205 7.909 7.638 7.351 7.079 6.837 6.596 6.356 6.145 5.914 5.688 5.512 5.328 5.148 4.956 4.732 4.575 4.41 4.161 4.006 3.828 3.73 3.53 3.31 3.08 2.96 2.759 2.563 2.435 2.288 1.914 1.717 1.529 1.308 1.049 0.733 0.243 -1.426 -6 ,31617 ,KEBNE ,16654276,Mon Nov 22 06:26:08 CET,Mon Nov 22 07:50:30 CET,0.0 0.789 1.059 1.269 1.458 1.616 1.745 1.869 2.112 2.23 2.353 2.499 2.659 2.752 2.939 3.134 3.323 3.414 3.585 3.74 3.964 4.108 4.247 4.45 4.645 4.834 5.013 5.191 5.419 5.628 5.826 6.06 6.28 6.5 6.771 7.076 7.346 7.629 7.935 8.253 8.616 9.013 9.415 9.821 10.284 10.781 11.323 11.911 12.482 12.958 13.296 13.069 12.557 12.071 11.618 11.146 10.709 10.281 9.86 9.412 9.036 8.723 8.42 8.12 7.834 7.569 7.285 7.029 6.795 6.546 6.3 6.094 5.88 5.63 5.43 5.246 5.047 4.843 4.629 4.48 4.335 4.091 3.912 3.728 3.625 3.407 3.194 2.966 2.846 2.653 2.447 2.29 2.138 1.828 1.646 1.436 1.191 0.932 0.584 0.063 -1.681 -7 ,31404 ,KEBNE ,16654277,Mon Nov 22 06:27:10 CET,Mon Nov 22 07:51:38 CET,0.0 1.351 1.734 1.988 2.199 2.388 2.549 2.705 2.998 3.135 3.258 3.429 3.603 3.7 3.889 4.076 4.25 4.331 4.493 4.635 4.836 4.983 5.127 5.33 5.525 5.711 5.886 6.062 6.271 6.462 6.668 6.917 7.149 7.376 7.637 7.928 8.186 8.463 8.77 9.101 9.449 9.837 10.29 10.734 11.197 11.645 12.12 12.601 13.076 13.544 13.891 13.84 13.473 12.966 12.468 11.993 11.526 11.06 10.669 10.275 9.916 9.571 9.215 8.866 8.568 8.305 8.007 7.734 7.499 7.265 7.023 6.817 6.603 6.376 6.187 5.988 5.779 5.565 5.341 5.183 5.015 4.753 4.584 4.405 4.303 4.095 3.896 3.678 3.553 3.354 3.16 3.025 2.877 2.53 2.34 2.115 1.835 1.54 1.193 0.746 -0.693 -8 ,19876 ,KEBNE ,16654278,Mon Nov 22 06:27:09 CET,Mon Nov 22 07:51:27 CET,0.0 0.949 1.332 1.619 1.86 2.07 2.25 2.418 2.705 2.83 2.964 3.159 3.333 3.446 3.656 3.85 4.02 4.098 4.256 4.411 4.642 4.791 4.928 5.126 5.324 5.512 5.706 5.892 6.117 6.339 6.546 6.778 6.996 7.201 7.456 7.758 8.038 8.341 8.65 8.98 9.336 9.717 10.132 10.542 11.007 11.52 12.08 12.638 13.197 13.736 14.103 13.969 13.522 12.968 12.45 11.975 11.498 11.08 10.713 10.32 9.987 9.683 9.392 9.089 8.797 8.528 8.242 7.999 7.786 7.549 7.3 7.101 6.884 6.652 6.473 6.28 6.095 5.895 5.675 5.521 5.352 5.09 4.911 4.733 4.638 4.442 4.234 3.984 3.853 3.657 3.442 3.28 3.106 2.759 2.561 2.329 2.092 1.833 1.504 1.023 -0.903 -9 ,12860 ,KEBNE ,16654279,Mon Nov 22 06:27:10 CET,Mon Nov 22 07:51:27 CET,0.0 0.773 1.118 1.342 1.543 1.742 1.922 2.081 2.366 2.509 2.641 2.818 2.991 3.096 3.3 3.506 3.704 3.795 3.957 4.103 4.336 4.484 4.617 4.813 5.001 5.188 5.351 5.49 5.682 5.889 6.092 6.319 6.543 6.762 7.024 7.322 7.587 7.885 8.215 8.582 8.956 9.34 9.748 10.124 10.566 11.038 11.571 12.186 12.787 13.243 13.49 13.281 12.826 12.296 11.776 11.298 10.838 10.371 9.951 9.537 9.177 8.864 8.566 8.269 7.977 7.714 7.462 7.23 6.997 6.733 6.47 6.268 6.045 5.809 5.634 5.442 5.241 5.029 4.795 4.634 4.469 4.206 4.013 3.807 3.704 3.511 3.316 3.095 2.974 2.778 2.565 2.429 2.277 1.935 1.752 1.529 1.28 1.01 0.631 0.139 -1.741 -10 ,28302 ,KEBNE ,16654280,Mon Nov 22 06:27:10 CET,Mon Nov 22 07:53:11 CET,0.0 0.724 1.041 1.276 1.456 1.608 1.753 1.885 2.119 2.238 2.359 2.528 2.692 2.786 2.971 3.154 3.327 3.409 3.574 3.732 3.964 4.114 4.257 4.455 4.639 4.821 5.003 5.169 5.388 5.599 5.793 6.021 6.245 6.464 6.719 7.01 7.271 7.553 7.854 8.181 8.531 8.927 9.391 9.825 10.295 10.79 11.292 11.84 12.41 12.907 13.219 13.148 12.796 12.349 11.862 11.355 10.883 10.405 9.981 9.578 9.227 8.891 8.559 8.235 7.929 7.647 7.335 7.059 6.829 6.572 6.292 6.057 5.831 5.619 5.445 5.268 5.079 4.867 4.645 4.494 4.349 4.118 3.95 3.778 3.685 3.479 3.26 3.037 2.912 2.713 2.511 2.364 2.216 1.88 1.677 1.466 1.259 0.994 0.641 0.079 -1.85 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_42_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_42_44.txt deleted file mode 100644 index a7066550..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_42_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8403 ,KEBNE ,16654281,Mon Nov 22 06:27:10 CET,Mon Nov 22 07:52:40 CET,0.0 0.568 0.761 0.903 1.013 1.096 1.183 1.282 1.452 1.527 1.597 1.665 1.799 1.871 1.996 2.102 2.205 2.26 2.368 2.464 2.598 2.687 2.769 2.891 3.006 3.115 3.232 3.352 3.511 3.646 3.784 3.968 4.112 4.227 4.37 4.545 4.739 4.957 5.195 5.451 5.694 5.953 6.282 6.639 6.978 7.291 7.665 8.066 8.438 8.678 8.675 8.32 7.864 7.38 6.889 6.385 5.926 5.52 5.136 4.744 4.376 4.036 3.719 3.414 3.151 2.909 2.654 2.429 2.246 2.058 1.829 1.64 1.456 1.25 1.096 0.93 0.747 0.563 0.378 0.26 0.138 -0.068 -0.21 -0.354 -0.438 -0.619 -0.802 -1.002 -1.121 -1.306 -1.46 -1.583 -1.712 -2.025 -2.219 -2.421 -2.638 -2.884 -3.198 -3.658 -5.561 -2 ,21671 ,KEBNE ,16654282,Mon Nov 22 06:27:10 CET,Mon Nov 22 07:51:46 CET,0.0 0.446 0.607 0.724 0.83 0.93 1.025 1.122 1.303 1.38 1.454 1.538 1.667 1.731 1.863 1.979 2.08 2.131 2.235 2.334 2.483 2.577 2.663 2.78 2.888 2.995 3.112 3.227 3.373 3.516 3.644 3.787 3.934 4.102 4.293 4.481 4.647 4.851 5.069 5.283 5.548 5.827 6.11 6.44 6.832 7.204 7.571 7.926 8.291 8.635 8.74 8.403 7.926 7.392 6.831 6.308 5.852 5.464 5.119 4.751 4.405 4.055 3.726 3.423 3.147 2.887 2.608 2.363 2.144 1.926 1.722 1.558 1.368 1.159 1.009 0.859 0.697 0.522 0.338 0.213 0.086 -0.128 -0.285 -0.442 -0.521 -0.684 -0.854 -1.034 -1.137 -1.315 -1.51 -1.647 -1.793 -2.119 -2.29 -2.473 -2.678 -2.913 -3.199 -3.608 -5.293 -3 ,792 ,KEBNE ,16654283,Mon Nov 22 06:27:10 CET,Mon Nov 22 07:51:40 CET,0.0 0.714 0.945 1.106 1.242 1.351 1.446 1.543 1.735 1.827 1.908 1.979 2.112 2.178 2.299 2.422 2.543 2.595 2.68 2.765 2.904 3.004 3.096 3.227 3.363 3.485 3.591 3.691 3.82 3.947 4.093 4.27 4.425 4.59 4.788 4.996 5.188 5.398 5.625 5.855 6.087 6.342 6.668 7.007 7.333 7.666 8.063 8.515 8.964 9.314 9.454 9.18 8.671 8.086 7.553 7.097 6.647 6.212 5.839 5.444 5.096 4.78 4.458 4.156 3.9 3.664 3.404 3.182 2.981 2.754 2.523 2.342 2.171 1.979 1.826 1.649 1.44 1.243 1.047 0.908 0.757 0.507 0.329 0.164 0.086 -0.068 -0.236 -0.428 -0.534 -0.729 -0.965 -1.107 -1.23 -1.5 -1.663 -1.862 -2.083 -2.334 -2.656 -3.094 -4.943 -4 ,14549 ,KEBNE ,16654284,Mon Nov 22 06:27:14 CET,Mon Nov 22 07:49:36 CET,0.0 0.584 0.738 0.868 0.986 1.102 1.199 1.292 1.458 1.533 1.607 1.674 1.801 1.867 2.008 2.126 2.234 2.292 2.403 2.509 2.674 2.774 2.862 2.995 3.121 3.232 3.338 3.44 3.583 3.727 3.869 4.064 4.248 4.407 4.587 4.8 5.013 5.226 5.458 5.717 5.981 6.231 6.523 6.827 7.149 7.478 7.833 8.207 8.523 8.761 8.768 8.413 7.862 7.289 6.798 6.311 5.835 5.398 5.013 4.611 4.253 3.932 3.626 3.353 3.072 2.81 2.561 2.32 2.111 1.902 1.684 1.499 1.295 1.073 0.897 0.72 0.541 0.344 0.128 -0.022 -0.187 -0.442 -0.604 -0.766 -0.847 -1.023 -1.214 -1.411 -1.507 -1.678 -1.87 -2.001 -2.133 -2.396 -2.553 -2.741 -2.947 -3.205 -3.554 -3.983 -5.477 -5 ,27444 ,KEBNE ,16654285,Mon Nov 22 06:28:12 CET,Mon Nov 22 07:53:48 CET,0.0 0.411 0.564 0.692 0.797 0.899 1.006 1.112 1.297 1.372 1.436 1.493 1.623 1.696 1.82 1.936 2.054 2.112 2.223 2.33 2.5 2.607 2.712 2.866 3.015 3.148 3.268 3.393 3.557 3.701 3.84 4.01 4.168 4.307 4.477 4.667 4.868 5.112 5.356 5.609 5.873 6.175 6.47 6.729 7.052 7.393 7.727 8.087 8.447 8.711 8.793 8.485 7.984 7.405 6.878 6.387 5.916 5.47 5.085 4.7 4.372 4.074 3.773 3.476 3.198 2.941 2.66 2.415 2.207 1.979 1.746 1.559 1.351 1.135 0.966 0.777 0.594 0.405 0.197 0.055 -0.096 -0.342 -0.509 -0.678 -0.782 -1.019 -1.233 -1.452 -1.569 -1.757 -1.967 -2.112 -2.273 -2.585 -2.738 -2.918 -3.114 -3.339 -3.601 -4.029 -6.481 -6 ,13906 ,KEBNE ,16654286,Mon Nov 22 06:28:16 CET,Mon Nov 22 07:51:15 CET,0.0 0.383 0.539 0.662 0.779 0.887 0.985 1.066 1.222 1.303 1.386 1.47 1.598 1.659 1.785 1.889 1.977 2.024 2.12 2.214 2.364 2.472 2.575 2.721 2.862 2.996 3.135 3.262 3.412 3.566 3.722 3.906 4.074 4.236 4.439 4.664 4.868 5.083 5.289 5.5 5.727 6.003 6.338 6.659 6.975 7.295 7.653 8.019 8.358 8.602 8.652 8.354 7.87 7.367 6.871 6.396 5.961 5.54 5.154 4.729 4.379 4.075 3.768 3.466 3.177 2.913 2.644 2.404 2.201 1.988 1.734 1.518 1.309 1.106 0.94 0.754 0.562 0.359 0.148 0.006 -0.142 -0.387 -0.567 -0.744 -0.835 -1.029 -1.228 -1.435 -1.544 -1.727 -1.94 -2.105 -2.271 -2.608 -2.811 -3.013 -3.237 -3.525 -3.901 -4.439 -6.376 -7 ,8007 ,KEBNE ,16654287,Mon Nov 22 06:29:14 CET,Mon Nov 22 07:53:17 CET,0.0 0.425 0.593 0.714 0.826 0.943 1.054 1.141 1.285 1.358 1.433 1.524 1.666 1.742 1.882 1.999 2.11 2.167 2.278 2.384 2.529 2.626 2.725 2.862 2.987 3.106 3.233 3.353 3.502 3.653 3.797 3.957 4.103 4.256 4.437 4.637 4.829 5.03 5.235 5.451 5.699 5.975 6.314 6.624 6.921 7.274 7.65 8.065 8.519 8.872 8.95 8.54 8.088 7.591 7.07 6.573 6.103 5.674 5.31 4.944 4.607 4.294 3.983 3.685 3.41 3.155 2.89 2.664 2.466 2.248 2.033 1.858 1.658 1.445 1.285 1.125 0.963 0.779 0.581 0.457 0.33 0.127 -0.012 -0.161 -0.242 -0.414 -0.577 -0.776 -0.901 -1.082 -1.26 -1.391 -1.519 -1.789 -1.943 -2.119 -2.311 -2.537 -2.816 -3.211 -5.013 -8 ,4568 ,KEBNE ,16654288,Mon Nov 22 06:29:14 CET,Mon Nov 22 07:55:11 CET,0.0 0.252 0.4 0.535 0.668 0.791 0.91 1.015 1.202 1.273 1.343 1.411 1.545 1.608 1.727 1.848 1.968 2.033 2.167 2.293 2.471 2.589 2.698 2.842 2.988 3.133 3.266 3.391 3.551 3.703 3.85 4.026 4.192 4.347 4.528 4.733 4.931 5.165 5.412 5.653 5.904 6.168 6.446 6.717 7.044 7.373 7.713 8.068 8.389 8.662 8.723 8.441 7.986 7.497 7.001 6.46 5.962 5.538 5.184 4.806 4.458 4.15 3.857 3.57 3.315 3.083 2.828 2.592 2.389 2.163 1.913 1.71 1.493 1.252 1.07 0.888 0.705 0.531 0.348 0.219 0.088 -0.116 -0.261 -0.418 -0.502 -0.685 -0.886 -1.113 -1.239 -1.427 -1.624 -1.768 -1.939 -2.331 -2.544 -2.765 -3.002 -3.27 -3.576 -4.009 -6.013 -9 ,3185 ,KEBNE ,16654289,Mon Nov 22 06:29:14 CET,Mon Nov 22 07:54:39 CET,0.0 0.527 0.769 0.916 1.021 1.126 1.221 1.303 1.475 1.553 1.635 1.732 1.869 1.937 2.062 2.176 2.286 2.34 2.442 2.544 2.706 2.8 2.879 2.992 3.095 3.195 3.3 3.414 3.571 3.728 3.888 4.086 4.275 4.446 4.633 4.854 5.075 5.31 5.551 5.799 6.077 6.363 6.667 6.957 7.243 7.589 7.995 8.35 8.673 8.94 8.981 8.704 8.27 7.774 7.275 6.798 6.349 5.932 5.575 5.199 4.86 4.516 4.188 3.904 3.623 3.367 3.097 2.845 2.635 2.41 2.18 1.99 1.774 1.546 1.385 1.231 1.067 0.899 0.724 0.598 0.469 0.274 0.137 -0.01 -0.084 -0.246 -0.419 -0.597 -0.695 -0.862 -1.022 -1.14 -1.261 -1.584 -1.776 -2.001 -2.259 -2.555 -2.913 -3.526 -6.139 -10 ,19819 ,KEBNE ,16654290,Mon Nov 22 06:29:16 CET,Mon Nov 22 07:51:10 CET,0.0 0.455 0.638 0.787 0.917 1.03 1.131 1.218 1.371 1.44 1.515 1.595 1.719 1.774 1.895 2.025 2.147 2.204 2.313 2.411 2.546 2.638 2.733 2.874 3.013 3.144 3.261 3.375 3.523 3.666 3.806 3.973 4.144 4.314 4.501 4.723 4.942 5.167 5.398 5.643 5.922 6.232 6.536 6.812 7.136 7.514 7.945 8.404 8.796 8.989 9.05 8.847 8.35 7.806 7.303 6.81 6.371 5.922 5.525 5.133 4.783 4.463 4.142 3.846 3.571 3.314 3.055 2.813 2.595 2.376 2.149 1.952 1.739 1.532 1.371 1.199 1.01 0.814 0.604 0.453 0.304 0.053 -0.12 -0.296 -0.389 -0.59 -0.805 -1.013 -1.13 -1.332 -1.545 -1.678 -1.824 -2.129 -2.289 -2.472 -2.691 -2.979 -3.332 -3.86 -6.299 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_42_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_42_45.txt deleted file mode 100644 index 99c063f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_42_45.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,472 ,KEBNE ,16654291,Mon Nov 22 06:29:14 CET,Mon Nov 22 07:53:46 CET,0.0 0.593 0.839 1.042 1.198 1.35 1.494 1.638 1.925 2.048 2.154 2.308 2.482 2.577 2.75 2.925 3.11 3.189 3.323 3.475 3.729 3.892 4.043 4.274 4.469 4.631 4.81 5.0 5.227 5.403 5.576 5.812 6.046 6.263 6.496 6.749 7.0 7.317 7.664 7.98 8.297 8.659 9.052 9.459 9.963 10.499 11.045 11.571 12.129 12.645 13.009 12.954 12.679 12.327 11.905 11.461 11.023 10.605 10.265 9.93 9.608 9.328 9.052 8.778 8.523 8.304 8.094 7.891 7.709 7.507 7.28 7.09 6.899 6.709 6.554 6.384 6.207 6.007 5.791 5.652 5.519 5.315 5.176 5.04 4.97 4.815 4.661 4.517 4.432 4.278 4.122 4.02 3.921 3.701 3.572 3.412 3.229 2.997 2.689 2.324 0.378 -2 ,18864 ,KEBNE ,16654292,Mon Nov 22 06:29:14 CET,Mon Nov 22 07:53:39 CET,0.0 0.889 1.157 1.358 1.535 1.684 1.823 1.961 2.206 2.318 2.435 2.612 2.786 2.885 3.068 3.223 3.369 3.438 3.574 3.707 3.904 4.029 4.162 4.354 4.53 4.711 4.879 5.041 5.259 5.468 5.657 5.896 6.146 6.38 6.635 6.911 7.193 7.508 7.843 8.175 8.509 8.905 9.357 9.81 10.32 10.848 11.418 11.983 12.493 12.87 13.136 12.92 12.473 12.062 11.586 11.112 10.728 10.368 10.026 9.646 9.295 8.998 8.72 8.438 8.176 7.953 7.712 7.478 7.283 7.077 6.856 6.691 6.529 6.363 6.229 6.077 5.926 5.779 5.614 5.495 5.385 5.215 5.084 4.956 4.893 4.756 4.606 4.442 4.355 4.208 4.072 3.967 3.856 3.612 3.465 3.273 3.052 2.828 2.587 2.267 0.92 -4 ,30595 ,KEBNE ,16654294,Mon Nov 22 06:30:17 CET,Mon Nov 22 07:54:44 CET,0.0 0.566 0.882 1.128 1.31 1.463 1.59 1.717 1.976 2.101 2.212 2.337 2.49 2.583 2.775 2.957 3.118 3.2 3.357 3.488 3.664 3.79 3.936 4.154 4.355 4.539 4.708 4.883 5.114 5.319 5.515 5.769 6.02 6.243 6.512 6.823 7.101 7.389 7.72 8.085 8.433 8.819 9.301 9.742 10.236 10.786 11.334 11.913 12.502 13.07 13.416 13.325 12.997 12.535 12.058 11.557 11.086 10.658 10.287 9.924 9.607 9.32 9.042 8.785 8.534 8.289 8.048 7.845 7.665 7.464 7.251 7.077 6.897 6.709 6.554 6.385 6.209 6.027 5.841 5.713 5.568 5.362 5.236 5.079 4.991 4.813 4.628 4.418 4.308 4.157 4.015 3.882 3.739 3.425 3.253 3.066 2.854 2.631 2.37 1.998 0.174 -5 ,241 ,KEBNE ,16654295,Mon Nov 22 06:30:16 CET,Mon Nov 22 07:56:09 CET,0.0 1.057 1.31 1.488 1.665 1.825 1.981 2.139 2.402 2.512 2.611 2.728 2.883 2.974 3.147 3.344 3.534 3.613 3.766 3.905 4.096 4.223 4.354 4.544 4.739 4.928 5.089 5.247 5.469 5.683 5.863 6.07 6.283 6.496 6.737 7.006 7.251 7.515 7.833 8.174 8.517 8.904 9.36 9.815 10.311 10.845 11.419 11.949 12.434 12.9 13.258 13.194 12.928 12.536 12.085 11.658 11.218 10.826 10.486 10.118 9.81 9.521 9.243 8.981 8.741 8.517 8.285 8.08 7.893 7.693 7.489 7.325 7.156 6.984 6.849 6.711 6.569 6.406 6.244 6.139 6.024 5.844 5.717 5.585 5.523 5.39 5.247 5.099 5.008 4.849 4.678 4.56 4.453 4.224 4.085 3.925 3.76 3.591 3.397 3.091 1.64 -6 ,25651 ,KEBNE ,16654296,Mon Nov 22 06:30:17 CET,Mon Nov 22 07:55:00 CET,0.0 0.99 1.255 1.462 1.645 1.807 1.949 2.096 2.382 2.51 2.628 2.789 2.958 3.045 3.21 3.378 3.533 3.609 3.744 3.865 4.07 4.226 4.372 4.566 4.749 4.942 5.131 5.308 5.531 5.734 5.922 6.161 6.419 6.663 6.941 7.255 7.537 7.816 8.116 8.451 8.8 9.171 9.588 10.031 10.536 11.047 11.612 12.204 12.851 13.434 13.807 13.86 13.538 12.999 12.441 11.954 11.544 11.125 10.745 10.346 10.019 9.746 9.477 9.221 8.968 8.718 8.463 8.244 8.058 7.862 7.655 7.484 7.316 7.138 6.999 6.858 6.707 6.552 6.392 6.287 6.172 5.976 5.843 5.721 5.661 5.527 5.381 5.226 5.149 5.009 4.892 4.798 4.703 4.448 4.291 4.145 3.967 3.738 3.483 3.122 1.548 -7 ,13859 ,KEBNE ,16654297,Mon Nov 22 06:30:16 CET,Mon Nov 22 07:54:46 CET,0.0 0.77 1.036 1.229 1.386 1.535 1.684 1.829 2.073 2.185 2.288 2.414 2.575 2.674 2.881 3.06 3.218 3.298 3.447 3.605 3.839 3.97 4.084 4.262 4.442 4.629 4.822 5.014 5.251 5.454 5.639 5.87 6.097 6.314 6.578 6.876 7.146 7.444 7.757 8.064 8.403 8.805 9.242 9.641 10.14 10.737 11.299 11.826 12.418 12.937 13.25 13.141 12.807 12.423 12.01 11.575 11.16 10.746 10.402 10.034 9.678 9.375 9.095 8.825 8.57 8.333 8.088 7.893 7.729 7.542 7.356 7.201 7.036 6.864 6.719 6.574 6.436 6.288 6.13 6.009 5.888 5.717 5.588 5.445 5.372 5.215 5.063 4.923 4.845 4.709 4.583 4.475 4.371 4.131 3.985 3.785 3.577 3.394 3.138 2.745 1.083 -8 ,23445 ,KEBNE ,16654298,Mon Nov 22 06:30:17 CET,Mon Nov 22 07:56:12 CET,0.0 1.069 1.36 1.556 1.726 1.889 2.038 2.182 2.434 2.535 2.625 2.733 2.887 2.971 3.138 3.311 3.485 3.567 3.727 3.894 4.115 4.244 4.374 4.557 4.728 4.89 5.045 5.202 5.404 5.605 5.812 6.06 6.293 6.508 6.761 7.053 7.323 7.624 7.974 8.33 8.677 9.072 9.52 9.941 10.413 10.921 11.485 12.107 12.666 13.112 13.363 13.119 12.736 12.383 11.996 11.578 11.177 10.794 10.454 10.084 9.759 9.467 9.171 8.908 8.673 8.453 8.227 8.035 7.859 7.664 7.471 7.301 7.131 6.955 6.814 6.686 6.553 6.395 6.216 6.098 5.988 5.821 5.706 5.574 5.497 5.342 5.175 4.999 4.915 4.764 4.617 4.502 4.373 4.125 3.982 3.821 3.642 3.439 3.222 2.866 1.606 -9 ,31906 ,KEBNE ,16654299,Mon Nov 22 06:30:17 CET,Mon Nov 22 07:56:19 CET,0.0 0.699 0.984 1.233 1.402 1.544 1.673 1.805 2.069 2.178 2.28 2.434 2.607 2.702 2.886 3.048 3.2 3.276 3.418 3.558 3.763 3.891 4.014 4.197 4.383 4.549 4.703 4.853 5.045 5.226 5.402 5.615 5.801 5.991 6.235 6.501 6.772 7.076 7.384 7.694 8.017 8.402 8.847 9.265 9.705 10.205 10.764 11.31 11.926 12.544 12.868 12.631 12.186 11.783 11.359 10.929 10.521 10.127 9.756 9.331 8.974 8.68 8.392 8.109 7.848 7.612 7.366 7.15 6.956 6.753 6.544 6.37 6.194 6.002 5.856 5.71 5.543 5.368 5.193 5.072 4.94 4.737 4.593 4.427 4.347 4.199 4.037 3.847 3.745 3.583 3.441 3.322 3.189 2.938 2.822 2.695 2.553 2.383 2.147 1.76 -0.143 -10 ,6018 ,KEBNE ,16654300,Mon Nov 22 06:30:17 CET,Mon Nov 22 07:56:27 CET,0.0 0.634 0.923 1.125 1.289 1.441 1.585 1.727 2.001 2.138 2.252 2.362 2.523 2.62 2.798 2.966 3.115 3.193 3.342 3.481 3.678 3.799 3.913 4.072 4.247 4.434 4.608 4.77 4.98 5.181 5.371 5.579 5.778 5.981 6.217 6.47 6.713 7.0 7.338 7.694 8.071 8.5 8.938 9.376 9.903 10.451 11.041 11.654 12.263 12.831 13.26 13.284 12.995 12.551 12.099 11.639 11.197 10.827 10.5 10.104 9.748 9.465 9.194 8.913 8.659 8.455 8.241 8.042 7.873 7.682 7.468 7.293 7.109 6.92 6.778 6.621 6.468 6.318 6.152 6.026 5.892 5.693 5.548 5.395 5.322 5.176 5.004 4.816 4.718 4.552 4.4 4.297 4.194 3.943 3.797 3.643 3.477 3.306 3.103 2.766 1.211 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_43_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_43_42.txt deleted file mode 100644 index 16b4e2a0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_43_42.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13196 ,KEBNE ,16654301,Mon Nov 22 06:30:17 CET,Mon Nov 22 07:56:39 CET,0.0 0.716 0.948 1.113 1.256 1.377 1.486 1.572 1.729 1.811 1.892 1.99 2.112 2.177 2.304 2.425 2.538 2.588 2.68 2.765 2.886 2.967 3.05 3.165 3.272 3.375 3.472 3.564 3.684 3.804 3.917 4.05 4.17 4.281 4.426 4.593 4.743 4.902 5.061 5.211 5.369 5.553 5.757 5.944 6.166 6.395 6.611 6.797 6.949 7.058 6.971 6.57 6.085 5.563 5.029 4.531 4.073 3.655 3.291 2.947 2.664 2.383 2.116 1.878 1.651 1.442 1.223 1.037 0.882 0.711 0.526 0.366 0.193 0.023 -0.103 -0.241 -0.389 -0.545 -0.706 -0.814 -0.922 -1.104 -1.233 -1.361 -1.425 -1.57 -1.728 -1.878 -1.952 -2.101 -2.22 -2.312 -2.404 -2.606 -2.726 -2.863 -3.002 -3.135 -3.286 -3.519 -4.062 -2 ,18695 ,KEBNE ,16654302,Mon Nov 22 06:30:17 CET,Mon Nov 22 07:54:42 CET,0.0 0.909 1.137 1.289 1.418 1.539 1.656 1.768 1.946 2.021 2.1 2.196 2.311 2.37 2.484 2.58 2.674 2.727 2.832 2.92 3.038 3.116 3.196 3.311 3.41 3.5 3.59 3.677 3.787 3.895 4.004 4.135 4.261 4.381 4.513 4.655 4.8 4.954 5.106 5.274 5.446 5.63 5.848 6.057 6.29 6.528 6.76 6.991 7.253 7.468 7.407 6.999 6.489 5.933 5.424 4.95 4.516 4.11 3.748 3.367 3.011 2.693 2.395 2.125 1.87 1.642 1.413 1.192 1.003 0.805 0.582 0.402 0.218 0.027 -0.108 -0.242 -0.381 -0.522 -0.671 -0.782 -0.9 -1.08 -1.193 -1.306 -1.368 -1.507 -1.648 -1.785 -1.866 -2.019 -2.12 -2.209 -2.299 -2.497 -2.616 -2.741 -2.873 -3.021 -3.208 -3.476 -4.282 -3 ,17515 ,KEBNE ,16654303,Mon Nov 22 06:30:17 CET,Mon Nov 22 07:54:41 CET,0.0 0.673 0.923 1.096 1.224 1.346 1.461 1.56 1.743 1.827 1.911 2.021 2.155 2.219 2.338 2.468 2.593 2.653 2.758 2.851 2.976 3.06 3.149 3.269 3.383 3.493 3.588 3.673 3.793 3.912 4.023 4.156 4.276 4.386 4.512 4.668 4.827 4.994 5.176 5.366 5.565 5.793 6.035 6.245 6.472 6.729 7.021 7.28 7.486 7.65 7.655 7.275 6.71 6.125 5.57 5.089 4.657 4.262 3.898 3.511 3.201 2.921 2.642 2.367 2.108 1.878 1.621 1.391 1.21 1.016 0.805 0.641 0.47 0.282 0.133 -0.021 -0.168 -0.312 -0.459 -0.559 -0.666 -0.843 -0.969 -1.097 -1.164 -1.306 -1.443 -1.572 -1.649 -1.819 -1.943 -2.038 -2.137 -2.335 -2.445 -2.575 -2.717 -2.869 -3.055 -3.28 -3.918 -4 ,25915 ,KEBNE ,16654304,Mon Nov 22 06:30:17 CET,Mon Nov 22 07:54:34 CET,0.0 0.711 0.954 1.136 1.28 1.402 1.511 1.617 1.792 1.869 1.945 2.035 2.165 2.236 2.358 2.468 2.568 2.613 2.705 2.798 2.933 3.019 3.099 3.217 3.331 3.443 3.55 3.653 3.8 3.936 4.056 4.201 4.338 4.474 4.641 4.818 4.983 5.167 5.368 5.576 5.784 6.004 6.233 6.449 6.701 6.97 7.23 7.497 7.751 7.902 7.826 7.409 6.879 6.348 5.847 5.372 4.928 4.526 4.195 3.835 3.513 3.216 2.916 2.633 2.359 2.116 1.889 1.69 1.514 1.335 1.142 0.972 0.795 0.62 0.48 0.335 0.181 0.016 -0.144 -0.248 -0.358 -0.543 -0.662 -0.779 -0.846 -0.989 -1.129 -1.284 -1.369 -1.528 -1.652 -1.752 -1.86 -2.118 -2.261 -2.4 -2.541 -2.698 -2.87 -3.132 -4.209 -6 ,8802 ,KEBNE ,16654306,Mon Nov 22 06:30:17 CET,Mon Nov 22 07:54:45 CET,0.0 0.709 0.935 1.108 1.25 1.378 1.491 1.586 1.775 1.858 1.93 2.012 2.138 2.205 2.321 2.426 2.533 2.585 2.674 2.748 2.865 2.949 3.037 3.153 3.256 3.365 3.468 3.562 3.684 3.803 3.922 4.055 4.188 4.325 4.489 4.667 4.83 5.012 5.199 5.382 5.569 5.779 6.023 6.253 6.49 6.725 6.954 7.148 7.337 7.489 7.389 6.842 6.239 5.669 5.168 4.69 4.256 3.866 3.518 3.161 2.832 2.52 2.223 1.951 1.703 1.49 1.275 1.074 0.888 0.702 0.49 0.292 0.101 -0.088 -0.239 -0.391 -0.554 -0.717 -0.868 -0.973 -1.077 -1.238 -1.349 -1.46 -1.52 -1.645 -1.777 -1.917 -1.992 -2.139 -2.267 -2.37 -2.466 -2.675 -2.786 -2.91 -3.037 -3.178 -3.36 -3.619 -4.618 -7 ,2917 ,KEBNE ,16654307,Mon Nov 22 06:30:17 CET,Mon Nov 22 07:54:42 CET,0.0 0.991 1.203 1.361 1.505 1.63 1.741 1.841 2.018 2.091 2.166 2.257 2.378 2.438 2.545 2.65 2.75 2.798 2.885 2.97 3.1 3.184 3.264 3.381 3.501 3.621 3.737 3.843 3.98 4.126 4.256 4.41 4.577 4.721 4.865 5.041 5.21 5.397 5.596 5.788 5.974 6.17 6.405 6.63 6.871 7.148 7.417 7.671 7.888 7.996 7.781 7.222 6.648 6.035 5.462 4.966 4.513 4.079 3.711 3.332 2.986 2.689 2.412 2.14 1.893 1.663 1.421 1.213 1.027 0.829 0.628 0.45 0.265 0.101 -0.02 -0.153 -0.3 -0.448 -0.592 -0.699 -0.811 -0.986 -1.115 -1.256 -1.325 -1.465 -1.609 -1.755 -1.835 -1.99 -2.121 -2.221 -2.326 -2.548 -2.662 -2.783 -2.921 -3.091 -3.292 -3.544 -4.281 -8 ,5422 ,KEBNE ,16654308,Mon Nov 22 06:31:19 CET,Mon Nov 22 07:55:36 CET,0.0 0.97 1.213 1.384 1.528 1.655 1.775 1.89 2.066 2.145 2.221 2.312 2.435 2.498 2.617 2.732 2.849 2.905 3.004 3.098 3.233 3.312 3.39 3.512 3.624 3.731 3.836 3.94 4.071 4.194 4.321 4.478 4.622 4.759 4.905 5.058 5.218 5.397 5.586 5.786 5.986 6.184 6.431 6.686 6.934 7.185 7.453 7.733 8.0 8.141 8.017 7.523 6.933 6.377 5.87 5.38 4.894 4.44 4.085 3.732 3.423 3.132 2.848 2.603 2.361 2.115 1.865 1.656 1.477 1.282 1.085 0.904 0.709 0.531 0.385 0.228 0.07 -0.097 -0.275 -0.399 -0.53 -0.74 -0.88 -1.027 -1.104 -1.261 -1.438 -1.63 -1.727 -1.883 -2.001 -2.096 -2.211 -2.492 -2.645 -2.81 -2.998 -3.201 -3.401 -3.654 -4.372 -9 ,12224 ,KEBNE ,16654309,Mon Nov 22 06:31:19 CET,Mon Nov 22 07:56:05 CET,0.0 0.614 0.811 0.977 1.142 1.288 1.416 1.525 1.704 1.783 1.853 1.93 2.047 2.11 2.229 2.337 2.443 2.494 2.589 2.688 2.835 2.918 2.995 3.114 3.228 3.34 3.438 3.526 3.647 3.775 3.89 4.021 4.15 4.272 4.412 4.568 4.711 4.865 5.043 5.212 5.377 5.591 5.827 6.026 6.257 6.523 6.805 7.11 7.38 7.517 7.44 7.052 6.561 6.086 5.615 5.123 4.671 4.252 3.899 3.538 3.195 2.891 2.618 2.343 2.082 1.851 1.607 1.39 1.207 1.015 0.806 0.632 0.453 0.272 0.134 -0.022 -0.186 -0.342 -0.497 -0.6 -0.715 -0.899 -1.017 -1.134 -1.194 -1.323 -1.466 -1.619 -1.698 -1.843 -1.937 -2.019 -2.119 -2.34 -2.463 -2.598 -2.748 -2.941 -3.159 -3.447 -4.561 -10 ,3651 ,KEBNE ,16654310,Mon Nov 22 06:31:19 CET,Mon Nov 22 07:55:34 CET,0.0 0.55 0.758 0.914 1.055 1.18 1.292 1.409 1.603 1.683 1.757 1.837 1.964 2.03 2.158 2.281 2.393 2.45 2.569 2.687 2.848 2.951 3.05 3.191 3.327 3.456 3.582 3.698 3.847 3.989 4.119 4.268 4.419 4.567 4.717 4.873 5.03 5.198 5.371 5.564 5.762 5.977 6.208 6.426 6.676 6.933 7.208 7.461 7.638 7.663 7.394 6.832 6.252 5.699 5.183 4.702 4.262 3.851 3.491 3.11 2.774 2.475 2.198 1.919 1.644 1.406 1.168 0.943 0.75 0.558 0.362 0.184 -0.019 -0.221 -0.372 -0.524 -0.693 -0.867 -1.031 -1.159 -1.299 -1.506 -1.645 -1.792 -1.868 -2.028 -2.204 -2.385 -2.475 -2.621 -2.739 -2.838 -2.943 -3.169 -3.29 -3.44 -3.619 -3.795 -3.991 -4.235 -4.925 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_43_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_43_44.txt deleted file mode 100644 index d3aac782..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_43_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23999 ,KEBNE ,17042425,Thu Dec 23 04:36:20 CET,Thu Dec 23 06:06:45 CET,0.0 0.358 0.515 0.628 0.741 0.841 0.911 0.983 1.114 1.17 1.228 1.292 1.397 1.445 1.546 1.649 1.733 1.767 1.84 1.917 2.031 2.102 2.168 2.26 2.352 2.447 2.535 2.617 2.718 2.811 2.903 3.012 3.121 3.226 3.335 3.455 3.572 3.709 3.859 4.006 4.15 4.313 4.511 4.703 4.893 5.076 5.284 5.516 5.689 5.706 5.444 4.907 4.264 3.564 2.959 2.435 1.972 1.539 1.151 0.739 0.381 0.072 -0.238 -0.539 -0.807 -1.061 -1.338 -1.58 -1.785 -2.002 -2.233 -2.429 -2.638 -2.852 -3.023 -3.187 -3.356 -3.54 -3.715 -3.843 -3.981 -4.202 -4.359 -4.508 -4.59 -4.757 -4.925 -5.118 -5.221 -5.384 -5.544 -5.667 -5.803 -6.093 -6.25 -6.432 -6.627 -6.862 -7.161 -7.55 -9.025 -2 ,3160 ,KEBNE ,17042426,Thu Dec 23 04:36:20 CET,Thu Dec 23 06:04:48 CET,0.0 0.525 0.69 0.79 0.877 0.954 1.032 1.105 1.219 1.271 1.321 1.374 1.481 1.529 1.626 1.719 1.813 1.86 1.946 2.028 2.136 2.202 2.267 2.368 2.459 2.537 2.615 2.692 2.795 2.89 2.983 3.108 3.231 3.34 3.467 3.604 3.723 3.849 3.988 4.141 4.307 4.484 4.684 4.882 5.089 5.313 5.552 5.772 5.926 5.941 5.693 5.072 4.392 3.745 3.163 2.597 2.062 1.557 1.108 0.68 0.311 -0.042 -0.373 -0.674 -0.957 -1.217 -1.5 -1.78 -2.017 -2.239 -2.475 -2.669 -2.866 -3.083 -3.258 -3.433 -3.609 -3.803 -4.003 -4.141 -4.286 -4.501 -4.645 -4.794 -4.872 -5.033 -5.215 -5.417 -5.52 -5.686 -5.826 -5.938 -6.069 -6.395 -6.563 -6.726 -6.917 -7.152 -7.442 -7.848 -9.394 -3 ,29848 ,KEBNE ,17042427,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:06:16 CET,0.0 0.541 0.685 0.793 0.889 0.977 1.046 1.113 1.236 1.292 1.346 1.396 1.505 1.557 1.663 1.755 1.832 1.873 1.959 2.034 2.133 2.202 2.275 2.365 2.446 2.534 2.622 2.705 2.809 2.909 3.013 3.133 3.227 3.318 3.433 3.563 3.678 3.802 3.942 4.101 4.264 4.425 4.584 4.733 4.897 5.067 5.247 5.407 5.526 5.471 5.138 4.492 3.762 3.08 2.513 1.975 1.46 0.966 0.539 0.118 -0.244 -0.577 -0.927 -1.244 -1.53 -1.797 -2.076 -2.334 -2.561 -2.797 -3.036 -3.243 -3.462 -3.692 -3.88 -4.061 -4.237 -4.432 -4.635 -4.778 -4.932 -5.179 -5.333 -5.47 -5.547 -5.717 -5.899 -6.097 -6.192 -6.363 -6.548 -6.672 -6.802 -7.087 -7.259 -7.455 -7.658 -7.91 -8.205 -8.577 -9.768 -4 ,12751 ,KEBNE ,17042428,Thu Dec 23 04:36:22 CET,Thu Dec 23 06:05:08 CET,0.0 0.285 0.449 0.604 0.721 0.813 0.899 0.974 1.109 1.166 1.214 1.257 1.367 1.421 1.522 1.615 1.699 1.74 1.816 1.881 1.988 2.061 2.125 2.22 2.31 2.397 2.483 2.571 2.685 2.785 2.88 2.995 3.111 3.221 3.351 3.494 3.628 3.771 3.913 4.037 4.16 4.313 4.503 4.683 4.863 5.047 5.24 5.393 5.482 5.487 5.211 4.617 4.014 3.422 2.855 2.294 1.766 1.309 0.94 0.541 0.174 -0.154 -0.455 -0.755 -1.053 -1.336 -1.637 -1.888 -2.106 -2.34 -2.607 -2.826 -3.046 -3.276 -3.444 -3.638 -3.846 -4.051 -4.269 -4.414 -4.551 -4.778 -4.939 -5.103 -5.182 -5.338 -5.515 -5.705 -5.801 -5.962 -6.131 -6.265 -6.403 -6.689 -6.858 -7.043 -7.242 -7.486 -7.773 -8.137 -9.635 -5 ,23803 ,KEBNE ,17042429,Thu Dec 23 04:36:22 CET,Thu Dec 23 06:05:02 CET,0.0 0.493 0.661 0.781 0.904 1.004 1.076 1.152 1.295 1.354 1.414 1.467 1.583 1.638 1.735 1.829 1.913 1.954 2.036 2.113 2.208 2.265 2.325 2.416 2.507 2.599 2.685 2.763 2.862 2.966 3.069 3.18 3.292 3.409 3.53 3.652 3.767 3.894 4.025 4.172 4.322 4.474 4.654 4.828 4.986 5.15 5.303 5.414 5.504 5.468 5.164 4.567 3.87 3.186 2.568 2.019 1.519 1.047 0.621 0.178 -0.181 -0.492 -0.797 -1.107 -1.414 -1.686 -1.98 -2.246 -2.473 -2.717 -2.963 -3.168 -3.394 -3.638 -3.827 -4.024 -4.232 -4.445 -4.662 -4.814 -4.972 -5.211 -5.371 -5.544 -5.634 -5.833 -6.041 -6.258 -6.373 -6.553 -6.75 -6.875 -7.007 -7.329 -7.508 -7.687 -7.883 -8.122 -8.461 -8.938 -10.666 -6 ,15211 ,KEBNE ,17042430,Thu Dec 23 04:36:21 CET,Thu Dec 23 06:06:39 CET,0.0 0.411 0.559 0.664 0.764 0.856 0.931 0.997 1.131 1.19 1.245 1.307 1.413 1.466 1.562 1.647 1.738 1.778 1.854 1.937 2.051 2.119 2.18 2.265 2.353 2.432 2.513 2.598 2.702 2.802 2.891 2.995 3.101 3.198 3.309 3.44 3.565 3.704 3.848 3.992 4.141 4.298 4.499 4.686 4.877 5.093 5.309 5.503 5.652 5.676 5.334 4.704 4.006 3.326 2.72 2.163 1.667 1.19 0.745 0.257 -0.15 -0.493 -0.823 -1.137 -1.429 -1.71 -2.002 -2.256 -2.485 -2.732 -2.989 -3.199 -3.415 -3.636 -3.807 -3.993 -4.195 -4.392 -4.597 -4.744 -4.884 -5.091 -5.232 -5.386 -5.465 -5.621 -5.816 -6.031 -6.131 -6.299 -6.47 -6.592 -6.718 -6.985 -7.128 -7.316 -7.535 -7.775 -8.059 -8.466 -10.176 -7 ,27088 ,KEBNE ,17042431,Thu Dec 23 04:38:28 CET,Thu Dec 23 06:04:26 CET,0.0 0.307 0.465 0.573 0.664 0.754 0.831 0.898 1.02 1.073 1.128 1.184 1.287 1.338 1.43 1.508 1.584 1.619 1.686 1.753 1.85 1.911 1.974 2.075 2.179 2.275 2.361 2.447 2.547 2.632 2.73 2.847 2.947 3.055 3.166 3.287 3.419 3.556 3.696 3.847 4.011 4.178 4.374 4.57 4.797 5.034 5.262 5.492 5.659 5.652 5.411 4.837 4.204 3.573 2.966 2.377 1.861 1.393 1.002 0.628 0.28 -0.037 -0.342 -0.644 -0.929 -1.201 -1.488 -1.741 -1.96 -2.169 -2.392 -2.582 -2.769 -2.973 -3.135 -3.296 -3.469 -3.647 -3.844 -3.995 -4.142 -4.37 -4.519 -4.678 -4.768 -4.94 -5.119 -5.309 -5.409 -5.58 -5.734 -5.86 -6.006 -6.349 -6.527 -6.706 -6.922 -7.167 -7.45 -7.902 -9.836 -8 ,30936 ,KEBNE ,17042432,Thu Dec 23 04:38:28 CET,Thu Dec 23 06:03:18 CET,0.0 0.378 0.549 0.689 0.806 0.903 1.001 1.09 1.237 1.302 1.36 1.45 1.57 1.624 1.726 1.822 1.921 1.974 2.082 2.18 2.314 2.399 2.485 2.605 2.72 2.837 2.946 3.048 3.181 3.303 3.414 3.551 3.675 3.787 3.933 4.107 4.263 4.425 4.579 4.741 4.913 5.101 5.317 5.529 5.759 5.994 6.232 6.448 6.655 6.732 6.494 5.853 5.165 4.532 3.902 3.294 2.728 2.181 1.722 1.3 0.923 0.563 0.225 -0.091 -0.396 -0.668 -0.948 -1.215 -1.45 -1.679 -1.917 -2.13 -2.344 -2.571 -2.76 -2.952 -3.156 -3.364 -3.566 -3.708 -3.856 -4.104 -4.286 -4.462 -4.556 -4.762 -4.971 -5.187 -5.303 -5.491 -5.704 -5.859 -6.028 -6.411 -6.609 -6.8 -6.994 -7.236 -7.582 -8.015 -9.595 -9 ,32648 ,KEBNE ,17042433,Thu Dec 23 04:38:28 CET,Thu Dec 23 06:04:51 CET,0.0 0.308 0.467 0.596 0.704 0.813 0.902 0.976 1.112 1.173 1.227 1.27 1.374 1.423 1.513 1.596 1.678 1.719 1.803 1.896 2.044 2.13 2.211 2.338 2.451 2.556 2.661 2.753 2.876 2.993 3.106 3.257 3.393 3.507 3.636 3.787 3.937 4.093 4.242 4.389 4.554 4.742 4.951 5.14 5.336 5.551 5.772 5.963 6.123 6.125 5.791 5.167 4.428 3.701 3.084 2.492 1.964 1.508 1.084 0.632 0.224 -0.154 -0.507 -0.822 -1.105 -1.364 -1.631 -1.875 -2.115 -2.367 -2.618 -2.828 -3.039 -3.257 -3.428 -3.617 -3.811 -4.02 -4.253 -4.399 -4.559 -4.831 -5.009 -5.202 -5.307 -5.512 -5.729 -5.995 -6.131 -6.313 -6.494 -6.635 -6.79 -7.119 -7.289 -7.482 -7.704 -7.924 -8.195 -8.652 -10.5 -10 ,17510 ,KEBNE ,17042434,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:13:36 CET,0.0 0.338 0.482 0.603 0.711 0.8 0.875 0.946 1.078 1.144 1.213 1.272 1.375 1.428 1.527 1.619 1.701 1.738 1.816 1.898 2.018 2.09 2.159 2.263 2.365 2.472 2.583 2.686 2.808 2.928 3.053 3.208 3.348 3.47 3.61 3.77 3.919 4.071 4.231 4.402 4.552 4.713 4.922 5.128 5.346 5.57 5.804 6.042 6.251 6.292 6.016 5.425 4.758 4.083 3.437 2.838 2.292 1.786 1.349 0.899 0.52 0.191 -0.14 -0.462 -0.76 -1.034 -1.322 -1.58 -1.804 -2.035 -2.279 -2.488 -2.723 -2.956 -3.125 -3.319 -3.522 -3.72 -3.922 -4.056 -4.194 -4.446 -4.62 -4.789 -4.874 -5.034 -5.221 -5.471 -5.602 -5.782 -5.926 -6.037 -6.165 -6.459 -6.627 -6.805 -7.005 -7.228 -7.498 -7.882 -9.336 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_44_18.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_44_18.txt deleted file mode 100644 index 2b7ce6e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_44_18.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,7780 ,KEBNE ,16654313,Mon Nov 22 06:31:19 CET,Mon Nov 22 07:54:40 CET,0.0 0.205 0.308 0.392 0.464 0.538 0.607 0.659 0.756 0.798 0.839 0.868 0.982 1.032 1.118 1.199 1.28 1.318 1.395 1.465 1.562 1.627 1.689 1.785 1.883 1.975 2.067 2.163 2.286 2.401 2.512 2.642 2.769 2.897 3.045 3.195 3.332 3.494 3.687 3.888 4.082 4.321 4.616 4.909 5.24 5.577 5.909 6.207 6.481 6.762 6.901 6.647 6.246 5.795 5.347 4.958 4.594 4.254 3.972 3.68 3.421 3.172 2.928 2.68 2.432 2.208 1.983 1.777 1.609 1.442 1.246 1.088 0.93 0.76 0.623 0.471 0.305 0.128 -0.056 -0.174 -0.298 -0.495 -0.625 -0.772 -0.854 -1.03 -1.211 -1.403 -1.512 -1.695 -1.873 -2.002 -2.14 -2.464 -2.627 -2.791 -2.996 -3.223 -3.5 -3.934 -5.291 -4 ,11882 ,KEBNE ,16654314,Mon Nov 22 06:31:19 CET,Mon Nov 22 07:54:16 CET,0.0 0.222 0.335 0.429 0.503 0.577 0.647 0.71 0.822 0.869 0.917 0.954 1.063 1.105 1.193 1.278 1.353 1.391 1.47 1.548 1.667 1.743 1.81 1.909 2.006 2.093 2.173 2.254 2.36 2.464 2.569 2.692 2.814 2.93 3.054 3.202 3.366 3.556 3.755 3.957 4.152 4.383 4.654 4.925 5.234 5.559 5.915 6.245 6.618 6.959 7.025 6.725 6.272 5.783 5.307 4.821 4.371 3.974 3.603 3.207 2.871 2.569 2.285 2.024 1.791 1.574 1.337 1.116 0.927 0.744 0.544 0.372 0.203 0.02 -0.137 -0.296 -0.457 -0.639 -0.831 -0.958 -1.092 -1.295 -1.441 -1.597 -1.669 -1.822 -1.988 -2.167 -2.275 -2.451 -2.596 -2.704 -2.821 -3.08 -3.234 -3.405 -3.606 -3.849 -4.127 -4.545 -6.107 -5 ,9222 ,KEBNE ,16654315,Mon Nov 22 06:31:23 CET,Mon Nov 22 07:54:19 CET,0.0 0.396 0.481 0.563 0.637 0.692 0.742 0.791 0.881 0.921 0.966 0.986 1.088 1.132 1.218 1.303 1.391 1.433 1.513 1.592 1.704 1.772 1.839 1.937 2.029 2.125 2.212 2.3 2.425 2.544 2.659 2.796 2.924 3.047 3.192 3.361 3.509 3.663 3.836 4.034 4.252 4.492 4.749 4.986 5.288 5.637 6.011 6.368 6.661 6.862 6.887 6.546 6.047 5.545 5.076 4.616 4.178 3.756 3.395 3.019 2.691 2.404 2.11 1.839 1.599 1.372 1.116 0.891 0.698 0.475 0.245 0.055 -0.141 -0.332 -0.474 -0.625 -0.786 -0.956 -1.126 -1.248 -1.388 -1.603 -1.76 -1.929 -2.012 -2.18 -2.362 -2.552 -2.655 -2.829 -2.971 -3.07 -3.182 -3.419 -3.547 -3.7 -3.891 -4.121 -4.415 -4.872 -6.244 -6 ,11082 ,KEBNE ,16654316,Mon Nov 22 06:31:20 CET,Mon Nov 22 07:54:33 CET,0.0 0.122 0.2 0.28 0.372 0.466 0.535 0.59 0.691 0.736 0.786 0.825 0.932 0.975 1.068 1.173 1.274 1.314 1.39 1.466 1.572 1.639 1.706 1.805 1.903 1.995 2.085 2.169 2.264 2.359 2.46 2.589 2.715 2.845 3.002 3.16 3.301 3.465 3.647 3.848 4.062 4.305 4.59 4.874 5.184 5.52 5.914 6.282 6.543 6.735 6.795 6.448 5.926 5.435 5.026 4.62 4.265 3.938 3.621 3.294 3.019 2.77 2.533 2.303 2.073 1.847 1.612 1.404 1.224 1.029 0.82 0.651 0.457 0.267 0.127 -0.019 -0.18 -0.345 -0.518 -0.64 -0.776 -0.992 -1.14 -1.3 -1.376 -1.528 -1.701 -1.897 -2.002 -2.17 -2.317 -2.431 -2.547 -2.814 -2.978 -3.156 -3.354 -3.576 -3.809 -4.083 -4.965 -7 ,22874 ,KEBNE ,16654317,Mon Nov 22 06:31:20 CET,Mon Nov 22 07:55:52 CET,0.0 0.228 0.299 0.359 0.43 0.495 0.553 0.616 0.739 0.786 0.834 0.869 0.98 1.029 1.121 1.201 1.273 1.312 1.385 1.453 1.55 1.608 1.669 1.775 1.88 1.979 2.072 2.16 2.27 2.377 2.481 2.604 2.73 2.853 2.989 3.136 3.283 3.449 3.62 3.804 4.016 4.251 4.512 4.756 5.028 5.318 5.618 5.925 6.242 6.574 6.766 6.555 6.153 5.663 5.221 4.819 4.407 4.006 3.681 3.341 3.004 2.722 2.475 2.221 1.986 1.777 1.581 1.403 1.226 1.047 0.863 0.704 0.534 0.344 0.193 0.043 -0.109 -0.268 -0.438 -0.556 -0.673 -0.865 -1.006 -1.161 -1.247 -1.415 -1.587 -1.774 -1.878 -2.052 -2.196 -2.307 -2.434 -2.728 -2.891 -3.08 -3.275 -3.475 -3.684 -4.005 -5.145 -8 ,11421 ,KEBNE ,16654318,Mon Nov 22 06:31:20 CET,Mon Nov 22 07:54:22 CET,0.0 0.159 0.258 0.344 0.429 0.497 0.555 0.605 0.711 0.763 0.815 0.849 0.954 0.998 1.086 1.172 1.264 1.314 1.404 1.479 1.588 1.659 1.728 1.828 1.93 2.033 2.129 2.21 2.317 2.429 2.532 2.659 2.779 2.906 3.058 3.208 3.367 3.554 3.747 3.936 4.129 4.354 4.618 4.868 5.157 5.475 5.843 6.251 6.587 6.796 6.797 6.42 5.983 5.558 5.088 4.623 4.209 3.811 3.473 3.123 2.802 2.515 2.235 1.957 1.7 1.466 1.215 0.988 0.8 0.611 0.408 0.237 0.068 -0.108 -0.248 -0.4 -0.565 -0.738 -0.931 -1.056 -1.184 -1.395 -1.534 -1.686 -1.759 -1.899 -2.052 -2.212 -2.29 -2.436 -2.567 -2.676 -2.799 -3.065 -3.213 -3.372 -3.555 -3.785 -4.048 -4.422 -5.418 -9 ,3407 ,KEBNE ,16654319,Mon Nov 22 06:31:19 CET,Mon Nov 22 07:54:29 CET,0.0 0.226 0.357 0.458 0.523 0.586 0.652 0.715 0.84 0.896 0.935 0.946 1.052 1.098 1.189 1.271 1.35 1.386 1.458 1.531 1.636 1.704 1.77 1.869 1.968 2.059 2.15 2.238 2.351 2.46 2.571 2.713 2.84 2.957 3.099 3.268 3.432 3.615 3.803 3.985 4.185 4.425 4.675 4.928 5.221 5.532 5.917 6.334 6.714 7.029 7.086 6.737 6.33 5.912 5.534 5.125 4.71 4.33 3.972 3.615 3.329 3.054 2.786 2.536 2.299 2.073 1.835 1.618 1.433 1.252 1.065 0.899 0.735 0.55 0.399 0.238 0.063 -0.097 -0.275 -0.404 -0.522 -0.725 -0.885 -1.045 -1.126 -1.283 -1.455 -1.642 -1.729 -1.886 -2.037 -2.151 -2.271 -2.529 -2.677 -2.835 -3.016 -3.212 -3.476 -3.856 -4.843 -10 ,9413 ,KEBNE ,16654320,Mon Nov 22 06:31:20 CET,Mon Nov 22 07:55:51 CET,0.0 0.234 0.42 0.535 0.605 0.674 0.745 0.813 0.932 0.99 1.047 1.084 1.19 1.232 1.317 1.405 1.497 1.54 1.623 1.71 1.832 1.903 1.973 2.078 2.18 2.269 2.356 2.446 2.558 2.66 2.76 2.881 2.998 3.111 3.249 3.424 3.584 3.762 3.969 4.171 4.375 4.613 4.878 5.15 5.491 5.855 6.218 6.593 6.969 7.298 7.41 7.137 6.736 6.279 5.799 5.32 4.875 4.469 4.125 3.755 3.415 3.136 2.896 2.635 2.371 2.142 1.915 1.704 1.52 1.334 1.137 0.974 0.8 0.622 0.48 0.323 0.158 -0.013 -0.199 -0.343 -0.492 -0.714 -0.859 -1.007 -1.091 -1.269 -1.451 -1.633 -1.731 -1.9 -2.059 -2.179 -2.31 -2.616 -2.78 -2.957 -3.171 -3.416 -3.711 -4.142 -5.678 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_44_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_44_43.txt deleted file mode 100644 index 10c62761..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_44_43.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,156 ,TETRA ,17698030,Sat Dec 4 16:36:54 CET,Sat Dec 4 18:19:51 CET,0.0 1.487 1.951 2.3 2.63 2.886 3.105 3.31 3.67 3.842 4.001 4.218 4.403 4.525 4.763 4.973 5.182 5.278 5.438 5.599 5.838 5.993 6.145 6.363 6.571 6.77 6.965 7.154 7.398 7.621 7.822 8.074 8.321 8.536 8.767 9.043 9.319 9.613 9.93 10.268 10.606 10.962 11.374 11.801 12.298 12.816 13.353 13.945 14.594 15.254 15.852 16.069 16.047 15.915 15.76 15.569 15.358 15.151 14.963 14.746 14.556 14.376 14.201 14.039 13.885 13.758 13.624 13.503 13.401 13.293 13.176 13.086 12.999 12.904 12.823 12.737 12.657 12.575 12.48 12.418 12.359 12.259 12.189 12.113 12.071 11.984 11.888 11.794 11.746 11.638 11.57 11.501 11.431 11.288 11.217 11.13 11.041 10.948 10.826 10.643 10.068 -2 ,11774 ,TETRA ,17675109,Sat Dec 4 16:13:59 CET,Sat Dec 4 17:57:54 CET,0.0 1.351 1.772 2.078 2.322 2.507 2.672 2.838 3.116 3.234 3.351 3.51 3.666 3.773 4.003 4.222 4.431 4.527 4.701 4.864 5.094 5.238 5.378 5.577 5.771 5.962 6.15 6.315 6.516 6.73 6.931 7.16 7.391 7.624 7.894 8.188 8.453 8.736 9.042 9.366 9.712 10.089 10.531 10.988 11.474 11.975 12.53 13.146 13.834 14.574 15.29 15.533 15.462 15.301 15.109 14.905 14.703 14.493 14.286 14.068 13.887 13.72 13.557 13.411 13.257 13.098 12.944 12.807 12.683 12.564 12.435 12.32 12.206 12.089 11.999 11.917 11.832 11.739 11.643 11.574 11.509 11.417 11.347 11.27 11.228 11.127 11.016 10.914 10.862 10.751 10.704 10.654 10.594 10.447 10.364 10.285 10.206 10.105 9.991 9.833 9.356 -3 ,32091 ,TETRA ,17675110,Sat Dec 4 16:14:00 CET,Sat Dec 4 17:55:19 CET,0.0 2.331 2.779 3.089 3.372 3.595 3.778 3.95 4.261 4.41 4.552 4.739 4.928 5.055 5.272 5.456 5.634 5.72 5.878 6.033 6.255 6.389 6.514 6.686 6.848 7.022 7.193 7.356 7.561 7.764 7.966 8.21 8.448 8.671 8.922 9.2 9.471 9.75 10.038 10.35 10.696 11.092 11.553 12.002 12.473 12.972 13.565 14.209 14.885 15.602 16.346 16.708 16.681 16.535 16.349 16.118 15.9 15.695 15.489 15.26 15.056 14.87 14.711 14.579 14.45 14.324 14.184 14.063 13.959 13.845 13.723 13.624 13.533 13.432 13.348 13.266 13.188 13.105 13.005 12.933 12.863 12.768 12.693 12.606 12.567 12.488 12.395 12.298 12.251 12.142 12.083 12.028 11.97 11.838 11.754 11.67 11.59 11.496 11.373 11.218 10.618 -4 ,32105 ,TETRA ,17675111,Sat Dec 4 16:14:01 CET,Sat Dec 4 17:47:59 CET,0.0 1.383 1.813 2.159 2.421 2.616 2.79 2.947 3.229 3.351 3.46 3.612 3.784 3.887 4.083 4.279 4.463 4.551 4.731 4.899 5.128 5.275 5.419 5.621 5.807 5.983 6.146 6.308 6.538 6.751 6.955 7.208 7.441 7.666 7.935 8.237 8.516 8.812 9.118 9.427 9.751 10.119 10.551 10.992 11.491 12.012 12.565 13.165 13.833 14.484 15.048 15.279 15.223 15.081 14.91 14.722 14.554 14.384 14.211 14.013 13.838 13.681 13.54 13.399 13.255 13.129 12.999 12.889 12.787 12.672 12.556 12.464 12.373 12.267 12.184 12.1 12.02 11.935 11.841 11.781 11.715 11.605 11.532 11.447 11.403 11.318 11.227 11.139 11.091 10.983 10.93 10.87 10.809 10.692 10.616 10.536 10.467 10.372 10.261 10.118 9.654 -5 ,8292 ,TETRA ,17698034,Sat Dec 4 16:36:55 CET,Sat Dec 4 17:49:19 CET,0.0 1.937 2.408 2.741 2.987 3.183 3.353 3.52 3.834 3.987 4.133 4.339 4.533 4.65 4.869 5.086 5.283 5.375 5.542 5.697 5.914 6.051 6.186 6.382 6.581 6.785 6.972 7.149 7.38 7.599 7.816 8.067 8.28 8.497 8.77 9.072 9.346 9.648 9.942 10.235 10.564 10.925 11.341 11.765 12.24 12.714 13.254 13.845 14.483 15.201 15.904 16.211 16.179 16.019 15.846 15.666 15.45 15.242 15.068 14.865 14.673 14.503 14.346 14.192 14.047 13.922 13.8 13.693 13.587 13.475 13.358 13.258 13.147 13.03 12.948 12.862 12.771 12.679 12.578 12.509 12.439 12.331 12.254 12.17 12.128 12.042 11.943 11.835 11.781 11.674 11.61 11.547 11.483 11.338 11.253 11.154 11.058 10.967 10.85 10.704 10.413 -6 ,12483 ,TETRA ,17675113,Sat Dec 4 16:15:02 CET,Sat Dec 4 17:58:31 CET,0.0 2.391 2.887 3.233 3.502 3.726 3.913 4.073 4.318 4.436 4.564 4.752 4.94 5.069 5.298 5.511 5.729 5.834 6.019 6.189 6.446 6.607 6.745 6.945 7.154 7.358 7.559 7.75 7.984 8.208 8.414 8.656 8.893 9.126 9.392 9.687 9.975 10.276 10.572 10.867 11.196 11.59 12.011 12.417 12.879 13.388 13.982 14.633 15.312 15.993 16.69 17.002 16.946 16.78 16.552 16.339 16.164 15.953 15.737 15.497 15.284 15.119 14.958 14.781 14.616 14.465 14.293 14.139 14.012 13.889 13.776 13.684 13.579 13.468 13.386 13.306 13.22 13.128 13.034 12.969 12.905 12.799 12.72 12.645 12.608 12.528 12.438 12.346 12.297 12.185 12.126 12.071 12.009 11.867 11.787 11.706 11.624 11.526 11.425 11.296 10.916 -8 ,15880 ,TETRA ,17698038,Sat Dec 4 16:36:58 CET,Sat Dec 4 18:20:43 CET,0.0 1.897 2.313 2.619 2.86 3.063 3.237 3.387 3.704 3.85 3.965 4.119 4.292 4.399 4.603 4.798 4.995 5.089 5.258 5.426 5.669 5.834 5.985 6.189 6.388 6.563 6.727 6.888 7.106 7.33 7.551 7.806 8.044 8.272 8.528 8.815 9.08 9.376 9.704 10.041 10.381 10.776 11.249 11.666 12.122 12.66 13.304 13.968 14.675 15.372 15.917 16.116 16.071 15.939 15.772 15.554 15.308 15.082 14.901 14.73 14.576 14.427 14.275 14.124 13.988 13.875 13.76 13.647 13.542 13.436 13.335 13.248 13.151 13.051 12.969 12.878 12.788 12.705 12.612 12.548 12.48 12.368 12.288 12.201 12.161 12.079 11.985 11.884 11.83 11.715 11.661 11.596 11.523 11.386 11.306 11.219 11.121 11.0 10.857 10.654 9.487 -9 ,13376 ,TETRA ,17675116,Sat Dec 4 16:16:00 CET,Sat Dec 4 17:59:45 CET,0.0 2.646 3.088 3.355 3.556 3.745 3.917 4.074 4.388 4.54 4.678 4.867 5.036 5.131 5.332 5.525 5.698 5.781 5.937 6.086 6.312 6.456 6.589 6.779 6.97 7.156 7.331 7.503 7.715 7.913 8.113 8.359 8.59 8.802 9.04 9.309 9.582 9.885 10.19 10.499 10.851 11.256 11.673 12.102 12.612 13.127 13.695 14.313 14.982 15.681 16.308 16.53 16.504 16.332 16.111 15.875 15.64 15.4 15.186 14.988 14.814 14.65 14.494 14.333 14.174 14.037 13.911 13.799 13.703 13.604 13.502 13.422 13.331 13.228 13.145 13.056 12.972 12.89 12.793 12.721 12.65 12.54 12.464 12.389 12.35 12.268 12.175 12.077 12.027 11.921 11.868 11.816 11.764 11.636 11.564 11.485 11.405 11.321 11.213 11.07 10.754 -10 ,10318 ,TETRA ,17698040,Sat Dec 4 16:36:55 CET,Sat Dec 4 18:01:13 CET,0.0 1.872 2.27 2.561 2.796 3.005 3.165 3.314 3.605 3.741 3.86 4.016 4.184 4.284 4.485 4.673 4.846 4.93 5.085 5.238 5.48 5.631 5.773 5.99 6.199 6.397 6.577 6.754 6.981 7.171 7.359 7.599 7.828 8.053 8.326 8.63 8.911 9.219 9.544 9.882 10.232 10.604 11.022 11.432 11.909 12.423 12.971 13.578 14.248 14.944 15.609 15.879 15.89 15.743 15.498 15.258 15.065 14.883 14.706 14.501 14.311 14.143 13.965 13.799 13.663 13.539 13.397 13.279 13.178 13.064 12.957 12.87 12.778 12.677 12.597 12.511 12.429 12.343 12.245 12.183 12.118 12.012 11.941 11.86 11.816 11.723 11.629 11.529 11.477 11.359 11.285 11.227 11.172 11.043 10.961 10.873 10.794 10.696 10.574 10.442 10.141 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_44_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_44_45.txt deleted file mode 100644 index f391cb57..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_44_45.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,29642 ,KEBNE ,16654322,Mon Nov 22 06:31:19 CET,Mon Nov 22 07:56:08 CET,0.0 0.917 1.204 1.443 1.669 1.869 2.037 2.173 2.403 2.508 2.614 2.752 2.914 3.009 3.189 3.36 3.533 3.624 3.806 3.961 4.158 4.29 4.414 4.588 4.771 4.953 5.123 5.285 5.492 5.684 5.854 6.063 6.289 6.497 6.728 6.986 7.23 7.504 7.788 8.081 8.403 8.748 9.133 9.535 9.987 10.446 10.94 11.488 12.045 12.594 13.046 13.113 12.907 12.595 12.289 11.991 11.69 11.427 11.212 10.946 10.692 10.471 10.26 10.058 9.859 9.675 9.481 9.313 9.171 9.018 8.856 8.719 8.578 8.427 8.309 8.195 8.081 7.958 7.814 7.711 7.609 7.468 7.382 7.297 7.253 7.155 7.045 6.939 6.885 6.771 6.713 6.634 6.555 6.397 6.303 6.214 6.127 6.039 5.941 5.824 5.59 -3 ,30772 ,KEBNE ,16654323,Mon Nov 22 06:31:19 CET,Mon Nov 22 07:55:38 CET,0.0 1.194 1.549 1.799 2.026 2.211 2.346 2.474 2.738 2.879 3.006 3.178 3.361 3.472 3.684 3.877 4.053 4.139 4.311 4.478 4.709 4.852 4.988 5.177 5.353 5.537 5.722 5.891 6.103 6.31 6.521 6.766 6.987 7.213 7.494 7.797 8.053 8.328 8.637 8.981 9.34 9.725 10.164 10.571 11.032 11.522 12.041 12.585 13.191 13.789 14.187 14.204 14.01 13.737 13.414 13.073 12.774 12.462 12.203 11.96 11.724 11.515 11.301 11.091 10.892 10.715 10.549 10.391 10.239 10.083 9.918 9.79 9.654 9.513 9.411 9.305 9.194 9.081 8.964 8.881 8.794 8.657 8.564 8.467 8.419 8.32 8.222 8.125 8.068 7.946 7.886 7.819 7.754 7.638 7.566 7.48 7.388 7.267 7.102 6.924 6.605 -4 ,9531 ,KEBNE ,16654324,Mon Nov 22 06:31:20 CET,Mon Nov 22 07:57:35 CET,0.0 1.776 2.177 2.484 2.705 2.878 3.045 3.181 3.42 3.541 3.661 3.83 4.007 4.11 4.299 4.47 4.631 4.712 4.863 5.011 5.219 5.345 5.484 5.694 5.869 6.038 6.206 6.365 6.557 6.734 6.914 7.138 7.347 7.558 7.814 8.091 8.339 8.593 8.873 9.188 9.502 9.845 10.279 10.725 11.172 11.633 12.212 12.831 13.406 13.949 14.375 14.321 14.081 13.896 13.699 13.465 13.223 12.994 12.791 12.568 12.38 12.191 12.012 11.863 11.713 11.564 11.399 11.247 11.118 10.993 10.864 10.743 10.615 10.483 10.373 10.261 10.152 10.042 9.927 9.846 9.772 9.66 9.575 9.484 9.436 9.332 9.216 9.11 9.057 8.94 8.853 8.777 8.709 8.542 8.456 8.372 8.283 8.197 8.09 7.915 7.598 -5 ,30846 ,KEBNE ,16654325,Mon Nov 22 06:31:19 CET,Mon Nov 22 07:56:03 CET,0.0 1.114 1.408 1.644 1.836 2.014 2.186 2.357 2.695 2.839 2.969 3.136 3.308 3.407 3.581 3.755 3.922 4.005 4.166 4.32 4.53 4.667 4.799 4.954 5.133 5.346 5.551 5.734 5.957 6.172 6.37 6.591 6.816 7.038 7.265 7.518 7.803 8.142 8.475 8.808 9.165 9.528 9.931 10.341 10.8 11.302 11.854 12.399 12.937 13.483 13.941 13.996 13.787 13.483 13.188 12.858 12.532 12.239 11.954 11.641 11.374 11.15 10.936 10.737 10.573 10.429 10.276 10.144 10.025 9.908 9.791 9.682 9.567 9.451 9.359 9.268 9.174 9.065 8.951 8.866 8.776 8.652 8.568 8.482 8.439 8.356 8.273 8.175 8.121 8.009 7.962 7.903 7.84 7.709 7.626 7.545 7.463 7.35 7.204 7.015 6.743 -6 ,14195 ,KEBNE ,16654326,Mon Nov 22 06:31:19 CET,Mon Nov 22 07:55:47 CET,0.0 1.423 1.817 2.098 2.343 2.602 2.847 3.045 3.385 3.535 3.661 3.816 3.979 4.074 4.267 4.446 4.627 4.723 4.883 5.026 5.249 5.392 5.53 5.736 5.925 6.099 6.26 6.421 6.631 6.805 6.976 7.207 7.414 7.587 7.785 8.045 8.313 8.618 8.944 9.269 9.61 10.007 10.44 10.837 11.315 11.83 12.401 12.969 13.512 14.09 14.612 14.89 14.775 14.464 14.211 13.934 13.612 13.313 13.077 12.832 12.611 12.391 12.169 11.963 11.744 11.559 11.402 11.254 11.124 11.001 10.872 10.757 10.64 10.516 10.413 10.299 10.168 10.028 9.883 9.782 9.683 9.527 9.422 9.328 9.281 9.184 9.084 8.97 8.909 8.783 8.697 8.636 8.569 8.438 8.374 8.29 8.186 8.038 7.816 7.52 6.663 -7 ,8067 ,KEBNE ,16654327,Mon Nov 22 06:31:20 CET,Mon Nov 22 07:55:41 CET,0.0 1.343 1.694 1.948 2.169 2.361 2.534 2.695 3.003 3.149 3.272 3.426 3.602 3.72 3.946 4.145 4.314 4.392 4.542 4.68 4.889 5.028 5.16 5.376 5.593 5.775 5.943 6.115 6.332 6.532 6.719 6.933 7.133 7.324 7.553 7.816 8.082 8.375 8.676 8.987 9.301 9.661 10.05 10.397 10.817 11.27 11.772 12.312 12.861 13.392 13.837 13.984 13.848 13.573 13.253 12.947 12.642 12.33 12.062 11.783 11.563 11.387 11.205 11.04 10.894 10.758 10.602 10.46 10.333 10.201 10.065 9.954 9.839 9.71 9.624 9.532 9.428 9.324 9.2 9.117 9.032 8.897 8.807 8.713 8.665 8.56 8.438 8.313 8.249 8.124 8.065 7.996 7.916 7.763 7.684 7.6 7.505 7.396 7.281 7.129 6.846 -8 ,28145 ,KEBNE ,16654328,Mon Nov 22 06:31:20 CET,Mon Nov 22 07:57:07 CET,0.0 0.697 0.968 1.216 1.41 1.581 1.742 1.9 2.201 2.332 2.445 2.576 2.723 2.802 2.974 3.162 3.338 3.414 3.555 3.693 3.912 4.068 4.22 4.43 4.625 4.811 5.002 5.187 5.426 5.665 5.879 6.118 6.343 6.554 6.802 7.088 7.363 7.664 7.974 8.294 8.616 8.975 9.402 9.814 10.268 10.78 11.348 11.906 12.459 12.93 13.274 13.3 13.158 12.916 12.643 12.345 11.999 11.696 11.463 11.224 11.021 10.847 10.667 10.512 10.373 10.228 10.063 9.918 9.807 9.683 9.538 9.413 9.286 9.174 9.09 8.998 8.896 8.788 8.667 8.585 8.511 8.387 8.292 8.19 8.141 8.041 7.931 7.826 7.775 7.658 7.598 7.534 7.462 7.336 7.275 7.193 7.105 7.012 6.898 6.736 6.339 -9 ,10857 ,KEBNE ,16654329,Mon Nov 22 06:31:20 CET,Mon Nov 22 07:55:41 CET,0.0 0.993 1.306 1.531 1.74 1.929 2.102 2.262 2.546 2.665 2.777 2.932 3.101 3.202 3.376 3.559 3.742 3.827 3.986 4.129 4.329 4.454 4.581 4.774 4.958 5.134 5.299 5.45 5.658 5.869 6.066 6.294 6.516 6.743 7.001 7.281 7.564 7.874 8.184 8.52 8.876 9.281 9.727 10.142 10.614 11.111 11.643 12.161 12.684 13.175 13.65 13.801 13.591 13.314 12.998 12.682 12.411 12.164 11.928 11.649 11.417 11.244 11.076 10.923 10.774 10.611 10.42 10.247 10.106 9.97 9.841 9.729 9.609 9.488 9.397 9.295 9.191 9.089 8.981 8.901 8.82 8.702 8.622 8.542 8.499 8.399 8.294 8.176 8.112 7.993 7.915 7.844 7.775 7.609 7.524 7.44 7.348 7.247 7.128 6.989 6.492 -10 ,2627 ,KEBNE ,16654330,Mon Nov 22 06:31:20 CET,Mon Nov 22 07:56:02 CET,0.0 0.736 1.085 1.382 1.644 1.859 2.031 2.187 2.488 2.621 2.748 2.89 3.047 3.15 3.363 3.545 3.706 3.788 3.938 4.082 4.291 4.432 4.57 4.765 4.941 5.119 5.294 5.447 5.64 5.818 5.993 6.213 6.431 6.645 6.899 7.169 7.407 7.667 7.939 8.225 8.538 8.852 9.224 9.618 10.027 10.474 11.039 11.647 12.217 12.762 13.223 13.307 13.081 12.772 12.526 12.282 12.023 11.774 11.517 11.228 10.997 10.79 10.565 10.372 10.21 10.059 9.895 9.749 9.633 9.518 9.385 9.255 9.124 8.997 8.899 8.793 8.688 8.579 8.47 8.395 8.31 8.19 8.115 8.032 7.987 7.898 7.803 7.696 7.631 7.508 7.461 7.399 7.338 7.217 7.14 7.052 6.96 6.876 6.774 6.63 6.384 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_45_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_45_44.txt deleted file mode 100644 index 67ef4b36..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cdk8/water/Summary_FEP_45_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16606 ,KEBNE ,17042437,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:12:05 CET,0.0 0.222 0.361 0.455 0.551 0.643 0.719 0.781 0.896 0.953 1.011 1.076 1.2 1.259 1.372 1.485 1.586 1.634 1.723 1.816 1.961 2.05 2.131 2.24 2.343 2.443 2.548 2.649 2.783 2.919 3.031 3.157 3.287 3.405 3.534 3.682 3.818 3.977 4.146 4.309 4.471 4.643 4.841 5.026 5.26 5.542 5.843 6.158 6.439 6.63 6.669 6.31 5.749 5.165 4.622 4.067 3.578 3.172 2.785 2.339 1.951 1.629 1.33 1.031 0.745 0.473 0.192 -0.057 -0.289 -0.543 -0.824 -1.061 -1.284 -1.519 -1.703 -1.884 -2.078 -2.278 -2.475 -2.615 -2.778 -3.043 -3.225 -3.382 -3.459 -3.65 -3.856 -4.057 -4.163 -4.343 -4.543 -4.682 -4.821 -5.131 -5.325 -5.545 -5.802 -6.078 -6.396 -6.802 -7.705 -2 ,11994 ,KEBNE ,17042438,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:11:33 CET,0.0 0.244 0.371 0.472 0.573 0.674 0.761 0.84 0.998 1.067 1.131 1.19 1.306 1.365 1.477 1.582 1.682 1.726 1.803 1.888 2.016 2.092 2.165 2.281 2.389 2.475 2.559 2.649 2.768 2.889 2.997 3.126 3.257 3.384 3.523 3.678 3.833 3.994 4.18 4.401 4.628 4.859 5.113 5.337 5.566 5.852 6.173 6.458 6.713 6.879 6.841 6.384 5.787 5.271 4.743 4.18 3.677 3.242 2.861 2.479 2.141 1.816 1.511 1.232 0.976 0.748 0.503 0.271 0.069 -0.146 -0.37 -0.55 -0.754 -0.977 -1.141 -1.298 -1.461 -1.662 -1.877 -2.01 -2.163 -2.432 -2.628 -2.804 -2.882 -3.046 -3.223 -3.41 -3.522 -3.708 -3.907 -4.056 -4.211 -4.546 -4.731 -4.925 -5.137 -5.381 -5.679 -6.029 -6.67 -3 ,18016 ,KEBNE ,17042440,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:13:43 CET,0.0 0.28 0.399 0.516 0.612 0.697 0.775 0.857 1.002 1.07 1.137 1.195 1.31 1.366 1.474 1.571 1.659 1.7 1.781 1.861 1.971 2.043 2.119 2.226 2.323 2.412 2.507 2.611 2.737 2.852 2.964 3.115 3.248 3.362 3.506 3.664 3.803 3.953 4.139 4.303 4.449 4.643 4.895 5.143 5.408 5.693 5.968 6.248 6.558 6.755 6.686 6.195 5.675 5.187 4.679 4.156 3.65 3.176 2.754 2.335 1.974 1.628 1.312 1.014 0.724 0.456 0.165 -0.108 -0.347 -0.575 -0.833 -1.049 -1.248 -1.474 -1.657 -1.838 -2.018 -2.211 -2.414 -2.552 -2.692 -2.901 -3.058 -3.231 -3.314 -3.479 -3.66 -3.854 -3.957 -4.135 -4.286 -4.391 -4.521 -4.804 -4.95 -5.118 -5.288 -5.469 -5.727 -6.052 -7.195 -4 ,1241 ,KEBNE ,17042441,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:11:43 CET,0.0 0.483 0.66 0.757 0.847 0.938 1.024 1.113 1.279 1.35 1.42 1.498 1.625 1.688 1.826 1.951 2.055 2.104 2.191 2.277 2.387 2.452 2.519 2.617 2.724 2.833 2.923 3.006 3.121 3.239 3.365 3.52 3.654 3.792 3.967 4.146 4.319 4.511 4.724 4.959 5.182 5.408 5.656 5.913 6.205 6.466 6.731 7.012 7.248 7.439 7.414 6.976 6.46 5.913 5.355 4.813 4.332 3.895 3.498 3.076 2.7 2.334 1.985 1.667 1.377 1.122 0.849 0.608 0.397 0.174 -0.057 -0.259 -0.476 -0.708 -0.895 -1.086 -1.28 -1.496 -1.716 -1.848 -1.979 -2.188 -2.331 -2.467 -2.537 -2.705 -2.89 -3.087 -3.183 -3.338 -3.469 -3.57 -3.678 -3.917 -4.056 -4.23 -4.421 -4.631 -4.872 -5.164 -6.168 -5 ,13849 ,KEBNE ,17042443,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:12:14 CET,0.0 0.313 0.525 0.705 0.854 0.984 1.103 1.193 1.333 1.4 1.469 1.539 1.66 1.713 1.811 1.902 1.997 2.039 2.121 2.198 2.301 2.375 2.453 2.562 2.664 2.771 2.881 2.987 3.129 3.26 3.373 3.499 3.633 3.779 3.938 4.1 4.257 4.423 4.607 4.807 5.01 5.211 5.429 5.656 5.923 6.203 6.505 6.814 7.095 7.317 7.24 6.729 6.163 5.618 5.041 4.46 3.944 3.5 3.13 2.741 2.379 2.027 1.704 1.425 1.152 0.89 0.612 0.368 0.145 -0.088 -0.328 -0.533 -0.752 -0.969 -1.136 -1.326 -1.504 -1.693 -1.901 -2.032 -2.169 -2.381 -2.519 -2.659 -2.73 -2.88 -3.034 -3.203 -3.3 -3.472 -3.665 -3.795 -3.925 -4.173 -4.326 -4.519 -4.724 -4.932 -5.166 -5.495 -6.696 -6 ,23689 ,KEBNE ,17042444,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:12:02 CET,0.0 0.199 0.343 0.451 0.535 0.6 0.674 0.743 0.844 0.901 0.965 1.021 1.131 1.181 1.283 1.401 1.513 1.562 1.651 1.728 1.84 1.918 1.998 2.113 2.224 2.341 2.468 2.583 2.74 2.888 3.006 3.159 3.323 3.48 3.657 3.849 4.018 4.198 4.38 4.576 4.81 5.077 5.375 5.66 5.975 6.317 6.63 6.828 7.035 7.25 7.279 6.935 6.394 5.78 5.177 4.614 4.108 3.66 3.267 2.836 2.452 2.135 1.82 1.512 1.232 0.963 0.682 0.438 0.218 -0.019 -0.249 -0.455 -0.691 -0.924 -1.097 -1.269 -1.449 -1.67 -1.91 -2.067 -2.223 -2.481 -2.672 -2.856 -2.945 -3.155 -3.372 -3.593 -3.713 -3.885 -4.074 -4.203 -4.336 -4.657 -4.836 -5.029 -5.241 -5.473 -5.77 -6.214 -7.478 -7 ,23599 ,KEBNE ,17042446,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:12:02 CET,0.0 0.231 0.405 0.558 0.68 0.796 0.898 0.98 1.118 1.187 1.248 1.295 1.412 1.479 1.602 1.711 1.808 1.854 1.941 2.02 2.147 2.228 2.3 2.403 2.501 2.588 2.667 2.754 2.877 3.0 3.125 3.273 3.4 3.515 3.654 3.817 3.968 4.127 4.298 4.491 4.685 4.888 5.134 5.376 5.602 5.834 6.11 6.387 6.676 6.876 6.885 6.495 6.002 5.452 4.893 4.393 3.938 3.483 3.06 2.663 2.321 1.982 1.653 1.369 1.088 0.822 0.533 0.265 0.041 -0.194 -0.449 -0.678 -0.913 -1.123 -1.281 -1.456 -1.652 -1.851 -2.05 -2.188 -2.342 -2.613 -2.8 -2.972 -3.061 -3.254 -3.463 -3.679 -3.782 -3.952 -4.111 -4.237 -4.363 -4.613 -4.764 -4.902 -5.042 -5.235 -5.467 -5.802 -7.0 -8 ,10736 ,KEBNE ,17042447,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:11:52 CET,0.0 0.348 0.481 0.584 0.683 0.776 0.862 0.939 1.079 1.141 1.203 1.275 1.398 1.458 1.566 1.677 1.778 1.819 1.899 1.978 2.099 2.177 2.249 2.349 2.444 2.537 2.637 2.734 2.847 2.952 3.051 3.176 3.309 3.45 3.622 3.803 3.965 4.151 4.352 4.569 4.795 5.038 5.324 5.582 5.859 6.153 6.433 6.705 6.961 7.148 7.109 6.609 5.987 5.419 4.914 4.418 3.923 3.432 2.981 2.529 2.14 1.796 1.468 1.165 0.875 0.588 0.28 0.014 -0.202 -0.408 -0.61 -0.779 -0.947 -1.127 -1.282 -1.441 -1.61 -1.799 -1.997 -2.13 -2.257 -2.469 -2.622 -2.778 -2.859 -3.015 -3.163 -3.323 -3.415 -3.584 -3.744 -3.85 -3.979 -4.244 -4.378 -4.551 -4.731 -4.932 -5.164 -5.459 -6.4 -9 ,14264 ,KEBNE ,17042448,Thu Dec 23 04:43:33 CET,Thu Dec 23 06:11:47 CET,0.0 0.295 0.458 0.575 0.681 0.764 0.818 0.875 0.991 1.045 1.108 1.176 1.297 1.357 1.475 1.577 1.676 1.726 1.815 1.9 2.037 2.12 2.205 2.333 2.443 2.548 2.65 2.743 2.856 2.963 3.078 3.22 3.34 3.454 3.586 3.729 3.863 4.018 4.193 4.4 4.636 4.862 5.111 5.361 5.618 5.886 6.199 6.489 6.666 6.725 6.693 6.377 5.855 5.314 4.768 4.196 3.653 3.163 2.757 2.333 1.959 1.618 1.281 0.969 0.685 0.443 0.19 -0.042 -0.236 -0.445 -0.67 -0.854 -1.046 -1.25 -1.408 -1.564 -1.726 -1.898 -2.084 -2.224 -2.364 -2.576 -2.724 -2.867 -2.942 -3.127 -3.34 -3.571 -3.696 -3.882 -4.087 -4.238 -4.387 -4.72 -4.911 -5.106 -5.333 -5.594 -5.906 -6.341 -7.645 -10 ,13209 ,KEBNE ,17042450,Thu Dec 23 04:43:33 CET,Thu Dec 23 06:12:02 CET,0.0 0.43 0.6 0.713 0.842 0.96 1.049 1.133 1.292 1.364 1.43 1.5 1.628 1.69 1.796 1.895 1.991 2.039 2.141 2.248 2.398 2.483 2.566 2.688 2.799 2.916 3.024 3.127 3.273 3.422 3.57 3.736 3.888 4.026 4.193 4.401 4.595 4.771 4.937 5.123 5.327 5.583 5.893 6.193 6.504 6.816 7.146 7.377 7.57 7.716 7.644 7.317 6.798 6.2 5.672 5.15 4.623 4.163 3.775 3.372 3.022 2.699 2.372 2.072 1.799 1.521 1.216 0.952 0.722 0.485 0.24 0.037 -0.172 -0.408 -0.595 -0.776 -0.956 -1.139 -1.336 -1.469 -1.606 -1.838 -1.998 -2.165 -2.26 -2.469 -2.672 -2.859 -2.949 -3.102 -3.226 -3.341 -3.466 -3.753 -3.894 -4.015 -4.157 -4.342 -4.557 -4.849 -6.222 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 4a3507fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9967 ,KEBNE ,16656548,Mon Nov 22 21:32:28 CET,Mon Nov 22 23:14:57 CET,0.0 0.739 1.324 1.812 2.23 2.579 2.864 3.361 3.593 3.817 4.039 4.417 4.609 4.966 5.294 5.609 5.762 6.04 6.309 6.716 6.972 7.214 7.552 7.856 8.135 8.442 8.744 9.103 9.467 9.814 10.203 10.573 10.937 11.347 11.78 12.192 12.644 13.132 13.655 14.172 14.735 15.366 15.932 16.541 17.205 17.928 18.596 19.151 19.459 19.092 17.869 16.469 15.054 13.669 12.345 11.11 9.895 8.814 7.704 6.701 5.838 5.037 4.253 3.488 2.754 1.988 1.325 0.764 0.174 -0.468 -1.015 -1.59 -2.178 -2.633 -3.127 -3.634 -4.164 -4.745 -5.154 -5.561 -6.164 -6.588 -7.057 -7.312 -7.837 -8.408 -9.048 -9.378 -9.921 -10.465 -10.859 -11.25 -12.077 -12.535 -13.033 -13.612 -14.257 -15.041 -16.306 -2 ,4134 ,KEBNE ,16656549,Mon Nov 22 21:32:28 CET,Mon Nov 22 23:14:42 CET,0.0 0.597 0.99 1.358 1.675 1.947 2.187 2.645 2.864 3.071 3.284 3.658 3.824 4.129 4.413 4.684 4.83 5.118 5.365 5.699 5.924 6.142 6.441 6.726 6.993 7.256 7.53 7.881 8.195 8.502 8.875 9.222 9.554 9.946 10.393 10.825 11.296 11.779 12.273 12.792 13.366 14.007 14.652 15.427 16.248 17.062 17.897 18.678 19.045 18.77 17.639 16.114 14.642 13.288 11.991 10.719 9.493 8.463 7.418 6.455 5.573 4.761 4.021 3.306 2.618 1.889 1.218 0.649 0.056 -0.614 -1.19 -1.772 -2.359 -2.807 -3.281 -3.782 -4.292 -4.836 -5.217 -5.605 -6.241 -6.729 -7.232 -7.481 -7.989 -8.517 -9.113 -9.429 -9.955 -10.477 -10.845 -11.218 -12.049 -12.544 -13.061 -13.619 -14.355 -15.253 -16.46 -3 ,31054 ,KEBNE ,16656550,Mon Nov 22 21:33:29 CET,Mon Nov 22 23:16:29 CET,0.0 0.608 1.053 1.415 1.717 2.003 2.268 2.785 3.038 3.269 3.503 3.887 4.091 4.495 4.836 5.138 5.293 5.586 5.858 6.263 6.52 6.762 7.122 7.466 7.78 8.081 8.379 8.75 9.081 9.4 9.805 10.19 10.549 10.96 11.405 11.823 12.269 12.735 13.227 13.726 14.279 14.896 15.512 16.179 16.814 17.513 18.258 18.901 19.211 18.982 17.716 16.114 14.549 12.965 11.508 10.243 9.061 7.997 6.86 5.91 5.042 4.158 3.286 2.434 1.663 0.845 0.127 -0.448 -1.072 -1.743 -2.306 -2.902 -3.524 -4.037 -4.559 -5.1 -5.692 -6.277 -6.682 -7.11 -7.774 -8.264 -8.784 -9.038 -9.544 -10.101 -10.726 -11.053 -11.587 -12.138 -12.557 -13.009 -13.982 -14.568 -15.2 -15.863 -16.622 -17.548 -18.648 -4 ,6793 ,KEBNE ,16656551,Mon Nov 22 21:33:28 CET,Mon Nov 22 23:14:15 CET,0.0 0.644 1.148 1.534 1.88 2.196 2.464 2.928 3.143 3.339 3.506 3.858 4.023 4.343 4.677 4.985 5.126 5.4 5.646 6.005 6.238 6.464 6.795 7.114 7.415 7.711 7.996 8.339 8.654 8.969 9.357 9.715 10.044 10.417 10.839 11.238 11.675 12.138 12.638 13.186 13.772 14.388 14.988 15.662 16.384 17.189 17.934 18.51 18.858 18.752 17.744 16.4 14.996 13.66 12.35 11.118 9.901 8.77 7.615 6.639 5.788 4.958 4.155 3.362 2.604 1.804 1.098 0.475 -0.175 -0.843 -1.419 -2.009 -2.606 -3.099 -3.643 -4.202 -4.779 -5.397 -5.829 -6.27 -6.95 -7.429 -7.932 -8.203 -8.751 -9.292 -9.876 -10.198 -10.742 -11.303 -11.71 -12.139 -13.086 -13.619 -14.207 -14.841 -15.508 -16.343 -17.672 -5 ,30432 ,KEBNE ,16656552,Mon Nov 22 21:33:28 CET,Mon Nov 22 23:14:45 CET,0.0 0.644 1.11 1.477 1.778 2.067 2.351 2.826 3.019 3.198 3.323 3.653 3.811 4.123 4.419 4.696 4.838 5.118 5.365 5.694 5.915 6.168 6.507 6.789 7.055 7.312 7.554 7.872 8.184 8.471 8.82 9.179 9.512 9.865 10.27 10.674 11.11 11.606 12.169 12.736 13.351 14.046 14.721 15.46 16.222 16.986 17.716 18.356 18.696 18.433 17.181 15.651 14.08 12.595 11.123 9.737 8.495 7.397 6.288 5.3 4.341 3.416 2.549 1.733 0.985 0.202 -0.505 -1.113 -1.755 -2.438 -3.035 -3.657 -4.284 -4.776 -5.269 -5.801 -6.395 -7.022 -7.46 -7.889 -8.546 -9.036 -9.521 -9.77 -10.311 -10.88 -11.473 -11.767 -12.275 -12.794 -13.189 -13.61 -14.535 -15.072 -15.688 -16.317 -16.973 -17.831 -19.114 -6 ,31476 ,KEBNE ,16656553,Mon Nov 22 21:33:29 CET,Mon Nov 22 23:17:54 CET,0.0 0.637 1.047 1.374 1.683 1.956 2.205 2.675 2.871 3.042 3.211 3.572 3.73 4.033 4.33 4.62 4.758 5.004 5.243 5.598 5.822 6.032 6.329 6.627 6.909 7.166 7.413 7.725 8.02 8.303 8.643 8.96 9.281 9.666 10.066 10.432 10.847 11.315 11.8 12.301 12.883 13.537 14.169 14.859 15.542 16.232 16.921 17.618 18.063 17.892 17.055 15.976 14.776 13.573 12.354 11.219 10.118 9.125 8.15 7.281 6.472 5.696 4.93 4.181 3.505 2.817 2.201 1.627 1.007 0.379 -0.143 -0.687 -1.242 -1.701 -2.223 -2.752 -3.274 -3.826 -4.22 -4.641 -5.33 -5.801 -6.274 -6.522 -7.043 -7.625 -8.24 -8.542 -9.041 -9.495 -9.843 -10.231 -11.141 -11.66 -12.212 -12.831 -13.518 -14.269 -15.441 -7 ,14125 ,KEBNE ,16656554,Mon Nov 22 21:33:32 CET,Mon Nov 22 23:12:00 CET,0.0 0.634 1.194 1.675 2.015 2.352 2.652 3.133 3.374 3.608 3.827 4.194 4.349 4.648 4.927 5.175 5.299 5.55 5.795 6.149 6.37 6.581 6.874 7.144 7.415 7.673 7.919 8.25 8.566 8.878 9.237 9.565 9.887 10.252 10.651 11.022 11.428 11.896 12.375 12.857 13.412 14.008 14.54 15.142 15.8 16.548 17.306 18.025 18.585 18.498 17.218 15.638 14.252 12.891 11.484 10.116 8.824 7.722 6.564 5.526 4.6 3.73 2.9 2.107 1.393 0.652 -0.021 -0.604 -1.218 -1.907 -2.489 -3.057 -3.658 -4.151 -4.668 -5.181 -5.732 -6.316 -6.727 -7.179 -7.851 -8.298 -8.765 -9.009 -9.535 -10.109 -10.716 -11.032 -11.551 -12.102 -12.502 -12.94 -13.93 -14.433 -14.972 -15.58 -16.314 -17.261 -18.546 -8 ,6885 ,KEBNE ,16656555,Mon Nov 22 21:34:32 CET,Mon Nov 22 23:22:03 CET,0.0 0.629 1.028 1.364 1.654 1.955 2.224 2.646 2.847 3.031 3.248 3.64 3.815 4.14 4.456 4.755 4.897 5.16 5.412 5.767 5.986 6.188 6.487 6.782 7.063 7.333 7.592 7.916 8.213 8.497 8.846 9.176 9.49 9.861 10.289 10.71 11.124 11.537 11.976 12.446 12.979 13.569 14.14 14.79 15.465 16.14 16.805 17.34 17.56 17.056 15.627 14.193 12.757 11.282 9.89 8.701 7.569 6.544 5.485 4.572 3.778 2.986 2.203 1.444 0.757 0.054 -0.602 -1.193 -1.798 -2.417 -2.929 -3.467 -4.05 -4.512 -4.977 -5.458 -5.977 -6.52 -6.883 -7.249 -7.859 -8.316 -8.794 -9.041 -9.548 -10.079 -10.634 -10.928 -11.441 -11.919 -12.25 -12.589 -13.357 -13.815 -14.335 -14.893 -15.561 -16.484 -17.698 -9 ,5405 ,KEBNE ,16656556,Mon Nov 22 21:34:36 CET,Mon Nov 22 23:14:21 CET,0.0 0.403 0.763 1.087 1.353 1.599 1.828 2.218 2.368 2.51 2.617 2.941 3.075 3.322 3.563 3.798 3.919 4.176 4.426 4.758 4.965 5.172 5.438 5.67 5.896 6.11 6.309 6.557 6.808 7.049 7.325 7.609 7.884 8.173 8.491 8.802 9.15 9.512 9.867 10.215 10.569 10.99 11.4 11.839 12.322 12.783 13.161 13.418 13.255 12.322 10.613 8.766 6.952 5.249 3.641 2.227 0.922 -0.269 -1.486 -2.503 -3.391 -4.235 -5.06 -5.878 -6.635 -7.419 -8.114 -8.712 -9.359 -10.05 -10.616 -11.236 -11.901 -12.398 -12.894 -13.386 -13.885 -14.39 -14.74 -15.126 -15.766 -16.23 -16.721 -16.974 -17.497 -18.038 -18.602 -18.892 -19.401 -19.904 -20.254 -20.612 -21.414 -21.87 -22.389 -22.965 -23.726 -24.769 -26.13 -10 ,10834 ,KEBNE ,16656557,Mon Nov 22 21:36:36 CET,Mon Nov 22 23:19:24 CET,0.0 0.585 1.04 1.423 1.746 2.01 2.238 2.649 2.851 3.037 3.184 3.538 3.695 4.01 4.299 4.543 4.658 4.889 5.115 5.446 5.656 5.873 6.222 6.566 6.895 7.223 7.512 7.826 8.137 8.443 8.809 9.161 9.509 9.917 10.373 10.811 11.285 11.765 12.281 12.807 13.385 14.032 14.678 15.452 16.216 17.006 17.728 18.21 18.438 18.047 16.458 14.554 12.843 11.352 9.969 8.749 7.554 6.457 5.368 4.409 3.511 2.64 1.783 0.971 0.221 -0.599 -1.324 -1.925 -2.536 -3.168 -3.688 -4.254 -4.86 -5.329 -5.803 -6.285 -6.779 -7.345 -7.774 -8.199 -8.833 -9.276 -9.732 -9.965 -10.469 -11.025 -11.587 -11.874 -12.397 -12.918 -13.27 -13.647 -14.507 -15.03 -15.579 -16.138 -16.801 -17.623 -18.69 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt deleted file mode 100644 index 86da8d7b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12467 ,KEBNE ,16656558,Mon Nov 22 21:37:40 CET,Mon Nov 22 23:20:06 CET,0.0 1.196 1.702 2.061 2.368 2.635 2.875 3.097 3.505 3.686 3.864 4.035 4.395 4.567 4.902 5.217 5.509 5.638 5.889 6.153 6.514 6.723 6.941 7.265 7.552 7.827 8.092 8.341 8.676 9.012 9.32 9.676 10.037 10.393 10.805 11.243 11.65 12.107 12.607 13.159 13.763 14.446 15.22 15.938 16.709 17.495 18.32 19.186 20.113 21.032 21.667 21.562 21.06 20.363 19.653 18.894 18.091 17.332 16.644 15.907 15.246 14.641 14.059 13.468 12.884 12.354 11.776 11.251 10.812 10.354 9.863 9.471 9.077 8.66 8.339 7.987 7.591 7.19 6.771 6.466 6.147 5.622 5.272 4.958 4.798 4.432 4.035 3.599 3.37 2.964 2.629 2.345 2.045 1.389 1.02 0.638 0.215 -0.289 -0.895 -1.622 -3.556 -2 ,6888 ,KEBNE ,16656559,Mon Nov 22 21:37:40 CET,Mon Nov 22 23:21:26 CET,0.0 0.897 1.386 1.727 2.026 2.294 2.539 2.772 3.208 3.412 3.601 3.792 4.143 4.29 4.572 4.861 5.144 5.277 5.536 5.807 6.179 6.4 6.616 6.923 7.226 7.505 7.777 8.043 8.375 8.705 9.025 9.423 9.804 10.132 10.505 10.939 11.352 11.805 12.308 12.847 13.368 13.941 14.637 15.318 16.1 16.94 17.803 18.666 19.547 20.354 20.822 20.597 20.029 19.325 18.633 17.855 17.043 16.232 15.512 14.802 14.187 13.629 13.06 12.521 11.984 11.471 10.957 10.475 10.045 9.61 9.16 8.782 8.39 7.96 7.616 7.261 6.906 6.563 6.19 5.911 5.618 5.159 4.829 4.48 4.296 3.889 3.449 3.002 2.768 2.348 2.013 1.746 1.469 0.903 0.601 0.277 -0.095 -0.567 -1.143 -1.95 -4.774 -3 ,8255 ,KEBNE ,16656560,Mon Nov 22 21:37:40 CET,Mon Nov 22 23:20:58 CET,0.0 1.436 1.867 2.225 2.551 2.864 3.127 3.362 3.81 4.015 4.22 4.423 4.768 4.926 5.224 5.53 5.855 6.004 6.278 6.542 6.921 7.16 7.392 7.741 8.065 8.373 8.663 8.933 9.29 9.636 9.947 10.321 10.702 11.081 11.501 11.955 12.407 12.892 13.39 13.886 14.392 14.956 15.592 16.238 16.986 17.787 18.666 19.541 20.364 21.168 21.773 21.535 20.873 20.135 19.298 18.418 17.599 16.811 16.091 15.29 14.516 13.84 13.225 12.64 12.094 11.588 11.055 10.564 10.137 9.698 9.199 8.739 8.291 7.855 7.51 7.153 6.763 6.336 5.903 5.612 5.283 4.717 4.324 3.926 3.734 3.36 2.962 2.52 2.287 1.881 1.496 1.185 0.856 0.177 -0.178 -0.6 -1.096 -1.614 -2.289 -3.247 -5.579 -4 ,17284 ,KEBNE ,16656561,Mon Nov 22 21:37:44 CET,Mon Nov 22 23:22:21 CET,0.0 0.915 1.296 1.634 1.969 2.259 2.529 2.773 3.234 3.436 3.615 3.769 4.106 4.257 4.567 4.874 5.156 5.291 5.549 5.796 6.153 6.38 6.605 6.92 7.218 7.516 7.792 8.044 8.358 8.656 8.961 9.349 9.734 10.1 10.536 11.008 11.423 11.887 12.382 12.897 13.438 14.058 14.761 15.423 16.23 17.084 17.916 18.761 19.628 20.425 20.981 20.799 20.181 19.41 18.542 17.65 16.771 15.941 15.23 14.463 13.774 13.162 12.535 11.921 11.343 10.809 10.256 9.762 9.31 8.834 8.337 7.909 7.465 7.01 6.663 6.303 5.928 5.53 5.116 4.824 4.525 4.05 3.703 3.34 3.152 2.766 2.351 1.907 1.673 1.263 0.936 0.669 0.379 -0.309 -0.666 -1.065 -1.529 -2.063 -2.684 -3.47 -5.272 -5 ,28328 ,KEBNE ,16656562,Mon Nov 22 21:37:40 CET,Mon Nov 22 23:21:07 CET,0.0 1.207 1.739 2.167 2.519 2.818 3.102 3.36 3.843 4.057 4.247 4.43 4.783 4.954 5.264 5.54 5.816 5.954 6.206 6.443 6.787 7.003 7.214 7.539 7.853 8.144 8.425 8.707 9.064 9.388 9.709 10.107 10.485 10.835 11.225 11.649 12.044 12.473 12.928 13.42 13.967 14.564 15.196 15.813 16.543 17.322 18.199 19.185 20.173 21.052 21.729 21.675 21.127 20.385 19.56 18.716 17.945 17.185 16.517 15.827 15.188 14.576 13.924 13.298 12.728 12.203 11.658 11.157 10.705 10.228 9.727 9.321 8.895 8.432 8.075 7.718 7.349 6.936 6.479 6.167 5.85 5.369 5.05 4.713 4.531 4.146 3.745 3.319 3.096 2.692 2.358 2.076 1.767 1.09 0.699 0.242 -0.278 -0.876 -1.568 -2.453 -4.988 -6 ,1131 ,KEBNE ,16656563,Mon Nov 22 21:37:39 CET,Mon Nov 22 23:19:34 CET,0.0 1.057 1.533 1.891 2.212 2.47 2.69 2.923 3.344 3.543 3.744 3.916 4.255 4.41 4.704 4.997 5.276 5.407 5.659 5.877 6.201 6.412 6.616 6.92 7.205 7.478 7.753 8.014 8.341 8.672 8.987 9.371 9.747 10.121 10.545 10.99 11.431 11.88 12.346 12.848 13.363 13.967 14.685 15.375 16.152 16.981 17.875 18.847 19.837 20.805 21.501 21.385 20.894 20.212 19.396 18.574 17.831 17.12 16.457 15.746 15.113 14.535 13.96 13.416 12.913 12.452 11.948 11.485 11.094 10.654 10.19 9.831 9.458 9.052 8.747 8.46 8.16 7.832 7.468 7.222 6.971 6.533 6.235 5.912 5.736 5.375 4.969 4.534 4.299 3.872 3.499 3.215 2.917 2.235 1.822 1.382 0.957 0.472 -0.167 -1.074 -3.811 -7 ,12413 ,KEBNE ,16656564,Mon Nov 22 21:37:40 CET,Mon Nov 22 23:20:11 CET,0.0 1.004 1.436 1.799 2.115 2.41 2.667 2.898 3.313 3.508 3.676 3.806 4.145 4.291 4.583 4.889 5.163 5.287 5.532 5.762 6.088 6.295 6.499 6.798 7.086 7.358 7.622 7.883 8.207 8.525 8.842 9.206 9.53 9.86 10.273 10.709 11.103 11.533 11.991 12.481 12.991 13.575 14.259 14.9 15.621 16.423 17.284 18.122 19.006 19.833 20.42 20.3 19.714 19.034 18.324 17.585 16.834 16.099 15.46 14.783 14.139 13.562 12.985 12.385 11.851 11.385 10.874 10.39 9.971 9.543 9.098 8.727 8.341 7.93 7.593 7.244 6.853 6.431 5.992 5.683 5.369 4.853 4.476 4.081 3.873 3.437 2.99 2.53 2.295 1.871 1.521 1.26 0.989 0.33 -0.05 -0.437 -0.871 -1.411 -2.003 -2.937 -5.746 -8 ,22816 ,KEBNE ,16656565,Mon Nov 22 21:37:40 CET,Mon Nov 22 23:20:02 CET,0.0 1.004 1.387 1.76 2.125 2.452 2.749 3.028 3.534 3.75 3.942 4.116 4.472 4.637 4.961 5.272 5.569 5.712 5.982 6.23 6.586 6.816 7.028 7.34 7.639 7.927 8.215 8.484 8.811 9.145 9.473 9.854 10.225 10.584 10.975 11.384 11.794 12.25 12.747 13.264 13.763 14.323 14.982 15.607 16.302 17.065 17.913 18.815 19.785 20.615 21.129 20.922 20.239 19.464 18.715 17.963 17.196 16.389 15.657 14.92 14.3 13.731 13.146 12.59 12.07 11.577 11.034 10.532 10.1 9.669 9.209 8.822 8.402 7.949 7.612 7.267 6.906 6.533 6.166 5.902 5.601 5.132 4.824 4.501 4.33 3.983 3.597 3.216 3.022 2.621 2.303 2.043 1.75 1.053 0.688 0.345 -0.079 -0.635 -1.3 -2.114 -4.401 -9 ,29805 ,KEBNE ,16656566,Mon Nov 22 21:38:43 CET,Mon Nov 22 23:22:48 CET,0.0 1.029 1.519 1.9 2.226 2.527 2.776 2.998 3.446 3.657 3.851 4.015 4.372 4.527 4.832 5.132 5.412 5.545 5.813 6.073 6.424 6.645 6.85 7.146 7.434 7.724 8.005 8.267 8.604 8.927 9.235 9.609 9.959 10.277 10.677 11.153 11.58 12.018 12.475 12.967 13.5 14.101 14.781 15.444 16.182 16.954 17.825 18.737 19.68 20.606 21.184 21.052 20.54 19.82 19.02 18.233 17.527 16.816 16.115 15.422 14.849 14.294 13.742 13.24 12.78 12.339 11.836 11.386 10.997 10.556 10.085 9.708 9.304 8.867 8.523 8.151 7.756 7.335 6.888 6.588 6.283 5.786 5.431 5.068 4.886 4.511 4.123 3.686 3.454 3.036 2.676 2.389 2.085 1.455 1.097 0.704 0.29 -0.161 -0.721 -1.51 -4.27 -10 ,31543 ,KEBNE ,16656567,Mon Nov 22 21:38:43 CET,Mon Nov 22 23:22:20 CET,0.0 1.478 1.891 2.239 2.552 2.811 3.032 3.257 3.662 3.853 4.05 4.235 4.593 4.76 5.071 5.358 5.669 5.832 6.13 6.407 6.79 7.024 7.24 7.547 7.854 8.129 8.382 8.63 8.94 9.238 9.544 9.905 10.24 10.568 10.948 11.384 11.792 12.239 12.73 13.233 13.741 14.322 14.992 15.624 16.348 17.127 17.978 18.857 19.759 20.622 21.133 20.914 20.36 19.657 18.866 18.045 17.249 16.456 15.749 15.043 14.424 13.858 13.283 12.73 12.226 11.749 11.234 10.77 10.352 9.925 9.493 9.107 8.661 8.168 7.799 7.437 7.075 6.694 6.249 5.924 5.605 5.136 4.789 4.414 4.222 3.83 3.457 3.061 2.841 2.435 2.097 1.842 1.554 0.849 0.489 0.148 -0.227 -0.665 -1.167 -1.83 -3.743 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index 38d7f7c4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11281 ,KEBNE ,17023541,Wed Dec 22 08:14:54 CET,Wed Dec 22 10:00:17 CET,0.0 2.233 2.628 2.976 3.284 3.58 3.871 4.119 4.54 4.732 4.897 5.003 5.355 5.503 5.807 6.096 6.379 6.524 6.81 7.089 7.485 7.757 8.037 8.449 8.822 9.161 9.485 9.787 10.175 10.543 10.902 11.348 11.793 12.214 12.694 13.235 13.759 14.351 15.002 15.729 16.528 17.367 18.346 19.385 20.626 22.061 23.711 25.558 27.696 30.187 33.064 35.04 35.783 35.974 35.904 35.741 35.615 35.491 35.329 35.063 34.762 34.492 34.214 33.921 33.619 33.322 32.998 32.711 32.457 32.173 31.868 31.622 31.37 31.101 30.887 30.669 30.462 30.221 29.946 29.755 29.551 29.226 28.989 28.752 28.627 28.305 27.958 27.637 27.477 27.141 26.913 26.699 26.466 25.975 25.713 25.436 25.13 24.784 24.333 23.601 20.567 -3 ,15009 ,KEBNE ,17023543,Wed Dec 22 08:14:58 CET,Wed Dec 22 09:56:30 CET,0.0 2.086 2.604 2.951 3.263 3.513 3.737 3.947 4.334 4.524 4.706 4.827 5.179 5.331 5.636 5.934 6.184 6.308 6.572 6.822 7.204 7.475 7.744 8.118 8.467 8.82 9.158 9.466 9.861 10.251 10.632 11.106 11.565 12.007 12.532 13.172 13.803 14.468 15.159 15.893 16.663 17.513 18.491 19.503 20.694 21.98 23.48 25.179 27.157 29.517 32.3 34.374 35.319 35.746 35.908 35.888 35.779 35.604 35.392 35.125 34.873 34.626 34.358 34.091 33.833 33.577 33.282 33.013 32.787 32.561 32.33 32.119 31.877 31.62 31.417 31.191 30.961 30.749 30.519 30.34 30.15 29.839 29.602 29.355 29.234 28.98 28.714 28.434 28.287 27.962 27.737 27.524 27.295 26.784 26.506 26.217 25.925 25.598 25.17 24.599 22.146 -8 ,25357 ,KEBNE ,17023548,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:02:00 CET,0.0 5.774 6.394 6.803 7.163 7.455 7.703 7.934 8.354 8.544 8.71 8.807 9.153 9.313 9.614 9.913 10.191 10.319 10.569 10.821 11.194 11.425 11.642 11.969 12.287 12.596 12.893 13.179 13.549 13.922 14.298 14.74 15.155 15.558 16.032 16.565 17.081 17.672 18.32 19.01 19.718 20.514 21.477 22.447 23.576 24.856 26.307 27.935 29.88 32.131 34.756 36.743 37.729 38.179 38.325 38.336 38.217 38.02 37.793 37.503 37.243 36.999 36.718 36.421 36.159 35.922 35.656 35.406 35.191 34.967 34.71 34.471 34.213 33.953 33.75 33.541 33.31 33.043 32.762 32.574 32.388 32.07 31.846 31.628 31.504 31.24 30.944 30.625 30.476 30.165 29.987 29.806 29.603 29.15 28.884 28.586 28.273 27.912 27.396 26.75 22.995 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index e137d381..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9602 ,KEBNE ,16656568,Mon Nov 22 21:38:44 CET,Mon Nov 22 23:22:01 CET,0.0 1.367 1.891 2.341 2.683 2.935 3.18 3.439 3.886 4.07 4.243 4.392 4.716 4.859 5.117 5.356 5.593 5.717 5.954 6.162 6.465 6.669 6.859 7.111 7.354 7.575 7.781 7.989 8.274 8.534 8.744 8.991 9.228 9.454 9.717 9.988 10.241 10.518 10.803 11.082 11.361 11.72 12.129 12.49 12.859 13.208 13.535 13.747 13.824 13.654 12.849 11.456 10.064 8.79 7.635 6.549 5.602 4.744 3.993 3.28 2.721 2.21 1.706 1.239 0.794 0.374 -0.06 -0.446 -0.784 -1.138 -1.497 -1.779 -2.064 -2.362 -2.599 -2.841 -3.083 -3.345 -3.622 -3.808 -3.999 -4.302 -4.519 -4.77 -4.9 -5.149 -5.409 -5.664 -5.789 -6.113 -6.205 -6.376 -6.553 -6.904 -7.131 -7.391 -7.668 -7.979 -8.311 -8.71 -10.576 -2 ,29122 ,KEBNE ,16654373,Mon Nov 22 06:33:22 CET,Mon Nov 22 08:15:27 CET,0.0 1.189 1.593 1.919 2.207 2.459 2.711 2.965 3.366 3.539 3.709 3.848 4.17 4.313 4.595 4.849 5.059 5.16 5.357 5.537 5.788 5.945 6.095 6.319 6.526 6.716 6.902 7.086 7.334 7.566 7.783 8.083 8.373 8.638 8.944 9.285 9.609 9.946 10.31 10.685 11.038 11.411 11.816 12.179 12.553 12.936 13.311 13.63 13.82 13.662 12.875 11.437 9.959 8.597 7.382 6.223 5.2 4.269 3.463 2.668 1.969 1.342 0.755 0.234 -0.213 -0.605 -1.012 -1.382 -1.694 -2.031 -2.414 -2.722 -3.023 -3.333 -3.584 -3.849 -4.107 -4.385 -4.685 -4.881 -5.085 -5.45 -5.725 -6.025 -6.176 -6.473 -6.784 -7.113 -7.292 -7.665 -7.856 -8.061 -8.287 -8.823 -9.114 -9.42 -9.721 -10.017 -10.353 -10.744 -11.938 -3 ,7766 ,KEBNE ,16656570,Mon Nov 22 21:38:43 CET,Mon Nov 22 23:22:32 CET,0.0 0.952 1.532 2.008 2.399 2.737 3.047 3.312 3.758 3.961 4.156 4.354 4.7 4.858 5.152 5.422 5.672 5.802 6.056 6.281 6.595 6.788 6.987 7.283 7.557 7.812 8.053 8.286 8.586 8.864 9.11 9.388 9.638 9.863 10.157 10.507 10.814 11.153 11.516 11.847 12.182 12.567 12.986 13.387 13.819 14.274 14.804 15.259 15.452 15.323 14.534 12.987 11.45 10.141 8.921 7.814 6.867 5.997 5.247 4.465 3.764 3.143 2.556 2.012 1.512 1.028 0.522 0.085 -0.307 -0.723 -1.149 -1.468 -1.773 -2.098 -2.355 -2.618 -2.882 -3.159 -3.447 -3.644 -3.842 -4.146 -4.37 -4.595 -4.706 -4.947 -5.196 -5.475 -5.628 -5.967 -6.078 -6.226 -6.371 -6.694 -6.875 -7.088 -7.339 -7.607 -7.941 -8.374 -9.768 -4 ,28795 ,KEBNE ,16656571,Mon Nov 22 21:38:43 CET,Mon Nov 22 23:21:39 CET,0.0 1.636 2.242 2.65 2.968 3.27 3.547 3.808 4.271 4.488 4.669 4.848 5.194 5.343 5.665 5.987 6.26 6.38 6.596 6.791 7.053 7.208 7.364 7.594 7.816 8.025 8.22 8.405 8.64 8.865 9.088 9.383 9.675 9.942 10.251 10.622 10.94 11.242 11.6 11.986 12.365 12.795 13.269 13.685 14.16 14.638 15.013 15.32 15.579 15.545 14.66 13.096 11.582 10.14 8.848 7.662 6.638 5.742 4.983 4.206 3.521 2.931 2.391 1.851 1.34 0.877 0.386 -0.039 -0.398 -0.778 -1.181 -1.515 -1.861 -2.216 -2.48 -2.746 -3.035 -3.35 -3.694 -3.934 -4.173 -4.552 -4.815 -5.092 -5.23 -5.491 -5.769 -6.078 -6.241 -6.6 -6.756 -6.938 -7.138 -7.587 -7.812 -8.069 -8.38 -8.73 -9.111 -9.585 -10.863 -5 ,22906 ,KEBNE ,16654376,Mon Nov 22 06:33:22 CET,Mon Nov 22 08:14:47 CET,0.0 1.064 1.488 1.822 2.121 2.408 2.668 2.888 3.309 3.482 3.629 3.733 4.037 4.163 4.417 4.66 4.86 4.96 5.184 5.411 5.727 5.916 6.099 6.357 6.592 6.821 7.041 7.257 7.538 7.802 8.052 8.338 8.612 8.871 9.161 9.484 9.784 10.087 10.407 10.771 11.132 11.485 11.885 12.264 12.636 13.003 13.346 13.66 13.971 14.006 13.216 11.574 9.995 8.545 7.226 6.05 5.013 4.037 3.229 2.453 1.782 1.192 0.59 0.035 -0.457 -0.929 -1.404 -1.811 -2.186 -2.571 -2.98 -3.325 -3.659 -4.002 -4.278 -4.574 -4.866 -5.146 -5.439 -5.637 -5.835 -6.158 -6.384 -6.61 -6.721 -6.961 -7.241 -7.537 -7.689 -8.028 -8.155 -8.322 -8.488 -8.866 -9.079 -9.298 -9.551 -9.827 -10.119 -10.512 -11.955 -6 ,46 ,KEBNE ,16656573,Mon Nov 22 21:39:46 CET,Mon Nov 22 23:23:13 CET,0.0 1.064 1.509 1.891 2.202 2.478 2.707 2.94 3.42 3.64 3.832 3.984 4.32 4.461 4.736 5.004 5.259 5.383 5.616 5.81 6.071 6.258 6.442 6.679 6.896 7.103 7.298 7.488 7.741 7.99 8.216 8.478 8.721 8.943 9.199 9.481 9.748 10.019 10.291 10.573 10.857 11.151 11.444 11.739 12.084 12.385 12.609 12.767 12.778 12.493 11.687 10.275 8.887 7.622 6.508 5.511 4.622 3.822 3.122 2.414 1.797 1.247 0.735 0.252 -0.218 -0.651 -1.096 -1.48 -1.817 -2.167 -2.529 -2.827 -3.133 -3.46 -3.717 -3.975 -4.234 -4.508 -4.803 -5.006 -5.224 -5.597 -5.869 -6.169 -6.314 -6.599 -6.93 -7.29 -7.481 -7.871 -8.09 -8.315 -8.556 -9.05 -9.284 -9.527 -9.85 -10.274 -10.758 -11.382 -12.849 -7 ,31979 ,KEBNE ,16656574,Mon Nov 22 21:39:47 CET,Mon Nov 22 23:24:18 CET,0.0 1.535 1.976 2.327 2.604 2.843 3.063 3.283 3.621 3.763 3.909 4.013 4.319 4.43 4.638 4.845 5.03 5.116 5.301 5.478 5.727 5.894 6.051 6.277 6.494 6.699 6.892 7.067 7.28 7.484 7.685 7.93 8.17 8.403 8.663 8.94 9.208 9.481 9.749 10.022 10.274 10.559 10.887 11.143 11.383 11.584 11.754 11.924 11.971 11.741 10.948 9.623 8.379 7.208 6.107 5.077 4.14 3.293 2.573 1.831 1.198 0.64 0.088 -0.446 -0.921 -1.346 -1.789 -2.18 -2.522 -2.867 -3.214 -3.514 -3.834 -4.154 -4.395 -4.644 -4.894 -5.159 -5.446 -5.651 -5.86 -6.188 -6.408 -6.635 -6.755 -6.987 -7.22 -7.475 -7.606 -7.941 -8.061 -8.236 -8.442 -8.823 -9.021 -9.24 -9.453 -9.711 -10.023 -10.475 -12.18 -8 ,31938 ,KEBNE ,16654379,Mon Nov 22 06:33:23 CET,Mon Nov 22 08:14:21 CET,0.0 1.089 1.519 1.811 2.085 2.298 2.49 2.696 3.104 3.282 3.437 3.547 3.87 4.004 4.242 4.472 4.693 4.8 4.998 5.182 5.429 5.582 5.734 5.949 6.165 6.373 6.562 6.738 6.965 7.191 7.404 7.658 7.896 8.097 8.329 8.578 8.819 9.105 9.386 9.637 9.892 10.189 10.508 10.795 11.069 11.312 11.55 11.775 11.889 11.715 10.952 9.531 7.951 6.477 5.274 4.242 3.324 2.487 1.744 0.978 0.323 -0.236 -0.75 -1.257 -1.742 -2.198 -2.689 -3.123 -3.492 -3.864 -4.243 -4.556 -4.876 -5.23 -5.511 -5.782 -6.051 -6.345 -6.677 -6.902 -7.124 -7.452 -7.662 -7.885 -7.999 -8.232 -8.492 -8.767 -8.912 -9.255 -9.388 -9.559 -9.74 -10.13 -10.349 -10.571 -10.811 -11.102 -11.444 -11.845 -13.005 -9 ,15363 ,KEBNE ,16656576,Mon Nov 22 21:39:47 CET,Mon Nov 22 23:27:09 CET,0.0 1.236 1.677 2.025 2.317 2.585 2.805 2.981 3.274 3.418 3.567 3.674 3.986 4.122 4.366 4.589 4.805 4.904 5.101 5.292 5.566 5.742 5.906 6.138 6.348 6.551 6.749 6.937 7.177 7.408 7.615 7.849 8.072 8.287 8.548 8.831 9.111 9.421 9.727 10.026 10.306 10.594 10.889 11.205 11.583 11.96 12.34 12.697 12.961 12.758 11.717 10.186 8.691 7.256 5.988 4.828 3.76 2.817 2.034 1.248 0.588 0.0 -0.585 -1.135 -1.646 -2.114 -2.598 -3.033 -3.411 -3.816 -4.223 -4.558 -4.917 -5.286 -5.572 -5.871 -6.173 -6.495 -6.841 -7.082 -7.308 -7.62 -7.836 -8.088 -8.219 -8.463 -8.713 -8.981 -9.139 -9.481 -9.578 -9.741 -9.92 -10.312 -10.518 -10.728 -10.988 -11.293 -11.625 -12.065 -13.459 -10 ,21190 ,KEBNE ,16656577,Mon Nov 22 21:39:45 CET,Mon Nov 22 23:22:31 CET,0.0 1.685 2.199 2.509 2.753 2.989 3.217 3.415 3.79 3.973 4.127 4.221 4.53 4.665 4.909 5.138 5.365 5.472 5.657 5.833 6.109 6.275 6.426 6.656 6.876 7.075 7.259 7.434 7.671 7.888 8.081 8.331 8.578 8.832 9.131 9.455 9.75 10.028 10.328 10.696 11.062 11.42 11.879 12.307 12.716 13.098 13.446 13.766 13.867 13.629 12.899 11.353 9.845 8.534 7.331 6.19 5.136 4.189 3.382 2.582 1.911 1.32 0.767 0.246 -0.26 -0.718 -1.182 -1.599 -1.971 -2.362 -2.751 -3.068 -3.401 -3.763 -4.05 -4.334 -4.626 -4.941 -5.27 -5.5 -5.747 -6.117 -6.374 -6.646 -6.79 -7.085 -7.379 -7.666 -7.818 -8.186 -8.348 -8.528 -8.736 -9.2 -9.423 -9.652 -9.914 -10.29 -10.728 -11.216 -12.384 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index 374de5c3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -5 ,17275 ,KEBNE ,16654387,Mon Nov 22 06:33:23 CET,Mon Nov 22 08:14:35 CET,0.0 2.353 2.743 3.016 3.227 3.447 3.694 3.923 4.328 4.528 4.72 4.889 5.236 5.398 5.705 5.995 6.261 6.397 6.656 6.907 7.287 7.519 7.734 8.024 8.298 8.57 8.843 9.117 9.477 9.815 10.125 10.506 10.877 11.242 11.677 12.172 12.653 13.186 13.76 14.364 15.006 15.757 16.653 17.58 18.621 19.71 20.94 22.217 23.594 25.139 26.806 27.723 27.904 27.828 27.585 27.226 26.852 26.443 26.05 25.635 25.208 24.798 24.407 24.017 23.622 23.26 22.904 22.559 22.244 21.948 21.656 21.411 21.15 20.856 20.634 20.401 20.16 19.916 19.648 19.459 19.262 18.928 18.687 18.428 18.295 18.014 17.719 17.434 17.289 16.989 16.82 16.626 16.427 16.046 15.846 15.582 15.268 14.905 14.468 13.82 9.301 -6 ,13364 ,KEBNE ,16656583,Mon Nov 22 21:40:49 CET,Mon Nov 22 23:24:13 CET,0.0 2.568 3.083 3.469 3.789 4.074 4.344 4.569 4.915 5.07 5.228 5.361 5.687 5.826 6.109 6.378 6.615 6.734 6.986 7.225 7.563 7.763 7.957 8.249 8.524 8.79 9.047 9.294 9.609 9.915 10.207 10.562 10.931 11.288 11.674 12.106 12.535 13.016 13.528 14.051 14.602 15.255 16.043 16.834 17.776 18.803 19.941 21.18 22.567 24.231 26.187 27.592 28.242 28.513 28.631 28.658 28.607 28.501 28.346 28.146 27.952 27.773 27.586 27.387 27.198 27.027 26.831 26.652 26.508 26.358 26.181 26.033 25.891 25.733 25.597 25.446 25.289 25.124 24.945 24.819 24.683 24.455 24.305 24.156 24.065 23.84 23.597 23.336 23.208 22.921 22.817 22.667 22.51 22.174 21.986 21.811 21.602 21.292 20.905 20.465 17.915 -9 ,20847 ,KEBNE ,16654391,Mon Nov 22 06:33:23 CET,Mon Nov 22 08:16:05 CET,0.0 2.341 2.911 3.263 3.547 3.793 4.02 4.241 4.632 4.799 4.965 5.118 5.465 5.654 6.011 6.318 6.602 6.745 7.032 7.275 7.582 7.772 7.971 8.283 8.585 8.868 9.146 9.418 9.746 10.059 10.381 10.775 11.134 11.478 11.902 12.378 12.81 13.288 13.794 14.324 14.899 15.538 16.292 17.04 17.895 18.836 19.912 21.141 22.504 23.934 25.415 26.321 26.475 26.322 26.08 25.735 25.341 24.96 24.583 24.151 23.765 23.427 23.107 22.791 22.465 22.136 21.776 21.445 21.148 20.833 20.512 20.258 19.985 19.685 19.453 19.203 18.936 18.654 18.35 18.147 17.939 17.618 17.384 17.134 17.006 16.719 16.404 16.083 15.929 15.6 15.407 15.225 15.014 14.53 14.278 14.026 13.747 13.391 12.902 12.234 9.686 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt deleted file mode 100644 index a0b81a05..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9816 ,KEBNE ,16654413,Mon Nov 22 06:35:25 CET,Mon Nov 22 08:12:27 CET,0.0 0.418 0.578 0.708 0.842 0.991 1.134 1.25 1.438 1.517 1.595 1.661 1.844 1.937 2.106 2.252 2.392 2.458 2.58 2.701 2.889 3.015 3.129 3.278 3.415 3.553 3.7 3.842 4.021 4.191 4.354 4.565 4.758 4.933 5.141 5.37 5.592 5.837 6.101 6.388 6.664 6.959 7.29 7.607 7.993 8.399 8.812 9.252 9.678 10.109 10.469 10.404 10.045 9.625 9.191 8.715 8.248 7.816 7.456 7.081 6.737 6.45 6.18 5.915 5.647 5.38 5.102 4.844 4.619 4.396 4.171 3.989 3.795 3.579 3.406 3.22 3.03 2.838 2.641 2.51 2.374 2.15 1.991 1.829 1.743 1.554 1.361 1.156 1.042 0.836 0.686 0.551 0.416 0.137 -0.018 -0.198 -0.387 -0.594 -0.815 -1.098 -2.292 -2 ,26260 ,KEBNE ,16654414,Mon Nov 22 06:35:25 CET,Mon Nov 22 08:11:56 CET,0.0 0.32 0.497 0.633 0.755 0.872 0.987 1.099 1.293 1.382 1.465 1.54 1.722 1.804 1.97 2.13 2.276 2.341 2.463 2.579 2.754 2.876 2.986 3.132 3.279 3.419 3.558 3.698 3.872 4.054 4.239 4.443 4.631 4.82 5.045 5.281 5.5 5.73 5.985 6.243 6.502 6.799 7.156 7.538 7.962 8.373 8.805 9.227 9.644 10.065 10.342 10.219 9.801 9.287 8.832 8.42 7.99 7.537 7.112 6.706 6.372 6.052 5.76 5.502 5.251 5.002 4.734 4.503 4.303 4.084 3.841 3.647 3.441 3.207 3.027 2.851 2.668 2.471 2.268 2.133 1.988 1.739 1.554 1.364 1.276 1.098 0.886 0.67 0.563 0.347 0.223 0.109 -0.023 -0.319 -0.5 -0.708 -0.949 -1.2 -1.449 -1.796 -2.808 -3 ,12757 ,KEBNE ,16654415,Mon Nov 22 06:35:25 CET,Mon Nov 22 08:12:28 CET,0.0 0.329 0.51 0.696 0.871 1.014 1.147 1.257 1.471 1.574 1.678 1.782 1.974 2.067 2.224 2.367 2.509 2.58 2.728 2.87 3.051 3.164 3.276 3.44 3.591 3.742 3.9 4.053 4.239 4.42 4.59 4.777 4.973 5.167 5.381 5.619 5.837 6.061 6.305 6.558 6.824 7.145 7.514 7.86 8.227 8.608 9.012 9.41 9.822 10.235 10.483 10.254 9.874 9.481 9.059 8.59 8.164 7.76 7.397 7.034 6.702 6.362 6.028 5.741 5.472 5.214 4.951 4.703 4.474 4.239 3.999 3.797 3.575 3.347 3.183 3.022 2.853 2.673 2.483 2.347 2.205 1.973 1.804 1.638 1.555 1.365 1.164 0.968 0.857 0.644 0.491 0.362 0.241 -0.028 -0.178 -0.339 -0.536 -0.78 -1.058 -1.383 -2.157 -4 ,27027 ,KEBNE ,16656591,Mon Nov 22 21:41:56 CET,Mon Nov 22 23:19:09 CET,0.0 0.294 0.483 0.649 0.781 0.923 1.073 1.188 1.39 1.481 1.567 1.651 1.834 1.921 2.089 2.229 2.355 2.415 2.537 2.66 2.839 2.951 3.066 3.234 3.389 3.542 3.677 3.802 3.972 4.138 4.297 4.505 4.714 4.891 5.101 5.345 5.564 5.813 6.076 6.341 6.614 6.912 7.246 7.565 7.934 8.32 8.77 9.27 9.786 10.265 10.487 10.169 9.712 9.291 8.851 8.384 7.964 7.589 7.219 6.839 6.528 6.249 5.964 5.654 5.346 5.063 4.795 4.577 4.381 4.163 3.917 3.719 3.522 3.295 3.126 2.95 2.765 2.571 2.362 2.229 2.083 1.846 1.69 1.527 1.443 1.259 1.059 0.852 0.739 0.531 0.407 0.29 0.162 -0.106 -0.262 -0.435 -0.62 -0.83 -1.063 -1.342 -2.295 -5 ,26493 ,KEBNE ,16654417,Mon Nov 22 06:35:25 CET,Mon Nov 22 08:12:32 CET,0.0 0.385 0.582 0.75 0.885 1.002 1.124 1.233 1.436 1.538 1.64 1.729 1.905 1.986 2.153 2.303 2.447 2.52 2.665 2.805 2.994 3.118 3.241 3.418 3.565 3.701 3.839 3.972 4.15 4.321 4.496 4.706 4.893 5.076 5.291 5.531 5.746 5.971 6.205 6.461 6.762 7.09 7.445 7.805 8.211 8.646 9.103 9.565 10.031 10.422 10.707 10.569 10.153 9.659 9.212 8.791 8.34 7.901 7.524 7.121 6.741 6.416 6.124 5.829 5.538 5.281 5.008 4.75 4.544 4.344 4.121 3.921 3.724 3.528 3.358 3.18 2.993 2.802 2.617 2.481 2.33 2.1 1.934 1.763 1.678 1.492 1.3 1.118 1.025 0.827 0.696 0.569 0.436 0.163 0.013 -0.148 -0.351 -0.563 -0.822 -1.137 -2.124 -6 ,29367 ,KEBNE ,16656593,Mon Nov 22 21:41:52 CET,Mon Nov 22 23:20:45 CET,0.0 0.513 0.736 0.876 1.006 1.122 1.224 1.335 1.554 1.65 1.739 1.802 1.981 2.064 2.219 2.348 2.478 2.55 2.685 2.794 2.957 3.066 3.17 3.323 3.473 3.619 3.754 3.884 4.061 4.232 4.398 4.613 4.813 4.993 5.206 5.452 5.679 5.936 6.232 6.517 6.775 7.08 7.444 7.8 8.188 8.583 8.998 9.385 9.776 10.175 10.345 10.063 9.625 9.19 8.742 8.281 7.895 7.512 7.121 6.701 6.325 6.008 5.73 5.457 5.196 4.94 4.676 4.442 4.207 3.967 3.726 3.518 3.316 3.116 2.945 2.759 2.569 2.375 2.181 2.055 1.927 1.717 1.553 1.383 1.294 1.092 0.894 0.697 0.593 0.398 0.275 0.152 0.026 -0.226 -0.365 -0.535 -0.723 -0.914 -1.141 -1.472 -2.356 -7 ,7164 ,KEBNE ,16656594,Mon Nov 22 21:41:52 CET,Mon Nov 22 23:21:51 CET,0.0 0.378 0.597 0.765 0.907 1.043 1.181 1.301 1.507 1.605 1.703 1.798 1.974 2.055 2.219 2.358 2.489 2.559 2.691 2.816 3.014 3.143 3.263 3.435 3.591 3.74 3.889 4.027 4.206 4.371 4.523 4.715 4.898 5.076 5.279 5.501 5.712 5.936 6.179 6.434 6.687 6.983 7.344 7.682 8.038 8.438 8.885 9.318 9.756 10.161 10.393 10.126 9.636 9.177 8.787 8.382 7.949 7.531 7.156 6.763 6.416 6.119 5.84 5.544 5.257 4.997 4.736 4.489 4.273 4.054 3.804 3.594 3.377 3.158 3.005 2.839 2.654 2.468 2.273 2.136 1.987 1.755 1.603 1.44 1.356 1.18 0.982 0.775 0.674 0.477 0.353 0.229 0.1 -0.185 -0.338 -0.498 -0.682 -0.907 -1.162 -1.462 -2.571 -8 ,10155 ,KEBNE ,16654420,Mon Nov 22 06:35:26 CET,Mon Nov 22 08:12:37 CET,0.0 0.417 0.606 0.764 0.899 1.029 1.163 1.285 1.476 1.564 1.657 1.744 1.922 2.002 2.149 2.287 2.43 2.496 2.619 2.74 2.92 3.036 3.149 3.309 3.457 3.605 3.758 3.907 4.097 4.285 4.472 4.685 4.882 5.077 5.294 5.536 5.76 5.987 6.241 6.517 6.805 7.127 7.471 7.806 8.177 8.56 9.024 9.519 9.971 10.34 10.555 10.359 9.97 9.494 9.007 8.541 8.133 7.774 7.424 7.044 6.709 6.407 6.131 5.864 5.602 5.349 5.08 4.859 4.659 4.429 4.184 3.962 3.742 3.529 3.361 3.179 2.981 2.775 2.557 2.407 2.255 2.018 1.851 1.684 1.601 1.432 1.259 1.067 0.957 0.734 0.568 0.45 0.332 0.034 -0.133 -0.303 -0.486 -0.709 -0.999 -1.339 -2.499 -9 ,7675 ,KEBNE ,16654421,Mon Nov 22 06:35:26 CET,Mon Nov 22 08:12:32 CET,0.0 0.448 0.706 0.882 1.005 1.119 1.221 1.333 1.546 1.638 1.726 1.79 1.962 2.036 2.18 2.311 2.446 2.518 2.66 2.795 2.984 3.102 3.207 3.358 3.517 3.671 3.803 3.933 4.111 4.279 4.429 4.61 4.784 4.946 5.139 5.369 5.587 5.822 6.077 6.325 6.576 6.849 7.149 7.45 7.789 8.153 8.572 9.02 9.468 9.839 10.02 9.869 9.513 9.068 8.616 8.177 7.75 7.363 7.034 6.651 6.295 6.01 5.738 5.457 5.196 4.963 4.724 4.496 4.289 4.085 3.858 3.656 3.434 3.201 3.024 2.841 2.646 2.434 2.231 2.101 1.96 1.722 1.548 1.386 1.307 1.137 0.962 0.78 0.681 0.478 0.354 0.232 0.097 -0.194 -0.349 -0.511 -0.688 -0.901 -1.16 -1.467 -2.316 -10 ,17322 ,KEBNE ,16656597,Mon Nov 22 21:42:54 CET,Mon Nov 22 23:21:10 CET,0.0 0.301 0.5 0.698 0.865 0.995 1.101 1.219 1.424 1.518 1.62 1.707 1.889 1.979 2.135 2.273 2.413 2.476 2.597 2.722 2.913 3.032 3.14 3.307 3.455 3.594 3.738 3.873 4.049 4.216 4.373 4.566 4.757 4.941 5.151 5.377 5.591 5.836 6.103 6.39 6.684 6.994 7.34 7.692 8.103 8.521 8.953 9.379 9.847 10.284 10.499 10.349 10.022 9.617 9.196 8.757 8.303 7.876 7.506 7.124 6.769 6.444 6.128 5.838 5.563 5.313 5.072 4.843 4.629 4.405 4.174 3.965 3.743 3.526 3.356 3.17 2.982 2.779 2.567 2.43 2.275 2.021 1.869 1.705 1.614 1.435 1.235 1.024 0.912 0.691 0.53 0.399 0.271 -0.011 -0.158 -0.312 -0.508 -0.708 -0.986 -1.345 -2.157 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt deleted file mode 100644 index 2db2793d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14545 ,KEBNE ,16656598,Mon Nov 22 21:42:54 CET,Mon Nov 22 23:23:31 CET,0.0 0.363 0.548 0.735 0.893 1.04 1.172 1.285 1.499 1.595 1.681 1.762 1.881 1.945 2.06 2.174 2.288 2.338 2.444 2.546 2.67 2.743 2.819 2.936 3.047 3.146 3.248 3.358 3.496 3.612 3.729 3.884 4.01 4.128 4.276 4.452 4.626 4.796 4.953 5.132 5.308 5.486 5.673 5.854 6.056 6.236 6.393 6.533 6.654 6.612 6.27 5.666 5.044 4.445 3.899 3.418 2.968 2.518 2.12 1.75 1.442 1.167 0.906 0.629 0.354 0.115 -0.121 -0.342 -0.524 -0.704 -0.904 -1.074 -1.255 -1.445 -1.588 -1.742 -1.906 -2.072 -2.228 -2.333 -2.451 -2.636 -2.768 -2.907 -2.978 -3.133 -3.308 -3.477 -3.558 -3.71 -3.833 -3.93 -4.029 -4.294 -4.438 -4.586 -4.752 -4.925 -5.184 -5.554 -6.747 -2 ,26444 ,KEBNE ,16656599,Mon Nov 22 21:42:54 CET,Mon Nov 22 23:23:13 CET,0.0 0.436 0.608 0.777 0.896 0.981 1.075 1.163 1.311 1.377 1.438 1.505 1.624 1.671 1.773 1.88 1.99 2.04 2.121 2.209 2.34 2.414 2.482 2.573 2.668 2.767 2.867 2.963 3.084 3.204 3.325 3.455 3.583 3.701 3.823 3.974 4.121 4.281 4.446 4.62 4.803 4.999 5.239 5.477 5.73 5.991 6.232 6.463 6.68 6.694 6.353 5.78 5.172 4.579 4.054 3.559 3.106 2.681 2.266 1.861 1.526 1.192 0.886 0.614 0.364 0.128 -0.139 -0.373 -0.575 -0.796 -1.014 -1.179 -1.357 -1.546 -1.696 -1.849 -2.003 -2.157 -2.307 -2.42 -2.546 -2.747 -2.885 -3.018 -3.087 -3.239 -3.4 -3.57 -3.66 -3.817 -3.935 -4.034 -4.141 -4.401 -4.549 -4.701 -4.876 -5.052 -5.231 -5.491 -6.312 -5 ,32741 ,KEBNE ,16656602,Mon Nov 22 21:43:57 CET,Mon Nov 22 23:24:02 CET,0.0 0.437 0.624 0.808 0.952 1.068 1.184 1.291 1.469 1.548 1.618 1.679 1.789 1.843 1.958 2.06 2.159 2.207 2.297 2.381 2.506 2.585 2.659 2.766 2.871 2.978 3.079 3.17 3.287 3.415 3.536 3.668 3.798 3.931 4.084 4.238 4.383 4.522 4.676 4.861 5.03 5.2 5.421 5.641 5.85 6.035 6.204 6.348 6.455 6.493 6.235 5.612 4.927 4.258 3.67 3.14 2.679 2.229 1.826 1.418 1.059 0.736 0.429 0.159 -0.089 -0.32 -0.559 -0.787 -0.977 -1.163 -1.37 -1.528 -1.695 -1.888 -2.029 -2.185 -2.354 -2.519 -2.687 -2.813 -2.947 -3.147 -3.278 -3.415 -3.494 -3.667 -3.854 -4.042 -4.137 -4.315 -4.469 -4.566 -4.673 -4.917 -5.053 -5.222 -5.414 -5.595 -5.809 -6.082 -6.943 -6 ,29603 ,KEBNE ,16656603,Mon Nov 22 21:43:57 CET,Mon Nov 22 23:26:35 CET,0.0 0.471 0.745 0.936 1.049 1.154 1.268 1.364 1.527 1.617 1.703 1.775 1.899 1.964 2.096 2.242 2.363 2.405 2.488 2.581 2.72 2.806 2.891 3.008 3.125 3.243 3.356 3.461 3.59 3.714 3.846 4.003 4.133 4.255 4.393 4.537 4.678 4.823 4.987 5.167 5.339 5.518 5.71 5.914 6.165 6.388 6.601 6.8 6.951 6.982 6.758 6.24 5.673 5.106 4.511 3.967 3.484 3.052 2.686 2.295 1.96 1.673 1.404 1.148 0.926 0.717 0.483 0.263 0.048 -0.17 -0.38 -0.55 -0.73 -0.914 -1.061 -1.224 -1.393 -1.562 -1.74 -1.875 -2.019 -2.23 -2.37 -2.513 -2.585 -2.719 -2.869 -3.044 -3.136 -3.3 -3.434 -3.551 -3.679 -3.94 -4.089 -4.257 -4.439 -4.635 -4.849 -5.21 -6.125 -7 ,667 ,KEBNE ,16654441,Mon Nov 22 06:36:31 CET,Mon Nov 22 08:13:20 CET,0.0 0.377 0.529 0.655 0.769 0.881 0.997 1.098 1.274 1.355 1.425 1.483 1.597 1.648 1.748 1.856 1.97 2.024 2.125 2.213 2.326 2.404 2.492 2.62 2.735 2.842 2.948 3.044 3.154 3.267 3.379 3.508 3.631 3.751 3.897 4.066 4.229 4.395 4.55 4.722 4.894 5.064 5.266 5.462 5.664 5.864 6.049 6.231 6.418 6.439 6.0 5.267 4.616 4.022 3.464 2.919 2.444 2.016 1.637 1.255 0.94 0.659 0.332 0.003 -0.279 -0.542 -0.81 -1.046 -1.236 -1.441 -1.664 -1.838 -2.022 -2.22 -2.362 -2.504 -2.669 -2.854 -3.048 -3.172 -3.288 -3.479 -3.617 -3.762 -3.839 -3.995 -4.163 -4.336 -4.427 -4.592 -4.726 -4.844 -4.977 -5.224 -5.352 -5.504 -5.683 -5.89 -6.145 -6.515 -7.801 -8 ,26162 ,KEBNE ,16656605,Mon Nov 22 21:43:56 CET,Mon Nov 22 23:22:10 CET,0.0 0.298 0.506 0.673 0.826 0.942 1.035 1.125 1.29 1.372 1.452 1.55 1.686 1.753 1.871 1.974 2.071 2.12 2.214 2.308 2.446 2.525 2.603 2.722 2.824 2.922 3.028 3.131 3.249 3.363 3.485 3.621 3.75 3.874 4.031 4.233 4.399 4.558 4.714 4.874 5.058 5.247 5.451 5.642 5.868 6.097 6.279 6.463 6.635 6.676 6.456 5.88 5.313 4.771 4.24 3.689 3.199 2.782 2.384 1.986 1.661 1.345 1.027 0.754 0.504 0.278 0.054 -0.16 -0.348 -0.551 -0.766 -0.943 -1.141 -1.346 -1.49 -1.641 -1.8 -1.956 -2.129 -2.248 -2.362 -2.549 -2.686 -2.835 -2.916 -3.077 -3.233 -3.395 -3.486 -3.645 -3.778 -3.886 -3.979 -4.201 -4.346 -4.506 -4.675 -4.86 -5.077 -5.408 -6.412 -10 ,9004 ,KEBNE ,16654444,Mon Nov 22 06:36:27 CET,Mon Nov 22 08:13:15 CET,0.0 0.696 0.924 1.04 1.138 1.236 1.35 1.467 1.625 1.69 1.758 1.83 1.955 2.012 2.125 2.232 2.334 2.379 2.467 2.558 2.684 2.766 2.849 2.967 3.078 3.185 3.278 3.364 3.488 3.617 3.738 3.871 4.004 4.131 4.264 4.416 4.564 4.719 4.874 5.035 5.2 5.376 5.566 5.738 5.913 6.109 6.337 6.533 6.657 6.684 6.503 5.973 5.401 4.857 4.268 3.669 3.175 2.757 2.376 1.978 1.649 1.355 1.071 0.816 0.58 0.358 0.124 -0.102 -0.309 -0.505 -0.708 -0.884 -1.06 -1.25 -1.395 -1.536 -1.695 -1.85 -1.999 -2.112 -2.229 -2.418 -2.553 -2.688 -2.758 -2.922 -3.098 -3.269 -3.35 -3.509 -3.625 -3.723 -3.823 -4.037 -4.162 -4.288 -4.446 -4.64 -4.879 -5.191 -6.161 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt deleted file mode 100644 index 2e453c72..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30648 ,KEBNE ,16656608,Mon Nov 22 21:46:02 CET,Mon Nov 22 23:24:36 CET,0.0 0.254 0.43 0.58 0.71 0.827 0.93 1.01 1.193 1.285 1.354 1.43 1.564 1.629 1.764 1.891 1.992 2.039 2.14 2.237 2.373 2.462 2.548 2.666 2.782 2.886 2.982 3.075 3.213 3.348 3.46 3.589 3.709 3.842 4.003 4.169 4.32 4.482 4.657 4.826 4.972 5.12 5.306 5.476 5.66 5.883 6.113 6.292 6.413 6.386 6.007 5.355 4.65 3.95 3.332 2.793 2.333 1.91 1.536 1.153 0.815 0.526 0.244 -0.04 -0.316 -0.575 -0.822 -1.037 -1.224 -1.417 -1.62 -1.781 -1.953 -2.15 -2.31 -2.461 -2.604 -2.758 -2.933 -3.057 -3.181 -3.367 -3.491 -3.63 -3.705 -3.842 -3.963 -4.111 -4.192 -4.342 -4.45 -4.551 -4.668 -4.929 -5.061 -5.211 -5.379 -5.556 -5.755 -6.0 -6.805 -3 ,991 ,KEBNE ,16654447,Mon Nov 22 06:36:27 CET,Mon Nov 22 08:12:24 CET,0.0 0.893 1.119 1.263 1.399 1.516 1.629 1.728 1.872 1.947 2.017 2.081 2.207 2.266 2.375 2.482 2.586 2.632 2.715 2.797 2.915 2.992 3.065 3.169 3.269 3.358 3.447 3.544 3.664 3.766 3.867 3.987 4.097 4.202 4.32 4.457 4.592 4.728 4.884 5.045 5.212 5.381 5.562 5.754 5.964 6.176 6.35 6.467 6.515 6.455 6.113 5.494 4.882 4.337 3.832 3.309 2.817 2.397 2.047 1.686 1.38 1.104 0.825 0.556 0.321 0.115 -0.109 -0.316 -0.488 -0.664 -0.849 -0.993 -1.146 -1.31 -1.449 -1.592 -1.729 -1.873 -2.016 -2.111 -2.208 -2.366 -2.481 -2.59 -2.649 -2.785 -2.929 -3.068 -3.141 -3.288 -3.374 -3.461 -3.551 -3.759 -3.882 -3.994 -4.111 -4.257 -4.411 -4.621 -5.342 -4 ,29883 ,KEBNE ,16654448,Mon Nov 22 06:36:27 CET,Mon Nov 22 08:12:40 CET,0.0 0.681 0.865 1.033 1.168 1.255 1.35 1.446 1.6 1.676 1.753 1.822 1.941 1.993 2.096 2.205 2.32 2.373 2.475 2.573 2.719 2.811 2.893 3.011 3.125 3.228 3.322 3.413 3.532 3.644 3.747 3.875 4.015 4.151 4.296 4.448 4.584 4.737 4.899 5.044 5.18 5.334 5.514 5.702 5.901 6.094 6.294 6.479 6.568 6.544 6.293 5.636 4.852 4.148 3.587 3.08 2.617 2.178 1.78 1.403 1.087 0.794 0.516 0.253 -0.002 -0.232 -0.462 -0.673 -0.857 -1.04 -1.248 -1.419 -1.588 -1.768 -1.897 -2.03 -2.174 -2.337 -2.507 -2.612 -2.721 -2.922 -3.07 -3.21 -3.285 -3.438 -3.584 -3.722 -3.793 -3.943 -4.068 -4.174 -4.278 -4.493 -4.61 -4.749 -4.91 -5.046 -5.176 -5.391 -6.024 -6 ,4280 ,KEBNE ,16656613,Mon Nov 22 21:48:07 CET,Mon Nov 22 23:25:34 CET,0.0 0.733 0.926 1.081 1.21 1.305 1.402 1.514 1.681 1.746 1.813 1.873 1.997 2.058 2.195 2.313 2.41 2.458 2.56 2.65 2.758 2.834 2.914 3.044 3.174 3.288 3.391 3.492 3.622 3.738 3.845 3.967 4.075 4.183 4.307 4.45 4.601 4.771 4.935 5.096 5.264 5.425 5.587 5.749 5.928 6.098 6.238 6.356 6.419 6.329 5.929 5.206 4.489 3.845 3.278 2.742 2.249 1.801 1.402 0.997 0.669 0.36 0.049 -0.229 -0.482 -0.711 -0.951 -1.164 -1.343 -1.529 -1.719 -1.872 -2.028 -2.196 -2.341 -2.491 -2.645 -2.804 -2.973 -3.092 -3.205 -3.374 -3.498 -3.641 -3.708 -3.834 -3.984 -4.14 -4.218 -4.372 -4.471 -4.566 -4.667 -4.873 -4.991 -5.133 -5.273 -5.428 -5.629 -5.873 -6.696 -7 ,13395 ,KEBNE ,16656614,Mon Nov 22 21:48:07 CET,Mon Nov 22 23:26:25 CET,0.0 0.51 0.695 0.795 0.88 0.964 1.047 1.146 1.328 1.415 1.49 1.529 1.654 1.719 1.847 1.974 2.084 2.132 2.218 2.308 2.449 2.525 2.596 2.711 2.818 2.916 3.017 3.121 3.251 3.378 3.488 3.622 3.759 3.884 4.013 4.161 4.31 4.477 4.634 4.791 4.965 5.164 5.377 5.558 5.771 5.974 6.152 6.293 6.36 6.303 5.938 5.22 4.488 3.854 3.293 2.749 2.282 1.889 1.544 1.2 0.886 0.596 0.338 0.089 -0.152 -0.368 -0.59 -0.785 -0.952 -1.126 -1.306 -1.458 -1.622 -1.793 -1.932 -2.077 -2.217 -2.362 -2.52 -2.616 -2.706 -2.884 -3.016 -3.128 -3.186 -3.326 -3.473 -3.614 -3.695 -3.852 -3.961 -4.051 -4.153 -4.37 -4.47 -4.576 -4.685 -4.821 -5.023 -5.254 -5.784 -8 ,10555 ,KEBNE ,16654452,Mon Nov 22 06:36:27 CET,Mon Nov 22 08:12:35 CET,0.0 0.408 0.63 0.742 0.839 0.942 1.04 1.113 1.288 1.38 1.456 1.517 1.635 1.699 1.821 1.933 2.054 2.109 2.199 2.278 2.385 2.454 2.524 2.626 2.726 2.828 2.919 3.004 3.134 3.265 3.37 3.483 3.615 3.754 3.906 4.072 4.212 4.348 4.506 4.674 4.827 5.005 5.204 5.364 5.524 5.667 5.8 5.896 5.956 5.92 5.589 4.914 4.156 3.511 2.953 2.418 1.936 1.474 1.081 0.701 0.367 0.082 -0.187 -0.45 -0.708 -0.954 -1.21 -1.448 -1.651 -1.853 -2.061 -2.23 -2.407 -2.596 -2.743 -2.885 -3.036 -3.202 -3.379 -3.495 -3.604 -3.784 -3.913 -4.035 -4.1 -4.242 -4.4 -4.567 -4.657 -4.816 -4.933 -5.039 -5.153 -5.425 -5.576 -5.718 -5.846 -6.003 -6.211 -6.471 -6.995 -9 ,7393 ,KEBNE ,16656616,Mon Nov 22 21:49:09 CET,Mon Nov 22 23:27:28 CET,0.0 0.424 0.635 0.802 0.941 1.022 1.091 1.178 1.375 1.449 1.516 1.601 1.722 1.78 1.9 1.998 2.078 2.124 2.219 2.309 2.429 2.507 2.59 2.703 2.807 2.914 3.022 3.11 3.216 3.327 3.426 3.552 3.676 3.798 3.931 4.072 4.211 4.347 4.489 4.647 4.797 4.949 5.136 5.315 5.514 5.717 5.912 6.081 6.161 6.092 5.784 5.215 4.563 3.895 3.293 2.742 2.227 1.76 1.39 1.021 0.699 0.404 0.093 -0.2 -0.468 -0.716 -0.971 -1.187 -1.374 -1.564 -1.75 -1.913 -2.098 -2.299 -2.456 -2.604 -2.746 -2.895 -3.067 -3.191 -3.304 -3.478 -3.609 -3.748 -3.819 -3.963 -4.116 -4.277 -4.356 -4.5 -4.601 -4.684 -4.776 -4.988 -5.105 -5.243 -5.382 -5.528 -5.712 -5.968 -6.691 -10 ,1667 ,KEBNE ,16654454,Mon Nov 22 06:38:30 CET,Mon Nov 22 08:14:59 CET,0.0 0.525 0.716 0.864 1.007 1.127 1.232 1.336 1.525 1.596 1.665 1.745 1.874 1.937 2.06 2.17 2.283 2.338 2.441 2.537 2.666 2.754 2.835 2.937 3.036 3.144 3.248 3.345 3.466 3.59 3.707 3.841 3.971 4.094 4.236 4.405 4.567 4.738 4.919 5.088 5.26 5.453 5.65 5.828 6.032 6.228 6.412 6.566 6.64 6.567 6.231 5.629 5.007 4.398 3.846 3.354 2.931 2.543 2.182 1.808 1.485 1.194 0.911 0.655 0.429 0.21 -0.038 -0.247 -0.416 -0.596 -0.781 -0.942 -1.123 -1.309 -1.455 -1.62 -1.782 -1.937 -2.101 -2.211 -2.32 -2.495 -2.624 -2.77 -2.84 -2.969 -3.115 -3.287 -3.38 -3.551 -3.67 -3.766 -3.861 -4.076 -4.192 -4.306 -4.418 -4.548 -4.713 -4.91 -5.434 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402751-2100_CHEMBL3402752-30000.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402751-2100_CHEMBL3402752-30000.txt deleted file mode 100644 index 071fc509..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402751-2100_CHEMBL3402752-30000.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7047 ,KEBNE ,17043585,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:22:56 CET,0.0 0.437 0.665 0.786 0.914 1.064 1.185 1.282 1.466 1.541 1.623 1.707 1.853 1.919 2.025 2.114 2.218 2.278 2.379 2.469 2.593 2.673 2.747 2.848 2.961 3.073 3.171 3.269 3.396 3.503 3.608 3.742 3.864 3.967 4.089 4.226 4.358 4.496 4.638 4.769 4.884 5.025 5.218 5.374 5.514 5.676 5.825 5.907 5.866 5.637 5.124 4.367 3.682 3.023 2.403 1.844 1.36 0.935 0.558 0.165 -0.167 -0.452 -0.727 -0.988 -1.239 -1.472 -1.708 -1.921 -2.101 -2.281 -2.478 -2.647 -2.812 -2.975 -3.099 -3.22 -3.35 -3.496 -3.64 -3.734 -3.842 -4.011 -4.128 -4.258 -4.317 -4.426 -4.546 -4.689 -4.768 -4.924 -5.007 -5.09 -5.182 -5.353 -5.46 -5.585 -5.689 -5.81 -5.994 -6.229 -6.719 -2 ,20056 ,KEBNE ,17043586,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:22:34 CET,0.0 0.416 0.607 0.751 0.878 0.996 1.091 1.185 1.351 1.429 1.502 1.56 1.687 1.745 1.839 1.938 2.041 2.083 2.167 2.243 2.354 2.433 2.512 2.614 2.706 2.808 2.899 2.977 3.076 3.179 3.281 3.399 3.513 3.61 3.71 3.814 3.907 4.018 4.147 4.28 4.419 4.587 4.774 4.916 5.054 5.186 5.295 5.369 5.346 5.164 4.646 3.744 2.926 2.235 1.636 1.092 0.594 0.128 -0.249 -0.628 -0.956 -1.235 -1.489 -1.716 -1.941 -2.171 -2.412 -2.602 -2.761 -2.931 -3.106 -3.255 -3.411 -3.574 -3.702 -3.833 -3.963 -4.09 -4.227 -4.323 -4.414 -4.56 -4.671 -4.792 -4.862 -5.007 -5.155 -5.305 -5.376 -5.527 -5.601 -5.68 -5.764 -5.946 -6.047 -6.15 -6.264 -6.4 -6.551 -6.755 -7.184 -3 ,31558 ,KEBNE ,17043587,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:22:23 CET,0.0 0.625 0.86 1.007 1.129 1.229 1.326 1.418 1.605 1.681 1.74 1.798 1.933 1.992 2.105 2.216 2.319 2.368 2.464 2.554 2.68 2.757 2.833 2.929 3.022 3.126 3.219 3.305 3.433 3.563 3.682 3.812 3.934 4.041 4.151 4.283 4.414 4.549 4.679 4.816 4.96 5.129 5.299 5.447 5.588 5.72 5.845 5.908 5.895 5.683 5.088 4.259 3.581 2.957 2.37 1.831 1.365 0.928 0.526 0.123 -0.21 -0.496 -0.764 -1.021 -1.266 -1.478 -1.696 -1.892 -2.067 -2.258 -2.451 -2.602 -2.762 -2.927 -3.053 -3.187 -3.329 -3.471 -3.615 -3.72 -3.826 -3.968 -4.073 -4.19 -4.251 -4.388 -4.536 -4.683 -4.759 -4.91 -4.998 -5.085 -5.166 -5.351 -5.451 -5.546 -5.656 -5.808 -5.988 -6.182 -6.431 -4 ,26227 ,KEBNE ,17043588,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:22:39 CET,0.0 0.491 0.64 0.765 0.881 0.991 1.081 1.159 1.318 1.409 1.493 1.545 1.669 1.725 1.83 1.927 2.029 2.086 2.186 2.266 2.393 2.473 2.553 2.672 2.775 2.873 2.965 3.053 3.175 3.293 3.402 3.532 3.658 3.773 3.901 4.041 4.179 4.32 4.446 4.581 4.715 4.834 4.98 5.135 5.288 5.444 5.583 5.679 5.709 5.557 5.121 4.419 3.692 3.026 2.408 1.849 1.385 0.965 0.605 0.247 -0.06 -0.331 -0.587 -0.838 -1.074 -1.301 -1.539 -1.739 -1.918 -2.106 -2.303 -2.46 -2.63 -2.807 -2.934 -3.071 -3.212 -3.341 -3.483 -3.588 -3.688 -3.844 -3.957 -4.08 -4.147 -4.294 -4.432 -4.548 -4.618 -4.773 -4.858 -4.939 -5.006 -5.16 -5.263 -5.368 -5.474 -5.593 -5.742 -5.924 -6.408 -5 ,12801 ,KEBNE ,17043589,Thu Dec 23 04:43:33 CET,Thu Dec 23 06:22:45 CET,0.0 0.573 0.718 0.823 0.947 1.08 1.207 1.297 1.431 1.505 1.574 1.634 1.764 1.817 1.918 2.015 2.102 2.145 2.23 2.313 2.434 2.508 2.566 2.662 2.777 2.878 2.957 3.04 3.154 3.245 3.335 3.454 3.558 3.665 3.796 3.927 4.033 4.155 4.307 4.459 4.604 4.751 4.896 5.035 5.2 5.358 5.504 5.605 5.616 5.512 5.021 4.162 3.369 2.638 1.979 1.399 0.9 0.436 0.055 -0.319 -0.657 -0.962 -1.26 -1.536 -1.781 -1.999 -2.236 -2.46 -2.644 -2.826 -3.023 -3.193 -3.362 -3.525 -3.654 -3.787 -3.92 -4.052 -4.191 -4.288 -4.382 -4.525 -4.625 -4.743 -4.813 -4.948 -5.075 -5.197 -5.26 -5.401 -5.467 -5.558 -5.658 -5.877 -5.987 -6.085 -6.205 -6.337 -6.473 -6.67 -7.775 -6 ,22737 ,KEBNE ,17043590,Thu Dec 23 04:43:33 CET,Thu Dec 23 06:23:21 CET,0.0 0.424 0.592 0.739 0.873 1.002 1.121 1.24 1.442 1.518 1.595 1.663 1.786 1.848 1.97 2.079 2.193 2.25 2.35 2.437 2.562 2.643 2.723 2.835 2.945 3.05 3.147 3.244 3.358 3.458 3.551 3.669 3.784 3.888 4.001 4.125 4.245 4.374 4.489 4.605 4.747 4.895 5.049 5.193 5.344 5.508 5.651 5.733 5.745 5.608 5.063 4.212 3.427 2.716 2.117 1.571 1.063 0.608 0.223 -0.155 -0.479 -0.767 -1.042 -1.315 -1.573 -1.8 -2.026 -2.233 -2.42 -2.607 -2.787 -2.944 -3.108 -3.273 -3.398 -3.523 -3.657 -3.8 -3.949 -4.052 -4.165 -4.343 -4.47 -4.6 -4.658 -4.77 -4.89 -5.024 -5.093 -5.247 -5.346 -5.426 -5.508 -5.687 -5.78 -5.878 -5.988 -6.111 -6.256 -6.397 -6.779 -7 ,29638 ,KEBNE ,17043591,Thu Dec 23 04:43:33 CET,Thu Dec 23 06:23:41 CET,0.0 0.442 0.613 0.748 0.835 0.927 1.043 1.151 1.335 1.422 1.49 1.537 1.669 1.734 1.86 1.989 2.106 2.159 2.256 2.346 2.478 2.563 2.649 2.762 2.86 2.966 3.071 3.161 3.286 3.412 3.526 3.656 3.777 3.899 4.035 4.175 4.295 4.418 4.556 4.717 4.876 5.045 5.238 5.394 5.536 5.678 5.828 5.905 5.851 5.65 5.169 4.418 3.733 3.119 2.528 1.965 1.484 1.041 0.657 0.276 -0.067 -0.366 -0.652 -0.917 -1.162 -1.387 -1.61 -1.827 -2.019 -2.205 -2.397 -2.559 -2.721 -2.882 -3.002 -3.126 -3.257 -3.381 -3.517 -3.613 -3.712 -3.877 -4.001 -4.14 -4.206 -4.342 -4.477 -4.61 -4.677 -4.817 -4.875 -4.935 -5.004 -5.182 -5.278 -5.385 -5.512 -5.644 -5.786 -5.945 -6.387 -8 ,30681 ,KEBNE ,17043592,Thu Dec 23 04:43:33 CET,Thu Dec 23 06:22:41 CET,0.0 0.477 0.64 0.806 0.955 1.061 1.164 1.249 1.388 1.458 1.521 1.55 1.671 1.726 1.834 1.953 2.057 2.099 2.186 2.271 2.411 2.504 2.586 2.706 2.811 2.917 3.026 3.124 3.234 3.324 3.402 3.499 3.614 3.724 3.843 3.981 4.104 4.229 4.341 4.46 4.602 4.775 4.964 5.129 5.283 5.425 5.57 5.68 5.718 5.579 5.094 4.374 3.67 3.016 2.405 1.85 1.384 0.93 0.52 0.111 -0.233 -0.527 -0.813 -1.084 -1.334 -1.568 -1.796 -1.992 -2.167 -2.344 -2.518 -2.659 -2.812 -2.969 -3.085 -3.213 -3.348 -3.485 -3.629 -3.729 -3.827 -3.984 -4.102 -4.22 -4.28 -4.394 -4.52 -4.67 -4.75 -4.908 -4.988 -5.063 -5.142 -5.322 -5.427 -5.542 -5.686 -5.837 -5.986 -6.178 -6.735 -9 ,5403 ,KEBNE ,17043593,Thu Dec 23 04:43:33 CET,Thu Dec 23 06:23:03 CET,0.0 0.577 0.81 0.984 1.123 1.229 1.314 1.394 1.552 1.628 1.704 1.766 1.892 1.944 2.059 2.183 2.299 2.344 2.422 2.506 2.643 2.723 2.788 2.889 2.993 3.092 3.191 3.292 3.421 3.551 3.68 3.817 3.94 4.055 4.186 4.334 4.457 4.59 4.745 4.907 5.058 5.214 5.394 5.56 5.705 5.83 5.942 5.996 6.002 5.855 5.401 4.68 4.012 3.345 2.72 2.164 1.678 1.242 0.853 0.457 0.125 -0.175 -0.452 -0.709 -0.946 -1.159 -1.384 -1.592 -1.77 -1.944 -2.12 -2.266 -2.421 -2.573 -2.696 -2.834 -2.964 -3.105 -3.255 -3.347 -3.449 -3.628 -3.752 -3.872 -3.933 -4.051 -4.178 -4.329 -4.404 -4.547 -4.604 -4.679 -4.768 -4.979 -5.081 -5.193 -5.334 -5.464 -5.615 -5.852 -6.68 -10 ,5937 ,KEBNE ,17043594,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:22:50 CET,0.0 0.496 0.708 0.856 0.956 1.056 1.16 1.257 1.424 1.501 1.57 1.625 1.743 1.795 1.901 2.002 2.103 2.155 2.276 2.384 2.509 2.589 2.672 2.784 2.894 3.003 3.097 3.19 3.299 3.388 3.486 3.608 3.725 3.83 3.948 4.08 4.202 4.343 4.482 4.617 4.751 4.884 5.037 5.198 5.361 5.494 5.601 5.683 5.741 5.646 5.154 4.353 3.573 2.842 2.225 1.694 1.215 0.8 0.446 0.042 -0.304 -0.58 -0.845 -1.117 -1.375 -1.601 -1.846 -2.075 -2.261 -2.44 -2.622 -2.772 -2.936 -3.118 -3.247 -3.385 -3.532 -3.679 -3.844 -3.954 -4.059 -4.208 -4.318 -4.434 -4.492 -4.628 -4.771 -4.901 -4.964 -5.104 -5.187 -5.264 -5.342 -5.531 -5.631 -5.733 -5.833 -5.943 -6.078 -6.245 -6.632 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt deleted file mode 100644 index 38bf4ef2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4530 ,KEBNE ,16654455,Mon Nov 22 06:37:29 CET,Mon Nov 22 08:13:26 CET,0.0 0.432 0.621 0.763 0.9 1.037 1.176 1.296 1.485 1.569 1.667 1.778 1.933 2.007 2.153 2.287 2.417 2.479 2.604 2.726 2.872 2.971 3.074 3.218 3.359 3.503 3.648 3.79 3.977 4.153 4.322 4.511 4.679 4.857 5.068 5.297 5.508 5.731 5.978 6.264 6.568 6.887 7.255 7.636 8.065 8.527 9.061 9.646 10.285 11.029 11.892 12.441 12.621 12.612 12.501 12.335 12.173 12.007 11.834 11.649 11.499 11.354 11.181 11.019 10.886 10.76 10.612 10.489 10.382 10.262 10.13 10.011 9.892 9.76 9.664 9.565 9.46 9.358 9.249 9.166 9.078 8.935 8.842 8.755 8.71 8.617 8.502 8.369 8.306 8.175 8.114 8.038 7.954 7.788 7.703 7.586 7.449 7.322 7.181 6.958 6.448 -2 ,12186 ,KEBNE ,16656619,Mon Nov 22 21:51:14 CET,Mon Nov 22 23:28:36 CET,0.0 0.289 0.463 0.639 0.814 0.946 1.06 1.175 1.378 1.477 1.571 1.658 1.817 1.894 2.033 2.177 2.316 2.378 2.501 2.609 2.759 2.857 2.966 3.118 3.246 3.376 3.5 3.624 3.793 3.952 4.1 4.279 4.467 4.638 4.821 5.05 5.26 5.496 5.764 6.037 6.316 6.616 6.987 7.365 7.795 8.271 8.8 9.385 10.051 10.775 11.503 11.907 12.0 11.947 11.834 11.69 11.548 11.39 11.235 11.077 10.929 10.789 10.64 10.493 10.345 10.201 10.063 9.942 9.835 9.717 9.597 9.493 9.366 9.225 9.119 9.017 8.915 8.823 8.727 8.649 8.567 8.451 8.366 8.264 8.213 8.118 8.024 7.907 7.841 7.711 7.671 7.606 7.539 7.38 7.297 7.22 7.11 6.981 6.855 6.667 5.762 -3 ,17918 ,KEBNE ,16654457,Mon Nov 22 06:37:28 CET,Mon Nov 22 08:13:54 CET,0.0 0.749 1.01 1.182 1.289 1.398 1.508 1.612 1.779 1.852 1.924 2.001 2.162 2.234 2.372 2.516 2.641 2.696 2.806 2.91 3.05 3.145 3.237 3.38 3.526 3.663 3.792 3.916 4.081 4.23 4.37 4.55 4.731 4.907 5.114 5.344 5.559 5.812 6.089 6.346 6.622 6.963 7.349 7.725 8.162 8.658 9.195 9.766 10.406 11.15 12.014 12.518 12.685 12.751 12.733 12.623 12.483 12.331 12.174 12.001 11.847 11.7 11.545 11.399 11.259 11.129 10.986 10.859 10.746 10.62 10.502 10.407 10.312 10.197 10.105 10.023 9.923 9.807 9.708 9.632 9.537 9.407 9.322 9.232 9.189 9.106 9.02 8.927 8.877 8.753 8.7 8.641 8.581 8.433 8.333 8.23 8.144 8.049 7.933 7.786 7.222 -4 ,14414 ,KEBNE ,16656621,Mon Nov 22 21:54:25 CET,Mon Nov 22 23:32:34 CET,0.0 0.431 0.594 0.743 0.871 0.972 1.056 1.157 1.333 1.405 1.479 1.538 1.683 1.757 1.913 2.061 2.199 2.263 2.387 2.507 2.681 2.797 2.906 3.056 3.195 3.331 3.468 3.598 3.764 3.922 4.075 4.266 4.444 4.62 4.836 5.06 5.268 5.504 5.769 6.053 6.335 6.654 7.032 7.42 7.847 8.295 8.839 9.468 10.158 10.868 11.511 11.877 11.979 11.942 11.825 11.681 11.533 11.381 11.241 11.101 10.966 10.803 10.64 10.485 10.347 10.222 10.076 9.965 9.874 9.762 9.645 9.546 9.437 9.323 9.239 9.148 9.046 8.927 8.793 8.723 8.661 8.547 8.46 8.365 8.32 8.223 8.109 7.987 7.928 7.802 7.752 7.676 7.599 7.444 7.35 7.248 7.143 7.039 6.915 6.705 6.249 -5 ,26620 ,KEBNE ,16656622,Mon Nov 22 21:55:26 CET,Mon Nov 22 23:31:54 CET,0.0 0.438 0.679 0.844 0.978 1.089 1.204 1.318 1.504 1.594 1.692 1.804 1.971 2.047 2.193 2.344 2.484 2.551 2.674 2.781 2.942 3.057 3.159 3.297 3.44 3.579 3.72 3.861 4.028 4.19 4.356 4.553 4.736 4.913 5.113 5.324 5.532 5.771 6.042 6.335 6.636 6.966 7.339 7.73 8.192 8.675 9.233 9.859 10.55 11.31 12.124 12.645 12.815 12.838 12.773 12.65 12.521 12.397 12.257 12.081 11.929 11.781 11.632 11.504 11.382 11.262 11.124 11.005 10.903 10.788 10.664 10.558 10.454 10.351 10.264 10.168 10.067 9.957 9.845 9.771 9.691 9.566 9.48 9.381 9.326 9.206 9.081 8.948 8.881 8.752 8.711 8.652 8.58 8.425 8.345 8.252 8.14 8.018 7.877 7.686 6.828 -6 ,13999 ,KEBNE ,16654460,Mon Nov 22 06:37:28 CET,Mon Nov 22 08:14:29 CET,0.0 0.406 0.604 0.755 0.881 0.996 1.09 1.183 1.386 1.492 1.587 1.658 1.807 1.877 2.006 2.139 2.262 2.329 2.464 2.579 2.744 2.852 2.958 3.119 3.264 3.399 3.527 3.644 3.806 3.972 4.131 4.318 4.503 4.69 4.904 5.138 5.357 5.596 5.86 6.136 6.412 6.726 7.086 7.444 7.872 8.346 8.893 9.508 10.203 10.956 11.723 12.163 12.3 12.313 12.213 12.021 11.835 11.68 11.526 11.345 11.179 11.019 10.852 10.703 10.569 10.438 10.3 10.169 10.044 9.911 9.771 9.671 9.583 9.491 9.402 9.306 9.212 9.116 9.021 8.954 8.88 8.758 8.665 8.562 8.509 8.401 8.302 8.211 8.16 8.03 7.955 7.868 7.776 7.584 7.493 7.386 7.271 7.161 7.033 6.843 6.175 -7 ,15410 ,KEBNE ,16654461,Mon Nov 22 06:37:28 CET,Mon Nov 22 08:15:01 CET,0.0 0.345 0.584 0.726 0.839 0.93 1.036 1.144 1.321 1.399 1.485 1.583 1.74 1.817 1.967 2.093 2.207 2.264 2.379 2.49 2.651 2.761 2.858 2.992 3.135 3.272 3.392 3.508 3.666 3.822 3.965 4.146 4.331 4.498 4.699 4.95 5.179 5.414 5.659 5.915 6.198 6.532 6.93 7.361 7.868 8.383 8.967 9.635 10.385 11.21 12.046 12.486 12.612 12.592 12.493 12.356 12.217 12.078 11.945 11.802 11.669 11.529 11.399 11.28 11.145 11.021 10.895 10.777 10.672 10.56 10.443 10.347 10.258 10.156 10.068 9.988 9.894 9.794 9.699 9.634 9.565 9.43 9.337 9.243 9.188 9.079 8.975 8.864 8.798 8.666 8.614 8.547 8.468 8.298 8.201 8.099 8.008 7.906 7.755 7.537 7.01 -8 ,10782 ,KEBNE ,16654462,Mon Nov 22 06:37:29 CET,Mon Nov 22 08:13:40 CET,0.0 0.649 0.865 1.015 1.144 1.271 1.383 1.481 1.657 1.746 1.839 1.925 2.09 2.168 2.307 2.442 2.571 2.637 2.761 2.883 3.056 3.167 3.279 3.429 3.55 3.671 3.795 3.916 4.076 4.238 4.398 4.596 4.787 4.976 5.198 5.441 5.677 5.935 6.208 6.483 6.758 7.069 7.445 7.827 8.263 8.755 9.313 9.887 10.518 11.248 12.013 12.448 12.568 12.511 12.421 12.338 12.234 12.102 11.973 11.813 11.648 11.497 11.339 11.189 11.069 10.951 10.814 10.705 10.602 10.486 10.362 10.249 10.135 10.019 9.927 9.83 9.725 9.622 9.511 9.425 9.344 9.213 9.11 9.003 8.952 8.864 8.768 8.641 8.576 8.443 8.374 8.315 8.241 8.096 8.007 7.891 7.763 7.623 7.449 7.216 6.222 -9 ,17992 ,KEBNE ,16656626,Mon Nov 22 22:13:10 CET,Mon Nov 22 23:49:43 CET,0.0 0.6 0.827 1.022 1.159 1.278 1.38 1.47 1.625 1.695 1.762 1.827 1.974 2.048 2.204 2.337 2.463 2.526 2.663 2.803 2.98 3.082 3.181 3.34 3.482 3.612 3.752 3.883 4.051 4.215 4.365 4.55 4.743 4.92 5.13 5.359 5.567 5.806 6.063 6.354 6.67 7.012 7.418 7.809 8.23 8.696 9.218 9.801 10.494 11.224 11.916 12.331 12.443 12.45 12.393 12.27 12.127 11.961 11.801 11.637 11.495 11.357 11.228 11.119 11.004 10.883 10.753 10.636 10.523 10.391 10.257 10.163 10.064 9.94 9.849 9.769 9.679 9.585 9.484 9.407 9.32 9.178 9.086 8.998 8.948 8.829 8.705 8.594 8.544 8.421 8.356 8.275 8.181 7.998 7.915 7.815 7.688 7.54 7.381 7.217 6.664 -10 ,31862 ,KEBNE ,16654464,Mon Nov 22 06:38:30 CET,Mon Nov 22 08:14:34 CET,0.0 0.498 0.677 0.852 1.006 1.118 1.219 1.319 1.536 1.634 1.709 1.774 1.93 2.019 2.198 2.343 2.454 2.504 2.599 2.693 2.859 2.966 3.063 3.216 3.36 3.497 3.638 3.774 3.935 4.092 4.237 4.415 4.587 4.749 4.948 5.173 5.393 5.637 5.905 6.18 6.479 6.815 7.171 7.562 8.027 8.513 9.054 9.654 10.338 11.027 11.709 12.124 12.203 12.169 12.107 11.969 11.79 11.6 11.429 11.248 11.084 10.927 10.765 10.623 10.5 10.378 10.237 10.091 9.966 9.852 9.727 9.611 9.492 9.372 9.28 9.19 9.086 8.972 8.855 8.777 8.688 8.542 8.454 8.362 8.308 8.197 8.089 7.978 7.915 7.787 7.75 7.688 7.623 7.481 7.399 7.304 7.173 7.004 6.831 6.657 6.169 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt deleted file mode 100644 index 66faf21b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31691 ,KEBNE ,16656628,Mon Nov 22 22:16:18 CET,Mon Nov 22 23:54:43 CET,0.0 0.594 0.786 0.96 1.131 1.287 1.43 1.561 1.821 1.94 2.049 2.154 2.35 2.445 2.642 2.824 2.997 3.083 3.245 3.402 3.643 3.806 3.967 4.19 4.405 4.63 4.85 5.053 5.321 5.588 5.851 6.175 6.486 6.787 7.152 7.576 7.972 8.411 8.893 9.401 9.952 10.6 11.362 12.148 13.091 14.177 15.48 17.026 18.963 21.394 24.392 27.028 28.717 29.856 30.646 31.222 31.544 31.693 31.765 31.777 31.773 31.763 31.738 31.685 31.607 31.524 31.446 31.377 31.302 31.216 31.113 31.032 30.96 30.878 30.803 30.716 30.614 30.508 30.395 30.315 30.229 30.09 29.992 29.889 29.839 29.723 29.601 29.475 29.401 29.255 29.196 29.115 29.018 28.805 28.693 28.566 28.431 28.292 28.092 27.828 27.323 -2 ,11063 ,KEBNE ,16656629,Mon Nov 22 22:17:22 CET,Mon Nov 22 23:56:25 CET,0.0 0.423 0.61 0.79 0.966 1.123 1.259 1.39 1.614 1.719 1.829 1.946 2.151 2.251 2.442 2.633 2.826 2.921 3.093 3.251 3.497 3.659 3.806 4.013 4.217 4.419 4.624 4.823 5.092 5.354 5.599 5.91 6.219 6.516 6.864 7.269 7.678 8.13 8.608 9.126 9.675 10.306 11.083 11.876 12.821 13.884 15.137 16.678 18.526 20.71 23.653 26.417 28.173 29.376 30.183 30.753 31.07 31.209 31.289 31.317 31.321 31.31 31.29 31.256 31.195 31.127 31.049 30.977 30.915 30.838 30.755 30.685 30.582 30.451 30.348 30.252 30.149 30.041 29.936 29.866 29.803 29.696 29.608 29.513 29.46 29.342 29.221 29.081 28.996 28.833 28.754 28.664 28.567 28.338 28.208 28.07 27.907 27.744 27.585 27.36 26.519 -3 ,10370 ,KEBNE ,16656630,Mon Nov 22 22:17:21 CET,Mon Nov 22 23:55:22 CET,0.0 0.606 0.819 1.013 1.205 1.372 1.518 1.655 1.897 2.01 2.115 2.204 2.392 2.488 2.687 2.876 3.055 3.137 3.303 3.483 3.76 3.938 4.102 4.322 4.529 4.733 4.941 5.142 5.406 5.674 5.937 6.249 6.541 6.832 7.181 7.577 7.971 8.42 8.906 9.434 9.99 10.619 11.392 12.194 13.159 14.252 15.531 17.048 18.956 21.307 24.214 26.599 27.947 28.738 29.217 29.628 29.986 30.168 30.236 30.275 30.257 30.214 30.175 30.122 30.064 29.995 29.891 29.805 29.727 29.64 29.547 29.47 29.394 29.306 29.229 29.145 29.055 28.949 28.834 28.757 28.682 28.553 28.447 28.332 28.268 28.125 27.986 27.848 27.773 27.618 27.527 27.433 27.331 27.105 26.981 26.853 26.715 26.507 26.253 25.981 25.319 -4 ,30167 ,KEBNE ,16656631,Mon Nov 22 22:17:21 CET,Mon Nov 22 23:56:06 CET,0.0 0.41 0.638 0.79 0.937 1.082 1.232 1.367 1.6 1.708 1.812 1.92 2.112 2.198 2.379 2.558 2.722 2.803 2.967 3.134 3.376 3.53 3.681 3.895 4.108 4.317 4.52 4.725 4.98 5.225 5.473 5.775 6.066 6.361 6.723 7.135 7.527 7.975 8.472 9.001 9.568 10.218 11.01 11.817 12.768 13.877 15.205 16.75 18.609 20.91 23.91 26.543 28.207 29.384 30.218 30.8 31.103 31.32 31.467 31.509 31.509 31.473 31.408 31.333 31.276 31.224 31.15 31.065 30.986 30.902 30.814 30.737 30.65 30.555 30.474 30.387 30.29 30.174 30.056 29.984 29.908 29.779 29.685 29.581 29.53 29.435 29.328 29.21 29.145 29.0 28.932 28.851 28.767 28.582 28.466 28.318 28.143 27.968 27.78 27.517 27.01 -5 ,6742 ,KEBNE ,16654469,Mon Nov 22 06:39:36 CET,Mon Nov 22 08:13:23 CET,0.0 0.412 0.629 0.844 1.019 1.163 1.292 1.413 1.644 1.751 1.851 1.961 2.164 2.259 2.443 2.622 2.797 2.885 3.057 3.224 3.469 3.624 3.782 4.002 4.2 4.397 4.592 4.786 5.033 5.288 5.538 5.828 6.116 6.405 6.751 7.139 7.513 7.951 8.431 8.952 9.531 10.182 10.95 11.739 12.661 13.754 15.081 16.595 18.446 20.737 23.716 26.346 27.793 28.665 29.392 30.01 30.464 30.831 31.108 31.318 31.385 31.357 31.314 31.261 31.194 31.122 31.038 30.951 30.872 30.796 30.72 30.657 30.578 30.474 30.399 30.339 30.253 30.152 30.057 29.987 29.914 29.79 29.697 29.599 29.549 29.452 29.34 29.208 29.138 28.988 28.919 28.847 28.767 28.593 28.493 28.377 28.249 28.085 27.905 27.697 26.827 -6 ,21921 ,KEBNE ,16654471,Mon Nov 22 06:39:32 CET,Mon Nov 22 08:16:40 CET,0.0 0.623 0.852 1.046 1.237 1.402 1.548 1.682 1.946 2.075 2.192 2.313 2.519 2.613 2.799 2.991 3.182 3.272 3.439 3.61 3.862 4.027 4.185 4.407 4.616 4.815 5.015 5.213 5.475 5.731 5.987 6.317 6.63 6.928 7.28 7.695 8.093 8.536 9.034 9.555 10.103 10.756 11.569 12.399 13.364 14.455 15.751 17.296 19.197 21.481 24.219 26.395 27.756 28.792 29.578 30.021 30.234 30.395 30.502 30.58 30.632 30.671 30.661 30.636 30.628 30.604 30.569 30.522 30.46 30.384 30.295 30.208 30.107 30.014 29.94 29.853 29.766 29.662 29.546 29.463 29.379 29.249 29.156 29.057 29.0 28.879 28.763 28.634 28.556 28.393 28.303 28.211 28.1 27.862 27.748 27.62 27.488 27.342 27.138 26.893 26.279 -7 ,11129 ,KEBNE ,16654472,Mon Nov 22 06:39:31 CET,Mon Nov 22 08:16:39 CET,0.0 1.004 1.231 1.409 1.57 1.73 1.889 2.028 2.277 2.391 2.504 2.642 2.846 2.941 3.122 3.297 3.47 3.552 3.707 3.855 4.084 4.241 4.395 4.614 4.831 5.053 5.262 5.458 5.713 5.968 6.219 6.518 6.817 7.115 7.464 7.87 8.264 8.691 9.153 9.657 10.22 10.878 11.65 12.433 13.351 14.395 15.664 17.188 19.055 21.384 24.348 26.985 28.627 29.753 30.535 31.093 31.496 31.772 31.927 32.034 32.064 32.041 32.014 32.019 32.041 32.063 32.066 32.008 31.928 31.829 31.718 31.625 31.533 31.431 31.349 31.265 31.165 31.043 30.917 30.828 30.731 30.613 30.539 30.445 30.392 30.274 30.159 30.039 29.969 29.816 29.742 29.666 29.58 29.398 29.299 29.176 29.042 28.899 28.706 28.49 28.103 -8 ,12380 ,KEBNE ,16654473,Mon Nov 22 06:39:32 CET,Mon Nov 22 08:16:29 CET,0.0 0.5 0.683 0.864 1.02 1.148 1.282 1.418 1.663 1.768 1.867 1.974 2.173 2.265 2.446 2.621 2.798 2.888 3.054 3.214 3.459 3.623 3.778 3.992 4.204 4.414 4.634 4.851 5.12 5.38 5.632 5.939 6.235 6.525 6.86 7.238 7.619 8.045 8.516 9.019 9.56 10.191 10.933 11.714 12.671 13.779 15.078 16.568 18.437 20.755 23.747 26.343 27.936 29.03 29.64 29.974 30.318 30.593 30.729 30.796 30.783 30.739 30.668 30.585 30.512 30.436 30.344 30.269 30.2 30.119 30.026 29.95 29.872 29.787 29.698 29.597 29.509 29.41 29.302 29.23 29.161 29.049 28.955 28.856 28.802 28.695 28.599 28.479 28.41 28.253 28.159 28.074 27.967 27.752 27.657 27.551 27.41 27.244 27.081 26.866 26.322 -9 ,32706 ,KEBNE ,16656636,Mon Nov 22 22:22:33 CET,Tue Nov 23 00:06:47 CET,0.0 0.469 0.66 0.85 1.016 1.178 1.328 1.47 1.725 1.832 1.933 2.036 2.234 2.326 2.519 2.714 2.899 2.983 3.142 3.303 3.548 3.706 3.853 4.074 4.294 4.507 4.716 4.921 5.192 5.455 5.703 5.997 6.29 6.593 6.953 7.365 7.768 8.197 8.664 9.185 9.752 10.397 11.172 11.974 12.933 14.044 15.383 16.939 18.795 21.11 24.083 26.606 28.163 29.118 29.678 30.133 30.479 30.715 30.852 30.906 30.918 30.952 31.01 31.065 31.097 31.117 31.12 31.132 31.126 31.066 30.977 30.889 30.775 30.653 30.564 30.469 30.366 30.254 30.14 30.061 29.971 29.808 29.708 29.613 29.561 29.458 29.335 29.207 29.142 28.99 28.896 28.803 28.709 28.506 28.379 28.253 28.133 27.985 27.812 27.598 27.086 -10 ,4289 ,KEBNE ,16656637,Mon Nov 22 22:22:33 CET,Tue Nov 23 00:02:41 CET,0.0 1.179 1.424 1.622 1.762 1.892 2.02 2.144 2.377 2.487 2.596 2.705 2.908 2.999 3.173 3.343 3.506 3.588 3.747 3.898 4.126 4.281 4.436 4.662 4.881 5.094 5.294 5.476 5.723 5.982 6.242 6.552 6.85 7.144 7.492 7.874 8.248 8.671 9.137 9.64 10.186 10.82 11.575 12.348 13.266 14.327 15.594 17.114 18.993 21.308 24.244 26.848 28.491 29.592 30.246 30.716 31.116 31.43 31.671 31.869 31.991 32.015 31.982 31.943 31.895 31.841 31.786 31.737 31.674 31.59 31.507 31.438 31.355 31.268 31.196 31.111 31.014 30.902 30.783 30.702 30.624 30.508 30.413 30.304 30.248 30.138 30.026 29.913 29.855 29.708 29.639 29.553 29.459 29.271 29.161 29.019 28.859 28.683 28.477 28.184 27.502 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt deleted file mode 100644 index a874477d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23781 ,KEBNE ,16654476,Mon Nov 22 06:40:33 CET,Mon Nov 22 08:17:05 CET,0.0 0.56 0.853 1.102 1.308 1.492 1.663 1.831 2.135 2.266 2.398 2.567 2.777 2.871 3.088 3.313 3.516 3.615 3.803 3.982 4.254 4.442 4.627 4.889 5.137 5.376 5.614 5.85 6.158 6.457 6.741 7.102 7.464 7.814 8.221 8.668 9.095 9.579 10.113 10.7 11.349 12.117 13.017 13.94 15.073 16.368 17.913 19.716 21.9 24.619 28.233 31.579 33.7 35.182 36.281 37.123 37.729 38.203 38.569 38.851 39.043 39.203 39.344 39.464 39.54 39.593 39.652 39.701 39.735 39.76 39.77 39.767 39.756 39.741 39.733 39.721 39.698 39.654 39.588 39.552 39.522 39.471 39.421 39.366 39.333 39.264 39.201 39.132 39.097 38.992 38.932 38.865 38.79 38.618 38.528 38.441 38.329 38.162 37.954 37.57 36.394 -2 ,20315 ,KEBNE ,16656639,Mon Nov 22 22:34:04 CET,Tue Nov 23 00:11:06 CET,0.0 1.188 1.464 1.678 1.864 2.039 2.199 2.355 2.655 2.804 2.936 3.071 3.286 3.395 3.621 3.834 4.034 4.137 4.347 4.547 4.833 5.02 5.202 5.465 5.725 5.974 6.213 6.44 6.742 7.043 7.337 7.696 8.038 8.378 8.78 9.224 9.656 10.153 10.701 11.307 11.961 12.701 13.597 14.537 15.655 16.911 18.404 20.218 22.492 25.345 29.07 32.392 34.516 35.963 37.0 37.821 38.426 38.906 39.287 39.592 39.791 39.957 40.103 40.202 40.284 40.363 40.42 40.458 40.487 40.501 40.506 40.499 40.486 40.479 40.478 40.475 40.47 40.456 40.428 40.409 40.382 40.315 40.265 40.221 40.193 40.122 40.055 39.996 39.963 39.853 39.807 39.749 39.686 39.531 39.451 39.362 39.239 39.077 38.871 38.589 37.903 -3 ,16937 ,KEBNE ,16654478,Mon Nov 22 06:40:33 CET,Mon Nov 22 08:17:20 CET,0.0 1.666 2.028 2.319 2.543 2.729 2.895 3.047 3.303 3.426 3.566 3.734 3.968 4.086 4.308 4.525 4.739 4.834 5.02 5.216 5.494 5.672 5.848 6.103 6.342 6.581 6.822 7.054 7.362 7.663 7.944 8.294 8.657 9.019 9.425 9.869 10.317 10.832 11.394 12.009 12.66 13.408 14.319 15.266 16.392 17.694 19.267 21.093 23.326 26.161 29.875 33.239 35.398 36.901 38.02 38.848 39.422 39.876 40.221 40.512 40.754 40.959 41.116 41.236 41.319 41.38 41.437 41.473 41.5 41.509 41.51 41.516 41.502 41.466 41.442 41.42 41.397 41.364 41.329 41.3 41.266 41.24 41.224 41.197 41.18 41.113 41.03 40.94 40.9 40.797 40.751 40.703 40.648 40.495 40.432 40.345 40.23 40.117 39.96 39.743 39.051 -4 ,7466 ,KEBNE ,16654479,Mon Nov 22 06:40:33 CET,Mon Nov 22 08:16:47 CET,0.0 0.873 1.143 1.347 1.519 1.698 1.856 2.02 2.311 2.426 2.546 2.681 2.887 2.992 3.185 3.376 3.57 3.666 3.852 4.027 4.279 4.436 4.603 4.851 5.082 5.316 5.547 5.774 6.078 6.372 6.656 6.997 7.321 7.651 8.039 8.469 8.898 9.394 9.954 10.564 11.209 11.946 12.821 13.705 14.794 16.071 17.564 19.328 21.533 24.338 28.05 31.386 33.516 35.002 36.047 36.817 37.384 37.848 38.214 38.527 38.761 38.957 39.104 39.217 39.327 39.417 39.483 39.518 39.559 39.581 39.569 39.56 39.563 39.559 39.539 39.52 39.504 39.473 39.441 39.424 39.408 39.388 39.358 39.306 39.281 39.24 39.167 39.063 39.009 38.898 38.85 38.791 38.737 38.595 38.512 38.422 38.302 38.181 38.061 37.882 36.879 -5 ,21537 ,KEBNE ,16654480,Mon Nov 22 06:40:33 CET,Mon Nov 22 08:17:15 CET,0.0 1.22 1.426 1.61 1.794 1.955 2.113 2.259 2.489 2.601 2.718 2.84 3.048 3.146 3.336 3.539 3.739 3.834 4.024 4.211 4.477 4.641 4.805 5.055 5.294 5.534 5.773 6.01 6.32 6.614 6.895 7.235 7.569 7.918 8.328 8.791 9.248 9.738 10.267 10.864 11.51 12.247 13.149 14.075 15.168 16.44 17.957 19.738 21.942 24.686 28.283 31.61 33.759 35.287 36.402 37.236 37.843 38.322 38.674 38.978 39.222 39.408 39.567 39.708 39.802 39.859 39.929 39.989 40.023 40.056 40.081 40.081 40.069 40.062 40.064 40.072 40.059 40.025 39.97 39.932 39.905 39.86 39.824 39.77 39.739 39.663 39.577 39.498 39.464 39.362 39.291 39.219 39.142 38.98 38.907 38.819 38.709 38.572 38.387 38.127 36.867 -6 ,21086 ,KEBNE ,16656643,Mon Nov 22 22:37:11 CET,Tue Nov 23 00:14:19 CET,0.0 1.641 1.915 2.104 2.328 2.553 2.727 2.873 3.139 3.276 3.41 3.546 3.756 3.857 4.056 4.255 4.459 4.561 4.754 4.93 5.194 5.375 5.544 5.81 6.073 6.324 6.565 6.796 7.1 7.391 7.676 8.026 8.376 8.726 9.137 9.602 10.057 10.572 11.144 11.768 12.425 13.159 14.048 14.966 16.054 17.318 18.841 20.621 22.788 25.542 29.203 32.536 34.735 36.231 37.279 38.092 38.722 39.203 39.553 39.873 40.118 40.304 40.443 40.555 40.657 40.748 40.825 40.867 40.895 40.929 40.966 40.981 40.974 40.96 40.929 40.891 40.881 40.86 40.815 40.778 40.741 40.687 40.643 40.561 40.511 40.438 40.394 40.35 40.307 40.199 40.157 40.094 40.018 39.861 39.791 39.702 39.594 39.473 39.335 39.116 38.641 -7 ,8322 ,KEBNE ,16654482,Mon Nov 22 06:40:33 CET,Mon Nov 22 08:17:13 CET,0.0 1.265 1.601 1.817 1.984 2.144 2.294 2.433 2.707 2.835 2.955 3.068 3.274 3.379 3.568 3.751 3.941 4.037 4.225 4.409 4.677 4.857 5.03 5.275 5.52 5.754 5.987 6.212 6.495 6.783 7.067 7.421 7.757 8.079 8.472 8.93 9.381 9.871 10.393 10.979 11.63 12.38 13.262 14.173 15.26 16.515 18.044 19.885 22.134 24.889 28.572 31.892 33.983 35.461 36.547 37.375 38.012 38.501 38.867 39.183 39.424 39.619 39.768 39.901 40.014 40.094 40.166 40.216 40.25 40.281 40.311 40.32 40.306 40.283 40.275 40.278 40.268 40.225 40.17 40.13 40.069 39.982 39.942 39.898 39.88 39.83 39.747 39.663 39.622 39.506 39.441 39.382 39.301 39.082 38.981 38.882 38.781 38.665 38.467 38.189 36.987 -8 ,17352 ,KEBNE ,16656645,Mon Nov 22 22:37:11 CET,Tue Nov 23 00:16:42 CET,0.0 0.475 0.712 0.936 1.131 1.285 1.435 1.61 1.953 2.092 2.218 2.367 2.577 2.684 2.895 3.093 3.302 3.41 3.602 3.776 4.035 4.208 4.382 4.632 4.892 5.156 5.401 5.631 5.932 6.233 6.535 6.913 7.287 7.645 8.066 8.535 8.992 9.505 10.065 10.695 11.354 12.101 13.001 13.923 15.051 16.329 17.836 19.648 21.915 24.715 28.347 31.709 33.858 35.375 36.463 37.262 37.886 38.378 38.739 39.049 39.285 39.489 39.68 39.825 39.917 39.98 40.039 40.072 40.094 40.113 40.102 40.09 40.086 40.078 40.066 40.054 40.038 40.008 39.964 39.932 39.894 39.841 39.803 39.761 39.732 39.664 39.594 39.51 39.466 39.354 39.299 39.221 39.137 38.925 38.814 38.702 38.524 38.302 38.133 37.972 37.37 -9 ,3389 ,KEBNE ,16656646,Mon Nov 22 22:38:14 CET,Tue Nov 23 00:17:27 CET,0.0 1.486 1.798 2.041 2.248 2.457 2.627 2.785 3.076 3.196 3.32 3.451 3.664 3.783 4.017 4.231 4.432 4.533 4.73 4.914 5.173 5.348 5.519 5.778 6.049 6.307 6.555 6.792 7.082 7.376 7.685 8.058 8.409 8.751 9.156 9.619 10.076 10.574 11.106 11.689 12.334 13.09 13.982 14.909 16.027 17.313 18.846 20.685 22.978 25.781 29.475 32.883 35.072 36.615 37.746 38.599 39.23 39.706 40.078 40.411 40.649 40.851 41.034 41.184 41.294 41.378 41.455 41.491 41.518 41.545 41.551 41.558 41.57 41.568 41.562 41.545 41.518 41.498 41.457 41.424 41.394 41.339 41.291 41.233 41.207 41.165 41.093 41.01 40.966 40.844 40.788 40.73 40.655 40.436 40.298 40.196 40.104 39.962 39.802 39.614 39.102 -10 ,15243 ,KEBNE ,16656647,Mon Nov 22 22:38:14 CET,Tue Nov 23 00:16:42 CET,0.0 0.894 1.193 1.427 1.605 1.779 1.94 2.095 2.376 2.506 2.638 2.785 2.999 3.112 3.318 3.515 3.722 3.823 4.009 4.197 4.488 4.668 4.848 5.112 5.35 5.586 5.821 6.056 6.372 6.676 6.964 7.319 7.663 7.998 8.399 8.862 9.32 9.819 10.355 10.963 11.617 12.366 13.253 14.143 15.222 16.5 18.039 19.84 22.096 24.954 28.617 31.997 34.199 35.688 36.772 37.628 38.243 38.698 39.038 39.344 39.582 39.747 39.878 39.998 40.104 40.184 40.256 40.302 40.322 40.35 40.378 40.366 40.344 40.324 40.3 40.279 40.262 40.221 40.15 40.104 40.064 40.01 39.962 39.91 39.886 39.819 39.745 39.659 39.608 39.49 39.462 39.406 39.324 39.14 39.048 38.969 38.869 38.704 38.466 38.171 37.517 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt deleted file mode 100644 index 811b4d4a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19658 ,KEBNE ,16654486,Mon Nov 22 06:41:35 CET,Mon Nov 22 08:18:45 CET,0.0 0.67 0.9 1.076 1.234 1.389 1.546 1.688 1.938 2.056 2.169 2.281 2.489 2.593 2.786 2.97 3.151 3.239 3.41 3.579 3.82 3.986 4.153 4.387 4.609 4.834 5.061 5.269 5.535 5.8 6.077 6.424 6.755 7.077 7.468 7.916 8.333 8.796 9.308 9.879 10.5 11.192 12.013 12.864 13.92 15.153 16.622 18.343 20.456 23.155 26.704 29.886 31.897 33.294 34.309 35.07 35.655 36.121 36.47 36.78 37.009 37.169 37.312 37.431 37.517 37.587 37.63 37.664 37.699 37.731 37.767 37.791 37.793 37.779 37.771 37.771 37.769 37.757 37.739 37.719 37.7 37.665 37.637 37.607 37.589 37.555 37.514 37.468 37.445 37.354 37.348 37.315 37.284 37.203 37.16 37.116 37.071 37.001 36.883 36.76 36.619 -2 ,8269 ,KEBNE ,16654487,Mon Nov 22 06:41:35 CET,Mon Nov 22 08:19:30 CET,0.0 0.291 0.456 0.613 0.742 0.873 0.997 1.121 1.361 1.467 1.572 1.683 1.885 1.985 2.172 2.352 2.534 2.622 2.784 2.946 3.193 3.358 3.521 3.765 4.014 4.24 4.449 4.664 4.957 5.24 5.517 5.864 6.194 6.512 6.886 7.321 7.747 8.211 8.714 9.269 9.873 10.582 11.449 12.33 13.397 14.657 16.135 17.851 20.013 22.691 26.208 29.442 31.51 32.937 33.93 34.694 35.291 35.751 36.088 36.363 36.579 36.773 36.944 37.083 37.185 37.263 37.331 37.392 37.444 37.499 37.554 37.586 37.594 37.589 37.585 37.584 37.571 37.549 37.535 37.525 37.515 37.497 37.471 37.444 37.432 37.393 37.338 37.272 37.237 37.145 37.159 37.124 37.092 37.008 36.937 36.88 36.842 36.786 36.69 36.502 36.154 -3 ,14768 ,KEBNE ,16656650,Mon Nov 22 22:39:16 CET,Tue Nov 23 00:17:57 CET,0.0 1.098 1.361 1.566 1.721 1.845 1.963 2.074 2.29 2.403 2.521 2.644 2.841 2.936 3.12 3.296 3.471 3.557 3.728 3.895 4.145 4.315 4.473 4.7 4.924 5.142 5.362 5.578 5.855 6.126 6.395 6.732 7.059 7.381 7.762 8.194 8.617 9.085 9.606 10.169 10.759 11.443 12.261 13.118 14.163 15.356 16.798 18.53 20.642 23.302 26.831 30.01 32.072 33.519 34.527 35.288 35.884 36.369 36.738 37.037 37.253 37.434 37.586 37.724 37.817 37.883 37.96 38.012 38.052 38.086 38.111 38.121 38.13 38.147 38.15 38.137 38.128 38.112 38.089 38.069 38.04 38.003 37.977 37.936 37.911 37.863 37.819 37.773 37.744 37.655 37.675 37.644 37.606 37.534 37.484 37.422 37.352 37.275 37.169 37.041 36.759 -4 ,15589 ,KEBNE ,16654489,Mon Nov 22 06:41:35 CET,Mon Nov 22 08:19:27 CET,0.0 0.506 0.739 0.894 1.04 1.176 1.305 1.43 1.666 1.778 1.886 1.995 2.2 2.307 2.506 2.686 2.861 2.951 3.131 3.31 3.563 3.722 3.884 4.121 4.348 4.568 4.778 4.983 5.26 5.542 5.821 6.156 6.476 6.791 7.177 7.624 8.055 8.536 9.054 9.619 10.249 10.974 11.828 12.722 13.805 15.047 16.516 18.254 20.368 23.009 26.533 29.706 31.699 33.108 34.141 34.916 35.475 35.913 36.255 36.552 36.788 36.966 37.097 37.211 37.304 37.384 37.466 37.518 37.559 37.592 37.604 37.614 37.636 37.656 37.665 37.674 37.669 37.652 37.633 37.618 37.592 37.535 37.504 37.471 37.449 37.407 37.354 37.29 37.264 37.174 37.163 37.11 37.06 36.984 36.927 36.86 36.8 36.735 36.652 36.553 36.252 -5 ,30587 ,KEBNE ,16654490,Mon Nov 22 06:41:35 CET,Mon Nov 22 08:19:03 CET,0.0 0.443 0.703 0.912 1.074 1.223 1.357 1.492 1.759 1.878 1.984 2.095 2.3 2.4 2.609 2.811 2.995 3.084 3.253 3.414 3.663 3.829 3.994 4.232 4.456 4.671 4.881 5.093 5.386 5.68 5.96 6.305 6.644 6.973 7.359 7.789 8.208 8.676 9.185 9.744 10.364 11.079 11.917 12.796 13.866 15.108 16.567 18.283 20.456 23.111 26.54 29.743 31.795 33.207 34.253 35.023 35.588 36.046 36.386 36.692 36.929 37.104 37.233 37.352 37.468 37.551 37.61 37.644 37.661 37.685 37.72 37.739 37.751 37.759 37.762 37.758 37.752 37.739 37.726 37.709 37.689 37.662 37.639 37.617 37.604 37.565 37.522 37.49 37.474 37.384 37.38 37.325 37.268 37.165 37.102 37.035 36.972 36.912 36.802 36.62 36.049 -6 ,6976 ,KEBNE ,16654491,Mon Nov 22 06:41:35 CET,Mon Nov 22 08:19:16 CET,0.0 0.731 0.994 1.201 1.381 1.542 1.685 1.817 2.102 2.218 2.318 2.428 2.628 2.73 2.945 3.153 3.352 3.443 3.606 3.763 4.004 4.158 4.313 4.552 4.783 5.007 5.221 5.432 5.719 5.995 6.267 6.6 6.919 7.225 7.589 8.02 8.461 8.954 9.481 10.05 10.66 11.38 12.236 13.124 14.231 15.514 17.029 18.816 20.982 23.711 27.308 30.526 32.597 34.086 35.16 35.959 36.551 37.007 37.358 37.657 37.877 38.044 38.174 38.273 38.369 38.448 38.503 38.558 38.603 38.626 38.657 38.682 38.7 38.715 38.719 38.72 38.725 38.718 38.691 38.677 38.662 38.631 38.61 38.581 38.561 38.516 38.479 38.441 38.416 38.329 38.331 38.29 38.24 38.143 38.091 38.017 37.93 37.854 37.73 37.565 37.18 -7 ,29963 ,KEBNE ,16656654,Mon Nov 22 22:50:41 CET,Tue Nov 23 00:30:26 CET,0.0 0.535 0.784 1.008 1.181 1.337 1.462 1.573 1.795 1.902 2.013 2.118 2.315 2.411 2.599 2.778 2.955 3.044 3.206 3.375 3.618 3.773 3.931 4.169 4.406 4.647 4.875 5.087 5.368 5.639 5.904 6.232 6.564 6.901 7.284 7.717 8.144 8.611 9.137 9.717 10.326 11.02 11.87 12.767 13.828 15.043 16.502 18.208 20.321 22.983 26.509 29.76 31.866 33.336 34.382 35.169 35.765 36.22 36.553 36.853 37.09 37.282 37.437 37.556 37.653 37.743 37.833 37.898 37.94 37.969 37.983 37.995 38.001 37.997 37.99 37.973 37.955 37.95 37.936 37.916 37.9 37.863 37.837 37.815 37.791 37.736 37.679 37.603 37.566 37.475 37.493 37.461 37.421 37.336 37.29 37.237 37.149 37.059 36.981 36.846 36.472 -8 ,18805 ,KEBNE ,16656655,Mon Nov 22 22:52:46 CET,Tue Nov 23 00:29:34 CET,0.0 0.371 0.553 0.717 0.871 1.008 1.135 1.252 1.468 1.584 1.708 1.842 2.051 2.153 2.339 2.519 2.694 2.784 2.961 3.126 3.38 3.541 3.686 3.903 4.124 4.349 4.575 4.788 5.051 5.311 5.576 5.894 6.193 6.493 6.874 7.321 7.756 8.242 8.777 9.344 9.945 10.648 11.504 12.384 13.439 14.653 16.109 17.832 19.929 22.546 26.054 29.251 31.27 32.69 33.723 34.475 35.025 35.459 35.788 36.086 36.332 36.513 36.648 36.761 36.853 36.928 37.001 37.051 37.091 37.135 37.173 37.187 37.202 37.231 37.242 37.243 37.242 37.224 37.199 37.182 37.171 37.159 37.136 37.109 37.097 37.064 37.018 36.965 36.935 36.844 36.834 36.796 36.758 36.675 36.634 36.587 36.514 36.408 36.296 36.159 35.884 -9 ,6741 ,KEBNE ,16656656,Mon Nov 22 22:52:46 CET,Tue Nov 23 00:29:19 CET,0.0 0.588 0.796 0.988 1.125 1.248 1.381 1.517 1.747 1.851 1.958 2.056 2.258 2.363 2.554 2.746 2.938 3.025 3.186 3.352 3.6 3.759 3.912 4.141 4.362 4.577 4.8 5.016 5.288 5.563 5.829 6.146 6.46 6.759 7.122 7.559 7.998 8.495 9.023 9.589 10.204 10.904 11.73 12.583 13.618 14.822 16.276 18.003 20.12 22.781 26.254 29.403 31.45 32.885 33.932 34.713 35.297 35.768 36.12 36.433 36.66 36.836 36.976 37.079 37.175 37.269 37.349 37.4 37.433 37.461 37.483 37.504 37.521 37.515 37.518 37.527 37.534 37.528 37.508 37.49 37.472 37.461 37.438 37.407 37.395 37.361 37.311 37.254 37.228 37.127 37.092 37.052 37.01 36.9 36.845 36.787 36.715 36.631 36.481 36.253 35.91 -10 ,28822 ,KEBNE ,16654495,Mon Nov 22 06:42:36 CET,Mon Nov 22 08:19:29 CET,0.0 0.406 0.636 0.788 0.938 1.092 1.222 1.335 1.549 1.661 1.782 1.908 2.104 2.193 2.38 2.568 2.755 2.842 3.001 3.161 3.395 3.548 3.703 3.936 4.164 4.391 4.618 4.838 5.131 5.418 5.686 6.025 6.357 6.677 7.071 7.507 7.914 8.383 8.909 9.471 10.08 10.791 11.654 12.555 13.613 14.81 16.272 18.028 20.16 22.797 26.308 29.585 31.652 33.036 34.067 34.887 35.507 35.992 36.355 36.662 36.878 37.07 37.233 37.346 37.427 37.475 37.523 37.576 37.619 37.652 37.675 37.695 37.718 37.725 37.724 37.719 37.702 37.664 37.621 37.596 37.571 37.538 37.512 37.481 37.46 37.406 37.365 37.313 37.28 37.182 37.173 37.133 37.087 36.998 36.957 36.913 36.857 36.76 36.627 36.489 35.676 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt deleted file mode 100644 index ecf6cb91..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1985 ,KEBNE ,16656658,Mon Nov 22 22:54:52 CET,Tue Nov 23 00:31:56 CET,0.0 0.191 0.274 0.33 0.376 0.421 0.45 0.464 0.489 0.497 0.503 0.407 0.509 0.515 0.523 0.516 0.512 0.508 0.48 0.448 0.413 0.39 0.352 0.285 0.216 0.146 0.071 -0.014 -0.126 -0.244 -0.37 -0.52 -0.68 -0.854 -1.056 -1.281 -1.518 -1.808 -2.152 -2.552 -3.011 -3.555 -4.228 -4.97 -5.933 -7.123 -8.636 -10.538 -13.077 -16.606 -21.938 -27.598 -31.747 -34.964 -37.557 -39.749 -41.549 -43.096 -44.378 -45.608 -46.637 -47.507 -48.32 -49.064 -49.72 -50.303 -50.898 -51.415 -51.845 -52.279 -52.716 -53.083 -53.451 -53.817 -54.102 -54.387 -54.682 -54.992 -55.306 -55.516 -55.723 -56.036 -56.254 -56.476 -56.585 -56.798 -57.019 -57.261 -57.387 -57.664 -57.737 -57.857 -57.98 -58.249 -58.403 -58.557 -58.692 -58.841 -59.009 -59.195 -59.581 -2 ,4523 ,KEBNE ,16656659,Mon Nov 22 22:54:52 CET,Tue Nov 23 00:31:56 CET,0.0 0.299 0.4 0.44 0.487 0.527 0.551 0.568 0.594 0.596 0.598 0.51 0.615 0.612 0.598 0.583 0.556 0.542 0.519 0.487 0.424 0.381 0.345 0.296 0.25 0.197 0.136 0.065 -0.045 -0.164 -0.289 -0.441 -0.593 -0.75 -0.951 -1.21 -1.473 -1.766 -2.107 -2.502 -2.949 -3.493 -4.172 -4.901 -5.839 -7.002 -8.499 -10.386 -12.894 -16.438 -21.691 -27.269 -31.453 -34.727 -37.351 -39.538 -41.342 -42.909 -44.206 -45.445 -46.454 -47.308 -48.094 -48.813 -49.467 -50.049 -50.632 -51.147 -51.601 -52.057 -52.511 -52.88 -53.263 -53.651 -53.939 -54.238 -54.546 -54.866 -55.206 -55.426 -55.635 -55.949 -56.159 -56.373 -56.485 -56.719 -56.973 -57.239 -57.374 -57.673 -57.798 -57.944 -58.085 -58.362 -58.509 -58.674 -58.846 -59.027 -59.244 -59.511 -60.038 -3 ,13532 ,KEBNE ,16654499,Mon Nov 22 06:42:36 CET,Mon Nov 22 08:19:38 CET,0.0 0.278 0.316 0.349 0.389 0.433 0.465 0.479 0.502 0.509 0.514 0.406 0.498 0.493 0.487 0.482 0.463 0.451 0.443 0.42 0.386 0.363 0.325 0.265 0.205 0.137 0.06 -0.015 -0.1 -0.2 -0.328 -0.497 -0.662 -0.826 -1.025 -1.256 -1.5 -1.78 -2.095 -2.461 -2.886 -3.401 -4.066 -4.839 -5.807 -6.987 -8.521 -10.45 -13.034 -16.648 -22.018 -27.602 -31.714 -34.961 -37.569 -39.75 -41.536 -43.075 -44.347 -45.554 -46.558 -47.428 -48.232 -48.951 -49.589 -50.172 -50.775 -51.305 -51.75 -52.208 -52.684 -53.053 -53.42 -53.795 -54.078 -54.369 -54.666 -54.966 -55.267 -55.466 -55.67 -55.982 -56.206 -56.435 -56.545 -56.761 -56.976 -57.2 -57.318 -57.603 -57.705 -57.831 -57.963 -58.261 -58.423 -58.592 -58.759 -58.905 -59.059 -59.279 -59.545 -4 ,4281 ,KEBNE ,16654500,Mon Nov 22 06:42:36 CET,Mon Nov 22 08:20:38 CET,0.0 0.225 0.347 0.405 0.433 0.456 0.477 0.501 0.548 0.558 0.562 0.486 0.598 0.605 0.61 0.604 0.578 0.566 0.548 0.534 0.493 0.459 0.421 0.352 0.297 0.242 0.164 0.08 -0.028 -0.147 -0.268 -0.416 -0.573 -0.738 -0.941 -1.188 -1.441 -1.749 -2.094 -2.48 -2.927 -3.472 -4.177 -4.939 -5.886 -7.035 -8.509 -10.421 -13.016 -16.598 -21.923 -27.587 -31.755 -35.007 -37.637 -39.82 -41.598 -43.121 -44.38 -45.605 -46.649 -47.558 -48.387 -49.136 -49.813 -50.42 -51.042 -51.58 -52.026 -52.475 -52.934 -53.304 -53.674 -54.056 -54.347 -54.634 -54.917 -55.214 -55.524 -55.728 -55.925 -56.226 -56.437 -56.663 -56.778 -57.001 -57.233 -57.465 -57.583 -57.882 -57.984 -58.115 -58.263 -58.543 -58.677 -58.822 -58.972 -59.122 -59.284 -59.483 -59.928 -5 ,6108 ,KEBNE ,16656662,Mon Nov 22 22:57:57 CET,Tue Nov 23 00:37:47 CET,0.0 0.167 0.262 0.355 0.416 0.444 0.476 0.512 0.572 0.586 0.592 0.492 0.593 0.594 0.582 0.579 0.585 0.585 0.573 0.55 0.514 0.483 0.449 0.392 0.337 0.284 0.216 0.139 0.028 -0.083 -0.189 -0.332 -0.498 -0.669 -0.883 -1.141 -1.406 -1.708 -2.04 -2.41 -2.834 -3.369 -4.039 -4.759 -5.694 -6.877 -8.37 -10.243 -12.781 -16.314 -21.591 -27.195 -31.349 -34.558 -37.128 -39.312 -41.148 -42.739 -44.047 -45.299 -46.331 -47.213 -48.006 -48.729 -49.395 -49.989 -50.575 -51.092 -51.541 -51.994 -52.446 -52.809 -53.188 -53.569 -53.852 -54.147 -54.469 -54.804 -55.142 -55.376 -55.608 -55.938 -56.149 -56.363 -56.476 -56.7 -56.915 -57.141 -57.266 -57.558 -57.652 -57.782 -57.915 -58.183 -58.319 -58.46 -58.62 -58.78 -58.957 -59.216 -59.553 -6 ,1321 ,KEBNE ,16654502,Mon Nov 22 06:43:38 CET,Mon Nov 22 08:19:51 CET,0.0 0.134 0.174 0.209 0.253 0.285 0.318 0.35 0.37 0.378 0.394 0.314 0.412 0.408 0.399 0.381 0.36 0.35 0.326 0.298 0.244 0.212 0.186 0.128 0.066 0.003 -0.065 -0.136 -0.236 -0.343 -0.461 -0.607 -0.752 -0.905 -1.103 -1.351 -1.605 -1.895 -2.236 -2.626 -3.06 -3.59 -4.292 -5.047 -5.967 -7.14 -8.651 -10.58 -13.154 -16.671 -22.021 -27.66 -31.786 -35.011 -37.622 -39.815 -41.618 -43.16 -44.443 -45.682 -46.712 -47.604 -48.4 -49.105 -49.74 -50.303 -50.887 -51.406 -51.846 -52.289 -52.744 -53.109 -53.483 -53.877 -54.165 -54.445 -54.733 -55.029 -55.316 -55.512 -55.723 -56.033 -56.231 -56.438 -56.549 -56.768 -56.98 -57.212 -57.33 -57.606 -57.695 -57.834 -57.984 -58.281 -58.428 -58.581 -58.741 -58.911 -59.147 -59.422 -59.724 -7 ,16633 ,KEBNE ,16654503,Mon Nov 22 06:44:38 CET,Mon Nov 22 08:22:30 CET,0.0 0.123 0.21 0.273 0.335 0.377 0.4 0.431 0.477 0.494 0.509 0.41 0.51 0.512 0.501 0.484 0.466 0.457 0.426 0.394 0.357 0.33 0.297 0.235 0.173 0.116 0.054 -0.015 -0.112 -0.219 -0.333 -0.488 -0.65 -0.819 -1.033 -1.282 -1.534 -1.827 -2.165 -2.558 -3.011 -3.57 -4.268 -5.018 -5.982 -7.177 -8.713 -10.629 -13.184 -16.712 -21.971 -27.591 -31.777 -35.024 -37.571 -39.726 -41.55 -43.139 -44.434 -45.663 -46.691 -47.572 -48.371 -49.094 -49.752 -50.333 -50.921 -51.435 -51.872 -52.319 -52.772 -53.129 -53.496 -53.877 -54.165 -54.455 -54.757 -55.067 -55.37 -55.566 -55.763 -56.091 -56.307 -56.522 -56.633 -56.853 -57.086 -57.33 -57.451 -57.729 -57.82 -57.948 -58.077 -58.359 -58.514 -58.669 -58.818 -59.009 -59.219 -59.426 -59.843 -8 ,32445 ,KEBNE ,16656665,Mon Nov 22 23:01:03 CET,Tue Nov 23 00:38:47 CET,0.0 0.246 0.354 0.409 0.434 0.467 0.497 0.509 0.525 0.525 0.533 0.445 0.548 0.546 0.54 0.518 0.491 0.48 0.455 0.429 0.376 0.342 0.315 0.262 0.198 0.134 0.062 -0.021 -0.132 -0.26 -0.388 -0.537 -0.691 -0.851 -1.057 -1.318 -1.589 -1.902 -2.241 -2.627 -3.078 -3.598 -4.268 -5.043 -6.027 -7.211 -8.73 -10.646 -13.228 -16.8 -22.104 -27.727 -31.878 -35.136 -37.761 -39.991 -41.844 -43.399 -44.681 -45.913 -46.931 -47.815 -48.618 -49.35 -50.015 -50.603 -51.205 -51.729 -52.166 -52.607 -53.06 -53.439 -53.822 -54.199 -54.501 -54.806 -55.1 -55.402 -55.716 -55.928 -56.146 -56.482 -56.704 -56.92 -57.033 -57.271 -57.502 -57.739 -57.86 -58.145 -58.258 -58.403 -58.55 -58.831 -58.982 -59.14 -59.284 -59.44 -59.621 -59.847 -60.149 -9 ,5221 ,KEBNE ,16654505,Mon Nov 22 06:44:38 CET,Mon Nov 22 08:22:38 CET,0.0 0.141 0.228 0.285 0.334 0.367 0.4 0.431 0.47 0.485 0.488 0.393 0.5 0.502 0.508 0.509 0.505 0.498 0.475 0.462 0.44 0.407 0.37 0.327 0.276 0.225 0.17 0.089 -0.023 -0.124 -0.225 -0.365 -0.518 -0.672 -0.849 -1.065 -1.297 -1.578 -1.928 -2.33 -2.767 -3.288 -3.94 -4.666 -5.619 -6.792 -8.282 -10.186 -12.749 -16.326 -21.68 -27.283 -31.407 -34.669 -37.274 -39.441 -41.267 -42.857 -44.172 -45.403 -46.405 -47.283 -48.091 -48.822 -49.488 -50.087 -50.713 -51.255 -51.686 -52.113 -52.551 -52.916 -53.291 -53.667 -53.945 -54.237 -54.543 -54.854 -55.161 -55.359 -55.569 -55.913 -56.156 -56.395 -56.508 -56.732 -56.964 -57.201 -57.314 -57.588 -57.686 -57.817 -57.962 -58.272 -58.422 -58.587 -58.766 -58.929 -59.083 -59.288 -59.717 -10 ,17135 ,KEBNE ,16656667,Mon Nov 22 23:05:16 CET,Tue Nov 23 00:40:31 CET,0.0 0.152 0.192 0.245 0.302 0.349 0.38 0.404 0.448 0.468 0.489 0.398 0.491 0.486 0.468 0.441 0.418 0.399 0.361 0.333 0.279 0.232 0.184 0.126 0.068 -0.004 -0.078 -0.163 -0.281 -0.388 -0.503 -0.658 -0.811 -0.977 -1.18 -1.421 -1.678 -1.982 -2.33 -2.714 -3.139 -3.653 -4.33 -5.104 -6.082 -7.286 -8.827 -10.74 -13.332 -16.98 -22.348 -27.999 -32.209 -35.47 -38.083 -40.294 -42.112 -43.661 -44.95 -46.207 -47.239 -48.102 -48.892 -49.614 -50.258 -50.839 -51.428 -51.942 -52.396 -52.853 -53.304 -53.674 -54.049 -54.424 -54.712 -55.0 -55.282 -55.57 -55.877 -56.098 -56.32 -56.63 -56.847 -57.073 -57.175 -57.385 -57.607 -57.827 -57.942 -58.229 -58.371 -58.53 -58.68 -58.973 -59.132 -59.286 -59.43 -59.598 -59.795 -59.988 -60.324 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt deleted file mode 100644 index 2ac08b18..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18580 ,KEBNE ,16656668,Mon Nov 22 23:06:15 CET,Tue Nov 23 00:43:08 CET,0.0 0.449 0.753 1.009 1.233 1.441 1.654 1.855 2.239 2.419 2.594 2.777 3.097 3.262 3.581 3.89 4.183 4.323 4.62 4.924 5.36 5.641 5.913 6.322 6.728 7.125 7.523 7.922 8.443 8.957 9.471 10.1 10.707 11.306 12.026 12.855 13.682 14.628 15.686 16.844 18.094 19.544 21.302 23.153 25.413 28.069 31.321 35.255 40.228 46.571 55.238 63.67 69.359 73.462 76.613 79.111 81.013 82.594 83.868 85.021 85.925 86.683 87.351 87.939 88.474 88.937 89.376 89.738 90.024 90.297 90.554 90.736 90.916 91.103 91.252 91.395 91.54 91.678 91.798 91.884 91.963 92.056 92.11 92.155 92.18 92.236 92.266 92.267 92.264 92.187 92.211 92.187 92.166 92.113 92.079 92.041 91.999 91.917 91.832 91.732 91.149 -2 ,11867 ,KEBNE ,16656669,Mon Nov 22 23:07:17 CET,Tue Nov 23 00:44:29 CET,0.0 0.749 1.062 1.311 1.523 1.724 1.934 2.123 2.484 2.662 2.825 3.009 3.342 3.508 3.805 4.101 4.417 4.573 4.88 5.181 5.611 5.893 6.171 6.569 6.969 7.377 7.778 8.167 8.678 9.186 9.687 10.311 10.944 11.568 12.301 13.163 14.016 14.963 16.013 17.181 18.441 19.913 21.708 23.592 25.901 28.578 31.805 35.705 40.685 47.132 55.911 64.326 70.117 74.322 77.466 80.008 82.016 83.654 84.936 86.094 87.018 87.795 88.483 89.071 89.575 90.004 90.419 90.766 91.048 91.311 91.563 91.765 91.957 92.148 92.267 92.363 92.48 92.592 92.7 92.769 92.832 92.932 92.985 93.027 93.049 93.107 93.155 93.181 93.189 93.123 93.169 93.16 93.153 93.109 93.07 93.035 92.987 92.861 92.704 92.446 91.479 -3 ,15959 ,KEBNE ,16656670,Mon Nov 22 23:08:20 CET,Tue Nov 23 00:45:50 CET,0.0 0.676 0.955 1.227 1.488 1.723 1.929 2.133 2.524 2.706 2.875 3.066 3.39 3.543 3.841 4.129 4.421 4.564 4.844 5.124 5.532 5.799 6.069 6.48 6.878 7.274 7.661 8.037 8.548 9.062 9.571 10.186 10.801 11.419 12.148 12.986 13.794 14.709 15.745 16.887 18.115 19.552 21.324 23.178 25.434 28.08 31.309 35.247 40.23 46.603 55.239 63.563 69.295 73.457 76.56 79.022 80.941 82.517 83.789 84.96 85.882 86.641 87.315 87.898 88.387 88.803 89.22 89.567 89.842 90.115 90.387 90.59 90.781 90.971 91.108 91.245 91.382 91.507 91.608 91.679 91.749 91.843 91.902 91.938 91.957 92.005 92.029 92.047 92.061 92.012 92.109 92.112 92.108 92.055 92.012 91.963 91.9 91.805 91.634 91.383 90.264 -4 ,18382 ,KEBNE ,16656671,Mon Nov 22 23:08:20 CET,Tue Nov 23 00:46:11 CET,0.0 0.532 0.786 1.02 1.217 1.401 1.596 1.79 2.142 2.309 2.481 2.659 2.977 3.136 3.452 3.758 4.044 4.185 4.47 4.753 5.169 5.438 5.713 6.137 6.557 6.957 7.338 7.73 8.259 8.775 9.275 9.905 10.532 11.143 11.873 12.718 13.543 14.474 15.52 16.666 17.915 19.383 21.177 23.049 25.318 27.987 31.213 35.103 40.014 46.344 55.032 63.364 69.06 73.22 76.301 78.732 80.644 82.201 83.451 84.614 85.543 86.324 87.001 87.58 88.088 88.522 88.939 89.282 89.56 89.838 90.106 90.312 90.515 90.715 90.857 90.983 91.105 91.238 91.37 91.449 91.51 91.606 91.659 91.695 91.721 91.754 91.771 91.786 91.795 91.729 91.774 91.759 91.741 91.666 91.622 91.566 91.504 91.418 91.315 91.148 90.351 -5 ,25701 ,KEBNE ,16654521,Mon Nov 22 06:46:44 CET,Mon Nov 22 08:23:36 CET,0.0 1.025 1.352 1.629 1.856 2.055 2.248 2.44 2.799 2.963 3.126 3.301 3.628 3.788 4.092 4.398 4.703 4.853 5.153 5.44 5.854 6.127 6.393 6.787 7.175 7.561 7.943 8.323 8.832 9.344 9.863 10.49 11.096 11.701 12.422 13.263 14.108 15.061 16.099 17.221 18.442 19.888 21.66 23.508 25.745 28.394 31.63 35.534 40.486 46.88 55.631 64.05 69.79 73.931 77.019 79.448 81.351 82.909 84.133 85.256 86.177 86.963 87.632 88.226 88.759 89.183 89.583 89.923 90.21 90.498 90.756 90.942 91.114 91.276 91.404 91.538 91.662 91.767 91.866 91.927 91.991 92.1 92.152 92.198 92.223 92.266 92.296 92.302 92.305 92.242 92.3 92.285 92.271 92.218 92.167 92.099 92.039 91.971 91.86 91.63 90.677 -6 ,2335 ,KEBNE ,16654523,Mon Nov 22 06:46:44 CET,Mon Nov 22 08:23:04 CET,0.0 0.873 1.207 1.451 1.651 1.857 2.069 2.279 2.661 2.84 3.016 3.184 3.503 3.659 3.966 4.271 4.572 4.722 5.02 5.316 5.76 6.042 6.315 6.728 7.133 7.531 7.916 8.292 8.8 9.313 9.817 10.435 11.062 11.686 12.425 13.287 14.128 15.073 16.136 17.298 18.548 20.008 21.767 23.626 25.908 28.563 31.781 35.638 40.536 46.902 55.667 64.112 69.834 74.036 77.21 79.709 81.682 83.293 84.543 85.719 86.681 87.441 88.083 88.658 89.166 89.585 89.99 90.34 90.624 90.893 91.165 91.373 91.567 91.756 91.884 92.012 92.146 92.267 92.381 92.454 92.519 92.606 92.662 92.713 92.727 92.738 92.756 92.769 92.772 92.696 92.757 92.745 92.716 92.63 92.591 92.546 92.489 92.417 92.288 92.071 91.047 -7 ,21834 ,KEBNE ,16654525,Mon Nov 22 06:46:44 CET,Mon Nov 22 08:23:40 CET,0.0 0.809 1.142 1.401 1.612 1.811 2.01 2.199 2.562 2.742 2.912 3.114 3.459 3.62 3.922 4.219 4.512 4.66 4.965 5.269 5.708 5.992 6.267 6.68 7.091 7.492 7.884 8.267 8.777 9.285 9.792 10.422 11.038 11.648 12.379 13.227 14.061 15.007 16.047 17.197 18.461 19.901 21.657 23.523 25.796 28.462 31.663 35.48 40.329 46.658 55.29 63.526 69.188 73.402 76.564 79.023 80.968 82.567 83.817 84.955 85.856 86.618 87.305 87.901 88.417 88.853 89.283 89.637 89.915 90.184 90.455 90.672 90.86 91.041 91.177 91.308 91.428 91.55 91.667 91.733 91.806 91.919 91.971 92.008 92.029 92.065 92.092 92.116 92.127 92.07 92.144 92.137 92.125 92.102 92.081 92.057 92.017 91.912 91.76 91.494 90.52 -8 ,167 ,KEBNE ,16654526,Mon Nov 22 06:46:44 CET,Mon Nov 22 08:23:14 CET,0.0 0.696 1.137 1.499 1.729 1.931 2.129 2.314 2.673 2.855 3.042 3.237 3.565 3.728 4.027 4.32 4.622 4.776 5.068 5.355 5.786 6.058 6.328 6.731 7.131 7.542 7.944 8.327 8.826 9.332 9.844 10.47 11.096 11.713 12.44 13.285 14.119 15.057 16.091 17.237 18.487 19.926 21.676 23.526 25.788 28.449 31.709 35.633 40.58 46.963 55.681 64.081 69.79 73.869 76.927 79.406 81.338 82.892 84.147 85.309 86.209 86.957 87.61 88.181 88.694 89.14 89.574 89.926 90.203 90.481 90.747 90.964 91.186 91.393 91.535 91.671 91.793 91.909 92.033 92.1 92.167 92.265 92.317 92.371 92.397 92.437 92.46 92.484 92.489 92.425 92.521 92.512 92.476 92.378 92.325 92.277 92.229 92.156 92.021 91.755 90.833 -9 ,7984 ,KEBNE ,16654527,Mon Nov 22 06:46:44 CET,Mon Nov 22 08:23:30 CET,0.0 0.961 1.313 1.596 1.834 2.037 2.222 2.4 2.753 2.928 3.092 3.247 3.563 3.723 4.039 4.341 4.627 4.768 5.05 5.325 5.731 5.999 6.265 6.664 7.064 7.469 7.871 8.255 8.77 9.292 9.808 10.44 11.06 11.674 12.406 13.26 14.099 15.025 16.044 17.184 18.439 19.906 21.689 23.572 25.871 28.554 31.801 35.698 40.661 47.101 55.857 64.308 70.023 74.203 77.355 79.808 81.728 83.276 84.515 85.671 86.6 87.378 88.059 88.654 89.171 89.594 89.997 90.354 90.65 90.931 91.209 91.43 91.645 91.85 91.988 92.121 92.253 92.367 92.475 92.553 92.617 92.678 92.716 92.751 92.771 92.808 92.833 92.859 92.866 92.796 92.847 92.833 92.819 92.806 92.764 92.683 92.603 92.521 92.38 92.163 90.872 -10 ,26514 ,KEBNE ,16656677,Mon Nov 22 23:11:31 CET,Tue Nov 23 00:43:09 CET,0.0 1.076 1.417 1.694 1.955 2.18 2.381 2.581 2.939 3.103 3.267 3.431 3.76 3.926 4.246 4.549 4.838 4.983 5.274 5.555 5.956 6.221 6.488 6.877 7.263 7.648 8.024 8.399 8.915 9.437 9.955 10.587 11.204 11.809 12.521 13.347 14.172 15.12 16.176 17.34 18.612 20.1 21.884 23.748 26.032 28.68 31.936 35.884 40.854 47.269 56.018 64.393 70.064 74.185 77.347 79.873 81.81 83.368 84.588 85.727 86.632 87.382 88.036 88.618 89.14 89.567 89.987 90.331 90.612 90.894 91.157 91.366 91.569 91.757 91.901 92.036 92.163 92.293 92.409 92.475 92.526 92.586 92.637 92.676 92.687 92.705 92.714 92.73 92.737 92.669 92.721 92.698 92.683 92.67 92.659 92.638 92.595 92.511 92.368 92.163 91.074 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt deleted file mode 100644 index 1b16a9e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12656 ,KEBNE ,16656678,Mon Nov 22 23:12:35 CET,Tue Nov 23 00:47:15 CET,0.0 0.572 0.841 1.102 1.323 1.514 1.706 1.906 2.28 2.454 2.624 2.791 3.119 3.28 3.593 3.899 4.193 4.341 4.636 4.925 5.353 5.635 5.911 6.313 6.705 7.094 7.481 7.864 8.369 8.878 9.413 10.084 10.728 11.376 12.157 13.027 13.859 14.792 15.814 16.92 18.126 19.531 21.259 23.083 25.297 27.897 31.033 34.816 39.599 45.734 54.132 61.962 67.279 71.282 74.302 76.736 78.683 80.16 81.206 82.136 82.896 83.558 84.147 84.649 85.076 85.445 85.806 86.12 86.372 86.599 86.824 87.0 87.156 87.295 87.402 87.515 87.635 87.759 87.871 87.935 87.991 88.042 88.069 88.1 88.116 88.152 88.169 88.171 88.172 88.097 88.182 88.183 88.171 88.088 88.038 88.005 87.946 87.846 87.749 87.591 87.172 -2 ,9721 ,KEBNE ,16656679,Mon Nov 22 23:13:33 CET,Tue Nov 23 00:51:30 CET,0.0 0.711 1.029 1.288 1.528 1.734 1.937 2.132 2.476 2.646 2.814 2.978 3.298 3.46 3.782 4.09 4.395 4.548 4.844 5.135 5.583 5.869 6.134 6.525 6.916 7.311 7.696 8.066 8.56 9.054 9.549 10.162 10.764 11.362 12.058 12.865 13.695 14.629 15.633 16.738 17.94 19.333 21.053 22.867 25.071 27.658 30.812 34.62 39.442 45.639 53.893 61.825 67.272 71.214 74.25 76.669 78.539 80.099 81.362 82.466 83.268 83.88 84.421 84.892 85.29 85.651 86.005 86.281 86.506 86.725 86.926 87.085 87.235 87.37 87.472 87.571 87.668 87.767 87.86 87.908 87.947 88.013 88.052 88.077 88.081 88.079 88.089 88.094 88.093 88.007 88.068 88.06 88.041 87.973 87.932 87.881 87.793 87.711 87.626 87.408 86.607 -3 ,27298 ,KEBNE ,16656680,Mon Nov 22 23:13:34 CET,Tue Nov 23 00:50:17 CET,0.0 0.713 1.022 1.282 1.553 1.803 2.014 2.216 2.593 2.781 2.97 3.165 3.492 3.659 3.992 4.309 4.624 4.778 5.073 5.364 5.785 6.062 6.343 6.766 7.168 7.559 7.967 8.381 8.909 9.428 9.944 10.59 11.225 11.841 12.564 13.384 14.201 15.126 16.15 17.265 18.471 19.891 21.625 23.431 25.637 28.216 31.351 35.136 39.912 46.11 54.63 62.691 68.115 72.103 74.95 77.026 78.635 79.982 81.032 81.987 82.742 83.356 83.897 84.366 84.779 85.151 85.499 85.77 85.994 86.21 86.411 86.562 86.708 86.85 86.945 87.043 87.143 87.239 87.328 87.377 87.43 87.504 87.55 87.596 87.612 87.636 87.658 87.68 87.683 87.607 87.67 87.653 87.642 87.593 87.55 87.498 87.433 87.349 87.243 87.094 86.817 -4 ,22597 ,KEBNE ,16656681,Mon Nov 22 23:13:33 CET,Tue Nov 23 00:51:49 CET,0.0 0.464 0.81 1.088 1.322 1.576 1.797 1.992 2.385 2.576 2.756 2.944 3.276 3.449 3.786 4.086 4.386 4.538 4.843 5.15 5.601 5.884 6.152 6.554 6.949 7.328 7.716 8.106 8.609 9.101 9.597 10.22 10.831 11.44 12.175 13.025 13.851 14.787 15.832 16.966 18.184 19.618 21.394 23.254 25.507 28.134 31.342 35.201 40.032 46.253 54.771 63.0 68.652 72.781 75.852 78.279 80.088 81.442 82.468 83.388 84.121 84.726 85.248 85.697 86.089 86.433 86.765 87.028 87.231 87.439 87.647 87.799 87.937 88.067 88.159 88.248 88.35 88.441 88.508 88.552 88.586 88.632 88.673 88.699 88.706 88.726 88.747 88.766 88.767 88.677 88.726 88.71 88.689 88.592 88.542 88.5 88.424 88.342 88.252 88.097 87.542 -5 ,27767 ,KEBNE ,16656682,Mon Nov 22 23:14:36 CET,Tue Nov 23 00:50:52 CET,0.0 0.656 0.973 1.241 1.465 1.674 1.876 2.07 2.444 2.628 2.808 2.989 3.308 3.468 3.768 4.073 4.368 4.508 4.792 5.075 5.481 5.747 6.004 6.4 6.804 7.216 7.63 8.02 8.529 9.027 9.516 10.13 10.748 11.361 12.086 12.918 13.725 14.63 15.647 16.769 18.004 19.462 21.219 23.035 25.237 27.817 30.946 34.706 39.485 45.619 54.002 62.126 67.658 71.666 74.575 76.767 78.412 79.74 80.857 81.895 82.685 83.323 83.867 84.339 84.755 85.111 85.459 85.745 85.974 86.19 86.403 86.577 86.732 86.885 86.999 87.099 87.196 87.295 87.386 87.437 87.479 87.52 87.545 87.577 87.587 87.621 87.673 87.688 87.684 87.602 87.631 87.6 87.562 87.499 87.476 87.439 87.391 87.329 87.206 87.02 86.518 -6 ,16157 ,KEBNE ,16656683,Mon Nov 22 23:14:36 CET,Tue Nov 23 00:51:03 CET,0.0 0.484 0.752 0.982 1.181 1.369 1.569 1.755 2.098 2.283 2.461 2.636 2.961 3.116 3.436 3.773 4.083 4.229 4.517 4.803 5.229 5.503 5.769 6.159 6.546 6.946 7.343 7.73 8.245 8.742 9.22 9.815 10.408 11.0 11.713 12.54 13.346 14.244 15.257 16.377 17.59 19.006 20.737 22.558 24.778 27.386 30.537 34.289 39.037 45.195 53.649 61.805 67.317 71.355 74.405 76.723 78.402 79.703 80.704 81.625 82.377 82.993 83.521 83.985 84.4 84.751 85.086 85.369 85.602 85.815 86.022 86.199 86.373 86.525 86.629 86.74 86.85 86.946 87.03 87.076 87.12 87.191 87.237 87.281 87.3 87.329 87.337 87.337 87.336 87.257 87.336 87.339 87.342 87.327 87.296 87.246 87.18 87.104 87.018 86.89 86.641 -7 ,7938 ,KEBNE ,16654535,Mon Nov 22 06:47:46 CET,Mon Nov 22 08:25:20 CET,0.0 0.58 0.905 1.148 1.358 1.563 1.776 1.981 2.359 2.529 2.699 2.891 3.213 3.371 3.681 3.961 4.238 4.384 4.668 4.946 5.365 5.646 5.926 6.339 6.738 7.122 7.512 7.898 8.398 8.889 9.374 9.973 10.582 11.192 11.933 12.802 13.636 14.543 15.549 16.652 17.865 19.283 20.997 22.784 24.953 27.52 30.677 34.436 39.163 45.326 53.651 61.643 67.16 71.166 74.166 76.58 78.492 80.054 81.29 82.345 83.106 83.739 84.299 84.77 85.171 85.514 85.863 86.153 86.375 86.593 86.813 86.977 87.129 87.273 87.38 87.486 87.584 87.689 87.782 87.828 87.875 87.946 87.992 88.034 88.055 88.093 88.116 88.129 88.133 88.059 88.128 88.113 88.102 88.074 88.047 88.012 87.966 87.893 87.813 87.711 87.478 -8 ,25517 ,KEBNE ,16654536,Mon Nov 22 06:47:46 CET,Mon Nov 22 08:24:55 CET,0.0 0.951 1.306 1.607 1.843 2.071 2.29 2.493 2.882 3.066 3.246 3.423 3.742 3.908 4.235 4.542 4.844 4.994 5.292 5.583 6.014 6.291 6.558 6.954 7.345 7.734 8.128 8.524 9.042 9.547 10.056 10.686 11.29 11.889 12.608 13.424 14.229 15.144 16.159 17.253 18.433 19.84 21.59 23.415 25.593 28.158 31.303 35.1 39.885 46.087 54.625 62.803 68.381 72.484 75.592 78.038 79.975 81.541 82.764 83.909 84.762 85.398 85.942 86.418 86.823 87.167 87.501 87.779 87.994 88.204 88.411 88.565 88.712 88.859 88.976 89.095 89.207 89.286 89.349 89.395 89.441 89.514 89.57 89.606 89.618 89.645 89.654 89.656 89.659 89.569 89.6 89.575 89.543 89.461 89.398 89.312 89.233 89.151 89.039 88.895 88.557 -9 ,30402 ,KEBNE ,16656686,Mon Nov 22 23:15:38 CET,Tue Nov 23 00:51:45 CET,0.0 0.771 1.092 1.376 1.612 1.812 2.008 2.198 2.556 2.731 2.893 3.056 3.374 3.532 3.852 4.158 4.462 4.623 4.935 5.223 5.637 5.922 6.209 6.619 7.01 7.408 7.812 8.207 8.722 9.228 9.725 10.346 10.965 11.575 12.295 13.125 13.962 14.91 15.963 17.111 18.354 19.802 21.539 23.351 25.573 28.19 31.383 35.228 40.018 46.18 54.655 62.762 68.36 72.458 75.527 77.941 79.806 81.351 82.465 83.38 84.119 84.751 85.305 85.771 86.164 86.492 86.819 87.095 87.314 87.528 87.738 87.899 88.045 88.187 88.297 88.398 88.479 88.556 88.628 88.672 88.712 88.745 88.775 88.805 88.816 88.824 88.826 88.838 88.845 88.762 88.797 88.776 88.752 88.692 88.64 88.573 88.503 88.41 88.305 88.192 87.845 -10 ,25770 ,KEBNE ,16654538,Mon Nov 22 06:48:48 CET,Mon Nov 22 08:25:54 CET,0.0 0.44 0.724 0.967 1.209 1.446 1.685 1.92 2.328 2.514 2.704 2.9 3.22 3.376 3.679 3.983 4.299 4.462 4.772 5.064 5.488 5.766 6.04 6.455 6.865 7.262 7.658 8.049 8.574 9.091 9.58 10.188 10.799 11.396 12.114 12.944 13.762 14.691 15.718 16.842 18.055 19.489 21.247 23.074 25.304 27.893 31.02 34.851 39.695 45.864 54.289 62.337 67.748 71.705 74.68 76.983 78.714 80.059 81.125 82.111 82.878 83.506 84.058 84.528 84.923 85.273 85.614 85.888 86.116 86.339 86.54 86.69 86.839 86.976 87.086 87.2 87.294 87.387 87.471 87.522 87.573 87.655 87.69 87.716 87.737 87.767 87.768 87.765 87.773 87.701 87.783 87.768 87.75 87.698 87.655 87.619 87.574 87.514 87.44 87.325 86.779 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt deleted file mode 100644 index 501465fc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14441 ,KEBNE ,16654539,Mon Nov 22 06:48:48 CET,Mon Nov 22 08:26:23 CET,0.0 0.383 0.633 0.846 1.071 1.283 1.469 1.663 2.046 2.221 2.388 2.554 2.867 3.014 3.301 3.581 3.862 4.005 4.292 4.576 5.019 5.318 5.602 6.024 6.437 6.833 7.235 7.639 8.17 8.694 9.206 9.855 10.507 11.123 11.847 12.687 13.519 14.465 15.52 16.694 17.972 19.459 21.296 23.235 25.562 28.276 31.584 35.544 40.55 47.017 55.901 64.542 70.459 74.782 78.055 80.662 82.712 84.396 85.745 86.981 87.974 88.804 89.532 90.204 90.804 91.306 91.784 92.183 92.516 92.842 93.165 93.421 93.681 93.936 94.112 94.285 94.468 94.657 94.828 94.929 95.029 95.162 95.24 95.329 95.377 95.472 95.556 95.625 95.663 95.638 95.741 95.762 95.775 95.79 95.805 95.79 95.779 95.786 95.775 95.722 95.501 -2 ,15925 ,KEBNE ,16654540,Mon Nov 22 06:48:48 CET,Mon Nov 22 08:25:33 CET,0.0 0.61 0.852 1.087 1.314 1.539 1.756 1.951 2.315 2.492 2.675 2.865 3.188 3.351 3.652 3.931 4.217 4.361 4.645 4.935 5.372 5.659 5.948 6.387 6.815 7.239 7.658 8.067 8.613 9.161 9.712 10.373 10.996 11.612 12.354 13.212 14.056 14.999 16.054 17.241 18.504 19.949 21.739 23.622 25.923 28.621 31.91 35.9 40.945 47.454 56.398 65.085 71.043 75.402 78.714 81.379 83.496 85.243 86.616 87.877 88.883 89.73 90.481 91.142 91.72 92.208 92.696 93.124 93.479 93.811 94.131 94.377 94.605 94.842 95.022 95.196 95.358 95.511 95.674 95.774 95.864 96.012 96.108 96.197 96.242 96.331 96.41 96.476 96.507 96.475 96.583 96.593 96.608 96.645 96.652 96.651 96.651 96.635 96.601 96.519 96.331 -3 ,14851 ,KEBNE ,16654541,Mon Nov 22 06:48:48 CET,Mon Nov 22 08:25:59 CET,0.0 0.589 0.852 1.09 1.324 1.529 1.714 1.908 2.265 2.427 2.604 2.806 3.132 3.304 3.65 3.965 4.255 4.396 4.678 4.968 5.403 5.69 5.975 6.408 6.836 7.248 7.65 8.053 8.587 9.103 9.611 10.245 10.879 11.506 12.25 13.112 13.953 14.898 15.941 17.091 18.357 19.852 21.666 23.559 25.869 28.584 31.894 35.876 40.926 47.479 56.519 65.273 71.222 75.551 78.819 81.45 83.53 85.235 86.572 87.806 88.818 89.655 90.381 91.025 91.587 92.071 92.55 92.952 93.287 93.618 93.937 94.196 94.451 94.702 94.888 95.069 95.251 95.424 95.575 95.673 95.782 95.937 96.018 96.094 96.137 96.222 96.295 96.365 96.403 96.378 96.516 96.549 96.575 96.623 96.648 96.66 96.649 96.632 96.552 96.44 96.309 -4 ,10012 ,KEBNE ,16656691,Mon Nov 22 23:16:42 CET,Tue Nov 23 00:54:36 CET,0.0 0.525 0.754 0.963 1.158 1.354 1.536 1.708 2.053 2.22 2.387 2.569 2.895 3.048 3.363 3.672 3.967 4.118 4.42 4.711 5.132 5.41 5.691 6.103 6.507 6.913 7.318 7.72 8.242 8.753 9.265 9.912 10.558 11.188 11.933 12.781 13.618 14.582 15.653 16.821 18.094 19.594 21.399 23.261 25.554 28.258 31.521 35.457 40.471 46.998 55.98 64.692 70.654 75.021 78.327 80.973 83.061 84.779 86.161 87.446 88.469 89.313 90.049 90.682 91.236 91.73 92.225 92.639 92.98 93.32 93.65 93.912 94.161 94.41 94.598 94.791 94.975 95.146 95.314 95.427 95.536 95.676 95.768 95.863 95.914 96.013 96.11 96.193 96.227 96.191 96.313 96.342 96.365 96.401 96.415 96.429 96.424 96.407 96.367 96.323 96.21 -5 ,25869 ,KEBNE ,16654543,Mon Nov 22 06:57:03 CET,Mon Nov 22 08:34:36 CET,0.0 0.558 0.833 1.054 1.272 1.488 1.686 1.87 2.232 2.411 2.58 2.755 3.086 3.255 3.58 3.895 4.189 4.333 4.624 4.923 5.372 5.668 5.954 6.37 6.781 7.193 7.606 8.008 8.53 9.045 9.555 10.194 10.841 11.466 12.213 13.081 13.919 14.874 15.942 17.095 18.356 19.85 21.678 23.595 25.897 28.605 31.925 35.888 40.901 47.421 56.407 65.175 71.186 75.59 78.922 81.526 83.585 85.318 86.68 87.953 88.978 89.82 90.572 91.236 91.817 92.32 92.822 93.247 93.588 93.909 94.231 94.5 94.761 95.009 95.201 95.396 95.571 95.739 95.906 96.013 96.122 96.273 96.368 96.459 96.498 96.577 96.661 96.734 96.763 96.723 96.835 96.86 96.896 96.939 96.941 96.931 96.905 96.89 96.849 96.701 95.966 -6 ,4110 ,KEBNE ,16656693,Mon Nov 22 23:16:42 CET,Tue Nov 23 00:54:11 CET,0.0 0.405 0.716 0.978 1.185 1.393 1.587 1.77 2.105 2.267 2.433 2.595 2.914 3.077 3.393 3.704 4.02 4.178 4.498 4.798 5.231 5.518 5.794 6.196 6.614 7.035 7.444 7.84 8.36 8.891 9.407 10.016 10.633 11.254 11.998 12.859 13.694 14.638 15.708 16.917 18.214 19.694 21.486 23.351 25.65 28.352 31.626 35.582 40.595 47.127 56.114 64.757 70.644 74.985 78.297 80.946 83.048 84.771 86.137 87.412 88.434 89.278 90.04 90.716 91.29 91.77 92.244 92.662 93.007 93.348 93.681 93.938 94.191 94.435 94.62 94.799 94.969 95.135 95.291 95.394 95.502 95.668 95.774 95.867 95.912 96.01 96.091 96.159 96.198 96.171 96.303 96.332 96.359 96.415 96.43 96.442 96.452 96.448 96.44 96.382 96.271 -7 ,16063 ,KEBNE ,16656694,Mon Nov 22 23:17:43 CET,Tue Nov 23 00:54:53 CET,0.0 0.769 1.077 1.31 1.533 1.736 1.922 2.096 2.418 2.582 2.757 2.923 3.236 3.398 3.709 4.009 4.303 4.451 4.747 5.039 5.461 5.748 6.03 6.426 6.826 7.226 7.611 8.004 8.535 9.056 9.57 10.209 10.831 11.447 12.187 13.034 13.865 14.809 15.864 17.02 18.286 19.778 21.578 23.457 25.758 28.459 31.749 35.704 40.731 47.295 56.251 64.829 70.726 75.049 78.342 81.0 83.089 84.8 86.153 87.409 88.41 89.228 89.962 90.625 91.215 91.71 92.201 92.634 92.983 93.325 93.658 93.908 94.154 94.4 94.57 94.732 94.902 95.077 95.24 95.344 95.446 95.576 95.667 95.758 95.799 95.884 95.973 96.067 96.109 96.086 96.225 96.256 96.271 96.307 96.336 96.34 96.328 96.302 96.251 96.194 95.94 -9 ,18161 ,KEBNE ,16656696,Mon Nov 22 23:17:43 CET,Tue Nov 23 00:55:44 CET,0.0 0.391 0.672 0.927 1.156 1.368 1.577 1.76 2.099 2.281 2.454 2.614 2.924 3.078 3.383 3.674 3.956 4.1 4.388 4.665 5.068 5.338 5.607 6.017 6.426 6.827 7.23 7.626 8.142 8.647 9.154 9.815 10.476 11.111 11.851 12.694 13.525 14.467 15.523 16.689 17.961 19.436 21.225 23.131 25.45 28.158 31.471 35.445 40.488 47.05 56.037 64.629 70.471 74.742 77.986 80.605 82.68 84.402 85.743 86.974 87.981 88.795 89.52 90.171 90.747 91.252 91.738 92.136 92.453 92.768 93.078 93.326 93.567 93.801 93.987 94.172 94.354 94.532 94.696 94.806 94.914 95.061 95.151 95.221 95.259 95.349 95.433 95.507 95.547 95.52 95.64 95.66 95.68 95.727 95.739 95.751 95.771 95.768 95.711 95.602 95.327 -10 ,22405 ,KEBNE ,16656697,Mon Nov 22 23:17:44 CET,Tue Nov 23 00:55:32 CET,0.0 0.577 0.798 1.003 1.206 1.411 1.63 1.842 2.203 2.375 2.538 2.701 3.018 3.17 3.475 3.78 4.083 4.231 4.521 4.806 5.224 5.504 5.787 6.201 6.611 7.017 7.412 7.801 8.323 8.84 9.346 9.972 10.592 11.207 11.947 12.813 13.656 14.62 15.694 16.86 18.134 19.621 21.433 23.349 25.665 28.368 31.678 35.663 40.71 47.241 56.242 64.852 70.735 75.08 78.327 80.908 82.96 84.693 86.101 87.39 88.396 89.227 89.963 90.606 91.186 91.69 92.177 92.584 92.919 93.26 93.609 93.873 94.117 94.372 94.567 94.749 94.927 95.098 95.257 95.362 95.472 95.618 95.708 95.802 95.843 95.917 95.998 96.074 96.105 96.072 96.194 96.219 96.245 96.294 96.314 96.318 96.302 96.267 96.221 96.193 95.891 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt deleted file mode 100644 index 9b83da74..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11248 ,KEBNE ,16656698,Mon Nov 22 23:17:43 CET,Tue Nov 23 00:55:17 CET,0.0 0.51 0.691 0.791 0.872 0.946 1.026 1.106 1.245 1.3 1.341 1.365 1.469 1.507 1.581 1.651 1.722 1.754 1.812 1.87 1.939 1.979 2.017 2.069 2.11 2.147 2.185 2.222 2.266 2.31 2.35 2.39 2.423 2.447 2.468 2.479 2.475 2.459 2.431 2.375 2.293 2.185 2.037 1.869 1.618 1.238 0.705 0.008 -1.008 -2.52 -5.035 -7.97 -10.266 -12.14 -13.671 -15.016 -16.169 -17.157 -18.004 -18.861 -19.556 -20.137 -20.708 -21.243 -21.716 -22.165 -22.657 -23.089 -23.457 -23.82 -24.196 -24.523 -24.859 -25.209 -25.456 -25.689 -25.939 -26.19 -26.448 -26.633 -26.827 -27.138 -27.351 -27.56 -27.677 -27.929 -28.184 -28.443 -28.57 -28.796 -28.978 -29.113 -29.261 -29.595 -29.779 -30.012 -30.276 -30.548 -30.836 -31.164 -32.147 -2 ,31346 ,KEBNE ,16656699,Mon Nov 22 23:17:44 CET,Tue Nov 23 00:55:52 CET,0.0 0.638 0.808 0.936 1.038 1.123 1.209 1.29 1.434 1.499 1.558 1.611 1.721 1.773 1.863 1.938 2.005 2.035 2.094 2.146 2.232 2.288 2.331 2.397 2.455 2.504 2.546 2.586 2.624 2.653 2.688 2.728 2.757 2.788 2.816 2.826 2.832 2.829 2.821 2.81 2.765 2.677 2.537 2.345 2.069 1.676 1.146 0.489 -0.481 -2.033 -4.664 -7.71 -10.053 -11.973 -13.546 -14.892 -16.046 -17.075 -17.921 -18.715 -19.384 -19.973 -20.52 -21.04 -21.538 -21.97 -22.42 -22.821 -23.169 -23.548 -23.917 -24.187 -24.454 -24.724 -24.931 -25.165 -25.423 -25.695 -25.988 -26.196 -26.399 -26.712 -26.944 -27.174 -27.289 -27.52 -27.775 -28.057 -28.194 -28.438 -28.643 -28.778 -28.905 -29.163 -29.328 -29.517 -29.739 -29.992 -30.293 -30.706 -31.918 -3 ,14911 ,KEBNE ,16656700,Mon Nov 22 23:17:43 CET,Tue Nov 23 00:55:21 CET,0.0 0.724 0.951 1.108 1.256 1.359 1.447 1.554 1.722 1.798 1.871 1.949 2.072 2.116 2.2 2.286 2.362 2.396 2.464 2.525 2.599 2.648 2.695 2.77 2.849 2.909 2.956 2.989 3.035 3.082 3.123 3.169 3.198 3.219 3.246 3.269 3.279 3.283 3.263 3.201 3.148 3.093 2.953 2.771 2.513 2.144 1.622 0.883 -0.164 -1.76 -4.308 -7.202 -9.487 -11.343 -12.877 -14.199 -15.306 -16.274 -17.103 -17.912 -18.633 -19.303 -19.906 -20.416 -20.871 -21.287 -21.714 -22.084 -22.394 -22.707 -23.042 -23.322 -23.605 -23.897 -24.123 -24.35 -24.574 -24.83 -25.121 -25.318 -25.523 -25.858 -26.1 -26.35 -26.467 -26.689 -26.919 -27.162 -27.282 -27.498 -27.69 -27.834 -27.983 -28.302 -28.461 -28.615 -28.779 -28.984 -29.224 -29.477 -30.39 -4 ,19610 ,KEBNE ,16656701,Mon Nov 22 23:17:44 CET,Tue Nov 23 00:55:44 CET,0.0 0.824 1.043 1.193 1.33 1.449 1.536 1.613 1.744 1.803 1.863 1.904 2.011 2.051 2.134 2.226 2.306 2.341 2.408 2.466 2.543 2.594 2.633 2.676 2.72 2.766 2.815 2.864 2.916 2.958 2.99 3.013 3.027 3.053 3.073 3.074 3.062 3.041 3.015 2.97 2.901 2.809 2.668 2.481 2.194 1.823 1.312 0.581 -0.467 -2.043 -4.673 -7.646 -9.909 -11.761 -13.274 -14.593 -15.73 -16.708 -17.541 -18.361 -19.03 -19.606 -20.155 -20.686 -21.164 -21.57 -22.029 -22.472 -22.838 -23.216 -23.621 -23.948 -24.274 -24.594 -24.854 -25.133 -25.41 -25.684 -25.973 -26.184 -26.39 -26.714 -26.945 -27.18 -27.307 -27.571 -27.839 -28.1 -28.232 -28.466 -28.677 -28.835 -28.999 -29.357 -29.548 -29.749 -29.962 -30.206 -30.486 -30.827 -31.767 -5 ,25203 ,KEBNE ,16656702,Mon Nov 22 23:17:43 CET,Tue Nov 23 00:56:05 CET,0.0 0.423 0.584 0.71 0.819 0.92 1.021 1.115 1.267 1.326 1.391 1.448 1.57 1.627 1.708 1.799 1.892 1.934 2.009 2.071 2.155 2.207 2.258 2.331 2.38 2.427 2.483 2.529 2.579 2.622 2.658 2.701 2.749 2.794 2.837 2.867 2.874 2.872 2.87 2.83 2.741 2.633 2.48 2.296 2.04 1.667 1.146 0.434 -0.617 -2.152 -4.593 -7.439 -9.714 -11.629 -13.177 -14.488 -15.627 -16.596 -17.395 -18.206 -18.934 -19.55 -20.112 -20.631 -21.092 -21.55 -22.02 -22.417 -22.783 -23.17 -23.551 -23.844 -24.15 -24.487 -24.759 -25.033 -25.309 -25.595 -25.893 -26.107 -26.335 -26.668 -26.887 -27.115 -27.235 -27.489 -27.75 -28.028 -28.175 -28.42 -28.635 -28.791 -28.958 -29.323 -29.54 -29.776 -30.011 -30.263 -30.559 -30.976 -32.269 -6 ,25360 ,KEBNE ,16656703,Mon Nov 22 23:18:46 CET,Tue Nov 23 00:56:37 CET,0.0 0.309 0.452 0.574 0.68 0.76 0.841 0.924 1.064 1.129 1.205 1.285 1.401 1.45 1.531 1.601 1.664 1.695 1.753 1.804 1.868 1.912 1.959 2.022 2.089 2.143 2.173 2.208 2.255 2.296 2.343 2.389 2.421 2.444 2.458 2.468 2.466 2.445 2.412 2.359 2.284 2.172 1.996 1.811 1.558 1.197 0.69 -0.039 -1.1 -2.628 -5.095 -8.003 -10.266 -12.109 -13.616 -14.9 -16.008 -16.966 -17.779 -18.596 -19.324 -19.989 -20.594 -21.17 -21.706 -22.167 -22.646 -23.081 -23.452 -23.823 -24.16 -24.421 -24.709 -25.025 -25.279 -25.553 -25.843 -26.141 -26.412 -26.597 -26.809 -27.137 -27.372 -27.62 -27.743 -27.989 -28.238 -28.524 -28.682 -28.926 -29.128 -29.287 -29.46 -29.828 -30.008 -30.183 -30.386 -30.638 -30.964 -31.365 -32.509 -7 ,17377 ,KEBNE ,16656704,Mon Nov 22 23:18:45 CET,Tue Nov 23 00:56:28 CET,0.0 0.316 0.504 0.621 0.71 0.802 0.886 0.961 1.095 1.164 1.232 1.296 1.411 1.457 1.537 1.631 1.712 1.741 1.8 1.857 1.936 1.992 2.04 2.101 2.161 2.218 2.263 2.288 2.316 2.351 2.382 2.414 2.431 2.444 2.459 2.459 2.452 2.442 2.428 2.389 2.325 2.243 2.113 1.945 1.691 1.317 0.77 0.013 -1.086 -2.749 -5.44 -8.433 -10.729 -12.633 -14.212 -15.525 -16.634 -17.654 -18.539 -19.449 -20.233 -20.888 -21.457 -21.958 -22.428 -22.849 -23.278 -23.68 -24.035 -24.389 -24.75 -25.062 -25.387 -25.727 -26.001 -26.275 -26.541 -26.816 -27.098 -27.297 -27.497 -27.789 -27.983 -28.192 -28.312 -28.569 -28.835 -29.111 -29.261 -29.499 -29.704 -29.87 -30.038 -30.426 -30.637 -30.864 -31.137 -31.37 -31.626 -32.073 -33.878 -8 ,13286 ,KEBNE ,16656705,Mon Nov 22 23:18:46 CET,Tue Nov 23 00:56:19 CET,0.0 0.381 0.526 0.649 0.777 0.893 0.983 1.066 1.207 1.263 1.316 1.376 1.496 1.541 1.617 1.694 1.766 1.801 1.871 1.924 1.994 2.033 2.067 2.122 2.169 2.215 2.259 2.294 2.326 2.353 2.392 2.427 2.448 2.476 2.512 2.527 2.53 2.53 2.506 2.46 2.382 2.277 2.131 1.937 1.671 1.314 0.801 0.089 -0.944 -2.481 -4.971 -7.851 -10.1 -11.933 -13.483 -14.815 -15.913 -16.878 -17.704 -18.498 -19.166 -19.764 -20.357 -20.927 -21.438 -21.879 -22.359 -22.808 -23.188 -23.556 -23.93 -24.257 -24.575 -24.873 -25.124 -25.412 -25.7 -25.965 -26.21 -26.395 -26.607 -26.925 -27.117 -27.299 -27.396 -27.619 -27.857 -28.104 -28.239 -28.461 -28.636 -28.779 -28.934 -29.277 -29.459 -29.67 -29.898 -30.164 -30.469 -30.88 -32.141 -9 ,6879 ,KEBNE ,16656706,Mon Nov 22 23:18:46 CET,Tue Nov 23 00:58:17 CET,0.0 0.506 0.643 0.77 0.878 0.974 1.074 1.152 1.281 1.341 1.398 1.448 1.567 1.624 1.726 1.822 1.908 1.946 2.014 2.085 2.199 2.254 2.304 2.363 2.408 2.46 2.51 2.551 2.591 2.626 2.662 2.701 2.728 2.749 2.775 2.774 2.75 2.707 2.644 2.576 2.5 2.378 2.194 1.989 1.724 1.35 0.826 0.102 -1.002 -2.625 -5.234 -8.194 -10.51 -12.396 -13.94 -15.269 -16.416 -17.432 -18.292 -19.163 -19.886 -20.496 -21.1 -21.69 -22.217 -22.682 -23.188 -23.652 -24.042 -24.419 -24.781 -25.079 -25.381 -25.672 -25.892 -26.109 -26.34 -26.589 -26.839 -27.023 -27.225 -27.528 -27.74 -27.94 -28.042 -28.296 -28.559 -28.791 -28.908 -29.135 -29.331 -29.483 -29.645 -30.008 -30.217 -30.43 -30.641 -30.861 -31.123 -31.501 -32.622 -10 ,28806 ,KEBNE ,16656707,Mon Nov 22 23:18:45 CET,Tue Nov 23 00:56:27 CET,0.0 0.445 0.63 0.778 0.89 0.985 1.071 1.142 1.276 1.345 1.41 1.444 1.558 1.61 1.696 1.774 1.841 1.871 1.921 1.982 2.08 2.141 2.198 2.272 2.332 2.385 2.441 2.49 2.544 2.591 2.626 2.65 2.672 2.702 2.733 2.743 2.726 2.707 2.686 2.648 2.593 2.479 2.301 2.094 1.803 1.418 0.902 0.216 -0.796 -2.353 -4.884 -7.781 -10.058 -11.895 -13.432 -14.771 -15.883 -16.886 -17.751 -18.59 -19.281 -19.872 -20.427 -20.936 -21.408 -21.841 -22.294 -22.715 -23.062 -23.394 -23.732 -24.007 -24.297 -24.608 -24.843 -25.073 -25.328 -25.603 -25.883 -26.064 -26.242 -26.52 -26.744 -26.988 -27.106 -27.374 -27.655 -27.897 -28.011 -28.239 -28.467 -28.652 -28.831 -29.169 -29.365 -29.58 -29.83 -30.112 -30.434 -30.855 -32.38 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt deleted file mode 100644 index 2af969ea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16229 ,KEBNE ,16656708,Mon Nov 22 23:18:45 CET,Tue Nov 23 00:58:28 CET,0.0 0.311 0.521 0.694 0.849 0.998 1.133 1.396 1.5 1.59 1.693 1.831 1.903 2.039 2.154 2.25 2.3 2.391 2.466 2.574 2.653 2.723 2.809 2.88 2.947 3.03 3.112 3.197 3.272 3.326 3.376 3.435 3.481 3.517 3.569 3.613 3.639 3.655 3.664 3.661 3.615 3.518 3.367 3.144 2.842 2.363 1.653 0.614 -0.914 -3.466 -6.471 -8.847 -10.771 -12.331 -13.663 -14.803 -15.825 -16.664 -17.463 -18.159 -18.734 -19.26 -19.754 -20.237 -20.719 -21.213 -21.629 -22.006 -22.411 -22.815 -23.139 -23.466 -23.822 -24.099 -24.371 -24.655 -24.954 -25.26 -25.475 -25.696 -26.018 -26.242 -26.485 -26.616 -26.887 -27.156 -27.447 -27.602 -27.845 -28.03 -28.19 -28.381 -28.77 -28.974 -29.192 -29.439 -29.732 -30.079 -30.544 -2 ,30484 ,KEBNE ,16656709,Mon Nov 22 23:18:46 CET,Tue Nov 23 00:58:57 CET,0.0 0.33 0.563 0.763 0.925 1.065 1.218 1.487 1.581 1.666 1.767 1.905 1.974 2.113 2.229 2.336 2.396 2.502 2.587 2.707 2.789 2.869 2.983 3.094 3.2 3.286 3.348 3.421 3.493 3.57 3.662 3.723 3.771 3.835 3.886 3.929 3.97 3.999 3.988 3.925 3.846 3.773 3.665 3.437 3.127 2.674 1.971 0.958 -0.561 -3.088 -6.074 -8.396 -10.233 -11.745 -13.109 -14.36 -15.462 -16.415 -17.346 -18.049 -18.641 -19.192 -19.708 -20.184 -20.592 -21.013 -21.386 -21.704 -22.039 -22.377 -22.656 -22.968 -23.308 -23.583 -23.873 -24.161 -24.449 -24.755 -24.972 -25.2 -25.547 -25.768 -26.0 -26.125 -26.371 -26.627 -26.898 -27.035 -27.274 -27.487 -27.651 -27.814 -28.159 -28.365 -28.589 -28.826 -29.095 -29.415 -29.983 -3 ,27640 ,KEBNE ,16656710,Mon Nov 22 23:18:45 CET,Tue Nov 23 00:57:25 CET,0.0 0.345 0.602 0.783 0.936 1.081 1.211 1.455 1.561 1.648 1.747 1.892 1.965 2.092 2.2 2.304 2.362 2.464 2.542 2.669 2.757 2.825 2.921 3.022 3.104 3.174 3.241 3.334 3.43 3.503 3.58 3.668 3.733 3.784 3.824 3.855 3.905 3.945 3.931 3.895 3.854 3.751 3.604 3.407 3.089 2.586 1.873 0.813 -0.788 -3.376 -6.317 -8.602 -10.449 -11.999 -13.327 -14.432 -15.398 -16.212 -17.016 -17.688 -18.267 -18.797 -19.291 -19.763 -20.212 -20.693 -21.123 -21.482 -21.858 -22.259 -22.583 -22.908 -23.251 -23.506 -23.752 -24.012 -24.29 -24.589 -24.803 -25.021 -25.341 -25.566 -25.8 -25.916 -26.159 -26.433 -26.717 -26.859 -27.098 -27.315 -27.492 -27.658 -27.982 -28.16 -28.362 -28.582 -28.854 -29.179 -29.578 -4 ,26802 ,KEBNE ,16656711,Mon Nov 22 23:18:45 CET,Tue Nov 23 00:58:33 CET,0.0 0.321 0.574 0.773 0.948 1.11 1.251 1.475 1.562 1.649 1.741 1.877 1.948 2.078 2.211 2.322 2.373 2.48 2.577 2.71 2.786 2.86 2.964 3.068 3.163 3.232 3.296 3.399 3.492 3.569 3.653 3.713 3.775 3.848 3.898 3.932 3.967 3.996 3.997 3.967 3.917 3.804 3.635 3.382 3.03 2.541 1.842 0.76 -0.879 -3.502 -6.571 -8.977 -10.895 -12.489 -13.864 -15.021 -16.04 -16.892 -17.733 -18.452 -19.059 -19.623 -20.18 -20.703 -21.167 -21.645 -22.045 -22.381 -22.728 -23.076 -23.364 -23.647 -23.969 -24.252 -24.53 -24.808 -25.09 -25.386 -25.597 -25.798 -26.118 -26.364 -26.589 -26.702 -26.968 -27.236 -27.504 -27.654 -27.903 -28.102 -28.266 -28.452 -28.862 -29.069 -29.295 -29.544 -29.84 -30.188 -30.622 -5 ,7079 ,KEBNE ,16656712,Mon Nov 22 23:18:45 CET,Tue Nov 23 00:57:16 CET,0.0 0.327 0.556 0.723 0.861 0.982 1.089 1.283 1.372 1.455 1.561 1.695 1.77 1.916 2.052 2.175 2.223 2.317 2.403 2.502 2.57 2.652 2.762 2.858 2.958 3.057 3.149 3.246 3.332 3.405 3.479 3.564 3.639 3.694 3.739 3.763 3.786 3.811 3.803 3.771 3.708 3.595 3.479 3.308 3.03 2.578 1.919 0.955 -0.513 -3.0 -5.984 -8.271 -10.111 -11.658 -12.978 -14.09 -15.066 -15.895 -16.741 -17.455 -18.041 -18.581 -19.092 -19.556 -19.959 -20.377 -20.759 -21.096 -21.434 -21.759 -22.027 -22.301 -22.584 -22.803 -23.038 -23.305 -23.587 -23.894 -24.11 -24.32 -24.653 -24.89 -25.135 -25.259 -25.498 -25.752 -26.006 -26.115 -26.304 -26.443 -26.568 -26.716 -27.098 -27.297 -27.511 -27.756 -28.034 -28.357 -28.77 -6 ,2074 ,KEBNE ,16656713,Mon Nov 22 23:18:46 CET,Tue Nov 23 00:57:57 CET,0.0 0.331 0.562 0.742 0.89 1.018 1.141 1.367 1.468 1.563 1.661 1.788 1.855 1.979 2.091 2.201 2.25 2.354 2.455 2.576 2.642 2.705 2.797 2.871 2.949 3.028 3.091 3.167 3.228 3.281 3.346 3.404 3.445 3.472 3.511 3.55 3.576 3.586 3.568 3.539 3.478 3.353 3.215 2.979 2.615 2.132 1.433 0.382 -1.1 -3.569 -6.535 -8.894 -10.845 -12.405 -13.728 -14.859 -15.873 -16.76 -17.625 -18.338 -18.964 -19.533 -20.041 -20.519 -20.939 -21.343 -21.693 -21.997 -22.318 -22.655 -22.922 -23.189 -23.483 -23.718 -23.947 -24.168 -24.393 -24.63 -24.799 -24.981 -25.251 -25.429 -25.615 -25.711 -25.92 -26.146 -26.397 -26.534 -26.775 -26.974 -27.133 -27.288 -27.554 -27.713 -27.894 -28.076 -28.301 -28.594 -28.966 -7 ,4001 ,KEBNE ,16656714,Mon Nov 22 23:18:45 CET,Tue Nov 23 01:00:03 CET,0.0 0.341 0.578 0.766 0.921 1.053 1.17 1.372 1.462 1.56 1.685 1.824 1.893 2.025 2.149 2.255 2.302 2.406 2.512 2.647 2.725 2.799 2.892 2.964 3.036 3.115 3.191 3.274 3.355 3.437 3.526 3.594 3.641 3.696 3.766 3.826 3.853 3.846 3.837 3.798 3.72 3.603 3.444 3.24 2.938 2.44 1.749 0.747 -0.834 -3.427 -6.401 -8.737 -10.623 -12.175 -13.474 -14.56 -15.526 -16.35 -17.141 -17.808 -18.401 -18.956 -19.469 -19.938 -20.36 -20.783 -21.143 -21.453 -21.781 -22.115 -22.388 -22.696 -23.013 -23.243 -23.485 -23.726 -23.967 -24.234 -24.439 -24.645 -24.966 -25.174 -25.35 -25.44 -25.647 -25.892 -26.173 -26.316 -26.565 -26.796 -26.967 -27.15 -27.53 -27.732 -27.934 -28.137 -28.405 -28.734 -29.233 -8 ,32618 ,KEBNE ,16656715,Mon Nov 22 23:19:48 CET,Tue Nov 23 00:58:41 CET,0.0 0.29 0.497 0.669 0.816 0.938 1.032 1.2 1.282 1.357 1.457 1.589 1.655 1.812 1.955 2.065 2.125 2.228 2.312 2.447 2.528 2.6 2.699 2.806 2.905 2.986 3.055 3.135 3.214 3.286 3.364 3.431 3.474 3.51 3.57 3.61 3.622 3.624 3.6 3.562 3.491 3.386 3.25 3.015 2.674 2.164 1.469 0.498 -1.015 -3.543 -6.392 -8.683 -10.59 -12.162 -13.518 -14.66 -15.669 -16.498 -17.291 -17.95 -18.516 -19.064 -19.563 -20.004 -20.434 -20.933 -21.4 -21.794 -22.192 -22.599 -22.917 -23.241 -23.576 -23.809 -24.035 -24.26 -24.473 -24.694 -24.863 -25.045 -25.304 -25.494 -25.733 -25.853 -26.085 -26.329 -26.592 -26.734 -26.968 -27.194 -27.363 -27.519 -27.853 -28.033 -28.235 -28.468 -28.739 -29.053 -29.41 -9 ,5924 ,KEBNE ,16656716,Mon Nov 22 23:19:48 CET,Tue Nov 23 01:00:00 CET,0.0 0.353 0.607 0.783 0.928 1.067 1.192 1.425 1.533 1.623 1.728 1.868 1.932 2.059 2.17 2.254 2.3 2.412 2.517 2.628 2.689 2.755 2.861 2.961 3.049 3.125 3.189 3.268 3.344 3.419 3.493 3.547 3.594 3.645 3.716 3.777 3.809 3.83 3.835 3.798 3.73 3.628 3.514 3.312 2.951 2.451 1.774 0.803 -0.753 -3.405 -6.336 -8.605 -10.505 -12.112 -13.495 -14.62 -15.61 -16.467 -17.296 -17.97 -18.556 -19.106 -19.613 -20.104 -20.562 -21.018 -21.427 -21.785 -22.142 -22.518 -22.842 -23.171 -23.505 -23.767 -24.039 -24.315 -24.599 -24.899 -25.11 -25.32 -25.644 -25.875 -26.113 -26.234 -26.49 -26.746 -27.023 -27.167 -27.399 -27.605 -27.783 -27.963 -28.311 -28.482 -28.661 -28.871 -29.123 -29.44 -29.897 -10 ,25626 ,KEBNE ,16656717,Mon Nov 22 23:19:48 CET,Tue Nov 23 00:58:46 CET,0.0 0.307 0.508 0.694 0.823 0.932 1.039 1.249 1.334 1.417 1.523 1.647 1.71 1.826 1.937 2.044 2.093 2.19 2.285 2.428 2.518 2.594 2.688 2.778 2.863 2.931 3.004 3.109 3.198 3.279 3.375 3.447 3.493 3.538 3.58 3.623 3.648 3.642 3.623 3.589 3.523 3.422 3.298 3.114 2.801 2.28 1.571 0.529 -1.073 -3.627 -6.559 -8.888 -10.802 -12.39 -13.733 -14.846 -15.83 -16.673 -17.499 -18.225 -18.893 -19.515 -20.108 -20.624 -21.056 -21.502 -21.886 -22.202 -22.533 -22.867 -23.151 -23.453 -23.742 -23.969 -24.199 -24.441 -24.692 -24.94 -25.109 -25.273 -25.518 -25.686 -25.865 -25.961 -26.156 -26.352 -26.559 -26.665 -26.868 -27.042 -27.182 -27.326 -27.593 -27.728 -27.899 -28.098 -28.329 -28.621 -29.054 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt deleted file mode 100644 index 9d525b26..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12750 ,KEBNE ,16656718,Mon Nov 22 23:19:48 CET,Tue Nov 23 00:59:12 CET,0.0 0.53 0.737 0.897 1.016 1.14 1.248 1.335 1.474 1.544 1.609 1.654 1.773 1.834 1.945 2.038 2.124 2.168 2.25 2.335 2.453 2.517 2.584 2.685 2.761 2.82 2.884 2.941 3.019 3.106 3.182 3.272 3.362 3.438 3.509 3.601 3.705 3.785 3.846 3.92 3.983 4.023 4.053 4.055 4.01 3.905 3.72 3.398 2.828 1.951 0.457 -1.4 -2.923 -4.219 -5.277 -6.176 -6.957 -7.663 -8.252 -8.847 -9.355 -9.78 -10.201 -10.594 -10.93 -11.254 -11.592 -11.871 -12.108 -12.355 -12.61 -12.822 -13.036 -13.258 -13.439 -13.615 -13.789 -13.982 -14.174 -14.297 -14.427 -14.625 -14.759 -14.906 -14.982 -15.134 -15.296 -15.471 -15.554 -15.722 -15.859 -15.964 -16.075 -16.319 -16.443 -16.561 -16.674 -16.822 -17.002 -17.213 -18.111 -2 ,15942 ,KEBNE ,16654560,Mon Nov 22 07:07:22 CET,Mon Nov 22 08:43:52 CET,0.0 0.895 1.167 1.351 1.474 1.559 1.649 1.741 1.88 1.941 2.005 2.045 2.158 2.222 2.344 2.458 2.58 2.63 2.703 2.763 2.861 2.927 2.999 3.105 3.202 3.282 3.344 3.42 3.513 3.578 3.645 3.732 3.818 3.902 3.987 4.075 4.154 4.218 4.264 4.321 4.378 4.412 4.413 4.389 4.319 4.194 4.051 3.824 3.407 2.629 1.094 -0.765 -2.256 -3.483 -4.519 -5.444 -6.25 -6.958 -7.549 -8.135 -8.625 -9.049 -9.452 -9.816 -10.161 -10.487 -10.815 -11.102 -11.355 -11.605 -11.859 -12.086 -12.318 -12.531 -12.688 -12.852 -13.026 -13.199 -13.375 -13.507 -13.64 -13.838 -13.977 -14.117 -14.186 -14.33 -14.504 -14.687 -14.775 -14.945 -15.071 -15.168 -15.266 -15.507 -15.632 -15.755 -15.899 -16.075 -16.298 -16.574 -17.073 -3 ,15939 ,KEBNE ,16654561,Mon Nov 22 07:08:28 CET,Mon Nov 22 08:46:34 CET,0.0 0.406 0.612 0.771 0.895 1.011 1.104 1.183 1.335 1.399 1.463 1.537 1.655 1.71 1.799 1.88 1.967 2.01 2.082 2.152 2.245 2.305 2.369 2.449 2.529 2.602 2.672 2.743 2.827 2.912 2.986 3.069 3.148 3.22 3.289 3.34 3.39 3.453 3.523 3.588 3.638 3.685 3.723 3.714 3.677 3.602 3.444 3.154 2.646 1.829 0.371 -1.465 -3.017 -4.331 -5.399 -6.318 -7.124 -7.832 -8.429 -9.035 -9.534 -9.967 -10.386 -10.754 -11.084 -11.399 -11.738 -12.033 -12.291 -12.555 -12.821 -13.036 -13.264 -13.506 -13.673 -13.839 -14.013 -14.187 -14.363 -14.49 -14.624 -14.825 -14.959 -15.096 -15.165 -15.315 -15.462 -15.603 -15.68 -15.84 -15.93 -16.017 -16.117 -16.312 -16.41 -16.533 -16.683 -16.849 -17.03 -17.253 -17.713 -4 ,8413 ,KEBNE ,16656721,Mon Nov 22 23:19:49 CET,Tue Nov 23 00:59:02 CET,0.0 0.63 0.811 0.946 1.078 1.174 1.246 1.312 1.453 1.517 1.578 1.635 1.75 1.8 1.884 1.964 2.046 2.083 2.153 2.218 2.303 2.354 2.402 2.483 2.565 2.635 2.709 2.786 2.871 2.94 3.012 3.101 3.174 3.239 3.307 3.374 3.437 3.501 3.554 3.588 3.613 3.628 3.636 3.628 3.576 3.462 3.277 3.015 2.578 1.764 0.182 -1.79 -3.387 -4.72 -5.844 -6.852 -7.713 -8.456 -9.076 -9.676 -10.171 -10.601 -11.024 -11.403 -11.731 -12.036 -12.367 -12.668 -12.916 -13.171 -13.438 -13.657 -13.88 -14.105 -14.284 -14.471 -14.657 -14.842 -15.036 -15.177 -15.316 -15.533 -15.695 -15.858 -15.946 -16.113 -16.276 -16.457 -16.545 -16.708 -16.814 -16.905 -17.005 -17.234 -17.367 -17.494 -17.612 -17.771 -17.957 -18.156 -18.674 -5 ,549 ,KEBNE ,16656722,Mon Nov 22 23:19:49 CET,Tue Nov 23 00:59:07 CET,0.0 0.319 0.502 0.645 0.755 0.859 0.963 1.044 1.209 1.295 1.36 1.422 1.529 1.573 1.661 1.743 1.826 1.865 1.935 2.004 2.109 2.176 2.239 2.347 2.452 2.531 2.602 2.665 2.743 2.831 2.919 3.015 3.097 3.162 3.23 3.313 3.389 3.457 3.52 3.57 3.605 3.632 3.634 3.614 3.573 3.444 3.234 2.941 2.407 1.515 0.027 -1.737 -3.208 -4.404 -5.416 -6.35 -7.17 -7.902 -8.492 -9.058 -9.553 -9.994 -10.408 -10.788 -11.136 -11.452 -11.788 -12.074 -12.314 -12.577 -12.86 -13.099 -13.329 -13.556 -13.73 -13.907 -14.093 -14.292 -14.5 -14.637 -14.781 -15.0 -15.145 -15.303 -15.391 -15.572 -15.742 -15.907 -15.992 -16.159 -16.285 -16.398 -16.513 -16.725 -16.84 -16.976 -17.151 -17.365 -17.56 -17.798 -18.31 -6 ,18579 ,KEBNE ,16654564,Mon Nov 22 07:07:21 CET,Mon Nov 22 08:45:52 CET,0.0 0.745 0.984 1.147 1.257 1.353 1.448 1.551 1.755 1.85 1.934 2.023 2.149 2.203 2.322 2.427 2.502 2.537 2.616 2.698 2.811 2.881 2.948 3.044 3.129 3.209 3.281 3.341 3.428 3.51 3.587 3.681 3.756 3.829 3.923 4.021 4.102 4.175 4.254 4.333 4.374 4.392 4.427 4.445 4.391 4.27 4.082 3.772 3.271 2.456 0.992 -0.808 -2.303 -3.564 -4.614 -5.538 -6.324 -7.024 -7.623 -8.202 -8.687 -9.121 -9.518 -9.864 -10.198 -10.506 -10.825 -11.124 -11.375 -11.612 -11.847 -12.044 -12.251 -12.46 -12.622 -12.793 -12.981 -13.169 -13.364 -13.512 -13.661 -13.879 -14.023 -14.168 -14.249 -14.417 -14.571 -14.723 -14.809 -14.975 -15.087 -15.196 -15.323 -15.573 -15.702 -15.837 -15.994 -16.17 -16.348 -16.589 -17.058 -7 ,21537 ,KEBNE ,16654565,Mon Nov 22 07:07:21 CET,Mon Nov 22 08:44:32 CET,0.0 0.523 0.692 0.837 0.976 1.061 1.132 1.216 1.37 1.427 1.477 1.537 1.654 1.705 1.808 1.908 1.997 2.035 2.103 2.163 2.252 2.315 2.381 2.468 2.543 2.603 2.659 2.725 2.808 2.881 2.951 3.034 3.105 3.17 3.241 3.308 3.373 3.432 3.496 3.547 3.56 3.571 3.574 3.54 3.488 3.4 3.185 2.839 2.344 1.519 0.02 -1.765 -3.236 -4.475 -5.505 -6.422 -7.236 -7.969 -8.583 -9.151 -9.626 -10.041 -10.421 -10.793 -11.148 -11.46 -11.784 -12.072 -12.305 -12.56 -12.83 -13.036 -13.246 -13.458 -13.626 -13.808 -13.991 -14.197 -14.406 -14.54 -14.684 -14.894 -15.028 -15.175 -15.25 -15.391 -15.546 -15.709 -15.787 -15.953 -16.058 -16.14 -16.231 -16.449 -16.57 -16.703 -16.857 -17.038 -17.251 -17.474 -17.926 -8 ,7436 ,KEBNE ,16654566,Mon Nov 22 07:07:21 CET,Mon Nov 22 08:44:43 CET,0.0 0.677 0.846 0.98 1.113 1.243 1.381 1.507 1.705 1.787 1.852 1.906 2.026 2.094 2.217 2.312 2.395 2.435 2.53 2.631 2.761 2.834 2.905 3.005 3.101 3.184 3.264 3.338 3.426 3.51 3.585 3.658 3.721 3.779 3.839 3.913 3.986 4.063 4.121 4.154 4.184 4.22 4.24 4.221 4.181 4.092 3.896 3.584 3.089 2.25 0.751 -1.12 -2.642 -3.929 -5.005 -5.953 -6.769 -7.477 -8.079 -8.663 -9.141 -9.573 -9.993 -10.378 -10.737 -11.056 -11.384 -11.67 -11.902 -12.135 -12.388 -12.611 -12.842 -13.078 -13.262 -13.449 -13.64 -13.833 -14.026 -14.159 -14.296 -14.494 -14.635 -14.793 -14.871 -15.022 -15.167 -15.337 -15.426 -15.598 -15.746 -15.851 -15.949 -16.149 -16.269 -16.419 -16.57 -16.741 -16.954 -17.201 -17.629 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt deleted file mode 100644 index 72374f52..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,907 ,KEBNE ,16656729,Mon Nov 22 23:19:49 CET,Tue Nov 23 00:59:30 CET,0.0 0.301 0.436 0.516 0.588 0.654 0.7 0.745 0.823 0.858 0.898 0.911 0.998 1.024 1.082 1.142 1.187 1.196 1.207 1.224 1.248 1.26 1.28 1.309 1.322 1.323 1.32 1.319 1.302 1.271 1.247 1.215 1.164 1.099 1.024 0.928 0.822 0.702 0.566 0.385 0.17 -0.082 -0.419 -0.806 -1.329 -2.014 -2.914 -4.093 -5.737 -8.065 -11.656 -15.629 -18.676 -21.111 -23.087 -24.753 -26.14 -27.323 -28.296 -29.225 -29.979 -30.659 -31.317 -31.919 -32.459 -32.935 -33.415 -33.835 -34.183 -34.527 -34.882 -35.172 -35.467 -35.778 -36.033 -36.282 -36.52 -36.771 -37.034 -37.214 -37.389 -37.651 -37.829 -38.016 -38.105 -38.273 -38.462 -38.66 -38.76 -38.967 -39.079 -39.181 -39.292 -39.55 -39.683 -39.82 -39.965 -40.143 -40.352 -40.558 -40.822 -3 ,22407 ,KEBNE ,16656730,Mon Nov 22 23:19:49 CET,Tue Nov 23 00:59:19 CET,0.0 0.68 0.782 0.867 0.954 1.027 1.095 1.165 1.296 1.354 1.389 1.38 1.481 1.517 1.575 1.63 1.676 1.7 1.741 1.77 1.8 1.815 1.833 1.845 1.851 1.864 1.87 1.866 1.857 1.836 1.805 1.754 1.7 1.649 1.572 1.471 1.387 1.267 1.096 0.899 0.658 0.375 0.004 -0.41 -0.951 -1.669 -2.593 -3.79 -5.425 -7.764 -11.374 -15.283 -18.283 -20.701 -22.667 -24.318 -25.698 -26.891 -27.886 -28.826 -29.595 -30.275 -30.904 -31.473 -31.992 -32.464 -32.946 -33.36 -33.706 -34.061 -34.437 -34.737 -35.029 -35.331 -35.566 -35.815 -36.071 -36.322 -36.58 -36.757 -36.932 -37.196 -37.397 -37.598 -37.693 -37.892 -38.102 -38.322 -38.435 -38.648 -38.753 -38.875 -39.009 -39.262 -39.388 -39.526 -39.707 -39.888 -40.05 -40.329 -40.703 -4 ,28814 ,KEBNE ,16656731,Mon Nov 22 23:19:48 CET,Tue Nov 23 00:59:20 CET,0.0 0.19 0.305 0.377 0.445 0.523 0.582 0.625 0.735 0.783 0.814 0.817 0.903 0.926 0.956 0.975 1.0 1.011 1.031 1.048 1.066 1.078 1.08 1.076 1.082 1.082 1.069 1.055 1.026 0.996 0.969 0.919 0.867 0.807 0.726 0.627 0.512 0.364 0.194 -0.004 -0.236 -0.534 -0.908 -1.326 -1.889 -2.592 -3.522 -4.744 -6.443 -8.804 -12.471 -16.519 -19.555 -21.995 -23.975 -25.63 -26.988 -28.148 -29.109 -30.044 -30.816 -31.48 -32.1 -32.674 -33.191 -33.647 -34.119 -34.534 -34.884 -35.245 -35.614 -35.904 -36.191 -36.496 -36.734 -36.977 -37.217 -37.459 -37.721 -37.896 -38.075 -38.358 -38.542 -38.719 -38.811 -39.007 -39.204 -39.419 -39.533 -39.746 -39.87 -39.984 -40.103 -40.347 -40.468 -40.597 -40.739 -40.882 -41.064 -41.284 -41.608 -5 ,14319 ,KEBNE ,16656732,Mon Nov 22 23:19:49 CET,Tue Nov 23 00:58:59 CET,0.0 0.293 0.452 0.542 0.607 0.694 0.784 0.854 0.957 1.001 1.036 1.054 1.154 1.19 1.245 1.298 1.343 1.358 1.378 1.401 1.438 1.454 1.465 1.478 1.494 1.496 1.494 1.489 1.474 1.453 1.423 1.394 1.372 1.324 1.25 1.161 1.056 0.924 0.774 0.589 0.365 0.081 -0.274 -0.674 -1.238 -1.947 -2.864 -4.048 -5.697 -8.074 -11.709 -15.677 -18.652 -21.04 -23.025 -24.707 -26.091 -27.328 -28.37 -29.353 -30.153 -30.832 -31.465 -32.042 -32.566 -33.042 -33.522 -33.933 -34.291 -34.664 -35.038 -35.344 -35.66 -35.981 -36.222 -36.461 -36.712 -36.963 -37.205 -37.382 -37.563 -37.82 -37.999 -38.19 -38.29 -38.49 -38.69 -38.904 -39.012 -39.215 -39.325 -39.439 -39.552 -39.808 -39.94 -40.077 -40.224 -40.371 -40.567 -40.806 -41.24 -6 ,29023 ,KEBNE ,16656733,Mon Nov 22 23:19:48 CET,Tue Nov 23 00:59:53 CET,0.0 0.37 0.54 0.646 0.737 0.815 0.897 0.972 1.075 1.111 1.145 1.152 1.239 1.264 1.313 1.344 1.363 1.38 1.413 1.444 1.49 1.504 1.514 1.532 1.548 1.556 1.56 1.562 1.544 1.532 1.515 1.481 1.439 1.386 1.321 1.24 1.145 1.018 0.847 0.643 0.416 0.116 -0.288 -0.712 -1.259 -1.97 -2.875 -4.025 -5.65 -7.987 -11.581 -15.516 -18.504 -20.871 -22.808 -24.479 -25.883 -27.093 -28.078 -29.025 -29.831 -30.554 -31.217 -31.806 -32.333 -32.791 -33.259 -33.666 -34.006 -34.348 -34.698 -34.985 -35.276 -35.583 -35.825 -36.054 -36.276 -36.52 -36.77 -36.94 -37.118 -37.376 -37.551 -37.741 -37.837 -38.032 -38.223 -38.418 -38.527 -38.737 -38.865 -38.973 -39.072 -39.306 -39.426 -39.555 -39.701 -39.859 -40.052 -40.272 -40.643 -7 ,24191 ,KEBNE ,16654575,Mon Nov 22 07:10:26 CET,Mon Nov 22 08:47:41 CET,0.0 0.486 0.586 0.701 0.83 0.922 0.977 1.033 1.131 1.169 1.203 1.197 1.281 1.3 1.343 1.387 1.429 1.445 1.47 1.499 1.528 1.548 1.572 1.591 1.603 1.602 1.603 1.606 1.58 1.542 1.519 1.484 1.44 1.402 1.351 1.266 1.168 1.045 0.888 0.695 0.48 0.224 -0.133 -0.539 -1.053 -1.716 -2.636 -3.85 -5.515 -7.857 -11.489 -15.536 -18.595 -21.028 -22.989 -24.659 -26.057 -27.262 -28.248 -29.199 -29.974 -30.649 -31.277 -31.845 -32.364 -32.829 -33.312 -33.742 -34.102 -34.455 -34.814 -35.112 -35.419 -35.718 -35.949 -36.196 -36.445 -36.702 -36.961 -37.136 -37.317 -37.59 -37.79 -38.004 -38.112 -38.336 -38.544 -38.757 -38.871 -39.094 -39.234 -39.342 -39.461 -39.706 -39.83 -39.963 -40.128 -40.315 -40.513 -40.735 -41.151 -8 ,26503 ,KEBNE ,16654576,Mon Nov 22 07:10:26 CET,Mon Nov 22 08:47:47 CET,0.0 0.598 0.789 0.896 0.961 1.015 1.07 1.134 1.246 1.285 1.307 1.293 1.382 1.414 1.468 1.497 1.526 1.541 1.567 1.597 1.642 1.665 1.674 1.674 1.678 1.685 1.697 1.707 1.709 1.7 1.683 1.654 1.62 1.582 1.529 1.455 1.366 1.242 1.092 0.917 0.708 0.432 0.091 -0.304 -0.873 -1.575 -2.492 -3.712 -5.332 -7.652 -11.264 -15.196 -18.22 -20.66 -22.641 -24.281 -25.631 -26.809 -27.799 -28.755 -29.536 -30.217 -30.865 -31.453 -31.968 -32.429 -32.909 -33.334 -33.708 -34.093 -34.476 -34.792 -35.1 -35.393 -35.627 -35.86 -36.086 -36.323 -36.567 -36.732 -36.894 -37.136 -37.308 -37.486 -37.576 -37.759 -37.946 -38.144 -38.248 -38.45 -38.554 -38.66 -38.773 -39.026 -39.164 -39.29 -39.423 -39.585 -39.783 -40.02 -40.331 -9 ,27376 ,KEBNE ,16656736,Mon Nov 22 23:20:51 CET,Tue Nov 23 00:59:09 CET,0.0 0.311 0.415 0.503 0.592 0.637 0.671 0.725 0.833 0.873 0.904 0.893 0.979 1.007 1.055 1.094 1.127 1.137 1.151 1.178 1.215 1.234 1.249 1.26 1.272 1.284 1.293 1.299 1.297 1.285 1.266 1.241 1.212 1.175 1.113 1.026 0.926 0.796 0.634 0.444 0.233 -0.015 -0.361 -0.784 -1.328 -2.012 -2.911 -4.1 -5.77 -8.173 -11.886 -15.896 -18.884 -21.217 -23.136 -24.791 -26.167 -27.348 -28.329 -29.283 -30.076 -30.743 -31.365 -31.954 -32.484 -32.953 -33.43 -33.85 -34.217 -34.588 -34.955 -35.265 -35.58 -35.887 -36.114 -36.346 -36.582 -36.828 -37.077 -37.251 -37.429 -37.696 -37.884 -38.064 -38.159 -38.364 -38.565 -38.778 -38.888 -39.095 -39.221 -39.343 -39.467 -39.71 -39.844 -40.002 -40.158 -40.3 -40.464 -40.73 -41.334 -10 ,29413 ,KEBNE ,16656737,Mon Nov 22 23:20:51 CET,Tue Nov 23 00:59:50 CET,0.0 0.426 0.528 0.614 0.682 0.733 0.789 0.851 0.993 1.053 1.088 1.079 1.173 1.212 1.287 1.333 1.355 1.37 1.403 1.429 1.452 1.464 1.475 1.492 1.511 1.519 1.517 1.508 1.479 1.453 1.432 1.396 1.344 1.287 1.215 1.125 1.034 0.916 0.765 0.569 0.33 0.043 -0.318 -0.734 -1.281 -1.957 -2.837 -3.978 -5.608 -7.997 -11.7 -15.654 -18.643 -21.068 -23.04 -24.717 -26.1 -27.276 -28.242 -29.178 -29.967 -30.647 -31.282 -31.864 -32.394 -32.873 -33.353 -33.769 -34.129 -34.497 -34.868 -35.173 -35.478 -35.79 -36.026 -36.264 -36.502 -36.735 -36.987 -37.159 -37.336 -37.622 -37.818 -38.011 -38.106 -38.302 -38.506 -38.703 -38.807 -39.018 -39.12 -39.225 -39.347 -39.625 -39.769 -39.915 -40.068 -40.228 -40.377 -40.528 -40.953 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index dbce04be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27182 ,KEBNE ,16654579,Mon Nov 22 07:10:26 CET,Mon Nov 22 08:51:47 CET,0.0 2.887 3.513 4.02 4.456 4.805 5.123 5.434 5.968 6.214 6.455 6.668 7.119 7.345 7.768 8.174 8.586 8.789 9.182 9.567 10.116 10.461 10.804 11.319 11.836 12.334 12.808 13.283 13.915 14.532 15.121 15.839 16.546 17.225 18.031 18.97 19.883 20.882 21.952 23.124 24.424 25.93 27.704 29.535 31.748 34.289 37.297 40.807 45.123 50.385 57.094 62.938 66.597 69.222 71.035 72.395 73.343 74.019 74.551 75.0 75.316 75.554 75.74 75.866 75.962 76.013 76.015 76.01 75.986 75.913 75.8 75.699 75.616 75.541 75.474 75.395 75.298 75.199 75.063 74.94 74.806 74.575 74.413 74.259 74.176 73.986 73.78 73.539 73.406 73.105 73.009 72.848 72.667 72.274 72.037 71.753 71.426 71.072 70.618 69.734 64.101 -3 ,28349 ,KEBNE ,16656740,Mon Nov 22 23:20:51 CET,Tue Nov 23 01:03:19 CET,0.0 3.265 3.873 4.356 4.791 5.166 5.48 5.769 6.307 6.566 6.825 7.09 7.562 7.776 8.182 8.598 9.007 9.208 9.604 9.988 10.544 10.905 11.252 11.761 12.284 12.798 13.276 13.732 14.321 14.915 15.492 16.194 16.89 17.582 18.419 19.392 20.337 21.375 22.52 23.748 25.042 26.535 28.312 30.135 32.32 34.844 37.874 41.378 45.611 50.791 57.33 63.172 66.992 69.655 71.516 72.848 73.837 74.63 75.207 75.658 75.986 76.239 76.447 76.608 76.722 76.788 76.805 76.783 76.749 76.716 76.641 76.568 76.445 76.245 76.087 75.941 75.829 75.72 75.566 75.434 75.285 75.021 74.823 74.598 74.486 74.279 74.032 73.737 73.582 73.244 73.063 72.854 72.629 72.126 71.844 71.537 71.163 70.727 70.122 69.203 57.032 -5 ,32752 ,KEBNE ,16656742,Mon Nov 22 23:21:53 CET,Tue Nov 23 01:06:21 CET,0.0 5.187 5.799 6.263 6.636 6.933 7.234 7.556 8.165 8.431 8.685 8.96 9.433 9.666 10.103 10.539 10.973 11.173 11.552 11.918 12.455 12.819 13.169 13.658 14.156 14.668 15.157 15.626 16.227 16.819 17.408 18.125 18.83 19.516 20.326 21.249 22.129 23.116 24.214 25.391 26.642 28.102 29.855 31.65 33.786 36.198 39.124 42.602 46.729 51.756 58.314 64.241 67.969 70.545 72.384 73.659 74.621 75.397 75.942 76.408 76.701 76.864 76.936 76.986 77.039 77.111 77.2 77.223 77.212 77.158 77.084 77.026 76.96 76.871 76.768 76.66 76.572 76.466 76.309 76.191 76.065 75.839 75.63 75.388 75.279 75.06 74.809 74.507 74.338 73.985 73.803 73.615 73.412 72.938 72.665 72.357 71.986 71.541 71.013 70.212 61.554 -6 ,16760 ,KEBNE ,16654584,Mon Nov 22 07:11:28 CET,Mon Nov 22 08:17:17 CET,0.0 2.637 3.168 3.563 3.935 4.322 4.667 4.978 5.578 5.881 6.184 6.473 6.942 7.167 7.606 8.034 8.432 8.623 9.015 9.406 9.975 10.349 10.713 11.238 11.761 12.279 12.776 13.254 13.878 14.495 15.116 15.887 16.638 17.36 18.204 19.181 20.118 21.149 22.273 23.468 24.742 26.227 28.021 29.826 32.015 34.537 37.52 40.997 45.17 50.317 56.965 62.999 66.817 69.289 70.999 72.355 73.368 74.153 74.737 75.231 75.588 75.844 76.053 76.225 76.365 76.455 76.523 76.586 76.612 76.595 76.571 76.553 76.493 76.368 76.227 76.084 75.938 75.736 75.532 75.41 75.268 75.052 74.906 74.686 74.561 74.331 74.105 73.881 73.761 73.469 73.351 73.184 73.008 72.591 72.352 72.083 71.73 71.306 70.76 70.004 66.913 -10 ,19646 ,KEBNE ,16654588,Mon Nov 22 07:11:28 CET,Mon Nov 22 08:53:43 CET,0.0 3.03 3.527 3.972 4.369 4.734 5.054 5.356 5.951 6.223 6.479 6.717 7.19 7.422 7.87 8.296 8.69 8.889 9.278 9.637 10.17 10.525 10.877 11.408 11.929 12.431 12.91 13.379 13.991 14.579 15.16 15.863 16.535 17.215 18.052 18.993 19.898 20.907 21.997 23.17 24.462 25.962 27.742 29.557 31.692 34.153 37.067 40.527 44.748 49.917 56.597 62.545 66.311 68.81 70.598 71.938 72.87 73.6 74.185 74.661 74.973 75.195 75.347 75.465 75.581 75.676 75.753 75.792 75.775 75.751 75.747 75.721 75.644 75.497 75.348 75.187 75.033 74.89 74.722 74.59 74.448 74.218 74.062 73.893 73.795 73.57 73.326 73.06 72.927 72.61 72.446 72.253 72.06 71.628 71.371 71.101 70.795 70.416 69.95 69.308 66.504 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index b005d9f9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1229 ,KEBNE ,16654589,Mon Nov 22 07:12:29 CET,Mon Nov 22 08:55:20 CET,0.0 0.734 1.069 1.372 1.632 1.873 2.082 2.245 2.521 2.659 2.796 2.836 3.203 3.329 3.567 3.788 3.996 4.108 4.323 4.512 4.784 4.96 5.131 5.376 5.611 5.838 6.072 6.3 6.576 6.849 7.114 7.429 7.733 8.038 8.39 8.807 9.232 9.686 10.189 10.734 11.299 11.925 12.639 13.358 14.205 15.134 16.133 17.159 18.368 19.794 21.345 22.231 22.37 22.19 21.908 21.573 21.193 20.811 20.46 20.09 19.779 19.482 19.182 18.891 18.612 18.336 18.032 17.764 17.55 17.341 17.126 16.936 16.737 16.536 16.375 16.212 16.027 15.814 15.579 15.403 15.22 14.959 14.793 14.618 14.526 14.338 14.129 13.889 13.764 13.411 13.365 13.213 13.041 12.648 12.442 12.232 12.014 11.786 11.501 11.118 10.25 -2 ,478 ,KEBNE ,16654590,Mon Nov 22 07:14:32 CET,Mon Nov 22 08:58:15 CET,0.0 1.152 1.51 1.775 2.025 2.252 2.441 2.619 2.964 3.123 3.283 3.342 3.715 3.852 4.124 4.398 4.648 4.769 4.989 5.184 5.449 5.61 5.778 6.048 6.308 6.541 6.782 7.028 7.337 7.653 7.967 8.335 8.675 9.014 9.426 9.851 10.255 10.711 11.188 11.704 12.253 12.877 13.616 14.351 15.238 16.203 17.286 18.471 19.758 21.15 22.466 23.07 23.127 22.983 22.793 22.493 22.118 21.769 21.457 21.128 20.815 20.502 20.194 19.89 19.6 19.342 19.066 18.804 18.588 18.375 18.15 17.98 17.828 17.649 17.488 17.31 17.125 16.922 16.706 16.564 16.42 16.206 16.061 15.907 15.824 15.637 15.421 15.214 15.11 14.774 14.764 14.644 14.5 14.189 14.023 13.852 13.682 13.469 13.197 12.828 11.553 -3 ,13235 ,KEBNE ,16656750,Mon Nov 22 23:21:53 CET,Tue Nov 23 01:05:34 CET,0.0 1.191 1.517 1.768 1.99 2.224 2.44 2.627 2.939 3.095 3.256 3.316 3.682 3.808 4.062 4.316 4.571 4.692 4.912 5.107 5.385 5.566 5.754 6.048 6.321 6.585 6.846 7.089 7.4 7.701 7.987 8.336 8.668 8.989 9.371 9.825 10.286 10.784 11.312 11.86 12.4 12.986 13.65 14.312 15.093 15.932 16.856 17.859 19.009 20.234 21.418 22.073 22.062 21.765 21.421 21.048 20.648 20.166 19.709 19.258 18.848 18.481 18.136 17.808 17.492 17.198 16.876 16.589 16.357 16.114 15.851 15.625 15.39 15.133 14.944 14.753 14.547 14.336 14.102 13.944 13.786 13.549 13.385 13.2 13.104 12.905 12.693 12.483 12.376 12.047 12.038 11.915 11.794 11.508 11.342 11.166 10.973 10.781 10.566 10.256 9.2 -4 ,9354 ,KEBNE ,16656751,Mon Nov 22 23:21:54 CET,Tue Nov 23 01:06:39 CET,0.0 1.375 1.751 2.074 2.375 2.625 2.851 3.058 3.445 3.637 3.804 3.857 4.245 4.405 4.69 4.93 5.145 5.25 5.456 5.642 5.902 6.076 6.237 6.491 6.742 6.97 7.193 7.416 7.711 7.98 8.24 8.562 8.865 9.154 9.494 9.874 10.238 10.629 11.053 11.51 11.995 12.564 13.205 13.851 14.666 15.58 16.613 17.742 18.92 20.149 21.498 22.294 22.514 22.486 22.365 22.189 21.964 21.725 21.461 21.18 20.921 20.662 20.421 20.185 19.961 19.76 19.537 19.328 19.159 18.985 18.772 18.578 18.373 18.168 18.024 17.873 17.703 17.517 17.303 17.136 16.964 16.702 16.502 16.297 16.19 15.975 15.759 15.54 15.432 15.095 15.092 14.97 14.822 14.53 14.36 14.16 13.954 13.693 13.354 12.927 11.451 -5 ,15834 ,KEBNE ,16654593,Mon Nov 22 07:15:38 CET,Mon Nov 22 08:54:55 CET,0.0 1.232 1.567 1.811 2.035 2.263 2.481 2.68 2.999 3.134 3.282 3.361 3.741 3.87 4.128 4.389 4.638 4.766 5.002 5.221 5.561 5.783 5.984 6.263 6.539 6.795 7.044 7.304 7.631 7.931 8.227 8.591 8.942 9.294 9.694 10.124 10.553 11.037 11.546 12.072 12.624 13.262 14.009 14.735 15.594 16.562 17.6 18.696 19.996 21.384 22.744 23.467 23.532 23.397 23.155 22.865 22.521 22.129 21.774 21.417 21.08 20.784 20.507 20.219 19.939 19.668 19.39 19.149 18.932 18.697 18.461 18.282 18.085 17.851 17.671 17.487 17.274 17.045 16.822 16.666 16.505 16.261 16.084 15.902 15.812 15.633 15.452 15.258 15.159 14.83 14.817 14.695 14.555 14.226 14.067 13.901 13.699 13.463 13.189 12.783 11.622 -6 ,15453 ,KEBNE ,16654594,Mon Nov 22 07:16:35 CET,Mon Nov 22 08:59:10 CET,0.0 1.354 1.77 2.052 2.289 2.492 2.678 2.884 3.254 3.433 3.604 3.644 4.009 4.142 4.403 4.65 4.89 5.006 5.222 5.428 5.736 5.936 6.133 6.428 6.704 6.969 7.232 7.477 7.77 8.071 8.393 8.757 9.093 9.432 9.83 10.277 10.709 11.176 11.665 12.189 12.71 13.275 13.966 14.694 15.546 16.446 17.436 18.555 19.902 21.336 22.681 23.314 23.348 23.179 22.918 22.586 22.191 21.801 21.41 21.003 20.688 20.406 20.113 19.813 19.536 19.28 18.993 18.729 18.51 18.283 18.034 17.821 17.589 17.344 17.154 16.96 16.751 16.507 16.273 16.122 15.944 15.681 15.52 15.363 15.287 15.128 14.944 14.732 14.62 14.281 14.248 14.09 13.923 13.596 13.412 13.195 12.942 12.683 12.408 12.066 10.821 -7 ,29736 ,KEBNE ,16656754,Mon Nov 22 23:21:53 CET,Tue Nov 23 01:06:34 CET,0.0 1.312 1.762 2.1 2.356 2.552 2.74 2.932 3.277 3.416 3.554 3.598 3.945 4.055 4.285 4.525 4.732 4.83 5.02 5.194 5.466 5.655 5.833 6.07 6.296 6.537 6.793 7.037 7.337 7.632 7.924 8.279 8.631 8.986 9.387 9.829 10.256 10.692 11.14 11.659 12.249 12.913 13.661 14.382 15.224 16.13 17.119 18.155 19.291 20.426 21.541 22.232 22.323 22.104 21.754 21.396 21.022 20.63 20.266 19.883 19.538 19.216 18.924 18.647 18.369 18.107 17.826 17.567 17.352 17.151 16.931 16.745 16.538 16.307 16.137 15.957 15.754 15.543 15.325 15.169 15.016 14.772 14.594 14.406 14.313 14.139 13.939 13.7 13.57 13.207 13.159 13.024 12.864 12.479 12.268 12.04 11.787 11.496 11.111 10.616 8.94 -8 ,25769 ,KEBNE ,16656755,Mon Nov 22 23:22:56 CET,Tue Nov 23 01:07:20 CET,0.0 1.311 1.605 1.852 2.083 2.283 2.466 2.636 2.948 3.09 3.224 3.25 3.63 3.777 4.048 4.301 4.53 4.635 4.857 5.082 5.393 5.567 5.739 6.019 6.284 6.53 6.789 7.047 7.364 7.664 7.968 8.34 8.679 9.011 9.389 9.826 10.279 10.757 11.243 11.772 12.324 12.928 13.65 14.414 15.306 16.295 17.426 18.676 20.043 21.597 23.343 24.245 24.361 24.175 23.895 23.524 23.167 22.843 22.51 22.123 21.775 21.475 21.164 20.842 20.549 20.296 20.03 19.796 19.585 19.36 19.131 18.935 18.747 18.568 18.429 18.273 18.105 17.924 17.731 17.608 17.471 17.228 17.065 16.896 16.812 16.644 16.453 16.275 16.186 15.861 15.865 15.751 15.636 15.371 15.213 15.044 14.86 14.634 14.352 13.969 12.918 -9 ,13524 ,KEBNE ,16656756,Mon Nov 22 23:22:56 CET,Tue Nov 23 01:07:26 CET,0.0 0.913 1.218 1.461 1.707 1.938 2.155 2.34 2.637 2.797 2.965 3.063 3.444 3.583 3.837 4.066 4.289 4.387 4.592 4.811 5.13 5.338 5.533 5.799 6.058 6.321 6.577 6.82 7.135 7.444 7.733 8.089 8.447 8.796 9.177 9.595 10.008 10.478 10.99 11.525 12.105 12.745 13.457 14.179 15.011 15.913 16.958 18.147 19.471 20.867 22.316 23.167 23.252 23.09 22.864 22.467 22.051 21.632 21.244 20.864 20.534 20.215 19.872 19.543 19.223 18.914 18.596 18.311 18.051 17.766 17.475 17.244 17.017 16.782 16.584 16.375 16.174 15.968 15.742 15.576 15.408 15.132 14.921 14.71 14.611 14.403 14.158 13.896 13.76 13.399 13.33 13.178 13.016 12.65 12.444 12.22 11.975 11.682 11.376 10.991 9.712 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index a833d891..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28687 ,KEBNE ,16656758,Mon Nov 22 23:22:56 CET,Tue Nov 23 01:07:00 CET,0.0 0.322 0.516 0.655 0.787 0.912 1.024 1.14 1.347 1.437 1.524 1.456 1.764 1.832 1.963 2.082 2.195 2.253 2.367 2.476 2.639 2.751 2.854 2.985 3.112 3.246 3.369 3.479 3.622 3.764 3.893 4.028 4.157 4.304 4.463 4.621 4.758 4.895 5.048 5.201 5.33 5.443 5.561 5.657 5.753 5.806 5.79 5.665 5.317 4.627 3.113 1.071 -0.689 -2.275 -3.656 -4.843 -5.856 -6.778 -7.582 -8.371 -9.017 -9.591 -10.15 -10.667 -11.125 -11.542 -12.001 -12.409 -12.74 -13.102 -13.48 -13.773 -14.076 -14.394 -14.641 -14.905 -15.184 -15.457 -15.733 -15.932 -16.135 -16.414 -16.606 -16.822 -16.935 -17.149 -17.373 -17.629 -17.765 -18.154 -18.196 -18.346 -18.481 -18.796 -18.992 -19.194 -19.384 -19.589 -19.844 -20.132 -20.895 -2 ,26840 ,KEBNE ,16656759,Mon Nov 22 23:22:56 CET,Tue Nov 23 01:08:23 CET,0.0 0.365 0.538 0.685 0.832 0.982 1.116 1.229 1.437 1.527 1.613 1.535 1.86 1.958 2.12 2.254 2.38 2.436 2.548 2.663 2.827 2.926 3.021 3.174 3.311 3.43 3.549 3.66 3.783 3.909 4.037 4.164 4.283 4.411 4.573 4.733 4.854 4.984 5.126 5.256 5.361 5.475 5.605 5.689 5.765 5.841 5.83 5.697 5.384 4.718 3.327 1.394 -0.374 -1.929 -3.265 -4.472 -5.522 -6.433 -7.178 -7.929 -8.57 -9.138 -9.67 -10.189 -10.693 -11.134 -11.602 -12.031 -12.385 -12.742 -13.12 -13.419 -13.715 -14.032 -14.28 -14.519 -14.758 -15.016 -15.286 -15.473 -15.66 -15.939 -16.137 -16.348 -16.46 -16.692 -16.916 -17.163 -17.303 -17.686 -17.698 -17.852 -18.028 -18.41 -18.584 -18.771 -18.997 -19.218 -19.451 -19.742 -20.563 -3 ,24030 ,KEBNE ,16654601,Mon Nov 22 07:22:45 CET,Mon Nov 22 09:04:48 CET,0.0 0.383 0.635 0.809 0.928 1.064 1.184 1.289 1.505 1.612 1.709 1.622 1.924 2.001 2.154 2.289 2.424 2.486 2.592 2.704 2.852 2.936 3.021 3.151 3.285 3.413 3.531 3.64 3.77 3.902 4.033 4.193 4.345 4.504 4.698 4.898 5.094 5.309 5.513 5.723 5.932 6.127 6.292 6.422 6.538 6.615 6.644 6.558 6.253 5.628 4.266 2.221 0.428 -1.09 -2.394 -3.555 -4.525 -5.368 -6.135 -6.944 -7.632 -8.234 -8.807 -9.321 -9.792 -10.218 -10.672 -11.091 -11.441 -11.813 -12.205 -12.529 -12.865 -13.214 -13.472 -13.744 -14.027 -14.299 -14.582 -14.779 -14.975 -15.28 -15.501 -15.736 -15.849 -16.071 -16.319 -16.601 -16.752 -17.152 -17.185 -17.347 -17.518 -17.881 -18.072 -18.279 -18.516 -18.806 -19.127 -19.499 -20.414 -4 ,27170 ,KEBNE ,16656761,Mon Nov 22 23:22:56 CET,Tue Nov 23 01:08:16 CET,0.0 0.56 0.856 1.055 1.189 1.308 1.409 1.511 1.723 1.829 1.925 1.857 2.167 2.232 2.363 2.494 2.619 2.677 2.794 2.905 3.055 3.149 3.239 3.372 3.5 3.627 3.743 3.85 3.994 4.12 4.238 4.394 4.547 4.693 4.859 5.035 5.193 5.372 5.561 5.717 5.861 6.008 6.143 6.271 6.38 6.408 6.372 6.252 5.929 5.252 3.773 1.74 -0.031 -1.631 -3.049 -4.313 -5.4 -6.317 -7.086 -7.862 -8.525 -9.113 -9.684 -10.227 -10.719 -11.16 -11.602 -11.993 -12.333 -12.679 -13.058 -13.38 -13.701 -14.042 -14.31 -14.573 -14.841 -15.127 -15.424 -15.628 -15.834 -16.139 -16.359 -16.58 -16.686 -16.934 -17.208 -17.464 -17.584 -17.969 -18.003 -18.146 -18.294 -18.62 -18.782 -18.946 -19.144 -19.379 -19.656 -20.053 -21.059 -5 ,3057 ,KEBNE ,16656762,Mon Nov 22 23:22:57 CET,Tue Nov 23 01:07:11 CET,0.0 0.467 0.651 0.809 0.947 1.079 1.223 1.36 1.575 1.676 1.771 1.726 2.046 2.117 2.252 2.383 2.522 2.584 2.69 2.793 2.943 3.049 3.155 3.303 3.443 3.576 3.703 3.82 3.949 4.061 4.176 4.322 4.458 4.589 4.761 4.953 5.118 5.269 5.427 5.593 5.75 5.911 6.072 6.188 6.246 6.248 6.153 5.928 5.545 4.813 3.334 1.235 -0.705 -2.311 -3.633 -4.857 -5.908 -6.809 -7.596 -8.374 -9.015 -9.592 -10.141 -10.672 -11.183 -11.62 -12.062 -12.458 -12.802 -13.159 -13.54 -13.845 -14.135 -14.431 -14.658 -14.905 -15.166 -15.438 -15.716 -15.902 -16.092 -16.377 -16.586 -16.815 -16.926 -17.139 -17.364 -17.632 -17.77 -18.153 -18.177 -18.327 -18.487 -18.799 -18.977 -19.168 -19.375 -19.613 -19.922 -20.291 -20.89 -6 ,14118 ,KEBNE ,16656763,Mon Nov 22 23:22:57 CET,Tue Nov 23 01:07:25 CET,0.0 0.445 0.727 0.977 1.143 1.289 1.434 1.581 1.828 1.927 2.013 1.952 2.269 2.353 2.504 2.636 2.757 2.816 2.939 3.055 3.227 3.333 3.424 3.563 3.706 3.857 4.028 4.184 4.348 4.508 4.669 4.839 4.985 5.137 5.312 5.492 5.657 5.824 5.982 6.129 6.258 6.399 6.559 6.668 6.761 6.825 6.8 6.658 6.329 5.636 4.216 2.256 0.54 -0.909 -2.179 -3.35 -4.402 -5.385 -6.219 -7.029 -7.717 -8.328 -8.916 -9.416 -9.849 -10.264 -10.712 -11.122 -11.478 -11.817 -12.149 -12.432 -12.734 -13.041 -13.27 -13.507 -13.756 -14.016 -14.279 -14.451 -14.642 -14.974 -15.186 -15.403 -15.519 -15.765 -16.03 -16.291 -16.428 -16.837 -16.912 -17.079 -17.249 -17.617 -17.828 -18.056 -18.285 -18.538 -18.831 -19.225 -19.952 -7 ,12286 ,KEBNE ,16654605,Mon Nov 22 07:24:49 CET,Mon Nov 22 09:06:53 CET,0.0 0.532 0.716 0.871 1.025 1.167 1.298 1.423 1.658 1.763 1.855 1.788 2.097 2.168 2.318 2.463 2.585 2.641 2.746 2.844 2.993 3.092 3.186 3.311 3.428 3.554 3.674 3.778 3.915 4.045 4.162 4.311 4.462 4.591 4.713 4.851 4.987 5.126 5.27 5.41 5.538 5.668 5.796 5.909 6.012 6.074 6.053 5.902 5.588 4.957 3.587 1.692 0.062 -1.405 -2.731 -3.896 -4.867 -5.767 -6.564 -7.352 -8.021 -8.606 -9.162 -9.679 -10.159 -10.593 -11.051 -11.463 -11.821 -12.181 -12.551 -12.867 -13.185 -13.529 -13.802 -14.084 -14.387 -14.69 -14.992 -15.2 -15.413 -15.739 -15.955 -16.18 -16.294 -16.525 -16.774 -17.035 -17.161 -17.535 -17.55 -17.699 -17.849 -18.157 -18.334 -18.549 -18.781 -19.018 -19.277 -19.536 -20.055 -8 ,30569 ,KEBNE ,16656765,Mon Nov 22 23:22:57 CET,Tue Nov 23 01:07:33 CET,0.0 0.542 0.769 0.924 1.046 1.157 1.263 1.367 1.564 1.653 1.743 1.665 1.969 2.038 2.168 2.295 2.429 2.498 2.629 2.743 2.904 3.007 3.104 3.229 3.345 3.456 3.574 3.704 3.851 3.978 4.116 4.273 4.404 4.519 4.642 4.774 4.913 5.072 5.23 5.37 5.513 5.665 5.794 5.883 5.941 5.969 5.966 5.813 5.408 4.715 3.312 1.334 -0.41 -1.909 -3.181 -4.297 -5.276 -6.16 -6.928 -7.702 -8.358 -8.926 -9.45 -9.936 -10.4 -10.824 -11.254 -11.646 -11.986 -12.33 -12.662 -12.944 -13.243 -13.54 -13.79 -14.059 -14.316 -14.566 -14.822 -14.998 -15.171 -15.443 -15.64 -15.842 -15.95 -16.178 -16.404 -16.631 -16.747 -17.133 -17.125 -17.24 -17.381 -17.709 -17.882 -18.055 -18.235 -18.426 -18.66 -19.007 -19.72 -9 ,27498 ,KEBNE ,16654607,Mon Nov 22 07:26:52 CET,Mon Nov 22 09:08:57 CET,0.0 0.457 0.726 0.916 1.087 1.242 1.358 1.478 1.709 1.819 1.92 1.863 2.178 2.255 2.419 2.585 2.733 2.8 2.922 3.041 3.221 3.337 3.438 3.57 3.703 3.842 3.975 4.095 4.235 4.373 4.505 4.671 4.83 4.961 5.102 5.24 5.367 5.513 5.643 5.753 5.872 5.992 6.111 6.218 6.31 6.362 6.359 6.254 5.92 5.255 3.882 1.914 0.115 -1.433 -2.695 -3.797 -4.801 -5.721 -6.488 -7.222 -7.853 -8.423 -8.965 -9.496 -9.992 -10.42 -10.848 -11.25 -11.599 -11.94 -12.296 -12.589 -12.885 -13.208 -13.461 -13.725 -13.991 -14.241 -14.505 -14.692 -14.876 -15.158 -15.369 -15.595 -15.701 -15.917 -16.154 -16.415 -16.545 -16.932 -16.968 -17.113 -17.264 -17.595 -17.785 -17.989 -18.209 -18.442 -18.707 -19.043 -19.485 -10 ,20117 ,KEBNE ,16656767,Mon Nov 22 23:22:57 CET,Tue Nov 23 01:11:44 CET,0.0 0.311 0.528 0.712 0.856 0.995 1.125 1.217 1.392 1.477 1.552 1.452 1.745 1.806 1.941 2.084 2.201 2.254 2.36 2.463 2.619 2.709 2.799 2.934 3.06 3.184 3.302 3.405 3.543 3.673 3.787 3.92 4.049 4.168 4.302 4.457 4.593 4.735 4.884 5.027 5.161 5.296 5.432 5.527 5.609 5.653 5.618 5.466 5.066 4.301 2.803 0.786 -0.928 -2.393 -3.649 -4.813 -5.82 -6.71 -7.488 -8.285 -8.978 -9.584 -10.146 -10.654 -11.115 -11.548 -12.017 -12.432 -12.783 -13.156 -13.529 -13.827 -14.14 -14.461 -14.721 -14.994 -15.262 -15.549 -15.851 -16.047 -16.247 -16.542 -16.746 -16.963 -17.071 -17.302 -17.556 -17.824 -17.956 -18.337 -18.331 -18.462 -18.611 -18.95 -19.156 -19.369 -19.581 -19.815 -20.07 -20.371 -20.972 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index 33bad1be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,3581 ,KEBNE ,17023552,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:01:25 CET,0.0 1.527 2.076 2.557 2.983 3.347 3.662 3.946 4.463 4.696 4.931 5.196 5.661 5.883 6.299 6.708 7.112 7.308 7.68 8.035 8.553 8.904 9.252 9.757 10.257 10.748 11.2 11.645 12.228 12.791 13.345 14.042 14.727 15.376 16.148 17.002 17.826 18.774 19.82 20.953 22.158 23.544 25.205 26.86 28.746 30.927 33.562 36.618 40.463 45.159 50.885 55.884 58.914 60.884 62.248 63.207 63.817 64.255 64.58 64.822 64.956 65.028 65.051 65.041 65.003 64.958 64.891 64.784 64.703 64.632 64.533 64.415 64.269 64.096 63.963 63.828 63.653 63.467 63.286 63.143 62.968 62.682 62.473 62.242 62.125 61.863 61.573 61.313 61.188 60.886 60.741 60.555 60.358 59.943 59.724 59.455 59.128 58.737 58.255 57.641 55.491 -3 ,27836 ,KEBNE ,17023553,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:01:02 CET,0.0 1.98 2.621 3.094 3.46 3.802 4.113 4.402 4.928 5.17 5.408 5.645 6.079 6.296 6.762 7.194 7.586 7.774 8.153 8.546 9.101 9.451 9.809 10.321 10.801 11.279 11.741 12.185 12.787 13.388 13.963 14.68 15.365 16.011 16.788 17.674 18.517 19.447 20.465 21.574 22.767 24.136 25.743 27.376 29.295 31.435 33.929 36.758 40.261 44.789 50.551 55.471 58.5 60.502 61.869 62.847 63.497 63.926 64.169 64.348 64.493 64.576 64.604 64.555 64.443 64.377 64.338 64.256 64.156 64.066 63.966 63.863 63.747 63.626 63.527 63.405 63.264 63.109 62.91 62.761 62.619 62.357 62.148 61.965 61.877 61.658 61.432 61.21 61.08 60.754 60.602 60.426 60.239 59.814 59.602 59.372 59.113 58.769 58.235 57.466 54.911 -4 ,17593 ,KEBNE ,17023554,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:01:47 CET,0.0 2.054 2.674 3.145 3.556 3.907 4.246 4.579 5.142 5.387 5.634 5.904 6.36 6.578 7.001 7.418 7.823 8.02 8.392 8.759 9.297 9.642 9.997 10.523 11.022 11.51 11.986 12.444 13.042 13.647 14.232 14.925 15.606 16.274 17.064 17.957 18.822 19.758 20.764 21.88 23.095 24.499 26.168 27.881 29.868 32.129 34.818 37.942 41.77 46.339 52.076 57.038 60.094 62.095 63.367 64.352 65.081 65.611 65.994 66.249 66.402 66.509 66.548 66.562 66.563 66.535 66.484 66.405 66.325 66.246 66.139 66.044 65.934 65.8 65.705 65.619 65.476 65.302 65.16 65.058 64.941 64.756 64.626 64.484 64.395 64.171 63.932 63.691 63.56 63.232 63.048 62.872 62.684 62.164 61.869 61.553 61.153 60.694 60.127 59.303 53.537 -5 ,67 ,KEBNE ,17023555,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:02:20 CET,0.0 1.134 1.606 2.025 2.409 2.749 3.083 3.381 3.92 4.193 4.459 4.701 5.142 5.37 5.832 6.282 6.691 6.883 7.272 7.663 8.22 8.57 8.908 9.392 9.863 10.32 10.78 11.248 11.869 12.469 13.016 13.672 14.316 14.969 15.745 16.604 17.448 18.387 19.424 20.611 21.88 23.31 25.033 26.744 28.735 31.023 33.691 36.802 40.601 45.272 51.178 56.172 59.063 60.951 62.158 62.885 63.463 63.992 64.391 64.678 64.906 65.053 65.133 65.202 65.225 65.223 65.164 65.082 65.011 64.939 64.817 64.676 64.519 64.326 64.156 63.981 63.795 63.584 63.359 63.219 63.097 62.945 62.848 62.704 62.623 62.452 62.226 61.953 61.795 61.463 61.283 61.078 60.881 60.459 60.189 59.853 59.494 59.091 58.498 57.656 53.561 -6 ,16602 ,KEBNE ,17023556,Wed Dec 22 08:15:56 CET,Wed Dec 22 10:01:19 CET,0.0 1.829 2.378 2.837 3.215 3.53 3.814 4.083 4.6 4.841 5.074 5.317 5.765 5.986 6.413 6.83 7.219 7.406 7.787 8.159 8.699 9.041 9.366 9.842 10.331 10.821 11.29 11.746 12.34 12.923 13.509 14.21 14.877 15.549 16.335 17.229 18.108 19.072 20.149 21.312 22.522 23.899 25.524 27.184 29.189 31.547 34.377 37.647 41.525 45.993 51.613 56.667 59.763 61.83 63.149 63.984 64.601 65.042 65.336 65.564 65.677 65.73 65.76 65.767 65.739 65.694 65.602 65.467 65.322 65.149 64.963 64.82 64.692 64.547 64.429 64.297 64.129 63.964 63.758 63.585 63.417 63.168 62.99 62.798 62.702 62.528 62.356 62.141 62.009 61.692 61.545 61.361 61.141 60.645 60.384 60.065 59.678 59.261 58.801 58.152 46.878 -7 ,10278 ,KEBNE ,17023557,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:01:23 CET,0.0 1.05 1.602 2.095 2.513 2.847 3.164 3.466 4.014 4.253 4.491 4.751 5.212 5.44 5.884 6.303 6.692 6.887 7.264 7.632 8.166 8.513 8.87 9.397 9.898 10.366 10.815 11.257 11.826 12.372 12.916 13.616 14.314 14.981 15.751 16.626 17.49 18.443 19.469 20.613 21.853 23.23 24.827 26.516 28.576 30.92 33.691 36.868 40.616 45.156 50.798 55.567 58.385 60.156 61.309 62.108 62.633 62.976 63.182 63.321 63.413 63.407 63.296 63.208 63.164 63.049 62.885 62.747 62.625 62.512 62.396 62.257 62.074 61.893 61.742 61.578 61.4 61.221 61.061 60.942 60.806 60.609 60.442 60.249 60.153 59.93 59.67 59.386 59.248 58.938 58.777 58.571 58.354 57.896 57.6 57.26 56.893 56.484 55.96 55.165 51.301 -8 ,20488 ,KEBNE ,17023558,Wed Dec 22 08:15:56 CET,Wed Dec 22 10:02:20 CET,0.0 1.597 2.1 2.495 2.835 3.131 3.405 3.68 4.24 4.514 4.776 5.051 5.498 5.726 6.153 6.553 6.945 7.131 7.483 7.835 8.396 8.747 9.086 9.608 10.107 10.571 11.022 11.465 12.019 12.554 13.107 13.789 14.453 15.111 15.884 16.748 17.593 18.566 19.661 20.846 22.087 23.505 25.166 26.83 28.848 31.21 33.979 37.171 41.066 45.677 51.25 55.98 58.86 60.804 62.134 63.071 63.705 64.176 64.465 64.686 64.838 64.961 65.072 65.131 65.158 65.171 65.175 65.117 64.992 64.843 64.691 64.553 64.408 64.255 64.113 63.962 63.819 63.649 63.433 63.266 63.065 62.709 62.471 62.261 62.157 61.924 61.668 61.384 61.235 60.915 60.758 60.567 60.365 59.945 59.708 59.471 59.217 58.846 58.329 57.654 54.718 -9 ,18345 ,KEBNE ,17023559,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:01:55 CET,0.0 0.918 1.457 1.919 2.299 2.652 2.977 3.284 3.854 4.112 4.371 4.643 5.093 5.33 5.78 6.191 6.603 6.803 7.186 7.576 8.15 8.528 8.888 9.388 9.874 10.379 10.874 11.336 11.938 12.545 13.156 13.89 14.594 15.25 16.031 16.951 17.839 18.792 19.83 20.969 22.181 23.6 25.27 26.882 28.73 30.848 33.367 36.261 39.751 44.089 49.58 54.375 57.194 58.979 60.202 60.975 61.48 61.857 62.104 62.262 62.335 62.418 62.476 62.459 62.416 62.383 62.301 62.213 62.151 62.059 61.937 61.822 61.7 61.577 61.474 61.348 61.186 60.995 60.813 60.683 60.525 60.249 60.031 59.801 59.696 59.492 59.275 59.027 58.887 58.552 58.357 58.156 57.937 57.404 57.123 56.825 56.469 56.081 55.573 54.774 51.145 -10 ,23747 ,KEBNE ,17023560,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:02:08 CET,0.0 1.486 1.943 2.318 2.653 2.976 3.296 3.579 4.085 4.323 4.572 4.849 5.294 5.51 5.926 6.321 6.725 6.922 7.304 7.669 8.199 8.54 8.878 9.369 9.837 10.308 10.78 11.244 11.857 12.449 13.017 13.726 14.409 15.069 15.843 16.704 17.552 18.514 19.563 20.714 21.946 23.338 24.977 26.655 28.673 31.038 33.837 37.019 40.741 45.305 51.236 56.207 59.025 60.882 62.148 62.961 63.491 63.899 64.157 64.295 64.413 64.45 64.379 64.33 64.315 64.295 64.235 64.096 63.904 63.73 63.598 63.476 63.294 63.038 62.827 62.628 62.455 62.293 62.097 61.94 61.787 61.551 61.377 61.207 61.11 60.85 60.562 60.286 60.141 59.811 59.629 59.419 59.18 58.648 58.364 58.019 57.635 57.262 56.86 56.267 53.385 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index 751d6c6e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28458 ,KEBNE ,16656768,Mon Nov 22 23:22:57 CET,Tue Nov 23 01:06:18 CET,0.0 0.795 1.141 1.388 1.581 1.759 1.931 2.093 2.398 2.539 2.66 2.665 2.994 3.087 3.25 3.408 3.556 3.626 3.769 3.899 4.04 4.131 4.236 4.378 4.501 4.627 4.744 4.856 5.003 5.141 5.269 5.418 5.565 5.707 5.855 5.998 6.123 6.276 6.438 6.581 6.692 6.747 6.787 6.819 6.773 6.623 6.34 5.806 4.961 3.62 1.106 -1.991 -4.493 -6.64 -8.444 -10.074 -11.492 -12.712 -13.759 -14.806 -15.711 -16.496 -17.209 -17.872 -18.491 -19.05 -19.607 -20.101 -20.519 -20.93 -21.347 -21.694 -22.042 -22.416 -22.714 -23.016 -23.325 -23.653 -23.992 -24.218 -24.452 -24.801 -25.057 -25.321 -25.44 -25.678 -25.958 -26.263 -26.415 -26.827 -26.905 -27.078 -27.256 -27.63 -27.87 -28.131 -28.422 -28.79 -29.242 -29.833 -31.123 -2 ,26495 ,KEBNE ,16656769,Mon Nov 22 23:22:57 CET,Tue Nov 23 01:06:16 CET,0.0 1.353 1.729 2.014 2.185 2.332 2.458 2.568 2.783 2.887 2.986 2.932 3.237 3.325 3.475 3.595 3.722 3.783 3.881 3.997 4.173 4.278 4.381 4.517 4.653 4.792 4.913 5.021 5.163 5.288 5.411 5.551 5.664 5.782 5.937 6.091 6.203 6.321 6.436 6.535 6.621 6.712 6.802 6.873 6.889 6.782 6.543 6.089 5.336 4.111 1.86 -1.064 -3.533 -5.606 -7.414 -8.999 -10.357 -11.56 -12.57 -13.582 -14.436 -15.155 -15.813 -16.463 -17.101 -17.67 -18.254 -18.773 -19.203 -19.629 -20.049 -20.381 -20.723 -21.079 -21.355 -21.645 -21.948 -22.276 -22.625 -22.866 -23.108 -23.47 -23.724 -23.984 -24.12 -24.412 -24.706 -25.005 -25.169 -25.593 -25.69 -25.883 -26.093 -26.555 -26.792 -27.069 -27.378 -27.702 -28.118 -28.66 -30.191 -3 ,31503 ,KEBNE ,16654611,Mon Nov 22 07:33:05 CET,Mon Nov 22 09:13:49 CET,0.0 1.109 1.473 1.722 1.913 2.079 2.242 2.406 2.695 2.818 2.927 2.876 3.178 3.263 3.391 3.517 3.642 3.699 3.813 3.923 4.072 4.173 4.262 4.39 4.51 4.611 4.714 4.807 4.919 5.013 5.091 5.213 5.332 5.426 5.519 5.608 5.692 5.765 5.811 5.85 5.875 5.868 5.809 5.713 5.556 5.285 4.873 4.285 3.353 1.913 -0.489 -3.492 -6.042 -8.286 -10.173 -11.777 -13.127 -14.354 -15.455 -16.527 -17.426 -18.24 -18.994 -19.678 -20.305 -20.877 -21.477 -22.005 -22.451 -22.923 -23.43 -23.838 -24.261 -24.696 -25.028 -25.375 -25.723 -26.085 -26.458 -26.708 -26.965 -27.373 -27.657 -27.939 -28.082 -28.369 -28.665 -28.98 -29.148 -29.576 -29.674 -29.859 -30.064 -30.553 -30.814 -31.062 -31.36 -31.732 -32.154 -32.663 -34.685 -4 ,20032 ,KEBNE ,16654612,Mon Nov 22 07:33:05 CET,Mon Nov 22 09:13:48 CET,0.0 1.55 1.92 2.2 2.446 2.653 2.829 2.993 3.244 3.349 3.457 3.471 3.787 3.864 4.026 4.189 4.319 4.381 4.506 4.611 4.756 4.841 4.915 5.036 5.161 5.255 5.34 5.43 5.541 5.648 5.739 5.835 5.921 5.984 6.068 6.143 6.196 6.261 6.315 6.349 6.35 6.325 6.285 6.203 6.024 5.824 5.611 5.19 4.462 3.275 1.015 -1.869 -4.293 -6.35 -8.099 -9.664 -11.067 -12.323 -13.355 -14.346 -15.198 -15.957 -16.652 -17.291 -17.89 -18.445 -19.03 -19.552 -19.998 -20.433 -20.853 -21.209 -21.58 -21.952 -22.234 -22.512 -22.806 -23.133 -23.469 -23.692 -23.909 -24.224 -24.452 -24.705 -24.836 -25.087 -25.347 -25.634 -25.785 -26.191 -26.267 -26.433 -26.603 -27.0 -27.214 -27.418 -27.636 -27.903 -28.238 -28.698 -29.946 -5 ,7610 ,KEBNE ,16654613,Mon Nov 22 07:33:05 CET,Mon Nov 22 09:13:55 CET,0.0 1.171 1.581 1.904 2.118 2.266 2.411 2.542 2.781 2.913 3.02 2.97 3.275 3.354 3.491 3.62 3.753 3.822 3.944 4.05 4.215 4.322 4.437 4.6 4.74 4.872 4.994 5.094 5.213 5.331 5.459 5.608 5.739 5.855 5.97 6.088 6.192 6.296 6.4 6.49 6.544 6.593 6.622 6.616 6.576 6.454 6.204 5.799 5.09 3.787 1.368 -1.755 -4.387 -6.597 -8.396 -9.95 -11.326 -12.597 -13.67 -14.703 -15.592 -16.34 -17.046 -17.709 -18.278 -18.776 -19.312 -19.812 -20.232 -20.659 -21.113 -21.5 -21.902 -22.303 -22.616 -22.951 -23.317 -23.691 -24.052 -24.292 -24.538 -24.911 -25.167 -25.427 -25.56 -25.831 -26.112 -26.41 -26.573 -27.008 -27.132 -27.338 -27.541 -27.911 -28.127 -28.376 -28.631 -28.945 -29.354 -29.902 -31.696 -6 ,2305 ,KEBNE ,16656773,Mon Nov 22 23:22:57 CET,Tue Nov 23 01:08:41 CET,0.0 1.059 1.434 1.699 1.891 2.087 2.264 2.405 2.689 2.803 2.899 2.883 3.204 3.302 3.472 3.626 3.787 3.866 4.004 4.128 4.308 4.414 4.508 4.642 4.769 4.891 5.011 5.127 5.268 5.398 5.511 5.636 5.75 5.852 5.974 6.098 6.203 6.296 6.399 6.514 6.602 6.698 6.775 6.788 6.769 6.682 6.472 6.076 5.364 4.114 1.717 -1.158 -3.479 -5.615 -7.537 -9.219 -10.705 -11.986 -13.023 -14.039 -14.919 -15.703 -16.422 -17.099 -17.728 -18.283 -18.865 -19.392 -19.832 -20.288 -20.771 -21.174 -21.594 -22.014 -22.32 -22.633 -22.96 -23.303 -23.653 -23.889 -24.132 -24.508 -24.781 -25.071 -25.211 -25.513 -25.845 -26.169 -26.33 -26.751 -26.871 -27.085 -27.295 -27.703 -27.948 -28.186 -28.463 -28.822 -29.219 -29.711 -31.09 -7 ,26747 ,KEBNE ,16656774,Mon Nov 22 23:22:56 CET,Tue Nov 23 01:04:21 CET,0.0 1.362 1.719 1.961 2.173 2.387 2.572 2.723 3.007 3.142 3.25 3.193 3.48 3.546 3.691 3.827 3.936 3.986 4.077 4.167 4.301 4.376 4.452 4.578 4.693 4.788 4.87 4.948 5.057 5.166 5.264 5.365 5.455 5.532 5.602 5.668 5.725 5.768 5.796 5.805 5.788 5.746 5.667 5.57 5.433 5.211 4.86 4.372 3.59 2.157 -0.337 -3.459 -6.043 -8.173 -10.046 -11.676 -13.033 -14.249 -15.325 -16.372 -17.249 -18.036 -18.777 -19.464 -20.112 -20.709 -21.276 -21.759 -22.186 -22.632 -23.083 -23.451 -23.836 -24.24 -24.551 -24.869 -25.203 -25.558 -25.918 -26.164 -26.426 -26.82 -27.094 -27.374 -27.514 -27.804 -28.097 -28.428 -28.602 -29.028 -29.147 -29.344 -29.551 -30.014 -30.276 -30.554 -30.845 -31.173 -31.576 -32.163 -34.251 -8 ,16688 ,KEBNE ,16656775,Mon Nov 22 23:23:59 CET,Tue Nov 23 01:05:11 CET,0.0 1.488 1.826 2.067 2.283 2.457 2.607 2.756 2.989 3.092 3.2 3.19 3.525 3.645 3.862 4.033 4.183 4.26 4.417 4.545 4.719 4.824 4.931 5.107 5.263 5.413 5.565 5.704 5.89 6.068 6.21 6.373 6.536 6.677 6.81 6.946 7.069 7.175 7.267 7.336 7.397 7.466 7.499 7.48 7.379 7.219 6.962 6.466 5.636 4.265 1.743 -1.339 -3.909 -6.08 -7.97 -9.65 -11.057 -12.35 -13.446 -14.503 -15.327 -16.006 -16.688 -17.316 -17.86 -18.37 -18.915 -19.386 -19.797 -20.22 -20.655 -21.019 -21.393 -21.77 -22.052 -22.34 -22.625 -22.914 -23.227 -23.438 -23.655 -24.011 -24.271 -24.542 -24.672 -24.937 -25.211 -25.495 -25.635 -26.033 -26.113 -26.297 -26.501 -26.925 -27.141 -27.371 -27.618 -27.898 -28.205 -28.615 -30.394 -9 ,27016 ,KEBNE ,16654617,Mon Nov 22 07:34:07 CET,Mon Nov 22 09:15:50 CET,0.0 1.526 1.99 2.296 2.556 2.797 2.984 3.144 3.446 3.56 3.658 3.637 3.948 4.029 4.196 4.354 4.491 4.561 4.694 4.821 5.026 5.155 5.271 5.429 5.562 5.678 5.795 5.909 6.055 6.197 6.318 6.444 6.555 6.659 6.796 6.955 7.095 7.214 7.306 7.379 7.441 7.497 7.532 7.512 7.41 7.274 7.038 6.577 5.765 4.414 2.048 -0.994 -3.564 -5.724 -7.574 -9.222 -10.662 -11.944 -13.012 -14.057 -14.954 -15.723 -16.435 -17.095 -17.707 -18.239 -18.758 -19.231 -19.643 -20.06 -20.483 -20.832 -21.195 -21.571 -21.863 -22.158 -22.45 -22.753 -23.081 -23.307 -23.539 -23.888 -24.134 -24.401 -24.534 -24.803 -25.085 -25.377 -25.539 -25.976 -26.105 -26.304 -26.517 -26.957 -27.19 -27.446 -27.719 -28.011 -28.333 -28.812 -30.344 -10 ,10242 ,KEBNE ,16654618,Mon Nov 22 07:34:07 CET,Mon Nov 22 09:15:40 CET,0.0 2.091 2.399 2.618 2.795 2.942 3.065 3.212 3.485 3.589 3.696 3.684 4.002 4.091 4.244 4.37 4.515 4.586 4.696 4.787 4.935 5.038 5.131 5.248 5.351 5.452 5.554 5.647 5.759 5.859 5.938 6.018 6.097 6.185 6.293 6.398 6.472 6.533 6.589 6.636 6.676 6.676 6.604 6.486 6.305 6.011 5.571 5.006 4.146 2.671 0.028 -3.223 -5.809 -7.933 -9.715 -11.231 -12.509 -13.663 -14.664 -15.62 -16.399 -17.083 -17.734 -18.35 -18.909 -19.416 -19.95 -20.449 -20.875 -21.278 -21.688 -22.027 -22.37 -22.742 -23.04 -23.339 -23.643 -23.96 -24.293 -24.523 -24.765 -25.146 -25.415 -25.717 -25.86 -26.123 -26.41 -26.715 -26.887 -27.317 -27.414 -27.606 -27.815 -28.273 -28.525 -28.803 -29.113 -29.442 -29.795 -30.303 -31.826 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index d399f6aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12635 ,KEBNE ,16656778,Mon Nov 22 23:23:59 CET,Tue Nov 23 01:08:02 CET,0.0 0.611 0.889 1.104 1.304 1.476 1.634 1.789 2.085 2.208 2.32 2.326 2.653 2.757 2.954 3.138 3.315 3.399 3.558 3.724 3.99 4.15 4.297 4.527 4.754 4.966 5.159 5.356 5.628 5.883 6.121 6.407 6.683 6.944 7.251 7.598 7.918 8.277 8.665 9.045 9.445 9.916 10.438 10.963 11.586 12.266 13.013 13.757 14.47 15.072 15.408 15.159 14.53 13.733 13.043 12.42 11.808 11.26 10.765 10.264 9.795 9.342 8.941 8.562 8.194 7.844 7.433 7.056 6.743 6.406 6.022 5.678 5.329 4.979 4.716 4.445 4.164 3.845 3.513 3.293 3.057 2.687 2.425 2.15 1.998 1.667 1.352 1.05 0.882 0.484 0.341 0.156 -0.017 -0.391 -0.626 -0.909 -1.198 -1.519 -1.957 -2.454 -3.656 -2 ,27875 ,KEBNE ,16656779,Mon Nov 22 23:23:59 CET,Tue Nov 23 01:08:26 CET,0.0 1.054 1.411 1.688 1.922 2.136 2.355 2.533 2.821 2.967 3.105 3.128 3.468 3.584 3.798 4.012 4.215 4.315 4.53 4.729 4.997 5.175 5.345 5.583 5.819 6.053 6.286 6.52 6.816 7.093 7.367 7.699 7.996 8.261 8.57 8.918 9.239 9.589 9.978 10.405 10.832 11.284 11.806 12.31 12.893 13.49 14.01 14.559 15.21 15.664 15.65 15.091 14.266 13.335 12.489 11.658 10.866 10.17 9.588 8.955 8.359 7.808 7.297 6.828 6.379 5.958 5.519 5.139 4.796 4.416 4.021 3.714 3.374 2.978 2.702 2.428 2.123 1.803 1.506 1.333 1.142 0.842 0.64 0.4 0.268 -0.004 -0.301 -0.612 -0.777 -1.175 -1.319 -1.508 -1.713 -2.132 -2.374 -2.659 -2.954 -3.265 -3.655 -4.208 -5.847 -3 ,13784 ,KEBNE ,16656780,Mon Nov 22 23:25:02 CET,Tue Nov 23 01:09:34 CET,0.0 0.758 1.128 1.402 1.611 1.785 1.948 2.089 2.304 2.408 2.516 2.488 2.804 2.901 3.085 3.257 3.42 3.506 3.674 3.823 4.025 4.154 4.288 4.481 4.665 4.851 5.026 5.204 5.445 5.678 5.907 6.191 6.465 6.724 7.035 7.376 7.686 8.034 8.411 8.788 9.184 9.614 10.112 10.638 11.236 11.868 12.537 13.189 13.764 14.119 13.976 13.23 12.354 11.463 10.606 9.796 9.072 8.395 7.785 7.18 6.645 6.128 5.612 5.095 4.631 4.255 3.85 3.47 3.135 2.768 2.383 2.079 1.744 1.382 1.119 0.852 0.571 0.283 0.002 -0.188 -0.395 -0.764 -1.031 -1.299 -1.44 -1.723 -2.006 -2.316 -2.49 -2.892 -3.054 -3.256 -3.451 -3.86 -4.097 -4.36 -4.645 -4.969 -5.377 -5.987 -8.144 -4 ,11339 ,KEBNE ,16656781,Mon Nov 22 23:25:02 CET,Tue Nov 23 01:09:26 CET,0.0 0.641 0.943 1.154 1.343 1.535 1.712 1.87 2.191 2.328 2.451 2.486 2.828 2.956 3.22 3.47 3.697 3.805 3.994 4.154 4.375 4.516 4.665 4.879 5.069 5.265 5.459 5.63 5.848 6.066 6.275 6.527 6.763 6.99 7.276 7.631 7.977 8.338 8.703 9.069 9.428 9.832 10.316 10.797 11.359 11.959 12.644 13.304 13.86 14.266 14.264 13.745 13.063 12.243 11.392 10.544 9.762 9.067 8.43 7.753 7.185 6.665 6.149 5.656 5.187 4.771 4.35 3.964 3.638 3.298 2.943 2.654 2.336 1.992 1.73 1.461 1.17 0.868 0.552 0.318 0.07 -0.325 -0.61 -0.904 -1.049 -1.34 -1.646 -1.99 -2.167 -2.563 -2.717 -2.941 -3.188 -3.688 -3.947 -4.228 -4.563 -4.977 -5.459 -6.07 -7.856 -6 ,20138 ,KEBNE ,16656783,Mon Nov 22 23:25:02 CET,Tue Nov 23 01:12:49 CET,0.0 0.597 0.933 1.216 1.417 1.6 1.775 1.932 2.233 2.373 2.507 2.548 2.894 3.015 3.265 3.497 3.698 3.795 3.987 4.176 4.44 4.608 4.764 4.969 5.172 5.372 5.567 5.758 6.001 6.236 6.462 6.742 7.002 7.257 7.578 7.943 8.264 8.61 8.996 9.397 9.805 10.262 10.8 11.326 11.916 12.555 13.249 13.981 14.734 15.354 15.681 15.385 14.751 14.019 13.316 12.641 11.968 11.307 10.693 10.055 9.521 9.06 8.611 8.183 7.772 7.371 6.964 6.601 6.272 5.933 5.56 5.224 4.884 4.531 4.266 4.005 3.729 3.456 3.173 2.961 2.746 2.413 2.167 1.897 1.76 1.496 1.21 0.893 0.728 0.329 0.16 -0.051 -0.274 -0.76 -1.032 -1.323 -1.629 -1.994 -2.41 -2.934 -4.291 -8 ,2777 ,KEBNE ,16656785,Mon Nov 22 23:25:02 CET,Tue Nov 23 01:08:42 CET,0.0 0.652 0.966 1.221 1.424 1.624 1.816 1.983 2.253 2.373 2.489 2.498 2.835 2.943 3.141 3.33 3.518 3.611 3.781 3.948 4.192 4.349 4.509 4.737 4.956 5.168 5.371 5.561 5.806 6.051 6.277 6.546 6.8 7.05 7.374 7.721 8.012 8.357 8.745 9.143 9.565 10.033 10.572 11.084 11.65 12.311 13.036 13.746 14.461 15.094 15.27 14.603 13.742 12.876 12.082 11.302 10.569 9.891 9.242 8.547 7.964 7.481 6.993 6.504 6.07 5.684 5.274 4.878 4.52 4.162 3.809 3.523 3.208 2.88 2.613 2.326 2.047 1.77 1.471 1.266 1.062 0.734 0.49 0.233 0.102 -0.168 -0.449 -0.751 -0.906 -1.286 -1.408 -1.595 -1.794 -2.204 -2.429 -2.706 -3.016 -3.335 -3.698 -4.179 -5.689 -9 ,4291 ,KEBNE ,16656786,Mon Nov 22 23:25:06 CET,Tue Nov 23 01:01:20 CET,0.0 0.806 1.19 1.477 1.717 1.92 2.122 2.309 2.625 2.772 2.918 2.978 3.333 3.459 3.72 3.962 4.175 4.28 4.483 4.683 4.959 5.133 5.307 5.553 5.782 5.997 6.213 6.432 6.705 6.953 7.193 7.478 7.765 8.066 8.398 8.74 9.066 9.426 9.809 10.204 10.601 11.056 11.573 12.061 12.626 13.231 13.919 14.646 15.392 15.943 16.081 15.65 14.885 14.034 13.25 12.517 11.799 11.092 10.433 9.73 9.12 8.609 8.132 7.663 7.235 6.858 6.462 6.106 5.776 5.42 5.051 4.748 4.44 4.14 3.904 3.647 3.379 3.088 2.79 2.581 2.36 2.019 1.798 1.566 1.443 1.18 0.883 0.584 0.433 0.039 -0.1 -0.28 -0.478 -0.949 -1.188 -1.425 -1.71 -2.068 -2.49 -3.01 -4.786 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index b1df8476..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,23709 ,KEBNE ,16654651,Mon Nov 22 07:37:16 CET,Mon Nov 22 09:16:05 CET,0.0 2.563 3.004 3.295 3.565 3.791 3.95 4.078 4.33 4.432 4.52 4.468 4.763 4.838 4.995 5.136 5.287 5.363 5.509 5.633 5.785 5.87 5.953 6.099 6.258 6.408 6.536 6.639 6.741 6.814 6.901 7.017 7.128 7.239 7.353 7.477 7.582 7.663 7.724 7.761 7.777 7.765 7.71 7.597 7.397 7.115 6.696 6.065 5.135 3.605 0.895 -2.355 -5.002 -7.196 -9.085 -10.762 -12.182 -13.432 -14.49 -15.539 -16.43 -17.206 -17.966 -18.655 -19.284 -19.881 -20.481 -20.992 -21.43 -21.898 -22.377 -22.788 -23.211 -23.658 -24.022 -24.398 -24.798 -25.201 -25.609 -25.898 -26.189 -26.639 -26.937 -27.231 -27.388 -27.715 -28.064 -28.438 -28.646 -29.118 -29.338 -29.604 -29.865 -30.423 -30.739 -31.085 -31.441 -31.829 -32.384 -33.164 -36.278 -4 ,20911 ,KEBNE ,16654653,Mon Nov 22 07:38:14 CET,Mon Nov 22 09:22:00 CET,0.0 1.555 1.843 2.118 2.315 2.434 2.547 2.672 2.896 2.969 3.025 2.935 3.23 3.302 3.421 3.524 3.629 3.678 3.773 3.882 4.044 4.135 4.215 4.329 4.433 4.536 4.631 4.703 4.793 4.871 4.933 5.008 5.095 5.175 5.237 5.288 5.332 5.37 5.393 5.394 5.365 5.313 5.24 5.108 4.886 4.576 4.122 3.468 2.457 0.872 -1.889 -5.274 -7.995 -10.266 -12.216 -13.942 -15.413 -16.705 -17.806 -18.885 -19.771 -20.562 -21.344 -22.072 -22.716 -23.282 -23.876 -24.398 -24.84 -25.316 -25.822 -26.217 -26.629 -27.076 -27.427 -27.776 -28.12 -28.473 -28.844 -29.112 -29.393 -29.817 -30.096 -30.388 -30.536 -30.837 -31.164 -31.501 -31.698 -32.181 -32.401 -32.618 -32.851 -33.419 -33.757 -34.14 -34.569 -35.015 -35.484 -36.11 -40.81 -5 ,26061 ,KEBNE ,16654654,Mon Nov 22 07:38:14 CET,Mon Nov 22 09:21:43 CET,0.0 1.382 1.774 2.007 2.18 2.342 2.463 2.566 2.79 2.894 2.994 2.946 3.241 3.312 3.453 3.575 3.694 3.754 3.863 3.954 4.069 4.148 4.221 4.324 4.426 4.508 4.572 4.629 4.697 4.772 4.857 4.955 5.041 5.111 5.185 5.271 5.333 5.368 5.399 5.425 5.42 5.405 5.357 5.251 5.087 4.82 4.429 3.852 2.839 1.164 -1.672 -5.039 -7.673 -9.871 -11.729 -13.396 -14.864 -16.15 -17.239 -18.275 -19.175 -20.026 -20.822 -21.544 -22.178 -22.735 -23.319 -23.832 -24.279 -24.768 -25.27 -25.665 -26.055 -26.474 -26.819 -27.167 -27.541 -27.94 -28.336 -28.609 -28.904 -29.373 -29.704 -30.044 -30.211 -30.538 -30.889 -31.256 -31.444 -31.892 -32.035 -32.241 -32.461 -32.926 -33.199 -33.525 -33.865 -34.255 -34.762 -35.462 -40.201 -6 ,15373 ,KEBNE ,16656793,Mon Nov 22 23:26:04 CET,Tue Nov 23 01:13:47 CET,0.0 1.305 1.625 1.858 2.047 2.22 2.36 2.454 2.636 2.726 2.823 2.796 3.092 3.154 3.306 3.468 3.629 3.715 3.879 4.017 4.174 4.258 4.325 4.445 4.592 4.733 4.858 4.956 5.047 5.121 5.199 5.312 5.428 5.531 5.64 5.73 5.791 5.853 5.903 5.925 5.931 5.926 5.892 5.825 5.709 5.478 5.083 4.53 3.618 2.078 -0.609 -3.871 -6.532 -8.744 -10.626 -12.315 -13.745 -14.986 -16.033 -17.055 -17.948 -18.746 -19.49 -20.188 -20.808 -21.376 -21.989 -22.526 -22.975 -23.446 -23.949 -24.363 -24.822 -25.318 -25.69 -26.077 -26.468 -26.873 -27.322 -27.641 -27.975 -28.429 -28.728 -29.069 -29.255 -29.642 -30.043 -30.458 -30.66 -31.121 -31.329 -31.564 -31.8 -32.387 -32.715 -33.044 -33.407 -33.819 -34.287 -34.919 -37.951 -9 ,4016 ,KEBNE ,16656796,Mon Nov 22 23:26:04 CET,Tue Nov 23 01:08:47 CET,0.0 1.979 2.393 2.715 2.93 3.091 3.24 3.397 3.644 3.762 3.881 3.879 4.201 4.293 4.471 4.62 4.771 4.841 4.952 5.044 5.166 5.255 5.349 5.474 5.58 5.673 5.763 5.859 5.99 6.114 6.238 6.37 6.493 6.607 6.718 6.83 6.915 6.975 6.996 7.003 7.004 6.991 6.947 6.842 6.636 6.316 5.828 5.154 4.124 2.5 -0.161 -3.497 -6.268 -8.55 -10.475 -12.165 -13.597 -14.862 -15.944 -17.004 -17.931 -18.765 -19.55 -20.292 -20.989 -21.622 -22.289 -22.87 -23.35 -23.862 -24.403 -24.83 -25.25 -25.704 -26.059 -26.425 -26.819 -27.216 -27.62 -27.902 -28.194 -28.652 -28.979 -29.337 -29.532 -29.918 -30.292 -30.701 -30.923 -31.409 -31.623 -31.869 -32.145 -32.729 -33.061 -33.42 -33.791 -34.199 -34.711 -35.515 -39.131 -10 ,13499 ,KEBNE ,16654659,Mon Nov 22 07:38:16 CET,Mon Nov 22 08:56:57 CET,0.0 2.85 3.272 3.51 3.707 3.88 3.996 4.112 4.339 4.43 4.521 4.45 4.749 4.827 5.0 5.164 5.292 5.346 5.452 5.554 5.693 5.772 5.843 5.953 6.069 6.182 6.284 6.372 6.455 6.518 6.602 6.703 6.783 6.856 6.923 7.003 7.073 7.137 7.19 7.213 7.228 7.219 7.147 7.031 6.855 6.567 6.121 5.478 4.477 2.915 0.374 -2.678 -5.245 -7.5 -9.389 -11.058 -12.486 -13.698 -14.758 -15.814 -16.713 -17.528 -18.29 -18.985 -19.615 -20.183 -20.778 -21.302 -21.774 -22.271 -22.775 -23.188 -23.613 -24.08 -24.44 -24.81 -25.205 -25.599 -26.001 -26.285 -26.578 -27.03 -27.342 -27.672 -27.85 -28.241 -28.657 -29.115 -29.359 -29.836 -30.007 -30.219 -30.461 -31.033 -31.318 -31.6 -31.933 -32.35 -32.853 -33.519 -36.194 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index f11bd848..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,29501 ,KEBNE ,16656800,Mon Nov 22 23:27:07 CET,Tue Nov 23 01:11:13 CET,0.0 2.785 3.171 3.513 3.794 3.995 4.164 4.329 4.636 4.761 4.877 4.89 5.223 5.337 5.567 5.772 5.976 6.078 6.267 6.466 6.771 6.967 7.151 7.419 7.678 7.915 8.14 8.357 8.645 8.92 9.162 9.454 9.738 10.013 10.343 10.701 11.04 11.407 11.796 12.226 12.712 13.257 13.874 14.443 15.034 15.744 16.559 17.277 17.898 18.457 18.72 18.159 17.164 16.051 15.059 14.27 13.593 12.971 12.396 11.816 11.359 10.926 10.445 9.981 9.554 9.13 8.669 8.263 7.923 7.591 7.253 6.958 6.634 6.285 6.018 5.754 5.483 5.18 4.858 4.631 4.391 4.021 3.765 3.517 3.376 3.068 2.771 2.445 2.272 1.878 1.706 1.495 1.284 0.863 0.611 0.308 -0.035 -0.456 -0.99 -1.573 -3.423 -5 ,29875 ,KEBNE ,16656802,Mon Nov 22 23:27:07 CET,Tue Nov 23 01:12:53 CET,0.0 3.902 4.42 4.803 5.126 5.412 5.682 5.942 6.383 6.559 6.731 6.829 7.199 7.326 7.576 7.819 8.05 8.161 8.362 8.57 8.888 9.093 9.292 9.588 9.873 10.134 10.376 10.604 10.902 11.181 11.443 11.76 12.068 12.367 12.711 13.106 13.483 13.878 14.3 14.743 15.21 15.746 16.339 16.889 17.511 18.192 18.912 19.621 20.278 20.732 20.657 20.048 19.206 18.3 17.5 16.746 15.989 15.251 14.633 14.005 13.461 12.994 12.532 12.088 11.662 11.273 10.866 10.467 10.119 9.758 9.397 9.102 8.745 8.343 8.041 7.731 7.398 7.043 6.685 6.441 6.17 5.74 5.448 5.122 4.953 4.606 4.222 3.803 3.583 3.14 2.909 2.689 2.465 1.881 1.566 1.241 0.883 0.475 -0.05 -0.724 -7.53 -6 ,30900 ,KEBNE ,16656803,Mon Nov 22 23:27:07 CET,Tue Nov 23 01:12:50 CET,0.0 2.823 3.324 3.681 3.941 4.183 4.425 4.649 5.066 5.271 5.475 5.629 6.007 6.127 6.337 6.538 6.74 6.839 7.021 7.198 7.472 7.635 7.782 7.991 8.211 8.452 8.684 8.888 9.14 9.397 9.644 9.931 10.203 10.451 10.729 11.048 11.368 11.768 12.207 12.629 13.071 13.579 14.153 14.676 15.261 15.895 16.508 17.054 17.599 18.133 18.279 17.772 17.107 16.327 15.564 14.851 14.194 13.579 13.015 12.446 11.95 11.501 11.062 10.619 10.212 9.858 9.5 9.174 8.896 8.609 8.254 7.913 7.551 7.173 6.891 6.624 6.362 6.079 5.754 5.523 5.301 4.934 4.684 4.442 4.304 3.991 3.67 3.369 3.206 2.803 2.632 2.424 2.195 1.706 1.467 1.172 0.823 0.452 -0.008 -0.706 -3.346 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt deleted file mode 100644 index e63448f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3910 ,KEBNE ,16656808,Mon Nov 22 23:28:09 CET,Tue Nov 23 01:14:11 CET,0.0 0.214 0.402 0.565 0.7 0.855 0.993 1.209 1.325 1.436 1.527 1.761 1.856 2.037 2.213 2.383 2.471 2.651 2.819 3.05 3.2 3.34 3.547 3.759 3.98 4.181 4.364 4.616 4.867 5.109 5.415 5.718 6.009 6.353 6.739 7.113 7.531 7.966 8.414 8.897 9.446 10.113 10.784 11.563 12.482 13.554 14.683 15.971 17.476 19.284 20.688 21.195 21.288 21.205 20.961 20.685 20.429 20.199 19.918 19.629 19.336 19.004 18.692 18.433 18.189 17.873 17.542 17.269 17.002 16.719 16.491 16.221 15.887 15.644 15.433 15.219 14.987 14.76 14.593 14.398 14.093 13.869 13.615 13.481 13.22 12.927 12.59 12.408 12.107 11.832 11.638 11.385 10.766 10.443 10.094 9.718 9.258 8.655 7.738 -2 ,7170 ,KEBNE ,16656809,Mon Nov 22 23:28:09 CET,Tue Nov 23 01:10:35 CET,0.0 0.301 0.493 0.681 0.855 1.012 1.146 1.394 1.516 1.631 1.715 1.951 2.056 2.248 2.428 2.598 2.686 2.847 3.008 3.25 3.394 3.529 3.74 3.969 4.196 4.4 4.588 4.841 5.081 5.305 5.584 5.857 6.123 6.435 6.797 7.158 7.56 7.991 8.448 8.915 9.456 10.114 10.774 11.558 12.42 13.43 14.584 15.83 17.214 18.572 19.235 19.401 19.353 19.077 18.71 18.463 18.231 17.927 17.562 17.249 16.993 16.702 16.396 16.089 15.765 15.438 15.148 14.891 14.636 14.378 14.187 13.986 13.71 13.476 13.247 13.012 12.755 12.483 12.295 12.09 11.758 11.512 11.224 11.075 10.79 10.503 10.184 10.006 9.716 9.39 9.169 8.926 8.363 8.052 7.734 7.402 6.937 6.296 5.429 -3 ,30733 ,KEBNE ,16656810,Mon Nov 22 23:28:09 CET,Tue Nov 23 01:16:04 CET,0.0 0.261 0.474 0.635 0.78 0.933 1.069 1.319 1.435 1.557 1.694 1.937 2.042 2.249 2.432 2.606 2.686 2.848 3.018 3.264 3.427 3.588 3.824 4.048 4.267 4.479 4.687 4.957 5.212 5.47 5.794 6.112 6.427 6.793 7.207 7.605 8.038 8.504 8.996 9.533 10.14 10.856 11.604 12.45 13.333 14.352 15.52 16.791 18.184 19.669 20.494 20.718 20.725 20.635 20.468 20.228 19.928 19.634 19.325 19.05 18.801 18.517 18.205 17.922 17.672 17.386 17.119 16.876 16.613 16.323 16.06 15.787 15.517 15.275 14.998 14.721 14.446 14.152 13.923 13.685 13.339 13.07 12.753 12.586 12.257 11.926 11.563 11.377 11.082 10.739 10.503 10.258 9.659 9.301 8.885 8.424 7.928 7.354 6.408 -4 ,1270 ,KEBNE ,16656811,Mon Nov 22 23:29:11 CET,Tue Nov 23 01:11:13 CET,0.0 0.295 0.488 0.654 0.823 0.957 1.068 1.278 1.377 1.473 1.533 1.75 1.848 2.044 2.228 2.394 2.474 2.637 2.797 3.019 3.163 3.314 3.531 3.725 3.918 4.118 4.318 4.591 4.855 5.111 5.41 5.694 5.978 6.318 6.7 7.066 7.477 7.917 8.371 8.852 9.42 10.087 10.737 11.495 12.387 13.413 14.58 15.946 17.447 19.061 20.027 20.329 20.383 20.297 20.148 19.913 19.66 19.445 19.181 18.896 18.611 18.331 18.057 17.792 17.525 17.22 16.946 16.728 16.512 16.255 15.992 15.711 15.443 15.238 15.025 14.776 14.492 14.19 13.988 13.789 13.46 13.217 12.944 12.8 12.512 12.22 11.905 11.726 11.455 11.197 10.964 10.712 10.11 9.76 9.386 8.899 8.382 7.711 6.724 -5 ,2294 ,KEBNE ,16656812,Mon Nov 22 23:29:11 CET,Tue Nov 23 01:11:26 CET,0.0 0.243 0.472 0.677 0.861 1.026 1.166 1.389 1.507 1.625 1.707 1.936 2.041 2.239 2.437 2.641 2.737 2.906 3.071 3.326 3.484 3.626 3.841 4.066 4.28 4.479 4.671 4.918 5.166 5.403 5.693 5.983 6.262 6.583 6.955 7.34 7.753 8.204 8.711 9.251 9.843 10.537 11.299 12.181 13.139 14.241 15.455 16.96 18.651 20.266 21.385 21.896 22.1 22.061 21.864 21.675 21.474 21.264 21.015 20.77 20.504 20.222 19.955 19.672 19.398 19.115 18.848 18.596 18.321 18.023 17.783 17.544 17.278 17.062 16.824 16.58 16.331 16.036 15.832 15.643 15.36 15.155 14.92 14.793 14.527 14.238 13.904 13.722 13.428 13.08 12.852 12.61 12.017 11.656 11.257 10.816 10.241 9.497 8.331 -6 ,27171 ,KEBNE ,16656813,Mon Nov 22 23:29:11 CET,Tue Nov 23 01:15:53 CET,0.0 0.262 0.483 0.668 0.807 0.942 1.074 1.304 1.413 1.524 1.605 1.826 1.919 2.107 2.288 2.47 2.567 2.738 2.889 3.103 3.24 3.389 3.608 3.81 4.007 4.196 4.396 4.669 4.919 5.161 5.468 5.78 6.077 6.4 6.775 7.153 7.563 7.995 8.458 8.954 9.514 10.186 10.854 11.624 12.448 13.414 14.604 15.998 17.604 19.261 20.309 20.763 20.889 20.787 20.54 20.3 20.082 19.839 19.548 19.263 18.988 18.722 18.453 18.191 17.937 17.683 17.448 17.207 16.933 16.659 16.422 16.165 15.9 15.689 15.477 15.258 15.023 14.776 14.595 14.392 14.089 13.883 13.637 13.498 13.221 12.926 12.571 12.374 12.053 11.624 11.344 11.037 10.397 10.097 9.654 9.123 8.596 7.95 6.996 -7 ,21658 ,KEBNE ,16656814,Mon Nov 22 23:30:13 CET,Tue Nov 23 01:13:27 CET,0.0 0.317 0.511 0.651 0.793 0.931 1.064 1.307 1.41 1.502 1.557 1.781 1.885 2.073 2.255 2.442 2.53 2.695 2.845 3.068 3.222 3.379 3.605 3.807 4.003 4.203 4.413 4.674 4.913 5.145 5.416 5.69 5.978 6.311 6.681 7.049 7.461 7.896 8.363 8.864 9.458 10.16 10.823 11.576 12.417 13.4 14.477 15.789 17.413 19.244 20.482 20.897 20.953 20.835 20.628 20.436 20.218 19.982 19.712 19.437 19.178 18.895 18.605 18.36 18.134 17.87 17.6 17.356 17.096 16.828 16.637 16.438 16.199 16.004 15.817 15.615 15.386 15.143 14.957 14.745 14.41 14.201 13.99 13.874 13.609 13.341 13.045 12.867 12.575 12.282 12.059 11.822 11.331 10.988 10.576 10.179 9.786 9.208 8.302 -8 ,18706 ,KEBNE ,16656815,Mon Nov 22 23:30:13 CET,Tue Nov 23 01:16:34 CET,0.0 0.257 0.444 0.603 0.762 0.929 1.088 1.358 1.474 1.593 1.684 1.919 2.023 2.221 2.407 2.586 2.674 2.833 2.979 3.21 3.372 3.527 3.75 3.97 4.182 4.391 4.597 4.873 5.133 5.384 5.694 5.988 6.275 6.619 7.014 7.379 7.774 8.219 8.724 9.27 9.866 10.561 11.278 12.131 13.114 14.247 15.472 16.905 18.677 20.628 21.768 22.249 22.514 22.591 22.522 22.333 22.095 21.876 21.634 21.389 21.13 20.825 20.543 20.292 20.037 19.773 19.528 19.32 19.104 18.866 18.645 18.399 18.151 17.946 17.721 17.451 17.141 16.823 16.611 16.406 16.071 15.841 15.593 15.456 15.2 14.917 14.612 14.439 14.145 13.86 13.637 13.368 12.822 12.501 12.163 11.828 11.333 10.604 9.463 -9 ,24694 ,KEBNE ,16656816,Mon Nov 22 23:30:13 CET,Tue Nov 23 01:13:14 CET,0.0 0.24 0.461 0.655 0.832 0.985 1.122 1.374 1.488 1.611 1.712 1.943 2.047 2.249 2.437 2.624 2.717 2.899 3.068 3.307 3.462 3.625 3.874 4.096 4.299 4.495 4.695 4.966 5.218 5.45 5.745 6.049 6.347 6.685 7.059 7.412 7.811 8.254 8.731 9.242 9.806 10.442 11.098 11.898 12.808 13.848 15.025 16.424 18.069 19.939 21.123 21.621 21.79 21.731 21.544 21.256 20.958 20.718 20.45 20.177 19.896 19.626 19.376 19.124 18.844 18.533 18.279 18.071 17.857 17.606 17.395 17.181 16.918 16.683 16.418 16.152 15.891 15.596 15.389 15.204 14.921 14.693 14.446 14.325 14.061 13.767 13.475 13.302 13.02 12.77 12.552 12.313 11.789 11.438 11.049 10.669 10.15 9.465 8.328 -10 ,294 ,KEBNE ,16656817,Mon Nov 22 23:31:16 CET,Tue Nov 23 01:13:52 CET,0.0 0.204 0.394 0.562 0.687 0.812 0.945 1.158 1.254 1.354 1.416 1.634 1.726 1.924 2.114 2.281 2.36 2.522 2.683 2.916 3.063 3.2 3.395 3.584 3.787 3.992 4.176 4.417 4.672 4.931 5.262 5.574 5.866 6.213 6.59 6.966 7.392 7.831 8.289 8.763 9.324 10.009 10.695 11.518 12.437 13.465 14.607 15.857 17.238 18.783 19.811 20.119 20.136 20.072 19.936 19.716 19.48 19.253 18.964 18.726 18.499 18.234 17.967 17.705 17.476 17.226 16.99 16.783 16.548 16.3 16.081 15.831 15.582 15.395 15.169 14.934 14.696 14.437 14.267 14.077 13.718 13.456 13.21 13.099 12.848 12.529 12.173 11.994 11.704 11.353 11.105 10.861 10.313 9.997 9.666 9.173 8.524 7.899 7.089 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt deleted file mode 100644 index 4912af31..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13295 ,KEBNE ,16656818,Mon Nov 22 23:32:19 CET,Tue Nov 23 01:13:02 CET,0.0 0.256 0.352 0.419 0.479 0.555 0.622 0.675 0.78 0.82 0.857 0.82 0.984 1.009 1.058 1.111 1.162 1.182 1.21 1.237 1.288 1.317 1.337 1.366 1.394 1.414 1.428 1.44 1.449 1.462 1.462 1.437 1.422 1.397 1.346 1.293 1.243 1.159 1.026 0.861 0.667 0.46 0.173 -0.184 -0.667 -1.306 -2.129 -3.282 -4.959 -7.369 -11.198 -15.422 -18.773 -21.625 -24.027 -26.026 -27.709 -29.252 -30.558 -31.83 -32.888 -33.8 -34.664 -35.482 -36.238 -36.942 -37.653 -38.257 -38.782 -39.336 -39.909 -40.374 -40.849 -41.334 -41.706 -42.074 -42.452 -42.848 -43.283 -43.573 -43.853 -44.338 -44.678 -45.012 -45.195 -45.553 -45.909 -46.353 -46.572 -46.93 -47.208 -47.466 -47.771 -48.452 -48.807 -49.19 -49.678 -50.265 -51.006 -52.167 -65.368 -6 ,23418 ,KEBNE ,16656823,Mon Nov 22 23:34:25 CET,Tue Nov 23 01:15:21 CET,0.0 0.271 0.409 0.552 0.677 0.749 0.81 0.868 0.973 1.02 1.074 1.06 1.218 1.246 1.307 1.347 1.39 1.407 1.435 1.47 1.52 1.542 1.565 1.604 1.627 1.654 1.685 1.691 1.668 1.647 1.632 1.614 1.587 1.557 1.527 1.478 1.421 1.338 1.216 1.088 0.945 0.752 0.471 0.152 -0.28 -0.924 -1.792 -2.921 -4.626 -7.04 -10.76 -15.06 -18.528 -21.383 -23.739 -25.812 -27.543 -29.018 -30.269 -31.544 -32.632 -33.569 -34.424 -35.231 -35.983 -36.671 -37.371 -37.976 -38.517 -39.056 -39.582 -40.045 -40.537 -41.036 -41.431 -41.851 -42.266 -42.674 -43.097 -43.391 -43.712 -44.22 -44.57 -44.935 -45.123 -45.536 -45.986 -46.436 -46.667 -47.083 -47.467 -47.735 -48.003 -48.6 -48.972 -49.403 -49.904 -50.471 -51.117 -52.152 -64.159 -10 ,975 ,KEBNE ,16656827,Mon Nov 22 23:35:28 CET,Tue Nov 23 01:15:05 CET,0.0 0.31 0.451 0.569 0.655 0.716 0.788 0.856 0.946 1.009 1.059 0.997 1.163 1.188 1.235 1.293 1.341 1.366 1.415 1.454 1.487 1.506 1.536 1.567 1.58 1.588 1.595 1.61 1.635 1.654 1.654 1.632 1.608 1.587 1.565 1.527 1.473 1.4 1.303 1.187 1.049 0.853 0.577 0.244 -0.24 -0.87 -1.708 -2.845 -4.537 -7.116 -11.098 -15.529 -19.024 -21.907 -24.36 -26.519 -28.312 -29.893 -31.234 -32.519 -33.587 -34.541 -35.46 -36.291 -37.062 -37.765 -38.513 -39.204 -39.799 -40.417 -41.043 -41.554 -42.075 -42.615 -43.027 -43.418 -43.816 -44.262 -44.743 -45.074 -45.404 -45.904 -46.286 -46.682 -46.877 -47.282 -47.713 -48.221 -48.484 -48.881 -49.195 -49.431 -49.678 -50.318 -50.678 -51.101 -51.585 -52.108 -52.779 -53.698 -59.831 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index c062a729..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32335 ,KEBNE ,16656828,Mon Nov 22 23:35:28 CET,Tue Nov 23 01:16:30 CET,0.0 1.201 1.609 1.936 2.236 2.513 2.746 2.943 3.303 3.476 3.649 3.749 4.117 4.252 4.494 4.734 4.989 5.112 5.335 5.556 5.875 6.06 6.236 6.516 6.773 7.002 7.229 7.466 7.781 8.063 8.334 8.688 9.024 9.343 9.731 10.17 10.576 11.005 11.473 11.96 12.469 13.037 13.696 14.352 15.06 15.835 16.685 17.546 18.385 19.162 19.627 19.202 18.396 17.503 16.649 15.843 15.056 14.249 13.511 12.714 12.007 11.397 10.815 10.265 9.776 9.337 8.86 8.432 8.066 7.677 7.258 6.932 6.601 6.222 5.927 5.639 5.331 4.965 4.587 4.337 4.073 3.64 3.359 3.1 2.963 2.654 2.298 1.903 1.692 1.273 1.084 0.85 0.587 0.013 -0.32 -0.658 -1.011 -1.46 -1.989 -2.773 -5.705 -2 ,26688 ,KEBNE ,16656829,Mon Nov 22 23:38:36 CET,Tue Nov 23 01:21:10 CET,0.0 0.815 1.269 1.681 1.979 2.208 2.402 2.578 2.912 3.076 3.245 3.341 3.713 3.865 4.152 4.444 4.712 4.827 5.059 5.286 5.612 5.822 6.017 6.299 6.57 6.814 7.032 7.259 7.57 7.871 8.167 8.514 8.823 9.123 9.49 9.877 10.248 10.661 11.094 11.548 12.015 12.528 13.101 13.702 14.404 15.108 15.886 16.715 17.487 18.111 18.373 17.937 17.137 16.224 15.359 14.538 13.828 13.163 12.552 11.935 11.416 10.916 10.414 9.959 9.511 9.113 8.714 8.344 8.027 7.673 7.293 6.977 6.658 6.351 6.12 5.863 5.582 5.285 4.996 4.797 4.588 4.267 4.02 3.744 3.583 3.258 2.941 2.586 2.403 1.985 1.756 1.535 1.329 0.877 0.615 0.327 -0.016 -0.4 -0.868 -1.533 -3.448 -3 ,13866 ,KEBNE ,16656830,Mon Nov 22 23:44:52 CET,Tue Nov 23 01:28:10 CET,0.0 1.411 1.843 2.112 2.409 2.67 2.882 3.084 3.407 3.555 3.706 3.781 4.15 4.298 4.565 4.801 5.034 5.143 5.359 5.577 5.888 6.096 6.3 6.577 6.826 7.072 7.318 7.56 7.873 8.171 8.458 8.812 9.152 9.462 9.785 10.146 10.505 10.904 11.358 11.854 12.352 12.871 13.472 14.104 14.823 15.545 16.368 17.251 18.087 18.863 19.332 18.995 18.17 17.187 16.241 15.294 14.478 13.703 12.948 12.197 11.567 11.005 10.479 10.009 9.573 9.127 8.641 8.217 7.842 7.459 7.077 6.773 6.435 6.034 5.737 5.461 5.15 4.803 4.459 4.221 3.976 3.605 3.346 3.084 2.942 2.644 2.34 2.007 1.825 1.404 1.169 0.94 0.706 0.201 -0.071 -0.376 -0.683 -1.041 -1.576 -2.41 -4.621 -4 ,1988 ,KEBNE ,16656831,Mon Nov 22 23:47:59 CET,Tue Nov 23 01:29:55 CET,0.0 0.931 1.295 1.58 1.844 2.11 2.327 2.51 2.853 3.002 3.152 3.211 3.569 3.713 3.988 4.222 4.439 4.542 4.752 4.971 5.282 5.469 5.654 5.93 6.196 6.444 6.694 6.945 7.253 7.538 7.81 8.136 8.449 8.743 9.088 9.487 9.881 10.302 10.759 11.232 11.731 12.301 12.906 13.499 14.185 14.938 15.739 16.543 17.387 18.116 18.454 18.053 17.305 16.427 15.604 14.79 13.984 13.232 12.553 11.894 11.357 10.874 10.385 9.902 9.469 9.055 8.605 8.184 7.811 7.438 7.052 6.732 6.403 6.053 5.759 5.443 5.124 4.793 4.441 4.2 3.971 3.601 3.325 3.05 2.92 2.635 2.303 1.921 1.725 1.314 1.125 0.921 0.716 0.22 -0.051 -0.345 -0.71 -1.149 -1.68 -2.37 -4.139 -5 ,12940 ,KEBNE ,16656832,Mon Nov 22 23:50:03 CET,Tue Nov 23 01:31:17 CET,0.0 0.972 1.438 1.757 1.996 2.218 2.448 2.656 2.983 3.14 3.287 3.335 3.695 3.828 4.087 4.346 4.597 4.716 4.959 5.19 5.513 5.719 5.911 6.19 6.469 6.729 6.978 7.236 7.563 7.864 8.158 8.514 8.856 9.186 9.57 9.995 10.404 10.867 11.343 11.826 12.321 12.871 13.537 14.2 14.916 15.654 16.436 17.228 18.034 18.716 19.027 18.591 17.826 17.056 16.352 15.664 14.935 14.178 13.524 12.83 12.212 11.676 11.154 10.661 10.206 9.817 9.401 9.01 8.661 8.267 7.835 7.473 7.141 6.828 6.583 6.32 6.016 5.684 5.361 5.128 4.874 4.499 4.241 3.979 3.829 3.502 3.18 2.835 2.655 2.255 2.081 1.85 1.595 1.023 0.713 0.382 0.058 -0.284 -0.722 -1.37 -4.503 -6 ,26082 ,KEBNE ,16656833,Mon Nov 22 23:50:03 CET,Tue Nov 23 01:31:12 CET,0.0 0.995 1.393 1.676 1.916 2.148 2.359 2.53 2.839 3.001 3.167 3.251 3.625 3.754 3.984 4.228 4.469 4.588 4.812 5.02 5.305 5.492 5.678 5.94 6.199 6.465 6.725 6.97 7.269 7.544 7.808 8.12 8.438 8.747 9.095 9.483 9.868 10.295 10.743 11.222 11.715 12.262 12.901 13.577 14.325 15.047 15.892 16.776 17.59 18.244 18.612 18.271 17.361 16.358 15.399 14.506 13.749 13.052 12.408 11.728 11.108 10.554 10.026 9.52 9.049 8.593 8.119 7.699 7.333 6.973 6.6 6.276 5.934 5.564 5.25 4.949 4.657 4.347 4.015 3.779 3.542 3.171 2.909 2.627 2.479 2.177 1.857 1.51 1.331 0.929 0.76 0.541 0.294 -0.218 -0.466 -0.729 -1.058 -1.464 -1.977 -2.739 -5.89 -7 ,15665 ,KEBNE ,16656834,Mon Nov 22 23:50:04 CET,Tue Nov 23 01:34:02 CET,0.0 1.327 1.75 2.11 2.409 2.649 2.892 3.128 3.5 3.651 3.798 3.863 4.22 4.341 4.574 4.809 5.02 5.129 5.346 5.529 5.801 5.986 6.165 6.428 6.686 6.942 7.188 7.429 7.732 8.042 8.366 8.728 9.034 9.32 9.679 10.094 10.495 10.945 11.404 11.886 12.386 12.909 13.52 14.138 14.853 15.585 16.335 17.188 18.179 19.184 19.946 19.972 19.317 18.498 17.748 16.963 16.206 15.472 14.799 14.133 13.575 13.055 12.55 12.081 11.628 11.213 10.812 10.441 10.103 9.711 9.286 8.971 8.645 8.273 7.969 7.655 7.331 7.002 6.666 6.434 6.185 5.779 5.492 5.207 5.068 4.763 4.411 4.044 3.854 3.427 3.231 3.007 2.748 2.184 1.91 1.632 1.311 0.957 0.482 -0.169 -2.354 -8 ,16533 ,KEBNE ,16656835,Mon Nov 22 23:52:09 CET,Tue Nov 23 01:34:52 CET,0.0 0.925 1.349 1.718 2.034 2.295 2.53 2.731 3.085 3.26 3.423 3.456 3.809 3.939 4.194 4.461 4.715 4.829 5.04 5.243 5.536 5.726 5.902 6.145 6.396 6.643 6.884 7.122 7.433 7.722 7.993 8.318 8.628 8.935 9.29 9.697 10.092 10.519 10.97 11.465 11.984 12.55 13.191 13.848 14.619 15.386 16.148 16.877 17.549 18.127 18.546 18.326 17.651 16.881 16.105 15.366 14.695 14.034 13.429 12.774 12.185 11.648 11.115 10.619 10.146 9.715 9.295 8.89 8.513 8.124 7.725 7.392 7.016 6.64 6.379 6.079 5.762 5.465 5.17 4.964 4.732 4.353 4.076 3.771 3.617 3.302 2.958 2.568 2.364 1.943 1.718 1.479 1.245 0.725 0.402 0.038 -0.348 -0.787 -1.334 -2.134 -4.633 -9 ,15205 ,KEBNE ,16656836,Mon Nov 22 23:55:16 CET,Tue Nov 23 01:37:37 CET,0.0 0.866 1.217 1.483 1.737 1.97 2.167 2.342 2.653 2.788 2.942 3.005 3.344 3.466 3.721 3.951 4.169 4.278 4.476 4.664 4.953 5.154 5.35 5.626 5.883 6.125 6.36 6.579 6.86 7.131 7.408 7.757 8.06 8.326 8.652 9.036 9.403 9.806 10.222 10.663 11.134 11.648 12.229 12.818 13.501 14.206 14.928 15.647 16.439 17.132 17.335 16.916 16.229 15.371 14.453 13.538 12.696 11.928 11.247 10.552 9.946 9.377 8.831 8.317 7.819 7.362 6.906 6.478 6.085 5.668 5.268 4.956 4.603 4.24 3.968 3.652 3.291 2.92 2.538 2.273 1.995 1.579 1.309 1.012 0.859 0.558 0.216 -0.171 -0.375 -0.808 -1.073 -1.322 -1.593 -2.24 -2.598 -2.977 -3.382 -3.889 -4.444 -5.084 -8.424 -10 ,20778 ,KEBNE ,16656837,Mon Nov 22 23:56:19 CET,Tue Nov 23 01:38:11 CET,0.0 0.755 1.169 1.496 1.745 1.991 2.215 2.41 2.743 2.875 3.011 3.063 3.417 3.546 3.794 4.014 4.225 4.335 4.541 4.746 5.04 5.224 5.413 5.695 5.966 6.226 6.477 6.71 6.981 7.245 7.499 7.814 8.146 8.458 8.805 9.192 9.567 9.979 10.411 10.862 11.319 11.812 12.371 12.97 13.673 14.355 15.057 15.817 16.662 17.283 17.275 16.673 15.782 14.768 13.765 12.844 12.01 11.189 10.421 9.62 8.901 8.287 7.731 7.199 6.709 6.252 5.757 5.31 4.948 4.576 4.169 3.825 3.483 3.165 2.933 2.671 2.385 2.076 1.728 1.48 1.219 0.818 0.524 0.232 0.092 -0.204 -0.499 -0.812 -0.987 -1.388 -1.569 -1.79 -2.031 -2.568 -2.858 -3.153 -3.517 -3.983 -4.529 -5.355 -7.783 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt deleted file mode 100644 index f5da7c3a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4579 ,KEBNE ,17023561,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:03:45 CET,0.0 4.291 4.968 5.518 5.971 6.33 6.644 6.948 7.502 7.742 7.955 8.105 8.522 8.72 9.093 9.44 9.757 9.914 10.228 10.526 10.941 11.217 11.488 11.862 12.226 12.593 12.949 13.266 13.64 14.018 14.388 14.828 15.263 15.673 16.108 16.608 17.104 17.609 18.137 18.71 19.291 19.868 20.495 21.128 21.852 22.699 23.662 24.594 25.45 26.193 26.697 26.491 25.868 25.054 24.171 23.308 22.581 21.927 21.324 20.719 20.182 19.68 19.205 18.764 18.326 17.921 17.499 17.122 16.807 16.462 16.076 15.729 15.34 14.934 14.629 14.277 13.914 13.563 13.165 12.874 12.574 12.13 11.861 11.606 11.467 11.152 10.792 10.392 10.173 9.72 9.469 9.225 8.968 8.394 8.072 7.72 7.305 6.772 6.17 5.464 1.648 -2 ,30037 ,KEBNE ,17023562,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:03:35 CET,0.0 3.524 4.493 5.188 5.733 6.188 6.6 7.004 7.679 7.952 8.212 8.438 8.883 9.12 9.553 9.942 10.29 10.45 10.745 11.04 11.443 11.675 11.916 12.275 12.622 12.951 13.28 13.601 13.977 14.333 14.675 15.121 15.549 15.942 16.416 16.934 17.414 17.935 18.522 19.135 19.703 20.313 21.039 21.772 22.618 23.577 24.597 25.544 26.463 27.346 27.967 27.874 27.393 26.723 26.033 25.357 24.687 24.049 23.558 23.054 22.52 22.023 21.563 21.112 20.689 20.305 19.893 19.499 19.126 18.714 18.29 17.957 17.602 17.215 16.92 16.629 16.31 15.958 15.592 15.338 15.094 14.712 14.426 14.116 13.961 13.656 13.31 12.908 12.693 12.267 12.089 11.87 11.606 11.026 10.711 10.346 9.941 9.518 8.946 8.06 4.478 -3 ,6358 ,KEBNE ,17023563,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:02:59 CET,0.0 3.163 3.792 4.335 4.819 5.166 5.469 5.79 6.391 6.643 6.886 7.131 7.546 7.715 8.075 8.421 8.739 8.901 9.236 9.54 9.957 10.212 10.452 10.814 11.143 11.46 11.78 12.091 12.5 12.882 13.238 13.684 14.092 14.466 14.906 15.371 15.819 16.318 16.861 17.42 17.988 18.668 19.426 20.117 20.948 21.846 22.805 23.803 24.694 25.36 25.603 25.154 24.447 23.677 22.879 22.11 21.484 20.886 20.311 19.696 19.129 18.599 18.084 17.604 17.184 16.802 16.413 16.059 15.737 15.385 14.991 14.678 14.355 13.976 13.682 13.404 13.128 12.85 12.553 12.336 12.108 11.748 11.493 11.244 11.12 10.838 10.491 10.125 9.942 9.529 9.353 9.14 8.899 8.341 8.026 7.692 7.316 6.832 6.187 5.291 2.033 -4 ,29481 ,KEBNE ,17023564,Wed Dec 22 08:15:56 CET,Wed Dec 22 10:03:52 CET,0.0 2.465 3.226 3.754 4.15 4.524 4.883 5.223 5.875 6.157 6.431 6.706 7.142 7.337 7.672 8.0 8.32 8.48 8.805 9.11 9.535 9.805 10.071 10.436 10.772 11.084 11.413 11.745 12.127 12.477 12.811 13.215 13.602 13.973 14.427 14.945 15.429 15.978 16.567 17.158 17.769 18.409 19.153 19.9 20.718 21.593 22.56 23.562 24.515 25.363 25.896 25.595 24.91 24.165 23.365 22.547 21.838 21.232 20.641 19.989 19.455 18.96 18.466 18.015 17.592 17.204 16.821 16.482 16.176 15.848 15.5 15.182 14.815 14.441 14.155 13.845 13.514 13.178 12.833 12.595 12.347 11.948 11.659 11.355 11.201 10.87 10.5 10.106 9.898 9.466 9.215 8.938 8.656 8.113 7.799 7.444 7.073 6.647 6.027 5.091 2.397 -5 ,3377 ,KEBNE ,17023565,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:03:04 CET,0.0 2.389 3.045 3.552 3.95 4.32 4.67 4.958 5.507 5.767 6.012 6.282 6.718 6.912 7.29 7.634 7.948 8.1 8.396 8.686 9.117 9.371 9.603 9.965 10.332 10.686 11.023 11.351 11.748 12.126 12.488 12.916 13.327 13.704 14.114 14.583 15.043 15.523 16.032 16.588 17.191 17.861 18.641 19.367 20.154 21.069 22.055 22.993 24.041 25.0 25.499 25.322 24.741 24.004 23.231 22.463 21.731 21.04 20.415 19.761 19.225 18.748 18.255 17.806 17.377 16.946 16.475 16.069 15.729 15.364 14.987 14.655 14.316 13.959 13.685 13.405 13.106 12.83 12.58 12.394 12.172 11.83 11.59 11.323 11.183 10.893 10.579 10.231 10.048 9.652 9.512 9.323 9.117 8.579 8.296 8.024 7.709 7.288 6.773 6.121 2.664 -6 ,25456 ,KEBNE ,17023566,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:03:38 CET,0.0 6.095 6.773 7.279 7.674 8.004 8.278 8.54 9.027 9.263 9.487 9.69 10.123 10.331 10.725 11.083 11.395 11.548 11.844 12.119 12.515 12.754 12.994 13.355 13.693 14.001 14.282 14.549 14.901 15.277 15.641 16.044 16.416 16.771 17.192 17.661 18.095 18.558 19.037 19.507 20.01 20.612 21.28 21.909 22.604 23.293 24.064 24.879 25.676 26.502 27.118 26.96 26.403 25.73 24.982 24.183 23.44 22.791 22.192 21.586 21.068 20.562 20.063 19.59 19.162 18.776 18.339 17.928 17.587 17.239 16.851 16.531 16.178 15.784 15.481 15.165 14.834 14.494 14.156 13.903 13.617 13.199 12.913 12.605 12.457 12.162 11.881 11.584 11.404 11.003 10.885 10.7 10.499 10.052 9.783 9.474 9.121 8.707 8.186 7.389 2.84 -7 ,8369 ,KEBNE ,17023567,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:03:59 CET,0.0 5.18 5.98 6.455 6.849 7.191 7.484 7.786 8.299 8.512 8.726 8.889 9.318 9.504 9.798 10.078 10.344 10.477 10.754 11.039 11.445 11.692 11.932 12.275 12.605 12.92 13.228 13.516 13.881 14.261 14.616 15.038 15.419 15.763 16.177 16.635 17.059 17.51 17.992 18.519 19.047 19.615 20.292 20.966 21.718 22.557 23.465 24.393 25.416 26.435 27.071 27.232 26.877 26.141 25.365 24.575 23.782 23.018 22.382 21.699 21.117 20.632 20.135 19.653 19.2 18.75 18.263 17.855 17.508 17.171 16.834 16.537 16.226 15.911 15.67 15.403 15.11 14.775 14.392 14.151 13.924 13.558 13.302 13.033 12.892 12.596 12.25 11.876 11.677 11.239 11.064 10.848 10.601 10.091 9.8 9.452 9.075 8.633 8.112 7.404 3.352 -8 ,21784 ,KEBNE ,17023568,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:03:18 CET,0.0 2.539 3.275 3.736 4.1 4.433 4.748 5.038 5.525 5.738 5.933 6.11 6.539 6.733 7.1 7.404 7.671 7.807 8.084 8.362 8.76 9.008 9.243 9.563 9.868 10.177 10.485 10.776 11.142 11.49 11.855 12.321 12.745 13.127 13.591 14.117 14.576 15.059 15.579 16.134 16.725 17.378 18.08 18.743 19.501 20.343 21.238 22.093 23.001 23.802 24.312 24.255 23.733 23.011 22.26 21.561 20.96 20.329 19.734 19.176 18.679 18.201 17.747 17.326 16.942 16.586 16.205 15.877 15.571 15.234 14.885 14.598 14.301 13.973 13.709 13.444 13.186 12.91 12.617 12.419 12.22 11.883 11.64 11.392 11.259 10.977 10.677 10.34 10.168 9.778 9.636 9.433 9.22 8.759 8.479 8.137 7.729 7.307 6.737 5.891 3.413 -9 ,17925 ,KEBNE ,17023569,Wed Dec 22 08:15:57 CET,Wed Dec 22 10:03:55 CET,0.0 2.729 3.421 3.982 4.393 4.73 5.054 5.348 5.842 6.085 6.335 6.535 6.959 7.159 7.533 7.899 8.236 8.394 8.702 9.001 9.422 9.691 9.966 10.359 10.725 11.063 11.383 11.678 12.059 12.427 12.765 13.166 13.542 13.911 14.339 14.769 15.168 15.631 16.139 16.674 17.217 17.822 18.524 19.222 19.997 20.801 21.626 22.523 23.499 24.416 24.88 24.547 24.067 23.456 22.8 22.124 21.433 20.811 20.229 19.571 18.986 18.457 17.957 17.502 17.06 16.646 16.229 15.841 15.489 15.113 14.698 14.358 14.019 13.649 13.335 13.0 12.655 12.27 11.856 11.584 11.305 10.845 10.529 10.212 10.04 9.7 9.379 9.038 8.857 8.429 8.242 8.044 7.827 7.326 7.047 6.741 6.393 6.0 5.482 4.734 2.551 -10 ,1494 ,KEBNE ,17023570,Wed Dec 22 08:15:58 CET,Wed Dec 22 10:02:58 CET,0.0 3.626 4.393 4.879 5.291 5.674 5.978 6.254 6.769 6.984 7.19 7.357 7.747 7.918 8.256 8.565 8.868 9.019 9.312 9.582 9.989 10.259 10.499 10.83 11.141 11.454 11.752 12.058 12.478 12.857 13.217 13.643 14.031 14.409 14.859 15.343 15.788 16.274 16.81 17.368 17.95 18.607 19.317 20.029 20.816 21.58 22.432 23.359 24.248 25.077 25.614 25.247 24.408 23.474 22.619 21.784 21.002 20.311 19.648 18.933 18.35 17.823 17.27 16.752 16.298 15.859 15.368 14.904 14.502 14.083 13.648 13.282 12.904 12.513 12.197 11.874 11.545 11.204 10.847 10.591 10.328 9.914 9.626 9.318 9.155 8.821 8.463 8.091 7.899 7.459 7.235 7.013 6.771 6.227 5.908 5.573 5.231 4.839 4.311 3.543 0.966 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt deleted file mode 100644 index cdf2768a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9752 ,KEBNE ,16656838,Mon Nov 22 23:56:19 CET,Tue Nov 23 01:39:50 CET,0.0 0.834 1.092 1.328 1.538 1.719 1.895 2.066 2.357 2.514 2.654 2.684 3.043 3.16 3.369 3.579 3.775 3.873 4.078 4.268 4.535 4.707 4.875 5.12 5.356 5.584 5.787 5.993 6.265 6.515 6.76 7.067 7.364 7.644 7.964 8.312 8.637 8.982 9.385 9.829 10.279 10.764 11.301 11.811 12.377 13.02 13.716 14.445 15.251 15.93 16.342 16.237 15.809 15.26 14.661 14.044 13.449 12.868 12.328 11.794 11.304 10.84 10.414 10.023 9.665 9.334 8.962 8.605 8.3 8.017 7.747 7.504 7.219 6.925 6.696 6.459 6.229 5.976 5.707 5.528 5.337 5.035 4.817 4.589 4.474 4.257 4.022 3.759 3.623 3.259 3.173 2.994 2.804 2.35 2.119 1.879 1.59 1.232 0.849 0.432 -1.204 -2 ,13334 ,KEBNE ,16656839,Mon Nov 22 23:57:22 CET,Tue Nov 23 01:42:43 CET,0.0 0.375 0.635 0.88 1.079 1.291 1.493 1.664 1.973 2.108 2.243 2.27 2.605 2.71 2.921 3.137 3.347 3.45 3.654 3.856 4.157 4.34 4.507 4.75 4.972 5.188 5.395 5.585 5.821 6.07 6.332 6.636 6.92 7.191 7.497 7.844 8.192 8.565 8.928 9.302 9.699 10.14 10.646 11.123 11.675 12.302 12.902 13.488 14.082 14.636 15.06 14.789 14.215 13.663 13.119 12.508 11.909 11.341 10.832 10.288 9.796 9.354 8.919 8.521 8.153 7.815 7.456 7.136 6.841 6.497 6.159 5.887 5.609 5.335 5.106 4.862 4.623 4.394 4.14 3.948 3.757 3.468 3.25 3.02 2.912 2.675 2.426 2.176 2.038 1.658 1.547 1.367 1.182 0.793 0.592 0.36 0.075 -0.238 -0.581 -1.008 -2.631 -3 ,30593 ,KEBNE ,16656840,Mon Nov 22 23:57:22 CET,Tue Nov 23 01:39:59 CET,0.0 1.09 1.429 1.698 1.933 2.16 2.365 2.555 2.911 3.075 3.218 3.244 3.582 3.701 3.937 4.152 4.362 4.462 4.637 4.817 5.098 5.288 5.462 5.692 5.913 6.124 6.345 6.544 6.781 7.015 7.247 7.544 7.831 8.101 8.41 8.758 9.062 9.382 9.728 10.08 10.469 10.922 11.433 11.933 12.48 13.009 13.56 14.18 14.918 15.594 15.89 15.638 15.143 14.468 13.764 13.184 12.647 12.135 11.697 11.257 10.855 10.47 10.079 9.684 9.307 8.947 8.568 8.247 7.974 7.687 7.365 7.08 6.812 6.554 6.333 6.091 5.835 5.58 5.321 5.124 4.925 4.629 4.411 4.177 4.051 3.793 3.538 3.274 3.138 2.781 2.736 2.599 2.439 2.094 1.876 1.627 1.337 0.98 0.6 0.144 -1.298 -4 ,26935 ,KEBNE ,16656841,Mon Nov 22 23:57:22 CET,Tue Nov 23 01:41:01 CET,0.0 0.696 1.012 1.255 1.505 1.751 1.95 2.124 2.434 2.572 2.714 2.767 3.111 3.23 3.461 3.672 3.882 3.984 4.179 4.369 4.621 4.776 4.941 5.183 5.407 5.626 5.841 6.053 6.318 6.563 6.798 7.069 7.32 7.571 7.861 8.182 8.496 8.832 9.207 9.619 10.03 10.471 10.973 11.485 12.074 12.684 13.304 13.953 14.598 15.206 15.611 15.455 15.005 14.416 13.858 13.297 12.739 12.187 11.665 11.115 10.629 10.192 9.776 9.377 9.009 8.656 8.291 7.984 7.714 7.423 7.129 6.88 6.617 6.336 6.109 5.888 5.659 5.419 5.149 4.961 4.776 4.474 4.267 4.045 3.923 3.681 3.427 3.156 3.02 2.635 2.498 2.322 2.147 1.711 1.46 1.213 0.937 0.638 0.276 -0.203 -1.896 -5 ,6301 ,KEBNE ,16656842,Mon Nov 22 23:58:24 CET,Tue Nov 23 01:41:46 CET,0.0 0.613 0.978 1.232 1.454 1.657 1.86 2.047 2.362 2.506 2.644 2.66 3.003 3.115 3.321 3.519 3.712 3.81 3.999 4.167 4.423 4.6 4.766 5.0 5.242 5.473 5.689 5.914 6.188 6.439 6.684 6.974 7.253 7.52 7.83 8.169 8.473 8.808 9.174 9.535 9.905 10.368 10.921 11.443 11.991 12.532 13.088 13.658 14.288 14.914 15.211 14.861 14.278 13.648 13.054 12.455 11.843 11.295 10.815 10.302 9.878 9.485 9.092 8.741 8.403 8.063 7.686 7.356 7.069 6.769 6.461 6.19 5.91 5.629 5.425 5.214 4.978 4.726 4.462 4.28 4.094 3.809 3.61 3.395 3.284 3.049 2.803 2.559 2.423 2.045 1.953 1.795 1.617 1.22 1.014 0.787 0.523 0.251 -0.08 -0.518 -1.385 -6 ,12687 ,KEBNE ,16656843,Mon Nov 22 23:58:25 CET,Tue Nov 23 01:41:32 CET,0.0 1.27 1.627 1.875 2.088 2.298 2.491 2.668 3.012 3.164 3.301 3.351 3.71 3.835 4.084 4.31 4.516 4.612 4.8 4.985 5.255 5.423 5.592 5.845 6.084 6.319 6.532 6.722 6.985 7.246 7.484 7.771 8.047 8.304 8.604 8.936 9.256 9.614 9.994 10.373 10.768 11.241 11.796 12.313 12.862 13.44 14.063 14.68 15.212 15.639 15.97 15.865 15.337 14.686 14.058 13.409 12.831 12.319 11.835 11.315 10.858 10.451 10.06 9.695 9.374 9.066 8.697 8.37 8.106 7.828 7.532 7.277 7.001 6.74 6.543 6.322 6.074 5.809 5.54 5.35 5.149 4.833 4.606 4.363 4.245 4.014 3.758 3.471 3.326 2.959 2.867 2.694 2.507 2.089 1.86 1.601 1.297 0.932 0.493 -0.075 -1.284 -7 ,3020 ,KEBNE ,16656844,Mon Nov 22 23:58:24 CET,Tue Nov 23 01:41:05 CET,0.0 1.301 1.642 1.893 2.083 2.24 2.397 2.56 2.837 2.977 3.116 3.141 3.477 3.587 3.807 4.014 4.206 4.301 4.486 4.659 4.921 5.104 5.286 5.541 5.778 5.997 6.202 6.39 6.629 6.877 7.118 7.394 7.66 7.927 8.229 8.567 8.885 9.228 9.635 10.056 10.464 10.912 11.405 11.906 12.497 13.114 13.766 14.403 15.044 15.634 15.846 15.486 14.99 14.44 13.853 13.244 12.678 12.162 11.715 11.242 10.823 10.415 9.993 9.608 9.23 8.893 8.537 8.196 7.91 7.616 7.277 6.975 6.693 6.408 6.177 5.949 5.702 5.438 5.181 5.005 4.81 4.511 4.303 4.08 3.966 3.728 3.473 3.202 3.061 2.679 2.609 2.452 2.272 1.871 1.652 1.416 1.144 0.853 0.481 -0.039 -2.079 -8 ,3504 ,KEBNE ,16656845,Tue Nov 23 00:00:30 CET,Tue Nov 23 01:45:06 CET,0.0 1.043 1.387 1.661 1.886 2.091 2.267 2.412 2.703 2.864 3.012 3.06 3.408 3.523 3.737 3.938 4.134 4.233 4.428 4.622 4.905 5.082 5.243 5.464 5.669 5.866 6.067 6.27 6.53 6.773 7.006 7.294 7.574 7.839 8.145 8.489 8.803 9.156 9.558 9.988 10.427 10.878 11.399 11.952 12.535 13.126 13.806 14.529 15.233 15.846 16.324 16.206 15.692 15.137 14.597 14.036 13.453 12.879 12.403 11.905 11.47 11.102 10.748 10.399 10.054 9.75 9.444 9.162 8.912 8.612 8.289 8.048 7.802 7.523 7.29 7.063 6.841 6.599 6.335 6.147 5.961 5.682 5.474 5.247 5.138 4.915 4.632 4.321 4.166 3.799 3.742 3.591 3.432 3.062 2.866 2.674 2.468 2.227 1.928 1.497 -0.394 -9 ,3042 ,KEBNE ,16656846,Tue Nov 23 00:03:37 CET,Tue Nov 23 01:48:19 CET,0.0 0.78 1.152 1.443 1.701 1.9 2.057 2.214 2.533 2.688 2.83 2.868 3.218 3.334 3.571 3.811 4.028 4.132 4.328 4.5 4.746 4.909 5.072 5.312 5.53 5.732 5.946 6.165 6.442 6.706 6.954 7.246 7.518 7.795 8.127 8.486 8.818 9.165 9.544 9.938 10.318 10.74 11.266 11.804 12.389 12.986 13.633 14.278 14.894 15.467 15.849 15.69 15.257 14.703 14.096 13.499 12.969 12.414 11.873 11.342 10.854 10.395 9.948 9.523 9.141 8.782 8.401 8.064 7.778 7.48 7.157 6.888 6.623 6.345 6.104 5.848 5.594 5.339 5.078 4.898 4.7 4.389 4.185 3.983 3.883 3.654 3.393 3.127 2.991 2.629 2.537 2.365 2.193 1.799 1.573 1.327 1.071 0.783 0.468 0.101 -1.25 -10 ,18574 ,KEBNE ,16656847,Tue Nov 23 00:05:42 CET,Tue Nov 23 01:47:46 CET,0.0 0.886 1.231 1.521 1.754 1.937 2.122 2.299 2.616 2.764 2.894 2.91 3.263 3.39 3.619 3.816 4.002 4.098 4.281 4.452 4.712 4.885 5.055 5.304 5.55 5.781 5.997 6.218 6.485 6.727 6.97 7.266 7.54 7.793 8.089 8.415 8.718 9.076 9.466 9.877 10.318 10.79 11.312 11.811 12.335 12.877 13.493 14.14 14.78 15.245 15.426 15.172 14.648 14.046 13.474 12.906 12.356 11.832 11.362 10.912 10.527 10.155 9.778 9.422 9.077 8.724 8.32 7.981 7.72 7.449 7.156 6.902 6.629 6.329 6.088 5.848 5.594 5.327 5.051 4.86 4.668 4.361 4.129 3.887 3.769 3.523 3.272 3.006 2.853 2.458 2.356 2.183 1.993 1.577 1.349 1.105 0.846 0.553 0.2 -0.294 -2.359 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 5256fa3a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11786 ,KEBNE ,16656848,Tue Nov 23 00:07:50 CET,Tue Nov 23 01:54:38 CET,0.0 0.595 0.995 1.333 1.655 1.974 2.275 2.808 3.057 3.289 3.515 3.864 4.023 4.319 4.586 4.852 4.982 5.225 5.464 5.806 6.015 6.226 6.543 6.828 7.11 7.366 7.589 7.892 8.201 8.492 8.847 9.191 9.509 9.877 10.288 10.664 11.072 11.508 11.955 12.431 12.963 13.536 14.057 14.641 15.23 15.773 16.261 16.668 16.944 16.738 15.664 14.194 12.614 11.231 9.927 8.711 7.588 6.623 5.618 4.703 3.899 3.105 2.356 1.698 1.083 0.416 -0.167 -0.654 -1.176 -1.75 -2.228 -2.729 -3.245 -3.63 -4.034 -4.463 -4.894 -5.371 -5.713 -6.039 -6.56 -6.918 -7.289 -7.493 -7.919 -8.362 -8.834 -9.084 -9.539 -9.888 -10.178 -10.475 -11.123 -11.481 -11.852 -12.25 -12.768 -13.448 -14.445 -2 ,20276 ,KEBNE ,16656849,Tue Nov 23 00:12:00 CET,Tue Nov 23 01:53:06 CET,0.0 0.524 0.938 1.247 1.541 1.841 2.114 2.657 2.91 3.143 3.368 3.707 3.864 4.156 4.467 4.781 4.925 5.2 5.467 5.849 6.086 6.311 6.629 6.941 7.235 7.496 7.754 8.081 8.375 8.677 9.025 9.33 9.638 10.014 10.425 10.783 11.15 11.538 11.955 12.39 12.866 13.396 13.933 14.498 15.071 15.718 16.391 16.969 17.196 16.733 15.478 14.193 12.906 11.742 10.613 9.498 8.439 7.528 6.609 5.8 5.086 4.415 3.77 3.129 2.513 1.862 1.298 0.822 0.328 -0.203 -0.686 -1.21 -1.734 -2.12 -2.509 -2.915 -3.338 -3.78 -4.104 -4.444 -4.952 -5.302 -5.663 -5.855 -6.281 -6.75 -7.239 -7.495 -7.947 -8.299 -8.6 -8.907 -9.587 -9.957 -10.349 -10.8 -11.32 -11.95 -12.87 -3 ,31334 ,KEBNE ,16656850,Tue Nov 23 00:13:03 CET,Tue Nov 23 01:53:17 CET,0.0 0.683 1.126 1.508 1.85 2.129 2.379 2.856 3.065 3.265 3.457 3.797 3.951 4.26 4.578 4.9 5.055 5.332 5.58 5.934 6.169 6.393 6.702 6.997 7.274 7.53 7.779 8.116 8.433 8.719 9.053 9.375 9.697 10.057 10.462 10.888 11.362 11.85 12.337 12.84 13.412 14.018 14.588 15.272 15.935 16.512 17.048 17.518 17.6 16.924 15.681 14.331 12.971 11.67 10.433 9.311 8.294 7.378 6.461 5.627 4.849 4.124 3.45 2.833 2.273 1.65 1.078 0.599 0.082 -0.437 -0.871 -1.361 -1.864 -2.239 -2.648 -3.088 -3.529 -3.972 -4.274 -4.593 -5.096 -5.453 -5.81 -5.984 -6.362 -6.783 -7.218 -7.442 -7.871 -8.163 -8.425 -8.719 -9.344 -9.704 -10.107 -10.533 -11.012 -11.638 -12.478 -4 ,17749 ,KEBNE ,16656851,Tue Nov 23 00:14:06 CET,Tue Nov 23 01:55:45 CET,0.0 0.611 1.098 1.508 1.848 2.125 2.384 2.91 3.144 3.348 3.618 3.997 4.161 4.47 4.754 5.02 5.153 5.429 5.687 6.043 6.277 6.5 6.822 7.106 7.379 7.654 7.916 8.233 8.541 8.839 9.191 9.547 9.869 10.217 10.614 10.987 11.377 11.786 12.196 12.603 13.045 13.561 14.037 14.531 15.065 15.607 16.034 16.343 16.506 16.179 14.813 13.261 11.859 10.627 9.506 8.421 7.453 6.66 5.829 5.092 4.443 3.798 3.174 2.587 2.011 1.405 0.88 0.416 -0.05 -0.535 -0.96 -1.403 -1.883 -2.264 -2.662 -3.049 -3.415 -3.799 -4.074 -4.356 -4.795 -5.101 -5.428 -5.612 -6.004 -6.408 -6.835 -7.069 -7.502 -7.8 -8.063 -8.351 -8.946 -9.27 -9.633 -10.034 -10.478 -11.02 -11.809 -5 ,13912 ,KEBNE ,16656852,Tue Nov 23 00:15:09 CET,Tue Nov 23 01:57:40 CET,0.0 0.454 0.824 1.109 1.376 1.638 1.852 2.219 2.378 2.533 2.649 2.946 3.065 3.305 3.527 3.743 3.846 4.036 4.231 4.494 4.64 4.778 4.998 5.225 5.434 5.631 5.814 6.04 6.261 6.48 6.747 7.005 7.255 7.519 7.794 8.04 8.307 8.614 8.928 9.194 9.483 9.833 10.128 10.412 10.662 10.93 11.181 11.246 10.927 9.755 7.862 6.124 4.399 2.773 1.369 0.169 -0.972 -1.961 -2.973 -3.838 -4.604 -5.37 -6.086 -6.741 -7.343 -7.995 -8.576 -9.078 -9.602 -10.148 -10.622 -11.105 -11.582 -11.957 -12.343 -12.733 -13.158 -13.61 -13.917 -14.243 -14.765 -15.12 -15.513 -15.728 -16.145 -16.572 -17.049 -17.305 -17.779 -18.16 -18.464 -18.803 -19.512 -19.908 -20.327 -20.804 -21.34 -21.92 -22.677 -6 ,18094 ,KEBNE ,16656853,Tue Nov 23 00:16:11 CET,Tue Nov 23 01:57:39 CET,0.0 0.436 0.8 1.195 1.546 1.855 2.157 2.675 2.884 3.1 3.318 3.672 3.85 4.206 4.547 4.858 5.003 5.274 5.551 5.967 6.223 6.47 6.818 7.109 7.383 7.649 7.89 8.21 8.508 8.795 9.153 9.496 9.81 10.157 10.561 10.931 11.305 11.713 12.153 12.619 13.133 13.682 14.18 14.689 15.187 15.681 16.113 16.497 16.614 16.01 14.76 13.369 11.997 10.715 9.533 8.457 7.438 6.549 5.651 4.837 4.129 3.476 2.846 2.253 1.704 1.143 0.618 0.136 -0.342 -0.836 -1.254 -1.674 -2.089 -2.417 -2.788 -3.172 -3.559 -3.983 -4.284 -4.577 -5.06 -5.418 -5.763 -5.935 -6.306 -6.692 -7.125 -7.367 -7.792 -8.108 -8.382 -8.657 -9.275 -9.6 -9.941 -10.306 -10.757 -11.331 -12.085 -7 ,25424 ,KEBNE ,16656854,Tue Nov 23 00:16:11 CET,Tue Nov 23 01:57:36 CET,0.0 0.638 1.076 1.436 1.752 2.048 2.321 2.823 3.06 3.286 3.506 3.861 4.035 4.336 4.609 4.87 5.0 5.251 5.479 5.813 6.032 6.241 6.535 6.839 7.136 7.396 7.645 7.964 8.263 8.548 8.893 9.222 9.523 9.857 10.237 10.628 11.028 11.416 11.843 12.272 12.711 13.234 13.724 14.245 14.826 15.445 16.001 16.396 16.586 16.067 14.625 13.003 11.505 10.3 9.262 8.223 7.19 6.327 5.441 4.7 4.072 3.419 2.792 2.242 1.706 1.13 0.635 0.208 -0.281 -0.801 -1.205 -1.631 -2.081 -2.427 -2.785 -3.168 -3.565 -3.989 -4.286 -4.57 -5.008 -5.33 -5.679 -5.855 -6.217 -6.604 -7.002 -7.209 -7.631 -7.906 -8.155 -8.418 -8.971 -9.333 -9.767 -10.219 -10.728 -11.312 -12.113 -8 ,7157 ,KEBNE ,16656855,Tue Nov 23 00:16:12 CET,Tue Nov 23 02:04:06 CET,0.0 0.475 0.857 1.192 1.478 1.762 2.044 2.518 2.719 2.912 3.105 3.445 3.591 3.875 4.167 4.456 4.592 4.859 5.107 5.454 5.679 5.896 6.2 6.479 6.752 7.011 7.262 7.605 7.943 8.266 8.657 9.015 9.345 9.735 10.147 10.494 10.859 11.256 11.653 12.059 12.514 13.036 13.542 14.069 14.601 15.146 15.661 16.103 16.32 15.96 14.859 13.509 12.21 11.03 9.868 8.792 7.824 6.998 6.155 5.448 4.819 4.176 3.527 2.905 2.361 1.793 1.287 0.857 0.418 -0.02 -0.426 -0.876 -1.324 -1.674 -2.041 -2.428 -2.842 -3.292 -3.607 -3.92 -4.391 -4.727 -5.091 -5.288 -5.717 -6.184 -6.686 -6.936 -7.375 -7.741 -8.021 -8.305 -8.899 -9.247 -9.656 -10.071 -10.556 -11.198 -12.115 -9 ,22728 ,KEBNE ,16656856,Tue Nov 23 00:17:14 CET,Tue Nov 23 01:58:43 CET,0.0 0.647 1.112 1.515 1.858 2.151 2.416 2.897 3.112 3.319 3.537 3.896 4.073 4.459 4.828 5.102 5.227 5.481 5.741 6.139 6.377 6.599 6.921 7.206 7.476 7.744 8.005 8.32 8.607 8.915 9.282 9.6 9.908 10.272 10.654 11.011 11.407 11.836 12.275 12.715 13.207 13.739 14.25 14.834 15.416 15.977 16.484 16.796 16.775 16.196 15.045 13.756 12.405 11.081 9.747 8.493 7.376 6.414 5.426 4.574 3.81 3.064 2.368 1.734 1.131 0.512 -0.054 -0.565 -1.098 -1.664 -2.135 -2.625 -3.112 -3.486 -3.902 -4.33 -4.749 -5.181 -5.482 -5.789 -6.284 -6.643 -7.004 -7.181 -7.548 -7.958 -8.398 -8.626 -9.048 -9.36 -9.632 -9.921 -10.534 -10.863 -11.287 -11.761 -12.288 -12.928 -13.753 -10 ,9898 ,KEBNE ,16656857,Tue Nov 23 00:18:16 CET,Tue Nov 23 02:00:50 CET,0.0 0.633 1.102 1.542 1.926 2.219 2.477 2.951 3.161 3.358 3.561 3.913 4.08 4.401 4.699 4.98 5.109 5.364 5.608 5.941 6.145 6.347 6.649 6.934 7.216 7.477 7.727 8.053 8.353 8.642 9.006 9.344 9.654 9.994 10.366 10.724 11.094 11.492 11.911 12.331 12.805 13.344 13.842 14.346 14.829 15.342 15.835 16.268 16.5 16.104 14.923 13.5 12.192 10.949 9.721 8.675 7.728 6.859 5.976 5.207 4.514 3.839 3.178 2.564 2.008 1.442 0.922 0.46 -0.049 -0.577 -0.972 -1.392 -1.848 -2.206 -2.584 -2.98 -3.39 -3.83 -4.141 -4.469 -4.984 -5.338 -5.702 -5.902 -6.329 -6.772 -7.232 -7.456 -7.88 -8.166 -8.434 -8.704 -9.238 -9.553 -9.932 -10.366 -10.849 -11.407 -12.126 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index 6f1c9e50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18823 ,KEBNE ,16656858,Tue Nov 23 00:18:16 CET,Tue Nov 23 02:01:16 CET,0.0 1.854 2.345 2.7 2.997 3.267 3.525 3.779 4.253 4.462 4.651 4.816 5.152 5.308 5.601 5.878 6.16 6.299 6.564 6.84 7.233 7.45 7.653 7.937 8.205 8.473 8.752 9.019 9.342 9.694 10.053 10.449 10.843 11.226 11.666 12.151 12.585 13.036 13.506 13.993 14.485 15.022 15.656 16.307 17.061 17.893 18.808 19.757 20.731 21.686 22.386 22.418 22.182 21.782 21.328 20.85 20.352 19.819 19.291 18.753 18.301 17.91 17.546 17.184 16.823 16.494 16.14 15.82 15.54 15.245 14.954 14.697 14.399 14.094 13.862 13.616 13.361 13.11 12.843 12.643 12.434 12.118 11.895 11.647 11.524 11.273 10.997 10.689 10.535 10.189 9.997 9.801 9.596 9.162 8.946 8.705 8.402 8.049 7.627 7.0 4.298 -4 ,5037 ,KEBNE ,16656861,Tue Nov 23 00:22:27 CET,Tue Nov 23 02:08:03 CET,0.0 2.181 2.615 2.953 3.286 3.574 3.855 4.126 4.568 4.741 4.886 4.991 5.296 5.426 5.689 5.92 6.151 6.278 6.543 6.813 7.213 7.463 7.715 8.074 8.411 8.731 9.016 9.312 9.702 10.042 10.352 10.698 11.032 11.368 11.748 12.169 12.569 12.989 13.436 13.914 14.407 14.974 15.618 16.26 17.01 17.787 18.629 19.541 20.495 21.337 21.946 22.01 21.603 21.01 20.424 19.836 19.199 18.553 17.956 17.319 16.793 16.338 15.883 15.437 15.013 14.627 14.223 13.867 13.575 13.276 12.966 12.711 12.442 12.152 11.921 11.665 11.397 11.137 10.866 10.68 10.484 10.168 9.943 9.701 9.557 9.254 8.953 8.639 8.472 8.105 7.864 7.646 7.439 6.984 6.722 6.452 6.158 5.777 5.326 4.836 2.373 -5 ,3180 ,KEBNE ,16656862,Tue Nov 23 00:23:30 CET,Tue Nov 23 02:05:26 CET,0.0 1.304 1.791 2.192 2.538 2.877 3.211 3.522 4.086 4.351 4.621 4.902 5.247 5.405 5.716 6.028 6.302 6.434 6.709 6.979 7.392 7.638 7.864 8.204 8.517 8.811 9.099 9.372 9.705 10.029 10.334 10.688 11.031 11.35 11.733 12.16 12.546 12.969 13.417 13.896 14.41 14.989 15.636 16.253 16.977 17.787 18.688 19.667 20.716 21.762 22.618 22.815 22.563 22.116 21.589 21.045 20.549 20.074 19.639 19.156 18.683 18.255 17.837 17.453 17.092 16.728 16.356 16.031 15.741 15.441 15.109 14.824 14.532 14.224 13.968 13.711 13.465 13.198 12.918 12.731 12.539 12.24 12.032 11.797 11.668 11.418 11.171 10.908 10.762 10.427 10.279 10.108 9.917 9.524 9.327 9.087 8.785 8.462 8.092 7.432 3.001 -7 ,2954 ,KEBNE ,16656864,Tue Nov 23 00:29:46 CET,Tue Nov 23 02:10:44 CET,0.0 1.904 2.292 2.593 2.848 3.053 3.242 3.422 3.769 3.932 4.075 4.179 4.486 4.604 4.827 5.036 5.234 5.331 5.525 5.706 5.98 6.16 6.321 6.543 6.764 7.008 7.247 7.455 7.697 7.919 8.151 8.45 8.71 8.945 9.231 9.549 9.838 10.157 10.504 10.859 11.219 11.629 12.129 12.606 13.101 13.593 14.112 14.667 15.234 15.716 15.863 15.455 14.78 14.033 13.353 12.718 12.106 11.534 11.014 10.459 9.997 9.552 9.068 8.596 8.179 7.78 7.361 7.006 6.664 6.285 5.898 5.603 5.306 4.979 4.72 4.45 4.181 3.914 3.622 3.401 3.17 2.813 2.575 2.332 2.198 1.936 1.682 1.38 1.218 0.881 0.75 0.578 0.378 -0.111 -0.368 -0.63 -0.945 -1.324 -1.765 -2.354 -5.166 -8 ,5704 ,KEBNE ,16656865,Tue Nov 23 00:30:48 CET,Tue Nov 23 02:13:56 CET,0.0 1.701 2.135 2.486 2.785 3.07 3.347 3.59 4.002 4.191 4.383 4.576 4.934 5.104 5.425 5.738 6.044 6.19 6.458 6.717 7.075 7.296 7.507 7.802 8.111 8.411 8.682 8.962 9.327 9.666 10.007 10.397 10.754 11.104 11.522 12.003 12.464 12.969 13.507 14.081 14.688 15.354 16.096 16.805 17.627 18.464 19.316 20.175 21.042 21.999 22.719 22.601 22.164 21.633 20.995 20.316 19.681 19.096 18.514 17.834 17.252 16.746 16.268 15.824 15.431 15.082 14.711 14.379 14.079 13.755 13.427 13.169 12.889 12.592 12.369 12.141 11.884 11.616 11.359 11.175 10.954 10.617 10.398 10.175 10.065 9.816 9.539 9.24 9.078 8.732 8.541 8.347 8.15 7.696 7.458 7.218 6.932 6.619 6.248 5.729 -0.617 -9 ,26780 ,KEBNE ,16656866,Tue Nov 23 00:32:54 CET,Tue Nov 23 02:15:16 CET,0.0 2.605 3.077 3.473 3.834 4.116 4.359 4.615 5.047 5.224 5.404 5.576 5.92 6.088 6.424 6.734 6.996 7.132 7.422 7.686 8.05 8.28 8.502 8.814 9.108 9.405 9.678 9.931 10.262 10.593 10.939 11.365 11.787 12.193 12.655 13.175 13.657 14.182 14.744 15.36 16.017 16.743 17.571 18.395 19.307 20.209 21.149 22.168 23.272 24.329 25.089 25.131 24.814 24.323 23.736 23.103 22.503 21.933 21.435 20.875 20.356 19.892 19.454 19.047 18.633 18.262 17.891 17.542 17.225 16.904 16.565 16.266 15.948 15.61 15.35 15.085 14.818 14.532 14.217 14.003 13.79 13.48 13.258 13.02 12.891 12.617 12.322 12.005 11.833 11.476 11.314 11.133 10.931 10.449 10.172 9.847 9.499 9.106 8.56 7.817 4.156 -10 ,16388 ,KEBNE ,16656867,Tue Nov 23 00:32:54 CET,Tue Nov 23 02:13:48 CET,0.0 1.805 2.146 2.393 2.646 2.874 3.073 3.257 3.569 3.709 3.853 3.949 4.26 4.39 4.637 4.871 5.095 5.199 5.388 5.564 5.81 5.971 6.131 6.347 6.559 6.766 6.942 7.127 7.363 7.574 7.787 8.044 8.287 8.509 8.759 9.041 9.318 9.601 9.889 10.182 10.485 10.83 11.23 11.623 12.054 12.495 12.995 13.542 14.015 14.378 14.42 13.917 13.314 12.624 11.912 11.241 10.636 10.081 9.576 9.076 8.631 8.196 7.779 7.383 7.016 6.679 6.305 5.921 5.57 5.225 4.872 4.581 4.291 3.973 3.713 3.441 3.158 2.884 2.576 2.34 2.106 1.753 1.503 1.25 1.119 0.85 0.584 0.271 0.096 -0.261 -0.433 -0.623 -0.834 -1.28 -1.509 -1.734 -2.011 -2.42 -2.92 -3.567 -7.462 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index c556c41f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7815 ,KEBNE ,16656868,Tue Nov 23 00:32:54 CET,Tue Nov 23 02:13:35 CET,0.0 9.42 9.95 10.286 10.541 10.796 11.052 11.276 11.715 11.919 12.091 12.199 12.515 12.66 12.984 13.279 13.53 13.65 13.912 14.151 14.452 14.652 14.839 15.124 15.411 15.673 15.925 16.175 16.514 16.833 17.121 17.475 17.82 18.165 18.575 19.022 19.463 19.947 20.44 20.986 21.566 22.234 23.038 23.823 24.739 25.764 26.925 28.22 29.661 31.209 33.004 34.358 34.858 34.933 34.831 34.617 34.373 34.097 33.83 33.521 33.225 32.905 32.538 32.203 31.916 31.679 31.427 31.179 30.949 30.705 30.438 30.219 29.992 29.73 29.524 29.315 29.098 28.877 28.636 28.459 28.267 27.952 27.747 27.543 27.436 27.208 26.917 26.584 26.411 26.059 25.888 25.728 25.556 25.13 24.855 24.569 24.254 23.873 23.387 22.752 13.043 -2 ,18156 ,KEBNE ,16656869,Tue Nov 23 00:36:00 CET,Tue Nov 23 02:18:33 CET,0.0 3.371 3.787 4.034 4.269 4.533 4.75 4.934 5.281 5.434 5.578 5.694 6.011 6.141 6.399 6.648 6.903 7.026 7.252 7.479 7.801 8.005 8.204 8.488 8.789 9.099 9.405 9.692 10.026 10.32 10.6 10.952 11.293 11.64 12.054 12.507 12.949 13.416 13.893 14.399 14.948 15.587 16.339 17.1 17.994 19.028 20.187 21.39 22.724 24.318 26.267 27.621 28.183 28.272 28.149 27.987 27.81 27.583 27.311 27.01 26.71 26.407 26.106 25.79 25.489 25.219 24.915 24.633 24.377 24.106 23.824 23.585 23.332 23.034 22.784 22.539 22.311 22.075 21.819 21.643 21.465 21.185 20.988 20.783 20.672 20.428 20.167 19.874 19.713 19.378 19.179 18.978 18.759 18.332 18.082 17.806 17.475 17.027 16.492 15.866 12.466 -3 ,20382 ,KEBNE ,16656870,Tue Nov 23 00:38:07 CET,Tue Nov 23 02:20:24 CET,0.0 2.505 2.981 3.331 3.626 3.935 4.251 4.516 5.008 5.234 5.427 5.568 5.888 6.023 6.297 6.564 6.805 6.919 7.139 7.359 7.675 7.87 8.067 8.362 8.638 8.927 9.225 9.48 9.78 10.068 10.36 10.708 11.037 11.358 11.734 12.164 12.578 13.042 13.548 14.092 14.654 15.269 15.989 16.727 17.598 18.587 19.704 20.895 22.275 23.841 25.569 26.76 27.198 27.292 27.227 27.06 26.845 26.588 26.306 25.991 25.677 25.368 25.088 24.828 24.564 24.304 24.004 23.719 23.481 23.238 22.977 22.75 22.528 22.302 22.105 21.889 21.668 21.43 21.162 20.966 20.753 20.429 20.202 19.971 19.84 19.561 19.285 19.008 18.878 18.575 18.421 18.25 18.046 17.622 17.393 17.133 16.859 16.556 16.195 15.7 12.48 -5 ,19963 ,KEBNE ,16656872,Tue Nov 23 00:38:07 CET,Tue Nov 23 02:20:28 CET,0.0 1.468 1.867 2.159 2.431 2.666 2.868 3.045 3.404 3.578 3.741 3.896 4.251 4.427 4.71 4.952 5.186 5.294 5.507 5.719 6.027 6.219 6.417 6.714 6.982 7.238 7.489 7.736 8.07 8.39 8.693 9.067 9.423 9.768 10.164 10.596 11.019 11.483 11.993 12.54 13.098 13.73 14.493 15.235 16.095 17.073 18.225 19.518 20.87 22.366 24.096 25.203 25.632 25.79 25.788 25.68 25.5 25.244 24.942 24.608 24.33 24.069 23.778 23.496 23.212 22.92 22.609 22.348 22.131 21.889 21.617 21.384 21.158 20.938 20.754 20.546 20.329 20.094 19.821 19.626 19.437 19.15 18.919 18.679 18.567 18.316 18.053 17.774 17.62 17.303 17.112 16.914 16.722 16.3 16.078 15.829 15.553 15.213 14.76 14.177 10.905 -6 ,9135 ,KEBNE ,16656873,Tue Nov 23 00:39:10 CET,Tue Nov 23 02:20:01 CET,0.0 1.385 1.737 2.061 2.361 2.616 2.86 3.067 3.41 3.577 3.745 3.881 4.207 4.349 4.627 4.893 5.129 5.241 5.468 5.689 6.006 6.21 6.407 6.702 6.976 7.231 7.488 7.741 8.076 8.405 8.715 9.095 9.466 9.813 10.217 10.662 11.086 11.565 12.088 12.652 13.246 13.899 14.654 15.391 16.232 17.182 18.303 19.578 21.026 22.652 24.416 25.65 26.132 26.187 26.057 25.881 25.656 25.356 25.029 24.669 24.351 24.038 23.728 23.453 23.181 22.923 22.647 22.39 22.16 21.906 21.625 21.398 21.166 20.904 20.697 20.477 20.245 20.009 19.768 19.586 19.379 19.071 18.856 18.626 18.503 18.267 18.029 17.752 17.588 17.253 17.056 16.857 16.651 16.216 15.956 15.646 15.33 14.994 14.566 13.972 10.47 -7 ,8527 ,KEBNE ,16656874,Tue Nov 23 00:39:10 CET,Tue Nov 23 02:20:27 CET,0.0 1.813 2.13 2.373 2.605 2.809 2.994 3.165 3.499 3.658 3.799 3.876 4.191 4.324 4.562 4.802 5.04 5.152 5.367 5.575 5.872 6.066 6.256 6.537 6.816 7.078 7.327 7.566 7.876 8.188 8.495 8.861 9.234 9.603 9.999 10.434 10.853 11.303 11.802 12.334 12.888 13.506 14.229 14.957 15.798 16.712 17.778 19.006 20.376 21.967 23.844 25.123 25.569 25.632 25.572 25.466 25.275 25.013 24.702 24.316 23.964 23.636 23.315 23.017 22.726 22.459 22.158 21.874 21.637 21.388 21.118 20.878 20.619 20.345 20.13 19.914 19.686 19.426 19.152 18.968 18.788 18.522 18.33 18.113 17.997 17.761 17.503 17.205 17.05 16.745 16.587 16.39 16.184 15.785 15.545 15.289 15.008 14.654 14.179 13.543 10.036 -8 ,19173 ,KEBNE ,16656875,Tue Nov 23 00:41:16 CET,Tue Nov 23 02:23:27 CET,0.0 1.394 1.789 2.11 2.376 2.655 2.926 3.163 3.55 3.729 3.911 4.064 4.397 4.544 4.842 5.145 5.43 5.553 5.775 5.988 6.286 6.489 6.692 6.978 7.257 7.534 7.824 8.106 8.438 8.739 9.026 9.385 9.727 10.075 10.489 10.938 11.367 11.833 12.343 12.893 13.498 14.206 15.038 15.866 16.817 17.853 19.016 20.296 21.724 23.361 25.133 26.266 26.746 26.902 26.821 26.605 26.347 26.093 25.837 25.529 25.219 24.922 24.64 24.378 24.102 23.812 23.506 23.239 22.986 22.714 22.438 22.202 21.969 21.737 21.536 21.304 21.052 20.79 20.528 20.342 20.141 19.835 19.621 19.405 19.292 19.041 18.791 18.529 18.384 18.082 17.934 17.754 17.556 17.132 16.89 16.635 16.359 16.013 15.614 15.064 10.405 -10 ,10188 ,KEBNE ,16656877,Tue Nov 23 00:43:22 CET,Tue Nov 23 02:25:35 CET,0.0 1.586 1.932 2.19 2.443 2.706 2.942 3.141 3.506 3.669 3.824 3.956 4.282 4.418 4.665 4.917 5.158 5.268 5.477 5.694 6.013 6.197 6.375 6.632 6.891 7.164 7.429 7.693 8.033 8.354 8.67 9.055 9.413 9.755 10.163 10.634 11.089 11.567 12.076 12.615 13.175 13.784 14.508 15.267 16.146 17.132 18.236 19.462 20.948 22.736 24.831 26.26 26.874 27.086 27.03 26.895 26.698 26.448 26.185 25.822 25.517 25.28 25.016 24.71 24.439 24.191 23.913 23.642 23.393 23.116 22.801 22.556 22.303 22.051 21.859 21.632 21.369 21.096 20.801 20.587 20.39 20.125 19.93 19.711 19.603 19.376 19.124 18.867 18.736 18.436 18.292 18.101 17.902 17.509 17.245 16.958 16.682 16.264 15.74 15.216 13.07 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 8d9513a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26149 ,KEBNE ,16656878,Tue Nov 23 00:43:22 CET,Tue Nov 23 02:16:02 CET,0.0 0.734 1.185 1.601 1.96 2.227 2.475 2.966 3.192 3.408 3.672 4.006 4.175 4.48 4.747 5.008 5.135 5.371 5.615 5.986 6.207 6.414 6.735 7.056 7.359 7.65 7.937 8.297 8.62 8.939 9.34 9.722 10.07 10.452 10.869 11.251 11.658 12.098 12.56 13.038 13.592 14.249 14.885 15.61 16.345 17.06 17.777 18.503 18.969 18.729 17.607 16.079 14.491 13.111 11.835 10.601 9.423 8.372 7.328 6.437 5.617 4.809 4.034 3.321 2.659 1.936 1.29 0.739 0.162 -0.438 -0.944 -1.498 -2.073 -2.51 -2.98 -3.465 -3.939 -4.419 -4.763 -5.126 -5.705 -6.102 -6.541 -6.776 -7.242 -7.735 -8.273 -8.567 -9.022 -9.471 -9.813 -10.173 -10.961 -11.418 -11.916 -12.502 -13.228 -14.149 -15.516 -2 ,19987 ,KEBNE ,16656879,Tue Nov 23 00:43:22 CET,Tue Nov 23 02:13:12 CET,0.0 0.548 1.007 1.422 1.736 2.02 2.303 2.815 3.037 3.238 3.469 3.789 3.951 4.295 4.619 4.917 5.053 5.306 5.557 5.928 6.184 6.427 6.775 7.123 7.457 7.765 8.045 8.385 8.694 8.996 9.388 9.755 10.073 10.424 10.822 11.207 11.618 12.041 12.486 12.958 13.483 14.075 14.651 15.265 15.88 16.5 17.122 17.718 18.096 17.886 16.639 15.189 13.778 12.387 11.085 9.89 8.75 7.721 6.647 5.73 4.907 4.116 3.363 2.648 1.993 1.309 0.685 0.132 -0.44 -1.065 -1.602 -2.146 -2.71 -3.141 -3.58 -4.047 -4.546 -5.052 -5.399 -5.768 -6.376 -6.804 -7.241 -7.468 -7.949 -8.475 -9.024 -9.3 -9.749 -10.231 -10.595 -10.998 -11.879 -12.338 -12.842 -13.419 -14.042 -14.834 -15.961 -3 ,22736 ,KEBNE ,16656880,Tue Nov 23 00:43:24 CET,Tue Nov 23 02:08:20 CET,0.0 0.813 1.342 1.717 1.988 2.247 2.506 2.906 3.08 3.265 3.471 3.791 3.934 4.182 4.411 4.64 4.754 4.973 5.206 5.548 5.752 5.938 6.209 6.466 6.697 6.916 7.119 7.37 7.607 7.831 8.1 8.354 8.612 8.913 9.23 9.51 9.807 10.132 10.469 10.817 11.169 11.538 11.869 12.218 12.571 12.878 13.071 13.208 13.057 12.066 10.383 8.698 7.067 5.578 4.21 2.955 1.766 0.744 -0.303 -1.237 -2.089 -2.912 -3.666 -4.369 -5.022 -5.704 -6.32 -6.868 -7.447 -8.045 -8.541 -9.066 -9.613 -10.04 -10.488 -10.964 -11.487 -12.045 -12.415 -12.794 -13.393 -13.804 -14.241 -14.47 -14.951 -15.458 -15.995 -16.269 -16.71 -17.169 -17.492 -17.837 -18.65 -19.101 -19.579 -20.129 -20.795 -21.635 -22.748 -4 ,3670 ,KEBNE ,16656881,Tue Nov 23 00:45:27 CET,Tue Nov 23 02:14:34 CET,0.0 0.679 1.141 1.509 1.848 2.164 2.459 2.963 3.19 3.417 3.659 3.969 4.142 4.513 4.851 5.147 5.294 5.57 5.821 6.191 6.434 6.658 6.955 7.242 7.508 7.756 7.994 8.31 8.631 8.93 9.271 9.599 9.919 10.282 10.685 11.063 11.46 11.9 12.375 12.858 13.387 13.977 14.532 15.134 15.74 16.357 16.924 17.417 17.598 17.168 15.989 14.622 13.274 12.024 10.704 9.411 8.225 7.191 6.156 5.245 4.41 3.567 2.757 2.03 1.357 0.632 -0.027 -0.62 -1.236 -1.882 -2.438 -3.027 -3.614 -4.06 -4.533 -5.044 -5.581 -6.132 -6.49 -6.854 -7.455 -7.896 -8.373 -8.607 -9.077 -9.596 -10.147 -10.432 -10.903 -11.438 -11.823 -12.2 -13.04 -13.52 -14.01 -14.577 -15.297 -16.149 -17.278 -5 ,9010 ,KEBNE ,16656882,Tue Nov 23 00:45:27 CET,Tue Nov 23 02:16:50 CET,0.0 0.538 0.96 1.316 1.604 1.859 2.1 2.508 2.698 2.888 3.094 3.423 3.584 3.88 4.158 4.422 4.54 4.755 4.951 5.206 5.384 5.558 5.783 6.001 6.199 6.392 6.58 6.827 7.078 7.315 7.597 7.887 8.182 8.512 8.859 9.179 9.515 9.868 10.248 10.648 11.067 11.507 11.91 12.313 12.765 13.208 13.511 13.612 13.389 12.447 10.584 8.756 7.077 5.5 4.042 2.776 1.606 0.57 -0.478 -1.381 -2.193 -2.976 -3.735 -4.45 -5.122 -5.827 -6.452 -6.986 -7.544 -8.148 -8.655 -9.183 -9.724 -10.161 -10.629 -11.111 -11.595 -12.111 -12.479 -12.848 -13.434 -13.836 -14.28 -14.525 -15.004 -15.52 -16.086 -16.38 -16.843 -17.321 -17.678 -18.059 -18.919 -19.41 -19.941 -20.595 -21.38 -22.262 -23.448 -6 ,16323 ,KEBNE ,16656883,Tue Nov 23 00:46:30 CET,Tue Nov 23 02:18:08 CET,0.0 0.644 1.18 1.583 1.905 2.23 2.522 3.018 3.236 3.454 3.713 4.049 4.216 4.547 4.882 5.206 5.36 5.628 5.858 6.173 6.381 6.597 6.947 7.289 7.609 7.908 8.167 8.509 8.851 9.171 9.542 9.875 10.201 10.598 11.041 11.448 11.874 12.332 12.825 13.319 13.873 14.522 15.125 15.819 16.515 17.16 17.835 18.431 18.761 18.354 16.878 15.233 13.571 12.061 10.692 9.398 8.158 7.057 5.907 4.875 3.906 3.014 2.24 1.534 0.871 0.153 -0.489 -1.075 -1.691 -2.307 -2.819 -3.346 -3.891 -4.32 -4.768 -5.233 -5.731 -6.25 -6.605 -6.985 -7.59 -8.012 -8.449 -8.674 -9.16 -9.665 -10.229 -10.542 -11.014 -11.482 -11.827 -12.195 -12.971 -13.41 -13.922 -14.498 -15.167 -16.007 -17.12 -7 ,3591 ,KEBNE ,16656884,Tue Nov 23 00:46:33 CET,Tue Nov 23 02:18:17 CET,0.0 0.659 1.174 1.569 1.894 2.228 2.552 3.064 3.299 3.519 3.746 4.059 4.216 4.526 4.811 5.081 5.211 5.46 5.706 6.048 6.266 6.476 6.772 7.064 7.355 7.622 7.855 8.163 8.482 8.808 9.188 9.545 9.89 10.272 10.687 11.114 11.563 12.022 12.518 13.035 13.634 14.306 14.94 15.633 16.374 17.112 17.735 18.396 18.877 18.32 16.659 15.051 13.504 11.98 10.52 9.201 7.957 6.833 5.705 4.704 3.795 2.963 2.141 1.332 0.603 -0.154 -0.851 -1.449 -2.056 -2.713 -3.266 -3.842 -4.437 -4.905 -5.409 -5.929 -6.459 -7.033 -7.432 -7.829 -8.441 -8.865 -9.311 -9.547 -10.045 -10.575 -11.132 -11.419 -11.882 -12.348 -12.694 -13.071 -13.883 -14.321 -14.806 -15.375 -16.04 -16.813 -17.999 -8 ,4113 ,KEBNE ,16656885,Tue Nov 23 00:46:30 CET,Tue Nov 23 02:17:55 CET,0.0 0.769 1.219 1.579 1.911 2.196 2.452 2.931 3.16 3.384 3.643 3.989 4.166 4.486 4.775 5.057 5.202 5.466 5.713 6.073 6.313 6.56 6.911 7.26 7.599 7.887 8.156 8.487 8.774 9.059 9.419 9.76 10.073 10.435 10.834 11.197 11.59 11.999 12.433 12.903 13.434 14.028 14.587 15.174 15.795 16.463 17.084 17.593 17.826 17.429 16.253 14.854 13.312 11.814 10.348 9.013 7.848 6.781 5.638 4.612 3.668 2.775 1.935 1.135 0.396 -0.356 -1.049 -1.646 -2.267 -2.924 -3.456 -4.006 -4.584 -5.043 -5.53 -6.044 -6.588 -7.149 -7.542 -7.958 -8.607 -9.058 -9.538 -9.788 -10.293 -10.84 -11.446 -11.759 -12.248 -12.791 -13.18 -13.596 -14.485 -15.004 -15.584 -16.215 -16.988 -17.915 -19.146 -9 ,18933 ,KEBNE ,16656886,Tue Nov 23 00:47:32 CET,Tue Nov 23 02:16:58 CET,0.0 0.657 1.159 1.564 1.898 2.187 2.462 2.963 3.181 3.382 3.578 3.89 4.057 4.395 4.707 5.02 5.179 5.451 5.667 5.974 6.178 6.392 6.71 7.009 7.309 7.609 7.902 8.276 8.617 8.934 9.32 9.675 9.99 10.36 10.766 11.139 11.572 12.038 12.484 12.957 13.497 14.099 14.673 15.294 15.905 16.54 17.169 17.745 18.083 17.752 16.548 15.089 13.615 12.234 10.946 9.746 8.565 7.546 6.566 5.709 4.887 4.069 3.311 2.588 1.923 1.252 0.645 0.092 -0.508 -1.135 -1.65 -2.192 -2.763 -3.205 -3.671 -4.144 -4.629 -5.157 -5.537 -5.94 -6.573 -7.017 -7.487 -7.738 -8.265 -8.812 -9.384 -9.68 -10.148 -10.616 -10.978 -11.368 -12.222 -12.685 -13.16 -13.723 -14.376 -15.161 -16.229 -10 ,17488 ,KEBNE ,16656887,Tue Nov 23 00:47:36 CET,Tue Nov 23 02:16:15 CET,0.0 0.714 1.304 1.706 2.061 2.402 2.691 3.177 3.398 3.592 3.781 4.102 4.269 4.59 4.875 5.14 5.278 5.546 5.79 6.138 6.37 6.596 6.934 7.257 7.566 7.848 8.097 8.417 8.719 9.028 9.422 9.811 10.189 10.604 11.04 11.436 11.851 12.279 12.735 13.216 13.739 14.326 14.885 15.494 16.143 16.769 17.329 17.88 18.24 17.919 16.613 15.141 13.68 12.213 10.872 9.704 8.564 7.514 6.459 5.587 4.811 4.033 3.304 2.599 1.941 1.261 0.635 0.098 -0.47 -1.068 -1.564 -2.086 -2.649 -3.087 -3.524 -3.987 -4.494 -5.041 -5.411 -5.783 -6.385 -6.839 -7.315 -7.559 -8.065 -8.597 -9.146 -9.425 -9.891 -10.372 -10.707 -11.071 -11.927 -12.411 -12.957 -13.573 -14.241 -15.057 -16.316 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt deleted file mode 100644 index fdb4ae32..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,2015 ,KEBNE ,16656889,Tue Nov 23 00:49:37 CET,Tue Nov 23 02:24:55 CET,0.0 1.349 1.883 2.288 2.655 2.964 3.236 3.484 3.927 4.132 4.322 4.546 4.867 5.021 5.316 5.596 5.883 6.024 6.288 6.546 6.916 7.142 7.351 7.644 7.936 8.215 8.474 8.729 9.057 9.368 9.667 10.038 10.375 10.691 11.064 11.484 11.887 12.309 12.758 13.231 13.724 14.281 14.913 15.548 16.288 17.055 17.816 18.59 19.421 20.225 20.811 20.599 19.908 19.069 18.21 17.387 16.631 15.908 15.262 14.565 13.952 13.407 12.86 12.312 11.813 11.37 10.89 10.446 10.043 9.622 9.179 8.804 8.419 8.013 7.69 7.366 7.038 6.675 6.269 5.991 5.701 5.232 4.901 4.568 4.396 4.042 3.657 3.228 3.007 2.644 2.303 2.04 1.772 1.173 0.827 0.459 0.019 -0.513 -1.148 -2.045 -5.066 -3 ,21581 ,KEBNE ,16656890,Tue Nov 23 00:49:41 CET,Tue Nov 23 02:16:51 CET,0.0 1.622 2.083 2.467 2.765 3.04 3.295 3.531 3.965 4.167 4.374 4.612 4.948 5.119 5.411 5.682 5.944 6.067 6.306 6.54 6.892 7.133 7.356 7.651 7.939 8.22 8.474 8.705 9.0 9.315 9.634 10.005 10.369 10.714 11.098 11.524 11.925 12.364 12.839 13.342 13.865 14.453 15.148 15.862 16.648 17.446 18.329 19.326 20.365 21.316 22.088 22.145 21.601 20.825 19.998 19.21 18.493 17.783 17.113 16.436 15.845 15.269 14.692 14.146 13.638 13.135 12.593 12.136 11.738 11.315 10.867 10.482 10.09 9.69 9.36 9.017 8.67 8.298 7.912 7.659 7.397 6.971 6.66 6.335 6.164 5.791 5.409 4.989 4.765 4.406 4.082 3.83 3.548 2.917 2.578 2.21 1.814 1.333 0.651 -0.297 -3.867 -4 ,16738 ,KEBNE ,16656891,Tue Nov 23 00:50:40 CET,Tue Nov 23 02:20:47 CET,0.0 1.475 1.975 2.391 2.72 3.0 3.256 3.508 3.967 4.165 4.342 4.539 4.859 5.016 5.313 5.598 5.879 6.016 6.279 6.533 6.908 7.153 7.384 7.708 8.009 8.304 8.587 8.829 9.13 9.43 9.72 10.072 10.415 10.769 11.185 11.628 12.038 12.476 12.901 13.364 13.882 14.457 15.09 15.675 16.36 17.114 17.949 18.798 19.642 20.409 20.878 20.699 20.091 19.27 18.474 17.711 16.989 16.285 15.615 14.936 14.323 13.752 13.209 12.693 12.209 11.756 11.267 10.803 10.406 9.995 9.549 9.178 8.795 8.387 8.068 7.734 7.373 6.996 6.605 6.322 6.031 5.59 5.282 4.96 4.784 4.407 4.02 3.601 3.366 2.984 2.637 2.38 2.112 1.493 1.163 0.797 0.39 -0.066 -0.651 -1.473 -4.217 -5 ,26503 ,KEBNE ,16656892,Tue Nov 23 00:51:42 CET,Tue Nov 23 02:24:21 CET,0.0 0.97 1.488 1.899 2.222 2.528 2.821 3.086 3.51 3.68 3.86 4.069 4.388 4.56 4.883 5.176 5.451 5.585 5.852 6.103 6.448 6.688 6.914 7.205 7.479 7.747 8.015 8.264 8.575 8.884 9.185 9.547 9.893 10.219 10.598 11.016 11.405 11.824 12.279 12.747 13.217 13.734 14.359 14.971 15.666 16.45 17.241 18.054 18.891 19.637 20.16 19.893 19.189 18.374 17.509 16.664 15.866 15.092 14.459 13.794 13.166 12.609 12.068 11.542 11.065 10.625 10.131 9.695 9.319 8.907 8.454 8.08 7.695 7.289 6.967 6.641 6.306 5.932 5.529 5.247 4.963 4.527 4.23 3.927 3.768 3.433 3.062 2.661 2.458 2.105 1.768 1.505 1.22 0.588 0.237 -0.146 -0.559 -1.063 -1.678 -2.493 -5.37 -6 ,16717 ,KEBNE ,16656893,Tue Nov 23 00:51:42 CET,Tue Nov 23 02:21:52 CET,0.0 1.717 2.248 2.574 2.872 3.162 3.427 3.68 4.145 4.351 4.528 4.698 5.009 5.157 5.438 5.729 6.0 6.125 6.369 6.599 6.925 7.149 7.374 7.667 7.938 8.215 8.499 8.774 9.096 9.385 9.674 10.041 10.41 10.757 11.151 11.589 12.002 12.459 12.92 13.38 13.867 14.445 15.092 15.683 16.367 17.11 17.911 18.74 19.585 20.324 20.685 20.412 19.791 19.001 18.219 17.421 16.616 15.829 15.113 14.373 13.699 13.084 12.503 11.941 11.409 10.913 10.368 9.854 9.423 8.983 8.494 8.081 7.659 7.212 6.857 6.47 6.063 5.652 5.223 4.923 4.614 4.11 3.745 3.379 3.196 2.804 2.374 1.933 1.714 1.325 0.882 0.572 0.274 -0.355 -0.734 -1.172 -1.646 -2.14 -2.702 -3.546 -6.885 -7 ,31980 ,KEBNE ,16656894,Tue Nov 23 00:51:42 CET,Tue Nov 23 02:22:23 CET,0.0 1.459 1.976 2.319 2.629 2.912 3.178 3.412 3.844 4.055 4.244 4.429 4.742 4.886 5.169 5.45 5.728 5.862 6.099 6.314 6.639 6.858 7.061 7.339 7.616 7.896 8.163 8.43 8.771 9.067 9.359 9.727 10.082 10.434 10.828 11.249 11.658 12.096 12.573 13.078 13.593 14.182 14.812 15.387 16.057 16.791 17.567 18.388 19.223 19.965 20.399 19.973 19.245 18.476 17.654 16.824 16.018 15.232 14.515 13.759 13.096 12.5 11.95 11.451 10.965 10.502 10.001 9.539 9.134 8.72 8.294 7.922 7.534 7.133 6.808 6.463 6.112 5.733 5.333 5.074 4.804 4.361 4.028 3.683 3.514 3.138 2.719 2.294 2.078 1.695 1.322 1.047 0.758 0.124 -0.216 -0.56 -0.989 -1.508 -2.133 -2.985 -6.144 -8 ,1448 ,KEBNE ,16656895,Tue Nov 23 00:51:44 CET,Tue Nov 23 02:16:16 CET,0.0 1.922 2.44 2.834 3.176 3.477 3.762 4.022 4.462 4.663 4.856 5.034 5.346 5.511 5.796 6.062 6.341 6.471 6.7 6.926 7.243 7.451 7.654 7.943 8.229 8.509 8.775 9.027 9.344 9.657 9.954 10.297 10.634 10.961 11.335 11.743 12.151 12.621 13.11 13.61 14.108 14.644 15.317 15.978 16.69 17.473 18.333 19.181 20.016 20.788 21.251 20.975 20.287 19.496 18.654 17.762 16.959 16.218 15.51 14.769 14.143 13.576 13.013 12.481 11.999 11.55 11.076 10.636 10.237 9.822 9.387 9.027 8.649 8.245 7.917 7.577 7.227 6.863 6.497 6.243 5.97 5.527 5.203 4.854 4.676 4.323 3.955 3.548 3.332 2.949 2.549 2.262 1.952 1.329 0.994 0.59 0.117 -0.429 -1.043 -1.891 -5.553 -9 ,30933 ,KEBNE ,16656896,Tue Nov 23 00:52:45 CET,Tue Nov 23 02:22:39 CET,0.0 1.736 2.246 2.609 2.929 3.228 3.486 3.722 4.138 4.312 4.483 4.672 4.981 5.141 5.474 5.778 6.047 6.168 6.397 6.619 6.962 7.177 7.38 7.682 7.966 8.241 8.503 8.747 9.057 9.378 9.692 10.058 10.408 10.752 11.156 11.579 11.965 12.391 12.831 13.291 13.767 14.304 14.95 15.584 16.286 17.024 17.832 18.679 19.54 20.341 20.858 20.585 19.928 19.169 18.391 17.574 16.828 16.129 15.463 14.749 14.13 13.58 13.024 12.472 11.964 11.499 10.998 10.54 10.132 9.703 9.257 8.897 8.527 8.139 7.826 7.492 7.143 6.762 6.351 6.078 5.806 5.355 5.037 4.718 4.556 4.221 3.86 3.472 3.262 2.904 2.571 2.302 2.021 1.431 1.099 0.716 0.287 -0.191 -0.744 -1.49 -5.165 -10 ,8927 ,KEBNE ,16656897,Tue Nov 23 00:52:45 CET,Tue Nov 23 02:25:17 CET,0.0 1.43 2.026 2.458 2.846 3.185 3.458 3.715 4.156 4.35 4.542 4.809 5.152 5.325 5.644 5.918 6.161 6.285 6.539 6.768 7.083 7.283 7.481 7.803 8.12 8.418 8.698 8.956 9.288 9.603 9.894 10.246 10.595 10.917 11.283 11.71 12.118 12.552 13.01 13.515 14.014 14.523 15.091 15.647 16.307 17.048 17.844 18.643 19.5 20.365 20.945 20.762 20.193 19.433 18.611 17.847 17.153 16.438 15.775 15.083 14.454 13.897 13.363 12.804 12.272 11.8 11.312 10.868 10.491 10.107 9.683 9.322 8.929 8.502 8.169 7.827 7.483 7.132 6.761 6.501 6.213 5.748 5.438 5.116 4.947 4.604 4.245 3.827 3.599 3.236 2.932 2.668 2.383 1.785 1.43 1.031 0.605 0.108 -0.522 -1.292 -4.441 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index d1f5971a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,5557 ,KEBNE ,17023572,Wed Dec 22 08:16:59 CET,Wed Dec 22 09:47:34 CET,0.0 4.758 5.457 5.964 6.359 6.71 7.053 7.352 7.85 8.075 8.281 8.503 8.847 9.028 9.383 9.709 10.024 10.171 10.454 10.738 11.158 11.426 11.674 12.031 12.386 12.737 13.065 13.37 13.767 14.163 14.555 15.049 15.531 15.983 16.491 17.049 17.595 18.208 18.862 19.559 20.286 21.087 22.028 22.968 24.094 25.429 26.974 28.637 30.531 32.683 35.162 37.02 37.876 38.231 38.312 38.228 38.049 37.839 37.573 37.237 36.925 36.613 36.308 36.008 35.723 35.462 35.164 34.87 34.626 34.391 34.135 33.91 33.673 33.418 33.216 32.998 32.744 32.489 32.23 32.031 31.818 31.458 31.194 30.938 30.811 30.555 30.288 30.0 29.841 29.547 29.343 29.155 28.953 28.507 28.247 27.945 27.599 27.237 26.767 26.041 22.496 -3 ,18658 ,KEBNE ,17023573,Wed Dec 22 08:16:59 CET,Wed Dec 22 09:49:21 CET,0.0 2.43 3.099 3.534 3.896 4.18 4.43 4.706 5.2 5.416 5.625 5.84 6.172 6.342 6.692 7.032 7.347 7.501 7.786 8.049 8.407 8.647 8.891 9.236 9.572 9.897 10.209 10.513 10.887 11.247 11.614 12.059 12.501 12.926 13.41 13.952 14.473 15.042 15.667 16.359 17.085 17.933 18.927 19.939 21.206 22.587 24.093 25.798 27.811 30.23 33.157 35.509 36.815 37.528 37.919 38.128 38.2 38.207 38.172 38.104 38.024 37.931 37.817 37.695 37.57 37.435 37.259 37.072 36.91 36.752 36.588 36.438 36.259 36.069 35.916 35.752 35.586 35.407 35.205 35.072 34.93 34.674 34.501 34.323 34.227 34.02 33.799 33.572 33.432 33.142 33.001 32.868 32.7 32.283 32.063 31.79 31.424 30.974 30.505 29.91 26.852 -4 ,18849 ,KEBNE ,17023574,Wed Dec 22 08:16:59 CET,Wed Dec 22 09:47:48 CET,0.0 5.594 6.171 6.552 6.881 7.184 7.453 7.71 8.184 8.4 8.616 8.876 9.225 9.397 9.743 10.069 10.385 10.542 10.826 11.087 11.489 11.75 11.996 12.362 12.692 12.987 13.277 13.57 13.946 14.321 14.691 15.129 15.541 15.941 16.419 16.959 17.473 18.082 18.783 19.532 20.358 21.322 22.381 23.352 24.482 25.751 27.181 28.76 30.592 32.752 35.173 36.876 37.657 37.953 38.016 37.934 37.766 37.559 37.328 37.042 36.79 36.545 36.261 35.968 35.678 35.402 35.091 34.772 34.486 34.189 33.872 33.605 33.332 33.066 32.872 32.639 32.377 32.103 31.796 31.598 31.397 31.049 30.809 30.554 30.421 30.149 29.854 29.528 29.357 29.065 28.834 28.627 28.43 28.002 27.759 27.495 27.165 26.769 26.306 25.635 22.657 -6 ,2165 ,KEBNE ,17023576,Wed Dec 22 08:16:59 CET,Wed Dec 22 09:48:05 CET,0.0 2.556 3.11 3.532 3.921 4.263 4.553 4.825 5.353 5.582 5.793 6.021 6.366 6.55 6.899 7.217 7.51 7.658 7.945 8.206 8.593 8.868 9.132 9.496 9.842 10.168 10.472 10.767 11.158 11.555 11.951 12.427 12.916 13.397 13.942 14.566 15.174 15.835 16.501 17.189 17.912 18.752 19.758 20.753 21.899 23.19 24.67 26.355 28.306 30.386 32.771 34.565 35.393 35.737 35.785 35.69 35.557 35.347 35.085 34.801 34.507 34.196 33.908 33.643 33.375 33.122 32.837 32.561 32.302 32.023 31.744 31.499 31.229 30.943 30.72 30.489 30.251 29.988 29.712 29.526 29.321 29.004 28.78 28.534 28.404 28.137 27.86 27.549 27.381 27.075 26.799 26.583 26.366 25.894 25.642 25.353 25.026 24.668 24.203 23.515 17.959 -7 ,22638 ,KEBNE ,17023577,Wed Dec 22 08:16:59 CET,Wed Dec 22 09:49:45 CET,0.0 3.397 3.982 4.435 4.809 5.143 5.445 5.714 6.2 6.423 6.634 6.841 7.17 7.343 7.672 7.965 8.241 8.374 8.639 8.904 9.291 9.531 9.754 10.099 10.446 10.795 11.136 11.464 11.88 12.253 12.606 13.059 13.508 13.936 14.423 14.977 15.52 16.091 16.721 17.415 18.134 18.927 19.865 20.84 22.001 23.341 24.869 26.507 28.365 30.546 33.035 34.829 35.656 35.972 36.061 35.972 35.773 35.569 35.365 35.094 34.804 34.534 34.247 33.921 33.616 33.34 33.046 32.772 32.52 32.271 32.005 31.765 31.525 31.279 31.058 30.827 30.607 30.368 30.106 29.911 29.699 29.373 29.146 28.911 28.786 28.516 28.219 27.897 27.729 27.423 27.183 26.984 26.765 26.29 26.037 25.765 25.447 25.069 24.532 23.698 19.576 -9 ,8922 ,KEBNE ,17023579,Wed Dec 22 08:16:59 CET,Wed Dec 22 09:48:15 CET,0.0 4.369 4.954 5.4 5.792 6.172 6.488 6.776 7.303 7.531 7.757 8.027 8.376 8.555 8.904 9.236 9.563 9.723 10.035 10.324 10.732 11.003 11.267 11.656 12.048 12.421 12.744 13.038 13.43 13.827 14.217 14.696 15.183 15.651 16.183 16.75 17.276 17.866 18.503 19.192 19.935 20.785 21.756 22.713 23.831 25.121 26.623 28.249 30.107 32.283 34.726 36.412 37.213 37.567 37.662 37.648 37.546 37.348 37.079 36.768 36.482 36.214 35.956 35.671 35.373 35.108 34.848 34.594 34.34 34.046 33.733 33.443 33.15 32.88 32.658 32.42 32.174 31.918 31.655 31.46 31.235 30.879 30.643 30.403 30.285 30.044 29.771 29.483 29.321 29.019 28.8 28.612 28.401 27.928 27.657 27.35 27.02 26.649 26.198 25.58 23.109 -10 ,1774 ,KEBNE ,17023580,Wed Dec 22 08:16:59 CET,Wed Dec 22 09:49:27 CET,0.0 1.815 2.441 2.926 3.353 3.708 3.997 4.283 4.768 4.956 5.15 5.38 5.718 5.892 6.262 6.613 6.942 7.111 7.422 7.714 8.161 8.445 8.711 9.1 9.455 9.792 10.124 10.433 10.833 11.226 11.608 12.08 12.527 12.962 13.493 14.093 14.662 15.292 15.981 16.693 17.427 18.295 19.292 20.257 21.387 22.661 24.173 25.87 27.758 29.889 32.365 34.078 34.881 35.262 35.333 35.257 35.079 34.83 34.587 34.293 34.007 33.755 33.487 33.203 32.916 32.642 32.372 32.14 31.918 31.649 31.341 31.098 30.843 30.548 30.329 30.103 29.855 29.603 29.331 29.127 28.917 28.592 28.38 28.163 28.028 27.735 27.449 27.149 26.999 26.708 26.469 26.254 26.016 25.522 25.265 24.96 24.591 24.196 23.747 23.086 18.192 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 2240d420..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13830 ,KEBNE ,16654720,Mon Nov 22 07:43:24 CET,Mon Nov 22 09:11:25 CET,0.0 1.649 2.073 2.414 2.691 2.93 3.188 3.453 3.919 4.105 4.284 4.447 4.726 4.86 5.128 5.367 5.598 5.709 5.91 6.115 6.403 6.584 6.777 7.039 7.272 7.49 7.696 7.91 8.192 8.442 8.655 8.9 9.133 9.364 9.64 9.932 10.187 10.482 10.8 11.11 11.416 11.741 12.089 12.411 12.743 13.061 13.375 13.656 13.825 13.723 13.091 11.893 10.664 9.52 8.486 7.523 6.666 5.903 5.234 4.534 3.928 3.406 2.907 2.426 1.973 1.551 1.128 0.742 0.389 0.025 -0.351 -0.651 -0.953 -1.268 -1.511 -1.781 -2.096 -2.441 -2.772 -2.977 -3.188 -3.54 -3.77 -3.988 -4.103 -4.349 -4.625 -4.915 -5.063 -5.37 -5.528 -5.706 -5.896 -6.315 -6.537 -6.786 -7.089 -7.401 -7.707 -8.165 -9.402 -2 ,19066 ,KEBNE ,16656899,Tue Nov 23 00:53:48 CET,Tue Nov 23 02:28:28 CET,0.0 1.741 2.22 2.561 2.845 3.138 3.426 3.66 4.074 4.257 4.413 4.556 4.853 4.984 5.241 5.522 5.802 5.927 6.145 6.354 6.667 6.862 7.045 7.31 7.555 7.774 7.977 8.171 8.425 8.671 8.896 9.151 9.401 9.64 9.916 10.229 10.526 10.822 11.111 11.405 11.727 12.098 12.47 12.815 13.18 13.537 13.906 14.191 14.332 14.252 13.577 12.255 10.991 9.828 8.806 7.915 7.104 6.314 5.628 4.953 4.369 3.849 3.351 2.865 2.399 1.976 1.536 1.143 0.807 0.466 0.112 -0.179 -0.481 -0.809 -1.064 -1.327 -1.613 -1.896 -2.179 -2.376 -2.583 -2.922 -3.15 -3.385 -3.51 -3.802 -4.13 -4.476 -4.654 -5.004 -5.264 -5.485 -5.708 -6.164 -6.432 -6.72 -7.045 -7.415 -7.877 -8.471 -10.37 -3 ,24611 ,KEBNE ,16656900,Tue Nov 23 00:53:48 CET,Tue Nov 23 02:22:07 CET,0.0 1.065 1.539 1.947 2.293 2.61 2.912 3.181 3.618 3.806 3.997 4.201 4.503 4.654 4.937 5.19 5.433 5.555 5.794 6.021 6.357 6.594 6.829 7.178 7.489 7.751 8.008 8.257 8.561 8.84 9.124 9.477 9.801 10.103 10.446 10.807 11.105 11.394 11.698 12.01 12.304 12.619 13.002 13.339 13.704 14.113 14.523 14.831 14.974 14.878 14.209 12.975 11.681 10.491 9.46 8.501 7.642 6.869 6.197 5.513 4.903 4.365 3.852 3.358 2.914 2.52 2.104 1.716 1.368 1.012 0.651 0.338 0.021 -0.297 -0.542 -0.805 -1.105 -1.432 -1.768 -1.991 -2.216 -2.568 -2.817 -3.076 -3.209 -3.479 -3.752 -4.044 -4.206 -4.53 -4.697 -4.89 -5.095 -5.514 -5.72 -5.922 -6.167 -6.492 -6.855 -7.426 -9.481 -4 ,20381 ,KEBNE ,16654723,Mon Nov 22 07:43:25 CET,Mon Nov 22 09:11:31 CET,0.0 1.738 2.184 2.529 2.812 3.057 3.32 3.554 3.93 4.091 4.251 4.428 4.718 4.844 5.089 5.325 5.557 5.659 5.857 6.063 6.36 6.555 6.737 6.993 7.229 7.451 7.658 7.848 8.091 8.325 8.561 8.827 9.07 9.317 9.586 9.868 10.146 10.452 10.791 11.147 11.493 11.862 12.256 12.605 12.972 13.331 13.658 13.919 14.038 13.917 13.29 12.097 10.886 9.749 8.723 7.761 6.896 6.112 5.441 4.762 4.159 3.613 3.107 2.632 2.186 1.783 1.346 0.953 0.618 0.284 -0.047 -0.338 -0.645 -0.955 -1.211 -1.479 -1.745 -2.022 -2.307 -2.503 -2.716 -3.046 -3.269 -3.515 -3.64 -3.9 -4.182 -4.486 -4.655 -4.998 -5.207 -5.381 -5.556 -5.961 -6.192 -6.443 -6.689 -6.986 -7.414 -7.959 -9.294 -5 ,22902 ,KEBNE ,16654724,Mon Nov 22 07:43:25 CET,Mon Nov 22 09:09:48 CET,0.0 1.395 1.894 2.244 2.573 2.844 3.059 3.262 3.669 3.875 4.069 4.263 4.571 4.723 5.017 5.29 5.526 5.641 5.865 6.069 6.343 6.514 6.683 6.955 7.206 7.42 7.632 7.833 8.079 8.311 8.542 8.811 9.058 9.297 9.579 9.897 10.191 10.482 10.775 11.086 11.4 11.735 12.089 12.413 12.745 13.066 13.393 13.693 13.878 13.777 13.107 11.856 10.631 9.431 8.342 7.354 6.462 5.677 5.014 4.333 3.722 3.145 2.588 2.096 1.639 1.231 0.805 0.408 0.074 -0.267 -0.614 -0.912 -1.221 -1.536 -1.802 -2.083 -2.364 -2.654 -2.966 -3.189 -3.4 -3.712 -3.951 -4.221 -4.36 -4.647 -4.955 -5.294 -5.466 -5.789 -5.962 -6.155 -6.372 -6.835 -7.07 -7.324 -7.625 -7.956 -8.328 -8.905 -11.461 -6 ,31551 ,KEBNE ,16654725,Mon Nov 22 07:43:29 CET,Mon Nov 22 09:03:55 CET,0.0 1.09 1.634 2.045 2.384 2.659 2.912 3.167 3.616 3.8 3.954 4.085 4.365 4.489 4.74 5.003 5.249 5.361 5.582 5.782 6.057 6.233 6.405 6.657 6.881 7.083 7.276 7.465 7.727 7.981 8.206 8.46 8.701 8.926 9.176 9.457 9.707 9.984 10.285 10.599 10.931 11.26 11.635 12.028 12.45 12.855 13.261 13.592 13.741 13.656 13.036 11.754 10.493 9.321 8.211 7.204 6.324 5.479 4.739 3.995 3.357 2.81 2.28 1.769 1.293 0.877 0.442 0.056 -0.265 -0.605 -0.997 -1.317 -1.621 -1.967 -2.242 -2.499 -2.757 -3.02 -3.297 -3.502 -3.728 -4.082 -4.321 -4.572 -4.701 -4.961 -5.239 -5.558 -5.728 -6.06 -6.222 -6.402 -6.597 -7.032 -7.284 -7.533 -7.818 -8.139 -8.512 -9.0 -10.513 -7 ,30087 ,KEBNE ,16654726,Mon Nov 22 07:43:29 CET,Mon Nov 22 09:07:49 CET,0.0 1.765 2.347 2.77 3.11 3.403 3.653 3.868 4.24 4.411 4.565 4.694 4.972 5.102 5.371 5.621 5.839 5.941 6.147 6.345 6.613 6.785 6.952 7.189 7.417 7.644 7.856 8.045 8.286 8.515 8.757 9.053 9.308 9.551 9.818 10.092 10.34 10.616 10.931 11.257 11.578 11.93 12.338 12.7 13.063 13.412 13.732 14.016 14.183 14.092 13.459 12.157 10.863 9.736 8.703 7.719 6.841 6.039 5.334 4.634 4.024 3.48 2.972 2.484 2.032 1.616 1.16 0.761 0.412 0.019 -0.402 -0.763 -1.139 -1.521 -1.811 -2.11 -2.432 -2.769 -3.115 -3.356 -3.607 -3.983 -4.237 -4.508 -4.648 -4.943 -5.254 -5.589 -5.762 -6.091 -6.295 -6.501 -6.725 -7.187 -7.414 -7.705 -8.062 -8.407 -8.772 -9.265 -10.942 -8 ,1925 ,KEBNE ,16654727,Mon Nov 22 07:43:27 CET,Mon Nov 22 09:06:10 CET,0.0 1.71 2.152 2.501 2.837 3.144 3.407 3.637 3.998 4.159 4.343 4.556 4.865 4.994 5.229 5.468 5.702 5.801 6.006 6.217 6.491 6.689 6.896 7.181 7.42 7.622 7.823 8.016 8.267 8.521 8.763 9.06 9.331 9.568 9.838 10.133 10.403 10.706 11.029 11.333 11.638 11.976 12.353 12.7 13.052 13.384 13.686 13.935 14.094 14.019 13.407 12.252 11.08 9.978 8.956 7.971 7.104 6.321 5.61 4.875 4.255 3.72 3.19 2.696 2.243 1.829 1.419 1.037 0.7 0.352 -0.031 -0.36 -0.704 -1.044 -1.291 -1.552 -1.835 -2.137 -2.459 -2.676 -2.89 -3.242 -3.504 -3.753 -3.878 -4.147 -4.418 -4.721 -4.891 -5.235 -5.483 -5.705 -5.927 -6.365 -6.619 -6.894 -7.175 -7.512 -7.954 -8.489 -9.847 -9 ,25203 ,KEBNE ,16656906,Tue Nov 23 00:55:52 CET,Tue Nov 23 02:24:09 CET,0.0 1.132 1.717 2.055 2.344 2.628 2.882 3.103 3.463 3.625 3.802 4.019 4.34 4.49 4.76 5.019 5.256 5.369 5.583 5.784 6.087 6.284 6.475 6.77 7.04 7.267 7.494 7.717 7.996 8.278 8.545 8.824 9.079 9.332 9.617 9.928 10.219 10.533 10.873 11.207 11.541 11.897 12.284 12.629 13.001 13.376 13.736 14.026 14.188 14.154 13.512 12.201 10.909 9.704 8.616 7.614 6.714 5.907 5.195 4.446 3.8 3.251 2.719 2.224 1.769 1.327 0.872 0.472 0.118 -0.258 -0.655 -1.009 -1.42 -1.831 -2.133 -2.461 -2.819 -3.184 -3.541 -3.779 -4.031 -4.433 -4.715 -5.007 -5.156 -5.457 -5.762 -6.087 -6.259 -6.599 -6.796 -6.994 -7.206 -7.655 -7.902 -8.137 -8.408 -8.749 -9.101 -9.629 -11.053 -10 ,9085 ,KEBNE ,16654729,Mon Nov 22 07:43:24 CET,Mon Nov 22 09:10:03 CET,0.0 1.217 1.738 2.137 2.396 2.65 2.903 3.13 3.539 3.711 3.89 4.083 4.389 4.533 4.794 5.074 5.347 5.467 5.686 5.902 6.234 6.431 6.619 6.907 7.162 7.375 7.587 7.808 8.071 8.337 8.588 8.862 9.133 9.396 9.702 10.042 10.356 10.684 11.02 11.359 11.734 12.168 12.619 12.987 13.345 13.727 14.064 14.326 14.508 14.407 13.751 12.539 11.251 10.034 8.975 8.022 7.139 6.302 5.582 4.861 4.215 3.645 3.127 2.612 2.073 1.558 1.01 0.517 0.109 -0.302 -0.709 -1.029 -1.361 -1.706 -1.955 -2.215 -2.485 -2.752 -3.059 -3.287 -3.502 -3.825 -4.06 -4.29 -4.411 -4.673 -4.94 -5.21 -5.356 -5.662 -5.8 -5.971 -6.156 -6.58 -6.824 -7.091 -7.367 -7.657 -8.014 -8.473 -10.146 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index ff62c323..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20215 ,KEBNE ,16656908,Tue Nov 23 00:55:53 CET,Tue Nov 23 02:26:27 CET,0.0 3.152 3.644 4.069 4.433 4.772 5.077 5.341 5.808 6.002 6.181 6.381 6.693 6.845 7.123 7.397 7.661 7.79 8.038 8.29 8.661 8.887 9.098 9.401 9.694 9.977 10.259 10.533 10.886 11.228 11.544 11.939 12.322 12.687 13.119 13.586 14.032 14.528 15.085 15.718 16.353 17.031 17.829 18.627 19.503 20.471 21.575 22.74 24.037 25.46 26.902 27.639 27.73 27.54 27.155 26.733 26.341 25.913 25.512 25.087 24.695 24.331 23.965 23.615 23.281 22.976 22.658 22.364 22.104 21.803 21.482 21.225 20.949 20.646 20.4 20.151 19.902 19.643 19.363 19.173 18.982 18.659 18.421 18.171 18.047 17.794 17.497 17.174 17.0 16.684 16.424 16.231 16.044 15.623 15.384 15.109 14.8 14.437 13.953 13.304 10.66 -2 ,14614 ,KEBNE ,16656909,Tue Nov 23 00:55:53 CET,Tue Nov 23 02:25:36 CET,0.0 3.357 3.884 4.298 4.63 4.923 5.175 5.397 5.798 5.978 6.143 6.295 6.586 6.731 7.02 7.308 7.601 7.739 7.982 8.224 8.599 8.829 9.039 9.365 9.712 10.052 10.367 10.652 11.011 11.356 11.684 12.081 12.495 12.898 13.342 13.866 14.373 14.913 15.495 16.115 16.762 17.442 18.184 18.92 19.761 20.687 21.734 22.882 24.159 25.567 27.026 27.824 28.037 27.912 27.602 27.177 26.696 26.184 25.671 25.115 24.635 24.191 23.723 23.3 22.912 22.534 22.152 21.803 21.473 21.131 20.795 20.516 20.234 19.954 19.725 19.485 19.247 18.997 18.714 18.509 18.3 17.965 17.727 17.462 17.325 17.048 16.751 16.441 16.291 15.997 15.754 15.561 15.346 14.86 14.603 14.35 14.074 13.739 13.31 12.572 5.896 -3 ,5463 ,KEBNE ,16654732,Mon Nov 22 07:44:26 CET,Mon Nov 22 09:13:11 CET,0.0 4.624 5.166 5.513 5.817 6.098 6.351 6.586 6.984 7.152 7.324 7.524 7.827 7.964 8.241 8.51 8.771 8.91 9.17 9.407 9.752 9.976 10.194 10.522 10.845 11.15 11.43 11.681 12.011 12.324 12.619 12.981 13.357 13.744 14.16 14.621 15.078 15.578 16.13 16.691 17.246 17.885 18.649 19.445 20.371 21.378 22.559 23.851 25.187 26.596 28.031 28.77 28.932 28.783 28.5 28.153 27.775 27.394 27.019 26.596 26.202 25.841 25.491 25.149 24.814 24.491 24.144 23.834 23.554 23.254 22.954 22.71 22.447 22.17 21.961 21.735 21.499 21.25 20.968 20.775 20.576 20.214 19.965 19.734 19.616 19.365 19.105 18.832 18.678 18.387 18.165 17.957 17.735 17.276 17.033 16.791 16.5 16.133 15.721 15.197 12.99 -4 ,19752 ,KEBNE ,16656911,Tue Nov 23 00:55:53 CET,Tue Nov 23 02:23:48 CET,0.0 7.83 8.371 8.755 9.077 9.349 9.584 9.805 10.251 10.453 10.639 10.854 11.179 11.35 11.679 12.0 12.31 12.455 12.702 12.936 13.287 13.502 13.718 14.04 14.34 14.613 14.866 15.128 15.488 15.818 16.136 16.534 16.93 17.318 17.754 18.235 18.692 19.19 19.758 20.387 20.997 21.657 22.486 23.34 24.287 25.298 26.442 27.693 29.059 30.561 32.055 32.802 32.919 32.745 32.432 32.078 31.682 31.238 30.826 30.411 30.035 29.655 29.29 28.958 28.627 28.308 27.958 27.641 27.374 27.094 26.786 26.511 26.196 25.886 25.666 25.435 25.199 24.951 24.679 24.487 24.293 23.995 23.776 23.534 23.402 23.131 22.846 22.524 22.36 22.07 21.859 21.67 21.471 21.05 20.831 20.597 20.306 19.929 19.468 18.889 16.146 -5 ,18668 ,KEBNE ,16656912,Tue Nov 23 00:55:53 CET,Tue Nov 23 02:24:24 CET,0.0 3.034 3.546 3.949 4.31 4.615 4.882 5.128 5.546 5.723 5.885 6.055 6.358 6.5 6.764 7.048 7.339 7.469 7.694 7.921 8.272 8.506 8.734 9.061 9.387 9.673 9.929 10.201 10.557 10.901 11.246 11.642 12.019 12.415 12.857 13.328 13.792 14.296 14.825 15.399 16.001 16.678 17.462 18.237 19.156 20.2 21.355 22.624 24.066 25.569 27.149 28.044 28.149 27.906 27.523 27.023 26.521 26.051 25.566 25.06 24.637 24.227 23.831 23.471 23.109 22.781 22.449 22.137 21.864 21.566 21.255 21.016 20.764 20.479 20.24 20.0 19.761 19.509 19.246 19.06 18.856 18.521 18.283 18.046 17.932 17.688 17.399 17.09 16.919 16.592 16.319 16.117 15.92 15.487 15.239 14.984 14.721 14.38 13.941 13.421 10.004 -6 ,25134 ,KEBNE ,16654735,Mon Nov 22 07:44:27 CET,Mon Nov 22 09:11:07 CET,0.0 3.161 3.658 4.017 4.305 4.567 4.811 5.022 5.392 5.587 5.772 5.941 6.245 6.395 6.672 6.947 7.213 7.333 7.561 7.781 8.121 8.366 8.604 8.923 9.201 9.46 9.716 9.965 10.292 10.616 10.935 11.316 11.69 12.062 12.503 13.026 13.51 14.006 14.542 15.112 15.704 16.455 17.453 18.366 19.295 20.281 21.349 22.504 23.829 25.243 26.666 27.411 27.517 27.367 27.075 26.68 26.256 25.856 25.471 25.043 24.66 24.303 23.94 23.578 23.242 22.943 22.613 22.299 22.02 21.744 21.452 21.198 20.922 20.638 20.415 20.182 19.946 19.68 19.407 19.209 18.977 18.62 18.379 18.121 17.99 17.702 17.403 17.102 16.939 16.621 16.373 16.182 15.978 15.561 15.329 15.084 14.821 14.485 14.074 13.545 4.045 -9 ,8987 ,KEBNE ,16654738,Mon Nov 22 07:44:27 CET,Mon Nov 22 09:11:59 CET,0.0 2.535 3.013 3.354 3.673 3.953 4.194 4.412 4.815 5.01 5.194 5.398 5.711 5.868 6.179 6.483 6.763 6.902 7.168 7.404 7.738 7.96 8.183 8.504 8.82 9.123 9.421 9.716 10.118 10.499 10.837 11.244 11.642 12.015 12.463 12.984 13.469 13.995 14.571 15.196 15.849 16.591 17.426 18.236 19.176 20.198 21.322 22.586 24.071 25.677 27.23 28.126 28.389 28.276 27.909 27.455 26.999 26.548 26.139 25.663 25.236 24.86 24.462 24.073 23.731 23.416 23.048 22.719 22.457 22.168 21.85 21.592 21.329 21.055 20.82 20.555 20.293 20.028 19.75 19.547 19.329 19.003 18.784 18.565 18.456 18.211 17.933 17.607 17.416 17.106 16.885 16.69 16.499 16.068 15.821 15.576 15.287 14.956 14.494 13.821 8.782 -10 ,5245 ,KEBNE ,16656917,Tue Nov 23 00:56:59 CET,Tue Nov 23 02:23:28 CET,0.0 2.017 2.486 2.819 3.106 3.374 3.621 3.859 4.271 4.456 4.643 4.848 5.165 5.331 5.649 5.953 6.238 6.362 6.595 6.825 7.159 7.367 7.579 7.896 8.216 8.537 8.839 9.113 9.447 9.764 10.067 10.445 10.804 11.153 11.565 12.0 12.432 12.964 13.566 14.188 14.825 15.532 16.344 17.132 17.999 18.945 20.071 21.36 22.759 24.243 25.798 26.65 26.793 26.632 26.338 25.925 25.48 25.065 24.655 24.231 23.856 23.514 23.187 22.857 22.526 22.203 21.841 21.519 21.227 20.91 20.602 20.349 20.087 19.803 19.573 19.336 19.087 18.829 18.552 18.356 18.158 17.836 17.605 17.371 17.248 16.981 16.702 16.411 16.254 15.963 15.749 15.557 15.353 14.905 14.65 14.374 14.061 13.688 13.25 12.554 5.601 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt deleted file mode 100644 index 7aa2783f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,447 ,KEBNE ,16656919,Tue Nov 23 00:56:57 CET,Tue Nov 23 02:20:27 CET,0.0 0.153 0.274 0.391 0.492 0.592 0.688 0.772 0.936 1.008 1.08 1.148 1.275 1.336 1.462 1.577 1.682 1.732 1.825 1.915 2.052 2.139 2.225 2.364 2.494 2.614 2.726 2.846 3.007 3.15 3.292 3.467 3.636 3.802 3.999 4.219 4.423 4.652 4.892 5.148 5.416 5.702 6.033 6.355 6.712 7.087 7.46 7.821 8.148 8.405 8.493 8.232 7.74 7.171 6.638 6.109 5.613 5.164 4.779 4.367 3.99 3.676 3.379 3.073 2.797 2.56 2.293 2.039 1.832 1.622 1.404 1.213 1.005 0.776 0.603 0.439 0.26 0.07 -0.127 -0.273 -0.416 -0.625 -0.775 -0.928 -1.009 -1.193 -1.385 -1.573 -1.672 -1.848 -2.031 -2.16 -2.29 -2.576 -2.72 -2.879 -3.055 -3.273 -3.564 -3.908 -4.699 -4 ,5954 ,KEBNE ,16656921,Tue Nov 23 00:57:58 CET,Tue Nov 23 02:22:07 CET,0.0 0.171 0.322 0.44 0.548 0.644 0.734 0.821 0.977 1.05 1.122 1.193 1.324 1.385 1.507 1.62 1.725 1.779 1.883 1.988 2.142 2.228 2.309 2.435 2.56 2.689 2.81 2.914 3.051 3.186 3.319 3.487 3.651 3.814 4.016 4.24 4.443 4.667 4.902 5.149 5.405 5.676 5.994 6.295 6.631 6.978 7.32 7.675 8.021 8.295 8.347 7.991 7.439 6.851 6.278 5.754 5.29 4.846 4.444 4.011 3.635 3.303 2.985 2.672 2.38 2.125 1.863 1.63 1.426 1.211 0.992 0.81 0.599 0.376 0.206 0.03 -0.149 -0.337 -0.526 -0.663 -0.812 -1.04 -1.198 -1.359 -1.442 -1.615 -1.793 -1.972 -2.066 -2.233 -2.394 -2.524 -2.66 -2.963 -3.116 -3.269 -3.458 -3.676 -3.929 -4.268 -4.995 -5 ,17175 ,KEBNE ,16656922,Tue Nov 23 00:59:00 CET,Tue Nov 23 02:23:15 CET,0.0 0.164 0.295 0.417 0.515 0.6 0.689 0.776 0.951 1.05 1.158 1.28 1.426 1.508 1.66 1.806 1.946 2.014 2.138 2.264 2.443 2.551 2.659 2.812 2.961 3.103 3.245 3.385 3.559 3.717 3.864 4.044 4.215 4.383 4.584 4.793 4.986 5.206 5.438 5.694 5.963 6.238 6.54 6.845 7.184 7.521 7.879 8.278 8.643 8.885 8.929 8.568 8.049 7.482 6.965 6.492 6.041 5.594 5.2 4.829 4.492 4.171 3.852 3.54 3.261 3.012 2.742 2.499 2.292 2.07 1.837 1.649 1.46 1.267 1.104 0.92 0.739 0.557 0.369 0.242 0.101 -0.119 -0.259 -0.406 -0.485 -0.651 -0.823 -1.011 -1.11 -1.274 -1.428 -1.555 -1.691 -1.966 -2.102 -2.27 -2.465 -2.682 -2.937 -3.257 -3.83 -6 ,30505 ,KEBNE ,16656923,Tue Nov 23 00:59:00 CET,Tue Nov 23 02:23:28 CET,0.0 0.26 0.388 0.503 0.616 0.7 0.778 0.867 1.035 1.109 1.179 1.24 1.365 1.424 1.555 1.688 1.808 1.864 1.973 2.071 2.214 2.305 2.393 2.536 2.667 2.789 2.91 3.028 3.178 3.322 3.471 3.649 3.835 4.015 4.206 4.419 4.623 4.847 5.094 5.346 5.599 5.874 6.18 6.489 6.815 7.125 7.45 7.78 8.103 8.361 8.371 7.947 7.405 6.902 6.425 5.912 5.432 5.001 4.615 4.226 3.877 3.549 3.24 2.959 2.691 2.446 2.186 1.935 1.716 1.498 1.286 1.101 0.896 0.675 0.504 0.336 0.163 -0.019 -0.211 -0.341 -0.479 -0.701 -0.858 -1.03 -1.124 -1.31 -1.487 -1.671 -1.77 -1.948 -2.136 -2.262 -2.389 -2.657 -2.805 -2.973 -3.167 -3.373 -3.636 -3.988 -4.727 -7 ,10303 ,KEBNE ,16654766,Mon Nov 22 07:46:31 CET,Mon Nov 22 09:09:33 CET,0.0 0.17 0.313 0.441 0.548 0.639 0.721 0.809 0.968 1.037 1.106 1.163 1.29 1.35 1.47 1.586 1.698 1.754 1.866 1.97 2.11 2.201 2.291 2.432 2.571 2.703 2.835 2.963 3.126 3.285 3.438 3.632 3.823 3.989 4.178 4.389 4.588 4.801 5.024 5.264 5.515 5.799 6.105 6.404 6.741 7.091 7.457 7.832 8.217 8.485 8.515 8.155 7.64 7.114 6.611 6.107 5.643 5.215 4.821 4.397 4.024 3.695 3.386 3.088 2.807 2.55 2.267 2.017 1.81 1.589 1.356 1.163 0.954 0.739 0.579 0.408 0.225 0.038 -0.152 -0.281 -0.412 -0.623 -0.775 -0.948 -1.038 -1.213 -1.395 -1.598 -1.699 -1.87 -2.034 -2.15 -2.277 -2.57 -2.731 -2.905 -3.103 -3.306 -3.546 -3.865 -4.839 -8 ,7483 ,KEBNE ,16656925,Tue Nov 23 00:59:01 CET,Tue Nov 23 02:24:03 CET,0.0 0.582 0.85 1.038 1.208 1.378 1.521 1.643 1.877 1.985 2.078 2.176 2.316 2.389 2.539 2.688 2.819 2.881 3.012 3.141 3.315 3.43 3.545 3.702 3.842 3.973 4.102 4.229 4.399 4.558 4.707 4.893 5.073 5.245 5.44 5.666 5.875 6.085 6.315 6.553 6.782 7.039 7.34 7.633 7.982 8.361 8.731 9.105 9.484 9.752 9.788 9.429 8.916 8.37 7.853 7.359 6.889 6.44 6.032 5.622 5.282 4.966 4.648 4.338 4.044 3.791 3.532 3.284 3.074 2.859 2.629 2.442 2.243 2.034 1.874 1.705 1.526 1.336 1.138 1.005 0.872 0.66 0.509 0.353 0.273 0.105 -0.094 -0.305 -0.409 -0.592 -0.767 -0.889 -1.012 -1.268 -1.404 -1.547 -1.704 -1.922 -2.188 -2.499 -3.355 -9 ,14601 ,KEBNE ,16654768,Mon Nov 22 07:46:35 CET,Mon Nov 22 09:03:50 CET,0.0 0.159 0.283 0.395 0.495 0.585 0.674 0.762 0.92 0.993 1.063 1.134 1.268 1.331 1.46 1.575 1.678 1.736 1.857 1.953 2.077 2.167 2.259 2.386 2.507 2.619 2.731 2.848 2.995 3.131 3.259 3.413 3.571 3.72 3.892 4.098 4.294 4.502 4.735 4.981 5.234 5.509 5.817 6.111 6.434 6.768 7.107 7.468 7.853 8.181 8.27 7.981 7.512 6.947 6.362 5.821 5.341 4.896 4.515 4.116 3.756 3.442 3.146 2.848 2.562 2.302 2.019 1.761 1.547 1.339 1.125 0.94 0.747 0.537 0.357 0.176 -0.002 -0.195 -0.387 -0.518 -0.664 -0.892 -1.038 -1.185 -1.265 -1.432 -1.608 -1.8 -1.899 -2.075 -2.245 -2.365 -2.483 -2.733 -2.885 -3.06 -3.267 -3.499 -3.751 -4.109 -4.981 -10 ,13789 ,KEBNE ,16654769,Mon Nov 22 07:46:35 CET,Mon Nov 22 09:05:56 CET,0.0 0.195 0.329 0.454 0.571 0.677 0.759 0.833 0.975 1.048 1.119 1.182 1.313 1.376 1.496 1.617 1.732 1.784 1.886 1.983 2.128 2.218 2.307 2.437 2.561 2.681 2.801 2.924 3.079 3.235 3.391 3.578 3.757 3.922 4.116 4.338 4.54 4.755 4.989 5.247 5.508 5.784 6.092 6.393 6.732 7.089 7.472 7.827 8.179 8.523 8.615 8.235 7.719 7.169 6.635 6.122 5.631 5.179 4.796 4.412 4.053 3.715 3.391 3.086 2.809 2.541 2.267 2.025 1.799 1.569 1.335 1.138 0.941 0.739 0.573 0.396 0.229 0.056 -0.129 -0.252 -0.386 -0.601 -0.749 -0.913 -0.999 -1.178 -1.369 -1.555 -1.654 -1.822 -1.97 -2.086 -2.208 -2.455 -2.584 -2.747 -2.929 -3.135 -3.406 -3.79 -4.559 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt deleted file mode 100644 index af03d38a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,1955 ,KEBNE ,16654781,Mon Nov 22 07:47:35 CET,Mon Nov 22 09:08:44 CET,0.0 0.626 0.891 1.1 1.248 1.374 1.489 1.583 1.755 1.844 1.924 2.027 2.13 2.189 2.312 2.427 2.529 2.585 2.698 2.798 2.932 3.013 3.092 3.209 3.336 3.455 3.558 3.662 3.795 3.913 4.018 4.147 4.271 4.387 4.53 4.691 4.833 4.977 5.139 5.321 5.499 5.686 5.892 6.08 6.257 6.413 6.595 6.758 6.856 6.808 6.404 5.609 4.819 4.123 3.491 2.896 2.387 1.922 1.511 1.083 0.723 0.423 0.136 -0.148 -0.423 -0.676 -0.936 -1.16 -1.344 -1.543 -1.764 -1.954 -2.142 -2.33 -2.473 -2.621 -2.785 -2.953 -3.12 -3.234 -3.364 -3.565 -3.694 -3.834 -3.909 -4.063 -4.223 -4.403 -4.493 -4.63 -4.8 -4.919 -5.039 -5.305 -5.441 -5.565 -5.708 -5.893 -6.153 -6.466 -7.338 -4 ,9613 ,KEBNE ,16654783,Mon Nov 22 07:48:34 CET,Mon Nov 22 09:11:25 CET,0.0 0.608 0.839 1.002 1.121 1.243 1.364 1.48 1.68 1.764 1.844 1.958 2.076 2.145 2.276 2.398 2.514 2.567 2.669 2.774 2.909 2.995 3.076 3.202 3.33 3.449 3.566 3.676 3.806 3.927 4.041 4.182 4.31 4.436 4.589 4.751 4.902 5.056 5.206 5.363 5.539 5.734 5.922 6.101 6.303 6.496 6.666 6.802 6.901 6.856 6.486 5.778 5.043 4.382 3.786 3.229 2.747 2.291 1.873 1.45 1.069 0.721 0.408 0.117 -0.152 -0.402 -0.669 -0.901 -1.096 -1.299 -1.518 -1.695 -1.872 -2.061 -2.208 -2.367 -2.534 -2.702 -2.88 -3.004 -3.137 -3.346 -3.485 -3.621 -3.692 -3.849 -4.01 -4.17 -4.262 -4.403 -4.558 -4.665 -4.773 -5.018 -5.151 -5.297 -5.468 -5.645 -5.829 -6.102 -6.785 -5 ,4326 ,KEBNE ,16656932,Tue Nov 23 01:00:03 CET,Tue Nov 23 02:25:36 CET,0.0 0.318 0.455 0.556 0.646 0.743 0.826 0.884 0.986 1.035 1.079 1.142 1.237 1.288 1.365 1.442 1.532 1.583 1.682 1.775 1.91 1.981 2.046 2.154 2.27 2.375 2.468 2.56 2.67 2.785 2.905 3.047 3.187 3.321 3.479 3.651 3.807 3.97 4.128 4.285 4.458 4.65 4.859 5.038 5.234 5.453 5.63 5.781 5.905 5.862 5.476 4.768 4.031 3.323 2.701 2.139 1.644 1.166 0.728 0.31 -0.025 -0.33 -0.636 -0.923 -1.196 -1.448 -1.707 -1.93 -2.118 -2.326 -2.545 -2.72 -2.901 -3.097 -3.249 -3.4 -3.552 -3.709 -3.886 -4.013 -4.139 -4.327 -4.457 -4.592 -4.663 -4.824 -4.993 -5.171 -5.258 -5.385 -5.534 -5.642 -5.758 -6.019 -6.159 -6.3 -6.454 -6.628 -6.821 -7.107 -7.793 -6 ,2883 ,KEBNE ,16654785,Mon Nov 22 07:48:34 CET,Mon Nov 22 09:11:43 CET,0.0 0.515 0.787 0.978 1.122 1.24 1.362 1.487 1.686 1.764 1.844 1.955 2.059 2.122 2.245 2.358 2.468 2.519 2.617 2.722 2.857 2.931 3.002 3.114 3.224 3.323 3.416 3.508 3.63 3.738 3.84 3.974 4.1 4.215 4.347 4.506 4.646 4.785 4.928 5.08 5.243 5.414 5.589 5.751 5.928 6.111 6.332 6.509 6.573 6.541 6.243 5.528 4.798 4.107 3.493 2.944 2.426 1.978 1.602 1.171 0.803 0.492 0.199 -0.089 -0.361 -0.594 -0.845 -1.074 -1.262 -1.453 -1.654 -1.815 -1.979 -2.16 -2.308 -2.46 -2.621 -2.795 -2.98 -3.108 -3.232 -3.42 -3.562 -3.714 -3.789 -3.94 -4.108 -4.293 -4.387 -4.523 -4.672 -4.78 -4.898 -5.149 -5.284 -5.433 -5.601 -5.773 -5.967 -6.232 -6.998 -7 ,4365 ,KEBNE ,16656934,Tue Nov 23 01:00:03 CET,Tue Nov 23 02:26:09 CET,0.0 0.686 0.917 1.131 1.297 1.428 1.535 1.638 1.832 1.928 2.016 2.133 2.244 2.305 2.418 2.529 2.637 2.693 2.806 2.904 3.032 3.117 3.194 3.31 3.433 3.549 3.65 3.756 3.889 4.005 4.12 4.241 4.36 4.481 4.614 4.754 4.893 5.048 5.216 5.396 5.573 5.766 5.968 6.164 6.394 6.6 6.785 6.955 7.062 7.024 6.658 5.975 5.266 4.588 3.991 3.429 2.946 2.481 2.062 1.652 1.284 0.959 0.655 0.365 0.105 -0.115 -0.362 -0.595 -0.785 -0.988 -1.195 -1.365 -1.553 -1.756 -1.918 -2.073 -2.226 -2.384 -2.548 -2.664 -2.784 -2.97 -3.094 -3.221 -3.292 -3.436 -3.592 -3.758 -3.835 -3.957 -4.097 -4.206 -4.324 -4.572 -4.721 -4.883 -5.044 -5.208 -5.422 -5.757 -6.582 -8 ,4963 ,KEBNE ,16654787,Mon Nov 22 07:48:34 CET,Mon Nov 22 09:11:29 CET,0.0 0.516 0.765 0.93 1.069 1.179 1.285 1.399 1.603 1.695 1.777 1.878 1.984 2.053 2.18 2.308 2.43 2.491 2.602 2.697 2.833 2.923 3.006 3.121 3.235 3.34 3.433 3.532 3.66 3.782 3.908 4.054 4.179 4.307 4.458 4.61 4.765 4.925 5.086 5.254 5.43 5.625 5.851 6.069 6.283 6.484 6.652 6.792 6.901 6.879 6.539 5.911 5.236 4.504 3.853 3.272 2.767 2.307 1.887 1.468 1.143 0.854 0.563 0.29 0.018 -0.224 -0.469 -0.699 -0.895 -1.088 -1.284 -1.449 -1.625 -1.822 -1.971 -2.113 -2.269 -2.45 -2.637 -2.752 -2.876 -3.083 -3.223 -3.363 -3.431 -3.577 -3.749 -3.933 -4.024 -4.163 -4.317 -4.421 -4.532 -4.763 -4.893 -5.047 -5.214 -5.378 -5.589 -5.875 -6.831 -9 ,24604 ,KEBNE ,16656936,Tue Nov 23 01:00:03 CET,Tue Nov 23 02:25:43 CET,0.0 0.522 0.723 0.882 1.013 1.135 1.245 1.337 1.522 1.61 1.692 1.805 1.903 1.961 2.076 2.191 2.304 2.359 2.462 2.551 2.679 2.765 2.846 2.967 3.086 3.194 3.299 3.405 3.541 3.663 3.772 3.911 4.047 4.168 4.3 4.44 4.567 4.714 4.897 5.091 5.268 5.449 5.647 5.826 6.027 6.242 6.419 6.565 6.668 6.65 6.278 5.48 4.721 4.006 3.357 2.784 2.275 1.806 1.402 1.0 0.657 0.342 0.032 -0.261 -0.524 -0.765 -1.033 -1.264 -1.465 -1.681 -1.89 -2.054 -2.229 -2.412 -2.56 -2.715 -2.873 -3.039 -3.211 -3.329 -3.451 -3.646 -3.785 -3.914 -3.976 -4.119 -4.282 -4.452 -4.538 -4.676 -4.825 -4.932 -5.049 -5.319 -5.471 -5.613 -5.765 -5.934 -6.15 -6.46 -7.406 -10 ,48 ,KEBNE ,16656937,Tue Nov 23 01:00:03 CET,Tue Nov 23 02:24:46 CET,0.0 0.68 0.909 1.107 1.267 1.413 1.542 1.646 1.811 1.887 1.966 2.078 2.19 2.266 2.392 2.505 2.612 2.668 2.777 2.874 3.021 3.111 3.19 3.318 3.443 3.552 3.653 3.752 3.88 4.009 4.133 4.283 4.423 4.55 4.695 4.854 4.995 5.16 5.336 5.505 5.686 5.876 6.046 6.218 6.439 6.654 6.83 6.949 7.04 6.991 6.574 5.831 5.09 4.383 3.749 3.173 2.661 2.199 1.803 1.401 1.033 0.704 0.395 0.102 -0.15 -0.381 -0.633 -0.861 -1.067 -1.275 -1.479 -1.65 -1.843 -2.052 -2.206 -2.363 -2.527 -2.691 -2.862 -2.984 -3.109 -3.308 -3.438 -3.572 -3.647 -3.796 -3.951 -4.133 -4.232 -4.375 -4.528 -4.631 -4.748 -5.002 -5.144 -5.301 -5.464 -5.646 -5.881 -6.203 -7.491 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt deleted file mode 100644 index 9c9be43d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13000 ,KEBNE ,16654790,Mon Nov 22 07:48:35 CET,Mon Nov 22 09:11:12 CET,0.0 0.518 0.732 0.87 1.013 1.161 1.284 1.393 1.612 1.704 1.784 1.918 2.029 2.095 2.228 2.351 2.472 2.525 2.616 2.709 2.845 2.927 2.999 3.115 3.228 3.338 3.442 3.54 3.672 3.793 3.908 4.042 4.166 4.284 4.419 4.569 4.699 4.828 4.97 5.114 5.265 5.445 5.662 5.86 6.035 6.193 6.369 6.497 6.521 6.434 6.0 5.185 4.439 3.776 3.16 2.59 2.088 1.625 1.237 0.848 0.52 0.234 -0.052 -0.336 -0.598 -0.829 -1.064 -1.284 -1.482 -1.679 -1.881 -2.054 -2.237 -2.427 -2.569 -2.715 -2.872 -3.031 -3.188 -3.301 -3.423 -3.615 -3.746 -3.877 -3.948 -4.098 -4.249 -4.406 -4.483 -4.612 -4.749 -4.852 -4.961 -5.197 -5.343 -5.508 -5.687 -5.884 -6.126 -6.405 -7.282 -2 ,25047 ,KEBNE ,16654791,Mon Nov 22 07:48:38 CET,Mon Nov 22 09:09:06 CET,0.0 0.482 0.702 0.882 1.037 1.171 1.288 1.402 1.602 1.688 1.768 1.875 1.982 2.05 2.183 2.314 2.442 2.499 2.606 2.709 2.842 2.934 3.029 3.148 3.259 3.366 3.468 3.559 3.667 3.784 3.91 4.05 4.169 4.283 4.41 4.559 4.701 4.844 4.996 5.16 5.323 5.472 5.632 5.783 5.935 6.085 6.221 6.351 6.425 6.335 5.917 5.155 4.455 3.809 3.192 2.652 2.203 1.764 1.369 0.996 0.676 0.389 0.101 -0.187 -0.448 -0.687 -0.935 -1.153 -1.339 -1.541 -1.752 -1.924 -2.112 -2.312 -2.458 -2.607 -2.768 -2.928 -3.085 -3.193 -3.303 -3.493 -3.627 -3.763 -3.831 -3.964 -4.109 -4.255 -4.329 -4.458 -4.584 -4.679 -4.773 -4.959 -5.054 -5.156 -5.28 -5.432 -5.625 -5.878 -6.321 -3 ,15839 ,KEBNE ,16654792,Mon Nov 22 07:48:34 CET,Mon Nov 22 09:11:07 CET,0.0 0.518 0.743 0.898 1.053 1.177 1.301 1.41 1.575 1.672 1.765 1.876 1.982 2.05 2.174 2.272 2.36 2.408 2.506 2.59 2.709 2.8 2.887 3.007 3.122 3.238 3.349 3.45 3.576 3.691 3.799 3.938 4.066 4.179 4.305 4.436 4.575 4.742 4.897 5.04 5.196 5.355 5.507 5.651 5.815 5.97 6.138 6.316 6.424 6.366 5.905 5.081 4.27 3.549 2.902 2.318 1.81 1.34 0.932 0.514 0.16 -0.154 -0.444 -0.704 -0.951 -1.191 -1.454 -1.68 -1.87 -2.08 -2.305 -2.483 -2.665 -2.855 -3.011 -3.161 -3.311 -3.472 -3.632 -3.746 -3.865 -4.048 -4.182 -4.329 -4.4 -4.538 -4.687 -4.842 -4.927 -5.065 -5.204 -5.305 -5.41 -5.608 -5.716 -5.824 -5.961 -6.132 -6.317 -6.539 -7.125 -4 ,29347 ,KEBNE ,16656941,Tue Nov 23 01:00:03 CET,Tue Nov 23 02:26:34 CET,0.0 0.795 1.056 1.252 1.408 1.535 1.662 1.774 1.956 2.036 2.117 2.231 2.34 2.407 2.537 2.659 2.773 2.833 2.943 3.038 3.172 3.25 3.326 3.438 3.546 3.646 3.733 3.829 3.96 4.089 4.22 4.36 4.488 4.612 4.75 4.902 5.045 5.207 5.371 5.518 5.678 5.855 6.033 6.183 6.337 6.509 6.66 6.77 6.785 6.606 6.088 5.294 4.571 3.905 3.309 2.76 2.259 1.798 1.408 1.028 0.698 0.39 0.085 -0.208 -0.47 -0.7 -0.952 -1.168 -1.349 -1.543 -1.746 -1.911 -2.075 -2.25 -2.395 -2.543 -2.693 -2.851 -3.016 -3.13 -3.244 -3.429 -3.561 -3.699 -3.77 -3.923 -4.075 -4.214 -4.293 -4.422 -4.563 -4.663 -4.755 -4.977 -5.114 -5.248 -5.399 -5.572 -5.749 -5.981 -6.714 -5 ,7981 ,KEBNE ,16654794,Mon Nov 22 07:48:34 CET,Mon Nov 22 09:12:33 CET,0.0 0.286 0.438 0.576 0.682 0.769 0.85 0.937 1.106 1.183 1.256 1.349 1.458 1.533 1.66 1.774 1.877 1.923 2.022 2.121 2.266 2.356 2.442 2.565 2.677 2.782 2.883 2.983 3.108 3.228 3.342 3.464 3.577 3.694 3.83 3.982 4.124 4.279 4.454 4.624 4.782 4.951 5.129 5.291 5.457 5.611 5.756 5.85 5.854 5.693 5.174 4.417 3.691 2.999 2.4 1.848 1.342 0.864 0.457 0.067 -0.28 -0.599 -0.89 -1.162 -1.412 -1.628 -1.862 -2.069 -2.245 -2.434 -2.639 -2.816 -2.997 -3.177 -3.322 -3.477 -3.627 -3.78 -3.947 -4.057 -4.17 -4.352 -4.475 -4.602 -4.666 -4.798 -4.946 -5.096 -5.177 -5.313 -5.451 -5.544 -5.643 -5.861 -5.979 -6.11 -6.253 -6.426 -6.644 -6.884 -7.384 -6 ,6022 ,KEBNE ,16656943,Tue Nov 23 01:01:05 CET,Tue Nov 23 02:28:37 CET,0.0 0.666 0.91 1.085 1.209 1.327 1.449 1.559 1.721 1.799 1.879 1.974 2.065 2.115 2.218 2.323 2.432 2.479 2.562 2.648 2.76 2.82 2.882 2.979 3.071 3.162 3.249 3.328 3.434 3.553 3.674 3.822 3.955 4.07 4.201 4.347 4.479 4.605 4.752 4.913 5.064 5.232 5.425 5.588 5.761 5.932 6.081 6.19 6.235 6.172 5.774 5.02 4.279 3.598 3.003 2.465 1.977 1.509 1.106 0.715 0.374 0.074 -0.219 -0.503 -0.764 -1.001 -1.243 -1.457 -1.651 -1.871 -2.102 -2.288 -2.482 -2.679 -2.831 -2.981 -3.133 -3.288 -3.445 -3.552 -3.669 -3.874 -4.011 -4.141 -4.209 -4.355 -4.513 -4.671 -4.749 -4.878 -5.016 -5.112 -5.208 -5.436 -5.558 -5.669 -5.812 -5.991 -6.223 -6.566 -7.145 -7 ,7693 ,KEBNE ,16654796,Mon Nov 22 07:48:38 CET,Mon Nov 22 09:09:10 CET,0.0 0.489 0.709 0.868 1.011 1.127 1.224 1.314 1.513 1.605 1.683 1.782 1.874 1.934 2.062 2.179 2.285 2.344 2.448 2.553 2.711 2.799 2.891 3.027 3.145 3.251 3.347 3.437 3.557 3.67 3.779 3.926 4.064 4.179 4.314 4.462 4.596 4.748 4.891 5.038 5.186 5.341 5.534 5.706 5.87 6.028 6.157 6.231 6.267 6.152 5.652 4.888 4.122 3.414 2.814 2.243 1.721 1.264 0.861 0.443 0.091 -0.209 -0.508 -0.794 -1.046 -1.275 -1.513 -1.717 -1.9 -2.097 -2.303 -2.481 -2.67 -2.875 -3.032 -3.179 -3.334 -3.498 -3.663 -3.772 -3.885 -4.072 -4.203 -4.342 -4.412 -4.558 -4.712 -4.87 -4.957 -5.093 -5.232 -5.328 -5.435 -5.693 -5.837 -5.976 -6.122 -6.289 -6.506 -6.833 -7.566 -8 ,799 ,KEBNE ,16654797,Mon Nov 22 07:49:37 CET,Mon Nov 22 09:14:13 CET,0.0 0.692 0.953 1.148 1.317 1.49 1.632 1.739 1.926 2.0 2.076 2.191 2.298 2.363 2.49 2.615 2.725 2.777 2.875 2.968 3.109 3.198 3.29 3.43 3.565 3.69 3.804 3.913 4.054 4.182 4.301 4.449 4.582 4.696 4.838 4.992 5.128 5.266 5.4 5.56 5.735 5.92 6.116 6.291 6.472 6.631 6.763 6.851 6.85 6.718 6.254 5.421 4.65 3.96 3.311 2.71 2.237 1.816 1.413 1.023 0.683 0.375 0.09 -0.181 -0.425 -0.658 -0.909 -1.121 -1.299 -1.486 -1.677 -1.834 -2.004 -2.19 -2.337 -2.485 -2.637 -2.794 -2.952 -3.065 -3.189 -3.393 -3.531 -3.668 -3.737 -3.874 -4.012 -4.169 -4.261 -4.403 -4.55 -4.643 -4.738 -4.984 -5.119 -5.254 -5.409 -5.579 -5.787 -6.044 -7.006 -9 ,3673 ,KEBNE ,16656946,Tue Nov 23 01:02:11 CET,Tue Nov 23 02:22:44 CET,0.0 0.577 0.793 0.956 1.091 1.217 1.328 1.425 1.59 1.672 1.761 1.886 1.991 2.057 2.19 2.309 2.422 2.472 2.564 2.671 2.826 2.907 2.986 3.107 3.217 3.32 3.425 3.528 3.653 3.77 3.881 4.015 4.144 4.266 4.4 4.547 4.681 4.831 4.99 5.139 5.301 5.478 5.666 5.838 6.028 6.214 6.351 6.428 6.445 6.326 5.879 5.103 4.343 3.659 3.06 2.506 1.995 1.512 1.107 0.72 0.378 0.078 -0.194 -0.452 -0.697 -0.914 -1.142 -1.376 -1.576 -1.762 -1.961 -2.126 -2.287 -2.472 -2.615 -2.749 -2.899 -3.059 -3.222 -3.336 -3.45 -3.628 -3.752 -3.872 -3.938 -4.093 -4.252 -4.422 -4.515 -4.654 -4.805 -4.903 -5.008 -5.231 -5.349 -5.482 -5.634 -5.813 -6.027 -6.283 -6.962 -10 ,9471 ,KEBNE ,16656947,Tue Nov 23 01:04:11 CET,Tue Nov 23 02:27:47 CET,0.0 0.92 1.236 1.469 1.646 1.761 1.868 1.964 2.136 2.222 2.301 2.405 2.505 2.577 2.719 2.845 2.945 2.993 3.091 3.183 3.317 3.391 3.465 3.595 3.718 3.831 3.931 4.026 4.158 4.268 4.373 4.505 4.638 4.765 4.893 5.031 5.171 5.325 5.484 5.646 5.805 5.962 6.117 6.26 6.437 6.601 6.704 6.789 6.83 6.717 6.243 5.427 4.651 3.92 3.241 2.645 2.134 1.656 1.268 0.901 0.56 0.24 -0.065 -0.349 -0.604 -0.83 -1.073 -1.296 -1.492 -1.694 -1.907 -2.095 -2.292 -2.477 -2.608 -2.75 -2.896 -3.047 -3.203 -3.312 -3.43 -3.613 -3.74 -3.882 -3.959 -4.102 -4.254 -4.427 -4.511 -4.64 -4.77 -4.867 -4.978 -5.211 -5.346 -5.492 -5.643 -5.808 -5.975 -6.244 -7.059 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402751-2100_CHEMBL3402752-30000.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402751-2100_CHEMBL3402752-30000.txt deleted file mode 100644 index 7fc44b1e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402751-2100_CHEMBL3402752-30000.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2201 ,KEBNE ,17043595,Thu Dec 23 04:43:33 CET,Thu Dec 23 06:10:31 CET,0.0 0.468 0.616 0.722 0.806 0.874 0.944 1.022 1.165 1.232 1.292 1.342 1.437 1.488 1.58 1.652 1.719 1.756 1.834 1.909 2.015 2.086 2.154 2.245 2.322 2.397 2.474 2.552 2.657 2.764 2.861 2.979 3.088 3.186 3.316 3.449 3.557 3.678 3.806 3.935 4.075 4.221 4.369 4.492 4.615 4.748 4.871 4.953 4.938 4.775 4.243 3.401 2.643 1.915 1.281 0.729 0.227 -0.238 -0.641 -1.033 -1.369 -1.672 -1.958 -2.243 -2.511 -2.754 -3.007 -3.224 -3.407 -3.601 -3.792 -3.936 -4.086 -4.251 -4.372 -4.496 -4.631 -4.764 -4.911 -5.012 -5.11 -5.272 -5.381 -5.486 -5.543 -5.659 -5.785 -5.911 -5.971 -6.091 -6.165 -6.237 -6.307 -6.448 -6.531 -6.632 -6.725 -6.819 -6.946 -7.137 -7.506 -2 ,23710 ,KEBNE ,17043596,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:10:40 CET,0.0 0.296 0.439 0.547 0.627 0.715 0.783 0.844 0.959 1.021 1.08 1.126 1.223 1.273 1.368 1.453 1.53 1.565 1.638 1.722 1.835 1.899 1.963 2.067 2.178 2.28 2.374 2.465 2.577 2.684 2.784 2.905 3.02 3.133 3.26 3.388 3.518 3.66 3.79 3.913 4.05 4.201 4.348 4.467 4.588 4.701 4.784 4.84 4.839 4.645 4.055 3.184 2.362 1.603 0.939 0.33 -0.191 -0.652 -1.054 -1.454 -1.8 -2.103 -2.385 -2.664 -2.913 -3.128 -3.36 -3.575 -3.768 -3.975 -4.192 -4.369 -4.558 -4.743 -4.877 -5.012 -5.144 -5.282 -5.421 -5.512 -5.606 -5.753 -5.849 -5.949 -5.999 -6.109 -6.235 -6.356 -6.417 -6.542 -6.643 -6.723 -6.803 -6.961 -7.045 -7.145 -7.25 -7.351 -7.458 -7.572 -7.871 -3 ,6713 ,KEBNE ,17043597,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:10:44 CET,0.0 0.373 0.537 0.701 0.841 0.933 1.02 1.094 1.229 1.287 1.331 1.387 1.489 1.54 1.625 1.709 1.787 1.82 1.881 1.945 2.041 2.095 2.146 2.23 2.312 2.391 2.463 2.537 2.633 2.719 2.801 2.897 2.99 3.069 3.155 3.252 3.34 3.436 3.544 3.643 3.736 3.862 4.014 4.138 4.272 4.417 4.538 4.593 4.59 4.44 3.906 3.025 2.19 1.461 0.815 0.242 -0.247 -0.699 -1.099 -1.509 -1.859 -2.167 -2.475 -2.761 -3.008 -3.221 -3.429 -3.614 -3.784 -3.955 -4.118 -4.252 -4.396 -4.55 -4.667 -4.788 -4.923 -5.056 -5.193 -5.291 -5.383 -5.525 -5.626 -5.734 -5.792 -5.908 -6.02 -6.136 -6.193 -6.309 -6.389 -6.466 -6.542 -6.681 -6.779 -6.889 -6.979 -7.09 -7.215 -7.367 -7.762 -4 ,2172 ,KEBNE ,17043598,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:10:22 CET,0.0 0.471 0.627 0.74 0.839 0.946 1.033 1.089 1.203 1.261 1.321 1.382 1.479 1.531 1.623 1.701 1.771 1.805 1.88 1.966 2.084 2.144 2.204 2.296 2.38 2.461 2.536 2.61 2.699 2.781 2.863 2.973 3.074 3.157 3.255 3.365 3.462 3.562 3.658 3.748 3.855 3.983 4.125 4.278 4.422 4.534 4.661 4.753 4.739 4.581 4.069 3.239 2.442 1.695 1.047 0.473 -0.037 -0.486 -0.889 -1.303 -1.655 -1.965 -2.252 -2.52 -2.766 -2.984 -3.223 -3.452 -3.647 -3.835 -4.022 -4.191 -4.379 -4.558 -4.688 -4.821 -4.95 -5.083 -5.21 -5.296 -5.397 -5.546 -5.638 -5.741 -5.793 -5.892 -6.002 -6.12 -6.187 -6.309 -6.39 -6.46 -6.534 -6.727 -6.832 -6.931 -7.032 -7.156 -7.303 -7.448 -7.793 -5 ,31018 ,KEBNE ,17043599,Thu Dec 23 04:43:33 CET,Thu Dec 23 06:10:38 CET,0.0 0.967 1.125 1.226 1.293 1.362 1.443 1.521 1.658 1.724 1.784 1.86 1.958 2.0 2.099 2.2 2.3 2.35 2.441 2.52 2.631 2.7 2.766 2.864 2.971 3.092 3.193 3.288 3.418 3.537 3.633 3.729 3.832 3.938 4.049 4.176 4.292 4.415 4.55 4.688 4.837 4.984 5.122 5.252 5.384 5.49 5.564 5.594 5.571 5.353 4.739 3.836 3.01 2.273 1.637 1.053 0.53 0.065 -0.323 -0.723 -1.07 -1.376 -1.678 -1.951 -2.185 -2.412 -2.671 -2.898 -3.089 -3.283 -3.479 -3.648 -3.823 -4.0 -4.149 -4.296 -4.436 -4.58 -4.723 -4.821 -4.93 -5.106 -5.215 -5.329 -5.387 -5.495 -5.598 -5.711 -5.773 -5.889 -5.957 -6.028 -6.106 -6.263 -6.346 -6.443 -6.551 -6.663 -6.795 -7.008 -7.526 -6 ,20407 ,KEBNE ,17043600,Thu Dec 23 04:43:33 CET,Thu Dec 23 06:12:38 CET,0.0 0.439 0.591 0.685 0.774 0.88 0.971 1.045 1.181 1.244 1.301 1.357 1.456 1.501 1.58 1.667 1.752 1.789 1.86 1.932 2.046 2.122 2.197 2.311 2.42 2.523 2.619 2.709 2.826 2.934 3.035 3.147 3.257 3.37 3.487 3.614 3.733 3.851 3.978 4.114 4.257 4.396 4.548 4.707 4.859 4.997 5.131 5.2 5.159 4.992 4.484 3.65 2.893 2.19 1.55 0.952 0.432 -0.023 -0.414 -0.795 -1.128 -1.419 -1.692 -1.952 -2.189 -2.4 -2.612 -2.798 -2.966 -3.133 -3.301 -3.443 -3.595 -3.753 -3.865 -3.982 -4.106 -4.231 -4.361 -4.449 -4.534 -4.671 -4.772 -4.88 -4.934 -5.048 -5.173 -5.302 -5.365 -5.485 -5.582 -5.662 -5.737 -5.899 -5.997 -6.096 -6.193 -6.293 -6.422 -6.572 -7.032 -7 ,16360 ,KEBNE ,17043601,Thu Dec 23 04:43:33 CET,Thu Dec 23 06:11:16 CET,0.0 0.44 0.598 0.705 0.797 0.89 0.978 1.058 1.195 1.256 1.312 1.378 1.479 1.525 1.615 1.7 1.787 1.832 1.921 1.997 2.09 2.156 2.218 2.299 2.369 2.436 2.507 2.577 2.673 2.754 2.823 2.915 3.003 3.091 3.208 3.339 3.45 3.581 3.723 3.879 4.038 4.179 4.311 4.454 4.627 4.759 4.86 4.923 4.892 4.69 4.117 3.198 2.36 1.653 1.031 0.475 -0.009 -0.469 -0.862 -1.266 -1.625 -1.931 -2.225 -2.509 -2.773 -3.0 -3.231 -3.443 -3.622 -3.82 -4.034 -4.208 -4.385 -4.562 -4.7 -4.836 -4.967 -5.099 -5.234 -5.329 -5.426 -5.571 -5.663 -5.766 -5.827 -5.949 -6.072 -6.206 -6.274 -6.398 -6.475 -6.537 -6.614 -6.783 -6.88 -6.977 -7.067 -7.166 -7.319 -7.497 -7.801 -8 ,10810 ,KEBNE ,17043602,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:10:36 CET,0.0 0.357 0.476 0.575 0.683 0.78 0.85 0.916 1.059 1.127 1.184 1.249 1.347 1.39 1.478 1.564 1.638 1.675 1.746 1.815 1.908 1.963 2.025 2.126 2.218 2.298 2.371 2.44 2.524 2.606 2.687 2.786 2.866 2.929 3.015 3.113 3.206 3.302 3.396 3.504 3.627 3.746 3.856 3.972 4.106 4.241 4.366 4.446 4.422 4.197 3.617 2.771 1.967 1.249 0.609 0.005 -0.512 -0.961 -1.367 -1.782 -2.133 -2.441 -2.723 -2.985 -3.217 -3.418 -3.625 -3.813 -3.984 -4.163 -4.335 -4.469 -4.616 -4.77 -4.892 -5.017 -5.143 -5.277 -5.419 -5.518 -5.617 -5.764 -5.863 -5.967 -6.019 -6.134 -6.256 -6.368 -6.43 -6.549 -6.624 -6.695 -6.772 -6.918 -7.009 -7.11 -7.207 -7.322 -7.446 -7.598 -7.927 -9 ,32513 ,KEBNE ,17043603,Thu Dec 23 04:43:33 CET,Thu Dec 23 06:12:02 CET,0.0 0.326 0.493 0.631 0.729 0.809 0.901 0.986 1.118 1.179 1.25 1.337 1.443 1.491 1.578 1.664 1.741 1.776 1.848 1.915 2.004 2.061 2.118 2.195 2.27 2.363 2.456 2.535 2.633 2.719 2.799 2.89 2.965 3.041 3.137 3.24 3.334 3.447 3.572 3.709 3.847 3.988 4.143 4.269 4.412 4.565 4.657 4.692 4.646 4.428 3.868 3.0 2.191 1.471 0.846 0.259 -0.277 -0.74 -1.12 -1.514 -1.85 -2.154 -2.457 -2.748 -3.014 -3.252 -3.5 -3.714 -3.895 -4.071 -4.257 -4.414 -4.565 -4.726 -4.851 -4.971 -5.098 -5.225 -5.351 -5.438 -5.524 -5.659 -5.763 -5.872 -5.925 -6.04 -6.164 -6.282 -6.343 -6.465 -6.539 -6.603 -6.678 -6.853 -6.944 -7.039 -7.135 -7.25 -7.378 -7.54 -8.047 -10 ,3749 ,KEBNE ,17043604,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:10:57 CET,0.0 0.446 0.636 0.762 0.865 0.955 1.034 1.111 1.234 1.297 1.36 1.441 1.547 1.598 1.693 1.769 1.846 1.884 1.954 2.032 2.158 2.229 2.292 2.394 2.488 2.569 2.641 2.711 2.794 2.878 2.966 3.062 3.151 3.233 3.322 3.42 3.507 3.59 3.685 3.789 3.882 3.978 4.067 4.141 4.239 4.361 4.463 4.487 4.44 4.27 3.696 2.846 2.061 1.316 0.698 0.161 -0.331 -0.807 -1.219 -1.627 -1.964 -2.27 -2.584 -2.858 -3.096 -3.331 -3.575 -3.775 -3.952 -4.126 -4.292 -4.43 -4.583 -4.737 -4.858 -4.981 -5.104 -5.237 -5.377 -5.473 -5.565 -5.709 -5.81 -5.916 -5.973 -6.091 -6.207 -6.326 -6.38 -6.496 -6.577 -6.643 -6.713 -6.875 -6.968 -7.068 -7.164 -7.249 -7.377 -7.549 -7.988 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt deleted file mode 100644 index 33ca21e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3737 ,KEBNE ,16656948,Tue Nov 23 01:05:13 CET,Tue Nov 23 02:29:18 CET,0.0 0.554 0.755 0.901 1.009 1.129 1.243 1.342 1.516 1.588 1.652 1.717 1.836 1.902 2.032 2.144 2.246 2.299 2.398 2.498 2.64 2.728 2.819 2.954 3.077 3.194 3.312 3.423 3.571 3.718 3.858 4.039 4.221 4.396 4.586 4.798 5.001 5.224 5.459 5.702 5.967 6.28 6.638 6.995 7.424 7.921 8.508 9.181 9.937 10.746 11.606 12.112 12.285 12.307 12.278 12.215 12.122 11.994 11.842 11.666 11.512 11.378 11.23 11.085 10.955 10.826 10.683 10.552 10.443 10.335 10.211 10.101 9.992 9.889 9.804 9.728 9.659 9.581 9.506 9.441 9.365 9.252 9.175 9.1 9.063 8.99 8.918 8.834 8.786 8.695 8.652 8.599 8.55 8.447 8.392 8.334 8.269 8.193 8.077 7.923 7.097 -2 ,11924 ,KEBNE ,16656949,Tue Nov 23 01:05:13 CET,Tue Nov 23 02:29:48 CET,0.0 0.336 0.506 0.668 0.814 0.938 1.052 1.15 1.311 1.384 1.455 1.539 1.662 1.725 1.846 1.975 2.098 2.15 2.252 2.351 2.498 2.598 2.69 2.813 2.935 3.052 3.169 3.298 3.458 3.601 3.742 3.912 4.083 4.253 4.457 4.69 4.926 5.177 5.436 5.715 6.004 6.335 6.738 7.141 7.593 8.1 8.696 9.359 10.084 10.883 11.708 12.211 12.375 12.401 12.356 12.271 12.161 12.021 11.881 11.722 11.571 11.439 11.306 11.165 11.034 10.921 10.795 10.664 10.552 10.442 10.324 10.224 10.11 9.987 9.897 9.801 9.715 9.643 9.559 9.497 9.437 9.341 9.263 9.183 9.146 9.048 8.913 8.764 8.702 8.603 8.536 8.478 8.415 8.277 8.209 8.126 8.021 7.913 7.805 7.624 7.074 -3 ,15220 ,KEBNE ,16656950,Tue Nov 23 01:05:13 CET,Tue Nov 23 02:28:57 CET,0.0 0.457 0.647 0.8 0.9 0.98 1.067 1.152 1.318 1.399 1.472 1.544 1.655 1.706 1.813 1.926 2.036 2.088 2.181 2.271 2.41 2.507 2.598 2.739 2.889 3.031 3.178 3.328 3.502 3.667 3.835 4.024 4.208 4.394 4.601 4.826 5.05 5.309 5.578 5.853 6.173 6.553 6.976 7.384 7.83 8.334 8.934 9.571 10.271 11.093 11.964 12.466 12.655 12.707 12.647 12.526 12.389 12.24 12.11 11.963 11.807 11.663 11.515 11.364 11.218 11.078 10.926 10.794 10.681 10.565 10.449 10.35 10.249 10.145 10.061 9.973 9.877 9.784 9.683 9.609 9.529 9.398 9.317 9.237 9.193 9.098 9.007 8.913 8.863 8.76 8.674 8.614 8.554 8.414 8.341 8.25 8.149 8.053 7.951 7.813 7.403 -4 ,10325 ,KEBNE ,16654803,Mon Nov 22 07:49:36 CET,Mon Nov 22 09:12:21 CET,0.0 0.486 0.629 0.764 0.869 0.971 1.069 1.151 1.307 1.387 1.457 1.528 1.646 1.707 1.831 1.942 2.04 2.092 2.207 2.314 2.464 2.563 2.661 2.801 2.923 3.039 3.164 3.285 3.441 3.592 3.732 3.9 4.06 4.215 4.395 4.604 4.809 5.043 5.305 5.585 5.87 6.2 6.613 7.034 7.526 8.046 8.634 9.309 10.075 10.872 11.695 12.211 12.371 12.353 12.277 12.179 12.066 11.933 11.784 11.621 11.466 11.311 11.18 11.057 10.931 10.81 10.684 10.573 10.469 10.35 10.226 10.129 10.02 9.894 9.804 9.712 9.61 9.503 9.4 9.329 9.254 9.141 9.054 8.957 8.914 8.834 8.746 8.658 8.613 8.52 8.455 8.387 8.325 8.2 8.127 8.051 7.978 7.888 7.751 7.57 7.111 -5 ,6609 ,KEBNE ,16656952,Tue Nov 23 01:06:15 CET,Tue Nov 23 02:31:37 CET,0.0 0.3 0.467 0.603 0.701 0.798 0.883 0.965 1.148 1.232 1.299 1.375 1.493 1.557 1.684 1.805 1.927 1.987 2.097 2.196 2.345 2.446 2.538 2.671 2.812 2.944 3.068 3.187 3.337 3.489 3.648 3.844 4.037 4.225 4.439 4.682 4.915 5.171 5.459 5.758 6.061 6.399 6.788 7.179 7.642 8.147 8.708 9.339 10.061 10.843 11.683 12.209 12.392 12.412 12.325 12.213 12.104 11.978 11.856 11.716 11.582 11.446 11.299 11.159 11.024 10.896 10.772 10.659 10.565 10.48 10.39 10.318 10.233 10.132 10.057 9.983 9.908 9.823 9.731 9.667 9.604 9.51 9.446 9.379 9.344 9.274 9.195 9.114 9.076 8.983 8.918 8.856 8.797 8.669 8.599 8.525 8.434 8.315 8.187 8.01 7.561 -6 ,27193 ,KEBNE ,16656953,Tue Nov 23 01:06:18 CET,Tue Nov 23 02:29:52 CET,0.0 0.348 0.478 0.587 0.685 0.792 0.893 0.984 1.155 1.236 1.305 1.391 1.515 1.579 1.704 1.823 1.939 1.995 2.104 2.212 2.375 2.483 2.593 2.754 2.901 3.042 3.185 3.325 3.493 3.652 3.809 4.005 4.198 4.379 4.588 4.836 5.078 5.335 5.607 5.894 6.199 6.547 6.947 7.357 7.821 8.336 8.929 9.587 10.33 11.156 12.048 12.557 12.737 12.789 12.721 12.617 12.487 12.341 12.205 12.052 11.897 11.743 11.596 11.446 11.307 11.184 11.047 10.917 10.8 10.68 10.55 10.429 10.305 10.19 10.103 10.014 9.919 9.817 9.714 9.637 9.567 9.476 9.412 9.345 9.308 9.221 9.138 9.047 8.993 8.897 8.845 8.789 8.73 8.611 8.547 8.464 8.372 8.285 8.189 8.058 7.616 -7 ,194 ,KEBNE ,16654806,Mon Nov 22 07:49:37 CET,Mon Nov 22 09:12:19 CET,0.0 0.411 0.578 0.702 0.822 0.936 1.032 1.113 1.268 1.347 1.421 1.506 1.625 1.682 1.802 1.919 2.04 2.101 2.21 2.329 2.517 2.637 2.753 2.916 3.066 3.201 3.328 3.457 3.628 3.803 3.972 4.165 4.351 4.539 4.753 4.983 5.213 5.478 5.766 6.067 6.379 6.727 7.122 7.522 7.998 8.511 9.083 9.742 10.485 11.28 12.142 12.668 12.839 12.829 12.768 12.697 12.578 12.417 12.268 12.136 12.004 11.866 11.73 11.607 11.483 11.352 11.222 11.102 10.989 10.882 10.776 10.685 10.588 10.481 10.408 10.338 10.258 10.179 10.093 10.03 9.968 9.864 9.788 9.713 9.671 9.587 9.501 9.412 9.362 9.26 9.197 9.132 9.073 8.943 8.868 8.801 8.726 8.637 8.552 8.465 7.686 -8 ,25253 ,KEBNE ,16656955,Tue Nov 23 01:06:14 CET,Tue Nov 23 02:30:34 CET,0.0 0.283 0.427 0.562 0.697 0.802 0.888 0.968 1.135 1.216 1.28 1.344 1.456 1.515 1.636 1.754 1.865 1.918 2.02 2.124 2.275 2.37 2.47 2.619 2.766 2.912 3.057 3.193 3.352 3.516 3.694 3.901 4.096 4.282 4.492 4.724 4.955 5.209 5.479 5.77 6.076 6.421 6.811 7.183 7.618 8.107 8.685 9.302 9.99 10.775 11.585 12.065 12.248 12.306 12.282 12.228 12.133 12.021 11.912 11.774 11.645 11.513 11.374 11.245 11.115 11.0 10.874 10.752 10.653 10.544 10.421 10.31 10.194 10.078 9.984 9.89 9.798 9.693 9.575 9.492 9.413 9.286 9.187 9.085 9.036 8.944 8.849 8.748 8.695 8.596 8.542 8.49 8.43 8.307 8.25 8.198 8.12 8.024 7.911 7.772 7.467 -9 ,13318 ,KEBNE ,16656956,Tue Nov 23 01:06:18 CET,Tue Nov 23 02:31:46 CET,0.0 0.572 0.761 0.901 1.016 1.121 1.216 1.296 1.452 1.535 1.615 1.721 1.862 1.945 2.077 2.19 2.311 2.37 2.472 2.569 2.717 2.813 2.904 3.036 3.167 3.289 3.405 3.518 3.662 3.812 3.965 4.144 4.313 4.471 4.648 4.852 5.044 5.261 5.507 5.78 6.078 6.417 6.807 7.199 7.656 8.164 8.738 9.366 10.06 10.837 11.7 12.194 12.367 12.418 12.38 12.268 12.144 12.013 11.882 11.733 11.593 11.458 11.317 11.193 11.07 10.943 10.813 10.703 10.609 10.507 10.39 10.293 10.194 10.079 9.979 9.88 9.784 9.677 9.572 9.501 9.434 9.354 9.296 9.231 9.195 9.121 9.044 8.957 8.908 8.807 8.736 8.676 8.617 8.487 8.41 8.332 8.251 8.162 8.056 7.861 7.212 -10 ,28925 ,KEBNE ,16656957,Tue Nov 23 01:06:15 CET,Tue Nov 23 02:31:17 CET,0.0 0.442 0.614 0.751 0.873 0.98 1.083 1.178 1.352 1.43 1.499 1.59 1.718 1.787 1.908 2.029 2.147 2.196 2.298 2.405 2.578 2.699 2.824 2.997 3.143 3.277 3.41 3.548 3.737 3.913 4.073 4.268 4.465 4.654 4.875 5.12 5.347 5.605 5.882 6.185 6.504 6.855 7.256 7.648 8.104 8.616 9.202 9.846 10.575 11.372 12.198 12.706 12.895 12.925 12.845 12.73 12.593 12.433 12.278 12.118 11.972 11.83 11.693 11.561 11.438 11.321 11.187 11.073 10.983 10.891 10.799 10.725 10.644 10.559 10.488 10.406 10.318 10.219 10.118 10.059 10.008 9.924 9.852 9.774 9.734 9.655 9.577 9.499 9.458 9.366 9.297 9.225 9.152 9.012 8.935 8.852 8.761 8.672 8.552 8.371 7.767 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt deleted file mode 100644 index 1eef95cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7456 ,KEBNE ,16654810,Mon Nov 22 07:49:37 CET,Mon Nov 22 09:12:52 CET,0.0 0.74 1.017 1.195 1.351 1.516 1.668 1.81 2.064 2.175 2.284 2.405 2.572 2.665 2.86 3.053 3.222 3.299 3.457 3.608 3.83 3.976 4.128 4.352 4.568 4.775 4.972 5.175 5.442 5.7 5.952 6.257 6.554 6.848 7.189 7.576 7.951 8.376 8.843 9.336 9.863 10.472 11.2 11.946 12.854 13.896 15.106 16.54 18.331 20.491 23.193 25.441 26.791 27.723 28.308 28.69 28.947 29.109 29.23 29.322 29.35 29.342 29.313 29.282 29.25 29.206 29.148 29.085 29.033 28.961 28.88 28.824 28.751 28.663 28.586 28.514 28.432 28.335 28.236 28.147 28.05 27.905 27.804 27.702 27.65 27.542 27.41 27.275 27.208 27.081 26.99 26.909 26.815 26.595 26.457 26.31 26.156 25.97 25.724 25.419 24.551 -2 ,12217 ,KEBNE ,16656959,Tue Nov 23 01:06:15 CET,Tue Nov 23 02:31:33 CET,0.0 0.48 0.72 0.922 1.06 1.174 1.286 1.403 1.623 1.721 1.814 1.93 2.102 2.192 2.363 2.526 2.694 2.781 2.955 3.12 3.353 3.495 3.629 3.829 4.032 4.232 4.421 4.598 4.842 5.116 5.381 5.685 5.966 6.231 6.55 6.914 7.27 7.682 8.148 8.654 9.199 9.837 10.597 11.374 12.322 13.41 14.667 16.116 17.863 19.973 22.705 25.15 26.608 27.511 28.13 28.575 28.863 29.06 29.185 29.255 29.285 29.3 29.296 29.293 29.279 29.246 29.187 29.12 29.06 29.0 28.944 28.883 28.804 28.72 28.647 28.573 28.489 28.394 28.295 28.217 28.138 28.014 27.917 27.809 27.755 27.648 27.532 27.398 27.331 27.208 27.094 27.002 26.892 26.657 26.541 26.399 26.249 26.065 25.823 25.531 24.364 -3 ,842 ,KEBNE ,16654812,Mon Nov 22 07:50:39 CET,Mon Nov 22 09:13:48 CET,0.0 0.789 1.042 1.246 1.417 1.578 1.718 1.845 2.098 2.217 2.332 2.471 2.647 2.746 2.922 3.093 3.277 3.366 3.538 3.699 3.928 4.089 4.249 4.474 4.686 4.892 5.096 5.293 5.546 5.803 6.06 6.375 6.674 6.967 7.32 7.725 8.121 8.547 9.011 9.526 10.074 10.705 11.466 12.231 13.144 14.197 15.421 16.873 18.659 20.807 23.596 26.064 27.487 28.382 28.956 29.367 29.655 29.836 29.931 30.001 30.033 30.017 29.979 29.955 29.936 29.897 29.828 29.749 29.682 29.612 29.518 29.442 29.371 29.274 29.194 29.117 29.03 28.948 28.861 28.789 28.715 28.6 28.518 28.438 28.394 28.295 28.189 28.06 27.993 27.873 27.772 27.682 27.596 27.391 27.27 27.155 26.998 26.81 26.591 26.204 25.33 -4 ,14006 ,KEBNE ,16656961,Tue Nov 23 01:06:15 CET,Tue Nov 23 02:32:43 CET,0.0 0.505 0.706 0.857 0.983 1.111 1.233 1.347 1.56 1.664 1.761 1.859 2.023 2.114 2.281 2.433 2.583 2.657 2.806 2.953 3.175 3.319 3.463 3.681 3.889 4.076 4.26 4.444 4.686 4.936 5.182 5.48 5.773 6.053 6.384 6.765 7.129 7.543 7.994 8.471 8.995 9.604 10.318 11.055 11.965 13.029 14.26 15.693 17.43 19.546 22.21 24.543 26.005 26.915 27.511 27.936 28.187 28.346 28.464 28.532 28.563 28.562 28.524 28.47 28.419 28.369 28.307 28.26 28.216 28.166 28.111 28.05 27.966 27.872 27.803 27.72 27.632 27.553 27.455 27.384 27.315 27.184 27.088 26.981 26.924 26.807 26.682 26.547 26.472 26.344 26.237 26.14 26.034 25.823 25.704 25.579 25.438 25.269 25.022 24.665 23.703 -5 ,21674 ,KEBNE ,16654814,Mon Nov 22 07:50:39 CET,Mon Nov 22 09:15:30 CET,0.0 0.451 0.651 0.812 0.946 1.069 1.188 1.309 1.528 1.629 1.728 1.837 2.003 2.089 2.262 2.419 2.575 2.652 2.794 2.943 3.165 3.306 3.444 3.658 3.871 4.078 4.289 4.495 4.758 5.021 5.283 5.598 5.9 6.203 6.551 6.941 7.323 7.741 8.196 8.687 9.216 9.855 10.609 11.368 12.293 13.356 14.604 16.061 17.825 19.956 22.624 24.895 26.268 27.183 27.765 28.155 28.418 28.59 28.703 28.769 28.789 28.803 28.802 28.765 28.73 28.701 28.651 28.591 28.523 28.448 28.369 28.286 28.185 28.084 28.005 27.925 27.843 27.754 27.654 27.584 27.509 27.381 27.277 27.174 27.127 27.017 26.897 26.782 26.722 26.595 26.491 26.406 26.313 26.099 25.977 25.84 25.673 25.503 25.287 24.964 23.93 -6 ,20290 ,KEBNE ,16654815,Mon Nov 22 07:50:39 CET,Mon Nov 22 09:15:51 CET,0.0 0.743 1.117 1.362 1.543 1.69 1.832 1.968 2.216 2.331 2.448 2.593 2.774 2.876 3.07 3.254 3.435 3.524 3.686 3.851 4.111 4.278 4.443 4.692 4.932 5.148 5.351 5.552 5.817 6.067 6.311 6.615 6.91 7.206 7.557 7.944 8.326 8.758 9.233 9.746 10.288 10.903 11.619 12.359 13.266 14.284 15.472 16.882 18.595 20.693 23.39 25.78 27.276 28.241 28.856 29.294 29.581 29.775 29.906 29.99 30.027 30.034 30.017 29.977 29.918 29.863 29.816 29.766 29.698 29.633 29.568 29.49 29.407 29.33 29.267 29.198 29.114 29.018 28.913 28.833 28.759 28.644 28.55 28.454 28.403 28.302 28.198 28.08 28.019 27.898 27.803 27.727 27.642 27.438 27.319 27.182 27.033 26.873 26.676 26.395 25.619 -7 ,25877 ,KEBNE ,16656964,Tue Nov 23 01:07:16 CET,Tue Nov 23 02:34:35 CET,0.0 0.531 0.833 1.045 1.228 1.379 1.511 1.646 1.888 2.003 2.111 2.233 2.41 2.509 2.704 2.904 3.107 3.206 3.39 3.562 3.809 3.974 4.128 4.346 4.564 4.788 5.007 5.217 5.497 5.763 6.01 6.318 6.624 6.923 7.274 7.658 8.033 8.459 8.939 9.458 9.995 10.619 11.372 12.148 13.06 14.116 15.383 16.842 18.598 20.74 23.427 25.673 27.036 27.953 28.525 28.918 29.215 29.417 29.527 29.6 29.634 29.636 29.632 29.609 29.585 29.549 29.483 29.417 29.347 29.286 29.228 29.158 29.075 28.984 28.909 28.827 28.736 28.633 28.526 28.451 28.368 28.24 28.155 28.061 28.011 27.911 27.793 27.665 27.603 27.48 27.355 27.257 27.153 26.918 26.794 26.672 26.529 26.32 26.074 25.789 24.885 -8 ,31937 ,KEBNE ,16656965,Tue Nov 23 01:08:18 CET,Tue Nov 23 02:34:17 CET,0.0 0.309 0.474 0.638 0.791 0.919 1.018 1.11 1.297 1.389 1.481 1.572 1.734 1.813 1.977 2.15 2.31 2.391 2.561 2.728 2.96 3.109 3.252 3.454 3.661 3.873 4.072 4.274 4.553 4.822 5.066 5.364 5.67 5.97 6.334 6.743 7.124 7.548 8.015 8.521 9.059 9.68 10.432 11.205 12.113 13.17 14.425 15.86 17.584 19.688 22.41 24.755 26.103 27.013 27.638 28.043 28.297 28.474 28.587 28.633 28.658 28.703 28.732 28.74 28.723 28.698 28.665 28.622 28.578 28.518 28.452 28.385 28.303 28.22 28.16 28.086 27.999 27.906 27.802 27.727 27.646 27.524 27.441 27.342 27.287 27.178 27.067 26.952 26.884 26.751 26.655 26.572 26.479 26.301 26.203 26.064 25.893 25.703 25.436 25.148 24.195 -10 ,7011 ,KEBNE ,16654819,Mon Nov 22 07:50:39 CET,Mon Nov 22 09:15:18 CET,0.0 1.053 1.325 1.541 1.722 1.869 2.0 2.135 2.375 2.478 2.584 2.714 2.891 2.992 3.191 3.378 3.55 3.639 3.815 3.984 4.22 4.368 4.519 4.745 4.959 5.162 5.355 5.556 5.827 6.08 6.315 6.608 6.914 7.21 7.543 7.921 8.287 8.707 9.179 9.695 10.248 10.853 11.586 12.369 13.274 14.309 15.535 16.954 18.715 20.869 23.622 25.986 27.367 28.253 28.818 29.203 29.474 29.652 29.754 29.81 29.85 29.879 29.882 29.868 29.843 29.815 29.78 29.721 29.653 29.59 29.513 29.439 29.345 29.247 29.183 29.109 29.026 28.938 28.84 28.776 28.716 28.595 28.503 28.403 28.352 28.242 28.12 28.013 27.954 27.831 27.729 27.644 27.558 27.387 27.297 27.181 27.04 26.891 26.705 26.404 25.492 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt deleted file mode 100644 index e401d2da..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27586 ,KEBNE ,16656968,Tue Nov 23 01:07:17 CET,Tue Nov 23 02:33:54 CET,0.0 1.0 1.328 1.583 1.802 1.988 2.157 2.331 2.665 2.819 2.966 3.152 3.351 3.471 3.702 3.923 4.128 4.222 4.418 4.628 4.913 5.09 5.263 5.518 5.766 6.008 6.252 6.5 6.824 7.132 7.427 7.773 8.118 8.479 8.908 9.406 9.89 10.422 10.991 11.604 12.271 13.035 13.938 14.868 15.971 17.225 18.761 20.598 22.844 25.652 29.282 32.546 34.591 35.975 36.946 37.649 38.178 38.58 38.878 39.134 39.315 39.441 39.541 39.609 39.661 39.709 39.737 39.755 39.761 39.757 39.744 39.723 39.697 39.662 39.633 39.595 39.559 39.526 39.462 39.414 39.373 39.302 39.235 39.148 39.101 39.021 38.934 38.826 38.766 38.664 38.555 38.477 38.399 38.226 38.123 38.013 37.896 37.736 37.529 37.186 35.696 -2 ,2563 ,KEBNE ,16656969,Tue Nov 23 01:07:16 CET,Tue Nov 23 02:33:33 CET,0.0 0.801 1.183 1.445 1.666 1.888 2.072 2.239 2.526 2.648 2.79 2.991 3.189 3.304 3.539 3.783 4.013 4.115 4.31 4.503 4.771 4.943 5.119 5.395 5.664 5.919 6.167 6.404 6.719 7.027 7.323 7.69 8.051 8.413 8.85 9.354 9.838 10.366 10.948 11.573 12.247 13.038 13.959 14.885 15.996 17.258 18.796 20.636 22.86 25.693 29.47 32.82 34.899 36.318 37.321 38.084 38.661 39.112 39.437 39.71 39.919 40.084 40.201 40.278 40.344 40.389 40.423 40.445 40.455 40.434 40.396 40.371 40.336 40.296 40.265 40.231 40.193 40.155 40.111 40.069 40.016 39.938 39.872 39.8 39.768 39.69 39.599 39.495 39.44 39.341 39.246 39.184 39.112 38.906 38.781 38.661 38.509 38.312 38.084 37.673 36.326 -3 ,14079 ,KEBNE ,16654822,Mon Nov 22 07:50:39 CET,Mon Nov 22 09:13:38 CET,0.0 0.815 1.074 1.266 1.44 1.59 1.735 1.864 2.112 2.242 2.372 2.537 2.734 2.851 3.084 3.32 3.549 3.652 3.845 4.038 4.325 4.515 4.704 4.98 5.238 5.478 5.716 5.954 6.268 6.576 6.881 7.265 7.636 8.003 8.414 8.858 9.303 9.816 10.389 11.004 11.655 12.415 13.319 14.238 15.358 16.67 18.228 20.063 22.298 25.061 28.683 31.942 34.013 35.432 36.466 37.242 37.783 38.19 38.495 38.752 38.933 39.064 39.172 39.272 39.358 39.414 39.438 39.446 39.446 39.426 39.387 39.356 39.328 39.3 39.268 39.215 39.161 39.097 39.02 38.971 38.924 38.84 38.772 38.701 38.663 38.585 38.494 38.393 38.338 38.233 38.127 38.046 37.943 37.74 37.639 37.514 37.371 37.19 36.947 36.636 34.905 -4 ,21643 ,KEBNE ,16654823,Mon Nov 22 07:50:39 CET,Mon Nov 22 09:13:47 CET,0.0 1.085 1.435 1.701 1.913 2.068 2.215 2.34 2.586 2.705 2.815 2.963 3.152 3.261 3.465 3.658 3.859 3.96 4.139 4.304 4.558 4.732 4.899 5.146 5.39 5.626 5.859 6.087 6.377 6.655 6.923 7.259 7.599 7.929 8.313 8.759 9.206 9.699 10.246 10.857 11.501 12.254 13.172 14.123 15.257 16.537 18.051 19.863 22.075 24.791 28.343 31.582 33.654 35.01 35.958 36.71 37.28 37.711 38.035 38.283 38.452 38.589 38.686 38.759 38.822 38.865 38.892 38.91 38.922 38.931 38.927 38.902 38.865 38.827 38.779 38.729 38.679 38.627 38.575 38.524 38.465 38.375 38.315 38.238 38.199 38.119 38.02 37.911 37.851 37.753 37.655 37.59 37.512 37.309 37.198 37.061 36.917 36.762 36.546 36.222 35.232 -5 ,17458 ,KEBNE ,16656972,Tue Nov 23 01:07:16 CET,Tue Nov 23 02:33:33 CET,0.0 1.29 1.66 1.927 2.145 2.325 2.511 2.697 3.007 3.147 3.282 3.448 3.649 3.782 4.036 4.269 4.499 4.607 4.798 4.986 5.276 5.464 5.633 5.883 6.155 6.423 6.673 6.903 7.212 7.514 7.801 8.157 8.51 8.869 9.295 9.784 10.274 10.815 11.404 12.053 12.748 13.571 14.525 15.45 16.576 17.928 19.579 21.435 23.631 26.457 30.137 33.356 35.403 36.837 37.858 38.594 39.151 39.599 39.91 40.182 40.368 40.503 40.618 40.713 40.794 40.846 40.875 40.881 40.886 40.881 40.861 40.845 40.823 40.786 40.757 40.719 40.663 40.606 40.549 40.502 40.448 40.374 40.315 40.249 40.211 40.114 40.01 39.899 39.843 39.744 39.65 39.577 39.491 39.278 39.159 39.044 38.916 38.749 38.554 38.273 37.33 -6 ,27588 ,KEBNE ,16656973,Tue Nov 23 01:08:18 CET,Tue Nov 23 02:34:17 CET,0.0 0.684 0.954 1.19 1.373 1.532 1.684 1.834 2.118 2.26 2.401 2.574 2.773 2.897 3.132 3.343 3.528 3.615 3.779 3.948 4.202 4.375 4.54 4.778 5.023 5.26 5.49 5.71 5.999 6.294 6.583 6.917 7.242 7.571 7.959 8.402 8.83 9.323 9.87 10.466 11.124 11.888 12.797 13.724 14.841 16.149 17.719 19.544 21.759 24.499 28.06 31.322 33.367 34.788 35.787 36.531 37.092 37.533 37.847 38.103 38.273 38.401 38.517 38.593 38.64 38.668 38.682 38.69 38.691 38.68 38.659 38.633 38.602 38.554 38.517 38.476 38.433 38.392 38.336 38.296 38.242 38.146 38.073 37.992 37.952 37.868 37.775 37.671 37.609 37.506 37.4 37.333 37.263 37.042 36.913 36.784 36.653 36.47 36.19 35.854 34.762 -7 ,11648 ,KEBNE ,16654826,Mon Nov 22 07:50:39 CET,Mon Nov 22 09:13:57 CET,0.0 1.183 1.469 1.667 1.829 1.962 2.097 2.238 2.497 2.621 2.744 2.884 3.076 3.191 3.402 3.604 3.802 3.898 4.095 4.3 4.593 4.774 4.963 5.242 5.488 5.736 5.984 6.217 6.522 6.828 7.127 7.489 7.835 8.169 8.579 9.062 9.536 10.057 10.602 11.205 11.862 12.608 13.496 14.428 15.557 16.85 18.386 20.158 22.372 25.231 28.91 32.129 34.142 35.502 36.479 37.219 37.757 38.159 38.471 38.735 38.909 39.044 39.162 39.26 39.336 39.388 39.423 39.438 39.433 39.42 39.397 39.379 39.347 39.307 39.284 39.255 39.226 39.179 39.111 39.062 39.008 38.925 38.866 38.799 38.752 38.658 38.566 38.465 38.409 38.303 38.193 38.115 38.038 37.872 37.761 37.633 37.471 37.277 37.031 36.611 34.789 -9 ,30237 ,KEBNE ,16654828,Mon Nov 22 07:50:39 CET,Mon Nov 22 09:13:50 CET,0.0 1.139 1.368 1.561 1.741 1.91 2.065 2.208 2.465 2.581 2.699 2.856 3.044 3.152 3.37 3.562 3.746 3.838 4.012 4.189 4.454 4.623 4.796 5.043 5.278 5.513 5.745 5.984 6.298 6.611 6.923 7.28 7.619 7.957 8.352 8.789 9.224 9.718 10.254 10.831 11.46 12.184 13.048 13.955 15.065 16.367 17.884 19.641 21.827 24.62 28.212 31.46 33.6 35.06 36.106 36.92 37.52 37.983 38.328 38.628 38.855 39.036 39.18 39.274 39.334 39.373 39.411 39.448 39.457 39.436 39.409 39.383 39.356 39.332 39.297 39.248 39.201 39.155 39.101 39.053 39.0 38.913 38.845 38.776 38.739 38.653 38.544 38.43 38.372 38.269 38.146 38.045 37.955 37.781 37.677 37.556 37.416 37.249 37.036 36.746 35.536 -10 ,14915 ,KEBNE ,16656977,Tue Nov 23 01:08:18 CET,Tue Nov 23 02:36:33 CET,0.0 1.307 1.569 1.751 1.914 2.046 2.173 2.308 2.589 2.715 2.829 2.97 3.163 3.278 3.5 3.703 3.891 3.985 4.169 4.347 4.598 4.766 4.941 5.205 5.45 5.679 5.898 6.107 6.389 6.683 6.986 7.363 7.72 8.069 8.487 8.956 9.403 9.916 10.502 11.126 11.774 12.533 13.453 14.385 15.521 16.823 18.329 20.113 22.328 25.112 28.764 32.016 34.014 35.374 36.354 37.085 37.63 38.056 38.361 38.615 38.809 38.955 39.069 39.146 39.196 39.246 39.288 39.3 39.305 39.301 39.285 39.259 39.219 39.174 39.129 39.084 39.043 38.987 38.92 38.876 38.824 38.717 38.64 38.565 38.535 38.462 38.365 38.27 38.216 38.113 38.002 37.916 37.812 37.601 37.485 37.354 37.201 37.017 36.779 36.366 34.845 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt deleted file mode 100644 index ae584a07..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1039 ,KEBNE ,16656978,Tue Nov 23 01:08:18 CET,Tue Nov 23 02:33:54 CET,0.0 0.494 0.661 0.809 0.953 1.082 1.215 1.343 1.556 1.656 1.761 1.878 2.048 2.151 2.373 2.58 2.763 2.854 3.033 3.21 3.465 3.619 3.782 4.025 4.251 4.485 4.711 4.917 5.185 5.456 5.719 6.039 6.356 6.67 7.034 7.452 7.867 8.327 8.831 9.404 10.028 10.732 11.581 12.451 13.521 14.801 16.343 18.126 20.328 23.089 26.651 29.858 31.91 33.347 34.345 35.075 35.633 36.073 36.406 36.691 36.902 37.069 37.216 37.324 37.38 37.406 37.426 37.442 37.445 37.441 37.43 37.418 37.406 37.384 37.364 37.351 37.331 37.297 37.261 37.234 37.209 37.174 37.142 37.101 37.077 37.021 36.946 36.874 36.842 36.756 36.689 36.641 36.584 36.442 36.359 36.27 36.167 36.048 35.92 35.745 34.93 -2 ,23387 ,KEBNE ,16654831,Mon Nov 22 07:50:39 CET,Mon Nov 22 09:14:04 CET,0.0 0.604 0.844 1.008 1.163 1.311 1.449 1.573 1.797 1.909 2.011 2.123 2.301 2.401 2.59 2.791 2.984 3.07 3.243 3.415 3.664 3.824 3.975 4.191 4.398 4.602 4.812 5.023 5.295 5.563 5.825 6.14 6.452 6.776 7.159 7.58 7.997 8.468 8.98 9.53 10.123 10.813 11.647 12.519 13.566 14.793 16.303 18.07 20.204 22.879 26.453 29.758 31.87 33.328 34.387 35.219 35.874 36.404 36.795 37.133 37.403 37.617 37.79 37.912 38.006 38.101 38.189 38.253 38.295 38.316 38.32 38.331 38.342 38.328 38.309 38.284 38.256 38.23 38.187 38.166 38.156 38.141 38.127 38.103 38.091 38.057 38.018 37.983 37.955 37.885 37.864 37.827 37.793 37.712 37.657 37.598 37.521 37.395 37.242 37.042 36.326 -3 ,9125 ,KEBNE ,16654832,Mon Nov 22 07:50:39 CET,Mon Nov 22 09:13:45 CET,0.0 0.422 0.652 0.813 0.939 1.061 1.178 1.293 1.518 1.63 1.739 1.872 2.049 2.145 2.325 2.495 2.683 2.775 2.951 3.122 3.358 3.516 3.669 3.898 4.129 4.352 4.572 4.794 5.106 5.404 5.683 6.025 6.348 6.655 7.023 7.453 7.877 8.356 8.877 9.439 10.051 10.753 11.595 12.47 13.517 14.737 16.2 17.897 19.983 22.655 26.208 29.476 31.567 33.042 34.129 34.972 35.591 36.068 36.425 36.744 37.004 37.222 37.401 37.543 37.658 37.747 37.827 37.889 37.939 37.981 38.001 38.002 37.997 37.989 37.982 37.964 37.938 37.911 37.873 37.837 37.798 37.751 37.726 37.691 37.666 37.609 37.552 37.495 37.467 37.397 37.358 37.321 37.277 37.181 37.13 37.076 37.011 36.924 36.827 36.687 36.328 -4 ,23563 ,KEBNE ,16656981,Tue Nov 23 01:09:19 CET,Tue Nov 23 02:33:28 CET,0.0 0.285 0.434 0.586 0.739 0.898 1.046 1.173 1.415 1.527 1.639 1.757 1.924 2.017 2.213 2.409 2.598 2.697 2.889 3.055 3.29 3.448 3.599 3.823 4.042 4.256 4.463 4.662 4.936 5.211 5.477 5.801 6.116 6.426 6.804 7.245 7.668 8.14 8.67 9.231 9.827 10.549 11.448 12.378 13.486 14.739 16.215 17.973 20.177 22.928 26.52 29.778 31.829 33.243 34.259 35.012 35.587 36.049 36.379 36.651 36.865 37.037 37.169 37.277 37.365 37.428 37.482 37.509 37.533 37.571 37.602 37.614 37.611 37.596 37.575 37.551 37.529 37.508 37.488 37.463 37.434 37.388 37.345 37.303 37.282 37.235 37.183 37.11 37.071 36.997 36.959 36.919 36.861 36.709 36.63 36.539 36.441 36.335 36.216 36.021 35.592 -5 ,26506 ,KEBNE ,16656982,Tue Nov 23 01:09:19 CET,Tue Nov 23 02:33:14 CET,0.0 0.481 0.667 0.816 0.97 1.111 1.229 1.344 1.566 1.668 1.773 1.902 2.085 2.187 2.383 2.581 2.761 2.842 3.011 3.179 3.412 3.566 3.721 3.961 4.203 4.429 4.652 4.89 5.205 5.501 5.783 6.121 6.46 6.798 7.19 7.63 8.064 8.566 9.134 9.731 10.365 11.105 11.975 12.885 13.994 15.263 16.766 18.514 20.668 23.378 26.916 30.075 32.125 33.557 34.586 35.367 35.942 36.421 36.783 37.078 37.298 37.475 37.618 37.74 37.842 37.931 38.006 38.039 38.05 38.054 38.065 38.067 38.064 38.058 38.05 38.038 38.01 37.966 37.92 37.896 37.877 37.833 37.798 37.769 37.747 37.7 37.668 37.636 37.619 37.557 37.531 37.494 37.453 37.369 37.319 37.26 37.19 37.107 37.012 36.905 36.567 -6 ,3702 ,KEBNE ,16654835,Mon Nov 22 07:51:41 CET,Mon Nov 22 09:14:58 CET,0.0 0.557 0.84 1.058 1.242 1.424 1.598 1.765 2.077 2.222 2.351 2.497 2.68 2.782 2.979 3.174 3.374 3.473 3.662 3.832 4.071 4.226 4.386 4.621 4.836 5.051 5.267 5.483 5.772 6.044 6.308 6.632 6.941 7.245 7.619 8.063 8.49 8.976 9.523 10.098 10.717 11.431 12.266 13.161 14.24 15.472 16.975 18.732 20.875 23.564 27.127 30.337 32.39 33.766 34.733 35.508 36.098 36.536 36.861 37.155 37.356 37.508 37.645 37.758 37.852 37.928 38.001 38.051 38.077 38.098 38.108 38.108 38.103 38.085 38.068 38.052 38.037 38.008 37.972 37.948 37.914 37.857 37.821 37.78 37.753 37.692 37.623 37.549 37.514 37.439 37.378 37.323 37.26 37.117 37.039 36.958 36.872 36.757 36.617 36.446 35.729 -7 ,29111 ,KEBNE ,16654836,Mon Nov 22 07:51:41 CET,Mon Nov 22 09:14:41 CET,0.0 0.478 0.656 0.82 0.956 1.08 1.187 1.301 1.531 1.64 1.742 1.857 2.029 2.124 2.31 2.485 2.66 2.744 2.914 3.091 3.352 3.513 3.664 3.903 4.129 4.343 4.552 4.751 5.024 5.295 5.559 5.883 6.206 6.522 6.889 7.309 7.712 8.17 8.69 9.257 9.876 10.608 11.491 12.411 13.525 14.797 16.3 18.106 20.342 23.083 26.617 29.828 31.887 33.278 34.279 35.057 35.654 36.114 36.465 36.773 36.987 37.145 37.289 37.407 37.487 37.545 37.594 37.634 37.657 37.675 37.686 37.695 37.708 37.703 37.685 37.665 37.648 37.636 37.61 37.579 37.548 37.492 37.442 37.385 37.356 37.303 37.261 37.206 37.165 37.086 37.022 36.973 36.926 36.796 36.728 36.664 36.589 36.511 36.429 36.31 35.902 -8 ,19469 ,KEBNE ,16654837,Mon Nov 22 07:51:41 CET,Mon Nov 22 09:15:57 CET,0.0 0.435 0.602 0.748 0.887 1.028 1.169 1.295 1.522 1.628 1.731 1.856 2.036 2.136 2.331 2.507 2.678 2.765 2.935 3.105 3.366 3.542 3.701 3.918 4.136 4.365 4.589 4.808 5.096 5.377 5.66 6.018 6.362 6.691 7.073 7.523 7.972 8.461 8.999 9.57 10.178 10.893 11.768 12.686 13.783 15.009 16.478 18.259 20.424 23.111 26.625 29.817 31.913 33.322 34.339 35.139 35.745 36.196 36.53 36.822 37.026 37.195 37.359 37.489 37.584 37.663 37.738 37.798 37.837 37.866 37.896 37.923 37.947 37.962 37.966 37.962 37.953 37.949 37.939 37.923 37.905 37.873 37.841 37.806 37.786 37.733 37.684 37.644 37.614 37.542 37.524 37.493 37.463 37.401 37.355 37.305 37.246 37.159 37.065 36.961 36.701 -9 ,3852 ,KEBNE ,16654838,Mon Nov 22 07:51:42 CET,Mon Nov 22 09:15:05 CET,0.0 0.565 0.774 0.971 1.129 1.278 1.423 1.549 1.789 1.901 2.012 2.151 2.336 2.436 2.637 2.824 3.003 3.092 3.26 3.424 3.655 3.803 3.952 4.174 4.393 4.605 4.814 5.019 5.289 5.567 5.842 6.166 6.484 6.799 7.179 7.622 8.042 8.516 9.035 9.604 10.216 10.909 11.743 12.607 13.675 14.922 16.411 18.185 20.39 23.141 26.691 29.889 31.935 33.356 34.374 35.135 35.715 36.164 36.484 36.768 36.973 37.121 37.248 37.345 37.428 37.501 37.569 37.614 37.636 37.649 37.667 37.667 37.657 37.651 37.643 37.624 37.598 37.575 37.545 37.517 37.489 37.452 37.415 37.375 37.356 37.307 37.248 37.176 37.136 37.056 37.005 36.952 36.89 36.761 36.691 36.609 36.523 36.425 36.289 36.065 35.157 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt deleted file mode 100644 index 9af5ee00..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29558 ,KEBNE ,16656988,Tue Nov 23 01:09:23 CET,Tue Nov 23 02:36:30 CET,0.0 0.254 0.336 0.389 0.429 0.465 0.492 0.51 0.551 0.561 0.564 0.49 0.562 0.554 0.553 0.551 0.532 0.52 0.504 0.484 0.432 0.396 0.357 0.297 0.234 0.166 0.1 0.026 -0.091 -0.206 -0.326 -0.489 -0.649 -0.804 -0.994 -1.212 -1.441 -1.725 -2.043 -2.393 -2.817 -3.34 -3.987 -4.69 -5.584 -6.673 -8.055 -9.834 -12.275 -15.711 -20.912 -26.464 -30.684 -34.037 -36.694 -38.916 -40.752 -42.321 -43.65 -44.919 -45.945 -46.843 -47.678 -48.431 -49.126 -49.755 -50.385 -50.938 -51.413 -51.89 -52.37 -52.76 -53.149 -53.544 -53.851 -54.169 -54.493 -54.813 -55.138 -55.365 -55.589 -55.91 -56.125 -56.34 -56.449 -56.676 -56.92 -57.173 -57.297 -57.563 -57.685 -57.823 -57.963 -58.229 -58.367 -58.513 -58.661 -58.815 -58.996 -59.194 -59.576 -2 ,12144 ,KEBNE ,16656989,Tue Nov 23 01:09:20 CET,Tue Nov 23 02:37:01 CET,0.0 0.246 0.334 0.406 0.455 0.487 0.497 0.506 0.536 0.547 0.551 0.478 0.557 0.556 0.55 0.54 0.524 0.516 0.499 0.475 0.434 0.403 0.368 0.308 0.239 0.163 0.087 0.018 -0.084 -0.198 -0.297 -0.421 -0.567 -0.728 -0.936 -1.173 -1.408 -1.686 -1.991 -2.311 -2.685 -3.169 -3.784 -4.456 -5.337 -6.43 -7.836 -9.641 -12.058 -15.513 -20.731 -26.246 -30.422 -33.724 -36.351 -38.559 -40.412 -42.015 -43.342 -44.635 -45.703 -46.617 -47.466 -48.251 -48.959 -49.581 -50.213 -50.765 -51.235 -51.712 -52.181 -52.554 -52.937 -53.325 -53.616 -53.911 -54.216 -54.524 -54.824 -55.022 -55.227 -55.538 -55.747 -55.96 -56.073 -56.317 -56.557 -56.801 -56.927 -57.197 -57.319 -57.441 -57.567 -57.838 -57.981 -58.125 -58.283 -58.463 -58.654 -58.876 -59.204 -4 ,29365 ,KEBNE ,16654843,Mon Nov 22 07:51:45 CET,Mon Nov 22 09:14:15 CET,0.0 0.263 0.348 0.408 0.454 0.481 0.498 0.506 0.528 0.544 0.546 0.466 0.549 0.546 0.532 0.52 0.507 0.501 0.492 0.478 0.46 0.449 0.431 0.389 0.339 0.283 0.237 0.199 0.123 0.034 -0.053 -0.168 -0.298 -0.438 -0.603 -0.791 -1.0 -1.254 -1.549 -1.901 -2.303 -2.774 -3.373 -4.063 -4.938 -5.997 -7.384 -9.195 -11.68 -15.153 -20.357 -25.974 -30.225 -33.545 -36.149 -38.358 -40.196 -41.783 -43.108 -44.392 -45.47 -46.409 -47.282 -48.076 -48.788 -49.405 -50.037 -50.586 -51.042 -51.496 -51.959 -52.346 -52.733 -53.12 -53.419 -53.716 -54.008 -54.315 -54.628 -54.828 -55.035 -55.374 -55.597 -55.821 -55.937 -56.176 -56.407 -56.632 -56.747 -57.0 -57.114 -57.244 -57.383 -57.675 -57.817 -57.965 -58.121 -58.278 -58.449 -58.639 -58.866 -5 ,5950 ,KEBNE ,16654844,Mon Nov 22 07:51:42 CET,Mon Nov 22 09:16:18 CET,0.0 0.194 0.291 0.367 0.416 0.438 0.443 0.445 0.456 0.474 0.495 0.423 0.493 0.487 0.486 0.482 0.462 0.45 0.423 0.389 0.341 0.309 0.278 0.23 0.178 0.123 0.06 -0.013 -0.123 -0.236 -0.35 -0.493 -0.638 -0.798 -0.972 -1.174 -1.413 -1.701 -2.028 -2.383 -2.768 -3.245 -3.859 -4.535 -5.393 -6.487 -7.939 -9.78 -12.245 -15.675 -20.939 -26.539 -30.658 -33.918 -36.558 -38.776 -40.629 -42.247 -43.599 -44.903 -45.967 -46.873 -47.708 -48.475 -49.155 -49.758 -50.375 -50.914 -51.369 -51.826 -52.297 -52.675 -53.053 -53.439 -53.731 -54.026 -54.324 -54.618 -54.919 -55.124 -55.337 -55.658 -55.872 -56.097 -56.21 -56.432 -56.658 -56.888 -57.005 -57.26 -57.364 -57.49 -57.624 -57.906 -58.047 -58.19 -58.352 -58.526 -58.684 -58.871 -59.13 -6 ,15907 ,KEBNE ,16654845,Mon Nov 22 07:51:41 CET,Mon Nov 22 09:16:37 CET,0.0 0.188 0.254 0.288 0.326 0.367 0.399 0.427 0.466 0.47 0.48 0.417 0.492 0.484 0.468 0.45 0.434 0.421 0.41 0.402 0.363 0.34 0.309 0.25 0.189 0.125 0.061 -0.011 -0.117 -0.222 -0.33 -0.469 -0.608 -0.754 -0.948 -1.188 -1.417 -1.68 -1.989 -2.333 -2.732 -3.22 -3.856 -4.583 -5.506 -6.628 -8.046 -9.843 -12.266 -15.701 -20.888 -26.395 -30.546 -33.863 -36.527 -38.746 -40.588 -42.173 -43.476 -44.752 -45.815 -46.714 -47.548 -48.327 -49.034 -49.645 -50.281 -50.85 -51.324 -51.812 -52.29 -52.679 -53.084 -53.498 -53.81 -54.118 -54.427 -54.736 -55.052 -55.26 -55.471 -55.8 -56.026 -56.248 -56.36 -56.596 -56.844 -57.099 -57.223 -57.479 -57.59 -57.717 -57.838 -58.106 -58.25 -58.396 -58.546 -58.714 -58.893 -59.114 -59.396 -7 ,19113 ,KEBNE ,16656994,Tue Nov 23 01:09:20 CET,Tue Nov 23 02:34:26 CET,0.0 0.293 0.38 0.411 0.446 0.486 0.523 0.543 0.566 0.574 0.576 0.506 0.592 0.59 0.578 0.554 0.533 0.525 0.503 0.476 0.426 0.39 0.349 0.287 0.222 0.146 0.088 0.032 -0.063 -0.16 -0.272 -0.427 -0.582 -0.747 -0.947 -1.173 -1.4 -1.65 -1.931 -2.271 -2.665 -3.15 -3.756 -4.425 -5.298 -6.382 -7.807 -9.652 -12.114 -15.573 -20.845 -26.474 -30.677 -33.956 -36.57 -38.8 -40.637 -42.192 -43.507 -44.794 -45.856 -46.788 -47.655 -48.432 -49.137 -49.773 -50.42 -50.989 -51.468 -51.956 -52.449 -52.843 -53.241 -53.641 -53.941 -54.243 -54.543 -54.835 -55.132 -55.342 -55.557 -55.884 -56.104 -56.331 -56.445 -56.668 -56.898 -57.141 -57.269 -57.536 -57.652 -57.78 -57.91 -58.203 -58.36 -58.504 -58.656 -58.816 -58.986 -59.173 -59.458 -8 ,6560 ,KEBNE ,16654847,Mon Nov 22 07:51:42 CET,Mon Nov 22 09:14:59 CET,0.0 0.18 0.257 0.315 0.364 0.4 0.429 0.457 0.485 0.496 0.502 0.418 0.495 0.491 0.484 0.468 0.44 0.43 0.418 0.394 0.342 0.309 0.273 0.218 0.163 0.101 0.035 -0.042 -0.143 -0.245 -0.356 -0.499 -0.645 -0.797 -0.999 -1.223 -1.432 -1.677 -1.963 -2.298 -2.688 -3.17 -3.779 -4.46 -5.374 -6.487 -7.885 -9.708 -12.167 -15.594 -20.792 -26.351 -30.514 -33.843 -36.524 -38.776 -40.648 -42.262 -43.615 -44.917 -45.998 -46.92 -47.762 -48.553 -49.273 -49.908 -50.549 -51.089 -51.549 -52.017 -52.479 -52.862 -53.259 -53.667 -53.977 -54.3 -54.623 -54.928 -55.229 -55.446 -55.675 -56.007 -56.225 -56.449 -56.565 -56.795 -57.028 -57.274 -57.398 -57.665 -57.775 -57.896 -58.028 -58.326 -58.482 -58.631 -58.773 -58.929 -59.101 -59.299 -59.823 -9 ,14100 ,KEBNE ,16654848,Mon Nov 22 07:51:41 CET,Mon Nov 22 09:16:15 CET,0.0 0.173 0.229 0.264 0.291 0.302 0.323 0.341 0.351 0.357 0.361 0.286 0.362 0.359 0.353 0.342 0.322 0.313 0.288 0.254 0.212 0.18 0.139 0.071 0.004 -0.064 -0.135 -0.201 -0.284 -0.373 -0.479 -0.615 -0.75 -0.891 -1.056 -1.249 -1.442 -1.68 -1.978 -2.343 -2.748 -3.223 -3.836 -4.533 -5.419 -6.504 -7.936 -9.761 -12.213 -15.649 -20.824 -26.385 -30.55 -33.86 -36.521 -38.757 -40.633 -42.258 -43.619 -44.912 -45.938 -46.819 -47.648 -48.412 -49.096 -49.695 -50.294 -50.814 -51.261 -51.707 -52.164 -52.534 -52.895 -53.263 -53.548 -53.845 -54.151 -54.463 -54.78 -54.989 -55.205 -55.54 -55.756 -55.978 -56.093 -56.316 -56.558 -56.817 -56.943 -57.205 -57.324 -57.46 -57.593 -57.859 -57.994 -58.13 -58.276 -58.431 -58.593 -58.812 -59.243 -10 ,28676 ,KEBNE ,16654849,Mon Nov 22 07:51:41 CET,Mon Nov 22 09:16:20 CET,0.0 0.19 0.253 0.299 0.337 0.366 0.393 0.417 0.432 0.439 0.443 0.353 0.426 0.423 0.421 0.405 0.374 0.357 0.332 0.317 0.284 0.251 0.212 0.157 0.103 0.046 -0.021 -0.089 -0.19 -0.298 -0.402 -0.541 -0.671 -0.813 -0.995 -1.215 -1.454 -1.73 -2.052 -2.419 -2.841 -3.361 -4.002 -4.711 -5.64 -6.769 -8.202 -10.047 -12.516 -15.999 -21.29 -26.961 -31.18 -34.467 -37.108 -39.33 -41.209 -42.826 -44.147 -45.423 -46.49 -47.413 -48.259 -49.022 -49.718 -50.334 -50.961 -51.515 -51.977 -52.451 -52.942 -53.339 -53.734 -54.126 -54.428 -54.728 -55.016 -55.313 -55.626 -55.829 -56.029 -56.335 -56.539 -56.756 -56.874 -57.113 -57.349 -57.594 -57.723 -57.988 -58.098 -58.231 -58.361 -58.604 -58.736 -58.884 -59.038 -59.192 -59.359 -59.573 -60.035 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt deleted file mode 100644 index fae25a59..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1650 ,KEBNE ,16654860,Mon Nov 22 07:53:47 CET,Mon Nov 22 09:18:21 CET,0.0 0.402 0.693 0.942 1.151 1.344 1.524 1.707 2.065 2.234 2.398 2.57 2.866 3.015 3.302 3.595 3.881 4.018 4.293 4.564 4.963 5.228 5.492 5.888 6.292 6.692 7.084 7.479 7.988 8.481 8.963 9.554 10.154 10.745 11.452 12.273 13.067 13.981 15.002 16.118 17.342 18.777 20.529 22.347 24.574 27.204 30.373 34.199 39.049 45.304 53.782 61.776 67.217 71.169 74.11 76.434 78.255 79.747 80.922 81.983 82.812 83.506 84.112 84.639 85.103 85.503 85.883 86.191 86.447 86.695 86.927 87.099 87.266 87.438 87.565 87.678 87.787 87.89 87.978 88.035 88.089 88.15 88.175 88.21 88.229 88.256 88.275 88.296 88.305 88.252 88.261 88.245 88.224 88.163 88.111 88.017 87.9 87.778 87.63 87.412 86.64 -2 ,23729 ,KEBNE ,16656999,Tue Nov 23 01:10:21 CET,Tue Nov 23 02:36:20 CET,0.0 0.506 0.73 0.933 1.125 1.302 1.474 1.654 1.996 2.16 2.32 2.485 2.775 2.922 3.212 3.499 3.773 3.909 4.185 4.459 4.868 5.141 5.419 5.818 6.203 6.595 6.984 7.366 7.867 8.368 8.869 9.474 10.064 10.651 11.354 12.174 12.994 13.905 14.928 16.06 17.28 18.709 20.449 22.269 24.485 27.08 30.237 34.075 38.943 45.201 53.712 61.777 67.214 71.192 74.18 76.512 78.34 79.846 81.019 82.076 82.905 83.579 84.162 84.675 85.126 85.506 85.878 86.179 86.423 86.662 86.888 87.062 87.222 87.374 87.485 87.594 87.694 87.792 87.892 87.951 87.999 88.062 88.101 88.135 88.153 88.187 88.201 88.21 88.207 88.153 88.157 88.115 88.072 87.981 87.917 87.827 87.717 87.603 87.445 87.237 86.186 -4 ,1222 ,KEBNE ,16654863,Mon Nov 22 07:53:46 CET,Mon Nov 22 09:16:44 CET,0.0 0.413 0.643 0.863 1.072 1.272 1.466 1.651 1.98 2.136 2.301 2.488 2.788 2.945 3.242 3.526 3.801 3.946 4.232 4.512 4.925 5.19 5.45 5.845 6.247 6.639 7.017 7.383 7.879 8.384 8.874 9.478 10.084 10.703 11.455 12.305 13.143 14.108 15.167 16.315 17.56 19.008 20.765 22.654 24.946 27.588 30.794 34.628 39.536 45.865 54.393 62.503 67.971 71.871 74.769 77.099 78.929 80.431 81.602 82.649 83.484 84.176 84.768 85.283 85.741 86.136 86.524 86.834 87.075 87.314 87.554 87.742 87.921 88.094 88.212 88.319 88.422 88.519 88.6 88.644 88.696 88.782 88.837 88.881 88.892 88.901 88.897 88.882 88.871 88.819 88.842 88.831 88.811 88.722 88.662 88.599 88.52 88.419 88.258 87.973 87.114 -5 ,20967 ,KEBNE ,16657002,Tue Nov 23 01:10:21 CET,Tue Nov 23 02:35:04 CET,0.0 0.886 1.182 1.43 1.654 1.856 2.043 2.214 2.543 2.704 2.867 3.037 3.324 3.475 3.766 4.055 4.355 4.506 4.814 5.111 5.541 5.827 6.108 6.524 6.938 7.343 7.734 8.137 8.67 9.192 9.718 10.359 10.981 11.594 12.335 13.184 14.019 14.981 16.05 17.198 18.45 19.917 21.683 23.532 25.791 28.431 31.667 35.55 40.381 46.569 54.994 63.014 68.45 72.365 75.293 77.595 79.384 80.841 81.978 83.047 83.901 84.603 85.225 85.77 86.238 86.62 86.981 87.298 87.554 87.8 88.04 88.215 88.38 88.532 88.649 88.765 88.875 88.978 89.063 89.112 89.158 89.227 89.267 89.295 89.306 89.33 89.351 89.366 89.365 89.31 89.331 89.311 89.284 89.216 89.164 89.085 88.989 88.838 88.636 88.383 87.67 -6 ,29569 ,KEBNE ,16654865,Mon Nov 22 07:53:47 CET,Mon Nov 22 09:16:58 CET,0.0 0.763 1.142 1.399 1.643 1.863 2.074 2.284 2.67 2.847 3.022 3.222 3.52 3.683 4.001 4.314 4.63 4.783 5.078 5.38 5.818 6.107 6.396 6.817 7.232 7.644 8.055 8.456 8.981 9.495 10.003 10.638 11.273 11.903 12.638 13.483 14.325 15.27 16.326 17.486 18.74 20.211 21.979 23.791 26.019 28.648 31.871 35.756 40.636 46.956 55.535 63.623 69.03 72.96 75.925 78.249 80.053 81.544 82.721 83.814 84.667 85.347 85.951 86.492 86.963 87.342 87.703 88.016 88.279 88.543 88.788 88.971 89.153 89.329 89.456 89.584 89.702 89.799 89.89 89.949 90.01 90.091 90.135 90.177 90.194 90.234 90.277 90.292 90.288 90.246 90.303 90.298 90.273 90.153 90.08 90.012 89.929 89.826 89.669 89.404 88.476 -7 ,20817 ,KEBNE ,16654866,Mon Nov 22 07:53:47 CET,Mon Nov 22 09:16:28 CET,0.0 0.63 0.863 1.069 1.269 1.455 1.624 1.797 2.134 2.285 2.437 2.61 2.9 3.045 3.334 3.621 3.915 4.062 4.347 4.627 5.043 5.305 5.568 5.969 6.366 6.772 7.182 7.592 8.133 8.654 9.168 9.803 10.419 11.038 11.785 12.64 13.473 14.408 15.452 16.597 17.841 19.292 21.071 22.938 25.213 27.881 31.094 34.935 39.801 46.075 54.556 62.59 67.988 71.926 74.89 77.22 79.041 80.533 81.694 82.74 83.573 84.273 84.889 85.411 85.862 86.254 86.639 86.963 87.213 87.438 87.668 87.852 88.018 88.173 88.293 88.417 88.524 88.621 88.713 88.768 88.825 88.896 88.934 88.969 88.977 88.98 88.994 89.006 89.0 88.937 88.953 88.941 88.92 88.847 88.79 88.714 88.611 88.509 88.399 88.181 87.416 -8 ,25758 ,KEBNE ,16657005,Tue Nov 23 01:11:23 CET,Tue Nov 23 02:36:35 CET,0.0 0.388 0.644 0.881 1.095 1.308 1.509 1.694 2.037 2.201 2.364 2.554 2.853 3.004 3.302 3.59 3.874 4.02 4.307 4.578 4.977 5.243 5.511 5.916 6.306 6.689 7.081 7.465 7.961 8.455 8.956 9.586 10.199 10.799 11.516 12.345 13.178 14.137 15.201 16.36 17.607 19.054 20.832 22.697 24.945 27.569 30.756 34.594 39.427 45.692 54.263 62.415 67.869 71.787 74.75 77.117 78.943 80.398 81.534 82.591 83.437 84.124 84.715 85.236 85.701 86.097 86.469 86.777 87.038 87.286 87.508 87.668 87.826 87.983 88.101 88.217 88.323 88.415 88.503 88.557 88.607 88.672 88.7 88.729 88.745 88.773 88.802 88.812 88.8 88.746 88.776 88.76 88.741 88.666 88.603 88.523 88.422 88.298 88.113 87.84 86.675 -9 ,1451 ,KEBNE ,16654868,Mon Nov 22 07:53:47 CET,Mon Nov 22 09:16:33 CET,0.0 0.33 0.56 0.776 0.982 1.191 1.385 1.56 1.894 2.049 2.193 2.36 2.652 2.797 3.079 3.367 3.65 3.788 4.066 4.351 4.767 5.04 5.316 5.718 6.109 6.497 6.879 7.255 7.754 8.246 8.732 9.336 9.929 10.519 11.237 12.072 12.895 13.823 14.858 15.992 17.22 18.637 20.361 22.192 24.435 27.061 30.236 34.046 38.881 45.129 53.581 61.619 67.11 71.175 74.225 76.62 78.485 79.993 81.185 82.272 83.11 83.775 84.368 84.891 85.354 85.754 86.132 86.451 86.703 86.943 87.167 87.342 87.507 87.654 87.768 87.892 88.016 88.126 88.22 88.275 88.317 88.363 88.391 88.413 88.418 88.418 88.415 88.419 88.417 88.36 88.382 88.363 88.332 88.258 88.209 88.148 88.067 87.928 87.741 87.499 86.254 -10 ,30906 ,KEBNE ,16654869,Mon Nov 22 07:53:47 CET,Mon Nov 22 09:16:58 CET,0.0 0.448 0.727 0.953 1.164 1.367 1.553 1.745 2.105 2.273 2.435 2.609 2.904 3.053 3.35 3.656 3.95 4.093 4.376 4.655 5.064 5.334 5.607 6.011 6.408 6.817 7.229 7.621 8.128 8.637 9.144 9.779 10.402 11.018 11.756 12.612 13.454 14.403 15.472 16.618 17.844 19.321 21.113 22.948 25.183 27.797 30.978 34.852 39.749 46.046 54.601 62.653 68.088 72.046 74.959 77.267 79.087 80.554 81.707 82.783 83.631 84.335 84.955 85.476 85.931 86.332 86.706 87.012 87.265 87.515 87.752 87.929 88.103 88.26 88.373 88.483 88.591 88.69 88.781 88.841 88.899 88.972 89.004 89.037 89.055 89.078 89.093 89.087 89.08 89.022 89.029 89.011 88.992 88.914 88.86 88.801 88.728 88.636 88.486 88.25 87.401 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt deleted file mode 100644 index b9184c90..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25043 ,KEBNE ,16654870,Mon Nov 22 07:53:47 CET,Mon Nov 22 09:18:17 CET,0.0 0.52 0.836 1.143 1.415 1.638 1.83 2.024 2.417 2.604 2.787 2.992 3.289 3.458 3.786 4.113 4.439 4.593 4.889 5.191 5.649 5.953 6.246 6.67 7.08 7.472 7.859 8.248 8.766 9.287 9.808 10.45 11.084 11.7 12.425 13.278 14.137 15.086 16.101 17.223 18.459 19.897 21.639 23.45 25.659 28.277 31.415 35.144 39.862 45.904 53.94 61.513 66.594 70.194 72.921 75.079 76.719 78.036 79.065 80.022 80.797 81.423 81.952 82.399 82.786 83.12 83.437 83.69 83.898 84.111 84.327 84.496 84.646 84.774 84.859 84.948 85.021 85.078 85.144 85.187 85.225 85.273 85.306 85.323 85.324 85.334 85.34 85.33 85.318 85.246 85.266 85.249 85.214 85.119 85.06 84.991 84.906 84.794 84.631 84.407 83.798 -2 ,2801 ,KEBNE ,16654871,Mon Nov 22 07:53:47 CET,Mon Nov 22 09:17:12 CET,0.0 0.43 0.674 0.92 1.138 1.332 1.514 1.706 2.088 2.259 2.422 2.608 2.904 3.065 3.373 3.661 3.944 4.087 4.37 4.653 5.084 5.373 5.659 6.084 6.507 6.913 7.307 7.707 8.251 8.783 9.302 9.939 10.571 11.191 11.927 12.79 13.639 14.584 15.615 16.743 17.986 19.433 21.165 22.98 25.197 27.737 30.831 34.617 39.307 45.247 53.219 60.786 65.839 69.421 72.126 74.333 76.009 77.324 78.375 79.343 80.093 80.7 81.233 81.718 82.141 82.48 82.822 83.111 83.337 83.559 83.765 83.909 84.038 84.162 84.26 84.35 84.426 84.496 84.568 84.622 84.664 84.707 84.727 84.742 84.747 84.749 84.736 84.719 84.719 84.656 84.657 84.625 84.598 84.528 84.471 84.407 84.323 84.199 84.057 83.864 83.175 -3 ,19033 ,KEBNE ,16654872,Mon Nov 22 07:53:47 CET,Mon Nov 22 09:18:27 CET,0.0 0.621 0.958 1.238 1.483 1.697 1.91 2.121 2.493 2.673 2.855 3.064 3.363 3.525 3.854 4.188 4.518 4.677 4.981 5.265 5.688 5.968 6.247 6.661 7.062 7.456 7.84 8.225 8.741 9.246 9.737 10.336 10.921 11.507 12.203 13.0 13.798 14.704 15.709 16.824 18.037 19.432 21.13 22.947 25.144 27.675 30.739 34.427 39.139 45.174 53.26 60.925 66.056 69.754 72.499 74.643 76.332 77.7 78.764 79.748 80.526 81.144 81.698 82.185 82.583 82.927 83.255 83.515 83.734 83.953 84.162 84.319 84.465 84.599 84.701 84.809 84.912 85.0 85.075 85.122 85.169 85.218 85.248 85.273 85.282 85.298 85.302 85.307 85.302 85.237 85.242 85.204 85.169 85.08 85.019 84.942 84.849 84.729 84.548 84.277 83.538 -4 ,23071 ,KEBNE ,16657011,Tue Nov 23 01:12:24 CET,Tue Nov 23 02:38:29 CET,0.0 0.895 1.212 1.446 1.654 1.843 2.021 2.193 2.517 2.675 2.845 3.046 3.345 3.507 3.828 4.153 4.472 4.623 4.912 5.195 5.618 5.908 6.193 6.604 7.013 7.412 7.796 8.188 8.721 9.242 9.761 10.401 11.018 11.619 12.32 13.143 13.976 14.915 15.945 17.072 18.303 19.744 21.487 23.296 25.498 28.067 31.198 34.957 39.627 45.594 53.6 61.183 66.322 70.026 72.764 74.903 76.582 77.972 79.049 80.005 80.781 81.42 81.964 82.429 82.823 83.17 83.512 83.789 84.01 84.222 84.424 84.583 84.733 84.866 84.96 85.048 85.127 85.206 85.285 85.325 85.363 85.417 85.437 85.444 85.45 85.465 85.47 85.463 85.457 85.402 85.439 85.412 85.379 85.286 85.229 85.161 85.072 84.956 84.807 84.593 83.922 -5 ,25042 ,KEBNE ,16657012,Tue Nov 23 01:13:26 CET,Tue Nov 23 02:37:52 CET,0.0 0.479 0.784 1.048 1.289 1.516 1.718 1.921 2.323 2.504 2.674 2.886 3.2 3.365 3.686 4.009 4.319 4.471 4.768 5.066 5.515 5.804 6.09 6.519 6.937 7.348 7.75 8.141 8.654 9.156 9.664 10.291 10.896 11.495 12.232 13.097 13.941 14.879 15.918 17.07 18.304 19.725 21.468 23.307 25.522 28.121 31.323 35.065 39.663 45.621 53.721 61.322 66.401 70.047 72.725 74.822 76.484 77.845 78.912 79.9 80.679 81.329 81.912 82.376 82.763 83.117 83.461 83.745 83.964 84.169 84.362 84.507 84.652 84.793 84.898 84.994 85.072 85.142 85.211 85.246 85.278 85.333 85.367 85.381 85.378 85.387 85.392 85.387 85.386 85.331 85.36 85.339 85.306 85.203 85.135 85.076 85.018 84.918 84.778 84.543 83.659 -6 ,22024 ,KEBNE ,16657013,Tue Nov 23 01:13:26 CET,Tue Nov 23 02:39:25 CET,0.0 0.571 0.871 1.163 1.422 1.659 1.876 2.078 2.482 2.68 2.87 3.079 3.383 3.556 3.889 4.205 4.516 4.666 4.97 5.277 5.724 6.015 6.298 6.723 7.141 7.547 7.951 8.363 8.911 9.45 9.965 10.593 11.208 11.821 12.566 13.418 14.261 15.2 16.225 17.363 18.622 20.072 21.792 23.596 25.775 28.327 31.472 35.246 39.989 46.069 54.209 61.829 66.895 70.541 73.224 75.342 77.025 78.388 79.449 80.418 81.175 81.785 82.319 82.793 83.207 83.549 83.875 84.149 84.366 84.559 84.743 84.893 85.037 85.176 85.267 85.35 85.441 85.531 85.613 85.651 85.682 85.723 85.746 85.765 85.773 85.786 85.803 85.814 85.8 85.724 85.727 85.705 85.677 85.578 85.507 85.433 85.365 85.282 85.162 84.947 84.194 -7 ,13221 ,KEBNE ,16654876,Mon Nov 22 07:54:49 CET,Mon Nov 22 09:17:51 CET,0.0 0.529 0.809 1.105 1.378 1.62 1.843 2.059 2.461 2.645 2.822 3.041 3.348 3.509 3.827 4.141 4.446 4.599 4.905 5.197 5.623 5.903 6.185 6.604 7.026 7.443 7.838 8.23 8.753 9.255 9.75 10.375 10.992 11.596 12.311 13.139 13.971 14.91 15.942 17.091 18.328 19.756 21.472 23.278 25.461 28.012 31.173 34.926 39.556 45.507 53.493 60.972 66.029 69.647 72.352 74.49 76.111 77.436 78.512 79.481 80.237 80.872 81.431 81.905 82.305 82.646 82.967 83.235 83.467 83.69 83.888 84.022 84.144 84.278 84.375 84.467 84.551 84.618 84.69 84.73 84.77 84.838 84.866 84.881 84.886 84.891 84.89 84.874 84.861 84.798 84.828 84.806 84.777 84.686 84.622 84.552 84.475 84.391 84.272 84.051 83.454 -8 ,4723 ,KEBNE ,16657015,Tue Nov 23 01:13:26 CET,Tue Nov 23 02:44:44 CET,0.0 0.427 0.722 0.97 1.195 1.41 1.611 1.793 2.135 2.295 2.455 2.643 2.938 3.087 3.378 3.673 3.967 4.117 4.407 4.695 5.143 5.434 5.706 6.105 6.505 6.9 7.299 7.694 8.204 8.705 9.198 9.821 10.431 11.028 11.732 12.534 13.329 14.239 15.247 16.338 17.534 18.952 20.679 22.498 24.692 27.232 30.324 34.025 38.675 44.608 52.652 60.36 65.481 69.163 71.887 73.998 75.616 76.932 77.975 78.931 79.692 80.322 80.88 81.353 81.761 82.112 82.445 82.721 82.937 83.136 83.331 83.491 83.651 83.792 83.88 83.963 84.035 84.11 84.189 84.229 84.257 84.302 84.326 84.34 84.344 84.342 84.342 84.328 84.314 84.246 84.242 84.212 84.177 84.073 84.004 83.919 83.83 83.723 83.562 83.309 82.503 -9 ,29072 ,KEBNE ,16654878,Mon Nov 22 07:54:50 CET,Mon Nov 22 09:19:16 CET,0.0 0.854 1.188 1.468 1.722 1.948 2.161 2.36 2.755 2.943 3.13 3.351 3.653 3.822 4.151 4.455 4.747 4.896 5.198 5.499 5.932 6.218 6.509 6.932 7.338 7.742 8.15 8.549 9.078 9.605 10.118 10.753 11.37 11.973 12.705 13.555 14.394 15.336 16.36 17.483 18.725 20.169 21.932 23.764 25.96 28.572 31.736 35.432 40.071 46.1 54.174 61.73 66.861 70.601 73.381 75.561 77.253 78.61 79.679 80.648 81.397 82.006 82.553 83.034 83.44 83.783 84.117 84.406 84.636 84.847 85.052 85.217 85.382 85.528 85.624 85.72 85.807 85.887 85.955 85.994 86.034 86.087 86.125 86.164 86.183 86.206 86.205 86.191 86.183 86.113 86.107 86.077 86.048 85.981 85.934 85.871 85.782 85.678 85.546 85.348 84.213 -10 ,27957 ,KEBNE ,16654879,Mon Nov 22 07:54:49 CET,Mon Nov 22 09:18:14 CET,0.0 0.778 1.117 1.376 1.625 1.857 2.056 2.248 2.626 2.807 2.982 3.208 3.52 3.684 3.995 4.315 4.634 4.784 5.077 5.372 5.815 6.106 6.397 6.832 7.255 7.672 8.081 8.489 9.018 9.536 10.043 10.669 11.284 11.881 12.608 13.453 14.297 15.257 16.322 17.471 18.703 20.147 21.906 23.707 25.867 28.457 31.599 35.279 39.868 45.851 54.01 61.689 66.814 70.46 73.163 75.292 76.954 78.295 79.35 80.324 81.095 81.736 82.305 82.796 83.223 83.579 83.903 84.164 84.383 84.601 84.807 84.961 85.098 85.223 85.325 85.431 85.521 85.601 85.662 85.697 85.736 85.789 85.813 85.831 85.838 85.852 85.865 85.863 85.856 85.788 85.807 85.784 85.753 85.661 85.61 85.55 85.47 85.36 85.181 84.931 84.309 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt deleted file mode 100644 index 2394b41c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30359 ,KEBNE ,16654880,Mon Nov 22 07:54:50 CET,Mon Nov 22 09:17:40 CET,0.0 0.517 0.813 1.097 1.379 1.634 1.863 2.078 2.483 2.664 2.826 3.019 3.323 3.477 3.78 4.088 4.396 4.555 4.878 5.187 5.635 5.932 6.228 6.665 7.1 7.53 7.943 8.352 8.91 9.461 9.999 10.645 11.286 11.937 12.706 13.585 14.454 15.446 16.556 17.779 19.101 20.628 22.491 24.45 26.805 29.536 32.872 36.868 41.91 48.446 57.43 66.143 72.022 76.271 79.481 82.043 84.06 85.71 87.024 88.258 89.253 90.079 90.801 91.436 91.994 92.475 92.953 93.351 93.674 94.005 94.339 94.602 94.861 95.108 95.29 95.473 95.643 95.812 95.982 96.089 96.193 96.346 96.444 96.547 96.597 96.692 96.783 96.858 96.892 96.889 96.987 97.006 97.024 97.077 97.098 97.104 97.106 97.098 97.078 97.052 96.874 -2 ,8749 ,KEBNE ,16654881,Mon Nov 22 07:54:50 CET,Mon Nov 22 09:19:12 CET,0.0 0.505 0.808 1.035 1.238 1.427 1.612 1.799 2.155 2.327 2.491 2.671 2.968 3.125 3.435 3.742 4.052 4.209 4.523 4.827 5.286 5.598 5.902 6.348 6.78 7.196 7.61 8.022 8.562 9.093 9.63 10.288 10.938 11.574 12.327 13.211 14.079 15.059 16.149 17.34 18.642 20.154 21.984 23.896 26.237 28.999 32.352 36.369 41.386 47.9 56.893 65.483 71.33 75.634 78.887 81.449 83.451 85.096 86.41 87.621 88.58 89.394 90.122 90.757 91.312 91.798 92.274 92.66 92.974 93.283 93.578 93.811 94.046 94.278 94.456 94.621 94.777 94.932 95.078 95.172 95.261 95.403 95.498 95.575 95.613 95.687 95.752 95.813 95.837 95.822 95.896 95.91 95.927 95.95 95.942 95.924 95.905 95.879 95.842 95.764 95.431 -3 ,3579 ,KEBNE ,16654882,Mon Nov 22 07:54:50 CET,Mon Nov 22 09:17:40 CET,0.0 0.393 0.646 0.87 1.076 1.266 1.448 1.62 1.954 2.119 2.28 2.463 2.76 2.913 3.214 3.523 3.817 3.957 4.24 4.527 4.954 5.236 5.52 5.94 6.342 6.742 7.145 7.541 8.071 8.6 9.124 9.772 10.405 11.032 11.787 12.672 13.55 14.548 15.653 16.852 18.149 19.661 21.5 23.438 25.798 28.553 31.871 35.844 40.902 47.435 56.317 64.844 70.66 74.918 78.146 80.728 82.766 84.451 85.772 86.995 87.977 88.783 89.505 90.146 90.709 91.182 91.636 92.033 92.361 92.673 92.973 93.208 93.445 93.676 93.839 93.988 94.128 94.274 94.427 94.522 94.611 94.743 94.821 94.893 94.925 94.993 95.051 95.088 95.114 95.108 95.183 95.193 95.209 95.256 95.261 95.26 95.234 95.18 95.115 95.022 94.773 -4 ,28464 ,KEBNE ,16657021,Tue Nov 23 01:15:29 CET,Tue Nov 23 02:40:31 CET,0.0 0.415 0.692 0.938 1.159 1.375 1.574 1.758 2.139 2.335 2.524 2.77 3.09 3.262 3.593 3.909 4.228 4.389 4.704 5.006 5.449 5.743 6.03 6.456 6.88 7.304 7.721 8.136 8.695 9.241 9.771 10.429 11.078 11.721 12.489 13.379 14.26 15.249 16.349 17.559 18.877 20.416 22.273 24.215 26.574 29.324 32.641 36.644 41.738 48.307 57.245 65.808 71.667 75.95 79.192 81.788 83.837 85.5 86.82 88.035 89.002 89.82 90.536 91.157 91.696 92.171 92.649 93.036 93.349 93.666 93.973 94.209 94.443 94.68 94.852 95.016 95.172 95.321 95.465 95.555 95.644 95.763 95.833 95.91 95.948 96.016 96.078 96.14 96.174 96.159 96.208 96.217 96.227 96.218 96.196 96.163 96.124 96.079 96.021 95.93 95.486 -5 ,15147 ,KEBNE ,16654884,Mon Nov 22 07:54:50 CET,Mon Nov 22 09:17:57 CET,0.0 0.471 0.708 0.933 1.135 1.324 1.518 1.707 2.07 2.238 2.398 2.577 2.873 3.028 3.336 3.651 3.965 4.118 4.42 4.72 5.176 5.474 5.763 6.195 6.618 7.045 7.474 7.887 8.417 8.95 9.485 10.134 10.775 11.409 12.153 13.015 13.88 14.886 15.985 17.186 18.511 20.033 21.86 23.77 26.119 28.884 32.238 36.255 41.339 47.927 56.857 65.405 71.268 75.568 78.829 81.425 83.469 85.157 86.485 87.722 88.702 89.5 90.219 90.855 91.399 91.873 92.361 92.764 93.077 93.377 93.669 93.904 94.147 94.389 94.564 94.73 94.899 95.064 95.205 95.295 95.376 95.483 95.562 95.641 95.676 95.74 95.798 95.862 95.889 95.871 95.944 95.962 95.976 95.975 95.967 95.974 95.99 96.001 95.98 95.909 95.516 -6 ,25718 ,KEBNE ,16654885,Mon Nov 22 07:54:50 CET,Mon Nov 22 09:17:39 CET,0.0 0.553 0.801 0.985 1.162 1.337 1.514 1.687 2.012 2.174 2.341 2.538 2.834 2.989 3.299 3.597 3.891 4.04 4.329 4.616 5.043 5.321 5.598 6.009 6.412 6.815 7.211 7.595 8.11 8.636 9.149 9.775 10.404 11.031 11.775 12.629 13.481 14.44 15.488 16.634 17.885 19.359 21.15 23.018 25.329 28.053 31.372 35.4 40.49 47.022 56.018 64.654 70.475 74.746 77.974 80.539 82.571 84.264 85.607 86.833 87.805 88.598 89.306 89.932 90.479 90.959 91.422 91.81 92.131 92.442 92.745 92.981 93.21 93.439 93.616 93.789 93.946 94.09 94.225 94.314 94.401 94.524 94.601 94.687 94.733 94.818 94.906 94.995 95.03 95.028 95.129 95.156 95.179 95.219 95.237 95.241 95.224 95.206 95.181 95.108 94.909 -7 ,292 ,KEBNE ,16657024,Tue Nov 23 01:15:29 CET,Tue Nov 23 02:46:27 CET,0.0 0.716 1.019 1.318 1.568 1.773 1.97 2.159 2.513 2.667 2.82 2.983 3.274 3.428 3.729 4.034 4.328 4.469 4.758 5.041 5.455 5.726 5.997 6.411 6.825 7.231 7.625 8.02 8.549 9.07 9.584 10.224 10.863 11.476 12.206 13.065 13.924 14.901 15.992 17.192 18.476 19.988 21.843 23.781 26.113 28.848 32.211 36.257 41.319 47.852 56.797 65.313 71.121 75.382 78.582 81.143 83.184 84.844 86.163 87.398 88.372 89.185 89.909 90.535 91.081 91.555 92.016 92.405 92.731 93.05 93.357 93.59 93.82 94.048 94.212 94.371 94.525 94.662 94.793 94.89 94.987 95.115 95.19 95.263 95.301 95.378 95.451 95.513 95.533 95.518 95.604 95.632 95.662 95.67 95.668 95.673 95.67 95.654 95.608 95.547 95.131 -8 ,21430 ,KEBNE ,16657025,Tue Nov 23 01:15:29 CET,Tue Nov 23 02:39:17 CET,0.0 0.376 0.632 0.844 1.037 1.217 1.392 1.564 1.903 2.074 2.245 2.434 2.725 2.874 3.167 3.462 3.753 3.893 4.173 4.454 4.872 5.151 5.43 5.835 6.231 6.628 7.016 7.403 7.923 8.439 8.958 9.6 10.237 10.873 11.632 12.521 13.385 14.354 15.453 16.651 17.96 19.474 21.3 23.233 25.561 28.307 31.685 35.703 40.782 47.36 56.292 64.835 70.641 74.921 78.159 80.719 82.733 84.375 85.68 86.89 87.858 88.67 89.385 90.022 90.577 91.049 91.532 91.929 92.234 92.548 92.862 93.101 93.346 93.595 93.767 93.928 94.084 94.237 94.391 94.487 94.575 94.693 94.781 94.877 94.924 95.02 95.105 95.183 95.222 95.217 95.329 95.36 95.382 95.438 95.455 95.454 95.455 95.454 95.437 95.4 95.177 -9 ,25069 ,KEBNE ,16657026,Tue Nov 23 01:16:31 CET,Tue Nov 23 02:41:50 CET,0.0 0.427 0.672 0.89 1.083 1.28 1.47 1.649 2.007 2.179 2.344 2.535 2.838 2.999 3.314 3.628 3.931 4.075 4.36 4.64 5.056 5.331 5.607 6.019 6.421 6.822 7.224 7.619 8.153 8.682 9.19 9.818 10.443 11.066 11.817 12.68 13.535 14.512 15.602 16.774 18.053 19.574 21.411 23.32 25.654 28.401 31.736 35.741 40.817 47.373 56.316 64.895 70.742 74.994 78.187 80.761 82.769 84.398 85.71 86.93 87.902 88.708 89.428 90.07 90.63 91.112 91.587 91.98 92.296 92.619 92.936 93.181 93.425 93.652 93.817 93.978 94.123 94.267 94.418 94.502 94.581 94.715 94.793 94.857 94.889 94.944 94.993 95.042 95.066 95.053 95.13 95.151 95.167 95.171 95.151 95.13 95.093 95.036 94.943 94.776 94.212 -10 ,27834 ,KEBNE ,16654889,Mon Nov 22 07:54:50 CET,Mon Nov 22 09:17:45 CET,0.0 0.361 0.599 0.815 1.021 1.226 1.422 1.601 1.924 2.082 2.243 2.42 2.717 2.874 3.183 3.486 3.788 3.938 4.221 4.51 4.943 5.216 5.49 5.917 6.333 6.733 7.129 7.531 8.076 8.617 9.142 9.793 10.458 11.111 11.88 12.769 13.649 14.639 15.735 16.941 18.242 19.769 21.633 23.587 25.943 28.681 32.029 36.052 41.142 47.72 56.627 65.134 70.962 75.253 78.476 81.038 83.05 84.705 86.036 87.271 88.261 89.081 89.805 90.443 90.99 91.46 91.947 92.366 92.683 92.994 93.304 93.543 93.766 93.978 94.14 94.302 94.465 94.621 94.77 94.867 94.96 95.079 95.152 95.223 95.253 95.311 95.376 95.438 95.466 95.456 95.537 95.548 95.556 95.574 95.578 95.555 95.495 95.439 95.373 95.221 94.906 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt deleted file mode 100644 index c7d0d757..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4980 ,KEBNE ,16657028,Tue Nov 23 01:16:31 CET,Tue Nov 23 02:40:16 CET,0.0 0.433 0.577 0.699 0.786 0.874 0.969 1.052 1.206 1.277 1.338 1.402 1.496 1.546 1.637 1.721 1.803 1.843 1.911 1.972 2.067 2.127 2.177 2.246 2.31 2.362 2.41 2.456 2.509 2.562 2.609 2.653 2.698 2.742 2.787 2.824 2.859 2.899 2.926 2.937 2.917 2.858 2.77 2.653 2.455 2.162 1.703 1.061 0.132 -1.354 -3.86 -6.812 -9.185 -11.123 -12.751 -14.114 -15.23 -16.252 -17.131 -17.987 -18.692 -19.292 -19.857 -20.39 -20.895 -21.343 -21.791 -22.201 -22.558 -22.919 -23.286 -23.58 -23.883 -24.196 -24.438 -24.687 -24.931 -25.172 -25.438 -25.619 -25.799 -26.077 -26.266 -26.469 -26.581 -26.813 -27.046 -27.294 -27.419 -27.61 -27.843 -27.997 -28.156 -28.516 -28.699 -28.885 -29.067 -29.247 -29.462 -29.765 -30.761 -2 ,14712 ,KEBNE ,16657029,Tue Nov 23 01:16:31 CET,Tue Nov 23 02:46:59 CET,0.0 0.283 0.409 0.507 0.595 0.672 0.742 0.818 0.948 1.012 1.086 1.178 1.28 1.338 1.444 1.534 1.613 1.652 1.727 1.799 1.905 1.964 2.012 2.087 2.161 2.231 2.309 2.388 2.485 2.583 2.667 2.761 2.844 2.921 2.99 3.022 3.057 3.092 3.099 3.087 3.064 3.023 2.991 2.92 2.733 2.47 2.052 1.447 0.495 -1.02 -3.46 -6.34 -8.637 -10.536 -12.105 -13.476 -14.642 -15.667 -16.551 -17.399 -18.087 -18.695 -19.29 -19.856 -20.366 -20.808 -21.247 -21.647 -21.999 -22.358 -22.725 -23.025 -23.32 -23.635 -23.89 -24.149 -24.418 -24.68 -24.942 -25.129 -25.317 -25.611 -25.804 -25.992 -26.092 -26.312 -26.544 -26.767 -26.876 -27.058 -27.236 -27.37 -27.504 -27.779 -27.927 -28.096 -28.27 -28.434 -28.637 -28.94 -29.635 -3 ,5531 ,KEBNE ,16657030,Tue Nov 23 01:16:31 CET,Tue Nov 23 02:47:22 CET,0.0 0.165 0.291 0.402 0.499 0.572 0.646 0.717 0.842 0.896 0.951 1.03 1.125 1.175 1.287 1.401 1.506 1.552 1.63 1.703 1.819 1.9 1.976 2.075 2.161 2.248 2.325 2.376 2.429 2.472 2.518 2.579 2.639 2.694 2.742 2.77 2.785 2.812 2.84 2.855 2.847 2.818 2.747 2.611 2.403 2.087 1.643 1.068 0.165 -1.297 -3.741 -6.656 -8.996 -10.937 -12.57 -13.969 -15.131 -16.133 -16.979 -17.805 -18.506 -19.122 -19.713 -20.262 -20.741 -21.173 -21.636 -22.054 -22.411 -22.782 -23.168 -23.475 -23.791 -24.128 -24.384 -24.641 -24.895 -25.151 -25.419 -25.6 -25.79 -26.089 -26.294 -26.501 -26.612 -26.855 -27.104 -27.355 -27.48 -27.676 -27.872 -28.001 -28.143 -28.475 -28.67 -28.876 -29.087 -29.319 -29.575 -29.934 -30.982 -4 ,7830 ,KEBNE ,16657031,Tue Nov 23 01:16:32 CET,Tue Nov 23 02:41:38 CET,0.0 0.318 0.443 0.53 0.612 0.689 0.757 0.826 0.948 1.003 1.056 1.101 1.183 1.228 1.322 1.407 1.484 1.518 1.584 1.657 1.772 1.848 1.916 2.012 2.102 2.176 2.238 2.295 2.373 2.459 2.548 2.658 2.747 2.826 2.918 3.006 3.06 3.099 3.126 3.122 3.09 3.04 2.946 2.812 2.615 2.309 1.852 1.235 0.303 -1.216 -3.668 -6.437 -8.722 -10.653 -12.233 -13.561 -14.714 -15.763 -16.635 -17.476 -18.177 -18.782 -19.358 -19.904 -20.407 -20.855 -21.325 -21.75 -22.127 -22.53 -22.953 -23.3 -23.633 -23.948 -24.184 -24.419 -24.67 -24.939 -25.201 -25.373 -25.548 -25.822 -26.027 -26.243 -26.347 -26.573 -26.84 -27.112 -27.242 -27.44 -27.644 -27.785 -27.925 -28.206 -28.357 -28.517 -28.695 -28.909 -29.174 -29.495 -30.509 -5 ,31919 ,KEBNE ,16657032,Tue Nov 23 01:17:33 CET,Tue Nov 23 02:48:06 CET,0.0 0.233 0.379 0.495 0.589 0.678 0.752 0.824 0.951 0.998 1.044 1.09 1.178 1.22 1.309 1.399 1.486 1.533 1.615 1.683 1.781 1.846 1.908 1.992 2.069 2.154 2.239 2.308 2.378 2.438 2.518 2.622 2.7 2.774 2.84 2.882 2.918 2.945 2.965 3.023 3.052 3.003 2.892 2.737 2.526 2.226 1.763 1.098 0.124 -1.389 -3.868 -6.762 -9.138 -11.117 -12.749 -14.149 -15.315 -16.349 -17.232 -18.079 -18.783 -19.403 -19.987 -20.519 -21.013 -21.478 -21.956 -22.377 -22.729 -23.079 -23.447 -23.753 -24.062 -24.395 -24.675 -24.953 -25.227 -25.53 -25.84 -26.048 -26.27 -26.613 -26.848 -27.077 -27.195 -27.458 -27.729 -28.007 -28.148 -28.358 -28.593 -28.754 -28.916 -29.236 -29.435 -29.65 -29.865 -30.112 -30.4 -30.761 -31.746 -6 ,1861 ,KEBNE ,16657033,Tue Nov 23 01:17:33 CET,Tue Nov 23 02:48:08 CET,0.0 0.285 0.477 0.618 0.744 0.864 0.967 1.064 1.252 1.33 1.396 1.459 1.546 1.59 1.671 1.751 1.838 1.872 1.929 1.992 2.073 2.127 2.185 2.268 2.334 2.387 2.442 2.496 2.56 2.634 2.712 2.777 2.82 2.857 2.899 2.943 2.976 3.02 3.086 3.122 3.098 3.042 2.953 2.836 2.636 2.335 1.902 1.255 0.254 -1.218 -3.629 -6.533 -8.872 -10.824 -12.415 -13.771 -14.935 -15.957 -16.8 -17.623 -18.318 -18.912 -19.488 -20.035 -20.56 -21.058 -21.576 -22.028 -22.415 -22.814 -23.213 -23.545 -23.888 -24.231 -24.502 -24.791 -25.083 -25.374 -25.67 -25.875 -26.083 -26.399 -26.626 -26.865 -26.982 -27.213 -27.448 -27.689 -27.812 -28.012 -28.225 -28.369 -28.512 -28.83 -29.002 -29.201 -29.414 -29.636 -29.918 -30.315 -31.17 -7 ,22722 ,KEBNE ,16657034,Tue Nov 23 01:17:33 CET,Tue Nov 23 02:42:24 CET,0.0 0.415 0.552 0.647 0.729 0.841 0.941 1.008 1.15 1.212 1.265 1.318 1.406 1.441 1.505 1.574 1.649 1.683 1.737 1.797 1.889 1.943 1.989 2.05 2.111 2.172 2.226 2.267 2.331 2.396 2.446 2.507 2.57 2.645 2.735 2.82 2.902 2.979 3.006 2.993 2.97 2.913 2.823 2.716 2.531 2.239 1.789 1.131 0.132 -1.323 -3.761 -6.657 -8.977 -10.874 -12.4 -13.756 -14.934 -15.948 -16.79 -17.611 -18.298 -18.906 -19.484 -20.011 -20.483 -20.915 -21.366 -21.774 -22.126 -22.475 -22.842 -23.151 -23.462 -23.784 -24.037 -24.288 -24.539 -24.799 -25.071 -25.261 -25.452 -25.746 -25.938 -26.13 -26.231 -26.443 -26.678 -26.927 -27.049 -27.242 -27.437 -27.585 -27.757 -28.138 -28.328 -28.526 -28.759 -29.019 -29.364 -29.806 -30.868 -8 ,6077 ,KEBNE ,16657035,Tue Nov 23 01:17:33 CET,Tue Nov 23 02:45:57 CET,0.0 0.201 0.364 0.48 0.568 0.647 0.714 0.781 0.905 0.962 1.02 1.089 1.177 1.22 1.304 1.383 1.453 1.484 1.539 1.591 1.679 1.73 1.779 1.869 1.964 2.059 2.158 2.248 2.345 2.43 2.51 2.619 2.7 2.754 2.811 2.847 2.878 2.907 2.922 2.916 2.881 2.827 2.756 2.62 2.39 2.084 1.644 1.042 0.094 -1.402 -3.863 -6.71 -8.989 -10.895 -12.474 -13.826 -14.948 -15.933 -16.783 -17.618 -18.317 -18.931 -19.518 -20.068 -20.555 -20.994 -21.44 -21.825 -22.164 -22.513 -22.871 -23.164 -23.462 -23.773 -24.016 -24.263 -24.528 -24.816 -25.131 -25.35 -25.564 -25.894 -26.124 -26.356 -26.475 -26.735 -27.004 -27.271 -27.411 -27.631 -27.879 -28.035 -28.193 -28.551 -28.739 -28.937 -29.152 -29.385 -29.64 -29.99 -31.152 -9 ,31377 ,KEBNE ,16657036,Tue Nov 23 01:18:35 CET,Tue Nov 23 02:44:04 CET,0.0 0.499 0.678 0.799 0.894 0.976 1.053 1.131 1.266 1.322 1.377 1.453 1.549 1.593 1.669 1.741 1.815 1.849 1.902 1.954 2.041 2.099 2.149 2.213 2.27 2.323 2.369 2.409 2.466 2.538 2.615 2.71 2.802 2.883 2.978 3.087 3.176 3.247 3.308 3.341 3.328 3.274 3.163 3.016 2.793 2.455 2.015 1.395 0.418 -1.057 -3.552 -6.431 -8.697 -10.574 -12.126 -13.461 -14.629 -15.668 -16.525 -17.355 -18.076 -18.707 -19.283 -19.824 -20.317 -20.765 -21.228 -21.629 -21.976 -22.327 -22.679 -22.972 -23.277 -23.593 -23.833 -24.075 -24.332 -24.586 -24.836 -25.005 -25.178 -25.461 -25.651 -25.836 -25.937 -26.152 -26.372 -26.598 -26.712 -26.894 -27.046 -27.158 -27.285 -27.561 -27.717 -27.89 -28.078 -28.3 -28.543 -28.858 -29.633 -10 ,10609 ,KEBNE ,16657037,Tue Nov 23 01:18:39 CET,Tue Nov 23 02:41:27 CET,0.0 0.195 0.333 0.437 0.542 0.632 0.709 0.777 0.895 0.949 0.999 1.052 1.14 1.18 1.263 1.349 1.434 1.477 1.561 1.649 1.776 1.855 1.931 2.037 2.127 2.199 2.272 2.346 2.432 2.52 2.616 2.713 2.803 2.9 2.982 3.026 3.054 3.077 3.084 3.069 3.032 2.985 2.906 2.785 2.646 2.448 2.062 1.553 0.751 -0.644 -3.02 -5.838 -8.107 -10.004 -11.622 -13.103 -14.417 -15.588 -16.517 -17.377 -18.098 -18.738 -19.318 -19.847 -20.362 -20.832 -21.309 -21.721 -22.071 -22.426 -22.788 -23.103 -23.457 -23.819 -24.074 -24.329 -24.584 -24.83 -25.086 -25.274 -25.471 -25.769 -25.977 -26.192 -26.301 -26.512 -26.716 -26.948 -27.084 -27.289 -27.477 -27.619 -27.771 -28.096 -28.289 -28.49 -28.674 -28.896 -29.198 -29.574 -30.417 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt deleted file mode 100644 index ffa3ab85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28464 ,KEBNE ,16657038,Tue Nov 23 01:21:40 CET,Tue Nov 23 02:46:41 CET,0.0 0.365 0.603 0.797 0.975 1.132 1.278 1.49 1.581 1.678 1.806 1.926 2.004 2.143 2.266 2.381 2.437 2.55 2.664 2.815 2.916 3.023 3.162 3.29 3.41 3.521 3.638 3.767 3.861 3.953 4.058 4.152 4.239 4.318 4.381 4.466 4.575 4.694 4.813 4.876 4.887 4.838 4.734 4.579 4.339 3.948 3.337 2.442 1.139 -1.119 -3.865 -6.09 -7.921 -9.434 -10.756 -11.916 -12.941 -13.777 -14.569 -15.22 -15.798 -16.35 -16.873 -17.358 -17.787 -18.225 -18.615 -18.943 -19.272 -19.614 -19.896 -20.175 -20.449 -20.657 -20.88 -21.111 -21.342 -21.577 -21.74 -21.903 -22.157 -22.339 -22.535 -22.63 -22.804 -22.988 -23.185 -23.29 -23.472 -23.629 -23.742 -23.867 -24.122 -24.269 -24.428 -24.598 -24.804 -25.024 -25.299 -2 ,712 ,KEBNE ,16657039,Tue Nov 23 01:28:55 CET,Tue Nov 23 02:54:27 CET,0.0 0.296 0.508 0.677 0.833 0.986 1.119 1.358 1.478 1.584 1.722 1.848 1.933 2.093 2.236 2.362 2.416 2.527 2.646 2.808 2.906 3.004 3.136 3.252 3.367 3.484 3.587 3.706 3.815 3.899 3.986 4.073 4.152 4.239 4.314 4.389 4.494 4.599 4.67 4.691 4.672 4.647 4.595 4.477 4.282 3.915 3.318 2.428 1.092 -1.173 -3.859 -6.062 -7.895 -9.419 -10.735 -11.878 -12.882 -13.705 -14.51 -15.194 -15.788 -16.34 -16.86 -17.334 -17.751 -18.187 -18.559 -18.875 -19.228 -19.587 -19.875 -20.163 -20.453 -20.685 -20.926 -21.167 -21.409 -21.658 -21.822 -21.987 -22.251 -22.433 -22.617 -22.712 -22.9 -23.089 -23.276 -23.374 -23.552 -23.703 -23.815 -23.934 -24.209 -24.368 -24.537 -24.735 -24.963 -25.203 -25.535 -3 ,11380 ,KEBNE ,16657040,Tue Nov 23 01:31:00 CET,Tue Nov 23 02:54:32 CET,0.0 0.313 0.539 0.715 0.875 1.022 1.155 1.386 1.49 1.593 1.754 1.888 1.97 2.123 2.26 2.378 2.442 2.565 2.666 2.809 2.892 2.974 3.096 3.216 3.338 3.451 3.564 3.705 3.835 3.96 4.097 4.216 4.324 4.449 4.573 4.693 4.82 4.934 5.045 5.136 5.224 5.282 5.279 5.236 5.164 4.971 4.512 3.782 2.553 0.225 -2.587 -4.787 -6.601 -8.149 -9.464 -10.57 -11.554 -12.375 -13.164 -13.837 -14.436 -15.001 -15.53 -16.016 -16.436 -16.862 -17.253 -17.579 -17.915 -18.268 -18.557 -18.859 -19.165 -19.389 -19.622 -19.859 -20.095 -20.332 -20.496 -20.667 -20.919 -21.093 -21.277 -21.373 -21.575 -21.788 -22.009 -22.116 -22.287 -22.441 -22.555 -22.673 -22.946 -23.097 -23.252 -23.429 -23.647 -23.902 -24.198 -4 ,515 ,KEBNE ,16657041,Tue Nov 23 01:32:02 CET,Tue Nov 23 02:56:10 CET,0.0 0.349 0.607 0.799 0.992 1.169 1.312 1.559 1.668 1.767 1.903 2.029 2.106 2.261 2.411 2.54 2.598 2.699 2.808 2.986 3.097 3.191 3.31 3.419 3.52 3.614 3.713 3.848 3.976 4.095 4.234 4.365 4.478 4.593 4.694 4.798 4.925 5.035 5.11 5.134 5.14 5.127 5.051 4.886 4.622 4.22 3.658 2.822 1.522 -0.756 -3.484 -5.714 -7.596 -9.135 -10.47 -11.615 -12.625 -13.473 -14.299 -14.989 -15.604 -16.168 -16.667 -17.123 -17.538 -17.973 -18.36 -18.687 -19.023 -19.379 -19.671 -19.964 -20.262 -20.486 -20.726 -20.988 -21.271 -21.569 -21.762 -21.952 -22.252 -22.461 -22.675 -22.786 -23.008 -23.231 -23.477 -23.604 -23.802 -24.016 -24.158 -24.301 -24.572 -24.722 -24.894 -25.079 -25.28 -25.518 -25.799 -5 ,19463 ,KEBNE ,16657042,Tue Nov 23 01:32:02 CET,Tue Nov 23 02:56:21 CET,0.0 0.313 0.531 0.755 0.956 1.142 1.3 1.525 1.625 1.723 1.874 2.012 2.098 2.24 2.384 2.517 2.57 2.675 2.783 2.931 3.018 3.099 3.219 3.332 3.439 3.555 3.66 3.769 3.865 3.959 4.066 4.16 4.228 4.298 4.378 4.444 4.511 4.569 4.622 4.667 4.67 4.627 4.57 4.447 4.214 3.886 3.401 2.528 1.097 -1.173 -3.787 -5.95 -7.767 -9.248 -10.562 -11.696 -12.691 -13.536 -14.345 -15.017 -15.611 -16.17 -16.679 -17.152 -17.583 -18.029 -18.438 -18.787 -19.131 -19.475 -19.758 -20.053 -20.353 -20.588 -20.83 -21.074 -21.329 -21.584 -21.764 -21.954 -22.257 -22.474 -22.68 -22.788 -23.017 -23.247 -23.495 -23.626 -23.822 -24.016 -24.145 -24.293 -24.62 -24.784 -24.958 -25.143 -25.355 -25.608 -25.918 -6 ,21870 ,KEBNE ,16657043,Tue Nov 23 01:33:04 CET,Tue Nov 23 02:56:45 CET,0.0 0.327 0.549 0.716 0.871 1.026 1.171 1.426 1.531 1.622 1.765 1.887 1.958 2.101 2.243 2.357 2.417 2.545 2.651 2.789 2.878 2.967 3.09 3.208 3.318 3.421 3.522 3.636 3.738 3.827 3.93 4.053 4.174 4.293 4.41 4.499 4.589 4.705 4.819 4.873 4.88 4.862 4.788 4.651 4.449 4.084 3.49 2.58 1.215 -1.116 -3.852 -6.036 -7.861 -9.359 -10.656 -11.739 -12.692 -13.499 -14.253 -14.897 -15.485 -16.031 -16.525 -16.973 -17.374 -17.779 -18.137 -18.446 -18.769 -19.112 -19.388 -19.675 -19.98 -20.204 -20.42 -20.638 -20.865 -21.097 -21.268 -21.448 -21.706 -21.881 -22.067 -22.164 -22.373 -22.608 -22.859 -22.99 -23.186 -23.365 -23.5 -23.645 -23.934 -24.087 -24.243 -24.41 -24.623 -24.864 -25.183 -7 ,10945 ,KEBNE ,16657044,Tue Nov 23 01:34:08 CET,Tue Nov 23 03:01:41 CET,0.0 0.299 0.49 0.649 0.808 0.96 1.088 1.297 1.404 1.511 1.67 1.795 1.881 2.047 2.18 2.316 2.383 2.492 2.592 2.746 2.84 2.938 3.085 3.209 3.315 3.404 3.48 3.579 3.683 3.783 3.889 3.98 4.06 4.146 4.258 4.382 4.519 4.613 4.694 4.803 4.879 4.893 4.809 4.661 4.439 4.069 3.541 2.761 1.459 -0.827 -3.558 -5.735 -7.514 -9.036 -10.345 -11.448 -12.413 -13.234 -14.031 -14.704 -15.315 -15.871 -16.404 -16.894 -17.299 -17.717 -18.09 -18.401 -18.729 -19.065 -19.349 -19.654 -19.961 -20.208 -20.465 -20.723 -20.988 -21.26 -21.447 -21.633 -21.918 -22.115 -22.315 -22.417 -22.623 -22.838 -23.066 -23.183 -23.37 -23.542 -23.669 -23.805 -24.115 -24.274 -24.427 -24.584 -24.772 -25.008 -25.309 -8 ,22877 ,KEBNE ,16657045,Tue Nov 23 01:35:11 CET,Tue Nov 23 03:00:34 CET,0.0 0.262 0.492 0.657 0.781 0.9 1.019 1.257 1.37 1.464 1.597 1.728 1.815 1.959 2.083 2.205 2.26 2.369 2.479 2.63 2.722 2.8 2.906 3.016 3.129 3.24 3.345 3.484 3.611 3.738 3.872 3.97 4.052 4.134 4.224 4.29 4.347 4.414 4.466 4.496 4.502 4.478 4.433 4.335 4.149 3.832 3.322 2.484 1.158 -1.069 -3.724 -5.907 -7.752 -9.266 -10.578 -11.694 -12.668 -13.495 -14.312 -15.001 -15.602 -16.166 -16.688 -17.158 -17.577 -18.03 -18.43 -18.757 -19.093 -19.445 -19.735 -20.036 -20.342 -20.565 -20.791 -21.03 -21.275 -21.533 -21.719 -21.898 -22.172 -22.363 -22.559 -22.662 -22.874 -23.092 -23.318 -23.432 -23.617 -23.791 -23.901 -24.021 -24.301 -24.449 -24.622 -24.808 -24.992 -25.208 -25.51 -9 ,14018 ,KEBNE ,16657046,Tue Nov 23 01:35:11 CET,Tue Nov 23 02:59:15 CET,0.0 0.407 0.673 0.864 1.013 1.164 1.309 1.544 1.649 1.748 1.881 2.007 2.089 2.241 2.385 2.516 2.579 2.689 2.786 2.924 3.017 3.117 3.255 3.368 3.484 3.605 3.717 3.851 3.972 4.085 4.223 4.359 4.469 4.562 4.639 4.705 4.766 4.839 4.94 5.047 5.139 5.196 5.231 5.181 4.97 4.626 4.136 3.332 2.017 -0.298 -3.035 -5.19 -6.982 -8.441 -9.702 -10.788 -11.712 -12.488 -13.264 -13.924 -14.485 -15.008 -15.501 -15.946 -16.345 -16.769 -17.143 -17.481 -17.861 -18.256 -18.58 -18.907 -19.242 -19.488 -19.743 -20.004 -20.269 -20.547 -20.743 -20.937 -21.217 -21.414 -21.621 -21.731 -21.957 -22.193 -22.433 -22.554 -22.746 -22.936 -23.074 -23.214 -23.496 -23.66 -23.833 -23.998 -24.179 -24.387 -24.691 -10 ,15701 ,KEBNE ,16657047,Tue Nov 23 01:37:15 CET,Tue Nov 23 03:05:25 CET,0.0 0.346 0.604 0.809 0.992 1.146 1.29 1.524 1.613 1.699 1.832 1.958 2.047 2.219 2.366 2.505 2.574 2.704 2.815 2.958 3.044 3.122 3.231 3.33 3.412 3.496 3.589 3.698 3.809 3.926 4.062 4.181 4.261 4.352 4.45 4.529 4.638 4.754 4.872 4.969 4.985 5.008 5.025 4.909 4.689 4.35 3.814 2.976 1.666 -0.579 -3.315 -5.504 -7.273 -8.794 -10.119 -11.236 -12.237 -13.057 -13.814 -14.454 -15.015 -15.533 -16.021 -16.478 -16.872 -17.273 -17.635 -17.935 -18.244 -18.578 -18.852 -19.122 -19.394 -19.607 -19.826 -20.043 -20.269 -20.503 -20.661 -20.823 -21.074 -21.245 -21.421 -21.518 -21.724 -21.943 -22.171 -22.288 -22.471 -22.657 -22.793 -22.937 -23.239 -23.401 -23.578 -23.77 -23.965 -24.178 -24.474 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt deleted file mode 100644 index 07442155..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10014 ,KEBNE ,16654900,Mon Nov 22 07:55:52 CET,Mon Nov 22 09:18:52 CET,0.0 1.088 1.278 1.432 1.597 1.747 1.86 1.957 2.127 2.204 2.272 2.333 2.422 2.47 2.567 2.657 2.743 2.781 2.847 2.91 2.998 3.065 3.126 3.197 3.271 3.342 3.41 3.475 3.556 3.62 3.674 3.738 3.805 3.876 3.953 4.029 4.089 4.153 4.227 4.301 4.353 4.41 4.462 4.485 4.458 4.365 4.208 3.941 3.474 2.639 1.16 -0.651 -2.211 -3.538 -4.65 -5.627 -6.458 -7.191 -7.808 -8.424 -8.96 -9.431 -9.872 -10.281 -10.654 -10.99 -11.331 -11.641 -11.913 -12.183 -12.452 -12.68 -12.924 -13.176 -13.376 -13.568 -13.752 -13.963 -14.199 -14.348 -14.489 -14.714 -14.868 -15.015 -15.091 -15.246 -15.396 -15.558 -15.642 -15.78 -15.897 -15.999 -16.106 -16.32 -16.438 -16.561 -16.702 -16.852 -17.004 -17.177 -17.541 -2 ,32231 ,KEBNE ,16654901,Mon Nov 22 07:55:52 CET,Mon Nov 22 09:20:18 CET,0.0 0.767 1.007 1.162 1.315 1.424 1.507 1.593 1.734 1.786 1.836 1.905 2.0 2.044 2.122 2.199 2.279 2.314 2.388 2.469 2.581 2.64 2.694 2.786 2.88 2.968 3.042 3.118 3.224 3.308 3.379 3.469 3.56 3.638 3.722 3.816 3.89 3.961 4.029 4.103 4.189 4.262 4.311 4.322 4.303 4.27 4.141 3.87 3.403 2.593 1.116 -0.701 -2.222 -3.513 -4.621 -5.618 -6.464 -7.207 -7.844 -8.478 -9.008 -9.474 -9.906 -10.295 -10.648 -10.971 -11.316 -11.623 -11.868 -12.113 -12.386 -12.624 -12.863 -13.111 -13.298 -13.487 -13.683 -13.881 -14.088 -14.234 -14.383 -14.608 -14.768 -14.94 -15.026 -15.189 -15.351 -15.514 -15.601 -15.746 -15.869 -15.957 -16.049 -16.247 -16.359 -16.495 -16.645 -16.799 -16.945 -17.121 -17.449 -3 ,15585 ,KEBNE ,16654902,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:19:53 CET,0.0 0.974 1.239 1.402 1.571 1.711 1.822 1.932 2.125 2.206 2.274 2.357 2.46 2.523 2.629 2.73 2.831 2.879 2.972 3.061 3.189 3.265 3.338 3.435 3.527 3.62 3.696 3.77 3.869 3.945 4.01 4.102 4.184 4.265 4.359 4.445 4.52 4.604 4.694 4.767 4.818 4.872 4.906 4.922 4.93 4.876 4.708 4.426 3.979 3.185 1.691 -0.216 -1.784 -3.108 -4.248 -5.228 -6.07 -6.818 -7.444 -8.065 -8.591 -9.053 -9.49 -9.896 -10.276 -10.612 -10.938 -11.233 -11.492 -11.747 -12.003 -12.233 -12.472 -12.7 -12.885 -13.08 -13.273 -13.478 -13.697 -13.841 -13.988 -14.223 -14.383 -14.542 -14.623 -14.79 -14.97 -15.174 -15.279 -15.431 -15.59 -15.709 -15.83 -16.077 -16.209 -16.342 -16.498 -16.686 -16.907 -17.195 -17.977 -4 ,16594 ,KEBNE ,16654903,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:19:48 CET,0.0 0.928 1.201 1.41 1.542 1.649 1.761 1.858 2.023 2.112 2.203 2.319 2.419 2.479 2.599 2.711 2.816 2.866 2.95 3.026 3.145 3.218 3.281 3.374 3.466 3.548 3.622 3.695 3.802 3.897 3.975 4.077 4.166 4.239 4.322 4.41 4.486 4.562 4.626 4.706 4.786 4.827 4.869 4.901 4.895 4.856 4.721 4.447 3.972 3.114 1.581 -0.308 -1.893 -3.216 -4.311 -5.317 -6.203 -6.959 -7.566 -8.18 -8.736 -9.206 -9.639 -10.048 -10.423 -10.778 -11.14 -11.443 -11.705 -11.986 -12.26 -12.471 -12.699 -12.944 -13.133 -13.326 -13.52 -13.714 -13.919 -14.062 -14.197 -14.398 -14.53 -14.667 -14.743 -14.901 -15.061 -15.237 -15.331 -15.473 -15.621 -15.733 -15.847 -16.086 -16.212 -16.346 -16.487 -16.629 -16.797 -16.987 -17.491 -5 ,12020 ,KEBNE ,16654904,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:21:19 CET,0.0 0.518 0.704 0.854 0.969 1.052 1.125 1.203 1.357 1.45 1.541 1.631 1.735 1.794 1.899 1.994 2.09 2.141 2.228 2.307 2.424 2.506 2.582 2.681 2.778 2.859 2.934 3.011 3.109 3.196 3.278 3.371 3.453 3.519 3.595 3.682 3.763 3.851 3.924 3.975 4.039 4.094 4.11 4.136 4.152 4.12 4.01 3.732 3.248 2.453 0.973 -0.912 -2.458 -3.765 -4.879 -5.823 -6.642 -7.39 -8.014 -8.602 -9.095 -9.533 -9.944 -10.348 -10.737 -11.073 -11.406 -11.7 -11.951 -12.208 -12.49 -12.718 -12.94 -13.168 -13.346 -13.529 -13.707 -13.89 -14.08 -14.207 -14.34 -14.548 -14.692 -14.843 -14.922 -15.085 -15.248 -15.408 -15.49 -15.631 -15.764 -15.86 -15.961 -16.168 -16.271 -16.376 -16.497 -16.641 -16.8 -17.006 -17.448 -6 ,29248 ,KEBNE ,16654905,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:20:02 CET,0.0 0.616 0.845 1.033 1.202 1.339 1.461 1.569 1.759 1.861 1.958 2.076 2.182 2.245 2.358 2.457 2.555 2.599 2.686 2.782 2.92 3.004 3.079 3.178 3.267 3.357 3.444 3.517 3.601 3.679 3.76 3.857 3.954 4.04 4.132 4.228 4.322 4.418 4.487 4.54 4.598 4.641 4.666 4.671 4.648 4.591 4.42 4.128 3.606 2.635 1.052 -0.845 -2.408 -3.705 -4.833 -5.82 -6.663 -7.414 -8.041 -8.67 -9.204 -9.668 -10.103 -10.509 -10.883 -11.222 -11.571 -11.875 -12.132 -12.396 -12.671 -12.899 -13.137 -13.387 -13.576 -13.765 -13.958 -14.155 -14.353 -14.508 -14.665 -14.882 -15.043 -15.206 -15.288 -15.469 -15.652 -15.843 -15.947 -16.105 -16.259 -16.367 -16.48 -16.733 -16.872 -17.025 -17.199 -17.394 -17.625 -17.975 -18.75 -7 ,29931 ,KEBNE ,16654906,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:19:43 CET,0.0 0.704 1.001 1.205 1.358 1.489 1.616 1.733 1.884 1.955 2.033 2.138 2.241 2.294 2.4 2.504 2.611 2.666 2.766 2.862 2.98 3.046 3.119 3.21 3.291 3.373 3.448 3.523 3.619 3.701 3.775 3.873 3.966 4.053 4.144 4.231 4.308 4.383 4.449 4.517 4.575 4.615 4.651 4.688 4.727 4.712 4.567 4.266 3.77 2.943 1.506 -0.343 -1.904 -3.25 -4.402 -5.43 -6.328 -7.114 -7.756 -8.407 -8.961 -9.425 -9.88 -10.302 -10.667 -10.995 -11.345 -11.651 -11.908 -12.189 -12.481 -12.712 -12.949 -13.2 -13.391 -13.58 -13.771 -13.969 -14.168 -14.301 -14.443 -14.672 -14.836 -15.003 -15.086 -15.264 -15.443 -15.628 -15.728 -15.882 -16.041 -16.15 -16.272 -16.529 -16.677 -16.833 -16.998 -17.166 -17.339 -17.599 -18.072 -8 ,30643 ,KEBNE ,16654907,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:21:29 CET,0.0 0.439 0.635 0.757 0.867 0.97 1.054 1.133 1.287 1.352 1.41 1.482 1.583 1.65 1.787 1.915 2.031 2.084 2.183 2.273 2.399 2.479 2.554 2.65 2.728 2.813 2.901 2.973 3.068 3.157 3.241 3.35 3.435 3.511 3.603 3.69 3.771 3.86 3.942 4.002 4.042 4.099 4.148 4.128 4.07 4.003 3.851 3.581 3.146 2.36 0.851 -1.108 -2.694 -3.985 -5.086 -6.054 -6.882 -7.62 -8.258 -8.891 -9.409 -9.853 -10.265 -10.642 -10.98 -11.29 -11.619 -11.898 -12.135 -12.381 -12.637 -12.858 -13.074 -13.292 -13.465 -13.635 -13.815 -13.991 -14.162 -14.287 -14.415 -14.604 -14.735 -14.877 -14.951 -15.108 -15.267 -15.421 -15.499 -15.634 -15.769 -15.87 -15.974 -16.205 -16.326 -16.459 -16.585 -16.71 -16.848 -17.017 -17.499 -9 ,25643 ,KEBNE ,16657056,Tue Nov 23 01:43:31 CET,Tue Nov 23 03:12:26 CET,0.0 0.738 1.02 1.192 1.353 1.488 1.6 1.704 1.888 1.973 2.051 2.144 2.246 2.307 2.421 2.534 2.631 2.671 2.749 2.83 2.942 3.011 3.081 3.181 3.277 3.37 3.447 3.508 3.597 3.689 3.777 3.875 3.968 4.047 4.121 4.203 4.278 4.362 4.452 4.537 4.608 4.669 4.711 4.73 4.701 4.586 4.396 4.124 3.652 2.823 1.371 -0.494 -2.101 -3.456 -4.616 -5.627 -6.465 -7.181 -7.804 -8.441 -8.967 -9.425 -9.861 -10.26 -10.633 -10.965 -11.308 -11.624 -11.884 -12.15 -12.438 -12.672 -12.91 -13.163 -13.356 -13.545 -13.734 -13.936 -14.139 -14.283 -14.431 -14.648 -14.803 -14.959 -15.032 -15.185 -15.37 -15.559 -15.648 -15.799 -15.979 -16.097 -16.211 -16.479 -16.624 -16.764 -16.926 -17.135 -17.363 -17.668 -18.459 -10 ,16723 ,KEBNE ,16654909,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:21:25 CET,0.0 1.035 1.297 1.511 1.686 1.814 1.923 2.021 2.189 2.278 2.374 2.507 2.617 2.681 2.792 2.885 2.993 3.043 3.131 3.221 3.334 3.393 3.446 3.527 3.606 3.672 3.734 3.805 3.889 3.964 4.042 4.14 4.241 4.334 4.422 4.502 4.58 4.66 4.729 4.797 4.865 4.907 4.925 4.947 4.936 4.872 4.741 4.483 4.01 3.172 1.59 -0.425 -2.018 -3.295 -4.4 -5.399 -6.239 -6.98 -7.604 -8.226 -8.758 -9.217 -9.647 -10.052 -10.421 -10.754 -11.104 -11.415 -11.687 -11.961 -12.236 -12.457 -12.681 -12.908 -13.083 -13.263 -13.446 -13.633 -13.821 -13.955 -14.088 -14.287 -14.424 -14.568 -14.647 -14.799 -14.961 -15.134 -15.219 -15.363 -15.49 -15.585 -15.688 -15.894 -16.0 -16.127 -16.261 -16.411 -16.619 -16.869 -17.471 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt deleted file mode 100644 index b6f78344..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25423 ,KEBNE ,16654910,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:21:59 CET,0.0 0.29 0.44 0.537 0.602 0.662 0.714 0.754 0.846 0.9 0.953 0.994 1.067 1.101 1.177 1.244 1.307 1.336 1.381 1.423 1.481 1.519 1.551 1.58 1.608 1.634 1.657 1.679 1.698 1.702 1.705 1.707 1.689 1.658 1.617 1.553 1.482 1.41 1.311 1.164 1.003 0.813 0.521 0.157 -0.32 -0.938 -1.739 -2.808 -4.386 -6.644 -10.145 -14.075 -17.082 -19.494 -21.475 -23.146 -24.531 -25.734 -26.736 -27.713 -28.533 -29.249 -29.917 -30.524 -31.067 -31.56 -32.069 -32.504 -32.876 -33.256 -33.64 -33.953 -34.269 -34.593 -34.846 -35.099 -35.351 -35.607 -35.86 -36.029 -36.202 -36.465 -36.642 -36.825 -36.916 -37.1 -37.286 -37.474 -37.576 -37.765 -37.915 -38.026 -38.136 -38.373 -38.512 -38.655 -38.787 -38.933 -39.097 -39.275 -39.55 -2 ,23546 ,KEBNE ,16654911,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:20:38 CET,0.0 0.448 0.614 0.713 0.796 0.854 0.907 0.967 1.08 1.117 1.151 1.184 1.257 1.282 1.333 1.38 1.414 1.43 1.463 1.495 1.534 1.552 1.563 1.576 1.592 1.599 1.603 1.605 1.591 1.571 1.551 1.526 1.488 1.447 1.383 1.29 1.211 1.11 0.986 0.829 0.627 0.402 0.105 -0.263 -0.746 -1.344 -2.154 -3.25 -4.798 -7.02 -10.534 -14.456 -17.447 -19.859 -21.816 -23.459 -24.833 -26.026 -27.019 -27.984 -28.778 -29.46 -30.101 -30.689 -31.218 -31.677 -32.16 -32.591 -32.942 -33.293 -33.649 -33.935 -34.231 -34.536 -34.769 -35.0 -35.23 -35.471 -35.723 -35.898 -36.074 -36.338 -36.514 -36.698 -36.788 -36.963 -37.162 -37.366 -37.47 -37.655 -37.789 -37.901 -38.018 -38.257 -38.377 -38.505 -38.636 -38.767 -38.918 -39.103 -39.448 -3 ,24734 ,KEBNE ,16654912,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:20:24 CET,0.0 0.294 0.42 0.515 0.601 0.687 0.759 0.814 0.896 0.93 0.958 0.961 1.027 1.055 1.117 1.165 1.2 1.221 1.258 1.289 1.316 1.324 1.338 1.368 1.383 1.379 1.378 1.376 1.372 1.365 1.346 1.317 1.294 1.263 1.208 1.135 1.053 0.938 0.815 0.678 0.491 0.244 -0.049 -0.4 -0.882 -1.458 -2.263 -3.348 -4.859 -7.095 -10.607 -14.495 -17.522 -19.975 -21.984 -23.687 -25.075 -26.243 -27.219 -28.179 -28.971 -29.653 -30.285 -30.856 -31.394 -31.879 -32.349 -32.767 -33.132 -33.503 -33.864 -34.149 -34.439 -34.734 -34.961 -35.196 -35.438 -35.683 -35.931 -36.102 -36.276 -36.537 -36.721 -36.902 -36.991 -37.181 -37.374 -37.568 -37.67 -37.861 -38.003 -38.109 -38.221 -38.447 -38.559 -38.683 -38.816 -38.95 -39.084 -39.254 -39.64 -4 ,20002 ,KEBNE ,16657061,Tue Nov 23 01:53:59 CET,Tue Nov 23 03:19:09 CET,0.0 0.29 0.405 0.502 0.585 0.649 0.705 0.756 0.844 0.888 0.923 0.947 1.023 1.048 1.088 1.127 1.169 1.192 1.239 1.279 1.351 1.395 1.418 1.446 1.478 1.506 1.527 1.536 1.548 1.555 1.552 1.537 1.515 1.49 1.454 1.407 1.343 1.264 1.172 1.05 0.882 0.664 0.36 0.016 -0.437 -1.037 -1.854 -2.96 -4.491 -6.761 -10.329 -14.237 -17.28 -19.698 -21.644 -23.308 -24.714 -25.951 -26.989 -27.973 -28.79 -29.506 -30.162 -30.784 -31.345 -31.831 -32.339 -32.769 -33.126 -33.49 -33.862 -34.172 -34.501 -34.841 -35.098 -35.35 -35.594 -35.834 -36.071 -36.233 -36.402 -36.658 -36.831 -37.007 -37.097 -37.292 -37.498 -37.702 -37.8 -37.979 -38.123 -38.245 -38.361 -38.584 -38.705 -38.825 -38.956 -39.116 -39.283 -39.44 -39.661 -5 ,32112 ,KEBNE ,16654914,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:20:20 CET,0.0 0.291 0.398 0.505 0.597 0.661 0.719 0.761 0.836 0.869 0.899 0.922 1.0 1.031 1.076 1.121 1.156 1.171 1.2 1.227 1.263 1.28 1.294 1.31 1.326 1.332 1.326 1.319 1.312 1.297 1.275 1.248 1.231 1.223 1.194 1.14 1.082 0.998 0.879 0.739 0.583 0.388 0.115 -0.227 -0.703 -1.32 -2.163 -3.306 -4.88 -7.137 -10.659 -14.578 -17.618 -20.043 -22.013 -23.712 -25.141 -26.382 -27.424 -28.401 -29.197 -29.899 -30.561 -31.165 -31.707 -32.202 -32.705 -33.142 -33.517 -33.883 -34.26 -34.583 -34.918 -35.254 -35.51 -35.768 -36.021 -36.284 -36.545 -36.729 -36.927 -37.223 -37.42 -37.618 -37.722 -37.935 -38.139 -38.337 -38.435 -38.62 -38.757 -38.871 -38.989 -39.211 -39.328 -39.461 -39.602 -39.746 -39.923 -40.154 -40.542 -6 ,30805 ,KEBNE ,16654915,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:20:36 CET,0.0 0.693 0.827 0.921 0.996 1.059 1.122 1.18 1.28 1.318 1.346 1.346 1.415 1.439 1.486 1.536 1.578 1.595 1.628 1.653 1.682 1.695 1.702 1.712 1.732 1.744 1.749 1.747 1.734 1.719 1.698 1.673 1.649 1.605 1.547 1.482 1.399 1.299 1.17 0.997 0.797 0.548 0.216 -0.151 -0.639 -1.25 -2.068 -3.165 -4.709 -6.933 -10.451 -14.377 -17.376 -19.761 -21.709 -23.369 -24.746 -25.967 -26.998 -27.982 -28.802 -29.511 -30.17 -30.784 -31.334 -31.806 -32.269 -32.665 -33.008 -33.364 -33.723 -34.013 -34.309 -34.607 -34.834 -35.064 -35.294 -35.528 -35.78 -35.949 -36.116 -36.383 -36.572 -36.758 -36.849 -37.032 -37.228 -37.434 -37.535 -37.721 -37.86 -37.965 -38.074 -38.323 -38.472 -38.621 -38.766 -38.92 -39.075 -39.26 -39.576 -7 ,15380 ,KEBNE ,16654916,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:21:26 CET,0.0 0.396 0.541 0.672 0.756 0.819 0.886 0.94 1.038 1.092 1.135 1.16 1.232 1.261 1.314 1.358 1.391 1.405 1.433 1.459 1.498 1.514 1.528 1.554 1.564 1.562 1.558 1.555 1.55 1.539 1.505 1.456 1.414 1.372 1.318 1.242 1.154 1.044 0.909 0.759 0.583 0.367 0.069 -0.28 -0.741 -1.347 -2.171 -3.282 -4.855 -7.161 -10.706 -14.64 -17.69 -20.12 -22.087 -23.742 -25.138 -26.354 -27.352 -28.331 -29.155 -29.862 -30.528 -31.133 -31.675 -32.161 -32.654 -33.084 -33.442 -33.811 -34.189 -34.487 -34.792 -35.101 -35.335 -35.573 -35.814 -36.061 -36.307 -36.474 -36.642 -36.899 -37.072 -37.242 -37.329 -37.508 -37.694 -37.881 -37.976 -38.158 -38.3 -38.411 -38.519 -38.739 -38.87 -39.012 -39.147 -39.29 -39.447 -39.639 -39.932 -8 ,31701 ,KEBNE ,16657065,Tue Nov 23 01:58:07 CET,Tue Nov 23 03:23:41 CET,0.0 0.38 0.536 0.649 0.734 0.807 0.907 0.99 1.113 1.169 1.229 1.303 1.383 1.412 1.458 1.491 1.518 1.527 1.544 1.567 1.609 1.636 1.654 1.68 1.711 1.744 1.765 1.777 1.801 1.815 1.812 1.808 1.796 1.771 1.722 1.64 1.574 1.509 1.391 1.232 1.072 0.866 0.564 0.211 -0.248 -0.848 -1.674 -2.778 -4.297 -6.507 -10.072 -14.035 -17.048 -19.43 -21.38 -23.086 -24.508 -25.74 -26.774 -27.763 -28.587 -29.303 -29.959 -30.55 -31.082 -31.552 -32.023 -32.435 -32.788 -33.139 -33.484 -33.77 -34.065 -34.363 -34.593 -34.828 -35.077 -35.333 -35.578 -35.746 -35.915 -36.183 -36.373 -36.571 -36.668 -36.855 -37.046 -37.241 -37.341 -37.522 -37.66 -37.769 -37.876 -38.097 -38.221 -38.357 -38.489 -38.625 -38.774 -38.963 -39.393 -9 ,496 ,KEBNE ,16657066,Tue Nov 23 01:58:08 CET,Tue Nov 23 03:22:47 CET,0.0 0.286 0.437 0.538 0.619 0.711 0.787 0.851 0.958 0.995 1.028 1.04 1.106 1.132 1.185 1.241 1.303 1.334 1.395 1.439 1.488 1.515 1.535 1.57 1.599 1.615 1.631 1.654 1.681 1.687 1.681 1.659 1.636 1.622 1.586 1.518 1.449 1.364 1.249 1.102 0.922 0.709 0.433 0.094 -0.341 -0.919 -1.727 -2.812 -4.366 -6.619 -10.142 -14.039 -17.093 -19.522 -21.513 -23.205 -24.576 -25.8 -26.838 -27.799 -28.595 -29.305 -29.972 -30.584 -31.117 -31.594 -32.103 -32.55 -32.918 -33.282 -33.658 -33.976 -34.311 -34.641 -34.898 -35.173 -35.445 -35.71 -35.966 -36.139 -36.315 -36.597 -36.799 -37.004 -37.104 -37.304 -37.504 -37.697 -37.796 -37.978 -38.101 -38.205 -38.312 -38.55 -38.683 -38.812 -38.942 -39.083 -39.236 -39.392 -39.734 -10 ,1854 ,KEBNE ,16654919,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:20:31 CET,0.0 0.431 0.606 0.71 0.782 0.852 0.92 0.978 1.075 1.125 1.165 1.188 1.269 1.312 1.397 1.471 1.533 1.561 1.609 1.644 1.687 1.718 1.746 1.781 1.814 1.838 1.859 1.889 1.916 1.917 1.909 1.907 1.893 1.859 1.826 1.779 1.721 1.65 1.554 1.422 1.256 1.039 0.734 0.381 -0.094 -0.696 -1.505 -2.639 -4.237 -6.483 -9.993 -13.991 -17.061 -19.464 -21.409 -23.09 -24.472 -25.648 -26.625 -27.564 -28.349 -29.036 -29.674 -30.25 -30.774 -31.245 -31.723 -32.133 -32.481 -32.836 -33.205 -33.503 -33.804 -34.115 -34.347 -34.584 -34.828 -35.07 -35.314 -35.479 -35.648 -35.904 -36.068 -36.242 -36.333 -36.519 -36.715 -36.911 -37.009 -37.187 -37.317 -37.425 -37.542 -37.784 -37.907 -38.033 -38.162 -38.308 -38.471 -38.645 -38.981 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index 8a798d50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,20198 ,KEBNE ,16654921,Mon Nov 22 07:56:55 CET,Mon Nov 22 09:23:46 CET,0.0 2.815 3.365 3.755 4.101 4.439 4.756 5.067 5.651 5.922 6.195 6.502 6.958 7.197 7.637 8.074 8.499 8.706 9.122 9.538 10.145 10.518 10.877 11.421 11.942 12.441 12.936 13.437 14.075 14.669 15.266 15.99 16.72 17.438 18.265 19.253 20.229 21.269 22.432 23.715 25.054 26.595 28.447 30.343 32.568 35.158 38.282 41.805 45.972 51.08 57.516 63.106 66.556 68.863 70.425 71.544 72.303 72.857 73.289 73.615 73.764 73.85 73.914 73.915 73.879 73.833 73.765 73.678 73.596 73.504 73.374 73.257 73.134 73.0 72.9 72.781 72.65 72.519 72.362 72.243 72.1 71.847 71.676 71.493 71.396 71.181 70.944 70.705 70.574 70.273 70.117 69.965 69.788 69.324 69.047 68.784 68.521 68.163 67.65 66.946 63.485 -3 ,9816 ,KEBNE ,16657070,Tue Nov 23 02:02:16 CET,Tue Nov 23 03:32:26 CET,0.0 3.275 3.992 4.466 4.829 5.168 5.514 5.833 6.385 6.659 6.928 7.239 7.693 7.942 8.42 8.854 9.282 9.493 9.902 10.296 10.873 11.262 11.626 12.163 12.716 13.24 13.742 14.232 14.856 15.481 16.119 16.907 17.676 18.411 19.245 20.203 21.169 22.248 23.437 24.679 25.957 27.439 29.21 31.034 33.223 35.695 38.556 41.858 45.928 50.806 56.949 62.485 65.999 68.345 69.953 71.12 71.921 72.539 72.974 73.306 73.565 73.744 73.826 73.861 73.847 73.788 73.739 73.713 73.685 73.641 73.549 73.436 73.299 73.16 73.057 72.927 72.762 72.583 72.393 72.262 72.126 71.88 71.717 71.552 71.458 71.264 71.058 70.818 70.691 70.412 70.254 70.08 69.898 69.476 69.233 68.992 68.727 68.415 68.021 67.39 64.342 -4 ,6988 ,KEBNE ,16657071,Tue Nov 23 02:04:23 CET,Tue Nov 23 03:41:03 CET,0.0 2.415 3.033 3.47 3.857 4.237 4.583 4.911 5.502 5.784 6.063 6.385 6.841 7.075 7.536 7.978 8.407 8.622 9.047 9.45 10.021 10.397 10.776 11.323 11.839 12.361 12.895 13.398 14.045 14.672 15.273 16.02 16.78 17.534 18.394 19.382 20.34 21.392 22.558 23.824 25.173 26.692 28.498 30.373 32.62 35.117 38.047 41.467 45.547 50.574 56.957 62.43 65.818 68.151 69.776 70.945 71.761 72.352 72.737 73.012 73.206 73.35 73.475 73.544 73.564 73.577 73.555 73.499 73.429 73.363 73.294 73.213 73.103 72.978 72.889 72.783 72.648 72.493 72.328 72.211 72.084 71.877 71.717 71.525 71.427 71.242 71.036 70.801 70.68 70.407 70.254 70.067 69.877 69.489 69.257 68.971 68.647 68.255 67.762 67.086 58.47 -6 ,20986 ,KEBNE ,16654925,Mon Nov 22 07:57:56 CET,Mon Nov 22 09:26:06 CET,0.0 3.478 4.096 4.55 4.944 5.338 5.726 6.066 6.663 6.932 7.19 7.492 7.941 8.177 8.642 9.096 9.537 9.75 10.171 10.571 11.167 11.561 11.942 12.503 13.041 13.563 14.055 14.528 15.147 15.754 16.384 17.181 17.936 18.643 19.474 20.438 21.375 22.424 23.592 24.871 26.229 27.747 29.552 31.374 33.485 35.945 38.82 42.106 46.164 51.23 57.664 63.208 66.684 69.093 70.754 71.945 72.765 73.339 73.719 74.014 74.243 74.409 74.506 74.548 74.549 74.508 74.452 74.388 74.312 74.227 74.124 74.04 73.945 73.809 73.679 73.537 73.391 73.222 73.04 72.919 72.791 72.575 72.408 72.237 72.145 71.94 71.711 71.449 71.316 71.028 70.852 70.664 70.477 70.07 69.834 69.574 69.267 68.936 68.518 67.888 64.163 -7 ,23106 ,KEBNE ,16657074,Tue Nov 23 02:08:38 CET,Tue Nov 23 03:35:20 CET,0.0 3.145 3.786 4.283 4.721 5.114 5.51 5.901 6.586 6.89 7.175 7.561 8.048 8.294 8.774 9.226 9.653 9.866 10.271 10.666 11.248 11.62 11.978 12.511 13.062 13.588 14.082 14.575 15.229 15.882 16.541 17.355 18.119 18.834 19.679 20.63 21.562 22.65 23.857 25.136 26.508 28.094 29.964 31.815 33.978 36.534 39.658 43.272 47.539 52.705 59.136 64.669 68.075 70.35 71.914 73.023 73.721 74.194 74.524 74.768 74.933 75.047 75.13 75.185 75.212 75.223 75.207 75.168 75.102 75.018 74.954 74.874 74.762 74.638 74.526 74.4 74.256 74.113 73.984 73.866 73.722 73.475 73.301 73.133 73.043 72.838 72.617 72.382 72.252 71.969 71.823 71.65 71.459 71.012 70.746 70.444 70.106 69.753 69.298 68.551 66.036 -8 ,2029 ,KEBNE ,16654927,Mon Nov 22 08:12:30 CET,Mon Nov 22 09:39:24 CET,0.0 2.817 3.554 4.085 4.506 4.901 5.246 5.565 6.172 6.455 6.73 7.093 7.577 7.823 8.285 8.734 9.185 9.406 9.83 10.234 10.813 11.193 11.563 12.097 12.627 13.159 13.679 14.184 14.846 15.491 16.12 16.874 17.605 18.33 19.169 20.149 21.129 22.189 23.35 24.589 25.911 27.472 29.349 31.264 33.491 35.982 38.885 42.254 46.363 51.328 57.744 63.364 66.76 69.029 70.587 71.756 72.587 73.132 73.511 73.825 74.003 74.085 74.123 74.139 74.152 74.144 74.094 74.031 73.976 73.911 73.821 73.73 73.603 73.46 73.349 73.224 73.073 72.904 72.719 72.569 72.415 72.202 72.06 71.904 71.802 71.581 71.361 71.113 70.965 70.669 70.516 70.338 70.147 69.721 69.5 69.273 69.022 68.69 68.221 67.623 64.489 -9 ,3288 ,KEBNE ,16654928,Mon Nov 22 08:13:32 CET,Mon Nov 22 09:40:26 CET,0.0 2.182 2.842 3.342 3.773 4.143 4.481 4.792 5.354 5.637 5.915 6.224 6.686 6.947 7.459 7.912 8.356 8.568 8.972 9.385 9.992 10.376 10.764 11.336 11.882 12.412 12.944 13.468 14.138 14.805 15.458 16.25 17.026 17.768 18.638 19.64 20.624 21.719 22.913 24.189 25.534 27.072 28.903 30.726 32.854 35.328 38.259 41.621 45.771 50.99 57.551 63.331 66.787 69.049 70.685 71.894 72.748 73.383 73.835 74.219 74.482 74.667 74.794 74.85 74.846 74.804 74.751 74.714 74.643 74.543 74.439 74.343 74.227 74.092 73.989 73.865 73.72 73.565 73.395 73.259 73.102 72.881 72.729 72.558 72.467 72.272 72.047 71.804 71.683 71.396 71.224 71.047 70.859 70.436 70.175 69.887 69.565 69.146 68.665 67.948 63.924 -10 ,22321 ,KEBNE ,16654929,Mon Nov 22 08:12:29 CET,Mon Nov 22 09:39:23 CET,0.0 2.729 3.36 3.825 4.212 4.583 4.996 5.39 5.976 6.245 6.514 6.825 7.278 7.514 7.987 8.434 8.865 9.072 9.471 9.867 10.434 10.813 11.193 11.753 12.308 12.853 13.375 13.888 14.561 15.194 15.811 16.595 17.374 18.103 18.954 19.936 20.896 21.97 23.12 24.378 25.747 27.315 29.203 31.142 33.4 35.898 38.843 42.28 46.374 51.306 57.654 63.232 66.678 69.026 70.688 71.903 72.748 73.349 73.794 74.168 74.387 74.538 74.654 74.715 74.741 74.752 74.735 74.692 74.626 74.52 74.389 74.268 74.13 74.001 73.883 73.735 73.581 73.419 73.242 73.109 72.985 72.788 72.64 72.464 72.364 72.167 71.945 71.688 71.563 71.278 71.079 70.893 70.717 70.285 70.019 69.733 69.412 69.047 68.577 67.881 64.932 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index f008a13e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4180 ,KEBNE ,16654930,Mon Nov 22 08:12:30 CET,Mon Nov 22 09:40:08 CET,0.0 1.391 1.931 2.339 2.647 2.909 3.138 3.381 3.844 4.051 4.241 4.356 4.725 4.872 5.142 5.398 5.625 5.74 5.993 6.237 6.58 6.802 7.001 7.269 7.525 7.784 8.033 8.263 8.546 8.824 9.101 9.422 9.74 10.051 10.405 10.794 11.158 11.566 12.029 12.543 13.094 13.768 14.574 15.372 16.265 17.247 18.353 19.465 20.657 22.023 23.394 23.966 23.999 23.839 23.539 23.2 22.833 22.428 22.067 21.703 21.371 21.069 20.771 20.48 20.229 20.001 19.756 19.519 19.304 19.088 18.859 18.673 18.483 18.275 18.082 17.861 17.652 17.438 17.208 17.047 16.888 16.645 16.464 16.266 16.171 15.969 15.737 15.478 15.338 14.997 14.886 14.719 14.537 14.141 13.927 13.68 13.418 13.161 12.816 12.316 10.557 -2 ,10278 ,KEBNE ,16657079,Tue Nov 23 02:13:45 CET,Tue Nov 23 03:42:00 CET,0.0 1.25 1.744 2.154 2.48 2.774 2.999 3.213 3.637 3.834 4.005 4.103 4.456 4.602 4.893 5.159 5.404 5.52 5.742 5.948 6.225 6.409 6.61 6.891 7.137 7.372 7.621 7.866 8.165 8.45 8.726 9.045 9.353 9.664 10.037 10.448 10.829 11.246 11.709 12.209 12.732 13.325 14.036 14.766 15.611 16.574 17.662 18.839 20.178 21.668 23.088 23.827 24.006 23.866 23.612 23.263 22.871 22.506 22.168 21.822 21.541 21.267 20.965 20.688 20.447 20.195 19.897 19.63 19.395 19.125 18.843 18.63 18.412 18.171 17.978 17.765 17.544 17.324 17.087 16.923 16.771 16.517 16.327 16.126 16.02 15.829 15.625 15.393 15.277 14.967 14.906 14.755 14.584 14.202 13.982 13.738 13.49 13.193 12.823 12.303 10.339 -3 ,31815 ,KEBNE ,16657080,Tue Nov 23 02:14:47 CET,Tue Nov 23 03:43:13 CET,0.0 1.781 2.22 2.596 2.912 3.166 3.414 3.643 4.047 4.227 4.395 4.506 4.872 5.04 5.347 5.631 5.879 5.978 6.18 6.384 6.656 6.839 7.028 7.301 7.575 7.854 8.129 8.384 8.707 9.031 9.345 9.731 10.096 10.429 10.827 11.29 11.736 12.229 12.761 13.31 13.874 14.542 15.305 16.025 16.894 17.859 18.929 20.086 21.434 22.939 24.377 25.106 25.161 24.902 24.525 24.129 23.766 23.422 23.085 22.696 22.349 22.035 21.717 21.429 21.192 20.988 20.764 20.553 20.353 20.129 19.907 19.727 19.532 19.323 19.152 18.986 18.823 18.637 18.436 18.302 18.169 17.947 17.771 17.577 17.48 17.3 17.113 16.91 16.803 16.487 16.402 16.25 16.095 15.763 15.576 15.369 15.12 14.852 14.569 14.142 12.367 -4 ,588 ,KEBNE ,16654933,Mon Nov 22 08:12:30 CET,Mon Nov 22 09:40:14 CET,0.0 1.692 2.199 2.534 2.806 3.075 3.323 3.551 3.978 4.183 4.375 4.501 4.864 5.007 5.3 5.587 5.849 5.978 6.222 6.45 6.773 6.978 7.18 7.477 7.756 8.018 8.275 8.527 8.85 9.163 9.451 9.776 10.088 10.406 10.79 11.236 11.641 12.078 12.559 13.069 13.622 14.234 14.908 15.56 16.321 17.207 18.279 19.473 20.804 22.239 23.674 24.435 24.495 24.271 24.017 23.749 23.412 23.05 22.701 22.334 22.028 21.727 21.404 21.086 20.801 20.554 20.288 20.032 19.806 19.579 19.329 19.118 18.904 18.673 18.49 18.298 18.089 17.858 17.614 17.457 17.299 17.043 16.869 16.679 16.578 16.362 16.114 15.861 15.729 15.394 15.302 15.151 14.983 14.59 14.369 14.13 13.873 13.606 13.262 12.81 11.484 -5 ,13269 ,KEBNE ,16654934,Mon Nov 22 08:12:30 CET,Mon Nov 22 09:39:56 CET,0.0 1.505 1.94 2.244 2.529 2.789 3.019 3.254 3.677 3.855 4.037 4.167 4.532 4.675 4.971 5.249 5.504 5.628 5.862 6.092 6.44 6.664 6.881 7.198 7.49 7.769 8.051 8.316 8.637 8.947 9.258 9.639 10.007 10.371 10.8 11.275 11.728 12.228 12.756 13.303 13.902 14.573 15.352 16.149 17.057 18.04 19.157 20.349 21.693 23.177 24.634 25.481 25.688 25.566 25.337 25.056 24.761 24.508 24.269 23.988 23.728 23.475 23.227 22.989 22.76 22.551 22.314 22.097 21.912 21.695 21.46 21.247 21.009 20.77 20.587 20.408 20.225 20.035 19.841 19.701 19.557 19.325 19.153 18.973 18.883 18.686 18.479 18.273 18.16 17.841 17.787 17.66 17.526 17.228 17.033 16.808 16.556 16.256 15.921 15.48 13.603 -6 ,6992 ,KEBNE ,16657083,Tue Nov 23 02:16:52 CET,Tue Nov 23 03:47:18 CET,0.0 2.079 2.64 3.051 3.405 3.692 3.945 4.161 4.531 4.705 4.878 4.989 5.356 5.51 5.788 6.054 6.323 6.463 6.721 6.954 7.3 7.512 7.712 8.024 8.342 8.645 8.929 9.189 9.5 9.799 10.103 10.469 10.814 11.155 11.548 12.006 12.465 12.958 13.474 14.009 14.565 15.214 15.988 16.758 17.63 18.6 19.77 21.053 22.464 23.916 25.427 26.283 26.361 26.191 25.954 25.687 25.393 25.059 24.731 24.387 24.101 23.859 23.61 23.346 23.081 22.841 22.593 22.362 22.165 21.932 21.645 21.406 21.176 20.931 20.732 20.534 20.33 20.107 19.862 19.702 19.547 19.316 19.157 18.974 18.876 18.673 18.451 18.231 18.122 17.809 17.748 17.608 17.46 17.15 16.992 16.789 16.519 16.214 15.882 15.393 14.038 -7 ,26500 ,KEBNE ,16657084,Tue Nov 23 02:16:56 CET,Tue Nov 23 03:43:47 CET,0.0 1.262 1.763 2.065 2.305 2.532 2.744 2.959 3.326 3.504 3.683 3.799 4.156 4.31 4.61 4.875 5.126 5.246 5.478 5.701 6.006 6.196 6.39 6.689 6.967 7.236 7.493 7.734 8.05 8.368 8.688 9.061 9.394 9.726 10.129 10.558 10.967 11.431 11.932 12.461 12.989 13.573 14.252 14.965 15.82 16.722 17.783 19.022 20.361 21.665 22.953 23.62 23.625 23.455 23.162 22.766 22.36 21.95 21.637 21.35 21.052 20.767 20.479 20.2 19.927 19.669 19.401 19.163 18.969 18.76 18.527 18.319 18.093 17.83 17.619 17.425 17.239 17.047 16.84 16.671 16.484 16.212 16.033 15.856 15.77 15.589 15.388 15.174 15.055 14.729 14.641 14.493 14.334 13.979 13.764 13.513 13.275 13.016 12.637 12.119 10.646 -8 ,26104 ,KEBNE ,16657085,Tue Nov 23 02:16:55 CET,Tue Nov 23 03:42:20 CET,0.0 1.363 1.783 2.117 2.408 2.673 2.947 3.184 3.575 3.765 3.959 4.107 4.477 4.631 4.926 5.201 5.442 5.559 5.8 6.024 6.362 6.593 6.802 7.085 7.354 7.607 7.852 8.101 8.413 8.701 8.981 9.323 9.65 9.957 10.321 10.746 11.147 11.596 12.1 12.637 13.222 13.881 14.636 15.382 16.259 17.206 18.217 19.359 20.721 22.207 23.706 24.588 24.834 24.773 24.569 24.31 24.01 23.699 23.403 23.071 22.752 22.46 22.191 21.92 21.631 21.352 21.061 20.8 20.56 20.315 20.071 19.857 19.628 19.384 19.176 18.952 18.74 18.515 18.261 18.086 17.907 17.642 17.463 17.287 17.201 17.015 16.817 16.613 16.501 16.191 16.156 16.014 15.855 15.533 15.354 15.134 14.86 14.582 14.283 13.865 12.037 -9 ,22120 ,KEBNE ,16657086,Tue Nov 23 02:17:55 CET,Tue Nov 23 03:46:05 CET,0.0 1.61 2.071 2.403 2.681 2.941 3.196 3.417 3.806 3.99 4.172 4.303 4.683 4.851 5.165 5.456 5.726 5.856 6.108 6.344 6.645 6.839 7.04 7.315 7.565 7.807 8.042 8.287 8.612 8.922 9.228 9.61 9.991 10.357 10.783 11.26 11.731 12.247 12.78 13.342 13.936 14.609 15.387 16.138 16.999 17.935 18.947 20.055 21.317 22.684 24.061 24.73 24.754 24.473 24.116 23.722 23.267 22.824 22.429 22.007 21.629 21.269 20.907 20.554 20.241 19.965 19.666 19.411 19.175 18.909 18.627 18.381 18.135 17.884 17.676 17.447 17.201 16.956 16.713 16.536 16.352 16.074 15.877 15.672 15.561 15.318 15.073 14.809 14.666 14.315 14.185 14.015 13.834 13.469 13.277 13.045 12.782 12.495 12.184 11.755 10.328 -10 ,26381 ,KEBNE ,16654939,Mon Nov 22 08:14:34 CET,Mon Nov 22 09:41:55 CET,0.0 1.425 1.904 2.236 2.525 2.787 3.027 3.246 3.635 3.822 3.996 4.105 4.465 4.612 4.886 5.133 5.384 5.511 5.748 5.962 6.258 6.45 6.633 6.904 7.158 7.394 7.628 7.853 8.138 8.422 8.701 9.037 9.361 9.663 10.016 10.417 10.794 11.218 11.679 12.166 12.703 13.316 14.018 14.739 15.606 16.57 17.621 18.779 20.055 21.416 22.843 23.605 23.736 23.604 23.329 22.988 22.631 22.264 21.939 21.63 21.395 21.17 20.899 20.634 20.378 20.146 19.906 19.684 19.498 19.31 19.113 18.936 18.745 18.541 18.368 18.202 18.047 17.889 17.704 17.568 17.424 17.185 17.012 16.813 16.706 16.482 16.217 15.952 15.831 15.506 15.429 15.273 15.101 14.711 14.498 14.284 14.039 13.737 13.362 12.864 10.866 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index 64e419e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28110 ,KEBNE ,16654940,Mon Nov 22 08:13:32 CET,Mon Nov 22 09:41:10 CET,0.0 0.732 1.084 1.38 1.615 1.792 1.957 2.109 2.365 2.487 2.6 2.593 2.903 2.993 3.14 3.279 3.411 3.476 3.609 3.735 3.912 4.029 4.136 4.276 4.42 4.582 4.743 4.872 5.026 5.179 5.316 5.471 5.623 5.78 5.956 6.138 6.302 6.472 6.65 6.833 7.016 7.209 7.379 7.509 7.654 7.754 7.762 7.657 7.367 6.723 5.3 3.307 1.522 -0.032 -1.359 -2.543 -3.578 -4.522 -5.348 -6.173 -6.86 -7.463 -8.046 -8.618 -9.163 -9.645 -10.177 -10.658 -11.023 -11.4 -11.804 -12.126 -12.464 -12.812 -13.071 -13.344 -13.632 -13.928 -14.231 -14.44 -14.664 -15.0 -15.235 -15.485 -15.615 -15.889 -16.164 -16.439 -16.585 -16.97 -17.088 -17.277 -17.453 -17.814 -18.028 -18.259 -18.515 -18.794 -19.116 -19.599 -20.653 -2 ,8086 ,KEBNE ,16654941,Mon Nov 22 08:13:32 CET,Mon Nov 22 09:41:09 CET,0.0 0.932 1.349 1.664 1.906 2.129 2.323 2.496 2.807 2.942 3.073 3.122 3.437 3.53 3.697 3.856 4.016 4.091 4.242 4.389 4.592 4.716 4.831 5.004 5.16 5.301 5.454 5.596 5.774 5.938 6.082 6.251 6.423 6.603 6.804 7.016 7.204 7.382 7.547 7.705 7.861 8.032 8.222 8.391 8.552 8.644 8.639 8.521 8.262 7.668 6.221 4.185 2.448 0.94 -0.426 -1.639 -2.673 -3.608 -4.391 -5.162 -5.838 -6.448 -7.02 -7.563 -8.077 -8.543 -9.028 -9.468 -9.85 -10.223 -10.609 -10.936 -11.265 -11.613 -11.899 -12.185 -12.467 -12.769 -13.087 -13.315 -13.547 -13.886 -14.124 -14.368 -14.496 -14.766 -15.034 -15.334 -15.498 -15.891 -15.994 -16.16 -16.331 -16.708 -16.919 -17.17 -17.443 -17.744 -18.102 -18.515 -19.656 -3 ,27381 ,KEBNE ,16657090,Tue Nov 23 02:19:00 CET,Tue Nov 23 03:48:38 CET,0.0 0.876 1.192 1.429 1.653 1.843 2.008 2.155 2.419 2.541 2.665 2.684 2.987 3.08 3.28 3.461 3.619 3.694 3.837 3.974 4.179 4.313 4.441 4.614 4.77 4.911 5.05 5.188 5.353 5.506 5.651 5.828 5.996 6.148 6.327 6.523 6.693 6.871 7.065 7.241 7.41 7.586 7.742 7.877 7.991 8.06 8.069 7.984 7.737 7.126 5.764 3.81 2.069 0.545 -0.809 -2.043 -3.119 -4.072 -4.874 -5.673 -6.386 -7.031 -7.634 -8.18 -8.68 -9.141 -9.611 -10.03 -10.391 -10.759 -11.152 -11.481 -11.816 -12.161 -12.426 -12.697 -12.97 -13.26 -13.562 -13.77 -13.995 -14.339 -14.578 -14.831 -14.968 -15.255 -15.539 -15.817 -15.964 -16.345 -16.447 -16.633 -16.821 -17.211 -17.432 -17.681 -17.95 -18.22 -18.556 -19.0 -19.999 -4 ,2428 ,KEBNE ,16654943,Mon Nov 22 08:13:32 CET,Mon Nov 22 09:42:30 CET,0.0 0.892 1.27 1.556 1.755 1.905 2.048 2.187 2.448 2.576 2.702 2.727 3.039 3.139 3.33 3.501 3.655 3.729 3.883 4.036 4.246 4.372 4.493 4.678 4.859 5.019 5.162 5.302 5.48 5.637 5.786 5.957 6.121 6.276 6.436 6.626 6.809 6.998 7.208 7.417 7.614 7.817 8.031 8.204 8.34 8.43 8.412 8.278 8.032 7.422 5.983 3.948 2.175 0.605 -0.749 -1.903 -2.902 -3.819 -4.618 -5.425 -6.123 -6.759 -7.346 -7.893 -8.399 -8.85 -9.324 -9.753 -10.128 -10.511 -10.93 -11.275 -11.607 -11.957 -12.233 -12.518 -12.798 -13.074 -13.374 -13.582 -13.797 -14.146 -14.382 -14.628 -14.754 -15.017 -15.298 -15.577 -15.72 -16.094 -16.178 -16.344 -16.512 -16.891 -17.088 -17.327 -17.623 -17.941 -18.322 -18.802 -20.074 -5 ,30955 ,KEBNE ,16654944,Mon Nov 22 08:13:32 CET,Mon Nov 22 09:41:27 CET,0.0 1.215 1.581 1.835 2.068 2.251 2.415 2.58 2.876 3.005 3.129 3.157 3.467 3.555 3.724 3.9 4.066 4.145 4.293 4.436 4.635 4.765 4.896 5.07 5.235 5.399 5.547 5.691 5.88 6.045 6.199 6.375 6.527 6.677 6.868 7.08 7.271 7.472 7.671 7.858 8.029 8.222 8.411 8.548 8.683 8.81 8.855 8.738 8.457 7.801 6.363 4.392 2.668 1.113 -0.28 -1.54 -2.602 -3.522 -4.322 -5.12 -5.823 -6.442 -7.024 -7.587 -8.096 -8.562 -9.041 -9.461 -9.815 -10.166 -10.555 -10.887 -11.215 -11.552 -11.827 -12.119 -12.421 -12.736 -13.051 -13.26 -13.475 -13.824 -14.064 -14.294 -14.415 -14.68 -14.972 -15.279 -15.427 -15.813 -15.92 -16.093 -16.294 -16.742 -16.996 -17.278 -17.568 -17.865 -18.226 -18.693 -19.482 -6 ,7698 ,KEBNE ,16657093,Tue Nov 23 02:21:02 CET,Tue Nov 23 03:49:16 CET,0.0 0.692 0.993 1.227 1.421 1.601 1.77 1.92 2.213 2.348 2.489 2.534 2.835 2.931 3.13 3.305 3.474 3.556 3.717 3.86 4.053 4.173 4.283 4.438 4.591 4.732 4.868 5.008 5.168 5.324 5.48 5.653 5.826 5.997 6.184 6.377 6.557 6.739 6.915 7.098 7.291 7.5 7.711 7.887 8.036 8.131 8.169 8.107 7.834 7.195 5.786 3.722 1.904 0.385 -0.945 -2.141 -3.186 -4.119 -4.941 -5.741 -6.39 -6.996 -7.581 -8.124 -8.636 -9.106 -9.602 -10.048 -10.424 -10.809 -11.213 -11.542 -11.874 -12.23 -12.5 -12.769 -13.053 -13.344 -13.655 -13.869 -14.088 -14.439 -14.687 -14.944 -15.078 -15.344 -15.618 -15.915 -16.068 -16.452 -16.557 -16.74 -16.92 -17.31 -17.509 -17.724 -17.979 -18.257 -18.602 -19.05 -20.338 -7 ,15537 ,KEBNE ,16657094,Tue Nov 23 02:21:02 CET,Tue Nov 23 03:48:55 CET,0.0 0.959 1.3 1.532 1.742 1.926 2.091 2.261 2.561 2.67 2.757 2.731 3.032 3.12 3.297 3.471 3.628 3.697 3.829 3.956 4.136 4.26 4.37 4.524 4.689 4.843 4.977 5.109 5.293 5.462 5.603 5.763 5.925 6.079 6.24 6.41 6.557 6.725 6.905 7.083 7.259 7.438 7.629 7.783 7.933 8.033 8.08 8.037 7.769 7.136 5.712 3.688 1.966 0.446 -0.885 -2.059 -3.125 -4.111 -4.927 -5.713 -6.423 -7.055 -7.642 -8.198 -8.702 -9.155 -9.635 -10.06 -10.429 -10.819 -11.222 -11.553 -11.897 -12.247 -12.509 -12.784 -13.067 -13.36 -13.667 -13.877 -14.091 -14.421 -14.664 -14.933 -15.065 -15.321 -15.585 -15.874 -16.022 -16.4 -16.512 -16.695 -16.877 -17.261 -17.475 -17.713 -17.958 -18.233 -18.561 -18.99 -20.2 -8 ,669 ,KEBNE ,16654947,Mon Nov 22 08:13:32 CET,Mon Nov 22 09:41:25 CET,0.0 0.613 0.967 1.174 1.351 1.509 1.665 1.807 2.059 2.183 2.298 2.282 2.573 2.66 2.843 3.012 3.159 3.23 3.359 3.473 3.654 3.766 3.876 4.042 4.193 4.343 4.492 4.635 4.821 4.995 5.174 5.389 5.558 5.709 5.881 6.057 6.214 6.39 6.591 6.788 6.962 7.146 7.371 7.552 7.673 7.784 7.836 7.739 7.445 6.79 5.349 3.376 1.619 0.076 -1.269 -2.475 -3.502 -4.448 -5.278 -6.096 -6.795 -7.409 -7.984 -8.523 -9.024 -9.485 -9.965 -10.392 -10.762 -11.138 -11.52 -11.848 -12.201 -12.563 -12.839 -13.125 -13.428 -13.745 -14.059 -14.262 -14.469 -14.813 -15.056 -15.298 -15.425 -15.696 -15.979 -16.277 -16.439 -16.839 -16.962 -17.142 -17.334 -17.766 -18.004 -18.253 -18.518 -18.795 -19.122 -19.588 -20.988 -9 ,5905 ,KEBNE ,16657096,Tue Nov 23 02:21:02 CET,Tue Nov 23 03:49:48 CET,0.0 0.672 0.985 1.263 1.491 1.664 1.817 1.947 2.191 2.321 2.439 2.447 2.769 2.865 3.034 3.189 3.33 3.397 3.524 3.647 3.826 3.945 4.067 4.237 4.385 4.527 4.675 4.828 5.014 5.178 5.324 5.496 5.67 5.828 6.011 6.214 6.397 6.584 6.766 6.974 7.181 7.356 7.538 7.706 7.861 7.976 8.032 7.929 7.619 7.015 5.609 3.677 1.996 0.481 -0.848 -2.027 -3.071 -4.022 -4.843 -5.649 -6.336 -6.95 -7.532 -8.085 -8.599 -9.055 -9.52 -9.939 -10.304 -10.689 -11.09 -11.422 -11.768 -12.117 -12.393 -12.675 -12.959 -13.261 -13.579 -13.797 -14.019 -14.352 -14.591 -14.845 -14.972 -15.23 -15.495 -15.786 -15.938 -16.322 -16.408 -16.57 -16.75 -17.124 -17.333 -17.582 -17.861 -18.167 -18.477 -18.855 -20.008 -10 ,9193 ,KEBNE ,16654949,Mon Nov 22 08:13:32 CET,Mon Nov 22 09:41:31 CET,0.0 0.539 0.812 1.049 1.267 1.482 1.663 1.812 2.1 2.224 2.338 2.357 2.669 2.762 2.944 3.105 3.239 3.308 3.462 3.613 3.819 3.944 4.061 4.23 4.394 4.563 4.72 4.85 5.014 5.172 5.328 5.526 5.713 5.89 6.065 6.251 6.443 6.635 6.829 7.018 7.193 7.349 7.509 7.647 7.768 7.869 7.933 7.87 7.59 6.922 5.441 3.472 1.78 0.27 -1.059 -2.232 -3.282 -4.256 -5.088 -5.914 -6.638 -7.265 -7.834 -8.381 -8.896 -9.362 -9.861 -10.309 -10.69 -11.101 -11.517 -11.85 -12.18 -12.507 -12.765 -13.044 -13.337 -13.626 -13.928 -14.141 -14.362 -14.713 -14.964 -15.224 -15.357 -15.623 -15.901 -16.205 -16.359 -16.749 -16.871 -17.058 -17.256 -17.668 -17.892 -18.136 -18.414 -18.728 -19.077 -19.5 -20.786 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index afe43254..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,53 ,KEBNE ,17023581,Wed Dec 22 08:16:59 CET,Wed Dec 22 09:48:52 CET,0.0 2.468 3.036 3.473 3.872 4.245 4.583 4.895 5.478 5.763 6.039 6.352 6.795 7.034 7.494 7.933 8.353 8.562 8.968 9.367 9.937 10.311 10.677 11.184 11.678 12.176 12.669 13.17 13.838 14.443 15.013 15.727 16.415 17.085 17.864 18.75 19.632 20.605 21.68 22.844 24.056 25.447 27.116 28.822 30.812 33.026 35.681 38.796 42.447 46.787 52.225 56.587 59.055 60.668 61.708 62.384 62.838 63.114 63.266 63.34 63.324 63.275 63.23 63.147 63.024 62.888 62.727 62.581 62.436 62.268 62.083 61.922 61.749 61.562 61.409 61.244 61.066 60.864 60.646 60.497 60.316 60.012 59.811 59.599 59.496 59.286 59.034 58.743 58.6 58.305 58.147 57.98 57.79 57.391 57.155 56.881 56.557 56.176 55.737 55.107 52.641 -2 ,26446 ,KEBNE ,17023582,Wed Dec 22 08:18:00 CET,Wed Dec 22 09:50:19 CET,0.0 1.493 2.114 2.565 2.955 3.3 3.631 3.945 4.502 4.753 5.009 5.301 5.72 5.949 6.389 6.806 7.211 7.404 7.78 8.156 8.7 9.052 9.398 9.886 10.362 10.841 11.31 11.768 12.348 12.904 13.457 14.125 14.776 15.419 16.178 17.039 17.847 18.75 19.783 20.937 22.179 23.587 25.272 26.915 28.808 30.971 33.501 36.425 39.923 44.196 49.514 53.935 56.573 58.284 59.411 60.215 60.758 61.129 61.298 61.38 61.444 61.423 61.324 61.213 61.117 61.028 60.909 60.764 60.621 60.442 60.248 60.078 59.89 59.699 59.559 59.405 59.242 59.06 58.837 58.68 58.525 58.274 58.094 57.883 57.77 57.542 57.272 57.011 56.882 56.581 56.391 56.202 55.989 55.533 55.28 54.983 54.639 54.233 53.701 52.964 49.131 -3 ,1887 ,KEBNE ,17023583,Wed Dec 22 08:18:00 CET,Wed Dec 22 09:49:37 CET,0.0 1.939 2.589 3.049 3.454 3.821 4.162 4.485 5.097 5.384 5.65 5.983 6.439 6.683 7.174 7.644 8.088 8.305 8.728 9.16 9.795 10.198 10.58 11.112 11.628 12.123 12.597 13.048 13.642 14.248 14.836 15.529 16.189 16.813 17.548 18.419 19.313 20.302 21.331 22.501 23.783 25.223 26.928 28.668 30.735 33.057 35.741 38.831 42.557 47.101 52.705 57.237 59.826 61.412 62.408 63.025 63.404 63.639 63.767 63.801 63.776 63.738 63.665 63.556 63.431 63.317 63.217 63.109 62.977 62.801 62.583 62.408 62.241 62.052 61.885 61.703 61.536 61.367 61.171 61.018 60.846 60.589 60.414 60.226 60.12 59.896 59.662 59.402 59.265 58.979 58.839 58.669 58.479 58.039 57.796 57.539 57.213 56.833 56.384 55.757 52.277 -4 ,30850 ,KEBNE ,17023584,Wed Dec 22 08:18:01 CET,Wed Dec 22 09:50:05 CET,0.0 1.515 2.157 2.627 3.026 3.385 3.715 4.033 4.609 4.894 5.168 5.483 5.916 6.147 6.62 7.071 7.497 7.704 8.121 8.532 9.114 9.493 9.872 10.429 10.964 11.474 11.97 12.452 13.084 13.712 14.32 15.074 15.806 16.487 17.303 18.22 19.098 20.117 21.199 22.319 23.506 24.886 26.553 28.239 30.266 32.563 35.291 38.506 42.312 46.852 52.252 56.795 59.542 61.216 62.329 63.067 63.497 63.76 63.934 64.03 64.057 64.058 64.045 63.991 63.908 63.817 63.666 63.519 63.382 63.205 63.007 62.854 62.706 62.536 62.393 62.243 62.061 61.845 61.622 61.467 61.315 61.072 60.884 60.685 60.578 60.336 60.072 59.805 59.665 59.377 59.221 59.037 58.824 58.358 58.111 57.818 57.458 57.059 56.506 55.767 52.309 -5 ,1677 ,KEBNE ,17023585,Wed Dec 22 08:18:00 CET,Wed Dec 22 09:49:39 CET,0.0 1.844 2.38 2.859 3.313 3.704 4.057 4.383 5.028 5.334 5.61 5.922 6.356 6.591 7.047 7.485 7.909 8.11 8.507 8.904 9.492 9.864 10.215 10.724 11.222 11.716 12.197 12.66 13.27 13.888 14.485 15.214 15.923 16.608 17.41 18.298 19.163 20.15 21.295 22.538 23.812 25.238 26.903 28.594 30.647 32.985 35.666 38.793 42.45 46.833 52.395 56.931 59.472 61.048 62.097 62.778 63.194 63.458 63.618 63.737 63.789 63.769 63.731 63.692 63.611 63.505 63.379 63.254 63.136 62.989 62.789 62.628 62.48 62.319 62.165 61.989 61.81 61.603 61.375 61.218 61.064 60.82 60.618 60.402 60.298 60.075 59.827 59.565 59.429 59.131 58.978 58.815 58.624 58.182 57.917 57.631 57.323 56.921 56.391 55.702 52.599 -6 ,6866 ,KEBNE ,17023586,Wed Dec 22 08:18:00 CET,Wed Dec 22 09:51:00 CET,0.0 1.603 2.165 2.629 3.019 3.369 3.691 3.983 4.521 4.778 5.029 5.308 5.748 5.986 6.438 6.859 7.255 7.449 7.826 8.196 8.742 9.089 9.422 9.922 10.421 10.912 11.392 11.871 12.483 13.08 13.696 14.455 15.161 15.838 16.655 17.594 18.501 19.481 20.513 21.599 22.743 24.11 25.777 27.454 29.43 31.686 34.311 37.274 40.832 45.126 50.412 54.934 57.645 59.3 60.369 61.125 61.62 61.94 62.126 62.219 62.248 62.249 62.172 62.068 61.973 61.876 61.751 61.596 61.442 61.276 61.099 60.92 60.75 60.573 60.393 60.187 59.974 59.77 59.563 59.41 59.242 58.967 58.772 58.561 58.458 58.261 58.029 57.751 57.607 57.311 57.142 56.967 56.775 56.288 55.993 55.688 55.367 55.007 54.506 53.773 50.155 -7 ,10267 ,KEBNE ,17023587,Wed Dec 22 08:18:01 CET,Wed Dec 22 09:49:52 CET,0.0 1.701 2.289 2.754 3.174 3.541 3.88 4.203 4.827 5.123 5.4 5.742 6.193 6.432 6.921 7.387 7.813 8.019 8.406 8.775 9.333 9.699 10.059 10.598 11.146 11.692 12.211 12.709 13.356 13.973 14.571 15.305 16.024 16.729 17.563 18.509 19.403 20.398 21.5 22.668 23.912 25.315 26.984 28.705 30.76 33.162 35.913 39.103 42.948 47.454 53.051 57.76 60.434 62.106 63.227 64.008 64.523 64.833 65.002 65.119 65.182 65.213 65.172 65.079 64.975 64.873 64.756 64.643 64.539 64.382 64.195 64.037 63.855 63.671 63.52 63.366 63.227 63.068 62.87 62.72 62.573 62.345 62.17 61.97 61.865 61.645 61.408 61.129 60.976 60.681 60.483 60.269 60.036 59.535 59.273 58.971 58.647 58.327 57.869 57.236 53.921 -8 ,25407 ,KEBNE ,17023588,Wed Dec 22 08:18:01 CET,Wed Dec 22 09:50:13 CET,0.0 1.762 2.375 2.843 3.244 3.622 3.963 4.275 4.848 5.115 5.376 5.693 6.147 6.4 6.863 7.296 7.713 7.913 8.308 8.694 9.279 9.66 10.017 10.542 11.072 11.581 12.065 12.564 13.22 13.832 14.431 15.176 15.906 16.607 17.425 18.368 19.269 20.266 21.334 22.417 23.556 24.921 26.549 28.129 30.057 32.324 34.929 37.879 41.429 45.728 50.913 55.3 57.882 59.512 60.546 61.247 61.679 61.961 62.145 62.227 62.276 62.259 62.172 62.088 62.018 61.949 61.845 61.711 61.572 61.429 61.293 61.179 61.039 60.879 60.744 60.592 60.434 60.271 60.078 59.929 59.783 59.54 59.351 59.137 59.031 58.811 58.569 58.339 58.218 57.942 57.79 57.632 57.448 56.992 56.732 56.449 56.132 55.74 55.256 54.539 49.61 -9 ,11660 ,KEBNE ,17023589,Wed Dec 22 08:18:04 CET,Wed Dec 22 09:42:48 CET,0.0 2.489 3.121 3.601 4.002 4.356 4.699 5.029 5.652 5.936 6.203 6.507 6.945 7.189 7.65 8.079 8.486 8.684 9.094 9.492 10.056 10.426 10.784 11.301 11.816 12.343 12.843 13.302 13.893 14.497 15.098 15.843 16.592 17.322 18.181 19.165 20.106 21.135 22.269 23.48 24.718 26.1 27.761 29.525 31.634 33.95 36.652 39.792 43.527 48.053 53.54 58.048 60.757 62.381 63.308 63.856 64.247 64.576 64.771 64.919 64.985 64.998 65.001 64.957 64.876 64.78 64.656 64.546 64.46 64.326 64.154 64.028 63.879 63.691 63.545 63.403 63.252 63.08 62.881 62.727 62.558 62.303 62.134 61.928 61.815 61.592 61.347 61.09 60.94 60.616 60.398 60.218 60.022 59.546 59.28 58.983 58.62 58.147 57.603 56.929 53.934 -10 ,2354 ,KEBNE ,17023590,Wed Dec 22 08:18:04 CET,Wed Dec 22 09:49:54 CET,0.0 1.904 2.497 2.884 3.281 3.663 3.994 4.3 4.863 5.125 5.37 5.662 6.102 6.343 6.805 7.228 7.635 7.843 8.249 8.631 9.184 9.539 9.898 10.43 10.933 11.442 11.938 12.404 13.016 13.644 14.255 14.957 15.645 16.317 17.105 18.012 18.897 19.873 20.906 22.042 23.289 24.696 26.381 28.136 30.217 32.609 35.412 38.642 42.488 47.037 52.621 57.23 59.746 61.237 62.215 62.878 63.341 63.649 63.811 63.899 63.912 63.874 63.808 63.728 63.631 63.527 63.411 63.28 63.152 63.016 62.848 62.7 62.552 62.392 62.268 62.121 61.944 61.754 61.556 61.402 61.231 60.971 60.775 60.578 60.472 60.226 59.949 59.623 59.456 59.15 58.95 58.759 58.559 58.101 57.844 57.558 57.225 56.81 56.261 55.529 51.779 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index 2f7fd745..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19602 ,KEBNE ,16657098,Tue Nov 23 02:21:03 CET,Tue Nov 23 03:51:25 CET,0.0 1.272 1.642 1.917 2.143 2.351 2.553 2.727 2.993 3.113 3.238 3.274 3.571 3.674 3.886 4.081 4.25 4.327 4.473 4.612 4.82 4.954 5.083 5.272 5.43 5.561 5.694 5.816 5.962 6.096 6.212 6.353 6.51 6.658 6.809 6.962 7.129 7.29 7.408 7.519 7.62 7.715 7.784 7.788 7.732 7.624 7.389 6.975 6.261 4.983 2.58 -0.535 -3.255 -5.56 -7.493 -9.181 -10.645 -11.973 -13.107 -14.191 -15.098 -15.881 -16.618 -17.331 -17.983 -18.562 -19.144 -19.654 -20.1 -20.554 -21.019 -21.416 -21.824 -22.234 -22.565 -22.919 -23.276 -23.641 -24.028 -24.285 -24.546 -24.954 -25.235 -25.523 -25.673 -25.99 -26.324 -26.683 -26.863 -27.268 -27.416 -27.621 -27.853 -28.368 -28.643 -28.946 -29.278 -29.657 -30.098 -30.638 -32.858 -2 ,17154 ,KEBNE ,16657099,Tue Nov 23 02:22:06 CET,Tue Nov 23 03:51:19 CET,0.0 1.718 2.141 2.446 2.688 2.865 3.03 3.202 3.501 3.629 3.746 3.756 4.05 4.144 4.325 4.476 4.609 4.679 4.817 4.931 5.096 5.206 5.295 5.417 5.549 5.675 5.809 5.944 6.073 6.188 6.3 6.414 6.509 6.596 6.697 6.812 6.898 6.954 6.999 7.034 7.061 7.051 7.022 7.023 6.999 6.883 6.658 6.268 5.582 4.326 1.828 -1.478 -4.169 -6.439 -8.405 -10.092 -11.541 -12.841 -13.935 -15.005 -15.905 -16.705 -17.476 -18.185 -18.805 -19.341 -19.882 -20.371 -20.806 -21.224 -21.639 -21.995 -22.381 -22.795 -23.113 -23.443 -23.788 -24.157 -24.526 -24.757 -24.995 -25.387 -25.666 -25.965 -26.119 -26.437 -26.769 -27.092 -27.257 -27.668 -27.811 -28.014 -28.229 -28.689 -28.956 -29.246 -29.554 -29.911 -30.293 -30.778 -32.56 -5 ,14593 ,KEBNE ,16657102,Tue Nov 23 02:22:04 CET,Tue Nov 23 03:50:19 CET,0.0 1.655 2.087 2.388 2.658 2.925 3.125 3.308 3.624 3.747 3.869 3.901 4.203 4.308 4.506 4.695 4.851 4.921 5.069 5.225 5.447 5.575 5.702 5.885 6.075 6.27 6.446 6.602 6.775 6.923 7.076 7.258 7.399 7.541 7.71 7.871 8.031 8.195 8.355 8.515 8.656 8.775 8.856 8.903 8.887 8.801 8.64 8.347 7.76 6.553 4.232 1.3 -1.197 -3.315 -5.042 -6.523 -7.825 -8.984 -9.971 -10.953 -11.777 -12.495 -13.172 -13.808 -14.39 -14.91 -15.442 -15.918 -16.327 -16.746 -17.173 -17.524 -17.913 -18.318 -18.618 -18.938 -19.257 -19.608 -19.997 -20.263 -20.531 -20.926 -21.194 -21.452 -21.587 -21.886 -22.216 -22.551 -22.72 -23.13 -23.298 -23.507 -23.72 -24.189 -24.458 -24.743 -25.029 -25.346 -25.757 -26.329 -27.708 -6 ,5729 ,KEBNE ,16657103,Tue Nov 23 02:22:09 CET,Tue Nov 23 03:47:44 CET,0.0 1.73 2.151 2.481 2.748 2.983 3.178 3.35 3.645 3.773 3.891 3.923 4.22 4.312 4.47 4.613 4.751 4.818 4.94 5.064 5.244 5.343 5.436 5.568 5.701 5.828 5.953 6.06 6.183 6.309 6.42 6.549 6.689 6.801 6.892 7.027 7.177 7.319 7.449 7.565 7.663 7.738 7.802 7.854 7.863 7.786 7.532 7.044 6.248 4.906 2.458 -0.714 -3.356 -5.665 -7.62 -9.282 -10.734 -12.038 -13.158 -14.238 -15.121 -15.908 -16.677 -17.383 -18.023 -18.595 -19.19 -19.732 -20.199 -20.687 -21.184 -21.583 -21.998 -22.434 -22.775 -23.127 -23.47 -23.819 -24.181 -24.426 -24.676 -25.07 -25.36 -25.656 -25.804 -26.11 -26.417 -26.745 -26.924 -27.334 -27.466 -27.668 -27.893 -28.44 -28.75 -29.05 -29.36 -29.694 -30.116 -30.727 -32.072 -7 ,723 ,KEBNE ,16657104,Tue Nov 23 02:22:13 CET,Tue Nov 23 03:48:36 CET,0.0 1.405 1.812 2.123 2.355 2.578 2.779 2.95 3.257 3.412 3.568 3.627 3.928 4.034 4.245 4.423 4.584 4.663 4.804 4.927 5.13 5.264 5.375 5.52 5.651 5.785 5.921 6.044 6.208 6.378 6.537 6.724 6.887 7.007 7.111 7.217 7.307 7.431 7.602 7.751 7.851 7.899 7.886 7.825 7.694 7.457 7.101 6.576 5.75 4.361 1.89 -1.212 -3.851 -6.064 -7.943 -9.575 -10.988 -12.316 -13.478 -14.568 -15.455 -16.255 -17.024 -17.73 -18.383 -18.978 -19.581 -20.1 -20.543 -20.989 -21.435 -21.803 -22.18 -22.566 -22.871 -23.185 -23.49 -23.793 -24.114 -24.335 -24.573 -24.968 -25.242 -25.504 -25.637 -25.936 -26.256 -26.58 -26.748 -27.159 -27.339 -27.559 -27.771 -28.204 -28.458 -28.742 -29.071 -29.425 -29.86 -30.454 -33.604 -8 ,2092 ,KEBNE ,16657105,Tue Nov 23 02:23:07 CET,Tue Nov 23 03:52:38 CET,0.0 1.263 1.683 2.001 2.284 2.523 2.704 2.886 3.218 3.354 3.464 3.48 3.797 3.906 4.092 4.264 4.437 4.513 4.635 4.758 4.949 5.064 5.18 5.353 5.511 5.649 5.777 5.922 6.117 6.293 6.448 6.609 6.758 6.903 7.055 7.21 7.362 7.519 7.675 7.823 7.908 7.971 8.021 8.002 7.925 7.792 7.503 7.016 6.276 5.028 2.715 -0.289 -2.813 -4.992 -6.821 -8.425 -9.845 -11.114 -12.158 -13.147 -13.975 -14.693 -15.362 -15.986 -16.569 -17.09 -17.63 -18.113 -18.529 -18.953 -19.39 -19.756 -20.145 -20.557 -20.875 -21.199 -21.534 -21.887 -22.26 -22.524 -22.794 -23.221 -23.525 -23.842 -24.002 -24.33 -24.688 -25.071 -25.272 -25.701 -25.908 -26.14 -26.378 -26.885 -27.17 -27.48 -27.808 -28.171 -28.648 -29.287 -31.083 -9 ,32411 ,KEBNE ,16657106,Tue Nov 23 02:23:07 CET,Tue Nov 23 03:51:32 CET,0.0 1.366 1.755 2.044 2.286 2.506 2.695 2.864 3.185 3.332 3.46 3.488 3.779 3.862 4.03 4.208 4.378 4.456 4.602 4.734 4.919 5.047 5.174 5.345 5.499 5.64 5.76 5.884 6.031 6.149 6.279 6.44 6.564 6.656 6.736 6.792 6.861 6.94 6.992 7.039 7.089 7.103 7.058 6.963 6.889 6.797 6.537 6.126 5.389 4.022 1.535 -1.616 -4.282 -6.546 -8.481 -10.154 -11.577 -12.858 -13.965 -15.057 -15.969 -16.776 -17.551 -18.26 -18.888 -19.48 -20.11 -20.637 -21.091 -21.553 -22.031 -22.428 -22.847 -23.299 -23.635 -23.962 -24.308 -24.662 -25.025 -25.283 -25.547 -25.96 -26.251 -26.54 -26.683 -26.991 -27.314 -27.644 -27.817 -28.232 -28.417 -28.636 -28.86 -29.351 -29.612 -29.908 -30.235 -30.57 -30.988 -31.501 -33.177 -10 ,30183 ,KEBNE ,16654959,Mon Nov 22 08:14:34 CET,Mon Nov 22 09:41:55 CET,0.0 1.628 2.016 2.311 2.551 2.75 2.934 3.098 3.388 3.525 3.641 3.652 3.946 4.027 4.201 4.377 4.532 4.594 4.712 4.834 4.988 5.081 5.171 5.319 5.46 5.574 5.691 5.792 5.925 6.078 6.206 6.355 6.5 6.607 6.707 6.796 6.872 6.953 7.018 7.083 7.147 7.175 7.161 7.099 7.023 6.917 6.745 6.409 5.722 4.484 1.932 -1.342 -4.106 -6.425 -8.336 -9.981 -11.41 -12.738 -13.861 -14.95 -15.893 -16.725 -17.5 -18.225 -18.914 -19.517 -20.087 -20.59 -21.04 -21.526 -22.032 -22.431 -22.831 -23.244 -23.562 -23.894 -24.23 -24.572 -24.935 -25.193 -25.469 -25.891 -26.186 -26.488 -26.643 -26.957 -27.287 -27.663 -27.859 -28.277 -28.436 -28.633 -28.834 -29.265 -29.51 -29.793 -30.096 -30.436 -30.8 -31.267 -32.72 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index 5d27fabe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10100 ,KEBNE ,16657108,Tue Nov 23 02:23:08 CET,Tue Nov 23 03:52:38 CET,0.0 1.006 1.348 1.62 1.88 2.091 2.272 2.45 2.791 2.946 3.094 3.169 3.49 3.61 3.836 4.068 4.274 4.367 4.553 4.714 4.946 5.106 5.262 5.488 5.703 5.909 6.107 6.31 6.575 6.827 7.088 7.399 7.695 7.973 8.301 8.677 9.028 9.398 9.784 10.194 10.599 11.053 11.599 12.107 12.645 13.219 13.858 14.553 15.182 15.545 15.453 14.77 13.803 12.794 11.907 11.074 10.319 9.601 8.948 8.288 7.701 7.184 6.689 6.215 5.77 5.354 4.903 4.488 4.129 3.77 3.393 3.075 2.741 2.388 2.108 1.812 1.501 1.17 0.826 0.59 0.351 -0.023 -0.294 -0.558 -0.69 -0.982 -1.3 -1.624 -1.787 -2.157 -2.333 -2.541 -2.754 -3.219 -3.473 -3.741 -4.04 -4.39 -4.829 -5.48 -7.629 -2 ,4713 ,KEBNE ,16657109,Tue Nov 23 02:23:08 CET,Tue Nov 23 03:52:56 CET,0.0 1.012 1.393 1.682 1.922 2.134 2.323 2.486 2.802 2.96 3.095 3.135 3.444 3.564 3.792 4.012 4.214 4.309 4.495 4.67 4.926 5.095 5.266 5.516 5.736 5.955 6.174 6.382 6.66 6.932 7.203 7.549 7.869 8.15 8.462 8.809 9.131 9.485 9.87 10.278 10.683 11.115 11.614 12.081 12.616 13.192 13.782 14.353 14.884 15.32 15.409 14.756 13.826 12.863 11.934 11.022 10.195 9.456 8.795 8.126 7.556 7.03 6.495 5.96 5.484 5.079 4.65 4.249 3.897 3.53 3.146 2.819 2.495 2.169 1.903 1.63 1.355 1.074 0.783 0.577 0.354 -0.013 -0.279 -0.567 -0.715 -1.003 -1.298 -1.627 -1.811 -2.2 -2.419 -2.626 -2.831 -3.314 -3.587 -3.883 -4.231 -4.622 -5.093 -5.702 -7.307 -3 ,8049 ,KEBNE ,16657110,Tue Nov 23 02:23:11 CET,Tue Nov 23 03:50:27 CET,0.0 0.899 1.289 1.586 1.827 2.064 2.28 2.469 2.836 3.002 3.158 3.252 3.578 3.703 3.937 4.156 4.37 4.475 4.683 4.881 5.16 5.339 5.504 5.741 5.981 6.221 6.453 6.662 6.936 7.214 7.477 7.78 8.065 8.335 8.637 8.974 9.289 9.636 10.032 10.457 10.894 11.375 11.919 12.429 13.013 13.627 14.276 14.938 15.596 16.226 16.532 16.084 15.31 14.469 13.659 12.814 11.992 11.272 10.673 10.043 9.467 8.923 8.39 7.887 7.413 6.988 6.55 6.143 5.796 5.443 5.063 4.746 4.427 4.085 3.811 3.514 3.182 2.853 2.521 2.283 2.042 1.68 1.415 1.137 0.996 0.702 0.389 0.046 -0.13 -0.513 -0.717 -0.915 -1.117 -1.565 -1.827 -2.114 -2.408 -2.732 -3.179 -3.762 -5.468 -4 ,9207 ,KEBNE ,16657111,Tue Nov 23 02:23:08 CET,Tue Nov 23 03:52:57 CET,0.0 1.117 1.481 1.766 2.029 2.262 2.473 2.672 3.045 3.207 3.359 3.457 3.791 3.923 4.171 4.396 4.603 4.71 4.92 5.112 5.391 5.568 5.739 5.985 6.228 6.472 6.708 6.926 7.187 7.445 7.713 8.014 8.291 8.569 8.884 9.232 9.575 9.925 10.302 10.734 11.161 11.622 12.156 12.685 13.282 13.927 14.634 15.289 15.874 16.38 16.433 15.679 14.705 13.752 12.842 11.955 11.143 10.377 9.711 9.025 8.421 7.873 7.35 6.852 6.38 5.955 5.518 5.131 4.796 4.444 4.06 3.744 3.426 3.105 2.845 2.552 2.258 1.965 1.665 1.453 1.228 0.877 0.624 0.364 0.229 -0.064 -0.385 -0.719 -0.888 -1.263 -1.447 -1.644 -1.852 -2.345 -2.625 -2.917 -3.241 -3.631 -4.092 -4.673 -6.616 -5 ,18356 ,KEBNE ,16657112,Tue Nov 23 02:23:07 CET,Tue Nov 23 03:53:19 CET,0.0 1.032 1.401 1.679 1.934 2.147 2.349 2.537 2.871 3.033 3.178 3.228 3.537 3.649 3.859 4.06 4.245 4.346 4.562 4.772 5.074 5.255 5.426 5.672 5.901 6.12 6.344 6.562 6.826 7.089 7.349 7.635 7.913 8.194 8.503 8.835 9.165 9.528 9.905 10.3 10.713 11.17 11.687 12.199 12.779 13.416 14.137 14.887 15.607 16.195 16.483 16.028 15.245 14.375 13.511 12.68 11.942 11.299 10.734 10.147 9.627 9.157 8.721 8.306 7.894 7.526 7.159 6.812 6.497 6.169 5.824 5.526 5.207 4.865 4.585 4.301 4.008 3.705 3.388 3.173 2.966 2.631 2.402 2.161 2.034 1.776 1.499 1.21 1.059 0.7 0.521 0.316 0.103 -0.332 -0.569 -0.86 -1.212 -1.615 -2.079 -2.636 -4.094 -6 ,2363 ,KEBNE ,16657113,Tue Nov 23 02:23:08 CET,Tue Nov 23 03:52:23 CET,0.0 0.882 1.303 1.608 1.877 2.106 2.313 2.503 2.83 2.983 3.136 3.241 3.576 3.71 3.968 4.214 4.444 4.559 4.773 4.957 5.229 5.407 5.572 5.807 6.054 6.299 6.519 6.738 7.024 7.297 7.556 7.856 8.142 8.426 8.758 9.126 9.468 9.843 10.244 10.653 11.08 11.547 12.068 12.581 13.168 13.769 14.38 14.995 15.609 16.05 16.054 15.451 14.634 13.743 12.834 11.926 11.101 10.373 9.775 9.174 8.658 8.227 7.803 7.375 6.976 6.594 6.182 5.824 5.508 5.166 4.82 4.514 4.186 3.852 3.582 3.324 3.071 2.781 2.454 2.231 2.007 1.659 1.415 1.153 1.016 0.753 0.481 0.184 0.017 -0.369 -0.566 -0.77 -0.985 -1.446 -1.682 -1.924 -2.196 -2.54 -2.979 -3.518 -4.981 -7 ,8300 ,KEBNE ,16657114,Tue Nov 23 02:24:10 CET,Tue Nov 23 03:52:55 CET,0.0 0.694 1.076 1.408 1.668 1.904 2.124 2.315 2.668 2.822 2.975 3.075 3.401 3.539 3.786 4.02 4.243 4.348 4.559 4.764 5.059 5.234 5.402 5.648 5.878 6.111 6.343 6.564 6.851 7.118 7.366 7.666 7.954 8.238 8.583 8.961 9.306 9.691 10.098 10.518 10.965 11.463 12.002 12.471 13.012 13.607 14.2 14.801 15.42 15.865 15.767 14.972 13.999 13.04 12.106 11.183 10.333 9.542 8.85 8.173 7.552 6.986 6.485 6.016 5.593 5.215 4.833 4.5 4.199 3.879 3.544 3.263 2.971 2.665 2.431 2.19 1.93 1.659 1.354 1.126 0.899 0.553 0.305 0.039 -0.096 -0.373 -0.685 -0.997 -1.154 -1.523 -1.727 -1.925 -2.118 -2.574 -2.822 -3.086 -3.413 -3.802 -4.227 -4.82 -6.513 -8 ,28911 ,KEBNE ,16657115,Tue Nov 23 02:24:10 CET,Tue Nov 23 03:53:27 CET,0.0 1.057 1.469 1.768 2.007 2.227 2.444 2.661 3.055 3.224 3.387 3.514 3.86 4.002 4.264 4.503 4.723 4.827 5.01 5.191 5.482 5.664 5.836 6.092 6.327 6.538 6.748 6.956 7.217 7.473 7.73 8.038 8.336 8.62 8.959 9.33 9.66 10.026 10.422 10.838 11.275 11.764 12.309 12.805 13.36 13.962 14.577 15.212 15.89 16.4 16.553 15.979 15.061 14.114 13.193 12.332 11.536 10.83 10.25 9.669 9.174 8.723 8.273 7.842 7.444 7.056 6.652 6.301 5.988 5.66 5.33 5.06 4.768 4.455 4.195 3.901 3.597 3.294 2.988 2.775 2.537 2.168 1.924 1.659 1.522 1.221 0.892 0.555 0.383 0.008 -0.194 -0.41 -0.633 -1.114 -1.392 -1.676 -2.003 -2.384 -2.798 -3.285 -5.113 -9 ,25206 ,KEBNE ,16657116,Tue Nov 23 02:24:10 CET,Tue Nov 23 03:53:04 CET,0.0 1.025 1.461 1.765 2.02 2.271 2.479 2.67 3.012 3.174 3.33 3.401 3.72 3.845 4.089 4.322 4.542 4.647 4.876 5.101 5.393 5.568 5.722 5.931 6.125 6.331 6.555 6.778 7.065 7.331 7.571 7.866 8.159 8.428 8.736 9.087 9.419 9.785 10.181 10.602 11.027 11.494 12.032 12.533 13.095 13.703 14.344 14.993 15.622 16.088 16.099 15.398 14.536 13.677 12.784 11.899 11.107 10.34 9.655 8.97 8.378 7.857 7.352 6.862 6.38 5.946 5.51 5.108 4.77 4.414 4.034 3.723 3.392 3.033 2.76 2.483 2.199 1.912 1.607 1.399 1.189 0.848 0.603 0.337 0.196 -0.084 -0.377 -0.706 -0.882 -1.257 -1.461 -1.665 -1.886 -2.396 -2.662 -2.941 -3.282 -3.672 -4.166 -4.839 -6.87 -10 ,2859 ,KEBNE ,16657117,Tue Nov 23 02:24:10 CET,Tue Nov 23 03:53:37 CET,0.0 1.14 1.564 1.888 2.147 2.39 2.625 2.845 3.225 3.391 3.543 3.641 3.975 4.103 4.337 4.567 4.773 4.871 5.081 5.277 5.545 5.711 5.875 6.112 6.341 6.57 6.796 7.02 7.297 7.558 7.801 8.093 8.387 8.669 8.989 9.343 9.678 10.026 10.405 10.805 11.223 11.699 12.225 12.731 13.318 13.967 14.669 15.345 15.899 16.327 16.372 15.738 14.875 13.932 13.05 12.23 11.43 10.672 10.015 9.331 8.719 8.159 7.612 7.102 6.644 6.228 5.781 5.37 5.011 4.651 4.289 3.989 3.692 3.381 3.121 2.844 2.562 2.278 1.982 1.768 1.54 1.178 0.933 0.683 0.543 0.26 -0.049 -0.388 -0.554 -0.917 -1.096 -1.299 -1.497 -1.952 -2.218 -2.505 -2.803 -3.149 -3.592 -4.133 -5.556 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index fb6fa8d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27287 ,KEBNE ,16657118,Tue Nov 23 02:24:10 CET,Tue Nov 23 03:54:28 CET,0.0 3.238 3.637 3.953 4.202 4.432 4.698 4.92 5.247 5.391 5.52 5.555 5.866 5.986 6.195 6.387 6.556 6.622 6.745 6.879 7.07 7.174 7.26 7.392 7.521 7.646 7.776 7.887 8.011 8.122 8.208 8.315 8.406 8.475 8.558 8.632 8.699 8.773 8.808 8.818 8.824 8.816 8.836 8.859 8.807 8.667 8.375 7.877 7.047 5.594 2.912 -0.518 -3.374 -5.811 -7.852 -9.56 -11.009 -12.323 -13.437 -14.522 -15.46 -16.284 -17.073 -17.815 -18.475 -19.092 -19.71 -20.241 -20.725 -21.231 -21.753 -22.184 -22.624 -23.088 -23.452 -23.813 -24.184 -24.559 -24.968 -25.264 -25.545 -26.005 -26.33 -26.658 -26.835 -27.23 -27.645 -28.051 -28.244 -28.679 -28.931 -29.186 -29.473 -30.137 -30.503 -30.886 -31.307 -31.784 -32.348 -33.108 -37.835 -2 ,28917 ,KEBNE ,16654992,Mon Nov 22 08:16:37 CET,Mon Nov 22 09:44:50 CET,0.0 2.777 3.285 3.634 3.923 4.174 4.387 4.574 4.907 5.056 5.194 5.222 5.51 5.61 5.821 5.987 6.129 6.194 6.31 6.425 6.59 6.697 6.8 6.949 7.119 7.286 7.421 7.536 7.658 7.769 7.876 8.006 8.128 8.223 8.313 8.395 8.456 8.511 8.581 8.644 8.659 8.642 8.592 8.484 8.287 8.018 7.596 7.002 6.099 4.552 1.823 -1.565 -4.303 -6.603 -8.589 -10.319 -11.85 -13.253 -14.434 -15.595 -16.557 -17.367 -18.136 -18.866 -19.546 -20.177 -20.856 -21.463 -21.959 -22.459 -22.984 -23.403 -23.831 -24.28 -24.632 -24.996 -25.361 -25.728 -26.145 -26.46 -26.787 -27.297 -27.659 -28.042 -28.242 -28.673 -29.089 -29.508 -29.737 -30.208 -30.499 -30.768 -31.057 -31.678 -32.023 -32.416 -32.856 -33.386 -34.055 -34.91 -47.048 -3 ,21957 ,KEBNE ,16657120,Tue Nov 23 02:24:10 CET,Tue Nov 23 03:55:03 CET,0.0 2.377 2.72 3.0 3.256 3.46 3.649 3.825 4.184 4.345 4.469 4.485 4.781 4.881 5.06 5.218 5.381 5.455 5.599 5.743 5.915 6.02 6.126 6.28 6.432 6.581 6.711 6.827 6.984 7.116 7.224 7.342 7.441 7.533 7.621 7.709 7.787 7.862 7.928 7.969 8.004 8.034 8.025 7.965 7.828 7.618 7.275 6.717 5.768 4.159 1.527 -1.651 -4.312 -6.578 -8.53 -10.258 -11.744 -13.097 -14.26 -15.407 -16.365 -17.212 -18.023 -18.774 -19.476 -20.132 -20.813 -21.398 -21.883 -22.408 -22.969 -23.404 -23.853 -24.318 -24.67 -25.039 -25.419 -25.805 -26.212 -26.499 -26.781 -27.223 -27.517 -27.83 -28.001 -28.361 -28.738 -29.108 -29.307 -29.771 -30.061 -30.305 -30.573 -31.216 -31.571 -31.95 -32.341 -32.768 -33.36 -34.183 -37.05 -4 ,17391 ,KEBNE ,16657121,Tue Nov 23 02:24:14 CET,Tue Nov 23 03:51:37 CET,0.0 9.029 9.585 9.982 10.302 10.547 10.779 10.989 11.293 11.421 11.522 11.503 11.789 11.893 12.106 12.285 12.435 12.497 12.605 12.717 12.878 12.98 13.077 13.201 13.32 13.44 13.543 13.64 13.779 13.916 14.042 14.179 14.322 14.448 14.538 14.594 14.65 14.714 14.758 14.784 14.803 14.795 14.741 14.655 14.529 14.305 13.88 13.245 12.271 10.685 7.94 4.57 1.751 -0.591 -2.518 -4.203 -5.627 -6.883 -7.986 -9.072 -9.999 -10.843 -11.665 -12.422 -13.082 -13.676 -14.306 -14.871 -15.347 -15.846 -16.39 -16.844 -17.302 -17.79 -18.178 -18.576 -18.998 -19.442 -19.908 -20.217 -20.516 -20.995 -21.347 -21.715 -21.905 -22.3 -22.693 -23.11 -23.326 -23.779 -24.041 -24.305 -24.569 -25.107 -25.409 -25.739 -26.13 -26.619 -27.206 -28.009 -33.803 -7 ,613 ,KEBNE ,16654997,Mon Nov 22 08:16:37 CET,Mon Nov 22 09:44:47 CET,0.0 1.685 2.209 2.618 2.944 3.18 3.408 3.653 4.077 4.241 4.381 4.421 4.719 4.82 5.004 5.164 5.308 5.39 5.549 5.7 5.915 6.044 6.174 6.351 6.505 6.647 6.795 6.924 7.07 7.215 7.335 7.479 7.633 7.752 7.846 7.932 7.99 8.055 8.116 8.154 8.162 8.153 8.118 8.029 7.866 7.607 7.258 6.755 5.875 4.462 1.874 -1.422 -4.122 -6.401 -8.422 -10.279 -11.843 -13.249 -14.49 -15.71 -16.765 -17.676 -18.478 -19.215 -19.899 -20.514 -21.144 -21.701 -22.193 -22.716 -23.249 -23.683 -24.159 -24.654 -25.022 -25.39 -25.771 -26.187 -26.62 -26.906 -27.197 -27.673 -28.013 -28.374 -28.554 -28.911 -29.296 -29.714 -29.93 -30.368 -30.607 -30.88 -31.158 -31.772 -32.127 -32.491 -32.897 -33.402 -34.055 -34.906 -39.175 -8 ,16968 ,KEBNE ,16654998,Mon Nov 22 08:16:37 CET,Mon Nov 22 09:44:38 CET,0.0 2.02 2.59 2.95 3.267 3.539 3.761 3.962 4.341 4.496 4.638 4.713 5.036 5.149 5.364 5.557 5.741 5.83 5.983 6.132 6.361 6.501 6.624 6.789 6.944 7.092 7.233 7.361 7.513 7.636 7.74 7.861 7.967 8.076 8.187 8.297 8.404 8.509 8.597 8.667 8.718 8.731 8.69 8.614 8.497 8.29 7.911 7.296 6.318 4.774 2.065 -1.245 -4.031 -6.432 -8.425 -10.146 -11.614 -12.937 -14.088 -15.248 -16.221 -17.066 -17.869 -18.624 -19.312 -19.928 -20.556 -21.098 -21.57 -22.059 -22.572 -22.993 -23.416 -23.85 -24.195 -24.564 -24.946 -25.33 -25.75 -26.05 -26.348 -26.822 -27.164 -27.533 -27.72 -28.081 -28.434 -28.855 -29.086 -29.53 -29.747 -29.995 -30.279 -30.935 -31.287 -31.675 -32.084 -32.529 -33.123 -33.97 -36.898 -9 ,28268 ,KEBNE ,16654999,Mon Nov 22 08:16:38 CET,Mon Nov 22 09:45:12 CET,0.0 5.358 5.798 6.152 6.437 6.67 6.865 7.015 7.321 7.492 7.639 7.679 7.983 8.099 8.319 8.508 8.682 8.762 8.913 9.055 9.256 9.372 9.489 9.68 9.845 9.992 10.108 10.202 10.32 10.427 10.554 10.697 10.823 10.955 11.08 11.182 11.258 11.31 11.353 11.405 11.454 11.499 11.517 11.457 11.284 11.026 10.628 9.999 8.994 7.351 4.571 1.293 -1.457 -3.855 -5.855 -7.577 -9.053 -10.357 -11.479 -12.61 -13.589 -14.447 -15.237 -15.985 -16.692 -17.348 -18.052 -18.698 -19.272 -19.816 -20.314 -20.725 -21.165 -21.619 -21.962 -22.336 -22.737 -23.145 -23.556 -23.838 -24.124 -24.567 -24.871 -25.196 -25.379 -25.77 -26.197 -26.648 -26.867 -27.317 -27.545 -27.785 -28.077 -28.704 -29.02 -29.379 -29.802 -30.272 -30.85 -31.675 -39.437 -10 ,3649 ,KEBNE ,16657127,Tue Nov 23 02:25:13 CET,Tue Nov 23 03:54:14 CET,0.0 6.535 7.03 7.366 7.635 7.882 8.109 8.307 8.628 8.762 8.895 8.919 9.204 9.296 9.507 9.713 9.873 9.942 10.074 10.198 10.384 10.508 10.625 10.782 10.915 11.036 11.153 11.267 11.409 11.531 11.646 11.786 11.908 12.002 12.095 12.198 12.301 12.406 12.469 12.504 12.524 12.501 12.43 12.355 12.228 11.975 11.609 11.024 10.007 8.381 5.657 2.312 -0.495 -2.851 -4.83 -6.542 -8.047 -9.378 -10.499 -11.654 -12.618 -13.447 -14.246 -14.98 -15.644 -16.263 -16.91 -17.495 -17.991 -18.491 -19.038 -19.498 -19.964 -20.436 -20.798 -21.174 -21.572 -22.021 -22.471 -22.747 -23.044 -23.535 -23.874 -24.221 -24.4 -24.769 -25.156 -25.578 -25.807 -26.269 -26.522 -26.785 -27.066 -27.675 -28.01 -28.379 -28.779 -29.254 -29.825 -30.551 -34.76 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index d5dbb742..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25287 ,KEBNE ,16657128,Tue Nov 23 02:25:16 CET,Tue Nov 23 03:54:36 CET,0.0 3.522 4.08 4.51 4.86 5.141 5.366 5.583 5.997 6.199 6.423 6.641 7.001 7.141 7.403 7.668 7.938 8.063 8.291 8.528 8.87 9.075 9.27 9.551 9.802 10.048 10.303 10.547 10.861 11.173 11.457 11.776 12.067 12.354 12.688 13.043 13.383 13.756 14.131 14.515 14.915 15.37 15.891 16.376 16.881 17.41 18.029 18.653 19.201 19.562 19.523 18.878 18.03 17.022 16.053 15.21 14.437 13.692 13.009 12.315 11.709 11.148 10.603 10.094 9.618 9.168 8.672 8.219 7.84 7.47 7.086 6.756 6.408 6.041 5.751 5.448 5.131 4.782 4.402 4.132 3.856 3.465 3.213 2.933 2.782 2.502 2.219 1.889 1.698 1.296 1.052 0.824 0.595 0.057 -0.272 -0.617 -0.972 -1.389 -1.888 -2.553 -6.783 -3 ,9036 ,KEBNE ,16657130,Tue Nov 23 02:25:16 CET,Tue Nov 23 03:58:55 CET,0.0 3.077 3.677 4.09 4.399 4.671 4.915 5.123 5.511 5.718 5.928 6.108 6.463 6.617 6.915 7.19 7.464 7.603 7.852 8.068 8.398 8.614 8.814 9.118 9.434 9.725 9.981 10.218 10.522 10.821 11.1 11.43 11.754 12.056 12.404 12.799 13.166 13.546 13.934 14.331 14.754 15.238 15.785 16.294 16.826 17.385 18.009 18.753 19.519 19.984 20.017 19.346 18.408 17.426 16.505 15.632 14.828 14.07 13.404 12.797 12.323 11.88 11.425 10.997 10.605 10.244 9.875 9.548 9.256 8.937 8.575 8.279 7.992 7.697 7.458 7.197 6.929 6.656 6.339 6.108 5.872 5.488 5.24 5.013 4.893 4.605 4.293 3.97 3.797 3.431 3.283 3.091 2.868 2.368 2.102 1.833 1.542 1.181 0.739 0.173 -2.865 -5 ,16308 ,KEBNE ,16657132,Tue Nov 23 02:25:13 CET,Tue Nov 23 03:55:27 CET,0.0 3.16 3.706 4.036 4.325 4.574 4.813 5.04 5.452 5.647 5.825 5.939 6.28 6.407 6.627 6.85 7.072 7.19 7.432 7.663 7.997 8.197 8.39 8.65 8.869 9.076 9.278 9.469 9.705 9.944 10.191 10.468 10.721 10.966 11.251 11.586 11.902 12.228 12.587 13.01 13.482 14.004 14.565 15.104 15.688 16.312 17.022 17.736 18.46 19.057 19.27 18.592 17.67 16.743 15.831 14.916 14.061 13.294 12.584 11.848 11.206 10.624 10.119 9.66 9.217 8.828 8.434 8.07 7.752 7.422 7.081 6.792 6.486 6.178 5.927 5.666 5.38 5.06 4.755 4.552 4.331 3.978 3.727 3.449 3.3 2.991 2.66 2.303 2.121 1.734 1.503 1.267 1.015 0.514 0.243 -0.076 -0.468 -0.915 -1.421 -2.124 -6.513 -6 ,12583 ,KEBNE ,16657133,Tue Nov 23 02:25:12 CET,Tue Nov 23 03:56:05 CET,0.0 2.994 3.534 3.896 4.204 4.499 4.763 4.996 5.437 5.629 5.789 5.907 6.251 6.394 6.672 6.924 7.175 7.295 7.505 7.712 8.019 8.213 8.408 8.716 9.002 9.256 9.502 9.747 10.07 10.356 10.6 10.879 11.146 11.411 11.733 12.091 12.412 12.751 13.113 13.467 13.803 14.177 14.596 15.019 15.495 15.985 16.503 17.014 17.507 17.893 17.937 17.356 16.584 15.755 14.964 14.248 13.593 12.967 12.413 11.869 11.408 10.985 10.572 10.176 9.799 9.454 9.094 8.771 8.498 8.2 7.835 7.515 7.19 6.844 6.586 6.335 6.068 5.793 5.515 5.32 5.12 4.814 4.612 4.402 4.273 3.995 3.711 3.416 3.252 2.872 2.674 2.459 2.247 1.779 1.517 1.224 0.905 0.515 -0.007 -0.654 -7.117 -7 ,8585 ,KEBNE ,16657134,Tue Nov 23 02:25:16 CET,Tue Nov 23 03:53:33 CET,0.0 4.177 4.713 5.09 5.386 5.657 5.954 6.235 6.635 6.819 7.003 7.186 7.552 7.697 7.978 8.259 8.512 8.622 8.83 9.019 9.266 9.423 9.595 9.864 10.123 10.346 10.556 10.782 11.061 11.31 11.549 11.837 12.115 12.381 12.681 13.008 13.335 13.7 14.069 14.462 14.875 15.337 15.889 16.407 16.956 17.542 18.167 18.768 19.353 19.8 19.812 19.151 18.278 17.37 16.483 15.657 14.907 14.182 13.557 12.894 12.3 11.782 11.296 10.866 10.436 10.01 9.576 9.176 8.808 8.422 8.044 7.737 7.427 7.113 6.876 6.633 6.35 6.062 5.77 5.553 5.332 4.979 4.719 4.452 4.317 4.037 3.707 3.356 3.189 2.826 2.679 2.493 2.295 1.855 1.591 1.296 0.99 0.625 0.097 -0.602 -3.559 -8 ,1966 ,KEBNE ,16657135,Tue Nov 23 02:25:13 CET,Tue Nov 23 03:55:06 CET,0.0 7.73 8.309 8.711 9.048 9.352 9.606 9.853 10.294 10.493 10.666 10.754 11.085 11.232 11.537 11.827 12.078 12.19 12.408 12.614 12.904 13.097 13.294 13.578 13.857 14.126 14.372 14.611 14.913 15.188 15.451 15.745 16.023 16.295 16.604 16.957 17.292 17.633 18.0 18.376 18.751 19.189 19.737 20.306 20.944 21.614 22.29 22.981 23.707 24.269 24.338 23.659 22.643 21.683 20.85 20.056 19.307 18.592 17.931 17.218 16.59 16.046 15.544 15.065 14.589 14.136 13.664 13.226 12.852 12.5 12.139 11.833 11.518 11.18 10.886 10.569 10.264 9.96 9.642 9.421 9.187 8.795 8.535 8.273 8.136 7.863 7.581 7.286 7.118 6.731 6.531 6.308 6.074 5.575 5.29 4.955 4.588 4.182 3.719 3.033 -0.529 -10 ,9785 ,KEBNE ,16657137,Tue Nov 23 02:25:16 CET,Tue Nov 23 03:53:50 CET,0.0 2.549 3.093 3.516 3.875 4.174 4.423 4.659 5.098 5.309 5.5 5.626 5.968 6.121 6.415 6.673 6.934 7.062 7.307 7.557 7.909 8.123 8.331 8.611 8.876 9.143 9.394 9.629 9.927 10.217 10.494 10.823 11.133 11.424 11.768 12.177 12.557 12.946 13.347 13.753 14.193 14.687 15.278 15.859 16.46 17.038 17.64 18.259 18.809 19.166 19.106 18.413 17.568 16.632 15.684 14.82 14.059 13.344 12.693 12.047 11.491 10.977 10.483 10.008 9.568 9.164 8.743 8.354 8.003 7.626 7.235 6.898 6.547 6.207 5.934 5.635 5.324 5.005 4.671 4.45 4.23 3.884 3.641 3.389 3.265 2.99 2.693 2.372 2.189 1.805 1.626 1.429 1.216 0.711 0.428 0.126 -0.18 -0.52 -0.96 -1.593 -5.201 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt deleted file mode 100644 index fd0e7f37..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18827 ,KEBNE ,16657138,Tue Nov 23 02:26:16 CET,Tue Nov 23 03:54:52 CET,0.0 0.262 0.446 0.597 0.739 0.864 0.971 1.163 1.265 1.374 1.478 1.683 1.787 1.986 2.173 2.343 2.423 2.576 2.73 2.966 3.124 3.279 3.505 3.732 3.951 4.164 4.38 4.662 4.94 5.208 5.538 5.854 6.17 6.537 6.933 7.308 7.724 8.2 8.706 9.224 9.822 10.564 11.28 12.034 12.849 13.787 14.851 16.107 17.446 18.655 19.284 19.328 19.021 18.622 18.191 17.708 17.216 16.798 16.318 15.861 15.471 15.095 14.726 14.346 13.986 13.625 13.288 12.982 12.669 12.349 12.06 11.738 11.428 11.194 10.928 10.642 10.341 10.042 9.83 9.609 9.251 8.987 8.723 8.58 8.284 7.97 7.63 7.456 7.201 6.884 6.652 6.401 5.837 5.539 5.211 4.778 4.256 3.557 2.529 -2 ,5404 ,KEBNE ,16657139,Tue Nov 23 02:26:16 CET,Tue Nov 23 03:54:39 CET,0.0 0.244 0.449 0.652 0.824 0.98 1.122 1.395 1.53 1.66 1.802 2.008 2.113 2.309 2.501 2.689 2.779 2.966 3.147 3.416 3.595 3.762 4.012 4.253 4.478 4.711 4.946 5.233 5.51 5.785 6.116 6.424 6.727 7.088 7.503 7.895 8.306 8.758 9.274 9.816 10.425 11.143 11.808 12.543 13.409 14.401 15.441 16.615 17.874 19.145 19.76 19.708 19.524 19.274 18.873 18.411 17.953 17.527 17.073 16.667 16.306 15.961 15.604 15.271 14.958 14.603 14.266 13.982 13.683 13.339 13.04 12.736 12.424 12.18 11.933 11.671 11.402 11.13 10.931 10.713 10.368 10.105 9.813 9.669 9.38 9.064 8.713 8.519 8.243 7.904 7.68 7.435 6.891 6.58 6.248 5.853 5.33 4.63 3.683 -3 ,18789 ,KEBNE ,16657140,Tue Nov 23 02:26:16 CET,Tue Nov 23 03:55:09 CET,0.0 0.308 0.563 0.765 0.926 1.073 1.207 1.497 1.646 1.779 1.927 2.145 2.263 2.488 2.708 2.914 3.008 3.206 3.402 3.682 3.856 4.029 4.292 4.54 4.768 4.994 5.219 5.504 5.777 6.041 6.354 6.665 6.992 7.356 7.748 8.14 8.573 9.042 9.536 10.047 10.611 11.256 11.939 12.781 13.714 14.7 15.756 17.006 18.372 19.667 20.198 20.166 19.881 19.473 19.044 18.607 18.155 17.755 17.333 16.957 16.592 16.216 15.848 15.487 15.149 14.791 14.464 14.178 13.869 13.538 13.259 12.961 12.662 12.43 12.182 11.915 11.617 11.308 11.101 10.877 10.526 10.282 10.012 9.871 9.55 9.198 8.852 8.669 8.405 8.051 7.818 7.578 7.035 6.725 6.376 5.936 5.353 4.625 3.658 -4 ,23886 ,KEBNE ,16657141,Tue Nov 23 02:26:17 CET,Tue Nov 23 03:55:03 CET,0.0 0.251 0.441 0.628 0.796 0.954 1.115 1.43 1.567 1.703 1.836 2.037 2.146 2.359 2.559 2.753 2.853 3.058 3.254 3.517 3.682 3.849 4.096 4.342 4.578 4.794 5.015 5.306 5.586 5.848 6.159 6.473 6.782 7.143 7.544 7.926 8.356 8.832 9.336 9.863 10.47 11.176 11.879 12.699 13.572 14.56 15.657 16.895 18.247 19.436 19.927 19.912 19.685 19.332 18.896 18.419 17.93 17.46 16.96 16.523 16.124 15.732 15.357 14.997 14.652 14.271 13.92 13.623 13.32 13.007 12.736 12.435 12.112 11.865 11.61 11.35 11.053 10.718 10.496 10.276 9.935 9.691 9.424 9.276 8.972 8.684 8.346 8.155 7.881 7.523 7.311 7.072 6.471 6.152 5.813 5.377 4.851 4.166 3.115 -5 ,8299 ,KEBNE ,16657142,Tue Nov 23 02:26:16 CET,Tue Nov 23 03:54:30 CET,0.0 0.214 0.42 0.608 0.755 0.892 1.022 1.269 1.38 1.488 1.599 1.793 1.882 2.052 2.222 2.396 2.483 2.648 2.806 3.032 3.176 3.321 3.543 3.772 3.989 4.189 4.38 4.624 4.881 5.139 5.434 5.715 5.991 6.332 6.727 7.101 7.521 7.988 8.48 8.974 9.506 10.114 10.752 11.524 12.339 13.198 14.134 15.147 16.181 17.316 17.874 17.777 17.424 17.004 16.538 16.07 15.613 15.228 14.807 14.402 14.041 13.673 13.35 13.029 12.709 12.378 12.075 11.81 11.514 11.202 10.945 10.667 10.371 10.149 9.908 9.623 9.325 9.029 8.828 8.62 8.277 8.029 7.759 7.607 7.309 7.015 6.675 6.487 6.209 5.834 5.592 5.307 4.631 4.293 3.953 3.586 3.156 2.541 1.602 -6 ,30116 ,KEBNE ,16657143,Tue Nov 23 02:26:16 CET,Tue Nov 23 03:54:13 CET,0.0 0.302 0.499 0.654 0.802 0.937 1.066 1.308 1.414 1.514 1.613 1.82 1.923 2.112 2.276 2.444 2.532 2.695 2.859 3.107 3.265 3.426 3.649 3.857 4.07 4.284 4.489 4.747 4.999 5.249 5.56 5.863 6.15 6.489 6.879 7.24 7.637 8.065 8.541 9.07 9.66 10.346 11.002 11.747 12.586 13.537 14.629 15.829 17.006 18.112 18.679 18.698 18.469 18.082 17.611 17.2 16.797 16.375 15.917 15.515 15.14 14.763 14.4 14.041 13.706 13.345 13.004 12.709 12.391 12.056 11.78 11.489 11.203 10.981 10.721 10.447 10.169 9.856 9.644 9.421 9.053 8.799 8.528 8.388 8.104 7.809 7.449 7.261 7.005 6.661 6.425 6.188 5.716 5.425 5.065 4.611 4.019 3.38 2.441 -7 ,7674 ,KEBNE ,16657144,Tue Nov 23 02:26:16 CET,Tue Nov 23 03:53:48 CET,0.0 0.316 0.539 0.721 0.879 1.036 1.177 1.436 1.562 1.686 1.827 2.041 2.152 2.353 2.541 2.738 2.835 3.011 3.177 3.404 3.555 3.705 3.926 4.15 4.363 4.572 4.769 5.03 5.309 5.584 5.919 6.249 6.562 6.892 7.262 7.633 8.059 8.522 8.994 9.507 10.093 10.778 11.479 12.285 13.187 14.18 15.279 16.524 17.752 19.054 19.742 19.718 19.448 19.074 18.612 18.133 17.635 17.166 16.712 16.305 15.927 15.551 15.165 14.785 14.431 14.074 13.752 13.449 13.148 12.832 12.533 12.212 11.887 11.647 11.409 11.149 10.85 10.539 10.336 10.116 9.771 9.553 9.344 9.214 8.933 8.638 8.312 8.14 7.876 7.544 7.318 7.092 6.578 6.288 5.949 5.519 5.042 4.467 3.619 -8 ,22395 ,KEBNE ,16657145,Tue Nov 23 02:26:17 CET,Tue Nov 23 03:54:50 CET,0.0 0.29 0.527 0.723 0.91 1.075 1.203 1.43 1.55 1.67 1.773 1.98 2.083 2.27 2.455 2.634 2.727 2.91 3.08 3.323 3.488 3.655 3.898 4.137 4.37 4.598 4.821 5.103 5.371 5.632 5.948 6.242 6.522 6.85 7.204 7.554 7.961 8.424 8.907 9.376 9.92 10.562 11.22 11.999 12.853 13.84 14.935 16.135 17.465 18.83 19.611 19.707 19.429 19.06 18.687 18.257 17.781 17.369 16.924 16.524 16.168 15.791 15.402 15.026 14.679 14.313 13.97 13.674 13.368 13.037 12.773 12.497 12.154 11.873 11.614 11.362 11.104 10.799 10.572 10.359 10.015 9.759 9.514 9.397 9.157 8.876 8.55 8.378 8.123 7.798 7.576 7.338 6.744 6.409 6.081 5.672 5.15 4.545 3.647 -9 ,18829 ,KEBNE ,16657146,Tue Nov 23 02:26:17 CET,Tue Nov 23 03:56:13 CET,0.0 0.286 0.47 0.64 0.813 0.984 1.147 1.434 1.558 1.678 1.802 2.003 2.097 2.285 2.485 2.67 2.754 2.922 3.096 3.362 3.534 3.69 3.905 4.126 4.354 4.574 4.784 5.06 5.328 5.587 5.914 6.236 6.538 6.898 7.304 7.689 8.123 8.596 9.107 9.638 10.239 10.96 11.696 12.543 13.443 14.455 15.571 16.766 17.954 19.195 19.913 19.817 19.481 19.1 18.669 18.232 17.81 17.408 16.971 16.593 16.238 15.888 15.55 15.232 14.919 14.59 14.288 13.996 13.668 13.326 13.061 12.792 12.514 12.292 12.041 11.759 11.479 11.184 10.972 10.775 10.437 10.173 9.911 9.782 9.519 9.236 8.886 8.687 8.417 8.102 7.88 7.642 7.128 6.808 6.448 6.076 5.584 4.887 3.904 -10 ,16821 ,KEBNE ,16657147,Tue Nov 23 02:26:17 CET,Tue Nov 23 03:55:34 CET,0.0 0.299 0.564 0.793 0.991 1.161 1.302 1.553 1.689 1.834 1.983 2.197 2.306 2.517 2.742 2.958 3.059 3.256 3.45 3.722 3.896 4.072 4.331 4.577 4.808 5.032 5.252 5.552 5.836 6.096 6.431 6.754 7.073 7.442 7.831 8.213 8.646 9.119 9.649 10.206 10.833 11.597 12.311 13.13 14.073 15.098 16.164 17.386 18.781 20.142 20.736 20.649 20.343 19.951 19.472 19.01 18.574 18.151 17.701 17.304 16.955 16.587 16.197 15.839 15.487 15.11 14.777 14.467 14.132 13.783 13.481 13.17 12.853 12.606 12.359 12.106 11.83 11.529 11.309 11.067 10.681 10.42 10.163 10.03 9.739 9.414 9.081 8.901 8.632 8.285 8.043 7.781 7.234 6.91 6.517 6.068 5.536 4.867 4.066 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt deleted file mode 100644 index dbd0b5bd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20216 ,KEBNE ,16657148,Tue Nov 23 02:26:16 CET,Tue Nov 23 03:53:58 CET,0.0 0.307 0.4 0.485 0.563 0.644 0.706 0.751 0.834 0.872 0.91 0.87 0.987 1.008 1.054 1.096 1.137 1.153 1.177 1.198 1.232 1.259 1.279 1.302 1.329 1.339 1.343 1.35 1.338 1.315 1.297 1.272 1.234 1.18 1.105 1.03 0.946 0.838 0.718 0.54 0.312 0.054 -0.291 -0.677 -1.188 -1.846 -2.728 -3.95 -5.712 -8.351 -12.548 -17.36 -21.206 -24.333 -26.917 -29.132 -31.002 -32.653 -34.08 -35.483 -36.659 -37.703 -38.688 -39.598 -40.41 -41.125 -41.844 -42.494 -43.068 -43.661 -44.262 -44.76 -45.267 -45.785 -46.194 -46.622 -47.067 -47.517 -47.991 -48.307 -48.64 -49.164 -49.511 -49.876 -50.061 -50.445 -50.857 -51.282 -51.505 -51.877 -52.264 -52.542 -52.834 -53.446 -53.771 -54.152 -54.661 -55.236 -55.897 -56.956 -62.447 -5 ,17353 ,KEBNE ,16657152,Tue Nov 23 02:27:22 CET,Tue Nov 23 03:55:53 CET,0.0 0.378 0.518 0.625 0.705 0.765 0.819 0.879 0.99 1.038 1.086 1.052 1.172 1.191 1.24 1.277 1.31 1.327 1.359 1.398 1.455 1.483 1.51 1.545 1.574 1.596 1.611 1.624 1.643 1.653 1.649 1.643 1.643 1.623 1.587 1.541 1.469 1.381 1.265 1.116 0.921 0.67 0.34 -0.064 -0.603 -1.302 -2.229 -3.398 -5.099 -7.672 -11.931 -16.936 -20.788 -23.941 -26.561 -28.789 -30.647 -32.265 -33.667 -35.067 -36.231 -37.242 -38.202 -39.088 -39.903 -40.636 -41.395 -42.079 -42.655 -43.237 -43.831 -44.317 -44.833 -45.351 -45.746 -46.166 -46.59 -47.038 -47.52 -47.851 -48.191 -48.737 -49.13 -49.533 -49.73 -50.121 -50.526 -50.973 -51.21 -51.585 -51.918 -52.184 -52.477 -53.074 -53.404 -53.77 -54.199 -54.699 -55.367 -56.295 -59.766 -9 ,3292 ,KEBNE ,16657156,Tue Nov 23 02:28:23 CET,Tue Nov 23 03:56:50 CET,0.0 0.41 0.582 0.747 0.877 0.975 1.064 1.143 1.29 1.348 1.407 1.418 1.561 1.586 1.611 1.637 1.661 1.67 1.695 1.73 1.772 1.799 1.828 1.863 1.892 1.918 1.944 1.962 1.965 1.966 1.972 1.973 1.966 1.942 1.898 1.853 1.804 1.709 1.583 1.442 1.245 0.993 0.652 0.249 -0.284 -0.94 -1.816 -3.066 -4.926 -7.71 -12.007 -16.8 -20.602 -23.713 -26.317 -28.602 -30.555 -32.25 -33.672 -35.096 -36.298 -37.346 -38.327 -39.233 -40.084 -40.842 -41.585 -42.227 -42.774 -43.364 -43.986 -44.489 -45.008 -45.552 -45.957 -46.374 -46.816 -47.271 -47.735 -48.031 -48.347 -48.882 -49.267 -49.663 -49.853 -50.231 -50.64 -51.066 -51.283 -51.649 -51.975 -52.236 -52.527 -53.176 -53.555 -53.981 -54.466 -55.042 -55.752 -56.688 -66.344 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index 8bfb8579..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5338 ,KEBNE ,16657158,Tue Nov 23 02:30:29 CET,Tue Nov 23 03:59:32 CET,0.0 0.689 1.065 1.363 1.606 1.815 2.001 2.171 2.476 2.631 2.784 2.871 3.196 3.33 3.583 3.82 4.045 4.15 4.356 4.555 4.836 5.015 5.185 5.431 5.669 5.901 6.124 6.338 6.603 6.848 7.098 7.41 7.716 8.014 8.342 8.692 9.052 9.446 9.84 10.265 10.695 11.161 11.711 12.264 12.866 13.472 14.11 14.723 15.352 15.874 15.878 15.205 14.242 13.187 12.2 11.249 10.408 9.63 8.932 8.237 7.621 7.068 6.57 6.093 5.628 5.206 4.757 4.361 3.992 3.618 3.245 2.922 2.593 2.253 1.977 1.686 1.384 1.043 0.696 0.472 0.249 -0.105 -0.355 -0.611 -0.74 -1.015 -1.317 -1.671 -1.858 -2.234 -2.416 -2.62 -2.852 -3.36 -3.628 -3.929 -4.264 -4.659 -5.161 -5.919 -8.586 -2 ,32231 ,KEBNE ,16657159,Tue Nov 23 02:30:27 CET,Tue Nov 23 04:03:24 CET,0.0 1.224 1.66 1.988 2.256 2.484 2.697 2.913 3.298 3.462 3.605 3.705 4.045 4.196 4.493 4.762 5.007 5.127 5.349 5.553 5.842 6.026 6.203 6.449 6.69 6.92 7.151 7.363 7.62 7.878 8.135 8.453 8.751 9.03 9.384 9.783 10.137 10.513 10.912 11.346 11.783 12.256 12.809 13.354 13.974 14.64 15.337 15.997 16.643 17.113 17.093 16.237 15.193 14.125 13.107 12.167 11.308 10.477 9.748 9.035 8.405 7.834 7.27 6.759 6.294 5.871 5.434 5.015 4.643 4.262 3.851 3.512 3.169 2.805 2.519 2.24 1.947 1.624 1.291 1.058 0.825 0.468 0.232 -0.016 -0.158 -0.458 -0.754 -1.056 -1.219 -1.603 -1.831 -2.043 -2.255 -2.762 -3.051 -3.362 -3.709 -4.092 -4.569 -5.232 -7.833 -3 ,3505 ,KEBNE ,16657160,Tue Nov 23 02:30:29 CET,Tue Nov 23 04:00:42 CET,0.0 1.31 1.738 2.025 2.285 2.518 2.728 2.932 3.298 3.463 3.618 3.725 4.06 4.2 4.474 4.737 4.994 5.114 5.327 5.535 5.829 6.021 6.212 6.475 6.72 6.973 7.229 7.461 7.764 8.065 8.356 8.693 9.014 9.328 9.688 10.092 10.461 10.848 11.28 11.756 12.222 12.727 13.307 13.862 14.461 15.127 15.891 16.622 17.376 17.971 17.984 17.198 16.144 15.065 14.067 13.094 12.22 11.395 10.589 9.773 9.087 8.48 7.895 7.333 6.799 6.311 5.817 5.37 4.984 4.586 4.157 3.791 3.412 3.03 2.731 2.423 2.11 1.788 1.444 1.201 0.946 0.532 0.24 -0.064 -0.207 -0.484 -0.797 -1.17 -1.361 -1.726 -1.91 -2.144 -2.394 -2.892 -3.16 -3.454 -3.799 -4.261 -4.857 -5.642 -8.511 -4 ,7976 ,KEBNE ,16657161,Tue Nov 23 02:30:27 CET,Tue Nov 23 04:06:43 CET,0.0 1.948 2.465 2.85 3.176 3.46 3.704 3.921 4.296 4.473 4.64 4.736 5.068 5.206 5.475 5.724 5.96 6.074 6.292 6.499 6.822 7.039 7.228 7.491 7.762 8.036 8.288 8.513 8.801 9.088 9.367 9.686 9.992 10.3 10.654 11.05 11.429 11.835 12.28 12.747 13.203 13.694 14.281 14.885 15.553 16.277 17.024 17.718 18.482 19.122 19.327 18.693 17.668 16.634 15.649 14.661 13.753 12.917 12.185 11.479 10.869 10.31 9.758 9.223 8.719 8.279 7.813 7.379 7.01 6.641 6.262 5.923 5.558 5.182 4.888 4.569 4.239 3.898 3.54 3.306 3.062 2.657 2.372 2.086 1.938 1.631 1.308 0.962 0.777 0.378 0.147 -0.084 -0.333 -0.861 -1.168 -1.526 -1.915 -2.342 -2.856 -3.555 -6.146 -5 ,27686 ,KEBNE ,16657162,Tue Nov 23 02:30:28 CET,Tue Nov 23 03:59:05 CET,0.0 0.939 1.313 1.623 1.879 2.1 2.301 2.498 2.832 2.978 3.141 3.256 3.582 3.707 3.933 4.157 4.387 4.496 4.706 4.921 5.237 5.422 5.598 5.849 6.088 6.318 6.538 6.767 7.058 7.324 7.579 7.891 8.194 8.479 8.804 9.155 9.486 9.868 10.281 10.709 11.142 11.631 12.203 12.725 13.319 13.984 14.674 15.316 15.899 16.386 16.525 15.753 14.684 13.636 12.582 11.564 10.637 9.831 9.137 8.41 7.764 7.164 6.603 6.076 5.633 5.223 4.756 4.339 3.957 3.577 3.173 2.823 2.475 2.105 1.803 1.497 1.204 0.88 0.543 0.314 0.081 -0.275 -0.545 -0.841 -0.993 -1.289 -1.648 -2.033 -2.215 -2.58 -2.739 -2.955 -3.181 -3.683 -3.99 -4.305 -4.648 -5.064 -5.552 -6.242 -9.211 -6 ,7234 ,KEBNE ,16657163,Tue Nov 23 02:31:32 CET,Tue Nov 23 04:00:42 CET,0.0 0.988 1.383 1.698 1.97 2.237 2.467 2.665 3.026 3.193 3.342 3.416 3.735 3.863 4.092 4.296 4.499 4.598 4.795 4.99 5.278 5.458 5.627 5.878 6.118 6.355 6.586 6.795 7.077 7.356 7.606 7.906 8.197 8.483 8.807 9.163 9.52 9.9 10.307 10.751 11.216 11.721 12.283 12.825 13.424 14.072 14.751 15.429 16.127 16.669 16.747 16.095 15.163 14.184 13.223 12.31 11.478 10.703 10.033 9.352 8.754 8.205 7.69 7.194 6.685 6.242 5.8 5.392 5.015 4.598 4.191 3.879 3.544 3.182 2.916 2.641 2.343 2.031 1.698 1.463 1.237 0.887 0.631 0.362 0.223 -0.064 -0.36 -0.688 -0.863 -1.228 -1.39 -1.573 -1.764 -2.269 -2.573 -2.864 -3.167 -3.541 -4.006 -4.608 -6.4 -7 ,19120 ,KEBNE ,16657164,Tue Nov 23 02:31:29 CET,Tue Nov 23 04:00:57 CET,0.0 0.926 1.372 1.657 1.91 2.145 2.339 2.512 2.835 3.004 3.169 3.295 3.63 3.763 4.029 4.267 4.496 4.602 4.8 4.992 5.271 5.439 5.604 5.846 6.076 6.309 6.533 6.755 7.05 7.319 7.572 7.889 8.192 8.471 8.781 9.138 9.513 9.928 10.327 10.737 11.193 11.704 12.269 12.82 13.429 14.085 14.773 15.393 15.993 16.386 16.228 15.43 14.446 13.438 12.425 11.438 10.54 9.684 8.923 8.162 7.482 6.883 6.332 5.806 5.307 4.852 4.386 3.973 3.619 3.243 2.835 2.503 2.162 1.808 1.528 1.235 0.924 0.586 0.244 0.006 -0.248 -0.649 -0.923 -1.199 -1.343 -1.649 -1.966 -2.313 -2.512 -2.907 -3.122 -3.348 -3.601 -4.151 -4.47 -4.812 -5.168 -5.599 -6.117 -6.736 -9.103 -8 ,22421 ,KEBNE ,16657165,Tue Nov 23 02:31:29 CET,Tue Nov 23 04:02:01 CET,0.0 1.342 1.797 2.116 2.385 2.62 2.833 3.019 3.376 3.551 3.721 3.842 4.181 4.332 4.623 4.885 5.119 5.235 5.46 5.67 5.984 6.185 6.369 6.632 6.887 7.132 7.375 7.61 7.909 8.198 8.465 8.768 9.077 9.378 9.715 10.105 10.478 10.861 11.277 11.752 12.227 12.766 13.389 13.962 14.605 15.283 15.992 16.719 17.485 18.191 18.462 17.914 17.054 16.057 15.062 14.111 13.228 12.421 11.705 10.967 10.311 9.713 9.164 8.631 8.122 7.68 7.205 6.762 6.392 6.014 5.617 5.289 4.95 4.587 4.301 4.025 3.744 3.446 3.131 2.916 2.689 2.326 2.08 1.815 1.683 1.405 1.101 0.777 0.598 0.233 0.08 -0.111 -0.33 -0.871 -1.177 -1.488 -1.812 -2.182 -2.598 -3.177 -5.541 -9 ,19414 ,KEBNE ,16657166,Tue Nov 23 02:32:32 CET,Tue Nov 23 04:03:12 CET,0.0 1.4 1.787 2.077 2.334 2.557 2.76 2.941 3.284 3.464 3.629 3.72 4.047 4.185 4.464 4.706 4.929 5.038 5.249 5.462 5.763 5.949 6.143 6.428 6.669 6.898 7.133 7.356 7.633 7.892 8.138 8.455 8.759 9.032 9.342 9.706 10.05 10.432 10.864 11.31 11.733 12.191 12.745 13.286 13.905 14.595 15.299 15.972 16.59 17.079 17.17 16.568 15.679 14.671 13.666 12.76 11.957 11.204 10.554 9.867 9.255 8.721 8.221 7.746 7.284 6.833 6.363 5.96 5.618 5.256 4.88 4.575 4.254 3.915 3.645 3.359 3.062 2.765 2.466 2.246 2.005 1.638 1.377 1.095 0.954 0.656 0.332 -0.003 -0.175 -0.548 -0.724 -0.932 -1.151 -1.589 -1.86 -2.202 -2.552 -2.931 -3.405 -4.047 -6.224 -10 ,12650 ,KEBNE ,16657167,Tue Nov 23 02:32:32 CET,Tue Nov 23 04:03:07 CET,0.0 1.12 1.552 1.858 2.111 2.358 2.579 2.785 3.17 3.332 3.477 3.573 3.903 4.03 4.268 4.501 4.735 4.846 5.052 5.251 5.53 5.719 5.919 6.175 6.4 6.64 6.878 7.097 7.377 7.65 7.918 8.237 8.535 8.814 9.127 9.473 9.805 10.183 10.595 11.033 11.475 11.939 12.454 12.972 13.569 14.207 14.923 15.624 16.29 16.864 17.038 16.565 15.755 14.771 13.788 12.796 11.883 11.071 10.373 9.649 9.012 8.464 7.947 7.458 7.008 6.582 6.114 5.677 5.293 4.895 4.476 4.131 3.77 3.39 3.092 2.78 2.444 2.088 1.723 1.472 1.215 0.802 0.503 0.192 0.034 -0.297 -0.644 -0.995 -1.182 -1.582 -1.828 -2.042 -2.281 -2.864 -3.166 -3.486 -3.858 -4.269 -4.755 -5.421 -7.138 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt deleted file mode 100644 index 183f19c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5615 ,KEBNE ,17023591,Wed Dec 22 08:18:01 CET,Wed Dec 22 09:52:32 CET,0.0 3.332 3.959 4.374 4.736 5.066 5.386 5.666 6.152 6.383 6.611 6.831 7.203 7.378 7.71 8.034 8.337 8.469 8.737 8.993 9.344 9.576 9.806 10.146 10.469 10.774 11.058 11.34 11.71 12.043 12.359 12.742 13.112 13.466 13.881 14.359 14.821 15.315 15.851 16.407 16.967 17.587 18.3 18.994 19.738 20.513 21.391 22.295 23.123 23.837 24.236 23.871 23.085 22.208 21.375 20.509 19.668 18.896 18.232 17.548 16.926 16.344 15.79 15.285 14.809 14.382 13.939 13.531 13.184 12.826 12.437 12.1 11.748 11.366 11.072 10.78 10.464 10.142 9.811 9.564 9.304 8.94 8.681 8.374 8.218 7.91 7.589 7.26 7.088 6.717 6.525 6.314 6.087 5.575 5.289 4.973 4.635 4.227 3.665 2.883 -0.852 -2 ,32659 ,KEBNE ,17023592,Wed Dec 22 08:18:05 CET,Wed Dec 22 09:52:30 CET,0.0 2.69 3.345 3.838 4.238 4.574 4.884 5.197 5.778 6.035 6.273 6.489 6.875 7.065 7.438 7.788 8.082 8.221 8.49 8.755 9.122 9.351 9.584 9.924 10.24 10.527 10.812 11.099 11.463 11.809 12.14 12.531 12.901 13.249 13.64 14.075 14.497 14.978 15.491 16.004 16.51 17.056 17.7 18.321 18.984 19.692 20.497 21.305 22.083 22.797 23.203 22.842 22.031 21.195 20.405 19.598 18.841 18.106 17.449 16.811 16.248 15.734 15.247 14.791 14.358 13.963 13.545 13.157 12.812 12.434 12.028 11.685 11.327 10.969 10.696 10.404 10.097 9.775 9.434 9.192 8.945 8.572 8.3 8.003 7.86 7.575 7.262 6.936 6.761 6.373 6.168 5.955 5.718 5.217 4.937 4.619 4.241 3.765 3.175 2.363 -2.02 -3 ,15329 ,KEBNE ,17023593,Wed Dec 22 08:18:01 CET,Wed Dec 22 09:52:29 CET,0.0 3.692 4.46 4.974 5.367 5.721 6.039 6.314 6.794 7.033 7.281 7.528 7.918 8.118 8.496 8.839 9.145 9.297 9.586 9.856 10.264 10.522 10.753 11.08 11.415 11.741 12.045 12.333 12.699 13.056 13.384 13.756 14.118 14.468 14.894 15.346 15.746 16.193 16.678 17.182 17.686 18.226 18.864 19.493 20.151 20.844 21.611 22.392 23.113 23.633 23.83 23.319 22.479 21.604 20.727 19.893 19.137 18.432 17.804 17.15 16.566 16.047 15.56 15.085 14.636 14.232 13.821 13.451 13.125 12.776 12.402 12.094 11.759 11.39 11.1 10.794 10.502 10.209 9.867 9.631 9.384 8.999 8.751 8.466 8.304 7.983 7.641 7.263 7.075 6.684 6.442 6.217 5.959 5.364 5.032 4.672 4.271 3.816 3.285 2.565 -0.75 -4 ,25233 ,KEBNE ,17023594,Wed Dec 22 08:18:01 CET,Wed Dec 22 09:52:19 CET,0.0 2.736 3.433 3.942 4.34 4.662 4.948 5.214 5.719 5.946 6.163 6.381 6.76 6.942 7.278 7.603 7.919 8.064 8.334 8.6 8.984 9.215 9.434 9.76 10.073 10.375 10.673 10.954 11.291 11.63 11.971 12.379 12.775 13.151 13.572 14.042 14.493 14.973 15.489 16.058 16.623 17.208 17.921 18.639 19.466 20.336 21.162 21.966 22.849 23.655 24.148 23.79 23.003 22.143 21.304 20.458 19.643 18.917 18.276 17.624 17.079 16.587 16.11 15.644 15.194 14.752 14.275 13.879 13.54 13.185 12.799 12.466 12.126 11.779 11.5 11.221 10.94 10.629 10.3 10.062 9.819 9.464 9.219 8.959 8.829 8.549 8.218 7.843 7.648 7.258 7.074 6.878 6.674 6.187 5.892 5.562 5.197 4.77 4.277 3.597 0.453 -5 ,5868 ,KEBNE ,17023595,Wed Dec 22 08:18:01 CET,Wed Dec 22 09:52:05 CET,0.0 2.182 2.894 3.416 3.812 4.15 4.434 4.694 5.189 5.416 5.627 5.825 6.193 6.362 6.695 7.015 7.309 7.448 7.722 7.991 8.373 8.624 8.87 9.218 9.559 9.877 10.175 10.45 10.793 11.143 11.496 11.905 12.265 12.601 13.003 13.466 13.894 14.347 14.846 15.359 15.883 16.463 17.105 17.696 18.341 19.024 19.752 20.492 21.228 21.885 22.125 21.615 20.833 20.002 19.203 18.451 17.708 16.96 16.329 15.68 15.103 14.571 14.051 13.573 13.132 12.713 12.267 11.88 11.553 11.194 10.81 10.494 10.151 9.808 9.525 9.21 8.908 8.615 8.294 8.058 7.828 7.466 7.193 6.91 6.773 6.497 6.184 5.824 5.641 5.264 5.085 4.873 4.618 4.068 3.789 3.459 3.043 2.566 1.995 1.169 -2.098 -6 ,21661 ,KEBNE ,17023596,Wed Dec 22 08:18:01 CET,Wed Dec 22 09:52:31 CET,0.0 3.0 3.705 4.254 4.707 5.077 5.382 5.685 6.229 6.45 6.667 6.897 7.288 7.473 7.808 8.125 8.422 8.576 8.895 9.195 9.599 9.851 10.111 10.48 10.801 11.113 11.431 11.732 12.112 12.471 12.811 13.208 13.589 13.967 14.392 14.868 15.328 15.806 16.297 16.825 17.381 17.987 18.685 19.347 20.075 20.886 21.787 22.68 23.548 24.379 24.816 24.439 23.694 22.868 22.02 21.188 20.394 19.639 18.976 18.306 17.748 17.237 16.723 16.217 15.742 15.307 14.836 14.414 14.056 13.67 13.249 12.907 12.566 12.211 11.929 11.641 11.334 11.015 10.686 10.449 10.197 9.81 9.549 9.264 9.107 8.781 8.431 8.061 7.87 7.481 7.287 7.072 6.847 6.32 6.022 5.698 5.314 4.861 4.36 3.755 0.555 -7 ,19351 ,KEBNE ,17023597,Wed Dec 22 08:18:01 CET,Wed Dec 22 09:52:16 CET,0.0 2.679 3.363 3.899 4.35 4.696 5.008 5.301 5.816 6.037 6.231 6.397 6.763 6.942 7.286 7.597 7.891 8.03 8.301 8.55 8.915 9.136 9.354 9.703 10.032 10.343 10.644 10.933 11.297 11.655 12.003 12.402 12.792 13.174 13.602 14.088 14.544 15.028 15.555 16.098 16.652 17.291 18.031 18.751 19.543 20.36 21.211 22.052 22.947 23.784 24.222 23.848 23.043 22.126 21.259 20.362 19.512 18.702 17.97 17.238 16.602 16.061 15.571 15.114 14.689 14.301 13.865 13.447 13.069 12.688 12.312 12.006 11.678 11.306 11.022 10.726 10.412 10.087 9.741 9.509 9.263 8.855 8.573 8.284 8.139 7.835 7.526 7.202 7.018 6.629 6.42 6.179 5.93 5.405 5.119 4.806 4.43 4.017 3.538 2.952 0.172 -8 ,11035 ,KEBNE ,17023598,Wed Dec 22 08:18:01 CET,Wed Dec 22 09:52:34 CET,0.0 3.97 4.626 5.131 5.558 5.909 6.238 6.538 7.117 7.372 7.588 7.807 8.194 8.374 8.698 9.008 9.314 9.468 9.771 10.058 10.466 10.709 10.94 11.272 11.585 11.883 12.159 12.428 12.801 13.178 13.536 13.945 14.308 14.652 15.056 15.511 15.945 16.413 16.916 17.463 18.032 18.646 19.295 19.911 20.632 21.387 22.183 22.968 23.693 24.266 24.404 23.996 23.341 22.503 21.687 20.927 20.212 19.502 18.841 18.179 17.625 17.089 16.553 16.08 15.642 15.227 14.799 14.411 14.065 13.711 13.334 13.008 12.664 12.322 12.071 11.81 11.52 11.2 10.869 10.638 10.404 10.045 9.798 9.545 9.406 9.12 8.812 8.483 8.305 7.91 7.704 7.497 7.259 6.751 6.497 6.218 5.898 5.508 5.042 4.394 2.168 -9 ,9546 ,KEBNE ,17023599,Wed Dec 22 08:19:02 CET,Wed Dec 22 09:54:43 CET,0.0 2.429 3.143 3.668 4.094 4.419 4.712 4.991 5.505 5.735 5.98 6.24 6.619 6.8 7.16 7.511 7.832 7.979 8.271 8.56 8.967 9.208 9.441 9.803 10.133 10.462 10.803 11.114 11.493 11.849 12.183 12.579 12.957 13.318 13.742 14.216 14.675 15.191 15.726 16.259 16.795 17.397 18.08 18.742 19.502 20.323 21.161 21.975 22.768 23.515 23.972 23.655 23.011 22.152 21.249 20.398 19.59 18.829 18.133 17.406 16.762 16.188 15.641 15.094 14.596 14.142 13.637 13.183 12.793 12.402 12.002 11.664 11.307 10.925 10.628 10.326 10.019 9.71 9.37 9.139 8.902 8.513 8.245 7.975 7.835 7.52 7.201 6.869 6.687 6.305 6.12 5.921 5.682 5.104 4.789 4.484 4.161 3.779 3.302 2.656 -0.938 -10 ,2276 ,KEBNE ,17023600,Wed Dec 22 08:19:03 CET,Wed Dec 22 09:55:24 CET,0.0 3.401 4.057 4.558 4.978 5.326 5.631 5.9 6.373 6.608 6.824 7.015 7.39 7.573 7.915 8.227 8.542 8.692 8.988 9.258 9.629 9.873 10.103 10.432 10.742 11.043 11.337 11.621 11.965 12.288 12.6 12.98 13.366 13.744 14.177 14.653 15.089 15.547 16.054 16.596 17.135 17.736 18.447 19.138 19.886 20.667 21.523 22.41 23.274 24.018 24.38 23.818 22.873 21.876 20.915 20.005 19.179 18.42 17.733 17.003 16.366 15.792 15.241 14.728 14.241 13.784 13.306 12.879 12.509 12.127 11.736 11.394 11.051 10.686 10.386 10.083 9.771 9.45 9.118 8.881 8.626 8.241 7.972 7.674 7.519 7.207 6.863 6.494 6.304 5.912 5.709 5.496 5.251 4.713 4.418 4.099 3.756 3.358 2.862 2.192 -0.305 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt deleted file mode 100644 index 0ce83d83..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6115 ,KEBNE ,16657168,Tue Nov 23 02:32:32 CET,Tue Nov 23 04:03:39 CET,0.0 0.808 1.182 1.493 1.787 2.034 2.244 2.448 2.81 2.97 3.124 3.199 3.505 3.618 3.849 4.072 4.279 4.373 4.554 4.74 5.02 5.2 5.369 5.622 5.867 6.097 6.314 6.52 6.793 7.064 7.324 7.629 7.928 8.209 8.516 8.875 9.234 9.615 10.0 10.399 10.794 11.244 11.785 12.282 12.802 13.366 13.996 14.603 15.139 15.571 15.71 15.32 14.689 14.008 13.377 12.725 12.095 11.513 10.976 10.432 9.976 9.542 9.098 8.668 8.284 7.952 7.58 7.228 6.916 6.597 6.27 5.994 5.716 5.43 5.198 4.967 4.745 4.502 4.241 4.052 3.846 3.534 3.304 3.059 2.939 2.679 2.398 2.123 1.972 1.611 1.459 1.277 1.103 0.734 0.51 0.266 -0.014 -0.336 -0.748 -1.235 -2.849 -2 ,8604 ,KEBNE ,16657169,Tue Nov 23 02:32:31 CET,Tue Nov 23 04:02:55 CET,0.0 1.717 2.161 2.486 2.758 3.007 3.235 3.432 3.774 3.939 4.091 4.184 4.519 4.657 4.918 5.167 5.402 5.51 5.719 5.92 6.198 6.376 6.55 6.787 7.009 7.217 7.426 7.627 7.892 8.162 8.405 8.705 8.988 9.235 9.525 9.857 10.179 10.524 10.883 11.266 11.661 12.087 12.561 13.029 13.549 14.093 14.687 15.312 15.937 16.435 16.653 16.267 15.591 14.877 14.204 13.54 12.879 12.234 11.646 11.058 10.552 10.079 9.636 9.24 8.852 8.464 8.054 7.684 7.359 7.018 6.665 6.372 6.072 5.77 5.526 5.266 4.992 4.716 4.44 4.245 4.04 3.712 3.486 3.261 3.142 2.895 2.623 2.312 2.152 1.794 1.634 1.444 1.244 0.793 0.526 0.245 -0.044 -0.378 -0.784 -1.29 -2.935 -3 ,2175 ,KEBNE ,16657170,Tue Nov 23 02:32:31 CET,Tue Nov 23 04:02:42 CET,0.0 1.275 1.693 2.019 2.298 2.535 2.741 2.914 3.204 3.346 3.487 3.549 3.865 3.989 4.224 4.459 4.69 4.795 4.989 5.167 5.434 5.618 5.799 6.057 6.294 6.51 6.724 6.928 7.182 7.443 7.697 7.992 8.254 8.506 8.803 9.122 9.444 9.813 10.224 10.657 11.056 11.476 11.959 12.431 12.946 13.492 14.088 14.7 15.326 15.891 16.098 15.522 14.855 14.233 13.601 12.952 12.292 11.654 11.116 10.634 10.21 9.782 9.366 8.975 8.617 8.264 7.867 7.505 7.185 6.859 6.534 6.278 5.987 5.681 5.452 5.224 4.986 4.727 4.453 4.26 4.068 3.776 3.57 3.34 3.216 2.969 2.716 2.413 2.252 1.907 1.768 1.589 1.4 0.986 0.769 0.522 0.239 -0.103 -0.551 -1.121 -2.693 -4 ,24413 ,KEBNE ,16657171,Tue Nov 23 02:33:35 CET,Tue Nov 23 04:02:29 CET,0.0 1.585 2.008 2.346 2.591 2.812 3.038 3.235 3.578 3.734 3.885 3.964 4.289 4.413 4.635 4.856 5.074 5.176 5.373 5.558 5.837 6.022 6.185 6.415 6.639 6.854 7.067 7.273 7.527 7.783 8.037 8.338 8.628 8.911 9.226 9.563 9.885 10.23 10.601 10.986 11.367 11.79 12.292 12.783 13.309 13.845 14.452 15.086 15.677 16.208 16.417 15.965 15.229 14.453 13.714 13.011 12.374 11.776 11.259 10.716 10.227 9.78 9.33 8.907 8.522 8.148 7.752 7.404 7.105 6.815 6.496 6.218 5.937 5.654 5.44 5.213 4.968 4.709 4.436 4.242 4.044 3.731 3.519 3.298 3.172 2.918 2.654 2.355 2.204 1.866 1.726 1.542 1.355 0.889 0.616 0.347 0.075 -0.249 -0.676 -1.233 -2.852 -5 ,28951 ,KEBNE ,16657172,Tue Nov 23 02:33:35 CET,Tue Nov 23 04:04:16 CET,0.0 1.194 1.557 1.884 2.154 2.387 2.626 2.831 3.161 3.317 3.47 3.555 3.889 4.028 4.268 4.491 4.717 4.828 5.039 5.246 5.547 5.738 5.921 6.173 6.395 6.616 6.845 7.062 7.321 7.571 7.819 8.117 8.413 8.701 9.033 9.4 9.752 10.145 10.54 10.979 11.453 11.942 12.467 12.946 13.459 14.035 14.637 15.218 15.803 16.265 16.469 16.189 15.594 14.913 14.23 13.547 12.917 12.297 11.745 11.177 10.683 10.238 9.812 9.424 9.065 8.715 8.323 7.98 7.69 7.392 7.067 6.797 6.523 6.239 6.013 5.766 5.509 5.244 4.976 4.792 4.601 4.321 4.117 3.892 3.774 3.523 3.256 2.978 2.83 2.468 2.327 2.154 1.971 1.58 1.352 1.098 0.816 0.524 0.195 -0.246 -1.496 -6 ,10744 ,KEBNE ,16657173,Tue Nov 23 02:33:35 CET,Tue Nov 23 04:04:15 CET,0.0 1.059 1.423 1.721 1.96 2.175 2.354 2.514 2.846 3.005 3.153 3.218 3.52 3.63 3.878 4.115 4.327 4.426 4.623 4.825 5.094 5.254 5.424 5.698 5.946 6.171 6.399 6.613 6.874 7.125 7.381 7.691 7.968 8.237 8.554 8.896 9.207 9.55 9.914 10.285 10.662 11.099 11.626 12.125 12.664 13.219 13.813 14.432 14.989 15.432 15.678 15.409 14.839 14.096 13.412 12.791 12.174 11.564 11.016 10.508 10.07 9.652 9.252 8.861 8.466 8.086 7.711 7.386 7.089 6.777 6.446 6.156 5.861 5.553 5.308 5.035 4.763 4.513 4.243 4.055 3.857 3.517 3.272 3.028 2.906 2.637 2.344 2.029 1.88 1.537 1.405 1.226 1.028 0.639 0.433 0.169 -0.172 -0.575 -1.056 -1.632 -3.29 -7 ,30431 ,KEBNE ,16657174,Tue Nov 23 02:33:35 CET,Tue Nov 23 04:03:48 CET,0.0 1.073 1.474 1.79 2.073 2.309 2.509 2.687 3.002 3.159 3.31 3.394 3.715 3.836 4.085 4.336 4.563 4.671 4.874 5.065 5.326 5.486 5.648 5.879 6.094 6.311 6.525 6.731 6.989 7.232 7.461 7.741 8.027 8.307 8.629 8.968 9.289 9.647 10.034 10.445 10.871 11.36 11.916 12.444 13.046 13.666 14.318 14.979 15.571 16.007 16.223 15.958 15.398 14.689 13.958 13.266 12.663 12.089 11.545 10.969 10.47 10.033 9.601 9.176 8.78 8.409 8.019 7.685 7.397 7.104 6.805 6.542 6.255 5.942 5.715 5.487 5.218 4.939 4.673 4.495 4.295 3.984 3.776 3.534 3.403 3.153 2.895 2.643 2.508 2.158 2.013 1.83 1.645 1.202 0.945 0.71 0.437 0.093 -0.312 -0.885 -2.828 -9 ,11482 ,KEBNE ,16657176,Tue Nov 23 02:33:35 CET,Tue Nov 23 04:04:35 CET,0.0 1.455 1.882 2.199 2.468 2.717 2.939 3.132 3.51 3.691 3.841 3.92 4.238 4.366 4.632 4.876 5.107 5.208 5.402 5.621 5.95 6.148 6.326 6.581 6.831 7.072 7.298 7.513 7.786 8.054 8.316 8.623 8.906 9.172 9.485 9.819 10.128 10.492 10.892 11.292 11.703 12.15 12.653 13.165 13.769 14.403 15.01 15.605 16.283 16.923 17.184 16.731 16.031 15.249 14.534 13.846 13.157 12.485 11.904 11.347 10.873 10.426 9.988 9.56 9.155 8.801 8.414 8.05 7.736 7.429 7.108 6.856 6.608 6.328 6.104 5.876 5.642 5.395 5.122 4.936 4.747 4.437 4.223 3.995 3.874 3.614 3.327 3.039 2.884 2.526 2.382 2.193 1.989 1.547 1.311 1.043 0.734 0.381 -0.093 -0.767 -3.185 -10 ,11899 ,KEBNE ,16657177,Tue Nov 23 02:33:35 CET,Tue Nov 23 04:03:02 CET,0.0 1.031 1.433 1.729 2.019 2.287 2.498 2.697 3.096 3.26 3.403 3.494 3.836 3.976 4.233 4.46 4.656 4.752 4.945 5.136 5.402 5.579 5.748 5.971 6.187 6.408 6.621 6.823 7.09 7.347 7.583 7.878 8.173 8.456 8.773 9.105 9.435 9.791 10.157 10.542 10.938 11.371 11.859 12.325 12.844 13.4 13.997 14.665 15.328 15.805 15.996 15.639 15.044 14.371 13.655 12.933 12.253 11.616 11.055 10.488 9.999 9.535 9.105 8.704 8.314 7.962 7.605 7.268 6.956 6.642 6.321 6.033 5.729 5.427 5.202 4.97 4.721 4.445 4.141 3.942 3.736 3.423 3.204 2.961 2.838 2.589 2.348 2.102 1.97 1.634 1.511 1.341 1.153 0.724 0.495 0.261 0.008 -0.302 -0.673 -1.173 -3.419 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 8abda344..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30838 ,KEBNE ,16657178,Tue Nov 23 02:33:34 CET,Tue Nov 23 04:01:43 CET,0.0 0.512 0.894 1.188 1.446 1.673 1.89 2.301 2.467 2.621 2.757 3.027 3.141 3.389 3.651 3.891 4.0 4.212 4.405 4.668 4.835 4.989 5.186 5.368 5.543 5.716 5.882 6.087 6.292 6.489 6.718 6.918 7.111 7.335 7.58 7.802 8.037 8.298 8.552 8.781 9.017 9.268 9.524 9.761 9.926 10.093 10.174 10.061 9.612 8.339 6.468 4.841 3.398 2.062 0.824 -0.29 -1.311 -2.184 -3.067 -3.836 -4.512 -5.139 -5.741 -6.331 -6.895 -7.487 -8.001 -8.433 -8.877 -9.343 -9.729 -10.111 -10.515 -10.835 -11.18 -11.551 -11.932 -12.314 -12.579 -12.869 -13.316 -13.631 -13.974 -14.156 -14.516 -14.902 -15.342 -15.571 -15.966 -16.278 -16.536 -16.806 -17.399 -17.738 -18.093 -18.481 -18.963 -19.638 -20.535 -2 ,31932 ,KEBNE ,16657179,Tue Nov 23 02:33:35 CET,Tue Nov 23 04:03:06 CET,0.0 0.513 0.923 1.281 1.61 1.893 2.139 2.608 2.824 3.016 3.242 3.562 3.717 4.007 4.308 4.608 4.75 5.004 5.25 5.613 5.827 6.017 6.285 6.551 6.829 7.093 7.339 7.671 7.979 8.291 8.664 8.976 9.278 9.633 10.01 10.372 10.772 11.178 11.608 12.052 12.547 13.099 13.618 14.218 14.823 15.4 15.946 16.392 16.517 16.028 14.803 13.359 11.873 10.457 9.161 7.992 6.894 5.94 4.972 4.134 3.392 2.692 2.048 1.429 0.813 0.156 -0.405 -0.866 -1.34 -1.85 -2.281 -2.731 -3.201 -3.576 -3.962 -4.346 -4.732 -5.147 -5.439 -5.722 -6.162 -6.49 -6.83 -7.002 -7.353 -7.713 -8.108 -8.317 -8.719 -9.098 -9.384 -9.672 -10.28 -10.638 -11.022 -11.465 -11.978 -12.68 -13.741 -3 ,29332 ,KEBNE ,16657180,Tue Nov 23 02:33:35 CET,Tue Nov 23 04:03:15 CET,0.0 0.545 0.978 1.385 1.743 2.049 2.313 2.807 3.035 3.226 3.407 3.709 3.868 4.174 4.46 4.74 4.875 5.136 5.388 5.715 5.911 6.114 6.4 6.665 6.926 7.172 7.397 7.684 7.969 8.245 8.57 8.884 9.202 9.55 9.911 10.266 10.656 11.057 11.476 11.936 12.432 12.928 13.37 13.823 14.254 14.695 15.072 15.341 15.449 14.977 13.621 12.101 10.617 9.229 7.969 6.792 5.628 4.635 3.677 2.845 2.088 1.379 0.721 0.095 -0.5 -1.133 -1.706 -2.195 -2.699 -3.191 -3.576 -3.979 -4.397 -4.743 -5.105 -5.461 -5.83 -6.224 -6.495 -6.783 -7.228 -7.545 -7.882 -8.056 -8.415 -8.794 -9.203 -9.42 -9.817 -10.136 -10.38 -10.632 -11.227 -11.566 -11.938 -12.399 -12.869 -13.354 -14.078 -4 ,8334 ,KEBNE ,16657181,Tue Nov 23 02:34:38 CET,Tue Nov 23 04:04:11 CET,0.0 0.605 1.045 1.394 1.715 2.013 2.276 2.742 2.935 3.11 3.315 3.624 3.785 4.115 4.434 4.72 4.845 5.085 5.322 5.645 5.848 6.041 6.316 6.574 6.822 7.066 7.301 7.584 7.849 8.106 8.411 8.702 8.991 9.335 9.699 10.034 10.391 10.779 11.198 11.644 12.13 12.633 13.102 13.621 14.108 14.605 15.172 15.663 15.803 15.28 13.984 12.511 11.057 9.693 8.378 7.192 6.185 5.303 4.355 3.507 2.718 1.956 1.296 0.741 0.212 -0.368 -0.882 -1.33 -1.805 -2.299 -2.704 -3.109 -3.532 -3.877 -4.227 -4.575 -4.944 -5.35 -5.64 -5.942 -6.399 -6.713 -7.048 -7.224 -7.596 -7.983 -8.408 -8.634 -9.018 -9.313 -9.556 -9.819 -10.424 -10.789 -11.204 -11.668 -12.184 -12.829 -13.719 -5 ,29636 ,KEBNE ,16657182,Tue Nov 23 02:34:37 CET,Tue Nov 23 04:05:11 CET,0.0 0.561 1.003 1.34 1.666 1.962 2.203 2.614 2.802 2.98 3.157 3.455 3.62 3.938 4.229 4.513 4.65 4.9 5.126 5.475 5.7 5.91 6.207 6.48 6.74 6.975 7.204 7.489 7.752 8.012 8.317 8.604 8.906 9.252 9.614 9.952 10.304 10.658 11.017 11.393 11.814 12.245 12.638 13.106 13.569 13.98 14.345 14.626 14.64 14.084 12.756 11.297 9.919 8.709 7.617 6.594 5.657 4.854 4.001 3.243 2.577 1.933 1.319 0.735 0.183 -0.396 -0.906 -1.347 -1.812 -2.297 -2.702 -3.13 -3.565 -3.891 -4.227 -4.599 -4.998 -5.404 -5.689 -5.991 -6.473 -6.81 -7.177 -7.36 -7.718 -8.091 -8.487 -8.702 -9.086 -9.415 -9.679 -9.95 -10.534 -10.87 -11.264 -11.695 -12.175 -12.748 -13.529 -6 ,15307 ,KEBNE ,16657183,Tue Nov 23 02:34:37 CET,Tue Nov 23 04:03:29 CET,0.0 0.586 1.005 1.352 1.638 1.91 2.163 2.614 2.813 3.019 3.255 3.562 3.731 4.05 4.331 4.601 4.739 5.0 5.245 5.585 5.8 5.992 6.257 6.553 6.852 7.106 7.327 7.622 7.908 8.169 8.475 8.785 9.086 9.405 9.772 10.148 10.538 10.908 11.273 11.635 12.042 12.543 13.019 13.516 14.001 14.524 14.987 15.281 15.265 14.524 13.109 11.559 10.05 8.623 7.25 6.042 4.974 4.052 3.122 2.334 1.656 0.999 0.363 -0.226 -0.77 -1.355 -1.884 -2.332 -2.792 -3.279 -3.704 -4.149 -4.607 -4.953 -5.305 -5.673 -6.06 -6.47 -6.758 -7.07 -7.552 -7.9 -8.28 -8.462 -8.817 -9.201 -9.635 -9.87 -10.272 -10.599 -10.864 -11.151 -11.781 -12.131 -12.531 -12.968 -13.44 -13.958 -14.737 -7 ,4559 ,KEBNE ,16657184,Tue Nov 23 02:34:37 CET,Tue Nov 23 04:02:29 CET,0.0 0.583 0.966 1.301 1.616 1.892 2.131 2.573 2.781 2.981 3.196 3.526 3.704 4.027 4.322 4.605 4.743 5.005 5.237 5.54 5.74 5.937 6.241 6.546 6.826 7.099 7.366 7.693 7.988 8.254 8.583 8.905 9.204 9.531 9.892 10.255 10.634 11.01 11.408 11.823 12.248 12.697 13.133 13.609 14.095 14.62 15.11 15.474 15.503 14.906 13.54 12.086 10.635 9.207 7.857 6.664 5.586 4.642 3.706 2.915 2.198 1.492 0.808 0.158 -0.418 -1.022 -1.574 -2.061 -2.563 -3.059 -3.47 -3.921 -4.397 -4.774 -5.158 -5.55 -5.967 -6.389 -6.683 -6.984 -7.445 -7.768 -8.122 -8.304 -8.689 -9.119 -9.567 -9.798 -10.184 -10.47 -10.725 -10.986 -11.552 -11.872 -12.219 -12.644 -13.158 -13.757 -14.584 -8 ,10458 ,KEBNE ,16657185,Tue Nov 23 02:34:37 CET,Tue Nov 23 04:04:18 CET,0.0 0.538 0.96 1.319 1.611 1.852 2.094 2.573 2.789 3.0 3.258 3.579 3.746 4.05 4.34 4.625 4.76 5.021 5.278 5.616 5.819 6.026 6.314 6.584 6.853 7.107 7.338 7.636 7.913 8.164 8.479 8.777 9.055 9.38 9.74 10.067 10.41 10.779 11.158 11.538 11.93 12.361 12.791 13.253 13.681 14.105 14.524 14.855 14.893 14.226 12.82 11.393 9.986 8.643 7.449 6.421 5.437 4.536 3.622 2.894 2.248 1.592 0.988 0.422 -0.112 -0.674 -1.189 -1.649 -2.144 -2.645 -3.047 -3.47 -3.927 -4.289 -4.654 -5.03 -5.436 -5.866 -6.164 -6.464 -6.93 -7.257 -7.585 -7.757 -8.111 -8.478 -8.908 -9.14 -9.529 -9.851 -10.097 -10.362 -10.973 -11.301 -11.678 -12.136 -12.613 -13.151 -13.981 -9 ,3331 ,KEBNE ,16657186,Tue Nov 23 02:34:37 CET,Tue Nov 23 04:03:40 CET,0.0 0.584 1.025 1.399 1.72 2.011 2.272 2.702 2.908 3.116 3.339 3.666 3.837 4.139 4.432 4.695 4.822 5.079 5.322 5.656 5.851 6.044 6.33 6.61 6.874 7.11 7.333 7.613 7.882 8.145 8.468 8.786 9.071 9.382 9.742 10.074 10.419 10.772 11.142 11.521 11.923 12.387 12.84 13.281 13.693 14.152 14.561 14.843 14.866 14.231 12.978 11.63 10.273 9.036 7.911 6.881 5.855 4.955 4.074 3.307 2.613 1.947 1.325 0.743 0.199 -0.386 -0.91 -1.369 -1.866 -2.373 -2.783 -3.227 -3.698 -4.074 -4.474 -4.878 -5.287 -5.721 -6.012 -6.31 -6.813 -7.138 -7.465 -7.64 -7.991 -8.356 -8.76 -8.976 -9.355 -9.669 -9.942 -10.246 -10.913 -11.286 -11.679 -12.081 -12.572 -13.229 -14.068 -10 ,5502 ,KEBNE ,16657187,Tue Nov 23 02:34:37 CET,Tue Nov 23 04:03:24 CET,0.0 0.598 1.037 1.382 1.675 1.952 2.215 2.695 2.906 3.085 3.273 3.582 3.74 4.073 4.391 4.681 4.811 5.063 5.305 5.648 5.869 6.083 6.393 6.674 6.935 7.193 7.446 7.777 8.101 8.393 8.705 8.997 9.285 9.596 9.922 10.242 10.588 10.944 11.313 11.689 12.092 12.538 12.984 13.45 13.853 14.252 14.643 14.953 15.0 14.444 13.169 11.753 10.416 9.212 8.055 6.994 6.016 5.162 4.308 3.545 2.839 2.16 1.509 0.898 0.35 -0.24 -0.773 -1.226 -1.691 -2.172 -2.568 -2.968 -3.392 -3.737 -4.094 -4.473 -4.879 -5.301 -5.582 -5.879 -6.365 -6.715 -7.082 -7.276 -7.678 -8.085 -8.559 -8.805 -9.216 -9.584 -9.862 -10.161 -10.819 -11.175 -11.558 -11.997 -12.521 -13.203 -14.088 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index 3d3f5bbc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13229 ,KEBNE ,16657188,Tue Nov 23 02:34:37 CET,Tue Nov 23 04:04:03 CET,0.0 2.826 3.363 3.769 4.085 4.34 4.57 4.776 5.143 5.31 5.469 5.638 5.943 6.095 6.38 6.663 6.949 7.084 7.337 7.581 7.902 8.107 8.309 8.601 8.885 9.145 9.386 9.62 9.934 10.234 10.531 10.901 11.24 11.568 11.953 12.393 12.809 13.245 13.701 14.178 14.66 15.178 15.78 16.385 17.075 17.81 18.633 19.486 20.352 21.163 21.765 21.67 21.194 20.577 19.941 19.33 18.713 18.118 17.546 16.901 16.357 15.89 15.452 15.036 14.644 14.296 13.919 13.558 13.24 12.911 12.571 12.286 11.977 11.66 11.405 11.102 10.786 10.487 10.18 9.957 9.717 9.374 9.16 8.936 8.817 8.566 8.294 7.999 7.833 7.5 7.251 7.054 6.856 6.418 6.174 5.905 5.552 5.157 4.747 4.218 2.111 -2 ,10646 ,KEBNE ,16657189,Tue Nov 23 02:34:38 CET,Tue Nov 23 04:02:57 CET,0.0 1.895 2.388 2.757 3.064 3.328 3.571 3.799 4.221 4.428 4.636 4.88 5.2 5.368 5.69 5.985 6.247 6.373 6.643 6.914 7.286 7.507 7.713 8.004 8.276 8.554 8.815 9.056 9.371 9.67 9.969 10.369 10.769 11.124 11.489 11.893 12.282 12.686 13.143 13.619 14.115 14.73 15.424 16.08 16.791 17.507 18.299 19.162 20.051 20.848 21.35 21.224 20.74 20.128 19.492 18.851 18.231 17.64 17.108 16.49 15.937 15.461 15.008 14.583 14.197 13.84 13.446 13.094 12.782 12.437 12.079 11.763 11.407 11.048 10.786 10.491 10.171 9.864 9.555 9.343 9.119 8.754 8.508 8.252 8.118 7.843 7.543 7.21 7.022 6.684 6.457 6.25 6.04 5.597 5.361 5.11 4.812 4.466 4.006 3.391 0.652 -3 ,3241 ,KEBNE ,16657190,Tue Nov 23 02:34:37 CET,Tue Nov 23 04:04:47 CET,0.0 1.971 2.531 2.89 3.192 3.44 3.65 3.864 4.293 4.498 4.691 4.895 5.207 5.362 5.657 5.936 6.208 6.337 6.573 6.796 7.096 7.286 7.473 7.746 8.021 8.288 8.545 8.783 9.096 9.421 9.738 10.092 10.402 10.71 11.065 11.457 11.858 12.292 12.739 13.211 13.685 14.186 14.795 15.432 16.104 16.778 17.554 18.417 19.255 19.995 20.528 20.414 19.933 19.371 18.764 18.12 17.499 16.926 16.407 15.832 15.35 14.924 14.496 14.083 13.684 13.31 12.923 12.552 12.205 11.844 11.459 11.132 10.787 10.438 10.191 9.931 9.653 9.392 9.128 8.933 8.726 8.394 8.152 7.892 7.761 7.495 7.227 6.942 6.789 6.475 6.254 6.068 5.864 5.427 5.207 4.957 4.652 4.328 3.945 3.43 -0.002 -4 ,26312 ,KEBNE ,16657191,Tue Nov 23 02:34:37 CET,Tue Nov 23 04:04:07 CET,0.0 2.672 3.167 3.529 3.838 4.102 4.36 4.593 5.004 5.199 5.386 5.626 5.955 6.112 6.397 6.666 6.929 7.054 7.288 7.507 7.805 8.006 8.21 8.507 8.811 9.12 9.408 9.666 9.983 10.293 10.603 10.982 11.353 11.722 12.152 12.635 13.096 13.581 14.093 14.617 15.167 15.799 16.487 17.113 17.807 18.551 19.376 20.264 21.199 22.043 22.587 22.507 22.116 21.591 20.998 20.338 19.695 19.121 18.61 18.058 17.561 17.124 16.703 16.306 15.933 15.594 15.234 14.873 14.559 14.258 13.921 13.631 13.343 13.032 12.792 12.552 12.304 12.049 11.775 11.583 11.375 11.05 10.829 10.586 10.451 10.152 9.839 9.52 9.348 9.022 8.795 8.601 8.403 7.936 7.661 7.382 7.082 6.712 6.219 5.544 3.67 -5 ,11421 ,KEBNE ,16657192,Tue Nov 23 02:35:41 CET,Tue Nov 23 04:03:15 CET,0.0 2.457 2.974 3.313 3.615 3.88 4.123 4.357 4.804 5.006 5.178 5.342 5.645 5.803 6.118 6.415 6.675 6.797 7.042 7.273 7.589 7.788 7.982 8.264 8.531 8.805 9.077 9.343 9.696 10.028 10.337 10.697 11.043 11.382 11.756 12.17 12.583 13.036 13.515 14.007 14.518 15.106 15.793 16.457 17.191 17.922 18.731 19.593 20.43 21.19 21.657 21.517 21.013 20.345 19.667 19.017 18.4 17.788 17.235 16.667 16.128 15.668 15.245 14.816 14.379 13.951 13.498 13.069 12.695 12.344 12.012 11.735 11.447 11.133 10.879 10.636 10.397 10.143 9.864 9.67 9.47 9.155 8.937 8.695 8.562 8.289 8.0 7.669 7.489 7.163 6.945 6.756 6.559 6.101 5.842 5.526 5.173 4.804 4.345 3.798 0.232 -6 ,16209 ,KEBNE ,16657193,Tue Nov 23 02:35:40 CET,Tue Nov 23 04:03:23 CET,0.0 1.559 2.047 2.42 2.735 3.016 3.269 3.503 3.926 4.115 4.298 4.479 4.775 4.948 5.276 5.574 5.844 5.973 6.244 6.498 6.827 7.039 7.253 7.553 7.829 8.093 8.351 8.623 8.981 9.313 9.613 9.949 10.284 10.607 10.963 11.363 11.759 12.188 12.64 13.11 13.59 14.129 14.76 15.377 16.037 16.74 17.526 18.336 19.142 19.867 20.42 20.448 20.105 19.564 18.975 18.345 17.707 17.128 16.624 16.092 15.619 15.21 14.808 14.414 14.026 13.616 13.181 12.791 12.449 12.104 11.76 11.483 11.201 10.896 10.654 10.395 10.112 9.835 9.557 9.348 9.107 8.742 8.493 8.225 8.085 7.782 7.483 7.209 7.06 6.738 6.517 6.331 6.127 5.668 5.421 5.159 4.857 4.495 4.068 3.422 1.115 -7 ,19097 ,KEBNE ,16657194,Tue Nov 23 02:35:40 CET,Tue Nov 23 04:07:09 CET,0.0 1.755 2.257 2.668 2.98 3.236 3.463 3.688 4.133 4.328 4.496 4.692 5.012 5.175 5.477 5.763 6.037 6.164 6.418 6.678 7.049 7.292 7.531 7.859 8.157 8.435 8.7 8.971 9.321 9.645 9.944 10.283 10.623 10.969 11.36 11.802 12.225 12.703 13.233 13.784 14.351 14.983 15.72 16.409 17.165 18.004 18.953 19.952 20.965 21.862 22.524 22.504 22.022 21.452 20.866 20.253 19.682 19.14 18.624 18.091 17.615 17.163 16.73 16.335 15.946 15.584 15.199 14.842 14.532 14.19 13.838 13.556 13.259 12.936 12.686 12.427 12.148 11.862 11.559 11.347 11.117 10.742 10.474 10.198 10.066 9.816 9.561 9.278 9.126 8.814 8.611 8.436 8.244 7.777 7.516 7.233 6.929 6.608 6.234 5.712 3.657 -8 ,7297 ,KEBNE ,16657195,Tue Nov 23 02:35:40 CET,Tue Nov 23 04:06:39 CET,0.0 1.856 2.279 2.649 2.993 3.28 3.521 3.741 4.137 4.315 4.477 4.63 4.92 5.061 5.319 5.555 5.787 5.9 6.121 6.318 6.586 6.756 6.936 7.232 7.523 7.803 8.06 8.287 8.551 8.798 9.033 9.313 9.602 9.885 10.19 10.523 10.844 11.189 11.559 11.946 12.331 12.762 13.246 13.707 14.233 14.773 15.322 15.915 16.536 17.083 17.299 16.788 15.969 15.127 14.286 13.415 12.572 11.749 10.993 10.251 9.672 9.156 8.664 8.174 7.701 7.281 6.826 6.422 6.078 5.732 5.36 5.033 4.685 4.322 4.03 3.737 3.444 3.136 2.832 2.611 2.369 1.989 1.713 1.415 1.261 0.95 0.635 0.284 0.088 -0.252 -0.468 -0.677 -0.906 -1.359 -1.632 -1.965 -2.315 -2.684 -3.1 -3.691 -8.267 -9 ,18545 ,KEBNE ,16657196,Tue Nov 23 02:35:40 CET,Tue Nov 23 04:05:39 CET,0.0 2.638 3.295 3.708 4.025 4.284 4.522 4.742 5.124 5.299 5.476 5.676 5.972 6.129 6.455 6.763 7.06 7.199 7.439 7.658 7.969 8.171 8.371 8.661 8.943 9.213 9.483 9.748 10.059 10.347 10.623 10.958 11.292 11.607 11.964 12.349 12.722 13.142 13.573 14.036 14.548 15.099 15.721 16.347 17.058 17.799 18.582 19.404 20.213 20.973 21.478 21.254 20.715 20.079 19.372 18.694 18.031 17.408 16.874 16.311 15.81 15.362 14.921 14.479 14.075 13.708 13.328 12.978 12.678 12.376 12.036 11.737 11.42 11.083 10.826 10.565 10.299 10.045 9.767 9.565 9.361 9.048 8.817 8.546 8.405 8.126 7.86 7.594 7.449 7.152 6.956 6.758 6.545 6.098 5.834 5.534 5.206 4.857 4.481 3.877 -8.179 -10 ,2707 ,KEBNE ,16657197,Tue Nov 23 02:35:40 CET,Tue Nov 23 04:04:31 CET,0.0 1.842 2.325 2.674 2.988 3.269 3.525 3.78 4.23 4.417 4.591 4.774 5.085 5.243 5.553 5.852 6.16 6.32 6.613 6.875 7.24 7.477 7.708 8.027 8.324 8.608 8.883 9.156 9.509 9.846 10.168 10.577 10.985 11.359 11.772 12.223 12.668 13.15 13.637 14.118 14.609 15.166 15.807 16.455 17.205 17.99 18.836 19.723 20.607 21.391 21.875 21.672 21.124 20.474 19.785 19.096 18.479 17.894 17.344 16.761 16.224 15.731 15.227 14.749 14.331 13.96 13.565 13.221 12.949 12.665 12.347 12.067 11.763 11.432 11.171 10.906 10.648 10.371 10.059 9.86 9.664 9.329 9.091 8.847 8.728 8.482 8.211 7.926 7.774 7.455 7.233 7.039 6.828 6.379 6.138 5.871 5.533 5.128 4.637 4.029 2.128 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index 5fb1486d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21583 ,KEBNE ,16657198,Tue Nov 23 02:35:41 CET,Tue Nov 23 04:03:26 CET,0.0 2.037 2.402 2.726 3.017 3.246 3.466 3.67 4.078 4.254 4.404 4.556 4.844 4.983 5.261 5.539 5.793 5.923 6.168 6.397 6.724 6.924 7.124 7.426 7.707 7.961 8.198 8.445 8.773 9.073 9.371 9.736 10.08 10.412 10.804 11.244 11.666 12.137 12.644 13.175 13.739 14.361 15.09 15.849 16.719 17.654 18.714 19.91 21.267 22.746 24.371 25.486 25.901 25.951 25.827 25.621 25.341 25.03 24.743 24.447 24.154 23.864 23.582 23.315 23.051 22.799 22.524 22.236 21.971 21.7 21.431 21.199 20.948 20.706 20.517 20.31 20.086 19.834 19.565 19.376 19.172 18.862 18.65 18.432 18.321 18.09 17.837 17.554 17.391 17.084 16.88 16.714 16.536 16.104 15.836 15.575 15.274 14.881 14.424 13.814 10.112 -2 ,1711 ,KEBNE ,16657199,Tue Nov 23 02:35:40 CET,Tue Nov 23 04:05:20 CET,0.0 2.504 2.945 3.247 3.547 3.793 3.996 4.188 4.524 4.679 4.844 5.042 5.348 5.498 5.765 6.028 6.309 6.442 6.671 6.885 7.189 7.392 7.601 7.904 8.196 8.473 8.74 8.995 9.314 9.619 9.921 10.291 10.661 11.023 11.428 11.862 12.283 12.758 13.259 13.806 14.406 15.075 15.818 16.542 17.399 18.388 19.508 20.697 22.028 23.504 25.15 26.139 26.427 26.443 26.269 25.972 25.674 25.389 25.097 24.772 24.462 24.165 23.866 23.563 23.277 23.018 22.732 22.482 22.263 22.019 21.751 21.503 21.212 20.892 20.668 20.463 20.241 20.013 19.776 19.614 19.44 19.146 18.935 18.722 18.612 18.379 18.129 17.862 17.726 17.448 17.252 17.077 16.88 16.42 16.144 15.852 15.553 15.198 14.696 13.902 10.82 -5 ,51 ,KEBNE ,16657202,Tue Nov 23 02:35:40 CET,Tue Nov 23 04:04:10 CET,0.0 1.79 2.201 2.492 2.795 3.1 3.345 3.548 3.892 4.057 4.227 4.402 4.681 4.809 5.066 5.315 5.539 5.642 5.863 6.088 6.403 6.604 6.803 7.106 7.401 7.701 8.004 8.27 8.6 8.914 9.212 9.566 9.896 10.22 10.6 11.04 11.474 11.933 12.433 12.966 13.503 14.137 14.903 15.626 16.438 17.367 18.428 19.583 20.888 22.343 23.85 24.872 25.264 25.3 25.166 24.923 24.642 24.34 24.045 23.715 23.408 23.111 22.814 22.533 22.248 21.963 21.687 21.448 21.212 20.95 20.678 20.447 20.194 19.934 19.73 19.515 19.278 19.027 18.781 18.609 18.426 18.13 17.921 17.697 17.583 17.347 17.067 16.761 16.61 16.318 16.104 15.929 15.736 15.296 15.053 14.785 14.482 14.101 13.611 12.938 9.943 -6 ,20930 ,KEBNE ,16657203,Tue Nov 23 02:36:43 CET,Tue Nov 23 04:08:03 CET,0.0 3.177 3.618 3.948 4.225 4.46 4.673 4.915 5.385 5.561 5.722 5.907 6.201 6.344 6.63 6.89 7.152 7.288 7.536 7.767 8.122 8.361 8.589 8.903 9.197 9.479 9.749 10.009 10.344 10.669 10.969 11.325 11.671 12.004 12.393 12.831 13.285 13.773 14.273 14.805 15.375 16.019 16.768 17.534 18.402 19.368 20.477 21.695 23.08 24.583 26.208 27.233 27.573 27.593 27.463 27.254 26.98 26.666 26.374 26.045 25.739 25.451 25.153 24.862 24.586 24.316 24.02 23.766 23.544 23.293 23.027 22.815 22.579 22.307 22.089 21.872 21.65 21.417 21.169 20.992 20.801 20.501 20.284 20.047 19.929 19.696 19.447 19.176 19.03 18.733 18.473 18.276 18.08 17.668 17.441 17.171 16.884 16.575 16.128 15.46 11.21 -7 ,9774 ,KEBNE ,16657204,Tue Nov 23 02:36:43 CET,Tue Nov 23 04:05:51 CET,0.0 1.93 2.44 2.838 3.117 3.34 3.57 3.788 4.167 4.343 4.505 4.679 4.979 5.122 5.392 5.652 5.912 6.037 6.276 6.506 6.813 7.027 7.236 7.531 7.822 8.079 8.321 8.564 8.899 9.237 9.545 9.905 10.282 10.669 11.117 11.623 12.115 12.626 13.13 13.665 14.246 14.893 15.64 16.378 17.26 18.268 19.413 20.661 22.055 23.557 25.137 26.215 26.581 26.588 26.436 26.201 25.906 25.58 25.251 24.922 24.636 24.342 24.041 23.748 23.471 23.217 22.942 22.678 22.447 22.203 21.929 21.696 21.47 21.24 21.048 20.832 20.602 20.361 20.113 19.922 19.699 19.345 19.108 18.856 18.722 18.448 18.172 17.893 17.755 17.483 17.272 17.077 16.884 16.444 16.182 15.887 15.554 15.177 14.747 14.121 11.296 -8 ,17404 ,KEBNE ,16657205,Tue Nov 23 02:36:43 CET,Tue Nov 23 04:05:42 CET,0.0 1.685 2.124 2.441 2.731 2.987 3.208 3.432 3.873 4.063 4.221 4.373 4.668 4.816 5.101 5.378 5.643 5.769 6.01 6.252 6.603 6.81 7.011 7.332 7.639 7.941 8.237 8.517 8.86 9.173 9.501 9.907 10.26 10.584 10.971 11.416 11.849 12.321 12.837 13.381 13.952 14.599 15.34 16.08 16.925 17.871 18.948 20.153 21.572 23.104 24.725 25.774 26.152 26.195 26.028 25.782 25.507 25.224 24.956 24.65 24.371 24.109 23.814 23.531 23.27 23.011 22.751 22.511 22.283 22.05 21.809 21.589 21.344 21.087 20.883 20.668 20.437 20.178 19.88 19.687 19.506 19.217 19.005 18.785 18.677 18.44 18.162 17.861 17.709 17.421 17.209 17.034 16.856 16.459 16.228 15.946 15.63 15.314 14.924 14.341 11.098 -9 ,14274 ,KEBNE ,16657206,Tue Nov 23 02:36:43 CET,Tue Nov 23 04:07:26 CET,0.0 2.139 2.584 2.889 3.136 3.358 3.583 3.802 4.193 4.368 4.541 4.727 5.017 5.164 5.441 5.683 5.917 6.03 6.269 6.502 6.808 7.007 7.209 7.503 7.805 8.108 8.397 8.673 9.006 9.313 9.597 9.953 10.314 10.656 11.051 11.495 11.926 12.408 12.918 13.423 13.959 14.59 15.337 16.109 17.023 18.028 19.133 20.303 21.645 23.199 24.88 25.929 26.33 26.336 26.163 25.959 25.69 25.374 25.061 24.699 24.359 24.029 23.719 23.429 23.139 22.867 22.569 22.294 22.05 21.791 21.514 21.27 21.015 20.734 20.507 20.293 20.081 19.852 19.581 19.382 19.18 18.857 18.632 18.411 18.306 18.086 17.823 17.52 17.37 17.095 16.883 16.693 16.5 16.072 15.827 15.564 15.259 14.891 14.475 13.908 10.8 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt deleted file mode 100644 index d616541c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8348 ,TETRA ,17555094,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:25:36 CET,0.0 0.834 1.157 1.397 1.633 1.85 2.032 2.211 2.517 2.666 2.818 2.814 3.25 3.371 3.605 3.834 4.064 4.176 4.397 4.608 4.898 5.091 5.281 5.543 5.808 6.068 6.308 6.553 6.881 7.195 7.514 7.898 8.253 8.622 9.038 9.494 9.955 10.469 11.045 11.65 12.261 12.982 13.879 14.792 15.868 17.069 18.485 20.135 22.085 24.455 27.417 30.061 31.613 32.467 33.056 33.523 33.845 34.092 34.256 34.364 34.429 34.423 34.358 34.283 34.206 34.145 34.08 34.018 33.955 33.868 33.764 33.686 33.61 33.519 33.451 33.37 33.275 33.172 33.06 32.982 32.892 32.73 32.611 32.482 32.416 32.25 32.059 31.894 31.812 31.451 31.526 31.44 31.337 31.053 30.887 30.723 30.539 30.322 30.051 29.649 28.551 -2 ,4333 ,TETRA ,17555095,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:26:13 CET,0.0 1.297 1.692 1.991 2.267 2.523 2.76 2.961 3.281 3.426 3.569 3.553 3.976 4.088 4.303 4.517 4.713 4.805 4.994 5.179 5.452 5.645 5.833 6.08 6.32 6.558 6.791 7.021 7.328 7.635 7.923 8.268 8.608 8.937 9.318 9.752 10.183 10.67 11.193 11.741 12.315 12.971 13.768 14.584 15.57 16.688 17.957 19.425 21.257 23.471 26.117 28.479 29.97 30.943 31.544 31.921 32.158 32.323 32.433 32.533 32.593 32.598 32.572 32.536 32.504 32.481 32.446 32.392 32.327 32.246 32.167 32.099 32.015 31.929 31.858 31.781 31.702 31.607 31.501 31.444 31.397 31.312 31.249 31.171 31.128 31.037 30.932 30.819 30.751 30.424 30.541 30.456 30.378 30.195 30.069 29.898 29.717 29.501 29.264 28.983 27.929 -3 ,32245 ,TETRA ,17555096,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:12:24 CET,0.0 0.54 0.772 1.003 1.226 1.427 1.622 1.794 2.076 2.209 2.345 2.288 2.713 2.833 3.067 3.286 3.502 3.613 3.824 4.03 4.339 4.525 4.714 5.0 5.27 5.527 5.771 6.015 6.343 6.656 6.963 7.343 7.692 8.038 8.462 8.931 9.392 9.918 10.485 11.065 11.686 12.42 13.294 14.185 15.243 16.457 17.906 19.585 21.648 24.129 27.118 29.626 31.147 32.161 32.824 33.258 33.552 33.755 33.869 33.938 33.987 34.009 34.02 33.996 33.957 33.91 33.861 33.839 33.803 33.745 33.678 33.613 33.532 33.446 33.382 33.307 33.228 33.141 33.022 32.933 32.851 32.724 32.627 32.524 32.466 32.318 32.136 31.928 31.817 31.429 31.441 31.299 31.168 30.879 30.699 30.545 30.398 30.206 29.965 29.517 27.877 -4 ,13157 ,TETRA ,17555097,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:28:04 CET,0.0 0.805 1.174 1.472 1.736 1.956 2.152 2.344 2.693 2.85 3.001 2.974 3.401 3.53 3.779 4.014 4.241 4.354 4.579 4.797 5.135 5.354 5.551 5.832 6.112 6.379 6.625 6.867 7.19 7.509 7.833 8.237 8.626 9.009 9.457 9.967 10.476 11.03 11.621 12.244 12.903 13.675 14.593 15.518 16.604 17.84 19.291 20.991 22.998 25.343 28.187 30.628 32.097 33.053 33.68 34.102 34.401 34.594 34.721 34.83 34.902 34.933 34.949 34.962 34.943 34.911 34.867 34.804 34.737 34.66 34.583 34.518 34.443 34.344 34.257 34.149 34.018 33.901 33.793 33.713 33.633 33.513 33.409 33.303 33.251 33.13 33.002 32.876 32.813 32.472 32.609 32.534 32.436 32.203 32.08 31.953 31.812 31.665 31.464 31.157 30.212 -5 ,3959 ,TETRA ,17555098,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:28:50 CET,0.0 0.72 1.042 1.3 1.54 1.754 1.956 2.164 2.547 2.73 2.91 2.957 3.422 3.578 3.912 4.226 4.517 4.655 4.903 5.152 5.526 5.766 5.997 6.308 6.606 6.899 7.166 7.417 7.752 8.081 8.407 8.79 9.163 9.531 9.949 10.419 10.879 11.373 11.912 12.508 13.118 13.831 14.699 15.57 16.583 17.695 18.962 20.456 22.231 24.356 27.176 29.623 30.972 31.826 32.405 32.78 33.008 33.137 33.229 33.31 33.352 33.36 33.342 33.302 33.249 33.212 33.16 33.102 33.062 33.019 32.939 32.857 32.78 32.693 32.599 32.503 32.398 32.285 32.181 32.093 32.011 31.902 31.805 31.706 31.662 31.552 31.435 31.321 31.251 30.896 31.016 30.936 30.839 30.613 30.484 30.319 30.123 29.925 29.675 29.343 28.031 -6 ,18329 ,TETRA ,17555099,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:12:19 CET,0.0 0.811 1.143 1.446 1.711 1.94 2.147 2.317 2.627 2.785 2.922 2.861 3.298 3.428 3.684 3.92 4.14 4.249 4.461 4.673 4.984 5.176 5.36 5.621 5.864 6.105 6.345 6.596 6.935 7.263 7.577 7.947 8.313 8.66 9.081 9.58 10.077 10.615 11.169 11.771 12.414 13.131 13.982 14.849 15.874 17.081 18.515 20.138 22.066 24.41 27.397 29.943 31.481 32.46 33.1 33.539 33.802 33.991 34.112 34.155 34.158 34.15 34.132 34.108 34.061 33.993 33.907 33.828 33.758 33.681 33.596 33.529 33.453 33.363 33.292 33.214 33.122 33.014 32.904 32.825 32.732 32.605 32.522 32.408 32.343 32.199 32.04 31.846 31.735 31.362 31.431 31.312 31.193 30.956 30.814 30.67 30.531 30.356 30.145 29.914 28.814 -7 ,2989 ,TETRA ,17555100,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:26:20 CET,0.0 0.848 1.143 1.42 1.661 1.874 2.081 2.277 2.61 2.755 2.893 2.873 3.327 3.493 3.787 4.03 4.258 4.357 4.551 4.752 5.055 5.25 5.433 5.724 6.033 6.337 6.617 6.876 7.196 7.503 7.822 8.205 8.566 8.924 9.346 9.824 10.287 10.794 11.373 11.992 12.626 13.363 14.234 15.133 16.26 17.522 18.961 20.623 22.581 24.918 27.743 30.141 31.621 32.551 33.116 33.491 33.716 33.872 33.991 34.068 34.103 34.103 34.071 34.041 34.017 33.97 33.914 33.852 33.78 33.689 33.566 33.464 33.333 33.17 33.051 32.932 32.823 32.722 32.614 32.53 32.45 32.34 32.253 32.153 32.098 31.981 31.848 31.715 31.643 31.291 31.431 31.365 31.269 30.99 30.858 30.745 30.615 30.443 30.23 29.975 28.877 -8 ,16525 ,TETRA ,17555101,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:26:33 CET,0.0 1.252 1.632 1.921 2.154 2.337 2.524 2.703 3.023 3.175 3.315 3.269 3.702 3.825 4.062 4.306 4.533 4.632 4.835 5.042 5.351 5.57 5.8 6.112 6.385 6.644 6.895 7.139 7.461 7.775 8.066 8.433 8.809 9.165 9.57 10.044 10.495 10.972 11.501 12.072 12.685 13.394 14.243 15.123 16.179 17.388 18.808 20.437 22.349 24.64 27.554 30.051 31.486 32.358 32.916 33.304 33.56 33.739 33.87 33.965 33.996 33.998 33.979 33.97 33.953 33.912 33.855 33.799 33.74 33.667 33.593 33.513 33.416 33.338 33.281 33.206 33.124 33.021 32.903 32.824 32.741 32.608 32.511 32.401 32.348 32.238 32.11 31.969 31.893 31.549 31.633 31.524 31.421 31.215 31.107 30.995 30.853 30.679 30.444 30.091 28.942 -9 ,23414 ,TETRA ,17555102,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:12:00 CET,0.0 1.493 1.812 2.064 2.317 2.534 2.742 2.955 3.29 3.428 3.568 3.551 4.007 4.156 4.435 4.672 4.882 4.984 5.19 5.39 5.678 5.871 6.07 6.34 6.596 6.872 7.131 7.366 7.687 7.993 8.285 8.642 8.993 9.343 9.751 10.229 10.69 11.204 11.757 12.341 13.005 13.786 14.708 15.67 16.827 18.123 19.573 21.225 23.284 25.785 28.817 31.361 32.886 33.916 34.64 35.159 35.514 35.746 35.872 35.961 36.041 36.064 36.047 36.032 36.011 35.976 35.921 35.871 35.83 35.796 35.751 35.696 35.637 35.566 35.502 35.441 35.375 35.279 35.181 35.131 35.072 34.963 34.866 34.764 34.723 34.616 34.493 34.376 34.312 33.974 34.054 33.951 33.84 33.61 33.488 33.367 33.23 33.057 32.853 32.553 31.55 -10 ,3661 ,TETRA ,17555103,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:26:22 CET,0.0 0.963 1.297 1.526 1.733 1.935 2.135 2.323 2.668 2.821 2.968 2.949 3.392 3.52 3.752 3.978 4.192 4.297 4.512 4.704 4.976 5.163 5.346 5.627 5.905 6.16 6.406 6.657 6.993 7.314 7.607 7.952 8.297 8.63 9.021 9.493 9.946 10.438 10.981 11.553 12.159 12.841 13.661 14.509 15.527 16.72 18.109 19.709 21.666 24.054 27.061 29.687 31.23 32.195 32.815 33.242 33.538 33.722 33.835 33.907 33.932 33.953 33.961 33.925 33.876 33.817 33.739 33.65 33.549 33.471 33.415 33.36 33.302 33.235 33.176 33.115 33.059 33.0 32.912 32.84 32.764 32.653 32.563 32.461 32.408 32.29 32.171 32.056 31.992 31.646 31.759 31.676 31.573 31.333 31.205 31.065 30.881 30.7 30.548 30.318 29.583 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 0263bb36..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9144 ,KEBNE ,17043611,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:29:33 CET,0.0 1.77 2.121 2.373 2.609 2.803 2.96 3.115 3.393 3.515 3.637 3.572 3.977 4.09 4.319 4.523 4.713 4.804 4.985 5.153 5.406 5.573 5.721 5.926 6.13 6.326 6.513 6.686 6.875 7.065 7.271 7.49 7.696 7.922 8.19 8.478 8.734 9.032 9.359 9.678 10.007 10.356 10.719 11.048 11.451 11.807 12.042 12.224 12.25 11.868 10.849 9.282 7.698 6.247 5.042 3.923 2.916 2.055 1.276 0.494 -0.135 -0.688 -1.254 -1.815 -2.331 -2.791 -3.259 -3.694 -4.083 -4.475 -4.876 -5.19 -5.499 -5.827 -6.079 -6.359 -6.666 -6.992 -7.334 -7.57 -7.821 -8.216 -8.505 -8.8 -8.949 -9.27 -9.614 -9.981 -10.171 -10.67 -10.73 -10.951 -11.197 -11.723 -11.99 -12.293 -12.631 -12.989 -13.413 -14.051 -16.361 -2 ,11765 ,KEBNE ,17043612,Thu Dec 23 04:43:32 CET,Thu Dec 23 06:28:37 CET,0.0 0.978 1.361 1.642 1.914 2.17 2.415 2.658 3.077 3.25 3.417 3.455 3.897 4.023 4.242 4.433 4.608 4.698 4.857 4.983 5.167 5.293 5.413 5.582 5.739 5.888 6.035 6.18 6.373 6.566 6.757 6.984 7.19 7.388 7.596 7.796 7.982 8.173 8.377 8.599 8.801 8.972 9.159 9.369 9.607 9.774 9.87 9.874 9.561 8.874 7.682 5.991 4.34 2.693 1.265 0.056 -1.037 -2.057 -2.9 -3.758 -4.533 -5.219 -5.873 -6.475 -7.044 -7.592 -8.145 -8.612 -9.0 -9.389 -9.814 -10.183 -10.555 -10.945 -11.257 -11.587 -11.909 -12.222 -12.572 -12.815 -13.058 -13.436 -13.694 -13.956 -14.1 -14.417 -14.738 -15.073 -15.254 -15.761 -15.851 -16.078 -16.32 -16.836 -17.094 -17.381 -17.755 -18.131 -18.59 -19.248 -21.227 -3 ,13223 ,KEBNE ,17043613,Thu Dec 23 04:44:34 CET,Thu Dec 23 06:29:55 CET,0.0 1.528 1.991 2.332 2.609 2.839 3.079 3.292 3.632 3.795 3.95 3.943 4.381 4.518 4.771 4.994 5.225 5.332 5.519 5.686 5.907 6.061 6.216 6.413 6.596 6.789 6.985 7.17 7.39 7.589 7.77 7.988 8.189 8.374 8.585 8.823 9.067 9.309 9.555 9.809 10.055 10.345 10.657 10.9 11.185 11.504 11.68 11.692 11.574 11.253 10.27 8.706 7.222 5.67 4.213 2.903 1.767 0.79 -0.029 -0.86 -1.593 -2.255 -2.846 -3.379 -3.943 -4.522 -5.109 -5.595 -6.017 -6.447 -6.881 -7.243 -7.626 -8.014 -8.312 -8.648 -8.977 -9.297 -9.646 -9.887 -10.142 -10.563 -10.848 -11.133 -11.291 -11.632 -11.976 -12.311 -12.498 -13.046 -13.176 -13.406 -13.64 -14.148 -14.432 -14.715 -14.99 -15.317 -15.752 -16.319 -18.272 -4 ,2443 ,KEBNE ,17043614,Thu Dec 23 04:44:34 CET,Thu Dec 23 06:29:32 CET,0.0 1.982 2.56 3.027 3.414 3.702 3.927 4.128 4.525 4.712 4.871 4.826 5.257 5.388 5.646 5.88 6.076 6.16 6.31 6.436 6.647 6.791 6.913 7.093 7.268 7.437 7.617 7.788 7.999 8.204 8.404 8.651 8.889 9.138 9.447 9.769 10.022 10.27 10.516 10.75 10.994 11.265 11.551 11.776 12.001 12.191 12.338 12.46 12.399 11.868 10.437 8.457 6.802 5.244 3.773 2.478 1.343 0.261 -0.703 -1.674 -2.502 -3.172 -3.781 -4.388 -4.94 -5.425 -5.941 -6.399 -6.795 -7.225 -7.684 -8.045 -8.437 -8.867 -9.177 -9.498 -9.837 -10.178 -10.533 -10.788 -11.064 -11.497 -11.798 -12.127 -12.294 -12.637 -13.002 -13.371 -13.552 -14.068 -14.138 -14.355 -14.602 -15.118 -15.37 -15.651 -15.985 -16.357 -16.779 -17.339 -19.38 -5 ,9535 ,KEBNE ,17043615,Thu Dec 23 04:44:34 CET,Thu Dec 23 06:29:50 CET,0.0 1.221 1.756 2.116 2.407 2.646 2.856 3.066 3.492 3.679 3.833 3.834 4.3 4.452 4.717 4.974 5.188 5.275 5.432 5.582 5.804 5.949 6.102 6.311 6.495 6.664 6.81 6.955 7.166 7.376 7.59 7.836 8.032 8.203 8.394 8.629 8.849 9.047 9.277 9.523 9.78 10.101 10.459 10.769 11.084 11.358 11.525 11.594 11.447 10.896 9.748 8.123 6.607 5.126 3.839 2.708 1.663 0.734 -0.105 -0.955 -1.738 -2.489 -3.187 -3.831 -4.411 -4.91 -5.433 -5.917 -6.336 -6.761 -7.211 -7.575 -7.928 -8.301 -8.604 -8.935 -9.273 -9.598 -9.935 -10.174 -10.418 -10.787 -11.057 -11.349 -11.499 -11.839 -12.221 -12.599 -12.785 -13.288 -13.317 -13.508 -13.715 -14.209 -14.47 -14.751 -15.067 -15.443 -15.933 -16.587 -18.925 -6 ,22239 ,KEBNE ,17043616,Thu Dec 23 04:44:34 CET,Thu Dec 23 06:29:36 CET,0.0 1.442 1.907 2.256 2.525 2.76 2.985 3.173 3.5 3.652 3.801 3.794 4.217 4.321 4.544 4.762 4.95 5.038 5.202 5.355 5.563 5.697 5.84 6.042 6.221 6.397 6.574 6.756 7.007 7.246 7.465 7.717 7.938 8.154 8.383 8.601 8.798 8.995 9.197 9.458 9.722 9.939 10.145 10.375 10.61 10.738 10.744 10.637 10.401 9.793 8.453 6.506 4.766 3.245 1.915 0.739 -0.294 -1.226 -2.023 -2.806 -3.47 -4.09 -4.677 -5.209 -5.713 -6.161 -6.606 -7.018 -7.401 -7.816 -8.229 -8.554 -8.883 -9.25 -9.557 -9.88 -10.231 -10.613 -11.019 -11.294 -11.569 -11.998 -12.292 -12.596 -12.755 -13.086 -13.412 -13.748 -13.938 -14.456 -14.529 -14.744 -14.965 -15.456 -15.751 -16.065 -16.402 -16.846 -17.381 -18.061 -20.738 -7 ,9664 ,KEBNE ,17043617,Thu Dec 23 04:44:34 CET,Thu Dec 23 06:29:29 CET,0.0 0.962 1.35 1.652 1.9 2.119 2.315 2.524 2.892 3.031 3.152 3.097 3.537 3.669 3.887 4.053 4.217 4.298 4.439 4.591 4.842 4.984 5.111 5.302 5.5 5.691 5.86 6.008 6.191 6.383 6.595 6.841 7.065 7.271 7.47 7.672 7.877 8.111 8.348 8.593 8.821 9.061 9.34 9.604 9.869 10.086 10.287 10.417 10.353 9.938 8.839 7.225 5.697 4.284 3.019 1.812 0.665 -0.386 -1.257 -2.089 -2.808 -3.465 -4.092 -4.677 -5.25 -5.772 -6.303 -6.805 -7.218 -7.627 -8.05 -8.415 -8.804 -9.185 -9.468 -9.782 -10.124 -10.46 -10.816 -11.055 -11.295 -11.686 -11.961 -12.252 -12.405 -12.714 -13.039 -13.389 -13.572 -14.091 -14.12 -14.321 -14.534 -15.001 -15.293 -15.611 -15.919 -16.318 -16.804 -17.395 -20.019 -8 ,17671 ,KEBNE ,17043618,Thu Dec 23 04:44:34 CET,Thu Dec 23 06:29:17 CET,0.0 1.851 2.442 2.882 3.178 3.447 3.705 3.939 4.301 4.463 4.625 4.648 5.119 5.274 5.577 5.844 6.087 6.203 6.416 6.638 6.988 7.19 7.373 7.632 7.877 8.104 8.325 8.55 8.829 9.071 9.286 9.551 9.817 10.058 10.332 10.613 10.842 11.084 11.344 11.632 11.906 12.153 12.424 12.714 13.013 13.212 13.267 13.239 13.072 12.522 11.233 9.375 7.576 5.827 4.264 2.93 1.809 0.775 -0.138 -1.0 -1.751 -2.467 -3.14 -3.749 -4.32 -4.847 -5.37 -5.831 -6.257 -6.696 -7.136 -7.514 -7.905 -8.31 -8.612 -8.89 -9.172 -9.476 -9.798 -10.032 -10.289 -10.707 -11.02 -11.33 -11.478 -11.79 -12.129 -12.46 -12.611 -13.105 -13.174 -13.368 -13.588 -14.093 -14.378 -14.692 -15.042 -15.446 -15.883 -16.419 -18.727 -9 ,6608 ,KEBNE ,17043619,Thu Dec 23 04:45:37 CET,Thu Dec 23 06:31:31 CET,0.0 1.19 1.733 2.216 2.547 2.823 3.093 3.319 3.631 3.765 3.897 3.817 4.215 4.312 4.538 4.755 4.938 5.032 5.194 5.335 5.547 5.675 5.801 6.01 6.2 6.36 6.518 6.673 6.877 7.06 7.225 7.41 7.576 7.735 7.924 8.135 8.332 8.544 8.775 8.992 9.186 9.395 9.616 9.826 10.05 10.23 10.354 10.441 10.315 9.704 8.161 5.902 3.895 2.177 0.627 -0.68 -1.765 -2.775 -3.644 -4.475 -5.162 -5.772 -6.363 -6.923 -7.474 -8.005 -8.526 -8.975 -9.392 -9.838 -10.28 -10.652 -11.03 -11.416 -11.728 -12.038 -12.338 -12.635 -12.934 -13.159 -13.422 -13.823 -14.077 -14.34 -14.481 -14.788 -15.095 -15.397 -15.548 -16.031 -16.049 -16.237 -16.444 -16.904 -17.116 -17.332 -17.608 -17.961 -18.386 -19.065 -23.037 -10 ,27237 ,KEBNE ,17043620,Thu Dec 23 04:45:38 CET,Thu Dec 23 06:30:45 CET,0.0 2.077 2.587 2.94 3.264 3.556 3.845 4.099 4.534 4.724 4.88 4.88 5.316 5.417 5.587 5.755 5.919 5.997 6.156 6.313 6.521 6.651 6.773 6.948 7.136 7.333 7.528 7.699 7.886 8.051 8.197 8.366 8.535 8.699 8.881 9.09 9.327 9.571 9.772 9.967 10.171 10.383 10.642 10.886 11.128 11.382 11.607 11.754 11.878 11.796 10.944 9.379 7.888 6.484 5.188 4.024 2.894 1.812 0.944 0.125 -0.578 -1.203 -1.793 -2.327 -2.821 -3.294 -3.788 -4.218 -4.585 -4.953 -5.334 -5.639 -5.954 -6.312 -6.593 -6.884 -7.195 -7.529 -7.867 -8.096 -8.339 -8.732 -9.007 -9.267 -9.396 -9.714 -10.083 -10.481 -10.698 -11.243 -11.382 -11.627 -11.874 -12.417 -12.722 -13.044 -13.39 -13.799 -14.275 -14.867 -17.694 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index ebef1ed9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13416 ,TETRA ,17555104,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:24:29 CET,0.0 0.284 0.548 0.795 0.997 1.195 1.403 1.811 2.009 2.205 2.273 2.742 2.908 3.246 3.589 3.933 4.101 4.428 4.752 5.23 5.544 5.848 6.297 6.749 7.198 7.644 8.094 8.696 9.274 9.831 10.533 11.231 11.92 12.753 13.689 14.585 15.602 16.729 17.947 19.253 20.738 22.505 24.319 26.488 28.976 31.874 35.189 39.12 43.728 49.24 53.25 54.992 55.876 56.273 56.325 56.303 56.215 56.044 55.754 55.415 55.1 54.797 54.495 54.176 53.822 53.431 53.103 52.8 52.459 52.111 51.848 51.568 51.238 50.95 50.664 50.338 49.976 49.638 49.418 49.187 48.807 48.481 48.097 47.908 47.517 47.075 46.595 46.358 45.864 45.602 45.312 44.987 44.264 43.854 43.398 42.878 42.168 41.267 40.02 -2 ,10941 ,TETRA ,17555105,Thu Nov 25 17:05:23 CET,Thu Nov 25 19:09:48 CET,0.0 0.25 0.484 0.709 0.933 1.155 1.364 1.775 1.968 2.148 2.183 2.663 2.841 3.192 3.513 3.827 3.982 4.293 4.612 5.098 5.426 5.748 6.224 6.701 7.164 7.616 8.073 8.671 9.26 9.846 10.567 11.287 11.994 12.821 13.762 14.682 15.725 16.919 18.205 19.562 21.153 23.07 25.051 27.394 30.061 33.168 36.727 40.874 45.676 51.375 55.45 57.273 57.975 58.322 58.536 58.472 58.241 57.944 57.659 57.381 57.02 56.627 56.267 55.895 55.54 55.183 54.853 54.562 54.246 53.879 53.575 53.286 52.948 52.661 52.367 52.047 51.682 51.257 50.982 50.704 50.267 49.976 49.654 49.499 49.21 48.87 48.437 48.202 47.716 47.467 47.173 46.852 46.086 45.659 45.222 44.683 44.075 43.326 42.046 -3 ,11789 ,TETRA ,17555106,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:22:26 CET,0.0 0.235 0.48 0.745 0.995 1.227 1.451 1.873 2.07 2.259 2.325 2.814 3.0 3.364 3.719 4.061 4.238 4.602 4.959 5.495 5.847 6.2 6.723 7.251 7.783 8.285 8.763 9.369 9.937 10.476 11.144 11.805 12.455 13.227 14.123 14.997 15.996 17.141 18.383 19.699 21.201 23.018 24.916 27.193 29.837 32.957 36.487 40.557 45.274 50.837 55.015 57.082 58.039 58.365 58.506 58.28 57.821 57.367 56.802 56.307 55.893 55.5 55.113 54.733 54.369 53.957 53.586 53.278 52.958 52.616 52.286 51.94 51.583 51.278 50.971 50.63 50.277 49.936 49.677 49.404 48.94 48.615 48.296 48.122 47.747 47.348 46.94 46.732 46.263 46.069 45.831 45.558 44.907 44.515 44.073 43.552 42.989 42.28 41.071 -4 ,22580 ,TETRA ,17555107,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:23:48 CET,0.0 0.251 0.452 0.664 0.872 1.07 1.26 1.627 1.816 2.001 2.045 2.523 2.693 3.032 3.384 3.734 3.912 4.281 4.646 5.184 5.527 5.866 6.371 6.86 7.357 7.855 8.327 8.934 9.524 10.085 10.796 11.533 12.272 13.095 13.986 14.872 15.866 16.943 18.097 19.336 20.791 22.533 24.296 26.396 28.877 31.801 35.038 38.98 43.786 49.357 53.58 55.764 56.922 57.522 57.77 57.768 57.624 57.424 57.152 56.866 56.56 56.218 55.865 55.546 55.289 54.997 54.635 54.284 53.922 53.537 53.223 52.89 52.558 52.314 52.053 51.775 51.469 51.135 50.905 50.662 50.285 50.013 49.711 49.555 49.237 48.866 48.457 48.254 47.785 47.56 47.305 47.042 46.407 46.011 45.535 44.956 44.342 43.604 42.512 -5 ,8431 ,TETRA ,17555108,Thu Nov 25 17:05:23 CET,Thu Nov 25 19:09:40 CET,0.0 0.281 0.549 0.789 1.002 1.198 1.393 1.782 1.959 2.133 2.172 2.637 2.803 3.135 3.472 3.804 3.965 4.287 4.607 5.074 5.38 5.681 6.123 6.56 6.998 7.432 7.857 8.423 8.986 9.54 10.232 10.917 11.574 12.366 13.301 14.221 15.255 16.399 17.631 18.938 20.428 22.219 24.068 26.238 28.718 31.592 34.904 38.88 43.719 49.577 53.607 55.298 56.095 56.427 56.456 56.347 56.111 55.633 54.984 54.392 53.866 53.392 52.977 52.624 52.275 51.894 51.539 51.23 50.921 50.564 50.23 49.885 49.509 49.198 48.895 48.586 48.252 47.893 47.632 47.369 47.018 46.785 46.527 46.385 46.088 45.769 45.388 45.191 44.759 44.571 44.316 44.054 43.445 43.11 42.759 42.291 41.719 41.006 40.002 -6 ,17503 ,TETRA ,17555109,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:22:33 CET,0.0 0.364 0.657 0.923 1.166 1.393 1.62 2.081 2.302 2.511 2.621 3.134 3.331 3.741 4.146 4.53 4.718 5.09 5.462 6.006 6.355 6.691 7.149 7.578 8.005 8.437 8.872 9.429 9.967 10.5 11.176 11.846 12.496 13.282 14.196 15.107 16.14 17.255 18.46 19.785 21.308 23.137 25.016 27.272 29.764 32.51 35.653 39.475 44.337 50.442 54.922 56.88 58.031 58.737 58.908 58.78 58.609 58.438 58.164 57.889 57.603 57.271 56.91 56.513 56.119 55.695 55.296 54.944 54.585 54.215 53.882 53.55 53.227 52.958 52.693 52.414 52.102 51.767 51.534 51.302 50.911 50.621 50.327 50.183 49.881 49.565 49.231 49.059 48.632 48.435 48.212 47.992 47.44 47.125 46.765 46.334 45.845 45.311 44.466 -7 ,2388 ,TETRA ,17555110,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:23:04 CET,0.0 0.265 0.533 0.773 1.001 1.221 1.434 1.865 2.089 2.304 2.413 2.923 3.12 3.5 3.867 4.22 4.397 4.776 5.153 5.71 6.083 6.444 6.963 7.48 7.985 8.493 9.007 9.664 10.308 10.908 11.586 12.252 12.923 13.717 14.632 15.538 16.549 17.639 18.829 20.153 21.674 23.482 25.383 27.66 30.314 33.47 36.949 41.022 45.929 51.663 56.114 58.474 59.759 60.409 60.675 60.788 60.722 60.475 60.195 59.931 59.572 59.112 58.645 58.184 57.707 57.182 56.719 56.328 55.978 55.628 55.299 54.978 54.659 54.409 54.157 53.879 53.575 53.251 53.018 52.77 52.391 52.136 51.852 51.694 51.375 51.037 50.686 50.509 50.068 49.871 49.617 49.356 48.776 48.377 47.987 47.617 47.147 46.49 45.543 -8 ,30758 ,TETRA ,17555111,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:09:55 CET,0.0 0.281 0.529 0.753 0.971 1.176 1.365 1.727 1.908 2.094 2.159 2.645 2.819 3.157 3.503 3.852 4.026 4.369 4.711 5.209 5.527 5.841 6.315 6.807 7.309 7.779 8.238 8.842 9.437 10.037 10.775 11.5 12.178 12.976 13.918 14.831 15.849 16.955 18.138 19.446 20.972 22.815 24.722 27.05 29.735 32.742 36.03 40.004 44.851 50.086 53.98 56.281 57.408 57.773 57.774 57.506 57.074 56.699 56.302 55.903 55.53 55.133 54.724 54.332 53.974 53.594 53.238 52.903 52.521 52.131 51.837 51.485 51.105 50.836 50.567 50.312 50.031 49.714 49.483 49.226 48.804 48.494 48.196 48.057 47.756 47.39 46.962 46.732 46.233 45.977 45.704 45.405 44.654 44.201 43.735 43.213 42.556 41.736 40.368 -9 ,10162 ,TETRA ,17555112,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:27:10 CET,0.0 0.254 0.482 0.692 0.898 1.103 1.296 1.678 1.877 2.066 2.109 2.587 2.763 3.116 3.465 3.815 3.984 4.308 4.632 5.118 5.433 5.748 6.24 6.733 7.201 7.66 8.121 8.728 9.331 9.927 10.668 11.392 12.077 12.89 13.86 14.833 15.91 17.044 18.253 19.541 20.994 22.746 24.618 26.815 29.3 32.31 35.744 39.935 44.968 51.026 55.848 58.261 59.518 60.076 60.216 60.069 59.683 59.257 58.797 58.389 58.0 57.599 57.2 56.806 56.405 55.961 55.521 55.103 54.7 54.303 53.981 53.663 53.294 52.999 52.709 52.408 52.082 51.741 51.516 51.258 50.778 50.419 50.08 49.912 49.515 49.093 48.622 48.354 47.838 47.487 47.142 46.759 45.95 45.497 44.978 44.412 43.741 42.904 41.883 -10 ,20088 ,TETRA ,17555113,Thu Nov 25 17:05:22 CET,Thu Nov 25 19:27:10 CET,0.0 0.258 0.489 0.7 0.903 1.099 1.283 1.673 1.876 2.074 2.174 2.678 2.877 3.284 3.681 4.059 4.243 4.598 4.927 5.386 5.698 6.014 6.463 6.904 7.35 7.797 8.236 8.8 9.352 9.905 10.589 11.276 11.955 12.738 13.643 14.544 15.556 16.652 17.851 19.168 20.706 22.542 24.409 26.577 28.995 31.936 35.325 39.187 43.732 49.288 53.582 55.624 56.632 57.153 57.4 57.422 57.202 56.919 56.612 56.294 55.953 55.56 55.143 54.716 54.294 53.862 53.502 53.173 52.797 52.42 52.122 51.79 51.446 51.178 50.873 50.57 50.291 49.991 49.773 49.538 49.149 48.88 48.598 48.446 48.11 47.779 47.457 47.284 46.841 46.61 46.351 46.077 45.427 45.068 44.653 44.193 43.682 42.919 41.889 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt deleted file mode 100644 index b05e27be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3539 ,TETRA ,17555114,Thu Nov 25 17:05:26 CET,Thu Nov 25 19:16:07 CET,0.0 0.305 0.458 0.57 0.664 0.752 0.843 0.947 1.135 1.209 1.271 1.315 1.456 1.519 1.643 1.747 1.849 1.899 1.997 2.09 2.207 2.289 2.384 2.523 2.64 2.764 2.887 2.995 3.14 3.282 3.407 3.558 3.714 3.863 4.033 4.235 4.434 4.652 4.892 5.151 5.41 5.704 6.038 6.323 6.636 7.013 7.489 7.958 8.457 8.979 9.352 9.362 9.152 8.932 8.706 8.426 8.137 7.854 7.577 7.295 7.042 6.793 6.555 6.362 6.192 6.021 5.832 5.67 5.538 5.391 5.225 5.089 4.955 4.798 4.673 4.55 4.415 4.27 4.129 4.032 3.936 3.796 3.685 3.548 3.478 3.327 3.172 3.041 2.962 2.794 2.681 2.593 2.503 2.307 2.195 2.07 1.957 1.798 1.55 1.252 0.441 -2 ,17970 ,TETRA ,17555115,Thu Nov 25 17:05:26 CET,Thu Nov 25 19:31:58 CET,0.0 0.42 0.564 0.665 0.77 0.873 0.965 1.047 1.207 1.277 1.332 1.376 1.52 1.582 1.709 1.825 1.935 1.987 2.086 2.193 2.355 2.453 2.551 2.693 2.834 2.963 3.081 3.204 3.362 3.512 3.654 3.818 3.966 4.103 4.278 4.485 4.678 4.886 5.105 5.33 5.571 5.841 6.177 6.558 6.98 7.409 7.862 8.312 8.808 9.248 9.597 9.646 9.491 9.261 8.996 8.745 8.488 8.221 7.98 7.705 7.441 7.228 7.024 6.814 6.617 6.422 6.211 6.022 5.852 5.681 5.519 5.392 5.249 5.101 4.984 4.859 4.731 4.599 4.456 4.349 4.245 4.085 3.964 3.831 3.765 3.634 3.501 3.363 3.288 3.139 3.053 2.969 2.869 2.633 2.523 2.407 2.259 2.092 1.914 1.711 0.993 -3 ,3049 ,TETRA ,17555116,Thu Nov 25 17:05:25 CET,Thu Nov 25 19:32:31 CET,0.0 0.397 0.579 0.764 0.921 1.046 1.152 1.251 1.434 1.512 1.581 1.629 1.781 1.851 1.979 2.105 2.234 2.291 2.395 2.49 2.624 2.717 2.814 2.965 3.11 3.247 3.372 3.49 3.644 3.8 3.957 4.139 4.308 4.476 4.675 4.889 5.083 5.297 5.538 5.812 6.101 6.418 6.775 7.124 7.524 7.968 8.466 8.967 9.523 10.112 10.62 10.875 10.905 10.775 10.571 10.31 9.989 9.65 9.36 9.077 8.841 8.635 8.433 8.227 8.01 7.798 7.586 7.392 7.218 7.035 6.841 6.686 6.522 6.365 6.249 6.12 5.986 5.847 5.695 5.594 5.506 5.362 5.244 5.113 5.051 4.916 4.761 4.605 4.517 4.35 4.258 4.18 4.097 3.896 3.768 3.624 3.488 3.343 3.149 2.918 2.288 -4 ,2629 ,TETRA ,17555117,Thu Nov 25 17:05:26 CET,Thu Nov 25 19:16:12 CET,0.0 0.333 0.49 0.628 0.751 0.865 0.959 1.06 1.263 1.331 1.397 1.444 1.586 1.656 1.786 1.912 2.044 2.104 2.213 2.306 2.44 2.532 2.616 2.733 2.847 2.956 3.067 3.17 3.303 3.435 3.568 3.733 3.896 4.047 4.216 4.409 4.594 4.799 4.998 5.204 5.434 5.666 5.915 6.176 6.507 6.915 7.353 7.784 8.265 8.662 8.983 8.991 8.61 8.196 7.844 7.541 7.272 6.997 6.76 6.503 6.246 6.026 5.812 5.595 5.389 5.212 5.035 4.855 4.692 4.528 4.364 4.231 4.102 3.962 3.847 3.743 3.645 3.535 3.417 3.341 3.258 3.111 3.0 2.884 2.825 2.699 2.57 2.429 2.359 2.213 2.119 2.037 1.952 1.781 1.694 1.609 1.499 1.379 1.286 1.119 0.466 -5 ,28877 ,TETRA ,17555118,Thu Nov 25 17:05:25 CET,Thu Nov 25 19:33:11 CET,0.0 0.37 0.538 0.685 0.819 0.931 1.026 1.114 1.288 1.374 1.453 1.512 1.652 1.707 1.828 1.965 2.096 2.153 2.257 2.36 2.511 2.612 2.705 2.841 2.99 3.123 3.243 3.365 3.522 3.668 3.813 3.998 4.17 4.345 4.554 4.787 5.007 5.237 5.469 5.701 5.945 6.218 6.532 6.859 7.238 7.631 8.015 8.418 8.91 9.435 9.819 9.918 9.774 9.441 9.059 8.679 8.29 7.88 7.513 7.141 6.831 6.583 6.353 6.134 5.935 5.75 5.553 5.379 5.227 5.055 4.881 4.727 4.554 4.384 4.257 4.121 3.987 3.845 3.705 3.62 3.519 3.368 3.254 3.123 3.065 2.951 2.83 2.701 2.625 2.463 2.349 2.264 2.185 1.974 1.839 1.702 1.553 1.35 1.109 0.775 -0.147 -6 ,30786 ,TETRA ,17555119,Thu Nov 25 17:05:26 CET,Thu Nov 25 19:33:18 CET,0.0 0.536 0.722 0.831 0.945 1.05 1.138 1.238 1.425 1.504 1.584 1.647 1.795 1.861 1.999 2.145 2.273 2.336 2.47 2.596 2.767 2.874 2.981 3.134 3.277 3.411 3.532 3.648 3.79 3.937 4.086 4.257 4.426 4.591 4.768 4.979 5.198 5.43 5.671 5.923 6.199 6.528 6.91 7.313 7.766 8.21 8.649 9.079 9.487 9.85 10.129 10.097 9.824 9.457 9.044 8.652 8.27 7.892 7.596 7.29 6.984 6.708 6.46 6.238 6.04 5.853 5.648 5.453 5.268 5.075 4.871 4.704 4.543 4.348 4.192 4.048 3.893 3.729 3.575 3.478 3.368 3.182 3.034 2.879 2.807 2.664 2.517 2.357 2.271 2.11 2.004 1.903 1.789 1.561 1.438 1.291 1.136 0.958 0.689 0.355 -0.746 -7 ,2474 ,TETRA ,17555120,Thu Nov 25 17:05:26 CET,Thu Nov 25 19:16:25 CET,0.0 0.5 0.735 0.897 1.011 1.116 1.21 1.291 1.435 1.502 1.574 1.64 1.79 1.855 1.988 2.119 2.226 2.276 2.378 2.487 2.645 2.747 2.861 3.016 3.143 3.267 3.393 3.521 3.686 3.833 3.987 4.172 4.329 4.488 4.689 4.926 5.137 5.361 5.605 5.858 6.13 6.415 6.737 7.076 7.45 7.848 8.306 8.804 9.295 9.806 10.344 10.437 10.326 10.114 9.804 9.477 9.159 8.885 8.638 8.387 8.146 7.908 7.693 7.489 7.273 7.073 6.876 6.695 6.539 6.382 6.212 6.064 5.912 5.729 5.575 5.422 5.287 5.161 5.019 4.908 4.788 4.6 4.464 4.33 4.257 4.111 3.976 3.807 3.723 3.572 3.458 3.351 3.246 3.024 2.896 2.759 2.61 2.479 2.334 2.116 1.082 -8 ,5410 ,TETRA ,17555121,Thu Nov 25 17:05:26 CET,Thu Nov 25 19:30:31 CET,0.0 0.268 0.394 0.506 0.639 0.755 0.836 0.918 1.1 1.176 1.249 1.318 1.468 1.525 1.642 1.758 1.872 1.934 2.043 2.143 2.295 2.393 2.491 2.627 2.758 2.892 3.02 3.135 3.285 3.434 3.574 3.742 3.919 4.092 4.286 4.505 4.702 4.92 5.163 5.425 5.709 6.006 6.337 6.689 7.1 7.553 8.06 8.614 9.23 9.873 10.406 10.623 10.599 10.426 10.144 9.809 9.486 9.16 8.872 8.546 8.205 7.89 7.588 7.305 7.065 6.858 6.65 6.479 6.345 6.204 6.03 5.882 5.744 5.603 5.472 5.323 5.183 5.029 4.858 4.744 4.619 4.41 4.281 4.142 4.07 3.914 3.741 3.57 3.484 3.33 3.246 3.163 3.068 2.875 2.777 2.662 2.515 2.322 2.097 1.792 1.108 -9 ,27937 ,TETRA ,17555122,Thu Nov 25 17:05:26 CET,Thu Nov 25 19:30:44 CET,0.0 0.367 0.496 0.582 0.682 0.791 0.884 0.976 1.162 1.243 1.32 1.373 1.512 1.566 1.68 1.801 1.902 1.95 2.05 2.145 2.283 2.374 2.466 2.604 2.731 2.855 2.976 3.088 3.231 3.387 3.541 3.727 3.907 4.075 4.275 4.484 4.669 4.884 5.127 5.369 5.626 5.925 6.258 6.585 6.961 7.38 7.853 8.345 8.854 9.391 10.006 10.298 10.213 9.897 9.515 9.157 8.817 8.491 8.204 7.92 7.668 7.461 7.289 7.13 6.97 6.784 6.555 6.361 6.208 6.054 5.89 5.748 5.597 5.437 5.306 5.167 5.034 4.893 4.738 4.63 4.524 4.364 4.244 4.111 4.041 3.885 3.736 3.571 3.472 3.311 3.209 3.117 3.023 2.795 2.661 2.528 2.393 2.236 2.051 1.801 1.363 -10 ,4525 ,TETRA ,17555123,Thu Nov 25 17:08:10 CET,Thu Nov 25 19:19:20 CET,0.0 0.311 0.477 0.603 0.722 0.831 0.943 1.052 1.228 1.315 1.396 1.453 1.598 1.653 1.765 1.88 1.975 2.018 2.116 2.211 2.341 2.43 2.522 2.658 2.785 2.897 3.006 3.117 3.259 3.394 3.529 3.699 3.872 4.027 4.198 4.403 4.595 4.802 5.041 5.29 5.543 5.848 6.226 6.586 6.973 7.393 7.874 8.427 9.065 9.704 10.312 10.652 10.67 10.518 10.265 10.01 9.76 9.481 9.222 8.965 8.718 8.493 8.318 8.148 7.957 7.752 7.537 7.364 7.214 7.068 6.912 6.77 6.628 6.48 6.366 6.235 6.086 5.939 5.786 5.688 5.589 5.424 5.313 5.177 5.1 4.95 4.813 4.664 4.567 4.381 4.218 4.101 3.992 3.75 3.619 3.497 3.348 3.176 2.975 2.734 2.072 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 2ed5735e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13065 ,TETRA ,17555124,Thu Nov 25 17:08:11 CET,Thu Nov 25 19:34:55 CET,0.0 0.442 0.65 0.794 0.915 1.025 1.129 1.229 1.418 1.507 1.591 1.658 1.806 1.874 2.015 2.154 2.274 2.335 2.466 2.595 2.792 2.914 3.021 3.179 3.339 3.496 3.651 3.804 4.007 4.203 4.388 4.605 4.807 5.002 5.233 5.518 5.815 6.127 6.466 6.836 7.216 7.631 8.122 8.625 9.202 9.846 10.581 11.441 12.47 13.633 15.071 16.249 16.847 17.151 17.302 17.343 17.302 17.197 17.1 17.02 16.922 16.808 16.685 16.553 16.431 16.319 16.201 16.098 16.008 15.912 15.795 15.691 15.594 15.494 15.406 15.314 15.215 15.106 14.996 14.924 14.841 14.707 14.624 14.539 14.493 14.395 14.295 14.179 14.12 14.005 13.967 13.918 13.856 13.696 13.604 13.505 13.402 13.293 13.154 12.992 12.617 -2 ,25868 ,TETRA ,17555125,Thu Nov 25 17:08:11 CET,Thu Nov 25 19:34:36 CET,0.0 0.37 0.513 0.627 0.75 0.873 0.99 1.098 1.282 1.374 1.475 1.587 1.75 1.836 2.004 2.155 2.295 2.362 2.492 2.623 2.804 2.927 3.052 3.224 3.409 3.579 3.731 3.881 4.093 4.314 4.519 4.761 4.988 5.2 5.438 5.71 5.987 6.31 6.663 7.015 7.414 7.899 8.452 8.992 9.612 10.319 11.132 12.024 13.063 14.22 15.367 16.061 16.391 16.463 16.379 16.261 16.161 16.047 15.903 15.769 15.662 15.544 15.42 15.306 15.176 15.035 14.861 14.703 14.581 14.448 14.325 14.232 14.143 14.054 13.976 13.89 13.801 13.707 13.609 13.538 13.459 13.339 13.243 13.136 13.085 12.989 12.887 12.783 12.73 12.609 12.528 12.447 12.375 12.205 12.108 12.014 11.904 11.789 11.66 11.499 11.037 -3 ,24162 ,TETRA ,17555126,Thu Nov 25 17:08:12 CET,Thu Nov 25 19:20:15 CET,0.0 0.347 0.512 0.658 0.796 0.924 1.039 1.142 1.334 1.423 1.517 1.617 1.785 1.873 2.029 2.176 2.326 2.396 2.524 2.639 2.813 2.935 3.052 3.224 3.395 3.557 3.716 3.871 4.069 4.282 4.494 4.742 4.972 5.188 5.438 5.724 6.021 6.354 6.702 7.068 7.446 7.873 8.381 8.919 9.565 10.27 11.102 12.076 13.275 14.756 16.451 17.593 18.055 18.347 18.55 18.589 18.521 18.413 18.311 18.199 18.111 18.019 17.912 17.797 17.655 17.534 17.427 17.323 17.228 17.129 17.024 16.928 16.823 16.71 16.626 16.531 16.416 16.293 16.178 16.098 16.02 15.912 15.83 15.746 15.699 15.595 15.502 15.419 15.36 15.218 15.123 15.045 14.966 14.812 14.735 14.638 14.534 14.436 14.326 14.167 13.723 -4 ,4610 ,TETRA ,17555127,Thu Nov 25 17:08:11 CET,Thu Nov 25 19:34:22 CET,0.0 0.394 0.558 0.676 0.8 0.914 1.006 1.093 1.261 1.344 1.427 1.515 1.671 1.745 1.889 2.027 2.161 2.221 2.33 2.442 2.615 2.725 2.831 2.994 3.161 3.322 3.48 3.632 3.825 4.004 4.185 4.42 4.64 4.86 5.109 5.383 5.655 5.953 6.282 6.636 7.01 7.427 7.916 8.419 9.018 9.701 10.487 11.359 12.365 13.53 14.824 15.756 16.2 16.416 16.492 16.498 16.465 16.385 16.285 16.185 16.103 16.003 15.876 15.735 15.598 15.481 15.373 15.275 15.173 15.068 14.952 14.843 14.731 14.612 14.509 14.413 14.322 14.221 14.117 14.038 13.95 13.806 13.701 13.599 13.558 13.462 13.348 13.252 13.199 13.082 13.029 12.947 12.861 12.702 12.6 12.47 12.345 12.243 12.133 11.966 11.537 -5 ,4489 ,TETRA ,17555128,Thu Nov 25 17:08:12 CET,Thu Nov 25 19:34:07 CET,0.0 0.29 0.44 0.603 0.764 0.891 0.994 1.083 1.235 1.31 1.39 1.469 1.621 1.695 1.852 2.009 2.155 2.228 2.362 2.479 2.658 2.78 2.909 3.1 3.276 3.442 3.613 3.781 3.98 4.175 4.358 4.574 4.794 5.014 5.264 5.545 5.825 6.134 6.479 6.854 7.24 7.674 8.2 8.734 9.368 10.124 11.002 11.985 13.185 14.588 16.137 17.392 18.101 18.418 18.509 18.507 18.44 18.329 18.265 18.236 18.185 18.113 18.036 17.959 17.876 17.798 17.713 17.632 17.565 17.501 17.417 17.329 17.222 17.098 17.003 16.914 16.826 16.721 16.61 16.536 16.449 16.32 16.234 16.135 16.088 15.995 15.879 15.745 15.676 15.543 15.454 15.382 15.309 15.139 15.046 14.957 14.867 14.731 14.601 14.439 13.936 -6 ,2464 ,TETRA ,17555129,Thu Nov 25 17:08:13 CET,Thu Nov 25 19:19:36 CET,0.0 0.234 0.406 0.561 0.688 0.792 0.893 0.982 1.152 1.246 1.334 1.411 1.568 1.641 1.808 1.972 2.117 2.188 2.322 2.438 2.619 2.748 2.868 3.042 3.216 3.386 3.551 3.721 3.935 4.122 4.319 4.577 4.816 5.05 5.314 5.607 5.895 6.209 6.558 6.934 7.34 7.817 8.378 8.942 9.598 10.34 11.228 12.247 13.4 14.762 16.45 17.761 18.408 18.784 18.983 19.047 19.018 18.965 18.883 18.725 18.58 18.475 18.383 18.284 18.178 18.075 17.974 17.885 17.807 17.723 17.617 17.511 17.404 17.303 17.23 17.161 17.081 16.976 16.864 16.796 16.72 16.604 16.525 16.424 16.372 16.272 16.172 16.067 16.009 15.887 15.828 15.766 15.701 15.562 15.477 15.376 15.259 15.137 14.976 14.789 14.576 -7 ,8457 ,TETRA ,17555130,Thu Nov 25 17:14:09 CET,Thu Nov 25 19:40:35 CET,0.0 0.22 0.415 0.561 0.697 0.821 0.933 1.033 1.202 1.287 1.368 1.454 1.608 1.678 1.818 1.963 2.097 2.152 2.257 2.359 2.515 2.621 2.725 2.869 3.008 3.161 3.317 3.456 3.625 3.791 3.963 4.171 4.374 4.576 4.803 5.064 5.325 5.603 5.9 6.245 6.606 6.994 7.468 7.949 8.495 9.121 9.832 10.631 11.605 12.728 14.056 15.076 15.55 15.808 15.965 16.025 15.996 15.948 15.869 15.746 15.627 15.509 15.393 15.277 15.163 15.051 14.931 14.825 14.723 14.621 14.529 14.444 14.348 14.247 14.17 14.092 14.011 13.917 13.8 13.722 13.65 13.535 13.45 13.363 13.314 13.2 13.073 12.962 12.91 12.784 12.705 12.634 12.556 12.382 12.293 12.192 12.092 11.992 11.859 11.717 11.282 -8 ,1545 ,TETRA ,17555131,Thu Nov 25 17:14:11 CET,Thu Nov 25 19:40:56 CET,0.0 0.632 0.854 1.005 1.14 1.253 1.356 1.471 1.676 1.761 1.859 1.956 2.108 2.175 2.306 2.44 2.571 2.637 2.761 2.884 3.081 3.207 3.316 3.484 3.653 3.815 3.97 4.12 4.317 4.506 4.687 4.9 5.118 5.34 5.587 5.858 6.132 6.445 6.782 7.143 7.517 7.926 8.392 8.869 9.469 10.167 10.993 11.934 12.944 14.142 15.627 16.625 16.986 17.112 17.175 17.207 17.216 17.204 17.138 17.024 16.91 16.793 16.672 16.559 16.462 16.377 16.28 16.185 16.109 16.024 15.93 15.854 15.775 15.693 15.619 15.541 15.469 15.393 15.303 15.239 15.169 15.05 14.975 14.905 14.87 14.793 14.702 14.596 14.539 14.417 14.372 14.31 14.24 14.108 14.025 13.939 13.86 13.765 13.629 13.466 13.166 -9 ,23160 ,TETRA ,17555132,Thu Nov 25 19:10:46 CET,Thu Nov 25 21:22:53 CET,0.0 0.32 0.535 0.671 0.78 0.895 0.999 1.09 1.274 1.36 1.448 1.526 1.685 1.762 1.905 2.047 2.19 2.261 2.399 2.539 2.738 2.865 2.995 3.189 3.384 3.564 3.737 3.904 4.114 4.317 4.533 4.808 5.062 5.301 5.563 5.87 6.174 6.502 6.87 7.267 7.681 8.149 8.701 9.281 9.958 10.675 11.515 12.46 13.587 14.946 16.566 17.881 18.585 18.978 19.206 19.33 19.322 19.246 19.179 19.1 19.021 18.947 18.859 18.769 18.667 18.557 18.463 18.362 18.274 18.195 18.097 18.014 17.926 17.834 17.76 17.662 17.564 17.467 17.355 17.284 17.216 17.109 17.015 16.918 16.874 16.78 16.678 16.579 16.526 16.403 16.335 16.266 16.202 16.068 15.985 15.896 15.801 15.682 15.538 15.375 14.979 -10 ,28976 ,TETRA ,17555133,Thu Nov 25 19:10:46 CET,Thu Nov 25 21:22:27 CET,0.0 0.57 0.766 0.914 1.033 1.134 1.234 1.333 1.513 1.599 1.686 1.766 1.915 1.994 2.147 2.276 2.401 2.463 2.589 2.721 2.899 3.001 3.105 3.265 3.418 3.579 3.74 3.891 4.083 4.277 4.461 4.68 4.907 5.129 5.382 5.654 5.912 6.209 6.541 6.9 7.28 7.717 8.217 8.657 9.151 9.732 10.393 11.147 12.07 13.126 14.377 15.316 15.683 15.781 15.798 15.836 15.812 15.723 15.646 15.574 15.493 15.391 15.272 15.159 15.031 14.892 14.772 14.658 14.553 14.442 14.313 14.208 14.105 13.989 13.893 13.802 13.701 13.598 13.501 13.43 13.353 13.236 13.158 13.083 13.046 12.968 12.879 12.791 12.739 12.618 12.57 12.518 12.466 12.305 12.218 12.139 12.04 11.935 11.818 11.696 11.415 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt deleted file mode 100644 index 80378fb6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7022 ,TETRA ,17555134,Thu Nov 25 19:10:47 CET,Thu Nov 25 21:24:13 CET,0.0 0.35 0.521 0.646 0.763 0.862 0.986 1.104 1.267 1.343 1.418 1.507 1.656 1.716 1.836 1.974 2.099 2.146 2.24 2.331 2.471 2.565 2.654 2.798 2.941 3.066 3.181 3.296 3.453 3.589 3.719 3.872 4.007 4.138 4.295 4.48 4.652 4.846 5.065 5.28 5.521 5.828 6.131 6.377 6.671 6.976 7.292 7.652 8.037 8.355 8.463 8.228 7.871 7.497 7.119 6.712 6.352 6.061 5.806 5.528 5.28 5.042 4.776 4.525 4.299 4.097 3.882 3.691 3.53 3.353 3.167 3.009 2.853 2.694 2.568 2.438 2.302 2.155 2.016 1.931 1.833 1.678 1.572 1.467 1.417 1.313 1.192 1.047 0.964 0.806 0.725 0.63 0.539 0.347 0.241 0.13 0.007 -0.132 -0.286 -0.489 -0.925 -2 ,16360 ,TETRA ,17555135,Thu Nov 25 19:12:49 CET,Thu Nov 25 21:25:50 CET,0.0 0.317 0.487 0.629 0.74 0.86 0.983 1.093 1.31 1.408 1.5 1.586 1.736 1.805 1.938 2.06 2.177 2.24 2.364 2.462 2.621 2.727 2.816 2.941 3.069 3.215 3.351 3.472 3.633 3.78 3.912 4.078 4.243 4.4 4.594 4.8 4.967 5.181 5.436 5.675 5.909 6.207 6.56 6.868 7.193 7.488 7.799 8.189 8.627 8.961 9.105 8.936 8.562 8.14 7.73 7.289 6.89 6.555 6.248 5.92 5.652 5.421 5.195 4.965 4.74 4.544 4.356 4.17 3.977 3.768 3.555 3.38 3.207 3.029 2.888 2.737 2.585 2.42 2.24 2.128 2.016 1.836 1.698 1.555 1.492 1.363 1.208 1.03 0.939 0.778 0.698 0.589 0.466 0.215 0.094 -0.02 -0.146 -0.288 -0.501 -0.773 -1.495 -3 ,2487 ,TETRA ,17555136,Thu Nov 25 19:12:49 CET,Thu Nov 25 21:25:35 CET,0.0 0.67 0.826 0.936 1.018 1.092 1.177 1.253 1.377 1.442 1.503 1.551 1.689 1.742 1.845 1.936 2.03 2.076 2.163 2.244 2.367 2.459 2.548 2.667 2.773 2.872 2.966 3.064 3.19 3.295 3.413 3.566 3.696 3.822 3.968 4.119 4.25 4.384 4.543 4.725 4.899 5.091 5.308 5.5 5.698 5.957 6.258 6.495 6.719 6.803 6.506 5.852 5.18 4.538 3.99 3.486 2.99 2.531 2.129 1.731 1.412 1.13 0.855 0.599 0.359 0.146 -0.076 -0.292 -0.477 -0.656 -0.847 -1.017 -1.194 -1.374 -1.518 -1.66 -1.806 -1.953 -2.106 -2.218 -2.339 -2.515 -2.624 -2.753 -2.82 -2.956 -3.104 -3.247 -3.316 -3.473 -3.567 -3.66 -3.754 -3.951 -4.055 -4.173 -4.308 -4.458 -4.623 -4.8 -5.148 -4 ,27498 ,TETRA ,17555137,Thu Nov 25 19:12:49 CET,Thu Nov 25 21:25:43 CET,0.0 0.321 0.513 0.693 0.843 0.96 1.057 1.146 1.289 1.362 1.439 1.487 1.63 1.699 1.817 1.942 2.063 2.112 2.208 2.322 2.497 2.606 2.715 2.878 3.024 3.149 3.264 3.375 3.53 3.685 3.837 4.014 4.183 4.346 4.537 4.757 4.954 5.161 5.371 5.576 5.785 6.011 6.287 6.537 6.787 7.093 7.397 7.677 7.988 8.269 8.324 8.095 7.782 7.392 6.969 6.538 6.118 5.713 5.38 5.014 4.689 4.416 4.134 3.876 3.656 3.444 3.21 3.014 2.858 2.691 2.49 2.331 2.18 2.013 1.88 1.738 1.604 1.453 1.279 1.165 1.056 0.895 0.781 0.667 0.611 0.478 0.332 0.197 0.131 -0.019 -0.098 -0.18 -0.259 -0.418 -0.507 -0.604 -0.718 -0.828 -0.951 -1.143 -1.379 -5 ,2130 ,TETRA ,17555138,Thu Nov 25 19:16:43 CET,Thu Nov 25 21:29:14 CET,0.0 0.284 0.47 0.618 0.743 0.852 0.954 1.054 1.25 1.339 1.419 1.492 1.626 1.687 1.818 1.938 2.047 2.101 2.2 2.308 2.481 2.594 2.694 2.827 2.958 3.077 3.183 3.284 3.416 3.542 3.67 3.838 3.994 4.131 4.302 4.491 4.666 4.854 5.055 5.274 5.521 5.789 6.041 6.265 6.529 6.823 7.061 7.204 7.266 7.152 6.767 6.178 5.596 5.028 4.493 3.955 3.444 2.972 2.548 2.116 1.733 1.383 1.058 0.776 0.533 0.306 0.052 -0.182 -0.396 -0.608 -0.814 -0.985 -1.168 -1.373 -1.534 -1.704 -1.868 -2.022 -2.187 -2.295 -2.394 -2.554 -2.667 -2.785 -2.848 -2.976 -3.101 -3.224 -3.291 -3.444 -3.516 -3.603 -3.695 -3.878 -3.978 -4.098 -4.229 -4.364 -4.573 -4.839 -5.233 -6 ,11252 ,TETRA ,17555139,Thu Nov 25 19:16:43 CET,Thu Nov 25 21:29:33 CET,0.0 0.412 0.621 0.789 0.916 1.028 1.136 1.224 1.378 1.46 1.54 1.611 1.765 1.843 1.977 2.082 2.194 2.253 2.359 2.456 2.614 2.722 2.824 2.961 3.091 3.229 3.355 3.478 3.644 3.79 3.916 4.073 4.237 4.39 4.559 4.745 4.919 5.111 5.342 5.57 5.8 6.069 6.396 6.713 7.008 7.292 7.625 7.959 8.227 8.415 8.298 7.786 7.268 6.75 6.236 5.757 5.324 4.907 4.527 4.131 3.8 3.535 3.271 2.987 2.726 2.495 2.251 2.038 1.857 1.662 1.454 1.295 1.126 0.949 0.811 0.667 0.518 0.359 0.199 0.088 -0.039 -0.232 -0.351 -0.479 -0.547 -0.675 -0.814 -0.971 -1.043 -1.2 -1.288 -1.385 -1.497 -1.742 -1.864 -1.971 -2.089 -2.234 -2.396 -2.585 -3.003 -7 ,3075 ,TETRA ,17555140,Thu Nov 25 19:16:43 CET,Thu Nov 25 21:29:14 CET,0.0 0.516 0.702 0.84 0.976 1.103 1.236 1.353 1.527 1.603 1.674 1.744 1.905 1.973 2.085 2.191 2.297 2.345 2.433 2.529 2.667 2.759 2.849 2.975 3.1 3.219 3.333 3.442 3.589 3.719 3.846 4.004 4.149 4.298 4.45 4.605 4.771 4.973 5.201 5.431 5.668 5.926 6.24 6.594 6.987 7.39 7.754 8.023 8.289 8.525 8.535 8.278 7.839 7.222 6.621 6.047 5.558 5.132 4.746 4.329 3.946 3.614 3.296 2.992 2.689 2.407 2.119 1.853 1.635 1.436 1.236 1.073 0.904 0.711 0.552 0.383 0.209 0.038 -0.142 -0.262 -0.379 -0.56 -0.682 -0.81 -0.877 -1.012 -1.16 -1.328 -1.405 -1.558 -1.659 -1.763 -1.863 -2.049 -2.153 -2.273 -2.414 -2.565 -2.722 -2.941 -3.717 -8 ,30691 ,TETRA ,17555141,Thu Nov 25 19:19:45 CET,Thu Nov 25 21:32:31 CET,0.0 0.322 0.474 0.597 0.702 0.816 0.912 0.998 1.152 1.225 1.308 1.387 1.527 1.586 1.7 1.813 1.937 1.994 2.081 2.163 2.293 2.385 2.475 2.602 2.733 2.864 2.993 3.124 3.281 3.424 3.552 3.704 3.869 4.018 4.181 4.362 4.538 4.733 4.924 5.115 5.34 5.613 5.875 6.104 6.399 6.752 7.076 7.359 7.655 7.888 7.853 7.531 7.166 6.739 6.32 5.908 5.532 5.211 4.961 4.695 4.434 4.167 3.908 3.686 3.49 3.314 3.122 2.943 2.786 2.62 2.447 2.305 2.123 1.896 1.716 1.529 1.338 1.159 0.977 0.837 0.691 0.464 0.305 0.15 0.074 -0.081 -0.227 -0.364 -0.435 -0.592 -0.668 -0.752 -0.845 -1.066 -1.187 -1.3 -1.42 -1.557 -1.716 -1.902 -2.25 -9 ,22185 ,TETRA ,17555142,Thu Nov 25 19:20:50 CET,Thu Nov 25 21:33:47 CET,0.0 0.453 0.63 0.765 0.883 0.989 1.101 1.211 1.374 1.44 1.502 1.547 1.684 1.744 1.868 1.992 2.104 2.159 2.271 2.371 2.525 2.624 2.71 2.833 2.961 3.086 3.191 3.29 3.442 3.598 3.723 3.859 4.0 4.143 4.322 4.515 4.682 4.868 5.054 5.253 5.473 5.714 5.977 6.231 6.514 6.806 7.13 7.479 7.791 7.992 7.984 7.663 7.301 6.931 6.527 6.123 5.725 5.36 5.05 4.72 4.41 4.082 3.744 3.43 3.139 2.891 2.657 2.45 2.275 2.089 1.896 1.731 1.552 1.382 1.244 1.106 0.972 0.832 0.697 0.598 0.493 0.336 0.217 0.086 0.025 -0.092 -0.221 -0.36 -0.432 -0.587 -0.654 -0.73 -0.819 -1.009 -1.096 -1.201 -1.331 -1.48 -1.645 -1.844 -2.342 -10 ,17170 ,TETRA ,17555143,Thu Nov 25 19:20:50 CET,Thu Nov 25 21:33:23 CET,0.0 0.472 0.676 0.807 0.898 0.972 1.052 1.142 1.312 1.391 1.474 1.545 1.684 1.747 1.854 1.965 2.083 2.132 2.246 2.365 2.513 2.609 2.702 2.83 2.957 3.074 3.185 3.297 3.44 3.574 3.705 3.874 4.037 4.193 4.376 4.582 4.771 4.971 5.177 5.381 5.603 5.897 6.209 6.473 6.812 7.199 7.599 7.978 8.303 8.558 8.603 8.266 7.853 7.501 7.133 6.714 6.303 5.927 5.603 5.275 5.001 4.751 4.495 4.258 4.05 3.85 3.636 3.45 3.287 3.097 2.887 2.735 2.583 2.428 2.307 2.173 2.038 1.886 1.718 1.613 1.515 1.352 1.231 1.103 1.038 0.912 0.782 0.636 0.566 0.417 0.343 0.258 0.166 -0.019 -0.126 -0.242 -0.36 -0.472 -0.586 -0.756 -1.223 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index be153622..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6408 ,TETRA ,17555144,Thu Nov 25 19:23:45 CET,Thu Nov 25 21:50:16 CET,0.0 0.314 0.482 0.648 0.803 0.936 1.039 1.136 1.318 1.401 1.479 1.546 1.697 1.775 1.926 2.053 2.175 2.233 2.341 2.444 2.595 2.697 2.797 2.952 3.1 3.244 3.386 3.521 3.697 3.887 4.086 4.314 4.514 4.71 4.942 5.202 5.455 5.726 6.009 6.325 6.665 7.067 7.534 7.996 8.581 9.225 9.951 10.813 11.857 12.993 14.272 15.26 15.69 15.817 15.803 15.724 15.623 15.529 15.412 15.248 15.081 14.926 14.778 14.637 14.511 14.383 14.23 14.083 13.953 13.811 13.649 13.523 13.388 13.24 13.136 13.032 12.923 12.818 12.713 12.635 12.553 12.428 12.332 12.225 12.171 12.063 11.942 11.79 11.714 11.583 11.47 11.376 11.283 11.104 11.005 10.893 10.757 10.597 10.407 10.182 9.662 -2 ,29618 ,TETRA ,17555145,Thu Nov 25 19:23:45 CET,Thu Nov 25 21:50:16 CET,0.0 0.298 0.486 0.637 0.769 0.894 1.004 1.109 1.281 1.363 1.453 1.538 1.68 1.751 1.893 2.02 2.149 2.217 2.347 2.464 2.621 2.726 2.837 2.996 3.145 3.295 3.439 3.576 3.763 3.94 4.112 4.328 4.525 4.708 4.921 5.164 5.417 5.706 6.011 6.337 6.681 7.053 7.483 7.937 8.487 9.062 9.706 10.469 11.36 12.36 13.417 14.025 14.239 14.247 14.183 14.087 13.962 13.877 13.819 13.721 13.638 13.552 13.431 13.304 13.186 13.066 12.94 12.832 12.727 12.609 12.503 12.42 12.327 12.23 12.149 12.064 11.981 11.9 11.81 11.748 11.677 11.543 11.45 11.363 11.323 11.242 11.15 11.057 11.008 10.886 10.812 10.735 10.655 10.493 10.397 10.292 10.181 10.078 9.975 9.804 9.549 -3 ,15608 ,TETRA ,17555146,Thu Nov 25 19:23:46 CET,Thu Nov 25 21:50:20 CET,0.0 0.205 0.378 0.517 0.627 0.728 0.819 0.913 1.094 1.172 1.24 1.301 1.45 1.513 1.633 1.756 1.877 1.936 2.04 2.143 2.301 2.402 2.505 2.658 2.812 2.974 3.129 3.281 3.483 3.684 3.875 4.091 4.29 4.475 4.689 4.94 5.185 5.454 5.742 6.034 6.338 6.696 7.123 7.569 8.105 8.702 9.393 10.169 11.127 12.262 13.411 14.164 14.512 14.683 14.73 14.704 14.645 14.54 14.429 14.295 14.179 14.086 13.991 13.874 13.749 13.635 13.505 13.378 13.273 13.169 13.064 12.98 12.877 12.765 12.685 12.595 12.503 12.412 12.311 12.236 12.156 12.024 11.934 11.847 11.797 11.702 11.613 11.516 11.457 11.324 11.25 11.182 11.1 10.948 10.864 10.768 10.678 10.561 10.401 10.175 9.589 -4 ,15905 ,TETRA ,17555147,Thu Nov 25 19:24:48 CET,Thu Nov 25 21:52:00 CET,0.0 0.227 0.387 0.515 0.624 0.723 0.823 0.936 1.135 1.224 1.31 1.386 1.532 1.614 1.756 1.867 1.97 2.024 2.146 2.278 2.453 2.553 2.659 2.815 2.975 3.132 3.288 3.44 3.636 3.828 4.003 4.195 4.381 4.573 4.803 5.068 5.316 5.591 5.888 6.205 6.571 6.99 7.476 7.958 8.501 9.104 9.756 10.452 11.316 12.325 13.398 14.063 14.323 14.385 14.343 14.228 14.069 13.916 13.755 13.595 13.435 13.3 13.188 13.044 12.899 12.778 12.646 12.523 12.426 12.323 12.204 12.108 12.012 11.895 11.794 11.695 11.594 11.484 11.367 11.281 11.179 11.024 10.923 10.812 10.755 10.65 10.528 10.394 10.329 10.199 10.12 10.051 9.964 9.775 9.676 9.563 9.434 9.282 9.073 8.822 8.283 -5 ,29824 ,TETRA ,17555148,Thu Nov 25 19:25:48 CET,Thu Nov 25 21:54:03 CET,0.0 0.264 0.394 0.516 0.654 0.78 0.889 0.98 1.148 1.235 1.328 1.449 1.603 1.669 1.797 1.922 2.045 2.104 2.217 2.327 2.488 2.598 2.704 2.854 2.994 3.136 3.278 3.414 3.583 3.745 3.902 4.087 4.267 4.442 4.649 4.887 5.139 5.423 5.734 6.07 6.413 6.797 7.241 7.688 8.209 8.787 9.458 10.178 11.029 11.964 12.934 13.642 13.971 14.163 14.207 14.193 14.16 14.066 13.938 13.803 13.707 13.608 13.49 13.372 13.248 13.125 12.985 12.849 12.74 12.628 12.504 12.398 12.273 12.13 12.023 11.918 11.795 11.657 11.511 11.41 11.31 11.139 11.023 10.91 10.847 10.727 10.601 10.449 10.368 10.23 10.139 10.057 9.961 9.76 9.663 9.561 9.458 9.331 9.161 8.972 8.498 -6 ,28388 ,TETRA ,17555149,Thu Nov 25 19:26:45 CET,Thu Nov 25 21:53:29 CET,0.0 0.26 0.371 0.474 0.575 0.674 0.767 0.852 1.01 1.087 1.172 1.256 1.407 1.476 1.597 1.712 1.824 1.886 2.02 2.143 2.311 2.421 2.522 2.675 2.827 2.972 3.126 3.271 3.457 3.646 3.83 4.047 4.249 4.43 4.65 4.905 5.147 5.417 5.7 5.995 6.32 6.707 7.135 7.532 8.04 8.615 9.257 10.004 10.852 11.832 13.017 13.922 14.347 14.562 14.626 14.582 14.51 14.42 14.324 14.215 14.11 14.002 13.883 13.769 13.676 13.574 13.441 13.316 13.203 13.094 12.982 12.876 12.759 12.636 12.543 12.447 12.341 12.225 12.099 12.0 11.896 11.771 11.69 11.598 11.548 11.44 11.336 11.222 11.157 11.027 10.925 10.83 10.744 10.573 10.487 10.388 10.265 10.143 9.984 9.774 9.066 -7 ,8328 ,TETRA ,17555150,Thu Nov 25 19:26:46 CET,Thu Nov 25 21:53:32 CET,0.0 0.426 0.606 0.758 0.919 1.078 1.209 1.313 1.496 1.582 1.664 1.742 1.891 1.966 2.105 2.243 2.386 2.452 2.575 2.695 2.875 3.002 3.125 3.28 3.423 3.561 3.686 3.808 3.983 4.168 4.341 4.543 4.745 4.944 5.171 5.424 5.665 5.926 6.198 6.509 6.854 7.246 7.701 8.152 8.696 9.305 9.966 10.719 11.549 12.447 13.545 14.308 14.57 14.568 14.433 14.234 14.03 13.848 13.686 13.531 13.397 13.26 13.123 12.965 12.792 12.629 12.453 12.297 12.162 12.024 11.869 11.739 11.621 11.498 11.399 11.294 11.196 11.096 10.973 10.888 10.809 10.685 10.596 10.498 10.447 10.338 10.212 10.06 9.982 9.84 9.731 9.647 9.564 9.376 9.268 9.149 9.033 8.895 8.728 8.505 7.953 -8 ,2557 ,TETRA ,17555151,Thu Nov 25 19:26:45 CET,Thu Nov 25 21:54:47 CET,0.0 0.29 0.412 0.524 0.636 0.754 0.857 0.947 1.148 1.247 1.325 1.381 1.533 1.615 1.767 1.912 2.051 2.116 2.239 2.357 2.516 2.618 2.725 2.89 3.051 3.206 3.36 3.509 3.694 3.872 4.052 4.275 4.487 4.689 4.931 5.21 5.473 5.755 6.049 6.357 6.693 7.072 7.519 7.953 8.474 9.056 9.651 10.323 11.089 12.017 13.076 13.761 13.929 13.961 13.973 13.899 13.819 13.742 13.617 13.461 13.317 13.168 13.009 12.838 12.686 12.552 12.416 12.304 12.188 12.061 11.919 11.775 11.624 11.472 11.357 11.248 11.127 10.991 10.849 10.748 10.633 10.458 10.341 10.222 10.16 10.019 9.861 9.699 9.612 9.464 9.361 9.257 9.144 8.94 8.843 8.726 8.593 8.473 8.328 8.056 7.466 -9 ,12009 ,TETRA ,17555152,Thu Nov 25 19:27:44 CET,Thu Nov 25 21:55:18 CET,0.0 0.325 0.494 0.62 0.72 0.835 0.949 1.052 1.238 1.318 1.392 1.456 1.603 1.678 1.807 1.925 2.056 2.119 2.239 2.354 2.514 2.621 2.729 2.899 3.056 3.194 3.322 3.448 3.621 3.8 3.978 4.184 4.372 4.556 4.776 5.027 5.273 5.526 5.81 6.121 6.439 6.816 7.272 7.735 8.282 8.897 9.577 10.302 11.136 12.133 13.138 13.758 14.027 14.105 14.056 13.961 13.842 13.738 13.64 13.495 13.361 13.238 13.105 12.978 12.871 12.762 12.62 12.484 12.373 12.254 12.125 12.021 11.9 11.769 11.673 11.576 11.467 11.351 11.232 11.155 11.078 10.952 10.861 10.758 10.706 10.611 10.514 10.413 10.354 10.223 10.137 10.054 9.972 9.819 9.734 9.644 9.518 9.363 9.217 9.073 8.746 -10 ,27673 ,TETRA ,17555153,Thu Nov 25 19:27:47 CET,Thu Nov 25 21:55:36 CET,0.0 0.433 0.604 0.731 0.84 0.942 1.035 1.117 1.272 1.352 1.432 1.525 1.675 1.739 1.87 2.008 2.133 2.19 2.32 2.443 2.597 2.692 2.793 2.936 3.066 3.197 3.323 3.45 3.623 3.801 3.969 4.159 4.346 4.524 4.733 4.989 5.24 5.503 5.766 6.056 6.374 6.716 7.113 7.542 8.049 8.607 9.236 9.865 10.574 11.389 12.157 12.548 12.628 12.607 12.574 12.507 12.415 12.324 12.225 12.1 11.976 11.864 11.761 11.651 11.528 11.391 11.239 11.098 10.97 10.84 10.705 10.596 10.473 10.353 10.256 10.143 10.032 9.917 9.802 9.724 9.633 9.486 9.404 9.314 9.263 9.159 9.052 8.945 8.881 8.752 8.69 8.615 8.539 8.389 8.288 8.177 8.036 7.872 7.702 7.489 7.082 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 21f69021..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,353 ,KEBNE ,17043621,Thu Dec 23 04:45:37 CET,Thu Dec 23 06:29:59 CET,0.0 0.627 0.9 1.099 1.266 1.422 1.56 1.692 1.952 2.076 2.193 2.128 2.53 2.648 2.865 3.069 3.277 3.374 3.569 3.755 4.019 4.194 4.363 4.625 4.886 5.146 5.403 5.643 5.956 6.261 6.556 6.928 7.312 7.688 8.126 8.635 9.119 9.641 10.231 10.896 11.618 12.43 13.407 14.447 15.672 17.072 18.729 20.709 23.187 26.211 30.05 33.459 35.588 36.983 37.919 38.631 39.155 39.51 39.779 39.995 40.146 40.249 40.325 40.41 40.469 40.501 40.497 40.493 40.482 40.42 40.341 40.289 40.226 40.142 40.069 39.994 39.914 39.807 39.687 39.592 39.479 39.307 39.193 39.071 39.009 38.838 38.611 38.371 38.241 37.872 37.84 37.685 37.516 37.064 36.812 36.518 36.194 35.808 35.325 34.684 31.86 -2 ,4132 ,KEBNE ,17043622,Thu Dec 23 04:45:37 CET,Thu Dec 23 06:29:31 CET,0.0 0.6 0.807 0.994 1.169 1.315 1.449 1.577 1.814 1.926 2.033 1.966 2.366 2.467 2.655 2.858 3.062 3.159 3.349 3.542 3.819 3.999 4.178 4.454 4.751 5.059 5.367 5.667 6.064 6.439 6.808 7.263 7.696 8.092 8.515 9.016 9.531 10.101 10.722 11.392 12.122 12.986 14.026 15.105 16.407 17.907 19.649 21.655 24.055 26.98 30.809 34.214 36.364 37.841 38.853 39.589 40.143 40.551 40.819 41.053 41.204 41.296 41.374 41.436 41.466 41.447 41.414 41.383 41.336 41.27 41.202 41.135 41.048 40.958 40.882 40.798 40.697 40.588 40.48 40.402 40.308 40.169 40.07 39.927 39.842 39.681 39.53 39.356 39.252 38.899 38.888 38.758 38.603 38.258 38.064 37.815 37.56 37.252 36.744 35.945 32.782 -3 ,31780 ,KEBNE ,17043623,Thu Dec 23 04:45:37 CET,Thu Dec 23 06:29:31 CET,0.0 0.426 0.676 0.878 1.086 1.267 1.437 1.596 1.88 2.021 2.151 2.126 2.531 2.654 2.89 3.116 3.333 3.433 3.628 3.817 4.096 4.279 4.446 4.692 4.95 5.218 5.488 5.734 6.046 6.374 6.7 7.083 7.462 7.845 8.303 8.791 9.263 9.81 10.41 11.092 11.848 12.727 13.77 14.838 16.107 17.561 19.295 21.297 23.76 26.831 30.534 33.694 35.758 37.24 38.218 38.926 39.444 39.815 40.084 40.306 40.466 40.598 40.706 40.748 40.751 40.758 40.749 40.727 40.714 40.675 40.635 40.596 40.547 40.489 40.437 40.391 40.32 40.22 40.126 40.064 39.993 39.853 39.75 39.65 39.594 39.431 39.253 39.095 39.003 38.665 38.675 38.548 38.422 38.104 37.941 37.765 37.51 37.19 36.711 36.091 30.944 -4 ,7588 ,KEBNE ,17043624,Thu Dec 23 04:45:37 CET,Thu Dec 23 06:29:41 CET,0.0 0.715 0.977 1.184 1.342 1.488 1.638 1.766 1.998 2.132 2.262 2.194 2.595 2.696 2.886 3.063 3.241 3.338 3.536 3.727 4.005 4.193 4.379 4.642 4.896 5.144 5.388 5.637 5.966 6.29 6.603 6.978 7.347 7.708 8.137 8.622 9.098 9.64 10.238 10.892 11.593 12.405 13.382 14.375 15.555 16.916 18.551 20.523 22.961 26.03 29.933 33.349 35.523 36.986 37.956 38.651 39.203 39.622 39.943 40.199 40.339 40.429 40.505 40.562 40.598 40.611 40.595 40.557 40.501 40.434 40.378 40.336 40.289 40.228 40.176 40.131 40.074 40.015 39.93 39.85 39.753 39.602 39.495 39.366 39.299 39.14 38.965 38.776 38.674 38.32 38.345 38.232 38.09 37.748 37.539 37.288 37.023 36.672 36.213 35.602 31.749 -5 ,11790 ,KEBNE ,17043625,Thu Dec 23 04:45:37 CET,Thu Dec 23 06:29:36 CET,0.0 0.495 0.802 1.028 1.187 1.335 1.476 1.62 1.881 1.99 2.1 2.053 2.454 2.559 2.762 2.965 3.187 3.295 3.489 3.686 3.976 4.165 4.352 4.615 4.863 5.106 5.342 5.591 5.919 6.225 6.541 6.933 7.306 7.663 8.093 8.594 9.077 9.651 10.328 11.051 11.784 12.593 13.56 14.576 15.81 17.238 18.935 20.886 23.296 26.346 30.262 33.717 35.899 37.339 38.362 39.203 39.81 40.277 40.618 40.877 41.086 41.239 41.327 41.398 41.442 41.409 41.358 41.362 41.355 41.308 41.252 41.215 41.16 41.083 41.003 40.905 40.811 40.714 40.601 40.516 40.416 40.259 40.146 39.983 39.89 39.713 39.548 39.341 39.214 38.866 38.872 38.758 38.599 38.129 37.898 37.658 37.372 37.021 36.498 35.697 31.025 -6 ,8770 ,KEBNE ,17043626,Thu Dec 23 04:45:37 CET,Thu Dec 23 06:29:18 CET,0.0 0.287 0.478 0.63 0.759 0.896 1.033 1.145 1.363 1.487 1.614 1.561 1.964 2.079 2.293 2.502 2.701 2.797 2.981 3.168 3.461 3.648 3.827 4.087 4.339 4.59 4.83 5.061 5.367 5.674 5.978 6.353 6.725 7.083 7.512 8.0 8.477 9.018 9.61 10.276 10.988 11.803 12.794 13.781 14.951 16.328 17.972 19.892 22.398 25.685 29.927 33.694 36.012 37.559 38.661 39.498 40.127 40.592 40.89 41.092 41.227 41.326 41.4 41.443 41.455 41.475 41.491 41.483 41.487 41.486 41.433 41.378 41.317 41.219 41.143 41.07 40.967 40.857 40.748 40.658 40.567 40.409 40.286 40.163 40.09 39.936 39.749 39.519 39.396 39.042 39.02 38.861 38.723 38.425 38.217 37.988 37.683 37.339 36.949 36.202 32.422 -7 ,24529 ,KEBNE ,17043627,Thu Dec 23 04:45:38 CET,Thu Dec 23 06:29:34 CET,0.0 0.41 0.632 0.819 0.99 1.129 1.26 1.389 1.62 1.725 1.832 1.757 2.162 2.278 2.491 2.68 2.873 2.964 3.144 3.336 3.625 3.812 3.987 4.228 4.464 4.7 4.942 5.183 5.493 5.803 6.101 6.456 6.819 7.179 7.613 8.096 8.576 9.135 9.732 10.389 11.113 11.935 12.92 13.956 15.191 16.617 18.278 20.159 22.486 25.372 29.078 32.374 34.409 35.782 36.724 37.414 37.894 38.225 38.496 38.746 38.919 39.044 39.143 39.207 39.252 39.292 39.313 39.313 39.297 39.257 39.196 39.152 39.1 39.013 38.938 38.876 38.8 38.703 38.572 38.472 38.388 38.259 38.155 38.02 37.95 37.787 37.601 37.42 37.321 36.965 36.942 36.791 36.617 36.226 35.993 35.724 35.365 34.926 34.404 33.651 29.789 -8 ,15836 ,KEBNE ,17043628,Thu Dec 23 04:45:37 CET,Thu Dec 23 06:29:13 CET,0.0 0.55 0.824 1.131 1.417 1.625 1.824 2.022 2.35 2.508 2.668 2.682 3.111 3.247 3.512 3.766 4.012 4.132 4.365 4.59 4.936 5.161 5.385 5.717 6.04 6.357 6.66 6.953 7.336 7.717 8.095 8.541 8.972 9.395 9.915 10.536 11.107 11.695 12.324 13.003 13.704 14.508 15.474 16.466 17.649 19.0 20.676 22.723 25.224 28.272 32.066 35.384 37.514 39.078 40.214 41.015 41.565 41.943 42.236 42.475 42.625 42.721 42.768 42.782 42.787 42.762 42.7 42.645 42.617 42.565 42.484 42.43 42.367 42.285 42.208 42.125 42.04 41.943 41.831 41.745 41.642 41.474 41.341 41.195 41.118 40.951 40.778 40.596 40.513 40.194 40.22 40.081 39.928 39.609 39.365 39.064 38.772 38.464 38.101 37.475 34.453 -9 ,23734 ,KEBNE ,17043629,Thu Dec 23 04:45:38 CET,Thu Dec 23 06:29:14 CET,0.0 0.461 0.73 0.969 1.176 1.377 1.562 1.735 2.055 2.201 2.334 2.303 2.718 2.834 3.04 3.232 3.423 3.523 3.736 3.947 4.257 4.462 4.656 4.949 5.247 5.526 5.793 6.052 6.403 6.741 7.062 7.496 7.942 8.369 8.874 9.457 10.036 10.633 11.222 11.868 12.604 13.471 14.445 15.439 16.695 18.135 19.854 21.885 24.332 27.393 31.282 34.676 36.82 38.263 39.269 39.988 40.473 40.866 41.137 41.314 41.485 41.618 41.682 41.728 41.747 41.73 41.67 41.598 41.541 41.457 41.341 41.241 41.137 41.02 40.918 40.813 40.714 40.595 40.427 40.323 40.228 40.046 39.923 39.813 39.749 39.588 39.416 39.244 39.163 38.836 38.843 38.701 38.53 38.196 38.003 37.748 37.439 37.057 36.614 35.932 31.865 -10 ,8396 ,KEBNE ,17043630,Thu Dec 23 04:45:37 CET,Thu Dec 23 06:30:11 CET,0.0 0.605 0.849 1.038 1.185 1.323 1.482 1.629 1.881 2.018 2.147 2.062 2.449 2.556 2.765 2.969 3.165 3.26 3.461 3.659 3.938 4.121 4.305 4.563 4.816 5.08 5.322 5.56 5.899 6.232 6.549 6.958 7.378 7.781 8.265 8.826 9.344 9.895 10.528 11.224 11.935 12.757 13.769 14.83 16.104 17.562 19.282 21.324 23.843 26.924 30.922 34.429 36.578 38.029 39.004 39.728 40.236 40.588 40.829 41.018 41.163 41.272 41.35 41.406 41.429 41.407 41.369 41.34 41.314 41.29 41.239 41.186 41.14 41.079 41.026 40.955 40.861 40.748 40.624 40.55 40.472 40.311 40.187 40.033 39.953 39.818 39.665 39.505 39.402 39.029 38.942 38.795 38.678 38.372 38.143 37.877 37.579 37.225 36.818 36.276 32.379 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt deleted file mode 100644 index e26549a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8987 ,TETRA ,17555154,Thu Nov 25 19:27:44 CET,Thu Nov 25 21:50:40 CET,0.0 0.462 0.676 0.868 1.034 1.201 1.369 1.51 1.776 1.923 2.059 1.993 2.382 2.492 2.697 2.895 3.101 3.203 3.404 3.592 3.866 4.049 4.228 4.485 4.737 4.984 5.226 5.47 5.79 6.09 6.388 6.766 7.133 7.485 7.918 8.42 8.887 9.43 10.035 10.66 11.319 12.071 12.978 13.93 15.051 16.348 17.898 19.725 21.937 24.64 28.148 31.069 32.827 33.96 34.659 35.093 35.426 35.667 35.753 35.777 35.776 35.748 35.666 35.543 35.416 35.307 35.182 35.076 34.996 34.905 34.791 34.681 34.576 34.476 34.384 34.256 34.127 33.988 33.824 33.714 33.608 33.442 33.307 33.156 33.081 32.922 32.741 32.549 32.439 32.055 31.987 31.808 31.615 31.176 30.904 30.637 30.325 29.952 29.486 28.818 26.308 -2 ,9073 ,TETRA ,17555155,Thu Nov 25 19:27:47 CET,Thu Nov 25 21:51:10 CET,0.0 0.403 0.666 0.881 1.061 1.202 1.338 1.485 1.757 1.88 2.003 1.955 2.362 2.478 2.704 2.912 3.11 3.205 3.38 3.554 3.814 3.995 4.181 4.445 4.697 4.947 5.197 5.439 5.748 6.05 6.339 6.697 7.048 7.381 7.771 8.212 8.647 9.145 9.706 10.3 10.926 11.66 12.538 13.445 14.566 15.888 17.384 19.117 21.367 24.187 27.772 30.967 32.893 34.065 34.771 35.268 35.681 36.012 36.211 36.302 36.317 36.328 36.306 36.245 36.188 36.115 36.032 35.967 35.89 35.792 35.691 35.602 35.479 35.333 35.226 35.119 34.998 34.849 34.689 34.579 34.458 34.249 34.109 33.977 33.895 33.722 33.556 33.358 33.261 32.896 32.873 32.743 32.597 32.256 32.064 31.839 31.56 31.164 30.717 30.199 27.865 -3 ,4865 ,TETRA ,17555156,Thu Nov 25 19:28:42 CET,Thu Nov 25 21:49:35 CET,0.0 0.239 0.467 0.669 0.833 0.994 1.159 1.306 1.557 1.69 1.819 1.774 2.177 2.293 2.491 2.675 2.861 2.951 3.13 3.319 3.605 3.78 3.95 4.201 4.448 4.719 4.996 5.242 5.536 5.827 6.127 6.51 6.862 7.187 7.598 8.066 8.504 9.025 9.606 10.222 10.896 11.68 12.619 13.587 14.723 16.028 17.575 19.412 21.723 24.581 28.178 31.219 32.959 34.029 34.735 35.226 35.55 35.78 35.913 35.976 36.02 36.058 36.057 36.037 35.988 35.934 35.901 35.843 35.785 35.717 35.612 35.532 35.445 35.338 35.257 35.173 35.048 34.885 34.729 34.622 34.51 34.334 34.201 34.036 33.944 33.738 33.499 33.217 33.062 32.667 32.618 32.446 32.231 31.737 31.469 31.188 30.892 30.541 30.126 29.557 26.584 -4 ,30128 ,TETRA ,17555157,Thu Nov 25 19:29:46 CET,Thu Nov 25 21:51:02 CET,0.0 0.644 0.893 1.075 1.246 1.424 1.587 1.752 2.057 2.189 2.309 2.253 2.662 2.772 2.979 3.179 3.378 3.476 3.669 3.856 4.121 4.294 4.464 4.706 4.958 5.219 5.456 5.681 6.003 6.321 6.604 6.978 7.356 7.716 8.137 8.616 9.084 9.579 10.12 10.733 11.409 12.185 13.105 14.032 15.157 16.486 18.064 19.939 22.235 24.858 28.034 30.816 32.492 33.642 34.441 34.987 35.327 35.495 35.604 35.712 35.782 35.818 35.817 35.802 35.778 35.734 35.666 35.582 35.493 35.395 35.26 35.13 34.999 34.865 34.754 34.615 34.466 34.312 34.145 34.024 33.885 33.652 33.496 33.336 33.263 33.09 32.876 32.652 32.538 32.14 32.077 31.934 31.773 31.343 31.096 30.878 30.647 30.345 29.925 29.262 25.426 -5 ,469 ,TETRA ,17555158,Thu Nov 25 19:31:44 CET,Thu Nov 25 21:50:11 CET,0.0 0.404 0.676 0.858 1.029 1.169 1.306 1.447 1.693 1.811 1.927 1.875 2.274 2.379 2.581 2.791 2.994 3.093 3.284 3.466 3.729 3.907 4.092 4.352 4.592 4.836 5.081 5.317 5.617 5.911 6.208 6.576 6.949 7.309 7.706 8.161 8.595 9.091 9.679 10.314 11.015 11.817 12.732 13.676 14.793 16.079 17.634 19.44 21.597 24.104 27.168 29.84 31.473 32.652 33.48 34.022 34.37 34.586 34.689 34.733 34.685 34.626 34.596 34.531 34.459 34.398 34.331 34.24 34.141 34.039 33.905 33.777 33.656 33.517 33.395 33.271 33.126 32.974 32.821 32.71 32.59 32.424 32.303 32.145 32.053 31.87 31.687 31.521 31.439 31.06 30.991 30.834 30.675 30.275 30.028 29.762 29.443 29.032 28.577 27.992 24.499 -6 ,22027 ,TETRA ,17555159,Thu Nov 25 19:31:45 CET,Thu Nov 25 21:50:41 CET,0.0 0.467 0.702 0.89 1.034 1.164 1.292 1.425 1.678 1.792 1.904 1.809 2.206 2.319 2.54 2.757 2.96 3.057 3.243 3.423 3.686 3.848 4.011 4.253 4.481 4.701 4.919 5.154 5.471 5.768 6.082 6.486 6.871 7.243 7.723 8.272 8.761 9.316 9.912 10.55 11.215 11.956 12.844 13.777 14.913 16.183 17.705 19.54 21.668 24.135 27.455 30.409 32.164 33.316 34.065 34.543 34.89 35.17 35.349 35.458 35.472 35.431 35.38 35.308 35.233 35.178 35.118 35.056 34.986 34.907 34.818 34.712 34.599 34.478 34.376 34.272 34.15 34.022 33.902 33.817 33.707 33.506 33.342 33.159 33.079 32.927 32.73 32.511 32.403 32.033 32.019 31.894 31.751 31.374 31.159 30.913 30.613 30.239 29.76 29.15 26.535 -7 ,17727 ,TETRA ,17555160,Thu Nov 25 19:33:45 CET,Thu Nov 25 21:54:51 CET,0.0 0.519 0.734 0.952 1.146 1.308 1.452 1.598 1.87 2.005 2.146 2.104 2.506 2.62 2.844 3.059 3.27 3.367 3.556 3.748 4.025 4.2 4.367 4.626 4.881 5.12 5.361 5.602 5.928 6.244 6.538 6.877 7.212 7.553 7.954 8.414 8.857 9.349 9.9 10.521 11.185 11.92 12.784 13.67 14.758 16.026 17.549 19.302 21.404 24.022 27.455 30.433 32.174 33.29 33.959 34.355 34.575 34.679 34.733 34.764 34.754 34.714 34.654 34.597 34.545 34.494 34.461 34.412 34.323 34.208 34.079 33.968 33.861 33.759 33.669 33.563 33.448 33.306 33.147 33.042 32.932 32.746 32.592 32.43 32.359 32.212 32.034 31.825 31.705 31.337 31.332 31.189 31.027 30.675 30.514 30.315 30.077 29.769 29.37 28.772 25.822 -8 ,20163 ,TETRA ,17555161,Thu Nov 25 19:33:48 CET,Thu Nov 25 21:55:15 CET,0.0 0.471 0.692 0.884 1.059 1.251 1.434 1.583 1.851 1.967 2.078 2.017 2.409 2.507 2.706 2.912 3.109 3.199 3.383 3.575 3.847 4.014 4.178 4.426 4.656 4.88 5.12 5.36 5.672 5.981 6.278 6.636 6.975 7.307 7.721 8.202 8.654 9.14 9.672 10.283 10.959 11.75 12.678 13.628 14.795 16.086 17.61 19.388 21.542 24.263 27.599 30.017 31.399 32.391 33.088 33.585 33.889 34.088 34.197 34.213 34.22 34.201 34.105 33.999 33.892 33.812 33.729 33.651 33.584 33.488 33.384 33.291 33.184 33.035 32.923 32.827 32.712 32.586 32.452 32.356 32.245 32.073 31.95 31.802 31.723 31.563 31.379 31.186 31.095 30.748 30.733 30.571 30.405 30.065 29.855 29.595 29.286 28.993 28.645 28.12 25.713 -9 ,24708 ,TETRA ,17555162,Thu Nov 25 19:33:45 CET,Thu Nov 25 21:54:35 CET,0.0 0.484 0.722 0.917 1.083 1.269 1.444 1.593 1.862 1.995 2.118 2.05 2.453 2.567 2.775 2.99 3.209 3.313 3.512 3.702 3.976 4.146 4.31 4.554 4.792 5.019 5.26 5.51 5.825 6.126 6.416 6.779 7.154 7.513 7.911 8.372 8.84 9.363 9.962 10.598 11.243 12.002 12.915 13.822 14.91 16.235 17.809 19.621 21.788 24.435 27.904 30.929 32.617 33.658 34.429 35.017 35.447 35.741 35.906 35.997 36.04 36.025 35.975 35.942 35.898 35.825 35.747 35.674 35.574 35.453 35.309 35.202 35.123 35.003 34.878 34.755 34.628 34.474 34.303 34.192 34.061 33.843 33.705 33.554 33.454 33.208 32.936 32.67 32.544 32.157 32.122 31.959 31.78 31.378 31.134 30.891 30.622 30.283 29.814 29.023 26.03 -10 ,32161 ,TETRA ,17555163,Thu Nov 25 19:33:48 CET,Thu Nov 25 21:54:49 CET,0.0 1.136 1.493 1.807 2.076 2.272 2.429 2.591 2.897 3.047 3.182 3.126 3.529 3.644 3.868 4.074 4.291 4.403 4.602 4.8 5.085 5.26 5.427 5.681 5.949 6.217 6.481 6.735 7.047 7.338 7.626 7.98 8.336 8.697 9.109 9.576 10.026 10.528 11.09 11.691 12.366 13.169 14.11 15.043 16.184 17.513 19.047 20.784 22.822 25.35 28.615 31.41 33.191 34.366 35.167 35.744 36.117 36.317 36.4 36.408 36.365 36.344 36.313 36.236 36.147 36.072 35.991 35.894 35.789 35.678 35.551 35.441 35.333 35.183 35.064 34.946 34.801 34.641 34.497 34.397 34.286 34.125 34.001 33.87 33.798 33.643 33.46 33.263 33.162 32.794 32.776 32.642 32.476 32.065 31.854 31.61 31.333 31.011 30.637 30.026 27.044 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt deleted file mode 100644 index 4f1c6df4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21992 ,TETRA ,17555164,Thu Nov 25 19:34:45 CET,Thu Nov 25 21:58:13 CET,0.0 0.269 0.417 0.568 0.699 0.816 0.93 1.033 1.219 1.309 1.396 1.325 1.651 1.737 1.93 2.107 2.279 2.359 2.501 2.621 2.785 2.899 3.01 3.182 3.34 3.491 3.649 3.794 3.988 4.179 4.356 4.578 4.812 5.045 5.309 5.599 5.882 6.207 6.549 6.902 7.275 7.703 8.201 8.672 9.217 9.799 10.465 11.25 12.144 13.252 14.596 15.529 15.956 16.057 15.95 15.724 15.548 15.424 15.272 15.129 15.002 14.866 14.727 14.578 14.428 14.295 14.157 14.04 13.937 13.833 13.725 13.616 13.516 13.421 13.328 13.222 13.124 13.031 12.937 12.871 12.801 12.673 12.578 12.484 12.44 12.344 12.247 12.161 12.114 11.826 11.922 11.847 11.774 11.603 11.501 11.395 11.278 11.149 10.998 10.839 10.307 -2 ,5012 ,TETRA ,17555165,Thu Nov 25 19:34:47 CET,Thu Nov 25 21:58:16 CET,0.0 0.346 0.507 0.681 0.856 1.0 1.13 1.25 1.46 1.566 1.663 1.569 1.898 1.979 2.158 2.351 2.522 2.597 2.736 2.862 3.05 3.176 3.296 3.456 3.615 3.78 3.933 4.078 4.273 4.457 4.658 4.934 5.209 5.493 5.828 6.204 6.511 6.793 7.105 7.434 7.772 8.179 8.678 9.175 9.749 10.416 11.208 12.104 13.137 14.266 15.539 16.388 16.747 16.894 16.854 16.717 16.517 16.282 16.074 15.851 15.648 15.467 15.301 15.164 15.039 14.915 14.783 14.657 14.551 14.45 14.353 14.26 14.157 14.051 13.959 13.867 13.787 13.704 13.59 13.511 13.442 13.327 13.251 13.18 13.141 13.047 12.939 12.836 12.778 12.478 12.583 12.517 12.423 12.188 12.065 11.93 11.796 11.68 11.525 11.276 10.591 -3 ,7866 ,TETRA ,17555166,Thu Nov 25 19:35:44 CET,Thu Nov 25 21:59:15 CET,0.0 0.646 0.836 1.0 1.153 1.294 1.411 1.528 1.741 1.831 1.917 1.839 2.177 2.262 2.424 2.58 2.73 2.799 2.932 3.06 3.248 3.378 3.515 3.716 3.889 4.055 4.22 4.361 4.535 4.714 4.891 5.116 5.358 5.595 5.862 6.153 6.426 6.745 7.079 7.429 7.815 8.239 8.705 9.195 9.791 10.436 11.167 11.976 12.909 13.915 14.943 15.644 15.881 15.956 15.942 15.795 15.582 15.372 15.177 14.976 14.785 14.624 14.477 14.333 14.205 14.072 13.926 13.792 13.659 13.524 13.405 13.311 13.203 13.085 12.967 12.817 12.652 12.465 12.271 12.136 11.996 11.779 11.627 11.46 11.37 11.201 11.023 10.841 10.757 10.434 10.456 10.339 10.221 9.987 9.862 9.729 9.583 9.399 9.202 8.985 8.479 -4 ,11077 ,TETRA ,17555167,Thu Nov 25 19:35:47 CET,Thu Nov 25 21:59:37 CET,0.0 0.528 0.734 0.896 1.033 1.135 1.233 1.34 1.52 1.603 1.684 1.611 1.946 2.038 2.197 2.342 2.486 2.558 2.689 2.813 2.994 3.116 3.237 3.394 3.551 3.715 3.872 4.026 4.23 4.432 4.607 4.82 5.04 5.244 5.491 5.792 6.08 6.39 6.727 7.103 7.538 8.017 8.54 9.075 9.67 10.316 11.097 11.996 13.034 14.275 15.769 16.882 17.418 17.655 17.734 17.683 17.551 17.398 17.24 17.064 16.889 16.743 16.625 16.497 16.356 16.229 16.109 15.991 15.89 15.783 15.627 15.473 15.313 15.149 15.013 14.874 14.766 14.681 14.583 14.519 14.454 14.337 14.261 14.174 14.128 14.044 13.945 13.834 13.777 13.479 13.588 13.527 13.46 13.307 13.228 13.146 13.051 12.929 12.805 12.676 12.388 -5 ,9478 ,TETRA ,17555168,Thu Nov 25 21:26:10 CET,Thu Nov 25 23:35:39 CET,0.0 0.241 0.427 0.586 0.72 0.851 0.972 1.075 1.255 1.327 1.392 1.279 1.605 1.679 1.799 1.927 2.061 2.13 2.276 2.403 2.558 2.663 2.771 2.926 3.078 3.228 3.37 3.513 3.691 3.85 4.007 4.211 4.405 4.593 4.817 5.11 5.397 5.687 5.995 6.302 6.65 7.06 7.555 8.066 8.588 9.18 9.883 10.594 11.409 12.269 13.127 13.644 13.803 13.809 13.738 13.601 13.424 13.232 13.076 12.915 12.76 12.633 12.511 12.377 12.241 12.112 11.979 11.86 11.765 11.667 11.56 11.474 11.379 11.278 11.192 11.106 11.023 10.928 10.836 10.775 10.706 10.57 10.447 10.317 10.249 10.097 9.944 9.787 9.71 9.398 9.46 9.37 9.264 9.002 8.842 8.681 8.526 8.341 8.136 7.908 7.394 -6 ,12403 ,TETRA ,17555169,Thu Nov 25 21:26:10 CET,Thu Nov 25 23:35:06 CET,0.0 0.486 0.714 0.896 1.038 1.15 1.264 1.373 1.566 1.651 1.744 1.695 2.03 2.109 2.263 2.416 2.563 2.63 2.767 2.903 3.078 3.188 3.306 3.487 3.651 3.813 3.964 4.099 4.28 4.46 4.64 4.859 5.072 5.287 5.541 5.81 6.065 6.352 6.653 6.967 7.3 7.695 8.156 8.593 9.097 9.67 10.316 11.022 11.871 12.889 14.055 14.815 15.135 15.27 15.303 15.264 15.186 15.065 14.953 14.837 14.699 14.553 14.419 14.283 14.138 14.002 13.869 13.76 13.653 13.532 13.41 13.325 13.24 13.143 13.062 12.97 12.872 12.779 12.68 12.606 12.529 12.414 12.338 12.257 12.196 12.035 11.876 11.723 11.641 11.322 11.381 11.281 11.178 10.948 10.801 10.653 10.491 10.317 10.147 9.946 9.382 -7 ,17688 ,TETRA ,17555170,Thu Nov 25 21:26:11 CET,Thu Nov 25 23:35:12 CET,0.0 0.353 0.512 0.653 0.794 0.923 1.035 1.139 1.333 1.421 1.518 1.45 1.772 1.85 2.0 2.134 2.266 2.333 2.467 2.602 2.783 2.895 3.007 3.164 3.32 3.476 3.629 3.784 3.985 4.167 4.337 4.557 4.805 5.081 5.378 5.659 5.912 6.185 6.483 6.799 7.114 7.472 7.903 8.348 8.886 9.468 10.134 10.91 11.831 12.87 13.976 14.692 14.943 15.004 15.002 14.931 14.807 14.676 14.554 14.417 14.276 14.143 14.017 13.902 13.795 13.678 13.53 13.388 13.266 13.133 12.987 12.86 12.736 12.622 12.528 12.423 12.314 12.199 12.085 12.006 11.92 11.768 11.667 11.568 11.519 11.411 11.299 11.193 11.134 10.835 10.946 10.88 10.807 10.646 10.565 10.463 10.344 10.188 9.97 9.687 9.053 -8 ,12988 ,TETRA ,17555171,Thu Nov 25 21:29:40 CET,Thu Nov 25 23:38:51 CET,0.0 0.273 0.442 0.601 0.726 0.817 0.906 0.983 1.121 1.192 1.27 1.187 1.519 1.588 1.714 1.844 1.964 2.023 2.164 2.305 2.472 2.576 2.678 2.826 2.957 3.08 3.215 3.355 3.523 3.684 3.854 4.067 4.264 4.456 4.678 4.933 5.183 5.467 5.779 6.102 6.438 6.818 7.276 7.726 8.246 8.838 9.54 10.35 11.27 12.317 13.555 14.488 14.897 15.093 15.161 15.13 15.067 15.0 14.904 14.79 14.686 14.568 14.438 14.299 14.164 14.047 13.915 13.791 13.688 13.574 13.456 13.355 13.251 13.152 13.071 12.989 12.907 12.818 12.724 12.661 12.589 12.462 12.369 12.263 12.209 12.118 12.026 11.912 11.853 11.553 11.658 11.591 11.522 11.372 11.283 11.196 11.1 10.978 10.817 10.621 10.255 -9 ,27923 ,TETRA ,17555172,Thu Nov 25 21:31:41 CET,Thu Nov 25 23:40:42 CET,0.0 0.327 0.529 0.689 0.806 0.939 1.067 1.171 1.398 1.507 1.583 1.454 1.767 1.845 1.992 2.132 2.257 2.317 2.433 2.548 2.711 2.816 2.922 3.076 3.217 3.348 3.48 3.61 3.786 3.963 4.137 4.346 4.537 4.711 4.925 5.171 5.39 5.645 5.939 6.27 6.635 7.018 7.447 7.894 8.436 9.106 9.908 10.739 11.661 12.764 14.061 14.908 15.23 15.364 15.333 15.233 15.124 14.962 14.786 14.617 14.471 14.334 14.207 14.078 13.942 13.83 13.71 13.59 13.493 13.397 13.291 13.191 13.077 12.956 12.862 12.775 12.692 12.608 12.514 12.441 12.371 12.267 12.189 12.098 12.048 11.928 11.812 11.717 11.666 11.381 11.514 11.454 11.392 11.251 11.173 11.093 11.001 10.882 10.702 10.47 10.06 -10 ,1294 ,TETRA ,17555173,Thu Nov 25 21:33:43 CET,Thu Nov 25 23:42:59 CET,0.0 0.574 0.775 0.928 1.072 1.222 1.348 1.45 1.634 1.715 1.797 1.719 2.046 2.119 2.26 2.411 2.568 2.65 2.801 2.94 3.12 3.23 3.343 3.515 3.688 3.859 4.02 4.159 4.349 4.55 4.745 4.979 5.195 5.403 5.66 5.935 6.183 6.472 6.796 7.131 7.475 7.861 8.327 8.799 9.374 10.051 10.825 11.659 12.547 13.468 14.421 15.027 15.204 15.147 15.05 14.991 14.93 14.837 14.721 14.568 14.42 14.301 14.157 13.993 13.846 13.705 13.553 13.379 13.226 13.101 12.979 12.864 12.728 12.591 12.488 12.373 12.243 12.106 11.958 11.867 11.762 11.59 11.483 11.374 11.319 11.195 11.059 10.922 10.857 10.552 10.641 10.567 10.502 10.345 10.232 10.09 9.955 9.821 9.659 9.44 8.862 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 4ed0d381..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8300 ,TETRA ,17555174,Thu Nov 25 21:34:46 CET,Thu Nov 25 23:44:55 CET,0.0 0.971 1.36 1.614 1.86 2.098 2.303 2.498 2.836 2.983 3.114 3.115 3.483 3.599 3.835 4.059 4.253 4.343 4.527 4.724 5.037 5.224 5.399 5.661 5.906 6.141 6.367 6.577 6.836 7.086 7.334 7.619 7.898 8.172 8.469 8.796 9.133 9.493 9.865 10.283 10.716 11.217 11.786 12.327 12.97 13.68 14.467 15.267 16.152 17.121 18.03 18.415 18.356 18.093 17.754 17.447 17.167 16.906 16.632 16.325 16.096 15.896 15.695 15.493 15.297 15.131 14.962 14.799 14.659 14.524 14.386 14.27 14.137 14.0 13.899 13.796 13.687 13.566 13.439 13.342 13.23 13.076 12.981 12.885 12.832 12.719 12.592 12.434 12.361 12.067 12.165 12.09 12.019 11.845 11.735 11.617 11.493 11.353 11.173 10.882 10.44 -2 ,31110 ,TETRA ,17555175,Thu Nov 25 21:34:47 CET,Thu Nov 25 23:44:39 CET,0.0 1.128 1.515 1.822 2.05 2.255 2.458 2.664 3.057 3.237 3.392 3.423 3.798 3.915 4.144 4.371 4.572 4.672 4.874 5.081 5.361 5.524 5.682 5.917 6.146 6.363 6.566 6.767 7.038 7.292 7.527 7.821 8.113 8.38 8.661 8.965 9.265 9.609 9.995 10.391 10.784 11.213 11.703 12.149 12.64 13.213 13.837 14.428 15.073 15.913 16.762 17.082 17.032 16.802 16.522 16.249 16.006 15.742 15.456 15.168 14.914 14.694 14.516 14.341 14.14 13.945 13.747 13.574 13.427 13.265 13.092 12.956 12.821 12.678 12.561 12.433 12.309 12.165 11.985 11.857 11.717 11.48 11.321 11.167 11.088 10.919 10.738 10.543 10.441 10.111 10.202 10.134 10.062 9.878 9.773 9.655 9.528 9.403 9.239 9.019 8.453 -3 ,27234 ,TETRA ,17555176,Thu Nov 25 21:52:38 CET,Fri Nov 26 00:18:32 CET,0.0 1.559 1.988 2.335 2.663 2.942 3.178 3.406 3.825 4.012 4.201 4.329 4.724 4.853 5.138 5.405 5.647 5.769 6.02 6.258 6.62 6.866 7.091 7.396 7.664 7.899 8.115 8.327 8.591 8.824 9.04 9.308 9.579 9.852 10.174 10.515 10.827 11.169 11.565 12.027 12.503 13.019 13.582 14.102 14.719 15.389 16.13 16.905 17.787 18.782 19.822 20.402 20.493 20.414 20.219 19.981 19.704 19.443 19.228 18.973 18.718 18.484 18.271 18.086 17.912 17.742 17.579 17.425 17.275 17.127 16.968 16.824 16.681 16.545 16.437 16.284 16.092 15.906 15.701 15.546 15.4 15.182 15.014 14.848 14.766 14.592 14.432 14.276 14.198 13.885 13.932 13.821 13.72 13.536 13.436 13.322 13.181 13.016 12.844 12.673 12.339 -4 ,6970 ,TETRA ,17555177,Thu Nov 25 21:54:38 CET,Fri Nov 26 00:18:20 CET,0.0 0.995 1.415 1.708 1.93 2.125 2.314 2.48 2.797 2.962 3.126 3.213 3.608 3.75 4.043 4.321 4.584 4.714 4.982 5.24 5.582 5.808 6.032 6.345 6.641 6.908 7.17 7.437 7.777 8.116 8.429 8.796 9.162 9.474 9.78 10.106 10.416 10.77 11.142 11.524 11.933 12.386 12.897 13.413 14.016 14.655 15.354 16.098 16.909 17.822 18.652 18.89 18.786 18.611 18.404 18.177 17.957 17.726 17.506 17.277 17.065 16.856 16.654 16.452 16.241 16.049 15.845 15.611 15.378 15.137 14.895 14.691 14.502 14.346 14.241 14.135 14.014 13.882 13.743 13.643 13.546 13.392 13.289 13.187 13.135 13.026 12.91 12.782 12.721 12.431 12.528 12.444 12.363 12.208 12.117 11.998 11.893 11.808 11.697 11.508 11.116 -5 ,26795 ,TETRA ,17555178,Thu Nov 25 21:54:39 CET,Fri Nov 26 00:18:39 CET,0.0 1.116 1.591 1.905 2.194 2.473 2.725 2.945 3.345 3.513 3.666 3.697 4.07 4.201 4.465 4.706 4.931 5.048 5.279 5.496 5.827 6.05 6.257 6.538 6.817 7.093 7.355 7.605 7.931 8.259 8.574 8.924 9.23 9.508 9.814 10.179 10.523 10.877 11.266 11.663 12.059 12.501 13.051 13.608 14.198 14.858 15.567 16.213 16.881 17.545 18.179 18.449 18.293 18.03 17.705 17.317 16.998 16.741 16.497 16.218 15.968 15.71 15.445 15.194 14.962 14.748 14.529 14.348 14.202 14.046 13.881 13.742 13.596 13.451 13.331 13.205 13.075 12.937 12.795 12.697 12.6 12.458 12.352 12.224 12.165 12.065 11.932 11.777 11.708 11.401 11.486 11.391 11.296 11.093 10.981 10.875 10.76 10.637 10.503 10.34 9.943 -6 ,4109 ,TETRA ,17555179,Thu Nov 25 21:54:40 CET,Fri Nov 26 00:21:33 CET,0.0 1.121 1.54 1.869 2.12 2.322 2.517 2.694 2.996 3.146 3.294 3.318 3.702 3.828 4.087 4.387 4.693 4.836 5.082 5.281 5.546 5.72 5.892 6.146 6.4 6.647 6.889 7.115 7.399 7.675 7.941 8.268 8.574 8.858 9.194 9.572 9.931 10.322 10.723 11.151 11.627 12.167 12.77 13.375 14.076 14.811 15.624 16.523 17.572 18.713 19.82 20.492 20.634 20.545 20.299 19.945 19.635 19.361 19.09 18.837 18.64 18.45 18.255 18.082 17.901 17.714 17.52 17.288 17.06 16.854 16.664 16.518 16.373 16.226 16.122 15.998 15.851 15.705 15.556 15.459 15.36 15.204 15.107 15.001 14.937 14.811 14.689 14.541 14.463 14.156 14.25 14.174 14.089 13.905 13.792 13.678 13.559 13.428 13.269 13.033 12.481 -7 ,26469 ,TETRA ,17555180,Thu Nov 25 21:54:39 CET,Fri Nov 26 00:19:28 CET,0.0 0.938 1.293 1.589 1.855 2.092 2.287 2.451 2.775 2.933 3.075 3.101 3.477 3.601 3.847 4.071 4.283 4.375 4.563 4.777 5.113 5.332 5.542 5.835 6.113 6.389 6.65 6.871 7.13 7.39 7.636 7.917 8.191 8.457 8.757 9.105 9.456 9.832 10.207 10.567 10.942 11.377 11.877 12.413 13.052 13.72 14.441 15.165 15.984 16.987 17.894 18.291 18.28 18.085 17.83 17.535 17.223 16.926 16.635 16.291 16.01 15.787 15.573 15.359 15.161 14.986 14.811 14.653 14.516 14.372 14.22 14.086 13.933 13.785 13.676 13.549 13.414 13.282 13.15 13.056 12.958 12.805 12.698 12.586 12.533 12.415 12.279 12.139 12.063 11.755 11.854 11.774 11.678 11.486 11.386 11.261 11.119 10.961 10.767 10.477 9.686 -8 ,4316 ,TETRA ,17555181,Thu Nov 25 21:55:37 CET,Fri Nov 26 00:19:46 CET,0.0 1.354 1.845 2.239 2.558 2.81 3.036 3.244 3.609 3.765 3.909 3.944 4.325 4.458 4.726 4.984 5.198 5.295 5.493 5.695 5.992 6.204 6.427 6.74 7.008 7.246 7.478 7.689 7.947 8.203 8.457 8.774 9.074 9.345 9.667 10.044 10.398 10.765 11.14 11.534 11.963 12.446 13.031 13.631 14.307 15.01 15.758 16.601 17.545 18.482 19.359 19.802 19.872 19.751 19.526 19.242 18.932 18.612 18.336 18.056 17.764 17.483 17.213 16.946 16.702 16.498 16.307 16.121 15.952 15.789 15.614 15.471 15.331 15.183 15.062 14.934 14.8 14.657 14.514 14.416 14.305 14.127 13.998 13.87 13.81 13.702 13.588 13.451 13.374 13.055 13.129 13.046 12.94 12.659 12.51 12.347 12.167 11.996 11.777 11.497 10.943 -9 ,15790 ,TETRA ,17555182,Thu Nov 25 21:55:37 CET,Fri Nov 26 00:20:22 CET,0.0 1.393 1.808 2.157 2.482 2.767 3.011 3.232 3.647 3.841 4.017 4.103 4.514 4.683 4.998 5.267 5.504 5.615 5.828 6.027 6.34 6.543 6.717 6.962 7.207 7.44 7.668 7.893 8.184 8.47 8.737 9.041 9.326 9.603 9.925 10.27 10.589 10.935 11.305 11.707 12.141 12.687 13.432 14.117 14.744 15.309 15.932 16.632 17.402 18.219 18.904 19.088 18.874 18.541 18.245 17.899 17.537 17.22 16.933 16.607 16.334 16.12 15.917 15.722 15.537 15.356 15.149 14.961 14.807 14.653 14.5 14.371 14.23 14.082 13.972 13.862 13.734 13.593 13.453 13.358 13.263 13.124 13.024 12.903 12.843 12.73 12.597 12.458 12.392 12.082 12.155 12.057 11.945 11.722 11.602 11.468 11.326 11.174 10.986 10.703 10.155 -10 ,25881 ,TETRA ,17555183,Thu Nov 25 21:55:37 CET,Fri Nov 26 00:21:39 CET,0.0 0.722 1.027 1.343 1.581 1.765 1.924 2.07 2.376 2.521 2.655 2.678 3.054 3.164 3.38 3.589 3.769 3.859 4.053 4.231 4.481 4.645 4.805 5.032 5.243 5.443 5.631 5.806 6.028 6.264 6.503 6.779 7.046 7.3 7.571 7.902 8.293 8.718 9.09 9.444 9.8 10.185 10.624 11.03 11.49 11.999 12.563 13.027 13.448 14.106 14.618 14.576 14.43 14.205 13.932 13.686 13.452 13.211 12.956 12.68 12.463 12.262 12.056 11.872 11.696 11.521 11.329 11.141 10.983 10.831 10.673 10.539 10.396 10.255 10.149 10.03 9.906 9.785 9.657 9.571 9.486 9.34 9.235 9.127 9.073 8.966 8.847 8.717 8.654 8.356 8.466 8.405 8.332 8.152 8.048 7.931 7.809 7.668 7.473 7.231 6.952 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 7bbcc0c7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21202 ,TETRA ,17555184,Thu Nov 25 21:55:38 CET,Fri Nov 26 00:23:05 CET,0.0 0.538 0.764 0.953 1.119 1.27 1.386 1.498 1.69 1.771 1.838 1.72 2.011 2.078 2.195 2.296 2.407 2.466 2.565 2.655 2.806 2.915 3.025 3.172 3.306 3.437 3.549 3.655 3.781 3.889 3.991 4.119 4.253 4.371 4.489 4.62 4.757 4.893 5.029 5.181 5.344 5.505 5.653 5.809 5.976 6.157 6.338 6.455 6.506 6.365 5.916 5.285 4.676 4.055 3.517 3.035 2.556 2.116 1.73 1.322 0.955 0.633 0.337 0.072 -0.174 -0.404 -0.647 -0.876 -1.071 -1.262 -1.461 -1.629 -1.799 -1.992 -2.147 -2.3 -2.465 -2.639 -2.83 -2.966 -3.1 -3.306 -3.453 -3.611 -3.689 -3.843 -4.019 -4.211 -4.309 -4.636 -4.601 -4.722 -4.865 -5.202 -5.393 -5.589 -5.803 -6.06 -6.417 -6.823 -8.028 -2 ,13546 ,TETRA ,17555185,Thu Nov 25 21:55:37 CET,Fri Nov 26 00:22:12 CET,0.0 0.588 0.845 1.041 1.208 1.357 1.508 1.641 1.862 1.955 2.05 2.028 2.365 2.48 2.693 2.871 3.029 3.106 3.258 3.4 3.594 3.708 3.826 4.015 4.192 4.348 4.458 4.548 4.662 4.774 4.888 5.034 5.165 5.282 5.42 5.568 5.719 5.876 6.044 6.223 6.395 6.598 6.822 7.029 7.272 7.557 7.822 8.009 8.156 8.209 8.025 7.548 7.018 6.511 6.019 5.546 5.138 4.752 4.401 4.032 3.685 3.379 3.102 2.84 2.587 2.341 2.08 1.854 1.645 1.407 1.168 0.977 0.77 0.553 0.372 0.175 -0.02 -0.207 -0.4 -0.55 -0.716 -0.959 -1.119 -1.277 -1.355 -1.526 -1.712 -1.896 -1.994 -2.33 -2.322 -2.465 -2.617 -2.948 -3.136 -3.334 -3.539 -3.766 -4.044 -4.413 -5.565 -3 ,5615 ,TETRA ,17555186,Thu Nov 25 21:55:39 CET,Fri Nov 26 00:22:51 CET,0.0 0.387 0.653 0.859 1.039 1.172 1.28 1.365 1.517 1.595 1.674 1.59 1.873 1.925 2.034 2.152 2.282 2.335 2.427 2.528 2.683 2.774 2.849 2.95 3.044 3.147 3.246 3.336 3.473 3.607 3.722 3.851 3.971 4.096 4.241 4.387 4.519 4.655 4.81 4.99 5.151 5.299 5.457 5.604 5.793 5.982 6.137 6.265 6.38 6.349 5.943 5.217 4.493 3.86 3.292 2.772 2.296 1.838 1.447 1.051 0.718 0.428 0.136 -0.158 -0.419 -0.643 -0.893 -1.113 -1.291 -1.488 -1.701 -1.874 -2.045 -2.213 -2.353 -2.513 -2.671 -2.829 -3.032 -3.191 -3.352 -3.612 -3.799 -3.989 -4.089 -4.29 -4.507 -4.738 -4.849 -5.209 -5.248 -5.389 -5.553 -5.931 -6.135 -6.325 -6.519 -6.778 -7.063 -7.435 -8.843 -4 ,20907 ,TETRA ,17555187,Thu Nov 25 21:56:37 CET,Fri Nov 26 00:22:31 CET,0.0 0.659 0.875 1.03 1.156 1.28 1.375 1.46 1.634 1.719 1.795 1.686 1.982 2.05 2.161 2.263 2.368 2.421 2.52 2.61 2.738 2.829 2.915 3.02 3.12 3.22 3.321 3.424 3.548 3.663 3.779 3.914 4.047 4.172 4.312 4.464 4.606 4.763 4.928 5.095 5.259 5.438 5.651 5.862 6.071 6.262 6.493 6.693 6.802 6.844 6.67 6.164 5.616 5.102 4.595 4.078 3.608 3.185 2.828 2.45 2.095 1.782 1.492 1.217 0.961 0.73 0.476 0.251 0.06 -0.147 -0.355 -0.521 -0.692 -0.883 -1.035 -1.196 -1.367 -1.532 -1.695 -1.826 -1.977 -2.232 -2.424 -2.62 -2.726 -2.952 -3.173 -3.401 -3.529 -3.894 -3.917 -4.062 -4.224 -4.554 -4.748 -4.976 -5.23 -5.5 -5.81 -6.231 -7.93 -5 ,5819 ,TETRA ,17555188,Thu Nov 25 21:57:39 CET,Fri Nov 26 00:25:16 CET,0.0 0.881 1.138 1.348 1.55 1.733 1.882 2.011 2.258 2.383 2.499 2.463 2.782 2.872 3.035 3.181 3.329 3.406 3.558 3.698 3.885 4.003 4.124 4.306 4.483 4.659 4.825 4.959 5.095 5.218 5.334 5.467 5.592 5.712 5.846 5.978 6.089 6.221 6.379 6.55 6.723 6.896 7.088 7.278 7.478 7.671 7.826 7.938 8.012 8.004 7.832 7.413 6.905 6.351 5.859 5.426 5.007 4.627 4.3 3.969 3.672 3.39 3.113 2.798 2.501 2.278 2.031 1.789 1.596 1.39 1.156 0.955 0.75 0.543 0.374 0.185 -0.041 -0.302 -0.559 -0.721 -0.901 -1.183 -1.374 -1.583 -1.692 -1.898 -2.113 -2.349 -2.469 -2.832 -2.874 -3.021 -3.173 -3.514 -3.715 -3.924 -4.145 -4.377 -4.648 -5.085 -6.406 -6 ,14544 ,TETRA ,17555189,Thu Nov 25 21:57:38 CET,Fri Nov 26 00:22:50 CET,0.0 0.779 1.077 1.312 1.495 1.648 1.794 1.912 2.121 2.208 2.276 2.17 2.454 2.51 2.626 2.733 2.83 2.879 2.978 3.073 3.215 3.304 3.387 3.497 3.6 3.71 3.824 3.93 4.052 4.179 4.292 4.415 4.537 4.648 4.782 4.948 5.104 5.27 5.441 5.617 5.81 6.023 6.254 6.454 6.655 6.878 7.084 7.213 7.265 7.144 6.728 6.146 5.557 4.989 4.45 3.921 3.442 3.0 2.627 2.271 1.934 1.616 1.323 1.045 0.794 0.562 0.312 0.082 -0.123 -0.324 -0.525 -0.703 -0.9 -1.117 -1.292 -1.458 -1.621 -1.789 -1.979 -2.118 -2.263 -2.501 -2.651 -2.81 -2.9 -3.08 -3.277 -3.483 -3.581 -3.92 -3.916 -4.04 -4.152 -4.393 -4.531 -4.709 -4.906 -5.107 -5.384 -5.753 -6.627 -7 ,5065 ,TETRA ,17555190,Thu Nov 25 21:57:40 CET,Fri Nov 26 00:22:49 CET,0.0 1.15 1.388 1.553 1.693 1.817 1.929 2.018 2.192 2.27 2.338 2.229 2.517 2.573 2.679 2.787 2.898 2.948 3.047 3.146 3.279 3.357 3.434 3.562 3.693 3.805 3.907 4.013 4.147 4.271 4.382 4.515 4.646 4.766 4.91 5.063 5.202 5.354 5.514 5.684 5.848 6.023 6.225 6.399 6.573 6.752 6.922 7.073 7.19 7.223 6.951 6.24 5.516 4.782 4.128 3.555 3.022 2.549 2.141 1.749 1.407 1.082 0.764 0.47 0.193 -0.065 -0.315 -0.547 -0.758 -0.981 -1.217 -1.408 -1.604 -1.82 -1.982 -2.139 -2.311 -2.487 -2.675 -2.806 -2.926 -3.118 -3.265 -3.418 -3.498 -3.677 -3.86 -4.063 -4.166 -4.505 -4.501 -4.63 -4.764 -5.039 -5.187 -5.354 -5.564 -5.802 -6.037 -6.356 -7.357 -8 ,428 ,TETRA ,17555191,Thu Nov 25 21:57:42 CET,Fri Nov 26 00:08:23 CET,0.0 0.596 0.857 1.047 1.196 1.35 1.494 1.618 1.842 1.94 2.033 1.979 2.279 2.34 2.456 2.575 2.688 2.74 2.849 2.949 3.077 3.159 3.241 3.351 3.449 3.541 3.634 3.73 3.847 3.958 4.083 4.229 4.349 4.476 4.625 4.782 4.939 5.101 5.26 5.444 5.637 5.831 6.044 6.255 6.507 6.749 7.003 7.232 7.35 7.309 6.984 6.333 5.603 4.937 4.278 3.664 3.22 2.85 2.524 2.17 1.837 1.558 1.299 1.055 0.847 0.663 0.451 0.254 0.084 -0.084 -0.272 -0.44 -0.608 -0.786 -0.921 -1.06 -1.221 -1.396 -1.562 -1.668 -1.785 -1.982 -2.124 -2.264 -2.338 -2.494 -2.656 -2.839 -2.936 -3.274 -3.216 -3.31 -3.417 -3.667 -3.802 -3.963 -4.145 -4.34 -4.596 -4.938 -5.75 -9 ,7000 ,TETRA ,17555192,Thu Nov 25 21:57:38 CET,Fri Nov 26 00:25:40 CET,0.0 0.506 0.7 0.862 1.013 1.152 1.291 1.397 1.534 1.596 1.659 1.564 1.861 1.926 2.03 2.121 2.212 2.256 2.34 2.422 2.529 2.595 2.661 2.76 2.856 2.952 3.048 3.143 3.267 3.378 3.477 3.603 3.73 3.839 3.968 4.109 4.255 4.421 4.567 4.72 4.89 5.08 5.293 5.498 5.729 5.976 6.234 6.465 6.625 6.663 6.544 6.137 5.615 5.085 4.57 4.047 3.545 3.095 2.696 2.228 1.799 1.452 1.151 0.865 0.588 0.324 0.037 -0.203 -0.41 -0.63 -0.836 -0.999 -1.175 -1.365 -1.521 -1.683 -1.849 -2.023 -2.201 -2.337 -2.489 -2.724 -2.9 -3.088 -3.178 -3.362 -3.555 -3.751 -3.857 -4.217 -4.239 -4.361 -4.493 -4.782 -4.931 -5.097 -5.304 -5.556 -5.872 -6.327 -7.455 -10 ,10237 ,TETRA ,17555193,Thu Nov 25 21:57:40 CET,Fri Nov 26 00:26:27 CET,0.0 0.766 1.052 1.304 1.494 1.64 1.749 1.858 2.089 2.203 2.307 2.262 2.578 2.671 2.835 2.983 3.135 3.216 3.365 3.512 3.723 3.842 3.954 4.128 4.297 4.462 4.595 4.689 4.797 4.903 5.015 5.134 5.25 5.37 5.507 5.649 5.771 5.919 6.08 6.243 6.399 6.546 6.707 6.867 7.059 7.271 7.489 7.698 7.893 7.998 7.883 7.393 6.813 6.24 5.736 5.235 4.74 4.319 3.991 3.664 3.371 3.115 2.87 2.603 2.337 2.099 1.864 1.666 1.479 1.264 1.034 0.853 0.665 0.462 0.309 0.158 -0.002 -0.174 -0.352 -0.472 -0.595 -0.804 -0.958 -1.122 -1.209 -1.377 -1.542 -1.73 -1.835 -2.171 -2.188 -2.329 -2.467 -2.781 -2.964 -3.159 -3.37 -3.609 -3.932 -4.384 -6.097 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt deleted file mode 100644 index b90d49a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8384 ,TETRA ,17555194,Thu Nov 25 21:57:41 CET,Fri Nov 26 00:08:10 CET,0.0 0.4 0.617 0.788 0.914 1.028 1.135 1.238 1.427 1.513 1.59 1.658 1.795 1.862 2.006 2.154 2.29 2.353 2.466 2.561 2.711 2.82 2.931 3.087 3.233 3.382 3.52 3.638 3.802 3.965 4.124 4.309 4.478 4.652 4.864 5.108 5.34 5.579 5.832 6.114 6.436 6.797 7.203 7.618 8.122 8.667 9.258 9.936 10.714 11.586 12.605 13.329 13.668 13.839 13.89 13.864 13.81 13.729 13.634 13.524 13.413 13.316 13.212 13.105 13.007 12.912 12.816 12.712 12.61 12.516 12.416 12.327 12.232 12.127 12.041 11.952 11.862 11.776 11.686 11.624 11.562 11.456 11.379 11.307 11.269 11.191 11.103 11.005 10.949 10.822 10.776 10.717 10.645 10.476 10.394 10.31 10.208 10.066 9.894 9.691 9.235 -2 ,31388 ,TETRA ,17555195,Thu Nov 25 21:58:42 CET,Fri Nov 26 00:23:13 CET,0.0 0.725 0.992 1.187 1.372 1.499 1.605 1.712 1.892 1.97 2.05 2.122 2.261 2.326 2.455 2.574 2.687 2.75 2.87 2.984 3.141 3.233 3.328 3.475 3.604 3.725 3.85 3.966 4.099 4.235 4.379 4.549 4.71 4.866 5.06 5.291 5.507 5.735 5.996 6.289 6.587 6.92 7.335 7.762 8.253 8.799 9.415 10.12 10.943 11.91 12.975 13.705 14.026 14.129 14.16 14.147 14.087 14.002 13.905 13.792 13.674 13.566 13.478 13.379 13.281 13.184 13.063 12.961 12.875 12.771 12.66 12.567 12.465 12.36 12.278 12.195 12.114 12.027 11.932 11.873 11.815 11.71 11.627 11.544 11.499 11.393 11.291 11.183 11.12 11.002 10.955 10.888 10.819 10.69 10.629 10.556 10.444 10.309 10.17 9.995 9.517 -3 ,9432 ,TETRA ,17555196,Thu Nov 25 21:58:45 CET,Fri Nov 26 00:23:18 CET,0.0 0.326 0.454 0.584 0.697 0.812 0.928 1.015 1.199 1.296 1.394 1.532 1.686 1.758 1.9 2.043 2.171 2.232 2.357 2.467 2.619 2.71 2.806 2.949 3.081 3.218 3.351 3.475 3.63 3.782 3.935 4.114 4.285 4.451 4.646 4.867 5.096 5.347 5.603 5.897 6.218 6.561 6.947 7.344 7.786 8.243 8.808 9.446 10.145 10.977 11.913 12.525 12.794 12.86 12.8 12.69 12.566 12.414 12.27 12.13 12.023 11.908 11.765 11.624 11.493 11.371 11.244 11.121 11.014 10.911 10.803 10.707 10.6 10.488 10.4 10.302 10.197 10.08 9.952 9.864 9.778 9.64 9.557 9.472 9.424 9.339 9.234 9.117 9.057 8.935 8.874 8.803 8.74 8.582 8.474 8.373 8.242 8.118 8.008 7.815 7.379 -4 ,19850 ,TETRA ,17555197,Thu Nov 25 21:59:42 CET,Fri Nov 26 00:24:13 CET,0.0 0.491 0.749 0.871 0.977 1.085 1.176 1.263 1.424 1.507 1.582 1.646 1.78 1.844 1.98 2.101 2.209 2.263 2.364 2.455 2.597 2.695 2.791 2.936 3.071 3.196 3.317 3.447 3.619 3.773 3.923 4.121 4.312 4.489 4.697 4.914 5.126 5.374 5.634 5.894 6.169 6.489 6.883 7.285 7.75 8.27 8.864 9.535 10.284 11.148 12.177 12.914 13.217 13.255 13.209 13.136 13.029 12.916 12.792 12.622 12.448 12.292 12.154 12.035 11.917 11.814 11.707 11.592 11.483 11.363 11.246 11.15 11.039 10.922 10.837 10.747 10.651 10.549 10.447 10.367 10.278 10.154 10.077 9.984 9.932 9.824 9.702 9.577 9.506 9.377 9.318 9.243 9.172 9.02 8.928 8.831 8.738 8.639 8.509 8.33 7.797 -5 ,18639 ,TETRA ,17555198,Thu Nov 25 22:00:46 CET,Fri Nov 26 00:25:34 CET,0.0 0.56 0.78 0.918 1.044 1.163 1.263 1.365 1.575 1.66 1.733 1.808 1.955 2.025 2.149 2.269 2.39 2.455 2.585 2.711 2.876 2.976 3.087 3.237 3.365 3.498 3.634 3.76 3.907 4.053 4.203 4.383 4.568 4.751 4.95 5.169 5.394 5.64 5.9 6.178 6.478 6.813 7.212 7.602 8.039 8.513 9.04 9.627 10.306 11.113 11.954 12.448 12.591 12.543 12.468 12.422 12.371 12.281 12.177 12.054 11.937 11.817 11.684 11.558 11.448 11.344 11.214 11.091 11.005 10.923 10.83 10.747 10.658 10.565 10.49 10.415 10.337 10.257 10.164 10.095 10.03 9.921 9.84 9.751 9.706 9.616 9.524 9.427 9.376 9.259 9.204 9.141 9.073 8.932 8.845 8.759 8.676 8.566 8.404 8.191 7.662 -6 ,8579 ,TETRA ,17555199,Thu Nov 25 22:08:43 CET,Fri Nov 26 00:34:15 CET,0.0 0.364 0.515 0.689 0.837 0.956 1.053 1.135 1.282 1.359 1.442 1.53 1.685 1.756 1.896 2.034 2.154 2.216 2.33 2.444 2.611 2.721 2.824 2.952 3.087 3.224 3.357 3.49 3.646 3.8 3.959 4.148 4.333 4.501 4.702 4.934 5.147 5.398 5.669 5.948 6.242 6.589 6.999 7.409 7.866 8.383 8.993 9.638 10.307 11.024 11.862 12.495 12.768 12.882 12.936 12.925 12.855 12.758 12.666 12.553 12.441 12.333 12.232 12.132 12.035 11.937 11.83 11.742 11.655 11.548 11.426 11.333 11.246 11.152 11.077 11.002 10.919 10.831 10.751 10.688 10.62 10.518 10.438 10.363 10.326 10.253 10.17 10.074 10.028 9.921 9.886 9.829 9.766 9.622 9.552 9.476 9.371 9.271 9.181 9.081 8.786 -7 ,5882 ,TETRA ,17555200,Thu Nov 25 22:08:45 CET,Fri Nov 26 00:34:07 CET,0.0 0.595 0.822 0.97 1.108 1.221 1.335 1.453 1.655 1.737 1.806 1.873 2.02 2.09 2.214 2.325 2.434 2.486 2.592 2.703 2.85 2.944 3.038 3.173 3.318 3.465 3.605 3.739 3.901 4.053 4.205 4.411 4.63 4.827 5.028 5.259 5.486 5.724 5.991 6.283 6.582 6.915 7.297 7.68 8.131 8.643 9.23 9.883 10.653 11.539 12.545 13.214 13.489 13.651 13.707 13.671 13.59 13.507 13.443 13.348 13.231 13.111 12.996 12.881 12.769 12.664 12.56 12.456 12.369 12.295 12.214 12.132 12.034 11.939 11.855 11.768 11.676 11.581 11.492 11.414 11.344 11.256 11.189 11.114 11.072 10.971 10.866 10.767 10.715 10.59 10.546 10.493 10.434 10.275 10.189 10.077 9.93 9.803 9.677 9.498 9.084 -8 ,19656 ,TETRA ,17555201,Thu Nov 25 22:12:41 CET,Fri Nov 26 00:37:23 CET,0.0 0.44 0.645 0.797 0.934 1.038 1.141 1.268 1.474 1.559 1.64 1.706 1.847 1.912 2.047 2.182 2.313 2.369 2.467 2.561 2.697 2.794 2.889 3.018 3.147 3.281 3.414 3.538 3.701 3.865 4.025 4.204 4.368 4.54 4.738 4.942 5.15 5.4 5.667 5.941 6.212 6.504 6.88 7.25 7.645 8.115 8.663 9.272 9.962 10.707 11.538 12.049 12.209 12.271 12.233 12.132 12.014 11.865 11.719 11.562 11.428 11.321 11.214 11.112 10.993 10.871 10.747 10.631 10.521 10.402 10.287 10.195 10.093 9.988 9.91 9.829 9.734 9.636 9.544 9.488 9.429 9.319 9.245 9.164 9.118 9.018 8.906 8.795 8.737 8.613 8.551 8.483 8.42 8.268 8.17 8.079 7.989 7.874 7.747 7.583 6.743 -9 ,6311 ,TETRA ,17555202,Thu Nov 25 22:12:42 CET,Fri Nov 26 00:36:43 CET,0.0 0.865 1.145 1.348 1.523 1.65 1.738 1.829 2.019 2.101 2.175 2.254 2.408 2.483 2.61 2.732 2.846 2.9 3.028 3.166 3.367 3.487 3.596 3.75 3.893 4.035 4.17 4.297 4.479 4.667 4.835 5.02 5.2 5.376 5.586 5.83 6.06 6.323 6.618 6.912 7.21 7.56 7.963 8.382 8.901 9.459 10.034 10.664 11.421 12.309 13.411 14.208 14.556 14.74 14.792 14.793 14.759 14.689 14.591 14.492 14.418 14.328 14.224 14.135 14.04 13.946 13.865 13.778 13.691 13.601 13.513 13.45 13.382 13.301 13.23 13.142 13.051 12.971 12.891 12.826 12.749 12.625 12.534 12.435 12.393 12.317 12.218 12.087 12.012 11.88 11.828 11.758 11.681 11.507 11.419 11.337 11.241 11.118 10.95 10.747 10.098 -10 ,27090 ,TETRA ,17555203,Thu Nov 25 22:13:42 CET,Fri Nov 26 00:41:23 CET,0.0 0.432 0.621 0.729 0.829 0.942 1.063 1.169 1.351 1.444 1.532 1.619 1.767 1.842 1.998 2.136 2.264 2.323 2.442 2.55 2.708 2.812 2.904 3.04 3.179 3.312 3.433 3.562 3.735 3.901 4.071 4.279 4.475 4.643 4.838 5.077 5.306 5.547 5.814 6.119 6.442 6.79 7.175 7.564 8.031 8.573 9.192 9.868 10.698 11.669 12.729 13.497 13.83 13.964 14.036 14.036 13.979 13.906 13.801 13.687 13.601 13.512 13.422 13.324 13.224 13.131 13.025 12.914 12.812 12.715 12.627 12.552 12.472 12.387 12.308 12.216 12.118 12.014 11.912 11.847 11.778 11.669 11.59 11.509 11.47 11.401 11.325 11.232 11.177 11.048 10.998 10.944 10.885 10.741 10.656 10.566 10.455 10.32 10.169 9.957 9.497 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 67899321..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29860 ,TETRA ,17555204,Thu Nov 25 22:13:44 CET,Fri Nov 26 00:37:40 CET,0.0 0.698 1.021 1.322 1.571 1.77 1.97 2.155 2.419 2.551 2.698 2.636 3.067 3.171 3.394 3.625 3.83 3.929 4.121 4.313 4.607 4.8 4.982 5.219 5.45 5.686 5.902 6.11 6.384 6.653 6.928 7.264 7.606 7.953 8.328 8.752 9.162 9.583 10.072 10.623 11.205 11.826 12.508 13.22 14.096 15.056 16.14 17.382 18.767 20.258 22.109 23.406 23.568 23.367 23.081 22.721 22.364 22.019 21.693 21.28 20.871 20.48 20.07 19.638 19.209 18.827 18.428 18.047 17.699 17.32 16.894 16.535 16.182 15.81 15.509 15.204 14.912 14.62 14.288 14.045 13.812 13.447 13.168 12.874 12.724 12.403 12.041 11.643 11.443 10.908 10.798 10.543 10.279 9.678 9.373 9.053 8.666 8.215 7.679 6.89 2.88 -2 ,8438 ,TETRA ,17555205,Thu Nov 25 22:23:56 CET,Fri Nov 26 00:48:17 CET,0.0 1.194 1.426 1.596 1.776 1.945 2.087 2.232 2.511 2.634 2.751 2.647 3.084 3.192 3.395 3.592 3.785 3.878 4.068 4.262 4.529 4.684 4.837 5.068 5.289 5.501 5.706 5.926 6.232 6.515 6.779 7.106 7.429 7.767 8.173 8.64 9.086 9.544 10.023 10.562 11.18 11.876 12.643 13.391 14.282 15.246 16.324 17.535 18.832 20.203 21.643 22.523 22.679 22.419 21.963 21.399 20.835 20.266 19.757 19.217 18.732 18.302 17.862 17.411 16.988 16.626 16.223 15.837 15.503 15.162 14.811 14.498 14.169 13.83 13.562 13.268 12.932 12.587 12.248 12.009 11.773 11.407 11.124 10.826 10.676 10.371 10.043 9.675 9.485 8.961 8.87 8.648 8.428 7.963 7.673 7.333 6.928 6.404 5.832 5.137 1.062 -3 ,16911 ,TETRA ,17555206,Thu Nov 25 22:23:52 CET,Fri Nov 26 00:47:54 CET,0.0 1.225 1.553 1.815 2.034 2.231 2.408 2.57 2.856 2.991 3.121 3.044 3.523 3.673 3.911 4.123 4.339 4.449 4.676 4.892 5.185 5.379 5.579 5.884 6.159 6.399 6.641 6.875 7.162 7.454 7.746 8.1 8.443 8.766 9.152 9.613 10.054 10.525 11.027 11.554 12.112 12.753 13.493 14.214 15.025 15.914 16.931 18.027 19.411 21.047 22.674 23.793 24.197 24.252 24.142 23.948 23.641 23.258 22.868 22.367 21.911 21.526 21.162 20.777 20.422 20.086 19.713 19.418 19.157 18.88 18.591 18.325 18.042 17.771 17.556 17.323 17.065 16.801 16.523 16.309 16.064 15.661 15.386 15.122 14.993 14.707 14.387 14.047 13.871 13.37 13.319 13.109 12.903 12.421 12.123 11.757 11.317 10.865 10.391 9.745 4.752 -4 ,15021 ,TETRA ,17555207,Thu Nov 25 22:23:54 CET,Fri Nov 26 00:47:33 CET,0.0 1.455 1.74 1.957 2.157 2.332 2.476 2.628 2.937 3.078 3.218 3.161 3.605 3.714 3.927 4.146 4.354 4.455 4.653 4.854 5.16 5.358 5.537 5.776 6.008 6.244 6.492 6.734 7.04 7.348 7.661 8.031 8.368 8.685 9.039 9.443 9.864 10.325 10.829 11.4 12.005 12.646 13.402 14.162 15.038 16.027 17.127 18.326 19.649 21.074 22.506 23.318 23.445 23.262 22.943 22.496 22.035 21.583 21.144 20.684 20.239 19.795 19.385 19.013 18.678 18.35 17.967 17.642 17.361 17.034 16.684 16.395 16.09 15.764 15.511 15.256 14.972 14.641 14.305 14.079 13.841 13.493 13.236 12.941 12.786 12.454 12.117 11.785 11.621 11.133 11.102 10.902 10.698 10.249 9.966 9.648 9.268 8.801 8.277 7.473 3.324 -5 ,938 ,TETRA ,17555208,Thu Nov 25 22:26:47 CET,Fri Nov 26 00:50:53 CET,0.0 1.448 1.783 1.976 2.159 2.321 2.454 2.587 2.833 2.953 3.079 2.997 3.43 3.548 3.789 4.018 4.226 4.321 4.511 4.689 4.943 5.109 5.277 5.526 5.77 6.018 6.265 6.501 6.806 7.098 7.376 7.695 7.99 8.31 8.7 9.121 9.532 9.992 10.489 11.024 11.599 12.24 12.984 13.743 14.65 15.671 16.824 18.105 19.495 20.888 22.298 23.103 23.25 23.143 22.9 22.508 21.967 21.43 20.996 20.544 20.128 19.728 19.335 18.971 18.618 18.272 17.905 17.565 17.24 16.883 16.505 16.194 15.863 15.525 15.276 15.022 14.748 14.452 14.164 13.964 13.75 13.418 13.169 12.895 12.772 12.517 12.213 11.868 11.674 11.151 11.08 10.87 10.658 10.207 9.912 9.58 9.22 8.791 8.252 7.556 5.253 -6 ,9718 ,TETRA ,17555209,Thu Nov 25 22:26:49 CET,Fri Nov 26 00:49:52 CET,0.0 0.447 0.734 1.01 1.244 1.436 1.616 1.785 2.094 2.233 2.357 2.26 2.715 2.84 3.081 3.325 3.567 3.677 3.888 4.085 4.351 4.524 4.696 4.965 5.212 5.437 5.659 5.891 6.208 6.504 6.782 7.112 7.457 7.806 8.212 8.681 9.117 9.558 10.025 10.568 11.14 11.768 12.489 13.215 14.116 15.104 16.215 17.482 18.944 20.599 22.208 22.983 23.038 22.814 22.477 22.046 21.564 21.053 20.56 20.059 19.651 19.262 18.894 18.55 18.18 17.825 17.447 17.086 16.773 16.463 16.123 15.824 15.518 15.191 14.911 14.609 14.3 13.981 13.656 13.434 13.204 12.849 12.588 12.309 12.163 11.878 11.597 11.284 11.116 10.621 10.552 10.321 10.08 9.562 9.273 8.971 8.598 8.15 7.597 6.787 3.399 -7 ,23288 ,TETRA ,17555210,Thu Nov 25 22:26:51 CET,Fri Nov 26 00:50:00 CET,0.0 1.358 1.705 2.019 2.258 2.458 2.634 2.792 3.087 3.205 3.318 3.199 3.63 3.74 3.952 4.144 4.325 4.412 4.58 4.747 4.994 5.15 5.301 5.526 5.753 5.981 6.204 6.436 6.727 6.997 7.272 7.598 7.905 8.215 8.58 8.99 9.39 9.852 10.384 10.974 11.579 12.188 12.86 13.542 14.339 15.254 16.311 17.535 18.877 20.391 22.268 23.485 23.833 23.699 23.323 22.889 22.434 21.957 21.522 21.041 20.609 20.23 19.822 19.413 19.044 18.704 18.313 17.966 17.683 17.366 17.011 16.704 16.391 16.099 15.876 15.63 15.373 15.101 14.805 14.583 14.361 14.052 13.822 13.53 13.388 13.148 12.86 12.505 12.311 11.777 11.626 11.374 11.099 10.509 10.206 9.862 9.476 9.038 8.445 7.604 -2.315 -8 ,6746 ,TETRA ,17555211,Thu Nov 25 22:28:43 CET,Fri Nov 26 00:51:32 CET,0.0 0.796 1.13 1.384 1.607 1.819 2.011 2.188 2.519 2.664 2.797 2.704 3.131 3.235 3.449 3.66 3.854 3.953 4.161 4.363 4.635 4.803 4.968 5.198 5.417 5.626 5.83 6.039 6.331 6.621 6.886 7.213 7.529 7.828 8.183 8.576 8.946 9.368 9.839 10.348 10.879 11.489 12.209 12.924 13.775 14.689 15.724 16.921 18.278 19.683 21.018 21.894 22.038 21.777 21.421 21.016 20.552 20.054 19.59 19.114 18.662 18.231 17.809 17.398 17.015 16.656 16.306 15.996 15.692 15.369 15.046 14.793 14.533 14.205 13.93 13.68 13.419 13.132 12.826 12.616 12.409 12.09 11.856 11.608 11.476 11.176 10.842 10.475 10.266 9.73 9.628 9.406 9.174 8.686 8.4 8.067 7.723 7.305 6.794 6.09 2.103 -9 ,23105 ,TETRA ,17555212,Thu Nov 25 22:28:45 CET,Fri Nov 26 00:52:34 CET,0.0 1.971 2.32 2.577 2.804 2.994 3.168 3.33 3.64 3.789 3.918 3.827 4.261 4.369 4.632 4.882 5.071 5.162 5.33 5.483 5.738 5.904 6.064 6.321 6.556 6.779 7.007 7.228 7.513 7.818 8.116 8.461 8.791 9.097 9.469 9.901 10.308 10.775 11.308 11.865 12.412 13.0 13.693 14.409 15.238 16.141 17.152 18.229 19.468 20.886 22.327 23.096 23.206 23.005 22.747 22.383 21.919 21.42 20.972 20.546 20.12 19.713 19.308 18.898 18.504 18.154 17.781 17.426 17.108 16.769 16.431 16.135 15.818 15.493 15.23 14.953 14.659 14.354 14.016 13.771 13.529 13.153 12.908 12.649 12.498 12.182 11.838 11.45 11.239 10.702 10.558 10.314 10.083 9.581 9.329 9.019 8.639 8.229 7.746 7.044 4.534 -10 ,12196 ,TETRA ,17555213,Thu Nov 25 22:28:47 CET,Fri Nov 26 00:41:15 CET,0.0 1.22 1.595 1.875 2.095 2.298 2.5 2.659 2.928 3.053 3.161 3.079 3.536 3.658 3.895 4.108 4.306 4.407 4.616 4.812 5.083 5.259 5.424 5.671 5.937 6.175 6.394 6.62 6.933 7.232 7.507 7.863 8.209 8.528 8.925 9.422 9.897 10.355 10.82 11.326 11.847 12.434 13.151 13.903 14.747 15.619 16.611 17.722 18.984 20.272 21.516 22.326 22.44 22.278 22.028 21.67 21.255 20.797 20.379 19.937 19.541 19.188 18.817 18.456 18.112 17.764 17.353 16.959 16.627 16.27 15.9 15.614 15.307 14.957 14.675 14.39 14.104 13.804 13.476 13.238 13.007 12.673 12.43 12.154 12.004 11.693 11.357 10.997 10.806 10.295 10.239 10.028 9.808 9.345 9.084 8.819 8.492 8.115 7.674 6.897 3.033 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt deleted file mode 100644 index 2cfae51d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30006 ,TETRA ,17555214,Thu Nov 25 22:28:43 CET,Fri Nov 26 00:52:26 CET,0.0 2.243 2.667 2.971 3.22 3.428 3.634 3.836 4.201 4.372 4.538 4.495 4.947 5.077 5.335 5.591 5.83 5.942 6.157 6.356 6.638 6.828 7.023 7.3 7.559 7.808 8.037 8.259 8.562 8.876 9.161 9.489 9.815 10.134 10.492 10.884 11.273 11.726 12.203 12.704 13.249 13.851 14.571 15.312 16.125 16.957 17.957 19.142 20.37 21.711 23.211 23.889 23.824 23.586 23.246 22.808 22.409 22.022 21.621 21.17 20.764 20.365 19.968 19.611 19.248 18.896 18.522 18.157 17.843 17.545 17.238 16.952 16.624 16.271 15.996 15.713 15.402 15.072 14.746 14.521 14.279 13.891 13.615 13.33 13.183 12.874 12.549 12.198 12.012 11.51 11.44 11.224 10.985 10.467 10.183 9.864 9.473 9.031 8.484 7.699 3.397 -2 ,12265 ,TETRA ,17555215,Thu Nov 25 22:28:45 CET,Fri Nov 26 00:52:47 CET,0.0 1.287 1.679 1.967 2.234 2.455 2.652 2.882 3.326 3.508 3.678 3.648 4.09 4.212 4.454 4.69 4.917 5.029 5.243 5.448 5.762 5.957 6.133 6.397 6.657 6.9 7.146 7.387 7.671 7.943 8.233 8.606 8.964 9.28 9.642 10.061 10.466 10.896 11.346 11.849 12.389 12.98 13.655 14.316 15.089 15.961 16.962 18.151 19.525 20.998 22.732 23.999 24.404 24.438 24.365 24.215 23.977 23.68 23.373 23.051 22.748 22.426 22.096 21.776 21.459 21.156 20.812 20.479 20.198 19.896 19.57 19.309 19.057 18.774 18.539 18.292 18.003 17.7 17.378 17.146 16.917 16.565 16.327 16.073 15.935 15.64 15.332 14.998 14.803 14.283 14.138 13.879 13.616 13.037 12.69 12.324 11.929 11.449 10.824 9.885 4.787 -3 ,2602 ,TETRA ,17555216,Thu Nov 25 22:28:46 CET,Fri Nov 26 00:52:38 CET,0.0 1.833 2.225 2.474 2.68 2.872 3.065 3.248 3.567 3.722 3.877 3.831 4.293 4.419 4.677 4.928 5.168 5.288 5.504 5.71 6.024 6.224 6.412 6.688 6.958 7.217 7.469 7.72 8.05 8.368 8.654 9.005 9.336 9.642 10.005 10.403 10.767 11.174 11.631 12.109 12.614 13.211 13.925 14.637 15.452 16.341 17.337 18.416 19.574 20.792 21.971 22.667 22.903 22.916 22.755 22.489 22.213 21.952 21.693 21.358 21.042 20.724 20.374 20.047 19.745 19.438 19.101 18.804 18.535 18.23 17.897 17.631 17.374 17.075 16.821 16.571 16.314 16.039 15.742 15.535 15.311 14.958 14.725 14.476 14.35 14.088 13.81 13.516 13.348 12.855 12.792 12.592 12.369 11.901 11.647 11.344 10.977 10.582 10.084 9.408 5.983 -4 ,2499 ,TETRA ,17555217,Thu Nov 25 22:30:51 CET,Fri Nov 26 00:54:30 CET,0.0 2.017 2.546 2.884 3.128 3.351 3.554 3.742 4.079 4.245 4.418 4.396 4.868 5.01 5.283 5.548 5.792 5.904 6.122 6.331 6.646 6.852 7.047 7.346 7.642 7.918 8.186 8.441 8.766 9.065 9.36 9.735 10.081 10.407 10.79 11.22 11.637 12.095 12.566 13.054 13.59 14.219 14.945 15.655 16.473 17.372 18.428 19.605 20.867 22.153 23.312 24.057 24.26 24.12 23.769 23.349 22.938 22.447 21.951 21.506 21.152 20.826 20.504 20.176 19.867 19.536 19.188 18.894 18.604 18.29 17.964 17.692 17.405 17.112 16.877 16.622 16.363 16.083 15.802 15.606 15.392 15.083 14.87 14.628 14.499 14.224 13.937 13.647 13.495 13.018 12.962 12.759 12.526 12.018 11.759 11.459 11.131 10.727 10.139 9.135 4.175 -5 ,18042 ,TETRA ,17555218,Thu Nov 25 22:30:53 CET,Fri Nov 26 00:53:56 CET,0.0 0.806 1.161 1.475 1.761 2.013 2.222 2.414 2.788 2.949 3.083 3.024 3.487 3.624 3.876 4.119 4.34 4.453 4.697 4.932 5.25 5.455 5.658 5.944 6.206 6.467 6.726 6.957 7.245 7.536 7.838 8.203 8.546 8.883 9.262 9.68 10.106 10.585 11.078 11.572 12.087 12.683 13.372 14.02 14.784 15.69 16.75 17.903 19.145 20.486 21.806 22.464 22.465 22.165 21.791 21.417 21.083 20.776 20.481 20.14 19.83 19.523 19.192 18.849 18.525 18.199 17.853 17.535 17.221 16.883 16.518 16.223 15.92 15.592 15.328 15.039 14.733 14.412 14.067 13.83 13.588 13.222 12.97 12.691 12.545 12.258 11.951 11.609 11.42 10.898 10.77 10.549 10.318 9.775 9.5 9.184 8.807 8.369 7.786 7.008 2.996 -6 ,21785 ,TETRA ,17555219,Thu Nov 25 22:30:55 CET,Fri Nov 26 00:53:21 CET,0.0 2.061 2.484 2.726 2.969 3.19 3.393 3.613 3.983 4.131 4.279 4.255 4.732 4.873 5.119 5.338 5.56 5.672 5.883 6.076 6.365 6.558 6.748 7.021 7.299 7.582 7.849 8.107 8.442 8.751 9.057 9.436 9.778 10.095 10.458 10.862 11.248 11.681 12.162 12.674 13.214 13.857 14.599 15.311 16.152 17.075 18.09 19.223 20.531 21.952 23.47 24.41 24.584 24.388 24.079 23.738 23.385 23.026 22.663 22.242 21.856 21.494 21.142 20.81 20.46 20.087 19.705 19.4 19.135 18.818 18.496 18.252 17.981 17.686 17.449 17.196 16.932 16.657 16.363 16.168 15.972 15.644 15.388 15.112 14.98 14.712 14.423 14.114 13.945 13.449 13.387 13.185 12.967 12.485 12.212 11.922 11.599 11.197 10.695 10.041 6.735 -7 ,10610 ,TETRA ,17555220,Thu Nov 25 22:30:51 CET,Fri Nov 26 00:57:11 CET,0.0 1.942 2.444 2.796 3.04 3.253 3.453 3.648 4.011 4.165 4.305 4.269 4.735 4.869 5.14 5.395 5.635 5.739 5.947 6.144 6.421 6.61 6.807 7.094 7.356 7.609 7.829 8.038 8.334 8.623 8.913 9.245 9.555 9.879 10.253 10.685 11.122 11.598 12.107 12.666 13.241 13.852 14.548 15.239 16.057 16.965 17.994 19.071 20.186 21.418 22.655 23.313 23.474 23.388 23.192 22.865 22.399 21.949 21.556 21.144 20.749 20.383 20.053 19.742 19.438 19.1 18.714 18.385 18.112 17.816 17.486 17.207 16.91 16.573 16.31 16.039 15.75 15.473 15.183 14.977 14.746 14.365 14.109 13.836 13.692 13.39 13.071 12.754 12.598 12.109 12.057 11.859 11.638 11.163 10.898 10.584 10.193 9.787 9.312 8.516 5.55 -8 ,20677 ,TETRA ,17555221,Thu Nov 25 22:30:53 CET,Fri Nov 26 00:53:40 CET,0.0 2.428 2.857 3.209 3.54 3.829 4.091 4.343 4.777 4.952 5.104 5.085 5.575 5.723 5.982 6.228 6.463 6.566 6.758 6.949 7.236 7.414 7.596 7.886 8.164 8.423 8.668 8.903 9.207 9.501 9.784 10.113 10.422 10.736 11.104 11.538 11.979 12.465 12.958 13.46 14.008 14.623 15.333 16.049 16.901 17.841 18.853 19.937 21.159 22.445 23.735 24.457 24.593 24.47 24.239 23.975 23.658 23.27 22.886 22.477 22.101 21.757 21.424 21.117 20.834 20.52 20.137 19.786 19.482 19.158 18.792 18.497 18.212 17.906 17.662 17.412 17.153 16.869 16.555 16.33 16.107 15.798 15.573 15.316 15.185 14.916 14.625 14.276 14.082 13.584 13.485 13.246 13.001 12.443 12.109 11.739 11.364 10.953 10.438 9.712 7.051 -9 ,18190 ,TETRA ,17555222,Thu Nov 25 22:30:51 CET,Fri Nov 26 00:54:36 CET,0.0 2.314 2.812 3.131 3.384 3.62 3.838 4.033 4.431 4.616 4.766 4.725 5.195 5.327 5.58 5.823 6.059 6.173 6.394 6.609 6.922 7.119 7.304 7.593 7.887 8.162 8.415 8.659 8.982 9.287 9.584 9.963 10.321 10.654 11.048 11.496 11.93 12.409 12.894 13.385 13.905 14.511 15.235 15.976 16.833 17.755 18.773 19.901 21.205 22.655 24.129 24.853 24.944 24.767 24.36 23.92 23.469 22.924 22.433 21.966 21.538 21.144 20.773 20.411 20.049 19.696 19.342 19.019 18.73 18.413 18.047 17.75 17.458 17.154 16.892 16.599 16.294 15.955 15.581 15.344 15.109 14.721 14.456 14.184 14.045 13.766 13.476 13.171 12.996 12.482 12.395 12.181 11.945 11.398 11.071 10.719 10.35 9.898 9.358 8.563 5.032 -10 ,16132 ,TETRA ,17555223,Thu Nov 25 22:30:54 CET,Fri Nov 26 00:53:59 CET,0.0 1.504 1.905 2.145 2.339 2.516 2.706 2.904 3.257 3.428 3.59 3.571 4.041 4.181 4.437 4.677 4.914 5.023 5.22 5.42 5.712 5.888 6.063 6.349 6.625 6.887 7.145 7.383 7.667 7.95 8.245 8.597 8.949 9.302 9.685 10.107 10.52 10.949 11.404 11.922 12.463 13.045 13.725 14.401 15.254 16.189 17.164 18.288 19.619 21.066 22.508 23.381 23.571 23.46 23.299 23.089 22.804 22.481 22.151 21.755 21.391 21.077 20.762 20.452 20.154 19.853 19.51 19.206 18.977 18.734 18.455 18.224 17.988 17.751 17.555 17.334 17.091 16.819 16.564 16.401 16.209 15.891 15.67 15.438 15.319 15.06 14.76 14.482 14.331 13.84 13.793 13.607 13.427 13.011 12.767 12.502 12.22 11.883 11.376 10.551 6.835 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt deleted file mode 100644 index c3362d28..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20880 ,TETRA ,17555224,Thu Nov 25 22:30:53 CET,Fri Nov 26 00:55:32 CET,0.0 0.615 0.998 1.34 1.703 2.002 2.215 2.573 2.763 2.959 3.043 3.465 3.578 3.789 3.955 4.113 4.195 4.327 4.431 4.574 4.648 4.731 4.867 4.981 5.063 5.14 5.217 5.307 5.4 5.46 5.467 5.466 5.489 5.493 5.457 5.398 5.326 5.211 5.063 4.849 4.553 4.279 3.958 3.46 2.797 1.821 0.432 -1.596 -4.708 -9.826 -15.656 -20.309 -24.195 -27.48 -30.435 -33.027 -35.237 -37.031 -38.769 -40.201 -41.468 -42.632 -43.661 -44.584 -45.404 -46.256 -47.001 -47.633 -48.322 -49.033 -49.611 -50.233 -50.873 -51.378 -51.892 -52.398 -52.941 -53.521 -53.934 -54.369 -55.024 -55.453 -55.912 -56.165 -56.678 -57.225 -57.84 -58.152 -58.827 -59.226 -59.629 -60.014 -60.956 -61.509 -62.118 -62.897 -63.796 -65.005 -66.691 -2 ,1737 ,TETRA ,17555225,Thu Nov 25 22:32:44 CET,Fri Nov 26 01:01:13 CET,0.0 0.934 1.592 2.088 2.478 2.828 3.15 3.649 3.862 4.056 4.112 4.56 4.735 5.084 5.387 5.691 5.831 6.075 6.316 6.705 6.962 7.173 7.411 7.586 7.72 7.821 7.895 7.96 8.025 8.098 8.209 8.298 8.328 8.326 8.305 8.243 8.165 8.066 7.909 7.721 7.458 7.106 6.679 6.068 5.275 4.229 2.773 0.622 -2.362 -6.902 -12.699 -17.582 -21.9 -25.904 -29.371 -32.24 -34.82 -37.04 -39.139 -40.893 -42.477 -43.906 -45.202 -46.407 -47.496 -48.658 -49.681 -50.535 -51.45 -52.381 -53.126 -53.947 -54.836 -55.478 -56.106 -56.763 -57.392 -58.024 -58.473 -58.955 -59.711 -60.226 -60.768 -61.044 -61.58 -62.168 -62.868 -63.206 -63.908 -64.391 -64.861 -65.357 -66.409 -67.012 -67.673 -68.42 -69.3 -70.322 -71.949 -3 ,13393 ,TETRA ,17555226,Thu Nov 25 22:35:52 CET,Fri Nov 26 01:02:43 CET,0.0 0.637 1.028 1.38 1.759 2.1 2.393 2.886 3.099 3.311 3.429 3.883 4.043 4.367 4.692 5.002 5.146 5.429 5.717 6.11 6.361 6.609 6.962 7.307 7.612 7.89 8.17 8.534 8.89 9.241 9.667 10.071 10.464 10.888 11.369 11.851 12.29 12.717 13.211 13.764 14.353 14.984 15.531 16.003 16.374 16.469 16.157 15.442 13.605 9.074 2.977 -2.183 -6.849 -11.0 -14.18 -16.644 -18.867 -20.747 -22.629 -24.272 -25.693 -26.988 -28.174 -29.3 -30.341 -31.388 -32.271 -33.031 -33.894 -34.817 -35.574 -36.325 -37.082 -37.674 -38.267 -38.886 -39.526 -40.167 -40.602 -41.051 -41.74 -42.229 -42.764 -43.042 -43.587 -44.15 -44.792 -45.132 -45.803 -46.14 -46.541 -46.98 -47.95 -48.551 -49.225 -49.891 -50.621 -51.575 -53.047 -4 ,12225 ,TETRA ,17555227,Thu Nov 25 22:35:54 CET,Fri Nov 26 01:02:16 CET,0.0 0.711 1.229 1.657 2.008 2.331 2.619 3.113 3.341 3.535 3.61 4.092 4.285 4.658 4.979 5.27 5.417 5.698 5.972 6.367 6.616 6.842 7.094 7.3 7.524 7.713 7.855 8.028 8.157 8.29 8.466 8.592 8.7 8.812 8.934 9.018 9.032 9.028 8.998 8.956 8.889 8.666 8.348 7.825 7.092 6.075 4.634 2.586 -0.679 -6.074 -12.202 -17.102 -21.148 -24.519 -27.45 -29.889 -31.995 -33.719 -35.381 -36.833 -38.128 -39.376 -40.572 -41.636 -42.617 -43.694 -44.637 -45.431 -46.244 -47.088 -47.778 -48.487 -49.205 -49.763 -50.364 -50.973 -51.574 -52.199 -52.642 -53.118 -53.924 -54.497 -55.053 -55.332 -55.924 -56.528 -57.19 -57.531 -58.208 -58.585 -58.999 -59.419 -60.418 -60.963 -61.476 -62.005 -62.599 -63.445 -64.743 -5 ,3063 ,TETRA ,17555228,Thu Nov 25 22:35:56 CET,Fri Nov 26 00:47:19 CET,0.0 0.702 1.233 1.661 2.004 2.293 2.564 3.068 3.307 3.551 3.727 4.2 4.351 4.677 5.002 5.295 5.44 5.741 6.022 6.398 6.643 6.871 7.201 7.544 7.874 8.188 8.501 8.92 9.338 9.703 10.092 10.454 10.783 11.182 11.662 12.114 12.6 13.133 13.669 14.261 14.924 15.596 16.194 16.733 17.257 17.646 17.765 17.504 16.083 12.23 6.476 1.215 -3.815 -8.251 -12.128 -15.405 -18.286 -20.841 -23.355 -25.488 -27.447 -29.37 -31.165 -32.762 -34.213 -35.735 -37.048 -38.142 -39.267 -40.39 -41.296 -42.234 -43.187 -43.934 -44.714 -45.513 -46.342 -47.202 -47.789 -48.372 -49.27 -49.885 -50.518 -50.846 -51.536 -52.254 -52.997 -53.391 -54.146 -54.673 -55.132 -55.604 -56.618 -57.161 -57.819 -58.641 -59.527 -60.558 -61.951 -6 ,2483 ,TETRA ,17555229,Thu Nov 25 22:35:52 CET,Fri Nov 26 01:00:55 CET,0.0 0.789 1.309 1.697 2.001 2.268 2.543 3.08 3.31 3.512 3.631 4.105 4.272 4.59 4.899 5.195 5.338 5.639 5.915 6.27 6.522 6.766 7.096 7.402 7.698 7.991 8.291 8.673 9.034 9.384 9.792 10.185 10.572 11.031 11.559 12.044 12.543 13.088 13.663 14.236 14.804 15.276 15.596 15.927 16.173 16.306 16.248 15.614 13.809 9.82 4.409 -0.67 -5.35 -9.314 -12.893 -16.174 -19.122 -21.693 -24.293 -26.485 -28.334 -30.049 -31.668 -33.13 -34.453 -35.82 -37.05 -38.099 -39.159 -40.261 -41.215 -42.208 -43.185 -43.949 -44.733 -45.529 -46.373 -47.231 -47.804 -48.395 -49.337 -50.003 -50.681 -51.032 -51.761 -52.497 -53.256 -53.661 -54.457 -55.056 -55.531 -56.03 -57.149 -57.765 -58.485 -59.275 -60.066 -60.997 -62.422 -7 ,12751 ,TETRA ,17555230,Thu Nov 25 22:35:54 CET,Fri Nov 26 01:01:13 CET,0.0 0.805 1.305 1.65 1.968 2.273 2.543 3.049 3.28 3.484 3.572 4.029 4.201 4.539 4.852 5.143 5.276 5.559 5.844 6.237 6.506 6.762 7.11 7.462 7.797 8.109 8.379 8.636 8.865 9.068 9.268 9.409 9.514 9.635 9.787 9.922 10.006 10.063 10.064 10.043 9.923 9.677 9.423 8.986 8.358 7.457 6.108 4.119 1.279 -3.365 -8.845 -13.19 -16.801 -19.888 -22.71 -25.114 -27.178 -28.895 -30.607 -32.024 -33.234 -34.413 -35.546 -36.624 -37.618 -38.642 -39.529 -40.298 -41.078 -41.877 -42.539 -43.194 -43.862 -44.398 -44.951 -45.481 -46.044 -46.66 -47.074 -47.502 -48.207 -48.714 -49.232 -49.49 -50.037 -50.608 -51.184 -51.492 -52.167 -52.53 -52.901 -53.289 -54.143 -54.615 -55.131 -55.762 -56.636 -57.658 -59.079 -8 ,22980 ,TETRA ,17555231,Thu Nov 25 22:35:56 CET,Fri Nov 26 00:46:48 CET,0.0 0.518 0.871 1.26 1.589 1.851 2.07 2.467 2.641 2.789 2.777 3.178 3.282 3.491 3.669 3.811 3.884 4.041 4.198 4.365 4.445 4.527 4.633 4.721 4.811 4.888 4.942 5.009 5.084 5.144 5.181 5.216 5.25 5.263 5.245 5.199 5.129 5.014 4.831 4.621 4.367 3.99 3.514 2.86 1.973 0.782 -0.837 -3.236 -6.781 -12.258 -18.192 -22.787 -26.586 -29.844 -32.703 -35.095 -37.171 -38.898 -40.565 -41.951 -43.209 -44.442 -45.59 -46.641 -47.59 -48.591 -49.489 -50.235 -50.979 -51.776 -52.443 -53.112 -53.802 -54.331 -54.87 -55.424 -56.001 -56.586 -56.971 -57.393 -58.107 -58.61 -59.131 -59.379 -59.877 -60.421 -61.021 -61.339 -62.02 -62.387 -62.771 -63.138 -63.897 -64.357 -64.907 -65.504 -66.214 -67.108 -68.465 -9 ,17456 ,TETRA ,17555232,Thu Nov 25 22:39:45 CET,Fri Nov 26 01:04:55 CET,0.0 0.826 1.353 1.742 2.076 2.384 2.654 3.075 3.278 3.499 3.666 4.151 4.315 4.627 4.935 5.227 5.371 5.657 5.935 6.334 6.576 6.793 7.123 7.451 7.761 8.065 8.363 8.728 9.07 9.409 9.794 10.124 10.458 10.872 11.294 11.71 12.179 12.632 13.123 13.65 14.134 14.626 15.124 15.531 15.724 15.773 15.715 15.243 13.748 9.834 3.346 -2.648 -7.826 -12.243 -16.143 -19.584 -22.788 -25.537 -28.135 -30.328 -32.2 -33.954 -35.611 -37.123 -38.491 -39.893 -41.128 -42.172 -43.268 -44.449 -45.427 -46.442 -47.474 -48.263 -49.085 -49.91 -50.778 -51.664 -52.261 -52.866 -53.764 -54.404 -55.066 -55.41 -56.141 -56.892 -57.639 -58.006 -58.746 -59.265 -59.731 -60.211 -61.252 -61.835 -62.431 -63.103 -63.892 -64.793 -66.021 -10 ,5148 ,TETRA ,17555233,Thu Nov 25 22:39:47 CET,Fri Nov 26 01:04:55 CET,0.0 0.602 1.085 1.499 1.83 2.134 2.421 2.945 3.186 3.407 3.527 4.005 4.205 4.599 4.976 5.317 5.474 5.746 5.956 6.279 6.493 6.7 6.956 7.18 7.418 7.607 7.752 7.939 8.105 8.256 8.434 8.589 8.691 8.768 8.872 8.983 9.038 9.027 9.003 8.935 8.78 8.5 8.104 7.568 6.801 5.661 4.146 2.057 -1.294 -6.918 -13.143 -18.093 -22.123 -25.389 -28.23 -30.683 -32.799 -34.549 -36.296 -37.776 -39.065 -40.274 -41.392 -42.399 -43.292 -44.217 -45.078 -45.822 -46.548 -47.323 -47.98 -48.642 -49.313 -49.832 -50.352 -50.881 -51.457 -52.067 -52.463 -52.88 -53.57 -54.049 -54.568 -54.834 -55.358 -55.905 -56.505 -56.812 -57.504 -57.938 -58.308 -58.707 -59.687 -60.219 -60.863 -61.57 -62.37 -63.434 -64.932 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt deleted file mode 100644 index 0b048ebd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,2143 ,TETRA ,17555235,Thu Nov 25 22:40:47 CET,Fri Nov 26 01:05:52 CET,0.0 2.4 3.099 3.675 4.19 4.627 5.011 5.372 6.059 6.386 6.697 7.002 7.601 7.891 8.449 8.976 9.453 9.682 10.126 10.557 11.188 11.603 12.007 12.625 13.246 13.839 14.43 14.989 15.693 16.387 17.066 17.933 18.808 19.672 20.665 21.72 22.694 23.71 24.752 25.919 27.218 28.647 30.321 32.065 34.082 36.344 38.969 41.746 44.716 47.664 49.978 50.257 49.263 47.956 46.439 44.772 43.072 41.423 40.026 38.715 37.772 37.085 36.408 35.793 35.249 34.567 33.696 32.918 32.22 31.485 30.723 30.079 29.41 28.692 28.134 27.575 26.976 26.35 25.696 25.231 24.758 24.023 23.487 22.943 22.679 22.134 21.55 20.893 20.524 19.861 19.351 18.957 18.565 17.705 17.202 16.621 15.946 15.158 14.239 12.929 3.879 -4 ,8767 ,TETRA ,17555237,Thu Nov 25 22:40:51 CET,Fri Nov 26 00:51:36 CET,0.0 5.499 6.407 7.046 7.541 7.996 8.391 8.768 9.55 9.926 10.274 10.634 11.203 11.463 11.964 12.446 12.91 13.146 13.588 13.971 14.555 14.971 15.348 15.829 16.298 16.759 17.185 17.604 18.105 18.535 18.969 19.511 20.028 20.502 21.046 21.68 22.287 22.915 23.591 24.298 25.04 25.905 26.922 28.272 30.185 32.318 34.763 37.41 40.137 42.889 45.622 46.098 44.975 43.473 42.086 40.886 39.771 38.667 37.629 36.564 35.662 34.839 34.041 33.244 32.5 31.833 31.117 30.464 29.917 29.264 28.506 27.9 27.293 26.65 26.123 25.595 25.079 24.568 24.041 23.662 23.242 22.602 22.165 21.695 21.448 20.915 20.323 19.647 19.273 18.602 18.028 17.569 17.124 16.238 15.779 15.252 14.547 13.676 12.645 10.887 -1.424 -9 ,31291 ,TETRA ,17555242,Thu Nov 25 22:45:47 CET,Fri Nov 26 01:10:58 CET,0.0 2.491 3.208 3.753 4.203 4.621 5.034 5.41 6.095 6.427 6.758 7.094 7.664 7.946 8.498 9.04 9.597 9.854 10.314 10.752 11.409 11.85 12.275 12.871 13.448 14.012 14.566 15.131 15.874 16.576 17.261 18.116 18.932 19.736 20.646 21.611 22.553 23.678 24.828 25.825 26.761 27.823 29.031 30.212 31.583 32.985 34.556 36.191 37.808 39.421 40.694 40.643 39.983 39.144 38.138 37.037 36.036 34.99 33.903 32.793 31.801 30.783 29.7 28.691 27.829 27.045 26.192 25.401 24.714 23.97 23.171 22.563 21.97 21.323 20.814 20.301 19.737 19.119 18.497 18.061 17.587 16.875 16.404 15.936 15.688 15.131 14.561 13.97 13.653 13.042 12.592 12.229 11.853 11.003 10.521 9.921 9.262 8.563 7.712 6.196 0.152 -10 ,11835 ,TETRA ,17555243,Thu Nov 25 22:45:49 CET,Fri Nov 26 00:56:35 CET,0.0 5.583 6.497 7.137 7.67 8.142 8.545 8.934 9.608 9.911 10.199 10.444 10.972 11.217 11.742 12.277 12.786 13.003 13.37 13.765 14.418 14.824 15.173 15.676 16.189 16.683 17.149 17.59 18.085 18.545 18.986 19.467 20.025 20.683 21.387 22.004 22.516 23.05 23.621 24.246 24.904 25.588 26.311 27.017 27.937 29.109 30.495 32.298 34.834 37.492 39.516 39.564 38.502 37.1 35.576 34.071 32.641 31.25 30.037 28.815 27.624 26.56 25.513 24.411 23.415 22.533 21.566 20.664 19.888 19.104 18.296 17.641 16.96 16.297 15.781 15.176 14.558 13.955 13.284 12.8 12.348 11.579 10.999 10.385 10.038 9.352 8.624 7.835 7.439 6.73 6.092 5.644 5.195 4.117 3.516 2.875 2.079 1.096 -0.112 -1.799 -10.394 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 33c23008..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25832 ,KEBNE ,17043631,Thu Dec 23 04:45:38 CET,Thu Dec 23 06:30:26 CET,0.0 1.177 1.524 1.832 2.087 2.266 2.429 2.582 2.836 2.959 3.089 3.047 3.405 3.482 3.626 3.762 3.908 3.98 4.088 4.186 4.337 4.425 4.511 4.642 4.762 4.856 4.938 5.013 5.109 5.194 5.262 5.333 5.409 5.481 5.548 5.613 5.665 5.695 5.703 5.708 5.685 5.633 5.537 5.395 5.187 4.793 4.116 3.127 1.723 -0.338 -3.894 -8.222 -11.692 -14.452 -16.752 -18.756 -20.482 -22.036 -23.371 -24.667 -25.721 -26.639 -27.501 -28.293 -29.015 -29.668 -30.355 -30.964 -31.487 -32.0 -32.534 -33.004 -33.486 -33.981 -34.364 -34.755 -35.15 -35.544 -35.948 -36.236 -36.528 -36.976 -37.287 -37.602 -37.761 -38.094 -38.452 -38.827 -39.026 -39.566 -39.704 -39.929 -40.154 -40.634 -40.899 -41.202 -41.54 -41.927 -42.425 -43.062 -45.281 -2 ,19773 ,KEBNE ,17043632,Thu Dec 23 04:45:38 CET,Thu Dec 23 06:30:55 CET,0.0 1.275 1.716 2.06 2.333 2.579 2.802 2.99 3.338 3.498 3.635 3.6 3.985 4.103 4.301 4.438 4.577 4.642 4.76 4.885 5.014 5.08 5.14 5.206 5.259 5.303 5.355 5.402 5.459 5.519 5.573 5.627 5.673 5.698 5.716 5.734 5.723 5.715 5.686 5.603 5.544 5.454 5.237 4.971 4.577 4.05 3.361 2.403 0.986 -1.238 -5.209 -9.591 -12.797 -15.468 -17.904 -20.217 -22.097 -23.628 -24.913 -26.179 -27.24 -28.182 -29.09 -29.906 -30.646 -31.314 -32.024 -32.648 -33.153 -33.676 -34.221 -34.683 -35.15 -35.606 -35.96 -36.321 -36.681 -37.072 -37.495 -37.776 -38.058 -38.499 -38.804 -39.12 -39.284 -39.619 -39.964 -40.333 -40.532 -41.056 -41.099 -41.309 -41.528 -41.993 -42.232 -42.498 -42.825 -43.179 -43.605 -44.182 -46.235 -3 ,22353 ,KEBNE ,17043633,Thu Dec 23 04:45:37 CET,Thu Dec 23 06:30:50 CET,0.0 0.893 1.116 1.263 1.388 1.521 1.639 1.751 1.969 2.069 2.153 2.023 2.359 2.428 2.545 2.647 2.756 2.815 2.917 3.012 3.149 3.226 3.294 3.378 3.442 3.509 3.583 3.663 3.745 3.802 3.861 3.927 3.985 4.039 4.069 4.086 4.094 4.084 4.057 4.04 4.0 3.87 3.648 3.403 3.121 2.776 2.227 1.388 0.207 -1.681 -5.064 -9.216 -12.565 -15.281 -17.554 -19.512 -21.196 -22.683 -23.931 -25.222 -26.32 -27.264 -28.173 -29.027 -29.804 -30.503 -31.203 -31.805 -32.305 -32.849 -33.414 -33.862 -34.348 -34.848 -35.198 -35.548 -35.925 -36.317 -36.701 -36.977 -37.271 -37.701 -38.01 -38.316 -38.469 -38.806 -39.146 -39.51 -39.703 -40.214 -40.273 -40.484 -40.709 -41.15 -41.402 -41.685 -41.999 -42.37 -42.776 -43.29 -45.0 -4 ,32289 ,KEBNE ,17043634,Thu Dec 23 04:45:38 CET,Thu Dec 23 06:30:57 CET,0.0 0.906 1.163 1.335 1.474 1.576 1.67 1.769 1.957 2.051 2.128 1.987 2.311 2.365 2.471 2.574 2.661 2.702 2.783 2.866 3.0 3.079 3.149 3.234 3.337 3.445 3.538 3.618 3.689 3.74 3.793 3.868 3.921 3.963 3.996 4.021 4.017 3.991 3.949 3.864 3.763 3.638 3.415 3.146 2.822 2.409 1.815 0.902 -0.538 -2.736 -6.356 -10.74 -14.249 -16.978 -19.237 -21.242 -22.895 -24.307 -25.489 -26.613 -27.574 -28.426 -29.249 -30.059 -30.816 -31.504 -32.204 -32.808 -33.321 -33.837 -34.377 -34.82 -35.259 -35.706 -36.043 -36.385 -36.736 -37.099 -37.502 -37.788 -38.078 -38.52 -38.836 -39.189 -39.361 -39.702 -40.066 -40.474 -40.698 -41.251 -41.374 -41.592 -41.821 -42.343 -42.632 -42.921 -43.252 -43.611 -44.009 -44.471 -46.146 -5 ,9212 ,KEBNE ,17043635,Thu Dec 23 04:47:41 CET,Thu Dec 23 06:32:45 CET,0.0 1.26 1.668 1.932 2.141 2.36 2.576 2.753 3.055 3.185 3.299 3.244 3.608 3.692 3.861 4.019 4.167 4.24 4.383 4.498 4.63 4.704 4.758 4.827 4.891 4.934 4.982 5.057 5.146 5.203 5.235 5.262 5.304 5.344 5.389 5.447 5.501 5.532 5.538 5.543 5.469 5.315 5.142 4.955 4.622 4.094 3.396 2.43 0.981 -1.262 -4.878 -8.972 -12.314 -15.104 -17.429 -19.447 -21.217 -22.833 -24.175 -25.444 -26.498 -27.435 -28.322 -29.152 -29.913 -30.591 -31.325 -31.977 -32.5 -33.015 -33.549 -34.007 -34.475 -34.954 -35.315 -35.676 -36.046 -36.438 -36.844 -37.116 -37.407 -37.885 -38.219 -38.55 -38.714 -39.054 -39.414 -39.768 -39.956 -40.484 -40.611 -40.853 -41.081 -41.564 -41.845 -42.15 -42.484 -42.853 -43.276 -43.798 -45.884 -6 ,13116 ,KEBNE ,17043636,Thu Dec 23 04:47:41 CET,Thu Dec 23 06:33:38 CET,0.0 1.309 1.712 1.999 2.215 2.399 2.576 2.752 3.051 3.184 3.307 3.245 3.621 3.729 3.938 4.134 4.317 4.394 4.51 4.613 4.764 4.859 4.947 5.092 5.254 5.404 5.554 5.698 5.858 6.011 6.147 6.275 6.353 6.407 6.466 6.539 6.683 6.795 6.782 6.716 6.614 6.499 6.307 6.036 5.623 5.069 4.238 3.022 1.344 -1.049 -4.721 -8.975 -12.502 -15.481 -17.923 -19.954 -21.654 -23.15 -24.407 -25.669 -26.79 -27.724 -28.56 -29.335 -30.052 -30.729 -31.428 -32.017 -32.517 -33.046 -33.585 -34.035 -34.513 -35.007 -35.374 -35.731 -36.105 -36.513 -36.933 -37.216 -37.499 -37.924 -38.226 -38.544 -38.709 -39.069 -39.449 -39.835 -40.03 -40.554 -40.627 -40.856 -41.096 -41.586 -41.852 -42.13 -42.432 -42.821 -43.277 -43.811 -46.138 -7 ,24400 ,KEBNE ,17043637,Thu Dec 23 04:50:47 CET,Thu Dec 23 06:37:57 CET,0.0 1.158 1.58 1.854 2.092 2.314 2.526 2.706 3.006 3.144 3.267 3.227 3.605 3.717 3.905 4.062 4.2 4.272 4.419 4.554 4.731 4.838 4.943 5.09 5.235 5.39 5.542 5.654 5.773 5.888 6.006 6.133 6.247 6.333 6.395 6.435 6.428 6.382 6.315 6.242 6.165 6.07 5.903 5.687 5.463 5.171 4.659 3.858 2.61 0.773 -2.44 -6.425 -9.596 -12.216 -14.547 -16.782 -18.712 -20.336 -21.685 -23.045 -24.187 -25.181 -26.114 -26.991 -27.799 -28.51 -29.21 -29.837 -30.379 -30.938 -31.5 -31.933 -32.41 -32.915 -33.279 -33.645 -34.023 -34.427 -34.845 -35.13 -35.415 -35.844 -36.127 -36.418 -36.578 -36.917 -37.284 -37.677 -37.886 -38.443 -38.59 -38.836 -39.067 -39.564 -39.854 -40.177 -40.504 -40.861 -41.324 -41.97 -43.6 -8 ,30632 ,KEBNE ,17043638,Thu Dec 23 04:59:04 CET,Thu Dec 23 06:43:57 CET,0.0 0.788 1.096 1.29 1.478 1.615 1.722 1.818 1.997 2.082 2.156 2.04 2.359 2.409 2.491 2.557 2.629 2.67 2.755 2.855 3.002 3.07 3.121 3.199 3.268 3.322 3.375 3.442 3.541 3.617 3.672 3.726 3.778 3.802 3.799 3.784 3.775 3.763 3.713 3.663 3.612 3.47 3.249 3.057 2.782 2.311 1.664 0.799 -0.454 -2.37 -5.753 -9.957 -13.376 -16.158 -18.529 -20.592 -22.301 -23.782 -24.984 -26.172 -27.202 -28.113 -28.969 -29.755 -30.484 -31.164 -31.88 -32.495 -33.015 -33.544 -34.094 -34.554 -35.006 -35.462 -35.816 -36.182 -36.562 -36.964 -37.392 -37.687 -37.992 -38.453 -38.749 -39.046 -39.201 -39.518 -39.892 -40.304 -40.51 -41.045 -41.133 -41.343 -41.562 -42.024 -42.295 -42.595 -42.917 -43.263 -43.671 -44.305 -46.416 -9 ,27225 ,KEBNE ,17043639,Thu Dec 23 05:01:08 CET,Thu Dec 23 06:46:10 CET,0.0 1.023 1.303 1.486 1.652 1.815 1.954 2.063 2.251 2.332 2.41 2.29 2.616 2.668 2.817 2.967 3.081 3.133 3.239 3.334 3.458 3.531 3.595 3.692 3.798 3.885 3.947 4.013 4.097 4.177 4.245 4.3 4.333 4.347 4.367 4.414 4.436 4.415 4.392 4.339 4.214 4.032 3.758 3.431 2.988 2.403 1.591 0.489 -1.09 -3.47 -7.188 -11.254 -14.542 -17.281 -19.543 -21.528 -23.276 -24.82 -26.119 -27.464 -28.597 -29.562 -30.484 -31.32 -32.089 -32.795 -33.513 -34.15 -34.678 -35.212 -35.781 -36.261 -36.734 -37.206 -37.565 -37.935 -38.317 -38.692 -39.087 -39.358 -39.618 -40.037 -40.343 -40.652 -40.797 -41.104 -41.436 -41.765 -41.936 -42.442 -42.5 -42.72 -42.963 -43.458 -43.721 -44.009 -44.33 -44.677 -45.059 -45.601 -48.161 -10 ,1404 ,KEBNE ,17043640,Thu Dec 23 05:04:15 CET,Thu Dec 23 06:50:40 CET,0.0 1.46 1.895 2.183 2.434 2.639 2.808 2.955 3.189 3.31 3.416 3.329 3.668 3.754 3.926 4.1 4.252 4.318 4.449 4.568 4.717 4.823 4.932 5.063 5.143 5.202 5.259 5.306 5.383 5.502 5.624 5.731 5.826 5.896 5.925 5.923 5.907 5.879 5.865 5.834 5.732 5.607 5.466 5.281 5.016 4.619 3.973 3.003 1.528 -0.708 -4.349 -8.572 -12.041 -14.974 -17.416 -19.46 -21.177 -22.688 -23.977 -25.228 -26.255 -27.152 -28.004 -28.781 -29.494 -30.164 -30.849 -31.446 -31.967 -32.519 -33.071 -33.511 -33.959 -34.415 -34.789 -35.185 -35.59 -36.0 -36.401 -36.681 -36.979 -37.434 -37.755 -38.077 -38.229 -38.537 -38.859 -39.225 -39.438 -39.979 -40.122 -40.336 -40.544 -41.051 -41.345 -41.644 -41.98 -42.38 -42.851 -43.532 -45.649 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 806aa9e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10418 ,TETRA ,17555244,Thu Nov 25 22:45:45 CET,Fri Nov 26 01:04:40 CET,0.0 0.547 0.794 1.016 1.212 1.4 1.588 1.762 2.097 2.249 2.386 2.408 2.811 2.939 3.207 3.485 3.75 3.886 4.166 4.425 4.78 5.012 5.234 5.552 5.876 6.205 6.525 6.854 7.299 7.733 8.174 8.707 9.2 9.673 10.23 10.861 11.467 12.177 12.997 13.838 14.697 15.652 16.783 17.998 19.424 20.987 22.817 24.743 26.792 28.966 31.147 32.327 32.608 32.419 32.0 31.426 30.772 30.21 29.634 28.816 28.062 27.332 26.564 25.858 25.21 24.64 24.036 23.501 23.039 22.531 22.024 21.627 21.231 20.853 20.57 20.271 19.945 19.603 19.245 18.998 18.74 18.314 18.037 17.778 17.635 17.257 16.83 16.41 16.176 15.675 15.398 15.089 14.764 14.095 13.759 13.436 13.051 12.536 11.669 10.05 nan -4 ,10144 ,TETRA ,17555247,Thu Nov 25 22:45:45 CET,Fri Nov 26 01:05:11 CET,0.0 0.469 0.751 0.958 1.139 1.31 1.482 1.665 2.019 2.186 2.349 2.399 2.82 2.972 3.275 3.573 3.87 4.008 4.267 4.541 4.94 5.193 5.449 5.832 6.217 6.608 6.975 7.313 7.749 8.167 8.559 9.071 9.552 9.978 10.499 11.096 11.705 12.412 13.166 13.964 14.793 15.824 17.186 18.561 20.042 21.628 23.466 25.465 27.662 30.045 32.817 34.711 35.314 35.287 35.025 34.532 33.902 33.289 32.716 32.073 31.468 30.855 30.207 29.606 29.052 28.546 28.045 27.619 27.206 26.714 26.182 25.714 25.215 24.719 24.354 23.993 23.607 23.19 22.774 22.479 22.166 21.735 21.435 21.064 20.85 20.421 19.994 19.516 19.263 18.748 18.453 18.173 17.867 17.122 16.666 16.159 15.62 14.967 14.183 13.069 7.488 -6 ,18876 ,TETRA ,17555249,Thu Nov 25 22:45:49 CET,Fri Nov 26 00:49:23 CET,0.0 0.429 0.666 0.863 1.039 1.207 1.378 1.54 1.865 2.037 2.205 2.251 2.679 2.839 3.149 3.453 3.746 3.888 4.165 4.432 4.825 5.083 5.331 5.699 6.075 6.427 6.755 7.073 7.502 7.932 8.339 8.803 9.245 9.671 10.162 10.726 11.281 11.888 12.533 13.247 14.034 14.946 16.12 17.424 18.983 20.578 22.188 23.859 25.66 27.641 29.613 30.749 30.961 30.749 30.426 30.064 29.634 29.087 28.573 28.08 27.579 27.042 26.544 26.11 25.642 25.168 24.665 24.201 23.796 23.337 22.831 22.418 21.99 21.541 21.203 20.862 20.502 20.118 19.689 19.409 19.138 18.706 18.42 18.105 17.939 17.6 17.217 16.809 16.593 16.119 15.918 15.678 15.425 14.856 14.49 13.997 13.478 12.887 12.041 10.808 5.657 -7 ,27643 ,TETRA ,17555250,Thu Nov 25 22:47:42 CET,Fri Nov 26 01:06:29 CET,0.0 0.328 0.578 0.778 0.966 1.155 1.345 1.524 1.853 2.008 2.161 2.211 2.631 2.779 3.071 3.361 3.629 3.762 4.043 4.33 4.762 5.039 5.297 5.656 6.016 6.395 6.771 7.147 7.649 8.147 8.622 9.173 9.695 10.194 10.738 11.326 11.921 12.591 13.36 14.209 15.075 16.066 17.243 18.424 19.77 21.268 22.996 25.009 27.236 29.571 32.137 33.659 34.253 34.515 34.423 33.96 33.383 32.774 32.118 31.431 30.861 30.258 29.579 28.968 28.385 27.862 27.364 26.888 26.448 25.995 25.588 25.25 24.841 24.404 24.079 23.768 23.436 23.097 22.715 22.426 22.138 21.668 21.335 21.002 20.828 20.457 20.057 19.612 19.391 18.95 18.762 18.515 18.253 17.663 17.325 16.937 16.497 15.951 15.121 13.932 nan diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836.txt deleted file mode 100644 index 6c89ad4e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,16743 ,KEBNE ,17043642,Thu Dec 23 05:01:08 CET,Thu Dec 23 06:47:28 CET,0.0 0.701 1.144 1.538 1.872 2.173 2.462 2.738 3.292 3.547 3.8 3.957 4.516 4.746 5.2 5.646 6.08 6.291 6.7 7.11 7.724 8.125 8.508 9.051 9.606 10.156 10.687 11.221 11.932 12.635 13.333 14.208 15.074 15.909 16.887 17.999 19.089 20.332 21.724 23.238 24.842 26.745 29.057 31.42 34.248 37.434 41.163 45.344 50.108 55.678 62.72 68.834 72.429 74.893 76.603 77.809 78.703 79.4 79.918 80.321 80.573 80.74 80.848 80.904 80.921 80.922 80.905 80.861 80.804 80.733 80.646 80.581 80.482 80.328 80.217 80.12 80.021 79.892 79.688 79.52 79.347 79.07 78.863 78.664 78.58 78.399 78.174 77.934 77.795 77.41 77.308 77.129 76.93 76.463 76.15 75.759 75.324 74.825 74.205 73.426 69.564 -7 ,16070 ,KEBNE ,17043647,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:50:01 CET,0.0 0.898 1.356 1.701 2.007 2.307 2.587 2.862 3.388 3.626 3.856 3.986 4.536 4.761 5.195 5.63 6.068 6.278 6.678 7.08 7.683 8.085 8.496 9.086 9.655 10.232 10.804 11.343 12.058 12.769 13.453 14.304 15.128 15.921 16.861 17.965 19.078 20.303 21.655 23.148 24.745 26.581 28.755 31.025 33.789 36.918 40.468 44.498 49.337 54.859 61.669 67.618 71.251 73.698 75.347 76.542 77.397 77.973 78.332 78.617 78.82 78.978 79.107 79.198 79.253 79.273 79.263 79.234 79.206 79.176 79.128 79.064 79.0 78.948 78.892 78.822 78.754 78.673 78.57 78.501 78.403 78.209 78.077 77.931 77.849 77.679 77.485 77.268 77.153 76.803 76.749 76.576 76.401 75.993 75.727 75.411 75.069 74.683 74.205 73.565 69.189 -9 ,2766 ,KEBNE ,17043649,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:50:16 CET,0.0 1.078 1.492 1.819 2.11 2.392 2.667 2.945 3.47 3.718 3.949 4.085 4.656 4.886 5.326 5.757 6.183 6.394 6.814 7.225 7.812 8.198 8.586 9.147 9.698 10.255 10.798 11.321 12.032 12.753 13.458 14.335 15.198 16.028 16.989 18.096 19.191 20.422 21.791 23.297 24.861 26.575 28.582 30.657 33.185 36.11 39.555 43.446 47.821 52.847 59.32 65.01 68.311 70.42 71.887 72.891 73.541 73.949 74.276 74.636 74.866 75.04 75.16 75.196 75.221 75.225 75.196 75.158 75.132 75.095 75.009 74.906 74.791 74.644 74.526 74.417 74.29 74.141 74.009 73.908 73.779 73.517 73.311 73.118 73.013 72.781 72.531 72.244 72.091 71.713 71.595 71.396 71.202 70.824 70.603 70.307 69.907 69.376 68.707 67.793 63.31 -10 ,32136 ,KEBNE ,17043650,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:50:18 CET,0.0 1.03 1.49 1.874 2.221 2.509 2.791 3.078 3.589 3.814 4.047 4.214 4.782 5.017 5.47 5.925 6.372 6.597 7.04 7.467 8.058 8.424 8.806 9.385 9.944 10.49 11.027 11.54 12.216 12.897 13.558 14.387 15.238 16.07 17.026 18.137 19.234 20.491 21.907 23.399 24.967 26.792 28.986 31.224 33.848 36.871 40.445 44.46 49.313 55.283 63.03 69.753 73.699 76.387 78.313 79.744 80.762 81.557 82.13 82.501 82.703 82.869 83.027 83.133 83.197 83.222 83.2 83.168 83.127 83.05 82.939 82.859 82.773 82.665 82.569 82.458 82.358 82.237 82.065 81.927 81.754 81.461 81.276 81.094 81.0 80.794 80.557 80.3 80.163 79.787 79.673 79.451 79.165 78.58 78.301 77.946 77.496 77.007 76.397 75.514 72.304 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 620c354a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -6 ,25453 ,TETRA ,17555259,Thu Nov 25 23:14:26 CET,Fri Nov 26 01:32:34 CET,0.0 0.349 0.619 0.877 1.122 1.339 1.546 1.764 2.166 2.353 2.548 2.626 3.152 3.346 3.712 4.066 4.425 4.6 4.936 5.267 5.77 6.098 6.426 6.906 7.364 7.821 8.28 8.742 9.343 9.927 10.49 11.178 11.839 12.493 13.316 14.265 15.182 16.218 17.366 18.627 20.047 21.701 23.602 25.509 27.826 30.531 33.656 37.135 41.219 46.27 52.789 58.115 61.146 62.988 64.051 64.795 65.303 65.59 65.682 65.615 65.465 65.292 65.094 64.91 64.746 64.586 64.381 64.191 64.059 63.935 63.792 63.657 63.519 63.386 63.253 63.082 62.887 62.696 62.495 62.325 62.14 61.855 61.647 61.413 61.294 61.053 60.796 60.481 60.292 59.862 59.761 59.573 59.36 58.879 58.58 58.209 57.739 57.175 56.48 55.437 50.386 -7 ,8951 ,TETRA ,17555260,Thu Nov 25 23:14:30 CET,Fri Nov 26 01:33:07 CET,0.0 0.432 0.712 0.969 1.212 1.446 1.687 1.913 2.329 2.548 2.76 2.826 3.339 3.527 3.91 4.277 4.626 4.801 5.154 5.502 6.025 6.385 6.739 7.242 7.745 8.248 8.747 9.214 9.784 10.334 10.886 11.568 12.236 12.897 13.677 14.556 15.412 16.384 17.492 18.751 20.086 21.589 23.366 25.216 27.42 29.899 32.867 36.371 40.567 45.551 51.85 57.388 60.797 63.045 64.509 65.364 65.854 66.079 66.129 66.108 66.074 66.039 66.023 65.98 65.866 65.703 65.532 65.37 65.221 65.072 64.865 64.658 64.441 64.238 64.075 63.875 63.636 63.383 63.108 62.902 62.713 62.422 62.202 61.971 61.841 61.542 61.233 60.899 60.731 60.317 60.159 59.936 59.714 59.147 58.815 58.446 58.013 57.46 56.641 55.397 49.737 -8 ,30780 ,TETRA ,17555261,Thu Nov 25 23:14:27 CET,Fri Nov 26 01:19:46 CET,0.0 0.369 0.635 0.879 1.118 1.355 1.578 1.782 2.151 2.35 2.565 2.659 3.192 3.393 3.77 4.128 4.481 4.658 5.015 5.37 5.885 6.227 6.564 7.051 7.529 8.002 8.47 8.932 9.554 10.177 10.789 11.529 12.26 12.987 13.846 14.845 15.833 16.953 18.193 19.542 21.003 22.733 24.84 26.96 29.502 32.483 35.993 40.035 44.923 50.692 57.361 63.08 66.634 68.82 70.151 71.065 71.752 72.302 72.689 72.972 73.118 73.166 73.151 73.131 73.096 73.01 72.912 72.791 72.616 72.419 72.234 72.054 71.814 71.549 71.366 71.166 70.95 70.731 70.502 70.347 70.164 69.858 69.65 69.426 69.302 69.059 68.803 68.503 68.342 67.923 67.757 67.525 67.278 66.649 66.231 65.682 65.162 64.666 63.903 62.656 50.883 -9 ,22475 ,TETRA ,17555262,Thu Nov 25 23:18:58 CET,Fri Nov 26 01:37:29 CET,0.0 0.325 0.588 0.836 1.068 1.274 1.47 1.676 2.081 2.282 2.483 2.543 3.065 3.254 3.634 4.006 4.37 4.55 4.898 5.24 5.763 6.111 6.453 6.953 7.446 7.948 8.444 8.936 9.595 10.251 10.884 11.664 12.422 13.178 14.114 15.131 16.07 17.146 18.325 19.591 20.983 22.584 24.486 26.5 28.921 31.461 34.235 37.475 41.438 46.521 53.09 58.362 61.277 63.001 64.122 64.943 65.481 65.745 65.819 65.808 65.721 65.659 65.611 65.521 65.384 65.256 65.073 64.856 64.694 64.508 64.279 64.087 63.843 63.565 63.358 63.137 62.91 62.654 62.352 62.157 61.968 61.641 61.41 61.188 61.077 60.828 60.508 60.123 59.919 59.475 59.34 59.104 58.835 58.198 57.829 57.393 56.934 56.432 55.688 54.313 48.428 -10 ,16783 ,TETRA ,17555263,Thu Nov 25 23:16:24 CET,Fri Nov 26 01:35:08 CET,0.0 0.498 0.781 1.054 1.297 1.523 1.743 1.963 2.387 2.593 2.799 2.881 3.411 3.605 3.985 4.382 4.769 4.953 5.321 5.682 6.203 6.555 6.908 7.435 7.962 8.482 8.983 9.472 10.119 10.757 11.364 12.112 12.873 13.6 14.446 15.429 16.406 17.511 18.729 20.08 21.521 23.135 25.147 27.245 29.601 32.229 35.308 38.984 43.414 48.259 54.229 59.519 62.497 64.148 65.038 65.53 65.711 65.686 65.701 65.788 65.772 65.666 65.518 65.322 65.139 64.984 64.797 64.621 64.482 64.331 64.163 64.025 63.898 63.733 63.567 63.365 63.138 62.91 62.671 62.52 62.356 62.008 61.76 61.543 61.425 61.145 60.835 60.547 60.408 59.991 59.854 59.617 59.325 58.664 58.333 57.978 57.511 56.865 56.113 55.287 51.201 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index dd883aa4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,7725 ,TETRA ,17555265,Thu Nov 25 23:16:28 CET,Fri Nov 26 01:23:40 CET,0.0 0.972 1.45 1.829 2.195 2.534 2.828 3.123 3.671 3.918 4.167 4.349 4.925 5.161 5.634 6.109 6.548 6.757 7.167 7.58 8.197 8.605 9.0 9.602 10.209 10.794 11.363 11.909 12.647 13.381 14.1 14.981 15.861 16.721 17.706 18.852 19.978 21.222 22.615 24.129 25.726 27.567 29.773 32.034 34.663 37.601 41.05 44.898 49.367 54.822 61.643 67.155 70.059 71.792 72.939 73.794 74.366 74.757 75.011 75.167 75.257 75.29 75.262 75.188 75.117 75.056 74.956 74.851 74.758 74.671 74.568 74.454 74.316 74.169 74.048 73.875 73.678 73.503 73.338 73.237 73.129 72.938 72.78 72.589 72.492 72.32 72.131 71.898 71.775 71.416 71.38 71.236 71.08 70.679 70.432 70.157 69.843 69.413 68.916 68.034 63.323 -3 ,13279 ,TETRA ,17555266,Thu Nov 25 23:16:24 CET,Fri Nov 26 01:36:56 CET,0.0 1.778 2.281 2.631 2.968 3.314 3.656 3.969 4.514 4.761 4.999 5.143 5.709 5.946 6.399 6.852 7.295 7.5 7.903 8.312 8.941 9.337 9.711 10.279 10.844 11.402 11.949 12.5 13.235 13.953 14.677 15.59 16.47 17.325 18.334 19.465 20.527 21.673 22.906 24.263 25.734 27.435 29.5 31.613 34.132 36.88 40.034 43.802 48.416 54.137 61.165 66.917 70.302 72.37 73.731 74.708 75.414 75.87 76.166 76.376 76.486 76.537 76.566 76.549 76.5 76.478 76.409 76.348 76.325 76.264 76.139 76.039 75.95 75.833 75.735 75.605 75.441 75.285 75.1 74.967 74.818 74.552 74.381 74.208 74.111 73.859 73.628 73.425 73.311 72.951 72.889 72.707 72.513 72.077 71.779 71.422 71.024 70.608 70.055 69.162 62.621 -4 ,7531 ,TETRA ,17555267,Thu Nov 25 23:16:25 CET,Fri Nov 26 01:36:48 CET,0.0 1.443 2.002 2.462 2.841 3.19 3.516 3.84 4.461 4.73 4.981 5.122 5.702 5.947 6.426 6.888 7.335 7.557 7.996 8.418 9.046 9.458 9.861 10.454 11.033 11.601 12.168 12.723 13.437 14.162 14.882 15.743 16.569 17.363 18.316 19.428 20.473 21.62 22.899 24.231 25.578 27.099 28.953 30.945 33.325 35.984 39.007 42.521 46.776 51.746 57.938 63.344 66.646 68.65 69.903 70.801 71.409 71.862 72.182 72.377 72.497 72.58 72.599 72.571 72.511 72.442 72.364 72.286 72.198 72.089 71.973 71.862 71.713 71.552 71.419 71.268 71.097 70.89 70.696 70.584 70.445 70.165 69.985 69.832 69.743 69.516 69.255 68.961 68.814 68.438 68.404 68.245 68.067 67.669 67.422 67.113 66.738 66.29 65.708 64.821 57.065 -5 ,20449 ,TETRA ,17555268,Thu Nov 25 23:16:27 CET,Fri Nov 26 01:23:39 CET,0.0 1.338 1.907 2.38 2.814 3.21 3.562 3.905 4.588 4.901 5.16 5.315 5.878 6.109 6.597 7.083 7.546 7.774 8.218 8.64 9.254 9.65 10.041 10.61 11.149 11.685 12.228 12.761 13.462 14.155 14.837 15.703 16.54 17.338 18.301 19.404 20.478 21.651 22.943 24.378 25.934 27.717 29.827 32.006 34.568 37.425 40.669 44.215 48.208 53.021 59.333 64.705 67.842 69.843 71.241 72.287 73.052 73.596 73.921 74.16 74.309 74.404 74.458 74.471 74.476 74.437 74.365 74.303 74.242 74.176 74.06 73.922 73.753 73.546 73.39 73.238 73.049 72.857 72.682 72.564 72.444 72.226 72.074 71.921 71.835 71.623 71.389 71.145 71.013 70.627 70.55 70.377 70.173 69.685 69.372 68.997 68.651 68.287 67.691 66.773 58.221 -6 ,13123 ,TETRA ,17555269,Thu Nov 25 23:19:41 CET,Fri Nov 26 01:40:24 CET,0.0 1.499 1.968 2.36 2.73 3.059 3.357 3.652 4.199 4.474 4.757 4.951 5.519 5.755 6.209 6.669 7.133 7.358 7.788 8.199 8.797 9.199 9.604 10.193 10.781 11.365 11.925 12.461 13.166 13.874 14.565 15.411 16.249 17.08 18.06 19.182 20.273 21.496 22.872 24.343 25.88 27.62 29.68 31.838 34.378 37.212 40.47 44.122 48.534 53.902 60.46 66.027 69.309 71.302 72.619 73.623 74.266 74.652 74.895 75.088 75.248 75.354 75.403 75.392 75.365 75.332 75.276 75.221 75.176 75.115 75.02 74.921 74.817 74.717 74.625 74.508 74.392 74.258 74.122 74.013 73.904 73.741 73.599 73.458 73.374 73.178 72.947 72.667 72.504 72.091 71.951 71.769 71.541 70.983 70.709 70.414 70.068 69.628 68.981 67.948 63.882 -8 ,22582 ,TETRA ,17555271,Thu Nov 25 23:28:42 CET,Fri Nov 26 01:49:03 CET,0.0 1.603 2.149 2.597 2.978 3.315 3.654 3.99 4.6 4.88 5.151 5.355 5.937 6.196 6.716 7.213 7.688 7.922 8.357 8.763 9.374 9.787 10.195 10.787 11.379 11.962 12.531 13.084 13.807 14.51 15.2 16.052 16.87 17.682 18.666 19.787 20.885 22.1 23.426 24.908 26.499 28.346 30.61 32.892 35.603 38.721 42.344 46.525 51.552 57.562 64.964 71.162 74.712 76.696 77.998 78.956 79.525 79.823 79.98 80.065 80.107 80.141 80.115 80.057 79.965 79.835 79.674 79.526 79.388 79.203 78.997 78.843 78.681 78.508 78.376 78.22 78.058 77.902 77.759 77.655 77.513 77.267 77.102 76.916 76.819 76.64 76.428 76.143 75.988 75.616 75.581 75.44 75.27 74.803 74.533 74.268 73.965 73.572 72.988 71.988 66.503 -10 ,16677 ,TETRA ,17555273,Thu Nov 25 23:27:47 CET,Fri Nov 26 01:46:46 CET,0.0 1.895 2.485 2.916 3.262 3.575 3.865 4.156 4.734 5.018 5.293 5.504 6.095 6.346 6.82 7.294 7.764 7.996 8.454 8.884 9.494 9.908 10.318 10.935 11.524 12.066 12.607 13.158 13.894 14.606 15.289 16.114 16.911 17.71 18.66 19.769 20.874 22.095 23.416 24.853 26.443 28.23 30.327 32.562 35.186 38.118 41.602 45.68 50.463 56.045 62.973 68.668 72.058 74.411 76.071 77.258 78.116 78.783 79.25 79.58 79.715 79.754 79.768 79.738 79.688 79.594 79.478 79.389 79.289 79.197 79.136 79.07 78.989 78.898 78.809 78.686 78.515 78.328 78.128 77.992 77.855 77.652 77.527 77.373 77.281 77.079 76.878 76.663 76.519 76.122 76.033 75.862 75.677 75.24 74.97 74.665 74.325 73.916 73.391 72.703 69.499 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 559bf0c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25199 ,KEBNE ,17043651,Thu Dec 23 05:04:15 CET,Thu Dec 23 06:51:18 CET,0.0 0.798 1.202 1.477 1.731 1.969 2.187 2.4 2.796 2.979 3.164 3.195 3.733 3.886 4.155 4.398 4.661 4.798 5.051 5.295 5.646 5.869 6.093 6.418 6.729 7.031 7.324 7.611 7.991 8.379 8.765 9.227 9.661 10.078 10.578 11.167 11.742 12.349 12.985 13.672 14.408 15.276 16.276 17.236 18.381 19.722 21.249 22.976 24.996 27.404 30.416 32.77 33.829 34.325 34.636 34.822 34.892 34.855 34.696 34.462 34.252 34.027 33.781 33.555 33.326 33.132 32.936 32.736 32.546 32.327 32.077 31.879 31.68 31.456 31.284 31.107 30.924 30.718 30.464 30.291 30.128 29.852 29.665 29.473 29.364 29.137 28.902 28.65 28.502 28.026 28.063 27.905 27.745 27.414 27.224 27.007 26.708 26.345 25.966 25.512 23.478 -2 ,29105 ,KEBNE ,17043652,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:50:37 CET,0.0 1.75 2.204 2.547 2.821 3.084 3.317 3.529 3.898 4.066 4.244 4.225 4.746 4.908 5.219 5.533 5.813 5.956 6.251 6.53 6.957 7.214 7.439 7.79 8.141 8.472 8.819 9.174 9.622 10.058 10.48 11.008 11.541 12.033 12.581 13.198 13.783 14.429 15.127 15.899 16.736 17.68 18.793 19.951 21.277 22.794 24.602 26.494 28.658 31.229 34.356 36.812 38.055 38.828 39.265 39.434 39.46 39.379 39.247 39.036 38.817 38.665 38.541 38.375 38.173 37.941 37.66 37.408 37.206 37.032 36.857 36.677 36.465 36.221 36.022 35.832 35.642 35.434 35.176 34.986 34.801 34.509 34.305 34.098 33.994 33.762 33.508 33.234 33.089 32.631 32.664 32.488 32.319 31.97 31.768 31.516 31.192 30.874 30.517 30.03 28.523 -3 ,5275 ,KEBNE ,17043653,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:50:53 CET,0.0 1.254 1.713 2.12 2.48 2.747 2.992 3.239 3.684 3.896 4.105 4.141 4.684 4.856 5.182 5.491 5.786 5.924 6.187 6.464 6.861 7.107 7.346 7.685 8.016 8.371 8.722 9.052 9.483 9.888 10.275 10.756 11.237 11.71 12.215 12.777 13.361 14.012 14.701 15.43 16.195 17.066 18.094 19.141 20.391 21.776 23.374 25.235 27.383 29.878 32.855 35.087 36.316 36.989 37.334 37.431 37.401 37.304 37.135 36.939 36.741 36.561 36.377 36.18 35.988 35.805 35.601 35.394 35.204 35.007 34.791 34.586 34.376 34.138 33.945 33.763 33.581 33.376 33.136 32.973 32.812 32.577 32.396 32.196 32.097 31.89 31.663 31.396 31.263 30.821 30.874 30.73 30.562 30.209 30.019 29.809 29.589 29.342 29.024 28.456 26.303 -4 ,1271 ,KEBNE ,17043654,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:50:25 CET,0.0 1.384 1.82 2.183 2.485 2.713 2.933 3.167 3.583 3.749 3.896 3.82 4.329 4.464 4.718 4.973 5.236 5.358 5.609 5.868 6.22 6.449 6.669 6.981 7.278 7.572 7.869 8.15 8.5 8.848 9.191 9.592 9.985 10.393 10.875 11.398 11.913 12.492 13.127 13.811 14.527 15.331 16.267 17.231 18.414 19.74 21.299 23.097 25.166 27.562 30.44 32.758 34.088 34.827 35.201 35.352 35.249 35.062 34.872 34.648 34.449 34.217 33.953 33.687 33.389 33.104 32.819 32.58 32.385 32.163 31.929 31.735 31.519 31.27 31.073 30.867 30.641 30.385 30.104 29.911 29.71 29.375 29.132 28.891 28.772 28.512 28.214 27.912 27.753 27.249 27.206 27.022 26.821 26.345 26.08 25.77 25.401 24.969 24.486 23.853 20.901 -5 ,16701 ,KEBNE ,17043655,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:50:55 CET,0.0 1.222 1.619 1.926 2.228 2.507 2.757 2.984 3.396 3.58 3.763 3.778 4.302 4.46 4.765 5.073 5.361 5.492 5.748 6.006 6.397 6.654 6.9 7.244 7.547 7.838 8.141 8.456 8.866 9.254 9.617 10.084 10.554 11.003 11.529 12.104 12.658 13.253 13.878 14.553 15.284 16.119 17.13 18.204 19.47 20.87 22.494 24.375 26.616 29.235 32.281 34.456 35.314 35.821 36.284 36.518 36.567 36.569 36.515 36.384 36.239 36.094 35.861 35.572 35.288 35.032 34.769 34.514 34.252 33.942 33.601 33.324 33.069 32.8 32.557 32.293 32.024 31.755 31.486 31.29 31.086 30.768 30.554 30.315 30.19 29.947 29.652 29.313 29.128 28.621 28.532 28.297 28.068 27.573 27.296 27.008 26.68 26.27 25.79 25.274 23.482 -6 ,22846 ,KEBNE ,17043656,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:50:47 CET,0.0 1.329 1.803 2.165 2.492 2.792 3.056 3.291 3.713 3.902 4.084 4.078 4.599 4.778 5.122 5.422 5.707 5.841 6.101 6.351 6.682 6.908 7.136 7.477 7.814 8.133 8.427 8.697 9.083 9.464 9.822 10.266 10.695 11.116 11.619 12.192 12.753 13.373 14.03 14.697 15.392 16.245 17.293 18.298 19.454 20.805 22.419 24.223 26.355 28.836 31.64 33.722 34.568 34.73 34.815 34.94 34.991 34.834 34.465 34.057 33.763 33.484 33.135 32.796 32.48 32.157 31.803 31.498 31.249 30.981 30.697 30.47 30.247 29.999 29.792 29.573 29.349 29.112 28.867 28.695 28.511 28.229 28.02 27.79 27.675 27.444 27.175 26.84 26.656 26.143 26.114 25.952 25.764 25.326 25.085 24.791 24.422 24.001 23.515 22.791 19.925 -7 ,6712 ,KEBNE ,17043657,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:50:29 CET,0.0 1.344 1.689 2.006 2.278 2.507 2.731 2.935 3.327 3.525 3.707 3.697 4.236 4.396 4.682 4.979 5.287 5.434 5.71 5.974 6.357 6.611 6.863 7.222 7.578 7.94 8.271 8.583 8.999 9.41 9.802 10.275 10.713 11.143 11.67 12.264 12.854 13.524 14.258 15.033 15.828 16.722 17.775 18.833 20.093 21.476 23.035 24.877 27.058 29.48 32.444 34.899 36.039 36.589 36.831 36.83 36.757 36.606 36.395 36.157 35.936 35.704 35.442 35.174 34.896 34.629 34.346 34.071 33.809 33.526 33.234 33.012 32.788 32.54 32.339 32.131 31.91 31.671 31.42 31.237 31.027 30.693 30.474 30.249 30.124 29.856 29.59 29.308 29.148 28.655 28.608 28.417 28.219 27.758 27.479 27.196 26.891 26.504 26.033 25.441 23.183 -8 ,31862 ,KEBNE ,17043658,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:50:40 CET,0.0 1.206 1.612 1.931 2.17 2.391 2.618 2.856 3.325 3.535 3.711 3.687 4.211 4.366 4.675 4.96 5.233 5.37 5.643 5.909 6.271 6.499 6.742 7.096 7.433 7.762 8.097 8.427 8.839 9.255 9.647 10.09 10.535 10.996 11.535 12.12 12.705 13.367 14.054 14.795 15.633 16.606 17.716 18.802 20.086 21.516 23.138 24.966 27.14 29.714 32.69 34.71 35.493 35.852 35.966 35.899 35.704 35.288 34.804 34.326 33.91 33.486 33.046 32.657 32.313 32.011 31.684 31.352 31.066 30.788 30.488 30.22 29.927 29.631 29.402 29.171 28.931 28.668 28.378 28.179 27.98 27.666 27.44 27.205 27.08 26.812 26.526 26.238 26.094 25.607 25.568 25.363 25.139 24.585 24.29 23.989 23.631 23.274 22.822 22.107 20.308 -9 ,9966 ,KEBNE ,17043659,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:50:46 CET,0.0 0.944 1.265 1.584 1.904 2.202 2.464 2.684 3.092 3.289 3.478 3.444 3.965 4.128 4.435 4.703 4.949 5.071 5.334 5.601 5.98 6.212 6.429 6.746 7.054 7.351 7.644 7.926 8.272 8.618 8.973 9.403 9.851 10.313 10.817 11.338 11.833 12.397 13.032 13.731 14.465 15.302 16.296 17.309 18.527 19.875 21.462 23.332 25.413 27.676 30.32 32.356 33.546 34.33 34.804 35.114 35.239 35.055 34.775 34.472 34.145 33.819 33.488 33.173 32.884 32.613 32.316 32.052 31.814 31.541 31.264 31.049 30.803 30.53 30.319 30.103 29.88 29.635 29.374 29.191 28.983 28.652 28.42 28.16 28.034 27.785 27.498 27.169 26.986 26.455 26.392 26.206 25.987 25.5 25.219 24.919 24.598 24.207 23.681 22.974 21.155 -10 ,8311 ,KEBNE ,17043660,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:50:42 CET,0.0 1.647 2.017 2.32 2.596 2.839 3.083 3.324 3.753 3.947 4.119 4.09 4.606 4.767 5.074 5.377 5.682 5.832 6.108 6.365 6.75 7.023 7.279 7.623 7.953 8.279 8.61 8.923 9.313 9.695 10.073 10.519 10.957 11.402 11.93 12.511 13.07 13.691 14.401 15.189 16.01 16.952 18.078 19.208 20.541 22.097 23.874 25.867 28.251 31.041 34.343 36.864 38.062 38.634 38.917 38.975 38.881 38.702 38.517 38.315 38.054 37.776 37.519 37.238 36.929 36.626 36.297 35.987 35.715 35.433 35.155 34.936 34.664 34.386 34.202 34.012 33.816 33.593 33.344 33.16 32.967 32.687 32.512 32.337 32.233 32.003 31.769 31.516 31.395 30.944 30.964 30.817 30.662 30.257 30.011 29.738 29.4 28.978 28.505 27.862 25.912 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 70511947..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,5203 ,KEBNE ,17069356,Fri Dec 24 01:17:53 CET,Fri Dec 24 03:04:04 CET,0.0 0.447 0.739 1.006 1.257 1.504 1.762 2.017 2.502 2.747 2.984 3.087 3.674 3.915 4.385 4.83 5.267 5.485 5.92 6.354 6.988 7.4 7.815 8.427 9.018 9.576 10.136 10.713 11.479 12.235 12.994 13.928 14.858 15.808 16.95 18.271 19.565 21.026 22.672 24.456 26.341 28.555 31.188 33.804 36.932 40.593 44.962 49.969 55.929 63.217 72.644 81.219 86.729 90.463 92.863 94.613 95.908 96.942 97.748 98.393 98.814 98.939 98.918 98.897 98.829 98.696 98.553 98.431 98.301 98.129 97.913 97.74 97.579 97.415 97.272 97.121 96.935 96.694 96.411 96.213 96.032 95.705 95.454 95.183 95.023 94.693 94.374 94.026 93.817 93.348 93.069 92.817 92.627 92.086 91.747 91.344 90.88 90.392 89.804 88.832 81.839 -4 ,27086 ,KEBNE ,17069357,Fri Dec 24 01:17:53 CET,Fri Dec 24 03:03:11 CET,0.0 0.636 0.985 1.274 1.544 1.81 2.083 2.347 2.835 3.071 3.3 3.409 4.0 4.235 4.687 5.128 5.587 5.817 6.277 6.724 7.384 7.822 8.246 8.87 9.498 10.12 10.73 11.322 12.129 12.97 13.798 14.808 15.793 16.771 17.956 19.338 20.72 22.217 23.816 25.58 27.482 29.646 32.13 34.566 37.454 40.823 44.957 49.86 55.801 62.994 71.847 79.525 84.617 88.414 90.892 92.566 93.849 94.867 95.594 96.223 96.709 97.032 97.157 97.206 97.283 97.248 97.077 96.887 96.718 96.513 96.29 96.106 95.865 95.574 95.338 95.085 94.797 94.509 94.22 94.008 93.789 93.424 93.165 92.891 92.746 92.407 92.052 91.686 91.493 91.053 90.931 90.717 90.433 89.662 89.207 88.746 88.203 87.57 86.823 85.524 74.664 -8 ,28023 ,KEBNE ,17069361,Fri Dec 24 01:42:02 CET,Fri Dec 24 03:28:09 CET,0.0 0.501 0.78 1.058 1.325 1.592 1.856 2.108 2.582 2.811 3.05 3.147 3.74 3.963 4.406 4.849 5.28 5.488 5.888 6.274 6.857 7.253 7.641 8.214 8.788 9.367 9.951 10.513 11.242 11.962 12.676 13.573 14.445 15.313 16.359 17.593 18.796 20.093 21.527 23.097 24.809 26.865 29.396 32.044 35.201 38.756 43.071 48.146 54.277 61.708 71.08 79.325 84.426 87.79 89.999 91.581 92.707 93.386 93.763 94.067 94.261 94.394 94.489 94.46 94.331 94.184 93.987 93.801 93.634 93.433 93.232 93.066 92.883 92.676 92.508 92.329 92.124 91.898 91.641 91.464 91.269 90.918 90.621 90.297 90.141 89.831 89.511 89.158 88.961 88.493 88.298 88.07 87.817 87.185 86.762 86.296 85.798 85.147 84.17 82.749 75.931 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index e962169e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2086 ,TETRA ,17555274,Thu Nov 25 23:28:44 CET,Fri Nov 26 01:51:01 CET,0.0 0.201 0.308 0.414 0.517 0.61 0.706 0.789 0.93 0.999 1.067 0.992 1.282 1.348 1.476 1.602 1.721 1.776 1.872 1.974 2.141 2.247 2.345 2.483 2.616 2.743 2.864 2.999 3.178 3.338 3.488 3.667 3.842 4.012 4.219 4.446 4.661 4.913 5.186 5.476 5.785 6.136 6.547 6.967 7.424 7.912 8.474 9.055 9.653 9.87 9.356 8.051 6.586 5.163 3.691 2.322 1.183 0.106 -0.899 -1.982 -2.997 -3.922 -4.807 -5.631 -6.398 -7.124 -7.887 -8.554 -9.126 -9.699 -10.282 -10.775 -11.3 -11.827 -12.215 -12.612 -13.049 -13.533 -14.049 -14.455 -14.89 -15.52 -15.94 -16.37 -16.597 -17.048 -17.506 -18.076 -18.396 -18.946 -19.399 -19.794 -20.204 -21.12 -21.621 -22.142 -22.68 -23.366 -24.231 -25.506 -33.724 -2 ,11274 ,TETRA ,17555275,Thu Nov 25 23:35:39 CET,Fri Nov 26 01:48:01 CET,0.0 0.442 0.645 0.778 0.89 1.007 1.124 1.225 1.398 1.471 1.543 1.466 1.763 1.841 1.981 2.103 2.225 2.284 2.409 2.537 2.721 2.838 2.94 3.081 3.22 3.348 3.476 3.614 3.799 3.969 4.129 4.331 4.532 4.731 4.967 5.221 5.453 5.713 6.002 6.331 6.693 7.068 7.506 7.954 8.486 9.1 9.66 10.19 10.831 11.22 11.052 10.223 8.969 7.663 6.432 5.128 3.852 2.695 1.721 0.777 -0.003 -0.704 -1.423 -2.141 -2.816 -3.431 -4.1 -4.689 -5.169 -5.685 -6.196 -6.611 -7.087 -7.601 -8.017 -8.462 -8.892 -9.304 -9.755 -10.094 -10.446 -10.983 -11.352 -11.747 -11.956 -12.399 -12.929 -13.478 -13.731 -14.271 -14.683 -15.024 -15.368 -16.046 -16.451 -16.923 -17.557 -18.323 -19.288 -20.772 -34.448 -4 ,24698 ,TETRA ,17555277,Thu Nov 25 23:29:48 CET,Fri Nov 26 01:56:41 CET,0.0 0.436 0.61 0.755 0.877 0.971 1.055 1.145 1.321 1.403 1.483 1.401 1.696 1.762 1.888 2.013 2.141 2.206 2.331 2.455 2.625 2.73 2.829 2.981 3.138 3.295 3.455 3.613 3.809 3.987 4.157 4.367 4.576 4.78 4.994 5.233 5.479 5.769 6.105 6.449 6.781 7.144 7.613 8.067 8.543 9.12 9.744 10.354 11.015 11.425 11.153 10.178 8.707 7.153 5.746 4.397 3.26 2.17 1.093 -0.016 -0.909 -1.697 -2.474 -3.221 -3.943 -4.604 -5.265 -5.829 -6.332 -6.866 -7.445 -7.921 -8.401 -8.917 -9.302 -9.708 -10.135 -10.559 -11.011 -11.352 -11.712 -12.25 -12.613 -13.024 -13.25 -13.735 -14.272 -14.805 -15.072 -15.611 -16.005 -16.351 -16.707 -17.595 -18.116 -18.648 -19.231 -19.907 -20.838 -22.122 -27.295 -5 ,11220 ,TETRA ,17555278,Thu Nov 25 23:29:50 CET,Fri Nov 26 01:58:48 CET,0.0 0.344 0.499 0.617 0.719 0.828 0.934 1.027 1.204 1.282 1.355 1.278 1.561 1.622 1.751 1.877 1.99 2.044 2.157 2.267 2.429 2.531 2.632 2.78 2.92 3.056 3.185 3.31 3.479 3.665 3.844 4.053 4.272 4.486 4.721 4.977 5.23 5.51 5.821 6.161 6.509 6.899 7.319 7.696 8.128 8.589 9.021 9.455 9.897 10.171 9.945 8.879 7.642 6.399 5.223 4.094 2.959 1.964 1.114 0.184 -0.653 -1.439 -2.186 -2.906 -3.575 -4.164 -4.787 -5.356 -5.869 -6.415 -6.963 -7.396 -7.841 -8.296 -8.684 -9.141 -9.62 -10.063 -10.524 -10.865 -11.205 -11.772 -12.168 -12.574 -12.807 -13.327 -13.912 -14.51 -14.813 -15.415 -15.938 -16.327 -16.712 -17.555 -18.075 -18.658 -19.321 -20.146 -21.183 -22.648 -29.926 -7 ,25704 ,TETRA ,17555280,Thu Nov 25 23:37:17 CET,Fri Nov 26 01:50:07 CET,0.0 0.222 0.321 0.414 0.52 0.615 0.68 0.754 0.912 0.985 1.058 0.971 1.261 1.323 1.448 1.56 1.662 1.708 1.802 1.905 2.052 2.14 2.224 2.358 2.495 2.624 2.752 2.873 3.012 3.153 3.297 3.477 3.661 3.852 4.068 4.297 4.512 4.752 5.043 5.369 5.717 6.098 6.527 6.926 7.35 7.774 8.171 8.537 8.838 8.954 8.258 6.439 4.574 2.847 1.32 -0.189 -1.584 -2.83 -3.93 -5.126 -6.171 -7.054 -7.874 -8.651 -9.408 -10.091 -10.776 -11.421 -11.994 -12.612 -13.271 -13.793 -14.326 -14.867 -15.293 -15.739 -16.204 -16.695 -17.189 -17.517 -17.867 -18.472 -18.922 -19.361 -19.57 -20.045 -20.573 -21.081 -21.344 -21.848 -22.118 -22.429 -22.77 -23.563 -24.071 -24.649 -25.327 -26.117 -27.013 -28.34 -33.871 -9 ,27364 ,TETRA ,17555282,Thu Nov 25 23:38:11 CET,Fri Nov 26 02:05:36 CET,0.0 0.14 0.246 0.352 0.446 0.528 0.604 0.677 0.825 0.906 0.97 0.856 1.125 1.178 1.284 1.387 1.493 1.543 1.645 1.751 1.903 2.001 2.094 2.231 2.36 2.492 2.625 2.748 2.895 3.034 3.17 3.344 3.539 3.734 3.942 4.187 4.434 4.687 4.951 5.243 5.558 5.908 6.252 6.536 6.927 7.365 7.748 8.115 8.453 8.522 7.863 6.328 4.894 3.509 2.057 0.603 -0.709 -1.907 -2.926 -3.953 -4.861 -5.643 -6.371 -7.099 -7.756 -8.362 -9.023 -9.584 -10.063 -10.568 -11.095 -11.551 -12.031 -12.522 -12.909 -13.312 -13.745 -14.188 -14.64 -14.978 -15.346 -15.905 -16.284 -16.665 -16.863 -17.325 -17.814 -18.311 -18.602 -19.177 -19.644 -20.039 -20.42 -21.178 -21.657 -22.182 -22.756 -23.554 -24.621 -26.139 -36.402 -10 ,4570 ,TETRA ,17555283,Thu Nov 25 23:38:13 CET,Fri Nov 26 02:05:35 CET,0.0 0.289 0.409 0.523 0.628 0.717 0.801 0.879 1.037 1.115 1.184 1.088 1.38 1.448 1.584 1.703 1.803 1.856 1.969 2.08 2.248 2.357 2.463 2.625 2.776 2.914 3.054 3.193 3.373 3.539 3.682 3.872 4.075 4.25 4.427 4.634 4.831 5.026 5.249 5.505 5.776 6.089 6.499 6.908 7.362 7.901 8.504 9.09 9.634 10.078 10.228 9.743 8.868 7.847 6.778 5.584 4.393 3.316 2.421 1.516 0.714 -0.072 -0.839 -1.54 -2.213 -2.816 -3.462 -4.065 -4.574 -5.12 -5.709 -6.175 -6.647 -7.169 -7.57 -7.966 -8.389 -8.834 -9.311 -9.636 -9.979 -10.542 -10.94 -11.363 -11.574 -12.012 -12.496 -13.039 -13.329 -13.864 -14.253 -14.61 -14.997 -15.88 -16.376 -16.833 -17.318 -18.042 -19.138 -20.841 -32.859 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index eda271a7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2504 ,TETRA ,17555284,Thu Nov 25 23:39:07 CET,Fri Nov 26 01:52:59 CET,0.0 0.835 1.107 1.32 1.48 1.621 1.749 1.873 2.098 2.199 2.3 2.275 2.599 2.688 2.854 3.009 3.156 3.225 3.349 3.475 3.68 3.824 3.957 4.131 4.305 4.48 4.647 4.809 5.012 5.207 5.395 5.613 5.822 6.024 6.272 6.568 6.851 7.173 7.536 7.914 8.287 8.715 9.214 9.71 10.29 10.803 11.191 11.529 11.773 11.819 11.442 10.35 9.024 7.618 6.318 5.146 4.137 3.28 2.531 1.712 0.997 0.407 -0.138 -0.682 -1.215 -1.717 -2.24 -2.694 -3.091 -3.548 -4.05 -4.452 -4.846 -5.237 -5.553 -5.894 -6.258 -6.631 -7.026 -7.301 -7.568 -7.998 -8.31 -8.643 -8.814 -9.157 -9.509 -9.881 -10.092 -10.551 -10.744 -10.985 -11.245 -11.809 -12.147 -12.492 -12.859 -13.296 -13.822 -14.531 -17.751 -2 ,19514 ,TETRA ,17555285,Thu Nov 25 23:40:11 CET,Fri Nov 26 02:09:57 CET,0.0 0.484 0.665 0.828 0.959 1.084 1.206 1.324 1.532 1.631 1.733 1.706 2.022 2.11 2.26 2.409 2.555 2.625 2.761 2.88 3.042 3.144 3.241 3.387 3.535 3.679 3.805 3.922 4.08 4.252 4.416 4.59 4.771 4.954 5.163 5.394 5.602 5.824 6.077 6.362 6.627 6.891 7.223 7.559 7.93 8.318 8.728 9.151 9.529 9.707 9.423 8.497 7.469 6.435 5.461 4.574 3.723 2.876 2.058 1.248 0.623 0.072 -0.525 -1.164 -1.778 -2.335 -2.906 -3.406 -3.828 -4.27 -4.758 -5.196 -5.669 -6.189 -6.616 -7.074 -7.521 -7.969 -8.444 -8.759 -9.102 -9.651 -10.027 -10.432 -10.64 -11.046 -11.441 -11.855 -12.08 -12.551 -12.829 -13.099 -13.396 -14.078 -14.411 -14.759 -15.256 -15.872 -16.546 -17.523 -22.314 -3 ,9026 ,TETRA ,17555286,Thu Nov 25 23:40:13 CET,Fri Nov 26 02:07:36 CET,0.0 0.513 0.721 0.857 0.984 1.134 1.277 1.413 1.656 1.754 1.85 1.821 2.139 2.222 2.39 2.552 2.701 2.775 2.912 3.049 3.25 3.371 3.493 3.66 3.809 3.955 4.101 4.245 4.432 4.623 4.818 5.037 5.234 5.437 5.676 5.936 6.194 6.498 6.819 7.119 7.421 7.732 8.05 8.34 8.652 9.01 9.345 9.678 10.06 10.296 10.005 9.107 8.064 6.996 5.989 5.039 4.187 3.367 2.596 1.767 1.036 0.394 -0.223 -0.802 -1.362 -1.892 -2.451 -2.979 -3.449 -3.948 -4.455 -4.87 -5.314 -5.765 -6.108 -6.463 -6.864 -7.301 -7.728 -8.046 -8.363 -8.814 -9.153 -9.516 -9.725 -10.188 -10.681 -11.174 -11.394 -11.86 -12.168 -12.471 -12.797 -13.489 -13.868 -14.299 -14.809 -15.383 -16.079 -17.16 -21.238 -4 ,26088 ,TETRA ,17555287,Thu Nov 25 23:41:20 CET,Fri Nov 26 01:55:39 CET,0.0 0.318 0.541 0.727 0.873 0.988 1.106 1.235 1.482 1.592 1.681 1.617 1.914 1.99 2.141 2.287 2.421 2.489 2.624 2.746 2.91 3.019 3.136 3.301 3.475 3.651 3.812 3.979 4.204 4.422 4.644 4.913 5.169 5.409 5.66 5.962 6.257 6.555 6.888 7.257 7.657 8.127 8.674 9.233 9.885 10.572 11.313 12.077 12.927 13.827 14.199 13.662 12.836 11.886 10.93 9.991 9.08 8.151 7.223 6.24 5.368 4.589 3.855 3.195 2.633 2.105 1.53 1.013 0.581 0.138 -0.334 -0.73 -1.12 -1.501 -1.81 -2.136 -2.473 -2.818 -3.181 -3.445 -3.72 -4.143 -4.428 -4.728 -4.887 -5.242 -5.634 -6.026 -6.223 -6.671 -6.898 -7.153 -7.427 -8.046 -8.363 -8.725 -9.158 -9.66 -10.297 -11.224 -15.248 -5 ,29356 ,TETRA ,17555288,Thu Nov 25 23:44:09 CET,Fri Nov 26 02:13:41 CET,0.0 0.611 0.851 1.029 1.18 1.315 1.437 1.54 1.742 1.844 1.942 1.906 2.217 2.302 2.46 2.6 2.749 2.83 2.998 3.162 3.393 3.534 3.672 3.879 4.065 4.233 4.392 4.535 4.727 4.918 5.109 5.365 5.621 5.876 6.167 6.48 6.768 7.06 7.393 7.741 8.049 8.367 8.714 9.046 9.42 9.819 10.21 10.559 10.909 11.082 11.116 10.684 9.808 8.879 7.985 7.094 6.325 5.597 4.911 4.223 3.61 3.066 2.553 2.024 1.53 1.074 0.573 0.085 -0.403 -0.917 -1.43 -1.849 -2.283 -2.77 -3.148 -3.514 -3.883 -4.274 -4.715 -5.021 -5.328 -5.808 -6.153 -6.535 -6.73 -7.094 -7.487 -7.926 -8.161 -8.664 -8.988 -9.254 -9.516 -10.133 -10.488 -10.891 -11.365 -11.995 -12.807 -13.93 -19.792 -6 ,32721 ,TETRA ,17555289,Thu Nov 25 23:42:17 CET,Fri Nov 26 02:10:53 CET,0.0 0.404 0.572 0.736 0.889 1.02 1.149 1.267 1.474 1.574 1.668 1.612 1.917 1.994 2.138 2.291 2.45 2.529 2.683 2.817 3.013 3.144 3.266 3.442 3.605 3.77 3.942 4.111 4.319 4.499 4.666 4.861 5.041 5.212 5.408 5.621 5.839 6.083 6.336 6.596 6.84 7.128 7.473 7.802 8.133 8.446 8.785 9.166 9.627 9.926 9.561 8.556 7.63 6.792 5.936 5.137 4.271 3.344 2.557 1.763 1.073 0.468 -0.128 -0.719 -1.295 -1.831 -2.359 -2.815 -3.21 -3.622 -4.058 -4.43 -4.829 -5.271 -5.608 -5.929 -6.277 -6.644 -7.023 -7.309 -7.609 -8.119 -8.466 -8.814 -9.011 -9.391 -9.762 -10.163 -10.39 -10.882 -11.226 -11.547 -11.859 -12.526 -12.921 -13.361 -13.867 -14.516 -15.277 -16.236 -20.272 -7 ,32334 ,TETRA ,17555290,Thu Nov 25 23:42:15 CET,Fri Nov 26 02:10:13 CET,0.0 0.376 0.569 0.738 0.864 0.987 1.098 1.185 1.356 1.441 1.521 1.447 1.755 1.843 2.004 2.158 2.309 2.379 2.505 2.626 2.809 2.926 3.052 3.241 3.407 3.57 3.734 3.886 4.08 4.277 4.462 4.676 4.882 5.087 5.325 5.593 5.857 6.153 6.48 6.83 7.198 7.615 8.089 8.546 9.036 9.571 10.211 10.802 11.423 12.013 12.301 12.074 11.455 10.649 9.904 9.254 8.625 7.972 7.267 6.411 5.612 4.903 4.229 3.575 2.966 2.408 1.824 1.305 0.88 0.455 -0.003 -0.405 -0.825 -1.251 -1.591 -1.942 -2.301 -2.693 -3.112 -3.406 -3.699 -4.136 -4.457 -4.798 -4.969 -5.332 -5.726 -6.17 -6.415 -6.896 -7.158 -7.424 -7.716 -8.388 -8.757 -9.141 -9.612 -10.141 -10.759 -11.712 -15.452 -8 ,19369 ,TETRA ,17555291,Thu Nov 25 23:44:10 CET,Fri Nov 26 02:11:30 CET,0.0 0.37 0.568 0.743 0.895 1.028 1.159 1.283 1.5 1.598 1.686 1.628 1.934 2.006 2.154 2.306 2.444 2.504 2.623 2.749 2.933 3.046 3.16 3.323 3.479 3.636 3.786 3.955 4.191 4.415 4.629 4.856 5.049 5.236 5.458 5.715 5.977 6.257 6.578 6.958 7.34 7.764 8.228 8.615 9.043 9.577 10.121 10.534 10.876 10.983 10.687 9.937 9.071 8.155 7.278 6.459 5.718 5.119 4.64 4.125 3.6 3.036 2.424 1.841 1.293 0.78 0.248 -0.234 -0.644 -1.048 -1.472 -1.851 -2.253 -2.69 -3.051 -3.422 -3.783 -4.157 -4.55 -4.815 -5.092 -5.557 -5.882 -6.23 -6.413 -6.769 -7.147 -7.551 -7.773 -8.258 -8.565 -8.869 -9.182 -9.888 -10.322 -10.824 -11.319 -11.868 -12.662 -13.822 -18.3 -9 ,393 ,TETRA ,17555292,Thu Nov 25 23:44:09 CET,Fri Nov 26 01:58:04 CET,0.0 0.439 0.67 0.893 1.065 1.197 1.319 1.451 1.713 1.834 1.946 1.926 2.239 2.319 2.47 2.627 2.795 2.88 3.036 3.184 3.405 3.539 3.661 3.853 4.035 4.208 4.384 4.552 4.772 4.993 5.205 5.46 5.713 5.946 6.22 6.546 6.858 7.18 7.508 7.856 8.236 8.676 9.146 9.617 10.181 10.723 11.325 12.012 12.713 13.313 13.352 12.483 11.398 10.211 9.005 7.828 6.729 5.748 4.884 4.007 3.271 2.616 1.97 1.345 0.759 0.201 -0.386 -0.894 -1.307 -1.72 -2.185 -2.561 -2.929 -3.334 -3.67 -4.031 -4.395 -4.765 -5.139 -5.394 -5.681 -6.127 -6.427 -6.729 -6.877 -7.199 -7.546 -7.884 -8.065 -8.507 -8.682 -8.929 -9.2 -9.824 -10.194 -10.564 -10.97 -11.46 -12.067 -12.913 -17.022 -10 ,26548 ,TETRA ,17555293,Thu Nov 25 23:45:23 CET,Fri Nov 26 01:59:17 CET,0.0 0.612 0.806 0.973 1.12 1.243 1.369 1.481 1.699 1.799 1.895 1.862 2.172 2.245 2.398 2.554 2.71 2.788 2.926 3.063 3.277 3.412 3.538 3.706 3.853 3.991 4.133 4.285 4.49 4.677 4.848 5.034 5.195 5.347 5.531 5.742 5.951 6.21 6.473 6.716 6.987 7.259 7.56 7.896 8.248 8.616 9.048 9.43 9.673 9.757 9.587 8.997 8.178 7.244 6.348 5.471 4.669 3.924 3.27 2.592 1.968 1.378 0.818 0.278 -0.233 -0.709 -1.235 -1.738 -2.142 -2.537 -2.987 -3.367 -3.759 -4.168 -4.521 -4.913 -5.321 -5.7 -6.075 -6.354 -6.638 -7.096 -7.446 -7.811 -7.985 -8.359 -8.77 -9.218 -9.472 -9.982 -10.293 -10.553 -10.815 -11.385 -11.733 -12.132 -12.528 -12.95 -13.45 -14.32 -19.627 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 142907f4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6681 ,TETRA ,17555294,Thu Nov 25 23:46:08 CET,Fri Nov 26 01:49:43 CET,0.0 0.248 0.506 0.738 0.969 1.191 1.387 1.752 1.918 2.081 2.165 2.618 2.777 3.074 3.352 3.615 3.745 4.009 4.274 4.694 4.987 5.273 5.702 6.111 6.487 6.858 7.227 7.722 8.202 8.657 9.212 9.787 10.354 10.995 11.703 12.338 13.05 13.825 14.64 15.513 16.527 17.76 19.023 20.556 22.248 24.16 26.3 28.686 31.694 35.494 38.664 40.587 41.499 41.764 41.796 41.645 41.353 41.063 40.715 40.361 40.011 39.63 39.229 38.838 38.461 38.06 37.717 37.398 37.067 36.753 36.505 36.256 35.984 35.757 35.509 35.248 34.976 34.676 34.439 34.197 33.843 33.549 33.255 33.122 32.825 32.502 32.156 31.956 31.506 31.372 31.192 30.982 30.452 30.122 29.789 29.43 28.952 28.275 27.223 -2 ,31414 ,TETRA ,17555295,Thu Nov 25 23:50:18 CET,Fri Nov 26 02:07:36 CET,0.0 0.312 0.6 0.859 1.06 1.26 1.464 1.874 2.078 2.26 2.292 2.725 2.873 3.145 3.402 3.667 3.806 4.088 4.355 4.742 4.999 5.267 5.659 6.022 6.379 6.733 7.087 7.548 7.982 8.415 8.956 9.492 10.018 10.634 11.327 11.993 12.743 13.583 14.49 15.475 16.619 17.94 19.289 20.88 22.538 24.385 26.496 28.917 31.805 35.255 37.887 39.218 39.773 39.884 39.832 39.757 39.623 39.43 39.2 38.93 38.631 38.342 38.064 37.823 37.602 37.328 37.014 36.713 36.401 36.073 35.791 35.499 35.2 34.941 34.665 34.406 34.13 33.839 33.636 33.428 33.112 32.888 32.619 32.465 32.192 31.886 31.528 31.372 30.971 30.824 30.615 30.38 29.845 29.522 29.171 28.812 28.332 27.647 26.796 -3 ,31624 ,TETRA ,17555296,Thu Nov 25 23:50:20 CET,Fri Nov 26 02:01:10 CET,0.0 0.299 0.549 0.764 0.968 1.181 1.389 1.791 1.976 2.162 2.262 2.693 2.831 3.104 3.36 3.609 3.733 3.976 4.219 4.57 4.805 5.04 5.379 5.712 6.046 6.375 6.694 7.127 7.552 7.97 8.502 8.982 9.409 9.922 10.572 11.266 12.022 12.799 13.614 14.478 15.464 16.625 17.776 19.176 20.791 22.725 25.023 27.685 30.935 34.888 37.358 38.556 39.204 39.478 39.62 39.592 39.493 39.354 39.145 38.936 38.599 38.177 37.788 37.416 37.066 36.702 36.379 36.09 35.787 35.469 35.205 34.934 34.642 34.397 34.148 33.904 33.659 33.395 33.175 32.959 32.653 32.412 32.141 31.994 31.713 31.417 31.095 30.933 30.516 30.356 30.12 29.86 29.32 29.003 28.631 28.192 27.753 27.071 26.13 -4 ,18489 ,TETRA ,17555297,Thu Nov 25 23:56:38 CET,Fri Nov 26 02:15:44 CET,0.0 0.288 0.54 0.798 1.03 1.267 1.503 1.913 2.11 2.293 2.36 2.808 2.972 3.292 3.598 3.888 4.036 4.337 4.631 5.057 5.329 5.603 6.01 6.375 6.725 7.067 7.402 7.836 8.267 8.714 9.271 9.806 10.324 10.962 11.694 12.398 13.21 14.122 15.135 16.201 17.367 18.736 20.086 21.578 23.199 25.107 27.327 29.79 32.576 35.884 38.457 39.718 40.338 40.609 40.497 40.232 40.061 39.88 39.624 39.266 38.846 38.471 38.114 37.782 37.467 37.099 36.77 36.493 36.187 35.873 35.607 35.329 35.04 34.798 34.556 34.304 34.046 33.774 33.568 33.35 33.026 32.79 32.537 32.395 32.082 31.773 31.48 31.323 30.918 30.811 30.613 30.386 29.872 29.585 29.29 28.977 28.582 28.014 27.174 -5 ,16310 ,TETRA ,17555298,Thu Nov 25 23:56:40 CET,Fri Nov 26 02:14:22 CET,0.0 0.269 0.48 0.679 0.889 1.082 1.247 1.57 1.73 1.894 1.929 2.341 2.483 2.783 3.089 3.383 3.519 3.783 4.053 4.447 4.698 4.953 5.33 5.693 6.042 6.377 6.708 7.154 7.593 8.013 8.523 9.036 9.541 10.075 10.671 11.272 11.934 12.651 13.403 14.223 15.175 16.313 17.501 18.925 20.562 22.458 24.546 27.074 30.148 33.712 36.428 37.648 38.204 38.458 38.466 38.382 38.23 37.967 37.635 37.287 36.946 36.594 36.246 35.91 35.561 35.199 34.898 34.635 34.344 34.038 33.779 33.481 33.168 32.936 32.7 32.468 32.203 31.907 31.709 31.488 31.122 30.882 30.635 30.502 30.209 29.91 29.563 29.351 28.906 28.712 28.503 28.298 27.764 27.423 27.065 26.623 25.937 25.116 24.069 -6 ,12620 ,TETRA ,17555299,Thu Nov 25 23:56:38 CET,Fri Nov 26 01:53:07 CET,0.0 0.264 0.511 0.718 0.906 1.101 1.284 1.63 1.808 1.984 2.037 2.469 2.632 2.957 3.267 3.576 3.736 4.038 4.333 4.757 5.028 5.315 5.753 6.174 6.582 6.97 7.34 7.83 8.335 8.842 9.468 10.093 10.694 11.347 12.053 12.745 13.497 14.32 15.244 16.253 17.346 18.589 19.807 21.186 22.794 24.679 26.846 29.336 32.269 35.839 38.455 39.712 40.361 40.617 40.464 40.092 39.649 39.24 38.8 38.369 37.958 37.565 37.191 36.826 36.478 36.101 35.78 35.497 35.164 34.814 34.528 34.216 33.887 33.631 33.359 33.07 32.776 32.491 32.3 32.09 31.772 31.53 31.247 31.106 30.798 30.491 30.204 30.047 29.653 29.544 29.341 29.111 28.597 28.324 28.025 27.664 27.179 26.506 25.525 -7 ,15381 ,TETRA ,17555300,Thu Nov 25 23:56:38 CET,Fri Nov 26 02:12:58 CET,0.0 0.372 0.743 1.026 1.257 1.486 1.681 1.985 2.132 2.292 2.333 2.766 2.909 3.202 3.493 3.764 3.901 4.169 4.418 4.782 5.021 5.253 5.592 5.959 6.357 6.758 7.156 7.673 8.184 8.636 9.157 9.69 10.213 10.844 11.581 12.29 13.06 13.923 14.844 15.8 16.893 18.216 19.647 21.378 23.358 25.627 28.005 30.53 33.321 36.642 39.216 40.42 41.031 41.325 41.263 41.105 41.009 40.931 40.708 40.366 40.036 39.731 39.416 39.099 38.811 38.489 38.186 37.916 37.634 37.319 37.03 36.725 36.421 36.181 35.912 35.637 35.354 35.051 34.833 34.589 34.173 33.891 33.599 33.449 33.161 32.851 32.53 32.361 31.935 31.751 31.529 31.298 30.782 30.518 30.227 29.861 29.373 28.731 27.876 -8 ,10305 ,TETRA ,17555301,Fri Nov 26 00:00:08 CET,Fri Nov 26 02:18:19 CET,0.0 0.25 0.483 0.693 0.886 1.059 1.233 1.555 1.705 1.866 1.911 2.336 2.484 2.772 3.044 3.316 3.451 3.708 3.971 4.351 4.585 4.817 5.176 5.539 5.883 6.226 6.576 7.022 7.46 7.892 8.407 8.918 9.42 10.021 10.701 11.361 12.112 12.951 13.866 14.829 15.943 17.237 18.492 20.098 21.95 23.934 26.081 28.596 31.582 34.63 36.876 38.229 38.761 38.743 38.478 38.265 38.079 37.762 37.334 36.916 36.531 36.148 35.767 35.418 35.12 34.814 34.519 34.264 34.006 33.723 33.49 33.197 32.849 32.595 32.337 32.071 31.771 31.453 31.241 31.016 30.675 30.449 30.215 30.081 29.769 29.451 29.116 28.942 28.516 28.341 28.112 27.856 27.184 26.818 26.471 26.11 25.692 25.086 24.198 -9 ,3458 ,TETRA ,17555302,Thu Nov 25 23:58:11 CET,Fri Nov 26 01:55:10 CET,0.0 0.322 0.573 0.794 1.005 1.215 1.414 1.79 1.98 2.168 2.237 2.68 2.855 3.206 3.546 3.889 4.06 4.406 4.732 5.17 5.428 5.681 6.07 6.448 6.82 7.194 7.572 8.092 8.619 9.116 9.691 10.253 10.836 11.556 12.343 13.033 13.784 14.622 15.541 16.553 17.686 19.012 20.416 22.101 24.008 26.309 28.932 31.857 35.243 38.867 41.159 42.11 42.622 42.905 42.97 42.883 42.592 42.199 41.864 41.633 41.342 41.009 40.676 40.342 40.011 39.664 39.359 39.084 38.787 38.447 38.163 37.871 37.557 37.302 37.043 36.772 36.484 36.193 35.986 35.78 35.44 35.17 34.899 34.768 34.504 34.241 33.929 33.751 33.332 33.154 32.92 32.677 32.117 31.748 31.282 30.817 30.299 29.581 28.306 -10 ,19635 ,TETRA ,17555303,Thu Nov 25 23:56:38 CET,Fri Nov 26 02:14:38 CET,0.0 0.252 0.472 0.687 0.911 1.111 1.293 1.664 1.84 2.005 2.042 2.445 2.582 2.855 3.118 3.391 3.531 3.814 4.097 4.51 4.775 5.033 5.41 5.778 6.127 6.453 6.783 7.235 7.671 8.085 8.591 9.113 9.634 10.219 10.894 11.599 12.371 13.126 13.878 14.697 15.658 16.812 17.98 19.346 20.898 22.768 24.977 27.573 30.498 33.886 36.513 37.714 38.191 38.348 38.394 38.372 38.293 38.144 37.925 37.71 37.483 37.254 36.968 36.644 36.329 35.979 35.655 35.373 35.08 34.805 34.559 34.29 33.999 33.745 33.494 33.235 32.963 32.668 32.464 32.262 31.947 31.705 31.435 31.284 30.944 30.568 30.142 29.918 29.469 29.284 29.04 28.82 28.306 27.99 27.647 27.27 26.793 26.13 25.213 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt deleted file mode 100644 index 67256b78..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30532 ,TETRA ,17555304,Thu Nov 25 23:56:38 CET,Fri Nov 26 02:15:22 CET,0.0 1.147 1.47 1.678 1.889 2.086 2.258 2.41 2.669 2.795 2.93 2.933 3.332 3.453 3.693 3.903 4.103 4.208 4.422 4.632 4.92 5.107 5.299 5.582 5.857 6.123 6.366 6.589 6.858 7.106 7.38 7.75 8.109 8.441 8.835 9.292 9.737 10.239 10.783 11.4 12.063 12.814 13.586 14.218 14.952 15.788 16.646 17.401 18.075 18.545 18.444 17.404 16.049 14.586 13.191 11.77 10.5 9.458 8.529 7.512 6.576 5.715 4.903 4.16 3.495 2.914 2.284 1.679 1.157 0.632 0.086 -0.376 -0.846 -1.33 -1.717 -2.12 -2.548 -2.983 -3.394 -3.661 -3.947 -4.385 -4.697 -5.03 -5.184 -5.519 -5.89 -6.26 -6.455 -6.954 -7.125 -7.35 -7.584 -8.101 -8.351 -8.62 -8.953 -9.329 -9.763 -10.228 -12.335 -2 ,16473 ,TETRA ,17555305,Thu Nov 25 23:58:11 CET,Fri Nov 26 02:10:51 CET,0.0 1.992 2.325 2.539 2.757 2.958 3.142 3.309 3.6 3.74 3.873 3.834 4.229 4.348 4.576 4.796 5.014 5.125 5.348 5.558 5.867 6.072 6.251 6.49 6.724 6.979 7.237 7.475 7.799 8.117 8.429 8.811 9.175 9.506 9.867 10.284 10.688 11.131 11.63 12.16 12.742 13.393 14.099 14.831 15.651 16.503 17.485 18.51 19.549 20.32 20.06 18.883 17.656 16.299 14.841 13.473 12.282 11.203 10.265 9.338 8.464 7.659 6.936 6.253 5.597 5.023 4.453 3.922 3.461 2.994 2.517 2.122 1.706 1.271 0.932 0.573 0.192 -0.191 -0.591 -0.873 -1.149 -1.549 -1.829 -2.14 -2.309 -2.659 -3.004 -3.358 -3.542 -4.007 -4.122 -4.333 -4.556 -5.076 -5.383 -5.717 -6.075 -6.439 -6.843 -7.37 -10.757 -3 ,28507 ,TETRA ,17555306,Fri Nov 26 00:00:11 CET,Fri Nov 26 02:19:43 CET,0.0 1.151 1.589 1.894 2.181 2.423 2.643 2.861 3.253 3.441 3.625 3.656 4.068 4.209 4.459 4.683 4.894 5.005 5.23 5.435 5.727 5.919 6.109 6.374 6.635 6.904 7.18 7.436 7.759 8.09 8.403 8.778 9.141 9.486 9.872 10.316 10.767 11.256 11.766 12.313 12.86 13.386 14.014 14.738 15.616 16.526 17.437 18.352 19.197 19.811 19.835 18.927 17.574 16.071 14.556 13.171 11.833 10.533 9.423 8.309 7.366 6.546 5.741 4.931 4.215 3.599 2.937 2.359 1.883 1.373 0.827 0.392 -0.041 -0.489 -0.837 -1.19 -1.561 -1.948 -2.341 -2.604 -2.884 -3.326 -3.635 -3.952 -4.115 -4.494 -4.898 -5.315 -5.524 -6.01 -6.173 -6.393 -6.629 -7.174 -7.442 -7.754 -8.125 -8.531 -9.015 -9.727 -12.251 -4 ,25108 ,TETRA ,17555307,Fri Nov 26 00:00:13 CET,Fri Nov 26 02:18:34 CET,0.0 1.292 1.647 1.888 2.096 2.296 2.485 2.678 3.064 3.236 3.39 3.397 3.814 3.949 4.206 4.436 4.675 4.794 5.002 5.216 5.544 5.752 5.954 6.245 6.547 6.848 7.125 7.392 7.768 8.129 8.461 8.848 9.228 9.614 10.058 10.571 11.056 11.581 12.116 12.617 13.141 13.748 14.439 15.079 15.764 16.551 17.495 18.425 19.306 19.893 19.926 18.939 17.202 15.387 13.679 12.054 10.704 9.501 8.385 7.295 6.396 5.515 4.655 3.937 3.296 2.676 2.031 1.428 0.871 0.307 -0.244 -0.697 -1.162 -1.637 -2.012 -2.402 -2.796 -3.196 -3.634 -3.939 -4.243 -4.711 -5.022 -5.328 -5.481 -5.817 -6.178 -6.55 -6.741 -7.235 -7.382 -7.596 -7.828 -8.347 -8.61 -8.889 -9.208 -9.57 -9.976 -10.548 -13.328 -5 ,18026 ,TETRA ,17555308,Fri Nov 26 00:02:46 CET,Fri Nov 26 02:24:07 CET,0.0 1.33 1.715 1.989 2.234 2.454 2.674 2.887 3.275 3.457 3.636 3.682 4.119 4.264 4.518 4.777 5.027 5.152 5.407 5.65 5.968 6.17 6.378 6.679 6.951 7.238 7.563 7.886 8.304 8.698 9.076 9.535 9.979 10.404 10.889 11.445 11.965 12.516 13.09 13.682 14.297 14.967 15.714 16.519 17.431 18.308 19.264 20.198 21.1 21.777 21.741 20.682 19.333 17.839 16.45 15.205 14.052 12.891 11.779 10.685 9.768 8.934 8.131 7.383 6.722 6.139 5.514 4.925 4.407 3.92 3.419 2.969 2.507 2.039 1.678 1.298 0.882 0.432 -0.022 -0.311 -0.599 -1.049 -1.364 -1.693 -1.867 -2.231 -2.593 -2.958 -3.141 -3.615 -3.726 -3.935 -4.168 -4.668 -4.94 -5.254 -5.588 -5.918 -6.278 -6.795 -8.928 -6 ,2354 ,TETRA ,17555309,Fri Nov 26 00:02:48 CET,Fri Nov 26 02:15:09 CET,0.0 1.368 1.689 1.917 2.122 2.316 2.52 2.7 2.983 3.119 3.272 3.373 3.813 3.947 4.226 4.521 4.797 4.941 5.222 5.494 5.88 6.112 6.331 6.627 6.912 7.184 7.458 7.732 8.078 8.416 8.75 9.16 9.554 9.947 10.406 10.939 11.442 11.968 12.501 13.026 13.6 14.313 15.191 16.015 16.933 17.921 18.898 19.912 20.902 21.597 21.899 20.917 19.318 17.708 16.337 15.064 13.957 12.875 11.85 10.806 9.86 9.005 8.205 7.453 6.787 6.18 5.504 4.894 4.402 3.933 3.442 3.028 2.6 2.154 1.806 1.449 1.086 0.702 0.29 0.008 -0.28 -0.721 -1.028 -1.354 -1.517 -1.849 -2.188 -2.554 -2.745 -3.213 -3.352 -3.578 -3.796 -4.265 -4.53 -4.815 -5.142 -5.5 -5.911 -6.472 -11.265 -7 ,27298 ,TETRA ,17555310,Fri Nov 26 00:02:46 CET,Fri Nov 26 02:23:11 CET,0.0 1.535 1.86 2.13 2.371 2.601 2.811 2.99 3.298 3.44 3.587 3.585 3.981 4.109 4.36 4.595 4.828 4.946 5.184 5.413 5.73 5.935 6.14 6.437 6.71 6.972 7.244 7.516 7.859 8.206 8.565 8.976 9.353 9.718 10.142 10.629 11.109 11.639 12.166 12.712 13.336 14.087 14.921 15.698 16.565 17.422 18.343 19.415 20.576 21.595 21.879 21.071 20.002 18.721 17.41 16.176 15.022 13.971 13.068 12.131 11.254 10.395 9.563 8.827 8.155 7.512 6.89 6.372 5.902 5.366 4.811 4.356 3.862 3.367 2.996 2.605 2.217 1.825 1.404 1.113 0.809 0.339 0.018 -0.315 -0.486 -0.836 -1.226 -1.637 -1.841 -2.34 -2.473 -2.717 -2.971 -3.476 -3.761 -4.08 -4.431 -4.806 -5.231 -5.827 -8.065 -8 ,8052 ,TETRA ,17555311,Fri Nov 26 00:03:51 CET,Fri Nov 26 02:22:33 CET,0.0 0.679 0.989 1.236 1.441 1.635 1.824 1.987 2.31 2.471 2.627 2.646 3.071 3.221 3.467 3.689 3.924 4.039 4.276 4.512 4.839 5.054 5.266 5.563 5.839 6.102 6.358 6.614 6.945 7.262 7.584 7.997 8.383 8.744 9.157 9.612 10.057 10.561 11.124 11.696 12.271 12.944 13.751 14.61 15.576 16.588 17.717 18.821 19.962 21.051 21.563 20.872 19.643 18.212 16.863 15.506 14.144 12.861 11.767 10.715 9.819 9.017 8.273 7.563 6.907 6.292 5.64 5.078 4.617 4.14 3.608 3.182 2.756 2.303 1.931 1.547 1.165 0.753 0.323 0.041 -0.226 -0.653 -0.965 -1.283 -1.449 -1.802 -2.186 -2.59 -2.785 -3.259 -3.401 -3.627 -3.866 -4.398 -4.674 -4.978 -5.32 -5.676 -6.102 -6.749 -11.646 -9 ,15584 ,TETRA ,17555314,Fri Nov 26 00:03:49 CET,Fri Nov 26 02:22:26 CET,0.0 1.619 2.026 2.306 2.549 2.75 2.942 3.12 3.422 3.568 3.723 3.751 4.171 4.306 4.573 4.841 5.093 5.208 5.441 5.665 5.969 6.166 6.358 6.644 6.926 7.189 7.449 7.702 8.052 8.399 8.716 9.095 9.443 9.792 10.214 10.7 11.194 11.714 12.253 12.832 13.435 14.058 14.715 15.418 16.297 17.269 18.23 19.148 20.123 21.046 21.654 21.188 19.957 18.502 17.048 15.662 14.485 13.336 12.282 11.209 10.307 9.534 8.708 7.916 7.254 6.631 5.974 5.413 4.913 4.39 3.884 3.465 3.014 2.551 2.19 1.817 1.45 1.073 0.652 0.353 0.059 -0.373 -0.687 -1.015 -1.182 -1.531 -1.87 -2.208 -2.401 -2.889 -2.99 -3.203 -3.431 -3.927 -4.195 -4.494 -4.837 -5.23 -5.646 -6.204 -10.556 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt deleted file mode 100644 index d2916ad1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23322 ,TETRA ,17555319,Thu Nov 25 23:06:29 CET,Fri Nov 26 01:06:11 CET,0.0 1.384 1.751 2.028 2.338 2.646 2.924 3.18 3.564 3.726 3.887 3.901 4.309 4.425 4.61 4.757 4.886 4.946 5.064 5.17 5.302 5.384 5.464 5.578 5.672 5.748 5.833 5.915 6.009 6.093 6.169 6.245 6.282 6.331 6.434 6.552 6.624 6.719 6.791 6.771 6.753 6.702 6.554 6.346 6.054 5.673 5.079 4.197 2.951 1.01 -2.199 -5.86 -8.733 -11.16 -13.25 -15.074 -16.595 -17.924 -19.062 -20.131 -20.993 -21.796 -22.553 -23.227 -23.849 -24.396 -24.956 -25.472 -25.899 -26.317 -26.77 -27.149 -27.536 -27.962 -28.321 -28.684 -29.037 -29.398 -29.792 -30.064 -30.338 -30.769 -31.076 -31.395 -31.555 -31.894 -32.224 -32.565 -32.752 -33.252 -33.323 -33.533 -33.749 -34.198 -34.46 -34.789 -35.154 -35.534 -35.974 -36.592 -39.305 -2 ,28045 ,TETRA ,17555320,Fri Nov 26 00:06:16 CET,Fri Nov 26 02:26:12 CET,0.0 0.66 0.978 1.237 1.446 1.604 1.701 1.787 1.948 2.045 2.143 2.029 2.365 2.445 2.604 2.732 2.845 2.897 2.996 3.094 3.21 3.26 3.31 3.378 3.434 3.527 3.682 3.848 4.019 4.169 4.31 4.455 4.561 4.633 4.706 4.759 4.811 4.861 4.883 4.87 4.83 4.787 4.725 4.591 4.293 3.872 3.303 2.473 1.238 -0.722 -4.038 -7.952 -11.11 -13.655 -15.676 -17.393 -18.848 -20.139 -21.238 -22.323 -23.233 -23.999 -24.7 -25.369 -26.002 -26.598 -27.208 -27.733 -28.188 -28.665 -29.16 -29.574 -30.009 -30.442 -30.775 -31.114 -31.465 -31.853 -32.247 -32.512 -32.776 -33.184 -33.467 -33.752 -33.897 -34.192 -34.512 -34.863 -35.042 -35.541 -35.608 -35.813 -36.03 -36.464 -36.718 -37.017 -37.316 -37.654 -38.066 -38.597 -40.563 -3 ,14354 ,TETRA ,17555321,Fri Nov 26 00:08:54 CET,Fri Nov 26 02:14:09 CET,0.0 1.229 1.547 1.784 2.019 2.237 2.434 2.608 2.917 3.062 3.194 3.14 3.544 3.666 3.865 4.027 4.159 4.212 4.311 4.401 4.53 4.61 4.683 4.774 4.842 4.915 4.994 5.081 5.192 5.267 5.326 5.411 5.489 5.539 5.557 5.565 5.565 5.555 5.527 5.475 5.4 5.287 5.11 4.9 4.603 4.171 3.603 2.842 1.64 -0.274 -3.356 -6.963 -9.811 -12.091 -13.989 -15.639 -17.01 -18.207 -19.259 -20.288 -21.135 -21.885 -22.564 -23.196 -23.809 -24.362 -24.924 -25.409 -25.81 -26.216 -26.625 -26.975 -27.34 -27.695 -27.986 -28.301 -28.615 -28.931 -29.259 -29.485 -29.717 -30.076 -30.333 -30.616 -30.767 -31.074 -31.373 -31.683 -31.838 -32.29 -32.288 -32.463 -32.651 -33.037 -33.254 -33.488 -33.726 -33.98 -34.29 -34.813 -36.717 -4 ,8094 ,TETRA ,17555322,Fri Nov 26 00:09:41 CET,Fri Nov 26 02:15:19 CET,0.0 1.797 2.294 2.653 2.881 3.061 3.217 3.343 3.568 3.676 3.776 3.674 4.035 4.13 4.287 4.423 4.566 4.637 4.772 4.921 5.119 5.23 5.356 5.533 5.697 5.859 6.022 6.17 6.325 6.459 6.587 6.748 6.9 7.003 7.082 7.156 7.225 7.295 7.354 7.375 7.349 7.289 7.175 7.008 6.752 6.358 5.844 5.149 4.009 2.138 -1.097 -4.888 -7.816 -10.173 -12.118 -13.821 -15.301 -16.559 -17.613 -18.644 -19.511 -20.295 -21.013 -21.666 -22.314 -22.923 -23.551 -24.106 -24.576 -25.055 -25.568 -25.99 -26.409 -26.856 -27.202 -27.535 -27.873 -28.237 -28.62 -28.886 -29.153 -29.553 -29.834 -30.118 -30.258 -30.533 -30.828 -31.14 -31.296 -31.781 -31.816 -32.017 -32.221 -32.682 -32.946 -33.21 -33.475 -33.775 -34.116 -34.507 -35.984 -5 ,10172 ,TETRA ,17555323,Fri Nov 26 00:12:55 CET,Fri Nov 26 02:31:20 CET,0.0 2.236 2.812 3.226 3.534 3.817 4.076 4.289 4.659 4.826 4.994 5.052 5.47 5.601 5.842 6.005 6.124 6.186 6.293 6.395 6.533 6.617 6.702 6.822 6.933 7.045 7.151 7.237 7.346 7.434 7.513 7.625 7.717 7.796 7.894 7.974 8.001 8.003 8.006 7.978 7.925 7.869 7.728 7.49 7.177 6.776 6.157 5.312 4.04 2.045 -1.136 -4.784 -7.704 -10.203 -12.288 -14.091 -15.667 -17.013 -18.096 -19.14 -20.049 -20.838 -21.56 -22.232 -22.836 -23.388 -23.963 -24.466 -24.885 -25.326 -25.795 -26.183 -26.585 -26.994 -27.307 -27.632 -27.963 -28.324 -28.707 -28.965 -29.23 -29.611 -29.889 -30.189 -30.326 -30.6 -30.889 -31.207 -31.377 -31.876 -31.942 -32.125 -32.304 -32.712 -32.955 -33.261 -33.597 -33.942 -34.333 -34.849 -36.98 -6 ,17935 ,TETRA ,17555324,Fri Nov 26 00:16:17 CET,Fri Nov 26 02:35:26 CET,0.0 2.441 3.09 3.53 3.903 4.195 4.447 4.688 5.103 5.283 5.455 5.474 5.879 6.002 6.218 6.41 6.598 6.695 6.879 7.044 7.266 7.404 7.549 7.739 7.91 8.101 8.287 8.449 8.637 8.816 8.932 9.028 9.116 9.167 9.186 9.198 9.193 9.17 9.171 9.125 9.002 8.843 8.622 8.32 7.921 7.47 6.841 5.891 4.465 2.244 -1.263 -5.205 -8.354 -10.901 -13.017 -14.841 -16.384 -17.743 -18.864 -19.914 -20.809 -21.609 -22.362 -23.057 -23.69 -24.266 -24.83 -25.305 -25.718 -26.168 -26.638 -27.026 -27.43 -27.859 -28.193 -28.531 -28.896 -29.279 -29.641 -29.881 -30.14 -30.547 -30.838 -31.145 -31.301 -31.637 -31.995 -32.348 -32.537 -33.071 -33.216 -33.47 -33.726 -34.261 -34.543 -34.849 -35.182 -35.564 -36.043 -36.64 -39.47 -7 ,9352 ,TETRA ,17555325,Fri Nov 26 00:13:34 CET,Fri Nov 26 02:30:13 CET,0.0 2.326 2.971 3.43 3.736 3.963 4.131 4.274 4.573 4.719 4.846 4.783 5.155 5.245 5.406 5.539 5.666 5.737 5.871 5.996 6.197 6.338 6.473 6.635 6.746 6.854 6.979 7.081 7.219 7.391 7.558 7.74 7.914 8.091 8.286 8.473 8.618 8.773 8.896 8.917 8.856 8.749 8.611 8.437 8.137 7.685 7.034 6.158 4.891 3.033 0.08 -3.345 -6.124 -8.41 -10.275 -11.928 -13.363 -14.652 -15.752 -16.815 -17.731 -18.545 -19.3 -20.012 -20.637 -21.195 -21.805 -22.333 -22.772 -23.237 -23.744 -24.163 -24.579 -25.025 -25.378 -25.713 -26.038 -26.418 -26.828 -27.091 -27.366 -27.787 -28.058 -28.323 -28.467 -28.758 -29.053 -29.367 -29.534 -30.033 -30.05 -30.241 -30.448 -30.883 -31.119 -31.372 -31.639 -31.962 -32.358 -32.8 -35.39 -8 ,20565 ,TETRA ,17555326,Fri Nov 26 00:16:20 CET,Fri Nov 26 02:35:37 CET,0.0 0.985 1.349 1.604 1.816 2.031 2.2 2.33 2.594 2.725 2.828 2.729 3.079 3.163 3.36 3.555 3.705 3.771 3.902 4.035 4.215 4.315 4.407 4.517 4.612 4.701 4.782 4.872 4.983 5.079 5.173 5.265 5.349 5.411 5.482 5.592 5.683 5.728 5.716 5.677 5.631 5.569 5.449 5.289 5.06 4.72 4.262 3.546 2.404 0.662 -2.296 -5.84 -8.653 -10.915 -12.835 -14.49 -15.901 -17.149 -18.217 -19.273 -20.155 -20.912 -21.607 -22.249 -22.828 -23.344 -23.888 -24.406 -24.857 -25.304 -25.775 -26.164 -26.54 -26.904 -27.196 -27.503 -27.82 -28.168 -28.515 -28.749 -28.998 -29.394 -29.677 -29.976 -30.125 -30.411 -30.712 -31.058 -31.233 -31.696 -31.729 -31.927 -32.135 -32.579 -32.812 -33.047 -33.304 -33.619 -34.017 -34.639 -37.04 -9 ,14312 ,TETRA ,17555327,Fri Nov 26 00:16:21 CET,Fri Nov 26 02:35:04 CET,0.0 2.171 2.797 3.208 3.528 3.812 4.062 4.296 4.732 4.932 5.117 5.19 5.635 5.794 6.047 6.273 6.524 6.654 6.89 7.104 7.417 7.606 7.777 7.994 8.165 8.315 8.453 8.592 8.755 8.917 9.098 9.309 9.473 9.601 9.731 9.863 10.008 10.163 10.31 10.452 10.516 10.499 10.374 10.174 9.932 9.605 9.112 8.379 7.233 5.48 2.62 -0.763 -3.524 -5.821 -7.756 -9.477 -10.923 -12.193 -13.324 -14.447 -15.35 -16.117 -16.853 -17.548 -18.213 -18.828 -19.447 -19.986 -20.462 -20.95 -21.433 -21.828 -22.241 -22.667 -22.979 -23.3 -23.635 -23.98 -24.324 -24.561 -24.819 -25.215 -25.485 -25.78 -25.934 -26.242 -26.588 -26.944 -27.113 -27.626 -27.727 -27.936 -28.156 -28.615 -28.854 -29.12 -29.411 -29.742 -30.138 -30.608 -32.371 -10 ,14467 ,TETRA ,17555328,Fri Nov 26 00:20:15 CET,Fri Nov 26 02:39:10 CET,0.0 2.416 2.855 3.142 3.428 3.669 3.88 4.109 4.491 4.631 4.772 4.771 5.16 5.257 5.451 5.65 5.828 5.908 6.045 6.167 6.364 6.484 6.586 6.707 6.805 6.881 6.926 6.967 7.023 7.065 7.1 7.163 7.209 7.234 7.255 7.274 7.297 7.293 7.261 7.199 7.122 7.006 6.817 6.607 6.301 5.871 5.255 4.338 2.937 0.812 -2.592 -6.45 -9.455 -11.912 -13.979 -15.728 -17.187 -18.491 -19.589 -20.648 -21.543 -22.362 -23.139 -23.83 -24.446 -25.008 -25.605 -26.122 -26.551 -27.005 -27.459 -27.824 -28.213 -28.613 -28.914 -29.239 -29.596 -29.964 -30.34 -30.589 -30.838 -31.24 -31.526 -31.811 -31.957 -32.281 -32.62 -32.965 -33.138 -33.635 -33.714 -33.919 -34.128 -34.579 -34.831 -35.086 -35.364 -35.669 -36.036 -36.554 -38.787 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index f763db5f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -7 ,30209 ,TETRA ,17555335,Fri Nov 26 00:22:44 CET,Fri Nov 26 02:45:03 CET,0.0 1.335 1.788 2.145 2.452 2.723 2.979 3.221 3.64 3.821 4.008 4.227 4.543 4.712 5.044 5.374 5.688 5.842 6.153 6.465 6.923 7.218 7.511 7.93 8.328 8.729 9.132 9.539 10.076 10.581 11.088 11.717 12.329 12.964 13.689 14.491 15.293 16.192 17.198 18.301 19.477 20.856 22.542 24.256 26.293 28.652 31.511 34.882 38.883 43.71 49.868 55.393 58.733 60.942 62.602 63.779 64.588 65.204 65.662 66.085 66.394 66.605 66.768 66.891 66.973 67.037 67.076 67.079 67.09 67.101 67.067 67.031 67.003 66.96 66.909 66.856 66.809 66.718 66.589 66.513 66.44 66.315 66.202 66.069 65.992 65.821 65.65 65.455 65.355 65.179 64.993 64.857 64.679 64.32 64.123 63.867 63.531 63.09 62.509 61.436 56.019 -8 ,1806 ,TETRA ,17555336,Fri Nov 26 00:22:44 CET,Fri Nov 26 02:44:15 CET,0.0 0.843 1.158 1.454 1.704 1.924 2.125 2.313 2.691 2.877 3.053 3.268 3.584 3.755 4.092 4.417 4.737 4.896 5.196 5.482 5.905 6.191 6.475 6.909 7.335 7.739 8.138 8.531 9.063 9.574 10.063 10.672 11.258 11.83 12.524 13.314 14.087 14.94 15.866 16.878 17.959 19.191 20.677 22.247 24.106 26.218 28.784 31.873 35.664 40.242 45.989 51.113 54.456 56.815 58.533 59.923 60.966 61.709 62.22 62.622 62.882 63.088 63.301 63.477 63.605 63.7 63.746 63.764 63.796 63.824 63.817 63.807 63.79 63.757 63.716 63.67 63.62 63.547 63.454 63.398 63.315 63.144 63.046 62.911 62.844 62.709 62.533 62.363 62.286 62.129 61.89 61.676 61.468 61.128 60.918 60.621 60.258 59.86 59.328 58.725 49.839 -9 ,32708 ,TETRA ,17555337,Fri Nov 26 00:23:32 CET,Fri Nov 26 02:43:52 CET,0.0 1.092 1.516 1.858 2.153 2.417 2.659 2.885 3.331 3.533 3.728 3.993 4.324 4.507 4.862 5.217 5.547 5.701 6.01 6.32 6.761 7.039 7.321 7.752 8.186 8.619 9.044 9.458 9.968 10.471 10.992 11.629 12.25 12.855 13.558 14.359 15.126 15.966 16.913 17.957 19.056 20.329 21.87 23.471 25.401 27.609 30.348 33.501 37.22 41.835 47.7 53.08 56.546 58.882 60.518 61.755 62.695 63.385 63.903 64.359 64.658 64.876 65.058 65.207 65.319 65.398 65.484 65.563 65.604 65.625 65.635 65.627 65.622 65.594 65.545 65.492 65.425 65.336 65.211 65.124 65.038 64.861 64.71 64.578 64.523 64.392 64.224 64.034 63.937 63.767 63.582 63.44 63.296 62.963 62.727 62.444 62.161 61.816 61.123 59.854 51.817 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt deleted file mode 100644 index 43f6a93a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23181 ,TETRA ,17555339,Fri Nov 26 00:23:35 CET,Fri Nov 26 02:43:46 CET,0.0 1.101 1.507 1.807 2.067 2.312 2.545 2.741 3.128 3.318 3.496 3.725 4.046 4.221 4.573 4.927 5.256 5.406 5.716 6.028 6.472 6.762 7.055 7.495 7.924 8.339 8.738 9.131 9.647 10.106 10.538 11.117 11.686 12.243 12.924 13.694 14.477 15.364 16.333 17.401 18.555 19.853 21.323 22.781 24.556 26.714 29.399 32.605 36.383 40.883 46.327 51.18 54.348 56.371 57.789 58.811 59.537 60.083 60.477 60.849 61.158 61.401 61.594 61.725 61.786 61.846 61.918 61.971 61.998 61.998 61.984 61.951 61.9 61.844 61.803 61.758 61.684 61.597 61.532 61.489 61.42 61.264 61.16 61.057 61.01 60.911 60.774 60.63 60.55 60.4 60.233 60.089 59.95 59.652 59.477 59.313 59.129 58.849 58.434 57.852 54.07 -2 ,2899 ,TETRA ,17555340,Fri Nov 26 00:23:32 CET,Fri Nov 26 02:45:37 CET,0.0 1.017 1.424 1.728 1.996 2.272 2.502 2.699 3.079 3.258 3.442 3.69 4.016 4.186 4.52 4.852 5.176 5.337 5.644 5.939 6.357 6.614 6.869 7.264 7.667 8.076 8.488 8.892 9.398 9.899 10.401 11.014 11.611 12.181 12.853 13.631 14.396 15.25 16.12 17.026 18.028 19.175 20.533 21.964 23.664 25.585 27.855 30.6 33.994 38.212 43.638 48.269 51.093 52.951 54.355 55.418 56.162 56.748 57.178 57.544 57.829 58.03 58.21 58.307 58.368 58.423 58.44 58.445 58.435 58.427 58.424 58.404 58.374 58.335 58.293 58.26 58.208 58.135 58.071 58.017 57.938 57.785 57.681 57.572 57.516 57.399 57.241 57.076 56.993 56.841 56.703 56.593 56.486 56.189 56.014 55.823 55.586 55.245 54.809 54.166 47.127 -3 ,24538 ,TETRA ,17555341,Fri Nov 26 00:23:33 CET,Fri Nov 26 02:44:48 CET,0.0 1.306 1.751 2.108 2.399 2.662 2.888 3.103 3.53 3.73 3.922 4.144 4.453 4.62 4.96 5.304 5.633 5.783 6.068 6.358 6.79 7.076 7.355 7.763 8.177 8.589 8.989 9.37 9.874 10.372 10.851 11.422 11.981 12.537 13.186 13.927 14.682 15.53 16.48 17.511 18.571 19.794 21.253 22.771 24.676 26.874 29.452 32.463 36.059 40.517 46.223 51.342 54.634 56.928 58.597 59.855 60.723 61.374 61.859 62.238 62.532 62.747 62.899 63.024 63.105 63.147 63.205 63.231 63.223 63.233 63.209 63.169 63.122 63.04 62.982 62.93 62.874 62.797 62.695 62.615 62.532 62.433 62.356 62.238 62.175 62.054 61.893 61.697 61.594 61.429 61.303 61.2 61.077 60.717 60.493 60.273 60.033 59.679 59.3 58.7 53.907 -4 ,4344 ,TETRA ,17555342,Fri Nov 26 00:24:45 CET,Fri Nov 26 02:44:02 CET,0.0 1.005 1.339 1.635 1.892 2.139 2.374 2.625 3.094 3.298 3.496 3.712 4.029 4.199 4.512 4.828 5.144 5.296 5.589 5.88 6.302 6.573 6.846 7.248 7.631 8.005 8.384 8.762 9.239 9.698 10.152 10.719 11.284 11.843 12.505 13.262 13.993 14.788 15.645 16.568 17.6 18.846 20.398 21.98 23.859 26.098 28.714 31.704 35.345 39.831 45.628 50.645 53.65 55.725 57.216 58.268 59.028 59.62 60.071 60.45 60.734 60.956 61.112 61.227 61.318 61.385 61.441 61.474 61.486 61.498 61.487 61.46 61.443 61.418 61.383 61.331 61.269 61.209 61.119 61.054 60.98 60.811 60.703 60.594 60.528 60.41 60.3 60.158 60.073 59.902 59.747 59.613 59.452 59.133 58.937 58.694 58.443 58.187 57.762 57.136 51.923 -5 ,5658 ,TETRA ,17555343,Fri Nov 26 00:24:47 CET,Fri Nov 26 02:44:40 CET,0.0 1.228 1.659 2.021 2.319 2.577 2.821 3.05 3.472 3.671 3.866 4.095 4.411 4.576 4.892 5.217 5.536 5.689 5.992 6.296 6.736 7.017 7.294 7.71 8.12 8.505 8.872 9.245 9.736 10.22 10.703 11.295 11.871 12.452 13.177 13.996 14.768 15.609 16.523 17.503 18.53 19.761 21.248 22.761 24.6 26.756 29.433 32.607 36.368 40.83 46.405 51.351 54.429 56.49 57.981 59.143 60.041 60.728 61.249 61.661 61.9 62.076 62.228 62.336 62.406 62.446 62.451 62.438 62.436 62.438 62.429 62.411 62.366 62.313 62.273 62.222 62.15 62.052 61.941 61.868 61.792 61.614 61.483 61.379 61.326 61.2 61.064 60.902 60.798 60.632 60.512 60.391 60.247 59.872 59.64 59.382 59.099 58.829 58.486 57.88 47.244 -6 ,30268 ,TETRA ,17555344,Fri Nov 26 00:24:45 CET,Fri Nov 26 02:44:21 CET,0.0 1.138 1.549 1.851 2.11 2.342 2.558 2.783 3.187 3.358 3.535 3.743 4.053 4.223 4.543 4.853 5.158 5.306 5.612 5.916 6.35 6.626 6.892 7.284 7.67 8.053 8.425 8.78 9.25 9.732 10.215 10.788 11.339 11.891 12.57 13.348 14.103 14.993 15.941 16.912 17.971 19.21 20.736 22.281 24.109 26.235 28.7 31.58 35.123 39.567 45.451 50.592 53.765 55.911 57.413 58.521 59.343 59.983 60.451 60.86 61.139 61.305 61.43 61.529 61.626 61.723 61.809 61.862 61.881 61.893 61.891 61.893 61.896 61.872 61.837 61.796 61.747 61.665 61.557 61.477 61.378 61.226 61.125 61.007 60.952 60.817 60.653 60.487 60.39 60.218 60.073 59.948 59.807 59.492 59.299 59.068 58.771 58.394 57.957 57.237 48.884 -7 ,13680 ,TETRA ,17555345,Fri Nov 26 00:25:47 CET,Fri Nov 26 02:47:45 CET,0.0 1.373 1.779 2.084 2.347 2.608 2.863 3.085 3.494 3.683 3.862 4.078 4.39 4.558 4.883 5.192 5.489 5.635 5.928 6.224 6.67 6.948 7.208 7.587 7.966 8.339 8.706 9.069 9.526 9.97 10.426 10.982 11.513 12.023 12.618 13.323 13.996 14.732 15.553 16.451 17.432 18.572 19.968 21.437 23.159 25.142 27.527 30.325 33.832 38.144 43.643 48.502 51.561 53.671 55.105 56.098 56.839 57.407 57.815 58.146 58.369 58.517 58.63 58.752 58.847 58.904 58.937 58.947 58.944 58.929 58.912 58.897 58.867 58.82 58.774 58.707 58.622 58.537 58.454 58.373 58.264 58.081 57.974 57.867 57.804 57.68 57.54 57.354 57.257 57.092 56.927 56.817 56.721 56.472 56.292 56.076 55.816 55.535 55.1 54.434 43.223 -8 ,16999 ,TETRA ,17555346,Fri Nov 26 00:27:52 CET,Fri Nov 26 02:46:51 CET,0.0 1.339 1.771 2.104 2.401 2.682 2.939 3.169 3.594 3.801 4.002 4.255 4.588 4.774 5.115 5.433 5.759 5.924 6.237 6.542 6.968 7.229 7.487 7.885 8.298 8.707 9.083 9.444 9.939 10.402 10.84 11.402 11.964 12.532 13.211 13.994 14.75 15.561 16.47 17.489 18.568 19.758 21.158 22.631 24.486 26.586 28.903 31.569 34.876 38.971 44.171 48.888 51.951 54.088 55.627 56.878 57.847 58.569 59.063 59.449 59.746 59.993 60.166 60.282 60.379 60.45 60.519 60.541 60.53 60.524 60.506 60.472 60.428 60.358 60.269 60.184 60.145 60.115 60.056 60.014 59.956 59.82 59.721 59.622 59.564 59.425 59.274 59.109 59.019 58.842 58.646 58.532 58.407 58.074 57.897 57.711 57.449 57.106 56.663 56.028 52.713 -9 ,25039 ,TETRA ,17555347,Fri Nov 26 00:27:53 CET,Fri Nov 26 02:47:07 CET,0.0 1.345 1.743 2.029 2.272 2.514 2.757 2.967 3.331 3.504 3.693 3.945 4.273 4.436 4.759 5.066 5.366 5.52 5.829 6.123 6.541 6.817 7.08 7.459 7.815 8.189 8.578 8.937 9.402 9.864 10.313 10.876 11.444 12.011 12.679 13.44 14.199 15.051 15.958 16.944 18.037 19.301 20.776 22.239 23.908 25.844 28.217 31.048 34.524 38.755 44.22 49.06 52.251 54.573 56.247 57.49 58.402 59.079 59.561 59.949 60.259 60.52 60.705 60.818 60.898 60.978 61.062 61.148 61.209 61.241 61.227 61.186 61.127 61.069 61.036 60.985 60.928 60.859 60.748 60.658 60.556 60.4 60.292 60.174 60.116 59.994 59.849 59.695 59.61 59.453 59.33 59.217 59.057 58.645 58.438 58.217 57.962 57.648 57.234 56.625 47.51 -10 ,6647 ,TETRA ,17555348,Fri Nov 26 00:27:51 CET,Fri Nov 26 02:50:19 CET,0.0 1.479 1.927 2.237 2.508 2.782 3.052 3.296 3.716 3.915 4.116 4.35 4.685 4.87 5.241 5.591 5.914 6.075 6.382 6.675 7.088 7.349 7.619 8.04 8.466 8.896 9.307 9.69 10.173 10.637 11.097 11.652 12.182 12.701 13.342 14.058 14.749 15.576 16.472 17.399 18.397 19.586 21.022 22.453 24.162 26.09 28.308 30.986 34.29 38.354 43.762 48.611 51.624 53.744 55.286 56.45 57.362 58.076 58.592 59.066 59.415 59.654 59.858 60.031 60.173 60.272 60.319 60.335 60.322 60.275 60.229 60.172 60.064 59.949 59.867 59.797 59.735 59.66 59.575 59.51 59.435 59.305 59.212 59.113 59.067 58.968 58.816 58.64 58.551 58.388 58.273 58.152 58.005 57.666 57.485 57.285 57.027 56.722 56.32 55.622 49.817 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt deleted file mode 100644 index 62a821f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23943 ,TETRA ,17555349,Fri Nov 26 00:27:54 CET,Fri Nov 26 02:55:27 CET,0.0 0.992 1.368 1.664 1.931 2.123 2.284 2.446 2.749 2.894 3.025 3.01 3.348 3.454 3.659 3.854 4.037 4.127 4.299 4.45 4.664 4.803 4.937 5.122 5.297 5.481 5.666 5.83 6.024 6.219 6.416 6.65 6.858 7.044 7.275 7.524 7.738 7.972 8.204 8.458 8.71 8.952 9.239 9.509 9.784 10.052 10.322 10.516 10.513 10.325 9.807 8.842 7.867 6.929 6.124 5.484 4.925 4.399 3.945 3.502 3.094 2.722 2.393 2.094 1.803 1.523 1.248 1.01 0.805 0.592 0.363 0.167 -0.03 -0.218 -0.364 -0.524 -0.687 -0.857 -1.033 -1.149 -1.272 -1.471 -1.609 -1.75 -1.818 -1.947 -2.098 -2.256 -2.336 -2.657 -2.593 -2.693 -2.79 -2.997 -3.129 -3.285 -3.449 -3.617 -3.803 -4.019 -4.755 -2 ,8252 ,TETRA ,17555350,Fri Nov 26 00:34:48 CET,Fri Nov 26 02:59:12 CET,0.0 1.648 2.054 2.37 2.658 2.9 3.116 3.324 3.724 3.895 4.034 4.057 4.408 4.531 4.772 5.007 5.233 5.332 5.514 5.694 5.949 6.105 6.24 6.407 6.569 6.723 6.874 7.022 7.21 7.382 7.55 7.752 7.943 8.121 8.306 8.527 8.732 8.926 9.132 9.354 9.572 9.79 10.063 10.322 10.58 10.829 11.013 11.156 11.252 11.141 10.587 9.734 8.884 8.065 7.337 6.697 6.159 5.694 5.293 4.878 4.518 4.176 3.862 3.573 3.283 3.039 2.798 2.575 2.373 2.153 1.934 1.751 1.551 1.355 1.202 1.037 0.876 0.715 0.542 0.425 0.312 0.134 0.0 -0.13 -0.194 -0.348 -0.517 -0.68 -0.766 -1.087 -0.994 -1.074 -1.161 -1.355 -1.465 -1.586 -1.705 -1.837 -2.012 -2.235 -2.93 -3 ,20110 ,TETRA ,17555351,Fri Nov 26 00:26:36 CET,Fri Nov 26 02:50:28 CET,0.0 1.082 1.484 1.775 2.026 2.253 2.468 2.677 3.025 3.182 3.33 3.38 3.756 3.886 4.112 4.321 4.527 4.629 4.837 5.035 5.314 5.505 5.687 5.938 6.18 6.42 6.628 6.809 7.037 7.246 7.431 7.652 7.883 8.095 8.315 8.565 8.806 9.045 9.29 9.545 9.793 10.052 10.353 10.658 10.962 11.22 11.46 11.65 11.744 11.697 11.126 10.142 9.361 8.636 7.98 7.344 6.781 6.265 5.801 5.344 4.955 4.613 4.282 3.969 3.701 3.455 3.187 2.945 2.728 2.514 2.294 2.107 1.909 1.7 1.546 1.383 1.213 1.035 0.857 0.742 0.617 0.428 0.302 0.158 0.083 -0.066 -0.222 -0.387 -0.475 -0.819 -0.779 -0.889 -1.003 -1.22 -1.346 -1.48 -1.622 -1.805 -2.045 -2.314 -3.127 -4 ,13550 ,TETRA ,17555352,Fri Nov 26 00:34:51 CET,Fri Nov 26 02:59:52 CET,0.0 0.817 1.155 1.384 1.566 1.718 1.855 1.984 2.225 2.341 2.442 2.417 2.747 2.826 3.002 3.168 3.318 3.385 3.524 3.659 3.824 3.948 4.077 4.249 4.404 4.544 4.679 4.807 4.965 5.126 5.281 5.474 5.659 5.805 5.978 6.18 6.367 6.577 6.791 7.01 7.226 7.435 7.638 7.865 8.118 8.345 8.608 8.847 8.956 8.924 8.549 7.792 7.082 6.397 5.737 5.109 4.505 3.927 3.438 2.944 2.502 2.104 1.738 1.4 1.081 0.801 0.517 0.272 0.048 -0.203 -0.456 -0.657 -0.868 -1.083 -1.256 -1.444 -1.63 -1.807 -1.977 -2.097 -2.232 -2.467 -2.624 -2.781 -2.865 -3.04 -3.218 -3.417 -3.518 -3.848 -3.804 -3.916 -4.044 -4.299 -4.423 -4.56 -4.748 -4.959 -5.2 -5.572 -7.005 -5 ,14735 ,TETRA ,17555353,Fri Nov 26 00:35:49 CET,Fri Nov 26 02:59:36 CET,0.0 1.259 1.683 1.964 2.189 2.376 2.533 2.695 2.985 3.121 3.259 3.25 3.579 3.676 3.866 4.055 4.24 4.324 4.489 4.646 4.851 4.981 5.113 5.304 5.49 5.667 5.844 6.02 6.242 6.449 6.636 6.867 7.09 7.281 7.492 7.717 7.934 8.183 8.438 8.691 8.959 9.269 9.59 9.884 10.189 10.441 10.676 10.89 11.025 11.015 10.622 9.858 9.082 8.28 7.558 6.94 6.416 5.963 5.576 5.179 4.831 4.516 4.215 3.916 3.622 3.359 3.096 2.858 2.652 2.453 2.242 2.061 1.877 1.693 1.553 1.403 1.241 1.078 0.907 0.787 0.669 0.487 0.348 0.198 0.121 -0.04 -0.186 -0.328 -0.408 -0.735 -0.665 -0.749 -0.839 -1.026 -1.139 -1.277 -1.428 -1.595 -1.804 -2.05 -2.832 -6 ,28274 ,TETRA ,17555354,Fri Nov 26 00:35:51 CET,Fri Nov 26 03:00:04 CET,0.0 0.927 1.188 1.427 1.612 1.752 1.885 2.017 2.3 2.431 2.559 2.539 2.855 2.923 3.055 3.208 3.388 3.47 3.606 3.736 3.903 4.014 4.123 4.27 4.416 4.547 4.672 4.797 4.951 5.102 5.249 5.422 5.585 5.732 5.891 6.072 6.242 6.437 6.644 6.844 7.065 7.276 7.498 7.701 7.903 8.132 8.333 8.427 8.35 8.035 7.273 6.16 5.138 4.214 3.329 2.524 1.856 1.26 0.772 0.292 -0.138 -0.515 -0.847 -1.172 -1.493 -1.78 -2.094 -2.378 -2.609 -2.837 -3.059 -3.251 -3.456 -3.655 -3.819 -3.99 -4.147 -4.308 -4.477 -4.593 -4.728 -4.96 -5.108 -5.245 -5.314 -5.456 -5.606 -5.768 -5.849 -6.177 -6.141 -6.243 -6.339 -6.572 -6.699 -6.846 -7.015 -7.166 -7.327 -7.549 -8.292 -7 ,21619 ,TETRA ,17555355,Fri Nov 26 00:35:54 CET,Fri Nov 26 03:00:34 CET,0.0 1.15 1.541 1.871 2.164 2.379 2.558 2.726 3.033 3.193 3.345 3.387 3.756 3.886 4.094 4.28 4.463 4.546 4.72 4.89 5.111 5.255 5.388 5.571 5.753 5.922 6.079 6.236 6.471 6.676 6.827 7.012 7.202 7.383 7.589 7.812 8.027 8.278 8.526 8.779 9.039 9.316 9.618 9.878 10.133 10.382 10.605 10.797 10.931 10.877 10.47 9.601 8.687 7.856 7.088 6.369 5.793 5.299 4.86 4.369 3.919 3.548 3.205 2.88 2.576 2.284 1.978 1.716 1.492 1.26 1.019 0.825 0.634 0.432 0.279 0.134 -0.033 -0.223 -0.409 -0.533 -0.661 -0.87 -1.023 -1.162 -1.232 -1.395 -1.559 -1.737 -1.838 -2.172 -2.127 -2.242 -2.359 -2.568 -2.683 -2.822 -2.963 -3.133 -3.338 -3.567 -4.408 -8 ,31182 ,TETRA ,17555356,Fri Nov 26 00:38:40 CET,Fri Nov 26 03:02:59 CET,0.0 1.002 1.422 1.742 2.018 2.267 2.479 2.654 2.962 3.11 3.256 3.293 3.644 3.756 3.97 4.169 4.359 4.46 4.676 4.875 5.143 5.329 5.511 5.765 6.01 6.233 6.445 6.656 6.924 7.18 7.428 7.744 8.04 8.329 8.682 9.077 9.425 9.706 9.957 10.214 10.455 10.722 11.02 11.295 11.603 11.916 12.231 12.519 12.685 12.573 12.094 11.403 10.64 9.81 9.078 8.441 7.85 7.311 6.86 6.397 6.029 5.726 5.424 5.133 4.847 4.582 4.318 4.074 3.833 3.561 3.265 3.015 2.764 2.5 2.288 2.081 1.876 1.653 1.429 1.274 1.117 0.89 0.718 0.544 0.451 0.234 0.022 -0.196 -0.309 -0.664 -0.683 -0.825 -0.968 -1.265 -1.418 -1.575 -1.761 -1.968 -2.205 -2.513 -3.891 -9 ,17188 ,TETRA ,17555357,Fri Nov 26 00:38:41 CET,Fri Nov 26 03:02:35 CET,0.0 1.071 1.4 1.621 1.792 1.973 2.144 2.272 2.496 2.604 2.706 2.668 2.99 3.068 3.216 3.365 3.518 3.585 3.711 3.84 4.038 4.163 4.277 4.428 4.562 4.689 4.812 4.932 5.082 5.215 5.344 5.505 5.657 5.789 5.932 6.106 6.273 6.446 6.644 6.838 7.012 7.205 7.413 7.605 7.806 8.024 8.271 8.467 8.572 8.468 7.945 7.07 6.209 5.395 4.607 3.937 3.399 2.895 2.439 1.987 1.621 1.295 0.993 0.719 0.443 0.188 -0.054 -0.266 -0.459 -0.68 -0.922 -1.111 -1.314 -1.525 -1.673 -1.831 -1.984 -2.14 -2.307 -2.417 -2.53 -2.719 -2.859 -3.006 -3.076 -3.2 -3.337 -3.491 -3.578 -3.918 -3.877 -3.981 -4.088 -4.319 -4.437 -4.556 -4.707 -4.873 -5.048 -5.305 -5.863 -10 ,3376 ,TETRA ,17555358,Fri Nov 26 00:48:06 CET,Fri Nov 26 02:58:21 CET,0.0 1.269 1.667 2.003 2.287 2.531 2.771 2.995 3.384 3.559 3.72 3.75 4.09 4.191 4.403 4.602 4.781 4.863 5.018 5.167 5.366 5.483 5.605 5.788 5.956 6.125 6.29 6.449 6.65 6.838 7.016 7.224 7.424 7.616 7.807 7.991 8.17 8.362 8.552 8.736 8.92 9.103 9.268 9.446 9.67 9.867 10.031 10.132 10.131 9.997 9.445 8.41 7.431 6.548 5.803 5.158 4.573 3.96 3.4 2.898 2.488 2.131 1.78 1.425 1.074 0.744 0.439 0.189 -0.024 -0.243 -0.477 -0.671 -0.855 -1.036 -1.187 -1.341 -1.49 -1.639 -1.799 -1.916 -2.031 -2.208 -2.336 -2.464 -2.528 -2.661 -2.807 -2.97 -3.052 -3.385 -3.326 -3.417 -3.501 -3.675 -3.779 -3.891 -4.011 -4.142 -4.3 -4.526 -5.053 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 94eb2d19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10951 ,TETRA ,17555359,Fri Nov 26 00:48:06 CET,Fri Nov 26 02:56:56 CET,0.0 0.311 0.477 0.59 0.674 0.755 0.838 0.913 1.043 1.11 1.17 1.035 1.317 1.37 1.484 1.598 1.69 1.723 1.789 1.855 1.947 2.003 2.063 2.142 2.208 2.279 2.348 2.414 2.498 2.581 2.664 2.752 2.839 2.935 3.05 3.176 3.274 3.388 3.51 3.616 3.747 3.899 4.032 4.147 4.273 4.408 4.492 4.524 4.514 4.4 4.092 3.371 2.6 1.864 1.179 0.54 -0.046 -0.59 -1.09 -1.606 -2.063 -2.503 -2.945 -3.329 -3.644 -3.939 -4.272 -4.615 -4.959 -5.318 -5.676 -5.972 -6.278 -6.577 -6.808 -7.05 -7.275 -7.5 -7.737 -7.903 -8.076 -8.342 -8.536 -8.733 -8.84 -9.059 -9.292 -9.6 -9.763 -10.154 -10.183 -10.34 -10.511 -10.921 -11.135 -11.331 -11.578 -11.889 -12.241 -12.736 -14.841 -2 ,22218 ,TETRA ,17555360,Fri Nov 26 00:38:40 CET,Fri Nov 26 03:02:35 CET,0.0 0.374 0.539 0.677 0.787 0.871 0.934 1.004 1.142 1.198 1.262 1.189 1.492 1.544 1.648 1.753 1.842 1.882 1.953 2.023 2.109 2.16 2.21 2.288 2.365 2.436 2.518 2.601 2.691 2.774 2.87 2.994 3.105 3.202 3.312 3.436 3.555 3.69 3.824 3.956 4.096 4.242 4.376 4.499 4.623 4.731 4.827 4.876 4.854 4.654 4.171 3.254 2.313 1.596 0.918 0.24 -0.335 -0.82 -1.254 -1.711 -2.156 -2.583 -2.956 -3.285 -3.608 -3.936 -4.281 -4.594 -4.846 -5.107 -5.385 -5.605 -5.853 -6.129 -6.342 -6.558 -6.766 -6.99 -7.239 -7.401 -7.567 -7.828 -7.999 -8.173 -8.272 -8.483 -8.729 -9.013 -9.153 -9.549 -9.595 -9.749 -9.91 -10.255 -10.45 -10.668 -10.938 -11.249 -11.61 -12.133 -13.75 -3 ,23739 ,TETRA ,17555361,Fri Nov 26 00:50:02 CET,Fri Nov 26 03:13:45 CET,0.0 0.364 0.543 0.694 0.808 0.911 1.02 1.127 1.304 1.383 1.464 1.39 1.698 1.772 1.917 2.059 2.182 2.241 2.362 2.474 2.65 2.762 2.863 3.016 3.166 3.313 3.429 3.512 3.61 3.715 3.818 3.926 4.034 4.144 4.268 4.427 4.57 4.687 4.798 4.927 5.084 5.257 5.446 5.613 5.757 5.894 6.054 6.191 6.273 6.236 5.885 5.161 4.321 3.549 2.889 2.272 1.729 1.207 0.693 0.183 -0.224 -0.593 -0.985 -1.397 -1.803 -2.175 -2.511 -2.821 -3.113 -3.401 -3.717 -3.991 -4.281 -4.573 -4.798 -5.065 -5.341 -5.601 -5.872 -6.067 -6.277 -6.613 -6.834 -7.063 -7.182 -7.42 -7.676 -7.934 -8.059 -8.434 -8.476 -8.638 -8.79 -9.154 -9.377 -9.62 -9.87 -10.145 -10.504 -10.93 -12.853 -4 ,3236 ,TETRA ,17555362,Fri Nov 26 00:50:02 CET,Fri Nov 26 02:58:34 CET,0.0 0.423 0.598 0.712 0.809 0.904 0.987 1.054 1.178 1.243 1.301 1.162 1.448 1.506 1.629 1.742 1.854 1.91 2.017 2.116 2.25 2.322 2.387 2.482 2.574 2.675 2.773 2.856 2.958 3.052 3.14 3.247 3.349 3.446 3.543 3.645 3.758 3.896 4.048 4.203 4.345 4.486 4.644 4.813 5.017 5.191 5.341 5.438 5.407 5.2 4.806 4.149 3.41 2.709 2.042 1.374 0.731 0.175 -0.264 -0.717 -1.117 -1.492 -1.849 -2.22 -2.577 -2.877 -3.207 -3.493 -3.733 -4.007 -4.292 -4.527 -4.775 -5.003 -5.179 -5.387 -5.603 -5.818 -6.043 -6.215 -6.4 -6.669 -6.863 -7.056 -7.155 -7.379 -7.612 -7.883 -8.039 -8.434 -8.495 -8.666 -8.842 -9.211 -9.42 -9.651 -9.891 -10.155 -10.571 -11.169 -13.071 -5 ,15404 ,TETRA ,17555363,Fri Nov 26 00:51:06 CET,Fri Nov 26 02:59:55 CET,0.0 0.297 0.463 0.6 0.712 0.808 0.906 1.0 1.187 1.278 1.36 1.26 1.541 1.597 1.71 1.793 1.854 1.889 1.966 2.031 2.116 2.173 2.228 2.321 2.435 2.553 2.677 2.801 2.959 3.126 3.288 3.455 3.601 3.722 3.846 3.98 4.097 4.215 4.309 4.408 4.53 4.647 4.78 4.937 5.106 5.247 5.341 5.385 5.339 5.079 4.409 3.413 2.53 1.594 0.664 -0.114 -0.765 -1.372 -1.932 -2.463 -2.985 -3.567 -4.146 -4.688 -5.176 -5.625 -6.088 -6.493 -6.862 -7.23 -7.597 -7.895 -8.195 -8.505 -8.734 -8.973 -9.235 -9.499 -9.776 -9.968 -10.15 -10.452 -10.696 -10.937 -11.043 -11.251 -11.476 -11.73 -11.863 -12.246 -12.262 -12.406 -12.573 -12.919 -13.103 -13.31 -13.536 -13.805 -14.122 -14.625 -16.54 -6 ,20362 ,TETRA ,17555364,Fri Nov 26 00:52:03 CET,Fri Nov 26 03:15:06 CET,0.0 0.343 0.516 0.675 0.779 0.877 0.962 1.031 1.171 1.231 1.283 1.166 1.463 1.523 1.638 1.732 1.81 1.855 1.948 2.029 2.138 2.208 2.273 2.359 2.442 2.523 2.641 2.779 2.944 3.107 3.265 3.438 3.563 3.666 3.793 3.942 4.078 4.227 4.376 4.514 4.649 4.805 4.993 5.166 5.341 5.539 5.725 5.805 5.804 5.679 5.259 4.503 3.733 3.026 2.374 1.755 1.176 0.668 0.156 -0.414 -0.845 -1.224 -1.609 -2.058 -2.509 -2.899 -3.305 -3.696 -4.045 -4.386 -4.735 -5.025 -5.316 -5.618 -5.863 -6.115 -6.385 -6.657 -6.915 -7.102 -7.307 -7.603 -7.806 -8.019 -8.122 -8.359 -8.622 -8.891 -9.043 -9.469 -9.55 -9.708 -9.906 -10.333 -10.543 -10.805 -11.114 -11.457 -11.82 -12.252 -13.758 -7 ,31755 ,TETRA ,17555365,Fri Nov 26 00:52:03 CET,Fri Nov 26 03:15:44 CET,0.0 0.336 0.518 0.666 0.778 0.885 0.984 1.066 1.222 1.29 1.358 1.246 1.541 1.587 1.696 1.801 1.894 1.933 2.01 2.089 2.196 2.267 2.334 2.459 2.587 2.678 2.765 2.846 2.94 3.039 3.124 3.235 3.375 3.49 3.592 3.717 3.843 3.98 4.12 4.25 4.388 4.525 4.676 4.833 4.972 5.104 5.214 5.256 5.246 5.099 4.627 3.908 3.194 2.491 1.842 1.222 0.674 0.169 -0.279 -0.739 -1.172 -1.565 -1.927 -2.308 -2.697 -3.048 -3.382 -3.683 -3.984 -4.307 -4.623 -4.901 -5.205 -5.522 -5.766 -5.988 -6.212 -6.472 -6.728 -6.891 -7.063 -7.316 -7.484 -7.675 -7.782 -7.99 -8.208 -8.468 -8.615 -9.007 -9.041 -9.198 -9.336 -9.617 -9.772 -9.942 -10.15 -10.412 -10.752 -11.245 -12.853 -8 ,32292 ,TETRA ,17555366,Fri Nov 26 00:52:03 CET,Fri Nov 26 03:00:29 CET,0.0 0.414 0.524 0.622 0.714 0.79 0.857 0.927 1.056 1.112 1.166 1.037 1.33 1.379 1.463 1.549 1.646 1.696 1.776 1.843 1.953 2.023 2.091 2.193 2.299 2.393 2.471 2.551 2.659 2.757 2.851 2.973 3.12 3.259 3.374 3.503 3.623 3.755 3.89 4.02 4.157 4.298 4.462 4.626 4.788 4.937 5.054 5.131 5.175 5.087 4.641 3.915 3.236 2.587 2.001 1.394 0.849 0.366 -0.078 -0.55 -0.986 -1.434 -1.901 -2.343 -2.774 -3.132 -3.475 -3.83 -4.145 -4.427 -4.701 -4.934 -5.175 -5.422 -5.631 -5.865 -6.112 -6.367 -6.624 -6.798 -6.979 -7.274 -7.484 -7.707 -7.818 -8.037 -8.264 -8.517 -8.665 -9.086 -9.19 -9.367 -9.56 -9.975 -10.198 -10.457 -10.758 -11.122 -11.528 -12.059 -13.848 -9 ,15821 ,TETRA ,17555367,Fri Nov 26 00:52:03 CET,Fri Nov 26 03:00:38 CET,0.0 0.32 0.47 0.596 0.686 0.78 0.869 0.944 1.095 1.172 1.241 1.123 1.411 1.463 1.56 1.659 1.745 1.788 1.87 1.944 2.048 2.108 2.169 2.264 2.357 2.439 2.51 2.587 2.698 2.805 2.911 3.028 3.125 3.222 3.333 3.459 3.583 3.711 3.842 3.961 4.094 4.263 4.431 4.572 4.727 4.878 5.022 5.121 5.099 4.924 4.44 3.692 2.82 1.976 1.255 0.506 -0.232 -0.91 -1.461 -1.984 -2.491 -2.976 -3.4 -3.774 -4.114 -4.421 -4.736 -5.037 -5.298 -5.579 -5.911 -6.191 -6.449 -6.689 -6.878 -7.104 -7.364 -7.614 -7.856 -8.029 -8.2 -8.463 -8.655 -8.866 -8.984 -9.217 -9.47 -9.711 -9.819 -10.198 -10.263 -10.438 -10.635 -11.046 -11.273 -11.511 -11.749 -12.037 -12.41 -12.895 -14.388 -10 ,31718 ,TETRA ,17555368,Fri Nov 26 00:53:03 CET,Fri Nov 26 03:17:29 CET,0.0 0.307 0.463 0.616 0.738 0.835 0.922 1.005 1.151 1.217 1.285 1.17 1.464 1.518 1.617 1.708 1.791 1.834 1.922 2.006 2.129 2.205 2.274 2.377 2.483 2.581 2.668 2.742 2.826 2.908 2.985 3.088 3.192 3.293 3.412 3.544 3.656 3.774 3.903 4.027 4.125 4.212 4.3 4.384 4.497 4.614 4.705 4.715 4.593 4.293 3.44 2.189 1.176 0.303 -0.5 -1.262 -1.945 -2.591 -3.182 -3.742 -4.181 -4.582 -4.95 -5.324 -5.743 -6.117 -6.496 -6.866 -7.18 -7.496 -7.811 -8.04 -8.278 -8.561 -8.806 -9.053 -9.308 -9.593 -9.863 -10.039 -10.236 -10.552 -10.778 -11.019 -11.138 -11.361 -11.599 -11.88 -12.03 -12.428 -12.474 -12.643 -12.823 -13.217 -13.446 -13.696 -13.996 -14.328 -14.694 -15.225 -16.809 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 46578b13..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1028 ,TETRA ,17555369,Fri Nov 26 00:53:03 CET,Fri Nov 26 03:19:42 CET,0.0 0.753 1.086 1.378 1.649 1.857 2.045 2.219 2.52 2.65 2.767 2.756 3.096 3.199 3.382 3.555 3.718 3.803 3.962 4.103 4.305 4.443 4.578 4.779 4.996 5.187 5.363 5.531 5.727 5.9 6.057 6.247 6.433 6.607 6.809 7.041 7.309 7.623 7.88 8.105 8.368 8.661 8.971 9.291 9.649 10.014 10.354 10.626 10.814 10.881 10.756 10.172 9.515 8.926 8.37 7.864 7.396 6.973 6.6 6.216 5.892 5.594 5.312 5.045 4.807 4.591 4.357 4.146 3.962 3.771 3.569 3.416 3.264 3.097 2.978 2.854 2.716 2.571 2.415 2.315 2.209 2.03 1.912 1.789 1.723 1.585 1.436 1.27 1.182 0.864 0.946 0.86 0.767 0.57 0.465 0.354 0.217 0.06 -0.111 -0.316 -0.725 -2 ,3201 ,TETRA ,17555370,Fri Nov 26 00:54:03 CET,Fri Nov 26 03:06:43 CET,0.0 1.223 1.549 1.802 2.038 2.253 2.435 2.602 2.91 3.052 3.189 3.196 3.549 3.663 3.873 4.065 4.238 4.324 4.484 4.628 4.847 4.996 5.152 5.361 5.546 5.723 5.884 6.054 6.264 6.447 6.647 6.944 7.257 7.541 7.817 8.081 8.305 8.549 8.803 9.047 9.286 9.551 9.858 10.138 10.447 10.767 11.107 11.38 11.546 11.498 11.092 10.323 9.532 8.785 8.12 7.524 6.992 6.529 6.107 5.571 5.081 4.656 4.225 3.88 3.637 3.418 3.179 2.965 2.78 2.579 2.362 2.17 1.979 1.802 1.68 1.56 1.429 1.284 1.126 1.021 0.919 0.767 0.652 0.525 0.463 0.356 0.245 0.12 0.054 -0.26 -0.181 -0.267 -0.354 -0.52 -0.61 -0.715 -0.83 -0.97 -1.13 -1.314 -1.726 -3 ,26580 ,TETRA ,17555371,Fri Nov 26 00:55:03 CET,Fri Nov 26 03:19:45 CET,0.0 1.11 1.489 1.762 1.997 2.213 2.413 2.608 2.959 3.106 3.244 3.261 3.62 3.749 3.988 4.191 4.369 4.453 4.621 4.785 5.022 5.171 5.311 5.526 5.738 5.918 6.082 6.254 6.47 6.667 6.873 7.127 7.349 7.547 7.782 8.04 8.283 8.54 8.822 9.118 9.399 9.699 10.018 10.308 10.649 11.001 11.343 11.717 12.072 12.214 11.947 11.291 10.677 10.093 9.484 8.895 8.387 7.971 7.597 7.185 6.846 6.545 6.24 5.962 5.716 5.495 5.268 5.062 4.873 4.678 4.485 4.324 4.149 3.954 3.811 3.667 3.512 3.362 3.205 3.093 2.978 2.799 2.67 2.54 2.477 2.353 2.212 2.059 1.988 1.68 1.77 1.686 1.596 1.408 1.292 1.168 1.044 0.894 0.705 0.503 0.026 -4 ,31144 ,TETRA ,17555372,Fri Nov 26 00:54:03 CET,Fri Nov 26 03:19:37 CET,0.0 1.096 1.53 1.868 2.156 2.399 2.633 2.854 3.247 3.42 3.56 3.549 3.892 3.998 4.204 4.399 4.594 4.682 4.836 4.982 5.191 5.321 5.448 5.619 5.797 5.983 6.155 6.323 6.53 6.721 6.917 7.148 7.361 7.571 7.819 8.084 8.32 8.578 8.848 9.14 9.437 9.77 10.146 10.478 10.83 11.164 11.503 11.821 12.121 12.308 12.156 11.599 10.979 10.377 9.832 9.318 8.847 8.418 8.033 7.67 7.38 7.102 6.844 6.614 6.379 6.164 5.955 5.755 5.578 5.393 5.202 5.054 4.889 4.723 4.607 4.474 4.307 4.125 3.944 3.812 3.673 3.453 3.3 3.154 3.078 2.914 2.744 2.571 2.485 2.157 2.192 2.093 1.999 1.783 1.648 1.508 1.378 1.239 1.066 0.827 0.072 -5 ,9457 ,TETRA ,17555373,Fri Nov 26 00:56:01 CET,Fri Nov 26 03:20:57 CET,0.0 1.024 1.371 1.563 1.791 2.015 2.232 2.44 2.761 2.906 3.047 3.098 3.464 3.597 3.849 4.053 4.233 4.324 4.504 4.674 4.914 5.067 5.21 5.413 5.61 5.793 5.971 6.147 6.379 6.604 6.812 7.065 7.292 7.505 7.756 8.032 8.291 8.556 8.845 9.114 9.368 9.674 10.027 10.379 10.768 11.15 11.504 11.882 12.24 12.39 12.166 11.588 10.986 10.381 9.81 9.245 8.759 8.341 7.973 7.587 7.251 6.964 6.712 6.473 6.248 6.044 5.822 5.63 5.463 5.28 5.087 4.926 4.762 4.599 4.48 4.353 4.213 4.057 3.887 3.773 3.655 3.484 3.38 3.271 3.216 3.096 2.958 2.807 2.727 2.406 2.479 2.378 2.253 1.958 1.795 1.647 1.51 1.367 1.164 0.929 0.502 -6 ,18262 ,TETRA ,17555374,Fri Nov 26 00:57:03 CET,Fri Nov 26 03:07:12 CET,0.0 1.267 1.709 1.995 2.232 2.48 2.716 2.904 3.253 3.413 3.557 3.587 3.943 4.059 4.264 4.466 4.662 4.758 4.939 5.099 5.318 5.452 5.578 5.756 5.938 6.112 6.271 6.421 6.617 6.827 7.03 7.26 7.483 7.691 7.926 8.192 8.442 8.707 8.981 9.262 9.534 9.812 10.136 10.466 10.826 11.176 11.496 11.725 11.855 11.799 11.433 10.642 9.795 9.067 8.442 7.897 7.386 6.901 6.5 6.114 5.792 5.502 5.204 4.936 4.701 4.469 4.221 4.007 3.822 3.628 3.42 3.242 3.056 2.857 2.685 2.498 2.303 2.101 1.899 1.78 1.674 1.506 1.385 1.264 1.202 1.058 0.894 0.724 0.645 0.335 0.408 0.329 0.247 0.074 -0.018 -0.117 -0.218 -0.333 -0.472 -0.673 -1.054 -7 ,12206 ,TETRA ,17555375,Fri Nov 26 00:58:02 CET,Fri Nov 26 03:26:29 CET,0.0 0.822 1.149 1.382 1.59 1.768 1.94 2.1 2.376 2.513 2.645 2.657 3.006 3.112 3.324 3.529 3.698 3.776 3.939 4.095 4.313 4.454 4.586 4.784 4.998 5.203 5.384 5.555 5.763 5.964 6.158 6.374 6.566 6.748 6.98 7.258 7.503 7.758 8.025 8.284 8.573 8.885 9.219 9.549 9.902 10.275 10.667 11.023 11.262 11.284 10.809 9.854 8.987 8.253 7.619 7.027 6.518 6.071 5.678 5.301 4.956 4.63 4.34 4.064 3.799 3.567 3.33 3.115 2.919 2.72 2.523 2.341 2.159 2.002 1.886 1.752 1.609 1.462 1.306 1.201 1.098 0.933 0.813 0.698 0.639 0.513 0.392 0.273 0.207 -0.098 -0.011 -0.101 -0.201 -0.41 -0.518 -0.63 -0.736 -0.897 -1.143 -1.397 -1.852 -8 ,9703 ,TETRA ,17555376,Fri Nov 26 00:58:02 CET,Fri Nov 26 03:09:00 CET,0.0 1.517 2.016 2.374 2.671 2.899 3.089 3.284 3.663 3.835 4.006 4.084 4.468 4.61 4.898 5.176 5.414 5.515 5.699 5.863 6.084 6.238 6.385 6.566 6.735 6.914 7.087 7.257 7.476 7.669 7.853 8.064 8.255 8.436 8.644 8.872 9.08 9.289 9.522 9.789 10.056 10.329 10.613 10.885 11.167 11.444 11.736 12.01 12.257 12.362 12.125 11.534 10.832 10.078 9.374 8.729 8.15 7.641 7.233 6.821 6.473 6.158 5.853 5.57 5.308 5.065 4.808 4.588 4.4 4.212 4.016 3.847 3.682 3.515 3.385 3.247 3.103 2.951 2.796 2.685 2.554 2.362 2.23 2.092 2.024 1.884 1.747 1.611 1.531 1.213 1.301 1.214 1.113 0.899 0.779 0.652 0.548 0.404 0.212 0.049 -0.386 -9 ,25269 ,TETRA ,17555377,Fri Nov 26 01:02:02 CET,Fri Nov 26 03:30:07 CET,0.0 0.86 1.233 1.512 1.744 1.967 2.17 2.349 2.644 2.781 2.917 2.914 3.262 3.379 3.591 3.778 3.95 4.03 4.183 4.325 4.545 4.695 4.837 5.032 5.219 5.395 5.556 5.708 5.899 6.087 6.288 6.543 6.779 7.01 7.271 7.536 7.775 8.02 8.281 8.546 8.816 9.145 9.516 9.855 10.212 10.577 10.949 11.262 11.485 11.456 11.006 10.191 9.403 8.718 8.125 7.619 7.141 6.676 6.273 5.851 5.514 5.235 4.962 4.706 4.462 4.232 3.997 3.787 3.599 3.412 3.233 3.073 2.911 2.764 2.643 2.517 2.385 2.252 2.114 2.017 1.917 1.746 1.628 1.515 1.46 1.346 1.214 1.063 0.984 0.677 0.769 0.682 0.597 0.43 0.327 0.214 0.104 -0.019 -0.181 -0.397 -1.207 -10 ,11354 ,TETRA ,17555378,Fri Nov 26 01:02:01 CET,Fri Nov 26 03:27:10 CET,0.0 0.914 1.244 1.494 1.737 1.954 2.134 2.298 2.624 2.778 2.92 2.927 3.266 3.373 3.572 3.77 3.967 4.064 4.254 4.436 4.689 4.838 4.99 5.218 5.434 5.633 5.814 5.994 6.23 6.443 6.623 6.826 7.019 7.197 7.392 7.597 7.781 7.975 8.177 8.38 8.588 8.828 9.12 9.404 9.687 9.928 10.133 10.257 10.32 10.29 9.873 9.053 8.288 7.622 7.061 6.563 6.102 5.66 5.29 4.936 4.609 4.323 4.069 3.823 3.601 3.404 3.186 2.992 2.825 2.644 2.444 2.268 2.096 1.936 1.82 1.703 1.574 1.435 1.296 1.204 1.11 0.96 0.855 0.747 0.69 0.575 0.458 0.337 0.273 -0.033 0.02 -0.102 -0.225 -0.454 -0.58 -0.723 -0.884 -1.089 -1.325 -1.581 -2.07 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt deleted file mode 100644 index 8f477544..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8823 ,TETRA ,17555379,Fri Nov 26 01:02:04 CET,Fri Nov 26 03:30:30 CET,0.0 0.395 0.694 0.901 1.044 1.151 1.265 1.383 1.579 1.662 1.738 1.639 1.956 2.033 2.179 2.307 2.432 2.494 2.61 2.728 2.906 3.0 3.089 3.228 3.354 3.467 3.584 3.705 3.853 3.993 4.125 4.287 4.456 4.617 4.797 5.004 5.19 5.378 5.573 5.779 5.999 6.211 6.447 6.724 7.002 7.248 7.507 7.789 8.072 8.229 8.16 7.711 7.174 6.649 6.119 5.59 5.107 4.633 4.232 3.845 3.488 3.171 2.866 2.582 2.276 1.934 1.557 1.218 0.915 0.608 0.298 0.038 -0.226 -0.498 -0.705 -0.924 -1.15 -1.372 -1.611 -1.778 -1.937 -2.187 -2.375 -2.571 -2.677 -2.886 -3.087 -3.294 -3.399 -3.752 -3.757 -3.891 -4.03 -4.331 -4.481 -4.653 -4.87 -5.102 -5.383 -5.728 -6.722 -2 ,4264 ,TETRA ,17555380,Fri Nov 26 01:03:02 CET,Fri Nov 26 03:31:43 CET,0.0 0.441 0.657 0.832 1.003 1.175 1.308 1.408 1.604 1.696 1.776 1.687 1.995 2.059 2.182 2.303 2.416 2.469 2.583 2.7 2.856 2.948 3.045 3.205 3.349 3.468 3.58 3.711 3.926 4.14 4.314 4.493 4.649 4.799 4.971 5.156 5.335 5.527 5.723 5.926 6.141 6.4 6.717 7.012 7.311 7.611 7.93 8.203 8.426 8.577 8.532 8.129 7.625 7.139 6.655 6.201 5.803 5.452 5.129 4.791 4.484 4.186 3.891 3.6 3.337 3.107 2.845 2.611 2.429 2.239 2.046 1.885 1.711 1.535 1.394 1.249 1.103 0.951 0.799 0.69 0.567 0.376 0.254 0.121 0.049 -0.087 -0.24 -0.42 -0.51 -0.834 -0.753 -0.84 -0.933 -1.171 -1.307 -1.423 -1.533 -1.682 -1.871 -2.163 -2.815 -3 ,32000 ,TETRA ,17555381,Fri Nov 26 01:03:04 CET,Fri Nov 26 03:30:56 CET,0.0 0.523 0.786 0.942 1.046 1.148 1.234 1.33 1.533 1.623 1.709 1.636 1.952 2.026 2.162 2.286 2.417 2.481 2.595 2.703 2.853 2.956 3.059 3.2 3.333 3.46 3.578 3.69 3.836 3.978 4.111 4.263 4.4 4.53 4.718 4.946 5.152 5.366 5.569 5.765 5.963 6.189 6.467 6.743 7.014 7.278 7.582 7.905 8.201 8.395 8.408 8.118 7.672 7.199 6.739 6.282 5.874 5.497 5.159 4.825 4.528 4.25 3.991 3.755 3.551 3.361 3.155 2.957 2.776 2.588 2.385 2.217 2.047 1.865 1.704 1.553 1.412 1.222 1.001 0.865 0.727 0.511 0.36 0.193 0.108 -0.057 -0.238 -0.435 -0.533 -0.873 -0.869 -0.987 -1.095 -1.32 -1.454 -1.607 -1.769 -1.971 -2.222 -2.504 -3.225 -4 ,8660 ,TETRA ,17555382,Fri Nov 26 01:03:02 CET,Fri Nov 26 03:33:09 CET,0.0 0.628 0.906 1.099 1.225 1.354 1.471 1.563 1.722 1.798 1.878 1.795 2.101 2.168 2.293 2.41 2.524 2.575 2.666 2.761 2.908 3.001 3.096 3.243 3.385 3.501 3.6 3.704 3.854 4.005 4.14 4.29 4.429 4.573 4.752 4.948 5.131 5.319 5.525 5.763 5.997 6.239 6.518 6.773 7.052 7.349 7.669 7.966 8.246 8.478 8.439 8.068 7.621 7.111 6.609 6.188 5.816 5.43 5.094 4.77 4.472 4.205 3.954 3.722 3.509 3.287 3.059 2.865 2.685 2.518 2.344 2.189 2.021 1.84 1.7 1.55 1.398 1.251 1.101 0.987 0.862 0.681 0.551 0.426 0.359 0.215 0.076 -0.087 -0.171 -0.493 -0.434 -0.532 -0.642 -0.898 -1.043 -1.191 -1.338 -1.537 -1.76 -2.011 -2.948 -5 ,30377 ,TETRA ,17555383,Fri Nov 26 01:03:04 CET,Fri Nov 26 03:32:38 CET,0.0 0.265 0.411 0.552 0.66 0.76 0.852 0.957 1.175 1.265 1.347 1.255 1.561 1.63 1.774 1.913 2.031 2.082 2.186 2.299 2.468 2.568 2.658 2.789 2.914 3.046 3.177 3.288 3.429 3.562 3.683 3.833 3.986 4.132 4.294 4.484 4.671 4.867 5.072 5.295 5.528 5.776 6.053 6.324 6.606 6.877 7.169 7.468 7.729 7.878 7.816 7.407 6.859 6.336 5.844 5.378 4.972 4.58 4.233 3.876 3.559 3.238 2.903 2.613 2.37 2.174 1.961 1.768 1.604 1.429 1.252 1.093 0.91 0.736 0.611 0.473 0.333 0.197 0.043 -0.08 -0.205 -0.383 -0.511 -0.652 -0.72 -0.855 -1.011 -1.185 -1.282 -1.619 -1.589 -1.692 -1.795 -2.018 -2.139 -2.271 -2.415 -2.583 -2.776 -3.066 -4.191 -6 ,18180 ,TETRA ,17555384,Fri Nov 26 00:41:14 CET,Fri Nov 26 03:11:43 CET,0.0 0.581 0.807 0.956 1.078 1.197 1.295 1.39 1.584 1.67 1.746 1.646 1.952 2.021 2.166 2.288 2.385 2.438 2.544 2.647 2.8 2.907 3.012 3.159 3.288 3.408 3.525 3.64 3.793 3.936 4.077 4.248 4.408 4.551 4.719 4.916 5.102 5.303 5.501 5.703 5.909 6.14 6.407 6.665 6.954 7.242 7.557 7.919 8.273 8.515 8.481 8.076 7.574 7.094 6.595 6.081 5.637 5.211 4.822 4.43 4.085 3.775 3.482 3.203 2.941 2.71 2.479 2.258 2.061 1.853 1.643 1.472 1.283 1.096 0.95 0.795 0.651 0.508 0.339 0.224 0.11 -0.082 -0.214 -0.338 -0.403 -0.547 -0.701 -0.858 -0.945 -1.291 -1.267 -1.37 -1.485 -1.8 -1.968 -2.122 -2.268 -2.493 -2.787 -3.108 -4.458 -7 ,28470 ,TETRA ,17555385,Fri Nov 26 00:41:16 CET,Fri Nov 26 03:10:08 CET,0.0 0.332 0.515 0.652 0.771 0.916 1.053 1.146 1.311 1.4 1.482 1.405 1.721 1.796 1.935 2.068 2.18 2.24 2.355 2.46 2.614 2.708 2.799 2.929 3.047 3.171 3.295 3.398 3.536 3.673 3.81 3.97 4.114 4.259 4.422 4.604 4.781 4.98 5.194 5.427 5.669 5.97 6.412 6.837 7.197 7.506 7.826 8.17 8.474 8.651 8.671 8.381 7.919 7.382 6.891 6.46 6.056 5.673 5.33 4.972 4.663 4.393 4.13 3.874 3.632 3.406 3.187 2.991 2.805 2.605 2.403 2.242 2.064 1.87 1.722 1.531 1.303 1.067 0.828 0.678 0.518 0.255 0.077 -0.104 -0.199 -0.39 -0.598 -0.838 -0.964 -1.328 -1.348 -1.489 -1.63 -1.935 -2.119 -2.304 -2.476 -2.638 -2.811 -3.078 -3.858 -8 ,12658 ,TETRA ,17555386,Fri Nov 26 00:42:16 CET,Fri Nov 26 03:11:12 CET,0.0 0.341 0.581 0.75 0.885 1.001 1.115 1.224 1.412 1.496 1.585 1.508 1.818 1.883 2.008 2.133 2.255 2.312 2.419 2.531 2.708 2.807 2.89 3.017 3.15 3.273 3.4 3.529 3.68 3.832 3.962 4.115 4.277 4.433 4.616 4.824 5.019 5.221 5.433 5.643 5.84 6.05 6.295 6.534 6.82 7.125 7.438 7.758 8.009 8.135 8.061 7.625 7.067 6.538 6.03 5.537 5.08 4.655 4.265 3.861 3.528 3.223 2.922 2.614 2.353 2.129 1.86 1.617 1.418 1.229 1.008 0.8 0.596 0.352 0.136 -0.083 -0.3 -0.507 -0.726 -0.878 -1.031 -1.234 -1.347 -1.466 -1.53 -1.682 -1.841 -2.014 -2.115 -2.464 -2.448 -2.576 -2.699 -2.91 -3.033 -3.186 -3.337 -3.514 -3.764 -4.007 -4.857 -9 ,22124 ,TETRA ,17555387,Fri Nov 26 00:42:17 CET,Fri Nov 26 03:13:46 CET,0.0 0.257 0.403 0.542 0.67 0.772 0.857 0.942 1.095 1.17 1.248 1.137 1.44 1.507 1.637 1.78 1.915 1.977 2.089 2.195 2.345 2.446 2.554 2.707 2.843 2.967 3.089 3.205 3.351 3.489 3.626 3.793 3.957 4.116 4.292 4.47 4.633 4.82 5.016 5.214 5.402 5.603 5.852 6.114 6.387 6.66 6.944 7.183 7.398 7.544 7.416 7.008 6.528 5.98 5.448 4.978 4.523 4.067 3.665 3.278 2.96 2.663 2.357 2.073 1.821 1.6 1.349 1.103 0.909 0.697 0.461 0.268 0.087 -0.092 -0.239 -0.391 -0.549 -0.718 -0.895 -1.017 -1.138 -1.323 -1.446 -1.571 -1.638 -1.786 -1.95 -2.121 -2.207 -2.542 -2.5 -2.603 -2.716 -2.994 -3.157 -3.33 -3.536 -3.759 -3.997 -4.372 -5.299 -10 ,12540 ,TETRA ,17555388,Fri Nov 26 00:43:20 CET,Fri Nov 26 03:12:20 CET,0.0 0.467 0.572 0.665 0.772 0.876 0.966 1.054 1.231 1.313 1.382 1.308 1.632 1.716 1.9 2.066 2.227 2.308 2.456 2.6 2.785 2.876 2.965 3.098 3.219 3.342 3.466 3.586 3.738 3.885 4.02 4.175 4.322 4.463 4.622 4.833 5.079 5.376 5.724 6.08 6.423 6.747 7.089 7.42 7.753 8.11 8.633 9.171 9.518 9.74 9.756 9.416 8.928 8.392 7.874 7.414 6.979 6.585 6.234 5.856 5.549 5.271 4.999 4.753 4.512 4.272 4.031 3.83 3.649 3.455 3.243 3.078 2.913 2.725 2.57 2.416 2.258 2.09 1.917 1.791 1.661 1.463 1.335 1.199 1.129 0.992 0.861 0.718 0.63 0.301 0.362 0.27 0.162 -0.089 -0.234 -0.391 -0.562 -0.747 -0.962 -1.264 -2.113 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 688ec1bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2418 ,KEBNE ,17069364,Fri Dec 24 01:46:12 CET,Fri Dec 24 03:37:24 CET,0.0 0.369 0.544 0.658 0.763 0.87 0.973 1.068 1.253 1.344 1.427 1.348 1.662 1.736 1.875 2.011 2.136 2.189 2.291 2.4 2.565 2.669 2.774 2.914 3.049 3.175 3.284 3.394 3.538 3.67 3.8 3.968 4.129 4.279 4.464 4.677 4.874 5.085 5.302 5.524 5.749 5.994 6.284 6.579 6.899 7.234 7.617 8.034 8.533 9.041 9.39 9.36 9.084 8.699 8.289 7.875 7.456 7.056 6.704 6.346 6.006 5.68 5.364 5.056 4.77 4.514 4.23 3.97 3.742 3.489 3.222 2.996 2.769 2.551 2.371 2.172 1.953 1.722 1.487 1.329 1.17 0.919 0.751 0.568 0.461 0.235 0.016 -0.223 -0.351 -0.72 -0.797 -0.971 -1.144 -1.514 -1.721 -1.953 -2.246 -2.599 -3.044 -3.633 -5.398 -2 ,21682 ,KEBNE ,17069365,Fri Dec 24 01:46:12 CET,Fri Dec 24 03:40:06 CET,0.0 0.543 0.781 0.965 1.147 1.319 1.45 1.571 1.812 1.92 2.02 1.982 2.321 2.426 2.622 2.792 2.946 3.024 3.188 3.329 3.528 3.671 3.81 4.004 4.199 4.363 4.487 4.613 4.775 4.91 5.038 5.199 5.351 5.506 5.705 5.928 6.132 6.334 6.54 6.784 7.061 7.343 7.651 7.977 8.348 8.734 9.162 9.657 10.231 10.71 10.893 10.701 10.288 9.8 9.327 8.841 8.387 7.952 7.548 7.122 6.761 6.437 6.119 5.824 5.536 5.265 4.975 4.698 4.452 4.151 3.791 3.486 3.171 2.829 2.553 2.318 2.119 1.909 1.691 1.534 1.363 1.108 0.932 0.74 0.637 0.426 0.183 -0.081 -0.208 -0.586 -0.695 -0.886 -1.097 -1.544 -1.787 -2.056 -2.329 -2.649 -3.093 -3.715 -5.42 -3 ,26406 ,KEBNE ,17069366,Fri Dec 24 02:02:11 CET,Fri Dec 24 03:53:28 CET,0.0 0.609 0.922 1.163 1.368 1.535 1.687 1.838 2.093 2.211 2.321 2.275 2.615 2.71 2.877 3.044 3.213 3.294 3.442 3.59 3.812 3.954 4.092 4.289 4.48 4.66 4.825 4.986 5.193 5.371 5.525 5.696 5.86 6.017 6.192 6.396 6.582 6.773 6.981 7.202 7.435 7.692 7.987 8.273 8.622 9.019 9.388 9.778 10.214 10.545 10.782 10.756 10.444 10.003 9.495 8.978 8.518 8.062 7.638 7.182 6.776 6.429 6.092 5.766 5.468 5.216 4.945 4.684 4.447 4.204 3.95 3.723 3.495 3.27 3.089 2.893 2.7 2.499 2.279 2.125 1.955 1.683 1.503 1.313 1.209 0.992 0.76 0.509 0.388 0.015 -0.085 -0.265 -0.465 -0.878 -1.094 -1.334 -1.631 -1.982 -2.37 -2.888 -4.935 -4 ,12008 ,KEBNE ,17069367,Fri Dec 24 02:06:28 CET,Fri Dec 24 03:58:59 CET,0.0 0.362 0.522 0.663 0.784 0.921 1.054 1.15 1.325 1.412 1.498 1.444 1.761 1.837 1.987 2.122 2.242 2.296 2.404 2.505 2.637 2.719 2.803 2.928 3.04 3.153 3.273 3.384 3.536 3.687 3.823 3.97 4.113 4.257 4.417 4.603 4.783 4.988 5.222 5.438 5.655 5.919 6.221 6.518 6.842 7.197 7.601 8.066 8.502 8.782 8.837 8.563 8.191 7.77 7.365 6.966 6.539 6.091 5.662 5.258 4.959 4.686 4.405 4.118 3.815 3.534 3.25 3.012 2.803 2.556 2.293 2.08 1.862 1.638 1.452 1.262 1.052 0.827 0.597 0.435 0.266 -0.001 -0.192 -0.392 -0.489 -0.705 -0.958 -1.255 -1.414 -1.807 -1.917 -2.112 -2.341 -2.839 -3.098 -3.373 -3.672 -4.036 -4.481 -5.039 -7.349 -5 ,25060 ,KEBNE ,17069368,Fri Dec 24 02:08:33 CET,Fri Dec 24 04:01:14 CET,0.0 0.813 1.091 1.308 1.456 1.575 1.679 1.767 1.93 2.015 2.088 1.993 2.294 2.357 2.477 2.584 2.7 2.757 2.856 2.95 3.076 3.158 3.253 3.391 3.52 3.65 3.766 3.879 4.033 4.186 4.328 4.489 4.653 4.821 5.012 5.222 5.423 5.637 5.863 6.112 6.365 6.6 6.849 7.135 7.474 7.799 8.162 8.574 8.956 9.178 9.198 8.962 8.644 8.279 7.909 7.539 7.141 6.75 6.38 5.973 5.621 5.314 5.023 4.721 4.432 4.17 3.898 3.628 3.346 3.043 2.745 2.529 2.33 2.118 1.939 1.75 1.57 1.384 1.2 1.065 0.912 0.679 0.519 0.362 0.277 0.072 -0.148 -0.348 -0.447 -0.793 -0.802 -0.935 -1.07 -1.389 -1.56 -1.736 -1.959 -2.238 -2.61 -3.055 -4.38 -6 ,23365 ,KEBNE ,17069369,Fri Dec 24 02:07:31 CET,Fri Dec 24 04:01:24 CET,0.0 0.458 0.637 0.817 0.979 1.112 1.245 1.38 1.604 1.703 1.802 1.753 2.091 2.19 2.373 2.538 2.687 2.764 2.917 3.058 3.281 3.434 3.571 3.765 3.926 4.042 4.156 4.269 4.409 4.533 4.656 4.808 4.947 5.088 5.26 5.449 5.622 5.809 6.028 6.269 6.515 6.778 7.097 7.413 7.753 8.129 8.534 8.954 9.351 9.682 9.87 9.624 9.187 8.69 8.153 7.648 7.235 6.852 6.496 6.129 5.794 5.471 5.073 4.629 4.228 3.869 3.497 3.147 2.82 2.487 2.14 1.858 1.575 1.271 1.039 0.798 0.548 0.293 0.038 -0.14 -0.331 -0.616 -0.819 -1.045 -1.164 -1.4 -1.639 -1.898 -2.026 -2.378 -2.382 -2.547 -2.738 -3.151 -3.394 -3.65 -3.938 -4.271 -4.639 -5.238 -7.437 -7 ,17682 ,KEBNE ,17069370,Fri Dec 24 02:07:30 CET,Fri Dec 24 04:00:53 CET,0.0 0.372 0.562 0.724 0.867 0.986 1.096 1.197 1.406 1.519 1.626 1.562 1.883 1.948 2.062 2.172 2.283 2.337 2.437 2.53 2.656 2.731 2.806 2.93 3.049 3.161 3.275 3.386 3.524 3.652 3.773 3.922 4.072 4.226 4.421 4.634 4.818 5.019 5.219 5.418 5.642 5.892 6.207 6.506 6.786 7.052 7.345 7.695 8.08 8.426 8.539 8.169 7.592 6.994 6.404 5.878 5.446 5.041 4.689 4.338 4.007 3.714 3.433 3.137 2.849 2.583 2.327 2.099 1.881 1.654 1.424 1.225 1.015 0.797 0.624 0.44 0.223 0.0 -0.223 -0.377 -0.526 -0.762 -0.942 -1.166 -1.288 -1.554 -1.853 -2.172 -2.339 -2.734 -2.806 -2.957 -3.108 -3.462 -3.662 -3.862 -4.084 -4.354 -4.683 -5.181 -6.666 -8 ,9565 ,KEBNE ,17069371,Fri Dec 24 02:08:33 CET,Fri Dec 24 04:00:36 CET,0.0 0.773 0.949 1.102 1.225 1.334 1.427 1.497 1.645 1.725 1.803 1.701 2.007 2.069 2.186 2.318 2.433 2.479 2.575 2.665 2.794 2.881 2.96 3.072 3.188 3.294 3.399 3.502 3.631 3.759 3.886 4.037 4.17 4.293 4.451 4.644 4.826 5.038 5.258 5.465 5.68 5.917 6.193 6.464 6.744 7.042 7.366 7.698 8.097 8.524 8.866 8.745 8.398 8.016 7.618 7.213 6.806 6.44 6.116 5.754 5.406 5.082 4.781 4.487 4.211 3.947 3.668 3.429 3.213 2.98 2.726 2.505 2.285 2.069 1.893 1.703 1.517 1.321 1.107 0.963 0.808 0.551 0.366 0.164 0.059 -0.164 -0.386 -0.628 -0.754 -1.128 -1.17 -1.326 -1.501 -1.899 -2.124 -2.361 -2.611 -2.88 -3.185 -3.669 -5.233 -9 ,7953 ,KEBNE ,17069372,Fri Dec 24 02:09:37 CET,Fri Dec 24 04:03:33 CET,0.0 0.694 0.876 0.995 1.102 1.239 1.36 1.455 1.642 1.719 1.789 1.694 1.996 2.059 2.179 2.284 2.395 2.46 2.587 2.693 2.833 2.928 3.024 3.152 3.273 3.402 3.531 3.647 3.781 3.916 4.054 4.214 4.364 4.507 4.664 4.847 5.034 5.248 5.477 5.719 5.987 6.286 6.587 6.881 7.232 7.614 8.071 8.547 9.034 9.503 9.813 9.781 9.508 9.12 8.704 8.27 7.847 7.452 7.101 6.738 6.413 6.081 5.745 5.466 5.211 4.955 4.686 4.434 4.195 3.943 3.695 3.492 3.277 3.048 2.872 2.704 2.529 2.337 2.124 1.98 1.832 1.601 1.441 1.263 1.168 0.959 0.737 0.509 0.399 0.045 0.033 -0.113 -0.272 -0.612 -0.823 -1.068 -1.304 -1.595 -1.983 -2.485 -4.762 -10 ,4485 ,KEBNE ,17069373,Fri Dec 24 02:09:35 CET,Fri Dec 24 04:01:54 CET,0.0 0.473 0.73 0.943 1.128 1.281 1.4 1.516 1.727 1.804 1.876 1.796 2.108 2.18 2.312 2.427 2.523 2.571 2.67 2.766 2.902 2.994 3.084 3.21 3.332 3.453 3.567 3.672 3.8 3.927 4.057 4.208 4.351 4.497 4.67 4.86 5.037 5.234 5.446 5.686 5.943 6.194 6.483 6.788 7.119 7.447 7.788 8.137 8.418 8.558 8.559 8.288 7.771 7.163 6.625 6.074 5.549 5.054 4.618 4.171 3.77 3.422 3.088 2.761 2.463 2.197 1.916 1.652 1.419 1.171 0.915 0.706 0.471 0.227 0.024 -0.196 -0.423 -0.66 -0.894 -1.065 -1.255 -1.563 -1.771 -1.974 -2.079 -2.297 -2.534 -2.814 -2.98 -3.383 -3.49 -3.695 -3.923 -4.431 -4.711 -5.021 -5.366 -5.757 -6.201 -6.821 -8.736 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt deleted file mode 100644 index 779fef5f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2722 ,TETRA ,17555389,Thu Nov 25 23:51:42 CET,Fri Nov 26 02:21:35 CET,0.0 0.796 1.006 1.14 1.287 1.412 1.499 1.586 1.739 1.82 1.91 1.82 2.122 2.188 2.309 2.416 2.522 2.575 2.682 2.784 2.94 3.045 3.149 3.302 3.443 3.588 3.725 3.843 4.008 4.176 4.32 4.482 4.649 4.83 5.041 5.251 5.445 5.653 5.894 6.155 6.418 6.747 7.151 7.52 7.918 8.362 8.86 9.428 10.079 10.748 11.449 11.873 11.917 11.753 11.506 11.264 11.027 10.737 10.489 10.239 9.993 9.74 9.488 9.246 9.009 8.805 8.586 8.383 8.21 8.022 7.816 7.652 7.482 7.312 7.165 6.991 6.821 6.638 6.447 6.324 6.2 5.992 5.841 5.681 5.592 5.413 5.234 5.039 4.941 4.611 4.627 4.508 4.377 4.102 3.952 3.785 3.607 3.396 3.138 2.833 2.114 -2 ,21256 ,TETRA ,17555390,Thu Nov 25 23:51:42 CET,Fri Nov 26 02:19:27 CET,0.0 0.593 0.874 1.122 1.323 1.49 1.638 1.771 2.046 2.172 2.273 2.231 2.563 2.655 2.844 3.025 3.202 3.292 3.462 3.618 3.861 4.014 4.157 4.377 4.586 4.767 4.954 5.15 5.388 5.616 5.818 6.024 6.241 6.476 6.752 7.059 7.361 7.721 8.11 8.518 8.955 9.434 10.005 10.603 11.253 11.922 12.596 13.214 13.881 14.576 15.249 15.663 15.68 15.534 15.382 15.173 14.935 14.715 14.465 14.159 13.895 13.679 13.479 13.289 13.109 12.926 12.71 12.515 12.344 12.165 11.991 11.842 11.677 11.497 11.347 11.189 11.023 10.856 10.685 10.56 10.426 10.22 10.079 9.932 9.855 9.704 9.553 9.378 9.289 8.971 8.997 8.889 8.778 8.507 8.362 8.22 8.071 7.895 7.656 7.337 6.362 -3 ,31536 ,TETRA ,17555391,Thu Nov 25 23:51:42 CET,Fri Nov 26 02:20:22 CET,0.0 0.817 0.981 1.126 1.264 1.377 1.472 1.56 1.704 1.772 1.846 1.768 2.078 2.143 2.267 2.392 2.522 2.585 2.685 2.776 2.931 3.033 3.138 3.289 3.428 3.554 3.659 3.771 3.925 4.074 4.22 4.398 4.562 4.705 4.875 5.079 5.277 5.526 5.79 6.036 6.294 6.583 6.918 7.243 7.625 8.06 8.524 8.963 9.447 9.963 10.413 10.591 10.531 10.397 10.159 9.858 9.571 9.253 8.939 8.654 8.438 8.234 8.014 7.786 7.56 7.338 7.114 6.928 6.773 6.601 6.413 6.263 6.108 5.933 5.794 5.653 5.511 5.358 5.207 5.101 4.979 4.781 4.651 4.521 4.445 4.293 4.134 3.969 3.881 3.555 3.582 3.48 3.364 3.089 2.935 2.775 2.6 2.38 2.125 1.807 0.878 -4 ,7072 ,TETRA ,17555392,Thu Nov 25 23:51:44 CET,Fri Nov 26 02:19:55 CET,0.0 0.31 0.447 0.553 0.656 0.755 0.848 0.938 1.108 1.18 1.248 1.144 1.45 1.519 1.656 1.787 1.897 1.951 2.053 2.143 2.287 2.382 2.469 2.588 2.703 2.824 2.936 3.051 3.218 3.368 3.512 3.691 3.859 4.031 4.243 4.471 4.676 4.9 5.141 5.4 5.675 5.996 6.385 6.775 7.204 7.67 8.192 8.774 9.4 10.063 10.812 11.279 11.396 11.272 11.028 10.743 10.458 10.182 9.945 9.708 9.492 9.281 9.048 8.796 8.562 8.358 8.138 7.938 7.746 7.542 7.353 7.203 7.046 6.888 6.778 6.645 6.481 6.324 6.153 6.028 5.896 5.678 5.532 5.39 5.314 5.149 4.972 4.777 4.679 4.353 4.371 4.257 4.141 3.9 3.764 3.61 3.437 3.202 2.95 2.684 2.005 -5 ,9543 ,TETRA ,17555393,Thu Nov 25 23:51:42 CET,Fri Nov 26 02:20:05 CET,0.0 0.387 0.573 0.729 0.849 0.964 1.077 1.174 1.356 1.442 1.519 1.447 1.771 1.845 1.966 2.085 2.206 2.266 2.379 2.487 2.682 2.829 2.953 3.104 3.244 3.39 3.535 3.665 3.839 4.022 4.19 4.374 4.559 4.734 4.929 5.135 5.318 5.528 5.781 6.053 6.323 6.634 7.002 7.37 7.793 8.248 8.739 9.252 9.79 10.332 10.882 11.158 11.113 10.883 10.634 10.354 10.061 9.814 9.602 9.38 9.189 9.008 8.832 8.661 8.483 8.305 8.095 7.895 7.721 7.538 7.351 7.194 7.044 6.9 6.769 6.623 6.475 6.318 6.151 6.039 5.914 5.704 5.566 5.443 5.379 5.237 5.092 4.943 4.856 4.535 4.57 4.452 4.325 4.072 3.958 3.843 3.688 3.529 3.351 3.05 2.348 -6 ,29652 ,TETRA ,17555394,Thu Nov 25 23:53:39 CET,Fri Nov 26 02:23:05 CET,0.0 0.473 0.695 0.887 1.067 1.231 1.38 1.521 1.791 1.905 2.013 1.989 2.316 2.408 2.57 2.719 2.866 2.942 3.093 3.253 3.49 3.634 3.776 3.974 4.148 4.299 4.421 4.533 4.685 4.83 4.975 5.164 5.349 5.527 5.736 5.972 6.192 6.452 6.736 7.025 7.328 7.658 8.027 8.396 8.848 9.366 9.932 10.53 11.189 11.876 12.554 12.844 12.809 12.687 12.52 12.295 12.012 11.703 11.45 11.217 11.007 10.813 10.615 10.39 10.166 9.97 9.762 9.558 9.374 9.135 8.847 8.625 8.394 8.151 7.962 7.756 7.552 7.358 7.169 7.056 6.951 6.767 6.616 6.459 6.381 6.211 6.03 5.838 5.74 5.408 5.414 5.294 5.167 4.902 4.766 4.612 4.435 4.243 3.982 3.607 2.694 -7 ,30771 ,TETRA ,17555395,Thu Nov 25 23:53:41 CET,Fri Nov 26 02:21:49 CET,0.0 0.429 0.672 0.91 1.112 1.267 1.416 1.554 1.823 1.949 2.064 2.049 2.385 2.48 2.642 2.776 2.914 2.982 3.105 3.22 3.376 3.472 3.568 3.708 3.846 3.974 4.087 4.199 4.348 4.486 4.625 4.815 5.0 5.172 5.361 5.57 5.778 6.002 6.236 6.481 6.751 7.068 7.443 7.809 8.212 8.655 9.151 9.695 10.292 10.913 11.47 11.617 11.564 11.452 11.266 11.002 10.713 10.396 10.101 9.845 9.615 9.372 9.139 8.901 8.652 8.445 8.235 8.032 7.855 7.652 7.429 7.253 7.076 6.897 6.76 6.608 6.441 6.261 6.038 5.877 5.722 5.47 5.28 5.07 4.964 4.761 4.552 4.322 4.202 3.842 3.799 3.643 3.463 3.108 2.933 2.758 2.549 2.289 2.032 1.692 0.771 -8 ,17788 ,TETRA ,17555396,Fri Nov 26 00:43:21 CET,Fri Nov 26 03:13:30 CET,0.0 0.84 1.126 1.299 1.476 1.652 1.827 1.983 2.218 2.313 2.395 2.303 2.62 2.692 2.825 2.955 3.08 3.143 3.267 3.384 3.539 3.647 3.762 3.918 4.069 4.218 4.358 4.492 4.655 4.809 4.953 5.121 5.291 5.466 5.664 5.884 6.104 6.336 6.563 6.817 7.116 7.447 7.825 8.186 8.592 9.084 9.643 10.212 10.792 11.447 12.173 12.558 12.603 12.484 12.325 12.13 11.901 11.678 11.454 11.21 11.0 10.798 10.6 10.322 9.999 9.731 9.45 9.189 8.967 8.729 8.478 8.27 8.048 7.811 7.618 7.412 7.214 7.02 6.818 6.682 6.53 6.282 6.111 5.929 5.839 5.668 5.49 5.292 5.19 4.855 4.834 4.701 4.569 4.284 4.131 3.952 3.758 3.535 3.238 2.876 2.155 -9 ,26404 ,TETRA ,17555397,Fri Nov 26 00:43:23 CET,Fri Nov 26 03:13:41 CET,0.0 0.681 0.865 1.019 1.149 1.27 1.384 1.478 1.66 1.758 1.847 1.757 2.059 2.12 2.24 2.352 2.473 2.534 2.643 2.752 2.914 3.014 3.107 3.233 3.359 3.496 3.633 3.762 3.941 4.104 4.258 4.456 4.64 4.806 4.995 5.213 5.429 5.656 5.894 6.164 6.454 6.784 7.171 7.57 8.014 8.478 9.049 9.699 10.406 11.186 11.971 12.382 12.46 12.349 12.149 11.97 11.789 11.596 11.402 11.188 10.982 10.78 10.588 10.373 10.152 9.956 9.761 9.593 9.456 9.313 9.147 8.996 8.833 8.677 8.559 8.434 8.312 8.182 8.03 7.918 7.81 7.637 7.499 7.359 7.291 7.127 6.965 6.825 6.749 6.445 6.486 6.381 6.279 6.075 5.956 5.805 5.648 5.487 5.302 5.067 4.495 -10 ,14227 ,TETRA ,17555398,Fri Nov 26 01:04:01 CET,Fri Nov 26 03:33:39 CET,0.0 0.674 0.93 1.151 1.338 1.53 1.717 1.881 2.173 2.312 2.45 2.464 2.808 2.896 3.054 3.192 3.314 3.375 3.502 3.617 3.775 3.871 3.962 4.099 4.229 4.364 4.499 4.622 4.786 4.945 5.102 5.289 5.462 5.639 5.859 6.11 6.336 6.573 6.843 7.123 7.397 7.723 8.094 8.447 8.863 9.348 9.896 10.481 11.103 11.745 12.415 12.794 12.86 12.754 12.554 12.334 12.153 11.931 11.692 11.459 11.243 11.026 10.83 10.665 10.489 10.316 10.126 9.943 9.795 9.637 9.457 9.301 9.14 8.972 8.838 8.696 8.545 8.383 8.214 8.103 7.984 7.793 7.656 7.506 7.428 7.276 7.121 6.97 6.891 6.562 6.558 6.422 6.231 5.807 5.602 5.351 5.003 4.623 4.244 3.771 2.222 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 6a3dbd50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19095 ,TETRA ,17555399,Fri Nov 26 01:04:04 CET,Fri Nov 26 03:32:04 CET,0.0 0.527 0.766 0.907 1.039 1.155 1.257 1.362 1.532 1.601 1.673 1.572 1.872 1.932 2.049 2.179 2.3 2.35 2.443 2.541 2.674 2.755 2.835 2.947 3.06 3.174 3.28 3.376 3.507 3.637 3.767 3.923 4.063 4.195 4.348 4.58 4.866 5.19 5.541 5.911 6.284 6.616 6.921 7.191 7.484 7.808 8.15 8.483 8.746 8.898 8.859 8.314 7.576 6.995 6.461 5.839 5.184 4.501 3.858 3.209 2.654 2.048 1.405 0.826 0.314 -0.137 -0.617 -1.032 -1.38 -1.775 -2.217 -2.561 -2.9 -3.295 -3.634 -3.982 -4.333 -4.69 -5.07 -5.338 -5.598 -5.984 -6.276 -6.581 -6.743 -7.103 -7.453 -7.805 -7.976 -8.414 -8.592 -8.826 -9.066 -9.589 -9.89 -10.194 -10.551 -10.988 -11.518 -12.224 -14.12 -2 ,25616 ,TETRA ,17555400,Fri Nov 26 01:05:02 CET,Fri Nov 26 03:32:59 CET,0.0 0.605 0.821 0.975 1.13 1.302 1.459 1.585 1.804 1.913 2.014 1.931 2.243 2.319 2.475 2.618 2.756 2.826 2.963 3.091 3.29 3.422 3.542 3.724 3.906 4.073 4.236 4.396 4.589 4.777 4.975 5.231 5.475 5.708 5.977 6.284 6.578 6.824 7.036 7.258 7.484 7.726 7.979 8.208 8.486 8.789 9.064 9.366 9.711 9.935 10.002 9.74 9.285 8.78 8.181 7.552 6.948 6.322 5.691 5.026 4.48 3.99 3.531 3.112 2.622 2.079 1.536 1.078 0.678 0.262 -0.153 -0.512 -0.897 -1.295 -1.612 -1.914 -2.213 -2.539 -2.885 -3.118 -3.368 -3.766 -4.031 -4.323 -4.478 -4.808 -5.164 -5.527 -5.715 -6.171 -6.355 -6.569 -6.792 -7.323 -7.616 -7.94 -8.29 -8.699 -9.185 -9.954 -12.576 -3 ,19539 ,TETRA ,17555401,Fri Nov 26 01:06:02 CET,Fri Nov 26 03:34:17 CET,0.0 0.3 0.526 0.695 0.826 0.952 1.058 1.155 1.346 1.432 1.518 1.46 1.771 1.842 1.997 2.151 2.284 2.351 2.474 2.581 2.734 2.818 2.895 3.017 3.145 3.268 3.378 3.477 3.597 3.709 3.815 3.94 4.074 4.219 4.371 4.534 4.689 4.854 5.025 5.214 5.414 5.632 5.91 6.181 6.463 6.756 7.059 7.383 7.696 7.928 8.007 7.598 6.96 6.342 5.698 5.012 4.248 3.393 2.587 1.734 1.082 0.601 0.173 -0.263 -0.737 -1.227 -1.756 -2.215 -2.584 -2.948 -3.353 -3.712 -4.098 -4.48 -4.766 -5.076 -5.391 -5.701 -6.032 -6.264 -6.511 -6.914 -7.184 -7.461 -7.604 -7.899 -8.206 -8.518 -8.684 -9.111 -9.242 -9.43 -9.623 -10.12 -10.419 -10.742 -11.087 -11.502 -12.03 -12.633 -14.849 -4 ,13750 ,TETRA ,17555402,Fri Nov 26 01:06:02 CET,Fri Nov 26 03:33:04 CET,0.0 0.261 0.395 0.515 0.641 0.758 0.857 0.953 1.133 1.219 1.297 1.221 1.549 1.633 1.762 1.867 1.959 2.003 2.089 2.173 2.306 2.393 2.469 2.583 2.691 2.799 2.915 3.022 3.153 3.278 3.399 3.548 3.697 3.847 4.013 4.19 4.362 4.542 4.731 4.923 5.09 5.282 5.517 5.737 6.032 6.381 6.756 7.19 7.623 7.972 8.072 7.802 7.478 7.001 6.403 5.757 5.083 4.458 3.95 3.405 2.823 2.234 1.691 1.252 0.855 0.448 0.026 -0.295 -0.572 -0.917 -1.267 -1.533 -1.815 -2.109 -2.339 -2.604 -2.903 -3.194 -3.481 -3.695 -3.919 -4.259 -4.507 -4.754 -4.879 -5.158 -5.446 -5.728 -5.866 -6.271 -6.379 -6.57 -6.791 -7.29 -7.566 -7.851 -8.145 -8.521 -9.008 -9.654 -11.771 -5 ,26687 ,TETRA ,17555403,Fri Nov 26 01:06:03 CET,Fri Nov 26 03:32:30 CET,0.0 0.327 0.602 0.796 0.945 1.064 1.177 1.288 1.495 1.601 1.687 1.598 1.912 1.995 2.149 2.283 2.394 2.447 2.557 2.654 2.777 2.852 2.927 3.032 3.137 3.247 3.364 3.477 3.622 3.788 3.948 4.13 4.3 4.445 4.607 4.788 4.948 5.137 5.352 5.579 5.81 6.053 6.318 6.577 6.882 7.22 7.607 8.014 8.376 8.686 8.793 8.457 7.964 7.461 6.972 6.425 5.893 5.364 4.787 4.22 3.801 3.413 2.985 2.536 2.117 1.742 1.326 0.941 0.598 0.216 -0.187 -0.518 -0.889 -1.293 -1.599 -1.901 -2.215 -2.553 -2.926 -3.182 -3.426 -3.832 -4.136 -4.441 -4.588 -4.892 -5.205 -5.541 -5.726 -6.155 -6.329 -6.566 -6.808 -7.314 -7.569 -7.851 -8.189 -8.609 -9.073 -9.733 -12.244 -6 ,23094 ,TETRA ,17555404,Fri Nov 26 01:06:03 CET,Fri Nov 26 03:34:16 CET,0.0 0.519 0.723 0.877 1.01 1.144 1.261 1.364 1.556 1.646 1.736 1.674 2.001 2.082 2.228 2.358 2.496 2.569 2.71 2.836 3.006 3.127 3.253 3.434 3.604 3.771 3.935 4.068 4.206 4.346 4.478 4.629 4.773 4.907 5.068 5.252 5.41 5.574 5.753 5.948 6.15 6.376 6.644 6.934 7.287 7.638 8.027 8.451 8.852 9.214 9.357 9.09 8.579 8.038 7.495 6.935 6.437 5.992 5.617 5.22 4.842 4.486 4.107 3.74 3.408 3.099 2.759 2.435 2.146 1.839 1.485 1.149 0.811 0.477 0.196 -0.105 -0.399 -0.708 -1.047 -1.273 -1.502 -1.858 -2.109 -2.381 -2.526 -2.806 -3.09 -3.413 -3.583 -4.013 -4.157 -4.365 -4.587 -5.069 -5.33 -5.607 -5.945 -6.361 -6.854 -7.47 -9.8 -7 ,15980 ,TETRA ,17555405,Fri Nov 26 01:07:02 CET,Fri Nov 26 03:36:45 CET,0.0 0.342 0.475 0.6 0.692 0.771 0.855 0.951 1.147 1.225 1.291 1.188 1.495 1.566 1.689 1.793 1.877 1.922 2.016 2.097 2.216 2.301 2.39 2.513 2.639 2.758 2.857 2.954 3.098 3.244 3.359 3.478 3.596 3.737 3.968 4.224 4.416 4.619 4.829 5.049 5.262 5.503 5.8 6.1 6.425 6.756 7.109 7.454 7.781 8.056 8.151 7.831 7.323 6.722 6.034 5.218 4.389 3.707 3.06 2.306 1.666 1.034 0.378 -0.231 -0.775 -1.256 -1.771 -2.228 -2.628 -3.045 -3.461 -3.82 -4.198 -4.581 -4.887 -5.216 -5.557 -5.904 -6.27 -6.516 -6.746 -7.103 -7.366 -7.64 -7.772 -8.047 -8.346 -8.658 -8.818 -9.228 -9.36 -9.576 -9.8 -10.293 -10.552 -10.846 -11.179 -11.561 -12.048 -12.695 -14.426 -8 ,10028 ,TETRA ,17555406,Fri Nov 26 01:07:03 CET,Fri Nov 26 03:25:19 CET,0.0 0.44 0.67 0.794 0.9 0.99 1.061 1.125 1.261 1.327 1.396 1.301 1.6 1.659 1.77 1.871 1.969 2.015 2.102 2.183 2.306 2.385 2.455 2.56 2.66 2.753 2.841 2.929 3.05 3.179 3.324 3.481 3.613 3.748 3.906 4.076 4.226 4.414 4.628 4.83 5.045 5.298 5.573 5.836 6.151 6.513 6.9 7.287 7.701 8.111 8.316 8.103 7.695 7.039 6.32 5.691 5.121 4.512 3.939 3.294 2.727 2.212 1.703 1.223 0.766 0.382 0.001 -0.33 -0.617 -0.936 -1.267 -1.53 -1.805 -2.091 -2.319 -2.573 -2.836 -3.092 -3.38 -3.594 -3.821 -4.164 -4.403 -4.656 -4.792 -5.077 -5.364 -5.669 -5.834 -6.262 -6.394 -6.603 -6.825 -7.334 -7.643 -7.998 -8.361 -8.727 -9.21 -9.873 -11.966 -9 ,22153 ,TETRA ,17555407,Fri Nov 26 01:07:05 CET,Fri Nov 26 03:23:12 CET,0.0 0.358 0.573 0.727 0.841 0.955 1.05 1.135 1.294 1.352 1.415 1.296 1.592 1.652 1.774 1.883 1.986 2.038 2.132 2.223 2.361 2.451 2.534 2.656 2.768 2.876 2.988 3.101 3.234 3.355 3.469 3.61 3.753 3.876 4.024 4.198 4.351 4.522 4.712 4.916 5.117 5.351 5.627 5.881 6.148 6.427 6.76 7.105 7.431 7.662 7.71 7.315 6.676 6.008 5.324 4.623 3.951 3.33 2.806 2.212 1.661 1.204 0.772 0.327 -0.061 -0.436 -0.893 -1.306 -1.663 -2.044 -2.441 -2.781 -3.144 -3.513 -3.804 -4.106 -4.419 -4.767 -5.117 -5.373 -5.651 -6.066 -6.349 -6.646 -6.798 -7.104 -7.442 -7.809 -7.988 -8.413 -8.556 -8.765 -8.977 -9.433 -9.708 -10.011 -10.33 -10.72 -11.269 -11.939 -13.735 -10 ,60 ,TETRA ,17555408,Fri Nov 26 01:07:03 CET,Fri Nov 26 03:13:17 CET,0.0 0.286 0.449 0.599 0.72 0.82 0.901 0.969 1.12 1.194 1.264 1.179 1.489 1.552 1.66 1.758 1.856 1.909 2.011 2.108 2.253 2.338 2.418 2.54 2.663 2.781 2.894 3.013 3.16 3.283 3.398 3.528 3.658 3.794 3.952 4.122 4.284 4.469 4.667 4.891 5.124 5.356 5.609 5.857 6.134 6.424 6.737 7.062 7.326 7.505 7.467 6.969 6.296 5.608 4.909 4.203 3.542 2.91 2.349 1.779 1.232 0.672 0.134 -0.3 -0.67 -1.033 -1.426 -1.782 -2.135 -2.502 -2.858 -3.149 -3.461 -3.812 -4.072 -4.33 -4.618 -4.946 -5.269 -5.503 -5.744 -6.085 -6.339 -6.617 -6.761 -7.042 -7.333 -7.639 -7.811 -8.26 -8.393 -8.593 -8.789 -9.179 -9.424 -9.716 -10.001 -10.33 -10.751 -11.389 -13.692 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt deleted file mode 100644 index bff18d99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23389 ,TETRA ,17555409,Fri Nov 26 01:07:03 CET,Fri Nov 26 03:25:28 CET,0.0 0.371 0.511 0.615 0.709 0.774 0.824 0.866 0.956 1.001 1.045 1.08 1.162 1.196 1.262 1.319 1.366 1.389 1.446 1.501 1.575 1.614 1.654 1.716 1.772 1.822 1.866 1.902 1.945 1.992 2.051 2.12 2.164 2.209 2.264 2.334 2.407 2.481 2.555 2.602 2.641 2.697 2.766 2.842 2.905 2.931 2.941 2.919 2.795 2.505 1.963 1.232 0.627 0.111 -0.362 -0.779 -1.144 -1.477 -1.751 -2.027 -2.279 -2.495 -2.698 -2.909 -3.1 -3.26 -3.425 -3.571 -3.704 -3.846 -3.987 -4.105 -4.224 -4.351 -4.451 -4.555 -4.661 -4.77 -4.888 -4.97 -5.057 -5.195 -5.283 -5.375 -5.422 -5.522 -5.634 -5.745 -5.8 -5.903 -5.963 -6.028 -6.086 -6.21 -6.287 -6.368 -6.465 -6.586 -6.727 -6.929 -7.776 -2 ,15575 ,TETRA ,17555410,Fri Nov 26 01:07:05 CET,Fri Nov 26 03:25:09 CET,0.0 0.349 0.492 0.601 0.709 0.806 0.88 0.939 1.03 1.072 1.119 1.16 1.247 1.278 1.337 1.39 1.447 1.475 1.523 1.566 1.628 1.676 1.722 1.784 1.854 1.914 1.968 2.022 2.086 2.142 2.196 2.26 2.328 2.39 2.45 2.519 2.573 2.622 2.669 2.734 2.814 2.881 2.93 2.966 2.99 2.991 2.96 2.891 2.746 2.482 1.951 1.211 0.569 0.018 -0.46 -0.9 -1.279 -1.629 -1.937 -2.245 -2.493 -2.694 -2.883 -3.063 -3.221 -3.372 -3.541 -3.678 -3.797 -3.932 -4.072 -4.189 -4.314 -4.447 -4.544 -4.635 -4.738 -4.842 -4.942 -5.019 -5.097 -5.215 -5.299 -5.374 -5.41 -5.492 -5.57 -5.659 -5.71 -5.82 -5.887 -5.947 -6.023 -6.18 -6.241 -6.325 -6.438 -6.559 -6.74 -6.977 -7.483 -3 ,22427 ,TETRA ,17555411,Fri Nov 26 01:07:03 CET,Fri Nov 26 03:27:56 CET,0.0 0.505 0.645 0.748 0.828 0.902 0.986 1.063 1.204 1.266 1.315 1.347 1.427 1.453 1.51 1.578 1.639 1.661 1.708 1.76 1.831 1.875 1.915 1.965 2.023 2.083 2.128 2.174 2.242 2.3 2.356 2.425 2.477 2.524 2.585 2.652 2.711 2.78 2.857 2.929 2.996 3.069 3.119 3.157 3.228 3.279 3.273 3.222 3.103 2.816 2.234 1.434 0.747 0.159 -0.374 -0.837 -1.235 -1.603 -1.913 -2.225 -2.504 -2.749 -2.973 -3.173 -3.346 -3.506 -3.678 -3.824 -3.942 -4.058 -4.185 -4.286 -4.386 -4.494 -4.585 -4.688 -4.794 -4.902 -5.012 -5.093 -5.183 -5.321 -5.42 -5.521 -5.564 -5.652 -5.748 -5.862 -5.918 -6.032 -6.103 -6.161 -6.219 -6.372 -6.456 -6.541 -6.626 -6.712 -6.826 -6.977 -7.289 -4 ,10054 ,TETRA ,17555412,Fri Nov 26 01:08:01 CET,Fri Nov 26 03:28:22 CET,0.0 0.288 0.454 0.563 0.649 0.745 0.827 0.888 1.003 1.052 1.097 1.141 1.233 1.27 1.336 1.403 1.458 1.484 1.544 1.603 1.668 1.703 1.746 1.802 1.853 1.918 1.982 2.034 2.089 2.146 2.203 2.28 2.353 2.413 2.478 2.548 2.624 2.7 2.78 2.856 2.918 2.997 3.081 3.141 3.189 3.221 3.226 3.172 3.03 2.769 2.227 1.47 0.762 0.16 -0.315 -0.758 -1.158 -1.483 -1.756 -2.036 -2.272 -2.488 -2.701 -2.901 -3.079 -3.238 -3.419 -3.576 -3.707 -3.846 -3.98 -4.088 -4.204 -4.322 -4.404 -4.493 -4.594 -4.704 -4.819 -4.888 -4.958 -5.074 -5.169 -5.272 -5.322 -5.423 -5.536 -5.667 -5.735 -5.867 -5.964 -6.036 -6.108 -6.266 -6.349 -6.447 -6.568 -6.697 -6.828 -7.062 -7.994 -5 ,8265 ,TETRA ,17555413,Fri Nov 26 01:08:00 CET,Fri Nov 26 03:27:09 CET,0.0 0.537 0.646 0.746 0.825 0.894 0.97 1.031 1.114 1.154 1.195 1.215 1.299 1.33 1.396 1.472 1.538 1.568 1.626 1.674 1.742 1.787 1.829 1.897 1.962 2.027 2.085 2.135 2.199 2.258 2.307 2.364 2.424 2.485 2.556 2.635 2.695 2.759 2.826 2.888 2.949 2.998 3.046 3.087 3.128 3.183 3.222 3.203 3.11 2.903 2.377 1.599 0.961 0.43 -0.035 -0.452 -0.8 -1.117 -1.408 -1.69 -1.925 -2.143 -2.364 -2.566 -2.746 -2.902 -3.059 -3.211 -3.35 -3.491 -3.635 -3.751 -3.863 -3.984 -4.086 -4.195 -4.307 -4.42 -4.539 -4.617 -4.7 -4.848 -4.945 -5.033 -5.076 -5.171 -5.273 -5.383 -5.434 -5.542 -5.588 -5.641 -5.692 -5.81 -5.895 -5.995 -6.109 -6.241 -6.397 -6.59 -7.144 -6 ,19050 ,TETRA ,17555414,Fri Nov 26 01:08:03 CET,Fri Nov 26 03:26:37 CET,0.0 0.206 0.287 0.358 0.423 0.497 0.566 0.621 0.725 0.771 0.809 0.834 0.92 0.95 1.009 1.067 1.119 1.145 1.197 1.25 1.306 1.347 1.393 1.452 1.505 1.556 1.607 1.658 1.724 1.783 1.835 1.888 1.939 1.997 2.053 2.096 2.156 2.229 2.295 2.347 2.398 2.484 2.571 2.613 2.645 2.688 2.71 2.688 2.618 2.382 1.775 0.959 0.282 -0.301 -0.807 -1.248 -1.614 -1.937 -2.23 -2.528 -2.771 -2.984 -3.187 -3.375 -3.554 -3.716 -3.873 -4.013 -4.144 -4.272 -4.391 -4.498 -4.615 -4.732 -4.819 -4.911 -5.013 -5.115 -5.219 -5.297 -5.373 -5.488 -5.572 -5.648 -5.684 -5.766 -5.859 -5.95 -5.997 -6.109 -6.176 -6.241 -6.299 -6.412 -6.476 -6.547 -6.624 -6.705 -6.787 -6.914 -7.317 -7 ,4435 ,TETRA ,17555415,Fri Nov 26 01:10:05 CET,Fri Nov 26 03:31:14 CET,0.0 0.224 0.38 0.488 0.565 0.631 0.685 0.734 0.843 0.89 0.931 0.966 1.056 1.097 1.167 1.227 1.278 1.302 1.365 1.43 1.521 1.563 1.601 1.669 1.728 1.776 1.829 1.881 1.943 2.001 2.057 2.121 2.17 2.216 2.272 2.33 2.387 2.442 2.502 2.586 2.678 2.745 2.796 2.841 2.877 2.913 2.929 2.886 2.743 2.444 1.886 1.138 0.531 -0.004 -0.491 -0.938 -1.349 -1.735 -2.054 -2.356 -2.607 -2.825 -3.035 -3.23 -3.415 -3.584 -3.766 -3.935 -4.069 -4.214 -4.373 -4.5 -4.624 -4.742 -4.834 -4.932 -5.028 -5.136 -5.252 -5.332 -5.409 -5.529 -5.614 -5.694 -5.736 -5.831 -5.932 -6.034 -6.083 -6.195 -6.268 -6.334 -6.408 -6.563 -6.633 -6.712 -6.791 -6.882 -7.007 -7.173 -8.036 -8 ,9751 ,TETRA ,17555416,Fri Nov 26 01:10:07 CET,Fri Nov 26 03:31:03 CET,0.0 0.413 0.549 0.649 0.721 0.804 0.89 0.958 1.077 1.125 1.164 1.189 1.278 1.308 1.358 1.415 1.468 1.491 1.539 1.587 1.655 1.7 1.745 1.815 1.88 1.938 1.993 2.043 2.109 2.166 2.215 2.274 2.329 2.38 2.433 2.499 2.568 2.625 2.671 2.722 2.767 2.805 2.834 2.859 2.887 2.886 2.849 2.795 2.672 2.401 1.874 1.157 0.486 -0.098 -0.569 -0.983 -1.367 -1.728 -2.036 -2.334 -2.584 -2.788 -2.967 -3.156 -3.334 -3.485 -3.636 -3.779 -3.914 -4.048 -4.183 -4.3 -4.429 -4.56 -4.659 -4.752 -4.851 -4.974 -5.104 -5.184 -5.261 -5.387 -5.473 -5.564 -5.615 -5.722 -5.813 -5.921 -5.979 -6.091 -6.155 -6.221 -6.29 -6.429 -6.507 -6.606 -6.721 -6.864 -7.003 -7.139 -7.757 -9 ,1763 ,TETRA ,17555417,Fri Nov 26 01:11:07 CET,Fri Nov 26 03:34:58 CET,0.0 0.288 0.438 0.589 0.663 0.73 0.812 0.881 0.994 1.038 1.08 1.109 1.199 1.236 1.291 1.364 1.438 1.462 1.515 1.579 1.667 1.72 1.767 1.832 1.904 1.965 2.017 2.07 2.142 2.205 2.256 2.316 2.375 2.427 2.478 2.535 2.597 2.669 2.736 2.79 2.854 2.924 2.971 3.022 3.08 3.114 3.123 3.106 3.007 2.736 2.142 1.34 0.68 0.115 -0.384 -0.833 -1.226 -1.564 -1.857 -2.143 -2.375 -2.597 -2.816 -3.022 -3.22 -3.395 -3.573 -3.73 -3.869 -4.011 -4.15 -4.271 -4.399 -4.533 -4.632 -4.733 -4.838 -4.939 -5.044 -5.127 -5.217 -5.346 -5.433 -5.525 -5.567 -5.651 -5.749 -5.858 -5.913 -6.022 -6.085 -6.152 -6.209 -6.334 -6.407 -6.49 -6.587 -6.676 -6.764 -6.928 -7.435 -10 ,8973 ,TETRA ,17555418,Fri Nov 26 01:12:05 CET,Fri Nov 26 03:31:29 CET,0.0 0.534 0.682 0.787 0.917 1.015 1.08 1.142 1.257 1.307 1.362 1.405 1.494 1.539 1.621 1.692 1.757 1.796 1.873 1.939 2.021 2.063 2.106 2.173 2.235 2.29 2.341 2.395 2.466 2.529 2.585 2.652 2.717 2.784 2.869 2.956 3.028 3.121 3.216 3.283 3.339 3.393 3.427 3.461 3.506 3.534 3.533 3.474 3.348 3.088 2.546 1.824 1.183 0.613 0.127 -0.294 -0.689 -1.053 -1.362 -1.678 -1.947 -2.181 -2.401 -2.612 -2.796 -2.964 -3.152 -3.313 -3.446 -3.592 -3.739 -3.865 -4.001 -4.144 -4.254 -4.366 -4.483 -4.589 -4.697 -4.778 -4.855 -4.967 -5.045 -5.124 -5.168 -5.261 -5.352 -5.46 -5.515 -5.62 -5.679 -5.751 -5.827 -5.98 -6.064 -6.151 -6.266 -6.4 -6.513 -6.652 -7.341 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt deleted file mode 100644 index 8318783d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27567 ,TETRA ,17555419,Fri Nov 26 01:12:05 CET,Fri Nov 26 03:38:29 CET,0.0 0.764 0.977 1.073 1.16 1.259 1.348 1.416 1.55 1.619 1.678 1.727 1.848 1.901 2.011 2.113 2.216 2.267 2.36 2.449 2.569 2.644 2.708 2.8 2.897 2.999 3.093 3.172 3.276 3.389 3.494 3.61 3.729 3.851 3.986 4.14 4.296 4.455 4.622 4.81 5.003 5.193 5.396 5.589 5.801 6.013 6.22 6.435 6.636 6.758 6.606 6.14 5.652 5.174 4.726 4.309 3.934 3.599 3.309 3.024 2.779 2.542 2.3 2.068 1.852 1.641 1.408 1.203 1.029 0.854 0.675 0.522 0.357 0.186 0.061 -0.059 -0.179 -0.31 -0.451 -0.545 -0.642 -0.792 -0.888 -0.991 -1.05 -1.164 -1.283 -1.419 -1.488 -1.623 -1.715 -1.797 -1.879 -2.074 -2.202 -2.341 -2.467 -2.609 -2.805 -3.05 -4.615 -2 ,5987 ,TETRA ,17555420,Fri Nov 26 01:12:06 CET,Fri Nov 26 03:37:52 CET,0.0 0.456 0.658 0.793 0.88 0.967 1.063 1.152 1.293 1.365 1.44 1.49 1.602 1.655 1.76 1.858 1.943 1.984 2.066 2.145 2.257 2.329 2.399 2.495 2.584 2.665 2.74 2.82 2.916 3.006 3.095 3.196 3.296 3.407 3.548 3.703 3.845 3.995 4.15 4.299 4.438 4.591 4.78 4.951 5.128 5.312 5.527 5.777 5.997 6.09 5.947 5.462 4.901 4.317 3.798 3.332 2.907 2.528 2.193 1.833 1.513 1.243 0.992 0.734 0.483 0.265 0.043 -0.155 -0.313 -0.476 -0.661 -0.834 -1.028 -1.22 -1.358 -1.5 -1.65 -1.796 -1.943 -2.052 -2.17 -2.359 -2.498 -2.636 -2.707 -2.858 -3.007 -3.176 -3.267 -3.419 -3.52 -3.607 -3.706 -3.959 -4.104 -4.27 -4.454 -4.641 -4.865 -5.165 -6.249 -3 ,21163 ,TETRA ,17555421,Fri Nov 26 01:12:05 CET,Fri Nov 26 03:37:04 CET,0.0 0.191 0.34 0.488 0.615 0.692 0.764 0.836 0.962 1.018 1.069 1.117 1.232 1.281 1.38 1.48 1.562 1.602 1.687 1.767 1.88 1.949 2.02 2.12 2.213 2.305 2.391 2.476 2.592 2.695 2.79 2.906 3.019 3.126 3.264 3.425 3.578 3.741 3.902 4.055 4.226 4.417 4.617 4.798 5.006 5.245 5.497 5.72 5.921 6.072 6.051 5.694 5.269 4.858 4.473 4.144 3.85 3.548 3.264 2.993 2.747 2.503 2.266 2.055 1.863 1.685 1.485 1.301 1.153 0.999 0.831 0.699 0.561 0.401 0.274 0.148 0.005 -0.155 -0.309 -0.421 -0.54 -0.718 -0.841 -0.962 -1.027 -1.155 -1.277 -1.424 -1.508 -1.667 -1.776 -1.872 -1.973 -2.184 -2.296 -2.422 -2.571 -2.726 -2.882 -3.068 -3.52 -4 ,5866 ,TETRA ,17555422,Fri Nov 26 01:12:06 CET,Fri Nov 26 03:36:53 CET,0.0 0.313 0.433 0.513 0.586 0.653 0.725 0.797 0.948 1.021 1.081 1.122 1.238 1.295 1.408 1.518 1.624 1.675 1.765 1.844 1.956 2.027 2.105 2.211 2.289 2.378 2.471 2.567 2.711 2.83 2.923 3.037 3.151 3.27 3.408 3.563 3.713 3.866 4.037 4.206 4.362 4.542 4.74 4.926 5.137 5.34 5.532 5.732 5.951 6.111 6.015 5.657 5.221 4.761 4.313 3.907 3.553 3.238 2.968 2.678 2.408 2.164 1.941 1.736 1.53 1.349 1.168 0.991 0.83 0.654 0.484 0.358 0.219 0.064 -0.048 -0.167 -0.294 -0.421 -0.552 -0.642 -0.736 -0.884 -0.987 -1.1 -1.155 -1.276 -1.424 -1.577 -1.65 -1.78 -1.858 -1.939 -2.023 -2.225 -2.344 -2.459 -2.598 -2.735 -2.878 -3.082 -3.881 -5 ,21181 ,TETRA ,17555423,Fri Nov 26 01:13:07 CET,Fri Nov 26 03:27:09 CET,0.0 0.416 0.625 0.714 0.811 0.895 0.971 1.041 1.17 1.241 1.305 1.342 1.453 1.508 1.625 1.734 1.822 1.865 1.952 2.034 2.145 2.222 2.3 2.402 2.495 2.592 2.693 2.783 2.895 3.003 3.104 3.227 3.343 3.455 3.577 3.707 3.836 3.977 4.134 4.297 4.476 4.677 4.886 5.086 5.303 5.519 5.727 5.944 6.138 6.244 6.219 5.928 5.555 5.183 4.803 4.427 4.102 3.788 3.482 3.173 2.925 2.704 2.479 2.265 2.071 1.895 1.711 1.538 1.389 1.237 1.075 0.946 0.82 0.685 0.571 0.455 0.34 0.211 0.069 -0.036 -0.149 -0.313 -0.427 -0.541 -0.599 -0.723 -0.85 -0.968 -1.027 -1.157 -1.243 -1.34 -1.452 -1.669 -1.785 -1.903 -2.04 -2.198 -2.375 -2.612 -2.963 -6 ,9481 ,TETRA ,17555424,Fri Nov 26 01:13:07 CET,Fri Nov 26 03:39:08 CET,0.0 0.217 0.329 0.425 0.515 0.599 0.669 0.731 0.851 0.906 0.95 0.968 1.075 1.115 1.191 1.279 1.359 1.392 1.466 1.542 1.645 1.704 1.765 1.865 1.967 2.065 2.158 2.238 2.332 2.434 2.536 2.665 2.779 2.874 2.998 3.134 3.262 3.403 3.552 3.725 3.911 4.098 4.293 4.476 4.676 4.874 5.059 5.25 5.417 5.533 5.447 5.08 4.653 4.255 3.836 3.402 3.007 2.647 2.352 2.039 1.785 1.556 1.307 1.077 0.862 0.667 0.469 0.28 0.117 -0.043 -0.218 -0.358 -0.489 -0.633 -0.753 -0.879 -1.013 -1.146 -1.277 -1.376 -1.487 -1.653 -1.75 -1.871 -1.938 -2.068 -2.204 -2.346 -2.422 -2.558 -2.652 -2.741 -2.835 -3.033 -3.146 -3.275 -3.417 -3.565 -3.746 -3.977 -4.631 -7 ,2940 ,TETRA ,17555425,Fri Nov 26 01:13:09 CET,Fri Nov 26 03:38:08 CET,0.0 0.195 0.316 0.415 0.527 0.637 0.722 0.795 0.931 0.996 1.059 1.108 1.219 1.269 1.381 1.478 1.556 1.597 1.677 1.761 1.884 1.951 2.019 2.131 2.23 2.32 2.416 2.507 2.615 2.723 2.822 2.933 3.034 3.13 3.259 3.412 3.557 3.709 3.867 4.035 4.216 4.413 4.62 4.819 5.043 5.301 5.566 5.803 6.031 6.219 6.248 5.933 5.556 5.208 4.858 4.493 4.149 3.834 3.563 3.278 3.026 2.803 2.59 2.386 2.195 2.019 1.822 1.648 1.507 1.358 1.203 1.083 0.951 0.804 0.692 0.567 0.441 0.316 0.188 0.103 0.021 -0.112 -0.211 -0.312 -0.364 -0.47 -0.59 -0.736 -0.808 -0.939 -1.021 -1.095 -1.18 -1.362 -1.463 -1.562 -1.658 -1.785 -1.942 -2.144 -2.848 -8 ,16299 ,TETRA ,17555426,Fri Nov 26 01:13:06 CET,Fri Nov 26 03:39:40 CET,0.0 0.166 0.274 0.369 0.478 0.57 0.648 0.714 0.822 0.879 0.932 1.004 1.13 1.18 1.272 1.355 1.443 1.489 1.583 1.678 1.797 1.872 1.953 2.067 2.165 2.256 2.343 2.425 2.524 2.622 2.725 2.85 2.96 3.069 3.195 3.336 3.465 3.605 3.761 3.903 4.032 4.185 4.374 4.588 4.838 5.061 5.265 5.476 5.707 5.912 5.843 5.422 4.986 4.58 4.199 3.801 3.417 3.088 2.812 2.523 2.286 2.065 1.847 1.644 1.456 1.273 1.069 0.891 0.738 0.579 0.412 0.273 0.134 -0.021 -0.141 -0.253 -0.378 -0.522 -0.673 -0.772 -0.866 -1.012 -1.116 -1.218 -1.273 -1.394 -1.506 -1.6 -1.653 -1.791 -1.863 -1.942 -2.035 -2.22 -2.309 -2.408 -2.522 -2.639 -2.762 -2.922 -3.348 -9 ,29135 ,TETRA ,17555427,Fri Nov 26 01:16:03 CET,Fri Nov 26 03:46:02 CET,0.0 0.219 0.333 0.438 0.539 0.616 0.684 0.751 0.898 0.959 1.013 1.05 1.154 1.201 1.29 1.365 1.447 1.492 1.574 1.664 1.8 1.875 1.939 2.041 2.143 2.232 2.32 2.41 2.522 2.625 2.722 2.831 2.934 3.029 3.134 3.26 3.376 3.502 3.638 3.781 3.925 4.085 4.275 4.463 4.672 4.901 5.144 5.358 5.539 5.646 5.57 5.246 4.857 4.444 4.051 3.643 3.234 2.865 2.547 2.246 1.993 1.732 1.471 1.229 1.009 0.804 0.582 0.396 0.24 0.052 -0.14 -0.285 -0.433 -0.579 -0.696 -0.828 -0.963 -1.106 -1.257 -1.352 -1.457 -1.629 -1.742 -1.867 -1.929 -2.045 -2.17 -2.315 -2.4 -2.552 -2.65 -2.732 -2.823 -3.041 -3.15 -3.249 -3.372 -3.53 -3.719 -3.977 -4.728 -10 ,25506 ,TETRA ,17555428,Fri Nov 26 01:16:06 CET,Fri Nov 26 03:45:45 CET,0.0 0.223 0.374 0.532 0.689 0.813 0.893 0.964 1.11 1.185 1.252 1.321 1.446 1.5 1.612 1.707 1.788 1.829 1.914 2.005 2.138 2.22 2.296 2.402 2.511 2.621 2.721 2.816 2.94 3.055 3.155 3.283 3.412 3.529 3.669 3.823 3.96 4.121 4.293 4.47 4.653 4.838 5.043 5.232 5.415 5.596 5.778 5.957 6.131 6.219 6.152 5.889 5.503 5.052 4.643 4.29 3.944 3.603 3.306 3.028 2.795 2.571 2.356 2.153 1.955 1.776 1.587 1.416 1.27 1.118 0.962 0.835 0.705 0.566 0.459 0.343 0.215 0.085 -0.057 -0.148 -0.235 -0.394 -0.507 -0.619 -0.676 -0.794 -0.929 -1.072 -1.146 -1.281 -1.366 -1.43 -1.501 -1.692 -1.802 -1.916 -2.046 -2.194 -2.353 -2.556 -3.24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt deleted file mode 100644 index 88868a48..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32214 ,TETRA ,17555429,Fri Nov 26 01:18:05 CET,Fri Nov 26 03:42:32 CET,0.0 0.394 0.548 0.68 0.795 0.884 0.959 1.034 1.16 1.215 1.267 1.315 1.43 1.483 1.575 1.65 1.718 1.75 1.817 1.883 1.963 2.015 2.069 2.147 2.22 2.293 2.369 2.444 2.534 2.604 2.675 2.77 2.858 2.938 3.015 3.102 3.184 3.279 3.363 3.43 3.5 3.561 3.616 3.683 3.757 3.801 3.813 3.766 3.601 3.234 2.503 1.5 0.62 -0.168 -0.875 -1.518 -2.103 -2.611 -3.055 -3.503 -3.86 -4.167 -4.464 -4.746 -5.007 -5.25 -5.508 -5.728 -5.931 -6.147 -6.361 -6.541 -6.72 -6.911 -7.063 -7.212 -7.361 -7.513 -7.665 -7.77 -7.883 -8.064 -8.186 -8.32 -8.392 -8.53 -8.672 -8.831 -8.921 -9.083 -9.209 -9.323 -9.453 -9.732 -9.864 -10.013 -10.173 -10.329 -10.571 -10.874 -11.855 -2 ,11809 ,TETRA ,17555430,Fri Nov 26 01:18:07 CET,Fri Nov 26 03:43:38 CET,0.0 0.493 0.636 0.757 0.854 0.932 1.004 1.068 1.193 1.261 1.328 1.373 1.483 1.529 1.616 1.696 1.778 1.823 1.9 1.973 2.092 2.161 2.23 2.318 2.395 2.466 2.545 2.622 2.718 2.812 2.896 2.997 3.098 3.188 3.286 3.394 3.489 3.585 3.698 3.802 3.892 3.994 4.105 4.201 4.286 4.36 4.361 4.278 4.065 3.622 2.829 1.766 0.801 -0.089 -0.876 -1.554 -2.118 -2.628 -3.091 -3.567 -3.964 -4.305 -4.626 -4.934 -5.217 -5.463 -5.716 -5.954 -6.169 -6.37 -6.574 -6.764 -6.956 -7.146 -7.298 -7.456 -7.608 -7.758 -7.918 -8.027 -8.143 -8.32 -8.437 -8.567 -8.633 -8.757 -8.884 -9.026 -9.106 -9.271 -9.396 -9.498 -9.607 -9.807 -9.904 -10.019 -10.146 -10.294 -10.47 -10.69 -11.184 -3 ,4973 ,TETRA ,17555431,Fri Nov 26 01:18:09 CET,Fri Nov 26 03:31:25 CET,0.0 0.58 0.76 0.863 0.957 1.058 1.158 1.232 1.357 1.421 1.479 1.512 1.631 1.686 1.78 1.869 1.954 1.996 2.079 2.15 2.249 2.305 2.367 2.455 2.544 2.644 2.725 2.794 2.895 2.994 3.072 3.159 3.245 3.322 3.4 3.492 3.6 3.706 3.8 3.885 3.965 4.069 4.17 4.258 4.314 4.338 4.351 4.328 4.194 3.828 3.025 1.894 0.894 0.026 -0.66 -1.277 -1.834 -2.307 -2.723 -3.158 -3.541 -3.913 -4.277 -4.571 -4.829 -5.089 -5.367 -5.593 -5.778 -5.973 -6.184 -6.356 -6.525 -6.704 -6.85 -6.996 -7.144 -7.293 -7.438 -7.549 -7.669 -7.847 -7.972 -8.093 -8.156 -8.294 -8.433 -8.576 -8.648 -8.804 -8.903 -8.99 -9.094 -9.314 -9.423 -9.552 -9.702 -9.859 -10.037 -10.208 -10.648 -4 ,28926 ,TETRA ,17555432,Fri Nov 26 01:20:05 CET,Fri Nov 26 03:46:25 CET,0.0 0.225 0.371 0.481 0.581 0.683 0.76 0.821 0.955 1.021 1.082 1.12 1.229 1.272 1.346 1.43 1.519 1.562 1.639 1.713 1.848 1.93 1.988 2.062 2.123 2.182 2.245 2.31 2.394 2.478 2.56 2.65 2.743 2.82 2.883 2.947 3.011 3.086 3.177 3.272 3.355 3.432 3.497 3.568 3.64 3.682 3.668 3.557 3.321 2.871 2.039 0.868 -0.164 -1.061 -1.831 -2.513 -3.114 -3.621 -4.037 -4.49 -4.901 -5.239 -5.553 -5.841 -6.118 -6.377 -6.631 -6.86 -7.057 -7.253 -7.449 -7.611 -7.773 -7.943 -8.085 -8.231 -8.372 -8.522 -8.692 -8.814 -8.934 -9.129 -9.273 -9.402 -9.461 -9.599 -9.749 -9.918 -10.003 -10.16 -10.259 -10.347 -10.454 -10.708 -10.823 -10.926 -11.042 -11.17 -11.314 -11.514 -12.127 -5 ,16631 ,TETRA ,17555433,Fri Nov 26 01:20:07 CET,Fri Nov 26 03:46:09 CET,0.0 0.309 0.414 0.505 0.609 0.702 0.772 0.834 0.961 1.021 1.073 1.118 1.234 1.289 1.385 1.471 1.547 1.588 1.668 1.737 1.849 1.915 1.97 2.06 2.156 2.24 2.322 2.4 2.485 2.575 2.658 2.745 2.818 2.89 3.003 3.128 3.225 3.308 3.401 3.499 3.588 3.674 3.752 3.804 3.846 3.878 3.851 3.737 3.485 3.033 2.197 1.113 0.199 -0.614 -1.339 -2.014 -2.579 -3.058 -3.489 -3.951 -4.343 -4.669 -4.977 -5.269 -5.542 -5.8 -6.074 -6.315 -6.511 -6.721 -6.957 -7.138 -7.32 -7.523 -7.683 -7.845 -8.009 -8.171 -8.324 -8.425 -8.539 -8.72 -8.848 -8.997 -9.072 -9.228 -9.383 -9.531 -9.606 -9.757 -9.857 -9.952 -10.056 -10.298 -10.422 -10.543 -10.684 -10.856 -11.057 -11.266 -12.339 -6 ,29111 ,TETRA ,17555434,Fri Nov 26 01:20:05 CET,Fri Nov 26 03:30:59 CET,0.0 0.461 0.555 0.636 0.727 0.815 0.896 0.961 1.074 1.138 1.192 1.222 1.327 1.372 1.453 1.527 1.597 1.636 1.706 1.771 1.876 1.939 1.998 2.1 2.2 2.279 2.363 2.454 2.555 2.63 2.703 2.795 2.87 2.951 3.045 3.131 3.206 3.287 3.381 3.471 3.544 3.624 3.697 3.745 3.8 3.848 3.88 3.833 3.668 3.25 2.327 1.085 -0.004 -0.898 -1.652 -2.353 -2.958 -3.488 -3.93 -4.366 -4.746 -5.082 -5.407 -5.718 -5.989 -6.225 -6.476 -6.702 -6.891 -7.082 -7.293 -7.465 -7.638 -7.811 -7.949 -8.095 -8.236 -8.393 -8.563 -8.685 -8.821 -9.023 -9.156 -9.293 -9.366 -9.507 -9.642 -9.797 -9.877 -10.042 -10.166 -10.267 -10.372 -10.584 -10.688 -10.798 -10.922 -11.06 -11.227 -11.411 -11.708 -7 ,22259 ,TETRA ,17555435,Fri Nov 26 01:28:15 CET,Fri Nov 26 03:39:31 CET,0.0 0.301 0.449 0.563 0.661 0.725 0.803 0.879 1.004 1.069 1.131 1.184 1.299 1.342 1.421 1.51 1.607 1.65 1.727 1.799 1.896 1.958 2.015 2.099 2.175 2.246 2.326 2.406 2.496 2.577 2.657 2.746 2.832 2.911 2.991 3.085 3.178 3.267 3.362 3.456 3.531 3.613 3.722 3.823 3.877 3.891 3.858 3.726 3.475 2.937 1.897 0.634 -0.46 -1.352 -2.103 -2.762 -3.353 -3.888 -4.326 -4.745 -5.077 -5.391 -5.699 -5.991 -6.241 -6.448 -6.679 -6.892 -7.085 -7.301 -7.533 -7.716 -7.9 -8.093 -8.243 -8.401 -8.562 -8.721 -8.898 -9.024 -9.146 -9.337 -9.465 -9.593 -9.657 -9.793 -9.943 -10.104 -10.188 -10.352 -10.466 -10.557 -10.651 -10.858 -10.974 -11.118 -11.297 -11.492 -11.688 -11.884 -12.547 -8 ,24756 ,TETRA ,17555436,Fri Nov 26 01:33:10 CET,Fri Nov 26 03:57:27 CET,0.0 0.264 0.404 0.501 0.59 0.677 0.75 0.813 0.955 1.024 1.08 1.128 1.243 1.283 1.365 1.457 1.541 1.577 1.654 1.729 1.816 1.877 1.949 2.053 2.147 2.226 2.297 2.365 2.45 2.519 2.589 2.697 2.787 2.853 2.931 3.027 3.124 3.229 3.324 3.409 3.506 3.591 3.664 3.721 3.763 3.788 3.788 3.724 3.54 3.226 2.6 1.617 0.727 -0.073 -0.772 -1.362 -1.9 -2.398 -2.819 -3.253 -3.63 -3.967 -4.293 -4.62 -4.913 -5.17 -5.439 -5.659 -5.849 -6.046 -6.238 -6.413 -6.605 -6.791 -6.933 -7.076 -7.207 -7.346 -7.506 -7.62 -7.746 -7.942 -8.084 -8.24 -8.314 -8.453 -8.589 -8.745 -8.83 -8.99 -9.09 -9.18 -9.281 -9.515 -9.645 -9.779 -9.913 -10.05 -10.243 -10.488 -11.342 -9 ,10881 ,TETRA ,17555437,Fri Nov 26 01:34:09 CET,Fri Nov 26 03:59:01 CET,0.0 0.42 0.565 0.693 0.807 0.902 0.967 1.026 1.151 1.216 1.275 1.321 1.433 1.489 1.6 1.686 1.773 1.818 1.891 1.954 2.037 2.088 2.138 2.214 2.297 2.372 2.441 2.513 2.604 2.695 2.781 2.871 2.959 3.054 3.171 3.279 3.368 3.48 3.588 3.673 3.766 3.876 3.973 4.05 4.146 4.216 4.224 4.147 3.954 3.591 2.85 1.847 0.911 0.147 -0.459 -1.022 -1.518 -1.981 -2.386 -2.777 -3.117 -3.418 -3.709 -3.988 -4.23 -4.454 -4.699 -4.923 -5.113 -5.295 -5.493 -5.659 -5.823 -5.986 -6.108 -6.245 -6.4 -6.576 -6.748 -6.865 -6.985 -7.176 -7.319 -7.45 -7.51 -7.64 -7.773 -7.901 -7.974 -8.118 -8.201 -8.284 -8.38 -8.605 -8.719 -8.854 -9.008 -9.179 -9.368 -9.562 -10.039 -10 ,28080 ,TETRA ,17555438,Fri Nov 26 01:24:08 CET,Fri Nov 26 03:35:25 CET,0.0 0.299 0.423 0.511 0.597 0.702 0.792 0.863 0.984 1.043 1.095 1.14 1.25 1.298 1.42 1.52 1.581 1.615 1.699 1.778 1.878 1.936 1.992 2.07 2.142 2.207 2.263 2.326 2.418 2.505 2.573 2.646 2.736 2.809 2.885 2.986 3.085 3.192 3.3 3.415 3.51 3.592 3.678 3.773 3.866 3.906 3.924 3.879 3.761 3.435 2.704 1.724 0.844 0.055 -0.681 -1.36 -1.935 -2.431 -2.863 -3.298 -3.676 -4.007 -4.332 -4.636 -4.889 -5.12 -5.367 -5.582 -5.77 -5.962 -6.155 -6.316 -6.475 -6.65 -6.801 -6.961 -7.114 -7.275 -7.446 -7.559 -7.676 -7.851 -7.975 -8.112 -8.186 -8.33 -8.48 -8.643 -8.724 -8.885 -8.99 -9.079 -9.179 -9.362 -9.463 -9.593 -9.736 -9.879 -10.046 -10.234 -10.698 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt deleted file mode 100644 index 50a2053d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30666 ,TETRA ,17555439,Fri Nov 26 01:24:08 CET,Fri Nov 26 03:33:34 CET,0.0 0.299 0.462 0.588 0.702 0.796 0.869 0.939 1.071 1.138 1.202 1.254 1.373 1.424 1.52 1.618 1.712 1.759 1.851 1.938 2.066 2.148 2.24 2.369 2.479 2.591 2.703 2.805 2.93 3.064 3.199 3.356 3.509 3.656 3.832 4.039 4.237 4.441 4.655 4.896 5.154 5.46 5.826 6.178 6.599 7.084 7.661 8.341 9.16 10.17 11.357 12.244 12.693 12.853 12.865 12.869 12.827 12.708 12.593 12.45 12.297 12.177 12.066 11.939 11.812 11.689 11.552 11.431 11.312 11.182 11.057 10.953 10.845 10.722 10.617 10.504 10.369 10.206 10.042 9.935 9.824 9.646 9.509 9.361 9.283 9.121 8.949 8.771 8.68 8.521 8.289 8.135 7.993 7.698 7.539 7.359 7.169 6.965 6.692 6.286 4.881 -2 ,12285 ,TETRA ,17555440,Fri Nov 26 01:38:10 CET,Fri Nov 26 04:01:34 CET,0.0 0.338 0.468 0.56 0.653 0.74 0.825 0.895 0.998 1.061 1.128 1.182 1.301 1.355 1.463 1.56 1.646 1.686 1.765 1.849 1.973 2.047 2.12 2.234 2.343 2.442 2.536 2.631 2.763 2.903 3.036 3.188 3.335 3.473 3.631 3.826 4.021 4.233 4.478 4.734 4.988 5.285 5.656 6.035 6.485 7.003 7.608 8.276 9.055 10.009 11.12 11.879 12.226 12.382 12.429 12.411 12.325 12.205 12.097 11.958 11.82 11.665 11.518 11.39 11.256 11.132 10.995 10.874 10.762 10.641 10.51 10.386 10.261 10.127 10.019 9.906 9.786 9.661 9.522 9.405 9.284 9.111 8.987 8.844 8.763 8.588 8.399 8.198 8.102 7.959 7.79 7.675 7.547 7.254 7.083 6.895 6.696 6.451 6.141 5.698 4.219 -3 ,25713 ,TETRA ,17555441,Fri Nov 26 01:36:06 CET,Fri Nov 26 03:59:32 CET,0.0 0.33 0.457 0.562 0.666 0.746 0.808 0.871 0.996 1.055 1.12 1.183 1.307 1.353 1.443 1.532 1.617 1.657 1.743 1.834 1.954 2.033 2.11 2.221 2.332 2.438 2.537 2.64 2.772 2.896 3.025 3.174 3.317 3.471 3.647 3.839 4.033 4.252 4.482 4.726 4.991 5.294 5.639 5.993 6.423 6.914 7.482 8.126 8.892 9.829 10.951 11.709 12.027 12.123 12.155 12.208 12.237 12.218 12.155 12.037 11.898 11.761 11.625 11.463 11.287 11.132 10.968 10.814 10.673 10.522 10.359 10.227 10.083 9.922 9.786 9.636 9.481 9.322 9.159 9.041 8.924 8.752 8.625 8.49 8.424 8.29 8.134 7.948 7.853 7.709 7.542 7.432 7.31 7.017 6.87 6.7 6.484 6.219 5.921 5.585 4.126 -4 ,25658 ,TETRA ,17555442,Fri Nov 26 01:38:10 CET,Fri Nov 26 04:01:40 CET,0.0 0.294 0.408 0.512 0.602 0.693 0.764 0.819 0.945 1.015 1.077 1.125 1.239 1.288 1.382 1.466 1.552 1.602 1.691 1.769 1.891 1.97 2.047 2.155 2.259 2.356 2.461 2.57 2.719 2.863 2.989 3.143 3.295 3.451 3.637 3.848 4.052 4.278 4.537 4.807 5.076 5.385 5.747 6.094 6.508 6.978 7.513 8.125 8.84 9.683 10.655 11.326 11.548 11.618 11.598 11.475 11.283 11.09 10.923 10.735 10.556 10.374 10.203 10.042 9.872 9.697 9.504 9.325 9.168 9.022 8.841 8.682 8.525 8.357 8.218 8.064 7.915 7.762 7.587 7.468 7.347 7.146 7.003 6.849 6.764 6.58 6.382 6.193 6.094 5.939 5.763 5.629 5.48 5.136 4.954 4.773 4.577 4.317 3.961 3.543 2.288 -5 ,3149 ,TETRA ,17555443,Fri Nov 26 01:38:10 CET,Fri Nov 26 04:01:14 CET,0.0 0.392 0.532 0.642 0.725 0.798 0.868 0.939 1.063 1.117 1.174 1.219 1.324 1.363 1.448 1.546 1.636 1.675 1.756 1.84 1.957 2.033 2.108 2.227 2.347 2.449 2.548 2.652 2.78 2.909 3.042 3.204 3.357 3.508 3.681 3.872 4.063 4.261 4.479 4.718 4.98 5.288 5.642 6.003 6.441 6.93 7.481 8.13 8.937 9.905 11.092 11.969 12.327 12.459 12.438 12.357 12.268 12.139 12.034 11.91 11.765 11.629 11.502 11.386 11.272 11.164 11.02 10.867 10.733 10.59 10.433 10.304 10.178 10.048 9.941 9.822 9.689 9.56 9.409 9.295 9.173 8.978 8.85 8.727 8.661 8.525 8.387 8.234 8.155 8.018 7.87 7.758 7.633 7.376 7.221 7.049 6.866 6.612 6.253 5.853 4.548 -6 ,6942 ,TETRA ,17555444,Fri Nov 26 01:38:11 CET,Fri Nov 26 04:01:28 CET,0.0 0.202 0.338 0.435 0.507 0.584 0.665 0.738 0.852 0.91 0.973 1.018 1.129 1.184 1.283 1.371 1.457 1.499 1.582 1.659 1.774 1.855 1.933 2.041 2.149 2.254 2.362 2.462 2.59 2.713 2.83 2.977 3.126 3.279 3.451 3.647 3.84 4.053 4.289 4.551 4.825 5.12 5.466 5.838 6.291 6.811 7.402 8.047 8.805 9.709 10.768 11.574 11.999 12.18 12.245 12.26 12.2 12.116 12.037 11.971 11.922 11.859 11.797 11.731 11.646 11.533 11.405 11.294 11.195 11.09 10.972 10.864 10.754 10.633 10.53 10.418 10.302 10.181 10.054 9.957 9.853 9.711 9.603 9.482 9.426 9.305 9.167 9.005 8.923 8.798 8.647 8.538 8.431 8.178 8.034 7.869 7.663 7.435 7.202 6.826 5.713 -7 ,6230 ,TETRA ,17555445,Fri Nov 26 01:47:13 CET,Fri Nov 26 04:08:41 CET,0.0 0.244 0.375 0.52 0.624 0.7 0.776 0.847 0.971 1.032 1.093 1.152 1.275 1.327 1.414 1.51 1.598 1.638 1.726 1.811 1.933 2.012 2.091 2.212 2.329 2.446 2.555 2.653 2.787 2.915 3.043 3.207 3.352 3.494 3.677 3.894 4.089 4.297 4.542 4.811 5.087 5.395 5.768 6.133 6.551 7.039 7.614 8.306 9.143 10.112 11.214 11.98 12.316 12.467 12.494 12.459 12.389 12.264 12.118 11.966 11.81 11.655 11.516 11.373 11.218 11.077 10.948 10.839 10.743 10.624 10.493 10.382 10.255 10.125 10.029 9.927 9.812 9.683 9.534 9.413 9.287 9.109 8.983 8.847 8.78 8.65 8.504 8.324 8.219 8.052 7.864 7.745 7.624 7.345 7.173 6.968 6.722 6.419 6.103 5.675 3.936 -8 ,8044 ,TETRA ,17555446,Fri Nov 26 01:40:10 CET,Fri Nov 26 04:07:32 CET,0.0 0.442 0.57 0.653 0.743 0.833 0.909 0.981 1.095 1.148 1.201 1.248 1.362 1.413 1.514 1.607 1.698 1.746 1.83 1.915 2.038 2.117 2.2 2.312 2.418 2.524 2.629 2.724 2.85 2.986 3.115 3.268 3.422 3.571 3.749 3.945 4.126 4.34 4.573 4.818 5.085 5.383 5.716 6.059 6.492 7.01 7.594 8.218 8.959 9.895 11.026 11.928 12.461 12.709 12.832 12.886 12.855 12.779 12.682 12.553 12.449 12.367 12.278 12.16 12.041 11.93 11.792 11.668 11.559 11.439 11.306 11.196 11.087 10.962 10.851 10.737 10.616 10.481 10.348 10.258 10.156 9.998 9.886 9.758 9.696 9.574 9.437 9.294 9.219 9.091 8.946 8.838 8.721 8.461 8.314 8.143 7.951 7.74 7.497 7.169 6.285 -9 ,8706 ,TETRA ,17555447,Fri Nov 26 01:40:12 CET,Fri Nov 26 04:08:45 CET,0.0 0.298 0.429 0.529 0.625 0.728 0.829 0.913 1.047 1.112 1.174 1.238 1.364 1.421 1.536 1.637 1.733 1.777 1.864 1.942 2.055 2.136 2.215 2.328 2.432 2.541 2.66 2.77 2.905 3.04 3.171 3.329 3.485 3.641 3.825 4.021 4.212 4.434 4.677 4.941 5.228 5.54 5.893 6.279 6.76 7.285 7.887 8.562 9.345 10.281 11.422 12.301 12.679 12.832 12.846 12.815 12.742 12.625 12.512 12.372 12.231 12.095 11.941 11.774 11.628 11.501 11.362 11.225 11.086 10.924 10.75 10.604 10.457 10.304 10.183 10.056 9.926 9.794 9.659 9.573 9.481 9.318 9.188 9.049 8.979 8.842 8.678 8.497 8.408 8.266 8.123 8.016 7.897 7.631 7.482 7.312 7.121 6.909 6.651 6.297 4.836 -10 ,30631 ,TETRA ,17555448,Fri Nov 26 01:41:11 CET,Fri Nov 26 04:04:48 CET,0.0 0.864 1.005 1.1 1.2 1.304 1.393 1.475 1.623 1.69 1.755 1.816 1.93 1.974 2.064 2.159 2.259 2.304 2.388 2.469 2.596 2.676 2.747 2.861 2.969 3.067 3.176 3.285 3.414 3.545 3.669 3.82 3.976 4.115 4.276 4.474 4.664 4.872 5.102 5.348 5.616 5.931 6.29 6.661 7.111 7.631 8.23 8.878 9.625 10.55 11.689 12.547 12.964 13.138 13.162 13.095 12.999 12.871 12.731 12.586 12.43 12.264 12.088 11.907 11.744 11.597 11.437 11.289 11.153 11.006 10.846 10.704 10.562 10.417 10.296 10.176 10.057 9.93 9.776 9.673 9.584 9.427 9.299 9.163 9.097 8.968 8.829 8.689 8.613 8.465 8.296 8.196 8.086 7.823 7.687 7.539 7.377 7.182 6.944 6.653 5.833 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt deleted file mode 100644 index 70e32346..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9370 ,TETRA ,17555450,Fri Nov 26 01:49:14 CET,Fri Nov 26 03:58:41 CET,0.0 0.271 0.388 0.481 0.584 0.668 0.727 0.786 0.897 0.961 1.024 1.069 1.183 1.234 1.307 1.382 1.475 1.521 1.596 1.663 1.761 1.828 1.896 1.991 2.077 2.165 2.248 2.324 2.426 2.528 2.626 2.734 2.841 2.955 3.084 3.216 3.335 3.47 3.639 3.83 4.026 4.254 4.514 4.777 5.088 5.437 5.812 6.193 6.684 7.241 7.733 7.949 7.943 7.814 7.605 7.375 7.148 6.907 6.658 6.394 6.161 5.946 5.751 5.569 5.37 5.171 4.959 4.763 4.596 4.42 4.221 4.043 3.867 3.689 3.548 3.406 3.255 3.093 2.95 2.863 2.755 2.561 2.429 2.299 2.23 2.07 1.898 1.707 1.602 1.443 1.261 1.135 1.004 0.726 0.567 0.387 0.202 0.001 -0.238 -0.588 -1.77 -2 ,2434 ,TETRA ,17555451,Fri Nov 26 01:49:14 CET,Fri Nov 26 03:58:41 CET,0.0 0.272 0.393 0.49 0.587 0.666 0.736 0.811 0.951 1.021 1.092 1.144 1.251 1.298 1.389 1.473 1.553 1.594 1.665 1.727 1.827 1.895 1.964 2.06 2.149 2.241 2.336 2.426 2.528 2.624 2.73 2.863 2.983 3.101 3.246 3.387 3.523 3.681 3.862 4.064 4.267 4.48 4.733 5.007 5.312 5.652 6.028 6.417 6.877 7.389 7.827 7.912 7.751 7.49 7.241 6.99 6.72 6.403 6.098 5.788 5.487 5.231 4.992 4.726 4.474 4.253 4.017 3.781 3.559 3.341 3.121 2.935 2.729 2.518 2.35 2.154 1.957 1.766 1.569 1.437 1.294 1.058 0.887 0.708 0.623 0.459 0.272 0.056 -0.052 -0.213 -0.384 -0.506 -0.636 -0.932 -1.091 -1.271 -1.489 -1.726 -1.995 -2.353 -3.51 -3 ,29215 ,TETRA ,17555452,Fri Nov 26 01:50:17 CET,Fri Nov 26 04:14:19 CET,0.0 0.319 0.441 0.535 0.631 0.725 0.795 0.861 0.991 1.05 1.104 1.134 1.249 1.3 1.382 1.471 1.564 1.607 1.689 1.761 1.874 1.953 2.024 2.129 2.229 2.318 2.395 2.467 2.573 2.674 2.773 2.898 3.019 3.136 3.27 3.421 3.555 3.708 3.882 4.054 4.236 4.465 4.725 4.999 5.329 5.658 6.023 6.404 6.821 7.301 7.767 7.907 7.781 7.562 7.286 6.978 6.677 6.367 6.087 5.804 5.549 5.301 5.029 4.764 4.516 4.3 4.083 3.869 3.672 3.459 3.233 3.045 2.849 2.638 2.477 2.298 2.098 1.901 1.705 1.577 1.449 1.241 1.09 0.924 0.834 0.649 0.445 0.228 0.117 -0.058 -0.247 -0.383 -0.54 -0.855 -1.01 -1.192 -1.398 -1.637 -1.946 -2.342 -3.748 -4 ,6031 ,TETRA ,17555453,Fri Nov 26 01:50:18 CET,Fri Nov 26 04:13:38 CET,0.0 0.367 0.51 0.647 0.75 0.816 0.896 0.977 1.096 1.145 1.199 1.253 1.37 1.424 1.516 1.612 1.71 1.753 1.836 1.919 2.04 2.114 2.188 2.297 2.391 2.478 2.56 2.637 2.747 2.857 2.962 3.088 3.206 3.327 3.475 3.641 3.794 3.969 4.151 4.336 4.537 4.767 5.029 5.284 5.566 5.877 6.235 6.594 6.962 7.375 7.777 7.907 7.761 7.533 7.245 6.929 6.618 6.31 6.021 5.723 5.464 5.206 4.958 4.741 4.552 4.351 4.11 3.9 3.724 3.535 3.338 3.18 2.999 2.802 2.665 2.516 2.349 2.176 1.984 1.85 1.714 1.499 1.35 1.194 1.109 0.925 0.739 0.531 0.425 0.271 0.087 -0.05 -0.188 -0.459 -0.624 -0.821 -1.04 -1.328 -1.704 -2.195 -3.98 -5 ,15156 ,TETRA ,17555454,Fri Nov 26 01:50:17 CET,Fri Nov 26 03:59:53 CET,0.0 0.606 0.822 0.993 1.108 1.186 1.251 1.317 1.449 1.513 1.577 1.619 1.725 1.775 1.864 1.945 2.021 2.06 2.139 2.212 2.321 2.397 2.461 2.55 2.645 2.733 2.814 2.898 3.015 3.129 3.244 3.381 3.504 3.623 3.756 3.9 4.036 4.195 4.365 4.543 4.739 4.959 5.198 5.43 5.695 5.988 6.324 6.662 7.05 7.484 7.829 7.886 7.732 7.522 7.261 6.956 6.629 6.33 6.04 5.708 5.425 5.147 4.872 4.606 4.363 4.162 3.943 3.738 3.567 3.377 3.168 2.986 2.788 2.586 2.435 2.278 2.111 1.943 1.78 1.652 1.519 1.319 1.184 1.05 0.975 0.818 0.659 0.461 0.36 0.2 -0.016 -0.158 -0.293 -0.575 -0.738 -0.93 -1.145 -1.399 -1.703 -2.099 -3.539 -6 ,12058 ,TETRA ,17555455,Fri Nov 26 01:51:18 CET,Fri Nov 26 04:01:03 CET,0.0 0.196 0.266 0.342 0.421 0.499 0.582 0.654 0.769 0.822 0.872 0.916 1.027 1.082 1.187 1.268 1.339 1.375 1.449 1.524 1.644 1.727 1.804 1.91 2.017 2.115 2.2 2.286 2.406 2.523 2.627 2.758 2.88 2.986 3.114 3.272 3.428 3.605 3.803 4.009 4.216 4.427 4.671 4.929 5.21 5.516 5.886 6.278 6.717 7.203 7.623 7.702 7.552 7.38 7.214 7.007 6.812 6.582 6.339 6.113 5.905 5.692 5.477 5.275 5.104 4.957 4.802 4.66 4.525 4.363 4.167 3.997 3.819 3.629 3.491 3.352 3.198 3.028 2.84 2.697 2.561 2.366 2.221 2.065 1.98 1.799 1.627 1.446 1.345 1.181 1.011 0.89 0.753 0.409 0.223 0.043 -0.182 -0.459 -0.786 -1.311 -3.152 -7 ,29889 ,TETRA ,17555456,Fri Nov 26 01:52:16 CET,Fri Nov 26 04:11:57 CET,0.0 0.426 0.579 0.662 0.756 0.851 0.917 0.971 1.077 1.129 1.183 1.236 1.349 1.401 1.499 1.584 1.675 1.721 1.802 1.877 1.988 2.057 2.119 2.209 2.311 2.409 2.499 2.585 2.691 2.798 2.898 3.019 3.136 3.24 3.364 3.517 3.666 3.822 3.992 4.176 4.366 4.592 4.89 5.173 5.463 5.798 6.214 6.675 7.178 7.698 8.174 8.369 8.285 8.065 7.843 7.589 7.289 6.94 6.62 6.339 6.084 5.84 5.612 5.364 5.13 4.922 4.68 4.453 4.249 4.018 3.784 3.601 3.421 3.236 3.094 2.959 2.803 2.604 2.39 2.253 2.105 1.876 1.718 1.533 1.438 1.239 1.029 0.835 0.736 0.571 0.369 0.226 0.091 -0.184 -0.351 -0.546 -0.75 -0.973 -1.308 -1.801 -3.666 -8 ,27687 ,TETRA ,17555457,Fri Nov 26 01:54:17 CET,Fri Nov 26 03:56:51 CET,0.0 0.317 0.446 0.571 0.656 0.727 0.796 0.865 0.993 1.047 1.103 1.139 1.242 1.281 1.372 1.471 1.564 1.604 1.677 1.757 1.881 1.954 2.016 2.112 2.211 2.31 2.408 2.491 2.597 2.698 2.794 2.918 3.033 3.141 3.274 3.428 3.576 3.737 3.905 4.084 4.282 4.508 4.765 5.023 5.348 5.708 6.092 6.481 6.921 7.393 7.812 8.024 7.972 7.761 7.528 7.29 7.049 6.792 6.543 6.303 6.091 5.878 5.661 5.455 5.26 5.068 4.865 4.671 4.482 4.295 4.118 3.982 3.851 3.705 3.573 3.43 3.278 3.12 2.952 2.825 2.692 2.484 2.342 2.208 2.136 1.97 1.796 1.603 1.495 1.318 1.123 0.989 0.842 0.541 0.39 0.213 0.002 -0.236 -0.506 -0.856 -1.951 -9 ,28394 ,TETRA ,17555458,Fri Nov 26 01:54:17 CET,Fri Nov 26 04:03:43 CET,0.0 0.21 0.293 0.378 0.458 0.519 0.584 0.658 0.785 0.838 0.887 0.926 1.041 1.096 1.186 1.263 1.342 1.378 1.452 1.541 1.675 1.752 1.828 1.936 2.022 2.104 2.189 2.271 2.371 2.471 2.573 2.701 2.83 2.949 3.083 3.232 3.368 3.525 3.702 3.895 4.097 4.311 4.562 4.821 5.114 5.42 5.778 6.157 6.568 7.019 7.415 7.537 7.429 7.214 6.972 6.754 6.522 6.301 6.12 5.91 5.715 5.519 5.307 5.094 4.882 4.681 4.476 4.288 4.122 3.952 3.777 3.622 3.446 3.261 3.119 2.977 2.816 2.647 2.482 2.356 2.228 2.028 1.883 1.735 1.657 1.483 1.295 1.084 0.967 0.791 0.605 0.479 0.348 0.074 -0.097 -0.31 -0.546 -0.816 -1.143 -1.576 -2.757 -10 ,21289 ,TETRA ,17555459,Fri Nov 26 01:56:22 CET,Fri Nov 26 03:58:59 CET,0.0 0.799 0.971 1.105 1.206 1.297 1.382 1.454 1.576 1.633 1.695 1.747 1.856 1.902 2.008 2.109 2.191 2.231 2.321 2.401 2.505 2.566 2.631 2.734 2.824 2.918 3.016 3.113 3.238 3.352 3.453 3.569 3.691 3.815 3.961 4.115 4.26 4.441 4.648 4.861 5.092 5.359 5.665 5.964 6.301 6.671 7.093 7.596 8.185 8.82 9.534 10.004 10.082 9.92 9.717 9.504 9.261 9.017 8.805 8.569 8.344 8.16 7.988 7.798 7.604 7.423 7.224 7.06 6.92 6.759 6.581 6.437 6.296 6.14 6.014 5.88 5.74 5.599 5.449 5.336 5.225 5.064 4.946 4.828 4.765 4.626 4.478 4.32 4.232 4.089 3.953 3.842 3.74 3.509 3.355 3.16 2.955 2.747 2.499 2.228 1.344 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt deleted file mode 100644 index 5a4efef7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26015 ,TETRA ,17555460,Fri Nov 26 01:55:16 CET,Fri Nov 26 04:19:40 CET,0.0 3.417 3.91 4.239 4.53 4.749 4.938 5.135 5.496 5.641 5.77 5.749 6.153 6.264 6.506 6.747 6.953 7.06 7.266 7.455 7.72 7.887 8.012 8.124 8.222 8.317 8.387 8.413 8.416 8.411 8.413 8.42 8.381 8.318 8.241 8.122 7.981 7.807 7.575 7.328 7.13 6.925 6.532 5.979 5.259 4.324 3.044 1.232 -1.345 -5.025 -10.908 -17.293 -22.131 -26.121 -29.476 -32.389 -34.842 -37.041 -38.915 -40.732 -42.264 -43.61 -44.876 -46.053 -47.127 -48.104 -49.143 -50.08 -50.894 -51.71 -52.537 -53.241 -53.999 -54.8 -55.415 -56.032 -56.648 -57.267 -57.873 -58.27 -58.693 -59.382 -59.882 -60.397 -60.656 -61.217 -61.779 -62.34 -62.661 -63.348 -63.619 -63.979 -64.363 -65.135 -65.508 -65.946 -66.486 -67.104 -67.782 -68.822 -73.542 -2 ,24230 ,TETRA ,17555461,Fri Nov 26 01:55:19 CET,Fri Nov 26 04:20:23 CET,0.0 2.166 2.685 3.066 3.39 3.67 3.914 4.173 4.638 4.839 5.034 5.117 5.565 5.705 5.973 6.228 6.419 6.504 6.701 6.869 7.07 7.201 7.335 7.531 7.693 7.832 7.948 8.056 8.183 8.29 8.397 8.473 8.489 8.517 8.543 8.536 8.519 8.444 8.321 8.142 7.9 7.551 7.068 6.546 5.842 4.873 3.54 1.688 -1.0 -4.796 -10.651 -17.223 -22.321 -26.474 -29.966 -32.992 -35.553 -37.812 -39.644 -41.398 -42.942 -44.264 -45.503 -46.694 -47.779 -48.753 -49.776 -50.735 -51.615 -52.56 -53.523 -54.3 -55.09 -55.878 -56.471 -57.056 -57.653 -58.247 -58.849 -59.266 -59.691 -60.384 -60.881 -61.354 -61.58 -62.051 -62.563 -63.128 -63.405 -64.049 -64.319 -64.654 -65.024 -65.841 -66.285 -66.741 -67.229 -67.799 -68.478 -69.303 -72.048 -4 ,28891 ,TETRA ,17555463,Fri Nov 26 01:56:22 CET,Fri Nov 26 04:06:05 CET,0.0 9.918 10.536 10.942 11.245 11.526 11.794 12.035 12.436 12.637 12.83 12.883 13.323 13.479 13.761 13.997 14.196 14.286 14.44 14.564 14.723 14.826 14.933 15.08 15.221 15.36 15.491 15.622 15.764 15.878 15.956 16.043 16.15 16.218 16.291 16.336 16.309 16.237 16.1 15.898 15.622 15.185 14.63 14.052 13.246 12.222 10.779 8.801 6.057 2.072 -4.033 -10.61 -15.691 -19.799 -23.133 -26.024 -28.464 -30.536 -32.345 -34.155 -35.652 -36.998 -38.289 -39.474 -40.583 -41.568 -42.511 -43.341 -44.053 -44.799 -45.598 -46.268 -46.95 -47.67 -48.257 -48.835 -49.384 -49.923 -50.47 -50.856 -51.288 -52.001 -52.488 -52.981 -53.248 -53.829 -54.438 -55.055 -55.363 -56.036 -56.345 -56.701 -57.07 -57.826 -58.217 -58.644 -59.097 -59.571 -60.153 -60.977 -63.753 -5 ,4346 ,TETRA ,17555464,Fri Nov 26 01:57:25 CET,Fri Nov 26 04:21:43 CET,0.0 3.381 3.737 4.094 4.393 4.611 4.862 5.098 5.425 5.574 5.724 5.727 6.16 6.296 6.564 6.805 7.023 7.139 7.364 7.578 7.868 8.04 8.21 8.477 8.752 9.01 9.242 9.477 9.782 10.079 10.348 10.618 10.86 11.097 11.368 11.616 11.714 11.682 11.632 11.513 11.273 10.909 10.398 9.809 9.064 8.059 6.627 4.728 2.014 -1.901 -8.049 -15.04 -20.383 -24.635 -28.162 -31.207 -33.763 -35.983 -37.89 -39.784 -41.408 -42.892 -44.305 -45.643 -46.84 -47.888 -48.99 -49.958 -50.775 -51.611 -52.457 -53.135 -53.828 -54.542 -55.105 -55.691 -56.287 -56.891 -57.539 -57.976 -58.416 -59.094 -59.569 -60.057 -60.299 -60.81 -61.336 -61.888 -62.179 -62.854 -63.108 -63.43 -63.754 -64.447 -64.866 -65.342 -65.885 -66.533 -67.239 -68.268 -72.342 -6 ,26728 ,TETRA ,17555465,Fri Nov 26 01:59:18 CET,Fri Nov 26 04:25:48 CET,0.0 3.041 3.54 3.932 4.268 4.578 4.856 5.084 5.474 5.66 5.837 5.889 6.336 6.478 6.71 6.941 7.157 7.24 7.39 7.513 7.646 7.739 7.834 7.978 8.139 8.286 8.383 8.459 8.574 8.681 8.764 8.934 9.13 9.232 9.264 9.236 9.179 9.108 8.968 8.76 8.55 8.299 7.895 7.348 6.549 5.525 4.132 2.294 -0.328 -4.209 -10.348 -17.252 -22.448 -26.566 -29.945 -32.884 -35.396 -37.585 -39.433 -41.242 -42.802 -44.147 -45.338 -46.421 -47.481 -48.496 -49.545 -50.437 -51.2 -52.012 -52.872 -53.591 -54.318 -55.083 -55.681 -56.262 -56.86 -57.509 -58.17 -58.625 -59.101 -59.861 -60.388 -60.891 -61.143 -61.68 -62.25 -62.866 -63.191 -63.861 -64.149 -64.492 -64.876 -65.797 -66.275 -66.739 -67.288 -67.951 -68.72 -69.861 -78.978 -7 ,9854 ,TETRA ,17555466,Fri Nov 26 01:59:18 CET,Fri Nov 26 04:09:38 CET,0.0 2.533 3.282 3.764 4.128 4.459 4.755 5.043 5.562 5.797 6.024 6.148 6.609 6.77 7.102 7.433 7.699 7.817 8.039 8.245 8.56 8.737 8.916 9.215 9.425 9.514 9.556 9.594 9.646 9.728 9.793 9.801 9.782 9.738 9.692 9.649 9.585 9.482 9.31 9.157 9.06 8.897 8.505 7.937 7.171 6.158 4.76 2.89 0.314 -3.402 -9.462 -16.172 -21.328 -25.531 -28.913 -31.826 -34.296 -36.424 -38.236 -40.128 -41.766 -43.131 -44.382 -45.536 -46.599 -47.575 -48.564 -49.492 -50.386 -51.35 -52.315 -53.073 -53.832 -54.609 -55.229 -55.912 -56.596 -57.223 -57.867 -58.332 -58.826 -59.545 -60.034 -60.575 -60.842 -61.336 -61.837 -62.401 -62.718 -63.409 -63.727 -64.09 -64.476 -65.284 -65.724 -66.17 -66.646 -67.199 -67.852 -68.828 -72.897 -8 ,30783 ,TETRA ,17555467,Fri Nov 26 02:02:20 CET,Fri Nov 26 04:27:09 CET,0.0 2.282 2.712 3.061 3.389 3.722 4.001 4.266 4.741 4.921 5.085 5.06 5.449 5.555 5.722 5.896 6.073 6.144 6.294 6.436 6.602 6.696 6.775 6.879 6.992 7.093 7.183 7.266 7.342 7.384 7.403 7.398 7.388 7.377 7.365 7.349 7.288 7.172 7.022 6.808 6.511 6.119 5.594 4.972 4.129 3.114 1.72 -0.254 -2.921 -6.667 -12.562 -19.204 -24.31 -28.302 -31.575 -34.424 -36.809 -38.861 -40.63 -42.368 -43.808 -45.04 -46.236 -47.387 -48.394 -49.312 -50.301 -51.174 -51.879 -52.618 -53.408 -54.025 -54.665 -55.353 -55.878 -56.406 -56.938 -57.462 -58.017 -58.424 -58.831 -59.49 -59.972 -60.497 -60.78 -61.368 -61.993 -62.627 -62.967 -63.665 -63.988 -64.33 -64.703 -65.576 -66.065 -66.552 -67.067 -67.621 -68.181 -68.969 -73.333 -9 ,7001 ,TETRA ,17555468,Fri Nov 26 02:00:17 CET,Fri Nov 26 04:26:46 CET,0.0 2.244 2.74 3.042 3.314 3.591 3.832 4.022 4.338 4.474 4.604 4.578 4.982 5.099 5.336 5.546 5.744 5.845 6.036 6.214 6.48 6.658 6.821 7.054 7.242 7.366 7.475 7.562 7.671 7.793 7.915 8.07 8.21 8.326 8.399 8.421 8.409 8.38 8.364 8.261 8.04 7.755 7.342 6.85 6.159 5.209 3.91 2.231 -0.226 -4.014 -10.081 -16.91 -22.122 -26.328 -29.906 -33.013 -35.594 -37.867 -39.813 -41.724 -43.359 -44.81 -46.142 -47.361 -48.465 -49.429 -50.414 -51.296 -52.038 -52.798 -53.631 -54.436 -55.337 -56.218 -56.869 -57.552 -58.284 -59.043 -59.838 -60.38 -60.926 -61.756 -62.308 -62.879 -63.174 -63.778 -64.417 -65.089 -65.426 -66.112 -66.419 -66.796 -67.197 -67.953 -68.357 -68.78 -69.225 -69.717 -70.37 -71.315 -74.941 -10 ,32536 ,TETRA ,17555469,Fri Nov 26 02:00:17 CET,Fri Nov 26 04:10:00 CET,0.0 3.776 4.2 4.528 4.823 5.09 5.346 5.58 5.953 6.113 6.278 6.31 6.74 6.882 7.179 7.477 7.737 7.863 8.112 8.326 8.629 8.84 9.049 9.356 9.63 9.884 10.094 10.245 10.432 10.6 10.724 10.811 10.861 10.909 10.935 10.926 10.901 10.836 10.752 10.64 10.448 10.141 9.717 9.162 8.315 7.238 5.825 3.762 0.807 -3.209 -9.543 -16.616 -21.928 -26.202 -29.646 -32.538 -34.967 -37.111 -38.931 -40.749 -42.338 -43.755 -45.05 -46.232 -47.306 -48.297 -49.31 -50.197 -50.972 -51.736 -52.486 -53.087 -53.706 -54.37 -54.897 -55.482 -56.091 -56.752 -57.447 -57.895 -58.349 -59.075 -59.591 -60.096 -60.335 -60.849 -61.426 -62.006 -62.312 -62.977 -63.188 -63.507 -63.85 -64.576 -64.986 -65.422 -65.879 -66.401 -67.041 -67.91 -71.736 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index e2b61626..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12976 ,TETRA ,17555470,Fri Nov 26 02:06:17 CET,Fri Nov 26 04:29:31 CET,0.0 0.243 0.443 0.623 0.796 0.963 1.134 1.479 1.64 1.781 1.787 2.211 2.356 2.642 2.913 3.176 3.296 3.541 3.791 4.158 4.4 4.637 4.991 5.327 5.647 5.976 6.308 6.734 7.162 7.585 8.075 8.538 9.005 9.581 10.251 10.9 11.592 12.334 13.156 14.06 15.086 16.361 17.698 19.252 21.039 23.135 25.461 28.169 31.362 34.904 37.297 38.139 38.344 38.309 37.987 37.601 37.165 36.717 36.214 35.699 35.145 34.62 34.13 33.638 33.266 32.877 32.402 31.95 31.516 31.036 30.588 30.129 29.641 29.226 28.788 28.337 27.829 27.295 26.96 26.636 26.117 25.721 25.314 25.12 24.728 24.303 23.837 23.571 23.058 22.742 22.403 22.041 21.255 20.748 20.159 19.578 18.882 17.801 16.327 -2 ,14082 ,TETRA ,17555471,Fri Nov 26 02:06:20 CET,Fri Nov 26 04:29:24 CET,0.0 0.184 0.343 0.478 0.615 0.756 0.891 1.149 1.278 1.406 1.372 1.757 1.872 2.104 2.328 2.544 2.648 2.859 3.079 3.412 3.628 3.841 4.16 4.467 4.749 5.033 5.325 5.694 6.07 6.45 6.91 7.353 7.777 8.285 8.862 9.44 10.104 10.845 11.643 12.48 13.466 14.666 15.843 17.103 18.508 20.257 22.366 24.9 27.753 30.881 33.132 34.191 34.561 34.355 33.911 33.475 33.045 32.462 31.661 30.959 30.317 29.713 29.152 28.579 28.037 27.458 26.919 26.439 25.937 25.424 25.017 24.579 24.088 23.726 23.361 22.971 22.563 22.123 21.799 21.453 20.926 20.546 20.111 19.869 19.363 18.867 18.344 18.063 17.514 17.127 16.791 16.43 15.573 15.065 14.497 13.904 13.252 12.39 11.093 -3 ,2620 ,TETRA ,17555472,Fri Nov 26 02:06:22 CET,Fri Nov 26 04:28:52 CET,0.0 0.307 0.566 0.769 0.968 1.161 1.34 1.692 1.863 2.022 2.05 2.476 2.62 2.909 3.189 3.465 3.604 3.884 4.146 4.518 4.759 4.999 5.371 5.732 6.077 6.405 6.724 7.165 7.599 8.01 8.523 9.023 9.501 10.089 10.782 11.429 12.128 12.899 13.736 14.603 15.59 16.778 17.977 19.425 21.052 22.889 25.01 27.522 30.296 33.313 35.255 35.705 35.395 34.883 34.244 33.549 32.933 32.378 31.664 30.954 30.313 29.692 29.163 28.638 28.093 27.526 27.045 26.654 26.219 25.714 25.259 24.81 24.384 23.981 23.532 23.139 22.762 22.346 22.018 21.65 21.086 20.673 20.259 20.047 19.578 19.037 18.447 18.14 17.539 17.067 16.702 16.282 15.238 14.637 14.004 13.31 12.404 11.143 9.482 -4 ,1748 ,TETRA ,17555473,Fri Nov 26 02:09:22 CET,Fri Nov 26 04:32:03 CET,0.0 0.182 0.363 0.542 0.702 0.838 0.973 1.244 1.377 1.515 1.51 1.907 2.031 2.285 2.538 2.782 2.902 3.132 3.352 3.69 3.921 4.149 4.483 4.806 5.133 5.451 5.757 6.166 6.582 6.985 7.451 7.928 8.412 8.982 9.639 10.282 11.01 11.811 12.665 13.559 14.583 15.806 17.061 18.54 20.168 21.997 24.058 26.354 28.816 31.791 33.992 35.048 35.325 35.092 34.887 34.661 34.27 33.715 33.038 32.42 31.775 31.071 30.391 29.773 29.205 28.587 27.982 27.446 26.918 26.383 25.945 25.5 25.035 24.688 24.332 23.916 23.424 22.903 22.575 22.238 21.657 21.279 20.935 20.741 20.332 19.869 19.339 19.045 18.454 17.937 17.536 17.128 16.245 15.79 15.299 14.646 13.9 13.007 11.63 -5 ,27015 ,TETRA ,17555474,Fri Nov 26 02:09:22 CET,Fri Nov 26 04:32:00 CET,0.0 0.189 0.37 0.556 0.735 0.906 1.058 1.354 1.509 1.656 1.649 2.069 2.206 2.477 2.734 2.985 3.112 3.369 3.621 3.976 4.206 4.432 4.77 5.105 5.445 5.787 6.114 6.537 6.953 7.364 7.865 8.37 8.863 9.434 10.094 10.734 11.442 12.24 13.128 14.048 15.053 16.253 17.456 18.848 20.449 22.318 24.433 26.914 29.869 33.382 36.102 37.345 37.851 38.068 38.184 38.139 37.962 37.727 37.415 37.124 36.785 36.378 35.993 35.651 35.328 34.959 34.563 34.163 33.738 33.303 32.951 32.534 32.044 31.661 31.222 30.73 30.209 29.687 29.308 28.895 28.296 27.878 27.412 27.148 26.608 26.06 25.491 25.196 24.62 24.109 23.689 23.254 22.332 21.86 21.353 20.79 20.095 19.22 17.877 -6 ,3228 ,TETRA ,17555475,Fri Nov 26 02:21:21 CET,Fri Nov 26 04:42:44 CET,0.0 0.219 0.412 0.583 0.74 0.886 1.029 1.335 1.489 1.633 1.636 2.041 2.161 2.407 2.663 2.908 3.026 3.264 3.503 3.85 4.079 4.311 4.65 4.967 5.289 5.618 5.951 6.39 6.807 7.227 7.739 8.207 8.637 9.144 9.717 10.276 10.935 11.658 12.416 13.221 14.152 15.275 16.425 17.762 19.275 21.032 22.993 25.213 27.701 30.346 31.806 32.397 32.568 32.404 32.073 31.696 31.239 30.751 30.242 29.775 29.383 28.992 28.562 28.14 27.767 27.374 26.984 26.637 26.272 25.778 25.246 24.711 24.229 23.858 23.464 23.051 22.623 22.179 21.889 21.571 20.989 20.568 20.116 19.879 19.392 18.858 18.253 17.917 17.311 16.834 16.439 16.03 15.057 14.556 14.089 13.535 12.856 12.049 10.785 -7 ,31175 ,TETRA ,17555476,Fri Nov 26 02:21:22 CET,Fri Nov 26 04:43:26 CET,0.0 0.218 0.403 0.575 0.766 0.948 1.107 1.417 1.563 1.705 1.699 2.119 2.254 2.529 2.793 3.057 3.183 3.423 3.664 4.027 4.273 4.515 4.864 5.218 5.579 5.921 6.252 6.691 7.115 7.532 8.047 8.538 9.009 9.576 10.248 10.918 11.682 12.538 13.451 14.401 15.463 16.669 17.913 19.39 20.969 22.753 24.779 27.141 29.785 32.666 34.587 35.224 35.346 35.331 35.098 34.594 33.915 33.239 32.568 32.07 31.569 30.867 30.146 29.501 28.914 28.276 27.704 27.234 26.74 26.193 25.734 25.286 24.826 24.448 24.032 23.602 23.147 22.685 22.369 22.018 21.455 21.081 20.691 20.475 20.015 19.525 19.013 18.74 18.196 17.833 17.498 17.087 16.092 15.568 15.075 14.578 14.03 13.203 11.828 -8 ,10039 ,TETRA ,17555477,Fri Nov 26 02:22:18 CET,Fri Nov 26 04:45:11 CET,0.0 0.243 0.447 0.647 0.847 1.021 1.174 1.475 1.631 1.776 1.764 2.182 2.32 2.588 2.864 3.142 3.277 3.539 3.794 4.163 4.418 4.685 5.065 5.414 5.751 6.077 6.394 6.824 7.263 7.676 8.151 8.624 9.107 9.67 10.296 10.923 11.658 12.464 13.246 14.042 14.976 16.118 17.284 18.597 20.099 21.866 23.827 26.134 28.88 32.048 34.353 35.464 35.929 36.051 35.96 35.711 35.417 35.128 34.731 34.203 33.655 33.098 32.546 32.062 31.619 31.147 30.711 30.315 29.903 29.432 28.982 28.506 28.031 27.671 27.262 26.777 26.29 25.775 25.38 24.969 24.344 23.919 23.478 23.264 22.798 22.254 21.668 21.369 20.818 20.371 20.011 19.67 18.891 18.382 17.733 17.067 16.395 15.607 14.349 -9 ,5256 ,TETRA ,17555478,Fri Nov 26 02:22:18 CET,Fri Nov 26 04:44:45 CET,0.0 0.22 0.401 0.561 0.706 0.854 1.003 1.293 1.44 1.58 1.587 2.014 2.144 2.409 2.683 2.941 3.054 3.268 3.486 3.802 4.018 4.236 4.56 4.9 5.221 5.52 5.809 6.181 6.568 6.945 7.395 7.834 8.254 8.761 9.357 9.962 10.674 11.429 12.204 13.015 13.951 15.071 16.198 17.601 19.264 21.185 23.329 25.802 28.733 32.122 34.437 35.315 35.532 35.493 35.26 34.766 34.18 33.467 32.547 31.856 31.353 30.917 30.504 30.057 29.619 29.193 28.822 28.452 28.01 27.547 27.168 26.746 26.265 25.881 25.488 25.034 24.526 24.009 23.646 23.282 22.717 22.335 21.936 21.711 21.249 20.759 20.196 19.871 19.273 18.804 18.402 17.957 16.991 16.449 15.841 15.195 14.392 13.371 12.203 -10 ,16791 ,TETRA ,17555479,Fri Nov 26 02:23:20 CET,Fri Nov 26 04:46:26 CET,0.0 0.232 0.45 0.657 0.849 1.026 1.186 1.478 1.617 1.769 1.798 2.23 2.369 2.643 2.912 3.189 3.33 3.596 3.858 4.23 4.46 4.693 5.049 5.413 5.786 6.149 6.495 6.95 7.401 7.862 8.439 8.98 9.497 10.111 10.818 11.521 12.314 13.159 14.049 15.016 16.109 17.394 18.705 20.246 22.086 24.244 26.529 29.1 31.994 35.244 37.511 38.518 38.999 39.1 38.943 38.657 38.324 38.031 37.667 37.272 36.813 36.352 35.927 35.499 35.096 34.635 34.187 33.804 33.434 33.042 32.663 32.238 31.814 31.486 31.146 30.803 30.45 30.022 29.672 29.27 28.65 28.232 27.789 27.561 27.089 26.599 26.089 25.833 25.319 24.923 24.557 24.165 23.344 22.86 22.306 21.664 20.866 19.793 18.005 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 9eb5582c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25347 ,TETRA ,17555480,Fri Nov 26 02:23:23 CET,Fri Nov 26 04:47:29 CET,0.0 1.128 1.467 1.736 1.975 2.181 2.374 2.548 2.842 2.98 3.119 3.295 3.477 3.584 3.797 4.017 4.216 4.307 4.489 4.665 4.933 5.104 5.261 5.478 5.679 5.884 6.076 6.26 6.496 6.719 6.933 7.196 7.47 7.724 8.014 8.344 8.63 8.934 9.263 9.593 9.935 10.327 10.76 11.194 11.74 12.377 13.081 13.834 14.653 15.408 15.974 16.178 16.036 15.811 15.523 15.137 14.72 14.348 14.04 13.723 13.444 13.168 12.891 12.63 12.389 12.179 11.957 11.763 11.587 11.396 11.194 11.002 10.78 10.562 10.392 10.181 9.973 9.789 9.609 9.49 9.37 9.161 8.999 8.821 8.717 8.489 8.254 8.013 7.892 7.706 7.451 7.286 7.137 6.779 6.53 6.224 5.893 5.541 5.095 4.463 2.12 -2 ,2658 ,TETRA ,17555481,Fri Nov 26 02:23:21 CET,Fri Nov 26 04:41:29 CET,0.0 0.734 1.057 1.343 1.535 1.717 1.892 2.052 2.34 2.469 2.597 2.783 2.966 3.075 3.283 3.486 3.685 3.777 3.946 4.102 4.322 4.456 4.59 4.789 4.972 5.165 5.377 5.584 5.833 6.07 6.31 6.58 6.811 7.025 7.284 7.586 7.868 8.181 8.528 8.888 9.248 9.635 10.095 10.559 11.083 11.667 12.309 12.979 13.685 14.378 15.009 15.218 15.118 14.926 14.704 14.413 14.044 13.671 13.32 12.914 12.556 12.269 11.985 11.685 11.403 11.152 10.881 10.626 10.404 10.167 9.914 9.708 9.49 9.249 9.06 8.853 8.643 8.442 8.226 8.067 7.887 7.587 7.363 7.127 7.019 6.785 6.538 6.313 6.195 6.009 5.785 5.629 5.473 5.141 4.96 4.71 4.38 4.013 3.55 2.832 -0.306 -3 ,25739 ,TETRA ,17555482,Fri Nov 26 02:23:23 CET,Fri Nov 26 04:48:56 CET,0.0 1.183 1.512 1.754 1.96 2.137 2.283 2.428 2.716 2.848 2.965 3.114 3.303 3.417 3.614 3.804 4.003 4.104 4.287 4.465 4.722 4.88 5.042 5.268 5.476 5.67 5.848 6.012 6.226 6.433 6.628 6.874 7.116 7.346 7.6 7.874 8.144 8.452 8.779 9.113 9.446 9.797 10.209 10.636 11.112 11.608 12.161 12.808 13.484 14.106 14.631 14.687 14.499 14.211 13.911 13.608 13.302 12.973 12.625 12.248 11.927 11.608 11.303 11.039 10.804 10.601 10.385 10.179 9.993 9.789 9.576 9.403 9.219 9.014 8.832 8.658 8.484 8.283 8.064 7.924 7.778 7.528 7.345 7.144 7.046 6.851 6.628 6.383 6.255 6.05 5.807 5.653 5.485 5.089 4.853 4.596 4.304 3.954 3.523 2.843 -0.166 -4 ,28834 ,TETRA ,17555483,Fri Nov 26 02:24:22 CET,Fri Nov 26 04:48:56 CET,0.0 1.12 1.54 1.812 2.044 2.258 2.458 2.621 2.912 3.069 3.21 3.373 3.561 3.688 3.937 4.152 4.354 4.457 4.656 4.839 5.089 5.258 5.428 5.667 5.891 6.095 6.291 6.487 6.736 6.97 7.184 7.445 7.708 7.962 8.266 8.597 8.899 9.237 9.622 10.015 10.405 10.878 11.427 11.943 12.536 13.192 13.918 14.7 15.551 16.388 17.106 17.311 17.197 16.956 16.6 16.214 15.867 15.53 15.192 14.85 14.577 14.3 14.004 13.723 13.47 13.245 12.998 12.754 12.536 12.287 12.03 11.836 11.623 11.397 11.22 11.048 10.875 10.683 10.481 10.346 10.206 9.973 9.803 9.655 9.581 9.404 9.21 8.978 8.85 8.653 8.407 8.231 8.04 7.607 7.367 7.125 6.861 6.494 5.987 5.318 -1.517 -5 ,10080 ,TETRA ,17555484,Fri Nov 26 02:24:22 CET,Fri Nov 26 04:49:50 CET,0.0 1.284 1.643 1.911 2.16 2.384 2.567 2.726 2.996 3.123 3.253 3.438 3.627 3.746 3.977 4.197 4.402 4.497 4.676 4.834 5.05 5.19 5.329 5.542 5.753 5.96 6.151 6.338 6.586 6.823 7.049 7.32 7.586 7.84 8.122 8.425 8.723 9.062 9.434 9.82 10.208 10.628 11.065 11.47 11.977 12.545 13.142 13.75 14.393 15.048 15.546 15.616 15.421 15.14 14.775 14.353 13.981 13.641 13.297 12.945 12.642 12.364 12.06 11.77 11.555 11.377 11.142 10.9 10.683 10.447 10.214 10.021 9.823 9.646 9.493 9.323 9.169 8.997 8.804 8.669 8.535 8.311 8.134 7.957 7.873 7.68 7.465 7.264 7.149 6.948 6.723 6.573 6.41 6.008 5.763 5.502 5.226 4.838 4.394 3.855 -3.429 -6 ,18184 ,TETRA ,17555485,Fri Nov 26 02:25:21 CET,Fri Nov 26 04:51:07 CET,0.0 1.108 1.409 1.628 1.826 2.019 2.185 2.328 2.581 2.705 2.83 2.998 3.175 3.274 3.476 3.664 3.841 3.928 4.097 4.266 4.519 4.663 4.779 4.959 5.155 5.346 5.526 5.687 5.897 6.12 6.33 6.579 6.829 7.074 7.355 7.659 7.948 8.241 8.555 8.872 9.194 9.556 9.962 10.38 10.904 11.48 12.077 12.747 13.485 14.17 14.656 14.711 14.506 14.215 13.87 13.492 13.129 12.768 12.464 12.133 11.787 11.505 11.244 10.987 10.74 10.501 10.268 10.068 9.877 9.656 9.426 9.219 9.01 8.807 8.624 8.427 8.227 8.001 7.75 7.589 7.434 7.171 6.968 6.754 6.647 6.418 6.162 5.895 5.762 5.563 5.345 5.205 5.034 4.606 4.357 4.051 3.73 3.384 2.859 2.075 -5.208 -7 ,14958 ,TETRA ,17555486,Fri Nov 26 02:27:32 CET,Fri Nov 26 04:52:12 CET,0.0 0.912 1.23 1.492 1.674 1.835 1.992 2.138 2.395 2.506 2.616 2.753 2.925 3.021 3.191 3.352 3.507 3.589 3.748 3.905 4.122 4.248 4.373 4.572 4.767 4.951 5.132 5.307 5.535 5.747 5.94 6.176 6.408 6.643 6.912 7.201 7.482 7.791 8.118 8.466 8.824 9.22 9.65 10.071 10.615 11.191 11.767 12.419 13.139 13.919 14.701 15.063 15.121 14.956 14.719 14.465 14.178 13.883 13.57 13.236 12.921 12.623 12.361 12.123 11.897 11.691 11.464 11.253 11.055 10.833 10.617 10.436 10.24 10.018 9.833 9.649 9.462 9.275 9.088 8.934 8.755 8.506 8.34 8.149 8.05 7.847 7.625 7.383 7.246 7.036 6.804 6.656 6.474 6.084 5.904 5.696 5.438 5.127 4.757 4.237 0.602 -8 ,26041 ,TETRA ,17555487,Fri Nov 26 02:27:33 CET,Fri Nov 26 04:52:08 CET,0.0 1.338 1.736 2.059 2.326 2.559 2.752 2.929 3.275 3.441 3.581 3.748 3.936 4.054 4.272 4.492 4.715 4.82 5.006 5.169 5.386 5.524 5.668 5.867 6.065 6.266 6.448 6.625 6.847 7.056 7.267 7.528 7.781 8.027 8.308 8.604 8.874 9.167 9.494 9.84 10.193 10.598 11.072 11.552 12.09 12.654 13.233 13.837 14.474 15.162 15.762 15.793 15.54 15.189 14.818 14.406 14.044 13.703 13.371 13.043 12.779 12.567 12.34 12.069 11.828 11.63 11.4 11.18 10.988 10.788 10.584 10.407 10.205 10.011 9.855 9.684 9.512 9.318 9.098 8.941 8.779 8.528 8.344 8.148 8.048 7.847 7.634 7.411 7.31 7.141 6.964 6.833 6.657 6.2 5.971 5.737 5.477 5.163 4.755 4.102 0.004 -9 ,25662 ,TETRA ,17555488,Fri Nov 26 02:36:26 CET,Fri Nov 26 05:01:00 CET,0.0 1.133 1.392 1.619 1.822 1.993 2.156 2.289 2.538 2.665 2.781 2.923 3.096 3.191 3.367 3.541 3.706 3.783 3.936 4.075 4.271 4.397 4.515 4.681 4.843 4.99 5.131 5.276 5.469 5.654 5.835 6.068 6.287 6.498 6.746 7.02 7.287 7.579 7.888 8.204 8.527 8.888 9.306 9.706 10.142 10.655 11.202 11.744 12.3 12.763 13.146 13.158 12.871 12.493 12.131 11.74 11.297 10.881 10.534 10.183 9.89 9.657 9.422 9.17 8.929 8.727 8.518 8.307 8.126 7.954 7.781 7.63 7.481 7.32 7.186 7.041 6.877 6.709 6.543 6.427 6.314 6.113 5.953 5.798 5.734 5.596 5.422 5.222 5.117 4.941 4.739 4.589 4.436 4.117 3.935 3.708 3.445 3.115 2.663 2.075 -1.092 -10 ,23955 ,TETRA ,17555489,Fri Nov 26 02:36:28 CET,Fri Nov 26 05:01:03 CET,0.0 1.176 1.471 1.686 1.9 2.081 2.236 2.396 2.669 2.784 2.901 3.047 3.226 3.333 3.539 3.75 3.947 4.037 4.205 4.364 4.576 4.717 4.861 5.06 5.237 5.413 5.58 5.735 5.94 6.131 6.323 6.564 6.808 7.043 7.295 7.572 7.842 8.146 8.481 8.848 9.234 9.671 10.135 10.574 11.099 11.64 12.232 12.886 13.567 14.224 14.8 14.959 14.721 14.433 14.2 13.851 13.519 13.24 12.967 12.697 12.442 12.204 11.967 11.724 11.489 11.252 11.023 10.825 10.645 10.437 10.205 10.038 9.853 9.647 9.494 9.325 9.147 8.953 8.727 8.577 8.409 8.137 7.974 7.81 7.721 7.525 7.298 7.036 6.883 6.673 6.474 6.331 6.161 5.752 5.516 5.27 4.965 4.628 4.263 3.728 0.65 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 7889af05..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28860 ,TETRA ,17555490,Fri Nov 26 02:36:30 CET,Fri Nov 26 04:55:39 CET,0.0 0.618 0.906 1.129 1.33 1.46 1.571 1.691 1.915 2.007 2.088 2.003 2.325 2.396 2.53 2.664 2.797 2.859 2.983 3.11 3.308 3.432 3.543 3.7 3.846 3.986 4.125 4.265 4.448 4.629 4.808 5.024 5.229 5.425 5.655 5.909 6.146 6.397 6.676 6.981 7.303 7.668 8.086 8.5 8.967 9.512 10.146 10.804 11.602 12.459 13.218 13.568 13.56 13.415 13.28 13.095 12.863 12.639 12.419 12.181 11.966 11.77 11.585 11.413 11.238 11.052 10.848 10.656 10.477 10.251 9.979 9.778 9.577 9.351 9.173 8.998 8.846 8.699 8.562 8.476 8.382 8.209 8.071 7.909 7.809 7.592 7.387 7.16 7.038 6.671 6.641 6.504 6.352 6.023 5.817 5.59 5.35 5.056 4.725 4.27 2.508 -2 ,7275 ,TETRA ,17555491,Fri Nov 26 02:40:31 CET,Fri Nov 26 04:59:39 CET,0.0 0.521 0.771 0.974 1.14 1.299 1.456 1.583 1.77 1.849 1.936 1.856 2.179 2.252 2.397 2.522 2.642 2.708 2.84 2.969 3.155 3.27 3.382 3.54 3.683 3.816 3.954 4.09 4.269 4.449 4.613 4.812 5.01 5.193 5.399 5.635 5.853 6.096 6.36 6.647 6.973 7.356 7.808 8.26 8.803 9.463 10.214 10.917 11.689 12.61 13.6 14.176 14.202 14.075 13.95 13.711 13.426 13.184 12.974 12.734 12.532 12.366 12.161 11.955 11.775 11.617 11.45 11.287 11.137 10.956 10.758 10.593 10.433 10.257 10.12 9.995 9.859 9.721 9.583 9.486 9.382 9.223 9.111 8.983 8.915 8.766 8.597 8.425 8.342 8.024 8.073 7.976 7.861 7.592 7.456 7.294 7.118 6.939 6.733 6.47 5.408 -3 ,29052 ,TETRA ,17555492,Fri Nov 26 02:37:21 CET,Fri Nov 26 04:43:12 CET,0.0 0.465 0.738 0.924 1.047 1.188 1.332 1.434 1.633 1.732 1.825 1.745 2.072 2.154 2.317 2.477 2.622 2.682 2.797 2.923 3.113 3.229 3.344 3.512 3.666 3.817 3.97 4.125 4.324 4.51 4.685 4.899 5.101 5.282 5.507 5.771 6.036 6.361 6.709 7.038 7.341 7.698 8.123 8.542 9.06 9.64 10.278 10.933 11.645 12.434 13.192 13.618 13.659 13.529 13.321 13.053 12.805 12.55 12.309 12.072 11.891 11.731 11.56 11.358 11.125 10.907 10.645 10.365 10.113 9.846 9.58 9.379 9.153 8.903 8.72 8.529 8.329 8.114 7.875 7.724 7.599 7.411 7.285 7.154 7.081 6.922 6.738 6.543 6.446 6.112 6.179 6.071 5.956 5.707 5.549 5.386 5.237 5.056 4.841 4.518 3.232 -4 ,2709 ,TETRA ,17555493,Fri Nov 26 02:40:33 CET,Fri Nov 26 05:00:23 CET,0.0 0.504 0.784 1.036 1.236 1.391 1.559 1.706 1.95 2.069 2.194 2.171 2.529 2.628 2.832 3.028 3.209 3.3 3.473 3.644 3.905 4.066 4.221 4.441 4.637 4.829 5.016 5.201 5.449 5.693 5.944 6.247 6.529 6.807 7.134 7.494 7.829 8.164 8.495 8.848 9.195 9.566 9.999 10.445 10.987 11.584 12.259 12.995 13.801 14.606 15.305 15.529 15.449 15.393 15.272 15.085 14.909 14.71 14.488 14.264 14.061 13.863 13.675 13.476 13.273 13.085 12.901 12.759 12.629 12.468 12.302 12.173 12.042 11.9 11.782 11.657 11.52 11.366 11.207 11.113 11.016 10.85 10.73 10.612 10.554 10.405 10.242 10.088 9.994 9.67 9.735 9.62 9.497 9.24 9.09 8.915 8.746 8.539 8.244 7.882 6.936 -5 ,17904 ,TETRA ,17555494,Fri Nov 26 02:40:31 CET,Fri Nov 26 05:00:30 CET,0.0 0.753 1.04 1.222 1.412 1.593 1.737 1.869 2.107 2.219 2.334 2.309 2.665 2.769 2.972 3.172 3.363 3.453 3.6 3.712 3.866 3.976 4.086 4.247 4.401 4.543 4.675 4.809 4.993 5.164 5.336 5.539 5.725 5.904 6.124 6.384 6.627 6.883 7.178 7.519 7.874 8.283 8.739 9.18 9.681 10.195 10.772 11.405 12.125 12.984 13.851 14.217 14.213 14.009 13.807 13.618 13.376 13.108 12.886 12.638 12.382 12.169 11.99 11.821 11.638 11.441 11.168 10.892 10.639 10.358 10.072 9.848 9.645 9.441 9.286 9.152 9.016 8.869 8.725 8.641 8.546 8.387 8.29 8.178 8.102 7.932 7.76 7.577 7.478 7.128 7.159 7.058 6.959 6.721 6.574 6.409 6.257 6.077 5.785 5.391 4.241 -6 ,24693 ,TETRA ,17555495,Fri Nov 26 02:46:29 CET,Fri Nov 26 05:05:40 CET,0.0 0.609 0.895 1.146 1.327 1.483 1.625 1.745 1.992 2.116 2.231 2.204 2.559 2.648 2.779 2.914 3.052 3.113 3.229 3.346 3.523 3.644 3.764 3.929 4.089 4.249 4.404 4.542 4.722 4.897 5.056 5.265 5.466 5.656 5.896 6.17 6.424 6.704 7.022 7.361 7.701 8.072 8.513 8.945 9.433 10.003 10.607 11.254 12.019 12.842 13.76 14.322 14.369 14.122 13.846 13.561 13.231 12.918 12.655 12.377 12.114 11.882 11.633 11.38 11.148 10.952 10.784 10.637 10.494 10.322 10.145 10.004 9.855 9.657 9.486 9.326 9.179 9.026 8.849 8.735 8.628 8.454 8.345 8.23 8.161 8.015 7.877 7.722 7.627 7.258 7.238 7.126 7.004 6.744 6.609 6.458 6.309 6.083 5.807 5.523 4.734 -7 ,11204 ,TETRA ,17555496,Fri Nov 26 02:46:29 CET,Fri Nov 26 05:08:24 CET,0.0 0.355 0.508 0.64 0.762 0.863 0.969 1.075 1.247 1.32 1.393 1.293 1.619 1.697 1.839 1.973 2.106 2.172 2.294 2.42 2.607 2.724 2.831 2.986 3.147 3.298 3.449 3.593 3.759 3.916 4.07 4.26 4.442 4.62 4.829 5.075 5.348 5.639 5.931 6.241 6.55 6.907 7.337 7.785 8.31 8.86 9.499 10.24 11.097 12.048 13.012 13.542 13.743 13.763 13.664 13.494 13.263 13.008 12.79 12.582 12.394 12.204 11.991 11.783 11.595 11.417 11.249 11.091 10.936 10.775 10.592 10.437 10.287 10.133 10.001 9.856 9.714 9.585 9.445 9.314 9.167 8.936 8.771 8.598 8.495 8.279 8.057 7.843 7.74 7.386 7.347 7.207 7.068 6.757 6.569 6.365 6.159 5.924 5.641 5.26 3.197 -8 ,13875 ,TETRA ,17555497,Fri Nov 26 02:46:29 CET,Fri Nov 26 05:08:01 CET,0.0 0.422 0.547 0.651 0.759 0.865 0.97 1.085 1.307 1.403 1.487 1.37 1.691 1.754 1.869 1.994 2.117 2.183 2.308 2.421 2.6 2.712 2.821 2.971 3.118 3.263 3.405 3.545 3.717 3.904 4.095 4.331 4.594 4.816 5.014 5.247 5.483 5.732 6.005 6.314 6.649 7.034 7.484 7.96 8.544 9.155 9.833 10.652 11.485 12.22 13.024 13.52 13.608 13.48 13.27 13.087 12.925 12.698 12.477 12.243 12.025 11.839 11.662 11.502 11.326 11.145 10.959 10.784 10.641 10.489 10.315 10.155 9.985 9.817 9.689 9.559 9.413 9.28 9.142 9.027 8.915 8.737 8.601 8.452 8.361 8.174 7.999 7.824 7.745 7.428 7.483 7.367 7.253 7.002 6.851 6.69 6.519 6.32 6.048 5.624 4.189 -9 ,254 ,TETRA ,17555498,Fri Nov 26 02:46:31 CET,Fri Nov 26 05:08:08 CET,0.0 0.41 0.66 0.874 1.045 1.194 1.323 1.441 1.688 1.812 1.928 1.888 2.231 2.332 2.526 2.7 2.868 2.957 3.141 3.32 3.568 3.719 3.877 4.123 4.369 4.602 4.778 4.914 5.101 5.286 5.466 5.692 5.908 6.105 6.312 6.552 6.809 7.11 7.421 7.724 8.064 8.468 8.928 9.38 9.887 10.448 11.104 11.814 12.612 13.413 14.056 14.379 14.409 14.284 14.118 13.937 13.723 13.47 13.238 12.995 12.755 12.527 12.304 12.083 11.885 11.712 11.534 11.368 11.22 11.049 10.868 10.722 10.559 10.394 10.248 10.092 9.939 9.782 9.59 9.438 9.283 9.045 8.894 8.763 8.699 8.561 8.409 8.233 8.134 7.796 7.865 7.784 7.691 7.47 7.354 7.239 7.109 6.899 6.621 6.266 5.357 -10 ,9014 ,TETRA ,17555499,Fri Nov 26 02:48:21 CET,Fri Nov 26 05:07:36 CET,0.0 0.364 0.58 0.747 0.902 1.037 1.167 1.292 1.519 1.63 1.747 1.724 2.078 2.181 2.374 2.548 2.717 2.801 2.99 3.169 3.402 3.557 3.71 3.94 4.164 4.376 4.579 4.776 5.038 5.257 5.437 5.648 5.835 6.013 6.227 6.466 6.685 6.933 7.218 7.542 7.859 8.18 8.559 8.966 9.454 9.989 10.579 11.189 11.87 12.646 13.36 13.56 13.457 13.252 13.031 12.832 12.628 12.409 12.207 11.975 11.732 11.505 11.304 11.102 10.885 10.682 10.48 10.308 10.152 9.982 9.796 9.633 9.473 9.301 9.16 9.025 8.878 8.704 8.52 8.407 8.299 8.137 8.027 7.9 7.816 7.619 7.412 7.182 7.058 6.702 6.722 6.591 6.45 6.135 5.954 5.752 5.525 5.274 4.978 4.576 3.609 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt deleted file mode 100644 index 958fe8a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9451 ,TETRA ,17555500,Fri Nov 26 02:49:08 CET,Fri Nov 26 04:39:10 CET,0.0 2.161 2.684 3.02 3.304 3.556 3.762 3.95 4.281 4.452 4.619 4.723 5.057 5.184 5.44 5.698 5.935 6.041 6.244 6.456 6.777 6.976 7.171 7.462 7.737 7.995 8.245 8.494 8.824 9.146 9.458 9.826 10.179 10.531 10.944 11.413 11.865 12.356 12.901 13.491 14.12 14.839 15.683 16.568 17.603 18.734 20.108 21.74 23.659 25.957 28.757 31.132 32.59 33.536 34.176 34.608 34.851 35.005 35.133 35.223 35.249 35.258 35.269 35.246 35.189 35.119 35.04 34.971 34.9 34.798 34.679 34.58 34.472 34.37 34.3 34.205 34.099 34.001 33.874 33.792 33.718 33.581 33.475 33.355 33.299 33.179 33.014 32.838 32.746 32.489 32.467 32.354 32.242 31.967 31.791 31.608 31.395 31.141 30.879 30.498 29.068 -2 ,12686 ,TETRA ,17555501,Fri Nov 26 02:49:09 CET,Fri Nov 26 04:41:16 CET,0.0 1.457 1.929 2.25 2.513 2.736 2.948 3.141 3.496 3.684 3.856 3.927 4.251 4.383 4.658 4.911 5.147 5.26 5.467 5.661 5.954 6.148 6.346 6.658 6.945 7.215 7.475 7.722 8.057 8.379 8.683 9.056 9.424 9.77 10.164 10.612 11.058 11.552 12.09 12.69 13.32 14.013 14.842 15.689 16.68 17.807 19.16 20.732 22.606 24.924 27.849 30.301 31.814 32.815 33.455 33.909 34.214 34.386 34.506 34.583 34.598 34.608 34.595 34.565 34.515 34.451 34.385 34.328 34.266 34.187 34.094 34.008 33.91 33.82 33.766 33.689 33.59 33.482 33.373 33.297 33.214 33.076 32.952 32.812 32.749 32.632 32.484 32.317 32.242 31.99 31.939 31.832 31.723 31.478 31.32 31.156 30.982 30.769 30.49 30.066 28.453 -3 ,21322 ,TETRA ,17555502,Fri Nov 26 02:57:29 CET,Fri Nov 26 04:36:28 CET,0.0 1.917 2.335 2.65 2.943 3.184 3.38 3.554 3.89 4.049 4.195 4.303 4.651 4.807 5.095 5.352 5.599 5.716 5.933 6.124 6.406 6.599 6.788 7.07 7.335 7.586 7.831 8.071 8.388 8.695 8.991 9.349 9.7 10.047 10.454 10.909 11.341 11.823 12.35 12.914 13.515 14.237 15.089 15.93 16.944 18.082 19.434 21.001 22.824 24.999 27.687 29.91 31.232 32.074 32.651 33.069 33.338 33.532 33.64 33.649 33.616 33.589 33.552 33.505 33.457 33.407 33.341 33.257 33.178 33.097 33.002 32.917 32.828 32.728 32.635 32.54 32.461 32.382 32.282 32.207 32.117 31.961 31.862 31.753 31.699 31.596 31.462 31.286 31.187 30.924 30.875 30.758 30.621 30.333 30.174 29.986 29.761 29.509 29.179 28.776 27.595 -4 ,16040 ,TETRA ,17555503,Fri Nov 26 02:56:31 CET,Fri Nov 26 04:47:38 CET,0.0 1.401 1.822 2.118 2.379 2.619 2.829 3.011 3.336 3.497 3.675 3.83 4.169 4.29 4.533 4.775 5.009 5.119 5.346 5.564 5.87 6.071 6.263 6.553 6.835 7.095 7.355 7.615 7.934 8.237 8.545 8.92 9.278 9.638 10.056 10.527 10.974 11.469 12.021 12.595 13.216 13.974 14.872 15.754 16.782 17.947 19.312 20.874 22.765 25.077 27.911 30.331 31.771 32.719 33.337 33.742 34.034 34.226 34.341 34.427 34.48 34.471 34.434 34.405 34.363 34.315 34.257 34.186 34.113 34.031 33.918 33.8 33.686 33.598 33.534 33.46 33.371 33.258 33.11 32.993 32.879 32.675 32.521 32.378 32.295 32.131 31.965 31.766 31.659 31.391 31.336 31.224 31.105 30.841 30.688 30.526 30.355 30.153 29.865 29.503 28.262 -5 ,6953 ,TETRA ,17555504,Fri Nov 26 02:59:27 CET,Fri Nov 26 04:50:25 CET,0.0 1.456 1.912 2.205 2.456 2.662 2.88 3.076 3.37 3.511 3.648 3.717 4.05 4.18 4.429 4.682 4.947 5.076 5.315 5.545 5.867 6.058 6.262 6.573 6.868 7.141 7.394 7.643 7.956 8.262 8.563 8.938 9.333 9.706 10.114 10.584 11.032 11.528 12.065 12.646 13.268 13.963 14.788 15.634 16.639 17.817 19.2 20.755 22.587 24.836 27.761 30.22 31.624 32.534 33.117 33.502 33.762 33.926 34.007 34.08 34.132 34.13 34.099 34.059 34.023 33.982 33.921 33.862 33.807 33.733 33.642 33.563 33.468 33.365 33.27 33.168 33.069 32.962 32.85 32.769 32.686 32.545 32.451 32.35 32.286 32.14 31.997 31.858 31.79 31.566 31.56 31.446 31.332 31.129 30.988 30.825 30.665 30.447 30.181 29.865 29.073 -6 ,318 ,TETRA ,17555505,Fri Nov 26 02:58:31 CET,Fri Nov 26 04:38:28 CET,0.0 1.73 2.155 2.489 2.781 3.037 3.249 3.451 3.816 3.989 4.161 4.283 4.626 4.769 5.049 5.315 5.569 5.693 5.931 6.144 6.458 6.662 6.851 7.126 7.396 7.656 7.903 8.143 8.455 8.755 9.048 9.423 9.792 10.14 10.548 11.008 11.472 11.999 12.553 13.14 13.761 14.454 15.271 16.136 17.158 18.291 19.637 21.201 23.066 25.324 28.151 30.536 31.871 32.719 33.322 33.739 33.988 34.129 34.212 34.279 34.326 34.333 34.318 34.288 34.246 34.19 34.113 34.067 34.023 33.962 33.888 33.812 33.729 33.636 33.549 33.41 33.271 33.181 33.087 33.017 32.949 32.819 32.722 32.629 32.579 32.469 32.346 32.19 32.092 31.828 31.77 31.648 31.529 31.263 31.104 30.955 30.804 30.588 30.313 29.975 28.444 -7 ,1929 ,TETRA ,17555506,Fri Nov 26 02:59:27 CET,Fri Nov 26 04:38:07 CET,0.0 0.876 1.325 1.698 2.025 2.28 2.487 2.672 3.011 3.161 3.298 3.379 3.729 3.882 4.138 4.366 4.592 4.702 4.903 5.108 5.43 5.627 5.818 6.112 6.387 6.65 6.921 7.197 7.558 7.882 8.179 8.543 8.9 9.252 9.67 10.146 10.601 11.104 11.655 12.243 12.851 13.558 14.409 15.27 16.28 17.416 18.811 20.399 22.23 24.484 27.327 29.709 31.137 32.038 32.64 33.072 33.365 33.54 33.642 33.73 33.76 33.739 33.707 33.655 33.578 33.503 33.446 33.397 33.335 33.26 33.173 33.082 32.989 32.892 32.814 32.73 32.634 32.537 32.422 32.35 32.279 32.137 32.008 31.868 31.813 31.698 31.567 31.419 31.328 31.074 31.035 30.917 30.797 30.537 30.379 30.205 30.018 29.835 29.583 29.209 27.441 -8 ,12899 ,TETRA ,17555507,Fri Nov 26 02:59:27 CET,Fri Nov 26 04:38:31 CET,0.0 1.572 2.011 2.319 2.578 2.834 3.079 3.285 3.678 3.842 3.978 4.039 4.366 4.501 4.757 5.012 5.26 5.374 5.597 5.806 6.115 6.322 6.52 6.795 7.055 7.319 7.588 7.842 8.167 8.482 8.788 9.15 9.494 9.831 10.228 10.685 11.141 11.64 12.173 12.748 13.352 14.067 14.918 15.749 16.763 17.957 19.338 20.925 22.88 25.204 27.992 30.349 31.779 32.713 33.28 33.637 33.912 34.118 34.242 34.313 34.339 34.338 34.33 34.31 34.278 34.238 34.176 34.116 34.077 34.014 33.912 33.831 33.736 33.625 33.547 33.472 33.36 33.243 33.139 33.062 32.985 32.863 32.777 32.683 32.63 32.502 32.363 32.234 32.165 31.921 31.881 31.753 31.616 31.317 31.147 30.981 30.767 30.471 30.128 29.705 28.581 -9 ,5879 ,TETRA ,17555508,Fri Nov 26 02:51:09 CET,Fri Nov 26 04:41:36 CET,0.0 1.502 1.895 2.182 2.404 2.601 2.799 2.979 3.315 3.497 3.678 3.798 4.127 4.259 4.511 4.77 5.029 5.143 5.366 5.592 5.9 6.098 6.292 6.559 6.813 7.059 7.312 7.56 7.863 8.156 8.451 8.82 9.201 9.59 10.067 10.571 11.002 11.491 12.034 12.622 13.249 13.952 14.797 15.654 16.658 17.823 19.15 20.715 22.639 24.892 27.656 30.008 31.435 32.349 32.93 33.288 33.562 33.782 33.896 33.956 33.966 33.938 33.899 33.845 33.796 33.749 33.688 33.639 33.583 33.503 33.417 33.337 33.243 33.143 33.06 32.974 32.892 32.791 32.672 32.596 32.518 32.367 32.255 32.15 32.097 31.993 31.885 31.737 31.643 31.381 31.368 31.271 31.167 30.945 30.806 30.654 30.48 30.266 29.981 29.575 28.472 -10 ,22030 ,TETRA ,17555509,Fri Nov 26 02:51:08 CET,Fri Nov 26 04:40:44 CET,0.0 1.666 2.19 2.535 2.802 3.06 3.305 3.504 3.868 4.048 4.21 4.301 4.624 4.751 5.029 5.32 5.591 5.71 5.926 6.141 6.46 6.662 6.854 7.122 7.372 7.634 7.893 8.145 8.478 8.797 9.1 9.458 9.809 10.157 10.563 11.036 11.495 11.983 12.51 13.077 13.699 14.416 15.276 16.152 17.155 18.303 19.659 21.234 23.142 25.405 28.148 30.601 32.118 33.025 33.595 33.973 34.2 34.379 34.501 34.575 34.61 34.61 34.585 34.559 34.515 34.455 34.371 34.28 34.21 34.139 34.056 33.974 33.882 33.788 33.706 33.617 33.518 33.407 33.271 33.178 33.096 32.958 32.853 32.749 32.693 32.576 32.456 32.33 32.267 32.036 32.019 31.914 31.789 31.494 31.333 31.179 31.01 30.776 30.492 30.06 28.834 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index a30f7b33..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2384 ,KEBNE ,17043661,Thu Dec 23 05:04:15 CET,Thu Dec 23 06:37:08 CET,0.0 2.277 2.926 3.3 3.549 3.76 3.958 4.161 4.562 4.741 4.91 5.016 5.348 5.488 5.765 5.999 6.194 6.291 6.472 6.654 6.933 7.113 7.28 7.515 7.742 7.945 8.131 8.304 8.52 8.736 8.957 9.231 9.477 9.682 9.895 10.118 10.325 10.539 10.776 11.034 11.311 11.626 11.956 12.225 12.48 12.727 13.024 13.232 13.223 12.985 12.114 10.568 8.964 7.434 6.133 5.028 4.078 3.237 2.457 1.632 0.913 0.26 -0.367 -0.953 -1.5 -2.018 -2.565 -3.03 -3.404 -3.787 -4.191 -4.547 -4.914 -5.295 -5.596 -5.884 -6.172 -6.48 -6.807 -7.036 -7.277 -7.641 -7.915 -8.241 -8.404 -8.724 -9.054 -9.394 -9.575 -9.982 -10.169 -10.388 -10.617 -11.099 -11.377 -11.701 -12.028 -12.376 -12.828 -13.417 -17.465 -2 ,120 ,KEBNE ,17043662,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:37:41 CET,0.0 1.851 2.333 2.663 2.974 3.223 3.423 3.616 3.971 4.129 4.259 4.305 4.617 4.736 4.981 5.217 5.413 5.507 5.707 5.885 6.13 6.3 6.463 6.671 6.864 7.057 7.245 7.429 7.678 7.911 8.134 8.423 8.685 8.905 9.16 9.469 9.757 10.056 10.355 10.671 10.998 11.292 11.589 11.888 12.171 12.424 12.678 12.884 12.934 12.718 11.865 10.317 8.819 7.397 6.162 5.049 4.042 3.094 2.271 1.434 0.699 0.051 -0.554 -1.124 -1.651 -2.137 -2.646 -3.087 -3.48 -3.879 -4.283 -4.627 -4.977 -5.326 -5.603 -5.892 -6.185 -6.501 -6.839 -7.077 -7.33 -7.719 -7.98 -8.253 -8.397 -8.681 -8.967 -9.264 -9.421 -9.815 -9.951 -10.14 -10.34 -10.806 -11.061 -11.336 -11.684 -12.071 -12.532 -13.13 -15.07 -3 ,17815 ,KEBNE ,17043663,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:37:35 CET,0.0 1.471 1.869 2.158 2.405 2.617 2.83 3.026 3.317 3.438 3.559 3.603 3.913 4.024 4.228 4.404 4.564 4.64 4.791 4.955 5.196 5.351 5.494 5.688 5.874 6.052 6.223 6.38 6.558 6.733 6.902 7.102 7.294 7.467 7.681 7.903 8.097 8.309 8.529 8.764 9.031 9.326 9.63 9.91 10.195 10.5 10.771 10.907 10.879 10.569 9.535 7.9 6.388 4.953 3.687 2.501 1.473 0.561 -0.256 -1.042 -1.704 -2.307 -2.903 -3.467 -4.013 -4.506 -4.962 -5.4 -5.796 -6.196 -6.601 -6.937 -7.286 -7.633 -7.907 -8.193 -8.494 -8.812 -9.143 -9.378 -9.617 -9.99 -10.268 -10.537 -10.66 -10.934 -11.248 -11.564 -11.727 -12.124 -12.282 -12.47 -12.666 -13.211 -13.517 -13.82 -14.176 -14.552 -14.976 -15.577 -17.991 -4 ,32096 ,KEBNE ,17043664,Thu Dec 23 05:04:14 CET,Thu Dec 23 06:37:30 CET,0.0 1.863 2.384 2.713 2.968 3.185 3.38 3.562 3.902 4.043 4.179 4.262 4.571 4.68 4.906 5.107 5.28 5.376 5.563 5.727 5.953 6.088 6.211 6.402 6.596 6.781 6.963 7.147 7.398 7.619 7.817 8.043 8.239 8.436 8.671 8.919 9.148 9.408 9.678 9.97 10.331 10.741 11.175 11.572 11.986 12.405 12.795 13.067 13.126 12.816 11.923 10.335 8.724 7.296 6.008 4.785 3.708 2.775 1.985 1.156 0.436 -0.187 -0.789 -1.353 -1.891 -2.407 -2.936 -3.391 -3.783 -4.2 -4.622 -4.957 -5.293 -5.677 -5.964 -6.217 -6.495 -6.8 -7.12 -7.35 -7.588 -7.96 -8.223 -8.494 -8.627 -8.906 -9.2 -9.507 -9.677 -10.07 -10.205 -10.406 -10.617 -11.065 -11.312 -11.593 -11.905 -12.214 -12.595 -13.151 -15.586 -5 ,26895 ,KEBNE ,17043665,Thu Dec 23 05:05:17 CET,Thu Dec 23 06:38:22 CET,0.0 2.45 3.017 3.426 3.741 4.023 4.26 4.455 4.852 5.045 5.215 5.33 5.652 5.772 6.01 6.248 6.474 6.574 6.752 6.928 7.182 7.347 7.507 7.723 7.924 8.127 8.326 8.534 8.806 9.045 9.289 9.553 9.753 9.947 10.196 10.465 10.713 10.987 11.242 11.474 11.706 11.95 12.234 12.5 12.763 13.025 13.293 13.448 13.43 13.125 12.112 10.544 8.933 7.341 5.965 4.762 3.695 2.752 1.968 1.223 0.582 -0.011 -0.617 -1.204 -1.726 -2.183 -2.664 -3.092 -3.453 -3.836 -4.241 -4.589 -4.965 -5.355 -5.662 -5.983 -6.288 -6.583 -6.899 -7.122 -7.366 -7.742 -7.991 -8.254 -8.383 -8.653 -8.973 -9.311 -9.482 -9.871 -10.0 -10.178 -10.372 -10.821 -11.059 -11.326 -11.622 -11.947 -12.329 -12.905 -15.196 -6 ,10444 ,KEBNE ,17043666,Thu Dec 23 05:05:17 CET,Thu Dec 23 06:38:20 CET,0.0 1.436 1.882 2.216 2.471 2.693 2.886 3.042 3.336 3.472 3.606 3.679 4.007 4.117 4.332 4.537 4.715 4.81 4.991 5.148 5.368 5.511 5.648 5.85 6.034 6.202 6.371 6.56 6.822 7.058 7.277 7.519 7.732 7.925 8.125 8.356 8.593 8.846 9.1 9.347 9.59 9.832 10.089 10.357 10.687 10.994 11.24 11.409 11.359 10.954 9.886 8.226 6.673 5.273 4.038 2.967 1.991 1.025 0.158 -0.671 -1.369 -2.004 -2.608 -3.208 -3.763 -4.225 -4.709 -5.15 -5.512 -5.884 -6.259 -6.562 -6.888 -7.242 -7.517 -7.819 -8.148 -8.468 -8.793 -9.023 -9.244 -9.573 -9.835 -10.123 -10.257 -10.52 -10.829 -11.169 -11.341 -11.734 -11.893 -12.091 -12.28 -12.701 -12.951 -13.233 -13.548 -13.902 -14.297 -14.853 -17.226 -7 ,22406 ,KEBNE ,17043667,Thu Dec 23 05:05:17 CET,Thu Dec 23 06:38:58 CET,0.0 0.997 1.467 1.789 2.063 2.311 2.535 2.72 2.992 3.126 3.271 3.369 3.689 3.797 3.991 4.178 4.351 4.437 4.615 4.794 5.052 5.205 5.352 5.57 5.766 5.945 6.116 6.3 6.524 6.711 6.899 7.123 7.335 7.541 7.797 8.093 8.378 8.7 9.03 9.339 9.64 9.939 10.2 10.426 10.684 10.91 11.065 11.219 11.232 10.858 9.837 8.12 6.437 4.948 3.617 2.401 1.364 0.458 -0.312 -1.101 -1.775 -2.39 -2.969 -3.496 -3.991 -4.44 -4.896 -5.3 -5.671 -6.077 -6.495 -6.841 -7.209 -7.591 -7.873 -8.147 -8.434 -8.734 -9.044 -9.245 -9.471 -9.842 -10.091 -10.356 -10.493 -10.774 -11.082 -11.42 -11.591 -11.967 -12.081 -12.278 -12.487 -12.928 -13.183 -13.488 -13.815 -14.137 -14.582 -15.191 -17.322 -8 ,28490 ,KEBNE ,17043668,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:41:44 CET,0.0 1.293 1.792 2.107 2.347 2.566 2.784 2.972 3.297 3.447 3.573 3.603 3.908 4.015 4.213 4.381 4.542 4.625 4.783 4.937 5.174 5.331 5.472 5.646 5.83 6.023 6.184 6.358 6.6 6.815 7.004 7.22 7.43 7.625 7.844 8.101 8.354 8.614 8.882 9.129 9.358 9.619 9.929 10.225 10.502 10.75 10.971 11.1 11.021 10.612 9.545 7.724 6.038 4.591 3.325 2.189 1.173 0.247 -0.537 -1.299 -1.978 -2.6 -3.166 -3.703 -4.216 -4.653 -5.093 -5.512 -5.898 -6.317 -6.736 -7.07 -7.43 -7.801 -8.07 -8.341 -8.617 -8.917 -9.236 -9.464 -9.714 -10.098 -10.351 -10.605 -10.745 -11.041 -11.349 -11.67 -11.837 -12.223 -12.369 -12.577 -12.801 -13.303 -13.572 -13.833 -14.128 -14.481 -14.881 -15.404 -17.039 -9 ,9305 ,KEBNE ,17043669,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:43:00 CET,0.0 1.703 2.083 2.382 2.662 2.872 3.061 3.236 3.539 3.686 3.818 3.861 4.171 4.291 4.516 4.715 4.892 4.97 5.144 5.323 5.547 5.689 5.835 6.033 6.206 6.37 6.534 6.708 6.927 7.128 7.322 7.554 7.769 7.954 8.169 8.424 8.659 8.898 9.15 9.418 9.707 10.027 10.423 10.818 11.25 11.671 11.97 12.107 12.044 11.668 10.65 8.953 7.322 5.792 4.358 3.035 1.894 0.925 0.135 -0.684 -1.424 -2.074 -2.686 -3.264 -3.783 -4.249 -4.739 -5.162 -5.535 -5.954 -6.379 -6.721 -7.084 -7.466 -7.764 -8.06 -8.364 -8.69 -9.005 -9.219 -9.446 -9.801 -10.07 -10.355 -10.499 -10.796 -11.099 -11.408 -11.571 -11.959 -12.111 -12.304 -12.514 -13.026 -13.288 -13.572 -13.916 -14.299 -14.783 -15.448 -17.383 -10 ,8064 ,KEBNE ,17043670,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:41:38 CET,0.0 1.684 2.106 2.438 2.718 2.954 3.135 3.3 3.631 3.783 3.926 3.99 4.299 4.408 4.612 4.811 5.006 5.097 5.265 5.437 5.695 5.852 5.989 6.177 6.357 6.514 6.668 6.834 7.049 7.253 7.438 7.644 7.853 8.054 8.28 8.533 8.759 8.999 9.242 9.467 9.679 9.933 10.245 10.524 10.803 11.076 11.324 11.48 11.501 11.3 10.398 8.699 7.068 5.588 4.328 3.205 2.178 1.195 0.368 -0.405 -1.105 -1.733 -2.319 -2.864 -3.371 -3.823 -4.282 -4.702 -5.079 -5.475 -5.883 -6.227 -6.567 -6.909 -7.195 -7.502 -7.812 -8.131 -8.466 -8.708 -8.955 -9.33 -9.589 -9.861 -10.008 -10.323 -10.659 -10.989 -11.156 -11.551 -11.74 -11.954 -12.181 -12.67 -12.942 -13.219 -13.507 -13.886 -14.362 -14.955 -17.492 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index ee3ce6bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19957 ,TETRA ,17555510,Fri Nov 26 03:00:28 CET,Fri Nov 26 04:48:06 CET,0.0 0.263 0.525 0.769 0.989 1.195 1.385 1.77 1.961 2.149 2.322 2.706 2.891 3.241 3.591 3.939 4.111 4.444 4.766 5.249 5.567 5.879 6.346 6.825 7.308 7.77 8.227 8.831 9.412 9.965 10.63 11.287 11.931 12.717 13.66 14.563 15.571 16.737 18.003 19.309 20.78 22.573 24.491 26.791 29.316 32.226 35.712 39.808 44.28 49.527 53.39 55.123 55.926 56.143 56.043 55.822 55.535 55.246 54.843 54.395 53.971 53.52 53.055 52.624 52.216 51.797 51.432 51.095 50.74 50.378 50.069 49.749 49.414 49.129 48.824 48.522 48.196 47.842 47.611 47.368 47.006 46.762 46.484 46.331 46.004 45.667 45.278 45.087 44.755 44.469 44.227 43.933 43.268 42.897 42.5 42.069 41.522 40.81 39.678 -2 ,16464 ,TETRA ,17555511,Fri Nov 26 03:00:28 CET,Fri Nov 26 04:46:39 CET,0.0 0.302 0.547 0.772 0.976 1.168 1.37 1.789 1.985 2.177 2.358 2.737 2.915 3.264 3.604 3.932 4.097 4.423 4.741 5.204 5.503 5.803 6.258 6.708 7.157 7.61 8.052 8.627 9.193 9.744 10.418 11.087 11.732 12.506 13.417 14.298 15.278 16.335 17.49 18.75 20.198 21.936 23.756 25.959 28.4 31.217 34.429 38.327 42.955 48.196 51.717 53.208 53.938 54.145 53.915 53.571 53.295 52.986 52.643 52.301 51.957 51.625 51.263 50.907 50.507 50.036 49.631 49.266 48.899 48.534 48.224 47.873 47.492 47.208 46.926 46.631 46.333 45.988 45.723 45.455 45.041 44.752 44.437 44.276 43.954 43.588 43.203 43.004 42.634 42.324 42.066 41.776 41.126 40.743 40.351 39.932 39.426 38.812 37.983 -3 ,5903 ,TETRA ,17555512,Fri Nov 26 03:00:29 CET,Fri Nov 26 04:46:38 CET,0.0 0.317 0.557 0.805 1.045 1.27 1.484 1.885 2.096 2.308 2.511 2.906 3.103 3.48 3.847 4.207 4.384 4.753 5.114 5.608 5.933 6.252 6.729 7.198 7.64 8.094 8.553 9.156 9.741 10.316 11.03 11.735 12.44 13.264 14.226 15.179 16.25 17.419 18.664 20.03 21.668 23.618 25.496 27.61 30.065 33.041 36.428 40.378 45.027 50.264 54.21 55.982 56.726 57.037 57.107 57.09 56.956 56.746 56.437 56.053 55.596 55.102 54.651 54.224 53.823 53.393 53.009 52.704 52.389 52.032 51.72 51.378 51.02 50.741 50.438 50.128 49.802 49.46 49.214 48.96 48.585 48.332 48.064 47.912 47.582 47.23 46.856 46.663 46.312 46.006 45.751 45.5 44.979 44.674 44.32 43.915 43.437 42.685 41.454 -4 ,17227 ,TETRA ,17555513,Fri Nov 26 03:00:28 CET,Fri Nov 26 04:36:42 CET,0.0 0.281 0.524 0.766 1.002 1.22 1.434 1.865 2.07 2.272 2.458 2.834 3.015 3.369 3.732 4.093 4.268 4.619 4.969 5.488 5.824 6.16 6.644 7.092 7.521 7.959 8.4 8.97 9.526 10.078 10.756 11.428 12.083 12.855 13.753 14.636 15.627 16.733 17.938 19.219 20.694 22.466 24.345 26.542 28.977 31.923 35.275 39.22 44.005 49.433 53.482 55.461 56.315 56.663 56.617 56.305 55.894 55.457 54.94 54.442 53.991 53.571 53.161 52.78 52.426 52.024 51.654 51.323 50.947 50.557 50.254 49.933 49.598 49.332 49.037 48.712 48.384 48.038 47.79 47.549 47.198 46.934 46.615 46.465 46.172 45.789 45.379 45.17 44.816 44.489 44.225 43.968 43.413 43.073 42.675 42.19 41.556 40.866 39.796 -5 ,11090 ,TETRA ,17555514,Fri Nov 26 03:02:27 CET,Fri Nov 26 04:49:49 CET,0.0 0.248 0.483 0.724 0.938 1.138 1.345 1.759 1.953 2.138 2.306 2.684 2.868 3.214 3.555 3.898 4.073 4.414 4.736 5.204 5.505 5.808 6.273 6.733 7.176 7.611 8.033 8.588 9.135 9.68 10.353 11.024 11.72 12.569 13.534 14.526 15.612 16.683 17.83 19.061 20.506 22.243 24.01 26.154 28.574 31.333 34.489 38.329 42.944 48.334 52.312 54.346 55.355 55.75 55.781 55.601 55.32 54.998 54.563 54.106 53.622 53.128 52.674 52.242 51.81 51.338 50.911 50.546 50.18 49.798 49.46 49.1 48.75 48.494 48.221 47.931 47.627 47.305 47.07 46.812 46.418 46.135 45.856 45.712 45.417 45.109 44.742 44.54 44.184 43.89 43.659 43.428 42.872 42.536 42.179 41.8 41.321 40.707 39.774 -6 ,11492 ,TETRA ,17555515,Fri Nov 26 03:01:26 CET,Fri Nov 26 04:38:05 CET,0.0 0.293 0.544 0.763 0.989 1.219 1.434 1.814 1.995 2.184 2.372 2.75 2.926 3.265 3.595 3.932 4.104 4.437 4.751 5.218 5.53 5.836 6.289 6.722 7.147 7.569 7.988 8.537 9.084 9.635 10.311 10.982 11.64 12.399 13.265 14.115 15.046 16.089 17.29 18.6 20.043 21.722 23.446 25.515 27.918 30.77 33.995 37.754 42.218 47.232 50.916 52.772 53.684 54.007 53.941 53.742 53.399 53.026 52.671 52.297 51.93 51.555 51.221 50.931 50.61 50.265 49.94 49.612 49.238 48.877 48.589 48.297 48.01 47.752 47.472 47.193 46.894 46.573 46.346 46.114 45.77 45.523 45.248 45.078 44.69 44.266 43.796 43.551 43.157 42.814 42.526 42.222 41.613 41.235 40.795 40.331 39.68 38.782 37.722 -7 ,32145 ,TETRA ,17555516,Fri Nov 26 03:01:26 CET,Fri Nov 26 04:37:27 CET,0.0 0.297 0.557 0.806 1.036 1.256 1.47 1.868 2.065 2.264 2.454 2.832 3.017 3.388 3.752 4.115 4.29 4.621 4.942 5.416 5.726 6.028 6.478 6.926 7.373 7.816 8.256 8.854 9.445 10.027 10.747 11.459 12.143 12.938 13.854 14.773 15.83 16.966 18.126 19.351 20.813 22.555 24.371 26.574 29.028 31.879 35.125 38.942 43.486 48.785 52.556 54.386 55.439 55.896 55.988 55.814 55.467 55.076 54.545 54.037 53.542 53.056 52.614 52.172 51.744 51.301 50.91 50.567 50.195 49.842 49.553 49.215 48.869 48.611 48.346 48.057 47.743 47.394 47.138 46.872 46.498 46.25 45.98 45.839 45.534 45.197 44.8 44.61 44.281 43.993 43.738 43.488 42.902 42.527 42.143 41.729 41.212 40.492 39.427 -8 ,1398 ,TETRA ,17555517,Fri Nov 26 03:03:25 CET,Fri Nov 26 04:50:09 CET,0.0 0.318 0.597 0.843 1.079 1.3 1.5 1.869 2.058 2.248 2.434 2.816 2.996 3.37 3.729 4.057 4.222 4.545 4.849 5.316 5.626 5.933 6.402 6.856 7.301 7.743 8.169 8.726 9.28 9.827 10.516 11.194 11.857 12.641 13.557 14.447 15.428 16.525 17.73 19.021 20.472 22.188 23.97 26.091 28.481 31.333 34.673 38.531 42.991 48.334 52.171 53.938 54.793 55.223 55.396 55.339 55.166 54.95 54.673 54.368 53.999 53.612 53.225 52.839 52.507 52.149 51.796 51.464 51.103 50.718 50.378 50.076 49.789 49.535 49.258 48.961 48.639 48.297 48.065 47.809 47.37 47.069 46.781 46.624 46.295 45.922 45.513 45.304 44.937 44.65 44.406 44.095 43.376 43.005 42.605 42.102 41.446 40.633 39.436 -9 ,21922 ,TETRA ,17555518,Fri Nov 26 03:03:26 CET,Fri Nov 26 04:49:43 CET,0.0 0.307 0.555 0.785 0.994 1.189 1.378 1.741 1.917 2.092 2.252 2.621 2.796 3.137 3.468 3.791 3.957 4.289 4.605 5.076 5.389 5.709 6.192 6.661 7.126 7.584 8.05 8.65 9.205 9.775 10.531 11.302 12.039 12.86 13.769 14.676 15.736 16.895 18.163 19.599 21.259 23.197 25.195 27.535 30.116 33.063 36.363 40.32 45.037 50.139 53.573 55.031 55.442 55.266 54.831 54.329 53.775 53.268 52.653 52.081 51.667 51.313 50.977 50.59 50.199 49.803 49.415 49.095 48.778 48.429 48.138 47.841 47.525 47.262 46.982 46.656 46.285 45.925 45.695 45.471 45.111 44.872 44.599 44.447 44.163 43.823 43.443 43.251 42.906 42.634 42.358 42.0 41.175 40.761 40.323 39.763 39.069 38.285 37.161 -10 ,2254 ,TETRA ,17555519,Fri Nov 26 03:03:25 CET,Fri Nov 26 04:50:39 CET,0.0 0.331 0.632 0.906 1.141 1.357 1.558 1.934 2.117 2.294 2.439 2.803 2.982 3.346 3.705 4.059 4.232 4.563 4.9 5.4 5.707 6.022 6.522 6.985 7.439 7.9 8.349 8.945 9.538 10.126 10.833 11.508 12.173 12.983 13.907 14.809 15.822 16.925 18.125 19.393 20.849 22.598 24.381 26.466 28.878 31.781 35.085 38.999 43.481 48.651 52.618 54.487 55.362 55.66 55.652 55.538 55.309 54.991 54.559 54.18 53.84 53.459 53.092 52.741 52.415 52.062 51.724 51.426 51.079 50.727 50.447 50.151 49.845 49.597 49.326 49.042 48.737 48.369 48.098 47.803 47.33 47.003 46.644 46.464 46.088 45.671 45.212 44.968 44.575 44.202 43.903 43.558 42.798 42.382 41.958 41.494 40.902 40.052 38.886 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt deleted file mode 100644 index 11f70c93..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8549 ,TETRA ,17555520,Fri Nov 26 03:07:26 CET,Fri Nov 26 04:41:16 CET,0.0 0.542 0.781 0.993 1.153 1.279 1.39 1.486 1.665 1.755 1.841 1.938 2.079 2.156 2.302 2.445 2.579 2.643 2.76 2.865 3.026 3.126 3.215 3.352 3.492 3.625 3.758 3.891 4.054 4.205 4.356 4.544 4.726 4.901 5.099 5.307 5.514 5.749 6.002 6.256 6.504 6.786 7.126 7.475 7.861 8.296 8.775 9.231 9.671 10.139 10.501 10.344 9.995 9.608 9.18 8.756 8.375 8.046 7.763 7.454 7.178 6.917 6.667 6.429 6.207 6.002 5.788 5.599 5.434 5.259 5.074 4.926 4.761 4.593 4.471 4.336 4.197 4.05 3.891 3.778 3.663 3.491 3.369 3.242 3.177 3.041 2.9 2.733 2.643 2.489 2.345 2.247 2.144 1.905 1.766 1.626 1.478 1.28 1.041 0.781 -0.154 -2 ,29483 ,TETRA ,17555521,Fri Nov 26 03:07:25 CET,Fri Nov 26 04:52:03 CET,0.0 0.538 0.794 0.977 1.133 1.271 1.397 1.497 1.685 1.777 1.866 1.978 2.112 2.188 2.338 2.472 2.599 2.659 2.767 2.865 3.009 3.104 3.193 3.327 3.463 3.592 3.722 3.851 4.009 4.171 4.328 4.509 4.689 4.866 5.074 5.305 5.513 5.722 5.945 6.184 6.445 6.754 7.125 7.491 7.885 8.306 8.739 9.182 9.679 10.171 10.503 10.439 10.173 9.825 9.462 9.109 8.772 8.448 8.163 7.856 7.579 7.338 7.098 6.871 6.658 6.46 6.25 6.063 5.895 5.706 5.511 5.338 5.164 4.989 4.839 4.689 4.539 4.386 4.232 4.129 4.018 3.822 3.695 3.582 3.518 3.365 3.202 3.038 2.957 2.813 2.666 2.558 2.455 2.197 2.044 1.888 1.723 1.533 1.299 0.947 0.126 -3 ,12209 ,TETRA ,17555522,Fri Nov 26 03:07:26 CET,Fri Nov 26 04:40:19 CET,0.0 0.497 0.718 0.915 1.055 1.186 1.307 1.411 1.612 1.703 1.794 1.894 2.028 2.102 2.237 2.364 2.483 2.544 2.659 2.772 2.934 3.032 3.136 3.298 3.45 3.586 3.713 3.832 3.991 4.157 4.31 4.488 4.657 4.814 4.995 5.2 5.413 5.641 5.87 6.113 6.365 6.648 6.97 7.299 7.681 8.105 8.576 9.061 9.539 9.983 10.269 10.15 9.833 9.438 9.07 8.701 8.341 7.994 7.683 7.375 7.114 6.87 6.633 6.414 6.207 6.011 5.783 5.563 5.374 5.19 5.01 4.864 4.714 4.549 4.42 4.29 4.15 4.002 3.846 3.736 3.623 3.445 3.322 3.192 3.123 2.983 2.843 2.697 2.622 2.48 2.346 2.236 2.119 1.885 1.76 1.633 1.495 1.324 1.061 0.67 -0.283 -4 ,27724 ,TETRA ,17555523,Fri Nov 26 03:09:24 CET,Fri Nov 26 04:42:22 CET,0.0 0.543 0.745 0.94 1.119 1.236 1.343 1.45 1.64 1.728 1.814 1.922 2.062 2.129 2.262 2.395 2.52 2.575 2.679 2.787 2.94 3.037 3.135 3.28 3.425 3.565 3.699 3.827 3.985 4.136 4.283 4.47 4.659 4.834 5.017 5.225 5.426 5.64 5.877 6.127 6.389 6.679 6.998 7.304 7.67 8.083 8.543 9.076 9.602 10.027 10.286 10.087 9.72 9.336 8.972 8.627 8.272 7.943 7.653 7.339 7.06 6.815 6.59 6.361 6.145 5.941 5.716 5.525 5.362 5.193 5.009 4.843 4.666 4.487 4.355 4.216 4.071 3.918 3.758 3.65 3.543 3.382 3.258 3.113 3.041 2.904 2.761 2.612 2.528 2.368 2.222 2.128 2.035 1.81 1.68 1.53 1.377 1.199 0.968 0.685 -0.315 -5 ,4235 ,TETRA ,17555524,Fri Nov 26 03:10:24 CET,Fri Nov 26 04:53:36 CET,0.0 0.621 0.847 1.007 1.162 1.305 1.428 1.532 1.721 1.802 1.877 1.976 2.118 2.19 2.328 2.47 2.606 2.669 2.789 2.905 3.067 3.167 3.27 3.422 3.558 3.676 3.799 3.926 4.087 4.236 4.371 4.531 4.697 4.86 5.051 5.265 5.466 5.689 5.92 6.172 6.443 6.751 7.094 7.397 7.745 8.132 8.556 9.025 9.518 9.872 10.138 10.131 9.87 9.537 9.179 8.835 8.508 8.18 7.868 7.551 7.281 7.054 6.834 6.604 6.386 6.197 6.0 5.81 5.645 5.474 5.269 5.1 4.946 4.778 4.633 4.489 4.338 4.183 4.041 3.942 3.83 3.65 3.522 3.397 3.333 3.192 3.049 2.899 2.818 2.674 2.532 2.426 2.322 2.085 1.959 1.826 1.669 1.471 1.188 0.845 -0.307 -6 ,28324 ,TETRA ,17555525,Fri Nov 26 03:11:26 CET,Fri Nov 26 04:55:27 CET,0.0 0.636 0.887 1.095 1.255 1.386 1.514 1.621 1.801 1.895 1.977 2.063 2.192 2.258 2.382 2.505 2.619 2.674 2.787 2.895 3.054 3.156 3.249 3.379 3.508 3.642 3.779 3.907 4.057 4.2 4.351 4.545 4.731 4.902 5.108 5.342 5.549 5.772 6.017 6.261 6.519 6.819 7.152 7.489 7.889 8.323 8.753 9.17 9.608 10.014 10.257 10.084 9.766 9.361 8.905 8.476 8.113 7.78 7.462 7.151 6.893 6.64 6.399 6.171 5.949 5.742 5.521 5.324 5.15 4.964 4.778 4.63 4.466 4.294 4.167 4.033 3.891 3.75 3.602 3.502 3.402 3.231 3.104 2.97 2.894 2.742 2.6 2.444 2.357 2.215 2.09 1.991 1.881 1.633 1.499 1.352 1.212 1.041 0.793 0.476 -0.427 -7 ,12256 ,TETRA ,17555526,Fri Nov 26 03:13:25 CET,Fri Nov 26 04:56:22 CET,0.0 0.441 0.616 0.76 0.892 1.03 1.16 1.276 1.45 1.529 1.605 1.694 1.834 1.909 2.058 2.197 2.327 2.388 2.508 2.632 2.806 2.904 2.998 3.152 3.301 3.434 3.558 3.677 3.839 3.994 4.134 4.306 4.476 4.647 4.839 5.053 5.266 5.491 5.732 5.986 6.227 6.501 6.852 7.207 7.612 8.044 8.508 8.983 9.48 9.946 10.208 10.098 9.808 9.419 8.977 8.567 8.237 7.927 7.638 7.349 7.086 6.846 6.597 6.357 6.147 5.938 5.73 5.554 5.385 5.204 5.021 4.871 4.707 4.529 4.393 4.246 4.09 3.925 3.751 3.638 3.525 3.343 3.214 3.083 3.013 2.876 2.735 2.581 2.503 2.359 2.205 2.1 1.997 1.752 1.589 1.422 1.271 1.058 0.779 0.386 -0.462 -8 ,9215 ,TETRA ,17555527,Fri Nov 26 03:12:26 CET,Fri Nov 26 04:57:04 CET,0.0 0.492 0.656 0.801 0.949 1.07 1.179 1.293 1.508 1.607 1.695 1.8 1.941 2.009 2.14 2.27 2.387 2.446 2.57 2.681 2.824 2.926 3.037 3.191 3.334 3.468 3.6 3.729 3.885 4.041 4.192 4.373 4.547 4.719 4.919 5.13 5.335 5.563 5.799 6.04 6.284 6.543 6.844 7.161 7.53 7.898 8.301 8.741 9.214 9.696 9.994 9.954 9.76 9.362 8.905 8.507 8.153 7.825 7.523 7.22 6.953 6.71 6.459 6.22 6.014 5.824 5.621 5.441 5.279 5.108 4.925 4.771 4.604 4.421 4.287 4.15 4.004 3.853 3.699 3.587 3.474 3.299 3.177 3.057 2.994 2.853 2.709 2.556 2.474 2.331 2.19 2.085 1.976 1.708 1.569 1.431 1.274 1.08 0.851 0.613 -0.217 -9 ,5138 ,TETRA ,17555528,Fri Nov 26 03:14:24 CET,Fri Nov 26 04:58:04 CET,0.0 0.39 0.619 0.76 0.871 0.979 1.08 1.175 1.355 1.448 1.525 1.603 1.742 1.824 1.968 2.09 2.206 2.264 2.378 2.487 2.645 2.749 2.85 2.985 3.11 3.243 3.38 3.502 3.659 3.813 3.967 4.158 4.336 4.502 4.692 4.904 5.097 5.308 5.541 5.787 6.052 6.366 6.731 7.068 7.423 7.818 8.282 8.759 9.271 9.756 10.0 9.83 9.517 9.139 8.732 8.372 8.023 7.699 7.434 7.15 6.884 6.63 6.387 6.158 5.93 5.724 5.514 5.326 5.154 4.974 4.794 4.637 4.478 4.325 4.199 4.063 3.928 3.785 3.622 3.503 3.384 3.198 3.079 2.95 2.874 2.721 2.563 2.414 2.339 2.197 2.064 1.968 1.868 1.657 1.543 1.405 1.221 1.01 0.796 0.536 -0.484 -10 ,8068 ,TETRA ,17555529,Fri Nov 26 03:14:26 CET,Fri Nov 26 04:57:55 CET,0.0 0.297 0.463 0.635 0.791 0.92 1.03 1.123 1.322 1.429 1.519 1.616 1.763 1.847 1.988 2.112 2.227 2.288 2.411 2.521 2.678 2.79 2.9 3.047 3.191 3.33 3.452 3.567 3.718 3.87 4.004 4.172 4.354 4.52 4.71 4.939 5.173 5.426 5.683 5.95 6.22 6.529 6.888 7.22 7.602 8.027 8.518 9.058 9.603 10.051 10.318 10.235 9.996 9.665 9.262 8.857 8.471 8.121 7.804 7.471 7.201 6.962 6.746 6.525 6.295 6.091 5.862 5.652 5.489 5.324 5.145 4.999 4.845 4.687 4.557 4.415 4.276 4.132 3.965 3.845 3.732 3.568 3.448 3.322 3.255 3.106 2.947 2.778 2.692 2.548 2.423 2.311 2.197 1.99 1.867 1.723 1.567 1.399 1.195 0.892 -0.328 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index bed6750a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4062 ,TETRA ,17555530,Fri Nov 26 03:14:28 CET,Fri Nov 26 04:58:16 CET,0.0 0.828 1.153 1.358 1.525 1.657 1.768 1.885 2.124 2.23 2.317 2.421 2.568 2.657 2.833 2.996 3.146 3.217 3.357 3.489 3.681 3.809 3.933 4.12 4.3 4.467 4.627 4.779 4.98 5.189 5.39 5.62 5.848 6.063 6.299 6.575 6.847 7.147 7.474 7.811 8.169 8.6 9.117 9.628 10.211 10.88 11.654 12.489 13.45 14.507 15.636 16.426 16.722 16.839 16.874 16.829 16.738 16.624 16.504 16.355 16.205 16.068 15.932 15.805 15.683 15.56 15.448 15.349 15.25 15.139 15.025 14.928 14.823 14.712 14.622 14.519 14.412 14.306 14.185 14.103 14.022 13.893 13.808 13.72 13.674 13.579 13.479 13.34 13.258 13.139 13.047 12.972 12.892 12.723 12.615 12.495 12.359 12.188 12.005 11.812 11.356 -2 ,7228 ,TETRA ,17555531,Fri Nov 26 03:14:26 CET,Fri Nov 26 04:43:14 CET,0.0 0.59 0.857 1.044 1.201 1.346 1.481 1.608 1.831 1.933 2.026 2.155 2.318 2.409 2.581 2.74 2.883 2.956 3.105 3.245 3.435 3.562 3.696 3.878 4.043 4.204 4.359 4.512 4.719 4.928 5.127 5.362 5.587 5.812 6.064 6.332 6.597 6.889 7.213 7.568 7.937 8.369 8.871 9.345 9.901 10.561 11.312 12.13 13.081 14.142 15.412 16.278 16.607 16.746 16.737 16.654 16.559 16.447 16.334 16.208 16.08 15.961 15.841 15.714 15.593 15.476 15.35 15.237 15.128 15.009 14.884 14.779 14.671 14.558 14.467 14.372 14.277 14.174 14.067 13.994 13.921 13.807 13.718 13.629 13.584 13.49 13.382 13.262 13.202 13.097 13.005 12.932 12.837 12.621 12.521 12.408 12.276 12.141 11.971 11.728 10.695 -3 ,21070 ,TETRA ,17555532,Fri Nov 26 03:14:26 CET,Fri Nov 26 05:00:13 CET,0.0 0.642 0.875 1.058 1.222 1.371 1.499 1.626 1.842 1.939 2.035 2.148 2.297 2.376 2.521 2.663 2.816 2.893 3.041 3.177 3.354 3.469 3.597 3.783 3.945 4.102 4.262 4.421 4.624 4.816 5.008 5.248 5.479 5.688 5.926 6.205 6.473 6.775 7.09 7.422 7.788 8.197 8.686 9.189 9.744 10.365 11.086 11.884 12.825 13.867 15.042 15.949 16.336 16.448 16.48 16.447 16.351 16.252 16.153 16.026 15.894 15.765 15.642 15.518 15.392 15.266 15.141 15.03 14.921 14.807 14.693 14.601 14.5 14.386 14.291 14.197 14.102 13.998 13.889 13.817 13.739 13.597 13.49 13.384 13.332 13.221 13.103 12.991 12.935 12.833 12.743 12.668 12.584 12.379 12.271 12.165 12.049 11.917 11.735 11.481 10.825 -4 ,13732 ,TETRA ,17555533,Fri Nov 26 03:14:26 CET,Fri Nov 26 05:00:18 CET,0.0 0.873 1.136 1.341 1.545 1.702 1.836 1.962 2.166 2.252 2.34 2.458 2.608 2.691 2.856 3.018 3.167 3.238 3.375 3.507 3.698 3.827 3.95 4.129 4.301 4.461 4.613 4.765 4.971 5.167 5.346 5.563 5.792 6.014 6.262 6.547 6.816 7.108 7.427 7.781 8.153 8.57 9.065 9.55 10.116 10.766 11.527 12.336 13.233 14.24 15.368 16.178 16.487 16.594 16.617 16.584 16.499 16.404 16.303 16.172 16.061 15.958 15.84 15.708 15.591 15.483 15.356 15.236 15.12 14.993 14.866 14.764 14.658 14.537 14.45 14.357 14.253 14.148 14.027 13.947 13.865 13.722 13.619 13.525 13.481 13.385 13.274 13.15 13.08 12.96 12.859 12.776 12.69 12.497 12.377 12.251 12.123 11.981 11.812 11.575 10.959 -5 ,16049 ,TETRA ,17555534,Fri Nov 26 03:14:27 CET,Fri Nov 26 05:01:07 CET,0.0 0.81 1.151 1.388 1.574 1.704 1.83 1.957 2.174 2.265 2.352 2.471 2.616 2.693 2.846 2.998 3.149 3.222 3.358 3.485 3.676 3.81 3.943 4.125 4.293 4.45 4.599 4.751 4.954 5.144 5.334 5.565 5.781 5.997 6.253 6.552 6.841 7.148 7.467 7.811 8.184 8.629 9.148 9.656 10.246 10.9 11.649 12.491 13.5 14.548 15.647 16.491 16.866 16.974 16.964 16.906 16.799 16.685 16.592 16.474 16.357 16.241 16.119 16.001 15.882 15.763 15.633 15.518 15.416 15.315 15.207 15.108 15.005 14.889 14.801 14.718 14.623 14.517 14.403 14.323 14.245 14.126 14.028 13.92 13.87 13.768 13.655 13.526 13.463 13.352 13.259 13.18 13.097 12.908 12.803 12.695 12.577 12.436 12.239 11.938 11.232 -6 ,15546 ,TETRA ,17555535,Fri Nov 26 03:14:30 CET,Fri Nov 26 04:47:59 CET,0.0 1.089 1.463 1.749 1.949 2.126 2.28 2.415 2.68 2.796 2.898 3.024 3.172 3.258 3.411 3.559 3.704 3.773 3.904 4.033 4.219 4.337 4.461 4.65 4.827 5.0 5.167 5.322 5.513 5.694 5.88 6.11 6.336 6.554 6.814 7.11 7.386 7.693 8.017 8.363 8.741 9.166 9.67 10.168 10.72 11.366 12.121 12.948 13.925 15.021 16.148 16.849 17.174 17.307 17.339 17.315 17.228 17.124 17.024 16.913 16.806 16.708 16.603 16.474 16.349 16.232 16.097 15.986 15.888 15.779 15.653 15.548 15.45 15.348 15.271 15.188 15.086 14.972 14.853 14.779 14.697 14.566 14.48 14.384 14.333 14.233 14.124 13.993 13.928 13.817 13.716 13.635 13.552 13.37 13.27 13.168 13.043 12.896 12.703 12.443 11.68 -7 ,19490 ,TETRA ,17555536,Fri Nov 26 03:15:24 CET,Fri Nov 26 05:00:01 CET,0.0 0.958 1.266 1.488 1.65 1.798 1.929 2.051 2.284 2.386 2.485 2.61 2.757 2.842 3.005 3.163 3.315 3.39 3.526 3.648 3.831 3.949 4.068 4.242 4.403 4.556 4.705 4.862 5.084 5.292 5.478 5.704 5.927 6.143 6.399 6.69 6.963 7.254 7.571 7.928 8.313 8.739 9.221 9.715 10.316 10.986 11.723 12.566 13.598 14.701 15.936 16.848 17.209 17.327 17.326 17.254 17.143 17.024 16.907 16.785 16.655 16.524 16.395 16.254 16.114 15.995 15.88 15.779 15.682 15.577 15.468 15.374 15.264 15.153 15.072 14.984 14.894 14.796 14.684 14.608 14.53 14.41 14.325 14.223 14.167 14.049 13.929 13.804 13.74 13.629 13.541 13.468 13.393 13.241 13.147 13.033 12.906 12.749 12.58 12.326 11.126 -8 ,5938 ,TETRA ,17555537,Fri Nov 26 02:44:23 CET,Fri Nov 26 04:28:53 CET,0.0 1.234 1.551 1.741 1.894 2.039 2.174 2.309 2.54 2.629 2.715 2.821 2.968 3.055 3.212 3.368 3.515 3.582 3.714 3.84 4.017 4.138 4.266 4.45 4.615 4.773 4.938 5.104 5.315 5.517 5.717 5.955 6.169 6.372 6.611 6.876 7.149 7.446 7.752 8.106 8.492 8.919 9.431 9.948 10.557 11.219 11.967 12.815 13.798 14.809 15.853 16.615 16.939 17.053 17.061 17.014 16.918 16.804 16.702 16.583 16.452 16.323 16.194 16.067 15.944 15.824 15.699 15.585 15.481 15.375 15.273 15.189 15.089 14.978 14.892 14.793 14.685 14.574 14.453 14.37 14.291 14.174 14.089 13.998 13.951 13.856 13.757 13.649 13.587 13.462 13.333 13.251 13.169 12.983 12.873 12.748 12.613 12.444 12.209 11.938 11.377 -9 ,5268 ,TETRA ,17555538,Fri Nov 26 02:11:19 CET,Fri Nov 26 03:56:12 CET,0.0 0.817 1.099 1.336 1.517 1.653 1.771 1.886 2.114 2.226 2.32 2.42 2.562 2.647 2.814 2.966 3.114 3.187 3.334 3.476 3.684 3.811 3.922 4.08 4.239 4.399 4.558 4.717 4.917 5.107 5.304 5.558 5.787 5.995 6.247 6.528 6.787 7.083 7.417 7.764 8.143 8.584 9.095 9.606 10.22 10.918 11.658 12.446 13.374 14.472 15.73 16.605 16.926 17.054 17.076 17.019 16.95 16.85 16.727 16.587 16.466 16.354 16.22 16.084 15.973 15.869 15.74 15.621 15.522 15.407 15.29 15.196 15.095 14.992 14.912 14.824 14.727 14.631 14.525 14.447 14.363 14.226 14.137 14.042 13.985 13.871 13.762 13.649 13.586 13.47 13.378 13.299 13.219 13.052 12.951 12.831 12.701 12.553 12.351 12.11 11.418 -10 ,25834 ,TETRA ,17555539,Fri Nov 26 02:11:18 CET,Fri Nov 26 03:57:08 CET,0.0 1.244 1.556 1.769 1.95 2.093 2.218 2.339 2.559 2.668 2.777 2.925 3.084 3.172 3.339 3.498 3.653 3.724 3.845 3.959 4.141 4.268 4.387 4.557 4.723 4.893 5.063 5.224 5.435 5.63 5.804 6.012 6.23 6.457 6.71 6.983 7.253 7.555 7.88 8.226 8.588 8.993 9.475 9.974 10.586 11.277 12.041 12.879 13.867 14.947 16.131 16.94 17.256 17.392 17.407 17.337 17.233 17.144 17.048 16.907 16.778 16.672 16.566 16.461 16.342 16.232 16.127 16.012 15.9 15.784 15.66 15.548 15.429 15.314 15.223 15.129 15.039 14.942 14.839 14.768 14.681 14.53 14.421 14.309 14.26 14.155 14.025 13.897 13.834 13.723 13.626 13.54 13.45 13.271 13.172 13.063 12.947 12.816 12.644 12.371 11.664 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt deleted file mode 100644 index b1282d25..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21547 ,TETRA ,17555540,Fri Nov 26 02:11:18 CET,Fri Nov 26 03:55:57 CET,0.0 0.565 0.795 0.973 1.096 1.215 1.328 1.44 1.643 1.726 1.805 1.909 2.05 2.131 2.289 2.434 2.579 2.641 2.761 2.878 3.039 3.142 3.23 3.376 3.529 3.672 3.809 3.927 4.071 4.213 4.337 4.487 4.642 4.789 4.953 5.148 5.335 5.53 5.738 5.949 6.16 6.397 6.679 6.982 7.305 7.596 7.909 8.234 8.544 8.787 8.769 8.424 7.949 7.499 7.052 6.586 6.198 5.851 5.554 5.243 4.966 4.719 4.491 4.279 4.074 3.875 3.661 3.471 3.304 3.14 2.955 2.767 2.578 2.409 2.281 2.14 1.988 1.837 1.688 1.584 1.475 1.29 1.152 1.018 0.951 0.815 0.671 0.507 0.413 0.243 0.064 -0.043 -0.145 -0.395 -0.543 -0.692 -0.852 -1.031 -1.242 -1.535 -2.315 -2 ,2809 ,TETRA ,17555541,Fri Nov 26 02:11:18 CET,Fri Nov 26 03:55:15 CET,0.0 0.887 1.255 1.501 1.672 1.82 1.969 2.107 2.348 2.45 2.544 2.682 2.831 2.912 3.058 3.2 3.344 3.423 3.568 3.685 3.861 3.986 4.102 4.26 4.399 4.525 4.641 4.757 4.902 5.039 5.174 5.353 5.539 5.713 5.9 6.069 6.228 6.419 6.629 6.863 7.12 7.426 7.748 8.009 8.267 8.51 8.763 9.015 9.249 9.353 9.162 8.615 8.032 7.555 7.148 6.774 6.412 6.054 5.734 5.415 5.137 4.879 4.638 4.407 4.185 3.956 3.69 3.451 3.249 3.06 2.881 2.738 2.591 2.437 2.306 2.162 2.019 1.89 1.753 1.638 1.521 1.337 1.208 1.086 1.023 0.881 0.736 0.588 0.513 0.382 0.286 0.19 0.085 -0.146 -0.289 -0.439 -0.591 -0.756 -0.933 -1.193 -1.737 -3 ,14160 ,TETRA ,17555542,Fri Nov 26 02:12:23 CET,Fri Nov 26 03:56:19 CET,0.0 0.505 0.71 0.865 0.999 1.136 1.255 1.364 1.572 1.67 1.763 1.866 2.009 2.094 2.266 2.418 2.545 2.606 2.726 2.835 2.984 3.075 3.168 3.321 3.448 3.553 3.683 3.825 4.011 4.196 4.344 4.514 4.69 4.841 5.002 5.197 5.375 5.571 5.793 6.004 6.226 6.51 6.833 7.102 7.395 7.692 7.982 8.267 8.551 8.781 8.837 8.533 8.122 7.724 7.317 6.915 6.524 6.141 5.8 5.44 5.123 4.846 4.585 4.337 4.105 3.89 3.656 3.445 3.264 3.086 2.909 2.752 2.576 2.393 2.254 2.115 1.976 1.83 1.677 1.573 1.459 1.244 1.081 0.921 0.843 0.685 0.514 0.34 0.259 0.114 0.011 -0.087 -0.193 -0.415 -0.55 -0.7 -0.871 -1.078 -1.315 -1.62 -2.588 -4 ,20466 ,TETRA ,17555543,Fri Nov 26 02:14:21 CET,Fri Nov 26 03:58:04 CET,0.0 0.65 0.895 1.061 1.184 1.3 1.409 1.516 1.741 1.838 1.919 2.008 2.139 2.222 2.382 2.519 2.652 2.719 2.85 2.967 3.125 3.223 3.317 3.461 3.598 3.717 3.827 3.934 4.074 4.211 4.345 4.506 4.656 4.809 4.995 5.19 5.369 5.562 5.764 5.972 6.187 6.447 6.772 7.075 7.382 7.695 8.017 8.324 8.622 8.907 9.012 8.796 8.422 7.992 7.56 7.128 6.739 6.405 6.094 5.769 5.495 5.231 4.979 4.747 4.521 4.328 4.144 3.962 3.792 3.617 3.433 3.279 3.117 2.95 2.819 2.687 2.558 2.428 2.292 2.189 2.065 1.873 1.749 1.613 1.54 1.388 1.241 1.078 0.989 0.851 0.764 0.67 0.56 0.304 0.178 0.065 -0.072 -0.229 -0.44 -0.715 -1.501 -5 ,8259 ,TETRA ,17555544,Fri Nov 26 02:14:20 CET,Fri Nov 26 03:58:29 CET,0.0 0.741 1.068 1.279 1.436 1.579 1.702 1.814 2.019 2.111 2.206 2.337 2.484 2.569 2.719 2.863 3.003 3.069 3.195 3.306 3.485 3.616 3.728 3.867 3.994 4.129 4.267 4.389 4.536 4.671 4.803 4.963 5.105 5.24 5.414 5.608 5.802 6.027 6.244 6.45 6.662 6.895 7.216 7.516 7.754 7.986 8.228 8.453 8.636 8.71 8.556 8.147 7.657 7.201 6.78 6.351 5.954 5.596 5.274 4.938 4.643 4.376 4.141 3.922 3.698 3.461 3.228 3.026 2.835 2.651 2.455 2.277 2.093 1.919 1.789 1.645 1.493 1.339 1.167 1.044 0.919 0.736 0.611 0.472 0.403 0.264 0.111 -0.056 -0.141 -0.296 -0.442 -0.548 -0.666 -0.922 -1.067 -1.202 -1.34 -1.527 -1.745 -2.041 -2.951 -6 ,27609 ,TETRA ,17555545,Fri Nov 26 02:15:16 CET,Fri Nov 26 03:59:04 CET,0.0 0.892 1.203 1.429 1.61 1.78 1.919 2.048 2.297 2.399 2.488 2.6 2.738 2.823 2.985 3.142 3.286 3.352 3.482 3.607 3.798 3.916 4.027 4.172 4.294 4.408 4.525 4.654 4.819 4.968 5.101 5.261 5.43 5.593 5.772 5.971 6.145 6.336 6.549 6.756 6.973 7.221 7.491 7.76 8.038 8.309 8.61 8.934 9.288 9.59 9.689 9.366 8.89 8.424 7.953 7.504 7.131 6.787 6.475 6.169 5.906 5.661 5.423 5.191 4.979 4.787 4.583 4.406 4.241 4.054 3.861 3.707 3.551 3.387 3.257 3.123 2.994 2.859 2.712 2.61 2.497 2.3 2.164 2.029 1.953 1.788 1.622 1.445 1.355 1.21 1.081 0.968 0.855 0.62 0.492 0.361 0.227 0.082 -0.105 -0.435 -1.427 -7 ,32678 ,TETRA ,17555546,Fri Nov 26 02:16:24 CET,Fri Nov 26 04:01:36 CET,0.0 1.112 1.428 1.656 1.829 1.974 2.078 2.181 2.387 2.478 2.567 2.684 2.833 2.916 3.07 3.205 3.329 3.392 3.516 3.644 3.813 3.912 4.009 4.142 4.265 4.393 4.518 4.63 4.77 4.914 5.052 5.211 5.364 5.513 5.692 5.896 6.086 6.292 6.504 6.721 6.948 7.176 7.452 7.777 8.162 8.541 8.882 9.178 9.457 9.724 9.796 9.478 9.06 8.634 8.215 7.804 7.44 7.099 6.779 6.449 6.152 5.884 5.635 5.399 5.185 4.99 4.769 4.573 4.411 4.241 4.051 3.893 3.736 3.577 3.451 3.315 3.169 3.023 2.883 2.782 2.672 2.503 2.379 2.236 2.157 1.989 1.826 1.678 1.605 1.465 1.362 1.268 1.173 0.958 0.835 0.701 0.548 0.388 0.199 -0.037 -0.698 -8 ,12585 ,TETRA ,17555547,Fri Nov 26 02:15:16 CET,Fri Nov 26 03:59:10 CET,0.0 0.907 1.189 1.365 1.516 1.661 1.794 1.915 2.137 2.232 2.323 2.448 2.592 2.667 2.806 2.939 3.054 3.106 3.213 3.322 3.473 3.564 3.658 3.798 3.939 4.086 4.215 4.328 4.472 4.608 4.738 4.91 5.094 5.257 5.431 5.634 5.816 6.008 6.226 6.449 6.67 6.909 7.188 7.462 7.771 8.082 8.442 8.79 9.08 9.313 9.296 8.973 8.576 8.179 7.761 7.332 6.951 6.594 6.266 5.876 5.527 5.264 5.026 4.805 4.581 4.364 4.15 3.956 3.795 3.628 3.445 3.289 3.131 2.96 2.824 2.7 2.571 2.427 2.277 2.171 2.068 1.903 1.787 1.676 1.615 1.486 1.358 1.215 1.137 0.986 0.856 0.763 0.662 0.428 0.304 0.185 0.035 -0.15 -0.366 -0.723 -1.765 -9 ,10675 ,TETRA ,17555548,Fri Nov 26 02:15:16 CET,Fri Nov 26 03:49:05 CET,0.0 0.745 1.001 1.171 1.33 1.459 1.562 1.654 1.823 1.916 2.015 2.125 2.261 2.333 2.469 2.599 2.71 2.764 2.871 2.971 3.118 3.207 3.301 3.442 3.558 3.672 3.787 3.895 4.042 4.198 4.341 4.496 4.661 4.831 5.034 5.261 5.48 5.732 5.99 6.223 6.438 6.682 6.956 7.213 7.497 7.823 8.169 8.5 8.83 9.093 9.16 8.886 8.438 7.98 7.559 7.101 6.672 6.294 5.957 5.604 5.293 5.02 4.766 4.511 4.257 4.035 3.819 3.619 3.44 3.259 3.072 2.892 2.693 2.506 2.376 2.246 2.105 1.955 1.797 1.691 1.584 1.423 1.3 1.15 1.069 0.905 0.732 0.54 0.451 0.317 0.217 0.123 0.018 -0.215 -0.351 -0.508 -0.66 -0.83 -1.071 -1.382 -2.223 -10 ,13574 ,TETRA ,17555549,Fri Nov 26 02:16:25 CET,Fri Nov 26 04:01:13 CET,0.0 0.554 0.847 1.079 1.246 1.375 1.487 1.575 1.738 1.818 1.9 2.005 2.135 2.207 2.35 2.478 2.591 2.654 2.778 2.887 3.045 3.155 3.265 3.42 3.569 3.725 3.879 4.02 4.205 4.377 4.539 4.737 4.914 5.068 5.229 5.398 5.566 5.753 5.956 6.193 6.429 6.653 6.914 7.177 7.452 7.736 8.039 8.334 8.673 8.957 8.993 8.677 8.252 7.812 7.398 7.031 6.671 6.295 5.977 5.677 5.405 5.152 4.913 4.692 4.487 4.289 4.077 3.891 3.728 3.546 3.349 3.189 3.026 2.859 2.717 2.559 2.403 2.242 2.066 1.943 1.822 1.653 1.539 1.42 1.36 1.224 1.065 0.902 0.825 0.681 0.539 0.42 0.284 0.001 -0.123 -0.247 -0.385 -0.55 -0.776 -1.093 -2.083 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 66cc5a4f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11947 ,TETRA ,17555550,Fri Nov 26 02:16:25 CET,Fri Nov 26 04:00:02 CET,0.0 0.51 0.733 0.946 1.149 1.325 1.471 1.599 1.817 1.917 2.023 2.166 2.311 2.4 2.593 2.754 2.898 2.971 3.109 3.25 3.451 3.581 3.707 3.892 4.07 4.227 4.372 4.517 4.704 4.887 5.062 5.284 5.502 5.708 5.956 6.231 6.496 6.782 7.086 7.42 7.779 8.193 8.677 9.164 9.733 10.366 11.082 11.89 12.734 13.661 14.804 15.56 15.825 15.869 15.806 15.704 15.576 15.418 15.258 15.076 14.922 14.798 14.672 14.544 14.409 14.269 14.119 13.993 13.871 13.726 13.572 13.448 13.317 13.179 13.074 12.963 12.842 12.713 12.574 12.473 12.373 12.216 12.111 11.998 11.936 11.82 11.693 11.553 11.483 11.364 11.252 11.164 11.065 10.881 10.791 10.691 10.56 10.372 10.119 9.806 9.098 -2 ,24530 ,TETRA ,17555551,Fri Nov 26 02:16:25 CET,Fri Nov 26 03:49:43 CET,0.0 1.282 1.641 1.848 1.998 2.133 2.266 2.384 2.608 2.707 2.796 2.929 3.074 3.154 3.307 3.459 3.602 3.673 3.815 3.953 4.147 4.264 4.377 4.535 4.691 4.855 5.022 5.175 5.362 5.56 5.751 5.982 6.21 6.415 6.665 6.935 7.195 7.497 7.805 8.126 8.48 8.913 9.411 9.865 10.4 11.013 11.69 12.492 13.443 14.433 15.444 16.041 16.247 16.289 16.222 16.095 15.923 15.735 15.567 15.393 15.231 15.084 14.919 14.752 14.61 14.484 14.342 14.222 14.118 13.993 13.853 13.742 13.628 13.506 13.402 13.294 13.187 13.064 12.937 12.845 12.744 12.591 12.478 12.359 12.294 12.165 12.035 11.903 11.837 11.716 11.596 11.505 11.415 11.207 11.071 10.927 10.766 10.583 10.346 10.046 9.549 -3 ,30676 ,TETRA ,17555552,Fri Nov 26 02:19:22 CET,Fri Nov 26 04:02:58 CET,0.0 0.598 0.869 1.062 1.222 1.355 1.477 1.598 1.798 1.891 1.989 2.117 2.266 2.349 2.513 2.661 2.791 2.861 2.99 3.118 3.314 3.435 3.555 3.727 3.882 4.03 4.182 4.327 4.52 4.716 4.901 5.127 5.344 5.547 5.779 6.042 6.305 6.603 6.921 7.274 7.647 8.041 8.503 8.986 9.556 10.196 10.908 11.669 12.523 13.479 14.577 15.177 15.302 15.323 15.255 15.138 15.023 14.875 14.723 14.58 14.437 14.282 14.122 13.969 13.829 13.698 13.566 13.446 13.33 13.21 13.091 12.985 12.864 12.748 12.653 12.552 12.446 12.333 12.218 12.128 12.026 11.867 11.753 11.637 11.579 11.439 11.287 11.137 11.063 10.942 10.831 10.736 10.64 10.46 10.344 10.223 10.107 9.969 9.795 9.553 8.891 -4 ,2311 ,TETRA ,17555553,Fri Nov 26 02:19:24 CET,Fri Nov 26 04:02:30 CET,0.0 0.809 1.021 1.175 1.319 1.452 1.586 1.711 1.925 2.018 2.107 2.227 2.365 2.444 2.602 2.751 2.897 2.964 3.089 3.231 3.434 3.555 3.667 3.829 3.992 4.151 4.309 4.464 4.651 4.828 5.012 5.246 5.46 5.661 5.905 6.178 6.428 6.693 6.997 7.332 7.68 8.083 8.558 9.035 9.597 10.219 10.929 11.677 12.541 13.604 14.72 15.343 15.53 15.549 15.49 15.392 15.214 14.984 14.782 14.585 14.399 14.211 14.032 13.866 13.713 13.585 13.455 13.325 13.208 13.081 12.927 12.8 12.672 12.534 12.42 12.308 12.205 12.092 11.964 11.875 11.785 11.651 11.559 11.456 11.398 11.27 11.141 11.003 10.926 10.811 10.728 10.648 10.556 10.378 10.274 10.16 10.034 9.89 9.76 9.609 9.175 -5 ,12619 ,TETRA ,17555554,Fri Nov 26 02:20:23 CET,Fri Nov 26 04:04:18 CET,0.0 0.539 0.83 1.057 1.23 1.392 1.537 1.658 1.855 1.945 2.036 2.158 2.302 2.382 2.527 2.67 2.812 2.879 3.012 3.146 3.355 3.486 3.604 3.771 3.933 4.083 4.224 4.377 4.583 4.774 4.961 5.177 5.38 5.582 5.82 6.099 6.365 6.656 6.956 7.272 7.624 8.026 8.493 8.954 9.515 10.136 10.815 11.599 12.535 13.566 14.626 15.357 15.615 15.702 15.681 15.561 15.436 15.293 15.137 14.97 14.825 14.693 14.528 14.339 14.155 13.98 13.788 13.615 13.476 13.334 13.188 13.068 12.945 12.828 12.726 12.613 12.507 12.397 12.28 12.187 12.083 11.934 11.839 11.743 11.691 11.58 11.469 11.341 11.269 11.151 11.031 10.937 10.836 10.61 10.49 10.36 10.193 10.0 9.751 9.438 8.486 -6 ,9125 ,TETRA ,17555555,Fri Nov 26 02:20:23 CET,Fri Nov 26 04:03:50 CET,0.0 0.882 1.227 1.462 1.629 1.77 1.886 1.998 2.212 2.311 2.409 2.521 2.658 2.734 2.876 3.015 3.156 3.224 3.356 3.485 3.684 3.815 3.929 4.099 4.272 4.434 4.596 4.751 4.943 5.125 5.296 5.505 5.718 5.927 6.158 6.428 6.704 7.003 7.322 7.66 8.023 8.419 8.878 9.362 9.908 10.49 11.165 11.94 12.871 13.966 15.05 15.691 15.967 16.07 16.015 15.862 15.71 15.555 15.411 15.261 15.12 14.981 14.824 14.67 14.535 14.404 14.259 14.118 13.99 13.862 13.73 13.619 13.506 13.377 13.266 13.158 13.042 12.906 12.756 12.659 12.561 12.389 12.268 12.148 12.089 11.961 11.827 11.698 11.628 11.51 11.389 11.298 11.202 10.997 10.893 10.768 10.63 10.481 10.278 10.042 9.459 -7 ,1790 ,TETRA ,17555556,Fri Nov 26 02:20:23 CET,Fri Nov 26 04:04:02 CET,0.0 0.822 1.036 1.188 1.329 1.452 1.564 1.683 1.901 2.002 2.106 2.232 2.375 2.455 2.611 2.766 2.911 2.979 3.106 3.22 3.39 3.505 3.621 3.789 3.948 4.11 4.272 4.425 4.616 4.8 4.986 5.223 5.444 5.647 5.891 6.17 6.434 6.719 7.037 7.369 7.715 8.11 8.587 9.059 9.586 10.212 10.95 11.756 12.651 13.585 14.573 15.269 15.566 15.633 15.551 15.397 15.226 15.077 14.946 14.798 14.661 14.521 14.381 14.248 14.101 13.954 13.81 13.688 13.583 13.461 13.322 13.206 13.083 12.956 12.859 12.762 12.661 12.559 12.445 12.359 12.265 12.123 12.033 11.932 11.876 11.763 11.64 11.494 11.425 11.317 11.206 11.126 11.034 10.806 10.684 10.547 10.409 10.265 10.077 9.782 8.947 -8 ,6870 ,TETRA ,17555557,Fri Nov 26 02:42:22 CET,Fri Nov 26 04:26:15 CET,0.0 0.651 0.913 1.083 1.24 1.373 1.484 1.596 1.807 1.909 2.012 2.149 2.296 2.377 2.522 2.66 2.807 2.877 3.009 3.138 3.316 3.438 3.556 3.728 3.902 4.056 4.202 4.347 4.536 4.725 4.912 5.137 5.352 5.57 5.822 6.084 6.343 6.64 6.967 7.322 7.692 8.101 8.572 9.048 9.598 10.21 10.902 11.647 12.536 13.591 14.698 15.308 15.498 15.545 15.498 15.399 15.28 15.148 15.003 14.85 14.724 14.602 14.461 14.304 14.166 14.043 13.903 13.771 13.652 13.526 13.399 13.294 13.179 13.049 12.95 12.854 12.742 12.618 12.487 12.388 12.283 12.134 12.04 11.931 11.87 11.744 11.602 11.465 11.398 11.275 11.139 11.049 10.954 10.751 10.631 10.502 10.385 10.242 10.022 9.732 9.211 -9 ,11284 ,TETRA ,17555558,Fri Nov 26 02:42:22 CET,Fri Nov 26 04:27:57 CET,0.0 0.561 0.838 1.038 1.186 1.327 1.449 1.564 1.804 1.912 2.013 2.139 2.28 2.357 2.497 2.635 2.777 2.848 2.982 3.108 3.286 3.397 3.506 3.674 3.83 3.982 4.123 4.257 4.441 4.627 4.812 5.029 5.247 5.461 5.701 5.98 6.255 6.551 6.858 7.194 7.557 7.955 8.428 8.901 9.461 10.088 10.792 11.542 12.39 13.391 14.448 15.137 15.383 15.44 15.407 15.297 15.154 15.025 14.891 14.71 14.528 14.366 14.211 14.057 13.908 13.769 13.631 13.501 13.374 13.249 13.119 13.002 12.887 12.756 12.649 12.54 12.422 12.299 12.167 12.072 11.981 11.838 11.726 11.61 11.55 11.418 11.291 11.161 11.086 10.962 10.832 10.74 10.649 10.438 10.322 10.196 10.025 9.82 9.589 9.268 8.178 -10 ,6 ,TETRA ,17555559,Fri Nov 26 02:31:24 CET,Fri Nov 26 04:15:44 CET,0.0 0.631 0.925 1.103 1.277 1.432 1.57 1.69 1.904 2.003 2.088 2.192 2.333 2.417 2.576 2.717 2.853 2.927 3.071 3.195 3.38 3.5 3.611 3.774 3.934 4.095 4.256 4.405 4.599 4.796 4.972 5.188 5.406 5.621 5.867 6.111 6.367 6.675 6.991 7.32 7.669 8.055 8.529 9.033 9.605 10.236 10.944 11.72 12.617 13.594 14.753 15.516 15.752 15.82 15.791 15.694 15.538 15.314 15.086 14.849 14.639 14.442 14.256 14.104 13.976 13.859 13.711 13.565 13.449 13.334 13.209 13.095 12.968 12.83 12.723 12.608 12.482 12.359 12.234 12.144 12.045 11.892 11.791 11.685 11.63 11.514 11.39 11.263 11.197 11.073 10.951 10.868 10.776 10.569 10.457 10.327 10.184 10.01 9.79 9.562 8.859 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index d4092ad3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17020 ,KEBNE ,17043671,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:37:48 CET,0.0 0.697 0.978 1.23 1.45 1.671 1.857 2.008 2.299 2.436 2.564 2.63 2.934 3.048 3.271 3.495 3.704 3.815 4.035 4.236 4.527 4.712 4.89 5.159 5.426 5.679 5.93 6.186 6.518 6.84 7.147 7.504 7.872 8.235 8.659 9.158 9.646 10.183 10.774 11.423 12.123 12.911 13.858 14.85 16.033 17.414 19.066 20.972 23.318 26.25 29.947 33.255 35.307 36.675 37.613 38.302 38.825 39.21 39.457 39.612 39.705 39.762 39.809 39.851 39.871 39.881 39.869 39.831 39.786 39.733 39.674 39.616 39.532 39.448 39.388 39.309 39.214 39.11 38.976 38.873 38.768 38.614 38.517 38.399 38.334 38.192 38.045 37.851 37.735 37.5 37.413 37.259 37.085 36.701 36.475 36.22 35.95 35.642 35.158 34.444 31.004 -2 ,15702 ,KEBNE ,17043672,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:37:50 CET,0.0 0.765 1.083 1.333 1.509 1.678 1.851 2.02 2.313 2.444 2.577 2.64 2.945 3.054 3.26 3.473 3.686 3.784 3.976 4.198 4.513 4.705 4.905 5.187 5.453 5.718 5.983 6.242 6.566 6.876 7.187 7.584 7.974 8.348 8.783 9.274 9.757 10.307 10.912 11.562 12.267 13.07 14.06 15.117 16.324 17.69 19.328 21.282 23.679 26.592 30.292 33.554 35.582 36.936 37.878 38.569 39.093 39.488 39.742 39.947 40.089 40.185 40.239 40.259 40.257 40.238 40.205 40.173 40.148 40.12 40.068 40.002 39.925 39.845 39.777 39.687 39.58 39.462 39.334 39.245 39.153 39.013 38.903 38.757 38.689 38.567 38.393 38.185 38.08 37.835 37.728 37.569 37.391 36.951 36.696 36.444 36.157 35.83 35.453 34.904 30.341 -3 ,9251 ,KEBNE ,17043673,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:38:07 CET,0.0 0.55 0.83 1.064 1.259 1.444 1.605 1.747 2.03 2.171 2.298 2.366 2.682 2.813 3.051 3.257 3.463 3.566 3.778 3.977 4.242 4.421 4.604 4.873 5.136 5.39 5.633 5.873 6.2 6.526 6.839 7.215 7.585 7.963 8.404 8.881 9.342 9.857 10.43 11.066 11.771 12.601 13.586 14.592 15.798 17.188 18.844 20.773 23.15 26.07 29.711 32.899 34.945 36.284 37.143 37.768 38.219 38.548 38.791 38.988 39.116 39.191 39.228 39.255 39.275 39.282 39.27 39.224 39.182 39.147 39.089 39.033 38.943 38.801 38.703 38.61 38.51 38.383 38.241 38.159 38.077 37.902 37.768 37.648 37.583 37.456 37.309 37.127 37.024 36.768 36.653 36.508 36.352 35.941 35.676 35.434 35.175 34.803 34.295 33.623 29.226 -4 ,7185 ,KEBNE ,17043674,Thu Dec 23 05:08:26 CET,Thu Dec 23 06:34:09 CET,0.0 0.61 0.94 1.216 1.468 1.68 1.843 1.985 2.255 2.388 2.517 2.605 2.909 3.016 3.238 3.463 3.677 3.77 3.953 4.146 4.441 4.626 4.799 5.06 5.326 5.587 5.84 6.08 6.396 6.713 7.02 7.396 7.77 8.132 8.556 9.028 9.49 10.03 10.63 11.353 12.136 12.957 13.903 14.863 16.062 17.451 19.09 20.982 23.33 26.28 29.993 33.238 35.311 36.734 37.688 38.381 38.857 39.199 39.463 39.688 39.805 39.886 39.961 39.995 39.929 39.808 39.715 39.652 39.59 39.525 39.46 39.409 39.329 39.197 39.079 38.967 38.864 38.758 38.655 38.58 38.493 38.34 38.23 38.118 38.051 37.897 37.732 37.527 37.429 37.213 37.14 36.997 36.822 36.445 36.224 35.972 35.699 35.368 34.949 34.373 30.458 -5 ,3142 ,KEBNE ,17043675,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:38:12 CET,0.0 1.014 1.333 1.555 1.772 1.976 2.133 2.277 2.561 2.705 2.847 2.916 3.213 3.327 3.553 3.763 3.963 4.061 4.244 4.433 4.714 4.891 5.076 5.354 5.606 5.843 6.086 6.332 6.649 6.971 7.291 7.668 8.04 8.415 8.862 9.413 9.993 10.638 11.315 11.989 12.664 13.456 14.433 15.453 16.651 18.019 19.648 21.54 23.833 26.627 30.24 33.427 35.461 36.831 37.745 38.412 38.865 39.18 39.441 39.655 39.782 39.882 39.938 39.94 39.929 39.906 39.858 39.808 39.761 39.706 39.622 39.544 39.465 39.36 39.278 39.192 39.086 38.973 38.846 38.754 38.661 38.506 38.401 38.281 38.213 38.068 37.896 37.693 37.577 37.32 37.193 37.042 36.895 36.529 36.336 36.136 35.871 35.549 35.146 34.535 31.6 -6 ,24572 ,KEBNE ,17043676,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:37:50 CET,0.0 0.644 0.951 1.206 1.413 1.611 1.827 2.028 2.378 2.535 2.677 2.768 3.081 3.192 3.408 3.649 3.906 4.029 4.279 4.507 4.795 4.994 5.214 5.535 5.83 6.099 6.359 6.605 6.916 7.216 7.515 7.893 8.258 8.631 9.07 9.557 10.04 10.601 11.226 11.876 12.584 13.403 14.367 15.361 16.567 17.946 19.54 21.43 23.791 26.702 30.378 33.591 35.592 36.934 37.879 38.548 39.006 39.353 39.617 39.83 39.945 40.02 40.08 40.121 40.12 40.087 40.063 40.04 40.012 39.97 39.917 39.867 39.799 39.707 39.624 39.542 39.449 39.352 39.245 39.161 39.071 38.925 38.822 38.687 38.604 38.444 38.255 38.046 37.944 37.703 37.612 37.489 37.359 37.048 36.864 36.627 36.34 36.004 35.59 34.847 30.561 -7 ,14419 ,KEBNE ,17043677,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:39:09 CET,0.0 0.816 1.063 1.245 1.418 1.601 1.763 1.909 2.194 2.327 2.454 2.501 2.798 2.916 3.145 3.362 3.576 3.689 3.922 4.163 4.527 4.762 4.987 5.29 5.555 5.806 6.051 6.326 6.722 7.103 7.493 7.964 8.405 8.834 9.323 9.836 10.318 10.861 11.455 12.105 12.81 13.62 14.591 15.607 16.811 18.184 19.843 21.784 24.137 27.078 30.93 34.347 36.407 37.771 38.713 39.385 39.863 40.22 40.481 40.665 40.78 40.881 40.944 40.987 41.015 41.011 40.992 40.962 40.931 40.881 40.797 40.722 40.607 40.446 40.325 40.208 40.102 39.992 39.865 39.787 39.698 39.553 39.464 39.358 39.299 39.171 39.011 38.804 38.684 38.431 38.324 38.179 38.03 37.671 37.46 37.246 36.982 36.61 36.177 35.482 31.637 -8 ,20446 ,KEBNE ,17043678,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:37:59 CET,0.0 0.923 1.212 1.464 1.656 1.827 1.976 2.117 2.378 2.5 2.628 2.691 2.995 3.109 3.339 3.575 3.789 3.887 4.086 4.278 4.555 4.734 4.916 5.183 5.457 5.755 6.05 6.331 6.687 7.008 7.307 7.698 8.079 8.443 8.904 9.438 9.927 10.468 11.062 11.712 12.401 13.181 14.144 15.187 16.416 17.807 19.472 21.369 23.657 26.501 30.154 33.385 35.356 36.699 37.647 38.316 38.795 39.152 39.401 39.602 39.744 39.842 39.912 39.933 39.936 39.939 39.927 39.888 39.836 39.784 39.71 39.637 39.554 39.457 39.388 39.303 39.189 39.089 38.997 38.904 38.788 38.616 38.515 38.408 38.34 38.192 38.021 37.84 37.738 37.491 37.387 37.248 37.097 36.742 36.542 36.338 36.087 35.759 35.319 34.689 31.366 -9 ,14133 ,KEBNE ,17043679,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:37:46 CET,0.0 1.067 1.33 1.559 1.768 1.948 2.108 2.254 2.53 2.658 2.782 2.831 3.123 3.231 3.451 3.667 3.87 3.971 4.168 4.365 4.69 4.914 5.136 5.462 5.79 6.107 6.402 6.69 7.069 7.442 7.815 8.278 8.72 9.129 9.571 10.06 10.57 11.145 11.745 12.388 13.079 13.853 14.802 15.822 17.038 18.426 20.047 21.931 24.267 27.217 30.973 34.236 36.279 37.678 38.648 39.345 39.844 40.188 40.429 40.612 40.721 40.809 40.864 40.877 40.876 40.87 40.839 40.803 40.765 40.704 40.622 40.554 40.49 40.414 40.35 40.281 40.18 40.066 39.969 39.886 39.787 39.603 39.474 39.358 39.288 39.139 38.985 38.806 38.709 38.482 38.429 38.317 38.184 37.884 37.686 37.426 37.128 36.796 36.304 35.534 30.815 -10 ,31773 ,KEBNE ,17043680,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:39:18 CET,0.0 1.055 1.408 1.655 1.867 2.06 2.24 2.404 2.679 2.811 2.948 3.019 3.323 3.447 3.694 3.91 4.115 4.213 4.402 4.587 4.866 5.053 5.235 5.51 5.784 6.054 6.312 6.571 6.904 7.223 7.544 7.941 8.328 8.701 9.145 9.646 10.125 10.667 11.256 11.892 12.575 13.37 14.335 15.329 16.489 17.845 19.482 21.363 23.693 26.605 30.336 33.602 35.629 36.991 37.922 38.61 39.101 39.426 39.664 39.897 40.024 40.092 40.133 40.145 40.141 40.096 40.039 40.0 39.945 39.882 39.814 39.738 39.654 39.576 39.513 39.418 39.308 39.208 39.088 39.008 38.936 38.772 38.638 38.496 38.418 38.236 38.05 37.864 37.763 37.529 37.429 37.285 37.143 36.852 36.653 36.405 36.117 35.804 35.409 34.898 30.051 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt deleted file mode 100644 index 6a4a999e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13805 ,TETRA ,17555560,Fri Nov 26 02:32:26 CET,Fri Nov 26 04:17:57 CET,0.0 0.597 0.938 1.224 1.467 1.669 1.849 2.014 2.292 2.426 2.565 2.651 2.961 3.08 3.294 3.51 3.728 3.837 4.048 4.248 4.526 4.692 4.863 5.136 5.401 5.656 5.9 6.142 6.456 6.758 7.064 7.453 7.818 8.157 8.569 9.047 9.512 10.044 10.643 11.281 11.948 12.694 13.596 14.533 15.632 16.901 18.423 20.228 22.418 25.07 28.354 30.993 32.581 33.72 34.523 35.097 35.458 35.675 35.791 35.868 35.899 35.86 35.798 35.713 35.607 35.49 35.381 35.283 35.168 35.066 34.946 34.831 34.716 34.568 34.429 34.301 34.191 34.065 33.893 33.762 33.633 33.441 33.317 33.195 33.124 32.953 32.74 32.485 32.365 32.105 31.979 31.827 31.671 31.289 31.08 30.852 30.568 30.202 29.695 28.928 26.318 -2 ,24048 ,TETRA ,17555561,Fri Nov 26 02:44:23 CET,Fri Nov 26 04:29:57 CET,0.0 0.779 1.053 1.257 1.434 1.608 1.781 1.927 2.211 2.357 2.494 2.557 2.857 2.966 3.17 3.363 3.555 3.659 3.869 4.062 4.354 4.548 4.742 5.023 5.283 5.539 5.783 6.016 6.316 6.621 6.932 7.309 7.682 8.044 8.461 8.929 9.375 9.889 10.469 11.095 11.765 12.534 13.445 14.344 15.424 16.708 18.23 20.004 22.153 24.775 28.173 31.222 33.026 34.129 34.892 35.393 35.709 35.934 36.013 36.03 36.045 36.051 36.025 35.989 35.943 35.851 35.732 35.63 35.546 35.454 35.356 35.259 35.134 35.004 34.903 34.784 34.668 34.547 34.382 34.27 34.16 33.961 33.811 33.652 33.571 33.425 33.258 33.039 32.922 32.642 32.532 32.394 32.245 31.881 31.659 31.403 31.11 30.783 30.426 29.917 27.159 -3 ,15113 ,TETRA ,17555562,Fri Nov 26 02:44:23 CET,Fri Nov 26 04:29:42 CET,0.0 0.949 1.29 1.549 1.743 1.903 2.052 2.201 2.48 2.624 2.765 2.821 3.115 3.233 3.466 3.677 3.876 3.979 4.19 4.388 4.671 4.86 5.034 5.291 5.561 5.819 6.071 6.307 6.618 6.953 7.282 7.673 8.041 8.408 8.857 9.365 9.843 10.358 10.916 11.529 12.194 12.952 13.854 14.765 15.813 17.015 18.513 20.229 22.302 24.866 27.978 30.561 31.985 32.85 33.453 33.847 34.129 34.313 34.368 34.419 34.466 34.462 34.413 34.341 34.27 34.178 34.067 33.952 33.852 33.759 33.638 33.522 33.392 33.25 33.135 33.019 32.908 32.78 32.614 32.489 32.349 32.128 31.996 31.857 31.774 31.616 31.453 31.257 31.15 30.883 30.756 30.601 30.432 30.075 29.852 29.613 29.352 29.036 28.658 28.022 25.029 -4 ,25668 ,TETRA ,17555563,Fri Nov 26 02:45:23 CET,Fri Nov 26 04:31:22 CET,0.0 0.754 1.009 1.233 1.424 1.592 1.767 1.921 2.188 2.314 2.428 2.464 2.764 2.878 3.101 3.314 3.512 3.61 3.811 4.003 4.286 4.476 4.663 4.937 5.196 5.453 5.702 5.953 6.283 6.623 6.977 7.366 7.722 8.079 8.504 8.978 9.436 9.948 10.512 11.126 11.791 12.596 13.565 14.53 15.675 16.932 18.405 20.166 22.252 24.787 28.019 30.756 32.486 33.523 34.125 34.538 34.789 34.878 34.922 34.977 34.993 34.991 34.94 34.864 34.831 34.784 34.687 34.599 34.516 34.412 34.292 34.19 34.07 33.94 33.839 33.727 33.595 33.435 33.276 33.169 33.043 32.841 32.715 32.584 32.514 32.328 32.111 31.904 31.801 31.537 31.448 31.328 31.179 30.851 30.659 30.426 30.131 29.745 29.294 28.719 25.59 -5 ,5852 ,TETRA ,17555564,Fri Nov 26 02:45:21 CET,Fri Nov 26 04:31:19 CET,0.0 1.002 1.321 1.574 1.784 1.973 2.152 2.319 2.599 2.721 2.858 2.968 3.28 3.398 3.62 3.824 4.024 4.122 4.321 4.523 4.811 4.994 5.169 5.432 5.696 5.963 6.23 6.498 6.84 7.167 7.498 7.883 8.233 8.584 9.015 9.511 9.991 10.533 11.114 11.742 12.418 13.174 14.089 15.031 16.145 17.406 18.902 20.677 22.811 25.443 28.791 31.64 33.251 34.202 34.912 35.411 35.73 35.981 36.144 36.238 36.276 36.255 36.198 36.154 36.095 36.006 35.893 35.781 35.68 35.575 35.445 35.331 35.205 35.05 34.929 34.817 34.7 34.55 34.39 34.277 34.144 33.949 33.83 33.698 33.626 33.463 33.265 33.055 32.951 32.683 32.515 32.363 32.214 31.866 31.643 31.366 31.07 30.716 30.275 29.674 26.34 -6 ,10764 ,TETRA ,17555565,Fri Nov 26 02:45:22 CET,Fri Nov 26 04:30:23 CET,0.0 0.886 1.11 1.349 1.561 1.752 1.929 2.085 2.36 2.498 2.637 2.71 3.005 3.125 3.377 3.601 3.811 3.913 4.123 4.327 4.63 4.83 5.016 5.286 5.546 5.803 6.05 6.285 6.593 6.9 7.211 7.61 7.995 8.357 8.774 9.248 9.718 10.254 10.839 11.44 12.087 12.834 13.738 14.657 15.742 17.024 18.559 20.338 22.498 25.181 28.5 31.368 33.212 34.463 35.217 35.672 35.962 36.176 36.321 36.427 36.47 36.461 36.429 36.361 36.267 36.177 36.06 35.934 35.821 35.706 35.591 35.503 35.401 35.259 35.143 35.014 34.865 34.719 34.589 34.501 34.398 34.235 34.116 33.969 33.895 33.738 33.567 33.382 33.266 33.0 32.894 32.742 32.593 32.233 32.016 31.797 31.501 31.111 30.664 30.098 26.595 -7 ,16055 ,TETRA ,17555566,Fri Nov 26 02:45:21 CET,Fri Nov 26 04:30:35 CET,0.0 1.123 1.615 1.974 2.245 2.448 2.617 2.757 3.012 3.145 3.273 3.353 3.669 3.783 4.01 4.239 4.456 4.56 4.754 4.938 5.222 5.409 5.584 5.838 6.092 6.353 6.613 6.86 7.179 7.497 7.808 8.193 8.566 8.938 9.383 9.874 10.339 10.844 11.417 12.036 12.712 13.504 14.417 15.339 16.436 17.738 19.285 21.047 23.219 25.92 29.374 32.329 34.071 35.281 36.11 36.693 37.067 37.268 37.365 37.44 37.459 37.413 37.358 37.314 37.269 37.183 37.071 36.984 36.899 36.8 36.669 36.555 36.446 36.314 36.193 36.041 35.879 35.738 35.615 35.515 35.386 35.174 35.044 34.909 34.825 34.655 34.462 34.255 34.138 33.862 33.734 33.578 33.418 33.035 32.807 32.572 32.33 32.022 31.622 31.006 28.543 -8 ,27194 ,TETRA ,17555567,Fri Nov 26 02:45:24 CET,Fri Nov 26 04:30:28 CET,0.0 1.262 1.563 1.761 1.968 2.172 2.366 2.536 2.818 2.949 3.069 3.122 3.43 3.557 3.787 3.999 4.195 4.299 4.511 4.704 4.993 5.19 5.378 5.642 5.913 6.184 6.44 6.687 7.006 7.309 7.601 7.975 8.349 8.707 9.136 9.631 10.157 10.755 11.349 11.975 12.648 13.417 14.318 15.228 16.333 17.631 19.176 20.918 23.058 25.801 29.198 31.98 33.599 34.627 35.306 35.781 36.077 36.274 36.4 36.514 36.587 36.582 36.556 36.506 36.417 36.337 36.242 36.144 36.054 35.944 35.786 35.618 35.455 35.257 35.088 34.942 34.773 34.579 34.406 34.298 34.184 33.999 33.858 33.716 33.655 33.53 33.368 33.182 33.081 32.825 32.731 32.586 32.443 32.163 31.972 31.706 31.415 31.135 30.75 30.162 26.499 -9 ,22369 ,TETRA ,17555568,Fri Nov 26 03:16:24 CET,Fri Nov 26 05:02:56 CET,0.0 0.48 0.783 1.025 1.209 1.375 1.523 1.674 1.97 2.106 2.229 2.265 2.572 2.695 2.91 3.116 3.321 3.426 3.634 3.835 4.132 4.326 4.511 4.785 5.053 5.31 5.565 5.814 6.128 6.445 6.755 7.134 7.52 7.895 8.313 8.772 9.226 9.75 10.318 10.937 11.607 12.37 13.295 14.248 15.383 16.659 18.151 19.851 21.905 24.518 27.912 30.89 32.547 33.583 34.318 34.74 34.964 35.124 35.231 35.272 35.263 35.249 35.212 35.141 35.07 35.014 34.932 34.836 34.729 34.599 34.463 34.358 34.231 34.085 33.972 33.859 33.741 33.547 33.29 33.116 32.936 32.664 32.522 32.401 32.332 32.175 31.988 31.806 31.712 31.45 31.316 31.172 31.012 30.625 30.409 30.18 29.912 29.576 29.202 28.604 24.856 -10 ,14595 ,TETRA ,17555569,Fri Nov 26 03:18:24 CET,Fri Nov 26 05:05:45 CET,0.0 0.556 0.778 0.988 1.199 1.423 1.636 1.808 2.078 2.208 2.343 2.455 2.777 2.895 3.119 3.332 3.534 3.639 3.844 4.038 4.315 4.501 4.689 4.947 5.197 5.459 5.715 5.958 6.273 6.581 6.877 7.238 7.605 7.965 8.385 8.868 9.377 9.95 10.525 11.127 11.78 12.549 13.464 14.393 15.518 16.834 18.4 20.225 22.418 25.085 28.46 31.2 32.687 33.635 34.297 34.754 35.063 35.257 35.375 35.434 35.416 35.365 35.295 35.233 35.154 35.085 35.017 34.94 34.859 34.755 34.63 34.512 34.389 34.263 34.136 33.996 33.873 33.729 33.552 33.437 33.335 33.192 33.074 32.934 32.86 32.711 32.536 32.343 32.246 31.987 31.856 31.698 31.541 31.204 31.008 30.765 30.461 30.137 29.766 29.157 25.926 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt deleted file mode 100644 index 018b8276..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31186 ,TETRA ,17555570,Fri Nov 26 03:20:24 CET,Fri Nov 26 05:05:17 CET,0.0 0.681 0.908 1.088 1.242 1.413 1.565 1.686 1.899 2.003 2.1 2.147 2.388 2.469 2.62 2.78 2.927 2.992 3.118 3.256 3.474 3.608 3.734 3.932 4.123 4.289 4.452 4.612 4.818 5.023 5.219 5.446 5.668 5.88 6.126 6.397 6.647 6.927 7.24 7.565 7.902 8.299 8.789 9.265 9.807 10.42 11.107 11.878 12.767 13.705 14.643 15.221 15.449 15.499 15.434 15.318 15.182 15.019 14.863 14.705 14.541 14.395 14.247 14.09 13.954 13.82 13.67 13.53 13.406 13.285 13.145 13.022 12.907 12.777 12.667 12.559 12.447 12.341 12.227 12.139 12.05 11.924 11.832 11.734 11.686 11.576 11.445 11.303 11.235 11.025 10.979 10.897 10.808 10.609 10.508 10.401 10.268 10.124 9.941 9.735 8.906 -2 ,25567 ,TETRA ,17555571,Fri Nov 26 03:20:24 CET,Fri Nov 26 05:04:20 CET,0.0 0.923 1.234 1.474 1.665 1.83 1.966 2.089 2.323 2.43 2.528 2.576 2.81 2.896 3.061 3.225 3.376 3.452 3.607 3.746 3.935 4.058 4.171 4.337 4.527 4.729 4.938 5.152 5.419 5.663 5.871 6.091 6.308 6.526 6.774 7.059 7.344 7.653 7.979 8.324 8.69 9.11 9.612 10.099 10.618 11.193 11.851 12.567 13.429 14.422 15.47 16.172 16.458 16.52 16.472 16.383 16.259 16.118 15.977 15.831 15.691 15.492 15.242 14.993 14.808 14.68 14.552 14.433 14.327 14.219 14.095 13.978 13.863 13.756 13.662 13.557 13.458 13.343 13.21 13.127 13.048 12.915 12.818 12.713 12.662 12.554 12.427 12.286 12.211 12.002 11.973 11.889 11.805 11.612 11.497 11.37 11.218 11.062 10.882 10.62 9.935 -3 ,20372 ,TETRA ,17555572,Fri Nov 26 03:20:24 CET,Fri Nov 26 05:05:31 CET,0.0 0.349 0.6 0.791 0.944 1.088 1.225 1.358 1.604 1.703 1.805 1.851 2.08 2.171 2.347 2.499 2.645 2.72 2.863 3.0 3.208 3.343 3.477 3.658 3.812 3.965 4.117 4.271 4.466 4.645 4.816 5.029 5.237 5.44 5.685 5.963 6.237 6.543 6.869 7.194 7.532 7.915 8.374 8.878 9.418 9.979 10.639 11.37 12.28 13.291 14.275 14.89 15.135 15.209 15.169 15.064 14.932 14.779 14.623 14.425 14.229 14.058 13.907 13.769 13.637 13.508 13.349 13.21 13.099 12.976 12.854 12.755 12.633 12.493 12.389 12.289 12.187 12.081 11.969 11.894 11.811 11.676 11.59 11.491 11.432 11.316 11.201 11.076 11.013 10.808 10.772 10.686 10.592 10.399 10.28 10.148 10.025 9.858 9.646 9.443 9.128 -4 ,15769 ,TETRA ,17555573,Fri Nov 26 03:21:24 CET,Fri Nov 26 05:06:19 CET,0.0 0.668 0.943 1.175 1.334 1.463 1.584 1.698 1.932 2.038 2.14 2.193 2.428 2.505 2.655 2.826 3.004 3.083 3.223 3.362 3.549 3.662 3.78 3.961 4.139 4.309 4.476 4.637 4.832 5.024 5.209 5.436 5.661 5.872 6.119 6.394 6.673 6.99 7.323 7.673 8.045 8.443 8.894 9.341 9.86 10.467 11.178 11.94 12.717 13.654 14.768 15.439 15.683 15.717 15.644 15.516 15.367 15.235 15.089 14.907 14.75 14.611 14.481 14.351 14.21 14.077 13.943 13.81 13.697 13.593 13.47 13.352 13.234 13.097 12.979 12.876 12.771 12.653 12.534 12.447 12.355 12.214 12.121 12.037 11.989 11.876 11.754 11.623 11.557 11.355 11.323 11.227 11.118 10.913 10.821 10.709 10.568 10.425 10.264 10.025 9.408 -5 ,7177 ,TETRA ,17555574,Fri Nov 26 03:23:24 CET,Fri Nov 26 04:59:42 CET,0.0 0.509 0.785 1.037 1.24 1.401 1.583 1.746 1.986 2.09 2.194 2.256 2.483 2.558 2.722 2.894 3.047 3.121 3.267 3.413 3.613 3.735 3.851 4.025 4.198 4.362 4.521 4.676 4.869 5.063 5.257 5.508 5.778 6.058 6.353 6.626 6.88 7.17 7.515 7.867 8.219 8.627 9.088 9.556 10.116 10.742 11.425 12.138 12.972 13.907 14.865 15.502 15.721 15.773 15.681 15.521 15.376 15.23 15.091 14.926 14.771 14.627 14.487 14.334 14.182 14.044 13.895 13.752 13.628 13.513 13.385 13.274 13.167 13.056 12.96 12.856 12.748 12.632 12.502 12.414 12.333 12.194 12.094 11.974 11.91 11.788 11.657 11.523 11.458 11.255 11.242 11.168 11.08 10.878 10.755 10.625 10.517 10.379 10.188 9.936 9.332 -6 ,22091 ,TETRA ,17555575,Fri Nov 26 03:26:26 CET,Fri Nov 26 05:04:07 CET,0.0 0.647 0.951 1.185 1.396 1.551 1.681 1.821 2.067 2.172 2.272 2.314 2.546 2.631 2.814 2.981 3.137 3.214 3.35 3.492 3.694 3.809 3.932 4.111 4.275 4.441 4.597 4.744 4.938 5.126 5.31 5.528 5.743 5.952 6.196 6.494 6.774 7.08 7.409 7.744 8.09 8.479 9.008 9.542 10.064 10.657 11.32 12.0 12.805 13.752 14.731 15.302 15.512 15.585 15.556 15.42 15.247 15.07 14.917 14.759 14.607 14.452 14.297 14.154 14.019 13.895 13.759 13.619 13.491 13.37 13.242 13.131 13.01 12.869 12.756 12.647 12.534 12.414 12.286 12.205 12.121 11.986 11.885 11.779 11.725 11.602 11.478 11.344 11.268 11.058 11.014 10.932 10.852 10.673 10.563 10.444 10.316 10.174 10.014 9.791 9.124 -7 ,5699 ,TETRA ,17555576,Fri Nov 26 03:25:25 CET,Fri Nov 26 05:09:51 CET,0.0 0.84 1.095 1.271 1.435 1.588 1.73 1.851 2.055 2.148 2.243 2.288 2.523 2.612 2.786 2.943 3.088 3.158 3.304 3.445 3.636 3.759 3.879 4.054 4.228 4.396 4.552 4.712 4.923 5.137 5.358 5.611 5.87 6.119 6.379 6.671 6.936 7.22 7.534 7.872 8.223 8.604 9.066 9.56 10.133 10.766 11.463 12.2 13.062 14.042 15.062 15.654 15.805 15.823 15.782 15.689 15.539 15.237 14.978 14.806 14.635 14.486 14.338 14.186 14.042 13.9 13.746 13.609 13.493 13.377 13.231 13.113 13.014 12.899 12.8 12.699 12.594 12.475 12.347 12.262 12.171 12.011 11.885 11.74 11.665 11.512 11.343 11.151 11.054 10.829 10.746 10.629 10.503 10.248 10.125 9.984 9.826 9.652 9.45 9.162 8.052 -8 ,13002 ,TETRA ,17555577,Fri Nov 26 03:26:25 CET,Fri Nov 26 05:10:26 CET,0.0 0.682 0.963 1.201 1.379 1.528 1.662 1.796 2.034 2.142 2.248 2.314 2.556 2.642 2.797 2.947 3.114 3.195 3.342 3.484 3.691 3.821 3.947 4.12 4.288 4.456 4.619 4.779 4.976 5.159 5.343 5.575 5.797 6.014 6.261 6.544 6.816 7.11 7.43 7.791 8.154 8.522 8.956 9.4 9.937 10.534 11.254 12.1 13.025 14.06 15.09 15.737 15.991 16.003 15.891 15.741 15.6 15.464 15.33 15.166 15.008 14.852 14.709 14.565 14.413 14.229 13.984 13.767 13.622 13.504 13.386 13.292 13.187 13.06 12.958 12.854 12.74 12.621 12.508 12.425 12.324 12.165 12.06 11.962 11.916 11.803 11.669 11.517 11.441 11.239 11.228 11.144 11.047 10.863 10.764 10.651 10.514 10.358 10.202 9.95 9.403 -9 ,26383 ,TETRA ,17555578,Fri Nov 26 03:27:26 CET,Fri Nov 26 05:04:43 CET,0.0 0.986 1.342 1.564 1.727 1.88 2.01 2.143 2.42 2.546 2.65 2.677 2.914 3.002 3.166 3.341 3.501 3.569 3.717 3.873 4.09 4.212 4.322 4.49 4.658 4.82 4.976 5.124 5.324 5.526 5.718 5.941 6.152 6.371 6.622 6.9 7.17 7.458 7.771 8.117 8.489 8.909 9.393 9.863 10.386 10.955 11.607 12.391 13.276 14.186 15.175 15.747 15.964 16.025 15.957 15.835 15.677 15.508 15.359 15.202 15.045 14.904 14.771 14.581 14.389 14.265 14.134 13.995 13.876 13.749 13.606 13.47 13.323 13.197 13.112 13.017 12.916 12.815 12.712 12.629 12.535 12.4 12.309 12.212 12.164 12.047 11.927 11.808 11.74 11.536 11.491 11.402 11.323 11.147 11.03 10.9 10.754 10.572 10.395 10.164 9.533 -10 ,4364 ,TETRA ,17555579,Fri Nov 26 03:27:25 CET,Fri Nov 26 05:14:19 CET,0.0 0.92 1.278 1.467 1.646 1.819 1.948 2.064 2.325 2.452 2.566 2.616 2.848 2.938 3.112 3.262 3.404 3.471 3.599 3.745 3.973 4.122 4.263 4.451 4.619 4.78 4.944 5.103 5.307 5.501 5.686 5.914 6.141 6.354 6.609 6.931 7.284 7.667 8.014 8.358 8.736 9.145 9.621 10.101 10.621 11.182 11.867 12.649 13.469 14.406 15.426 16.041 16.227 16.188 16.115 16.038 15.926 15.765 15.617 15.47 15.308 15.152 15.007 14.848 14.687 14.548 14.403 14.264 14.139 14.015 13.883 13.774 13.659 13.536 13.436 13.334 13.229 13.113 12.991 12.902 12.817 12.682 12.593 12.502 12.449 12.328 12.197 12.055 11.987 11.79 11.742 11.645 11.553 11.345 11.224 11.092 10.963 10.789 10.511 10.226 9.535 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 1304175e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,945 ,TETRA ,17555580,Fri Nov 26 03:27:25 CET,Fri Nov 26 05:13:45 CET,0.0 1.077 1.474 1.807 2.053 2.246 2.435 2.622 2.946 3.093 3.227 3.33 3.6 3.721 3.95 4.171 4.386 4.496 4.719 4.931 5.224 5.414 5.607 5.894 6.162 6.431 6.659 6.845 7.101 7.342 7.571 7.841 8.096 8.35 8.637 8.952 9.282 9.64 10.008 10.407 10.802 11.226 11.71 12.193 12.779 13.392 14.049 14.786 15.458 16.037 16.65 16.841 16.577 16.209 15.847 15.463 15.093 14.741 14.414 13.996 13.651 13.423 13.228 13.045 12.858 12.673 12.49 12.326 12.175 12.027 11.88 11.753 11.618 11.482 11.382 11.277 11.166 11.055 10.94 10.853 10.764 10.634 10.539 10.439 10.385 10.26 10.143 10.033 9.971 9.768 9.755 9.683 9.62 9.485 9.405 9.305 9.196 9.093 8.983 8.805 8.339 -2 ,5118 ,TETRA ,17555581,Fri Nov 26 03:27:26 CET,Fri Nov 26 05:12:53 CET,0.0 1.7 2.098 2.4 2.654 2.895 3.094 3.264 3.582 3.718 3.853 3.999 4.281 4.402 4.614 4.823 5.037 5.144 5.367 5.594 5.916 6.112 6.303 6.587 6.871 7.123 7.336 7.536 7.803 8.054 8.285 8.563 8.831 9.094 9.401 9.718 10.027 10.376 10.728 11.1 11.489 11.905 12.383 12.863 13.41 14.007 14.681 15.372 16.082 16.809 17.379 17.481 17.249 16.932 16.56 16.178 15.856 15.518 15.201 14.906 14.651 14.414 14.195 13.986 13.792 13.629 13.454 13.279 13.122 12.962 12.801 12.676 12.555 12.429 12.328 12.216 12.108 11.999 11.877 11.787 11.69 11.54 11.433 11.323 11.268 11.159 11.055 10.949 10.891 10.693 10.706 10.639 10.568 10.388 10.287 10.189 10.082 9.971 9.811 9.572 8.907 -3 ,27698 ,TETRA ,17555582,Fri Nov 26 03:28:04 CET,Fri Nov 26 05:13:56 CET,0.0 1.282 1.667 1.966 2.233 2.451 2.63 2.811 3.172 3.333 3.485 3.608 3.862 3.97 4.19 4.404 4.612 4.713 4.903 5.084 5.358 5.528 5.684 5.915 6.142 6.362 6.574 6.773 7.02 7.258 7.496 7.786 8.048 8.291 8.591 8.939 9.255 9.581 9.927 10.313 10.736 11.205 11.751 12.282 12.853 13.455 14.141 14.887 15.686 16.4 16.919 17.03 16.795 16.456 16.073 15.7 15.364 15.021 14.705 14.416 14.176 13.948 13.725 13.525 13.333 13.151 12.962 12.79 12.64 12.493 12.343 12.216 12.091 11.966 11.86 11.737 11.617 11.497 11.363 11.27 11.174 11.03 10.933 10.833 10.783 10.657 10.491 10.308 10.214 9.977 9.905 9.807 9.725 9.538 9.442 9.368 9.277 9.165 9.034 8.859 8.516 -4 ,15838 ,TETRA ,17555583,Fri Nov 26 03:29:06 CET,Fri Nov 26 05:15:57 CET,0.0 1.154 1.557 1.883 2.171 2.418 2.635 2.826 3.156 3.311 3.45 3.581 3.862 3.991 4.226 4.445 4.654 4.758 4.981 5.206 5.519 5.725 5.928 6.217 6.465 6.68 6.897 7.099 7.349 7.602 7.846 8.127 8.397 8.668 8.989 9.346 9.691 10.067 10.46 10.858 11.23 11.625 12.103 12.603 13.178 13.774 14.42 15.111 15.825 16.472 16.998 17.089 16.864 16.515 16.137 15.727 15.345 15.011 14.688 14.37 14.127 13.889 13.659 13.463 13.28 13.105 12.929 12.77 12.633 12.494 12.337 12.196 12.044 11.896 11.793 11.692 11.594 11.488 11.364 11.272 11.177 11.031 10.924 10.818 10.771 10.674 10.574 10.469 10.412 10.205 10.194 10.126 10.053 9.893 9.819 9.739 9.637 9.513 9.357 9.097 8.305 -5 ,19535 ,TETRA ,17555584,Fri Nov 26 03:29:05 CET,Fri Nov 26 05:15:44 CET,0.0 1.239 1.715 2.064 2.307 2.552 2.761 2.944 3.27 3.422 3.573 3.708 3.985 4.096 4.317 4.534 4.746 4.853 5.046 5.215 5.459 5.624 5.793 6.028 6.243 6.455 6.665 6.857 7.101 7.337 7.563 7.836 8.084 8.334 8.63 8.94 9.247 9.58 9.927 10.302 10.695 11.133 11.665 12.185 12.732 13.349 14.036 14.755 15.535 16.2 16.639 16.694 16.47 16.124 15.72 15.184 14.733 14.418 14.139 13.85 13.592 13.358 13.14 12.927 12.72 12.531 12.339 12.168 12.023 11.881 11.72 11.583 11.444 11.295 11.186 11.079 10.971 10.862 10.744 10.66 10.576 10.444 10.348 10.234 10.175 10.07 9.965 9.849 9.785 9.58 9.571 9.49 9.41 9.251 9.161 9.072 8.979 8.882 8.778 8.587 8.189 -6 ,27515 ,TETRA ,17555585,Fri Nov 26 03:31:04 CET,Fri Nov 26 05:18:51 CET,0.0 1.617 2.139 2.514 2.765 2.981 3.182 3.363 3.699 3.847 3.98 4.087 4.355 4.482 4.732 4.951 5.152 5.245 5.415 5.586 5.853 6.028 6.197 6.427 6.639 6.841 7.042 7.237 7.495 7.752 7.992 8.271 8.544 8.818 9.12 9.438 9.75 10.106 10.492 10.891 11.318 11.773 12.278 12.78 13.412 14.11 14.765 15.424 16.149 16.852 17.296 17.286 17.099 16.764 16.379 16.012 15.645 15.292 15.003 14.715 14.462 14.246 14.037 13.829 13.629 13.451 13.271 13.11 12.966 12.818 12.673 12.545 12.407 12.268 12.164 12.031 11.89 11.77 11.646 11.561 11.479 11.367 11.283 11.178 11.126 11.032 10.938 10.831 10.765 10.563 10.576 10.511 10.441 10.286 10.205 10.119 10.025 9.931 9.805 9.62 9.38 -7 ,6140 ,TETRA ,17555586,Fri Nov 26 03:31:04 CET,Fri Nov 26 05:17:10 CET,0.0 1.321 1.732 2.063 2.366 2.619 2.815 2.997 3.331 3.469 3.599 3.719 3.989 4.105 4.331 4.554 4.777 4.884 5.068 5.244 5.512 5.682 5.844 6.079 6.317 6.538 6.75 6.952 7.185 7.406 7.628 7.905 8.172 8.44 8.747 9.07 9.37 9.707 10.065 10.439 10.884 11.385 11.896 12.412 12.998 13.58 14.227 14.944 15.715 16.43 16.975 17.077 16.842 16.531 16.213 15.877 15.554 15.253 14.978 14.703 14.425 14.161 13.933 13.721 13.539 13.377 13.188 13.014 12.878 12.735 12.582 12.462 12.332 12.187 12.077 11.973 11.858 11.738 11.631 11.555 11.458 11.306 11.21 11.111 11.062 10.969 10.868 10.76 10.703 10.502 10.504 10.434 10.359 10.186 10.09 9.982 9.88 9.779 9.645 9.49 9.235 -8 ,9080 ,TETRA ,17555587,Fri Nov 26 03:32:04 CET,Fri Nov 26 05:18:36 CET,0.0 0.951 1.331 1.607 1.862 2.067 2.257 2.44 2.767 2.914 3.052 3.177 3.444 3.555 3.766 3.978 4.19 4.286 4.477 4.667 4.927 5.094 5.253 5.491 5.719 5.935 6.135 6.337 6.634 6.949 7.225 7.512 7.787 8.049 8.364 8.706 9.018 9.349 9.696 10.068 10.458 10.887 11.365 11.867 12.472 13.113 13.762 14.423 15.161 15.858 16.401 16.399 16.082 15.712 15.314 14.94 14.609 14.286 14.003 13.731 13.49 13.253 13.014 12.799 12.605 12.425 12.229 12.056 11.911 11.758 11.601 11.478 11.351 11.217 11.111 10.991 10.862 10.734 10.611 10.525 10.424 10.283 10.198 10.105 10.056 9.95 9.834 9.718 9.654 9.446 9.433 9.364 9.298 9.139 9.051 8.955 8.851 8.739 8.586 8.401 7.904 -9 ,12103 ,TETRA ,17555588,Fri Nov 26 03:32:05 CET,Fri Nov 26 05:09:57 CET,0.0 0.876 1.236 1.527 1.785 1.985 2.167 2.367 2.727 2.867 3.001 3.134 3.414 3.54 3.776 4.001 4.215 4.311 4.503 4.695 4.96 5.121 5.276 5.505 5.722 5.931 6.136 6.329 6.582 6.851 7.099 7.38 7.655 7.91 8.2 8.533 8.854 9.217 9.607 9.989 10.364 10.793 11.296 11.777 12.347 12.978 13.636 14.333 15.083 15.806 16.46 16.569 16.353 16.064 15.704 15.31 14.95 14.607 14.298 13.995 13.745 13.518 13.307 13.104 12.915 12.744 12.559 12.396 12.255 12.114 11.973 11.856 11.721 11.581 11.473 11.362 11.252 11.14 11.021 10.909 10.765 10.551 10.411 10.265 10.187 10.022 9.859 9.711 9.644 9.445 9.447 9.382 9.305 9.138 9.052 8.963 8.866 8.753 8.632 8.464 8.074 -10 ,23188 ,TETRA ,17555589,Fri Nov 26 03:32:05 CET,Fri Nov 26 05:18:37 CET,0.0 1.199 1.626 1.972 2.252 2.479 2.678 2.862 3.219 3.376 3.507 3.604 3.865 3.975 4.193 4.413 4.617 4.714 4.893 5.074 5.342 5.504 5.663 5.896 6.107 6.305 6.511 6.716 6.96 7.195 7.434 7.697 7.936 8.183 8.482 8.802 9.097 9.449 9.819 10.193 10.614 11.104 11.664 12.188 12.796 13.461 14.173 14.895 15.667 16.433 17.051 17.238 17.016 16.7 16.371 16.024 15.685 15.358 15.064 14.767 14.498 14.242 14.007 13.795 13.589 13.409 13.224 13.052 12.907 12.759 12.61 12.476 12.335 12.201 12.099 11.993 11.89 11.785 11.666 11.582 11.492 11.332 11.226 11.124 11.073 10.965 10.84 10.704 10.638 10.432 10.434 10.365 10.287 10.107 10.01 9.913 9.81 9.691 9.567 9.393 9.057 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index e43fc088..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28615 ,TETRA ,17555590,Fri Nov 26 03:32:07 CET,Fri Nov 26 05:16:58 CET,0.0 0.658 0.881 1.073 1.26 1.41 1.547 1.669 1.872 1.971 2.059 2.09 2.293 2.368 2.511 2.647 2.79 2.858 2.972 3.073 3.224 3.323 3.42 3.563 3.686 3.811 3.939 4.043 4.169 4.3 4.431 4.583 4.724 4.867 5.036 5.215 5.373 5.54 5.72 5.907 6.112 6.334 6.59 6.938 7.358 7.662 7.893 8.121 8.324 8.364 8.05 7.277 6.551 5.942 5.358 4.805 4.296 3.81 3.383 2.921 2.466 2.085 1.776 1.479 1.203 0.956 0.682 0.433 0.22 0.006 -0.207 -0.394 -0.583 -0.779 -0.934 -1.082 -1.244 -1.41 -1.591 -1.727 -1.863 -2.074 -2.223 -2.383 -2.467 -2.634 -2.806 -2.99 -3.08 -3.312 -3.396 -3.511 -3.622 -3.869 -4.015 -4.181 -4.376 -4.613 -4.899 -5.191 -6.184 -2 ,7414 ,TETRA ,17555591,Fri Nov 26 03:32:05 CET,Fri Nov 26 05:15:57 CET,0.0 0.683 0.896 1.088 1.273 1.448 1.593 1.709 1.89 1.984 2.092 2.149 2.353 2.436 2.59 2.724 2.839 2.892 3.015 3.132 3.305 3.415 3.506 3.629 3.743 3.849 3.95 4.052 4.186 4.319 4.453 4.598 4.743 4.892 5.042 5.198 5.357 5.525 5.704 5.902 6.112 6.333 6.554 6.754 6.978 7.201 7.404 7.588 7.758 7.828 7.6 6.998 6.327 5.698 5.112 4.541 4.045 3.593 3.172 2.742 2.386 2.07 1.754 1.467 1.196 0.945 0.689 0.447 0.234 0.017 -0.216 -0.421 -0.618 -0.805 -0.952 -1.113 -1.28 -1.455 -1.659 -1.797 -1.939 -2.163 -2.307 -2.457 -2.534 -2.702 -2.878 -3.063 -3.169 -3.411 -3.498 -3.621 -3.743 -3.996 -4.149 -4.337 -4.532 -4.739 -4.993 -5.341 -6.479 -3 ,9332 ,TETRA ,17555592,Fri Nov 26 03:32:05 CET,Fri Nov 26 05:15:55 CET,0.0 0.635 0.874 1.093 1.264 1.416 1.559 1.686 1.896 2.0 2.097 2.144 2.358 2.427 2.551 2.689 2.823 2.888 3.021 3.133 3.289 3.396 3.483 3.605 3.736 3.855 3.973 4.086 4.231 4.369 4.497 4.66 4.857 5.072 5.27 5.466 5.708 5.989 6.265 6.547 6.863 7.213 7.511 7.754 8.038 8.329 8.626 8.887 9.077 9.099 8.868 8.256 7.558 6.935 6.335 5.753 5.26 4.812 4.441 4.056 3.69 3.359 3.039 2.737 2.467 2.214 1.961 1.749 1.537 1.303 1.076 0.894 0.708 0.509 0.347 0.173 -0.011 -0.196 -0.381 -0.507 -0.642 -0.852 -1.019 -1.19 -1.261 -1.412 -1.57 -1.743 -1.838 -2.065 -2.111 -2.225 -2.359 -2.651 -2.807 -2.978 -3.177 -3.392 -3.612 -3.946 -5.154 -4 ,31822 ,TETRA ,17555593,Fri Nov 26 03:32:06 CET,Fri Nov 26 05:05:39 CET,0.0 1.219 1.499 1.725 1.912 2.054 2.176 2.277 2.456 2.557 2.661 2.709 2.915 2.985 3.12 3.246 3.37 3.435 3.551 3.658 3.827 3.923 4.026 4.186 4.313 4.427 4.53 4.631 4.758 4.886 5.03 5.192 5.328 5.469 5.626 5.805 5.98 6.15 6.328 6.51 6.685 6.87 7.089 7.309 7.541 7.765 7.994 8.207 8.339 8.324 8.023 7.4 6.742 6.085 5.479 4.939 4.474 4.033 3.638 3.247 2.887 2.558 2.248 1.948 1.679 1.426 1.142 0.897 0.671 0.433 0.201 0.007 -0.191 -0.4 -0.559 -0.712 -0.873 -1.043 -1.226 -1.364 -1.516 -1.737 -1.88 -2.03 -2.11 -2.282 -2.462 -2.65 -2.755 -3.003 -3.114 -3.244 -3.375 -3.658 -3.812 -3.98 -4.15 -4.337 -4.626 -4.981 -6.294 -5 ,7498 ,TETRA ,17555594,Fri Nov 26 03:33:04 CET,Fri Nov 26 05:17:50 CET,0.0 0.702 0.964 1.116 1.253 1.382 1.499 1.611 1.825 1.926 2.022 2.045 2.251 2.33 2.48 2.613 2.737 2.799 2.921 3.03 3.18 3.284 3.379 3.51 3.629 3.744 3.861 3.978 4.161 4.361 4.556 4.749 4.89 5.031 5.194 5.374 5.553 5.741 5.936 6.132 6.326 6.546 6.791 7.028 7.282 7.524 7.793 8.033 8.178 8.227 8.012 7.426 6.833 6.26 5.713 5.22 4.77 4.315 3.884 3.463 3.099 2.771 2.47 2.173 1.895 1.638 1.366 1.136 0.941 0.731 0.497 0.31 0.112 -0.098 -0.258 -0.422 -0.579 -0.746 -0.936 -1.067 -1.215 -1.482 -1.645 -1.808 -1.895 -2.069 -2.239 -2.431 -2.534 -2.764 -2.82 -2.931 -3.066 -3.378 -3.548 -3.727 -3.921 -4.131 -4.402 -4.794 -6.117 -6 ,18202 ,TETRA ,17555595,Fri Nov 26 03:33:04 CET,Fri Nov 26 05:16:53 CET,0.0 0.546 0.793 0.945 1.092 1.233 1.359 1.477 1.683 1.781 1.879 1.923 2.131 2.2 2.319 2.448 2.581 2.647 2.77 2.874 3.023 3.123 3.227 3.37 3.492 3.607 3.73 3.856 4.001 4.124 4.238 4.374 4.51 4.648 4.813 4.995 5.153 5.342 5.586 5.84 6.062 6.261 6.492 6.726 6.96 7.209 7.447 7.674 7.881 7.891 7.617 7.009 6.365 5.715 5.088 4.489 3.961 3.49 3.082 2.666 2.312 2.011 1.711 1.421 1.144 0.896 0.641 0.392 0.184 -0.025 -0.24 -0.456 -0.71 -0.973 -1.167 -1.354 -1.571 -1.791 -2.02 -2.198 -2.367 -2.594 -2.747 -2.896 -2.971 -3.137 -3.318 -3.513 -3.613 -3.85 -3.943 -4.065 -4.2 -4.511 -4.665 -4.826 -5.008 -5.24 -5.555 -5.948 -7.762 -7 ,28794 ,TETRA ,17555596,Fri Nov 26 03:33:04 CET,Fri Nov 26 05:16:58 CET,0.0 0.753 1.083 1.341 1.515 1.647 1.769 1.882 2.105 2.208 2.303 2.364 2.573 2.655 2.811 2.94 3.061 3.117 3.229 3.351 3.514 3.594 3.678 3.819 3.955 4.088 4.213 4.322 4.459 4.61 4.757 4.917 5.063 5.195 5.36 5.549 5.722 5.902 6.142 6.394 6.593 6.832 7.093 7.318 7.541 7.758 7.996 8.213 8.361 8.435 8.206 7.593 6.959 6.324 5.738 5.18 4.684 4.253 3.857 3.451 3.095 2.769 2.451 2.155 1.878 1.598 1.299 1.05 0.844 0.63 0.406 0.214 0.008 -0.204 -0.363 -0.521 -0.695 -0.88 -1.079 -1.238 -1.411 -1.681 -1.862 -2.032 -2.116 -2.31 -2.521 -2.739 -2.855 -3.11 -3.252 -3.406 -3.555 -3.856 -4.01 -4.175 -4.373 -4.591 -4.862 -5.239 -6.666 -8 ,23868 ,TETRA ,17555597,Fri Nov 26 03:34:04 CET,Fri Nov 26 05:18:53 CET,0.0 0.387 0.655 0.891 1.082 1.256 1.394 1.526 1.733 1.821 1.921 1.981 2.187 2.259 2.413 2.562 2.701 2.763 2.868 2.962 3.114 3.22 3.321 3.456 3.58 3.701 3.824 3.942 4.087 4.214 4.33 4.466 4.598 4.732 4.882 5.056 5.232 5.407 5.581 5.767 5.956 6.175 6.481 6.846 7.161 7.391 7.672 7.87 7.963 7.972 7.739 7.096 6.364 5.665 5.036 4.487 4.025 3.573 3.146 2.709 2.351 2.04 1.735 1.447 1.124 0.774 0.43 0.179 -0.022 -0.231 -0.451 -0.643 -0.844 -1.055 -1.211 -1.37 -1.541 -1.726 -1.927 -2.065 -2.206 -2.425 -2.572 -2.73 -2.813 -2.992 -3.177 -3.362 -3.465 -3.702 -3.793 -3.926 -4.06 -4.336 -4.496 -4.671 -4.865 -5.093 -5.357 -5.734 -6.896 -9 ,1326 ,TETRA ,17555598,Fri Nov 26 03:34:04 CET,Fri Nov 26 05:18:41 CET,0.0 0.877 1.163 1.35 1.503 1.642 1.756 1.857 2.064 2.156 2.245 2.297 2.506 2.589 2.749 2.889 3.013 3.07 3.18 3.288 3.435 3.524 3.612 3.742 3.87 3.996 4.116 4.231 4.374 4.501 4.613 4.744 4.875 5.0 5.155 5.34 5.495 5.647 5.794 5.958 6.14 6.327 6.534 6.734 6.958 7.2 7.449 7.683 7.846 7.833 7.572 6.971 6.298 5.661 5.1 4.595 4.132 3.691 3.287 2.877 2.531 2.226 1.944 1.658 1.384 1.124 0.847 0.607 0.396 0.178 -0.045 -0.232 -0.426 -0.629 -0.795 -0.961 -1.132 -1.31 -1.497 -1.621 -1.752 -1.973 -2.123 -2.27 -2.346 -2.5 -2.673 -2.878 -2.982 -3.225 -3.356 -3.49 -3.617 -3.892 -4.04 -4.203 -4.373 -4.592 -4.823 -5.127 -6.491 -10 ,18076 ,TETRA ,17555599,Fri Nov 26 03:34:04 CET,Fri Nov 26 05:18:36 CET,0.0 0.887 1.133 1.324 1.489 1.626 1.75 1.863 2.058 2.145 2.222 2.256 2.462 2.544 2.706 2.833 2.943 3.001 3.128 3.252 3.414 3.507 3.601 3.734 3.855 3.971 4.087 4.194 4.329 4.472 4.611 4.765 4.911 5.063 5.238 5.404 5.554 5.726 5.9 6.073 6.263 6.478 6.723 6.958 7.201 7.421 7.612 7.811 7.988 8.007 7.697 7.033 6.383 5.83 5.264 4.685 4.175 3.715 3.294 2.869 2.51 2.178 1.872 1.59 1.319 1.067 0.814 0.59 0.391 0.191 -0.012 -0.183 -0.367 -0.56 -0.711 -0.88 -1.054 -1.227 -1.408 -1.539 -1.682 -1.906 -2.059 -2.223 -2.31 -2.472 -2.63 -2.837 -2.957 -3.209 -3.323 -3.461 -3.594 -3.883 -4.028 -4.165 -4.318 -4.509 -4.753 -5.074 -5.975 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt deleted file mode 100644 index d8e1ca82..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,82 ,TETRA ,17555600,Fri Nov 26 03:34:04 CET,Fri Nov 26 05:07:04 CET,0.0 0.674 0.999 1.244 1.398 1.546 1.697 1.822 2.031 2.127 2.229 2.394 2.546 2.629 2.809 2.984 3.137 3.198 3.308 3.419 3.583 3.692 3.801 3.946 4.087 4.231 4.369 4.493 4.646 4.801 4.952 5.139 5.322 5.508 5.716 5.932 6.145 6.385 6.634 6.899 7.185 7.504 7.866 8.224 8.659 9.166 9.764 10.376 10.993 11.688 12.458 12.95 13.116 13.119 13.065 12.961 12.834 12.7 12.568 12.429 12.312 12.195 12.065 11.935 11.811 11.698 11.565 11.446 11.352 11.257 11.156 11.058 10.953 10.857 10.783 10.699 10.607 10.504 10.396 10.318 10.24 10.117 10.032 9.95 9.905 9.808 9.697 9.581 9.522 9.414 9.317 9.229 9.151 8.991 8.897 8.789 8.658 8.502 8.298 8.032 7.625 -2 ,32558 ,TETRA ,17555601,Fri Nov 26 03:34:04 CET,Fri Nov 26 05:16:25 CET,0.0 0.507 0.731 0.926 1.113 1.301 1.457 1.571 1.776 1.877 1.991 2.144 2.283 2.363 2.508 2.65 2.79 2.856 2.98 3.098 3.278 3.39 3.49 3.627 3.767 3.909 4.052 4.19 4.37 4.537 4.697 4.894 5.064 5.226 5.43 5.66 5.872 6.104 6.363 6.637 6.922 7.25 7.637 8.021 8.454 8.929 9.47 10.042 10.689 11.441 12.259 12.739 12.889 12.908 12.867 12.772 12.637 12.489 12.356 12.228 12.103 11.965 11.829 11.71 11.587 11.471 11.356 11.251 11.149 11.043 10.928 10.82 10.706 10.593 10.505 10.412 10.319 10.215 10.104 10.032 9.957 9.834 9.741 9.633 9.576 9.463 9.347 9.234 9.176 9.068 8.993 8.912 8.819 8.612 8.507 8.405 8.294 8.171 8.01 7.81 7.265 -3 ,11849 ,TETRA ,17555602,Fri Nov 26 03:36:05 CET,Fri Nov 26 05:21:11 CET,0.0 0.715 0.907 1.073 1.214 1.36 1.491 1.622 1.855 1.946 2.019 2.091 2.224 2.299 2.455 2.61 2.735 2.796 2.921 3.039 3.198 3.305 3.413 3.568 3.725 3.879 4.018 4.152 4.319 4.477 4.647 4.848 5.03 5.193 5.381 5.606 5.833 6.081 6.346 6.616 6.891 7.207 7.579 7.941 8.369 8.852 9.37 9.953 10.629 11.382 12.2 12.706 12.869 12.906 12.89 12.792 12.662 12.526 12.389 12.24 12.109 11.986 11.865 11.743 11.618 11.502 11.375 11.263 11.16 11.047 10.935 10.842 10.738 10.632 10.548 10.45 10.347 10.25 10.149 10.069 9.988 9.858 9.761 9.652 9.594 9.486 9.385 9.267 9.205 9.098 8.998 8.922 8.851 8.707 8.615 8.499 8.383 8.241 8.07 7.82 7.227 -4 ,12010 ,TETRA ,17555603,Fri Nov 26 03:35:04 CET,Fri Nov 26 05:18:22 CET,0.0 0.621 0.901 1.13 1.337 1.484 1.588 1.707 1.947 2.031 2.111 2.21 2.338 2.409 2.542 2.677 2.803 2.863 2.99 3.115 3.292 3.403 3.516 3.682 3.831 3.97 4.103 4.236 4.407 4.57 4.731 4.925 5.115 5.281 5.465 5.687 5.905 6.153 6.422 6.7 6.989 7.323 7.699 8.065 8.514 9.006 9.553 10.146 10.78 11.512 12.363 12.91 13.076 13.108 13.072 12.962 12.827 12.706 12.593 12.455 12.323 12.179 12.024 11.887 11.763 11.647 11.519 11.396 11.287 11.181 11.057 10.94 10.833 10.725 10.637 10.543 10.44 10.337 10.227 10.149 10.071 9.941 9.844 9.739 9.689 9.588 9.471 9.345 9.283 9.169 9.085 9.015 8.943 8.79 8.699 8.598 8.478 8.324 8.138 7.921 7.497 -5 ,4819 ,TETRA ,17555604,Fri Nov 26 03:35:04 CET,Fri Nov 26 05:18:09 CET,0.0 0.624 0.868 1.089 1.278 1.401 1.506 1.616 1.821 1.908 1.993 2.104 2.242 2.317 2.451 2.585 2.712 2.776 2.911 3.034 3.197 3.304 3.413 3.563 3.698 3.839 3.975 4.095 4.255 4.414 4.567 4.757 4.94 5.115 5.315 5.549 5.782 6.026 6.285 6.55 6.837 7.169 7.554 7.937 8.347 8.794 9.323 9.948 10.658 11.409 12.262 12.845 13.045 13.078 13.028 12.938 12.821 12.706 12.603 12.467 12.327 12.196 12.064 11.943 11.836 11.73 11.598 11.467 11.36 11.248 11.137 11.04 10.929 10.809 10.718 10.627 10.528 10.429 10.311 10.226 10.147 10.02 9.932 9.838 9.785 9.679 9.575 9.453 9.391 9.282 9.204 9.138 9.065 8.895 8.786 8.657 8.507 8.353 8.181 7.932 7.339 -6 ,29019 ,TETRA ,17555605,Fri Nov 26 03:36:05 CET,Fri Nov 26 05:09:45 CET,0.0 0.671 0.935 1.193 1.367 1.495 1.605 1.688 1.855 1.942 2.054 2.223 2.363 2.435 2.568 2.695 2.824 2.892 3.02 3.134 3.305 3.416 3.517 3.653 3.785 3.921 4.046 4.174 4.34 4.488 4.642 4.831 4.99 5.15 5.353 5.58 5.8 6.041 6.303 6.566 6.823 7.137 7.509 7.863 8.29 8.771 9.318 9.899 10.539 11.269 12.039 12.524 12.695 12.72 12.677 12.604 12.507 12.394 12.265 12.13 11.993 11.845 11.713 11.591 11.469 11.356 11.237 11.132 11.035 10.928 10.809 10.702 10.592 10.479 10.39 10.301 10.213 10.118 10.013 9.935 9.852 9.726 9.638 9.544 9.497 9.398 9.283 9.152 9.088 8.969 8.872 8.807 8.738 8.58 8.492 8.402 8.298 8.17 7.97 7.72 7.323 -7 ,30461 ,TETRA ,17555606,Fri Nov 26 03:37:05 CET,Fri Nov 26 05:19:53 CET,0.0 1.036 1.347 1.559 1.783 1.951 2.089 2.218 2.436 2.541 2.652 2.8 2.939 3.021 3.181 3.329 3.48 3.552 3.675 3.786 3.961 4.075 4.177 4.322 4.46 4.601 4.744 4.876 5.055 5.224 5.382 5.572 5.755 5.926 6.119 6.327 6.535 6.778 7.028 7.29 7.564 7.879 8.267 8.665 9.129 9.632 10.171 10.734 11.38 12.105 12.832 13.327 13.501 13.512 13.469 13.398 13.313 13.225 13.115 12.98 12.873 12.752 12.621 12.49 12.365 12.25 12.131 12.025 11.924 11.816 11.698 11.597 11.491 11.375 11.284 11.198 11.107 11.006 10.9 10.829 10.751 10.622 10.532 10.442 10.396 10.3 10.198 10.081 10.023 9.917 9.827 9.745 9.662 9.489 9.388 9.27 9.122 8.946 8.759 8.491 7.941 -8 ,6669 ,TETRA ,17555607,Fri Nov 26 03:37:05 CET,Fri Nov 26 05:23:07 CET,0.0 0.844 1.08 1.248 1.389 1.504 1.626 1.751 1.957 2.049 2.133 2.253 2.395 2.472 2.616 2.757 2.903 2.976 3.107 3.22 3.388 3.506 3.614 3.765 3.908 4.038 4.168 4.304 4.478 4.647 4.812 5.007 5.188 5.359 5.553 5.773 5.984 6.218 6.474 6.743 7.014 7.31 7.659 8.009 8.422 8.87 9.388 9.994 10.657 11.395 12.242 12.78 12.915 12.943 12.91 12.807 12.692 12.566 12.443 12.296 12.163 12.058 11.954 11.833 11.708 11.602 11.488 11.367 11.248 11.128 11.014 10.919 10.821 10.712 10.614 10.514 10.416 10.315 10.212 10.143 10.066 9.929 9.82 9.702 9.645 9.532 9.4 9.245 9.172 9.063 8.98 8.909 8.837 8.673 8.568 8.455 8.339 8.183 7.982 7.733 7.186 -9 ,11722 ,TETRA ,17555608,Fri Nov 26 03:37:06 CET,Fri Nov 26 05:20:09 CET,0.0 0.676 0.95 1.123 1.307 1.477 1.617 1.76 2.039 2.159 2.263 2.382 2.527 2.607 2.746 2.88 3.002 3.061 3.177 3.294 3.47 3.576 3.674 3.823 3.974 4.126 4.27 4.391 4.551 4.708 4.852 5.039 5.229 5.412 5.623 5.857 6.077 6.307 6.561 6.841 7.128 7.457 7.85 8.24 8.658 9.104 9.647 10.264 10.933 11.696 12.535 13.088 13.322 13.359 13.297 13.169 13.034 12.909 12.779 12.627 12.483 12.365 12.247 12.125 12.017 11.913 11.801 11.692 11.588 11.487 11.372 11.262 11.153 11.045 10.957 10.855 10.751 10.652 10.552 10.478 10.4 10.269 10.178 10.086 10.04 9.937 9.827 9.719 9.654 9.537 9.46 9.4 9.316 9.107 9.001 8.878 8.736 8.598 8.458 8.255 7.689 -10 ,6901 ,TETRA ,17555609,Fri Nov 26 03:38:05 CET,Fri Nov 26 05:20:38 CET,0.0 0.702 0.934 1.114 1.265 1.398 1.51 1.618 1.834 1.946 2.047 2.149 2.285 2.371 2.526 2.657 2.787 2.85 2.969 3.088 3.264 3.381 3.49 3.656 3.818 3.968 4.111 4.245 4.4 4.543 4.698 4.895 5.087 5.277 5.485 5.721 5.944 6.172 6.425 6.703 6.992 7.302 7.667 8.03 8.425 8.91 9.49 10.079 10.757 11.502 12.275 12.805 13.007 13.025 12.942 12.818 12.676 12.518 12.386 12.249 12.113 11.989 11.854 11.727 11.614 11.51 11.386 11.268 11.17 11.057 10.944 10.851 10.74 10.625 10.538 10.453 10.359 10.255 10.15 10.073 10.002 9.893 9.806 9.72 9.676 9.568 9.455 9.342 9.281 9.17 9.081 8.998 8.911 8.703 8.588 8.476 8.359 8.213 8.011 7.773 7.229 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 8e73ef56..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10666 ,TETRA ,17555611,Fri Nov 26 03:38:06 CET,Fri Nov 26 05:28:51 CET,0.0 0.818 1.056 1.243 1.419 1.574 1.723 1.878 2.144 2.267 2.407 2.464 2.802 2.91 3.12 3.331 3.528 3.619 3.805 3.982 4.213 4.372 4.53 4.737 4.946 5.166 5.389 5.612 5.913 6.195 6.455 6.774 7.076 7.361 7.692 8.079 8.459 8.876 9.362 9.896 10.441 11.079 11.833 12.577 13.462 14.435 15.546 16.882 18.329 19.764 21.135 21.868 22.015 21.806 21.393 20.853 20.313 19.765 19.281 18.806 18.372 17.984 17.569 17.162 16.772 16.388 15.978 15.597 15.279 14.941 14.565 14.269 13.965 13.643 13.404 13.133 12.839 12.548 12.206 11.963 11.735 11.379 11.112 10.827 10.676 10.351 10.022 9.699 9.522 9.115 8.925 8.694 8.448 7.94 7.654 7.304 6.9 6.429 5.901 5.213 -1.523 -2 ,27499 ,TETRA ,17555612,Fri Nov 26 03:39:05 CET,Fri Nov 26 05:30:57 CET,0.0 1.097 1.39 1.628 1.863 2.08 2.267 2.419 2.698 2.845 2.999 3.044 3.374 3.484 3.701 3.905 4.087 4.182 4.371 4.546 4.803 4.986 5.167 5.414 5.646 5.867 6.069 6.261 6.517 6.777 7.034 7.337 7.643 7.963 8.344 8.769 9.182 9.634 10.123 10.641 11.173 11.804 12.566 13.302 14.151 15.12 16.181 17.377 18.832 20.361 21.798 22.668 22.827 22.615 22.264 21.914 21.512 21.054 20.661 20.2 19.745 19.337 18.938 18.548 18.178 17.837 17.454 17.107 16.8 16.445 16.074 15.77 15.451 15.123 14.869 14.587 14.294 14.009 13.701 13.479 13.267 12.932 12.667 12.345 12.176 11.88 11.575 11.26 11.096 10.696 10.541 10.331 10.096 9.579 9.29 8.975 8.624 8.207 7.695 6.957 3.345 -3 ,24721 ,TETRA ,17555613,Fri Nov 26 03:39:05 CET,Fri Nov 26 05:30:45 CET,0.0 0.899 1.21 1.437 1.645 1.867 2.056 2.194 2.465 2.581 2.688 2.693 3.031 3.137 3.31 3.487 3.673 3.759 3.933 4.112 4.382 4.55 4.714 4.983 5.241 5.472 5.695 5.922 6.23 6.529 6.809 7.137 7.453 7.765 8.14 8.569 8.962 9.373 9.832 10.346 10.904 11.557 12.318 13.067 13.945 14.924 16.007 17.189 18.58 20.074 21.539 22.291 22.223 21.874 21.483 21.044 20.584 20.108 19.681 19.24 18.807 18.437 18.09 17.714 17.353 17.021 16.64 16.292 16.007 15.686 15.322 15.021 14.713 14.38 14.116 13.852 13.585 13.307 13.004 12.778 12.556 12.215 11.958 11.697 11.565 11.274 10.959 10.616 10.44 10.035 9.82 9.594 9.349 8.768 8.461 8.156 7.803 7.387 6.787 5.924 2.469 -4 ,23296 ,TETRA ,17555614,Fri Nov 26 03:40:06 CET,Fri Nov 26 05:33:01 CET,0.0 0.97 1.35 1.595 1.809 2.003 2.184 2.34 2.613 2.746 2.875 2.905 3.247 3.373 3.619 3.846 4.062 4.166 4.358 4.538 4.811 4.99 5.176 5.446 5.7 5.963 6.228 6.475 6.808 7.132 7.442 7.815 8.149 8.462 8.841 9.269 9.708 10.207 10.719 11.283 11.933 12.652 13.422 14.183 15.038 15.947 16.968 18.171 19.434 20.649 21.923 22.479 22.528 22.319 21.963 21.536 21.069 20.612 20.208 19.752 19.336 18.94 18.561 18.197 17.833 17.474 17.077 16.719 16.413 16.117 15.806 15.529 15.243 14.933 14.688 14.432 14.151 13.855 13.532 13.307 13.077 12.689 12.414 12.143 12.004 11.695 11.352 11.01 10.84 10.43 10.258 10.056 9.832 9.342 9.086 8.798 8.43 7.969 7.43 6.712 0.749 -5 ,9113 ,TETRA ,17555615,Fri Nov 26 03:40:06 CET,Fri Nov 26 05:31:44 CET,0.0 1.141 1.516 1.8 2.04 2.273 2.466 2.621 2.881 3.003 3.122 3.132 3.464 3.58 3.817 4.041 4.263 4.37 4.572 4.763 5.028 5.196 5.366 5.611 5.852 6.095 6.333 6.568 6.865 7.154 7.437 7.772 8.098 8.429 8.837 9.296 9.711 10.145 10.622 11.169 11.771 12.429 13.196 13.976 14.865 15.878 17.07 18.278 19.552 20.906 22.201 22.869 22.956 22.737 22.395 22.004 21.562 21.104 20.715 20.261 19.824 19.427 19.028 18.63 18.234 17.863 17.475 17.135 16.84 16.536 16.215 15.939 15.65 15.347 15.111 14.868 14.608 14.327 14.015 13.799 13.589 13.255 13.008 12.742 12.596 12.276 11.964 11.658 11.496 11.104 10.952 10.751 10.535 10.056 9.783 9.474 9.085 8.655 8.102 7.244 3.242 -6 ,10324 ,TETRA ,17555616,Fri Nov 26 03:40:06 CET,Fri Nov 26 05:22:27 CET,0.0 0.753 1.009 1.218 1.407 1.584 1.767 1.932 2.201 2.331 2.46 2.487 2.826 2.94 3.149 3.363 3.572 3.674 3.864 4.043 4.296 4.457 4.617 4.843 5.06 5.277 5.492 5.714 6.006 6.278 6.557 6.909 7.235 7.54 7.904 8.327 8.735 9.194 9.675 10.203 10.758 11.33 12.036 12.79 13.676 14.681 15.868 17.101 18.354 19.662 20.943 21.677 21.801 21.628 21.298 20.907 20.434 19.924 19.445 18.924 18.459 18.019 17.585 17.156 16.756 16.395 15.99 15.614 15.286 14.938 14.591 14.302 13.984 13.665 13.418 13.147 12.86 12.565 12.254 12.029 11.805 11.464 11.222 10.956 10.821 10.553 10.257 9.929 9.744 9.333 9.162 8.958 8.748 8.262 7.977 7.648 7.28 6.836 6.313 5.589 1.149 -7 ,21274 ,TETRA ,17555617,Fri Nov 26 03:43:05 CET,Fri Nov 26 05:36:05 CET,0.0 0.767 1.076 1.332 1.527 1.684 1.827 1.965 2.235 2.361 2.484 2.498 2.836 2.941 3.134 3.322 3.51 3.603 3.788 3.97 4.247 4.437 4.624 4.897 5.17 5.428 5.654 5.878 6.205 6.515 6.804 7.153 7.475 7.784 8.165 8.601 9.015 9.466 9.956 10.485 11.034 11.658 12.379 13.093 13.969 14.938 16.06 17.329 18.672 20.081 21.532 22.236 22.313 22.091 21.695 21.193 20.667 20.143 19.672 19.183 18.724 18.3 17.867 17.468 17.092 16.723 16.346 16.007 15.699 15.37 15.034 14.758 14.464 14.148 13.895 13.631 13.351 13.052 12.746 12.518 12.269 11.889 11.628 11.35 11.197 10.887 10.588 10.254 10.07 9.663 9.463 9.247 9.017 8.475 8.163 7.81 7.428 6.997 6.485 5.743 1.209 -8 ,3830 ,TETRA ,17555618,Fri Nov 26 03:43:04 CET,Fri Nov 26 05:33:07 CET,0.0 1.357 1.716 1.982 2.186 2.354 2.518 2.655 2.919 3.056 3.185 3.19 3.528 3.652 3.891 4.096 4.282 4.384 4.59 4.783 5.046 5.212 5.377 5.632 5.901 6.17 6.408 6.626 6.914 7.19 7.469 7.811 8.129 8.441 8.825 9.265 9.68 10.141 10.623 11.095 11.603 12.229 12.956 13.685 14.51 15.408 16.465 17.591 18.837 20.194 21.651 22.385 22.331 21.951 21.546 21.128 20.636 20.148 19.703 19.235 18.823 18.414 17.982 17.563 17.2 16.854 16.484 16.127 15.792 15.457 15.129 14.85 14.533 14.195 13.932 13.674 13.399 13.113 12.817 12.594 12.367 12.014 11.76 11.481 11.331 11.009 10.674 10.324 10.141 9.735 9.556 9.347 9.117 8.576 8.251 7.904 7.508 7.048 6.485 5.753 -3.247 -9 ,12339 ,TETRA ,17555619,Fri Nov 26 03:44:05 CET,Fri Nov 26 05:38:29 CET,0.0 1.147 1.483 1.75 2.005 2.232 2.399 2.53 2.764 2.873 2.989 2.979 3.305 3.425 3.671 3.917 4.153 4.256 4.437 4.61 4.854 5.008 5.163 5.391 5.625 5.86 6.08 6.288 6.553 6.813 7.07 7.401 7.726 8.05 8.425 8.825 9.217 9.657 10.127 10.635 11.185 11.794 12.484 13.187 14.017 14.929 15.984 17.132 18.324 19.556 20.826 21.537 21.589 21.327 20.923 20.466 20.002 19.545 19.066 18.543 18.131 17.755 17.363 16.971 16.597 16.267 15.899 15.541 15.235 14.914 14.557 14.241 13.917 13.596 13.343 13.064 12.767 12.459 12.128 11.892 11.645 11.251 10.987 10.715 10.574 10.288 9.981 9.65 9.476 9.083 8.939 8.734 8.513 8.052 7.761 7.408 7.029 6.638 6.19 5.537 2.69 -10 ,22206 ,TETRA ,17555620,Fri Nov 26 03:44:05 CET,Fri Nov 26 05:35:12 CET,0.0 1.121 1.465 1.771 1.994 2.198 2.381 2.535 2.835 2.972 3.095 3.098 3.427 3.548 3.806 4.032 4.228 4.331 4.529 4.708 4.964 5.137 5.297 5.527 5.761 5.98 6.199 6.427 6.711 6.983 7.269 7.61 7.944 8.294 8.701 9.177 9.642 10.131 10.664 11.234 11.83 12.49 13.231 13.974 14.847 15.786 16.899 18.13 19.477 21.011 22.56 23.451 23.672 23.566 23.259 22.778 22.262 21.775 21.3 20.765 20.281 19.867 19.471 19.072 18.69 18.325 17.956 17.622 17.322 17.0 16.654 16.36 16.043 15.72 15.471 15.203 14.914 14.616 14.301 14.089 13.876 13.513 13.248 12.98 12.842 12.56 12.266 11.94 11.76 11.349 11.176 10.967 10.74 10.251 9.966 9.611 9.218 8.783 8.244 7.572 3.036 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt deleted file mode 100644 index e531d2f9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14243 ,TETRA ,17555621,Fri Nov 26 03:46:05 CET,Fri Nov 26 05:37:59 CET,0.0 1.826 2.194 2.505 2.79 3.071 3.321 3.541 3.917 4.096 4.286 4.399 4.765 4.911 5.194 5.442 5.669 5.788 6.029 6.264 6.58 6.779 6.979 7.264 7.54 7.809 8.054 8.292 8.611 8.922 9.219 9.573 9.906 10.207 10.575 11.022 11.444 11.918 12.439 12.969 13.491 14.115 14.888 15.641 16.485 17.396 18.439 19.543 20.704 21.94 23.247 23.979 24.118 24.031 23.835 23.491 23.109 22.736 22.392 22.006 21.611 21.227 20.842 20.494 20.142 19.794 19.449 19.135 18.838 18.507 18.164 17.89 17.607 17.322 17.093 16.839 16.573 16.285 16.004 15.805 15.585 15.218 14.945 14.681 14.547 14.256 13.951 13.634 13.461 13.076 12.889 12.666 12.43 11.886 11.609 11.32 10.958 10.529 10.01 9.346 6.149 -2 ,19700 ,TETRA ,17555622,Fri Nov 26 03:47:08 CET,Fri Nov 26 05:38:27 CET,0.0 1.584 2.047 2.419 2.726 3.005 3.264 3.487 3.863 4.05 4.241 4.374 4.743 4.882 5.135 5.376 5.62 5.744 5.968 6.194 6.531 6.73 6.914 7.179 7.442 7.711 7.962 8.19 8.494 8.809 9.115 9.458 9.788 10.116 10.513 10.97 11.402 11.881 12.382 12.893 13.457 14.098 14.816 15.537 16.396 17.319 18.26 19.234 20.366 21.725 23.17 23.959 24.116 23.93 23.612 23.188 22.73 22.27 21.804 21.336 20.951 20.59 20.221 19.841 19.475 19.128 18.737 18.372 18.074 17.786 17.491 17.229 16.957 16.677 16.455 16.212 15.941 15.661 15.37 15.17 14.962 14.619 14.382 14.147 14.015 13.723 13.407 13.048 12.861 12.464 12.252 12.025 11.793 11.259 10.954 10.672 10.35 9.899 9.403 8.761 6.46 -3 ,19979 ,TETRA ,17555623,Fri Nov 26 03:47:06 CET,Fri Nov 26 05:38:15 CET,0.0 1.323 1.78 2.136 2.413 2.686 2.93 3.122 3.478 3.643 3.785 3.84 4.199 4.336 4.618 4.872 5.101 5.215 5.434 5.635 5.929 6.121 6.315 6.601 6.885 7.16 7.421 7.679 8.005 8.321 8.633 9.022 9.401 9.745 10.143 10.586 10.974 11.411 11.91 12.427 12.958 13.544 14.232 14.901 15.702 16.623 17.616 18.712 20.027 21.476 23.013 24.022 24.383 24.365 24.12 23.827 23.525 23.196 22.826 22.407 22.035 21.665 21.268 20.855 20.455 20.083 19.704 19.378 19.082 18.759 18.422 18.121 17.811 17.517 17.285 17.041 16.795 16.541 16.272 16.067 15.845 15.508 15.275 15.038 14.906 14.586 14.23 13.857 13.672 13.279 13.077 12.862 12.636 12.162 11.906 11.575 11.166 10.713 10.153 9.26 5.289 -4 ,12375 ,TETRA ,17555624,Fri Nov 26 03:47:05 CET,Fri Nov 26 05:39:21 CET,0.0 1.472 1.823 2.098 2.365 2.625 2.85 3.062 3.458 3.633 3.785 3.85 4.207 4.336 4.581 4.837 5.082 5.206 5.452 5.687 6.011 6.205 6.4 6.682 6.956 7.223 7.465 7.696 8.023 8.339 8.626 8.964 9.292 9.619 10.013 10.467 10.904 11.39 11.927 12.464 12.999 13.612 14.313 15.02 15.872 16.765 17.744 18.842 20.061 21.499 23.002 23.701 23.77 23.58 23.281 22.919 22.523 22.133 21.784 21.387 20.983 20.595 20.234 19.911 19.591 19.268 18.932 18.601 18.299 17.978 17.637 17.362 17.075 16.764 16.514 16.249 15.974 15.7 15.413 15.207 14.996 14.658 14.416 14.162 14.027 13.762 13.475 13.151 12.984 12.605 12.435 12.225 12.001 11.51 11.229 10.922 10.567 10.143 9.603 8.801 3.626 -5 ,13477 ,TETRA ,17555625,Fri Nov 26 03:48:05 CET,Fri Nov 26 05:40:41 CET,0.0 1.997 2.447 2.78 3.082 3.347 3.585 3.798 4.169 4.338 4.51 4.628 5.0 5.14 5.43 5.715 5.984 6.118 6.373 6.596 6.898 7.088 7.266 7.528 7.792 8.04 8.293 8.551 8.876 9.18 9.487 9.859 10.184 10.503 10.897 11.333 11.728 12.158 12.602 13.058 13.552 14.1 14.747 15.427 16.211 17.046 18.012 19.141 20.403 21.737 23.09 23.798 23.93 23.825 23.602 23.298 22.934 22.548 22.238 21.881 21.521 21.214 20.889 20.512 20.126 19.799 19.464 19.144 18.861 18.585 18.299 18.04 17.768 17.485 17.258 17.007 16.754 16.501 16.21 16.01 15.797 15.439 15.191 14.921 14.77 14.455 14.132 13.8 13.624 13.217 12.976 12.741 12.505 11.974 11.684 11.367 11.0 10.576 10.015 9.219 4.316 -6 ,32516 ,TETRA ,17555626,Fri Nov 26 03:50:07 CET,Fri Nov 26 05:29:57 CET,0.0 1.588 2.131 2.555 2.897 3.146 3.381 3.627 4.093 4.3 4.488 4.596 4.96 5.099 5.366 5.62 5.855 5.974 6.209 6.424 6.721 6.914 7.089 7.333 7.598 7.868 8.127 8.367 8.678 8.973 9.255 9.594 9.916 10.237 10.618 11.051 11.447 11.876 12.345 12.868 13.447 14.088 14.829 15.586 16.469 17.412 18.426 19.564 20.959 22.434 23.756 24.428 24.484 24.333 24.129 23.851 23.557 23.226 22.868 22.445 22.009 21.588 21.203 20.834 20.478 20.17 19.844 19.522 19.243 18.948 18.605 18.305 17.995 17.663 17.417 17.172 16.899 16.608 16.283 16.065 15.854 15.514 15.278 15.034 14.907 14.629 14.31 13.963 13.799 13.406 13.227 13.017 12.778 12.267 11.983 11.657 11.283 10.885 10.35 9.569 5.063 -7 ,31023 ,TETRA ,17555627,Fri Nov 26 03:50:07 CET,Fri Nov 26 05:30:48 CET,0.0 1.644 2.025 2.351 2.638 2.92 3.156 3.353 3.702 3.901 4.11 4.248 4.614 4.758 5.038 5.305 5.545 5.66 5.891 6.114 6.451 6.676 6.887 7.165 7.439 7.725 8.004 8.253 8.56 8.885 9.203 9.567 9.91 10.259 10.673 11.139 11.592 12.083 12.622 13.176 13.738 14.373 15.131 15.87 16.716 17.699 18.778 19.925 21.215 22.641 24.069 24.721 24.744 24.518 24.13 23.713 23.316 22.882 22.429 21.945 21.543 21.188 20.838 20.498 20.168 19.852 19.497 19.18 18.911 18.624 18.312 18.064 17.808 17.521 17.292 17.043 16.782 16.511 16.212 16.0 15.783 15.423 15.165 14.899 14.765 14.482 14.168 13.831 13.642 13.242 13.055 12.84 12.611 12.005 11.669 11.316 10.947 10.552 10.02 9.235 5.94 -8 ,5705 ,TETRA ,17555628,Fri Nov 26 03:53:06 CET,Fri Nov 26 05:45:35 CET,0.0 1.404 1.823 2.161 2.435 2.678 2.915 3.122 3.485 3.665 3.84 3.938 4.311 4.456 4.72 4.958 5.189 5.304 5.538 5.759 6.046 6.229 6.409 6.666 6.925 7.179 7.42 7.67 7.99 8.297 8.607 8.975 9.323 9.645 10.004 10.422 10.856 11.348 11.843 12.378 12.937 13.537 14.233 14.921 15.769 16.732 17.768 18.85 20.036 21.277 22.632 23.459 23.544 23.436 23.202 22.852 22.471 21.992 21.514 21.042 20.628 20.226 19.803 19.393 19.014 18.685 18.342 18.022 17.75 17.474 17.167 16.905 16.64 16.331 16.091 15.852 15.595 15.313 14.996 14.773 14.547 14.207 13.942 13.661 13.526 13.246 12.941 12.607 12.429 12.03 11.834 11.628 11.401 10.896 10.605 10.287 9.902 9.431 8.878 8.081 4.319 -9 ,19125 ,TETRA ,17555629,Fri Nov 26 03:53:06 CET,Fri Nov 26 05:45:14 CET,0.0 1.812 2.228 2.534 2.826 3.112 3.365 3.593 3.971 4.139 4.303 4.427 4.821 4.978 5.268 5.554 5.828 5.961 6.218 6.48 6.861 7.092 7.319 7.632 7.905 8.172 8.432 8.675 8.993 9.322 9.64 10.009 10.363 10.704 11.095 11.545 11.983 12.457 12.968 13.512 14.091 14.743 15.479 16.222 17.08 17.991 19.007 20.11 21.405 22.927 24.516 25.424 25.642 25.534 25.225 24.86 24.484 24.077 23.64 23.179 22.789 22.4 22.014 21.655 21.333 21.039 20.712 20.39 20.11 19.83 19.514 19.227 18.931 18.625 18.366 18.083 17.809 17.52 17.209 17.01 16.798 16.458 16.221 15.974 15.843 15.561 15.249 14.892 14.707 14.306 14.073 13.855 13.624 13.069 12.764 12.405 11.995 11.568 11.059 10.276 3.863 -10 ,27461 ,TETRA ,17555630,Fri Nov 26 03:53:06 CET,Fri Nov 26 05:43:58 CET,0.0 2.246 2.885 3.345 3.721 4.057 4.364 4.609 5.001 5.183 5.356 5.461 5.837 6.001 6.311 6.575 6.824 6.944 7.168 7.4 7.739 7.935 8.12 8.416 8.728 9.02 9.291 9.572 9.939 10.257 10.54 10.883 11.234 11.576 11.966 12.425 12.873 13.332 13.825 14.373 14.943 15.585 16.296 16.978 17.796 18.696 19.666 20.703 21.976 23.411 24.661 25.382 25.634 25.606 25.356 24.948 24.515 24.1 23.763 23.374 22.977 22.592 22.214 21.848 21.494 21.199 20.875 20.545 20.264 19.97 19.647 19.375 19.106 18.818 18.58 18.322 18.056 17.761 17.433 17.223 17.006 16.652 16.392 16.114 15.976 15.704 15.427 15.121 14.953 14.562 14.351 14.122 13.879 13.321 13.017 12.702 12.35 11.898 11.306 10.47 6.296 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt deleted file mode 100644 index cb2d21bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16954 ,TETRA ,17555631,Fri Nov 26 03:56:05 CET,Fri Nov 26 05:47:04 CET,0.0 0.652 1.098 1.479 1.821 2.147 2.421 2.883 3.098 3.298 3.416 3.724 3.847 4.065 4.308 4.53 4.602 4.748 4.911 5.12 5.214 5.315 5.463 5.557 5.636 5.717 5.801 5.875 5.926 5.982 6.037 6.057 6.058 6.041 6.012 5.979 5.895 5.74 5.52 5.248 4.886 4.415 3.911 3.212 2.268 1.029 -0.607 -3.09 -6.852 -12.687 -19.265 -24.333 -28.483 -31.988 -34.968 -37.495 -39.744 -41.628 -43.449 -45.044 -46.453 -47.719 -48.878 -49.937 -50.889 -51.898 -52.842 -53.692 -54.557 -55.422 -56.117 -56.825 -57.575 -58.178 -58.781 -59.367 -60.059 -60.86 -61.429 -62.038 -62.964 -63.568 -64.18 -64.499 -65.16 -65.853 -66.585 -66.972 -67.617 -68.201 -68.635 -69.117 -70.174 -70.754 -71.404 -72.136 -72.919 -73.852 -75.213 -2 ,14075 ,TETRA ,17555632,Fri Nov 26 03:56:06 CET,Fri Nov 26 05:46:53 CET,0.0 0.567 0.993 1.329 1.608 1.883 2.137 2.613 2.85 3.077 3.337 3.7 3.838 4.077 4.283 4.473 4.565 4.768 4.956 5.176 5.318 5.467 5.705 5.931 6.109 6.24 6.361 6.523 6.635 6.718 6.807 6.869 6.923 6.938 6.938 6.96 6.975 6.904 6.723 6.495 6.198 5.853 5.453 4.797 3.927 2.729 1.122 -1.216 -4.601 -10.01 -16.307 -21.235 -25.179 -28.447 -31.346 -33.779 -35.948 -37.768 -39.536 -41.019 -42.313 -43.522 -44.609 -45.628 -46.614 -47.623 -48.535 -49.372 -50.2 -51.035 -51.711 -52.4 -53.088 -53.621 -54.169 -54.727 -55.333 -55.962 -56.413 -56.889 -57.629 -58.147 -58.668 -58.931 -59.461 -60.019 -60.624 -60.941 -61.536 -62.095 -62.481 -62.847 -63.666 -64.167 -64.708 -65.296 -66.043 -67.033 -68.411 -3 ,31154 ,TETRA ,17555633,Fri Nov 26 03:57:05 CET,Fri Nov 26 05:49:11 CET,0.0 0.504 0.955 1.346 1.682 1.979 2.247 2.673 2.891 3.128 3.321 3.654 3.811 4.13 4.441 4.743 4.878 5.146 5.411 5.778 5.985 6.17 6.401 6.579 6.762 6.945 7.123 7.31 7.47 7.626 7.754 7.842 7.93 8.052 8.152 8.207 8.353 8.687 9.087 9.171 8.976 8.677 8.294 7.711 6.88 5.728 4.126 1.858 -1.474 -6.963 -13.238 -18.27 -22.472 -25.966 -28.99 -31.485 -33.672 -35.598 -37.424 -38.936 -40.303 -41.607 -42.806 -43.888 -44.92 -46.029 -47.001 -47.8 -48.588 -49.42 -50.141 -50.868 -51.609 -52.231 -52.885 -53.521 -54.155 -54.822 -55.28 -55.762 -56.5 -57.016 -57.558 -57.853 -58.478 -59.101 -59.778 -60.115 -60.699 -61.221 -61.664 -62.153 -63.192 -63.743 -64.33 -64.989 -65.748 -66.766 -68.334 -4 ,32413 ,TETRA ,17555634,Fri Nov 26 03:57:06 CET,Fri Nov 26 05:32:36 CET,0.0 0.674 1.093 1.441 1.756 2.013 2.245 2.712 2.942 3.147 3.336 3.697 3.867 4.197 4.515 4.809 4.948 5.206 5.445 5.784 5.985 6.148 6.366 6.584 6.805 7.006 7.211 7.444 7.623 7.802 8.003 8.159 8.295 8.443 8.533 8.563 8.568 8.549 8.477 8.342 8.153 7.852 7.458 6.896 6.111 4.976 3.361 0.979 -2.414 -7.643 -13.545 -18.15 -21.897 -24.959 -27.636 -29.958 -31.968 -33.681 -35.426 -36.936 -38.278 -39.582 -40.883 -42.09 -43.162 -44.245 -45.219 -46.07 -46.975 -47.988 -48.873 -49.799 -50.762 -51.523 -52.319 -53.127 -53.943 -54.781 -55.345 -55.913 -56.811 -57.44 -58.063 -58.378 -59.051 -59.745 -60.455 -60.835 -61.481 -62.139 -62.629 -63.108 -64.114 -64.641 -65.189 -65.834 -66.57 -67.544 -69.025 -5 ,7868 ,TETRA ,17555635,Fri Nov 26 03:57:08 CET,Fri Nov 26 05:48:25 CET,0.0 0.728 1.222 1.597 1.914 2.191 2.461 2.992 3.22 3.416 3.601 3.957 4.12 4.409 4.666 4.894 5.008 5.279 5.554 5.909 6.131 6.361 6.689 7.006 7.316 7.584 7.808 8.008 8.165 8.346 8.532 8.657 8.811 9.023 9.161 9.215 9.238 9.176 9.044 8.864 8.674 8.422 8.059 7.498 6.722 5.583 3.996 1.779 -1.567 -7.049 -13.259 -18.135 -22.155 -25.476 -28.382 -30.875 -33.088 -35.035 -37.047 -38.742 -40.251 -41.708 -43.046 -44.283 -45.414 -46.58 -47.588 -48.406 -49.218 -50.03 -50.704 -51.41 -52.136 -52.712 -53.324 -53.956 -54.584 -55.213 -55.649 -56.105 -56.82 -57.322 -57.847 -58.108 -58.639 -59.184 -59.746 -60.061 -60.631 -61.087 -61.486 -61.918 -62.81 -63.326 -63.9 -64.542 -65.358 -66.312 -67.607 -6 ,11300 ,TETRA ,17555636,Fri Nov 26 03:57:06 CET,Fri Nov 26 05:47:43 CET,0.0 0.556 0.985 1.38 1.766 2.082 2.345 2.829 3.025 3.209 3.397 3.768 3.938 4.258 4.579 4.879 5.019 5.314 5.606 5.988 6.165 6.283 6.444 6.564 6.66 6.766 6.864 6.965 7.049 7.129 7.213 7.281 7.328 7.333 7.298 7.246 7.174 7.053 6.903 6.727 6.465 6.047 5.539 4.837 3.894 2.631 0.983 -1.293 -4.737 -10.221 -16.316 -21.02 -24.823 -27.944 -30.732 -33.15 -35.305 -37.221 -39.09 -40.625 -42.015 -43.338 -44.49 -45.529 -46.503 -47.541 -48.481 -49.25 -50.021 -50.87 -51.603 -52.353 -53.124 -53.738 -54.322 -54.878 -55.494 -56.117 -56.546 -57.015 -57.75 -58.244 -58.741 -59.004 -59.571 -60.146 -60.735 -61.037 -61.609 -62.11 -62.491 -62.883 -63.75 -64.243 -64.78 -65.399 -66.098 -66.941 -68.251 -7 ,12709 ,TETRA ,17555637,Fri Nov 26 03:57:06 CET,Fri Nov 26 05:49:08 CET,0.0 0.599 1.071 1.451 1.794 2.086 2.342 2.786 2.987 3.175 3.372 3.735 3.916 4.27 4.548 4.735 4.817 5.023 5.209 5.404 5.519 5.65 5.831 5.968 6.14 6.277 6.346 6.416 6.469 6.516 6.547 6.563 6.573 6.545 6.5 6.465 6.396 6.283 6.145 5.967 5.683 5.216 4.694 4.008 3.04 1.864 1.055 0.277 -1.751 -6.522 -13.529 -19.339 -23.569 -26.827 -29.75 -32.225 -34.394 -36.257 -38.088 -39.646 -41.036 -42.318 -43.493 -44.6 -45.617 -46.682 -47.719 -48.661 -49.608 -50.599 -51.449 -52.351 -53.315 -54.064 -54.831 -55.61 -56.392 -57.194 -57.744 -58.317 -59.194 -59.785 -60.409 -60.731 -61.351 -61.999 -62.719 -63.101 -63.743 -64.342 -64.793 -65.281 -66.346 -66.936 -67.551 -68.219 -68.986 -69.916 -71.284 -8 ,18510 ,TETRA ,17555638,Fri Nov 26 03:57:06 CET,Fri Nov 26 05:49:07 CET,0.0 0.638 1.157 1.543 1.835 2.101 2.379 2.844 3.044 3.249 3.441 3.819 4.011 4.329 4.624 4.919 5.064 5.327 5.564 5.922 6.159 6.387 6.723 7.047 7.322 7.515 7.685 7.876 8.02 8.16 8.306 8.455 8.565 8.632 8.682 8.738 8.81 8.823 8.766 8.66 8.482 8.199 7.829 7.202 6.325 5.16 3.562 1.336 -1.95 -7.214 -13.235 -17.916 -21.73 -24.876 -27.602 -29.881 -31.899 -33.679 -35.403 -36.85 -38.152 -39.361 -40.442 -41.53 -42.627 -43.892 -45.138 -46.238 -47.366 -48.481 -49.366 -50.289 -51.284 -52.062 -52.846 -53.636 -54.439 -55.259 -55.831 -56.42 -57.307 -57.926 -58.579 -58.911 -59.609 -60.327 -61.061 -61.456 -62.099 -62.671 -63.083 -63.515 -64.589 -65.203 -65.844 -66.528 -67.321 -68.236 -69.555 -9 ,8964 ,TETRA ,17555639,Fri Nov 26 03:58:06 CET,Fri Nov 26 05:49:40 CET,0.0 0.563 1.03 1.379 1.682 1.99 2.266 2.764 3.003 3.203 3.372 3.727 3.884 4.196 4.497 4.784 4.919 5.173 5.418 5.76 5.945 6.115 6.381 6.612 6.797 6.979 7.193 7.5 7.707 7.791 7.928 8.074 8.173 8.228 8.284 8.322 8.296 8.275 8.225 8.101 7.902 7.599 7.233 6.674 5.865 4.723 3.175 0.964 -2.376 -7.772 -13.803 -18.506 -22.361 -25.582 -28.364 -30.685 -32.75 -34.554 -36.337 -37.821 -39.125 -40.324 -41.517 -42.711 -43.784 -44.861 -45.785 -46.659 -47.682 -48.7 -49.528 -50.416 -51.357 -52.105 -52.85 -53.611 -54.394 -55.218 -55.78 -56.326 -57.186 -57.79 -58.403 -58.716 -59.379 -60.076 -60.778 -61.142 -61.78 -62.414 -62.889 -63.358 -64.396 -64.995 -65.632 -66.339 -67.148 -68.076 -69.38 -10 ,687 ,TETRA ,17555640,Fri Nov 26 03:58:05 CET,Fri Nov 26 05:48:08 CET,0.0 0.669 1.13 1.46 1.742 1.994 2.228 2.688 2.921 3.138 3.345 3.711 3.881 4.199 4.499 4.737 4.821 4.987 5.141 5.309 5.395 5.492 5.636 5.768 5.899 5.997 6.097 6.247 6.358 6.466 6.596 6.704 6.804 6.897 6.964 6.981 7.002 7.003 6.945 6.864 6.735 6.474 6.069 5.48 4.692 3.585 2.058 -0.103 -3.383 -8.786 -14.827 -19.491 -23.311 -26.526 -29.62 -32.377 -34.76 -36.734 -38.475 -39.888 -41.211 -42.49 -43.724 -44.906 -45.915 -46.911 -47.796 -48.551 -49.376 -50.229 -50.899 -51.577 -52.317 -52.918 -53.546 -54.208 -54.902 -55.685 -56.262 -56.855 -57.73 -58.317 -58.946 -59.281 -59.957 -60.647 -61.356 -61.735 -62.376 -62.989 -63.451 -63.927 -64.937 -65.491 -66.067 -66.742 -67.593 -68.664 -70.255 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt deleted file mode 100644 index 69ff7f5c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6935 ,TETRA ,17555641,Fri Nov 26 04:00:07 CET,Fri Nov 26 05:51:06 CET,0.0 2.317 3.13 3.761 4.319 4.78 5.162 5.522 6.181 6.464 6.709 6.986 7.374 7.564 7.939 8.299 8.637 8.801 9.126 9.426 9.824 10.105 10.433 10.88 11.232 11.56 11.879 12.2 12.623 13.033 13.421 13.871 14.31 14.744 15.238 15.788 16.296 16.825 17.397 17.996 18.625 19.348 20.157 20.966 21.885 22.894 23.976 25.052 26.289 27.57 28.529 28.659 28.404 28.015 27.492 26.87 26.27 25.728 25.236 24.674 24.123 23.577 23.029 22.495 21.925 21.455 21.023 20.519 19.91 19.182 18.446 17.869 17.312 16.748 16.32 15.818 15.248 14.667 14.072 13.679 13.287 12.683 12.265 11.828 11.608 11.147 10.63 10.069 9.767 9.261 8.713 8.341 7.946 7.075 6.584 6.081 5.512 4.798 3.845 2.436 -7.067 -2 ,23212 ,TETRA ,17555642,Fri Nov 26 03:59:06 CET,Fri Nov 26 05:53:47 CET,0.0 4.168 4.937 5.582 6.087 6.545 6.945 7.292 7.89 8.157 8.409 8.695 9.11 9.338 9.759 10.151 10.527 10.705 11.033 11.37 11.848 12.147 12.442 12.863 13.282 13.683 14.06 14.412 14.859 15.298 15.718 16.223 16.714 17.18 17.714 18.298 18.845 19.428 20.05 20.709 21.384 22.122 22.943 23.775 24.759 25.807 26.868 27.975 29.126 30.204 31.1 31.238 31.033 30.547 29.901 29.181 28.511 27.887 27.277 26.637 26.075 25.534 24.991 24.404 23.778 23.123 22.376 21.707 21.139 20.55 19.916 19.39 18.85 18.292 17.876 17.421 16.923 16.393 15.823 15.447 15.064 14.479 14.075 13.616 13.364 12.863 12.363 11.818 11.527 11.066 10.626 10.295 9.934 9.134 8.655 8.118 7.527 6.783 5.678 4.063 -8.783 -3 ,29155 ,TETRA ,17555643,Fri Nov 26 03:59:06 CET,Fri Nov 26 05:49:29 CET,0.0 2.594 3.384 3.99 4.489 4.918 5.299 5.646 6.305 6.619 6.926 7.333 7.812 8.109 8.653 9.162 9.665 9.913 10.381 10.819 11.466 11.884 12.296 12.904 13.485 14.033 14.575 15.124 15.835 16.537 17.217 18.036 18.841 19.642 20.584 21.457 22.066 22.686 23.332 24.024 24.755 25.499 26.338 27.248 28.332 29.471 30.709 31.988 33.153 34.138 34.85 34.719 34.128 33.332 32.468 31.65 30.878 29.923 28.833 27.681 26.794 25.959 25.05 24.184 23.417 22.688 21.887 21.192 20.566 19.906 19.243 18.703 18.118 17.481 16.998 16.522 16.029 15.491 14.91 14.521 14.137 13.522 13.106 12.683 12.452 11.978 11.491 10.965 10.683 10.217 9.756 9.426 9.073 8.32 7.873 7.367 6.818 6.218 5.406 4.028 -5.829 -4 ,19676 ,TETRA ,17555644,Fri Nov 26 03:59:06 CET,Fri Nov 26 05:52:17 CET,0.0 2.944 3.717 4.356 4.887 5.324 5.716 6.075 6.734 7.058 7.371 7.776 8.238 8.496 9.01 9.522 10.015 10.246 10.7 11.148 11.791 12.219 12.644 13.255 13.849 14.425 14.96 15.504 16.232 16.924 17.572 18.222 18.736 19.245 19.824 20.436 21.062 21.776 22.477 23.161 23.877 24.718 25.826 27.017 28.378 29.755 31.125 32.488 33.701 34.733 35.424 35.262 34.672 33.837 32.988 32.154 31.088 30.081 29.283 28.135 26.938 25.91 24.969 24.058 23.176 22.38 21.57 20.87 20.252 19.604 18.963 18.419 17.849 17.251 16.781 16.311 15.817 15.294 14.743 14.362 13.985 13.382 12.964 12.528 12.291 11.802 11.321 10.802 10.524 10.072 9.596 9.232 8.843 8.041 7.586 7.041 6.464 5.835 5.055 3.988 -4.2 -8 ,21265 ,TETRA ,17555648,Fri Nov 26 04:00:05 CET,Fri Nov 26 05:51:22 CET,0.0 3.37 4.147 4.686 5.106 5.491 5.821 6.103 6.618 6.857 7.089 7.339 7.724 7.943 8.364 8.729 9.056 9.217 9.523 9.795 10.204 10.484 10.754 11.158 11.553 11.922 12.29 12.629 13.04 13.446 13.834 14.295 14.753 15.189 15.666 16.2 16.721 17.297 17.902 18.532 19.217 19.914 20.65 21.49 22.587 23.789 25.012 26.316 27.753 29.198 30.495 30.775 30.418 29.926 29.428 28.918 28.397 27.827 27.301 26.829 26.385 25.938 25.531 25.131 24.696 24.291 23.856 23.345 22.901 22.519 22.138 21.781 21.401 20.988 20.615 20.272 19.938 19.546 19.122 18.788 18.392 17.76 17.315 16.823 16.552 15.981 15.421 14.874 14.596 14.131 13.659 13.314 12.943 12.049 11.543 11.013 10.413 9.677 8.771 7.548 1.362 -10 ,12348 ,TETRA ,17555650,Fri Nov 26 04:00:05 CET,Fri Nov 26 05:53:07 CET,0.0 2.994 3.656 4.116 4.482 4.808 5.155 5.495 6.177 6.478 6.72 6.959 7.335 7.534 7.921 8.27 8.597 8.754 9.069 9.377 9.809 10.104 10.386 10.768 11.127 11.472 11.818 12.156 12.577 12.988 13.381 13.829 14.258 14.677 15.16 15.69 16.206 16.784 17.386 18.012 18.67 19.378 20.199 21.014 21.904 22.881 23.945 25.109 26.442 27.633 28.544 28.928 28.839 28.466 27.927 27.356 26.809 26.259 25.732 25.152 24.657 24.206 23.767 23.288 22.777 22.352 21.938 21.527 21.159 20.787 20.309 19.779 19.174 18.526 18.002 17.531 17.07 16.53 15.94 15.531 15.115 14.481 14.052 13.609 13.372 12.875 12.362 11.834 11.547 11.029 10.398 10.02 9.652 8.833 8.391 7.882 7.305 6.608 5.749 4.521 -2.787 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 502ecb1e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10597 ,KEBNE ,17043681,Thu Dec 23 05:08:24 CET,Thu Dec 23 06:42:15 CET,0.0 1.186 1.535 1.813 2.073 2.292 2.469 2.608 2.831 2.922 3.008 3.011 3.247 3.314 3.439 3.566 3.685 3.737 3.828 3.913 4.032 4.097 4.157 4.262 4.356 4.434 4.509 4.561 4.603 4.634 4.668 4.711 4.753 4.781 4.805 4.83 4.846 4.863 4.857 4.835 4.806 4.744 4.629 4.451 4.162 3.747 3.153 2.259 0.845 -1.292 -4.845 -9.014 -12.278 -15.026 -17.32 -19.278 -20.949 -22.441 -23.698 -24.969 -26.039 -26.948 -27.814 -28.622 -29.349 -30.017 -30.728 -31.34 -31.852 -32.362 -32.914 -33.397 -33.881 -34.384 -34.758 -35.118 -35.49 -35.88 -36.275 -36.551 -36.847 -37.313 -37.628 -37.959 -38.129 -38.472 -38.825 -39.197 -39.389 -39.802 -40.045 -40.3 -40.553 -41.039 -41.297 -41.588 -41.917 -42.269 -42.695 -43.246 -45.629 -2 ,30725 ,KEBNE ,17043682,Thu Dec 23 05:08:24 CET,Thu Dec 23 06:41:41 CET,0.0 1.774 2.196 2.419 2.609 2.798 2.971 3.136 3.442 3.561 3.663 3.698 3.952 4.032 4.195 4.36 4.493 4.547 4.643 4.746 4.899 4.989 5.066 5.16 5.257 5.346 5.414 5.471 5.547 5.633 5.724 5.825 5.901 5.954 5.996 6.03 6.052 6.06 6.032 5.971 5.906 5.818 5.66 5.448 5.148 4.696 4.031 3.145 1.826 -0.27 -3.791 -8.009 -11.397 -14.159 -16.444 -18.421 -20.127 -21.645 -22.895 -24.105 -25.132 -26.039 -26.905 -27.697 -28.431 -29.079 -29.724 -30.301 -30.802 -31.317 -31.838 -32.272 -32.72 -33.172 -33.52 -33.886 -34.262 -34.653 -35.045 -35.305 -35.582 -36.028 -36.337 -36.646 -36.805 -37.148 -37.504 -37.861 -38.049 -38.467 -38.68 -38.902 -39.149 -39.726 -40.034 -40.366 -40.706 -41.065 -41.511 -42.203 -44.419 -3 ,8874 ,KEBNE ,17043683,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:41:26 CET,0.0 1.084 1.547 1.852 2.081 2.286 2.467 2.61 2.857 2.973 3.073 3.059 3.294 3.373 3.52 3.647 3.767 3.823 3.927 4.024 4.15 4.237 4.318 4.423 4.511 4.589 4.664 4.73 4.815 4.893 4.956 5.026 5.079 5.125 5.194 5.255 5.267 5.269 5.254 5.204 5.146 5.075 4.966 4.786 4.454 3.988 3.308 2.389 1.007 -1.14 -4.58 -8.568 -11.834 -14.58 -16.852 -18.809 -20.477 -21.942 -23.198 -24.463 -25.52 -26.439 -27.314 -28.123 -28.834 -29.478 -30.166 -30.753 -31.241 -31.749 -32.276 -32.707 -33.158 -33.642 -34.021 -34.412 -34.807 -35.206 -35.605 -35.873 -36.162 -36.617 -36.927 -37.252 -37.418 -37.744 -38.059 -38.404 -38.594 -39.018 -39.246 -39.476 -39.708 -40.219 -40.51 -40.811 -41.142 -41.562 -42.046 -42.686 -45.281 -4 ,25329 ,KEBNE ,17043684,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:41:28 CET,0.0 0.745 1.105 1.407 1.659 1.85 1.994 2.117 2.346 2.464 2.577 2.604 2.86 2.956 3.127 3.249 3.359 3.414 3.512 3.607 3.744 3.823 3.896 3.999 4.096 4.179 4.255 4.337 4.437 4.509 4.563 4.616 4.656 4.706 4.75 4.78 4.814 4.812 4.793 4.781 4.724 4.595 4.413 4.217 3.922 3.502 2.904 2.051 0.821 -1.04 -4.331 -8.408 -11.756 -14.475 -16.733 -18.733 -20.386 -21.82 -23.051 -24.225 -25.215 -26.111 -26.954 -27.729 -28.449 -29.083 -29.746 -30.352 -30.855 -31.364 -31.89 -32.333 -32.798 -33.268 -33.622 -33.995 -34.405 -34.829 -35.251 -35.53 -35.815 -36.256 -36.576 -36.919 -37.093 -37.446 -37.805 -38.196 -38.398 -38.82 -39.032 -39.258 -39.508 -40.021 -40.297 -40.6 -40.913 -41.279 -41.783 -42.39 -44.401 -5 ,21660 ,KEBNE ,17043685,Thu Dec 23 05:08:24 CET,Thu Dec 23 06:41:26 CET,0.0 1.716 2.17 2.554 2.848 3.065 3.238 3.393 3.698 3.839 3.973 4.054 4.319 4.414 4.59 4.754 4.913 4.987 5.122 5.242 5.399 5.493 5.582 5.712 5.851 5.962 6.039 6.107 6.198 6.29 6.35 6.405 6.445 6.48 6.534 6.593 6.623 6.626 6.604 6.545 6.45 6.337 6.157 5.894 5.54 5.051 4.39 3.454 1.93 -0.283 -3.739 -7.807 -11.235 -14.059 -16.428 -18.49 -20.25 -21.813 -23.091 -24.34 -25.383 -26.296 -27.152 -27.936 -28.677 -29.355 -30.057 -30.678 -31.196 -31.73 -32.288 -32.748 -33.202 -33.661 -34.044 -34.443 -34.823 -35.215 -35.636 -35.914 -36.19 -36.619 -36.926 -37.259 -37.434 -37.788 -38.14 -38.5 -38.69 -39.109 -39.306 -39.522 -39.762 -40.265 -40.554 -40.87 -41.205 -41.576 -42.024 -42.639 -44.996 -6 ,11222 ,KEBNE ,17043686,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:41:34 CET,0.0 1.269 1.607 1.904 2.13 2.288 2.459 2.618 2.851 2.95 3.045 3.061 3.312 3.395 3.54 3.67 3.782 3.834 3.94 4.047 4.176 4.249 4.33 4.45 4.549 4.631 4.707 4.78 4.863 4.925 4.974 5.03 5.083 5.136 5.172 5.19 5.194 5.18 5.197 5.199 5.149 5.057 4.923 4.8 4.632 4.37 3.896 3.105 1.891 -0.14 -3.618 -7.569 -10.741 -13.42 -15.676 -17.678 -19.437 -20.952 -22.237 -23.507 -24.586 -25.532 -26.408 -27.249 -27.998 -28.653 -29.33 -29.937 -30.457 -30.98 -31.521 -31.966 -32.444 -32.921 -33.281 -33.655 -34.023 -34.405 -34.805 -35.074 -35.367 -35.845 -36.168 -36.497 -36.671 -37.035 -37.399 -37.799 -38.001 -38.407 -38.58 -38.815 -39.071 -39.563 -39.822 -40.099 -40.426 -40.818 -41.258 -41.869 -44.238 -7 ,17034 ,KEBNE ,17043687,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:41:39 CET,0.0 1.645 2.037 2.283 2.464 2.61 2.745 2.864 3.076 3.158 3.241 3.262 3.512 3.585 3.72 3.855 3.981 4.044 4.158 4.259 4.391 4.467 4.539 4.652 4.737 4.795 4.846 4.896 4.967 5.026 5.075 5.127 5.173 5.215 5.267 5.277 5.268 5.278 5.284 5.27 5.219 5.121 4.943 4.732 4.466 4.014 3.307 2.369 1.042 -1.02 -4.634 -8.977 -12.502 -15.467 -17.854 -19.827 -21.513 -23.016 -24.295 -25.56 -26.64 -27.555 -28.387 -29.169 -29.949 -30.677 -31.41 -32.06 -32.61 -33.182 -33.762 -34.243 -34.724 -35.216 -35.603 -36.008 -36.433 -36.854 -37.274 -37.564 -37.86 -38.328 -38.652 -38.995 -39.173 -39.527 -39.923 -40.338 -40.545 -40.967 -41.185 -41.426 -41.677 -42.187 -42.46 -42.769 -43.118 -43.523 -44.014 -44.682 -48.344 -8 ,10304 ,KEBNE ,17043688,Thu Dec 23 05:08:23 CET,Thu Dec 23 06:41:28 CET,0.0 1.527 1.98 2.276 2.49 2.687 2.855 2.994 3.25 3.362 3.469 3.52 3.781 3.879 4.055 4.205 4.356 4.432 4.561 4.69 4.878 4.985 5.088 5.228 5.355 5.481 5.58 5.647 5.724 5.779 5.818 5.872 5.911 5.943 5.972 5.991 6.021 6.035 6.001 5.94 5.863 5.753 5.562 5.302 4.951 4.474 3.761 2.764 1.344 -0.821 -4.368 -8.569 -11.975 -14.791 -17.173 -19.182 -20.87 -22.354 -23.585 -24.759 -25.718 -26.615 -27.492 -28.289 -29.013 -29.652 -30.317 -30.906 -31.418 -31.969 -32.534 -32.98 -33.416 -33.863 -34.21 -34.567 -34.958 -35.362 -35.77 -36.05 -36.337 -36.775 -37.103 -37.439 -37.6 -37.938 -38.275 -38.628 -38.816 -39.231 -39.447 -39.664 -39.891 -40.39 -40.672 -40.988 -41.334 -41.714 -42.218 -42.881 -45.442 -9 ,29199 ,KEBNE ,17043689,Thu Dec 23 05:09:26 CET,Thu Dec 23 06:42:47 CET,0.0 1.211 1.497 1.717 1.944 2.15 2.33 2.472 2.721 2.82 2.903 2.932 3.182 3.266 3.426 3.579 3.722 3.789 3.901 4.002 4.161 4.259 4.336 4.44 4.538 4.636 4.722 4.797 4.891 4.979 5.047 5.095 5.153 5.236 5.288 5.301 5.356 5.433 5.45 5.422 5.35 5.227 5.04 4.814 4.512 4.071 3.39 2.378 0.908 -1.284 -4.811 -9.029 -12.485 -15.318 -17.7 -19.716 -21.417 -22.982 -24.338 -25.601 -26.64 -27.564 -28.415 -29.231 -30.004 -30.679 -31.358 -31.962 -32.49 -33.016 -33.535 -33.981 -34.459 -34.96 -35.347 -35.719 -36.109 -36.533 -36.945 -37.226 -37.512 -37.957 -38.267 -38.575 -38.736 -39.071 -39.413 -39.785 -39.984 -40.398 -40.583 -40.796 -41.016 -41.517 -41.781 -42.072 -42.402 -42.76 -43.222 -43.826 -46.576 -10 ,18241 ,KEBNE ,17043690,Thu Dec 23 05:09:26 CET,Thu Dec 23 06:42:40 CET,0.0 1.247 1.587 1.851 2.053 2.2 2.352 2.494 2.746 2.844 2.933 2.958 3.202 3.272 3.4 3.505 3.6 3.648 3.74 3.824 3.948 4.034 4.117 4.221 4.314 4.409 4.503 4.588 4.687 4.79 4.881 4.978 5.071 5.141 5.207 5.281 5.349 5.404 5.449 5.477 5.465 5.415 5.311 5.149 4.888 4.526 3.95 3.051 1.786 -0.224 -3.92 -8.272 -11.692 -14.505 -16.835 -18.816 -20.473 -21.917 -23.158 -24.436 -25.481 -26.356 -27.201 -28.018 -28.786 -29.451 -30.102 -30.674 -31.178 -31.692 -32.229 -32.674 -33.132 -33.63 -34.024 -34.421 -34.821 -35.231 -35.661 -35.973 -36.284 -36.729 -37.031 -37.338 -37.498 -37.83 -38.172 -38.538 -38.72 -39.121 -39.304 -39.521 -39.758 -40.253 -40.525 -40.826 -41.157 -41.544 -42.006 -42.623 -44.659 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 1e52420e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,22481 ,TETRA ,17555652,Fri Nov 26 04:00:05 CET,Fri Nov 26 05:36:39 CET,0.0 0.929 1.191 1.425 1.641 1.833 2.018 2.188 2.478 2.623 2.773 2.895 3.191 3.331 3.629 3.896 4.145 4.271 4.519 4.751 5.092 5.324 5.546 5.87 6.204 6.545 6.877 7.199 7.626 8.045 8.447 8.945 9.435 9.908 10.46 11.115 11.758 12.444 13.174 13.95 14.806 15.8 16.996 18.215 19.629 21.13 22.727 24.481 26.551 28.83 31.23 32.564 32.907 32.804 32.503 32.135 31.692 31.252 30.79 30.221 29.67 29.085 28.502 27.977 27.473 27.023 26.529 26.07 25.641 25.182 24.713 24.322 23.909 23.448 23.09 22.729 22.393 22.03 21.634 21.368 21.092 20.651 20.332 20.027 19.867 19.483 19.073 18.663 18.461 18.089 17.736 17.468 17.182 16.603 16.272 15.838 15.384 14.855 14.105 12.9 0.723 -4 ,13322 ,TETRA ,17555654,Fri Nov 26 04:01:04 CET,Fri Nov 26 05:49:07 CET,0.0 0.401 0.687 0.915 1.141 1.364 1.564 1.745 2.082 2.237 2.389 2.537 2.855 3.006 3.292 3.564 3.818 3.947 4.206 4.462 4.865 5.123 5.367 5.727 6.079 6.429 6.782 7.154 7.647 8.113 8.583 9.168 9.74 10.301 10.921 11.594 12.25 12.996 13.788 14.625 15.519 16.488 17.631 18.83 20.241 21.834 23.617 25.508 27.653 30.049 32.623 34.291 34.708 34.54 33.961 33.238 32.669 32.123 31.59 30.961 30.413 29.906 29.318 28.734 28.203 27.747 27.315 26.874 26.442 26.01 25.58 25.211 24.805 24.356 24.014 23.697 23.354 22.995 22.635 22.379 22.106 21.662 21.358 21.065 20.916 20.559 20.113 19.608 19.33 18.89 18.43 18.145 17.876 17.17 16.73 16.24 15.664 14.936 14.094 12.89 5.092 -6 ,4038 ,TETRA ,17555656,Fri Nov 26 04:02:04 CET,Fri Nov 26 05:48:44 CET,0.0 0.583 0.842 1.052 1.236 1.428 1.627 1.798 2.086 2.233 2.388 2.523 2.826 2.96 3.218 3.479 3.736 3.862 4.112 4.364 4.728 4.966 5.201 5.552 5.897 6.239 6.593 6.938 7.369 7.814 8.247 8.764 9.258 9.729 10.299 10.912 11.512 12.237 13.056 13.916 14.852 15.95 17.152 18.271 19.502 20.888 22.541 24.418 26.578 29.126 31.816 33.104 33.389 33.343 33.119 32.572 31.843 31.158 30.544 29.928 29.438 28.926 28.304 27.676 27.091 26.538 25.949 25.432 25.002 24.59 24.204 23.866 23.513 23.132 22.809 22.469 22.109 21.736 21.359 21.099 20.82 20.397 20.11 19.799 19.633 19.275 18.899 18.491 18.269 17.881 17.512 17.254 17.002 16.384 16.014 15.601 15.109 14.503 13.701 12.63 -1.639 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836.txt deleted file mode 100644 index 612ff24b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,5695 ,KEBNE ,17043692,Thu Dec 23 05:09:26 CET,Thu Dec 23 06:42:22 CET,0.0 1.15 1.581 1.927 2.231 2.534 2.824 3.098 3.609 3.842 4.07 4.303 4.75 4.98 5.434 5.857 6.273 6.48 6.882 7.276 7.862 8.245 8.615 9.146 9.672 10.215 10.747 11.25 11.91 12.565 13.222 14.046 14.846 15.611 16.51 17.545 18.564 19.731 21.01 22.394 23.912 25.588 27.489 29.47 31.889 34.637 37.859 41.574 46.096 51.656 58.557 64.56 68.339 70.902 72.63 73.817 74.678 75.337 75.781 76.125 76.33 76.46 76.583 76.673 76.716 76.696 76.632 76.6 76.58 76.543 76.463 76.365 76.239 76.104 76.006 75.903 75.789 75.668 75.521 75.404 75.28 75.071 74.923 74.772 74.691 74.512 74.313 74.047 73.899 73.628 73.451 73.285 73.088 72.635 72.407 72.125 71.781 71.38 70.814 70.097 65.398 -4 ,22545 ,KEBNE ,17043694,Thu Dec 23 05:09:26 CET,Thu Dec 23 06:41:46 CET,0.0 0.93 1.31 1.638 1.955 2.271 2.562 2.823 3.324 3.557 3.802 4.079 4.536 4.774 5.213 5.637 6.051 6.251 6.647 7.031 7.61 8.007 8.383 8.935 9.473 9.995 10.515 11.023 11.701 12.385 13.058 13.863 14.628 15.366 16.264 17.304 18.308 19.41 20.632 22.005 23.505 25.26 27.353 29.495 32.084 35.082 38.618 42.705 47.685 53.434 60.352 66.482 70.197 72.631 74.347 75.614 76.448 76.997 77.42 77.781 78.008 78.133 78.187 78.162 78.099 78.027 77.918 77.804 77.704 77.593 77.447 77.323 77.196 77.078 76.976 76.842 76.675 76.5 76.321 76.186 76.046 75.837 75.699 75.574 75.51 75.327 75.106 74.85 74.717 74.458 74.277 74.107 73.926 73.508 73.281 73.02 72.701 72.337 71.834 71.049 62.168 -5 ,5507 ,KEBNE ,17043695,Thu Dec 23 05:09:26 CET,Thu Dec 23 06:42:11 CET,0.0 1.598 2.1 2.463 2.757 3.05 3.345 3.617 4.115 4.352 4.585 4.824 5.263 5.481 5.919 6.34 6.748 6.946 7.338 7.741 8.313 8.68 9.051 9.589 10.124 10.665 11.209 11.739 12.406 13.061 13.722 14.548 15.366 16.162 17.106 18.196 19.237 20.389 21.668 23.08 24.625 26.46 28.656 30.814 33.352 36.278 39.63 43.349 47.903 53.574 60.468 66.229 69.733 71.967 73.455 74.521 75.249 75.763 76.137 76.444 76.665 76.845 76.941 76.952 76.937 76.911 76.879 76.842 76.779 76.674 76.566 76.491 76.408 76.313 76.217 76.09 75.932 75.771 75.625 75.52 75.394 75.143 74.967 74.767 74.632 74.376 74.129 73.857 73.732 73.47 73.288 73.134 72.947 72.482 72.235 71.953 71.595 71.167 70.641 69.805 60.287 -6 ,12574 ,KEBNE ,17043696,Thu Dec 23 05:10:28 CET,Thu Dec 23 06:41:43 CET,0.0 1.521 2.008 2.366 2.696 3.016 3.323 3.615 4.143 4.396 4.642 4.89 5.339 5.563 5.995 6.415 6.835 7.047 7.463 7.867 8.453 8.844 9.228 9.784 10.341 10.884 11.399 11.909 12.605 13.292 13.959 14.804 15.645 16.458 17.434 18.535 19.589 20.764 22.09 23.561 25.122 26.921 29.104 31.249 33.646 36.292 39.397 43.152 47.709 53.251 60.313 66.259 69.944 72.483 74.09 75.165 75.953 76.524 76.904 77.295 77.631 77.837 77.929 77.901 77.835 77.804 77.817 77.829 77.801 77.726 77.614 77.521 77.427 77.311 77.219 77.121 76.985 76.816 76.637 76.516 76.382 76.157 75.992 75.821 75.732 75.546 75.361 75.152 75.033 74.778 74.635 74.488 74.315 73.895 73.664 73.357 72.956 72.465 71.908 71.209 67.06 -7 ,15912 ,KEBNE ,17043697,Thu Dec 23 05:10:29 CET,Thu Dec 23 06:41:49 CET,0.0 1.045 1.518 1.93 2.262 2.593 2.898 3.171 3.678 3.924 4.16 4.361 4.784 5.002 5.445 5.864 6.272 6.476 6.863 7.237 7.829 8.223 8.587 9.123 9.658 10.178 10.708 11.231 11.902 12.597 13.292 14.117 14.929 15.728 16.622 17.648 18.716 19.895 21.196 22.622 24.127 25.867 27.926 29.971 32.385 35.038 38.104 41.663 46.006 51.373 58.08 63.987 67.684 70.217 71.998 73.339 74.269 74.856 75.203 75.412 75.474 75.513 75.559 75.601 75.661 75.719 75.773 75.779 75.721 75.643 75.564 75.462 75.348 75.229 75.133 75.025 74.88 74.68 74.471 74.348 74.215 73.994 73.844 73.675 73.59 73.42 73.222 73.013 72.893 72.618 72.445 72.3 72.128 71.695 71.432 71.137 70.768 70.344 69.848 69.088 65.728 -8 ,20988 ,KEBNE ,17043698,Thu Dec 23 05:10:28 CET,Thu Dec 23 06:41:22 CET,0.0 1.211 1.704 2.122 2.492 2.816 3.113 3.394 3.955 4.238 4.498 4.765 5.229 5.473 5.949 6.376 6.798 7.015 7.414 7.793 8.377 8.751 9.126 9.68 10.2 10.733 11.296 11.863 12.604 13.334 14.033 14.845 15.62 16.429 17.431 18.524 19.569 20.755 22.073 23.502 24.993 26.625 28.559 30.596 33.07 35.807 38.895 42.564 47.067 52.643 59.844 66.086 69.973 72.562 74.267 75.478 76.328 76.987 77.481 77.835 77.978 78.01 78.057 78.101 78.126 78.158 78.157 78.13 78.083 78.007 77.898 77.807 77.726 77.627 77.534 77.428 77.29 77.124 76.934 76.768 76.576 76.309 76.148 75.968 75.872 75.668 75.403 75.116 74.972 74.697 74.512 74.334 74.147 73.674 73.375 73.054 72.648 72.144 71.54 70.707 64.396 -9 ,13462 ,KEBNE ,17043699,Thu Dec 23 05:10:28 CET,Thu Dec 23 06:43:20 CET,0.0 2.009 2.508 2.875 3.206 3.533 3.829 4.097 4.609 4.856 5.085 5.321 5.775 6.008 6.457 6.882 7.299 7.499 7.876 8.238 8.757 9.105 9.451 9.951 10.441 10.923 11.406 11.894 12.536 13.164 13.788 14.549 15.29 16.011 16.861 17.837 18.81 19.911 21.131 22.46 23.866 25.492 27.443 29.465 31.956 34.813 38.118 41.951 46.55 52.23 59.332 65.465 69.274 71.714 73.246 74.278 75.052 75.603 75.998 76.329 76.501 76.618 76.715 76.766 76.771 76.736 76.685 76.641 76.572 76.489 76.411 76.322 76.233 76.119 76.023 75.925 75.777 75.625 75.493 75.389 75.261 75.05 74.907 74.755 74.671 74.493 74.312 74.106 73.991 73.737 73.555 73.386 73.206 72.8 72.568 72.279 71.942 71.534 71.013 70.357 66.815 -10 ,24429 ,KEBNE ,17043700,Thu Dec 23 05:10:28 CET,Thu Dec 23 06:42:36 CET,0.0 1.295 1.868 2.239 2.583 2.892 3.172 3.432 3.927 4.171 4.409 4.638 5.074 5.287 5.707 6.109 6.502 6.695 7.064 7.444 8.018 8.389 8.753 9.285 9.812 10.328 10.843 11.347 12.004 12.684 13.357 14.162 14.948 15.711 16.628 17.703 18.725 19.883 21.185 22.548 23.963 25.56 27.444 29.366 31.667 34.355 37.576 41.283 45.83 51.511 58.834 65.325 69.184 71.535 73.12 74.347 75.191 75.784 76.162 76.433 76.581 76.684 76.736 76.724 76.709 76.67 76.618 76.535 76.444 76.36 76.254 76.138 76.018 75.881 75.777 75.683 75.565 75.435 75.294 75.185 75.08 74.914 74.772 74.589 74.476 74.258 74.05 73.819 73.699 73.446 73.265 73.104 72.949 72.578 72.325 72.04 71.719 71.349 70.893 70.144 58.51 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index cec425fc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8106 ,TETRA ,17555661,Fri Nov 26 04:02:07 CET,Fri Nov 26 05:48:13 CET,0.0 0.842 1.132 1.413 1.663 1.888 2.1 2.317 2.731 2.922 3.118 3.278 3.683 3.863 4.218 4.596 4.973 5.151 5.501 5.849 6.361 6.693 7.019 7.494 7.96 8.428 8.899 9.366 9.989 10.6 11.179 11.884 12.597 13.322 14.197 15.225 16.224 17.356 18.594 19.9 21.324 22.952 24.867 26.767 28.943 31.442 34.512 38.321 42.896 48.108 54.118 59.07 61.967 63.685 64.903 65.781 66.237 66.37 66.316 66.173 66.042 65.967 65.908 65.78 65.648 65.529 65.411 65.303 65.15 64.937 64.655 64.4 64.13 63.821 63.576 63.326 63.093 62.868 62.573 62.345 62.118 61.772 61.542 61.312 61.196 60.938 60.659 60.368 60.206 59.881 59.645 59.443 59.255 58.796 58.502 58.186 57.793 57.275 56.652 55.686 49.429 -5 ,30883 ,TETRA ,17555665,Fri Nov 26 04:04:04 CET,Fri Nov 26 05:49:55 CET,0.0 0.537 0.815 1.068 1.322 1.57 1.799 2.031 2.486 2.69 2.888 3.061 3.47 3.659 4.036 4.411 4.768 4.944 5.299 5.645 6.144 6.478 6.817 7.327 7.822 8.309 8.8 9.285 9.925 10.56 11.189 11.974 12.74 13.495 14.397 15.432 16.458 17.61 18.883 20.242 21.719 23.451 25.471 27.405 29.588 32.102 35.08 38.535 42.848 48.198 54.757 60.401 63.529 65.159 66.132 66.854 67.314 67.569 67.752 67.845 67.831 67.751 67.548 67.299 67.064 66.828 66.612 66.412 66.221 66.034 65.8 65.584 65.355 65.105 64.912 64.72 64.522 64.314 64.092 63.921 63.736 63.423 63.189 62.938 62.807 62.523 62.225 61.924 61.76 61.446 61.179 60.942 60.705 60.201 59.88 59.519 59.12 58.598 57.858 56.831 45.835 -7 ,924 ,TETRA ,17555667,Fri Nov 26 04:04:07 CET,Fri Nov 26 05:49:51 CET,0.0 0.528 0.854 1.145 1.378 1.604 1.834 2.057 2.472 2.662 2.851 3.027 3.443 3.633 3.999 4.352 4.709 4.883 5.228 5.571 6.087 6.438 6.774 7.261 7.745 8.22 8.696 9.162 9.764 10.379 10.997 11.731 12.429 13.139 13.985 14.951 15.919 16.999 18.173 19.413 20.743 22.264 24.088 26.004 28.283 30.939 34.055 37.629 41.937 47.05 53.376 58.675 61.544 63.271 64.514 65.426 66.049 66.385 66.533 66.599 66.567 66.45 66.259 66.107 65.963 65.788 65.619 65.448 65.306 65.159 64.946 64.718 64.453 64.19 63.986 63.76 63.515 63.263 63.01 62.832 62.638 62.359 62.166 61.95 61.828 61.525 61.226 60.949 60.803 60.47 60.206 60.011 59.787 59.211 58.865 58.542 58.221 57.837 57.239 56.227 47.621 -8 ,16355 ,TETRA ,17555668,Fri Nov 26 04:04:04 CET,Fri Nov 26 05:40:15 CET,0.0 0.78 1.085 1.374 1.63 1.875 2.103 2.323 2.743 2.944 3.14 3.312 3.716 3.908 4.302 4.679 5.04 5.217 5.578 5.927 6.432 6.763 7.088 7.572 8.068 8.574 9.074 9.571 10.218 10.848 11.467 12.209 12.929 13.65 14.508 15.48 16.436 17.532 18.684 19.834 21.063 22.475 24.166 25.933 28.048 30.443 33.261 36.475 40.436 45.351 51.442 56.776 60.007 62.167 63.725 64.842 65.598 66.164 66.538 66.734 66.648 66.469 66.29 66.047 65.815 65.651 65.515 65.398 65.243 65.027 64.771 64.539 64.297 64.06 63.856 63.635 63.405 63.163 62.931 62.758 62.568 62.262 62.03 61.769 61.645 61.41 61.126 60.794 60.617 60.269 59.964 59.745 59.539 59.002 58.663 58.283 57.852 57.314 56.648 55.708 49.987 -9 ,16037 ,TETRA ,17555669,Fri Nov 26 04:05:04 CET,Fri Nov 26 05:51:12 CET,0.0 0.838 1.135 1.407 1.671 1.91 2.131 2.352 2.802 3.017 3.22 3.391 3.798 3.991 4.37 4.727 5.075 5.262 5.644 5.997 6.505 6.838 7.167 7.662 8.155 8.64 9.118 9.593 10.225 10.863 11.483 12.246 13.003 13.733 14.588 15.57 16.535 17.629 18.833 20.133 21.472 22.876 24.506 26.23 28.267 30.6 33.38 36.568 40.46 45.311 51.381 56.48 59.663 61.895 63.353 64.326 65.033 65.571 65.814 65.828 65.728 65.566 65.35 65.116 64.897 64.679 64.428 64.212 64.028 63.808 63.564 63.379 63.172 62.927 62.736 62.534 62.333 62.126 61.87 61.684 61.482 61.142 60.918 60.69 60.567 60.294 59.983 59.635 59.441 59.086 58.815 58.6 58.368 57.799 57.484 57.109 56.688 56.165 55.398 54.344 43.838 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 6d9ae20e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15097 ,TETRA ,17555671,Fri Nov 26 04:05:04 CET,Fri Nov 26 05:55:18 CET,0.0 1.176 1.674 2.122 2.504 2.846 3.167 3.456 4.007 4.267 4.52 4.811 5.279 5.513 5.968 6.406 6.821 7.028 7.435 7.827 8.418 8.809 9.187 9.733 10.28 10.827 11.35 11.87 12.579 13.264 13.933 14.771 15.58 16.366 17.301 18.364 19.369 20.432 21.593 22.862 24.217 25.807 27.703 29.584 31.8 34.346 37.341 40.889 45.207 50.465 57.158 62.931 66.367 68.58 70.124 71.232 72.016 72.588 73.003 73.285 73.38 73.414 73.414 73.42 73.398 73.311 73.17 73.009 72.897 72.802 72.701 72.611 72.51 72.392 72.284 72.188 72.089 71.967 71.81 71.697 71.593 71.413 71.269 71.113 71.028 70.844 70.638 70.407 70.269 69.998 69.899 69.756 69.59 69.211 68.976 68.712 68.386 67.951 67.411 66.552 61.672 -2 ,7443 ,TETRA ,17555672,Fri Nov 26 04:06:04 CET,Fri Nov 26 05:58:24 CET,0.0 1.476 1.972 2.388 2.789 3.138 3.435 3.73 4.299 4.56 4.818 5.08 5.522 5.749 6.234 6.716 7.174 7.389 7.835 8.302 8.94 9.348 9.752 10.336 10.91 11.478 12.045 12.605 13.33 14.052 14.771 15.629 16.444 17.24 18.161 19.231 20.305 21.505 22.821 24.238 25.777 27.525 29.462 31.326 33.537 36.089 39.086 42.641 47.036 52.391 59.166 64.98 68.684 71.25 73.035 74.285 75.06 75.562 75.965 76.349 76.59 76.748 76.873 76.971 77.041 77.083 77.09 77.046 76.97 76.89 76.765 76.607 76.453 76.342 76.246 76.139 76.024 75.866 75.685 75.553 75.42 75.216 75.061 74.885 74.781 74.57 74.346 74.093 73.96 73.689 73.482 73.282 73.093 72.629 72.339 72.048 71.728 71.323 70.774 69.909 65.192 -3 ,23232 ,TETRA ,17555673,Fri Nov 26 04:07:04 CET,Fri Nov 26 05:44:48 CET,0.0 1.083 1.574 2.008 2.409 2.735 3.025 3.323 3.88 4.129 4.385 4.662 5.123 5.373 5.853 6.308 6.757 6.977 7.416 7.848 8.465 8.865 9.265 9.872 10.45 11.013 11.584 12.148 12.908 13.656 14.37 15.251 16.091 16.884 17.82 18.902 19.96 21.157 22.502 23.945 25.462 27.213 29.277 31.409 33.989 36.96 40.515 44.423 48.857 54.226 60.94 66.589 69.964 72.187 73.736 74.868 75.677 76.302 76.728 77.047 77.223 77.253 77.238 77.25 77.288 77.315 77.312 77.277 77.218 77.125 77.005 76.902 76.805 76.674 76.542 76.4 76.251 76.068 75.837 75.689 75.55 75.301 75.105 74.895 74.791 74.586 74.357 74.099 73.949 73.668 73.534 73.368 73.16 72.658 72.378 72.083 71.767 71.4 70.895 70.067 66.262 -4 ,32471 ,TETRA ,17555674,Fri Nov 26 04:08:04 CET,Fri Nov 26 05:58:36 CET,0.0 1.879 2.564 3.106 3.518 3.884 4.224 4.519 5.066 5.323 5.581 5.86 6.312 6.543 7.0 7.439 7.877 8.098 8.535 8.956 9.579 9.979 10.362 10.929 11.503 12.079 12.649 13.206 13.924 14.64 15.351 16.225 17.077 17.894 18.863 19.976 21.068 22.296 23.64 25.117 26.711 28.526 30.682 32.876 35.349 38.099 41.248 44.746 49.036 54.256 61.013 67.137 70.848 73.221 74.67 75.581 76.162 76.543 76.855 77.113 77.296 77.472 77.598 77.656 77.642 77.571 77.439 77.306 77.218 77.117 76.997 76.88 76.732 76.566 76.436 76.303 76.128 75.927 75.721 75.57 75.41 75.148 74.951 74.747 74.641 74.428 74.231 73.983 73.848 73.571 73.383 73.224 73.07 72.657 72.411 72.157 71.831 71.474 71.038 70.276 60.374 -5 ,4726 ,TETRA ,17555675,Fri Nov 26 04:09:05 CET,Fri Nov 26 05:56:08 CET,0.0 1.105 1.689 2.144 2.512 2.879 3.216 3.508 4.06 4.32 4.573 4.846 5.301 5.536 6.012 6.466 6.896 7.111 7.533 7.946 8.548 8.946 9.345 9.944 10.536 11.102 11.653 12.203 12.909 13.592 14.285 15.146 15.968 16.756 17.669 18.69 19.697 20.863 22.149 23.57 25.108 26.903 29.047 31.201 33.713 36.427 39.54 43.136 47.436 52.618 59.032 64.554 67.988 70.344 71.997 73.107 73.741 74.111 74.392 74.657 74.813 74.913 74.977 75.006 74.991 74.919 74.863 74.826 74.745 74.617 74.483 74.375 74.23 74.053 73.931 73.812 73.687 73.551 73.399 73.291 73.18 72.988 72.85 72.709 72.634 72.469 72.267 72.047 71.927 71.654 71.422 71.206 71.003 70.609 70.387 70.105 69.765 69.373 68.803 67.989 57.641 -6 ,14350 ,TETRA ,17555676,Fri Nov 26 04:09:05 CET,Fri Nov 26 05:59:23 CET,0.0 1.388 1.916 2.353 2.727 3.071 3.384 3.68 4.227 4.483 4.737 5.0 5.45 5.691 6.174 6.623 7.057 7.278 7.715 8.147 8.789 9.215 9.618 10.199 10.78 11.333 11.867 12.392 13.066 13.74 14.408 15.188 15.944 16.719 17.638 18.688 19.712 20.852 22.118 23.51 24.966 26.592 28.542 30.619 33.2 36.054 39.292 42.964 47.353 52.658 59.346 65.043 68.288 70.243 71.504 72.405 73.045 73.478 73.767 73.991 74.155 74.245 74.287 74.31 74.291 74.253 74.175 74.103 74.067 74.005 73.896 73.786 73.686 73.562 73.442 73.316 73.181 73.034 72.881 72.771 72.635 72.412 72.261 72.108 72.023 71.83 71.612 71.346 71.189 70.894 70.683 70.501 70.333 69.938 69.689 69.434 69.108 68.675 68.198 67.52 63.998 -7 ,5623 ,TETRA ,17555677,Fri Nov 26 04:09:07 CET,Fri Nov 26 05:56:49 CET,0.0 1.423 1.955 2.387 2.778 3.141 3.455 3.762 4.323 4.581 4.849 5.149 5.614 5.856 6.32 6.772 7.203 7.418 7.856 8.276 8.878 9.268 9.635 10.171 10.707 11.252 11.793 12.323 13.047 13.738 14.397 15.205 16.004 16.799 17.72 18.773 19.814 20.972 22.275 23.712 25.209 26.904 28.916 30.974 33.4 36.035 38.991 42.351 46.421 51.467 58.042 63.771 67.283 69.681 71.315 72.407 73.074 73.593 73.954 74.18 74.312 74.388 74.433 74.459 74.45 74.421 74.386 74.379 74.352 74.266 74.149 74.027 73.897 73.773 73.658 73.528 73.386 73.215 73.019 72.865 72.705 72.458 72.281 72.103 72.0 71.775 71.547 71.301 71.179 70.923 70.731 70.544 70.359 69.959 69.742 69.515 69.223 68.804 68.316 67.611 62.482 -8 ,6574 ,TETRA ,17555678,Fri Nov 26 04:09:04 CET,Fri Nov 26 05:59:42 CET,0.0 1.223 1.728 2.128 2.457 2.772 3.073 3.36 3.902 4.148 4.389 4.668 5.136 5.371 5.799 6.22 6.657 6.873 7.293 7.7 8.304 8.71 9.112 9.702 10.266 10.779 11.28 11.787 12.455 13.146 13.806 14.557 15.283 15.988 16.82 17.776 18.694 19.707 20.841 22.126 23.544 25.194 27.137 29.133 31.558 34.312 37.607 41.561 46.366 51.987 58.598 64.112 67.449 69.581 70.996 72.001 72.634 73.019 73.26 73.412 73.537 73.621 73.622 73.648 73.741 73.805 73.817 73.788 73.704 73.582 73.468 73.363 73.233 73.126 73.028 72.9 72.764 72.598 72.413 72.287 72.16 71.963 71.821 71.672 71.602 71.452 71.267 71.046 70.923 70.649 70.484 70.334 70.171 69.707 69.433 69.163 68.829 68.458 67.955 67.149 59.038 -10 ,487 ,TETRA ,17555680,Fri Nov 26 04:11:05 CET,Fri Nov 26 06:04:14 CET,0.0 1.341 1.842 2.23 2.577 2.926 3.253 3.56 4.139 4.406 4.666 4.96 5.417 5.655 6.131 6.586 7.014 7.229 7.648 8.054 8.66 9.064 9.474 10.077 10.655 11.211 11.767 12.329 13.064 13.772 14.466 15.316 16.165 16.998 17.983 19.098 20.153 21.358 22.723 24.209 25.782 27.535 29.578 31.619 33.943 36.536 39.632 43.393 47.9 53.219 60.02 66.04 69.603 71.796 73.228 74.194 74.82 75.256 75.484 75.595 75.665 75.727 75.782 75.828 75.836 75.77 75.657 75.565 75.474 75.342 75.162 74.989 74.805 74.612 74.457 74.296 74.162 74.029 73.873 73.774 73.668 73.485 73.342 73.193 73.122 72.949 72.738 72.53 72.416 72.143 71.97 71.785 71.592 71.169 70.907 70.6 70.279 69.838 69.247 68.584 63.906 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 14f7425b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,968 ,KEBNE ,17043701,Thu Dec 23 05:10:29 CET,Thu Dec 23 06:45:28 CET,0.0 1.688 2.169 2.522 2.823 3.077 3.322 3.557 3.943 4.127 4.301 4.39 4.81 4.963 5.252 5.561 5.87 6.012 6.274 6.528 6.916 7.163 7.389 7.719 8.066 8.419 8.759 9.073 9.48 9.876 10.262 10.757 11.25 11.732 12.262 12.843 13.419 14.08 14.823 15.568 16.335 17.254 18.381 19.549 20.957 22.539 24.275 26.167 28.318 30.76 33.665 35.85 37.1 37.806 38.081 38.159 38.107 37.978 37.788 37.657 37.574 37.431 37.288 37.097 36.855 36.605 36.342 36.118 35.915 35.679 35.432 35.234 35.006 34.769 34.599 34.409 34.179 33.937 33.69 33.523 33.347 33.061 32.849 32.621 32.5 32.248 32.025 31.792 31.637 31.252 31.145 30.983 30.789 30.385 30.163 29.889 29.576 29.19 28.701 28.082 25.268 -2 ,19495 ,KEBNE ,17043702,Thu Dec 23 05:10:29 CET,Thu Dec 23 06:45:08 CET,0.0 1.411 1.922 2.357 2.712 2.982 3.208 3.438 3.888 4.092 4.284 4.402 4.824 4.993 5.324 5.635 5.941 6.096 6.379 6.659 7.079 7.354 7.613 7.963 8.3 8.615 8.927 9.259 9.694 10.095 10.466 10.917 11.358 11.818 12.401 13.051 13.662 14.306 14.974 15.69 16.472 17.412 18.504 19.569 20.819 22.27 23.94 25.732 27.873 30.343 33.181 35.535 36.745 37.325 37.574 37.691 37.712 37.723 37.718 37.564 37.353 37.143 36.916 36.705 36.472 36.237 35.992 35.757 35.561 35.348 35.103 34.891 34.651 34.397 34.207 34.001 33.786 33.57 33.358 33.214 33.042 32.774 32.594 32.396 32.283 32.056 31.829 31.569 31.422 31.05 30.951 30.789 30.601 30.17 29.928 29.67 29.401 29.069 28.659 28.051 25.241 -3 ,28067 ,KEBNE ,17043703,Thu Dec 23 05:10:29 CET,Thu Dec 23 06:45:19 CET,0.0 1.429 1.921 2.247 2.543 2.816 3.063 3.316 3.787 3.998 4.194 4.311 4.729 4.898 5.257 5.594 5.893 6.038 6.324 6.599 6.994 7.238 7.472 7.826 8.177 8.526 8.868 9.196 9.614 10.015 10.411 10.904 11.378 11.836 12.374 12.989 13.586 14.21 14.863 15.592 16.388 17.278 18.325 19.394 20.678 22.14 23.786 25.625 27.877 30.463 33.326 35.564 36.865 37.63 37.927 38.071 38.112 37.99 37.81 37.599 37.377 37.195 37.017 36.79 36.571 36.353 36.092 35.861 35.661 35.443 35.207 34.998 34.786 34.551 34.367 34.185 33.97 33.708 33.424 33.238 33.042 32.741 32.509 32.25 32.126 31.877 31.583 31.242 31.062 30.658 30.438 30.209 29.982 29.485 29.24 28.972 28.664 28.325 27.876 27.183 24.797 -4 ,616 ,KEBNE ,17043704,Thu Dec 23 05:10:29 CET,Thu Dec 23 06:45:36 CET,0.0 1.764 2.13 2.419 2.713 2.973 3.204 3.399 3.776 3.969 4.145 4.217 4.641 4.807 5.109 5.393 5.666 5.792 6.027 6.258 6.616 6.847 7.067 7.393 7.715 8.026 8.326 8.609 8.967 9.322 9.679 10.112 10.522 10.942 11.438 12.003 12.55 13.138 13.789 14.543 15.377 16.258 17.273 18.312 19.561 21.004 22.643 24.53 26.845 29.53 32.69 35.322 36.775 37.529 37.794 37.894 37.909 37.886 37.79 37.536 37.296 37.069 36.833 36.606 36.368 36.145 35.893 35.672 35.478 35.273 35.043 34.81 34.584 34.349 34.142 33.933 33.744 33.542 33.299 33.118 32.923 32.614 32.399 32.186 32.072 31.833 31.586 31.295 31.13 30.74 30.599 30.393 30.153 29.631 29.357 29.079 28.763 28.398 27.964 27.296 24.062 -5 ,14675 ,KEBNE ,17043705,Thu Dec 23 05:10:28 CET,Thu Dec 23 06:45:41 CET,0.0 1.954 2.404 2.76 3.091 3.371 3.617 3.858 4.293 4.485 4.673 4.815 5.24 5.408 5.72 6.001 6.277 6.417 6.688 6.938 7.31 7.557 7.803 8.175 8.547 8.902 9.232 9.556 9.972 10.358 10.75 11.245 11.698 12.15 12.69 13.284 13.845 14.461 15.138 15.885 16.677 17.59 18.672 19.776 21.067 22.5 24.161 25.984 28.074 30.617 33.804 36.373 37.687 38.403 38.747 38.791 38.681 38.55 38.419 38.245 38.03 37.808 37.585 37.347 37.123 36.888 36.632 36.403 36.178 35.96 35.754 35.576 35.371 35.145 34.963 34.765 34.55 34.304 34.065 33.893 33.694 33.398 33.186 32.953 32.836 32.587 32.308 32.012 31.859 31.462 31.274 31.068 30.846 30.329 30.039 29.768 29.481 29.146 28.711 28.036 25.519 -6 ,18051 ,KEBNE ,17043706,Thu Dec 23 05:10:29 CET,Thu Dec 23 06:45:21 CET,0.0 1.649 2.122 2.514 2.818 3.071 3.3 3.51 3.917 4.114 4.308 4.413 4.824 4.989 5.29 5.585 5.883 6.029 6.319 6.6 6.988 7.233 7.476 7.839 8.177 8.51 8.845 9.166 9.582 9.971 10.35 10.834 11.303 11.764 12.312 12.934 13.54 14.188 14.873 15.624 16.406 17.291 18.329 19.351 20.635 22.092 23.697 25.499 27.657 30.198 33.219 35.6 36.773 37.27 37.424 37.472 37.424 37.338 37.209 37.035 36.859 36.647 36.398 36.115 35.801 35.499 35.193 34.933 34.702 34.435 34.137 33.886 33.629 33.365 33.136 32.873 32.629 32.394 32.131 31.95 31.785 31.535 31.341 31.111 30.998 30.767 30.514 30.254 30.111 29.75 29.659 29.512 29.36 28.944 28.687 28.422 28.123 27.774 27.393 26.836 24.514 -7 ,16252 ,KEBNE ,17043707,Thu Dec 23 05:10:29 CET,Thu Dec 23 06:44:00 CET,0.0 1.344 1.687 2.027 2.37 2.687 2.94 3.162 3.578 3.77 3.966 4.094 4.509 4.665 4.985 5.321 5.621 5.754 6.027 6.306 6.698 6.938 7.184 7.54 7.882 8.217 8.54 8.85 9.266 9.693 10.098 10.581 11.076 11.532 12.05 12.656 13.203 13.827 14.554 15.288 16.015 16.872 17.901 18.883 20.049 21.38 22.932 24.758 26.867 29.316 32.219 34.555 35.726 36.239 36.49 36.562 36.434 36.295 36.163 35.96 35.751 35.551 35.336 35.105 34.887 34.676 34.428 34.183 33.992 33.788 33.539 33.319 33.082 32.842 32.647 32.439 32.221 31.986 31.74 31.571 31.39 31.091 30.89 30.675 30.561 30.323 30.073 29.816 29.676 29.311 29.212 29.04 28.83 28.362 28.125 27.869 27.572 27.202 26.734 26.094 23.808 -8 ,21328 ,KEBNE ,17043708,Thu Dec 23 05:10:29 CET,Thu Dec 23 06:44:56 CET,0.0 1.633 2.122 2.456 2.749 3.037 3.284 3.515 3.932 4.13 4.332 4.453 4.878 5.049 5.372 5.688 5.99 6.136 6.423 6.688 7.057 7.3 7.546 7.914 8.264 8.609 8.952 9.291 9.713 10.107 10.492 10.964 11.45 11.932 12.478 13.079 13.66 14.312 15.012 15.774 16.585 17.49 18.595 19.719 20.989 22.42 24.12 25.956 28.049 30.642 33.544 35.658 36.841 37.46 37.714 37.796 37.766 37.643 37.504 37.348 37.154 36.984 36.814 36.584 36.353 36.147 35.922 35.717 35.537 35.316 35.065 34.879 34.682 34.458 34.294 34.143 33.939 33.693 33.47 33.325 33.171 32.92 32.734 32.534 32.434 32.216 31.983 31.737 31.608 31.249 31.139 30.973 30.784 30.369 30.136 29.858 29.569 29.188 28.721 28.172 26.234 -9 ,29959 ,KEBNE ,17043709,Thu Dec 23 05:10:28 CET,Thu Dec 23 06:45:07 CET,0.0 1.867 2.34 2.731 3.066 3.335 3.573 3.803 4.218 4.41 4.603 4.742 5.184 5.366 5.681 5.971 6.269 6.414 6.681 6.929 7.307 7.565 7.815 8.173 8.528 8.86 9.168 9.482 9.902 10.294 10.672 11.125 11.553 11.976 12.463 13.005 13.522 14.099 14.754 15.472 16.228 17.082 18.082 19.094 20.243 21.533 23.117 24.959 27.139 29.665 32.667 34.969 35.953 36.496 36.862 36.997 36.967 36.86 36.734 36.517 36.265 36.019 35.783 35.536 35.279 35.053 34.819 34.563 34.331 34.107 33.865 33.636 33.389 33.149 32.961 32.765 32.563 32.349 32.116 31.948 31.772 31.494 31.297 31.088 30.97 30.718 30.474 30.204 30.055 29.699 29.616 29.451 29.277 28.893 28.666 28.42 28.157 27.837 27.445 26.863 24.92 -10 ,3262 ,KEBNE ,17043710,Thu Dec 23 05:10:29 CET,Thu Dec 23 06:44:00 CET,0.0 1.537 2.026 2.322 2.594 2.856 3.083 3.3 3.69 3.874 4.058 4.174 4.589 4.732 5.013 5.312 5.592 5.731 6.038 6.337 6.751 7.021 7.289 7.686 8.077 8.463 8.808 9.107 9.498 9.889 10.286 10.759 11.22 11.682 12.206 12.8 13.367 13.977 14.633 15.388 16.239 17.188 18.31 19.46 20.761 22.184 23.811 25.664 27.862 30.385 33.393 35.517 36.422 36.94 37.293 37.461 37.385 37.177 36.976 36.752 36.504 36.253 35.987 35.715 35.462 35.202 34.895 34.607 34.362 34.122 33.865 33.617 33.335 33.053 32.842 32.614 32.37 32.105 31.813 31.623 31.435 31.146 30.936 30.701 30.574 30.289 29.987 29.649 29.46 29.048 28.844 28.629 28.397 27.878 27.614 27.324 26.979 26.583 26.06 25.317 22.653 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index beb5fd6e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6639 ,KEBNE ,17069374,Fri Dec 24 02:09:37 CET,Fri Dec 24 03:40:58 CET,0.0 0.443 0.759 1.035 1.303 1.558 1.822 2.08 2.571 2.805 3.034 3.259 3.734 3.952 4.389 4.828 5.268 5.486 5.917 6.354 6.99 7.413 7.837 8.455 9.046 9.618 10.203 10.804 11.606 12.398 13.187 14.176 15.127 16.037 17.126 18.379 19.623 21.016 22.551 24.257 26.097 28.195 30.717 33.342 36.48 40.094 44.35 49.216 55.03 62.171 71.526 79.924 85.128 88.482 90.623 91.952 92.752 93.217 93.534 93.815 93.849 93.734 93.54 93.352 93.246 93.15 92.979 92.765 92.563 92.333 92.08 91.876 91.651 91.382 91.162 90.959 90.741 90.495 90.253 90.075 89.867 89.511 89.225 88.929 88.789 88.464 88.098 87.73 87.542 87.193 86.854 86.592 86.293 85.606 85.212 84.732 84.183 83.511 82.754 81.507 73.139 -4 ,19250 ,KEBNE ,17069377,Fri Dec 24 02:13:56 CET,Fri Dec 24 03:44:38 CET,0.0 0.605 0.981 1.268 1.532 1.803 2.064 2.32 2.817 3.045 3.272 3.467 3.928 4.154 4.617 5.064 5.491 5.704 6.137 6.571 7.217 7.641 8.061 8.684 9.299 9.908 10.497 11.078 11.87 12.673 13.448 14.355 15.23 16.106 17.173 18.382 19.556 20.901 22.399 24.038 25.787 27.824 30.31 32.855 35.808 39.126 42.968 47.417 53.013 59.943 69.117 77.311 82.303 85.644 87.904 89.327 89.933 90.228 90.38 90.362 90.271 90.132 89.942 89.759 89.552 89.334 89.112 88.892 88.672 88.447 88.246 88.097 87.938 87.754 87.579 87.378 87.155 86.901 86.62 86.41 86.194 85.879 85.657 85.406 85.284 85.034 84.763 84.456 84.258 83.89 83.585 83.325 83.024 82.3 81.903 81.471 80.875 80.137 79.236 77.773 65.468 -7 ,11085 ,KEBNE ,17069380,Fri Dec 24 02:26:47 CET,Fri Dec 24 03:59:02 CET,0.0 0.742 1.068 1.349 1.619 1.89 2.146 2.405 2.915 3.159 3.394 3.628 4.114 4.341 4.792 5.245 5.692 5.909 6.356 6.807 7.46 7.897 8.329 8.959 9.591 10.221 10.837 11.445 12.262 13.065 13.853 14.829 15.784 16.725 17.862 19.203 20.508 21.933 23.493 25.174 26.973 29.131 31.758 34.388 37.429 40.798 44.649 49.11 54.58 61.327 70.128 77.933 82.906 86.376 88.713 90.374 91.557 92.417 92.945 93.33 93.529 93.572 93.509 93.376 93.214 93.023 92.792 92.579 92.357 92.094 91.805 91.552 91.297 91.01 90.762 90.502 90.24 89.936 89.611 89.395 89.156 88.751 88.479 88.217 88.079 87.76 87.407 87.001 86.786 86.429 86.047 85.768 85.477 84.703 84.214 83.601 82.83 81.834 80.524 78.778 66.879 -8 ,32482 ,KEBNE ,17069381,Fri Dec 24 02:26:47 CET,Fri Dec 24 03:57:38 CET,0.0 0.488 0.81 1.102 1.374 1.631 1.876 2.127 2.623 2.865 3.1 3.324 3.797 4.017 4.458 4.891 5.32 5.534 5.96 6.377 6.988 7.406 7.827 8.452 9.076 9.687 10.263 10.829 11.603 12.377 13.149 14.123 15.099 16.053 17.177 18.493 19.796 21.239 22.793 24.437 26.201 28.301 30.889 33.491 36.587 40.171 44.293 49.194 55.24 62.439 71.73 79.872 84.871 88.173 90.373 91.962 93.064 93.773 94.151 94.408 94.516 94.494 94.483 94.489 94.424 94.344 94.214 94.038 93.909 93.776 93.601 93.43 93.225 93.024 92.858 92.68 92.515 92.333 92.121 91.938 91.753 91.474 91.252 90.995 90.865 90.582 90.267 89.965 89.806 89.478 89.224 89.014 88.761 88.206 87.903 87.544 87.149 86.634 85.857 84.603 77.722 -9 ,16417 ,KEBNE ,17069382,Fri Dec 24 02:27:53 CET,Fri Dec 24 04:00:47 CET,0.0 0.591 0.885 1.171 1.455 1.719 1.967 2.208 2.683 2.921 3.156 3.374 3.85 4.08 4.537 4.983 5.42 5.638 6.074 6.504 7.126 7.524 7.922 8.525 9.113 9.703 10.293 10.874 11.645 12.405 13.152 14.076 14.986 15.887 16.965 18.219 19.474 20.88 22.435 24.165 26.089 28.329 31.02 33.82 37.132 40.958 45.5 50.557 56.519 63.868 73.216 81.314 86.284 89.241 90.977 92.105 92.869 93.426 93.757 94.0 94.079 94.073 94.052 93.942 93.764 93.566 93.311 93.066 92.867 92.653 92.427 92.251 92.039 91.806 91.608 91.4 91.176 90.893 90.594 90.384 90.142 89.762 89.503 89.196 89.032 88.715 88.369 87.973 87.775 87.418 87.108 86.865 86.591 85.922 85.452 84.943 84.494 84.0 83.248 82.042 71.161 -10 ,6270 ,KEBNE ,17069383,Fri Dec 24 02:27:52 CET,Fri Dec 24 04:00:56 CET,0.0 0.798 1.127 1.428 1.701 1.96 2.22 2.473 2.977 3.228 3.482 3.728 4.209 4.447 4.901 5.355 5.813 6.033 6.46 6.891 7.53 7.953 8.373 9.002 9.63 10.26 10.877 11.48 12.294 13.099 13.886 14.855 15.821 16.78 17.912 19.21 20.474 21.901 23.508 25.262 27.17 29.379 31.85 34.294 37.241 40.59 44.568 49.193 54.786 61.746 70.669 78.576 83.614 87.045 89.448 91.171 92.148 92.53 92.612 92.599 92.475 92.29 92.125 91.943 91.743 91.559 91.35 91.126 90.912 90.679 90.419 90.195 89.944 89.657 89.403 89.12 88.869 88.62 88.316 88.1 87.864 87.486 87.236 86.984 86.845 86.532 86.206 85.816 85.603 85.254 84.936 84.688 84.43 83.853 83.485 83.037 82.509 81.756 80.882 79.573 67.037 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index b5900f4a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32190 ,TETRA ,17555681,Fri Nov 26 04:11:04 CET,Fri Nov 26 05:47:57 CET,0.0 0.329 0.43 0.511 0.571 0.635 0.709 0.777 0.902 0.959 1.014 0.995 1.174 1.228 1.334 1.431 1.521 1.563 1.645 1.731 1.874 1.965 2.044 2.168 2.286 2.385 2.488 2.587 2.711 2.829 2.94 3.095 3.258 3.407 3.569 3.75 3.91 4.079 4.286 4.522 4.755 5.034 5.346 5.63 6.004 6.394 6.763 7.026 7.17 7.14 6.563 5.045 3.536 2.273 1.094 -0.244 -1.659 -2.949 -4.039 -5.083 -5.936 -6.704 -7.475 -8.228 -8.943 -9.591 -10.242 -10.806 -11.32 -11.862 -12.412 -12.893 -13.417 -13.975 -14.395 -14.828 -15.294 -15.751 -16.214 -16.544 -16.897 -17.507 -17.955 -18.406 -18.64 -19.147 -19.714 -20.278 -20.531 -20.951 -21.414 -21.771 -22.145 -22.916 -23.362 -23.897 -24.494 -25.232 -26.165 -27.538 -33.213 -3 ,24841 ,TETRA ,17555683,Fri Nov 26 04:14:06 CET,Fri Nov 26 06:00:53 CET,0.0 0.329 0.448 0.553 0.646 0.712 0.784 0.872 1.017 1.077 1.144 1.138 1.313 1.363 1.456 1.542 1.622 1.659 1.728 1.802 1.917 1.994 2.065 2.173 2.285 2.388 2.497 2.607 2.735 2.847 2.97 3.134 3.274 3.413 3.587 3.778 3.97 4.186 4.406 4.642 4.871 5.132 5.447 5.748 6.086 6.423 6.718 6.939 7.071 6.936 6.264 4.904 3.498 2.269 1.075 -0.199 -1.424 -2.601 -3.649 -4.678 -5.555 -6.355 -7.099 -7.747 -8.447 -9.201 -9.965 -10.611 -11.176 -11.747 -12.342 -12.861 -13.38 -13.89 -14.292 -14.728 -15.168 -15.627 -16.127 -16.473 -16.817 -17.36 -17.753 -18.176 -18.393 -18.841 -19.387 -19.959 -20.255 -20.73 -21.255 -21.613 -21.995 -22.813 -23.29 -23.821 -24.432 -25.17 -26.062 -27.392 -34.119 -4 ,12213 ,TETRA ,17555684,Fri Nov 26 04:13:06 CET,Fri Nov 26 06:01:56 CET,0.0 0.497 0.621 0.728 0.817 0.903 0.976 1.038 1.148 1.2 1.248 1.215 1.395 1.446 1.542 1.636 1.728 1.771 1.863 1.955 2.075 2.153 2.23 2.343 2.451 2.554 2.654 2.752 2.883 3.006 3.134 3.296 3.452 3.596 3.75 3.939 4.13 4.342 4.568 4.815 5.085 5.38 5.74 6.076 6.405 6.71 6.95 7.121 7.248 7.249 6.74 5.527 4.143 2.805 1.584 0.385 -0.715 -1.797 -2.818 -3.839 -4.671 -5.461 -6.265 -6.994 -7.67 -8.302 -8.959 -9.571 -10.118 -10.689 -11.279 -11.772 -12.29 -12.806 -13.225 -13.674 -14.104 -14.547 -15.026 -15.357 -15.687 -16.208 -16.59 -16.989 -17.197 -17.671 -18.152 -18.647 -18.936 -19.378 -19.862 -20.192 -20.556 -21.459 -22.007 -22.609 -23.233 -23.948 -24.918 -26.255 -31.52 -5 ,10168 ,TETRA ,17555685,Fri Nov 26 04:13:05 CET,Fri Nov 26 05:45:01 CET,0.0 0.171 0.274 0.376 0.462 0.53 0.598 0.664 0.782 0.836 0.89 0.858 1.033 1.079 1.182 1.284 1.366 1.41 1.496 1.573 1.691 1.772 1.85 1.964 2.067 2.166 2.269 2.377 2.518 2.641 2.767 2.93 3.086 3.238 3.402 3.577 3.744 3.931 4.14 4.363 4.597 4.849 5.126 5.41 5.759 6.144 6.507 6.814 7.1 7.152 6.691 5.375 3.81 2.363 1.086 -0.051 -1.098 -2.126 -3.029 -4.015 -4.893 -5.682 -6.502 -7.256 -7.923 -8.571 -9.285 -9.923 -10.463 -11.012 -11.61 -12.106 -12.61 -13.146 -13.55 -13.955 -14.379 -14.83 -15.3 -15.627 -15.966 -16.476 -16.84 -17.247 -17.463 -17.893 -18.372 -18.909 -19.17 -19.6 -20.067 -20.381 -20.73 -21.559 -22.047 -22.625 -23.324 -24.123 -25.062 -26.551 -34.459 -6 ,30714 ,TETRA ,17555686,Fri Nov 26 04:15:05 CET,Fri Nov 26 06:03:13 CET,0.0 0.3 0.433 0.537 0.629 0.713 0.781 0.841 0.957 1.02 1.084 1.072 1.246 1.292 1.393 1.504 1.607 1.655 1.747 1.838 1.973 2.064 2.153 2.284 2.407 2.526 2.631 2.715 2.815 2.919 3.021 3.158 3.307 3.448 3.603 3.778 3.935 4.102 4.287 4.488 4.71 4.973 5.304 5.59 5.902 6.225 6.519 6.794 6.972 6.879 6.325 5.133 3.811 2.499 1.145 -0.109 -1.208 -2.207 -3.106 -4.074 -4.874 -5.62 -6.368 -7.118 -7.876 -8.536 -9.187 -9.8 -10.326 -10.845 -11.402 -11.881 -12.393 -12.919 -13.314 -13.728 -14.172 -14.607 -15.113 -15.517 -15.936 -16.592 -17.042 -17.489 -17.705 -18.157 -18.613 -19.095 -19.366 -19.781 -20.185 -20.493 -20.821 -21.467 -21.856 -22.35 -22.9 -23.528 -24.373 -25.808 -31.204 -8 ,11164 ,TETRA ,17555688,Fri Nov 26 04:16:06 CET,Fri Nov 26 06:04:07 CET,0.0 0.161 0.269 0.355 0.436 0.514 0.58 0.643 0.763 0.82 0.874 0.87 1.058 1.112 1.21 1.303 1.395 1.437 1.526 1.618 1.74 1.819 1.899 2.017 2.132 2.251 2.37 2.477 2.62 2.752 2.873 3.025 3.163 3.293 3.464 3.66 3.831 4.016 4.209 4.441 4.71 5.019 5.366 5.671 5.996 6.373 6.832 7.188 7.368 7.321 6.854 5.77 4.565 3.212 1.75 0.444 -0.724 -1.858 -2.908 -3.964 -4.849 -5.622 -6.373 -7.073 -7.777 -8.471 -9.157 -9.778 -10.333 -10.912 -11.514 -12.005 -12.516 -13.061 -13.455 -13.86 -14.289 -14.743 -15.229 -15.559 -15.897 -16.421 -16.806 -17.232 -17.45 -17.881 -18.34 -18.847 -19.129 -19.573 -20.044 -20.415 -20.825 -21.694 -22.181 -22.778 -23.475 -24.291 -25.334 -26.826 -35.167 -9 ,2893 ,TETRA ,17555689,Fri Nov 26 04:18:06 CET,Fri Nov 26 06:07:48 CET,0.0 0.247 0.365 0.455 0.539 0.612 0.672 0.736 0.865 0.926 0.984 0.961 1.137 1.19 1.297 1.394 1.484 1.531 1.621 1.703 1.832 1.914 1.99 2.096 2.194 2.299 2.401 2.493 2.619 2.749 2.874 3.031 3.188 3.33 3.473 3.636 3.817 4.016 4.224 4.43 4.648 4.915 5.232 5.571 5.941 6.282 6.63 6.902 7.136 7.217 6.728 5.737 4.608 3.374 2.235 1.149 0.143 -0.813 -1.672 -2.583 -3.439 -4.233 -4.981 -5.729 -6.459 -7.102 -7.744 -8.348 -8.905 -9.435 -10.001 -10.489 -10.986 -11.519 -11.926 -12.362 -12.817 -13.267 -13.745 -14.081 -14.427 -14.978 -15.354 -15.729 -15.937 -16.399 -16.849 -17.321 -17.588 -18.029 -18.547 -18.909 -19.298 -20.189 -20.718 -21.306 -21.893 -22.544 -23.488 -24.894 -32.469 -10 ,11499 ,TETRA ,17555690,Fri Nov 26 04:18:08 CET,Fri Nov 26 06:06:05 CET,0.0 0.291 0.45 0.548 0.627 0.702 0.77 0.831 0.948 1.008 1.069 1.055 1.224 1.278 1.386 1.482 1.576 1.625 1.726 1.821 1.949 2.036 2.125 2.25 2.369 2.486 2.599 2.712 2.855 2.996 3.133 3.3 3.461 3.612 3.801 4.018 4.22 4.432 4.669 4.937 5.221 5.545 5.922 6.293 6.692 7.124 7.62 8.154 8.58 8.567 7.847 6.644 5.438 4.192 2.91 1.592 0.363 -0.722 -1.687 -2.747 -3.661 -4.493 -5.338 -6.163 -6.906 -7.565 -8.277 -8.94 -9.512 -10.074 -10.654 -11.163 -11.702 -12.228 -12.62 -13.028 -13.477 -13.958 -14.441 -14.775 -15.121 -15.672 -16.077 -16.492 -16.698 -17.119 -17.578 -18.048 -18.289 -18.703 -19.128 -19.438 -19.788 -20.608 -21.049 -21.5 -22.057 -22.727 -23.62 -25.046 -32.061 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index ce2d89f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14415 ,TETRA ,17555691,Fri Nov 26 04:19:06 CET,Fri Nov 26 06:09:58 CET,0.0 0.427 0.621 0.783 0.933 1.066 1.199 1.317 1.506 1.599 1.695 1.757 1.969 2.06 2.236 2.391 2.534 2.6 2.715 2.827 3.006 3.128 3.252 3.423 3.583 3.732 3.874 4.029 4.233 4.407 4.572 4.783 4.987 5.184 5.411 5.654 5.875 6.111 6.362 6.631 6.909 7.214 7.558 7.884 8.228 8.585 8.963 9.308 9.589 9.769 9.511 8.63 7.54 6.444 5.374 4.292 3.353 2.528 1.771 0.973 0.28 -0.339 -0.939 -1.516 -2.032 -2.482 -2.96 -3.404 -3.793 -4.192 -4.624 -4.993 -5.36 -5.748 -6.059 -6.364 -6.696 -7.068 -7.443 -7.693 -7.955 -8.361 -8.636 -8.943 -9.113 -9.473 -9.834 -10.195 -10.387 -10.737 -11.09 -11.33 -11.586 -12.167 -12.502 -12.886 -13.34 -13.858 -14.555 -15.508 -19.254 -2 ,8759 ,TETRA ,17555692,Fri Nov 26 04:19:06 CET,Fri Nov 26 06:09:02 CET,0.0 0.537 0.809 0.98 1.113 1.255 1.39 1.516 1.748 1.848 1.938 1.985 2.195 2.281 2.445 2.596 2.728 2.791 2.918 3.054 3.258 3.376 3.478 3.63 3.789 3.934 4.072 4.209 4.381 4.546 4.714 4.92 5.106 5.28 5.492 5.729 5.946 6.174 6.419 6.677 6.952 7.268 7.614 7.911 8.257 8.642 9.0 9.316 9.542 9.594 9.305 8.46 7.451 6.323 5.329 4.506 3.724 2.974 2.311 1.618 1.022 0.488 -0.076 -0.631 -1.141 -1.634 -2.156 -2.611 -3.001 -3.424 -3.892 -4.261 -4.615 -5.0 -5.315 -5.646 -6.005 -6.368 -6.725 -6.98 -7.247 -7.683 -8.023 -8.365 -8.525 -8.846 -9.161 -9.514 -9.724 -10.066 -10.372 -10.611 -10.857 -11.438 -11.77 -12.14 -12.614 -13.187 -13.775 -14.575 -17.487 -3 ,24438 ,TETRA ,17555693,Fri Nov 26 04:21:07 CET,Fri Nov 26 06:10:02 CET,0.0 0.811 1.062 1.264 1.416 1.572 1.721 1.838 2.056 2.157 2.253 2.309 2.519 2.593 2.732 2.871 3.0 3.059 3.171 3.293 3.494 3.618 3.733 3.89 4.041 4.181 4.303 4.427 4.598 4.761 4.918 5.118 5.295 5.468 5.672 5.872 6.064 6.282 6.533 6.777 7.023 7.303 7.599 7.904 8.241 8.568 8.908 9.279 9.599 9.707 9.348 8.52 7.486 6.337 5.419 4.502 3.544 2.655 1.87 1.09 0.443 -0.147 -0.722 -1.251 -1.739 -2.19 -2.652 -3.057 -3.433 -3.828 -4.21 -4.541 -4.905 -5.294 -5.587 -5.879 -6.191 -6.513 -6.864 -7.108 -7.371 -7.793 -8.072 -8.375 -8.534 -8.881 -9.25 -9.619 -9.815 -10.135 -10.405 -10.644 -10.913 -11.482 -11.789 -12.137 -12.521 -13.014 -13.625 -14.607 -19.564 -4 ,13024 ,TETRA ,17555694,Fri Nov 26 04:21:07 CET,Fri Nov 26 06:10:42 CET,0.0 0.494 0.704 0.869 1.011 1.149 1.263 1.375 1.596 1.697 1.79 1.844 2.05 2.122 2.267 2.406 2.542 2.608 2.737 2.871 3.047 3.148 3.255 3.412 3.566 3.714 3.853 3.985 4.144 4.301 4.465 4.673 4.869 5.048 5.261 5.499 5.718 5.973 6.232 6.506 6.797 7.104 7.452 7.794 8.173 8.542 8.934 9.336 9.627 9.661 9.305 8.438 7.394 6.233 5.246 4.395 3.647 2.898 2.144 1.376 0.711 0.117 -0.451 -0.998 -1.512 -1.976 -2.465 -2.908 -3.287 -3.698 -4.143 -4.512 -4.876 -5.245 -5.543 -5.853 -6.185 -6.544 -6.906 -7.146 -7.4 -7.812 -8.114 -8.441 -8.599 -8.915 -9.255 -9.618 -9.818 -10.166 -10.465 -10.698 -10.966 -11.583 -11.914 -12.281 -12.709 -13.226 -13.866 -14.683 -17.785 -5 ,1432 ,TETRA ,17555695,Fri Nov 26 04:24:09 CET,Fri Nov 26 06:13:29 CET,0.0 0.471 0.752 0.944 1.089 1.21 1.331 1.457 1.66 1.753 1.846 1.909 2.123 2.203 2.341 2.475 2.616 2.686 2.82 2.935 3.085 3.19 3.287 3.427 3.567 3.705 3.836 3.957 4.118 4.281 4.437 4.604 4.76 4.92 5.107 5.315 5.516 5.736 5.958 6.2 6.448 6.706 6.999 7.295 7.634 7.943 8.238 8.544 8.778 8.865 8.562 7.613 6.478 5.314 4.245 3.305 2.446 1.557 0.718 -0.104 -0.773 -1.411 -2.031 -2.586 -3.096 -3.569 -4.07 -4.503 -4.873 -5.274 -5.691 -6.034 -6.376 -6.723 -7.002 -7.297 -7.612 -7.949 -8.307 -8.548 -8.798 -9.194 -9.482 -9.788 -9.938 -10.259 -10.619 -11.004 -11.192 -11.51 -11.795 -12.023 -12.297 -13.002 -13.358 -13.706 -14.126 -14.585 -15.119 -15.989 -19.712 -6 ,1522 ,TETRA ,17555696,Fri Nov 26 04:24:12 CET,Fri Nov 26 06:14:25 CET,0.0 0.531 0.766 0.942 1.109 1.251 1.376 1.502 1.731 1.835 1.933 1.979 2.18 2.266 2.441 2.593 2.737 2.805 2.934 3.062 3.241 3.355 3.468 3.642 3.817 3.973 4.117 4.251 4.415 4.576 4.736 4.922 5.093 5.265 5.47 5.7 5.929 6.161 6.407 6.68 6.946 7.256 7.61 7.939 8.298 8.685 9.103 9.512 9.835 9.964 9.71 8.69 7.494 6.387 5.271 4.224 3.285 2.398 1.651 0.908 0.233 -0.374 -0.937 -1.471 -1.965 -2.428 -2.918 -3.36 -3.748 -4.145 -4.571 -4.933 -5.301 -5.697 -6.009 -6.309 -6.627 -6.97 -7.337 -7.595 -7.858 -8.293 -8.593 -8.91 -9.079 -9.41 -9.756 -10.133 -10.343 -10.7 -11.007 -11.247 -11.528 -12.119 -12.444 -12.813 -13.219 -13.69 -14.256 -15.029 -17.935 -7 ,19973 ,TETRA ,17555697,Fri Nov 26 04:24:09 CET,Fri Nov 26 06:13:59 CET,0.0 0.936 1.19 1.356 1.498 1.634 1.751 1.86 2.078 2.176 2.268 2.333 2.549 2.628 2.777 2.914 3.04 3.102 3.233 3.37 3.557 3.676 3.794 3.963 4.13 4.293 4.438 4.565 4.74 4.918 5.077 5.277 5.488 5.677 5.895 6.141 6.371 6.625 6.886 7.147 7.419 7.74 8.104 8.439 8.815 9.185 9.561 9.977 10.342 10.551 10.508 10.008 9.182 8.003 6.753 5.589 4.577 3.712 2.928 2.123 1.453 0.87 0.307 -0.225 -0.732 -1.196 -1.665 -2.11 -2.506 -2.906 -3.309 -3.641 -3.999 -4.375 -4.661 -4.974 -5.321 -5.696 -6.094 -6.353 -6.608 -7.009 -7.293 -7.588 -7.753 -8.095 -8.442 -8.831 -9.037 -9.39 -9.713 -9.96 -10.206 -10.724 -11.045 -11.392 -11.779 -12.239 -12.818 -13.666 -17.531 -8 ,13930 ,TETRA ,17555698,Fri Nov 26 04:26:08 CET,Fri Nov 26 06:22:46 CET,0.0 0.597 0.861 1.061 1.201 1.331 1.457 1.563 1.77 1.873 1.965 2.014 2.223 2.302 2.444 2.582 2.725 2.795 2.932 3.065 3.248 3.359 3.471 3.627 3.779 3.931 4.075 4.206 4.384 4.566 4.725 4.909 5.105 5.292 5.5 5.742 5.971 6.225 6.496 6.779 7.061 7.37 7.721 8.02 8.326 8.672 9.032 9.372 9.666 9.791 9.614 8.912 7.949 6.943 5.941 4.964 4.093 3.224 2.493 1.789 1.151 0.575 -0.002 -0.573 -1.105 -1.591 -2.096 -2.545 -2.927 -3.324 -3.724 -4.063 -4.428 -4.776 -5.043 -5.368 -5.728 -6.085 -6.457 -6.706 -6.97 -7.411 -7.708 -8.015 -8.173 -8.521 -8.889 -9.249 -9.437 -9.774 -10.091 -10.328 -10.61 -11.252 -11.571 -11.92 -12.33 -12.808 -13.43 -14.308 -18.576 -9 ,27414 ,TETRA ,17555699,Fri Nov 26 04:26:08 CET,Fri Nov 26 06:17:11 CET,0.0 0.553 0.829 1.034 1.209 1.361 1.478 1.583 1.783 1.876 1.97 2.034 2.237 2.318 2.482 2.631 2.776 2.841 2.959 3.078 3.254 3.362 3.46 3.606 3.758 3.91 4.054 4.193 4.36 4.515 4.671 4.863 5.045 5.22 5.427 5.671 5.918 6.174 6.429 6.711 7.005 7.321 7.686 8.051 8.465 8.904 9.398 9.881 10.333 10.696 10.676 10.021 9.075 8.053 7.205 6.45 5.707 4.95 4.294 3.577 2.858 2.269 1.721 1.169 0.685 0.266 -0.195 -0.614 -0.981 -1.379 -1.783 -2.107 -2.45 -2.817 -3.095 -3.387 -3.694 -4.042 -4.423 -4.671 -4.934 -5.323 -5.582 -5.89 -6.061 -6.408 -6.765 -7.137 -7.329 -7.672 -8.006 -8.253 -8.51 -9.072 -9.38 -9.703 -10.074 -10.568 -11.228 -12.06 -15.961 -10 ,23416 ,TETRA ,17555700,Fri Nov 26 04:27:08 CET,Fri Nov 26 06:17:53 CET,0.0 0.584 0.776 0.962 1.115 1.245 1.373 1.489 1.695 1.785 1.875 1.917 2.12 2.194 2.349 2.511 2.654 2.719 2.843 2.977 3.179 3.298 3.404 3.558 3.711 3.854 4.0 4.146 4.326 4.5 4.669 4.873 5.067 5.254 5.476 5.703 5.895 6.11 6.351 6.606 6.865 7.153 7.496 7.803 8.15 8.525 8.885 9.355 9.872 10.225 10.286 9.357 8.116 7.058 6.17 5.264 4.336 3.457 2.653 1.836 1.148 0.542 -0.029 -0.572 -1.08 -1.537 -2.014 -2.455 -2.839 -3.257 -3.69 -4.036 -4.405 -4.796 -5.104 -5.416 -5.738 -6.08 -6.432 -6.681 -6.95 -7.363 -7.641 -7.937 -8.094 -8.418 -8.772 -9.163 -9.38 -9.728 -10.019 -10.253 -10.501 -11.074 -11.403 -11.794 -12.239 -12.681 -13.22 -14.046 -17.258 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 045c37e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11813 ,TETRA ,17555701,Fri Nov 26 04:27:08 CET,Fri Nov 26 06:12:41 CET,0.0 0.278 0.516 0.761 0.996 1.222 1.434 1.827 2.003 2.193 2.383 2.688 2.825 3.125 3.413 3.674 3.801 4.064 4.322 4.71 4.973 5.232 5.613 5.981 6.334 6.682 7.025 7.48 7.938 8.365 8.889 9.39 9.856 10.384 10.954 11.508 12.199 13.046 13.954 14.911 16.003 17.3 18.564 20.001 21.601 23.421 25.542 28.058 31.042 34.381 36.696 37.784 38.173 38.329 38.348 38.149 37.804 37.452 37.091 36.716 36.331 35.95 35.575 35.197 34.843 34.471 34.132 33.832 33.505 33.175 32.913 32.628 32.315 32.088 31.851 31.574 31.257 30.933 30.736 30.538 30.212 29.975 29.717 29.575 29.292 28.993 28.666 28.503 28.185 27.904 27.679 27.425 26.899 26.604 26.235 25.807 25.317 24.725 23.827 -2 ,16654 ,TETRA ,17555702,Fri Nov 26 04:28:08 CET,Fri Nov 26 06:13:56 CET,0.0 0.274 0.513 0.701 0.887 1.081 1.264 1.618 1.785 1.941 2.062 2.37 2.519 2.82 3.122 3.42 3.567 3.852 4.124 4.511 4.748 4.986 5.351 5.721 6.104 6.488 6.85 7.307 7.749 8.169 8.688 9.203 9.707 10.315 11.01 11.689 12.449 13.287 14.212 15.195 16.328 17.684 19.067 20.701 22.566 24.744 27.165 29.84 32.745 36.01 38.372 39.552 40.084 40.29 40.194 39.872 39.507 39.119 38.661 38.25 37.847 37.45 37.066 36.716 36.402 36.054 35.729 35.443 35.138 34.804 34.506 34.202 33.893 33.66 33.435 33.19 32.908 32.608 32.402 32.192 31.853 31.598 31.325 31.185 30.885 30.572 30.249 30.066 29.742 29.472 29.227 28.973 28.456 28.151 27.823 27.461 26.944 26.236 25.439 -3 ,12745 ,TETRA ,17555703,Fri Nov 26 04:29:08 CET,Fri Nov 26 06:15:38 CET,0.0 0.297 0.532 0.739 0.934 1.11 1.269 1.588 1.752 1.921 2.081 2.402 2.558 2.877 3.186 3.479 3.623 3.924 4.222 4.66 4.952 5.231 5.608 5.977 6.365 6.761 7.145 7.622 8.078 8.535 9.095 9.63 10.147 10.709 11.322 11.927 12.623 13.436 14.324 15.276 16.382 17.636 18.827 20.229 21.794 23.691 26.081 28.728 31.67 34.976 37.194 38.374 38.949 39.073 39.038 38.804 38.375 38.051 37.781 37.491 37.165 36.805 36.441 36.079 35.725 35.327 34.967 34.665 34.349 34.029 33.778 33.483 33.165 32.933 32.675 32.402 32.119 31.827 31.637 31.431 31.078 30.831 30.577 30.446 30.173 29.879 29.564 29.407 29.1 28.797 28.543 28.291 27.72 27.413 27.085 26.714 26.293 25.675 24.691 -4 ,27109 ,TETRA ,17555704,Fri Nov 26 04:29:08 CET,Fri Nov 26 06:16:12 CET,0.0 0.308 0.557 0.775 0.969 1.155 1.348 1.705 1.869 2.029 2.166 2.481 2.624 2.899 3.181 3.464 3.603 3.868 4.121 4.494 4.751 5.001 5.36 5.724 6.091 6.443 6.788 7.232 7.637 8.036 8.524 8.992 9.468 10.024 10.653 11.257 11.908 12.624 13.412 14.26 15.23 16.453 17.678 19.034 20.602 22.427 24.557 27.058 29.741 32.645 34.693 35.565 35.84 35.811 35.668 35.37 35.011 34.663 34.271 33.895 33.591 33.266 32.884 32.542 32.193 31.81 31.475 31.175 30.862 30.538 30.265 29.967 29.649 29.407 29.146 28.879 28.599 28.321 28.14 27.933 27.568 27.312 27.057 26.931 26.676 26.379 26.039 25.858 25.527 25.227 24.995 24.753 24.212 23.874 23.516 23.122 22.608 21.972 20.987 -5 ,7431 ,TETRA ,17555705,Fri Nov 26 04:29:08 CET,Fri Nov 26 06:17:00 CET,0.0 0.307 0.556 0.76 0.959 1.153 1.34 1.692 1.86 2.02 2.17 2.49 2.639 2.92 3.193 3.473 3.615 3.892 4.149 4.53 4.784 5.024 5.384 5.757 6.119 6.466 6.81 7.268 7.717 8.167 8.736 9.283 9.802 10.427 11.164 11.863 12.626 13.46 14.37 15.332 16.428 17.693 18.892 20.323 21.938 23.773 25.881 28.333 31.096 34.295 36.813 38.025 38.598 38.877 38.932 38.805 38.477 38.055 37.617 37.224 36.828 36.434 36.081 35.742 35.4 35.02 34.686 34.389 34.064 33.75 33.488 33.19 32.877 32.637 32.396 32.141 31.855 31.542 31.313 31.075 30.738 30.491 30.21 30.048 29.719 29.404 29.054 28.874 28.562 28.323 28.124 27.89 27.326 27.003 26.626 26.217 25.76 25.162 24.177 -6 ,10143 ,TETRA ,17555706,Fri Nov 26 04:30:08 CET,Fri Nov 26 06:16:43 CET,0.0 0.312 0.538 0.754 0.962 1.174 1.376 1.756 1.941 2.115 2.303 2.644 2.808 3.12 3.438 3.738 3.875 4.127 4.406 4.849 5.124 5.398 5.784 6.138 6.507 6.874 7.227 7.708 8.168 8.601 9.126 9.639 10.138 10.736 11.449 12.138 12.893 13.714 14.596 15.571 16.709 18.038 19.433 21.084 22.9 25.067 27.43 29.997 33.032 36.459 38.706 39.575 39.689 39.554 39.297 38.936 38.572 38.246 37.936 37.686 37.382 37.023 36.707 36.407 36.096 35.763 35.462 35.179 34.877 34.549 34.266 33.963 33.652 33.426 33.18 32.92 32.652 32.349 32.14 31.914 31.547 31.29 31.031 30.904 30.626 30.327 29.966 29.773 29.452 29.173 28.961 28.742 28.208 27.911 27.582 27.193 26.734 26.096 25.235 -7 ,30808 ,TETRA ,17555707,Fri Nov 26 04:30:11 CET,Fri Nov 26 06:16:51 CET,0.0 0.33 0.622 0.862 1.048 1.224 1.397 1.738 1.888 2.032 2.162 2.487 2.645 2.951 3.238 3.508 3.647 3.918 4.178 4.571 4.834 5.095 5.467 5.811 6.165 6.545 6.917 7.376 7.824 8.269 8.814 9.356 9.911 10.556 11.269 11.957 12.718 13.491 14.291 15.17 16.214 17.496 18.867 20.471 22.109 23.961 26.089 28.547 31.402 34.656 37.135 38.439 39.112 39.321 39.35 39.264 39.045 38.856 38.621 38.381 38.118 37.807 37.462 37.099 36.777 36.435 36.093 35.79 35.47 35.129 34.845 34.557 34.29 34.079 33.837 33.562 33.25 32.929 32.722 32.511 32.157 31.913 31.659 31.521 31.234 30.941 30.635 30.452 30.115 29.84 29.624 29.398 28.927 28.667 28.293 27.865 27.362 26.674 25.736 -8 ,8848 ,TETRA ,17555708,Fri Nov 26 04:30:08 CET,Fri Nov 26 06:17:03 CET,0.0 0.27 0.517 0.747 0.961 1.167 1.377 1.773 1.947 2.109 2.253 2.574 2.722 3.017 3.32 3.615 3.757 4.038 4.309 4.707 4.97 5.223 5.581 5.938 6.301 6.654 6.985 7.435 7.893 8.328 8.863 9.39 9.913 10.533 11.183 11.767 12.402 13.109 13.899 14.731 15.644 16.746 17.91 19.338 20.997 22.83 24.77 27.096 29.896 33.276 35.688 36.588 36.845 36.812 36.626 36.349 35.944 35.54 35.142 34.774 34.435 34.092 33.754 33.441 33.126 32.778 32.462 32.193 31.928 31.644 31.37 31.078 30.775 30.538 30.312 30.07 29.798 29.51 29.32 29.119 28.757 28.506 28.252 28.112 27.805 27.48 27.141 26.957 26.634 26.379 26.167 25.936 25.407 25.085 24.732 24.344 23.898 23.34 22.479 -9 ,4240 ,TETRA ,17555709,Fri Nov 26 04:31:11 CET,Fri Nov 26 06:17:21 CET,0.0 0.336 0.579 0.804 1.039 1.294 1.521 1.9 2.071 2.238 2.407 2.736 2.894 3.217 3.53 3.829 3.984 4.297 4.613 5.077 5.361 5.611 5.971 6.333 6.675 7.016 7.368 7.828 8.265 8.69 9.222 9.746 10.258 10.877 11.595 12.297 13.074 13.912 14.81 15.787 16.912 18.23 19.602 21.235 23.05 25.137 27.334 29.84 32.788 36.169 38.683 40.06 40.672 40.784 40.612 40.263 39.957 39.674 39.328 39.031 38.72 38.378 38.036 37.688 37.364 37.036 36.716 36.416 36.103 35.774 35.502 35.217 34.913 34.67 34.416 34.152 33.872 33.588 33.395 33.189 32.854 32.602 32.305 32.154 31.859 31.511 31.112 30.902 30.556 30.239 29.987 29.737 29.212 28.886 28.555 28.181 27.7 27.045 25.984 -10 ,18532 ,TETRA ,17555710,Fri Nov 26 04:31:11 CET,Fri Nov 26 06:16:27 CET,0.0 0.3 0.531 0.726 0.933 1.138 1.32 1.654 1.814 1.973 2.11 2.429 2.586 2.89 3.197 3.498 3.631 3.882 4.135 4.509 4.752 5.023 5.426 5.796 6.156 6.497 6.832 7.288 7.741 8.173 8.699 9.211 9.71 10.278 10.908 11.527 12.215 12.978 13.836 14.786 15.841 17.06 18.35 19.907 21.694 23.807 26.238 29.083 32.395 35.957 38.085 39.076 39.562 39.733 39.65 39.347 38.955 38.601 38.19 37.787 37.44 37.078 36.711 36.372 36.019 35.633 35.303 35.016 34.707 34.375 34.108 33.843 33.548 33.288 33.018 32.754 32.469 32.158 31.933 31.697 31.325 31.033 30.721 30.57 30.27 29.941 29.591 29.419 29.104 28.835 28.6 28.358 27.846 27.555 27.24 26.842 26.312 25.663 24.792 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt deleted file mode 100644 index 213f2873..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9355 ,TETRA ,17555711,Fri Nov 26 04:31:11 CET,Fri Nov 26 06:18:32 CET,0.0 0.97 1.286 1.549 1.799 2.03 2.256 2.474 2.831 2.996 3.157 3.301 3.602 3.729 3.991 4.252 4.506 4.629 4.857 5.077 5.408 5.621 5.826 6.123 6.414 6.694 6.979 7.268 7.631 8.0 8.359 8.776 9.166 9.551 10.023 10.528 11.014 11.55 12.139 12.791 13.44 14.175 15.032 15.842 16.746 17.768 18.848 19.767 20.682 21.45 21.642 20.864 19.519 17.988 16.526 15.06 13.667 12.392 11.304 10.274 9.403 8.609 7.831 7.073 6.362 5.71 5.025 4.41 3.858 3.306 2.752 2.291 1.833 1.357 0.977 0.597 0.205 -0.21 -0.63 -0.917 -1.21 -1.677 -2.001 -2.338 -2.518 -2.89 -3.271 -3.659 -3.857 -4.241 -4.477 -4.707 -4.948 -5.455 -5.725 -6.026 -6.373 -6.76 -7.182 -7.714 -10.678 -2 ,2055 ,TETRA ,17555712,Fri Nov 26 04:31:14 CET,Fri Nov 26 06:18:47 CET,0.0 1.03 1.454 1.796 2.06 2.283 2.472 2.656 3.03 3.201 3.369 3.526 3.846 3.99 4.269 4.532 4.764 4.878 5.101 5.309 5.633 5.858 6.089 6.45 6.801 7.132 7.457 7.773 8.174 8.595 9.0 9.441 9.883 10.324 10.806 11.334 11.82 12.337 12.902 13.531 14.19 14.9 15.723 16.581 17.53 18.518 19.64 20.849 22.005 22.819 22.926 21.8 20.137 18.419 16.859 15.332 13.969 12.687 11.578 10.478 9.503 8.631 7.816 7.048 6.298 5.61 4.899 4.269 3.736 3.194 2.615 2.123 1.635 1.133 0.736 0.339 -0.055 -0.454 -0.89 -1.198 -1.508 -1.986 -2.321 -2.66 -2.834 -3.19 -3.578 -4.008 -4.221 -4.626 -4.911 -5.145 -5.392 -5.916 -6.197 -6.512 -6.876 -7.296 -7.767 -8.417 -11.374 -3 ,22695 ,TETRA ,17555713,Fri Nov 26 04:32:12 CET,Fri Nov 26 06:25:07 CET,0.0 1.991 2.492 2.937 3.29 3.573 3.811 4.007 4.348 4.503 4.648 4.795 5.126 5.288 5.616 5.924 6.219 6.354 6.589 6.819 7.134 7.329 7.536 7.893 8.216 8.492 8.793 9.09 9.446 9.748 10.032 10.401 10.745 11.06 11.432 11.847 12.246 12.713 13.226 13.769 14.333 14.936 15.614 16.239 16.971 17.791 18.629 19.459 20.255 20.972 20.943 19.571 18.117 16.708 15.3 13.943 12.756 11.684 10.646 9.462 8.436 7.519 6.688 5.968 5.282 4.631 3.937 3.287 2.732 2.191 1.638 1.182 0.717 0.237 -0.128 -0.511 -0.939 -1.393 -1.839 -2.135 -2.445 -2.933 -3.282 -3.617 -3.783 -4.14 -4.491 -4.861 -5.061 -5.445 -5.685 -5.911 -6.163 -6.716 -7.006 -7.317 -7.652 -8.019 -8.434 -9.01 -13.291 -4 ,21455 ,TETRA ,17555714,Fri Nov 26 04:32:11 CET,Fri Nov 26 06:20:48 CET,0.0 1.925 2.266 2.541 2.758 2.932 3.094 3.253 3.552 3.694 3.829 3.928 4.226 4.351 4.585 4.804 5.03 5.141 5.348 5.549 5.854 6.057 6.261 6.57 6.863 7.136 7.39 7.64 7.985 8.32 8.657 9.08 9.47 9.835 10.28 10.791 11.259 11.762 12.323 12.937 13.566 14.271 15.072 15.867 16.773 17.734 18.748 19.851 20.886 21.666 21.863 20.791 19.211 17.491 15.845 14.386 13.118 11.881 10.789 9.694 8.699 7.803 6.966 6.157 5.41 4.745 4.046 3.432 2.913 2.373 1.829 1.389 0.924 0.448 0.083 -0.299 -0.704 -1.133 -1.575 -1.864 -2.156 -2.635 -2.981 -3.327 -3.502 -3.853 -4.226 -4.626 -4.825 -5.217 -5.487 -5.723 -5.977 -6.5 -6.782 -7.121 -7.476 -7.839 -8.322 -8.988 -12.478 -5 ,7963 ,TETRA ,17555715,Fri Nov 26 04:32:14 CET,Fri Nov 26 06:21:28 CET,0.0 1.86 2.291 2.612 2.873 3.111 3.307 3.474 3.786 3.948 4.118 4.259 4.558 4.697 4.98 5.229 5.437 5.543 5.776 6.006 6.336 6.554 6.757 7.04 7.336 7.635 7.944 8.255 8.637 8.992 9.321 9.717 10.125 10.515 10.946 11.455 11.937 12.425 12.978 13.595 14.237 14.927 15.641 16.312 17.086 17.916 18.734 19.517 20.224 20.827 21.182 20.449 19.005 17.297 15.695 14.174 12.802 11.526 10.443 9.358 8.384 7.518 6.666 5.855 5.117 4.474 3.826 3.234 2.725 2.18 1.611 1.152 0.67 0.131 -0.29 -0.701 -1.124 -1.561 -1.995 -2.291 -2.605 -3.098 -3.456 -3.819 -4.003 -4.366 -4.739 -5.148 -5.347 -5.741 -6.021 -6.261 -6.512 -7.033 -7.337 -7.675 -8.035 -8.449 -8.916 -9.519 -14.043 -6 ,11997 ,TETRA ,17555716,Fri Nov 26 04:33:12 CET,Fri Nov 26 06:21:07 CET,0.0 2.126 2.777 3.12 3.351 3.566 3.784 3.982 4.327 4.482 4.645 4.815 5.128 5.26 5.514 5.776 6.037 6.16 6.398 6.623 6.944 7.159 7.37 7.664 7.935 8.199 8.476 8.751 9.096 9.439 9.768 10.152 10.54 10.932 11.383 11.869 12.333 12.862 13.451 14.053 14.674 15.366 16.127 16.871 17.725 18.627 19.573 20.528 21.422 22.121 22.194 21.172 19.675 18.114 16.55 14.929 13.526 12.293 11.196 10.088 9.118 8.262 7.451 6.69 5.989 5.335 4.663 4.06 3.561 3.069 2.537 2.093 1.607 1.097 0.708 0.308 -0.095 -0.506 -0.939 -1.24 -1.555 -2.028 -2.359 -2.704 -2.87 -3.225 -3.616 -4.027 -4.235 -4.638 -4.916 -5.153 -5.405 -5.969 -6.261 -6.584 -6.947 -7.327 -7.777 -8.382 -10.473 -7 ,3144 ,TETRA ,17555717,Fri Nov 26 04:33:12 CET,Fri Nov 26 06:21:00 CET,0.0 1.573 2.064 2.42 2.69 2.925 3.136 3.334 3.685 3.855 4.019 4.158 4.465 4.604 4.872 5.122 5.359 5.475 5.718 5.975 6.373 6.62 6.842 7.165 7.465 7.752 8.03 8.288 8.62 8.972 9.322 9.733 10.142 10.526 10.963 11.481 11.987 12.515 13.044 13.618 14.22 14.895 15.708 16.475 17.277 18.168 19.169 20.164 21.082 21.824 22.022 20.777 19.206 17.638 16.083 14.535 13.121 11.839 10.728 9.624 8.631 7.703 6.805 6.003 5.277 4.619 3.954 3.345 2.816 2.252 1.66 1.211 0.756 0.274 -0.1 -0.496 -0.897 -1.319 -1.789 -2.119 -2.443 -2.938 -3.285 -3.624 -3.787 -4.129 -4.505 -4.899 -5.1 -5.492 -5.762 -5.998 -6.24 -6.764 -7.045 -7.343 -7.7 -8.089 -8.525 -9.131 -13.686 -8 ,5834 ,TETRA ,17555718,Fri Nov 26 04:37:12 CET,Fri Nov 26 06:14:13 CET,0.0 1.649 2.073 2.403 2.642 2.834 3.039 3.247 3.609 3.772 3.925 4.062 4.366 4.503 4.794 5.066 5.317 5.446 5.722 5.975 6.324 6.531 6.734 7.05 7.353 7.652 7.945 8.225 8.585 8.939 9.277 9.675 10.053 10.431 10.898 11.398 11.846 12.356 12.934 13.542 14.18 14.82 15.523 16.231 17.061 17.985 18.888 19.745 20.57 21.206 21.012 19.847 18.52 17.146 15.768 14.303 12.92 11.591 10.427 9.27 8.268 7.393 6.584 5.799 5.058 4.4 3.699 3.102 2.593 2.041 1.472 0.996 0.511 0.01 -0.37 -0.761 -1.177 -1.607 -2.037 -2.325 -2.618 -3.078 -3.406 -3.741 -3.911 -4.273 -4.645 -5.017 -5.217 -5.624 -5.882 -6.103 -6.339 -6.863 -7.156 -7.46 -7.806 -8.209 -8.66 -9.29 -13.13 -9 ,28569 ,TETRA ,17555719,Fri Nov 26 04:37:12 CET,Fri Nov 26 06:14:18 CET,0.0 1.414 1.884 2.292 2.582 2.788 2.988 3.185 3.523 3.666 3.81 3.945 4.256 4.402 4.706 4.978 5.243 5.376 5.63 5.873 6.218 6.447 6.666 6.962 7.236 7.505 7.79 8.062 8.405 8.744 9.051 9.392 9.721 10.044 10.418 10.835 11.223 11.633 12.102 12.622 13.153 13.737 14.419 15.1 15.84 16.604 17.402 18.249 19.094 19.582 19.533 18.488 17.084 15.689 14.293 12.884 11.573 10.315 9.163 8.004 7.02 6.158 5.319 4.509 3.766 3.108 2.416 1.808 1.295 0.744 0.162 -0.328 -0.83 -1.322 -1.7 -2.098 -2.527 -2.97 -3.402 -3.687 -3.979 -4.445 -4.757 -5.07 -5.235 -5.579 -5.964 -6.343 -6.538 -6.927 -7.154 -7.368 -7.601 -8.107 -8.403 -8.727 -9.066 -9.461 -9.914 -10.526 -14.117 -10 ,19527 ,TETRA ,17555720,Fri Nov 26 04:39:13 CET,Fri Nov 26 06:18:36 CET,0.0 1.462 1.843 2.2 2.517 2.793 3.032 3.227 3.579 3.749 3.916 4.07 4.393 4.549 4.845 5.118 5.381 5.51 5.748 5.974 6.331 6.573 6.818 7.177 7.524 7.863 8.202 8.524 8.898 9.243 9.571 9.972 10.342 10.718 11.155 11.577 11.98 12.432 12.921 13.42 13.927 14.515 15.201 15.921 16.741 17.536 18.356 19.225 20.019 20.6 20.7 19.82 18.526 17.099 15.79 14.562 13.217 11.88 10.789 9.717 8.747 7.84 7.002 6.229 5.493 4.809 4.127 3.531 2.999 2.445 1.868 1.407 0.938 0.459 0.077 -0.332 -0.728 -1.118 -1.557 -1.876 -2.187 -2.648 -2.97 -3.301 -3.474 -3.847 -4.237 -4.623 -4.824 -5.216 -5.495 -5.735 -5.967 -6.511 -6.82 -7.126 -7.44 -7.795 -8.244 -8.877 -12.09 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt deleted file mode 100644 index 36a61506..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10804 ,TETRA ,17555722,Fri Nov 26 04:38:12 CET,Fri Nov 26 06:16:24 CET,0.0 1.941 2.458 2.841 3.125 3.333 3.531 3.736 4.061 4.177 4.294 4.399 4.693 4.823 5.069 5.258 5.416 5.481 5.574 5.671 5.826 5.929 6.024 6.152 6.272 6.402 6.524 6.619 6.742 6.86 6.986 7.141 7.251 7.35 7.422 7.458 7.482 7.51 7.543 7.542 7.53 7.478 7.333 7.109 6.761 6.348 5.85 5.116 3.908 2.023 -0.985 -4.418 -7.147 -9.369 -11.239 -12.926 -14.362 -15.62 -16.727 -17.804 -18.694 -19.481 -20.226 -20.927 -21.579 -22.171 -22.79 -23.333 -23.785 -24.254 -24.746 -25.146 -25.552 -25.964 -26.277 -26.606 -26.937 -27.285 -27.647 -27.904 -28.182 -28.608 -28.879 -29.146 -29.29 -29.589 -29.89 -30.218 -30.4 -30.793 -30.97 -31.168 -31.382 -31.861 -32.103 -32.343 -32.621 -32.958 -33.377 -33.93 -35.892 -2 ,31990 ,TETRA ,17555723,Fri Nov 26 04:39:12 CET,Fri Nov 26 06:18:38 CET,0.0 2.545 3.174 3.577 3.894 4.14 4.336 4.541 4.965 5.127 5.276 5.412 5.714 5.839 6.067 6.275 6.455 6.547 6.735 6.902 7.136 7.278 7.399 7.576 7.723 7.854 7.978 8.061 8.16 8.249 8.319 8.394 8.477 8.556 8.614 8.653 8.698 8.737 8.74 8.718 8.674 8.612 8.474 8.298 8.018 7.571 6.983 6.167 4.894 2.975 -0.146 -3.885 -6.884 -9.284 -11.292 -13.024 -14.51 -15.847 -16.974 -18.091 -19.0 -19.766 -20.495 -21.185 -21.857 -22.503 -23.131 -23.65 -24.076 -24.511 -24.981 -25.361 -25.743 -26.145 -26.474 -26.822 -27.176 -27.533 -27.893 -28.127 -28.365 -28.74 -29.0 -29.278 -29.423 -29.717 -30.024 -30.343 -30.51 -30.904 -31.097 -31.315 -31.541 -31.995 -32.245 -32.537 -32.868 -33.255 -33.723 -34.291 -36.154 -3 ,11948 ,TETRA ,17555724,Fri Nov 26 04:39:13 CET,Fri Nov 26 06:18:36 CET,0.0 1.736 2.185 2.5 2.781 3.01 3.19 3.354 3.645 3.78 3.916 4.008 4.297 4.403 4.588 4.759 4.943 5.025 5.164 5.288 5.463 5.597 5.719 5.876 6.011 6.117 6.211 6.301 6.418 6.527 6.611 6.707 6.787 6.842 6.875 6.908 6.951 6.986 6.993 6.969 6.951 6.907 6.764 6.56 6.292 5.952 5.448 4.691 3.511 1.625 -1.576 -5.21 -8.061 -10.433 -12.395 -14.047 -15.447 -16.711 -17.769 -18.804 -19.68 -20.449 -21.191 -21.866 -22.472 -23.002 -23.546 -24.055 -24.507 -24.981 -25.468 -25.859 -26.249 -26.637 -26.952 -27.283 -27.626 -27.987 -28.365 -28.628 -28.89 -29.299 -29.585 -29.866 -30.014 -30.326 -30.634 -30.972 -31.168 -31.579 -31.782 -31.987 -32.211 -32.711 -32.98 -33.262 -33.575 -33.954 -34.43 -35.042 -36.979 -4 ,854 ,TETRA ,17555725,Fri Nov 26 04:39:13 CET,Fri Nov 26 06:17:48 CET,0.0 1.587 2.017 2.353 2.629 2.862 3.076 3.3 3.685 3.835 3.969 4.042 4.312 4.412 4.61 4.78 4.924 4.981 5.098 5.218 5.38 5.497 5.603 5.74 5.897 6.078 6.214 6.297 6.41 6.521 6.597 6.679 6.771 6.841 6.885 6.959 7.057 7.113 7.137 7.131 7.067 6.951 6.805 6.635 6.356 5.963 5.394 4.57 3.351 1.498 -1.558 -5.081 -7.946 -10.309 -12.294 -13.985 -15.408 -16.672 -17.74 -18.788 -19.719 -20.589 -21.42 -22.154 -22.775 -23.341 -23.929 -24.444 -24.892 -25.342 -25.805 -26.196 -26.602 -27.017 -27.334 -27.664 -28.004 -28.357 -28.72 -28.979 -29.238 -29.617 -29.889 -30.188 -30.349 -30.683 -30.999 -31.334 -31.523 -31.931 -32.161 -32.375 -32.585 -33.096 -33.384 -33.66 -33.939 -34.28 -34.726 -35.289 -38.394 -5 ,32585 ,TETRA ,17555726,Fri Nov 26 04:40:12 CET,Fri Nov 26 06:28:43 CET,0.0 2.232 2.719 3.056 3.333 3.557 3.755 3.918 4.195 4.323 4.448 4.519 4.806 4.909 5.07 5.214 5.348 5.423 5.558 5.675 5.84 5.948 6.043 6.155 6.279 6.398 6.485 6.565 6.668 6.754 6.833 6.915 6.98 7.03 7.078 7.114 7.133 7.146 7.139 7.153 7.134 7.04 6.903 6.708 6.432 6.072 5.508 4.695 3.494 1.677 -1.317 -4.828 -7.689 -10.101 -12.115 -13.848 -15.317 -16.631 -17.744 -18.809 -19.705 -20.477 -21.2 -21.892 -22.537 -23.108 -23.688 -24.216 -24.669 -25.13 -25.59 -25.968 -26.376 -26.803 -27.126 -27.461 -27.816 -28.19 -28.574 -28.841 -29.095 -29.47 -29.742 -30.027 -30.179 -30.486 -30.793 -31.11 -31.283 -31.677 -31.834 -32.023 -32.239 -32.717 -32.972 -33.255 -33.586 -33.932 -34.332 -34.937 -37.206 -6 ,32671 ,TETRA ,17555727,Fri Nov 26 04:41:11 CET,Fri Nov 26 06:29:36 CET,0.0 2.445 3.141 3.652 4.015 4.303 4.546 4.73 5.026 5.158 5.291 5.384 5.651 5.746 5.918 6.072 6.236 6.329 6.501 6.661 6.897 7.036 7.152 7.298 7.432 7.564 7.697 7.826 8.0 8.142 8.244 8.353 8.438 8.501 8.573 8.647 8.677 8.69 8.686 8.639 8.593 8.541 8.4 8.188 7.9 7.511 6.975 6.197 4.982 3.092 0.008 -3.58 -6.413 -8.709 -10.651 -12.378 -13.871 -15.164 -16.24 -17.311 -18.224 -19.031 -19.787 -20.483 -21.129 -21.71 -22.309 -22.829 -23.273 -23.728 -24.176 -24.538 -24.912 -25.301 -25.6 -25.911 -26.249 -26.61 -26.968 -27.21 -27.461 -27.848 -28.117 -28.403 -28.554 -28.856 -29.161 -29.475 -29.639 -30.023 -30.222 -30.467 -30.698 -31.172 -31.431 -31.701 -32.004 -32.37 -32.822 -33.479 -36.136 -7 ,9143 ,TETRA ,17555728,Fri Nov 26 04:41:11 CET,Fri Nov 26 06:21:09 CET,0.0 2.008 2.439 2.751 2.994 3.218 3.455 3.674 4.016 4.137 4.248 4.295 4.554 4.637 4.791 4.944 5.082 5.152 5.272 5.385 5.556 5.662 5.761 5.89 6.001 6.083 6.154 6.233 6.331 6.406 6.46 6.518 6.587 6.657 6.706 6.742 6.779 6.789 6.808 6.828 6.781 6.687 6.538 6.334 6.015 5.604 5.049 4.213 3.005 1.168 -1.876 -5.461 -8.311 -10.616 -12.551 -14.256 -15.688 -16.923 -17.973 -19.022 -19.906 -20.705 -21.477 -22.173 -22.788 -23.336 -23.929 -24.472 -24.934 -25.399 -25.866 -26.239 -26.639 -27.097 -27.465 -27.834 -28.2 -28.591 -29.008 -29.28 -29.577 -30.046 -30.34 -30.657 -30.83 -31.175 -31.512 -31.859 -32.047 -32.456 -32.68 -32.893 -33.131 -33.658 -33.927 -34.218 -34.55 -34.947 -35.395 -36.022 -38.481 -8 ,437 ,TETRA ,17555729,Fri Nov 26 04:42:11 CET,Fri Nov 26 06:21:07 CET,0.0 1.678 2.038 2.304 2.532 2.709 2.898 3.09 3.379 3.502 3.62 3.695 3.965 4.054 4.226 4.38 4.512 4.574 4.686 4.786 4.923 5.026 5.124 5.234 5.348 5.462 5.564 5.66 5.772 5.868 5.962 6.082 6.189 6.287 6.389 6.478 6.53 6.541 6.539 6.534 6.512 6.486 6.375 6.19 5.923 5.517 4.965 4.155 2.872 1.008 -2.09 -5.715 -8.529 -10.802 -12.724 -14.422 -15.886 -17.166 -18.255 -19.333 -20.255 -21.071 -21.851 -22.586 -23.24 -23.809 -24.382 -24.893 -25.33 -25.781 -26.247 -26.639 -27.044 -27.469 -27.805 -28.148 -28.499 -28.851 -29.21 -29.457 -29.711 -30.104 -30.376 -30.652 -30.794 -31.094 -31.407 -31.733 -31.894 -32.279 -32.475 -32.679 -32.881 -33.306 -33.545 -33.829 -34.155 -34.513 -34.959 -35.583 -38.102 -9 ,32705 ,TETRA ,17555730,Fri Nov 26 04:42:12 CET,Fri Nov 26 06:24:41 CET,0.0 2.104 2.675 3.064 3.312 3.508 3.691 3.852 4.14 4.263 4.373 4.429 4.705 4.805 4.971 5.113 5.257 5.33 5.473 5.591 5.726 5.82 5.926 6.098 6.276 6.449 6.598 6.726 6.867 7.013 7.169 7.338 7.48 7.581 7.667 7.716 7.741 7.751 7.751 7.738 7.675 7.575 7.424 7.239 6.985 6.654 6.138 5.338 4.111 2.184 -0.953 -4.576 -7.435 -9.724 -11.638 -13.341 -14.766 -16.046 -17.14 -18.189 -19.079 -19.847 -20.586 -21.289 -21.929 -22.491 -23.053 -23.579 -24.038 -24.486 -24.948 -25.339 -25.741 -26.166 -26.499 -26.836 -27.172 -27.499 -27.839 -28.089 -28.356 -28.771 -29.05 -29.331 -29.464 -29.756 -30.088 -30.42 -30.595 -30.996 -31.165 -31.345 -31.556 -32.03 -32.269 -32.554 -32.92 -33.318 -33.765 -34.389 -37.206 -10 ,30572 ,TETRA ,17555731,Fri Nov 26 04:42:12 CET,Fri Nov 26 06:33:30 CET,0.0 1.622 2.137 2.573 2.962 3.244 3.48 3.709 4.096 4.255 4.395 4.477 4.755 4.867 5.095 5.313 5.531 5.629 5.806 5.972 6.171 6.276 6.364 6.475 6.576 6.695 6.811 6.915 7.05 7.158 7.253 7.358 7.449 7.528 7.6 7.672 7.756 7.82 7.855 7.898 7.922 7.908 7.87 7.773 7.576 7.276 6.763 6.03 4.876 3.04 -0.011 -3.755 -6.805 -9.306 -11.381 -13.185 -14.728 -16.071 -17.17 -18.212 -19.093 -19.857 -20.571 -21.249 -21.868 -22.428 -23.016 -23.543 -23.986 -24.434 -24.898 -25.278 -25.678 -26.107 -26.438 -26.786 -27.137 -27.478 -27.819 -28.069 -28.332 -28.72 -28.996 -29.263 -29.398 -29.695 -30.018 -30.393 -30.595 -30.999 -31.196 -31.394 -31.602 -32.068 -32.326 -32.625 -32.934 -33.258 -33.668 -34.219 -36.223 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 74f27f78..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14307 ,TETRA ,17555732,Fri Nov 26 04:42:11 CET,Fri Nov 26 06:31:50 CET,0.0 0.87 1.278 1.61 1.901 2.166 2.407 2.628 3.04 3.234 3.421 3.661 3.966 4.137 4.47 4.81 5.132 5.287 5.603 5.911 6.344 6.613 6.877 7.268 7.654 8.043 8.433 8.802 9.267 9.723 10.183 10.761 11.336 11.907 12.573 13.321 14.038 14.843 15.758 16.778 17.876 19.12 20.612 22.137 23.968 26.081 28.615 31.598 35.199 39.684 45.478 50.609 53.798 55.9 57.4 58.529 59.371 60.011 60.465 60.818 61.068 61.291 61.466 61.598 61.696 61.756 61.793 61.815 61.83 61.837 61.823 61.779 61.729 61.68 61.626 61.56 61.48 61.381 61.244 61.142 61.046 60.898 60.807 60.712 60.652 60.513 60.32 60.118 60.012 59.857 59.674 59.521 59.333 58.864 58.637 58.402 58.078 57.63 57.086 56.328 47.521 -4 ,1164 ,TETRA ,17555735,Fri Nov 26 04:44:42 CET,Fri Nov 26 06:15:09 CET,0.0 1.014 1.405 1.705 1.968 2.201 2.435 2.66 3.044 3.235 3.428 3.658 3.961 4.137 4.487 4.816 5.119 5.269 5.58 5.896 6.344 6.633 6.914 7.307 7.684 8.063 8.439 8.808 9.292 9.764 10.23 10.787 11.331 11.87 12.522 13.275 14.001 14.816 15.728 16.731 17.804 19.025 20.465 21.976 23.792 25.864 28.316 31.157 34.648 38.984 44.687 49.705 52.685 54.744 56.192 57.25 58.013 58.58 58.977 59.303 59.571 59.795 59.993 60.156 60.267 60.328 60.381 60.43 60.456 60.473 60.464 60.441 60.417 60.38 60.349 60.291 60.217 60.144 60.045 59.975 59.906 59.769 59.681 59.566 59.493 59.329 59.139 58.96 58.872 58.72 58.526 58.384 58.229 57.836 57.599 57.359 57.079 56.729 56.213 55.157 50.079 -7 ,9904 ,TETRA ,17555739,Fri Nov 26 04:45:11 CET,Fri Nov 26 06:31:41 CET,0.0 1.322 1.726 2.058 2.357 2.607 2.837 3.06 3.471 3.67 3.874 4.139 4.44 4.613 4.956 5.298 5.63 5.782 6.083 6.38 6.815 7.097 7.372 7.776 8.183 8.585 8.971 9.354 9.85 10.335 10.821 11.416 11.99 12.554 13.221 13.966 14.713 15.559 16.494 17.51 18.593 19.845 21.377 22.967 24.843 27.021 29.63 32.621 36.253 40.938 47.013 52.122 55.293 57.493 59.093 60.257 61.036 61.627 62.082 62.504 62.801 62.997 63.152 63.27 63.372 63.457 63.508 63.53 63.565 63.606 63.6 63.565 63.543 63.529 63.495 63.436 63.383 63.33 63.255 63.182 63.096 62.949 62.836 62.724 62.668 62.563 62.434 62.258 62.147 61.967 61.768 61.634 61.474 61.11 60.9 60.659 60.405 60.036 59.408 58.58 50.513 -8 ,6853 ,TETRA ,17555740,Fri Nov 26 04:46:11 CET,Fri Nov 26 06:32:10 CET,0.0 0.759 1.085 1.382 1.643 1.911 2.142 2.353 2.777 2.984 3.185 3.452 3.759 3.934 4.263 4.587 4.901 5.045 5.323 5.601 6.016 6.29 6.556 6.955 7.353 7.727 8.096 8.477 8.98 9.452 9.906 10.468 11.041 11.59 12.213 12.958 13.683 14.479 15.371 16.356 17.425 18.655 20.121 21.633 23.48 25.629 28.224 31.271 34.947 39.478 45.306 50.499 53.683 55.815 57.382 58.493 59.326 60.0 60.471 60.874 61.169 61.383 61.539 61.671 61.772 61.842 61.883 61.883 61.889 61.885 61.842 61.811 61.771 61.707 61.657 61.615 61.564 61.472 61.357 61.277 61.178 61.008 60.892 60.736 60.649 60.469 60.274 60.072 59.944 59.773 59.55 59.392 59.233 58.817 58.536 58.232 57.883 57.485 57.01 56.198 51.631 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt deleted file mode 100644 index 332aecdd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,2188 ,TETRA ,17555745,Fri Nov 26 04:48:12 CET,Fri Nov 26 06:36:43 CET,0.0 1.63 1.991 2.279 2.55 2.786 3.0 3.208 3.627 3.835 4.035 4.281 4.563 4.722 5.031 5.327 5.633 5.781 6.062 6.34 6.758 7.035 7.312 7.719 8.085 8.44 8.802 9.169 9.654 10.109 10.568 11.142 11.698 12.253 12.896 13.618 14.31 15.091 15.976 16.926 17.933 19.114 20.59 22.142 23.955 25.989 28.417 31.349 35.001 39.426 45.103 50.022 53.065 55.262 56.868 57.996 58.779 59.419 59.89 60.287 60.585 60.795 60.939 61.07 61.185 61.252 61.31 61.368 61.401 61.39 61.352 61.339 61.317 61.281 61.261 61.211 61.136 61.059 60.977 60.91 60.815 60.663 60.561 60.455 60.4 60.27 60.117 59.962 59.88 59.729 59.581 59.45 59.284 58.97 58.781 58.533 58.254 57.96 57.574 56.96 53.846 -4 ,10582 ,TETRA ,17555746,Fri Nov 26 04:49:12 CET,Fri Nov 26 06:36:11 CET,0.0 2.347 2.787 3.075 3.309 3.527 3.738 3.945 4.324 4.506 4.699 4.938 5.227 5.389 5.699 6.004 6.3 6.443 6.728 7.0 7.403 7.68 7.951 8.336 8.715 9.093 9.467 9.836 10.327 10.804 11.268 11.846 12.415 12.958 13.603 14.343 15.053 15.861 16.764 17.734 18.793 20.009 21.414 22.844 24.536 26.529 28.956 31.784 35.28 39.659 45.286 50.254 53.326 55.393 56.9 58.051 58.83 59.394 59.808 60.199 60.499 60.703 60.87 61.002 61.094 61.147 61.147 61.134 61.131 61.129 61.127 61.104 61.057 61.005 60.959 60.914 60.868 60.797 60.71 60.636 60.558 60.42 60.319 60.226 60.169 60.021 59.856 59.693 59.595 59.435 59.216 59.07 58.951 58.681 58.511 58.316 58.061 57.734 57.305 56.648 51.108 -5 ,9722 ,TETRA ,17555747,Fri Nov 26 04:49:11 CET,Fri Nov 26 06:24:51 CET,0.0 1.675 2.077 2.398 2.675 2.91 3.138 3.358 3.752 3.938 4.118 4.358 4.652 4.829 5.179 5.482 5.788 5.951 6.257 6.55 6.977 7.264 7.545 7.938 8.34 8.735 9.117 9.495 9.985 10.448 10.896 11.437 11.959 12.488 13.149 13.895 14.576 15.35 16.247 17.239 18.293 19.472 20.893 22.409 24.214 26.234 28.618 31.424 34.876 39.155 44.653 49.615 52.796 54.884 56.318 57.423 58.226 58.841 59.311 59.705 59.969 60.151 60.312 60.422 60.481 60.542 60.613 60.671 60.696 60.699 60.676 60.642 60.59 60.488 60.423 60.385 60.329 60.246 60.16 60.088 59.989 59.816 59.708 59.585 59.517 59.384 59.238 59.073 58.979 58.828 58.631 58.499 58.367 58.046 57.86 57.66 57.419 57.092 56.64 55.951 52.434 -7 ,3208 ,TETRA ,17555749,Fri Nov 26 04:50:12 CET,Fri Nov 26 06:36:40 CET,0.0 1.101 1.57 1.955 2.26 2.505 2.735 2.966 3.392 3.582 3.77 3.996 4.286 4.462 4.797 5.12 5.421 5.563 5.854 6.138 6.552 6.826 7.087 7.468 7.849 8.239 8.625 8.991 9.453 9.914 10.375 10.941 11.496 12.038 12.671 13.41 14.148 14.946 15.805 16.732 17.751 18.931 20.311 21.718 23.381 25.324 27.667 30.35 33.678 37.922 43.451 48.457 51.661 53.758 55.088 56.093 56.875 57.498 57.98 58.291 58.508 58.737 58.893 59.011 59.1 59.136 59.161 59.192 59.21 59.164 59.081 59.042 58.996 58.942 58.897 58.833 58.755 58.664 58.578 58.511 58.42 58.27 58.162 58.03 57.958 57.787 57.599 57.417 57.32 57.179 57.036 56.924 56.8 56.516 56.346 56.127 55.839 55.464 55.036 54.441 49.594 -8 ,7310 ,TETRA ,17555750,Fri Nov 26 04:50:12 CET,Fri Nov 26 06:37:20 CET,0.0 2.114 2.421 2.699 2.977 3.23 3.448 3.65 4.055 4.252 4.443 4.678 4.98 5.151 5.474 5.781 6.075 6.222 6.497 6.764 7.168 7.433 7.703 8.094 8.466 8.837 9.207 9.565 10.043 10.507 10.951 11.511 12.06 12.587 13.225 13.977 14.699 15.492 16.385 17.378 18.418 19.586 20.97 22.376 24.102 26.073 28.453 31.267 34.669 38.886 44.365 49.236 52.339 54.395 55.765 56.821 57.583 58.103 58.479 58.818 59.051 59.198 59.311 59.388 59.402 59.384 59.368 59.376 59.388 59.395 59.405 59.393 59.349 59.29 59.248 59.195 59.115 59.023 58.933 58.856 58.766 58.628 58.533 58.43 58.372 58.23 58.065 57.885 57.793 57.646 57.466 57.335 57.192 56.857 56.681 56.489 56.241 55.928 55.502 54.823 51.939 -9 ,8484 ,TETRA ,17555751,Fri Nov 26 04:50:12 CET,Fri Nov 26 06:39:42 CET,0.0 1.205 1.589 1.875 2.128 2.378 2.613 2.832 3.235 3.429 3.616 3.857 4.151 4.322 4.658 4.989 5.307 5.461 5.774 6.08 6.524 6.804 7.071 7.461 7.831 8.207 8.591 8.956 9.418 9.898 10.375 10.924 11.447 11.962 12.569 13.281 13.998 14.796 15.663 16.629 17.688 18.894 20.345 21.828 23.548 25.554 27.942 30.784 34.322 38.665 44.284 49.363 52.639 54.855 56.347 57.425 58.169 58.724 59.151 59.539 59.814 60.013 60.189 60.324 60.41 60.457 60.519 60.572 60.593 60.591 60.556 60.505 60.455 60.404 60.357 60.303 60.22 60.115 60.02 59.951 59.874 59.729 59.61 59.506 59.444 59.277 59.112 58.94 58.846 58.693 58.541 58.437 58.318 58.017 57.826 57.601 57.289 56.96 56.579 55.892 51.443 -10 ,2374 ,TETRA ,17555752,Fri Nov 26 04:50:12 CET,Fri Nov 26 06:37:10 CET,0.0 1.448 1.833 2.107 2.375 2.614 2.835 3.044 3.431 3.632 3.843 4.088 4.377 4.539 4.854 5.152 5.452 5.6 5.896 6.186 6.588 6.853 7.109 7.498 7.902 8.286 8.651 9.027 9.528 9.983 10.412 10.952 11.491 12.03 12.692 13.456 14.174 14.983 15.893 16.873 17.903 19.084 20.532 22.05 23.854 25.894 28.289 31.078 34.502 38.792 44.34 49.19 52.296 54.507 56.031 57.152 57.972 58.61 59.078 59.438 59.707 59.913 60.07 60.185 60.283 60.359 60.395 60.396 60.389 60.365 60.338 60.321 60.292 60.242 60.183 60.116 60.04 59.947 59.839 59.743 59.649 59.531 59.436 59.327 59.258 59.118 58.988 58.818 58.729 58.591 58.435 58.33 58.19 57.828 57.627 57.414 57.176 56.882 56.507 55.841 50.073 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt deleted file mode 100644 index ada02f75..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21903 ,TETRA ,17555753,Fri Nov 26 04:50:12 CET,Fri Nov 26 06:24:46 CET,0.0 1.073 1.465 1.743 1.968 2.153 2.329 2.484 2.75 2.862 2.983 3.099 3.331 3.437 3.651 3.836 3.997 4.07 4.217 4.37 4.563 4.691 4.824 4.996 5.162 5.32 5.466 5.605 5.778 5.94 6.097 6.284 6.452 6.616 6.811 7.017 7.213 7.429 7.647 7.864 8.091 8.337 8.588 8.838 9.174 9.475 9.706 9.882 9.918 9.827 9.305 8.307 7.357 6.464 5.663 4.874 4.145 3.574 3.121 2.649 2.231 1.884 1.576 1.266 0.963 0.705 0.448 0.202 -0.005 -0.214 -0.431 -0.604 -0.78 -0.971 -1.134 -1.291 -1.438 -1.598 -1.758 -1.87 -1.981 -2.149 -2.28 -2.41 -2.47 -2.599 -2.736 -2.882 -2.956 -3.166 -3.178 -3.267 -3.375 -3.596 -3.708 -3.83 -3.95 -4.063 -4.193 -4.379 -4.85 -2 ,9608 ,TETRA ,17555754,Fri Nov 26 04:50:12 CET,Fri Nov 26 06:24:48 CET,0.0 1.185 1.573 1.863 2.055 2.233 2.412 2.561 2.833 2.969 3.088 3.161 3.391 3.485 3.655 3.824 3.986 4.061 4.202 4.339 4.534 4.661 4.777 4.925 5.079 5.244 5.401 5.553 5.741 5.908 6.062 6.25 6.422 6.583 6.772 7.007 7.253 7.49 7.703 7.937 8.2 8.498 8.833 9.1 9.336 9.607 9.859 10.032 10.169 10.114 9.574 8.63 7.738 6.888 6.118 5.376 4.733 4.187 3.71 3.189 2.757 2.403 2.061 1.756 1.479 1.224 0.958 0.729 0.536 0.341 0.138 -0.039 -0.221 -0.404 -0.545 -0.694 -0.861 -1.04 -1.211 -1.325 -1.436 -1.593 -1.71 -1.838 -1.901 -2.038 -2.174 -2.305 -2.38 -2.6 -2.632 -2.721 -2.798 -2.953 -3.055 -3.187 -3.336 -3.483 -3.643 -3.836 -4.567 -3 ,10965 ,TETRA ,17555755,Fri Nov 26 04:51:11 CET,Fri Nov 26 06:36:44 CET,0.0 0.801 1.111 1.371 1.587 1.755 1.915 2.056 2.348 2.501 2.634 2.75 2.986 3.075 3.251 3.43 3.598 3.677 3.842 3.999 4.222 4.366 4.493 4.664 4.821 5.001 5.204 5.366 5.54 5.707 5.872 6.07 6.266 6.445 6.636 6.869 7.063 7.25 7.472 7.688 7.9 8.147 8.405 8.659 8.896 9.082 9.248 9.417 9.544 9.422 8.799 7.747 6.788 5.891 5.086 4.391 3.784 3.235 2.775 2.328 1.938 1.599 1.283 0.982 0.712 0.463 0.199 -0.032 -0.233 -0.443 -0.648 -0.815 -0.994 -1.19 -1.34 -1.478 -1.628 -1.795 -1.96 -2.067 -2.183 -2.376 -2.5 -2.621 -2.684 -2.813 -2.941 -3.079 -3.156 -3.37 -3.382 -3.46 -3.547 -3.733 -3.823 -3.935 -4.056 -4.179 -4.349 -4.556 -4.98 -4 ,20349 ,TETRA ,17555756,Fri Nov 26 04:51:11 CET,Fri Nov 26 06:36:45 CET,0.0 1.167 1.549 1.81 1.997 2.172 2.333 2.487 2.742 2.85 2.957 3.032 3.258 3.345 3.544 3.737 3.898 3.973 4.106 4.238 4.436 4.556 4.668 4.833 4.991 5.151 5.302 5.447 5.625 5.782 5.94 6.12 6.308 6.495 6.692 6.906 7.105 7.311 7.516 7.728 7.955 8.233 8.538 8.761 9.004 9.28 9.505 9.664 9.732 9.564 8.952 7.934 6.99 6.12 5.341 4.613 3.972 3.435 2.97 2.477 2.066 1.712 1.382 1.072 0.773 0.502 0.227 -0.011 -0.213 -0.411 -0.617 -0.804 -0.992 -1.18 -1.332 -1.523 -1.731 -1.923 -2.098 -2.21 -2.327 -2.509 -2.635 -2.761 -2.828 -2.967 -3.108 -3.259 -3.332 -3.544 -3.562 -3.648 -3.736 -3.926 -4.029 -4.14 -4.254 -4.38 -4.539 -4.787 -5.327 -5 ,25268 ,TETRA ,17555757,Fri Nov 26 04:51:11 CET,Fri Nov 26 06:38:03 CET,0.0 1.058 1.427 1.665 1.863 2.041 2.206 2.363 2.644 2.769 2.899 3.015 3.261 3.373 3.579 3.76 3.922 4.003 4.157 4.291 4.489 4.621 4.748 4.93 5.091 5.244 5.401 5.547 5.716 5.87 6.03 6.222 6.404 6.613 6.89 7.224 7.513 7.745 7.943 8.181 8.448 8.708 8.97 9.229 9.501 9.76 10.002 10.195 10.308 10.229 9.647 8.69 7.775 6.89 6.085 5.346 4.724 4.168 3.693 3.241 2.845 2.459 2.09 1.771 1.488 1.237 0.964 0.706 0.483 0.259 0.028 -0.161 -0.347 -0.529 -0.675 -0.827 -0.973 -1.133 -1.303 -1.419 -1.534 -1.714 -1.836 -1.958 -2.024 -2.162 -2.304 -2.456 -2.538 -2.763 -2.784 -2.869 -2.958 -3.138 -3.242 -3.357 -3.474 -3.653 -3.856 -4.044 -4.663 -6 ,712 ,TETRA ,17555758,Fri Nov 26 04:51:12 CET,Fri Nov 26 06:25:46 CET,0.0 0.756 1.095 1.335 1.533 1.703 1.868 2.023 2.297 2.421 2.535 2.603 2.83 2.916 3.082 3.255 3.419 3.495 3.645 3.798 4.008 4.134 4.25 4.411 4.573 4.731 4.878 5.022 5.2 5.358 5.51 5.7 5.874 6.035 6.225 6.437 6.634 6.834 7.055 7.309 7.547 7.797 8.148 8.51 8.795 9.011 9.238 9.429 9.527 9.339 8.647 7.696 6.843 6.018 5.267 4.564 3.924 3.34 2.858 2.411 2.021 1.669 1.358 1.069 0.791 0.541 0.279 0.042 -0.167 -0.365 -0.552 -0.708 -0.884 -1.08 -1.232 -1.388 -1.544 -1.706 -1.881 -1.995 -2.113 -2.301 -2.43 -2.557 -2.619 -2.753 -2.904 -3.056 -3.132 -3.345 -3.355 -3.442 -3.534 -3.728 -3.835 -3.945 -4.059 -4.203 -4.349 -4.56 -5.377 -7 ,26336 ,TETRA ,17555759,Fri Nov 26 04:52:12 CET,Fri Nov 26 06:37:15 CET,0.0 1.266 1.72 2.033 2.254 2.443 2.631 2.804 3.065 3.17 3.275 3.362 3.601 3.707 3.9 4.074 4.237 4.309 4.45 4.587 4.791 4.933 5.062 5.227 5.394 5.562 5.711 5.849 6.025 6.188 6.347 6.541 6.728 6.923 7.138 7.328 7.504 7.709 7.924 8.142 8.36 8.589 8.845 9.094 9.343 9.583 9.803 9.977 10.041 9.88 9.338 8.395 7.462 6.627 5.867 5.169 4.559 3.99 3.49 3.003 2.603 2.244 1.911 1.599 1.302 1.023 0.745 0.518 0.327 0.12 -0.103 -0.289 -0.473 -0.658 -0.798 -0.943 -1.102 -1.263 -1.418 -1.523 -1.637 -1.823 -1.95 -2.072 -2.133 -2.267 -2.408 -2.557 -2.636 -2.859 -2.895 -2.987 -3.091 -3.316 -3.429 -3.542 -3.652 -3.777 -3.928 -4.117 -4.613 -8 ,25196 ,TETRA ,17555760,Fri Nov 26 04:52:12 CET,Fri Nov 26 06:26:32 CET,0.0 0.829 1.13 1.408 1.606 1.778 1.935 2.081 2.358 2.479 2.599 2.687 2.917 3.019 3.22 3.403 3.574 3.655 3.795 3.942 4.154 4.283 4.412 4.576 4.73 4.881 5.037 5.189 5.369 5.531 5.693 5.899 6.072 6.225 6.42 6.645 6.85 7.05 7.244 7.467 7.688 7.946 8.266 8.521 8.784 9.052 9.29 9.492 9.598 9.501 8.922 7.886 6.873 5.969 5.235 4.488 3.698 3.076 2.625 2.163 1.773 1.416 1.064 0.739 0.451 0.186 -0.096 -0.34 -0.538 -0.738 -0.95 -1.134 -1.33 -1.526 -1.673 -1.821 -1.976 -2.145 -2.318 -2.431 -2.543 -2.724 -2.851 -2.973 -3.034 -3.163 -3.297 -3.447 -3.528 -3.745 -3.764 -3.851 -3.948 -4.15 -4.249 -4.35 -4.462 -4.591 -4.74 -4.933 -5.452 -9 ,28377 ,TETRA ,17555761,Fri Nov 26 04:52:12 CET,Fri Nov 26 06:26:50 CET,0.0 0.918 1.264 1.551 1.772 1.976 2.167 2.316 2.587 2.712 2.828 2.927 3.165 3.266 3.452 3.594 3.739 3.818 3.967 4.128 4.356 4.487 4.611 4.786 4.947 5.098 5.238 5.382 5.566 5.733 5.889 6.076 6.267 6.449 6.643 6.851 7.055 7.302 7.581 7.844 8.082 8.323 8.575 8.825 9.086 9.31 9.522 9.728 9.861 9.753 9.218 8.292 7.345 6.459 5.679 4.974 4.37 3.828 3.356 2.879 2.47 2.11 1.776 1.463 1.153 0.879 0.615 0.384 0.188 -0.019 -0.229 -0.4 -0.584 -0.762 -0.902 -1.06 -1.226 -1.391 -1.566 -1.698 -1.827 -2.001 -2.122 -2.252 -2.32 -2.471 -2.625 -2.767 -2.838 -3.054 -3.106 -3.207 -3.306 -3.522 -3.638 -3.759 -3.895 -4.051 -4.223 -4.397 -4.76 -10 ,14237 ,TETRA ,17555762,Fri Nov 26 04:52:13 CET,Fri Nov 26 06:26:58 CET,0.0 1.245 1.604 1.871 2.1 2.304 2.474 2.635 2.902 3.021 3.146 3.237 3.467 3.565 3.751 3.922 4.075 4.148 4.292 4.436 4.637 4.758 4.885 5.071 5.241 5.397 5.541 5.681 5.86 6.028 6.189 6.381 6.559 6.745 6.955 7.167 7.403 7.646 7.854 8.071 8.312 8.581 8.86 9.105 9.376 9.638 9.861 10.016 10.064 9.961 9.355 8.269 7.262 6.376 5.617 4.943 4.354 3.81 3.336 2.873 2.465 2.104 1.767 1.45 1.158 0.901 0.653 0.431 0.233 0.021 -0.204 -0.383 -0.569 -0.764 -0.907 -1.053 -1.211 -1.371 -1.537 -1.655 -1.77 -1.954 -2.08 -2.206 -2.27 -2.399 -2.549 -2.698 -2.776 -3.002 -3.029 -3.119 -3.209 -3.405 -3.533 -3.668 -3.795 -3.931 -4.09 -4.291 -4.948 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index c5eb7250..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,136 ,TETRA ,17555763,Fri Nov 26 04:53:12 CET,Fri Nov 26 06:37:02 CET,0.0 0.529 0.772 0.953 1.087 1.226 1.355 1.443 1.582 1.651 1.72 1.726 1.915 1.963 2.067 2.177 2.285 2.337 2.425 2.506 2.629 2.709 2.776 2.877 2.982 3.082 3.185 3.278 3.387 3.497 3.603 3.714 3.803 3.892 4.03 4.189 4.309 4.446 4.589 4.729 4.874 5.03 5.204 5.348 5.488 5.613 5.694 5.733 5.664 5.225 4.239 2.96 1.927 1.052 0.23 -0.49 -1.146 -1.754 -2.267 -2.819 -3.32 -3.771 -4.223 -4.65 -5.03 -5.386 -5.759 -6.093 -6.41 -6.752 -7.065 -7.308 -7.567 -7.847 -8.071 -8.281 -8.511 -8.777 -9.045 -9.231 -9.414 -9.691 -9.908 -10.131 -10.24 -10.479 -10.738 -11.005 -11.14 -11.421 -11.559 -11.72 -11.882 -12.23 -12.435 -12.667 -12.914 -13.224 -13.591 -14.042 -15.384 -2 ,2088 ,TETRA ,17555764,Fri Nov 26 04:53:14 CET,Fri Nov 26 06:36:16 CET,0.0 1.048 1.378 1.609 1.772 1.893 1.984 2.077 2.26 2.339 2.426 2.471 2.662 2.715 2.824 2.928 3.025 3.075 3.178 3.267 3.392 3.48 3.559 3.659 3.749 3.838 3.926 4.008 4.118 4.214 4.296 4.404 4.518 4.623 4.739 4.883 5.013 5.136 5.259 5.381 5.493 5.639 5.848 6.016 6.134 6.241 6.324 6.396 6.418 6.2 5.52 4.417 3.451 2.558 1.716 0.954 0.226 -0.416 -1.038 -1.695 -2.176 -2.609 -3.02 -3.403 -3.801 -4.176 -4.549 -4.879 -5.152 -5.432 -5.718 -5.963 -6.228 -6.496 -6.706 -6.917 -7.14 -7.385 -7.646 -7.84 -8.048 -8.359 -8.567 -8.786 -8.904 -9.148 -9.406 -9.674 -9.805 -10.087 -10.207 -10.346 -10.511 -10.902 -11.107 -11.332 -11.603 -11.89 -12.222 -12.699 -14.143 -3 ,20522 ,TETRA ,17555765,Fri Nov 26 04:53:15 CET,Fri Nov 26 06:37:56 CET,0.0 0.637 0.883 1.087 1.276 1.43 1.539 1.62 1.779 1.852 1.93 1.975 2.184 2.255 2.389 2.504 2.598 2.644 2.745 2.847 2.978 3.056 3.128 3.236 3.342 3.437 3.527 3.611 3.736 3.856 3.95 4.06 4.174 4.276 4.39 4.517 4.619 4.739 4.878 5.004 5.121 5.251 5.389 5.523 5.689 5.834 5.9 5.882 5.792 5.552 4.927 3.771 2.716 1.865 1.062 0.279 -0.408 -1.005 -1.538 -2.085 -2.581 -3.06 -3.517 -3.921 -4.292 -4.664 -5.056 -5.393 -5.684 -5.976 -6.291 -6.581 -6.866 -7.138 -7.358 -7.601 -7.846 -8.09 -8.358 -8.537 -8.707 -8.982 -9.197 -9.427 -9.545 -9.787 -10.043 -10.317 -10.456 -10.749 -10.908 -11.074 -11.251 -11.621 -11.819 -12.04 -12.288 -12.58 -12.889 -13.289 -15.114 -4 ,22270 ,TETRA ,17555766,Fri Nov 26 04:53:12 CET,Fri Nov 26 06:27:32 CET,0.0 1.146 1.497 1.714 1.851 1.966 2.081 2.173 2.326 2.396 2.474 2.495 2.694 2.758 2.874 2.983 3.101 3.162 3.266 3.363 3.519 3.611 3.686 3.817 3.947 4.059 4.156 4.231 4.341 4.463 4.576 4.703 4.816 4.919 5.037 5.204 5.364 5.492 5.617 5.742 5.871 6.006 6.164 6.321 6.457 6.578 6.681 6.725 6.631 6.342 5.648 4.63 3.747 2.91 2.111 1.322 0.567 -0.08 -0.623 -1.248 -1.777 -2.219 -2.725 -3.234 -3.689 -4.105 -4.546 -4.947 -5.294 -5.657 -6.043 -6.368 -6.662 -6.929 -7.143 -7.362 -7.615 -7.902 -8.192 -8.378 -8.55 -8.814 -9.006 -9.222 -9.337 -9.57 -9.825 -10.091 -10.232 -10.522 -10.672 -10.837 -11.003 -11.333 -11.536 -11.775 -12.009 -12.297 -12.661 -13.174 -15.45 -5 ,22871 ,TETRA ,17555767,Fri Nov 26 04:53:12 CET,Fri Nov 26 06:27:27 CET,0.0 0.75 1.039 1.195 1.342 1.464 1.562 1.652 1.839 1.945 2.036 2.047 2.241 2.298 2.417 2.527 2.627 2.676 2.768 2.86 3.002 3.089 3.16 3.244 3.331 3.426 3.509 3.586 3.702 3.813 3.919 4.078 4.251 4.393 4.515 4.645 4.778 4.909 5.042 5.172 5.276 5.395 5.533 5.654 5.769 5.867 5.969 6.058 6.035 5.741 5.069 4.07 3.163 2.357 1.629 0.943 0.237 -0.453 -1.056 -1.659 -2.164 -2.624 -3.06 -3.467 -3.877 -4.26 -4.62 -4.949 -5.26 -5.577 -5.883 -6.126 -6.39 -6.677 -6.9 -7.15 -7.403 -7.649 -7.907 -8.086 -8.269 -8.57 -8.785 -9.016 -9.144 -9.406 -9.662 -9.918 -10.042 -10.326 -10.479 -10.624 -10.778 -11.17 -11.387 -11.603 -11.841 -12.114 -12.467 -12.955 -14.536 -6 ,25533 ,TETRA ,17555768,Fri Nov 26 04:54:10 CET,Fri Nov 26 06:38:04 CET,0.0 0.452 0.613 0.736 0.868 0.985 1.088 1.185 1.356 1.432 1.5 1.488 1.675 1.738 1.885 2.021 2.125 2.166 2.259 2.346 2.458 2.531 2.593 2.704 2.836 2.967 3.092 3.213 3.391 3.578 3.754 3.959 4.145 4.277 4.404 4.539 4.648 4.77 4.91 5.054 5.183 5.321 5.476 5.614 5.746 5.864 5.973 6.032 5.977 5.726 5.125 4.191 3.255 2.336 1.475 0.733 0.072 -0.667 -1.318 -1.887 -2.412 -2.907 -3.37 -3.794 -4.175 -4.538 -4.907 -5.244 -5.539 -5.817 -6.116 -6.374 -6.659 -6.968 -7.193 -7.406 -7.634 -7.878 -8.132 -8.31 -8.489 -8.761 -8.972 -9.203 -9.321 -9.554 -9.784 -10.036 -10.169 -10.45 -10.598 -10.76 -10.916 -11.229 -11.422 -11.651 -11.909 -12.207 -12.531 -12.934 -14.35 -7 ,27582 ,TETRA ,17555769,Fri Nov 26 04:54:10 CET,Fri Nov 26 06:27:27 CET,0.0 0.533 0.793 0.963 1.117 1.234 1.327 1.426 1.615 1.69 1.755 1.736 1.923 1.985 2.111 2.222 2.333 2.395 2.515 2.613 2.734 2.823 2.91 3.018 3.132 3.247 3.343 3.43 3.558 3.679 3.775 3.893 4.002 4.101 4.225 4.355 4.474 4.601 4.731 4.893 5.063 5.216 5.377 5.526 5.666 5.806 5.916 5.947 5.827 5.488 4.843 3.844 2.686 1.409 0.217 -0.819 -1.697 -2.504 -3.234 -3.984 -4.547 -4.975 -5.384 -5.796 -6.253 -6.655 -7.034 -7.375 -7.645 -7.924 -8.239 -8.525 -8.826 -9.107 -9.322 -9.556 -9.791 -10.035 -10.298 -10.484 -10.675 -10.97 -11.184 -11.408 -11.519 -11.765 -12.033 -12.311 -12.45 -12.729 -12.878 -13.05 -13.205 -13.518 -13.719 -13.974 -14.238 -14.524 -14.875 -15.334 -16.814 -8 ,2789 ,TETRA ,17555770,Fri Nov 26 04:54:10 CET,Fri Nov 26 06:32:08 CET,0.0 0.444 0.645 0.817 0.955 1.042 1.154 1.279 1.468 1.551 1.632 1.627 1.823 1.912 2.083 2.243 2.385 2.452 2.561 2.65 2.767 2.842 2.923 3.03 3.129 3.22 3.304 3.427 3.622 3.802 3.964 4.136 4.314 4.485 4.636 4.756 4.869 5.054 5.307 5.559 5.805 6.063 6.311 6.457 6.561 6.653 6.706 6.711 6.628 6.365 5.669 4.604 3.611 2.668 1.804 0.964 0.164 -0.52 -1.129 -1.766 -2.267 -2.729 -3.184 -3.59 -3.977 -4.321 -4.701 -5.072 -5.363 -5.637 -5.931 -6.19 -6.464 -6.749 -6.974 -7.195 -7.423 -7.682 -7.956 -8.146 -8.353 -8.668 -8.87 -9.08 -9.19 -9.411 -9.658 -9.924 -10.061 -10.345 -10.485 -10.641 -10.807 -11.186 -11.402 -11.641 -11.885 -12.144 -12.435 -12.876 -14.76 -9 ,7854 ,TETRA ,17555771,Fri Nov 26 04:56:09 CET,Fri Nov 26 06:40:36 CET,0.0 0.766 1.037 1.198 1.326 1.45 1.59 1.705 1.864 1.928 1.989 1.973 2.159 2.217 2.336 2.451 2.565 2.618 2.715 2.813 2.957 3.04 3.109 3.212 3.343 3.467 3.563 3.653 3.765 3.882 3.999 4.14 4.259 4.386 4.526 4.654 4.779 4.919 5.056 5.173 5.296 5.449 5.609 5.734 5.862 5.951 6.029 6.079 5.999 5.712 4.957 3.922 2.945 1.947 1.041 0.201 -0.608 -1.315 -1.911 -2.531 -3.037 -3.485 -3.899 -4.287 -4.657 -5.012 -5.394 -5.724 -6.018 -6.321 -6.617 -6.869 -7.124 -7.411 -7.646 -7.875 -8.11 -8.339 -8.58 -8.758 -8.949 -9.256 -9.465 -9.685 -9.792 -9.987 -10.197 -10.432 -10.567 -10.862 -11.014 -11.175 -11.358 -11.758 -11.961 -12.178 -12.441 -12.769 -13.135 -13.593 -15.236 -10 ,18885 ,TETRA ,17555772,Fri Nov 26 04:55:11 CET,Fri Nov 26 06:28:20 CET,0.0 0.482 0.699 0.884 1.024 1.121 1.205 1.288 1.434 1.502 1.573 1.58 1.773 1.829 1.943 2.051 2.148 2.201 2.299 2.38 2.505 2.586 2.66 2.766 2.869 2.966 3.058 3.147 3.259 3.365 3.458 3.572 3.68 3.782 3.889 3.998 4.11 4.225 4.354 4.497 4.631 4.763 4.917 5.058 5.191 5.34 5.461 5.473 5.395 5.134 4.47 3.411 2.361 1.446 0.627 -0.13 -0.879 -1.565 -2.08 -2.603 -3.072 -3.49 -3.884 -4.292 -4.73 -5.11 -5.503 -5.86 -6.156 -6.472 -6.792 -7.049 -7.305 -7.567 -7.787 -8.011 -8.257 -8.53 -8.798 -8.971 -9.156 -9.477 -9.708 -9.94 -10.045 -10.272 -10.513 -10.749 -10.879 -11.167 -11.318 -11.479 -11.65 -12.003 -12.209 -12.449 -12.709 -13.008 -13.397 -13.924 -15.565 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 55376ce7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28579 ,TETRA ,17555773,Fri Nov 26 04:55:12 CET,Fri Nov 26 06:34:44 CET,0.0 0.934 1.306 1.552 1.756 1.957 2.15 2.312 2.596 2.731 2.859 2.955 3.187 3.284 3.472 3.649 3.836 3.922 4.074 4.216 4.425 4.563 4.701 4.912 5.102 5.27 5.421 5.57 5.766 5.951 6.127 6.329 6.528 6.723 6.94 7.167 7.386 7.616 7.843 8.103 8.376 8.677 9.016 9.299 9.59 9.925 10.23 10.448 10.674 10.834 10.624 9.968 9.263 8.546 7.931 7.399 6.894 6.394 5.942 5.52 5.18 4.878 4.58 4.305 4.064 3.85 3.635 3.436 3.258 3.083 2.908 2.758 2.598 2.431 2.306 2.178 2.042 1.91 1.781 1.69 1.591 1.429 1.316 1.204 1.15 1.036 0.912 0.788 0.729 0.535 0.547 0.478 0.404 0.238 0.142 0.042 -0.058 -0.177 -0.313 -0.464 -0.914 -2 ,31640 ,TETRA ,17555774,Fri Nov 26 04:55:12 CET,Fri Nov 26 06:30:18 CET,0.0 0.979 1.422 1.695 1.913 2.116 2.281 2.44 2.736 2.858 2.987 3.108 3.351 3.457 3.657 3.843 4.025 4.113 4.278 4.43 4.64 4.778 4.903 5.076 5.25 5.421 5.578 5.718 5.903 6.08 6.241 6.461 6.696 6.917 7.166 7.414 7.619 7.831 8.061 8.315 8.56 8.826 9.12 9.392 9.695 9.987 10.24 10.458 10.618 10.685 10.393 9.628 8.861 8.11 7.418 6.801 6.261 5.774 5.37 4.981 4.646 4.34 4.041 3.766 3.523 3.305 3.075 2.873 2.696 2.507 2.312 2.151 1.99 1.822 1.699 1.577 1.444 1.313 1.185 1.098 1.009 0.869 0.766 0.656 0.6 0.492 0.374 0.248 0.179 -0.03 -0.037 -0.106 -0.177 -0.358 -0.449 -0.539 -0.637 -0.745 -0.868 -1.003 -1.246 -3 ,8360 ,TETRA ,17555775,Fri Nov 26 04:55:12 CET,Fri Nov 26 06:30:21 CET,0.0 0.993 1.368 1.664 1.918 2.109 2.276 2.425 2.708 2.842 2.96 3.051 3.289 3.39 3.591 3.777 3.948 4.027 4.164 4.317 4.558 4.698 4.831 5.012 5.175 5.33 5.478 5.623 5.822 6.017 6.191 6.394 6.59 6.778 6.986 7.208 7.427 7.654 7.886 8.133 8.382 8.664 8.958 9.233 9.534 9.82 10.135 10.403 10.58 10.651 10.367 9.73 9.068 8.39 7.757 7.163 6.646 6.179 5.778 5.376 5.033 4.727 4.42 4.132 3.876 3.646 3.409 3.206 3.034 2.845 2.653 2.496 2.329 2.168 2.053 1.935 1.804 1.66 1.513 1.414 1.319 1.173 1.066 0.964 0.911 0.798 0.678 0.552 0.486 0.282 0.237 0.126 0.022 -0.218 -0.351 -0.478 -0.614 -0.784 -0.975 -1.21 -1.617 -4 ,22861 ,TETRA ,17555776,Fri Nov 26 04:56:10 CET,Fri Nov 26 06:43:11 CET,0.0 1.253 1.741 2.108 2.377 2.596 2.774 2.955 3.295 3.439 3.576 3.704 3.951 4.058 4.25 4.422 4.591 4.678 4.855 5.015 5.228 5.366 5.491 5.674 5.859 6.024 6.186 6.36 6.565 6.745 6.932 7.145 7.327 7.502 7.708 7.931 8.138 8.355 8.58 8.82 9.069 9.337 9.647 9.903 10.176 10.52 10.862 11.15 11.34 11.413 11.215 10.504 9.741 9.055 8.451 7.888 7.384 6.898 6.472 6.09 5.766 5.455 5.145 4.866 4.628 4.418 4.194 3.983 3.799 3.621 3.435 3.282 3.13 2.975 2.855 2.734 2.611 2.478 2.333 2.234 2.14 1.994 1.892 1.78 1.72 1.609 1.495 1.37 1.303 1.094 1.089 1.024 0.958 0.8 0.709 0.618 0.522 0.417 0.296 0.148 -0.136 -5 ,10873 ,TETRA ,17555777,Fri Nov 26 04:56:10 CET,Fri Nov 26 06:31:17 CET,0.0 0.939 1.33 1.633 1.871 2.058 2.217 2.362 2.632 2.758 2.884 2.979 3.212 3.316 3.497 3.68 3.847 3.917 4.064 4.205 4.411 4.549 4.679 4.863 5.044 5.21 5.36 5.509 5.702 5.878 6.042 6.242 6.433 6.605 6.808 7.045 7.259 7.48 7.713 7.96 8.224 8.508 8.793 9.049 9.342 9.63 9.945 10.262 10.464 10.452 10.051 9.257 8.497 7.81 7.178 6.592 6.087 5.637 5.24 4.841 4.501 4.208 3.94 3.683 3.432 3.208 2.981 2.776 2.605 2.434 2.26 2.109 1.955 1.801 1.675 1.543 1.405 1.265 1.124 1.033 0.936 0.783 0.679 0.566 0.51 0.403 0.286 0.161 0.088 -0.124 -0.126 -0.198 -0.272 -0.446 -0.541 -0.633 -0.725 -0.829 -0.953 -1.085 -1.272 -6 ,5746 ,TETRA ,17555778,Fri Nov 26 04:56:12 CET,Fri Nov 26 06:38:05 CET,0.0 1.812 2.3 2.59 2.852 3.063 3.25 3.393 3.639 3.772 3.902 3.999 4.239 4.341 4.535 4.705 4.856 4.932 5.081 5.23 5.459 5.6 5.729 5.916 6.089 6.245 6.402 6.567 6.778 6.968 7.153 7.369 7.559 7.734 7.93 8.154 8.365 8.59 8.828 9.071 9.324 9.623 9.944 10.222 10.537 10.874 11.181 11.441 11.662 11.701 11.352 10.509 9.682 8.987 8.37 7.788 7.276 6.793 6.382 5.995 5.651 5.343 5.056 4.805 4.589 4.374 4.145 3.948 3.773 3.587 3.386 3.225 3.07 2.911 2.793 2.663 2.533 2.409 2.27 2.171 2.067 1.914 1.811 1.699 1.645 1.541 1.428 1.304 1.24 1.034 1.029 0.953 0.875 0.725 0.651 0.564 0.448 0.308 0.091 -0.222 -1.242 -7 ,12655 ,TETRA ,17555779,Fri Nov 26 04:56:12 CET,Fri Nov 26 06:31:51 CET,0.0 1.031 1.398 1.691 1.907 2.095 2.267 2.456 2.812 2.953 3.081 3.178 3.416 3.521 3.736 3.927 4.096 4.171 4.309 4.453 4.661 4.792 4.919 5.112 5.295 5.453 5.603 5.748 5.924 6.104 6.29 6.501 6.706 6.944 7.244 7.511 7.719 7.958 8.203 8.452 8.695 8.955 9.278 9.586 9.879 10.164 10.468 10.722 10.95 11.035 10.723 10.017 9.282 8.584 7.953 7.369 6.825 6.347 5.947 5.529 5.18 4.874 4.578 4.304 4.055 3.832 3.601 3.385 3.203 3.031 2.852 2.711 2.568 2.404 2.275 2.154 2.024 1.884 1.743 1.649 1.554 1.408 1.315 1.221 1.167 1.045 0.925 0.805 0.743 0.548 0.552 0.474 0.399 0.229 0.136 0.041 -0.068 -0.195 -0.372 -0.56 -0.954 -8 ,23127 ,TETRA ,17555780,Fri Nov 26 04:56:12 CET,Fri Nov 26 06:35:27 CET,0.0 1.261 1.684 1.931 2.149 2.385 2.589 2.749 3.049 3.177 3.301 3.419 3.664 3.776 3.981 4.178 4.368 4.452 4.609 4.762 4.973 5.111 5.239 5.409 5.588 5.775 5.947 6.102 6.298 6.483 6.655 6.861 7.053 7.232 7.459 7.708 7.902 8.099 8.327 8.567 8.8 9.071 9.398 9.73 10.089 10.372 10.619 10.87 11.058 11.118 10.801 10.073 9.342 8.646 7.987 7.35 6.803 6.346 5.943 5.509 5.161 4.874 4.606 4.361 4.137 3.925 3.705 3.512 3.331 3.141 2.95 2.796 2.646 2.491 2.367 2.245 2.119 1.989 1.855 1.759 1.657 1.499 1.388 1.277 1.223 1.112 0.996 0.87 0.803 0.601 0.584 0.498 0.42 0.275 0.194 0.108 0.014 -0.101 -0.236 -0.414 -0.689 -9 ,23900 ,TETRA ,17555781,Fri Nov 26 04:56:12 CET,Fri Nov 26 06:31:09 CET,0.0 0.887 1.261 1.591 1.84 2.051 2.227 2.372 2.658 2.797 2.923 3.019 3.251 3.353 3.574 3.776 3.951 4.034 4.187 4.34 4.557 4.683 4.811 5.013 5.203 5.368 5.516 5.663 5.856 6.042 6.218 6.412 6.589 6.783 7.009 7.233 7.454 7.7 7.94 8.156 8.389 8.654 8.936 9.224 9.57 9.927 10.222 10.459 10.651 10.657 10.265 9.511 8.781 8.075 7.423 6.858 6.358 5.882 5.469 5.071 4.738 4.43 4.13 3.865 3.631 3.409 3.179 2.988 2.82 2.633 2.443 2.283 2.118 1.954 1.828 1.704 1.579 1.447 1.31 1.212 1.095 0.919 0.814 0.697 0.64 0.525 0.413 0.302 0.244 0.044 0.04 -0.039 -0.119 -0.293 -0.389 -0.482 -0.574 -0.671 -0.791 -0.932 -1.191 -10 ,8190 ,TETRA ,17555782,Fri Nov 26 04:57:12 CET,Fri Nov 26 06:42:24 CET,0.0 1.21 1.575 1.844 2.069 2.304 2.507 2.674 2.973 3.108 3.232 3.335 3.576 3.681 3.867 4.043 4.223 4.303 4.467 4.627 4.846 4.99 5.124 5.31 5.486 5.655 5.811 5.96 6.175 6.382 6.557 6.75 6.964 7.159 7.362 7.581 7.776 8.008 8.249 8.51 8.788 9.067 9.338 9.615 9.925 10.225 10.543 10.822 11.016 11.052 10.666 9.873 9.135 8.436 7.811 7.225 6.702 6.254 5.86 5.465 5.131 4.83 4.556 4.301 4.051 3.829 3.602 3.388 3.207 3.025 2.833 2.679 2.52 2.356 2.226 2.087 1.941 1.796 1.614 1.471 1.334 1.121 0.965 0.799 0.716 0.543 0.362 0.158 0.051 -0.168 -0.182 -0.262 -0.349 -0.516 -0.594 -0.672 -0.756 -0.858 -0.985 -1.13 -1.348 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt deleted file mode 100644 index 7120b67b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6049 ,TETRA ,17555783,Fri Nov 26 04:58:11 CET,Fri Nov 26 06:45:17 CET,0.0 0.66 1.013 1.181 1.296 1.408 1.542 1.663 1.837 1.915 1.992 2.009 2.215 2.283 2.403 2.524 2.647 2.707 2.844 2.978 3.142 3.238 3.329 3.465 3.597 3.716 3.84 3.959 4.099 4.26 4.429 4.604 4.749 4.898 5.068 5.256 5.44 5.643 5.861 6.077 6.282 6.5 6.751 6.979 7.206 7.437 7.663 7.887 8.104 8.205 8.024 7.5 6.956 6.437 5.922 5.422 4.961 4.523 4.139 3.748 3.427 3.147 2.852 2.557 2.286 2.051 1.817 1.607 1.409 1.2 0.983 0.811 0.63 0.429 0.274 0.124 -0.02 -0.17 -0.34 -0.462 -0.593 -0.811 -0.962 -1.109 -1.178 -1.318 -1.47 -1.638 -1.727 -1.955 -2.007 -2.111 -2.222 -2.47 -2.605 -2.742 -2.891 -3.059 -3.26 -3.499 -4.261 -2 ,4490 ,TETRA ,17555784,Fri Nov 26 04:57:12 CET,Fri Nov 26 06:32:57 CET,0.0 0.651 0.877 1.065 1.229 1.39 1.525 1.619 1.792 1.882 1.965 1.981 2.189 2.262 2.402 2.537 2.669 2.726 2.831 2.946 3.124 3.227 3.327 3.493 3.673 3.855 4.03 4.181 4.332 4.469 4.608 4.767 4.915 5.054 5.217 5.405 5.577 5.765 5.958 6.151 6.345 6.564 6.84 7.098 7.373 7.676 7.973 8.245 8.499 8.688 8.577 8.072 7.524 6.995 6.498 6.03 5.586 5.143 4.763 4.39 4.056 3.764 3.485 3.225 2.977 2.735 2.484 2.256 2.056 1.85 1.639 1.454 1.254 1.053 0.897 0.725 0.552 0.388 0.223 0.108 -0.014 -0.21 -0.353 -0.495 -0.566 -0.718 -0.889 -1.062 -1.144 -1.371 -1.423 -1.534 -1.65 -1.878 -1.998 -2.163 -2.359 -2.544 -2.779 -3.129 -3.957 -3 ,5201 ,TETRA ,17555785,Fri Nov 26 04:57:12 CET,Fri Nov 26 06:37:30 CET,0.0 0.702 0.993 1.19 1.329 1.473 1.606 1.722 1.892 1.979 2.074 2.122 2.344 2.423 2.556 2.685 2.818 2.879 2.984 3.087 3.257 3.369 3.461 3.586 3.716 3.854 3.983 4.086 4.22 4.37 4.515 4.691 4.863 5.03 5.214 5.399 5.576 5.775 5.98 6.201 6.424 6.657 6.934 7.205 7.487 7.756 8.02 8.249 8.454 8.627 8.546 8.119 7.588 7.012 6.499 5.994 5.537 5.147 4.793 4.41 4.069 3.769 3.484 3.204 2.896 2.619 2.379 2.162 1.961 1.75 1.546 1.373 1.194 1.02 0.869 0.713 0.556 0.386 0.212 0.1 -0.019 -0.243 -0.392 -0.541 -0.627 -0.8 -0.985 -1.186 -1.278 -1.511 -1.598 -1.72 -1.834 -2.072 -2.23 -2.401 -2.561 -2.766 -3.047 -3.4 -4.174 -4 ,6569 ,TETRA ,17555786,Fri Nov 26 04:57:12 CET,Fri Nov 26 06:36:26 CET,0.0 0.73 0.988 1.222 1.43 1.583 1.711 1.824 2.04 2.144 2.241 2.285 2.5 2.581 2.729 2.854 2.977 3.034 3.144 3.251 3.399 3.494 3.591 3.729 3.858 3.985 4.106 4.218 4.363 4.516 4.647 4.799 4.964 5.112 5.272 5.454 5.629 5.808 6.015 6.302 6.579 6.822 7.083 7.333 7.628 7.925 8.204 8.488 8.762 8.943 8.896 8.455 7.919 7.383 6.888 6.411 5.949 5.512 5.162 4.818 4.497 4.17 3.8 3.419 3.056 2.758 2.496 2.28 2.094 1.889 1.676 1.493 1.313 1.138 1.0 0.871 0.729 0.568 0.399 0.28 0.163 -0.02 -0.159 -0.311 -0.391 -0.546 -0.7 -0.871 -0.958 -1.186 -1.248 -1.35 -1.444 -1.661 -1.798 -1.962 -2.151 -2.352 -2.595 -2.924 -4.0 -5 ,15412 ,TETRA ,17555787,Fri Nov 26 04:57:12 CET,Fri Nov 26 06:32:57 CET,0.0 0.497 0.829 1.038 1.213 1.39 1.54 1.657 1.841 1.924 2.002 2.021 2.237 2.316 2.459 2.607 2.755 2.818 2.93 3.052 3.26 3.384 3.483 3.64 3.828 4.007 4.186 4.367 4.576 4.771 4.96 5.151 5.307 5.45 5.609 5.786 5.954 6.138 6.337 6.527 6.703 6.92 7.197 7.446 7.691 7.947 8.237 8.518 8.742 8.909 8.86 8.423 7.88 7.336 6.777 6.194 5.707 5.299 4.929 4.546 4.22 3.933 3.667 3.407 3.161 2.927 2.672 2.446 2.249 2.047 1.843 1.679 1.505 1.317 1.169 1.021 0.875 0.719 0.535 0.406 0.277 0.087 -0.042 -0.182 -0.257 -0.42 -0.588 -0.75 -0.836 -1.059 -1.101 -1.207 -1.325 -1.563 -1.704 -1.872 -2.053 -2.265 -2.477 -2.731 -3.691 -6 ,18864 ,TETRA ,17555788,Fri Nov 26 04:57:12 CET,Fri Nov 26 06:33:34 CET,0.0 0.836 1.034 1.224 1.392 1.53 1.635 1.754 1.987 2.075 2.148 2.153 2.373 2.449 2.572 2.695 2.821 2.882 3.008 3.134 3.308 3.422 3.526 3.659 3.794 3.93 4.066 4.192 4.331 4.473 4.63 4.81 4.974 5.137 5.321 5.514 5.681 5.868 6.083 6.301 6.51 6.734 6.978 7.215 7.478 7.752 8.039 8.322 8.589 8.768 8.74 8.305 7.786 7.294 6.802 6.329 5.872 5.453 5.073 4.676 4.336 4.032 3.756 3.501 3.259 3.032 2.786 2.569 2.375 2.171 1.967 1.793 1.612 1.419 1.247 1.044 0.839 0.656 0.485 0.367 0.249 0.075 -0.06 -0.202 -0.276 -0.43 -0.585 -0.766 -0.858 -1.085 -1.152 -1.254 -1.368 -1.638 -1.801 -1.999 -2.211 -2.433 -2.682 -3.028 -4.089 -7 ,29908 ,TETRA ,17555789,Fri Nov 26 04:59:11 CET,Fri Nov 26 06:28:21 CET,0.0 1.052 1.36 1.578 1.755 1.897 2.027 2.128 2.32 2.424 2.518 2.554 2.768 2.847 3.0 3.16 3.317 3.382 3.502 3.617 3.784 3.893 3.991 4.13 4.282 4.428 4.558 4.684 4.834 4.97 5.099 5.264 5.417 5.564 5.736 5.926 6.106 6.292 6.48 6.691 6.92 7.157 7.406 7.634 7.904 8.187 8.47 8.759 9.011 9.142 9.001 8.459 7.856 7.333 6.834 6.336 5.839 5.352 4.962 4.598 4.294 4.006 3.713 3.439 3.174 2.935 2.69 2.471 2.286 2.1 1.909 1.747 1.56 1.366 1.231 1.084 0.93 0.78 0.621 0.506 0.38 0.172 0.034 -0.095 -0.161 -0.307 -0.48 -0.656 -0.74 -0.971 -1.035 -1.146 -1.281 -1.567 -1.714 -1.884 -2.093 -2.334 -2.625 -3.002 -3.801 -8 ,17185 ,TETRA ,17555790,Fri Nov 26 04:58:11 CET,Fri Nov 26 06:38:45 CET,0.0 0.969 1.233 1.429 1.608 1.752 1.867 1.967 2.151 2.241 2.33 2.356 2.56 2.627 2.763 2.889 3.004 3.059 3.162 3.254 3.387 3.484 3.583 3.73 3.86 3.972 4.08 4.189 4.344 4.493 4.629 4.792 4.929 5.051 5.204 5.377 5.55 5.75 5.962 6.173 6.386 6.618 6.869 7.121 7.39 7.654 7.939 8.227 8.465 8.541 8.41 7.972 7.386 6.798 6.269 5.787 5.353 4.946 4.585 4.212 3.893 3.599 3.301 3.023 2.721 2.453 2.222 2.011 1.827 1.631 1.418 1.237 1.059 0.886 0.745 0.592 0.435 0.266 0.09 -0.028 -0.149 -0.356 -0.5 -0.642 -0.715 -0.858 -1.013 -1.183 -1.272 -1.501 -1.572 -1.679 -1.785 -2.027 -2.16 -2.296 -2.452 -2.651 -2.885 -3.244 -4.291 -9 ,31646 ,TETRA ,17555791,Fri Nov 26 04:59:11 CET,Fri Nov 26 06:44:57 CET,0.0 0.29 0.552 0.752 0.916 1.039 1.153 1.25 1.428 1.512 1.605 1.644 1.844 1.908 2.046 2.172 2.293 2.353 2.477 2.61 2.785 2.881 2.982 3.129 3.265 3.394 3.526 3.647 3.787 3.92 4.046 4.204 4.356 4.505 4.682 4.872 5.059 5.25 5.435 5.68 5.976 6.256 6.526 6.773 7.023 7.305 7.62 7.893 8.107 8.237 8.123 7.691 7.2 6.686 6.187 5.612 5.095 4.67 4.294 3.914 3.582 3.271 2.981 2.706 2.445 2.221 1.993 1.78 1.596 1.406 1.201 1.036 0.856 0.659 0.511 0.369 0.218 0.049 -0.12 -0.235 -0.363 -0.575 -0.718 -0.878 -0.964 -1.128 -1.285 -1.456 -1.546 -1.767 -1.826 -1.935 -2.052 -2.315 -2.464 -2.62 -2.767 -2.937 -3.171 -3.466 -3.996 -10 ,12436 ,TETRA ,17555792,Fri Nov 26 04:59:13 CET,Fri Nov 26 06:46:14 CET,0.0 0.876 1.177 1.38 1.555 1.717 1.849 1.968 2.187 2.283 2.367 2.375 2.573 2.644 2.782 2.916 3.054 3.124 3.237 3.341 3.501 3.595 3.684 3.812 3.927 4.042 4.181 4.324 4.49 4.659 4.813 4.988 5.154 5.304 5.476 5.664 5.841 6.031 6.234 6.446 6.664 6.907 7.165 7.415 7.704 7.984 8.238 8.505 8.783 8.95 8.836 8.393 7.88 7.356 6.856 6.369 5.933 5.532 5.179 4.815 4.492 4.21 3.927 3.652 3.412 3.185 2.945 2.725 2.528 2.336 2.134 1.958 1.747 1.501 1.304 1.097 0.915 0.75 0.581 0.464 0.344 0.146 0.0 -0.147 -0.225 -0.373 -0.527 -0.712 -0.799 -1.017 -1.067 -1.168 -1.278 -1.499 -1.622 -1.769 -1.935 -2.125 -2.349 -2.655 -3.707 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index bcf697bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5996 ,KEBNE ,17069384,Fri Dec 24 02:28:57 CET,Fri Dec 24 04:01:09 CET,0.0 0.88 1.149 1.344 1.52 1.665 1.802 1.933 2.172 2.282 2.367 2.377 2.595 2.679 2.819 2.937 3.06 3.123 3.235 3.351 3.537 3.66 3.78 3.942 4.08 4.213 4.348 4.476 4.625 4.767 4.904 5.071 5.241 5.401 5.576 5.772 5.972 6.203 6.443 6.692 6.939 7.204 7.515 7.823 8.179 8.567 9.0 9.462 9.934 10.32 10.481 10.27 9.878 9.434 8.964 8.496 8.063 7.674 7.31 6.91 6.567 6.247 5.935 5.639 5.358 5.088 4.798 4.559 4.357 4.134 3.897 3.691 3.468 3.237 3.059 2.883 2.7 2.494 2.287 2.149 2.002 1.764 1.599 1.422 1.322 1.112 0.904 0.686 0.564 0.298 0.136 -0.018 -0.168 -0.5 -0.701 -0.937 -1.175 -1.468 -1.837 -2.374 -3.908 -2 ,893 ,KEBNE ,17069385,Fri Dec 24 02:28:57 CET,Fri Dec 24 04:00:28 CET,0.0 0.628 0.881 1.036 1.186 1.336 1.47 1.568 1.754 1.846 1.936 1.978 2.191 2.274 2.449 2.601 2.728 2.787 2.91 3.025 3.203 3.324 3.426 3.586 3.744 3.872 3.989 4.108 4.265 4.429 4.585 4.762 4.924 5.093 5.33 5.595 5.838 6.106 6.362 6.602 6.862 7.171 7.504 7.797 8.117 8.489 8.897 9.301 9.663 9.973 10.101 9.875 9.525 9.107 8.657 8.206 7.772 7.363 7.011 6.632 6.269 5.954 5.657 5.352 5.068 4.789 4.493 4.252 4.044 3.821 3.573 3.36 3.127 2.877 2.706 2.528 2.341 2.154 1.946 1.807 1.671 1.432 1.259 1.085 0.992 0.792 0.581 0.348 0.218 -0.051 -0.187 -0.332 -0.48 -0.834 -1.034 -1.259 -1.543 -1.867 -2.234 -2.722 -4.432 -3 ,26075 ,KEBNE ,17069387,Fri Dec 24 02:31:08 CET,Fri Dec 24 04:03:13 CET,0.0 1.044 1.348 1.59 1.77 1.922 2.05 2.181 2.425 2.525 2.61 2.635 2.847 2.917 3.055 3.19 3.316 3.381 3.52 3.643 3.815 3.926 4.035 4.201 4.357 4.513 4.656 4.785 4.964 5.135 5.284 5.459 5.628 5.801 6.0 6.209 6.417 6.646 6.888 7.146 7.407 7.705 8.048 8.389 8.759 9.12 9.511 9.928 10.361 10.752 10.988 10.873 10.539 10.135 9.721 9.248 8.795 8.393 8.003 7.612 7.278 6.958 6.652 6.374 6.11 5.838 5.552 5.297 5.071 4.839 4.561 4.325 4.124 3.912 3.732 3.549 3.351 3.144 2.932 2.78 2.612 2.358 2.185 1.988 1.89 1.705 1.496 1.259 1.142 0.881 0.715 0.557 0.403 0.05 -0.149 -0.38 -0.658 -0.971 -1.314 -1.796 -3.759 -4 ,1 ,KEBNE ,17069390,Fri Dec 24 02:33:14 CET,Fri Dec 24 04:03:20 CET,0.0 1.17 1.482 1.69 1.86 1.999 2.136 2.292 2.534 2.628 2.723 2.75 2.956 3.033 3.183 3.318 3.44 3.498 3.614 3.734 3.906 4.013 4.115 4.262 4.401 4.531 4.654 4.776 4.939 5.09 5.237 5.41 5.561 5.717 5.911 6.129 6.34 6.555 6.782 7.029 7.288 7.564 7.874 8.188 8.549 8.926 9.302 9.723 10.199 10.666 11.002 10.895 10.558 10.116 9.638 9.163 8.732 8.308 7.913 7.528 7.206 6.911 6.606 6.317 6.039 5.787 5.525 5.272 5.039 4.795 4.569 4.387 4.191 3.972 3.789 3.597 3.394 3.193 2.982 2.827 2.668 2.397 2.214 2.046 1.949 1.725 1.503 1.274 1.151 0.887 0.755 0.603 0.439 0.058 -0.152 -0.358 -0.603 -0.868 -1.197 -1.759 -4.024 -5 ,8652 ,KEBNE ,17069392,Fri Dec 24 02:34:19 CET,Fri Dec 24 04:04:07 CET,0.0 1.069 1.326 1.494 1.64 1.768 1.879 1.98 2.146 2.242 2.342 2.377 2.587 2.668 2.832 2.983 3.117 3.18 3.302 3.411 3.562 3.671 3.78 3.928 4.073 4.208 4.34 4.481 4.645 4.779 4.919 5.106 5.273 5.425 5.611 5.827 6.047 6.279 6.503 6.733 6.973 7.243 7.568 7.905 8.281 8.649 9.057 9.506 9.932 10.317 10.602 10.431 9.993 9.541 9.061 8.584 8.166 7.765 7.37 6.955 6.617 6.3 5.99 5.705 5.441 5.191 4.926 4.692 4.476 4.231 3.985 3.787 3.583 3.371 3.213 3.045 2.856 2.657 2.423 2.258 2.107 1.88 1.711 1.521 1.426 1.244 1.047 0.824 0.7 0.433 0.284 0.14 -0.005 -0.32 -0.526 -0.773 -1.035 -1.319 -1.664 -2.122 -3.659 -6 ,15813 ,KEBNE ,17069395,Fri Dec 24 02:37:29 CET,Fri Dec 24 04:09:06 CET,0.0 1.092 1.359 1.541 1.675 1.814 1.949 2.069 2.291 2.404 2.5 2.529 2.744 2.816 2.958 3.099 3.224 3.282 3.4 3.517 3.693 3.81 3.916 4.057 4.197 4.336 4.472 4.6 4.753 4.924 5.11 5.308 5.485 5.653 5.839 6.042 6.239 6.462 6.707 6.949 7.184 7.448 7.745 8.057 8.412 8.762 9.14 9.574 10.047 10.455 10.618 10.413 10.079 9.648 9.142 8.661 8.252 7.846 7.441 7.001 6.648 6.345 6.028 5.728 5.463 5.204 4.936 4.698 4.482 4.265 4.035 3.836 3.624 3.41 3.229 3.041 2.861 2.662 2.447 2.291 2.133 1.898 1.73 1.541 1.447 1.258 1.062 0.861 0.747 0.484 0.353 0.217 0.063 -0.272 -0.458 -0.685 -0.931 -1.215 -1.592 -2.096 -3.962 -7 ,14404 ,KEBNE ,17069397,Fri Dec 24 02:45:59 CET,Fri Dec 24 04:16:09 CET,0.0 1.069 1.303 1.486 1.632 1.76 1.878 2.0 2.238 2.336 2.42 2.444 2.647 2.715 2.864 3.015 3.175 3.251 3.377 3.493 3.656 3.757 3.857 4.016 4.169 4.301 4.425 4.55 4.719 4.872 5.017 5.191 5.354 5.514 5.691 5.881 6.067 6.281 6.516 6.742 6.971 7.256 7.6 7.916 8.264 8.691 9.153 9.542 9.938 10.33 10.525 10.289 9.868 9.412 8.961 8.519 8.087 7.668 7.305 6.933 6.605 6.29 5.994 5.726 5.472 5.226 4.944 4.677 4.452 4.23 3.993 3.787 3.58 3.349 3.147 2.95 2.756 2.559 2.366 2.224 2.061 1.817 1.653 1.482 1.388 1.173 0.949 0.709 0.585 0.318 0.151 -0.003 -0.152 -0.455 -0.64 -0.858 -1.1 -1.413 -1.791 -2.322 -4.337 -8 ,18851 ,KEBNE ,17069399,Fri Dec 24 03:03:02 CET,Fri Dec 24 04:32:55 CET,0.0 0.839 1.063 1.232 1.401 1.535 1.651 1.762 1.965 2.058 2.155 2.208 2.417 2.483 2.612 2.734 2.865 2.935 3.072 3.206 3.387 3.507 3.618 3.757 3.895 4.032 4.175 4.316 4.48 4.634 4.785 4.968 5.145 5.309 5.496 5.718 5.925 6.143 6.426 6.738 7.013 7.307 7.658 7.98 8.331 8.733 9.164 9.591 9.982 10.297 10.484 10.305 9.919 9.49 9.056 8.615 8.179 7.764 7.377 6.993 6.608 6.241 5.922 5.641 5.383 5.13 4.866 4.631 4.414 4.192 3.967 3.764 3.532 3.293 3.112 2.927 2.745 2.555 2.351 2.21 2.057 1.808 1.643 1.469 1.377 1.183 0.99 0.775 0.65 0.383 0.241 0.097 -0.049 -0.371 -0.574 -0.787 -1.002 -1.285 -1.69 -2.165 -3.432 -9 ,8507 ,KEBNE ,17069401,Fri Dec 24 03:06:11 CET,Fri Dec 24 04:37:33 CET,0.0 0.788 1.076 1.272 1.434 1.592 1.742 1.858 2.069 2.168 2.271 2.344 2.564 2.641 2.787 2.923 3.065 3.14 3.289 3.426 3.589 3.69 3.79 3.951 4.105 4.241 4.371 4.486 4.686 4.906 5.075 5.266 5.449 5.614 5.809 6.024 6.224 6.457 6.712 6.956 7.191 7.463 7.796 8.099 8.45 8.845 9.24 9.623 9.972 10.288 10.422 10.184 9.757 9.266 8.804 8.331 7.871 7.437 7.05 6.666 6.33 5.986 5.587 5.152 4.762 4.447 4.154 3.906 3.677 3.429 3.182 2.984 2.762 2.526 2.352 2.177 1.991 1.781 1.559 1.406 1.24 0.968 0.792 0.605 0.5 0.3 0.082 -0.167 -0.283 -0.543 -0.71 -0.86 -0.992 -1.304 -1.495 -1.708 -1.957 -2.255 -2.568 -2.981 -4.495 -10 ,15424 ,KEBNE ,17069404,Fri Dec 24 03:26:15 CET,Fri Dec 24 04:56:38 CET,0.0 0.815 1.064 1.232 1.394 1.551 1.718 1.865 2.064 2.146 2.225 2.258 2.469 2.544 2.702 2.85 2.992 3.054 3.166 3.277 3.45 3.569 3.682 3.838 3.973 4.098 4.235 4.366 4.537 4.701 4.868 5.067 5.24 5.417 5.619 5.842 6.064 6.306 6.559 6.811 7.052 7.317 7.626 7.936 8.263 8.599 8.983 9.388 9.803 10.186 10.352 10.098 9.666 9.216 8.731 8.233 7.807 7.419 7.065 6.705 6.374 6.053 5.741 5.465 5.214 4.958 4.676 4.438 4.226 3.998 3.751 3.547 3.335 3.108 2.935 2.754 2.567 2.366 2.159 2.014 1.859 1.613 1.438 1.251 1.147 0.941 0.734 0.51 0.385 0.119 -0.029 -0.182 -0.336 -0.664 -0.83 -1.016 -1.236 -1.521 -1.875 -2.379 -4.01 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt deleted file mode 100644 index 2448511d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8630 ,TETRA ,17555793,Fri Nov 26 04:59:12 CET,Fri Nov 26 06:45:09 CET,0.0 0.812 1.149 1.374 1.57 1.731 1.847 1.956 2.146 2.234 2.318 2.353 2.571 2.643 2.793 2.938 3.061 3.123 3.242 3.357 3.514 3.616 3.715 3.859 4.009 4.152 4.286 4.415 4.567 4.717 4.872 5.043 5.205 5.376 5.575 5.786 5.993 6.226 6.491 6.766 7.031 7.342 7.688 8.03 8.446 8.904 9.418 9.981 10.59 11.169 11.742 12.022 11.951 11.807 11.617 11.371 11.11 10.847 10.604 10.353 10.124 9.924 9.732 9.525 9.322 9.127 8.92 8.738 8.57 8.397 8.206 8.053 7.897 7.735 7.617 7.485 7.332 7.16 6.991 6.879 6.764 6.581 6.455 6.32 6.238 6.053 5.842 5.624 5.527 5.302 5.234 5.135 5.023 4.747 4.589 4.413 4.182 3.95 3.73 3.407 2.321 -2 ,19718 ,TETRA ,17555794,Fri Nov 26 05:00:12 CET,Fri Nov 26 06:38:52 CET,0.0 0.863 1.113 1.36 1.562 1.724 1.866 1.981 2.183 2.295 2.421 2.492 2.705 2.782 2.928 3.083 3.226 3.297 3.438 3.565 3.747 3.86 3.963 4.129 4.285 4.423 4.549 4.667 4.819 4.968 5.122 5.31 5.485 5.649 5.837 6.052 6.255 6.475 6.703 6.956 7.236 7.531 7.886 8.228 8.642 9.099 9.58 10.096 10.618 11.171 11.741 11.973 11.92 11.774 11.564 11.333 11.099 10.844 10.579 10.314 10.083 9.869 9.663 9.457 9.247 9.046 8.851 8.671 8.51 8.355 8.203 8.062 7.901 7.734 7.597 7.444 7.287 7.132 6.974 6.871 6.757 6.553 6.419 6.285 6.212 6.056 5.893 5.726 5.635 5.414 5.329 5.222 5.112 4.844 4.696 4.53 4.362 4.17 3.939 3.646 2.925 -3 ,25460 ,TETRA ,17555795,Fri Nov 26 05:00:11 CET,Fri Nov 26 06:35:59 CET,0.0 0.881 1.17 1.425 1.618 1.748 1.87 1.989 2.185 2.274 2.363 2.389 2.605 2.688 2.84 2.995 3.139 3.199 3.324 3.443 3.598 3.701 3.808 3.951 4.073 4.195 4.329 4.46 4.622 4.807 5.007 5.235 5.426 5.588 5.777 5.996 6.216 6.451 6.762 7.134 7.448 7.762 8.094 8.414 8.797 9.224 9.705 10.214 10.816 11.448 12.022 12.272 12.243 12.081 11.868 11.595 11.317 11.069 10.811 10.536 10.323 10.112 9.89 9.632 9.382 9.204 9.027 8.846 8.682 8.514 8.348 8.207 8.043 7.872 7.736 7.6 7.47 7.328 7.18 7.076 6.961 6.774 6.648 6.515 6.442 6.297 6.151 6.0 5.918 5.689 5.593 5.486 5.373 5.119 4.973 4.813 4.643 4.43 4.168 3.833 2.863 -4 ,4954 ,TETRA ,17555796,Fri Nov 26 05:00:11 CET,Fri Nov 26 06:45:47 CET,0.0 0.48 0.697 0.913 1.095 1.242 1.365 1.489 1.733 1.838 1.922 1.917 2.118 2.197 2.351 2.492 2.619 2.678 2.799 2.93 3.123 3.227 3.321 3.458 3.6 3.737 3.87 4.012 4.193 4.354 4.503 4.687 4.866 5.034 5.226 5.45 5.67 5.9 6.144 6.404 6.669 6.965 7.318 7.669 8.055 8.484 8.933 9.371 9.9 10.517 11.116 11.42 11.423 11.237 10.998 10.742 10.491 10.228 9.987 9.741 9.494 9.259 9.06 8.864 8.669 8.501 8.321 8.104 7.887 7.696 7.514 7.362 7.203 7.033 6.9 6.755 6.607 6.45 6.287 6.178 6.064 5.89 5.756 5.623 5.55 5.391 5.253 5.105 5.016 4.791 4.723 4.611 4.486 4.207 4.053 3.881 3.701 3.507 3.274 2.963 1.941 -5 ,8144 ,TETRA ,17555797,Fri Nov 26 05:01:12 CET,Fri Nov 26 06:49:24 CET,0.0 0.797 1.08 1.311 1.467 1.598 1.718 1.825 2.064 2.179 2.275 2.304 2.514 2.587 2.729 2.872 2.999 3.06 3.186 3.306 3.465 3.567 3.666 3.801 3.929 4.06 4.19 4.314 4.466 4.62 4.776 4.96 5.128 5.293 5.488 5.706 5.915 6.153 6.415 6.686 6.986 7.327 7.678 8.007 8.37 8.767 9.237 9.742 10.299 10.857 11.394 11.628 11.532 11.336 11.114 10.869 10.617 10.369 10.16 9.917 9.697 9.49 9.27 9.064 8.866 8.68 8.492 8.324 8.172 8.006 7.826 7.665 7.496 7.323 7.178 7.028 6.881 6.734 6.577 6.466 6.357 6.188 6.069 5.927 5.85 5.699 5.553 5.384 5.284 5.06 5.008 4.911 4.8 4.518 4.356 4.205 4.053 3.867 3.615 3.293 2.217 -6 ,8233 ,TETRA ,17555798,Fri Nov 26 05:01:13 CET,Fri Nov 26 06:52:00 CET,0.0 0.989 1.272 1.484 1.662 1.791 1.899 2.01 2.212 2.299 2.381 2.409 2.62 2.693 2.838 2.972 3.088 3.144 3.255 3.361 3.519 3.623 3.722 3.873 4.018 4.158 4.293 4.436 4.619 4.784 4.942 5.116 5.276 5.437 5.626 5.837 6.049 6.279 6.523 6.779 7.054 7.36 7.706 8.066 8.476 8.908 9.377 9.905 10.482 11.052 11.626 11.888 11.854 11.669 11.42 11.156 10.933 10.69 10.437 10.188 9.971 9.755 9.545 9.347 9.146 8.96 8.761 8.59 8.445 8.279 8.105 7.96 7.797 7.624 7.493 7.348 7.205 7.065 6.903 6.79 6.668 6.467 6.334 6.209 6.142 5.982 5.824 5.648 5.547 5.329 5.249 5.126 5.014 4.764 4.622 4.462 4.267 4.066 3.83 3.498 2.616 -7 ,9594 ,TETRA ,17555799,Fri Nov 26 05:01:12 CET,Fri Nov 26 06:46:54 CET,0.0 0.904 1.269 1.494 1.68 1.843 1.988 2.113 2.323 2.422 2.514 2.543 2.752 2.829 2.978 3.129 3.289 3.361 3.483 3.602 3.771 3.875 3.986 4.159 4.312 4.455 4.586 4.713 4.888 5.043 5.185 5.365 5.536 5.702 5.908 6.135 6.352 6.596 6.838 7.076 7.331 7.616 7.952 8.306 8.697 9.128 9.627 10.147 10.717 11.315 11.851 12.064 12.004 11.835 11.642 11.429 11.178 10.927 10.708 10.47 10.248 10.031 9.826 9.626 9.428 9.25 9.045 8.855 8.697 8.534 8.358 8.213 8.035 7.843 7.721 7.599 7.467 7.312 7.142 7.025 6.908 6.721 6.572 6.427 6.36 6.216 6.071 5.907 5.816 5.59 5.509 5.401 5.285 5.029 4.888 4.73 4.552 4.358 4.137 3.753 2.761 -8 ,14266 ,TETRA ,17555800,Fri Nov 26 05:01:12 CET,Fri Nov 26 06:47:29 CET,0.0 1.131 1.445 1.663 1.818 1.986 2.146 2.269 2.487 2.591 2.697 2.732 2.939 3.011 3.146 3.29 3.428 3.484 3.595 3.715 3.875 3.975 4.07 4.213 4.351 4.484 4.627 4.76 4.92 5.079 5.231 5.462 5.725 5.93 6.126 6.35 6.551 6.777 7.025 7.287 7.563 7.843 8.165 8.486 8.86 9.29 9.773 10.324 10.899 11.517 12.163 12.404 12.364 12.159 11.946 11.719 11.452 11.193 10.984 10.778 10.561 10.341 10.124 9.92 9.728 9.542 9.338 9.148 8.991 8.831 8.65 8.482 8.302 8.125 7.993 7.854 7.707 7.551 7.387 7.274 7.162 6.992 6.863 6.724 6.655 6.521 6.377 6.207 6.114 5.89 5.821 5.723 5.61 5.341 5.2 5.056 4.901 4.737 4.534 4.213 3.438 -9 ,22928 ,TETRA ,17555801,Fri Nov 26 05:01:12 CET,Fri Nov 26 06:49:14 CET,0.0 1.046 1.298 1.498 1.668 1.825 1.949 2.059 2.266 2.379 2.489 2.531 2.746 2.819 2.972 3.125 3.262 3.329 3.466 3.589 3.749 3.852 3.948 4.092 4.227 4.357 4.489 4.611 4.766 4.926 5.089 5.288 5.478 5.648 5.829 6.04 6.23 6.428 6.663 6.912 7.173 7.508 7.888 8.224 8.622 9.043 9.497 10.015 10.598 11.209 11.832 12.113 12.054 11.849 11.581 11.323 11.079 10.848 10.621 10.36 10.087 9.839 9.619 9.395 9.196 9.005 8.802 8.628 8.47 8.299 8.121 7.98 7.828 7.66 7.533 7.405 7.27 7.13 6.975 6.855 6.731 6.53 6.39 6.258 6.193 6.057 5.909 5.747 5.661 5.444 5.382 5.279 5.172 4.909 4.75 4.582 4.417 4.234 4.009 3.659 2.579 -10 ,23766 ,TETRA ,17555802,Fri Nov 26 05:02:11 CET,Fri Nov 26 06:49:07 CET,0.0 1.089 1.376 1.549 1.687 1.84 1.999 2.113 2.302 2.395 2.47 2.485 2.685 2.75 2.889 3.022 3.145 3.205 3.327 3.45 3.609 3.711 3.819 3.965 4.105 4.24 4.363 4.48 4.642 4.804 4.942 5.094 5.249 5.414 5.615 5.845 6.066 6.293 6.523 6.767 7.031 7.339 7.696 8.026 8.398 8.823 9.361 9.95 10.521 11.147 11.753 12.046 12.015 11.838 11.596 11.34 11.084 10.805 10.548 10.294 10.083 9.879 9.658 9.46 9.28 9.11 8.932 8.763 8.605 8.446 8.277 8.126 7.962 7.79 7.666 7.528 7.376 7.221 7.048 6.931 6.82 6.648 6.523 6.378 6.304 6.168 6.012 5.834 5.743 5.525 5.471 5.356 5.232 4.966 4.817 4.664 4.499 4.313 4.064 3.647 2.642 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 871746cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3761 ,TETRA ,17555803,Fri Nov 26 05:02:14 CET,Fri Nov 26 06:49:18 CET,0.0 0.255 0.4 0.509 0.595 0.682 0.783 0.881 1.043 1.109 1.17 1.175 1.372 1.426 1.523 1.612 1.705 1.749 1.83 1.903 2.0 2.066 2.139 2.24 2.329 2.422 2.516 2.601 2.699 2.808 2.924 3.057 3.19 3.313 3.451 3.608 3.742 3.9 4.081 4.267 4.449 4.649 4.91 5.188 5.496 5.794 6.089 6.425 6.777 6.985 6.915 6.359 5.656 4.971 4.314 3.649 2.984 2.218 1.45 0.714 0.091 -0.464 -0.979 -1.425 -1.805 -2.158 -2.554 -2.914 -3.225 -3.561 -3.93 -4.233 -4.539 -4.876 -5.137 -5.41 -5.713 -6.026 -6.337 -6.556 -6.79 -7.173 -7.434 -7.692 -7.815 -8.047 -8.306 -8.614 -8.787 -9.114 -9.326 -9.514 -9.692 -10.114 -10.385 -10.692 -11.032 -11.404 -11.866 -12.536 -14.728 -2 ,4157 ,TETRA ,17555804,Fri Nov 26 05:02:11 CET,Fri Nov 26 06:50:04 CET,0.0 0.302 0.43 0.53 0.618 0.702 0.768 0.827 0.946 1.007 1.078 1.086 1.279 1.328 1.426 1.512 1.587 1.629 1.708 1.777 1.876 1.946 2.019 2.115 2.206 2.304 2.399 2.479 2.572 2.667 2.77 2.897 3.014 3.129 3.26 3.394 3.517 3.67 3.854 4.047 4.239 4.44 4.677 4.901 5.146 5.437 5.769 6.081 6.366 6.605 6.585 6.009 5.247 4.551 3.818 3.076 2.48 1.944 1.283 0.477 -0.238 -0.859 -1.413 -1.942 -2.413 -2.807 -3.2 -3.571 -3.899 -4.246 -4.659 -4.993 -5.286 -5.611 -5.872 -6.111 -6.377 -6.694 -7.033 -7.249 -7.46 -7.81 -8.07 -8.326 -8.452 -8.737 -9.042 -9.364 -9.53 -9.845 -10.036 -10.234 -10.452 -10.924 -11.192 -11.49 -11.817 -12.171 -12.618 -13.182 -15.381 -3 ,11674 ,TETRA ,17555805,Fri Nov 26 05:03:12 CET,Fri Nov 26 06:47:56 CET,0.0 0.166 0.265 0.348 0.418 0.5 0.583 0.65 0.759 0.814 0.868 0.83 1.026 1.085 1.181 1.278 1.367 1.402 1.476 1.555 1.668 1.744 1.815 1.91 2.005 2.096 2.18 2.261 2.365 2.473 2.585 2.716 2.837 2.949 3.082 3.248 3.415 3.588 3.776 3.974 4.169 4.376 4.618 4.839 5.082 5.327 5.603 5.903 6.131 6.281 6.185 5.663 4.991 4.252 3.575 2.865 2.032 1.197 0.538 -0.085 -0.622 -1.097 -1.56 -1.99 -2.398 -2.799 -3.206 -3.55 -3.864 -4.177 -4.496 -4.798 -5.118 -5.427 -5.656 -5.917 -6.209 -6.475 -6.778 -7.012 -7.242 -7.59 -7.831 -8.096 -8.23 -8.492 -8.778 -9.114 -9.291 -9.623 -9.866 -10.072 -10.302 -10.785 -11.045 -11.315 -11.637 -12.046 -12.515 -13.156 -15.843 -4 ,3082 ,TETRA ,17555806,Fri Nov 26 05:04:12 CET,Fri Nov 26 06:50:55 CET,0.0 0.208 0.303 0.409 0.518 0.607 0.699 0.77 0.893 0.95 1.005 0.999 1.202 1.264 1.371 1.462 1.547 1.587 1.668 1.748 1.862 1.932 2.014 2.169 2.333 2.496 2.659 2.816 3.006 3.184 3.356 3.56 3.711 3.821 3.947 4.092 4.244 4.418 4.607 4.81 5.018 5.244 5.5 5.757 6.048 6.353 6.644 6.935 7.191 7.31 7.232 6.719 6.104 5.486 4.777 4.049 3.398 2.823 2.317 1.767 1.258 0.785 0.347 -0.112 -0.573 -0.979 -1.433 -1.875 -2.26 -2.621 -2.97 -3.281 -3.596 -3.905 -4.162 -4.448 -4.74 -5.027 -5.323 -5.529 -5.742 -6.089 -6.326 -6.568 -6.695 -6.958 -7.255 -7.579 -7.752 -8.083 -8.32 -8.534 -8.743 -9.207 -9.491 -9.802 -10.142 -10.529 -10.993 -11.599 -13.24 -5 ,21128 ,TETRA ,17555807,Fri Nov 26 05:04:11 CET,Fri Nov 26 06:49:41 CET,0.0 0.169 0.301 0.413 0.497 0.568 0.646 0.729 0.894 0.967 1.028 0.998 1.183 1.231 1.331 1.429 1.51 1.547 1.623 1.699 1.813 1.888 1.962 2.071 2.171 2.26 2.351 2.46 2.629 2.79 2.916 3.041 3.168 3.296 3.437 3.598 3.752 3.919 4.11 4.301 4.487 4.703 4.957 5.203 5.461 5.744 6.058 6.363 6.621 6.739 6.521 5.859 5.095 4.307 3.618 2.985 2.36 1.718 1.096 0.476 -0.053 -0.516 -0.943 -1.377 -1.803 -2.202 -2.608 -2.974 -3.308 -3.646 -3.995 -4.286 -4.595 -4.958 -5.233 -5.508 -5.812 -6.131 -6.458 -6.674 -6.906 -7.262 -7.494 -7.736 -7.864 -8.165 -8.497 -8.842 -9.028 -9.36 -9.599 -9.803 -10.015 -10.492 -10.759 -11.037 -11.328 -11.664 -12.107 -12.752 -14.976 -6 ,10769 ,TETRA ,17555808,Fri Nov 26 05:05:11 CET,Fri Nov 26 06:44:26 CET,0.0 0.397 0.521 0.634 0.729 0.82 0.895 0.966 1.103 1.159 1.215 1.201 1.396 1.447 1.543 1.644 1.745 1.787 1.868 1.94 2.043 2.116 2.182 2.283 2.38 2.473 2.567 2.655 2.757 2.854 2.951 3.086 3.214 3.319 3.435 3.567 3.703 3.852 4.009 4.185 4.387 4.621 4.895 5.138 5.388 5.656 5.91 6.156 6.427 6.557 6.319 5.724 5.012 4.243 3.509 2.833 2.223 1.557 0.939 0.336 -0.195 -0.685 -1.181 -1.634 -2.039 -2.427 -2.836 -3.182 -3.48 -3.807 -4.15 -4.458 -4.796 -5.152 -5.419 -5.686 -5.957 -6.221 -6.497 -6.703 -6.928 -7.276 -7.515 -7.757 -7.89 -8.186 -8.487 -8.814 -8.991 -9.316 -9.542 -9.738 -9.952 -10.427 -10.682 -10.972 -11.298 -11.681 -12.16 -12.8 -15.038 -7 ,5498 ,TETRA ,17555809,Fri Nov 26 05:05:12 CET,Fri Nov 26 06:44:32 CET,0.0 0.237 0.329 0.413 0.502 0.589 0.67 0.742 0.863 0.916 0.964 0.925 1.117 1.165 1.256 1.343 1.425 1.465 1.536 1.609 1.725 1.801 1.869 1.969 2.075 2.175 2.268 2.354 2.465 2.57 2.679 2.818 2.94 3.066 3.213 3.361 3.508 3.68 3.861 4.05 4.268 4.504 4.754 4.973 5.23 5.535 5.827 6.105 6.375 6.488 6.271 5.643 4.956 4.275 3.576 2.926 2.264 1.553 0.97 0.366 -0.178 -0.659 -1.131 -1.57 -1.978 -2.397 -2.835 -3.198 -3.508 -3.837 -4.2 -4.501 -4.806 -5.121 -5.364 -5.616 -5.895 -6.205 -6.532 -6.761 -6.981 -7.314 -7.558 -7.823 -7.961 -8.25 -8.573 -8.918 -9.093 -9.414 -9.639 -9.853 -10.07 -10.533 -10.796 -11.093 -11.426 -11.809 -12.3 -12.989 -15.826 -8 ,3578 ,TETRA ,17555810,Fri Nov 26 05:05:11 CET,Fri Nov 26 06:49:31 CET,0.0 0.379 0.496 0.594 0.691 0.784 0.862 0.924 1.047 1.104 1.156 1.128 1.315 1.365 1.471 1.559 1.645 1.688 1.769 1.848 1.957 2.025 2.085 2.185 2.297 2.41 2.512 2.6 2.712 2.816 2.919 3.037 3.157 3.275 3.4 3.54 3.706 3.894 4.086 4.303 4.507 4.765 5.126 5.424 5.691 5.958 6.237 6.507 6.787 6.977 6.801 6.2 5.521 4.833 4.137 3.373 2.568 1.751 1.029 0.31 -0.286 -0.758 -1.224 -1.69 -2.118 -2.496 -2.892 -3.29 -3.614 -3.919 -4.247 -4.524 -4.823 -5.153 -5.417 -5.681 -5.947 -6.222 -6.528 -6.748 -6.983 -7.38 -7.657 -7.934 -8.072 -8.353 -8.642 -8.939 -9.096 -9.429 -9.688 -9.889 -10.094 -10.564 -10.826 -11.117 -11.446 -11.819 -12.301 -12.949 -15.068 -9 ,19098 ,TETRA ,17555811,Fri Nov 26 05:06:12 CET,Fri Nov 26 06:50:42 CET,0.0 0.272 0.381 0.475 0.556 0.628 0.693 0.752 0.864 0.931 0.988 0.943 1.134 1.182 1.269 1.361 1.446 1.486 1.567 1.646 1.759 1.827 1.899 2.041 2.194 2.341 2.456 2.551 2.68 2.785 2.893 3.034 3.169 3.304 3.449 3.617 3.788 3.964 4.147 4.327 4.521 4.745 5.007 5.277 5.551 5.815 6.144 6.456 6.701 6.881 6.751 6.117 5.321 4.556 3.823 3.121 2.461 1.85 1.325 0.777 0.201 -0.372 -0.914 -1.439 -1.938 -2.409 -2.908 -3.348 -3.698 -4.051 -4.41 -4.701 -4.995 -5.306 -5.555 -5.809 -6.079 -6.358 -6.652 -6.862 -7.075 -7.402 -7.63 -7.872 -8.008 -8.281 -8.56 -8.889 -9.062 -9.376 -9.56 -9.737 -9.938 -10.429 -10.714 -11.013 -11.348 -11.76 -12.249 -12.861 -14.912 -10 ,30978 ,TETRA ,17555812,Fri Nov 26 05:06:12 CET,Fri Nov 26 06:53:43 CET,0.0 0.202 0.311 0.396 0.479 0.565 0.653 0.734 0.88 0.941 0.99 0.957 1.143 1.192 1.287 1.372 1.459 1.5 1.578 1.661 1.772 1.842 1.908 2.003 2.092 2.172 2.254 2.339 2.445 2.562 2.67 2.79 2.911 3.023 3.157 3.314 3.474 3.662 3.855 4.045 4.253 4.498 4.774 5.035 5.308 5.568 5.855 6.126 6.364 6.564 6.518 5.991 5.336 4.652 3.992 3.355 2.72 2.106 1.598 1.067 0.55 0.097 -0.332 -0.752 -1.153 -1.51 -1.876 -2.234 -2.569 -2.923 -3.275 -3.581 -3.913 -4.248 -4.497 -4.759 -5.032 -5.311 -5.624 -5.839 -6.065 -6.416 -6.662 -6.935 -7.075 -7.363 -7.653 -7.94 -8.102 -8.424 -8.626 -8.813 -9.016 -9.458 -9.694 -9.989 -10.333 -10.726 -11.193 -11.814 -14.3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt deleted file mode 100644 index 0a2cae06..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26244 ,TETRA ,17555813,Fri Nov 26 05:06:12 CET,Fri Nov 26 06:45:18 CET,0.0 0.576 0.795 0.935 1.05 1.166 1.261 1.338 1.486 1.554 1.611 1.671 1.75 1.797 1.907 2.001 2.088 2.13 2.2 2.272 2.382 2.445 2.507 2.593 2.67 2.743 2.806 2.875 2.958 3.034 3.111 3.193 3.266 3.33 3.41 3.496 3.578 3.672 3.761 3.846 3.931 4.014 4.096 4.155 4.217 4.279 4.329 4.347 4.286 4.117 3.651 2.937 2.309 1.767 1.283 0.83 0.432 0.08 -0.226 -0.531 -0.797 -1.032 -1.244 -1.45 -1.647 -1.829 -2.017 -2.179 -2.319 -2.466 -2.611 -2.726 -2.854 -2.985 -3.07 -3.154 -3.249 -3.356 -3.456 -3.52 -3.597 -3.71 -3.782 -3.864 -3.907 -3.993 -4.079 -4.173 -4.226 -4.326 -4.397 -4.453 -4.513 -4.636 -4.7 -4.777 -4.88 -4.984 -5.087 -5.213 -5.504 -2 ,32224 ,TETRA ,17555814,Fri Nov 26 05:06:12 CET,Fri Nov 26 06:45:33 CET,0.0 0.612 0.79 0.949 1.091 1.198 1.286 1.373 1.528 1.601 1.676 1.759 1.841 1.885 1.977 2.073 2.157 2.199 2.289 2.374 2.485 2.55 2.606 2.683 2.76 2.829 2.894 2.959 3.042 3.12 3.194 3.293 3.393 3.481 3.573 3.661 3.74 3.81 3.89 3.989 4.074 4.17 4.266 4.345 4.429 4.5 4.551 4.559 4.492 4.271 3.722 2.988 2.335 1.758 1.264 0.812 0.404 0.038 -0.269 -0.562 -0.801 -1.028 -1.255 -1.464 -1.66 -1.841 -2.031 -2.203 -2.344 -2.496 -2.659 -2.782 -2.915 -3.052 -3.157 -3.278 -3.401 -3.522 -3.648 -3.734 -3.83 -3.982 -4.083 -4.188 -4.243 -4.357 -4.469 -4.592 -4.656 -4.765 -4.848 -4.907 -4.959 -5.066 -5.133 -5.209 -5.288 -5.38 -5.503 -5.659 -6.077 -3 ,26012 ,TETRA ,17555816,Fri Nov 26 05:06:12 CET,Fri Nov 26 06:37:23 CET,0.0 0.735 0.997 1.157 1.286 1.402 1.496 1.577 1.724 1.791 1.86 1.957 2.054 2.115 2.233 2.336 2.434 2.476 2.551 2.626 2.744 2.816 2.874 2.956 3.046 3.133 3.2 3.265 3.35 3.43 3.51 3.602 3.68 3.75 3.834 3.919 3.999 4.089 4.174 4.251 4.321 4.409 4.496 4.558 4.649 4.724 4.756 4.767 4.698 4.468 3.953 3.176 2.487 1.911 1.422 0.984 0.594 0.23 -0.079 -0.375 -0.617 -0.828 -1.023 -1.207 -1.39 -1.551 -1.71 -1.847 -1.967 -2.102 -2.24 -2.343 -2.446 -2.555 -2.645 -2.734 -2.825 -2.929 -3.031 -3.097 -3.164 -3.275 -3.351 -3.43 -3.472 -3.557 -3.648 -3.738 -3.783 -3.876 -3.936 -3.997 -4.057 -4.164 -4.224 -4.298 -4.368 -4.44 -4.556 -4.731 -4.966 -4 ,24258 ,TETRA ,17555817,Fri Nov 26 05:07:11 CET,Fri Nov 26 06:38:33 CET,0.0 0.719 0.954 1.105 1.251 1.375 1.47 1.555 1.701 1.763 1.818 1.898 1.993 2.046 2.145 2.24 2.323 2.365 2.447 2.513 2.599 2.658 2.718 2.8 2.882 2.954 3.022 3.095 3.186 3.265 3.344 3.435 3.519 3.599 3.685 3.79 3.894 3.989 4.069 4.16 4.26 4.353 4.436 4.521 4.611 4.674 4.7 4.677 4.604 4.376 3.806 3.057 2.43 1.862 1.353 0.891 0.492 0.129 -0.195 -0.507 -0.76 -0.998 -1.233 -1.446 -1.652 -1.841 -2.035 -2.195 -2.33 -2.476 -2.621 -2.74 -2.867 -2.991 -3.082 -3.174 -3.261 -3.35 -3.449 -3.52 -3.587 -3.681 -3.752 -3.83 -3.869 -3.958 -4.058 -4.155 -4.201 -4.29 -4.337 -4.393 -4.463 -4.606 -4.674 -4.732 -4.81 -4.921 -5.042 -5.171 -5.495 -5 ,12279 ,TETRA ,17555818,Fri Nov 26 05:07:10 CET,Fri Nov 26 06:46:29 CET,0.0 0.892 1.074 1.234 1.398 1.549 1.658 1.748 1.925 1.995 2.058 2.131 2.216 2.272 2.385 2.479 2.556 2.595 2.671 2.737 2.82 2.864 2.916 2.997 3.069 3.141 3.206 3.263 3.338 3.413 3.489 3.569 3.639 3.714 3.799 3.879 3.954 4.044 4.132 4.211 4.301 4.388 4.473 4.554 4.633 4.691 4.723 4.727 4.645 4.396 3.876 3.13 2.487 1.933 1.424 0.96 0.57 0.216 -0.111 -0.447 -0.713 -0.935 -1.141 -1.342 -1.531 -1.702 -1.887 -2.052 -2.191 -2.331 -2.464 -2.575 -2.707 -2.848 -2.948 -3.064 -3.197 -3.32 -3.443 -3.529 -3.613 -3.736 -3.81 -3.884 -3.929 -4.035 -4.138 -4.231 -4.28 -4.372 -4.427 -4.479 -4.53 -4.641 -4.7 -4.768 -4.849 -4.943 -5.045 -5.168 -5.361 -6 ,1739 ,TETRA ,17555819,Fri Nov 26 05:08:10 CET,Fri Nov 26 06:47:33 CET,0.0 0.538 0.738 0.879 0.996 1.114 1.223 1.327 1.5 1.574 1.639 1.696 1.785 1.837 1.927 2.009 2.106 2.154 2.226 2.299 2.402 2.46 2.52 2.603 2.673 2.74 2.812 2.885 2.976 3.055 3.119 3.193 3.26 3.33 3.422 3.515 3.608 3.709 3.798 3.875 3.949 4.02 4.097 4.166 4.226 4.291 4.319 4.301 4.21 3.971 3.445 2.703 2.039 1.464 0.957 0.498 0.104 -0.252 -0.573 -0.892 -1.151 -1.377 -1.6 -1.82 -2.015 -2.192 -2.381 -2.548 -2.697 -2.853 -3.011 -3.14 -3.273 -3.416 -3.522 -3.634 -3.756 -3.872 -3.986 -4.068 -4.155 -4.307 -4.417 -4.524 -4.578 -4.687 -4.804 -4.937 -5.002 -5.112 -5.213 -5.29 -5.374 -5.579 -5.683 -5.785 -5.887 -5.979 -6.096 -6.236 -6.429 -7 ,2145 ,TETRA ,17555820,Fri Nov 26 05:08:10 CET,Fri Nov 26 06:37:55 CET,0.0 0.624 0.816 1.007 1.183 1.307 1.405 1.493 1.656 1.721 1.782 1.871 1.968 2.024 2.132 2.226 2.302 2.34 2.427 2.518 2.614 2.667 2.727 2.814 2.894 2.968 3.041 3.114 3.202 3.278 3.346 3.437 3.516 3.584 3.667 3.754 3.834 3.916 4.007 4.1 4.183 4.271 4.362 4.435 4.492 4.545 4.599 4.579 4.462 4.226 3.705 2.978 2.348 1.766 1.243 0.779 0.386 0.045 -0.268 -0.597 -0.879 -1.133 -1.365 -1.567 -1.756 -1.922 -2.109 -2.287 -2.429 -2.575 -2.727 -2.861 -3.004 -3.144 -3.246 -3.359 -3.48 -3.595 -3.713 -3.801 -3.895 -4.03 -4.116 -4.204 -4.248 -4.334 -4.416 -4.503 -4.557 -4.655 -4.714 -4.772 -4.837 -4.985 -5.065 -5.143 -5.22 -5.299 -5.385 -5.52 -5.775 -8 ,6633 ,TETRA ,17555821,Fri Nov 26 05:09:11 CET,Fri Nov 26 06:53:17 CET,0.0 0.522 0.725 0.9 1.025 1.123 1.223 1.319 1.481 1.547 1.611 1.692 1.782 1.831 1.924 2.012 2.086 2.128 2.203 2.27 2.37 2.423 2.48 2.567 2.644 2.717 2.783 2.849 2.931 3.004 3.072 3.152 3.23 3.308 3.401 3.491 3.567 3.654 3.749 3.835 3.93 4.024 4.104 4.189 4.285 4.359 4.369 4.347 4.298 4.089 3.599 2.913 2.301 1.747 1.234 0.758 0.366 0.021 -0.291 -0.614 -0.895 -1.13 -1.355 -1.561 -1.749 -1.931 -2.133 -2.307 -2.451 -2.602 -2.756 -2.885 -3.025 -3.161 -3.262 -3.375 -3.49 -3.604 -3.723 -3.814 -3.919 -4.079 -4.18 -4.274 -4.322 -4.416 -4.515 -4.619 -4.67 -4.767 -4.821 -4.876 -4.934 -5.071 -5.144 -5.221 -5.303 -5.38 -5.462 -5.595 -5.969 -9 ,15857 ,TETRA ,17555822,Fri Nov 26 05:09:10 CET,Fri Nov 26 06:48:50 CET,0.0 0.597 0.809 0.978 1.126 1.23 1.328 1.427 1.578 1.648 1.709 1.766 1.852 1.909 2.01 2.098 2.182 2.221 2.294 2.36 2.459 2.515 2.569 2.662 2.739 2.811 2.876 2.928 3.005 3.081 3.161 3.266 3.352 3.426 3.507 3.588 3.669 3.752 3.842 3.94 4.023 4.113 4.2 4.26 4.305 4.362 4.405 4.389 4.309 4.115 3.687 2.978 2.327 1.752 1.239 0.792 0.428 0.11 -0.164 -0.437 -0.668 -0.871 -1.06 -1.238 -1.41 -1.573 -1.736 -1.872 -1.997 -2.131 -2.261 -2.368 -2.49 -2.614 -2.7 -2.788 -2.877 -2.966 -3.058 -3.119 -3.182 -3.286 -3.363 -3.443 -3.484 -3.569 -3.661 -3.759 -3.804 -3.897 -3.973 -4.034 -4.092 -4.205 -4.277 -4.356 -4.43 -4.504 -4.592 -4.75 -4.978 -10 ,18817 ,TETRA ,17555823,Fri Nov 26 05:09:13 CET,Fri Nov 26 06:49:32 CET,0.0 0.441 0.673 0.855 0.974 1.093 1.21 1.29 1.406 1.463 1.526 1.614 1.699 1.743 1.835 1.936 2.032 2.069 2.14 2.214 2.316 2.371 2.419 2.488 2.566 2.656 2.733 2.793 2.875 2.958 3.028 3.106 3.18 3.251 3.338 3.431 3.521 3.613 3.707 3.812 3.899 3.984 4.075 4.16 4.25 4.305 4.325 4.324 4.237 4.004 3.527 2.747 2.016 1.41 0.909 0.456 0.054 -0.299 -0.595 -0.909 -1.198 -1.457 -1.68 -1.884 -2.068 -2.229 -2.416 -2.582 -2.719 -2.867 -3.014 -3.134 -3.262 -3.382 -3.473 -3.56 -3.643 -3.74 -3.845 -3.911 -3.984 -4.104 -4.179 -4.259 -4.299 -4.371 -4.448 -4.541 -4.589 -4.679 -4.737 -4.798 -4.872 -5.014 -5.076 -5.14 -5.212 -5.313 -5.417 -5.52 -5.814 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt deleted file mode 100644 index da8d3afa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21398 ,TETRA ,17555824,Fri Nov 26 05:10:12 CET,Fri Nov 26 06:52:36 CET,0.0 0.471 0.671 0.803 0.938 1.068 1.166 1.254 1.424 1.509 1.582 1.656 1.759 1.817 1.918 2.013 2.105 2.146 2.23 2.317 2.452 2.542 2.619 2.723 2.833 2.945 3.038 3.118 3.243 3.369 3.473 3.598 3.72 3.831 3.964 4.109 4.242 4.378 4.516 4.665 4.818 5.005 5.23 5.421 5.592 5.767 5.964 6.157 6.325 6.417 6.313 5.937 5.518 5.1 4.701 4.329 3.976 3.626 3.316 3.01 2.752 2.521 2.289 2.06 1.852 1.661 1.45 1.268 1.106 0.94 0.786 0.657 0.519 0.373 0.253 0.121 -0.019 -0.16 -0.305 -0.405 -0.504 -0.648 -0.745 -0.853 -0.91 -1.036 -1.17 -1.308 -1.378 -1.498 -1.6 -1.682 -1.779 -1.977 -2.086 -2.218 -2.36 -2.518 -2.69 -2.945 -3.889 -2 ,13748 ,TETRA ,17555825,Fri Nov 26 05:10:12 CET,Fri Nov 26 06:43:11 CET,0.0 0.604 0.817 0.943 1.051 1.167 1.285 1.378 1.555 1.651 1.738 1.836 1.946 2.014 2.134 2.25 2.354 2.4 2.489 2.575 2.696 2.777 2.856 2.966 3.07 3.163 3.26 3.364 3.49 3.612 3.723 3.857 3.992 4.112 4.229 4.353 4.475 4.624 4.792 4.961 5.121 5.282 5.474 5.68 5.884 6.072 6.269 6.464 6.642 6.718 6.552 6.175 5.734 5.235 4.757 4.297 3.909 3.582 3.288 2.989 2.735 2.499 2.274 2.059 1.856 1.678 1.483 1.303 1.151 0.998 0.833 0.676 0.511 0.346 0.225 0.102 -0.027 -0.145 -0.285 -0.393 -0.496 -0.668 -0.785 -0.899 -0.957 -1.085 -1.229 -1.365 -1.433 -1.556 -1.684 -1.781 -1.886 -2.135 -2.271 -2.41 -2.568 -2.741 -2.93 -3.209 -4.125 -3 ,184 ,TETRA ,17555826,Fri Nov 26 05:11:13 CET,Fri Nov 26 06:46:37 CET,0.0 0.583 0.862 1.059 1.198 1.304 1.412 1.51 1.66 1.734 1.809 1.885 1.99 2.057 2.187 2.306 2.419 2.472 2.57 2.657 2.78 2.873 2.961 3.075 3.176 3.276 3.376 3.474 3.596 3.705 3.806 3.928 4.05 4.162 4.281 4.422 4.557 4.704 4.856 5.013 5.174 5.346 5.541 5.733 5.931 6.131 6.344 6.559 6.774 6.904 6.789 6.428 5.993 5.536 5.106 4.691 4.313 3.976 3.707 3.419 3.132 2.878 2.648 2.424 2.213 2.016 1.806 1.627 1.48 1.321 1.148 1.0 0.86 0.719 0.606 0.493 0.37 0.238 0.098 -0.001 -0.103 -0.26 -0.364 -0.478 -0.546 -0.673 -0.79 -0.921 -0.998 -1.13 -1.246 -1.334 -1.423 -1.613 -1.735 -1.878 -2.04 -2.21 -2.395 -2.677 -3.447 -4 ,27897 ,TETRA ,17555827,Fri Nov 26 05:11:12 CET,Fri Nov 26 06:53:32 CET,0.0 0.644 0.855 1.042 1.205 1.319 1.406 1.495 1.656 1.728 1.802 1.893 2.0 2.063 2.186 2.297 2.412 2.465 2.566 2.665 2.799 2.887 2.965 3.079 3.187 3.287 3.389 3.48 3.592 3.704 3.814 3.942 4.055 4.159 4.278 4.409 4.54 4.68 4.832 5.004 5.167 5.328 5.518 5.709 5.924 6.159 6.365 6.532 6.71 6.831 6.785 6.398 5.881 5.393 4.971 4.579 4.205 3.85 3.542 3.245 3.0 2.773 2.55 2.341 2.139 1.949 1.748 1.557 1.394 1.231 1.059 0.923 0.784 0.638 0.533 0.428 0.311 0.18 0.042 -0.055 -0.16 -0.331 -0.444 -0.558 -0.618 -0.746 -0.881 -1.02 -1.099 -1.233 -1.349 -1.435 -1.538 -1.772 -1.904 -2.047 -2.191 -2.348 -2.566 -2.842 -3.61 -5 ,15340 ,TETRA ,17555828,Fri Nov 26 05:11:15 CET,Fri Nov 26 06:53:54 CET,0.0 0.529 0.859 1.086 1.234 1.349 1.452 1.552 1.718 1.786 1.855 1.947 2.056 2.114 2.231 2.336 2.426 2.477 2.573 2.66 2.791 2.87 2.944 3.058 3.162 3.255 3.342 3.439 3.579 3.696 3.796 3.911 4.008 4.11 4.241 4.388 4.528 4.68 4.837 4.986 5.143 5.315 5.496 5.679 5.903 6.116 6.306 6.485 6.633 6.724 6.592 6.203 5.752 5.242 4.77 4.364 3.992 3.626 3.302 2.987 2.72 2.483 2.256 2.047 1.863 1.686 1.478 1.288 1.128 0.973 0.82 0.683 0.532 0.366 0.244 0.113 -0.037 -0.186 -0.336 -0.434 -0.538 -0.714 -0.837 -0.954 -1.009 -1.143 -1.292 -1.423 -1.495 -1.622 -1.728 -1.815 -1.92 -2.156 -2.284 -2.423 -2.579 -2.741 -2.932 -3.172 -3.96 -6 ,4031 ,TETRA ,17555829,Fri Nov 26 05:12:12 CET,Fri Nov 26 06:54:28 CET,0.0 0.471 0.644 0.763 0.862 0.961 1.056 1.148 1.31 1.383 1.457 1.547 1.657 1.721 1.835 1.933 2.027 2.073 2.166 2.253 2.38 2.468 2.548 2.663 2.776 2.88 2.968 3.058 3.171 3.275 3.385 3.516 3.636 3.752 3.894 4.044 4.174 4.311 4.457 4.613 4.788 4.969 5.167 5.358 5.561 5.778 5.983 6.164 6.333 6.442 6.302 5.842 5.402 4.972 4.562 4.176 3.829 3.504 3.212 2.897 2.625 2.404 2.184 1.967 1.754 1.562 1.382 1.211 1.042 0.872 0.707 0.564 0.414 0.257 0.143 0.03 -0.098 -0.236 -0.384 -0.487 -0.595 -0.779 -0.907 -1.033 -1.1 -1.243 -1.391 -1.54 -1.619 -1.752 -1.879 -1.973 -2.073 -2.289 -2.41 -2.543 -2.681 -2.823 -2.991 -3.243 -3.995 -7 ,32609 ,TETRA ,17555830,Fri Nov 26 05:12:13 CET,Fri Nov 26 06:48:15 CET,0.0 0.526 0.731 0.872 0.994 1.113 1.218 1.315 1.512 1.608 1.697 1.845 1.978 2.04 2.139 2.23 2.327 2.385 2.499 2.591 2.73 2.818 2.897 3.005 3.113 3.221 3.319 3.408 3.512 3.619 3.721 3.839 3.964 4.076 4.198 4.349 4.484 4.62 4.776 4.928 5.067 5.219 5.391 5.561 5.743 5.938 6.137 6.301 6.427 6.471 6.343 5.956 5.529 5.099 4.655 4.227 3.849 3.505 3.194 2.881 2.618 2.381 2.141 1.907 1.707 1.528 1.317 1.131 0.967 0.79 0.628 0.493 0.34 0.176 0.049 -0.08 -0.212 -0.348 -0.49 -0.587 -0.693 -0.861 -0.97 -1.078 -1.141 -1.273 -1.392 -1.527 -1.601 -1.727 -1.862 -1.954 -2.047 -2.276 -2.402 -2.546 -2.713 -2.888 -3.096 -3.375 -4.419 -8 ,15572 ,TETRA ,17555831,Fri Nov 26 05:13:10 CET,Fri Nov 26 06:55:49 CET,0.0 0.675 0.904 1.077 1.183 1.279 1.373 1.46 1.627 1.698 1.763 1.864 1.985 2.047 2.174 2.296 2.403 2.452 2.554 2.643 2.746 2.818 2.9 3.016 3.112 3.212 3.311 3.406 3.527 3.632 3.726 3.839 3.963 4.095 4.236 4.373 4.504 4.657 4.818 4.981 5.142 5.329 5.544 5.725 5.9 6.087 6.291 6.472 6.634 6.76 6.7 6.347 5.945 5.505 5.051 4.645 4.284 3.925 3.614 3.318 3.051 2.81 2.589 2.371 2.143 1.94 1.744 1.573 1.424 1.265 1.104 0.959 0.81 0.657 0.538 0.416 0.293 0.157 0.017 -0.076 -0.17 -0.312 -0.419 -0.536 -0.597 -0.736 -0.886 -1.033 -1.107 -1.232 -1.356 -1.444 -1.542 -1.751 -1.865 -1.99 -2.126 -2.307 -2.527 -2.833 -3.627 -9 ,25385 ,TETRA ,17555832,Fri Nov 26 05:14:10 CET,Fri Nov 26 06:57:10 CET,0.0 0.852 1.116 1.331 1.515 1.659 1.755 1.836 2.008 2.081 2.146 2.242 2.349 2.408 2.529 2.644 2.742 2.785 2.878 2.983 3.139 3.227 3.31 3.438 3.557 3.659 3.753 3.851 3.978 4.083 4.179 4.297 4.411 4.522 4.643 4.776 4.903 5.043 5.191 5.348 5.519 5.697 5.884 6.068 6.265 6.463 6.681 6.903 7.092 7.166 7.027 6.608 6.132 5.712 5.294 4.875 4.508 4.182 3.891 3.571 3.308 3.077 2.853 2.629 2.419 2.238 2.042 1.869 1.716 1.555 1.387 1.244 1.096 0.945 0.825 0.697 0.565 0.429 0.27 0.167 0.074 -0.09 -0.204 -0.319 -0.378 -0.503 -0.642 -0.792 -0.873 -1.005 -1.123 -1.212 -1.3 -1.497 -1.611 -1.743 -1.882 -2.036 -2.244 -2.495 -3.249 -10 ,525 ,TETRA ,17555833,Fri Nov 26 05:15:12 CET,Fri Nov 26 06:59:43 CET,0.0 0.498 0.753 0.961 1.123 1.247 1.334 1.412 1.551 1.613 1.679 1.761 1.866 1.926 2.04 2.148 2.249 2.3 2.39 2.474 2.596 2.677 2.757 2.88 2.998 3.101 3.191 3.281 3.403 3.51 3.616 3.747 3.873 3.993 4.126 4.263 4.39 4.54 4.696 4.837 4.977 5.139 5.338 5.551 5.776 5.991 6.205 6.399 6.567 6.635 6.429 6.007 5.563 5.075 4.613 4.211 3.868 3.544 3.261 2.965 2.703 2.454 2.213 1.994 1.789 1.602 1.399 1.219 1.07 0.913 0.743 0.601 0.454 0.296 0.173 0.046 -0.085 -0.218 -0.359 -0.457 -0.561 -0.729 -0.855 -0.987 -1.047 -1.164 -1.294 -1.449 -1.533 -1.663 -1.795 -1.892 -1.984 -2.16 -2.264 -2.395 -2.537 -2.71 -2.941 -3.212 -4.064 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt deleted file mode 100644 index 384fc546..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11950 ,TETRA ,17555834,Fri Nov 26 05:15:12 CET,Fri Nov 26 06:42:10 CET,0.0 0.502 0.78 0.94 1.047 1.164 1.269 1.356 1.503 1.579 1.653 1.725 1.822 1.88 2.002 2.105 2.191 2.233 2.317 2.394 2.493 2.556 2.621 2.707 2.793 2.877 2.95 3.012 3.1 3.187 3.258 3.343 3.432 3.519 3.604 3.683 3.774 3.881 3.981 4.075 4.166 4.258 4.342 4.412 4.485 4.504 4.465 4.41 4.252 3.863 3.081 2.016 1.111 0.351 -0.34 -0.978 -1.511 -2.005 -2.435 -2.846 -3.203 -3.524 -3.83 -4.135 -4.408 -4.642 -4.882 -5.094 -5.293 -5.503 -5.701 -5.863 -6.049 -6.239 -6.383 -6.53 -6.687 -6.849 -7.003 -7.109 -7.228 -7.425 -7.569 -7.718 -7.791 -7.941 -8.095 -8.253 -8.344 -8.492 -8.619 -8.718 -8.826 -9.065 -9.197 -9.334 -9.492 -9.67 -9.845 -10.116 -11.309 -2 ,16482 ,TETRA ,17555835,Fri Nov 26 05:15:13 CET,Fri Nov 26 06:58:10 CET,0.0 0.527 0.745 0.884 0.998 1.11 1.219 1.311 1.447 1.508 1.575 1.656 1.756 1.812 1.923 2.018 2.128 2.183 2.282 2.369 2.474 2.54 2.606 2.698 2.783 2.865 2.943 3.017 3.113 3.2 3.291 3.4 3.486 3.56 3.644 3.742 3.845 3.948 4.035 4.118 4.201 4.289 4.377 4.437 4.48 4.505 4.512 4.474 4.277 3.862 3.105 2.079 1.127 0.29 -0.407 -1.024 -1.561 -2.045 -2.469 -2.886 -3.236 -3.548 -3.859 -4.161 -4.445 -4.705 -4.979 -5.203 -5.386 -5.59 -5.805 -5.973 -6.142 -6.334 -6.486 -6.63 -6.779 -6.937 -7.1 -7.211 -7.332 -7.522 -7.645 -7.779 -7.845 -7.978 -8.137 -8.315 -8.406 -8.559 -8.698 -8.793 -8.896 -9.133 -9.28 -9.453 -9.615 -9.781 -9.965 -10.182 -10.822 -3 ,13309 ,TETRA ,17555836,Fri Nov 26 05:16:13 CET,Fri Nov 26 06:49:59 CET,0.0 0.768 0.976 1.194 1.39 1.52 1.623 1.71 1.866 1.935 2.003 2.092 2.196 2.245 2.344 2.452 2.549 2.596 2.693 2.782 2.902 2.966 3.026 3.124 3.205 3.279 3.356 3.424 3.517 3.6 3.673 3.768 3.853 3.928 4.014 4.116 4.218 4.323 4.421 4.517 4.611 4.688 4.749 4.827 4.901 4.927 4.919 4.87 4.696 4.293 3.485 2.36 1.379 0.537 -0.192 -0.82 -1.367 -1.885 -2.325 -2.746 -3.115 -3.444 -3.76 -4.054 -4.323 -4.569 -4.825 -5.052 -5.25 -5.459 -5.667 -5.837 -6.016 -6.202 -6.347 -6.496 -6.65 -6.804 -6.966 -7.087 -7.213 -7.409 -7.543 -7.678 -7.754 -7.904 -8.047 -8.198 -8.284 -8.44 -8.581 -8.676 -8.782 -9.01 -9.139 -9.309 -9.493 -9.692 -9.938 -10.269 -11.109 -4 ,13515 ,TETRA ,17555837,Fri Nov 26 05:16:12 CET,Fri Nov 26 07:00:20 CET,0.0 0.553 0.759 0.908 1.038 1.131 1.219 1.311 1.471 1.54 1.607 1.691 1.794 1.846 1.938 2.029 2.119 2.162 2.246 2.325 2.432 2.497 2.555 2.646 2.734 2.822 2.906 2.982 3.083 3.175 3.261 3.364 3.457 3.542 3.636 3.739 3.828 3.916 3.995 4.065 4.149 4.241 4.308 4.356 4.411 4.441 4.449 4.388 4.23 3.871 3.112 2.122 1.23 0.454 -0.198 -0.769 -1.293 -1.793 -2.242 -2.678 -3.035 -3.364 -3.679 -3.982 -4.268 -4.515 -4.766 -5.006 -5.225 -5.437 -5.637 -5.794 -5.96 -6.144 -6.289 -6.434 -6.586 -6.749 -6.923 -7.042 -7.158 -7.349 -7.483 -7.615 -7.688 -7.849 -8.003 -8.175 -8.263 -8.412 -8.557 -8.655 -8.752 -8.978 -9.11 -9.246 -9.405 -9.573 -9.773 -10.059 -11.14 -5 ,21561 ,TETRA ,17555838,Fri Nov 26 05:17:12 CET,Fri Nov 26 07:00:54 CET,0.0 0.876 1.148 1.297 1.413 1.519 1.63 1.736 1.909 1.973 2.038 2.127 2.229 2.279 2.395 2.512 2.613 2.659 2.747 2.831 2.949 3.012 3.072 3.181 3.274 3.347 3.425 3.505 3.603 3.697 3.781 3.878 3.978 4.068 4.158 4.257 4.337 4.431 4.534 4.623 4.708 4.813 4.927 5.006 5.065 5.101 5.093 5.001 4.81 4.44 3.701 2.704 1.791 0.992 0.293 -0.332 -0.875 -1.363 -1.784 -2.21 -2.577 -2.911 -3.228 -3.523 -3.797 -4.048 -4.32 -4.558 -4.75 -4.96 -5.171 -5.357 -5.558 -5.747 -5.895 -6.043 -6.19 -6.348 -6.506 -6.613 -6.728 -6.908 -7.03 -7.155 -7.225 -7.369 -7.535 -7.728 -7.819 -7.959 -8.086 -8.187 -8.285 -8.491 -8.618 -8.778 -8.943 -9.094 -9.265 -9.484 -10.527 -6 ,8203 ,TETRA ,17555839,Fri Nov 26 05:17:12 CET,Fri Nov 26 06:59:43 CET,0.0 0.713 1.004 1.185 1.327 1.451 1.544 1.628 1.778 1.84 1.903 1.999 2.119 2.187 2.294 2.394 2.496 2.54 2.629 2.72 2.85 2.929 2.998 3.091 3.181 3.269 3.353 3.437 3.535 3.614 3.683 3.768 3.851 3.925 4.008 4.104 4.179 4.252 4.327 4.416 4.504 4.586 4.684 4.77 4.839 4.853 4.819 4.737 4.568 4.235 3.541 2.524 1.566 0.74 0.028 -0.621 -1.179 -1.656 -2.08 -2.521 -2.891 -3.212 -3.506 -3.788 -4.058 -4.312 -4.573 -4.797 -4.993 -5.193 -5.403 -5.579 -5.757 -5.951 -6.086 -6.214 -6.359 -6.522 -6.701 -6.819 -6.936 -7.117 -7.239 -7.371 -7.441 -7.585 -7.741 -7.897 -7.98 -8.125 -8.25 -8.345 -8.445 -8.674 -8.8 -8.94 -9.094 -9.241 -9.41 -9.681 -10.598 -7 ,17325 ,TETRA ,17555840,Fri Nov 26 05:17:15 CET,Fri Nov 26 07:00:04 CET,0.0 0.866 1.087 1.243 1.376 1.5 1.615 1.718 1.879 1.959 2.029 2.093 2.191 2.244 2.358 2.471 2.576 2.62 2.702 2.783 2.901 2.965 3.031 3.13 3.222 3.314 3.396 3.472 3.58 3.667 3.744 3.845 3.936 4.017 4.106 4.207 4.302 4.39 4.471 4.561 4.646 4.731 4.831 4.909 4.968 5.0 4.992 4.928 4.768 4.38 3.573 2.525 1.594 0.784 0.063 -0.608 -1.17 -1.665 -2.095 -2.504 -2.869 -3.193 -3.484 -3.766 -4.04 -4.292 -4.549 -4.773 -4.965 -5.167 -5.373 -5.546 -5.734 -5.929 -6.076 -6.234 -6.397 -6.556 -6.727 -6.848 -6.972 -7.16 -7.284 -7.412 -7.477 -7.608 -7.757 -7.922 -8.006 -8.152 -8.301 -8.403 -8.504 -8.75 -8.889 -9.039 -9.211 -9.4 -9.652 -9.945 -11.163 -8 ,29907 ,TETRA ,17555841,Fri Nov 26 05:17:12 CET,Fri Nov 26 07:01:39 CET,0.0 0.65 0.85 1.006 1.141 1.259 1.369 1.463 1.653 1.738 1.799 1.862 1.958 2.001 2.086 2.181 2.273 2.323 2.415 2.49 2.602 2.67 2.731 2.825 2.915 2.996 3.067 3.137 3.228 3.315 3.397 3.492 3.572 3.643 3.73 3.824 3.911 3.995 4.066 4.155 4.256 4.359 4.456 4.523 4.582 4.616 4.602 4.538 4.388 4.047 3.264 2.179 1.24 0.401 -0.301 -0.917 -1.466 -1.959 -2.382 -2.822 -3.203 -3.53 -3.834 -4.124 -4.404 -4.65 -4.899 -5.133 -5.338 -5.537 -5.739 -5.916 -6.095 -6.276 -6.424 -6.589 -6.761 -6.923 -7.083 -7.201 -7.327 -7.518 -7.651 -7.78 -7.844 -7.974 -8.113 -8.268 -8.35 -8.494 -8.625 -8.729 -8.836 -9.049 -9.176 -9.32 -9.466 -9.63 -9.833 -10.182 -11.177 -9 ,10831 ,TETRA ,17555842,Fri Nov 26 05:18:12 CET,Fri Nov 26 06:48:44 CET,0.0 0.523 0.768 0.949 1.09 1.198 1.293 1.382 1.546 1.628 1.706 1.78 1.877 1.932 2.033 2.128 2.218 2.262 2.345 2.426 2.555 2.631 2.692 2.776 2.851 2.926 3.01 3.098 3.198 3.272 3.346 3.438 3.522 3.606 3.701 3.794 3.87 3.951 4.033 4.121 4.218 4.317 4.409 4.488 4.561 4.591 4.546 4.434 4.238 3.854 3.02 1.938 1.029 0.203 -0.515 -1.16 -1.716 -2.198 -2.62 -3.05 -3.423 -3.767 -4.093 -4.393 -4.672 -4.928 -5.183 -5.403 -5.587 -5.777 -5.982 -6.151 -6.34 -6.532 -6.665 -6.808 -6.962 -7.12 -7.294 -7.408 -7.523 -7.708 -7.837 -7.975 -8.045 -8.191 -8.348 -8.513 -8.594 -8.731 -8.849 -8.941 -9.041 -9.268 -9.39 -9.524 -9.693 -9.886 -10.116 -10.438 -11.41 -10 ,19149 ,TETRA ,17555843,Fri Nov 26 05:18:11 CET,Fri Nov 26 07:01:44 CET,0.0 0.572 0.809 0.975 1.074 1.166 1.264 1.359 1.526 1.591 1.657 1.741 1.846 1.903 2.01 2.11 2.194 2.241 2.337 2.423 2.534 2.606 2.683 2.787 2.878 2.963 3.042 3.126 3.233 3.319 3.404 3.511 3.602 3.676 3.766 3.872 3.963 4.058 4.162 4.262 4.341 4.425 4.5 4.566 4.642 4.675 4.662 4.612 4.476 4.125 3.373 2.315 1.41 0.628 -0.061 -0.685 -1.249 -1.766 -2.212 -2.641 -3.001 -3.322 -3.63 -3.918 -4.184 -4.428 -4.685 -4.909 -5.102 -5.309 -5.525 -5.689 -5.855 -6.038 -6.182 -6.331 -6.486 -6.641 -6.804 -6.925 -7.05 -7.24 -7.376 -7.517 -7.587 -7.729 -7.865 -8.011 -8.095 -8.232 -8.351 -8.454 -8.561 -8.784 -8.908 -9.049 -9.226 -9.411 -9.623 -9.909 -10.927 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt deleted file mode 100644 index 9885d534..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3735 ,TETRA ,17555844,Fri Nov 26 05:18:11 CET,Fri Nov 26 07:00:15 CET,0.0 0.15 0.238 0.306 0.382 0.468 0.548 0.618 0.73 0.782 0.837 0.889 0.983 1.026 1.109 1.183 1.256 1.298 1.378 1.453 1.556 1.62 1.685 1.785 1.886 1.975 2.056 2.134 2.246 2.362 2.467 2.594 2.717 2.834 2.971 3.136 3.299 3.471 3.668 3.884 4.11 4.367 4.656 4.959 5.325 5.728 6.216 6.776 7.436 8.208 9.105 9.823 10.17 10.319 10.393 10.399 10.368 10.32 10.258 10.182 10.085 9.972 9.862 9.742 9.619 9.519 9.406 9.298 9.187 9.067 8.958 8.863 8.75 8.616 8.519 8.429 8.32 8.199 8.078 7.99 7.891 7.733 7.624 7.502 7.441 7.319 7.191 7.051 6.98 6.87 6.728 6.624 6.513 6.266 6.105 5.928 5.734 5.49 5.194 4.787 3.31 -2 ,5175 ,TETRA ,17555845,Fri Nov 26 05:18:11 CET,Fri Nov 26 07:01:20 CET,0.0 0.177 0.263 0.329 0.393 0.467 0.539 0.593 0.679 0.725 0.775 0.818 0.905 0.944 1.017 1.092 1.17 1.208 1.28 1.352 1.454 1.52 1.589 1.687 1.779 1.866 1.948 2.027 2.13 2.238 2.351 2.485 2.607 2.723 2.867 3.039 3.205 3.396 3.592 3.796 4.023 4.276 4.582 4.891 5.276 5.705 6.168 6.708 7.359 8.116 9.003 9.69 10.019 10.183 10.258 10.259 10.215 10.14 10.064 9.968 9.876 9.768 9.644 9.532 9.416 9.308 9.189 9.077 8.98 8.861 8.715 8.59 8.47 8.347 8.248 8.142 8.032 7.917 7.791 7.703 7.618 7.485 7.387 7.28 7.226 7.102 6.954 6.804 6.727 6.604 6.428 6.316 6.201 5.922 5.736 5.525 5.32 5.095 4.759 4.281 2.742 -3 ,1297 ,TETRA ,17555846,Fri Nov 26 05:18:14 CET,Fri Nov 26 07:02:06 CET,0.0 0.301 0.393 0.46 0.521 0.588 0.65 0.701 0.803 0.853 0.904 0.95 1.042 1.084 1.17 1.256 1.33 1.365 1.434 1.509 1.618 1.678 1.742 1.841 1.935 2.025 2.111 2.196 2.304 2.41 2.521 2.65 2.775 2.897 3.039 3.199 3.358 3.537 3.719 3.928 4.153 4.407 4.715 5.034 5.417 5.834 6.303 6.853 7.491 8.249 9.2 9.927 10.312 10.499 10.544 10.507 10.454 10.37 10.277 10.188 10.092 9.981 9.858 9.733 9.604 9.49 9.366 9.252 9.151 9.041 8.921 8.798 8.658 8.524 8.43 8.324 8.209 8.084 7.943 7.848 7.759 7.6 7.482 7.383 7.323 7.179 7.041 6.889 6.798 6.658 6.498 6.388 6.25 5.958 5.804 5.627 5.422 5.167 4.857 4.417 2.103 -4 ,22069 ,TETRA ,17555847,Fri Nov 26 05:18:11 CET,Fri Nov 26 07:00:04 CET,0.0 0.191 0.298 0.369 0.434 0.488 0.544 0.606 0.714 0.759 0.806 0.847 0.937 0.979 1.065 1.148 1.229 1.267 1.337 1.408 1.515 1.583 1.647 1.746 1.842 1.927 2.005 2.081 2.186 2.296 2.41 2.553 2.677 2.793 2.934 3.091 3.246 3.418 3.608 3.817 4.044 4.311 4.623 4.938 5.31 5.736 6.24 6.794 7.432 8.176 9.049 9.726 10.055 10.191 10.225 10.21 10.174 10.124 10.051 9.947 9.834 9.704 9.586 9.482 9.364 9.244 9.123 9.005 8.907 8.792 8.654 8.536 8.402 8.262 8.167 8.073 7.963 7.838 7.712 7.625 7.531 7.394 7.281 7.151 7.084 6.934 6.78 6.629 6.55 6.428 6.271 6.166 6.044 5.777 5.64 5.487 5.29 5.035 4.742 4.365 3.176 -5 ,25136 ,TETRA ,17555848,Fri Nov 26 05:19:11 CET,Fri Nov 26 07:02:48 CET,0.0 0.291 0.375 0.449 0.525 0.595 0.657 0.711 0.813 0.86 0.91 0.959 1.051 1.09 1.176 1.271 1.352 1.387 1.456 1.524 1.622 1.69 1.757 1.858 1.958 2.052 2.142 2.227 2.342 2.456 2.567 2.7 2.825 2.944 3.092 3.262 3.427 3.617 3.819 4.029 4.26 4.522 4.823 5.138 5.514 5.926 6.411 6.977 7.626 8.405 9.367 10.058 10.403 10.581 10.646 10.647 10.61 10.539 10.451 10.346 10.248 10.143 10.028 9.917 9.8 9.687 9.57 9.457 9.354 9.246 9.121 9.018 8.911 8.789 8.697 8.594 8.473 8.351 8.217 8.123 8.032 7.875 7.762 7.649 7.586 7.44 7.289 7.128 7.04 6.912 6.758 6.655 6.552 6.304 6.151 5.983 5.773 5.501 5.181 4.792 3.635 -6 ,25030 ,TETRA ,17555849,Fri Nov 26 05:19:10 CET,Fri Nov 26 07:01:20 CET,0.0 0.241 0.366 0.453 0.526 0.599 0.666 0.72 0.837 0.896 0.951 1.01 1.107 1.152 1.235 1.315 1.396 1.435 1.505 1.581 1.694 1.769 1.843 1.942 2.034 2.123 2.218 2.311 2.428 2.539 2.644 2.778 2.908 3.025 3.165 3.323 3.482 3.663 3.859 4.076 4.297 4.554 4.859 5.156 5.517 5.933 6.405 6.948 7.589 8.346 9.236 9.912 10.276 10.455 10.519 10.486 10.424 10.372 10.304 10.189 10.041 9.9 9.79 9.692 9.583 9.48 9.36 9.229 9.115 8.989 8.86 8.752 8.634 8.508 8.408 8.307 8.193 8.052 7.914 7.829 7.734 7.595 7.493 7.361 7.282 7.125 6.976 6.774 6.661 6.525 6.353 6.236 6.106 5.796 5.632 5.47 5.266 5.016 4.726 4.324 3.216 -7 ,19124 ,TETRA ,17555850,Fri Nov 26 05:19:11 CET,Fri Nov 26 07:01:33 CET,0.0 0.517 0.606 0.684 0.753 0.813 0.88 0.941 1.039 1.085 1.129 1.181 1.283 1.339 1.442 1.528 1.597 1.631 1.706 1.776 1.875 1.946 2.014 2.108 2.194 2.281 2.371 2.456 2.562 2.665 2.765 2.888 3.007 3.125 3.263 3.423 3.583 3.752 3.946 4.174 4.416 4.673 4.982 5.289 5.659 6.081 6.566 7.137 7.794 8.564 9.466 10.178 10.536 10.689 10.746 10.741 10.691 10.61 10.509 10.403 10.302 10.185 10.062 9.934 9.813 9.703 9.578 9.47 9.378 9.268 9.147 9.032 8.906 8.791 8.702 8.603 8.493 8.375 8.254 8.169 8.072 7.909 7.79 7.664 7.593 7.441 7.281 7.104 7.002 6.857 6.68 6.568 6.449 6.169 5.999 5.796 5.583 5.332 5.016 4.578 3.172 -8 ,24410 ,TETRA ,17555851,Fri Nov 26 05:19:11 CET,Fri Nov 26 07:00:46 CET,0.0 0.273 0.361 0.423 0.486 0.544 0.597 0.653 0.764 0.815 0.86 0.908 1.002 1.043 1.127 1.212 1.29 1.326 1.404 1.479 1.587 1.658 1.724 1.828 1.931 2.024 2.119 2.211 2.336 2.464 2.582 2.721 2.852 2.988 3.153 3.333 3.499 3.679 3.873 4.081 4.298 4.55 4.848 5.152 5.513 5.922 6.413 6.986 7.628 8.374 9.239 9.85 10.14 10.253 10.276 10.279 10.206 10.083 9.99 9.871 9.763 9.684 9.597 9.493 9.361 9.231 9.106 8.983 8.872 8.762 8.652 8.56 8.455 8.337 8.246 8.136 8.019 7.913 7.796 7.701 7.598 7.436 7.314 7.189 7.126 6.983 6.822 6.645 6.545 6.407 6.244 6.136 6.023 5.755 5.597 5.412 5.221 5.009 4.704 4.219 2.763 -9 ,5059 ,TETRA ,17555852,Fri Nov 26 05:19:13 CET,Fri Nov 26 07:01:08 CET,0.0 0.148 0.249 0.334 0.406 0.47 0.539 0.608 0.72 0.766 0.813 0.853 0.944 0.99 1.078 1.157 1.236 1.274 1.347 1.419 1.521 1.591 1.658 1.752 1.857 1.953 2.038 2.129 2.248 2.362 2.475 2.603 2.723 2.847 2.994 3.159 3.311 3.472 3.655 3.857 4.082 4.341 4.649 4.965 5.326 5.74 6.224 6.779 7.449 8.226 9.125 9.819 10.147 10.332 10.426 10.424 10.384 10.335 10.255 10.151 10.055 9.942 9.816 9.706 9.593 9.474 9.35 9.245 9.158 9.049 8.923 8.82 8.711 8.602 8.508 8.4 8.286 8.17 8.034 7.929 7.825 7.661 7.548 7.434 7.37 7.237 7.074 6.881 6.779 6.64 6.481 6.368 6.242 5.953 5.785 5.617 5.451 5.22 4.924 4.503 3.387 -10 ,4430 ,TETRA ,17555853,Fri Nov 26 05:19:10 CET,Fri Nov 26 07:03:25 CET,0.0 0.289 0.388 0.475 0.559 0.623 0.688 0.757 0.87 0.919 0.968 1.01 1.103 1.145 1.232 1.309 1.381 1.417 1.491 1.566 1.673 1.737 1.803 1.899 1.997 2.095 2.19 2.278 2.384 2.488 2.589 2.711 2.832 2.955 3.103 3.272 3.431 3.597 3.78 3.995 4.227 4.476 4.773 5.081 5.435 5.847 6.322 6.867 7.513 8.257 9.213 9.905 10.21 10.394 10.469 10.434 10.383 10.31 10.231 10.153 10.071 9.963 9.85 9.751 9.65 9.545 9.421 9.307 9.19 9.052 8.922 8.814 8.7 8.582 8.481 8.367 8.245 8.114 7.991 7.916 7.838 7.707 7.592 7.468 7.405 7.275 7.126 6.933 6.824 6.682 6.515 6.401 6.27 5.99 5.837 5.666 5.453 5.196 4.912 4.489 3.002 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt deleted file mode 100644 index 86ba6fdd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24334 ,TETRA ,17555854,Fri Nov 26 05:19:11 CET,Fri Nov 26 07:02:07 CET,0.0 0.564 0.761 0.868 0.979 1.09 1.177 1.26 1.407 1.462 1.529 1.616 1.721 1.776 1.873 1.971 2.061 2.104 2.185 2.269 2.407 2.485 2.558 2.663 2.755 2.846 2.93 3.012 3.123 3.239 3.351 3.478 3.6 3.716 3.859 4.02 4.163 4.323 4.487 4.659 4.851 5.059 5.29 5.509 5.776 6.091 6.429 6.786 7.19 7.558 7.871 7.913 7.712 7.436 7.145 6.846 6.564 6.301 6.051 5.779 5.544 5.33 5.108 4.897 4.702 4.517 4.299 4.105 3.937 3.744 3.528 3.338 3.147 2.965 2.821 2.67 2.523 2.363 2.198 2.087 1.965 1.771 1.631 1.48 1.395 1.221 1.05 0.869 0.761 0.603 0.425 0.304 0.149 -0.197 -0.373 -0.575 -0.824 -1.122 -1.481 -1.924 -3.802 -2 ,13291 ,TETRA ,17555855,Fri Nov 26 05:20:12 CET,Fri Nov 26 06:46:36 CET,0.0 0.473 0.669 0.845 0.95 1.044 1.134 1.216 1.376 1.453 1.521 1.596 1.708 1.773 1.872 1.98 2.086 2.134 2.22 2.305 2.431 2.508 2.578 2.685 2.789 2.883 2.986 3.088 3.2 3.306 3.411 3.531 3.652 3.777 3.926 4.073 4.211 4.368 4.536 4.725 4.913 5.111 5.351 5.592 5.864 6.166 6.476 6.798 7.178 7.533 7.766 7.737 7.584 7.332 7.044 6.753 6.447 6.145 5.883 5.616 5.377 5.134 4.887 4.666 4.475 4.292 4.079 3.866 3.67 3.48 3.286 3.129 2.96 2.779 2.634 2.475 2.328 2.184 2.017 1.89 1.759 1.552 1.402 1.241 1.159 0.987 0.805 0.619 0.52 0.368 0.181 0.056 -0.081 -0.374 -0.553 -0.747 -0.979 -1.302 -1.68 -2.145 -4.051 -3 ,3929 ,TETRA ,17555856,Fri Nov 26 05:20:12 CET,Fri Nov 26 06:47:58 CET,0.0 0.748 0.946 1.088 1.208 1.319 1.397 1.456 1.575 1.635 1.7 1.778 1.87 1.915 2.012 2.114 2.211 2.258 2.347 2.43 2.555 2.637 2.713 2.824 2.932 3.033 3.132 3.23 3.352 3.46 3.564 3.691 3.821 3.954 4.103 4.271 4.427 4.591 4.764 4.942 5.132 5.352 5.601 5.854 6.128 6.397 6.678 7.008 7.363 7.707 8.01 8.025 7.854 7.619 7.396 7.138 6.877 6.622 6.375 6.129 5.896 5.664 5.43 5.215 5.021 4.835 4.627 4.435 4.256 4.061 3.86 3.689 3.513 3.336 3.195 3.05 2.897 2.709 2.503 2.377 2.247 2.041 1.898 1.741 1.662 1.492 1.305 1.095 0.981 0.833 0.656 0.523 0.38 0.046 -0.141 -0.338 -0.56 -0.807 -1.18 -1.723 -3.202 -4 ,32175 ,TETRA ,17555857,Fri Nov 26 05:20:11 CET,Fri Nov 26 07:02:06 CET,0.0 0.608 0.798 0.921 1.039 1.132 1.229 1.327 1.493 1.569 1.632 1.717 1.821 1.875 1.984 2.093 2.198 2.246 2.343 2.435 2.555 2.631 2.701 2.801 2.903 3.001 3.097 3.197 3.323 3.435 3.546 3.685 3.819 3.952 4.09 4.232 4.383 4.545 4.702 4.879 5.078 5.301 5.533 5.752 6.016 6.317 6.653 6.992 7.392 7.776 8.051 8.064 7.843 7.561 7.29 7.006 6.705 6.42 6.16 5.894 5.66 5.429 5.201 4.979 4.763 4.571 4.373 4.193 4.024 3.836 3.649 3.504 3.357 3.17 3.017 2.87 2.711 2.544 2.379 2.266 2.137 1.943 1.8 1.638 1.553 1.373 1.189 0.995 0.89 0.744 0.55 0.414 0.27 -0.058 -0.242 -0.44 -0.669 -0.943 -1.297 -1.8 -3.595 -5 ,19330 ,TETRA ,17555858,Fri Nov 26 05:21:11 CET,Fri Nov 26 07:02:15 CET,0.0 0.48 0.67 0.81 0.923 1.004 1.091 1.19 1.341 1.4 1.468 1.546 1.643 1.693 1.79 1.897 1.998 2.044 2.145 2.244 2.367 2.442 2.516 2.627 2.741 2.836 2.925 3.018 3.137 3.251 3.359 3.482 3.609 3.734 3.884 4.04 4.17 4.317 4.48 4.646 4.819 5.024 5.268 5.515 5.806 6.104 6.423 6.769 7.104 7.427 7.636 7.627 7.5 7.288 7.029 6.756 6.467 6.167 5.908 5.615 5.34 5.106 4.901 4.707 4.516 4.324 4.116 3.939 3.791 3.623 3.436 3.284 3.125 2.96 2.822 2.669 2.516 2.352 2.19 2.08 1.961 1.756 1.606 1.452 1.368 1.19 1.014 0.812 0.703 0.558 0.354 0.223 0.089 -0.223 -0.388 -0.567 -0.796 -1.095 -1.468 -1.932 -3.672 -6 ,4771 ,TETRA ,17555859,Fri Nov 26 05:21:11 CET,Fri Nov 26 07:05:59 CET,0.0 0.525 0.719 0.868 0.976 1.082 1.182 1.262 1.388 1.456 1.535 1.626 1.728 1.784 1.886 1.984 2.074 2.122 2.209 2.293 2.419 2.495 2.559 2.649 2.746 2.843 2.939 3.029 3.137 3.248 3.361 3.49 3.604 3.72 3.852 3.988 4.118 4.257 4.424 4.606 4.794 5.005 5.24 5.457 5.717 6.021 6.341 6.688 7.072 7.422 7.696 7.761 7.62 7.408 7.146 6.847 6.594 6.347 6.099 5.822 5.557 5.319 5.093 4.876 4.678 4.498 4.293 4.105 3.928 3.737 3.559 3.418 3.251 3.067 2.911 2.749 2.596 2.447 2.283 2.149 2.011 1.808 1.659 1.502 1.416 1.228 1.042 0.852 0.748 0.587 0.381 0.243 0.093 -0.217 -0.387 -0.582 -0.798 -1.047 -1.357 -1.79 -3.23 -7 ,28390 ,TETRA ,17555860,Fri Nov 26 05:21:14 CET,Fri Nov 26 07:06:51 CET,0.0 0.478 0.66 0.806 0.927 1.022 1.093 1.164 1.305 1.365 1.437 1.53 1.633 1.69 1.794 1.897 1.998 2.046 2.132 2.221 2.358 2.434 2.499 2.596 2.693 2.787 2.881 2.977 3.099 3.216 3.323 3.444 3.557 3.673 3.803 3.947 4.089 4.252 4.422 4.58 4.759 4.967 5.208 5.449 5.715 5.988 6.281 6.593 6.914 7.29 7.632 7.667 7.519 7.28 7.006 6.756 6.497 6.234 5.995 5.72 5.492 5.288 5.057 4.829 4.635 4.46 4.263 4.071 3.897 3.726 3.547 3.393 3.232 3.058 2.925 2.779 2.625 2.468 2.299 2.185 2.061 1.856 1.706 1.553 1.478 1.314 1.115 0.918 0.819 0.672 0.502 0.378 0.237 -0.059 -0.246 -0.462 -0.675 -0.937 -1.245 -1.654 -3.261 -8 ,18640 ,TETRA ,17555861,Fri Nov 26 05:21:12 CET,Fri Nov 26 07:02:20 CET,0.0 0.211 0.416 0.55 0.668 0.796 0.902 0.99 1.136 1.203 1.265 1.321 1.421 1.474 1.574 1.68 1.781 1.826 1.91 1.992 2.121 2.199 2.269 2.376 2.468 2.555 2.647 2.74 2.857 2.968 3.076 3.213 3.347 3.47 3.614 3.767 3.907 4.064 4.231 4.405 4.588 4.78 5.005 5.249 5.527 5.812 6.116 6.469 6.858 7.203 7.5 7.533 7.329 7.048 6.74 6.426 6.149 5.872 5.608 5.346 5.125 4.914 4.675 4.44 4.234 4.051 3.844 3.64 3.474 3.3 3.099 2.948 2.787 2.603 2.454 2.294 2.144 1.98 1.797 1.68 1.56 1.366 1.208 1.028 0.94 0.769 0.602 0.426 0.317 0.148 -0.055 -0.184 -0.329 -0.647 -0.832 -1.03 -1.231 -1.446 -1.758 -2.315 -3.692 -9 ,8946 ,TETRA ,17555862,Fri Nov 26 05:21:11 CET,Fri Nov 26 07:04:16 CET,0.0 0.41 0.59 0.728 0.833 0.936 1.039 1.137 1.324 1.393 1.454 1.529 1.628 1.685 1.79 1.891 1.98 2.019 2.092 2.167 2.278 2.351 2.429 2.54 2.649 2.752 2.839 2.921 3.033 3.135 3.234 3.361 3.486 3.611 3.765 3.931 4.066 4.218 4.394 4.569 4.754 4.974 5.23 5.466 5.729 6.035 6.363 6.68 6.98 7.277 7.508 7.555 7.414 7.139 6.845 6.58 6.318 6.025 5.755 5.494 5.261 5.023 4.789 4.581 4.384 4.189 3.995 3.832 3.675 3.501 3.317 3.155 2.98 2.786 2.646 2.503 2.339 2.166 1.985 1.86 1.734 1.528 1.373 1.204 1.119 0.958 0.785 0.592 0.488 0.338 0.159 0.028 -0.113 -0.407 -0.584 -0.797 -1.032 -1.282 -1.621 -2.103 -3.584 -10 ,11560 ,TETRA ,17555863,Fri Nov 26 05:22:11 CET,Fri Nov 26 07:06:35 CET,0.0 0.36 0.6 0.722 0.832 0.93 1.025 1.104 1.23 1.295 1.359 1.436 1.538 1.594 1.696 1.782 1.869 1.916 2.016 2.104 2.222 2.295 2.366 2.473 2.581 2.686 2.785 2.881 3.003 3.115 3.225 3.358 3.489 3.613 3.745 3.895 4.053 4.222 4.396 4.583 4.77 4.976 5.233 5.469 5.73 6.04 6.366 6.699 7.068 7.483 7.827 7.8 7.651 7.45 7.192 6.905 6.607 6.326 6.08 5.823 5.581 5.342 5.103 4.886 4.69 4.496 4.291 4.103 3.932 3.756 3.568 3.405 3.234 3.045 2.896 2.754 2.614 2.456 2.277 2.16 2.035 1.834 1.692 1.53 1.452 1.298 1.126 0.956 0.853 0.695 0.51 0.379 0.228 -0.099 -0.284 -0.505 -0.766 -1.025 -1.314 -1.737 -4.189 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt deleted file mode 100644 index 35374d7d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22392 ,TETRA ,17555864,Fri Nov 26 05:23:12 CET,Fri Nov 26 07:02:09 CET,0.0 2.621 3.354 3.755 4.068 4.339 4.575 4.812 5.227 5.402 5.573 5.717 6.039 6.181 6.443 6.675 6.911 7.022 7.211 7.388 7.636 7.808 7.987 8.237 8.475 8.682 8.869 9.074 9.331 9.565 9.798 10.064 10.283 10.393 10.41 10.354 10.345 10.339 10.207 9.994 9.721 9.341 8.817 8.215 7.344 6.228 4.791 2.885 0.126 -3.826 -10.038 -17.191 -22.67 -27.089 -30.795 -33.945 -36.552 -38.837 -40.738 -42.555 -44.111 -45.514 -46.887 -48.176 -49.336 -50.382 -51.478 -52.436 -53.249 -54.09 -54.957 -55.665 -56.361 -57.063 -57.617 -58.205 -58.805 -59.416 -60.044 -60.464 -60.895 -61.548 -62.003 -62.482 -62.732 -63.241 -63.761 -64.301 -64.58 -65.11 -65.465 -65.789 -66.126 -66.831 -67.227 -67.644 -68.082 -68.568 -69.08 -69.761 -75.923 -2 ,27175 ,TETRA ,17555865,Fri Nov 26 05:24:11 CET,Fri Nov 26 07:12:11 CET,0.0 4.256 4.949 5.432 5.796 6.147 6.503 6.776 7.232 7.449 7.645 7.848 8.192 8.366 8.701 8.981 9.254 9.399 9.676 9.922 10.269 10.496 10.715 11.037 11.347 11.649 11.936 12.207 12.568 12.907 13.203 13.567 13.922 14.248 14.423 14.348 14.253 14.159 14.059 13.94 13.748 13.406 12.89 12.348 11.663 10.693 9.306 7.454 4.859 1.095 -4.86 -11.488 -16.625 -20.865 -24.388 -27.41 -29.927 -32.172 -34.117 -35.981 -37.545 -38.927 -40.218 -41.427 -42.532 -43.495 -44.623 -45.763 -46.774 -47.812 -48.854 -49.731 -50.628 -51.52 -52.182 -52.85 -53.536 -54.245 -54.976 -55.473 -55.983 -56.762 -57.275 -57.771 -58.016 -58.54 -59.107 -59.681 -59.983 -60.552 -60.958 -61.304 -61.656 -62.362 -62.741 -63.176 -63.638 -64.158 -64.772 -65.601 -68.967 -3 ,5599 ,TETRA ,17555866,Fri Nov 26 05:24:12 CET,Fri Nov 26 06:58:27 CET,0.0 4.31 4.929 5.326 5.657 5.984 6.296 6.575 7.096 7.307 7.464 7.595 7.914 8.063 8.365 8.626 8.853 8.962 9.164 9.366 9.691 9.869 9.996 10.143 10.256 10.372 10.52 10.658 10.799 10.929 11.028 11.114 11.151 11.182 11.224 11.227 11.206 11.153 11.017 10.808 10.553 10.243 9.789 9.183 8.384 7.42 6.138 4.366 1.729 -2.241 -8.518 -15.61 -21.098 -25.471 -29.099 -32.266 -34.95 -37.281 -39.289 -41.315 -42.992 -44.429 -45.796 -47.092 -48.292 -49.356 -50.435 -51.371 -52.165 -52.963 -53.784 -54.47 -55.154 -55.881 -56.457 -57.046 -57.648 -58.232 -58.826 -59.23 -59.653 -60.328 -60.785 -61.256 -61.494 -61.969 -62.459 -62.988 -63.264 -63.769 -64.092 -64.417 -64.753 -65.441 -65.816 -66.211 -66.665 -67.225 -67.911 -68.902 -76.761 -4 ,5122 ,TETRA ,17555867,Fri Nov 26 05:24:12 CET,Fri Nov 26 07:17:58 CET,0.0 2.044 2.686 3.094 3.44 3.735 3.975 4.205 4.623 4.796 4.963 5.08 5.395 5.533 5.815 6.112 6.401 6.542 6.802 7.054 7.407 7.634 7.846 8.08 8.226 8.344 8.463 8.626 8.864 8.988 9.023 9.069 9.121 9.159 9.178 9.172 9.121 9.021 8.882 8.689 8.428 8.062 7.549 6.899 6.024 4.894 3.368 1.42 -1.286 -5.27 -11.519 -18.595 -24.154 -28.601 -32.24 -35.503 -38.299 -40.7 -42.684 -44.594 -46.212 -47.634 -48.971 -50.236 -51.407 -52.466 -53.561 -54.521 -55.338 -56.16 -56.999 -57.685 -58.397 -59.137 -59.707 -60.309 -60.929 -61.578 -62.25 -62.713 -63.178 -63.862 -64.329 -64.798 -65.032 -65.52 -66.016 -66.533 -66.807 -67.345 -67.671 -67.97 -68.3 -68.987 -69.331 -69.705 -70.149 -70.628 -71.188 -72.065 -76.107 -5 ,3625 ,TETRA ,17555868,Fri Nov 26 05:27:10 CET,Fri Nov 26 07:08:24 CET,0.0 3.016 3.514 3.906 4.24 4.526 4.752 4.966 5.371 5.554 5.719 5.857 6.178 6.312 6.581 6.848 7.091 7.208 7.444 7.663 7.941 8.123 8.327 8.631 8.893 9.073 9.197 9.314 9.442 9.525 9.57 9.593 9.632 9.65 9.626 9.616 9.581 9.468 9.261 8.984 8.687 8.33 7.846 7.255 6.445 5.416 4.001 2.022 -0.831 -4.958 -11.283 -18.145 -23.492 -27.786 -31.293 -34.36 -36.894 -39.076 -40.945 -42.773 -44.279 -45.599 -46.862 -48.045 -49.134 -50.085 -51.019 -51.856 -52.612 -53.435 -54.319 -55.052 -55.787 -56.518 -57.081 -57.67 -58.266 -58.877 -59.538 -59.98 -60.407 -61.076 -61.531 -61.973 -62.2 -62.687 -63.204 -63.727 -63.984 -64.511 -64.891 -65.209 -65.545 -66.282 -66.678 -67.07 -67.507 -68.0 -68.552 -69.3 -75.682 -6 ,11896 ,TETRA ,17555869,Fri Nov 26 05:29:09 CET,Fri Nov 26 07:17:36 CET,0.0 3.428 3.929 4.289 4.598 4.884 5.142 5.389 5.766 5.919 6.063 6.167 6.499 6.643 6.868 7.078 7.298 7.404 7.607 7.819 8.101 8.267 8.446 8.713 8.954 9.209 9.461 9.662 9.81 9.863 9.894 9.944 9.988 10.005 9.991 9.926 9.848 9.747 9.636 9.453 9.146 8.762 8.252 7.607 6.756 5.673 4.185 2.228 -0.437 -4.289 -10.479 -17.319 -22.549 -26.867 -30.503 -33.609 -36.223 -38.553 -40.516 -42.364 -43.89 -45.267 -46.636 -47.938 -49.127 -50.151 -51.179 -52.103 -52.908 -53.738 -54.569 -55.228 -55.924 -56.642 -57.204 -57.8 -58.397 -59.018 -59.631 -60.043 -60.501 -61.256 -61.79 -62.328 -62.602 -63.161 -63.731 -64.315 -64.616 -65.17 -65.567 -65.924 -66.296 -67.056 -67.442 -67.851 -68.32 -68.862 -69.479 -70.387 -74.54 -7 ,13887 ,TETRA ,17555870,Fri Nov 26 05:29:09 CET,Fri Nov 26 07:20:45 CET,0.0 2.775 3.482 4.04 4.458 4.798 5.113 5.376 5.815 6.018 6.225 6.396 6.708 6.864 7.178 7.487 7.777 7.886 8.065 8.266 8.586 8.795 8.974 9.131 9.241 9.351 9.468 9.584 9.702 9.809 9.908 9.975 10.002 9.997 10.032 10.057 9.978 9.85 9.665 9.447 9.185 8.869 8.424 7.85 7.126 6.186 4.814 2.932 0.336 -3.395 -9.448 -16.171 -21.334 -25.629 -29.124 -32.083 -34.624 -36.898 -38.839 -40.728 -42.308 -43.687 -44.983 -46.177 -47.276 -48.288 -49.324 -50.206 -50.942 -51.712 -52.531 -53.196 -53.878 -54.554 -55.06 -55.597 -56.21 -56.899 -57.59 -58.077 -58.585 -59.36 -59.909 -60.488 -60.769 -61.293 -61.821 -62.387 -62.667 -63.19 -63.536 -63.854 -64.216 -65.033 -65.467 -65.975 -66.523 -67.055 -67.722 -68.679 -74.388 -8 ,30332 ,TETRA ,17555871,Fri Nov 26 05:31:09 CET,Fri Nov 26 07:10:28 CET,0.0 2.398 2.903 3.287 3.629 3.921 4.178 4.41 4.836 5.029 5.212 5.371 5.701 5.87 6.193 6.468 6.719 6.836 7.076 7.311 7.632 7.838 8.021 8.289 8.572 8.829 9.047 9.271 9.568 9.817 10.027 10.2 10.305 10.379 10.402 10.385 10.353 10.311 10.227 10.055 9.853 9.593 9.192 8.712 8.063 7.198 5.995 4.291 1.792 -1.907 -7.816 -14.359 -19.618 -23.86 -27.45 -30.654 -33.242 -35.467 -37.345 -39.18 -40.738 -42.068 -43.272 -44.4 -45.442 -46.383 -47.342 -48.295 -49.23 -50.241 -51.303 -52.147 -52.993 -53.865 -54.535 -55.219 -55.9 -56.596 -57.297 -57.776 -58.275 -59.047 -59.572 -60.1 -60.365 -60.904 -61.465 -62.046 -62.347 -62.903 -63.297 -63.634 -64.0 -64.717 -65.058 -65.465 -65.949 -66.452 -66.972 -67.664 -72.135 -9 ,23421 ,TETRA ,17555872,Fri Nov 26 05:31:09 CET,Fri Nov 26 07:21:25 CET,0.0 3.321 3.961 4.432 4.813 5.132 5.395 5.628 6.054 6.247 6.421 6.577 6.904 7.042 7.308 7.572 7.835 7.966 8.203 8.405 8.696 8.895 9.083 9.347 9.579 9.791 10.02 10.262 10.559 10.755 10.854 10.899 10.948 11.005 11.02 11.025 11.033 10.965 10.798 10.539 10.207 9.782 9.19 8.499 7.586 6.375 4.727 2.64 -0.193 -4.289 -10.637 -17.621 -22.993 -27.337 -30.937 -34.023 -36.581 -38.885 -40.91 -42.845 -44.404 -45.745 -46.982 -48.138 -49.236 -50.245 -51.292 -52.243 -53.056 -53.874 -54.722 -55.434 -56.158 -56.892 -57.464 -58.046 -58.631 -59.249 -59.876 -60.297 -60.757 -61.475 -61.955 -62.451 -62.697 -63.189 -63.695 -64.206 -64.466 -65.002 -65.367 -65.686 -66.012 -66.664 -67.016 -67.417 -67.867 -68.376 -69.027 -69.934 -75.179 -10 ,19215 ,TETRA ,17555873,Fri Nov 26 05:31:09 CET,Fri Nov 26 07:10:17 CET,0.0 1.75 2.292 2.687 2.977 3.257 3.504 3.723 4.132 4.324 4.516 4.665 4.987 5.129 5.384 5.621 5.848 5.953 6.167 6.386 6.687 6.872 7.051 7.356 7.667 7.874 7.998 8.137 8.28 8.354 8.421 8.484 8.518 8.533 8.568 8.59 8.547 8.455 8.327 8.142 7.904 7.583 7.098 6.499 5.704 4.685 3.288 1.32 -1.387 -5.221 -11.322 -18.282 -23.719 -28.119 -31.757 -34.949 -37.647 -39.988 -42.022 -43.946 -45.491 -46.89 -48.235 -49.434 -50.553 -51.602 -52.682 -53.629 -54.433 -55.25 -56.085 -56.77 -57.49 -58.247 -58.814 -59.378 -59.951 -60.539 -61.142 -61.563 -61.997 -62.646 -63.09 -63.553 -63.796 -64.296 -64.81 -65.374 -65.675 -66.213 -66.549 -66.88 -67.234 -67.955 -68.323 -68.727 -69.176 -69.672 -70.33 -71.171 -74.231 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index cd86a12c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4380 ,TETRA ,17555874,Fri Nov 26 05:31:11 CET,Fri Nov 26 07:09:05 CET,0.0 0.219 0.408 0.583 0.76 0.925 1.093 1.404 1.554 1.701 1.816 2.133 2.267 2.549 2.83 3.094 3.224 3.484 3.74 4.125 4.387 4.649 5.017 5.364 5.709 6.039 6.361 6.799 7.238 7.671 8.21 8.714 9.186 9.736 10.379 11.025 11.751 12.55 13.371 14.208 15.152 16.313 17.492 18.771 20.22 21.993 23.995 26.131 28.477 30.981 32.359 32.68 32.566 32.26 31.669 30.918 30.23 29.63 28.959 28.249 27.594 26.992 26.368 25.758 25.195 24.622 24.13 23.672 23.167 22.654 22.241 21.808 21.355 21.0 20.629 20.246 19.863 19.474 19.17 18.853 18.379 18.036 17.659 17.452 17.048 16.628 16.155 15.918 15.526 15.147 14.861 14.55 13.907 13.506 13.016 12.519 11.893 11.072 9.734 -2 ,1922 ,TETRA ,17555875,Fri Nov 26 05:32:10 CET,Fri Nov 26 07:18:53 CET,0.0 0.244 0.449 0.644 0.84 1.011 1.166 1.501 1.661 1.812 1.931 2.229 2.358 2.624 2.898 3.169 3.301 3.56 3.808 4.17 4.406 4.644 5.012 5.375 5.722 6.06 6.394 6.825 7.258 7.708 8.263 8.796 9.304 9.904 10.615 11.3 12.029 12.803 13.667 14.605 15.65 16.868 18.096 19.488 21.048 22.925 24.911 27.066 29.473 31.817 33.162 33.649 33.585 33.225 32.767 32.264 31.664 31.091 30.522 30.016 29.523 28.928 28.275 27.639 27.063 26.439 25.852 25.354 24.834 24.314 23.887 23.444 22.988 22.641 22.282 21.89 21.48 21.062 20.766 20.448 19.955 19.6 19.212 19.015 18.598 18.142 17.669 17.428 17.021 16.625 16.339 16.039 15.376 14.964 14.462 13.903 13.295 12.472 11.215 -3 ,7192 ,TETRA ,17555876,Fri Nov 26 05:32:10 CET,Fri Nov 26 07:22:34 CET,0.0 0.229 0.415 0.574 0.753 0.933 1.087 1.391 1.54 1.685 1.782 2.078 2.202 2.439 2.67 2.895 3.002 3.208 3.421 3.744 3.951 4.152 4.449 4.746 5.048 5.341 5.637 6.024 6.386 6.744 7.185 7.613 8.033 8.521 9.074 9.618 10.238 10.916 11.642 12.433 13.337 14.385 15.461 16.757 18.206 19.802 21.563 23.584 25.834 28.496 30.313 31.052 31.261 31.102 30.799 30.453 30.063 29.647 29.027 28.29 27.604 26.891 26.159 25.495 24.88 24.199 23.561 23.004 22.439 21.865 21.383 20.881 20.384 20.025 19.651 19.263 18.842 18.391 18.081 17.751 17.225 16.868 16.52 16.334 15.921 15.466 14.995 14.736 14.304 13.866 13.569 13.25 12.515 12.09 11.595 11.012 10.306 9.413 8.208 -4 ,29676 ,TETRA ,17555877,Fri Nov 26 05:32:11 CET,Fri Nov 26 07:14:35 CET,0.0 0.21 0.415 0.59 0.737 0.881 1.03 1.315 1.443 1.565 1.656 1.96 2.081 2.314 2.538 2.76 2.872 3.095 3.314 3.633 3.848 4.071 4.392 4.691 4.975 5.261 5.554 5.934 6.276 6.636 7.115 7.572 8.025 8.539 9.114 9.685 10.342 11.073 11.832 12.617 13.508 14.624 15.713 16.982 18.54 20.361 22.347 24.528 27.029 29.802 31.873 32.91 33.409 33.517 33.265 32.841 32.381 31.906 31.352 30.832 30.28 29.716 29.176 28.611 28.117 27.635 27.113 26.636 26.179 25.703 25.306 24.862 24.403 24.047 23.625 23.189 22.762 22.317 21.989 21.608 21.026 20.641 20.218 20.011 19.626 19.209 18.75 18.515 18.125 17.686 17.359 17.034 16.284 15.874 15.426 14.929 14.359 13.61 12.418 -5 ,3422 ,TETRA ,17555878,Fri Nov 26 05:32:11 CET,Fri Nov 26 07:16:49 CET,0.0 0.286 0.518 0.706 0.878 1.044 1.208 1.521 1.673 1.835 1.979 2.308 2.458 2.748 3.02 3.277 3.397 3.633 3.877 4.251 4.488 4.717 5.054 5.372 5.682 5.988 6.303 6.721 7.122 7.515 8.02 8.537 9.023 9.581 10.228 10.839 11.525 12.292 13.081 13.895 14.857 16.037 17.224 18.583 20.079 21.808 23.659 25.695 28.03 30.827 32.64 33.173 32.929 32.132 31.369 30.66 29.843 28.972 27.98 27.146 26.382 25.652 24.999 24.347 23.759 23.169 22.628 22.16 21.653 21.136 20.709 20.27 19.811 19.444 19.07 18.672 18.229 17.742 17.417 17.098 16.604 16.238 15.84 15.635 15.211 14.771 14.304 14.053 13.642 13.209 12.898 12.537 11.713 11.302 10.887 10.416 9.793 8.937 7.667 -6 ,5226 ,TETRA ,17555879,Fri Nov 26 05:32:10 CET,Fri Nov 26 07:19:47 CET,0.0 0.263 0.474 0.65 0.813 0.975 1.126 1.421 1.566 1.699 1.795 2.105 2.24 2.522 2.798 3.074 3.204 3.45 3.696 4.055 4.298 4.538 4.892 5.226 5.552 5.886 6.203 6.644 7.101 7.529 8.047 8.558 9.073 9.668 10.307 10.933 11.652 12.436 13.31 14.303 15.394 16.54 17.672 19.033 20.58 22.359 24.224 26.105 28.101 30.365 31.647 31.76 31.554 31.113 30.244 29.332 28.495 27.731 26.924 26.166 25.482 24.805 24.143 23.54 22.965 22.349 21.81 21.33 20.835 20.334 19.901 19.434 18.935 18.558 18.199 17.815 17.402 16.976 16.659 16.313 15.8 15.464 15.089 14.869 14.416 13.991 13.563 13.315 12.917 12.47 12.145 11.812 11.06 10.641 10.158 9.604 8.993 8.127 6.855 -7 ,26738 ,TETRA ,17555880,Fri Nov 26 05:33:12 CET,Fri Nov 26 07:14:46 CET,0.0 0.221 0.434 0.612 0.759 0.913 1.078 1.386 1.533 1.688 1.806 2.109 2.239 2.504 2.763 3.004 3.116 3.332 3.551 3.88 4.088 4.288 4.583 4.88 5.162 5.446 5.732 6.093 6.447 6.794 7.229 7.666 8.095 8.593 9.153 9.696 10.291 10.966 11.725 12.523 13.423 14.487 15.548 16.817 18.34 20.087 21.894 23.97 26.448 29.128 30.824 31.576 31.741 31.248 30.431 29.62 28.867 28.176 27.421 26.716 25.952 25.238 24.645 24.033 23.443 22.843 22.302 21.821 21.327 20.822 20.405 19.974 19.525 19.167 18.786 18.372 17.942 17.528 17.234 16.904 16.397 16.065 15.719 15.531 15.136 14.699 14.245 14.014 13.615 13.234 12.929 12.6 11.897 11.516 11.07 10.489 9.769 8.829 7.321 -8 ,20402 ,TETRA ,17555881,Fri Nov 26 05:33:11 CET,Fri Nov 26 07:06:20 CET,0.0 0.234 0.429 0.596 0.753 0.899 1.045 1.321 1.448 1.565 1.62 1.918 2.045 2.299 2.539 2.753 2.861 3.086 3.311 3.643 3.858 4.067 4.373 4.673 4.967 5.255 5.534 5.916 6.29 6.656 7.119 7.571 8.013 8.521 9.106 9.704 10.344 11.024 11.772 12.569 13.522 14.664 15.808 17.15 18.606 20.308 22.188 24.302 26.79 29.481 31.166 31.702 31.889 31.879 31.601 31.13 30.362 29.565 28.722 27.98 27.342 26.626 25.93 25.297 24.731 24.185 23.65 23.137 22.576 21.996 21.515 21.031 20.541 20.155 19.756 19.338 18.926 18.499 18.186 17.862 17.352 16.997 16.632 16.433 16.001 15.536 15.047 14.806 14.43 14.028 13.716 13.406 12.701 12.258 11.79 11.321 10.702 9.899 8.728 -9 ,31658 ,TETRA ,17555882,Fri Nov 26 05:34:12 CET,Fri Nov 26 07:21:22 CET,0.0 0.208 0.421 0.604 0.748 0.9 1.056 1.348 1.476 1.601 1.698 2.001 2.13 2.367 2.596 2.826 2.944 3.174 3.391 3.697 3.899 4.099 4.391 4.682 4.974 5.251 5.524 5.891 6.245 6.604 7.065 7.518 7.937 8.42 8.999 9.577 10.212 10.898 11.618 12.398 13.295 14.337 15.446 16.754 18.211 19.84 21.561 23.55 25.906 28.558 30.55 31.352 31.561 31.572 31.326 30.96 30.549 30.098 29.562 29.025 28.413 27.721 27.053 26.418 25.839 25.221 24.645 24.165 23.669 23.133 22.701 22.256 21.772 21.407 21.03 20.629 20.228 19.809 19.491 19.164 18.663 18.288 17.906 17.716 17.311 16.858 16.363 16.104 15.703 15.308 14.995 14.647 13.823 13.374 12.894 12.305 11.621 10.835 9.597 -10 ,1762 ,TETRA ,17555883,Fri Nov 26 05:34:12 CET,Fri Nov 26 07:20:38 CET,0.0 0.264 0.47 0.632 0.79 0.942 1.087 1.372 1.509 1.649 1.747 2.047 2.173 2.43 2.683 2.918 3.031 3.257 3.488 3.831 4.043 4.251 4.559 4.861 5.159 5.451 5.735 6.111 6.487 6.863 7.322 7.754 8.184 8.703 9.3 9.9 10.575 11.301 12.059 12.84 13.708 14.735 15.835 17.122 18.572 20.177 21.825 23.665 25.822 28.18 29.562 29.868 29.629 29.245 28.847 28.419 27.96 27.509 27.01 26.534 26.077 25.51 24.846 24.23 23.686 23.096 22.516 22.014 21.513 20.983 20.554 20.102 19.611 19.246 18.876 18.475 18.048 17.583 17.272 16.957 16.449 16.085 15.69 15.493 15.1 14.669 14.208 13.965 13.554 13.148 12.833 12.484 11.731 11.273 10.724 10.041 9.157 8.021 6.322 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 4f9db4e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32706 ,TETRA ,17555884,Fri Nov 26 05:36:12 CET,Fri Nov 26 07:04:55 CET,0.0 1.004 1.427 1.694 1.916 2.126 2.291 2.423 2.684 2.812 2.944 3.14 3.299 3.396 3.58 3.776 3.971 4.058 4.223 4.381 4.594 4.729 4.864 5.069 5.26 5.438 5.608 5.774 5.995 6.203 6.394 6.627 6.855 7.075 7.318 7.594 7.865 8.159 8.47 8.795 9.141 9.524 9.959 10.385 10.888 11.467 12.091 12.733 13.442 14.158 14.804 14.903 14.613 14.212 13.821 13.401 13.002 12.675 12.381 12.055 11.783 11.572 11.354 11.131 10.921 10.71 10.469 10.268 10.118 9.956 9.776 9.623 9.453 9.27 9.136 9.001 8.856 8.7 8.528 8.416 8.302 8.117 7.995 7.868 7.798 7.635 7.469 7.285 7.188 7.042 6.854 6.73 6.585 6.234 6.031 5.825 5.611 5.319 4.953 4.514 1.322 -2 ,8011 ,TETRA ,17555885,Fri Nov 26 05:37:11 CET,Fri Nov 26 07:22:21 CET,0.0 0.942 1.227 1.474 1.699 1.892 2.067 2.232 2.521 2.64 2.759 2.946 3.104 3.199 3.39 3.591 3.786 3.872 4.031 4.192 4.406 4.54 4.684 4.889 5.074 5.261 5.438 5.603 5.821 6.025 6.222 6.451 6.678 6.907 7.173 7.468 7.744 8.043 8.354 8.678 9.021 9.396 9.838 10.281 10.754 11.301 11.92 12.542 13.1 13.558 13.923 13.952 13.735 13.402 13.08 12.742 12.388 12.017 11.656 11.321 11.059 10.817 10.566 10.314 10.063 9.839 9.613 9.4 9.216 9.02 8.817 8.639 8.449 8.263 8.119 7.973 7.83 7.685 7.516 7.392 7.278 7.083 6.924 6.743 6.652 6.487 6.313 6.093 5.973 5.806 5.607 5.475 5.326 4.993 4.788 4.556 4.312 4.033 3.638 3.079 -0.293 -3 ,5372 ,TETRA ,17555886,Fri Nov 26 05:36:12 CET,Fri Nov 26 07:20:34 CET,0.0 1.018 1.289 1.498 1.705 1.891 2.052 2.205 2.485 2.612 2.737 2.907 3.061 3.167 3.377 3.571 3.743 3.831 3.995 4.143 4.369 4.505 4.632 4.811 4.987 5.17 5.348 5.519 5.723 5.91 6.095 6.309 6.52 6.723 6.945 7.203 7.471 7.76 8.05 8.353 8.678 9.032 9.445 9.871 10.364 10.918 11.495 12.056 12.67 13.202 13.47 13.431 13.192 12.854 12.479 12.095 11.717 11.349 11.021 10.691 10.398 10.116 9.826 9.552 9.308 9.078 8.836 8.613 8.408 8.206 8.013 7.843 7.657 7.46 7.308 7.14 6.958 6.791 6.61 6.468 6.33 6.136 5.989 5.823 5.736 5.562 5.388 5.204 5.093 4.921 4.701 4.552 4.389 4.07 3.876 3.626 3.358 3.001 2.536 1.977 -3.827 -4 ,32660 ,TETRA ,17555887,Fri Nov 26 05:37:11 CET,Fri Nov 26 07:19:55 CET,0.0 0.853 1.165 1.406 1.644 1.845 2.02 2.185 2.471 2.591 2.703 2.856 3.009 3.103 3.277 3.458 3.646 3.736 3.898 4.068 4.328 4.471 4.606 4.802 4.985 5.161 5.33 5.491 5.697 5.898 6.089 6.334 6.572 6.797 7.063 7.364 7.646 7.937 8.247 8.571 8.921 9.311 9.724 10.14 10.641 11.173 11.75 12.351 12.967 13.541 13.93 13.885 13.591 13.214 12.805 12.37 11.955 11.564 11.221 10.872 10.575 10.294 10.014 9.755 9.497 9.25 9.014 8.8 8.598 8.397 8.194 8.03 7.841 7.623 7.455 7.288 7.116 6.937 6.751 6.622 6.491 6.276 6.11 5.94 5.852 5.667 5.478 5.252 5.126 4.949 4.729 4.588 4.432 4.137 3.964 3.747 3.499 3.134 2.727 2.229 -1.767 -5 ,24392 ,TETRA ,17555888,Fri Nov 26 05:41:11 CET,Fri Nov 26 07:28:08 CET,0.0 1.062 1.378 1.613 1.83 2.008 2.173 2.333 2.614 2.728 2.829 2.993 3.158 3.264 3.467 3.662 3.825 3.901 4.058 4.22 4.437 4.563 4.698 4.915 5.114 5.287 5.452 5.619 5.837 6.052 6.257 6.482 6.709 6.934 7.19 7.471 7.748 8.065 8.383 8.702 9.022 9.367 9.789 10.209 10.694 11.25 11.866 12.503 13.147 13.721 14.087 14.142 13.939 13.57 13.199 12.841 12.529 12.222 11.919 11.608 11.329 11.049 10.783 10.547 10.319 10.105 9.885 9.701 9.536 9.357 9.196 9.05 8.86 8.664 8.528 8.385 8.223 8.069 7.919 7.811 7.693 7.501 7.368 7.232 7.156 6.978 6.759 6.553 6.455 6.299 6.103 5.965 5.827 5.51 5.305 5.06 4.807 4.513 4.144 3.62 0.578 -6 ,14812 ,TETRA ,17555889,Fri Nov 26 05:39:11 CET,Fri Nov 26 07:24:06 CET,0.0 1.208 1.547 1.792 1.981 2.141 2.304 2.449 2.693 2.804 2.909 3.08 3.235 3.332 3.531 3.722 3.912 3.998 4.147 4.294 4.508 4.642 4.771 4.951 5.128 5.306 5.47 5.625 5.836 6.043 6.232 6.472 6.706 6.923 7.17 7.452 7.732 8.029 8.327 8.653 8.998 9.373 9.821 10.264 10.737 11.244 11.85 12.526 13.238 13.94 14.487 14.508 14.24 13.84 13.429 13.065 12.683 12.298 11.943 11.561 11.242 10.976 10.722 10.478 10.271 10.092 9.909 9.723 9.542 9.376 9.195 9.032 8.887 8.708 8.554 8.408 8.25 8.08 7.892 7.765 7.63 7.383 7.222 7.054 6.964 6.79 6.591 6.369 6.262 6.112 5.865 5.694 5.532 5.21 5.048 4.822 4.531 4.179 3.805 3.275 -2.956 -7 ,3131 ,TETRA ,17555890,Fri Nov 26 05:39:14 CET,Fri Nov 26 07:24:00 CET,0.0 0.881 1.196 1.443 1.649 1.843 2.037 2.201 2.458 2.575 2.699 2.869 3.027 3.135 3.325 3.503 3.675 3.762 3.927 4.077 4.308 4.456 4.594 4.794 4.98 5.157 5.34 5.512 5.73 5.949 6.163 6.418 6.654 6.874 7.132 7.41 7.682 7.994 8.328 8.684 9.047 9.436 9.875 10.332 10.866 11.453 12.076 12.656 13.298 14.055 14.689 14.724 14.431 14.069 13.679 13.282 12.913 12.583 12.262 11.902 11.603 11.343 11.092 10.864 10.644 10.423 10.198 9.992 9.815 9.616 9.387 9.196 8.997 8.795 8.639 8.471 8.302 8.136 7.957 7.82 7.683 7.502 7.369 7.226 7.154 6.975 6.778 6.604 6.515 6.353 6.165 6.062 5.944 5.635 5.46 5.276 5.088 4.812 4.443 3.903 -1.489 -8 ,11715 ,TETRA ,17555891,Fri Nov 26 05:39:11 CET,Fri Nov 26 07:25:41 CET,0.0 0.712 1.055 1.296 1.511 1.722 1.898 2.038 2.296 2.426 2.549 2.724 2.88 2.977 3.172 3.359 3.531 3.622 3.788 3.942 4.183 4.324 4.464 4.68 4.881 5.07 5.246 5.411 5.635 5.843 6.03 6.267 6.496 6.71 6.962 7.255 7.542 7.85 8.163 8.488 8.854 9.261 9.723 10.198 10.718 11.245 11.775 12.288 12.874 13.423 13.781 13.675 13.29 12.856 12.451 12.066 11.692 11.368 11.071 10.689 10.354 10.069 9.799 9.537 9.286 9.055 8.816 8.603 8.418 8.205 7.973 7.794 7.617 7.432 7.287 7.127 6.962 6.784 6.596 6.468 6.323 6.091 5.936 5.789 5.715 5.545 5.373 5.188 5.089 4.942 4.761 4.633 4.479 4.137 3.96 3.774 3.562 3.284 2.894 2.306 -1.633 -9 ,30522 ,TETRA ,17555892,Fri Nov 26 05:39:11 CET,Fri Nov 26 07:13:10 CET,0.0 1.155 1.539 1.815 2.037 2.209 2.38 2.541 2.816 2.954 3.074 3.256 3.421 3.525 3.722 3.912 4.091 4.171 4.321 4.476 4.707 4.849 4.979 5.165 5.361 5.548 5.721 5.892 6.102 6.296 6.49 6.729 6.96 7.176 7.424 7.707 7.964 8.238 8.54 8.88 9.228 9.599 10.043 10.467 10.969 11.531 12.113 12.75 13.429 13.952 14.18 14.01 13.6 13.162 12.817 12.444 12.048 11.691 11.367 11.023 10.722 10.439 10.168 9.931 9.723 9.507 9.262 9.048 8.859 8.659 8.454 8.269 8.081 7.909 7.766 7.612 7.452 7.268 7.09 6.967 6.824 6.594 6.435 6.281 6.19 5.999 5.801 5.586 5.485 5.344 5.18 5.049 4.894 4.559 4.369 4.145 3.901 3.595 3.208 2.649 -4.656 -10 ,14416 ,TETRA ,17555893,Fri Nov 26 05:39:11 CET,Fri Nov 26 07:24:14 CET,0.0 1.23 1.568 1.817 2.032 2.228 2.396 2.539 2.793 2.915 3.045 3.244 3.417 3.523 3.712 3.876 4.043 4.127 4.287 4.442 4.659 4.808 4.96 5.169 5.365 5.544 5.713 5.88 6.096 6.306 6.513 6.749 6.964 7.182 7.449 7.742 8.011 8.306 8.63 8.957 9.302 9.7 10.137 10.55 11.026 11.595 12.224 12.862 13.579 14.303 14.88 14.973 14.746 14.408 14.045 13.7 13.354 12.986 12.633 12.298 12.022 11.743 11.463 11.193 10.945 10.723 10.495 10.299 10.13 9.96 9.774 9.605 9.433 9.271 9.142 9.006 8.872 8.736 8.578 8.466 8.354 8.169 8.034 7.895 7.819 7.643 7.476 7.305 7.204 7.047 6.863 6.753 6.633 6.31 6.123 5.917 5.699 5.407 5.003 4.469 -0.049 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 25743684..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30223 ,TETRA ,17555894,Fri Nov 26 05:40:13 CET,Fri Nov 26 07:22:29 CET,0.0 1.08 1.444 1.662 1.833 1.98 2.12 2.247 2.45 2.547 2.641 2.693 2.949 3.041 3.206 3.365 3.512 3.584 3.74 3.896 4.103 4.227 4.345 4.525 4.71 4.878 5.04 5.198 5.386 5.565 5.74 5.958 6.17 6.383 6.627 6.896 7.18 7.507 7.86 8.208 8.567 8.974 9.425 9.849 10.332 10.922 11.575 12.189 12.879 13.64 14.31 14.508 14.403 14.205 13.976 13.725 13.441 13.154 12.899 12.639 12.391 12.145 11.922 11.719 11.518 11.314 11.092 10.896 10.716 10.514 10.317 10.133 9.908 9.683 9.537 9.4 9.246 9.083 8.935 8.833 8.715 8.543 8.421 8.285 8.212 8.038 7.86 7.683 7.594 7.36 7.272 7.162 7.038 6.764 6.608 6.431 6.24 6.013 5.727 5.315 3.582 -2 ,14523 ,TETRA ,17555895,Fri Nov 26 05:40:13 CET,Fri Nov 26 07:25:09 CET,0.0 0.508 0.745 0.941 1.111 1.271 1.415 1.541 1.751 1.856 1.96 2.017 2.264 2.363 2.545 2.703 2.854 2.93 3.079 3.221 3.438 3.57 3.691 3.866 4.031 4.183 4.331 4.489 4.689 4.865 5.039 5.257 5.469 5.671 5.896 6.152 6.401 6.674 6.959 7.259 7.577 7.936 8.343 8.759 9.242 9.748 10.308 10.96 11.643 12.317 13.031 13.302 13.272 13.113 12.918 12.689 12.424 12.178 11.964 11.691 11.432 11.224 11.032 10.835 10.636 10.447 10.228 10.045 9.902 9.74 9.558 9.404 9.241 9.074 8.933 8.781 8.626 8.466 8.289 8.165 8.04 7.839 7.699 7.562 7.491 7.336 7.165 6.992 6.89 6.637 6.546 6.429 6.31 6.019 5.835 5.654 5.463 5.236 4.984 4.693 3.626 -3 ,6175 ,TETRA ,17555896,Fri Nov 26 05:41:10 CET,Fri Nov 26 07:24:12 CET,0.0 0.679 0.954 1.178 1.35 1.529 1.69 1.824 2.073 2.176 2.281 2.345 2.58 2.658 2.818 2.998 3.17 3.244 3.377 3.506 3.706 3.836 3.959 4.152 4.345 4.515 4.678 4.837 5.032 5.214 5.397 5.631 5.852 6.054 6.284 6.543 6.803 7.104 7.439 7.773 8.092 8.436 8.871 9.317 9.791 10.304 10.887 11.573 12.32 12.98 13.619 13.955 13.99 13.818 13.573 13.331 13.067 12.785 12.513 12.249 12.016 11.789 11.595 11.41 11.213 11.035 10.853 10.672 10.518 10.362 10.171 10.007 9.849 9.679 9.538 9.398 9.257 9.104 8.945 8.841 8.72 8.516 8.371 8.224 8.153 8.0 7.831 7.658 7.568 7.332 7.275 7.171 7.037 6.72 6.557 6.367 6.144 5.904 5.616 5.16 3.992 -4 ,19302 ,TETRA ,17555897,Fri Nov 26 05:41:10 CET,Fri Nov 26 07:20:28 CET,0.0 0.908 1.185 1.385 1.556 1.717 1.864 2.002 2.231 2.343 2.459 2.503 2.747 2.829 2.97 3.116 3.27 3.35 3.494 3.638 3.851 3.975 4.092 4.271 4.456 4.623 4.777 4.941 5.15 5.337 5.529 5.762 5.976 6.18 6.433 6.719 6.995 7.337 7.697 8.049 8.401 8.803 9.365 9.881 10.377 10.928 11.569 12.301 13.138 14.144 15.269 15.825 15.884 15.786 15.6 15.353 15.107 14.843 14.587 14.318 14.063 13.849 13.655 13.45 13.247 13.039 12.809 12.612 12.443 12.266 12.093 11.954 11.798 11.624 11.488 11.347 11.2 11.05 10.888 10.767 10.641 10.438 10.301 10.161 10.086 9.927 9.764 9.6 9.5 9.252 9.143 9.013 8.89 8.621 8.455 8.281 8.116 7.893 7.614 7.254 5.59 -5 ,31795 ,TETRA ,17555898,Fri Nov 26 05:42:11 CET,Fri Nov 26 07:15:31 CET,0.0 0.713 1.006 1.253 1.437 1.581 1.7 1.824 2.06 2.161 2.261 2.293 2.524 2.611 2.792 2.971 3.133 3.211 3.348 3.474 3.658 3.779 3.905 4.082 4.246 4.404 4.562 4.718 4.915 5.108 5.297 5.511 5.717 5.929 6.172 6.45 6.751 7.081 7.396 7.723 8.079 8.49 8.948 9.431 9.995 10.586 11.258 12.031 12.972 13.96 14.833 15.26 15.322 15.184 14.911 14.621 14.36 14.083 13.81 13.557 13.34 13.11 12.883 12.669 12.464 12.281 12.086 11.89 11.714 11.534 11.364 11.228 11.064 10.878 10.748 10.61 10.46 10.323 10.172 10.064 9.955 9.768 9.62 9.454 9.372 9.216 9.035 8.834 8.738 8.503 8.412 8.282 8.146 7.867 7.715 7.557 7.393 7.186 6.905 6.52 4.982 -6 ,30536 ,TETRA ,17555899,Fri Nov 26 05:42:12 CET,Fri Nov 26 07:22:51 CET,0.0 0.532 0.808 1.033 1.199 1.347 1.485 1.615 1.852 1.97 2.077 2.109 2.355 2.453 2.636 2.819 2.981 3.058 3.221 3.397 3.645 3.783 3.91 4.105 4.3 4.477 4.649 4.837 5.066 5.25 5.44 5.673 5.884 6.096 6.336 6.609 6.877 7.161 7.474 7.812 8.148 8.553 9.07 9.573 10.115 10.649 11.237 11.862 12.545 13.261 13.965 14.309 14.281 14.09 13.871 13.636 13.404 13.215 12.983 12.692 12.438 12.216 12.012 11.821 11.645 11.462 11.263 11.064 10.88 10.711 10.533 10.34 10.122 9.921 9.774 9.634 9.483 9.322 9.17 9.067 8.95 8.74 8.601 8.465 8.391 8.231 8.065 7.893 7.801 7.565 7.49 7.381 7.265 6.989 6.827 6.659 6.479 6.235 5.946 5.598 4.051 -7 ,30850 ,TETRA ,17555900,Fri Nov 26 05:44:11 CET,Fri Nov 26 07:17:33 CET,0.0 0.999 1.234 1.438 1.607 1.765 1.932 2.069 2.284 2.394 2.504 2.552 2.793 2.884 3.06 3.238 3.401 3.479 3.623 3.758 3.968 4.105 4.233 4.398 4.562 4.737 4.906 5.063 5.26 5.448 5.629 5.85 6.071 6.277 6.522 6.811 7.072 7.379 7.699 8.016 8.368 8.776 9.257 9.711 10.203 10.707 11.284 11.932 12.598 13.305 14.022 14.339 14.317 14.162 13.987 13.745 13.44 13.173 12.933 12.645 12.388 12.174 11.987 11.79 11.59 11.412 11.213 11.027 10.871 10.704 10.536 10.386 10.215 10.049 9.914 9.765 9.621 9.469 9.298 9.186 9.081 8.904 8.772 8.615 8.532 8.375 8.219 8.058 7.967 7.73 7.666 7.564 7.445 7.133 6.946 6.754 6.541 6.32 6.076 5.688 4.016 -8 ,23174 ,TETRA ,17555901,Fri Nov 26 05:45:11 CET,Fri Nov 26 07:25:54 CET,0.0 0.607 0.857 1.038 1.179 1.326 1.466 1.591 1.826 1.933 2.037 2.099 2.335 2.433 2.619 2.765 2.902 2.97 3.1 3.235 3.435 3.562 3.691 3.879 4.062 4.231 4.386 4.545 4.766 4.957 5.138 5.39 5.629 5.839 6.08 6.339 6.585 6.866 7.169 7.485 7.816 8.191 8.631 9.072 9.59 10.135 10.71 11.359 12.104 12.904 13.795 14.234 14.205 14.088 13.864 13.571 13.311 13.05 12.808 12.564 12.34 12.121 11.889 11.666 11.461 11.251 11.024 10.83 10.654 10.482 10.278 10.085 9.886 9.696 9.553 9.394 9.234 9.072 8.901 8.785 8.67 8.488 8.365 8.246 8.179 8.035 7.891 7.716 7.624 7.394 7.328 7.211 7.08 6.794 6.642 6.495 6.309 6.035 5.724 5.305 3.681 -9 ,10907 ,TETRA ,17555902,Fri Nov 26 05:45:11 CET,Fri Nov 26 07:28:53 CET,0.0 0.705 0.949 1.142 1.32 1.495 1.643 1.759 1.985 2.088 2.193 2.264 2.504 2.59 2.77 2.924 3.076 3.152 3.287 3.412 3.605 3.73 3.856 4.055 4.225 4.38 4.545 4.713 4.927 5.127 5.322 5.555 5.772 5.973 6.218 6.503 6.779 7.082 7.397 7.749 8.119 8.52 8.987 9.445 9.978 10.57 11.231 11.955 12.715 13.434 14.079 14.302 14.192 14.032 13.81 13.544 13.306 13.066 12.837 12.586 12.351 12.122 11.906 11.714 11.505 11.301 11.104 10.89 10.7 10.523 10.335 10.182 10.018 9.842 9.708 9.575 9.434 9.28 9.113 9.006 8.893 8.708 8.586 8.45 8.381 8.239 8.069 7.869 7.767 7.538 7.444 7.318 7.186 6.902 6.749 6.574 6.361 6.103 5.806 5.302 3.553 -10 ,21297 ,TETRA ,17555903,Fri Nov 26 05:45:11 CET,Fri Nov 26 07:18:13 CET,0.0 0.694 0.963 1.154 1.339 1.509 1.648 1.776 2.011 2.121 2.224 2.259 2.491 2.575 2.751 2.929 3.092 3.168 3.308 3.446 3.654 3.782 3.909 4.099 4.268 4.438 4.6 4.748 4.946 5.14 5.324 5.537 5.739 5.947 6.195 6.467 6.741 7.071 7.421 7.748 8.101 8.507 8.975 9.447 9.99 10.539 11.136 11.784 12.51 13.375 14.315 14.748 14.724 14.576 14.297 13.954 13.666 13.384 13.081 12.773 12.523 12.298 12.085 11.879 11.672 11.463 11.231 11.033 10.868 10.698 10.504 10.332 10.16 9.986 9.855 9.716 9.564 9.396 9.208 9.075 8.948 8.762 8.633 8.494 8.418 8.259 8.087 7.899 7.802 7.575 7.505 7.377 7.233 6.929 6.777 6.615 6.407 6.156 5.877 5.576 4.181 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/get_summary_files.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/get_summary_files.py deleted file mode 100644 index c0db7f0e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/get_summary_files.py +++ /dev/null @@ -1,15 +0,0 @@ -import glob -import os -import shlex -import subprocess - -wd = os.getcwd() -for target in glob.glob('*/'): - os.chdir(os.path.join(wd, target)) - for leg in glob.glob('*/'): - os.chdir(os.path.join(wd, target, leg)) - executable = 'rsync -av kebne:/proj/nobackup/uucompbiochem/diazalej/qligfep-benchmarking/OPLS2015/{}*{}*/analysis/*.txt .'.format(target, leg) - #print(executable) - #print(os.getcwd()) - run = subprocess.run(shlex.split(executable)) - os.chdir(wd) diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_124_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_124_41.txt deleted file mode 100644 index 8dd11a8a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_124_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14128 ,KEBNE ,16657283,Tue Nov 23 02:36:43 CET,Tue Nov 23 03:58:17 CET,0.0 0.691 0.95 1.139 1.324 1.486 1.606 1.696 1.913 2.021 2.111 2.228 2.342 2.433 2.574 2.67 2.787 2.856 2.962 3.052 3.17 3.235 3.303 3.383 3.451 3.521 3.577 3.62 3.659 3.697 3.751 3.829 3.852 3.822 3.793 3.77 3.749 3.738 3.702 3.59 3.432 3.222 2.926 2.582 2.126 1.556 0.786 -0.207 -1.619 -3.823 -7.312 -11.11 -14.001 -16.358 -18.269 -19.85 -21.157 -22.276 -23.206 -24.135 -24.888 -25.513 -26.099 -26.644 -27.142 -27.608 -28.105 -28.526 -28.873 -29.233 -29.599 -29.889 -30.185 -30.485 -30.716 -30.959 -31.205 -31.454 -31.709 -31.873 -32.045 -32.315 -32.493 -32.663 -32.759 -32.976 -33.177 -33.375 -33.486 -33.68 -33.845 -33.972 -34.091 -34.352 -34.49 -34.637 -34.796 -34.976 -35.21 -35.465 -35.775 -2 ,7938 ,KEBNE ,16657284,Tue Nov 23 02:36:43 CET,Tue Nov 23 03:58:55 CET,0.0 0.86 1.236 1.505 1.704 1.848 1.953 2.058 2.275 2.367 2.445 2.573 2.689 2.765 2.915 3.039 3.142 3.188 3.276 3.363 3.506 3.595 3.666 3.761 3.846 3.909 3.954 3.998 4.052 4.069 4.075 4.126 4.178 4.231 4.304 4.367 4.408 4.391 4.325 4.223 4.076 3.877 3.603 3.287 2.883 2.367 1.59 0.473 -1.049 -3.154 -6.473 -10.069 -12.825 -15.094 -16.957 -18.524 -19.85 -20.983 -21.881 -22.747 -23.477 -24.123 -24.734 -25.283 -25.772 -26.223 -26.69 -27.107 -27.468 -27.82 -28.176 -28.473 -28.769 -29.066 -29.302 -29.543 -29.783 -30.026 -30.279 -30.457 -30.632 -30.904 -31.096 -31.275 -31.361 -31.555 -31.767 -31.987 -32.099 -32.287 -32.432 -32.538 -32.654 -32.901 -33.026 -33.165 -33.322 -33.492 -33.676 -33.907 -34.375 -3 ,30752 ,KEBNE ,16657285,Tue Nov 23 02:36:47 CET,Tue Nov 23 03:59:52 CET,0.0 0.753 1.08 1.294 1.471 1.609 1.741 1.871 2.089 2.18 2.25 2.357 2.468 2.538 2.66 2.762 2.851 2.904 3.004 3.08 3.215 3.31 3.39 3.474 3.547 3.61 3.646 3.675 3.726 3.778 3.803 3.804 3.805 3.816 3.82 3.792 3.743 3.697 3.612 3.48 3.329 3.105 2.766 2.409 1.986 1.41 0.566 -0.524 -2.0 -4.187 -7.641 -11.395 -14.256 -16.546 -18.386 -19.931 -21.217 -22.346 -23.319 -24.292 -25.079 -25.75 -26.369 -26.933 -27.441 -27.884 -28.342 -28.747 -29.087 -29.437 -29.794 -30.076 -30.379 -30.692 -30.931 -31.18 -31.423 -31.657 -31.899 -32.081 -32.267 -32.538 -32.73 -32.945 -33.057 -33.279 -33.5 -33.715 -33.835 -34.038 -34.186 -34.294 -34.409 -34.661 -34.814 -34.968 -35.108 -35.268 -35.462 -35.705 -36.479 -4 ,10611 ,KEBNE ,16657286,Tue Nov 23 02:36:43 CET,Tue Nov 23 03:58:38 CET,0.0 0.732 1.01 1.202 1.394 1.563 1.694 1.823 2.039 2.131 2.224 2.36 2.47 2.554 2.724 2.873 3.022 3.091 3.205 3.309 3.464 3.551 3.631 3.739 3.846 3.953 4.044 4.12 4.18 4.226 4.287 4.374 4.455 4.5 4.493 4.482 4.478 4.452 4.374 4.244 4.094 3.883 3.629 3.346 2.874 2.211 1.341 0.274 -1.228 -3.393 -6.824 -10.63 -13.456 -15.718 -17.52 -19.039 -20.355 -21.51 -22.466 -23.343 -24.036 -24.678 -25.28 -25.809 -26.308 -26.769 -27.243 -27.661 -28.011 -28.359 -28.713 -28.993 -29.28 -29.579 -29.807 -30.035 -30.263 -30.5 -30.747 -30.92 -31.102 -31.377 -31.552 -31.74 -31.847 -32.066 -32.277 -32.482 -32.583 -32.763 -32.902 -33.014 -33.137 -33.403 -33.551 -33.729 -33.928 -34.115 -34.313 -34.577 -34.994 -5 ,23472 ,KEBNE ,16657287,Tue Nov 23 02:36:43 CET,Tue Nov 23 03:57:01 CET,0.0 0.836 1.136 1.343 1.523 1.683 1.812 1.946 2.173 2.27 2.362 2.498 2.603 2.664 2.776 2.884 2.969 3.003 3.1 3.203 3.295 3.331 3.38 3.485 3.582 3.66 3.744 3.817 3.873 3.915 3.953 4.006 4.05 4.091 4.133 4.154 4.135 4.057 3.932 3.801 3.693 3.504 3.235 2.912 2.443 1.867 1.066 -0.012 -1.513 -3.735 -7.166 -10.861 -13.689 -15.928 -17.754 -19.319 -20.634 -21.759 -22.675 -23.603 -24.383 -25.032 -25.626 -26.174 -26.691 -27.155 -27.609 -28.008 -28.355 -28.718 -29.082 -29.36 -29.641 -29.93 -30.142 -30.367 -30.604 -30.847 -31.109 -31.277 -31.436 -31.7 -31.884 -32.065 -32.155 -32.348 -32.556 -32.775 -32.888 -33.076 -33.232 -33.355 -33.472 -33.74 -33.892 -34.046 -34.236 -34.436 -34.636 -34.847 -35.281 -6 ,8540 ,KEBNE ,16657288,Tue Nov 23 02:36:43 CET,Tue Nov 23 03:57:30 CET,0.0 0.635 0.836 1.016 1.203 1.356 1.478 1.568 1.711 1.78 1.854 1.937 2.017 2.07 2.166 2.246 2.309 2.342 2.426 2.504 2.602 2.654 2.694 2.756 2.816 2.866 2.936 3.0 3.049 3.086 3.131 3.164 3.166 3.174 3.188 3.205 3.219 3.194 3.104 2.974 2.823 2.647 2.387 2.043 1.562 0.942 0.071 -1.113 -2.698 -4.907 -8.354 -12.121 -14.967 -17.283 -19.183 -20.794 -22.076 -23.163 -24.082 -25.004 -25.795 -26.449 -27.044 -27.605 -28.11 -28.556 -29.011 -29.411 -29.748 -30.089 -30.439 -30.736 -31.041 -31.341 -31.564 -31.794 -32.028 -32.267 -32.518 -32.699 -32.891 -33.158 -33.339 -33.523 -33.613 -33.81 -34.026 -34.235 -34.332 -34.514 -34.66 -34.774 -34.889 -35.172 -35.343 -35.504 -35.652 -35.823 -36.021 -36.271 -36.781 -7 ,15165 ,KEBNE ,16657289,Tue Nov 23 02:37:46 CET,Tue Nov 23 03:58:17 CET,0.0 0.81 1.036 1.215 1.375 1.516 1.64 1.754 1.93 1.998 2.072 2.191 2.294 2.367 2.496 2.59 2.678 2.721 2.811 2.891 2.971 3.029 3.092 3.16 3.217 3.258 3.289 3.336 3.388 3.417 3.442 3.474 3.506 3.526 3.524 3.502 3.472 3.412 3.313 3.182 3.03 2.823 2.565 2.256 1.746 1.069 0.186 -0.945 -2.484 -4.684 -8.105 -11.798 -14.611 -16.862 -18.674 -20.247 -21.577 -22.719 -23.658 -24.58 -25.374 -26.053 -26.658 -27.199 -27.691 -28.151 -28.623 -29.027 -29.376 -29.728 -30.076 -30.359 -30.641 -30.943 -31.175 -31.401 -31.639 -31.889 -32.13 -32.287 -32.451 -32.703 -32.882 -33.078 -33.18 -33.386 -33.595 -33.808 -33.915 -34.089 -34.233 -34.354 -34.476 -34.737 -34.876 -35.039 -35.214 -35.396 -35.646 -35.956 -36.404 -8 ,533 ,KEBNE ,16657290,Tue Nov 23 02:37:47 CET,Tue Nov 23 03:58:42 CET,0.0 0.858 1.123 1.334 1.503 1.66 1.805 1.935 2.162 2.256 2.341 2.45 2.548 2.616 2.746 2.86 2.978 3.037 3.158 3.288 3.479 3.57 3.638 3.727 3.794 3.856 3.922 3.989 4.073 4.143 4.191 4.239 4.27 4.29 4.292 4.241 4.193 4.131 4.028 3.877 3.658 3.41 3.106 2.76 2.289 1.64 0.763 -0.396 -1.993 -4.174 -7.474 -11.227 -14.076 -16.265 -18.042 -19.576 -20.838 -21.961 -22.916 -23.802 -24.534 -25.173 -25.786 -26.363 -26.873 -27.317 -27.78 -28.193 -28.549 -28.917 -29.277 -29.56 -29.851 -30.16 -30.404 -30.642 -30.87 -31.119 -31.387 -31.558 -31.724 -31.992 -32.182 -32.38 -32.474 -32.649 -32.848 -33.061 -33.165 -33.348 -33.498 -33.613 -33.72 -33.941 -34.069 -34.218 -34.411 -34.609 -34.805 -35.062 -35.605 -9 ,386 ,KEBNE ,16657291,Tue Nov 23 02:37:47 CET,Tue Nov 23 04:00:00 CET,0.0 0.762 1.087 1.309 1.511 1.684 1.813 1.921 2.12 2.211 2.301 2.424 2.528 2.588 2.707 2.831 2.948 3.0 3.087 3.159 3.273 3.342 3.407 3.499 3.577 3.656 3.737 3.802 3.882 3.975 4.031 4.052 4.079 4.097 4.111 4.105 4.066 4.011 3.922 3.792 3.617 3.393 3.08 2.691 2.167 1.514 0.668 -0.458 -2.012 -4.231 -7.733 -11.581 -14.477 -16.753 -18.605 -20.161 -21.486 -22.613 -23.514 -24.383 -25.126 -25.783 -26.393 -26.969 -27.478 -27.922 -28.363 -28.743 -29.081 -29.438 -29.807 -30.113 -30.414 -30.704 -30.93 -31.171 -31.418 -31.669 -31.926 -32.099 -32.291 -32.58 -32.76 -32.95 -33.054 -33.258 -33.444 -33.645 -33.757 -33.952 -34.105 -34.221 -34.349 -34.633 -34.784 -34.934 -35.088 -35.269 -35.462 -35.651 -36.145 -10 ,3686 ,KEBNE ,16657292,Tue Nov 23 02:37:47 CET,Tue Nov 23 04:00:14 CET,0.0 0.659 0.895 1.113 1.332 1.476 1.583 1.695 1.896 1.993 2.093 2.222 2.327 2.397 2.535 2.67 2.791 2.842 2.935 3.028 3.17 3.274 3.365 3.487 3.588 3.646 3.686 3.733 3.791 3.837 3.884 3.923 3.927 3.924 3.921 3.905 3.876 3.825 3.764 3.677 3.538 3.349 3.07 2.744 2.309 1.743 0.965 -0.122 -1.592 -3.64 -6.836 -10.328 -12.981 -15.096 -16.843 -18.346 -19.606 -20.746 -21.712 -22.657 -23.431 -24.057 -24.648 -25.208 -25.721 -26.186 -26.645 -27.033 -27.362 -27.719 -28.086 -28.38 -28.678 -28.986 -29.222 -29.452 -29.707 -29.976 -30.228 -30.403 -30.596 -30.876 -31.05 -31.233 -31.332 -31.535 -31.739 -31.959 -32.076 -32.264 -32.41 -32.52 -32.628 -32.865 -32.99 -33.135 -33.299 -33.451 -33.642 -33.871 -34.296 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_124_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_124_54.txt deleted file mode 100644 index 7e787ed3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_124_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7211 ,KEBNE ,16657293,Tue Nov 23 02:38:48 CET,Tue Nov 23 03:59:06 CET,0.0 0.946 1.296 1.545 1.74 1.89 2.023 2.14 2.336 2.442 2.531 2.638 2.742 2.812 2.914 2.992 3.081 3.124 3.2 3.275 3.369 3.442 3.522 3.594 3.644 3.683 3.705 3.727 3.752 3.774 3.793 3.819 3.823 3.767 3.666 3.565 3.468 3.328 3.155 2.953 2.7 2.337 1.844 1.327 0.618 -0.287 -1.446 -2.992 -5.154 -8.197 -12.751 -17.671 -21.441 -24.457 -26.811 -28.82 -30.533 -31.986 -33.205 -34.411 -35.403 -36.246 -37.003 -37.715 -38.387 -38.96 -39.526 -40.018 -40.436 -40.888 -41.373 -41.762 -42.144 -42.522 -42.809 -43.098 -43.374 -43.654 -43.941 -44.137 -44.338 -44.647 -44.88 -45.131 -45.254 -45.505 -45.773 -46.04 -46.174 -46.402 -46.592 -46.735 -46.887 -47.229 -47.415 -47.592 -47.767 -47.961 -48.187 -48.472 -49.082 -2 ,5998 ,KEBNE ,16657294,Tue Nov 23 02:38:51 CET,Tue Nov 23 04:02:39 CET,0.0 0.887 1.221 1.504 1.718 1.908 2.092 2.26 2.498 2.582 2.663 2.787 2.9 2.977 3.101 3.19 3.276 3.32 3.411 3.489 3.585 3.643 3.698 3.763 3.815 3.85 3.883 3.909 3.916 3.916 3.907 3.885 3.827 3.75 3.668 3.558 3.43 3.275 3.09 2.863 2.588 2.249 1.789 1.238 0.519 -0.362 -1.538 -3.133 -5.249 -8.243 -13.107 -18.395 -22.289 -25.354 -27.8 -29.833 -31.503 -32.959 -34.157 -35.278 -36.215 -37.036 -37.8 -38.486 -39.11 -39.684 -40.275 -40.796 -41.236 -41.678 -42.099 -42.421 -42.768 -43.145 -43.423 -43.698 -44.001 -44.318 -44.638 -44.859 -45.085 -45.438 -45.672 -45.902 -46.025 -46.298 -46.584 -46.874 -47.013 -47.249 -47.483 -47.653 -47.812 -48.187 -48.383 -48.584 -48.825 -49.078 -49.311 -49.601 -50.125 -3 ,7316 ,KEBNE ,16657295,Tue Nov 23 02:38:50 CET,Tue Nov 23 04:00:19 CET,0.0 1.094 1.429 1.678 1.913 2.124 2.297 2.457 2.695 2.781 2.865 3.011 3.127 3.194 3.301 3.405 3.506 3.555 3.621 3.679 3.756 3.793 3.83 3.862 3.902 3.946 3.964 3.991 4.015 4.023 4.044 4.063 4.041 3.986 3.911 3.811 3.686 3.529 3.326 3.054 2.737 2.385 1.942 1.436 0.774 -0.053 -1.194 -2.749 -4.865 -7.933 -12.674 -17.709 -21.451 -24.392 -26.738 -28.714 -30.347 -31.765 -32.945 -34.093 -35.056 -35.88 -36.645 -37.341 -37.957 -38.497 -39.059 -39.536 -39.939 -40.367 -40.797 -41.146 -41.513 -41.882 -42.158 -42.439 -42.724 -43.03 -43.337 -43.537 -43.744 -44.056 -44.269 -44.482 -44.592 -44.836 -45.082 -45.32 -45.437 -45.648 -45.79 -45.911 -46.051 -46.354 -46.507 -46.652 -46.798 -46.972 -47.216 -47.529 -48.029 -4 ,6771 ,KEBNE ,16657296,Tue Nov 23 02:39:51 CET,Tue Nov 23 04:01:50 CET,0.0 0.961 1.33 1.607 1.808 1.959 2.104 2.238 2.475 2.573 2.644 2.707 2.796 2.866 3.014 3.14 3.236 3.272 3.337 3.408 3.52 3.584 3.641 3.718 3.78 3.825 3.878 3.929 3.968 3.998 4.02 4.014 3.983 3.949 3.9 3.82 3.72 3.616 3.473 3.268 3.01 2.708 2.321 1.827 1.148 0.249 -1.002 -2.641 -4.893 -8.06 -12.818 -17.95 -21.794 -24.806 -27.222 -29.274 -30.972 -32.425 -33.614 -34.722 -35.643 -36.452 -37.21 -37.899 -38.521 -39.071 -39.625 -40.131 -40.56 -40.98 -41.402 -41.749 -42.097 -42.458 -42.746 -43.024 -43.303 -43.588 -43.868 -44.074 -44.285 -44.595 -44.814 -45.044 -45.161 -45.389 -45.615 -45.854 -45.985 -46.208 -46.377 -46.515 -46.649 -46.934 -47.098 -47.27 -47.447 -47.628 -47.843 -48.163 -48.793 -5 ,27656 ,KEBNE ,16657297,Tue Nov 23 02:39:51 CET,Tue Nov 23 04:00:31 CET,0.0 1.072 1.521 1.859 2.039 2.173 2.285 2.387 2.603 2.691 2.764 2.876 2.987 3.055 3.159 3.238 3.308 3.347 3.417 3.467 3.528 3.568 3.609 3.649 3.675 3.701 3.712 3.725 3.752 3.761 3.756 3.72 3.68 3.663 3.625 3.522 3.396 3.267 3.127 2.928 2.646 2.299 1.846 1.326 0.627 -0.285 -1.473 -3.034 -5.225 -8.385 -13.191 -18.335 -22.261 -25.356 -27.826 -29.933 -31.656 -33.108 -34.303 -35.462 -36.411 -37.221 -37.966 -38.637 -39.273 -39.864 -40.461 -40.982 -41.428 -41.889 -42.354 -42.718 -43.089 -43.481 -43.787 -44.102 -44.421 -44.738 -45.058 -45.264 -45.467 -45.774 -45.989 -46.209 -46.313 -46.545 -46.813 -47.103 -47.252 -47.487 -47.682 -47.837 -47.987 -48.289 -48.46 -48.645 -48.844 -49.062 -49.321 -49.623 -50.016 -6 ,14461 ,KEBNE ,16657298,Tue Nov 23 02:40:54 CET,Tue Nov 23 04:01:56 CET,0.0 0.991 1.369 1.599 1.803 1.953 2.077 2.212 2.461 2.565 2.665 2.817 2.924 2.995 3.129 3.243 3.342 3.375 3.426 3.476 3.567 3.647 3.732 3.847 3.922 3.971 4.008 4.019 4.026 4.049 4.048 4.008 3.963 3.926 3.885 3.791 3.676 3.539 3.355 3.121 2.844 2.519 2.086 1.565 0.879 -0.042 -1.282 -2.873 -5.118 -8.352 -13.165 -18.323 -22.179 -25.23 -27.655 -29.62 -31.212 -32.571 -33.715 -34.844 -35.793 -36.6 -37.328 -37.999 -38.605 -39.153 -39.73 -40.245 -40.674 -41.102 -41.537 -41.883 -42.239 -42.607 -42.886 -43.155 -43.43 -43.719 -44.03 -44.243 -44.445 -44.75 -44.955 -45.161 -45.27 -45.495 -45.721 -45.96 -46.086 -46.304 -46.491 -46.641 -46.791 -47.083 -47.226 -47.382 -47.553 -47.728 -47.935 -48.169 -48.602 -7 ,12812 ,KEBNE ,16657299,Tue Nov 23 02:40:54 CET,Tue Nov 23 04:00:45 CET,0.0 0.8 1.201 1.458 1.671 1.871 2.027 2.17 2.419 2.525 2.599 2.669 2.764 2.825 2.934 3.03 3.108 3.15 3.231 3.285 3.361 3.432 3.509 3.602 3.646 3.661 3.683 3.708 3.735 3.742 3.731 3.72 3.693 3.656 3.604 3.501 3.358 3.174 2.992 2.766 2.476 2.114 1.65 1.127 0.43 -0.441 -1.608 -3.137 -5.24 -8.268 -12.945 -17.924 -21.693 -24.697 -27.09 -29.098 -30.755 -32.18 -33.374 -34.504 -35.434 -36.268 -37.037 -37.735 -38.374 -38.949 -39.552 -40.075 -40.49 -40.926 -41.383 -41.74 -42.1 -42.466 -42.739 -43.009 -43.3 -43.604 -43.911 -44.12 -44.331 -44.663 -44.893 -45.117 -45.232 -45.473 -45.716 -45.956 -46.075 -46.292 -46.45 -46.59 -46.731 -46.996 -47.138 -47.291 -47.449 -47.615 -47.803 -48.036 -48.611 -8 ,109 ,KEBNE ,16657300,Tue Nov 23 02:40:55 CET,Tue Nov 23 04:01:57 CET,0.0 1.176 1.521 1.763 1.944 2.103 2.255 2.379 2.584 2.679 2.75 2.852 2.956 3.021 3.124 3.215 3.3 3.341 3.437 3.511 3.576 3.608 3.635 3.657 3.68 3.713 3.731 3.742 3.755 3.753 3.721 3.69 3.677 3.642 3.565 3.45 3.347 3.217 3.027 2.803 2.538 2.189 1.742 1.234 0.555 -0.28 -1.352 -2.835 -4.99 -8.012 -12.577 -17.331 -20.959 -24.002 -26.498 -28.58 -30.273 -31.699 -32.872 -34.021 -34.985 -35.814 -36.589 -37.309 -37.947 -38.508 -39.089 -39.59 -40.0 -40.434 -40.89 -41.245 -41.604 -41.968 -42.244 -42.52 -42.793 -43.073 -43.37 -43.584 -43.795 -44.101 -44.321 -44.555 -44.68 -44.94 -45.193 -45.436 -45.559 -45.772 -45.923 -46.055 -46.211 -46.557 -46.741 -46.938 -47.143 -47.358 -47.577 -47.863 -48.571 -9 ,27686 ,KEBNE ,16657301,Tue Nov 23 02:40:54 CET,Tue Nov 23 04:02:29 CET,0.0 0.965 1.344 1.566 1.746 1.893 2.041 2.197 2.468 2.577 2.665 2.784 2.896 2.97 3.08 3.193 3.315 3.366 3.444 3.519 3.618 3.663 3.695 3.725 3.755 3.783 3.816 3.845 3.848 3.857 3.868 3.856 3.812 3.751 3.676 3.582 3.495 3.383 3.21 2.999 2.746 2.408 1.936 1.391 0.704 -0.179 -1.347 -2.857 -5.011 -8.192 -13.001 -18.212 -22.092 -25.093 -27.528 -29.571 -31.261 -32.706 -33.903 -35.08 -36.067 -36.895 -37.652 -38.343 -38.949 -39.475 -40.024 -40.505 -40.917 -41.334 -41.755 -42.107 -42.469 -42.833 -43.099 -43.363 -43.63 -43.906 -44.192 -44.379 -44.571 -44.877 -45.082 -45.299 -45.418 -45.671 -45.917 -46.179 -46.313 -46.531 -46.714 -46.857 -46.997 -47.327 -47.512 -47.698 -47.89 -48.105 -48.329 -48.591 -49.26 -10 ,5931 ,KEBNE ,16657302,Tue Nov 23 02:40:54 CET,Tue Nov 23 04:01:31 CET,0.0 0.928 1.245 1.479 1.736 1.973 2.161 2.298 2.53 2.628 2.703 2.796 2.901 2.972 3.103 3.227 3.319 3.345 3.403 3.466 3.547 3.607 3.639 3.671 3.714 3.751 3.791 3.822 3.819 3.802 3.794 3.755 3.706 3.666 3.604 3.515 3.407 3.249 3.053 2.802 2.52 2.173 1.703 1.183 0.481 -0.402 -1.596 -3.21 -5.382 -8.513 -13.309 -18.471 -22.368 -25.445 -27.961 -30.025 -31.694 -33.16 -34.395 -35.562 -36.511 -37.329 -38.094 -38.766 -39.351 -39.875 -40.423 -40.922 -41.348 -41.775 -42.2 -42.558 -42.932 -43.306 -43.586 -43.867 -44.161 -44.471 -44.806 -45.039 -45.259 -45.593 -45.822 -46.045 -46.156 -46.385 -46.621 -46.859 -46.982 -47.204 -47.385 -47.524 -47.662 -47.997 -48.168 -48.349 -48.583 -48.849 -49.099 -49.373 -50.183 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_1.txt deleted file mode 100644 index 251e1045..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9246 ,KEBNE ,16657303,Tue Nov 23 02:41:57 CET,Tue Nov 23 04:03:11 CET,0.0 0.453 0.66 0.815 0.934 1.051 1.146 1.21 1.373 1.471 1.552 1.607 1.777 1.85 1.987 2.123 2.254 2.319 2.43 2.527 2.695 2.808 2.914 3.063 3.193 3.315 3.44 3.563 3.716 3.862 4.0 4.168 4.342 4.514 4.709 4.928 5.134 5.363 5.611 5.874 6.128 6.387 6.714 7.053 7.423 7.81 8.275 8.804 9.361 9.897 10.42 10.684 10.668 10.602 10.499 10.365 10.23 10.07 9.906 9.694 9.5 9.348 9.192 9.028 8.864 8.705 8.524 8.352 8.2 8.051 7.902 7.775 7.632 7.482 7.382 7.271 7.152 7.041 6.916 6.835 6.754 6.614 6.507 6.386 6.327 6.218 6.104 5.977 5.913 5.752 5.657 5.564 5.478 5.309 5.205 5.096 4.984 4.839 4.646 4.429 3.847 -2 ,5442 ,KEBNE ,16657304,Tue Nov 23 02:41:57 CET,Tue Nov 23 04:04:36 CET,0.0 0.33 0.495 0.684 0.857 0.984 1.101 1.224 1.415 1.5 1.582 1.65 1.812 1.874 1.988 2.086 2.182 2.237 2.352 2.457 2.609 2.715 2.813 2.947 3.084 3.221 3.346 3.461 3.624 3.774 3.91 4.089 4.252 4.406 4.597 4.791 4.969 5.174 5.382 5.616 5.878 6.145 6.45 6.75 7.086 7.444 7.824 8.222 8.669 9.179 9.676 9.879 9.861 9.727 9.547 9.36 9.137 8.871 8.646 8.447 8.268 8.099 7.942 7.785 7.605 7.435 7.291 7.166 7.037 6.91 6.787 6.681 6.575 6.465 6.374 6.265 6.155 6.041 5.913 5.827 5.737 5.579 5.467 5.356 5.306 5.209 5.099 4.99 4.93 4.781 4.71 4.618 4.527 4.351 4.232 4.081 3.931 3.755 3.532 3.264 2.556 -3 ,26316 ,KEBNE ,16657305,Tue Nov 23 02:41:58 CET,Tue Nov 23 04:05:35 CET,0.0 0.592 0.811 0.997 1.152 1.279 1.408 1.536 1.732 1.806 1.875 1.921 2.082 2.163 2.32 2.459 2.594 2.654 2.776 2.905 3.078 3.174 3.267 3.412 3.555 3.694 3.824 3.939 4.077 4.223 4.368 4.533 4.689 4.867 5.071 5.267 5.452 5.645 5.852 6.073 6.302 6.562 6.874 7.178 7.504 7.876 8.323 8.844 9.418 9.957 10.479 10.799 10.891 10.859 10.755 10.585 10.394 10.194 10.025 9.887 9.754 9.616 9.486 9.364 9.237 9.109 8.946 8.802 8.69 8.565 8.437 8.326 8.179 8.026 7.922 7.812 7.678 7.537 7.407 7.317 7.221 7.049 6.936 6.816 6.743 6.602 6.467 6.299 6.217 6.058 5.964 5.869 5.764 5.556 5.457 5.353 5.246 5.07 4.863 4.607 3.838 -4 ,11216 ,KEBNE ,16657306,Tue Nov 23 02:41:57 CET,Tue Nov 23 04:06:08 CET,0.0 0.644 0.866 1.056 1.189 1.287 1.4 1.504 1.665 1.741 1.83 1.893 2.052 2.126 2.265 2.384 2.485 2.542 2.668 2.779 2.92 3.013 3.118 3.27 3.403 3.543 3.682 3.811 3.983 4.13 4.274 4.462 4.623 4.775 4.959 5.172 5.362 5.596 5.851 6.085 6.339 6.606 6.9 7.22 7.59 7.973 8.412 8.914 9.454 10.04 10.646 10.987 11.055 10.952 10.815 10.691 10.523 10.336 10.156 9.955 9.788 9.637 9.443 9.266 9.13 8.99 8.824 8.685 8.562 8.437 8.302 8.179 8.064 7.935 7.822 7.701 7.592 7.484 7.364 7.286 7.21 7.067 6.963 6.842 6.776 6.661 6.552 6.44 6.38 6.234 6.184 6.107 6.021 5.836 5.747 5.666 5.552 5.423 5.302 5.142 4.405 -5 ,30256 ,KEBNE ,16657307,Tue Nov 23 02:42:01 CET,Tue Nov 23 04:02:36 CET,0.0 0.456 0.617 0.755 0.892 1.024 1.134 1.222 1.396 1.489 1.574 1.632 1.81 1.892 2.032 2.185 2.345 2.418 2.546 2.665 2.836 2.954 3.066 3.213 3.359 3.491 3.623 3.755 3.914 4.073 4.22 4.389 4.565 4.738 4.921 5.117 5.307 5.509 5.727 5.963 6.212 6.493 6.819 7.133 7.484 7.881 8.334 8.817 9.358 9.887 10.399 10.668 10.689 10.602 10.481 10.322 10.126 9.95 9.806 9.646 9.486 9.32 9.141 8.959 8.799 8.665 8.521 8.381 8.254 8.128 7.985 7.862 7.747 7.614 7.494 7.375 7.257 7.127 6.998 6.915 6.824 6.683 6.573 6.451 6.392 6.268 6.157 6.024 5.941 5.768 5.673 5.592 5.501 5.254 5.133 5.026 4.891 4.715 4.504 4.282 3.327 -6 ,17542 ,KEBNE ,16657308,Tue Nov 23 02:43:00 CET,Tue Nov 23 04:09:39 CET,0.0 0.649 0.821 0.952 1.07 1.172 1.27 1.365 1.539 1.638 1.732 1.805 1.978 2.053 2.197 2.33 2.451 2.509 2.62 2.723 2.883 2.984 3.082 3.222 3.357 3.488 3.612 3.737 3.9 4.06 4.2 4.353 4.51 4.668 4.864 5.071 5.252 5.463 5.679 5.889 6.125 6.402 6.709 7.02 7.389 7.765 8.177 8.667 9.228 9.823 10.407 10.771 10.86 10.81 10.697 10.538 10.375 10.231 10.076 9.857 9.663 9.49 9.311 9.137 8.974 8.83 8.685 8.561 8.45 8.325 8.198 8.087 7.952 7.816 7.712 7.606 7.489 7.352 7.212 7.109 7.013 6.858 6.735 6.621 6.559 6.441 6.324 6.196 6.127 5.968 5.911 5.84 5.749 5.527 5.421 5.317 5.208 5.077 4.911 4.729 4.003 -7 ,13473 ,KEBNE ,16657309,Tue Nov 23 02:43:00 CET,Tue Nov 23 04:09:38 CET,0.0 0.526 0.706 0.862 0.996 1.11 1.208 1.305 1.515 1.604 1.678 1.73 1.888 1.956 2.094 2.225 2.337 2.399 2.516 2.628 2.802 2.902 3.002 3.159 3.322 3.474 3.608 3.729 3.893 4.064 4.215 4.404 4.598 4.772 4.946 5.159 5.386 5.609 5.83 6.071 6.315 6.575 6.892 7.196 7.543 7.938 8.378 8.849 9.353 9.896 10.446 10.694 10.683 10.6 10.483 10.327 10.147 9.975 9.812 9.617 9.443 9.281 9.14 8.998 8.811 8.633 8.471 8.332 8.218 8.102 7.977 7.863 7.736 7.624 7.54 7.422 7.277 7.127 6.986 6.893 6.783 6.598 6.472 6.354 6.299 6.176 6.07 5.971 5.914 5.77 5.722 5.653 5.578 5.406 5.308 5.189 5.011 4.815 4.616 4.344 3.645 -8 ,6126 ,KEBNE ,16657310,Tue Nov 23 02:43:00 CET,Tue Nov 23 04:08:30 CET,0.0 0.605 0.897 1.076 1.208 1.324 1.414 1.493 1.677 1.779 1.869 1.942 2.105 2.183 2.34 2.452 2.563 2.624 2.728 2.826 3.006 3.125 3.23 3.407 3.588 3.736 3.863 3.997 4.168 4.321 4.472 4.662 4.845 5.011 5.194 5.419 5.646 5.869 6.097 6.35 6.617 6.905 7.201 7.483 7.822 8.228 8.662 9.123 9.656 10.216 10.777 11.007 10.98 10.918 10.84 10.709 10.553 10.369 10.169 9.975 9.795 9.633 9.477 9.309 9.146 8.984 8.823 8.685 8.558 8.419 8.274 8.134 7.978 7.838 7.726 7.615 7.513 7.402 7.271 7.172 7.075 6.918 6.809 6.709 6.654 6.526 6.385 6.228 6.149 5.991 5.92 5.846 5.767 5.589 5.494 5.369 5.235 5.094 4.904 4.679 4.017 -9 ,21381 ,KEBNE ,16657311,Tue Nov 23 02:43:00 CET,Tue Nov 23 04:05:29 CET,0.0 0.474 0.724 0.928 1.07 1.203 1.301 1.38 1.543 1.645 1.743 1.801 1.957 2.015 2.132 2.254 2.372 2.43 2.535 2.639 2.809 2.921 3.037 3.2 3.345 3.466 3.577 3.686 3.836 3.992 4.125 4.272 4.433 4.594 4.769 4.956 5.148 5.369 5.6 5.844 6.102 6.398 6.719 7.022 7.364 7.717 8.128 8.592 9.108 9.666 10.232 10.485 10.497 10.439 10.318 10.173 9.994 9.791 9.6 9.42 9.239 9.035 8.839 8.681 8.547 8.39 8.21 8.068 7.953 7.844 7.695 7.551 7.417 7.279 7.182 7.084 6.973 6.843 6.715 6.635 6.535 6.367 6.252 6.141 6.089 5.978 5.86 5.748 5.683 5.523 5.484 5.418 5.336 5.15 5.044 4.927 4.792 4.635 4.441 4.215 3.357 -10 ,8716 ,KEBNE ,16657312,Tue Nov 23 02:45:06 CET,Tue Nov 23 04:07:55 CET,0.0 0.554 0.777 0.924 1.028 1.141 1.248 1.335 1.497 1.575 1.655 1.715 1.883 1.961 2.096 2.244 2.395 2.461 2.586 2.699 2.835 2.922 3.004 3.12 3.247 3.393 3.535 3.659 3.811 3.946 4.09 4.258 4.401 4.55 4.729 4.923 5.132 5.376 5.599 5.821 6.056 6.324 6.645 6.975 7.352 7.752 8.159 8.588 9.077 9.584 10.134 10.464 10.53 10.459 10.328 10.148 9.991 9.86 9.697 9.517 9.363 9.22 9.084 8.947 8.807 8.661 8.489 8.328 8.198 8.076 7.952 7.861 7.757 7.635 7.526 7.397 7.244 7.1 6.982 6.9 6.807 6.639 6.506 6.378 6.321 6.192 6.032 5.873 5.8 5.64 5.582 5.505 5.42 5.231 5.119 4.994 4.856 4.709 4.553 4.349 3.144 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_156.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_156.txt deleted file mode 100644 index e17524b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_156.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8319 ,KEBNE ,16657313,Tue Nov 23 02:45:07 CET,Tue Nov 23 04:13:21 CET,0.0 0.423 0.626 0.797 0.938 1.07 1.185 1.287 1.463 1.547 1.638 1.723 1.898 1.985 2.144 2.291 2.43 2.493 2.618 2.728 2.882 2.979 3.084 3.259 3.427 3.585 3.742 3.892 4.07 4.223 4.375 4.587 4.792 4.973 5.18 5.416 5.643 5.892 6.163 6.426 6.7 7.029 7.407 7.799 8.24 8.717 9.311 9.985 10.707 11.51 12.441 13.065 13.317 13.429 13.506 13.53 13.483 13.415 13.332 13.242 13.167 13.088 12.997 12.867 12.749 12.661 12.553 12.449 12.364 12.278 12.177 12.093 12.012 11.912 11.814 11.711 11.604 11.499 11.38 11.304 11.239 11.104 11.013 10.937 10.9 10.803 10.691 10.581 10.513 10.363 10.323 10.249 10.162 9.973 9.887 9.802 9.706 9.593 9.442 9.294 9.018 -2 ,13218 ,KEBNE ,16657314,Tue Nov 23 02:46:09 CET,Tue Nov 23 04:13:26 CET,0.0 0.468 0.666 0.772 0.893 1.026 1.173 1.299 1.471 1.549 1.628 1.691 1.858 1.931 2.078 2.235 2.376 2.441 2.585 2.726 2.901 3.006 3.11 3.261 3.414 3.553 3.685 3.822 4.0 4.17 4.337 4.544 4.73 4.924 5.144 5.356 5.572 5.813 6.078 6.364 6.684 7.042 7.446 7.833 8.265 8.748 9.291 9.919 10.653 11.458 12.385 13.11 13.385 13.503 13.612 13.672 13.632 13.549 13.477 13.384 13.3 13.215 13.101 12.965 12.843 12.743 12.643 12.536 12.435 12.333 12.211 12.102 12.004 11.92 11.842 11.767 11.693 11.602 11.497 11.414 11.335 11.225 11.15 11.06 11.015 10.927 10.836 10.752 10.697 10.552 10.484 10.413 10.338 10.175 10.091 9.996 9.895 9.783 9.656 9.496 8.972 -3 ,31388 ,KEBNE ,16657315,Tue Nov 23 02:46:09 CET,Tue Nov 23 04:11:18 CET,0.0 0.422 0.537 0.653 0.759 0.879 0.987 1.072 1.226 1.306 1.376 1.406 1.574 1.66 1.806 1.933 2.075 2.144 2.268 2.392 2.55 2.656 2.76 2.895 3.049 3.2 3.328 3.472 3.662 3.821 3.982 4.2 4.42 4.607 4.807 5.043 5.272 5.506 5.756 6.031 6.334 6.663 7.032 7.41 7.88 8.423 9.004 9.578 10.23 10.984 11.82 12.384 12.619 12.693 12.678 12.624 12.532 12.412 12.295 12.186 12.066 11.942 11.83 11.716 11.595 11.467 11.349 11.255 11.169 11.082 10.987 10.889 10.787 10.692 10.613 10.502 10.367 10.235 10.126 10.065 9.996 9.886 9.815 9.713 9.658 9.537 9.393 9.274 9.219 9.073 8.984 8.898 8.827 8.676 8.586 8.48 8.369 8.232 8.063 7.891 7.532 -4 ,14566 ,KEBNE ,16657316,Tue Nov 23 02:48:14 CET,Tue Nov 23 04:10:44 CET,0.0 0.51 0.693 0.864 1.033 1.161 1.262 1.357 1.567 1.668 1.748 1.809 1.972 2.053 2.212 2.359 2.499 2.569 2.714 2.845 3.047 3.186 3.319 3.514 3.688 3.853 4.008 4.145 4.327 4.495 4.656 4.849 5.022 5.198 5.403 5.623 5.846 6.093 6.352 6.63 6.933 7.272 7.667 8.059 8.512 9.014 9.585 10.205 10.933 11.851 12.892 13.679 14.09 14.278 14.312 14.294 14.286 14.194 14.091 14.006 13.92 13.82 13.685 13.555 13.423 13.293 13.178 13.085 12.999 12.893 12.778 12.691 12.594 12.486 12.412 12.312 12.183 12.073 11.975 11.905 11.814 11.675 11.598 11.517 11.473 11.361 11.246 11.142 11.089 10.959 10.917 10.84 10.759 10.603 10.508 10.412 10.318 10.193 10.055 9.886 9.339 -5 ,22687 ,KEBNE ,16657317,Tue Nov 23 02:48:15 CET,Tue Nov 23 04:15:31 CET,0.0 0.209 0.418 0.627 0.775 0.899 1.02 1.128 1.327 1.408 1.479 1.53 1.694 1.771 1.93 2.088 2.228 2.29 2.411 2.531 2.713 2.82 2.925 3.075 3.213 3.35 3.483 3.628 3.823 4.011 4.188 4.392 4.595 4.791 5.045 5.349 5.596 5.845 6.121 6.406 6.705 7.016 7.361 7.714 8.153 8.653 9.218 9.875 10.659 11.585 12.593 13.311 13.655 13.789 13.823 13.787 13.733 13.685 13.628 13.555 13.477 13.38 13.275 13.169 13.054 12.949 12.836 12.72 12.625 12.544 12.454 12.378 12.302 12.195 12.094 11.986 11.886 11.79 11.671 11.591 11.519 11.391 11.289 11.178 11.131 11.05 10.944 10.825 10.766 10.622 10.554 10.473 10.395 10.216 10.099 9.98 9.87 9.749 9.621 9.457 8.794 -6 ,990 ,KEBNE ,16657318,Tue Nov 23 02:48:14 CET,Tue Nov 23 04:15:51 CET,0.0 0.405 0.616 0.822 0.961 1.096 1.233 1.356 1.542 1.625 1.711 1.773 1.934 2.002 2.127 2.252 2.381 2.441 2.551 2.661 2.832 2.934 3.032 3.186 3.352 3.514 3.654 3.797 3.975 4.124 4.28 4.482 4.667 4.832 5.029 5.25 5.452 5.676 5.945 6.245 6.559 6.889 7.265 7.651 8.078 8.585 9.177 9.823 10.561 11.389 12.371 13.084 13.423 13.598 13.672 13.672 13.627 13.549 13.458 13.35 13.265 13.178 13.067 12.961 12.857 12.747 12.624 12.528 12.433 12.307 12.188 12.089 11.992 11.903 11.826 11.742 11.645 11.535 11.436 11.381 11.324 11.211 11.132 11.041 10.983 10.849 10.711 10.586 10.518 10.369 10.31 10.232 10.158 9.998 9.91 9.821 9.733 9.623 9.492 9.345 8.9 -7 ,20702 ,KEBNE ,16657319,Tue Nov 23 02:48:14 CET,Tue Nov 23 04:16:04 CET,0.0 0.284 0.442 0.568 0.681 0.778 0.865 0.942 1.104 1.189 1.266 1.33 1.503 1.599 1.785 1.934 2.082 2.151 2.269 2.384 2.553 2.656 2.765 2.939 3.103 3.264 3.409 3.532 3.709 3.881 4.037 4.221 4.398 4.571 4.772 5.009 5.221 5.444 5.713 6.024 6.356 6.701 7.063 7.448 7.915 8.412 8.973 9.603 10.327 11.086 11.943 12.563 12.83 12.98 13.043 13.03 12.963 12.865 12.747 12.6 12.451 12.324 12.207 12.095 11.99 11.894 11.782 11.66 11.556 11.439 11.314 11.223 11.134 11.047 10.966 10.857 10.736 10.618 10.49 10.402 10.325 10.208 10.108 10.01 9.976 9.899 9.769 9.646 9.597 9.454 9.415 9.351 9.275 9.081 8.978 8.898 8.81 8.675 8.477 8.233 7.777 -8 ,2072 ,KEBNE ,16657320,Tue Nov 23 02:48:14 CET,Tue Nov 23 04:16:27 CET,0.0 0.252 0.385 0.536 0.657 0.747 0.84 0.938 1.106 1.189 1.278 1.358 1.521 1.584 1.709 1.838 1.97 2.035 2.161 2.275 2.435 2.545 2.658 2.828 2.978 3.106 3.227 3.347 3.514 3.699 3.884 4.077 4.262 4.439 4.655 4.897 5.107 5.337 5.589 5.854 6.142 6.46 6.842 7.25 7.713 8.204 8.741 9.326 9.987 10.788 11.721 12.327 12.551 12.63 12.639 12.608 12.563 12.48 12.385 12.258 12.128 12.009 11.907 11.822 11.718 11.593 11.453 11.336 11.226 11.107 11.001 10.916 10.825 10.717 10.63 10.539 10.433 10.31 10.178 10.095 10.029 9.908 9.813 9.722 9.668 9.552 9.464 9.375 9.313 9.167 9.095 9.004 8.921 8.759 8.662 8.557 8.435 8.297 8.151 7.985 7.667 -9 ,29222 ,KEBNE ,16657321,Tue Nov 23 02:48:14 CET,Tue Nov 23 04:15:44 CET,0.0 0.364 0.496 0.642 0.78 0.896 1.002 1.103 1.285 1.376 1.463 1.543 1.714 1.783 1.923 2.064 2.204 2.272 2.415 2.537 2.678 2.775 2.871 3.019 3.166 3.301 3.439 3.579 3.752 3.91 4.063 4.269 4.466 4.646 4.867 5.105 5.318 5.591 5.874 6.15 6.469 6.804 7.2 7.591 8.012 8.494 9.078 9.727 10.463 11.295 12.23 12.841 13.078 13.212 13.256 13.232 13.173 13.046 12.933 12.814 12.7 12.606 12.511 12.403 12.282 12.174 12.065 11.947 11.849 11.743 11.607 11.503 11.401 11.291 11.203 11.117 11.025 10.902 10.776 10.706 10.628 10.498 10.402 10.292 10.244 10.15 10.044 9.927 9.861 9.707 9.63 9.555 9.478 9.302 9.213 9.115 9.013 8.902 8.723 8.537 8.101 -10 ,18717 ,KEBNE ,16657322,Tue Nov 23 02:48:15 CET,Tue Nov 23 04:16:09 CET,0.0 0.548 0.807 0.975 1.095 1.199 1.314 1.442 1.643 1.724 1.807 1.868 2.028 2.102 2.255 2.4 2.535 2.596 2.703 2.814 2.988 3.101 3.218 3.388 3.529 3.661 3.788 3.91 4.063 4.205 4.345 4.538 4.741 4.918 5.119 5.368 5.597 5.829 6.096 6.376 6.674 7.002 7.371 7.768 8.222 8.743 9.365 10.052 10.786 11.571 12.526 13.231 13.549 13.699 13.755 13.731 13.654 13.577 13.498 13.413 13.308 13.191 13.1 13.016 12.93 12.834 12.716 12.605 12.514 12.414 12.303 12.224 12.131 12.024 11.939 11.843 11.745 11.657 11.553 11.462 11.363 11.209 11.094 10.981 10.923 10.818 10.741 10.639 10.571 10.428 10.36 10.287 10.208 10.028 9.949 9.855 9.74 9.616 9.477 9.318 8.713 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_23.txt deleted file mode 100644 index 29b49da6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_23.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31764 ,KEBNE ,16657323,Tue Nov 23 02:48:15 CET,Tue Nov 23 04:14:42 CET,0.0 0.59 0.803 0.986 1.149 1.289 1.41 1.514 1.696 1.778 1.852 1.904 2.071 2.165 2.342 2.508 2.651 2.706 2.809 2.915 3.075 3.176 3.27 3.412 3.549 3.68 3.802 3.916 4.069 4.21 4.322 4.456 4.616 4.789 4.982 5.17 5.338 5.505 5.692 5.916 6.165 6.439 6.723 6.991 7.298 7.627 7.948 8.215 8.49 8.707 8.752 8.523 8.096 7.648 7.253 6.842 6.456 6.111 5.788 5.441 5.126 4.85 4.604 4.353 4.105 3.884 3.646 3.43 3.249 3.072 2.886 2.722 2.54 2.359 2.223 2.077 1.925 1.774 1.608 1.479 1.365 1.205 1.093 0.969 0.893 0.74 0.602 0.435 0.344 0.177 0.108 0.018 -0.079 -0.32 -0.454 -0.588 -0.733 -0.877 -1.061 -1.346 -2.255 -2 ,9536 ,KEBNE ,16657324,Tue Nov 23 02:53:27 CET,Tue Nov 23 04:14:55 CET,0.0 0.358 0.543 0.716 0.872 1.004 1.141 1.266 1.451 1.537 1.63 1.713 1.878 1.947 2.089 2.235 2.387 2.461 2.591 2.712 2.891 3.0 3.105 3.274 3.448 3.615 3.766 3.903 4.083 4.246 4.391 4.578 4.767 4.943 5.14 5.349 5.54 5.774 6.052 6.343 6.611 6.869 7.164 7.457 7.763 8.075 8.385 8.749 9.15 9.409 9.524 9.353 9.058 8.763 8.48 8.193 7.888 7.592 7.325 7.046 6.796 6.571 6.357 6.137 5.926 5.73 5.516 5.317 5.143 4.954 4.739 4.558 4.386 4.202 4.056 3.902 3.738 3.586 3.422 3.294 3.175 2.981 2.844 2.721 2.651 2.496 2.333 2.145 2.051 1.876 1.766 1.647 1.535 1.333 1.241 1.112 0.957 0.76 0.497 0.227 -0.653 -3 ,6378 ,KEBNE ,16657325,Tue Nov 23 02:53:27 CET,Tue Nov 23 04:14:55 CET,0.0 0.426 0.649 0.816 0.951 1.062 1.171 1.274 1.472 1.576 1.671 1.731 1.894 1.975 2.113 2.25 2.402 2.48 2.613 2.72 2.873 2.989 3.103 3.241 3.39 3.537 3.665 3.781 3.922 4.075 4.232 4.432 4.627 4.792 4.993 5.218 5.42 5.644 5.878 6.103 6.346 6.631 6.937 7.25 7.58 7.928 8.381 8.848 9.241 9.572 9.821 9.729 9.431 9.055 8.657 8.232 7.843 7.478 7.175 6.885 6.612 6.36 6.105 5.861 5.642 5.423 5.16 4.923 4.736 4.558 4.368 4.206 4.031 3.85 3.716 3.58 3.412 3.227 3.05 2.931 2.798 2.578 2.436 2.296 2.217 2.044 1.883 1.725 1.646 1.472 1.348 1.233 1.133 0.901 0.764 0.619 0.474 0.307 0.088 -0.212 -1.106 -5 ,18427 ,KEBNE ,16657327,Tue Nov 23 02:55:32 CET,Tue Nov 23 04:18:26 CET,0.0 0.566 0.798 0.99 1.126 1.265 1.383 1.477 1.664 1.755 1.837 1.889 2.042 2.104 2.252 2.397 2.538 2.6 2.703 2.809 2.98 3.106 3.227 3.383 3.514 3.637 3.769 3.918 4.126 4.308 4.474 4.668 4.857 5.054 5.283 5.512 5.744 5.986 6.202 6.444 6.705 7.017 7.381 7.696 8.03 8.389 8.778 9.114 9.434 9.753 9.911 9.716 9.364 8.981 8.574 8.184 7.853 7.531 7.2 6.893 6.644 6.383 6.13 5.907 5.706 5.508 5.298 5.107 4.909 4.708 4.528 4.355 4.166 3.987 3.854 3.71 3.557 3.408 3.233 3.108 2.994 2.802 2.664 2.523 2.454 2.326 2.175 1.997 1.906 1.725 1.613 1.505 1.379 1.088 0.919 0.743 0.555 0.337 0.128 -0.221 -1.437 -6 ,484 ,KEBNE ,16657328,Tue Nov 23 02:55:32 CET,Tue Nov 23 04:16:53 CET,0.0 0.732 0.938 1.091 1.234 1.402 1.564 1.69 1.865 1.935 1.999 2.049 2.212 2.275 2.423 2.572 2.705 2.771 2.899 3.021 3.195 3.309 3.422 3.573 3.705 3.841 4.001 4.158 4.334 4.491 4.654 4.847 5.026 5.2 5.392 5.632 5.855 6.079 6.319 6.557 6.78 7.023 7.323 7.632 7.954 8.283 8.68 9.142 9.61 9.986 10.214 10.173 9.901 9.566 9.235 8.855 8.487 8.168 7.882 7.569 7.292 7.034 6.783 6.549 6.336 6.134 5.901 5.707 5.548 5.381 5.199 5.025 4.846 4.666 4.538 4.404 4.268 4.146 4.0 3.888 3.767 3.557 3.419 3.272 3.192 3.052 2.902 2.723 2.615 2.411 2.274 2.168 2.07 1.856 1.748 1.594 1.394 1.206 0.977 0.701 -0.255 -7 ,17120 ,KEBNE ,16657329,Tue Nov 23 02:56:34 CET,Tue Nov 23 04:18:10 CET,0.0 0.408 0.592 0.749 0.87 0.977 1.09 1.194 1.391 1.476 1.555 1.639 1.806 1.874 2.02 2.167 2.304 2.365 2.476 2.597 2.773 2.877 2.971 3.103 3.243 3.396 3.548 3.677 3.832 3.99 4.142 4.317 4.488 4.651 4.831 5.025 5.224 5.433 5.645 5.885 6.125 6.399 6.741 7.065 7.428 7.801 8.165 8.527 8.852 9.157 9.265 9.0 8.685 8.382 8.062 7.704 7.328 6.98 6.683 6.356 6.083 5.836 5.577 5.325 5.099 4.884 4.654 4.431 4.229 4.045 3.868 3.724 3.552 3.34 3.152 2.957 2.767 2.577 2.392 2.265 2.141 1.959 1.833 1.699 1.626 1.493 1.353 1.182 1.098 0.921 0.8 0.677 0.537 0.242 0.09 -0.081 -0.281 -0.473 -0.669 -0.96 -2.44 -8 ,29471 ,KEBNE ,16657330,Tue Nov 23 02:56:34 CET,Tue Nov 23 04:18:21 CET,0.0 0.492 0.675 0.845 1.018 1.192 1.339 1.464 1.695 1.805 1.891 1.964 2.143 2.221 2.373 2.518 2.654 2.722 2.832 2.936 3.11 3.232 3.347 3.502 3.641 3.793 3.939 4.068 4.244 4.407 4.567 4.781 4.982 5.163 5.351 5.54 5.728 5.965 6.229 6.501 6.775 7.073 7.403 7.721 8.054 8.379 8.731 9.1 9.507 9.825 9.916 9.705 9.383 9.038 8.702 8.374 8.072 7.783 7.507 7.229 6.99 6.753 6.515 6.288 6.047 5.805 5.571 5.378 5.207 5.021 4.835 4.674 4.501 4.324 4.17 4.006 3.856 3.695 3.537 3.425 3.292 3.069 2.919 2.779 2.71 2.554 2.392 2.24 2.149 1.96 1.86 1.755 1.626 1.345 1.195 1.01 0.818 0.618 0.401 0.191 -1.064 -9 ,32540 ,KEBNE ,16657331,Tue Nov 23 02:57:38 CET,Tue Nov 23 04:19:51 CET,0.0 0.479 0.661 0.809 0.944 1.063 1.179 1.29 1.491 1.6 1.696 1.779 1.952 2.024 2.164 2.317 2.463 2.529 2.65 2.757 2.926 3.05 3.162 3.322 3.482 3.635 3.776 3.899 4.061 4.232 4.387 4.538 4.677 4.838 5.047 5.272 5.471 5.688 5.928 6.175 6.431 6.711 7.026 7.321 7.593 7.877 8.219 8.55 8.83 9.064 9.192 8.97 8.505 7.991 7.549 7.167 6.805 6.439 6.134 5.828 5.559 5.315 5.056 4.786 4.544 4.348 4.149 3.951 3.771 3.591 3.39 3.211 3.033 2.864 2.723 2.573 2.439 2.3 2.155 2.055 1.941 1.748 1.614 1.485 1.42 1.284 1.153 1.007 0.925 0.754 0.688 0.607 0.517 0.304 0.192 0.079 -0.054 -0.197 -0.371 -0.605 -1.322 -10 ,9165 ,KEBNE ,16657332,Tue Nov 23 02:57:38 CET,Tue Nov 23 04:19:20 CET,0.0 0.551 0.754 0.896 1.034 1.165 1.298 1.419 1.622 1.715 1.798 1.872 2.044 2.131 2.297 2.446 2.569 2.629 2.764 2.893 3.053 3.164 3.272 3.401 3.53 3.654 3.796 3.953 4.133 4.281 4.42 4.6 4.786 4.968 5.165 5.391 5.611 5.844 6.078 6.317 6.572 6.822 7.104 7.389 7.733 8.155 8.608 8.98 9.278 9.473 9.552 9.401 9.048 8.654 8.251 7.882 7.55 7.229 6.946 6.642 6.341 6.058 5.815 5.589 5.367 5.157 4.909 4.705 4.525 4.304 4.101 3.933 3.736 3.526 3.374 3.235 3.084 2.923 2.758 2.645 2.531 2.336 2.193 2.057 1.989 1.82 1.639 1.48 1.4 1.215 1.086 0.975 0.857 0.555 0.393 0.24 0.073 -0.104 -0.352 -0.684 -1.707 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_30.txt deleted file mode 100644 index 5b1ed5bf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19285 ,KEBNE ,16657333,Tue Nov 23 02:59:46 CET,Tue Nov 23 04:21:03 CET,0.0 0.264 0.532 0.741 0.912 1.05 1.189 1.315 1.564 1.695 1.811 1.928 2.129 2.232 2.412 2.59 2.762 2.846 3.021 3.196 3.446 3.61 3.774 4.018 4.237 4.438 4.63 4.823 5.076 5.322 5.587 5.906 6.215 6.518 6.853 7.243 7.624 8.043 8.511 9.013 9.558 10.171 10.901 11.652 12.522 13.527 14.73 16.142 17.867 20.01 22.73 25.013 26.283 27.099 27.699 28.105 28.322 28.461 28.566 28.619 28.636 28.653 28.666 28.663 28.642 28.608 28.557 28.488 28.42 28.357 28.287 28.229 28.161 28.09 28.033 27.962 27.89 27.814 27.73 27.668 27.614 27.527 27.459 27.373 27.326 27.241 27.15 27.048 26.989 26.85 26.748 26.677 26.606 26.428 26.313 26.202 26.078 25.909 25.731 25.552 25.112 -2 ,27402 ,KEBNE ,16657334,Tue Nov 23 03:00:48 CET,Tue Nov 23 04:22:21 CET,0.0 0.512 0.729 0.883 1.02 1.142 1.256 1.393 1.682 1.8 1.898 1.995 2.182 2.282 2.483 2.685 2.87 2.961 3.133 3.281 3.507 3.66 3.81 4.035 4.245 4.445 4.639 4.83 5.099 5.354 5.585 5.866 6.151 6.445 6.789 7.165 7.543 7.978 8.441 8.932 9.468 10.086 10.829 11.588 12.504 13.542 14.739 16.185 17.953 20.025 22.551 24.799 26.192 27.1 27.732 28.194 28.476 28.644 28.727 28.775 28.819 28.838 28.83 28.818 28.789 28.745 28.718 28.692 28.65 28.595 28.521 28.44 28.364 28.297 28.236 28.16 28.074 27.993 27.921 27.858 27.783 27.671 27.59 27.504 27.456 27.35 27.244 27.134 27.073 26.934 26.863 26.791 26.718 26.57 26.471 26.371 26.279 26.15 25.945 25.653 24.949 -3 ,24313 ,KEBNE ,16657335,Tue Nov 23 03:01:55 CET,Tue Nov 23 04:25:11 CET,0.0 0.362 0.583 0.77 0.954 1.116 1.268 1.407 1.651 1.762 1.873 1.99 2.161 2.24 2.411 2.591 2.766 2.847 3.007 3.173 3.42 3.571 3.714 3.93 4.142 4.348 4.551 4.754 5.027 5.282 5.523 5.805 6.084 6.364 6.689 7.082 7.469 7.892 8.369 8.889 9.443 10.087 10.829 11.569 12.463 13.52 14.768 16.15 17.863 20.017 22.649 24.896 26.114 26.811 27.282 27.609 27.79 27.88 27.924 27.952 27.959 27.946 27.936 27.902 27.856 27.819 27.772 27.737 27.713 27.663 27.584 27.511 27.44 27.362 27.308 27.251 27.169 27.082 26.995 26.933 26.871 26.774 26.697 26.619 26.576 26.478 26.374 26.267 26.217 26.101 26.039 25.966 25.888 25.726 25.628 25.498 25.375 25.234 25.012 24.772 24.401 -4 ,22333 ,KEBNE ,16657336,Tue Nov 23 03:02:54 CET,Tue Nov 23 04:23:59 CET,0.0 0.339 0.529 0.676 0.808 0.929 1.063 1.198 1.411 1.512 1.619 1.728 1.913 2.004 2.18 2.349 2.499 2.57 2.719 2.87 3.095 3.25 3.411 3.638 3.862 4.08 4.284 4.477 4.726 4.979 5.222 5.527 5.834 6.14 6.5 6.89 7.271 7.691 8.138 8.609 9.101 9.704 10.441 11.186 12.06 13.04 14.22 15.581 17.198 19.238 21.964 24.293 25.663 26.583 27.132 27.434 27.591 27.686 27.748 27.772 27.752 27.737 27.739 27.724 27.692 27.65 27.595 27.515 27.424 27.335 27.252 27.172 27.092 27.024 26.959 26.882 26.793 26.699 26.613 26.541 26.456 26.327 26.239 26.142 26.081 25.956 25.841 25.729 25.678 25.553 25.463 25.387 25.305 25.098 24.99 24.879 24.755 24.586 24.395 24.209 23.448 -5 ,28205 ,KEBNE ,16657337,Tue Nov 23 03:03:57 CET,Tue Nov 23 04:25:07 CET,0.0 0.319 0.589 0.769 0.89 1.004 1.113 1.227 1.437 1.53 1.627 1.706 1.887 1.977 2.143 2.312 2.477 2.56 2.734 2.902 3.14 3.29 3.434 3.647 3.854 4.068 4.282 4.476 4.729 4.986 5.226 5.515 5.817 6.116 6.464 6.867 7.269 7.712 8.177 8.677 9.22 9.845 10.593 11.382 12.346 13.425 14.685 16.179 18.008 20.233 22.882 25.171 26.554 27.423 28.009 28.396 28.669 28.851 28.935 28.963 28.96 28.95 28.939 28.918 28.884 28.853 28.81 28.759 28.707 28.631 28.539 28.471 28.404 28.337 28.275 28.194 28.118 28.049 27.968 27.906 27.837 27.733 27.668 27.588 27.538 27.422 27.292 27.161 27.094 26.965 26.9 26.821 26.737 26.567 26.481 26.391 26.282 26.145 25.997 25.796 25.368 -6 ,22967 ,KEBNE ,16657338,Tue Nov 23 03:06:02 CET,Tue Nov 23 04:29:22 CET,0.0 0.34 0.556 0.711 0.864 1.008 1.13 1.246 1.483 1.6 1.718 1.858 2.044 2.132 2.314 2.492 2.667 2.752 2.92 3.083 3.312 3.463 3.606 3.833 4.067 4.291 4.503 4.698 4.946 5.2 5.449 5.741 6.033 6.326 6.675 7.069 7.443 7.864 8.328 8.837 9.391 10.006 10.71 11.433 12.319 13.342 14.569 16.002 17.713 19.797 22.485 24.793 26.176 27.128 27.773 28.171 28.402 28.593 28.75 28.829 28.831 28.813 28.778 28.752 28.718 28.659 28.593 28.537 28.476 28.408 28.343 28.282 28.218 28.15 28.092 28.042 27.988 27.915 27.817 27.74 27.659 27.533 27.448 27.366 27.324 27.227 27.119 27.003 26.948 26.827 26.766 26.697 26.621 26.468 26.372 26.247 26.131 26.007 25.863 25.684 25.293 -7 ,13491 ,KEBNE ,16657339,Tue Nov 23 03:06:03 CET,Tue Nov 23 04:28:25 CET,0.0 0.566 0.789 0.979 1.146 1.294 1.433 1.551 1.79 1.914 2.021 2.127 2.319 2.42 2.607 2.797 3.0 3.1 3.279 3.442 3.674 3.822 3.963 4.166 4.365 4.575 4.786 4.996 5.267 5.548 5.824 6.132 6.425 6.713 7.048 7.43 7.799 8.202 8.649 9.143 9.668 10.264 10.978 11.744 12.68 13.765 15.07 16.535 18.253 20.376 23.021 25.333 26.806 27.744 28.346 28.796 29.11 29.293 29.384 29.461 29.52 29.551 29.542 29.488 29.437 29.4 29.349 29.302 29.257 29.208 29.139 29.076 29.008 28.924 28.859 28.788 28.7 28.611 28.526 28.452 28.368 28.241 28.161 28.068 28.015 27.915 27.805 27.68 27.615 27.48 27.393 27.308 27.21 27.008 26.883 26.743 26.595 26.41 26.237 26.042 25.359 -8 ,20180 ,KEBNE ,16657340,Tue Nov 23 03:06:03 CET,Tue Nov 23 04:26:31 CET,0.0 0.321 0.489 0.618 0.775 0.924 1.039 1.156 1.386 1.496 1.598 1.694 1.883 1.99 2.196 2.375 2.541 2.625 2.792 2.974 3.249 3.413 3.571 3.801 4.017 4.225 4.433 4.649 4.924 5.18 5.429 5.742 6.05 6.342 6.678 7.069 7.465 7.909 8.399 8.92 9.488 10.146 10.9 11.665 12.558 13.584 14.798 16.217 17.902 19.835 22.27 24.461 25.785 26.647 27.195 27.525 27.773 28.01 28.174 28.276 28.294 28.295 28.283 28.268 28.261 28.232 28.181 28.13 28.078 28.002 27.925 27.875 27.827 27.757 27.688 27.628 27.558 27.466 27.368 27.304 27.239 27.142 27.056 26.962 26.92 26.815 26.695 26.557 26.481 26.333 26.269 26.207 26.123 25.882 25.775 25.682 25.573 25.451 25.288 25.02 24.019 -9 ,10263 ,KEBNE ,16657341,Tue Nov 23 03:07:10 CET,Tue Nov 23 04:29:12 CET,0.0 0.475 0.686 0.837 0.971 1.103 1.236 1.36 1.574 1.687 1.799 1.91 2.092 2.19 2.392 2.581 2.763 2.846 3.006 3.175 3.422 3.572 3.711 3.93 4.15 4.367 4.57 4.783 5.069 5.328 5.583 5.889 6.186 6.476 6.819 7.203 7.569 7.984 8.453 8.97 9.53 10.177 10.946 11.739 12.687 13.796 15.083 16.551 18.252 20.204 22.724 24.868 26.089 26.796 27.233 27.53 27.701 27.841 27.936 27.997 28.048 28.039 28.003 27.97 27.928 27.892 27.842 27.775 27.702 27.628 27.537 27.452 27.373 27.283 27.212 27.14 27.054 26.961 26.855 26.775 26.697 26.585 26.497 26.399 26.352 26.259 26.149 26.04 25.988 25.865 25.798 25.723 25.639 25.465 25.349 25.207 25.078 24.943 24.724 24.423 24.074 -10 ,10158 ,KEBNE ,16657342,Tue Nov 23 03:07:10 CET,Tue Nov 23 04:28:49 CET,0.0 0.168 0.395 0.628 0.808 0.962 1.1 1.216 1.447 1.561 1.665 1.777 1.979 2.085 2.259 2.44 2.629 2.716 2.881 3.04 3.269 3.421 3.576 3.793 4.002 4.21 4.421 4.624 4.881 5.144 5.401 5.706 6.012 6.318 6.672 7.057 7.411 7.823 8.31 8.806 9.303 9.886 10.6 11.349 12.251 13.264 14.436 15.814 17.486 19.489 22.072 24.341 25.721 26.632 27.231 27.611 27.816 27.937 28.025 28.079 28.124 28.146 28.114 28.065 28.022 27.969 27.902 27.832 27.76 27.69 27.621 27.547 27.451 27.358 27.285 27.216 27.151 27.072 26.98 26.912 26.839 26.716 26.622 26.519 26.474 26.375 26.261 26.126 26.062 25.94 25.858 25.783 25.712 25.497 25.378 25.281 25.187 25.071 24.89 24.667 24.256 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_42.txt deleted file mode 100644 index 52e727b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26511 ,KEBNE ,17023727,Wed Dec 22 08:24:10 CET,Wed Dec 22 09:48:31 CET,0.0 0.554 0.843 1.042 1.211 1.371 1.51 1.636 1.904 2.037 2.153 2.277 2.481 2.587 2.761 2.924 3.081 3.161 3.312 3.451 3.649 3.774 3.903 4.086 4.279 4.477 4.667 4.859 5.105 5.335 5.544 5.775 5.994 6.222 6.485 6.751 6.999 7.312 7.65 7.98 8.327 8.718 9.177 9.63 10.131 10.691 11.357 12.074 12.904 13.823 14.842 15.597 15.897 15.965 15.93 15.85 15.772 15.665 15.507 15.354 15.244 15.13 15.013 14.883 14.75 14.64 14.493 14.351 14.24 14.114 13.962 13.847 13.73 13.587 13.483 13.377 13.25 13.119 12.987 12.904 12.826 12.692 12.597 12.501 12.445 12.311 12.174 12.017 11.933 11.777 11.724 11.642 11.538 11.326 11.222 11.123 11.01 10.851 10.647 10.454 9.885 -2 ,4724 ,KEBNE ,17023728,Wed Dec 22 08:24:10 CET,Wed Dec 22 09:48:04 CET,0.0 0.581 0.802 1.017 1.218 1.386 1.533 1.65 1.855 1.955 2.046 2.146 2.345 2.453 2.648 2.819 2.979 3.061 3.221 3.369 3.58 3.724 3.874 4.084 4.299 4.499 4.664 4.829 5.056 5.279 5.518 5.785 6.02 6.252 6.503 6.783 7.056 7.345 7.647 7.961 8.312 8.71 9.15 9.585 10.071 10.621 11.24 11.891 12.633 13.488 14.455 15.122 15.361 15.439 15.438 15.373 15.31 15.206 15.071 14.923 14.773 14.627 14.485 14.353 14.221 14.078 13.914 13.771 13.668 13.553 13.424 13.304 13.175 13.054 12.956 12.855 12.734 12.607 12.47 12.377 12.291 12.159 12.055 11.938 11.884 11.778 11.663 11.546 11.47 11.302 11.241 11.166 11.088 10.895 10.759 10.597 10.431 10.269 10.068 9.834 9.182 -3 ,31933 ,KEBNE ,17023729,Wed Dec 22 08:24:10 CET,Wed Dec 22 09:48:58 CET,0.0 0.634 0.883 1.134 1.339 1.504 1.654 1.784 2.033 2.174 2.309 2.449 2.631 2.724 2.913 3.072 3.229 3.307 3.467 3.622 3.836 3.976 4.117 4.33 4.522 4.705 4.886 5.055 5.269 5.507 5.743 5.996 6.246 6.476 6.707 7.002 7.29 7.576 7.906 8.247 8.592 8.999 9.436 9.87 10.387 10.956 11.593 12.283 13.084 13.955 14.788 15.318 15.556 15.661 15.663 15.593 15.483 15.385 15.293 15.161 15.041 14.929 14.795 14.655 14.534 14.417 14.282 14.167 14.056 13.929 13.793 13.671 13.546 13.429 13.343 13.244 13.119 12.984 12.856 12.772 12.701 12.596 12.506 12.411 12.365 12.272 12.163 12.051 11.992 11.85 11.819 11.749 11.676 11.527 11.434 11.324 11.227 11.096 10.936 10.723 10.283 -4 ,8022 ,KEBNE ,17023740,Wed Dec 22 08:24:10 CET,Wed Dec 22 09:47:31 CET,0.0 0.688 0.923 1.108 1.299 1.475 1.599 1.719 1.966 2.077 2.184 2.3 2.486 2.583 2.76 2.93 3.087 3.16 3.327 3.487 3.685 3.82 3.944 4.12 4.313 4.505 4.673 4.822 5.039 5.248 5.469 5.754 5.978 6.186 6.447 6.728 6.982 7.255 7.546 7.869 8.227 8.625 9.07 9.522 10.003 10.526 11.16 11.841 12.622 13.539 14.576 15.203 15.403 15.496 15.533 15.472 15.364 15.276 15.177 15.047 14.935 14.816 14.685 14.546 14.403 14.277 14.133 13.977 13.823 13.671 13.536 13.431 13.328 13.219 13.13 13.02 12.911 12.805 12.691 12.62 12.54 12.4 12.296 12.173 12.103 11.966 11.833 11.687 11.615 11.452 11.373 11.283 11.185 11.004 10.914 10.813 10.7 10.584 10.411 10.16 9.621 -5 ,7945 ,KEBNE ,17023741,Wed Dec 22 08:24:10 CET,Wed Dec 22 09:48:16 CET,0.0 0.484 0.771 0.999 1.187 1.345 1.473 1.59 1.819 1.921 2.013 2.108 2.293 2.374 2.528 2.714 2.901 2.978 3.121 3.279 3.52 3.667 3.809 4.021 4.216 4.395 4.577 4.752 4.967 5.19 5.413 5.68 5.934 6.163 6.428 6.712 6.964 7.249 7.543 7.831 8.134 8.489 8.901 9.294 9.771 10.328 10.957 11.626 12.353 13.131 13.982 14.599 14.878 14.953 14.946 14.906 14.814 14.697 14.547 14.365 14.219 14.068 13.921 13.797 13.675 13.548 13.412 13.262 13.127 12.982 12.834 12.733 12.631 12.505 12.384 12.269 12.157 12.05 11.948 11.869 11.79 11.677 11.574 11.456 11.405 11.297 11.17 11.032 10.966 10.819 10.745 10.651 10.555 10.367 10.278 10.172 10.066 9.92 9.716 9.488 9.06 -6 ,7121 ,KEBNE ,17023732,Wed Dec 22 08:24:10 CET,Wed Dec 22 09:47:42 CET,0.0 0.616 0.89 1.129 1.324 1.489 1.625 1.751 2.001 2.112 2.232 2.361 2.538 2.628 2.813 3.003 3.183 3.264 3.415 3.58 3.819 3.953 4.076 4.263 4.455 4.644 4.819 5.0 5.244 5.449 5.625 5.862 6.114 6.367 6.639 6.904 7.148 7.41 7.701 8.004 8.322 8.682 9.084 9.484 9.955 10.471 11.062 11.701 12.439 13.271 14.131 14.727 15.0 15.103 15.099 15.004 14.877 14.765 14.654 14.519 14.394 14.269 14.137 13.999 13.867 13.751 13.625 13.494 13.368 13.238 13.085 12.957 12.841 12.711 12.602 12.486 12.365 12.247 12.123 12.037 11.942 11.804 11.709 11.582 11.518 11.405 11.291 11.168 11.099 10.935 10.832 10.749 10.658 10.425 10.297 10.168 10.042 9.882 9.716 9.486 8.741 -7 ,8074 ,KEBNE ,17023743,Wed Dec 22 08:25:13 CET,Wed Dec 22 09:48:26 CET,0.0 0.432 0.665 0.89 1.111 1.282 1.421 1.558 1.809 1.933 2.043 2.145 2.336 2.433 2.619 2.809 2.977 3.062 3.23 3.365 3.539 3.662 3.786 3.978 4.174 4.36 4.531 4.715 4.957 5.155 5.365 5.64 5.88 6.115 6.378 6.649 6.931 7.228 7.534 7.868 8.258 8.674 9.114 9.564 10.064 10.576 11.134 11.792 12.54 13.368 14.276 14.913 15.191 15.268 15.261 15.199 15.074 14.941 14.83 14.7 14.549 14.413 14.291 14.156 14.017 13.871 13.704 13.556 13.427 13.308 13.193 13.092 12.996 12.902 12.815 12.725 12.644 12.522 12.383 12.311 12.239 12.125 12.048 11.957 11.901 11.774 11.647 11.526 11.459 11.303 11.212 11.12 11.045 10.863 10.744 10.645 10.548 10.408 10.236 10.058 9.643 -8 ,5590 ,KEBNE ,17023734,Wed Dec 22 08:24:10 CET,Wed Dec 22 09:46:54 CET,0.0 0.64 0.936 1.116 1.268 1.421 1.568 1.704 1.955 2.071 2.174 2.29 2.485 2.591 2.778 2.942 3.111 3.197 3.372 3.536 3.768 3.916 4.055 4.247 4.435 4.62 4.779 4.939 5.159 5.349 5.536 5.765 6.005 6.273 6.567 6.847 7.117 7.422 7.753 8.101 8.439 8.802 9.197 9.597 10.069 10.602 11.232 11.902 12.665 13.535 14.523 15.181 15.415 15.503 15.491 15.403 15.293 15.172 15.061 14.917 14.759 14.587 14.426 14.298 14.167 14.033 13.875 13.719 13.58 13.453 13.325 13.201 13.073 12.944 12.843 12.726 12.608 12.504 12.394 12.307 12.22 12.079 11.974 11.87 11.813 11.689 11.568 11.444 11.387 11.237 11.141 11.04 10.938 10.735 10.62 10.496 10.359 10.192 9.998 9.766 9.319 -9 ,4375 ,KEBNE ,17023745,Wed Dec 22 08:25:13 CET,Wed Dec 22 09:47:58 CET,0.0 0.76 1.004 1.202 1.342 1.477 1.619 1.753 2.014 2.129 2.243 2.361 2.545 2.63 2.81 2.992 3.149 3.223 3.37 3.52 3.734 3.866 4.003 4.216 4.438 4.633 4.808 4.978 5.2 5.43 5.634 5.886 6.173 6.441 6.704 6.977 7.251 7.565 7.885 8.2 8.519 8.899 9.327 9.746 10.223 10.737 11.36 12.019 12.754 13.611 14.528 15.126 15.408 15.542 15.579 15.522 15.397 15.264 15.13 14.981 14.851 14.744 14.636 14.503 14.376 14.237 14.087 13.97 13.87 13.745 13.572 13.44 13.318 13.186 13.079 12.974 12.874 12.747 12.597 12.502 12.413 12.286 12.19 12.076 12.013 11.884 11.762 11.631 11.552 11.384 11.302 11.225 11.133 10.915 10.812 10.712 10.597 10.466 10.305 10.096 9.802 -10 ,3349 ,KEBNE ,17023736,Wed Dec 22 08:24:10 CET,Wed Dec 22 09:48:22 CET,0.0 0.613 0.886 1.111 1.289 1.454 1.627 1.787 2.065 2.192 2.315 2.446 2.631 2.727 2.917 3.099 3.27 3.36 3.536 3.678 3.866 3.994 4.132 4.343 4.55 4.754 4.94 5.097 5.292 5.499 5.695 5.919 6.145 6.379 6.677 6.976 7.241 7.569 7.909 8.208 8.521 8.865 9.247 9.619 10.078 10.632 11.234 11.908 12.727 13.723 14.78 15.391 15.641 15.705 15.672 15.606 15.491 15.371 15.246 15.071 14.932 14.817 14.695 14.562 14.427 14.307 14.173 14.046 13.937 13.827 13.718 13.63 13.524 13.399 13.299 13.192 13.085 12.961 12.819 12.728 12.639 12.481 12.364 12.249 12.197 12.098 11.984 11.846 11.774 11.618 11.545 11.469 11.378 11.169 11.065 10.952 10.828 10.701 10.527 10.261 9.574 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_61.txt deleted file mode 100644 index da9dab1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_155_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25460 ,KEBNE ,16657343,Tue Nov 23 03:09:12 CET,Tue Nov 23 04:30:42 CET,0.0 0.569 0.839 1.02 1.194 1.354 1.48 1.617 1.874 1.973 2.059 2.121 2.278 2.351 2.493 2.62 2.747 2.815 2.94 3.042 3.193 3.287 3.382 3.524 3.636 3.738 3.847 3.957 4.1 4.231 4.357 4.533 4.719 4.884 5.059 5.236 5.399 5.579 5.743 5.906 6.073 6.264 6.494 6.725 6.968 7.23 7.496 7.703 7.925 8.152 8.195 7.903 7.542 7.162 6.749 6.389 6.034 5.646 5.316 5.003 4.714 4.465 4.256 4.048 3.824 3.617 3.402 3.212 3.058 2.87 2.653 2.468 2.264 2.064 1.907 1.745 1.595 1.439 1.27 1.156 1.046 0.872 0.741 0.6 0.525 0.366 0.192 0.018 -0.069 -0.249 -0.341 -0.44 -0.539 -0.765 -0.895 -1.031 -1.189 -1.361 -1.544 -1.813 -2.709 -2 ,1039 ,KEBNE ,16657344,Tue Nov 23 03:09:12 CET,Tue Nov 23 04:30:31 CET,0.0 1.034 1.256 1.402 1.545 1.684 1.784 1.88 2.086 2.183 2.278 2.34 2.503 2.576 2.695 2.816 2.949 3.009 3.127 3.253 3.418 3.514 3.605 3.737 3.868 3.989 4.096 4.205 4.346 4.474 4.614 4.792 4.96 5.112 5.263 5.425 5.564 5.722 5.909 6.104 6.316 6.548 6.801 7.056 7.302 7.521 7.79 8.072 8.287 8.427 8.451 8.189 7.823 7.404 6.986 6.606 6.29 5.995 5.707 5.404 5.107 4.834 4.6 4.38 4.176 3.987 3.794 3.6 3.403 3.206 3.009 2.847 2.685 2.525 2.397 2.262 2.116 1.954 1.8 1.708 1.605 1.416 1.296 1.174 1.102 0.951 0.805 0.633 0.539 0.358 0.246 0.145 0.047 -0.178 -0.302 -0.458 -0.654 -0.863 -1.05 -1.296 -2.772 -3 ,10250 ,KEBNE ,16657345,Tue Nov 23 03:09:12 CET,Tue Nov 23 04:32:20 CET,0.0 0.494 0.668 0.833 0.982 1.128 1.252 1.355 1.551 1.634 1.702 1.741 1.89 1.951 2.081 2.213 2.352 2.42 2.551 2.686 2.867 2.963 3.041 3.162 3.301 3.434 3.552 3.665 3.806 3.937 4.065 4.222 4.369 4.517 4.691 4.855 4.998 5.165 5.364 5.58 5.802 6.052 6.304 6.53 6.771 7.009 7.282 7.522 7.723 7.839 7.714 7.331 6.943 6.561 6.167 5.749 5.338 4.979 4.658 4.314 4.038 3.808 3.569 3.315 3.076 2.823 2.548 2.338 2.162 1.962 1.762 1.592 1.409 1.241 1.099 0.933 0.771 0.601 0.432 0.323 0.2 -0.004 -0.136 -0.269 -0.34 -0.495 -0.649 -0.791 -0.867 -1.042 -1.143 -1.248 -1.352 -1.595 -1.746 -1.911 -2.077 -2.26 -2.459 -2.753 -4.037 -4 ,23030 ,KEBNE ,16657346,Tue Nov 23 03:09:12 CET,Tue Nov 23 04:31:32 CET,0.0 0.522 0.687 0.843 0.996 1.111 1.219 1.319 1.462 1.527 1.596 1.637 1.802 1.882 2.003 2.112 2.224 2.276 2.382 2.49 2.644 2.748 2.861 3.025 3.17 3.307 3.443 3.56 3.724 3.898 4.049 4.237 4.411 4.562 4.719 4.876 5.051 5.267 5.479 5.69 5.886 6.077 6.299 6.514 6.796 7.095 7.345 7.575 7.814 8.056 8.041 7.623 7.246 6.901 6.573 6.245 5.912 5.566 5.258 4.954 4.648 4.387 4.15 3.909 3.689 3.479 3.239 3.005 2.813 2.646 2.455 2.288 2.123 1.929 1.763 1.609 1.469 1.334 1.191 1.084 0.959 0.743 0.585 0.43 0.362 0.227 0.058 -0.125 -0.206 -0.384 -0.474 -0.564 -0.659 -0.875 -0.999 -1.145 -1.344 -1.564 -1.772 -2.052 -3.304 -5 ,23993 ,KEBNE ,16657347,Tue Nov 23 03:13:23 CET,Tue Nov 23 04:35:47 CET,0.0 0.4 0.652 0.794 0.908 1.015 1.124 1.23 1.391 1.476 1.571 1.648 1.814 1.88 2.011 2.126 2.23 2.286 2.395 2.487 2.626 2.721 2.81 2.935 3.066 3.189 3.302 3.418 3.566 3.715 3.876 4.044 4.201 4.361 4.514 4.679 4.838 5.002 5.18 5.364 5.538 5.721 5.926 6.126 6.369 6.631 6.92 7.181 7.357 7.459 7.39 7.032 6.584 6.155 5.726 5.25 4.827 4.465 4.159 3.848 3.576 3.319 3.048 2.789 2.557 2.341 2.127 1.941 1.761 1.577 1.382 1.222 1.061 0.887 0.748 0.617 0.482 0.322 0.148 0.037 -0.082 -0.281 -0.416 -0.561 -0.642 -0.797 -0.93 -1.061 -1.147 -1.34 -1.47 -1.587 -1.688 -1.932 -2.091 -2.246 -2.4 -2.575 -2.763 -3.055 -3.567 -6 ,5261 ,KEBNE ,16657348,Tue Nov 23 03:13:24 CET,Tue Nov 23 04:36:04 CET,0.0 0.314 0.453 0.588 0.704 0.799 0.897 1.0 1.169 1.248 1.338 1.404 1.554 1.614 1.752 1.895 2.019 2.076 2.187 2.288 2.444 2.556 2.66 2.793 2.911 3.035 3.166 3.286 3.429 3.562 3.691 3.856 4.018 4.174 4.354 4.542 4.698 4.846 5.008 5.185 5.394 5.623 5.861 6.09 6.342 6.61 6.889 7.204 7.475 7.587 7.544 7.297 6.977 6.583 6.174 5.805 5.447 5.104 4.813 4.505 4.225 3.955 3.707 3.483 3.261 3.041 2.813 2.627 2.468 2.297 2.11 1.96 1.81 1.651 1.507 1.336 1.176 1.014 0.834 0.707 0.573 0.357 0.218 0.092 0.028 -0.129 -0.287 -0.445 -0.53 -0.711 -0.808 -0.926 -1.041 -1.263 -1.407 -1.561 -1.743 -1.942 -2.179 -2.562 -3.608 -7 ,525 ,KEBNE ,16657349,Tue Nov 23 03:14:26 CET,Tue Nov 23 04:37:52 CET,0.0 0.641 0.875 1.052 1.185 1.28 1.359 1.436 1.594 1.678 1.754 1.816 1.982 2.043 2.174 2.301 2.432 2.501 2.615 2.719 2.866 2.959 3.045 3.175 3.302 3.423 3.558 3.685 3.852 3.997 4.122 4.27 4.425 4.592 4.787 4.996 5.158 5.348 5.564 5.766 5.965 6.169 6.4 6.633 6.877 7.131 7.413 7.708 7.968 8.179 8.294 8.067 7.734 7.392 7.04 6.685 6.36 6.042 5.724 5.414 5.144 4.894 4.663 4.438 4.224 4.03 3.839 3.665 3.506 3.34 3.157 3.007 2.841 2.656 2.521 2.388 2.25 2.092 1.919 1.812 1.703 1.52 1.383 1.235 1.169 1.008 0.826 0.648 0.551 0.368 0.235 0.114 -0.002 -0.245 -0.386 -0.546 -0.743 -0.947 -1.148 -1.45 -2.628 -8 ,19395 ,KEBNE ,16657350,Tue Nov 23 03:20:39 CET,Tue Nov 23 04:42:09 CET,0.0 0.565 0.779 0.954 1.1 1.216 1.345 1.464 1.636 1.725 1.816 1.873 2.041 2.122 2.255 2.384 2.512 2.569 2.655 2.746 2.881 2.965 3.057 3.203 3.328 3.432 3.541 3.647 3.795 3.93 4.051 4.214 4.375 4.521 4.679 4.858 5.028 5.206 5.394 5.588 5.78 6.004 6.257 6.48 6.693 6.927 7.205 7.482 7.803 8.107 8.24 8.081 7.782 7.435 7.081 6.701 6.372 6.052 5.753 5.486 5.253 5.006 4.745 4.532 4.355 4.195 4.026 3.868 3.735 3.587 3.417 3.26 3.092 2.919 2.786 2.641 2.493 2.348 2.198 2.09 1.972 1.79 1.664 1.525 1.455 1.318 1.165 0.994 0.904 0.718 0.615 0.53 0.441 0.219 0.096 -0.035 -0.184 -0.347 -0.518 -0.739 -1.507 -9 ,12453 ,KEBNE ,16657351,Tue Nov 23 03:20:39 CET,Tue Nov 23 04:44:59 CET,0.0 0.446 0.66 0.81 0.918 1.023 1.13 1.238 1.435 1.531 1.627 1.697 1.857 1.926 2.073 2.195 2.304 2.357 2.462 2.571 2.727 2.823 2.916 3.048 3.178 3.3 3.42 3.537 3.677 3.825 3.973 4.141 4.292 4.444 4.613 4.779 4.937 5.104 5.292 5.489 5.698 5.926 6.161 6.419 6.708 6.963 7.244 7.549 7.745 7.8 7.805 7.512 7.044 6.563 6.136 5.759 5.427 5.131 4.847 4.497 4.194 3.941 3.691 3.453 3.224 3.021 2.821 2.641 2.471 2.288 2.1 1.956 1.818 1.645 1.504 1.359 1.214 1.07 0.906 0.79 0.676 0.502 0.384 0.255 0.184 0.041 -0.107 -0.268 -0.353 -0.52 -0.559 -0.636 -0.735 -0.955 -1.079 -1.228 -1.375 -1.521 -1.758 -2.066 -2.999 -10 ,10622 ,KEBNE ,16657352,Tue Nov 23 03:20:39 CET,Tue Nov 23 04:41:58 CET,0.0 0.446 0.693 0.873 1.034 1.171 1.277 1.379 1.586 1.69 1.788 1.856 2.019 2.08 2.21 2.362 2.496 2.557 2.67 2.781 2.943 3.047 3.161 3.316 3.457 3.598 3.715 3.823 3.96 4.093 4.244 4.419 4.571 4.72 4.917 5.161 5.37 5.563 5.737 5.914 6.1 6.306 6.561 6.801 7.047 7.302 7.577 7.855 8.125 8.346 8.331 8.026 7.634 7.235 6.848 6.469 6.127 5.81 5.541 5.255 4.963 4.695 4.443 4.224 4.041 3.859 3.641 3.439 3.261 3.069 2.88 2.742 2.574 2.395 2.26 2.105 1.936 1.789 1.659 1.548 1.439 1.286 1.149 1.003 0.941 0.818 0.688 0.516 0.407 0.214 0.101 -0.014 -0.135 -0.397 -0.546 -0.696 -0.875 -1.059 -1.237 -1.5 -2.472 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_156_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_156_1.txt deleted file mode 100644 index 356c939c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_156_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5708 ,KEBNE ,16657353,Tue Nov 23 03:21:41 CET,Tue Nov 23 04:42:58 CET,0.0 0.732 0.96 1.132 1.271 1.407 1.515 1.623 1.827 1.919 2.014 2.11 2.272 2.339 2.467 2.6 2.708 2.755 2.852 2.95 3.107 3.203 3.296 3.44 3.557 3.653 3.753 3.86 4.013 4.145 4.255 4.387 4.502 4.611 4.728 4.849 4.978 5.135 5.3 5.448 5.593 5.761 5.949 6.125 6.289 6.412 6.542 6.673 6.73 6.603 6.21 5.648 5.115 4.616 4.168 3.766 3.394 3.033 2.715 2.398 2.119 1.845 1.583 1.354 1.145 0.958 0.761 0.58 0.423 0.255 0.089 -0.041 -0.193 -0.364 -0.489 -0.613 -0.745 -0.874 -1.005 -1.107 -1.213 -1.364 -1.478 -1.607 -1.674 -1.821 -1.971 -2.137 -2.226 -2.401 -2.513 -2.618 -2.729 -2.974 -3.087 -3.199 -3.336 -3.522 -3.726 -3.971 -4.946 -2 ,1257 ,KEBNE ,16657354,Tue Nov 23 03:21:41 CET,Tue Nov 23 04:45:11 CET,0.0 1.31 1.535 1.71 1.867 2.017 2.146 2.243 2.412 2.497 2.577 2.638 2.796 2.876 3.02 3.16 3.275 3.32 3.414 3.503 3.63 3.706 3.776 3.898 4.026 4.152 4.249 4.327 4.446 4.557 4.657 4.798 4.945 5.075 5.209 5.353 5.478 5.612 5.752 5.875 6.023 6.189 6.358 6.516 6.689 6.872 7.052 7.205 7.31 7.308 6.984 6.424 5.859 5.337 4.844 4.351 3.908 3.499 3.17 2.83 2.539 2.247 1.948 1.693 1.466 1.266 1.048 0.862 0.715 0.518 0.288 0.102 -0.077 -0.249 -0.38 -0.511 -0.65 -0.808 -0.974 -1.108 -1.248 -1.436 -1.569 -1.697 -1.761 -1.893 -2.02 -2.153 -2.223 -2.382 -2.458 -2.551 -2.655 -2.87 -2.985 -3.117 -3.282 -3.477 -3.716 -4.024 -4.738 -3 ,13018 ,KEBNE ,16657355,Tue Nov 23 03:23:45 CET,Tue Nov 23 04:45:38 CET,0.0 0.877 1.147 1.358 1.544 1.701 1.805 1.89 2.063 2.143 2.214 2.258 2.419 2.499 2.631 2.767 2.901 2.969 3.095 3.203 3.324 3.394 3.463 3.597 3.744 3.867 3.979 4.098 4.255 4.38 4.481 4.609 4.743 4.858 4.985 5.162 5.307 5.453 5.622 5.782 5.95 6.122 6.305 6.466 6.639 6.818 6.968 7.082 7.151 7.125 6.818 6.302 5.837 5.347 4.904 4.48 4.09 3.765 3.484 3.173 2.88 2.627 2.392 2.16 1.946 1.755 1.552 1.348 1.147 0.963 0.79 0.635 0.464 0.273 0.141 0.023 -0.109 -0.258 -0.408 -0.504 -0.596 -0.743 -0.847 -0.973 -1.034 -1.148 -1.283 -1.418 -1.482 -1.635 -1.693 -1.773 -1.869 -2.057 -2.181 -2.316 -2.468 -2.634 -2.779 -3.009 -4.218 -4 ,27530 ,KEBNE ,16657356,Tue Nov 23 03:24:47 CET,Tue Nov 23 04:47:17 CET,0.0 0.541 0.771 0.951 1.105 1.234 1.334 1.422 1.615 1.696 1.762 1.811 1.958 2.028 2.19 2.335 2.453 2.503 2.603 2.718 2.877 2.977 3.084 3.21 3.313 3.432 3.55 3.646 3.77 3.883 3.989 4.14 4.306 4.446 4.569 4.705 4.831 4.983 5.177 5.374 5.555 5.752 5.956 6.114 6.282 6.46 6.621 6.745 6.815 6.78 6.573 6.12 5.622 5.139 4.692 4.282 3.869 3.45 3.078 2.71 2.408 2.131 1.858 1.612 1.401 1.204 0.996 0.81 0.636 0.462 0.293 0.156 0.012 -0.156 -0.307 -0.475 -0.633 -0.802 -0.986 -1.102 -1.213 -1.376 -1.495 -1.628 -1.696 -1.842 -2.0 -2.174 -2.272 -2.454 -2.536 -2.626 -2.719 -2.899 -3.02 -3.166 -3.334 -3.546 -3.821 -4.165 -5.606 -5 ,7331 ,KEBNE ,16657357,Tue Nov 23 03:24:48 CET,Tue Nov 23 04:47:18 CET,0.0 0.627 0.81 0.956 1.103 1.222 1.319 1.403 1.561 1.641 1.723 1.798 1.95 2.01 2.134 2.256 2.363 2.414 2.529 2.652 2.801 2.886 2.982 3.126 3.25 3.368 3.481 3.59 3.729 3.845 3.945 4.069 4.196 4.315 4.447 4.594 4.744 4.904 5.066 5.229 5.393 5.564 5.73 5.878 6.037 6.216 6.385 6.485 6.536 6.516 6.274 5.777 5.197 4.689 4.265 3.844 3.446 3.045 2.667 2.306 2.023 1.766 1.497 1.236 0.979 0.758 0.562 0.394 0.242 0.075 -0.093 -0.243 -0.394 -0.547 -0.668 -0.809 -0.967 -1.118 -1.285 -1.403 -1.527 -1.714 -1.844 -1.973 -2.033 -2.165 -2.301 -2.445 -2.525 -2.702 -2.783 -2.86 -2.969 -3.224 -3.345 -3.472 -3.624 -3.782 -3.93 -4.232 -5.545 -6 ,2889 ,KEBNE ,16657358,Tue Nov 23 03:29:57 CET,Tue Nov 23 04:58:34 CET,0.0 0.759 0.986 1.155 1.298 1.409 1.519 1.615 1.778 1.857 1.927 1.992 2.147 2.216 2.365 2.49 2.592 2.659 2.792 2.881 3.012 3.105 3.187 3.308 3.428 3.541 3.643 3.746 3.886 4.016 4.126 4.26 4.381 4.481 4.621 4.8 4.96 5.119 5.275 5.43 5.594 5.781 5.988 6.153 6.333 6.518 6.699 6.844 6.919 6.885 6.605 6.072 5.58 5.066 4.567 4.141 3.745 3.35 3.012 2.66 2.347 2.083 1.845 1.615 1.388 1.163 0.929 0.728 0.554 0.372 0.182 0.015 -0.152 -0.321 -0.466 -0.621 -0.772 -0.922 -1.079 -1.186 -1.291 -1.456 -1.579 -1.721 -1.793 -1.939 -2.094 -2.261 -2.348 -2.512 -2.618 -2.712 -2.823 -3.056 -3.173 -3.309 -3.459 -3.628 -3.848 -4.15 -5.139 -7 ,4491 ,KEBNE ,16657359,Tue Nov 23 03:31:00 CET,Tue Nov 23 04:54:05 CET,0.0 0.968 1.209 1.438 1.6 1.733 1.84 1.939 2.124 2.201 2.288 2.369 2.511 2.577 2.72 2.853 2.973 3.032 3.146 3.255 3.419 3.509 3.596 3.733 3.861 3.983 4.091 4.184 4.311 4.431 4.541 4.674 4.806 4.926 5.035 5.155 5.274 5.409 5.547 5.687 5.823 5.971 6.158 6.326 6.484 6.63 6.773 6.901 6.953 6.869 6.551 5.993 5.422 4.911 4.471 4.029 3.641 3.318 2.998 2.612 2.282 1.998 1.729 1.479 1.219 0.989 0.776 0.6 0.455 0.3 0.132 -0.009 -0.154 -0.311 -0.438 -0.571 -0.717 -0.889 -1.07 -1.178 -1.294 -1.478 -1.592 -1.737 -1.812 -1.95 -2.102 -2.257 -2.357 -2.542 -2.628 -2.728 -2.839 -3.046 -3.162 -3.325 -3.504 -3.666 -3.896 -4.193 -5.126 -8 ,12415 ,KEBNE ,16657360,Tue Nov 23 03:33:04 CET,Tue Nov 23 04:57:13 CET,0.0 0.845 1.05 1.219 1.391 1.532 1.652 1.754 1.899 1.979 2.079 2.206 2.368 2.425 2.53 2.639 2.748 2.795 2.875 2.959 3.076 3.153 3.239 3.356 3.458 3.552 3.667 3.785 3.913 4.033 4.147 4.289 4.442 4.583 4.72 4.896 5.075 5.244 5.432 5.629 5.793 5.957 6.162 6.338 6.493 6.633 6.78 6.912 6.977 6.915 6.619 6.062 5.514 4.992 4.515 4.057 3.647 3.31 3.02 2.711 2.425 2.174 1.941 1.712 1.491 1.281 1.054 0.856 0.697 0.53 0.347 0.201 0.053 -0.117 -0.247 -0.372 -0.5 -0.636 -0.765 -0.851 -0.957 -1.133 -1.257 -1.38 -1.438 -1.57 -1.714 -1.855 -1.933 -2.106 -2.213 -2.337 -2.466 -2.705 -2.823 -2.946 -3.132 -3.395 -3.662 -4.048 -5.553 -9 ,1133 ,KEBNE ,16657361,Tue Nov 23 03:33:04 CET,Tue Nov 23 04:56:25 CET,0.0 0.974 1.184 1.348 1.471 1.6 1.712 1.819 2.03 2.112 2.186 2.264 2.423 2.484 2.597 2.706 2.8 2.851 2.949 3.03 3.162 3.252 3.345 3.483 3.607 3.719 3.821 3.924 4.078 4.225 4.354 4.511 4.658 4.78 4.9 5.036 5.165 5.298 5.449 5.604 5.757 5.94 6.128 6.289 6.449 6.607 6.778 6.907 6.988 6.953 6.648 6.11 5.575 5.047 4.579 4.112 3.689 3.311 2.977 2.649 2.373 2.103 1.836 1.605 1.387 1.184 0.986 0.791 0.606 0.407 0.208 0.056 -0.093 -0.255 -0.395 -0.55 -0.706 -0.864 -1.03 -1.131 -1.226 -1.396 -1.521 -1.649 -1.721 -1.851 -1.972 -2.124 -2.208 -2.379 -2.492 -2.599 -2.707 -2.925 -3.049 -3.185 -3.336 -3.502 -3.687 -3.925 -5.169 -10 ,11694 ,KEBNE ,16657362,Tue Nov 23 03:35:11 CET,Tue Nov 23 04:55:02 CET,0.0 0.513 0.686 0.824 0.935 1.039 1.145 1.252 1.456 1.55 1.64 1.716 1.872 1.94 2.07 2.208 2.325 2.373 2.466 2.56 2.696 2.776 2.862 3.021 3.173 3.292 3.402 3.5 3.607 3.712 3.829 3.98 4.113 4.241 4.383 4.534 4.673 4.815 4.978 5.142 5.292 5.481 5.694 5.876 6.075 6.264 6.418 6.54 6.597 6.501 6.157 5.558 4.965 4.412 3.921 3.472 3.076 2.719 2.414 2.1 1.798 1.524 1.267 1.017 0.79 0.602 0.406 0.206 0.006 -0.209 -0.418 -0.592 -0.756 -0.916 -1.047 -1.194 -1.348 -1.507 -1.701 -1.825 -1.934 -2.118 -2.24 -2.361 -2.426 -2.578 -2.752 -2.914 -2.998 -3.174 -3.274 -3.368 -3.475 -3.702 -3.817 -3.927 -4.058 -4.254 -4.51 -4.843 -6.111 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_156_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_156_31.txt deleted file mode 100644 index c7716833..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_156_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5522 ,KEBNE ,16657363,Tue Nov 23 03:36:12 CET,Tue Nov 23 04:56:49 CET,0.0 0.884 1.186 1.365 1.545 1.733 1.902 2.051 2.347 2.496 2.634 2.795 2.997 3.12 3.348 3.567 3.783 3.891 4.107 4.326 4.647 4.859 5.062 5.354 5.629 5.894 6.169 6.436 6.78 7.132 7.47 7.878 8.281 8.678 9.152 9.688 10.22 10.823 11.495 12.233 13.028 13.969 15.097 16.226 17.581 19.175 21.111 23.395 26.166 29.7 34.378 38.654 41.499 43.547 45.072 46.227 47.105 47.839 48.389 48.837 49.202 49.522 49.791 50.028 50.242 50.415 50.546 50.626 50.688 50.757 50.84 50.894 50.927 50.948 50.973 50.997 51.018 51.02 51.008 50.997 50.98 50.946 50.913 50.88 50.861 50.822 50.777 50.725 50.686 50.621 50.611 50.576 50.541 50.492 50.453 50.399 50.318 50.216 50.11 49.976 49.708 -2 ,12794 ,KEBNE ,16657364,Tue Nov 23 03:36:12 CET,Tue Nov 23 04:56:56 CET,0.0 0.374 0.607 0.827 1.035 1.212 1.374 1.538 1.838 1.982 2.135 2.344 2.551 2.666 2.884 3.097 3.295 3.388 3.588 3.794 4.09 4.292 4.503 4.793 5.063 5.33 5.612 5.909 6.282 6.656 7.04 7.505 7.945 8.371 8.864 9.402 9.934 10.548 11.219 11.944 12.756 13.731 14.866 15.993 17.359 18.937 20.872 23.224 26.123 29.77 34.558 38.94 41.751 43.688 45.129 46.266 47.133 47.807 48.346 48.825 49.174 49.467 49.724 49.924 50.077 50.193 50.296 50.371 50.421 50.463 50.513 50.553 50.566 50.574 50.577 50.578 50.575 50.56 50.541 50.524 50.508 50.482 50.45 50.415 50.384 50.289 50.217 50.149 50.113 50.054 50.031 49.981 49.917 49.808 49.744 49.641 49.504 49.348 49.191 48.993 48.39 -3 ,17982 ,KEBNE ,16657365,Tue Nov 23 03:36:14 CET,Tue Nov 23 04:56:52 CET,0.0 0.302 0.53 0.738 0.945 1.144 1.333 1.503 1.806 1.94 2.083 2.27 2.478 2.605 2.841 3.066 3.291 3.402 3.612 3.815 4.103 4.288 4.484 4.784 5.063 5.343 5.626 5.897 6.246 6.616 6.979 7.392 7.81 8.23 8.723 9.288 9.838 10.436 11.09 11.814 12.6 13.515 14.622 15.769 17.146 18.757 20.706 22.985 25.802 29.361 34.079 38.41 41.278 43.365 44.87 46.042 46.974 47.725 48.285 48.768 49.116 49.342 49.511 49.687 49.847 49.95 50.034 50.109 50.163 50.2 50.238 50.255 50.254 50.242 50.229 50.222 50.21 50.191 50.153 50.128 50.11 50.083 50.058 50.019 49.997 49.95 49.888 49.804 49.758 49.685 49.618 49.556 49.508 49.424 49.351 49.24 49.11 48.978 48.857 48.68 48.42 -4 ,1336 ,KEBNE ,16657366,Tue Nov 23 03:38:17 CET,Tue Nov 23 05:00:17 CET,0.0 0.411 0.595 0.785 0.986 1.183 1.369 1.545 1.848 2.004 2.166 2.385 2.599 2.73 2.995 3.252 3.496 3.607 3.82 4.032 4.343 4.543 4.744 5.056 5.356 5.648 5.939 6.226 6.593 6.943 7.299 7.719 8.122 8.536 9.017 9.554 10.095 10.719 11.411 12.143 12.914 13.807 14.901 16.051 17.423 18.998 20.853 23.046 25.819 29.342 34.07 38.468 41.353 43.428 44.947 46.148 47.073 47.8 48.317 48.786 49.179 49.442 49.642 49.848 50.011 50.131 50.263 50.369 50.444 50.518 50.589 50.636 50.667 50.681 50.689 50.682 50.675 50.672 50.663 50.657 50.65 50.637 50.609 50.586 50.579 50.547 50.489 50.413 50.372 50.305 50.271 50.229 50.185 50.08 50.019 49.946 49.857 49.755 49.626 49.45 48.83 -5 ,20422 ,KEBNE ,16657367,Tue Nov 23 03:42:25 CET,Tue Nov 23 05:03:11 CET,0.0 0.625 0.895 1.136 1.341 1.535 1.731 1.92 2.253 2.4 2.538 2.705 2.904 3.026 3.282 3.523 3.743 3.853 4.074 4.29 4.603 4.812 5.019 5.298 5.561 5.821 6.083 6.348 6.71 7.075 7.416 7.836 8.254 8.664 9.146 9.699 10.25 10.857 11.514 12.218 12.983 13.891 14.993 16.121 17.485 19.092 21.019 23.276 26.076 29.665 34.465 38.694 41.374 43.285 44.651 45.673 46.47 47.099 47.568 47.985 48.302 48.562 48.774 48.945 49.095 49.208 49.312 49.388 49.436 49.483 49.533 49.566 49.591 49.615 49.624 49.626 49.622 49.608 49.587 49.569 49.551 49.503 49.453 49.412 49.392 49.349 49.294 49.228 49.185 49.098 49.037 48.988 48.942 48.825 48.743 48.653 48.564 48.442 48.275 48.065 47.633 -6 ,28585 ,KEBNE ,16657368,Tue Nov 23 03:42:26 CET,Tue Nov 23 05:10:38 CET,0.0 0.603 0.874 1.094 1.273 1.448 1.621 1.794 2.132 2.286 2.432 2.631 2.85 2.994 3.258 3.488 3.707 3.82 4.052 4.278 4.604 4.821 5.036 5.344 5.641 5.93 6.202 6.465 6.818 7.184 7.538 7.935 8.326 8.723 9.178 9.702 10.235 10.836 11.505 12.224 13.003 13.939 15.073 16.219 17.569 19.137 20.98 23.142 25.899 29.43 33.961 38.164 40.966 42.923 44.364 45.477 46.345 47.038 47.552 48.007 48.377 48.664 48.875 49.066 49.249 49.394 49.523 49.612 49.672 49.74 49.809 49.851 49.871 49.895 49.919 49.932 49.939 49.943 49.942 49.944 49.945 49.932 49.918 49.89 49.87 49.834 49.795 49.75 49.719 49.654 49.625 49.588 49.533 49.407 49.334 49.239 49.147 49.043 48.914 48.772 48.181 -7 ,27461 ,KEBNE ,16657369,Tue Nov 23 03:42:25 CET,Tue Nov 23 05:03:57 CET,0.0 0.368 0.597 0.842 1.068 1.264 1.432 1.582 1.882 2.026 2.162 2.327 2.538 2.666 2.89 3.105 3.318 3.425 3.653 3.873 4.198 4.416 4.63 4.929 5.211 5.502 5.778 6.045 6.403 6.756 7.101 7.512 7.922 8.326 8.79 9.329 9.867 10.485 11.171 11.904 12.674 13.569 14.658 15.778 17.147 18.746 20.672 22.964 25.761 29.207 33.754 38.094 41.01 43.069 44.589 45.73 46.613 47.342 47.894 48.354 48.685 48.919 49.118 49.305 49.461 49.584 49.692 49.777 49.841 49.886 49.918 49.942 49.954 49.96 49.984 50.006 50.012 50.004 49.978 49.955 49.937 49.915 49.89 49.858 49.841 49.799 49.737 49.672 49.644 49.581 49.554 49.512 49.447 49.269 49.169 49.08 48.978 48.847 48.713 48.548 48.081 -8 ,5085 ,KEBNE ,16657370,Tue Nov 23 03:42:25 CET,Tue Nov 23 05:04:53 CET,0.0 0.528 0.81 1.006 1.225 1.443 1.633 1.802 2.126 2.282 2.415 2.585 2.791 2.917 3.155 3.38 3.611 3.722 3.927 4.145 4.467 4.663 4.863 5.153 5.434 5.714 5.994 6.27 6.634 6.988 7.337 7.776 8.2 8.606 9.081 9.627 10.157 10.755 11.426 12.153 12.934 13.845 14.93 16.033 17.352 18.917 20.796 23.005 25.779 29.182 33.609 37.725 40.437 42.293 43.656 44.761 45.586 46.253 46.754 47.183 47.529 47.817 48.058 48.258 48.408 48.521 48.643 48.736 48.795 48.832 48.857 48.883 48.908 48.919 48.922 48.928 48.922 48.904 48.871 48.844 48.821 48.783 48.757 48.725 48.702 48.649 48.595 48.539 48.51 48.442 48.4 48.349 48.283 48.131 48.044 47.957 47.836 47.696 47.557 47.363 46.746 -9 ,16822 ,KEBNE ,16657371,Tue Nov 23 03:43:27 CET,Tue Nov 23 05:03:57 CET,0.0 0.458 0.786 1.033 1.22 1.416 1.595 1.757 2.086 2.232 2.374 2.572 2.787 2.916 3.162 3.404 3.629 3.742 3.968 4.182 4.489 4.7 4.906 5.201 5.509 5.807 6.086 6.356 6.712 7.066 7.421 7.864 8.299 8.71 9.182 9.73 10.288 10.902 11.555 12.27 13.045 13.933 15.013 16.151 17.519 19.105 21.025 23.289 26.057 29.583 34.245 38.437 41.174 43.135 44.569 45.611 46.377 47.0 47.466 47.868 48.175 48.439 48.681 48.876 49.023 49.141 49.251 49.317 49.363 49.423 49.483 49.522 49.56 49.585 49.591 49.59 49.583 49.565 49.559 49.56 49.546 49.498 49.459 49.42 49.393 49.327 49.269 49.204 49.168 49.099 49.067 49.031 48.976 48.849 48.792 48.721 48.624 48.521 48.402 48.233 47.645 -10 ,25697 ,KEBNE ,16657372,Tue Nov 23 03:43:27 CET,Tue Nov 23 05:09:27 CET,0.0 0.491 0.746 0.978 1.167 1.337 1.53 1.709 2.007 2.14 2.278 2.474 2.681 2.803 3.054 3.302 3.536 3.652 3.876 4.09 4.393 4.596 4.803 5.097 5.381 5.658 5.926 6.187 6.544 6.906 7.257 7.687 8.098 8.504 8.989 9.532 10.05 10.632 11.3 12.038 12.813 13.699 14.795 15.955 17.322 18.899 20.814 23.061 25.868 29.415 33.935 37.999 40.674 42.498 43.787 44.761 45.523 46.169 46.659 47.057 47.339 47.59 47.838 48.046 48.208 48.314 48.392 48.46 48.509 48.545 48.565 48.573 48.576 48.578 48.58 48.591 48.592 48.569 48.552 48.544 48.538 48.548 48.538 48.508 48.486 48.422 48.343 48.275 48.253 48.191 48.142 48.099 48.053 47.914 47.824 47.735 47.65 47.574 47.48 47.283 46.424 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_15_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_15_163.txt deleted file mode 100644 index df768c49..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_15_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15682 ,KEBNE ,16657373,Tue Nov 23 03:43:29 CET,Tue Nov 23 05:03:51 CET,0.0 0.289 0.476 0.606 0.69 0.777 0.862 0.939 1.051 1.114 1.172 1.16 1.296 1.334 1.42 1.508 1.583 1.616 1.673 1.719 1.793 1.845 1.89 1.957 2.029 2.084 2.115 2.141 2.185 2.228 2.266 2.312 2.366 2.417 2.455 2.493 2.508 2.498 2.468 2.437 2.398 2.352 2.266 2.102 1.888 1.608 1.185 0.625 -0.14 -1.326 -3.287 -5.493 -7.207 -8.582 -9.715 -10.702 -11.572 -12.353 -13.001 -13.633 -14.177 -14.646 -15.068 -15.467 -15.84 -16.166 -16.52 -16.835 -17.093 -17.368 -17.647 -17.88 -18.123 -18.37 -18.555 -18.747 -18.95 -19.157 -19.363 -19.493 -19.623 -19.836 -20.008 -20.179 -20.26 -20.437 -20.616 -20.801 -20.897 -21.117 -21.205 -21.308 -21.407 -21.603 -21.725 -21.873 -22.026 -22.212 -22.429 -22.675 -23.34 -2 ,2928 ,KEBNE ,16657374,Tue Nov 23 03:43:31 CET,Tue Nov 23 05:03:30 CET,0.0 0.375 0.55 0.655 0.757 0.855 0.953 1.034 1.164 1.216 1.259 1.25 1.39 1.431 1.514 1.594 1.679 1.727 1.802 1.848 1.916 1.964 2.011 2.067 2.111 2.15 2.191 2.227 2.266 2.311 2.355 2.395 2.433 2.465 2.498 2.534 2.553 2.58 2.591 2.568 2.538 2.478 2.395 2.283 2.109 1.867 1.512 1.004 0.222 -0.937 -2.878 -5.148 -6.854 -8.216 -9.306 -10.253 -11.109 -11.876 -12.506 -13.146 -13.71 -14.207 -14.669 -15.087 -15.46 -15.804 -16.173 -16.512 -16.81 -17.114 -17.419 -17.661 -17.926 -18.175 -18.349 -18.549 -18.754 -18.956 -19.173 -19.32 -19.478 -19.732 -19.892 -20.073 -20.176 -20.37 -20.566 -20.798 -20.918 -21.149 -21.237 -21.348 -21.481 -21.757 -21.9 -22.06 -22.205 -22.342 -22.524 -22.756 -23.111 -3 ,10171 ,KEBNE ,16657375,Tue Nov 23 03:43:27 CET,Tue Nov 23 05:05:32 CET,0.0 0.208 0.356 0.479 0.56 0.638 0.724 0.809 0.956 1.012 1.073 1.111 1.269 1.326 1.409 1.483 1.558 1.589 1.655 1.721 1.819 1.877 1.919 1.969 2.022 2.073 2.124 2.167 2.22 2.282 2.344 2.397 2.427 2.451 2.479 2.493 2.493 2.501 2.495 2.474 2.439 2.391 2.318 2.189 2.008 1.747 1.355 0.841 0.11 -1.046 -2.97 -5.135 -6.85 -8.259 -9.41 -10.376 -11.211 -11.949 -12.58 -13.232 -13.762 -14.224 -14.651 -15.049 -15.422 -15.768 -16.126 -16.428 -16.684 -16.941 -17.199 -17.396 -17.612 -17.849 -18.024 -18.207 -18.408 -18.644 -18.903 -19.063 -19.214 -19.456 -19.625 -19.796 -19.88 -20.05 -20.242 -20.446 -20.548 -20.767 -20.855 -20.96 -21.072 -21.299 -21.426 -21.583 -21.723 -21.888 -22.115 -22.372 -23.095 -4 ,21738 ,KEBNE ,16657376,Tue Nov 23 03:43:27 CET,Tue Nov 23 05:05:09 CET,0.0 0.144 0.244 0.34 0.43 0.522 0.603 0.67 0.789 0.845 0.897 0.902 1.05 1.092 1.162 1.235 1.316 1.347 1.406 1.473 1.561 1.61 1.663 1.761 1.849 1.908 1.959 2.016 2.054 2.093 2.144 2.213 2.279 2.308 2.324 2.327 2.331 2.343 2.34 2.315 2.273 2.198 2.093 1.964 1.758 1.474 1.085 0.535 -0.277 -1.451 -3.382 -5.606 -7.388 -8.884 -10.104 -11.159 -12.022 -12.756 -13.387 -14.029 -14.608 -15.129 -15.62 -16.079 -16.489 -16.841 -17.2 -17.511 -17.807 -18.142 -18.454 -18.684 -18.929 -19.184 -19.373 -19.56 -19.776 -19.993 -20.211 -20.368 -20.515 -20.77 -20.962 -21.152 -21.248 -21.438 -21.635 -21.844 -21.951 -22.182 -22.281 -22.397 -22.528 -22.795 -22.928 -23.083 -23.27 -23.461 -23.672 -23.947 -24.525 -5 ,27289 ,KEBNE ,16657377,Tue Nov 23 03:44:33 CET,Tue Nov 23 05:04:36 CET,0.0 0.29 0.484 0.636 0.749 0.826 0.898 0.981 1.121 1.185 1.243 1.234 1.367 1.4 1.474 1.554 1.632 1.67 1.745 1.806 1.892 1.948 1.991 2.056 2.126 2.181 2.229 2.286 2.341 2.372 2.395 2.399 2.403 2.421 2.445 2.474 2.502 2.509 2.497 2.48 2.456 2.396 2.278 2.119 1.902 1.633 1.246 0.708 -0.064 -1.239 -3.194 -5.452 -7.146 -8.487 -9.653 -10.706 -11.614 -12.405 -13.037 -13.612 -14.176 -14.716 -15.158 -15.552 -15.917 -16.242 -16.574 -16.853 -17.094 -17.387 -17.721 -17.972 -18.203 -18.464 -18.673 -18.876 -19.073 -19.277 -19.495 -19.63 -19.777 -20.036 -20.212 -20.383 -20.466 -20.631 -20.804 -20.997 -21.098 -21.319 -21.405 -21.515 -21.641 -21.902 -22.053 -22.229 -22.424 -22.621 -22.819 -23.083 -23.71 -6 ,3928 ,KEBNE ,16657378,Tue Nov 23 03:45:32 CET,Tue Nov 23 05:08:32 CET,0.0 0.699 0.888 1.011 1.11 1.174 1.239 1.317 1.464 1.54 1.619 1.652 1.807 1.862 1.957 2.036 2.122 2.168 2.247 2.313 2.387 2.428 2.479 2.56 2.635 2.694 2.753 2.809 2.863 2.919 2.965 3.01 3.073 3.119 3.165 3.203 3.22 3.23 3.24 3.238 3.2 3.135 3.028 2.903 2.712 2.428 2.033 1.473 0.645 -0.541 -2.584 -4.921 -6.64 -8.041 -9.204 -10.226 -11.088 -11.81 -12.434 -13.07 -13.586 -14.027 -14.455 -14.869 -15.265 -15.616 -15.951 -16.241 -16.498 -16.782 -17.075 -17.317 -17.577 -17.832 -18.018 -18.215 -18.44 -18.666 -18.884 -19.038 -19.195 -19.428 -19.586 -19.755 -19.851 -20.067 -20.265 -20.44 -20.539 -20.761 -20.851 -20.965 -21.081 -21.334 -21.476 -21.646 -21.82 -21.983 -22.171 -22.402 -22.773 -7 ,28898 ,KEBNE ,16657379,Tue Nov 23 03:46:34 CET,Tue Nov 23 05:08:11 CET,0.0 0.19 0.333 0.447 0.536 0.613 0.697 0.768 0.884 0.949 1.009 1.027 1.17 1.203 1.29 1.371 1.428 1.463 1.53 1.576 1.654 1.702 1.731 1.788 1.862 1.935 1.993 2.032 2.08 2.125 2.157 2.183 2.23 2.288 2.321 2.342 2.355 2.355 2.367 2.363 2.317 2.247 2.141 2.004 1.802 1.516 1.109 0.564 -0.236 -1.462 -3.441 -5.684 -7.41 -8.822 -9.987 -10.972 -11.806 -12.555 -13.183 -13.802 -14.337 -14.816 -15.261 -15.656 -16.036 -16.408 -16.787 -17.113 -17.385 -17.65 -17.914 -18.123 -18.335 -18.557 -18.728 -18.904 -19.092 -19.287 -19.492 -19.638 -19.784 -19.999 -20.138 -20.283 -20.358 -20.539 -20.743 -20.939 -21.039 -21.271 -21.37 -21.493 -21.624 -21.895 -22.033 -22.154 -22.268 -22.404 -22.587 -22.848 -23.452 -8 ,7340 ,KEBNE ,16657380,Tue Nov 23 03:47:37 CET,Tue Nov 23 05:10:52 CET,0.0 0.339 0.471 0.618 0.747 0.862 0.949 1.015 1.167 1.234 1.291 1.296 1.444 1.489 1.563 1.639 1.726 1.761 1.824 1.913 2.03 2.07 2.113 2.199 2.28 2.349 2.399 2.432 2.464 2.509 2.556 2.586 2.609 2.639 2.679 2.711 2.73 2.766 2.793 2.797 2.782 2.728 2.604 2.449 2.246 1.98 1.6 1.043 0.219 -0.966 -2.892 -5.109 -6.831 -8.269 -9.465 -10.503 -11.413 -12.232 -12.893 -13.511 -14.039 -14.502 -14.96 -15.399 -15.793 -16.122 -16.454 -16.756 -17.013 -17.265 -17.509 -17.709 -17.912 -18.125 -18.312 -18.516 -18.728 -18.954 -19.159 -19.295 -19.451 -19.7 -19.867 -20.036 -20.128 -20.325 -20.519 -20.711 -20.806 -21.021 -21.111 -21.215 -21.318 -21.582 -21.737 -21.881 -22.03 -22.215 -22.455 -22.722 -23.031 -9 ,29118 ,KEBNE ,16657381,Tue Nov 23 03:48:44 CET,Tue Nov 23 05:08:56 CET,0.0 0.485 0.624 0.745 0.846 0.934 1.029 1.108 1.232 1.293 1.35 1.365 1.523 1.581 1.667 1.736 1.818 1.868 1.942 2.001 2.092 2.148 2.205 2.291 2.354 2.406 2.467 2.521 2.569 2.602 2.631 2.653 2.671 2.699 2.737 2.769 2.784 2.792 2.781 2.747 2.693 2.628 2.542 2.413 2.233 1.987 1.601 1.049 0.236 -0.985 -2.957 -5.263 -7.12 -8.643 -9.894 -10.989 -11.938 -12.754 -13.438 -14.105 -14.647 -15.122 -15.571 -16.006 -16.422 -16.783 -17.141 -17.46 -17.739 -18.035 -18.348 -18.618 -18.885 -19.149 -19.352 -19.575 -19.811 -20.039 -20.266 -20.419 -20.572 -20.801 -20.97 -21.152 -21.235 -21.42 -21.642 -21.852 -21.949 -22.176 -22.284 -22.413 -22.55 -22.814 -22.957 -23.099 -23.241 -23.399 -23.566 -23.794 -24.162 -10 ,22899 ,KEBNE ,16657382,Tue Nov 23 03:49:43 CET,Tue Nov 23 05:13:01 CET,0.0 0.462 0.62 0.746 0.842 0.903 0.962 1.024 1.168 1.243 1.305 1.305 1.451 1.499 1.575 1.658 1.73 1.762 1.845 1.91 1.981 2.025 2.068 2.128 2.198 2.26 2.304 2.354 2.406 2.441 2.479 2.526 2.562 2.602 2.639 2.651 2.662 2.685 2.707 2.702 2.677 2.641 2.551 2.398 2.159 1.862 1.489 0.96 0.203 -0.945 -3.003 -5.362 -7.274 -8.807 -10.004 -11.079 -12.022 -12.826 -13.488 -14.154 -14.718 -15.219 -15.687 -16.112 -16.515 -16.878 -17.242 -17.56 -17.839 -18.149 -18.465 -18.717 -18.968 -19.215 -19.406 -19.619 -19.839 -20.074 -20.317 -20.481 -20.647 -20.887 -21.045 -21.213 -21.307 -21.498 -21.697 -21.906 -22.009 -22.237 -22.335 -22.447 -22.555 -22.791 -22.938 -23.09 -23.22 -23.37 -23.571 -23.801 -24.199 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_15_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_15_25.txt deleted file mode 100644 index f8f105ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_15_25.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28828 ,KEBNE ,16657383,Tue Nov 23 03:49:43 CET,Tue Nov 23 05:11:34 CET,0.0 1.11 1.359 1.545 1.682 1.797 1.887 1.979 2.145 2.203 2.259 2.288 2.45 2.499 2.579 2.674 2.762 2.8 2.885 2.975 3.108 3.18 3.24 3.33 3.422 3.507 3.589 3.673 3.782 3.887 3.978 4.071 4.154 4.235 4.322 4.419 4.509 4.604 4.695 4.786 4.87 4.947 5.036 5.121 5.213 5.273 5.269 5.219 5.077 4.735 3.969 2.936 2.044 1.273 0.615 0.01 -0.57 -1.114 -1.583 -2.02 -2.381 -2.721 -3.05 -3.379 -3.668 -3.912 -4.182 -4.436 -4.657 -4.881 -5.113 -5.314 -5.524 -5.745 -5.909 -6.071 -6.238 -6.411 -6.611 -6.765 -6.905 -7.099 -7.251 -7.409 -7.487 -7.648 -7.807 -7.984 -8.085 -8.297 -8.418 -8.531 -8.649 -8.924 -9.066 -9.257 -9.465 -9.649 -9.93 -10.276 -11.532 -2 ,10741 ,KEBNE ,16657384,Tue Nov 23 03:49:43 CET,Tue Nov 23 05:11:01 CET,0.0 1.482 1.716 1.88 1.997 2.103 2.234 2.348 2.499 2.59 2.69 2.735 2.881 2.93 3.039 3.145 3.24 3.287 3.395 3.487 3.608 3.693 3.773 3.888 3.974 4.052 4.131 4.219 4.348 4.466 4.565 4.667 4.769 4.867 4.962 5.047 5.133 5.266 5.416 5.555 5.669 5.75 5.845 5.941 6.027 6.081 6.095 6.028 5.812 5.398 4.564 3.486 2.571 1.746 1.021 0.372 -0.195 -0.757 -1.26 -1.733 -2.134 -2.477 -2.788 -3.085 -3.35 -3.584 -3.835 -4.074 -4.287 -4.518 -4.756 -4.938 -5.137 -5.361 -5.538 -5.71 -5.892 -6.096 -6.306 -6.449 -6.58 -6.772 -6.917 -7.066 -7.141 -7.3 -7.469 -7.638 -7.738 -7.963 -8.092 -8.21 -8.326 -8.556 -8.683 -8.839 -9.012 -9.188 -9.43 -9.802 -10.993 -3 ,25158 ,KEBNE ,16657385,Tue Nov 23 03:49:43 CET,Tue Nov 23 05:12:03 CET,0.0 0.593 0.781 0.943 1.073 1.189 1.312 1.415 1.59 1.674 1.738 1.773 1.941 2.004 2.129 2.253 2.353 2.403 2.523 2.624 2.778 2.894 2.989 3.107 3.218 3.305 3.398 3.51 3.654 3.761 3.834 3.951 4.07 4.169 4.293 4.412 4.514 4.623 4.752 4.868 4.968 5.079 5.183 5.274 5.354 5.405 5.4 5.331 5.183 4.845 4.121 3.165 2.337 1.592 0.941 0.355 -0.155 -0.629 -1.032 -1.434 -1.788 -2.123 -2.461 -2.758 -3.015 -3.259 -3.557 -3.815 -4.011 -4.229 -4.462 -4.661 -4.883 -5.095 -5.248 -5.413 -5.577 -5.745 -5.921 -6.053 -6.192 -6.4 -6.54 -6.683 -6.765 -6.937 -7.103 -7.286 -7.378 -7.588 -7.722 -7.849 -7.976 -8.228 -8.367 -8.507 -8.669 -8.866 -9.13 -9.509 -11.02 -4 ,25789 ,KEBNE ,16657386,Tue Nov 23 03:49:43 CET,Tue Nov 23 05:12:15 CET,0.0 0.536 0.721 0.861 0.98 1.099 1.217 1.31 1.473 1.548 1.636 1.732 1.901 1.95 2.035 2.122 2.201 2.238 2.313 2.384 2.482 2.554 2.626 2.727 2.839 2.945 3.041 3.131 3.238 3.324 3.399 3.507 3.607 3.684 3.78 3.896 4.0 4.089 4.168 4.263 4.366 4.451 4.566 4.678 4.732 4.771 4.813 4.794 4.669 4.302 3.528 2.488 1.574 0.793 0.135 -0.464 -1.013 -1.507 -1.912 -2.307 -2.646 -2.943 -3.239 -3.534 -3.807 -4.048 -4.283 -4.488 -4.675 -4.877 -5.081 -5.255 -5.453 -5.658 -5.819 -5.982 -6.149 -6.315 -6.486 -6.599 -6.715 -6.922 -7.066 -7.227 -7.314 -7.49 -7.688 -7.888 -7.988 -8.2 -8.317 -8.435 -8.547 -8.767 -8.878 -9.011 -9.152 -9.31 -9.493 -9.749 -11.02 -5 ,4129 ,KEBNE ,16657387,Tue Nov 23 03:49:43 CET,Tue Nov 23 05:12:12 CET,0.0 0.562 0.76 0.925 1.048 1.162 1.281 1.379 1.554 1.63 1.691 1.705 1.871 1.947 2.075 2.201 2.322 2.372 2.456 2.524 2.617 2.687 2.761 2.862 2.947 3.043 3.148 3.236 3.327 3.415 3.488 3.562 3.648 3.745 3.855 3.97 4.077 4.172 4.278 4.392 4.48 4.574 4.682 4.767 4.845 4.897 4.893 4.813 4.631 4.272 3.603 2.687 1.876 1.087 0.363 -0.265 -0.818 -1.328 -1.753 -2.158 -2.512 -2.843 -3.175 -3.492 -3.791 -4.067 -4.336 -4.556 -4.756 -4.965 -5.183 -5.368 -5.571 -5.78 -5.932 -6.1 -6.274 -6.439 -6.595 -6.706 -6.844 -7.055 -7.192 -7.345 -7.423 -7.593 -7.774 -7.945 -8.041 -8.245 -8.332 -8.446 -8.563 -8.785 -8.912 -9.063 -9.202 -9.387 -9.645 -10.057 -11.871 -6 ,19374 ,KEBNE ,16657388,Tue Nov 23 03:49:47 CET,Tue Nov 23 05:09:24 CET,0.0 1.031 1.234 1.368 1.488 1.597 1.688 1.765 1.901 1.976 2.056 2.106 2.266 2.328 2.443 2.534 2.617 2.664 2.76 2.843 2.958 3.042 3.121 3.213 3.306 3.405 3.504 3.587 3.698 3.813 3.908 4.015 4.108 4.18 4.266 4.375 4.473 4.575 4.69 4.795 4.889 5.002 5.098 5.161 5.251 5.328 5.333 5.251 5.063 4.693 4.008 3.054 2.155 1.375 0.711 0.13 -0.373 -0.829 -1.216 -1.609 -1.949 -2.265 -2.584 -2.896 -3.173 -3.413 -3.693 -3.945 -4.153 -4.375 -4.583 -4.743 -4.923 -5.123 -5.282 -5.449 -5.609 -5.77 -5.954 -6.079 -6.207 -6.423 -6.586 -6.747 -6.821 -6.979 -7.156 -7.346 -7.441 -7.659 -7.815 -7.948 -8.089 -8.35 -8.499 -8.683 -8.857 -9.031 -9.262 -9.548 -11.108 -7 ,16318 ,KEBNE ,16657389,Tue Nov 23 03:49:43 CET,Tue Nov 23 05:12:08 CET,0.0 0.876 1.168 1.315 1.432 1.541 1.623 1.706 1.885 1.96 2.024 2.08 2.252 2.316 2.435 2.534 2.625 2.675 2.784 2.889 3.025 3.109 3.185 3.312 3.443 3.56 3.657 3.739 3.859 3.971 4.079 4.209 4.299 4.37 4.458 4.557 4.648 4.767 4.906 5.002 5.075 5.194 5.32 5.39 5.453 5.488 5.474 5.408 5.216 4.822 4.18 3.277 2.39 1.548 0.813 0.161 -0.424 -0.938 -1.378 -1.841 -2.244 -2.572 -2.893 -3.199 -3.483 -3.75 -4.011 -4.241 -4.452 -4.686 -4.934 -5.135 -5.315 -5.486 -5.648 -5.827 -6.008 -6.191 -6.362 -6.482 -6.626 -6.861 -7.032 -7.224 -7.325 -7.513 -7.705 -7.93 -8.044 -8.249 -8.335 -8.436 -8.554 -8.813 -8.938 -9.069 -9.229 -9.422 -9.634 -9.92 -11.072 -8 ,32204 ,KEBNE ,16657390,Tue Nov 23 03:49:43 CET,Tue Nov 23 05:11:25 CET,0.0 0.683 0.913 1.098 1.252 1.378 1.473 1.564 1.718 1.781 1.849 1.883 2.041 2.109 2.236 2.347 2.46 2.519 2.628 2.718 2.848 2.936 3.012 3.102 3.191 3.287 3.375 3.463 3.593 3.699 3.786 3.889 3.983 4.083 4.182 4.286 4.403 4.523 4.636 4.745 4.835 4.93 5.027 5.085 5.14 5.177 5.162 5.078 4.923 4.597 3.814 2.696 1.778 1.041 0.358 -0.307 -0.9 -1.47 -1.949 -2.41 -2.802 -3.145 -3.484 -3.785 -4.059 -4.328 -4.598 -4.847 -5.066 -5.29 -5.521 -5.706 -5.889 -6.104 -6.285 -6.461 -6.637 -6.811 -6.992 -7.115 -7.241 -7.441 -7.586 -7.742 -7.819 -7.956 -8.104 -8.285 -8.387 -8.61 -8.78 -8.91 -9.02 -9.232 -9.364 -9.506 -9.644 -9.812 -10.015 -10.426 -11.925 -10 ,3722 ,KEBNE ,16657392,Tue Nov 23 03:50:45 CET,Tue Nov 23 05:12:06 CET,0.0 0.601 0.771 0.928 1.062 1.167 1.268 1.367 1.526 1.597 1.663 1.68 1.828 1.888 2.015 2.137 2.243 2.291 2.37 2.445 2.558 2.626 2.7 2.807 2.907 2.99 3.068 3.154 3.242 3.316 3.409 3.516 3.598 3.691 3.791 3.872 3.959 4.061 4.158 4.267 4.37 4.45 4.507 4.55 4.6 4.634 4.65 4.579 4.361 3.952 3.158 2.15 1.31 0.52 -0.194 -0.793 -1.31 -1.798 -2.243 -2.703 -3.1 -3.458 -3.789 -4.086 -4.387 -4.677 -4.962 -5.203 -5.423 -5.652 -5.909 -6.154 -6.382 -6.581 -6.733 -6.881 -7.044 -7.224 -7.399 -7.527 -7.664 -7.865 -8.024 -8.204 -8.291 -8.475 -8.648 -8.828 -8.921 -9.123 -9.253 -9.378 -9.504 -9.761 -9.879 -10.004 -10.158 -10.323 -10.543 -10.87 -11.953 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_15_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_15_252.txt deleted file mode 100644 index 3a3b2b2a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_15_252.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3764 ,KEBNE ,16657393,Tue Nov 23 03:50:46 CET,Tue Nov 23 05:12:25 CET,0.0 0.329 0.486 0.614 0.725 0.818 0.907 0.982 1.119 1.18 1.241 1.254 1.39 1.436 1.527 1.594 1.658 1.683 1.736 1.793 1.841 1.867 1.893 1.94 1.984 2.013 2.042 2.056 2.075 2.09 2.08 2.065 2.058 2.056 2.062 2.044 2.014 1.985 1.937 1.844 1.724 1.565 1.313 1.024 0.648 0.131 -0.557 -1.411 -2.615 -4.384 -7.124 -10.125 -12.407 -14.277 -15.83 -17.157 -18.243 -19.215 -20.08 -20.924 -21.619 -22.244 -22.842 -23.388 -23.872 -24.305 -24.765 -25.188 -25.539 -25.871 -26.226 -26.528 -26.841 -27.177 -27.427 -27.668 -27.939 -28.227 -28.512 -28.707 -28.905 -29.233 -29.468 -29.704 -29.818 -30.038 -30.264 -30.512 -30.637 -30.892 -31.032 -31.181 -31.341 -31.698 -31.894 -32.084 -32.291 -32.513 -32.767 -33.134 -34.239 -2 ,1590 ,KEBNE ,16657394,Tue Nov 23 03:50:50 CET,Tue Nov 23 05:11:26 CET,0.0 0.331 0.501 0.596 0.698 0.786 0.847 0.917 1.046 1.096 1.154 1.174 1.318 1.367 1.449 1.509 1.571 1.603 1.645 1.669 1.708 1.747 1.808 1.873 1.891 1.9 1.907 1.918 1.93 1.94 1.974 2.025 2.044 2.05 2.029 1.988 1.954 1.889 1.795 1.684 1.554 1.386 1.155 0.887 0.514 0.007 -0.675 -1.583 -2.857 -4.679 -7.556 -10.769 -13.303 -15.261 -16.831 -18.268 -19.428 -20.42 -21.28 -22.129 -22.86 -23.507 -24.12 -24.698 -25.232 -25.725 -26.213 -26.613 -26.977 -27.36 -27.743 -28.046 -28.335 -28.618 -28.854 -29.12 -29.385 -29.658 -29.941 -30.13 -30.321 -30.602 -30.787 -30.984 -31.095 -31.35 -31.637 -31.928 -32.066 -32.339 -32.515 -32.673 -32.834 -33.174 -33.361 -33.561 -33.796 -34.047 -34.3 -34.669 -35.641 -3 ,31838 ,KEBNE ,16657395,Tue Nov 23 03:52:52 CET,Tue Nov 23 05:15:15 CET,0.0 0.468 0.61 0.681 0.75 0.836 0.919 0.979 1.072 1.102 1.137 1.108 1.239 1.27 1.34 1.401 1.443 1.464 1.501 1.524 1.56 1.582 1.596 1.629 1.663 1.688 1.719 1.739 1.756 1.762 1.76 1.75 1.743 1.743 1.712 1.669 1.645 1.597 1.488 1.355 1.205 0.991 0.723 0.435 0.069 -0.386 -1.037 -1.985 -3.353 -5.284 -8.248 -11.607 -14.295 -16.463 -18.221 -19.721 -20.987 -22.066 -22.974 -23.868 -24.611 -25.255 -25.893 -26.519 -27.07 -27.554 -28.043 -28.468 -28.83 -29.212 -29.635 -29.99 -30.34 -30.688 -30.972 -31.273 -31.565 -31.864 -32.19 -32.41 -32.615 -32.932 -33.169 -33.415 -33.541 -33.796 -34.041 -34.326 -34.476 -34.763 -34.96 -35.127 -35.306 -35.682 -35.887 -36.131 -36.384 -36.658 -36.951 -37.341 -38.284 -5 ,29343 ,KEBNE ,16657397,Tue Nov 23 03:52:51 CET,Tue Nov 23 05:15:19 CET,0.0 0.164 0.295 0.4 0.49 0.554 0.633 0.716 0.831 0.876 0.913 0.889 1.018 1.062 1.154 1.23 1.293 1.316 1.354 1.38 1.439 1.486 1.525 1.549 1.56 1.588 1.621 1.643 1.672 1.704 1.728 1.74 1.737 1.738 1.736 1.707 1.648 1.583 1.515 1.426 1.301 1.122 0.898 0.634 0.265 -0.212 -0.86 -1.733 -2.981 -4.725 -7.395 -10.42 -12.749 -14.658 -16.214 -17.507 -18.614 -19.644 -20.533 -21.381 -22.061 -22.648 -23.222 -23.77 -24.279 -24.727 -25.19 -25.598 -25.94 -26.282 -26.657 -26.973 -27.284 -27.597 -27.846 -28.095 -28.337 -28.606 -28.897 -29.098 -29.306 -29.639 -29.876 -30.116 -30.234 -30.475 -30.745 -31.022 -31.167 -31.448 -31.631 -31.782 -31.932 -32.268 -32.449 -32.659 -32.875 -33.088 -33.337 -33.697 -34.79 -6 ,30287 ,KEBNE ,16657398,Tue Nov 23 03:52:51 CET,Tue Nov 23 05:14:05 CET,0.0 0.259 0.377 0.482 0.577 0.677 0.781 0.859 0.949 0.988 1.036 1.024 1.151 1.182 1.259 1.331 1.392 1.424 1.481 1.543 1.618 1.644 1.674 1.729 1.755 1.767 1.786 1.797 1.832 1.863 1.879 1.901 1.916 1.912 1.907 1.883 1.828 1.757 1.658 1.557 1.425 1.222 0.964 0.664 0.274 -0.19 -0.842 -1.713 -2.92 -4.657 -7.506 -10.758 -13.203 -15.212 -16.943 -18.478 -19.766 -20.883 -21.81 -22.682 -23.42 -24.076 -24.667 -25.214 -25.721 -26.173 -26.645 -27.062 -27.41 -27.789 -28.222 -28.561 -28.881 -29.207 -29.467 -29.744 -30.02 -30.298 -30.579 -30.762 -30.946 -31.26 -31.49 -31.699 -31.798 -32.008 -32.237 -32.494 -32.628 -32.889 -33.007 -33.138 -33.283 -33.597 -33.771 -33.965 -34.167 -34.396 -34.692 -35.066 -35.975 -7 ,10423 ,KEBNE ,16657399,Tue Nov 23 03:52:51 CET,Tue Nov 23 05:15:25 CET,0.0 0.301 0.448 0.588 0.713 0.811 0.892 0.955 1.05 1.101 1.147 1.143 1.294 1.335 1.407 1.489 1.559 1.59 1.649 1.694 1.735 1.764 1.802 1.843 1.869 1.903 1.944 1.967 1.988 1.994 1.997 2.005 1.991 1.973 1.977 1.966 1.911 1.85 1.761 1.645 1.516 1.33 1.086 0.809 0.422 -0.089 -0.74 -1.596 -2.836 -4.627 -7.485 -10.725 -13.168 -15.124 -16.733 -18.107 -19.261 -20.265 -21.151 -22.067 -22.838 -23.507 -24.145 -24.745 -25.29 -25.766 -26.243 -26.675 -27.047 -27.431 -27.827 -28.138 -28.47 -28.822 -29.107 -29.405 -29.7 -29.994 -30.295 -30.507 -30.719 -31.037 -31.248 -31.463 -31.579 -31.831 -32.089 -32.366 -32.516 -32.795 -32.967 -33.128 -33.298 -33.659 -33.855 -34.061 -34.292 -34.561 -34.87 -35.246 -35.974 -8 ,18477 ,KEBNE ,16657400,Tue Nov 23 03:52:52 CET,Tue Nov 23 05:15:39 CET,0.0 0.222 0.341 0.452 0.547 0.623 0.708 0.792 0.931 0.99 1.046 1.052 1.183 1.214 1.288 1.358 1.41 1.439 1.482 1.511 1.578 1.612 1.629 1.673 1.72 1.747 1.762 1.767 1.771 1.761 1.76 1.755 1.733 1.711 1.672 1.605 1.532 1.451 1.36 1.254 1.141 0.98 0.746 0.476 0.08 -0.407 -1.036 -1.877 -3.054 -4.809 -7.556 -10.592 -12.931 -14.847 -16.386 -17.675 -18.765 -19.72 -20.534 -21.322 -21.996 -22.592 -23.172 -23.713 -24.179 -24.624 -25.093 -25.514 -25.886 -26.256 -26.63 -26.944 -27.279 -27.614 -27.859 -28.112 -28.394 -28.685 -28.974 -29.183 -29.401 -29.742 -29.965 -30.175 -30.282 -30.499 -30.735 -30.992 -31.11 -31.354 -31.474 -31.609 -31.756 -32.084 -32.273 -32.484 -32.702 -32.913 -33.154 -33.486 -34.449 -9 ,26463 ,KEBNE ,16657401,Tue Nov 23 03:52:52 CET,Tue Nov 23 05:15:20 CET,0.0 0.277 0.486 0.6 0.689 0.762 0.839 0.915 1.034 1.086 1.139 1.143 1.286 1.337 1.431 1.503 1.553 1.575 1.634 1.699 1.77 1.811 1.855 1.904 1.927 1.948 1.969 1.981 1.983 1.998 2.031 2.054 2.068 2.096 2.101 2.07 2.017 1.923 1.812 1.686 1.53 1.336 1.093 0.807 0.453 0.023 -0.563 -1.37 -2.508 -4.175 -6.916 -10.096 -12.572 -14.548 -16.191 -17.646 -18.927 -20.018 -20.897 -21.769 -22.537 -23.223 -23.846 -24.43 -24.971 -25.43 -25.888 -26.306 -26.678 -27.059 -27.443 -27.766 -28.096 -28.438 -28.71 -28.989 -29.274 -29.56 -29.849 -30.039 -30.237 -30.554 -30.773 -31.01 -31.129 -31.382 -31.656 -31.93 -32.057 -32.31 -32.464 -32.62 -32.778 -33.11 -33.272 -33.442 -33.655 -33.917 -34.191 -34.505 -35.21 -10 ,23355 ,KEBNE ,16657402,Tue Nov 23 03:52:52 CET,Tue Nov 23 05:14:56 CET,0.0 0.249 0.452 0.633 0.772 0.882 0.966 1.045 1.149 1.192 1.248 1.249 1.392 1.424 1.465 1.513 1.565 1.594 1.647 1.697 1.749 1.781 1.836 1.912 1.943 1.972 2.004 2.032 2.057 2.053 2.057 2.057 2.053 2.049 2.029 1.989 1.92 1.854 1.787 1.708 1.616 1.439 1.196 0.933 0.6 0.164 -0.489 -1.382 -2.663 -4.601 -7.653 -10.916 -13.412 -15.448 -17.174 -18.653 -19.871 -20.944 -21.866 -22.826 -23.643 -24.327 -24.963 -25.545 -26.081 -26.581 -27.104 -27.548 -27.913 -28.286 -28.673 -28.994 -29.328 -29.676 -29.949 -30.236 -30.514 -30.804 -31.122 -31.327 -31.528 -31.871 -32.128 -32.383 -32.507 -32.75 -33.012 -33.272 -33.401 -33.689 -33.9 -34.053 -34.205 -34.551 -34.751 -34.961 -35.179 -35.404 -35.665 -36.035 -36.833 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_164.txt deleted file mode 100644 index de2f35b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21265 ,KEBNE ,16657403,Tue Nov 23 03:52:51 CET,Tue Nov 23 05:14:38 CET,0.0 0.3 0.502 0.669 0.806 0.95 1.084 1.21 1.442 1.557 1.668 1.729 1.946 2.036 2.197 2.34 2.491 2.565 2.704 2.839 3.029 3.153 3.271 3.439 3.606 3.773 3.929 4.073 4.27 4.466 4.648 4.876 5.097 5.307 5.548 5.821 6.082 6.349 6.647 6.983 7.317 7.657 8.038 8.438 8.871 9.337 9.912 10.484 11.146 11.975 12.881 13.442 13.507 13.375 13.2 12.96 12.717 12.499 12.315 12.123 11.903 11.684 11.509 11.34 11.159 10.998 10.833 10.693 10.576 10.455 10.315 10.19 10.055 9.909 9.793 9.676 9.565 9.44 9.318 9.242 9.151 9.004 8.908 8.8 8.74 8.624 8.488 8.327 8.246 8.061 8.008 7.912 7.812 7.617 7.512 7.396 7.277 7.139 6.953 6.717 6.215 -2 ,2480 ,KEBNE ,16657404,Tue Nov 23 03:52:55 CET,Tue Nov 23 05:14:04 CET,0.0 0.53 0.755 0.937 1.114 1.263 1.402 1.528 1.76 1.865 1.965 2.074 2.293 2.384 2.557 2.726 2.89 2.965 3.109 3.252 3.454 3.583 3.711 3.902 4.087 4.267 4.44 4.608 4.834 5.049 5.242 5.485 5.723 5.949 6.212 6.508 6.778 7.043 7.325 7.61 7.898 8.243 8.664 9.095 9.655 10.368 11.169 11.956 12.815 13.839 14.932 15.499 15.521 15.336 15.115 14.848 14.598 14.341 14.096 13.864 13.673 13.516 13.346 13.155 12.98 12.814 12.603 12.434 12.314 12.182 12.047 11.934 11.806 11.668 11.55 11.421 11.304 11.195 11.076 10.993 10.9 10.761 10.662 10.548 10.493 10.383 10.268 10.135 10.064 9.871 9.838 9.749 9.65 9.44 9.323 9.211 9.074 8.911 8.725 8.491 7.861 -3 ,1165 ,KEBNE ,16657405,Tue Nov 23 03:54:56 CET,Tue Nov 23 05:16:22 CET,0.0 0.507 0.784 0.975 1.126 1.289 1.451 1.58 1.816 1.934 2.04 2.109 2.32 2.406 2.599 2.797 2.956 3.031 3.186 3.328 3.533 3.677 3.819 4.012 4.189 4.364 4.536 4.699 4.902 5.104 5.305 5.53 5.745 5.969 6.237 6.543 6.823 7.111 7.431 7.774 8.14 8.527 8.963 9.43 9.948 10.507 11.098 11.673 12.262 12.871 13.562 13.845 13.801 13.685 13.514 13.281 13.01 12.752 12.549 12.331 12.131 11.94 11.738 11.555 11.393 11.25 11.079 10.923 10.806 10.665 10.503 10.375 10.228 10.06 9.94 9.825 9.703 9.568 9.424 9.331 9.235 9.088 8.995 8.882 8.818 8.698 8.564 8.41 8.335 8.149 8.129 8.051 7.955 7.737 7.629 7.518 7.408 7.289 7.127 6.914 6.543 -4 ,29594 ,KEBNE ,16657406,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:46 CET,0.0 0.641 0.935 1.117 1.262 1.42 1.576 1.7 1.905 1.994 2.101 2.206 2.417 2.51 2.688 2.866 3.034 3.112 3.267 3.402 3.59 3.713 3.83 4.0 4.173 4.336 4.486 4.644 4.847 5.037 5.229 5.467 5.687 5.892 6.136 6.42 6.707 7.031 7.368 7.719 8.105 8.551 9.006 9.426 9.936 10.447 10.977 11.541 12.08 12.705 13.45 13.772 13.781 13.69 13.543 13.335 13.103 12.862 12.653 12.464 12.274 12.089 11.917 11.729 11.556 11.423 11.259 11.071 10.923 10.793 10.64 10.505 10.375 10.246 10.139 10.015 9.884 9.74 9.581 9.476 9.377 9.22 9.105 8.977 8.914 8.794 8.651 8.504 8.429 8.238 8.189 8.098 7.991 7.779 7.672 7.548 7.408 7.26 7.105 6.913 6.343 -5 ,30662 ,KEBNE ,16657407,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:08 CET,0.0 0.516 0.804 1.013 1.181 1.312 1.433 1.549 1.76 1.869 1.975 2.053 2.265 2.355 2.515 2.657 2.803 2.872 2.993 3.111 3.274 3.376 3.484 3.635 3.774 3.911 4.049 4.196 4.389 4.559 4.723 4.93 5.135 5.321 5.521 5.743 5.958 6.204 6.484 6.785 7.096 7.431 7.814 8.193 8.609 9.096 9.683 10.295 10.961 11.695 12.528 13.099 13.272 13.267 13.135 12.912 12.668 12.418 12.177 11.971 11.778 11.555 11.353 11.159 10.968 10.778 10.571 10.421 10.29 10.149 10.013 9.894 9.761 9.628 9.528 9.415 9.286 9.155 9.024 8.927 8.823 8.662 8.535 8.405 8.347 8.212 8.071 7.944 7.874 7.694 7.649 7.555 7.453 7.229 7.116 7.005 6.879 6.721 6.53 6.294 5.887 -6 ,18717 ,KEBNE ,16657408,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:18:13 CET,0.0 0.53 0.759 0.94 1.103 1.265 1.415 1.541 1.751 1.849 1.959 2.047 2.254 2.339 2.499 2.66 2.821 2.899 3.053 3.194 3.398 3.525 3.64 3.81 3.973 4.132 4.286 4.443 4.651 4.852 5.055 5.293 5.499 5.69 5.928 6.221 6.509 6.841 7.209 7.587 7.977 8.409 8.935 9.497 10.119 10.744 11.477 12.294 13.105 13.887 14.558 14.765 14.718 14.576 14.396 14.2 13.978 13.707 13.473 13.277 13.11 12.936 12.713 12.484 12.29 12.123 11.928 11.743 11.595 11.44 11.273 11.133 10.994 10.857 10.742 10.617 10.505 10.39 10.268 10.181 10.088 9.934 9.827 9.727 9.675 9.551 9.405 9.265 9.197 9.007 8.96 8.876 8.786 8.605 8.505 8.391 8.264 8.109 7.935 7.739 7.219 -7 ,19006 ,KEBNE ,16657409,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:11 CET,0.0 0.397 0.602 0.753 0.896 1.038 1.186 1.325 1.574 1.685 1.779 1.837 2.052 2.145 2.309 2.455 2.592 2.664 2.806 2.943 3.151 3.292 3.43 3.623 3.81 3.988 4.155 4.315 4.525 4.729 4.924 5.146 5.344 5.531 5.755 6.019 6.283 6.585 6.91 7.241 7.548 7.903 8.332 8.753 9.247 9.781 10.405 11.11 11.891 12.738 13.603 14.117 14.242 14.146 14.004 13.845 13.649 13.416 13.199 12.948 12.709 12.519 12.33 12.145 11.962 11.786 11.612 11.438 11.284 11.135 10.98 10.849 10.691 10.521 10.389 10.257 10.132 9.998 9.847 9.746 9.647 9.493 9.389 9.274 9.216 9.086 8.936 8.774 8.685 8.48 8.438 8.359 8.276 8.057 7.927 7.802 7.678 7.539 7.387 7.159 6.685 -8 ,10814 ,KEBNE ,16657410,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:18:02 CET,0.0 0.255 0.444 0.616 0.755 0.905 1.031 1.144 1.367 1.477 1.582 1.656 1.864 1.962 2.152 2.308 2.464 2.543 2.694 2.837 3.049 3.185 3.31 3.485 3.653 3.825 3.99 4.15 4.368 4.569 4.76 4.991 5.199 5.404 5.656 5.942 6.201 6.475 6.766 7.081 7.429 7.819 8.246 8.649 9.107 9.637 10.215 10.8 11.473 12.207 12.925 13.272 13.298 13.189 13.015 12.8 12.59 12.393 12.226 12.038 11.839 11.652 11.475 11.282 11.091 10.923 10.725 10.544 10.412 10.274 10.116 9.979 9.839 9.696 9.577 9.456 9.329 9.188 9.049 8.956 8.864 8.706 8.59 8.473 8.417 8.31 8.184 8.037 7.954 7.756 7.707 7.618 7.528 7.344 7.242 7.129 7.013 6.871 6.675 6.45 5.895 -9 ,27106 ,KEBNE ,16657411,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:31 CET,0.0 0.396 0.594 0.739 0.876 1.002 1.123 1.229 1.421 1.522 1.613 1.655 1.869 1.961 2.13 2.294 2.453 2.53 2.676 2.809 3.003 3.124 3.242 3.413 3.573 3.743 3.909 4.068 4.281 4.476 4.658 4.885 5.108 5.32 5.559 5.826 6.077 6.363 6.687 7.032 7.381 7.753 8.185 8.606 9.115 9.67 10.278 10.927 11.636 12.424 13.198 13.537 13.507 13.36 13.2 12.989 12.754 12.528 12.327 12.111 11.928 11.747 11.546 11.358 11.177 11.019 10.871 10.724 10.585 10.433 10.276 10.146 10.008 9.869 9.763 9.646 9.526 9.406 9.285 9.199 9.099 8.929 8.817 8.7 8.636 8.502 8.377 8.251 8.183 8.003 7.95 7.858 7.772 7.597 7.489 7.359 7.226 7.086 6.929 6.737 6.247 -10 ,20939 ,KEBNE ,16657412,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:18:30 CET,0.0 0.385 0.567 0.716 0.876 1.029 1.161 1.275 1.5 1.614 1.715 1.771 1.985 2.083 2.276 2.438 2.586 2.661 2.799 2.924 3.116 3.245 3.369 3.552 3.734 3.913 4.083 4.253 4.464 4.66 4.85 5.067 5.291 5.506 5.742 6.021 6.288 6.571 6.872 7.191 7.53 7.912 8.343 8.759 9.25 9.807 10.386 10.934 11.618 12.409 13.103 13.399 13.429 13.347 13.156 12.9 12.647 12.404 12.182 11.951 11.725 11.513 11.334 11.156 10.981 10.826 10.666 10.52 10.383 10.241 10.085 9.948 9.812 9.658 9.534 9.406 9.247 9.086 8.935 8.833 8.718 8.537 8.424 8.312 8.247 8.107 7.975 7.854 7.793 7.606 7.582 7.509 7.424 7.231 7.135 7.025 6.904 6.776 6.626 6.449 6.1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_165.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_165.txt deleted file mode 100644 index 70e380e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_165.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24225 ,KEBNE ,16657413,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:51 CET,0.0 0.315 0.505 0.643 0.775 0.902 1.004 1.108 1.311 1.391 1.461 1.474 1.679 1.749 1.885 2.015 2.137 2.194 2.311 2.437 2.632 2.76 2.871 3.012 3.138 3.267 3.399 3.519 3.681 3.843 3.981 4.146 4.311 4.47 4.659 4.861 5.045 5.262 5.498 5.737 6.007 6.305 6.637 6.962 7.317 7.707 8.136 8.576 9.009 9.391 9.671 9.707 9.574 9.35 9.115 8.884 8.637 8.39 8.175 7.967 7.771 7.586 7.425 7.256 7.088 6.931 6.748 6.572 6.431 6.298 6.163 6.051 5.925 5.792 5.679 5.552 5.408 5.258 5.115 5.018 4.92 4.782 4.686 4.588 4.541 4.43 4.316 4.168 4.086 3.896 3.874 3.781 3.685 3.498 3.403 3.302 3.176 3.03 2.848 2.602 2.083 -2 ,20421 ,KEBNE ,16657414,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:47 CET,0.0 0.752 0.956 1.147 1.299 1.401 1.502 1.598 1.758 1.843 1.924 1.966 2.159 2.217 2.343 2.472 2.594 2.654 2.769 2.876 3.021 3.126 3.231 3.383 3.524 3.644 3.76 3.883 4.035 4.175 4.307 4.465 4.631 4.794 4.971 5.154 5.334 5.538 5.746 5.955 6.177 6.411 6.693 6.998 7.335 7.705 8.09 8.487 8.937 9.397 9.788 9.893 9.774 9.581 9.38 9.127 8.893 8.692 8.502 8.283 8.079 7.908 7.734 7.561 7.387 7.232 7.074 6.914 6.788 6.66 6.526 6.418 6.307 6.196 6.107 6.006 5.899 5.774 5.639 5.554 5.472 5.357 5.267 5.157 5.096 4.974 4.862 4.743 4.675 4.474 4.423 4.355 4.279 4.102 3.998 3.885 3.753 3.632 3.535 3.404 3.104 -3 ,29048 ,KEBNE ,16657415,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:38 CET,0.0 0.701 0.905 1.073 1.22 1.33 1.443 1.548 1.737 1.832 1.913 1.944 2.141 2.218 2.352 2.471 2.584 2.637 2.746 2.858 3.008 3.096 3.19 3.334 3.475 3.611 3.744 3.867 4.032 4.19 4.32 4.48 4.634 4.786 4.972 5.172 5.376 5.615 5.846 6.068 6.289 6.547 6.863 7.171 7.517 7.899 8.319 8.741 9.186 9.611 9.95 10.038 9.913 9.707 9.514 9.316 9.126 8.924 8.715 8.481 8.275 8.1 7.927 7.766 7.591 7.419 7.25 7.098 6.97 6.83 6.671 6.535 6.402 6.261 6.151 6.049 5.939 5.815 5.684 5.598 5.515 5.363 5.245 5.134 5.075 4.949 4.825 4.69 4.622 4.432 4.397 4.319 4.235 4.062 3.964 3.864 3.761 3.653 3.542 3.381 3.178 -4 ,11912 ,KEBNE ,16657416,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:18:55 CET,0.0 0.29 0.492 0.631 0.752 0.855 0.958 1.058 1.236 1.315 1.39 1.41 1.605 1.676 1.824 1.983 2.125 2.186 2.3 2.409 2.57 2.68 2.798 2.954 3.086 3.228 3.369 3.499 3.663 3.81 3.946 4.106 4.261 4.411 4.584 4.771 4.946 5.136 5.376 5.629 5.868 6.142 6.434 6.73 7.061 7.426 7.834 8.248 8.718 9.192 9.6 9.697 9.569 9.379 9.139 8.879 8.638 8.399 8.187 7.957 7.745 7.558 7.358 7.17 7.007 6.85 6.685 6.542 6.417 6.273 6.115 5.996 5.87 5.72 5.592 5.467 5.358 5.242 5.116 5.035 4.94 4.771 4.663 4.563 4.512 4.392 4.259 4.129 4.068 3.89 3.865 3.783 3.695 3.501 3.38 3.26 3.134 2.983 2.797 2.596 1.975 -5 ,18684 ,KEBNE ,16657417,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:31 CET,0.0 0.254 0.409 0.562 0.693 0.819 0.927 1.024 1.187 1.278 1.365 1.38 1.561 1.623 1.744 1.871 2.007 2.069 2.185 2.307 2.479 2.58 2.678 2.812 2.933 3.052 3.171 3.285 3.452 3.623 3.777 3.943 4.101 4.253 4.439 4.642 4.812 5.008 5.226 5.454 5.71 5.999 6.331 6.66 7.015 7.386 7.779 8.17 8.604 9.031 9.358 9.455 9.364 9.192 8.979 8.71 8.465 8.216 7.985 7.759 7.547 7.358 7.172 7.0 6.823 6.646 6.476 6.333 6.216 6.073 5.914 5.807 5.682 5.532 5.424 5.314 5.202 5.082 4.954 4.867 4.767 4.605 4.499 4.39 4.334 4.227 4.11 3.968 3.897 3.706 3.667 3.577 3.482 3.309 3.229 3.153 3.062 2.945 2.816 2.674 2.281 -6 ,27709 ,KEBNE ,16657418,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:18:02 CET,0.0 0.483 0.67 0.821 0.964 1.091 1.211 1.326 1.524 1.613 1.685 1.692 1.877 1.944 2.084 2.212 2.314 2.368 2.483 2.59 2.75 2.854 2.95 3.08 3.213 3.342 3.456 3.571 3.731 3.884 4.025 4.191 4.351 4.504 4.684 4.879 5.065 5.255 5.456 5.682 5.915 6.176 6.479 6.753 7.056 7.397 7.785 8.194 8.608 9.041 9.406 9.461 9.273 8.977 8.671 8.407 8.172 7.95 7.77 7.571 7.371 7.185 6.988 6.809 6.634 6.445 6.247 6.076 5.948 5.811 5.636 5.489 5.351 5.212 5.101 4.986 4.86 4.723 4.577 4.477 4.381 4.235 4.13 4.019 3.968 3.869 3.761 3.635 3.565 3.374 3.348 3.267 3.173 2.988 2.909 2.815 2.705 2.583 2.415 2.219 1.824 -7 ,15555 ,KEBNE ,16657419,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:38 CET,0.0 0.405 0.598 0.722 0.847 0.993 1.112 1.217 1.425 1.512 1.585 1.603 1.797 1.867 2.017 2.146 2.267 2.329 2.45 2.56 2.707 2.811 2.91 3.044 3.174 3.303 3.426 3.538 3.694 3.845 3.983 4.147 4.298 4.455 4.651 4.85 5.025 5.23 5.457 5.691 5.95 6.242 6.56 6.868 7.186 7.529 7.97 8.461 8.9 9.283 9.613 9.633 9.47 9.222 8.961 8.706 8.451 8.212 7.993 7.737 7.524 7.351 7.166 6.974 6.797 6.634 6.46 6.295 6.145 5.996 5.844 5.717 5.594 5.47 5.371 5.259 5.129 4.996 4.867 4.772 4.672 4.521 4.412 4.301 4.246 4.14 4.031 3.912 3.849 3.667 3.671 3.596 3.505 3.314 3.217 3.125 3.037 2.936 2.797 2.618 2.148 -8 ,6743 ,KEBNE ,16657420,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:45 CET,0.0 0.355 0.583 0.767 0.93 1.086 1.207 1.305 1.484 1.572 1.661 1.706 1.913 1.983 2.129 2.255 2.364 2.419 2.526 2.636 2.79 2.891 3.001 3.158 3.304 3.44 3.571 3.689 3.849 4.02 4.181 4.364 4.544 4.724 4.921 5.138 5.347 5.575 5.823 6.077 6.337 6.635 6.968 7.305 7.682 8.051 8.446 8.885 9.365 9.826 10.157 10.145 9.952 9.689 9.405 9.148 8.9 8.655 8.431 8.171 7.929 7.684 7.456 7.252 7.05 6.863 6.672 6.515 6.386 6.249 6.106 5.977 5.827 5.672 5.551 5.431 5.32 5.198 5.055 4.955 4.848 4.656 4.531 4.422 4.361 4.232 4.107 3.954 3.877 3.687 3.665 3.589 3.506 3.337 3.228 3.103 2.984 2.88 2.756 2.598 2.286 -9 ,10320 ,KEBNE ,16657421,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:18:14 CET,0.0 0.484 0.684 0.841 0.964 1.071 1.187 1.301 1.491 1.586 1.676 1.705 1.896 1.961 2.076 2.193 2.306 2.357 2.459 2.583 2.752 2.844 2.939 3.085 3.222 3.354 3.487 3.611 3.766 3.927 4.075 4.233 4.388 4.552 4.755 4.965 5.161 5.382 5.622 5.873 6.126 6.422 6.765 7.112 7.499 7.883 8.331 8.813 9.294 9.769 10.117 10.205 10.104 9.877 9.601 9.289 9.013 8.769 8.562 8.348 8.142 7.958 7.771 7.572 7.391 7.227 7.048 6.876 6.728 6.582 6.421 6.29 6.158 6.015 5.901 5.779 5.65 5.521 5.397 5.303 5.196 5.026 4.898 4.774 4.721 4.613 4.502 4.386 4.306 4.095 4.076 4.007 3.923 3.725 3.621 3.508 3.388 3.255 3.085 2.871 2.571 -10 ,21445 ,KEBNE ,16657422,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:40 CET,0.0 0.365 0.556 0.719 0.873 0.996 1.102 1.202 1.373 1.453 1.531 1.55 1.74 1.81 1.944 2.067 2.175 2.23 2.338 2.449 2.621 2.724 2.821 2.961 3.099 3.229 3.355 3.473 3.623 3.784 3.938 4.109 4.269 4.424 4.615 4.829 5.022 5.238 5.476 5.706 5.954 6.231 6.524 6.795 7.089 7.405 7.783 8.197 8.629 9.053 9.374 9.423 9.277 9.071 8.831 8.58 8.356 8.14 7.926 7.696 7.487 7.282 7.093 6.928 6.776 6.622 6.454 6.307 6.179 6.041 5.902 5.789 5.659 5.523 5.417 5.311 5.214 5.116 4.991 4.897 4.797 4.649 4.548 4.43 4.372 4.246 4.105 3.981 3.925 3.739 3.698 3.613 3.52 3.328 3.246 3.156 3.046 2.919 2.795 2.678 2.497 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_234.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_234.txt deleted file mode 100644 index 3a8b01e2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_234.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8618 ,KEBNE ,16657423,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:18:31 CET,0.0 0.427 0.596 0.756 0.926 1.09 1.226 1.345 1.557 1.653 1.75 1.815 2.026 2.103 2.264 2.405 2.534 2.608 2.753 2.886 3.069 3.17 3.273 3.426 3.567 3.695 3.824 3.954 4.126 4.285 4.457 4.679 4.876 5.053 5.242 5.47 5.692 5.91 6.126 6.349 6.587 6.878 7.22 7.528 7.848 8.197 8.545 8.876 9.227 9.48 9.544 9.331 8.996 8.646 8.326 7.977 7.614 7.288 7.035 6.798 6.585 6.382 6.175 5.98 5.803 5.627 5.433 5.266 5.124 4.972 4.819 4.691 4.562 4.424 4.31 4.198 4.084 3.966 3.833 3.736 3.639 3.48 3.364 3.24 3.182 3.073 2.948 2.801 2.722 2.525 2.487 2.4 2.319 2.108 1.981 1.863 1.757 1.641 1.505 1.297 1.057 -2 ,29931 ,KEBNE ,16657424,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:44 CET,0.0 0.478 0.713 0.914 1.085 1.234 1.378 1.517 1.762 1.859 1.952 2.022 2.245 2.331 2.488 2.643 2.775 2.838 2.975 3.102 3.292 3.41 3.511 3.662 3.824 3.982 4.117 4.247 4.414 4.584 4.748 4.928 5.099 5.245 5.419 5.619 5.817 6.037 6.26 6.507 6.762 7.027 7.339 7.651 7.998 8.366 8.737 9.114 9.494 9.84 10.023 9.801 9.43 9.041 8.651 8.271 7.92 7.58 7.279 6.983 6.716 6.473 6.236 6.016 5.808 5.605 5.393 5.204 5.039 4.861 4.67 4.512 4.366 4.207 4.077 3.952 3.827 3.695 3.543 3.447 3.352 3.187 3.071 2.941 2.875 2.759 2.623 2.464 2.388 2.187 2.138 2.044 1.951 1.748 1.637 1.529 1.408 1.253 1.081 0.876 0.398 -3 ,21122 ,KEBNE ,16657425,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:22 CET,0.0 0.664 0.931 1.063 1.191 1.331 1.452 1.556 1.768 1.864 1.958 2.028 2.242 2.318 2.471 2.62 2.756 2.824 2.956 3.076 3.247 3.357 3.463 3.611 3.752 3.889 4.022 4.154 4.322 4.482 4.649 4.832 5.0 5.171 5.355 5.56 5.767 5.974 6.183 6.425 6.693 6.978 7.278 7.556 7.862 8.201 8.55 8.853 9.131 9.361 9.475 9.304 8.977 8.62 8.275 7.941 7.604 7.27 6.974 6.67 6.413 6.194 5.971 5.741 5.554 5.397 5.215 5.049 4.888 4.712 4.539 4.401 4.267 4.13 4.015 3.888 3.754 3.636 3.518 3.427 3.33 3.168 3.053 2.947 2.886 2.755 2.641 2.515 2.447 2.249 2.228 2.149 2.073 1.918 1.816 1.699 1.586 1.459 1.318 1.156 0.84 -4 ,20896 ,KEBNE ,16657426,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:18:12 CET,0.0 0.646 0.913 1.095 1.238 1.373 1.5 1.611 1.817 1.929 2.045 2.132 2.339 2.431 2.606 2.748 2.871 2.93 3.057 3.175 3.332 3.432 3.531 3.675 3.81 3.94 4.075 4.23 4.427 4.594 4.766 4.96 5.124 5.288 5.479 5.687 5.886 6.098 6.323 6.563 6.796 7.043 7.345 7.627 7.921 8.25 8.592 8.894 9.205 9.496 9.546 9.299 8.942 8.592 8.277 7.916 7.548 7.216 6.937 6.67 6.431 6.203 5.987 5.788 5.585 5.401 5.217 5.06 4.92 4.765 4.602 4.466 4.339 4.2 4.069 3.921 3.766 3.614 3.466 3.372 3.281 3.118 3.006 2.899 2.84 2.709 2.582 2.437 2.356 2.163 2.132 2.052 1.975 1.807 1.709 1.61 1.494 1.365 1.22 1.01 0.236 -5 ,17550 ,KEBNE ,16657427,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:17:58 CET,0.0 0.586 0.782 0.965 1.126 1.276 1.418 1.533 1.742 1.84 1.929 1.967 2.168 2.244 2.394 2.55 2.703 2.773 2.9 3.021 3.203 3.326 3.449 3.618 3.77 3.904 4.023 4.142 4.296 4.432 4.573 4.747 4.914 5.096 5.297 5.486 5.672 5.889 6.095 6.309 6.538 6.795 7.072 7.326 7.625 7.942 8.234 8.502 8.782 9.057 9.202 8.997 8.65 8.293 7.958 7.633 7.321 7.001 6.711 6.427 6.189 5.95 5.726 5.545 5.372 5.192 4.994 4.801 4.629 4.469 4.318 4.186 4.048 3.918 3.815 3.7 3.579 3.45 3.307 3.21 3.119 2.976 2.858 2.736 2.682 2.576 2.459 2.32 2.242 2.045 1.999 1.912 1.821 1.626 1.546 1.472 1.35 1.192 1.012 0.754 0.236 -6 ,13874 ,KEBNE ,16657428,Tue Nov 23 03:54:57 CET,Tue Nov 23 05:18:25 CET,0.0 0.43 0.677 0.895 1.079 1.224 1.339 1.467 1.711 1.816 1.923 1.999 2.196 2.275 2.436 2.59 2.718 2.776 2.897 3.01 3.184 3.299 3.401 3.548 3.697 3.847 3.989 4.121 4.286 4.446 4.61 4.796 4.965 5.124 5.297 5.485 5.679 5.886 6.089 6.304 6.544 6.801 7.047 7.292 7.574 7.879 8.218 8.542 8.833 9.04 9.1 8.916 8.586 8.241 7.895 7.547 7.243 6.968 6.724 6.441 6.186 5.971 5.752 5.529 5.332 5.166 4.995 4.83 4.678 4.511 4.347 4.221 4.091 3.951 3.833 3.707 3.563 3.426 3.29 3.181 3.052 2.865 2.762 2.651 2.588 2.462 2.331 2.189 2.12 1.93 1.889 1.805 1.721 1.512 1.386 1.268 1.146 1.03 0.89 0.709 0.292 -8 ,14530 ,KEBNE ,16657430,Tue Nov 23 03:55:59 CET,Tue Nov 23 05:19:31 CET,0.0 0.792 1.082 1.312 1.484 1.631 1.766 1.896 2.135 2.237 2.323 2.381 2.587 2.668 2.834 2.998 3.155 3.231 3.372 3.51 3.712 3.837 3.948 4.113 4.279 4.437 4.585 4.718 4.891 5.049 5.197 5.381 5.552 5.713 5.892 6.078 6.263 6.467 6.666 6.878 7.091 7.33 7.621 7.921 8.225 8.49 8.784 9.087 9.324 9.459 9.427 9.161 8.829 8.469 8.093 7.763 7.468 7.162 6.884 6.607 6.356 6.104 5.866 5.669 5.5 5.331 5.137 4.96 4.8 4.645 4.487 4.346 4.213 4.077 3.951 3.823 3.693 3.558 3.414 3.312 3.199 3.011 2.903 2.799 2.741 2.627 2.498 2.33 2.236 2.034 2.016 1.941 1.85 1.649 1.55 1.444 1.32 1.201 1.079 0.908 0.508 -9 ,7149 ,KEBNE ,16657431,Tue Nov 23 03:55:59 CET,Tue Nov 23 05:19:28 CET,0.0 0.508 0.686 0.872 1.045 1.196 1.342 1.479 1.707 1.808 1.899 1.961 2.173 2.247 2.379 2.519 2.664 2.73 2.868 3.003 3.186 3.294 3.397 3.542 3.676 3.814 3.948 4.076 4.242 4.403 4.581 4.816 5.016 5.19 5.37 5.559 5.748 5.977 6.223 6.462 6.696 6.935 7.217 7.497 7.815 8.132 8.451 8.789 9.118 9.378 9.429 9.164 8.754 8.353 8.009 7.665 7.333 7.03 6.748 6.45 6.187 5.931 5.694 5.47 5.266 5.091 4.902 4.715 4.553 4.389 4.215 4.072 3.917 3.749 3.62 3.49 3.359 3.213 3.053 2.943 2.815 2.612 2.482 2.35 2.286 2.169 2.046 1.915 1.849 1.648 1.631 1.554 1.46 1.276 1.177 1.05 0.903 0.739 0.565 0.355 0.052 -10 ,28500 ,KEBNE ,16657432,Tue Nov 23 03:55:59 CET,Tue Nov 23 05:20:12 CET,0.0 0.557 0.772 0.92 1.054 1.2 1.336 1.449 1.679 1.785 1.885 1.951 2.165 2.254 2.44 2.605 2.755 2.822 2.964 3.108 3.272 3.372 3.478 3.632 3.78 3.928 4.067 4.194 4.36 4.523 4.677 4.859 5.028 5.184 5.363 5.571 5.787 6.003 6.219 6.435 6.649 6.905 7.196 7.48 7.788 8.117 8.509 8.907 9.224 9.405 9.469 9.272 8.913 8.535 8.156 7.786 7.462 7.171 6.891 6.596 6.334 6.077 5.839 5.617 5.412 5.233 5.061 4.905 4.763 4.611 4.443 4.307 4.173 4.045 3.937 3.814 3.69 3.562 3.425 3.326 3.229 3.086 2.988 2.882 2.825 2.699 2.568 2.435 2.362 2.159 2.129 2.036 1.94 1.753 1.65 1.538 1.421 1.279 1.128 0.939 0.38 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_252.txt deleted file mode 100644 index 498f0cd3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_252.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30798 ,KEBNE ,16657433,Tue Nov 23 03:55:59 CET,Tue Nov 23 05:18:40 CET,0.0 0.412 0.573 0.693 0.808 0.918 1.022 1.114 1.296 1.378 1.446 1.46 1.646 1.704 1.811 1.912 2.012 2.065 2.157 2.231 2.362 2.456 2.545 2.669 2.787 2.894 2.983 3.075 3.223 3.355 3.46 3.585 3.709 3.832 3.974 4.103 4.192 4.277 4.367 4.461 4.548 4.637 4.729 4.826 4.929 4.997 5.029 5.008 4.82 4.396 3.662 2.556 1.515 0.633 -0.134 -0.824 -1.41 -1.952 -2.435 -2.909 -3.33 -3.71 -4.051 -4.37 -4.679 -4.954 -5.246 -5.512 -5.738 -5.974 -6.214 -6.414 -6.631 -6.857 -7.032 -7.205 -7.383 -7.577 -7.79 -7.942 -8.088 -8.303 -8.455 -8.608 -8.689 -8.868 -9.071 -9.28 -9.382 -9.621 -9.71 -9.832 -9.956 -10.214 -10.363 -10.526 -10.69 -10.852 -11.065 -11.388 -12.1 -2 ,7506 ,KEBNE ,16657434,Tue Nov 23 03:55:59 CET,Tue Nov 23 05:19:40 CET,0.0 0.265 0.446 0.585 0.699 0.791 0.889 0.984 1.137 1.203 1.272 1.273 1.451 1.51 1.628 1.748 1.853 1.904 2.006 2.095 2.209 2.287 2.362 2.476 2.597 2.704 2.802 2.885 2.98 3.088 3.191 3.287 3.377 3.477 3.589 3.708 3.826 3.937 4.033 4.142 4.249 4.347 4.435 4.502 4.564 4.606 4.598 4.526 4.367 3.952 3.149 2.012 0.957 0.093 -0.656 -1.355 -2.024 -2.637 -3.13 -3.627 -4.055 -4.421 -4.792 -5.149 -5.463 -5.742 -6.03 -6.304 -6.543 -6.784 -7.036 -7.261 -7.502 -7.744 -7.935 -8.124 -8.307 -8.494 -8.693 -8.829 -8.971 -9.221 -9.387 -9.542 -9.62 -9.779 -9.961 -10.148 -10.237 -10.47 -10.552 -10.664 -10.773 -11.012 -11.148 -11.302 -11.475 -11.669 -11.889 -12.136 -12.741 -4 ,27680 ,KEBNE ,16657436,Tue Nov 23 03:55:59 CET,Tue Nov 23 05:18:56 CET,0.0 0.479 0.705 0.879 1.026 1.148 1.253 1.353 1.532 1.604 1.665 1.653 1.829 1.886 1.999 2.111 2.204 2.245 2.318 2.387 2.5 2.582 2.654 2.755 2.87 2.993 3.118 3.217 3.309 3.401 3.498 3.606 3.705 3.797 3.895 3.997 4.092 4.185 4.278 4.371 4.484 4.592 4.679 4.786 4.872 4.896 4.863 4.798 4.661 4.321 3.537 2.489 1.591 0.762 0.002 -0.655 -1.233 -1.801 -2.278 -2.725 -3.125 -3.505 -3.868 -4.207 -4.518 -4.789 -5.094 -5.382 -5.614 -5.834 -6.069 -6.264 -6.467 -6.679 -6.836 -7.012 -7.199 -7.394 -7.584 -7.706 -7.833 -8.028 -8.171 -8.316 -8.387 -8.533 -8.704 -8.892 -8.988 -9.215 -9.275 -9.373 -9.482 -9.734 -9.872 -10.023 -10.183 -10.373 -10.613 -10.918 -11.647 -5 ,10951 ,KEBNE ,16657437,Tue Nov 23 03:56:02 CET,Tue Nov 23 05:17:08 CET,0.0 0.281 0.448 0.59 0.712 0.829 0.924 1.011 1.171 1.245 1.319 1.341 1.526 1.581 1.674 1.779 1.88 1.926 2.002 2.095 2.256 2.338 2.406 2.501 2.602 2.696 2.775 2.846 2.95 3.069 3.16 3.25 3.355 3.457 3.553 3.643 3.738 3.847 3.958 4.078 4.192 4.306 4.429 4.538 4.613 4.662 4.687 4.641 4.467 4.07 3.274 2.133 1.118 0.275 -0.463 -1.137 -1.728 -2.279 -2.744 -3.216 -3.62 -3.976 -4.343 -4.701 -5.017 -5.289 -5.585 -5.86 -6.081 -6.309 -6.557 -6.745 -6.929 -7.129 -7.294 -7.468 -7.643 -7.829 -8.014 -8.134 -8.265 -8.476 -8.608 -8.74 -8.813 -8.968 -9.143 -9.348 -9.445 -9.669 -9.758 -9.875 -9.991 -10.245 -10.381 -10.539 -10.701 -10.873 -11.094 -11.384 -12.067 -7 ,21863 ,KEBNE ,16657439,Tue Nov 23 03:55:59 CET,Tue Nov 23 05:17:51 CET,0.0 0.361 0.507 0.623 0.736 0.846 0.959 1.055 1.211 1.282 1.341 1.355 1.543 1.612 1.765 1.898 2.012 2.066 2.177 2.289 2.432 2.512 2.587 2.693 2.804 2.902 2.992 3.083 3.2 3.31 3.41 3.542 3.665 3.763 3.857 3.944 4.028 4.136 4.244 4.337 4.453 4.578 4.703 4.836 4.942 5.03 5.1 5.094 4.978 4.676 3.958 2.97 2.131 1.286 0.545 -0.123 -0.721 -1.229 -1.691 -2.164 -2.557 -2.909 -3.236 -3.531 -3.803 -4.055 -4.333 -4.58 -4.791 -5.011 -5.24 -5.434 -5.64 -5.859 -6.031 -6.196 -6.375 -6.563 -6.74 -6.866 -6.995 -7.2 -7.354 -7.52 -7.604 -7.774 -7.938 -8.107 -8.202 -8.433 -8.521 -8.638 -8.762 -9.011 -9.157 -9.323 -9.484 -9.666 -9.89 -10.171 -10.781 -8 ,13304 ,KEBNE ,16657440,Tue Nov 23 03:55:59 CET,Tue Nov 23 05:18:54 CET,0.0 0.333 0.49 0.608 0.709 0.81 0.92 1.016 1.196 1.273 1.338 1.34 1.516 1.576 1.692 1.794 1.901 1.962 2.068 2.151 2.264 2.332 2.4 2.494 2.596 2.698 2.785 2.862 2.958 3.079 3.198 3.323 3.426 3.507 3.599 3.7 3.803 3.951 4.093 4.207 4.312 4.42 4.556 4.651 4.753 4.834 4.807 4.732 4.597 4.25 3.449 2.42 1.522 0.668 -0.107 -0.797 -1.4 -1.965 -2.443 -2.897 -3.286 -3.64 -3.972 -4.302 -4.64 -4.922 -5.178 -5.432 -5.664 -5.886 -6.111 -6.288 -6.484 -6.715 -6.875 -7.025 -7.183 -7.356 -7.543 -7.667 -7.796 -7.996 -8.136 -8.278 -8.354 -8.517 -8.67 -8.834 -8.921 -9.138 -9.2 -9.309 -9.433 -9.701 -9.855 -10.009 -10.156 -10.32 -10.485 -10.739 -11.407 -9 ,16993 ,KEBNE ,16657441,Tue Nov 23 03:55:59 CET,Tue Nov 23 05:17:48 CET,0.0 0.539 0.737 0.881 0.996 1.092 1.202 1.288 1.425 1.513 1.599 1.616 1.808 1.879 2.005 2.135 2.245 2.285 2.364 2.469 2.639 2.729 2.795 2.909 3.024 3.111 3.197 3.297 3.441 3.574 3.676 3.77 3.863 3.963 4.062 4.153 4.259 4.383 4.493 4.587 4.679 4.787 4.896 4.977 5.055 5.102 5.144 5.175 5.101 4.784 4.018 2.982 2.084 1.355 0.677 0.023 -0.552 -1.088 -1.552 -2.006 -2.394 -2.739 -3.1 -3.462 -3.766 -4.033 -4.316 -4.564 -4.775 -4.992 -5.244 -5.458 -5.669 -5.881 -6.033 -6.193 -6.351 -6.534 -6.738 -6.868 -7.002 -7.217 -7.367 -7.512 -7.586 -7.742 -7.911 -8.091 -8.191 -8.422 -8.503 -8.623 -8.748 -8.988 -9.119 -9.253 -9.375 -9.528 -9.727 -10.032 -10.82 -10 ,28773 ,KEBNE ,16657442,Tue Nov 23 03:55:59 CET,Tue Nov 23 05:18:30 CET,0.0 0.293 0.448 0.592 0.69 0.782 0.894 1.005 1.188 1.268 1.343 1.358 1.545 1.609 1.726 1.821 1.927 1.976 2.058 2.131 2.26 2.338 2.411 2.528 2.62 2.704 2.784 2.869 2.977 3.08 3.172 3.269 3.371 3.461 3.562 3.687 3.813 3.946 4.066 4.188 4.297 4.387 4.481 4.583 4.676 4.747 4.79 4.776 4.667 4.384 3.741 2.797 1.898 1.103 0.402 -0.284 -0.892 -1.429 -1.904 -2.38 -2.76 -3.098 -3.445 -3.775 -4.077 -4.341 -4.619 -4.867 -5.081 -5.311 -5.543 -5.735 -5.932 -6.137 -6.308 -6.484 -6.663 -6.849 -7.04 -7.17 -7.301 -7.513 -7.67 -7.832 -7.912 -8.07 -8.251 -8.436 -8.524 -8.755 -8.815 -8.919 -9.038 -9.3 -9.444 -9.589 -9.75 -9.922 -10.128 -10.404 -11.058 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_54.txt deleted file mode 100644 index 3883dc07..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_163_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5559 ,KEBNE ,17023747,Wed Dec 22 08:25:14 CET,Wed Dec 22 09:48:52 CET,0.0 1.232 1.626 1.898 2.098 2.318 2.54 2.719 3.027 3.186 3.344 3.509 3.763 3.908 4.207 4.496 4.763 4.89 5.145 5.406 5.794 6.043 6.288 6.62 6.933 7.239 7.519 7.783 8.107 8.4 8.694 9.058 9.404 9.75 10.17 10.646 11.089 11.585 12.13 12.702 13.296 13.984 14.844 15.722 16.717 17.832 19.105 20.503 22.219 24.334 27.021 29.365 30.744 31.621 32.238 32.691 32.967 33.123 33.215 33.282 33.311 33.319 33.3 33.255 33.214 33.184 33.113 33.021 32.947 32.881 32.788 32.683 32.586 32.489 32.414 32.329 32.23 32.124 32.014 31.94 31.857 31.725 31.638 31.537 31.479 31.372 31.253 31.116 31.042 30.863 30.765 30.673 30.579 30.337 30.219 30.097 29.921 29.699 29.459 29.133 27.901 -2 ,20374 ,KEBNE ,17023748,Wed Dec 22 08:25:13 CET,Wed Dec 22 09:48:36 CET,0.0 1.303 1.738 2.076 2.369 2.632 2.846 3.052 3.465 3.645 3.793 3.964 4.231 4.375 4.657 4.931 5.197 5.329 5.581 5.799 6.105 6.294 6.481 6.783 7.089 7.377 7.649 7.909 8.227 8.542 8.84 9.187 9.536 9.895 10.337 10.83 11.287 11.765 12.285 12.869 13.499 14.209 15.042 15.891 16.881 17.99 19.282 20.746 22.453 24.574 27.316 29.72 31.199 32.176 32.849 33.293 33.583 33.806 33.966 34.077 34.124 34.152 34.165 34.163 34.157 34.139 34.105 34.064 34.02 33.959 33.894 33.837 33.774 33.716 33.651 33.562 33.47 33.372 33.267 33.205 33.129 32.986 32.889 32.78 32.724 32.614 32.477 32.325 32.257 32.1 32.054 31.98 31.883 31.617 31.489 31.349 31.177 31.011 30.789 30.472 28.933 -3 ,28175 ,KEBNE ,17023749,Wed Dec 22 08:25:14 CET,Wed Dec 22 09:47:46 CET,0.0 1.11 1.476 1.757 2.0 2.24 2.486 2.703 3.106 3.28 3.434 3.62 3.896 4.052 4.326 4.603 4.874 5.005 5.264 5.499 5.825 6.035 6.224 6.512 6.812 7.097 7.377 7.631 7.94 8.248 8.547 8.932 9.325 9.693 10.106 10.588 11.088 11.609 12.159 12.756 13.366 14.088 14.96 15.807 16.786 17.878 19.179 20.681 22.478 24.721 27.544 29.887 31.277 32.229 32.906 33.356 33.653 33.86 34.008 34.121 34.187 34.21 34.187 34.141 34.102 34.085 34.052 34.005 33.957 33.882 33.79 33.716 33.65 33.572 33.49 33.383 33.272 33.171 33.069 32.999 32.919 32.795 32.718 32.625 32.567 32.444 32.299 32.149 32.081 31.914 31.85 31.761 31.664 31.453 31.345 31.223 31.058 30.847 30.565 30.186 28.718 -4 ,17458 ,KEBNE ,17023750,Wed Dec 22 08:25:13 CET,Wed Dec 22 09:49:23 CET,0.0 1.158 1.5 1.777 2.028 2.257 2.472 2.678 3.044 3.22 3.388 3.557 3.806 3.929 4.18 4.435 4.691 4.812 5.041 5.27 5.622 5.843 6.042 6.334 6.643 6.965 7.272 7.562 7.929 8.271 8.588 8.984 9.372 9.71 10.081 10.52 10.96 11.453 11.974 12.496 13.054 13.719 14.539 15.398 16.417 17.603 19.027 20.585 22.392 24.524 27.275 29.691 31.082 31.999 32.612 33.026 33.306 33.494 33.622 33.705 33.744 33.757 33.744 33.712 33.667 33.616 33.569 33.514 33.46 33.408 33.34 33.283 33.21 33.112 33.02 32.9 32.76 32.643 32.54 32.467 32.403 32.309 32.233 32.138 32.091 31.999 31.884 31.759 31.698 31.531 31.456 31.382 31.308 31.106 30.997 30.888 30.728 30.525 30.325 30.054 29.04 -5 ,8816 ,KEBNE ,17023751,Wed Dec 22 08:25:13 CET,Wed Dec 22 09:48:34 CET,0.0 1.328 1.807 2.148 2.422 2.659 2.865 3.051 3.415 3.596 3.782 4.025 4.325 4.491 4.826 5.148 5.429 5.561 5.828 6.084 6.443 6.67 6.889 7.24 7.583 7.861 8.114 8.367 8.699 9.017 9.325 9.739 10.175 10.562 10.996 11.493 11.943 12.426 12.97 13.568 14.179 14.856 15.638 16.438 17.403 18.478 19.768 21.265 23.039 25.241 28.053 30.454 31.94 32.934 33.602 34.058 34.348 34.525 34.644 34.729 34.765 34.779 34.785 34.777 34.758 34.718 34.645 34.582 34.517 34.447 34.377 34.302 34.22 34.152 34.092 34.019 33.931 33.817 33.703 33.628 33.541 33.391 33.28 33.165 33.104 32.977 32.848 32.713 32.638 32.457 32.361 32.254 32.138 31.89 31.773 31.634 31.467 31.304 31.113 30.764 29.382 -6 ,2275 ,KEBNE ,17023752,Wed Dec 22 08:25:14 CET,Wed Dec 22 09:48:40 CET,0.0 1.022 1.461 1.803 2.057 2.302 2.54 2.782 3.248 3.437 3.612 3.821 4.105 4.254 4.527 4.792 5.067 5.207 5.462 5.714 6.081 6.308 6.537 6.869 7.196 7.494 7.765 8.038 8.398 8.754 9.119 9.575 9.988 10.385 10.88 11.392 11.839 12.343 12.894 13.456 14.039 14.717 15.516 16.307 17.212 18.246 19.481 20.952 22.726 24.848 27.574 29.972 31.379 32.335 32.988 33.4 33.681 33.885 34.011 34.067 34.098 34.119 34.113 34.099 34.077 34.042 34.0 33.955 33.909 33.857 33.796 33.728 33.658 33.589 33.518 33.446 33.386 33.314 33.228 33.175 33.106 32.987 32.918 32.838 32.792 32.693 32.572 32.439 32.368 32.194 32.125 32.028 31.918 31.684 31.545 31.398 31.242 31.057 30.839 30.541 29.538 -7 ,15530 ,KEBNE ,17023753,Wed Dec 22 08:25:13 CET,Wed Dec 22 09:49:22 CET,0.0 1.181 1.533 1.813 2.063 2.295 2.505 2.709 3.115 3.332 3.543 3.793 4.103 4.278 4.591 4.873 5.151 5.28 5.517 5.736 6.038 6.262 6.502 6.859 7.214 7.518 7.797 8.065 8.392 8.722 9.042 9.434 9.801 10.175 10.668 11.228 11.746 12.293 12.869 13.458 14.076 14.789 15.592 16.413 17.416 18.551 19.864 21.333 23.124 25.325 27.966 30.177 31.473 32.302 32.845 33.215 33.481 33.674 33.826 33.965 34.034 34.062 34.075 34.049 34.015 33.999 33.962 33.877 33.797 33.743 33.685 33.619 33.513 33.397 33.315 33.216 33.11 33.002 32.897 32.835 32.76 32.625 32.54 32.441 32.388 32.282 32.162 32.027 31.952 31.767 31.677 31.59 31.512 31.297 31.158 30.993 30.819 30.619 30.39 30.092 28.968 -8 ,7151 ,KEBNE ,17023754,Wed Dec 22 08:25:13 CET,Wed Dec 22 09:49:38 CET,0.0 0.833 1.186 1.449 1.697 1.935 2.144 2.346 2.711 2.881 3.038 3.229 3.505 3.649 3.926 4.198 4.464 4.584 4.815 5.06 5.428 5.667 5.906 6.242 6.563 6.878 7.161 7.43 7.785 8.095 8.375 8.73 9.071 9.404 9.797 10.236 10.671 11.184 11.753 12.335 12.936 13.619 14.415 15.23 16.195 17.285 18.535 19.949 21.637 23.714 26.413 28.763 30.207 31.202 31.866 32.32 32.618 32.806 32.944 33.076 33.159 33.196 33.207 33.207 33.203 33.199 33.177 33.128 33.078 33.019 32.944 32.892 32.838 32.744 32.653 32.567 32.488 32.405 32.314 32.24 32.148 32.014 31.924 31.818 31.754 31.624 31.504 31.368 31.287 31.105 31.033 30.94 30.822 30.574 30.438 30.28 30.1 29.876 29.591 29.164 27.831 -9 ,6005 ,KEBNE ,17023755,Wed Dec 22 08:25:14 CET,Wed Dec 22 09:49:32 CET,0.0 1.17 1.548 1.818 2.065 2.276 2.464 2.634 2.95 3.111 3.278 3.475 3.74 3.87 4.117 4.371 4.611 4.723 4.942 5.164 5.51 5.74 5.952 6.267 6.581 6.861 7.131 7.407 7.759 8.078 8.394 8.784 9.165 9.551 10.01 10.544 11.028 11.525 12.05 12.637 13.263 13.936 14.708 15.522 16.519 17.636 18.963 20.509 22.3 24.462 27.135 29.373 30.719 31.578 32.182 32.646 32.951 33.142 33.245 33.318 33.362 33.375 33.373 33.369 33.345 33.29 33.232 33.196 33.17 33.127 33.052 32.978 32.901 32.822 32.749 32.667 32.593 32.495 32.384 32.315 32.241 32.131 32.052 31.976 31.941 31.843 31.718 31.563 31.482 31.31 31.247 31.159 31.075 30.896 30.796 30.657 30.508 30.357 30.147 29.909 28.588 -10 ,26601 ,KEBNE ,17023756,Wed Dec 22 08:25:14 CET,Wed Dec 22 09:47:44 CET,0.0 0.722 1.071 1.389 1.68 1.959 2.203 2.428 2.809 2.958 3.107 3.288 3.541 3.676 3.938 4.205 4.473 4.601 4.849 5.077 5.428 5.648 5.852 6.153 6.429 6.687 6.945 7.214 7.587 7.958 8.314 8.71 9.081 9.458 9.901 10.4 10.895 11.453 12.043 12.667 13.327 14.039 14.84 15.685 16.686 17.769 19.076 20.61 22.422 24.621 27.388 29.839 31.323 32.258 32.932 33.429 33.779 34.044 34.19 34.279 34.306 34.305 34.317 34.323 34.324 34.304 34.256 34.192 34.14 34.084 34.023 33.968 33.88 33.78 33.705 33.623 33.538 33.44 33.332 33.243 33.155 33.015 32.903 32.795 32.732 32.603 32.464 32.29 32.202 32.026 31.953 31.856 31.747 31.53 31.401 31.24 31.076 30.904 30.662 30.357 29.333 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_164_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_164_231.txt deleted file mode 100644 index 9e4ea91b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_164_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24887 ,KEBNE ,17069386,Fri Dec 24 02:31:08 CET,Fri Dec 24 03:55:24 CET,0.0 0.521 0.748 0.936 1.085 1.216 1.335 1.443 1.653 1.76 1.86 1.939 2.145 2.23 2.376 2.518 2.663 2.731 2.858 2.995 3.209 3.342 3.463 3.627 3.793 3.961 4.119 4.271 4.46 4.644 4.823 5.023 5.219 5.407 5.621 5.864 6.104 6.361 6.612 6.899 7.214 7.552 7.937 8.305 8.718 9.157 9.621 10.125 10.722 11.348 11.787 11.599 11.294 10.963 10.531 10.051 9.594 9.177 8.806 8.422 8.085 7.765 7.435 7.121 6.827 6.57 6.315 6.096 5.902 5.681 5.451 5.274 5.099 4.911 4.75 4.571 4.397 4.217 4.019 3.883 3.735 3.495 3.333 3.168 3.083 2.928 2.772 2.588 2.488 2.276 2.174 2.062 1.936 1.658 1.524 1.376 1.22 1.029 0.764 0.39 -0.499 -2 ,23608 ,KEBNE ,17069388,Fri Dec 24 02:32:10 CET,Fri Dec 24 03:55:23 CET,0.0 0.627 0.844 1.014 1.15 1.276 1.388 1.487 1.662 1.741 1.823 1.886 2.088 2.169 2.337 2.492 2.618 2.68 2.807 2.927 3.101 3.215 3.33 3.504 3.66 3.798 3.941 4.096 4.3 4.489 4.673 4.892 5.099 5.292 5.515 5.766 6.007 6.251 6.505 6.786 7.08 7.393 7.763 8.139 8.551 9.016 9.537 10.069 10.593 11.013 11.183 10.865 10.299 9.698 9.149 8.595 8.073 7.604 7.205 6.783 6.407 6.082 5.756 5.464 5.204 4.948 4.676 4.439 4.236 4.028 3.803 3.611 3.415 3.218 3.065 2.901 2.736 2.566 2.378 2.244 2.09 1.815 1.628 1.448 1.355 1.17 0.967 0.745 0.63 0.401 0.256 0.113 -0.026 -0.315 -0.462 -0.611 -0.767 -0.941 -1.16 -1.44 -2.032 -3 ,26259 ,KEBNE ,17069389,Fri Dec 24 02:32:10 CET,Fri Dec 24 03:56:42 CET,0.0 0.327 0.502 0.663 0.809 0.919 1.027 1.142 1.36 1.445 1.523 1.573 1.759 1.823 1.956 2.095 2.207 2.262 2.367 2.477 2.647 2.758 2.884 3.071 3.233 3.39 3.55 3.706 3.898 4.087 4.257 4.44 4.616 4.788 4.995 5.225 5.44 5.666 5.895 6.136 6.394 6.727 7.121 7.483 7.893 8.328 8.794 9.245 9.643 9.963 10.066 9.62 8.95 8.312 7.713 7.152 6.663 6.203 5.782 5.324 4.938 4.598 4.25 3.929 3.63 3.348 3.065 2.826 2.613 2.389 2.158 1.961 1.766 1.55 1.385 1.221 1.049 0.872 0.679 0.546 0.415 0.217 0.079 -0.075 -0.155 -0.323 -0.507 -0.69 -0.783 -0.996 -1.116 -1.238 -1.359 -1.629 -1.774 -1.921 -2.054 -2.193 -2.352 -2.523 -3.026 -4 ,24941 ,KEBNE ,17069391,Fri Dec 24 02:34:20 CET,Fri Dec 24 03:57:32 CET,0.0 0.74 0.997 1.142 1.257 1.373 1.498 1.603 1.794 1.889 1.98 2.035 2.233 2.313 2.447 2.575 2.691 2.745 2.855 2.966 3.124 3.227 3.333 3.508 3.692 3.852 3.99 4.116 4.28 4.443 4.604 4.809 5.018 5.214 5.427 5.663 5.879 6.129 6.408 6.666 6.942 7.258 7.612 7.964 8.353 8.788 9.291 9.829 10.416 11.049 11.725 11.861 11.64 11.277 10.799 10.304 9.828 9.382 8.966 8.525 8.136 7.796 7.473 7.153 6.856 6.586 6.303 6.063 5.851 5.615 5.381 5.192 4.977 4.751 4.576 4.393 4.205 4.017 3.823 3.689 3.558 3.351 3.207 3.057 2.977 2.813 2.652 2.497 2.413 2.206 2.113 1.996 1.863 1.59 1.47 1.345 1.181 0.993 0.758 0.458 -0.141 -5 ,29217 ,KEBNE ,17069393,Fri Dec 24 02:34:19 CET,Fri Dec 24 03:59:27 CET,0.0 0.88 1.142 1.345 1.52 1.675 1.806 1.926 2.15 2.25 2.348 2.433 2.64 2.725 2.899 3.054 3.206 3.284 3.429 3.567 3.752 3.87 3.99 4.164 4.333 4.495 4.646 4.789 4.967 5.147 5.34 5.555 5.731 5.91 6.126 6.355 6.583 6.84 7.116 7.41 7.695 7.999 8.374 8.74 9.156 9.617 10.069 10.547 11.049 11.456 11.631 11.314 10.788 10.274 9.743 9.238 8.824 8.421 8.052 7.682 7.353 7.037 6.723 6.415 6.121 5.86 5.587 5.337 5.114 4.889 4.653 4.445 4.223 3.997 3.825 3.64 3.452 3.268 3.073 2.931 2.782 2.551 2.388 2.203 2.118 1.976 1.805 1.62 1.522 1.302 1.201 1.092 0.978 0.716 0.577 0.428 0.258 0.083 -0.116 -0.387 -0.931 -6 ,12793 ,KEBNE ,17069394,Fri Dec 24 02:36:25 CET,Fri Dec 24 04:01:20 CET,0.0 0.622 0.804 0.961 1.117 1.248 1.378 1.506 1.734 1.839 1.934 1.976 2.175 2.253 2.404 2.547 2.675 2.737 2.863 2.987 3.173 3.283 3.385 3.544 3.686 3.816 3.951 4.085 4.261 4.441 4.607 4.796 4.977 5.15 5.349 5.577 5.796 6.044 6.313 6.585 6.859 7.164 7.509 7.84 8.245 8.688 9.175 9.677 10.265 10.91 11.383 11.503 11.433 11.336 11.161 10.902 10.623 10.34 10.092 9.851 9.632 9.399 9.163 8.955 8.759 8.575 8.38 8.192 8.024 7.853 7.679 7.525 7.336 7.129 6.977 6.826 6.677 6.523 6.349 6.23 6.121 5.964 5.849 5.715 5.643 5.499 5.343 5.171 5.079 4.861 4.741 4.614 4.476 4.215 4.087 3.949 3.775 3.557 3.328 3.043 2.498 -7 ,26823 ,KEBNE ,17069396,Fri Dec 24 02:43:53 CET,Fri Dec 24 04:07:17 CET,0.0 0.303 0.479 0.632 0.777 0.923 1.054 1.179 1.389 1.471 1.558 1.627 1.833 1.921 2.083 2.225 2.364 2.439 2.578 2.701 2.869 2.98 3.096 3.268 3.422 3.57 3.728 3.876 4.045 4.214 4.393 4.611 4.816 5.018 5.256 5.521 5.756 6.022 6.318 6.595 6.859 7.164 7.551 7.925 8.343 8.81 9.301 9.759 10.169 10.535 10.749 10.547 10.208 9.72 9.221 8.788 8.366 7.948 7.554 7.132 6.785 6.478 6.178 5.908 5.654 5.41 5.142 4.907 4.703 4.48 4.249 4.059 3.868 3.68 3.527 3.361 3.189 3.021 2.855 2.727 2.593 2.39 2.245 2.093 2.017 1.849 1.665 1.488 1.398 1.182 1.095 0.988 0.876 0.629 0.496 0.351 0.185 -0.018 -0.254 -0.531 -1.006 -8 ,8676 ,KEBNE ,17069398,Fri Dec 24 02:48:06 CET,Fri Dec 24 04:12:44 CET,0.0 0.631 0.832 0.997 1.145 1.272 1.387 1.51 1.755 1.854 1.943 2.027 2.229 2.3 2.445 2.595 2.746 2.823 2.958 3.074 3.261 3.384 3.493 3.642 3.791 3.944 4.092 4.238 4.412 4.572 4.735 4.946 5.159 5.368 5.612 5.847 6.058 6.311 6.578 6.844 7.132 7.45 7.807 8.154 8.541 8.93 9.394 9.921 10.418 10.833 10.985 10.708 10.177 9.627 9.095 8.551 8.069 7.645 7.25 6.828 6.465 6.143 5.838 5.561 5.296 5.05 4.797 4.555 4.337 4.112 3.863 3.672 3.487 3.279 3.118 2.951 2.768 2.562 2.347 2.199 2.06 1.854 1.713 1.565 1.482 1.311 1.122 0.914 0.812 0.604 0.515 0.402 0.277 0.008 -0.135 -0.284 -0.452 -0.629 -0.823 -1.09 -1.65 -9 ,16586 ,KEBNE ,17069400,Fri Dec 24 03:04:06 CET,Fri Dec 24 04:27:42 CET,0.0 0.365 0.566 0.724 0.854 0.98 1.103 1.209 1.39 1.47 1.552 1.611 1.814 1.9 2.052 2.19 2.321 2.387 2.514 2.642 2.831 2.948 3.07 3.24 3.391 3.554 3.714 3.851 4.041 4.245 4.412 4.599 4.791 4.984 5.199 5.432 5.668 5.934 6.227 6.539 6.863 7.226 7.636 8.019 8.433 8.848 9.237 9.658 10.169 10.682 10.97 10.592 10.058 9.54 8.962 8.415 7.931 7.48 7.098 6.701 6.35 6.028 5.708 5.409 5.142 4.897 4.631 4.386 4.164 3.937 3.694 3.481 3.264 3.055 2.901 2.742 2.568 2.385 2.208 2.082 1.95 1.746 1.596 1.447 1.372 1.206 1.023 0.82 0.723 0.517 0.431 0.313 0.183 -0.079 -0.233 -0.406 -0.58 -0.748 -0.94 -1.259 -1.922 -10 ,9348 ,KEBNE ,17069402,Fri Dec 24 03:06:11 CET,Fri Dec 24 04:30:44 CET,0.0 0.502 0.711 0.886 1.051 1.195 1.325 1.436 1.662 1.76 1.846 1.911 2.112 2.199 2.354 2.511 2.67 2.741 2.878 2.998 3.154 3.259 3.363 3.523 3.676 3.813 3.956 4.099 4.274 4.446 4.613 4.817 5.035 5.242 5.463 5.719 5.967 6.229 6.503 6.772 7.063 7.409 7.788 8.131 8.531 8.969 9.443 9.97 10.503 10.952 11.155 11.07 10.729 10.277 9.88 9.442 8.991 8.591 8.227 7.824 7.451 7.134 6.844 6.563 6.297 6.034 5.763 5.526 5.314 5.102 4.887 4.708 4.512 4.311 4.162 3.999 3.822 3.642 3.474 3.362 3.231 3.014 2.868 2.722 2.647 2.49 2.315 2.136 2.049 1.835 1.732 1.635 1.523 1.271 1.141 0.958 0.785 0.619 0.397 0.131 -0.73 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_167_234.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_167_234.txt deleted file mode 100644 index ce7e925d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_167_234.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21978 ,KEBNE ,16657443,Tue Nov 23 03:57:01 CET,Tue Nov 23 05:20:38 CET,0.0 0.379 0.547 0.681 0.797 0.893 0.997 1.101 1.276 1.342 1.399 1.399 1.557 1.608 1.72 1.833 1.932 1.971 2.038 2.096 2.189 2.254 2.306 2.395 2.48 2.545 2.618 2.693 2.786 2.87 2.949 3.047 3.128 3.187 3.263 3.333 3.373 3.42 3.485 3.556 3.596 3.61 3.625 3.622 3.563 3.441 3.252 2.973 2.515 1.744 0.427 -1.157 -2.434 -3.497 -4.436 -5.264 -5.973 -6.605 -7.127 -7.662 -8.122 -8.548 -8.937 -9.268 -9.597 -9.923 -10.258 -10.529 -10.763 -11.012 -11.26 -11.456 -11.654 -11.869 -12.048 -12.233 -12.412 -12.59 -12.786 -12.915 -13.036 -13.237 -13.373 -13.509 -13.581 -13.738 -13.921 -14.122 -14.223 -14.436 -14.507 -14.612 -14.718 -14.936 -15.05 -15.172 -15.303 -15.458 -15.662 -15.923 -16.494 -2 ,14885 ,KEBNE ,16657444,Tue Nov 23 03:57:01 CET,Tue Nov 23 05:21:28 CET,0.0 0.336 0.509 0.659 0.814 0.928 1.025 1.123 1.282 1.345 1.404 1.413 1.563 1.609 1.72 1.83 1.934 1.981 2.074 2.162 2.271 2.341 2.408 2.495 2.586 2.668 2.74 2.806 2.891 2.972 3.022 3.096 3.18 3.243 3.317 3.389 3.44 3.487 3.535 3.583 3.606 3.607 3.603 3.573 3.527 3.462 3.281 2.979 2.526 1.74 0.358 -1.341 -2.757 -3.922 -4.885 -5.732 -6.434 -7.086 -7.668 -8.232 -8.717 -9.172 -9.622 -10.04 -10.419 -10.748 -11.083 -11.394 -11.648 -11.901 -12.172 -12.386 -12.617 -12.864 -13.053 -13.245 -13.43 -13.629 -13.834 -13.972 -14.123 -14.376 -14.555 -14.73 -14.82 -15.007 -15.196 -15.402 -15.505 -15.727 -15.81 -15.91 -16.009 -16.268 -16.422 -16.582 -16.771 -16.962 -17.161 -17.416 -18.01 -3 ,7937 ,KEBNE ,16657445,Tue Nov 23 03:57:01 CET,Tue Nov 23 05:21:23 CET,0.0 0.269 0.443 0.607 0.728 0.805 0.878 0.958 1.124 1.218 1.298 1.305 1.464 1.512 1.621 1.738 1.857 1.911 1.987 2.039 2.126 2.185 2.241 2.339 2.435 2.51 2.579 2.653 2.744 2.819 2.91 3.012 3.076 3.137 3.193 3.26 3.333 3.39 3.433 3.476 3.508 3.53 3.554 3.543 3.491 3.387 3.242 2.99 2.517 1.752 0.431 -1.135 -2.431 -3.534 -4.495 -5.355 -6.061 -6.688 -7.245 -7.819 -8.323 -8.75 -9.139 -9.519 -9.867 -10.155 -10.456 -10.744 -10.977 -11.21 -11.457 -11.654 -11.861 -12.086 -12.257 -12.43 -12.611 -12.818 -13.034 -13.165 -13.309 -13.523 -13.668 -13.825 -13.905 -14.079 -14.252 -14.414 -14.5 -14.715 -14.791 -14.899 -15.022 -15.33 -15.482 -15.61 -15.744 -15.91 -16.118 -16.353 -17.14 -4 ,22591 ,KEBNE ,16657446,Tue Nov 23 03:57:01 CET,Tue Nov 23 05:21:14 CET,0.0 0.442 0.65 0.793 0.902 0.99 1.075 1.161 1.313 1.372 1.424 1.422 1.572 1.624 1.735 1.825 1.897 1.934 2.017 2.092 2.214 2.292 2.353 2.437 2.524 2.616 2.7 2.764 2.822 2.886 2.957 3.03 3.102 3.172 3.253 3.331 3.378 3.426 3.475 3.522 3.592 3.643 3.65 3.636 3.586 3.512 3.36 3.065 2.574 1.778 0.468 -1.1 -2.374 -3.453 -4.379 -5.156 -5.865 -6.544 -7.119 -7.683 -8.163 -8.57 -8.932 -9.276 -9.607 -9.899 -10.232 -10.553 -10.804 -11.038 -11.283 -11.499 -11.746 -12.001 -12.186 -12.373 -12.567 -12.772 -12.972 -13.106 -13.239 -13.453 -13.605 -13.766 -13.855 -14.03 -14.207 -14.382 -14.47 -14.683 -14.75 -14.849 -14.962 -15.202 -15.334 -15.472 -15.6 -15.736 -15.925 -16.153 -16.671 -5 ,29619 ,KEBNE ,16657447,Tue Nov 23 03:57:01 CET,Tue Nov 23 05:21:39 CET,0.0 0.407 0.543 0.696 0.842 0.946 1.04 1.138 1.323 1.411 1.493 1.535 1.699 1.757 1.868 1.947 2.037 2.09 2.19 2.295 2.436 2.507 2.572 2.665 2.759 2.839 2.908 2.985 3.087 3.172 3.244 3.33 3.406 3.48 3.552 3.626 3.694 3.748 3.788 3.834 3.865 3.882 3.91 3.902 3.841 3.768 3.621 3.345 2.892 2.126 0.846 -0.7 -1.99 -3.07 -3.969 -4.754 -5.421 -6.007 -6.505 -6.993 -7.408 -7.776 -8.144 -8.495 -8.803 -9.08 -9.37 -9.626 -9.85 -10.095 -10.359 -10.57 -10.791 -11.039 -11.225 -11.407 -11.589 -11.779 -11.991 -12.143 -12.296 -12.525 -12.689 -12.859 -12.942 -13.107 -13.276 -13.45 -13.543 -13.752 -13.797 -13.897 -14.015 -14.265 -14.381 -14.5 -14.656 -14.839 -15.035 -15.224 -15.588 -6 ,31593 ,KEBNE ,16657448,Tue Nov 23 03:57:01 CET,Tue Nov 23 05:20:21 CET,0.0 0.307 0.501 0.64 0.735 0.814 0.882 0.938 1.052 1.115 1.193 1.225 1.377 1.426 1.53 1.635 1.734 1.777 1.859 1.937 2.054 2.132 2.189 2.285 2.378 2.449 2.512 2.554 2.6 2.652 2.709 2.774 2.846 2.917 2.986 3.06 3.126 3.179 3.229 3.276 3.303 3.313 3.288 3.235 3.152 3.029 2.845 2.556 2.108 1.371 0.065 -1.542 -2.822 -3.894 -4.808 -5.624 -6.34 -6.964 -7.492 -8.015 -8.503 -8.952 -9.343 -9.688 -10.015 -10.333 -10.684 -10.965 -11.176 -11.437 -11.722 -11.943 -12.166 -12.401 -12.589 -12.773 -12.947 -13.124 -13.331 -13.484 -13.629 -13.838 -13.979 -14.117 -14.193 -14.352 -14.519 -14.701 -14.793 -15.007 -15.086 -15.197 -15.318 -15.539 -15.669 -15.811 -15.946 -16.08 -16.229 -16.432 -17.009 -7 ,48 ,KEBNE ,16657449,Tue Nov 23 03:58:04 CET,Tue Nov 23 05:20:39 CET,0.0 0.342 0.496 0.613 0.722 0.832 0.933 1.023 1.21 1.29 1.353 1.355 1.517 1.572 1.672 1.759 1.853 1.899 1.981 2.058 2.167 2.235 2.295 2.374 2.456 2.526 2.582 2.646 2.723 2.783 2.851 2.945 3.029 3.108 3.179 3.262 3.345 3.409 3.465 3.518 3.566 3.589 3.583 3.551 3.482 3.375 3.207 2.933 2.466 1.675 0.354 -1.206 -2.52 -3.64 -4.564 -5.359 -6.051 -6.644 -7.172 -7.719 -8.193 -8.63 -9.055 -9.463 -9.836 -10.164 -10.495 -10.793 -11.049 -11.312 -11.58 -11.788 -12.001 -12.228 -12.413 -12.598 -12.781 -12.973 -13.181 -13.329 -13.485 -13.71 -13.87 -14.039 -14.116 -14.3 -14.486 -14.67 -14.782 -15.026 -15.154 -15.27 -15.384 -15.644 -15.767 -15.894 -16.066 -16.27 -16.494 -16.731 -17.403 -8 ,30751 ,KEBNE ,16657450,Tue Nov 23 03:58:04 CET,Tue Nov 23 05:20:31 CET,0.0 0.403 0.576 0.713 0.853 0.975 1.071 1.158 1.321 1.401 1.462 1.481 1.655 1.716 1.822 1.908 1.983 2.022 2.098 2.15 2.212 2.265 2.334 2.419 2.48 2.541 2.601 2.671 2.766 2.833 2.902 2.998 3.077 3.151 3.233 3.297 3.352 3.412 3.458 3.495 3.533 3.57 3.582 3.532 3.46 3.378 3.218 2.926 2.462 1.735 0.476 -1.008 -2.249 -3.34 -4.285 -5.077 -5.761 -6.423 -7.019 -7.643 -8.134 -8.511 -8.864 -9.212 -9.549 -9.837 -10.137 -10.418 -10.661 -10.918 -11.184 -11.401 -11.613 -11.842 -12.021 -12.208 -12.397 -12.577 -12.763 -12.886 -13.014 -13.233 -13.385 -13.536 -13.617 -13.79 -13.968 -14.143 -14.229 -14.451 -14.542 -14.632 -14.725 -14.931 -15.049 -15.175 -15.336 -15.537 -15.742 -15.948 -16.484 -9 ,10830 ,KEBNE ,16657451,Tue Nov 23 03:58:04 CET,Tue Nov 23 05:21:13 CET,0.0 0.32 0.476 0.594 0.685 0.765 0.849 0.936 1.088 1.153 1.21 1.235 1.409 1.469 1.561 1.65 1.735 1.783 1.875 1.939 2.03 2.091 2.148 2.243 2.338 2.416 2.495 2.564 2.636 2.709 2.773 2.845 2.922 3.011 3.087 3.157 3.233 3.295 3.341 3.369 3.391 3.402 3.384 3.351 3.313 3.232 3.075 2.8 2.331 1.543 0.135 -1.469 -2.732 -3.798 -4.733 -5.54 -6.231 -6.844 -7.345 -7.869 -8.352 -8.767 -9.147 -9.509 -9.836 -10.112 -10.393 -10.651 -10.886 -11.155 -11.441 -11.659 -11.87 -12.081 -12.252 -12.435 -12.63 -12.826 -13.016 -13.141 -13.281 -13.505 -13.653 -13.822 -13.903 -14.059 -14.224 -14.402 -14.493 -14.701 -14.766 -14.864 -14.984 -15.249 -15.391 -15.545 -15.714 -15.901 -16.072 -16.316 -16.81 -10 ,29245 ,KEBNE ,16657452,Tue Nov 23 03:59:06 CET,Tue Nov 23 05:21:44 CET,0.0 0.324 0.49 0.601 0.707 0.818 0.927 1.023 1.172 1.24 1.307 1.341 1.513 1.574 1.682 1.784 1.886 1.934 2.014 2.093 2.207 2.273 2.333 2.431 2.525 2.604 2.672 2.747 2.857 2.946 3.031 3.122 3.194 3.254 3.308 3.375 3.45 3.513 3.558 3.59 3.623 3.658 3.665 3.65 3.591 3.477 3.326 3.071 2.595 1.855 0.601 -1.007 -2.359 -3.431 -4.355 -5.255 -6.04 -6.702 -7.255 -7.827 -8.337 -8.768 -9.166 -9.537 -9.884 -10.204 -10.532 -10.848 -11.119 -11.368 -11.621 -11.83 -12.042 -12.272 -12.44 -12.621 -12.823 -13.028 -13.234 -13.362 -13.504 -13.721 -13.863 -14.037 -14.126 -14.289 -14.452 -14.629 -14.723 -14.944 -15.024 -15.135 -15.247 -15.48 -15.613 -15.757 -15.928 -16.113 -16.293 -16.52 -17.194 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_1_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_1_61.txt deleted file mode 100644 index 8f49b2a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_1_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20593 ,KEBNE ,16657453,Tue Nov 23 03:59:06 CET,Tue Nov 23 05:20:35 CET,0.0 0.373 0.519 0.63 0.744 0.86 0.97 1.07 1.237 1.322 1.406 1.475 1.625 1.687 1.807 1.928 2.037 2.087 2.182 2.273 2.404 2.491 2.577 2.712 2.84 2.953 3.067 3.162 3.271 3.372 3.489 3.628 3.744 3.859 3.98 4.112 4.233 4.379 4.544 4.69 4.812 4.94 5.077 5.212 5.381 5.549 5.689 5.767 5.796 5.692 5.192 4.431 3.748 3.106 2.521 2.002 1.567 1.15 0.787 0.423 0.118 -0.154 -0.449 -0.715 -0.97 -1.202 -1.408 -1.597 -1.777 -1.959 -2.13 -2.28 -2.454 -2.626 -2.759 -2.908 -3.051 -3.19 -3.355 -3.484 -3.604 -3.761 -3.866 -3.986 -4.05 -4.197 -4.359 -4.526 -4.618 -4.796 -4.883 -4.98 -5.073 -5.242 -5.342 -5.47 -5.61 -5.764 -5.938 -6.115 -6.468 -2 ,709 ,KEBNE ,16657454,Tue Nov 23 03:59:06 CET,Tue Nov 23 05:22:00 CET,0.0 0.536 0.792 0.983 1.117 1.215 1.32 1.441 1.636 1.719 1.794 1.84 1.995 2.058 2.179 2.304 2.406 2.457 2.564 2.674 2.817 2.9 2.981 3.096 3.214 3.33 3.437 3.539 3.674 3.793 3.894 4.031 4.165 4.278 4.419 4.581 4.719 4.852 4.999 5.148 5.286 5.436 5.596 5.728 5.891 6.054 6.173 6.258 6.27 6.147 5.659 4.895 4.212 3.618 3.091 2.602 2.16 1.754 1.38 1.03 0.723 0.435 0.171 -0.068 -0.289 -0.506 -0.713 -0.887 -1.063 -1.254 -1.443 -1.599 -1.773 -1.949 -2.072 -2.204 -2.338 -2.498 -2.675 -2.786 -2.896 -3.059 -3.161 -3.276 -3.352 -3.508 -3.652 -3.798 -3.872 -4.044 -4.139 -4.232 -4.322 -4.526 -4.63 -4.74 -4.877 -5.045 -5.206 -5.39 -5.662 -3 ,4643 ,KEBNE ,16657455,Tue Nov 23 03:59:06 CET,Tue Nov 23 05:21:50 CET,0.0 0.452 0.621 0.746 0.897 1.019 1.111 1.216 1.418 1.498 1.569 1.648 1.816 1.886 1.997 2.121 2.248 2.302 2.393 2.472 2.592 2.672 2.758 2.882 2.991 3.088 3.181 3.277 3.421 3.572 3.697 3.842 3.991 4.106 4.231 4.36 4.477 4.62 4.767 4.925 5.072 5.219 5.375 5.496 5.666 5.863 5.956 6.027 6.098 5.951 5.491 4.838 4.169 3.559 3.06 2.587 2.155 1.766 1.409 1.055 0.738 0.464 0.198 -0.063 -0.313 -0.555 -0.815 -1.029 -1.196 -1.371 -1.561 -1.725 -1.892 -2.056 -2.176 -2.313 -2.459 -2.6 -2.75 -2.849 -2.951 -3.139 -3.278 -3.409 -3.467 -3.586 -3.717 -3.852 -3.93 -4.108 -4.169 -4.248 -4.34 -4.527 -4.621 -4.746 -4.896 -5.046 -5.209 -5.459 -5.969 -4 ,1076 ,KEBNE ,16657456,Tue Nov 23 03:59:06 CET,Tue Nov 23 05:22:46 CET,0.0 0.293 0.452 0.587 0.716 0.828 0.932 1.036 1.217 1.29 1.36 1.391 1.533 1.604 1.752 1.869 1.964 2.015 2.112 2.208 2.354 2.439 2.507 2.614 2.728 2.825 2.928 3.036 3.176 3.316 3.426 3.541 3.674 3.815 3.978 4.175 4.352 4.495 4.643 4.815 4.963 5.118 5.308 5.457 5.582 5.707 5.825 5.891 5.843 5.577 5.015 4.22 3.539 2.927 2.333 1.799 1.346 0.888 0.468 0.063 -0.279 -0.569 -0.843 -1.098 -1.337 -1.553 -1.776 -1.965 -2.144 -2.344 -2.541 -2.701 -2.865 -3.031 -3.181 -3.363 -3.534 -3.703 -3.889 -4.012 -4.134 -4.314 -4.426 -4.548 -4.616 -4.776 -4.953 -5.124 -5.207 -5.384 -5.485 -5.574 -5.668 -5.898 -6.021 -6.136 -6.271 -6.45 -6.621 -6.816 -7.202 -5 ,7667 ,KEBNE ,16657457,Tue Nov 23 03:59:06 CET,Tue Nov 23 05:24:06 CET,0.0 0.3 0.446 0.564 0.667 0.765 0.862 0.945 1.093 1.162 1.232 1.29 1.445 1.513 1.643 1.751 1.843 1.889 1.981 2.076 2.224 2.323 2.41 2.523 2.639 2.751 2.85 2.943 3.048 3.144 3.244 3.362 3.474 3.588 3.731 3.872 3.993 4.139 4.297 4.431 4.56 4.707 4.865 5.001 5.133 5.285 5.43 5.501 5.482 5.343 4.94 4.254 3.581 2.973 2.44 1.924 1.456 1.068 0.739 0.367 0.051 -0.221 -0.481 -0.717 -0.941 -1.163 -1.395 -1.605 -1.792 -1.98 -2.186 -2.359 -2.538 -2.722 -2.874 -3.027 -3.174 -3.328 -3.469 -3.569 -3.678 -3.831 -3.931 -4.035 -4.091 -4.205 -4.313 -4.432 -4.51 -4.686 -4.757 -4.852 -4.946 -5.135 -5.244 -5.367 -5.503 -5.627 -5.785 -6.016 -6.635 -6 ,28229 ,KEBNE ,16657458,Tue Nov 23 04:00:07 CET,Tue Nov 23 05:21:32 CET,0.0 0.274 0.455 0.625 0.759 0.856 0.946 1.029 1.21 1.297 1.376 1.46 1.627 1.711 1.859 1.955 2.065 2.122 2.228 2.335 2.456 2.528 2.612 2.744 2.86 2.961 3.065 3.154 3.26 3.373 3.481 3.617 3.763 3.888 4.016 4.157 4.285 4.434 4.594 4.745 4.893 5.05 5.244 5.423 5.602 5.759 5.892 6.027 6.138 6.103 5.734 5.069 4.421 3.821 3.322 2.847 2.364 1.934 1.586 1.23 0.923 0.652 0.372 0.111 -0.13 -0.384 -0.641 -0.836 -0.994 -1.164 -1.353 -1.507 -1.662 -1.838 -1.971 -2.089 -2.219 -2.359 -2.501 -2.593 -2.704 -2.911 -3.052 -3.203 -3.281 -3.44 -3.598 -3.751 -3.831 -3.999 -4.077 -4.17 -4.264 -4.494 -4.618 -4.734 -4.859 -5.015 -5.188 -5.393 -5.835 -7 ,30831 ,KEBNE ,16657459,Tue Nov 23 04:00:07 CET,Tue Nov 23 05:21:58 CET,0.0 0.676 0.908 1.064 1.176 1.271 1.367 1.455 1.608 1.692 1.778 1.84 1.988 2.046 2.169 2.287 2.392 2.441 2.529 2.624 2.785 2.881 2.964 3.07 3.173 3.273 3.37 3.468 3.594 3.722 3.858 4.011 4.148 4.269 4.401 4.567 4.723 4.872 5.035 5.191 5.331 5.493 5.674 5.824 5.962 6.078 6.139 6.184 6.193 6.076 5.708 5.051 4.396 3.784 3.246 2.761 2.329 1.951 1.575 1.14 0.78 0.481 0.211 -0.034 -0.255 -0.461 -0.674 -0.894 -1.103 -1.314 -1.524 -1.672 -1.814 -1.97 -2.089 -2.207 -2.337 -2.489 -2.653 -2.759 -2.867 -3.021 -3.133 -3.265 -3.333 -3.469 -3.592 -3.724 -3.8 -3.973 -4.049 -4.153 -4.274 -4.495 -4.612 -4.736 -4.861 -5.013 -5.203 -5.454 -5.961 -8 ,10417 ,KEBNE ,16657460,Tue Nov 23 04:00:07 CET,Tue Nov 23 05:24:10 CET,0.0 0.426 0.608 0.741 0.86 0.966 1.055 1.133 1.324 1.412 1.474 1.502 1.658 1.735 1.873 1.996 2.101 2.15 2.253 2.352 2.473 2.558 2.649 2.771 2.884 2.996 3.102 3.209 3.349 3.461 3.576 3.727 3.861 3.992 4.149 4.302 4.439 4.591 4.732 4.859 5.006 5.186 5.355 5.51 5.688 5.84 5.966 6.044 6.053 5.928 5.509 4.836 4.137 3.503 2.962 2.453 2.01 1.604 1.25 0.893 0.554 0.242 -0.034 -0.292 -0.531 -0.746 -0.968 -1.167 -1.341 -1.522 -1.709 -1.874 -2.05 -2.216 -2.358 -2.529 -2.707 -2.872 -3.03 -3.141 -3.255 -3.442 -3.583 -3.734 -3.808 -3.941 -4.075 -4.233 -4.317 -4.492 -4.552 -4.63 -4.719 -4.926 -5.052 -5.183 -5.31 -5.458 -5.615 -5.834 -6.414 -9 ,24935 ,KEBNE ,16657461,Tue Nov 23 04:00:07 CET,Tue Nov 23 05:21:12 CET,0.0 0.246 0.389 0.522 0.655 0.775 0.879 0.983 1.16 1.237 1.332 1.438 1.598 1.663 1.78 1.892 2.006 2.059 2.156 2.251 2.386 2.466 2.546 2.668 2.792 2.911 3.022 3.118 3.231 3.335 3.428 3.548 3.69 3.833 3.976 4.113 4.244 4.402 4.553 4.714 4.891 5.044 5.189 5.336 5.509 5.658 5.782 5.845 5.842 5.758 5.352 4.635 4.013 3.459 2.936 2.44 1.961 1.526 1.167 0.829 0.522 0.244 -0.039 -0.319 -0.579 -0.845 -1.123 -1.348 -1.528 -1.715 -1.906 -2.06 -2.234 -2.409 -2.52 -2.644 -2.793 -2.959 -3.135 -3.244 -3.349 -3.545 -3.699 -3.852 -3.928 -4.074 -4.212 -4.339 -4.405 -4.575 -4.636 -4.714 -4.81 -5.022 -5.133 -5.252 -5.378 -5.497 -5.645 -5.834 -6.147 -10 ,18714 ,KEBNE ,16657462,Tue Nov 23 04:00:11 CET,Tue Nov 23 05:24:09 CET,0.0 0.32 0.458 0.592 0.712 0.825 0.943 1.06 1.25 1.326 1.396 1.441 1.597 1.673 1.812 1.934 2.038 2.089 2.19 2.281 2.416 2.5 2.58 2.705 2.814 2.911 2.996 3.074 3.183 3.294 3.407 3.546 3.683 3.821 3.965 4.094 4.216 4.352 4.482 4.614 4.79 4.988 5.162 5.331 5.519 5.658 5.764 5.831 5.803 5.648 5.208 4.511 3.826 3.217 2.698 2.206 1.767 1.394 1.091 0.776 0.466 0.186 -0.086 -0.368 -0.631 -0.857 -1.082 -1.301 -1.511 -1.712 -1.899 -2.052 -2.223 -2.398 -2.535 -2.671 -2.781 -2.928 -3.128 -3.259 -3.375 -3.543 -3.67 -3.805 -3.871 -4.018 -4.169 -4.325 -4.414 -4.594 -4.658 -4.745 -4.842 -5.009 -5.104 -5.233 -5.361 -5.515 -5.687 -5.858 -6.415 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_1_84.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_1_84.txt deleted file mode 100644 index 1d2b89b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_1_84.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26255 ,KEBNE ,16657463,Tue Nov 23 04:01:09 CET,Tue Nov 23 05:21:06 CET,0.0 0.681 0.844 0.959 1.073 1.211 1.332 1.427 1.627 1.724 1.805 1.895 2.069 2.146 2.317 2.479 2.624 2.698 2.829 2.953 3.139 3.261 3.384 3.555 3.741 3.917 4.057 4.185 4.363 4.534 4.693 4.909 5.12 5.311 5.53 5.783 6.046 6.363 6.699 7.042 7.405 7.829 8.341 8.855 9.455 10.124 10.889 11.776 12.852 14.146 15.705 17.016 17.733 18.092 18.252 18.359 18.461 18.506 18.483 18.422 18.363 18.291 18.201 18.119 18.038 17.948 17.849 17.769 17.706 17.623 17.524 17.447 17.358 17.245 17.147 17.052 16.959 16.857 16.748 16.667 16.596 16.499 16.419 16.326 16.282 16.204 16.113 16.009 15.957 15.839 15.79 15.712 15.626 15.462 15.376 15.268 15.131 14.957 14.764 14.559 13.87 -2 ,32356 ,KEBNE ,16657464,Tue Nov 23 04:01:13 CET,Tue Nov 23 05:22:55 CET,0.0 0.428 0.706 0.92 1.075 1.202 1.32 1.436 1.641 1.721 1.798 1.868 2.032 2.113 2.259 2.391 2.52 2.581 2.701 2.823 2.996 3.112 3.221 3.362 3.508 3.667 3.824 3.973 4.17 4.374 4.567 4.786 5.014 5.236 5.49 5.759 6.015 6.33 6.658 6.992 7.378 7.836 8.38 8.92 9.533 10.223 10.987 11.867 12.947 14.202 15.761 17.043 17.772 18.087 18.19 18.245 18.276 18.274 18.219 18.145 18.041 17.936 17.854 17.761 17.655 17.525 17.375 17.252 17.152 17.035 16.904 16.797 16.687 16.572 16.487 16.39 16.291 16.196 16.078 15.997 15.918 15.779 15.677 15.584 15.538 15.423 15.299 15.194 15.139 14.998 14.909 14.837 14.776 14.616 14.515 14.409 14.283 14.141 13.963 13.687 13.281 -3 ,10795 ,KEBNE ,16657465,Tue Nov 23 04:01:09 CET,Tue Nov 23 05:22:16 CET,0.0 0.621 0.816 0.935 1.054 1.186 1.293 1.386 1.551 1.634 1.729 1.838 2.007 2.079 2.202 2.327 2.461 2.527 2.659 2.772 2.934 3.051 3.159 3.315 3.471 3.626 3.785 3.943 4.144 4.335 4.512 4.731 4.94 5.143 5.398 5.694 5.96 6.257 6.591 6.952 7.358 7.832 8.399 8.967 9.626 10.396 11.28 12.236 13.36 14.663 16.022 17.074 17.674 17.999 18.127 18.176 18.225 18.212 18.159 18.1 18.027 17.955 17.882 17.808 17.735 17.656 17.559 17.47 17.394 17.294 17.172 17.082 16.997 16.895 16.815 16.732 16.633 16.531 16.421 16.338 16.255 16.121 16.025 15.921 15.867 15.744 15.606 15.456 15.368 15.213 15.136 15.058 14.981 14.8 14.683 14.553 14.419 14.276 14.112 13.854 13.224 -4 ,10377 ,KEBNE ,16657466,Tue Nov 23 04:01:09 CET,Tue Nov 23 05:22:28 CET,0.0 0.427 0.596 0.771 0.938 1.068 1.161 1.257 1.448 1.538 1.626 1.717 1.881 1.954 2.107 2.262 2.404 2.474 2.606 2.729 2.908 3.02 3.138 3.308 3.473 3.642 3.799 3.95 4.156 4.353 4.539 4.773 5.007 5.229 5.489 5.787 6.082 6.417 6.784 7.164 7.569 8.019 8.558 9.142 9.811 10.553 11.399 12.367 13.465 14.78 16.487 17.808 18.599 19.08 19.269 19.309 19.3 19.273 19.212 19.099 18.965 18.857 18.763 18.656 18.55 18.436 18.309 18.198 18.102 17.999 17.89 17.801 17.706 17.598 17.504 17.411 17.325 17.231 17.125 17.056 16.976 16.838 16.764 16.696 16.657 16.573 16.473 16.352 16.289 16.151 16.069 15.984 15.898 15.733 15.638 15.525 15.396 15.277 15.122 14.815 14.209 -5 ,24517 ,KEBNE ,16657467,Tue Nov 23 04:01:09 CET,Tue Nov 23 05:23:16 CET,0.0 0.299 0.481 0.611 0.707 0.82 0.93 1.023 1.211 1.292 1.368 1.467 1.639 1.721 1.881 2.015 2.153 2.225 2.352 2.474 2.646 2.753 2.864 3.026 3.183 3.342 3.503 3.664 3.867 4.051 4.232 4.442 4.652 4.861 5.101 5.378 5.637 5.9 6.182 6.508 6.871 7.292 7.795 8.319 8.982 9.724 10.617 11.699 12.991 14.495 16.149 17.435 18.202 18.603 18.755 18.827 18.792 18.691 18.593 18.449 18.344 18.279 18.208 18.147 18.083 17.993 17.885 17.775 17.664 17.543 17.422 17.321 17.208 17.096 17.011 16.914 16.805 16.694 16.577 16.495 16.411 16.288 16.212 16.124 16.075 15.973 15.869 15.767 15.701 15.562 15.459 15.363 15.282 15.133 15.039 14.921 14.794 14.655 14.481 14.244 13.814 -6 ,7762 ,KEBNE ,16657468,Tue Nov 23 04:01:11 CET,Tue Nov 23 05:22:28 CET,0.0 0.634 0.847 1.01 1.119 1.228 1.331 1.433 1.636 1.719 1.796 1.875 2.039 2.117 2.277 2.431 2.571 2.637 2.761 2.884 3.062 3.177 3.286 3.458 3.635 3.795 3.95 4.099 4.3 4.506 4.7 4.945 5.195 5.423 5.68 5.979 6.269 6.609 6.974 7.353 7.757 8.209 8.748 9.303 9.963 10.705 11.563 12.534 13.675 15.011 16.638 18.025 18.643 18.944 19.11 19.124 19.116 19.082 18.985 18.844 18.701 18.576 18.455 18.333 18.21 18.09 17.954 17.814 17.686 17.567 17.453 17.353 17.255 17.15 17.052 16.954 16.848 16.728 16.609 16.533 16.462 16.362 16.278 16.162 16.104 15.996 15.872 15.749 15.684 15.543 15.446 15.365 15.296 15.113 14.999 14.889 14.779 14.661 14.49 14.213 13.603 -7 ,20031 ,KEBNE ,16657469,Tue Nov 23 04:01:09 CET,Tue Nov 23 05:23:49 CET,0.0 0.773 0.965 1.114 1.253 1.374 1.492 1.607 1.815 1.911 2.002 2.087 2.25 2.32 2.473 2.626 2.772 2.847 2.994 3.125 3.298 3.412 3.525 3.7 3.87 4.021 4.172 4.327 4.525 4.717 4.905 5.135 5.353 5.57 5.838 6.139 6.421 6.737 7.09 7.461 7.835 8.266 8.8 9.351 9.983 10.665 11.459 12.352 13.471 14.891 16.627 18.079 18.897 19.346 19.602 19.776 19.82 19.793 19.705 19.568 19.47 19.384 19.304 19.229 19.139 19.032 18.888 18.748 18.633 18.518 18.387 18.263 18.137 18.017 17.921 17.823 17.716 17.601 17.491 17.416 17.331 17.188 17.088 16.993 16.948 16.842 16.712 16.587 16.529 16.392 16.304 16.215 16.126 15.953 15.835 15.697 15.573 15.43 15.247 14.996 14.413 -8 ,19589 ,KEBNE ,16657470,Tue Nov 23 04:02:12 CET,Tue Nov 23 05:23:58 CET,0.0 0.322 0.45 0.57 0.689 0.79 0.888 0.979 1.185 1.293 1.385 1.464 1.619 1.688 1.839 1.979 2.102 2.165 2.292 2.418 2.59 2.697 2.818 3.007 3.175 3.321 3.472 3.633 3.838 4.025 4.205 4.444 4.674 4.878 5.11 5.386 5.654 5.943 6.284 6.66 7.049 7.513 8.057 8.608 9.272 9.981 10.814 11.717 12.735 14.02 15.547 16.813 17.485 17.861 18.095 18.183 18.209 18.199 18.08 17.899 17.782 17.686 17.579 17.471 17.355 17.227 17.093 16.983 16.887 16.782 16.669 16.566 16.434 16.314 16.225 16.109 15.975 15.851 15.742 15.667 15.585 15.432 15.324 15.229 15.184 15.074 14.938 14.8 14.73 14.592 14.523 14.445 14.359 14.184 14.086 13.983 13.872 13.74 13.573 13.318 12.555 -9 ,3478 ,KEBNE ,16657471,Tue Nov 23 04:02:12 CET,Tue Nov 23 05:23:50 CET,0.0 0.191 0.342 0.517 0.659 0.768 0.855 0.936 1.107 1.192 1.287 1.384 1.537 1.618 1.802 1.963 2.098 2.163 2.287 2.406 2.591 2.712 2.821 2.986 3.153 3.305 3.45 3.599 3.798 3.98 4.157 4.397 4.632 4.85 5.1 5.369 5.635 5.944 6.289 6.658 7.029 7.446 7.955 8.502 9.149 9.863 10.662 11.504 12.422 13.43 14.556 15.419 15.914 16.135 16.125 16.07 16.033 16.005 15.994 15.967 15.903 15.806 15.702 15.592 15.496 15.402 15.283 15.183 15.085 14.977 14.875 14.783 14.668 14.536 14.433 14.325 14.219 14.112 13.995 13.912 13.823 13.69 13.603 13.493 13.433 13.313 13.178 13.03 12.959 12.819 12.724 12.635 12.554 12.415 12.318 12.192 12.066 11.939 11.801 11.588 11.193 -10 ,2426 ,KEBNE ,16657472,Tue Nov 23 04:02:12 CET,Tue Nov 23 05:23:28 CET,0.0 0.339 0.503 0.642 0.759 0.879 1.009 1.117 1.305 1.404 1.497 1.584 1.743 1.815 1.946 2.069 2.215 2.29 2.424 2.549 2.731 2.85 2.967 3.134 3.298 3.455 3.599 3.743 3.946 4.149 4.347 4.587 4.812 5.015 5.261 5.552 5.83 6.136 6.481 6.865 7.278 7.754 8.292 8.84 9.518 10.231 10.996 11.906 12.987 14.188 15.576 16.694 17.353 17.748 17.928 17.928 17.833 17.776 17.73 17.636 17.537 17.438 17.324 17.216 17.112 16.999 16.867 16.715 16.575 16.445 16.327 16.227 16.12 16.002 15.896 15.781 15.676 15.575 15.463 15.384 15.3 15.167 15.079 14.982 14.923 14.783 14.642 14.523 14.462 14.314 14.207 14.105 13.998 13.787 13.671 13.548 13.431 13.271 13.098 12.942 12.543 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_206_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_206_163.txt deleted file mode 100644 index d9042975..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_206_163.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27332 ,KEBNE ,16657473,Tue Nov 23 04:02:12 CET,Tue Nov 23 05:26:06 CET,0.0 0.314 0.468 0.577 0.664 0.746 0.834 0.919 1.049 1.12 1.18 1.163 1.326 1.384 1.506 1.609 1.697 1.745 1.847 1.941 2.056 2.119 2.177 2.283 2.396 2.501 2.585 2.668 2.782 2.904 3.027 3.134 3.217 3.32 3.44 3.547 3.649 3.754 3.862 3.972 4.087 4.207 4.331 4.441 4.528 4.608 4.678 4.674 4.562 4.257 3.486 2.31 1.322 0.473 -0.3 -0.972 -1.579 -2.162 -2.657 -3.151 -3.564 -3.921 -4.299 -4.669 -4.988 -5.271 -5.554 -5.815 -6.049 -6.304 -6.578 -6.784 -6.99 -7.24 -7.432 -7.624 -7.844 -8.073 -8.315 -8.481 -8.661 -8.95 -9.138 -9.321 -9.411 -9.612 -9.834 -10.077 -10.21 -10.466 -10.615 -10.773 -10.946 -11.306 -11.501 -11.693 -11.907 -12.159 -12.428 -12.768 -13.972 -2 ,11207 ,KEBNE ,16657474,Tue Nov 23 04:02:11 CET,Tue Nov 23 05:24:40 CET,0.0 0.295 0.442 0.559 0.643 0.75 0.847 0.927 1.075 1.141 1.208 1.227 1.408 1.472 1.577 1.67 1.764 1.811 1.923 2.042 2.18 2.262 2.347 2.471 2.581 2.683 2.799 2.908 3.036 3.152 3.249 3.369 3.496 3.6 3.716 3.847 3.978 4.133 4.281 4.424 4.571 4.736 4.905 5.041 5.158 5.238 5.283 5.29 5.258 5.077 4.442 3.409 2.443 1.546 0.787 0.086 -0.548 -1.098 -1.573 -2.101 -2.564 -2.946 -3.304 -3.637 -3.946 -4.241 -4.559 -4.85 -5.097 -5.344 -5.6 -5.81 -6.025 -6.258 -6.439 -6.626 -6.814 -7.006 -7.223 -7.365 -7.51 -7.753 -7.931 -8.11 -8.197 -8.376 -8.572 -8.783 -8.89 -9.136 -9.289 -9.429 -9.582 -9.941 -10.134 -10.317 -10.51 -10.751 -11.06 -11.462 -12.469 -3 ,24907 ,KEBNE ,16657475,Tue Nov 23 04:02:11 CET,Tue Nov 23 05:24:30 CET,0.0 0.302 0.539 0.743 0.898 1.008 1.105 1.205 1.383 1.462 1.536 1.581 1.758 1.818 1.951 2.078 2.194 2.246 2.35 2.434 2.547 2.62 2.7 2.847 2.99 3.115 3.222 3.311 3.424 3.543 3.665 3.821 3.977 4.111 4.261 4.416 4.572 4.746 4.893 5.041 5.201 5.36 5.54 5.706 5.864 6.023 6.158 6.225 6.2 5.931 5.214 4.189 3.271 2.437 1.701 1.079 0.537 0.033 -0.426 -0.899 -1.286 -1.639 -2.016 -2.376 -2.695 -2.989 -3.299 -3.562 -3.791 -4.039 -4.284 -4.489 -4.709 -4.931 -5.108 -5.3 -5.509 -5.726 -5.946 -6.099 -6.244 -6.477 -6.649 -6.824 -6.917 -7.103 -7.29 -7.488 -7.608 -7.849 -7.952 -8.082 -8.245 -8.584 -8.749 -8.932 -9.135 -9.332 -9.583 -9.915 -10.807 -4 ,10105 ,KEBNE ,16657476,Tue Nov 23 04:03:14 CET,Tue Nov 23 05:25:00 CET,0.0 0.398 0.547 0.675 0.792 0.895 0.995 1.09 1.259 1.328 1.393 1.42 1.595 1.652 1.756 1.844 1.928 1.984 2.093 2.173 2.294 2.377 2.468 2.599 2.7 2.782 2.855 2.934 3.042 3.141 3.228 3.319 3.414 3.51 3.608 3.707 3.81 3.922 4.058 4.196 4.314 4.436 4.585 4.739 4.871 4.952 5.006 5.016 4.951 4.72 4.129 3.174 2.266 1.429 0.687 0.02 -0.582 -1.109 -1.543 -2.045 -2.536 -2.96 -3.34 -3.688 -3.985 -4.259 -4.573 -4.89 -5.171 -5.421 -5.687 -5.909 -6.11 -6.328 -6.511 -6.704 -6.881 -7.054 -7.254 -7.41 -7.585 -7.855 -8.037 -8.219 -8.315 -8.512 -8.716 -8.949 -9.072 -9.302 -9.401 -9.517 -9.636 -9.883 -10.026 -10.189 -10.358 -10.541 -10.735 -11.031 -11.811 -5 ,28376 ,KEBNE ,16657477,Tue Nov 23 04:03:14 CET,Tue Nov 23 05:26:46 CET,0.0 0.205 0.399 0.573 0.703 0.798 0.874 0.939 1.049 1.116 1.192 1.207 1.381 1.435 1.564 1.681 1.774 1.822 1.914 2.005 2.124 2.2 2.271 2.377 2.487 2.585 2.685 2.768 2.88 2.993 3.086 3.199 3.307 3.401 3.507 3.621 3.718 3.812 3.937 4.082 4.206 4.327 4.467 4.587 4.688 4.791 4.883 4.911 4.828 4.488 3.684 2.494 1.458 0.612 -0.161 -0.892 -1.562 -2.163 -2.645 -3.147 -3.589 -3.978 -4.357 -4.694 -5.005 -5.324 -5.65 -5.925 -6.171 -6.443 -6.726 -6.946 -7.171 -7.414 -7.601 -7.787 -7.984 -8.179 -8.369 -8.508 -8.663 -8.914 -9.09 -9.265 -9.364 -9.574 -9.773 -9.99 -10.106 -10.347 -10.483 -10.635 -10.785 -11.065 -11.215 -11.39 -11.601 -11.845 -12.121 -12.449 -13.285 -6 ,14375 ,KEBNE ,16657478,Tue Nov 23 04:03:14 CET,Tue Nov 23 05:25:02 CET,0.0 0.425 0.644 0.816 0.951 1.034 1.127 1.224 1.375 1.454 1.537 1.577 1.765 1.826 1.945 2.058 2.151 2.209 2.35 2.474 2.6 2.686 2.784 2.924 3.052 3.156 3.254 3.361 3.489 3.595 3.687 3.794 3.898 4.0 4.108 4.235 4.371 4.487 4.6 4.732 4.848 4.954 5.088 5.23 5.33 5.394 5.42 5.391 5.299 5.066 4.418 3.478 2.65 1.854 1.114 0.407 -0.202 -0.746 -1.267 -1.795 -2.251 -2.653 -3.008 -3.324 -3.622 -3.904 -4.191 -4.456 -4.682 -4.904 -5.15 -5.372 -5.613 -5.841 -6.003 -6.178 -6.365 -6.572 -6.787 -6.928 -7.075 -7.317 -7.494 -7.671 -7.761 -7.958 -8.173 -8.398 -8.507 -8.738 -8.851 -8.992 -9.139 -9.406 -9.562 -9.739 -9.907 -10.12 -10.408 -10.75 -11.867 -7 ,3746 ,KEBNE ,16657479,Tue Nov 23 04:03:14 CET,Tue Nov 23 05:26:46 CET,0.0 0.521 0.667 0.811 0.925 1.016 1.101 1.184 1.339 1.408 1.472 1.461 1.626 1.679 1.774 1.858 1.942 1.988 2.088 2.188 2.329 2.408 2.481 2.604 2.711 2.793 2.872 2.951 3.059 3.164 3.259 3.374 3.482 3.591 3.733 3.872 3.973 4.07 4.169 4.268 4.367 4.49 4.638 4.77 4.906 5.03 5.126 5.153 5.1 4.872 4.243 3.369 2.533 1.729 1.021 0.412 -0.136 -0.659 -1.111 -1.55 -1.89 -2.207 -2.557 -2.87 -3.162 -3.438 -3.737 -4.024 -4.276 -4.522 -4.781 -4.999 -5.236 -5.495 -5.68 -5.874 -6.076 -6.279 -6.497 -6.661 -6.824 -7.073 -7.248 -7.418 -7.503 -7.682 -7.865 -8.048 -8.153 -8.386 -8.499 -8.628 -8.765 -9.088 -9.257 -9.424 -9.612 -9.839 -10.111 -10.497 -11.245 -8 ,2399 ,KEBNE ,16657480,Tue Nov 23 04:03:14 CET,Tue Nov 23 05:28:56 CET,0.0 0.488 0.675 0.803 0.895 0.991 1.11 1.226 1.421 1.503 1.562 1.566 1.739 1.787 1.904 2.032 2.148 2.198 2.279 2.351 2.488 2.579 2.655 2.777 2.894 2.983 3.065 3.155 3.258 3.368 3.473 3.571 3.66 3.741 3.834 3.952 4.069 4.195 4.313 4.413 4.518 4.627 4.762 4.903 5.027 5.115 5.155 5.128 4.972 4.645 4.003 3.041 2.17 1.376 0.623 -0.105 -0.697 -1.189 -1.631 -2.1 -2.508 -2.87 -3.241 -3.596 -3.908 -4.196 -4.507 -4.794 -5.039 -5.276 -5.544 -5.794 -6.045 -6.306 -6.507 -6.712 -6.933 -7.147 -7.393 -7.577 -7.764 -8.039 -8.207 -8.401 -8.508 -8.703 -8.903 -9.114 -9.22 -9.443 -9.546 -9.676 -9.832 -10.186 -10.369 -10.559 -10.783 -11.042 -11.299 -11.624 -12.767 -9 ,21029 ,KEBNE ,16657481,Tue Nov 23 04:03:14 CET,Tue Nov 23 05:26:00 CET,0.0 0.312 0.433 0.586 0.713 0.815 0.918 1.013 1.16 1.221 1.292 1.297 1.462 1.525 1.658 1.785 1.893 1.941 2.04 2.135 2.264 2.342 2.418 2.542 2.66 2.762 2.85 2.941 3.06 3.19 3.309 3.427 3.547 3.669 3.824 3.988 4.126 4.28 4.461 4.648 4.815 4.991 5.161 5.304 5.467 5.645 5.81 5.915 5.913 5.66 4.997 4.049 3.052 2.178 1.466 0.79 0.17 -0.366 -0.825 -1.305 -1.721 -2.078 -2.439 -2.792 -3.111 -3.414 -3.748 -4.014 -4.224 -4.447 -4.688 -4.89 -5.112 -5.359 -5.534 -5.712 -5.92 -6.139 -6.352 -6.498 -6.641 -6.876 -7.048 -7.22 -7.317 -7.532 -7.773 -8.003 -8.109 -8.355 -8.518 -8.665 -8.807 -9.097 -9.264 -9.422 -9.602 -9.839 -10.122 -10.498 -11.438 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_206_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_206_252.txt deleted file mode 100644 index a43b7748..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_206_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19836 ,KEBNE ,17069403,Fri Dec 24 03:11:26 CET,Fri Dec 24 04:35:58 CET,0.0 0.495 0.711 0.852 0.984 1.105 1.207 1.296 1.485 1.566 1.628 1.639 1.807 1.866 1.976 2.082 2.19 2.236 2.319 2.391 2.499 2.562 2.629 2.734 2.818 2.904 2.979 3.053 3.159 3.239 3.308 3.405 3.505 3.58 3.668 3.76 3.834 3.916 3.991 4.053 4.106 4.179 4.249 4.285 4.304 4.264 4.125 3.886 3.479 2.809 1.616 0.069 -1.33 -2.543 -3.575 -4.539 -5.403 -6.219 -6.976 -7.747 -8.37 -8.922 -9.45 -9.928 -10.376 -10.791 -11.212 -11.591 -11.94 -12.313 -12.692 -13.001 -13.324 -13.658 -13.916 -14.172 -14.432 -14.73 -15.07 -15.292 -15.494 -15.822 -16.07 -16.326 -16.45 -16.702 -16.985 -17.282 -17.442 -17.748 -18.0 -18.198 -18.402 -18.833 -19.076 -19.349 -19.665 -20.04 -20.469 -21.069 -22.534 -2 ,8367 ,KEBNE ,17069405,Fri Dec 24 03:28:22 CET,Fri Dec 24 04:53:23 CET,0.0 0.228 0.425 0.593 0.72 0.82 0.925 1.025 1.203 1.288 1.36 1.403 1.594 1.661 1.78 1.875 1.968 2.018 2.102 2.17 2.272 2.326 2.366 2.44 2.533 2.61 2.684 2.762 2.854 2.932 3.009 3.117 3.2 3.262 3.324 3.383 3.438 3.496 3.548 3.604 3.644 3.661 3.658 3.636 3.616 3.544 3.349 3.04 2.537 1.687 0.193 -1.731 -3.381 -4.756 -5.889 -6.861 -7.707 -8.516 -9.213 -9.848 -10.396 -10.902 -11.358 -11.779 -12.171 -12.541 -12.923 -13.26 -13.572 -13.894 -14.212 -14.476 -14.776 -15.086 -15.31 -15.537 -15.782 -16.06 -16.363 -16.574 -16.799 -17.151 -17.388 -17.621 -17.738 -18.002 -18.302 -18.614 -18.766 -19.05 -19.249 -19.434 -19.622 -20.028 -20.245 -20.473 -20.755 -21.093 -21.424 -21.798 -23.303 -3 ,20200 ,KEBNE ,17069406,Fri Dec 24 03:29:24 CET,Fri Dec 24 04:54:00 CET,0.0 0.212 0.42 0.574 0.698 0.799 0.877 0.957 1.113 1.185 1.255 1.29 1.484 1.545 1.628 1.728 1.848 1.903 1.994 2.091 2.223 2.293 2.367 2.477 2.575 2.671 2.77 2.872 3.002 3.102 3.186 3.279 3.365 3.475 3.583 3.654 3.712 3.778 3.851 3.921 3.967 3.992 4.014 4.023 4.024 4.008 3.867 3.546 2.993 2.081 0.432 -1.66 -3.385 -4.819 -6.0 -7.08 -8.006 -8.827 -9.57 -10.335 -11.005 -11.572 -12.085 -12.558 -13.01 -13.435 -13.868 -14.242 -14.571 -14.929 -15.286 -15.571 -15.878 -16.204 -16.458 -16.708 -16.963 -17.243 -17.543 -17.732 -17.925 -18.251 -18.478 -18.721 -18.853 -19.117 -19.377 -19.657 -19.804 -20.095 -20.287 -20.456 -20.645 -21.024 -21.219 -21.452 -21.714 -22.041 -22.472 -23.049 -24.419 -4 ,21658 ,KEBNE ,17069407,Fri Dec 24 03:31:29 CET,Fri Dec 24 04:55:50 CET,0.0 0.202 0.377 0.53 0.67 0.783 0.893 0.991 1.135 1.19 1.247 1.285 1.453 1.507 1.612 1.707 1.797 1.837 1.921 2.005 2.113 2.17 2.226 2.321 2.393 2.451 2.52 2.587 2.667 2.737 2.818 2.913 2.988 3.054 3.13 3.226 3.3 3.367 3.441 3.499 3.551 3.6 3.611 3.576 3.496 3.366 3.212 3.035 2.652 1.981 0.73 -0.911 -2.215 -3.381 -4.416 -5.308 -6.108 -6.829 -7.439 -8.069 -8.621 -9.119 -9.625 -10.104 -10.516 -10.892 -11.305 -11.665 -11.971 -12.301 -12.648 -12.924 -13.197 -13.482 -13.72 -13.992 -14.258 -14.514 -14.807 -15.026 -15.252 -15.579 -15.815 -16.061 -16.179 -16.429 -16.698 -16.983 -17.127 -17.419 -17.638 -17.817 -18.009 -18.401 -18.633 -18.904 -19.17 -19.442 -19.787 -20.297 -22.697 -5 ,32328 ,KEBNE ,17069408,Fri Dec 24 03:31:29 CET,Fri Dec 24 04:56:35 CET,0.0 0.274 0.495 0.666 0.79 0.933 1.048 1.129 1.267 1.326 1.402 1.446 1.621 1.676 1.771 1.863 1.962 2.014 2.11 2.195 2.324 2.392 2.452 2.534 2.624 2.717 2.801 2.882 2.976 3.06 3.145 3.249 3.35 3.439 3.525 3.661 3.781 3.859 3.945 4.036 4.112 4.202 4.306 4.357 4.345 4.292 4.235 4.074 3.73 3.073 1.855 0.412 -0.839 -1.982 -2.98 -3.871 -4.634 -5.352 -6.005 -6.641 -7.209 -7.702 -8.144 -8.555 -8.955 -9.339 -9.704 -10.01 -10.298 -10.599 -10.91 -11.175 -11.431 -11.691 -11.895 -12.113 -12.341 -12.59 -12.847 -13.001 -13.166 -13.432 -13.6 -13.779 -13.881 -14.087 -14.303 -14.545 -14.676 -14.94 -15.118 -15.275 -15.432 -15.785 -15.989 -16.21 -16.453 -16.77 -17.143 -17.632 -19.828 -6 ,18379 ,KEBNE ,17069409,Fri Dec 24 03:31:29 CET,Fri Dec 24 04:55:49 CET,0.0 0.371 0.532 0.652 0.756 0.861 0.953 1.048 1.267 1.361 1.449 1.509 1.707 1.778 1.888 1.995 2.093 2.141 2.238 2.313 2.41 2.491 2.59 2.718 2.82 2.91 2.984 3.054 3.138 3.216 3.301 3.409 3.503 3.597 3.718 3.834 3.933 4.035 4.132 4.219 4.274 4.342 4.424 4.467 4.469 4.431 4.357 4.216 3.964 3.441 2.339 0.898 -0.414 -1.62 -2.634 -3.548 -4.34 -5.014 -5.639 -6.301 -6.875 -7.396 -7.885 -8.368 -8.863 -9.301 -9.728 -10.114 -10.442 -10.78 -11.17 -11.509 -11.822 -12.126 -12.373 -12.626 -12.873 -13.141 -13.432 -13.635 -13.839 -14.149 -14.367 -14.616 -14.746 -14.976 -15.214 -15.497 -15.671 -15.983 -16.166 -16.333 -16.512 -16.903 -17.122 -17.359 -17.625 -17.919 -18.284 -18.843 -20.903 -7 ,26688 ,KEBNE ,17069410,Fri Dec 24 03:37:49 CET,Fri Dec 24 05:02:56 CET,0.0 0.261 0.441 0.59 0.715 0.831 0.929 1.011 1.155 1.224 1.306 1.35 1.522 1.578 1.672 1.76 1.843 1.885 1.986 2.06 2.155 2.233 2.297 2.385 2.491 2.592 2.663 2.736 2.835 2.92 2.993 3.079 3.146 3.191 3.253 3.328 3.387 3.426 3.469 3.515 3.567 3.617 3.611 3.589 3.542 3.416 3.18 2.811 2.272 1.457 -0.041 -1.937 -3.517 -4.887 -6.068 -7.122 -8.069 -8.902 -9.608 -10.313 -10.918 -11.455 -11.962 -12.431 -12.864 -13.265 -13.673 -14.034 -14.335 -14.637 -14.976 -15.267 -15.566 -15.874 -16.114 -16.375 -16.641 -16.907 -17.187 -17.378 -17.594 -17.939 -18.162 -18.391 -18.505 -18.741 -18.986 -19.248 -19.394 -19.677 -19.871 -20.04 -20.227 -20.64 -20.855 -21.086 -21.352 -21.664 -22.035 -22.511 -24.189 -8 ,168 ,KEBNE ,17069411,Fri Dec 24 03:40:58 CET,Fri Dec 24 05:06:11 CET,0.0 0.355 0.544 0.741 0.896 0.993 1.077 1.177 1.406 1.509 1.599 1.637 1.808 1.863 1.975 2.084 2.189 2.239 2.359 2.46 2.573 2.649 2.708 2.798 2.881 2.953 3.025 3.089 3.186 3.273 3.342 3.445 3.547 3.623 3.686 3.754 3.81 3.849 3.886 3.926 3.974 4.004 4.003 3.984 3.927 3.83 3.673 3.432 2.993 2.171 0.659 -1.235 -2.829 -4.168 -5.344 -6.446 -7.403 -8.227 -8.934 -9.643 -10.238 -10.769 -11.31 -11.823 -12.266 -12.674 -13.109 -13.515 -13.858 -14.192 -14.541 -14.815 -15.097 -15.407 -15.642 -15.897 -16.18 -16.468 -16.754 -16.958 -17.17 -17.506 -17.756 -18.01 -18.136 -18.392 -18.672 -18.977 -19.132 -19.421 -19.624 -19.812 -19.994 -20.37 -20.594 -20.82 -21.054 -21.36 -21.765 -22.309 -23.878 -9 ,18775 ,KEBNE ,17069412,Fri Dec 24 03:40:57 CET,Fri Dec 24 05:06:19 CET,0.0 0.532 0.788 0.953 1.075 1.197 1.323 1.436 1.606 1.669 1.741 1.779 1.957 2.02 2.142 2.253 2.375 2.437 2.543 2.641 2.791 2.876 2.958 3.079 3.178 3.269 3.361 3.45 3.554 3.641 3.727 3.845 3.936 4.004 4.078 4.173 4.278 4.363 4.453 4.542 4.604 4.662 4.693 4.695 4.639 4.498 4.291 3.969 3.442 2.581 1.062 -0.869 -2.451 -3.756 -4.88 -5.915 -6.83 -7.666 -8.389 -9.089 -9.72 -10.339 -10.925 -11.452 -11.936 -12.384 -12.856 -13.267 -13.635 -14.029 -14.412 -14.72 -15.048 -15.399 -15.674 -15.957 -16.256 -16.572 -16.892 -17.114 -17.346 -17.688 -17.919 -18.164 -18.291 -18.562 -18.865 -19.188 -19.348 -19.649 -19.897 -20.107 -20.324 -20.809 -21.087 -21.39 -21.688 -22.005 -22.427 -23.004 -25.009 -10 ,29718 ,KEBNE ,17069413,Fri Dec 24 03:42:00 CET,Fri Dec 24 05:06:15 CET,0.0 0.176 0.327 0.472 0.6 0.705 0.789 0.854 0.963 1.021 1.084 1.1 1.282 1.345 1.436 1.512 1.591 1.633 1.726 1.822 1.932 2.007 2.088 2.188 2.285 2.365 2.425 2.484 2.565 2.646 2.711 2.796 2.875 2.956 3.043 3.122 3.188 3.245 3.308 3.371 3.427 3.449 3.449 3.444 3.414 3.339 3.2 2.948 2.498 1.833 0.665 -0.811 -2.096 -3.304 -4.373 -5.312 -6.074 -6.797 -7.473 -8.159 -8.75 -9.28 -9.797 -10.269 -10.707 -11.099 -11.481 -11.827 -12.142 -12.489 -12.861 -13.161 -13.476 -13.802 -14.051 -14.309 -14.569 -14.833 -15.11 -15.309 -15.52 -15.869 -16.108 -16.345 -16.467 -16.726 -17.005 -17.27 -17.409 -17.695 -17.855 -18.007 -18.193 -18.63 -18.869 -19.125 -19.4 -19.709 -20.087 -20.581 -22.271 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_215_167.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_215_167.txt deleted file mode 100644 index adb8cb1d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_215_167.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13831 ,KEBNE ,16657483,Tue Nov 23 04:03:14 CET,Tue Nov 23 05:25:59 CET,0.0 0.55 0.849 1.099 1.294 1.465 1.594 1.701 1.941 2.051 2.141 2.228 2.428 2.505 2.655 2.79 2.909 2.976 3.12 3.256 3.446 3.558 3.665 3.834 3.991 4.149 4.311 4.464 4.666 4.846 5.01 5.21 5.418 5.62 5.839 6.089 6.316 6.573 6.849 7.124 7.449 7.807 8.18 8.55 8.952 9.376 9.873 10.398 10.918 11.467 11.972 12.179 12.1 11.927 11.74 11.511 11.251 11.008 10.781 10.537 10.322 10.08 9.842 9.657 9.474 9.279 9.079 8.909 8.767 8.599 8.435 8.306 8.157 8.006 7.876 7.744 7.624 7.506 7.381 7.284 7.187 7.033 6.914 6.777 6.698 6.535 6.362 6.191 6.114 5.932 5.857 5.749 5.624 5.35 5.212 5.072 4.926 4.771 4.541 4.238 3.49 -2 ,9705 ,KEBNE ,16657484,Tue Nov 23 04:03:18 CET,Tue Nov 23 05:24:49 CET,0.0 0.587 0.823 1.017 1.2 1.353 1.481 1.627 1.906 2.02 2.121 2.186 2.384 2.472 2.643 2.822 2.989 3.063 3.198 3.328 3.526 3.655 3.781 3.96 4.115 4.25 4.41 4.572 4.762 4.955 5.145 5.36 5.529 5.699 5.907 6.132 6.359 6.591 6.823 7.07 7.346 7.653 7.987 8.339 8.736 9.163 9.719 10.35 10.953 11.523 12.002 12.193 12.125 11.921 11.678 11.439 11.201 10.939 10.684 10.439 10.225 9.993 9.766 9.563 9.378 9.196 8.986 8.808 8.646 8.471 8.273 8.102 7.927 7.732 7.596 7.456 7.305 7.16 6.995 6.887 6.777 6.591 6.467 6.337 6.263 6.099 5.935 5.76 5.669 5.465 5.348 5.249 5.15 4.933 4.812 4.676 4.534 4.365 4.151 3.836 2.909 -3 ,22653 ,KEBNE ,16657485,Tue Nov 23 04:03:14 CET,Tue Nov 23 05:26:35 CET,0.0 0.571 0.797 0.981 1.146 1.292 1.423 1.544 1.771 1.878 1.99 2.102 2.308 2.389 2.572 2.751 2.897 2.966 3.105 3.237 3.418 3.536 3.659 3.853 4.033 4.193 4.345 4.484 4.664 4.851 5.037 5.259 5.476 5.691 5.928 6.164 6.394 6.673 6.978 7.273 7.566 7.871 8.207 8.57 9.014 9.501 10.009 10.524 11.056 11.558 12.017 12.207 12.147 11.97 11.718 11.451 11.221 10.975 10.69 10.426 10.222 10.025 9.844 9.659 9.484 9.318 9.141 8.954 8.756 8.579 8.406 8.251 8.109 7.971 7.847 7.699 7.517 7.319 7.151 7.05 6.94 6.767 6.644 6.498 6.42 6.258 6.085 5.914 5.825 5.628 5.545 5.435 5.311 5.072 4.935 4.781 4.623 4.439 4.229 3.958 3.251 -4 ,7542 ,KEBNE ,16657486,Tue Nov 23 04:03:14 CET,Tue Nov 23 05:26:20 CET,0.0 1.002 1.27 1.474 1.627 1.752 1.874 2.002 2.244 2.363 2.479 2.551 2.747 2.838 3.023 3.213 3.373 3.448 3.616 3.767 3.959 4.075 4.196 4.389 4.571 4.753 4.925 5.082 5.287 5.492 5.69 5.915 6.111 6.297 6.514 6.763 7.001 7.253 7.527 7.819 8.142 8.508 8.886 9.243 9.659 10.103 10.586 11.111 11.703 12.314 12.886 13.116 12.989 12.706 12.415 12.133 11.891 11.658 11.415 11.145 10.916 10.695 10.46 10.222 9.996 9.809 9.621 9.401 9.214 9.038 8.83 8.654 8.464 8.258 8.087 7.922 7.779 7.643 7.492 7.377 7.253 7.052 6.916 6.766 6.686 6.538 6.4 6.219 6.112 5.91 5.828 5.725 5.61 5.382 5.252 5.11 4.965 4.808 4.635 4.383 3.924 -5 ,5585 ,KEBNE ,16657487,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:26:01 CET,0.0 0.694 0.962 1.133 1.312 1.504 1.673 1.828 2.099 2.205 2.308 2.4 2.599 2.687 2.858 3.013 3.164 3.243 3.394 3.53 3.711 3.825 3.939 4.114 4.294 4.47 4.64 4.81 5.031 5.231 5.423 5.645 5.836 6.014 6.229 6.487 6.732 6.99 7.269 7.542 7.827 8.146 8.52 8.916 9.353 9.801 10.278 10.78 11.349 11.911 12.348 12.506 12.43 12.253 12.075 11.834 11.558 11.285 11.036 10.797 10.577 10.364 10.16 9.961 9.775 9.604 9.415 9.253 9.086 8.899 8.74 8.602 8.434 8.27 8.145 8.019 7.897 7.766 7.621 7.517 7.399 7.219 7.104 6.965 6.896 6.761 6.607 6.455 6.369 6.174 6.081 5.974 5.872 5.645 5.507 5.349 5.158 4.929 4.674 4.386 3.691 -6 ,1183 ,KEBNE ,16657488,Tue Nov 23 04:05:19 CET,Tue Nov 23 05:29:00 CET,0.0 0.679 0.885 1.097 1.293 1.448 1.599 1.744 2.022 2.151 2.272 2.39 2.591 2.678 2.861 3.052 3.238 3.315 3.446 3.572 3.752 3.877 4.017 4.202 4.366 4.516 4.659 4.811 4.999 5.165 5.33 5.54 5.746 5.944 6.148 6.371 6.598 6.862 7.151 7.443 7.73 8.041 8.445 8.868 9.315 9.784 10.277 10.815 11.392 11.909 12.279 12.395 12.383 12.244 12.057 11.835 11.591 11.368 11.188 11.027 10.852 10.669 10.498 10.315 10.124 9.959 9.809 9.674 9.52 9.357 9.211 9.081 8.943 8.802 8.694 8.573 8.443 8.315 8.18 8.082 7.971 7.809 7.701 7.572 7.5 7.352 7.21 7.064 6.995 6.821 6.755 6.668 6.553 6.293 6.175 6.051 5.919 5.759 5.557 5.334 4.903 -7 ,19398 ,KEBNE ,16657489,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:28:00 CET,0.0 0.374 0.623 0.858 1.043 1.196 1.342 1.487 1.747 1.847 1.947 2.031 2.216 2.301 2.45 2.585 2.733 2.797 2.916 3.036 3.21 3.33 3.443 3.593 3.741 3.882 4.031 4.18 4.369 4.546 4.697 4.883 5.075 5.254 5.455 5.671 5.88 6.13 6.38 6.621 6.901 7.221 7.594 7.976 8.421 8.888 9.391 9.971 10.567 11.117 11.597 11.687 11.515 11.228 10.94 10.674 10.424 10.154 9.872 9.557 9.248 8.941 8.653 8.395 8.15 7.904 7.643 7.408 7.214 7.039 6.841 6.662 6.488 6.313 6.167 6.02 5.852 5.68 5.533 5.416 5.276 5.07 4.941 4.802 4.726 4.569 4.396 4.208 4.114 3.919 3.822 3.7 3.586 3.358 3.209 3.036 2.856 2.653 2.443 2.151 1.356 -9 ,28152 ,KEBNE ,16657491,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:27:50 CET,0.0 0.777 1.065 1.309 1.533 1.693 1.823 1.958 2.189 2.297 2.401 2.489 2.692 2.778 2.963 3.151 3.298 3.369 3.527 3.669 3.864 3.996 4.127 4.319 4.491 4.64 4.775 4.904 5.092 5.29 5.461 5.669 5.87 6.064 6.305 6.541 6.745 6.973 7.234 7.532 7.838 8.166 8.524 8.847 9.247 9.722 10.227 10.747 11.332 11.936 12.486 12.716 12.689 12.543 12.36 12.165 11.947 11.705 11.487 11.282 11.104 10.947 10.787 10.608 10.386 10.172 9.976 9.788 9.632 9.477 9.308 9.17 9.036 8.904 8.791 8.669 8.543 8.422 8.278 8.149 8.017 7.823 7.686 7.554 7.498 7.373 7.224 7.089 7.021 6.833 6.734 6.629 6.521 6.283 6.166 6.036 5.894 5.717 5.484 5.168 4.089 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_215_206.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_215_206.txt deleted file mode 100644 index 812e8703..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_215_206.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16134 ,KEBNE ,16657493,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:27:08 CET,0.0 0.615 0.911 1.138 1.344 1.53 1.669 1.795 2.039 2.15 2.254 2.348 2.552 2.64 2.804 2.96 3.107 3.18 3.328 3.468 3.684 3.818 3.93 4.091 4.234 4.37 4.518 4.661 4.814 4.972 5.143 5.351 5.513 5.661 5.856 6.058 6.247 6.455 6.672 6.87 7.047 7.233 7.459 7.697 7.926 8.135 8.338 8.516 8.594 8.539 8.248 7.704 7.142 6.596 6.086 5.592 5.16 4.782 4.458 4.108 3.804 3.56 3.323 3.091 2.884 2.693 2.482 2.287 2.116 1.944 1.745 1.563 1.35 1.115 0.968 0.839 0.699 0.553 0.387 0.267 0.154 -0.022 -0.142 -0.261 -0.32 -0.457 -0.612 -0.795 -0.899 -1.106 -1.192 -1.302 -1.417 -1.66 -1.779 -1.904 -2.039 -2.192 -2.387 -2.684 -3.213 -3 ,8961 ,KEBNE ,16657495,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:27:23 CET,0.0 0.744 1.083 1.315 1.497 1.634 1.77 1.897 2.086 2.178 2.271 2.334 2.526 2.611 2.763 2.908 3.052 3.116 3.254 3.386 3.57 3.701 3.83 4.007 4.154 4.296 4.435 4.571 4.759 4.93 5.101 5.326 5.54 5.735 5.94 6.128 6.302 6.508 6.712 6.915 7.116 7.308 7.508 7.719 7.983 8.245 8.476 8.667 8.827 8.893 8.719 8.171 7.536 6.947 6.427 5.969 5.577 5.185 4.838 4.487 4.189 3.936 3.679 3.409 3.154 2.927 2.68 2.465 2.289 2.104 1.924 1.757 1.562 1.359 1.193 1.036 0.879 0.725 0.583 0.481 0.367 0.179 0.048 -0.079 -0.141 -0.259 -0.389 -0.526 -0.594 -0.787 -0.842 -0.924 -1.02 -1.233 -1.368 -1.515 -1.649 -1.807 -1.978 -2.226 -2.935 -4 ,25867 ,KEBNE ,16657496,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:26:53 CET,0.0 0.476 0.738 0.976 1.158 1.324 1.484 1.602 1.793 1.87 1.948 2.026 2.222 2.296 2.443 2.597 2.758 2.839 2.997 3.137 3.319 3.443 3.563 3.742 3.912 4.059 4.204 4.342 4.502 4.642 4.787 4.956 5.091 5.232 5.395 5.568 5.718 5.886 6.095 6.314 6.516 6.732 6.97 7.169 7.393 7.635 7.866 8.02 8.068 8.053 7.996 7.678 7.226 6.786 6.37 5.943 5.562 5.198 4.852 4.473 4.141 3.866 3.592 3.302 3.031 2.801 2.554 2.323 2.124 1.891 1.648 1.47 1.3 1.129 0.979 0.805 0.641 0.469 0.291 0.18 0.061 -0.111 -0.238 -0.387 -0.457 -0.602 -0.773 -0.959 -1.053 -1.255 -1.35 -1.467 -1.576 -1.825 -1.977 -2.128 -2.272 -2.436 -2.613 -2.842 -3.345 -5 ,6355 ,KEBNE ,16657497,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:27:47 CET,0.0 0.599 0.851 1.031 1.193 1.344 1.462 1.571 1.751 1.823 1.902 1.929 2.107 2.186 2.335 2.477 2.624 2.688 2.812 2.939 3.111 3.222 3.342 3.523 3.67 3.806 3.954 4.093 4.24 4.364 4.498 4.665 4.819 4.961 5.142 5.342 5.528 5.734 5.933 6.143 6.35 6.557 6.793 7.03 7.282 7.523 7.755 7.918 8.046 8.112 7.873 7.325 6.696 6.067 5.51 5.065 4.683 4.289 3.937 3.573 3.231 2.912 2.618 2.351 2.096 1.87 1.612 1.371 1.183 0.977 0.769 0.608 0.431 0.241 0.097 -0.063 -0.246 -0.415 -0.572 -0.689 -0.822 -1.025 -1.163 -1.304 -1.367 -1.506 -1.668 -1.836 -1.928 -2.14 -2.236 -2.344 -2.45 -2.678 -2.804 -2.946 -3.097 -3.254 -3.431 -3.691 -4.173 -6 ,25147 ,KEBNE ,16657498,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:26:49 CET,0.0 0.789 1.057 1.263 1.416 1.554 1.702 1.831 2.019 2.097 2.164 2.185 2.346 2.402 2.545 2.705 2.85 2.915 3.048 3.173 3.329 3.42 3.518 3.664 3.803 3.929 4.043 4.164 4.338 4.497 4.643 4.837 5.012 5.166 5.333 5.511 5.697 5.893 6.094 6.287 6.48 6.702 6.966 7.198 7.414 7.65 7.878 8.062 8.231 8.327 8.134 7.642 7.142 6.636 6.156 5.723 5.347 5.002 4.712 4.42 4.146 3.903 3.646 3.394 3.18 2.988 2.785 2.61 2.454 2.284 2.111 1.954 1.793 1.629 1.487 1.329 1.173 1.007 0.838 0.727 0.608 0.426 0.307 0.174 0.107 -0.018 -0.165 -0.328 -0.418 -0.63 -0.724 -0.825 -0.925 -1.123 -1.268 -1.427 -1.576 -1.761 -1.973 -2.265 -2.703 -7 ,19439 ,KEBNE ,16657499,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:26:44 CET,0.0 0.968 1.288 1.495 1.656 1.8 1.929 2.058 2.297 2.407 2.507 2.591 2.795 2.884 3.046 3.202 3.351 3.423 3.568 3.693 3.862 3.983 4.097 4.256 4.414 4.557 4.688 4.813 4.962 5.111 5.263 5.432 5.585 5.735 5.917 6.116 6.294 6.473 6.648 6.831 7.02 7.22 7.459 7.681 7.893 8.096 8.314 8.51 8.667 8.716 8.462 7.868 7.234 6.663 6.106 5.545 5.01 4.572 4.235 3.899 3.597 3.304 3.04 2.807 2.581 2.363 2.125 1.917 1.735 1.541 1.358 1.214 1.049 0.877 0.742 0.597 0.458 0.323 0.163 0.042 -0.088 -0.27 -0.385 -0.511 -0.574 -0.709 -0.872 -1.05 -1.133 -1.325 -1.365 -1.457 -1.55 -1.714 -1.83 -1.976 -2.129 -2.291 -2.44 -2.605 -3.06 -8 ,322 ,KEBNE ,16657500,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:28:12 CET,0.0 0.449 0.718 0.923 1.117 1.276 1.4 1.519 1.739 1.848 1.949 2.021 2.222 2.313 2.49 2.661 2.817 2.893 3.029 3.159 3.351 3.471 3.585 3.756 3.912 4.054 4.187 4.32 4.51 4.695 4.858 5.04 5.211 5.385 5.587 5.804 6.003 6.205 6.425 6.658 6.894 7.113 7.331 7.573 7.835 8.057 8.266 8.447 8.592 8.644 8.362 7.765 7.138 6.503 5.942 5.477 5.047 4.634 4.296 3.923 3.576 3.295 3.024 2.762 2.501 2.267 2.052 1.848 1.661 1.461 1.25 1.083 0.914 0.732 0.592 0.441 0.271 0.107 -0.067 -0.193 -0.32 -0.523 -0.649 -0.782 -0.862 -1.036 -1.202 -1.349 -1.427 -1.638 -1.723 -1.824 -1.919 -2.113 -2.209 -2.336 -2.476 -2.616 -2.794 -3.004 -3.504 -9 ,1287 ,KEBNE ,16657501,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:27:29 CET,0.0 0.582 0.851 1.024 1.149 1.319 1.48 1.623 1.89 2.005 2.099 2.157 2.338 2.402 2.547 2.704 2.845 2.911 3.043 3.191 3.401 3.512 3.606 3.737 3.856 3.969 4.099 4.245 4.421 4.581 4.723 4.878 5.048 5.207 5.378 5.577 5.762 5.947 6.134 6.338 6.556 6.766 6.986 7.225 7.487 7.695 7.884 8.056 8.138 8.091 7.808 7.232 6.61 6.04 5.524 5.074 4.599 4.148 3.758 3.337 2.931 2.579 2.273 1.969 1.7 1.447 1.203 0.976 0.77 0.583 0.405 0.228 0.024 -0.154 -0.294 -0.437 -0.588 -0.757 -0.934 -1.064 -1.203 -1.402 -1.527 -1.653 -1.72 -1.885 -2.061 -2.237 -2.319 -2.518 -2.613 -2.733 -2.851 -3.065 -3.189 -3.337 -3.498 -3.646 -3.812 -4.043 -4.432 -10 ,31045 ,KEBNE ,16657502,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:28:27 CET,0.0 0.794 1.048 1.263 1.43 1.582 1.728 1.853 2.098 2.21 2.315 2.419 2.637 2.747 2.948 3.105 3.234 3.301 3.437 3.563 3.72 3.823 3.93 4.082 4.226 4.365 4.494 4.603 4.741 4.885 5.03 5.196 5.343 5.51 5.727 5.939 6.128 6.33 6.531 6.745 6.973 7.229 7.49 7.712 7.962 8.205 8.41 8.641 8.819 8.812 8.524 7.949 7.338 6.784 6.308 5.832 5.387 4.98 4.605 4.23 3.9 3.608 3.347 3.088 2.838 2.596 2.337 2.115 1.905 1.691 1.477 1.274 1.056 0.825 0.656 0.504 0.345 0.186 0.014 -0.109 -0.229 -0.41 -0.543 -0.685 -0.764 -0.942 -1.108 -1.288 -1.379 -1.577 -1.657 -1.75 -1.846 -2.049 -2.154 -2.288 -2.441 -2.626 -2.814 -3.001 -3.324 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_215_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_215_252.txt deleted file mode 100644 index 0ba0764c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_215_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13267 ,KEBNE ,16657503,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:26:17 CET,0.0 0.467 0.627 0.781 0.918 1.035 1.145 1.244 1.374 1.436 1.503 1.508 1.667 1.727 1.851 1.965 2.062 2.104 2.191 2.268 2.36 2.415 2.469 2.549 2.628 2.683 2.746 2.816 2.895 2.962 3.016 3.091 3.153 3.199 3.248 3.313 3.366 3.42 3.473 3.516 3.566 3.614 3.617 3.557 3.456 3.299 3.063 2.717 2.2 1.329 -0.237 -2.064 -3.611 -4.951 -6.029 -7.046 -8.054 -8.977 -9.785 -10.578 -11.245 -11.841 -12.396 -12.909 -13.383 -13.793 -14.209 -14.558 -14.847 -15.185 -15.545 -15.822 -16.111 -16.411 -16.626 -16.847 -17.095 -17.367 -17.64 -17.829 -18.018 -18.308 -18.536 -18.776 -18.895 -19.143 -19.411 -19.681 -19.809 -20.069 -20.229 -20.397 -20.582 -20.997 -21.219 -21.45 -21.702 -21.979 -22.325 -22.82 -24.023 -2 ,24830 ,KEBNE ,16657504,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:27:27 CET,0.0 0.195 0.332 0.47 0.583 0.677 0.766 0.85 1.004 1.074 1.14 1.129 1.274 1.316 1.413 1.518 1.605 1.639 1.709 1.778 1.882 1.94 1.985 2.053 2.121 2.198 2.272 2.337 2.422 2.486 2.539 2.6 2.641 2.668 2.705 2.79 2.861 2.892 2.914 2.931 2.947 2.945 2.903 2.835 2.727 2.58 2.333 1.941 1.372 0.449 -1.199 -3.12 -4.702 -6.097 -7.378 -8.613 -9.686 -10.663 -11.499 -12.315 -13.043 -13.695 -14.302 -14.853 -15.354 -15.823 -16.31 -16.729 -17.09 -17.471 -17.858 -18.172 -18.51 -18.86 -19.135 -19.442 -19.756 -20.06 -20.363 -20.564 -20.77 -21.116 -21.357 -21.603 -21.738 -22.017 -22.311 -22.638 -22.793 -23.066 -23.248 -23.413 -23.582 -23.98 -24.212 -24.465 -24.727 -25.008 -25.334 -25.746 -26.901 -3 ,9060 ,KEBNE ,16657505,Tue Nov 23 04:04:17 CET,Tue Nov 23 05:28:55 CET,0.0 0.302 0.427 0.55 0.666 0.742 0.827 0.919 1.084 1.156 1.216 1.204 1.356 1.394 1.481 1.567 1.654 1.696 1.764 1.831 1.925 1.986 2.049 2.147 2.222 2.281 2.344 2.398 2.466 2.52 2.561 2.604 2.66 2.718 2.765 2.844 2.918 2.967 3.005 3.021 3.027 3.026 3.009 2.989 2.905 2.685 2.382 1.975 1.355 0.361 -1.378 -3.442 -5.105 -6.559 -7.811 -8.933 -9.874 -10.628 -11.289 -11.978 -12.57 -13.148 -13.736 -14.265 -14.708 -15.096 -15.524 -15.921 -16.272 -16.65 -17.047 -17.358 -17.689 -18.045 -18.31 -18.578 -18.879 -19.221 -19.598 -19.855 -20.101 -20.462 -20.718 -21.0 -21.15 -21.456 -21.784 -22.104 -22.264 -22.576 -22.841 -23.056 -23.265 -23.675 -23.895 -24.135 -24.44 -24.791 -25.172 -25.669 -27.324 -4 ,21607 ,KEBNE ,16657506,Tue Nov 23 04:05:19 CET,Tue Nov 23 05:28:22 CET,0.0 0.237 0.379 0.511 0.614 0.7 0.789 0.874 1.029 1.1 1.163 1.18 1.346 1.408 1.517 1.603 1.686 1.725 1.829 1.935 2.049 2.12 2.193 2.274 2.358 2.443 2.504 2.561 2.633 2.689 2.744 2.802 2.858 2.915 2.967 3.034 3.095 3.134 3.149 3.145 3.161 3.195 3.166 3.08 2.947 2.762 2.462 1.969 1.223 0.039 -1.865 -4.026 -5.881 -7.552 -9.006 -10.263 -11.38 -12.417 -13.282 -14.101 -14.803 -15.433 -16.022 -16.581 -17.107 -17.574 -18.081 -18.526 -18.903 -19.312 -19.724 -20.054 -20.411 -20.796 -21.082 -21.366 -21.667 -21.964 -22.263 -22.476 -22.684 -23.018 -23.256 -23.506 -23.641 -23.905 -24.175 -24.447 -24.589 -24.881 -25.084 -25.257 -25.443 -25.88 -26.122 -26.365 -26.655 -26.994 -27.406 -27.901 -29.465 -5 ,21567 ,KEBNE ,16657507,Tue Nov 23 04:05:19 CET,Tue Nov 23 05:28:18 CET,0.0 0.289 0.445 0.561 0.654 0.739 0.824 0.894 1.031 1.102 1.16 1.179 1.34 1.384 1.473 1.561 1.645 1.686 1.76 1.816 1.898 1.961 2.023 2.11 2.191 2.251 2.305 2.367 2.442 2.503 2.566 2.629 2.695 2.764 2.818 2.874 2.922 2.934 2.934 2.941 2.919 2.877 2.82 2.742 2.64 2.505 2.282 1.947 1.386 0.315 -1.545 -3.724 -5.495 -6.973 -8.249 -9.295 -10.167 -10.956 -11.618 -12.322 -13.0 -13.623 -14.176 -14.706 -15.218 -15.658 -16.131 -16.57 -16.945 -17.336 -17.741 -18.072 -18.399 -18.752 -19.031 -19.307 -19.584 -19.863 -20.16 -20.378 -20.601 -20.945 -21.181 -21.422 -21.55 -21.816 -22.098 -22.383 -22.533 -22.832 -23.044 -23.235 -23.433 -23.833 -24.069 -24.332 -24.618 -24.948 -25.309 -25.809 -27.471 -6 ,21923 ,KEBNE ,16657508,Tue Nov 23 04:05:19 CET,Tue Nov 23 05:28:16 CET,0.0 0.561 0.756 0.89 1.002 1.105 1.179 1.268 1.445 1.513 1.58 1.576 1.74 1.792 1.885 1.996 2.101 2.144 2.22 2.286 2.38 2.436 2.48 2.539 2.603 2.665 2.724 2.779 2.848 2.914 2.963 3.003 3.053 3.102 3.153 3.225 3.27 3.299 3.322 3.32 3.296 3.256 3.182 3.072 2.953 2.784 2.473 2.044 1.366 0.292 -1.377 -3.368 -5.057 -6.506 -7.752 -8.845 -9.77 -10.609 -11.297 -11.97 -12.614 -13.22 -13.781 -14.303 -14.779 -15.188 -15.625 -16.039 -16.401 -16.769 -17.146 -17.462 -17.805 -18.165 -18.425 -18.691 -18.979 -19.287 -19.605 -19.809 -20.012 -20.346 -20.587 -20.831 -20.944 -21.189 -21.465 -21.756 -21.911 -22.182 -22.36 -22.531 -22.704 -23.088 -23.309 -23.538 -23.781 -24.061 -24.396 -24.888 -26.314 -7 ,3577 ,KEBNE ,16657509,Tue Nov 23 04:05:20 CET,Tue Nov 23 05:28:10 CET,0.0 0.342 0.56 0.721 0.823 0.912 0.986 1.064 1.22 1.284 1.345 1.357 1.519 1.57 1.667 1.768 1.857 1.904 1.975 2.036 2.139 2.208 2.278 2.364 2.439 2.514 2.585 2.654 2.728 2.785 2.841 2.893 2.938 2.986 3.023 3.063 3.094 3.112 3.128 3.13 3.128 3.117 3.08 3.007 2.885 2.708 2.418 1.974 1.327 0.321 -1.335 -3.239 -4.744 -6.082 -7.248 -8.263 -9.2 -10.013 -10.674 -11.328 -11.896 -12.418 -12.936 -13.419 -13.842 -14.224 -14.614 -14.981 -15.328 -15.709 -16.094 -16.398 -16.719 -17.078 -17.363 -17.637 -17.897 -18.176 -18.46 -18.634 -18.801 -19.086 -19.309 -19.54 -19.658 -19.895 -20.143 -20.401 -20.541 -20.822 -21.01 -21.184 -21.377 -21.796 -22.018 -22.274 -22.535 -22.827 -23.223 -23.752 -25.589 -8 ,19058 ,KEBNE ,16657510,Tue Nov 23 04:05:20 CET,Tue Nov 23 05:28:46 CET,0.0 0.297 0.511 0.677 0.804 0.889 0.972 1.047 1.181 1.253 1.318 1.344 1.525 1.582 1.672 1.786 1.889 1.93 2.003 2.066 2.137 2.182 2.235 2.318 2.377 2.416 2.463 2.526 2.595 2.635 2.676 2.74 2.818 2.884 2.935 2.977 3.002 3.018 3.056 3.112 3.125 3.096 3.034 2.939 2.808 2.649 2.377 1.985 1.402 0.334 -1.503 -3.697 -5.482 -6.909 -8.039 -9.006 -9.833 -10.604 -11.3 -11.976 -12.547 -13.069 -13.582 -14.069 -14.51 -14.901 -15.302 -15.648 -15.965 -16.319 -16.672 -16.941 -17.209 -17.492 -17.718 -17.962 -18.212 -18.478 -18.784 -18.994 -19.188 -19.491 -19.72 -19.969 -20.095 -20.331 -20.576 -20.839 -20.973 -21.242 -21.409 -21.583 -21.774 -22.163 -22.377 -22.608 -22.869 -23.173 -23.551 -24.048 -25.508 -9 ,13280 ,KEBNE ,16657511,Tue Nov 23 04:05:20 CET,Tue Nov 23 05:27:51 CET,0.0 0.295 0.443 0.564 0.659 0.756 0.845 0.939 1.093 1.157 1.219 1.204 1.361 1.414 1.532 1.633 1.716 1.753 1.832 1.904 2.011 2.076 2.125 2.205 2.277 2.337 2.39 2.449 2.521 2.579 2.634 2.709 2.782 2.835 2.88 2.917 2.943 2.953 2.955 2.954 2.942 2.917 2.868 2.803 2.677 2.488 2.229 1.798 1.111 0.104 -1.621 -3.586 -5.116 -6.505 -7.717 -8.818 -9.826 -10.665 -11.327 -12.008 -12.622 -13.152 -13.612 -14.053 -14.498 -14.883 -15.286 -15.655 -15.977 -16.331 -16.68 -16.957 -17.261 -17.596 -17.868 -18.15 -18.424 -18.714 -19.022 -19.225 -19.441 -19.763 -19.987 -20.24 -20.368 -20.629 -20.896 -21.186 -21.342 -21.629 -21.835 -22.042 -22.249 -22.647 -22.851 -23.07 -23.321 -23.596 -23.95 -24.415 -26.154 -10 ,19469 ,KEBNE ,16657512,Tue Nov 23 04:05:19 CET,Tue Nov 23 05:27:48 CET,0.0 0.393 0.599 0.8 0.921 1.006 1.085 1.159 1.29 1.345 1.404 1.4 1.562 1.613 1.702 1.787 1.854 1.893 1.995 2.097 2.224 2.302 2.366 2.432 2.498 2.553 2.614 2.672 2.725 2.767 2.803 2.855 2.92 2.977 3.053 3.133 3.183 3.24 3.274 3.289 3.283 3.274 3.243 3.178 3.066 2.896 2.618 2.163 1.484 0.464 -1.152 -3.109 -4.716 -6.09 -7.285 -8.427 -9.42 -10.316 -11.078 -11.799 -12.444 -13.022 -13.538 -13.986 -14.426 -14.878 -15.353 -15.77 -16.157 -16.553 -16.895 -17.186 -17.507 -17.836 -18.086 -18.33 -18.59 -18.861 -19.157 -19.364 -19.571 -19.895 -20.115 -20.34 -20.462 -20.722 -20.983 -21.244 -21.389 -21.676 -21.845 -22.002 -22.19 -22.597 -22.82 -23.09 -23.377 -23.711 -24.096 -24.6 -25.617 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_227_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_227_231.txt deleted file mode 100644 index f7519a66..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_227_231.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32046 ,KEBNE ,16657513,Tue Nov 23 04:05:19 CET,Tue Nov 23 05:28:25 CET,0.0 0.181 0.265 0.385 0.487 0.561 0.622 0.666 0.737 0.776 0.819 0.813 0.922 0.947 0.985 1.033 1.061 1.08 1.127 1.164 1.188 1.191 1.208 1.241 1.262 1.273 1.278 1.282 1.281 1.272 1.254 1.222 1.188 1.142 1.078 1.004 0.923 0.822 0.703 0.545 0.34 0.104 -0.177 -0.495 -0.957 -1.578 -2.39 -3.446 -4.857 -6.889 -10.214 -13.814 -16.461 -18.544 -20.254 -21.785 -23.099 -24.301 -25.28 -26.212 -27.017 -27.687 -28.297 -28.866 -29.385 -29.842 -30.335 -30.759 -31.11 -31.472 -31.827 -32.129 -32.461 -32.788 -33.037 -33.286 -33.541 -33.803 -34.055 -34.226 -34.404 -34.688 -34.887 -35.094 -35.194 -35.394 -35.624 -35.866 -35.988 -36.222 -36.355 -36.496 -36.648 -36.96 -37.122 -37.299 -37.491 -37.701 -37.975 -38.319 -38.776 -2 ,6595 ,KEBNE ,16657514,Tue Nov 23 04:07:25 CET,Tue Nov 23 05:31:39 CET,0.0 0.155 0.287 0.372 0.459 0.536 0.58 0.629 0.726 0.764 0.813 0.839 0.946 0.975 1.029 1.081 1.123 1.146 1.189 1.214 1.245 1.263 1.28 1.309 1.329 1.343 1.347 1.351 1.369 1.384 1.387 1.384 1.366 1.329 1.274 1.194 1.102 0.983 0.837 0.677 0.507 0.258 -0.094 -0.462 -0.949 -1.586 -2.425 -3.482 -4.894 -6.954 -10.165 -13.703 -16.398 -18.564 -20.387 -21.89 -23.09 -24.135 -25.012 -25.892 -26.648 -27.307 -27.902 -28.433 -28.944 -29.43 -29.945 -30.418 -30.81 -31.193 -31.595 -31.937 -32.267 -32.587 -32.854 -33.153 -33.466 -33.773 -34.054 -34.243 -34.434 -34.749 -34.979 -35.205 -35.327 -35.585 -35.835 -36.071 -36.199 -36.45 -36.628 -36.777 -36.922 -37.244 -37.431 -37.636 -37.852 -38.057 -38.273 -38.551 -39.122 -3 ,15719 ,KEBNE ,16657515,Tue Nov 23 04:07:24 CET,Tue Nov 23 05:30:53 CET,0.0 0.179 0.345 0.461 0.533 0.613 0.681 0.747 0.877 0.926 0.981 1.015 1.12 1.144 1.192 1.248 1.303 1.325 1.369 1.412 1.464 1.487 1.501 1.519 1.542 1.575 1.597 1.601 1.595 1.577 1.553 1.537 1.511 1.471 1.428 1.36 1.287 1.204 1.093 0.961 0.812 0.596 0.285 -0.067 -0.545 -1.124 -1.876 -2.9 -4.327 -6.391 -9.548 -12.948 -15.554 -17.683 -19.395 -20.83 -22.095 -23.203 -24.133 -25.038 -25.772 -26.404 -27.01 -27.576 -28.096 -28.567 -29.052 -29.489 -29.85 -30.221 -30.601 -30.905 -31.221 -31.559 -31.821 -32.072 -32.315 -32.566 -32.831 -33.009 -33.2 -33.508 -33.733 -33.989 -34.12 -34.376 -34.626 -34.862 -34.989 -35.239 -35.423 -35.574 -35.726 -36.061 -36.244 -36.444 -36.69 -36.952 -37.177 -37.448 -38.131 -4 ,25523 ,KEBNE ,16657516,Tue Nov 23 04:07:24 CET,Tue Nov 23 05:31:24 CET,0.0 0.441 0.624 0.76 0.845 0.922 0.989 1.058 1.184 1.231 1.267 1.25 1.354 1.386 1.448 1.501 1.543 1.562 1.591 1.62 1.67 1.695 1.72 1.739 1.756 1.785 1.801 1.799 1.802 1.822 1.842 1.853 1.834 1.79 1.734 1.643 1.551 1.456 1.325 1.155 0.954 0.719 0.423 0.073 -0.415 -1.034 -1.827 -2.848 -4.258 -6.207 -9.256 -12.615 -15.192 -17.272 -18.979 -20.46 -21.649 -22.672 -23.544 -24.418 -25.196 -25.843 -26.416 -26.945 -27.433 -27.904 -28.379 -28.779 -29.12 -29.471 -29.827 -30.123 -30.431 -30.739 -30.969 -31.213 -31.471 -31.713 -31.952 -32.131 -32.324 -32.61 -32.802 -33.005 -33.106 -33.326 -33.566 -33.802 -33.92 -34.146 -34.28 -34.407 -34.534 -34.817 -34.976 -35.138 -35.293 -35.468 -35.666 -35.876 -36.321 -5 ,8499 ,KEBNE ,16657517,Tue Nov 23 04:07:24 CET,Tue Nov 23 05:30:49 CET,0.0 0.437 0.56 0.673 0.757 0.814 0.874 0.948 1.075 1.118 1.156 1.151 1.262 1.289 1.341 1.4 1.46 1.486 1.535 1.585 1.649 1.675 1.69 1.731 1.757 1.771 1.793 1.804 1.824 1.828 1.822 1.814 1.793 1.763 1.709 1.636 1.555 1.453 1.326 1.192 1.042 0.832 0.544 0.214 -0.249 -0.851 -1.644 -2.672 -4.109 -6.163 -9.26 -12.626 -15.202 -17.272 -18.987 -20.509 -21.814 -22.963 -23.937 -24.871 -25.617 -26.253 -26.842 -27.371 -27.839 -28.252 -28.69 -29.095 -29.431 -29.752 -30.085 -30.362 -30.64 -30.927 -31.163 -31.414 -31.67 -31.927 -32.183 -32.352 -32.522 -32.791 -32.983 -33.196 -33.297 -33.507 -33.734 -33.948 -34.062 -34.285 -34.416 -34.539 -34.656 -34.909 -35.047 -35.193 -35.353 -35.56 -35.84 -36.184 -36.928 -6 ,569 ,KEBNE ,16657518,Tue Nov 23 04:07:25 CET,Tue Nov 23 05:34:23 CET,0.0 0.445 0.602 0.701 0.777 0.844 0.897 0.955 1.074 1.119 1.167 1.179 1.274 1.302 1.375 1.428 1.474 1.492 1.533 1.587 1.657 1.697 1.727 1.769 1.805 1.822 1.833 1.841 1.843 1.827 1.817 1.809 1.771 1.729 1.685 1.62 1.572 1.52 1.416 1.266 1.101 0.888 0.589 0.246 -0.227 -0.814 -1.604 -2.664 -4.104 -6.136 -9.248 -12.609 -15.134 -17.179 -18.882 -20.329 -21.518 -22.535 -23.389 -24.236 -24.979 -25.636 -26.235 -26.779 -27.26 -27.693 -28.149 -28.528 -28.837 -29.15 -29.476 -29.749 -30.025 -30.312 -30.528 -30.764 -31.028 -31.289 -31.529 -31.691 -31.869 -32.148 -32.341 -32.544 -32.646 -32.847 -33.062 -33.307 -33.436 -33.678 -33.836 -33.976 -34.125 -34.442 -34.61 -34.787 -34.97 -35.156 -35.382 -35.707 -36.544 -7 ,16618 ,KEBNE ,16657519,Tue Nov 23 04:07:25 CET,Tue Nov 23 05:28:23 CET,0.0 0.28 0.445 0.543 0.638 0.726 0.791 0.846 0.942 0.991 1.043 1.048 1.153 1.18 1.238 1.303 1.364 1.389 1.437 1.484 1.535 1.554 1.572 1.598 1.624 1.657 1.694 1.706 1.702 1.699 1.685 1.664 1.644 1.618 1.561 1.481 1.399 1.325 1.226 1.076 0.895 0.643 0.312 -0.069 -0.552 -1.124 -1.905 -2.902 -4.254 -6.298 -9.508 -12.956 -15.561 -17.697 -19.444 -20.909 -22.108 -23.121 -24.001 -24.864 -25.583 -26.233 -26.825 -27.369 -27.887 -28.343 -28.782 -29.184 -29.527 -29.875 -30.24 -30.535 -30.85 -31.185 -31.449 -31.702 -31.951 -32.195 -32.429 -32.609 -32.795 -33.066 -33.266 -33.471 -33.569 -33.782 -34.009 -34.228 -34.347 -34.585 -34.752 -34.904 -35.055 -35.374 -35.54 -35.722 -35.925 -36.137 -36.367 -36.638 -37.263 -8 ,29823 ,KEBNE ,16657520,Tue Nov 23 04:07:24 CET,Tue Nov 23 05:31:50 CET,0.0 0.29 0.42 0.531 0.615 0.677 0.744 0.814 0.919 0.971 1.026 1.035 1.143 1.168 1.224 1.283 1.318 1.334 1.371 1.412 1.467 1.496 1.518 1.544 1.568 1.593 1.605 1.61 1.603 1.595 1.599 1.58 1.55 1.516 1.467 1.41 1.338 1.22 1.082 0.932 0.75 0.519 0.212 -0.142 -0.621 -1.224 -2.025 -3.076 -4.523 -6.624 -9.839 -13.251 -15.782 -17.796 -19.436 -20.858 -22.069 -23.146 -24.057 -24.902 -25.581 -26.191 -26.786 -27.348 -27.834 -28.249 -28.695 -29.087 -29.422 -29.776 -30.157 -30.474 -30.794 -31.129 -31.384 -31.625 -31.854 -32.093 -32.369 -32.555 -32.737 -33.029 -33.236 -33.445 -33.551 -33.773 -34.014 -34.269 -34.398 -34.638 -34.788 -34.918 -35.046 -35.337 -35.505 -35.671 -35.861 -36.092 -36.35 -36.615 -37.316 -10 ,17989 ,KEBNE ,16657522,Tue Nov 23 04:07:25 CET,Tue Nov 23 05:29:59 CET,0.0 0.192 0.33 0.452 0.542 0.619 0.68 0.738 0.844 0.899 0.945 0.937 1.037 1.069 1.124 1.157 1.201 1.223 1.261 1.305 1.355 1.385 1.422 1.452 1.471 1.495 1.512 1.525 1.53 1.524 1.511 1.485 1.454 1.41 1.351 1.285 1.209 1.111 0.989 0.847 0.693 0.495 0.216 -0.113 -0.574 -1.197 -2.002 -3.051 -4.512 -6.584 -9.749 -13.138 -15.702 -17.791 -19.491 -20.894 -22.054 -23.085 -23.977 -24.846 -25.582 -26.206 -26.78 -27.316 -27.8 -28.265 -28.733 -29.14 -29.511 -29.887 -30.265 -30.563 -30.864 -31.17 -31.402 -31.638 -31.873 -32.13 -32.386 -32.558 -32.75 -33.073 -33.272 -33.462 -33.565 -33.771 -33.983 -34.215 -34.339 -34.57 -34.684 -34.801 -34.943 -35.231 -35.4 -35.586 -35.786 -36.028 -36.282 -36.656 -37.452 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_227_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_227_57.txt deleted file mode 100644 index 053a00fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_227_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31289 ,KEBNE ,16657523,Tue Nov 23 04:07:25 CET,Tue Nov 23 05:30:37 CET,0.0 0.383 0.603 0.767 0.93 1.065 1.186 1.291 1.468 1.55 1.628 1.682 1.813 1.872 1.999 2.115 2.213 2.257 2.343 2.418 2.539 2.622 2.7 2.814 2.923 3.03 3.122 3.226 3.375 3.505 3.623 3.78 3.92 4.022 4.166 4.341 4.493 4.645 4.811 4.996 5.168 5.34 5.564 5.79 6.017 6.241 6.478 6.744 7.048 7.292 7.32 7.045 6.661 6.313 5.94 5.568 5.245 4.928 4.637 4.349 4.088 3.857 3.615 3.381 3.164 2.948 2.723 2.531 2.37 2.197 2.028 1.893 1.752 1.595 1.467 1.35 1.227 1.095 0.971 0.889 0.797 0.628 0.51 0.378 0.303 0.169 0.037 -0.108 -0.181 -0.331 -0.408 -0.485 -0.565 -0.775 -0.892 -1.001 -1.113 -1.221 -1.355 -1.526 -1.961 -2 ,32201 ,KEBNE ,16657524,Tue Nov 23 04:07:25 CET,Tue Nov 23 05:30:10 CET,0.0 0.235 0.39 0.547 0.699 0.809 0.91 1.011 1.174 1.247 1.308 1.364 1.507 1.569 1.688 1.793 1.912 1.973 2.08 2.175 2.299 2.39 2.484 2.607 2.716 2.824 2.938 3.035 3.171 3.312 3.442 3.593 3.734 3.861 4.01 4.193 4.355 4.522 4.696 4.866 5.048 5.259 5.511 5.764 6.01 6.233 6.498 6.752 6.97 7.119 7.104 6.857 6.474 6.046 5.638 5.181 4.77 4.44 4.144 3.842 3.567 3.337 3.135 2.935 2.742 2.563 2.371 2.188 2.024 1.845 1.665 1.526 1.367 1.208 1.096 0.979 0.848 0.709 0.564 0.46 0.364 0.204 0.082 -0.039 -0.102 -0.236 -0.378 -0.526 -0.603 -0.754 -0.843 -0.931 -1.015 -1.225 -1.351 -1.469 -1.595 -1.718 -1.857 -2.03 -2.423 -3 ,3024 ,KEBNE ,16657525,Tue Nov 23 04:07:25 CET,Tue Nov 23 05:30:44 CET,0.0 0.408 0.632 0.768 0.874 0.963 1.058 1.155 1.329 1.404 1.471 1.528 1.659 1.724 1.855 1.979 2.096 2.145 2.257 2.37 2.507 2.589 2.68 2.809 2.918 3.036 3.148 3.246 3.379 3.498 3.615 3.768 3.914 4.05 4.211 4.407 4.567 4.744 4.944 5.12 5.28 5.466 5.69 5.9 6.137 6.384 6.659 6.912 7.116 7.264 7.246 6.887 6.491 6.057 5.633 5.275 4.979 4.668 4.372 4.068 3.821 3.601 3.372 3.164 2.932 2.715 2.501 2.296 2.098 1.88 1.679 1.536 1.393 1.219 1.069 0.926 0.799 0.66 0.51 0.406 0.286 0.092 -0.034 -0.16 -0.229 -0.372 -0.51 -0.66 -0.742 -0.905 -1.016 -1.107 -1.199 -1.388 -1.493 -1.605 -1.739 -1.901 -2.062 -2.239 -2.65 -4 ,8398 ,KEBNE ,16657526,Tue Nov 23 04:08:27 CET,Tue Nov 23 05:33:18 CET,0.0 0.243 0.403 0.541 0.679 0.814 0.941 1.047 1.211 1.292 1.374 1.448 1.602 1.683 1.813 1.933 2.04 2.09 2.205 2.327 2.48 2.571 2.661 2.772 2.874 2.994 3.108 3.213 3.37 3.51 3.635 3.785 3.924 4.062 4.222 4.399 4.548 4.704 4.895 5.091 5.277 5.481 5.707 5.906 6.124 6.349 6.591 6.824 7.045 7.229 7.244 6.98 6.632 6.264 5.885 5.477 5.128 4.824 4.563 4.305 4.06 3.828 3.588 3.346 3.128 2.941 2.734 2.537 2.356 2.158 1.971 1.833 1.686 1.53 1.407 1.282 1.151 1.003 0.843 0.736 0.625 0.443 0.319 0.196 0.134 0.001 -0.13 -0.268 -0.341 -0.493 -0.61 -0.713 -0.822 -1.068 -1.18 -1.289 -1.431 -1.605 -1.792 -1.971 -2.278 -5 ,19175 ,KEBNE ,16657527,Tue Nov 23 04:08:30 CET,Tue Nov 23 05:32:34 CET,0.0 0.337 0.503 0.63 0.735 0.82 0.893 0.974 1.136 1.211 1.293 1.376 1.513 1.573 1.679 1.772 1.873 1.918 1.997 2.086 2.222 2.307 2.396 2.533 2.647 2.734 2.825 2.918 3.037 3.161 3.278 3.416 3.548 3.678 3.844 4.035 4.207 4.413 4.615 4.791 4.975 5.175 5.384 5.567 5.8 6.103 6.433 6.711 6.917 7.069 7.106 6.827 6.474 6.106 5.741 5.424 5.127 4.815 4.525 4.196 3.903 3.665 3.439 3.194 2.936 2.717 2.511 2.324 2.165 2.01 1.834 1.683 1.537 1.396 1.272 1.13 0.988 0.848 0.712 0.62 0.511 0.338 0.228 0.11 0.044 -0.092 -0.233 -0.402 -0.492 -0.645 -0.737 -0.824 -0.902 -1.065 -1.154 -1.246 -1.347 -1.476 -1.631 -1.825 -2.138 -6 ,20241 ,KEBNE ,16657528,Tue Nov 23 04:08:27 CET,Tue Nov 23 05:31:35 CET,0.0 0.478 0.659 0.816 0.99 1.148 1.298 1.425 1.634 1.728 1.81 1.898 2.059 2.131 2.26 2.38 2.496 2.553 2.658 2.786 2.966 3.065 3.169 3.301 3.43 3.568 3.691 3.792 3.918 4.042 4.169 4.33 4.489 4.637 4.8 4.971 5.098 5.25 5.439 5.615 5.806 6.047 6.283 6.506 6.762 6.982 7.21 7.452 7.673 7.817 7.75 7.386 6.977 6.599 6.233 5.856 5.496 5.137 4.837 4.564 4.314 4.079 3.862 3.658 3.449 3.264 3.059 2.876 2.725 2.551 2.368 2.207 2.046 1.887 1.76 1.634 1.507 1.374 1.234 1.129 1.022 0.862 0.752 0.639 0.575 0.434 0.285 0.119 0.038 -0.105 -0.172 -0.269 -0.375 -0.6 -0.734 -0.864 -0.991 -1.138 -1.301 -1.486 -1.819 -7 ,13035 ,KEBNE ,16657529,Tue Nov 23 04:09:30 CET,Tue Nov 23 05:35:17 CET,0.0 0.546 0.821 0.957 1.076 1.193 1.314 1.441 1.665 1.742 1.804 1.866 2.01 2.078 2.214 2.339 2.462 2.522 2.643 2.755 2.9 3.003 3.104 3.229 3.34 3.45 3.568 3.687 3.83 3.97 4.104 4.244 4.374 4.494 4.639 4.813 4.982 5.189 5.375 5.522 5.698 5.898 6.115 6.328 6.547 6.777 7.028 7.231 7.387 7.516 7.51 7.195 6.789 6.385 5.998 5.642 5.323 4.978 4.667 4.378 4.135 3.9 3.661 3.442 3.245 3.066 2.863 2.67 2.506 2.341 2.15 1.997 1.858 1.72 1.611 1.493 1.372 1.236 1.085 0.99 0.896 0.742 0.632 0.525 0.476 0.371 0.258 0.143 0.085 -0.048 -0.12 -0.189 -0.258 -0.406 -0.492 -0.585 -0.678 -0.789 -0.93 -1.116 -1.365 -8 ,7995 ,KEBNE ,16657530,Tue Nov 23 04:12:40 CET,Tue Nov 23 05:34:39 CET,0.0 0.285 0.428 0.567 0.673 0.782 0.891 0.989 1.161 1.239 1.321 1.402 1.543 1.597 1.683 1.781 1.892 1.942 2.047 2.148 2.283 2.374 2.458 2.576 2.715 2.856 2.968 3.064 3.206 3.361 3.491 3.621 3.767 3.926 4.1 4.274 4.419 4.564 4.725 4.913 5.127 5.341 5.568 5.799 6.031 6.287 6.581 6.828 7.022 7.16 7.152 6.918 6.612 6.237 5.856 5.497 5.168 4.855 4.574 4.309 4.089 3.861 3.632 3.399 3.167 2.956 2.733 2.532 2.351 2.17 1.989 1.839 1.684 1.528 1.408 1.293 1.172 1.03 0.881 0.765 0.635 0.463 0.363 0.255 0.194 0.077 -0.04 -0.167 -0.241 -0.392 -0.48 -0.568 -0.661 -0.889 -1.018 -1.142 -1.252 -1.381 -1.549 -1.796 -2.326 -9 ,2496 ,KEBNE ,16657531,Tue Nov 23 04:12:40 CET,Tue Nov 23 05:39:10 CET,0.0 0.625 0.857 0.985 1.094 1.201 1.313 1.43 1.635 1.729 1.808 1.894 2.046 2.115 2.244 2.377 2.499 2.547 2.63 2.72 2.859 2.957 3.057 3.194 3.329 3.444 3.547 3.652 3.782 3.909 4.023 4.146 4.271 4.407 4.566 4.727 4.864 5.017 5.184 5.36 5.552 5.768 6.023 6.256 6.5 6.758 6.996 7.214 7.419 7.551 7.535 7.293 6.971 6.604 6.228 5.85 5.512 5.218 4.938 4.66 4.423 4.199 3.979 3.753 3.523 3.294 3.077 2.892 2.722 2.552 2.375 2.228 2.064 1.896 1.768 1.63 1.481 1.316 1.157 1.048 0.931 0.769 0.655 0.54 0.475 0.33 0.187 0.045 -0.032 -0.183 -0.261 -0.364 -0.473 -0.674 -0.798 -0.941 -1.099 -1.269 -1.436 -1.684 -2.332 -10 ,7338 ,KEBNE ,16657532,Tue Nov 23 04:12:40 CET,Tue Nov 23 05:35:07 CET,0.0 0.379 0.583 0.724 0.851 0.966 1.07 1.172 1.4 1.51 1.605 1.697 1.847 1.924 2.05 2.159 2.262 2.311 2.417 2.522 2.669 2.763 2.859 3.001 3.127 3.239 3.346 3.455 3.587 3.696 3.813 3.951 4.076 4.219 4.388 4.56 4.723 4.896 5.059 5.237 5.436 5.657 5.907 6.127 6.358 6.6 6.851 7.087 7.297 7.454 7.429 7.15 6.81 6.389 5.954 5.558 5.203 4.86 4.575 4.294 4.045 3.832 3.622 3.416 3.226 3.05 2.842 2.654 2.496 2.321 2.134 1.976 1.824 1.661 1.534 1.403 1.279 1.154 1.005 0.905 0.798 0.616 0.497 0.394 0.342 0.214 0.079 -0.051 -0.121 -0.273 -0.378 -0.487 -0.589 -0.795 -0.912 -1.027 -1.168 -1.318 -1.473 -1.662 -1.971 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_235_167.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_235_167.txt deleted file mode 100644 index 6112e153..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_235_167.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11099 ,KEBNE ,16657533,Tue Nov 23 04:12:40 CET,Tue Nov 23 05:37:40 CET,0.0 0.836 1.192 1.476 1.716 1.93 2.101 2.268 2.577 2.719 2.874 3.058 3.299 3.425 3.669 3.901 4.102 4.191 4.369 4.553 4.8 4.947 5.093 5.299 5.507 5.713 5.896 6.064 6.274 6.496 6.729 7.002 7.261 7.482 7.717 8.01 8.296 8.592 8.9 9.231 9.57 9.924 10.296 10.646 11.046 11.514 12.035 12.531 13.09 13.648 14.106 14.344 14.249 14.042 13.797 13.537 13.297 13.085 12.89 12.688 12.521 12.347 12.177 12.032 11.884 11.733 11.577 11.44 11.313 11.19 11.066 10.95 10.834 10.72 10.622 10.501 10.383 10.269 10.14 10.034 9.921 9.77 9.669 9.576 9.524 9.39 9.266 9.12 9.035 8.846 8.749 8.639 8.538 8.34 8.236 8.117 7.978 7.826 7.637 7.396 7.077 -2 ,18079 ,KEBNE ,16657534,Tue Nov 23 04:13:44 CET,Tue Nov 23 05:40:27 CET,0.0 0.998 1.322 1.578 1.786 1.969 2.123 2.257 2.512 2.629 2.738 2.851 3.064 3.162 3.347 3.533 3.711 3.785 3.949 4.126 4.373 4.513 4.642 4.856 5.067 5.242 5.383 5.525 5.732 5.962 6.183 6.446 6.681 6.888 7.143 7.416 7.648 7.888 8.155 8.472 8.808 9.164 9.55 9.91 10.372 10.86 11.336 11.829 12.292 12.678 12.993 13.062 12.887 12.595 12.304 12.028 11.732 11.397 11.098 10.814 10.568 10.362 10.154 9.966 9.786 9.615 9.438 9.27 9.132 8.98 8.815 8.689 8.542 8.364 8.226 8.099 7.965 7.828 7.684 7.578 7.484 7.343 7.221 7.082 7.017 6.89 6.744 6.581 6.502 6.311 6.204 6.102 6.01 5.796 5.695 5.599 5.445 5.246 5.029 4.782 4.118 -3 ,7403 ,KEBNE ,16657535,Tue Nov 23 04:13:44 CET,Tue Nov 23 05:40:12 CET,0.0 0.736 1.039 1.26 1.455 1.605 1.735 1.851 2.079 2.2 2.3 2.38 2.575 2.655 2.82 2.989 3.167 3.244 3.377 3.519 3.735 3.876 4.006 4.199 4.388 4.57 4.749 4.908 5.088 5.242 5.39 5.581 5.778 5.969 6.176 6.422 6.642 6.868 7.114 7.364 7.625 7.911 8.259 8.608 8.954 9.278 9.653 10.051 10.457 10.881 11.329 11.505 11.403 11.193 10.942 10.678 10.418 10.133 9.882 9.625 9.394 9.204 9.017 8.838 8.662 8.481 8.284 8.109 7.956 7.798 7.637 7.496 7.347 7.189 7.061 6.916 6.764 6.623 6.478 6.373 6.262 6.091 5.974 5.846 5.784 5.673 5.545 5.39 5.311 5.13 5.069 4.984 4.888 4.674 4.564 4.454 4.343 4.21 4.048 3.84 3.416 -4 ,3543 ,KEBNE ,16657536,Tue Nov 23 04:17:55 CET,Tue Nov 23 05:40:09 CET,0.0 0.917 1.245 1.476 1.678 1.872 2.032 2.157 2.382 2.516 2.655 2.781 2.989 3.09 3.294 3.481 3.648 3.737 3.926 4.111 4.359 4.497 4.627 4.808 4.986 5.155 5.318 5.481 5.708 5.935 6.129 6.342 6.553 6.769 6.997 7.24 7.476 7.705 7.971 8.283 8.578 8.882 9.233 9.582 9.974 10.384 10.835 11.297 11.787 12.307 12.783 12.891 12.719 12.51 12.249 11.956 11.677 11.401 11.157 10.898 10.673 10.471 10.278 10.098 9.921 9.759 9.584 9.411 9.253 9.096 8.939 8.804 8.674 8.525 8.401 8.273 8.144 8.003 7.843 7.743 7.629 7.443 7.321 7.19 7.123 6.98 6.838 6.681 6.593 6.397 6.32 6.22 6.126 5.91 5.781 5.649 5.512 5.372 5.182 4.945 4.594 -6 ,7225 ,KEBNE ,16657538,Tue Nov 23 04:17:55 CET,Tue Nov 23 05:44:42 CET,0.0 0.737 1.046 1.328 1.548 1.711 1.876 2.028 2.29 2.415 2.521 2.619 2.83 2.94 3.141 3.32 3.492 3.576 3.736 3.877 4.08 4.228 4.376 4.583 4.76 4.906 5.048 5.186 5.348 5.502 5.655 5.837 6.009 6.169 6.384 6.64 6.842 7.06 7.31 7.548 7.806 8.103 8.465 8.841 9.234 9.652 10.097 10.562 11.067 11.53 11.889 11.859 11.655 11.391 11.058 10.763 10.521 10.258 10.016 9.781 9.549 9.336 9.135 8.948 8.781 8.602 8.41 8.264 8.128 7.972 7.8 7.658 7.53 7.404 7.299 7.177 7.05 6.934 6.814 6.725 6.638 6.486 6.375 6.259 6.2 6.08 5.948 5.818 5.75 5.565 5.495 5.402 5.301 5.089 4.971 4.82 4.651 4.486 4.331 4.111 3.265 -7 ,17553 ,KEBNE ,16657539,Tue Nov 23 04:17:54 CET,Tue Nov 23 05:39:15 CET,0.0 1.277 1.674 1.953 2.18 2.335 2.461 2.582 2.814 2.931 3.056 3.164 3.362 3.45 3.652 3.84 3.984 4.061 4.218 4.381 4.609 4.745 4.883 5.082 5.263 5.432 5.606 5.776 5.984 6.196 6.402 6.628 6.828 7.009 7.199 7.424 7.652 7.891 8.165 8.466 8.763 9.092 9.477 9.851 10.252 10.63 11.013 11.45 11.956 12.512 12.915 12.969 12.821 12.615 12.353 12.048 11.82 11.598 11.386 11.172 10.966 10.77 10.574 10.38 10.198 10.032 9.847 9.661 9.502 9.356 9.21 9.074 8.932 8.788 8.655 8.499 8.351 8.217 8.079 7.979 7.878 7.721 7.591 7.443 7.38 7.267 7.139 6.988 6.911 6.732 6.673 6.572 6.47 6.291 6.19 6.071 5.926 5.766 5.582 5.384 5.125 -8 ,4025 ,KEBNE ,16657540,Tue Nov 23 04:17:54 CET,Tue Nov 23 05:44:10 CET,0.0 0.882 1.18 1.415 1.634 1.811 1.987 2.145 2.371 2.475 2.594 2.71 2.913 3.006 3.189 3.367 3.521 3.587 3.72 3.858 4.056 4.169 4.29 4.478 4.635 4.789 4.934 5.066 5.244 5.427 5.593 5.794 5.993 6.166 6.357 6.578 6.773 6.995 7.25 7.496 7.739 8.01 8.34 8.681 9.052 9.443 9.883 10.315 10.737 11.162 11.477 11.477 11.297 11.021 10.746 10.484 10.191 9.919 9.694 9.438 9.214 9.014 8.824 8.639 8.423 8.21 8.013 7.857 7.724 7.574 7.392 7.239 7.064 6.873 6.762 6.646 6.509 6.366 6.216 6.106 5.987 5.809 5.687 5.569 5.508 5.381 5.252 5.112 5.035 4.855 4.812 4.738 4.641 4.413 4.291 4.162 4.033 3.879 3.7 3.478 2.634 -9 ,6789 ,KEBNE ,16657541,Tue Nov 23 04:17:54 CET,Tue Nov 23 05:44:52 CET,0.0 1.251 1.573 1.804 2.053 2.266 2.428 2.574 2.853 2.962 3.074 3.196 3.399 3.496 3.685 3.86 4.029 4.112 4.255 4.386 4.58 4.701 4.815 4.978 5.13 5.288 5.444 5.581 5.747 5.907 6.07 6.243 6.407 6.603 6.839 7.075 7.279 7.507 7.759 8.007 8.253 8.56 8.917 9.229 9.569 9.927 10.294 10.685 11.142 11.599 11.952 11.952 11.81 11.553 11.254 10.989 10.746 10.489 10.24 9.988 9.768 9.573 9.38 9.178 8.991 8.84 8.673 8.524 8.377 8.2 8.028 7.897 7.755 7.591 7.463 7.342 7.206 7.071 6.949 6.858 6.764 6.606 6.497 6.387 6.323 6.203 6.07 5.918 5.845 5.658 5.573 5.476 5.385 5.192 5.078 4.935 4.787 4.652 4.476 4.255 3.757 -10 ,24112 ,KEBNE ,16657542,Tue Nov 23 04:17:55 CET,Tue Nov 23 05:44:07 CET,0.0 1.107 1.419 1.66 1.856 2.037 2.205 2.347 2.624 2.749 2.859 2.963 3.172 3.266 3.439 3.621 3.795 3.879 4.045 4.211 4.446 4.605 4.76 4.968 5.156 5.336 5.521 5.689 5.884 6.08 6.269 6.485 6.714 6.936 7.185 7.462 7.709 7.986 8.274 8.564 8.862 9.184 9.563 9.924 10.296 10.696 11.158 11.62 12.13 12.658 13.042 13.096 12.964 12.758 12.541 12.292 12.035 11.799 11.582 11.334 11.082 10.867 10.668 10.47 10.286 10.104 9.91 9.747 9.613 9.457 9.271 9.13 8.998 8.861 8.73 8.592 8.472 8.356 8.228 8.121 8.0 7.812 7.682 7.557 7.494 7.356 7.219 7.092 7.032 6.858 6.812 6.727 6.636 6.432 6.312 6.185 6.048 5.9 5.74 5.561 4.955 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_235_224.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_235_224.txt deleted file mode 100644 index cb382d92..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_235_224.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15079 ,KEBNE ,16657543,Tue Nov 23 04:17:55 CET,Tue Nov 23 05:44:13 CET,0.0 0.797 1.043 1.275 1.453 1.607 1.751 1.888 2.16 2.276 2.385 2.503 2.717 2.819 3.002 3.181 3.374 3.471 3.652 3.815 4.044 4.194 4.344 4.573 4.809 5.045 5.271 5.486 5.751 5.999 6.256 6.575 6.866 7.162 7.527 7.952 8.344 8.774 9.267 9.811 10.398 11.057 11.821 12.624 13.576 14.629 15.896 17.403 19.253 21.517 24.359 26.919 28.571 29.689 30.468 31.045 31.442 31.698 31.852 31.946 31.959 31.922 31.883 31.806 31.72 31.669 31.615 31.552 31.465 31.355 31.254 31.173 31.092 31.015 30.969 30.912 30.832 30.75 30.659 30.597 30.535 30.434 30.364 30.286 30.242 30.138 30.023 29.902 29.839 29.701 29.629 29.547 29.461 29.281 29.185 29.084 28.97 28.8 28.603 28.388 27.082 -2 ,3800 ,KEBNE ,16657544,Tue Nov 23 04:17:55 CET,Tue Nov 23 05:44:50 CET,0.0 0.819 1.094 1.274 1.43 1.582 1.748 1.933 2.247 2.375 2.504 2.682 2.923 3.04 3.258 3.465 3.666 3.761 3.939 4.124 4.393 4.565 4.732 4.983 5.235 5.461 5.683 5.909 6.192 6.465 6.739 7.085 7.417 7.738 8.111 8.527 8.925 9.375 9.888 10.425 10.984 11.615 12.359 13.12 14.033 15.093 16.328 17.768 19.556 21.741 24.509 26.99 28.545 29.597 30.326 30.846 31.189 31.462 31.691 31.869 31.97 32.002 31.983 31.943 31.882 31.796 31.72 31.668 31.613 31.531 31.414 31.298 31.173 31.059 30.966 30.87 30.787 30.702 30.608 30.542 30.463 30.324 30.232 30.13 30.073 29.968 29.854 29.74 29.685 29.541 29.442 29.353 29.267 29.058 28.941 28.822 28.69 28.532 28.338 28.063 26.325 -3 ,5369 ,KEBNE ,16657545,Tue Nov 23 04:17:55 CET,Tue Nov 23 05:43:35 CET,0.0 0.631 0.885 1.092 1.281 1.45 1.602 1.733 1.973 2.089 2.2 2.319 2.521 2.617 2.805 2.999 3.187 3.272 3.445 3.617 3.873 4.05 4.205 4.431 4.66 4.873 5.085 5.288 5.565 5.859 6.14 6.465 6.781 7.105 7.47 7.886 8.305 8.762 9.249 9.773 10.334 10.954 11.706 12.49 13.396 14.423 15.65 17.137 18.957 21.145 24.027 26.598 28.158 29.167 29.854 30.384 30.718 30.895 31.033 31.157 31.251 31.329 31.374 31.38 31.388 31.392 31.372 31.327 31.278 31.22 31.114 31.012 30.903 30.815 30.752 30.672 30.601 30.516 30.397 30.321 30.256 30.134 30.037 29.938 29.891 29.806 29.711 29.594 29.527 29.383 29.309 29.221 29.128 28.933 28.81 28.684 28.55 28.33 28.056 27.769 27.019 -4 ,30320 ,KEBNE ,16657546,Tue Nov 23 04:20:00 CET,Tue Nov 23 05:40:24 CET,0.0 0.621 0.838 1.042 1.227 1.388 1.541 1.704 2.012 2.141 2.267 2.4 2.614 2.716 2.923 3.137 3.361 3.468 3.647 3.818 4.061 4.225 4.396 4.643 4.9 5.144 5.356 5.553 5.821 6.086 6.361 6.706 7.024 7.324 7.675 8.082 8.489 8.938 9.414 9.933 10.508 11.162 11.919 12.704 13.648 14.719 15.972 17.472 19.317 21.54 24.431 26.948 28.555 29.686 30.467 31.044 31.443 31.722 31.923 32.071 32.141 32.185 32.229 32.268 32.283 32.284 32.27 32.205 32.115 32.048 31.995 31.926 31.84 31.736 31.655 31.573 31.478 31.366 31.235 31.148 31.068 30.94 30.827 30.718 30.674 30.572 30.44 30.309 30.244 30.079 29.945 29.852 29.759 29.516 29.387 29.234 29.019 28.76 28.478 28.096 26.637 -5 ,17911 ,KEBNE ,16657547,Tue Nov 23 04:20:00 CET,Tue Nov 23 05:40:59 CET,0.0 0.845 1.075 1.289 1.469 1.636 1.805 1.953 2.23 2.376 2.508 2.614 2.831 2.941 3.135 3.311 3.487 3.577 3.751 3.915 4.185 4.371 4.538 4.775 4.999 5.205 5.41 5.621 5.889 6.159 6.423 6.761 7.103 7.416 7.776 8.171 8.556 8.992 9.49 10.019 10.553 11.16 11.902 12.695 13.627 14.706 15.999 17.473 19.263 21.499 24.366 26.918 28.543 29.633 30.387 30.939 31.309 31.524 31.684 31.802 31.826 31.855 31.873 31.857 31.827 31.793 31.761 31.711 31.659 31.6 31.537 31.481 31.39 31.262 31.159 31.061 30.986 30.893 30.752 30.651 30.546 30.407 30.289 30.158 30.101 29.962 29.809 29.638 29.546 29.385 29.272 29.148 28.986 28.6 28.39 28.175 27.939 27.655 27.323 26.851 24.632 -6 ,11182 ,KEBNE ,16657548,Tue Nov 23 04:20:00 CET,Tue Nov 23 05:42:17 CET,0.0 0.771 1.032 1.235 1.385 1.521 1.66 1.791 2.043 2.162 2.283 2.399 2.604 2.709 2.934 3.147 3.342 3.432 3.592 3.744 3.966 4.129 4.292 4.514 4.742 4.968 5.185 5.395 5.666 5.92 6.162 6.487 6.81 7.119 7.473 7.854 8.216 8.634 9.099 9.613 10.17 10.795 11.569 12.373 13.288 14.324 15.585 17.083 18.877 21.05 23.778 26.24 27.809 28.842 29.575 30.114 30.485 30.758 30.94 31.075 31.148 31.192 31.204 31.172 31.074 30.971 30.921 30.892 30.855 30.804 30.711 30.582 30.443 30.302 30.207 30.117 30.002 29.896 29.795 29.718 29.621 29.463 29.353 29.241 29.18 29.051 28.897 28.705 28.61 28.441 28.302 28.168 28.021 27.748 27.59 27.412 27.205 26.943 26.583 26.076 24.149 -7 ,18275 ,KEBNE ,16657549,Tue Nov 23 04:20:00 CET,Tue Nov 23 05:45:59 CET,0.0 0.766 0.997 1.178 1.341 1.5 1.633 1.772 2.031 2.145 2.261 2.388 2.603 2.704 2.898 3.097 3.29 3.379 3.547 3.711 3.976 4.143 4.302 4.55 4.793 5.02 5.222 5.417 5.682 5.955 6.227 6.562 6.884 7.185 7.533 7.938 8.345 8.786 9.244 9.764 10.327 10.981 11.776 12.559 13.467 14.501 15.726 17.136 18.869 21.056 23.828 26.269 27.792 28.787 29.459 29.956 30.297 30.564 30.747 30.866 30.972 31.063 31.113 31.14 31.129 31.109 31.087 31.044 30.987 30.922 30.811 30.687 30.55 30.398 30.298 30.202 30.088 29.984 29.899 29.834 29.761 29.64 29.548 29.448 29.398 29.294 29.169 29.032 28.963 28.807 28.719 28.63 28.538 28.325 28.208 28.092 27.958 27.783 27.589 27.34 26.295 -8 ,19096 ,KEBNE ,16657550,Tue Nov 23 04:20:00 CET,Tue Nov 23 05:41:04 CET,0.0 0.875 1.221 1.465 1.63 1.788 1.935 2.065 2.291 2.403 2.511 2.6 2.794 2.89 3.08 3.26 3.445 3.534 3.711 3.885 4.123 4.273 4.42 4.633 4.842 5.056 5.266 5.468 5.736 5.996 6.256 6.571 6.855 7.139 7.487 7.864 8.24 8.681 9.142 9.652 10.229 10.882 11.645 12.447 13.398 14.449 15.694 17.174 18.99 21.228 24.158 26.729 28.315 29.368 30.1 30.673 31.065 31.276 31.411 31.553 31.668 31.759 31.804 31.802 31.81 31.817 31.772 31.724 31.676 31.622 31.584 31.509 31.389 31.264 31.187 31.119 31.047 30.961 30.866 30.779 30.668 30.505 30.397 30.298 30.236 30.076 29.923 29.782 29.708 29.551 29.462 29.37 29.265 29.035 28.889 28.702 28.481 28.226 27.874 27.398 25.763 -9 ,13634 ,KEBNE ,16657551,Tue Nov 23 04:24:11 CET,Tue Nov 23 05:46:28 CET,0.0 0.804 1.157 1.352 1.512 1.667 1.806 1.931 2.183 2.315 2.446 2.567 2.794 2.922 3.15 3.371 3.578 3.664 3.83 4.003 4.271 4.442 4.587 4.814 5.05 5.273 5.483 5.702 6.002 6.289 6.555 6.877 7.199 7.512 7.88 8.289 8.695 9.144 9.629 10.15 10.683 11.292 12.022 12.789 13.725 14.76 15.989 17.467 19.244 21.409 24.245 26.758 28.303 29.346 30.079 30.641 31.043 31.347 31.559 31.703 31.757 31.77 31.802 31.817 31.788 31.747 31.692 31.629 31.573 31.51 31.437 31.37 31.286 31.183 31.107 31.016 30.896 30.759 30.593 30.474 30.354 30.188 30.07 29.938 29.87 29.741 29.6 29.44 29.34 29.147 28.995 28.879 28.758 28.465 28.306 28.127 27.916 27.666 27.365 26.945 24.404 -10 ,28306 ,KEBNE ,16657552,Tue Nov 23 04:24:11 CET,Tue Nov 23 05:45:34 CET,0.0 0.798 1.069 1.287 1.45 1.593 1.736 1.862 2.129 2.266 2.388 2.513 2.728 2.838 3.038 3.221 3.41 3.502 3.672 3.833 4.066 4.215 4.369 4.595 4.811 5.024 5.229 5.432 5.692 5.943 6.198 6.505 6.815 7.116 7.461 7.863 8.246 8.693 9.184 9.71 10.28 10.916 11.654 12.4 13.313 14.368 15.591 17.035 18.784 20.944 23.745 26.247 27.841 28.904 29.627 30.162 30.531 30.739 30.839 30.919 30.939 30.922 30.898 30.872 30.843 30.794 30.715 30.622 30.539 30.472 30.392 30.323 30.249 30.141 30.048 29.961 29.876 29.773 29.656 29.576 29.49 29.332 29.225 29.118 29.065 28.972 28.867 28.722 28.639 28.475 28.378 28.292 28.198 28.016 27.933 27.832 27.69 27.506 27.31 27.06 26.223 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_155.txt deleted file mode 100644 index 523add87..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27551 ,KEBNE ,16657553,Tue Nov 23 04:24:11 CET,Tue Nov 23 05:46:09 CET,0.0 0.262 0.458 0.625 0.765 0.874 0.986 1.102 1.284 1.367 1.455 1.535 1.702 1.783 1.931 2.075 2.218 2.283 2.409 2.532 2.709 2.823 2.923 3.076 3.238 3.384 3.523 3.657 3.818 3.974 4.109 4.273 4.454 4.621 4.805 5.028 5.255 5.479 5.706 5.971 6.237 6.493 6.773 7.071 7.437 7.775 8.086 8.346 8.496 8.481 8.249 7.635 6.871 6.139 5.483 4.871 4.288 3.719 3.225 2.771 2.388 2.031 1.662 1.32 1.033 0.753 0.454 0.206 -0.002 -0.223 -0.454 -0.642 -0.831 -1.032 -1.196 -1.367 -1.545 -1.728 -1.911 -2.041 -2.172 -2.391 -2.543 -2.692 -2.771 -2.926 -3.076 -3.238 -3.338 -3.526 -3.623 -3.729 -3.849 -4.109 -4.236 -4.36 -4.524 -4.73 -4.935 -5.141 -5.508 -2 ,25239 ,KEBNE ,16657554,Tue Nov 23 04:24:11 CET,Tue Nov 23 05:46:55 CET,0.0 0.333 0.521 0.658 0.782 0.886 0.981 1.076 1.245 1.333 1.416 1.466 1.623 1.693 1.809 1.922 2.046 2.106 2.202 2.296 2.448 2.541 2.628 2.767 2.892 3.013 3.135 3.247 3.396 3.539 3.683 3.867 4.029 4.173 4.347 4.533 4.706 4.888 5.089 5.329 5.573 5.829 6.12 6.399 6.717 7.07 7.451 7.838 8.131 8.215 8.053 7.603 7.073 6.514 5.968 5.445 4.941 4.475 4.079 3.689 3.335 3.012 2.716 2.437 2.169 1.919 1.671 1.459 1.276 1.076 0.854 0.66 0.464 0.27 0.125 -0.026 -0.193 -0.374 -0.559 -0.697 -0.832 -1.022 -1.163 -1.304 -1.377 -1.526 -1.678 -1.843 -1.926 -2.103 -2.209 -2.318 -2.437 -2.677 -2.816 -2.979 -3.157 -3.313 -3.478 -3.761 -4.258 -3 ,23209 ,KEBNE ,16657555,Tue Nov 23 04:24:11 CET,Tue Nov 23 05:46:10 CET,0.0 0.472 0.7 0.864 0.995 1.103 1.208 1.305 1.497 1.589 1.678 1.747 1.909 1.982 2.128 2.272 2.407 2.467 2.587 2.697 2.84 2.941 3.041 3.197 3.339 3.465 3.605 3.743 3.908 4.06 4.209 4.404 4.585 4.765 4.986 5.222 5.436 5.659 5.898 6.158 6.434 6.726 7.041 7.368 7.692 8.018 8.346 8.596 8.832 9.126 9.243 8.736 8.085 7.401 6.763 6.19 5.672 5.182 4.747 4.315 3.945 3.598 3.265 2.956 2.662 2.391 2.104 1.86 1.641 1.398 1.172 0.99 0.787 0.577 0.41 0.231 0.045 -0.151 -0.347 -0.476 -0.617 -0.84 -0.987 -1.14 -1.225 -1.408 -1.589 -1.763 -1.857 -2.048 -2.167 -2.274 -2.387 -2.63 -2.763 -2.907 -3.055 -3.237 -3.437 -3.624 -4.151 -4 ,15934 ,KEBNE ,16657556,Tue Nov 23 04:26:15 CET,Tue Nov 23 05:48:58 CET,0.0 0.495 0.712 0.86 0.995 1.126 1.239 1.324 1.469 1.536 1.603 1.665 1.827 1.894 2.034 2.159 2.273 2.326 2.419 2.525 2.685 2.782 2.887 3.036 3.171 3.305 3.434 3.559 3.715 3.878 4.03 4.202 4.373 4.533 4.692 4.866 5.048 5.265 5.498 5.716 5.958 6.271 6.652 6.998 7.332 7.626 7.891 8.188 8.477 8.64 8.569 8.025 7.316 6.68 6.059 5.417 4.844 4.339 3.901 3.443 3.058 2.721 2.374 2.027 1.732 1.476 1.189 0.945 0.738 0.508 0.277 0.079 -0.135 -0.34 -0.486 -0.633 -0.788 -0.963 -1.15 -1.277 -1.411 -1.61 -1.757 -1.913 -1.989 -2.154 -2.33 -2.52 -2.623 -2.817 -2.929 -3.036 -3.16 -3.413 -3.552 -3.704 -3.855 -4.043 -4.27 -4.514 -5.129 -5 ,13427 ,KEBNE ,16657557,Tue Nov 23 04:26:15 CET,Tue Nov 23 05:50:43 CET,0.0 0.458 0.655 0.804 0.928 1.057 1.171 1.279 1.475 1.56 1.65 1.734 1.896 1.968 2.125 2.278 2.413 2.476 2.601 2.714 2.89 3.004 3.097 3.242 3.385 3.531 3.673 3.802 3.967 4.125 4.277 4.452 4.631 4.809 5.003 5.224 5.46 5.715 5.959 6.207 6.46 6.723 7.01 7.317 7.702 8.07 8.387 8.649 8.899 9.1 9.004 8.525 7.951 7.331 6.762 6.265 5.804 5.378 4.988 4.576 4.223 3.897 3.576 3.288 3.01 2.747 2.493 2.276 2.072 1.855 1.638 1.458 1.264 1.062 0.896 0.709 0.52 0.332 0.142 0.01 -0.127 -0.311 -0.427 -0.561 -0.632 -0.778 -0.929 -1.091 -1.184 -1.367 -1.45 -1.543 -1.652 -1.893 -2.015 -2.13 -2.247 -2.387 -2.552 -2.782 -3.193 -6 ,19289 ,KEBNE ,16657558,Tue Nov 23 04:27:18 CET,Tue Nov 23 05:52:10 CET,0.0 0.505 0.737 0.923 1.114 1.257 1.373 1.489 1.706 1.802 1.897 1.985 2.167 2.24 2.39 2.551 2.704 2.767 2.886 3.01 3.194 3.31 3.42 3.579 3.74 3.899 4.046 4.181 4.358 4.526 4.677 4.849 5.015 5.186 5.384 5.589 5.783 6.002 6.248 6.519 6.796 7.098 7.443 7.768 8.14 8.555 8.98 9.378 9.79 10.124 10.21 9.846 9.355 8.845 8.329 7.811 7.328 6.882 6.502 6.096 5.741 5.445 5.164 4.898 4.643 4.404 4.157 3.942 3.755 3.562 3.364 3.196 3.025 2.832 2.67 2.519 2.354 2.168 1.985 1.86 1.74 1.561 1.422 1.277 1.209 1.058 0.892 0.727 0.64 0.46 0.373 0.27 0.143 -0.121 -0.256 -0.41 -0.6 -0.795 -1.034 -1.369 -1.841 -7 ,7226 ,KEBNE ,16657559,Tue Nov 23 04:31:28 CET,Tue Nov 23 05:54:44 CET,0.0 0.46 0.634 0.758 0.873 0.983 1.084 1.188 1.371 1.461 1.551 1.639 1.812 1.899 2.048 2.172 2.291 2.35 2.474 2.592 2.76 2.868 2.968 3.126 3.276 3.411 3.533 3.659 3.832 3.98 4.124 4.318 4.523 4.718 4.939 5.173 5.377 5.603 5.827 6.047 6.267 6.498 6.792 7.08 7.371 7.623 7.851 8.064 8.287 8.448 8.19 7.603 6.966 6.251 5.621 5.061 4.556 4.166 3.833 3.46 3.137 2.831 2.534 2.255 1.993 1.782 1.56 1.349 1.177 0.998 0.805 0.645 0.479 0.298 0.154 0.004 -0.16 -0.335 -0.519 -0.639 -0.752 -0.938 -1.065 -1.201 -1.266 -1.384 -1.506 -1.658 -1.745 -1.916 -2.002 -2.089 -2.196 -2.467 -2.613 -2.763 -2.9 -3.047 -3.229 -3.47 -4.186 -8 ,31938 ,KEBNE ,16657560,Tue Nov 23 04:31:28 CET,Tue Nov 23 05:54:54 CET,0.0 0.399 0.575 0.729 0.861 0.976 1.071 1.161 1.333 1.423 1.515 1.59 1.765 1.844 1.968 2.088 2.202 2.259 2.376 2.48 2.626 2.729 2.821 2.953 3.095 3.236 3.369 3.497 3.666 3.83 3.988 4.159 4.338 4.53 4.734 4.977 5.195 5.396 5.585 5.769 5.969 6.199 6.467 6.772 7.113 7.417 7.688 7.892 8.038 8.117 7.99 7.543 6.898 6.237 5.674 5.139 4.627 4.111 3.678 3.27 2.917 2.611 2.324 2.058 1.791 1.537 1.272 1.026 0.808 0.585 0.357 0.164 -0.035 -0.244 -0.412 -0.582 -0.746 -0.914 -1.096 -1.227 -1.366 -1.59 -1.751 -1.913 -1.996 -2.168 -2.336 -2.52 -2.617 -2.812 -2.936 -3.035 -3.139 -3.366 -3.495 -3.617 -3.731 -3.863 -4.08 -4.343 -4.688 -9 ,27649 ,KEBNE ,16657561,Tue Nov 23 04:31:28 CET,Tue Nov 23 05:55:58 CET,0.0 0.528 0.774 0.947 1.08 1.211 1.326 1.435 1.658 1.757 1.85 1.941 2.11 2.182 2.31 2.439 2.577 2.644 2.772 2.897 3.062 3.166 3.273 3.42 3.554 3.687 3.815 3.949 4.116 4.273 4.437 4.62 4.794 4.965 5.147 5.369 5.587 5.826 6.102 6.377 6.63 6.913 7.218 7.493 7.787 8.034 8.317 8.689 9.044 9.296 9.365 9.086 8.692 8.253 7.782 7.311 6.856 6.393 5.998 5.633 5.314 5.017 4.718 4.44 4.173 3.924 3.669 3.429 3.225 3.012 2.766 2.555 2.352 2.141 1.962 1.783 1.605 1.41 1.206 1.079 0.955 0.743 0.593 0.443 0.365 0.214 0.069 -0.102 -0.198 -0.388 -0.513 -0.615 -0.724 -1.007 -1.162 -1.301 -1.455 -1.646 -1.851 -2.152 -2.648 -10 ,16760 ,KEBNE ,16657562,Tue Nov 23 04:31:28 CET,Tue Nov 23 05:55:15 CET,0.0 0.379 0.54 0.7 0.825 0.928 1.034 1.13 1.297 1.38 1.458 1.499 1.655 1.73 1.865 1.991 2.124 2.192 2.331 2.457 2.634 2.742 2.843 2.998 3.138 3.276 3.419 3.55 3.703 3.838 3.974 4.146 4.325 4.485 4.67 4.875 5.04 5.228 5.433 5.678 5.939 6.178 6.434 6.642 6.884 7.18 7.49 7.766 7.996 8.153 8.031 7.455 6.692 6.101 5.602 5.101 4.623 4.159 3.776 3.372 2.99 2.65 2.301 1.972 1.686 1.423 1.154 0.927 0.718 0.488 0.244 0.039 -0.166 -0.386 -0.563 -0.742 -0.936 -1.133 -1.318 -1.447 -1.577 -1.787 -1.933 -2.066 -2.139 -2.292 -2.466 -2.667 -2.765 -2.956 -3.066 -3.177 -3.301 -3.545 -3.674 -3.817 -3.959 -4.094 -4.261 -4.478 -4.878 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_163.txt deleted file mode 100644 index ac9e6fba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8107 ,KEBNE ,16657563,Tue Nov 23 04:31:27 CET,Tue Nov 23 05:53:40 CET,0.0 0.49 0.703 0.859 0.974 1.077 1.157 1.223 1.363 1.439 1.508 1.55 1.695 1.749 1.847 1.918 1.977 2.007 2.064 2.119 2.201 2.252 2.3 2.367 2.419 2.477 2.537 2.582 2.636 2.68 2.719 2.77 2.802 2.83 2.861 2.897 2.935 2.936 2.904 2.846 2.743 2.576 2.339 2.07 1.726 1.349 0.899 0.253 -0.758 -2.457 -5.284 -8.476 -11.002 -13.051 -14.787 -16.373 -17.667 -18.714 -19.579 -20.446 -21.204 -21.876 -22.492 -23.048 -23.558 -24.014 -24.488 -24.919 -25.29 -25.671 -26.05 -26.352 -26.672 -27.012 -27.263 -27.511 -27.759 -28.024 -28.279 -28.442 -28.62 -28.901 -29.095 -29.294 -29.396 -29.6 -29.81 -30.043 -30.162 -30.408 -30.556 -30.691 -30.839 -31.185 -31.38 -31.571 -31.765 -31.95 -32.16 -32.421 -32.928 -2 ,25534 ,KEBNE ,16657564,Tue Nov 23 04:31:27 CET,Tue Nov 23 05:53:01 CET,0.0 0.422 0.653 0.848 0.988 1.091 1.173 1.251 1.385 1.441 1.493 1.497 1.615 1.654 1.745 1.818 1.875 1.901 1.949 2.006 2.107 2.165 2.209 2.266 2.311 2.355 2.399 2.424 2.464 2.519 2.556 2.569 2.589 2.623 2.643 2.641 2.608 2.558 2.511 2.439 2.342 2.226 2.084 1.929 1.674 1.273 0.669 -0.094 -1.193 -2.989 -5.943 -9.264 -11.795 -13.843 -15.527 -16.991 -18.252 -19.336 -20.224 -21.079 -21.787 -22.394 -22.952 -23.471 -23.962 -24.403 -24.868 -25.291 -25.649 -26.002 -26.365 -26.67 -26.979 -27.298 -27.544 -27.793 -28.052 -28.317 -28.575 -28.753 -28.935 -29.231 -29.445 -29.651 -29.749 -29.944 -30.159 -30.387 -30.505 -30.747 -30.87 -30.991 -31.107 -31.365 -31.511 -31.658 -31.821 -31.995 -32.195 -32.449 -33.291 -3 ,3829 ,KEBNE ,16657565,Tue Nov 23 04:32:30 CET,Tue Nov 23 05:55:43 CET,0.0 0.283 0.451 0.594 0.718 0.847 0.956 1.052 1.254 1.328 1.396 1.413 1.55 1.59 1.671 1.757 1.84 1.88 1.954 2.036 2.128 2.167 2.209 2.271 2.346 2.414 2.468 2.517 2.571 2.607 2.634 2.663 2.691 2.719 2.773 2.84 2.879 2.881 2.828 2.746 2.661 2.568 2.427 2.232 1.965 1.602 1.073 0.343 -0.737 -2.381 -5.007 -8.079 -10.542 -12.53 -14.15 -15.55 -16.787 -17.925 -18.893 -19.803 -20.55 -21.2 -21.797 -22.344 -22.837 -23.281 -23.759 -24.195 -24.555 -24.905 -25.253 -25.536 -25.841 -26.153 -26.381 -26.606 -26.849 -27.108 -27.363 -27.537 -27.723 -28.033 -28.244 -28.44 -28.536 -28.753 -28.979 -29.205 -29.321 -29.554 -29.685 -29.816 -29.945 -30.234 -30.395 -30.556 -30.733 -30.945 -31.178 -31.468 -31.904 -4 ,17670 ,KEBNE ,16657566,Tue Nov 23 04:32:30 CET,Tue Nov 23 05:55:11 CET,0.0 0.395 0.575 0.714 0.805 0.896 0.989 1.075 1.235 1.312 1.387 1.429 1.58 1.637 1.741 1.833 1.915 1.955 2.035 2.103 2.209 2.274 2.333 2.419 2.506 2.589 2.66 2.73 2.804 2.87 2.954 3.063 3.165 3.251 3.331 3.404 3.467 3.506 3.514 3.55 3.558 3.481 3.347 3.195 3.008 2.705 2.175 1.394 0.259 -1.388 -4.029 -7.11 -9.646 -11.784 -13.551 -15.031 -16.247 -17.274 -18.132 -18.971 -19.682 -20.318 -20.915 -21.454 -21.934 -22.36 -22.805 -23.202 -23.543 -23.889 -24.244 -24.532 -24.824 -25.146 -25.401 -25.648 -25.894 -26.158 -26.44 -26.626 -26.814 -27.094 -27.279 -27.483 -27.589 -27.804 -28.027 -28.255 -28.374 -28.617 -28.743 -28.865 -28.993 -29.259 -29.397 -29.538 -29.688 -29.864 -30.053 -30.271 -30.699 -5 ,24519 ,KEBNE ,16657567,Tue Nov 23 04:34:37 CET,Tue Nov 23 05:59:22 CET,0.0 0.587 0.821 0.983 1.114 1.224 1.329 1.429 1.587 1.674 1.748 1.778 1.924 1.975 2.075 2.164 2.243 2.281 2.34 2.399 2.479 2.532 2.583 2.644 2.707 2.771 2.822 2.859 2.903 2.947 2.989 3.014 3.028 3.05 3.061 3.059 3.046 3.037 3.015 2.937 2.867 2.755 2.512 2.238 1.915 1.497 0.895 0.076 -1.09 -2.839 -5.678 -8.914 -11.479 -13.55 -15.266 -16.754 -17.994 -19.06 -19.988 -20.896 -21.644 -22.306 -22.919 -23.476 -23.991 -24.464 -24.951 -25.376 -25.73 -26.097 -26.472 -26.789 -27.135 -27.478 -27.73 -27.994 -28.273 -28.551 -28.818 -29.001 -29.191 -29.48 -29.68 -29.893 -30.001 -30.219 -30.451 -30.7 -30.828 -31.08 -31.227 -31.357 -31.497 -31.784 -31.946 -32.137 -32.345 -32.573 -32.807 -33.123 -33.647 -6 ,611 ,KEBNE ,16657568,Tue Nov 23 04:38:45 CET,Tue Nov 23 06:02:58 CET,0.0 0.303 0.472 0.634 0.768 0.871 0.965 1.047 1.202 1.266 1.313 1.316 1.446 1.488 1.561 1.625 1.679 1.71 1.774 1.833 1.911 1.954 1.997 2.066 2.127 2.187 2.245 2.287 2.339 2.4 2.455 2.509 2.559 2.611 2.657 2.666 2.638 2.59 2.514 2.409 2.287 2.158 2.019 1.845 1.573 1.171 0.559 -0.253 -1.36 -3.037 -5.802 -9.053 -11.616 -13.629 -15.303 -16.756 -17.986 -19.095 -20.015 -20.875 -21.589 -22.218 -22.832 -23.428 -23.964 -24.437 -24.912 -25.319 -25.652 -26.004 -26.375 -26.676 -26.986 -27.297 -27.538 -27.787 -28.03 -28.287 -28.552 -28.72 -28.901 -29.208 -29.418 -29.627 -29.736 -29.962 -30.201 -30.462 -30.596 -30.834 -30.971 -31.115 -31.262 -31.586 -31.749 -31.913 -32.091 -32.323 -32.598 -32.872 -33.46 -7 ,1566 ,KEBNE ,16657569,Tue Nov 23 04:38:45 CET,Tue Nov 23 06:01:32 CET,0.0 0.511 0.712 0.865 0.979 1.078 1.181 1.278 1.429 1.501 1.572 1.59 1.729 1.78 1.871 1.943 2.018 2.059 2.126 2.185 2.28 2.348 2.41 2.482 2.542 2.599 2.661 2.73 2.822 2.885 2.923 2.955 2.984 3.036 3.101 3.153 3.197 3.236 3.262 3.278 3.264 3.171 3.01 2.807 2.514 2.145 1.677 1.031 -0.034 -1.588 -4.036 -6.928 -9.17 -11.028 -12.569 -13.865 -14.956 -15.934 -16.793 -17.665 -18.408 -19.013 -19.591 -20.138 -20.633 -21.082 -21.551 -21.975 -22.337 -22.704 -23.085 -23.398 -23.711 -24.033 -24.286 -24.549 -24.806 -25.068 -25.339 -25.523 -25.705 -26.002 -26.221 -26.434 -26.538 -26.746 -26.974 -27.223 -27.346 -27.599 -27.748 -27.872 -28.006 -28.318 -28.497 -28.692 -28.91 -29.134 -29.373 -29.662 -30.169 -8 ,20588 ,KEBNE ,16657570,Tue Nov 23 04:40:50 CET,Tue Nov 23 06:02:00 CET,0.0 0.507 0.711 0.884 1.039 1.172 1.285 1.376 1.533 1.608 1.672 1.717 1.868 1.92 2.007 2.083 2.147 2.184 2.255 2.311 2.395 2.454 2.499 2.536 2.571 2.613 2.666 2.703 2.739 2.781 2.813 2.851 2.886 2.9 2.92 2.972 3.01 3.036 3.035 3.003 2.973 2.918 2.803 2.68 2.509 2.233 1.811 1.161 0.191 -1.197 -3.476 -6.349 -8.626 -10.439 -11.982 -13.373 -14.614 -15.719 -16.646 -17.566 -18.318 -18.953 -19.558 -20.128 -20.653 -21.115 -21.594 -22.033 -22.395 -22.751 -23.114 -23.395 -23.684 -24.003 -24.248 -24.497 -24.763 -25.043 -25.33 -25.527 -25.727 -26.052 -26.286 -26.505 -26.622 -26.876 -27.109 -27.349 -27.483 -27.738 -27.859 -27.992 -28.134 -28.452 -28.62 -28.801 -28.971 -29.155 -29.392 -29.778 -30.443 -9 ,4627 ,KEBNE ,16657571,Tue Nov 23 04:40:50 CET,Tue Nov 23 06:02:43 CET,0.0 0.8 1.037 1.192 1.321 1.443 1.533 1.614 1.762 1.838 1.909 1.93 2.077 2.141 2.245 2.328 2.403 2.435 2.493 2.554 2.644 2.692 2.728 2.78 2.844 2.903 2.949 2.994 3.042 3.077 3.111 3.144 3.17 3.193 3.222 3.256 3.283 3.288 3.261 3.211 3.144 3.052 2.921 2.712 2.39 1.961 1.379 0.611 -0.558 -2.287 -5.009 -8.155 -10.641 -12.665 -14.342 -15.792 -17.034 -18.143 -19.057 -19.938 -20.704 -21.403 -22.053 -22.632 -23.156 -23.626 -24.081 -24.476 -24.848 -25.249 -25.644 -25.968 -26.314 -26.664 -26.932 -27.198 -27.462 -27.733 -28.024 -28.223 -28.417 -28.713 -28.905 -29.099 -29.209 -29.454 -29.717 -29.967 -30.084 -30.323 -30.433 -30.563 -30.709 -31.018 -31.19 -31.356 -31.539 -31.751 -31.975 -32.265 -32.784 -10 ,12835 ,KEBNE ,16657572,Tue Nov 23 04:42:56 CET,Tue Nov 23 06:04:52 CET,0.0 0.473 0.658 0.775 0.878 0.998 1.1 1.166 1.298 1.358 1.427 1.471 1.61 1.66 1.769 1.864 1.94 1.976 2.039 2.106 2.202 2.253 2.295 2.349 2.407 2.466 2.513 2.551 2.609 2.658 2.697 2.742 2.789 2.822 2.841 2.868 2.905 2.927 2.916 2.876 2.793 2.657 2.463 2.227 1.933 1.54 0.99 0.214 -0.895 -2.581 -5.413 -8.609 -11.188 -13.285 -14.961 -16.382 -17.58 -18.625 -19.526 -20.421 -21.137 -21.727 -22.278 -22.809 -23.294 -23.72 -24.165 -24.558 -24.901 -25.245 -25.593 -25.889 -26.188 -26.484 -26.721 -26.965 -27.2 -27.447 -27.701 -27.875 -28.061 -28.354 -28.556 -28.761 -28.866 -29.072 -29.282 -29.512 -29.636 -29.882 -30.035 -30.17 -30.291 -30.541 -30.673 -30.814 -30.989 -31.191 -31.447 -31.884 -32.574 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_164.txt deleted file mode 100644 index 1872947e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30156 ,KEBNE ,17069414,Fri Dec 24 03:42:00 CET,Fri Dec 24 05:06:14 CET,0.0 0.234 0.358 0.466 0.548 0.641 0.748 0.837 0.985 1.059 1.121 1.164 1.314 1.362 1.442 1.512 1.587 1.622 1.687 1.747 1.82 1.868 1.91 1.963 2.014 2.07 2.126 2.17 2.225 2.269 2.303 2.35 2.389 2.417 2.436 2.459 2.478 2.493 2.502 2.487 2.447 2.386 2.295 2.174 2.011 1.794 1.434 0.871 0.044 -1.203 -3.327 -5.898 -7.861 -9.471 -10.819 -11.924 -12.887 -13.742 -14.448 -15.148 -15.711 -16.2 -16.706 -17.187 -17.632 -18.035 -18.436 -18.782 -19.082 -19.389 -19.695 -19.954 -20.233 -20.516 -20.721 -20.93 -21.15 -21.378 -21.618 -21.79 -21.96 -22.214 -22.38 -22.545 -22.637 -22.833 -23.033 -23.245 -23.354 -23.581 -23.664 -23.775 -23.901 -24.155 -24.282 -24.429 -24.592 -24.772 -24.961 -25.181 -25.912 -2 ,3863 ,KEBNE ,17069417,Fri Dec 24 03:53:39 CET,Fri Dec 24 05:17:21 CET,0.0 0.329 0.498 0.589 0.657 0.726 0.795 0.857 0.989 1.061 1.122 1.124 1.253 1.301 1.388 1.466 1.544 1.578 1.64 1.692 1.769 1.821 1.869 1.931 1.998 2.064 2.119 2.169 2.218 2.261 2.302 2.346 2.371 2.393 2.425 2.452 2.463 2.467 2.452 2.428 2.388 2.316 2.212 2.079 1.873 1.553 1.119 0.561 -0.251 -1.53 -3.685 -6.322 -8.401 -9.991 -11.268 -12.397 -13.379 -14.223 -14.934 -15.628 -16.202 -16.687 -17.163 -17.612 -18.023 -18.4 -18.792 -19.135 -19.431 -19.73 -20.015 -20.248 -20.505 -20.774 -20.971 -21.175 -21.397 -21.628 -21.856 -22.006 -22.176 -22.451 -22.631 -22.803 -22.89 -23.086 -23.277 -23.457 -23.56 -23.781 -23.891 -24.0 -24.112 -24.377 -24.513 -24.65 -24.8 -24.983 -25.174 -25.397 -25.784 -3 ,27733 ,KEBNE ,17069420,Fri Dec 24 03:55:45 CET,Fri Dec 24 05:19:25 CET,0.0 0.451 0.678 0.811 0.912 1.009 1.091 1.152 1.261 1.319 1.378 1.391 1.532 1.581 1.674 1.755 1.821 1.848 1.904 1.959 2.031 2.081 2.135 2.199 2.256 2.302 2.341 2.375 2.414 2.457 2.486 2.509 2.527 2.543 2.575 2.617 2.644 2.651 2.656 2.651 2.612 2.54 2.424 2.283 2.049 1.696 1.226 0.594 -0.31 -1.679 -3.9 -6.535 -8.63 -10.287 -11.638 -12.813 -13.814 -14.686 -15.473 -16.28 -16.944 -17.518 -18.042 -18.506 -18.936 -19.325 -19.725 -20.063 -20.341 -20.648 -20.964 -21.21 -21.463 -21.734 -21.948 -22.162 -22.391 -22.626 -22.856 -23.026 -23.206 -23.473 -23.65 -23.836 -23.93 -24.115 -24.323 -24.524 -24.626 -24.854 -24.984 -25.113 -25.239 -25.524 -25.684 -25.844 -25.997 -26.143 -26.333 -26.613 -27.17 -4 ,16054 ,KEBNE ,17069422,Fri Dec 24 03:57:50 CET,Fri Dec 24 05:23:05 CET,0.0 0.318 0.461 0.572 0.666 0.754 0.847 0.921 1.036 1.094 1.147 1.147 1.289 1.339 1.427 1.49 1.542 1.571 1.63 1.685 1.76 1.804 1.848 1.91 1.967 2.022 2.063 2.108 2.172 2.223 2.266 2.32 2.372 2.405 2.423 2.437 2.45 2.451 2.434 2.411 2.366 2.281 2.144 1.98 1.753 1.426 0.955 0.329 -0.546 -1.87 -4.022 -6.495 -8.51 -10.196 -11.618 -12.864 -13.917 -14.839 -15.595 -16.311 -16.917 -17.467 -17.98 -18.455 -18.896 -19.293 -19.716 -20.078 -20.377 -20.691 -21.01 -21.271 -21.543 -21.833 -22.053 -22.267 -22.499 -22.738 -22.962 -23.114 -23.276 -23.529 -23.707 -23.892 -23.982 -24.156 -24.349 -24.564 -24.674 -24.895 -25.022 -25.146 -25.267 -25.567 -25.727 -25.89 -26.048 -26.206 -26.379 -26.634 -27.073 -5 ,31265 ,KEBNE ,17069424,Fri Dec 24 03:57:49 CET,Fri Dec 24 05:21:17 CET,0.0 0.324 0.457 0.545 0.627 0.719 0.79 0.848 0.958 1.009 1.056 1.054 1.182 1.218 1.289 1.369 1.436 1.458 1.497 1.544 1.617 1.653 1.68 1.73 1.781 1.828 1.869 1.904 1.943 1.973 1.998 2.022 2.039 2.055 2.071 2.077 2.065 2.062 2.059 2.041 2.011 1.958 1.853 1.707 1.526 1.266 0.914 0.428 -0.336 -1.538 -3.493 -5.745 -7.568 -9.085 -10.293 -11.319 -12.236 -13.05 -13.721 -14.375 -14.954 -15.47 -15.958 -16.408 -16.821 -17.212 -17.596 -17.909 -18.177 -18.461 -18.756 -18.996 -19.236 -19.496 -19.708 -19.928 -20.157 -20.38 -20.59 -20.736 -20.889 -21.12 -21.287 -21.463 -21.554 -21.739 -21.938 -22.147 -22.252 -22.481 -22.603 -22.716 -22.834 -23.061 -23.195 -23.347 -23.507 -23.672 -23.887 -24.194 -24.861 -6 ,30634 ,KEBNE ,17069426,Fri Dec 24 03:59:56 CET,Fri Dec 24 05:23:55 CET,0.0 0.356 0.501 0.61 0.711 0.819 0.906 0.981 1.109 1.164 1.222 1.233 1.38 1.434 1.523 1.59 1.654 1.688 1.75 1.799 1.871 1.92 1.966 2.021 2.078 2.139 2.179 2.213 2.269 2.313 2.343 2.372 2.403 2.435 2.455 2.466 2.476 2.478 2.463 2.431 2.384 2.332 2.252 2.131 1.971 1.743 1.401 0.927 0.172 -0.979 -2.747 -4.966 -6.797 -8.307 -9.613 -10.748 -11.728 -12.604 -13.313 -14.0 -14.574 -15.071 -15.561 -16.02 -16.433 -16.793 -17.162 -17.497 -17.789 -18.102 -18.421 -18.686 -18.954 -19.204 -19.392 -19.596 -19.815 -20.043 -20.267 -20.403 -20.546 -20.798 -20.978 -21.155 -21.242 -21.425 -21.631 -21.833 -21.935 -22.159 -22.273 -22.385 -22.496 -22.748 -22.893 -23.042 -23.193 -23.344 -23.508 -23.728 -24.201 -7 ,20281 ,KEBNE ,17069428,Fri Dec 24 04:00:59 CET,Fri Dec 24 05:26:20 CET,0.0 0.26 0.361 0.448 0.548 0.652 0.743 0.821 0.966 1.038 1.102 1.108 1.244 1.294 1.383 1.465 1.558 1.597 1.664 1.731 1.82 1.87 1.917 1.979 2.039 2.101 2.154 2.205 2.273 2.339 2.398 2.444 2.48 2.519 2.567 2.604 2.632 2.66 2.677 2.683 2.653 2.583 2.479 2.353 2.163 1.879 1.5 1.005 0.254 -0.936 -2.944 -5.369 -7.351 -8.904 -10.22 -11.387 -12.393 -13.305 -14.048 -14.779 -15.406 -15.933 -16.418 -16.864 -17.29 -17.691 -18.09 -18.436 -18.729 -19.021 -19.32 -19.568 -19.813 -20.07 -20.278 -20.485 -20.7 -20.926 -21.163 -21.323 -21.485 -21.735 -21.9 -22.071 -22.164 -22.353 -22.552 -22.749 -22.845 -23.058 -23.162 -23.288 -23.421 -23.695 -23.839 -23.992 -24.156 -24.33 -24.535 -24.774 -25.117 -8 ,20107 ,KEBNE ,17069429,Fri Dec 24 04:02:03 CET,Fri Dec 24 05:27:20 CET,0.0 0.42 0.619 0.782 0.89 0.995 1.087 1.176 1.351 1.419 1.473 1.501 1.646 1.695 1.784 1.864 1.935 1.968 2.038 2.103 2.174 2.213 2.265 2.341 2.397 2.452 2.504 2.554 2.62 2.684 2.739 2.791 2.83 2.862 2.897 2.934 2.962 2.981 2.989 2.961 2.904 2.829 2.717 2.576 2.353 2.056 1.607 0.957 0.129 -1.081 -3.185 -5.592 -7.436 -8.992 -10.327 -11.445 -12.386 -13.217 -13.917 -14.623 -15.22 -15.737 -16.236 -16.698 -17.119 -17.504 -17.891 -18.229 -18.518 -18.807 -19.104 -19.343 -19.589 -19.845 -20.044 -20.246 -20.447 -20.66 -20.882 -21.026 -21.174 -21.408 -21.574 -21.741 -21.831 -22.022 -22.21 -22.41 -22.514 -22.735 -22.842 -22.961 -23.083 -23.339 -23.488 -23.643 -23.793 -23.973 -24.197 -24.464 -24.96 -9 ,22076 ,KEBNE ,17069431,Fri Dec 24 04:00:59 CET,Fri Dec 24 05:25:15 CET,0.0 0.259 0.416 0.558 0.687 0.807 0.899 0.982 1.124 1.182 1.238 1.256 1.393 1.44 1.524 1.59 1.658 1.695 1.76 1.819 1.914 1.964 2.003 2.06 2.107 2.152 2.198 2.237 2.292 2.351 2.399 2.447 2.48 2.5 2.522 2.554 2.572 2.575 2.567 2.538 2.487 2.414 2.3 2.166 1.963 1.686 1.26 0.624 -0.221 -1.419 -3.518 -6.033 -7.932 -9.455 -10.758 -11.895 -12.872 -13.728 -14.447 -15.15 -15.729 -16.215 -16.663 -17.086 -17.467 -17.805 -18.159 -18.473 -18.744 -19.037 -19.34 -19.583 -19.832 -20.088 -20.282 -20.485 -20.702 -20.927 -21.147 -21.298 -21.452 -21.698 -21.87 -22.045 -22.14 -22.333 -22.514 -22.711 -22.82 -23.044 -23.152 -23.267 -23.39 -23.642 -23.766 -23.896 -24.044 -24.208 -24.418 -24.681 -25.253 -10 ,27060 ,KEBNE ,17069433,Fri Dec 24 04:02:03 CET,Fri Dec 24 05:27:53 CET,0.0 0.25 0.396 0.505 0.602 0.711 0.797 0.868 1.008 1.075 1.144 1.196 1.35 1.408 1.498 1.57 1.645 1.681 1.743 1.802 1.883 1.934 1.984 2.053 2.125 2.186 2.234 2.281 2.345 2.407 2.451 2.484 2.515 2.546 2.581 2.612 2.642 2.661 2.657 2.654 2.639 2.599 2.501 2.363 2.165 1.882 1.468 0.874 -0.004 -1.343 -3.478 -5.846 -7.812 -9.47 -10.81 -11.922 -12.875 -13.75 -14.478 -15.176 -15.752 -16.266 -16.773 -17.252 -17.697 -18.086 -18.481 -18.815 -19.095 -19.402 -19.729 -20.003 -20.273 -20.519 -20.706 -20.905 -21.105 -21.31 -21.532 -21.695 -21.86 -22.11 -22.286 -22.459 -22.547 -22.738 -22.937 -23.14 -23.246 -23.468 -23.582 -23.693 -23.809 -24.095 -24.256 -24.421 -24.593 -24.773 -24.985 -25.27 -25.982 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_215.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_215.txt deleted file mode 100644 index 5d9bccd6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_215.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5054 ,TETRA ,17667904,Fri Dec 3 06:08:48 CET,Fri Dec 3 07:53:36 CET,0.0 0.845 1.109 1.3 1.449 1.601 1.771 1.913 2.109 2.195 2.283 2.37 2.544 2.623 2.774 2.919 3.042 3.098 3.214 3.325 3.479 3.577 3.665 3.78 3.9 4.014 4.113 4.208 4.338 4.459 4.559 4.677 4.791 4.88 4.966 5.07 5.182 5.298 5.428 5.535 5.597 5.666 5.696 5.663 5.613 5.537 5.336 4.925 4.241 3.214 1.511 -0.626 -2.418 -3.886 -5.108 -6.21 -7.136 -7.919 -8.631 -9.358 -9.955 -10.474 -10.952 -11.396 -11.803 -12.165 -12.547 -12.89 -13.185 -13.485 -13.781 -14.026 -14.287 -14.564 -14.765 -14.963 -15.17 -15.384 -15.613 -15.768 -15.925 -16.17 -16.336 -16.501 -16.585 -16.769 -16.964 -17.154 -17.264 -17.497 -17.619 -17.742 -17.877 -18.175 -18.342 -18.511 -18.676 -18.857 -19.066 -19.333 -19.794 -2 ,7302 ,TETRA ,17667905,Fri Dec 3 06:08:50 CET,Fri Dec 3 07:53:12 CET,0.0 0.875 1.197 1.415 1.609 1.795 1.941 2.062 2.283 2.385 2.471 2.548 2.717 2.798 2.942 3.051 3.15 3.201 3.306 3.402 3.538 3.627 3.718 3.864 3.992 4.109 4.221 4.315 4.429 4.529 4.621 4.751 4.872 4.967 5.077 5.216 5.349 5.479 5.619 5.777 5.872 5.895 5.913 5.912 5.87 5.773 5.515 5.072 4.408 3.29 1.423 -0.807 -2.582 -4.083 -5.385 -6.469 -7.37 -8.202 -8.907 -9.598 -10.178 -10.682 -11.167 -11.602 -12.021 -12.409 -12.809 -13.16 -13.45 -13.757 -14.071 -14.316 -14.562 -14.833 -15.043 -15.26 -15.484 -15.709 -15.924 -16.071 -16.236 -16.485 -16.655 -16.836 -16.928 -17.119 -17.317 -17.533 -17.646 -17.863 -17.97 -18.088 -18.212 -18.473 -18.619 -18.766 -18.936 -19.151 -19.408 -19.721 -20.318 -4 ,16177 ,TETRA ,17667907,Fri Dec 3 06:08:46 CET,Fri Dec 3 07:53:35 CET,0.0 0.668 0.916 1.113 1.275 1.409 1.55 1.669 1.859 1.94 2.03 2.124 2.291 2.363 2.494 2.622 2.751 2.808 2.912 3.009 3.161 3.26 3.351 3.481 3.597 3.71 3.818 3.904 4.004 4.106 4.202 4.304 4.401 4.485 4.574 4.682 4.771 4.854 4.919 4.988 5.042 5.071 5.126 5.127 5.049 4.936 4.69 4.232 3.57 2.582 0.7 -1.573 -3.363 -4.771 -5.924 -6.956 -7.836 -8.611 -9.283 -9.96 -10.518 -11.0 -11.477 -11.927 -12.332 -12.698 -13.073 -13.409 -13.683 -13.96 -14.265 -14.524 -14.782 -15.039 -15.239 -15.441 -15.642 -15.858 -16.095 -16.253 -16.399 -16.633 -16.808 -16.998 -17.098 -17.281 -17.453 -17.645 -17.751 -17.975 -18.09 -18.187 -18.293 -18.544 -18.686 -18.828 -18.974 -19.119 -19.291 -19.497 -19.816 -5 ,10980 ,TETRA ,17667908,Fri Dec 3 06:08:44 CET,Fri Dec 3 07:52:14 CET,0.0 1.091 1.442 1.653 1.825 1.968 2.079 2.2 2.433 2.524 2.611 2.696 2.863 2.935 3.085 3.224 3.347 3.407 3.528 3.635 3.78 3.869 3.944 4.066 4.199 4.319 4.414 4.501 4.61 4.726 4.839 4.965 5.096 5.214 5.32 5.437 5.544 5.667 5.806 5.912 6.001 6.07 6.127 6.147 6.063 5.881 5.613 5.263 4.705 3.72 1.868 -0.211 -1.897 -3.348 -4.509 -5.543 -6.429 -7.178 -7.819 -8.465 -9.024 -9.517 -10.004 -10.458 -10.849 -11.209 -11.589 -11.921 -12.206 -12.506 -12.801 -13.032 -13.282 -13.545 -13.748 -13.963 -14.188 -14.414 -14.653 -14.817 -14.973 -15.221 -15.401 -15.59 -15.686 -15.891 -16.117 -16.333 -16.445 -16.669 -16.79 -16.912 -17.036 -17.288 -17.444 -17.611 -17.76 -17.92 -18.126 -18.379 -18.838 -6 ,23367 ,TETRA ,17667909,Fri Dec 3 06:08:46 CET,Fri Dec 3 07:51:44 CET,0.0 0.791 1.086 1.309 1.512 1.674 1.823 1.952 2.162 2.276 2.379 2.449 2.617 2.698 2.853 2.974 3.086 3.14 3.252 3.368 3.524 3.62 3.714 3.845 3.969 4.086 4.189 4.282 4.403 4.523 4.631 4.765 4.873 4.958 5.049 5.137 5.237 5.358 5.494 5.64 5.751 5.834 5.916 5.948 5.948 5.948 5.808 5.431 4.88 3.989 2.272 0.265 -1.427 -2.899 -4.09 -5.171 -6.132 -6.971 -7.65 -8.309 -8.883 -9.347 -9.796 -10.234 -10.621 -10.987 -11.368 -11.68 -11.948 -12.229 -12.495 -12.72 -12.973 -13.238 -13.438 -13.636 -13.842 -14.048 -14.261 -14.417 -14.574 -14.81 -14.985 -15.164 -15.255 -15.452 -15.651 -15.848 -15.958 -16.175 -16.28 -16.399 -16.538 -16.851 -17.012 -17.165 -17.306 -17.461 -17.658 -17.897 -18.398 -7 ,19319 ,TETRA ,17667910,Fri Dec 3 06:08:49 CET,Fri Dec 3 07:51:59 CET,0.0 0.869 1.199 1.447 1.614 1.782 1.937 2.057 2.272 2.378 2.492 2.618 2.795 2.881 3.05 3.195 3.318 3.373 3.484 3.587 3.714 3.796 3.877 3.994 4.124 4.263 4.403 4.531 4.679 4.821 4.936 5.07 5.197 5.292 5.392 5.499 5.616 5.758 5.861 5.955 6.065 6.135 6.152 6.163 6.153 6.056 5.881 5.552 4.923 3.883 2.21 0.119 -1.65 -3.105 -4.321 -5.369 -6.248 -7.008 -7.667 -8.392 -9.001 -9.493 -9.971 -10.436 -10.843 -11.19 -11.535 -11.845 -12.131 -12.426 -12.719 -12.969 -13.237 -13.512 -13.724 -13.935 -14.136 -14.339 -14.561 -14.712 -14.869 -15.118 -15.288 -15.455 -15.545 -15.734 -15.929 -16.149 -16.257 -16.463 -16.574 -16.689 -16.811 -17.1 -17.243 -17.402 -17.574 -17.728 -17.927 -18.143 -18.609 -8 ,28301 ,TETRA ,17667911,Fri Dec 3 06:08:46 CET,Fri Dec 3 07:51:56 CET,0.0 0.705 1.0 1.183 1.333 1.503 1.667 1.799 2.02 2.116 2.206 2.289 2.457 2.529 2.669 2.792 2.905 2.969 3.088 3.187 3.318 3.405 3.494 3.612 3.723 3.846 3.963 4.067 4.207 4.345 4.471 4.601 4.716 4.815 4.917 5.032 5.14 5.241 5.326 5.409 5.503 5.591 5.641 5.67 5.665 5.581 5.412 5.103 4.532 3.607 2.006 0.009 -1.617 -3.0 -4.129 -5.087 -5.953 -6.756 -7.436 -8.096 -8.659 -9.153 -9.609 -10.026 -10.415 -10.786 -11.178 -11.518 -11.797 -12.072 -12.365 -12.61 -12.855 -13.122 -13.345 -13.565 -13.769 -13.984 -14.211 -14.362 -14.514 -14.758 -14.929 -15.112 -15.213 -15.409 -15.596 -15.8 -15.908 -16.123 -16.237 -16.366 -16.496 -16.743 -16.88 -17.017 -17.151 -17.337 -17.583 -17.901 -18.422 -9 ,21879 ,TETRA ,17667912,Fri Dec 3 06:08:43 CET,Fri Dec 3 07:52:23 CET,0.0 0.659 0.919 1.105 1.249 1.388 1.524 1.63 1.829 1.933 2.027 2.103 2.272 2.359 2.546 2.696 2.827 2.896 3.02 3.137 3.317 3.423 3.523 3.685 3.831 3.961 4.082 4.193 4.325 4.444 4.564 4.707 4.828 4.937 5.086 5.229 5.343 5.446 5.522 5.618 5.717 5.797 5.893 5.967 5.998 5.952 5.836 5.594 5.061 4.14 2.482 0.359 -1.406 -2.887 -4.184 -5.334 -6.343 -7.241 -7.987 -8.735 -9.361 -9.925 -10.454 -10.911 -11.323 -11.693 -12.082 -12.426 -12.726 -13.043 -13.35 -13.612 -13.88 -14.144 -14.353 -14.569 -14.789 -15.016 -15.253 -15.411 -15.57 -15.827 -16.013 -16.195 -16.285 -16.484 -16.702 -16.913 -17.007 -17.216 -17.31 -17.417 -17.539 -17.781 -17.918 -18.074 -18.226 -18.389 -18.57 -18.811 -19.308 -10 ,4555 ,TETRA ,17667913,Fri Dec 3 06:08:44 CET,Fri Dec 3 07:51:44 CET,0.0 0.977 1.288 1.531 1.718 1.893 2.064 2.204 2.413 2.509 2.593 2.667 2.831 2.901 3.033 3.168 3.29 3.353 3.491 3.601 3.735 3.821 3.895 4.017 4.141 4.245 4.338 4.423 4.542 4.651 4.739 4.848 4.97 5.096 5.214 5.316 5.434 5.582 5.735 5.863 5.94 5.961 5.912 5.85 5.759 5.585 5.279 4.737 3.946 2.818 0.98 -1.227 -3.077 -4.636 -5.875 -6.912 -7.805 -8.585 -9.243 -9.91 -10.499 -11.011 -11.506 -11.972 -12.376 -12.739 -13.101 -13.414 -13.681 -13.955 -14.242 -14.473 -14.712 -14.969 -15.166 -15.363 -15.581 -15.814 -16.042 -16.196 -16.358 -16.59 -16.741 -16.907 -17.003 -17.199 -17.402 -17.625 -17.734 -17.948 -18.058 -18.172 -18.304 -18.585 -18.72 -18.856 -19.016 -19.18 -19.361 -19.648 -20.423 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_235.txt deleted file mode 100644 index e5b46cba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31328 ,KEBNE ,17023757,Wed Dec 22 08:25:14 CET,Wed Dec 22 09:48:32 CET,0.0 0.493 0.708 0.871 1.013 1.127 1.241 1.368 1.569 1.661 1.752 1.821 1.981 2.057 2.2 2.312 2.412 2.469 2.582 2.682 2.815 2.898 2.989 3.122 3.245 3.369 3.495 3.608 3.743 3.866 3.977 4.094 4.207 4.314 4.421 4.545 4.663 4.783 4.903 5.016 5.127 5.244 5.342 5.403 5.429 5.392 5.282 4.935 4.207 3.139 1.375 -0.771 -2.434 -3.831 -5.03 -6.067 -7.032 -7.913 -8.631 -9.338 -9.942 -10.48 -10.987 -11.458 -11.902 -12.302 -12.705 -13.061 -13.361 -13.685 -14.025 -14.3 -14.588 -14.875 -15.087 -15.309 -15.538 -15.762 -16.007 -16.184 -16.352 -16.61 -16.79 -16.982 -17.076 -17.258 -17.464 -17.69 -17.803 -18.027 -18.163 -18.295 -18.439 -18.766 -18.938 -19.1 -19.277 -19.477 -19.722 -20.068 -20.669 -2 ,13422 ,KEBNE ,17023758,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:51:37 CET,0.0 0.772 1.034 1.221 1.369 1.507 1.637 1.74 1.934 2.025 2.103 2.175 2.342 2.414 2.535 2.643 2.744 2.788 2.875 2.974 3.125 3.22 3.299 3.399 3.482 3.564 3.665 3.768 3.902 4.037 4.168 4.314 4.42 4.507 4.613 4.747 4.869 4.972 5.1 5.22 5.305 5.394 5.475 5.55 5.6 5.558 5.407 5.125 4.637 3.779 2.3 0.419 -1.109 -2.413 -3.578 -4.631 -5.548 -6.384 -7.101 -7.823 -8.434 -8.966 -9.479 -9.962 -10.413 -10.804 -11.187 -11.523 -11.823 -12.148 -12.484 -12.759 -13.043 -13.334 -13.565 -13.807 -14.053 -14.297 -14.541 -14.708 -14.874 -15.134 -15.308 -15.485 -15.577 -15.777 -16.012 -16.24 -16.35 -16.572 -16.73 -16.861 -16.983 -17.256 -17.415 -17.598 -17.785 -17.973 -18.209 -18.486 -19.058 -3 ,2993 ,KEBNE ,17023759,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:50:14 CET,0.0 0.722 0.984 1.203 1.366 1.51 1.634 1.754 1.975 2.073 2.175 2.261 2.422 2.493 2.638 2.773 2.89 2.943 3.041 3.14 3.269 3.347 3.433 3.563 3.677 3.782 3.885 3.973 4.086 4.195 4.304 4.437 4.576 4.719 4.86 4.997 5.107 5.193 5.265 5.372 5.49 5.614 5.76 5.862 5.931 5.974 5.933 5.704 5.212 4.244 2.411 0.252 -1.382 -2.779 -4.053 -5.16 -6.077 -6.879 -7.531 -8.18 -8.758 -9.251 -9.738 -10.217 -10.638 -11.019 -11.409 -11.737 -12.014 -12.309 -12.615 -12.869 -13.132 -13.398 -13.617 -13.851 -14.093 -14.329 -14.571 -14.746 -14.924 -15.187 -15.371 -15.564 -15.662 -15.876 -16.099 -16.312 -16.417 -16.642 -16.773 -16.885 -17.004 -17.265 -17.406 -17.548 -17.731 -17.931 -18.128 -18.35 -19.03 -4 ,31810 ,KEBNE ,17023760,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:50:33 CET,0.0 0.661 0.841 0.983 1.133 1.274 1.41 1.533 1.743 1.83 1.908 1.952 2.107 2.172 2.322 2.458 2.555 2.602 2.695 2.798 2.939 3.029 3.124 3.243 3.362 3.473 3.574 3.671 3.788 3.912 4.027 4.152 4.272 4.388 4.513 4.62 4.709 4.828 4.968 5.113 5.243 5.378 5.494 5.544 5.516 5.346 5.084 4.8 4.327 3.444 1.86 -0.197 -1.933 -3.32 -4.517 -5.648 -6.628 -7.494 -8.233 -8.96 -9.558 -10.08 -10.583 -11.045 -11.484 -11.884 -12.277 -12.634 -12.945 -13.251 -13.565 -13.821 -14.094 -14.392 -14.617 -14.849 -15.086 -15.328 -15.594 -15.779 -15.955 -16.215 -16.392 -16.578 -16.676 -16.87 -17.078 -17.303 -17.422 -17.652 -17.818 -17.969 -18.112 -18.358 -18.495 -18.659 -18.836 -19.012 -19.224 -19.489 -20.068 -5 ,15024 ,KEBNE ,17023761,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:51:00 CET,0.0 0.53 0.77 0.955 1.104 1.224 1.346 1.471 1.675 1.756 1.838 1.904 2.061 2.123 2.248 2.388 2.521 2.574 2.685 2.791 2.919 3.008 3.104 3.23 3.35 3.469 3.581 3.692 3.821 3.937 4.047 4.166 4.278 4.386 4.499 4.622 4.739 4.85 4.964 5.071 5.205 5.355 5.47 5.542 5.586 5.634 5.634 5.466 5.082 4.402 2.979 1.171 -0.494 -1.896 -3.065 -4.095 -4.957 -5.73 -6.366 -7.024 -7.612 -8.133 -8.627 -9.066 -9.459 -9.811 -10.184 -10.513 -10.784 -11.069 -11.365 -11.611 -11.865 -12.128 -12.327 -12.535 -12.752 -12.976 -13.203 -13.353 -13.511 -13.754 -13.932 -14.138 -14.238 -14.431 -14.625 -14.824 -14.93 -15.15 -15.301 -15.429 -15.553 -15.85 -16.01 -16.154 -16.314 -16.524 -16.771 -17.008 -17.763 -6 ,14373 ,KEBNE ,17023762,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:49:57 CET,0.0 0.491 0.748 0.911 1.048 1.17 1.291 1.406 1.601 1.695 1.783 1.832 1.992 2.056 2.166 2.28 2.395 2.454 2.569 2.674 2.82 2.907 3.001 3.145 3.276 3.397 3.504 3.602 3.733 3.879 4.007 4.146 4.277 4.407 4.565 4.72 4.845 4.97 5.108 5.237 5.357 5.502 5.634 5.68 5.684 5.667 5.585 5.404 5.046 4.342 2.991 1.308 -0.067 -1.219 -2.333 -3.405 -4.352 -5.242 -5.977 -6.656 -7.247 -7.777 -8.286 -8.787 -9.245 -9.644 -10.058 -10.408 -10.701 -10.996 -11.301 -11.573 -11.85 -12.126 -12.337 -12.569 -12.812 -13.046 -13.267 -13.429 -13.607 -13.869 -14.046 -14.229 -14.32 -14.505 -14.705 -14.917 -15.026 -15.244 -15.363 -15.485 -15.623 -15.941 -16.098 -16.253 -16.449 -16.652 -16.868 -17.139 -17.898 -7 ,29011 ,KEBNE ,17023763,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:51:19 CET,0.0 0.677 0.867 1.01 1.156 1.289 1.405 1.515 1.722 1.816 1.903 2.002 2.181 2.259 2.406 2.52 2.621 2.676 2.779 2.865 2.985 3.074 3.158 3.258 3.355 3.459 3.556 3.653 3.789 3.918 4.027 4.133 4.232 4.31 4.392 4.482 4.559 4.658 4.775 4.878 4.962 5.032 5.087 5.108 5.074 4.973 4.757 4.395 3.801 2.71 0.904 -1.248 -3.105 -4.628 -5.853 -6.947 -7.894 -8.721 -9.418 -10.097 -10.667 -11.151 -11.615 -12.052 -12.464 -12.842 -13.228 -13.56 -13.849 -14.161 -14.486 -14.745 -15.005 -15.28 -15.5 -15.723 -15.945 -16.181 -16.421 -16.585 -16.761 -17.04 -17.227 -17.422 -17.525 -17.73 -17.941 -18.161 -18.275 -18.507 -18.653 -18.775 -18.924 -19.257 -19.424 -19.59 -19.779 -19.999 -20.233 -20.525 -21.087 -8 ,16028 ,KEBNE ,17023764,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:50:56 CET,0.0 0.546 0.829 1.061 1.244 1.417 1.552 1.653 1.855 1.95 2.034 2.083 2.239 2.315 2.465 2.599 2.725 2.791 2.912 3.023 3.176 3.273 3.359 3.474 3.581 3.682 3.786 3.886 4.005 4.118 4.221 4.319 4.424 4.537 4.664 4.792 4.888 4.99 5.099 5.19 5.247 5.316 5.405 5.456 5.48 5.407 5.162 4.845 4.435 3.781 2.335 0.233 -1.53 -3.005 -4.266 -5.401 -6.4 -7.26 -7.975 -8.72 -9.334 -9.855 -10.356 -10.829 -11.258 -11.625 -12.005 -12.351 -12.668 -12.995 -13.306 -13.564 -13.843 -14.122 -14.332 -14.561 -14.804 -15.063 -15.319 -15.478 -15.652 -15.932 -16.123 -16.321 -16.426 -16.652 -16.876 -17.111 -17.228 -17.448 -17.591 -17.727 -17.896 -18.235 -18.394 -18.55 -18.719 -18.94 -19.185 -19.44 -19.996 -9 ,37 ,KEBNE ,17023765,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:51:24 CET,0.0 0.64 0.883 1.047 1.175 1.302 1.434 1.552 1.731 1.816 1.902 1.977 2.137 2.205 2.347 2.475 2.591 2.652 2.761 2.853 2.99 3.077 3.173 3.292 3.381 3.473 3.57 3.668 3.787 3.905 4.015 4.148 4.274 4.377 4.503 4.63 4.73 4.856 4.995 5.098 5.171 5.26 5.407 5.558 5.641 5.662 5.628 5.425 4.956 4.036 2.403 0.352 -1.416 -2.863 -4.074 -5.132 -6.017 -6.786 -7.43 -8.059 -8.653 -9.177 -9.629 -10.065 -10.469 -10.833 -11.205 -11.537 -11.819 -12.135 -12.469 -12.726 -12.992 -13.275 -13.496 -13.708 -13.911 -14.13 -14.38 -14.555 -14.726 -14.993 -15.172 -15.348 -15.445 -15.642 -15.853 -16.078 -16.193 -16.417 -16.558 -16.683 -16.814 -17.088 -17.236 -17.391 -17.548 -17.72 -17.932 -18.206 -18.732 -10 ,15719 ,KEBNE ,17023766,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:51:45 CET,0.0 0.539 0.761 0.966 1.14 1.272 1.4 1.549 1.783 1.867 1.949 2.031 2.206 2.285 2.429 2.553 2.666 2.725 2.845 2.955 3.105 3.201 3.291 3.426 3.55 3.656 3.75 3.837 3.955 4.071 4.177 4.302 4.419 4.532 4.663 4.787 4.903 5.027 5.12 5.211 5.325 5.437 5.575 5.657 5.656 5.624 5.465 5.149 4.688 3.983 2.596 0.762 -0.749 -2.009 -3.15 -4.208 -5.104 -5.909 -6.598 -7.28 -7.867 -8.381 -8.865 -9.307 -9.7 -10.059 -10.435 -10.769 -11.059 -11.351 -11.654 -11.909 -12.176 -12.454 -12.677 -12.907 -13.133 -13.355 -13.577 -13.726 -13.874 -14.115 -14.28 -14.448 -14.539 -14.737 -14.944 -15.151 -15.262 -15.477 -15.599 -15.722 -15.849 -16.109 -16.249 -16.414 -16.593 -16.763 -16.961 -17.203 -17.828 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_25.txt deleted file mode 100644 index 27bdf3f9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29022 ,KEBNE ,16657573,Tue Nov 23 04:42:56 CET,Tue Nov 23 06:03:56 CET,0.0 0.968 1.274 1.445 1.597 1.744 1.853 1.942 2.106 2.187 2.269 2.331 2.493 2.566 2.688 2.81 2.929 2.978 3.054 3.125 3.231 3.306 3.383 3.495 3.606 3.712 3.808 3.896 4.027 4.142 4.226 4.315 4.38 4.442 4.537 4.635 4.726 4.82 4.893 4.958 4.995 5.028 5.076 5.124 5.153 5.082 4.86 4.523 4.03 3.195 1.631 -0.294 -1.899 -3.298 -4.477 -5.478 -6.294 -7.032 -7.678 -8.338 -8.919 -9.427 -9.9 -10.357 -10.774 -11.144 -11.544 -11.894 -12.189 -12.49 -12.798 -13.062 -13.334 -13.61 -13.828 -14.045 -14.258 -14.486 -14.733 -14.901 -15.073 -15.35 -15.536 -15.744 -15.846 -16.039 -16.249 -16.478 -16.604 -16.849 -17.009 -17.129 -17.262 -17.586 -17.772 -17.95 -18.144 -18.374 -18.647 -18.982 -20.1 -2 ,31979 ,KEBNE ,16657574,Tue Nov 23 04:43:58 CET,Tue Nov 23 06:05:40 CET,0.0 0.811 1.032 1.217 1.391 1.528 1.644 1.733 1.892 1.983 2.071 2.137 2.294 2.36 2.482 2.581 2.664 2.709 2.81 2.896 3.019 3.103 3.169 3.252 3.344 3.448 3.55 3.631 3.723 3.803 3.882 3.998 4.101 4.182 4.273 4.367 4.439 4.506 4.58 4.657 4.749 4.825 4.846 4.831 4.803 4.719 4.533 4.282 3.925 3.304 2.152 0.706 -0.546 -1.584 -2.478 -3.314 -4.056 -4.714 -5.284 -5.867 -6.36 -6.819 -7.282 -7.706 -8.081 -8.404 -8.757 -9.094 -9.41 -9.735 -10.043 -10.317 -10.608 -10.875 -11.065 -11.267 -11.474 -11.691 -11.928 -12.085 -12.25 -12.533 -12.713 -12.89 -12.989 -13.196 -13.412 -13.681 -13.817 -14.04 -14.205 -14.353 -14.508 -14.819 -14.98 -15.151 -15.344 -15.583 -15.857 -16.187 -18.136 -3 ,15431 ,KEBNE ,16657575,Tue Nov 23 04:46:03 CET,Tue Nov 23 06:07:41 CET,0.0 0.856 1.065 1.241 1.383 1.524 1.658 1.775 1.967 2.047 2.124 2.175 2.33 2.395 2.539 2.672 2.782 2.841 2.936 3.018 3.135 3.211 3.293 3.415 3.525 3.615 3.702 3.786 3.881 3.979 4.079 4.206 4.323 4.409 4.509 4.634 4.728 4.81 4.906 4.984 5.049 5.111 5.134 5.15 5.153 5.043 4.806 4.45 3.96 3.117 1.429 -0.61 -2.282 -3.652 -4.864 -5.989 -6.941 -7.771 -8.481 -9.162 -9.733 -10.252 -10.74 -11.194 -11.628 -12.024 -12.42 -12.778 -13.092 -13.413 -13.727 -13.992 -14.269 -14.549 -14.765 -14.993 -15.238 -15.466 -15.691 -15.858 -16.036 -16.307 -16.49 -16.695 -16.803 -17.018 -17.239 -17.461 -17.571 -17.795 -17.943 -18.08 -18.243 -18.57 -18.742 -18.919 -19.099 -19.357 -19.673 -20.048 -21.423 -4 ,31601 ,KEBNE ,16657576,Tue Nov 23 04:46:03 CET,Tue Nov 23 06:09:06 CET,0.0 1.023 1.307 1.521 1.71 1.875 2.032 2.152 2.345 2.431 2.5 2.531 2.684 2.76 2.91 3.027 3.129 3.178 3.266 3.347 3.471 3.557 3.639 3.761 3.872 3.976 4.073 4.161 4.285 4.394 4.488 4.592 4.682 4.773 4.888 5.023 5.14 5.253 5.34 5.432 5.543 5.656 5.732 5.733 5.74 5.749 5.692 5.551 5.217 4.556 3.072 1.133 -0.409 -1.749 -2.904 -3.897 -4.744 -5.532 -6.2 -6.845 -7.382 -7.853 -8.295 -8.716 -9.124 -9.488 -9.861 -10.208 -10.499 -10.792 -11.091 -11.335 -11.587 -11.849 -12.06 -12.278 -12.498 -12.722 -12.964 -13.139 -13.315 -13.578 -13.755 -13.931 -14.019 -14.219 -14.447 -14.662 -14.772 -14.995 -15.162 -15.315 -15.461 -15.781 -15.952 -16.123 -16.315 -16.563 -16.883 -17.289 -18.722 -5 ,9497 ,KEBNE ,16657577,Tue Nov 23 04:46:03 CET,Tue Nov 23 06:10:42 CET,0.0 0.937 1.245 1.485 1.646 1.77 1.898 2.004 2.171 2.265 2.349 2.376 2.525 2.592 2.739 2.872 2.977 3.025 3.114 3.196 3.309 3.387 3.466 3.556 3.634 3.726 3.819 3.898 4.003 4.099 4.191 4.31 4.404 4.49 4.578 4.666 4.74 4.792 4.863 4.939 5.007 5.097 5.167 5.183 5.189 5.174 5.036 4.776 4.354 3.657 2.419 0.75 -0.774 -2.1 -3.214 -4.247 -5.136 -5.896 -6.567 -7.234 -7.788 -8.284 -8.755 -9.184 -9.579 -9.931 -10.3 -10.632 -10.936 -11.256 -11.57 -11.814 -12.06 -12.325 -12.527 -12.748 -12.98 -13.197 -13.431 -13.601 -13.773 -14.051 -14.245 -14.437 -14.538 -14.774 -15.009 -15.201 -15.302 -15.519 -15.674 -15.804 -15.924 -16.188 -16.329 -16.516 -16.749 -16.984 -17.212 -17.498 -19.101 -6 ,23829 ,KEBNE ,16657578,Tue Nov 23 04:48:07 CET,Tue Nov 23 06:10:54 CET,0.0 1.37 1.628 1.782 1.924 2.062 2.191 2.312 2.536 2.627 2.703 2.777 2.939 3.001 3.139 3.274 3.385 3.438 3.545 3.644 3.768 3.84 3.912 4.021 4.131 4.238 4.32 4.403 4.526 4.62 4.697 4.799 4.902 5.001 5.114 5.216 5.286 5.358 5.411 5.45 5.49 5.52 5.536 5.505 5.433 5.354 5.183 4.819 4.319 3.536 1.924 -0.116 -1.704 -3.026 -4.137 -5.104 -5.974 -6.766 -7.434 -8.118 -8.708 -9.2 -9.639 -10.064 -10.472 -10.822 -11.181 -11.515 -11.797 -12.085 -12.376 -12.626 -12.895 -13.155 -13.36 -13.577 -13.801 -14.028 -14.26 -14.423 -14.589 -14.865 -15.052 -15.236 -15.335 -15.543 -15.765 -15.977 -16.088 -16.319 -16.459 -16.605 -16.761 -17.092 -17.276 -17.452 -17.65 -17.873 -18.146 -18.469 -19.608 -7 ,19758 ,KEBNE ,16657579,Tue Nov 23 04:48:08 CET,Tue Nov 23 06:10:45 CET,0.0 0.898 1.126 1.329 1.517 1.684 1.832 1.936 2.093 2.159 2.233 2.291 2.445 2.514 2.641 2.768 2.895 2.947 3.035 3.112 3.225 3.307 3.385 3.488 3.597 3.69 3.763 3.832 3.931 4.046 4.143 4.247 4.348 4.433 4.528 4.645 4.746 4.842 4.937 5.021 5.096 5.139 5.151 5.179 5.224 5.233 5.11 4.859 4.44 3.609 1.912 -0.204 -1.815 -3.165 -4.371 -5.414 -6.285 -7.106 -7.805 -8.459 -9.038 -9.556 -10.022 -10.447 -10.854 -11.235 -11.637 -11.999 -12.284 -12.574 -12.891 -13.148 -13.401 -13.662 -13.881 -14.109 -14.335 -14.571 -14.822 -14.996 -15.175 -15.443 -15.626 -15.833 -15.937 -16.15 -16.38 -16.624 -16.75 -16.979 -17.141 -17.285 -17.445 -17.8 -17.981 -18.175 -18.437 -18.717 -18.985 -19.388 -20.892 -8 ,4540 ,KEBNE ,16657580,Tue Nov 23 04:54:18 CET,Tue Nov 23 06:17:44 CET,0.0 0.839 1.086 1.318 1.486 1.6 1.725 1.84 1.999 2.079 2.161 2.218 2.366 2.425 2.554 2.675 2.793 2.851 2.952 3.037 3.163 3.251 3.324 3.413 3.496 3.588 3.695 3.793 3.894 3.988 4.078 4.179 4.278 4.362 4.445 4.53 4.613 4.726 4.836 4.906 4.962 5.026 5.079 5.093 5.035 4.892 4.687 4.406 3.898 3.032 1.487 -0.43 -2.042 -3.426 -4.603 -5.633 -6.499 -7.285 -7.97 -8.636 -9.226 -9.746 -10.217 -10.648 -11.039 -11.412 -11.814 -12.155 -12.441 -12.747 -13.075 -13.334 -13.591 -13.862 -14.069 -14.272 -14.492 -14.728 -14.973 -15.141 -15.307 -15.56 -15.743 -15.943 -16.048 -16.265 -16.491 -16.736 -16.879 -17.136 -17.298 -17.438 -17.613 -17.976 -18.137 -18.322 -18.545 -18.8 -19.09 -19.428 -21.088 -9 ,151 ,KEBNE ,16657581,Tue Nov 23 04:55:21 CET,Tue Nov 23 06:15:26 CET,0.0 1.032 1.329 1.564 1.733 1.886 2.005 2.121 2.334 2.426 2.509 2.594 2.77 2.84 2.959 3.067 3.177 3.226 3.31 3.388 3.506 3.578 3.652 3.774 3.877 3.972 4.055 4.133 4.244 4.344 4.423 4.501 4.581 4.647 4.728 4.836 4.91 4.971 5.051 5.129 5.204 5.295 5.363 5.357 5.313 5.231 5.048 4.701 4.266 3.506 1.904 -0.026 -1.641 -2.979 -4.128 -5.158 -6.036 -6.833 -7.503 -8.174 -8.761 -9.267 -9.754 -10.215 -10.623 -10.984 -11.346 -11.673 -11.97 -12.289 -12.631 -12.904 -13.177 -13.462 -13.673 -13.898 -14.134 -14.374 -14.638 -14.816 -14.989 -15.267 -15.472 -15.71 -15.829 -16.043 -16.271 -16.53 -16.657 -16.882 -17.043 -17.191 -17.345 -17.664 -17.832 -18.024 -18.229 -18.44 -18.717 -19.105 -20.464 -10 ,94 ,KEBNE ,16657582,Tue Nov 23 04:57:23 CET,Tue Nov 23 06:19:10 CET,0.0 0.785 1.027 1.18 1.309 1.434 1.553 1.659 1.825 1.902 1.981 2.054 2.212 2.264 2.359 2.467 2.579 2.626 2.72 2.804 2.918 2.991 3.058 3.154 3.252 3.359 3.452 3.519 3.607 3.705 3.789 3.89 3.989 4.073 4.168 4.245 4.318 4.435 4.546 4.613 4.667 4.717 4.726 4.732 4.721 4.613 4.395 4.086 3.603 2.781 1.34 -0.602 -2.322 -3.778 -4.954 -5.966 -6.844 -7.601 -8.237 -8.897 -9.479 -9.992 -10.474 -10.931 -11.347 -11.712 -12.112 -12.466 -12.761 -13.062 -13.364 -13.614 -13.87 -14.136 -14.337 -14.56 -14.809 -15.057 -15.298 -15.457 -15.625 -15.876 -16.04 -16.213 -16.3 -16.483 -16.691 -16.901 -17.016 -17.239 -17.363 -17.503 -17.656 -17.957 -18.124 -18.317 -18.545 -18.781 -19.084 -19.493 -21.493 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_252.txt deleted file mode 100644 index 45d324cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_237_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32297 ,KEBNE ,16657583,Tue Nov 23 04:57:23 CET,Tue Nov 23 06:18:10 CET,0.0 0.302 0.493 0.635 0.741 0.85 0.945 1.04 1.189 1.244 1.305 1.339 1.476 1.523 1.622 1.691 1.74 1.764 1.812 1.861 1.92 1.951 1.997 2.071 2.125 2.172 2.219 2.253 2.283 2.311 2.321 2.308 2.296 2.285 2.265 2.248 2.198 2.108 2.025 1.919 1.757 1.553 1.307 1.01 0.591 0.016 -0.797 -1.901 -3.525 -5.821 -9.312 -13.416 -16.684 -19.347 -21.483 -23.274 -24.824 -26.179 -27.286 -28.359 -29.261 -30.05 -30.791 -31.453 -32.035 -32.566 -33.112 -33.621 -34.059 -34.5 -34.955 -35.326 -35.712 -36.095 -36.383 -36.698 -37.024 -37.348 -37.673 -37.886 -38.119 -38.492 -38.735 -38.976 -39.097 -39.349 -39.622 -39.908 -40.055 -40.338 -40.542 -40.714 -40.883 -41.268 -41.46 -41.658 -41.878 -42.118 -42.441 -42.891 -43.969 -2 ,15723 ,KEBNE ,16657584,Tue Nov 23 04:57:23 CET,Tue Nov 23 06:20:30 CET,0.0 0.428 0.552 0.654 0.775 0.893 0.972 1.031 1.138 1.185 1.227 1.233 1.368 1.407 1.483 1.556 1.626 1.659 1.722 1.777 1.851 1.889 1.913 1.952 1.99 2.02 2.048 2.071 2.087 2.095 2.102 2.1 2.079 2.047 1.999 1.953 1.912 1.837 1.742 1.622 1.47 1.28 1.019 0.718 0.288 -0.242 -0.92 -1.943 -3.51 -5.772 -9.398 -13.49 -16.633 -19.139 -21.176 -22.889 -24.348 -25.643 -26.736 -27.817 -28.729 -29.513 -30.224 -30.875 -31.491 -32.047 -32.618 -33.105 -33.528 -33.979 -34.419 -34.768 -35.128 -35.502 -35.796 -36.106 -36.423 -36.753 -37.085 -37.306 -37.537 -37.902 -38.149 -38.4 -38.523 -38.785 -39.065 -39.336 -39.476 -39.755 -39.949 -40.131 -40.305 -40.683 -40.898 -41.128 -41.385 -41.662 -41.97 -42.404 -43.442 -3 ,8428 ,KEBNE ,16657585,Tue Nov 23 04:57:25 CET,Tue Nov 23 06:18:49 CET,0.0 0.358 0.521 0.622 0.715 0.801 0.878 0.966 1.13 1.203 1.271 1.276 1.397 1.426 1.491 1.573 1.654 1.683 1.738 1.804 1.883 1.921 1.961 2.021 2.067 2.112 2.153 2.173 2.172 2.173 2.178 2.172 2.181 2.187 2.164 2.133 2.095 2.04 1.947 1.805 1.655 1.492 1.239 0.878 0.412 -0.178 -1.001 -2.1 -3.649 -6.017 -9.867 -14.14 -17.349 -19.886 -21.968 -23.725 -25.217 -26.522 -27.582 -28.615 -29.499 -30.293 -31.041 -31.705 -32.278 -32.793 -33.339 -33.831 -34.228 -34.612 -35.032 -35.385 -35.735 -36.082 -36.348 -36.63 -36.919 -37.214 -37.528 -37.739 -37.947 -38.289 -38.529 -38.768 -38.891 -39.131 -39.382 -39.665 -39.816 -40.102 -40.266 -40.416 -40.585 -40.925 -41.12 -41.345 -41.586 -41.832 -42.133 -42.566 -43.637 -4 ,25747 ,KEBNE ,16657586,Tue Nov 23 04:59:26 CET,Tue Nov 23 06:28:22 CET,0.0 0.3 0.461 0.56 0.661 0.776 0.865 0.935 1.075 1.144 1.201 1.202 1.328 1.364 1.442 1.514 1.588 1.625 1.697 1.768 1.845 1.879 1.906 1.944 1.976 2.004 2.028 2.06 2.102 2.139 2.166 2.171 2.157 2.123 2.082 2.028 1.974 1.903 1.775 1.589 1.384 1.147 0.844 0.514 -0.002 -0.696 -1.594 -2.817 -4.585 -7.106 -10.914 -15.032 -18.236 -20.863 -22.948 -24.698 -26.181 -27.501 -28.575 -29.616 -30.521 -31.326 -32.098 -32.816 -33.448 -34.003 -34.578 -35.081 -35.504 -35.918 -36.345 -36.697 -37.056 -37.412 -37.682 -37.98 -38.27 -38.564 -38.883 -39.109 -39.343 -39.692 -39.931 -40.162 -40.279 -40.527 -40.795 -41.093 -41.237 -41.501 -41.665 -41.832 -42.005 -42.345 -42.553 -42.787 -43.017 -43.257 -43.528 -43.906 -45.009 -5 ,17005 ,KEBNE ,16657587,Tue Nov 23 05:00:28 CET,Tue Nov 23 06:23:22 CET,0.0 0.221 0.374 0.534 0.68 0.793 0.881 0.955 1.069 1.129 1.184 1.202 1.34 1.393 1.488 1.546 1.593 1.616 1.668 1.731 1.803 1.839 1.876 1.912 1.942 1.972 2.005 2.043 2.072 2.072 2.071 2.063 2.047 2.035 2.024 1.97 1.898 1.831 1.722 1.58 1.432 1.225 0.957 0.629 0.203 -0.407 -1.279 -2.268 -3.721 -6.047 -9.808 -13.942 -16.978 -19.379 -21.428 -23.143 -24.538 -25.813 -26.921 -27.993 -28.871 -29.631 -30.329 -30.986 -31.587 -32.124 -32.67 -33.159 -33.578 -33.992 -34.43 -34.796 -35.161 -35.532 -35.822 -36.115 -36.417 -36.742 -37.075 -37.297 -37.518 -37.858 -38.098 -38.353 -38.484 -38.752 -39.024 -39.298 -39.438 -39.713 -39.907 -40.072 -40.246 -40.603 -40.8 -41.02 -41.251 -41.509 -41.827 -42.244 -43.136 -6 ,18013 ,KEBNE ,16657588,Tue Nov 23 05:03:34 CET,Tue Nov 23 06:24:42 CET,0.0 0.431 0.597 0.722 0.818 0.909 1.007 1.094 1.259 1.325 1.376 1.401 1.553 1.611 1.701 1.761 1.805 1.826 1.872 1.907 1.95 1.987 2.031 2.094 2.158 2.226 2.271 2.304 2.332 2.338 2.354 2.391 2.415 2.418 2.39 2.356 2.318 2.244 2.15 2.032 1.873 1.656 1.398 1.077 0.578 -0.067 -0.896 -1.954 -3.568 -5.972 -9.63 -13.748 -16.92 -19.483 -21.614 -23.414 -24.891 -26.168 -27.264 -28.355 -29.271 -30.057 -30.789 -31.486 -32.125 -32.695 -33.279 -33.791 -34.228 -34.682 -35.133 -35.488 -35.863 -36.249 -36.546 -36.857 -37.17 -37.489 -37.818 -38.052 -38.292 -38.65 -38.9 -39.149 -39.271 -39.529 -39.812 -40.09 -40.227 -40.498 -40.66 -40.821 -40.998 -41.355 -41.548 -41.769 -42.015 -42.283 -42.555 -42.944 -43.987 -7 ,31007 ,KEBNE ,16657589,Tue Nov 23 05:04:34 CET,Tue Nov 23 06:25:24 CET,0.0 0.41 0.611 0.764 0.894 1.006 1.112 1.209 1.361 1.425 1.477 1.491 1.622 1.654 1.711 1.789 1.873 1.907 1.971 2.015 2.077 2.115 2.15 2.2 2.239 2.274 2.298 2.297 2.295 2.296 2.294 2.294 2.293 2.269 2.217 2.156 2.093 2.021 1.944 1.836 1.674 1.467 1.193 0.877 0.458 -0.052 -0.789 -1.922 -3.599 -6.03 -9.845 -14.007 -17.097 -19.598 -21.614 -23.338 -24.849 -26.168 -27.249 -28.306 -29.18 -29.927 -30.628 -31.292 -31.909 -32.471 -33.052 -33.539 -33.95 -34.37 -34.796 -35.146 -35.507 -35.88 -36.152 -36.435 -36.743 -37.053 -37.354 -37.556 -37.764 -38.085 -38.314 -38.559 -38.688 -38.937 -39.198 -39.486 -39.626 -39.895 -40.056 -40.217 -40.39 -40.76 -40.971 -41.187 -41.43 -41.713 -42.019 -42.381 -43.172 -8 ,14836 ,KEBNE ,16657590,Tue Nov 23 05:04:35 CET,Tue Nov 23 06:26:46 CET,0.0 0.322 0.491 0.622 0.717 0.798 0.893 0.978 1.097 1.149 1.201 1.197 1.333 1.38 1.454 1.518 1.581 1.604 1.642 1.689 1.749 1.782 1.811 1.844 1.874 1.912 1.935 1.941 1.954 1.96 1.948 1.94 1.927 1.91 1.89 1.853 1.794 1.682 1.553 1.414 1.259 1.032 0.674 0.329 -0.109 -0.765 -1.672 -2.889 -4.62 -7.106 -10.904 -15.069 -18.298 -20.863 -22.932 -24.758 -26.348 -27.728 -28.869 -29.996 -30.936 -31.727 -32.454 -33.131 -33.755 -34.307 -34.859 -35.341 -35.753 -36.175 -36.6 -36.939 -37.293 -37.671 -37.961 -38.264 -38.58 -38.892 -39.214 -39.443 -39.667 -40.013 -40.259 -40.508 -40.632 -40.883 -41.134 -41.417 -41.565 -41.837 -42.022 -42.199 -42.375 -42.708 -42.887 -43.091 -43.322 -43.568 -43.835 -44.171 -45.264 -9 ,30839 ,KEBNE ,16657591,Tue Nov 23 05:04:37 CET,Tue Nov 23 06:24:31 CET,0.0 0.469 0.641 0.78 0.924 1.043 1.136 1.224 1.377 1.433 1.483 1.495 1.629 1.669 1.752 1.833 1.902 1.924 1.964 2.012 2.082 2.125 2.159 2.197 2.22 2.249 2.284 2.307 2.318 2.331 2.333 2.314 2.286 2.254 2.24 2.205 2.148 2.088 1.997 1.86 1.68 1.452 1.144 0.794 0.318 -0.289 -1.132 -2.358 -4.081 -6.418 -10.019 -14.168 -17.408 -19.989 -22.077 -23.849 -25.358 -26.667 -27.759 -28.827 -29.731 -30.524 -31.253 -31.925 -32.531 -33.095 -33.693 -34.227 -34.674 -35.134 -35.609 -35.98 -36.376 -36.786 -37.096 -37.419 -37.751 -38.081 -38.401 -38.616 -38.839 -39.186 -39.424 -39.66 -39.781 -40.048 -40.323 -40.591 -40.727 -41.012 -41.218 -41.397 -41.589 -41.986 -42.196 -42.423 -42.666 -42.937 -43.245 -43.666 -45.146 -10 ,29312 ,KEBNE ,16657592,Tue Nov 23 05:04:39 CET,Tue Nov 23 06:24:27 CET,0.0 0.727 0.902 1.077 1.219 1.33 1.42 1.495 1.645 1.713 1.772 1.787 1.932 1.973 2.061 2.142 2.201 2.227 2.289 2.356 2.448 2.496 2.532 2.591 2.637 2.687 2.728 2.742 2.768 2.793 2.803 2.801 2.794 2.79 2.776 2.747 2.7 2.618 2.542 2.452 2.346 2.183 1.912 1.631 1.216 0.657 -0.019 -0.995 -2.459 -4.603 -7.988 -11.755 -14.638 -16.997 -18.955 -20.636 -22.068 -23.336 -24.394 -25.418 -26.313 -27.097 -27.83 -28.493 -29.094 -29.663 -30.246 -30.764 -31.208 -31.653 -32.121 -32.503 -32.883 -33.28 -33.594 -33.924 -34.26 -34.589 -34.935 -35.177 -35.416 -35.788 -36.045 -36.312 -36.448 -36.721 -37.019 -37.347 -37.51 -37.808 -38.028 -38.212 -38.407 -38.822 -39.042 -39.288 -39.578 -39.913 -40.272 -40.728 -41.869 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_23_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_23_1.txt deleted file mode 100644 index 0ab7c420..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_23_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,852 ,KEBNE ,16657593,Tue Nov 23 05:05:37 CET,Tue Nov 23 06:27:34 CET,0.0 0.774 0.983 1.152 1.306 1.454 1.58 1.692 1.925 2.029 2.126 2.237 2.42 2.492 2.627 2.766 2.902 2.976 3.115 3.247 3.422 3.523 3.628 3.786 3.933 4.087 4.232 4.374 4.591 4.787 4.965 5.2 5.41 5.581 5.773 5.986 6.2 6.447 6.703 6.972 7.265 7.613 8.021 8.396 8.816 9.269 9.766 10.284 10.851 11.507 12.198 12.627 12.688 12.588 12.47 12.334 12.195 12.067 11.898 11.669 11.482 11.317 11.146 10.969 10.806 10.655 10.473 10.304 10.178 10.059 9.911 9.79 9.677 9.537 9.42 9.318 9.215 9.093 8.966 8.871 8.779 8.644 8.552 8.456 8.392 8.247 8.103 7.955 7.886 7.731 7.681 7.615 7.535 7.357 7.263 7.154 7.03 6.907 6.758 6.511 5.839 -2 ,12799 ,KEBNE ,16657594,Tue Nov 23 05:05:36 CET,Tue Nov 23 06:29:08 CET,0.0 0.45 0.649 0.808 0.952 1.07 1.173 1.277 1.471 1.564 1.657 1.769 1.96 2.042 2.183 2.326 2.479 2.551 2.68 2.798 2.984 3.108 3.233 3.407 3.553 3.697 3.845 3.986 4.162 4.348 4.534 4.746 4.952 5.139 5.33 5.555 5.793 6.089 6.418 6.72 7.022 7.366 7.745 8.109 8.525 8.99 9.503 10.046 10.656 11.325 12.011 12.347 12.318 12.185 12.007 11.792 11.581 11.365 11.144 10.913 10.717 10.509 10.293 10.102 9.913 9.751 9.583 9.417 9.265 9.106 8.933 8.786 8.629 8.47 8.363 8.244 8.113 7.995 7.868 7.767 7.658 7.488 7.383 7.271 7.214 7.102 6.985 6.848 6.775 6.623 6.558 6.476 6.394 6.204 6.107 6.019 5.922 5.79 5.635 5.443 4.968 -3 ,29484 ,KEBNE ,16657595,Tue Nov 23 05:05:43 CET,Tue Nov 23 06:25:52 CET,0.0 0.4 0.596 0.76 0.903 1.034 1.164 1.279 1.485 1.577 1.668 1.767 1.945 2.022 2.166 2.302 2.456 2.52 2.625 2.739 2.913 3.038 3.16 3.327 3.49 3.652 3.801 3.937 4.116 4.286 4.455 4.663 4.873 5.083 5.319 5.576 5.817 6.067 6.343 6.666 6.992 7.334 7.705 8.08 8.528 9.034 9.59 10.18 10.902 11.723 12.549 13.058 13.19 13.137 13.028 12.833 12.647 12.444 12.225 12.005 11.788 11.587 11.373 11.142 10.933 10.735 10.537 10.379 10.237 10.076 9.9 9.741 9.578 9.424 9.313 9.208 9.09 8.956 8.806 8.703 8.592 8.412 8.281 8.151 8.094 7.956 7.802 7.654 7.577 7.423 7.377 7.302 7.206 6.99 6.895 6.785 6.657 6.513 6.324 6.133 5.8 -4 ,4386 ,KEBNE ,16657596,Tue Nov 23 05:06:38 CET,Tue Nov 23 06:28:45 CET,0.0 0.76 1.016 1.188 1.319 1.443 1.566 1.681 1.884 1.973 2.073 2.173 2.338 2.406 2.547 2.705 2.852 2.92 3.048 3.165 3.339 3.46 3.576 3.734 3.888 4.033 4.165 4.29 4.459 4.623 4.789 5.0 5.2 5.397 5.629 5.874 6.105 6.37 6.645 6.926 7.21 7.53 7.921 8.314 8.762 9.216 9.721 10.278 10.837 11.44 12.116 12.519 12.574 12.448 12.276 12.037 11.761 11.493 11.246 11.02 10.815 10.615 10.433 10.262 10.095 9.938 9.751 9.575 9.435 9.295 9.137 8.993 8.855 8.727 8.628 8.518 8.398 8.266 8.132 8.048 7.961 7.81 7.695 7.579 7.52 7.412 7.302 7.175 7.092 6.919 6.832 6.745 6.66 6.469 6.367 6.257 6.15 6.037 5.885 5.698 5.234 -5 ,32064 ,KEBNE ,16657597,Tue Nov 23 05:08:41 CET,Tue Nov 23 06:32:00 CET,0.0 0.626 0.892 1.069 1.229 1.385 1.53 1.667 1.893 1.999 2.105 2.2 2.375 2.468 2.645 2.809 2.958 3.029 3.173 3.308 3.503 3.623 3.739 3.903 4.074 4.247 4.403 4.552 4.74 4.919 5.086 5.279 5.469 5.678 5.898 6.106 6.316 6.559 6.814 7.076 7.341 7.633 8.013 8.419 8.844 9.301 9.838 10.424 11.026 11.634 12.247 12.583 12.621 12.529 12.375 12.182 12.003 11.827 11.639 11.446 11.268 11.094 10.916 10.749 10.587 10.409 10.223 10.042 9.893 9.757 9.591 9.456 9.323 9.182 9.07 8.955 8.833 8.701 8.557 8.46 8.364 8.194 8.075 7.964 7.909 7.786 7.642 7.502 7.436 7.287 7.249 7.181 7.098 6.91 6.812 6.707 6.581 6.46 6.329 6.17 5.87 -6 ,9596 ,KEBNE ,16657598,Tue Nov 23 05:08:41 CET,Tue Nov 23 06:29:59 CET,0.0 0.597 0.807 0.987 1.155 1.305 1.432 1.537 1.752 1.862 1.963 2.055 2.222 2.301 2.456 2.61 2.766 2.835 2.97 3.108 3.308 3.447 3.578 3.755 3.912 4.046 4.184 4.336 4.527 4.697 4.878 5.099 5.274 5.427 5.633 5.874 6.089 6.325 6.575 6.845 7.14 7.464 7.816 8.167 8.579 9.045 9.586 10.131 10.686 11.303 11.889 12.131 12.157 12.092 11.961 11.794 11.611 11.409 11.233 11.043 10.862 10.69 10.533 10.381 10.216 10.061 9.888 9.735 9.601 9.466 9.332 9.197 9.056 8.934 8.823 8.688 8.572 8.474 8.36 8.276 8.179 8.009 7.9 7.775 7.703 7.571 7.449 7.304 7.225 7.069 7.004 6.924 6.845 6.671 6.573 6.469 6.355 6.22 6.046 5.851 5.483 -7 ,25257 ,KEBNE ,16657599,Tue Nov 23 05:09:43 CET,Tue Nov 23 06:33:18 CET,0.0 0.847 1.184 1.422 1.572 1.698 1.824 1.929 2.106 2.195 2.289 2.394 2.568 2.647 2.796 2.935 3.086 3.159 3.29 3.422 3.603 3.727 3.855 4.033 4.213 4.38 4.525 4.662 4.835 5.011 5.191 5.411 5.607 5.802 6.024 6.256 6.517 6.82 7.107 7.395 7.704 8.037 8.411 8.773 9.191 9.651 10.166 10.708 11.295 11.918 12.514 12.806 12.845 12.774 12.594 12.347 12.082 11.825 11.626 11.407 11.19 10.991 10.784 10.585 10.417 10.266 10.1 9.93 9.784 9.644 9.487 9.356 9.215 9.049 8.915 8.784 8.667 8.545 8.376 8.274 8.186 8.026 7.912 7.787 7.719 7.595 7.49 7.384 7.323 7.166 7.08 6.995 6.91 6.718 6.602 6.471 6.353 6.239 6.109 5.895 5.437 -8 ,21510 ,KEBNE ,16657600,Tue Nov 23 05:09:42 CET,Tue Nov 23 06:30:45 CET,0.0 0.875 1.108 1.257 1.382 1.511 1.655 1.797 2.031 2.131 2.235 2.326 2.494 2.576 2.723 2.865 3.022 3.096 3.224 3.347 3.516 3.621 3.726 3.879 4.018 4.157 4.302 4.439 4.609 4.775 4.937 5.12 5.292 5.48 5.721 5.989 6.22 6.473 6.749 7.032 7.339 7.67 8.059 8.449 8.888 9.351 9.868 10.446 11.059 11.718 12.389 12.714 12.794 12.725 12.584 12.426 12.228 12.004 11.789 11.568 11.373 11.174 10.979 10.796 10.608 10.436 10.256 10.098 9.985 9.879 9.754 9.641 9.513 9.365 9.25 9.136 9.016 8.893 8.77 8.678 8.583 8.449 8.342 8.22 8.155 8.024 7.912 7.802 7.741 7.583 7.498 7.403 7.308 7.134 7.029 6.923 6.82 6.695 6.541 6.364 5.95 -9 ,17152 ,KEBNE ,16657601,Tue Nov 23 05:09:42 CET,Tue Nov 23 06:31:03 CET,0.0 0.563 0.793 0.991 1.163 1.293 1.421 1.539 1.722 1.823 1.941 2.056 2.225 2.301 2.445 2.588 2.721 2.787 2.919 3.035 3.22 3.354 3.469 3.616 3.756 3.888 4.03 4.172 4.348 4.521 4.674 4.883 5.082 5.25 5.455 5.69 5.922 6.17 6.45 6.746 7.042 7.38 7.775 8.165 8.629 9.158 9.73 10.345 11.003 11.651 12.4 12.844 12.966 13.004 12.894 12.684 12.48 12.306 12.158 11.995 11.83 11.639 11.457 11.298 11.13 10.974 10.824 10.69 10.576 10.454 10.314 10.196 10.068 9.938 9.836 9.723 9.607 9.478 9.345 9.257 9.174 9.045 8.951 8.856 8.802 8.689 8.577 8.444 8.365 8.206 8.127 8.037 7.948 7.754 7.652 7.552 7.437 7.307 7.189 7.051 6.8 -10 ,2659 ,KEBNE ,16657602,Tue Nov 23 05:09:43 CET,Tue Nov 23 06:36:41 CET,0.0 0.455 0.667 0.822 0.946 1.07 1.194 1.322 1.562 1.659 1.743 1.822 1.998 2.079 2.25 2.404 2.551 2.63 2.753 2.873 3.046 3.146 3.259 3.43 3.593 3.745 3.895 4.062 4.271 4.439 4.595 4.782 4.972 5.151 5.351 5.591 5.825 6.071 6.325 6.586 6.836 7.127 7.474 7.807 8.216 8.703 9.215 9.737 10.358 11.06 11.81 12.172 12.227 12.173 12.017 11.797 11.545 11.289 11.084 10.844 10.618 10.403 10.189 10.005 9.826 9.654 9.484 9.322 9.181 9.033 8.858 8.715 8.558 8.398 8.285 8.18 8.075 7.94 7.785 7.696 7.619 7.491 7.396 7.29 7.228 7.086 6.929 6.766 6.683 6.521 6.463 6.377 6.278 6.076 5.977 5.889 5.769 5.61 5.442 5.254 4.731 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_251_256.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_251_256.txt deleted file mode 100644 index d7eac37e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_251_256.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20511 ,KEBNE ,16657603,Tue Nov 23 05:09:47 CET,Tue Nov 23 06:30:11 CET,0.0 0.332 0.505 0.613 0.709 0.795 0.867 0.939 1.093 1.171 1.24 1.245 1.401 1.453 1.549 1.633 1.708 1.746 1.81 1.866 1.954 2.015 2.083 2.184 2.28 2.359 2.417 2.469 2.544 2.626 2.694 2.774 2.839 2.897 2.972 3.026 3.071 3.128 3.184 3.231 3.288 3.334 3.334 3.334 3.32 3.239 3.046 2.724 2.187 1.347 -0.079 -1.878 -3.365 -4.634 -5.711 -6.659 -7.496 -8.283 -8.961 -9.612 -10.171 -10.667 -11.145 -11.61 -12.037 -12.43 -12.815 -13.138 -13.421 -13.72 -14.04 -14.291 -14.554 -14.847 -15.079 -15.323 -15.568 -15.814 -16.072 -16.244 -16.431 -16.737 -16.948 -17.161 -17.274 -17.521 -17.762 -18.002 -18.12 -18.364 -18.525 -18.68 -18.841 -19.181 -19.381 -19.608 -19.853 -20.138 -20.47 -20.919 -22.325 -2 ,18080 ,KEBNE ,16657604,Tue Nov 23 05:09:47 CET,Tue Nov 23 06:30:12 CET,0.0 0.269 0.399 0.499 0.609 0.706 0.776 0.846 0.997 1.068 1.136 1.153 1.315 1.365 1.47 1.574 1.67 1.72 1.82 1.906 2.02 2.093 2.157 2.252 2.351 2.447 2.527 2.586 2.663 2.742 2.806 2.869 2.927 2.983 3.043 3.108 3.176 3.236 3.287 3.317 3.34 3.375 3.386 3.366 3.298 3.168 2.981 2.687 2.154 1.254 -0.28 -2.093 -3.583 -4.911 -6.061 -7.061 -7.941 -8.717 -9.36 -10.011 -10.567 -11.045 -11.493 -11.917 -12.309 -12.653 -13.002 -13.322 -13.616 -13.911 -14.218 -14.487 -14.757 -15.034 -15.25 -15.473 -15.704 -15.943 -16.207 -16.385 -16.557 -16.825 -17.014 -17.222 -17.325 -17.528 -17.756 -17.984 -18.102 -18.349 -18.474 -18.616 -18.774 -19.104 -19.288 -19.502 -19.732 -19.988 -20.297 -20.722 -22.066 -3 ,32126 ,KEBNE ,16657605,Tue Nov 23 05:10:46 CET,Tue Nov 23 06:40:13 CET,0.0 0.238 0.379 0.515 0.637 0.71 0.785 0.869 1.008 1.064 1.113 1.103 1.256 1.295 1.39 1.491 1.575 1.609 1.674 1.746 1.861 1.932 1.988 2.078 2.162 2.229 2.296 2.348 2.416 2.488 2.574 2.682 2.758 2.826 2.914 3.012 3.078 3.131 3.179 3.233 3.286 3.306 3.312 3.312 3.24 3.078 2.843 2.528 2.033 1.212 -0.228 -1.961 -3.428 -4.677 -5.794 -6.82 -7.702 -8.525 -9.237 -9.892 -10.445 -10.946 -11.409 -11.851 -12.252 -12.608 -12.997 -13.347 -13.643 -13.952 -14.256 -14.496 -14.751 -15.029 -15.254 -15.487 -15.72 -15.956 -16.195 -16.362 -16.538 -16.813 -17.005 -17.206 -17.308 -17.516 -17.727 -17.961 -18.089 -18.341 -18.497 -18.651 -18.818 -19.18 -19.379 -19.597 -19.837 -20.098 -20.386 -20.79 -22.625 -4 ,24593 ,KEBNE ,16657606,Tue Nov 23 05:11:46 CET,Tue Nov 23 06:33:24 CET,0.0 0.354 0.52 0.65 0.752 0.838 0.918 0.988 1.129 1.199 1.259 1.275 1.441 1.495 1.598 1.716 1.819 1.868 1.972 2.056 2.175 2.264 2.344 2.452 2.545 2.621 2.714 2.819 2.932 3.029 3.116 3.206 3.297 3.406 3.536 3.658 3.767 3.911 4.039 4.155 4.279 4.401 4.535 4.64 4.709 4.699 4.619 4.418 3.984 3.271 2.007 0.362 -1.004 -2.182 -3.223 -4.193 -5.05 -5.786 -6.428 -7.059 -7.567 -8.019 -8.468 -8.901 -9.306 -9.672 -10.06 -10.405 -10.706 -11.013 -11.307 -11.545 -11.792 -12.056 -12.274 -12.505 -12.731 -12.97 -13.225 -13.4 -13.582 -13.854 -14.036 -14.226 -14.322 -14.527 -14.754 -14.987 -15.114 -15.376 -15.518 -15.663 -15.832 -16.194 -16.381 -16.588 -16.792 -17.017 -17.326 -17.79 -19.707 -5 ,23573 ,KEBNE ,16657607,Tue Nov 23 05:11:47 CET,Tue Nov 23 06:34:16 CET,0.0 0.276 0.427 0.518 0.602 0.699 0.794 0.868 0.985 1.039 1.093 1.096 1.248 1.291 1.371 1.476 1.578 1.613 1.678 1.762 1.872 1.93 1.994 2.091 2.185 2.266 2.34 2.428 2.539 2.609 2.669 2.747 2.821 2.876 2.937 2.993 3.034 3.064 3.09 3.117 3.13 3.154 3.188 3.196 3.139 3.005 2.813 2.506 2.027 1.307 -0.115 -1.982 -3.581 -4.936 -6.064 -7.027 -7.855 -8.617 -9.25 -9.881 -10.441 -10.944 -11.414 -11.838 -12.224 -12.587 -12.972 -13.297 -13.567 -13.864 -14.169 -14.413 -14.679 -14.95 -15.155 -15.361 -15.583 -15.83 -16.081 -16.252 -16.433 -16.707 -16.894 -17.094 -17.199 -17.404 -17.601 -17.832 -17.951 -18.195 -18.347 -18.485 -18.629 -18.97 -19.158 -19.346 -19.569 -19.839 -20.178 -20.595 -22.785 -6 ,8664 ,KEBNE ,16657608,Tue Nov 23 05:11:46 CET,Tue Nov 23 06:34:19 CET,0.0 0.23 0.382 0.501 0.593 0.669 0.734 0.789 0.907 0.968 1.026 1.04 1.186 1.229 1.328 1.413 1.496 1.539 1.617 1.693 1.806 1.873 1.931 2.014 2.108 2.186 2.258 2.331 2.407 2.483 2.54 2.607 2.687 2.745 2.796 2.861 2.922 2.979 3.04 3.089 3.103 3.081 3.041 2.989 2.914 2.809 2.587 2.213 1.654 0.755 -0.886 -2.881 -4.479 -5.802 -6.966 -8.017 -8.891 -9.663 -10.332 -11.004 -11.567 -12.058 -12.539 -12.991 -13.393 -13.754 -14.148 -14.5 -14.789 -15.097 -15.433 -15.705 -15.982 -16.265 -16.472 -16.676 -16.908 -17.169 -17.434 -17.617 -17.802 -18.088 -18.289 -18.503 -18.62 -18.862 -19.119 -19.376 -19.502 -19.761 -19.928 -20.075 -20.22 -20.56 -20.752 -20.975 -21.232 -21.514 -21.851 -22.311 -23.867 -7 ,19830 ,KEBNE ,16657609,Tue Nov 23 05:11:46 CET,Tue Nov 23 06:35:19 CET,0.0 0.346 0.472 0.565 0.665 0.765 0.839 0.895 0.996 1.056 1.127 1.132 1.293 1.343 1.419 1.495 1.576 1.61 1.672 1.743 1.839 1.904 1.97 2.058 2.138 2.213 2.287 2.362 2.45 2.525 2.583 2.642 2.717 2.796 2.868 2.952 3.031 3.091 3.137 3.178 3.223 3.287 3.352 3.345 3.294 3.164 2.89 2.513 1.98 1.162 -0.378 -2.383 -4.031 -5.375 -6.517 -7.507 -8.327 -9.043 -9.669 -10.297 -10.833 -11.327 -11.805 -12.256 -12.666 -13.041 -13.435 -13.781 -14.08 -14.395 -14.728 -15.019 -15.318 -15.632 -15.869 -16.083 -16.306 -16.552 -16.82 -17.011 -17.196 -17.5 -17.728 -17.947 -18.053 -18.289 -18.533 -18.779 -18.904 -19.146 -19.277 -19.417 -19.568 -19.876 -20.052 -20.246 -20.451 -20.714 -21.034 -21.39 -22.855 -8 ,3521 ,KEBNE ,16657610,Tue Nov 23 05:11:50 CET,Tue Nov 23 06:32:17 CET,0.0 0.369 0.541 0.671 0.775 0.854 0.927 0.993 1.156 1.236 1.291 1.28 1.431 1.469 1.549 1.632 1.715 1.761 1.844 1.914 2.0 2.056 2.111 2.196 2.284 2.374 2.449 2.505 2.603 2.693 2.752 2.818 2.876 2.937 2.996 3.055 3.116 3.175 3.234 3.302 3.364 3.402 3.411 3.4 3.391 3.342 3.21 2.999 2.659 2.068 0.951 -0.505 -1.763 -2.822 -3.763 -4.618 -5.363 -6.033 -6.606 -7.176 -7.661 -8.087 -8.473 -8.839 -9.195 -9.515 -9.827 -10.12 -10.373 -10.627 -10.895 -11.124 -11.372 -11.642 -11.855 -12.074 -12.305 -12.517 -12.726 -12.88 -13.06 -13.338 -13.508 -13.681 -13.773 -13.964 -14.168 -14.405 -14.533 -14.775 -14.914 -15.056 -15.195 -15.461 -15.621 -15.807 -16.0 -16.243 -16.526 -16.916 -18.426 -9 ,965 ,KEBNE ,16657611,Tue Nov 23 05:12:48 CET,Tue Nov 23 06:36:00 CET,0.0 0.276 0.438 0.564 0.687 0.781 0.851 0.924 1.061 1.115 1.166 1.189 1.354 1.394 1.492 1.597 1.704 1.751 1.837 1.921 2.035 2.096 2.144 2.222 2.315 2.413 2.503 2.59 2.703 2.8 2.896 3.013 3.122 3.21 3.301 3.39 3.458 3.546 3.63 3.692 3.736 3.788 3.866 3.91 3.909 3.853 3.687 3.433 3.036 2.34 1.006 -0.732 -2.248 -3.534 -4.651 -5.701 -6.666 -7.515 -8.207 -8.894 -9.487 -9.987 -10.442 -10.883 -11.291 -11.651 -12.05 -12.435 -12.77 -13.119 -13.464 -13.738 -14.041 -14.36 -14.604 -14.864 -15.136 -15.404 -15.658 -15.84 -16.054 -16.365 -16.573 -16.802 -16.914 -17.152 -17.387 -17.623 -17.745 -17.986 -18.127 -18.279 -18.428 -18.775 -18.974 -19.182 -19.415 -19.694 -20.005 -20.44 -22.387 -10 ,28545 ,KEBNE ,16657612,Tue Nov 23 05:12:48 CET,Tue Nov 23 06:34:56 CET,0.0 0.243 0.371 0.474 0.575 0.66 0.737 0.815 0.931 0.985 1.045 1.068 1.237 1.29 1.372 1.441 1.505 1.537 1.613 1.691 1.796 1.858 1.915 1.992 2.061 2.132 2.189 2.24 2.312 2.384 2.444 2.51 2.586 2.66 2.748 2.859 2.952 3.019 3.085 3.144 3.176 3.183 3.175 3.151 3.091 2.963 2.728 2.416 1.926 1.113 -0.323 -2.151 -3.68 -5.007 -6.188 -7.262 -8.183 -8.994 -9.671 -10.327 -10.898 -11.404 -11.893 -12.366 -12.792 -13.172 -13.574 -13.944 -14.255 -14.564 -14.889 -15.165 -15.445 -15.74 -15.96 -16.173 -16.405 -16.658 -16.916 -17.084 -17.253 -17.518 -17.704 -17.902 -18.008 -18.224 -18.435 -18.659 -18.778 -19.03 -19.186 -19.336 -19.494 -19.857 -20.059 -20.254 -20.475 -20.754 -21.117 -21.629 -22.928 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_155.txt deleted file mode 100644 index 765439c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9601 ,KEBNE ,16657613,Tue Nov 23 05:12:47 CET,Tue Nov 23 06:34:13 CET,0.0 1.045 1.399 1.684 1.938 2.166 2.355 2.524 2.844 2.995 3.143 3.311 3.589 3.725 3.977 4.222 4.47 4.592 4.821 5.043 5.357 5.548 5.751 6.076 6.378 6.66 6.936 7.208 7.571 7.93 8.268 8.662 9.072 9.463 9.906 10.411 10.874 11.402 11.999 12.646 13.38 14.236 15.245 16.286 17.498 18.867 20.455 22.289 24.53 27.311 31.03 34.45 36.647 38.174 39.271 40.116 40.748 41.211 41.584 41.943 42.231 42.458 42.617 42.733 42.816 42.866 42.906 42.938 42.945 42.937 42.947 42.968 42.988 42.994 42.968 42.944 42.917 42.882 42.865 42.846 42.811 42.759 42.729 42.691 42.674 42.631 42.57 42.509 42.475 42.345 42.347 42.296 42.244 42.112 42.042 41.975 41.883 41.757 41.61 41.404 40.864 -2 ,3071 ,KEBNE ,16657614,Tue Nov 23 05:12:48 CET,Tue Nov 23 06:35:03 CET,0.0 0.887 1.208 1.471 1.7 1.879 2.059 2.25 2.574 2.708 2.844 2.992 3.262 3.4 3.664 3.92 4.162 4.278 4.506 4.736 5.069 5.285 5.496 5.794 6.095 6.385 6.665 6.954 7.32 7.664 7.984 8.384 8.815 9.218 9.651 10.171 10.689 11.244 11.852 12.509 13.209 14.003 14.981 15.999 17.192 18.564 20.134 21.971 24.321 27.202 30.886 34.344 36.591 38.113 39.234 40.117 40.768 41.291 41.693 42.035 42.3 42.495 42.658 42.795 42.901 42.985 43.06 43.108 43.147 43.194 43.221 43.225 43.217 43.212 43.206 43.173 43.146 43.11 43.068 43.06 43.055 43.03 43.0 42.966 42.953 42.907 42.846 42.788 42.755 42.625 42.598 42.532 42.462 42.298 42.223 42.15 42.051 41.94 41.825 41.709 41.281 -3 ,21230 ,KEBNE ,16657615,Tue Nov 23 05:12:48 CET,Tue Nov 23 06:34:49 CET,0.0 0.809 1.169 1.446 1.686 1.913 2.131 2.341 2.704 2.867 3.022 3.189 3.467 3.607 3.88 4.134 4.374 4.496 4.729 4.944 5.272 5.468 5.652 5.924 6.188 6.472 6.763 7.038 7.358 7.691 8.038 8.424 8.776 9.13 9.568 10.073 10.568 11.115 11.708 12.327 12.987 13.763 14.664 15.643 16.84 18.119 19.621 21.465 23.714 26.42 29.964 33.263 35.379 36.789 37.788 38.598 39.267 39.813 40.231 40.602 40.89 41.108 41.265 41.388 41.494 41.586 41.673 41.73 41.766 41.786 41.796 41.826 41.858 41.861 41.853 41.843 41.821 41.798 41.786 41.756 41.704 41.625 41.57 41.516 41.486 41.416 41.345 41.283 41.245 41.108 41.092 41.043 41.001 40.872 40.777 40.669 40.553 40.446 40.314 40.101 39.591 -4 ,18479 ,KEBNE ,16657616,Tue Nov 23 05:12:48 CET,Tue Nov 23 06:35:36 CET,0.0 1.178 1.559 1.858 2.127 2.39 2.607 2.784 3.119 3.284 3.434 3.584 3.853 3.997 4.26 4.492 4.727 4.843 5.081 5.314 5.661 5.886 6.091 6.391 6.687 6.981 7.253 7.502 7.856 8.216 8.549 8.965 9.4 9.823 10.307 10.847 11.351 11.931 12.59 13.29 14.046 14.912 15.892 16.875 18.055 19.372 20.892 22.663 24.858 27.619 31.338 34.75 36.889 38.404 39.542 40.418 41.066 41.552 41.916 42.231 42.48 42.679 42.839 42.982 43.115 43.224 43.276 43.297 43.325 43.354 43.373 43.376 43.391 43.402 43.388 43.362 43.337 43.302 43.274 43.256 43.233 43.198 43.167 43.117 43.09 43.04 42.974 42.893 42.848 42.712 42.7 42.645 42.599 42.485 42.393 42.296 42.203 42.111 41.985 41.808 41.435 -5 ,16965 ,KEBNE ,16657617,Tue Nov 23 05:12:48 CET,Tue Nov 23 06:34:40 CET,0.0 1.191 1.617 1.897 2.11 2.332 2.549 2.734 3.064 3.215 3.366 3.551 3.834 3.982 4.247 4.482 4.708 4.822 5.067 5.303 5.628 5.86 6.088 6.393 6.693 6.997 7.295 7.593 7.974 8.328 8.66 9.057 9.446 9.825 10.298 10.863 11.402 11.998 12.656 13.335 14.034 14.828 15.807 16.811 17.96 19.277 20.854 22.733 25.087 28.063 32.025 35.671 37.993 39.611 40.802 41.71 42.338 42.809 43.171 43.495 43.738 43.933 44.13 44.307 44.431 44.508 44.577 44.636 44.693 44.743 44.776 44.804 44.83 44.849 44.835 44.796 44.762 44.729 44.704 44.681 44.643 44.578 44.538 44.5 44.486 44.467 44.434 44.372 44.333 44.201 44.19 44.137 44.08 43.957 43.899 43.822 43.729 43.62 43.504 43.334 42.811 -6 ,690 ,KEBNE ,16657618,Tue Nov 23 05:13:50 CET,Tue Nov 23 06:36:36 CET,0.0 0.921 1.278 1.548 1.758 1.937 2.129 2.316 2.644 2.8 2.956 3.138 3.406 3.542 3.807 4.08 4.352 4.475 4.713 4.956 5.308 5.525 5.733 6.056 6.369 6.665 6.947 7.22 7.577 7.909 8.228 8.637 9.049 9.45 9.933 10.481 11.0 11.565 12.176 12.844 13.578 14.452 15.469 16.477 17.648 18.977 20.549 22.362 24.578 27.328 30.985 34.352 36.49 37.984 39.092 39.972 40.634 41.151 41.537 41.867 42.125 42.328 42.508 42.655 42.754 42.84 42.931 42.994 43.034 43.086 43.141 43.168 43.19 43.209 43.202 43.186 43.187 43.167 43.139 43.134 43.119 43.051 42.993 42.948 42.921 42.871 42.821 42.725 42.675 42.54 42.497 42.43 42.371 42.225 42.145 42.04 41.917 41.802 41.668 41.471 41.132 -7 ,4640 ,KEBNE ,16657619,Tue Nov 23 05:14:51 CET,Tue Nov 23 06:36:21 CET,0.0 1.113 1.499 1.803 2.041 2.277 2.514 2.741 3.146 3.322 3.485 3.663 3.951 4.099 4.361 4.634 4.893 5.013 5.26 5.5 5.853 6.081 6.287 6.58 6.871 7.166 7.45 7.715 8.082 8.433 8.778 9.21 9.612 10.008 10.498 11.063 11.586 12.151 12.782 13.51 14.264 15.077 16.037 17.011 18.202 19.592 21.215 23.154 25.553 28.432 32.242 35.888 38.264 39.861 40.965 41.812 42.454 42.967 43.336 43.661 43.936 44.156 44.349 44.507 44.618 44.696 44.741 44.776 44.828 44.872 44.899 44.898 44.872 44.844 44.83 44.823 44.812 44.77 44.73 44.719 44.683 44.609 44.571 44.524 44.502 44.444 44.354 44.256 44.2 44.061 44.064 44.01 43.942 43.781 43.706 43.642 43.553 43.43 43.303 43.123 42.677 -8 ,30004 ,KEBNE ,16657620,Tue Nov 23 05:14:51 CET,Tue Nov 23 06:36:47 CET,0.0 0.707 1.038 1.305 1.579 1.836 2.066 2.26 2.6 2.765 2.927 3.111 3.386 3.522 3.807 4.107 4.377 4.507 4.763 5.008 5.351 5.567 5.778 6.091 6.401 6.688 6.966 7.238 7.597 7.956 8.304 8.715 9.117 9.523 9.995 10.534 11.077 11.694 12.382 13.102 13.811 14.61 15.568 16.529 17.66 18.935 20.503 22.381 24.684 27.597 31.54 35.08 37.36 39.028 40.207 41.076 41.716 42.18 42.531 42.851 43.093 43.279 43.413 43.55 43.683 43.772 43.845 43.901 43.945 43.977 44.007 44.036 44.03 43.995 43.98 43.971 43.946 43.928 43.912 43.897 43.872 43.812 43.771 43.732 43.706 43.654 43.614 43.574 43.542 43.415 43.434 43.383 43.315 43.149 43.076 43.004 42.883 42.738 42.588 42.445 42.156 -9 ,4011 ,KEBNE ,16657621,Tue Nov 23 05:14:55 CET,Tue Nov 23 06:35:24 CET,0.0 0.761 1.084 1.376 1.631 1.858 2.074 2.281 2.68 2.855 3.007 3.16 3.43 3.559 3.796 4.011 4.234 4.35 4.582 4.816 5.129 5.323 5.528 5.834 6.14 6.446 6.722 6.981 7.333 7.686 8.037 8.464 8.875 9.262 9.724 10.248 10.71 11.204 11.779 12.416 13.114 13.961 14.951 15.912 17.032 18.359 19.919 21.711 23.944 26.748 30.434 33.816 35.956 37.487 38.649 39.534 40.191 40.687 41.081 41.441 41.703 41.934 42.139 42.303 42.449 42.564 42.652 42.725 42.775 42.804 42.817 42.829 42.853 42.86 42.835 42.82 42.817 42.812 42.81 42.795 42.771 42.746 42.71 42.66 42.641 42.579 42.504 42.408 42.345 42.193 42.178 42.135 42.081 41.921 41.834 41.758 41.7 41.604 41.439 41.249 40.853 -10 ,25683 ,KEBNE ,16657622,Tue Nov 23 05:15:53 CET,Tue Nov 23 06:38:05 CET,0.0 0.915 1.293 1.579 1.835 2.079 2.292 2.473 2.787 2.937 3.099 3.296 3.59 3.742 4.018 4.269 4.521 4.659 4.922 5.164 5.498 5.722 5.942 6.255 6.556 6.837 7.139 7.438 7.781 8.103 8.406 8.785 9.18 9.597 10.115 10.689 11.251 11.858 12.519 13.24 13.99 14.881 15.938 16.995 18.32 19.804 21.469 23.43 25.847 28.875 32.849 36.336 38.48 39.972 41.101 41.983 42.637 43.16 43.549 43.87 44.082 44.27 44.46 44.593 44.684 44.765 44.841 44.9 44.955 44.982 44.967 44.964 44.96 44.966 44.977 44.983 44.976 44.948 44.923 44.916 44.907 44.867 44.843 44.821 44.8 44.751 44.695 44.63 44.586 44.451 44.46 44.408 44.347 44.199 44.125 44.044 43.954 43.854 43.703 43.498 43.236 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_164.txt deleted file mode 100644 index 3d65d773..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26129 ,KEBNE ,17069435,Fri Dec 24 04:02:02 CET,Fri Dec 24 05:26:14 CET,0.0 0.83 1.145 1.384 1.588 1.784 1.968 2.121 2.411 2.553 2.684 2.794 3.035 3.144 3.358 3.563 3.758 3.849 4.032 4.21 4.46 4.623 4.777 4.992 5.218 5.439 5.646 5.854 6.102 6.333 6.571 6.862 7.149 7.414 7.717 8.079 8.439 8.835 9.261 9.711 10.187 10.731 11.38 12.016 12.754 13.575 14.464 15.481 16.663 17.993 19.591 20.801 21.452 21.825 21.981 22.092 22.208 22.256 22.239 22.17 22.118 22.07 22.009 21.963 21.909 21.835 21.756 21.692 21.623 21.546 21.451 21.351 21.242 21.123 21.042 20.981 20.922 20.857 20.775 20.713 20.649 20.536 20.446 20.363 20.323 20.216 20.106 19.992 19.928 19.743 19.702 19.61 19.505 19.298 19.196 19.1 18.994 18.88 18.772 18.612 18.22 -2 ,20285 ,KEBNE ,17069437,Fri Dec 24 04:02:03 CET,Fri Dec 24 05:26:33 CET,0.0 0.701 0.991 1.199 1.374 1.527 1.663 1.794 2.067 2.209 2.338 2.44 2.678 2.782 2.978 3.185 3.39 3.477 3.65 3.821 4.075 4.239 4.402 4.646 4.869 5.087 5.308 5.516 5.764 6.0 6.236 6.522 6.803 7.069 7.372 7.715 8.054 8.417 8.79 9.228 9.701 10.204 10.799 11.393 12.103 12.932 13.924 15.065 16.393 17.914 19.533 20.76 21.47 21.847 22.034 22.122 22.144 22.103 22.041 21.96 21.857 21.779 21.717 21.642 21.553 21.459 21.359 21.253 21.164 21.085 21.005 20.938 20.87 20.782 20.704 20.611 20.513 20.423 20.316 20.245 20.174 20.045 19.952 19.856 19.814 19.732 19.632 19.516 19.451 19.277 19.264 19.195 19.115 18.952 18.868 18.759 18.627 18.463 18.272 18.033 17.706 -3 ,680 ,KEBNE ,17069439,Fri Dec 24 04:04:08 CET,Fri Dec 24 05:29:23 CET,0.0 0.783 1.07 1.294 1.475 1.638 1.794 1.932 2.196 2.325 2.454 2.553 2.786 2.888 3.093 3.3 3.507 3.599 3.762 3.936 4.198 4.353 4.497 4.706 4.919 5.132 5.338 5.541 5.794 6.037 6.281 6.572 6.848 7.112 7.413 7.754 8.096 8.481 8.912 9.376 9.849 10.371 11.003 11.665 12.428 13.279 14.276 15.392 16.7 18.16 19.817 21.216 21.995 22.355 22.535 22.631 22.651 22.605 22.516 22.433 22.351 22.264 22.152 22.023 21.897 21.79 21.678 21.565 21.457 21.336 21.197 21.087 20.989 20.876 20.802 20.721 20.635 20.558 20.458 20.382 20.308 20.184 20.093 20.0 19.956 19.872 19.771 19.662 19.61 19.436 19.426 19.358 19.285 19.11 19.017 18.911 18.792 18.668 18.543 18.375 18.029 -4 ,8289 ,KEBNE ,17069441,Fri Dec 24 04:05:11 CET,Fri Dec 24 05:29:26 CET,0.0 1.034 1.37 1.643 1.88 2.069 2.227 2.383 2.685 2.819 2.939 3.041 3.292 3.41 3.624 3.836 4.046 4.14 4.334 4.512 4.764 4.927 5.085 5.325 5.55 5.772 5.996 6.195 6.455 6.715 6.952 7.238 7.535 7.828 8.137 8.489 8.831 9.212 9.64 10.085 10.55 11.084 11.717 12.346 13.094 13.913 14.803 15.776 16.983 18.44 20.045 21.288 21.971 22.383 22.594 22.669 22.709 22.725 22.674 22.607 22.582 22.538 22.477 22.405 22.316 22.223 22.127 22.044 21.95 21.86 21.766 21.65 21.527 21.421 21.349 21.271 21.187 21.096 20.987 20.91 20.839 20.712 20.614 20.524 20.477 20.38 20.288 20.179 20.115 19.937 19.91 19.842 19.766 19.582 19.49 19.392 19.281 19.161 18.997 18.789 18.408 -5 ,29668 ,KEBNE ,17069443,Fri Dec 24 04:09:25 CET,Fri Dec 24 05:34:24 CET,0.0 0.562 0.874 1.148 1.327 1.485 1.648 1.803 2.109 2.251 2.383 2.484 2.724 2.837 3.07 3.296 3.49 3.58 3.758 3.921 4.164 4.33 4.498 4.733 4.953 5.163 5.37 5.582 5.853 6.109 6.368 6.692 6.998 7.286 7.631 8.006 8.33 8.697 9.112 9.56 10.031 10.533 11.145 11.803 12.554 13.365 14.287 15.34 16.583 18.014 19.699 20.927 21.585 22.013 22.266 22.362 22.365 22.357 22.322 22.247 22.172 22.107 22.026 21.935 21.855 21.786 21.698 21.61 21.537 21.425 21.285 21.186 21.089 20.993 20.925 20.857 20.767 20.672 20.589 20.52 20.448 20.327 20.233 20.134 20.083 19.981 19.865 19.744 19.679 19.497 19.467 19.398 19.324 19.163 19.066 18.96 18.843 18.702 18.56 18.381 18.076 -6 ,14813 ,KEBNE ,17069445,Fri Dec 24 04:16:48 CET,Fri Dec 24 05:41:19 CET,0.0 0.553 0.823 1.077 1.303 1.483 1.658 1.839 2.14 2.267 2.385 2.497 2.754 2.875 3.091 3.289 3.47 3.559 3.741 3.923 4.182 4.346 4.509 4.745 4.971 5.185 5.392 5.595 5.845 6.082 6.307 6.585 6.875 7.147 7.466 7.834 8.182 8.573 8.99 9.425 9.883 10.408 11.022 11.645 12.375 13.198 14.15 15.22 16.427 17.808 19.496 20.826 21.547 21.912 22.127 22.288 22.336 22.31 22.288 22.234 22.151 22.045 21.933 21.809 21.694 21.602 21.512 21.439 21.359 21.258 21.156 21.06 20.945 20.844 20.778 20.7 20.614 20.541 20.468 20.405 20.322 20.168 20.067 19.968 19.919 19.808 19.697 19.614 19.569 19.396 19.376 19.297 19.224 19.084 18.989 18.881 18.781 18.681 18.56 18.413 18.138 -7 ,32311 ,KEBNE ,17069447,Fri Dec 24 04:31:39 CET,Fri Dec 24 05:56:38 CET,0.0 0.454 0.781 1.075 1.32 1.524 1.697 1.852 2.111 2.24 2.365 2.468 2.708 2.817 3.029 3.221 3.411 3.511 3.71 3.898 4.163 4.326 4.476 4.7 4.93 5.161 5.377 5.573 5.813 6.041 6.262 6.543 6.832 7.096 7.387 7.735 8.088 8.47 8.887 9.335 9.8 10.329 10.951 11.539 12.234 13.049 13.993 15.023 16.185 17.583 19.301 20.714 21.49 21.906 22.096 22.193 22.224 22.191 22.148 22.082 21.983 21.885 21.794 21.703 21.619 21.523 21.401 21.285 21.188 21.09 20.991 20.906 20.809 20.702 20.618 20.527 20.436 20.349 20.246 20.174 20.1 19.983 19.893 19.797 19.748 19.65 19.548 19.43 19.363 19.17 19.141 19.068 18.973 18.745 18.615 18.502 18.386 18.245 18.059 17.853 17.64 -8 ,12877 ,KEBNE ,17069448,Fri Dec 24 04:33:44 CET,Fri Dec 24 05:57:52 CET,0.0 0.552 0.845 1.103 1.344 1.539 1.709 1.861 2.142 2.287 2.427 2.525 2.771 2.886 3.095 3.293 3.49 3.582 3.758 3.936 4.18 4.339 4.501 4.738 4.97 5.185 5.391 5.599 5.884 6.158 6.406 6.694 6.992 7.292 7.635 8.012 8.367 8.751 9.148 9.602 10.115 10.692 11.37 12.077 12.911 13.834 14.85 15.956 17.245 18.694 20.41 21.794 22.565 22.966 23.182 23.262 23.216 23.159 23.133 23.094 23.05 23.006 22.915 22.804 22.711 22.619 22.526 22.443 22.357 22.232 22.101 22.004 21.892 21.794 21.716 21.628 21.533 21.42 21.315 21.233 21.139 21.0 20.914 20.821 20.764 20.669 20.575 20.468 20.409 20.223 20.173 20.102 20.03 19.865 19.774 19.656 19.525 19.39 19.263 19.121 18.696 -9 ,27031 ,KEBNE ,17069450,Fri Dec 24 04:37:59 CET,Fri Dec 24 06:02:40 CET,0.0 0.551 0.85 1.096 1.32 1.523 1.713 1.864 2.113 2.238 2.361 2.47 2.722 2.834 3.065 3.287 3.476 3.564 3.733 3.912 4.171 4.322 4.47 4.693 4.904 5.107 5.301 5.498 5.782 6.051 6.285 6.553 6.81 7.071 7.387 7.733 8.053 8.419 8.83 9.268 9.737 10.269 10.894 11.515 12.213 12.969 13.838 14.867 16.067 17.489 19.264 20.615 21.321 21.721 21.914 21.981 22.006 22.028 22.043 22.021 21.962 21.917 21.872 21.77 21.66 21.56 21.402 21.277 21.189 21.093 20.988 20.909 20.811 20.699 20.626 20.544 20.438 20.318 20.211 20.15 20.09 19.992 19.93 19.85 19.794 19.683 19.569 19.437 19.378 19.209 19.202 19.141 19.081 18.937 18.849 18.746 18.635 18.527 18.391 18.227 17.831 -10 ,22205 ,KEBNE ,17069452,Fri Dec 24 04:54:51 CET,Fri Dec 24 06:19:34 CET,0.0 0.724 1.037 1.283 1.474 1.642 1.806 1.952 2.248 2.388 2.523 2.643 2.887 2.994 3.204 3.404 3.589 3.673 3.837 4.011 4.266 4.431 4.586 4.815 5.051 5.285 5.509 5.722 5.979 6.217 6.451 6.734 7.014 7.282 7.577 7.908 8.223 8.577 8.982 9.408 9.871 10.38 10.952 11.547 12.297 13.143 14.073 15.135 16.405 17.948 19.688 20.987 21.767 22.228 22.476 22.615 22.657 22.64 22.571 22.486 22.43 22.384 22.344 22.297 22.245 22.188 22.104 22.014 21.92 21.811 21.707 21.611 21.504 21.394 21.297 21.2 21.106 21.014 20.93 20.866 20.792 20.681 20.608 20.528 20.488 20.393 20.284 20.172 20.113 19.944 19.921 19.841 19.763 19.585 19.476 19.368 19.254 19.105 18.912 18.698 18.091 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_256.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_256.txt deleted file mode 100644 index 7bb0b90c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_256.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24099 ,KEBNE ,16657623,Tue Nov 23 05:15:53 CET,Tue Nov 23 06:38:18 CET,0.0 0.653 0.886 1.077 1.219 1.343 1.47 1.576 1.744 1.83 1.913 1.946 2.163 2.238 2.37 2.501 2.635 2.703 2.835 2.968 3.162 3.278 3.393 3.539 3.667 3.808 3.944 4.071 4.241 4.402 4.562 4.767 4.959 5.126 5.318 5.549 5.774 6.026 6.278 6.529 6.797 7.111 7.463 7.812 8.255 8.745 9.286 9.924 10.634 11.371 12.208 12.796 13.029 13.079 13.044 12.959 12.841 12.693 12.555 12.419 12.285 12.154 12.022 11.867 11.719 11.598 11.461 11.341 11.242 11.125 10.975 10.857 10.755 10.636 10.549 10.455 10.335 10.22 10.091 9.994 9.893 9.707 9.579 9.461 9.397 9.244 9.08 8.933 8.866 8.667 8.63 8.526 8.411 8.184 8.068 7.932 7.772 7.61 7.414 7.139 6.24 -2 ,20808 ,KEBNE ,16657624,Tue Nov 23 05:15:52 CET,Tue Nov 23 06:37:41 CET,0.0 0.507 0.677 0.813 0.936 1.05 1.172 1.29 1.481 1.563 1.643 1.68 1.893 1.958 2.106 2.261 2.403 2.469 2.587 2.707 2.875 2.978 3.082 3.242 3.392 3.536 3.673 3.815 4.002 4.162 4.31 4.482 4.642 4.806 5.021 5.252 5.459 5.686 5.901 6.135 6.422 6.754 7.112 7.454 7.845 8.317 8.864 9.459 10.13 10.84 11.604 12.106 12.196 12.114 11.997 11.884 11.742 11.595 11.459 11.271 11.076 10.921 10.783 10.631 10.478 10.338 10.204 10.08 9.966 9.852 9.72 9.607 9.498 9.367 9.267 9.155 9.029 8.91 8.769 8.659 8.565 8.418 8.31 8.204 8.144 8.021 7.868 7.707 7.63 7.427 7.395 7.311 7.226 7.049 6.945 6.823 6.672 6.497 6.287 6.005 5.188 -3 ,12465 ,KEBNE ,16657625,Tue Nov 23 05:15:53 CET,Tue Nov 23 06:38:23 CET,0.0 0.635 0.781 0.898 1.007 1.105 1.199 1.286 1.454 1.534 1.611 1.639 1.838 1.895 2.02 2.157 2.291 2.355 2.474 2.587 2.753 2.87 2.984 3.137 3.28 3.428 3.568 3.695 3.867 4.033 4.195 4.385 4.565 4.747 4.955 5.17 5.363 5.584 5.829 6.09 6.362 6.674 7.043 7.412 7.845 8.319 8.86 9.432 10.129 10.923 11.758 12.306 12.45 12.488 12.471 12.393 12.29 12.154 12.02 11.858 11.717 11.586 11.439 11.278 11.129 11.011 10.862 10.716 10.587 10.451 10.322 10.201 10.062 9.936 9.843 9.733 9.602 9.466 9.322 9.213 9.11 8.968 8.85 8.714 8.647 8.508 8.358 8.204 8.125 7.923 7.857 7.748 7.642 7.389 7.238 7.075 6.909 6.727 6.517 6.236 5.153 -4 ,15696 ,KEBNE ,16657626,Tue Nov 23 05:15:53 CET,Tue Nov 23 06:38:24 CET,0.0 0.519 0.715 0.884 1.052 1.205 1.334 1.445 1.643 1.727 1.812 1.85 2.055 2.118 2.248 2.378 2.497 2.556 2.687 2.817 2.97 3.066 3.168 3.307 3.445 3.592 3.728 3.87 4.057 4.212 4.363 4.553 4.739 4.924 5.123 5.342 5.554 5.785 6.04 6.304 6.578 6.893 7.254 7.614 8.022 8.491 9.056 9.646 10.31 11.063 11.835 12.325 12.411 12.3 12.153 11.968 11.768 11.578 11.409 11.201 11.017 10.86 10.703 10.553 10.407 10.257 10.11 9.971 9.839 9.709 9.567 9.445 9.303 9.158 9.049 8.946 8.827 8.679 8.526 8.413 8.302 8.147 8.037 7.917 7.857 7.738 7.6 7.447 7.368 7.161 7.101 7.006 6.914 6.72 6.594 6.476 6.378 6.242 6.06 5.814 4.797 -5 ,23197 ,KEBNE ,16657627,Tue Nov 23 05:15:53 CET,Tue Nov 23 06:37:44 CET,0.0 0.44 0.63 0.793 0.937 1.063 1.177 1.289 1.495 1.591 1.683 1.712 1.915 1.984 2.114 2.239 2.354 2.41 2.529 2.641 2.784 2.877 2.975 3.127 3.271 3.412 3.556 3.697 3.876 4.023 4.156 4.332 4.498 4.659 4.854 5.072 5.299 5.568 5.826 6.068 6.345 6.676 7.053 7.432 7.859 8.295 8.786 9.339 9.981 10.735 11.466 11.905 12.061 12.064 11.986 11.876 11.747 11.595 11.454 11.286 11.117 10.961 10.815 10.647 10.474 10.336 10.179 10.03 9.905 9.78 9.637 9.506 9.372 9.238 9.134 9.037 8.924 8.79 8.653 8.555 8.459 8.293 8.163 8.044 7.978 7.826 7.685 7.538 7.452 7.244 7.194 7.095 6.981 6.701 6.581 6.479 6.342 6.161 5.957 5.675 4.706 -6 ,26930 ,KEBNE ,16657628,Tue Nov 23 05:15:53 CET,Tue Nov 23 06:37:20 CET,0.0 0.484 0.694 0.858 0.996 1.123 1.234 1.336 1.541 1.637 1.711 1.715 1.916 1.987 2.126 2.261 2.396 2.458 2.571 2.678 2.814 2.904 3.0 3.141 3.281 3.409 3.535 3.671 3.862 4.025 4.179 4.372 4.544 4.718 4.934 5.18 5.411 5.667 5.935 6.223 6.513 6.797 7.142 7.514 7.935 8.374 8.866 9.403 10.024 10.694 11.389 11.836 11.941 11.907 11.795 11.637 11.491 11.321 11.132 10.906 10.697 10.524 10.343 10.149 9.941 9.743 9.571 9.432 9.297 9.161 9.021 8.888 8.739 8.566 8.444 8.324 8.212 8.108 7.983 7.899 7.81 7.645 7.537 7.426 7.36 7.225 7.095 6.951 6.86 6.648 6.631 6.554 6.457 6.258 6.143 6.008 5.865 5.694 5.492 5.195 4.376 -7 ,1265 ,KEBNE ,16657629,Tue Nov 23 05:16:54 CET,Tue Nov 23 06:37:41 CET,0.0 0.505 0.685 0.848 0.989 1.122 1.235 1.332 1.54 1.642 1.744 1.814 2.036 2.116 2.261 2.411 2.566 2.637 2.761 2.866 3.014 3.113 3.21 3.341 3.465 3.587 3.71 3.832 3.988 4.139 4.288 4.479 4.659 4.827 5.03 5.267 5.493 5.742 6.003 6.273 6.556 6.866 7.244 7.652 8.118 8.606 9.153 9.735 10.384 11.084 11.841 12.284 12.431 12.465 12.393 12.253 12.085 11.893 11.705 11.513 11.318 11.146 11.005 10.838 10.653 10.471 10.297 10.156 10.029 9.892 9.743 9.608 9.461 9.309 9.174 9.026 8.889 8.748 8.599 8.509 8.409 8.231 8.11 7.983 7.913 7.768 7.624 7.462 7.374 7.169 7.116 7.011 6.895 6.684 6.581 6.44 6.279 6.105 5.901 5.632 4.556 -8 ,26029 ,KEBNE ,16657630,Tue Nov 23 05:17:56 CET,Tue Nov 23 06:39:22 CET,0.0 0.312 0.479 0.602 0.731 0.875 1.005 1.127 1.345 1.436 1.528 1.533 1.725 1.789 1.934 2.069 2.188 2.248 2.368 2.481 2.639 2.737 2.839 2.994 3.138 3.278 3.404 3.531 3.704 3.855 3.998 4.193 4.38 4.544 4.768 5.028 5.24 5.483 5.75 6.009 6.271 6.587 6.963 7.316 7.71 8.136 8.636 9.211 9.833 10.541 11.349 11.803 11.917 11.955 11.936 11.827 11.667 11.494 11.316 11.113 10.936 10.779 10.634 10.494 10.356 10.224 10.057 9.896 9.775 9.655 9.509 9.377 9.244 9.106 9.002 8.902 8.806 8.695 8.545 8.439 8.344 8.203 8.077 7.934 7.874 7.756 7.616 7.456 7.382 7.192 7.158 7.061 6.967 6.781 6.675 6.558 6.426 6.279 6.105 5.83 4.8 -9 ,15785 ,KEBNE ,16657631,Tue Nov 23 05:17:56 CET,Tue Nov 23 06:38:32 CET,0.0 0.53 0.686 0.804 0.921 1.049 1.155 1.244 1.444 1.551 1.64 1.66 1.866 1.924 2.043 2.165 2.288 2.352 2.467 2.572 2.721 2.813 2.908 3.053 3.205 3.356 3.491 3.617 3.782 3.939 4.104 4.322 4.544 4.75 4.945 5.153 5.364 5.603 5.867 6.141 6.427 6.749 7.121 7.479 7.873 8.3 8.819 9.423 10.071 10.788 11.609 12.171 12.325 12.265 12.156 12.029 11.88 11.734 11.584 11.405 11.25 11.102 10.925 10.751 10.588 10.421 10.256 10.113 9.973 9.817 9.658 9.54 9.417 9.282 9.183 9.093 9.001 8.884 8.743 8.643 8.552 8.406 8.301 8.183 8.11 7.962 7.824 7.678 7.604 7.411 7.376 7.283 7.173 6.926 6.803 6.682 6.534 6.382 6.184 5.907 4.974 -10 ,26525 ,KEBNE ,16657632,Tue Nov 23 05:17:55 CET,Tue Nov 23 06:39:04 CET,0.0 0.637 0.853 0.995 1.118 1.24 1.353 1.45 1.64 1.735 1.829 1.863 2.056 2.112 2.229 2.354 2.476 2.536 2.648 2.746 2.883 2.99 3.103 3.258 3.425 3.584 3.712 3.826 3.982 4.138 4.287 4.465 4.635 4.799 4.991 5.222 5.438 5.658 5.889 6.142 6.415 6.73 7.119 7.491 7.918 8.377 8.862 9.419 10.095 10.846 11.617 12.153 12.386 12.39 12.305 12.22 12.118 11.986 11.829 11.661 11.512 11.361 11.214 11.068 10.909 10.743 10.582 10.444 10.323 10.195 10.039 9.918 9.79 9.646 9.53 9.395 9.264 9.135 8.983 8.876 8.774 8.627 8.527 8.424 8.368 8.238 8.095 7.94 7.867 7.662 7.604 7.512 7.415 7.197 7.067 6.932 6.792 6.649 6.494 6.25 5.106 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_336.txt deleted file mode 100644 index 565e8734..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32298 ,KEBNE ,16657633,Tue Nov 23 05:17:56 CET,Tue Nov 23 06:39:18 CET,0.0 0.397 0.58 0.736 0.898 1.038 1.16 1.254 1.434 1.534 1.633 1.683 1.896 1.976 2.138 2.289 2.437 2.499 2.606 2.736 2.947 3.064 3.184 3.391 3.563 3.711 3.864 4.001 4.219 4.451 4.657 4.903 5.132 5.32 5.543 5.821 6.104 6.397 6.694 7.046 7.382 7.73 8.138 8.545 9.029 9.553 10.151 10.815 11.55 12.345 13.267 13.769 13.869 13.909 13.878 13.783 13.667 13.543 13.398 13.236 13.106 12.98 12.869 12.769 12.66 12.549 12.425 12.297 12.186 12.089 11.995 11.911 11.795 11.667 11.558 11.456 11.367 11.262 11.166 11.1 11.017 10.856 10.739 10.647 10.6 10.487 10.37 10.217 10.14 9.953 9.92 9.844 9.761 9.568 9.472 9.351 9.22 9.079 8.916 8.7 8.162 -2 ,29422 ,KEBNE ,16657634,Tue Nov 23 05:17:55 CET,Tue Nov 23 06:39:38 CET,0.0 0.284 0.482 0.66 0.812 0.942 1.057 1.166 1.364 1.459 1.556 1.609 1.836 1.919 2.056 2.194 2.35 2.426 2.573 2.715 2.918 3.051 3.161 3.301 3.457 3.624 3.788 3.939 4.111 4.262 4.411 4.609 4.797 4.997 5.238 5.466 5.678 5.913 6.181 6.473 6.764 7.096 7.488 7.871 8.301 8.785 9.357 9.999 10.735 11.535 12.386 12.975 13.18 13.183 13.104 13.006 12.899 12.778 12.661 12.536 12.429 12.315 12.184 12.035 11.92 11.824 11.717 11.603 11.491 11.384 11.268 11.166 11.054 10.908 10.783 10.655 10.534 10.431 10.32 10.234 10.137 9.978 9.88 9.777 9.712 9.597 9.501 9.373 9.3 9.117 9.1 9.027 8.951 8.768 8.666 8.563 8.457 8.338 8.19 8.007 7.554 -3 ,1020 ,KEBNE ,16657635,Tue Nov 23 05:17:55 CET,Tue Nov 23 06:39:31 CET,0.0 0.353 0.606 0.771 0.904 1.03 1.134 1.235 1.459 1.555 1.635 1.665 1.887 1.983 2.171 2.33 2.463 2.521 2.633 2.765 2.962 3.08 3.19 3.344 3.494 3.634 3.766 3.919 4.133 4.325 4.532 4.788 5.003 5.211 5.462 5.722 5.941 6.182 6.447 6.734 7.055 7.434 7.871 8.281 8.761 9.3 9.872 10.538 11.307 12.128 13.023 13.624 13.87 13.976 13.963 13.913 13.853 13.757 13.617 13.429 13.268 13.131 13.007 12.885 12.754 12.639 12.526 12.393 12.253 12.104 11.95 11.837 11.73 11.61 11.495 11.358 11.213 11.076 10.953 10.873 10.799 10.682 10.578 10.462 10.404 10.29 10.19 10.071 9.999 9.806 9.752 9.66 9.564 9.345 9.226 9.093 8.939 8.785 8.606 8.386 7.759 -4 ,3976 ,KEBNE ,16657636,Tue Nov 23 05:17:56 CET,Tue Nov 23 06:40:04 CET,0.0 0.305 0.459 0.613 0.744 0.864 0.991 1.104 1.277 1.373 1.479 1.55 1.774 1.86 2.014 2.16 2.318 2.394 2.51 2.606 2.771 2.884 2.989 3.148 3.302 3.465 3.622 3.779 3.968 4.118 4.274 4.469 4.64 4.826 5.058 5.316 5.572 5.816 6.056 6.337 6.647 6.992 7.381 7.766 8.204 8.685 9.274 9.942 10.647 11.446 12.391 12.986 13.246 13.316 13.258 13.163 13.066 12.948 12.823 12.688 12.544 12.387 12.244 12.098 11.948 11.8 11.628 11.47 11.344 11.222 11.081 10.951 10.823 10.708 10.61 10.475 10.341 10.215 10.096 10.026 9.944 9.811 9.722 9.611 9.552 9.428 9.287 9.143 9.067 8.866 8.83 8.745 8.664 8.483 8.383 8.285 8.164 7.999 7.819 7.648 7.329 -5 ,24702 ,KEBNE ,16657637,Tue Nov 23 05:17:55 CET,Tue Nov 23 06:40:13 CET,0.0 0.374 0.557 0.711 0.836 0.938 1.06 1.172 1.353 1.458 1.565 1.623 1.841 1.925 2.105 2.293 2.467 2.539 2.66 2.786 2.952 3.042 3.135 3.278 3.45 3.624 3.775 3.916 4.09 4.25 4.404 4.607 4.801 4.987 5.19 5.445 5.712 5.999 6.309 6.597 6.901 7.274 7.684 8.069 8.518 9.01 9.527 10.099 10.767 11.46 12.205 12.769 12.998 12.963 12.842 12.737 12.608 12.439 12.259 12.082 11.912 11.754 11.604 11.469 11.347 11.226 11.109 11.004 10.889 10.745 10.605 10.504 10.395 10.288 10.21 10.123 10.024 9.906 9.768 9.69 9.621 9.507 9.421 9.316 9.261 9.142 9.011 8.879 8.811 8.62 8.613 8.549 8.473 8.282 8.172 8.052 7.907 7.748 7.571 7.357 6.986 -6 ,31828 ,KEBNE ,16657638,Tue Nov 23 05:17:56 CET,Tue Nov 23 06:39:59 CET,0.0 0.458 0.668 0.825 0.974 1.102 1.218 1.337 1.538 1.642 1.748 1.813 2.051 2.156 2.33 2.474 2.615 2.688 2.836 2.975 3.152 3.276 3.41 3.602 3.789 3.972 4.147 4.291 4.456 4.632 4.797 5.003 5.23 5.456 5.676 5.914 6.175 6.469 6.769 7.074 7.411 7.793 8.209 8.624 9.113 9.664 10.301 10.953 11.663 12.455 13.372 13.996 14.267 14.363 14.307 14.16 14.026 13.906 13.795 13.664 13.519 13.363 13.216 13.084 12.948 12.816 12.673 12.545 12.419 12.285 12.181 12.094 11.987 11.869 11.769 11.643 11.506 11.395 11.27 11.178 11.1 10.979 10.879 10.764 10.705 10.59 10.464 10.311 10.237 10.03 9.955 9.861 9.774 9.6 9.497 9.388 9.246 9.087 8.907 8.643 8.155 -7 ,9348 ,KEBNE ,16657639,Tue Nov 23 05:17:55 CET,Tue Nov 23 06:39:31 CET,0.0 0.485 0.672 0.844 1.005 1.136 1.24 1.348 1.552 1.639 1.723 1.742 1.949 2.03 2.211 2.378 2.531 2.6 2.713 2.832 3.031 3.165 3.279 3.435 3.592 3.731 3.871 4.026 4.228 4.402 4.568 4.756 4.942 5.132 5.336 5.563 5.802 6.07 6.346 6.66 7.009 7.376 7.779 8.19 8.671 9.24 9.885 10.533 11.275 12.12 13.007 13.631 13.954 14.095 14.063 13.956 13.851 13.715 13.579 13.442 13.307 13.165 13.031 12.913 12.792 12.666 12.528 12.398 12.292 12.174 12.031 11.914 11.795 11.667 11.559 11.457 11.368 11.275 11.17 11.081 10.984 10.85 10.745 10.637 10.589 10.479 10.353 10.224 10.16 9.968 9.94 9.846 9.738 9.505 9.375 9.262 9.159 9.04 8.865 8.638 8.18 -8 ,31941 ,KEBNE ,16657640,Tue Nov 23 05:17:55 CET,Tue Nov 23 06:39:23 CET,0.0 0.461 0.701 0.834 0.977 1.116 1.23 1.333 1.527 1.617 1.702 1.767 1.993 2.079 2.221 2.346 2.488 2.564 2.697 2.827 3.014 3.126 3.254 3.444 3.6 3.759 3.906 4.058 4.278 4.464 4.653 4.884 5.075 5.255 5.477 5.706 5.91 6.143 6.426 6.759 7.079 7.414 7.832 8.237 8.69 9.195 9.726 10.279 10.98 11.819 12.651 13.149 13.401 13.48 13.479 13.407 13.281 13.142 13.003 12.837 12.67 12.533 12.405 12.288 12.178 12.051 11.913 11.774 11.633 11.483 11.338 11.238 11.123 10.984 10.872 10.753 10.645 10.553 10.445 10.373 10.308 10.173 10.066 9.962 9.911 9.812 9.708 9.583 9.521 9.324 9.269 9.186 9.1 8.873 8.745 8.613 8.476 8.334 8.141 7.907 7.515 -9 ,13010 ,KEBNE ,16657641,Tue Nov 23 05:17:55 CET,Tue Nov 23 06:40:09 CET,0.0 0.62 0.829 1.031 1.194 1.352 1.487 1.585 1.773 1.88 1.987 2.046 2.271 2.356 2.519 2.669 2.813 2.888 3.028 3.144 3.332 3.463 3.583 3.764 3.928 4.095 4.284 4.453 4.653 4.847 5.027 5.228 5.409 5.601 5.83 6.064 6.292 6.56 6.84 7.106 7.421 7.798 8.216 8.617 9.066 9.568 10.166 10.809 11.525 12.364 13.284 13.902 14.166 14.253 14.244 14.183 14.079 13.964 13.863 13.74 13.599 13.455 13.316 13.18 13.056 12.939 12.799 12.671 12.561 12.428 12.296 12.203 12.086 11.951 11.841 11.715 11.581 11.426 11.269 11.17 11.065 10.914 10.81 10.686 10.616 10.483 10.352 10.207 10.131 9.928 9.883 9.792 9.71 9.538 9.44 9.325 9.192 9.045 8.856 8.595 8.074 -10 ,11577 ,KEBNE ,16657642,Tue Nov 23 05:17:55 CET,Tue Nov 23 06:40:02 CET,0.0 0.617 0.854 1.07 1.206 1.329 1.439 1.548 1.746 1.836 1.933 1.982 2.189 2.271 2.439 2.595 2.735 2.794 2.894 3.003 3.166 3.267 3.37 3.537 3.704 3.86 4.005 4.147 4.34 4.503 4.652 4.84 5.029 5.213 5.421 5.656 5.916 6.187 6.46 6.768 7.045 7.351 7.735 8.124 8.545 8.995 9.532 10.131 10.791 11.599 12.459 12.909 13.088 13.144 13.119 13.037 12.944 12.822 12.69 12.553 12.42 12.294 12.176 12.04 11.905 11.798 11.671 11.541 11.417 11.29 11.169 11.081 10.979 10.859 10.756 10.63 10.496 10.353 10.221 10.148 10.067 9.934 9.838 9.733 9.686 9.57 9.438 9.313 9.251 9.056 9.019 8.94 8.862 8.696 8.588 8.458 8.33 8.209 8.077 7.894 7.325 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_67.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_67.txt deleted file mode 100644 index 7cbf3add..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_252_67.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7765 ,KEBNE ,16657643,Tue Nov 23 05:17:56 CET,Tue Nov 23 06:38:46 CET,0.0 0.532 0.754 0.944 1.12 1.302 1.473 1.626 1.89 2.014 2.145 2.268 2.529 2.652 2.899 3.151 3.375 3.478 3.703 3.93 4.248 4.452 4.648 4.933 5.218 5.506 5.801 6.097 6.483 6.868 7.259 7.728 8.168 8.612 9.137 9.729 10.315 10.991 11.746 12.56 13.449 14.471 15.703 17.013 18.599 20.406 22.561 25.185 28.498 32.698 38.435 43.897 47.499 50.075 51.936 53.384 54.527 55.447 56.128 56.71 57.162 57.528 57.821 58.064 58.255 58.409 58.575 58.699 58.777 58.851 58.919 58.96 58.987 58.985 58.976 58.965 58.936 58.898 58.856 58.824 58.778 58.699 58.639 58.582 58.557 58.489 58.41 58.324 58.271 58.136 58.047 57.951 57.834 57.596 57.488 57.357 57.191 56.992 56.761 56.481 55.221 -2 ,29246 ,KEBNE ,16657644,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:41:26 CET,0.0 0.556 0.759 0.927 1.086 1.244 1.393 1.531 1.797 1.934 2.064 2.167 2.428 2.548 2.786 3.009 3.208 3.313 3.546 3.771 4.073 4.271 4.472 4.78 5.068 5.342 5.625 5.908 6.278 6.637 6.993 7.447 7.908 8.355 8.867 9.481 10.097 10.78 11.548 12.373 13.274 14.333 15.586 16.884 18.421 20.254 22.51 25.205 28.591 32.884 38.722 44.293 47.992 50.544 52.413 53.93 55.116 56.092 56.852 57.537 58.032 58.4 58.689 58.884 59.051 59.217 59.391 59.523 59.596 59.645 59.674 59.686 59.709 59.726 59.724 59.721 59.717 59.692 59.651 59.624 59.588 59.533 59.503 59.46 59.429 59.371 59.312 59.237 59.184 59.055 58.993 58.923 58.843 58.637 58.531 58.421 58.28 58.096 57.803 57.437 56.087 -3 ,20214 ,KEBNE ,16657645,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:41:04 CET,0.0 0.775 1.033 1.219 1.405 1.571 1.726 1.869 2.127 2.261 2.391 2.508 2.763 2.886 3.121 3.342 3.559 3.668 3.883 4.104 4.421 4.619 4.819 5.119 5.422 5.727 6.034 6.326 6.701 7.078 7.45 7.892 8.318 8.742 9.244 9.832 10.438 11.118 11.863 12.695 13.602 14.658 15.902 17.175 18.742 20.574 22.744 25.333 28.6 32.84 38.647 44.007 47.48 49.944 51.829 53.319 54.429 55.327 56.05 56.646 57.082 57.461 57.78 58.016 58.201 58.356 58.498 58.604 58.677 58.744 58.805 58.852 58.898 58.941 58.963 58.985 58.992 58.966 58.933 58.918 58.901 58.859 58.827 58.779 58.757 58.716 58.652 58.56 58.515 58.411 58.363 58.286 58.197 57.977 57.872 57.754 57.595 57.372 57.081 56.681 55.002 -4 ,2113 ,KEBNE ,16657646,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:40:36 CET,0.0 0.529 0.753 0.96 1.155 1.313 1.452 1.589 1.856 1.989 2.113 2.218 2.466 2.586 2.833 3.085 3.333 3.446 3.667 3.881 4.177 4.371 4.582 4.905 5.201 5.487 5.77 6.043 6.419 6.8 7.167 7.607 8.04 8.469 8.974 9.555 10.153 10.828 11.548 12.339 13.197 14.207 15.436 16.719 18.287 20.119 22.32 24.948 28.372 32.847 38.794 44.415 48.076 50.655 52.526 53.908 54.965 55.802 56.423 56.98 57.417 57.758 58.018 58.235 58.42 58.558 58.689 58.787 58.863 58.946 59.015 59.047 59.059 59.057 59.05 59.038 59.011 58.979 58.949 58.929 58.904 58.841 58.791 58.719 58.671 58.56 58.461 58.378 58.318 58.18 58.106 58.017 57.92 57.695 57.552 57.412 57.262 57.066 56.86 56.594 55.44 -5 ,3946 ,KEBNE ,16657647,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:40:43 CET,0.0 0.668 0.88 1.061 1.237 1.4 1.547 1.686 1.963 2.102 2.237 2.363 2.622 2.747 2.994 3.247 3.478 3.584 3.802 4.028 4.359 4.574 4.788 5.091 5.381 5.666 5.943 6.216 6.587 6.941 7.289 7.739 8.18 8.612 9.117 9.698 10.271 10.93 11.672 12.477 13.346 14.356 15.616 16.936 18.519 20.35 22.535 25.236 28.621 32.84 38.66 44.225 47.878 50.497 52.46 53.981 55.072 55.916 56.525 57.011 57.397 57.733 57.989 58.167 58.323 58.477 58.625 58.722 58.785 58.838 58.862 58.874 58.903 58.919 58.919 58.909 58.889 58.859 58.823 58.787 58.746 58.666 58.604 58.528 58.489 58.4 58.287 58.15 58.079 57.942 57.845 57.744 57.644 57.424 57.286 57.123 56.927 56.733 56.469 56.118 54.861 -6 ,9558 ,KEBNE ,16657648,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:40:40 CET,0.0 0.522 0.769 0.945 1.118 1.275 1.431 1.583 1.867 2.0 2.123 2.233 2.498 2.625 2.854 3.082 3.306 3.409 3.613 3.828 4.14 4.333 4.523 4.807 5.093 5.373 5.642 5.912 6.276 6.639 7.002 7.447 7.895 8.36 8.919 9.549 10.15 10.819 11.562 12.361 13.21 14.213 15.455 16.767 18.378 20.243 22.492 25.149 28.464 32.764 38.501 43.902 47.545 50.162 52.096 53.613 54.757 55.642 56.312 56.858 57.269 57.584 57.829 58.069 58.272 58.418 58.533 58.631 58.721 58.795 58.849 58.885 58.912 58.928 58.934 58.931 58.908 58.859 58.807 58.78 58.746 58.687 58.637 58.573 58.538 58.457 58.366 58.261 58.211 58.103 58.066 57.992 57.912 57.743 57.639 57.513 57.353 57.174 56.96 56.66 55.004 -7 ,15004 ,KEBNE ,16657649,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:41:00 CET,0.0 0.506 0.753 0.978 1.16 1.315 1.46 1.594 1.854 1.99 2.116 2.218 2.469 2.595 2.84 3.056 3.285 3.4 3.617 3.837 4.17 4.378 4.579 4.881 5.181 5.477 5.772 6.062 6.436 6.798 7.144 7.573 8.002 8.435 8.946 9.526 10.098 10.737 11.448 12.253 13.138 14.14 15.336 16.595 18.172 20.022 22.252 24.964 28.352 32.685 38.518 43.953 47.486 49.919 51.613 52.903 53.901 54.744 55.424 56.021 56.463 56.791 57.049 57.259 57.454 57.604 57.737 57.861 57.949 58.003 58.041 58.045 58.02 58.006 58.005 58.005 57.997 57.977 57.935 57.891 57.84 57.766 57.72 57.674 57.641 57.545 57.43 57.312 57.259 57.132 57.036 56.938 56.826 56.582 56.44 56.303 56.167 56.007 55.788 55.437 54.087 -8 ,12517 ,KEBNE ,16657650,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:40:19 CET,0.0 0.316 0.574 0.785 0.948 1.088 1.23 1.382 1.688 1.835 1.967 2.076 2.323 2.44 2.685 2.912 3.115 3.227 3.453 3.665 3.965 4.168 4.377 4.672 4.95 5.228 5.509 5.785 6.14 6.499 6.87 7.32 7.777 8.23 8.747 9.344 9.944 10.63 11.383 12.204 13.094 14.125 15.345 16.607 18.151 19.943 22.136 24.823 28.174 32.355 38.127 43.604 47.164 49.745 51.689 53.176 54.219 54.993 55.608 56.125 56.522 56.849 57.137 57.409 57.635 57.813 57.918 57.991 58.067 58.142 58.207 58.23 58.243 58.242 58.244 58.25 58.255 58.255 58.241 58.232 58.214 58.178 58.135 58.08 58.055 57.994 57.935 57.866 57.816 57.692 57.626 57.541 57.45 57.237 57.119 56.997 56.859 56.693 56.442 56.118 55.032 -9 ,8237 ,KEBNE ,16657651,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:39:51 CET,0.0 0.57 0.836 1.049 1.239 1.414 1.567 1.701 1.97 2.105 2.238 2.362 2.607 2.716 2.934 3.153 3.374 3.482 3.696 3.912 4.228 4.441 4.652 4.945 5.215 5.481 5.76 6.043 6.412 6.775 7.14 7.606 8.065 8.507 9.025 9.616 10.197 10.851 11.577 12.368 13.228 14.239 15.468 16.763 18.323 20.138 22.373 25.079 28.461 32.726 38.472 43.921 47.587 50.246 52.163 53.64 54.762 55.629 56.294 56.913 57.384 57.73 58.001 58.191 58.361 58.536 58.698 58.825 58.943 59.036 59.082 59.109 59.141 59.181 59.178 59.148 59.127 59.083 59.035 59.004 58.967 58.902 58.844 58.777 58.746 58.667 58.573 58.489 58.432 58.298 58.203 58.127 58.067 57.873 57.731 57.583 57.421 57.221 56.957 56.603 55.073 -10 ,9262 ,KEBNE ,16657653,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:39:59 CET,0.0 0.378 0.58 0.77 0.94 1.089 1.219 1.354 1.623 1.749 1.869 1.991 2.255 2.379 2.637 2.884 3.112 3.23 3.468 3.687 3.993 4.195 4.396 4.694 4.984 5.271 5.559 5.846 6.208 6.552 6.892 7.319 7.75 8.204 8.755 9.367 9.968 10.634 11.367 12.173 13.052 14.09 15.337 16.637 18.208 20.022 22.246 24.919 28.302 32.744 38.68 44.272 48.114 50.86 52.778 54.236 55.374 56.21 56.805 57.387 57.864 58.227 58.515 58.767 58.991 59.166 59.331 59.461 59.545 59.607 59.663 59.694 59.71 59.718 59.703 59.682 59.662 59.635 59.602 59.576 59.554 59.511 59.475 59.441 59.415 59.345 59.289 59.214 59.16 59.03 58.959 58.873 58.778 58.555 58.429 58.306 58.141 57.959 57.75 57.312 55.696 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_254_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_254_163.txt deleted file mode 100644 index 21a32670..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_254_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23751 ,KEBNE ,16657654,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:41:42 CET,0.0 0.429 0.61 0.78 0.926 1.039 1.14 1.245 1.429 1.521 1.626 1.698 1.892 1.969 2.112 2.234 2.347 2.403 2.507 2.606 2.769 2.873 2.975 3.114 3.23 3.343 3.448 3.544 3.669 3.796 3.91 4.037 4.182 4.314 4.441 4.577 4.702 4.856 5.011 5.149 5.288 5.458 5.638 5.758 5.878 6.003 6.117 6.197 6.171 5.988 5.442 4.508 3.666 2.91 2.245 1.621 1.041 0.507 0.065 -0.365 -0.75 -1.1 -1.452 -1.794 -2.114 -2.391 -2.675 -2.931 -3.133 -3.329 -3.547 -3.745 -3.937 -4.121 -4.274 -4.437 -4.626 -4.828 -5.006 -5.13 -5.26 -5.483 -5.653 -5.823 -5.906 -6.057 -6.212 -6.389 -6.479 -6.694 -6.782 -6.884 -6.996 -7.253 -7.389 -7.535 -7.706 -7.928 -8.174 -8.467 -9.711 -2 ,15935 ,KEBNE ,16657655,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:41:38 CET,0.0 0.307 0.504 0.672 0.834 0.964 1.076 1.173 1.348 1.426 1.502 1.549 1.74 1.813 1.924 2.006 2.089 2.136 2.224 2.316 2.444 2.522 2.611 2.731 2.829 2.917 3.004 3.094 3.2 3.296 3.395 3.514 3.632 3.746 3.862 3.972 4.077 4.196 4.325 4.465 4.612 4.765 4.912 5.027 5.127 5.227 5.322 5.385 5.383 5.182 4.591 3.69 2.847 2.072 1.348 0.699 0.159 -0.342 -0.767 -1.211 -1.604 -1.943 -2.284 -2.59 -2.87 -3.142 -3.439 -3.705 -3.916 -4.137 -4.384 -4.586 -4.781 -4.988 -5.162 -5.358 -5.559 -5.752 -5.951 -6.098 -6.242 -6.443 -6.593 -6.759 -6.848 -7.031 -7.227 -7.439 -7.545 -7.771 -7.869 -7.994 -8.131 -8.43 -8.595 -8.8 -9.01 -9.228 -9.523 -9.894 -11.304 -3 ,20687 ,KEBNE ,16657656,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:42:01 CET,0.0 0.241 0.432 0.588 0.702 0.822 0.938 1.035 1.233 1.325 1.408 1.443 1.631 1.705 1.863 1.995 2.103 2.156 2.276 2.382 2.516 2.609 2.69 2.799 2.91 3.024 3.131 3.231 3.345 3.447 3.566 3.713 3.853 3.977 4.105 4.249 4.378 4.525 4.673 4.801 4.919 5.058 5.199 5.333 5.511 5.647 5.728 5.777 5.724 5.486 4.885 3.998 3.217 2.505 1.846 1.239 0.635 0.081 -0.353 -0.787 -1.189 -1.565 -1.909 -2.207 -2.489 -2.761 -3.046 -3.292 -3.512 -3.74 -3.958 -4.137 -4.31 -4.51 -4.696 -4.881 -5.058 -5.245 -5.446 -5.593 -5.754 -6.003 -6.171 -6.35 -6.439 -6.612 -6.797 -6.984 -7.082 -7.307 -7.402 -7.523 -7.666 -7.971 -8.131 -8.315 -8.511 -8.728 -8.958 -9.27 -10.485 -4 ,29325 ,KEBNE ,16657657,Tue Nov 23 05:18:57 CET,Tue Nov 23 06:41:36 CET,0.0 0.501 0.712 0.844 0.968 1.07 1.147 1.219 1.388 1.468 1.54 1.572 1.751 1.822 1.954 2.063 2.164 2.215 2.323 2.415 2.552 2.662 2.757 2.864 2.969 3.072 3.168 3.253 3.357 3.465 3.59 3.727 3.826 3.931 4.049 4.173 4.28 4.372 4.465 4.576 4.718 4.868 5.03 5.17 5.282 5.386 5.483 5.528 5.503 5.33 4.779 3.881 3.054 2.332 1.649 0.97 0.369 -0.176 -0.626 -1.054 -1.419 -1.758 -2.078 -2.368 -2.661 -2.926 -3.195 -3.472 -3.718 -3.946 -4.168 -4.354 -4.556 -4.772 -4.938 -5.105 -5.284 -5.468 -5.662 -5.797 -5.939 -6.172 -6.338 -6.507 -6.589 -6.764 -6.954 -7.17 -7.273 -7.5 -7.591 -7.708 -7.834 -8.08 -8.22 -8.386 -8.563 -8.737 -8.927 -9.197 -10.667 -5 ,5540 ,KEBNE ,16657658,Tue Nov 23 05:19:58 CET,Tue Nov 23 06:43:17 CET,0.0 0.467 0.638 0.749 0.836 0.943 1.071 1.181 1.359 1.431 1.495 1.509 1.681 1.755 1.903 2.011 2.091 2.13 2.22 2.324 2.471 2.553 2.623 2.736 2.851 2.952 3.046 3.133 3.267 3.395 3.509 3.663 3.799 3.912 4.027 4.157 4.282 4.421 4.575 4.699 4.82 4.968 5.122 5.268 5.407 5.51 5.613 5.685 5.647 5.425 4.853 3.978 3.143 2.401 1.694 1.006 0.418 -0.097 -0.536 -1.008 -1.411 -1.754 -2.102 -2.438 -2.752 -3.031 -3.316 -3.58 -3.802 -4.052 -4.324 -4.533 -4.746 -4.954 -5.112 -5.281 -5.471 -5.667 -5.868 -6.009 -6.144 -6.351 -6.51 -6.682 -6.765 -6.937 -7.127 -7.337 -7.444 -7.68 -7.816 -7.946 -8.06 -8.274 -8.415 -8.577 -8.77 -9.016 -9.332 -9.718 -11.107 -6 ,7684 ,KEBNE ,16657659,Tue Nov 23 05:19:58 CET,Tue Nov 23 06:43:14 CET,0.0 0.348 0.526 0.66 0.776 0.866 0.947 1.045 1.242 1.321 1.379 1.392 1.568 1.63 1.748 1.851 1.951 2.01 2.117 2.207 2.35 2.432 2.499 2.606 2.709 2.8 2.896 2.997 3.125 3.249 3.372 3.515 3.652 3.766 3.879 4.012 4.126 4.242 4.36 4.462 4.566 4.693 4.822 4.937 5.045 5.113 5.168 5.169 5.059 4.781 4.143 3.237 2.357 1.522 0.81 0.21 -0.307 -0.808 -1.253 -1.713 -2.124 -2.474 -2.795 -3.095 -3.38 -3.643 -3.909 -4.142 -4.351 -4.584 -4.834 -5.051 -5.261 -5.477 -5.646 -5.809 -5.979 -6.147 -6.333 -6.475 -6.615 -6.835 -6.994 -7.15 -7.226 -7.397 -7.575 -7.749 -7.839 -8.062 -8.188 -8.326 -8.456 -8.738 -8.916 -9.097 -9.265 -9.461 -9.713 -10.087 -11.179 -7 ,21379 ,KEBNE ,16657660,Tue Nov 23 05:19:58 CET,Tue Nov 23 06:43:05 CET,0.0 0.283 0.473 0.612 0.716 0.798 0.871 0.951 1.102 1.178 1.252 1.267 1.448 1.518 1.65 1.771 1.879 1.928 2.021 2.105 2.223 2.301 2.383 2.521 2.654 2.756 2.846 2.933 3.044 3.14 3.234 3.364 3.495 3.619 3.753 3.884 3.993 4.111 4.242 4.377 4.503 4.632 4.763 4.863 4.967 5.091 5.198 5.243 5.176 4.974 4.46 3.521 2.618 1.849 1.142 0.498 -0.011 -0.499 -0.957 -1.405 -1.781 -2.107 -2.431 -2.745 -3.034 -3.302 -3.577 -3.818 -4.023 -4.24 -4.454 -4.633 -4.852 -5.087 -5.253 -5.431 -5.631 -5.831 -6.026 -6.159 -6.297 -6.51 -6.664 -6.837 -6.922 -7.083 -7.274 -7.489 -7.598 -7.837 -7.948 -8.072 -8.203 -8.507 -8.674 -8.839 -9.026 -9.238 -9.475 -9.794 -10.767 -8 ,14473 ,KEBNE ,16657661,Tue Nov 23 05:19:58 CET,Tue Nov 23 06:43:24 CET,0.0 0.351 0.517 0.659 0.788 0.893 0.986 1.068 1.205 1.277 1.354 1.386 1.571 1.639 1.759 1.884 2.005 2.059 2.154 2.235 2.364 2.454 2.537 2.654 2.784 2.901 3.0 3.099 3.217 3.333 3.452 3.592 3.705 3.813 3.942 4.073 4.206 4.347 4.492 4.656 4.824 5.037 5.261 5.448 5.675 5.885 6.08 6.256 6.371 6.363 6.116 5.59 4.991 4.369 3.804 3.284 2.826 2.441 2.101 1.708 1.345 1.011 0.7 0.384 0.082 -0.161 -0.423 -0.667 -0.877 -1.097 -1.332 -1.535 -1.733 -1.935 -2.101 -2.277 -2.472 -2.681 -2.917 -3.071 -3.217 -3.455 -3.618 -3.791 -3.884 -4.07 -4.244 -4.445 -4.567 -4.814 -4.931 -5.061 -5.194 -5.489 -5.657 -5.839 -6.038 -6.242 -6.472 -6.804 -7.985 -9 ,22110 ,KEBNE ,16657662,Tue Nov 23 05:19:58 CET,Tue Nov 23 06:43:00 CET,0.0 0.376 0.551 0.702 0.857 0.98 1.072 1.152 1.308 1.374 1.448 1.482 1.653 1.715 1.829 1.929 2.022 2.065 2.163 2.265 2.403 2.49 2.573 2.682 2.79 2.904 3.013 3.112 3.228 3.334 3.439 3.584 3.716 3.825 3.978 4.161 4.314 4.446 4.579 4.725 4.854 4.977 5.127 5.268 5.391 5.522 5.637 5.682 5.648 5.441 4.821 3.905 3.065 2.301 1.651 1.044 0.473 -0.043 -0.471 -0.885 -1.245 -1.576 -1.91 -2.22 -2.502 -2.766 -3.054 -3.318 -3.539 -3.781 -4.029 -4.23 -4.451 -4.674 -4.843 -5.001 -5.162 -5.358 -5.55 -5.678 -5.811 -6.021 -6.184 -6.351 -6.439 -6.628 -6.804 -6.965 -7.055 -7.27 -7.336 -7.44 -7.553 -7.788 -7.93 -8.091 -8.268 -8.489 -8.755 -9.052 -9.824 -10 ,25068 ,KEBNE ,16657663,Tue Nov 23 05:19:58 CET,Tue Nov 23 06:43:44 CET,0.0 0.237 0.382 0.512 0.642 0.751 0.835 0.91 1.067 1.147 1.219 1.231 1.415 1.488 1.612 1.725 1.844 1.904 2.016 2.113 2.26 2.354 2.435 2.565 2.699 2.82 2.934 3.047 3.194 3.328 3.456 3.609 3.741 3.856 3.995 4.167 4.32 4.467 4.619 4.766 4.927 5.114 5.292 5.393 5.522 5.682 5.8 5.884 5.891 5.71 5.086 4.052 3.07 2.225 1.48 0.784 0.173 -0.368 -0.863 -1.356 -1.753 -2.118 -2.514 -2.898 -3.216 -3.498 -3.787 -4.043 -4.275 -4.509 -4.75 -4.962 -5.19 -5.429 -5.616 -5.806 -5.99 -6.183 -6.408 -6.561 -6.713 -6.947 -7.101 -7.26 -7.345 -7.539 -7.734 -7.906 -8.006 -8.241 -8.34 -8.459 -8.588 -8.837 -8.982 -9.145 -9.296 -9.459 -9.628 -9.812 -10.843 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_254_251.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_254_251.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_254_251.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_254_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_254_252.txt deleted file mode 100644 index 82da5d9f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_254_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10382 ,KEBNE ,17069454,Fri Dec 24 04:56:58 CET,Fri Dec 24 06:21:10 CET,0.0 0.208 0.347 0.467 0.567 0.646 0.718 0.785 0.919 1.001 1.068 1.059 1.238 1.292 1.383 1.457 1.528 1.566 1.633 1.708 1.834 1.9 1.974 2.09 2.181 2.254 2.329 2.409 2.508 2.605 2.692 2.793 2.902 2.988 3.069 3.155 3.217 3.292 3.364 3.413 3.45 3.466 3.468 3.462 3.427 3.335 3.146 2.857 2.387 1.618 0.252 -1.451 -2.829 -3.975 -4.984 -5.9 -6.707 -7.456 -8.108 -8.758 -9.317 -9.827 -10.299 -10.733 -11.123 -11.505 -11.913 -12.241 -12.521 -12.815 -13.132 -13.386 -13.653 -13.949 -14.174 -14.401 -14.629 -14.88 -15.148 -15.32 -15.498 -15.774 -15.969 -16.168 -16.267 -16.486 -16.719 -16.974 -17.101 -17.365 -17.534 -17.685 -17.843 -18.183 -18.368 -18.581 -18.825 -19.122 -19.465 -19.904 -21.402 -2 ,15966 ,KEBNE ,17069456,Fri Dec 24 04:56:58 CET,Fri Dec 24 06:21:52 CET,0.0 0.328 0.505 0.619 0.724 0.84 0.931 0.997 1.151 1.222 1.276 1.265 1.437 1.504 1.627 1.712 1.789 1.835 1.934 2.011 2.103 2.169 2.237 2.344 2.441 2.528 2.623 2.708 2.794 2.871 2.948 3.046 3.132 3.193 3.258 3.348 3.441 3.536 3.638 3.726 3.781 3.824 3.866 3.863 3.797 3.681 3.495 3.214 2.772 2.037 0.636 -1.17 -2.688 -3.98 -5.094 -6.074 -6.948 -7.742 -8.408 -9.066 -9.616 -10.113 -10.604 -11.056 -11.45 -11.819 -12.213 -12.549 -12.833 -13.132 -13.433 -13.696 -13.98 -14.272 -14.502 -14.729 -14.957 -15.216 -15.497 -15.68 -15.874 -16.178 -16.386 -16.599 -16.701 -16.923 -17.184 -17.466 -17.606 -17.882 -18.045 -18.193 -18.343 -18.674 -18.863 -19.069 -19.315 -19.592 -19.908 -20.331 -21.889 -3 ,28454 ,KEBNE ,17069457,Fri Dec 24 05:02:14 CET,Fri Dec 24 06:26:51 CET,0.0 0.314 0.467 0.584 0.697 0.796 0.876 0.957 1.106 1.176 1.237 1.212 1.37 1.42 1.514 1.589 1.68 1.738 1.833 1.902 2.011 2.084 2.16 2.269 2.346 2.41 2.482 2.554 2.648 2.748 2.848 2.952 3.038 3.117 3.199 3.278 3.349 3.442 3.535 3.599 3.639 3.667 3.681 3.687 3.654 3.521 3.271 2.95 2.492 1.597 -0.068 -2.065 -3.712 -5.04 -6.169 -7.196 -8.098 -8.927 -9.634 -10.329 -10.896 -11.385 -11.854 -12.288 -12.69 -13.053 -13.429 -13.788 -14.094 -14.397 -14.719 -14.986 -15.275 -15.586 -15.825 -16.058 -16.278 -16.515 -16.772 -16.952 -17.141 -17.419 -17.61 -17.813 -17.916 -18.144 -18.385 -18.648 -18.797 -19.08 -19.232 -19.386 -19.548 -19.932 -20.151 -20.367 -20.59 -20.83 -21.136 -21.551 -23.031 -4 ,7361 ,KEBNE ,17069459,Fri Dec 24 05:06:26 CET,Fri Dec 24 06:31:24 CET,0.0 0.277 0.497 0.636 0.72 0.799 0.878 0.965 1.129 1.205 1.267 1.263 1.428 1.486 1.611 1.722 1.822 1.87 1.952 2.04 2.153 2.22 2.281 2.358 2.448 2.546 2.638 2.715 2.813 2.904 2.985 3.068 3.123 3.179 3.251 3.309 3.366 3.435 3.483 3.508 3.533 3.541 3.532 3.513 3.474 3.405 3.297 3.051 2.536 1.633 0.05 -1.818 -3.3 -4.597 -5.738 -6.727 -7.58 -8.335 -8.999 -9.64 -10.174 -10.667 -11.156 -11.608 -12.01 -12.375 -12.75 -13.097 -13.409 -13.733 -14.049 -14.297 -14.554 -14.838 -15.075 -15.303 -15.531 -15.779 -16.043 -16.229 -16.422 -16.709 -16.903 -17.113 -17.225 -17.461 -17.696 -17.96 -18.106 -18.386 -18.553 -18.704 -18.87 -19.243 -19.455 -19.677 -19.914 -20.194 -20.532 -21.061 -22.843 -5 ,7704 ,KEBNE ,17069462,Fri Dec 24 05:06:26 CET,Fri Dec 24 06:29:58 CET,0.0 0.337 0.453 0.531 0.61 0.704 0.799 0.885 1.046 1.127 1.2 1.197 1.361 1.416 1.53 1.62 1.698 1.738 1.816 1.897 2.01 2.086 2.163 2.257 2.341 2.418 2.488 2.557 2.652 2.75 2.833 2.914 2.999 3.075 3.148 3.238 3.309 3.366 3.427 3.493 3.573 3.657 3.7 3.678 3.644 3.552 3.343 2.989 2.452 1.652 0.125 -1.795 -3.39 -4.748 -5.898 -6.933 -7.845 -8.647 -9.323 -10.004 -10.571 -11.059 -11.525 -11.948 -12.341 -12.705 -13.088 -13.443 -13.766 -14.096 -14.419 -14.696 -14.984 -15.285 -15.512 -15.734 -15.956 -16.197 -16.474 -16.665 -16.868 -17.183 -17.399 -17.626 -17.74 -17.973 -18.204 -18.442 -18.57 -18.836 -19.011 -19.165 -19.312 -19.679 -19.89 -20.111 -20.355 -20.642 -20.987 -21.395 -22.907 -6 ,14812 ,KEBNE ,17069463,Fri Dec 24 05:13:45 CET,Fri Dec 24 06:38:01 CET,0.0 0.324 0.445 0.537 0.613 0.682 0.758 0.83 0.971 1.031 1.077 1.056 1.209 1.255 1.352 1.446 1.543 1.59 1.673 1.747 1.834 1.899 1.965 2.045 2.137 2.222 2.303 2.385 2.475 2.562 2.667 2.775 2.857 2.939 3.032 3.13 3.22 3.309 3.367 3.43 3.505 3.569 3.617 3.65 3.649 3.585 3.411 3.119 2.639 1.847 0.501 -1.324 -2.879 -4.182 -5.255 -6.226 -7.105 -7.857 -8.493 -9.111 -9.628 -10.106 -10.556 -10.989 -11.381 -11.718 -12.083 -12.422 -12.713 -13.023 -13.345 -13.593 -13.856 -14.133 -14.337 -14.575 -14.843 -15.109 -15.371 -15.543 -15.727 -16.018 -16.215 -16.421 -16.527 -16.75 -16.995 -17.26 -17.387 -17.638 -17.772 -17.936 -18.108 -18.461 -18.668 -18.9 -19.156 -19.442 -19.758 -20.178 -21.87 -7 ,6016 ,KEBNE ,17069465,Fri Dec 24 05:20:03 CET,Fri Dec 24 06:43:27 CET,0.0 0.283 0.46 0.629 0.733 0.845 0.957 1.049 1.226 1.307 1.372 1.371 1.54 1.598 1.705 1.804 1.905 1.951 2.036 2.121 2.236 2.302 2.361 2.44 2.536 2.628 2.704 2.773 2.854 2.933 3.027 3.138 3.237 3.328 3.395 3.465 3.528 3.587 3.656 3.719 3.777 3.823 3.851 3.861 3.845 3.808 3.746 3.611 3.322 2.793 1.693 0.169 -1.066 -2.108 -3.014 -3.814 -4.525 -5.187 -5.78 -6.368 -6.874 -7.311 -7.714 -8.109 -8.481 -8.82 -9.173 -9.498 -9.784 -10.083 -10.388 -10.646 -10.906 -11.163 -11.373 -11.588 -11.807 -12.053 -12.319 -12.496 -12.682 -12.957 -13.149 -13.365 -13.476 -13.703 -13.922 -14.16 -14.296 -14.559 -14.677 -14.816 -14.972 -15.339 -15.531 -15.73 -15.958 -16.216 -16.509 -16.94 -18.329 -8 ,25791 ,KEBNE ,17069467,Fri Dec 24 05:23:10 CET,Fri Dec 24 06:47:13 CET,0.0 0.379 0.537 0.676 0.803 0.896 0.987 1.067 1.192 1.253 1.323 1.343 1.512 1.559 1.636 1.71 1.778 1.811 1.876 1.935 2.027 2.092 2.148 2.236 2.318 2.386 2.449 2.498 2.549 2.605 2.667 2.743 2.818 2.893 2.964 3.043 3.117 3.17 3.208 3.23 3.257 3.305 3.329 3.289 3.216 3.079 2.858 2.53 2.023 1.209 -0.308 -2.183 -3.729 -5.033 -6.124 -7.101 -7.944 -8.69 -9.34 -9.985 -10.53 -11.005 -11.459 -11.891 -12.302 -12.651 -13.01 -13.346 -13.627 -13.909 -14.203 -14.446 -14.703 -14.995 -15.216 -15.431 -15.655 -15.876 -16.113 -16.282 -16.447 -16.72 -16.918 -17.124 -17.236 -17.458 -17.671 -17.902 -18.03 -18.301 -18.445 -18.595 -18.76 -19.091 -19.28 -19.492 -19.746 -20.024 -20.329 -20.741 -22.471 -9 ,32023 ,KEBNE ,17069470,Fri Dec 24 05:24:13 CET,Fri Dec 24 06:47:54 CET,0.0 0.233 0.361 0.472 0.571 0.657 0.734 0.818 0.978 1.055 1.141 1.166 1.339 1.39 1.47 1.543 1.617 1.653 1.72 1.8 1.932 2.007 2.071 2.159 2.258 2.358 2.433 2.503 2.608 2.703 2.789 2.89 2.97 3.037 3.134 3.226 3.284 3.346 3.39 3.426 3.477 3.533 3.561 3.56 3.542 3.48 3.33 3.032 2.554 1.728 0.147 -1.715 -3.252 -4.594 -5.791 -6.836 -7.69 -8.448 -9.107 -9.736 -10.268 -10.762 -11.218 -11.643 -12.073 -12.462 -12.838 -13.175 -13.47 -13.772 -14.099 -14.39 -14.688 -14.966 -15.185 -15.411 -15.634 -15.867 -16.114 -16.291 -16.47 -16.748 -16.947 -17.16 -17.276 -17.506 -17.728 -17.97 -18.099 -18.362 -18.505 -18.656 -18.822 -19.209 -19.43 -19.66 -19.919 -20.205 -20.562 -21.023 -22.73 -10 ,29225 ,KEBNE ,17069472,Fri Dec 24 05:27:21 CET,Fri Dec 24 06:51:54 CET,0.0 0.225 0.317 0.41 0.493 0.555 0.641 0.737 0.891 0.95 1.006 0.989 1.146 1.179 1.264 1.35 1.42 1.456 1.519 1.574 1.679 1.746 1.812 1.91 1.993 2.066 2.13 2.191 2.253 2.307 2.365 2.444 2.503 2.553 2.627 2.716 2.795 2.858 2.908 2.965 3.023 3.062 3.084 3.072 3.012 2.941 2.856 2.671 2.297 1.686 0.595 -0.862 -2.149 -3.369 -4.48 -5.424 -6.218 -6.959 -7.607 -8.247 -8.786 -9.251 -9.682 -10.106 -10.509 -10.866 -11.222 -11.544 -11.851 -12.171 -12.481 -12.75 -13.041 -13.32 -13.545 -13.788 -14.024 -14.26 -14.504 -14.679 -14.857 -15.123 -15.313 -15.504 -15.599 -15.822 -16.074 -16.317 -16.447 -16.724 -16.883 -17.039 -17.2 -17.542 -17.724 -17.936 -18.187 -18.488 -18.858 -19.379 -21.158 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_256_67.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_256_67.txt deleted file mode 100644 index 7958a290..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_256_67.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28842 ,KEBNE ,16657674,Tue Nov 23 05:22:01 CET,Tue Nov 23 06:44:23 CET,0.0 0.243 0.397 0.534 0.675 0.825 0.96 1.076 1.306 1.424 1.541 1.65 1.897 2.016 2.233 2.421 2.606 2.702 2.89 3.076 3.348 3.535 3.727 4.007 4.279 4.533 4.772 5.01 5.333 5.66 5.99 6.406 6.803 7.178 7.624 8.149 8.697 9.297 9.939 10.687 11.513 12.433 13.527 14.681 16.078 17.69 19.619 21.94 24.891 28.711 33.891 38.794 42.06 44.384 46.056 47.288 48.269 49.11 49.754 50.322 50.745 51.061 51.323 51.543 51.717 51.861 52.006 52.128 52.237 52.316 52.366 52.417 52.47 52.512 52.516 52.509 52.511 52.512 52.508 52.499 52.486 52.439 52.406 52.373 52.352 52.302 52.231 52.164 52.121 51.992 51.939 51.885 51.812 51.619 51.527 51.451 51.374 51.271 51.094 50.841 50.08 -2 ,28598 ,KEBNE ,16657675,Tue Nov 23 05:22:00 CET,Tue Nov 23 06:41:41 CET,0.0 0.359 0.551 0.705 0.866 1.017 1.151 1.28 1.522 1.633 1.749 1.874 2.116 2.223 2.434 2.64 2.828 2.92 3.106 3.295 3.574 3.769 3.968 4.257 4.54 4.812 5.079 5.346 5.697 6.023 6.33 6.718 7.113 7.506 7.971 8.521 9.062 9.652 10.321 11.068 11.863 12.78 13.897 15.071 16.482 18.104 20.067 22.405 25.338 29.155 34.363 39.35 42.684 45.062 46.786 48.105 49.126 49.936 50.576 51.167 51.572 51.857 52.123 52.334 52.503 52.646 52.804 52.944 53.035 53.105 53.153 53.181 53.214 53.229 53.228 53.237 53.233 53.219 53.19 53.165 53.147 53.111 53.074 53.034 53.014 52.947 52.837 52.723 52.672 52.548 52.473 52.383 52.298 52.079 51.942 51.823 51.72 51.572 51.345 51.098 50.458 -3 ,10955 ,KEBNE ,16657676,Tue Nov 23 05:22:01 CET,Tue Nov 23 06:43:23 CET,0.0 0.251 0.45 0.614 0.76 0.906 1.037 1.155 1.396 1.512 1.616 1.692 1.929 2.039 2.259 2.478 2.685 2.789 2.988 3.182 3.469 3.658 3.841 4.114 4.392 4.651 4.897 5.142 5.472 5.794 6.121 6.541 6.943 7.334 7.803 8.338 8.861 9.466 10.156 10.907 11.689 12.604 13.715 14.885 16.297 17.904 19.868 22.235 25.193 28.968 34.014 38.71 41.868 44.184 45.868 47.136 48.102 48.909 49.529 50.05 50.441 50.753 51.038 51.286 51.47 51.585 51.674 51.768 51.867 51.952 51.997 52.016 52.028 52.042 52.06 52.077 52.078 52.068 52.055 52.025 51.987 51.953 51.906 51.838 51.815 51.77 51.716 51.647 51.593 51.47 51.43 51.373 51.316 51.18 51.093 50.981 50.861 50.726 50.54 50.271 49.563 -4 ,28533 ,KEBNE ,16657677,Tue Nov 23 05:22:01 CET,Tue Nov 23 06:44:29 CET,0.0 0.524 0.746 0.939 1.103 1.24 1.365 1.493 1.762 1.891 2.005 2.094 2.337 2.451 2.665 2.869 3.079 3.183 3.386 3.595 3.901 4.107 4.311 4.6 4.871 5.123 5.385 5.647 5.987 6.306 6.627 7.033 7.421 7.804 8.25 8.771 9.305 9.903 10.567 11.29 12.052 12.948 14.044 15.186 16.585 18.202 20.12 22.454 25.387 29.087 34.15 38.993 42.213 44.556 46.252 47.526 48.481 49.198 49.756 50.296 50.696 51.007 51.27 51.488 51.663 51.799 51.932 52.041 52.126 52.186 52.23 52.255 52.278 52.303 52.308 52.308 52.314 52.306 52.273 52.246 52.216 52.172 52.138 52.102 52.08 52.024 51.976 51.904 51.861 51.753 51.716 51.654 51.585 51.431 51.333 51.204 51.083 50.957 50.766 50.538 49.859 -5 ,20945 ,KEBNE ,16657678,Tue Nov 23 05:22:01 CET,Tue Nov 23 06:42:02 CET,0.0 0.252 0.451 0.617 0.757 0.88 0.995 1.114 1.34 1.444 1.551 1.646 1.88 1.99 2.201 2.409 2.613 2.71 2.893 3.075 3.345 3.527 3.706 3.965 4.23 4.496 4.744 4.985 5.322 5.66 5.984 6.392 6.8 7.205 7.687 8.23 8.746 9.328 9.977 10.686 11.465 12.368 13.451 14.59 15.989 17.622 19.618 22.007 24.965 28.751 33.881 38.771 42.004 44.264 45.921 47.197 48.188 48.984 49.56 50.025 50.417 50.792 51.104 51.339 51.544 51.711 51.852 51.961 52.036 52.111 52.161 52.196 52.233 52.272 52.308 52.341 52.364 52.374 52.394 52.406 52.414 52.413 52.406 52.387 52.37 52.344 52.306 52.249 52.216 52.108 52.082 52.025 51.961 51.825 51.753 51.674 51.574 51.445 51.273 51.009 50.199 -6 ,29749 ,KEBNE ,16657679,Tue Nov 23 05:22:00 CET,Tue Nov 23 06:44:41 CET,0.0 0.464 0.679 0.835 0.984 1.113 1.234 1.355 1.595 1.718 1.833 1.949 2.181 2.284 2.485 2.69 2.897 2.993 3.179 3.368 3.676 3.882 4.079 4.377 4.662 4.926 5.189 5.466 5.844 6.199 6.526 6.929 7.346 7.779 8.269 8.803 9.339 9.936 10.585 11.307 12.091 12.984 14.077 15.23 16.621 18.241 20.23 22.627 25.582 29.359 34.49 39.29 42.48 44.758 46.367 47.577 48.546 49.29 49.835 50.308 50.647 50.933 51.192 51.417 51.615 51.773 51.896 51.981 52.03 52.072 52.115 52.155 52.19 52.201 52.201 52.194 52.19 52.184 52.175 52.168 52.15 52.103 52.066 52.018 51.991 51.939 51.876 51.791 51.751 51.643 51.617 51.569 51.502 51.35 51.253 51.126 50.987 50.843 50.691 50.521 49.651 -7 ,1413 ,KEBNE ,16657680,Tue Nov 23 05:22:01 CET,Tue Nov 23 06:41:41 CET,0.0 0.456 0.651 0.817 0.979 1.125 1.259 1.381 1.591 1.703 1.816 1.914 2.15 2.264 2.479 2.683 2.885 2.981 3.162 3.345 3.643 3.846 4.035 4.317 4.596 4.85 5.095 5.346 5.68 5.995 6.311 6.705 7.091 7.48 7.933 8.443 8.944 9.506 10.144 10.848 11.616 12.512 13.646 14.823 16.185 17.794 19.749 22.059 24.884 28.553 33.664 38.512 41.697 43.994 45.723 47.05 48.032 48.788 49.34 49.847 50.241 50.538 50.801 51.029 51.204 51.319 51.423 51.508 51.558 51.596 51.636 51.686 51.731 51.745 51.747 51.739 51.723 51.702 51.678 51.657 51.645 51.636 51.616 51.581 51.563 51.523 51.464 51.38 51.336 51.233 51.196 51.129 51.06 50.894 50.793 50.672 50.534 50.373 50.172 49.888 49.039 -8 ,22709 ,KEBNE ,16657681,Tue Nov 23 05:22:01 CET,Tue Nov 23 06:44:51 CET,0.0 0.291 0.478 0.656 0.818 0.959 1.091 1.219 1.469 1.594 1.712 1.811 2.053 2.166 2.381 2.585 2.787 2.89 3.083 3.263 3.541 3.733 3.918 4.189 4.457 4.73 5.019 5.298 5.636 5.965 6.297 6.701 7.095 7.481 7.94 8.476 9.011 9.619 10.31 11.047 11.842 12.781 13.888 15.048 16.45 18.063 19.996 22.317 25.254 28.999 34.007 38.741 41.922 44.172 45.847 47.178 48.21 49.033 49.659 50.24 50.69 51.03 51.309 51.526 51.712 51.866 51.988 52.095 52.194 52.29 52.379 52.451 52.508 52.546 52.565 52.572 52.559 52.53 52.491 52.467 52.445 52.4 52.368 52.327 52.303 52.24 52.172 52.105 52.061 51.944 51.909 51.859 51.799 51.659 51.594 51.514 51.41 51.28 51.1 50.918 50.431 -9 ,2604 ,KEBNE ,16657682,Tue Nov 23 05:22:01 CET,Tue Nov 23 06:44:23 CET,0.0 0.417 0.641 0.834 1.001 1.138 1.256 1.378 1.631 1.753 1.873 1.97 2.199 2.301 2.51 2.718 2.917 3.02 3.222 3.424 3.721 3.907 4.091 4.376 4.658 4.921 5.185 5.447 5.783 6.113 6.436 6.842 7.236 7.617 8.08 8.631 9.172 9.769 10.418 11.112 11.857 12.744 13.818 14.946 16.342 17.973 19.941 22.283 25.261 29.103 34.207 38.99 42.272 44.658 46.36 47.695 48.711 49.501 50.132 50.696 51.112 51.411 51.657 51.882 52.065 52.224 52.407 52.511 52.558 52.614 52.674 52.705 52.73 52.768 52.779 52.777 52.764 52.745 52.73 52.711 52.692 52.663 52.639 52.605 52.576 52.511 52.44 52.375 52.333 52.219 52.178 52.116 52.065 51.926 51.838 51.73 51.586 51.426 51.241 50.984 49.886 -10 ,19657 ,KEBNE ,16657683,Tue Nov 23 05:22:01 CET,Tue Nov 23 06:43:00 CET,0.0 0.449 0.626 0.782 0.935 1.095 1.24 1.376 1.636 1.766 1.901 2.014 2.247 2.353 2.576 2.802 3.014 3.111 3.309 3.51 3.794 3.971 4.144 4.414 4.682 4.937 5.198 5.465 5.805 6.131 6.451 6.847 7.237 7.62 8.087 8.649 9.204 9.801 10.456 11.204 12.014 12.947 14.069 15.224 16.663 18.36 20.434 22.91 25.994 29.896 35.08 39.807 42.896 45.192 46.956 48.316 49.242 49.943 50.488 50.992 51.386 51.687 51.963 52.206 52.418 52.58 52.705 52.798 52.865 52.936 53.03 53.111 53.164 53.204 53.23 53.237 53.226 53.211 53.211 53.197 53.174 53.138 53.103 53.038 53.006 52.957 52.891 52.81 52.766 52.654 52.615 52.543 52.476 52.354 52.279 52.186 52.058 51.912 51.729 51.452 50.667 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_266_224.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_266_224.txt deleted file mode 100644 index 4c94db27..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_266_224.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25895 ,KEBNE ,16657684,Tue Nov 23 05:23:02 CET,Tue Nov 23 06:45:20 CET,0.0 0.553 0.784 0.987 1.142 1.279 1.399 1.516 1.731 1.824 1.912 1.993 2.143 2.222 2.361 2.481 2.6 2.658 2.78 2.895 3.02 3.097 3.181 3.318 3.453 3.59 3.713 3.817 3.955 4.089 4.221 4.381 4.528 4.672 4.839 5.044 5.248 5.439 5.656 5.902 6.134 6.363 6.641 6.911 7.231 7.565 7.894 8.229 8.56 8.87 9.064 8.926 8.66 8.356 7.967 7.572 7.204 6.821 6.495 6.159 5.869 5.61 5.339 5.077 4.813 4.551 4.285 4.051 3.834 3.615 3.385 3.179 2.97 2.77 2.594 2.403 2.226 2.021 1.804 1.661 1.507 1.247 1.064 0.899 0.817 0.622 0.402 0.184 0.072 -0.121 -0.316 -0.447 -0.571 -0.843 -1.018 -1.213 -1.42 -1.669 -1.971 -2.445 -4.715 -2 ,485 ,KEBNE ,16657685,Tue Nov 23 05:23:02 CET,Tue Nov 23 06:45:19 CET,0.0 0.469 0.638 0.792 0.925 1.042 1.158 1.262 1.47 1.558 1.639 1.729 1.888 1.953 2.074 2.207 2.324 2.373 2.474 2.574 2.707 2.792 2.879 3.009 3.131 3.26 3.376 3.478 3.631 3.787 3.929 4.101 4.253 4.39 4.55 4.722 4.91 5.113 5.316 5.518 5.724 5.973 6.262 6.535 6.833 7.156 7.51 7.879 8.26 8.642 8.929 8.893 8.662 8.34 8.002 7.655 7.295 6.943 6.615 6.257 5.948 5.655 5.371 5.096 4.838 4.605 4.363 4.142 3.913 3.673 3.463 3.285 3.076 2.859 2.696 2.515 2.323 2.136 1.949 1.814 1.67 1.455 1.313 1.149 1.062 0.887 0.686 0.471 0.353 0.167 0.032 -0.102 -0.273 -0.69 -0.899 -1.086 -1.281 -1.517 -1.808 -2.174 -3.975 -3 ,14504 ,KEBNE ,16657686,Tue Nov 23 05:23:02 CET,Tue Nov 23 06:46:48 CET,0.0 0.482 0.666 0.845 1.022 1.186 1.338 1.476 1.685 1.782 1.858 1.913 2.06 2.123 2.25 2.388 2.521 2.584 2.69 2.8 2.967 3.058 3.156 3.304 3.437 3.569 3.7 3.822 3.983 4.12 4.247 4.413 4.548 4.686 4.867 5.048 5.21 5.373 5.554 5.776 6.001 6.242 6.484 6.729 7.038 7.341 7.677 8.013 8.348 8.667 8.806 8.63 8.29 7.781 7.297 6.906 6.516 6.127 5.785 5.406 5.062 4.784 4.528 4.248 3.975 3.723 3.448 3.207 2.985 2.722 2.444 2.248 2.057 1.861 1.716 1.551 1.359 1.146 0.933 0.791 0.63 0.371 0.194 0.012 -0.081 -0.267 -0.459 -0.66 -0.758 -0.939 -1.09 -1.221 -1.361 -1.643 -1.797 -1.975 -2.183 -2.403 -2.657 -3.004 -4.186 -4 ,8270 ,KEBNE ,16657687,Tue Nov 23 05:23:02 CET,Tue Nov 23 06:44:41 CET,0.0 0.714 0.943 1.121 1.282 1.409 1.513 1.616 1.801 1.889 1.979 2.075 2.232 2.307 2.444 2.573 2.704 2.774 2.896 3.004 3.161 3.253 3.354 3.506 3.643 3.782 3.908 4.027 4.175 4.318 4.464 4.627 4.776 4.924 5.097 5.301 5.507 5.734 5.98 6.215 6.442 6.686 6.986 7.292 7.641 8.007 8.376 8.763 9.189 9.647 10.007 9.925 9.603 9.207 8.796 8.409 8.012 7.627 7.323 6.977 6.648 6.343 6.067 5.84 5.612 5.384 5.16 4.938 4.736 4.533 4.288 4.085 3.887 3.686 3.527 3.348 3.163 2.979 2.783 2.643 2.486 2.237 2.055 1.856 1.762 1.577 1.376 1.165 1.062 0.873 0.666 0.492 0.321 -0.055 -0.284 -0.531 -0.779 -1.091 -1.53 -2.116 -3.751 -5 ,25569 ,KEBNE ,16657688,Tue Nov 23 05:23:01 CET,Tue Nov 23 06:46:14 CET,0.0 0.76 1.027 1.227 1.384 1.524 1.63 1.72 1.907 1.992 2.065 2.116 2.257 2.331 2.483 2.613 2.74 2.8 2.912 3.026 3.189 3.292 3.412 3.577 3.69 3.789 3.885 3.98 4.126 4.272 4.397 4.549 4.689 4.813 4.97 5.155 5.333 5.525 5.708 5.893 6.103 6.341 6.6 6.851 7.145 7.47 7.832 8.197 8.533 8.81 8.98 8.811 8.386 7.868 7.407 7.001 6.624 6.23 5.855 5.456 5.132 4.844 4.495 4.161 3.883 3.622 3.335 3.075 2.851 2.61 2.36 2.142 1.906 1.666 1.476 1.258 1.026 0.826 0.639 0.492 0.342 0.127 -0.035 -0.226 -0.336 -0.582 -0.84 -1.086 -1.23 -1.464 -1.738 -1.918 -2.088 -2.471 -2.676 -2.902 -3.145 -3.422 -3.761 -4.285 -6.749 -6 ,17096 ,KEBNE ,16657689,Tue Nov 23 05:23:02 CET,Tue Nov 23 06:45:00 CET,0.0 0.393 0.563 0.694 0.824 0.953 1.075 1.181 1.353 1.445 1.536 1.613 1.757 1.825 1.958 2.068 2.179 2.234 2.335 2.446 2.621 2.73 2.818 2.933 3.05 3.164 3.276 3.384 3.531 3.67 3.787 3.925 4.077 4.227 4.387 4.565 4.734 4.912 5.126 5.366 5.583 5.821 6.097 6.357 6.645 6.94 7.292 7.647 7.935 8.179 8.28 8.067 7.695 7.304 6.928 6.548 6.157 5.803 5.484 5.09 4.745 4.449 4.161 3.896 3.642 3.401 3.158 2.939 2.748 2.55 2.327 2.128 1.899 1.656 1.467 1.278 1.099 0.902 0.674 0.511 0.359 0.098 -0.091 -0.287 -0.395 -0.611 -0.82 -1.04 -1.158 -1.361 -1.55 -1.683 -1.816 -2.114 -2.29 -2.5 -2.733 -2.971 -3.265 -3.671 -5.116 -7 ,17084 ,KEBNE ,16657690,Tue Nov 23 05:23:01 CET,Tue Nov 23 06:47:21 CET,0.0 0.476 0.676 0.83 0.955 1.054 1.151 1.247 1.44 1.527 1.606 1.682 1.833 1.905 2.046 2.172 2.288 2.344 2.458 2.568 2.714 2.813 2.911 3.045 3.168 3.285 3.401 3.523 3.686 3.821 3.94 4.086 4.233 4.374 4.533 4.724 4.904 5.096 5.294 5.484 5.706 5.953 6.209 6.453 6.707 6.989 7.29 7.612 7.939 8.201 8.287 8.033 7.634 7.189 6.747 6.305 5.874 5.494 5.174 4.833 4.544 4.298 4.058 3.82 3.583 3.357 3.129 2.921 2.725 2.508 2.286 2.117 1.952 1.772 1.625 1.47 1.319 1.151 0.957 0.824 0.682 0.458 0.295 0.13 0.048 -0.116 -0.288 -0.471 -0.561 -0.736 -0.881 -0.995 -1.131 -1.442 -1.608 -1.778 -1.959 -2.179 -2.449 -2.826 -3.872 -8 ,30546 ,KEBNE ,16657691,Tue Nov 23 05:24:03 CET,Tue Nov 23 06:45:58 CET,0.0 0.501 0.659 0.796 0.907 1.009 1.107 1.21 1.416 1.51 1.592 1.659 1.805 1.868 2.004 2.138 2.256 2.308 2.414 2.539 2.735 2.86 2.982 3.139 3.276 3.405 3.527 3.649 3.811 3.958 4.092 4.244 4.404 4.58 4.786 4.996 5.163 5.342 5.553 5.77 5.982 6.228 6.523 6.811 7.119 7.448 7.828 8.21 8.627 9.025 9.209 9.046 8.681 8.317 7.992 7.671 7.338 6.968 6.615 6.25 5.925 5.602 5.274 4.98 4.719 4.484 4.243 4.025 3.819 3.606 3.385 3.185 2.978 2.766 2.589 2.403 2.223 2.04 1.841 1.709 1.576 1.359 1.208 1.049 0.964 0.797 0.628 0.426 0.301 0.11 -0.04 -0.173 -0.298 -0.552 -0.7 -0.861 -1.054 -1.304 -1.623 -2.045 -3.175 -9 ,27831 ,KEBNE ,16657692,Tue Nov 23 05:24:03 CET,Tue Nov 23 06:46:36 CET,0.0 0.627 0.865 1.056 1.192 1.305 1.405 1.482 1.642 1.73 1.807 1.87 2.015 2.078 2.207 2.348 2.485 2.545 2.663 2.783 2.935 3.017 3.102 3.247 3.394 3.541 3.68 3.806 3.967 4.12 4.261 4.417 4.571 4.732 4.902 5.086 5.278 5.474 5.678 5.908 6.144 6.399 6.693 6.958 7.225 7.531 7.905 8.257 8.616 9.0 9.319 9.292 8.975 8.581 8.174 7.766 7.386 6.996 6.658 6.332 6.037 5.745 5.462 5.211 4.971 4.728 4.469 4.233 4.03 3.825 3.58 3.355 3.145 2.924 2.753 2.596 2.432 2.254 2.052 1.896 1.732 1.49 1.318 1.14 1.049 0.845 0.627 0.416 0.309 0.118 -0.04 -0.156 -0.269 -0.516 -0.662 -0.839 -1.064 -1.331 -1.624 -2.047 -3.573 -10 ,16107 ,KEBNE ,16657693,Tue Nov 23 05:24:03 CET,Tue Nov 23 06:47:17 CET,0.0 0.452 0.671 0.893 1.099 1.244 1.346 1.443 1.641 1.729 1.805 1.878 2.024 2.081 2.201 2.338 2.464 2.519 2.625 2.726 2.881 2.983 3.072 3.179 3.298 3.433 3.574 3.701 3.849 3.986 4.109 4.258 4.398 4.538 4.708 4.914 5.102 5.283 5.468 5.658 5.872 6.12 6.394 6.664 6.97 7.286 7.618 7.95 8.289 8.566 8.69 8.527 8.183 7.77 7.337 6.907 6.524 6.153 5.799 5.438 5.098 4.773 4.472 4.191 3.925 3.675 3.419 3.185 2.983 2.771 2.54 2.327 2.105 1.88 1.703 1.523 1.315 1.096 0.898 0.766 0.625 0.395 0.216 0.04 -0.043 -0.225 -0.436 -0.675 -0.796 -0.989 -1.162 -1.298 -1.447 -1.762 -1.948 -2.18 -2.473 -2.817 -3.227 -3.822 -5.494 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_266_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_266_235.txt deleted file mode 100644 index 8a3e6fad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_266_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1296 ,KEBNE ,16657694,Tue Nov 23 05:24:03 CET,Tue Nov 23 06:46:58 CET,0.0 1.494 1.832 2.068 2.253 2.412 2.583 2.726 2.94 3.037 3.121 3.2 3.359 3.441 3.599 3.732 3.833 3.878 3.968 4.064 4.197 4.282 4.354 4.446 4.508 4.564 4.625 4.682 4.752 4.809 4.877 4.948 5.013 5.062 5.091 5.131 5.159 5.193 5.2 5.159 5.092 4.996 4.864 4.684 4.423 4.086 3.634 2.971 1.945 0.361 -2.272 -5.251 -7.527 -9.345 -10.82 -12.045 -13.059 -13.976 -14.755 -15.52 -16.177 -16.755 -17.319 -17.842 -18.291 -18.697 -19.129 -19.504 -19.818 -20.143 -20.497 -20.781 -21.056 -21.334 -21.539 -21.754 -21.99 -22.224 -22.471 -22.647 -22.829 -23.104 -23.293 -23.494 -23.601 -23.809 -23.998 -24.22 -24.343 -24.573 -24.696 -24.81 -24.945 -25.288 -25.472 -25.673 -25.881 -26.078 -26.329 -26.639 -27.977 -2 ,6285 ,KEBNE ,16657695,Tue Nov 23 05:24:03 CET,Tue Nov 23 06:47:56 CET,0.0 1.065 1.458 1.735 1.94 2.111 2.247 2.364 2.582 2.677 2.769 2.867 3.027 3.109 3.244 3.367 3.487 3.54 3.656 3.757 3.885 3.967 4.032 4.106 4.175 4.226 4.274 4.342 4.432 4.501 4.542 4.562 4.602 4.653 4.696 4.747 4.787 4.799 4.777 4.74 4.671 4.562 4.409 4.204 3.924 3.541 3.015 2.305 1.245 -0.337 -2.815 -5.624 -7.871 -9.673 -11.144 -12.431 -13.49 -14.415 -15.24 -16.06 -16.722 -17.277 -17.789 -18.268 -18.711 -19.121 -19.558 -19.931 -20.242 -20.573 -20.922 -21.206 -21.503 -21.82 -22.058 -22.292 -22.534 -22.783 -23.043 -23.232 -23.426 -23.71 -23.902 -24.103 -24.209 -24.433 -24.679 -24.942 -25.076 -25.31 -25.478 -25.629 -25.782 -26.134 -26.319 -26.496 -26.698 -26.968 -27.305 -27.676 -28.919 -3 ,30360 ,KEBNE ,16657696,Tue Nov 23 05:24:03 CET,Tue Nov 23 06:46:46 CET,0.0 1.666 1.997 2.23 2.465 2.676 2.823 2.942 3.154 3.252 3.343 3.42 3.569 3.637 3.755 3.876 3.992 4.035 4.1 4.173 4.276 4.335 4.405 4.481 4.524 4.584 4.666 4.731 4.784 4.825 4.87 4.925 4.972 5.003 5.009 5.008 4.993 4.973 4.947 4.905 4.833 4.731 4.598 4.428 4.208 3.869 3.312 2.549 1.497 -0.052 -2.572 -5.458 -7.706 -9.581 -11.101 -12.347 -13.389 -14.313 -15.129 -15.949 -16.618 -17.172 -17.705 -18.22 -18.703 -19.124 -19.532 -19.898 -20.214 -20.537 -20.888 -21.187 -21.514 -21.857 -22.104 -22.351 -22.594 -22.845 -23.133 -23.33 -23.516 -23.787 -23.967 -24.171 -24.281 -24.498 -24.706 -24.927 -25.039 -25.266 -25.412 -25.532 -25.668 -25.972 -26.152 -26.343 -26.556 -26.834 -27.152 -27.492 -28.611 -4 ,15031 ,KEBNE ,16657697,Tue Nov 23 05:25:04 CET,Tue Nov 23 06:49:17 CET,0.0 1.422 1.723 1.93 2.118 2.301 2.472 2.613 2.842 2.945 3.045 3.16 3.326 3.406 3.542 3.669 3.796 3.859 3.959 4.036 4.153 4.22 4.278 4.384 4.497 4.584 4.635 4.674 4.72 4.767 4.812 4.867 4.912 4.937 4.958 4.975 4.972 4.955 4.978 4.979 4.909 4.808 4.646 4.427 4.159 3.799 3.266 2.581 1.557 0.004 -2.489 -5.345 -7.547 -9.307 -10.736 -11.975 -13.046 -13.981 -14.749 -15.503 -16.155 -16.752 -17.317 -17.822 -18.264 -18.655 -19.079 -19.462 -19.783 -20.109 -20.45 -20.722 -20.99 -21.289 -21.532 -21.773 -22.011 -22.254 -22.493 -22.649 -22.826 -23.137 -23.351 -23.566 -23.673 -23.883 -24.096 -24.331 -24.45 -24.683 -24.85 -24.984 -25.153 -25.501 -25.66 -25.839 -26.05 -26.301 -26.595 -26.943 -27.865 -5 ,30153 ,KEBNE ,16657698,Tue Nov 23 05:25:04 CET,Tue Nov 23 06:48:04 CET,0.0 1.13 1.467 1.686 1.856 2.01 2.155 2.28 2.48 2.574 2.66 2.712 2.854 2.912 3.038 3.157 3.256 3.313 3.412 3.499 3.611 3.685 3.762 3.831 3.903 3.994 4.088 4.167 4.237 4.309 4.384 4.444 4.486 4.523 4.538 4.545 4.558 4.566 4.549 4.505 4.442 4.319 4.141 3.937 3.645 3.263 2.742 2.002 0.922 -0.629 -3.094 -5.892 -8.078 -9.876 -11.331 -12.536 -13.536 -14.403 -15.13 -15.848 -16.497 -17.093 -17.659 -18.168 -18.623 -19.044 -19.495 -19.89 -20.204 -20.537 -20.917 -21.233 -21.563 -21.92 -22.176 -22.402 -22.63 -22.888 -23.16 -23.346 -23.547 -23.873 -24.089 -24.298 -24.4 -24.614 -24.869 -25.129 -25.25 -25.487 -25.682 -25.844 -25.999 -26.319 -26.498 -26.692 -26.899 -27.118 -27.392 -27.794 -29.115 -6 ,18858 ,KEBNE ,16657699,Tue Nov 23 05:25:04 CET,Tue Nov 23 06:47:53 CET,0.0 0.949 1.234 1.462 1.675 1.829 1.978 2.124 2.365 2.487 2.579 2.646 2.822 2.916 3.047 3.146 3.237 3.281 3.361 3.455 3.6 3.688 3.76 3.852 3.946 4.029 4.106 4.174 4.252 4.299 4.336 4.384 4.431 4.476 4.492 4.471 4.446 4.425 4.395 4.333 4.253 4.191 4.084 3.895 3.6 3.232 2.738 1.971 0.879 -0.713 -3.253 -6.052 -8.214 -9.989 -11.464 -12.707 -13.793 -14.772 -15.578 -16.358 -17.007 -17.574 -18.11 -18.623 -19.084 -19.486 -19.9 -20.259 -20.569 -20.899 -21.242 -21.52 -21.816 -22.109 -22.321 -22.564 -22.826 -23.088 -23.359 -23.535 -23.704 -23.987 -24.186 -24.391 -24.497 -24.701 -24.93 -25.187 -25.322 -25.57 -25.757 -25.908 -26.062 -26.383 -26.55 -26.72 -26.934 -27.158 -27.431 -27.791 -28.827 -7 ,12185 ,KEBNE ,16657700,Tue Nov 23 05:25:04 CET,Tue Nov 23 06:47:22 CET,0.0 1.37 1.774 2.06 2.266 2.453 2.617 2.748 2.945 3.041 3.145 3.256 3.402 3.472 3.598 3.703 3.805 3.859 3.961 4.052 4.173 4.251 4.326 4.422 4.514 4.605 4.701 4.779 4.853 4.909 4.958 5.016 5.058 5.085 5.104 5.107 5.115 5.152 5.186 5.163 5.094 5.001 4.863 4.676 4.408 4.05 3.536 2.815 1.793 0.281 -2.141 -4.888 -7.005 -8.723 -10.161 -11.441 -12.537 -13.488 -14.305 -15.085 -15.728 -16.316 -16.869 -17.376 -17.849 -18.294 -18.751 -19.153 -19.504 -19.862 -20.222 -20.507 -20.79 -21.07 -21.286 -21.522 -21.772 -22.028 -22.284 -22.464 -22.658 -22.964 -23.165 -23.369 -23.481 -23.695 -23.915 -24.151 -24.268 -24.494 -24.671 -24.818 -24.952 -25.264 -25.442 -25.648 -25.865 -26.092 -26.341 -26.69 -27.979 -8 ,22161 ,KEBNE ,16657701,Tue Nov 23 05:25:04 CET,Tue Nov 23 06:47:30 CET,0.0 1.167 1.527 1.809 2.005 2.17 2.308 2.433 2.676 2.77 2.854 2.945 3.099 3.175 3.317 3.466 3.604 3.661 3.75 3.834 3.961 4.033 4.102 4.2 4.269 4.319 4.376 4.431 4.493 4.566 4.631 4.672 4.686 4.711 4.744 4.759 4.76 4.734 4.678 4.609 4.515 4.366 4.195 3.999 3.701 3.299 2.752 2.034 0.989 -0.565 -3.003 -5.803 -8.014 -9.851 -11.396 -12.703 -13.803 -14.765 -15.572 -16.365 -17.032 -17.62 -18.175 -18.684 -19.147 -19.598 -20.056 -20.43 -20.75 -21.071 -21.394 -21.669 -21.963 -22.277 -22.513 -22.742 -22.982 -23.247 -23.516 -23.691 -23.861 -24.137 -24.341 -24.57 -24.688 -24.907 -25.134 -25.378 -25.499 -25.733 -25.916 -26.059 -26.215 -26.58 -26.764 -26.946 -27.162 -27.458 -27.783 -28.127 -29.133 -9 ,2897 ,KEBNE ,16657702,Tue Nov 23 05:25:04 CET,Tue Nov 23 06:50:47 CET,0.0 1.38 1.766 2.01 2.186 2.342 2.495 2.653 2.933 3.044 3.117 3.165 3.319 3.385 3.493 3.599 3.704 3.751 3.84 3.928 4.04 4.12 4.191 4.252 4.336 4.429 4.513 4.584 4.643 4.691 4.739 4.782 4.795 4.803 4.825 4.855 4.856 4.827 4.793 4.742 4.668 4.56 4.402 4.249 4.013 3.597 3.02 2.293 1.294 -0.22 -2.648 -5.388 -7.567 -9.344 -10.801 -12.058 -13.132 -14.07 -14.861 -15.654 -16.318 -16.899 -17.466 -17.987 -18.444 -18.868 -19.302 -19.675 -20.015 -20.364 -20.703 -20.98 -21.27 -21.562 -21.774 -21.992 -22.234 -22.487 -22.737 -22.901 -23.073 -23.357 -23.56 -23.768 -23.871 -24.094 -24.321 -24.548 -24.677 -24.918 -25.094 -25.246 -25.407 -25.714 -25.878 -26.061 -26.251 -26.468 -26.734 -27.098 -28.677 -10 ,21661 ,KEBNE ,16657703,Tue Nov 23 05:25:08 CET,Tue Nov 23 06:48:36 CET,0.0 1.063 1.452 1.726 1.93 2.102 2.252 2.392 2.602 2.7 2.8 2.922 3.1 3.185 3.299 3.399 3.507 3.562 3.648 3.723 3.838 3.9 3.963 4.044 4.106 4.161 4.234 4.297 4.353 4.398 4.441 4.489 4.52 4.546 4.564 4.597 4.62 4.638 4.657 4.627 4.554 4.47 4.336 4.136 3.871 3.511 2.999 2.324 1.306 -0.323 -2.878 -5.733 -7.9 -9.652 -11.114 -12.37 -13.454 -14.411 -15.216 -16.012 -16.682 -17.265 -17.808 -18.297 -18.747 -19.152 -19.579 -19.993 -20.35 -20.727 -21.105 -21.404 -21.72 -22.037 -22.29 -22.535 -22.767 -23.015 -23.26 -23.418 -23.588 -23.869 -24.068 -24.266 -24.372 -24.599 -24.825 -25.055 -25.173 -25.398 -25.539 -25.682 -25.844 -26.188 -26.387 -26.6 -26.799 -27.02 -27.295 -27.619 -28.825 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_289_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_289_231.txt deleted file mode 100644 index 3cb8dc0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_289_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13966 ,KEBNE ,16657704,Tue Nov 23 05:25:08 CET,Tue Nov 23 06:46:06 CET,0.0 0.328 0.484 0.639 0.796 0.943 1.052 1.149 1.319 1.395 1.463 1.507 1.705 1.783 1.935 2.079 2.215 2.275 2.38 2.488 2.657 2.752 2.84 2.966 3.101 3.249 3.381 3.503 3.645 3.778 3.918 4.087 4.23 4.353 4.495 4.654 4.791 4.945 5.137 5.352 5.596 5.855 6.096 6.304 6.534 6.781 7.031 7.253 7.469 7.625 7.545 7.144 6.721 6.367 6.036 5.676 5.349 5.047 4.77 4.46 4.205 3.995 3.797 3.59 3.4 3.239 3.044 2.87 2.735 2.598 2.437 2.299 2.154 1.981 1.841 1.711 1.586 1.448 1.31 1.228 1.136 0.952 0.818 0.682 0.615 0.505 0.399 0.253 0.166 -0.038 -0.098 -0.191 -0.286 -0.496 -0.624 -0.752 -0.861 -0.981 -1.151 -1.318 -1.58 -2 ,30622 ,KEBNE ,16657705,Tue Nov 23 05:26:06 CET,Tue Nov 23 06:50:04 CET,0.0 0.532 0.785 0.915 1.044 1.186 1.305 1.407 1.61 1.703 1.791 1.844 2.034 2.105 2.218 2.325 2.434 2.495 2.624 2.738 2.902 3.007 3.103 3.237 3.365 3.485 3.598 3.713 3.865 4.001 4.127 4.289 4.455 4.605 4.767 4.942 5.105 5.286 5.474 5.685 5.923 6.148 6.371 6.588 6.816 7.05 7.33 7.602 7.835 8.049 8.201 8.126 7.837 7.449 7.078 6.75 6.444 6.134 5.872 5.607 5.36 5.131 4.927 4.746 4.565 4.392 4.214 4.062 3.919 3.767 3.607 3.481 3.348 3.187 3.057 2.937 2.823 2.689 2.551 2.459 2.357 2.171 2.041 1.914 1.847 1.698 1.542 1.382 1.304 1.106 1.044 0.955 0.865 0.674 0.578 0.469 0.35 0.225 0.084 -0.064 -0.31 -3 ,707 ,KEBNE ,16657706,Tue Nov 23 05:26:05 CET,Tue Nov 23 06:48:10 CET,0.0 0.524 0.721 0.865 0.983 1.095 1.194 1.283 1.462 1.558 1.646 1.679 1.862 1.927 2.046 2.165 2.283 2.339 2.44 2.534 2.687 2.784 2.879 3.023 3.172 3.323 3.457 3.582 3.745 3.9 4.05 4.228 4.374 4.502 4.676 4.892 5.088 5.304 5.516 5.706 5.909 6.127 6.388 6.628 6.848 7.09 7.361 7.63 7.877 8.102 8.153 7.924 7.629 7.262 6.9 6.56 6.24 5.943 5.663 5.363 5.086 4.831 4.596 4.365 4.162 3.975 3.767 3.576 3.411 3.245 3.071 2.92 2.771 2.616 2.486 2.345 2.193 2.038 1.899 1.812 1.713 1.533 1.402 1.283 1.223 1.079 0.913 0.76 0.692 0.5 0.446 0.354 0.246 0.006 -0.116 -0.241 -0.379 -0.515 -0.638 -0.812 -1.145 -4 ,29855 ,KEBNE ,16657707,Tue Nov 23 05:26:05 CET,Tue Nov 23 06:47:49 CET,0.0 0.169 0.288 0.406 0.525 0.626 0.748 0.869 1.052 1.142 1.233 1.288 1.474 1.543 1.685 1.83 1.958 2.016 2.138 2.243 2.376 2.467 2.557 2.683 2.81 2.938 3.058 3.174 3.319 3.455 3.589 3.748 3.886 4.022 4.188 4.39 4.575 4.749 4.939 5.142 5.346 5.567 5.805 6.012 6.239 6.471 6.716 6.954 7.19 7.443 7.516 7.222 6.846 6.515 6.149 5.775 5.475 5.179 4.902 4.644 4.41 4.182 3.949 3.729 3.542 3.372 3.196 3.025 2.871 2.728 2.583 2.447 2.291 2.149 2.053 1.936 1.808 1.69 1.562 1.466 1.377 1.243 1.136 1.013 0.951 0.827 0.682 0.517 0.44 0.267 0.235 0.146 0.053 -0.118 -0.207 -0.328 -0.474 -0.638 -0.819 -0.98 -1.241 -5 ,25383 ,KEBNE ,16657708,Tue Nov 23 05:26:05 CET,Tue Nov 23 06:48:48 CET,0.0 0.308 0.485 0.632 0.751 0.852 0.95 1.044 1.208 1.29 1.371 1.394 1.582 1.649 1.766 1.867 1.972 2.026 2.138 2.247 2.397 2.491 2.586 2.721 2.843 2.964 3.077 3.176 3.303 3.429 3.55 3.713 3.867 3.998 4.153 4.351 4.543 4.722 4.896 5.078 5.259 5.462 5.709 5.956 6.222 6.478 6.794 7.165 7.48 7.662 7.667 7.403 7.039 6.696 6.345 6.007 5.684 5.376 5.114 4.835 4.585 4.362 4.14 3.936 3.746 3.533 3.313 3.135 2.956 2.77 2.606 2.46 2.299 2.145 2.029 1.9 1.757 1.59 1.401 1.281 1.158 0.983 0.873 0.756 0.692 0.557 0.434 0.311 0.237 0.048 0.007 -0.088 -0.183 -0.344 -0.435 -0.557 -0.672 -0.777 -0.911 -1.138 -1.959 -6 ,7946 ,KEBNE ,16657709,Tue Nov 23 05:26:05 CET,Tue Nov 23 06:48:01 CET,0.0 0.41 0.62 0.804 0.918 1.017 1.123 1.215 1.367 1.439 1.518 1.568 1.769 1.854 1.993 2.138 2.282 2.338 2.447 2.562 2.717 2.811 2.908 3.046 3.17 3.303 3.427 3.534 3.68 3.812 3.927 4.087 4.251 4.39 4.545 4.717 4.889 5.073 5.286 5.514 5.734 5.972 6.263 6.533 6.793 7.078 7.377 7.671 7.931 8.135 8.209 8.027 7.701 7.361 7.018 6.621 6.257 5.958 5.668 5.373 5.133 4.889 4.643 4.399 4.179 3.965 3.752 3.568 3.389 3.218 3.046 2.892 2.733 2.565 2.432 2.301 2.169 2.029 1.891 1.799 1.708 1.538 1.401 1.275 1.214 1.076 0.951 0.819 0.742 0.552 0.523 0.451 0.378 0.219 0.128 0.02 -0.097 -0.218 -0.376 -0.563 -0.885 -7 ,9116 ,KEBNE ,16657710,Tue Nov 23 05:26:06 CET,Tue Nov 23 06:48:21 CET,0.0 0.374 0.577 0.734 0.854 0.943 1.038 1.141 1.31 1.388 1.463 1.493 1.673 1.737 1.866 1.995 2.124 2.179 2.29 2.395 2.555 2.657 2.751 2.894 3.036 3.174 3.291 3.402 3.547 3.689 3.826 3.981 4.126 4.253 4.406 4.577 4.729 4.886 5.058 5.241 5.419 5.617 5.838 6.045 6.314 6.588 6.895 7.222 7.488 7.721 7.796 7.582 7.254 6.94 6.631 6.314 6.007 5.704 5.468 5.228 5.007 4.809 4.612 4.404 4.209 4.043 3.874 3.727 3.586 3.423 3.259 3.112 2.958 2.805 2.676 2.55 2.425 2.279 2.122 2.02 1.918 1.746 1.613 1.485 1.419 1.258 1.118 1.013 0.954 0.77 0.731 0.66 0.584 0.409 0.324 0.22 0.108 -0.001 -0.115 -0.277 -0.715 -8 ,11786 ,KEBNE ,16657711,Tue Nov 23 05:26:05 CET,Tue Nov 23 06:48:05 CET,0.0 0.165 0.31 0.438 0.561 0.694 0.811 0.905 1.047 1.112 1.191 1.241 1.422 1.492 1.621 1.745 1.869 1.922 2.023 2.124 2.272 2.372 2.459 2.564 2.67 2.791 2.903 3.009 3.16 3.29 3.417 3.577 3.727 3.872 4.054 4.241 4.403 4.591 4.79 5.002 5.202 5.433 5.719 5.95 6.179 6.431 6.708 6.973 7.184 7.327 7.341 7.161 6.878 6.58 6.262 5.907 5.568 5.254 4.98 4.719 4.484 4.26 4.045 3.82 3.605 3.419 3.211 3.037 2.892 2.735 2.584 2.466 2.335 2.178 2.06 1.945 1.829 1.705 1.552 1.433 1.311 1.156 1.06 0.945 0.877 0.741 0.602 0.436 0.345 0.142 0.105 0.028 -0.064 -0.269 -0.368 -0.478 -0.616 -0.776 -0.971 -1.163 -1.723 -9 ,20757 ,KEBNE ,16657712,Tue Nov 23 05:26:05 CET,Tue Nov 23 06:49:10 CET,0.0 0.357 0.562 0.731 0.874 1.006 1.128 1.231 1.426 1.527 1.617 1.683 1.886 1.965 2.099 2.226 2.35 2.409 2.53 2.638 2.804 2.927 3.028 3.151 3.282 3.409 3.529 3.639 3.794 3.944 4.076 4.246 4.412 4.556 4.71 4.886 5.047 5.234 5.451 5.663 5.879 6.101 6.345 6.608 6.876 7.154 7.481 7.779 8.056 8.234 8.232 7.952 7.604 7.237 6.872 6.572 6.295 5.999 5.706 5.408 5.149 4.908 4.649 4.41 4.208 4.024 3.815 3.622 3.457 3.288 3.115 2.968 2.825 2.656 2.509 2.358 2.214 2.077 1.939 1.84 1.735 1.56 1.432 1.295 1.23 1.114 0.967 0.787 0.705 0.499 0.399 0.282 0.178 -0.027 -0.128 -0.231 -0.348 -0.489 -0.628 -0.79 -1.226 -10 ,5993 ,KEBNE ,16657713,Tue Nov 23 05:26:05 CET,Tue Nov 23 06:48:27 CET,0.0 0.278 0.429 0.559 0.671 0.783 0.883 0.961 1.102 1.187 1.267 1.288 1.472 1.546 1.694 1.841 1.973 2.029 2.143 2.258 2.41 2.514 2.619 2.763 2.899 3.015 3.127 3.256 3.423 3.567 3.695 3.847 3.996 4.141 4.301 4.485 4.659 4.827 5.011 5.242 5.466 5.672 5.889 6.139 6.415 6.647 6.923 7.213 7.509 7.727 7.776 7.541 7.218 6.901 6.593 6.293 6.002 5.667 5.382 5.123 4.879 4.657 4.453 4.245 4.047 3.881 3.7 3.529 3.384 3.213 3.034 2.904 2.774 2.631 2.516 2.415 2.305 2.181 2.054 1.966 1.876 1.724 1.613 1.484 1.41 1.264 1.129 0.985 0.898 0.701 0.643 0.555 0.48 0.31 0.211 0.096 -0.013 -0.146 -0.31 -0.483 -0.812 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_289_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_289_336.txt deleted file mode 100644 index d2403b80..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_289_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31915 ,KEBNE ,16657714,Tue Nov 23 05:26:05 CET,Tue Nov 23 06:46:56 CET,0.0 0.46 0.636 0.778 0.864 0.913 1.001 1.108 1.275 1.339 1.39 1.386 1.56 1.61 1.695 1.778 1.861 1.898 1.967 2.04 2.168 2.265 2.34 2.441 2.563 2.677 2.779 2.889 3.047 3.184 3.309 3.465 3.607 3.694 3.782 3.889 3.966 4.035 4.123 4.207 4.279 4.387 4.498 4.576 4.662 4.724 4.69 4.55 4.326 3.94 3.134 1.982 0.958 0.099 -0.642 -1.323 -1.939 -2.493 -2.993 -3.509 -3.934 -4.285 -4.586 -4.887 -5.189 -5.452 -5.703 -5.942 -6.154 -6.379 -6.633 -6.845 -7.043 -7.221 -7.367 -7.536 -7.713 -7.891 -8.062 -8.171 -8.296 -8.511 -8.67 -8.833 -8.907 -9.065 -9.234 -9.4 -9.483 -9.71 -9.811 -9.917 -10.023 -10.288 -10.425 -10.554 -10.711 -10.898 -11.129 -11.399 -11.986 -2 ,13900 ,KEBNE ,16657715,Tue Nov 23 05:26:05 CET,Tue Nov 23 06:47:59 CET,0.0 0.389 0.571 0.715 0.831 0.93 1.032 1.13 1.283 1.363 1.437 1.454 1.633 1.697 1.832 1.955 2.042 2.078 2.161 2.262 2.411 2.501 2.597 2.725 2.851 2.961 3.047 3.124 3.207 3.301 3.383 3.474 3.577 3.684 3.817 3.949 4.047 4.156 4.293 4.453 4.593 4.691 4.777 4.883 4.978 5.039 5.076 5.019 4.836 4.463 3.657 2.524 1.519 0.659 -0.076 -0.744 -1.342 -1.865 -2.275 -2.693 -3.062 -3.383 -3.711 -4.042 -4.345 -4.613 -4.914 -5.19 -5.424 -5.665 -5.921 -6.135 -6.34 -6.564 -6.74 -6.918 -7.099 -7.282 -7.478 -7.605 -7.745 -7.979 -8.136 -8.298 -8.378 -8.526 -8.678 -8.86 -8.954 -9.177 -9.274 -9.392 -9.504 -9.726 -9.859 -10.0 -10.156 -10.337 -10.528 -10.745 -11.242 -3 ,14448 ,KEBNE ,16657716,Tue Nov 23 05:26:05 CET,Tue Nov 23 06:47:31 CET,0.0 0.252 0.427 0.599 0.729 0.814 0.887 0.972 1.126 1.211 1.288 1.306 1.484 1.551 1.677 1.773 1.87 1.936 2.054 2.134 2.264 2.352 2.434 2.546 2.639 2.743 2.85 2.938 3.051 3.155 3.268 3.402 3.49 3.58 3.682 3.788 3.902 4.026 4.122 4.221 4.343 4.436 4.519 4.605 4.651 4.647 4.619 4.535 4.383 4.039 3.17 2.044 1.054 0.179 -0.582 -1.294 -1.917 -2.472 -2.93 -3.376 -3.754 -4.097 -4.423 -4.731 -5.037 -5.307 -5.58 -5.819 -6.012 -6.217 -6.436 -6.616 -6.798 -6.992 -7.144 -7.3 -7.477 -7.66 -7.864 -8.0 -8.138 -8.363 -8.509 -8.663 -8.746 -8.92 -9.107 -9.291 -9.377 -9.597 -9.664 -9.767 -9.872 -10.084 -10.221 -10.384 -10.568 -10.785 -11.063 -11.356 -11.937 -4 ,13695 ,KEBNE ,16657717,Tue Nov 23 05:26:06 CET,Tue Nov 23 06:48:48 CET,0.0 0.446 0.647 0.788 0.913 1.018 1.108 1.202 1.37 1.449 1.523 1.518 1.687 1.75 1.875 1.984 2.069 2.111 2.208 2.298 2.41 2.48 2.538 2.635 2.726 2.817 2.908 2.999 3.121 3.223 3.322 3.434 3.515 3.628 3.754 3.837 3.918 4.019 4.12 4.208 4.299 4.376 4.431 4.512 4.597 4.629 4.65 4.612 4.41 3.957 3.158 2.156 1.28 0.486 -0.252 -0.894 -1.459 -1.966 -2.389 -2.817 -3.236 -3.616 -3.94 -4.224 -4.507 -4.811 -5.123 -5.388 -5.619 -5.852 -6.074 -6.247 -6.423 -6.626 -6.782 -6.92 -7.084 -7.272 -7.471 -7.615 -7.766 -7.993 -8.141 -8.286 -8.359 -8.512 -8.675 -8.832 -8.911 -9.124 -9.204 -9.308 -9.419 -9.664 -9.794 -9.935 -10.1 -10.283 -10.481 -10.753 -11.385 -5 ,12758 ,KEBNE ,16657718,Tue Nov 23 05:27:07 CET,Tue Nov 23 06:49:54 CET,0.0 0.338 0.558 0.749 0.887 0.995 1.088 1.168 1.313 1.396 1.47 1.486 1.675 1.735 1.84 1.957 2.067 2.12 2.222 2.331 2.474 2.554 2.633 2.737 2.842 2.938 3.024 3.113 3.225 3.314 3.388 3.493 3.613 3.712 3.802 3.911 3.999 4.084 4.186 4.29 4.392 4.508 4.632 4.748 4.852 4.933 4.985 4.924 4.741 4.386 3.596 2.479 1.497 0.656 -0.088 -0.754 -1.318 -1.849 -2.317 -2.773 -3.168 -3.511 -3.857 -4.2 -4.494 -4.758 -5.052 -5.312 -5.528 -5.754 -5.985 -6.174 -6.366 -6.56 -6.712 -6.884 -7.067 -7.252 -7.431 -7.551 -7.683 -7.892 -8.034 -8.192 -8.282 -8.468 -8.65 -8.825 -8.918 -9.155 -9.258 -9.373 -9.502 -9.779 -9.91 -10.054 -10.23 -10.407 -10.607 -10.852 -11.339 -6 ,26616 ,KEBNE ,16657719,Tue Nov 23 05:27:07 CET,Tue Nov 23 06:49:11 CET,0.0 0.268 0.403 0.541 0.673 0.771 0.851 0.923 1.046 1.112 1.183 1.22 1.41 1.476 1.581 1.665 1.742 1.791 1.897 1.981 2.107 2.194 2.257 2.351 2.447 2.518 2.59 2.689 2.809 2.893 2.975 3.074 3.167 3.262 3.364 3.479 3.573 3.654 3.748 3.857 3.967 4.061 4.166 4.298 4.417 4.458 4.437 4.335 4.128 3.731 2.874 1.766 0.853 0.013 -0.701 -1.338 -1.93 -2.513 -3.036 -3.535 -3.965 -4.33 -4.657 -4.958 -5.234 -5.494 -5.78 -6.044 -6.285 -6.532 -6.765 -6.969 -7.196 -7.424 -7.599 -7.789 -7.979 -8.181 -8.381 -8.511 -8.646 -8.856 -9.003 -9.164 -9.246 -9.403 -9.559 -9.72 -9.819 -10.051 -10.13 -10.244 -10.347 -10.595 -10.746 -10.885 -11.038 -11.203 -11.382 -11.67 -12.297 -7 ,1117 ,KEBNE ,16657720,Tue Nov 23 05:27:07 CET,Tue Nov 23 06:48:27 CET,0.0 0.564 0.775 0.889 0.986 1.082 1.162 1.227 1.369 1.446 1.514 1.523 1.685 1.735 1.827 1.92 2.018 2.068 2.147 2.212 2.321 2.396 2.475 2.584 2.676 2.771 2.854 2.931 3.048 3.172 3.282 3.425 3.559 3.649 3.748 3.862 3.973 4.098 4.225 4.321 4.411 4.529 4.622 4.67 4.671 4.623 4.579 4.499 4.317 3.959 3.197 2.109 1.197 0.423 -0.29 -0.972 -1.583 -2.112 -2.547 -3.012 -3.413 -3.763 -4.112 -4.435 -4.715 -5.002 -5.321 -5.564 -5.756 -5.967 -6.189 -6.369 -6.561 -6.763 -6.923 -7.116 -7.315 -7.504 -7.701 -7.831 -7.965 -8.162 -8.292 -8.449 -8.534 -8.705 -8.879 -9.057 -9.15 -9.369 -9.436 -9.534 -9.647 -9.895 -10.027 -10.172 -10.318 -10.479 -10.661 -10.879 -11.47 -8 ,11412 ,KEBNE ,16657721,Tue Nov 23 05:27:07 CET,Tue Nov 23 06:49:05 CET,0.0 0.42 0.605 0.716 0.821 0.927 1.016 1.109 1.271 1.349 1.42 1.407 1.57 1.615 1.733 1.856 1.965 2.013 2.092 2.169 2.297 2.382 2.459 2.586 2.713 2.813 2.907 3.002 3.119 3.216 3.289 3.377 3.47 3.556 3.652 3.757 3.844 3.912 3.998 4.117 4.229 4.316 4.396 4.473 4.535 4.565 4.556 4.504 4.319 3.935 3.152 2.089 1.208 0.414 -0.348 -1.041 -1.617 -2.12 -2.563 -3.003 -3.381 -3.733 -4.076 -4.404 -4.696 -4.952 -5.227 -5.47 -5.67 -5.881 -6.111 -6.305 -6.486 -6.678 -6.837 -6.986 -7.14 -7.314 -7.493 -7.606 -7.733 -7.959 -8.124 -8.286 -8.368 -8.539 -8.701 -8.858 -8.943 -9.163 -9.249 -9.366 -9.488 -9.772 -9.926 -10.081 -10.25 -10.436 -10.647 -10.879 -11.396 -9 ,28734 ,KEBNE ,16657722,Tue Nov 23 05:27:06 CET,Tue Nov 23 06:47:49 CET,0.0 0.278 0.448 0.569 0.666 0.752 0.832 0.912 1.084 1.155 1.222 1.248 1.435 1.507 1.637 1.763 1.882 1.944 2.066 2.167 2.297 2.369 2.431 2.527 2.639 2.752 2.852 2.936 3.024 3.096 3.154 3.251 3.353 3.438 3.533 3.634 3.749 3.868 3.963 4.051 4.124 4.2 4.301 4.376 4.412 4.44 4.45 4.39 4.258 3.946 3.137 1.902 0.856 -0.042 -0.794 -1.424 -1.974 -2.483 -2.946 -3.419 -3.822 -4.195 -4.536 -4.837 -5.11 -5.35 -5.603 -5.831 -6.036 -6.262 -6.49 -6.667 -6.882 -7.139 -7.326 -7.503 -7.671 -7.854 -8.047 -8.16 -8.28 -8.488 -8.638 -8.79 -8.867 -9.034 -9.2 -9.372 -9.467 -9.693 -9.797 -9.914 -10.024 -10.27 -10.41 -10.563 -10.739 -10.934 -11.163 -11.475 -12.19 -10 ,792 ,KEBNE ,16657723,Tue Nov 23 05:27:06 CET,Tue Nov 23 06:49:26 CET,0.0 0.345 0.498 0.618 0.737 0.851 0.959 1.081 1.318 1.409 1.491 1.533 1.706 1.752 1.837 1.951 2.057 2.095 2.189 2.294 2.451 2.54 2.614 2.741 2.878 3.003 3.093 3.185 3.321 3.453 3.57 3.69 3.813 3.949 4.099 4.211 4.32 4.465 4.625 4.786 4.92 5.056 5.181 5.28 5.427 5.533 5.56 5.531 5.404 5.049 4.274 3.197 2.202 1.323 0.554 -0.16 -0.76 -1.285 -1.753 -2.231 -2.636 -3.023 -3.395 -3.757 -4.106 -4.385 -4.654 -4.878 -5.079 -5.29 -5.503 -5.706 -5.927 -6.159 -6.336 -6.499 -6.675 -6.865 -7.052 -7.178 -7.309 -7.515 -7.662 -7.82 -7.908 -8.083 -8.263 -8.449 -8.541 -8.755 -8.808 -8.918 -9.036 -9.302 -9.47 -9.653 -9.816 -9.983 -10.183 -10.413 -10.984 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_164.txt deleted file mode 100644 index f4a74476..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23136 ,KEBNE ,16657724,Tue Nov 23 05:27:06 CET,Tue Nov 23 06:50:25 CET,0.0 0.276 0.451 0.572 0.667 0.777 0.883 0.972 1.127 1.204 1.277 1.312 1.455 1.519 1.638 1.747 1.856 1.911 2.024 2.13 2.251 2.323 2.398 2.502 2.602 2.685 2.754 2.814 2.882 2.958 3.021 3.08 3.15 3.208 3.256 3.3 3.325 3.345 3.36 3.343 3.299 3.228 3.109 2.958 2.73 2.424 1.987 1.307 0.325 -1.098 -3.411 -6.123 -8.301 -10.204 -11.887 -13.282 -14.437 -15.519 -16.444 -17.336 -18.062 -18.675 -19.258 -19.791 -20.29 -20.755 -21.232 -21.65 -22.002 -22.359 -22.715 -23.006 -23.317 -23.647 -23.895 -24.135 -24.385 -24.656 -24.934 -25.121 -25.31 -25.607 -25.822 -26.035 -26.14 -26.375 -26.622 -26.881 -27.02 -27.283 -27.48 -27.635 -27.804 -28.188 -28.382 -28.568 -28.77 -28.993 -29.222 -29.519 -30.23 -2 ,7801 ,KEBNE ,16657725,Tue Nov 23 05:27:06 CET,Tue Nov 23 06:50:47 CET,0.0 0.472 0.676 0.853 0.999 1.103 1.196 1.291 1.474 1.548 1.615 1.678 1.833 1.903 2.029 2.128 2.222 2.272 2.359 2.425 2.511 2.571 2.634 2.718 2.801 2.878 2.953 3.016 3.084 3.148 3.19 3.225 3.255 3.282 3.3 3.274 3.242 3.228 3.209 3.17 3.095 2.972 2.792 2.595 2.351 1.984 1.412 0.654 -0.434 -2.227 -5.157 -8.301 -10.681 -12.66 -14.365 -15.815 -17.027 -18.084 -18.979 -19.858 -20.604 -21.269 -21.892 -22.453 -22.959 -23.424 -23.903 -24.304 -24.643 -25.008 -25.377 -25.67 -25.97 -26.293 -26.546 -26.805 -27.073 -27.347 -27.615 -27.793 -27.981 -28.267 -28.473 -28.7 -28.809 -29.034 -29.28 -29.508 -29.614 -29.84 -29.991 -30.118 -30.251 -30.537 -30.682 -30.836 -31.005 -31.193 -31.399 -31.64 -32.141 -3 ,25534 ,KEBNE ,16657726,Tue Nov 23 05:27:06 CET,Tue Nov 23 06:49:37 CET,0.0 0.418 0.66 0.807 0.929 1.048 1.144 1.223 1.378 1.453 1.527 1.58 1.722 1.776 1.879 1.968 2.06 2.108 2.191 2.258 2.346 2.392 2.433 2.489 2.543 2.606 2.66 2.704 2.744 2.75 2.746 2.748 2.733 2.699 2.644 2.589 2.541 2.505 2.474 2.407 2.302 2.15 1.952 1.705 1.341 0.853 0.191 -0.643 -1.798 -3.546 -6.34 -9.404 -11.761 -13.676 -15.268 -16.686 -17.951 -19.015 -19.841 -20.644 -21.338 -21.959 -22.518 -23.006 -23.443 -23.858 -24.314 -24.705 -25.032 -25.376 -25.733 -26.029 -26.337 -26.637 -26.855 -27.081 -27.323 -27.564 -27.802 -27.968 -28.142 -28.422 -28.627 -28.847 -28.963 -29.193 -29.4 -29.615 -29.732 -29.978 -30.139 -30.27 -30.414 -30.719 -30.879 -31.056 -31.261 -31.485 -31.72 -32.035 -32.608 -4 ,12526 ,KEBNE ,16657727,Tue Nov 23 05:27:07 CET,Tue Nov 23 06:49:32 CET,0.0 0.461 0.643 0.745 0.823 0.91 0.984 1.068 1.236 1.298 1.359 1.386 1.519 1.574 1.684 1.787 1.872 1.911 1.985 2.064 2.179 2.243 2.295 2.359 2.423 2.478 2.531 2.593 2.67 2.734 2.79 2.853 2.904 2.946 2.988 3.029 3.051 3.046 3.026 3.012 2.984 2.9 2.769 2.631 2.441 2.147 1.742 1.014 -0.304 -2.247 -5.236 -8.562 -11.035 -13.013 -14.681 -16.166 -17.439 -18.535 -19.432 -20.285 -21.006 -21.625 -22.193 -22.76 -23.274 -23.705 -24.157 -24.562 -24.92 -25.279 -25.645 -25.951 -26.253 -26.559 -26.797 -27.054 -27.313 -27.573 -27.839 -28.02 -28.209 -28.5 -28.699 -28.9 -29.004 -29.223 -29.47 -29.724 -29.855 -30.106 -30.289 -30.452 -30.603 -30.907 -31.075 -31.247 -31.448 -31.672 -31.927 -32.186 -32.781 -5 ,26864 ,KEBNE ,16657728,Tue Nov 23 05:27:07 CET,Tue Nov 23 06:50:00 CET,0.0 0.332 0.468 0.587 0.7 0.801 0.874 0.948 1.111 1.203 1.281 1.301 1.444 1.505 1.605 1.694 1.772 1.809 1.884 1.957 2.06 2.114 2.168 2.253 2.313 2.373 2.441 2.498 2.567 2.632 2.69 2.743 2.784 2.832 2.881 2.908 2.918 2.935 2.944 2.932 2.907 2.845 2.72 2.564 2.331 2.025 1.59 0.982 0.091 -1.335 -3.693 -6.556 -8.987 -10.98 -12.623 -14.023 -15.162 -16.161 -17.015 -17.892 -18.634 -19.265 -19.868 -20.414 -20.887 -21.317 -21.766 -22.157 -22.486 -22.843 -23.214 -23.497 -23.783 -24.092 -24.337 -24.592 -24.843 -25.086 -25.342 -25.522 -25.701 -25.984 -26.179 -26.376 -26.481 -26.699 -26.93 -27.18 -27.316 -27.576 -27.783 -27.942 -28.088 -28.407 -28.586 -28.756 -28.941 -29.17 -29.436 -29.794 -30.789 -6 ,23568 ,KEBNE ,16657729,Tue Nov 23 05:27:06 CET,Tue Nov 23 06:49:10 CET,0.0 0.444 0.619 0.744 0.864 0.985 1.089 1.174 1.319 1.386 1.456 1.517 1.669 1.734 1.847 1.959 2.063 2.104 2.178 2.255 2.369 2.442 2.509 2.592 2.667 2.734 2.79 2.828 2.885 2.951 2.997 3.055 3.106 3.139 3.169 3.199 3.221 3.23 3.227 3.191 3.14 3.093 3.002 2.841 2.617 2.345 1.934 1.307 0.374 -1.083 -3.507 -6.333 -8.558 -10.316 -11.734 -13.033 -14.162 -15.133 -15.979 -16.794 -17.477 -18.086 -18.657 -19.185 -19.662 -20.087 -20.538 -20.95 -21.305 -21.669 -22.029 -22.314 -22.612 -22.933 -23.187 -23.441 -23.708 -23.985 -24.257 -24.445 -24.644 -24.949 -25.157 -25.362 -25.462 -25.671 -25.888 -26.116 -26.241 -26.49 -26.676 -26.823 -26.956 -27.254 -27.432 -27.611 -27.811 -28.032 -28.257 -28.59 -29.314 -7 ,16757 ,KEBNE ,16657730,Tue Nov 23 05:27:06 CET,Tue Nov 23 06:50:37 CET,0.0 0.63 0.808 0.943 1.057 1.169 1.257 1.334 1.492 1.572 1.638 1.656 1.796 1.855 1.951 2.04 2.133 2.181 2.274 2.355 2.446 2.508 2.572 2.648 2.726 2.802 2.861 2.915 2.986 3.043 3.091 3.146 3.192 3.238 3.286 3.337 3.36 3.356 3.342 3.322 3.302 3.241 3.127 2.978 2.758 2.436 1.997 1.381 0.458 -0.883 -3.144 -5.935 -8.124 -9.942 -11.471 -12.849 -14.063 -15.138 -16.033 -16.862 -17.548 -18.176 -18.816 -19.392 -19.895 -20.347 -20.805 -21.195 -21.529 -21.878 -22.234 -22.537 -22.843 -23.151 -23.393 -23.633 -23.882 -24.148 -24.427 -24.614 -24.798 -25.102 -25.316 -25.522 -25.629 -25.857 -26.106 -26.355 -26.484 -26.729 -26.89 -27.031 -27.168 -27.475 -27.651 -27.841 -28.052 -28.268 -28.496 -28.783 -29.69 -8 ,32108 ,KEBNE ,16657731,Tue Nov 23 05:28:08 CET,Tue Nov 23 06:51:09 CET,0.0 0.247 0.425 0.588 0.736 0.861 0.969 1.055 1.193 1.262 1.327 1.38 1.531 1.591 1.708 1.807 1.898 1.945 2.032 2.102 2.195 2.255 2.314 2.396 2.468 2.54 2.611 2.678 2.764 2.849 2.917 2.973 3.034 3.098 3.152 3.211 3.256 3.276 3.271 3.254 3.247 3.233 3.173 3.063 2.874 2.583 2.13 1.477 0.542 -0.838 -3.118 -5.957 -8.254 -10.279 -12.039 -13.513 -14.754 -15.852 -16.763 -17.655 -18.44 -19.118 -19.736 -20.317 -20.848 -21.305 -21.794 -22.237 -22.59 -22.941 -23.311 -23.614 -23.914 -24.243 -24.504 -24.759 -25.011 -25.271 -25.545 -25.736 -25.927 -26.222 -26.426 -26.629 -26.742 -26.984 -27.218 -27.459 -27.585 -27.828 -27.992 -28.14 -28.304 -28.647 -28.833 -29.032 -29.238 -29.474 -29.744 -30.065 -30.724 -9 ,11008 ,KEBNE ,16657732,Tue Nov 23 05:28:08 CET,Tue Nov 23 06:50:45 CET,0.0 0.488 0.675 0.807 0.918 1.037 1.128 1.207 1.353 1.427 1.506 1.546 1.68 1.728 1.817 1.915 2.003 2.043 2.126 2.204 2.306 2.369 2.436 2.517 2.576 2.633 2.685 2.732 2.784 2.819 2.852 2.881 2.909 2.938 2.959 2.979 2.989 2.991 2.989 2.976 2.928 2.845 2.725 2.549 2.264 1.899 1.418 0.774 -0.165 -1.609 -3.999 -6.698 -8.791 -10.586 -12.139 -13.483 -14.599 -15.625 -16.51 -17.355 -18.04 -18.627 -19.211 -19.746 -20.215 -20.651 -21.107 -21.512 -21.844 -22.181 -22.532 -22.823 -23.125 -23.428 -23.659 -23.886 -24.103 -24.329 -24.569 -24.734 -24.91 -25.18 -25.37 -25.566 -25.662 -25.851 -26.056 -26.265 -26.366 -26.591 -26.742 -26.876 -27.004 -27.268 -27.414 -27.579 -27.765 -28.006 -28.27 -28.579 -29.114 -10 ,20129 ,KEBNE ,16657733,Tue Nov 23 05:28:08 CET,Tue Nov 23 06:51:42 CET,0.0 0.423 0.618 0.777 0.932 1.087 1.213 1.295 1.449 1.528 1.593 1.635 1.779 1.827 1.936 2.04 2.118 2.159 2.233 2.306 2.416 2.48 2.543 2.628 2.701 2.774 2.843 2.904 2.975 3.037 3.093 3.145 3.204 3.265 3.31 3.352 3.372 3.379 3.388 3.371 3.325 3.242 3.142 3.022 2.804 2.454 1.939 1.288 0.386 -1.012 -3.305 -5.922 -7.999 -9.75 -11.21 -12.547 -13.727 -14.747 -15.583 -16.406 -17.142 -17.794 -18.386 -18.921 -19.407 -19.836 -20.28 -20.673 -21.013 -21.357 -21.701 -22.001 -22.312 -22.622 -22.866 -23.119 -23.381 -23.658 -23.937 -24.12 -24.308 -24.594 -24.78 -24.97 -25.074 -25.298 -25.523 -25.749 -25.866 -26.105 -26.279 -26.415 -26.556 -26.874 -27.049 -27.231 -27.442 -27.673 -27.922 -28.24 -28.853 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_165.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_165.txt deleted file mode 100644 index 4cf55d50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_165.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12848 ,KEBNE ,16657734,Tue Nov 23 05:28:10 CET,Tue Nov 23 06:51:35 CET,0.0 0.193 0.323 0.407 0.484 0.552 0.612 0.673 0.777 0.816 0.849 0.844 0.959 0.982 1.034 1.092 1.142 1.158 1.182 1.204 1.231 1.255 1.282 1.31 1.324 1.337 1.349 1.355 1.356 1.358 1.358 1.347 1.326 1.306 1.278 1.228 1.164 1.074 0.959 0.825 0.668 0.474 0.22 -0.065 -0.441 -0.943 -1.623 -2.524 -3.791 -5.603 -8.385 -11.448 -13.785 -15.654 -17.198 -18.497 -19.576 -20.531 -21.33 -22.11 -22.778 -23.356 -23.877 -24.355 -24.811 -25.23 -25.669 -26.048 -26.36 -26.676 -27.022 -27.332 -27.626 -27.909 -28.127 -28.351 -28.6 -28.871 -29.148 -29.33 -29.505 -29.751 -29.929 -30.118 -30.215 -30.435 -30.646 -30.856 -30.977 -31.228 -31.364 -31.484 -31.602 -31.87 -32.031 -32.194 -32.362 -32.557 -32.778 -33.015 -33.453 -2 ,15246 ,KEBNE ,16657735,Tue Nov 23 05:28:08 CET,Tue Nov 23 06:51:31 CET,0.0 0.343 0.458 0.532 0.594 0.646 0.693 0.748 0.814 0.845 0.879 0.849 0.956 0.974 1.01 1.045 1.08 1.099 1.135 1.163 1.183 1.202 1.241 1.305 1.345 1.375 1.413 1.438 1.452 1.457 1.461 1.454 1.436 1.42 1.396 1.363 1.308 1.23 1.131 0.994 0.832 0.631 0.368 0.069 -0.351 -0.89 -1.564 -2.46 -3.748 -5.604 -8.431 -11.48 -13.813 -15.746 -17.335 -18.684 -19.804 -20.751 -21.541 -22.295 -22.938 -23.507 -24.052 -24.57 -25.024 -25.421 -25.826 -26.181 -26.496 -26.824 -27.143 -27.401 -27.666 -27.931 -28.149 -28.378 -28.592 -28.797 -29.018 -29.173 -29.337 -29.606 -29.783 -29.961 -30.055 -30.241 -30.435 -30.642 -30.746 -30.974 -31.092 -31.207 -31.326 -31.625 -31.774 -31.925 -32.094 -32.257 -32.432 -32.686 -33.184 -3 ,19141 ,KEBNE ,16657736,Tue Nov 23 05:28:08 CET,Tue Nov 23 06:51:19 CET,0.0 0.388 0.542 0.683 0.803 0.889 0.943 0.991 1.076 1.105 1.141 1.133 1.249 1.277 1.333 1.389 1.431 1.446 1.483 1.521 1.572 1.603 1.622 1.656 1.684 1.693 1.7 1.708 1.72 1.726 1.722 1.72 1.714 1.691 1.668 1.65 1.61 1.534 1.434 1.311 1.155 0.965 0.719 0.409 -0.011 -0.542 -1.228 -2.121 -3.351 -5.099 -7.862 -10.914 -13.247 -15.157 -16.738 -18.075 -19.164 -20.101 -20.912 -21.715 -22.384 -22.945 -23.475 -23.97 -24.42 -24.822 -25.227 -25.577 -25.875 -26.194 -26.515 -26.772 -27.037 -27.298 -27.492 -27.705 -27.933 -28.158 -28.392 -28.548 -28.704 -28.949 -29.111 -29.28 -29.372 -29.561 -29.752 -29.972 -30.097 -30.331 -30.441 -30.57 -30.707 -30.983 -31.121 -31.261 -31.403 -31.549 -31.717 -31.929 -32.355 -4 ,29894 ,KEBNE ,16657737,Tue Nov 23 05:28:09 CET,Tue Nov 23 06:51:07 CET,0.0 0.249 0.375 0.454 0.534 0.608 0.659 0.711 0.828 0.882 0.92 0.9 1.016 1.047 1.107 1.146 1.178 1.193 1.22 1.247 1.288 1.316 1.343 1.368 1.381 1.402 1.418 1.435 1.453 1.452 1.478 1.517 1.516 1.494 1.45 1.401 1.347 1.254 1.126 0.985 0.827 0.637 0.388 0.086 -0.322 -0.856 -1.568 -2.489 -3.747 -5.542 -8.374 -11.506 -13.92 -15.873 -17.473 -18.823 -19.942 -20.899 -21.668 -22.406 -23.039 -23.616 -24.163 -24.662 -25.122 -25.534 -25.95 -26.334 -26.669 -27.0 -27.344 -27.626 -27.915 -28.204 -28.419 -28.641 -28.882 -29.14 -29.401 -29.574 -29.749 -30.031 -30.214 -30.386 -30.471 -30.668 -30.893 -31.131 -31.245 -31.479 -31.599 -31.722 -31.851 -32.133 -32.282 -32.443 -32.621 -32.814 -33.021 -33.275 -34.001 -5 ,20619 ,KEBNE ,16657738,Tue Nov 23 05:28:08 CET,Tue Nov 23 06:51:51 CET,0.0 0.174 0.304 0.407 0.492 0.559 0.624 0.678 0.765 0.812 0.858 0.86 0.983 1.015 1.066 1.117 1.166 1.186 1.22 1.241 1.261 1.28 1.301 1.323 1.349 1.368 1.367 1.379 1.429 1.457 1.445 1.436 1.433 1.417 1.384 1.333 1.283 1.223 1.144 1.042 0.9 0.701 0.458 0.175 -0.223 -0.726 -1.394 -2.288 -3.525 -5.269 -8.015 -11.036 -13.358 -15.248 -16.764 -18.036 -19.108 -20.028 -20.793 -21.549 -22.191 -22.754 -23.287 -23.787 -24.271 -24.705 -25.136 -25.521 -25.832 -26.14 -26.472 -26.739 -27.0 -27.271 -27.49 -27.712 -27.926 -28.137 -28.358 -28.519 -28.691 -28.95 -29.128 -29.305 -29.386 -29.553 -29.725 -29.911 -30.011 -30.228 -30.313 -30.427 -30.548 -30.77 -30.885 -31.011 -31.16 -31.373 -31.613 -31.872 -32.744 -6 ,23393 ,KEBNE ,16657739,Tue Nov 23 05:28:07 CET,Tue Nov 23 06:50:52 CET,0.0 0.216 0.362 0.469 0.567 0.652 0.718 0.789 0.886 0.916 0.95 0.938 1.055 1.084 1.133 1.183 1.233 1.251 1.287 1.33 1.385 1.414 1.446 1.494 1.532 1.56 1.577 1.591 1.601 1.6 1.588 1.578 1.568 1.559 1.536 1.471 1.398 1.323 1.225 1.086 0.921 0.711 0.446 0.155 -0.23 -0.722 -1.392 -2.286 -3.551 -5.357 -8.186 -11.328 -13.688 -15.549 -17.086 -18.383 -19.432 -20.369 -21.164 -21.924 -22.562 -23.131 -23.654 -24.115 -24.531 -24.915 -25.314 -25.655 -25.951 -26.259 -26.59 -26.851 -27.11 -27.397 -27.629 -27.86 -28.077 -28.289 -28.514 -28.667 -28.812 -29.054 -29.22 -29.385 -29.48 -29.675 -29.866 -30.068 -30.177 -30.4 -30.488 -30.604 -30.728 -30.996 -31.15 -31.323 -31.482 -31.637 -31.842 -32.093 -32.678 -7 ,31547 ,KEBNE ,16657740,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:52:24 CET,0.0 0.237 0.394 0.508 0.61 0.685 0.739 0.784 0.89 0.94 0.977 0.955 1.066 1.094 1.151 1.187 1.225 1.248 1.291 1.325 1.364 1.389 1.406 1.425 1.441 1.444 1.449 1.461 1.498 1.555 1.574 1.552 1.523 1.492 1.464 1.427 1.368 1.29 1.208 1.107 0.958 0.757 0.482 0.176 -0.217 -0.728 -1.42 -2.333 -3.602 -5.399 -8.214 -11.336 -13.715 -15.622 -17.202 -18.558 -19.682 -20.65 -21.479 -22.288 -22.973 -23.595 -24.174 -24.696 -25.167 -25.583 -26.013 -26.441 -26.821 -27.171 -27.531 -27.826 -28.122 -28.431 -28.663 -28.895 -29.121 -29.339 -29.574 -29.74 -29.906 -30.178 -30.361 -30.542 -30.632 -30.815 -31.018 -31.219 -31.323 -31.556 -31.675 -31.796 -31.925 -32.186 -32.316 -32.471 -32.655 -32.827 -33.014 -33.291 -33.803 -8 ,18342 ,KEBNE ,16657741,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:52:38 CET,0.0 0.23 0.334 0.409 0.474 0.525 0.586 0.652 0.769 0.816 0.847 0.851 0.983 1.021 1.105 1.184 1.242 1.26 1.296 1.344 1.41 1.439 1.46 1.477 1.485 1.498 1.518 1.532 1.536 1.528 1.522 1.515 1.51 1.5 1.472 1.43 1.376 1.295 1.193 1.064 0.914 0.732 0.47 0.155 -0.249 -0.743 -1.416 -2.319 -3.584 -5.421 -8.2 -11.204 -13.532 -15.437 -16.983 -18.292 -19.41 -20.357 -21.147 -21.928 -22.579 -23.141 -23.663 -24.16 -24.612 -25.01 -25.422 -25.787 -26.113 -26.446 -26.806 -27.122 -27.434 -27.726 -27.934 -28.145 -28.363 -28.582 -28.813 -28.976 -29.137 -29.397 -29.577 -29.764 -29.855 -30.022 -30.195 -30.396 -30.503 -30.722 -30.834 -30.951 -31.079 -31.364 -31.5 -31.633 -31.777 -31.953 -32.159 -32.391 -32.755 -9 ,17328 ,KEBNE ,16657742,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:52:44 CET,0.0 0.096 0.219 0.352 0.459 0.549 0.621 0.667 0.733 0.766 0.798 0.786 0.895 0.914 0.948 0.984 1.034 1.052 1.07 1.09 1.117 1.134 1.149 1.168 1.176 1.169 1.164 1.165 1.158 1.142 1.128 1.113 1.105 1.079 1.014 0.941 0.857 0.753 0.654 0.525 0.355 0.128 -0.181 -0.513 -0.951 -1.528 -2.31 -3.291 -4.639 -6.602 -9.625 -12.957 -15.515 -17.627 -19.317 -20.764 -22.024 -23.096 -23.976 -24.827 -25.554 -26.185 -26.775 -27.317 -27.801 -28.237 -28.703 -29.124 -29.454 -29.778 -30.121 -30.394 -30.665 -30.949 -31.167 -31.391 -31.635 -31.89 -32.154 -32.334 -32.521 -32.822 -33.028 -33.23 -33.326 -33.521 -33.742 -33.981 -34.102 -34.35 -34.51 -34.651 -34.783 -35.075 -35.226 -35.374 -35.543 -35.735 -35.941 -36.233 -36.957 -10 ,4360 ,KEBNE ,16657743,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:50:35 CET,0.0 0.294 0.406 0.51 0.613 0.701 0.772 0.84 0.939 0.982 1.026 1.011 1.123 1.16 1.227 1.282 1.323 1.337 1.365 1.391 1.428 1.445 1.457 1.478 1.5 1.511 1.53 1.55 1.56 1.565 1.559 1.547 1.529 1.503 1.468 1.407 1.34 1.264 1.168 1.093 1.007 0.827 0.548 0.209 -0.224 -0.757 -1.461 -2.4 -3.696 -5.532 -8.382 -11.496 -13.868 -15.726 -17.232 -18.543 -19.665 -20.64 -21.433 -22.191 -22.828 -23.385 -23.901 -24.407 -24.882 -25.267 -25.647 -25.994 -26.299 -26.626 -26.949 -27.216 -27.495 -27.768 -27.972 -28.183 -28.4 -28.622 -28.846 -28.998 -29.153 -29.378 -29.538 -29.719 -29.817 -30.025 -30.226 -30.429 -30.534 -30.755 -30.849 -30.962 -31.082 -31.338 -31.469 -31.6 -31.744 -31.895 -32.051 -32.239 -32.957 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_227.txt deleted file mode 100644 index 308f4450..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11803 ,TETRA ,17667914,Fri Dec 3 06:08:45 CET,Fri Dec 3 07:52:23 CET,0.0 0.298 0.459 0.583 0.689 0.796 0.884 0.972 1.172 1.266 1.349 1.427 1.605 1.694 1.854 1.997 2.132 2.202 2.338 2.455 2.611 2.712 2.819 2.982 3.145 3.296 3.44 3.587 3.781 3.977 4.172 4.394 4.59 4.766 4.976 5.235 5.479 5.728 6.011 6.308 6.59 6.897 7.255 7.614 8.075 8.599 9.159 9.809 10.512 11.32 12.23 12.754 12.995 13.078 13.038 12.95 12.828 12.699 12.58 12.45 12.328 12.203 12.071 11.949 11.826 11.707 11.593 11.487 11.387 11.287 11.184 11.09 10.973 10.849 10.772 10.681 10.586 10.498 10.396 10.319 10.23 10.091 10.0 9.91 9.866 9.772 9.67 9.565 9.503 9.365 9.315 9.238 9.149 8.993 8.926 8.834 8.712 8.584 8.44 8.247 7.788 -2 ,18677 ,TETRA ,17667915,Fri Dec 3 06:08:47 CET,Fri Dec 3 07:52:42 CET,0.0 0.374 0.565 0.711 0.861 0.999 1.113 1.218 1.415 1.499 1.577 1.632 1.78 1.846 1.979 2.115 2.252 2.313 2.434 2.551 2.727 2.849 2.975 3.148 3.301 3.449 3.582 3.706 3.865 4.02 4.168 4.341 4.519 4.708 4.927 5.175 5.416 5.656 5.906 6.182 6.481 6.793 7.147 7.509 7.92 8.378 8.904 9.492 10.143 10.905 11.758 12.341 12.583 12.619 12.574 12.495 12.374 12.241 12.13 11.981 11.835 11.715 11.593 11.448 11.3 11.183 11.071 10.97 10.874 10.759 10.638 10.54 10.439 10.33 10.234 10.141 10.051 9.955 9.85 9.78 9.704 9.551 9.438 9.329 9.277 9.174 9.041 8.909 8.856 8.714 8.623 8.537 8.463 8.334 8.246 8.119 7.996 7.886 7.727 7.497 7.089 -3 ,25959 ,TETRA ,17667916,Fri Dec 3 06:08:49 CET,Fri Dec 3 07:53:14 CET,0.0 0.342 0.53 0.702 0.851 0.974 1.08 1.179 1.377 1.452 1.522 1.588 1.743 1.811 1.942 2.082 2.216 2.284 2.422 2.539 2.694 2.799 2.903 3.065 3.231 3.393 3.552 3.7 3.884 4.066 4.236 4.419 4.591 4.773 4.993 5.248 5.508 5.779 6.042 6.314 6.628 7.027 7.478 7.871 8.303 8.771 9.291 9.889 10.554 11.219 11.956 12.501 12.679 12.646 12.553 12.419 12.289 12.156 12.023 11.877 11.729 11.585 11.428 11.269 11.119 10.985 10.844 10.684 10.525 10.398 10.284 10.173 10.052 9.929 9.84 9.748 9.652 9.539 9.414 9.336 9.255 9.111 9.002 8.895 8.845 8.752 8.647 8.521 8.441 8.283 8.199 8.129 8.059 7.883 7.79 7.694 7.58 7.455 7.295 7.063 6.415 -4 ,14234 ,TETRA ,17667917,Fri Dec 3 06:08:50 CET,Fri Dec 3 07:52:52 CET,0.0 0.506 0.723 0.888 1.021 1.136 1.25 1.351 1.528 1.621 1.705 1.775 1.94 2.016 2.152 2.304 2.454 2.518 2.646 2.776 2.954 3.062 3.166 3.328 3.484 3.628 3.753 3.878 4.048 4.2 4.361 4.57 4.768 4.952 5.162 5.397 5.617 5.863 6.124 6.403 6.722 7.074 7.457 7.858 8.308 8.776 9.293 9.869 10.519 11.242 12.037 12.545 12.744 12.832 12.821 12.721 12.57 12.395 12.247 12.081 11.924 11.804 11.684 11.555 11.426 11.297 11.149 11.016 10.897 10.766 10.631 10.51 10.39 10.264 10.171 10.074 9.957 9.845 9.734 9.655 9.565 9.413 9.307 9.19 9.133 9.013 8.882 8.749 8.685 8.541 8.448 8.363 8.285 8.134 8.048 7.964 7.855 7.722 7.574 7.345 6.996 -5 ,20387 ,TETRA ,17667918,Fri Dec 3 06:08:47 CET,Fri Dec 3 07:52:43 CET,0.0 0.796 1.042 1.235 1.387 1.528 1.681 1.815 2.032 2.124 2.207 2.275 2.437 2.514 2.645 2.773 2.906 2.979 3.125 3.26 3.465 3.594 3.712 3.876 4.037 4.186 4.328 4.48 4.676 4.851 5.011 5.2 5.398 5.583 5.778 6.021 6.261 6.506 6.786 7.091 7.404 7.762 8.159 8.546 8.999 9.481 10.065 10.748 11.443 12.171 13.049 13.649 13.891 13.989 14.018 13.965 13.859 13.701 13.559 13.425 13.29 13.182 13.062 12.919 12.796 12.671 12.522 12.41 12.322 12.223 12.118 12.027 11.92 11.81 11.725 11.63 11.543 11.442 11.325 11.248 11.164 11.048 10.96 10.86 10.81 10.699 10.599 10.49 10.426 10.29 10.216 10.126 10.028 9.844 9.741 9.644 9.553 9.438 9.286 9.034 8.027 -6 ,6244 ,TETRA ,17667919,Fri Dec 3 06:08:45 CET,Fri Dec 3 07:52:50 CET,0.0 0.498 0.706 0.859 0.979 1.087 1.187 1.288 1.492 1.582 1.665 1.75 1.915 1.996 2.156 2.303 2.428 2.496 2.629 2.75 2.929 3.041 3.143 3.304 3.464 3.607 3.754 3.898 4.069 4.228 4.401 4.611 4.792 4.963 5.167 5.402 5.638 5.908 6.17 6.44 6.743 7.082 7.479 7.883 8.34 8.853 9.448 10.073 10.814 11.65 12.46 12.992 13.257 13.336 13.297 13.216 13.126 13.019 12.904 12.776 12.653 12.533 12.409 12.267 12.123 11.995 11.852 11.726 11.6 11.463 11.339 11.237 11.118 10.999 10.918 10.822 10.713 10.605 10.493 10.411 10.328 10.185 10.082 9.983 9.936 9.836 9.716 9.603 9.542 9.397 9.339 9.268 9.194 9.047 8.957 8.852 8.723 8.567 8.414 8.205 7.78 -7 ,32736 ,TETRA ,17667920,Fri Dec 3 06:09:15 CET,Fri Dec 3 07:53:29 CET,0.0 0.57 0.813 0.998 1.158 1.291 1.418 1.537 1.747 1.842 1.936 2.028 2.186 2.259 2.405 2.537 2.653 2.713 2.829 2.936 3.088 3.189 3.294 3.446 3.595 3.749 3.9 4.043 4.214 4.386 4.57 4.785 4.995 5.19 5.409 5.652 5.875 6.114 6.371 6.66 6.985 7.324 7.714 8.129 8.593 9.127 9.767 10.41 11.11 11.891 12.699 13.296 13.522 13.591 13.596 13.519 13.431 13.36 13.286 13.193 13.076 12.94 12.816 12.702 12.577 12.449 12.27 12.119 12.024 11.925 11.822 11.737 11.634 11.514 11.418 11.305 11.19 11.084 10.976 10.895 10.806 10.675 10.584 10.481 10.431 10.349 10.25 10.126 10.069 9.943 9.905 9.836 9.763 9.628 9.544 9.432 9.307 9.169 9.005 8.822 8.568 -8 ,16509 ,TETRA ,17667921,Fri Dec 3 06:09:12 CET,Fri Dec 3 07:54:20 CET,0.0 0.493 0.684 0.829 0.953 1.072 1.193 1.306 1.525 1.624 1.712 1.785 1.931 2.005 2.155 2.287 2.415 2.476 2.595 2.706 2.864 2.964 3.078 3.236 3.361 3.489 3.633 3.782 3.965 4.126 4.277 4.461 4.647 4.835 5.053 5.294 5.524 5.774 6.041 6.328 6.625 6.938 7.292 7.656 8.103 8.621 9.181 9.759 10.431 11.186 11.954 12.423 12.581 12.578 12.55 12.511 12.421 12.297 12.165 12.012 11.871 11.742 11.591 11.443 11.305 11.186 11.074 10.95 10.831 10.705 10.567 10.45 10.328 10.191 10.083 9.99 9.899 9.799 9.678 9.591 9.513 9.394 9.297 9.184 9.128 9.033 8.944 8.837 8.775 8.626 8.552 8.479 8.397 8.244 8.166 8.084 7.985 7.867 7.728 7.524 7.169 -9 ,26680 ,TETRA ,17667922,Fri Dec 3 06:09:12 CET,Fri Dec 3 07:53:00 CET,0.0 0.267 0.431 0.595 0.741 0.875 0.992 1.098 1.286 1.371 1.461 1.572 1.743 1.824 1.966 2.096 2.227 2.292 2.42 2.545 2.731 2.85 2.96 3.122 3.28 3.432 3.568 3.696 3.866 4.033 4.213 4.441 4.662 4.872 5.092 5.319 5.576 5.883 6.174 6.48 6.791 7.119 7.515 7.917 8.384 8.911 9.508 10.112 10.799 11.549 12.397 13.05 13.306 13.37 13.358 13.275 13.156 13.002 12.84 12.68 12.553 12.443 12.334 12.201 12.056 11.923 11.78 11.65 11.529 11.399 11.268 11.171 11.062 10.944 10.857 10.758 10.665 10.57 10.459 10.376 10.289 10.16 10.066 9.979 9.926 9.81 9.707 9.594 9.527 9.39 9.342 9.256 9.174 9.014 8.93 8.848 8.739 8.592 8.407 8.201 7.898 -10 ,12702 ,TETRA ,17667923,Fri Dec 3 06:09:14 CET,Fri Dec 3 07:53:39 CET,0.0 0.298 0.56 0.771 0.937 1.056 1.166 1.26 1.422 1.512 1.607 1.708 1.87 1.947 2.103 2.25 2.393 2.465 2.605 2.735 2.912 3.02 3.129 3.294 3.451 3.601 3.738 3.854 4.004 4.168 4.332 4.545 4.763 4.968 5.198 5.442 5.663 5.913 6.187 6.479 6.777 7.106 7.485 7.862 8.275 8.7 9.232 9.882 10.582 11.339 12.233 12.83 13.051 13.123 13.098 13.01 12.888 12.751 12.616 12.47 12.347 12.221 12.084 11.959 11.833 11.713 11.591 11.463 11.336 11.215 11.111 11.022 10.898 10.754 10.658 10.545 10.415 10.3 10.17 10.077 9.988 9.839 9.741 9.638 9.59 9.497 9.387 9.271 9.195 9.043 8.975 8.895 8.816 8.634 8.525 8.419 8.312 8.201 8.069 7.864 7.351 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_235.txt deleted file mode 100644 index 8df5f71b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30554 ,KEBNE ,16657744,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:52:10 CET,0.0 0.662 0.929 1.073 1.205 1.353 1.468 1.548 1.7 1.777 1.838 1.859 1.997 2.044 2.139 2.234 2.302 2.331 2.396 2.454 2.53 2.587 2.654 2.739 2.804 2.872 2.951 3.022 3.086 3.148 3.215 3.265 3.286 3.315 3.368 3.424 3.46 3.479 3.478 3.466 3.451 3.43 3.373 3.302 3.192 2.94 2.551 2.028 1.294 0.202 -1.616 -3.74 -5.397 -6.791 -7.972 -9.007 -9.881 -10.647 -11.304 -11.934 -12.463 -12.933 -13.371 -13.773 -14.134 -14.458 -14.814 -15.131 -15.387 -15.66 -15.951 -16.191 -16.438 -16.676 -16.86 -17.054 -17.259 -17.479 -17.692 -17.836 -17.982 -18.2 -18.366 -18.547 -18.628 -18.787 -18.96 -19.142 -19.229 -19.435 -19.578 -19.703 -19.822 -20.049 -20.17 -20.317 -20.482 -20.657 -20.872 -21.109 -21.625 -2 ,30645 ,KEBNE ,16657745,Tue Nov 23 05:29:08 CET,Tue Nov 23 06:50:23 CET,0.0 0.238 0.395 0.545 0.663 0.766 0.84 0.911 1.053 1.121 1.188 1.213 1.338 1.384 1.481 1.562 1.623 1.662 1.744 1.812 1.9 1.949 1.999 2.063 2.135 2.211 2.283 2.353 2.427 2.494 2.561 2.622 2.651 2.677 2.721 2.772 2.796 2.799 2.794 2.786 2.769 2.715 2.615 2.505 2.351 2.125 1.796 1.34 0.612 -0.538 -2.419 -4.584 -6.279 -7.591 -8.665 -9.637 -10.464 -11.187 -11.8 -12.402 -12.923 -13.379 -13.808 -14.214 -14.578 -14.886 -15.183 -15.452 -15.717 -15.995 -16.267 -16.494 -16.752 -17.021 -17.195 -17.368 -17.56 -17.764 -17.986 -18.133 -18.268 -18.479 -18.636 -18.795 -18.877 -19.067 -19.263 -19.454 -19.549 -19.751 -19.84 -19.938 -20.047 -20.269 -20.405 -20.565 -20.721 -20.904 -21.127 -21.37 -21.757 -3 ,21978 ,KEBNE ,16657746,Tue Nov 23 05:29:08 CET,Tue Nov 23 06:50:14 CET,0.0 0.275 0.396 0.493 0.605 0.713 0.792 0.866 0.992 1.053 1.121 1.163 1.301 1.349 1.448 1.537 1.626 1.666 1.74 1.821 1.928 1.991 2.052 2.121 2.164 2.214 2.273 2.315 2.357 2.398 2.442 2.491 2.529 2.565 2.604 2.625 2.635 2.643 2.635 2.594 2.545 2.489 2.362 2.196 1.989 1.722 1.315 0.744 -0.079 -1.324 -3.355 -5.652 -7.474 -8.974 -10.198 -11.261 -12.117 -12.864 -13.524 -14.167 -14.7 -15.157 -15.582 -15.992 -16.35 -16.65 -16.98 -17.275 -17.528 -17.788 -18.046 -18.268 -18.497 -18.725 -18.905 -19.091 -19.285 -19.488 -19.692 -19.83 -19.976 -20.195 -20.349 -20.521 -20.609 -20.774 -20.929 -21.091 -21.181 -21.383 -21.505 -21.628 -21.723 -21.903 -22.006 -22.132 -22.276 -22.419 -22.585 -22.83 -23.608 -4 ,12641 ,KEBNE ,16657747,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:52:38 CET,0.0 0.372 0.535 0.647 0.739 0.853 0.965 1.052 1.201 1.254 1.311 1.341 1.473 1.52 1.603 1.68 1.763 1.808 1.894 1.962 2.042 2.115 2.179 2.248 2.326 2.391 2.439 2.485 2.563 2.624 2.661 2.705 2.752 2.788 2.807 2.843 2.88 2.908 2.919 2.925 2.924 2.873 2.774 2.649 2.469 2.223 1.87 1.379 0.664 -0.461 -2.403 -4.666 -6.422 -7.85 -8.99 -10.002 -10.888 -11.664 -12.31 -12.951 -13.488 -13.949 -14.378 -14.775 -15.134 -15.46 -15.802 -16.11 -16.385 -16.659 -16.919 -17.134 -17.369 -17.603 -17.775 -17.955 -18.152 -18.354 -18.548 -18.684 -18.834 -19.061 -19.208 -19.361 -19.441 -19.602 -19.76 -19.919 -20.004 -20.202 -20.288 -20.405 -20.542 -20.816 -20.96 -21.103 -21.24 -21.417 -21.625 -21.878 -22.522 -5 ,13766 ,KEBNE ,16657748,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:53:52 CET,0.0 0.296 0.423 0.54 0.645 0.758 0.858 0.938 1.104 1.179 1.237 1.267 1.408 1.458 1.552 1.634 1.713 1.759 1.842 1.904 2.007 2.07 2.12 2.196 2.261 2.319 2.375 2.408 2.447 2.495 2.545 2.593 2.632 2.659 2.685 2.712 2.724 2.742 2.738 2.713 2.68 2.611 2.534 2.444 2.3 2.069 1.683 1.144 0.407 -0.725 -2.673 -4.899 -6.612 -8.003 -9.179 -10.24 -11.113 -11.862 -12.509 -13.155 -13.701 -14.178 -14.622 -15.02 -15.383 -15.719 -16.066 -16.369 -16.631 -16.889 -17.156 -17.388 -17.625 -17.875 -18.07 -18.253 -18.44 -18.641 -18.837 -18.98 -19.132 -19.356 -19.51 -19.675 -19.761 -19.946 -20.143 -20.333 -20.435 -20.655 -20.78 -20.903 -21.023 -21.26 -21.393 -21.525 -21.667 -21.814 -21.971 -22.186 -22.811 -6 ,26938 ,KEBNE ,16657749,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:52:14 CET,0.0 0.333 0.535 0.698 0.83 0.935 1.02 1.091 1.216 1.271 1.313 1.293 1.419 1.469 1.561 1.658 1.76 1.802 1.879 1.95 2.021 2.07 2.125 2.204 2.28 2.349 2.404 2.447 2.488 2.526 2.576 2.622 2.664 2.696 2.733 2.779 2.795 2.781 2.757 2.734 2.708 2.656 2.552 2.429 2.25 2.012 1.702 1.212 0.421 -0.768 -2.653 -4.781 -6.445 -7.819 -8.968 -9.99 -10.849 -11.588 -12.245 -12.886 -13.428 -13.916 -14.364 -14.763 -15.125 -15.449 -15.782 -16.091 -16.346 -16.597 -16.869 -17.098 -17.33 -17.577 -17.771 -17.979 -18.191 -18.403 -18.637 -18.793 -18.943 -19.181 -19.344 -19.503 -19.582 -19.764 -19.971 -20.162 -20.26 -20.471 -20.553 -20.656 -20.77 -21.001 -21.129 -21.275 -21.446 -21.635 -21.832 -22.077 -22.542 -7 ,3537 ,KEBNE ,16657750,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:52:06 CET,0.0 0.479 0.643 0.762 0.86 0.974 1.071 1.139 1.26 1.317 1.375 1.389 1.516 1.556 1.629 1.711 1.778 1.81 1.869 1.91 1.966 2.018 2.076 2.149 2.221 2.297 2.381 2.467 2.556 2.627 2.674 2.717 2.78 2.845 2.892 2.913 2.922 2.942 2.963 2.96 2.932 2.878 2.796 2.702 2.553 2.297 1.912 1.385 0.639 -0.492 -2.399 -4.54 -6.204 -7.579 -8.73 -9.735 -10.585 -11.334 -11.957 -12.564 -13.094 -13.555 -13.984 -14.382 -14.756 -15.089 -15.424 -15.737 -16.009 -16.292 -16.578 -16.806 -17.036 -17.283 -17.476 -17.672 -17.877 -18.082 -18.298 -18.457 -18.626 -18.883 -19.063 -19.257 -19.355 -19.537 -19.706 -19.878 -19.978 -20.185 -20.272 -20.385 -20.502 -20.73 -20.859 -21.011 -21.162 -21.293 -21.459 -21.685 -22.078 -8 ,12272 ,KEBNE ,16657751,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:54:13 CET,0.0 0.536 0.684 0.782 0.873 0.977 1.074 1.152 1.286 1.346 1.4 1.44 1.583 1.629 1.717 1.811 1.882 1.908 1.969 2.036 2.122 2.176 2.222 2.276 2.342 2.419 2.475 2.518 2.582 2.647 2.704 2.774 2.828 2.849 2.869 2.884 2.896 2.906 2.913 2.906 2.866 2.822 2.749 2.641 2.486 2.263 1.909 1.397 0.661 -0.446 -2.273 -4.398 -6.129 -7.55 -8.7 -9.708 -10.573 -11.331 -11.96 -12.594 -13.136 -13.605 -14.088 -14.529 -14.908 -15.243 -15.589 -15.902 -16.155 -16.42 -16.693 -16.923 -17.187 -17.466 -17.667 -17.861 -18.064 -18.27 -18.475 -18.621 -18.779 -19.037 -19.204 -19.358 -19.44 -19.602 -19.766 -19.937 -20.024 -20.227 -20.333 -20.441 -20.552 -20.803 -20.954 -21.104 -21.248 -21.41 -21.606 -21.852 -22.316 -9 ,157 ,KEBNE ,16657752,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:52:03 CET,0.0 0.378 0.591 0.711 0.808 0.894 0.975 1.062 1.204 1.265 1.337 1.395 1.535 1.582 1.674 1.765 1.846 1.879 1.951 2.019 2.114 2.17 2.221 2.293 2.361 2.432 2.486 2.525 2.585 2.645 2.678 2.706 2.749 2.795 2.83 2.863 2.877 2.885 2.901 2.881 2.841 2.797 2.757 2.696 2.514 2.237 1.824 1.265 0.511 -0.669 -2.624 -4.871 -6.616 -8.004 -9.156 -10.161 -11.018 -11.775 -12.421 -13.058 -13.602 -14.085 -14.527 -14.928 -15.297 -15.645 -15.999 -16.292 -16.541 -16.809 -17.1 -17.325 -17.554 -17.788 -17.969 -18.152 -18.324 -18.517 -18.729 -18.873 -19.02 -19.248 -19.405 -19.564 -19.65 -19.828 -20.004 -20.196 -20.304 -20.519 -20.605 -20.714 -20.83 -21.067 -21.21 -21.35 -21.48 -21.635 -21.819 -22.064 -22.578 -10 ,1893 ,KEBNE ,16657753,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:51:41 CET,0.0 0.365 0.596 0.736 0.838 0.928 1.008 1.097 1.241 1.299 1.361 1.408 1.569 1.636 1.721 1.789 1.852 1.886 1.955 2.016 2.107 2.17 2.232 2.313 2.376 2.452 2.521 2.563 2.624 2.68 2.725 2.774 2.816 2.855 2.888 2.896 2.886 2.878 2.882 2.87 2.827 2.773 2.687 2.533 2.32 2.047 1.667 1.128 0.323 -0.883 -2.783 -4.87 -6.567 -7.944 -9.03 -10.023 -10.897 -11.67 -12.325 -12.959 -13.488 -13.953 -14.39 -14.795 -15.175 -15.522 -15.879 -16.195 -16.466 -16.742 -17.03 -17.269 -17.52 -17.787 -17.995 -18.199 -18.413 -18.646 -18.872 -19.027 -19.194 -19.432 -19.586 -19.748 -19.831 -20.011 -20.214 -20.425 -20.535 -20.753 -20.864 -20.976 -21.082 -21.306 -21.456 -21.641 -21.851 -22.05 -22.27 -22.52 -23.109 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_252.txt deleted file mode 100644 index 64e1c473..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18999 ,KEBNE ,16657754,Tue Nov 23 05:29:09 CET,Tue Nov 23 06:52:59 CET,0.0 0.501 0.68 0.797 0.88 0.957 1.023 1.079 1.172 1.205 1.246 1.274 1.413 1.448 1.496 1.547 1.587 1.599 1.613 1.62 1.622 1.619 1.621 1.624 1.635 1.63 1.601 1.587 1.591 1.579 1.539 1.479 1.417 1.352 1.277 1.166 1.042 0.917 0.767 0.572 0.311 -0.04 -0.462 -0.913 -1.526 -2.291 -3.285 -4.614 -6.438 -8.95 -12.777 -17.008 -20.233 -22.809 -24.861 -26.565 -28.017 -29.29 -30.372 -31.435 -32.328 -33.119 -33.848 -34.509 -35.107 -35.627 -36.154 -36.627 -37.044 -37.471 -37.892 -38.258 -38.646 -39.007 -39.272 -39.544 -39.818 -40.106 -40.416 -40.637 -40.852 -41.183 -41.42 -41.639 -41.751 -42.0 -42.256 -42.527 -42.658 -42.921 -43.075 -43.229 -43.391 -43.718 -43.908 -44.112 -44.333 -44.594 -44.876 -45.184 -45.981 -2 ,32537 ,KEBNE ,16657755,Tue Nov 23 05:30:10 CET,Tue Nov 23 06:52:19 CET,0.0 0.217 0.339 0.466 0.573 0.648 0.706 0.744 0.825 0.897 0.961 0.936 1.043 1.065 1.118 1.178 1.223 1.243 1.291 1.327 1.373 1.386 1.393 1.408 1.413 1.41 1.398 1.395 1.378 1.332 1.301 1.245 1.153 1.059 0.959 0.831 0.684 0.5 0.285 0.055 -0.217 -0.549 -0.965 -1.444 -2.07 -2.868 -3.921 -5.283 -7.109 -9.656 -13.58 -17.837 -21.057 -23.62 -25.685 -27.457 -28.92 -30.154 -31.232 -32.337 -33.243 -34.059 -34.837 -35.543 -36.199 -36.78 -37.359 -37.85 -38.274 -38.709 -39.137 -39.494 -39.859 -40.216 -40.51 -40.83 -41.143 -41.463 -41.812 -42.043 -42.279 -42.65 -42.913 -43.2 -43.344 -43.617 -43.913 -44.239 -44.396 -44.683 -44.873 -45.047 -45.231 -45.625 -45.818 -46.038 -46.275 -46.537 -46.854 -47.221 -48.038 -3 ,1979 ,KEBNE ,16657756,Tue Nov 23 05:31:11 CET,Tue Nov 23 06:54:25 CET,0.0 0.271 0.433 0.555 0.622 0.674 0.721 0.776 0.889 0.935 0.981 0.993 1.115 1.149 1.196 1.223 1.246 1.264 1.296 1.327 1.367 1.371 1.38 1.402 1.414 1.412 1.403 1.405 1.385 1.342 1.3 1.247 1.213 1.182 1.098 0.964 0.832 0.668 0.463 0.226 -0.051 -0.388 -0.818 -1.305 -1.916 -2.686 -3.732 -5.087 -6.864 -9.327 -13.168 -17.345 -20.527 -23.064 -25.069 -26.773 -28.227 -29.515 -30.621 -31.641 -32.459 -33.206 -33.955 -34.67 -35.32 -35.896 -36.489 -37.027 -37.457 -37.884 -38.339 -38.713 -39.116 -39.525 -39.818 -40.113 -40.428 -40.772 -41.129 -41.355 -41.574 -41.932 -42.191 -42.444 -42.575 -42.857 -43.125 -43.402 -43.557 -43.857 -44.043 -44.201 -44.371 -44.76 -44.968 -45.189 -45.452 -45.729 -46.019 -46.403 -47.609 -4 ,12343 ,KEBNE ,16657757,Tue Nov 23 05:31:11 CET,Tue Nov 23 06:54:28 CET,0.0 0.342 0.461 0.515 0.564 0.63 0.678 0.737 0.877 0.926 0.964 0.942 1.055 1.08 1.124 1.162 1.215 1.24 1.268 1.3 1.342 1.367 1.388 1.399 1.413 1.428 1.424 1.405 1.389 1.363 1.313 1.261 1.217 1.169 1.095 0.99 0.87 0.732 0.562 0.342 0.097 -0.196 -0.584 -1.034 -1.667 -2.474 -3.498 -4.775 -6.519 -9.125 -13.178 -17.522 -20.882 -23.542 -25.663 -27.452 -29.0 -30.384 -31.545 -32.689 -33.589 -34.351 -35.05 -35.696 -36.308 -36.853 -37.393 -37.85 -38.237 -38.646 -39.076 -39.451 -39.841 -40.218 -40.519 -40.828 -41.135 -41.453 -41.786 -42.015 -42.231 -42.575 -42.821 -43.052 -43.174 -43.45 -43.739 -44.033 -44.174 -44.444 -44.605 -44.759 -44.92 -45.267 -45.47 -45.696 -45.93 -46.17 -46.472 -46.951 -48.344 -5 ,5756 ,KEBNE ,16657758,Tue Nov 23 05:31:12 CET,Tue Nov 23 06:54:10 CET,0.0 0.331 0.462 0.556 0.637 0.699 0.745 0.788 0.876 0.931 0.984 0.992 1.109 1.132 1.179 1.216 1.248 1.265 1.296 1.317 1.347 1.366 1.386 1.392 1.379 1.372 1.36 1.337 1.288 1.247 1.204 1.133 1.05 0.965 0.894 0.814 0.709 0.562 0.39 0.18 -0.105 -0.444 -0.877 -1.369 -2.01 -2.779 -3.786 -5.124 -6.927 -9.456 -13.252 -17.431 -20.674 -23.224 -25.312 -27.09 -28.554 -29.842 -30.95 -32.035 -32.92 -33.67 -34.395 -35.088 -35.702 -36.24 -36.808 -37.319 -37.754 -38.187 -38.633 -39.018 -39.431 -39.836 -40.129 -40.432 -40.751 -41.086 -41.428 -41.659 -41.891 -42.238 -42.488 -42.742 -42.864 -43.119 -43.383 -43.661 -43.816 -44.1 -44.277 -44.446 -44.613 -44.977 -45.176 -45.396 -45.637 -45.872 -46.162 -46.566 -47.553 -6 ,19847 ,KEBNE ,16657759,Tue Nov 23 05:31:11 CET,Tue Nov 23 06:53:46 CET,0.0 0.3 0.413 0.529 0.62 0.688 0.765 0.831 0.938 0.996 1.046 1.018 1.13 1.163 1.21 1.258 1.314 1.34 1.372 1.381 1.386 1.395 1.397 1.399 1.383 1.367 1.357 1.339 1.322 1.286 1.246 1.2 1.12 1.041 0.955 0.847 0.728 0.577 0.399 0.194 -0.07 -0.403 -0.83 -1.311 -1.928 -2.706 -3.716 -5.031 -6.85 -9.419 -13.339 -17.564 -20.762 -23.331 -25.414 -27.185 -28.643 -29.904 -30.993 -32.046 -32.906 -33.649 -34.338 -34.973 -35.552 -36.072 -36.605 -37.084 -37.499 -37.925 -38.345 -38.674 -39.006 -39.353 -39.624 -39.896 -40.172 -40.454 -40.751 -40.958 -41.175 -41.51 -41.73 -41.945 -42.058 -42.309 -42.574 -42.846 -42.98 -43.243 -43.398 -43.563 -43.733 -44.055 -44.233 -44.457 -44.708 -44.961 -45.244 -45.599 -46.7 -7 ,14161 ,KEBNE ,16657760,Tue Nov 23 05:31:11 CET,Tue Nov 23 06:54:00 CET,0.0 0.309 0.472 0.576 0.664 0.73 0.771 0.813 0.92 0.977 1.025 1.019 1.135 1.159 1.209 1.269 1.321 1.345 1.388 1.415 1.442 1.454 1.46 1.456 1.451 1.442 1.429 1.41 1.384 1.368 1.338 1.282 1.221 1.161 1.074 0.935 0.789 0.634 0.444 0.215 -0.054 -0.404 -0.846 -1.354 -2.033 -2.835 -3.869 -5.265 -7.176 -9.798 -13.775 -18.05 -21.357 -24.013 -26.176 -28.026 -29.517 -30.784 -31.854 -32.934 -33.875 -34.713 -35.508 -36.235 -36.883 -37.462 -38.064 -38.595 -39.055 -39.518 -39.974 -40.353 -40.743 -41.143 -41.445 -41.742 -42.076 -42.43 -42.752 -42.964 -43.189 -43.557 -43.809 -44.059 -44.19 -44.475 -44.76 -45.04 -45.188 -45.465 -45.64 -45.808 -45.986 -46.373 -46.58 -46.8 -47.067 -47.388 -47.754 -48.21 -49.621 -8 ,11685 ,KEBNE ,16657761,Tue Nov 23 05:32:13 CET,Tue Nov 23 06:56:05 CET,0.0 0.34 0.462 0.576 0.704 0.797 0.847 0.88 0.952 0.996 1.029 0.999 1.111 1.143 1.193 1.228 1.252 1.258 1.272 1.287 1.315 1.329 1.35 1.363 1.358 1.359 1.349 1.342 1.328 1.29 1.247 1.195 1.142 1.092 1.023 0.904 0.752 0.575 0.394 0.191 -0.061 -0.382 -0.812 -1.272 -1.852 -2.617 -3.607 -4.905 -6.726 -9.3 -13.178 -17.351 -20.588 -23.168 -25.268 -27.059 -28.592 -29.945 -31.058 -32.136 -33.03 -33.786 -34.503 -35.176 -35.786 -36.331 -36.909 -37.445 -37.903 -38.35 -38.792 -39.172 -39.573 -39.982 -40.291 -40.597 -40.926 -41.302 -41.699 -41.948 -42.185 -42.565 -42.832 -43.094 -43.223 -43.488 -43.777 -44.089 -44.241 -44.523 -44.732 -44.911 -45.106 -45.533 -45.768 -45.998 -46.223 -46.489 -46.777 -47.113 -47.979 -9 ,19608 ,KEBNE ,16657762,Tue Nov 23 05:32:13 CET,Tue Nov 23 06:56:45 CET,0.0 0.498 0.618 0.723 0.844 0.923 0.99 1.051 1.145 1.196 1.252 1.243 1.342 1.365 1.43 1.493 1.558 1.589 1.633 1.661 1.691 1.696 1.705 1.729 1.749 1.752 1.744 1.737 1.714 1.678 1.64 1.569 1.472 1.388 1.286 1.15 1.016 0.876 0.714 0.49 0.239 -0.064 -0.499 -0.982 -1.637 -2.454 -3.471 -4.771 -6.588 -9.137 -12.93 -17.087 -20.26 -22.824 -24.92 -26.693 -28.205 -29.557 -30.705 -31.843 -32.804 -33.618 -34.382 -35.108 -35.754 -36.33 -36.93 -37.449 -37.908 -38.371 -38.828 -39.194 -39.554 -39.935 -40.226 -40.517 -40.793 -41.095 -41.451 -41.686 -41.921 -42.287 -42.531 -42.784 -42.915 -43.184 -43.471 -43.8 -43.97 -44.266 -44.481 -44.675 -44.866 -45.233 -45.427 -45.634 -45.869 -46.123 -46.439 -46.83 -47.576 -10 ,10000 ,KEBNE ,16657763,Tue Nov 23 05:32:13 CET,Tue Nov 23 06:56:27 CET,0.0 0.356 0.524 0.643 0.729 0.796 0.853 0.916 1.013 1.053 1.095 1.085 1.211 1.256 1.326 1.388 1.442 1.465 1.508 1.532 1.539 1.55 1.567 1.582 1.586 1.585 1.587 1.586 1.58 1.566 1.546 1.506 1.46 1.401 1.299 1.169 1.028 0.875 0.692 0.465 0.215 -0.112 -0.538 -1.014 -1.633 -2.391 -3.406 -4.73 -6.479 -8.949 -12.787 -16.974 -20.089 -22.599 -24.648 -26.352 -27.82 -29.162 -30.33 -31.463 -32.387 -33.183 -33.933 -34.609 -35.202 -35.749 -36.302 -36.767 -37.162 -37.577 -38.018 -38.373 -38.736 -39.117 -39.415 -39.71 -40.006 -40.309 -40.616 -40.831 -41.049 -41.402 -41.657 -41.913 -42.053 -42.335 -42.599 -42.891 -43.049 -43.342 -43.552 -43.74 -43.937 -44.359 -44.583 -44.823 -45.08 -45.371 -45.712 -46.119 -47.285 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_57.txt deleted file mode 100644 index 2721834d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_290_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1610 ,KEBNE ,17043712,Thu Dec 23 05:11:32 CET,Thu Dec 23 06:36:42 CET,0.0 0.225 0.404 0.547 0.69 0.817 0.927 1.024 1.204 1.293 1.37 1.417 1.567 1.639 1.782 1.925 2.065 2.125 2.237 2.349 2.519 2.633 2.749 2.926 3.081 3.205 3.32 3.437 3.582 3.717 3.858 4.032 4.189 4.358 4.559 4.767 4.981 5.217 5.454 5.699 5.96 6.261 6.645 7.033 7.405 7.791 8.237 8.725 9.271 9.853 10.474 10.77 10.747 10.616 10.469 10.324 10.144 9.963 9.808 9.634 9.48 9.326 9.162 9.014 8.87 8.729 8.583 8.446 8.32 8.19 8.048 7.919 7.788 7.649 7.535 7.417 7.313 7.209 7.096 7.014 6.915 6.759 6.654 6.544 6.488 6.382 6.258 6.122 6.061 5.914 5.847 5.779 5.71 5.571 5.493 5.403 5.292 5.162 5.023 4.829 4.438 -2 ,11561 ,KEBNE ,17043713,Thu Dec 23 05:11:32 CET,Thu Dec 23 06:36:18 CET,0.0 0.346 0.585 0.729 0.848 0.976 1.09 1.194 1.388 1.477 1.568 1.641 1.795 1.864 2.0 2.129 2.253 2.315 2.432 2.544 2.71 2.817 2.923 3.087 3.247 3.39 3.53 3.67 3.848 4.001 4.134 4.306 4.473 4.63 4.833 5.063 5.27 5.507 5.769 6.036 6.308 6.606 6.984 7.387 7.793 8.201 8.665 9.175 9.73 10.301 10.869 11.218 11.305 11.273 11.19 11.031 10.842 10.657 10.487 10.304 10.124 9.969 9.764 9.533 9.351 9.197 9.048 8.92 8.804 8.661 8.524 8.416 8.286 8.164 8.068 7.965 7.867 7.764 7.644 7.562 7.478 7.329 7.219 7.106 7.049 6.942 6.828 6.697 6.633 6.492 6.446 6.373 6.286 6.099 5.987 5.865 5.748 5.626 5.463 5.248 4.909 -3 ,7000 ,KEBNE ,17043714,Thu Dec 23 05:11:32 CET,Thu Dec 23 06:36:23 CET,0.0 0.222 0.403 0.53 0.622 0.705 0.796 0.886 1.033 1.096 1.152 1.195 1.347 1.419 1.546 1.667 1.78 1.834 1.941 2.049 2.198 2.285 2.369 2.489 2.613 2.743 2.873 2.992 3.13 3.26 3.397 3.571 3.76 3.953 4.161 4.366 4.552 4.765 4.995 5.252 5.529 5.832 6.17 6.489 6.859 7.265 7.755 8.297 8.843 9.4 9.996 10.39 10.482 10.444 10.333 10.178 10.017 9.837 9.667 9.511 9.363 9.214 9.056 8.899 8.765 8.652 8.526 8.419 8.289 8.131 8.002 7.881 7.751 7.629 7.516 7.404 7.301 7.179 7.046 6.965 6.886 6.761 6.676 6.586 6.537 6.427 6.319 6.199 6.137 6.004 5.955 5.882 5.805 5.613 5.514 5.427 5.327 5.185 5.029 4.866 4.616 -4 ,16097 ,KEBNE ,17043715,Thu Dec 23 05:11:32 CET,Thu Dec 23 06:36:16 CET,0.0 0.291 0.452 0.555 0.653 0.745 0.847 0.947 1.122 1.206 1.278 1.327 1.48 1.554 1.684 1.796 1.916 1.975 2.086 2.189 2.34 2.451 2.561 2.712 2.85 2.985 3.106 3.219 3.4 3.586 3.736 3.914 4.103 4.269 4.45 4.669 4.872 5.089 5.325 5.583 5.851 6.129 6.46 6.8 7.19 7.625 8.124 8.659 9.225 9.796 10.373 10.663 10.641 10.556 10.429 10.257 10.072 9.9 9.738 9.568 9.423 9.257 9.086 8.94 8.776 8.608 8.458 8.333 8.222 8.092 7.954 7.843 7.724 7.6 7.503 7.411 7.315 7.208 7.076 6.984 6.903 6.781 6.69 6.593 6.543 6.434 6.317 6.202 6.145 6.004 5.943 5.86 5.773 5.577 5.458 5.35 5.228 5.081 4.916 4.704 4.403 -5 ,30783 ,KEBNE ,17043716,Thu Dec 23 05:11:32 CET,Thu Dec 23 06:35:11 CET,0.0 0.459 0.674 0.848 0.975 1.095 1.194 1.279 1.473 1.564 1.647 1.732 1.905 1.982 2.109 2.226 2.334 2.392 2.514 2.633 2.792 2.89 2.991 3.146 3.291 3.416 3.536 3.662 3.825 3.999 4.175 4.357 4.512 4.666 4.853 5.051 5.238 5.449 5.681 5.914 6.15 6.44 6.772 7.086 7.452 7.858 8.33 8.847 9.395 9.976 10.575 10.93 11.005 10.928 10.808 10.666 10.489 10.285 10.09 9.865 9.68 9.531 9.366 9.198 9.037 8.896 8.755 8.615 8.481 8.341 8.193 8.071 7.944 7.811 7.714 7.609 7.482 7.344 7.216 7.133 7.046 6.91 6.814 6.706 6.65 6.538 6.43 6.335 6.285 6.145 6.077 6.001 5.932 5.797 5.711 5.601 5.469 5.34 5.219 5.028 4.348 -6 ,11493 ,KEBNE ,17043717,Thu Dec 23 05:11:32 CET,Thu Dec 23 06:35:55 CET,0.0 0.224 0.354 0.498 0.644 0.759 0.862 0.965 1.149 1.238 1.321 1.379 1.53 1.596 1.738 1.877 2.002 2.059 2.155 2.246 2.37 2.455 2.545 2.66 2.779 2.918 3.059 3.203 3.404 3.593 3.768 3.965 4.135 4.29 4.473 4.718 4.96 5.192 5.437 5.706 5.964 6.241 6.588 6.956 7.386 7.821 8.306 8.833 9.389 9.998 10.616 10.974 11.049 10.948 10.8 10.641 10.471 10.292 10.125 9.958 9.784 9.61 9.447 9.278 9.11 8.949 8.775 8.633 8.518 8.395 8.251 8.112 7.945 7.792 7.7 7.603 7.473 7.311 7.146 7.044 6.944 6.79 6.681 6.555 6.495 6.38 6.257 6.14 6.064 5.901 5.827 5.737 5.649 5.467 5.366 5.241 5.099 4.975 4.832 4.637 4.162 -7 ,25361 ,KEBNE ,17043718,Thu Dec 23 05:11:32 CET,Thu Dec 23 06:36:24 CET,0.0 0.442 0.602 0.756 0.913 1.055 1.161 1.246 1.437 1.53 1.608 1.656 1.8 1.862 2.003 2.147 2.272 2.331 2.455 2.585 2.757 2.861 2.96 3.092 3.224 3.364 3.498 3.628 3.794 3.934 4.079 4.274 4.469 4.661 4.86 5.071 5.274 5.494 5.732 5.991 6.246 6.523 6.862 7.206 7.606 8.043 8.546 9.057 9.599 10.202 10.843 11.18 11.259 11.239 11.136 10.982 10.813 10.645 10.481 10.307 10.147 9.998 9.841 9.683 9.516 9.351 9.193 9.064 8.936 8.795 8.659 8.529 8.389 8.261 8.153 8.033 7.924 7.816 7.704 7.629 7.543 7.398 7.281 7.161 7.107 6.999 6.885 6.755 6.681 6.528 6.439 6.342 6.25 6.07 5.977 5.884 5.758 5.605 5.436 5.247 4.908 -8 ,14108 ,KEBNE ,17043719,Thu Dec 23 05:11:32 CET,Thu Dec 23 06:36:00 CET,0.0 0.203 0.377 0.498 0.625 0.743 0.828 0.932 1.144 1.233 1.328 1.417 1.572 1.648 1.809 1.953 2.073 2.133 2.244 2.359 2.539 2.65 2.761 2.917 3.058 3.201 3.358 3.497 3.639 3.788 3.936 4.106 4.278 4.44 4.611 4.813 5.003 5.214 5.456 5.727 6.023 6.328 6.656 7.003 7.373 7.754 8.236 8.761 9.309 9.963 10.708 11.074 11.091 10.98 10.862 10.732 10.549 10.34 10.161 9.974 9.807 9.654 9.496 9.339 9.186 9.03 8.814 8.609 8.467 8.332 8.162 8.026 7.913 7.786 7.688 7.593 7.497 7.393 7.267 7.175 7.09 6.942 6.838 6.739 6.683 6.572 6.456 6.326 6.256 6.116 6.06 5.983 5.903 5.734 5.659 5.579 5.472 5.347 5.196 4.995 4.578 -9 ,4147 ,KEBNE ,17043720,Thu Dec 23 05:11:32 CET,Thu Dec 23 06:36:24 CET,0.0 0.393 0.58 0.734 0.869 0.98 1.072 1.173 1.392 1.488 1.596 1.699 1.85 1.923 2.068 2.202 2.337 2.395 2.495 2.596 2.743 2.849 2.95 3.095 3.241 3.376 3.507 3.634 3.807 3.971 4.132 4.315 4.491 4.666 4.869 5.106 5.298 5.519 5.8 6.1 6.389 6.667 6.997 7.335 7.706 8.131 8.588 9.047 9.588 10.186 10.813 11.2 11.247 11.139 10.997 10.826 10.658 10.5 10.354 10.201 10.033 9.872 9.734 9.606 9.48 9.344 9.192 9.055 8.937 8.797 8.636 8.517 8.403 8.274 8.158 8.029 7.908 7.767 7.619 7.541 7.458 7.299 7.183 7.073 7.014 6.896 6.777 6.646 6.576 6.421 6.335 6.248 6.164 6.005 5.911 5.806 5.666 5.478 5.255 4.991 4.536 -10 ,12547 ,KEBNE ,17043721,Thu Dec 23 05:14:38 CET,Thu Dec 23 06:39:40 CET,0.0 0.256 0.433 0.584 0.722 0.829 0.929 1.024 1.235 1.327 1.398 1.455 1.618 1.696 1.854 2.007 2.15 2.214 2.328 2.44 2.597 2.696 2.792 2.942 3.093 3.234 3.373 3.524 3.714 3.87 4.005 4.178 4.363 4.544 4.751 4.989 5.198 5.405 5.619 5.845 6.1 6.416 6.77 7.086 7.451 7.877 8.356 8.862 9.371 9.926 10.529 10.842 10.965 10.937 10.818 10.657 10.455 10.251 10.092 9.917 9.737 9.577 9.421 9.26 9.097 8.953 8.805 8.664 8.54 8.416 8.289 8.172 8.062 7.961 7.87 7.77 7.663 7.553 7.424 7.318 7.213 7.052 6.945 6.834 6.782 6.695 6.6 6.478 6.41 6.266 6.199 6.129 6.066 5.922 5.826 5.714 5.604 5.479 5.369 5.263 4.818 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_30_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_30_42.txt deleted file mode 100644 index 2d7aeed3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_30_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8174 ,KEBNE ,16657774,Tue Nov 23 05:37:21 CET,Tue Nov 23 07:00:16 CET,0.0 0.697 1.07 1.31 1.468 1.599 1.721 1.831 2.037 2.138 2.235 2.395 2.565 2.649 2.823 2.978 3.118 3.185 3.321 3.452 3.627 3.743 3.854 4.011 4.16 4.291 4.411 4.529 4.667 4.79 4.926 5.105 5.269 5.422 5.581 5.728 5.852 5.997 6.153 6.316 6.474 6.623 6.735 6.774 6.818 6.812 6.728 6.623 6.392 5.708 4.299 2.545 1.123 -0.037 -1.04 -1.933 -2.702 -3.405 -4.01 -4.59 -5.079 -5.506 -5.917 -6.297 -6.638 -6.952 -7.295 -7.602 -7.843 -8.075 -8.329 -8.545 -8.769 -9.002 -9.169 -9.344 -9.539 -9.744 -9.945 -10.07 -10.195 -10.392 -10.536 -10.693 -10.774 -10.941 -11.111 -11.297 -11.392 -11.577 -11.685 -11.781 -11.887 -12.126 -12.278 -12.437 -12.595 -12.779 -12.967 -13.239 -13.893 -2 ,4754 ,KEBNE ,16657775,Tue Nov 23 05:38:22 CET,Tue Nov 23 06:59:42 CET,0.0 0.688 0.947 1.164 1.345 1.497 1.638 1.771 1.987 2.08 2.188 2.326 2.47 2.547 2.706 2.851 2.984 3.049 3.169 3.289 3.453 3.557 3.667 3.812 3.939 4.064 4.188 4.314 4.477 4.605 4.703 4.832 4.956 5.084 5.247 5.414 5.57 5.737 5.891 6.03 6.149 6.284 6.407 6.492 6.565 6.532 6.375 6.206 5.991 5.485 4.292 2.863 1.672 0.531 -0.482 -1.382 -2.153 -2.858 -3.464 -4.057 -4.562 -5.004 -5.408 -5.781 -6.148 -6.49 -6.821 -7.111 -7.369 -7.633 -7.903 -8.121 -8.341 -8.566 -8.742 -8.938 -9.141 -9.327 -9.52 -9.661 -9.805 -10.034 -10.191 -10.358 -10.447 -10.616 -10.784 -10.986 -11.094 -11.268 -11.369 -11.471 -11.566 -11.749 -11.855 -12.008 -12.19 -12.373 -12.572 -12.842 -13.371 -3 ,16112 ,KEBNE ,16657776,Tue Nov 23 05:38:23 CET,Tue Nov 23 07:00:15 CET,0.0 0.628 0.892 1.11 1.294 1.464 1.625 1.737 1.933 2.049 2.165 2.299 2.455 2.533 2.675 2.813 2.953 3.026 3.173 3.317 3.503 3.61 3.698 3.827 3.967 4.105 4.241 4.36 4.502 4.63 4.75 4.893 5.011 5.128 5.287 5.446 5.558 5.68 5.837 5.985 6.089 6.156 6.229 6.335 6.433 6.455 6.367 6.171 5.787 5.059 3.747 2.025 0.493 -0.788 -1.826 -2.736 -3.537 -4.23 -4.809 -5.38 -5.865 -6.328 -6.762 -7.14 -7.491 -7.811 -8.143 -8.437 -8.695 -8.946 -9.197 -9.425 -9.658 -9.892 -10.071 -10.257 -10.453 -10.644 -10.839 -10.97 -11.096 -11.298 -11.452 -11.61 -11.698 -11.885 -12.062 -12.24 -12.325 -12.502 -12.662 -12.777 -12.875 -13.094 -13.22 -13.366 -13.525 -13.678 -13.855 -14.094 -14.52 -4 ,19606 ,KEBNE ,16657777,Tue Nov 23 05:38:22 CET,Tue Nov 23 07:01:39 CET,0.0 0.743 1.07 1.301 1.503 1.649 1.777 1.901 2.116 2.212 2.304 2.422 2.57 2.655 2.838 2.993 3.124 3.187 3.307 3.427 3.598 3.705 3.796 3.912 4.045 4.19 4.321 4.434 4.576 4.713 4.846 5.003 5.133 5.261 5.404 5.523 5.657 5.835 5.977 6.084 6.201 6.308 6.434 6.55 6.621 6.628 6.58 6.44 6.121 5.57 4.444 3.019 1.916 0.939 0.09 -0.666 -1.329 -1.911 -2.417 -2.903 -3.36 -3.818 -4.246 -4.631 -4.982 -5.308 -5.643 -5.935 -6.186 -6.439 -6.688 -6.89 -7.099 -7.313 -7.49 -7.669 -7.846 -8.039 -8.241 -8.375 -8.51 -8.715 -8.855 -8.994 -9.065 -9.223 -9.379 -9.558 -9.656 -9.827 -9.925 -10.026 -10.125 -10.347 -10.469 -10.598 -10.728 -10.891 -11.075 -11.244 -11.635 -5 ,30045 ,KEBNE ,16657778,Tue Nov 23 05:39:24 CET,Tue Nov 23 07:01:36 CET,0.0 0.589 0.877 1.096 1.267 1.422 1.548 1.665 1.904 2.011 2.107 2.239 2.407 2.487 2.628 2.778 2.929 2.998 3.118 3.239 3.413 3.526 3.636 3.795 3.93 4.037 4.147 4.269 4.436 4.576 4.719 4.892 5.022 5.141 5.3 5.466 5.569 5.674 5.793 5.909 6.04 6.189 6.328 6.481 6.643 6.682 6.574 6.397 6.041 5.311 3.817 1.95 0.435 -0.854 -1.974 -2.968 -3.826 -4.554 -5.131 -5.696 -6.193 -6.646 -7.079 -7.463 -7.817 -8.136 -8.445 -8.716 -8.947 -9.187 -9.446 -9.669 -9.89 -10.111 -10.281 -10.454 -10.629 -10.814 -11.012 -11.152 -11.291 -11.503 -11.659 -11.819 -11.901 -12.063 -12.214 -12.377 -12.466 -12.642 -12.771 -12.878 -12.982 -13.213 -13.332 -13.457 -13.622 -13.797 -13.98 -14.222 -14.608 -6 ,32028 ,KEBNE ,16657779,Tue Nov 23 05:39:24 CET,Tue Nov 23 06:59:55 CET,0.0 0.834 1.084 1.3 1.502 1.691 1.849 1.967 2.176 2.278 2.363 2.454 2.596 2.668 2.811 2.942 3.062 3.123 3.25 3.373 3.551 3.658 3.762 3.926 4.081 4.218 4.348 4.472 4.626 4.775 4.923 5.104 5.252 5.377 5.533 5.676 5.807 5.966 6.131 6.301 6.436 6.57 6.723 6.858 6.986 7.064 7.084 6.974 6.642 5.906 4.45 2.632 1.089 -0.253 -1.315 -2.221 -3.019 -3.722 -4.305 -4.885 -5.38 -5.811 -6.238 -6.635 -6.99 -7.309 -7.646 -7.938 -8.174 -8.416 -8.663 -8.871 -9.087 -9.31 -9.48 -9.662 -9.861 -10.053 -10.238 -10.367 -10.513 -10.744 -10.902 -11.067 -11.142 -11.287 -11.439 -11.593 -11.678 -11.85 -11.968 -12.071 -12.169 -12.387 -12.499 -12.606 -12.749 -12.922 -13.091 -13.286 -13.798 -7 ,12178 ,KEBNE ,16657780,Tue Nov 23 05:39:24 CET,Tue Nov 23 07:03:48 CET,0.0 0.866 1.212 1.478 1.656 1.814 1.967 2.095 2.339 2.462 2.569 2.697 2.841 2.926 3.084 3.24 3.399 3.465 3.586 3.699 3.856 3.953 4.052 4.206 4.343 4.451 4.564 4.679 4.821 4.954 5.066 5.216 5.357 5.477 5.628 5.802 5.95 6.106 6.236 6.299 6.363 6.414 6.448 6.489 6.468 6.366 6.166 5.838 5.302 4.413 2.83 0.891 -0.698 -1.987 -3.058 -3.996 -4.83 -5.6 -6.235 -6.828 -7.32 -7.773 -8.191 -8.585 -8.96 -9.287 -9.604 -9.88 -10.119 -10.367 -10.628 -10.842 -11.062 -11.29 -11.459 -11.641 -11.838 -12.029 -12.236 -12.374 -12.496 -12.699 -12.849 -12.998 -13.077 -13.233 -13.395 -13.596 -13.692 -13.857 -13.968 -14.069 -14.164 -14.371 -14.498 -14.635 -14.779 -14.922 -15.056 -15.276 -15.913 -8 ,28827 ,KEBNE ,16657781,Tue Nov 23 05:39:24 CET,Tue Nov 23 07:00:24 CET,0.0 0.973 1.237 1.414 1.577 1.74 1.892 2.025 2.247 2.363 2.464 2.578 2.736 2.837 3.008 3.152 3.296 3.362 3.487 3.606 3.767 3.88 3.989 4.133 4.273 4.397 4.516 4.642 4.798 4.94 5.084 5.254 5.404 5.547 5.682 5.798 5.924 6.066 6.207 6.371 6.525 6.655 6.81 6.897 6.942 6.98 6.967 6.964 6.849 6.219 4.83 3.037 1.483 0.24 -0.747 -1.657 -2.483 -3.204 -3.79 -4.375 -4.889 -5.34 -5.76 -6.141 -6.479 -6.797 -7.132 -7.426 -7.674 -7.924 -8.174 -8.384 -8.605 -8.836 -9.022 -9.206 -9.393 -9.577 -9.764 -9.906 -10.052 -10.257 -10.401 -10.555 -10.634 -10.801 -10.967 -11.134 -11.226 -11.406 -11.515 -11.615 -11.716 -11.952 -12.102 -12.239 -12.351 -12.473 -12.644 -12.858 -13.186 -9 ,23229 ,KEBNE ,16657782,Tue Nov 23 05:40:25 CET,Tue Nov 23 07:00:30 CET,0.0 0.592 0.844 1.011 1.154 1.305 1.465 1.606 1.797 1.882 1.974 2.07 2.203 2.272 2.418 2.563 2.683 2.744 2.877 3.008 3.17 3.257 3.34 3.463 3.587 3.707 3.826 3.94 4.091 4.234 4.348 4.488 4.631 4.757 4.882 5.002 5.125 5.251 5.381 5.518 5.648 5.756 5.851 5.916 5.96 5.997 5.989 5.931 5.705 5.146 4.099 2.775 1.648 0.662 -0.176 -0.918 -1.559 -2.135 -2.632 -3.093 -3.478 -3.828 -4.158 -4.469 -4.76 -5.023 -5.291 -5.541 -5.767 -6.0 -6.245 -6.451 -6.658 -6.868 -7.019 -7.17 -7.341 -7.524 -7.707 -7.823 -7.937 -8.121 -8.243 -8.368 -8.446 -8.603 -8.737 -8.881 -8.958 -9.113 -9.211 -9.314 -9.427 -9.664 -9.78 -9.887 -9.997 -10.172 -10.402 -10.653 -11.037 -10 ,27250 ,KEBNE ,16657783,Tue Nov 23 05:40:26 CET,Tue Nov 23 07:05:37 CET,0.0 0.854 1.215 1.461 1.629 1.776 1.914 2.042 2.27 2.368 2.457 2.56 2.707 2.78 2.924 3.08 3.232 3.293 3.401 3.508 3.654 3.751 3.848 3.98 4.101 4.228 4.362 4.49 4.65 4.799 4.935 5.09 5.232 5.349 5.486 5.617 5.717 5.85 5.987 6.123 6.265 6.387 6.449 6.483 6.516 6.47 6.357 6.149 5.743 4.991 3.636 1.845 0.261 -1.021 -2.068 -3.016 -3.838 -4.548 -5.146 -5.736 -6.246 -6.682 -7.091 -7.483 -7.843 -8.173 -8.514 -8.809 -9.058 -9.313 -9.564 -9.775 -10.001 -10.237 -10.413 -10.585 -10.763 -10.951 -11.142 -11.273 -11.411 -11.636 -11.796 -11.949 -12.029 -12.199 -12.366 -12.548 -12.639 -12.812 -12.935 -13.047 -13.156 -13.371 -13.493 -13.628 -13.765 -13.932 -14.135 -14.357 -14.827 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_338_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_338_252.txt deleted file mode 100644 index e088fc09..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_338_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9429 ,KEBNE ,16657784,Tue Nov 23 05:40:26 CET,Tue Nov 23 07:07:02 CET,0.0 0.441 0.647 0.818 0.959 1.095 1.216 1.321 1.495 1.57 1.641 1.653 1.852 1.917 2.049 2.177 2.297 2.348 2.442 2.537 2.661 2.739 2.828 2.95 3.055 3.169 3.273 3.364 3.499 3.627 3.74 3.887 4.049 4.2 4.349 4.492 4.629 4.786 4.937 5.084 5.223 5.373 5.564 5.754 5.938 6.127 6.318 6.464 6.562 6.561 6.361 5.862 5.32 4.818 4.377 4.005 3.65 3.319 3.035 2.738 2.457 2.188 1.949 1.738 1.528 1.323 1.093 0.895 0.744 0.59 0.431 0.288 0.136 -0.02 -0.15 -0.281 -0.399 -0.527 -0.672 -0.765 -0.872 -1.047 -1.175 -1.307 -1.366 -1.479 -1.598 -1.716 -1.781 -1.983 -2.032 -2.131 -2.217 -2.422 -2.529 -2.626 -2.751 -2.909 -3.093 -3.315 -3.683 -2 ,17929 ,KEBNE ,16657785,Tue Nov 23 05:40:25 CET,Tue Nov 23 07:06:35 CET,0.0 0.304 0.471 0.611 0.747 0.86 0.956 1.044 1.202 1.275 1.351 1.392 1.592 1.647 1.747 1.86 1.979 2.043 2.164 2.267 2.409 2.499 2.585 2.699 2.801 2.902 3.003 3.101 3.21 3.311 3.426 3.551 3.671 3.799 3.936 4.09 4.238 4.409 4.579 4.727 4.876 5.056 5.248 5.447 5.662 5.815 5.993 6.17 6.302 6.382 6.155 5.567 5.005 4.509 4.029 3.571 3.185 2.814 2.482 2.134 1.838 1.597 1.352 1.112 0.876 0.673 0.472 0.283 0.127 -0.034 -0.197 -0.338 -0.493 -0.669 -0.797 -0.907 -1.035 -1.183 -1.339 -1.456 -1.576 -1.746 -1.856 -1.964 -2.021 -2.14 -2.266 -2.41 -2.493 -2.73 -2.796 -2.881 -2.968 -3.166 -3.286 -3.404 -3.512 -3.635 -3.779 -3.983 -4.449 -3 ,28745 ,KEBNE ,16657786,Tue Nov 23 05:40:26 CET,Tue Nov 23 07:07:01 CET,0.0 0.501 0.669 0.798 0.931 1.055 1.158 1.252 1.427 1.514 1.606 1.618 1.812 1.876 1.992 2.111 2.234 2.289 2.391 2.489 2.625 2.716 2.808 2.943 3.063 3.169 3.285 3.398 3.529 3.637 3.745 3.895 4.045 4.192 4.35 4.518 4.688 4.85 5.004 5.17 5.342 5.528 5.709 5.892 6.12 6.324 6.502 6.618 6.667 6.648 6.422 5.887 5.361 4.874 4.405 3.948 3.545 3.174 2.848 2.527 2.25 1.992 1.749 1.514 1.273 1.046 0.813 0.617 0.459 0.278 0.08 -0.084 -0.25 -0.424 -0.576 -0.712 -0.825 -0.953 -1.085 -1.166 -1.256 -1.422 -1.568 -1.722 -1.787 -1.924 -2.094 -2.288 -2.384 -2.604 -2.659 -2.746 -2.829 -3.018 -3.113 -3.204 -3.305 -3.444 -3.635 -3.863 -4.231 -4 ,9533 ,KEBNE ,16657787,Tue Nov 23 05:40:26 CET,Tue Nov 23 07:02:28 CET,0.0 0.245 0.398 0.527 0.67 0.802 0.923 1.045 1.255 1.33 1.401 1.426 1.623 1.683 1.806 1.916 2.031 2.089 2.196 2.299 2.454 2.546 2.627 2.75 2.856 2.957 3.064 3.168 3.31 3.441 3.545 3.656 3.763 3.863 3.985 4.144 4.295 4.452 4.598 4.741 4.888 5.045 5.215 5.396 5.608 5.796 6.008 6.199 6.308 6.329 6.088 5.532 5.007 4.543 4.108 3.682 3.271 2.902 2.612 2.31 2.019 1.755 1.51 1.275 1.04 0.822 0.599 0.391 0.208 0.036 -0.136 -0.296 -0.461 -0.627 -0.758 -0.887 -1.008 -1.147 -1.303 -1.416 -1.555 -1.757 -1.872 -1.98 -2.033 -2.152 -2.292 -2.434 -2.493 -2.7 -2.763 -2.869 -2.974 -3.178 -3.299 -3.436 -3.567 -3.701 -3.872 -4.067 -4.336 -5 ,27055 ,KEBNE ,16657788,Tue Nov 23 05:40:26 CET,Tue Nov 23 07:02:46 CET,0.0 0.256 0.424 0.549 0.668 0.772 0.871 0.976 1.169 1.259 1.345 1.341 1.526 1.591 1.703 1.802 1.896 1.955 2.075 2.162 2.267 2.34 2.419 2.545 2.66 2.767 2.869 2.958 3.069 3.18 3.287 3.422 3.55 3.651 3.757 3.894 4.035 4.179 4.323 4.488 4.669 4.867 5.09 5.293 5.506 5.706 5.905 6.105 6.282 6.372 6.178 5.622 5.093 4.624 4.177 3.754 3.393 3.052 2.76 2.439 2.13 1.869 1.625 1.411 1.213 1.009 0.79 0.593 0.413 0.214 0.016 -0.118 -0.245 -0.381 -0.503 -0.634 -0.759 -0.908 -1.071 -1.171 -1.283 -1.466 -1.578 -1.683 -1.74 -1.86 -1.977 -2.107 -2.185 -2.391 -2.42 -2.5 -2.585 -2.759 -2.856 -2.965 -3.076 -3.198 -3.346 -3.574 -3.885 -6 ,8454 ,KEBNE ,16657789,Tue Nov 23 05:41:26 CET,Tue Nov 23 07:02:14 CET,0.0 0.46 0.61 0.747 0.873 0.992 1.082 1.159 1.332 1.426 1.514 1.543 1.751 1.827 1.954 2.061 2.187 2.249 2.357 2.466 2.613 2.702 2.784 2.908 3.033 3.139 3.24 3.344 3.493 3.641 3.779 3.924 4.053 4.183 4.322 4.462 4.593 4.743 4.904 5.065 5.223 5.386 5.55 5.698 5.845 5.988 6.169 6.313 6.404 6.429 6.185 5.669 5.155 4.697 4.285 3.859 3.473 3.126 2.844 2.58 2.346 2.128 1.906 1.692 1.478 1.283 1.077 0.861 0.674 0.492 0.297 0.136 -0.029 -0.199 -0.328 -0.456 -0.594 -0.749 -0.909 -1.007 -1.106 -1.272 -1.377 -1.492 -1.551 -1.656 -1.788 -1.913 -1.99 -2.22 -2.253 -2.326 -2.415 -2.623 -2.716 -2.842 -2.983 -3.098 -3.227 -3.421 -3.752 -7 ,6988 ,KEBNE ,16657790,Tue Nov 23 05:41:26 CET,Tue Nov 23 07:02:04 CET,0.0 0.267 0.434 0.566 0.702 0.817 0.904 1.0 1.196 1.276 1.35 1.369 1.552 1.608 1.727 1.835 1.937 1.998 2.116 2.203 2.345 2.444 2.527 2.621 2.707 2.79 2.881 2.982 3.108 3.222 3.322 3.437 3.544 3.663 3.827 4.007 4.172 4.351 4.521 4.672 4.814 4.963 5.164 5.387 5.607 5.839 6.096 6.324 6.522 6.572 6.334 5.876 5.4 4.958 4.539 4.105 3.705 3.353 3.049 2.748 2.473 2.222 1.972 1.735 1.534 1.355 1.185 1.019 0.857 0.689 0.519 0.38 0.224 0.061 -0.054 -0.164 -0.287 -0.442 -0.617 -0.729 -0.833 -0.985 -1.087 -1.202 -1.262 -1.386 -1.523 -1.691 -1.781 -1.987 -2.034 -2.141 -2.235 -2.43 -2.549 -2.673 -2.798 -2.937 -3.092 -3.322 -3.728 -8 ,2002 ,KEBNE ,16657791,Tue Nov 23 05:41:27 CET,Tue Nov 23 07:06:33 CET,0.0 0.443 0.62 0.751 0.87 0.979 1.084 1.195 1.416 1.501 1.566 1.584 1.784 1.844 1.977 2.112 2.227 2.28 2.387 2.491 2.642 2.742 2.838 2.966 3.084 3.202 3.342 3.474 3.63 3.788 3.938 4.106 4.251 4.396 4.569 4.765 4.94 5.089 5.236 5.397 5.571 5.76 5.96 6.131 6.318 6.534 6.731 6.89 7.028 7.06 6.964 6.612 6.056 5.513 4.988 4.525 4.139 3.781 3.474 3.146 2.848 2.564 2.297 2.046 1.803 1.604 1.395 1.183 1.005 0.843 0.661 0.507 0.352 0.181 0.039 -0.113 -0.274 -0.441 -0.628 -0.76 -0.88 -1.052 -1.158 -1.271 -1.335 -1.466 -1.589 -1.734 -1.819 -2.036 -2.066 -2.145 -2.237 -2.458 -2.572 -2.707 -2.86 -3.01 -3.185 -3.443 -3.873 -9 ,31241 ,KEBNE ,16657792,Tue Nov 23 05:41:27 CET,Tue Nov 23 07:08:08 CET,0.0 0.256 0.411 0.549 0.665 0.775 0.882 0.975 1.162 1.247 1.325 1.344 1.551 1.637 1.788 1.909 1.995 2.038 2.13 2.211 2.325 2.402 2.489 2.64 2.774 2.874 2.973 3.066 3.186 3.31 3.438 3.587 3.713 3.822 3.931 4.051 4.176 4.324 4.488 4.653 4.826 5.035 5.243 5.406 5.604 5.824 6.014 6.149 6.231 6.244 6.031 5.559 5.024 4.528 4.077 3.608 3.2 2.852 2.547 2.219 1.933 1.685 1.447 1.23 1.026 0.844 0.649 0.458 0.298 0.126 -0.066 -0.217 -0.365 -0.53 -0.664 -0.795 -0.912 -1.032 -1.172 -1.278 -1.394 -1.558 -1.667 -1.784 -1.843 -1.96 -2.094 -2.256 -2.343 -2.555 -2.573 -2.649 -2.734 -2.964 -3.087 -3.215 -3.354 -3.486 -3.653 -3.859 -4.237 -10 ,9010 ,KEBNE ,16657793,Tue Nov 23 05:41:27 CET,Tue Nov 23 07:02:04 CET,0.0 0.435 0.62 0.806 0.956 1.061 1.161 1.265 1.458 1.562 1.663 1.682 1.87 1.927 2.052 2.188 2.304 2.358 2.47 2.574 2.702 2.79 2.885 3.013 3.128 3.252 3.36 3.452 3.563 3.66 3.774 3.921 4.062 4.185 4.308 4.451 4.597 4.752 4.897 5.06 5.237 5.433 5.638 5.813 6.013 6.193 6.382 6.562 6.669 6.682 6.439 5.824 5.228 4.738 4.273 3.826 3.42 3.053 2.752 2.46 2.183 1.927 1.695 1.468 1.257 1.065 0.835 0.633 0.484 0.321 0.149 0.006 -0.139 -0.304 -0.434 -0.556 -0.693 -0.842 -1.009 -1.12 -1.235 -1.425 -1.563 -1.708 -1.783 -1.924 -2.066 -2.224 -2.315 -2.541 -2.589 -2.673 -2.75 -2.936 -3.059 -3.198 -3.32 -3.442 -3.628 -3.844 -4.172 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_338_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_338_336.txt deleted file mode 100644 index 95fc315c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_338_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30997 ,KEBNE ,16657794,Tue Nov 23 05:42:28 CET,Tue Nov 23 07:04:58 CET,0.0 0.608 0.898 1.087 1.227 1.381 1.53 1.637 1.847 1.952 2.043 2.054 2.264 2.346 2.495 2.635 2.778 2.852 2.98 3.1 3.283 3.397 3.505 3.658 3.803 3.957 4.118 4.267 4.448 4.612 4.76 4.942 5.147 5.351 5.543 5.75 5.957 6.184 6.432 6.688 6.984 7.308 7.676 8.044 8.421 8.821 9.231 9.664 10.178 10.704 11.285 11.572 11.525 11.371 11.151 10.941 10.75 10.541 10.348 10.123 9.931 9.734 9.533 9.365 9.191 9.031 8.869 8.709 8.549 8.384 8.224 8.07 7.9 7.745 7.636 7.52 7.407 7.29 7.17 7.091 7.001 6.827 6.705 6.591 6.524 6.39 6.267 6.148 6.079 5.876 5.839 5.742 5.645 5.438 5.324 5.22 5.099 4.953 4.775 4.455 3.752 -2 ,16347 ,KEBNE ,16657795,Tue Nov 23 05:42:28 CET,Tue Nov 23 07:05:04 CET,0.0 0.434 0.666 0.867 1.019 1.113 1.207 1.309 1.488 1.576 1.667 1.725 1.922 1.988 2.128 2.251 2.38 2.439 2.531 2.628 2.771 2.865 2.966 3.103 3.25 3.407 3.563 3.701 3.859 4.016 4.177 4.366 4.537 4.723 4.924 5.126 5.329 5.533 5.743 5.962 6.188 6.446 6.752 7.048 7.384 7.758 8.161 8.653 9.208 9.726 10.174 10.354 10.328 10.179 9.937 9.668 9.437 9.22 9.025 8.839 8.657 8.459 8.275 8.104 7.942 7.794 7.628 7.484 7.37 7.243 7.1 6.994 6.886 6.765 6.664 6.542 6.422 6.322 6.224 6.142 6.056 5.938 5.847 5.741 5.687 5.58 5.459 5.317 5.246 5.051 5.023 4.951 4.875 4.666 4.539 4.428 4.33 4.22 4.059 3.85 3.423 -3 ,5689 ,KEBNE ,16657796,Tue Nov 23 05:44:30 CET,Tue Nov 23 07:10:51 CET,0.0 0.739 0.943 1.09 1.225 1.332 1.44 1.55 1.748 1.844 1.934 1.97 2.186 2.266 2.418 2.564 2.711 2.783 2.931 3.071 3.251 3.351 3.444 3.579 3.708 3.833 3.945 4.056 4.218 4.386 4.54 4.743 4.955 5.139 5.341 5.553 5.755 6.006 6.274 6.563 6.886 7.242 7.629 7.992 8.377 8.775 9.26 9.786 10.354 10.95 11.498 11.768 11.801 11.698 11.523 11.302 11.092 10.876 10.655 10.426 10.196 9.988 9.799 9.601 9.424 9.273 9.116 8.959 8.79 8.619 8.458 8.315 8.137 7.952 7.836 7.718 7.593 7.459 7.31 7.211 7.112 6.958 6.848 6.738 6.681 6.538 6.387 6.25 6.184 5.997 5.945 5.852 5.759 5.539 5.415 5.285 5.154 5.016 4.823 4.536 3.771 -4 ,22514 ,KEBNE ,16657797,Tue Nov 23 05:44:31 CET,Tue Nov 23 07:11:04 CET,0.0 0.784 1.06 1.212 1.341 1.48 1.593 1.691 1.88 1.972 2.071 2.137 2.345 2.427 2.575 2.704 2.828 2.895 3.022 3.142 3.319 3.432 3.55 3.708 3.86 4.001 4.146 4.297 4.47 4.639 4.792 4.966 5.127 5.306 5.541 5.78 6.011 6.257 6.498 6.762 7.032 7.328 7.706 8.052 8.419 8.834 9.277 9.765 10.379 10.989 11.468 11.63 11.555 11.415 11.229 11.017 10.774 10.541 10.352 10.128 9.911 9.723 9.54 9.347 9.175 9.027 8.866 8.725 8.6 8.455 8.292 8.158 8.028 7.889 7.775 7.644 7.502 7.371 7.22 7.118 7.028 6.873 6.764 6.658 6.603 6.474 6.308 6.152 6.084 5.873 5.817 5.724 5.622 5.401 5.277 5.147 5.014 4.854 4.671 4.455 4.131 -5 ,18702 ,KEBNE ,16657798,Tue Nov 23 05:44:30 CET,Tue Nov 23 07:10:51 CET,0.0 0.796 1.048 1.213 1.359 1.498 1.621 1.733 1.937 2.032 2.116 2.135 2.325 2.395 2.54 2.666 2.79 2.855 2.991 3.114 3.267 3.376 3.499 3.669 3.825 3.968 4.1 4.242 4.432 4.603 4.754 4.927 5.085 5.248 5.432 5.619 5.809 6.012 6.228 6.473 6.755 7.085 7.426 7.741 8.098 8.499 8.988 9.507 10.035 10.597 11.085 11.358 11.323 11.068 10.784 10.521 10.268 10.018 9.794 9.559 9.359 9.178 9.003 8.845 8.689 8.545 8.386 8.218 8.085 7.933 7.756 7.63 7.501 7.367 7.26 7.15 7.029 6.892 6.759 6.665 6.556 6.381 6.261 6.139 6.079 5.951 5.808 5.634 5.541 5.33 5.285 5.185 5.075 4.853 4.745 4.622 4.471 4.285 4.029 3.704 3.164 -6 ,28120 ,KEBNE ,16657799,Tue Nov 23 05:44:30 CET,Tue Nov 23 07:10:29 CET,0.0 0.356 0.508 0.658 0.811 0.947 1.069 1.158 1.31 1.401 1.499 1.544 1.747 1.831 1.975 2.115 2.257 2.317 2.432 2.568 2.791 2.921 3.029 3.172 3.302 3.419 3.538 3.665 3.83 3.979 4.104 4.26 4.432 4.597 4.779 4.984 5.191 5.421 5.649 5.897 6.157 6.45 6.811 7.178 7.564 7.984 8.485 9.01 9.573 10.156 10.709 10.975 10.978 10.887 10.717 10.48 10.269 10.093 9.94 9.766 9.582 9.406 9.218 9.031 8.878 8.752 8.606 8.467 8.343 8.211 8.044 7.894 7.763 7.624 7.51 7.395 7.284 7.168 7.026 6.916 6.804 6.641 6.541 6.435 6.379 6.248 6.114 6.002 5.943 5.746 5.708 5.631 5.554 5.392 5.302 5.177 5.015 4.841 4.689 4.505 4.04 -7 ,11787 ,KEBNE ,16657800,Tue Nov 23 05:45:32 CET,Tue Nov 23 07:12:04 CET,0.0 0.585 0.791 0.932 1.074 1.195 1.306 1.422 1.625 1.725 1.821 1.856 2.066 2.147 2.301 2.462 2.599 2.655 2.783 2.904 3.063 3.171 3.276 3.459 3.629 3.763 3.894 4.019 4.184 4.35 4.501 4.679 4.862 5.037 5.228 5.434 5.623 5.804 6.014 6.269 6.527 6.812 7.124 7.427 7.815 8.23 8.678 9.163 9.702 10.243 10.715 10.928 10.921 10.811 10.578 10.297 10.039 9.793 9.576 9.342 9.099 8.886 8.699 8.536 8.383 8.208 8.019 7.862 7.73 7.593 7.458 7.341 7.209 7.05 6.926 6.822 6.705 6.566 6.438 6.348 6.255 6.119 6.015 5.895 5.839 5.717 5.566 5.4 5.32 5.124 5.082 4.995 4.901 4.662 4.517 4.36 4.202 4.069 3.903 3.624 3.179 -8 ,12719 ,KEBNE ,16657801,Tue Nov 23 05:45:32 CET,Tue Nov 23 07:12:13 CET,0.0 0.39 0.528 0.659 0.822 0.98 1.105 1.211 1.404 1.491 1.578 1.638 1.849 1.927 2.069 2.212 2.344 2.412 2.554 2.677 2.838 2.951 3.064 3.22 3.39 3.552 3.691 3.821 3.982 4.143 4.291 4.458 4.632 4.798 4.989 5.221 5.436 5.667 5.9 6.143 6.423 6.732 7.046 7.347 7.687 8.048 8.465 8.907 9.426 9.945 10.352 10.525 10.464 10.334 10.185 10.026 9.836 9.637 9.449 9.247 9.058 8.856 8.679 8.523 8.368 8.193 8.015 7.881 7.762 7.631 7.471 7.34 7.215 7.092 6.991 6.878 6.748 6.615 6.487 6.4 6.317 6.183 6.089 5.983 5.924 5.824 5.72 5.6 5.532 5.323 5.278 5.195 5.103 4.906 4.799 4.675 4.515 4.316 4.111 3.825 3.188 -9 ,6970 ,KEBNE ,16657802,Tue Nov 23 05:45:32 CET,Tue Nov 23 07:12:11 CET,0.0 0.447 0.676 0.85 0.996 1.15 1.289 1.409 1.621 1.719 1.808 1.845 2.066 2.152 2.319 2.48 2.63 2.694 2.813 2.936 3.105 3.206 3.305 3.461 3.615 3.761 3.903 4.044 4.215 4.385 4.555 4.743 4.916 5.083 5.265 5.486 5.703 5.908 6.137 6.413 6.674 6.948 7.306 7.67 8.042 8.463 8.949 9.484 10.042 10.578 11.05 11.181 11.082 10.902 10.72 10.496 10.258 10.011 9.764 9.501 9.267 9.048 8.828 8.634 8.468 8.313 8.133 7.97 7.834 7.694 7.547 7.422 7.291 7.149 7.039 6.931 6.821 6.706 6.582 6.494 6.392 6.232 6.131 6.02 5.964 5.858 5.723 5.566 5.488 5.276 5.245 5.168 5.08 4.883 4.766 4.654 4.549 4.411 4.232 4.013 3.505 -10 ,17650 ,KEBNE ,16657803,Tue Nov 23 05:46:33 CET,Tue Nov 23 07:08:33 CET,0.0 0.276 0.481 0.648 0.799 0.948 1.077 1.197 1.402 1.509 1.616 1.669 1.882 1.965 2.099 2.228 2.356 2.421 2.552 2.66 2.798 2.894 2.989 3.132 3.272 3.408 3.55 3.683 3.842 3.995 4.15 4.332 4.493 4.648 4.835 5.053 5.271 5.513 5.781 6.066 6.35 6.634 6.956 7.275 7.629 8.036 8.515 9.038 9.564 10.134 10.719 11.014 11.009 10.871 10.696 10.486 10.259 10.031 9.815 9.59 9.387 9.205 9.033 8.871 8.702 8.531 8.335 8.147 8.002 7.863 7.72 7.592 7.455 7.319 7.214 7.098 6.968 6.834 6.681 6.569 6.469 6.325 6.211 6.096 6.032 5.894 5.756 5.602 5.529 5.332 5.265 5.168 5.069 4.817 4.659 4.5 4.359 4.232 4.091 3.876 3.229 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_35_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_35_41.txt deleted file mode 100644 index b046c90f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_35_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23538 ,KEBNE ,16657804,Tue Nov 23 05:46:34 CET,Tue Nov 23 07:07:12 CET,0.0 0.825 1.083 1.291 1.469 1.629 1.761 1.885 2.128 2.238 2.342 2.441 2.594 2.686 2.852 2.991 3.127 3.188 3.31 3.443 3.64 3.77 3.896 4.063 4.219 4.379 4.52 4.65 4.827 5.008 5.17 5.369 5.565 5.721 5.897 6.104 6.3 6.488 6.689 6.896 7.104 7.327 7.564 7.805 8.074 8.366 8.646 8.897 9.108 9.161 8.874 8.254 7.597 6.981 6.434 5.925 5.47 5.06 4.703 4.318 3.966 3.655 3.365 3.08 2.8 2.541 2.283 2.05 1.859 1.667 1.422 1.202 0.993 0.767 0.587 0.407 0.216 0.034 -0.157 -0.294 -0.434 -0.679 -0.837 -0.989 -1.065 -1.204 -1.352 -1.516 -1.612 -1.789 -1.92 -2.042 -2.168 -2.404 -2.544 -2.716 -2.89 -3.052 -3.268 -3.564 -4.497 -2 ,5063 ,KEBNE ,16657805,Tue Nov 23 05:46:33 CET,Tue Nov 23 07:12:11 CET,0.0 0.545 0.798 1.004 1.182 1.337 1.471 1.597 1.827 1.934 2.036 2.157 2.318 2.39 2.543 2.694 2.83 2.897 3.025 3.149 3.309 3.409 3.524 3.685 3.839 3.995 4.133 4.257 4.407 4.565 4.721 4.926 5.116 5.271 5.45 5.648 5.85 6.056 6.263 6.478 6.69 6.903 7.149 7.383 7.59 7.806 8.021 8.215 8.406 8.465 8.276 7.788 7.212 6.615 6.032 5.475 4.945 4.481 4.118 3.723 3.362 3.044 2.724 2.422 2.161 1.916 1.642 1.4 1.193 0.987 0.759 0.552 0.353 0.148 -0.022 -0.207 -0.391 -0.549 -0.727 -0.861 -1.001 -1.207 -1.346 -1.505 -1.588 -1.778 -1.985 -2.205 -2.307 -2.473 -2.59 -2.706 -2.821 -3.062 -3.201 -3.332 -3.478 -3.669 -3.881 -4.152 -5.062 -3 ,1884 ,KEBNE ,16657806,Tue Nov 23 05:46:33 CET,Tue Nov 23 07:06:42 CET,0.0 0.492 0.785 0.974 1.098 1.21 1.334 1.455 1.643 1.732 1.832 1.953 2.118 2.191 2.31 2.427 2.554 2.623 2.757 2.881 3.066 3.181 3.283 3.427 3.559 3.689 3.825 3.95 4.106 4.265 4.43 4.634 4.814 4.973 5.143 5.334 5.502 5.673 5.861 6.069 6.282 6.525 6.785 6.998 7.217 7.445 7.676 7.851 7.969 7.984 7.663 7.034 6.407 5.817 5.292 4.805 4.333 3.873 3.478 3.084 2.738 2.423 2.077 1.768 1.529 1.312 1.082 0.842 0.616 0.355 0.06 -0.168 -0.39 -0.62 -0.8 -0.974 -1.148 -1.334 -1.529 -1.672 -1.816 -2.022 -2.159 -2.306 -2.394 -2.587 -2.783 -2.964 -3.049 -3.22 -3.351 -3.467 -3.595 -3.867 -4.007 -4.165 -4.345 -4.51 -4.681 -4.901 -5.593 -4 ,13202 ,KEBNE ,16657807,Tue Nov 23 05:46:34 CET,Tue Nov 23 07:07:15 CET,0.0 0.617 0.932 1.165 1.333 1.459 1.568 1.682 1.921 2.036 2.142 2.267 2.434 2.526 2.682 2.817 2.955 3.026 3.158 3.266 3.426 3.54 3.663 3.842 3.993 4.131 4.258 4.364 4.496 4.654 4.805 4.973 5.131 5.288 5.482 5.697 5.884 6.086 6.287 6.497 6.73 6.964 7.214 7.451 7.704 7.983 8.295 8.521 8.645 8.675 8.433 7.883 7.287 6.694 6.14 5.607 5.139 4.717 4.308 3.877 3.509 3.174 2.876 2.614 2.368 2.15 1.911 1.688 1.5 1.29 1.076 0.904 0.711 0.511 0.358 0.186 0.01 -0.156 -0.334 -0.458 -0.583 -0.777 -0.905 -1.055 -1.138 -1.288 -1.444 -1.629 -1.722 -1.894 -2.059 -2.186 -2.3 -2.542 -2.696 -2.852 -3.014 -3.201 -3.377 -3.577 -4.412 -5 ,4296 ,KEBNE ,16657808,Tue Nov 23 05:47:35 CET,Tue Nov 23 07:09:48 CET,0.0 0.715 0.975 1.169 1.341 1.494 1.634 1.763 1.99 2.094 2.194 2.312 2.479 2.571 2.742 2.919 3.093 3.172 3.316 3.431 3.595 3.704 3.809 3.942 4.065 4.194 4.325 4.442 4.594 4.753 4.909 5.086 5.247 5.411 5.593 5.802 5.99 6.182 6.42 6.651 6.876 7.115 7.324 7.538 7.792 8.035 8.326 8.606 8.79 8.879 8.71 8.133 7.509 6.904 6.339 5.823 5.357 4.948 4.572 4.19 3.879 3.584 3.303 3.008 2.727 2.487 2.201 1.958 1.765 1.555 1.336 1.145 0.933 0.715 0.561 0.402 0.246 0.081 -0.127 -0.279 -0.425 -0.656 -0.819 -0.982 -1.064 -1.224 -1.41 -1.605 -1.704 -1.886 -2.014 -2.125 -2.244 -2.495 -2.631 -2.797 -2.966 -3.154 -3.389 -3.736 -4.521 -6 ,9780 ,KEBNE ,16657809,Tue Nov 23 05:47:34 CET,Tue Nov 23 07:07:50 CET,0.0 0.769 1.08 1.28 1.474 1.646 1.766 1.89 2.153 2.275 2.392 2.535 2.699 2.784 2.945 3.098 3.24 3.311 3.455 3.583 3.764 3.889 4.002 4.167 4.321 4.449 4.578 4.711 4.886 5.056 5.205 5.375 5.553 5.701 5.875 6.088 6.237 6.388 6.571 6.786 7.021 7.296 7.604 7.856 8.12 8.367 8.611 8.812 8.986 9.062 8.835 8.295 7.653 7.024 6.466 5.946 5.48 5.026 4.615 4.218 3.878 3.572 3.262 2.951 2.676 2.412 2.127 1.889 1.682 1.465 1.232 1.055 0.882 0.698 0.546 0.354 0.147 -0.057 -0.269 -0.414 -0.563 -0.799 -0.967 -1.134 -1.221 -1.399 -1.582 -1.774 -1.873 -2.055 -2.206 -2.325 -2.457 -2.753 -2.901 -3.053 -3.24 -3.448 -3.646 -3.895 -4.327 -7 ,1875 ,KEBNE ,16657810,Tue Nov 23 05:47:35 CET,Tue Nov 23 07:08:41 CET,0.0 0.589 0.881 1.076 1.246 1.395 1.518 1.629 1.844 1.948 2.041 2.152 2.327 2.427 2.592 2.746 2.895 2.966 3.102 3.239 3.427 3.542 3.651 3.8 3.948 4.09 4.236 4.36 4.518 4.663 4.789 4.947 5.092 5.246 5.438 5.652 5.87 6.1 6.339 6.583 6.806 7.066 7.316 7.496 7.72 7.955 8.178 8.372 8.529 8.608 8.425 7.825 7.171 6.563 6.024 5.555 5.137 4.72 4.358 3.983 3.633 3.331 3.042 2.722 2.404 2.147 1.897 1.667 1.446 1.195 0.954 0.764 0.565 0.349 0.185 0.037 -0.099 -0.255 -0.43 -0.549 -0.674 -0.877 -1.03 -1.188 -1.263 -1.436 -1.627 -1.824 -1.918 -2.09 -2.22 -2.327 -2.44 -2.662 -2.78 -2.911 -3.056 -3.244 -3.458 -3.727 -4.291 -8 ,19734 ,KEBNE ,16657811,Tue Nov 23 05:49:38 CET,Tue Nov 23 07:10:21 CET,0.0 0.743 0.999 1.161 1.288 1.451 1.612 1.743 1.982 2.085 2.17 2.252 2.406 2.49 2.657 2.802 2.931 2.995 3.12 3.224 3.37 3.465 3.564 3.717 3.854 3.983 4.109 4.236 4.407 4.573 4.736 4.936 5.109 5.241 5.405 5.59 5.739 5.908 6.091 6.275 6.48 6.712 6.969 7.19 7.409 7.624 7.82 7.995 8.131 8.177 7.961 7.397 6.818 6.233 5.616 5.052 4.589 4.189 3.833 3.439 3.096 2.782 2.455 2.124 1.848 1.63 1.379 1.139 0.924 0.695 0.481 0.317 0.134 -0.053 -0.199 -0.364 -0.527 -0.702 -0.918 -1.064 -1.198 -1.425 -1.594 -1.752 -1.828 -1.981 -2.141 -2.331 -2.43 -2.612 -2.77 -2.885 -2.999 -3.245 -3.385 -3.535 -3.711 -3.9 -4.106 -4.371 -4.984 -9 ,24100 ,KEBNE ,16657812,Tue Nov 23 05:51:40 CET,Tue Nov 23 07:14:24 CET,0.0 0.82 1.188 1.418 1.601 1.768 1.907 2.015 2.239 2.356 2.468 2.614 2.782 2.867 3.014 3.168 3.314 3.387 3.531 3.646 3.807 3.911 4.006 4.159 4.326 4.476 4.607 4.732 4.905 5.075 5.236 5.427 5.598 5.755 5.919 6.105 6.305 6.517 6.719 6.934 7.137 7.332 7.537 7.753 7.999 8.225 8.439 8.636 8.839 8.933 8.708 8.081 7.407 6.827 6.302 5.782 5.308 4.878 4.501 4.085 3.741 3.402 3.052 2.786 2.557 2.334 2.08 1.839 1.627 1.422 1.218 1.035 0.821 0.6 0.433 0.269 0.107 -0.071 -0.272 -0.424 -0.58 -0.815 -0.971 -1.131 -1.222 -1.411 -1.599 -1.784 -1.869 -2.038 -2.17 -2.28 -2.387 -2.665 -2.83 -3.0 -3.173 -3.328 -3.54 -3.8 -4.307 -10 ,5814 ,KEBNE ,16657813,Tue Nov 23 05:52:42 CET,Tue Nov 23 07:16:01 CET,0.0 0.575 0.794 0.946 1.083 1.219 1.34 1.446 1.648 1.752 1.848 1.938 2.089 2.169 2.337 2.514 2.676 2.739 2.868 2.985 3.125 3.228 3.337 3.486 3.618 3.734 3.855 3.984 4.142 4.284 4.441 4.63 4.788 4.942 5.114 5.296 5.456 5.645 5.842 6.026 6.221 6.432 6.667 6.883 7.115 7.353 7.579 7.802 7.93 7.926 7.666 7.065 6.437 5.828 5.272 4.728 4.243 3.8 3.423 3.046 2.69 2.352 2.046 1.774 1.506 1.248 0.993 0.748 0.527 0.312 0.078 -0.133 -0.344 -0.566 -0.738 -0.899 -1.068 -1.262 -1.462 -1.593 -1.738 -1.964 -2.122 -2.278 -2.35 -2.506 -2.691 -2.905 -3.017 -3.202 -3.34 -3.443 -3.553 -3.835 -3.987 -4.172 -4.385 -4.604 -4.861 -5.178 -5.852 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_35_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_35_50.txt deleted file mode 100644 index 492cbe78..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_35_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29008 ,KEBNE ,16657814,Tue Nov 23 05:52:42 CET,Tue Nov 23 07:13:59 CET,0.0 0.217 0.365 0.522 0.683 0.815 0.917 1.014 1.216 1.308 1.393 1.479 1.636 1.721 1.877 2.008 2.124 2.181 2.294 2.406 2.555 2.648 2.744 2.893 3.033 3.16 3.284 3.402 3.555 3.701 3.838 4.009 4.177 4.336 4.511 4.704 4.879 5.065 5.269 5.473 5.681 5.904 6.166 6.442 6.735 7.005 7.298 7.601 7.888 8.106 8.172 7.994 7.604 7.127 6.589 6.081 5.663 5.298 4.94 4.523 4.169 3.859 3.554 3.231 2.931 2.677 2.419 2.188 1.969 1.731 1.475 1.261 1.046 0.822 0.652 0.471 0.285 0.09 -0.107 -0.228 -0.357 -0.584 -0.761 -0.941 -1.03 -1.225 -1.425 -1.639 -1.752 -1.937 -2.101 -2.221 -2.335 -2.611 -2.775 -2.941 -3.139 -3.373 -3.611 -3.877 -4.702 -2 ,21556 ,KEBNE ,16657815,Tue Nov 23 05:53:43 CET,Tue Nov 23 07:13:24 CET,0.0 0.475 0.701 0.864 0.996 1.126 1.24 1.33 1.503 1.598 1.678 1.758 1.912 1.986 2.124 2.267 2.408 2.473 2.597 2.719 2.9 3.016 3.115 3.246 3.375 3.496 3.614 3.736 3.895 4.048 4.19 4.349 4.502 4.652 4.83 5.024 5.198 5.388 5.6 5.824 6.044 6.288 6.552 6.822 7.156 7.506 7.874 8.257 8.634 8.947 9.088 8.89 8.541 8.198 7.863 7.478 7.088 6.705 6.358 5.97 5.591 5.294 5.041 4.779 4.517 4.281 4.03 3.792 3.582 3.352 3.111 2.916 2.71 2.503 2.338 2.158 1.965 1.755 1.534 1.389 1.24 0.994 0.841 0.702 0.625 0.437 0.261 0.09 -0.011 -0.195 -0.369 -0.488 -0.616 -0.912 -1.046 -1.161 -1.311 -1.474 -1.656 -1.935 -2.568 -3 ,20785 ,KEBNE ,16657816,Tue Nov 23 05:54:44 CET,Tue Nov 23 07:14:41 CET,0.0 0.359 0.554 0.723 0.864 0.964 1.064 1.172 1.386 1.476 1.561 1.665 1.815 1.886 2.025 2.135 2.25 2.313 2.423 2.524 2.677 2.78 2.879 3.005 3.128 3.256 3.376 3.492 3.648 3.795 3.931 4.097 4.263 4.414 4.588 4.779 4.965 5.195 5.424 5.662 5.907 6.163 6.464 6.759 7.071 7.38 7.717 8.039 8.397 8.758 8.96 8.794 8.359 7.876 7.45 6.89 6.268 5.719 5.258 4.816 4.431 4.121 3.857 3.555 3.246 2.983 2.694 2.455 2.273 2.058 1.806 1.585 1.356 1.142 0.982 0.824 0.662 0.483 0.298 0.165 0.023 -0.194 -0.35 -0.506 -0.591 -0.767 -0.949 -1.157 -1.256 -1.432 -1.606 -1.739 -1.867 -2.138 -2.299 -2.449 -2.588 -2.738 -2.908 -3.257 -4.568 -4 ,23149 ,KEBNE ,16657817,Tue Nov 23 05:55:46 CET,Tue Nov 23 07:17:02 CET,0.0 0.445 0.653 0.783 0.905 1.04 1.157 1.274 1.492 1.576 1.662 1.772 1.935 2.015 2.157 2.286 2.409 2.468 2.585 2.709 2.878 2.982 3.084 3.218 3.359 3.497 3.614 3.718 3.844 3.978 4.123 4.288 4.434 4.574 4.735 4.915 5.082 5.26 5.463 5.681 5.907 6.16 6.438 6.705 7.02 7.342 7.69 8.006 8.305 8.631 8.816 8.667 8.301 7.887 7.475 7.054 6.689 6.271 5.862 5.479 5.079 4.711 4.382 4.071 3.775 3.49 3.195 2.926 2.685 2.424 2.166 1.966 1.747 1.518 1.344 1.166 0.968 0.763 0.563 0.426 0.284 0.051 -0.118 -0.287 -0.38 -0.578 -0.778 -0.978 -1.087 -1.283 -1.467 -1.587 -1.705 -1.938 -2.068 -2.251 -2.457 -2.649 -2.874 -3.204 -3.984 -5 ,1334 ,KEBNE ,16657818,Tue Nov 23 05:55:46 CET,Tue Nov 23 07:17:45 CET,0.0 0.44 0.689 0.876 1.03 1.157 1.256 1.37 1.578 1.666 1.745 1.815 1.956 2.024 2.147 2.277 2.404 2.463 2.572 2.664 2.804 2.91 3.006 3.139 3.268 3.39 3.509 3.625 3.77 3.914 4.066 4.237 4.378 4.512 4.675 4.86 5.033 5.224 5.426 5.636 5.848 6.074 6.345 6.603 6.86 7.157 7.494 7.799 8.067 8.132 7.954 7.557 7.024 6.477 5.941 5.364 4.806 4.274 3.796 3.267 2.804 2.418 2.051 1.712 1.393 1.101 0.791 0.523 0.273 -0.013 -0.306 -0.538 -0.756 -0.966 -1.135 -1.33 -1.544 -1.766 -1.99 -2.145 -2.299 -2.547 -2.726 -2.901 -2.987 -3.178 -3.389 -3.592 -3.697 -3.868 -4.015 -4.156 -4.303 -4.594 -4.761 -4.966 -5.185 -5.419 -5.693 -6.026 -6.938 -6 ,24050 ,KEBNE ,16657819,Tue Nov 23 05:55:46 CET,Tue Nov 23 07:16:44 CET,0.0 0.287 0.457 0.619 0.784 0.891 0.979 1.071 1.25 1.33 1.418 1.519 1.675 1.771 1.933 2.051 2.181 2.25 2.375 2.479 2.625 2.724 2.812 2.937 3.072 3.211 3.344 3.466 3.619 3.763 3.897 4.049 4.199 4.345 4.526 4.742 4.937 5.151 5.379 5.613 5.839 6.093 6.382 6.643 6.936 7.219 7.545 7.877 8.172 8.441 8.528 8.272 7.847 7.359 6.866 6.328 5.808 5.336 4.937 4.543 4.155 3.817 3.511 3.192 2.882 2.584 2.291 2.046 1.811 1.565 1.32 1.108 0.876 0.635 0.453 0.261 0.054 -0.154 -0.351 -0.5 -0.66 -0.893 -1.059 -1.235 -1.324 -1.509 -1.708 -1.909 -2.016 -2.204 -2.366 -2.507 -2.66 -2.946 -3.094 -3.26 -3.467 -3.719 -4.001 -4.336 -5.471 -7 ,18498 ,KEBNE ,16657820,Tue Nov 23 05:55:46 CET,Tue Nov 23 07:15:28 CET,0.0 0.271 0.398 0.513 0.644 0.786 0.902 0.995 1.161 1.254 1.346 1.433 1.58 1.641 1.783 1.923 2.035 2.086 2.195 2.306 2.458 2.554 2.657 2.801 2.921 3.037 3.152 3.265 3.411 3.559 3.704 3.869 4.023 4.174 4.366 4.597 4.793 5.001 5.24 5.471 5.686 5.903 6.151 6.41 6.681 6.975 7.3 7.594 7.803 7.868 7.754 7.329 6.744 6.171 5.63 5.126 4.696 4.297 3.912 3.474 3.123 2.857 2.58 2.283 2.011 1.783 1.552 1.315 1.098 0.869 0.631 0.438 0.227 0.0 -0.17 -0.338 -0.526 -0.718 -0.909 -1.052 -1.202 -1.414 -1.558 -1.711 -1.792 -1.958 -2.133 -2.332 -2.432 -2.602 -2.771 -2.896 -3.019 -3.299 -3.446 -3.625 -3.857 -4.135 -4.447 -4.823 -5.664 -8 ,26646 ,KEBNE ,16657821,Tue Nov 23 05:55:47 CET,Tue Nov 23 07:17:35 CET,0.0 0.414 0.606 0.761 0.912 1.037 1.144 1.258 1.456 1.541 1.623 1.706 1.855 1.925 2.058 2.183 2.298 2.355 2.486 2.609 2.781 2.885 2.976 3.106 3.227 3.347 3.472 3.587 3.732 3.877 4.008 4.17 4.33 4.476 4.653 4.856 5.04 5.239 5.462 5.692 5.921 6.173 6.47 6.767 7.089 7.388 7.663 7.976 8.255 8.432 8.446 8.05 7.561 7.053 6.559 6.107 5.643 5.202 4.825 4.43 4.069 3.727 3.399 3.088 2.78 2.492 2.202 1.953 1.734 1.488 1.239 1.03 0.808 0.584 0.402 0.203 0.001 -0.212 -0.427 -0.563 -0.705 -0.93 -1.093 -1.261 -1.338 -1.51 -1.712 -1.922 -2.026 -2.208 -2.371 -2.486 -2.604 -2.893 -3.046 -3.212 -3.411 -3.634 -3.901 -4.217 -4.903 -9 ,11001 ,KEBNE ,16657822,Tue Nov 23 05:56:47 CET,Tue Nov 23 07:17:55 CET,0.0 0.333 0.566 0.755 0.9 1.026 1.135 1.248 1.47 1.565 1.65 1.737 1.89 1.964 2.11 2.238 2.354 2.409 2.519 2.635 2.819 2.938 3.038 3.179 3.322 3.457 3.583 3.709 3.866 4.011 4.149 4.307 4.46 4.608 4.786 4.987 5.172 5.385 5.61 5.833 6.059 6.297 6.571 6.857 7.177 7.515 7.878 8.227 8.56 8.882 9.009 8.691 8.302 7.927 7.546 7.175 6.818 6.444 6.094 5.756 5.484 5.214 4.876 4.524 4.258 4.036 3.799 3.58 3.367 3.147 2.904 2.7 2.495 2.279 2.12 1.954 1.779 1.577 1.359 1.218 1.069 0.848 0.699 0.554 0.477 0.301 0.116 -0.076 -0.174 -0.354 -0.506 -0.624 -0.755 -1.036 -1.187 -1.34 -1.529 -1.771 -2.038 -2.361 -3.056 -10 ,4258 ,KEBNE ,16657823,Tue Nov 23 05:56:47 CET,Tue Nov 23 07:19:38 CET,0.0 0.555 0.857 1.031 1.176 1.311 1.434 1.536 1.708 1.806 1.907 2.013 2.159 2.229 2.378 2.52 2.649 2.711 2.831 2.935 3.089 3.188 3.284 3.43 3.574 3.725 3.853 3.968 4.133 4.284 4.423 4.581 4.726 4.867 5.037 5.232 5.409 5.595 5.803 6.035 6.279 6.542 6.836 7.113 7.427 7.741 8.061 8.391 8.734 9.0 8.972 8.541 7.985 7.46 7.04 6.615 6.153 5.724 5.374 5.007 4.685 4.401 4.125 3.853 3.604 3.369 3.118 2.888 2.688 2.499 2.275 2.059 1.852 1.646 1.467 1.284 1.105 0.927 0.738 0.602 0.451 0.203 0.042 -0.116 -0.203 -0.396 -0.6 -0.821 -0.936 -1.123 -1.299 -1.428 -1.563 -1.875 -2.029 -2.171 -2.324 -2.501 -2.761 -3.139 -3.543 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_35_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_35_54.txt deleted file mode 100644 index 60c9d504..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_35_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16803 ,KEBNE ,17023767,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:49:31 CET,0.0 0.672 0.9 1.15 1.372 1.566 1.737 1.877 2.125 2.232 2.338 2.452 2.609 2.687 2.857 3.025 3.176 3.246 3.381 3.516 3.721 3.852 3.965 4.112 4.26 4.402 4.543 4.68 4.852 5.017 5.16 5.306 5.442 5.568 5.7 5.854 5.983 6.126 6.273 6.426 6.578 6.724 6.875 7.003 7.083 7.081 7.022 6.829 6.398 5.69 4.425 2.638 1.074 -0.288 -1.492 -2.584 -3.512 -4.34 -5.086 -5.782 -6.367 -6.906 -7.423 -7.919 -8.36 -8.76 -9.184 -9.562 -9.88 -10.209 -10.576 -10.867 -11.146 -11.453 -11.705 -11.967 -12.246 -12.533 -12.841 -13.058 -13.262 -13.597 -13.853 -14.114 -14.24 -14.494 -14.764 -15.045 -15.182 -15.416 -15.625 -15.786 -15.954 -16.277 -16.43 -16.622 -16.881 -17.158 -17.437 -17.815 -18.579 -2 ,29339 ,KEBNE ,17023768,Wed Dec 22 08:26:15 CET,Wed Dec 22 09:49:49 CET,0.0 0.703 0.997 1.248 1.479 1.667 1.818 1.966 2.249 2.375 2.495 2.646 2.826 2.926 3.094 3.246 3.399 3.475 3.63 3.769 3.939 4.038 4.139 4.295 4.437 4.559 4.65 4.749 4.886 5.011 5.144 5.331 5.511 5.662 5.799 5.898 6.002 6.115 6.266 6.459 6.627 6.804 6.963 7.038 7.03 6.93 6.757 6.482 6.07 5.235 3.481 1.287 -0.457 -1.898 -3.1 -4.188 -5.155 -5.969 -6.675 -7.435 -8.054 -8.558 -9.051 -9.515 -9.924 -10.294 -10.7 -11.08 -11.399 -11.703 -12.023 -12.293 -12.56 -12.834 -13.052 -13.281 -13.534 -13.807 -14.081 -14.259 -14.441 -14.717 -14.903 -15.104 -15.205 -15.4 -15.609 -15.852 -15.973 -16.163 -16.309 -16.457 -16.614 -16.953 -17.113 -17.257 -17.438 -17.644 -17.901 -18.27 -18.893 -3 ,8783 ,KEBNE ,17023769,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:48:54 CET,0.0 0.875 1.207 1.469 1.691 1.887 2.07 2.232 2.517 2.642 2.761 2.89 3.043 3.128 3.317 3.488 3.637 3.718 3.893 4.057 4.263 4.375 4.492 4.658 4.82 4.978 5.12 5.271 5.443 5.584 5.727 5.905 6.074 6.227 6.377 6.539 6.711 6.848 6.939 7.051 7.221 7.377 7.447 7.475 7.511 7.493 7.391 7.201 6.758 5.902 4.406 2.578 1.083 -0.161 -1.219 -2.257 -3.198 -3.994 -4.674 -5.338 -5.881 -6.396 -6.891 -7.306 -7.7 -8.091 -8.502 -8.863 -9.171 -9.486 -9.8 -10.053 -10.316 -10.58 -10.804 -11.041 -11.271 -11.513 -11.765 -11.941 -12.117 -12.4 -12.599 -12.804 -12.904 -13.092 -13.304 -13.555 -13.691 -13.916 -14.102 -14.277 -14.463 -14.806 -14.98 -15.162 -15.394 -15.683 -16.001 -16.449 -17.369 -4 ,20763 ,KEBNE ,17023770,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:49:53 CET,0.0 1.088 1.374 1.563 1.746 1.94 2.108 2.259 2.519 2.634 2.739 2.864 3.036 3.132 3.324 3.513 3.676 3.745 3.88 4.013 4.195 4.315 4.421 4.554 4.695 4.83 4.956 5.098 5.294 5.448 5.572 5.718 5.853 6.001 6.182 6.399 6.626 6.794 6.898 7.041 7.208 7.36 7.507 7.65 7.826 7.967 8.002 7.909 7.605 7.02 5.798 4.085 2.673 1.502 0.512 -0.411 -1.229 -1.932 -2.577 -3.226 -3.794 -4.328 -4.828 -5.29 -5.725 -6.125 -6.528 -6.87 -7.161 -7.457 -7.768 -8.044 -8.323 -8.62 -8.862 -9.128 -9.424 -9.703 -9.942 -10.125 -10.341 -10.644 -10.849 -11.069 -11.184 -11.427 -11.69 -11.954 -12.089 -12.33 -12.554 -12.717 -12.882 -13.247 -13.423 -13.612 -13.828 -14.055 -14.324 -14.609 -15.196 -5 ,15416 ,KEBNE ,17023771,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:48:11 CET,0.0 0.792 1.049 1.243 1.441 1.626 1.782 1.911 2.145 2.263 2.373 2.518 2.688 2.774 2.975 3.168 3.343 3.42 3.555 3.682 3.868 3.979 4.078 4.228 4.386 4.558 4.704 4.816 4.971 5.098 5.194 5.307 5.409 5.529 5.685 5.866 6.028 6.163 6.302 6.429 6.534 6.667 6.817 6.888 6.873 6.797 6.655 6.439 6.001 5.157 3.534 1.444 -0.137 -1.466 -2.591 -3.567 -4.472 -5.305 -5.982 -6.625 -7.159 -7.653 -8.128 -8.601 -9.089 -9.496 -9.892 -10.259 -10.577 -10.905 -11.268 -11.563 -11.844 -12.149 -12.399 -12.654 -12.922 -13.19 -13.448 -13.623 -13.799 -14.104 -14.335 -14.558 -14.67 -14.907 -15.15 -15.387 -15.506 -15.735 -15.929 -16.078 -16.229 -16.538 -16.71 -16.904 -17.115 -17.354 -17.617 -17.928 -18.763 -6 ,32265 ,KEBNE ,17023772,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:48:48 CET,0.0 0.736 1.052 1.326 1.558 1.741 1.872 1.99 2.223 2.335 2.434 2.533 2.693 2.783 2.964 3.139 3.293 3.357 3.481 3.611 3.799 3.92 4.04 4.22 4.387 4.524 4.649 4.78 4.943 5.091 5.234 5.397 5.563 5.736 5.887 6.026 6.168 6.301 6.422 6.534 6.667 6.805 6.923 6.983 7.045 7.06 6.891 6.659 6.247 5.325 3.528 1.327 -0.43 -1.931 -3.154 -4.188 -5.172 -6.159 -7.026 -7.848 -8.541 -9.161 -9.718 -10.193 -10.613 -11.022 -11.46 -11.813 -12.1 -12.421 -12.788 -13.085 -13.362 -13.647 -13.864 -14.089 -14.351 -14.628 -14.919 -15.118 -15.316 -15.624 -15.85 -16.085 -16.197 -16.428 -16.669 -16.924 -17.058 -17.29 -17.478 -17.611 -17.747 -18.079 -18.255 -18.431 -18.655 -18.909 -19.202 -19.582 -20.669 -7 ,18313 ,KEBNE ,17023773,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:49:48 CET,0.0 0.914 1.159 1.375 1.589 1.772 1.962 2.144 2.43 2.558 2.666 2.779 2.958 3.063 3.231 3.392 3.566 3.645 3.787 3.908 4.096 4.214 4.321 4.48 4.63 4.766 4.893 5.029 5.204 5.347 5.492 5.672 5.838 5.991 6.151 6.318 6.484 6.654 6.811 6.941 7.03 7.134 7.256 7.399 7.538 7.576 7.511 7.329 6.942 6.168 4.674 2.764 1.169 -0.195 -1.376 -2.443 -3.384 -4.229 -4.918 -5.568 -6.133 -6.637 -7.102 -7.555 -7.992 -8.375 -8.768 -9.153 -9.51 -9.883 -10.254 -10.567 -10.901 -11.226 -11.471 -11.721 -11.976 -12.241 -12.492 -12.655 -12.837 -13.153 -13.38 -13.591 -13.701 -13.935 -14.173 -14.429 -14.554 -14.776 -14.969 -15.126 -15.287 -15.583 -15.75 -15.954 -16.181 -16.424 -16.708 -17.049 -17.566 -8 ,1056 ,KEBNE ,17023774,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:49:54 CET,0.0 1.266 1.753 2.026 2.247 2.415 2.541 2.678 2.96 3.095 3.22 3.359 3.522 3.618 3.808 3.974 4.131 4.197 4.318 4.446 4.611 4.707 4.811 4.957 5.098 5.242 5.369 5.463 5.573 5.708 5.832 5.975 6.118 6.235 6.354 6.473 6.582 6.697 6.802 6.894 6.978 7.067 7.156 7.227 7.275 7.253 7.093 6.805 6.326 5.438 3.82 1.863 0.245 -1.092 -2.215 -3.276 -4.204 -5.004 -5.694 -6.405 -6.993 -7.471 -7.933 -8.369 -8.782 -9.155 -9.529 -9.877 -10.176 -10.475 -10.793 -11.063 -11.328 -11.62 -11.868 -12.099 -12.316 -12.543 -12.776 -12.946 -13.143 -13.446 -13.647 -13.855 -13.963 -14.196 -14.419 -14.654 -14.782 -15.005 -15.193 -15.356 -15.519 -15.841 -16.013 -16.2 -16.426 -16.662 -16.904 -17.2 -17.817 -9 ,22479 ,KEBNE ,17023775,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:50:18 CET,0.0 0.441 0.661 0.902 1.117 1.291 1.454 1.622 1.926 2.051 2.154 2.277 2.454 2.554 2.744 2.904 3.052 3.13 3.283 3.415 3.575 3.677 3.778 3.978 4.185 4.337 4.462 4.572 4.716 4.852 4.968 5.113 5.277 5.426 5.544 5.666 5.802 5.949 6.071 6.165 6.252 6.318 6.379 6.423 6.394 6.309 6.17 5.878 5.339 4.387 2.845 1.046 -0.446 -1.681 -2.771 -3.767 -4.628 -5.363 -6.001 -6.682 -7.256 -7.727 -8.185 -8.645 -9.07 -9.445 -9.816 -10.157 -10.444 -10.721 -11.02 -11.28 -11.564 -11.886 -12.127 -12.371 -12.622 -12.876 -13.169 -13.383 -13.6 -13.912 -14.1 -14.295 -14.411 -14.665 -14.908 -15.166 -15.31 -15.55 -15.784 -15.958 -16.128 -16.495 -16.7 -16.907 -17.124 -17.382 -17.694 -18.081 -19.004 -10 ,27108 ,KEBNE ,17023776,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:49:22 CET,0.0 1.076 1.485 1.747 1.957 2.16 2.361 2.529 2.829 2.958 3.068 3.223 3.401 3.492 3.668 3.823 3.974 4.052 4.18 4.308 4.519 4.643 4.749 4.889 5.021 5.164 5.296 5.42 5.587 5.751 5.907 6.06 6.177 6.286 6.403 6.55 6.7 6.832 6.941 7.069 7.226 7.348 7.42 7.47 7.49 7.465 7.337 7.046 6.518 5.636 4.081 2.182 0.508 -0.894 -2.055 -3.043 -3.876 -4.636 -5.322 -6.014 -6.568 -7.046 -7.502 -7.925 -8.338 -8.728 -9.135 -9.482 -9.777 -10.107 -10.458 -10.738 -11.029 -11.354 -11.607 -11.843 -12.082 -12.345 -12.609 -12.772 -12.929 -13.207 -13.424 -13.638 -13.738 -13.948 -14.181 -14.438 -14.569 -14.802 -14.982 -15.125 -15.285 -15.604 -15.801 -16.021 -16.233 -16.486 -16.787 -17.136 -17.987 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_41_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_41_54.txt deleted file mode 100644 index 15bf920a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_41_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30578 ,KEBNE ,16657824,Tue Nov 23 05:59:53 CET,Tue Nov 23 07:23:07 CET,0.0 0.964 1.28 1.506 1.703 1.89 2.061 2.235 2.547 2.681 2.808 2.948 3.121 3.218 3.424 3.618 3.792 3.88 4.04 4.17 4.363 4.484 4.599 4.789 4.978 5.132 5.288 5.452 5.656 5.848 6.015 6.21 6.419 6.597 6.784 6.99 7.168 7.368 7.594 7.802 7.979 8.175 8.383 8.515 8.576 8.67 8.703 8.525 8.167 7.53 6.319 4.739 3.388 2.213 1.253 0.403 -0.356 -1.035 -1.609 -2.195 -2.746 -3.244 -3.681 -4.083 -4.482 -4.849 -5.247 -5.61 -5.901 -6.184 -6.478 -6.717 -6.952 -7.229 -7.452 -7.67 -7.912 -8.163 -8.391 -8.539 -8.693 -8.945 -9.137 -9.329 -9.428 -9.644 -9.887 -10.122 -10.237 -10.446 -10.612 -10.753 -10.893 -11.17 -11.305 -11.461 -11.66 -11.907 -12.193 -12.503 -13.101 -2 ,2040 ,KEBNE ,16657825,Tue Nov 23 05:59:53 CET,Tue Nov 23 07:20:07 CET,0.0 0.818 1.129 1.394 1.641 1.851 2.034 2.179 2.432 2.556 2.681 2.842 3.023 3.13 3.364 3.58 3.773 3.865 4.033 4.183 4.395 4.516 4.624 4.793 4.969 5.131 5.263 5.404 5.617 5.807 5.975 6.184 6.408 6.613 6.799 6.96 7.14 7.36 7.582 7.793 7.956 8.108 8.267 8.363 8.397 8.408 8.385 8.295 8.143 7.634 6.431 4.93 3.603 2.453 1.481 0.612 -0.143 -0.78 -1.314 -1.883 -2.381 -2.808 -3.199 -3.564 -3.919 -4.258 -4.627 -4.945 -5.198 -5.455 -5.74 -5.989 -6.249 -6.505 -6.702 -6.913 -7.137 -7.36 -7.571 -7.723 -7.885 -8.131 -8.308 -8.493 -8.581 -8.757 -8.94 -9.146 -9.257 -9.469 -9.63 -9.752 -9.862 -10.104 -10.237 -10.391 -10.567 -10.732 -10.94 -11.268 -12.029 -3 ,5862 ,KEBNE ,16657826,Tue Nov 23 06:01:56 CET,Tue Nov 23 07:23:45 CET,0.0 0.813 1.059 1.264 1.457 1.636 1.823 2.002 2.29 2.415 2.542 2.705 2.897 3.003 3.195 3.378 3.561 3.651 3.825 4.004 4.254 4.395 4.529 4.727 4.9 5.054 5.19 5.313 5.487 5.645 5.771 5.933 6.087 6.219 6.365 6.544 6.714 6.899 7.08 7.233 7.378 7.522 7.694 7.873 8.009 8.104 8.146 8.049 7.759 7.151 5.945 4.383 3.053 1.927 0.983 0.106 -0.683 -1.442 -2.094 -2.705 -3.206 -3.642 -4.07 -4.461 -4.809 -5.133 -5.475 -5.792 -6.072 -6.374 -6.676 -6.919 -7.179 -7.457 -7.681 -7.915 -8.146 -8.372 -8.581 -8.729 -8.901 -9.194 -9.407 -9.607 -9.703 -9.907 -10.125 -10.348 -10.459 -10.667 -10.818 -10.945 -11.084 -11.364 -11.527 -11.703 -11.869 -12.078 -12.326 -12.607 -13.467 -4 ,9419 ,KEBNE ,16657827,Tue Nov 23 06:02:57 CET,Tue Nov 23 07:24:33 CET,0.0 0.963 1.298 1.541 1.789 2.008 2.199 2.372 2.647 2.769 2.885 3.04 3.223 3.322 3.512 3.705 3.883 3.967 4.131 4.279 4.477 4.587 4.712 4.906 5.065 5.208 5.362 5.519 5.692 5.865 6.024 6.198 6.375 6.553 6.759 6.964 7.136 7.309 7.466 7.6 7.808 8.076 8.309 8.485 8.654 8.712 8.648 8.511 8.224 7.636 6.379 4.705 3.315 2.224 1.295 0.418 -0.358 -1.052 -1.614 -2.187 -2.709 -3.18 -3.622 -4.008 -4.397 -4.762 -5.124 -5.467 -5.753 -6.067 -6.401 -6.668 -6.947 -7.248 -7.505 -7.746 -7.99 -8.263 -8.538 -8.725 -8.915 -9.217 -9.428 -9.647 -9.752 -9.967 -10.203 -10.439 -10.548 -10.754 -10.931 -11.083 -11.242 -11.555 -11.717 -11.897 -12.111 -12.341 -12.63 -13.004 -13.785 -5 ,24782 ,KEBNE ,16657828,Tue Nov 23 06:02:57 CET,Tue Nov 23 07:23:09 CET,0.0 0.808 1.125 1.405 1.623 1.799 1.955 2.098 2.381 2.508 2.614 2.75 2.924 3.02 3.211 3.397 3.571 3.651 3.815 3.979 4.194 4.322 4.444 4.63 4.822 4.994 5.143 5.278 5.44 5.59 5.73 5.912 6.087 6.256 6.466 6.676 6.838 7.037 7.291 7.512 7.71 7.894 8.027 8.135 8.212 8.247 8.233 8.097 7.78 7.195 6.02 4.397 3.011 1.85 0.906 0.076 -0.664 -1.321 -1.97 -2.657 -3.201 -3.661 -4.081 -4.49 -4.876 -5.242 -5.646 -6.0 -6.29 -6.578 -6.887 -7.145 -7.401 -7.687 -7.927 -8.175 -8.423 -8.689 -8.969 -9.156 -9.35 -9.649 -9.855 -10.068 -10.176 -10.397 -10.622 -10.835 -10.944 -11.16 -11.321 -11.461 -11.61 -11.915 -12.087 -12.27 -12.468 -12.705 -13.004 -13.4 -14.22 -6 ,22794 ,KEBNE ,16657829,Tue Nov 23 06:02:57 CET,Tue Nov 23 07:24:14 CET,0.0 0.951 1.326 1.619 1.892 2.138 2.355 2.541 2.836 2.957 3.072 3.213 3.398 3.507 3.701 3.889 4.085 4.173 4.321 4.466 4.681 4.809 4.925 5.106 5.29 5.461 5.644 5.812 6.0 6.199 6.377 6.56 6.737 6.896 7.073 7.266 7.403 7.526 7.682 7.855 8.02 8.179 8.332 8.465 8.586 8.676 8.733 8.691 8.493 8.01 7.017 5.574 4.228 3.104 2.154 1.347 0.635 -0.075 -0.688 -1.29 -1.801 -2.243 -2.661 -3.074 -3.447 -3.783 -4.152 -4.476 -4.748 -5.011 -5.284 -5.543 -5.814 -6.075 -6.274 -6.475 -6.685 -6.909 -7.161 -7.332 -7.493 -7.766 -7.96 -8.157 -8.263 -8.47 -8.677 -8.904 -9.012 -9.221 -9.4 -9.527 -9.656 -9.962 -10.125 -10.301 -10.485 -10.7 -10.977 -11.327 -12.098 -7 ,11708 ,KEBNE ,16657830,Tue Nov 23 06:03:58 CET,Tue Nov 23 07:27:07 CET,0.0 0.824 1.243 1.525 1.741 1.938 2.13 2.293 2.595 2.727 2.863 3.048 3.226 3.324 3.515 3.705 3.874 3.958 4.131 4.289 4.501 4.633 4.763 4.939 5.106 5.267 5.433 5.592 5.8 5.972 6.088 6.236 6.396 6.545 6.715 6.921 7.095 7.282 7.508 7.725 7.936 8.148 8.32 8.427 8.501 8.529 8.522 8.401 8.094 7.535 6.354 4.832 3.538 2.397 1.351 0.469 -0.241 -0.9 -1.5 -2.118 -2.671 -3.158 -3.582 -3.987 -4.386 -4.741 -5.086 -5.398 -5.697 -5.992 -6.272 -6.506 -6.749 -7.0 -7.204 -7.418 -7.641 -7.868 -8.089 -8.251 -8.438 -8.73 -8.924 -9.124 -9.221 -9.405 -9.616 -9.839 -9.952 -10.161 -10.307 -10.431 -10.55 -10.809 -10.959 -11.124 -11.309 -11.521 -11.73 -11.986 -12.6 -8 ,13755 ,KEBNE ,16657831,Tue Nov 23 06:03:58 CET,Tue Nov 23 07:26:20 CET,0.0 0.933 1.397 1.682 1.9 2.083 2.252 2.391 2.653 2.775 2.884 3.015 3.193 3.3 3.5 3.676 3.839 3.919 4.082 4.233 4.45 4.589 4.716 4.9 5.071 5.221 5.366 5.519 5.693 5.819 5.937 6.089 6.24 6.394 6.563 6.749 6.919 7.098 7.28 7.444 7.606 7.756 7.944 8.127 8.229 8.28 8.27 8.134 7.872 7.324 6.142 4.606 3.316 2.211 1.261 0.362 -0.4 -1.066 -1.639 -2.19 -2.674 -3.086 -3.5 -3.943 -4.38 -4.816 -5.252 -5.613 -5.915 -6.23 -6.583 -6.865 -7.128 -7.398 -7.607 -7.826 -8.063 -8.311 -8.571 -8.743 -8.914 -9.178 -9.362 -9.565 -9.669 -9.874 -10.081 -10.296 -10.413 -10.632 -10.795 -10.938 -11.109 -11.472 -11.643 -11.809 -12.011 -12.251 -12.54 -12.871 -13.899 -9 ,24573 ,KEBNE ,16657832,Tue Nov 23 06:05:00 CET,Tue Nov 23 07:25:34 CET,0.0 0.731 1.031 1.296 1.493 1.663 1.825 1.971 2.261 2.396 2.513 2.661 2.843 2.945 3.144 3.341 3.509 3.577 3.723 3.879 4.081 4.204 4.311 4.474 4.642 4.798 4.938 5.07 5.256 5.432 5.615 5.85 6.043 6.211 6.424 6.625 6.791 6.972 7.158 7.376 7.567 7.707 7.814 7.897 7.997 8.102 8.17 8.11 7.859 7.339 6.325 4.909 3.614 2.449 1.434 0.574 -0.13 -0.837 -1.482 -2.147 -2.754 -3.297 -3.817 -4.277 -4.68 -5.043 -5.41 -5.755 -6.062 -6.391 -6.732 -6.995 -7.258 -7.527 -7.742 -7.962 -8.175 -8.392 -8.632 -8.801 -8.974 -9.258 -9.456 -9.649 -9.744 -9.939 -10.147 -10.365 -10.473 -10.681 -10.84 -10.972 -11.1 -11.389 -11.564 -11.748 -11.965 -12.238 -12.488 -12.738 -13.368 -10 ,16862 ,KEBNE ,16657833,Tue Nov 23 06:05:00 CET,Tue Nov 23 07:25:29 CET,0.0 1.224 1.558 1.83 2.067 2.284 2.49 2.668 2.943 3.067 3.202 3.352 3.526 3.632 3.87 4.078 4.251 4.328 4.48 4.629 4.836 4.962 5.091 5.294 5.464 5.597 5.726 5.867 6.05 6.21 6.361 6.523 6.675 6.837 7.007 7.185 7.348 7.525 7.71 7.856 8.009 8.199 8.384 8.543 8.62 8.622 8.629 8.561 8.324 7.785 6.671 5.195 3.892 2.686 1.639 0.719 -0.137 -0.895 -1.543 -2.198 -2.755 -3.249 -3.723 -4.145 -4.539 -4.912 -5.258 -5.579 -5.878 -6.173 -6.482 -6.727 -6.981 -7.27 -7.508 -7.749 -8.001 -8.26 -8.516 -8.686 -8.855 -9.115 -9.299 -9.498 -9.595 -9.782 -9.998 -10.256 -10.396 -10.63 -10.798 -10.939 -11.086 -11.373 -11.52 -11.686 -11.876 -12.088 -12.31 -12.635 -13.242 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_42_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_42_35.txt deleted file mode 100644 index a4aec688..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_42_35.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32305 ,KEBNE ,16657834,Tue Nov 23 06:06:01 CET,Tue Nov 23 07:27:22 CET,0.0 1.122 1.48 1.757 1.964 2.145 2.312 2.474 2.773 2.916 3.036 3.161 3.35 3.455 3.643 3.838 4.041 4.14 4.324 4.497 4.745 4.904 5.054 5.251 5.442 5.619 5.8 5.991 6.215 6.424 6.632 6.902 7.171 7.409 7.67 7.979 8.275 8.591 8.922 9.291 9.678 10.067 10.531 11.018 11.554 12.116 12.771 13.517 14.302 15.106 15.912 16.42 16.614 16.658 16.611 16.512 16.387 16.249 16.125 15.955 15.784 15.623 15.465 15.317 15.168 15.029 14.866 14.72 14.588 14.441 14.296 14.187 14.079 13.96 13.841 13.695 13.565 13.425 13.259 13.128 13.001 12.841 12.721 12.577 12.504 12.358 12.217 12.063 11.972 11.808 11.681 11.561 11.438 11.185 11.056 10.904 10.743 10.58 10.364 10.058 9.115 -2 ,31233 ,KEBNE ,16657835,Tue Nov 23 06:07:03 CET,Tue Nov 23 07:28:05 CET,0.0 0.899 1.308 1.639 1.861 2.013 2.177 2.351 2.659 2.792 2.913 3.051 3.23 3.322 3.52 3.719 3.92 4.008 4.149 4.285 4.478 4.606 4.736 4.935 5.128 5.298 5.455 5.624 5.849 6.06 6.269 6.525 6.77 7.006 7.273 7.558 7.829 8.112 8.43 8.776 9.15 9.569 10.01 10.446 10.975 11.583 12.267 12.972 13.744 14.534 15.359 15.979 16.235 16.269 16.142 15.944 15.753 15.544 15.344 15.128 14.93 14.748 14.571 14.409 14.256 14.102 13.926 13.753 13.598 13.432 13.248 13.1 12.951 12.81 12.695 12.552 12.392 12.226 12.06 11.947 11.832 11.641 11.515 11.394 11.325 11.178 11.033 10.877 10.8 10.646 10.545 10.447 10.335 10.074 9.928 9.787 9.61 9.402 9.179 8.821 7.514 -3 ,17735 ,KEBNE ,16657836,Tue Nov 23 06:08:04 CET,Tue Nov 23 07:28:02 CET,0.0 1.104 1.465 1.74 2.004 2.23 2.41 2.575 2.898 3.048 3.169 3.29 3.477 3.589 3.817 4.037 4.245 4.335 4.512 4.696 4.959 5.113 5.252 5.439 5.632 5.854 6.047 6.22 6.431 6.624 6.806 7.044 7.312 7.573 7.883 8.233 8.538 8.863 9.22 9.584 9.945 10.337 10.8 11.264 11.829 12.468 13.184 14.029 14.947 15.916 16.954 17.607 17.87 17.904 17.858 17.792 17.696 17.551 17.369 17.144 16.96 16.812 16.645 16.436 16.221 16.053 15.89 15.743 15.61 15.444 15.271 15.145 14.996 14.836 14.72 14.583 14.44 14.305 14.159 14.05 13.931 13.744 13.615 13.472 13.395 13.241 13.065 12.875 12.786 12.62 12.5 12.399 12.28 11.995 11.829 11.621 11.426 11.229 10.966 10.609 9.686 -4 ,26702 ,KEBNE ,16657837,Tue Nov 23 06:10:07 CET,Tue Nov 23 07:31:43 CET,0.0 1.014 1.349 1.606 1.828 2.028 2.195 2.347 2.654 2.786 2.899 3.037 3.231 3.336 3.543 3.754 3.933 4.019 4.188 4.338 4.557 4.709 4.868 5.096 5.307 5.511 5.703 5.891 6.139 6.385 6.614 6.879 7.128 7.349 7.61 7.904 8.181 8.496 8.839 9.181 9.519 9.91 10.389 10.869 11.426 12.048 12.723 13.49 14.395 15.324 16.303 16.95 17.206 17.292 17.259 17.148 17.01 16.842 16.676 16.488 16.303 16.132 15.962 15.799 15.649 15.509 15.329 15.139 14.971 14.794 14.638 14.534 14.407 14.265 14.163 14.054 13.926 13.783 13.616 13.497 13.393 13.216 13.079 12.943 12.866 12.719 12.578 12.414 12.327 12.177 12.068 11.955 11.841 11.574 11.432 11.281 11.104 10.883 10.575 10.158 8.962 -5 ,6956 ,KEBNE ,16657838,Tue Nov 23 06:11:08 CET,Tue Nov 23 07:32:10 CET,0.0 1.243 1.615 1.855 2.051 2.228 2.409 2.577 2.835 2.96 3.085 3.272 3.473 3.577 3.79 3.994 4.187 4.282 4.447 4.613 4.88 5.045 5.193 5.389 5.581 5.771 5.959 6.138 6.354 6.564 6.779 7.026 7.27 7.511 7.787 8.099 8.383 8.689 8.994 9.317 9.681 10.113 10.587 11.027 11.594 12.22 12.878 13.62 14.479 15.406 16.424 17.157 17.414 17.495 17.53 17.478 17.366 17.226 17.066 16.872 16.699 16.531 16.334 16.127 15.954 15.797 15.604 15.419 15.259 15.119 14.949 14.78 14.617 14.454 14.323 14.193 14.059 13.915 13.762 13.652 13.54 13.365 13.233 13.09 13.012 12.859 12.713 12.54 12.446 12.276 12.154 12.066 11.972 11.732 11.583 11.424 11.226 11.033 10.857 10.552 9.565 -6 ,30230 ,KEBNE ,16657839,Tue Nov 23 06:11:08 CET,Tue Nov 23 07:32:01 CET,0.0 0.679 1.018 1.247 1.434 1.618 1.808 1.974 2.235 2.36 2.485 2.642 2.842 2.954 3.176 3.386 3.58 3.668 3.841 3.999 4.206 4.359 4.516 4.732 4.941 5.142 5.326 5.488 5.714 5.951 6.173 6.428 6.67 6.92 7.205 7.485 7.741 8.034 8.362 8.703 9.052 9.455 9.924 10.377 10.896 11.484 12.131 12.837 13.652 14.559 15.557 16.29 16.624 16.696 16.661 16.573 16.442 16.306 16.155 15.962 15.803 15.665 15.483 15.29 15.129 14.972 14.803 14.677 14.555 14.408 14.242 14.078 13.892 13.704 13.56 13.412 13.274 13.119 12.936 12.819 12.712 12.527 12.393 12.26 12.187 12.032 11.875 11.711 11.632 11.477 11.341 11.221 11.113 10.908 10.799 10.671 10.503 10.314 10.062 9.692 8.586 -8 ,6385 ,KEBNE ,16657841,Tue Nov 23 06:14:13 CET,Tue Nov 23 07:34:55 CET,0.0 0.636 0.982 1.209 1.382 1.541 1.695 1.839 2.1 2.213 2.312 2.457 2.668 2.784 2.998 3.206 3.401 3.491 3.667 3.838 4.08 4.239 4.382 4.575 4.773 4.966 5.173 5.381 5.649 5.888 6.093 6.346 6.606 6.864 7.132 7.402 7.664 7.991 8.351 8.692 9.06 9.511 10.042 10.535 11.07 11.665 12.319 13.038 13.871 14.768 15.727 16.417 16.724 16.826 16.804 16.692 16.505 16.28 16.082 15.896 15.744 15.595 15.435 15.261 15.082 14.934 14.781 14.633 14.484 14.314 14.133 13.977 13.817 13.645 13.512 13.383 13.249 13.104 12.928 12.793 12.656 12.448 12.31 12.175 12.107 11.975 11.826 11.648 11.551 11.381 11.244 11.125 11.01 10.775 10.637 10.461 10.279 10.09 9.825 9.502 8.121 -9 ,23039 ,KEBNE ,16657842,Tue Nov 23 06:16:19 CET,Tue Nov 23 07:34:38 CET,0.0 0.798 1.239 1.557 1.8 1.997 2.177 2.33 2.589 2.707 2.805 2.914 3.101 3.197 3.388 3.598 3.806 3.9 4.076 4.24 4.473 4.628 4.782 5.005 5.218 5.426 5.632 5.823 6.039 6.238 6.453 6.73 6.985 7.223 7.472 7.76 8.089 8.446 8.801 9.165 9.53 9.936 10.417 10.876 11.399 11.998 12.676 13.417 14.293 15.366 16.608 17.426 17.734 17.802 17.725 17.6 17.453 17.272 17.099 16.912 16.708 16.527 16.38 16.231 16.09 15.956 15.791 15.608 15.456 15.307 15.134 14.988 14.826 14.666 14.536 14.396 14.257 14.085 13.909 13.813 13.711 13.527 13.383 13.225 13.149 13.006 12.86 12.713 12.634 12.475 12.341 12.214 12.083 11.844 11.734 11.573 11.38 11.216 11.002 10.703 9.972 -10 ,4955 ,KEBNE ,16657843,Tue Nov 23 06:18:21 CET,Tue Nov 23 07:37:47 CET,0.0 1.108 1.444 1.721 1.945 2.142 2.301 2.444 2.696 2.809 2.932 3.08 3.277 3.391 3.607 3.814 4.013 4.107 4.276 4.454 4.711 4.866 5.024 5.255 5.461 5.653 5.829 6.008 6.272 6.505 6.718 6.983 7.225 7.458 7.716 8.015 8.315 8.635 8.968 9.326 9.708 10.127 10.608 11.06 11.57 12.157 12.827 13.54 14.334 15.262 16.315 17.043 17.286 17.351 17.303 17.15 16.978 16.833 16.704 16.549 16.389 16.223 16.05 15.896 15.746 15.573 15.371 15.196 15.05 14.909 14.755 14.594 14.435 14.277 14.134 13.977 13.811 13.649 13.505 13.41 13.301 13.117 12.995 12.873 12.805 12.663 12.527 12.38 12.289 12.108 11.99 11.889 11.778 11.534 11.39 11.253 11.093 10.893 10.656 10.345 9.37 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_42_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_42_41.txt deleted file mode 100644 index 22ef084f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_42_41.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25162 ,KEBNE ,16657844,Tue Nov 23 06:18:21 CET,Tue Nov 23 07:39:56 CET,0.0 0.799 1.036 1.262 1.463 1.646 1.837 1.998 2.225 2.329 2.432 2.531 2.689 2.766 2.932 3.108 3.283 3.358 3.507 3.66 3.881 4.029 4.164 4.356 4.529 4.685 4.845 5.003 5.203 5.39 5.575 5.802 6.026 6.244 6.505 6.786 7.026 7.269 7.529 7.806 8.113 8.484 8.872 9.231 9.649 10.069 10.517 11.009 11.595 12.218 12.825 13.17 13.174 12.978 12.716 12.469 12.221 11.967 11.739 11.511 11.314 11.117 10.901 10.696 10.504 10.322 10.129 9.951 9.804 9.645 9.444 9.276 9.105 8.935 8.799 8.652 8.509 8.354 8.172 8.033 7.899 7.697 7.557 7.425 7.35 7.183 7.026 6.862 6.773 6.591 6.43 6.326 6.228 5.979 5.83 5.663 5.487 5.303 5.106 4.854 3.497 -2 ,18846 ,KEBNE ,16657845,Tue Nov 23 06:19:23 CET,Tue Nov 23 07:39:29 CET,0.0 0.66 0.894 1.069 1.22 1.372 1.507 1.626 1.894 2.03 2.135 2.234 2.427 2.536 2.749 2.947 3.113 3.185 3.321 3.459 3.685 3.828 3.954 4.131 4.307 4.48 4.656 4.819 4.998 5.164 5.338 5.535 5.751 5.966 6.17 6.408 6.655 6.941 7.251 7.58 7.916 8.254 8.633 9.017 9.452 9.908 10.412 10.959 11.533 12.136 12.736 12.993 12.951 12.767 12.54 12.281 12.035 11.819 11.591 11.322 11.103 10.924 10.753 10.569 10.381 10.184 9.971 9.768 9.564 9.344 9.112 8.951 8.823 8.685 8.552 8.402 8.26 8.106 7.931 7.811 7.685 7.503 7.389 7.268 7.203 7.067 6.912 6.735 6.656 6.489 6.346 6.233 6.115 5.894 5.763 5.601 5.402 5.151 4.859 4.524 3.576 -3 ,15025 ,KEBNE ,16657846,Tue Nov 23 06:19:25 CET,Tue Nov 23 07:38:45 CET,0.0 0.706 1.049 1.308 1.51 1.664 1.79 1.913 2.132 2.238 2.336 2.425 2.592 2.676 2.858 3.045 3.214 3.294 3.446 3.599 3.827 3.952 4.069 4.24 4.405 4.592 4.777 4.936 5.146 5.337 5.488 5.683 5.899 6.113 6.355 6.607 6.844 7.121 7.401 7.672 7.96 8.28 8.626 8.95 9.353 9.839 10.393 10.986 11.616 12.27 12.896 13.18 13.189 13.095 12.902 12.652 12.403 12.152 11.929 11.693 11.465 11.244 11.036 10.823 10.563 10.292 10.035 9.834 9.663 9.485 9.306 9.157 8.989 8.802 8.653 8.505 8.347 8.18 8.009 7.902 7.792 7.564 7.396 7.236 7.161 7.011 6.851 6.669 6.563 6.373 6.211 6.084 5.954 5.709 5.586 5.463 5.296 5.06 4.792 4.424 3.289 -4 ,20784 ,KEBNE ,16657847,Tue Nov 23 06:20:24 CET,Tue Nov 23 07:40:57 CET,0.0 0.844 1.104 1.293 1.488 1.687 1.824 1.96 2.216 2.32 2.422 2.538 2.713 2.802 2.973 3.128 3.262 3.332 3.488 3.647 3.864 3.998 4.135 4.34 4.51 4.669 4.837 5.007 5.215 5.42 5.639 5.874 6.074 6.27 6.502 6.734 6.951 7.21 7.484 7.775 8.092 8.421 8.77 9.109 9.5 9.958 10.502 11.095 11.752 12.393 12.995 13.358 13.403 13.311 13.174 12.977 12.747 12.52 12.279 12.007 11.754 11.518 11.308 11.113 10.919 10.722 10.526 10.349 10.165 9.964 9.765 9.615 9.458 9.266 9.105 8.946 8.794 8.645 8.494 8.383 8.245 8.042 7.914 7.782 7.711 7.546 7.362 7.168 7.06 6.879 6.765 6.654 6.538 6.313 6.183 6.017 5.853 5.665 5.407 4.995 3.7 -6 ,17279 ,KEBNE ,16657849,Tue Nov 23 06:21:26 CET,Tue Nov 23 07:43:00 CET,0.0 0.557 0.792 1.022 1.218 1.388 1.548 1.681 1.933 2.061 2.164 2.275 2.459 2.551 2.711 2.851 2.976 3.036 3.178 3.327 3.523 3.663 3.804 3.997 4.187 4.352 4.499 4.649 4.854 5.053 5.234 5.442 5.632 5.823 6.052 6.295 6.528 6.773 7.037 7.356 7.686 8.039 8.471 8.849 9.263 9.74 10.262 10.826 11.409 12.012 12.58 12.825 12.806 12.706 12.555 12.359 12.15 11.915 11.675 11.441 11.209 10.964 10.713 10.485 10.279 10.081 9.89 9.705 9.51 9.314 9.122 8.961 8.802 8.631 8.496 8.353 8.213 8.076 7.917 7.803 7.686 7.486 7.341 7.182 7.098 6.949 6.815 6.664 6.579 6.413 6.303 6.197 6.067 5.792 5.649 5.481 5.318 5.147 4.922 4.583 3.522 -7 ,30561 ,KEBNE ,16657850,Tue Nov 23 06:22:28 CET,Tue Nov 23 07:43:04 CET,0.0 0.786 1.025 1.213 1.371 1.531 1.681 1.81 2.05 2.172 2.286 2.418 2.607 2.71 2.885 3.056 3.219 3.29 3.422 3.562 3.777 3.907 4.027 4.195 4.368 4.533 4.696 4.853 5.034 5.228 5.433 5.67 5.884 6.09 6.316 6.551 6.783 7.044 7.326 7.642 7.983 8.338 8.713 9.081 9.513 9.965 10.509 11.081 11.617 12.219 12.862 13.163 13.148 12.974 12.748 12.538 12.304 12.043 11.829 11.59 11.364 11.182 10.999 10.804 10.621 10.427 10.206 9.999 9.816 9.657 9.494 9.35 9.159 8.948 8.814 8.669 8.518 8.36 8.186 8.064 7.938 7.736 7.595 7.451 7.377 7.227 7.074 6.902 6.788 6.593 6.45 6.345 6.24 6.014 5.884 5.736 5.568 5.36 5.11 4.769 3.463 -8 ,29146 ,KEBNE ,16657851,Tue Nov 23 06:23:29 CET,Tue Nov 23 07:44:05 CET,0.0 0.657 0.938 1.171 1.371 1.537 1.682 1.821 2.101 2.236 2.341 2.475 2.662 2.764 2.964 3.137 3.295 3.376 3.53 3.673 3.859 3.971 4.094 4.294 4.483 4.661 4.825 4.988 5.205 5.387 5.559 5.767 5.951 6.133 6.359 6.624 6.898 7.184 7.474 7.767 8.077 8.448 8.846 9.238 9.705 10.182 10.667 11.185 11.718 12.247 12.809 13.103 13.107 12.983 12.8 12.571 12.345 12.13 11.929 11.695 11.461 11.234 11.011 10.795 10.594 10.412 10.214 10.003 9.815 9.641 9.476 9.332 9.165 9.0 8.875 8.735 8.578 8.405 8.23 8.122 7.998 7.8 7.669 7.527 7.458 7.322 7.176 7.008 6.917 6.744 6.619 6.51 6.393 6.153 6.024 5.878 5.723 5.544 5.329 5.063 4.376 -9 ,7462 ,KEBNE ,16657852,Tue Nov 23 06:25:34 CET,Tue Nov 23 07:46:07 CET,0.0 0.895 1.223 1.439 1.598 1.749 1.887 2.02 2.275 2.397 2.506 2.62 2.81 2.915 3.101 3.268 3.426 3.494 3.617 3.751 3.965 4.105 4.23 4.412 4.587 4.732 4.872 5.008 5.215 5.44 5.627 5.824 6.02 6.232 6.468 6.727 6.976 7.215 7.47 7.77 8.098 8.437 8.797 9.171 9.609 10.111 10.642 11.139 11.717 12.353 12.945 13.184 13.153 12.998 12.798 12.568 12.338 12.099 11.876 11.652 11.45 11.272 11.075 10.877 10.694 10.506 10.295 10.11 9.938 9.731 9.54 9.378 9.202 9.037 8.9 8.774 8.647 8.505 8.349 8.239 8.123 7.922 7.773 7.615 7.544 7.412 7.254 7.076 6.975 6.799 6.689 6.576 6.444 6.169 6.028 5.887 5.731 5.539 5.24 4.917 3.914 -10 ,13290 ,KEBNE ,16657853,Tue Nov 23 06:25:34 CET,Tue Nov 23 07:45:03 CET,0.0 0.685 0.908 1.104 1.306 1.481 1.626 1.757 1.999 2.109 2.22 2.36 2.547 2.638 2.83 3.018 3.175 3.248 3.39 3.555 3.813 3.959 4.089 4.265 4.445 4.632 4.815 4.978 5.17 5.365 5.545 5.761 5.979 6.19 6.424 6.687 6.923 7.152 7.403 7.674 7.96 8.27 8.627 8.974 9.357 9.76 10.191 10.675 11.223 11.804 12.408 12.724 12.721 12.572 12.377 12.19 11.991 11.779 11.568 11.321 11.061 10.8 10.572 10.368 10.162 9.975 9.767 9.57 9.405 9.228 9.033 8.867 8.683 8.48 8.328 8.189 8.022 7.839 7.658 7.521 7.38 7.17 7.026 6.896 6.833 6.69 6.541 6.386 6.305 6.133 5.977 5.855 5.75 5.515 5.369 5.192 5.002 4.769 4.495 4.157 3.246 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_42_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_42_43.txt deleted file mode 100644 index 42b1ad1d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_42_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10130 ,KEBNE ,16657854,Tue Nov 23 06:25:36 CET,Tue Nov 23 07:44:21 CET,0.0 0.687 0.99 1.212 1.389 1.528 1.662 1.794 2.068 2.197 2.321 2.46 2.637 2.743 2.955 3.162 3.353 3.436 3.601 3.768 3.976 4.101 4.231 4.414 4.586 4.771 4.947 5.117 5.36 5.577 5.791 6.055 6.27 6.475 6.738 7.023 7.276 7.552 7.88 8.226 8.578 9.016 9.505 9.962 10.468 11.005 11.618 12.343 13.163 14.035 15.015 15.624 15.826 15.906 15.906 15.817 15.683 15.528 15.353 15.174 15.0 14.832 14.687 14.535 14.382 14.221 14.012 13.837 13.711 13.569 13.409 13.269 13.123 12.97 12.844 12.718 12.576 12.417 12.262 12.162 12.06 11.873 11.735 11.609 11.547 11.42 11.287 11.131 11.038 10.873 10.767 10.675 10.565 10.301 10.142 9.962 9.789 9.613 9.42 9.124 8.235 -2 ,18442 ,KEBNE ,16657855,Tue Nov 23 06:25:38 CET,Tue Nov 23 07:44:01 CET,0.0 0.57 0.85 1.087 1.288 1.444 1.579 1.731 2.04 2.173 2.287 2.42 2.603 2.705 2.882 3.039 3.193 3.273 3.436 3.591 3.806 3.943 4.082 4.283 4.484 4.679 4.862 5.039 5.272 5.492 5.689 5.918 6.143 6.386 6.651 6.903 7.141 7.419 7.737 8.088 8.445 8.816 9.259 9.706 10.225 10.816 11.483 12.236 13.057 13.939 14.886 15.57 15.828 15.857 15.805 15.699 15.555 15.397 15.216 14.994 14.799 14.617 14.436 14.263 14.106 13.956 13.794 13.653 13.534 13.409 13.271 13.158 13.03 12.881 12.767 12.642 12.502 12.365 12.219 12.105 11.989 11.829 11.715 11.574 11.497 11.351 11.208 11.04 10.947 10.786 10.674 10.556 10.423 10.147 10.017 9.9 9.756 9.552 9.348 9.114 8.686 -3 ,21901 ,KEBNE ,16657856,Tue Nov 23 06:26:39 CET,Tue Nov 23 07:44:45 CET,0.0 0.675 0.89 1.066 1.259 1.424 1.557 1.693 1.939 2.058 2.173 2.305 2.483 2.582 2.781 2.995 3.2 3.287 3.459 3.634 3.868 4.012 4.157 4.354 4.525 4.699 4.877 5.055 5.279 5.483 5.682 5.932 6.179 6.392 6.644 6.933 7.217 7.525 7.841 8.179 8.555 8.964 9.399 9.855 10.382 10.961 11.626 12.35 13.186 14.109 15.073 15.752 16.061 16.143 16.121 16.05 15.942 15.802 15.654 15.495 15.334 15.163 15.0 14.856 14.704 14.53 14.345 14.207 14.098 13.956 13.803 13.67 13.508 13.338 13.219 13.098 12.966 12.833 12.681 12.576 12.474 12.286 12.148 12.011 11.936 11.777 11.614 11.429 11.331 11.167 11.031 10.923 10.812 10.561 10.426 10.293 10.163 10.013 9.815 9.528 8.989 -4 ,5893 ,KEBNE ,16657857,Tue Nov 23 06:27:37 CET,Tue Nov 23 07:48:26 CET,0.0 0.89 1.148 1.372 1.564 1.725 1.872 1.993 2.2 2.305 2.416 2.553 2.738 2.841 3.012 3.168 3.343 3.433 3.606 3.763 4.017 4.185 4.324 4.497 4.672 4.831 4.994 5.164 5.366 5.565 5.778 6.034 6.254 6.461 6.713 6.997 7.261 7.539 7.846 8.196 8.548 8.915 9.315 9.715 10.189 10.74 11.367 12.051 12.862 13.775 14.762 15.377 15.598 15.657 15.632 15.538 15.443 15.343 15.222 15.064 14.902 14.747 14.577 14.414 14.267 14.112 13.947 13.817 13.687 13.533 13.382 13.246 13.111 12.973 12.837 12.697 12.556 12.409 12.245 12.125 12.0 11.8 11.675 11.555 11.49 11.339 11.177 11.008 10.918 10.759 10.647 10.551 10.468 10.265 10.147 10.007 9.837 9.63 9.376 9.112 8.666 -5 ,4095 ,KEBNE ,16657858,Tue Nov 23 06:28:39 CET,Tue Nov 23 07:56:03 CET,0.0 0.711 1.011 1.216 1.383 1.519 1.644 1.781 2.049 2.161 2.268 2.385 2.557 2.651 2.845 3.026 3.212 3.302 3.455 3.598 3.816 3.966 4.114 4.297 4.467 4.652 4.86 5.048 5.249 5.444 5.63 5.866 6.103 6.322 6.56 6.828 7.11 7.422 7.771 8.16 8.543 8.942 9.373 9.793 10.273 10.824 11.466 12.176 12.962 13.777 14.686 15.362 15.618 15.668 15.608 15.525 15.433 15.304 15.15 14.953 14.765 14.588 14.432 14.304 14.132 13.957 13.808 13.662 13.521 13.353 13.157 13.011 12.86 12.696 12.569 12.432 12.293 12.161 12.015 11.896 11.782 11.605 11.48 11.341 11.267 11.144 11.01 10.842 10.749 10.581 10.476 10.378 10.258 10.016 9.895 9.756 9.602 9.441 9.249 8.979 8.303 -6 ,20488 ,KEBNE ,16657859,Tue Nov 23 06:28:39 CET,Tue Nov 23 07:48:09 CET,0.0 0.643 0.919 1.147 1.347 1.53 1.671 1.811 2.079 2.19 2.297 2.418 2.611 2.732 2.951 3.138 3.304 3.39 3.551 3.689 3.897 4.04 4.189 4.392 4.599 4.795 4.971 5.149 5.385 5.597 5.791 6.048 6.283 6.507 6.776 7.073 7.341 7.635 7.95 8.271 8.626 9.003 9.453 9.928 10.447 11.006 11.626 12.265 13.015 13.922 14.883 15.494 15.74 15.791 15.721 15.628 15.515 15.358 15.177 15.001 14.833 14.659 14.478 14.305 14.167 14.023 13.858 13.714 13.573 13.418 13.257 13.11 12.948 12.79 12.679 12.565 12.427 12.278 12.132 12.032 11.928 11.76 11.634 11.504 11.431 11.279 11.123 10.934 10.836 10.671 10.561 10.465 10.361 10.126 10.002 9.868 9.72 9.517 9.272 8.994 8.322 -7 ,9399 ,KEBNE ,16657860,Tue Nov 23 06:29:40 CET,Tue Nov 23 07:49:40 CET,0.0 0.587 0.859 1.032 1.225 1.396 1.548 1.7 1.991 2.138 2.257 2.384 2.577 2.686 2.883 3.064 3.242 3.324 3.488 3.645 3.855 4.008 4.153 4.336 4.522 4.719 4.923 5.108 5.335 5.548 5.746 5.984 6.207 6.424 6.677 6.971 7.252 7.548 7.878 8.236 8.593 8.986 9.432 9.859 10.373 10.957 11.625 12.372 13.238 14.198 15.187 15.896 16.232 16.313 16.257 16.166 16.059 15.949 15.823 15.679 15.541 15.383 15.224 15.079 14.937 14.789 14.608 14.452 14.325 14.197 14.055 13.917 13.775 13.628 13.498 13.376 13.246 13.088 12.93 12.835 12.728 12.549 12.431 12.31 12.24 12.088 11.936 11.767 11.682 11.513 11.388 11.292 11.177 10.911 10.775 10.626 10.481 10.33 10.114 9.817 9.09 -8 ,8326 ,KEBNE ,16657861,Tue Nov 23 06:29:40 CET,Tue Nov 23 07:50:45 CET,0.0 0.682 1.044 1.3 1.473 1.616 1.78 1.931 2.154 2.255 2.353 2.465 2.651 2.755 2.947 3.129 3.309 3.398 3.565 3.713 3.936 4.074 4.196 4.388 4.577 4.76 4.935 5.107 5.347 5.556 5.733 5.954 6.159 6.368 6.606 6.875 7.158 7.446 7.738 8.082 8.456 8.864 9.335 9.778 10.299 10.885 11.521 12.229 13.068 13.951 14.92 15.603 15.847 15.9 15.878 15.797 15.642 15.498 15.364 15.222 15.084 14.92 14.727 14.556 14.419 14.28 14.126 13.96 13.812 13.662 13.506 13.359 13.194 13.047 12.932 12.825 12.717 12.591 12.445 12.346 12.247 12.066 11.937 11.796 11.729 11.601 11.46 11.311 11.232 11.068 10.936 10.834 10.736 10.519 10.382 10.235 10.077 9.91 9.715 9.458 8.471 -9 ,4617 ,KEBNE ,16657862,Tue Nov 23 06:30:42 CET,Tue Nov 23 07:50:07 CET,0.0 0.694 0.976 1.162 1.309 1.451 1.593 1.712 1.937 2.056 2.178 2.349 2.54 2.627 2.804 2.996 3.173 3.262 3.441 3.581 3.791 3.926 4.06 4.266 4.471 4.667 4.841 5.01 5.252 5.495 5.712 5.964 6.216 6.453 6.718 7.017 7.292 7.586 7.897 8.234 8.593 8.979 9.442 9.898 10.359 10.876 11.477 12.144 12.917 13.736 14.612 15.141 15.327 15.412 15.404 15.33 15.244 15.134 14.999 14.846 14.691 14.536 14.353 14.179 14.02 13.863 13.656 13.428 13.256 13.099 12.921 12.779 12.616 12.437 12.313 12.179 12.042 11.912 11.758 11.642 11.525 11.345 11.233 11.111 11.04 10.889 10.745 10.594 10.508 10.348 10.262 10.162 10.032 9.755 9.607 9.463 9.337 9.181 8.969 8.664 8.041 -10 ,5502 ,KEBNE ,16657863,Tue Nov 23 06:30:46 CET,Tue Nov 23 07:49:02 CET,0.0 0.697 0.969 1.168 1.342 1.488 1.615 1.763 2.079 2.231 2.356 2.486 2.681 2.797 3.023 3.223 3.416 3.502 3.669 3.829 4.026 4.143 4.266 4.492 4.709 4.895 5.081 5.244 5.439 5.621 5.805 6.024 6.231 6.446 6.701 6.98 7.257 7.554 7.862 8.213 8.594 9.013 9.52 10.0 10.477 11.038 11.664 12.303 13.076 13.957 14.842 15.404 15.583 15.575 15.503 15.399 15.265 15.113 14.967 14.784 14.613 14.451 14.285 14.133 13.953 13.744 13.542 13.372 13.204 13.007 12.799 12.617 12.415 12.229 12.098 11.939 11.786 11.65 11.485 11.373 11.256 11.057 10.92 10.779 10.7 10.536 10.372 10.196 10.103 9.941 9.817 9.712 9.616 9.405 9.282 9.159 9.006 8.816 8.601 8.24 7.457 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_43_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_43_31.txt deleted file mode 100644 index 3dce28ad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_43_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23570 ,KEBNE ,16657864,Tue Nov 23 06:30:46 CET,Tue Nov 23 07:49:03 CET,0.0 0.505 0.786 0.999 1.182 1.347 1.518 1.678 1.944 2.084 2.224 2.397 2.585 2.704 2.939 3.166 3.399 3.512 3.718 3.924 4.221 4.404 4.582 4.852 5.12 5.381 5.645 5.901 6.223 6.534 6.836 7.232 7.616 7.976 8.402 8.9 9.404 9.96 10.565 11.234 11.941 12.742 13.673 14.641 15.834 17.192 18.814 20.712 22.979 25.798 29.544 32.974 35.225 36.752 37.848 38.672 39.242 39.649 39.928 40.189 40.366 40.458 40.533 40.619 40.662 40.68 40.704 40.711 40.708 40.673 40.615 40.571 40.532 40.479 40.442 40.406 40.342 40.269 40.19 40.133 40.069 39.961 39.879 39.786 39.738 39.642 39.546 39.442 39.383 39.282 39.185 39.111 39.033 38.824 38.706 38.59 38.431 38.244 38.021 37.695 36.685 -2 ,22179 ,KEBNE ,16657865,Tue Nov 23 06:31:43 CET,Tue Nov 23 07:51:33 CET,0.0 0.736 1.001 1.193 1.382 1.551 1.71 1.867 2.165 2.31 2.445 2.621 2.816 2.931 3.149 3.365 3.583 3.689 3.891 4.087 4.376 4.564 4.74 4.986 5.248 5.51 5.75 5.985 6.298 6.614 6.927 7.301 7.665 8.02 8.431 8.905 9.385 9.922 10.49 11.09 11.745 12.515 13.422 14.364 15.524 16.877 18.508 20.394 22.702 25.638 29.518 33.059 35.286 36.781 37.806 38.586 39.175 39.641 39.977 40.264 40.501 40.666 40.773 40.858 40.911 40.913 40.905 40.886 40.865 40.859 40.843 40.817 40.787 40.737 40.698 40.665 40.61 40.529 40.431 40.371 40.318 40.223 40.14 40.05 39.999 39.906 39.804 39.65 39.567 39.468 39.366 39.276 39.169 38.952 38.838 38.713 38.546 38.321 38.125 37.859 37.384 -3 ,32691 ,KEBNE ,16657866,Tue Nov 23 06:31:43 CET,Tue Nov 23 07:50:53 CET,0.0 0.703 0.996 1.224 1.43 1.616 1.8 1.973 2.279 2.426 2.58 2.791 2.995 3.135 3.419 3.665 3.874 3.974 4.172 4.378 4.678 4.86 5.04 5.308 5.569 5.829 6.088 6.351 6.679 6.995 7.313 7.68 8.025 8.374 8.792 9.272 9.744 10.256 10.816 11.435 12.106 12.886 13.795 14.728 15.89 17.207 18.76 20.662 23.043 26.032 29.925 33.436 35.719 37.309 38.409 39.232 39.865 40.342 40.727 41.072 41.29 41.482 41.655 41.787 41.885 41.923 41.936 41.937 41.943 41.957 41.967 41.964 41.95 41.927 41.889 41.833 41.777 41.711 41.637 41.583 41.524 41.419 41.342 41.274 41.239 41.173 41.1 41.005 40.953 40.868 40.776 40.705 40.631 40.447 40.338 40.18 40.016 39.87 39.658 39.315 38.462 -4 ,5055 ,KEBNE ,16657867,Tue Nov 23 06:32:46 CET,Tue Nov 23 07:54:03 CET,0.0 0.581 0.854 1.105 1.326 1.509 1.682 1.86 2.202 2.351 2.494 2.697 2.896 3.012 3.241 3.474 3.697 3.801 4.023 4.23 4.517 4.716 4.906 5.178 5.446 5.709 5.974 6.234 6.561 6.877 7.194 7.586 7.962 8.337 8.785 9.296 9.791 10.353 10.968 11.628 12.321 13.114 14.077 15.068 16.289 17.696 19.329 21.21 23.524 26.506 30.452 33.973 36.203 37.758 38.888 39.749 40.396 40.897 41.272 41.598 41.849 42.001 42.117 42.228 42.291 42.329 42.358 42.378 42.366 42.33 42.295 42.269 42.236 42.186 42.141 42.091 42.036 41.972 41.906 41.866 41.812 41.695 41.613 41.528 41.481 41.387 41.291 41.171 41.105 41.006 40.909 40.842 40.778 40.591 40.462 40.333 40.21 40.072 39.882 39.611 38.802 -5 ,3517 ,KEBNE ,16657868,Tue Nov 23 06:32:49 CET,Tue Nov 23 07:51:13 CET,0.0 0.931 1.311 1.577 1.825 2.033 2.209 2.389 2.722 2.863 3.002 3.189 3.384 3.501 3.728 3.949 4.178 4.296 4.508 4.714 5.022 5.233 5.429 5.693 5.972 6.253 6.523 6.79 7.138 7.468 7.789 8.175 8.547 8.922 9.365 9.872 10.354 10.881 11.482 12.144 12.839 13.618 14.58 15.591 16.781 18.152 19.799 21.745 24.159 27.231 31.304 35.084 37.556 39.271 40.544 41.512 42.233 42.767 43.124 43.365 43.529 43.71 43.841 43.907 43.976 44.046 44.103 44.136 44.136 44.117 44.107 44.097 44.073 44.031 43.985 43.934 43.889 43.828 43.768 43.725 43.667 43.573 43.507 43.427 43.385 43.293 43.182 43.059 42.997 42.908 42.812 42.737 42.644 42.418 42.303 42.202 42.091 41.969 41.804 41.548 40.901 -6 ,15652 ,KEBNE ,16657869,Tue Nov 23 06:33:46 CET,Tue Nov 23 07:54:10 CET,0.0 0.516 0.887 1.125 1.331 1.525 1.714 1.886 2.15 2.289 2.432 2.592 2.78 2.904 3.134 3.376 3.619 3.727 3.944 4.15 4.449 4.648 4.832 5.098 5.363 5.627 5.897 6.152 6.466 6.768 7.065 7.441 7.824 8.193 8.604 9.088 9.574 10.115 10.717 11.369 12.077 12.891 13.857 14.851 16.042 17.391 18.987 20.906 23.315 26.292 30.128 33.705 36.042 37.525 38.579 39.341 39.778 40.117 40.382 40.641 40.871 41.036 41.154 41.235 41.291 41.303 41.318 41.336 41.325 41.301 41.279 41.253 41.216 41.167 41.115 41.067 41.018 40.96 40.885 40.828 40.764 40.675 40.616 40.546 40.508 40.426 40.332 40.221 40.17 40.089 39.988 39.911 39.84 39.663 39.563 39.461 39.352 39.233 39.065 38.841 38.179 -7 ,1246 ,KEBNE ,16657870,Tue Nov 23 06:33:47 CET,Tue Nov 23 07:53:22 CET,0.0 0.629 0.954 1.173 1.364 1.566 1.75 1.919 2.229 2.374 2.513 2.691 2.885 2.997 3.204 3.411 3.631 3.735 3.939 4.155 4.451 4.628 4.807 5.085 5.368 5.636 5.895 6.157 6.488 6.8 7.119 7.517 7.906 8.272 8.714 9.225 9.705 10.262 10.868 11.518 12.223 13.031 13.995 14.996 16.196 17.56 19.19 21.107 23.439 26.373 30.313 33.92 36.178 37.72 38.866 39.713 40.312 40.796 41.168 41.47 41.671 41.781 41.872 41.987 42.085 42.125 42.12 42.118 42.11 42.084 42.055 42.016 41.942 41.873 41.833 41.784 41.722 41.66 41.602 41.557 41.515 41.45 41.391 41.325 41.29 41.191 41.076 40.954 40.901 40.815 40.674 40.584 40.51 40.331 40.232 40.115 39.959 39.788 39.582 39.309 38.467 -8 ,20507 ,KEBNE ,16657871,Tue Nov 23 06:34:48 CET,Tue Nov 23 07:55:01 CET,0.0 0.74 1.065 1.292 1.492 1.673 1.847 2.009 2.28 2.412 2.545 2.74 2.952 3.076 3.286 3.505 3.723 3.831 4.047 4.251 4.543 4.736 4.932 5.199 5.456 5.717 5.969 6.221 6.551 6.865 7.171 7.55 7.924 8.293 8.729 9.233 9.734 10.273 10.84 11.455 12.135 12.927 13.889 14.914 16.111 17.473 19.125 21.058 23.434 26.35 30.026 33.295 35.464 36.989 38.003 38.717 39.22 39.601 39.944 40.271 40.448 40.581 40.72 40.792 40.821 40.84 40.824 40.763 40.702 40.647 40.592 40.533 40.469 40.409 40.371 40.34 40.286 40.221 40.169 40.118 40.067 40.002 39.941 39.882 39.843 39.72 39.602 39.513 39.461 39.364 39.276 39.216 39.135 38.952 38.853 38.754 38.666 38.524 38.305 38.058 37.622 -9 ,21449 ,KEBNE ,16657872,Tue Nov 23 06:34:48 CET,Tue Nov 23 07:54:48 CET,0.0 0.868 1.157 1.367 1.562 1.738 1.897 2.052 2.331 2.463 2.598 2.793 2.99 3.108 3.33 3.555 3.782 3.879 4.056 4.247 4.547 4.729 4.91 5.177 5.418 5.664 5.921 6.177 6.5 6.806 7.112 7.504 7.878 8.24 8.675 9.161 9.634 10.177 10.781 11.422 12.115 12.919 13.883 14.863 16.035 17.426 19.066 20.977 23.292 26.045 29.654 32.944 34.962 36.334 37.34 38.12 38.676 39.077 39.343 39.587 39.81 39.968 40.08 40.176 40.249 40.281 40.319 40.347 40.355 40.36 40.342 40.313 40.27 40.214 40.164 40.105 40.054 39.997 39.898 39.811 39.723 39.613 39.545 39.458 39.414 39.326 39.231 39.114 39.051 38.96 38.858 38.785 38.713 38.553 38.457 38.331 38.2 38.051 37.877 37.679 37.117 -10 ,15009 ,KEBNE ,16657873,Tue Nov 23 06:34:48 CET,Tue Nov 23 07:54:47 CET,0.0 0.461 0.696 0.908 1.089 1.261 1.43 1.603 1.904 2.028 2.153 2.33 2.521 2.637 2.859 3.06 3.265 3.367 3.579 3.782 4.062 4.25 4.433 4.701 4.969 5.231 5.486 5.741 6.075 6.399 6.724 7.118 7.509 7.888 8.327 8.825 9.305 9.846 10.448 11.098 11.799 12.62 13.577 14.545 15.733 17.116 18.753 20.714 23.138 26.109 29.935 33.288 35.426 36.91 37.95 38.734 39.285 39.69 39.991 40.251 40.464 40.629 40.746 40.807 40.824 40.864 40.917 40.938 40.932 40.913 40.889 40.86 40.823 40.768 40.719 40.662 40.602 40.538 40.461 40.409 40.361 40.283 40.212 40.133 40.096 40.006 39.887 39.753 39.683 39.58 39.462 39.375 39.288 39.084 38.971 38.868 38.729 38.522 38.288 38.01 37.397 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_54_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_54_50.txt deleted file mode 100644 index ca7ffa61..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_54_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2504 ,KEBNE ,16657874,Tue Nov 23 06:34:48 CET,Tue Nov 23 07:55:32 CET,0.0 0.763 1.053 1.278 1.473 1.63 1.767 1.91 2.162 2.269 2.361 2.453 2.649 2.757 2.954 3.131 3.297 3.381 3.552 3.7 3.896 4.034 4.179 4.383 4.575 4.77 4.972 5.163 5.409 5.653 5.879 6.164 6.455 6.727 7.024 7.361 7.698 8.074 8.489 8.935 9.426 9.997 10.648 11.296 12.11 13.045 14.105 15.31 16.67 18.245 20.136 21.542 22.135 22.396 22.556 22.602 22.557 22.449 22.334 22.184 22.021 21.862 21.707 21.579 21.446 21.288 21.086 20.904 20.759 20.606 20.459 20.339 20.187 20.02 19.895 19.774 19.633 19.466 19.306 19.199 19.079 18.895 18.757 18.596 18.517 18.355 18.17 17.955 17.847 17.663 17.48 17.348 17.218 16.945 16.788 16.608 16.373 16.072 15.723 15.305 14.475 -2 ,15403 ,KEBNE ,16657875,Tue Nov 23 06:35:50 CET,Tue Nov 23 07:56:26 CET,0.0 0.498 0.741 0.963 1.155 1.322 1.444 1.554 1.767 1.868 1.972 2.096 2.294 2.393 2.588 2.761 2.924 3.007 3.17 3.334 3.578 3.728 3.875 4.077 4.265 4.455 4.64 4.821 5.055 5.288 5.508 5.769 6.033 6.292 6.599 6.951 7.288 7.651 8.051 8.489 8.945 9.485 10.142 10.812 11.581 12.414 13.392 14.519 15.855 17.336 19.001 20.33 21.04 21.426 21.611 21.625 21.546 21.416 21.28 21.141 20.994 20.832 20.673 20.506 20.333 20.163 19.977 19.814 19.665 19.491 19.298 19.137 18.968 18.797 18.666 18.516 18.351 18.183 17.997 17.87 17.742 17.56 17.439 17.294 17.212 17.032 16.846 16.679 16.593 16.428 16.28 16.164 16.053 15.779 15.614 15.45 15.27 15.03 14.753 14.367 13.346 -3 ,14685 ,KEBNE ,16657876,Tue Nov 23 06:35:50 CET,Tue Nov 23 07:56:58 CET,0.0 0.61 0.934 1.141 1.299 1.467 1.639 1.809 2.095 2.201 2.305 2.421 2.621 2.719 2.905 3.102 3.307 3.409 3.593 3.754 3.991 4.156 4.323 4.545 4.755 4.958 5.141 5.32 5.56 5.804 6.046 6.333 6.618 6.915 7.269 7.666 8.032 8.43 8.878 9.348 9.827 10.376 11.008 11.638 12.372 13.24 14.294 15.432 16.736 18.284 20.047 21.375 22.122 22.477 22.613 22.661 22.675 22.646 22.542 22.42 22.287 22.139 22.011 21.86 21.701 21.528 21.316 21.123 20.952 20.774 20.602 20.477 20.341 20.155 19.994 19.835 19.665 19.489 19.301 19.176 19.057 18.868 18.723 18.566 18.49 18.352 18.195 18.007 17.915 17.747 17.593 17.461 17.335 17.066 16.902 16.734 16.552 16.351 16.122 15.784 15.013 -4 ,13180 ,KEBNE ,16657877,Tue Nov 23 06:35:50 CET,Tue Nov 23 07:56:42 CET,0.0 0.545 0.791 0.994 1.175 1.345 1.498 1.623 1.865 1.975 2.08 2.196 2.381 2.469 2.658 2.86 3.058 3.143 3.302 3.454 3.678 3.831 3.971 4.172 4.379 4.578 4.778 4.98 5.234 5.484 5.727 6.024 6.312 6.592 6.929 7.307 7.663 8.052 8.465 8.897 9.386 9.961 10.596 11.205 11.924 12.777 13.759 14.893 16.306 17.945 19.845 21.367 22.161 22.566 22.738 22.768 22.736 22.659 22.573 22.433 22.303 22.214 22.095 21.936 21.761 21.58 21.373 21.174 20.998 20.826 20.652 20.491 20.302 20.115 19.979 19.841 19.697 19.542 19.387 19.271 19.146 18.953 18.814 18.672 18.603 18.463 18.288 18.084 17.981 17.806 17.652 17.533 17.394 17.08 16.921 16.733 16.539 16.312 16.007 15.561 14.706 -5 ,31228 ,KEBNE ,16657878,Tue Nov 23 06:35:50 CET,Tue Nov 23 07:57:49 CET,0.0 0.728 0.992 1.174 1.334 1.489 1.636 1.779 2.017 2.122 2.24 2.385 2.596 2.708 2.889 3.058 3.248 3.338 3.49 3.644 3.888 4.053 4.205 4.431 4.652 4.864 5.082 5.285 5.536 5.775 6.016 6.328 6.621 6.904 7.235 7.608 7.962 8.342 8.758 9.215 9.699 10.24 10.911 11.59 12.351 13.181 14.172 15.355 16.74 18.451 20.488 21.832 22.458 22.827 23.017 23.086 23.075 23.039 22.991 22.89 22.762 22.649 22.535 22.392 22.208 22.002 21.783 21.602 21.45 21.275 21.075 20.919 20.775 20.62 20.485 20.336 20.191 20.042 19.867 19.742 19.616 19.414 19.271 19.124 19.047 18.888 18.729 18.559 18.46 18.279 18.132 18.022 17.894 17.589 17.426 17.269 17.077 16.852 16.61 16.271 15.242 -6 ,27806 ,KEBNE ,16657879,Tue Nov 23 06:35:50 CET,Tue Nov 23 07:57:24 CET,0.0 0.493 0.749 0.933 1.126 1.292 1.423 1.548 1.786 1.904 2.029 2.148 2.345 2.45 2.653 2.829 3.005 3.089 3.237 3.394 3.628 3.773 3.923 4.153 4.373 4.588 4.801 5.008 5.258 5.495 5.73 6.012 6.287 6.562 6.888 7.243 7.587 7.981 8.408 8.843 9.299 9.825 10.439 11.088 11.859 12.701 13.739 14.989 16.449 18.151 20.061 21.462 22.248 22.567 22.581 22.532 22.448 22.329 22.214 22.108 22.023 21.93 21.829 21.711 21.549 21.392 21.251 21.089 20.924 20.764 20.594 20.455 20.301 20.135 20.012 19.883 19.748 19.592 19.416 19.297 19.172 18.996 18.868 18.716 18.638 18.475 18.311 18.136 18.037 17.861 17.724 17.609 17.487 17.238 17.093 16.92 16.708 16.462 16.204 15.881 14.708 -7 ,2894 ,KEBNE ,16657880,Tue Nov 23 06:35:54 CET,Tue Nov 23 07:55:29 CET,0.0 0.516 0.765 0.985 1.172 1.333 1.478 1.61 1.869 1.999 2.122 2.25 2.454 2.556 2.756 2.947 3.121 3.207 3.388 3.563 3.822 3.987 4.145 4.38 4.614 4.834 5.038 5.234 5.496 5.755 6.005 6.311 6.603 6.89 7.219 7.591 7.962 8.371 8.825 9.298 9.771 10.321 11.0 11.665 12.463 13.467 14.651 15.879 17.175 18.808 20.748 22.07 22.74 23.081 23.225 23.247 23.226 23.196 23.088 22.906 22.742 22.615 22.49 22.359 22.197 22.012 21.818 21.65 21.518 21.382 21.235 21.101 20.951 20.798 20.691 20.572 20.436 20.309 20.151 20.028 19.908 19.718 19.564 19.387 19.3 19.141 18.976 18.79 18.693 18.505 18.331 18.215 18.094 17.827 17.67 17.505 17.303 17.051 16.771 16.376 15.593 -8 ,30227 ,KEBNE ,16657881,Tue Nov 23 06:36:51 CET,Tue Nov 23 07:58:56 CET,0.0 0.444 0.669 0.888 1.116 1.304 1.449 1.594 1.899 2.029 2.144 2.266 2.47 2.578 2.779 2.981 3.174 3.263 3.451 3.641 3.904 4.07 4.235 4.468 4.691 4.907 5.115 5.324 5.589 5.843 6.101 6.408 6.696 6.98 7.296 7.656 8.028 8.453 8.91 9.414 9.972 10.582 11.281 12.023 12.916 13.909 15.063 16.406 17.91 19.55 21.54 23.213 24.106 24.568 24.776 24.825 24.801 24.734 24.628 24.478 24.309 24.161 24.051 23.911 23.736 23.569 23.397 23.238 23.075 22.888 22.696 22.559 22.418 22.254 22.121 21.992 21.874 21.741 21.603 21.508 21.388 21.172 21.026 20.87 20.791 20.625 20.435 20.241 20.145 19.98 19.855 19.722 19.587 19.284 19.105 18.923 18.72 18.509 18.26 17.958 17.284 -9 ,592 ,KEBNE ,16657882,Tue Nov 23 06:36:51 CET,Tue Nov 23 07:56:54 CET,0.0 0.487 0.727 0.901 1.068 1.225 1.362 1.508 1.783 1.912 2.04 2.163 2.348 2.444 2.634 2.81 2.989 3.083 3.258 3.419 3.647 3.79 3.944 4.163 4.364 4.563 4.754 4.943 5.199 5.445 5.681 5.979 6.265 6.548 6.874 7.241 7.603 7.989 8.406 8.866 9.336 9.869 10.544 11.237 12.045 12.983 14.052 15.221 16.626 18.24 20.154 21.585 22.238 22.567 22.67 22.712 22.738 22.677 22.565 22.416 22.252 22.08 21.903 21.737 21.573 21.392 21.194 21.017 20.858 20.665 20.444 20.275 20.113 19.93 19.781 19.64 19.504 19.373 19.21 19.078 18.94 18.715 18.565 18.425 18.348 18.186 18.027 17.841 17.734 17.552 17.41 17.302 17.199 16.948 16.779 16.598 16.434 16.226 15.886 15.442 14.609 -10 ,11001 ,KEBNE ,16657883,Tue Nov 23 06:36:51 CET,Tue Nov 23 08:01:45 CET,0.0 0.588 0.911 1.172 1.415 1.61 1.773 1.924 2.216 2.355 2.478 2.599 2.804 2.919 3.136 3.336 3.513 3.604 3.779 3.94 4.17 4.321 4.485 4.72 4.927 5.126 5.328 5.524 5.791 6.064 6.316 6.608 6.887 7.17 7.508 7.881 8.236 8.617 9.02 9.454 9.941 10.498 11.134 11.798 12.599 13.503 14.513 15.601 16.969 18.589 20.374 21.669 22.267 22.618 22.842 22.968 22.993 22.968 22.897 22.758 22.565 22.366 22.189 22.018 21.869 21.721 21.563 21.418 21.271 21.116 20.95 20.795 20.63 20.461 20.334 20.209 20.069 19.904 19.73 19.611 19.493 19.29 19.146 19.01 18.935 18.767 18.599 18.413 18.304 18.129 18.001 17.888 17.761 17.484 17.336 17.178 17.02 16.81 16.516 16.138 15.24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_57_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_57_155.txt deleted file mode 100644 index b75e7e3d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_57_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15292 ,KEBNE ,16657884,Tue Nov 23 06:36:51 CET,Tue Nov 23 08:00:57 CET,0.0 0.173 0.322 0.459 0.57 0.673 0.761 0.846 0.989 1.058 1.139 1.214 1.358 1.413 1.517 1.613 1.683 1.725 1.808 1.889 2.024 2.093 2.152 2.242 2.328 2.406 2.501 2.602 2.712 2.811 2.904 3.02 3.133 3.238 3.348 3.443 3.527 3.616 3.691 3.769 3.849 3.911 3.961 4.02 4.08 4.102 4.098 4.037 3.823 3.373 2.48 1.364 0.384 -0.476 -1.196 -1.867 -2.44 -2.937 -3.381 -3.812 -4.19 -4.547 -4.887 -5.203 -5.498 -5.763 -6.05 -6.309 -6.517 -6.71 -6.906 -7.082 -7.255 -7.421 -7.55 -7.701 -7.87 -8.043 -8.216 -8.333 -8.459 -8.678 -8.835 -9.004 -9.083 -9.222 -9.372 -9.53 -9.607 -9.777 -9.869 -9.972 -10.078 -10.298 -10.427 -10.555 -10.667 -10.797 -11.0 -11.305 -11.91 -2 ,26201 ,KEBNE ,16657885,Tue Nov 23 06:36:51 CET,Tue Nov 23 08:00:06 CET,0.0 0.45 0.641 0.757 0.861 0.976 1.084 1.164 1.291 1.347 1.4 1.42 1.57 1.646 1.783 1.903 2.004 2.054 2.142 2.218 2.328 2.391 2.454 2.557 2.642 2.709 2.783 2.878 3.021 3.136 3.232 3.341 3.446 3.557 3.654 3.775 3.894 3.976 4.068 4.169 4.252 4.33 4.405 4.459 4.508 4.519 4.486 4.43 4.247 3.791 2.856 1.647 0.613 -0.255 -0.991 -1.636 -2.193 -2.688 -3.105 -3.536 -3.918 -4.254 -4.6 -4.921 -5.187 -5.422 -5.671 -5.896 -6.108 -6.34 -6.55 -6.711 -6.885 -7.067 -7.213 -7.369 -7.516 -7.668 -7.824 -7.931 -8.053 -8.262 -8.404 -8.545 -8.607 -8.736 -8.891 -9.058 -9.143 -9.312 -9.389 -9.471 -9.556 -9.767 -9.889 -10.017 -10.131 -10.238 -10.379 -10.579 -10.903 -3 ,29139 ,KEBNE ,16657886,Tue Nov 23 06:37:53 CET,Tue Nov 23 07:59:38 CET,0.0 0.426 0.589 0.754 0.907 1.046 1.152 1.228 1.378 1.469 1.559 1.639 1.785 1.845 1.954 2.058 2.162 2.213 2.313 2.401 2.521 2.597 2.663 2.75 2.841 2.929 3.003 3.082 3.2 3.306 3.396 3.509 3.615 3.7 3.788 3.898 3.987 4.079 4.184 4.278 4.369 4.458 4.547 4.594 4.589 4.559 4.549 4.457 4.184 3.723 2.839 1.652 0.691 -0.126 -0.849 -1.483 -2.037 -2.541 -2.961 -3.391 -3.772 -4.097 -4.393 -4.676 -4.933 -5.158 -5.395 -5.626 -5.842 -6.067 -6.315 -6.511 -6.689 -6.888 -7.049 -7.199 -7.342 -7.492 -7.648 -7.769 -7.902 -8.106 -8.253 -8.392 -8.46 -8.591 -8.716 -8.851 -8.932 -9.119 -9.214 -9.307 -9.413 -9.653 -9.762 -9.867 -9.979 -10.123 -10.29 -10.451 -10.863 -4 ,6888 ,KEBNE ,16657887,Tue Nov 23 06:37:53 CET,Tue Nov 23 08:00:40 CET,0.0 0.253 0.408 0.546 0.684 0.792 0.89 0.98 1.118 1.18 1.23 1.236 1.368 1.433 1.548 1.633 1.712 1.753 1.831 1.9 2.006 2.078 2.138 2.222 2.309 2.381 2.463 2.556 2.672 2.791 2.884 2.959 3.045 3.14 3.243 3.346 3.443 3.546 3.641 3.73 3.828 3.932 3.992 4.022 4.029 4.007 3.948 3.823 3.569 3.137 2.296 1.149 0.122 -0.775 -1.49 -2.147 -2.728 -3.215 -3.641 -4.06 -4.437 -4.803 -5.136 -5.422 -5.688 -5.942 -6.224 -6.471 -6.665 -6.867 -7.085 -7.266 -7.441 -7.624 -7.766 -7.908 -8.045 -8.184 -8.338 -8.454 -8.573 -8.737 -8.846 -8.97 -9.036 -9.157 -9.28 -9.429 -9.507 -9.666 -9.725 -9.813 -9.907 -10.115 -10.235 -10.352 -10.468 -10.59 -10.727 -10.913 -11.203 -5 ,23889 ,KEBNE ,16657888,Tue Nov 23 06:37:53 CET,Tue Nov 23 08:01:06 CET,0.0 0.326 0.52 0.691 0.827 0.944 1.055 1.149 1.331 1.418 1.489 1.55 1.692 1.741 1.84 1.94 2.038 2.084 2.176 2.267 2.385 2.476 2.559 2.639 2.715 2.798 2.879 2.949 3.055 3.149 3.22 3.297 3.392 3.481 3.563 3.66 3.76 3.867 3.949 4.023 4.104 4.183 4.239 4.271 4.306 4.308 4.261 4.136 3.89 3.42 2.461 1.21 0.192 -0.625 -1.339 -2.002 -2.573 -3.098 -3.572 -4.023 -4.421 -4.803 -5.151 -5.472 -5.787 -6.081 -6.354 -6.581 -6.784 -6.986 -7.206 -7.398 -7.579 -7.743 -7.878 -8.035 -8.193 -8.362 -8.531 -8.646 -8.767 -8.95 -9.09 -9.214 -9.275 -9.428 -9.593 -9.752 -9.833 -10.007 -10.079 -10.167 -10.254 -10.445 -10.567 -10.683 -10.78 -10.906 -11.091 -11.279 -11.609 -6 ,3802 ,KEBNE ,16657889,Tue Nov 23 06:37:53 CET,Tue Nov 23 08:00:45 CET,0.0 0.204 0.366 0.507 0.629 0.737 0.832 0.922 1.099 1.177 1.248 1.291 1.42 1.462 1.538 1.615 1.69 1.724 1.785 1.846 1.94 2.001 2.064 2.171 2.269 2.371 2.469 2.543 2.643 2.739 2.806 2.893 2.987 3.078 3.174 3.256 3.328 3.404 3.473 3.566 3.67 3.751 3.863 3.957 3.996 3.978 3.921 3.834 3.638 3.223 2.407 1.265 0.255 -0.573 -1.266 -1.892 -2.459 -2.954 -3.378 -3.84 -4.231 -4.552 -4.847 -5.14 -5.426 -5.675 -5.93 -6.162 -6.379 -6.596 -6.803 -6.972 -7.148 -7.329 -7.463 -7.609 -7.765 -7.918 -8.066 -8.173 -8.285 -8.448 -8.561 -8.688 -8.763 -8.909 -9.038 -9.188 -9.266 -9.427 -9.491 -9.585 -9.687 -9.893 -9.999 -10.116 -10.251 -10.403 -10.547 -10.704 -11.02 -7 ,29083 ,KEBNE ,16657890,Tue Nov 23 06:37:53 CET,Tue Nov 23 08:00:15 CET,0.0 0.583 0.755 0.898 1.027 1.121 1.195 1.276 1.43 1.492 1.547 1.583 1.732 1.785 1.873 1.966 2.06 2.11 2.206 2.293 2.409 2.476 2.534 2.629 2.737 2.831 2.906 2.979 3.082 3.185 3.272 3.363 3.446 3.522 3.621 3.715 3.79 3.859 3.909 3.96 4.018 4.074 4.125 4.162 4.168 4.141 4.098 3.963 3.675 3.18 2.186 0.922 -0.095 -0.991 -1.785 -2.476 -3.052 -3.576 -4.045 -4.496 -4.868 -5.205 -5.541 -5.851 -6.124 -6.368 -6.614 -6.832 -7.031 -7.24 -7.474 -7.677 -7.857 -8.048 -8.21 -8.378 -8.546 -8.701 -8.857 -8.974 -9.097 -9.292 -9.421 -9.537 -9.593 -9.712 -9.868 -10.058 -10.151 -10.325 -10.431 -10.535 -10.632 -10.873 -10.998 -11.096 -11.226 -11.373 -11.525 -11.75 -12.049 -8 ,29212 ,KEBNE ,16657891,Tue Nov 23 06:38:56 CET,Tue Nov 23 08:02:13 CET,0.0 0.392 0.615 0.777 0.879 0.967 1.049 1.135 1.29 1.36 1.426 1.478 1.608 1.653 1.748 1.845 1.929 1.968 2.056 2.151 2.27 2.338 2.402 2.475 2.554 2.632 2.701 2.781 2.885 2.985 3.079 3.188 3.286 3.365 3.435 3.51 3.6 3.691 3.768 3.854 3.932 3.994 4.076 4.144 4.18 4.217 4.194 4.027 3.749 3.281 2.361 1.22 0.269 -0.533 -1.241 -1.907 -2.501 -3.028 -3.479 -3.931 -4.309 -4.621 -4.952 -5.299 -5.58 -5.807 -6.065 -6.349 -6.581 -6.793 -7.015 -7.182 -7.352 -7.543 -7.691 -7.833 -7.98 -8.151 -8.325 -8.438 -8.56 -8.747 -8.867 -8.995 -9.068 -9.223 -9.379 -9.551 -9.649 -9.832 -9.923 -10.016 -10.118 -10.348 -10.467 -10.579 -10.685 -10.804 -10.933 -11.127 -11.588 -9 ,29504 ,KEBNE ,16657892,Tue Nov 23 06:38:56 CET,Tue Nov 23 08:02:13 CET,0.0 0.202 0.356 0.484 0.589 0.672 0.755 0.841 0.957 1.009 1.071 1.113 1.253 1.321 1.434 1.54 1.643 1.684 1.759 1.828 1.942 2.031 2.118 2.234 2.344 2.453 2.556 2.643 2.73 2.805 2.886 2.972 3.063 3.175 3.278 3.379 3.469 3.556 3.64 3.71 3.792 3.889 3.984 4.032 4.054 4.07 4.032 3.92 3.712 3.293 2.407 1.224 0.227 -0.636 -1.387 -2.057 -2.636 -3.157 -3.619 -4.067 -4.437 -4.762 -5.051 -5.328 -5.622 -5.886 -6.121 -6.33 -6.515 -6.707 -6.906 -7.07 -7.248 -7.446 -7.613 -7.774 -7.945 -8.119 -8.271 -8.386 -8.516 -8.705 -8.833 -8.97 -9.04 -9.188 -9.351 -9.529 -9.618 -9.79 -9.853 -9.929 -10.005 -10.186 -10.3 -10.43 -10.577 -10.742 -10.94 -11.162 -11.605 -10 ,9739 ,KEBNE ,16657893,Tue Nov 23 06:38:55 CET,Tue Nov 23 08:00:42 CET,0.0 0.363 0.483 0.593 0.7 0.794 0.886 0.959 1.066 1.113 1.165 1.179 1.302 1.339 1.403 1.486 1.566 1.598 1.659 1.719 1.804 1.858 1.923 2.026 2.124 2.219 2.307 2.402 2.516 2.601 2.671 2.746 2.819 2.889 2.969 3.063 3.133 3.188 3.243 3.302 3.387 3.484 3.554 3.613 3.672 3.693 3.639 3.539 3.358 2.922 2.038 0.878 -0.115 -0.962 -1.687 -2.328 -2.896 -3.386 -3.801 -4.243 -4.615 -4.929 -5.247 -5.549 -5.825 -6.088 -6.359 -6.585 -6.769 -6.956 -7.148 -7.326 -7.514 -7.693 -7.834 -7.979 -8.126 -8.286 -8.448 -8.563 -8.68 -8.855 -8.985 -9.117 -9.188 -9.348 -9.504 -9.663 -9.754 -9.941 -10.035 -10.14 -10.245 -10.435 -10.548 -10.669 -10.817 -10.969 -11.11 -11.299 -11.495 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_57_290.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_57_290.txt deleted file mode 100644 index c4cddaf4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_57_290.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17220 ,TETRA ,17675344,Sat Dec 4 16:24:57 CET,Sat Dec 4 18:09:10 CET,0.0 0.325 0.479 0.625 0.77 0.903 1.006 1.106 1.325 1.438 1.529 1.601 1.763 1.848 2.003 2.133 2.241 2.288 2.385 2.49 2.632 2.717 2.807 2.943 3.077 3.227 3.37 3.476 3.604 3.727 3.839 3.966 4.094 4.221 4.373 4.538 4.672 4.827 5.002 5.164 5.326 5.517 5.709 5.864 6.048 6.238 6.395 6.514 6.569 6.535 6.244 5.606 4.949 4.351 3.857 3.4 2.97 2.564 2.199 1.853 1.566 1.307 1.055 0.823 0.618 0.409 0.178 -0.018 -0.189 -0.363 -0.552 -0.729 -0.913 -1.093 -1.222 -1.347 -1.475 -1.607 -1.745 -1.845 -1.954 -2.114 -2.215 -2.317 -2.369 -2.483 -2.615 -2.757 -2.818 -2.964 -3.023 -3.098 -3.179 -3.362 -3.463 -3.568 -3.698 -3.849 -3.994 -4.183 -4.425 -2 ,13003 ,TETRA ,17675345,Sat Dec 4 16:24:59 CET,Sat Dec 4 18:08:54 CET,0.0 0.513 0.706 0.838 0.944 1.029 1.129 1.245 1.42 1.49 1.557 1.606 1.741 1.797 1.936 2.071 2.181 2.231 2.326 2.423 2.573 2.669 2.756 2.881 3.003 3.119 3.228 3.333 3.463 3.596 3.721 3.866 4.001 4.135 4.298 4.459 4.613 4.777 4.934 5.106 5.274 5.437 5.618 5.773 5.945 6.106 6.245 6.374 6.464 6.39 5.969 5.354 4.791 4.239 3.736 3.235 2.781 2.399 2.059 1.701 1.378 1.077 0.803 0.575 0.354 0.144 -0.07 -0.259 -0.43 -0.622 -0.815 -0.947 -1.071 -1.21 -1.326 -1.453 -1.607 -1.758 -1.89 -1.987 -2.088 -2.247 -2.358 -2.471 -2.53 -2.647 -2.763 -2.893 -2.978 -3.157 -3.263 -3.354 -3.449 -3.649 -3.749 -3.857 -3.977 -4.106 -4.245 -4.432 -4.812 -3 ,2282 ,TETRA ,17675346,Sat Dec 4 16:24:55 CET,Sat Dec 4 18:10:56 CET,0.0 0.419 0.563 0.695 0.823 0.946 1.058 1.149 1.319 1.401 1.461 1.493 1.637 1.703 1.813 1.916 2.018 2.062 2.148 2.245 2.39 2.47 2.547 2.663 2.784 2.916 3.043 3.139 3.264 3.393 3.501 3.625 3.761 3.884 4.012 4.156 4.29 4.448 4.609 4.766 4.908 5.062 5.253 5.437 5.61 5.754 5.894 6.017 6.122 6.078 5.747 5.198 4.574 3.967 3.401 2.89 2.479 2.068 1.699 1.345 1.022 0.737 0.496 0.267 0.056 -0.13 -0.338 -0.541 -0.723 -0.904 -1.089 -1.231 -1.371 -1.528 -1.66 -1.8 -1.95 -2.086 -2.211 -2.301 -2.392 -2.551 -2.664 -2.77 -2.827 -2.961 -3.093 -3.211 -3.277 -3.432 -3.495 -3.577 -3.663 -3.838 -3.926 -4.016 -4.116 -4.236 -4.384 -4.544 -4.936 -4 ,29292 ,TETRA ,17675347,Sat Dec 4 16:24:59 CET,Sat Dec 4 18:11:02 CET,0.0 0.443 0.607 0.771 0.895 0.991 1.084 1.19 1.402 1.491 1.556 1.589 1.735 1.805 1.939 2.054 2.153 2.199 2.289 2.38 2.516 2.609 2.7 2.838 2.967 3.068 3.172 3.283 3.411 3.533 3.652 3.79 3.931 4.079 4.243 4.412 4.559 4.693 4.833 4.995 5.158 5.343 5.534 5.704 5.907 6.084 6.236 6.37 6.463 6.477 6.207 5.629 5.061 4.5 3.984 3.531 3.119 2.731 2.397 2.076 1.795 1.545 1.288 1.012 0.771 0.563 0.348 0.161 0.011 -0.147 -0.338 -0.512 -0.688 -0.868 -1.015 -1.153 -1.283 -1.431 -1.587 -1.691 -1.808 -1.996 -2.116 -2.225 -2.28 -2.4 -2.537 -2.679 -2.746 -2.898 -2.952 -3.025 -3.115 -3.286 -3.348 -3.425 -3.536 -3.681 -3.851 -4.054 -4.354 -5 ,31721 ,TETRA ,17675348,Sat Dec 4 16:24:55 CET,Sat Dec 4 18:09:18 CET,0.0 0.402 0.595 0.725 0.845 0.956 1.059 1.161 1.349 1.428 1.508 1.585 1.746 1.813 1.921 2.041 2.169 2.232 2.346 2.442 2.567 2.645 2.721 2.836 2.945 3.06 3.172 3.276 3.416 3.554 3.676 3.802 3.922 4.042 4.191 4.351 4.499 4.658 4.815 4.984 5.151 5.336 5.553 5.744 5.915 6.091 6.259 6.395 6.471 6.393 6.045 5.417 4.849 4.305 3.791 3.281 2.799 2.386 2.055 1.716 1.412 1.135 0.868 0.616 0.377 0.155 -0.074 -0.258 -0.41 -0.576 -0.756 -0.92 -1.082 -1.245 -1.376 -1.515 -1.672 -1.821 -1.957 -2.063 -2.185 -2.367 -2.477 -2.598 -2.666 -2.794 -2.915 -3.053 -3.125 -3.272 -3.323 -3.409 -3.49 -3.653 -3.744 -3.838 -3.951 -4.073 -4.191 -4.313 -4.474 -6 ,32344 ,TETRA ,17675349,Sat Dec 4 16:24:57 CET,Sat Dec 4 18:09:04 CET,0.0 0.186 0.327 0.465 0.604 0.709 0.825 0.933 1.091 1.168 1.248 1.348 1.507 1.565 1.673 1.786 1.9 1.954 2.064 2.178 2.342 2.447 2.553 2.708 2.842 2.953 3.063 3.177 3.327 3.46 3.591 3.754 3.905 4.04 4.18 4.334 4.49 4.666 4.859 5.05 5.229 5.409 5.611 5.821 6.017 6.191 6.371 6.568 6.714 6.698 6.416 5.811 5.206 4.686 4.183 3.702 3.25 2.823 2.445 2.066 1.759 1.504 1.243 0.979 0.759 0.572 0.369 0.192 0.038 -0.131 -0.309 -0.461 -0.61 -0.752 -0.873 -1.011 -1.153 -1.303 -1.457 -1.56 -1.657 -1.801 -1.908 -2.017 -2.069 -2.173 -2.289 -2.41 -2.466 -2.609 -2.674 -2.763 -2.852 -3.046 -3.159 -3.263 -3.355 -3.452 -3.581 -3.734 -4.057 -7 ,1791 ,TETRA ,17675350,Sat Dec 4 16:27:54 CET,Sat Dec 4 18:13:05 CET,0.0 0.623 0.809 0.952 1.095 1.215 1.319 1.414 1.585 1.673 1.763 1.852 2.006 2.08 2.225 2.357 2.491 2.552 2.651 2.749 2.912 3.018 3.116 3.268 3.414 3.552 3.677 3.787 3.926 4.049 4.169 4.33 4.485 4.625 4.785 4.948 5.094 5.266 5.456 5.658 5.837 5.993 6.169 6.351 6.539 6.708 6.861 6.975 7.029 6.922 6.557 5.952 5.324 4.748 4.19 3.659 3.209 2.799 2.447 2.106 1.828 1.587 1.341 1.081 0.85 0.65 0.43 0.231 0.067 -0.11 -0.304 -0.45 -0.588 -0.733 -0.846 -0.968 -1.098 -1.233 -1.37 -1.466 -1.572 -1.75 -1.87 -1.985 -2.048 -2.18 -2.317 -2.466 -2.546 -2.713 -2.775 -2.845 -2.922 -3.087 -3.187 -3.308 -3.425 -3.527 -3.639 -3.764 -4.144 -8 ,7241 ,TETRA ,17675351,Sat Dec 4 16:25:55 CET,Sat Dec 4 18:09:48 CET,0.0 0.388 0.58 0.754 0.919 1.04 1.162 1.285 1.486 1.58 1.66 1.735 1.902 1.977 2.103 2.222 2.332 2.392 2.508 2.615 2.752 2.836 2.922 3.035 3.145 3.256 3.37 3.474 3.594 3.722 3.843 3.981 4.117 4.247 4.399 4.583 4.75 4.91 5.069 5.236 5.427 5.64 5.836 6.008 6.22 6.437 6.597 6.704 6.764 6.644 6.211 5.558 4.972 4.422 3.911 3.426 3.013 2.644 2.312 1.975 1.652 1.348 1.05 0.766 0.502 0.263 0.035 -0.152 -0.326 -0.502 -0.67 -0.837 -1.004 -1.155 -1.277 -1.401 -1.54 -1.694 -1.843 -1.938 -2.037 -2.202 -2.315 -2.436 -2.498 -2.618 -2.743 -2.881 -2.953 -3.11 -3.182 -3.261 -3.343 -3.533 -3.638 -3.753 -3.872 -3.989 -4.111 -4.241 -4.591 -9 ,14445 ,TETRA ,17675352,Sat Dec 4 16:25:55 CET,Sat Dec 4 18:09:44 CET,0.0 0.592 0.751 0.888 1.017 1.141 1.273 1.382 1.55 1.624 1.688 1.764 1.925 1.996 2.125 2.236 2.359 2.421 2.523 2.624 2.764 2.844 2.921 3.05 3.179 3.29 3.4 3.5 3.623 3.75 3.867 3.992 4.123 4.26 4.409 4.573 4.735 4.898 5.079 5.256 5.426 5.606 5.77 5.918 6.072 6.24 6.418 6.57 6.666 6.599 6.234 5.586 4.916 4.279 3.699 3.169 2.683 2.228 1.866 1.522 1.2 0.911 0.667 0.429 0.199 -0.006 -0.226 -0.428 -0.612 -0.788 -0.953 -1.112 -1.285 -1.457 -1.604 -1.742 -1.873 -1.999 -2.132 -2.24 -2.343 -2.515 -2.638 -2.757 -2.82 -2.942 -3.076 -3.211 -3.269 -3.415 -3.454 -3.511 -3.587 -3.786 -3.903 -4.029 -4.154 -4.271 -4.399 -4.579 -4.993 -10 ,11865 ,TETRA ,17675353,Sat Dec 4 16:25:56 CET,Sat Dec 4 18:11:15 CET,0.0 0.306 0.501 0.646 0.797 0.931 1.037 1.127 1.333 1.433 1.514 1.583 1.735 1.802 1.938 2.065 2.181 2.234 2.325 2.417 2.569 2.666 2.746 2.863 2.996 3.126 3.235 3.333 3.46 3.567 3.671 3.841 4.018 4.168 4.316 4.464 4.607 4.756 4.906 5.058 5.217 5.401 5.624 5.831 6.029 6.179 6.292 6.406 6.478 6.434 6.154 5.597 5.0 4.44 3.937 3.446 3.021 2.672 2.372 2.056 1.78 1.526 1.289 1.062 0.843 0.625 0.39 0.179 0.0 -0.179 -0.357 -0.503 -0.673 -0.852 -0.987 -1.116 -1.238 -1.369 -1.51 -1.604 -1.696 -1.848 -1.954 -2.074 -2.135 -2.256 -2.41 -2.566 -2.631 -2.784 -2.879 -2.98 -3.062 -3.194 -3.275 -3.377 -3.482 -3.597 -3.758 -3.944 -4.115 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_1.txt deleted file mode 100644 index 49c10177..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29961 ,KEBNE ,16657894,Tue Nov 23 06:38:55 CET,Tue Nov 23 08:01:28 CET,0.0 0.209 0.357 0.48 0.617 0.752 0.87 0.977 1.162 1.237 1.313 1.373 1.529 1.606 1.749 1.872 1.983 2.026 2.101 2.186 2.313 2.395 2.478 2.595 2.725 2.854 2.953 3.045 3.172 3.301 3.429 3.576 3.7 3.806 3.941 4.108 4.264 4.42 4.598 4.8 5.008 5.24 5.478 5.697 5.922 6.157 6.42 6.654 6.857 6.975 6.834 6.441 6.05 5.67 5.253 4.807 4.433 4.083 3.734 3.396 3.112 2.846 2.581 2.338 2.102 1.877 1.656 1.453 1.265 1.075 0.883 0.717 0.547 0.358 0.2 0.031 -0.158 -0.34 -0.501 -0.625 -0.762 -0.974 -1.132 -1.3 -1.39 -1.576 -1.743 -1.925 -2.028 -2.207 -2.337 -2.456 -2.577 -2.818 -2.928 -3.049 -3.211 -3.404 -3.626 -3.9 -4.69 -2 ,4530 ,KEBNE ,16657895,Tue Nov 23 06:38:55 CET,Tue Nov 23 08:02:32 CET,0.0 0.646 0.835 0.942 1.034 1.143 1.244 1.332 1.488 1.558 1.629 1.663 1.808 1.87 1.983 2.096 2.212 2.273 2.387 2.488 2.657 2.753 2.827 2.939 3.048 3.164 3.275 3.375 3.525 3.66 3.76 3.878 3.999 4.134 4.298 4.465 4.596 4.721 4.86 5.019 5.188 5.357 5.561 5.781 5.99 6.194 6.406 6.586 6.761 6.904 6.857 6.438 5.939 5.472 5.027 4.56 4.136 3.772 3.403 3.03 2.756 2.492 2.221 1.97 1.717 1.495 1.286 1.092 0.923 0.729 0.506 0.333 0.151 -0.055 -0.197 -0.333 -0.471 -0.595 -0.737 -0.848 -0.967 -1.149 -1.276 -1.42 -1.491 -1.632 -1.769 -1.918 -2.007 -2.186 -2.31 -2.42 -2.538 -2.798 -2.937 -3.097 -3.261 -3.431 -3.629 -3.909 -4.698 -3 ,30187 ,KEBNE ,16657896,Tue Nov 23 06:38:56 CET,Tue Nov 23 08:02:40 CET,0.0 0.684 0.882 1.029 1.152 1.262 1.357 1.44 1.601 1.681 1.757 1.797 1.939 2.002 2.128 2.247 2.346 2.401 2.516 2.614 2.734 2.811 2.888 2.997 3.114 3.239 3.348 3.439 3.558 3.694 3.82 3.954 4.106 4.26 4.4 4.548 4.698 4.877 5.075 5.25 5.406 5.611 5.887 6.118 6.33 6.548 6.769 6.97 7.186 7.329 7.298 7.011 6.639 6.206 5.779 5.398 5.022 4.654 4.335 4.002 3.705 3.464 3.234 2.975 2.729 2.52 2.299 2.101 1.92 1.73 1.539 1.38 1.213 1.05 0.926 0.78 0.614 0.435 0.256 0.133 0.01 -0.189 -0.334 -0.481 -0.554 -0.708 -0.873 -1.041 -1.139 -1.321 -1.439 -1.537 -1.636 -1.858 -1.97 -2.105 -2.255 -2.423 -2.635 -2.941 -3.653 -4 ,14420 ,KEBNE ,16657897,Tue Nov 23 06:39:58 CET,Tue Nov 23 08:02:21 CET,0.0 0.602 0.802 0.955 1.085 1.207 1.319 1.407 1.541 1.604 1.674 1.721 1.866 1.926 2.035 2.128 2.219 2.262 2.347 2.431 2.557 2.628 2.699 2.814 2.926 3.028 3.119 3.206 3.346 3.478 3.585 3.719 3.837 3.959 4.093 4.241 4.391 4.534 4.689 4.847 5.007 5.203 5.414 5.612 5.841 6.046 6.226 6.435 6.644 6.739 6.616 6.18 5.685 5.233 4.831 4.445 4.071 3.708 3.371 3.054 2.778 2.51 2.256 1.985 1.719 1.472 1.228 1.028 0.835 0.611 0.374 0.177 -0.005 -0.188 -0.35 -0.529 -0.71 -0.892 -1.081 -1.201 -1.32 -1.498 -1.626 -1.767 -1.841 -1.991 -2.156 -2.345 -2.438 -2.612 -2.713 -2.821 -2.927 -3.128 -3.251 -3.39 -3.519 -3.667 -3.877 -4.111 -4.559 -5 ,27385 ,KEBNE ,16657898,Tue Nov 23 06:39:58 CET,Tue Nov 23 08:02:12 CET,0.0 0.31 0.447 0.605 0.734 0.823 0.898 0.972 1.119 1.183 1.245 1.282 1.422 1.478 1.585 1.695 1.798 1.844 1.942 2.048 2.209 2.295 2.362 2.458 2.567 2.677 2.778 2.872 2.981 3.077 3.174 3.321 3.461 3.578 3.718 3.868 4.002 4.158 4.335 4.533 4.73 4.918 5.117 5.333 5.561 5.777 6.023 6.297 6.564 6.763 6.77 6.44 6.04 5.635 5.268 4.882 4.511 4.172 3.858 3.532 3.247 2.986 2.725 2.464 2.217 1.991 1.763 1.559 1.377 1.2 1.04 0.908 0.752 0.587 0.471 0.347 0.201 0.045 -0.116 -0.223 -0.335 -0.522 -0.655 -0.786 -0.859 -1.007 -1.143 -1.292 -1.381 -1.556 -1.639 -1.735 -1.853 -2.101 -2.217 -2.349 -2.506 -2.649 -2.817 -3.065 -3.675 -6 ,9826 ,KEBNE ,16657899,Tue Nov 23 06:39:58 CET,Tue Nov 23 08:02:32 CET,0.0 0.186 0.318 0.45 0.553 0.639 0.728 0.827 0.993 1.066 1.136 1.167 1.31 1.378 1.503 1.623 1.745 1.807 1.914 2.017 2.168 2.257 2.338 2.45 2.581 2.716 2.822 2.915 3.033 3.146 3.269 3.414 3.539 3.653 3.777 3.915 4.051 4.209 4.383 4.547 4.735 4.955 5.171 5.374 5.593 5.806 6.031 6.305 6.595 6.791 6.806 6.476 6.029 5.51 5.034 4.647 4.29 3.947 3.653 3.36 3.105 2.871 2.621 2.374 2.15 1.953 1.741 1.535 1.361 1.173 0.984 0.829 0.661 0.474 0.325 0.184 0.036 -0.109 -0.245 -0.35 -0.454 -0.626 -0.758 -0.893 -0.967 -1.114 -1.272 -1.45 -1.533 -1.69 -1.758 -1.845 -1.944 -2.173 -2.299 -2.43 -2.574 -2.736 -2.902 -3.107 -3.611 -7 ,26477 ,KEBNE ,16657900,Tue Nov 23 06:39:57 CET,Tue Nov 23 08:03:24 CET,0.0 0.31 0.453 0.564 0.656 0.743 0.827 0.903 1.043 1.117 1.185 1.241 1.397 1.456 1.591 1.724 1.829 1.88 1.968 2.046 2.159 2.233 2.306 2.426 2.561 2.688 2.797 2.893 3.001 3.103 3.222 3.39 3.544 3.674 3.831 4.011 4.187 4.375 4.548 4.707 4.876 5.078 5.29 5.465 5.66 5.873 6.102 6.339 6.536 6.682 6.636 6.25 5.8 5.336 4.908 4.475 4.077 3.719 3.412 3.101 2.821 2.568 2.332 2.094 1.847 1.617 1.384 1.199 1.021 0.809 0.609 0.468 0.335 0.185 0.057 -0.096 -0.269 -0.448 -0.643 -0.767 -0.888 -1.07 -1.199 -1.336 -1.4 -1.543 -1.695 -1.853 -1.942 -2.112 -2.207 -2.298 -2.385 -2.624 -2.757 -2.881 -3.006 -3.169 -3.37 -3.595 -4.231 -8 ,11323 ,KEBNE ,16657901,Tue Nov 23 06:39:58 CET,Tue Nov 23 08:02:19 CET,0.0 0.494 0.711 0.819 0.904 1.004 1.105 1.199 1.413 1.507 1.581 1.646 1.807 1.879 1.992 2.112 2.249 2.306 2.41 2.518 2.679 2.792 2.892 3.005 3.11 3.228 3.349 3.484 3.658 3.791 3.905 4.051 4.192 4.321 4.45 4.583 4.711 4.864 5.041 5.221 5.407 5.594 5.76 5.932 6.167 6.395 6.631 6.848 7.06 7.27 7.31 7.091 6.758 6.304 5.845 5.456 5.102 4.735 4.392 4.017 3.69 3.429 3.189 2.952 2.715 2.482 2.216 2.003 1.822 1.617 1.414 1.238 1.062 0.904 0.765 0.589 0.406 0.212 0.013 -0.116 -0.25 -0.452 -0.597 -0.749 -0.822 -0.968 -1.145 -1.336 -1.427 -1.6 -1.729 -1.856 -1.985 -2.258 -2.398 -2.547 -2.691 -2.847 -3.03 -3.258 -3.871 -9 ,28228 ,KEBNE ,16657902,Tue Nov 23 06:39:57 CET,Tue Nov 23 08:02:17 CET,0.0 0.243 0.363 0.506 0.664 0.81 0.907 0.991 1.145 1.212 1.288 1.343 1.49 1.556 1.677 1.781 1.884 1.938 2.045 2.158 2.295 2.371 2.445 2.549 2.665 2.78 2.887 2.982 3.096 3.214 3.36 3.531 3.662 3.79 3.936 4.1 4.24 4.377 4.541 4.711 4.891 5.099 5.297 5.495 5.716 5.925 6.15 6.354 6.524 6.647 6.674 6.393 5.951 5.451 4.958 4.543 4.174 3.823 3.497 3.132 2.788 2.493 2.237 1.999 1.772 1.564 1.339 1.139 0.966 0.762 0.55 0.371 0.183 -0.003 -0.149 -0.297 -0.45 -0.619 -0.792 -0.906 -1.011 -1.169 -1.289 -1.421 -1.489 -1.627 -1.779 -1.946 -2.037 -2.21 -2.324 -2.435 -2.552 -2.839 -2.992 -3.14 -3.3 -3.484 -3.718 -4.029 -4.883 -10 ,25933 ,KEBNE ,16657903,Tue Nov 23 06:39:57 CET,Tue Nov 23 08:02:15 CET,0.0 0.201 0.371 0.505 0.629 0.756 0.863 0.952 1.105 1.185 1.256 1.303 1.455 1.514 1.612 1.72 1.852 1.911 2.011 2.112 2.255 2.342 2.432 2.578 2.72 2.858 2.99 3.093 3.209 3.322 3.434 3.568 3.69 3.829 3.996 4.158 4.298 4.458 4.635 4.796 4.949 5.145 5.375 5.572 5.777 5.98 6.189 6.4 6.62 6.802 6.771 6.46 6.1 5.719 5.332 4.907 4.515 4.141 3.809 3.479 3.158 2.866 2.606 2.355 2.127 1.933 1.716 1.513 1.338 1.156 0.954 0.781 0.614 0.454 0.336 0.216 0.086 -0.064 -0.237 -0.357 -0.477 -0.656 -0.778 -0.911 -0.981 -1.111 -1.258 -1.422 -1.509 -1.683 -1.779 -1.877 -1.985 -2.211 -2.321 -2.449 -2.613 -2.803 -3.03 -3.261 -3.664 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_41.txt deleted file mode 100644 index d40c0b9a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7689 ,KEBNE ,16657904,Tue Nov 23 06:39:58 CET,Tue Nov 23 08:01:43 CET,0.0 0.61 0.903 1.135 1.34 1.507 1.639 1.774 2.018 2.13 2.231 2.337 2.515 2.614 2.821 3.0 3.154 3.229 3.38 3.522 3.73 3.874 4.016 4.205 4.395 4.578 4.751 4.927 5.144 5.334 5.515 5.742 5.958 6.152 6.369 6.627 6.901 7.195 7.485 7.791 8.113 8.486 8.922 9.375 9.892 10.395 10.914 11.542 12.329 13.172 13.964 14.354 14.379 14.276 14.126 13.931 13.676 13.353 13.066 12.803 12.558 12.335 12.138 11.959 11.796 11.617 11.399 11.217 11.069 10.912 10.766 10.63 10.468 10.311 10.186 10.055 9.908 9.738 9.571 9.459 9.334 9.116 8.968 8.831 8.764 8.631 8.48 8.318 8.222 8.043 7.898 7.766 7.634 7.359 7.204 7.043 6.874 6.67 6.421 6.08 5.099 -2 ,16950 ,KEBNE ,16657905,Tue Nov 23 06:40:59 CET,Tue Nov 23 08:04:06 CET,0.0 0.506 0.812 1.102 1.32 1.482 1.61 1.745 2.036 2.169 2.295 2.422 2.602 2.686 2.837 2.992 3.149 3.23 3.393 3.542 3.762 3.92 4.07 4.292 4.502 4.695 4.881 5.063 5.284 5.496 5.698 5.923 6.129 6.35 6.652 6.984 7.253 7.548 7.894 8.257 8.635 9.035 9.475 9.88 10.338 10.882 11.485 12.129 12.84 13.589 14.351 14.723 14.778 14.664 14.452 14.201 13.96 13.736 13.523 13.267 13.004 12.739 12.507 12.322 12.14 11.96 11.786 11.604 11.41 11.209 10.995 10.81 10.613 10.436 10.314 10.178 10.029 9.867 9.692 9.566 9.439 9.218 9.047 8.871 8.789 8.646 8.499 8.329 8.23 8.052 7.943 7.858 7.768 7.567 7.449 7.321 7.173 6.991 6.774 6.467 5.646 -3 ,24307 ,KEBNE ,16657906,Tue Nov 23 06:40:59 CET,Tue Nov 23 08:03:01 CET,0.0 0.419 0.666 0.858 0.995 1.124 1.248 1.365 1.588 1.691 1.792 1.912 2.101 2.207 2.412 2.6 2.768 2.854 3.017 3.169 3.392 3.531 3.663 3.851 4.029 4.202 4.375 4.547 4.775 4.998 5.228 5.487 5.712 5.917 6.139 6.408 6.664 6.928 7.212 7.498 7.841 8.258 8.711 9.134 9.591 10.058 10.565 11.2 11.95 12.781 13.639 14.13 14.269 14.214 14.025 13.745 13.484 13.216 12.973 12.742 12.533 12.315 12.078 11.837 11.584 11.367 11.182 10.99 10.8 10.609 10.413 10.259 10.103 9.95 9.82 9.663 9.504 9.344 9.179 9.071 8.946 8.739 8.588 8.421 8.34 8.192 8.049 7.895 7.795 7.6 7.45 7.337 7.202 6.919 6.792 6.657 6.506 6.336 6.112 5.737 4.625 -4 ,25234 ,KEBNE ,16657907,Tue Nov 23 06:41:00 CET,Tue Nov 23 08:10:55 CET,0.0 0.84 1.071 1.269 1.448 1.613 1.778 1.935 2.194 2.295 2.4 2.541 2.716 2.801 2.949 3.102 3.261 3.336 3.48 3.629 3.861 4.005 4.147 4.342 4.522 4.7 4.865 5.034 5.247 5.427 5.608 5.855 6.084 6.277 6.497 6.758 7.002 7.272 7.576 7.883 8.183 8.533 8.981 9.417 9.868 10.395 10.991 11.639 12.456 13.308 14.07 14.444 14.443 14.27 14.008 13.683 13.381 13.089 12.763 12.392 12.095 11.813 11.531 11.285 11.043 10.817 10.594 10.402 10.234 10.047 9.833 9.663 9.496 9.32 9.185 9.039 8.885 8.73 8.563 8.441 8.318 8.121 7.981 7.831 7.763 7.632 7.462 7.289 7.202 7.019 6.864 6.747 6.62 6.386 6.254 6.087 5.893 5.694 5.501 5.202 4.402 -5 ,19908 ,KEBNE ,16657908,Tue Nov 23 06:40:59 CET,Tue Nov 23 08:03:03 CET,0.0 0.726 1.015 1.264 1.495 1.649 1.795 1.941 2.186 2.294 2.4 2.513 2.687 2.768 2.93 3.103 3.267 3.355 3.532 3.69 3.907 4.049 4.194 4.405 4.605 4.785 4.958 5.133 5.355 5.578 5.782 6.013 6.236 6.452 6.715 6.998 7.245 7.509 7.782 8.065 8.389 8.773 9.209 9.661 10.171 10.683 11.253 11.906 12.623 13.383 14.199 14.564 14.613 14.558 14.429 14.221 13.984 13.697 13.423 13.165 12.928 12.673 12.415 12.189 11.977 11.801 11.612 11.421 11.256 11.088 10.895 10.74 10.585 10.406 10.268 10.126 9.964 9.788 9.603 9.473 9.36 9.179 9.028 8.877 8.808 8.664 8.49 8.291 8.203 8.041 7.93 7.83 7.72 7.483 7.342 7.17 6.983 6.797 6.572 6.233 5.242 -6 ,9053 ,KEBNE ,16657909,Tue Nov 23 06:40:59 CET,Tue Nov 23 08:03:56 CET,0.0 0.628 0.889 1.072 1.238 1.384 1.517 1.655 1.912 2.032 2.137 2.235 2.409 2.501 2.683 2.851 3.014 3.093 3.255 3.424 3.655 3.784 3.915 4.114 4.308 4.501 4.686 4.856 5.062 5.248 5.435 5.664 5.871 6.054 6.258 6.501 6.757 7.051 7.358 7.68 8.009 8.362 8.778 9.222 9.713 10.209 10.793 11.447 12.138 12.86 13.556 13.823 13.646 13.419 13.17 12.845 12.551 12.281 12.012 11.703 11.425 11.189 10.953 10.725 10.53 10.336 10.096 9.859 9.671 9.495 9.318 9.161 8.986 8.811 8.666 8.506 8.357 8.225 8.07 7.949 7.819 7.603 7.446 7.292 7.213 7.029 6.832 6.622 6.513 6.329 6.183 6.07 5.938 5.644 5.503 5.353 5.162 4.947 4.729 4.46 3.724 -7 ,13718 ,KEBNE ,16657910,Tue Nov 23 06:40:59 CET,Tue Nov 23 08:04:24 CET,0.0 0.499 0.718 0.917 1.115 1.271 1.413 1.554 1.81 1.947 2.068 2.18 2.35 2.442 2.632 2.813 2.981 3.065 3.222 3.37 3.586 3.718 3.855 4.07 4.277 4.476 4.662 4.827 5.052 5.268 5.456 5.696 5.939 6.149 6.385 6.661 6.924 7.199 7.549 7.955 8.32 8.695 9.14 9.586 10.061 10.565 11.115 11.724 12.444 13.215 13.965 14.295 14.249 14.107 13.94 13.74 13.47 13.179 12.935 12.653 12.398 12.172 11.944 11.724 11.508 11.289 11.038 10.798 10.614 10.436 10.247 10.101 9.923 9.734 9.598 9.456 9.319 9.176 9.013 8.898 8.767 8.549 8.386 8.224 8.152 8.001 7.825 7.625 7.526 7.352 7.233 7.128 7.004 6.707 6.548 6.379 6.192 5.959 5.676 5.332 4.438 -8 ,16706 ,KEBNE ,16657911,Tue Nov 23 06:40:59 CET,Tue Nov 23 08:03:01 CET,0.0 0.975 1.244 1.448 1.611 1.781 1.932 2.047 2.257 2.361 2.465 2.594 2.777 2.869 3.06 3.243 3.404 3.481 3.639 3.78 3.984 4.132 4.283 4.488 4.682 4.877 5.051 5.216 5.451 5.672 5.864 6.094 6.332 6.556 6.803 7.067 7.307 7.562 7.822 8.108 8.426 8.82 9.293 9.746 10.244 10.742 11.289 11.899 12.59 13.35 14.162 14.664 14.711 14.542 14.349 14.107 13.867 13.621 13.342 13.074 12.836 12.599 12.374 12.16 11.936 11.73 11.516 11.303 11.12 10.94 10.739 10.576 10.419 10.24 10.081 9.905 9.722 9.553 9.386 9.268 9.135 8.924 8.775 8.611 8.525 8.338 8.144 7.95 7.851 7.677 7.542 7.427 7.285 6.99 6.852 6.684 6.505 6.322 6.07 5.705 4.639 -9 ,6223 ,KEBNE ,16657912,Tue Nov 23 06:40:59 CET,Tue Nov 23 08:03:41 CET,0.0 0.554 0.783 0.967 1.125 1.267 1.4 1.54 1.808 1.926 2.055 2.235 2.428 2.523 2.689 2.866 3.037 3.123 3.286 3.426 3.633 3.776 3.917 4.118 4.297 4.477 4.648 4.808 5.035 5.244 5.451 5.694 5.931 6.164 6.411 6.684 6.948 7.231 7.53 7.822 8.12 8.497 8.918 9.302 9.77 10.264 10.792 11.378 12.011 12.645 13.21 13.475 13.483 13.388 13.213 12.991 12.78 12.553 12.316 12.05 11.788 11.531 11.288 11.07 10.862 10.648 10.423 10.221 10.057 9.886 9.676 9.506 9.349 9.173 9.029 8.887 8.729 8.563 8.407 8.291 8.158 7.972 7.849 7.716 7.651 7.511 7.351 7.171 7.074 6.907 6.792 6.681 6.572 6.33 6.188 6.048 5.893 5.698 5.461 5.164 4.533 -10 ,16200 ,KEBNE ,16657913,Tue Nov 23 06:40:59 CET,Tue Nov 23 08:02:43 CET,0.0 0.96 1.257 1.476 1.649 1.802 1.945 2.075 2.325 2.446 2.555 2.671 2.843 2.934 3.103 3.263 3.446 3.525 3.664 3.819 4.031 4.159 4.283 4.463 4.653 4.839 5.023 5.198 5.413 5.606 5.787 6.016 6.245 6.503 6.798 7.06 7.299 7.567 7.855 8.148 8.443 8.778 9.181 9.599 10.062 10.551 11.093 11.71 12.396 13.132 13.959 14.485 14.617 14.575 14.455 14.31 14.117 13.903 13.722 13.524 13.338 13.135 12.923 12.72 12.539 12.39 12.229 12.079 11.941 11.779 11.609 11.484 11.35 11.208 11.097 10.974 10.844 10.697 10.522 10.406 10.298 10.127 9.997 9.855 9.78 9.609 9.449 9.291 9.204 9.031 8.849 8.725 8.6 8.311 8.161 8.0 7.8 7.551 7.278 6.945 5.75 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_1.txt deleted file mode 100644 index 4c10036d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10254 ,KEBNE ,16657914,Tue Nov 23 06:40:59 CET,Tue Nov 23 08:04:44 CET,0.0 0.361 0.568 0.771 0.932 1.072 1.18 1.282 1.454 1.534 1.628 1.714 1.864 1.938 2.07 2.178 2.292 2.359 2.481 2.595 2.742 2.834 2.927 3.05 3.156 3.242 3.328 3.413 3.526 3.641 3.747 3.875 4.01 4.146 4.283 4.435 4.598 4.751 4.888 5.066 5.252 5.427 5.646 5.823 5.994 6.195 6.377 6.471 6.48 6.248 5.394 4.126 3.042 2.037 1.058 0.191 -0.535 -1.171 -1.696 -2.236 -2.732 -3.189 -3.642 -4.074 -4.446 -4.766 -5.127 -5.474 -5.769 -6.069 -6.407 -6.672 -6.925 -7.202 -7.408 -7.627 -7.852 -8.082 -8.328 -8.504 -8.691 -9.012 -9.239 -9.457 -9.568 -9.807 -10.043 -10.285 -10.419 -10.633 -10.803 -10.946 -11.104 -11.446 -11.632 -11.825 -12.023 -12.256 -12.553 -12.905 -13.691 -2 ,5359 ,KEBNE ,16657915,Tue Nov 23 06:40:59 CET,Tue Nov 23 08:04:11 CET,0.0 0.329 0.476 0.617 0.718 0.828 0.933 1.018 1.211 1.311 1.4 1.465 1.603 1.664 1.809 1.95 2.067 2.121 2.228 2.33 2.472 2.568 2.659 2.781 2.908 3.038 3.158 3.273 3.43 3.577 3.709 3.859 3.996 4.142 4.313 4.488 4.651 4.843 5.054 5.26 5.465 5.709 5.98 6.228 6.501 6.77 7.033 7.28 7.399 7.189 6.497 5.321 4.25 3.341 2.559 1.786 1.011 0.336 -0.214 -0.73 -1.13 -1.508 -1.913 -2.314 -2.681 -3.013 -3.371 -3.666 -3.922 -4.23 -4.546 -4.781 -5.017 -5.282 -5.493 -5.705 -5.92 -6.138 -6.361 -6.508 -6.653 -6.896 -7.077 -7.266 -7.362 -7.557 -7.765 -7.985 -8.093 -8.29 -8.448 -8.581 -8.71 -8.999 -9.161 -9.329 -9.508 -9.709 -9.949 -10.225 -11.118 -3 ,13514 ,KEBNE ,16657916,Tue Nov 23 06:40:59 CET,Tue Nov 23 08:04:24 CET,0.0 0.473 0.681 0.86 0.987 1.093 1.196 1.284 1.46 1.543 1.608 1.666 1.823 1.891 2.004 2.119 2.223 2.268 2.357 2.451 2.586 2.667 2.748 2.857 2.952 3.035 3.115 3.217 3.369 3.515 3.646 3.792 3.914 4.018 4.156 4.331 4.506 4.676 4.825 5.001 5.168 5.321 5.49 5.65 5.817 6.002 6.166 6.181 6.053 5.768 5.281 4.524 3.68 2.865 2.106 1.356 0.63 -0.003 -0.558 -1.162 -1.646 -2.03 -2.398 -2.776 -3.132 -3.437 -3.75 -4.03 -4.282 -4.544 -4.808 -5.026 -5.247 -5.464 -5.625 -5.798 -5.987 -6.19 -6.404 -6.55 -6.699 -6.918 -7.066 -7.23 -7.318 -7.492 -7.67 -7.867 -7.969 -8.144 -8.24 -8.356 -8.501 -8.767 -8.895 -9.055 -9.26 -9.478 -9.699 -9.948 -10.697 -4 ,13670 ,KEBNE ,16657917,Tue Nov 23 06:42:01 CET,Tue Nov 23 08:05:33 CET,0.0 0.385 0.594 0.774 0.913 1.009 1.118 1.226 1.406 1.492 1.578 1.646 1.795 1.868 2.005 2.136 2.244 2.29 2.393 2.5 2.671 2.778 2.87 3.02 3.167 3.298 3.426 3.549 3.692 3.82 3.939 4.071 4.203 4.34 4.507 4.684 4.851 5.037 5.224 5.414 5.592 5.761 5.98 6.22 6.474 6.666 6.77 6.782 6.64 6.297 5.563 4.446 3.486 2.631 1.783 0.994 0.272 -0.368 -0.888 -1.376 -1.847 -2.269 -2.641 -3.02 -3.389 -3.735 -4.083 -4.397 -4.678 -4.969 -5.293 -5.553 -5.802 -6.056 -6.251 -6.456 -6.668 -6.894 -7.127 -7.292 -7.459 -7.718 -7.904 -8.097 -8.196 -8.392 -8.601 -8.817 -8.934 -9.146 -9.314 -9.444 -9.589 -9.906 -10.081 -10.277 -10.481 -10.684 -10.93 -11.274 -11.997 -5 ,4371 ,KEBNE ,16657918,Tue Nov 23 06:42:01 CET,Tue Nov 23 08:06:07 CET,0.0 0.553 0.75 0.915 1.086 1.23 1.372 1.5 1.704 1.8 1.882 1.956 2.112 2.177 2.312 2.457 2.591 2.65 2.765 2.886 3.054 3.146 3.232 3.363 3.497 3.62 3.728 3.825 3.953 4.075 4.2 4.357 4.509 4.647 4.794 4.966 5.134 5.309 5.487 5.672 5.858 6.059 6.27 6.463 6.684 6.923 7.164 7.371 7.489 7.414 7.01 6.32 5.65 4.943 4.244 3.61 3.098 2.629 2.183 1.704 1.295 0.959 0.667 0.383 0.097 -0.175 -0.467 -0.748 -1.007 -1.262 -1.526 -1.75 -1.963 -2.192 -2.376 -2.558 -2.747 -2.951 -3.166 -3.318 -3.475 -3.709 -3.878 -4.051 -4.139 -4.315 -4.501 -4.709 -4.812 -5.005 -5.17 -5.296 -5.423 -5.707 -5.858 -5.986 -6.119 -6.326 -6.598 -6.927 -7.737 -6 ,10218 ,KEBNE ,16657919,Tue Nov 23 06:42:01 CET,Tue Nov 23 08:04:01 CET,0.0 0.309 0.495 0.627 0.736 0.853 0.99 1.116 1.286 1.353 1.428 1.49 1.627 1.68 1.785 1.879 1.971 2.019 2.127 2.239 2.377 2.459 2.538 2.657 2.774 2.884 2.985 3.079 3.194 3.307 3.427 3.581 3.721 3.859 4.025 4.203 4.352 4.485 4.621 4.805 4.997 5.176 5.365 5.538 5.734 5.887 6.049 6.147 6.092 5.822 4.965 3.723 2.676 1.741 0.87 0.103 -0.529 -1.128 -1.643 -2.157 -2.621 -3.032 -3.406 -3.755 -4.084 -4.365 -4.66 -4.905 -5.112 -5.334 -5.582 -5.821 -6.056 -6.28 -6.453 -6.632 -6.815 -6.999 -7.209 -7.36 -7.501 -7.723 -7.886 -8.059 -8.156 -8.366 -8.58 -8.819 -8.947 -9.154 -9.347 -9.5 -9.65 -9.972 -10.13 -10.293 -10.481 -10.712 -10.971 -11.283 -11.922 -7 ,6020 ,KEBNE ,16657920,Tue Nov 23 06:42:01 CET,Tue Nov 23 08:05:54 CET,0.0 0.396 0.594 0.744 0.864 0.961 1.05 1.141 1.327 1.408 1.484 1.537 1.682 1.756 1.889 2.018 2.14 2.202 2.327 2.434 2.56 2.641 2.724 2.854 2.975 3.086 3.184 3.264 3.371 3.492 3.61 3.736 3.855 3.96 4.078 4.216 4.337 4.471 4.627 4.804 4.978 5.147 5.309 5.43 5.58 5.702 5.715 5.674 5.595 5.353 4.632 3.47 2.449 1.554 0.73 -0.032 -0.764 -1.409 -1.916 -2.409 -2.857 -3.295 -3.73 -4.134 -4.508 -4.83 -5.174 -5.506 -5.787 -6.087 -6.393 -6.644 -6.908 -7.177 -7.385 -7.591 -7.809 -8.03 -8.25 -8.411 -8.592 -8.888 -9.072 -9.248 -9.343 -9.531 -9.752 -9.994 -10.113 -10.327 -10.517 -10.664 -10.821 -11.164 -11.343 -11.535 -11.77 -12.034 -12.293 -12.561 -13.334 -8 ,26767 ,KEBNE ,16657921,Tue Nov 23 06:42:01 CET,Tue Nov 23 08:04:18 CET,0.0 0.43 0.636 0.798 0.906 1.007 1.103 1.194 1.39 1.48 1.553 1.604 1.747 1.811 1.925 2.039 2.156 2.209 2.306 2.403 2.531 2.615 2.705 2.831 2.94 3.057 3.178 3.281 3.41 3.548 3.685 3.845 3.994 4.129 4.299 4.476 4.621 4.777 4.953 5.127 5.3 5.506 5.745 5.968 6.189 6.414 6.661 6.905 7.126 7.201 6.844 6.075 5.358 4.555 3.724 2.972 2.306 1.659 1.139 0.683 0.265 -0.128 -0.514 -0.893 -1.257 -1.588 -1.945 -2.279 -2.576 -2.881 -3.183 -3.42 -3.648 -3.895 -4.095 -4.297 -4.5 -4.706 -4.931 -5.094 -5.266 -5.53 -5.709 -5.915 -6.019 -6.2 -6.406 -6.667 -6.796 -7.003 -7.194 -7.335 -7.472 -7.748 -7.904 -8.087 -8.279 -8.47 -8.711 -9.043 -9.644 -9 ,30040 ,KEBNE ,16657922,Tue Nov 23 06:42:01 CET,Tue Nov 23 08:05:10 CET,0.0 0.368 0.55 0.707 0.853 0.969 1.06 1.155 1.335 1.41 1.483 1.545 1.683 1.747 1.863 1.967 2.067 2.111 2.192 2.276 2.397 2.48 2.565 2.684 2.793 2.9 3.001 3.106 3.237 3.344 3.448 3.577 3.691 3.806 3.933 4.054 4.169 4.276 4.381 4.497 4.614 4.782 5.001 5.189 5.343 5.517 5.693 5.79 5.774 5.544 4.923 3.925 3.033 2.212 1.39 0.624 -0.052 -0.689 -1.24 -1.829 -2.318 -2.728 -3.136 -3.525 -3.878 -4.195 -4.53 -4.823 -5.076 -5.364 -5.67 -5.893 -6.105 -6.326 -6.505 -6.705 -6.912 -7.132 -7.364 -7.533 -7.721 -7.996 -8.174 -8.344 -8.431 -8.624 -8.831 -9.07 -9.194 -9.396 -9.556 -9.687 -9.832 -10.137 -10.308 -10.514 -10.725 -10.938 -11.196 -11.506 -12.232 -10 ,2234 ,KEBNE ,16657923,Tue Nov 23 06:42:01 CET,Tue Nov 23 08:06:21 CET,0.0 0.344 0.528 0.676 0.822 0.957 1.059 1.162 1.335 1.41 1.481 1.539 1.705 1.78 1.917 2.048 2.17 2.225 2.328 2.427 2.567 2.657 2.737 2.852 2.976 3.095 3.199 3.289 3.414 3.533 3.635 3.776 3.92 4.044 4.188 4.362 4.508 4.666 4.842 5.005 5.171 5.323 5.461 5.599 5.749 5.843 5.927 6.03 6.02 5.816 5.058 3.807 2.727 1.867 1.069 0.259 -0.445 -1.077 -1.621 -2.13 -2.576 -2.987 -3.366 -3.73 -4.068 -4.377 -4.692 -4.962 -5.21 -5.473 -5.748 -5.975 -6.21 -6.458 -6.652 -6.853 -7.058 -7.272 -7.505 -7.657 -7.8 -8.024 -8.191 -8.374 -8.466 -8.649 -8.84 -9.044 -9.143 -9.333 -9.462 -9.572 -9.695 -9.946 -10.089 -10.265 -10.443 -10.615 -10.837 -11.228 -12.281 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_41.txt deleted file mode 100644 index 768afe99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20611 ,KEBNE ,16657924,Tue Nov 23 06:42:01 CET,Tue Nov 23 08:04:08 CET,0.0 0.621 0.856 1.027 1.19 1.333 1.46 1.58 1.782 1.878 1.97 2.069 2.234 2.321 2.478 2.626 2.774 2.845 2.971 3.092 3.271 3.386 3.499 3.668 3.831 3.996 4.165 4.322 4.507 4.685 4.873 5.094 5.301 5.493 5.698 5.93 6.152 6.411 6.681 6.961 7.274 7.607 7.982 8.328 8.708 9.12 9.541 10.006 10.493 10.844 11.017 10.728 10.225 9.65 9.138 8.688 8.243 7.774 7.319 6.9 6.549 6.227 5.935 5.64 5.353 5.074 4.754 4.468 4.217 3.963 3.707 3.491 3.271 3.046 2.876 2.703 2.511 2.305 2.08 1.919 1.764 1.523 1.359 1.207 1.128 0.946 0.746 0.537 0.428 0.235 0.066 -0.072 -0.229 -0.558 -0.737 -0.934 -1.153 -1.383 -1.662 -2.047 -3.279 -2 ,2949 ,KEBNE ,16657925,Tue Nov 23 06:42:01 CET,Tue Nov 23 08:04:14 CET,0.0 0.488 0.754 0.917 1.081 1.238 1.367 1.482 1.705 1.821 1.93 2.048 2.216 2.311 2.492 2.667 2.824 2.902 3.051 3.18 3.373 3.5 3.614 3.777 3.943 4.093 4.23 4.367 4.55 4.721 4.902 5.139 5.349 5.545 5.792 6.066 6.313 6.554 6.83 7.15 7.455 7.793 8.175 8.562 8.972 9.35 9.75 10.221 10.732 11.194 11.469 11.164 10.661 10.137 9.602 9.086 8.619 8.157 7.746 7.332 6.966 6.624 6.28 5.979 5.704 5.418 5.128 4.866 4.631 4.408 4.175 3.982 3.781 3.565 3.387 3.201 3.019 2.822 2.62 2.478 2.329 2.122 1.964 1.78 1.682 1.47 1.257 1.05 0.93 0.72 0.532 0.397 0.241 -0.132 -0.319 -0.506 -0.729 -0.966 -1.23 -1.661 -2.652 -3 ,22366 ,KEBNE ,16657926,Tue Nov 23 06:43:02 CET,Tue Nov 23 08:04:40 CET,0.0 0.559 0.817 1.042 1.245 1.405 1.549 1.71 2.041 2.184 2.304 2.432 2.616 2.714 2.899 3.068 3.221 3.291 3.441 3.595 3.81 3.958 4.113 4.325 4.518 4.702 4.873 5.036 5.269 5.487 5.686 5.911 6.112 6.311 6.541 6.795 7.052 7.354 7.68 8.002 8.317 8.673 9.063 9.425 9.844 10.241 10.628 11.042 11.391 11.647 11.703 11.332 10.898 10.478 10.023 9.641 9.313 8.936 8.523 8.053 7.657 7.304 6.959 6.64 6.336 6.053 5.743 5.436 5.165 4.888 4.596 4.369 4.135 3.888 3.695 3.493 3.29 3.08 2.849 2.686 2.525 2.271 2.097 1.9 1.796 1.591 1.37 1.136 0.997 0.769 0.562 0.418 0.264 -0.077 -0.266 -0.477 -0.696 -0.953 -1.253 -1.655 -2.966 -4 ,25186 ,KEBNE ,16657927,Tue Nov 23 06:43:02 CET,Tue Nov 23 08:04:24 CET,0.0 0.376 0.575 0.753 0.929 1.08 1.23 1.376 1.647 1.768 1.882 2.008 2.168 2.251 2.428 2.595 2.76 2.837 2.98 3.117 3.309 3.438 3.545 3.69 3.855 4.028 4.196 4.35 4.56 4.763 4.942 5.16 5.366 5.555 5.777 6.035 6.284 6.554 6.843 7.134 7.442 7.824 8.243 8.662 9.143 9.563 10.088 10.612 10.967 11.27 11.349 11.032 10.491 9.776 9.118 8.518 7.957 7.476 7.033 6.596 6.234 5.902 5.565 5.234 4.938 4.659 4.35 4.06 3.817 3.556 3.292 3.075 2.838 2.588 2.384 2.191 1.999 1.793 1.558 1.389 1.216 0.938 0.754 0.572 0.479 0.288 0.076 -0.155 -0.26 -0.448 -0.626 -0.769 -0.935 -1.287 -1.471 -1.672 -1.889 -2.12 -2.385 -2.78 -4.16 -5 ,19942 ,KEBNE ,16657928,Tue Nov 23 06:43:03 CET,Tue Nov 23 08:06:03 CET,0.0 0.407 0.628 0.847 1.036 1.197 1.335 1.467 1.721 1.832 1.932 2.041 2.211 2.313 2.49 2.664 2.829 2.903 3.035 3.162 3.374 3.509 3.639 3.835 4.026 4.201 4.371 4.537 4.741 4.943 5.134 5.353 5.573 5.798 6.055 6.346 6.619 6.903 7.186 7.443 7.685 7.975 8.291 8.567 8.907 9.276 9.636 9.945 10.244 10.468 10.365 9.836 9.231 8.633 8.029 7.426 6.869 6.369 5.926 5.426 4.971 4.593 4.236 3.891 3.567 3.268 2.967 2.686 2.407 2.107 1.824 1.603 1.37 1.12 0.922 0.735 0.542 0.324 0.107 -0.037 -0.189 -0.458 -0.652 -0.834 -0.931 -1.135 -1.344 -1.562 -1.679 -1.887 -2.087 -2.251 -2.413 -2.758 -2.951 -3.138 -3.35 -3.617 -3.951 -4.328 -5.232 -6 ,21134 ,KEBNE ,16657929,Tue Nov 23 06:44:04 CET,Tue Nov 23 08:07:36 CET,0.0 1.062 1.326 1.548 1.743 1.91 2.059 2.195 2.434 2.545 2.646 2.75 2.915 3.006 3.187 3.357 3.505 3.572 3.72 3.877 4.098 4.233 4.366 4.547 4.716 4.888 5.055 5.228 5.458 5.665 5.844 6.057 6.276 6.492 6.722 6.971 7.218 7.501 7.792 8.065 8.326 8.659 9.087 9.46 9.839 10.218 10.569 10.894 11.262 11.621 11.843 11.558 11.023 10.482 9.947 9.403 8.88 8.39 7.952 7.487 7.076 6.699 6.337 6.021 5.724 5.431 5.149 4.901 4.659 4.39 4.112 3.871 3.622 3.385 3.19 2.975 2.748 2.523 2.297 2.14 1.981 1.734 1.551 1.349 1.246 1.031 0.801 0.556 0.434 0.238 0.036 -0.114 -0.259 -0.57 -0.753 -0.942 -1.16 -1.424 -1.747 -2.231 -3.339 -7 ,17742 ,KEBNE ,16657930,Tue Nov 23 06:44:04 CET,Tue Nov 23 08:06:36 CET,0.0 0.367 0.59 0.78 0.952 1.102 1.22 1.335 1.557 1.663 1.763 1.883 2.059 2.149 2.311 2.467 2.621 2.697 2.841 2.967 3.137 3.253 3.358 3.509 3.667 3.812 3.956 4.104 4.295 4.473 4.638 4.848 5.058 5.253 5.465 5.709 5.959 6.217 6.493 6.776 7.074 7.4 7.7 7.991 8.35 8.695 9.046 9.408 9.756 10.007 10.094 9.895 9.35 8.748 8.208 7.665 7.196 6.721 6.266 5.841 5.462 5.123 4.813 4.498 4.197 3.929 3.634 3.358 3.121 2.882 2.625 2.403 2.174 1.944 1.772 1.594 1.401 1.191 0.962 0.798 0.635 0.379 0.205 0.045 -0.039 -0.212 -0.407 -0.613 -0.712 -0.904 -1.087 -1.227 -1.379 -1.691 -1.851 -2.018 -2.216 -2.451 -2.743 -3.095 -3.895 -8 ,25745 ,KEBNE ,16657931,Tue Nov 23 06:44:04 CET,Tue Nov 23 08:07:20 CET,0.0 0.937 1.169 1.341 1.489 1.643 1.777 1.883 2.079 2.167 2.253 2.357 2.524 2.616 2.796 2.97 3.131 3.207 3.353 3.486 3.679 3.802 3.92 4.088 4.251 4.404 4.557 4.707 4.897 5.082 5.248 5.455 5.671 5.882 6.12 6.383 6.646 6.963 7.304 7.634 7.953 8.275 8.662 9.068 9.463 9.94 10.51 10.967 11.328 11.608 11.597 11.292 10.879 10.336 9.803 9.286 8.833 8.403 7.998 7.585 7.186 6.799 6.442 6.131 5.825 5.53 5.233 4.967 4.744 4.546 4.353 4.179 3.976 3.739 3.565 3.39 3.199 3.003 2.799 2.654 2.505 2.278 2.115 1.934 1.842 1.67 1.478 1.269 1.166 0.972 0.788 0.657 0.524 0.248 0.072 -0.133 -0.342 -0.592 -0.881 -1.211 -2.07 -9 ,12361 ,KEBNE ,16657932,Tue Nov 23 06:44:04 CET,Tue Nov 23 08:06:46 CET,0.0 0.589 0.891 1.118 1.323 1.525 1.681 1.795 1.997 2.095 2.201 2.339 2.521 2.617 2.782 2.949 3.141 3.234 3.399 3.562 3.789 3.917 4.033 4.201 4.366 4.521 4.671 4.826 5.014 5.196 5.367 5.58 5.794 5.996 6.236 6.483 6.728 6.998 7.248 7.52 7.848 8.236 8.661 9.1 9.607 10.096 10.572 11.042 11.511 11.886 12.171 12.25 11.942 11.411 10.81 10.196 9.656 9.218 8.863 8.445 8.081 7.752 7.407 7.079 6.776 6.5 6.23 5.985 5.754 5.507 5.237 5.018 4.8 4.563 4.359 4.148 3.944 3.738 3.524 3.369 3.213 2.976 2.795 2.596 2.495 2.278 2.067 1.852 1.733 1.537 1.374 1.233 1.066 0.741 0.582 0.391 0.168 -0.077 -0.374 -0.776 -1.817 -10 ,20210 ,KEBNE ,16657933,Tue Nov 23 06:44:04 CET,Tue Nov 23 08:07:24 CET,0.0 0.742 0.968 1.133 1.29 1.467 1.628 1.749 1.976 2.079 2.176 2.288 2.449 2.531 2.704 2.879 3.043 3.118 3.262 3.407 3.607 3.733 3.856 4.031 4.2 4.361 4.515 4.661 4.862 5.066 5.247 5.472 5.696 5.89 6.095 6.331 6.564 6.844 7.159 7.45 7.757 8.127 8.558 8.97 9.404 9.852 10.322 10.726 11.102 11.329 11.242 10.857 10.307 9.7 9.098 8.527 7.981 7.436 6.968 6.502 6.114 5.774 5.463 5.169 4.862 4.559 4.23 3.921 3.661 3.427 3.183 2.969 2.763 2.541 2.365 2.185 1.998 1.811 1.602 1.456 1.3 1.056 0.892 0.719 0.635 0.453 0.257 0.052 -0.056 -0.254 -0.427 -0.555 -0.686 -0.932 -1.084 -1.268 -1.468 -1.688 -1.976 -2.475 -3.753 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_84_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_84_41.txt deleted file mode 100644 index ddfef61a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/protein/Summary_FEP_84_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26379 ,KEBNE ,16657934,Tue Nov 23 06:44:04 CET,Tue Nov 23 08:05:57 CET,0.0 0.597 0.897 1.104 1.256 1.398 1.519 1.627 1.844 1.96 2.077 2.235 2.399 2.482 2.655 2.814 2.958 3.027 3.155 3.277 3.446 3.554 3.665 3.837 3.997 4.143 4.276 4.409 4.591 4.776 4.953 5.162 5.366 5.554 5.765 5.998 6.236 6.508 6.774 7.045 7.321 7.613 7.884 8.107 8.369 8.586 8.769 8.934 8.977 8.768 8.331 7.64 6.902 6.244 5.659 5.108 4.613 4.157 3.76 3.389 3.089 2.826 2.576 2.33 2.108 1.906 1.675 1.471 1.306 1.134 0.951 0.803 0.652 0.488 0.363 0.24 0.11 -0.024 -0.164 -0.265 -0.364 -0.527 -0.646 -0.757 -0.813 -0.957 -1.099 -1.224 -1.289 -1.436 -1.529 -1.628 -1.721 -1.894 -1.981 -2.079 -2.181 -2.306 -2.463 -2.64 -3.072 -2 ,28351 ,KEBNE ,16657935,Tue Nov 23 06:44:04 CET,Tue Nov 23 08:05:29 CET,0.0 0.473 0.719 0.917 1.068 1.197 1.331 1.461 1.686 1.802 1.93 2.087 2.266 2.367 2.551 2.723 2.87 2.936 3.077 3.215 3.418 3.548 3.659 3.816 3.972 4.12 4.267 4.409 4.589 4.747 4.885 5.038 5.185 5.336 5.521 5.73 5.943 6.168 6.345 6.535 6.735 6.955 7.226 7.43 7.614 7.798 7.941 8.04 8.059 7.868 7.321 6.473 5.723 5.024 4.379 3.813 3.325 2.876 2.498 2.137 1.835 1.557 1.293 1.047 0.802 0.574 0.353 0.155 -0.02 -0.187 -0.374 -0.541 -0.715 -0.882 -1.007 -1.146 -1.274 -1.399 -1.539 -1.637 -1.737 -1.878 -1.985 -2.11 -2.178 -2.312 -2.438 -2.58 -2.65 -2.798 -2.867 -2.947 -3.033 -3.191 -3.279 -3.4 -3.528 -3.66 -3.849 -4.107 -4.677 -3 ,13523 ,KEBNE ,16657936,Tue Nov 23 06:44:04 CET,Tue Nov 23 08:05:03 CET,0.0 0.433 0.695 0.863 1.015 1.169 1.314 1.459 1.711 1.83 1.941 2.086 2.269 2.369 2.572 2.759 2.917 2.994 3.157 3.321 3.54 3.673 3.79 3.937 4.084 4.252 4.424 4.586 4.787 4.951 5.108 5.318 5.505 5.684 5.888 6.102 6.292 6.473 6.659 6.876 7.096 7.311 7.552 7.748 7.904 8.056 8.176 8.239 8.228 8.043 7.497 6.654 5.957 5.321 4.721 4.163 3.67 3.26 2.917 2.577 2.292 2.033 1.767 1.51 1.293 1.098 0.877 0.68 0.518 0.349 0.168 0.024 -0.129 -0.291 -0.421 -0.552 -0.675 -0.806 -0.939 -1.026 -1.118 -1.292 -1.415 -1.526 -1.585 -1.71 -1.832 -1.951 -2.019 -2.165 -2.24 -2.329 -2.421 -2.599 -2.685 -2.777 -2.878 -2.99 -3.097 -3.218 -3.425 -4 ,5340 ,KEBNE ,16657937,Tue Nov 23 06:45:05 CET,Tue Nov 23 08:07:37 CET,0.0 0.44 0.661 0.883 1.056 1.21 1.376 1.517 1.711 1.808 1.915 2.032 2.196 2.292 2.47 2.621 2.763 2.832 2.959 3.09 3.287 3.417 3.542 3.708 3.853 3.994 4.136 4.272 4.423 4.571 4.72 4.908 5.086 5.246 5.451 5.655 5.822 6.017 6.241 6.464 6.724 6.996 7.282 7.567 7.821 8.033 8.222 8.476 8.728 8.72 8.33 7.624 6.926 6.254 5.644 5.094 4.618 4.21 3.858 3.485 3.18 2.92 2.672 2.446 2.219 2.007 1.799 1.615 1.453 1.279 1.081 0.925 0.782 0.626 0.495 0.364 0.236 0.106 -0.033 -0.125 -0.214 -0.357 -0.462 -0.583 -0.64 -0.75 -0.875 -0.995 -1.06 -1.218 -1.297 -1.36 -1.449 -1.671 -1.788 -1.906 -2.011 -2.118 -2.27 -2.458 -2.827 -5 ,6728 ,KEBNE ,16657938,Tue Nov 23 06:45:06 CET,Tue Nov 23 08:06:56 CET,0.0 0.596 0.838 1.088 1.275 1.407 1.521 1.631 1.86 1.971 2.069 2.183 2.337 2.422 2.608 2.762 2.892 2.964 3.111 3.251 3.451 3.581 3.702 3.867 4.012 4.158 4.302 4.439 4.636 4.814 4.968 5.158 5.354 5.532 5.707 5.911 6.135 6.379 6.627 6.889 7.139 7.362 7.577 7.773 7.979 8.217 8.423 8.594 8.718 8.6 8.048 7.214 6.46 5.769 5.166 4.625 4.156 3.723 3.346 2.972 2.644 2.348 2.07 1.823 1.586 1.353 1.117 0.914 0.737 0.547 0.339 0.171 0.019 -0.134 -0.26 -0.389 -0.531 -0.664 -0.789 -0.886 -0.989 -1.152 -1.268 -1.379 -1.432 -1.575 -1.729 -1.867 -1.944 -2.089 -2.143 -2.21 -2.284 -2.486 -2.595 -2.711 -2.837 -2.95 -3.104 -3.383 -3.96 -6 ,24737 ,KEBNE ,16657939,Tue Nov 23 06:45:06 CET,Tue Nov 23 08:07:01 CET,0.0 0.758 1.069 1.283 1.469 1.614 1.739 1.875 2.162 2.291 2.419 2.586 2.759 2.856 3.02 3.158 3.304 3.38 3.519 3.654 3.844 3.972 4.102 4.275 4.429 4.587 4.748 4.87 5.003 5.156 5.317 5.506 5.674 5.843 6.049 6.255 6.434 6.628 6.855 7.063 7.25 7.487 7.724 7.92 8.149 8.335 8.477 8.563 8.557 8.401 8.021 7.317 6.488 5.721 5.077 4.519 4.039 3.584 3.188 2.811 2.491 2.209 1.933 1.667 1.429 1.229 1.026 0.826 0.65 0.48 0.304 0.163 0.021 -0.127 -0.251 -0.378 -0.497 -0.617 -0.737 -0.821 -0.921 -1.081 -1.18 -1.278 -1.332 -1.449 -1.569 -1.693 -1.755 -1.9 -1.998 -2.074 -2.145 -2.311 -2.412 -2.517 -2.619 -2.75 -2.9 -3.117 -3.644 -7 ,20167 ,KEBNE ,16657940,Tue Nov 23 06:45:06 CET,Tue Nov 23 08:07:53 CET,0.0 0.295 0.516 0.723 0.915 1.061 1.185 1.304 1.54 1.655 1.757 1.871 2.033 2.123 2.289 2.431 2.588 2.669 2.803 2.936 3.137 3.271 3.393 3.567 3.729 3.862 3.997 4.138 4.315 4.472 4.624 4.806 4.971 5.139 5.333 5.52 5.716 5.947 6.147 6.342 6.601 6.857 7.093 7.322 7.524 7.735 7.972 8.228 8.394 8.311 7.995 7.406 6.744 6.117 5.559 5.068 4.649 4.258 3.917 3.582 3.285 3.011 2.756 2.518 2.304 2.117 1.916 1.736 1.58 1.419 1.259 1.12 0.968 0.812 0.689 0.558 0.423 0.294 0.167 0.069 -0.036 -0.188 -0.283 -0.382 -0.433 -0.535 -0.643 -0.761 -0.827 -0.977 -1.061 -1.134 -1.219 -1.438 -1.538 -1.631 -1.724 -1.827 -1.969 -2.196 -2.705 -8 ,918 ,KEBNE ,16657941,Tue Nov 23 06:45:06 CET,Tue Nov 23 08:05:14 CET,0.0 0.611 0.856 1.039 1.219 1.39 1.544 1.672 1.89 1.997 2.113 2.264 2.433 2.524 2.686 2.836 2.974 3.04 3.174 3.301 3.485 3.619 3.748 3.918 4.079 4.24 4.403 4.558 4.754 4.937 5.104 5.297 5.473 5.656 5.883 6.121 6.341 6.568 6.764 6.936 7.111 7.281 7.442 7.606 7.809 8.006 8.253 8.43 8.425 8.297 7.88 7.17 6.427 5.734 5.1 4.534 4.085 3.663 3.286 2.928 2.628 2.359 2.089 1.835 1.606 1.395 1.177 0.986 0.815 0.635 0.447 0.291 0.15 0.007 -0.12 -0.26 -0.407 -0.563 -0.711 -0.803 -0.897 -1.05 -1.16 -1.269 -1.327 -1.45 -1.582 -1.729 -1.799 -1.943 -2.014 -2.091 -2.168 -2.341 -2.427 -2.515 -2.628 -2.749 -2.86 -3.015 -3.329 -9 ,9918 ,KEBNE ,16657942,Tue Nov 23 06:45:06 CET,Tue Nov 23 08:06:38 CET,0.0 0.528 0.777 0.98 1.142 1.31 1.466 1.592 1.815 1.928 2.031 2.154 2.312 2.392 2.552 2.712 2.869 2.942 3.079 3.216 3.4 3.506 3.611 3.776 3.922 4.049 4.178 4.31 4.494 4.647 4.773 4.935 5.085 5.223 5.363 5.53 5.717 5.946 6.191 6.426 6.667 6.892 7.086 7.255 7.421 7.535 7.616 7.672 7.656 7.486 6.966 6.121 5.344 4.66 4.06 3.504 3.025 2.604 2.247 1.876 1.547 1.273 1.019 0.77 0.542 0.332 0.123 -0.059 -0.22 -0.396 -0.576 -0.724 -0.875 -1.027 -1.15 -1.278 -1.406 -1.533 -1.66 -1.75 -1.841 -1.981 -2.074 -2.166 -2.214 -2.331 -2.464 -2.583 -2.649 -2.8 -2.88 -2.962 -3.033 -3.188 -3.282 -3.382 -3.489 -3.583 -3.707 -3.88 -4.213 -10 ,25785 ,KEBNE ,16657943,Tue Nov 23 06:45:06 CET,Tue Nov 23 08:05:33 CET,0.0 0.692 0.923 1.13 1.299 1.45 1.586 1.708 1.945 2.054 2.156 2.291 2.462 2.565 2.755 2.926 3.097 3.176 3.317 3.449 3.625 3.741 3.858 4.014 4.155 4.301 4.463 4.612 4.796 4.953 5.077 5.237 5.418 5.6 5.801 6.011 6.196 6.39 6.573 6.794 7.061 7.341 7.645 7.94 8.266 8.507 8.637 8.716 8.696 8.523 8.011 7.127 6.289 5.536 4.87 4.308 3.826 3.38 2.986 2.573 2.195 1.872 1.56 1.274 1.043 0.831 0.618 0.433 0.276 0.118 -0.064 -0.212 -0.368 -0.547 -0.671 -0.785 -0.901 -1.028 -1.159 -1.249 -1.353 -1.516 -1.628 -1.741 -1.801 -1.921 -2.04 -2.167 -2.229 -2.367 -2.43 -2.513 -2.596 -2.756 -2.839 -2.935 -3.061 -3.193 -3.352 -3.554 -3.963 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_124_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_124_41.txt deleted file mode 100644 index c9f543b1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_124_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8426 ,KEBNE ,16657944,Tue Nov 23 06:46:08 CET,Tue Nov 23 08:07:36 CET,0.0 1.32 1.646 1.881 2.051 2.209 2.345 2.468 2.694 2.792 2.871 3.023 3.127 3.195 3.331 3.46 3.572 3.629 3.744 3.844 3.964 4.042 4.114 4.208 4.295 4.367 4.433 4.489 4.551 4.613 4.656 4.714 4.777 4.82 4.85 4.863 4.87 4.85 4.814 4.773 4.705 4.618 4.446 4.229 3.95 3.517 2.883 1.98 0.643 -1.321 -4.4 -7.905 -10.634 -12.825 -14.644 -16.201 -17.508 -18.638 -19.559 -20.453 -21.215 -21.873 -22.479 -23.034 -23.545 -24.016 -24.488 -24.885 -25.242 -25.609 -25.96 -26.253 -26.561 -26.872 -27.103 -27.338 -27.583 -27.833 -28.089 -28.268 -28.457 -28.76 -28.955 -29.143 -29.241 -29.44 -29.651 -29.879 -29.995 -30.178 -30.372 -30.506 -30.639 -30.933 -31.092 -31.252 -31.424 -31.636 -31.856 -32.093 -32.989 -2 ,30403 ,KEBNE ,16657945,Tue Nov 23 06:46:08 CET,Tue Nov 23 08:07:52 CET,0.0 1.42 1.79 2.095 2.318 2.473 2.605 2.731 2.951 3.041 3.13 3.282 3.378 3.451 3.581 3.7 3.818 3.873 3.963 4.052 4.18 4.252 4.326 4.437 4.536 4.622 4.712 4.794 4.866 4.913 4.973 5.042 5.09 5.127 5.147 5.166 5.171 5.154 5.11 5.036 4.976 4.897 4.733 4.533 4.211 3.713 2.999 2.051 0.761 -1.114 -4.192 -7.723 -10.467 -12.696 -14.554 -16.131 -17.408 -18.518 -19.474 -20.393 -21.14 -21.794 -22.402 -22.955 -23.469 -23.933 -24.411 -24.823 -25.176 -25.535 -25.881 -26.168 -26.474 -26.793 -27.04 -27.287 -27.541 -27.804 -28.061 -28.242 -28.433 -28.709 -28.896 -29.091 -29.188 -29.384 -29.594 -29.819 -29.933 -30.112 -30.288 -30.417 -30.548 -30.815 -30.974 -31.151 -31.335 -31.528 -31.755 -32.073 -32.715 -3 ,4660 ,KEBNE ,16657946,Tue Nov 23 06:46:08 CET,Tue Nov 23 08:07:26 CET,0.0 1.019 1.385 1.644 1.858 2.013 2.165 2.318 2.55 2.651 2.75 2.898 2.991 3.068 3.235 3.386 3.499 3.546 3.643 3.729 3.85 3.93 4.003 4.104 4.197 4.282 4.35 4.415 4.487 4.544 4.601 4.656 4.699 4.733 4.776 4.83 4.847 4.836 4.797 4.741 4.663 4.535 4.37 4.184 3.872 3.413 2.785 1.911 0.581 -1.378 -4.38 -7.798 -10.484 -12.654 -14.415 -15.925 -17.206 -18.321 -19.269 -20.191 -20.934 -21.575 -22.195 -22.771 -23.283 -23.749 -24.216 -24.614 -24.969 -25.33 -25.685 -25.981 -26.276 -26.587 -26.835 -27.073 -27.313 -27.566 -27.83 -28.005 -28.185 -28.467 -28.669 -28.876 -28.973 -29.16 -29.365 -29.585 -29.705 -29.898 -30.073 -30.198 -30.33 -30.611 -30.769 -30.92 -31.08 -31.281 -31.488 -31.725 -32.717 -4 ,30342 ,KEBNE ,16657947,Tue Nov 23 06:47:10 CET,Tue Nov 23 08:09:28 CET,0.0 1.173 1.482 1.727 1.955 2.158 2.343 2.491 2.72 2.831 2.932 3.085 3.188 3.265 3.395 3.499 3.601 3.655 3.745 3.827 3.962 4.052 4.133 4.247 4.338 4.415 4.488 4.553 4.632 4.697 4.738 4.768 4.803 4.83 4.862 4.885 4.878 4.887 4.873 4.819 4.768 4.647 4.429 4.193 3.854 3.347 2.652 1.768 0.48 -1.504 -4.632 -8.107 -10.849 -13.051 -14.826 -16.321 -17.581 -18.707 -19.654 -20.585 -21.363 -22.018 -22.626 -23.187 -23.69 -24.148 -24.629 -25.053 -25.409 -25.764 -26.126 -26.424 -26.724 -27.024 -27.261 -27.519 -27.773 -28.02 -28.286 -28.468 -28.647 -28.922 -29.105 -29.291 -29.388 -29.589 -29.796 -30.012 -30.123 -30.3 -30.477 -30.605 -30.736 -31.025 -31.186 -31.342 -31.514 -31.725 -31.965 -32.275 -33.12 -5 ,24592 ,KEBNE ,16657948,Tue Nov 23 06:47:10 CET,Tue Nov 23 08:09:17 CET,0.0 1.056 1.439 1.685 1.871 2.039 2.183 2.317 2.56 2.669 2.773 2.927 3.031 3.125 3.265 3.379 3.492 3.538 3.629 3.743 3.897 3.967 4.037 4.141 4.22 4.296 4.381 4.457 4.529 4.592 4.657 4.718 4.757 4.774 4.787 4.799 4.814 4.828 4.839 4.821 4.747 4.618 4.412 4.169 3.855 3.393 2.763 1.908 0.603 -1.364 -4.476 -7.889 -10.593 -12.819 -14.633 -16.162 -17.416 -18.52 -19.457 -20.353 -21.09 -21.74 -22.352 -22.904 -23.403 -23.861 -24.328 -24.743 -25.087 -25.422 -25.769 -26.051 -26.348 -26.651 -26.882 -27.118 -27.36 -27.613 -27.857 -28.026 -28.206 -28.487 -28.674 -28.861 -28.962 -29.159 -29.357 -29.566 -29.669 -29.847 -30.025 -30.145 -30.272 -30.578 -30.742 -30.902 -31.097 -31.312 -31.527 -31.819 -32.659 -6 ,23000 ,KEBNE ,16657949,Tue Nov 23 06:47:10 CET,Tue Nov 23 08:09:30 CET,0.0 1.003 1.33 1.606 1.821 2.01 2.185 2.337 2.605 2.717 2.83 3.013 3.119 3.194 3.326 3.468 3.597 3.654 3.752 3.847 3.963 4.034 4.115 4.221 4.316 4.402 4.473 4.538 4.64 4.717 4.765 4.823 4.882 4.917 4.94 4.963 4.979 4.976 4.937 4.867 4.78 4.642 4.425 4.18 3.847 3.417 2.803 1.903 0.624 -1.264 -4.249 -7.732 -10.542 -12.772 -14.594 -16.166 -17.472 -18.596 -19.541 -20.409 -21.125 -21.768 -22.35 -22.896 -23.411 -23.861 -24.317 -24.72 -25.057 -25.401 -25.762 -26.061 -26.365 -26.668 -26.907 -27.153 -27.398 -27.647 -27.917 -28.095 -28.266 -28.528 -28.71 -28.899 -28.996 -29.198 -29.402 -29.624 -29.745 -29.928 -30.097 -30.217 -30.344 -30.688 -30.872 -31.032 -31.208 -31.398 -31.639 -31.989 -33.214 -7 ,11571 ,KEBNE ,16657950,Tue Nov 23 06:47:10 CET,Tue Nov 23 08:09:07 CET,0.0 1.373 1.745 1.99 2.178 2.334 2.467 2.59 2.822 2.921 3.003 3.139 3.249 3.338 3.49 3.623 3.75 3.814 3.908 3.978 4.092 4.177 4.256 4.369 4.469 4.549 4.618 4.674 4.751 4.809 4.851 4.904 4.946 4.99 5.028 5.072 5.093 5.07 5.043 4.99 4.893 4.784 4.596 4.359 4.068 3.598 2.873 1.906 0.582 -1.348 -4.513 -8.111 -10.858 -13.039 -14.807 -16.326 -17.634 -18.765 -19.721 -20.65 -21.407 -22.061 -22.668 -23.217 -23.713 -24.171 -24.647 -25.058 -25.413 -25.772 -26.137 -26.436 -26.73 -27.038 -27.275 -27.518 -27.774 -28.028 -28.27 -28.436 -28.615 -28.903 -29.096 -29.285 -29.379 -29.575 -29.786 -30.017 -30.138 -30.327 -30.523 -30.655 -30.782 -31.051 -31.208 -31.4 -31.591 -31.78 -32.011 -32.294 -33.369 -8 ,8421 ,KEBNE ,16657951,Tue Nov 23 06:47:14 CET,Tue Nov 23 08:06:46 CET,0.0 1.364 1.71 1.973 2.208 2.4 2.554 2.669 2.875 2.969 3.057 3.194 3.288 3.363 3.489 3.61 3.736 3.797 3.907 3.999 4.117 4.2 4.275 4.373 4.473 4.553 4.623 4.692 4.763 4.799 4.842 4.913 4.97 5.022 5.073 5.107 5.115 5.097 5.072 5.053 5.006 4.915 4.774 4.592 4.292 3.865 3.302 2.522 1.323 -0.508 -3.441 -6.942 -9.711 -11.904 -13.655 -15.135 -16.395 -17.514 -18.438 -19.312 -20.042 -20.68 -21.274 -21.841 -22.374 -22.838 -23.311 -23.738 -24.101 -24.455 -24.809 -25.109 -25.415 -25.723 -25.968 -26.211 -26.45 -26.701 -26.954 -27.124 -27.302 -27.578 -27.771 -27.96 -28.061 -28.27 -28.466 -28.678 -28.793 -28.985 -29.177 -29.312 -29.466 -29.764 -29.915 -30.072 -30.237 -30.423 -30.665 -30.95 -31.684 -9 ,4028 ,KEBNE ,16657952,Tue Nov 23 06:47:10 CET,Tue Nov 23 08:08:18 CET,0.0 1.25 1.664 1.891 2.075 2.238 2.387 2.52 2.746 2.844 2.926 3.047 3.143 3.23 3.389 3.53 3.67 3.728 3.806 3.883 4.003 4.086 4.17 4.277 4.382 4.475 4.557 4.63 4.708 4.774 4.827 4.897 4.974 5.026 5.066 5.102 5.125 5.119 5.065 5.016 4.941 4.818 4.618 4.398 4.148 3.683 2.971 2.05 0.703 -1.267 -4.277 -7.627 -10.294 -12.498 -14.328 -15.854 -17.129 -18.255 -19.184 -20.08 -20.821 -21.463 -22.065 -22.621 -23.143 -23.619 -24.093 -24.495 -24.84 -25.192 -25.551 -25.864 -26.185 -26.497 -26.727 -26.965 -27.208 -27.452 -27.717 -27.893 -28.067 -28.334 -28.514 -28.705 -28.807 -29.014 -29.216 -29.415 -29.519 -29.702 -29.901 -30.033 -30.168 -30.444 -30.59 -30.745 -30.904 -31.073 -31.252 -31.514 -32.131 -10 ,7960 ,KEBNE ,16657953,Tue Nov 23 06:47:09 CET,Tue Nov 23 08:07:12 CET,0.0 1.118 1.458 1.699 1.89 2.056 2.219 2.359 2.603 2.71 2.809 2.972 3.075 3.158 3.301 3.423 3.533 3.584 3.693 3.793 3.909 3.984 4.058 4.163 4.256 4.331 4.4 4.46 4.541 4.617 4.668 4.715 4.764 4.815 4.857 4.892 4.904 4.899 4.85 4.8 4.742 4.599 4.425 4.223 3.866 3.35 2.653 1.706 0.32 -1.735 -4.925 -8.471 -11.187 -13.368 -15.178 -16.722 -18.023 -19.134 -20.066 -20.986 -21.738 -22.406 -23.023 -23.581 -24.113 -24.585 -25.06 -25.482 -25.825 -26.17 -26.528 -26.83 -27.149 -27.469 -27.711 -27.958 -28.206 -28.457 -28.708 -28.878 -29.057 -29.331 -29.525 -29.727 -29.83 -30.051 -30.273 -30.492 -30.607 -30.793 -30.966 -31.09 -31.234 -31.542 -31.69 -31.859 -32.048 -32.224 -32.414 -32.69 -33.29 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_124_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_124_54.txt deleted file mode 100644 index 1561590d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_124_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21884 ,KEBNE ,16657954,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:09:23 CET,0.0 0.942 1.302 1.526 1.708 1.88 2.018 2.135 2.355 2.461 2.558 2.705 2.808 2.889 3.02 3.121 3.217 3.262 3.335 3.4 3.495 3.55 3.585 3.624 3.664 3.71 3.743 3.744 3.733 3.71 3.702 3.706 3.68 3.64 3.579 3.488 3.381 3.235 3.046 2.842 2.582 2.229 1.784 1.246 0.526 -0.353 -1.53 -3.103 -5.256 -8.255 -12.811 -17.836 -21.677 -24.761 -27.194 -29.178 -30.856 -32.317 -33.545 -34.723 -35.686 -36.524 -37.302 -38.01 -38.648 -39.22 -39.8 -40.316 -40.769 -41.209 -41.635 -41.98 -42.334 -42.708 -42.992 -43.28 -43.582 -43.888 -44.2 -44.413 -44.63 -44.947 -45.159 -45.387 -45.503 -45.725 -45.957 -46.195 -46.315 -46.525 -46.708 -46.844 -46.986 -47.27 -47.422 -47.592 -47.79 -48.016 -48.273 -48.593 -49.111 -2 ,19957 ,KEBNE ,16657955,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:09:24 CET,0.0 1.022 1.394 1.636 1.849 2.05 2.224 2.36 2.583 2.686 2.777 2.908 3.001 3.082 3.236 3.364 3.473 3.522 3.605 3.68 3.78 3.837 3.891 3.971 4.039 4.084 4.123 4.145 4.153 4.157 4.155 4.142 4.116 4.086 4.037 3.964 3.851 3.696 3.504 3.255 2.975 2.653 2.235 1.723 1.033 0.165 -0.973 -2.447 -4.525 -7.544 -12.168 -17.164 -20.937 -23.921 -26.32 -28.37 -30.06 -31.504 -32.729 -33.916 -34.909 -35.776 -36.561 -37.252 -37.884 -38.476 -39.067 -39.567 -39.995 -40.433 -40.881 -41.234 -41.594 -41.964 -42.254 -42.548 -42.829 -43.117 -43.42 -43.624 -43.831 -44.156 -44.37 -44.585 -44.697 -44.937 -45.184 -45.425 -45.551 -45.766 -45.96 -46.108 -46.272 -46.608 -46.792 -46.967 -47.148 -47.359 -47.591 -47.872 -48.385 -3 ,14829 ,KEBNE ,16657956,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:10:27 CET,0.0 1.349 1.729 1.991 2.214 2.401 2.582 2.756 3.018 3.127 3.23 3.396 3.501 3.581 3.714 3.799 3.878 3.924 4.013 4.098 4.194 4.232 4.278 4.343 4.386 4.419 4.444 4.48 4.508 4.519 4.533 4.519 4.478 4.441 4.393 4.311 4.204 4.076 3.91 3.671 3.397 3.07 2.615 2.082 1.383 0.485 -0.683 -2.172 -4.31 -7.388 -11.979 -16.877 -20.664 -23.645 -25.993 -28.033 -29.744 -31.207 -32.445 -33.619 -34.579 -35.418 -36.187 -36.894 -37.548 -38.128 -38.693 -39.205 -39.654 -40.097 -40.545 -40.916 -41.287 -41.655 -41.936 -42.223 -42.509 -42.799 -43.1 -43.307 -43.517 -43.85 -44.072 -44.279 -44.391 -44.634 -44.883 -45.137 -45.263 -45.478 -45.664 -45.796 -45.945 -46.241 -46.389 -46.553 -46.724 -46.909 -47.14 -47.443 -48.059 -4 ,17751 ,KEBNE ,16657957,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:12:19 CET,0.0 1.392 1.789 2.04 2.222 2.373 2.52 2.667 2.908 3.013 3.113 3.243 3.328 3.392 3.506 3.602 3.682 3.726 3.823 3.919 4.019 4.063 4.12 4.185 4.213 4.23 4.248 4.257 4.264 4.27 4.262 4.242 4.222 4.194 4.148 4.069 3.967 3.823 3.632 3.41 3.133 2.77 2.282 1.726 0.998 0.096 -1.065 -2.605 -4.712 -7.66 -12.251 -17.263 -21.081 -24.127 -26.543 -28.565 -30.261 -31.715 -32.935 -34.154 -35.156 -35.993 -36.759 -37.44 -38.068 -38.646 -39.221 -39.727 -40.161 -40.592 -41.026 -41.383 -41.753 -42.13 -42.411 -42.696 -42.984 -43.275 -43.569 -43.776 -43.989 -44.307 -44.521 -44.734 -44.842 -45.073 -45.309 -45.553 -45.686 -45.904 -46.084 -46.229 -46.39 -46.72 -46.888 -47.064 -47.247 -47.436 -47.666 -47.951 -48.368 -5 ,23439 ,KEBNE ,16657958,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:09:03 CET,0.0 0.958 1.357 1.625 1.848 2.022 2.181 2.349 2.605 2.71 2.815 2.962 3.054 3.121 3.23 3.314 3.402 3.443 3.511 3.568 3.642 3.689 3.728 3.782 3.824 3.848 3.872 3.893 3.917 3.915 3.894 3.865 3.826 3.802 3.762 3.67 3.549 3.389 3.2 3.001 2.764 2.435 2.004 1.549 0.897 0.004 -1.152 -2.668 -4.798 -7.866 -12.562 -17.649 -21.454 -24.463 -26.855 -28.872 -30.598 -32.079 -33.307 -34.519 -35.518 -36.359 -37.126 -37.843 -38.509 -39.094 -39.68 -40.206 -40.655 -41.105 -41.561 -41.928 -42.299 -42.685 -42.981 -43.28 -43.585 -43.894 -44.207 -44.409 -44.608 -44.925 -45.149 -45.385 -45.509 -45.753 -45.989 -46.241 -46.37 -46.576 -46.758 -46.899 -47.044 -47.327 -47.495 -47.681 -47.872 -48.076 -48.296 -48.574 -49.003 -6 ,20226 ,KEBNE ,16657959,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:10:44 CET,0.0 0.975 1.363 1.627 1.841 2.03 2.194 2.329 2.576 2.693 2.798 2.95 3.033 3.093 3.203 3.29 3.362 3.398 3.469 3.535 3.636 3.704 3.759 3.812 3.839 3.866 3.902 3.933 3.945 3.937 3.923 3.907 3.871 3.808 3.718 3.604 3.502 3.389 3.219 3.018 2.769 2.416 1.984 1.489 0.767 -0.145 -1.298 -2.794 -4.908 -7.9 -12.443 -17.633 -21.53 -24.548 -26.984 -29.007 -30.694 -32.174 -33.408 -34.575 -35.563 -36.433 -37.214 -37.927 -38.575 -39.141 -39.714 -40.212 -40.643 -41.08 -41.516 -41.882 -42.254 -42.628 -42.923 -43.213 -43.494 -43.784 -44.084 -44.289 -44.499 -44.837 -45.068 -45.313 -45.44 -45.68 -45.909 -46.152 -46.281 -46.49 -46.686 -46.832 -46.971 -47.265 -47.431 -47.603 -47.775 -47.976 -48.226 -48.511 -49.111 -7 ,17936 ,KEBNE ,16657960,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:10:13 CET,0.0 1.438 1.853 2.169 2.41 2.582 2.744 2.887 3.142 3.254 3.336 3.461 3.56 3.634 3.777 3.894 3.971 4.01 4.097 4.159 4.214 4.249 4.29 4.347 4.397 4.438 4.471 4.497 4.538 4.575 4.574 4.539 4.503 4.469 4.426 4.343 4.236 4.087 3.881 3.633 3.342 2.976 2.509 1.969 1.26 0.374 -0.826 -2.394 -4.51 -7.49 -11.974 -16.859 -20.637 -23.607 -26.037 -28.147 -29.883 -31.355 -32.597 -33.806 -34.786 -35.637 -36.437 -37.168 -37.827 -38.399 -38.98 -39.49 -39.921 -40.354 -40.796 -41.16 -41.533 -41.926 -42.219 -42.494 -42.777 -43.079 -43.389 -43.598 -43.812 -44.142 -44.361 -44.58 -44.695 -44.924 -45.153 -45.399 -45.529 -45.736 -45.911 -46.061 -46.218 -46.545 -46.717 -46.902 -47.103 -47.295 -47.5 -47.773 -48.281 -8 ,23351 ,KEBNE ,16657961,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:10:55 CET,0.0 0.984 1.329 1.617 1.857 2.056 2.221 2.357 2.56 2.661 2.774 2.944 3.04 3.113 3.243 3.352 3.437 3.465 3.537 3.618 3.707 3.761 3.807 3.846 3.881 3.916 3.942 3.956 3.956 3.955 3.951 3.914 3.845 3.778 3.699 3.593 3.468 3.299 3.109 2.876 2.578 2.215 1.745 1.213 0.523 -0.335 -1.467 -2.984 -5.089 -8.122 -12.771 -17.791 -21.666 -24.83 -27.338 -29.371 -31.077 -32.572 -33.803 -34.989 -35.977 -36.829 -37.618 -38.338 -38.997 -39.572 -40.158 -40.681 -41.107 -41.534 -41.978 -42.34 -42.711 -43.09 -43.378 -43.67 -43.964 -44.263 -44.565 -44.768 -44.985 -45.325 -45.547 -45.786 -45.913 -46.15 -46.386 -46.631 -46.76 -46.974 -47.145 -47.283 -47.424 -47.718 -47.879 -48.05 -48.252 -48.483 -48.716 -48.995 -49.547 -9 ,1173 ,KEBNE ,16657962,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:09:14 CET,0.0 1.484 1.876 2.15 2.37 2.54 2.701 2.845 3.074 3.168 3.259 3.415 3.512 3.583 3.706 3.813 3.9 3.944 4.026 4.092 4.181 4.233 4.277 4.325 4.363 4.395 4.425 4.464 4.499 4.504 4.5 4.483 4.455 4.408 4.343 4.252 4.126 3.971 3.788 3.575 3.315 2.952 2.472 1.949 1.246 0.323 -0.837 -2.325 -4.47 -7.525 -12.219 -17.288 -21.061 -24.071 -26.554 -28.629 -30.312 -31.762 -32.992 -34.168 -35.116 -35.939 -36.699 -37.419 -38.083 -38.661 -39.247 -39.759 -40.188 -40.62 -41.07 -41.432 -41.802 -42.189 -42.48 -42.782 -43.09 -43.384 -43.692 -43.913 -44.118 -44.423 -44.652 -44.895 -45.018 -45.254 -45.494 -45.743 -45.867 -46.084 -46.284 -46.441 -46.594 -46.891 -47.054 -47.211 -47.388 -47.586 -47.807 -48.039 -48.445 -10 ,16062 ,KEBNE ,16657963,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:10:10 CET,0.0 1.027 1.464 1.79 2.0 2.151 2.292 2.428 2.648 2.752 2.854 2.993 3.075 3.14 3.286 3.403 3.497 3.542 3.617 3.689 3.78 3.824 3.863 3.9 3.92 3.945 3.98 4.006 4.025 4.035 4.038 4.047 4.051 4.019 3.94 3.827 3.699 3.554 3.389 3.181 2.922 2.604 2.173 1.655 0.933 0.0 -1.198 -2.789 -4.972 -8.038 -12.648 -17.633 -21.458 -24.51 -26.883 -28.869 -30.588 -32.072 -33.3 -34.498 -35.503 -36.362 -37.149 -37.884 -38.542 -39.105 -39.68 -40.195 -40.62 -41.047 -41.496 -41.859 -42.226 -42.604 -42.892 -43.18 -43.472 -43.771 -44.075 -44.282 -44.488 -44.816 -45.045 -45.268 -45.382 -45.608 -45.844 -46.103 -46.234 -46.453 -46.647 -46.783 -46.922 -47.218 -47.383 -47.556 -47.749 -47.953 -48.188 -48.471 -48.878 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_1.txt deleted file mode 100644 index 7947ae87..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7998 ,KEBNE ,16657964,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:09:52 CET,0.0 0.542 0.817 1.035 1.215 1.371 1.52 1.673 1.903 2.002 2.101 2.203 2.372 2.453 2.615 2.772 2.927 3.003 3.161 3.297 3.47 3.602 3.723 3.867 3.998 4.137 4.282 4.421 4.606 4.791 4.956 5.162 5.373 5.566 5.781 6.011 6.224 6.462 6.716 6.97 7.235 7.535 7.889 8.232 8.629 9.076 9.567 10.067 10.61 11.226 11.863 12.171 12.162 12.048 11.873 11.688 11.52 11.338 11.158 10.967 10.802 10.633 10.461 10.305 10.148 9.98 9.793 9.63 9.497 9.365 9.216 9.094 8.975 8.849 8.751 8.636 8.513 8.388 8.263 8.176 8.08 7.94 7.846 7.742 7.684 7.563 7.437 7.302 7.224 7.067 6.975 6.889 6.793 6.568 6.45 6.324 6.193 6.028 5.842 5.619 5.059 -2 ,8331 ,KEBNE ,16657965,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:11:19 CET,0.0 0.603 0.87 1.082 1.272 1.437 1.56 1.679 1.911 2.015 2.121 2.244 2.41 2.484 2.629 2.782 2.933 3.004 3.139 3.28 3.479 3.587 3.689 3.848 4.01 4.17 4.336 4.492 4.679 4.851 5.028 5.239 5.439 5.634 5.843 6.066 6.27 6.502 6.763 7.029 7.301 7.608 7.949 8.278 8.676 9.128 9.622 10.146 10.714 11.303 11.899 12.188 12.213 12.192 12.111 11.929 11.728 11.529 11.322 11.107 10.946 10.789 10.618 10.474 10.329 10.17 9.999 9.841 9.707 9.567 9.408 9.287 9.158 9.005 8.882 8.751 8.624 8.491 8.348 8.258 8.164 7.994 7.872 7.75 7.687 7.555 7.412 7.262 7.192 7.042 6.941 6.833 6.716 6.498 6.388 6.263 6.11 5.927 5.715 5.438 4.974 -3 ,18963 ,KEBNE ,16657966,Tue Nov 23 06:48:11 CET,Tue Nov 23 08:10:27 CET,0.0 0.803 1.007 1.188 1.389 1.552 1.676 1.794 2.031 2.13 2.219 2.313 2.49 2.58 2.749 2.925 3.091 3.165 3.299 3.437 3.631 3.742 3.854 4.017 4.171 4.332 4.484 4.616 4.777 4.946 5.108 5.304 5.505 5.689 5.887 6.107 6.331 6.589 6.843 7.096 7.388 7.721 8.076 8.419 8.828 9.245 9.692 10.183 10.709 11.281 11.906 12.264 12.296 12.179 11.974 11.732 11.526 11.349 11.168 10.946 10.756 10.578 10.381 10.184 9.999 9.86 9.717 9.582 9.453 9.299 9.143 8.999 8.843 8.692 8.574 8.455 8.341 8.213 8.082 7.996 7.89 7.728 7.626 7.504 7.438 7.311 7.179 7.047 6.979 6.827 6.749 6.653 6.549 6.324 6.204 6.085 5.941 5.762 5.546 5.272 4.5 -4 ,2179 ,KEBNE ,16657967,Tue Nov 23 06:49:13 CET,Tue Nov 23 08:12:57 CET,0.0 0.533 0.823 1.067 1.272 1.415 1.541 1.672 1.889 1.986 2.082 2.165 2.326 2.413 2.592 2.755 2.903 2.979 3.123 3.245 3.41 3.521 3.633 3.786 3.929 4.07 4.2 4.321 4.481 4.636 4.792 4.979 5.158 5.346 5.555 5.767 5.967 6.185 6.415 6.649 6.896 7.193 7.535 7.868 8.244 8.657 9.152 9.673 10.188 10.739 11.272 11.572 11.654 11.544 11.379 11.14 10.909 10.732 10.522 10.303 10.126 9.954 9.749 9.546 9.387 9.255 9.099 8.926 8.779 8.64 8.479 8.343 8.211 8.072 7.968 7.861 7.731 7.598 7.46 7.356 7.245 7.083 6.963 6.843 6.784 6.649 6.521 6.379 6.301 6.147 6.062 5.981 5.883 5.664 5.531 5.387 5.234 5.043 4.812 4.565 3.963 -5 ,19556 ,KEBNE ,16657968,Tue Nov 23 06:49:13 CET,Tue Nov 23 08:11:27 CET,0.0 0.96 1.221 1.441 1.629 1.794 1.938 2.073 2.319 2.439 2.563 2.686 2.854 2.942 3.101 3.25 3.392 3.456 3.577 3.697 3.876 3.988 4.096 4.267 4.426 4.573 4.722 4.86 5.036 5.219 5.389 5.575 5.751 5.928 6.144 6.377 6.59 6.818 7.049 7.29 7.558 7.858 8.203 8.558 8.958 9.4 9.871 10.367 10.935 11.511 12.103 12.474 12.525 12.443 12.342 12.169 11.943 11.73 11.551 11.365 11.201 11.028 10.853 10.695 10.55 10.416 10.263 10.126 9.983 9.823 9.675 9.533 9.386 9.255 9.148 9.032 8.911 8.789 8.648 8.553 8.461 8.309 8.199 8.078 8.014 7.88 7.74 7.589 7.504 7.346 7.257 7.159 7.06 6.858 6.72 6.559 6.383 6.186 5.967 5.676 4.466 -6 ,17209 ,KEBNE ,16657969,Tue Nov 23 06:49:13 CET,Tue Nov 23 08:12:53 CET,0.0 0.66 0.882 1.051 1.205 1.357 1.479 1.596 1.833 1.94 2.028 2.104 2.265 2.342 2.494 2.628 2.75 2.815 2.941 3.059 3.24 3.36 3.485 3.657 3.804 3.951 4.089 4.222 4.399 4.569 4.738 4.937 5.113 5.276 5.472 5.699 5.909 6.137 6.402 6.671 6.952 7.27 7.64 8.044 8.492 8.937 9.42 9.967 10.572 11.174 11.765 12.072 12.107 12.021 11.895 11.732 11.512 11.304 11.146 10.952 10.735 10.556 10.393 10.219 10.045 9.861 9.689 9.556 9.431 9.296 9.137 8.997 8.863 8.726 8.621 8.511 8.383 8.237 8.083 7.978 7.877 7.721 7.599 7.46 7.389 7.252 7.117 6.983 6.911 6.755 6.661 6.579 6.471 6.224 6.093 5.959 5.831 5.655 5.422 5.168 4.595 -7 ,29779 ,KEBNE ,16657970,Tue Nov 23 06:49:12 CET,Tue Nov 23 08:12:05 CET,0.0 1.191 1.511 1.729 1.909 2.066 2.196 2.319 2.547 2.65 2.752 2.869 3.046 3.146 3.316 3.473 3.612 3.67 3.797 3.92 4.091 4.208 4.314 4.47 4.615 4.744 4.88 5.015 5.182 5.348 5.513 5.708 5.901 6.084 6.272 6.486 6.691 6.913 7.167 7.423 7.674 7.962 8.324 8.675 9.073 9.504 9.958 10.456 11.026 11.63 12.249 12.606 12.647 12.582 12.499 12.373 12.211 12.023 11.836 11.637 11.469 11.303 11.13 10.966 10.818 10.678 10.519 10.384 10.272 10.131 9.967 9.835 9.676 9.505 9.392 9.286 9.169 9.036 8.895 8.795 8.695 8.54 8.439 8.332 8.264 8.121 7.986 7.852 7.787 7.646 7.56 7.464 7.356 7.126 6.998 6.868 6.722 6.565 6.37 6.057 5.352 -8 ,19601 ,KEBNE ,16657971,Tue Nov 23 06:49:13 CET,Tue Nov 23 08:12:01 CET,0.0 0.61 0.901 1.148 1.343 1.501 1.647 1.807 2.062 2.164 2.26 2.355 2.517 2.594 2.737 2.879 3.023 3.093 3.224 3.346 3.529 3.656 3.773 3.927 4.084 4.232 4.368 4.512 4.685 4.839 4.99 5.171 5.353 5.54 5.749 5.98 6.212 6.455 6.705 6.979 7.285 7.626 7.99 8.31 8.698 9.137 9.594 10.097 10.667 11.265 11.776 12.023 12.048 11.965 11.823 11.669 11.491 11.272 11.082 10.898 10.723 10.568 10.413 10.239 10.068 9.898 9.733 9.585 9.44 9.295 9.15 9.027 8.901 8.758 8.641 8.524 8.399 8.264 8.133 8.049 7.938 7.742 7.611 7.486 7.428 7.313 7.191 7.058 6.983 6.833 6.729 6.623 6.501 6.237 6.096 5.951 5.789 5.611 5.42 5.146 4.531 -9 ,11851 ,KEBNE ,16657972,Tue Nov 23 06:49:16 CET,Tue Nov 23 08:11:04 CET,0.0 0.878 1.172 1.383 1.546 1.709 1.882 2.016 2.247 2.351 2.44 2.537 2.705 2.79 2.966 3.126 3.274 3.342 3.465 3.591 3.786 3.91 4.027 4.185 4.337 4.488 4.618 4.757 4.951 5.123 5.292 5.498 5.701 5.891 6.101 6.329 6.528 6.741 6.987 7.256 7.522 7.831 8.184 8.504 8.871 9.28 9.752 10.277 10.873 11.513 12.13 12.421 12.442 12.363 12.239 12.098 11.918 11.706 11.523 11.317 11.126 10.975 10.82 10.637 10.465 10.304 10.139 9.987 9.853 9.734 9.606 9.483 9.35 9.215 9.106 8.982 8.859 8.727 8.583 8.499 8.406 8.251 8.131 8.004 7.941 7.801 7.664 7.534 7.461 7.297 7.168 7.059 6.952 6.711 6.579 6.451 6.309 6.148 5.977 5.748 5.083 -10 ,15291 ,KEBNE ,16657973,Tue Nov 23 06:49:13 CET,Tue Nov 23 08:11:19 CET,0.0 0.835 1.057 1.263 1.446 1.574 1.693 1.823 2.062 2.169 2.264 2.356 2.524 2.619 2.791 2.932 3.088 3.17 3.313 3.439 3.618 3.745 3.865 4.017 4.17 4.33 4.477 4.609 4.781 4.944 5.106 5.328 5.522 5.702 5.944 6.194 6.431 6.697 6.951 7.191 7.457 7.777 8.129 8.478 8.869 9.28 9.757 10.29 10.881 11.501 12.031 12.299 12.337 12.262 12.133 11.943 11.752 11.598 11.465 11.292 11.114 10.921 10.721 10.564 10.401 10.24 10.079 9.909 9.756 9.599 9.433 9.292 9.131 8.977 8.867 8.735 8.59 8.443 8.298 8.2 8.1 7.946 7.844 7.733 7.667 7.536 7.399 7.249 7.168 7.0 6.866 6.75 6.633 6.399 6.282 6.13 5.934 5.744 5.547 5.307 4.652 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_156.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_156.txt deleted file mode 100644 index 651fc0aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_156.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31758 ,KEBNE ,16657974,Tue Nov 23 06:49:13 CET,Tue Nov 23 08:11:27 CET,0.0 0.491 0.718 0.907 1.076 1.218 1.33 1.45 1.707 1.818 1.916 2.022 2.194 2.281 2.452 2.627 2.784 2.86 3.0 3.122 3.313 3.431 3.539 3.699 3.86 4.015 4.17 4.323 4.513 4.695 4.866 5.066 5.26 5.444 5.65 5.902 6.164 6.446 6.748 7.072 7.406 7.772 8.178 8.605 9.109 9.65 10.264 10.972 11.807 12.708 13.7 14.431 14.783 14.926 14.938 14.886 14.812 14.71 14.611 14.512 14.409 14.293 14.174 14.059 13.935 13.798 13.644 13.509 13.393 13.285 13.176 13.082 12.955 12.798 12.691 12.581 12.454 12.338 12.229 12.147 12.065 11.937 11.839 11.727 11.676 11.578 11.443 11.303 11.235 11.082 10.982 10.898 10.811 10.587 10.461 10.342 10.225 10.075 9.855 9.602 9.164 -2 ,14497 ,KEBNE ,16657975,Tue Nov 23 06:50:14 CET,Tue Nov 23 08:14:03 CET,0.0 0.384 0.631 0.853 1.031 1.19 1.319 1.435 1.654 1.753 1.842 1.936 2.109 2.191 2.344 2.5 2.653 2.725 2.867 3.013 3.209 3.316 3.42 3.586 3.755 3.917 4.087 4.252 4.441 4.612 4.785 5.012 5.221 5.413 5.633 5.871 6.103 6.373 6.66 6.969 7.298 7.629 8.01 8.431 8.928 9.488 10.104 10.762 11.565 12.477 13.514 14.299 14.626 14.739 14.75 14.678 14.592 14.511 14.417 14.301 14.189 14.09 13.992 13.889 13.792 13.675 13.536 13.399 13.278 13.164 13.03 12.917 12.801 12.674 12.567 12.464 12.374 12.269 12.148 12.064 11.979 11.843 11.743 11.64 11.587 11.465 11.342 11.204 11.127 10.989 10.921 10.837 10.733 10.508 10.387 10.258 10.111 9.957 9.786 9.555 8.983 -3 ,898 ,KEBNE ,16657976,Tue Nov 23 06:50:14 CET,Tue Nov 23 08:13:45 CET,0.0 0.497 0.771 0.981 1.14 1.272 1.407 1.536 1.775 1.893 2.007 2.133 2.303 2.394 2.568 2.714 2.858 2.927 3.063 3.198 3.388 3.506 3.622 3.793 3.968 4.135 4.286 4.42 4.59 4.77 4.951 5.167 5.369 5.568 5.794 6.047 6.3 6.588 6.906 7.212 7.543 7.919 8.309 8.7 9.154 9.669 10.31 10.994 11.735 12.581 13.498 14.195 14.521 14.6 14.596 14.552 14.48 14.392 14.268 14.143 14.037 13.915 13.797 13.67 13.533 13.402 13.257 13.115 13.002 12.893 12.767 12.661 12.543 12.414 12.317 12.211 12.105 11.99 11.858 11.775 11.684 11.541 11.426 11.301 11.247 11.129 10.993 10.847 10.776 10.634 10.549 10.46 10.364 10.166 10.058 9.938 9.818 9.689 9.532 9.262 8.566 -4 ,25575 ,KEBNE ,16657977,Tue Nov 23 06:50:14 CET,Tue Nov 23 08:14:14 CET,0.0 0.561 0.824 1.006 1.165 1.308 1.437 1.562 1.803 1.913 2.014 2.114 2.295 2.397 2.57 2.726 2.86 2.931 3.07 3.196 3.394 3.521 3.644 3.82 3.992 4.149 4.288 4.433 4.647 4.846 5.022 5.229 5.425 5.623 5.849 6.106 6.366 6.647 6.939 7.247 7.588 7.969 8.382 8.792 9.259 9.769 10.372 11.055 11.83 12.713 13.776 14.572 14.923 15.061 15.113 15.075 14.996 14.916 14.83 14.698 14.574 14.447 14.316 14.188 14.04 13.912 13.792 13.685 13.589 13.466 13.326 13.22 13.101 12.967 12.867 12.768 12.654 12.52 12.392 12.302 12.203 12.054 11.952 11.846 11.793 11.681 11.547 11.41 11.34 11.193 11.101 11.014 10.932 10.742 10.63 10.494 10.337 10.173 9.972 9.667 8.906 -5 ,9504 ,KEBNE ,16657978,Tue Nov 23 06:50:14 CET,Tue Nov 23 08:15:54 CET,0.0 0.715 0.995 1.222 1.412 1.574 1.69 1.802 2.028 2.129 2.229 2.342 2.516 2.597 2.743 2.889 3.03 3.101 3.233 3.35 3.522 3.632 3.751 3.928 4.088 4.241 4.391 4.541 4.724 4.912 5.088 5.285 5.468 5.652 5.909 6.193 6.443 6.727 7.028 7.331 7.647 8.008 8.42 8.844 9.34 9.86 10.456 11.13 11.879 12.73 13.736 14.472 14.836 14.964 14.956 14.903 14.826 14.728 14.624 14.508 14.383 14.259 14.16 14.049 13.93 13.825 13.706 13.587 13.471 13.362 13.25 13.144 13.024 12.883 12.791 12.695 12.575 12.463 12.338 12.248 12.164 12.025 11.919 11.806 11.751 11.642 11.522 11.394 11.324 11.181 11.101 11.017 10.925 10.733 10.616 10.48 10.342 10.206 10.04 9.812 9.277 -6 ,9546 ,KEBNE ,16657979,Tue Nov 23 06:50:14 CET,Tue Nov 23 08:13:29 CET,0.0 0.685 0.976 1.173 1.345 1.487 1.613 1.729 1.947 2.043 2.133 2.245 2.423 2.515 2.674 2.819 2.956 3.024 3.166 3.3 3.497 3.632 3.761 3.929 4.097 4.262 4.41 4.565 4.758 4.948 5.14 5.353 5.565 5.777 6.005 6.261 6.523 6.803 7.104 7.432 7.754 8.101 8.515 8.938 9.427 9.982 10.64 11.398 12.196 13.06 14.07 14.802 15.173 15.342 15.363 15.336 15.273 15.169 15.061 14.912 14.778 14.661 14.535 14.422 14.299 14.183 14.079 13.965 13.846 13.726 13.598 13.476 13.366 13.271 13.179 13.065 12.949 12.823 12.702 12.621 12.537 12.403 12.306 12.204 12.148 12.03 11.909 11.781 11.716 11.584 11.518 11.433 11.335 11.122 11.005 10.888 10.765 10.631 10.455 10.173 9.545 -7 ,12845 ,KEBNE ,16657980,Tue Nov 23 06:50:14 CET,Tue Nov 23 08:13:11 CET,0.0 0.354 0.579 0.801 0.992 1.166 1.31 1.432 1.663 1.765 1.861 1.968 2.137 2.226 2.4 2.553 2.708 2.782 2.923 3.057 3.235 3.356 3.481 3.662 3.844 4.013 4.171 4.32 4.51 4.692 4.873 5.091 5.301 5.496 5.719 5.99 6.248 6.549 6.867 7.167 7.492 7.855 8.251 8.655 9.126 9.676 10.319 11.013 11.841 12.756 13.736 14.495 14.859 14.997 15.027 14.979 14.891 14.783 14.684 14.568 14.471 14.373 14.251 14.121 13.98 13.853 13.715 13.588 13.482 13.367 13.234 13.124 12.998 12.87 12.776 12.67 12.566 12.458 12.329 12.244 12.154 11.994 11.897 11.808 11.757 11.644 11.519 11.385 11.317 11.16 11.061 10.98 10.89 10.706 10.602 10.477 10.323 10.154 9.994 9.763 9.197 -8 ,30686 ,KEBNE ,16657981,Tue Nov 23 06:50:15 CET,Tue Nov 23 08:13:22 CET,0.0 0.619 0.891 1.091 1.251 1.392 1.53 1.665 1.904 2.012 2.111 2.205 2.371 2.459 2.639 2.808 2.953 3.021 3.153 3.275 3.468 3.586 3.703 3.88 4.038 4.188 4.338 4.493 4.687 4.868 5.046 5.264 5.466 5.664 5.906 6.181 6.436 6.725 7.051 7.38 7.713 8.069 8.493 8.923 9.382 9.909 10.547 11.25 12.04 12.966 14.017 14.765 15.103 15.242 15.249 15.167 15.058 14.93 14.794 14.661 14.528 14.385 14.249 14.124 13.997 13.873 13.754 13.638 13.529 13.426 13.308 13.201 13.091 12.98 12.891 12.786 12.677 12.557 12.428 12.339 12.247 12.105 12.003 11.91 11.865 11.765 11.648 11.511 11.433 11.282 11.198 11.111 11.025 10.829 10.722 10.626 10.526 10.394 10.245 10.065 9.637 -9 ,20636 ,KEBNE ,16657982,Tue Nov 23 06:50:14 CET,Tue Nov 23 08:12:28 CET,0.0 0.694 0.976 1.17 1.34 1.476 1.601 1.73 1.958 2.06 2.154 2.251 2.421 2.512 2.69 2.857 3.007 3.075 3.208 3.351 3.538 3.658 3.794 3.976 4.137 4.304 4.473 4.63 4.821 5.009 5.208 5.448 5.663 5.878 6.124 6.387 6.635 6.908 7.203 7.517 7.846 8.202 8.611 9.037 9.543 10.097 10.744 11.426 12.149 12.974 13.922 14.655 15.031 15.152 15.147 15.086 14.989 14.869 14.748 14.582 14.446 14.342 14.215 14.088 13.969 13.858 13.735 13.615 13.498 13.357 13.212 13.108 13.006 12.883 12.781 12.685 12.58 12.459 12.322 12.223 12.127 11.985 11.885 11.787 11.732 11.6 11.471 11.345 11.28 11.139 11.048 10.962 10.868 10.667 10.557 10.446 10.33 10.212 10.044 9.798 9.283 -10 ,2081 ,KEBNE ,16657983,Tue Nov 23 06:50:14 CET,Tue Nov 23 08:12:48 CET,0.0 0.664 0.903 1.077 1.218 1.354 1.484 1.594 1.797 1.896 2.0 2.116 2.281 2.365 2.524 2.664 2.799 2.867 2.999 3.128 3.31 3.426 3.535 3.701 3.869 4.019 4.169 4.332 4.537 4.722 4.906 5.133 5.334 5.519 5.755 6.025 6.265 6.514 6.793 7.097 7.398 7.738 8.146 8.568 9.064 9.611 10.208 10.884 11.657 12.538 13.52 14.181 14.495 14.628 14.662 14.636 14.545 14.43 14.31 14.193 14.075 13.954 13.843 13.698 13.546 13.433 13.31 13.173 13.051 12.932 12.818 12.725 12.624 12.517 12.423 12.324 12.21 12.097 11.984 11.894 11.799 11.645 11.543 11.449 11.396 11.286 11.164 11.036 10.964 10.805 10.688 10.595 10.498 10.285 10.175 10.043 9.907 9.761 9.554 9.268 8.827 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_23.txt deleted file mode 100644 index fbdde4ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29575 ,KEBNE ,16657984,Tue Nov 23 06:50:15 CET,Tue Nov 23 08:12:43 CET,0.0 0.59 0.918 1.143 1.303 1.451 1.586 1.723 1.977 2.095 2.198 2.294 2.458 2.54 2.692 2.842 2.99 3.061 3.192 3.317 3.496 3.617 3.742 3.919 4.082 4.235 4.377 4.513 4.684 4.852 5.016 5.226 5.439 5.624 5.827 6.044 6.242 6.472 6.724 6.977 7.24 7.543 7.878 8.208 8.585 8.973 9.386 9.808 10.17 10.339 10.217 9.665 9.078 8.524 7.983 7.455 6.949 6.502 6.127 5.698 5.335 5.018 4.691 4.39 4.12 3.853 3.567 3.317 3.096 2.868 2.657 2.485 2.286 2.075 1.907 1.741 1.578 1.399 1.211 1.076 0.931 0.705 0.56 0.424 0.343 0.153 -0.038 -0.238 -0.344 -0.539 -0.684 -0.805 -0.929 -1.188 -1.324 -1.483 -1.642 -1.81 -2.052 -2.424 -3.963 -2 ,26958 ,KEBNE ,16657985,Tue Nov 23 06:51:16 CET,Tue Nov 23 08:13:54 CET,0.0 0.566 0.894 1.17 1.38 1.549 1.687 1.819 2.048 2.146 2.237 2.352 2.526 2.612 2.777 2.934 3.076 3.138 3.262 3.386 3.556 3.661 3.771 3.953 4.139 4.313 4.474 4.625 4.818 4.993 5.146 5.333 5.528 5.721 5.933 6.154 6.358 6.582 6.831 7.069 7.315 7.624 8.008 8.353 8.725 9.123 9.497 9.848 10.176 10.376 10.363 9.998 9.468 8.831 8.172 7.586 7.086 6.611 6.185 5.773 5.404 5.042 4.707 4.398 4.1 3.844 3.573 3.323 3.105 2.871 2.635 2.44 2.24 2.028 1.867 1.713 1.55 1.367 1.169 1.043 0.917 0.719 0.574 0.42 0.341 0.17 -0.016 -0.21 -0.304 -0.482 -0.6 -0.712 -0.828 -1.118 -1.287 -1.465 -1.65 -1.84 -2.125 -2.526 -3.532 -3 ,27582 ,KEBNE ,16657986,Tue Nov 23 06:51:16 CET,Tue Nov 23 08:12:57 CET,0.0 0.574 0.845 1.017 1.192 1.366 1.528 1.659 1.884 1.981 2.073 2.17 2.339 2.426 2.613 2.791 2.936 3.007 3.143 3.27 3.452 3.585 3.714 3.881 4.04 4.194 4.342 4.486 4.673 4.846 5.015 5.234 5.447 5.643 5.867 6.097 6.306 6.552 6.817 7.063 7.32 7.623 7.964 8.285 8.645 9.02 9.422 9.838 10.203 10.469 10.443 9.968 9.429 8.864 8.3 7.761 7.257 6.779 6.36 5.96 5.611 5.282 4.966 4.665 4.394 4.146 3.865 3.613 3.407 3.189 2.937 2.739 2.545 2.326 2.147 1.966 1.795 1.627 1.449 1.324 1.189 0.969 0.808 0.637 0.553 0.384 0.192 -0.002 -0.099 -0.29 -0.415 -0.526 -0.641 -0.916 -1.075 -1.231 -1.381 -1.552 -1.799 -2.141 -3.002 -4 ,24931 ,KEBNE ,16657987,Tue Nov 23 06:51:16 CET,Tue Nov 23 08:13:04 CET,0.0 0.686 0.95 1.137 1.313 1.47 1.624 1.779 2.05 2.164 2.281 2.413 2.585 2.676 2.834 2.968 3.112 3.187 3.331 3.469 3.642 3.761 3.877 4.038 4.195 4.341 4.483 4.624 4.81 4.991 5.17 5.366 5.553 5.723 5.91 6.156 6.402 6.645 6.901 7.17 7.433 7.722 8.08 8.391 8.715 9.113 9.51 9.881 10.262 10.502 10.502 10.1 9.497 8.901 8.275 7.665 7.144 6.682 6.27 5.848 5.49 5.166 4.829 4.519 4.241 3.985 3.707 3.429 3.205 2.994 2.776 2.587 2.38 2.181 2.023 1.844 1.666 1.484 1.283 1.147 1.027 0.842 0.693 0.533 0.449 0.283 0.119 -0.055 -0.154 -0.345 -0.455 -0.573 -0.7 -0.962 -1.115 -1.277 -1.449 -1.67 -1.941 -2.292 -3.317 -5 ,10828 ,KEBNE ,16657988,Tue Nov 23 06:51:16 CET,Tue Nov 23 08:14:00 CET,0.0 0.571 0.81 0.991 1.166 1.342 1.464 1.568 1.787 1.898 2.02 2.177 2.36 2.454 2.62 2.769 2.908 2.979 3.123 3.258 3.447 3.561 3.676 3.85 4.022 4.176 4.316 4.452 4.624 4.783 4.934 5.116 5.302 5.485 5.688 5.905 6.1 6.32 6.553 6.809 7.076 7.379 7.754 8.09 8.435 8.782 9.14 9.517 9.934 10.207 10.161 9.821 9.301 8.711 8.111 7.548 7.061 6.585 6.195 5.834 5.481 5.128 4.794 4.484 4.207 3.958 3.692 3.455 3.235 3.007 2.781 2.598 2.403 2.183 2.011 1.838 1.671 1.479 1.265 1.125 0.985 0.774 0.626 0.464 0.382 0.214 0.036 -0.146 -0.237 -0.419 -0.534 -0.637 -0.751 -1.034 -1.201 -1.385 -1.568 -1.752 -2.03 -2.41 -3.389 -6 ,30471 ,KEBNE ,16657989,Tue Nov 23 06:51:16 CET,Tue Nov 23 08:14:12 CET,0.0 0.561 0.836 1.064 1.247 1.417 1.576 1.718 1.958 2.06 2.17 2.305 2.484 2.577 2.754 2.922 3.064 3.135 3.293 3.431 3.621 3.743 3.852 4.01 4.179 4.341 4.486 4.632 4.813 4.977 5.141 5.342 5.534 5.72 5.929 6.144 6.345 6.571 6.814 7.076 7.35 7.651 8.01 8.352 8.711 9.102 9.514 9.879 10.222 10.556 10.584 10.097 9.549 8.962 8.34 7.755 7.251 6.795 6.395 5.983 5.612 5.274 4.943 4.647 4.37 4.094 3.785 3.512 3.295 3.055 2.797 2.589 2.381 2.187 2.036 1.87 1.703 1.52 1.336 1.213 1.078 0.867 0.713 0.543 0.456 0.282 0.104 -0.074 -0.171 -0.366 -0.517 -0.635 -0.753 -1.008 -1.152 -1.313 -1.49 -1.701 -1.967 -2.384 -3.736 -7 ,15144 ,KEBNE ,16657990,Tue Nov 23 06:51:16 CET,Tue Nov 23 08:13:11 CET,0.0 0.658 0.888 1.09 1.27 1.428 1.58 1.708 1.936 2.046 2.15 2.263 2.433 2.518 2.674 2.829 2.977 3.047 3.186 3.329 3.528 3.651 3.77 3.921 4.072 4.224 4.368 4.51 4.696 4.888 5.071 5.276 5.459 5.64 5.857 6.082 6.29 6.523 6.77 7.008 7.245 7.514 7.839 8.153 8.506 8.883 9.22 9.538 9.885 10.175 10.173 9.73 9.172 8.592 8.03 7.473 6.968 6.491 6.052 5.594 5.201 4.867 4.543 4.233 3.963 3.721 3.461 3.215 2.99 2.76 2.534 2.34 2.127 1.914 1.751 1.578 1.413 1.245 1.062 0.936 0.803 0.585 0.438 0.28 0.196 0.019 -0.168 -0.375 -0.483 -0.677 -0.815 -0.941 -1.085 -1.386 -1.541 -1.704 -1.879 -2.091 -2.337 -2.645 -3.623 -8 ,2238 ,KEBNE ,16657991,Tue Nov 23 06:51:16 CET,Tue Nov 23 08:14:08 CET,0.0 0.81 1.107 1.375 1.586 1.754 1.907 2.041 2.308 2.418 2.522 2.645 2.821 2.913 3.086 3.238 3.38 3.45 3.592 3.727 3.913 4.031 4.143 4.313 4.475 4.631 4.782 4.927 5.12 5.291 5.45 5.658 5.854 6.026 6.233 6.478 6.703 6.926 7.17 7.426 7.662 7.923 8.258 8.59 8.938 9.306 9.704 10.122 10.545 10.831 10.811 10.443 9.897 9.3 8.74 8.172 7.623 7.123 6.704 6.296 5.918 5.563 5.25 4.938 4.63 4.358 4.085 3.845 3.642 3.443 3.226 3.023 2.814 2.608 2.453 2.299 2.119 1.912 1.709 1.581 1.456 1.244 1.09 0.926 0.841 0.675 0.502 0.313 0.208 0.01 -0.115 -0.226 -0.35 -0.612 -0.744 -0.897 -1.079 -1.3 -1.574 -1.948 -2.897 -9 ,31199 ,KEBNE ,16657992,Tue Nov 23 06:51:16 CET,Tue Nov 23 08:15:00 CET,0.0 0.627 0.915 1.143 1.316 1.47 1.619 1.735 1.953 2.078 2.198 2.318 2.49 2.586 2.77 2.943 3.117 3.19 3.339 3.487 3.685 3.814 3.929 4.086 4.238 4.401 4.547 4.665 4.821 4.993 5.163 5.349 5.538 5.721 5.933 6.176 6.391 6.641 6.912 7.163 7.405 7.703 8.061 8.402 8.772 9.145 9.563 9.958 10.311 10.61 10.697 10.349 9.786 9.217 8.666 8.103 7.598 7.122 6.66 6.205 5.835 5.485 5.153 4.835 4.534 4.277 4.008 3.761 3.559 3.344 3.104 2.903 2.707 2.508 2.341 2.163 1.968 1.758 1.561 1.426 1.281 1.065 0.928 0.774 0.689 0.505 0.312 0.13 0.034 -0.151 -0.27 -0.382 -0.496 -0.751 -0.915 -1.089 -1.254 -1.46 -1.753 -2.113 -3.634 -10 ,28774 ,KEBNE ,16657993,Tue Nov 23 06:51:16 CET,Tue Nov 23 08:13:47 CET,0.0 0.684 0.948 1.176 1.331 1.465 1.603 1.742 2.009 2.128 2.232 2.344 2.52 2.609 2.781 2.925 3.07 3.149 3.299 3.436 3.639 3.764 3.869 4.036 4.211 4.362 4.505 4.649 4.831 5.005 5.182 5.39 5.573 5.743 5.94 6.165 6.366 6.586 6.844 7.132 7.392 7.662 8.012 8.344 8.675 9.011 9.368 9.728 10.116 10.471 10.555 10.131 9.606 9.074 8.531 7.98 7.471 6.991 6.557 6.115 5.738 5.394 5.07 4.783 4.517 4.259 3.984 3.735 3.515 3.281 3.032 2.83 2.622 2.404 2.238 2.063 1.885 1.707 1.508 1.375 1.237 1.023 0.872 0.708 0.619 0.439 0.275 0.102 0.002 -0.191 -0.311 -0.414 -0.525 -0.801 -0.967 -1.137 -1.337 -1.596 -1.916 -2.278 -3.049 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_30.txt deleted file mode 100644 index a47393c4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2193 ,KEBNE ,16657994,Tue Nov 23 06:51:16 CET,Tue Nov 23 08:17:06 CET,0.0 0.513 0.737 0.925 1.108 1.288 1.456 1.616 1.92 2.053 2.178 2.332 2.523 2.63 2.828 3.02 3.224 3.322 3.499 3.684 3.958 4.125 4.288 4.528 4.765 4.999 5.232 5.462 5.756 6.045 6.325 6.65 6.97 7.282 7.64 8.053 8.471 8.949 9.455 10.012 10.597 11.231 11.99 12.796 13.75 14.844 16.128 17.594 19.372 21.464 24.0 26.089 27.303 28.017 28.437 28.704 28.882 28.992 29.046 29.082 29.081 29.05 29.014 28.966 28.898 28.831 28.764 28.694 28.62 28.547 28.456 28.369 28.29 28.207 28.135 28.061 27.974 27.882 27.789 27.72 27.651 27.546 27.463 27.372 27.327 27.239 27.145 27.045 26.992 26.87 26.775 26.693 26.615 26.449 26.351 26.232 26.101 25.944 25.783 25.567 24.856 -2 ,18565 ,KEBNE ,16657995,Tue Nov 23 06:51:16 CET,Tue Nov 23 08:13:28 CET,0.0 0.822 1.136 1.375 1.555 1.718 1.873 2.013 2.297 2.434 2.56 2.731 2.932 3.051 3.266 3.456 3.652 3.751 3.942 4.119 4.374 4.54 4.697 4.94 5.181 5.419 5.661 5.89 6.182 6.462 6.743 7.097 7.42 7.727 8.093 8.509 8.925 9.387 9.902 10.452 11.033 11.703 12.452 13.214 14.168 15.247 16.504 18.01 19.748 21.737 24.253 26.376 27.594 28.384 28.897 29.233 29.461 29.597 29.675 29.697 29.687 29.665 29.634 29.595 29.547 29.507 29.453 29.397 29.337 29.256 29.179 29.125 29.068 29.007 28.943 28.861 28.77 28.677 28.578 28.513 28.441 28.314 28.23 28.153 28.11 28.003 27.893 27.782 27.719 27.593 27.504 27.417 27.321 27.116 26.999 26.886 26.765 26.61 26.428 26.163 25.528 -3 ,289 ,KEBNE ,16657996,Tue Nov 23 06:52:18 CET,Tue Nov 23 08:14:56 CET,0.0 0.446 0.753 0.985 1.187 1.361 1.524 1.681 1.969 2.106 2.235 2.4 2.589 2.695 2.911 3.119 3.322 3.417 3.595 3.778 4.047 4.222 4.398 4.661 4.918 5.165 5.395 5.612 5.901 6.195 6.484 6.826 7.154 7.468 7.847 8.284 8.695 9.147 9.643 10.192 10.775 11.405 12.181 13.015 13.947 14.984 16.261 17.729 19.418 21.44 24.099 26.256 27.418 28.153 28.617 28.95 29.149 29.251 29.321 29.363 29.381 29.376 29.338 29.289 29.244 29.191 29.123 29.053 28.981 28.902 28.812 28.744 28.677 28.596 28.528 28.45 28.371 28.294 28.196 28.127 28.061 27.946 27.859 27.761 27.712 27.616 27.504 27.386 27.331 27.218 27.153 27.088 27.01 26.813 26.703 26.592 26.458 26.286 26.072 25.816 24.987 -4 ,28225 ,KEBNE ,16657997,Tue Nov 23 06:52:17 CET,Tue Nov 23 08:15:30 CET,0.0 0.723 1.016 1.248 1.452 1.622 1.773 1.918 2.196 2.33 2.462 2.64 2.837 2.951 3.181 3.402 3.613 3.711 3.903 4.093 4.377 4.556 4.732 4.991 5.241 5.477 5.695 5.913 6.214 6.506 6.781 7.112 7.434 7.757 8.155 8.605 9.033 9.516 10.025 10.546 11.134 11.83 12.625 13.421 14.369 15.483 16.785 18.356 20.26 22.363 24.83 26.875 28.093 28.854 29.321 29.655 29.881 30.004 30.05 30.07 30.07 30.04 29.989 29.95 29.902 29.841 29.773 29.699 29.632 29.553 29.45 29.36 29.266 29.175 29.115 29.045 28.962 28.869 28.764 28.694 28.62 28.492 28.413 28.336 28.287 28.177 28.072 27.964 27.899 27.771 27.668 27.582 27.487 27.266 27.155 27.03 26.877 26.728 26.567 26.301 25.427 -5 ,18693 ,KEBNE ,16657998,Tue Nov 23 06:52:17 CET,Tue Nov 23 08:14:27 CET,0.0 0.564 0.831 1.051 1.219 1.378 1.551 1.699 1.943 2.069 2.192 2.348 2.55 2.666 2.88 3.087 3.29 3.388 3.582 3.771 4.059 4.244 4.407 4.647 4.896 5.14 5.376 5.591 5.862 6.148 6.436 6.783 7.127 7.471 7.884 8.348 8.77 9.223 9.739 10.289 10.846 11.511 12.312 13.141 14.129 15.193 16.383 17.791 19.552 21.633 24.218 26.43 27.662 28.414 28.904 29.244 29.486 29.604 29.656 29.688 29.68 29.635 29.582 29.547 29.513 29.471 29.407 29.332 29.265 29.191 29.099 29.02 28.941 28.854 28.771 28.692 28.61 28.511 28.404 28.329 28.259 28.138 28.043 27.944 27.893 27.786 27.682 27.564 27.501 27.383 27.27 27.17 27.075 26.908 26.815 26.693 26.56 26.41 26.207 25.98 25.569 -6 ,5108 ,KEBNE ,16657999,Tue Nov 23 06:52:17 CET,Tue Nov 23 08:15:52 CET,0.0 0.708 0.954 1.147 1.337 1.509 1.674 1.817 2.101 2.242 2.372 2.535 2.735 2.845 3.058 3.268 3.458 3.55 3.738 3.927 4.19 4.355 4.528 4.79 5.04 5.264 5.479 5.697 5.988 6.276 6.553 6.902 7.259 7.606 7.997 8.43 8.865 9.352 9.859 10.391 10.958 11.619 12.418 13.247 14.204 15.243 16.444 17.853 19.63 21.767 24.303 26.32 27.462 28.174 28.637 28.959 29.154 29.241 29.272 29.302 29.312 29.299 29.278 29.236 29.176 29.117 29.053 28.979 28.903 28.825 28.746 28.673 28.599 28.517 28.443 28.367 28.286 28.197 28.103 28.037 27.972 27.879 27.8 27.705 27.659 27.553 27.442 27.323 27.25 27.112 27.026 26.949 26.866 26.678 26.571 26.462 26.316 26.139 25.948 25.715 24.978 -7 ,3123 ,KEBNE ,16658000,Tue Nov 23 06:52:18 CET,Tue Nov 23 08:15:24 CET,0.0 0.545 0.872 1.12 1.317 1.485 1.652 1.801 2.052 2.176 2.296 2.462 2.666 2.784 2.992 3.195 3.403 3.502 3.704 3.902 4.184 4.357 4.525 4.777 5.023 5.264 5.487 5.709 6.011 6.312 6.618 6.973 7.315 7.652 8.026 8.464 8.896 9.39 9.934 10.47 11.018 11.645 12.421 13.251 14.239 15.36 16.671 18.198 20.075 22.226 24.746 26.894 28.104 28.842 29.282 29.543 29.749 29.909 29.986 30.017 30.025 30.019 29.991 29.932 29.866 29.817 29.762 29.696 29.633 29.561 29.48 29.407 29.331 29.264 29.216 29.148 29.064 28.98 28.899 28.834 28.752 28.626 28.544 28.449 28.4 28.301 28.18 28.037 27.972 27.852 27.778 27.709 27.626 27.418 27.309 27.21 27.085 26.897 26.67 26.352 25.415 -8 ,11982 ,KEBNE ,16658001,Tue Nov 23 06:52:18 CET,Tue Nov 23 08:15:19 CET,0.0 0.483 0.756 0.955 1.122 1.268 1.4 1.541 1.808 1.944 2.079 2.235 2.429 2.539 2.746 2.951 3.154 3.245 3.42 3.608 3.889 4.072 4.249 4.501 4.746 4.983 5.218 5.444 5.739 6.024 6.288 6.626 6.952 7.263 7.644 8.099 8.529 8.999 9.535 10.106 10.715 11.412 12.222 13.041 13.994 15.081 16.33 17.755 19.494 21.596 24.217 26.421 27.61 28.316 28.811 29.13 29.316 29.457 29.527 29.555 29.565 29.556 29.524 29.465 29.401 29.333 29.256 29.189 29.116 29.033 28.949 28.875 28.804 28.728 28.666 28.595 28.5 28.403 28.308 28.238 28.165 28.044 27.957 27.865 27.825 27.737 27.637 27.517 27.446 27.317 27.23 27.155 27.068 26.878 26.769 26.638 26.492 26.334 26.163 25.914 25.053 -9 ,26401 ,KEBNE ,16658002,Tue Nov 23 06:52:18 CET,Tue Nov 23 08:15:28 CET,0.0 0.473 0.766 0.992 1.167 1.33 1.487 1.634 1.932 2.079 2.215 2.376 2.571 2.682 2.898 3.116 3.33 3.436 3.642 3.832 4.093 4.258 4.419 4.658 4.909 5.155 5.382 5.61 5.898 6.175 6.454 6.793 7.129 7.461 7.84 8.273 8.683 9.132 9.637 10.195 10.812 11.503 12.317 13.174 14.181 15.29 16.545 17.984 19.749 21.828 24.276 26.359 27.528 28.26 28.732 28.994 29.173 29.327 29.401 29.421 29.429 29.413 29.385 29.343 29.272 29.183 29.098 29.026 28.947 28.858 28.782 28.721 28.637 28.55 28.465 28.378 28.307 28.217 28.112 28.039 27.968 27.864 27.783 27.689 27.643 27.541 27.432 27.315 27.246 27.113 27.016 26.942 26.856 26.649 26.544 26.426 26.279 26.108 25.907 25.647 25.011 -10 ,8333 ,KEBNE ,16658003,Tue Nov 23 06:52:18 CET,Tue Nov 23 08:15:28 CET,0.0 0.376 0.632 0.825 1.007 1.177 1.337 1.493 1.766 1.885 1.997 2.13 2.311 2.41 2.613 2.815 3.024 3.124 3.312 3.503 3.766 3.93 4.099 4.345 4.587 4.836 5.084 5.325 5.63 5.929 6.228 6.59 6.947 7.282 7.667 8.122 8.55 9.015 9.529 10.06 10.617 11.26 12.022 12.806 13.736 14.776 16.01 17.441 19.149 21.267 23.89 25.99 27.223 28.022 28.532 28.848 29.047 29.195 29.294 29.341 29.331 29.292 29.247 29.2 29.143 29.08 29.021 28.953 28.881 28.807 28.718 28.637 28.546 28.453 28.39 28.321 28.239 28.146 28.049 27.983 27.909 27.794 27.716 27.616 27.559 27.452 27.322 27.191 27.135 27.009 26.91 26.823 26.736 26.56 26.456 26.336 26.211 26.054 25.85 25.574 24.752 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_42.txt deleted file mode 100644 index ad17eac0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17732 ,KEBNE ,17023777,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:53:28 CET,0.0 0.661 0.959 1.199 1.407 1.592 1.759 1.913 2.211 2.357 2.49 2.654 2.85 2.968 3.203 3.416 3.616 3.712 3.884 4.068 4.345 4.507 4.657 4.873 5.084 5.301 5.502 5.677 5.91 6.139 6.363 6.636 6.917 7.202 7.5 7.786 8.069 8.388 8.735 9.121 9.5 9.913 10.414 10.917 11.515 12.172 12.887 13.66 14.501 15.416 16.4 17.091 17.332 17.375 17.357 17.253 17.109 16.951 16.812 16.679 16.555 16.416 16.256 16.098 15.951 15.805 15.625 15.473 15.357 15.216 15.066 14.955 14.83 14.699 14.604 14.487 14.348 14.213 14.071 13.966 13.873 13.715 13.601 13.494 13.432 13.306 13.178 13.044 12.974 12.827 12.756 12.662 12.558 12.364 12.246 12.089 11.925 11.757 11.546 11.29 10.65 -2 ,11637 ,KEBNE ,17023778,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:53:03 CET,0.0 0.718 1.093 1.38 1.625 1.84 2.035 2.199 2.482 2.618 2.752 2.949 3.155 3.274 3.497 3.693 3.893 3.995 4.179 4.345 4.579 4.73 4.896 5.146 5.382 5.592 5.79 5.99 6.24 6.483 6.728 7.009 7.255 7.488 7.758 8.054 8.347 8.685 9.028 9.367 9.741 10.208 10.739 11.201 11.735 12.359 13.097 13.896 14.763 15.705 16.732 17.346 17.532 17.576 17.553 17.486 17.377 17.234 17.085 16.94 16.819 16.683 16.532 16.393 16.247 16.108 15.977 15.859 15.751 15.609 15.451 15.325 15.18 15.04 14.939 14.813 14.688 14.564 14.424 14.332 14.239 14.103 14.004 13.889 13.831 13.705 13.564 13.417 13.341 13.187 13.089 12.997 12.898 12.681 12.565 12.441 12.282 12.105 11.935 11.707 11.2 -3 ,22335 ,KEBNE ,17023779,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:51:15 CET,0.0 0.664 1.03 1.301 1.509 1.703 1.872 2.041 2.361 2.505 2.635 2.821 3.034 3.147 3.352 3.552 3.74 3.826 3.998 4.171 4.414 4.566 4.725 4.956 5.176 5.392 5.601 5.805 6.071 6.321 6.534 6.799 7.071 7.317 7.605 7.933 8.228 8.53 8.86 9.211 9.56 9.957 10.424 10.891 11.458 12.091 12.773 13.533 14.406 15.329 16.312 16.995 17.296 17.414 17.424 17.371 17.265 17.123 16.965 16.788 16.618 16.458 16.313 16.187 16.061 15.917 15.756 15.611 15.48 15.338 15.192 15.064 14.911 14.76 14.658 14.557 14.443 14.289 14.128 14.032 13.92 13.752 13.639 13.517 13.451 13.311 13.179 13.035 12.954 12.804 12.724 12.637 12.535 12.31 12.189 12.06 11.926 11.784 11.611 11.39 10.855 -4 ,9143 ,KEBNE ,17023780,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:53:15 CET,0.0 0.689 1.032 1.292 1.52 1.722 1.887 2.035 2.312 2.445 2.577 2.76 2.964 3.079 3.316 3.53 3.729 3.823 3.994 4.16 4.404 4.552 4.702 4.941 5.161 5.367 5.569 5.759 6.006 6.253 6.496 6.802 7.069 7.307 7.579 7.873 8.164 8.513 8.903 9.325 9.759 10.189 10.66 11.15 11.732 12.349 13.039 13.772 14.6 15.559 16.596 17.305 17.583 17.657 17.63 17.529 17.376 17.224 17.073 16.907 16.762 16.613 16.468 16.335 16.203 16.071 15.914 15.777 15.666 15.54 15.386 15.253 15.138 15.013 14.904 14.792 14.676 14.556 14.416 14.308 14.198 14.034 13.921 13.79 13.721 13.586 13.443 13.306 13.235 13.082 12.998 12.913 12.81 12.569 12.436 12.313 12.185 12.051 11.886 11.598 11.008 -5 ,21133 ,KEBNE ,17023781,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:53:09 CET,0.0 0.709 0.996 1.232 1.457 1.643 1.796 1.942 2.211 2.327 2.445 2.6 2.8 2.92 3.15 3.357 3.541 3.634 3.805 3.96 4.193 4.342 4.497 4.714 4.917 5.116 5.307 5.491 5.739 5.987 6.22 6.49 6.751 6.998 7.273 7.596 7.907 8.277 8.658 8.998 9.363 9.797 10.313 10.822 11.407 12.026 12.73 13.51 14.381 15.38 16.447 17.101 17.353 17.408 17.365 17.267 17.155 17.028 16.895 16.721 16.533 16.392 16.25 16.094 15.962 15.826 15.673 15.544 15.425 15.303 15.166 15.049 14.937 14.804 14.702 14.598 14.476 14.345 14.2 14.096 13.994 13.829 13.714 13.601 13.54 13.403 13.266 13.119 13.033 12.864 12.732 12.62 12.504 12.288 12.176 12.054 11.922 11.768 11.596 11.377 10.592 -6 ,22730 ,KEBNE ,17023782,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:51:25 CET,0.0 0.693 1.07 1.338 1.542 1.735 1.912 2.08 2.393 2.522 2.646 2.809 3.0 3.103 3.308 3.522 3.724 3.82 4.005 4.179 4.447 4.622 4.787 5.029 5.249 5.463 5.668 5.866 6.132 6.363 6.591 6.873 7.123 7.368 7.656 7.993 8.317 8.656 9.01 9.383 9.767 10.19 10.701 11.202 11.754 12.351 13.02 13.748 14.58 15.542 16.608 17.333 17.666 17.779 17.765 17.677 17.558 17.42 17.278 17.134 16.987 16.836 16.699 16.562 16.427 16.302 16.143 15.987 15.863 15.747 15.625 15.511 15.382 15.259 15.171 15.066 14.943 14.82 14.695 14.605 14.518 14.377 14.27 14.17 14.111 13.985 13.857 13.693 13.609 13.46 13.38 13.292 13.194 12.986 12.878 12.747 12.59 12.424 12.214 11.93 11.19 -7 ,13118 ,KEBNE ,17023783,Wed Dec 22 08:26:15 CET,Wed Dec 22 09:53:21 CET,0.0 0.697 1.055 1.348 1.58 1.782 1.961 2.128 2.428 2.567 2.706 2.873 3.063 3.17 3.371 3.564 3.753 3.852 4.035 4.207 4.459 4.613 4.775 5.014 5.233 5.433 5.623 5.825 6.082 6.319 6.56 6.831 7.104 7.374 7.665 8.015 8.331 8.647 8.996 9.362 9.728 10.118 10.59 11.072 11.634 12.257 12.94 13.678 14.52 15.443 16.44 17.13 17.444 17.568 17.557 17.484 17.394 17.274 17.118 16.929 16.744 16.588 16.443 16.284 16.155 16.031 15.882 15.75 15.626 15.502 15.377 15.265 15.134 14.99 14.88 14.768 14.643 14.505 14.364 14.267 14.159 13.996 13.894 13.787 13.73 13.605 13.474 13.33 13.252 13.098 13.009 12.916 12.808 12.577 12.447 12.294 12.123 11.915 11.704 11.468 10.888 -8 ,20246 ,KEBNE ,17023784,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:53:12 CET,0.0 0.757 1.147 1.444 1.689 1.903 2.081 2.24 2.567 2.722 2.858 3.035 3.229 3.339 3.577 3.797 4.002 4.101 4.302 4.486 4.706 4.858 5.022 5.25 5.469 5.679 5.872 6.062 6.303 6.529 6.759 7.038 7.3 7.557 7.84 8.15 8.467 8.823 9.189 9.545 9.955 10.439 10.974 11.484 12.012 12.619 13.338 14.102 14.948 15.896 16.956 17.648 17.908 18.002 18.009 17.955 17.845 17.708 17.588 17.416 17.233 17.056 16.878 16.718 16.572 16.43 16.276 16.121 15.976 15.829 15.675 15.538 15.399 15.268 15.162 15.032 14.89 14.749 14.596 14.489 14.375 14.192 14.08 13.977 13.922 13.813 13.678 13.512 13.436 13.286 13.198 13.109 13.006 12.808 12.686 12.533 12.388 12.228 12.024 11.756 11.125 -9 ,30989 ,KEBNE ,17023785,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:52:53 CET,0.0 0.738 1.059 1.33 1.546 1.748 1.926 2.071 2.363 2.507 2.644 2.805 2.997 3.111 3.333 3.547 3.765 3.869 4.054 4.225 4.479 4.647 4.799 5.003 5.2 5.417 5.621 5.808 6.059 6.303 6.537 6.816 7.093 7.349 7.636 7.977 8.32 8.697 9.083 9.464 9.857 10.316 10.847 11.361 11.943 12.601 13.336 14.074 14.916 15.892 16.927 17.598 17.853 17.954 17.932 17.851 17.741 17.59 17.417 17.231 17.088 16.958 16.823 16.669 16.514 16.385 16.248 16.12 15.999 15.869 15.729 15.603 15.471 15.325 15.222 15.123 15.004 14.878 14.744 14.646 14.555 14.431 14.334 14.207 14.139 14.021 13.909 13.773 13.703 13.555 13.437 13.329 13.212 12.985 12.884 12.769 12.638 12.487 12.294 12.057 11.645 -10 ,20235 ,KEBNE ,17023786,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:53:02 CET,0.0 0.527 0.822 1.087 1.325 1.52 1.687 1.844 2.154 2.307 2.442 2.595 2.79 2.901 3.107 3.315 3.525 3.626 3.805 3.971 4.222 4.396 4.558 4.779 4.988 5.19 5.389 5.582 5.815 6.041 6.271 6.534 6.795 7.053 7.343 7.659 7.964 8.289 8.638 9.007 9.377 9.792 10.299 10.788 11.325 11.915 12.585 13.363 14.241 15.191 16.271 17.02 17.317 17.415 17.394 17.299 17.182 17.043 16.909 16.735 16.559 16.406 16.236 16.086 15.964 15.838 15.688 15.553 15.438 15.324 15.205 15.09 14.953 14.817 14.706 14.587 14.457 14.322 14.192 14.106 14.012 13.86 13.761 13.654 13.593 13.463 13.33 13.193 13.118 12.97 12.862 12.766 12.671 12.443 12.307 12.166 12.011 11.827 11.628 11.362 10.641 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_61.txt deleted file mode 100644 index 6f718fbf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_155_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12271 ,KEBNE ,16658004,Tue Nov 23 06:52:17 CET,Tue Nov 23 08:16:05 CET,0.0 0.71 0.954 1.152 1.328 1.504 1.651 1.764 1.983 2.096 2.202 2.309 2.472 2.546 2.682 2.814 2.945 3.012 3.134 3.249 3.423 3.533 3.64 3.79 3.918 4.041 4.164 4.295 4.467 4.611 4.752 4.904 5.056 5.224 5.405 5.579 5.753 5.958 6.171 6.389 6.593 6.805 7.061 7.341 7.621 7.866 8.145 8.404 8.636 8.79 8.643 8.214 7.73 7.23 6.734 6.24 5.828 5.456 5.112 4.752 4.397 4.074 3.805 3.548 3.307 3.095 2.868 2.664 2.491 2.305 2.109 1.937 1.751 1.581 1.436 1.288 1.146 0.985 0.797 0.665 0.543 0.343 0.203 0.065 -0.013 -0.181 -0.338 -0.49 -0.574 -0.754 -0.859 -0.967 -1.086 -1.342 -1.491 -1.654 -1.824 -1.998 -2.214 -2.52 -3.244 -2 ,12387 ,KEBNE ,16658005,Tue Nov 23 06:53:19 CET,Tue Nov 23 08:17:38 CET,0.0 0.754 1.034 1.243 1.459 1.648 1.817 1.967 2.178 2.276 2.376 2.481 2.647 2.729 2.88 3.029 3.16 3.219 3.337 3.448 3.606 3.715 3.826 3.98 4.112 4.241 4.375 4.501 4.658 4.796 4.937 5.123 5.293 5.438 5.594 5.769 5.944 6.126 6.293 6.467 6.69 6.96 7.238 7.495 7.765 8.006 8.243 8.463 8.67 8.814 8.701 8.335 7.891 7.428 7.017 6.637 6.256 5.851 5.489 5.129 4.824 4.543 4.261 3.991 3.729 3.488 3.248 3.036 2.836 2.623 2.392 2.195 2.006 1.809 1.658 1.501 1.329 1.152 0.976 0.852 0.729 0.54 0.39 0.225 0.147 0.005 -0.164 -0.353 -0.445 -0.629 -0.755 -0.852 -0.949 -1.161 -1.285 -1.436 -1.608 -1.802 -2.047 -2.369 -3.14 -3 ,13147 ,KEBNE ,16658006,Tue Nov 23 06:53:19 CET,Tue Nov 23 08:17:08 CET,0.0 1.044 1.319 1.523 1.702 1.848 1.979 2.109 2.338 2.445 2.544 2.638 2.789 2.856 2.995 3.135 3.269 3.332 3.462 3.59 3.778 3.898 3.998 4.148 4.299 4.429 4.548 4.66 4.807 4.948 5.093 5.26 5.407 5.563 5.758 5.981 6.171 6.36 6.572 6.792 7.015 7.258 7.516 7.759 8.001 8.214 8.465 8.732 8.951 9.057 8.911 8.477 7.939 7.388 6.898 6.457 6.029 5.639 5.291 4.924 4.632 4.362 4.063 3.783 3.536 3.299 3.054 2.855 2.673 2.487 2.316 2.158 1.997 1.829 1.683 1.526 1.355 1.182 1.005 0.886 0.761 0.575 0.439 0.275 0.197 0.053 -0.106 -0.273 -0.36 -0.539 -0.656 -0.758 -0.878 -1.142 -1.28 -1.437 -1.612 -1.814 -2.042 -2.317 -3.223 -4 ,5558 ,KEBNE ,16658007,Tue Nov 23 06:53:19 CET,Tue Nov 23 08:17:00 CET,0.0 0.609 0.88 1.092 1.258 1.422 1.571 1.716 1.994 2.106 2.201 2.293 2.457 2.537 2.683 2.817 2.939 2.992 3.111 3.232 3.39 3.485 3.58 3.726 3.868 3.994 4.116 4.234 4.381 4.525 4.659 4.835 5.003 5.146 5.314 5.499 5.668 5.86 6.07 6.283 6.473 6.697 6.971 7.202 7.481 7.775 8.034 8.259 8.435 8.505 8.326 7.902 7.42 6.94 6.485 6.027 5.582 5.186 4.858 4.514 4.177 3.872 3.607 3.362 3.124 2.907 2.685 2.471 2.277 2.077 1.87 1.712 1.539 1.339 1.177 1.011 0.849 0.681 0.515 0.396 0.257 0.041 -0.087 -0.224 -0.298 -0.456 -0.638 -0.833 -0.928 -1.103 -1.224 -1.33 -1.437 -1.666 -1.813 -1.977 -2.127 -2.306 -2.513 -2.765 -3.708 -5 ,22365 ,KEBNE ,16658008,Tue Nov 23 06:53:19 CET,Tue Nov 23 08:15:57 CET,0.0 1.718 2.047 2.251 2.406 2.531 2.648 2.77 2.998 3.101 3.201 3.287 3.459 3.547 3.687 3.836 3.985 4.058 4.194 4.314 4.477 4.579 4.673 4.814 4.948 5.083 5.223 5.358 5.527 5.683 5.822 5.978 6.123 6.262 6.433 6.616 6.769 6.934 7.119 7.335 7.581 7.836 8.088 8.322 8.591 8.874 9.142 9.372 9.572 9.683 9.572 9.122 8.607 8.118 7.675 7.268 6.87 6.472 6.131 5.783 5.469 5.186 4.916 4.66 4.409 4.164 3.926 3.734 3.548 3.332 3.132 2.978 2.803 2.624 2.474 2.313 2.155 1.981 1.797 1.68 1.571 1.386 1.237 1.083 1.008 0.857 0.697 0.536 0.45 0.278 0.163 0.053 -0.06 -0.316 -0.463 -0.629 -0.82 -1.031 -1.274 -1.66 -2.615 -6 ,3398 ,KEBNE ,16658009,Tue Nov 23 06:53:19 CET,Tue Nov 23 08:17:10 CET,0.0 0.631 0.976 1.196 1.361 1.481 1.587 1.696 1.903 2.008 2.101 2.184 2.355 2.442 2.597 2.74 2.874 2.933 3.045 3.169 3.337 3.446 3.562 3.714 3.861 4.002 4.126 4.242 4.403 4.563 4.695 4.837 4.988 5.144 5.312 5.49 5.673 5.862 6.049 6.254 6.443 6.636 6.849 7.067 7.325 7.581 7.861 8.114 8.333 8.509 8.446 8.009 7.49 6.949 6.419 5.951 5.55 5.181 4.846 4.496 4.194 3.923 3.651 3.389 3.162 2.952 2.704 2.473 2.292 2.12 1.938 1.774 1.604 1.435 1.283 1.116 0.949 0.765 0.581 0.45 0.306 0.089 -0.051 -0.196 -0.273 -0.433 -0.61 -0.788 -0.879 -1.059 -1.2 -1.323 -1.445 -1.721 -1.872 -2.022 -2.195 -2.377 -2.592 -2.897 -4.044 -7 ,14925 ,KEBNE ,16658010,Tue Nov 23 06:53:19 CET,Tue Nov 23 08:16:27 CET,0.0 0.933 1.227 1.419 1.57 1.716 1.865 1.991 2.203 2.288 2.367 2.453 2.625 2.715 2.874 3.019 3.161 3.224 3.34 3.461 3.636 3.75 3.851 3.979 4.114 4.249 4.379 4.502 4.655 4.82 4.98 5.144 5.299 5.452 5.618 5.793 5.967 6.158 6.348 6.538 6.736 6.942 7.153 7.344 7.559 7.812 8.067 8.295 8.487 8.61 8.524 8.121 7.622 7.132 6.676 6.233 5.835 5.446 5.091 4.728 4.42 4.149 3.894 3.641 3.383 3.151 2.928 2.73 2.55 2.353 2.135 1.956 1.788 1.629 1.491 1.332 1.168 0.994 0.82 0.709 0.602 0.428 0.296 0.155 0.077 -0.081 -0.236 -0.415 -0.509 -0.687 -0.811 -0.909 -1.019 -1.282 -1.426 -1.566 -1.718 -1.939 -2.224 -2.514 -3.113 -8 ,10322 ,KEBNE ,16658011,Tue Nov 23 06:53:19 CET,Tue Nov 23 08:17:53 CET,0.0 0.786 1.058 1.253 1.415 1.56 1.684 1.798 2.012 2.115 2.218 2.334 2.506 2.588 2.76 2.93 3.082 3.15 3.279 3.407 3.569 3.674 3.79 3.944 4.072 4.198 4.334 4.464 4.635 4.797 4.932 5.086 5.247 5.416 5.583 5.733 5.895 6.089 6.281 6.476 6.66 6.864 7.138 7.372 7.598 7.859 8.166 8.422 8.6 8.724 8.642 8.228 7.712 7.192 6.687 6.194 5.756 5.36 5.003 4.643 4.345 4.078 3.814 3.532 3.267 3.041 2.813 2.614 2.432 2.218 1.988 1.811 1.625 1.445 1.311 1.151 0.992 0.826 0.637 0.506 0.369 0.16 0.033 -0.101 -0.184 -0.357 -0.521 -0.68 -0.766 -0.945 -1.063 -1.162 -1.27 -1.514 -1.648 -1.795 -1.971 -2.198 -2.457 -2.795 -3.625 -9 ,2251 ,KEBNE ,16658012,Tue Nov 23 06:54:21 CET,Tue Nov 23 08:20:13 CET,0.0 0.589 0.872 1.1 1.283 1.442 1.578 1.703 1.93 2.024 2.122 2.247 2.416 2.495 2.648 2.79 2.921 2.994 3.13 3.245 3.402 3.492 3.586 3.731 3.866 3.997 4.115 4.239 4.416 4.565 4.687 4.852 5.012 5.15 5.303 5.478 5.649 5.843 6.03 6.219 6.443 6.675 6.946 7.212 7.456 7.693 7.963 8.227 8.437 8.486 8.307 7.85 7.326 6.82 6.357 5.881 5.451 5.082 4.763 4.419 4.101 3.816 3.539 3.28 3.039 2.802 2.554 2.352 2.16 1.941 1.727 1.554 1.359 1.159 1.011 0.852 0.679 0.507 0.335 0.208 0.079 -0.118 -0.262 -0.418 -0.498 -0.66 -0.845 -1.034 -1.131 -1.314 -1.446 -1.563 -1.676 -1.903 -2.035 -2.196 -2.359 -2.565 -2.813 -3.148 -3.936 -10 ,13434 ,KEBNE ,16658013,Tue Nov 23 06:54:21 CET,Tue Nov 23 08:19:49 CET,0.0 0.719 0.95 1.166 1.35 1.51 1.643 1.749 1.963 2.069 2.175 2.286 2.451 2.526 2.656 2.801 2.946 3.006 3.126 3.251 3.421 3.529 3.629 3.784 3.951 4.102 4.226 4.339 4.497 4.649 4.795 4.974 5.133 5.29 5.461 5.633 5.796 5.983 6.176 6.366 6.574 6.803 7.071 7.359 7.65 7.92 8.181 8.429 8.654 8.792 8.704 8.271 7.781 7.285 6.791 6.343 5.916 5.528 5.206 4.883 4.593 4.302 4.028 3.768 3.53 3.292 3.042 2.837 2.648 2.449 2.254 2.079 1.885 1.688 1.533 1.366 1.202 1.044 0.864 0.736 0.611 0.42 0.288 0.141 0.065 -0.086 -0.255 -0.44 -0.546 -0.742 -0.892 -1.012 -1.12 -1.357 -1.489 -1.627 -1.784 -1.966 -2.199 -2.535 -3.829 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_156_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_156_1.txt deleted file mode 100644 index 84d9f97f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_156_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10810 ,KEBNE ,16658014,Tue Nov 23 06:54:21 CET,Tue Nov 23 08:18:19 CET,0.0 0.481 0.746 0.955 1.111 1.252 1.396 1.518 1.728 1.83 1.936 2.032 2.179 2.263 2.418 2.561 2.699 2.77 2.896 3.011 3.17 3.271 3.368 3.501 3.645 3.781 3.899 4.022 4.164 4.283 4.404 4.55 4.691 4.836 5.015 5.207 5.364 5.516 5.674 5.838 6.02 6.221 6.442 6.654 6.871 7.07 7.272 7.471 7.64 7.698 7.472 6.953 6.357 5.79 5.281 4.808 4.394 3.999 3.661 3.317 3.005 2.725 2.454 2.183 1.933 1.712 1.462 1.228 1.03 0.837 0.626 0.449 0.283 0.107 -0.038 -0.186 -0.337 -0.5 -0.671 -0.791 -0.924 -1.133 -1.269 -1.407 -1.485 -1.646 -1.801 -1.945 -2.028 -2.195 -2.324 -2.426 -2.536 -2.806 -2.948 -3.081 -3.231 -3.394 -3.597 -3.861 -4.822 -2 ,732 ,KEBNE ,16658015,Tue Nov 23 06:54:21 CET,Tue Nov 23 08:17:47 CET,0.0 0.856 1.159 1.411 1.589 1.76 1.926 2.05 2.293 2.395 2.48 2.617 2.781 2.851 2.991 3.137 3.274 3.344 3.482 3.615 3.801 3.895 3.986 4.13 4.257 4.379 4.495 4.611 4.776 4.923 5.057 5.235 5.39 5.524 5.691 5.89 6.082 6.277 6.471 6.654 6.835 7.062 7.34 7.569 7.781 7.972 8.164 8.362 8.508 8.538 8.294 7.724 7.154 6.577 6.034 5.567 5.137 4.714 4.36 4.031 3.733 3.447 3.173 2.906 2.641 2.394 2.152 1.948 1.765 1.569 1.35 1.169 0.994 0.81 0.66 0.493 0.332 0.173 -0.02 -0.163 -0.288 -0.464 -0.593 -0.725 -0.798 -0.954 -1.113 -1.281 -1.371 -1.54 -1.66 -1.761 -1.878 -2.155 -2.289 -2.423 -2.576 -2.763 -3.036 -3.374 -4.501 -3 ,20732 ,KEBNE ,16658016,Tue Nov 23 06:54:21 CET,Tue Nov 23 08:18:16 CET,0.0 0.638 0.912 1.127 1.262 1.36 1.482 1.612 1.813 1.901 1.988 2.091 2.249 2.337 2.5 2.636 2.761 2.827 2.958 3.073 3.228 3.337 3.431 3.566 3.702 3.829 3.948 4.057 4.204 4.338 4.459 4.616 4.779 4.927 5.079 5.265 5.427 5.574 5.76 5.966 6.159 6.358 6.571 6.766 6.983 7.207 7.391 7.533 7.67 7.701 7.459 6.911 6.335 5.807 5.319 4.851 4.428 4.048 3.718 3.347 3.038 2.758 2.463 2.213 1.976 1.761 1.538 1.305 1.11 0.919 0.702 0.52 0.34 0.15 0.004 -0.147 -0.295 -0.458 -0.647 -0.778 -0.91 -1.12 -1.265 -1.406 -1.481 -1.648 -1.826 -2.01 -2.099 -2.259 -2.369 -2.482 -2.607 -2.838 -2.955 -3.106 -3.289 -3.488 -3.735 -4.102 -5.052 -4 ,5499 ,KEBNE ,16658017,Tue Nov 23 06:55:22 CET,Tue Nov 23 08:18:34 CET,0.0 0.878 1.192 1.435 1.625 1.78 1.897 2.002 2.192 2.276 2.364 2.465 2.618 2.691 2.821 2.952 3.072 3.13 3.257 3.384 3.559 3.664 3.759 3.908 4.051 4.173 4.291 4.404 4.543 4.678 4.812 4.982 5.143 5.28 5.423 5.582 5.755 5.935 6.11 6.292 6.475 6.662 6.876 7.07 7.26 7.49 7.716 7.87 7.955 7.956 7.726 7.18 6.559 5.959 5.481 5.026 4.58 4.162 3.803 3.445 3.113 2.815 2.546 2.296 2.067 1.86 1.64 1.419 1.213 1.018 0.814 0.63 0.438 0.246 0.101 -0.058 -0.231 -0.398 -0.587 -0.717 -0.839 -1.041 -1.175 -1.307 -1.374 -1.521 -1.677 -1.851 -1.949 -2.113 -2.232 -2.341 -2.449 -2.684 -2.816 -2.964 -3.122 -3.295 -3.494 -3.785 -4.822 -5 ,12415 ,KEBNE ,16658018,Tue Nov 23 06:55:22 CET,Tue Nov 23 08:18:39 CET,0.0 0.708 1.038 1.283 1.486 1.659 1.808 1.932 2.184 2.314 2.416 2.514 2.679 2.768 2.933 3.082 3.225 3.298 3.43 3.549 3.742 3.854 3.962 4.126 4.278 4.42 4.549 4.666 4.816 4.975 5.11 5.258 5.409 5.558 5.719 5.892 6.055 6.219 6.38 6.559 6.756 6.957 7.189 7.424 7.653 7.85 8.038 8.211 8.348 8.388 8.202 7.663 7.067 6.528 6.016 5.526 5.082 4.69 4.359 4.017 3.722 3.44 3.156 2.911 2.683 2.464 2.239 2.042 1.861 1.671 1.478 1.311 1.142 0.965 0.825 0.685 0.533 0.361 0.187 0.077 -0.044 -0.246 -0.381 -0.519 -0.593 -0.746 -0.896 -1.07 -1.162 -1.328 -1.438 -1.529 -1.63 -1.874 -2.008 -2.171 -2.339 -2.502 -2.692 -2.947 -3.587 -6 ,14987 ,KEBNE ,16658019,Tue Nov 23 06:56:24 CET,Tue Nov 23 08:20:54 CET,0.0 1.034 1.28 1.5 1.698 1.867 1.989 2.094 2.311 2.417 2.524 2.656 2.809 2.886 3.021 3.15 3.293 3.364 3.49 3.611 3.805 3.934 4.049 4.2 4.348 4.486 4.611 4.728 4.874 5.012 5.14 5.309 5.474 5.623 5.795 5.979 6.144 6.318 6.5 6.696 6.902 7.122 7.345 7.548 7.771 7.977 8.192 8.374 8.498 8.54 8.286 7.776 7.253 6.677 6.131 5.676 5.277 4.9 4.562 4.204 3.908 3.643 3.368 3.118 2.898 2.683 2.43 2.198 1.998 1.786 1.583 1.428 1.25 1.065 0.941 0.806 0.656 0.5 0.308 0.165 0.035 -0.145 -0.284 -0.425 -0.493 -0.643 -0.794 -0.958 -1.05 -1.224 -1.349 -1.455 -1.566 -1.817 -1.965 -2.14 -2.342 -2.557 -2.798 -3.034 -3.66 -7 ,19788 ,KEBNE ,16658020,Tue Nov 23 06:57:25 CET,Tue Nov 23 08:22:50 CET,0.0 0.777 1.136 1.415 1.615 1.786 1.933 2.067 2.314 2.404 2.494 2.6 2.749 2.831 2.978 3.127 3.281 3.351 3.481 3.613 3.794 3.895 3.995 4.135 4.255 4.377 4.493 4.61 4.783 4.939 5.065 5.205 5.36 5.525 5.712 5.909 6.081 6.252 6.435 6.636 6.831 7.026 7.22 7.432 7.656 7.855 8.066 8.264 8.439 8.505 8.308 7.791 7.211 6.62 6.071 5.562 5.114 4.728 4.394 4.044 3.735 3.445 3.149 2.88 2.632 2.403 2.169 1.951 1.759 1.567 1.363 1.185 0.995 0.796 0.633 0.47 0.308 0.145 -0.031 -0.158 -0.291 -0.501 -0.63 -0.773 -0.846 -0.991 -1.153 -1.329 -1.417 -1.574 -1.696 -1.799 -1.902 -2.158 -2.301 -2.446 -2.584 -2.753 -3.014 -3.327 -4.122 -8 ,22204 ,KEBNE ,16658021,Tue Nov 23 06:57:25 CET,Tue Nov 23 08:22:23 CET,0.0 0.888 1.175 1.344 1.489 1.652 1.801 1.917 2.139 2.241 2.339 2.434 2.58 2.662 2.806 2.928 3.063 3.133 3.259 3.386 3.571 3.682 3.787 3.933 4.076 4.225 4.353 4.463 4.61 4.766 4.913 5.075 5.248 5.399 5.549 5.732 5.903 6.088 6.269 6.441 6.642 6.862 7.072 7.281 7.531 7.769 7.976 8.14 8.25 8.278 8.085 7.584 7.087 6.57 6.054 5.576 5.111 4.694 4.344 3.967 3.652 3.395 3.138 2.856 2.586 2.364 2.133 1.924 1.747 1.564 1.379 1.221 1.059 0.883 0.743 0.597 0.44 0.27 0.098 -0.022 -0.148 -0.344 -0.475 -0.611 -0.686 -0.85 -1.022 -1.177 -1.253 -1.414 -1.552 -1.665 -1.77 -1.98 -2.09 -2.238 -2.413 -2.588 -2.851 -3.233 -4.364 -9 ,14156 ,KEBNE ,16658022,Tue Nov 23 07:00:30 CET,Tue Nov 23 08:23:46 CET,0.0 1.042 1.362 1.602 1.788 1.96 2.129 2.273 2.479 2.571 2.663 2.76 2.906 2.979 3.126 3.273 3.413 3.48 3.61 3.734 3.911 4.017 4.116 4.251 4.382 4.523 4.657 4.775 4.934 5.074 5.212 5.392 5.542 5.67 5.823 6.005 6.171 6.351 6.525 6.697 6.872 7.047 7.229 7.408 7.614 7.815 8.033 8.225 8.362 8.364 8.068 7.53 6.938 6.336 5.779 5.271 4.837 4.447 4.084 3.714 3.399 3.111 2.822 2.552 2.319 2.096 1.845 1.605 1.41 1.222 1.023 0.862 0.694 0.513 0.373 0.23 0.07 -0.109 -0.279 -0.389 -0.503 -0.68 -0.808 -0.939 -1.011 -1.175 -1.333 -1.487 -1.572 -1.736 -1.888 -2.01 -2.113 -2.318 -2.449 -2.602 -2.758 -2.934 -3.179 -3.561 -4.289 -10 ,2847 ,KEBNE ,16658023,Tue Nov 23 07:00:30 CET,Tue Nov 23 08:25:02 CET,0.0 0.914 1.219 1.444 1.61 1.768 1.933 2.053 2.267 2.37 2.458 2.553 2.705 2.783 2.935 3.074 3.194 3.258 3.397 3.524 3.69 3.792 3.899 4.037 4.162 4.291 4.411 4.537 4.685 4.821 4.964 5.138 5.293 5.436 5.62 5.804 5.946 6.121 6.303 6.472 6.652 6.854 7.083 7.309 7.544 7.749 7.934 8.113 8.313 8.405 8.157 7.601 7.039 6.49 6.005 5.539 5.061 4.622 4.262 3.872 3.529 3.256 2.996 2.725 2.455 2.223 1.982 1.768 1.585 1.393 1.186 1.019 0.869 0.691 0.531 0.371 0.209 0.033 -0.145 -0.253 -0.373 -0.585 -0.731 -0.871 -0.941 -1.089 -1.255 -1.436 -1.529 -1.695 -1.819 -1.922 -2.025 -2.264 -2.392 -2.518 -2.663 -2.849 -3.095 -3.373 -4.17 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_156_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_156_31.txt deleted file mode 100644 index aebf9d9f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_156_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14450 ,KEBNE ,16658024,Tue Nov 23 07:00:30 CET,Tue Nov 23 08:24:59 CET,0.0 0.624 0.985 1.294 1.542 1.742 1.938 2.115 2.438 2.596 2.757 2.993 3.213 3.375 3.688 3.983 4.253 4.381 4.621 4.845 5.183 5.405 5.618 5.924 6.222 6.523 6.82 7.12 7.514 7.88 8.246 8.704 9.141 9.567 10.079 10.665 11.234 11.861 12.543 13.283 14.084 15.021 16.136 17.275 18.646 20.245 22.148 24.349 27.151 30.66 35.129 39.242 41.95 43.802 45.099 46.088 46.842 47.45 47.909 48.294 48.579 48.82 49.033 49.215 49.363 49.474 49.574 49.658 49.715 49.767 49.817 49.843 49.855 49.856 49.85 49.841 49.832 49.817 49.797 49.783 49.75 49.687 49.641 49.586 49.563 49.507 49.428 49.328 49.271 49.195 49.129 49.071 49.004 48.867 48.783 48.693 48.562 48.392 48.2 47.94 47.244 -2 ,2391 ,KEBNE ,16658025,Tue Nov 23 07:00:31 CET,Tue Nov 23 08:24:57 CET,0.0 0.644 1.033 1.346 1.598 1.795 1.984 2.165 2.51 2.676 2.836 3.057 3.265 3.398 3.661 3.918 4.172 4.3 4.552 4.798 5.149 5.369 5.583 5.892 6.187 6.477 6.775 7.078 7.469 7.834 8.185 8.625 9.059 9.486 9.998 10.579 11.143 11.763 12.439 13.186 13.996 14.931 16.057 17.219 18.6 20.225 22.164 24.39 27.121 30.555 35.15 39.389 42.109 43.951 45.302 46.347 47.122 47.736 48.2 48.609 48.919 49.176 49.382 49.541 49.687 49.81 49.926 50.007 50.064 50.116 50.148 50.159 50.175 50.179 50.171 50.173 50.171 50.153 50.135 50.12 50.095 50.051 50.013 49.976 49.96 49.925 49.881 49.809 49.766 49.699 49.618 49.56 49.487 49.321 49.237 49.147 49.04 48.894 48.747 48.522 47.812 -3 ,20876 ,KEBNE ,16658026,Tue Nov 23 07:00:30 CET,Tue Nov 23 08:26:17 CET,0.0 0.664 0.962 1.203 1.41 1.627 1.83 2.01 2.345 2.502 2.659 2.891 3.106 3.24 3.503 3.762 4.003 4.129 4.378 4.609 4.949 5.163 5.371 5.685 5.992 6.295 6.591 6.888 7.287 7.668 8.029 8.474 8.914 9.343 9.849 10.421 10.995 11.647 12.353 13.102 13.914 14.855 15.988 17.146 18.517 20.171 22.153 24.49 27.359 30.845 35.341 39.268 41.846 43.733 45.064 46.054 46.839 47.457 47.921 48.338 48.645 48.893 49.104 49.262 49.377 49.483 49.593 49.658 49.712 49.764 49.793 49.81 49.828 49.839 49.836 49.824 49.817 49.811 49.787 49.757 49.727 49.673 49.62 49.571 49.551 49.487 49.42 49.349 49.297 49.221 49.155 49.094 49.021 48.87 48.791 48.716 48.625 48.483 48.297 48.031 47.035 -4 ,7351 ,KEBNE ,16658027,Tue Nov 23 07:01:32 CET,Tue Nov 23 08:23:39 CET,0.0 0.47 0.776 1.026 1.254 1.473 1.685 1.876 2.23 2.394 2.546 2.781 3.0 3.136 3.397 3.654 3.899 4.022 4.269 4.513 4.857 5.073 5.289 5.61 5.926 6.238 6.54 6.837 7.217 7.595 7.966 8.408 8.849 9.287 9.806 10.399 10.983 11.643 12.358 13.115 13.922 14.889 16.052 17.21 18.608 20.205 22.099 24.336 27.128 30.657 35.268 39.382 42.011 43.897 45.215 46.19 46.939 47.534 47.998 48.401 48.69 48.927 49.136 49.303 49.438 49.552 49.648 49.725 49.778 49.818 49.85 49.868 49.888 49.908 49.916 49.903 49.885 49.875 49.864 49.841 49.816 49.797 49.779 49.737 49.712 49.65 49.583 49.51 49.462 49.382 49.278 49.216 49.156 49.003 48.893 48.787 48.672 48.52 48.335 48.08 47.556 -5 ,5644 ,KEBNE ,16658028,Tue Nov 23 07:02:34 CET,Tue Nov 23 08:27:14 CET,0.0 0.725 1.077 1.34 1.581 1.812 2.028 2.23 2.571 2.721 2.866 3.084 3.303 3.449 3.715 3.961 4.205 4.323 4.574 4.822 5.168 5.391 5.6 5.915 6.222 6.503 6.785 7.071 7.443 7.813 8.174 8.615 9.054 9.485 10.001 10.595 11.172 11.809 12.506 13.27 14.095 15.041 16.188 17.38 18.766 20.384 22.339 24.612 27.392 30.812 35.273 39.314 41.891 43.709 45.102 46.135 46.892 47.509 47.96 48.351 48.629 48.822 48.995 49.148 49.269 49.358 49.446 49.524 49.589 49.649 49.703 49.727 49.739 49.75 49.749 49.741 49.727 49.707 49.687 49.676 49.646 49.581 49.538 49.491 49.469 49.413 49.344 49.286 49.253 49.188 49.109 49.045 48.973 48.819 48.734 48.656 48.572 48.453 48.279 47.97 47.106 -6 ,26250 ,KEBNE ,16658029,Tue Nov 23 07:03:35 CET,Tue Nov 23 08:26:10 CET,0.0 0.659 0.98 1.241 1.459 1.686 1.92 2.124 2.5 2.681 2.851 3.087 3.295 3.423 3.685 3.95 4.196 4.316 4.554 4.787 5.144 5.375 5.598 5.918 6.235 6.538 6.825 7.112 7.486 7.851 8.209 8.65 9.096 9.55 10.068 10.632 11.181 11.8 12.483 13.21 14.008 14.957 16.09 17.257 18.668 20.294 22.207 24.488 27.276 30.74 35.261 39.424 42.112 43.933 45.268 46.306 47.075 47.67 48.119 48.495 48.783 49.018 49.209 49.36 49.486 49.576 49.672 49.763 49.821 49.862 49.882 49.893 49.905 49.906 49.892 49.877 49.862 49.848 49.834 49.822 49.809 49.772 49.735 49.693 49.668 49.621 49.575 49.498 49.452 49.38 49.292 49.227 49.159 49.018 48.927 48.806 48.675 48.524 48.316 47.994 47.092 -7 ,20546 ,KEBNE ,16658030,Tue Nov 23 07:02:34 CET,Tue Nov 23 08:23:59 CET,0.0 0.533 0.79 0.992 1.19 1.391 1.59 1.775 2.12 2.28 2.434 2.663 2.872 3.01 3.295 3.569 3.833 3.954 4.186 4.42 4.769 4.997 5.211 5.521 5.833 6.149 6.455 6.753 7.152 7.535 7.906 8.364 8.819 9.272 9.786 10.361 10.937 11.577 12.292 13.081 13.922 14.884 16.013 17.176 18.59 20.207 22.122 24.378 27.201 30.777 35.459 39.713 42.4 44.21 45.476 46.48 47.243 47.846 48.328 48.742 49.048 49.276 49.462 49.638 49.78 49.889 49.977 50.046 50.1 50.133 50.163 50.176 50.185 50.208 50.217 50.206 50.185 50.167 50.135 50.108 50.083 50.035 49.992 49.94 49.913 49.859 49.811 49.759 49.708 49.626 49.543 49.485 49.419 49.269 49.184 49.085 48.986 48.87 48.716 48.486 47.986 -8 ,18405 ,KEBNE ,16658031,Tue Nov 23 07:02:34 CET,Tue Nov 23 08:23:52 CET,0.0 0.635 0.977 1.289 1.518 1.725 1.927 2.118 2.477 2.635 2.787 3.01 3.218 3.352 3.607 3.856 4.093 4.208 4.439 4.66 4.984 5.197 5.415 5.737 6.061 6.371 6.661 6.96 7.349 7.733 8.106 8.563 9.014 9.449 9.96 10.535 11.104 11.751 12.451 13.199 13.988 14.894 16.025 17.208 18.581 20.158 22.069 24.337 27.109 30.604 35.179 39.291 41.964 43.872 45.264 46.28 47.043 47.624 48.054 48.45 48.766 49.01 49.206 49.353 49.467 49.568 49.671 49.744 49.79 49.844 49.886 49.901 49.922 49.939 49.937 49.93 49.921 49.899 49.87 49.846 49.823 49.79 49.756 49.717 49.693 49.636 49.577 49.496 49.453 49.389 49.33 49.277 49.22 49.073 48.983 48.884 48.743 48.583 48.397 48.153 47.215 -9 ,3491 ,KEBNE ,16658032,Tue Nov 23 07:02:34 CET,Tue Nov 23 08:24:04 CET,0.0 0.819 1.121 1.376 1.607 1.802 1.988 2.172 2.505 2.674 2.846 3.092 3.323 3.482 3.773 4.053 4.327 4.457 4.693 4.923 5.267 5.492 5.706 6.023 6.336 6.629 6.91 7.191 7.571 7.949 8.316 8.753 9.174 9.603 10.117 10.699 11.273 11.912 12.612 13.378 14.198 15.14 16.284 17.441 18.806 20.409 22.31 24.571 27.372 30.814 35.353 39.508 42.211 44.096 45.457 46.48 47.231 47.81 48.238 48.614 48.919 49.161 49.348 49.509 49.641 49.732 49.828 49.923 49.988 50.03 50.069 50.105 50.124 50.133 50.134 50.131 50.129 50.119 50.103 50.087 50.068 50.029 49.988 49.94 49.911 49.845 49.774 49.705 49.661 49.582 49.483 49.419 49.356 49.217 49.149 49.079 48.964 48.808 48.636 48.434 47.725 -10 ,24941 ,KEBNE ,16658033,Tue Nov 23 07:02:34 CET,Tue Nov 23 08:28:26 CET,0.0 0.626 0.988 1.309 1.565 1.773 1.96 2.134 2.472 2.626 2.764 2.984 3.199 3.336 3.613 3.875 4.125 4.244 4.477 4.71 5.064 5.3 5.516 5.83 6.146 6.452 6.754 7.044 7.423 7.804 8.172 8.611 9.05 9.473 9.979 10.581 11.166 11.81 12.525 13.297 14.136 15.121 16.279 17.463 18.879 20.499 22.418 24.67 27.433 30.864 35.31 39.38 42.056 43.909 45.218 46.229 47.007 47.623 48.092 48.494 48.785 49.021 49.234 49.408 49.544 49.658 49.753 49.827 49.892 49.941 49.977 49.999 50.01 50.012 50.005 49.992 49.974 49.965 49.951 49.926 49.894 49.836 49.797 49.762 49.741 49.695 49.635 49.571 49.532 49.456 49.372 49.313 49.249 49.101 49.01 48.911 48.783 48.637 48.461 48.168 47.502 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_15_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_15_163.txt deleted file mode 100644 index bd90b50c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_15_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11190 ,KEBNE ,16658034,Tue Nov 23 07:03:35 CET,Tue Nov 23 08:26:16 CET,0.0 0.417 0.614 0.75 0.878 1.002 1.12 1.222 1.37 1.441 1.511 1.544 1.691 1.742 1.827 1.922 2.0 2.036 2.115 2.179 2.261 2.315 2.361 2.436 2.51 2.564 2.608 2.642 2.678 2.722 2.762 2.804 2.855 2.904 2.95 2.98 3.001 3.004 2.99 2.959 2.913 2.841 2.727 2.583 2.377 2.076 1.644 1.053 0.205 -1.079 -3.247 -5.721 -7.623 -9.161 -10.451 -11.58 -12.575 -13.463 -14.176 -14.88 -15.492 -15.994 -16.461 -16.909 -17.322 -17.69 -18.064 -18.406 -18.702 -19.005 -19.315 -19.568 -19.827 -20.098 -20.305 -20.524 -20.745 -20.972 -21.21 -21.365 -21.532 -21.786 -21.961 -22.153 -22.25 -22.441 -22.642 -22.853 -22.957 -23.179 -23.328 -23.464 -23.609 -23.91 -24.056 -24.218 -24.414 -24.632 -24.889 -25.216 -25.979 -2 ,32569 ,KEBNE ,16658035,Tue Nov 23 07:04:37 CET,Tue Nov 23 08:27:49 CET,0.0 0.454 0.609 0.728 0.833 0.938 1.026 1.116 1.278 1.348 1.408 1.428 1.564 1.611 1.694 1.781 1.866 1.901 1.975 2.041 2.123 2.181 2.23 2.288 2.342 2.402 2.451 2.493 2.551 2.586 2.618 2.662 2.699 2.749 2.796 2.805 2.802 2.816 2.817 2.775 2.713 2.636 2.546 2.412 2.179 1.875 1.446 0.846 -0.009 -1.305 -3.442 -5.935 -7.905 -9.475 -10.734 -11.843 -12.827 -13.704 -14.445 -15.139 -15.725 -16.262 -16.763 -17.22 -17.639 -18.008 -18.379 -18.714 -19.029 -19.356 -19.675 -19.946 -20.226 -20.493 -20.687 -20.891 -21.11 -21.325 -21.546 -21.715 -21.89 -22.153 -22.327 -22.492 -22.584 -22.782 -22.972 -23.179 -23.293 -23.517 -23.653 -23.786 -23.913 -24.177 -24.312 -24.454 -24.617 -24.819 -25.037 -25.332 -25.925 -3 ,4408 ,KEBNE ,16658036,Tue Nov 23 07:04:37 CET,Tue Nov 23 08:32:49 CET,0.0 0.567 0.796 0.971 1.091 1.18 1.27 1.349 1.493 1.562 1.629 1.658 1.795 1.844 1.918 1.996 2.077 2.114 2.194 2.261 2.332 2.37 2.418 2.505 2.57 2.615 2.662 2.695 2.735 2.773 2.796 2.82 2.843 2.866 2.886 2.888 2.888 2.893 2.902 2.886 2.859 2.802 2.677 2.531 2.314 2.049 1.649 1.041 0.181 -1.097 -3.17 -5.597 -7.541 -9.124 -10.424 -11.532 -12.487 -13.319 -14.015 -14.724 -15.325 -15.841 -16.309 -16.741 -17.151 -17.515 -17.885 -18.231 -18.537 -18.843 -19.164 -19.445 -19.746 -20.04 -20.244 -20.45 -20.678 -20.917 -21.156 -21.304 -21.456 -21.704 -21.886 -22.076 -22.172 -22.379 -22.586 -22.791 -22.894 -23.117 -23.245 -23.365 -23.486 -23.757 -23.914 -24.083 -24.258 -24.457 -24.686 -24.95 -25.375 -4 ,32479 ,KEBNE ,16658037,Tue Nov 23 07:05:38 CET,Tue Nov 23 08:29:15 CET,0.0 0.415 0.618 0.735 0.847 0.962 1.049 1.127 1.274 1.342 1.414 1.458 1.604 1.659 1.74 1.819 1.914 1.966 2.047 2.108 2.197 2.25 2.306 2.378 2.436 2.495 2.55 2.589 2.623 2.657 2.695 2.742 2.771 2.81 2.855 2.858 2.855 2.85 2.829 2.811 2.797 2.732 2.601 2.457 2.256 1.964 1.568 1.026 0.178 -1.158 -3.357 -5.884 -7.848 -9.437 -10.775 -11.899 -12.848 -13.72 -14.461 -15.163 -15.731 -16.228 -16.724 -17.198 -17.63 -17.996 -18.376 -18.722 -19.014 -19.315 -19.628 -19.885 -20.156 -20.438 -20.648 -20.867 -21.095 -21.319 -21.535 -21.69 -21.86 -22.125 -22.305 -22.491 -22.593 -22.796 -22.998 -23.212 -23.317 -23.532 -23.659 -23.785 -23.918 -24.213 -24.371 -24.534 -24.694 -24.852 -25.064 -25.37 -26.307 -5 ,15926 ,KEBNE ,16658038,Tue Nov 23 07:05:39 CET,Tue Nov 23 08:29:18 CET,0.0 0.439 0.621 0.739 0.842 0.96 1.062 1.141 1.285 1.344 1.399 1.42 1.549 1.584 1.656 1.733 1.804 1.837 1.903 1.968 2.048 2.101 2.155 2.239 2.309 2.354 2.4 2.463 2.548 2.607 2.657 2.701 2.729 2.755 2.787 2.815 2.812 2.803 2.787 2.763 2.731 2.655 2.526 2.365 2.135 1.832 1.399 0.779 -0.083 -1.324 -3.338 -5.737 -7.659 -9.267 -10.622 -11.743 -12.706 -13.587 -14.309 -14.985 -15.56 -16.076 -16.555 -17.005 -17.411 -17.768 -18.151 -18.482 -18.763 -19.058 -19.366 -19.626 -19.879 -20.134 -20.344 -20.555 -20.765 -20.99 -21.213 -21.363 -21.519 -21.744 -21.905 -22.081 -22.173 -22.362 -22.561 -22.773 -22.877 -23.1 -23.243 -23.365 -23.488 -23.78 -23.927 -24.072 -24.25 -24.45 -24.673 -24.931 -25.533 -6 ,14321 ,KEBNE ,16658039,Tue Nov 23 07:06:40 CET,Tue Nov 23 08:36:07 CET,0.0 0.431 0.608 0.756 0.865 0.959 1.053 1.147 1.297 1.366 1.425 1.451 1.596 1.652 1.75 1.838 1.918 1.957 2.032 2.096 2.164 2.207 2.26 2.339 2.397 2.442 2.484 2.524 2.574 2.635 2.688 2.731 2.764 2.788 2.81 2.834 2.855 2.856 2.838 2.805 2.758 2.68 2.551 2.363 2.131 1.87 1.465 0.857 -0.051 -1.401 -3.534 -5.95 -7.859 -9.443 -10.782 -11.966 -12.932 -13.746 -14.439 -15.123 -15.699 -16.206 -16.705 -17.174 -17.582 -17.957 -18.352 -18.693 -18.984 -19.292 -19.601 -19.845 -20.094 -20.359 -20.57 -20.784 -20.995 -21.213 -21.454 -21.61 -21.762 -22.002 -22.177 -22.365 -22.457 -22.657 -22.866 -23.074 -23.184 -23.404 -23.52 -23.638 -23.77 -24.063 -24.218 -24.379 -24.528 -24.69 -24.919 -25.187 -25.639 -7 ,24392 ,KEBNE ,16658040,Tue Nov 23 07:06:40 CET,Tue Nov 23 08:35:44 CET,0.0 0.352 0.532 0.687 0.817 0.942 1.046 1.126 1.271 1.342 1.402 1.436 1.586 1.637 1.731 1.821 1.898 1.941 2.022 2.083 2.171 2.226 2.266 2.322 2.376 2.43 2.483 2.531 2.583 2.627 2.676 2.71 2.733 2.763 2.801 2.846 2.869 2.866 2.857 2.842 2.811 2.736 2.611 2.46 2.212 1.867 1.425 0.834 -0.044 -1.381 -3.502 -5.909 -7.835 -9.427 -10.728 -11.822 -12.76 -13.58 -14.268 -14.946 -15.533 -16.058 -16.536 -16.98 -17.391 -17.769 -18.153 -18.475 -18.756 -19.055 -19.369 -19.624 -19.881 -20.143 -20.345 -20.55 -20.767 -20.997 -21.223 -21.375 -21.531 -21.783 -21.958 -22.139 -22.23 -22.408 -22.614 -22.84 -22.955 -23.173 -23.281 -23.393 -23.516 -23.814 -23.97 -24.139 -24.341 -24.577 -24.824 -25.056 -25.742 -8 ,11773 ,KEBNE ,16658041,Tue Nov 23 07:06:40 CET,Tue Nov 23 08:33:19 CET,0.0 0.363 0.545 0.7 0.817 0.911 0.997 1.072 1.234 1.323 1.4 1.424 1.554 1.6 1.7 1.786 1.854 1.889 1.962 2.03 2.122 2.168 2.208 2.263 2.31 2.365 2.421 2.475 2.544 2.587 2.604 2.629 2.678 2.714 2.728 2.743 2.757 2.771 2.761 2.737 2.699 2.644 2.547 2.409 2.214 1.931 1.478 0.836 -0.029 -1.307 -3.475 -5.968 -7.869 -9.481 -10.84 -11.984 -12.93 -13.761 -14.467 -15.146 -15.718 -16.238 -16.741 -17.219 -17.655 -18.05 -18.464 -18.81 -19.104 -19.403 -19.7 -19.937 -20.188 -20.46 -20.67 -20.877 -21.09 -21.319 -21.555 -21.713 -21.864 -22.103 -22.281 -22.472 -22.569 -22.772 -22.998 -23.209 -23.316 -23.547 -23.688 -23.826 -23.958 -24.239 -24.409 -24.576 -24.757 -24.965 -25.196 -25.506 -26.133 -9 ,23632 ,KEBNE ,16658042,Tue Nov 23 07:07:41 CET,Tue Nov 23 08:29:49 CET,0.0 0.348 0.544 0.695 0.793 0.87 0.972 1.07 1.226 1.29 1.348 1.376 1.518 1.563 1.633 1.703 1.78 1.816 1.885 1.962 2.057 2.114 2.165 2.236 2.312 2.374 2.423 2.463 2.52 2.578 2.627 2.681 2.71 2.741 2.791 2.84 2.865 2.865 2.838 2.803 2.763 2.703 2.603 2.465 2.262 1.961 1.548 0.971 0.121 -1.157 -3.237 -5.633 -7.518 -9.108 -10.417 -11.512 -12.471 -13.312 -14.015 -14.69 -15.272 -15.797 -16.294 -16.761 -17.16 -17.526 -17.915 -18.25 -18.541 -18.835 -19.135 -19.39 -19.657 -19.93 -20.141 -20.359 -20.596 -20.841 -21.083 -21.246 -21.41 -21.688 -21.889 -22.081 -22.173 -22.373 -22.567 -22.746 -22.844 -23.066 -23.217 -23.351 -23.49 -23.78 -23.921 -24.079 -24.275 -24.497 -24.731 -25.029 -25.671 -10 ,17695 ,KEBNE ,16658043,Tue Nov 23 07:07:41 CET,Tue Nov 23 08:35:51 CET,0.0 0.424 0.588 0.698 0.799 0.89 0.993 1.097 1.245 1.31 1.374 1.404 1.539 1.581 1.669 1.76 1.839 1.878 1.952 2.013 2.101 2.148 2.189 2.249 2.311 2.363 2.405 2.455 2.505 2.551 2.603 2.661 2.711 2.748 2.771 2.771 2.771 2.779 2.765 2.718 2.663 2.602 2.513 2.382 2.193 1.899 1.468 0.888 0.028 -1.224 -3.274 -5.706 -7.675 -9.338 -10.711 -11.857 -12.805 -13.651 -14.384 -15.069 -15.642 -16.157 -16.63 -17.079 -17.494 -17.836 -18.184 -18.52 -18.813 -19.124 -19.452 -19.706 -19.962 -20.234 -20.435 -20.647 -20.888 -21.132 -21.376 -21.546 -21.708 -21.956 -22.136 -22.32 -22.415 -22.614 -22.815 -23.038 -23.156 -23.386 -23.521 -23.64 -23.752 -24.002 -24.142 -24.291 -24.451 -24.624 -24.85 -25.151 -25.638 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_15_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_15_25.txt deleted file mode 100644 index 6b657eb0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_15_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25863 ,KEBNE ,16658044,Tue Nov 23 07:07:41 CET,Tue Nov 23 08:29:11 CET,0.0 0.855 1.12 1.316 1.494 1.646 1.783 1.911 2.121 2.209 2.296 2.367 2.526 2.593 2.716 2.848 2.972 3.027 3.126 3.221 3.365 3.463 3.559 3.686 3.807 3.931 4.043 4.13 4.222 4.311 4.415 4.534 4.649 4.797 4.974 5.131 5.256 5.39 5.514 5.632 5.751 5.874 6.012 6.119 6.208 6.268 6.289 6.239 6.116 5.767 4.933 3.793 2.801 1.949 1.203 0.508 -0.118 -0.661 -1.127 -1.601 -2.033 -2.421 -2.776 -3.118 -3.434 -3.711 -4.011 -4.311 -4.573 -4.815 -5.058 -5.264 -5.478 -5.712 -5.903 -6.102 -6.304 -6.51 -6.731 -6.879 -7.019 -7.243 -7.412 -7.579 -7.662 -7.849 -8.045 -8.24 -8.344 -8.543 -8.676 -8.796 -8.905 -9.14 -9.288 -9.446 -9.624 -9.847 -10.121 -10.481 -11.912 -2 ,17650 ,KEBNE ,16658045,Tue Nov 23 07:07:41 CET,Tue Nov 23 08:36:10 CET,0.0 0.603 0.9 1.112 1.257 1.399 1.544 1.663 1.881 1.981 2.078 2.18 2.339 2.4 2.544 2.69 2.812 2.873 2.986 3.092 3.236 3.314 3.388 3.498 3.615 3.739 3.848 3.952 4.074 4.184 4.305 4.453 4.569 4.666 4.787 4.938 5.095 5.241 5.359 5.467 5.567 5.668 5.789 5.906 6.007 6.088 6.135 6.102 5.927 5.559 4.866 3.839 2.875 1.979 1.199 0.533 -0.086 -0.661 -1.146 -1.621 -2.016 -2.384 -2.77 -3.127 -3.453 -3.737 -4.02 -4.297 -4.535 -4.782 -5.047 -5.263 -5.495 -5.728 -5.907 -6.11 -6.308 -6.502 -6.722 -6.868 -7.008 -7.241 -7.4 -7.576 -7.676 -7.87 -8.06 -8.256 -8.369 -8.586 -8.725 -8.847 -8.982 -9.29 -9.461 -9.628 -9.81 -10.016 -10.272 -10.641 -11.841 -3 ,22624 ,KEBNE ,16658046,Tue Nov 23 07:07:41 CET,Tue Nov 23 08:29:26 CET,0.0 0.623 0.938 1.223 1.393 1.523 1.632 1.728 1.916 2.012 2.097 2.173 2.341 2.41 2.531 2.635 2.744 2.805 2.911 3.007 3.159 3.254 3.338 3.453 3.57 3.689 3.788 3.869 3.98 4.096 4.202 4.317 4.415 4.525 4.656 4.769 4.88 5.016 5.132 5.233 5.342 5.471 5.599 5.74 5.881 5.951 5.979 5.925 5.756 5.371 4.611 3.576 2.61 1.743 0.973 0.275 -0.371 -0.94 -1.408 -1.881 -2.298 -2.673 -3.03 -3.37 -3.69 -3.969 -4.247 -4.506 -4.753 -5.023 -5.295 -5.524 -5.732 -5.927 -6.102 -6.302 -6.499 -6.685 -6.884 -7.028 -7.182 -7.437 -7.614 -7.8 -7.894 -8.079 -8.26 -8.457 -8.575 -8.794 -8.939 -9.071 -9.212 -9.497 -9.648 -9.834 -10.052 -10.268 -10.587 -10.985 -11.938 -4 ,3108 ,KEBNE ,16658047,Tue Nov 23 07:08:42 CET,Tue Nov 23 08:31:36 CET,0.0 0.618 0.865 1.07 1.242 1.376 1.487 1.603 1.803 1.888 1.973 2.044 2.202 2.28 2.423 2.538 2.656 2.715 2.826 2.927 3.079 3.185 3.281 3.409 3.522 3.628 3.732 3.825 3.939 4.045 4.146 4.272 4.396 4.505 4.63 4.772 4.903 5.042 5.174 5.308 5.444 5.578 5.7 5.796 5.894 5.969 6.0 5.929 5.785 5.498 4.783 3.757 2.801 1.95 1.211 0.534 -0.06 -0.602 -1.07 -1.522 -1.919 -2.273 -2.614 -2.94 -3.233 -3.502 -3.794 -4.064 -4.294 -4.526 -4.783 -5.015 -5.237 -5.452 -5.63 -5.82 -6.003 -6.19 -6.404 -6.551 -6.7 -6.93 -7.083 -7.254 -7.348 -7.536 -7.72 -7.908 -8.008 -8.213 -8.346 -8.469 -8.59 -8.857 -9.018 -9.195 -9.396 -9.654 -9.974 -10.328 -11.633 -5 ,10110 ,KEBNE ,16658048,Tue Nov 23 07:08:42 CET,Tue Nov 23 08:30:09 CET,0.0 1.116 1.373 1.574 1.729 1.854 1.972 2.099 2.311 2.41 2.51 2.596 2.758 2.828 2.964 3.086 3.209 3.268 3.381 3.496 3.631 3.7 3.783 3.917 4.019 4.112 4.214 4.314 4.44 4.57 4.691 4.819 4.932 5.036 5.149 5.262 5.368 5.473 5.589 5.715 5.831 5.968 6.101 6.201 6.312 6.409 6.456 6.422 6.27 5.95 5.242 4.187 3.189 2.321 1.571 0.873 0.25 -0.306 -0.775 -1.253 -1.67 -2.036 -2.392 -2.738 -3.053 -3.344 -3.642 -3.896 -4.133 -4.392 -4.644 -4.847 -5.05 -5.276 -5.454 -5.626 -5.803 -5.986 -6.187 -6.329 -6.468 -6.703 -6.889 -7.075 -7.171 -7.364 -7.569 -7.785 -7.884 -8.081 -8.219 -8.343 -8.465 -8.745 -8.913 -9.104 -9.304 -9.534 -9.846 -10.248 -12.017 -6 ,9267 ,KEBNE ,16658049,Tue Nov 23 07:08:43 CET,Tue Nov 23 08:37:57 CET,0.0 0.715 0.987 1.197 1.355 1.517 1.653 1.747 1.938 2.027 2.116 2.218 2.391 2.462 2.597 2.729 2.851 2.912 3.028 3.135 3.303 3.416 3.517 3.649 3.772 3.878 3.969 4.06 4.184 4.298 4.412 4.546 4.665 4.787 4.924 5.04 5.157 5.303 5.445 5.58 5.702 5.832 5.971 6.084 6.199 6.303 6.366 6.355 6.258 5.928 5.119 4.08 3.157 2.278 1.522 0.867 0.288 -0.257 -0.742 -1.202 -1.599 -1.955 -2.291 -2.618 -2.932 -3.223 -3.514 -3.778 -4.029 -4.303 -4.569 -4.765 -4.972 -5.208 -5.389 -5.58 -5.786 -5.991 -6.194 -6.342 -6.496 -6.714 -6.88 -7.065 -7.151 -7.321 -7.513 -7.711 -7.812 -8.019 -8.149 -8.269 -8.419 -8.729 -8.885 -9.077 -9.285 -9.511 -9.807 -10.216 -11.821 -7 ,5249 ,KEBNE ,16658050,Tue Nov 23 07:09:44 CET,Tue Nov 23 08:32:29 CET,0.0 0.959 1.237 1.424 1.58 1.737 1.866 1.99 2.202 2.298 2.392 2.486 2.656 2.731 2.862 2.993 3.131 3.194 3.321 3.441 3.588 3.678 3.768 3.906 4.014 4.114 4.232 4.333 4.456 4.575 4.677 4.805 4.943 5.071 5.189 5.309 5.417 5.52 5.642 5.774 5.887 5.997 6.135 6.256 6.358 6.42 6.428 6.38 6.219 5.86 5.061 3.981 3.057 2.192 1.444 0.804 0.216 -0.361 -0.872 -1.371 -1.771 -2.126 -2.481 -2.812 -3.118 -3.39 -3.658 -3.904 -4.124 -4.36 -4.603 -4.807 -5.013 -5.227 -5.4 -5.586 -5.785 -5.985 -6.189 -6.327 -6.471 -6.688 -6.834 -6.997 -7.084 -7.258 -7.452 -7.652 -7.756 -7.956 -8.073 -8.196 -8.33 -8.606 -8.765 -8.962 -9.16 -9.376 -9.631 -9.985 -11.008 -8 ,26642 ,KEBNE ,16658051,Tue Nov 23 07:10:45 CET,Tue Nov 23 08:34:06 CET,0.0 0.847 1.063 1.246 1.402 1.54 1.687 1.835 2.055 2.16 2.272 2.364 2.526 2.599 2.748 2.876 2.981 3.033 3.144 3.255 3.412 3.512 3.599 3.71 3.811 3.923 4.018 4.105 4.244 4.37 4.475 4.599 4.715 4.811 4.926 5.063 5.188 5.321 5.468 5.613 5.743 5.874 5.993 6.08 6.167 6.235 6.286 6.266 6.092 5.701 4.95 3.922 2.949 2.077 1.268 0.576 0.043 -0.463 -0.935 -1.425 -1.841 -2.192 -2.538 -2.884 -3.205 -3.489 -3.78 -4.04 -4.272 -4.526 -4.796 -5.015 -5.237 -5.48 -5.67 -5.867 -6.082 -6.313 -6.533 -6.665 -6.816 -7.066 -7.235 -7.414 -7.504 -7.708 -7.913 -8.105 -8.207 -8.407 -8.542 -8.665 -8.79 -9.088 -9.265 -9.462 -9.672 -9.9 -10.176 -10.501 -11.638 -9 ,24441 ,KEBNE ,16658052,Tue Nov 23 07:10:45 CET,Tue Nov 23 08:38:18 CET,0.0 0.762 1.031 1.228 1.399 1.564 1.707 1.82 2.026 2.132 2.229 2.334 2.506 2.581 2.723 2.846 2.972 3.03 3.13 3.231 3.389 3.489 3.572 3.683 3.79 3.899 4.002 4.103 4.232 4.348 4.456 4.583 4.705 4.82 4.944 5.088 5.223 5.35 5.485 5.604 5.696 5.808 5.933 6.053 6.178 6.258 6.297 6.275 6.138 5.823 5.09 4.014 3.052 2.187 1.411 0.76 0.201 -0.299 -0.746 -1.218 -1.621 -1.953 -2.267 -2.585 -2.899 -3.19 -3.484 -3.749 -3.982 -4.22 -4.46 -4.659 -4.876 -5.1 -5.274 -5.454 -5.64 -5.83 -6.019 -6.155 -6.305 -6.528 -6.684 -6.849 -6.932 -7.111 -7.314 -7.523 -7.631 -7.837 -7.961 -8.07 -8.183 -8.443 -8.603 -8.802 -9.025 -9.258 -9.512 -9.813 -10.869 -10 ,2402 ,KEBNE ,16658053,Tue Nov 23 07:10:45 CET,Tue Nov 23 08:32:38 CET,0.0 0.91 1.263 1.459 1.604 1.752 1.886 1.996 2.191 2.288 2.377 2.447 2.615 2.691 2.837 2.984 3.109 3.167 3.282 3.395 3.548 3.642 3.726 3.854 3.989 4.091 4.183 4.285 4.419 4.546 4.672 4.806 4.916 5.022 5.154 5.295 5.4 5.516 5.65 5.785 5.926 6.068 6.215 6.339 6.444 6.524 6.576 6.57 6.453 6.123 5.346 4.314 3.414 2.587 1.854 1.18 0.56 0.019 -0.422 -0.894 -1.328 -1.703 -2.05 -2.381 -2.694 -2.975 -3.267 -3.554 -3.794 -4.025 -4.276 -4.48 -4.705 -4.94 -5.121 -5.311 -5.52 -5.752 -5.958 -6.084 -6.222 -6.452 -6.619 -6.796 -6.883 -7.063 -7.252 -7.438 -7.54 -7.746 -7.879 -8.002 -8.15 -8.486 -8.647 -8.797 -8.972 -9.178 -9.432 -9.844 -11.148 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_15_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_15_252.txt deleted file mode 100644 index 6f6dba42..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_15_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24217 ,KEBNE ,16658054,Tue Nov 23 07:11:46 CET,Tue Nov 23 08:40:31 CET,0.0 0.459 0.692 0.84 0.95 1.057 1.155 1.241 1.402 1.48 1.559 1.596 1.731 1.777 1.85 1.908 1.961 1.991 2.052 2.116 2.207 2.251 2.287 2.334 2.374 2.415 2.459 2.498 2.549 2.571 2.575 2.586 2.589 2.572 2.546 2.535 2.515 2.472 2.404 2.291 2.139 1.968 1.744 1.457 1.075 0.633 0.043 -0.778 -1.951 -3.626 -6.284 -9.356 -11.74 -13.679 -15.297 -16.686 -17.847 -18.861 -19.699 -20.535 -21.274 -21.909 -22.499 -23.067 -23.574 -24.017 -24.472 -24.884 -25.256 -25.63 -26.01 -26.318 -26.618 -26.933 -27.18 -27.433 -27.702 -27.971 -28.26 -28.477 -28.682 -28.986 -29.2 -29.421 -29.532 -29.754 -30.007 -30.275 -30.411 -30.677 -30.832 -30.973 -31.124 -31.455 -31.638 -31.852 -32.067 -32.286 -32.581 -32.961 -33.691 -2 ,13448 ,KEBNE ,16658055,Tue Nov 23 07:11:46 CET,Tue Nov 23 08:40:25 CET,0.0 0.459 0.631 0.742 0.875 1.011 1.12 1.204 1.326 1.394 1.463 1.488 1.627 1.675 1.746 1.818 1.884 1.91 1.969 2.031 2.099 2.153 2.207 2.262 2.3 2.331 2.368 2.404 2.454 2.482 2.487 2.505 2.509 2.495 2.481 2.459 2.432 2.384 2.33 2.263 2.131 1.936 1.691 1.425 1.082 0.651 0.048 -0.788 -1.973 -3.744 -6.534 -9.627 -12.043 -13.961 -15.518 -16.888 -18.053 -19.062 -19.886 -20.702 -21.417 -22.038 -22.631 -23.2 -23.715 -24.187 -24.661 -25.08 -25.452 -25.812 -26.175 -26.5 -26.834 -27.144 -27.379 -27.643 -27.911 -28.178 -28.461 -28.651 -28.849 -29.164 -29.377 -29.599 -29.719 -29.953 -30.185 -30.424 -30.557 -30.825 -31.017 -31.182 -31.351 -31.71 -31.894 -32.092 -32.331 -32.596 -32.897 -33.321 -34.338 -3 ,11864 ,KEBNE ,16658056,Tue Nov 23 07:11:46 CET,Tue Nov 23 08:40:20 CET,0.0 0.422 0.613 0.765 0.884 0.987 1.067 1.131 1.268 1.344 1.409 1.446 1.589 1.633 1.724 1.81 1.882 1.913 1.978 2.04 2.12 2.175 2.22 2.272 2.318 2.362 2.409 2.453 2.498 2.55 2.604 2.657 2.682 2.686 2.67 2.632 2.597 2.555 2.493 2.409 2.295 2.126 1.898 1.632 1.291 0.839 0.202 -0.636 -1.822 -3.539 -6.254 -9.319 -11.695 -13.608 -15.179 -16.541 -17.684 -18.692 -19.583 -20.446 -21.143 -21.754 -22.326 -22.865 -23.376 -23.833 -24.29 -24.69 -25.042 -25.414 -25.788 -26.108 -26.451 -26.828 -27.126 -27.385 -27.645 -27.919 -28.209 -28.412 -28.612 -28.925 -29.143 -29.372 -29.492 -29.741 -30.002 -30.265 -30.394 -30.661 -30.876 -31.055 -31.23 -31.591 -31.797 -32.013 -32.229 -32.496 -32.808 -33.156 -33.908 -4 ,24720 ,KEBNE ,16658057,Tue Nov 23 07:12:47 CET,Tue Nov 23 08:42:08 CET,0.0 0.466 0.65 0.769 0.874 0.973 1.051 1.119 1.273 1.343 1.408 1.449 1.598 1.656 1.735 1.806 1.872 1.899 1.96 2.021 2.096 2.146 2.197 2.263 2.305 2.347 2.403 2.452 2.501 2.551 2.606 2.669 2.704 2.705 2.694 2.722 2.737 2.677 2.593 2.484 2.366 2.207 1.984 1.731 1.381 0.908 0.289 -0.506 -1.651 -3.349 -6.016 -9.03 -11.407 -13.33 -14.882 -16.274 -17.477 -18.498 -19.361 -20.203 -20.922 -21.582 -22.181 -22.714 -23.221 -23.662 -24.111 -24.515 -24.851 -25.207 -25.577 -25.878 -26.193 -26.529 -26.779 -27.025 -27.296 -27.586 -27.885 -28.089 -28.299 -28.632 -28.872 -29.119 -29.24 -29.47 -29.708 -29.982 -30.126 -30.388 -30.551 -30.692 -30.845 -31.203 -31.393 -31.581 -31.772 -31.992 -32.262 -32.644 -33.523 -5 ,30697 ,KEBNE ,16658058,Tue Nov 23 07:12:48 CET,Tue Nov 23 08:41:46 CET,0.0 0.357 0.545 0.681 0.826 0.946 1.063 1.175 1.356 1.432 1.494 1.526 1.658 1.686 1.735 1.811 1.911 1.948 2.009 2.076 2.158 2.208 2.251 2.304 2.35 2.377 2.403 2.434 2.469 2.504 2.55 2.582 2.589 2.594 2.586 2.547 2.504 2.482 2.439 2.339 2.235 2.098 1.845 1.554 1.204 0.745 0.074 -0.839 -2.076 -3.783 -6.513 -9.614 -12.008 -13.941 -15.551 -16.935 -18.091 -19.113 -19.977 -20.811 -21.54 -22.194 -22.799 -23.34 -23.838 -24.311 -24.786 -25.187 -25.527 -25.876 -26.235 -26.526 -26.83 -27.154 -27.409 -27.677 -27.953 -28.228 -28.521 -28.731 -28.936 -29.237 -29.449 -29.665 -29.779 -30.028 -30.265 -30.501 -30.634 -30.889 -31.04 -31.189 -31.35 -31.698 -31.883 -32.069 -32.294 -32.554 -32.876 -33.326 -34.509 -6 ,30678 ,KEBNE ,16658059,Tue Nov 23 07:12:47 CET,Tue Nov 23 08:41:30 CET,0.0 0.396 0.572 0.691 0.811 0.903 0.977 1.056 1.18 1.234 1.295 1.306 1.438 1.491 1.598 1.689 1.767 1.809 1.877 1.935 2.012 2.051 2.081 2.132 2.207 2.276 2.322 2.361 2.382 2.399 2.435 2.458 2.448 2.422 2.387 2.343 2.308 2.261 2.184 2.096 2.005 1.883 1.669 1.39 0.996 0.488 -0.149 -0.995 -2.198 -3.878 -6.517 -9.521 -11.973 -13.952 -15.523 -16.854 -17.995 -19.026 -19.883 -20.728 -21.446 -22.053 -22.617 -23.143 -23.643 -24.091 -24.536 -24.927 -25.253 -25.598 -25.987 -26.317 -26.645 -26.985 -27.251 -27.515 -27.781 -28.056 -28.339 -28.526 -28.716 -29.022 -29.229 -29.437 -29.549 -29.786 -30.024 -30.274 -30.413 -30.676 -30.846 -31.002 -31.16 -31.485 -31.662 -31.869 -32.112 -32.367 -32.697 -33.096 -34.321 -7 ,21012 ,KEBNE ,16658060,Tue Nov 23 07:12:47 CET,Tue Nov 23 08:41:25 CET,0.0 0.372 0.566 0.712 0.842 0.948 1.048 1.146 1.305 1.379 1.44 1.447 1.585 1.635 1.713 1.797 1.883 1.921 1.986 2.043 2.146 2.202 2.249 2.324 2.392 2.449 2.489 2.52 2.569 2.62 2.665 2.687 2.696 2.71 2.701 2.699 2.694 2.684 2.688 2.643 2.527 2.354 2.126 1.858 1.518 1.113 0.506 -0.356 -1.577 -3.353 -6.156 -9.315 -11.757 -13.693 -15.283 -16.676 -17.867 -18.92 -19.788 -20.625 -21.331 -21.948 -22.556 -23.133 -23.644 -24.08 -24.509 -24.904 -25.262 -25.621 -25.996 -26.313 -26.625 -26.962 -27.233 -27.498 -27.771 -28.052 -28.335 -28.526 -28.722 -29.021 -29.226 -29.445 -29.56 -29.797 -30.048 -30.3 -30.428 -30.689 -30.892 -31.06 -31.236 -31.607 -31.804 -32.019 -32.241 -32.491 -32.779 -33.155 -34.251 -8 ,2205 ,KEBNE ,16658061,Tue Nov 23 07:13:48 CET,Tue Nov 23 08:35:17 CET,0.0 0.242 0.429 0.558 0.661 0.758 0.839 0.926 1.068 1.125 1.19 1.213 1.347 1.394 1.473 1.535 1.598 1.64 1.733 1.813 1.894 1.938 1.985 2.046 2.097 2.136 2.168 2.187 2.207 2.237 2.269 2.279 2.294 2.314 2.308 2.298 2.273 2.226 2.155 2.053 1.93 1.768 1.544 1.281 0.947 0.542 -0.048 -0.909 -2.076 -3.777 -6.501 -9.548 -11.838 -13.696 -15.284 -16.639 -17.774 -18.763 -19.586 -20.408 -21.09 -21.695 -22.274 -22.809 -23.306 -23.759 -24.214 -24.608 -24.962 -25.324 -25.704 -26.014 -26.326 -26.659 -26.911 -27.164 -27.429 -27.687 -27.953 -28.155 -28.368 -28.718 -28.949 -29.154 -29.262 -29.503 -29.737 -29.991 -30.126 -30.373 -30.566 -30.731 -30.88 -31.212 -31.4 -31.599 -31.824 -32.094 -32.424 -32.821 -33.911 -9 ,20807 ,KEBNE ,16658062,Tue Nov 23 07:13:48 CET,Tue Nov 23 08:39:34 CET,0.0 0.544 0.76 0.898 1.014 1.139 1.239 1.313 1.455 1.525 1.581 1.571 1.7 1.756 1.859 1.954 2.038 2.072 2.142 2.214 2.286 2.334 2.379 2.415 2.455 2.5 2.541 2.587 2.623 2.633 2.655 2.685 2.695 2.686 2.696 2.722 2.705 2.645 2.567 2.484 2.392 2.262 2.083 1.875 1.568 1.14 0.548 -0.241 -1.4 -3.176 -5.956 -9.109 -11.565 -13.49 -15.06 -16.429 -17.607 -18.638 -19.506 -20.359 -21.087 -21.701 -22.286 -22.833 -23.336 -23.798 -24.264 -24.676 -25.033 -25.391 -25.758 -26.075 -26.409 -26.75 -27.008 -27.272 -27.549 -27.824 -28.111 -28.321 -28.532 -28.858 -29.083 -29.315 -29.432 -29.668 -29.923 -30.191 -30.321 -30.578 -30.768 -30.925 -31.079 -31.399 -31.587 -31.793 -32.015 -32.273 -32.601 -33.057 -33.866 -10 ,29529 ,KEBNE ,16658063,Tue Nov 23 07:14:50 CET,Tue Nov 23 08:36:25 CET,0.0 0.548 0.725 0.878 1.03 1.15 1.244 1.33 1.478 1.548 1.611 1.637 1.777 1.824 1.902 1.964 2.021 2.051 2.098 2.143 2.215 2.259 2.295 2.341 2.383 2.419 2.462 2.521 2.587 2.625 2.635 2.638 2.647 2.664 2.672 2.674 2.655 2.607 2.545 2.45 2.343 2.2 1.988 1.727 1.369 0.917 0.267 -0.61 -1.799 -3.518 -6.236 -9.26 -11.631 -13.576 -15.161 -16.51 -17.637 -18.627 -19.46 -20.27 -20.956 -21.561 -22.151 -22.728 -23.248 -23.704 -24.182 -24.6 -24.968 -25.347 -25.73 -26.045 -26.36 -26.674 -26.915 -27.163 -27.419 -27.692 -27.982 -28.172 -28.363 -28.673 -28.887 -29.113 -29.225 -29.445 -29.679 -29.946 -30.091 -30.353 -30.54 -30.702 -30.868 -31.232 -31.414 -31.599 -31.833 -32.098 -32.39 -32.764 -33.629 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_164.txt deleted file mode 100644 index d5ae3ad1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20027 ,KEBNE ,16658064,Tue Nov 23 07:14:50 CET,Tue Nov 23 08:40:08 CET,0.0 0.617 0.902 1.101 1.265 1.409 1.543 1.68 1.95 2.081 2.203 2.307 2.503 2.591 2.754 2.897 3.046 3.119 3.256 3.391 3.584 3.709 3.844 4.038 4.204 4.364 4.525 4.674 4.873 5.064 5.236 5.444 5.647 5.844 6.07 6.323 6.554 6.813 7.101 7.407 7.719 8.06 8.457 8.858 9.316 9.828 10.402 10.97 11.554 12.159 12.633 12.638 12.298 11.912 11.554 11.173 10.811 10.468 10.164 9.837 9.539 9.286 9.045 8.822 8.613 8.418 8.202 8.016 7.878 7.723 7.551 7.397 7.225 7.042 6.898 6.755 6.618 6.476 6.325 6.221 6.113 5.934 5.797 5.662 5.598 5.465 5.316 5.161 5.081 4.89 4.817 4.713 4.609 4.405 4.3 4.163 4.002 3.84 3.645 3.399 2.74 -2 ,21310 ,KEBNE ,16658065,Tue Nov 23 07:14:50 CET,Tue Nov 23 08:38:40 CET,0.0 0.682 0.969 1.174 1.366 1.539 1.679 1.81 2.059 2.159 2.257 2.358 2.564 2.652 2.821 2.985 3.14 3.217 3.372 3.512 3.713 3.843 3.968 4.155 4.331 4.5 4.662 4.816 5.01 5.194 5.369 5.59 5.807 6.006 6.241 6.508 6.765 7.04 7.315 7.613 7.928 8.271 8.667 9.089 9.546 9.986 10.495 11.074 11.638 12.122 12.556 12.641 12.408 12.025 11.655 11.351 11.076 10.808 10.523 10.197 9.934 9.685 9.434 9.213 8.998 8.788 8.572 8.381 8.215 8.042 7.865 7.716 7.559 7.385 7.248 7.119 6.983 6.836 6.679 6.569 6.463 6.295 6.176 6.062 6.003 5.881 5.749 5.619 5.556 5.379 5.323 5.223 5.123 4.939 4.84 4.721 4.573 4.399 4.215 4.008 3.58 -3 ,31875 ,KEBNE ,16658066,Tue Nov 23 07:15:51 CET,Tue Nov 23 08:37:28 CET,0.0 0.565 0.791 0.988 1.156 1.313 1.45 1.571 1.789 1.894 2.005 2.092 2.29 2.382 2.555 2.705 2.858 2.937 3.086 3.224 3.422 3.546 3.664 3.844 4.01 4.172 4.332 4.488 4.696 4.887 5.067 5.302 5.521 5.706 5.939 6.218 6.458 6.714 6.988 7.278 7.613 7.977 8.352 8.737 9.177 9.647 10.139 10.7 11.364 11.961 12.458 12.592 12.467 12.217 11.886 11.532 11.167 10.808 10.491 10.183 9.909 9.634 9.369 9.128 8.917 8.735 8.527 8.341 8.183 8.011 7.835 7.697 7.552 7.394 7.266 7.134 6.99 6.833 6.678 6.575 6.465 6.291 6.172 6.043 5.977 5.823 5.655 5.493 5.412 5.23 5.148 5.037 4.929 4.721 4.623 4.522 4.41 4.271 4.107 3.852 3.27 -4 ,1181 ,KEBNE ,16658067,Tue Nov 23 07:16:53 CET,Tue Nov 23 08:41:46 CET,0.0 0.554 0.786 0.979 1.159 1.344 1.511 1.651 1.89 1.993 2.101 2.197 2.405 2.501 2.681 2.836 2.976 3.049 3.197 3.342 3.544 3.668 3.793 3.975 4.143 4.306 4.461 4.602 4.769 4.945 5.12 5.328 5.533 5.721 5.926 6.166 6.403 6.643 6.918 7.215 7.53 7.894 8.283 8.661 9.087 9.52 9.974 10.494 11.122 11.619 11.9 11.943 11.691 11.347 10.966 10.602 10.262 9.912 9.597 9.3 9.028 8.764 8.532 8.309 8.094 7.894 7.674 7.484 7.311 7.131 6.955 6.799 6.628 6.456 6.332 6.199 6.05 5.901 5.746 5.643 5.536 5.379 5.268 5.141 5.079 4.946 4.808 4.663 4.578 4.388 4.329 4.241 4.155 3.961 3.849 3.74 3.62 3.468 3.297 3.091 2.749 -5 ,16186 ,KEBNE ,16658068,Tue Nov 23 07:16:53 CET,Tue Nov 23 08:38:51 CET,0.0 0.619 0.927 1.152 1.32 1.472 1.612 1.739 1.955 2.059 2.162 2.255 2.466 2.565 2.76 2.931 3.073 3.145 3.297 3.452 3.677 3.812 3.932 4.095 4.251 4.406 4.559 4.707 4.904 5.085 5.257 5.472 5.664 5.846 6.07 6.333 6.575 6.841 7.128 7.425 7.73 8.074 8.469 8.862 9.314 9.795 10.35 10.892 11.421 11.974 12.453 12.543 12.246 11.843 11.485 11.11 10.748 10.418 10.113 9.803 9.529 9.272 9.014 8.767 8.546 8.342 8.129 7.927 7.744 7.559 7.376 7.222 7.046 6.858 6.717 6.569 6.424 6.292 6.152 6.052 5.941 5.775 5.664 5.534 5.467 5.335 5.201 5.063 4.996 4.815 4.749 4.656 4.557 4.356 4.241 4.114 3.969 3.797 3.601 3.34 2.776 -6 ,14608 ,KEBNE ,16658069,Tue Nov 23 07:16:53 CET,Tue Nov 23 08:40:08 CET,0.0 0.354 0.608 0.798 0.96 1.114 1.257 1.395 1.645 1.745 1.842 1.924 2.119 2.204 2.372 2.533 2.686 2.766 2.915 3.046 3.236 3.359 3.472 3.64 3.815 3.98 4.138 4.302 4.521 4.72 4.909 5.138 5.356 5.554 5.776 6.024 6.27 6.561 6.858 7.158 7.492 7.853 8.222 8.582 9.017 9.477 9.968 10.52 11.139 11.717 12.093 12.105 11.861 11.467 11.071 10.674 10.341 10.05 9.746 9.425 9.145 8.906 8.657 8.41 8.188 7.961 7.737 7.552 7.39 7.224 7.05 6.908 6.746 6.574 6.443 6.312 6.183 6.043 5.9 5.806 5.698 5.523 5.406 5.288 5.222 5.084 4.948 4.8 4.725 4.542 4.483 4.396 4.298 4.068 3.952 3.839 3.718 3.574 3.397 3.178 2.507 -7 ,13079 ,KEBNE ,16658070,Tue Nov 23 07:17:55 CET,Tue Nov 23 08:41:58 CET,0.0 0.7 0.979 1.164 1.365 1.539 1.687 1.82 2.028 2.121 2.219 2.305 2.511 2.609 2.783 2.941 3.075 3.143 3.293 3.436 3.636 3.764 3.881 4.041 4.194 4.348 4.492 4.622 4.799 4.984 5.172 5.397 5.603 5.796 6.026 6.279 6.502 6.745 7.014 7.308 7.608 7.947 8.339 8.711 9.139 9.581 10.061 10.623 11.204 11.721 12.167 12.174 11.934 11.585 11.185 10.763 10.369 10.037 9.778 9.516 9.273 9.048 8.808 8.577 8.368 8.166 7.957 7.772 7.62 7.467 7.296 7.148 6.992 6.837 6.717 6.589 6.459 6.322 6.159 6.036 5.91 5.718 5.597 5.484 5.421 5.268 5.107 4.96 4.891 4.708 4.653 4.568 4.471 4.264 4.148 4.023 3.898 3.747 3.574 3.366 2.892 -8 ,7158 ,KEBNE ,16658071,Tue Nov 23 07:17:54 CET,Tue Nov 23 08:41:37 CET,0.0 0.559 0.788 0.991 1.172 1.326 1.47 1.602 1.836 1.947 2.045 2.103 2.304 2.394 2.564 2.729 2.872 2.941 3.083 3.227 3.417 3.537 3.661 3.839 3.999 4.157 4.312 4.449 4.627 4.805 4.977 5.193 5.395 5.578 5.796 6.049 6.288 6.546 6.816 7.094 7.395 7.75 8.163 8.593 9.047 9.524 10.067 10.645 11.27 11.884 12.415 12.527 12.357 12.002 11.581 11.146 10.757 10.411 10.108 9.793 9.517 9.262 9.025 8.813 8.604 8.399 8.177 7.979 7.812 7.645 7.461 7.317 7.169 6.994 6.864 6.732 6.586 6.445 6.305 6.204 6.102 5.949 5.841 5.722 5.658 5.533 5.392 5.231 5.149 4.96 4.893 4.793 4.7 4.505 4.403 4.297 4.187 4.058 3.909 3.71 3.295 -9 ,22738 ,KEBNE ,16658072,Tue Nov 23 07:17:54 CET,Tue Nov 23 08:41:07 CET,0.0 0.705 0.979 1.214 1.412 1.56 1.692 1.821 2.054 2.166 2.275 2.358 2.558 2.645 2.81 2.968 3.128 3.201 3.333 3.461 3.655 3.783 3.908 4.086 4.256 4.413 4.564 4.712 4.893 5.064 5.24 5.46 5.659 5.841 6.063 6.321 6.571 6.828 7.098 7.394 7.683 8.01 8.424 8.842 9.292 9.749 10.24 10.783 11.453 12.091 12.5 12.566 12.453 12.157 11.767 11.391 10.989 10.606 10.296 9.986 9.733 9.482 9.227 8.989 8.755 8.541 8.333 8.147 7.976 7.796 7.616 7.463 7.301 7.13 7.002 6.876 6.734 6.588 6.453 6.358 6.254 6.093 5.975 5.852 5.788 5.649 5.512 5.372 5.292 5.105 5.044 4.955 4.862 4.65 4.526 4.376 4.226 4.096 3.956 3.753 3.344 -10 ,5534 ,KEBNE ,16658073,Tue Nov 23 07:18:56 CET,Tue Nov 23 08:42:45 CET,0.0 0.558 0.799 1.003 1.178 1.326 1.458 1.586 1.81 1.924 2.026 2.098 2.296 2.378 2.549 2.709 2.863 2.937 3.071 3.203 3.408 3.544 3.674 3.842 3.999 4.166 4.315 4.457 4.653 4.835 5.012 5.235 5.439 5.628 5.851 6.099 6.332 6.592 6.863 7.157 7.469 7.795 8.181 8.59 9.034 9.504 10.02 10.579 11.156 11.691 12.118 12.074 11.774 11.474 11.162 10.791 10.467 10.175 9.896 9.598 9.315 9.062 8.829 8.595 8.359 8.155 7.951 7.758 7.592 7.432 7.265 7.112 6.943 6.775 6.643 6.509 6.381 6.241 6.088 5.976 5.859 5.683 5.562 5.437 5.373 5.244 5.113 4.966 4.886 4.691 4.612 4.513 4.416 4.211 4.097 3.973 3.842 3.707 3.538 3.274 2.557 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_165.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_165.txt deleted file mode 100644 index 4999f052..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_165.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7395 ,KEBNE ,16658074,Tue Nov 23 07:19:57 CET,Tue Nov 23 08:45:45 CET,0.0 0.732 0.982 1.165 1.312 1.458 1.609 1.739 1.957 2.048 2.132 2.188 2.378 2.45 2.597 2.74 2.879 2.947 3.069 3.186 3.358 3.458 3.548 3.689 3.832 3.971 4.111 4.24 4.388 4.533 4.684 4.865 5.029 5.185 5.376 5.579 5.753 5.949 6.159 6.376 6.614 6.871 7.144 7.403 7.714 8.056 8.443 8.861 9.258 9.653 9.963 9.939 9.741 9.492 9.239 8.964 8.705 8.463 8.209 7.937 7.734 7.542 7.316 7.121 6.941 6.773 6.628 6.494 6.354 6.209 6.058 5.933 5.814 5.672 5.56 5.454 5.34 5.227 5.097 4.994 4.886 4.716 4.607 4.503 4.446 4.32 4.197 4.066 3.996 3.813 3.743 3.656 3.562 3.351 3.247 3.13 3.004 2.86 2.699 2.497 2.067 -2 ,9383 ,KEBNE ,16658075,Tue Nov 23 07:20:58 CET,Tue Nov 23 08:42:43 CET,0.0 0.606 0.898 1.079 1.235 1.357 1.481 1.601 1.812 1.919 2.013 2.069 2.254 2.323 2.467 2.606 2.737 2.799 2.916 3.021 3.176 3.276 3.379 3.526 3.664 3.802 3.929 4.044 4.195 4.347 4.491 4.659 4.814 4.963 5.141 5.366 5.582 5.808 6.034 6.261 6.517 6.788 7.079 7.364 7.683 8.001 8.312 8.643 8.986 9.258 9.437 9.382 9.194 8.955 8.677 8.342 8.017 7.756 7.531 7.284 7.064 6.861 6.656 6.463 6.292 6.136 5.975 5.833 5.711 5.581 5.429 5.295 5.156 5.024 4.929 4.815 4.689 4.564 4.425 4.322 4.219 4.063 3.953 3.85 3.796 3.659 3.521 3.393 3.322 3.141 3.091 2.995 2.894 2.686 2.572 2.437 2.284 2.116 1.914 1.708 1.268 -3 ,16635 ,KEBNE ,16658076,Tue Nov 23 07:24:02 CET,Tue Nov 23 08:49:30 CET,0.0 0.386 0.649 0.848 1.041 1.196 1.308 1.417 1.645 1.743 1.832 1.88 2.065 2.14 2.281 2.414 2.548 2.616 2.741 2.856 3.02 3.122 3.221 3.362 3.496 3.621 3.741 3.863 4.02 4.162 4.296 4.461 4.621 4.779 4.964 5.162 5.354 5.555 5.762 5.98 6.205 6.446 6.731 7.02 7.324 7.667 8.043 8.421 8.847 9.233 9.478 9.399 9.174 8.92 8.652 8.38 8.098 7.824 7.557 7.264 7.022 6.824 6.644 6.472 6.3 6.139 5.968 5.817 5.699 5.556 5.394 5.254 5.111 4.979 4.88 4.784 4.667 4.529 4.382 4.286 4.187 4.036 3.94 3.837 3.775 3.628 3.465 3.309 3.234 3.054 2.996 2.91 2.829 2.649 2.537 2.402 2.263 2.104 1.934 1.738 1.304 -4 ,27668 ,KEBNE ,16658077,Tue Nov 23 07:24:02 CET,Tue Nov 23 08:46:02 CET,0.0 0.436 0.67 0.877 1.039 1.185 1.313 1.422 1.615 1.702 1.8 1.876 2.081 2.171 2.325 2.469 2.601 2.665 2.796 2.922 3.08 3.174 3.26 3.395 3.533 3.662 3.792 3.921 4.079 4.229 4.366 4.529 4.695 4.85 5.01 5.185 5.357 5.536 5.716 5.923 6.147 6.402 6.694 6.969 7.267 7.586 7.918 8.259 8.635 8.941 9.126 9.084 8.876 8.598 8.318 8.029 7.755 7.492 7.247 7.01 6.818 6.636 6.439 6.241 6.061 5.906 5.74 5.583 5.45 5.3 5.135 5.003 4.879 4.756 4.649 4.528 4.406 4.294 4.179 4.083 3.988 3.844 3.721 3.603 3.548 3.427 3.29 3.155 3.087 2.903 2.842 2.757 2.658 2.448 2.344 2.219 2.08 1.954 1.799 1.53 0.856 -5 ,1512 ,KEBNE ,16658078,Tue Nov 23 07:24:02 CET,Tue Nov 23 08:48:23 CET,0.0 0.66 0.96 1.178 1.341 1.483 1.601 1.706 1.924 2.029 2.124 2.2 2.399 2.475 2.611 2.723 2.832 2.891 3.003 3.11 3.278 3.38 3.471 3.614 3.751 3.866 3.985 4.116 4.271 4.418 4.567 4.747 4.915 5.063 5.232 5.428 5.622 5.816 6.029 6.251 6.483 6.755 7.043 7.307 7.594 7.918 8.263 8.632 9.055 9.434 9.651 9.583 9.399 9.143 8.856 8.563 8.302 8.049 7.812 7.573 7.369 7.175 6.955 6.744 6.565 6.401 6.213 6.045 5.898 5.749 5.601 5.473 5.347 5.219 5.118 4.999 4.865 4.719 4.562 4.467 4.369 4.204 4.093 3.987 3.932 3.816 3.702 3.567 3.496 3.321 3.288 3.212 3.129 2.929 2.821 2.718 2.612 2.493 2.349 2.08 1.553 -6 ,15990 ,KEBNE ,16658079,Tue Nov 23 07:25:03 CET,Tue Nov 23 08:49:09 CET,0.0 0.407 0.649 0.816 0.938 1.058 1.171 1.267 1.434 1.519 1.604 1.644 1.829 1.905 2.046 2.176 2.304 2.366 2.484 2.599 2.762 2.866 2.964 3.097 3.227 3.359 3.478 3.584 3.734 3.889 4.044 4.211 4.355 4.503 4.689 4.867 5.034 5.237 5.443 5.655 5.889 6.153 6.436 6.719 7.033 7.36 7.731 8.089 8.424 8.739 8.924 8.799 8.553 8.291 8.022 7.752 7.474 7.212 6.99 6.746 6.522 6.331 6.137 5.945 5.768 5.597 5.415 5.249 5.113 4.971 4.814 4.683 4.544 4.4 4.287 4.166 4.038 3.91 3.769 3.674 3.587 3.447 3.335 3.207 3.141 3.012 2.883 2.746 2.676 2.491 2.422 2.327 2.234 2.052 1.939 1.812 1.678 1.534 1.352 1.116 0.58 -7 ,5877 ,KEBNE ,16658080,Tue Nov 23 07:25:03 CET,Tue Nov 23 08:48:28 CET,0.0 0.536 0.795 1.0 1.169 1.311 1.422 1.519 1.702 1.796 1.883 1.942 2.133 2.204 2.338 2.482 2.631 2.693 2.809 2.925 3.104 3.228 3.341 3.492 3.627 3.764 3.903 4.027 4.175 4.315 4.454 4.629 4.796 4.945 5.118 5.32 5.514 5.716 5.93 6.136 6.334 6.563 6.827 7.086 7.389 7.727 8.083 8.433 8.798 9.144 9.344 9.275 9.068 8.772 8.453 8.146 7.875 7.637 7.419 7.177 6.959 6.767 6.574 6.362 6.175 6.016 5.835 5.679 5.556 5.419 5.27 5.148 5.011 4.87 4.769 4.661 4.54 4.4 4.261 4.172 4.077 3.929 3.831 3.723 3.665 3.544 3.416 3.28 3.209 3.023 2.968 2.884 2.805 2.664 2.573 2.444 2.288 2.133 1.997 1.826 1.274 -8 ,29018 ,KEBNE ,16658081,Tue Nov 23 07:26:04 CET,Tue Nov 23 08:48:19 CET,0.0 0.357 0.603 0.79 0.935 1.065 1.2 1.33 1.551 1.652 1.742 1.798 1.99 2.074 2.219 2.35 2.485 2.552 2.68 2.795 2.973 3.091 3.19 3.326 3.468 3.613 3.756 3.89 4.054 4.195 4.333 4.501 4.65 4.792 4.96 5.147 5.326 5.525 5.734 5.952 6.175 6.422 6.704 6.968 7.262 7.582 7.93 8.301 8.673 9.048 9.344 9.342 9.133 8.841 8.562 8.261 7.97 7.699 7.461 7.226 7.019 6.824 6.619 6.422 6.251 6.096 5.919 5.759 5.628 5.488 5.318 5.177 5.033 4.872 4.744 4.62 4.511 4.406 4.289 4.192 4.089 3.946 3.839 3.717 3.656 3.534 3.402 3.266 3.197 3.018 2.969 2.882 2.791 2.587 2.487 2.386 2.259 2.12 1.976 1.804 1.488 -9 ,15319 ,KEBNE ,16658082,Tue Nov 23 07:26:04 CET,Tue Nov 23 08:47:57 CET,0.0 0.635 0.878 1.058 1.207 1.348 1.477 1.595 1.806 1.903 1.997 2.06 2.257 2.337 2.481 2.618 2.739 2.802 2.928 3.034 3.178 3.27 3.374 3.527 3.664 3.8 3.932 4.057 4.223 4.382 4.518 4.681 4.837 4.998 5.181 5.372 5.561 5.769 5.986 6.194 6.415 6.675 6.977 7.258 7.568 7.937 8.341 8.731 9.115 9.458 9.684 9.61 9.383 9.129 8.863 8.595 8.336 8.091 7.861 7.616 7.403 7.198 6.987 6.79 6.604 6.428 6.256 6.113 5.977 5.819 5.664 5.54 5.412 5.283 5.176 5.062 4.946 4.821 4.686 4.587 4.488 4.338 4.235 4.131 4.073 3.943 3.805 3.656 3.583 3.407 3.354 3.261 3.17 2.96 2.841 2.727 2.612 2.465 2.255 1.985 1.423 -10 ,9346 ,KEBNE ,16658083,Tue Nov 23 07:27:05 CET,Tue Nov 23 08:52:32 CET,0.0 0.577 0.789 0.984 1.146 1.305 1.431 1.514 1.681 1.766 1.843 1.886 2.075 2.146 2.273 2.394 2.518 2.586 2.718 2.836 3.01 3.128 3.246 3.407 3.558 3.694 3.816 3.947 4.118 4.272 4.407 4.572 4.731 4.89 5.077 5.268 5.444 5.641 5.868 6.104 6.35 6.611 6.886 7.149 7.432 7.749 8.102 8.464 8.824 9.144 9.346 9.242 9.0 8.71 8.434 8.165 7.887 7.641 7.428 7.203 6.991 6.786 6.584 6.395 6.217 6.045 5.862 5.705 5.567 5.413 5.26 5.141 5.013 4.871 4.75 4.627 4.518 4.404 4.265 4.166 4.065 3.906 3.794 3.677 3.619 3.493 3.363 3.225 3.147 2.966 2.886 2.789 2.702 2.534 2.428 2.299 2.173 2.022 1.829 1.598 1.123 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_234.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_234.txt deleted file mode 100644 index a9e8748c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_234.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3897 ,KEBNE ,16658084,Tue Nov 23 07:28:07 CET,Tue Nov 23 08:50:49 CET,0.0 0.719 0.944 1.129 1.319 1.494 1.641 1.764 1.998 2.114 2.221 2.306 2.501 2.577 2.735 2.891 3.032 3.099 3.22 3.337 3.507 3.604 3.704 3.845 3.978 4.127 4.289 4.432 4.602 4.781 4.947 5.128 5.29 5.439 5.618 5.816 5.995 6.194 6.415 6.633 6.859 7.114 7.377 7.602 7.848 8.139 8.465 8.789 9.098 9.351 9.473 9.352 9.086 8.738 8.405 8.107 7.82 7.546 7.315 7.057 6.833 6.642 6.446 6.255 6.079 5.922 5.757 5.597 5.457 5.3 5.133 4.999 4.86 4.717 4.6 4.469 4.329 4.191 4.06 3.96 3.839 3.659 3.556 3.449 3.393 3.268 3.124 2.973 2.9 2.716 2.672 2.579 2.477 2.257 2.137 2.016 1.887 1.736 1.574 1.375 0.892 -2 ,26328 ,KEBNE ,16658085,Tue Nov 23 07:28:07 CET,Tue Nov 23 08:49:59 CET,0.0 0.633 0.915 1.13 1.319 1.496 1.639 1.768 2.01 2.112 2.211 2.298 2.499 2.587 2.765 2.929 3.076 3.146 3.288 3.412 3.573 3.683 3.784 3.931 4.086 4.227 4.357 4.487 4.648 4.793 4.928 5.082 5.25 5.41 5.583 5.783 5.974 6.18 6.385 6.621 6.87 7.12 7.401 7.666 7.957 8.25 8.557 8.888 9.215 9.506 9.68 9.577 9.349 9.051 8.722 8.409 8.128 7.851 7.579 7.288 7.055 6.858 6.665 6.479 6.284 6.097 5.908 5.73 5.571 5.41 5.257 5.117 4.95 4.792 4.68 4.569 4.456 4.332 4.203 4.103 3.988 3.82 3.702 3.576 3.515 3.397 3.279 3.148 3.077 2.887 2.825 2.734 2.639 2.446 2.338 2.204 2.068 1.956 1.832 1.593 0.945 -3 ,21455 ,KEBNE ,16658086,Tue Nov 23 07:28:07 CET,Tue Nov 23 08:52:50 CET,0.0 0.648 0.938 1.156 1.357 1.516 1.647 1.774 2.014 2.118 2.214 2.288 2.486 2.568 2.731 2.885 3.038 3.108 3.238 3.375 3.569 3.687 3.787 3.924 4.06 4.186 4.322 4.453 4.619 4.783 4.928 5.099 5.266 5.436 5.631 5.828 6.014 6.228 6.458 6.677 6.898 7.161 7.443 7.683 7.959 8.259 8.581 8.902 9.194 9.449 9.574 9.457 9.18 8.9 8.599 8.298 8.006 7.719 7.457 7.176 6.954 6.764 6.573 6.379 6.197 6.034 5.84 5.651 5.51 5.37 5.216 5.087 4.942 4.789 4.671 4.557 4.442 4.318 4.188 4.082 3.963 3.792 3.686 3.577 3.518 3.388 3.257 3.12 3.049 2.856 2.784 2.69 2.588 2.387 2.271 2.124 1.969 1.804 1.621 1.413 0.84 -4 ,27391 ,KEBNE ,16658087,Tue Nov 23 07:29:08 CET,Tue Nov 23 08:52:09 CET,0.0 0.701 0.956 1.151 1.31 1.442 1.584 1.739 1.99 2.096 2.204 2.294 2.49 2.579 2.759 2.93 3.075 3.139 3.26 3.386 3.576 3.686 3.79 3.95 4.096 4.229 4.359 4.491 4.663 4.828 4.973 5.134 5.305 5.466 5.643 5.839 6.014 6.203 6.422 6.643 6.856 7.073 7.328 7.598 7.879 8.16 8.476 8.802 9.106 9.386 9.522 9.383 9.128 8.816 8.48 8.149 7.821 7.514 7.264 6.995 6.75 6.548 6.365 6.184 6.0 5.831 5.657 5.494 5.346 5.197 5.049 4.915 4.772 4.628 4.507 4.38 4.253 4.126 3.986 3.886 3.782 3.623 3.511 3.385 3.325 3.197 3.044 2.899 2.827 2.644 2.616 2.531 2.42 2.229 2.14 2.037 1.93 1.797 1.632 1.399 0.797 -5 ,1558 ,KEBNE ,16658088,Tue Nov 23 07:32:12 CET,Tue Nov 23 08:55:23 CET,0.0 0.626 0.903 1.095 1.287 1.467 1.624 1.767 2.021 2.132 2.234 2.323 2.53 2.621 2.771 2.892 3.012 3.085 3.233 3.371 3.569 3.697 3.817 3.983 4.13 4.267 4.407 4.541 4.708 4.869 5.031 5.213 5.387 5.561 5.741 5.942 6.15 6.349 6.547 6.766 6.99 7.241 7.506 7.755 8.031 8.319 8.622 8.935 9.226 9.457 9.587 9.469 9.233 8.957 8.647 8.323 8.039 7.788 7.553 7.275 7.031 6.829 6.627 6.427 6.246 6.076 5.882 5.712 5.567 5.413 5.245 5.11 4.977 4.815 4.681 4.567 4.452 4.33 4.204 4.118 4.028 3.862 3.746 3.634 3.573 3.441 3.307 3.171 3.098 2.918 2.892 2.808 2.721 2.533 2.429 2.315 2.178 2.033 1.877 1.668 1.176 -6 ,24791 ,KEBNE ,16658089,Tue Nov 23 07:32:12 CET,Tue Nov 23 08:56:26 CET,0.0 0.628 0.858 1.031 1.184 1.33 1.484 1.621 1.835 1.937 2.036 2.113 2.317 2.403 2.554 2.703 2.843 2.908 3.025 3.139 3.311 3.414 3.518 3.656 3.777 3.904 4.045 4.192 4.36 4.499 4.634 4.805 4.971 5.137 5.344 5.54 5.691 5.891 6.111 6.324 6.544 6.787 7.067 7.348 7.644 7.918 8.234 8.551 8.864 9.149 9.268 9.155 8.877 8.551 8.25 7.933 7.616 7.331 7.087 6.821 6.587 6.367 6.145 5.938 5.756 5.599 5.434 5.281 5.141 4.995 4.847 4.717 4.572 4.423 4.315 4.203 4.083 3.947 3.81 3.71 3.605 3.453 3.341 3.23 3.175 3.065 2.931 2.766 2.678 2.483 2.402 2.299 2.211 2.059 1.961 1.829 1.686 1.539 1.397 1.191 0.681 -7 ,19843 ,KEBNE ,16658090,Tue Nov 23 07:33:13 CET,Tue Nov 23 08:56:42 CET,0.0 0.554 0.82 1.023 1.207 1.344 1.463 1.579 1.802 1.909 2.008 2.1 2.309 2.397 2.56 2.703 2.832 2.89 3.015 3.15 3.343 3.463 3.581 3.743 3.881 4.023 4.164 4.29 4.469 4.642 4.797 4.985 5.16 5.322 5.511 5.717 5.911 6.11 6.318 6.537 6.77 7.019 7.289 7.566 7.86 8.186 8.54 8.877 9.215 9.468 9.512 9.303 9.026 8.728 8.44 8.13 7.866 7.63 7.395 7.137 6.9 6.69 6.477 6.278 6.099 5.942 5.775 5.612 5.471 5.312 5.139 5.003 4.85 4.693 4.59 4.481 4.363 4.24 4.104 4.0 3.892 3.73 3.611 3.495 3.447 3.346 3.227 3.091 3.01 2.815 2.76 2.676 2.581 2.351 2.227 2.08 1.936 1.772 1.551 1.304 0.743 -8 ,28930 ,KEBNE ,16658091,Tue Nov 23 07:35:16 CET,Tue Nov 23 08:58:22 CET,0.0 0.747 1.021 1.247 1.452 1.614 1.743 1.879 2.115 2.207 2.309 2.4 2.592 2.671 2.827 2.976 3.127 3.202 3.324 3.431 3.6 3.713 3.816 3.95 4.075 4.208 4.346 4.479 4.65 4.805 4.942 5.102 5.25 5.396 5.561 5.76 5.968 6.182 6.389 6.599 6.813 7.044 7.321 7.589 7.881 8.177 8.521 8.874 9.221 9.491 9.584 9.425 9.159 8.847 8.536 8.248 7.956 7.662 7.401 7.151 6.931 6.713 6.512 6.317 6.119 5.947 5.759 5.568 5.403 5.251 5.108 4.979 4.836 4.68 4.553 4.433 4.305 4.164 4.028 3.942 3.853 3.696 3.581 3.465 3.408 3.283 3.158 3.02 2.939 2.757 2.71 2.619 2.514 2.291 2.188 2.079 1.975 1.841 1.659 1.428 0.959 -9 ,27439 ,KEBNE ,16658092,Tue Nov 23 07:35:18 CET,Tue Nov 23 08:54:34 CET,0.0 0.656 0.91 1.144 1.339 1.503 1.642 1.751 1.957 2.066 2.179 2.271 2.47 2.554 2.71 2.864 3.002 3.065 3.19 3.328 3.523 3.629 3.733 3.887 4.03 4.169 4.3 4.428 4.591 4.738 4.893 5.091 5.259 5.405 5.596 5.799 5.969 6.162 6.373 6.604 6.839 7.075 7.34 7.61 7.908 8.231 8.588 8.934 9.265 9.534 9.636 9.432 9.126 8.797 8.456 8.12 7.794 7.515 7.284 7.033 6.816 6.617 6.415 6.199 6.0 5.82 5.638 5.489 5.352 5.192 5.028 4.906 4.773 4.608 4.476 4.351 4.225 4.095 3.958 3.861 3.764 3.607 3.488 3.374 3.316 3.213 3.106 2.974 2.905 2.713 2.656 2.567 2.465 2.233 2.123 2.016 1.883 1.714 1.485 1.224 0.648 -10 ,3747 ,KEBNE ,16658093,Tue Nov 23 07:38:20 CET,Tue Nov 23 09:00:16 CET,0.0 0.823 1.062 1.244 1.411 1.565 1.722 1.875 2.165 2.28 2.375 2.445 2.654 2.749 2.914 3.057 3.202 3.275 3.401 3.512 3.663 3.767 3.883 4.059 4.214 4.35 4.481 4.603 4.759 4.906 5.041 5.212 5.381 5.539 5.7 5.896 6.11 6.331 6.55 6.772 7.0 7.24 7.511 7.768 8.054 8.361 8.668 8.973 9.264 9.498 9.606 9.43 9.137 8.789 8.429 8.117 7.842 7.554 7.299 7.042 6.803 6.598 6.403 6.2 6.008 5.822 5.616 5.446 5.31 5.166 5.017 4.876 4.715 4.568 4.46 4.33 4.185 4.052 3.926 3.832 3.732 3.573 3.454 3.336 3.282 3.165 3.023 2.868 2.798 2.614 2.534 2.44 2.347 2.123 1.999 1.881 1.747 1.589 1.411 1.151 0.612 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_252.txt deleted file mode 100644 index 92af304b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,680 ,KEBNE ,16658094,Tue Nov 23 07:39:23 CET,Tue Nov 23 09:00:07 CET,0.0 0.49 0.742 0.922 1.076 1.212 1.336 1.459 1.696 1.809 1.907 1.961 2.159 2.243 2.374 2.496 2.614 2.677 2.801 2.916 3.081 3.201 3.322 3.465 3.592 3.729 3.855 3.967 4.102 4.23 4.352 4.495 4.625 4.762 4.919 5.065 5.216 5.38 5.535 5.674 5.804 5.963 6.159 6.336 6.507 6.663 6.824 6.941 6.98 6.884 6.426 5.623 4.831 4.146 3.532 2.973 2.452 1.933 1.462 1.002 0.622 0.267 -0.076 -0.387 -0.68 -0.961 -1.254 -1.513 -1.727 -1.946 -2.187 -2.39 -2.6 -2.828 -3.021 -3.21 -3.39 -3.579 -3.761 -3.896 -4.041 -4.244 -4.39 -4.546 -4.626 -4.786 -4.955 -5.155 -5.268 -5.502 -5.585 -5.681 -5.796 -6.086 -6.248 -6.433 -6.633 -6.871 -7.139 -7.439 -8.327 -2 ,23545 ,KEBNE ,16658095,Tue Nov 23 07:40:23 CET,Tue Nov 23 09:02:21 CET,0.0 0.493 0.731 0.909 1.072 1.214 1.348 1.467 1.677 1.772 1.864 1.934 2.127 2.206 2.351 2.487 2.63 2.696 2.796 2.881 3.012 3.106 3.215 3.373 3.497 3.612 3.737 3.861 4.032 4.192 4.328 4.479 4.604 4.714 4.85 5.002 5.16 5.343 5.504 5.673 5.837 5.969 6.128 6.296 6.49 6.675 6.775 6.858 6.913 6.793 6.3 5.48 4.67 3.946 3.314 2.73 2.222 1.752 1.326 0.898 0.509 0.134 -0.217 -0.545 -0.836 -1.093 -1.381 -1.639 -1.864 -2.105 -2.352 -2.539 -2.74 -2.954 -3.106 -3.273 -3.445 -3.619 -3.81 -3.94 -4.079 -4.306 -4.455 -4.61 -4.685 -4.844 -5.01 -5.191 -5.293 -5.514 -5.62 -5.75 -5.886 -6.184 -6.351 -6.539 -6.728 -6.953 -7.244 -7.599 -8.642 -3 ,29380 ,KEBNE ,16658096,Tue Nov 23 07:40:23 CET,Tue Nov 23 09:04:27 CET,0.0 0.299 0.493 0.658 0.79 0.92 1.054 1.178 1.395 1.498 1.599 1.672 1.857 1.923 2.057 2.181 2.304 2.363 2.48 2.597 2.77 2.886 2.984 3.112 3.235 3.347 3.478 3.61 3.736 3.851 3.972 4.11 4.248 4.383 4.53 4.673 4.791 4.93 5.092 5.243 5.394 5.547 5.715 5.879 6.043 6.211 6.347 6.408 6.42 6.333 5.911 5.153 4.416 3.741 3.14 2.545 1.977 1.462 1.025 0.582 0.213 -0.113 -0.417 -0.688 -0.961 -1.218 -1.482 -1.737 -1.974 -2.209 -2.457 -2.677 -2.891 -3.118 -3.303 -3.485 -3.677 -3.876 -4.061 -4.187 -4.338 -4.573 -4.729 -4.91 -5.005 -5.185 -5.382 -5.595 -5.692 -5.912 -6.011 -6.125 -6.248 -6.501 -6.635 -6.79 -6.968 -7.189 -7.447 -7.766 -8.428 -4 ,31605 ,KEBNE ,16658097,Tue Nov 23 07:40:23 CET,Tue Nov 23 09:02:47 CET,0.0 0.517 0.803 1.002 1.18 1.348 1.482 1.582 1.742 1.819 1.893 1.92 2.104 2.185 2.331 2.477 2.629 2.689 2.796 2.911 3.071 3.163 3.246 3.385 3.533 3.668 3.775 3.871 4.002 4.139 4.276 4.428 4.584 4.725 4.865 5.025 5.162 5.296 5.442 5.606 5.781 5.954 6.127 6.283 6.469 6.662 6.822 6.913 6.889 6.735 6.292 5.501 4.741 4.074 3.434 2.822 2.298 1.816 1.382 0.964 0.577 0.218 -0.09 -0.398 -0.718 -0.993 -1.259 -1.499 -1.712 -1.948 -2.18 -2.363 -2.573 -2.793 -2.954 -3.118 -3.295 -3.48 -3.678 -3.828 -3.98 -4.202 -4.348 -4.502 -4.585 -4.744 -4.908 -5.097 -5.202 -5.43 -5.52 -5.633 -5.757 -6.0 -6.128 -6.283 -6.47 -6.686 -6.961 -7.265 -7.927 -5 ,28635 ,KEBNE ,16658098,Tue Nov 23 07:41:24 CET,Tue Nov 23 09:04:27 CET,0.0 0.437 0.702 0.914 1.108 1.296 1.451 1.589 1.827 1.919 2.008 2.074 2.271 2.356 2.513 2.665 2.821 2.89 3.003 3.124 3.289 3.384 3.481 3.628 3.774 3.9 4.009 4.108 4.247 4.378 4.506 4.66 4.79 4.916 5.058 5.209 5.358 5.511 5.652 5.801 5.947 6.094 6.251 6.403 6.579 6.717 6.85 6.968 6.99 6.87 6.422 5.631 4.798 4.046 3.377 2.787 2.266 1.732 1.281 0.852 0.47 0.119 -0.227 -0.554 -0.843 -1.094 -1.385 -1.66 -1.885 -2.125 -2.389 -2.598 -2.81 -3.037 -3.211 -3.396 -3.577 -3.762 -3.964 -4.104 -4.254 -4.493 -4.662 -4.836 -4.926 -5.103 -5.277 -5.48 -5.58 -5.798 -5.917 -6.044 -6.171 -6.451 -6.595 -6.749 -6.944 -7.155 -7.381 -7.689 -8.356 -6 ,32538 ,KEBNE ,16658099,Tue Nov 23 07:43:27 CET,Tue Nov 23 09:06:44 CET,0.0 0.444 0.727 0.977 1.208 1.393 1.526 1.624 1.8 1.894 1.991 2.037 2.229 2.317 2.48 2.627 2.752 2.811 2.951 3.081 3.239 3.342 3.445 3.6 3.735 3.851 3.959 4.06 4.207 4.346 4.461 4.607 4.752 4.885 5.021 5.162 5.3 5.438 5.589 5.746 5.908 6.086 6.258 6.424 6.574 6.703 6.83 6.907 6.919 6.79 6.297 5.455 4.648 3.901 3.259 2.658 2.128 1.622 1.163 0.704 0.304 -0.046 -0.388 -0.712 -0.992 -1.25 -1.519 -1.758 -1.965 -2.184 -2.411 -2.615 -2.829 -3.045 -3.228 -3.413 -3.599 -3.794 -3.994 -4.13 -4.286 -4.526 -4.683 -4.855 -4.941 -5.103 -5.264 -5.445 -5.547 -5.77 -5.866 -5.98 -6.106 -6.384 -6.544 -6.724 -6.896 -7.087 -7.342 -7.658 -8.538 -7 ,16379 ,KEBNE ,16658100,Tue Nov 23 07:43:27 CET,Tue Nov 23 09:07:11 CET,0.0 0.667 0.938 1.149 1.314 1.447 1.544 1.647 1.865 1.961 2.052 2.101 2.291 2.376 2.53 2.663 2.776 2.833 2.943 3.05 3.199 3.286 3.382 3.535 3.671 3.803 3.926 4.037 4.166 4.291 4.416 4.556 4.695 4.819 4.967 5.139 5.268 5.411 5.587 5.751 5.902 6.053 6.212 6.359 6.532 6.712 6.879 6.985 7.0 6.881 6.456 5.744 5.03 4.307 3.633 3.034 2.493 1.991 1.557 1.116 0.741 0.402 0.077 -0.231 -0.514 -0.781 -1.066 -1.313 -1.52 -1.74 -1.981 -2.18 -2.383 -2.6 -2.78 -2.954 -3.125 -3.324 -3.55 -3.7 -3.845 -4.066 -4.222 -4.387 -4.469 -4.651 -4.841 -5.033 -5.131 -5.349 -5.445 -5.569 -5.694 -5.964 -6.131 -6.307 -6.482 -6.688 -6.938 -7.272 -8.074 -8 ,24112 ,KEBNE ,16658101,Tue Nov 23 07:44:29 CET,Tue Nov 23 09:07:13 CET,0.0 0.531 0.795 0.981 1.145 1.306 1.431 1.541 1.754 1.853 1.959 2.019 2.195 2.257 2.403 2.561 2.7 2.76 2.861 2.972 3.152 3.251 3.334 3.459 3.587 3.727 3.856 3.97 4.125 4.285 4.434 4.581 4.71 4.837 4.982 5.158 5.321 5.491 5.666 5.827 5.988 6.154 6.319 6.477 6.633 6.759 6.859 6.91 6.911 6.8 6.391 5.587 4.849 4.121 3.429 2.851 2.317 1.799 1.333 0.859 0.464 0.125 -0.2 -0.504 -0.78 -1.043 -1.337 -1.589 -1.806 -2.034 -2.271 -2.479 -2.695 -2.895 -3.047 -3.214 -3.399 -3.592 -3.784 -3.923 -4.056 -4.266 -4.423 -4.582 -4.665 -4.829 -5.004 -5.207 -5.313 -5.533 -5.624 -5.733 -5.847 -6.113 -6.276 -6.452 -6.667 -6.912 -7.145 -7.456 -8.417 -9 ,154 ,KEBNE ,16658102,Tue Nov 23 07:44:31 CET,Tue Nov 23 09:03:25 CET,0.0 0.346 0.533 0.704 0.878 1.035 1.178 1.304 1.483 1.57 1.66 1.705 1.888 1.952 2.083 2.216 2.339 2.395 2.508 2.615 2.756 2.848 2.941 3.082 3.206 3.325 3.446 3.551 3.694 3.833 3.953 4.1 4.247 4.382 4.514 4.654 4.792 4.944 5.103 5.263 5.415 5.555 5.704 5.844 5.98 6.115 6.253 6.378 6.402 6.308 5.896 5.073 4.296 3.573 2.906 2.304 1.785 1.293 0.85 0.4 0.018 -0.318 -0.646 -0.951 -1.236 -1.501 -1.789 -2.043 -2.243 -2.466 -2.711 -2.916 -3.128 -3.33 -3.494 -3.656 -3.811 -3.99 -4.187 -4.325 -4.474 -4.692 -4.836 -4.989 -5.072 -5.243 -5.42 -5.644 -5.754 -5.973 -6.089 -6.217 -6.353 -6.651 -6.803 -6.954 -7.121 -7.339 -7.595 -7.906 -8.688 -10 ,26042 ,KEBNE ,16658103,Tue Nov 23 07:44:33 CET,Tue Nov 23 09:02:57 CET,0.0 0.483 0.75 0.958 1.129 1.263 1.401 1.536 1.792 1.891 1.983 2.074 2.263 2.329 2.467 2.602 2.75 2.822 2.937 3.037 3.19 3.287 3.378 3.526 3.67 3.784 3.898 4.002 4.117 4.234 4.372 4.54 4.678 4.799 4.928 5.069 5.22 5.394 5.548 5.691 5.859 6.05 6.233 6.374 6.502 6.618 6.767 6.87 6.886 6.783 6.351 5.57 4.789 4.115 3.508 2.923 2.383 1.871 1.436 1.027 0.631 0.261 -0.075 -0.387 -0.673 -0.941 -1.223 -1.465 -1.668 -1.891 -2.139 -2.342 -2.552 -2.76 -2.914 -3.083 -3.272 -3.473 -3.682 -3.83 -3.987 -4.215 -4.359 -4.516 -4.603 -4.784 -4.976 -5.187 -5.291 -5.523 -5.643 -5.761 -5.876 -6.137 -6.288 -6.466 -6.667 -6.876 -7.11 -7.407 -8.186 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_54.txt deleted file mode 100644 index 9554a759..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_163_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19529 ,KEBNE ,17023787,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:51:56 CET,0.0 1.334 1.77 2.139 2.464 2.765 3.02 3.233 3.623 3.816 3.988 4.19 4.455 4.604 4.904 5.195 5.469 5.606 5.861 6.102 6.448 6.67 6.891 7.208 7.516 7.821 8.108 8.376 8.754 9.121 9.462 9.862 10.248 10.643 11.098 11.6 12.09 12.655 13.244 13.832 14.461 15.184 16.015 16.831 17.813 18.937 20.243 21.706 23.382 25.423 28.083 30.365 31.701 32.58 33.213 33.676 33.971 34.183 34.352 34.459 34.516 34.558 34.574 34.577 34.566 34.545 34.508 34.455 34.392 34.326 34.246 34.171 34.1 34.025 33.96 33.888 33.803 33.711 33.623 33.552 33.478 33.374 33.292 33.203 33.155 33.06 32.962 32.856 32.799 32.648 32.584 32.496 32.41 32.219 32.093 31.972 31.827 31.65 31.44 31.145 30.236 -2 ,8137 ,KEBNE ,17023788,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:51:45 CET,0.0 1.361 1.85 2.235 2.548 2.792 3.002 3.204 3.609 3.803 3.978 4.189 4.452 4.591 4.869 5.159 5.43 5.555 5.805 6.047 6.372 6.575 6.787 7.097 7.39 7.674 7.947 8.22 8.569 8.894 9.218 9.611 9.977 10.347 10.803 11.316 11.787 12.294 12.89 13.556 14.278 15.065 15.892 16.728 17.698 18.785 20.092 21.61 23.392 25.566 28.293 30.507 31.812 32.673 33.281 33.729 34.04 34.26 34.387 34.476 34.535 34.548 34.533 34.517 34.5 34.475 34.439 34.394 34.32 34.229 34.147 34.077 33.992 33.9 33.828 33.755 33.69 33.623 33.539 33.474 33.403 33.291 33.2 33.102 33.058 32.953 32.832 32.716 32.65 32.498 32.431 32.343 32.246 32.046 31.939 31.817 31.667 31.485 31.274 30.963 29.592 -3 ,21600 ,KEBNE ,17023789,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:52:48 CET,0.0 1.656 2.176 2.51 2.829 3.113 3.36 3.59 4.022 4.206 4.366 4.56 4.823 4.976 5.264 5.533 5.797 5.923 6.167 6.416 6.775 6.998 7.221 7.551 7.849 8.128 8.401 8.676 9.029 9.373 9.706 10.09 10.462 10.823 11.264 11.786 12.287 12.827 13.404 13.999 14.641 15.37 16.181 17.001 17.988 19.109 20.401 21.852 23.603 25.719 28.353 30.652 32.0 32.879 33.523 33.965 34.247 34.44 34.57 34.657 34.666 34.66 34.666 34.65 34.601 34.558 34.535 34.494 34.439 34.365 34.284 34.223 34.149 34.068 34.0 33.914 33.819 33.732 33.646 33.566 33.482 33.36 33.264 33.177 33.138 33.054 32.937 32.776 32.696 32.534 32.434 32.333 32.228 32.005 31.891 31.767 31.626 31.458 31.242 30.941 29.517 -4 ,15501 ,KEBNE ,17023790,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:51:46 CET,0.0 1.698 2.18 2.555 2.837 3.097 3.326 3.524 3.941 4.132 4.307 4.568 4.847 5.002 5.283 5.56 5.838 5.96 6.197 6.435 6.778 6.99 7.201 7.505 7.79 8.072 8.352 8.623 8.968 9.309 9.662 10.096 10.499 10.878 11.317 11.817 12.286 12.805 13.375 13.95 14.577 15.317 16.169 17.029 18.09 19.328 20.666 22.084 23.758 25.817 28.433 30.712 32.086 33.001 33.602 34.015 34.304 34.527 34.686 34.805 34.871 34.904 34.915 34.926 34.935 34.916 34.877 34.824 34.77 34.713 34.641 34.575 34.5 34.426 34.37 34.308 34.247 34.173 34.075 34.007 33.941 33.835 33.757 33.674 33.629 33.509 33.384 33.27 33.207 33.05 32.98 32.907 32.822 32.623 32.521 32.398 32.229 32.019 31.78 31.489 30.807 -5 ,4014 ,KEBNE ,17023791,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:53:11 CET,0.0 1.019 1.496 1.864 2.137 2.389 2.649 2.889 3.293 3.472 3.645 3.843 4.1 4.251 4.538 4.82 5.096 5.225 5.468 5.709 6.069 6.297 6.514 6.834 7.141 7.43 7.716 7.988 8.327 8.659 8.976 9.363 9.737 10.087 10.487 10.949 11.414 11.918 12.441 13.007 13.633 14.32 15.111 15.943 16.931 18.019 19.307 20.79 22.536 24.68 27.365 29.648 31.014 31.909 32.498 32.916 33.218 33.439 33.596 33.704 33.749 33.76 33.747 33.729 33.709 33.678 33.646 33.623 33.572 33.497 33.435 33.388 33.325 33.236 33.161 33.084 32.998 32.913 32.835 32.776 32.702 32.587 32.504 32.398 32.339 32.234 32.143 32.04 31.981 31.833 31.748 31.657 31.581 31.416 31.321 31.194 31.039 30.856 30.643 30.348 29.368 -6 ,16004 ,KEBNE ,17023792,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:51:46 CET,0.0 1.521 1.972 2.297 2.576 2.81 3.034 3.255 3.669 3.862 4.033 4.259 4.536 4.689 4.968 5.239 5.507 5.635 5.88 6.128 6.483 6.694 6.892 7.186 7.499 7.797 8.088 8.368 8.71 9.05 9.392 9.81 10.221 10.608 11.019 11.465 11.903 12.403 12.946 13.528 14.15 14.862 15.708 16.526 17.485 18.597 19.895 21.362 23.146 25.32 27.961 30.254 31.641 32.536 33.101 33.492 33.786 33.994 34.137 34.246 34.294 34.319 34.326 34.307 34.285 34.264 34.221 34.17 34.126 34.069 33.996 33.925 33.837 33.755 33.69 33.603 33.519 33.431 33.328 33.256 33.182 33.062 32.982 32.903 32.852 32.738 32.63 32.514 32.448 32.292 32.225 32.146 32.061 31.845 31.717 31.556 31.379 31.205 30.985 30.642 29.194 -7 ,8230 ,KEBNE ,17023793,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:52:33 CET,0.0 1.455 2.002 2.386 2.667 2.914 3.146 3.368 3.77 3.938 4.103 4.319 4.588 4.742 5.051 5.33 5.569 5.688 5.938 6.179 6.528 6.758 6.976 7.288 7.598 7.906 8.186 8.445 8.784 9.114 9.43 9.814 10.202 10.596 11.055 11.521 11.967 12.479 13.037 13.651 14.31 15.07 16.013 16.95 17.962 19.089 20.485 22.078 23.869 26.039 28.764 31.106 32.442 33.328 33.998 34.428 34.722 34.957 35.119 35.217 35.251 35.272 35.28 35.291 35.291 35.254 35.199 35.152 35.095 35.03 34.956 34.89 34.817 34.731 34.665 34.59 34.509 34.42 34.319 34.245 34.16 34.028 33.942 33.824 33.752 33.628 33.51 33.384 33.319 33.166 33.069 32.97 32.872 32.652 32.519 32.384 32.206 31.988 31.717 31.298 30.215 -8 ,28321 ,KEBNE ,17023794,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:52:57 CET,0.0 1.051 1.481 1.85 2.145 2.391 2.61 2.809 3.21 3.405 3.573 3.782 4.048 4.192 4.477 4.754 5.019 5.145 5.401 5.654 6.018 6.246 6.45 6.736 7.007 7.271 7.551 7.831 8.19 8.533 8.864 9.252 9.627 10.013 10.451 10.934 11.419 11.974 12.578 13.204 13.837 14.565 15.458 16.355 17.36 18.533 19.903 21.375 23.158 25.3 27.907 30.163 31.513 32.368 32.945 33.335 33.599 33.794 33.938 34.04 34.069 34.077 34.085 34.089 34.081 34.065 34.04 33.994 33.933 33.861 33.788 33.736 33.687 33.626 33.573 33.5 33.418 33.336 33.238 33.165 33.094 32.989 32.907 32.819 32.771 32.661 32.542 32.402 32.324 32.167 32.1 32.012 31.911 31.723 31.62 31.507 31.395 31.238 30.999 30.679 29.724 -9 ,10321 ,KEBNE ,17023795,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:53:40 CET,0.0 1.539 2.021 2.365 2.665 2.959 3.205 3.411 3.821 4.019 4.19 4.408 4.67 4.81 5.086 5.357 5.623 5.741 5.974 6.221 6.574 6.793 6.999 7.293 7.585 7.884 8.177 8.461 8.813 9.149 9.489 9.909 10.308 10.695 11.139 11.639 12.113 12.623 13.178 13.789 14.473 15.25 16.156 17.051 18.058 19.223 20.631 22.231 24.086 26.263 28.945 31.264 32.677 33.571 34.14 34.518 34.797 35.005 35.142 35.207 35.232 35.263 35.286 35.288 35.267 35.243 35.206 35.152 35.102 35.032 34.935 34.864 34.8 34.733 34.676 34.605 34.522 34.437 34.333 34.256 34.183 34.069 33.991 33.915 33.87 33.774 33.66 33.528 33.461 33.301 33.229 33.149 33.066 32.898 32.792 32.661 32.485 32.291 32.107 31.817 30.281 -10 ,29132 ,KEBNE ,17023796,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:51:47 CET,0.0 1.03 1.489 1.863 2.161 2.449 2.723 2.957 3.376 3.552 3.718 3.939 4.207 4.354 4.621 4.88 5.14 5.265 5.505 5.739 6.106 6.343 6.555 6.852 7.137 7.416 7.688 7.96 8.321 8.649 8.969 9.387 9.781 10.143 10.57 11.043 11.507 12.059 12.642 13.222 13.82 14.499 15.309 16.151 17.174 18.345 19.735 21.393 23.42 25.675 28.312 30.602 31.953 32.83 33.456 33.899 34.175 34.4 34.54 34.622 34.681 34.703 34.725 34.726 34.697 34.659 34.594 34.538 34.506 34.465 34.391 34.314 34.222 34.132 34.071 34.015 33.942 33.843 33.743 33.688 33.613 33.474 33.393 33.309 33.263 33.156 33.038 32.923 32.861 32.704 32.625 32.533 32.443 32.264 32.151 32.006 31.84 31.658 31.386 31.072 30.252 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_164_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_164_231.txt deleted file mode 100644 index 3e888195..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_164_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8039 ,KEBNE ,17069473,Fri Dec 24 05:27:21 CET,Fri Dec 24 06:54:49 CET,0.0 0.662 0.907 1.1 1.26 1.395 1.52 1.637 1.847 1.945 2.033 2.099 2.297 2.383 2.545 2.707 2.857 2.926 3.063 3.194 3.383 3.504 3.629 3.815 3.987 4.149 4.292 4.424 4.61 4.797 4.981 5.197 5.405 5.618 5.858 6.116 6.379 6.672 6.971 7.285 7.629 8.001 8.439 8.888 9.409 9.991 10.612 11.275 11.942 12.528 12.96 12.951 12.763 12.485 12.137 11.758 11.361 10.996 10.661 10.327 10.065 9.815 9.532 9.255 9.014 8.805 8.578 8.352 8.16 7.96 7.746 7.577 7.407 7.223 7.073 6.919 6.762 6.597 6.416 6.286 6.155 5.961 5.837 5.701 5.619 5.448 5.291 5.127 5.045 4.857 4.759 4.64 4.509 4.232 4.084 3.929 3.772 3.607 3.413 3.138 2.48 -2 ,13222 ,KEBNE ,17069475,Fri Dec 24 05:28:26 CET,Fri Dec 24 06:56:28 CET,0.0 0.434 0.644 0.839 1.003 1.152 1.293 1.413 1.631 1.731 1.82 1.899 2.101 2.179 2.335 2.491 2.634 2.704 2.848 2.979 3.164 3.293 3.422 3.599 3.769 3.931 4.077 4.221 4.406 4.581 4.758 4.99 5.21 5.411 5.663 5.954 6.199 6.463 6.774 7.121 7.473 7.816 8.22 8.636 9.098 9.625 10.244 10.922 11.565 12.118 12.627 12.813 12.711 12.399 12.03 11.691 11.319 10.99 10.692 10.355 10.076 9.826 9.582 9.331 9.082 8.839 8.594 8.398 8.228 8.038 7.837 7.661 7.473 7.29 7.137 6.972 6.808 6.643 6.466 6.342 6.225 6.037 5.9 5.767 5.698 5.537 5.371 5.211 5.124 4.928 4.837 4.727 4.61 4.357 4.219 4.073 3.912 3.752 3.576 3.303 2.655 -3 ,21413 ,KEBNE ,17069478,Fri Dec 24 05:37:55 CET,Fri Dec 24 07:03:31 CET,0.0 0.35 0.559 0.74 0.917 1.064 1.193 1.324 1.556 1.665 1.772 1.864 2.06 2.139 2.29 2.429 2.571 2.642 2.777 2.906 3.077 3.194 3.318 3.486 3.644 3.803 3.961 4.119 4.321 4.506 4.685 4.912 5.126 5.328 5.558 5.828 6.099 6.369 6.659 6.998 7.361 7.748 8.196 8.621 9.082 9.585 10.151 10.836 11.6 12.333 12.96 13.144 12.945 12.532 12.078 11.697 11.365 11.009 10.707 10.407 10.122 9.847 9.586 9.345 9.105 8.875 8.62 8.388 8.194 7.997 7.79 7.616 7.432 7.243 7.098 6.948 6.79 6.618 6.442 6.328 6.202 6.007 5.881 5.744 5.671 5.523 5.368 5.195 5.103 4.899 4.798 4.687 4.577 4.361 4.23 4.089 3.931 3.741 3.528 3.197 2.479 -4 ,6122 ,KEBNE ,17069479,Fri Dec 24 05:42:04 CET,Fri Dec 24 07:08:00 CET,0.0 0.533 0.779 0.966 1.122 1.251 1.377 1.508 1.743 1.842 1.935 1.998 2.189 2.265 2.417 2.56 2.697 2.768 2.892 3.023 3.221 3.34 3.466 3.637 3.789 3.949 4.11 4.26 4.455 4.655 4.849 5.085 5.31 5.519 5.763 6.031 6.284 6.568 6.885 7.226 7.57 7.956 8.417 8.854 9.304 9.816 10.451 11.046 11.69 12.419 12.95 12.858 12.516 12.193 11.885 11.544 11.182 10.816 10.493 10.138 9.811 9.522 9.245 8.994 8.763 8.542 8.307 8.084 7.895 7.699 7.483 7.314 7.141 6.955 6.8 6.639 6.476 6.297 6.113 5.995 5.873 5.685 5.564 5.434 5.366 5.224 5.061 4.892 4.813 4.625 4.534 4.422 4.315 4.064 3.904 3.762 3.63 3.47 3.276 3.01 2.347 -5 ,9902 ,KEBNE ,17069482,Fri Dec 24 05:50:34 CET,Fri Dec 24 07:18:10 CET,0.0 0.507 0.743 0.927 1.063 1.191 1.324 1.444 1.639 1.723 1.811 1.883 2.081 2.175 2.352 2.516 2.673 2.748 2.896 3.033 3.225 3.355 3.478 3.654 3.824 3.988 4.147 4.3 4.503 4.707 4.9 5.124 5.335 5.543 5.788 6.057 6.31 6.588 6.894 7.214 7.553 7.939 8.349 8.757 9.235 9.765 10.394 11.111 11.793 12.379 12.917 12.953 12.736 12.407 12.058 11.696 11.317 10.968 10.66 10.335 10.027 9.732 9.445 9.182 8.94 8.72 8.494 8.279 8.082 7.89 7.695 7.531 7.359 7.177 7.037 6.896 6.745 6.578 6.406 6.294 6.177 5.988 5.854 5.712 5.641 5.489 5.326 5.15 5.055 4.858 4.794 4.697 4.588 4.335 4.2 4.058 3.898 3.719 3.477 3.159 2.565 -6 ,14274 ,KEBNE ,17069483,Fri Dec 24 05:50:34 CET,Fri Dec 24 07:16:27 CET,0.0 0.625 0.899 1.095 1.24 1.383 1.526 1.658 1.886 1.992 2.085 2.159 2.36 2.45 2.618 2.785 2.93 2.995 3.129 3.266 3.456 3.569 3.68 3.846 4.019 4.178 4.326 4.474 4.666 4.851 5.021 5.242 5.464 5.677 5.918 6.179 6.425 6.691 6.984 7.284 7.585 7.929 8.352 8.781 9.241 9.741 10.332 11.019 11.76 12.457 12.963 13.122 13.012 12.751 12.411 12.063 11.732 11.354 11.01 10.674 10.372 10.09 9.802 9.507 9.247 9.039 8.813 8.596 8.415 8.226 8.017 7.835 7.641 7.451 7.307 7.151 6.988 6.818 6.639 6.522 6.407 6.214 6.076 5.926 5.846 5.695 5.537 5.362 5.267 5.063 4.946 4.828 4.722 4.493 4.367 4.236 4.076 3.892 3.708 3.488 2.967 -7 ,31140 ,KEBNE ,17069486,Fri Dec 24 05:54:56 CET,Fri Dec 24 07:22:16 CET,0.0 0.537 0.785 0.965 1.116 1.248 1.372 1.497 1.707 1.802 1.891 1.949 2.142 2.223 2.383 2.535 2.674 2.744 2.891 3.029 3.231 3.362 3.48 3.643 3.803 3.967 4.121 4.27 4.471 4.67 4.862 5.091 5.309 5.504 5.734 6.006 6.264 6.55 6.837 7.14 7.495 7.837 8.198 8.626 9.126 9.683 10.295 10.92 11.611 12.266 12.847 13.14 13.01 12.728 12.449 12.132 11.798 11.45 11.117 10.747 10.44 10.185 9.924 9.675 9.437 9.209 8.98 8.779 8.607 8.42 8.215 8.049 7.875 7.683 7.527 7.377 7.219 7.036 6.845 6.728 6.614 6.434 6.301 6.162 6.092 5.935 5.78 5.629 5.552 5.363 5.273 5.169 5.069 4.848 4.719 4.577 4.423 4.254 4.046 3.765 3.257 -8 ,23000 ,KEBNE ,17069487,Fri Dec 24 05:56:00 CET,Fri Dec 24 07:23:37 CET,0.0 0.624 0.919 1.123 1.274 1.399 1.51 1.632 1.865 1.965 2.063 2.139 2.336 2.42 2.579 2.734 2.885 2.955 3.087 3.213 3.393 3.515 3.64 3.813 3.995 4.179 4.342 4.491 4.673 4.859 5.056 5.295 5.525 5.739 5.969 6.235 6.496 6.784 7.104 7.433 7.771 8.138 8.56 8.984 9.478 10.049 10.661 11.297 11.926 12.553 13.176 13.383 13.175 12.859 12.529 12.161 11.836 11.52 11.212 10.888 10.585 10.325 10.092 9.861 9.643 9.444 9.209 8.989 8.808 8.61 8.407 8.239 8.053 7.879 7.748 7.6 7.448 7.287 7.108 6.985 6.857 6.657 6.527 6.397 6.33 6.176 6.017 5.847 5.757 5.559 5.454 5.336 5.223 4.998 4.874 4.717 4.531 4.349 4.161 3.923 3.395 -9 ,8338 ,KEBNE ,17069489,Fri Dec 24 05:57:05 CET,Fri Dec 24 07:24:45 CET,0.0 0.467 0.718 0.885 1.009 1.118 1.225 1.338 1.555 1.654 1.749 1.815 2.008 2.097 2.27 2.43 2.589 2.66 2.791 2.92 3.103 3.224 3.35 3.527 3.697 3.863 4.02 4.164 4.358 4.562 4.747 4.963 5.171 5.367 5.59 5.83 6.063 6.331 6.624 6.937 7.27 7.663 8.146 8.609 9.121 9.666 10.245 10.878 11.632 12.391 12.876 12.9 12.639 12.284 11.918 11.563 11.188 10.782 10.421 10.067 9.773 9.504 9.24 8.983 8.73 8.511 8.294 8.099 7.925 7.737 7.532 7.358 7.178 6.99 6.841 6.69 6.531 6.366 6.198 6.074 5.954 5.773 5.634 5.48 5.403 5.257 5.114 4.961 4.875 4.68 4.601 4.495 4.383 4.157 4.018 3.846 3.659 3.455 3.204 2.86 2.299 -10 ,26092 ,KEBNE ,17069492,Fri Dec 24 05:59:10 CET,Fri Dec 24 07:26:56 CET,0.0 0.49 0.712 0.929 1.093 1.228 1.347 1.455 1.655 1.761 1.868 1.963 2.169 2.263 2.431 2.581 2.719 2.787 2.926 3.064 3.258 3.381 3.504 3.678 3.849 4.017 4.176 4.324 4.517 4.709 4.901 5.129 5.35 5.574 5.822 6.077 6.331 6.615 6.915 7.243 7.601 7.978 8.382 8.784 9.243 9.736 10.327 11.038 11.783 12.495 13.121 13.428 13.361 13.055 12.716 12.356 12.004 11.683 11.39 11.072 10.793 10.555 10.326 10.089 9.85 9.623 9.397 9.192 9.006 8.803 8.591 8.425 8.243 8.058 7.915 7.746 7.58 7.422 7.251 7.135 7.017 6.815 6.67 6.536 6.47 6.336 6.189 6.018 5.928 5.732 5.647 5.548 5.445 5.192 5.06 4.928 4.77 4.559 4.289 3.975 3.473 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_167_234.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_167_234.txt deleted file mode 100644 index 84987cbe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_167_234.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12270 ,KEBNE ,16658104,Tue Nov 23 07:46:31 CET,Tue Nov 23 09:09:13 CET,0.0 0.558 0.822 0.99 1.104 1.191 1.288 1.398 1.578 1.654 1.737 1.789 1.938 1.997 2.143 2.28 2.381 2.426 2.512 2.6 2.72 2.789 2.865 2.979 3.063 3.133 3.205 3.264 3.33 3.402 3.464 3.533 3.601 3.659 3.731 3.811 3.87 3.914 3.952 3.994 4.01 4.022 4.031 3.982 3.915 3.825 3.651 3.366 2.916 2.173 0.739 -1.026 -2.437 -3.602 -4.563 -5.409 -6.137 -6.789 -7.354 -7.927 -8.413 -8.844 -9.252 -9.616 -9.947 -10.247 -10.565 -10.852 -11.091 -11.327 -11.575 -11.808 -12.044 -12.258 -12.422 -12.604 -12.792 -12.984 -13.18 -13.31 -13.446 -13.67 -13.838 -14.013 -14.102 -14.286 -14.457 -14.634 -14.731 -14.935 -15.036 -15.16 -15.294 -15.583 -15.723 -15.86 -16.009 -16.19 -16.379 -16.614 -17.04 -2 ,16409 ,KEBNE ,16658105,Tue Nov 23 07:46:31 CET,Tue Nov 23 09:08:10 CET,0.0 0.357 0.572 0.759 0.904 1.018 1.131 1.24 1.446 1.544 1.627 1.681 1.837 1.906 2.044 2.157 2.257 2.305 2.403 2.489 2.587 2.647 2.712 2.81 2.9 2.98 3.054 3.119 3.206 3.302 3.397 3.502 3.576 3.651 3.739 3.802 3.853 3.9 3.951 4.003 4.031 4.045 4.021 3.983 3.946 3.847 3.665 3.377 2.861 2.047 0.701 -0.996 -2.431 -3.605 -4.586 -5.434 -6.154 -6.801 -7.354 -7.903 -8.377 -8.778 -9.146 -9.51 -9.847 -10.158 -10.506 -10.815 -11.085 -11.363 -11.633 -11.851 -12.067 -12.293 -12.469 -12.65 -12.852 -13.068 -13.275 -13.416 -13.563 -13.79 -13.949 -14.111 -14.196 -14.366 -14.546 -14.744 -14.845 -15.059 -15.153 -15.263 -15.387 -15.671 -15.831 -16.004 -16.189 -16.358 -16.53 -16.754 -17.196 -3 ,29669 ,KEBNE ,16658106,Tue Nov 23 07:46:35 CET,Tue Nov 23 09:05:50 CET,0.0 0.565 0.799 0.935 1.044 1.147 1.26 1.366 1.528 1.597 1.669 1.715 1.869 1.931 2.037 2.142 2.237 2.278 2.365 2.45 2.572 2.637 2.701 2.799 2.878 2.955 3.036 3.106 3.185 3.265 3.348 3.433 3.489 3.542 3.621 3.711 3.785 3.853 3.908 3.954 3.998 4.025 4.041 4.023 3.968 3.873 3.697 3.405 2.895 2.074 0.669 -0.998 -2.363 -3.485 -4.428 -5.303 -6.076 -6.739 -7.274 -7.82 -8.3 -8.713 -9.109 -9.504 -9.864 -10.18 -10.522 -10.82 -11.071 -11.341 -11.614 -11.829 -12.048 -12.288 -12.48 -12.683 -12.895 -13.089 -13.288 -13.43 -13.584 -13.821 -13.982 -14.15 -14.233 -14.396 -14.564 -14.749 -14.854 -15.073 -15.195 -15.313 -15.442 -15.736 -15.874 -16.001 -16.16 -16.35 -16.527 -16.723 -17.14 -4 ,18426 ,KEBNE ,16658107,Tue Nov 23 07:47:32 CET,Tue Nov 23 09:09:11 CET,0.0 0.553 0.743 0.908 1.062 1.183 1.279 1.377 1.545 1.617 1.687 1.703 1.849 1.906 2.024 2.124 2.218 2.269 2.359 2.444 2.57 2.644 2.72 2.83 2.921 2.995 3.06 3.125 3.202 3.268 3.339 3.431 3.522 3.597 3.675 3.77 3.837 3.885 3.937 3.996 4.043 4.081 4.105 4.101 4.048 3.953 3.791 3.518 3.064 2.3 0.969 -0.657 -2.02 -3.168 -4.157 -5.021 -5.744 -6.404 -6.972 -7.551 -8.04 -8.45 -8.848 -9.224 -9.564 -9.864 -10.183 -10.459 -10.683 -10.937 -11.207 -11.428 -11.668 -11.918 -12.105 -12.291 -12.486 -12.689 -12.896 -13.034 -13.185 -13.415 -13.571 -13.741 -13.823 -13.985 -14.148 -14.334 -14.436 -14.653 -14.767 -14.873 -14.983 -15.213 -15.339 -15.495 -15.685 -15.896 -16.12 -16.417 -17.02 -5 ,26727 ,KEBNE ,16658108,Tue Nov 23 07:48:33 CET,Tue Nov 23 09:10:27 CET,0.0 0.289 0.487 0.641 0.791 0.923 1.045 1.152 1.326 1.408 1.503 1.588 1.749 1.814 1.945 2.063 2.167 2.214 2.294 2.375 2.497 2.569 2.641 2.74 2.834 2.928 3.015 3.085 3.177 3.267 3.344 3.425 3.491 3.557 3.622 3.676 3.737 3.804 3.869 3.919 3.944 3.959 3.992 3.996 3.933 3.808 3.592 3.283 2.781 1.97 0.573 -1.178 -2.587 -3.704 -4.696 -5.606 -6.356 -7.043 -7.626 -8.203 -8.701 -9.129 -9.549 -9.919 -10.239 -10.544 -10.886 -11.182 -11.421 -11.671 -11.939 -12.171 -12.405 -12.631 -12.805 -12.984 -13.18 -13.388 -13.589 -13.724 -13.861 -14.06 -14.201 -14.366 -14.454 -14.622 -14.795 -14.99 -15.096 -15.309 -15.41 -15.52 -15.635 -15.932 -16.1 -16.269 -16.451 -16.623 -16.828 -17.092 -17.515 -6 ,20805 ,KEBNE ,16658109,Tue Nov 23 07:48:33 CET,Tue Nov 23 09:12:02 CET,0.0 0.49 0.687 0.865 1.036 1.173 1.277 1.362 1.541 1.622 1.686 1.726 1.889 1.94 2.026 2.108 2.198 2.241 2.308 2.373 2.48 2.545 2.61 2.713 2.817 2.922 3.019 3.108 3.208 3.301 3.382 3.456 3.534 3.606 3.67 3.737 3.82 3.926 3.997 4.036 4.075 4.101 4.122 4.132 4.097 4.002 3.801 3.477 3.008 2.281 0.964 -0.727 -2.106 -3.254 -4.255 -5.142 -5.91 -6.57 -7.104 -7.649 -8.129 -8.561 -8.963 -9.336 -9.683 -9.993 -10.314 -10.591 -10.839 -11.105 -11.376 -11.608 -11.85 -12.091 -12.264 -12.447 -12.649 -12.861 -13.066 -13.201 -13.342 -13.584 -13.752 -13.914 -13.999 -14.176 -14.369 -14.563 -14.668 -14.886 -14.981 -15.104 -15.246 -15.545 -15.693 -15.828 -15.982 -16.194 -16.438 -16.689 -17.028 -7 ,23996 ,KEBNE ,16658110,Tue Nov 23 07:49:38 CET,Tue Nov 23 09:08:28 CET,0.0 0.397 0.59 0.758 0.89 1.002 1.108 1.211 1.411 1.494 1.571 1.598 1.741 1.796 1.904 2.01 2.12 2.17 2.249 2.329 2.448 2.52 2.595 2.703 2.79 2.865 2.935 3.001 3.088 3.166 3.232 3.33 3.436 3.511 3.564 3.638 3.729 3.801 3.852 3.898 3.95 3.994 3.983 3.934 3.835 3.713 3.554 3.284 2.785 1.957 0.55 -1.201 -2.611 -3.816 -4.833 -5.68 -6.4 -7.067 -7.654 -8.202 -8.645 -9.04 -9.427 -9.81 -10.168 -10.491 -10.831 -11.123 -11.369 -11.625 -11.88 -12.094 -12.316 -12.533 -12.701 -12.887 -13.084 -13.288 -13.5 -13.633 -13.77 -14.006 -14.179 -14.343 -14.417 -14.575 -14.755 -14.969 -15.07 -15.274 -15.384 -15.507 -15.628 -15.868 -15.999 -16.139 -16.285 -16.466 -16.67 -16.957 -17.599 -8 ,21714 ,KEBNE ,16658111,Tue Nov 23 07:49:38 CET,Tue Nov 23 09:08:50 CET,0.0 0.495 0.685 0.785 0.873 0.971 1.063 1.141 1.271 1.338 1.417 1.461 1.617 1.677 1.786 1.884 1.968 2.013 2.107 2.19 2.305 2.375 2.44 2.532 2.623 2.711 2.79 2.861 2.954 3.044 3.122 3.207 3.283 3.345 3.418 3.499 3.571 3.634 3.685 3.738 3.783 3.812 3.795 3.767 3.726 3.602 3.386 3.058 2.551 1.718 0.237 -1.54 -2.928 -4.077 -5.08 -5.981 -6.747 -7.404 -7.963 -8.53 -9.006 -9.436 -9.83 -10.183 -10.531 -10.852 -11.17 -11.463 -11.71 -11.948 -12.215 -12.444 -12.676 -12.926 -13.116 -13.303 -13.496 -13.697 -13.91 -14.057 -14.206 -14.424 -14.575 -14.748 -14.831 -14.987 -15.15 -15.329 -15.424 -15.634 -15.739 -15.855 -15.974 -16.226 -16.365 -16.519 -16.692 -16.916 -17.186 -17.496 -18.099 -9 ,6976 ,KEBNE ,16658112,Tue Nov 23 07:50:35 CET,Tue Nov 23 09:13:39 CET,0.0 0.419 0.633 0.777 0.903 1.018 1.128 1.232 1.433 1.519 1.596 1.649 1.81 1.87 1.971 2.07 2.171 2.223 2.314 2.398 2.523 2.593 2.661 2.759 2.858 2.942 3.019 3.1 3.195 3.29 3.371 3.447 3.517 3.591 3.69 3.772 3.819 3.875 3.924 3.967 4.007 4.029 4.034 4.016 3.965 3.848 3.647 3.382 2.927 2.129 0.677 -1.113 -2.559 -3.771 -4.748 -5.582 -6.309 -6.973 -7.536 -8.091 -8.556 -8.97 -9.368 -9.753 -10.103 -10.398 -10.704 -10.977 -11.227 -11.478 -11.725 -11.947 -12.183 -12.408 -12.585 -12.793 -13.002 -13.206 -13.428 -13.588 -13.738 -13.963 -14.121 -14.278 -14.356 -14.528 -14.71 -14.882 -14.971 -15.178 -15.263 -15.375 -15.499 -15.734 -15.859 -16.0 -16.146 -16.312 -16.511 -16.745 -17.324 -10 ,109 ,KEBNE ,16658113,Tue Nov 23 07:50:35 CET,Tue Nov 23 09:12:03 CET,0.0 0.662 0.917 1.096 1.243 1.344 1.436 1.54 1.731 1.813 1.888 1.921 2.068 2.118 2.233 2.342 2.438 2.483 2.574 2.659 2.78 2.855 2.916 3.012 3.108 3.191 3.268 3.355 3.457 3.535 3.607 3.688 3.765 3.838 3.915 4.002 4.088 4.168 4.248 4.312 4.365 4.411 4.447 4.45 4.389 4.298 4.136 3.831 3.357 2.566 1.15 -0.57 -1.988 -3.19 -4.21 -5.073 -5.801 -6.441 -6.988 -7.549 -8.037 -8.463 -8.883 -9.282 -9.627 -9.948 -10.283 -10.577 -10.831 -11.079 -11.319 -11.51 -11.726 -11.957 -12.125 -12.313 -12.507 -12.694 -12.893 -13.031 -13.163 -13.382 -13.545 -13.719 -13.801 -13.96 -14.141 -14.323 -14.423 -14.639 -14.744 -14.86 -14.984 -15.244 -15.381 -15.526 -15.696 -15.893 -16.08 -16.376 -17.248 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_1_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_1_61.txt deleted file mode 100644 index 8a5a20fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_1_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8687 ,KEBNE ,16658114,Tue Nov 23 07:51:36 CET,Tue Nov 23 09:13:09 CET,0.0 0.426 0.639 0.826 0.991 1.141 1.262 1.365 1.564 1.651 1.725 1.818 1.971 2.04 2.167 2.285 2.401 2.459 2.592 2.715 2.857 2.943 3.032 3.153 3.27 3.379 3.478 3.58 3.705 3.82 3.941 4.09 4.207 4.313 4.438 4.589 4.752 4.912 5.064 5.211 5.343 5.489 5.641 5.768 5.899 6.012 6.128 6.157 6.072 5.864 5.278 4.362 3.561 2.855 2.207 1.611 1.097 0.642 0.252 -0.153 -0.508 -0.822 -1.121 -1.403 -1.674 -1.914 -2.152 -2.369 -2.568 -2.795 -3.036 -3.223 -3.41 -3.6 -3.745 -3.899 -4.047 -4.199 -4.375 -4.497 -4.622 -4.822 -4.952 -5.087 -5.158 -5.304 -5.45 -5.602 -5.688 -5.859 -5.965 -6.074 -6.195 -6.459 -6.589 -6.724 -6.883 -7.057 -7.251 -7.517 -8.013 -2 ,1195 ,KEBNE ,16658115,Tue Nov 23 07:51:36 CET,Tue Nov 23 09:15:14 CET,0.0 0.336 0.507 0.657 0.798 0.931 1.058 1.159 1.337 1.43 1.508 1.585 1.735 1.809 1.935 2.049 2.165 2.221 2.324 2.422 2.563 2.65 2.73 2.836 2.954 3.065 3.161 3.265 3.387 3.51 3.625 3.747 3.856 3.984 4.136 4.27 4.387 4.508 4.63 4.758 4.896 5.03 5.162 5.276 5.398 5.512 5.578 5.609 5.554 5.293 4.637 3.73 2.957 2.306 1.674 1.091 0.603 0.126 -0.276 -0.684 -1.054 -1.364 -1.657 -1.94 -2.204 -2.458 -2.723 -2.95 -3.145 -3.341 -3.539 -3.718 -3.899 -4.088 -4.249 -4.422 -4.59 -4.756 -4.934 -5.062 -5.199 -5.399 -5.535 -5.689 -5.769 -5.917 -6.061 -6.228 -6.321 -6.497 -6.621 -6.734 -6.854 -7.106 -7.246 -7.384 -7.523 -7.68 -7.883 -8.14 -8.576 -3 ,17289 ,KEBNE ,16658116,Tue Nov 23 07:51:40 CET,Tue Nov 23 09:10:30 CET,0.0 0.393 0.595 0.769 0.909 1.035 1.149 1.249 1.442 1.542 1.641 1.724 1.869 1.948 2.094 2.212 2.324 2.378 2.494 2.605 2.739 2.831 2.916 3.043 3.168 3.274 3.378 3.478 3.606 3.73 3.847 3.979 4.094 4.212 4.342 4.471 4.604 4.732 4.864 5.012 5.159 5.312 5.465 5.578 5.674 5.757 5.823 5.834 5.763 5.589 5.057 4.19 3.407 2.703 2.06 1.47 0.962 0.501 0.1 -0.29 -0.625 -0.927 -1.217 -1.504 -1.769 -2.006 -2.258 -2.488 -2.678 -2.873 -3.084 -3.253 -3.432 -3.629 -3.771 -3.926 -4.099 -4.261 -4.423 -4.539 -4.666 -4.874 -5.024 -5.166 -5.23 -5.372 -5.535 -5.709 -5.796 -5.969 -6.102 -6.21 -6.332 -6.606 -6.739 -6.867 -6.999 -7.164 -7.382 -7.656 -8.307 -4 ,8996 ,KEBNE ,16658117,Tue Nov 23 07:52:37 CET,Tue Nov 23 09:14:07 CET,0.0 0.486 0.735 0.958 1.145 1.285 1.396 1.503 1.69 1.761 1.834 1.928 2.072 2.137 2.288 2.433 2.554 2.609 2.721 2.836 2.991 3.084 3.176 3.299 3.415 3.533 3.634 3.726 3.848 3.975 4.089 4.211 4.345 4.45 4.556 4.694 4.821 4.946 5.069 5.214 5.372 5.52 5.67 5.807 5.937 6.051 6.135 6.165 6.124 5.895 5.318 4.447 3.631 2.896 2.258 1.676 1.139 0.641 0.201 -0.22 -0.582 -0.89 -1.162 -1.432 -1.701 -1.966 -2.227 -2.43 -2.607 -2.813 -3.042 -3.238 -3.439 -3.637 -3.788 -3.948 -4.118 -4.296 -4.492 -4.627 -4.763 -4.982 -5.134 -5.294 -5.372 -5.525 -5.688 -5.846 -5.931 -6.105 -6.218 -6.333 -6.45 -6.673 -6.812 -6.963 -7.114 -7.313 -7.551 -7.792 -8.287 -5 ,15586 ,KEBNE ,16658118,Tue Nov 23 07:53:39 CET,Tue Nov 23 09:15:33 CET,0.0 0.596 0.834 1.039 1.215 1.355 1.456 1.56 1.76 1.853 1.944 2.032 2.17 2.232 2.345 2.449 2.554 2.6 2.687 2.775 2.915 3.01 3.1 3.221 3.33 3.442 3.546 3.642 3.759 3.874 3.99 4.121 4.263 4.4 4.518 4.639 4.768 4.892 5.02 5.157 5.286 5.422 5.575 5.712 5.846 5.979 6.084 6.115 6.051 5.823 5.255 4.369 3.564 2.846 2.183 1.59 1.076 0.6 0.178 -0.238 -0.581 -0.887 -1.179 -1.443 -1.693 -1.932 -2.186 -2.411 -2.605 -2.81 -3.027 -3.205 -3.402 -3.626 -3.789 -3.944 -4.11 -4.293 -4.47 -4.593 -4.73 -4.953 -5.101 -5.24 -5.309 -5.461 -5.626 -5.803 -5.894 -6.069 -6.161 -6.245 -6.34 -6.568 -6.703 -6.852 -7.027 -7.236 -7.497 -7.827 -8.363 -6 ,16422 ,KEBNE ,16658119,Tue Nov 23 07:54:39 CET,Tue Nov 23 09:17:28 CET,0.0 0.573 0.809 0.982 1.13 1.256 1.36 1.458 1.626 1.71 1.789 1.87 2.019 2.094 2.229 2.352 2.471 2.526 2.627 2.719 2.864 2.959 3.034 3.141 3.273 3.397 3.496 3.6 3.723 3.83 3.947 4.067 4.174 4.286 4.411 4.566 4.703 4.842 4.993 5.131 5.247 5.373 5.546 5.698 5.833 5.958 6.044 6.055 5.969 5.736 5.124 4.226 3.425 2.725 2.101 1.531 1.032 0.577 0.178 -0.221 -0.544 -0.844 -1.181 -1.49 -1.732 -1.951 -2.2 -2.44 -2.656 -2.864 -3.088 -3.288 -3.477 -3.659 -3.813 -3.967 -4.124 -4.295 -4.453 -4.555 -4.671 -4.874 -5.024 -5.162 -5.232 -5.408 -5.592 -5.772 -5.861 -6.034 -6.152 -6.258 -6.365 -6.601 -6.734 -6.864 -7.021 -7.199 -7.389 -7.672 -8.45 -7 ,26082 ,KEBNE ,16658120,Tue Nov 23 07:54:40 CET,Tue Nov 23 09:17:17 CET,0.0 0.504 0.776 0.99 1.176 1.344 1.502 1.639 1.845 1.93 2.011 2.078 2.223 2.297 2.432 2.548 2.652 2.707 2.807 2.906 3.041 3.117 3.204 3.343 3.475 3.598 3.715 3.815 3.945 4.066 4.157 4.25 4.354 4.473 4.608 4.745 4.876 5.019 5.145 5.261 5.394 5.541 5.7 5.833 5.958 6.066 6.12 6.14 6.103 5.881 5.325 4.459 3.631 2.904 2.275 1.693 1.202 0.769 0.384 -0.005 -0.346 -0.65 -0.937 -1.21 -1.466 -1.718 -1.983 -2.215 -2.435 -2.658 -2.868 -3.038 -3.218 -3.408 -3.566 -3.731 -3.878 -4.036 -4.207 -4.335 -4.465 -4.656 -4.814 -4.979 -5.058 -5.218 -5.38 -5.551 -5.633 -5.8 -5.914 -6.036 -6.169 -6.445 -6.576 -6.713 -6.894 -7.094 -7.287 -7.51 -8.029 -8 ,30975 ,KEBNE ,16658121,Tue Nov 23 07:55:41 CET,Tue Nov 23 09:17:31 CET,0.0 0.619 0.818 1.029 1.232 1.386 1.523 1.639 1.83 1.915 1.998 2.074 2.22 2.288 2.412 2.521 2.629 2.684 2.794 2.889 3.022 3.113 3.195 3.314 3.438 3.55 3.652 3.757 3.88 4.008 4.138 4.251 4.357 4.479 4.621 4.769 4.896 5.022 5.152 5.314 5.489 5.624 5.734 5.846 5.976 6.065 6.121 6.151 6.084 5.86 5.321 4.493 3.736 3.062 2.453 1.855 1.322 0.876 0.49 0.08 -0.278 -0.588 -0.89 -1.175 -1.422 -1.651 -1.904 -2.128 -2.338 -2.555 -2.762 -2.937 -3.116 -3.288 -3.43 -3.584 -3.75 -3.929 -4.107 -4.226 -4.349 -4.554 -4.701 -4.843 -4.911 -5.059 -5.213 -5.377 -5.472 -5.653 -5.765 -5.875 -5.995 -6.249 -6.378 -6.524 -6.701 -6.892 -7.093 -7.341 -7.96 -9 ,2007 ,KEBNE ,16658122,Tue Nov 23 07:55:40 CET,Tue Nov 23 09:17:28 CET,0.0 0.446 0.67 0.829 0.956 1.069 1.177 1.279 1.486 1.588 1.678 1.768 1.909 1.971 2.099 2.233 2.361 2.414 2.511 2.61 2.766 2.868 2.963 3.094 3.222 3.341 3.451 3.552 3.672 3.781 3.889 4.011 4.113 4.211 4.334 4.455 4.565 4.68 4.791 4.915 5.04 5.192 5.358 5.499 5.647 5.771 5.844 5.846 5.77 5.533 4.937 4.045 3.233 2.536 1.94 1.377 0.872 0.401 -0.003 -0.39 -0.703 -0.992 -1.287 -1.56 -1.821 -2.054 -2.293 -2.526 -2.736 -2.954 -3.169 -3.338 -3.525 -3.722 -3.872 -4.033 -4.189 -4.35 -4.517 -4.628 -4.75 -4.943 -5.083 -5.233 -5.307 -5.451 -5.605 -5.772 -5.86 -6.038 -6.171 -6.276 -6.379 -6.605 -6.735 -6.877 -7.036 -7.222 -7.455 -7.753 -8.304 -10 ,24480 ,KEBNE ,16658123,Tue Nov 23 07:55:41 CET,Tue Nov 23 09:17:28 CET,0.0 0.484 0.678 0.847 1.014 1.153 1.276 1.382 1.549 1.621 1.698 1.801 1.952 2.031 2.187 2.319 2.43 2.48 2.591 2.702 2.842 2.927 3.024 3.159 3.268 3.375 3.489 3.6 3.728 3.842 3.951 4.095 4.228 4.349 4.476 4.61 4.743 4.872 5.009 5.162 5.304 5.437 5.575 5.701 5.814 5.907 5.983 6.015 5.975 5.754 5.126 4.25 3.476 2.788 2.151 1.531 0.97 0.463 0.044 -0.365 -0.707 -1.005 -1.304 -1.61 -1.892 -2.136 -2.382 -2.595 -2.776 -2.978 -3.213 -3.416 -3.609 -3.795 -3.947 -4.105 -4.266 -4.427 -4.598 -4.714 -4.826 -5.004 -5.128 -5.265 -5.332 -5.471 -5.629 -5.792 -5.882 -6.06 -6.176 -6.279 -6.379 -6.587 -6.71 -6.859 -7.037 -7.217 -7.371 -7.56 -8.277 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_1_84.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_1_84.txt deleted file mode 100644 index e4741720..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_1_84.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9960 ,KEBNE ,16658124,Tue Nov 23 07:55:41 CET,Tue Nov 23 09:17:01 CET,0.0 0.398 0.627 0.827 1.002 1.152 1.272 1.394 1.62 1.705 1.79 1.911 2.085 2.175 2.352 2.518 2.665 2.739 2.89 3.034 3.247 3.379 3.492 3.66 3.839 4.01 4.168 4.332 4.551 4.758 4.965 5.213 5.448 5.68 5.942 6.244 6.527 6.837 7.178 7.548 7.967 8.43 8.97 9.521 10.14 10.831 11.634 12.544 13.639 14.937 16.373 17.349 17.803 18.002 18.048 17.994 17.896 17.782 17.642 17.46 17.307 17.165 17.012 16.867 16.737 16.608 16.453 16.319 16.201 16.072 15.929 15.805 15.675 15.539 15.436 15.326 15.207 15.084 14.944 14.848 14.746 14.584 14.488 14.386 14.323 14.196 14.07 13.94 13.87 13.728 13.615 13.526 13.43 13.214 13.081 12.955 12.821 12.668 12.498 12.252 11.858 -2 ,6216 ,KEBNE ,16658125,Tue Nov 23 07:55:45 CET,Tue Nov 23 09:15:05 CET,0.0 0.483 0.71 0.889 1.054 1.188 1.315 1.431 1.66 1.769 1.867 1.964 2.115 2.196 2.359 2.514 2.653 2.722 2.86 2.999 3.209 3.344 3.476 3.666 3.848 4.019 4.182 4.332 4.52 4.708 4.9 5.138 5.361 5.579 5.845 6.14 6.429 6.763 7.128 7.524 7.936 8.396 8.938 9.487 10.128 10.831 11.667 12.598 13.674 14.944 16.293 17.232 17.679 17.862 17.882 17.822 17.734 17.634 17.526 17.376 17.203 17.053 16.903 16.747 16.606 16.485 16.35 16.209 16.081 15.949 15.81 15.687 15.56 15.421 15.311 15.212 15.108 14.989 14.856 14.763 14.67 14.537 14.437 14.325 14.27 14.151 14.025 13.882 13.804 13.663 13.56 13.469 13.366 13.149 13.031 12.881 12.712 12.522 12.289 12.051 11.475 -3 ,363 ,KEBNE ,16658126,Tue Nov 23 07:56:44 CET,Tue Nov 23 09:17:55 CET,0.0 0.389 0.576 0.736 0.869 0.99 1.099 1.201 1.404 1.501 1.604 1.736 1.898 1.98 2.127 2.27 2.42 2.493 2.645 2.793 2.999 3.135 3.262 3.433 3.599 3.766 3.931 4.086 4.28 4.478 4.686 4.94 5.185 5.42 5.689 5.993 6.293 6.617 6.95 7.312 7.717 8.197 8.77 9.328 9.967 10.677 11.529 12.518 13.639 14.928 16.409 17.543 18.043 18.206 18.229 18.157 18.065 17.986 17.879 17.733 17.588 17.452 17.329 17.211 17.088 16.956 16.811 16.689 16.577 16.454 16.323 16.208 16.077 15.924 15.807 15.699 15.585 15.458 15.324 15.235 15.146 14.994 14.885 14.775 14.72 14.599 14.455 14.308 14.24 14.1 13.978 13.883 13.792 13.602 13.489 13.359 13.2 13.031 12.826 12.533 11.969 -4 ,2553 ,KEBNE ,16658127,Tue Nov 23 07:56:42 CET,Tue Nov 23 09:27:17 CET,0.0 0.486 0.73 0.916 1.058 1.18 1.289 1.409 1.632 1.73 1.831 1.94 2.096 2.177 2.331 2.483 2.641 2.726 2.884 3.04 3.249 3.376 3.508 3.692 3.857 4.014 4.171 4.323 4.52 4.729 4.953 5.225 5.467 5.699 5.972 6.28 6.57 6.885 7.238 7.62 8.008 8.445 8.985 9.539 10.201 10.917 11.758 12.735 13.797 15.033 16.452 17.473 17.986 18.164 18.148 18.113 18.059 17.929 17.793 17.649 17.505 17.374 17.245 17.105 16.954 16.83 16.705 16.567 16.435 16.314 16.2 16.075 15.931 15.784 15.676 15.562 15.435 15.314 15.189 15.092 14.998 14.841 14.72 14.604 14.547 14.424 14.298 14.154 14.08 13.945 13.831 13.743 13.643 13.426 13.306 13.18 13.033 12.843 12.6 12.289 11.628 -5 ,15575 ,KEBNE ,16658128,Tue Nov 23 07:57:43 CET,Tue Nov 23 09:18:38 CET,0.0 0.43 0.618 0.777 0.958 1.123 1.255 1.361 1.558 1.654 1.75 1.866 2.022 2.102 2.264 2.426 2.572 2.641 2.785 2.918 3.096 3.213 3.33 3.498 3.667 3.846 4.017 4.185 4.408 4.617 4.819 5.07 5.316 5.552 5.823 6.122 6.413 6.74 7.106 7.509 7.945 8.431 8.955 9.497 10.151 10.868 11.696 12.658 13.739 14.913 16.3 17.303 17.743 17.944 18.015 18.001 17.917 17.803 17.686 17.545 17.411 17.282 17.137 16.995 16.878 16.756 16.61 16.477 16.363 16.236 16.088 15.981 15.869 15.723 15.606 15.491 15.373 15.25 15.123 15.039 14.949 14.804 14.702 14.587 14.522 14.388 14.256 14.127 14.056 13.908 13.777 13.685 13.587 13.36 13.23 13.092 12.944 12.775 12.543 12.236 11.346 -6 ,26482 ,KEBNE ,16658129,Tue Nov 23 07:57:43 CET,Tue Nov 23 09:19:52 CET,0.0 0.505 0.741 0.938 1.103 1.255 1.395 1.511 1.725 1.825 1.92 2.024 2.18 2.26 2.414 2.561 2.698 2.761 2.893 3.026 3.217 3.339 3.464 3.648 3.813 3.978 4.144 4.309 4.519 4.718 4.925 5.174 5.398 5.618 5.88 6.18 6.461 6.767 7.11 7.481 7.885 8.341 8.881 9.433 10.068 10.833 11.742 12.679 13.769 15.042 16.429 17.413 17.873 18.086 18.145 18.107 18.014 17.89 17.744 17.58 17.428 17.277 17.121 16.973 16.845 16.726 16.584 16.425 16.284 16.161 16.03 15.913 15.791 15.661 15.555 15.439 15.318 15.201 15.081 14.985 14.889 14.745 14.64 14.525 14.461 14.338 14.205 14.049 13.971 13.835 13.716 13.624 13.527 13.317 13.199 13.061 12.909 12.721 12.515 12.277 11.282 -7 ,11176 ,KEBNE ,16658130,Tue Nov 23 07:57:43 CET,Tue Nov 23 09:19:49 CET,0.0 0.507 0.755 0.933 1.125 1.328 1.498 1.617 1.803 1.895 1.989 2.114 2.28 2.372 2.561 2.741 2.907 2.983 3.125 3.265 3.478 3.612 3.738 3.923 4.104 4.277 4.438 4.602 4.826 5.039 5.26 5.522 5.756 5.982 6.24 6.55 6.852 7.178 7.536 7.934 8.353 8.792 9.308 9.857 10.505 11.195 12.011 13.015 14.159 15.413 16.88 17.927 18.352 18.526 18.594 18.576 18.477 18.34 18.213 18.059 17.908 17.766 17.609 17.439 17.286 17.155 17.0 16.86 16.748 16.632 16.488 16.363 16.239 16.105 16.01 15.912 15.798 15.665 15.526 15.433 15.34 15.196 15.092 14.981 14.919 14.779 14.638 14.488 14.413 14.284 14.202 14.118 14.024 13.839 13.718 13.564 13.409 13.254 13.056 12.801 12.178 -8 ,23675 ,KEBNE ,16658131,Tue Nov 23 07:57:43 CET,Tue Nov 23 09:20:34 CET,0.0 0.521 0.739 0.878 1.04 1.205 1.333 1.439 1.642 1.751 1.851 1.96 2.118 2.197 2.354 2.52 2.676 2.752 2.899 3.038 3.235 3.364 3.492 3.682 3.863 4.03 4.191 4.353 4.564 4.761 4.955 5.198 5.438 5.673 5.939 6.23 6.517 6.837 7.175 7.553 7.966 8.427 8.966 9.518 10.137 10.812 11.616 12.571 13.67 14.865 16.324 17.484 18.018 18.239 18.297 18.248 18.162 18.063 17.946 17.804 17.67 17.524 17.367 17.234 17.104 16.972 16.819 16.678 16.566 16.433 16.292 16.182 16.052 15.907 15.799 15.69 15.563 15.435 15.312 15.224 15.132 14.981 14.874 14.773 14.715 14.582 14.443 14.304 14.228 14.088 13.979 13.883 13.777 13.576 13.479 13.35 13.205 13.026 12.799 12.507 11.68 -9 ,29124 ,KEBNE ,16658132,Tue Nov 23 07:58:44 CET,Tue Nov 23 09:21:31 CET,0.0 0.366 0.569 0.726 0.874 1.011 1.13 1.243 1.466 1.578 1.677 1.785 1.952 2.037 2.201 2.368 2.537 2.616 2.761 2.895 3.095 3.228 3.351 3.538 3.724 3.901 4.068 4.23 4.459 4.68 4.89 5.146 5.393 5.628 5.901 6.217 6.524 6.868 7.231 7.62 8.057 8.57 9.152 9.712 10.368 11.107 11.937 12.842 13.969 15.297 16.716 17.601 17.973 18.149 18.182 18.143 18.032 17.898 17.77 17.62 17.477 17.346 17.209 17.079 16.943 16.8 16.659 16.529 16.408 16.281 16.142 16.008 15.869 15.737 15.629 15.51 15.383 15.247 15.114 15.028 14.946 14.808 14.699 14.579 14.518 14.394 14.259 14.117 14.046 13.913 13.823 13.739 13.639 13.42 13.305 13.175 13.01 12.826 12.605 12.272 11.467 -10 ,27623 ,KEBNE ,16658133,Tue Nov 23 07:59:45 CET,Tue Nov 23 09:20:47 CET,0.0 0.325 0.543 0.769 0.94 1.067 1.186 1.294 1.501 1.595 1.683 1.791 1.951 2.037 2.205 2.369 2.534 2.614 2.768 2.912 3.102 3.224 3.351 3.538 3.717 3.889 4.049 4.204 4.418 4.62 4.812 5.056 5.29 5.513 5.765 6.057 6.347 6.664 7.023 7.405 7.815 8.283 8.825 9.377 10.034 10.756 11.575 12.56 13.696 14.956 16.405 17.458 17.909 18.042 18.047 18.003 17.897 17.753 17.599 17.45 17.327 17.189 17.039 16.887 16.721 16.574 16.426 16.298 16.179 16.036 15.879 15.75 15.64 15.524 15.414 15.292 15.176 15.067 14.944 14.85 14.749 14.58 14.465 14.349 14.287 14.166 14.032 13.889 13.818 13.68 13.557 13.458 13.351 13.1 12.962 12.832 12.682 12.518 12.307 12.045 11.552 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_206_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_206_163.txt deleted file mode 100644 index 42f37fa3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_206_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15442 ,KEBNE ,16658134,Tue Nov 23 07:59:45 CET,Tue Nov 23 09:23:17 CET,0.0 0.269 0.431 0.559 0.677 0.794 0.904 1.003 1.172 1.256 1.345 1.411 1.589 1.651 1.765 1.857 1.945 1.993 2.097 2.192 2.313 2.395 2.475 2.582 2.69 2.788 2.87 2.96 3.093 3.206 3.301 3.408 3.517 3.629 3.751 3.871 3.982 4.11 4.248 4.384 4.513 4.648 4.793 4.924 5.058 5.188 5.295 5.368 5.392 5.281 4.818 4.046 3.31 2.64 2.049 1.516 1.046 0.601 0.206 -0.202 -0.553 -0.879 -1.189 -1.465 -1.725 -1.962 -2.2 -2.417 -2.625 -2.855 -3.086 -3.29 -3.499 -3.696 -3.852 -4.015 -4.202 -4.412 -4.614 -4.752 -4.89 -5.102 -5.266 -5.436 -5.529 -5.726 -5.923 -6.126 -6.229 -6.442 -6.564 -6.684 -6.801 -7.079 -7.237 -7.401 -7.572 -7.778 -8.015 -8.292 -9.279 -2 ,30311 ,KEBNE ,16658135,Tue Nov 23 08:00:46 CET,Tue Nov 23 09:24:34 CET,0.0 0.202 0.403 0.546 0.661 0.769 0.863 0.959 1.139 1.219 1.305 1.358 1.534 1.603 1.723 1.827 1.926 1.976 2.082 2.176 2.314 2.413 2.507 2.639 2.759 2.861 2.951 3.039 3.161 3.278 3.386 3.512 3.627 3.739 3.868 3.994 4.117 4.249 4.371 4.504 4.654 4.811 4.978 5.118 5.222 5.307 5.373 5.433 5.419 5.232 4.746 3.926 3.174 2.491 1.87 1.305 0.812 0.352 -0.052 -0.472 -0.842 -1.152 -1.451 -1.739 -2.022 -2.288 -2.551 -2.792 -3.006 -3.215 -3.445 -3.632 -3.819 -4.023 -4.175 -4.324 -4.483 -4.653 -4.832 -4.964 -5.102 -5.3 -5.44 -5.611 -5.701 -5.884 -6.072 -6.283 -6.394 -6.605 -6.706 -6.822 -6.944 -7.227 -7.406 -7.59 -7.78 -7.99 -8.21 -8.511 -9.322 -3 ,19907 ,KEBNE ,16658136,Tue Nov 23 08:01:47 CET,Tue Nov 23 09:26:15 CET,0.0 0.298 0.44 0.535 0.652 0.772 0.869 0.968 1.162 1.25 1.329 1.361 1.527 1.588 1.716 1.842 1.954 2.003 2.094 2.177 2.296 2.368 2.429 2.535 2.645 2.743 2.841 2.931 3.04 3.162 3.29 3.417 3.53 3.645 3.768 3.894 4.014 4.135 4.261 4.416 4.574 4.723 4.885 5.042 5.191 5.304 5.4 5.456 5.432 5.274 4.761 3.9 3.172 2.525 1.94 1.392 0.897 0.457 0.072 -0.338 -0.716 -1.07 -1.419 -1.748 -2.02 -2.273 -2.575 -2.829 -3.025 -3.22 -3.421 -3.588 -3.767 -3.962 -4.133 -4.312 -4.483 -4.66 -4.839 -4.958 -5.087 -5.306 -5.46 -5.614 -5.689 -5.833 -5.992 -6.175 -6.271 -6.474 -6.575 -6.686 -6.795 -7.056 -7.209 -7.381 -7.566 -7.772 -8.007 -8.314 -9.172 -4 ,19090 ,KEBNE ,16658137,Tue Nov 23 08:00:46 CET,Tue Nov 23 09:24:19 CET,0.0 0.532 0.768 0.918 1.036 1.155 1.258 1.335 1.483 1.564 1.641 1.662 1.833 1.903 2.029 2.14 2.235 2.283 2.382 2.472 2.607 2.686 2.76 2.889 2.997 3.086 3.181 3.27 3.378 3.487 3.585 3.701 3.821 3.938 4.055 4.177 4.293 4.425 4.559 4.687 4.807 4.922 5.048 5.171 5.321 5.472 5.593 5.648 5.625 5.48 5.029 4.298 3.521 2.811 2.221 1.711 1.248 0.797 0.391 -0.01 -0.357 -0.666 -0.977 -1.289 -1.545 -1.768 -2.02 -2.253 -2.461 -2.678 -2.896 -3.077 -3.267 -3.475 -3.637 -3.8 -3.981 -4.174 -4.377 -4.516 -4.653 -4.877 -5.03 -5.175 -5.25 -5.408 -5.581 -5.763 -5.855 -6.067 -6.177 -6.295 -6.43 -6.731 -6.881 -7.038 -7.215 -7.404 -7.625 -7.917 -8.626 -5 ,10976 ,KEBNE ,16658138,Tue Nov 23 08:00:46 CET,Tue Nov 23 09:23:16 CET,0.0 0.603 0.855 1.027 1.157 1.27 1.372 1.467 1.656 1.744 1.817 1.854 2.019 2.081 2.217 2.339 2.436 2.481 2.57 2.661 2.799 2.885 2.965 3.072 3.18 3.299 3.405 3.499 3.629 3.756 3.86 3.967 4.088 4.201 4.323 4.469 4.601 4.746 4.881 5.028 5.187 5.321 5.456 5.584 5.728 5.883 6.022 6.124 6.17 6.043 5.588 4.878 4.201 3.561 2.983 2.417 1.896 1.444 1.062 0.661 0.318 0.022 -0.282 -0.595 -0.882 -1.138 -1.411 -1.651 -1.87 -2.111 -2.353 -2.547 -2.744 -2.938 -3.09 -3.254 -3.416 -3.588 -3.774 -3.899 -4.034 -4.238 -4.381 -4.541 -4.621 -4.784 -4.961 -5.156 -5.253 -5.459 -5.556 -5.663 -5.772 -6.024 -6.167 -6.322 -6.502 -6.684 -6.867 -7.133 -8.062 -6 ,30363 ,KEBNE ,16658139,Tue Nov 23 08:02:49 CET,Tue Nov 23 09:25:51 CET,0.0 0.465 0.639 0.765 0.9 1.036 1.148 1.259 1.447 1.524 1.593 1.621 1.796 1.859 1.974 2.092 2.194 2.244 2.344 2.429 2.559 2.657 2.748 2.873 3.001 3.106 3.199 3.294 3.414 3.528 3.634 3.747 3.849 3.946 4.046 4.165 4.294 4.43 4.547 4.675 4.821 4.97 5.112 5.224 5.351 5.482 5.577 5.605 5.567 5.367 4.84 4.022 3.309 2.693 2.143 1.628 1.132 0.679 0.286 -0.123 -0.48 -0.811 -1.118 -1.396 -1.661 -1.899 -2.142 -2.369 -2.58 -2.813 -3.045 -3.233 -3.426 -3.624 -3.785 -3.965 -4.133 -4.287 -4.46 -4.588 -4.727 -4.938 -5.088 -5.244 -5.314 -5.464 -5.642 -5.838 -5.933 -6.138 -6.251 -6.371 -6.481 -6.69 -6.825 -6.978 -7.131 -7.311 -7.539 -7.844 -8.61 -7 ,22763 ,KEBNE ,16658140,Tue Nov 23 08:01:47 CET,Tue Nov 23 09:24:32 CET,0.0 0.45 0.627 0.782 0.911 1.056 1.203 1.319 1.501 1.58 1.652 1.673 1.836 1.899 2.023 2.134 2.227 2.274 2.354 2.434 2.558 2.643 2.734 2.856 2.97 3.076 3.18 3.281 3.403 3.513 3.615 3.742 3.862 3.97 4.098 4.237 4.344 4.464 4.591 4.705 4.829 4.975 5.125 5.255 5.393 5.532 5.625 5.664 5.665 5.535 5.054 4.306 3.613 2.963 2.342 1.781 1.29 0.791 0.375 -0.004 -0.346 -0.671 -0.973 -1.256 -1.532 -1.774 -2.021 -2.254 -2.463 -2.67 -2.89 -3.068 -3.261 -3.48 -3.638 -3.803 -3.982 -4.175 -4.374 -4.51 -4.657 -4.895 -5.069 -5.236 -5.314 -5.482 -5.663 -5.846 -5.945 -6.161 -6.277 -6.397 -6.531 -6.826 -6.973 -7.14 -7.332 -7.528 -7.769 -8.075 -8.856 -8 ,24205 ,KEBNE ,16658141,Tue Nov 23 08:01:47 CET,Tue Nov 23 09:24:34 CET,0.0 0.571 0.742 0.905 1.045 1.154 1.252 1.358 1.572 1.654 1.723 1.769 1.947 2.017 2.138 2.255 2.361 2.405 2.499 2.6 2.745 2.846 2.93 3.04 3.17 3.291 3.393 3.484 3.602 3.711 3.808 3.915 4.016 4.132 4.267 4.396 4.514 4.642 4.779 4.921 5.064 5.208 5.365 5.506 5.628 5.714 5.825 5.912 5.905 5.782 5.307 4.551 3.893 3.234 2.578 1.971 1.429 0.951 0.537 0.126 -0.2 -0.521 -0.854 -1.14 -1.396 -1.651 -1.925 -2.183 -2.413 -2.622 -2.833 -3.028 -3.234 -3.443 -3.6 -3.761 -3.931 -4.119 -4.32 -4.461 -4.606 -4.824 -4.972 -5.121 -5.202 -5.366 -5.537 -5.742 -5.843 -6.054 -6.166 -6.282 -6.412 -6.672 -6.793 -6.925 -7.081 -7.257 -7.464 -7.738 -8.434 -9 ,9268 ,KEBNE ,16658142,Tue Nov 23 08:01:47 CET,Tue Nov 23 09:25:32 CET,0.0 0.367 0.569 0.712 0.854 1.002 1.126 1.221 1.373 1.437 1.504 1.525 1.688 1.744 1.857 1.961 2.054 2.102 2.195 2.293 2.436 2.518 2.592 2.694 2.8 2.906 3.0 3.09 3.197 3.297 3.407 3.541 3.649 3.757 3.885 4.012 4.132 4.268 4.438 4.605 4.748 4.914 5.108 5.267 5.41 5.533 5.639 5.686 5.689 5.586 5.137 4.385 3.658 3.016 2.439 1.889 1.362 0.871 0.455 0.027 -0.342 -0.669 -1.004 -1.327 -1.598 -1.848 -2.129 -2.374 -2.585 -2.804 -3.026 -3.22 -3.432 -3.651 -3.807 -3.974 -4.167 -4.371 -4.583 -4.72 -4.851 -5.058 -5.205 -5.355 -5.438 -5.617 -5.808 -6.002 -6.104 -6.324 -6.406 -6.511 -6.635 -6.926 -7.086 -7.252 -7.439 -7.662 -7.903 -8.187 -8.812 -10 ,21016 ,KEBNE ,16658143,Tue Nov 23 08:01:47 CET,Tue Nov 23 09:24:19 CET,0.0 0.342 0.539 0.708 0.835 0.947 1.053 1.149 1.324 1.396 1.473 1.516 1.674 1.732 1.851 1.961 2.053 2.098 2.2 2.3 2.439 2.527 2.612 2.729 2.831 2.932 3.035 3.126 3.247 3.355 3.446 3.564 3.673 3.781 3.895 4.016 4.153 4.308 4.456 4.603 4.747 4.872 5.005 5.145 5.283 5.399 5.488 5.549 5.537 5.322 4.792 4.049 3.345 2.681 2.079 1.526 1.05 0.631 0.253 -0.115 -0.433 -0.75 -1.063 -1.359 -1.631 -1.87 -2.116 -2.34 -2.542 -2.756 -2.976 -3.171 -3.379 -3.571 -3.718 -3.875 -4.052 -4.235 -4.414 -4.536 -4.66 -4.867 -5.032 -5.206 -5.292 -5.469 -5.647 -5.829 -5.921 -6.13 -6.236 -6.353 -6.474 -6.705 -6.826 -6.973 -7.147 -7.342 -7.57 -7.817 -8.429 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_206_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_206_252.txt deleted file mode 100644 index 49d6ac2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_206_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25126 ,KEBNE ,17069493,Fri Dec 24 06:03:25 CET,Fri Dec 24 07:31:13 CET,0.0 0.389 0.596 0.768 0.906 1.046 1.159 1.249 1.444 1.544 1.625 1.653 1.816 1.875 1.997 2.126 2.269 2.334 2.449 2.564 2.724 2.808 2.881 3.009 3.122 3.219 3.317 3.411 3.535 3.657 3.765 3.873 3.994 4.115 4.228 4.358 4.476 4.584 4.692 4.806 4.912 4.992 5.064 5.11 5.143 5.158 5.106 4.974 4.706 4.121 2.981 1.623 0.479 -0.494 -1.404 -2.244 -2.945 -3.564 -4.145 -4.734 -5.211 -5.643 -6.065 -6.476 -6.848 -7.188 -7.561 -7.883 -8.185 -8.525 -8.877 -9.174 -9.478 -9.764 -9.997 -10.255 -10.512 -10.776 -11.046 -11.228 -11.403 -11.669 -11.871 -12.099 -12.213 -12.44 -12.686 -12.933 -13.058 -13.323 -13.547 -13.725 -13.899 -14.245 -14.436 -14.672 -14.942 -15.223 -15.578 -16.045 -17.8 -2 ,8806 ,KEBNE ,17069495,Fri Dec 24 06:06:35 CET,Fri Dec 24 07:32:53 CET,0.0 0.614 0.857 1.073 1.257 1.401 1.503 1.596 1.809 1.907 1.988 2.049 2.238 2.317 2.453 2.579 2.708 2.769 2.868 2.957 3.081 3.159 3.234 3.348 3.465 3.567 3.67 3.761 3.845 3.941 4.04 4.137 4.226 4.322 4.433 4.556 4.661 4.753 4.852 4.95 5.032 5.113 5.193 5.249 5.286 5.294 5.255 5.124 4.86 4.351 3.291 1.951 0.821 -0.191 -1.062 -1.865 -2.6 -3.254 -3.811 -4.37 -4.827 -5.253 -5.683 -6.064 -6.479 -6.904 -7.321 -7.698 -8.019 -8.336 -8.696 -8.983 -9.247 -9.547 -9.802 -10.058 -10.317 -10.595 -10.871 -11.053 -11.239 -11.539 -11.745 -11.965 -12.083 -12.318 -12.556 -12.811 -12.948 -13.215 -13.418 -13.596 -13.792 -14.222 -14.471 -14.72 -14.95 -15.207 -15.562 -16.085 -17.625 -3 ,10751 ,KEBNE ,17069496,Fri Dec 24 06:09:49 CET,Fri Dec 24 07:37:41 CET,0.0 0.853 1.135 1.322 1.483 1.612 1.732 1.855 2.077 2.175 2.258 2.295 2.462 2.526 2.663 2.797 2.922 2.981 3.08 3.168 3.297 3.375 3.454 3.578 3.683 3.771 3.856 3.946 4.067 4.167 4.258 4.368 4.483 4.594 4.713 4.841 4.966 5.091 5.189 5.287 5.385 5.475 5.594 5.674 5.7 5.701 5.685 5.592 5.323 4.781 3.743 2.378 1.264 0.3 -0.597 -1.39 -2.084 -2.73 -3.314 -3.905 -4.392 -4.823 -5.214 -5.591 -5.962 -6.297 -6.622 -6.917 -7.187 -7.46 -7.734 -7.957 -8.209 -8.483 -8.682 -8.896 -9.14 -9.388 -9.624 -9.803 -10.003 -10.305 -10.509 -10.737 -10.854 -11.077 -11.341 -11.628 -11.77 -12.056 -12.261 -12.422 -12.587 -12.931 -13.132 -13.364 -13.604 -13.882 -14.244 -14.716 -16.125 -4 ,27192 ,KEBNE ,17069497,Fri Dec 24 06:12:59 CET,Fri Dec 24 07:40:46 CET,0.0 0.581 0.788 0.962 1.112 1.242 1.36 1.476 1.7 1.791 1.869 1.909 2.075 2.133 2.256 2.392 2.533 2.601 2.724 2.837 2.996 3.082 3.164 3.294 3.414 3.521 3.621 3.717 3.829 3.928 4.026 4.15 4.272 4.375 4.488 4.604 4.688 4.768 4.864 4.995 5.122 5.227 5.341 5.43 5.486 5.512 5.488 5.362 5.094 4.597 3.617 2.313 1.108 0.066 -0.802 -1.616 -2.33 -2.979 -3.564 -4.11 -4.584 -5.083 -5.593 -6.06 -6.48 -6.865 -7.259 -7.596 -7.902 -8.215 -8.521 -8.79 -9.068 -9.339 -9.569 -9.805 -10.053 -10.338 -10.632 -10.826 -11.024 -11.322 -11.528 -11.742 -11.852 -12.082 -12.321 -12.571 -12.702 -12.958 -13.126 -13.282 -13.462 -13.852 -14.064 -14.302 -14.576 -14.89 -15.235 -15.653 -17.109 -5 ,718 ,KEBNE ,17069498,Fri Dec 24 06:14:07 CET,Fri Dec 24 07:42:12 CET,0.0 0.427 0.663 0.83 0.975 1.099 1.215 1.321 1.483 1.561 1.638 1.684 1.866 1.943 2.081 2.21 2.349 2.415 2.534 2.623 2.739 2.818 2.889 2.981 3.098 3.226 3.323 3.408 3.516 3.606 3.694 3.819 3.908 3.988 4.101 4.231 4.329 4.413 4.516 4.638 4.739 4.82 4.897 4.973 5.043 5.038 4.995 4.893 4.631 4.133 3.15 1.805 0.633 -0.406 -1.295 -2.1 -2.823 -3.467 -4.029 -4.604 -5.068 -5.481 -5.903 -6.284 -6.64 -6.963 -7.282 -7.583 -7.858 -8.14 -8.44 -8.688 -8.957 -9.231 -9.426 -9.625 -9.845 -10.103 -10.376 -10.557 -10.756 -11.065 -11.267 -11.495 -11.613 -11.842 -12.097 -12.365 -12.491 -12.734 -12.899 -13.055 -13.216 -13.579 -13.781 -13.98 -14.225 -14.54 -14.858 -15.294 -16.982 -6 ,802 ,KEBNE ,17069499,Fri Dec 24 06:16:15 CET,Fri Dec 24 07:42:13 CET,0.0 0.554 0.807 0.99 1.125 1.258 1.376 1.48 1.697 1.794 1.877 1.91 2.083 2.153 2.275 2.389 2.497 2.545 2.639 2.726 2.839 2.92 2.994 3.094 3.204 3.314 3.411 3.497 3.61 3.74 3.856 3.972 4.068 4.148 4.24 4.348 4.473 4.595 4.695 4.792 4.882 4.989 5.075 5.145 5.216 5.231 5.19 5.057 4.808 4.337 3.432 2.166 0.969 -0.033 -0.932 -1.744 -2.417 -3.027 -3.587 -4.169 -4.653 -5.063 -5.441 -5.848 -6.249 -6.618 -7.014 -7.375 -7.7 -8.029 -8.379 -8.675 -8.974 -9.289 -9.534 -9.778 -10.029 -10.293 -10.571 -10.764 -10.952 -11.251 -11.465 -11.677 -11.79 -11.997 -12.207 -12.422 -12.534 -12.779 -12.923 -13.075 -13.26 -13.694 -13.916 -14.142 -14.38 -14.647 -14.979 -15.397 -16.868 -7 ,28939 ,KEBNE ,17069500,Fri Dec 24 06:19:25 CET,Fri Dec 24 07:46:37 CET,0.0 0.56 0.791 0.962 1.102 1.229 1.352 1.46 1.652 1.739 1.823 1.868 2.041 2.117 2.273 2.406 2.523 2.58 2.696 2.803 2.939 3.026 3.122 3.261 3.37 3.468 3.577 3.687 3.801 3.892 3.986 4.105 4.212 4.304 4.405 4.506 4.583 4.675 4.773 4.863 4.95 5.031 5.108 5.163 5.191 5.184 5.133 5.011 4.734 4.205 3.207 1.908 0.777 -0.246 -1.137 -1.923 -2.608 -3.21 -3.727 -4.268 -4.726 -5.141 -5.544 -5.927 -6.297 -6.633 -6.999 -7.321 -7.577 -7.863 -8.2 -8.483 -8.784 -9.098 -9.306 -9.521 -9.753 -10.0 -10.261 -10.432 -10.614 -10.871 -11.042 -11.229 -11.334 -11.571 -11.813 -12.055 -12.191 -12.46 -12.66 -12.817 -12.987 -13.395 -13.617 -13.849 -14.091 -14.365 -14.7 -15.214 -17.519 -8 ,14590 ,KEBNE ,17069501,Fri Dec 24 06:20:28 CET,Fri Dec 24 07:48:25 CET,0.0 0.466 0.718 0.922 1.07 1.19 1.309 1.419 1.629 1.718 1.787 1.827 2.0 2.059 2.179 2.309 2.425 2.469 2.567 2.675 2.826 2.913 2.995 3.12 3.239 3.35 3.453 3.551 3.679 3.784 3.87 3.971 4.059 4.143 4.263 4.384 4.486 4.62 4.733 4.81 4.883 4.971 5.057 5.119 5.195 5.244 5.223 5.098 4.801 4.291 3.272 1.85 0.635 -0.391 -1.273 -2.05 -2.753 -3.385 -3.909 -4.464 -4.948 -5.366 -5.773 -6.173 -6.549 -6.899 -7.282 -7.633 -7.96 -8.296 -8.622 -8.891 -9.163 -9.423 -9.616 -9.823 -10.034 -10.258 -10.508 -10.682 -10.869 -11.182 -11.403 -11.634 -11.746 -11.969 -12.202 -12.444 -12.575 -12.842 -13.034 -13.187 -13.352 -13.717 -13.911 -14.153 -14.436 -14.753 -15.129 -15.649 -17.939 -9 ,32239 ,KEBNE ,17069502,Fri Dec 24 06:20:28 CET,Fri Dec 24 07:47:45 CET,0.0 0.366 0.627 0.81 0.945 1.061 1.17 1.281 1.479 1.572 1.665 1.739 1.917 1.982 2.099 2.217 2.358 2.418 2.513 2.62 2.758 2.843 2.941 3.081 3.197 3.307 3.402 3.479 3.593 3.713 3.814 3.91 4.014 4.117 4.2 4.291 4.404 4.519 4.627 4.749 4.855 4.94 5.011 5.072 5.117 5.135 5.122 4.992 4.714 4.201 3.249 2.002 0.826 -0.235 -1.158 -2.0 -2.719 -3.382 -3.946 -4.5 -5.016 -5.485 -5.896 -6.266 -6.641 -6.969 -7.315 -7.658 -7.958 -8.255 -8.583 -8.86 -9.123 -9.411 -9.634 -9.841 -10.04 -10.271 -10.522 -10.69 -10.872 -11.176 -11.387 -11.598 -11.708 -11.944 -12.176 -12.396 -12.509 -12.745 -12.901 -13.045 -13.197 -13.543 -13.726 -13.918 -14.164 -14.477 -14.858 -15.369 -17.012 -10 ,598 ,KEBNE ,17069503,Fri Dec 24 06:20:28 CET,Fri Dec 24 07:46:15 CET,0.0 0.493 0.727 0.899 1.041 1.154 1.281 1.415 1.649 1.747 1.836 1.907 2.085 2.148 2.268 2.385 2.502 2.555 2.659 2.756 2.881 2.954 3.03 3.146 3.258 3.38 3.507 3.617 3.739 3.854 3.948 4.059 4.156 4.232 4.337 4.483 4.618 4.723 4.815 4.899 4.981 5.077 5.205 5.326 5.4 5.437 5.426 5.284 5.01 4.532 3.576 2.258 1.073 0.041 -0.868 -1.692 -2.412 -3.037 -3.534 -4.044 -4.512 -4.941 -5.361 -5.777 -6.162 -6.503 -6.847 -7.16 -7.434 -7.718 -8.013 -8.277 -8.561 -8.835 -9.057 -9.297 -9.534 -9.773 -10.024 -10.186 -10.352 -10.656 -10.866 -11.075 -11.186 -11.415 -11.676 -11.952 -12.076 -12.318 -12.492 -12.651 -12.815 -13.203 -13.416 -13.636 -13.894 -14.202 -14.571 -15.004 -16.605 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_215_167.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_215_167.txt deleted file mode 100644 index ef3db6a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_215_167.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17310 ,KEBNE ,16658144,Tue Nov 23 08:02:49 CET,Tue Nov 23 09:25:00 CET,0.0 0.836 1.116 1.349 1.558 1.734 1.884 2.023 2.251 2.362 2.474 2.573 2.759 2.847 3.033 3.197 3.355 3.434 3.59 3.735 3.933 4.066 4.188 4.355 4.519 4.671 4.817 4.954 5.136 5.333 5.525 5.737 5.923 6.103 6.306 6.523 6.738 7.01 7.289 7.562 7.871 8.206 8.566 8.926 9.371 9.856 10.373 10.929 11.522 12.152 12.752 13.046 13.052 12.926 12.732 12.5 12.281 12.068 11.878 11.657 11.46 11.271 11.082 10.911 10.742 10.588 10.401 10.216 10.056 9.888 9.71 9.571 9.442 9.295 9.177 9.04 8.894 8.746 8.565 8.448 8.335 8.157 8.035 7.898 7.827 7.668 7.508 7.353 7.258 7.06 6.965 6.861 6.739 6.487 6.341 6.179 6.012 5.821 5.585 5.293 4.281 -2 ,15064 ,KEBNE ,16658145,Tue Nov 23 08:02:49 CET,Tue Nov 23 09:25:05 CET,0.0 0.856 1.179 1.391 1.568 1.734 1.892 2.029 2.255 2.365 2.481 2.584 2.768 2.856 3.042 3.222 3.396 3.469 3.607 3.745 3.937 4.061 4.184 4.378 4.564 4.728 4.89 5.047 5.235 5.424 5.591 5.778 5.973 6.161 6.384 6.642 6.889 7.162 7.456 7.749 8.05 8.355 8.709 9.069 9.457 9.91 10.418 10.984 11.575 12.121 12.643 12.895 12.927 12.842 12.665 12.455 12.255 12.036 11.834 11.627 11.414 11.217 11.023 10.838 10.676 10.525 10.349 10.195 10.067 9.921 9.76 9.613 9.448 9.28 9.159 9.041 8.919 8.79 8.642 8.531 8.409 8.21 8.069 7.916 7.841 7.708 7.579 7.429 7.338 7.148 7.034 6.929 6.825 6.606 6.479 6.319 6.137 5.944 5.678 5.323 4.612 -3 ,22613 ,KEBNE ,16658146,Tue Nov 23 08:02:48 CET,Tue Nov 23 09:26:24 CET,0.0 0.604 0.885 1.105 1.314 1.496 1.662 1.827 2.103 2.225 2.347 2.467 2.666 2.758 2.942 3.114 3.279 3.358 3.506 3.648 3.853 3.986 4.113 4.298 4.466 4.619 4.774 4.93 5.129 5.326 5.506 5.71 5.906 6.098 6.315 6.554 6.789 7.042 7.302 7.556 7.834 8.179 8.539 8.85 9.227 9.655 10.142 10.684 11.256 11.84 12.426 12.702 12.689 12.575 12.409 12.176 11.961 11.7 11.452 11.24 11.014 10.809 10.62 10.428 10.22 10.025 9.842 9.674 9.535 9.386 9.216 9.075 8.929 8.768 8.653 8.539 8.4 8.265 8.152 8.069 7.96 7.782 7.66 7.527 7.457 7.301 7.14 6.973 6.89 6.712 6.625 6.518 6.402 6.154 6.022 5.878 5.696 5.485 5.246 4.93 4.377 -4 ,8868 ,KEBNE ,16658147,Tue Nov 23 08:02:48 CET,Tue Nov 23 09:24:33 CET,0.0 0.658 0.937 1.171 1.37 1.549 1.699 1.825 2.056 2.155 2.265 2.383 2.581 2.671 2.839 2.997 3.165 3.251 3.395 3.529 3.727 3.836 3.95 4.136 4.306 4.475 4.642 4.789 4.974 5.166 5.355 5.577 5.792 5.995 6.219 6.465 6.695 6.964 7.259 7.553 7.859 8.23 8.639 9.004 9.424 9.873 10.409 11.017 11.617 12.216 12.75 12.974 12.975 12.904 12.761 12.561 12.351 12.127 11.899 11.657 11.441 11.229 11.004 10.813 10.648 10.482 10.302 10.147 10.001 9.837 9.677 9.529 9.356 9.195 9.071 8.934 8.802 8.668 8.514 8.405 8.296 8.127 8.009 7.881 7.811 7.658 7.499 7.325 7.226 7.034 6.94 6.85 6.753 6.541 6.417 6.268 6.111 5.926 5.69 5.417 4.784 -5 ,8526 ,KEBNE ,16658148,Tue Nov 23 08:02:48 CET,Tue Nov 23 09:24:52 CET,0.0 0.686 1.015 1.238 1.414 1.566 1.694 1.817 2.054 2.177 2.294 2.41 2.611 2.705 2.878 3.047 3.206 3.285 3.442 3.58 3.785 3.921 4.041 4.222 4.402 4.569 4.734 4.884 5.072 5.261 5.433 5.636 5.837 6.03 6.237 6.475 6.731 7.004 7.286 7.576 7.884 8.233 8.636 9.043 9.45 9.867 10.348 10.864 11.416 12.02 12.62 12.894 12.906 12.797 12.629 12.412 12.196 11.985 11.773 11.54 11.342 11.15 10.948 10.775 10.609 10.447 10.26 10.092 9.957 9.804 9.646 9.498 9.333 9.177 9.043 8.886 8.734 8.593 8.428 8.309 8.207 8.058 7.937 7.809 7.744 7.608 7.468 7.307 7.216 7.033 6.952 6.867 6.778 6.574 6.445 6.285 6.082 5.844 5.608 5.321 4.548 -6 ,18613 ,KEBNE ,16658149,Tue Nov 23 08:02:49 CET,Tue Nov 23 09:26:44 CET,0.0 0.779 1.076 1.305 1.496 1.663 1.801 1.931 2.169 2.278 2.384 2.477 2.671 2.759 2.932 3.111 3.285 3.37 3.525 3.675 3.883 4.012 4.139 4.314 4.465 4.62 4.778 4.916 5.099 5.297 5.495 5.717 5.918 6.13 6.379 6.662 6.911 7.148 7.406 7.671 7.959 8.273 8.64 9.0 9.418 9.908 10.427 10.957 11.554 12.252 12.899 13.129 13.122 13.007 12.802 12.583 12.364 12.138 11.918 11.68 11.462 11.264 11.044 10.778 10.562 10.393 10.189 10.02 9.886 9.746 9.584 9.445 9.305 9.146 9.005 8.853 8.705 8.544 8.365 8.246 8.134 7.96 7.834 7.704 7.638 7.505 7.341 7.162 7.073 6.892 6.811 6.714 6.607 6.336 6.178 6.032 5.86 5.66 5.406 5.016 4.291 -7 ,25521 ,KEBNE ,16658150,Tue Nov 23 08:02:49 CET,Tue Nov 23 09:31:20 CET,0.0 0.825 1.165 1.397 1.572 1.723 1.863 1.999 2.243 2.359 2.469 2.599 2.811 2.905 3.085 3.255 3.422 3.508 3.673 3.828 4.035 4.156 4.275 4.459 4.626 4.777 4.929 5.093 5.296 5.483 5.679 5.898 6.097 6.297 6.518 6.76 7.0 7.274 7.568 7.871 8.187 8.518 8.888 9.265 9.683 10.125 10.58 11.053 11.602 12.198 12.736 12.996 12.982 12.844 12.653 12.424 12.184 11.978 11.79 11.573 11.369 11.181 10.987 10.776 10.555 10.361 10.191 10.035 9.876 9.706 9.54 9.403 9.263 9.115 8.968 8.795 8.642 8.501 8.353 8.251 8.141 7.969 7.843 7.696 7.629 7.508 7.367 7.197 7.105 6.908 6.797 6.693 6.582 6.318 6.154 5.981 5.799 5.603 5.386 5.141 4.399 -8 ,15158 ,KEBNE ,16658151,Tue Nov 23 08:02:48 CET,Tue Nov 23 09:25:45 CET,0.0 0.626 0.89 1.082 1.276 1.44 1.594 1.741 1.979 2.084 2.19 2.293 2.483 2.576 2.748 2.905 3.056 3.127 3.264 3.394 3.602 3.745 3.866 4.039 4.209 4.372 4.536 4.702 4.909 5.109 5.307 5.528 5.728 5.919 6.147 6.411 6.674 6.949 7.213 7.476 7.775 8.122 8.497 8.879 9.305 9.742 10.216 10.72 11.269 11.859 12.466 12.753 12.789 12.653 12.409 12.175 11.97 11.751 11.547 11.345 11.154 10.955 10.744 10.545 10.365 10.197 9.999 9.824 9.673 9.535 9.4 9.258 9.111 8.958 8.838 8.716 8.585 8.452 8.301 8.192 8.08 7.908 7.788 7.656 7.586 7.431 7.28 7.138 7.059 6.876 6.776 6.679 6.58 6.355 6.224 6.077 5.908 5.72 5.496 5.203 4.415 -9 ,13295 ,KEBNE ,16658152,Tue Nov 23 08:02:49 CET,Tue Nov 23 09:25:15 CET,0.0 0.564 0.851 1.084 1.292 1.47 1.615 1.744 1.989 2.1 2.211 2.327 2.528 2.623 2.809 2.972 3.128 3.204 3.344 3.476 3.668 3.795 3.925 4.109 4.26 4.421 4.595 4.761 4.97 5.157 5.333 5.557 5.778 5.977 6.215 6.483 6.728 6.977 7.228 7.494 7.797 8.164 8.567 8.932 9.333 9.752 10.19 10.712 11.269 11.8 12.402 12.744 12.738 12.551 12.34 12.107 11.866 11.65 11.429 11.194 10.986 10.79 10.586 10.387 10.206 10.043 9.861 9.682 9.524 9.369 9.213 9.085 8.927 8.734 8.597 8.469 8.347 8.21 8.058 7.947 7.822 7.637 7.519 7.382 7.304 7.147 6.978 6.809 6.736 6.569 6.475 6.364 6.257 6.006 5.854 5.693 5.53 5.323 5.06 4.744 4.209 -10 ,3643 ,KEBNE ,16658153,Tue Nov 23 08:02:49 CET,Tue Nov 23 09:24:56 CET,0.0 0.67 0.936 1.114 1.274 1.406 1.529 1.662 1.914 2.029 2.139 2.252 2.445 2.533 2.725 2.902 3.055 3.125 3.264 3.416 3.623 3.753 3.886 4.09 4.279 4.445 4.61 4.771 4.982 5.17 5.347 5.571 5.774 5.961 6.193 6.452 6.685 6.958 7.275 7.599 7.889 8.201 8.587 8.96 9.372 9.793 10.27 10.811 11.379 11.975 12.527 12.798 12.775 12.675 12.54 12.378 12.171 11.955 11.773 11.57 11.394 11.23 11.054 10.862 10.683 10.512 10.316 10.131 9.944 9.748 9.562 9.419 9.269 9.123 9.009 8.875 8.741 8.595 8.429 8.314 8.204 8.029 7.898 7.772 7.711 7.577 7.424 7.255 7.176 6.991 6.86 6.757 6.661 6.426 6.274 6.121 5.965 5.765 5.523 5.275 4.796 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_215_206.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_215_206.txt deleted file mode 100644 index 583ac649..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_215_206.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10931 ,KEBNE ,16658154,Tue Nov 23 08:02:49 CET,Tue Nov 23 09:25:46 CET,0.0 0.785 1.019 1.168 1.309 1.473 1.63 1.767 2.022 2.129 2.223 2.293 2.46 2.523 2.668 2.841 2.996 3.061 3.175 3.288 3.474 3.591 3.691 3.814 3.928 4.051 4.168 4.276 4.418 4.548 4.665 4.798 4.942 5.074 5.215 5.384 5.544 5.742 5.94 6.126 6.319 6.523 6.737 6.924 7.149 7.356 7.525 7.718 7.889 7.901 7.539 6.875 6.201 5.576 5.057 4.581 4.13 3.717 3.355 2.991 2.679 2.394 2.111 1.833 1.567 1.329 1.089 0.869 0.663 0.466 0.265 0.07 -0.134 -0.34 -0.509 -0.67 -0.828 -0.991 -1.158 -1.286 -1.418 -1.608 -1.745 -1.896 -1.977 -2.147 -2.311 -2.489 -2.588 -2.791 -2.884 -2.98 -3.083 -3.341 -3.484 -3.62 -3.764 -3.939 -4.123 -4.385 -5.091 -2 ,20786 ,KEBNE ,16658155,Tue Nov 23 08:02:48 CET,Tue Nov 23 09:26:53 CET,0.0 0.714 1.012 1.25 1.421 1.559 1.684 1.809 2.062 2.182 2.276 2.35 2.538 2.62 2.751 2.874 3.005 3.068 3.188 3.294 3.446 3.555 3.657 3.8 3.94 4.064 4.183 4.298 4.444 4.585 4.722 4.879 5.012 5.143 5.301 5.469 5.622 5.786 5.955 6.106 6.244 6.412 6.621 6.8 6.964 7.143 7.362 7.551 7.652 7.658 7.407 6.736 6.023 5.367 4.772 4.28 3.844 3.416 3.028 2.656 2.362 2.078 1.799 1.525 1.259 1.012 0.763 0.545 0.34 0.118 -0.111 -0.293 -0.483 -0.682 -0.842 -1.015 -1.199 -1.38 -1.569 -1.696 -1.821 -2.018 -2.151 -2.299 -2.372 -2.523 -2.698 -2.879 -2.972 -3.173 -3.269 -3.368 -3.477 -3.755 -3.907 -4.062 -4.222 -4.399 -4.584 -4.814 -5.419 -3 ,23774 ,KEBNE ,16658156,Tue Nov 23 08:03:49 CET,Tue Nov 23 09:27:40 CET,0.0 0.527 0.831 1.067 1.26 1.426 1.574 1.689 1.877 1.98 2.085 2.165 2.351 2.438 2.595 2.743 2.881 2.953 3.105 3.231 3.378 3.466 3.557 3.697 3.831 3.943 4.042 4.151 4.305 4.45 4.591 4.771 4.934 5.074 5.225 5.386 5.531 5.679 5.829 5.986 6.131 6.281 6.472 6.658 6.867 7.048 7.214 7.364 7.445 7.445 7.143 6.447 5.769 5.155 4.602 4.076 3.613 3.205 2.837 2.456 2.134 1.86 1.582 1.306 1.061 0.842 0.593 0.357 0.161 -0.052 -0.265 -0.42 -0.582 -0.762 -0.916 -1.081 -1.242 -1.42 -1.602 -1.734 -1.878 -2.082 -2.223 -2.368 -2.445 -2.607 -2.77 -2.937 -3.032 -3.232 -3.335 -3.453 -3.568 -3.799 -3.932 -4.073 -4.237 -4.419 -4.634 -4.905 -5.338 -4 ,31950 ,KEBNE ,16658157,Tue Nov 23 08:03:49 CET,Tue Nov 23 09:25:57 CET,0.0 0.748 1.056 1.272 1.444 1.598 1.758 1.899 2.135 2.246 2.338 2.412 2.589 2.671 2.834 2.974 3.11 3.18 3.306 3.419 3.572 3.669 3.77 3.925 4.056 4.174 4.303 4.426 4.556 4.67 4.796 4.958 5.096 5.22 5.362 5.524 5.683 5.861 6.044 6.223 6.395 6.583 6.816 7.002 7.175 7.372 7.554 7.7 7.82 7.803 7.445 6.814 6.222 5.637 5.084 4.553 4.072 3.637 3.273 2.91 2.581 2.269 1.974 1.713 1.468 1.25 1.034 0.826 0.633 0.439 0.229 0.038 -0.165 -0.362 -0.505 -0.652 -0.815 -0.983 -1.165 -1.304 -1.44 -1.643 -1.778 -1.92 -1.998 -2.167 -2.331 -2.474 -2.559 -2.762 -2.864 -2.977 -3.098 -3.377 -3.533 -3.69 -3.859 -4.031 -4.227 -4.515 -5.387 -5 ,26632 ,KEBNE ,16658158,Tue Nov 23 08:03:49 CET,Tue Nov 23 09:26:40 CET,0.0 0.656 0.906 1.087 1.254 1.398 1.502 1.609 1.824 1.918 2.017 2.107 2.29 2.366 2.51 2.669 2.823 2.889 3.006 3.118 3.281 3.386 3.499 3.651 3.778 3.908 4.042 4.164 4.305 4.435 4.566 4.727 4.871 5.007 5.158 5.333 5.539 5.767 6.001 6.228 6.423 6.611 6.804 6.989 7.224 7.437 7.602 7.712 7.774 7.727 7.35 6.695 6.004 5.345 4.79 4.272 3.801 3.365 3.0 2.644 2.321 2.035 1.758 1.494 1.252 1.02 0.758 0.529 0.331 0.137 -0.059 -0.239 -0.43 -0.637 -0.792 -0.94 -1.102 -1.265 -1.431 -1.548 -1.665 -1.859 -2.003 -2.147 -2.215 -2.362 -2.526 -2.69 -2.777 -2.975 -3.068 -3.183 -3.296 -3.523 -3.664 -3.809 -3.961 -4.15 -4.365 -4.629 -5.221 -6 ,4039 ,KEBNE ,16658159,Tue Nov 23 08:03:49 CET,Tue Nov 23 09:27:14 CET,0.0 0.763 1.036 1.234 1.397 1.561 1.685 1.777 1.985 2.105 2.217 2.32 2.494 2.572 2.739 2.899 3.047 3.113 3.242 3.341 3.469 3.562 3.657 3.816 3.961 4.086 4.203 4.313 4.464 4.603 4.731 4.898 5.069 5.233 5.398 5.562 5.723 5.888 6.061 6.253 6.437 6.596 6.775 6.967 7.177 7.399 7.584 7.759 7.91 7.922 7.598 6.892 6.19 5.548 5.005 4.503 4.011 3.561 3.182 2.789 2.457 2.17 1.905 1.652 1.399 1.168 0.904 0.644 0.43 0.215 -0.011 -0.194 -0.38 -0.563 -0.702 -0.855 -1.027 -1.205 -1.391 -1.513 -1.635 -1.836 -1.972 -2.119 -2.201 -2.38 -2.556 -2.734 -2.824 -3.017 -3.117 -3.227 -3.348 -3.608 -3.751 -3.907 -4.046 -4.196 -4.392 -4.626 -5.479 -7 ,16825 ,KEBNE ,16658160,Tue Nov 23 08:03:49 CET,Tue Nov 23 09:26:51 CET,0.0 0.922 1.241 1.464 1.69 1.853 1.977 2.091 2.284 2.368 2.467 2.556 2.729 2.805 2.966 3.121 3.272 3.337 3.465 3.596 3.768 3.876 3.971 4.101 4.235 4.372 4.502 4.629 4.788 4.933 5.077 5.234 5.364 5.489 5.632 5.781 5.943 6.132 6.301 6.471 6.666 6.862 7.05 7.223 7.425 7.639 7.819 7.982 8.122 8.121 7.779 7.16 6.548 5.927 5.344 4.809 4.338 3.902 3.534 3.148 2.812 2.512 2.205 1.92 1.666 1.439 1.214 1.008 0.796 0.572 0.354 0.174 -0.027 -0.231 -0.389 -0.566 -0.749 -0.935 -1.124 -1.246 -1.366 -1.565 -1.706 -1.848 -1.924 -2.096 -2.275 -2.453 -2.544 -2.741 -2.872 -3.004 -3.139 -3.407 -3.54 -3.66 -3.784 -3.955 -4.165 -4.451 -5.062 -8 ,9903 ,KEBNE ,16658161,Tue Nov 23 08:04:51 CET,Tue Nov 23 09:27:04 CET,0.0 1.141 1.435 1.644 1.822 1.969 2.11 2.249 2.475 2.569 2.662 2.727 2.897 2.975 3.133 3.277 3.411 3.477 3.601 3.711 3.867 3.972 4.074 4.218 4.351 4.474 4.59 4.693 4.827 4.955 5.082 5.243 5.408 5.574 5.783 6.019 6.219 6.425 6.63 6.82 6.996 7.18 7.399 7.63 7.86 8.037 8.212 8.366 8.444 8.391 8.025 7.388 6.772 6.197 5.687 5.199 4.753 4.332 3.95 3.564 3.23 2.913 2.6 2.317 2.066 1.843 1.598 1.366 1.16 0.954 0.76 0.607 0.443 0.245 0.095 -0.043 -0.201 -0.364 -0.533 -0.652 -0.77 -0.953 -1.086 -1.226 -1.301 -1.466 -1.63 -1.8 -1.888 -2.082 -2.166 -2.264 -2.368 -2.582 -2.706 -2.836 -2.968 -3.125 -3.322 -3.632 -4.11 -9 ,14803 ,KEBNE ,16658162,Tue Nov 23 08:04:51 CET,Tue Nov 23 09:27:00 CET,0.0 0.552 0.846 1.109 1.313 1.48 1.625 1.759 1.994 2.098 2.192 2.293 2.477 2.554 2.722 2.884 3.047 3.121 3.258 3.38 3.533 3.635 3.736 3.882 4.036 4.193 4.348 4.495 4.663 4.814 4.951 5.104 5.253 5.386 5.539 5.712 5.873 6.061 6.249 6.427 6.611 6.845 7.142 7.391 7.62 7.835 8.052 8.225 8.283 8.227 7.936 7.341 6.748 6.182 5.641 5.138 4.66 4.231 3.845 3.465 3.133 2.822 2.546 2.294 2.046 1.796 1.521 1.297 1.108 0.894 0.664 0.487 0.309 0.131 -0.013 -0.184 -0.365 -0.553 -0.732 -0.835 -0.944 -1.143 -1.287 -1.427 -1.497 -1.639 -1.797 -1.973 -2.064 -2.254 -2.359 -2.474 -2.583 -2.835 -2.976 -3.123 -3.293 -3.497 -3.711 -3.947 -4.37 -10 ,24965 ,KEBNE ,16658163,Tue Nov 23 08:04:50 CET,Tue Nov 23 09:26:39 CET,0.0 0.808 1.113 1.325 1.496 1.653 1.782 1.899 2.123 2.213 2.294 2.371 2.556 2.649 2.845 3.019 3.172 3.246 3.394 3.53 3.723 3.845 3.953 4.123 4.291 4.451 4.606 4.741 4.896 5.051 5.205 5.396 5.584 5.753 5.952 6.168 6.358 6.543 6.715 6.891 7.093 7.298 7.495 7.681 7.875 8.046 8.23 8.417 8.534 8.48 8.06 7.371 6.733 6.1 5.498 4.942 4.465 4.045 3.651 3.26 2.937 2.629 2.319 2.035 1.769 1.523 1.27 1.038 0.834 0.636 0.425 0.231 0.026 -0.165 -0.305 -0.452 -0.617 -0.797 -0.982 -1.104 -1.238 -1.456 -1.591 -1.74 -1.814 -1.956 -2.117 -2.279 -2.367 -2.572 -2.662 -2.763 -2.87 -3.113 -3.249 -3.388 -3.541 -3.714 -3.921 -4.181 -4.711 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_215_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_215_252.txt deleted file mode 100644 index 435716b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_215_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25568 ,KEBNE ,16658164,Tue Nov 23 08:04:51 CET,Tue Nov 23 09:28:24 CET,0.0 0.478 0.682 0.819 0.946 1.068 1.182 1.283 1.453 1.537 1.624 1.686 1.856 1.917 2.015 2.122 2.227 2.267 2.353 2.45 2.592 2.68 2.76 2.868 2.972 3.068 3.154 3.226 3.299 3.36 3.416 3.473 3.538 3.606 3.665 3.735 3.809 3.895 3.986 4.054 4.107 4.146 4.126 4.065 3.991 3.881 3.683 3.317 2.78 1.966 0.513 -1.226 -2.692 -3.96 -5.05 -6.019 -6.888 -7.681 -8.324 -8.957 -9.493 -9.976 -10.47 -10.921 -11.353 -11.751 -12.135 -12.488 -12.781 -13.061 -13.382 -13.666 -13.946 -14.243 -14.47 -14.711 -14.962 -15.232 -15.517 -15.711 -15.913 -16.212 -16.412 -16.608 -16.711 -16.94 -17.176 -17.42 -17.552 -17.81 -17.981 -18.141 -18.305 -18.651 -18.859 -19.086 -19.33 -19.628 -19.985 -20.436 -21.525 -2 ,10391 ,KEBNE ,16658165,Tue Nov 23 08:04:51 CET,Tue Nov 23 09:28:33 CET,0.0 0.341 0.54 0.703 0.856 0.989 1.079 1.164 1.353 1.446 1.528 1.572 1.735 1.788 1.909 2.037 2.147 2.194 2.274 2.362 2.511 2.611 2.693 2.784 2.872 2.951 3.019 3.094 3.183 3.26 3.342 3.421 3.486 3.545 3.617 3.697 3.768 3.843 3.917 3.987 4.026 4.042 4.007 3.95 3.872 3.757 3.576 3.278 2.76 1.892 0.409 -1.426 -2.97 -4.257 -5.4 -6.438 -7.321 -8.095 -8.762 -9.419 -9.969 -10.469 -10.966 -11.424 -11.846 -12.236 -12.65 -13.033 -13.349 -13.669 -14.014 -14.317 -14.614 -14.9 -15.125 -15.366 -15.626 -15.891 -16.166 -16.347 -16.521 -16.813 -17.029 -17.243 -17.355 -17.587 -17.834 -18.098 -18.246 -18.511 -18.668 -18.827 -19.015 -19.424 -19.63 -19.876 -20.17 -20.483 -20.833 -21.249 -22.416 -3 ,19733 ,KEBNE ,16658166,Tue Nov 23 08:04:51 CET,Tue Nov 23 09:28:33 CET,0.0 0.459 0.695 0.889 1.048 1.188 1.323 1.435 1.631 1.716 1.791 1.836 2.008 2.08 2.193 2.3 2.415 2.463 2.543 2.623 2.75 2.821 2.882 2.973 3.064 3.161 3.255 3.341 3.449 3.558 3.659 3.742 3.823 3.903 3.987 4.053 4.079 4.12 4.178 4.243 4.275 4.276 4.275 4.255 4.196 4.072 3.869 3.582 3.136 2.342 0.873 -0.968 -2.533 -3.838 -4.936 -5.895 -6.732 -7.512 -8.185 -8.821 -9.346 -9.825 -10.304 -10.766 -11.17 -11.517 -11.901 -12.248 -12.532 -12.83 -13.178 -13.467 -13.745 -14.044 -14.272 -14.522 -14.807 -15.089 -15.375 -15.566 -15.754 -16.053 -16.261 -16.479 -16.594 -16.845 -17.1 -17.355 -17.498 -17.759 -17.932 -18.089 -18.253 -18.626 -18.825 -19.048 -19.297 -19.603 -19.955 -20.416 -21.458 -4 ,24137 ,KEBNE ,16658167,Tue Nov 23 08:04:51 CET,Tue Nov 23 09:26:36 CET,0.0 0.318 0.592 0.797 0.954 1.074 1.182 1.287 1.443 1.508 1.568 1.584 1.733 1.788 1.894 1.992 2.107 2.157 2.242 2.331 2.445 2.513 2.577 2.662 2.751 2.847 2.94 3.028 3.128 3.214 3.294 3.404 3.512 3.592 3.675 3.75 3.802 3.854 3.904 3.945 3.977 4.022 4.042 4.001 3.929 3.788 3.524 3.165 2.652 1.815 0.317 -1.539 -3.108 -4.398 -5.477 -6.436 -7.236 -7.972 -8.621 -9.282 -9.842 -10.337 -10.813 -11.251 -11.633 -11.994 -12.403 -12.754 -13.067 -13.417 -13.762 -14.033 -14.331 -14.645 -14.886 -15.132 -15.386 -15.637 -15.89 -16.073 -16.282 -16.601 -16.798 -17.005 -17.117 -17.353 -17.592 -17.846 -17.983 -18.255 -18.47 -18.644 -18.814 -19.174 -19.379 -19.59 -19.822 -20.063 -20.372 -20.8 -21.843 -5 ,5679 ,KEBNE ,16658168,Tue Nov 23 08:04:51 CET,Tue Nov 23 09:27:49 CET,0.0 0.44 0.641 0.792 0.928 1.042 1.151 1.266 1.466 1.547 1.622 1.671 1.839 1.909 2.044 2.162 2.262 2.306 2.405 2.505 2.615 2.679 2.727 2.793 2.873 2.958 3.051 3.139 3.228 3.313 3.399 3.487 3.575 3.677 3.78 3.856 3.898 3.974 4.064 4.121 4.158 4.163 4.143 4.126 4.074 3.902 3.654 3.321 2.753 1.851 0.314 -1.493 -3.012 -4.314 -5.412 -6.45 -7.353 -8.125 -8.76 -9.377 -9.915 -10.422 -10.916 -11.368 -11.799 -12.188 -12.58 -12.941 -13.262 -13.581 -13.912 -14.178 -14.45 -14.744 -14.972 -15.207 -15.448 -15.706 -15.997 -16.195 -16.393 -16.719 -16.934 -17.149 -17.268 -17.511 -17.765 -18.037 -18.183 -18.452 -18.636 -18.794 -18.96 -19.348 -19.594 -19.871 -20.137 -20.403 -20.742 -21.236 -22.317 -6 ,287 ,KEBNE ,16658169,Tue Nov 23 08:04:51 CET,Tue Nov 23 09:27:35 CET,0.0 0.372 0.567 0.739 0.882 0.999 1.137 1.263 1.456 1.537 1.61 1.668 1.84 1.909 2.02 2.125 2.229 2.275 2.36 2.448 2.581 2.64 2.697 2.805 2.905 2.982 3.056 3.149 3.263 3.357 3.451 3.553 3.641 3.711 3.787 3.865 3.942 4.044 4.131 4.178 4.19 4.197 4.228 4.244 4.196 4.072 3.863 3.524 2.999 2.149 0.687 -1.149 -2.759 -4.121 -5.229 -6.261 -7.17 -7.922 -8.577 -9.227 -9.781 -10.279 -10.744 -11.183 -11.594 -11.953 -12.33 -12.673 -12.96 -13.275 -13.634 -13.927 -14.203 -14.495 -14.724 -14.95 -15.187 -15.438 -15.704 -15.896 -16.091 -16.394 -16.614 -16.831 -16.941 -17.174 -17.417 -17.681 -17.822 -18.078 -18.27 -18.443 -18.619 -18.991 -19.192 -19.418 -19.663 -19.942 -20.302 -20.746 -21.985 -7 ,3768 ,KEBNE ,16658170,Tue Nov 23 08:04:51 CET,Tue Nov 23 09:28:52 CET,0.0 0.411 0.581 0.728 0.857 0.966 1.067 1.166 1.344 1.422 1.508 1.551 1.717 1.794 1.923 2.046 2.157 2.2 2.28 2.352 2.443 2.51 2.586 2.695 2.787 2.88 2.971 3.046 3.15 3.232 3.298 3.379 3.451 3.523 3.591 3.659 3.724 3.793 3.855 3.885 3.916 3.943 3.942 3.923 3.852 3.714 3.495 3.145 2.581 1.72 0.264 -1.513 -2.997 -4.291 -5.402 -6.381 -7.223 -7.975 -8.627 -9.288 -9.866 -10.365 -10.83 -11.266 -11.665 -12.025 -12.404 -12.733 -13.016 -13.344 -13.687 -13.953 -14.229 -14.522 -14.756 -14.991 -15.234 -15.497 -15.774 -15.974 -16.166 -16.443 -16.643 -16.841 -16.949 -17.166 -17.417 -17.694 -17.825 -18.076 -18.241 -18.399 -18.563 -18.94 -19.144 -19.36 -19.603 -19.858 -20.186 -20.6 -21.74 -8 ,30816 ,KEBNE ,16658171,Tue Nov 23 08:04:51 CET,Tue Nov 23 09:27:51 CET,0.0 0.381 0.628 0.828 0.998 1.11 1.22 1.333 1.551 1.66 1.737 1.75 1.914 1.981 2.096 2.208 2.315 2.361 2.446 2.527 2.656 2.73 2.795 2.89 2.973 3.069 3.15 3.205 3.284 3.373 3.448 3.519 3.599 3.684 3.786 3.871 3.921 3.967 3.997 4.022 4.038 4.068 4.098 4.071 3.987 3.84 3.617 3.292 2.743 1.831 0.293 -1.634 -3.23 -4.514 -5.597 -6.552 -7.378 -8.114 -8.721 -9.321 -9.853 -10.343 -10.833 -11.289 -11.705 -12.097 -12.493 -12.843 -13.152 -13.467 -13.787 -14.047 -14.324 -14.631 -14.855 -15.095 -15.371 -15.644 -15.926 -16.114 -16.303 -16.605 -16.817 -17.017 -17.11 -17.333 -17.588 -17.852 -17.987 -18.24 -18.416 -18.594 -18.782 -19.151 -19.353 -19.586 -19.837 -20.125 -20.485 -20.931 -22.278 -9 ,25350 ,KEBNE ,16658172,Tue Nov 23 08:04:51 CET,Tue Nov 23 09:27:29 CET,0.0 0.533 0.738 0.892 1.025 1.153 1.271 1.382 1.568 1.646 1.722 1.753 1.91 1.975 2.125 2.261 2.368 2.415 2.516 2.622 2.77 2.859 2.929 3.031 3.13 3.206 3.266 3.318 3.386 3.47 3.553 3.65 3.76 3.843 3.92 3.987 4.031 4.1 4.163 4.215 4.239 4.222 4.19 4.14 4.039 3.893 3.669 3.334 2.812 1.942 0.437 -1.364 -2.802 -4.059 -5.163 -6.111 -6.914 -7.645 -8.275 -8.883 -9.435 -9.928 -10.389 -10.819 -11.199 -11.555 -11.93 -12.26 -12.54 -12.836 -13.163 -13.443 -13.738 -14.044 -14.283 -14.522 -14.753 -15.014 -15.298 -15.491 -15.686 -15.997 -16.217 -16.442 -16.559 -16.8 -17.065 -17.343 -17.481 -17.74 -17.892 -18.05 -18.229 -18.595 -18.793 -19.006 -19.256 -19.535 -19.85 -20.251 -21.608 -10 ,29781 ,KEBNE ,16658173,Tue Nov 23 08:05:52 CET,Tue Nov 23 09:29:27 CET,0.0 0.557 0.763 0.926 1.048 1.141 1.23 1.324 1.491 1.558 1.619 1.654 1.815 1.871 1.977 2.078 2.198 2.258 2.361 2.451 2.588 2.691 2.776 2.885 2.991 3.072 3.144 3.213 3.321 3.408 3.46 3.525 3.572 3.616 3.702 3.795 3.849 3.895 3.941 3.978 4.022 4.047 4.031 3.999 3.923 3.798 3.595 3.244 2.652 1.773 0.279 -1.629 -3.184 -4.508 -5.627 -6.612 -7.46 -8.193 -8.833 -9.48 -10.021 -10.519 -11.016 -11.493 -11.937 -12.335 -12.739 -13.085 -13.377 -13.693 -14.033 -14.305 -14.584 -14.875 -15.116 -15.374 -15.614 -15.865 -16.146 -16.349 -16.565 -16.902 -17.13 -17.342 -17.449 -17.687 -17.93 -18.166 -18.294 -18.562 -18.762 -18.939 -19.103 -19.474 -19.701 -19.93 -20.17 -20.444 -20.743 -21.14 -22.289 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_227_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_227_231.txt deleted file mode 100644 index fc8aff17..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_227_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28330 ,KEBNE ,16658174,Tue Nov 23 08:05:51 CET,Tue Nov 23 09:28:52 CET,0.0 0.249 0.396 0.496 0.593 0.687 0.784 0.866 0.973 1.02 1.068 1.098 1.208 1.243 1.304 1.352 1.385 1.4 1.434 1.459 1.482 1.501 1.518 1.531 1.541 1.543 1.538 1.526 1.509 1.497 1.488 1.473 1.44 1.418 1.383 1.3 1.21 1.112 0.99 0.826 0.623 0.372 0.072 -0.266 -0.757 -1.39 -2.208 -3.257 -4.725 -6.82 -10.128 -13.778 -16.538 -18.77 -20.605 -22.167 -23.464 -24.565 -25.494 -26.385 -27.137 -27.823 -28.445 -29.002 -29.536 -30.018 -30.481 -30.889 -31.244 -31.623 -32.031 -32.36 -32.691 -33.03 -33.286 -33.535 -33.796 -34.08 -34.368 -34.564 -34.76 -35.063 -35.266 -35.482 -35.6 -35.827 -36.042 -36.271 -36.399 -36.636 -36.772 -36.9 -37.037 -37.33 -37.496 -37.687 -37.893 -38.118 -38.43 -38.858 -39.775 -2 ,15013 ,KEBNE ,16658175,Tue Nov 23 08:05:51 CET,Tue Nov 23 09:28:02 CET,0.0 0.347 0.492 0.596 0.678 0.76 0.836 0.902 1.021 1.071 1.113 1.146 1.261 1.304 1.383 1.449 1.501 1.526 1.58 1.63 1.693 1.719 1.733 1.763 1.786 1.795 1.799 1.805 1.793 1.763 1.744 1.715 1.69 1.662 1.612 1.524 1.436 1.337 1.2 1.056 0.881 0.63 0.305 -0.059 -0.57 -1.207 -2.019 -3.1 -4.598 -6.732 -10.006 -13.597 -16.396 -18.588 -20.349 -21.861 -23.127 -24.246 -25.174 -26.086 -26.845 -27.491 -28.097 -28.678 -29.22 -29.686 -30.154 -30.571 -30.936 -31.3 -31.659 -31.972 -32.317 -32.676 -32.931 -33.178 -33.438 -33.725 -34.036 -34.242 -34.455 -34.785 -35.009 -35.229 -35.334 -35.553 -35.781 -36.024 -36.154 -36.382 -36.523 -36.664 -36.815 -37.117 -37.284 -37.471 -37.665 -37.896 -38.168 -38.45 -39.115 -3 ,25205 ,KEBNE ,16658176,Tue Nov 23 08:05:52 CET,Tue Nov 23 09:27:42 CET,0.0 0.396 0.515 0.625 0.715 0.795 0.874 0.943 1.047 1.094 1.146 1.163 1.264 1.298 1.358 1.411 1.452 1.47 1.514 1.563 1.612 1.624 1.634 1.651 1.666 1.673 1.673 1.679 1.698 1.701 1.697 1.687 1.659 1.617 1.58 1.525 1.425 1.306 1.188 1.045 0.857 0.611 0.259 -0.132 -0.626 -1.245 -2.088 -3.185 -4.634 -6.787 -10.123 -13.784 -16.601 -18.838 -20.651 -22.189 -23.48 -24.574 -25.5 -26.417 -27.18 -27.838 -28.444 -29.022 -29.553 -30.03 -30.519 -30.938 -31.297 -31.665 -32.054 -32.377 -32.701 -33.025 -33.263 -33.515 -33.796 -34.085 -34.37 -34.559 -34.755 -35.061 -35.264 -35.473 -35.588 -35.826 -36.062 -36.303 -36.427 -36.661 -36.831 -36.976 -37.114 -37.412 -37.572 -37.758 -37.972 -38.192 -38.449 -38.775 -39.331 -4 ,10111 ,KEBNE ,16658177,Tue Nov 23 08:05:52 CET,Tue Nov 23 09:29:39 CET,0.0 0.273 0.402 0.483 0.563 0.637 0.703 0.76 0.862 0.914 0.951 0.944 1.042 1.072 1.13 1.18 1.22 1.244 1.297 1.354 1.407 1.425 1.438 1.447 1.47 1.497 1.516 1.519 1.509 1.499 1.486 1.46 1.423 1.381 1.329 1.256 1.171 1.065 0.919 0.729 0.52 0.263 -0.075 -0.438 -0.931 -1.571 -2.404 -3.522 -5.082 -7.296 -10.68 -14.323 -17.086 -19.276 -21.036 -22.552 -23.832 -24.942 -25.855 -26.735 -27.479 -28.128 -28.75 -29.325 -29.862 -30.341 -30.823 -31.26 -31.625 -31.986 -32.344 -32.653 -32.98 -33.307 -33.56 -33.82 -34.086 -34.36 -34.641 -34.832 -35.026 -35.322 -35.523 -35.734 -35.841 -36.065 -36.304 -36.542 -36.669 -36.91 -37.087 -37.227 -37.37 -37.702 -37.884 -38.074 -38.281 -38.505 -38.772 -39.103 -39.832 -5 ,11816 ,KEBNE ,16658178,Tue Nov 23 08:05:52 CET,Tue Nov 23 09:28:45 CET,0.0 0.473 0.64 0.754 0.845 0.921 0.992 1.05 1.134 1.181 1.234 1.246 1.342 1.379 1.441 1.484 1.523 1.548 1.603 1.643 1.677 1.691 1.714 1.755 1.772 1.778 1.787 1.794 1.801 1.808 1.798 1.784 1.784 1.757 1.696 1.621 1.553 1.461 1.331 1.187 1.0 0.738 0.408 0.019 -0.467 -1.057 -1.882 -2.993 -4.482 -6.596 -9.979 -13.688 -16.493 -18.699 -20.482 -22.017 -23.319 -24.447 -25.394 -26.305 -27.047 -27.698 -28.331 -28.916 -29.436 -29.901 -30.369 -30.782 -31.143 -31.508 -31.891 -32.206 -32.521 -32.862 -33.136 -33.415 -33.688 -33.957 -34.238 -34.427 -34.611 -34.905 -35.117 -35.328 -35.437 -35.668 -35.911 -36.17 -36.292 -36.507 -36.644 -36.788 -36.934 -37.265 -37.46 -37.648 -37.852 -38.092 -38.354 -38.668 -39.303 -6 ,27752 ,KEBNE ,16658179,Tue Nov 23 08:06:53 CET,Tue Nov 23 09:30:24 CET,0.0 0.231 0.388 0.531 0.654 0.754 0.837 0.913 1.023 1.073 1.115 1.121 1.223 1.253 1.312 1.358 1.399 1.413 1.441 1.477 1.539 1.569 1.579 1.589 1.603 1.604 1.596 1.579 1.576 1.578 1.568 1.543 1.509 1.49 1.454 1.378 1.293 1.185 1.052 0.908 0.717 0.461 0.154 -0.214 -0.71 -1.323 -2.167 -3.289 -4.815 -7.011 -10.367 -13.995 -16.757 -18.973 -20.793 -22.358 -23.654 -24.781 -25.749 -26.674 -27.451 -28.123 -28.739 -29.333 -29.876 -30.346 -30.826 -31.25 -31.607 -31.972 -32.346 -32.648 -32.977 -33.324 -33.576 -33.839 -34.113 -34.373 -34.634 -34.821 -35.003 -35.27 -35.47 -35.676 -35.776 -35.99 -36.223 -36.478 -36.607 -36.84 -36.999 -37.137 -37.279 -37.594 -37.766 -37.954 -38.161 -38.374 -38.624 -38.9 -39.585 -7 ,23414 ,KEBNE ,16658180,Tue Nov 23 08:06:53 CET,Tue Nov 23 09:30:40 CET,0.0 0.262 0.424 0.55 0.634 0.7 0.762 0.821 0.919 0.96 0.995 0.998 1.097 1.13 1.201 1.259 1.309 1.336 1.378 1.417 1.459 1.479 1.504 1.535 1.558 1.574 1.581 1.585 1.581 1.574 1.569 1.55 1.522 1.482 1.435 1.388 1.316 1.217 1.094 0.94 0.767 0.53 0.2 -0.165 -0.678 -1.323 -2.16 -3.274 -4.758 -6.899 -10.25 -13.907 -16.676 -18.873 -20.653 -22.191 -23.493 -24.617 -25.549 -26.458 -27.234 -27.928 -28.562 -29.13 -29.653 -30.146 -30.653 -31.066 -31.424 -31.803 -32.172 -32.478 -32.811 -33.143 -33.401 -33.668 -33.934 -34.208 -34.505 -34.699 -34.896 -35.2 -35.398 -35.602 -35.715 -35.938 -36.148 -36.376 -36.499 -36.739 -36.907 -37.054 -37.212 -37.549 -37.732 -37.916 -38.098 -38.3 -38.569 -38.904 -39.524 -8 ,14191 ,KEBNE ,16658181,Tue Nov 23 08:06:53 CET,Tue Nov 23 09:29:54 CET,0.0 0.311 0.491 0.628 0.702 0.774 0.849 0.914 1.027 1.077 1.128 1.153 1.252 1.278 1.322 1.375 1.424 1.445 1.482 1.513 1.553 1.587 1.617 1.651 1.694 1.731 1.754 1.769 1.788 1.78 1.754 1.726 1.687 1.629 1.569 1.502 1.42 1.305 1.156 0.993 0.795 0.536 0.171 -0.24 -0.741 -1.351 -2.165 -3.256 -4.788 -7.007 -10.331 -13.966 -16.75 -18.97 -20.792 -22.351 -23.643 -24.744 -25.652 -26.567 -27.343 -28.035 -28.693 -29.281 -29.813 -30.287 -30.76 -31.188 -31.557 -31.923 -32.288 -32.596 -32.92 -33.244 -33.488 -33.727 -33.976 -34.25 -34.537 -34.735 -34.932 -35.23 -35.437 -35.657 -35.771 -36.004 -36.245 -36.483 -36.603 -36.834 -36.999 -37.139 -37.288 -37.621 -37.811 -38.025 -38.251 -38.473 -38.702 -39.022 -39.945 -9 ,1125 ,KEBNE ,16658182,Tue Nov 23 08:06:53 CET,Tue Nov 23 09:31:33 CET,0.0 0.316 0.504 0.637 0.734 0.808 0.871 0.93 1.019 1.061 1.102 1.129 1.239 1.279 1.357 1.414 1.459 1.486 1.541 1.579 1.615 1.637 1.658 1.68 1.688 1.691 1.697 1.7 1.716 1.738 1.733 1.723 1.708 1.666 1.607 1.535 1.453 1.364 1.252 1.089 0.879 0.632 0.33 -0.035 -0.526 -1.149 -1.956 -3.03 -4.528 -6.634 -9.914 -13.55 -16.358 -18.599 -20.408 -21.943 -23.201 -24.291 -25.222 -26.141 -26.94 -27.619 -28.225 -28.793 -29.309 -29.77 -30.263 -30.707 -31.066 -31.412 -31.788 -32.112 -32.427 -32.748 -33.001 -33.259 -33.52 -33.787 -34.06 -34.249 -34.447 -34.753 -34.951 -35.158 -35.271 -35.493 -35.702 -35.92 -36.043 -36.275 -36.442 -36.582 -36.721 -37.024 -37.192 -37.369 -37.562 -37.781 -38.025 -38.356 -38.994 -10 ,28134 ,KEBNE ,16658183,Tue Nov 23 08:06:53 CET,Tue Nov 23 09:29:04 CET,0.0 0.302 0.497 0.618 0.722 0.817 0.885 0.937 1.05 1.098 1.134 1.138 1.239 1.268 1.326 1.38 1.421 1.44 1.483 1.527 1.576 1.59 1.597 1.615 1.646 1.654 1.65 1.649 1.636 1.614 1.578 1.538 1.505 1.461 1.404 1.327 1.243 1.139 0.999 0.831 0.637 0.399 0.095 -0.246 -0.725 -1.381 -2.242 -3.364 -4.908 -7.082 -10.432 -14.091 -16.853 -19.042 -20.838 -22.383 -23.685 -24.817 -25.757 -26.691 -27.469 -28.127 -28.723 -29.28 -29.81 -30.284 -30.773 -31.187 -31.529 -31.909 -32.313 -32.625 -32.934 -33.256 -33.514 -33.79 -34.067 -34.342 -34.625 -34.812 -35.012 -35.333 -35.548 -35.769 -35.888 -36.135 -36.381 -36.629 -36.752 -36.983 -37.153 -37.293 -37.438 -37.742 -37.904 -38.077 -38.271 -38.482 -38.729 -39.041 -39.69 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_227_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_227_57.txt deleted file mode 100644 index df58cc36..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_227_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9611 ,KEBNE ,16658184,Tue Nov 23 08:06:53 CET,Tue Nov 23 09:30:30 CET,0.0 0.438 0.645 0.841 1.011 1.166 1.288 1.388 1.574 1.652 1.728 1.806 1.938 2.001 2.127 2.261 2.382 2.443 2.559 2.665 2.83 2.926 3.017 3.147 3.269 3.387 3.512 3.651 3.815 3.947 4.076 4.232 4.381 4.525 4.667 4.822 5.004 5.208 5.414 5.632 5.825 6.006 6.214 6.427 6.69 6.976 7.221 7.423 7.596 7.735 7.699 7.303 6.88 6.442 5.986 5.56 5.192 4.86 4.543 4.206 3.926 3.668 3.406 3.161 2.938 2.738 2.52 2.319 2.145 1.967 1.779 1.619 1.452 1.278 1.135 0.985 0.832 0.667 0.493 0.385 0.283 0.115 -0.004 -0.113 -0.179 -0.329 -0.483 -0.643 -0.725 -0.871 -0.984 -1.079 -1.173 -1.394 -1.531 -1.677 -1.818 -1.963 -2.156 -2.399 -3.035 -2 ,16504 ,KEBNE ,16658185,Tue Nov 23 08:07:54 CET,Tue Nov 23 09:30:31 CET,0.0 0.44 0.635 0.841 1.003 1.119 1.227 1.325 1.508 1.602 1.694 1.785 1.909 1.971 2.104 2.235 2.345 2.393 2.506 2.621 2.777 2.873 2.964 3.108 3.251 3.374 3.48 3.593 3.734 3.861 3.999 4.171 4.32 4.468 4.649 4.831 4.991 5.153 5.331 5.514 5.707 5.924 6.158 6.369 6.575 6.825 7.107 7.357 7.584 7.72 7.624 7.212 6.751 6.304 5.868 5.454 5.085 4.717 4.409 4.125 3.85 3.582 3.333 3.089 2.857 2.646 2.435 2.24 2.06 1.882 1.691 1.537 1.367 1.181 1.042 0.898 0.752 0.608 0.456 0.341 0.221 0.047 -0.073 -0.191 -0.253 -0.39 -0.538 -0.702 -0.785 -0.942 -1.071 -1.175 -1.292 -1.508 -1.616 -1.748 -1.898 -2.064 -2.242 -2.454 -3.121 -3 ,5664 ,KEBNE ,16658186,Tue Nov 23 08:06:53 CET,Tue Nov 23 09:29:51 CET,0.0 0.293 0.486 0.653 0.801 0.921 1.052 1.18 1.366 1.447 1.529 1.611 1.754 1.833 1.966 2.079 2.199 2.26 2.379 2.494 2.636 2.719 2.803 2.935 3.063 3.193 3.318 3.425 3.572 3.721 3.851 4.0 4.154 4.289 4.43 4.598 4.752 4.911 5.085 5.283 5.483 5.703 5.937 6.134 6.365 6.603 6.82 7.029 7.226 7.342 7.2 6.768 6.303 5.84 5.395 5.016 4.67 4.304 3.98 3.661 3.396 3.158 2.913 2.685 2.445 2.216 2.005 1.825 1.663 1.472 1.267 1.105 0.934 0.751 0.609 0.458 0.302 0.138 -0.037 -0.162 -0.29 -0.482 -0.611 -0.747 -0.812 -0.933 -1.078 -1.25 -1.336 -1.49 -1.584 -1.668 -1.774 -2.015 -2.149 -2.292 -2.432 -2.589 -2.761 -3.01 -3.564 -4 ,28178 ,KEBNE ,16658187,Tue Nov 23 08:06:53 CET,Tue Nov 23 09:29:15 CET,0.0 0.558 0.8 1.005 1.177 1.332 1.449 1.547 1.729 1.82 1.9 1.964 2.103 2.181 2.337 2.483 2.609 2.667 2.778 2.876 3.009 3.095 3.175 3.314 3.458 3.584 3.698 3.813 3.971 4.104 4.233 4.42 4.596 4.756 4.937 5.105 5.257 5.431 5.605 5.802 6.011 6.251 6.524 6.756 7.004 7.248 7.495 7.73 7.933 8.032 7.858 7.441 7.01 6.542 6.1 5.711 5.348 4.984 4.673 4.371 4.093 3.835 3.596 3.378 3.155 2.94 2.718 2.519 2.359 2.189 2.014 1.857 1.684 1.5 1.349 1.2 1.059 0.92 0.77 0.66 0.547 0.383 0.249 0.107 0.04 -0.1 -0.248 -0.421 -0.515 -0.672 -0.793 -0.878 -0.967 -1.205 -1.339 -1.482 -1.646 -1.817 -2.002 -2.218 -2.776 -5 ,5677 ,KEBNE ,16658188,Tue Nov 23 08:07:53 CET,Tue Nov 23 09:32:02 CET,0.0 0.748 0.942 1.081 1.214 1.343 1.463 1.574 1.791 1.886 1.965 2.051 2.196 2.267 2.391 2.515 2.627 2.677 2.773 2.872 3.033 3.147 3.251 3.377 3.499 3.628 3.742 3.845 3.973 4.098 4.239 4.401 4.535 4.676 4.832 4.982 5.138 5.32 5.494 5.673 5.866 6.08 6.305 6.505 6.734 6.967 7.238 7.484 7.657 7.758 7.678 7.307 6.848 6.372 5.919 5.494 5.1 4.736 4.406 4.059 3.761 3.504 3.257 3.013 2.774 2.555 2.32 2.108 1.948 1.784 1.611 1.457 1.286 1.126 1.004 0.86 0.71 0.578 0.45 0.35 0.234 0.05 -0.069 -0.184 -0.252 -0.394 -0.539 -0.69 -0.763 -0.917 -1.037 -1.133 -1.231 -1.445 -1.555 -1.674 -1.83 -2.006 -2.199 -2.465 -3.009 -6 ,12621 ,KEBNE ,16658189,Tue Nov 23 08:07:54 CET,Tue Nov 23 09:32:02 CET,0.0 0.449 0.676 0.845 0.96 1.076 1.196 1.307 1.529 1.627 1.708 1.794 1.927 2.003 2.161 2.302 2.421 2.475 2.594 2.707 2.852 2.955 3.06 3.192 3.311 3.442 3.57 3.678 3.806 3.938 4.081 4.25 4.411 4.555 4.711 4.895 5.066 5.24 5.417 5.609 5.814 5.999 6.214 6.445 6.666 6.903 7.151 7.373 7.575 7.663 7.553 7.187 6.685 6.186 5.733 5.285 4.894 4.541 4.217 3.885 3.599 3.335 3.085 2.853 2.623 2.376 2.135 1.941 1.765 1.584 1.382 1.208 1.032 0.853 0.718 0.565 0.406 0.252 0.103 0.006 -0.113 -0.306 -0.424 -0.553 -0.624 -0.755 -0.888 -1.038 -1.123 -1.283 -1.411 -1.508 -1.612 -1.861 -2.004 -2.151 -2.299 -2.445 -2.66 -2.916 -3.262 -7 ,18051 ,KEBNE ,16658190,Tue Nov 23 08:07:54 CET,Tue Nov 23 09:31:09 CET,0.0 0.417 0.617 0.782 0.917 1.042 1.155 1.259 1.476 1.568 1.638 1.707 1.835 1.9 2.029 2.153 2.283 2.345 2.459 2.57 2.735 2.835 2.921 3.056 3.189 3.308 3.433 3.554 3.693 3.822 3.952 4.113 4.258 4.388 4.553 4.738 4.899 5.072 5.239 5.42 5.629 5.856 6.08 6.29 6.55 6.818 7.077 7.322 7.571 7.726 7.604 7.203 6.773 6.328 5.862 5.416 5.042 4.698 4.373 4.051 3.765 3.502 3.26 3.024 2.787 2.554 2.333 2.154 1.991 1.819 1.651 1.502 1.326 1.145 1.012 0.878 0.726 0.575 0.426 0.313 0.194 0.016 -0.112 -0.24 -0.304 -0.445 -0.59 -0.74 -0.823 -0.978 -1.081 -1.177 -1.293 -1.564 -1.71 -1.863 -2.008 -2.143 -2.331 -2.601 -3.014 -8 ,22000 ,KEBNE ,16658191,Tue Nov 23 08:07:54 CET,Tue Nov 23 09:30:21 CET,0.0 0.51 0.749 0.906 1.045 1.184 1.301 1.4 1.585 1.679 1.759 1.813 1.945 2.016 2.137 2.253 2.375 2.437 2.552 2.647 2.781 2.87 2.964 3.107 3.235 3.342 3.447 3.558 3.704 3.835 3.967 4.145 4.311 4.467 4.633 4.809 4.981 5.167 5.345 5.512 5.702 5.905 6.122 6.339 6.566 6.773 6.975 7.193 7.4 7.519 7.379 6.928 6.45 6.002 5.588 5.184 4.815 4.491 4.191 3.878 3.611 3.349 3.098 2.876 2.652 2.44 2.244 2.073 1.92 1.742 1.539 1.368 1.197 1.039 0.909 0.767 0.624 0.47 0.311 0.204 0.094 -0.086 -0.213 -0.335 -0.4 -0.545 -0.699 -0.859 -0.942 -1.104 -1.245 -1.348 -1.461 -1.7 -1.818 -1.947 -2.085 -2.252 -2.444 -2.7 -3.236 -9 ,30159 ,KEBNE ,16658192,Tue Nov 23 08:07:54 CET,Tue Nov 23 09:29:07 CET,0.0 0.567 0.81 0.97 1.109 1.218 1.31 1.412 1.617 1.718 1.808 1.887 2.02 2.091 2.218 2.338 2.463 2.521 2.629 2.73 2.868 2.959 3.058 3.193 3.311 3.434 3.539 3.642 3.792 3.94 4.08 4.229 4.365 4.496 4.631 4.778 4.93 5.109 5.286 5.468 5.672 5.903 6.146 6.355 6.583 6.832 7.081 7.291 7.506 7.686 7.617 7.202 6.745 6.285 5.854 5.471 5.118 4.77 4.465 4.147 3.868 3.622 3.375 3.139 2.905 2.699 2.488 2.297 2.133 1.957 1.762 1.594 1.436 1.268 1.136 1.006 0.866 0.719 0.567 0.465 0.35 0.166 0.042 -0.107 -0.186 -0.332 -0.485 -0.637 -0.717 -0.862 -0.974 -1.074 -1.173 -1.372 -1.492 -1.635 -1.784 -1.954 -2.121 -2.293 -2.724 -10 ,32500 ,KEBNE ,16658193,Tue Nov 23 08:07:54 CET,Tue Nov 23 09:31:28 CET,0.0 0.427 0.646 0.82 0.967 1.106 1.225 1.313 1.486 1.563 1.641 1.723 1.856 1.93 2.07 2.19 2.316 2.381 2.483 2.577 2.745 2.851 2.939 3.064 3.192 3.311 3.429 3.545 3.688 3.832 3.961 4.105 4.236 4.374 4.551 4.734 4.886 5.046 5.232 5.446 5.664 5.891 6.117 6.306 6.531 6.787 7.021 7.221 7.41 7.536 7.361 6.857 6.355 5.867 5.391 4.971 4.605 4.243 3.888 3.49 3.177 2.922 2.683 2.456 2.225 2.008 1.778 1.584 1.419 1.245 1.07 0.909 0.735 0.562 0.429 0.299 0.161 0.021 -0.115 -0.217 -0.331 -0.514 -0.638 -0.772 -0.846 -0.992 -1.135 -1.28 -1.36 -1.508 -1.605 -1.695 -1.794 -2.003 -2.111 -2.23 -2.361 -2.527 -2.726 -2.956 -3.584 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_235_167.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_235_167.txt deleted file mode 100644 index f908b7e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_235_167.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22190 ,KEBNE ,16658194,Tue Nov 23 08:07:58 CET,Tue Nov 23 09:28:35 CET,0.0 1.4 1.817 2.098 2.324 2.527 2.687 2.843 3.15 3.283 3.405 3.546 3.746 3.852 4.058 4.243 4.429 4.526 4.694 4.852 5.103 5.249 5.382 5.579 5.762 5.94 6.111 6.29 6.515 6.717 6.897 7.087 7.281 7.472 7.688 7.938 8.181 8.455 8.733 9.017 9.322 9.669 10.05 10.381 10.745 11.158 11.613 12.068 12.553 12.983 13.242 13.193 12.941 12.607 12.287 11.938 11.589 11.263 10.972 10.693 10.465 10.251 10.022 9.8 9.589 9.374 9.16 8.987 8.835 8.678 8.512 8.365 8.193 8.011 7.877 7.729 7.578 7.438 7.279 7.163 7.047 6.881 6.757 6.615 6.548 6.4 6.236 6.066 5.975 5.788 5.705 5.608 5.504 5.296 5.185 5.048 4.884 4.706 4.511 4.224 3.629 -2 ,21876 ,KEBNE ,16658195,Tue Nov 23 08:07:54 CET,Tue Nov 23 09:31:25 CET,0.0 1.123 1.497 1.773 2.012 2.216 2.395 2.545 2.836 2.987 3.116 3.256 3.466 3.574 3.783 3.961 4.128 4.211 4.376 4.531 4.746 4.892 5.035 5.24 5.425 5.595 5.767 5.941 6.143 6.315 6.498 6.734 6.943 7.142 7.379 7.622 7.849 8.099 8.378 8.688 8.991 9.288 9.59 9.873 10.239 10.654 11.073 11.477 11.874 12.293 12.649 12.659 12.413 12.103 11.765 11.461 11.193 10.892 10.614 10.339 10.085 9.843 9.609 9.377 9.146 8.939 8.709 8.496 8.324 8.151 7.974 7.832 7.679 7.527 7.406 7.281 7.147 7.002 6.854 6.733 6.603 6.427 6.313 6.186 6.114 5.975 5.839 5.694 5.617 5.433 5.341 5.249 5.145 4.923 4.807 4.676 4.517 4.324 4.127 3.913 3.367 -3 ,28522 ,KEBNE ,16658196,Tue Nov 23 08:07:54 CET,Tue Nov 23 09:31:31 CET,0.0 1.028 1.459 1.741 1.973 2.173 2.359 2.532 2.817 2.945 3.077 3.252 3.463 3.566 3.745 3.923 4.105 4.188 4.348 4.505 4.738 4.887 5.023 5.206 5.368 5.538 5.723 5.887 6.085 6.288 6.474 6.706 6.927 7.128 7.371 7.627 7.863 8.128 8.394 8.68 8.972 9.292 9.687 10.071 10.493 10.929 11.394 11.864 12.327 12.788 13.118 12.991 12.686 12.344 11.999 11.68 11.374 11.058 10.76 10.471 10.221 9.978 9.741 9.547 9.345 9.146 8.947 8.756 8.587 8.403 8.22 8.071 7.911 7.749 7.628 7.489 7.333 7.195 7.057 6.952 6.841 6.674 6.55 6.413 6.353 6.229 6.083 5.928 5.853 5.673 5.572 5.471 5.361 5.123 4.997 4.859 4.691 4.523 4.362 4.142 3.395 -4 ,20130 ,KEBNE ,16658197,Tue Nov 23 08:08:55 CET,Tue Nov 23 09:31:28 CET,0.0 1.445 1.808 2.04 2.257 2.423 2.585 2.754 3.03 3.166 3.304 3.466 3.667 3.761 3.948 4.141 4.32 4.41 4.587 4.746 4.988 5.138 5.278 5.475 5.676 5.862 6.015 6.178 6.404 6.614 6.822 7.068 7.291 7.494 7.717 7.959 8.182 8.439 8.737 9.042 9.337 9.652 10.005 10.367 10.747 11.105 11.539 11.975 12.383 12.8 13.104 12.997 12.684 12.296 11.901 11.535 11.208 10.909 10.622 10.327 10.087 9.852 9.601 9.364 9.143 8.949 8.734 8.52 8.334 8.153 7.964 7.803 7.651 7.5 7.374 7.237 7.086 6.922 6.752 6.639 6.529 6.366 6.24 6.097 6.025 5.868 5.696 5.526 5.442 5.269 5.21 5.115 5.005 4.779 4.668 4.544 4.405 4.211 3.994 3.753 3.284 -5 ,24700 ,KEBNE ,16658198,Tue Nov 23 08:08:55 CET,Tue Nov 23 09:32:50 CET,0.0 0.971 1.282 1.556 1.789 1.976 2.15 2.311 2.581 2.708 2.849 3.02 3.24 3.357 3.556 3.745 3.93 4.018 4.196 4.372 4.596 4.727 4.859 5.067 5.254 5.412 5.561 5.713 5.923 6.125 6.317 6.558 6.789 6.994 7.227 7.488 7.741 7.989 8.236 8.528 8.847 9.212 9.604 9.944 10.318 10.729 11.186 11.592 12.031 12.544 12.884 12.821 12.569 12.264 11.969 11.663 11.345 11.036 10.754 10.475 10.22 9.954 9.691 9.458 9.245 9.049 8.841 8.634 8.443 8.25 8.047 7.876 7.722 7.56 7.415 7.263 7.118 6.977 6.827 6.727 6.622 6.441 6.308 6.176 6.102 5.935 5.764 5.595 5.513 5.337 5.248 5.147 5.04 4.819 4.693 4.545 4.389 4.211 3.988 3.694 2.816 -6 ,7340 ,KEBNE ,16658199,Tue Nov 23 08:08:55 CET,Tue Nov 23 09:31:40 CET,0.0 1.107 1.503 1.764 2.002 2.219 2.409 2.565 2.848 2.991 3.117 3.262 3.477 3.59 3.807 4.016 4.203 4.288 4.447 4.598 4.806 4.94 5.076 5.272 5.457 5.63 5.783 5.938 6.143 6.33 6.526 6.767 6.981 7.162 7.383 7.631 7.862 8.105 8.375 8.657 8.929 9.269 9.657 10.008 10.438 10.897 11.303 11.775 12.323 12.741 13.003 12.991 12.81 12.531 12.205 11.854 11.504 11.177 10.912 10.62 10.346 10.11 9.871 9.647 9.431 9.23 9.03 8.839 8.666 8.479 8.28 8.121 7.958 7.783 7.643 7.502 7.359 7.202 7.03 6.909 6.79 6.606 6.473 6.342 6.276 6.13 5.985 5.825 5.736 5.561 5.468 5.359 5.256 5.034 4.902 4.763 4.613 4.435 4.259 4.039 3.473 -7 ,4107 ,KEBNE ,16658200,Tue Nov 23 08:09:56 CET,Tue Nov 23 09:31:50 CET,0.0 1.218 1.558 1.831 2.041 2.215 2.374 2.535 2.845 2.973 3.096 3.229 3.421 3.523 3.73 3.926 4.113 4.199 4.359 4.495 4.701 4.842 4.974 5.174 5.364 5.533 5.696 5.871 6.088 6.285 6.484 6.725 6.953 7.165 7.404 7.667 7.94 8.233 8.513 8.808 9.102 9.412 9.759 10.109 10.52 10.964 11.459 11.911 12.333 12.778 13.082 13.069 12.878 12.572 12.232 11.897 11.589 11.307 11.033 10.745 10.479 10.226 9.989 9.75 9.525 9.308 9.086 8.905 8.745 8.569 8.386 8.235 8.071 7.897 7.76 7.627 7.468 7.3 7.143 7.031 6.922 6.758 6.634 6.494 6.424 6.287 6.134 5.961 5.863 5.674 5.59 5.49 5.373 5.145 5.025 4.878 4.693 4.495 4.284 4.039 3.401 -8 ,11734 ,KEBNE ,16658201,Tue Nov 23 08:09:56 CET,Tue Nov 23 09:31:48 CET,0.0 1.057 1.399 1.677 1.878 2.041 2.202 2.36 2.652 2.781 2.904 3.05 3.256 3.369 3.578 3.755 3.919 4.0 4.17 4.329 4.549 4.691 4.822 5.002 5.163 5.315 5.468 5.617 5.816 6.009 6.194 6.422 6.644 6.858 7.093 7.356 7.604 7.832 8.071 8.341 8.621 8.926 9.296 9.679 10.109 10.555 11.001 11.442 11.861 12.268 12.586 12.526 12.269 11.954 11.6 11.244 10.909 10.617 10.364 10.088 9.798 9.519 9.269 9.045 8.855 8.676 8.462 8.26 8.085 7.917 7.736 7.579 7.426 7.26 7.128 7.002 6.865 6.707 6.551 6.447 6.332 6.145 6.015 5.88 5.812 5.674 5.512 5.342 5.266 5.1 5.029 4.929 4.815 4.584 4.47 4.345 4.205 4.044 3.851 3.589 3.009 -9 ,29645 ,KEBNE ,16658202,Tue Nov 23 08:10:58 CET,Tue Nov 23 09:34:34 CET,0.0 1.051 1.421 1.72 1.987 2.204 2.38 2.539 2.829 2.954 3.072 3.202 3.4 3.509 3.731 3.93 4.112 4.194 4.367 4.549 4.792 4.937 5.073 5.268 5.458 5.632 5.808 5.989 6.198 6.407 6.607 6.827 7.035 7.237 7.473 7.727 7.972 8.229 8.511 8.832 9.161 9.502 9.874 10.225 10.624 11.07 11.532 12.021 12.506 12.891 13.124 12.992 12.755 12.432 12.067 11.732 11.413 11.094 10.812 10.535 10.287 10.055 9.815 9.576 9.379 9.197 8.99 8.811 8.653 8.486 8.307 8.146 7.979 7.807 7.682 7.549 7.407 7.25 7.075 6.957 6.838 6.667 6.549 6.421 6.357 6.21 6.05 5.877 5.79 5.613 5.53 5.438 5.338 5.108 4.988 4.864 4.726 4.572 4.408 4.185 3.696 -10 ,32269 ,KEBNE ,16658203,Tue Nov 23 08:09:56 CET,Tue Nov 23 09:33:19 CET,0.0 1.554 1.965 2.263 2.507 2.714 2.894 3.061 3.379 3.532 3.666 3.795 3.989 4.084 4.268 4.435 4.592 4.673 4.843 5.01 5.234 5.365 5.49 5.672 5.847 6.025 6.193 6.355 6.572 6.764 6.954 7.185 7.388 7.594 7.825 8.063 8.31 8.573 8.845 9.119 9.396 9.709 10.023 10.325 10.696 11.116 11.557 12.046 12.568 13.028 13.347 13.349 13.136 12.84 12.496 12.141 11.817 11.496 11.195 10.874 10.612 10.383 10.146 9.907 9.69 9.507 9.302 9.1 8.939 8.776 8.595 8.438 8.268 8.105 7.981 7.842 7.703 7.562 7.402 7.291 7.178 6.991 6.857 6.712 6.639 6.507 6.357 6.196 6.12 5.94 5.866 5.764 5.652 5.423 5.306 5.184 5.054 4.913 4.735 4.5 4.244 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_235_224.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_235_224.txt deleted file mode 100644 index b17b9ee1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_235_224.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21656 ,KEBNE ,16658204,Tue Nov 23 08:09:56 CET,Tue Nov 23 09:33:23 CET,0.0 0.773 1.091 1.341 1.534 1.702 1.855 1.99 2.244 2.368 2.495 2.648 2.852 2.964 3.182 3.396 3.604 3.703 3.887 4.069 4.333 4.492 4.651 4.887 5.105 5.322 5.536 5.74 6.001 6.249 6.5 6.815 7.101 7.368 7.687 8.069 8.449 8.857 9.303 9.788 10.299 10.918 11.648 12.362 13.205 14.132 15.205 16.459 17.962 19.805 22.11 24.051 25.195 25.904 26.309 26.581 26.728 26.777 26.803 26.802 26.78 26.747 26.687 26.61 26.525 26.436 26.331 26.247 26.185 26.107 25.997 25.898 25.794 25.688 25.614 25.527 25.427 25.298 25.157 25.072 24.983 24.841 24.739 24.621 24.557 24.414 24.278 24.133 24.043 23.892 23.786 23.676 23.56 23.324 23.186 23.04 22.893 22.7 22.427 22.112 20.49 -2 ,23173 ,KEBNE ,16658205,Tue Nov 23 08:09:56 CET,Tue Nov 23 09:33:20 CET,0.0 0.754 0.996 1.161 1.331 1.504 1.671 1.825 2.112 2.25 2.376 2.521 2.729 2.852 3.072 3.258 3.456 3.554 3.737 3.912 4.168 4.335 4.487 4.706 4.917 5.112 5.302 5.492 5.748 6.015 6.266 6.563 6.855 7.151 7.493 7.864 8.24 8.659 9.128 9.634 10.159 10.738 11.406 12.114 12.967 13.932 15.034 16.282 17.82 19.712 21.985 23.961 25.168 25.922 26.388 26.674 26.865 26.999 27.081 27.117 27.114 27.089 27.054 27.023 26.975 26.917 26.847 26.777 26.707 26.604 26.499 26.401 26.296 26.203 26.108 25.998 25.902 25.802 25.682 25.587 25.491 25.338 25.227 25.125 25.068 24.936 24.785 24.618 24.534 24.379 24.244 24.124 24.011 23.772 23.645 23.517 23.361 23.142 22.785 22.315 20.395 -3 ,21007 ,KEBNE ,16658206,Tue Nov 23 08:09:56 CET,Tue Nov 23 09:31:48 CET,0.0 0.544 0.848 1.059 1.236 1.415 1.586 1.742 2.052 2.203 2.327 2.447 2.654 2.762 2.981 3.205 3.407 3.502 3.691 3.886 4.153 4.304 4.452 4.674 4.881 5.088 5.306 5.506 5.758 6.008 6.253 6.557 6.837 7.102 7.415 7.77 8.122 8.511 8.932 9.39 9.885 10.451 11.131 11.85 12.691 13.618 14.709 15.968 17.49 19.35 21.708 23.731 24.872 25.525 25.937 26.262 26.474 26.57 26.611 26.634 26.607 26.548 26.507 26.451 26.37 26.28 26.199 26.129 26.048 25.96 25.85 25.758 25.658 25.543 25.46 25.358 25.261 25.173 25.055 24.975 24.894 24.741 24.628 24.51 24.455 24.343 24.218 24.059 23.973 23.809 23.674 23.582 23.485 23.253 23.094 22.922 22.758 22.557 22.323 22.018 20.043 -4 ,30600 ,KEBNE ,16658207,Tue Nov 23 08:09:57 CET,Tue Nov 23 09:33:25 CET,0.0 0.843 1.17 1.436 1.669 1.866 2.037 2.188 2.449 2.566 2.681 2.809 3.026 3.144 3.353 3.556 3.749 3.842 4.033 4.211 4.453 4.609 4.758 4.982 5.21 5.426 5.631 5.834 6.102 6.368 6.613 6.918 7.22 7.494 7.814 8.188 8.563 8.959 9.378 9.844 10.355 10.926 11.601 12.295 13.11 14.036 15.094 16.321 17.834 19.702 22.054 23.996 25.109 25.813 26.25 26.494 26.631 26.724 26.752 26.739 26.711 26.68 26.633 26.573 26.51 26.438 26.357 26.284 26.22 26.139 26.028 25.899 25.746 25.625 25.543 25.455 25.357 25.229 25.087 24.991 24.9 24.782 24.689 24.567 24.502 24.369 24.229 24.071 23.985 23.831 23.725 23.626 23.516 23.285 23.163 23.034 22.868 22.662 22.432 22.074 20.834 -5 ,28287 ,KEBNE ,16658208,Tue Nov 23 08:09:57 CET,Tue Nov 23 09:31:48 CET,0.0 0.671 0.981 1.233 1.447 1.625 1.791 1.945 2.206 2.336 2.46 2.584 2.796 2.913 3.113 3.305 3.483 3.562 3.722 3.904 4.19 4.37 4.547 4.786 4.995 5.211 5.426 5.631 5.89 6.15 6.413 6.724 7.018 7.309 7.645 8.017 8.376 8.776 9.211 9.677 10.162 10.717 11.421 12.141 12.958 13.898 15.003 16.218 17.662 19.412 21.636 23.607 24.798 25.547 25.994 26.283 26.488 26.641 26.73 26.778 26.778 26.741 26.685 26.622 26.573 26.506 26.407 26.306 26.206 26.103 26.0 25.914 25.815 25.696 25.606 25.512 25.409 25.307 25.178 25.088 25.012 24.876 24.773 24.676 24.625 24.506 24.377 24.228 24.142 23.992 23.873 23.763 23.65 23.415 23.282 23.113 22.903 22.677 22.38 21.976 19.837 -6 ,16474 ,KEBNE ,16658209,Tue Nov 23 08:10:58 CET,Tue Nov 23 09:33:50 CET,0.0 0.851 1.098 1.29 1.488 1.676 1.835 1.98 2.233 2.371 2.523 2.692 2.899 3.017 3.236 3.434 3.622 3.711 3.883 4.051 4.301 4.459 4.612 4.84 5.065 5.296 5.52 5.727 5.994 6.24 6.488 6.788 7.073 7.348 7.662 8.043 8.424 8.839 9.29 9.773 10.285 10.872 11.556 12.25 13.08 14.011 15.113 16.401 17.92 19.73 21.998 23.9 25.025 25.738 26.196 26.5 26.672 26.765 26.806 26.812 26.785 26.732 26.652 26.581 26.507 26.417 26.31 26.202 26.105 26.004 25.88 25.764 25.674 25.584 25.502 25.408 25.301 25.194 25.082 25.007 24.929 24.784 24.669 24.556 24.493 24.347 24.197 24.04 23.942 23.763 23.639 23.53 23.417 23.173 23.045 22.909 22.73 22.505 22.222 21.883 20.211 -7 ,5090 ,KEBNE ,16658210,Tue Nov 23 08:10:58 CET,Tue Nov 23 09:34:14 CET,0.0 1.052 1.391 1.68 1.902 2.073 2.221 2.356 2.617 2.745 2.872 3.008 3.203 3.304 3.51 3.706 3.895 3.991 4.181 4.367 4.619 4.769 4.92 5.137 5.351 5.547 5.719 5.891 6.118 6.346 6.565 6.833 7.094 7.365 7.686 8.024 8.371 8.78 9.22 9.692 10.192 10.757 11.421 12.093 12.905 13.838 14.901 16.111 17.616 19.442 21.664 23.555 24.632 25.32 25.734 25.999 26.171 26.272 26.334 26.362 26.358 26.34 26.288 26.213 26.146 26.063 25.97 25.885 25.799 25.714 25.613 25.519 25.425 25.325 25.242 25.158 25.054 24.921 24.783 24.693 24.607 24.466 24.369 24.258 24.195 24.059 23.909 23.758 23.678 23.522 23.385 23.279 23.16 22.907 22.773 22.605 22.43 22.23 21.953 21.568 20.087 -8 ,11186 ,KEBNE ,16658211,Tue Nov 23 08:10:57 CET,Tue Nov 23 09:34:02 CET,0.0 0.637 1.006 1.281 1.501 1.69 1.837 1.985 2.244 2.352 2.45 2.519 2.696 2.777 2.934 3.088 3.234 3.313 3.475 3.637 3.88 4.041 4.198 4.424 4.641 4.845 5.045 5.248 5.513 5.759 6.006 6.304 6.602 6.901 7.25 7.65 8.009 8.392 8.826 9.32 9.831 10.4 11.078 11.753 12.55 13.474 14.564 15.841 17.414 19.292 21.636 23.527 24.57 25.251 25.728 26.046 26.228 26.345 26.417 26.467 26.471 26.435 26.385 26.331 26.263 26.191 26.104 26.027 25.953 25.863 25.78 25.694 25.594 25.484 25.386 25.274 25.156 25.043 24.933 24.852 24.769 24.628 24.51 24.393 24.337 24.213 24.078 23.924 23.837 23.676 23.561 23.458 23.341 23.084 22.94 22.774 22.58 22.357 22.087 21.704 19.996 -9 ,30769 ,KEBNE ,16658212,Tue Nov 23 08:10:58 CET,Tue Nov 23 09:33:48 CET,0.0 0.871 1.223 1.508 1.744 1.939 2.099 2.239 2.52 2.647 2.756 2.845 3.032 3.135 3.338 3.525 3.724 3.832 4.04 4.218 4.466 4.63 4.788 5.034 5.285 5.512 5.721 5.936 6.209 6.457 6.688 6.974 7.266 7.55 7.899 8.307 8.679 9.078 9.507 9.971 10.464 11.041 11.741 12.447 13.266 14.196 15.275 16.494 17.987 19.784 22.08 24.126 25.31 26.037 26.529 26.88 27.114 27.252 27.306 27.308 27.278 27.24 27.188 27.126 27.066 26.993 26.887 26.8 26.74 26.66 26.56 26.457 26.336 26.214 26.127 26.04 25.942 25.828 25.703 25.621 25.537 25.386 25.269 25.152 25.092 24.955 24.793 24.611 24.52 24.363 24.262 24.135 23.991 23.728 23.584 23.43 23.252 23.032 22.779 22.366 20.556 -10 ,17937 ,KEBNE ,16658213,Tue Nov 23 08:10:58 CET,Tue Nov 23 09:32:21 CET,0.0 0.674 0.895 1.081 1.255 1.41 1.537 1.649 1.861 1.968 2.061 2.13 2.312 2.4 2.565 2.726 2.915 3.016 3.22 3.41 3.649 3.803 3.961 4.196 4.405 4.603 4.805 4.995 5.239 5.467 5.683 5.95 6.207 6.447 6.742 7.134 7.518 7.916 8.37 8.861 9.37 9.945 10.633 11.322 12.125 13.063 14.155 15.425 16.975 18.804 21.019 22.935 24.086 24.783 25.224 25.533 25.712 25.789 25.836 25.844 25.834 25.826 25.782 25.728 25.665 25.596 25.495 25.387 25.296 25.204 25.1 25.017 24.931 24.803 24.712 24.634 24.539 24.429 24.305 24.215 24.117 23.982 23.879 23.759 23.702 23.583 23.437 23.265 23.181 23.026 22.902 22.802 22.702 22.47 22.335 22.196 22.023 21.806 21.573 21.288 20.076 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_155.txt deleted file mode 100644 index 85b3b573..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16124 ,KEBNE ,16658214,Tue Nov 23 08:10:57 CET,Tue Nov 23 09:33:02 CET,0.0 0.544 0.76 0.956 1.124 1.269 1.396 1.52 1.739 1.841 1.944 2.064 2.246 2.327 2.486 2.658 2.821 2.894 3.026 3.151 3.337 3.462 3.584 3.754 3.934 4.107 4.25 4.38 4.56 4.753 4.941 5.168 5.384 5.596 5.847 6.103 6.331 6.59 6.898 7.215 7.544 7.909 8.292 8.685 9.144 9.621 10.132 10.635 11.125 11.648 12.112 12.059 11.69 11.25 10.78 10.351 9.978 9.569 9.188 8.809 8.483 8.181 7.883 7.621 7.345 7.076 6.82 6.601 6.422 6.223 5.993 5.799 5.602 5.4 5.251 5.108 4.961 4.794 4.619 4.502 4.374 4.164 4.017 3.868 3.786 3.62 3.464 3.291 3.19 3.01 2.893 2.778 2.653 2.402 2.281 2.153 1.989 1.805 1.595 1.298 0.244 -2 ,29702 ,KEBNE ,16658215,Tue Nov 23 08:11:58 CET,Tue Nov 23 09:35:09 CET,0.0 0.687 0.911 1.07 1.25 1.404 1.518 1.63 1.883 1.998 2.097 2.198 2.376 2.465 2.614 2.768 2.923 2.99 3.114 3.246 3.438 3.557 3.676 3.854 4.006 4.148 4.305 4.444 4.631 4.822 4.998 5.204 5.407 5.614 5.849 6.105 6.368 6.655 6.937 7.226 7.51 7.821 8.195 8.567 8.998 9.439 9.915 10.454 11.025 11.476 11.736 11.706 11.441 11.025 10.565 10.156 9.777 9.389 9.014 8.624 8.281 7.99 7.733 7.472 7.224 6.987 6.724 6.486 6.279 6.066 5.864 5.695 5.504 5.305 5.146 4.976 4.795 4.602 4.405 4.277 4.149 3.955 3.814 3.664 3.589 3.438 3.26 3.07 2.975 2.797 2.686 2.586 2.466 2.202 2.071 1.934 1.781 1.609 1.427 1.194 0.375 -3 ,3099 ,KEBNE ,16658216,Tue Nov 23 08:11:59 CET,Tue Nov 23 09:33:54 CET,0.0 0.41 0.655 0.87 1.048 1.194 1.319 1.44 1.665 1.769 1.87 1.953 2.124 2.215 2.39 2.56 2.713 2.78 2.91 3.035 3.213 3.33 3.455 3.638 3.809 3.964 4.109 4.258 4.456 4.663 4.858 5.066 5.272 5.469 5.693 5.95 6.201 6.488 6.783 7.092 7.408 7.743 8.137 8.507 8.946 9.452 10.037 10.677 11.321 11.896 12.33 12.316 12.006 11.588 11.129 10.679 10.255 9.827 9.48 9.158 8.86 8.575 8.293 8.032 7.787 7.545 7.285 7.063 6.876 6.679 6.469 6.29 6.093 5.877 5.717 5.558 5.392 5.222 5.033 4.895 4.77 4.572 4.427 4.29 4.217 4.064 3.914 3.751 3.662 3.489 3.384 3.274 3.149 2.898 2.776 2.638 2.478 2.277 2.016 1.691 0.78 -4 ,24259 ,KEBNE ,16658217,Tue Nov 23 08:12:00 CET,Tue Nov 23 09:37:34 CET,0.0 0.653 0.892 1.087 1.27 1.437 1.59 1.713 1.948 2.061 2.161 2.247 2.417 2.505 2.653 2.789 2.935 3.009 3.149 3.282 3.484 3.624 3.754 3.93 4.098 4.262 4.41 4.544 4.733 4.918 5.086 5.306 5.521 5.731 5.977 6.247 6.51 6.771 7.051 7.374 7.681 7.988 8.381 8.82 9.305 9.772 10.285 10.847 11.461 12.025 12.382 12.388 12.107 11.712 11.307 10.864 10.423 10.034 9.674 9.318 9.023 8.718 8.424 8.152 7.908 7.696 7.441 7.213 7.03 6.823 6.606 6.441 6.277 6.096 5.936 5.768 5.606 5.443 5.267 5.136 5.002 4.8 4.664 4.526 4.45 4.286 4.124 3.953 3.859 3.68 3.546 3.424 3.294 2.997 2.833 2.681 2.54 2.384 2.168 1.871 1.398 -5 ,2048 ,KEBNE ,16658218,Tue Nov 23 08:11:59 CET,Tue Nov 23 09:35:33 CET,0.0 0.579 0.907 1.153 1.318 1.461 1.586 1.706 1.936 2.039 2.139 2.232 2.406 2.488 2.638 2.799 2.974 3.047 3.18 3.32 3.529 3.659 3.781 3.972 4.154 4.316 4.472 4.614 4.804 4.996 5.18 5.402 5.606 5.796 6.016 6.271 6.541 6.841 7.149 7.478 7.787 8.119 8.54 8.952 9.391 9.862 10.425 10.971 11.464 11.944 12.331 12.373 12.182 11.837 11.455 11.016 10.574 10.194 9.849 9.489 9.191 8.933 8.67 8.381 8.122 7.912 7.678 7.445 7.23 7.016 6.808 6.627 6.418 6.189 6.028 5.874 5.706 5.521 5.336 5.209 5.078 4.866 4.713 4.553 4.471 4.323 4.172 4.0 3.907 3.728 3.602 3.487 3.36 3.103 2.96 2.797 2.614 2.42 2.227 1.987 1.259 -6 ,13089 ,KEBNE ,16658219,Tue Nov 23 08:12:03 CET,Tue Nov 23 09:33:47 CET,0.0 0.717 0.967 1.171 1.348 1.521 1.664 1.797 2.035 2.127 2.227 2.344 2.514 2.599 2.761 2.928 3.097 3.17 3.311 3.454 3.638 3.757 3.884 4.068 4.244 4.419 4.585 4.733 4.935 5.136 5.315 5.54 5.771 5.983 6.199 6.447 6.685 6.958 7.285 7.6 7.905 8.253 8.677 9.078 9.492 9.956 10.447 10.953 11.481 11.995 12.328 12.125 11.721 11.302 10.847 10.393 10.001 9.601 9.237 8.906 8.611 8.321 8.043 7.782 7.518 7.278 7.014 6.757 6.543 6.326 6.11 5.936 5.746 5.548 5.387 5.21 5.038 4.873 4.698 4.574 4.446 4.249 4.12 3.984 3.907 3.736 3.555 3.36 3.257 3.078 2.963 2.858 2.743 2.479 2.339 2.189 2.015 1.82 1.576 1.265 0.711 -7 ,25354 ,KEBNE ,16658220,Tue Nov 23 08:11:59 CET,Tue Nov 23 09:34:07 CET,0.0 0.52 0.716 0.869 1.008 1.138 1.268 1.403 1.641 1.741 1.84 1.946 2.115 2.201 2.376 2.539 2.685 2.749 2.87 2.991 3.174 3.296 3.416 3.588 3.76 3.939 4.108 4.269 4.471 4.665 4.84 5.029 5.22 5.424 5.654 5.898 6.141 6.391 6.655 6.947 7.262 7.611 7.987 8.362 8.806 9.262 9.77 10.3 10.84 11.294 11.531 11.384 11.042 10.653 10.22 9.769 9.294 8.844 8.495 8.121 7.771 7.486 7.203 6.907 6.635 6.392 6.151 5.926 5.725 5.532 5.32 5.128 4.924 4.717 4.571 4.419 4.238 4.059 3.888 3.765 3.625 3.417 3.29 3.147 3.066 2.899 2.731 2.547 2.454 2.284 2.162 2.062 1.964 1.739 1.605 1.458 1.283 1.088 0.891 0.648 -0.141 -8 ,12211 ,KEBNE ,16658221,Tue Nov 23 08:11:59 CET,Tue Nov 23 09:34:42 CET,0.0 0.32 0.563 0.763 0.922 1.06 1.192 1.304 1.507 1.599 1.687 1.791 1.98 2.062 2.202 2.353 2.504 2.575 2.72 2.848 3.03 3.148 3.268 3.462 3.64 3.803 3.956 4.091 4.261 4.441 4.631 4.852 5.044 5.234 5.467 5.705 5.929 6.189 6.475 6.788 7.105 7.461 7.86 8.237 8.676 9.133 9.638 10.167 10.693 11.209 11.559 11.45 11.202 10.832 10.378 9.991 9.611 9.209 8.86 8.512 8.182 7.869 7.576 7.301 7.046 6.808 6.552 6.33 6.127 5.902 5.668 5.478 5.287 5.083 4.918 4.76 4.612 4.448 4.266 4.139 4.002 3.777 3.624 3.463 3.379 3.221 3.066 2.885 2.795 2.621 2.478 2.368 2.261 2.028 1.888 1.732 1.554 1.338 1.093 0.78 0.087 -9 ,30960 ,KEBNE ,16658222,Tue Nov 23 08:13:00 CET,Tue Nov 23 09:36:37 CET,0.0 0.49 0.694 0.901 1.071 1.186 1.307 1.423 1.603 1.693 1.792 1.921 2.109 2.2 2.357 2.495 2.627 2.689 2.818 2.957 3.17 3.308 3.441 3.626 3.803 3.972 4.121 4.265 4.448 4.631 4.811 5.01 5.193 5.375 5.595 5.857 6.115 6.386 6.71 7.057 7.395 7.752 8.128 8.499 8.958 9.493 10.03 10.534 11.071 11.576 11.812 11.595 11.224 10.855 10.488 10.07 9.639 9.265 8.945 8.59 8.293 8.019 7.728 7.442 7.186 6.959 6.719 6.506 6.31 6.083 5.852 5.663 5.475 5.277 5.112 4.948 4.776 4.601 4.421 4.288 4.159 3.961 3.82 3.684 3.61 3.442 3.262 3.059 2.959 2.794 2.698 2.598 2.493 2.249 2.106 1.948 1.786 1.619 1.421 1.201 0.711 -10 ,30630 ,KEBNE ,16658223,Tue Nov 23 08:13:00 CET,Tue Nov 23 09:35:09 CET,0.0 0.661 0.938 1.152 1.316 1.439 1.549 1.666 1.89 1.989 2.079 2.181 2.353 2.435 2.605 2.758 2.89 2.958 3.118 3.264 3.452 3.574 3.69 3.859 4.033 4.213 4.383 4.539 4.731 4.924 5.115 5.343 5.556 5.745 5.969 6.218 6.461 6.742 7.03 7.334 7.659 7.996 8.375 8.774 9.23 9.684 10.162 10.705 11.271 11.752 12.074 12.012 11.712 11.316 10.889 10.425 9.991 9.606 9.245 8.866 8.549 8.247 7.944 7.656 7.389 7.152 6.893 6.661 6.451 6.226 6.013 5.826 5.621 5.417 5.268 5.116 4.948 4.786 4.62 4.504 4.384 4.182 4.04 3.895 3.815 3.65 3.485 3.282 3.18 3.013 2.895 2.779 2.663 2.439 2.318 2.186 2.026 1.826 1.59 1.326 0.551 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_163.txt deleted file mode 100644 index e99d2713..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21573 ,KEBNE ,16658224,Tue Nov 23 08:13:00 CET,Tue Nov 23 09:35:34 CET,0.0 0.451 0.642 0.837 0.998 1.127 1.242 1.343 1.517 1.6 1.686 1.751 1.896 1.948 2.057 2.161 2.256 2.3 2.383 2.452 2.548 2.617 2.693 2.798 2.865 2.921 2.985 3.046 3.124 3.197 3.259 3.326 3.378 3.427 3.467 3.515 3.583 3.638 3.66 3.647 3.62 3.604 3.555 3.445 3.261 2.998 2.6 2.03 1.099 -0.305 -2.58 -5.461 -7.738 -9.537 -11.038 -12.335 -13.436 -14.43 -15.259 -16.058 -16.725 -17.334 -17.929 -18.467 -18.965 -19.414 -19.87 -20.263 -20.596 -20.94 -21.29 -21.581 -21.88 -22.194 -22.445 -22.703 -22.959 -23.207 -23.473 -23.661 -23.847 -24.139 -24.337 -24.54 -24.647 -24.867 -25.101 -25.345 -25.469 -25.706 -25.86 -25.997 -26.144 -26.435 -26.597 -26.782 -26.982 -27.216 -27.477 -27.789 -28.415 -2 ,26431 ,KEBNE ,16658225,Tue Nov 23 08:13:00 CET,Tue Nov 23 09:35:51 CET,0.0 0.409 0.624 0.786 0.925 1.04 1.147 1.256 1.453 1.53 1.596 1.632 1.772 1.824 1.933 2.023 2.095 2.133 2.213 2.29 2.399 2.468 2.527 2.6 2.673 2.754 2.821 2.878 2.955 3.028 3.084 3.146 3.206 3.268 3.325 3.352 3.389 3.419 3.432 3.458 3.457 3.441 3.385 3.282 3.104 2.847 2.457 1.782 0.826 -0.524 -2.874 -5.715 -7.971 -9.762 -11.234 -12.571 -13.733 -14.711 -15.542 -16.393 -17.115 -17.733 -18.313 -18.865 -19.371 -19.814 -20.269 -20.669 -21.003 -21.343 -21.707 -22.012 -22.321 -22.637 -22.882 -23.14 -23.4 -23.654 -23.922 -24.112 -24.297 -24.576 -24.765 -24.955 -25.053 -25.277 -25.524 -25.782 -25.912 -26.149 -26.291 -26.42 -26.574 -26.907 -27.07 -27.244 -27.424 -27.637 -27.911 -28.277 -29.0 -3 ,17753 ,KEBNE ,16658226,Tue Nov 23 08:13:00 CET,Tue Nov 23 09:38:12 CET,0.0 0.632 0.867 1.026 1.173 1.309 1.437 1.53 1.697 1.776 1.849 1.886 2.034 2.098 2.213 2.309 2.392 2.431 2.517 2.595 2.694 2.766 2.845 2.949 3.031 3.111 3.184 3.242 3.317 3.384 3.443 3.508 3.567 3.622 3.66 3.693 3.733 3.766 3.783 3.795 3.821 3.819 3.778 3.705 3.543 3.265 2.83 2.222 1.319 -0.043 -2.393 -5.178 -7.358 -9.175 -10.743 -12.092 -13.215 -14.209 -15.059 -15.942 -16.687 -17.32 -17.917 -18.47 -18.979 -19.445 -19.923 -20.334 -20.693 -21.072 -21.451 -21.739 -22.032 -22.349 -22.586 -22.818 -23.064 -23.32 -23.586 -23.777 -23.97 -24.269 -24.469 -24.659 -24.76 -24.978 -25.192 -25.415 -25.536 -25.776 -25.934 -26.084 -26.247 -26.567 -26.735 -26.931 -27.138 -27.351 -27.595 -27.888 -28.743 -4 ,9725 ,KEBNE ,16658227,Tue Nov 23 08:13:00 CET,Tue Nov 23 09:35:10 CET,0.0 0.8 1.039 1.202 1.326 1.442 1.557 1.655 1.814 1.884 1.955 2.013 2.159 2.208 2.322 2.436 2.538 2.586 2.668 2.745 2.843 2.899 2.954 3.039 3.124 3.192 3.251 3.307 3.384 3.453 3.508 3.564 3.626 3.687 3.74 3.779 3.817 3.856 3.879 3.891 3.902 3.876 3.782 3.656 3.48 3.216 2.8 2.216 1.345 0.048 -2.22 -5.04 -7.275 -9.059 -10.592 -11.95 -13.084 -14.124 -14.989 -15.828 -16.555 -17.173 -17.756 -18.311 -18.81 -19.256 -19.714 -20.116 -20.459 -20.802 -21.16 -21.448 -21.739 -22.051 -22.292 -22.544 -22.802 -23.057 -23.323 -23.517 -23.72 -24.027 -24.237 -24.444 -24.547 -24.759 -24.98 -25.216 -25.336 -25.571 -25.737 -25.886 -26.039 -26.379 -26.553 -26.724 -26.911 -27.126 -27.366 -27.654 -28.574 -5 ,21572 ,KEBNE ,16658228,Tue Nov 23 08:13:00 CET,Tue Nov 23 09:35:08 CET,0.0 0.562 0.814 0.985 1.129 1.247 1.346 1.409 1.528 1.603 1.688 1.746 1.893 1.958 2.068 2.179 2.294 2.339 2.41 2.476 2.583 2.651 2.721 2.803 2.867 2.931 2.99 3.04 3.095 3.16 3.234 3.316 3.382 3.435 3.497 3.552 3.568 3.573 3.576 3.58 3.576 3.573 3.533 3.428 3.238 2.952 2.529 1.996 1.151 -0.28 -2.608 -5.4 -7.708 -9.642 -11.24 -12.608 -13.747 -14.759 -15.639 -16.507 -17.205 -17.822 -18.423 -18.977 -19.478 -19.931 -20.39 -20.784 -21.113 -21.465 -21.842 -22.146 -22.454 -22.762 -23.001 -23.244 -23.495 -23.757 -24.031 -24.214 -24.388 -24.663 -24.861 -25.07 -25.179 -25.393 -25.62 -25.853 -25.972 -26.2 -26.341 -26.478 -26.624 -26.941 -27.099 -27.287 -27.501 -27.731 -28.005 -28.317 -29.089 -6 ,31058 ,KEBNE ,16658229,Tue Nov 23 08:14:02 CET,Tue Nov 23 09:36:42 CET,0.0 0.562 0.831 1.017 1.158 1.282 1.39 1.478 1.656 1.74 1.813 1.876 2.029 2.085 2.186 2.272 2.347 2.383 2.46 2.541 2.642 2.702 2.773 2.869 2.947 3.021 3.09 3.153 3.225 3.284 3.344 3.414 3.484 3.561 3.634 3.672 3.69 3.712 3.724 3.723 3.696 3.641 3.582 3.488 3.328 3.076 2.648 2.061 1.198 -0.206 -2.718 -5.666 -7.957 -9.816 -11.405 -12.79 -13.969 -14.977 -15.805 -16.636 -17.341 -17.956 -18.512 -19.026 -19.528 -19.972 -20.397 -20.773 -21.099 -21.441 -21.807 -22.117 -22.431 -22.753 -22.995 -23.23 -23.472 -23.726 -23.995 -24.179 -24.369 -24.666 -24.868 -25.078 -25.185 -25.395 -25.628 -25.871 -25.994 -26.23 -26.381 -26.517 -26.655 -26.992 -27.17 -27.342 -27.533 -27.736 -27.968 -28.284 -28.907 -7 ,7173 ,KEBNE ,16658230,Tue Nov 23 08:14:01 CET,Tue Nov 23 09:36:19 CET,0.0 0.39 0.569 0.696 0.797 0.902 1.01 1.113 1.306 1.385 1.445 1.473 1.621 1.682 1.793 1.889 1.982 2.032 2.123 2.197 2.302 2.37 2.431 2.532 2.628 2.7 2.771 2.837 2.916 3.003 3.077 3.135 3.19 3.24 3.29 3.327 3.359 3.394 3.401 3.4 3.398 3.376 3.322 3.256 3.132 2.855 2.435 1.839 0.842 -0.596 -2.849 -5.501 -7.659 -9.469 -10.978 -12.311 -13.452 -14.481 -15.353 -16.196 -16.894 -17.498 -18.08 -18.623 -19.105 -19.547 -20.01 -20.404 -20.747 -21.107 -21.487 -21.799 -22.11 -22.421 -22.651 -22.884 -23.131 -23.388 -23.649 -23.838 -24.033 -24.317 -24.515 -24.72 -24.827 -25.049 -25.28 -25.516 -25.637 -25.87 -26.001 -26.133 -26.276 -26.582 -26.744 -26.918 -27.112 -27.349 -27.608 -27.922 -28.497 -8 ,23650 ,KEBNE ,16658231,Tue Nov 23 08:14:01 CET,Tue Nov 23 09:35:24 CET,0.0 0.705 0.93 1.098 1.251 1.379 1.495 1.593 1.742 1.813 1.886 1.94 2.089 2.14 2.238 2.329 2.412 2.456 2.554 2.642 2.731 2.791 2.859 2.95 3.034 3.107 3.166 3.226 3.302 3.381 3.46 3.544 3.62 3.681 3.732 3.808 3.87 3.892 3.925 3.939 3.921 3.921 3.886 3.796 3.685 3.445 3.017 2.43 1.502 0.057 -2.297 -5.154 -7.429 -9.279 -10.877 -12.285 -13.497 -14.554 -15.407 -16.232 -16.927 -17.532 -18.106 -18.643 -19.142 -19.584 -20.039 -20.443 -20.791 -21.145 -21.485 -21.777 -22.084 -22.4 -22.651 -22.912 -23.174 -23.421 -23.689 -23.88 -24.069 -24.363 -24.568 -24.778 -24.887 -25.122 -25.357 -25.594 -25.713 -25.948 -26.109 -26.26 -26.425 -26.755 -26.932 -27.126 -27.321 -27.523 -27.775 -28.072 -28.613 -9 ,15529 ,KEBNE ,16658232,Tue Nov 23 08:14:01 CET,Tue Nov 23 09:35:37 CET,0.0 0.619 0.834 1.005 1.134 1.257 1.372 1.453 1.616 1.701 1.78 1.829 1.985 2.054 2.168 2.268 2.372 2.423 2.512 2.584 2.679 2.742 2.801 2.888 2.978 3.054 3.124 3.203 3.299 3.372 3.425 3.49 3.556 3.612 3.659 3.699 3.716 3.726 3.746 3.751 3.724 3.659 3.559 3.448 3.252 2.951 2.568 2.03 1.154 -0.201 -2.549 -5.353 -7.548 -9.396 -10.959 -12.337 -13.509 -14.512 -15.358 -16.2 -16.9 -17.509 -18.094 -18.66 -19.162 -19.598 -20.051 -20.439 -20.773 -21.145 -21.528 -21.813 -22.098 -22.407 -22.645 -22.89 -23.143 -23.394 -23.661 -23.847 -24.039 -24.339 -24.54 -24.743 -24.846 -25.05 -25.268 -25.497 -25.625 -25.868 -26.023 -26.164 -26.306 -26.614 -26.779 -26.962 -27.153 -27.336 -27.568 -27.855 -28.464 -10 ,3416 ,KEBNE ,16658233,Tue Nov 23 08:14:02 CET,Tue Nov 23 09:37:00 CET,0.0 0.541 0.735 0.922 1.095 1.21 1.304 1.398 1.555 1.628 1.702 1.744 1.89 1.946 2.039 2.131 2.226 2.269 2.35 2.428 2.528 2.586 2.632 2.703 2.765 2.834 2.91 2.967 3.046 3.123 3.183 3.243 3.306 3.38 3.448 3.516 3.559 3.582 3.601 3.578 3.526 3.459 3.379 3.258 3.044 2.733 2.316 1.797 0.955 -0.486 -2.915 -5.712 -7.95 -9.823 -11.437 -12.846 -14.013 -15.066 -15.935 -16.753 -17.455 -18.074 -18.654 -19.181 -19.661 -20.093 -20.55 -20.969 -21.319 -21.669 -22.025 -22.326 -22.641 -22.95 -23.186 -23.435 -23.688 -23.939 -24.195 -24.381 -24.579 -24.879 -25.082 -25.289 -25.392 -25.616 -25.859 -26.106 -26.232 -26.47 -26.621 -26.762 -26.913 -27.222 -27.384 -27.568 -27.767 -27.978 -28.241 -28.555 -29.157 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_164.txt deleted file mode 100644 index c3699466..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22715 ,KEBNE ,17069504,Fri Dec 24 06:21:31 CET,Fri Dec 24 07:47:45 CET,0.0 0.342 0.523 0.661 0.79 0.927 1.052 1.15 1.287 1.344 1.402 1.428 1.573 1.631 1.741 1.837 1.93 1.975 2.055 2.129 2.227 2.287 2.346 2.427 2.5 2.57 2.636 2.698 2.774 2.833 2.881 2.941 2.995 3.049 3.102 3.145 3.177 3.191 3.19 3.165 3.123 3.091 3.02 2.912 2.748 2.483 2.083 1.526 0.691 -0.637 -2.841 -5.38 -7.374 -9.038 -10.422 -11.601 -12.624 -13.525 -14.301 -15.055 -15.658 -16.183 -16.701 -17.192 -17.624 -18.007 -18.399 -18.749 -19.061 -19.37 -19.69 -19.962 -20.249 -20.542 -20.76 -20.979 -21.19 -21.404 -21.636 -21.793 -21.958 -22.222 -22.402 -22.589 -22.682 -22.871 -23.075 -23.278 -23.386 -23.609 -23.743 -23.873 -24.005 -24.282 -24.439 -24.613 -24.767 -24.95 -25.17 -25.418 -25.847 -2 ,9887 ,KEBNE ,17069505,Fri Dec 24 06:21:31 CET,Fri Dec 24 07:47:40 CET,0.0 0.328 0.549 0.729 0.872 0.972 1.067 1.162 1.318 1.392 1.459 1.488 1.621 1.676 1.779 1.867 1.961 2.008 2.095 2.17 2.263 2.319 2.376 2.46 2.532 2.615 2.699 2.761 2.833 2.9 2.954 3.014 3.053 3.089 3.15 3.21 3.239 3.236 3.234 3.231 3.207 3.158 3.067 2.938 2.734 2.421 1.961 1.34 0.422 -0.956 -3.209 -5.831 -7.885 -9.582 -11.003 -12.206 -13.228 -14.145 -14.912 -15.653 -16.268 -16.809 -17.321 -17.783 -18.203 -18.609 -19.035 -19.403 -19.71 -20.021 -20.342 -20.595 -20.847 -21.108 -21.324 -21.55 -21.782 -22.018 -22.268 -22.443 -22.609 -22.875 -23.072 -23.267 -23.357 -23.538 -23.751 -23.985 -24.096 -24.315 -24.458 -24.591 -24.726 -24.995 -25.135 -25.295 -25.483 -25.701 -25.958 -26.261 -26.761 -3 ,3043 ,KEBNE ,17069506,Fri Dec 24 06:23:39 CET,Fri Dec 24 07:51:41 CET,0.0 0.358 0.558 0.717 0.849 0.949 1.041 1.133 1.298 1.373 1.435 1.471 1.615 1.672 1.779 1.863 1.953 1.999 2.075 2.149 2.243 2.299 2.355 2.438 2.528 2.611 2.672 2.719 2.793 2.859 2.921 3.008 3.078 3.151 3.22 3.252 3.272 3.302 3.333 3.344 3.328 3.284 3.2 3.066 2.857 2.584 2.205 1.661 0.799 -0.54 -2.737 -5.321 -7.358 -8.997 -10.366 -11.568 -12.573 -13.464 -14.222 -14.968 -15.594 -16.153 -16.682 -17.167 -17.609 -17.996 -18.402 -18.761 -19.072 -19.379 -19.688 -19.952 -20.225 -20.497 -20.706 -20.931 -21.159 -21.383 -21.624 -21.79 -21.958 -22.213 -22.389 -22.569 -22.664 -22.859 -23.061 -23.301 -23.426 -23.646 -23.778 -23.91 -24.048 -24.301 -24.437 -24.592 -24.774 -24.979 -25.185 -25.435 -25.923 -4 ,640 ,KEBNE ,17069507,Fri Dec 24 06:24:43 CET,Fri Dec 24 07:50:36 CET,0.0 0.459 0.676 0.837 0.958 1.071 1.18 1.274 1.44 1.52 1.591 1.633 1.776 1.83 1.941 2.045 2.138 2.188 2.289 2.37 2.474 2.535 2.59 2.671 2.757 2.837 2.9 2.962 3.048 3.12 3.191 3.264 3.328 3.383 3.416 3.45 3.479 3.508 3.534 3.533 3.536 3.517 3.41 3.262 3.066 2.826 2.438 1.858 0.982 -0.387 -2.537 -5.024 -7.044 -8.738 -10.148 -11.364 -12.383 -13.28 -14.041 -14.788 -15.411 -15.965 -16.516 -17.034 -17.507 -17.912 -18.308 -18.663 -18.97 -19.286 -19.612 -19.875 -20.148 -20.432 -20.644 -20.87 -21.103 -21.336 -21.579 -21.747 -21.913 -22.167 -22.348 -22.534 -22.626 -22.822 -23.036 -23.257 -23.372 -23.606 -23.772 -23.901 -24.039 -24.319 -24.468 -24.65 -24.847 -25.048 -25.254 -25.553 -26.079 -5 ,30458 ,KEBNE ,17069508,Fri Dec 24 06:25:50 CET,Fri Dec 24 07:53:51 CET,0.0 0.42 0.64 0.791 0.932 1.051 1.158 1.256 1.423 1.497 1.56 1.61 1.753 1.803 1.908 2.003 2.089 2.132 2.216 2.296 2.399 2.471 2.553 2.655 2.723 2.786 2.85 2.903 2.965 3.029 3.083 3.138 3.193 3.237 3.29 3.341 3.357 3.371 3.398 3.385 3.357 3.326 3.238 3.117 2.917 2.663 2.297 1.721 0.89 -0.361 -2.491 -5.028 -7.047 -8.7 -10.095 -11.305 -12.333 -13.222 -13.955 -14.676 -15.286 -15.826 -16.336 -16.805 -17.226 -17.613 -18.012 -18.353 -18.634 -18.933 -19.27 -19.548 -19.821 -20.096 -20.309 -20.538 -20.769 -21.008 -21.27 -21.451 -21.63 -21.898 -22.097 -22.304 -22.403 -22.589 -22.778 -22.993 -23.112 -23.343 -23.497 -23.631 -23.758 -24.012 -24.154 -24.303 -24.469 -24.665 -24.914 -25.226 -25.898 -6 ,13160 ,KEBNE ,17069509,Fri Dec 24 06:30:00 CET,Fri Dec 24 07:56:26 CET,0.0 0.364 0.536 0.693 0.833 0.939 1.03 1.128 1.321 1.405 1.475 1.503 1.645 1.705 1.818 1.903 1.981 2.027 2.114 2.195 2.307 2.374 2.44 2.523 2.6 2.669 2.723 2.772 2.843 2.905 2.943 2.994 3.051 3.101 3.156 3.215 3.253 3.265 3.28 3.301 3.284 3.211 3.103 2.973 2.805 2.528 2.074 1.483 0.65 -0.645 -2.814 -5.348 -7.402 -9.057 -10.413 -11.604 -12.634 -13.544 -14.308 -15.069 -15.693 -16.214 -16.712 -17.174 -17.595 -17.983 -18.383 -18.733 -19.032 -19.335 -19.645 -19.904 -20.172 -20.445 -20.658 -20.877 -21.108 -21.362 -21.606 -21.776 -21.952 -22.208 -22.392 -22.577 -22.674 -22.877 -23.09 -23.319 -23.43 -23.652 -23.792 -23.92 -24.053 -24.35 -24.516 -24.687 -24.877 -25.086 -25.319 -25.597 -26.12 -7 ,23468 ,KEBNE ,17069510,Fri Dec 24 06:30:00 CET,Fri Dec 24 07:56:19 CET,0.0 0.469 0.697 0.884 1.051 1.184 1.292 1.397 1.573 1.657 1.738 1.806 1.965 2.023 2.117 2.2 2.282 2.324 2.413 2.488 2.587 2.652 2.703 2.773 2.849 2.921 2.978 3.026 3.098 3.179 3.248 3.315 3.382 3.439 3.483 3.52 3.548 3.564 3.567 3.563 3.535 3.499 3.442 3.313 3.098 2.807 2.418 1.808 0.887 -0.457 -2.679 -5.223 -7.271 -8.976 -10.365 -11.548 -12.585 -13.51 -14.268 -14.997 -15.591 -16.114 -16.627 -17.108 -17.549 -17.945 -18.345 -18.69 -18.991 -19.308 -19.62 -19.883 -20.165 -20.445 -20.663 -20.892 -21.118 -21.346 -21.589 -21.753 -21.912 -22.158 -22.329 -22.514 -22.611 -22.826 -23.051 -23.263 -23.372 -23.593 -23.721 -23.851 -23.985 -24.273 -24.427 -24.589 -24.774 -24.959 -25.153 -25.431 -26.11 -8 ,18530 ,KEBNE ,17069511,Fri Dec 24 06:32:05 CET,Fri Dec 24 07:58:08 CET,0.0 0.471 0.685 0.82 0.947 1.053 1.146 1.233 1.386 1.46 1.538 1.584 1.729 1.796 1.915 2.014 2.107 2.151 2.238 2.316 2.414 2.468 2.519 2.598 2.677 2.746 2.807 2.858 2.93 3.009 3.079 3.156 3.208 3.239 3.27 3.291 3.315 3.346 3.362 3.361 3.337 3.307 3.252 3.151 2.962 2.659 2.237 1.673 0.803 -0.575 -2.812 -5.334 -7.356 -9.025 -10.392 -11.556 -12.546 -13.418 -14.171 -14.928 -15.57 -16.137 -16.642 -17.088 -17.505 -17.894 -18.313 -18.677 -18.979 -19.29 -19.607 -19.868 -20.146 -20.441 -20.668 -20.884 -21.093 -21.318 -21.567 -21.738 -21.907 -22.162 -22.336 -22.519 -22.615 -22.806 -23.015 -23.236 -23.337 -23.547 -23.658 -23.778 -23.9 -24.175 -24.324 -24.474 -24.642 -24.824 -25.053 -25.369 -25.888 -9 ,30784 ,KEBNE ,17069512,Fri Dec 24 06:32:05 CET,Fri Dec 24 07:59:48 CET,0.0 0.407 0.585 0.741 0.879 0.965 1.039 1.127 1.314 1.394 1.477 1.569 1.721 1.774 1.886 1.991 2.086 2.131 2.22 2.289 2.373 2.443 2.51 2.603 2.696 2.775 2.831 2.879 2.944 3.007 3.064 3.105 3.133 3.163 3.18 3.175 3.182 3.218 3.253 3.256 3.225 3.184 3.117 2.979 2.764 2.475 2.077 1.52 0.651 -0.703 -2.86 -5.359 -7.401 -9.077 -10.452 -11.608 -12.578 -13.471 -14.23 -14.955 -15.56 -16.104 -16.625 -17.094 -17.518 -17.91 -18.319 -18.676 -18.981 -19.308 -19.656 -19.928 -20.202 -20.478 -20.691 -20.923 -21.162 -21.403 -21.65 -21.821 -21.999 -22.276 -22.455 -22.635 -22.735 -22.935 -23.127 -23.323 -23.433 -23.661 -23.813 -23.946 -24.07 -24.326 -24.482 -24.658 -24.839 -25.035 -25.263 -25.581 -26.416 -10 ,5083 ,KEBNE ,17069513,Fri Dec 24 06:32:05 CET,Fri Dec 24 08:00:03 CET,0.0 0.828 1.064 1.222 1.333 1.439 1.536 1.627 1.786 1.86 1.927 1.959 2.107 2.167 2.264 2.354 2.448 2.493 2.572 2.644 2.753 2.814 2.867 2.945 3.026 3.105 3.173 3.225 3.292 3.355 3.403 3.438 3.47 3.518 3.566 3.604 3.622 3.631 3.626 3.597 3.561 3.507 3.417 3.285 3.062 2.767 2.319 1.676 0.802 -0.567 -2.812 -5.295 -7.317 -9.031 -10.431 -11.63 -12.642 -13.52 -14.272 -15.002 -15.615 -16.164 -16.667 -17.14 -17.585 -17.994 -18.436 -18.812 -19.118 -19.437 -19.763 -20.02 -20.297 -20.583 -20.79 -21.003 -21.234 -21.476 -21.724 -21.896 -22.064 -22.31 -22.494 -22.686 -22.779 -22.979 -23.194 -23.411 -23.523 -23.748 -23.888 -24.02 -24.16 -24.451 -24.599 -24.75 -24.902 -25.071 -25.28 -25.546 -26.231 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_215.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_215.txt deleted file mode 100644 index 5b0862ab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_215.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6051 ,TETRA ,17667924,Fri Dec 3 06:09:16 CET,Fri Dec 3 07:49:25 CET,0.0 0.515 0.815 1.023 1.198 1.349 1.488 1.617 1.846 1.952 2.058 2.179 2.355 2.437 2.581 2.731 2.889 2.963 3.103 3.237 3.42 3.525 3.62 3.758 3.891 4.013 4.135 4.253 4.387 4.524 4.671 4.84 4.98 5.108 5.239 5.378 5.524 5.676 5.824 5.962 6.106 6.263 6.407 6.501 6.574 6.647 6.688 6.61 6.339 5.723 4.498 2.909 1.492 0.242 -0.827 -1.754 -2.575 -3.341 -3.988 -4.608 -5.121 -5.567 -5.994 -6.407 -6.802 -7.17 -7.522 -7.81 -8.062 -8.336 -8.634 -8.882 -9.138 -9.409 -9.616 -9.82 -10.031 -10.247 -10.47 -10.618 -10.767 -11.023 -11.195 -11.365 -11.456 -11.629 -11.807 -12.006 -12.106 -12.313 -12.455 -12.583 -12.714 -12.964 -13.094 -13.247 -13.415 -13.606 -13.833 -14.089 -14.949 -2 ,12181 ,TETRA ,17667925,Fri Dec 3 06:09:14 CET,Fri Dec 3 07:49:36 CET,0.0 0.706 1.032 1.286 1.476 1.629 1.774 1.914 2.149 2.255 2.359 2.443 2.61 2.69 2.844 3.002 3.127 3.183 3.311 3.44 3.61 3.714 3.818 3.982 4.135 4.269 4.409 4.543 4.69 4.808 4.917 5.085 5.263 5.404 5.557 5.712 5.868 6.039 6.174 6.301 6.457 6.629 6.776 6.889 6.962 6.985 6.961 6.892 6.635 5.986 4.717 3.041 1.56 0.313 -0.771 -1.765 -2.609 -3.335 -3.953 -4.571 -5.093 -5.557 -5.994 -6.404 -6.786 -7.144 -7.512 -7.842 -8.127 -8.396 -8.668 -8.905 -9.161 -9.426 -9.622 -9.819 -10.031 -10.251 -10.476 -10.631 -10.787 -11.023 -11.194 -11.381 -11.473 -11.668 -11.865 -12.063 -12.171 -12.382 -12.517 -12.649 -12.784 -13.049 -13.191 -13.35 -13.518 -13.694 -13.906 -14.23 -15.046 -3 ,23924 ,TETRA ,17667926,Fri Dec 3 06:09:18 CET,Fri Dec 3 07:49:15 CET,0.0 0.841 1.16 1.39 1.597 1.792 1.936 2.073 2.332 2.462 2.581 2.699 2.89 2.978 3.119 3.266 3.406 3.474 3.601 3.714 3.866 3.958 4.06 4.208 4.342 4.477 4.607 4.716 4.858 4.993 5.112 5.26 5.411 5.55 5.691 5.823 5.941 6.076 6.219 6.359 6.492 6.643 6.79 6.904 6.98 7.01 7.032 6.97 6.672 6.014 4.663 2.887 1.327 0.033 -1.044 -2.036 -2.888 -3.661 -4.299 -4.898 -5.41 -5.869 -6.302 -6.717 -7.111 -7.464 -7.825 -8.147 -8.424 -8.705 -9.0 -9.242 -9.5 -9.774 -9.978 -10.174 -10.389 -10.621 -10.849 -10.993 -11.142 -11.397 -11.58 -11.754 -11.836 -12.009 -12.192 -12.382 -12.482 -12.681 -12.793 -12.913 -13.042 -13.319 -13.476 -13.629 -13.784 -13.974 -14.204 -14.5 -15.203 -4 ,26723 ,TETRA ,17667927,Fri Dec 3 06:09:20 CET,Fri Dec 3 07:48:49 CET,0.0 0.947 1.297 1.523 1.7 1.862 2.005 2.117 2.307 2.41 2.52 2.635 2.815 2.899 3.05 3.193 3.331 3.404 3.539 3.657 3.811 3.915 4.026 4.164 4.298 4.434 4.569 4.696 4.844 4.976 5.101 5.251 5.387 5.507 5.645 5.791 5.929 6.093 6.232 6.35 6.489 6.631 6.777 6.886 6.967 7.022 6.985 6.834 6.523 5.912 4.646 2.972 1.47 0.165 -0.913 -1.87 -2.732 -3.516 -4.162 -4.778 -5.294 -5.754 -6.194 -6.604 -6.99 -7.358 -7.73 -8.043 -8.305 -8.584 -8.898 -9.156 -9.427 -9.71 -9.922 -10.13 -10.332 -10.541 -10.76 -10.913 -11.068 -11.319 -11.504 -11.682 -11.774 -11.963 -12.143 -12.334 -12.438 -12.642 -12.768 -12.884 -13.013 -13.298 -13.446 -13.614 -13.805 -14.005 -14.221 -14.497 -15.292 -5 ,25989 ,TETRA ,17667928,Fri Dec 3 06:09:14 CET,Fri Dec 3 07:49:16 CET,0.0 0.858 1.177 1.416 1.603 1.773 1.932 2.068 2.315 2.433 2.55 2.671 2.853 2.951 3.135 3.289 3.426 3.497 3.644 3.774 3.93 4.035 4.154 4.324 4.46 4.572 4.699 4.825 4.966 5.112 5.26 5.421 5.571 5.712 5.859 6.027 6.185 6.341 6.515 6.69 6.835 6.97 7.106 7.211 7.301 7.403 7.448 7.296 7.001 6.434 5.042 3.205 1.757 0.504 -0.636 -1.625 -2.446 -3.165 -3.804 -4.436 -4.975 -5.456 -5.9 -6.329 -6.723 -7.092 -7.464 -7.766 -8.028 -8.312 -8.616 -8.86 -9.103 -9.341 -9.533 -9.751 -9.963 -10.168 -10.385 -10.543 -10.712 -10.958 -11.124 -11.307 -11.4 -11.574 -11.77 -11.977 -12.073 -12.279 -12.412 -12.531 -12.652 -12.925 -13.093 -13.269 -13.437 -13.623 -13.871 -14.207 -14.984 -6 ,9320 ,TETRA ,17667929,Fri Dec 3 06:09:16 CET,Fri Dec 3 07:49:15 CET,0.0 1.022 1.286 1.512 1.69 1.857 2.024 2.162 2.402 2.524 2.646 2.753 2.915 3.0 3.155 3.3 3.44 3.504 3.642 3.77 3.95 4.069 4.175 4.318 4.452 4.573 4.678 4.79 4.945 5.083 5.203 5.358 5.509 5.636 5.78 5.939 6.082 6.239 6.398 6.539 6.676 6.801 6.926 7.039 7.117 7.162 7.169 7.022 6.699 6.047 4.625 2.791 1.239 -0.061 -1.12 -2.059 -2.929 -3.713 -4.34 -4.971 -5.53 -6.003 -6.452 -6.899 -7.292 -7.634 -8.008 -8.316 -8.572 -8.874 -9.195 -9.445 -9.693 -9.959 -10.164 -10.371 -10.585 -10.794 -11.02 -11.176 -11.332 -11.576 -11.747 -11.931 -12.031 -12.228 -12.415 -12.602 -12.698 -12.903 -13.038 -13.167 -13.306 -13.591 -13.742 -13.907 -14.086 -14.285 -14.502 -14.786 -15.374 -7 ,14255 ,TETRA ,17667930,Fri Dec 3 06:09:18 CET,Fri Dec 3 07:49:28 CET,0.0 0.784 1.046 1.266 1.473 1.646 1.805 1.94 2.143 2.253 2.364 2.469 2.648 2.737 2.903 3.048 3.193 3.268 3.398 3.514 3.673 3.776 3.876 4.04 4.204 4.355 4.483 4.601 4.757 4.906 5.059 5.231 5.379 5.508 5.652 5.801 5.929 6.056 6.219 6.397 6.541 6.698 6.867 7.006 7.072 7.1 7.081 6.917 6.562 5.888 4.574 2.714 1.224 -0.013 -1.1 -2.044 -2.867 -3.624 -4.293 -4.961 -5.506 -5.962 -6.392 -6.823 -7.208 -7.535 -7.894 -8.214 -8.489 -8.776 -9.073 -9.323 -9.59 -9.859 -10.056 -10.26 -10.477 -10.705 -10.926 -11.079 -11.239 -11.482 -11.653 -11.821 -11.908 -12.092 -12.281 -12.477 -12.581 -12.788 -12.922 -13.044 -13.163 -13.447 -13.601 -13.757 -13.915 -14.074 -14.272 -14.533 -15.148 -8 ,4758 ,TETRA ,17667931,Fri Dec 3 06:09:20 CET,Fri Dec 3 07:49:13 CET,0.0 0.847 1.147 1.364 1.549 1.716 1.867 2.006 2.249 2.351 2.45 2.54 2.719 2.811 2.981 3.125 3.264 3.337 3.479 3.609 3.769 3.858 3.956 4.099 4.221 4.351 4.476 4.59 4.729 4.858 4.979 5.127 5.267 5.376 5.502 5.664 5.806 5.959 6.121 6.26 6.406 6.58 6.75 6.902 7.005 7.035 6.996 6.87 6.563 5.926 4.646 2.873 1.392 0.141 -0.997 -1.969 -2.773 -3.527 -4.163 -4.786 -5.351 -5.833 -6.264 -6.674 -7.061 -7.4 -7.756 -8.093 -8.372 -8.653 -8.944 -9.184 -9.437 -9.694 -9.89 -10.088 -10.283 -10.494 -10.727 -10.888 -11.05 -11.298 -11.473 -11.652 -11.741 -11.93 -12.136 -12.35 -12.46 -12.667 -12.799 -12.916 -13.039 -13.313 -13.464 -13.623 -13.779 -13.953 -14.184 -14.475 -15.162 -9 ,20540 ,TETRA ,17667932,Fri Dec 3 06:09:14 CET,Fri Dec 3 07:49:43 CET,0.0 0.899 1.202 1.42 1.617 1.799 1.96 2.082 2.295 2.406 2.523 2.642 2.812 2.899 3.054 3.203 3.349 3.413 3.521 3.629 3.784 3.878 3.978 4.124 4.26 4.389 4.507 4.64 4.813 4.948 5.074 5.236 5.386 5.518 5.669 5.833 5.965 6.088 6.211 6.361 6.519 6.652 6.776 6.869 6.959 7.002 6.973 6.853 6.511 5.87 4.585 2.702 1.179 -0.09 -1.202 -2.169 -2.978 -3.733 -4.394 -5.028 -5.551 -5.999 -6.432 -6.839 -7.22 -7.575 -7.949 -8.28 -8.555 -8.818 -9.083 -9.311 -9.562 -9.812 -9.995 -10.2 -10.422 -10.63 -10.836 -10.982 -11.134 -11.38 -11.553 -11.727 -11.813 -11.992 -12.178 -12.381 -12.489 -12.698 -12.823 -12.949 -13.08 -13.347 -13.497 -13.65 -13.809 -13.995 -14.236 -14.564 -15.272 -10 ,18129 ,TETRA ,17667933,Fri Dec 3 06:09:16 CET,Fri Dec 3 07:49:53 CET,0.0 0.983 1.253 1.45 1.604 1.733 1.852 1.981 2.221 2.329 2.429 2.526 2.7 2.779 2.939 3.09 3.226 3.287 3.411 3.536 3.703 3.799 3.892 4.055 4.2 4.324 4.458 4.586 4.737 4.882 5.019 5.159 5.303 5.458 5.608 5.762 5.916 6.081 6.224 6.367 6.526 6.668 6.815 6.96 7.074 7.126 7.101 7.029 6.9 6.445 5.196 3.468 2.016 0.754 -0.299 -1.244 -2.107 -2.858 -3.476 -4.107 -4.641 -5.11 -5.564 -5.968 -6.329 -6.672 -7.028 -7.337 -7.589 -7.852 -8.137 -8.366 -8.597 -8.841 -9.04 -9.245 -9.457 -9.679 -9.904 -10.057 -10.212 -10.451 -10.619 -10.791 -10.881 -11.067 -11.263 -11.471 -11.587 -11.804 -11.933 -12.055 -12.182 -12.477 -12.637 -12.791 -12.949 -13.126 -13.336 -13.611 -14.282 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_235.txt deleted file mode 100644 index ac3ac697..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17050 ,KEBNE ,17023797,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:53:52 CET,0.0 0.7 0.965 1.178 1.338 1.483 1.629 1.754 1.988 2.092 2.192 2.287 2.45 2.532 2.694 2.83 2.943 3.007 3.128 3.243 3.434 3.557 3.665 3.818 3.981 4.127 4.25 4.368 4.516 4.666 4.811 4.98 5.134 5.264 5.398 5.54 5.689 5.865 6.036 6.201 6.351 6.521 6.716 6.87 7.058 7.237 7.317 7.273 7.094 6.647 5.572 4.072 2.75 1.638 0.651 -0.279 -1.148 -1.943 -2.582 -3.187 -3.724 -4.206 -4.636 -5.046 -5.434 -5.784 -6.151 -6.481 -6.755 -7.033 -7.332 -7.578 -7.828 -8.084 -8.294 -8.517 -8.738 -8.966 -9.207 -9.363 -9.521 -9.777 -9.951 -10.135 -10.242 -10.461 -10.687 -10.927 -11.043 -11.262 -11.432 -11.572 -11.704 -11.975 -12.137 -12.309 -12.503 -12.711 -12.946 -13.245 -14.342 -2 ,16497 ,KEBNE ,17023798,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:52:18 CET,0.0 0.738 1.027 1.27 1.466 1.637 1.776 1.892 2.111 2.206 2.289 2.366 2.534 2.616 2.756 2.891 3.027 3.097 3.222 3.331 3.499 3.607 3.706 3.844 3.977 4.107 4.227 4.355 4.528 4.691 4.834 4.989 5.138 5.273 5.412 5.565 5.719 5.886 6.08 6.28 6.455 6.626 6.821 6.998 7.141 7.292 7.371 7.305 7.151 6.732 5.683 4.19 2.84 1.673 0.682 -0.232 -1.018 -1.726 -2.329 -2.927 -3.462 -3.97 -4.447 -4.868 -5.25 -5.606 -5.988 -6.307 -6.579 -6.875 -7.169 -7.404 -7.654 -7.912 -8.121 -8.34 -8.553 -8.772 -9.012 -9.177 -9.34 -9.59 -9.774 -9.972 -10.068 -10.272 -10.493 -10.719 -10.836 -11.046 -11.193 -11.324 -11.456 -11.752 -11.924 -12.12 -12.337 -12.561 -12.796 -13.07 -13.693 -3 ,470 ,KEBNE ,17023799,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:53:39 CET,0.0 0.945 1.216 1.406 1.559 1.723 1.88 2.028 2.278 2.387 2.499 2.593 2.752 2.83 2.992 3.161 3.306 3.367 3.492 3.616 3.784 3.899 4.012 4.168 4.324 4.46 4.58 4.696 4.846 4.991 5.139 5.311 5.455 5.594 5.743 5.895 6.037 6.185 6.338 6.493 6.638 6.8 6.999 7.175 7.354 7.509 7.616 7.646 7.539 7.177 6.222 4.776 3.459 2.294 1.289 0.368 -0.446 -1.195 -1.872 -2.542 -3.091 -3.559 -4.017 -4.457 -4.848 -5.195 -5.564 -5.909 -6.196 -6.491 -6.816 -7.073 -7.332 -7.596 -7.806 -8.032 -8.26 -8.48 -8.715 -8.876 -9.028 -9.268 -9.446 -9.643 -9.744 -9.939 -10.137 -10.356 -10.476 -10.689 -10.829 -10.958 -11.093 -11.392 -11.566 -11.747 -11.948 -12.173 -12.441 -12.828 -13.565 -4 ,30920 ,KEBNE ,17023800,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:53:55 CET,0.0 0.569 0.821 1.015 1.173 1.321 1.452 1.579 1.819 1.928 2.026 2.129 2.3 2.38 2.535 2.667 2.796 2.865 3.004 3.134 3.298 3.401 3.503 3.655 3.793 3.913 4.021 4.135 4.284 4.416 4.539 4.684 4.843 4.994 5.155 5.334 5.496 5.655 5.817 6.028 6.242 6.429 6.626 6.814 7.002 7.162 7.273 7.323 7.208 6.74 5.663 4.079 2.729 1.581 0.587 -0.293 -1.045 -1.745 -2.386 -3.033 -3.576 -4.048 -4.509 -4.962 -5.373 -5.74 -6.143 -6.512 -6.817 -7.127 -7.43 -7.671 -7.933 -8.209 -8.415 -8.632 -8.866 -9.1 -9.344 -9.512 -9.684 -9.949 -10.124 -10.299 -10.39 -10.577 -10.774 -10.998 -11.116 -11.332 -11.503 -11.629 -11.753 -12.028 -12.175 -12.345 -12.548 -12.771 -13.043 -13.346 -14.229 -5 ,11002 ,KEBNE ,17023801,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:52:15 CET,0.0 0.701 0.964 1.172 1.354 1.501 1.638 1.768 2.0 2.114 2.223 2.324 2.486 2.561 2.713 2.854 2.983 3.048 3.187 3.321 3.511 3.622 3.724 3.874 4.004 4.136 4.263 4.38 4.542 4.696 4.827 4.98 5.137 5.294 5.463 5.641 5.793 5.946 6.117 6.317 6.519 6.726 6.956 7.136 7.329 7.502 7.652 7.691 7.541 7.136 5.986 4.34 2.957 1.745 0.711 -0.185 -1.009 -1.726 -2.337 -2.97 -3.499 -3.991 -4.461 -4.89 -5.291 -5.653 -6.041 -6.379 -6.651 -6.933 -7.231 -7.481 -7.741 -8.017 -8.223 -8.444 -8.68 -8.907 -9.135 -9.294 -9.461 -9.723 -9.91 -10.103 -10.201 -10.402 -10.618 -10.86 -10.97 -11.179 -11.359 -11.495 -11.629 -11.933 -12.117 -12.308 -12.502 -12.721 -12.972 -13.305 -14.344 -6 ,10273 ,KEBNE ,17023802,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:54:20 CET,0.0 0.592 0.849 1.036 1.193 1.362 1.504 1.627 1.845 1.949 2.053 2.165 2.337 2.42 2.589 2.748 2.897 2.962 3.073 3.192 3.367 3.482 3.594 3.728 3.867 4.026 4.174 4.302 4.444 4.581 4.715 4.877 5.035 5.183 5.34 5.518 5.683 5.844 5.995 6.159 6.366 6.559 6.746 6.934 7.098 7.223 7.314 7.268 7.034 6.515 5.456 3.965 2.549 1.252 0.144 -0.843 -1.708 -2.47 -3.088 -3.706 -4.256 -4.743 -5.199 -5.612 -6.001 -6.379 -6.764 -7.109 -7.412 -7.717 -8.047 -8.311 -8.582 -8.863 -9.074 -9.294 -9.522 -9.754 -10.001 -10.174 -10.348 -10.613 -10.793 -10.975 -11.07 -11.272 -11.494 -11.714 -11.823 -12.046 -12.22 -12.359 -12.494 -12.78 -12.944 -13.109 -13.281 -13.482 -13.708 -14.027 -15.05 -7 ,25201 ,KEBNE ,17023803,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:54:05 CET,0.0 0.43 0.687 0.926 1.102 1.276 1.431 1.573 1.82 1.931 2.044 2.156 2.329 2.421 2.592 2.755 2.909 2.978 3.108 3.236 3.42 3.525 3.625 3.774 3.91 4.032 4.162 4.293 4.458 4.614 4.754 4.903 5.056 5.21 5.376 5.567 5.743 5.915 6.093 6.265 6.433 6.61 6.793 6.973 7.134 7.208 7.254 7.349 7.324 6.923 5.902 4.441 3.057 1.828 0.796 -0.115 -0.932 -1.68 -2.315 -2.945 -3.486 -3.965 -4.416 -4.827 -5.215 -5.585 -5.972 -6.313 -6.605 -6.902 -7.227 -7.495 -7.752 -8.023 -8.24 -8.455 -8.662 -8.876 -9.103 -9.255 -9.408 -9.657 -9.833 -10.022 -10.124 -10.331 -10.546 -10.767 -10.88 -11.094 -11.263 -11.402 -11.532 -11.829 -12.004 -12.188 -12.397 -12.643 -12.905 -13.213 -14.191 -8 ,13337 ,KEBNE ,17023804,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:54:16 CET,0.0 0.624 0.939 1.176 1.35 1.498 1.635 1.757 1.992 2.112 2.22 2.313 2.478 2.56 2.71 2.839 2.966 3.028 3.15 3.271 3.427 3.532 3.645 3.789 3.921 4.051 4.164 4.268 4.39 4.514 4.653 4.816 4.966 5.105 5.265 5.428 5.574 5.747 5.967 6.201 6.415 6.62 6.831 7.028 7.178 7.297 7.406 7.429 7.255 6.751 5.742 4.334 3.043 1.955 0.927 -0.076 -0.888 -1.594 -2.244 -2.883 -3.446 -3.953 -4.414 -4.842 -5.237 -5.583 -5.952 -6.291 -6.579 -6.872 -7.166 -7.413 -7.678 -7.948 -8.148 -8.353 -8.578 -8.823 -9.072 -9.243 -9.416 -9.68 -9.87 -10.063 -10.164 -10.37 -10.582 -10.814 -10.936 -11.151 -11.291 -11.422 -11.558 -11.838 -11.981 -12.158 -12.367 -12.588 -12.828 -13.124 -14.077 -9 ,28645 ,KEBNE ,17023805,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:54:16 CET,0.0 0.701 0.951 1.163 1.345 1.487 1.609 1.732 1.971 2.094 2.198 2.285 2.454 2.538 2.703 2.854 2.998 3.067 3.194 3.314 3.483 3.594 3.699 3.845 3.993 4.129 4.255 4.364 4.5 4.64 4.774 4.945 5.104 5.229 5.372 5.552 5.73 5.92 6.098 6.265 6.441 6.625 6.8 6.953 7.104 7.241 7.37 7.397 7.214 6.821 5.99 4.58 3.179 1.893 0.767 -0.186 -0.992 -1.715 -2.328 -2.938 -3.48 -3.979 -4.473 -4.914 -5.29 -5.636 -5.998 -6.317 -6.604 -6.896 -7.193 -7.442 -7.698 -7.961 -8.168 -8.38 -8.597 -8.838 -9.088 -9.246 -9.396 -9.64 -9.814 -9.996 -10.087 -10.284 -10.511 -10.75 -10.869 -11.082 -11.238 -11.379 -11.528 -11.825 -11.986 -12.168 -12.354 -12.547 -12.779 -13.1 -14.072 -10 ,30063 ,KEBNE ,17023806,Wed Dec 22 08:26:17 CET,Wed Dec 22 09:54:11 CET,0.0 0.764 1.032 1.256 1.445 1.627 1.784 1.909 2.108 2.202 2.299 2.396 2.567 2.647 2.801 2.954 3.107 3.174 3.291 3.407 3.569 3.681 3.793 3.962 4.121 4.259 4.392 4.516 4.667 4.805 4.932 5.103 5.27 5.41 5.563 5.744 5.922 6.122 6.324 6.519 6.733 6.982 7.213 7.389 7.557 7.686 7.806 7.846 7.719 7.328 6.377 4.906 3.547 2.375 1.371 0.461 -0.345 -1.075 -1.704 -2.355 -2.916 -3.404 -3.908 -4.372 -4.765 -5.125 -5.488 -5.811 -6.095 -6.388 -6.711 -6.968 -7.226 -7.502 -7.707 -7.919 -8.139 -8.371 -8.615 -8.782 -8.945 -9.195 -9.369 -9.551 -9.647 -9.851 -10.071 -10.291 -10.403 -10.62 -10.78 -10.916 -11.068 -11.382 -11.562 -11.763 -11.97 -12.214 -12.475 -12.794 -13.789 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_25.txt deleted file mode 100644 index d9e88357..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10053 ,KEBNE ,16658234,Tue Nov 23 08:14:02 CET,Tue Nov 23 09:36:51 CET,0.0 1.137 1.461 1.71 1.893 2.058 2.22 2.373 2.666 2.776 2.863 2.942 3.115 3.208 3.375 3.513 3.625 3.685 3.801 3.901 4.041 4.133 4.23 4.365 4.495 4.632 4.758 4.878 5.047 5.203 5.341 5.501 5.642 5.787 5.942 6.105 6.274 6.436 6.582 6.732 6.906 7.078 7.255 7.436 7.617 7.741 7.773 7.764 7.635 7.247 6.199 4.558 3.204 2.003 0.903 -0.089 -0.934 -1.694 -2.349 -2.988 -3.539 -4.041 -4.515 -4.963 -5.366 -5.719 -6.087 -6.405 -6.69 -6.992 -7.299 -7.55 -7.791 -8.049 -8.266 -8.485 -8.709 -8.947 -9.206 -9.386 -9.578 -9.88 -10.072 -10.272 -10.378 -10.59 -10.802 -11.027 -11.152 -11.368 -11.527 -11.677 -11.837 -12.17 -12.342 -12.534 -12.758 -13.011 -13.307 -13.654 -15.427 -2 ,27454 ,KEBNE ,16658235,Tue Nov 23 08:14:02 CET,Tue Nov 23 09:36:31 CET,0.0 0.785 1.046 1.237 1.395 1.527 1.659 1.799 2.046 2.15 2.25 2.334 2.494 2.566 2.705 2.836 2.975 3.046 3.174 3.298 3.463 3.568 3.671 3.831 3.995 4.136 4.262 4.401 4.582 4.76 4.927 5.083 5.229 5.377 5.536 5.71 5.859 6.006 6.152 6.314 6.484 6.668 6.866 7.027 7.149 7.24 7.312 7.251 7.055 6.646 5.646 4.183 2.884 1.671 0.626 -0.281 -1.1 -1.83 -2.458 -3.078 -3.598 -4.068 -4.51 -4.941 -5.348 -5.7 -6.059 -6.384 -6.662 -6.951 -7.248 -7.496 -7.771 -8.051 -8.252 -8.454 -8.67 -8.909 -9.16 -9.329 -9.5 -9.756 -9.94 -10.146 -10.25 -10.447 -10.642 -10.855 -10.976 -11.199 -11.352 -11.475 -11.622 -11.97 -12.156 -12.358 -12.568 -12.806 -13.081 -13.464 -15.272 -3 ,10610 ,KEBNE ,16658236,Tue Nov 23 08:14:01 CET,Tue Nov 23 09:37:01 CET,0.0 1.006 1.37 1.656 1.867 2.015 2.144 2.275 2.507 2.611 2.704 2.785 2.947 3.027 3.179 3.319 3.45 3.514 3.638 3.767 3.948 4.053 4.16 4.325 4.474 4.605 4.729 4.85 5.011 5.15 5.281 5.447 5.588 5.72 5.877 6.025 6.156 6.318 6.488 6.654 6.839 7.041 7.245 7.433 7.627 7.771 7.82 7.811 7.649 7.167 6.124 4.698 3.45 2.302 1.281 0.375 -0.44 -1.183 -1.823 -2.463 -3.011 -3.484 -3.923 -4.341 -4.715 -5.049 -5.412 -5.738 -6.013 -6.302 -6.601 -6.857 -7.124 -7.392 -7.605 -7.823 -8.045 -8.28 -8.527 -8.698 -8.875 -9.148 -9.335 -9.527 -9.627 -9.837 -10.063 -10.3 -10.417 -10.629 -10.784 -10.911 -11.046 -11.371 -11.559 -11.765 -12.004 -12.265 -12.576 -13.075 -14.247 -4 ,3610 ,KEBNE ,16658237,Tue Nov 23 08:14:01 CET,Tue Nov 23 09:37:37 CET,0.0 1.013 1.435 1.752 1.957 2.09 2.217 2.345 2.643 2.776 2.88 2.991 3.158 3.237 3.394 3.539 3.678 3.749 3.887 4.008 4.178 4.292 4.399 4.545 4.685 4.818 4.94 5.048 5.181 5.314 5.461 5.625 5.776 5.923 6.088 6.252 6.392 6.577 6.768 6.923 7.064 7.236 7.431 7.564 7.685 7.852 8.019 8.098 8.004 7.6 6.628 5.157 3.722 2.478 1.433 0.494 -0.309 -1.037 -1.68 -2.329 -2.881 -3.367 -3.832 -4.263 -4.66 -5.042 -5.445 -5.78 -6.063 -6.366 -6.659 -6.891 -7.139 -7.4 -7.612 -7.838 -8.072 -8.314 -8.553 -8.726 -8.917 -9.2 -9.382 -9.555 -9.649 -9.85 -10.068 -10.308 -10.429 -10.653 -10.852 -11.004 -11.151 -11.492 -11.682 -11.876 -12.088 -12.317 -12.621 -13.072 -14.435 -5 ,5202 ,KEBNE ,16658238,Tue Nov 23 08:14:02 CET,Tue Nov 23 09:36:33 CET,0.0 1.04 1.362 1.58 1.756 1.892 2.033 2.17 2.393 2.496 2.592 2.69 2.867 2.946 3.105 3.249 3.357 3.412 3.529 3.639 3.806 3.922 4.033 4.194 4.34 4.458 4.568 4.69 4.837 4.952 5.075 5.235 5.374 5.507 5.657 5.812 5.963 6.137 6.332 6.514 6.683 6.878 7.083 7.253 7.389 7.473 7.544 7.532 7.351 6.948 5.888 4.276 3.01 1.935 0.905 -0.041 -0.858 -1.624 -2.284 -2.922 -3.474 -3.96 -4.394 -4.797 -5.192 -5.546 -5.913 -6.25 -6.551 -6.85 -7.159 -7.423 -7.696 -7.977 -8.188 -8.406 -8.638 -8.882 -9.125 -9.293 -9.47 -9.745 -9.927 -10.11 -10.218 -10.452 -10.681 -10.918 -11.046 -11.269 -11.449 -11.592 -11.73 -12.041 -12.226 -12.423 -12.641 -12.884 -13.163 -13.533 -14.872 -6 ,29711 ,KEBNE ,16658239,Tue Nov 23 08:14:02 CET,Tue Nov 23 09:35:32 CET,0.0 1.106 1.405 1.676 1.871 2.048 2.223 2.352 2.565 2.653 2.739 2.818 2.975 3.051 3.203 3.348 3.477 3.533 3.642 3.755 3.924 4.031 4.13 4.269 4.404 4.54 4.667 4.776 4.916 5.057 5.185 5.34 5.474 5.594 5.731 5.877 6.025 6.187 6.34 6.495 6.662 6.848 7.021 7.146 7.267 7.33 7.302 7.218 7.05 6.564 5.45 3.999 2.688 1.47 0.429 -0.476 -1.257 -1.988 -2.614 -3.234 -3.796 -4.269 -4.7 -5.105 -5.499 -5.866 -6.231 -6.562 -6.849 -7.147 -7.468 -7.734 -8.008 -8.291 -8.51 -8.736 -8.953 -9.182 -9.437 -9.606 -9.771 -10.03 -10.219 -10.421 -10.52 -10.726 -10.952 -11.186 -11.302 -11.513 -11.67 -11.813 -11.964 -12.293 -12.483 -12.682 -12.898 -13.137 -13.427 -13.841 -15.881 -7 ,30925 ,KEBNE ,16658240,Tue Nov 23 08:15:03 CET,Tue Nov 23 09:38:24 CET,0.0 0.761 1.038 1.293 1.497 1.662 1.806 1.943 2.189 2.292 2.393 2.499 2.668 2.747 2.905 3.056 3.187 3.244 3.351 3.463 3.637 3.745 3.835 3.959 4.088 4.216 4.337 4.445 4.585 4.728 4.864 5.028 5.183 5.318 5.472 5.645 5.785 5.927 6.091 6.252 6.424 6.596 6.763 6.893 7.012 7.146 7.23 7.189 6.988 6.53 5.498 4.022 2.677 1.502 0.46 -0.485 -1.298 -2.001 -2.605 -3.241 -3.801 -4.29 -4.764 -5.227 -5.637 -6.013 -6.408 -6.738 -7.015 -7.302 -7.607 -7.871 -8.154 -8.44 -8.656 -8.887 -9.123 -9.358 -9.6 -9.773 -9.956 -10.234 -10.428 -10.625 -10.723 -10.927 -11.148 -11.379 -11.501 -11.715 -11.845 -11.974 -12.125 -12.44 -12.596 -12.772 -12.978 -13.216 -13.482 -13.806 -14.975 -8 ,29491 ,KEBNE ,16658241,Tue Nov 23 08:15:02 CET,Tue Nov 23 09:37:47 CET,0.0 0.898 1.212 1.458 1.656 1.82 1.953 2.077 2.312 2.407 2.507 2.598 2.759 2.84 2.982 3.135 3.285 3.343 3.476 3.617 3.8 3.913 4.017 4.162 4.296 4.416 4.54 4.652 4.791 4.938 5.079 5.244 5.393 5.526 5.666 5.82 5.974 6.149 6.345 6.553 6.718 6.856 6.997 7.139 7.296 7.439 7.586 7.622 7.557 7.2 6.149 4.69 3.345 2.211 1.243 0.299 -0.545 -1.313 -1.975 -2.614 -3.162 -3.65 -4.098 -4.499 -4.889 -5.263 -5.643 -5.987 -6.285 -6.583 -6.886 -7.127 -7.375 -7.639 -7.851 -8.073 -8.301 -8.54 -8.789 -8.963 -9.143 -9.411 -9.594 -9.785 -9.887 -10.096 -10.32 -10.573 -10.699 -10.921 -11.096 -11.236 -11.381 -11.684 -11.858 -12.047 -12.255 -12.476 -12.72 -13.09 -14.426 -9 ,7277 ,KEBNE ,16658242,Tue Nov 23 08:15:03 CET,Tue Nov 23 09:38:25 CET,0.0 0.995 1.303 1.561 1.779 1.943 2.096 2.24 2.468 2.565 2.665 2.778 2.952 3.037 3.21 3.371 3.507 3.57 3.698 3.812 3.967 4.083 4.192 4.341 4.479 4.611 4.743 4.857 4.995 5.14 5.276 5.43 5.583 5.725 5.875 6.04 6.183 6.348 6.537 6.722 6.893 7.071 7.251 7.394 7.529 7.644 7.748 7.776 7.706 7.335 6.344 5.019 3.787 2.661 1.612 0.687 -0.084 -0.812 -1.439 -2.051 -2.572 -3.018 -3.469 -3.921 -4.332 -4.684 -5.027 -5.337 -5.613 -5.908 -6.211 -6.455 -6.701 -6.965 -7.185 -7.408 -7.64 -7.894 -8.141 -8.303 -8.47 -8.735 -8.925 -9.122 -9.223 -9.44 -9.667 -9.892 -10.009 -10.233 -10.422 -10.568 -10.707 -11.009 -11.194 -11.395 -11.628 -11.9 -12.176 -12.52 -13.573 -10 ,1667 ,KEBNE ,16658243,Tue Nov 23 08:15:03 CET,Tue Nov 23 09:37:32 CET,0.0 0.968 1.32 1.609 1.82 1.98 2.133 2.266 2.5 2.608 2.698 2.776 2.955 3.048 3.205 3.35 3.502 3.576 3.713 3.837 4.004 4.11 4.212 4.355 4.486 4.608 4.731 4.837 4.977 5.128 5.266 5.425 5.566 5.705 5.862 6.021 6.193 6.365 6.523 6.685 6.847 7.012 7.167 7.342 7.522 7.677 7.785 7.765 7.595 7.159 6.113 4.584 3.268 2.095 1.055 0.124 -0.669 -1.402 -2.021 -2.617 -3.144 -3.598 -4.029 -4.453 -4.853 -5.212 -5.583 -5.924 -6.212 -6.492 -6.793 -7.063 -7.34 -7.62 -7.83 -8.044 -8.277 -8.52 -8.768 -8.941 -9.119 -9.398 -9.598 -9.802 -9.903 -10.114 -10.337 -10.558 -10.669 -10.88 -11.055 -11.201 -11.345 -11.692 -11.894 -12.082 -12.284 -12.507 -12.782 -13.215 -14.563 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_252.txt deleted file mode 100644 index 8456e17d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_237_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1254 ,KEBNE ,16658244,Tue Nov 23 08:15:02 CET,Tue Nov 23 09:37:37 CET,0.0 0.591 0.799 0.969 1.113 1.24 1.364 1.465 1.612 1.681 1.75 1.793 1.942 2.012 2.132 2.237 2.334 2.375 2.453 2.518 2.613 2.691 2.762 2.845 2.915 2.982 3.05 3.114 3.196 3.272 3.327 3.379 3.445 3.506 3.566 3.624 3.653 3.655 3.672 3.669 3.588 3.47 3.295 3.038 2.703 2.294 1.7 0.875 -0.406 -2.399 -5.503 -9.021 -11.77 -14.058 -16.014 -17.666 -19.003 -20.162 -21.153 -22.144 -23.008 -23.753 -24.423 -25.036 -25.601 -26.128 -26.695 -27.173 -27.558 -27.956 -28.371 -28.727 -29.093 -29.455 -29.732 -30.009 -30.285 -30.586 -30.908 -31.128 -31.355 -31.71 -31.962 -32.217 -32.344 -32.606 -32.883 -33.172 -33.321 -33.597 -33.798 -33.964 -34.141 -34.525 -34.726 -34.966 -35.261 -35.577 -35.934 -36.393 -37.64 -2 ,15326 ,KEBNE ,16658245,Tue Nov 23 08:15:03 CET,Tue Nov 23 09:37:26 CET,0.0 0.897 1.111 1.244 1.368 1.498 1.602 1.695 1.853 1.931 2.007 2.048 2.202 2.271 2.368 2.448 2.536 2.577 2.656 2.753 2.861 2.902 2.952 3.032 3.111 3.178 3.239 3.298 3.375 3.448 3.503 3.541 3.568 3.593 3.632 3.677 3.669 3.626 3.583 3.506 3.4 3.286 3.118 2.916 2.642 2.198 1.548 0.787 -0.211 -1.902 -4.91 -8.367 -10.985 -13.153 -15.032 -16.668 -18.047 -19.252 -20.264 -21.262 -22.091 -22.802 -23.49 -24.128 -24.729 -25.274 -25.823 -26.312 -26.723 -27.135 -27.562 -27.91 -28.261 -28.616 -28.886 -29.173 -29.476 -29.784 -30.098 -30.311 -30.53 -30.886 -31.14 -31.404 -31.529 -31.79 -32.07 -32.353 -32.505 -32.78 -32.964 -33.119 -33.285 -33.655 -33.858 -34.062 -34.306 -34.581 -34.861 -35.22 -36.236 -3 ,914 ,KEBNE ,16658246,Tue Nov 23 08:15:03 CET,Tue Nov 23 09:38:54 CET,0.0 0.712 0.93 1.104 1.238 1.345 1.443 1.538 1.708 1.779 1.845 1.884 2.035 2.095 2.203 2.304 2.401 2.454 2.557 2.64 2.731 2.79 2.857 2.952 3.032 3.11 3.175 3.234 3.31 3.381 3.456 3.531 3.583 3.637 3.69 3.723 3.724 3.696 3.641 3.596 3.564 3.513 3.405 3.216 2.896 2.513 1.993 1.157 -0.027 -1.799 -4.77 -8.158 -10.794 -12.97 -14.863 -16.539 -17.931 -19.098 -20.066 -21.06 -21.901 -22.627 -23.315 -23.949 -24.531 -25.051 -25.587 -26.06 -26.465 -26.869 -27.28 -27.62 -27.963 -28.309 -28.577 -28.863 -29.155 -29.451 -29.757 -29.972 -30.191 -30.536 -30.787 -31.051 -31.176 -31.43 -31.714 -31.992 -32.135 -32.406 -32.588 -32.75 -32.92 -33.282 -33.489 -33.742 -34.006 -34.277 -34.593 -34.977 -36.034 -4 ,21335 ,KEBNE ,16658247,Tue Nov 23 08:15:03 CET,Tue Nov 23 09:37:40 CET,0.0 0.539 0.76 0.905 1.041 1.163 1.262 1.356 1.526 1.602 1.659 1.698 1.851 1.914 2.04 2.153 2.244 2.286 2.367 2.441 2.55 2.615 2.674 2.763 2.841 2.901 2.947 2.997 3.083 3.141 3.169 3.197 3.227 3.26 3.278 3.296 3.309 3.31 3.309 3.279 3.207 3.089 2.894 2.637 2.3 1.896 1.332 0.541 -0.661 -2.5 -5.565 -9.04 -11.67 -13.785 -15.624 -17.254 -18.593 -19.74 -20.717 -21.696 -22.55 -23.297 -23.955 -24.556 -25.119 -25.613 -26.117 -26.573 -26.972 -27.391 -27.822 -28.172 -28.528 -28.893 -29.173 -29.468 -29.778 -30.097 -30.408 -30.611 -30.83 -31.183 -31.418 -31.659 -31.784 -32.044 -32.313 -32.59 -32.739 -33.014 -33.204 -33.37 -33.539 -33.925 -34.144 -34.368 -34.621 -34.893 -35.21 -35.59 -36.613 -5 ,9455 ,KEBNE ,16658248,Tue Nov 23 08:16:04 CET,Tue Nov 23 09:41:26 CET,0.0 0.758 1.004 1.195 1.348 1.478 1.57 1.644 1.79 1.863 1.936 2.005 2.158 2.211 2.306 2.4 2.498 2.542 2.621 2.683 2.775 2.844 2.903 2.993 3.066 3.12 3.181 3.242 3.312 3.372 3.424 3.475 3.515 3.567 3.619 3.658 3.665 3.647 3.653 3.637 3.585 3.515 3.437 3.294 2.981 2.509 1.935 1.251 0.135 -1.755 -4.825 -8.338 -11.097 -13.317 -15.169 -16.781 -18.142 -19.333 -20.35 -21.365 -22.215 -22.956 -23.647 -24.264 -24.84 -25.368 -25.897 -26.386 -26.815 -27.222 -27.636 -27.988 -28.361 -28.754 -29.037 -29.322 -29.629 -29.942 -30.256 -30.471 -30.691 -31.034 -31.277 -31.524 -31.647 -31.911 -32.192 -32.484 -32.643 -32.928 -33.12 -33.285 -33.46 -33.842 -34.046 -34.255 -34.488 -34.74 -35.031 -35.447 -36.376 -6 ,10391 ,KEBNE ,16658249,Tue Nov 23 08:16:04 CET,Tue Nov 23 09:39:39 CET,0.0 0.486 0.668 0.793 0.918 1.036 1.144 1.251 1.432 1.512 1.59 1.653 1.801 1.854 1.966 2.061 2.14 2.177 2.245 2.314 2.408 2.464 2.519 2.599 2.683 2.747 2.786 2.841 2.904 2.933 2.966 3.014 3.057 3.076 3.065 3.067 3.063 3.04 3.042 3.034 2.98 2.911 2.808 2.615 2.379 2.087 1.575 0.805 -0.418 -2.326 -5.303 -8.717 -11.468 -13.697 -15.524 -17.115 -18.487 -19.676 -20.688 -21.687 -22.508 -23.239 -23.959 -24.62 -25.224 -25.801 -26.39 -26.899 -27.33 -27.744 -28.157 -28.493 -28.835 -29.196 -29.485 -29.77 -30.06 -30.355 -30.657 -30.874 -31.102 -31.45 -31.685 -31.924 -32.049 -32.31 -32.581 -32.868 -33.025 -33.304 -33.508 -33.676 -33.855 -34.249 -34.45 -34.659 -34.878 -35.149 -35.472 -35.88 -36.786 -7 ,21989 ,KEBNE ,16658250,Tue Nov 23 08:16:04 CET,Tue Nov 23 09:39:13 CET,0.0 0.615 0.866 1.057 1.214 1.346 1.455 1.554 1.716 1.785 1.864 1.923 2.071 2.128 2.209 2.283 2.365 2.406 2.489 2.577 2.713 2.795 2.857 2.927 2.988 3.052 3.113 3.162 3.217 3.271 3.319 3.365 3.406 3.446 3.474 3.463 3.459 3.457 3.427 3.395 3.353 3.258 3.062 2.819 2.482 2.048 1.476 0.638 -0.606 -2.419 -5.504 -9.052 -11.747 -13.967 -15.796 -17.427 -18.847 -20.066 -21.099 -22.097 -22.949 -23.71 -24.394 -25.024 -25.611 -26.138 -26.665 -27.108 -27.494 -27.902 -28.339 -28.701 -29.058 -29.422 -29.711 -30.018 -30.326 -30.627 -30.935 -31.154 -31.374 -31.716 -31.948 -32.183 -32.304 -32.551 -32.806 -33.068 -33.21 -33.478 -33.674 -33.843 -34.006 -34.331 -34.527 -34.747 -34.994 -35.301 -35.618 -36.041 -37.364 -8 ,20752 ,KEBNE ,16658251,Tue Nov 23 08:16:04 CET,Tue Nov 23 09:40:07 CET,0.0 0.61 0.877 1.062 1.209 1.321 1.43 1.525 1.676 1.755 1.833 1.903 2.063 2.123 2.235 2.336 2.45 2.503 2.572 2.629 2.727 2.8 2.865 2.952 3.027 3.087 3.144 3.2 3.274 3.331 3.366 3.406 3.462 3.516 3.574 3.622 3.669 3.694 3.699 3.693 3.613 3.493 3.33 3.128 2.821 2.378 1.818 0.996 -0.297 -2.167 -5.246 -8.805 -11.524 -13.737 -15.587 -17.195 -18.545 -19.699 -20.685 -21.667 -22.499 -23.212 -23.882 -24.527 -25.105 -25.62 -26.159 -26.608 -26.981 -27.381 -27.81 -28.163 -28.526 -28.91 -29.192 -29.457 -29.728 -30.023 -30.334 -30.554 -30.781 -31.132 -31.367 -31.613 -31.742 -32.016 -32.293 -32.554 -32.688 -32.955 -33.168 -33.338 -33.506 -33.873 -34.074 -34.284 -34.512 -34.757 -35.072 -35.55 -36.34 -9 ,19683 ,KEBNE ,16658252,Tue Nov 23 08:16:04 CET,Tue Nov 23 09:39:12 CET,0.0 0.626 0.927 1.116 1.268 1.402 1.519 1.634 1.814 1.892 1.963 1.988 2.119 2.167 2.254 2.346 2.442 2.491 2.592 2.675 2.796 2.87 2.924 2.995 3.048 3.102 3.16 3.206 3.28 3.338 3.368 3.425 3.475 3.502 3.542 3.575 3.563 3.549 3.56 3.541 3.482 3.433 3.304 3.041 2.68 2.219 1.617 0.794 -0.399 -2.194 -5.143 -8.591 -11.34 -13.568 -15.409 -17.006 -18.346 -19.516 -20.543 -21.542 -22.357 -23.059 -23.736 -24.385 -24.98 -25.53 -26.074 -26.543 -26.954 -27.373 -27.813 -28.163 -28.506 -28.868 -29.159 -29.452 -29.747 -30.065 -30.38 -30.594 -30.822 -31.161 -31.397 -31.632 -31.751 -32.009 -32.271 -32.539 -32.678 -32.94 -33.129 -33.292 -33.476 -33.911 -34.131 -34.356 -34.604 -34.892 -35.266 -35.764 -37.151 -10 ,1367 ,KEBNE ,16658253,Tue Nov 23 08:16:04 CET,Tue Nov 23 09:40:05 CET,0.0 0.525 0.718 0.869 1.01 1.139 1.242 1.337 1.536 1.631 1.71 1.765 1.915 1.972 2.064 2.162 2.249 2.288 2.37 2.453 2.559 2.618 2.682 2.771 2.836 2.896 2.96 3.016 3.072 3.13 3.198 3.273 3.334 3.386 3.426 3.447 3.435 3.389 3.361 3.343 3.301 3.26 3.108 2.85 2.592 2.284 1.842 1.167 0.002 -1.871 -4.958 -8.472 -11.185 -13.389 -15.189 -16.723 -18.039 -19.255 -20.32 -21.32 -22.104 -22.795 -23.471 -24.12 -24.731 -25.252 -25.781 -26.25 -26.643 -27.047 -27.472 -27.821 -28.167 -28.532 -28.812 -29.087 -29.379 -29.688 -29.994 -30.207 -30.432 -30.78 -31.021 -31.259 -31.38 -31.639 -31.917 -32.2 -32.34 -32.604 -32.802 -32.984 -33.165 -33.539 -33.76 -33.997 -34.261 -34.558 -34.868 -35.273 -36.259 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_23_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_23_1.txt deleted file mode 100644 index 8b4196cf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_23_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24925 ,KEBNE ,16658254,Tue Nov 23 08:16:04 CET,Tue Nov 23 09:38:40 CET,0.0 0.613 0.935 1.172 1.36 1.512 1.662 1.807 2.071 2.19 2.293 2.379 2.562 2.661 2.836 2.99 3.147 3.233 3.409 3.57 3.78 3.92 4.066 4.268 4.459 4.649 4.827 5.007 5.233 5.446 5.647 5.878 6.104 6.329 6.608 6.921 7.206 7.512 7.845 8.209 8.581 9.0 9.483 9.954 10.528 11.173 11.872 12.628 13.44 14.318 15.32 15.831 15.856 15.731 15.573 15.39 15.175 14.969 14.766 14.542 14.338 14.145 13.959 13.775 13.597 13.417 13.211 13.043 12.886 12.708 12.549 12.425 12.299 12.141 12.015 11.891 11.75 11.597 11.433 11.328 11.225 11.055 10.934 10.8 10.726 10.587 10.449 10.286 10.203 10.056 9.975 9.877 9.778 9.59 9.48 9.343 9.184 9.032 8.862 8.597 8.233 -2 ,30961 ,KEBNE ,16658255,Tue Nov 23 08:16:04 CET,Tue Nov 23 09:39:31 CET,0.0 0.862 1.132 1.359 1.574 1.749 1.894 2.022 2.284 2.418 2.54 2.655 2.844 2.949 3.139 3.321 3.494 3.576 3.731 3.875 4.089 4.225 4.358 4.547 4.738 4.938 5.125 5.296 5.518 5.726 5.92 6.155 6.385 6.61 6.881 7.183 7.455 7.759 8.083 8.412 8.779 9.193 9.66 10.142 10.703 11.338 12.034 12.771 13.567 14.389 15.232 15.702 15.806 15.776 15.645 15.457 15.259 15.029 14.827 14.621 14.43 14.261 14.077 13.892 13.727 13.568 13.392 13.211 13.041 12.882 12.723 12.589 12.448 12.292 12.172 12.044 11.896 11.747 11.604 11.491 11.379 11.212 11.081 10.951 10.891 10.756 10.611 10.466 10.388 10.237 10.152 10.056 9.957 9.757 9.621 9.477 9.334 9.155 8.952 8.733 8.131 -3 ,3878 ,KEBNE ,16658256,Tue Nov 23 08:16:04 CET,Tue Nov 23 09:39:34 CET,0.0 0.637 0.901 1.125 1.321 1.495 1.642 1.781 2.05 2.171 2.288 2.425 2.612 2.709 2.898 3.067 3.231 3.315 3.473 3.624 3.833 3.973 4.114 4.309 4.49 4.655 4.822 4.995 5.213 5.415 5.613 5.867 6.109 6.339 6.618 6.936 7.221 7.52 7.871 8.246 8.617 9.019 9.48 9.939 10.469 11.053 11.695 12.423 13.266 14.123 14.908 15.315 15.393 15.304 15.136 14.909 14.656 14.43 14.212 13.964 13.749 13.55 13.329 13.113 12.951 12.809 12.648 12.498 12.362 12.215 12.043 11.893 11.749 11.601 11.489 11.376 11.248 11.11 10.961 10.861 10.764 10.593 10.465 10.336 10.273 10.142 9.982 9.809 9.723 9.561 9.471 9.388 9.288 9.062 8.951 8.824 8.677 8.525 8.353 8.115 7.419 -4 ,9197 ,KEBNE ,16658257,Tue Nov 23 08:17:05 CET,Tue Nov 23 09:40:36 CET,0.0 1.082 1.402 1.606 1.77 1.952 2.127 2.295 2.578 2.69 2.797 2.922 3.107 3.2 3.382 3.556 3.73 3.811 3.961 4.112 4.326 4.463 4.592 4.788 4.981 5.161 5.347 5.526 5.742 5.946 6.152 6.407 6.653 6.893 7.167 7.472 7.764 8.079 8.413 8.767 9.144 9.571 10.065 10.535 11.063 11.659 12.329 13.023 13.815 14.725 15.584 16.01 16.108 16.051 15.953 15.807 15.613 15.388 15.169 14.927 14.704 14.496 14.305 14.135 13.979 13.817 13.633 13.48 13.336 13.179 13.039 12.92 12.777 12.628 12.512 12.385 12.251 12.114 11.982 11.891 11.797 11.635 11.515 11.395 11.33 11.198 11.067 10.922 10.842 10.685 10.589 10.504 10.417 10.212 10.081 9.932 9.766 9.57 9.372 9.188 8.773 -5 ,22282 ,KEBNE ,16658258,Tue Nov 23 08:17:06 CET,Tue Nov 23 09:40:10 CET,0.0 0.706 1.06 1.321 1.535 1.719 1.876 2.014 2.253 2.36 2.469 2.598 2.787 2.886 3.08 3.247 3.398 3.476 3.637 3.79 3.993 4.13 4.273 4.474 4.667 4.862 5.047 5.203 5.402 5.598 5.795 6.043 6.26 6.462 6.711 6.997 7.268 7.557 7.879 8.248 8.618 9.017 9.476 9.936 10.486 11.088 11.828 12.644 13.513 14.479 15.487 16.067 16.158 15.985 15.736 15.509 15.289 15.061 14.819 14.567 14.368 14.183 13.986 13.793 13.625 13.467 13.291 13.122 12.965 12.812 12.665 12.535 12.38 12.2 12.061 11.911 11.764 11.627 11.489 11.4 11.302 11.133 11.009 10.892 10.841 10.74 10.623 10.482 10.408 10.247 10.129 10.037 9.942 9.711 9.577 9.439 9.281 9.109 8.922 8.667 8.041 -6 ,5454 ,KEBNE ,16658259,Tue Nov 23 08:17:05 CET,Tue Nov 23 09:40:47 CET,0.0 0.965 1.288 1.522 1.702 1.84 1.978 2.11 2.341 2.447 2.544 2.653 2.84 2.94 3.131 3.306 3.471 3.552 3.698 3.841 4.074 4.217 4.349 4.538 4.721 4.884 5.051 5.227 5.432 5.637 5.854 6.116 6.348 6.568 6.827 7.113 7.387 7.69 8.028 8.38 8.743 9.145 9.627 10.118 10.661 11.251 11.939 12.734 13.558 14.451 15.365 15.802 15.892 15.847 15.736 15.562 15.353 15.145 14.968 14.775 14.554 14.349 14.165 13.982 13.82 13.665 13.49 13.336 13.199 13.036 12.864 12.725 12.59 12.452 12.338 12.216 12.092 11.962 11.822 11.729 11.625 11.439 11.314 11.205 11.144 11.001 10.865 10.716 10.631 10.467 10.355 10.263 10.178 9.988 9.865 9.72 9.565 9.415 9.246 9.026 8.589 -7 ,4254 ,KEBNE ,16658260,Tue Nov 23 08:18:07 CET,Tue Nov 23 09:42:22 CET,0.0 0.842 1.168 1.405 1.586 1.741 1.893 2.031 2.303 2.428 2.533 2.638 2.819 2.912 3.089 3.247 3.399 3.479 3.645 3.799 4.019 4.15 4.291 4.502 4.689 4.87 5.045 5.201 5.403 5.633 5.849 6.081 6.298 6.507 6.752 7.037 7.312 7.606 7.929 8.288 8.666 9.087 9.568 10.04 10.592 11.197 11.882 12.636 13.448 14.352 15.266 15.803 15.94 15.875 15.745 15.583 15.394 15.18 14.965 14.73 14.534 14.353 14.177 13.997 13.824 13.665 13.484 13.329 13.199 13.055 12.902 12.768 12.616 12.463 12.343 12.22 12.084 11.928 11.777 11.684 11.587 11.41 11.276 11.144 11.078 10.924 10.778 10.646 10.565 10.406 10.279 10.173 10.066 9.851 9.733 9.589 9.422 9.212 8.988 8.757 8.225 -8 ,5027 ,KEBNE ,16658261,Tue Nov 23 08:18:07 CET,Tue Nov 23 09:41:48 CET,0.0 0.709 0.991 1.193 1.376 1.543 1.689 1.815 2.054 2.173 2.282 2.413 2.601 2.7 2.887 3.059 3.221 3.299 3.453 3.608 3.837 3.976 4.103 4.294 4.491 4.685 4.86 5.029 5.236 5.438 5.651 5.894 6.133 6.372 6.636 6.931 7.213 7.509 7.833 8.176 8.542 8.971 9.486 10.004 10.588 11.207 11.889 12.659 13.551 14.507 15.393 15.8 15.863 15.808 15.66 15.449 15.253 15.039 14.83 14.591 14.361 14.179 14.009 13.833 13.657 13.482 13.303 13.151 13.017 12.873 12.713 12.562 12.413 12.266 12.143 12.021 11.895 11.756 11.613 11.516 11.413 11.227 11.097 10.977 10.914 10.772 10.619 10.459 10.371 10.211 10.129 10.046 9.962 9.764 9.644 9.523 9.379 9.218 9.035 8.777 8.017 -9 ,12691 ,KEBNE ,16658262,Tue Nov 23 08:18:07 CET,Tue Nov 23 09:41:40 CET,0.0 0.924 1.216 1.451 1.662 1.866 2.022 2.158 2.439 2.564 2.668 2.779 2.972 3.073 3.258 3.432 3.587 3.665 3.809 3.947 4.154 4.297 4.441 4.649 4.844 5.029 5.211 5.381 5.603 5.814 6.006 6.239 6.476 6.697 6.944 7.236 7.51 7.813 8.173 8.557 8.934 9.333 9.799 10.253 10.755 11.352 12.078 12.848 13.708 14.679 15.677 16.229 16.336 16.246 16.095 15.867 15.647 15.451 15.243 14.999 14.784 14.601 14.425 14.242 14.064 13.872 13.652 13.491 13.361 13.218 13.043 12.892 12.744 12.583 12.471 12.367 12.252 12.121 11.98 11.879 11.772 11.608 11.489 11.365 11.304 11.177 11.045 10.9 10.821 10.654 10.51 10.398 10.283 10.034 9.902 9.756 9.59 9.403 9.179 8.898 8.351 -10 ,5154 ,KEBNE ,16658263,Tue Nov 23 08:18:07 CET,Tue Nov 23 09:42:08 CET,0.0 0.786 1.058 1.299 1.52 1.704 1.845 1.975 2.247 2.361 2.459 2.562 2.74 2.828 2.995 3.168 3.336 3.413 3.556 3.693 3.9 4.03 4.154 4.337 4.515 4.687 4.852 5.007 5.218 5.432 5.635 5.864 6.081 6.307 6.57 6.879 7.201 7.537 7.874 8.231 8.62 9.06 9.533 9.997 10.559 11.174 11.864 12.63 13.459 14.361 15.278 15.673 15.682 15.567 15.426 15.263 15.086 14.902 14.71 14.506 14.324 14.141 13.954 13.787 13.634 13.483 13.317 13.163 13.024 12.87 12.705 12.569 12.428 12.28 12.159 12.022 11.892 11.776 11.628 11.51 11.397 11.226 11.088 10.942 10.879 10.748 10.6 10.457 10.38 10.227 10.109 10.004 9.905 9.672 9.546 9.414 9.26 9.105 8.936 8.69 8.184 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_251_256.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_251_256.txt deleted file mode 100644 index 05d4b7fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_251_256.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7802 ,KEBNE ,16658264,Tue Nov 23 08:18:07 CET,Tue Nov 23 09:41:21 CET,0.0 0.446 0.696 0.878 1.023 1.127 1.228 1.337 1.524 1.598 1.678 1.751 1.928 2.002 2.13 2.247 2.351 2.392 2.466 2.542 2.643 2.707 2.77 2.857 2.947 3.042 3.121 3.186 3.278 3.359 3.44 3.541 3.622 3.704 3.801 3.901 3.993 4.084 4.171 4.244 4.31 4.359 4.39 4.413 4.403 4.35 4.227 4.029 3.698 3.12 2.028 0.628 -0.519 -1.501 -2.354 -3.107 -3.793 -4.442 -4.982 -5.506 -5.977 -6.429 -6.883 -7.269 -7.601 -7.904 -8.224 -8.531 -8.797 -9.072 -9.385 -9.656 -9.92 -10.206 -10.433 -10.651 -10.886 -11.116 -11.352 -11.537 -11.716 -11.985 -12.181 -12.372 -12.466 -12.684 -12.907 -13.13 -13.25 -13.487 -13.653 -13.808 -13.968 -14.287 -14.456 -14.642 -14.841 -15.109 -15.439 -15.842 -17.272 -2 ,9636 ,KEBNE ,16658265,Tue Nov 23 08:18:07 CET,Tue Nov 23 09:44:28 CET,0.0 0.334 0.537 0.716 0.857 0.981 1.076 1.178 1.365 1.437 1.507 1.542 1.701 1.757 1.862 1.977 2.087 2.139 2.245 2.341 2.462 2.538 2.606 2.708 2.806 2.877 2.949 3.032 3.142 3.253 3.352 3.449 3.533 3.613 3.7 3.782 3.876 3.987 4.082 4.164 4.233 4.288 4.35 4.372 4.343 4.297 4.182 3.934 3.542 2.851 1.53 -0.151 -1.495 -2.566 -3.454 -4.23 -4.939 -5.601 -6.129 -6.653 -7.131 -7.575 -8.009 -8.401 -8.772 -9.135 -9.503 -9.815 -10.073 -10.354 -10.667 -10.924 -11.186 -11.437 -11.63 -11.826 -12.027 -12.273 -12.544 -12.721 -12.9 -13.187 -13.393 -13.604 -13.708 -13.927 -14.165 -14.416 -14.554 -14.819 -14.986 -15.139 -15.306 -15.678 -15.876 -16.088 -16.337 -16.646 -16.98 -17.401 -18.716 -3 ,29396 ,KEBNE ,16658266,Tue Nov 23 08:19:09 CET,Tue Nov 23 09:42:26 CET,0.0 0.381 0.529 0.661 0.783 0.941 1.084 1.193 1.417 1.524 1.615 1.681 1.854 1.931 2.063 2.193 2.312 2.367 2.476 2.573 2.707 2.788 2.852 2.924 3.0 3.094 3.18 3.26 3.37 3.46 3.543 3.631 3.713 3.808 3.895 3.979 4.066 4.148 4.235 4.321 4.393 4.436 4.462 4.486 4.511 4.515 4.443 4.249 3.895 3.274 2.14 0.67 -0.607 -1.653 -2.535 -3.34 -4.04 -4.661 -5.196 -5.743 -6.207 -6.608 -7.01 -7.399 -7.775 -8.126 -8.483 -8.809 -9.093 -9.394 -9.719 -9.97 -10.212 -10.474 -10.69 -10.931 -11.178 -11.422 -11.674 -11.853 -12.049 -12.363 -12.577 -12.791 -12.899 -13.119 -13.336 -13.55 -13.663 -13.898 -14.057 -14.205 -14.35 -14.656 -14.83 -15.033 -15.259 -15.487 -15.771 -16.205 -17.793 -4 ,13236 ,KEBNE ,16658267,Tue Nov 23 08:19:09 CET,Tue Nov 23 09:42:26 CET,0.0 0.384 0.592 0.789 0.937 1.059 1.18 1.271 1.424 1.502 1.572 1.613 1.774 1.83 1.93 2.022 2.115 2.159 2.248 2.333 2.438 2.509 2.579 2.677 2.773 2.857 2.939 3.014 3.115 3.218 3.319 3.448 3.55 3.631 3.731 3.844 3.935 4.027 4.127 4.203 4.268 4.342 4.42 4.451 4.457 4.442 4.348 4.178 3.897 3.343 2.266 0.909 -0.257 -1.264 -2.134 -2.925 -3.64 -4.285 -4.84 -5.396 -5.866 -6.29 -6.698 -7.093 -7.465 -7.788 -8.12 -8.429 -8.698 -8.985 -9.283 -9.528 -9.781 -10.038 -10.256 -10.489 -10.71 -10.923 -11.147 -11.318 -11.506 -11.802 -12.011 -12.225 -12.335 -12.555 -12.776 -13.021 -13.163 -13.409 -13.562 -13.706 -13.869 -14.247 -14.451 -14.667 -14.912 -15.23 -15.629 -16.106 -17.46 -5 ,5166 ,KEBNE ,16658268,Tue Nov 23 08:19:09 CET,Tue Nov 23 09:43:10 CET,0.0 0.442 0.682 0.876 1.02 1.137 1.253 1.359 1.541 1.622 1.699 1.763 1.92 1.981 2.125 2.245 2.333 2.382 2.488 2.576 2.703 2.793 2.864 2.951 3.044 3.131 3.212 3.296 3.391 3.501 3.609 3.696 3.769 3.853 3.927 3.988 4.052 4.128 4.207 4.273 4.347 4.408 4.459 4.515 4.551 4.506 4.381 4.181 3.838 3.252 2.2 0.861 -0.272 -1.204 -2.015 -2.758 -3.391 -3.989 -4.507 -5.028 -5.498 -5.92 -6.295 -6.651 -6.993 -7.285 -7.608 -7.902 -8.139 -8.383 -8.659 -8.888 -9.109 -9.354 -9.55 -9.754 -9.963 -10.158 -10.369 -10.527 -10.693 -10.962 -11.151 -11.349 -11.455 -11.658 -11.859 -12.089 -12.216 -12.455 -12.619 -12.774 -12.925 -13.235 -13.416 -13.638 -13.895 -14.146 -14.409 -14.756 -16.105 -6 ,15086 ,KEBNE ,16658269,Tue Nov 23 08:19:09 CET,Tue Nov 23 09:43:07 CET,0.0 0.639 0.903 1.086 1.232 1.363 1.482 1.589 1.768 1.841 1.911 1.953 2.122 2.187 2.313 2.429 2.519 2.56 2.65 2.73 2.852 2.933 3.0 3.092 3.194 3.294 3.381 3.458 3.552 3.637 3.716 3.804 3.883 3.972 4.063 4.128 4.203 4.313 4.415 4.504 4.591 4.644 4.689 4.768 4.83 4.813 4.74 4.601 4.324 3.754 2.646 1.229 0.016 -1.059 -1.975 -2.763 -3.426 -4.04 -4.582 -5.156 -5.663 -6.12 -6.578 -7.017 -7.412 -7.782 -8.187 -8.516 -8.8 -9.116 -9.43 -9.685 -9.955 -10.237 -10.453 -10.666 -10.881 -11.112 -11.367 -11.541 -11.715 -11.984 -12.161 -12.353 -12.462 -12.686 -12.923 -13.154 -13.276 -13.515 -13.649 -13.79 -13.942 -14.266 -14.44 -14.635 -14.853 -15.084 -15.366 -15.81 -17.347 -7 ,15186 ,KEBNE ,16658270,Tue Nov 23 08:20:11 CET,Tue Nov 23 09:45:39 CET,0.0 0.414 0.616 0.796 0.969 1.122 1.231 1.316 1.481 1.573 1.665 1.724 1.884 1.948 2.073 2.191 2.291 2.337 2.431 2.52 2.637 2.713 2.788 2.908 3.034 3.152 3.256 3.347 3.459 3.55 3.634 3.749 3.859 3.956 4.063 4.15 4.219 4.308 4.398 4.488 4.589 4.676 4.721 4.751 4.784 4.792 4.738 4.577 4.241 3.634 2.544 1.16 -0.038 -1.096 -2.035 -2.853 -3.56 -4.23 -4.827 -5.393 -5.866 -6.293 -6.71 -7.103 -7.447 -7.764 -8.113 -8.434 -8.696 -8.956 -9.25 -9.499 -9.763 -10.056 -10.286 -10.499 -10.718 -10.969 -11.237 -11.41 -11.576 -11.841 -12.033 -12.23 -12.329 -12.538 -12.758 -12.998 -13.131 -13.369 -13.504 -13.65 -13.803 -14.128 -14.313 -14.528 -14.782 -15.073 -15.406 -15.834 -17.069 -8 ,19182 ,KEBNE ,16658271,Tue Nov 23 08:21:12 CET,Tue Nov 23 09:45:52 CET,0.0 0.521 0.806 1.004 1.144 1.254 1.351 1.448 1.641 1.727 1.8 1.838 1.988 2.04 2.14 2.242 2.347 2.39 2.47 2.554 2.657 2.73 2.802 2.905 3.001 3.087 3.163 3.22 3.304 3.413 3.504 3.597 3.69 3.764 3.839 3.902 3.97 4.059 4.158 4.247 4.308 4.396 4.469 4.479 4.458 4.404 4.286 4.052 3.654 2.995 1.86 0.311 -1.115 -2.301 -3.275 -4.173 -4.971 -5.64 -6.206 -6.762 -7.221 -7.621 -8.03 -8.44 -8.816 -9.153 -9.495 -9.808 -10.063 -10.323 -10.611 -10.864 -11.141 -11.413 -11.606 -11.797 -12.002 -12.234 -12.495 -12.67 -12.85 -13.126 -13.31 -13.504 -13.606 -13.854 -14.104 -14.33 -14.455 -14.701 -14.856 -15.003 -15.154 -15.483 -15.667 -15.857 -16.078 -16.322 -16.615 -17.033 -18.496 -9 ,11234 ,KEBNE ,16658272,Tue Nov 23 08:21:12 CET,Tue Nov 23 09:47:15 CET,0.0 0.498 0.728 0.903 1.074 1.209 1.304 1.384 1.537 1.611 1.678 1.696 1.843 1.897 2.014 2.142 2.259 2.31 2.406 2.492 2.602 2.67 2.734 2.827 2.911 2.987 3.062 3.148 3.255 3.348 3.434 3.54 3.628 3.704 3.8 3.898 3.978 4.044 4.104 4.184 4.262 4.336 4.411 4.457 4.494 4.474 4.35 4.126 3.777 3.172 1.986 0.413 -0.915 -2.034 -3.039 -3.971 -4.79 -5.519 -6.141 -6.766 -7.285 -7.757 -8.213 -8.621 -9.013 -9.371 -9.728 -10.044 -10.323 -10.622 -10.927 -11.174 -11.429 -11.713 -11.931 -12.161 -12.423 -12.684 -12.94 -13.112 -13.28 -13.534 -13.724 -13.941 -14.053 -14.278 -14.508 -14.747 -14.879 -15.134 -15.286 -15.427 -15.576 -15.913 -16.128 -16.344 -16.565 -16.824 -17.123 -17.512 -18.8 -10 ,4204 ,KEBNE ,16658273,Tue Nov 23 08:23:16 CET,Tue Nov 23 09:48:40 CET,0.0 0.339 0.566 0.749 0.919 1.058 1.168 1.262 1.423 1.507 1.601 1.655 1.812 1.875 1.986 2.075 2.163 2.211 2.302 2.385 2.489 2.56 2.636 2.744 2.85 2.949 3.036 3.112 3.207 3.302 3.401 3.512 3.608 3.695 3.785 3.887 3.991 4.089 4.17 4.246 4.322 4.41 4.48 4.498 4.494 4.483 4.42 4.263 3.917 3.323 2.247 0.846 -0.382 -1.504 -2.406 -3.158 -3.824 -4.43 -4.945 -5.465 -5.927 -6.313 -6.665 -7.035 -7.379 -7.685 -8.011 -8.311 -8.565 -8.826 -9.124 -9.381 -9.635 -9.884 -10.088 -10.298 -10.507 -10.723 -10.947 -11.11 -11.285 -11.545 -11.725 -11.922 -12.022 -12.237 -12.483 -12.74 -12.868 -13.103 -13.258 -13.41 -13.558 -13.891 -14.094 -14.303 -14.545 -14.807 -15.101 -15.488 -16.831 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_155.txt deleted file mode 100644 index af63cf4b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_155.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20622 ,KEBNE ,16658274,Tue Nov 23 08:23:15 CET,Tue Nov 23 09:48:14 CET,0.0 1.093 1.486 1.765 2.023 2.264 2.478 2.685 3.067 3.242 3.407 3.594 3.86 3.994 4.252 4.513 4.779 4.915 5.175 5.41 5.724 5.93 6.137 6.436 6.734 7.022 7.297 7.57 7.922 8.257 8.592 9.008 9.42 9.819 10.262 10.761 11.249 11.781 12.365 12.999 13.668 14.429 15.34 16.298 17.43 18.711 20.266 22.063 24.255 26.97 30.434 33.674 35.788 37.208 38.2 38.946 39.514 39.94 40.234 40.508 40.704 40.859 40.959 40.997 41.041 41.085 41.108 41.119 41.142 41.165 41.169 41.15 41.113 41.056 41.004 40.95 40.89 40.826 40.757 40.71 40.664 40.585 40.52 40.445 40.409 40.331 40.23 40.115 40.054 39.919 39.902 39.836 39.753 39.582 39.473 39.346 39.228 39.098 38.903 38.598 38.088 -2 ,20685 ,KEBNE ,16658275,Tue Nov 23 08:24:17 CET,Tue Nov 23 09:47:33 CET,0.0 1.004 1.389 1.66 1.879 2.065 2.262 2.47 2.852 3.007 3.147 3.318 3.589 3.724 3.961 4.199 4.442 4.565 4.797 5.02 5.365 5.588 5.792 6.068 6.349 6.629 6.907 7.183 7.517 7.832 8.157 8.565 8.944 9.309 9.745 10.237 10.718 11.264 11.864 12.498 13.163 13.939 14.853 15.779 16.882 18.147 19.694 21.503 23.7 26.483 30.058 33.206 35.229 36.65 37.689 38.465 39.044 39.47 39.763 40.031 40.2 40.324 40.468 40.581 40.652 40.713 40.773 40.782 40.779 40.801 40.809 40.798 40.787 40.757 40.724 40.667 40.584 40.499 40.419 40.378 40.334 40.241 40.163 40.089 40.057 39.991 39.917 39.836 39.786 39.658 39.635 39.565 39.494 39.329 39.226 39.118 38.98 38.827 38.652 38.366 37.482 -3 ,1841 ,KEBNE ,16658276,Tue Nov 23 08:24:17 CET,Tue Nov 23 09:45:46 CET,0.0 0.964 1.351 1.7 1.965 2.2 2.405 2.586 2.921 3.098 3.275 3.466 3.724 3.847 4.082 4.32 4.561 4.691 4.936 5.154 5.471 5.675 5.868 6.146 6.427 6.7 6.963 7.221 7.543 7.871 8.211 8.613 9.017 9.417 9.869 10.363 10.839 11.377 11.959 12.582 13.244 14.008 14.952 15.927 17.068 18.377 19.909 21.699 23.887 26.604 30.138 33.349 35.418 36.836 37.818 38.555 39.104 39.534 39.866 40.162 40.327 40.435 40.545 40.644 40.702 40.725 40.776 40.816 40.821 40.813 40.795 40.774 40.745 40.718 40.699 40.663 40.623 40.558 40.492 40.457 40.418 40.353 40.306 40.254 40.219 40.155 40.092 40.001 39.947 39.812 39.78 39.717 39.65 39.478 39.364 39.24 39.109 38.958 38.785 38.573 37.908 -5 ,21154 ,KEBNE ,16658278,Tue Nov 23 08:24:17 CET,Tue Nov 23 09:46:11 CET,0.0 1.103 1.526 1.829 2.103 2.334 2.536 2.728 3.067 3.217 3.36 3.521 3.783 3.922 4.19 4.441 4.688 4.808 5.035 5.262 5.601 5.821 6.023 6.31 6.592 6.873 7.154 7.435 7.786 8.106 8.421 8.807 9.204 9.601 10.042 10.551 11.051 11.585 12.177 12.841 13.546 14.337 15.282 16.269 17.408 18.727 20.315 22.153 24.36 27.054 30.593 33.752 35.771 37.194 38.196 38.955 39.521 39.962 40.31 40.622 40.821 40.961 41.078 41.164 41.218 41.25 41.29 41.324 41.33 41.315 41.302 41.282 41.263 41.262 41.248 41.198 41.139 41.084 41.04 41.012 40.969 40.899 40.845 40.775 40.737 40.648 40.55 40.453 40.396 40.257 40.195 40.123 40.048 39.868 39.779 39.676 39.555 39.414 39.229 38.968 38.346 -6 ,21503 ,KEBNE ,16658279,Tue Nov 23 08:24:17 CET,Tue Nov 23 09:46:56 CET,0.0 0.887 1.189 1.48 1.741 1.957 2.152 2.346 2.694 2.857 3.018 3.176 3.431 3.568 3.831 4.083 4.324 4.443 4.673 4.898 5.236 5.446 5.643 5.935 6.232 6.529 6.8 7.053 7.391 7.721 8.043 8.454 8.85 9.231 9.679 10.183 10.694 11.27 11.892 12.543 13.208 13.988 14.919 15.863 16.989 18.293 19.848 21.627 23.803 26.505 30.08 33.347 35.423 36.882 37.958 38.753 39.322 39.766 40.075 40.33 40.525 40.654 40.768 40.872 40.953 41.025 41.091 41.126 41.142 41.165 41.181 41.169 41.133 41.077 41.033 41.001 40.975 40.931 40.867 40.833 40.802 40.726 40.663 40.591 40.552 40.475 40.385 40.292 40.241 40.088 40.012 39.943 39.864 39.692 39.599 39.486 39.371 39.248 39.082 38.894 38.609 -7 ,9313 ,KEBNE ,16658280,Tue Nov 23 08:25:19 CET,Tue Nov 23 09:50:03 CET,0.0 1.125 1.541 1.827 2.074 2.284 2.48 2.669 3.008 3.174 3.347 3.54 3.809 3.943 4.205 4.464 4.686 4.801 5.027 5.248 5.578 5.777 5.976 6.283 6.59 6.884 7.162 7.422 7.776 8.125 8.455 8.871 9.271 9.655 10.095 10.61 11.115 11.653 12.243 12.89 13.58 14.374 15.332 16.291 17.418 18.684 20.189 22.008 24.237 27.032 30.64 33.804 35.853 37.267 38.245 38.975 39.539 39.97 40.303 40.572 40.755 40.918 41.048 41.156 41.215 41.248 41.304 41.344 41.361 41.375 41.38 41.351 41.291 41.222 41.183 41.155 41.126 41.091 41.034 40.985 40.945 40.873 40.814 40.747 40.707 40.628 40.56 40.487 40.439 40.305 40.272 40.205 40.133 39.931 39.821 39.727 39.611 39.449 39.244 38.968 38.512 -8 ,23695 ,KEBNE ,16658281,Tue Nov 23 08:25:19 CET,Tue Nov 23 09:50:01 CET,0.0 1.069 1.45 1.745 2.04 2.313 2.516 2.69 3.027 3.185 3.322 3.464 3.725 3.862 4.114 4.349 4.589 4.72 4.969 5.201 5.536 5.749 5.955 6.25 6.555 6.87 7.161 7.427 7.766 8.09 8.418 8.843 9.253 9.638 10.076 10.557 11.013 11.521 12.122 12.79 13.473 14.236 15.132 16.069 17.186 18.427 19.949 21.738 23.948 26.629 30.07 33.273 35.346 36.808 37.835 38.616 39.211 39.659 39.969 40.25 40.445 40.575 40.689 40.766 40.827 40.889 40.927 40.933 40.938 40.939 40.935 40.929 40.89 40.841 40.811 40.778 40.741 40.698 40.646 40.6 40.527 40.402 40.336 40.277 40.243 40.169 40.088 39.995 39.944 39.799 39.718 39.637 39.558 39.401 39.33 39.236 39.076 38.889 38.711 38.469 37.875 -9 ,8718 ,KEBNE ,16658282,Tue Nov 23 08:25:19 CET,Tue Nov 23 09:50:08 CET,0.0 0.857 1.173 1.431 1.661 1.878 2.099 2.307 2.656 2.816 2.977 3.149 3.402 3.541 3.822 4.083 4.334 4.449 4.66 4.871 5.191 5.4 5.6 5.897 6.182 6.451 6.724 6.994 7.352 7.701 8.042 8.472 8.886 9.268 9.71 10.216 10.697 11.219 11.818 12.461 13.119 13.884 14.797 15.733 16.87 18.188 19.746 21.517 23.633 26.325 29.817 32.929 35.002 36.441 37.429 38.158 38.71 39.159 39.449 39.69 39.895 40.052 40.181 40.265 40.322 40.366 40.405 40.442 40.474 40.493 40.482 40.471 40.469 40.442 40.412 40.391 40.357 40.319 40.281 40.234 40.173 40.083 40.02 39.962 39.93 39.849 39.775 39.694 39.642 39.507 39.468 39.393 39.31 39.14 39.036 38.914 38.781 38.635 38.456 38.19 37.606 -10 ,26731 ,KEBNE ,16658283,Tue Nov 23 08:26:20 CET,Tue Nov 23 09:49:10 CET,0.0 0.905 1.298 1.626 1.869 2.062 2.247 2.431 2.774 2.948 3.119 3.318 3.582 3.715 3.983 4.256 4.51 4.624 4.836 5.046 5.366 5.572 5.78 6.091 6.381 6.657 6.93 7.201 7.557 7.902 8.233 8.633 9.001 9.361 9.807 10.312 10.828 11.416 12.024 12.651 13.309 14.07 14.977 15.911 17.007 18.267 19.802 21.609 23.78 26.461 29.981 33.142 35.175 36.61 37.615 38.37 38.942 39.362 39.686 39.951 40.147 40.303 40.422 40.513 40.585 40.644 40.678 40.671 40.662 40.668 40.636 40.607 40.598 40.58 40.544 40.505 40.453 40.399 40.356 40.317 40.272 40.195 40.13 40.067 40.037 39.963 39.892 39.811 39.754 39.606 39.576 39.509 39.423 39.238 39.142 39.033 38.909 38.761 38.583 38.339 37.89 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_164.txt deleted file mode 100644 index 18438b9d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9733 ,KEBNE ,17069515,Fri Dec 24 06:33:10 CET,Fri Dec 24 08:00:51 CET,0.0 0.903 1.29 1.59 1.828 2.019 2.202 2.381 2.702 2.827 2.945 3.066 3.304 3.42 3.641 3.836 4.016 4.107 4.287 4.468 4.735 4.905 5.065 5.29 5.505 5.721 5.922 6.104 6.347 6.594 6.833 7.104 7.381 7.653 7.95 8.286 8.616 8.961 9.339 9.75 10.164 10.632 11.217 11.792 12.396 13.086 13.905 14.766 15.686 16.765 17.999 18.759 18.956 18.971 18.877 18.625 18.399 18.174 17.885 17.562 17.288 17.028 16.765 16.513 16.287 16.11 15.919 15.727 15.559 15.383 15.188 15.033 14.891 14.743 14.621 14.482 14.341 14.206 14.064 13.962 13.847 13.665 13.537 13.407 13.338 13.181 13.025 12.871 12.791 12.602 12.551 12.457 12.347 12.137 12.036 11.921 11.789 11.635 11.429 11.17 10.674 -2 ,18841 ,KEBNE ,17069517,Fri Dec 24 06:37:23 CET,Fri Dec 24 08:05:27 CET,0.0 0.991 1.299 1.539 1.724 1.907 2.086 2.25 2.54 2.677 2.809 2.926 3.163 3.283 3.511 3.724 3.929 4.028 4.217 4.392 4.638 4.802 4.962 5.204 5.437 5.662 5.87 6.068 6.324 6.577 6.831 7.14 7.423 7.678 7.983 8.352 8.704 9.075 9.489 9.914 10.348 10.84 11.408 11.994 12.67 13.391 14.184 15.017 15.974 17.028 18.07 18.716 18.872 18.799 18.686 18.498 18.257 18.009 17.783 17.585 17.405 17.224 17.032 16.839 16.668 16.521 16.37 16.219 16.084 15.933 15.766 15.63 15.48 15.322 15.212 15.102 14.98 14.839 14.681 14.586 14.487 14.311 14.191 14.064 13.997 13.854 13.701 13.534 13.449 13.263 13.2 13.11 13.013 12.803 12.679 12.537 12.398 12.267 12.089 11.796 11.063 -3 ,8532 ,KEBNE ,17069519,Fri Dec 24 06:39:30 CET,Fri Dec 24 08:06:56 CET,0.0 0.947 1.288 1.556 1.749 1.937 2.122 2.291 2.611 2.75 2.877 2.995 3.231 3.349 3.555 3.74 3.928 4.02 4.204 4.38 4.637 4.803 4.956 5.174 5.393 5.606 5.818 6.024 6.285 6.544 6.794 7.102 7.387 7.651 7.959 8.313 8.624 8.948 9.323 9.734 10.154 10.636 11.239 11.84 12.492 13.194 13.997 14.843 15.772 16.838 17.998 18.608 18.77 18.769 18.647 18.545 18.376 18.146 17.936 17.666 17.393 17.15 16.916 16.685 16.451 16.226 16.009 15.82 15.665 15.495 15.299 15.139 14.966 14.784 14.647 14.505 14.361 14.201 14.027 13.91 13.788 13.607 13.488 13.365 13.299 13.17 13.023 12.851 12.766 12.575 12.505 12.408 12.312 12.112 11.984 11.847 11.699 11.519 11.331 11.112 10.589 -4 ,19880 ,KEBNE ,17069521,Fri Dec 24 06:41:37 CET,Fri Dec 24 08:07:14 CET,0.0 1.046 1.344 1.581 1.806 2.026 2.211 2.374 2.696 2.846 2.983 3.115 3.356 3.477 3.712 3.928 4.128 4.22 4.406 4.588 4.846 5.005 5.16 5.391 5.606 5.819 6.031 6.227 6.484 6.74 6.972 7.231 7.488 7.748 8.056 8.414 8.763 9.124 9.505 9.912 10.327 10.786 11.326 11.887 12.534 13.221 13.99 14.83 15.715 16.706 17.783 18.385 18.444 18.332 18.15 17.912 17.721 17.531 17.339 17.123 16.899 16.681 16.466 16.273 16.103 15.922 15.726 15.563 15.419 15.265 15.094 14.936 14.779 14.609 14.476 14.353 14.224 14.09 13.94 13.831 13.718 13.541 13.409 13.273 13.212 13.112 12.998 12.861 12.786 12.595 12.528 12.434 12.335 12.147 12.048 11.933 11.788 11.601 11.423 11.199 10.595 -5 ,5733 ,KEBNE ,17069524,Fri Dec 24 06:47:59 CET,Fri Dec 24 08:13:59 CET,0.0 1.071 1.438 1.716 1.942 2.122 2.292 2.449 2.738 2.878 3.003 3.123 3.361 3.48 3.708 3.915 4.105 4.197 4.377 4.557 4.815 4.978 5.152 5.408 5.632 5.847 6.067 6.273 6.53 6.777 7.011 7.286 7.554 7.806 8.101 8.443 8.777 9.15 9.556 10.005 10.462 10.945 11.519 12.094 12.741 13.462 14.309 15.236 16.209 17.225 18.329 19.024 19.282 19.261 19.038 18.796 18.588 18.355 18.126 17.925 17.753 17.557 17.335 17.127 16.955 16.789 16.592 16.422 16.268 16.102 15.941 15.804 15.655 15.504 15.384 15.257 15.128 15.001 14.865 14.752 14.645 14.488 14.372 14.249 14.184 14.046 13.91 13.761 13.679 13.496 13.442 13.353 13.257 13.022 12.884 12.753 12.627 12.46 12.266 12.014 11.147 -6 ,4154 ,KEBNE ,17069525,Fri Dec 24 06:47:59 CET,Fri Dec 24 08:16:00 CET,0.0 0.982 1.327 1.594 1.812 1.991 2.168 2.346 2.671 2.813 2.943 3.061 3.309 3.428 3.657 3.885 4.081 4.172 4.35 4.526 4.781 4.951 5.117 5.349 5.575 5.79 6.005 6.213 6.478 6.758 7.026 7.331 7.61 7.879 8.193 8.524 8.862 9.251 9.628 10.015 10.448 10.966 11.564 12.112 12.71 13.344 14.049 14.827 15.595 16.282 16.934 17.185 17.003 16.719 16.406 16.078 15.775 15.47 15.215 14.925 14.655 14.44 14.232 14.02 13.805 13.598 13.384 13.19 13.02 12.832 12.625 12.462 12.298 12.125 11.992 11.863 11.726 11.576 11.418 11.313 11.212 11.043 10.924 10.797 10.731 10.59 10.438 10.278 10.187 9.982 9.889 9.789 9.699 9.493 9.37 9.234 9.092 8.945 8.776 8.55 7.744 -7 ,29969 ,KEBNE ,17069527,Fri Dec 24 06:49:02 CET,Fri Dec 24 08:16:40 CET,0.0 0.976 1.324 1.552 1.768 1.969 2.158 2.311 2.591 2.737 2.869 3.002 3.237 3.353 3.579 3.785 3.98 4.08 4.265 4.44 4.705 4.872 5.034 5.263 5.487 5.708 5.918 6.11 6.365 6.623 6.851 7.117 7.4 7.683 7.982 8.318 8.651 9.001 9.383 9.804 10.247 10.735 11.299 11.863 12.504 13.201 14.008 14.87 15.834 16.931 17.996 18.704 18.87 18.685 18.454 18.202 17.927 17.677 17.444 17.153 16.9 16.7 16.527 16.349 16.164 15.995 15.8 15.614 15.453 15.288 15.122 14.992 14.855 14.715 14.598 14.475 14.329 14.177 14.041 13.942 13.838 13.667 13.541 13.417 13.353 13.22 13.086 12.941 12.867 12.686 12.645 12.555 12.452 12.211 12.068 11.936 11.815 11.664 11.473 11.197 10.664 -8 ,5961 ,KEBNE ,17069530,Fri Dec 24 06:51:08 CET,Fri Dec 24 08:17:06 CET,0.0 0.875 1.203 1.464 1.705 1.926 2.104 2.249 2.514 2.653 2.794 2.942 3.185 3.301 3.521 3.718 3.906 3.995 4.172 4.354 4.622 4.794 4.952 5.181 5.407 5.622 5.835 6.039 6.299 6.552 6.802 7.098 7.386 7.666 7.982 8.32 8.639 8.992 9.381 9.826 10.288 10.788 11.363 11.937 12.572 13.262 14.054 14.883 15.826 16.918 18.108 18.809 19.046 18.997 18.8 18.591 18.362 18.136 17.883 17.605 17.385 17.162 16.966 16.792 16.601 16.425 16.249 16.08 15.927 15.764 15.573 15.406 15.25 15.108 14.988 14.858 14.728 14.585 14.419 14.305 14.197 14.039 13.927 13.799 13.733 13.605 13.476 13.336 13.26 13.075 13.007 12.912 12.818 12.606 12.487 12.358 12.225 12.067 11.869 11.57 10.864 -9 ,8824 ,KEBNE ,17069532,Fri Dec 24 06:52:11 CET,Fri Dec 24 08:17:58 CET,0.0 0.935 1.266 1.535 1.756 1.947 2.131 2.304 2.616 2.758 2.892 3.012 3.247 3.369 3.585 3.787 3.981 4.077 4.275 4.47 4.743 4.913 5.077 5.311 5.529 5.738 5.952 6.162 6.422 6.68 6.934 7.228 7.514 7.806 8.139 8.483 8.801 9.161 9.558 9.969 10.401 10.905 11.454 11.997 12.665 13.398 14.22 15.1 16.031 17.082 18.263 18.984 19.201 19.164 18.989 18.748 18.507 18.294 18.074 17.83 17.62 17.43 17.262 17.088 16.884 16.688 16.48 16.294 16.135 15.98 15.828 15.687 15.541 15.391 15.272 15.157 15.031 14.896 14.765 14.673 14.57 14.396 14.27 14.14 14.076 13.952 13.821 13.678 13.597 13.395 13.319 13.225 13.128 12.902 12.785 12.675 12.542 12.385 12.217 12.012 11.388 -10 ,9046 ,KEBNE ,17069534,Fri Dec 24 06:55:20 CET,Fri Dec 24 08:22:34 CET,0.0 1.022 1.401 1.678 1.905 2.1 2.288 2.45 2.727 2.865 3.001 3.127 3.363 3.482 3.702 3.918 4.133 4.235 4.423 4.599 4.859 5.025 5.188 5.429 5.649 5.847 6.045 6.239 6.491 6.744 6.989 7.279 7.565 7.837 8.148 8.499 8.839 9.225 9.626 10.043 10.476 10.965 11.537 12.1 12.784 13.531 14.34 15.227 16.185 17.251 18.355 18.882 19.112 19.143 18.953 18.673 18.35 18.016 17.714 17.404 17.139 16.916 16.678 16.441 16.224 16.03 15.827 15.621 15.46 15.294 15.112 14.971 14.814 14.642 14.513 14.383 14.255 14.109 13.953 13.857 13.745 13.561 13.437 13.305 13.241 13.103 12.951 12.789 12.707 12.527 12.465 12.37 12.271 12.048 11.926 11.795 11.671 11.544 11.357 11.133 10.762 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_256.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_256.txt deleted file mode 100644 index afd6267b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_256.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24191 ,KEBNE ,16658284,Tue Nov 23 08:27:22 CET,Tue Nov 23 09:53:09 CET,0.0 0.795 1.025 1.243 1.427 1.598 1.747 1.884 2.131 2.239 2.343 2.428 2.647 2.743 2.916 3.081 3.246 3.322 3.466 3.599 3.78 3.898 4.021 4.205 4.368 4.526 4.677 4.821 5.013 5.194 5.362 5.569 5.805 6.03 6.256 6.496 6.709 6.947 7.213 7.497 7.796 8.122 8.506 8.874 9.291 9.762 10.29 10.869 11.558 12.306 13.01 13.397 13.494 13.431 13.288 13.119 12.943 12.747 12.539 12.304 12.111 11.945 11.769 11.593 11.427 11.274 11.104 10.939 10.798 10.66 10.512 10.38 10.226 10.051 9.903 9.749 9.61 9.479 9.325 9.207 9.098 8.906 8.761 8.624 8.55 8.397 8.225 8.015 7.908 7.7 7.615 7.494 7.371 7.107 6.957 6.787 6.611 6.372 6.037 5.658 4.126 -2 ,15703 ,KEBNE ,16658285,Tue Nov 23 08:27:22 CET,Tue Nov 23 09:52:34 CET,0.0 0.596 0.861 1.087 1.283 1.427 1.576 1.705 1.951 2.073 2.184 2.267 2.479 2.574 2.756 2.921 3.059 3.13 3.281 3.425 3.635 3.76 3.87 4.026 4.182 4.341 4.504 4.648 4.823 5.002 5.179 5.37 5.57 5.77 5.971 6.225 6.47 6.718 6.99 7.278 7.582 7.929 8.33 8.708 9.13 9.61 10.143 10.707 11.337 12.052 12.77 13.202 13.297 13.198 13.054 12.882 12.685 12.489 12.3 12.102 11.938 11.783 11.596 11.413 11.253 11.09 10.901 10.725 10.571 10.411 10.237 10.083 9.938 9.795 9.666 9.526 9.383 9.242 9.091 8.971 8.851 8.678 8.558 8.431 8.357 8.207 8.062 7.913 7.831 7.623 7.515 7.393 7.262 6.982 6.818 6.643 6.474 6.288 6.054 5.751 4.803 -3 ,9059 ,KEBNE ,16658286,Tue Nov 23 08:27:22 CET,Tue Nov 23 09:49:43 CET,0.0 0.508 0.825 1.071 1.229 1.355 1.497 1.651 1.894 1.997 2.104 2.203 2.421 2.517 2.705 2.86 3.001 3.078 3.235 3.374 3.555 3.676 3.789 3.953 4.122 4.288 4.447 4.589 4.793 4.99 5.157 5.357 5.553 5.734 5.946 6.191 6.423 6.679 6.947 7.244 7.551 7.874 8.262 8.643 9.075 9.562 10.12 10.745 11.408 12.095 12.8 13.13 13.133 13.047 12.884 12.657 12.446 12.253 12.062 11.835 11.61 11.412 11.216 11.023 10.856 10.71 10.526 10.316 10.15 9.99 9.799 9.64 9.484 9.334 9.217 9.098 8.961 8.806 8.642 8.521 8.401 8.212 8.077 7.929 7.844 7.689 7.529 7.354 7.267 7.066 6.987 6.866 6.735 6.477 6.313 6.116 5.9 5.665 5.397 5.011 4.177 -4 ,11485 ,KEBNE ,16658287,Tue Nov 23 08:28:24 CET,Tue Nov 23 09:51:13 CET,0.0 0.837 1.134 1.397 1.633 1.824 1.992 2.136 2.394 2.517 2.622 2.687 2.906 3.007 3.182 3.347 3.521 3.612 3.786 3.954 4.176 4.314 4.457 4.643 4.8 4.956 5.101 5.24 5.42 5.608 5.788 5.985 6.182 6.379 6.613 6.869 7.104 7.372 7.651 7.929 8.228 8.563 8.957 9.348 9.78 10.253 10.812 11.426 12.092 12.781 13.455 13.857 13.92 13.87 13.738 13.543 13.328 13.095 12.887 12.666 12.459 12.266 12.062 11.864 11.683 11.507 11.337 11.163 10.994 10.832 10.663 10.518 10.37 10.215 10.101 9.962 9.803 9.655 9.505 9.391 9.268 9.089 8.958 8.814 8.737 8.574 8.396 8.208 8.11 7.891 7.778 7.656 7.528 7.266 7.113 6.925 6.732 6.543 6.307 5.951 4.545 -5 ,2486 ,KEBNE ,16658288,Tue Nov 23 08:28:24 CET,Tue Nov 23 09:50:24 CET,0.0 0.688 1.008 1.242 1.42 1.568 1.715 1.857 2.116 2.237 2.341 2.426 2.647 2.74 2.898 3.052 3.217 3.285 3.421 3.549 3.72 3.836 3.948 4.113 4.284 4.449 4.59 4.72 4.897 5.076 5.248 5.466 5.678 5.872 6.095 6.345 6.598 6.889 7.183 7.459 7.767 8.117 8.493 8.866 9.311 9.806 10.336 10.924 11.579 12.295 13.043 13.459 13.547 13.456 13.291 13.103 12.911 12.715 12.521 12.308 12.109 11.919 11.726 11.558 11.395 11.236 11.059 10.872 10.713 10.551 10.39 10.258 10.104 9.933 9.81 9.67 9.514 9.369 9.228 9.122 8.998 8.8 8.657 8.51 8.442 8.298 8.135 7.97 7.879 7.665 7.565 7.455 7.349 7.098 6.952 6.812 6.625 6.408 6.152 5.789 4.639 -6 ,12073 ,KEBNE ,16658289,Tue Nov 23 08:28:24 CET,Tue Nov 23 09:52:24 CET,0.0 0.527 0.832 1.066 1.253 1.432 1.581 1.704 1.974 2.088 2.185 2.245 2.457 2.539 2.691 2.843 3.007 3.085 3.22 3.36 3.563 3.682 3.793 3.964 4.138 4.302 4.459 4.607 4.79 4.987 5.18 5.379 5.57 5.768 6.005 6.257 6.48 6.73 7.007 7.282 7.567 7.894 8.293 8.696 9.131 9.61 10.16 10.75 11.418 12.103 12.877 13.338 13.379 13.246 13.055 12.843 12.643 12.43 12.208 11.975 11.778 11.596 11.409 11.228 11.045 10.862 10.67 10.495 10.344 10.199 10.053 9.922 9.768 9.6 9.48 9.355 9.216 9.057 8.897 8.793 8.683 8.503 8.369 8.235 8.173 8.024 7.853 7.679 7.584 7.381 7.298 7.188 7.078 6.814 6.658 6.484 6.292 6.094 5.86 5.531 4.551 -7 ,28335 ,KEBNE ,16658290,Tue Nov 23 08:29:25 CET,Tue Nov 23 09:52:34 CET,0.0 0.434 0.663 0.874 1.062 1.201 1.335 1.468 1.693 1.797 1.898 1.954 2.154 2.241 2.427 2.611 2.775 2.841 2.964 3.104 3.318 3.452 3.589 3.774 3.955 4.126 4.282 4.43 4.616 4.797 4.973 5.175 5.376 5.578 5.795 6.021 6.232 6.472 6.736 7.02 7.328 7.672 8.059 8.439 8.9 9.395 9.904 10.473 11.129 11.838 12.494 12.825 12.903 12.834 12.712 12.545 12.34 12.114 11.908 11.69 11.5 11.325 11.139 10.962 10.794 10.632 10.452 10.279 10.132 9.995 9.823 9.66 9.506 9.35 9.227 9.095 8.961 8.795 8.619 8.504 8.385 8.218 8.108 7.989 7.917 7.762 7.596 7.432 7.358 7.165 7.078 6.972 6.866 6.606 6.439 6.26 6.073 5.843 5.582 5.273 4.481 -8 ,21050 ,KEBNE ,16658291,Tue Nov 23 08:29:25 CET,Tue Nov 23 09:50:52 CET,0.0 0.832 1.134 1.37 1.559 1.709 1.837 1.967 2.188 2.284 2.385 2.457 2.681 2.78 2.95 3.109 3.261 3.333 3.468 3.588 3.748 3.858 3.973 4.144 4.316 4.481 4.634 4.781 4.967 5.138 5.305 5.508 5.693 5.872 6.08 6.303 6.536 6.793 7.056 7.359 7.688 8.037 8.42 8.782 9.203 9.676 10.233 10.845 11.484 12.165 12.872 13.283 13.342 13.275 13.131 12.948 12.748 12.52 12.331 12.12 11.899 11.71 11.523 11.329 11.136 10.961 10.762 10.562 10.399 10.248 10.091 9.966 9.825 9.656 9.525 9.379 9.229 9.069 8.908 8.806 8.684 8.473 8.32 8.169 8.099 7.973 7.833 7.649 7.551 7.346 7.279 7.178 7.05 6.764 6.6 6.424 6.25 6.031 5.77 5.452 4.282 -9 ,11366 ,KEBNE ,16658292,Tue Nov 23 08:29:25 CET,Tue Nov 23 09:52:54 CET,0.0 0.458 0.737 0.96 1.145 1.31 1.466 1.597 1.839 1.956 2.065 2.142 2.354 2.438 2.606 2.769 2.916 2.993 3.155 3.298 3.489 3.619 3.738 3.911 4.077 4.222 4.373 4.534 4.734 4.908 5.091 5.305 5.482 5.675 5.907 6.141 6.369 6.628 6.893 7.171 7.477 7.82 8.213 8.592 9.01 9.465 10.0 10.6 11.244 11.931 12.632 13.022 13.082 12.989 12.822 12.651 12.479 12.278 12.091 11.899 11.715 11.548 11.343 11.133 10.959 10.786 10.614 10.465 10.331 10.175 10.007 9.869 9.717 9.547 9.405 9.273 9.139 8.998 8.854 8.738 8.614 8.419 8.279 8.128 8.049 7.889 7.729 7.538 7.433 7.226 7.158 7.053 6.931 6.699 6.585 6.424 6.229 6.011 5.768 5.422 4.417 -10 ,4000 ,KEBNE ,16658293,Tue Nov 23 08:29:25 CET,Tue Nov 23 09:55:27 CET,0.0 0.636 0.898 1.092 1.262 1.401 1.536 1.676 1.942 2.066 2.162 2.23 2.448 2.546 2.724 2.883 3.038 3.113 3.239 3.366 3.575 3.692 3.82 4.008 4.164 4.309 4.458 4.611 4.808 5.002 5.187 5.391 5.578 5.761 5.985 6.236 6.471 6.751 7.071 7.403 7.736 8.107 8.542 8.943 9.376 9.872 10.416 10.985 11.643 12.351 13.075 13.545 13.649 13.567 13.43 13.27 13.082 12.877 12.67 12.453 12.243 12.026 11.82 11.638 11.449 11.258 11.082 10.934 10.807 10.662 10.502 10.361 10.209 10.047 9.897 9.745 9.606 9.431 9.218 9.076 8.95 8.774 8.657 8.528 8.446 8.266 8.092 7.931 7.843 7.643 7.575 7.456 7.329 7.04 6.892 6.747 6.556 6.345 6.102 5.77 4.855 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_336.txt deleted file mode 100644 index c6402b2d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8107 ,KEBNE ,16658294,Tue Nov 23 08:30:27 CET,Tue Nov 23 09:52:15 CET,0.0 0.586 0.834 1.038 1.208 1.374 1.516 1.634 1.841 1.938 2.036 2.127 2.352 2.446 2.616 2.787 2.943 3.014 3.17 3.317 3.508 3.631 3.76 3.935 4.097 4.273 4.447 4.601 4.789 4.973 5.16 5.395 5.618 5.839 6.11 6.399 6.661 6.954 7.255 7.576 7.95 8.356 8.79 9.217 9.692 10.216 10.817 11.449 12.139 12.988 13.924 14.391 14.51 14.527 14.491 14.413 14.244 14.054 13.893 13.697 13.504 13.32 13.151 13.007 12.856 12.678 12.473 12.288 12.142 12.002 11.856 11.717 11.552 11.391 11.271 11.153 11.026 10.877 10.723 10.633 10.548 10.387 10.261 10.122 10.052 9.917 9.763 9.607 9.526 9.316 9.252 9.166 9.063 8.828 8.687 8.552 8.423 8.251 8.034 7.781 7.003 -2 ,30814 ,KEBNE ,16658295,Tue Nov 23 08:30:26 CET,Tue Nov 23 09:52:03 CET,0.0 0.651 0.879 1.065 1.248 1.412 1.568 1.725 1.994 2.114 2.227 2.309 2.535 2.634 2.819 2.991 3.153 3.233 3.38 3.522 3.747 3.891 4.02 4.211 4.405 4.582 4.743 4.892 5.077 5.258 5.434 5.67 5.9 6.117 6.373 6.653 6.908 7.193 7.498 7.806 8.13 8.513 8.979 9.442 9.957 10.504 11.111 11.796 12.586 13.424 14.349 14.956 15.13 15.128 15.041 14.86 14.682 14.509 14.349 14.191 14.018 13.843 13.66 13.484 13.324 13.175 12.986 12.8 12.647 12.488 12.323 12.184 12.041 11.872 11.736 11.613 11.492 11.364 11.227 11.116 11.0 10.841 10.733 10.619 10.552 10.388 10.217 10.043 9.947 9.743 9.682 9.581 9.482 9.282 9.163 9.014 8.88 8.703 8.498 8.278 7.696 -3 ,11034 ,KEBNE ,16658296,Tue Nov 23 08:30:26 CET,Tue Nov 23 09:52:16 CET,0.0 0.706 0.972 1.182 1.364 1.51 1.671 1.831 2.097 2.221 2.338 2.428 2.65 2.747 2.928 3.105 3.287 3.37 3.513 3.652 3.854 3.98 4.113 4.325 4.518 4.67 4.82 4.971 5.172 5.396 5.617 5.853 6.073 6.29 6.525 6.784 7.057 7.37 7.677 7.996 8.318 8.665 9.082 9.501 9.996 10.542 11.16 11.837 12.605 13.466 14.342 14.793 14.914 14.911 14.793 14.622 14.465 14.286 14.117 13.939 13.757 13.58 13.41 13.251 13.111 12.984 12.833 12.683 12.526 12.328 12.128 11.981 11.829 11.675 11.564 11.437 11.296 11.169 11.025 10.916 10.819 10.656 10.534 10.409 10.34 10.196 10.057 9.914 9.828 9.623 9.546 9.454 9.364 9.137 9.006 8.864 8.706 8.518 8.322 8.069 7.456 -4 ,5750 ,KEBNE ,16658297,Tue Nov 23 08:32:30 CET,Tue Nov 23 09:55:32 CET,0.0 0.59 0.863 1.049 1.218 1.374 1.505 1.637 1.883 1.995 2.114 2.213 2.432 2.524 2.716 2.911 3.086 3.169 3.313 3.442 3.643 3.777 3.909 4.098 4.277 4.441 4.588 4.732 4.919 5.099 5.281 5.51 5.741 5.966 6.23 6.523 6.785 7.072 7.399 7.746 8.09 8.473 8.918 9.352 9.846 10.357 10.916 11.572 12.362 13.227 14.067 14.553 14.709 14.695 14.6 14.472 14.295 14.085 13.92 13.748 13.559 13.367 13.205 13.063 12.932 12.803 12.631 12.479 12.353 12.217 12.081 11.967 11.831 11.674 11.549 11.432 11.304 11.159 11.015 10.922 10.821 10.656 10.528 10.381 10.307 10.166 10.029 9.872 9.785 9.579 9.524 9.441 9.348 9.107 8.969 8.81 8.637 8.462 8.266 8.023 7.619 -5 ,14314 ,KEBNE ,16658298,Tue Nov 23 08:33:32 CET,Tue Nov 23 10:01:24 CET,0.0 0.753 1.012 1.234 1.417 1.569 1.719 1.868 2.132 2.257 2.381 2.499 2.727 2.824 3.021 3.213 3.391 3.476 3.647 3.811 4.03 4.173 4.323 4.52 4.698 4.887 5.073 5.234 5.43 5.616 5.805 6.05 6.275 6.503 6.759 7.021 7.277 7.557 7.881 8.225 8.565 8.938 9.372 9.826 10.352 10.929 11.521 12.158 12.951 13.828 14.753 15.255 15.337 15.302 15.22 15.072 14.905 14.73 14.553 14.35 14.149 13.957 13.77 13.602 13.433 13.274 13.111 12.949 12.814 12.683 12.538 12.405 12.276 12.137 12.015 11.896 11.761 11.609 11.469 11.372 11.262 11.101 11.009 10.911 10.85 10.705 10.549 10.376 10.281 10.078 10.019 9.924 9.821 9.582 9.452 9.313 9.154 8.954 8.715 8.395 7.855 -6 ,23979 ,KEBNE ,16658299,Tue Nov 23 08:33:33 CET,Tue Nov 23 09:55:28 CET,0.0 0.506 0.756 0.959 1.127 1.275 1.424 1.566 1.815 1.921 2.017 2.084 2.295 2.383 2.565 2.741 2.907 2.988 3.157 3.318 3.523 3.66 3.801 3.979 4.137 4.31 4.501 4.683 4.916 5.127 5.331 5.578 5.798 6.012 6.254 6.514 6.765 7.049 7.351 7.686 8.039 8.411 8.813 9.218 9.732 10.289 10.9 11.592 12.373 13.164 13.982 14.454 14.598 14.621 14.546 14.425 14.301 14.149 13.979 13.803 13.636 13.475 13.312 13.157 13.018 12.886 12.731 12.571 12.43 12.289 12.141 12.026 11.894 11.749 11.628 11.5 11.377 11.25 11.104 11.002 10.908 10.751 10.636 10.514 10.451 10.321 10.189 10.046 9.962 9.767 9.706 9.611 9.518 9.289 9.152 8.996 8.837 8.689 8.503 8.208 7.604 -7 ,31740 ,KEBNE ,16658300,Tue Nov 23 08:33:32 CET,Tue Nov 23 09:56:21 CET,0.0 0.409 0.741 0.939 1.116 1.285 1.422 1.549 1.771 1.874 1.971 2.036 2.255 2.353 2.533 2.693 2.844 2.919 3.072 3.217 3.429 3.576 3.721 3.925 4.122 4.305 4.484 4.659 4.865 5.056 5.251 5.487 5.708 5.922 6.187 6.487 6.758 7.065 7.384 7.694 8.019 8.396 8.826 9.254 9.744 10.268 10.865 11.524 12.293 13.155 14.046 14.579 14.755 14.767 14.676 14.518 14.354 14.197 14.028 13.828 13.657 13.49 13.329 13.185 13.011 12.845 12.707 12.575 12.438 12.301 12.16 12.027 11.878 11.736 11.627 11.51 11.38 11.248 11.091 10.979 10.881 10.712 10.587 10.454 10.383 10.248 10.109 9.95 9.874 9.677 9.618 9.517 9.413 9.189 9.056 8.928 8.791 8.637 8.478 8.224 7.556 -8 ,12796 ,KEBNE ,16658301,Tue Nov 23 08:33:32 CET,Tue Nov 23 10:00:21 CET,0.0 0.532 0.804 1.012 1.204 1.374 1.518 1.639 1.841 1.934 2.043 2.163 2.385 2.478 2.656 2.825 2.989 3.071 3.215 3.347 3.549 3.686 3.824 4.018 4.195 4.366 4.536 4.703 4.915 5.108 5.284 5.504 5.716 5.915 6.154 6.421 6.67 6.939 7.234 7.553 7.894 8.269 8.708 9.172 9.679 10.23 10.859 11.562 12.371 13.26 14.245 14.794 14.909 14.92 14.864 14.721 14.538 14.332 14.131 13.913 13.695 13.512 13.351 13.193 13.028 12.861 12.697 12.549 12.417 12.279 12.136 12.013 11.876 11.731 11.615 11.488 11.345 11.177 11.003 10.895 10.776 10.574 10.442 10.328 10.268 10.124 9.959 9.776 9.691 9.502 9.441 9.337 9.226 8.975 8.847 8.725 8.572 8.384 8.195 7.978 7.379 -9 ,20149 ,KEBNE ,16658302,Tue Nov 23 08:34:35 CET,Tue Nov 23 09:58:17 CET,0.0 0.465 0.741 0.954 1.129 1.28 1.423 1.573 1.847 1.965 2.079 2.179 2.416 2.529 2.722 2.88 3.03 3.103 3.244 3.398 3.626 3.769 3.904 4.092 4.283 4.461 4.624 4.797 5.012 5.199 5.384 5.623 5.849 6.059 6.309 6.589 6.847 7.127 7.427 7.739 8.054 8.415 8.85 9.296 9.8 10.327 10.952 11.669 12.449 13.294 14.192 14.728 14.929 14.937 14.834 14.72 14.603 14.443 14.259 14.043 13.867 13.714 13.563 13.414 13.265 13.118 12.941 12.791 12.667 12.519 12.381 12.263 12.125 11.989 11.876 11.754 11.621 11.478 11.333 11.223 11.111 10.949 10.83 10.708 10.637 10.49 10.349 10.184 10.102 9.901 9.816 9.72 9.621 9.371 9.223 9.063 8.89 8.709 8.506 8.284 7.918 -10 ,31942 ,KEBNE ,16658303,Tue Nov 23 08:35:36 CET,Tue Nov 23 09:57:14 CET,0.0 0.611 0.868 1.115 1.317 1.48 1.636 1.788 2.074 2.199 2.304 2.374 2.595 2.69 2.868 3.028 3.197 3.282 3.436 3.577 3.769 3.903 4.047 4.25 4.428 4.6 4.775 4.939 5.129 5.304 5.476 5.685 5.892 6.12 6.386 6.656 6.901 7.169 7.488 7.827 8.165 8.553 8.991 9.428 9.933 10.499 11.097 11.738 12.542 13.436 14.337 14.826 14.9 14.848 14.729 14.573 14.409 14.228 14.036 13.839 13.669 13.502 13.339 13.157 12.971 12.784 12.587 12.431 12.297 12.142 11.987 11.859 11.721 11.574 11.442 11.305 11.166 11.013 10.856 10.758 10.663 10.522 10.413 10.287 10.209 10.04 9.89 9.742 9.665 9.461 9.373 9.269 9.16 8.884 8.74 8.608 8.467 8.321 8.136 7.875 7.238 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_67.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_67.txt deleted file mode 100644 index 435d9d33..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_252_67.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,634 ,KEBNE ,16658304,Tue Nov 23 08:36:38 CET,Tue Nov 23 09:57:57 CET,0.0 0.393 0.612 0.815 0.999 1.165 1.307 1.458 1.788 1.943 2.085 2.232 2.48 2.608 2.872 3.13 3.378 3.5 3.739 3.97 4.305 4.527 4.747 5.077 5.401 5.71 6.017 6.323 6.719 7.114 7.506 7.989 8.474 8.958 9.511 10.129 10.742 11.427 12.191 13.045 13.989 15.085 16.389 17.763 19.446 21.357 23.685 26.49 29.992 34.442 40.314 45.743 49.298 51.806 53.677 55.116 56.169 57.017 57.665 58.214 58.636 58.963 59.254 59.527 59.748 59.897 60.03 60.142 60.215 60.29 60.363 60.395 60.416 60.441 60.451 60.463 60.453 60.418 60.394 60.373 60.324 60.225 60.161 60.081 60.038 59.959 59.882 59.792 59.724 59.607 59.53 59.45 59.358 59.149 59.013 58.845 58.652 58.435 58.191 57.895 56.737 -2 ,21045 ,KEBNE ,16658305,Tue Nov 23 08:36:38 CET,Tue Nov 23 10:02:44 CET,0.0 0.692 0.959 1.167 1.345 1.519 1.69 1.839 2.138 2.291 2.432 2.576 2.826 2.949 3.182 3.417 3.66 3.779 4.017 4.252 4.593 4.816 5.036 5.353 5.662 5.973 6.281 6.589 7.001 7.402 7.796 8.277 8.748 9.222 9.79 10.457 11.11 11.84 12.655 13.507 14.411 15.474 16.781 18.165 19.825 21.751 24.083 26.868 30.366 34.766 40.551 45.934 49.516 52.018 53.835 55.208 56.205 57.018 57.651 58.193 58.617 58.956 59.227 59.447 59.643 59.813 59.935 60.011 60.081 60.148 60.185 60.204 60.226 60.232 60.234 60.244 60.241 60.212 60.17 60.142 60.114 60.059 60.019 59.954 59.916 59.842 59.728 59.613 59.568 59.459 59.345 59.255 59.158 58.916 58.799 58.693 58.544 58.33 58.071 57.663 56.22 -3 ,17154 ,KEBNE ,16658306,Tue Nov 23 08:36:38 CET,Tue Nov 23 10:00:35 CET,0.0 0.566 0.862 1.066 1.249 1.426 1.602 1.77 2.093 2.234 2.367 2.52 2.777 2.906 3.158 3.405 3.647 3.767 4.006 4.242 4.579 4.801 5.025 5.364 5.692 6.005 6.312 6.618 7.025 7.415 7.799 8.289 8.771 9.23 9.776 10.409 11.035 11.752 12.561 13.439 14.363 15.45 16.772 18.134 19.786 21.712 24.023 26.754 30.194 34.616 40.466 45.834 49.351 51.778 53.51 54.854 55.858 56.638 57.235 57.766 58.147 58.435 58.687 58.89 59.085 59.254 59.394 59.504 59.581 59.631 59.655 59.687 59.726 59.741 59.742 59.737 59.73 59.716 59.697 59.68 59.645 59.57 59.5 59.44 59.418 59.374 59.304 59.195 59.141 59.034 58.932 58.839 58.746 58.542 58.418 58.265 58.096 57.92 57.682 57.298 56.147 -4 ,10758 ,KEBNE ,16658307,Tue Nov 23 08:36:38 CET,Tue Nov 23 10:04:30 CET,0.0 0.886 1.122 1.32 1.505 1.664 1.821 1.987 2.279 2.411 2.55 2.716 2.971 3.1 3.349 3.58 3.812 3.931 4.156 4.379 4.727 4.969 5.204 5.525 5.845 6.163 6.483 6.803 7.205 7.594 7.996 8.484 8.957 9.432 10.002 10.647 11.284 12.012 12.805 13.674 14.609 15.708 17.033 18.421 20.127 22.085 24.441 27.294 30.827 35.229 41.048 46.396 49.904 52.364 54.123 55.451 56.486 57.303 57.938 58.506 58.934 59.265 59.526 59.763 59.958 60.114 60.254 60.354 60.44 60.529 60.587 60.61 60.633 60.648 60.652 60.645 60.628 60.594 60.562 60.534 60.483 60.405 60.344 60.277 60.251 60.188 60.111 60.012 59.948 59.833 59.745 59.674 59.599 59.429 59.316 59.165 58.993 58.766 58.527 58.201 56.476 -5 ,22317 ,KEBNE ,16658308,Tue Nov 23 08:36:38 CET,Tue Nov 23 10:04:43 CET,0.0 0.56 0.818 1.022 1.204 1.394 1.572 1.731 2.033 2.176 2.315 2.472 2.727 2.857 3.112 3.354 3.61 3.736 3.956 4.173 4.506 4.72 4.93 5.249 5.567 5.877 6.183 6.492 6.892 7.28 7.668 8.141 8.6 9.055 9.613 10.26 10.883 11.57 12.331 13.192 14.144 15.243 16.57 17.961 19.635 21.566 23.881 26.666 30.134 34.54 40.426 45.847 49.412 51.828 53.608 55.026 56.064 56.845 57.446 57.998 58.407 58.755 59.068 59.302 59.496 59.657 59.807 59.927 59.996 60.045 60.091 60.116 60.133 60.142 60.134 60.119 60.122 60.107 60.069 60.049 60.017 59.946 59.898 59.852 59.833 59.776 59.706 59.617 59.557 59.444 59.346 59.275 59.192 58.969 58.841 58.701 58.549 58.359 58.114 57.775 56.879 -6 ,23873 ,KEBNE ,16658309,Tue Nov 23 08:37:39 CET,Tue Nov 23 09:58:39 CET,0.0 0.657 0.931 1.146 1.32 1.486 1.639 1.783 2.088 2.236 2.373 2.515 2.764 2.901 3.169 3.412 3.651 3.767 3.989 4.223 4.584 4.817 5.045 5.378 5.706 6.032 6.351 6.656 7.066 7.476 7.865 8.348 8.839 9.321 9.88 10.52 11.158 11.865 12.637 13.501 14.447 15.557 16.891 18.272 19.952 21.9 24.248 26.995 30.44 34.857 40.751 46.116 49.614 52.145 53.96 55.297 56.345 57.152 57.739 58.289 58.719 59.067 59.336 59.547 59.753 59.928 60.071 60.183 60.26 60.314 60.375 60.423 60.453 60.468 60.474 60.473 60.46 60.446 60.423 60.392 60.364 60.317 60.262 60.206 60.174 60.091 59.998 59.907 59.852 59.735 59.618 59.537 59.474 59.309 59.199 59.066 58.902 58.678 58.386 58.02 56.772 -7 ,30152 ,KEBNE ,16658310,Tue Nov 23 08:38:41 CET,Tue Nov 23 10:06:03 CET,0.0 0.395 0.658 0.876 1.072 1.24 1.402 1.56 1.846 1.99 2.14 2.3 2.557 2.692 2.953 3.186 3.423 3.544 3.778 4.014 4.355 4.572 4.786 5.115 5.448 5.777 6.091 6.393 6.799 7.188 7.562 8.029 8.501 8.975 9.531 10.166 10.798 11.513 12.297 13.151 14.089 15.187 16.502 17.877 19.592 21.588 23.948 26.766 30.295 34.704 40.467 45.778 49.285 51.704 53.43 54.785 55.818 56.631 57.255 57.808 58.252 58.615 58.91 59.155 59.351 59.514 59.669 59.785 59.867 59.926 59.975 60.002 60.025 60.04 60.039 60.031 60.012 59.987 59.962 59.943 59.919 59.877 59.829 59.754 59.718 59.664 59.592 59.49 59.437 59.328 59.228 59.135 59.039 58.834 58.71 58.579 58.414 58.2 57.928 57.527 56.015 -8 ,26168 ,KEBNE ,16658311,Tue Nov 23 08:38:41 CET,Tue Nov 23 10:07:09 CET,0.0 0.92 1.19 1.427 1.627 1.792 1.952 2.099 2.37 2.504 2.632 2.761 3.013 3.147 3.398 3.637 3.879 4.0 4.238 4.467 4.795 5.014 5.226 5.547 5.875 6.187 6.488 6.787 7.183 7.58 7.973 8.456 8.938 9.415 9.973 10.62 11.252 11.954 12.73 13.581 14.504 15.592 16.931 18.325 20.034 22.003 24.295 27.085 30.671 35.177 41.119 46.53 50.068 52.55 54.359 55.802 56.896 57.707 58.308 58.849 59.277 59.608 59.876 60.108 60.3 60.443 60.572 60.689 60.777 60.845 60.9 60.942 60.985 61.012 61.012 61.006 60.99 60.971 60.937 60.907 60.871 60.806 60.762 60.693 60.651 60.562 60.458 60.359 60.309 60.192 60.088 60.008 59.92 59.723 59.617 59.462 59.277 59.09 58.841 58.468 57.218 -9 ,13885 ,KEBNE ,16658312,Tue Nov 23 08:39:44 CET,Tue Nov 23 10:05:05 CET,0.0 0.67 0.916 1.108 1.279 1.455 1.621 1.785 2.084 2.221 2.358 2.51 2.768 2.901 3.165 3.424 3.661 3.777 4.009 4.23 4.57 4.794 5.006 5.324 5.64 5.953 6.261 6.562 6.967 7.373 7.768 8.253 8.733 9.209 9.785 10.466 11.112 11.807 12.594 13.464 14.402 15.476 16.748 18.103 19.781 21.731 24.064 26.857 30.315 34.706 40.615 45.985 49.546 52.105 54.006 55.43 56.434 57.244 57.874 58.43 58.892 59.257 59.54 59.778 59.972 60.133 60.262 60.357 60.442 60.515 60.572 60.604 60.623 60.636 60.651 60.663 60.642 60.59 60.54 60.513 60.481 60.416 60.377 60.339 60.312 60.232 60.14 60.032 59.977 59.887 59.827 59.743 59.658 59.44 59.317 59.19 59.01 58.778 58.478 58.058 56.578 -10 ,15906 ,KEBNE ,16658313,Tue Nov 23 08:39:44 CET,Tue Nov 23 10:02:39 CET,0.0 0.431 0.644 0.86 1.064 1.251 1.42 1.563 1.832 1.969 2.101 2.247 2.504 2.631 2.893 3.152 3.404 3.524 3.749 3.972 4.299 4.515 4.731 5.049 5.37 5.687 5.995 6.302 6.698 7.096 7.496 7.969 8.438 8.903 9.459 10.106 10.745 11.465 12.249 13.108 14.057 15.17 16.505 17.906 19.585 21.52 23.879 26.68 30.125 34.491 40.425 45.9 49.43 51.919 53.744 55.165 56.206 57.042 57.693 58.243 58.643 58.961 59.216 59.436 59.648 59.825 59.968 60.063 60.14 60.209 60.276 60.315 60.337 60.344 60.342 60.332 60.321 60.303 60.27 60.26 60.242 60.181 60.134 60.084 60.056 60.001 59.936 59.839 59.786 59.676 59.563 59.478 59.395 59.198 59.071 58.908 58.708 58.491 58.264 57.923 56.483 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_254_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_254_163.txt deleted file mode 100644 index 4607c039..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_254_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31936 ,KEBNE ,16658314,Tue Nov 23 08:39:44 CET,Tue Nov 23 10:02:16 CET,0.0 0.362 0.52 0.638 0.758 0.897 1.047 1.181 1.41 1.505 1.581 1.622 1.802 1.881 2.016 2.147 2.274 2.328 2.436 2.555 2.718 2.819 2.905 3.027 3.145 3.245 3.364 3.497 3.632 3.761 3.908 4.065 4.203 4.328 4.471 4.633 4.788 4.957 5.109 5.246 5.39 5.553 5.72 5.875 6.016 6.131 6.24 6.297 6.219 5.907 5.253 4.241 3.275 2.4 1.623 0.948 0.358 -0.175 -0.629 -1.103 -1.532 -1.906 -2.252 -2.592 -2.905 -3.175 -3.452 -3.684 -3.9 -4.149 -4.396 -4.607 -4.837 -5.077 -5.264 -5.449 -5.648 -5.855 -6.053 -6.189 -6.327 -6.544 -6.704 -6.872 -6.957 -7.132 -7.333 -7.534 -7.627 -7.838 -7.949 -8.067 -8.194 -8.466 -8.624 -8.775 -8.937 -9.148 -9.427 -9.827 -10.722 -2 ,23806 ,KEBNE ,16658315,Tue Nov 23 08:39:44 CET,Tue Nov 23 10:03:38 CET,0.0 0.916 1.24 1.477 1.665 1.835 1.998 2.135 2.367 2.475 2.569 2.634 2.825 2.915 3.083 3.228 3.357 3.419 3.546 3.671 3.836 3.934 4.028 4.16 4.282 4.405 4.527 4.646 4.798 4.929 5.047 5.184 5.32 5.467 5.624 5.791 5.964 6.14 6.298 6.433 6.604 6.817 6.993 7.129 7.261 7.393 7.535 7.64 7.606 7.319 6.6 5.511 4.536 3.721 2.977 2.335 1.773 1.212 0.718 0.262 -0.111 -0.428 -0.729 -1.016 -1.272 -1.529 -1.784 -2.014 -2.215 -2.412 -2.63 -2.818 -3.008 -3.211 -3.365 -3.51 -3.668 -3.847 -4.024 -4.15 -4.283 -4.484 -4.63 -4.791 -4.871 -5.02 -5.179 -5.351 -5.447 -5.658 -5.754 -5.872 -5.987 -6.221 -6.35 -6.501 -6.686 -6.922 -7.222 -7.617 -8.407 -3 ,9376 ,KEBNE ,16658316,Tue Nov 23 08:40:46 CET,Tue Nov 23 10:06:41 CET,0.0 0.326 0.51 0.705 0.88 1.013 1.138 1.254 1.465 1.557 1.634 1.672 1.847 1.926 2.083 2.217 2.337 2.398 2.506 2.61 2.762 2.854 2.945 3.08 3.219 3.337 3.446 3.559 3.702 3.833 3.951 4.086 4.218 4.33 4.455 4.599 4.728 4.873 5.012 5.146 5.29 5.465 5.635 5.763 5.869 5.96 6.058 6.062 5.956 5.725 5.125 4.153 3.223 2.399 1.667 0.971 0.359 -0.175 -0.623 -1.091 -1.517 -1.89 -2.244 -2.589 -2.899 -3.186 -3.49 -3.753 -3.984 -4.217 -4.47 -4.677 -4.884 -5.099 -5.266 -5.445 -5.627 -5.815 -6.024 -6.165 -6.308 -6.538 -6.707 -6.892 -6.982 -7.155 -7.335 -7.52 -7.614 -7.82 -7.921 -8.042 -8.169 -8.433 -8.586 -8.746 -8.924 -9.11 -9.318 -9.615 -10.97 -4 ,13739 ,KEBNE ,16658317,Tue Nov 23 08:40:45 CET,Tue Nov 23 10:09:10 CET,0.0 0.914 1.155 1.319 1.493 1.656 1.781 1.906 2.151 2.272 2.383 2.47 2.659 2.735 2.886 3.039 3.178 3.242 3.366 3.489 3.672 3.784 3.887 4.029 4.177 4.321 4.45 4.577 4.724 4.863 4.993 5.143 5.301 5.445 5.59 5.738 5.886 6.065 6.247 6.421 6.6 6.78 6.958 7.117 7.284 7.425 7.529 7.577 7.507 7.196 6.487 5.543 4.638 3.767 3.029 2.372 1.79 1.241 0.76 0.255 -0.196 -0.565 -0.892 -1.213 -1.523 -1.774 -2.023 -2.254 -2.45 -2.658 -2.878 -3.064 -3.271 -3.491 -3.655 -3.819 -3.989 -4.162 -4.341 -4.474 -4.616 -4.828 -4.984 -5.164 -5.249 -5.396 -5.55 -5.724 -5.824 -6.031 -6.103 -6.208 -6.332 -6.625 -6.794 -6.95 -7.118 -7.33 -7.583 -7.9 -8.753 -5 ,2809 ,KEBNE ,16658318,Tue Nov 23 08:40:46 CET,Tue Nov 23 10:09:51 CET,0.0 0.594 0.835 1.032 1.192 1.323 1.44 1.554 1.771 1.885 1.98 2.006 2.175 2.253 2.41 2.562 2.712 2.78 2.919 3.041 3.2 3.298 3.384 3.514 3.641 3.753 3.864 3.98 4.115 4.238 4.367 4.514 4.64 4.767 4.923 5.079 5.228 5.408 5.566 5.728 5.903 6.064 6.21 6.332 6.48 6.607 6.728 6.779 6.652 6.356 5.654 4.568 3.585 2.732 2.017 1.374 0.775 0.196 -0.3 -0.759 -1.137 -1.511 -1.896 -2.247 -2.562 -2.825 -3.108 -3.363 -3.59 -3.84 -4.092 -4.301 -4.52 -4.735 -4.908 -5.1 -5.297 -5.504 -5.717 -5.859 -6.005 -6.244 -6.405 -6.553 -6.633 -6.809 -6.998 -7.203 -7.306 -7.513 -7.612 -7.732 -7.863 -8.141 -8.304 -8.489 -8.684 -8.91 -9.156 -9.44 -10.452 -6 ,2358 ,KEBNE ,16658319,Tue Nov 23 08:40:46 CET,Tue Nov 23 10:04:23 CET,0.0 0.652 1.022 1.326 1.516 1.666 1.798 1.912 2.12 2.212 2.296 2.338 2.521 2.605 2.749 2.874 2.988 3.039 3.144 3.248 3.391 3.477 3.556 3.679 3.792 3.898 4.002 4.105 4.243 4.371 4.493 4.633 4.748 4.869 5.025 5.192 5.341 5.504 5.655 5.797 5.949 6.09 6.234 6.397 6.572 6.681 6.759 6.805 6.758 6.514 5.833 4.844 3.878 2.967 2.19 1.528 0.938 0.388 -0.083 -0.542 -0.931 -1.276 -1.615 -1.951 -2.264 -2.545 -2.849 -3.13 -3.359 -3.586 -3.816 -4.003 -4.2 -4.402 -4.558 -4.72 -4.885 -5.054 -5.231 -5.366 -5.503 -5.712 -5.857 -6.006 -6.087 -6.248 -6.429 -6.606 -6.699 -6.919 -7.011 -7.118 -7.24 -7.5 -7.635 -7.781 -7.953 -8.168 -8.434 -8.757 -9.501 -7 ,12108 ,KEBNE ,16658320,Tue Nov 23 08:40:45 CET,Tue Nov 23 10:09:56 CET,0.0 0.38 0.631 0.804 0.92 1.026 1.156 1.281 1.475 1.565 1.643 1.681 1.856 1.925 2.045 2.155 2.267 2.319 2.427 2.528 2.667 2.766 2.857 2.985 3.109 3.226 3.335 3.441 3.577 3.694 3.805 3.929 4.034 4.141 4.297 4.469 4.617 4.764 4.896 5.045 5.198 5.343 5.484 5.638 5.806 5.945 6.045 6.107 6.109 5.843 5.068 3.996 3.05 2.19 1.428 0.692 0.055 -0.487 -0.946 -1.402 -1.807 -2.193 -2.573 -2.913 -3.215 -3.495 -3.788 -4.042 -4.279 -4.536 -4.783 -4.98 -5.195 -5.431 -5.609 -5.788 -5.964 -6.154 -6.365 -6.509 -6.654 -6.874 -7.034 -7.202 -7.282 -7.442 -7.636 -7.851 -7.956 -8.175 -8.293 -8.408 -8.535 -8.849 -9.03 -9.199 -9.351 -9.528 -9.747 -10.047 -11.101 -8 ,226 ,KEBNE ,16658321,Tue Nov 23 08:41:47 CET,Tue Nov 23 10:05:17 CET,0.0 0.887 1.213 1.413 1.575 1.714 1.841 1.961 2.172 2.259 2.345 2.427 2.616 2.694 2.853 3.003 3.128 3.183 3.3 3.425 3.623 3.74 3.837 3.96 4.083 4.221 4.343 4.446 4.575 4.697 4.836 5.014 5.167 5.302 5.457 5.624 5.776 5.922 6.067 6.236 6.391 6.539 6.701 6.89 7.083 7.21 7.302 7.353 7.335 7.102 6.398 5.377 4.464 3.623 2.865 2.181 1.589 1.048 0.587 0.127 -0.264 -0.624 -0.982 -1.311 -1.611 -1.887 -2.179 -2.48 -2.737 -2.961 -3.2 -3.404 -3.614 -3.837 -4.007 -4.18 -4.362 -4.544 -4.737 -4.878 -5.02 -5.237 -5.381 -5.534 -5.616 -5.783 -5.978 -6.193 -6.295 -6.514 -6.664 -6.809 -6.95 -7.223 -7.362 -7.509 -7.683 -7.884 -8.125 -8.459 -9.599 -9 ,22307 ,KEBNE ,16658322,Tue Nov 23 08:41:47 CET,Tue Nov 23 10:05:24 CET,0.0 0.91 1.18 1.377 1.529 1.691 1.854 1.978 2.163 2.247 2.34 2.419 2.609 2.682 2.807 2.928 3.057 3.123 3.256 3.392 3.563 3.661 3.754 3.896 4.034 4.159 4.285 4.411 4.561 4.683 4.794 4.931 5.064 5.193 5.34 5.469 5.588 5.754 5.919 6.068 6.208 6.355 6.524 6.678 6.82 6.933 7.046 7.124 7.095 6.822 6.184 5.277 4.36 3.557 2.842 2.177 1.604 1.077 0.605 0.138 -0.275 -0.664 -1.048 -1.405 -1.725 -2.008 -2.298 -2.575 -2.82 -3.055 -3.287 -3.492 -3.72 -3.962 -4.134 -4.304 -4.497 -4.7 -4.908 -5.063 -5.224 -5.441 -5.584 -5.743 -5.831 -6.018 -6.211 -6.419 -6.532 -6.751 -6.874 -6.999 -7.122 -7.406 -7.565 -7.729 -7.914 -8.132 -8.378 -8.715 -9.931 -10 ,10410 ,KEBNE ,16658323,Tue Nov 23 08:41:47 CET,Tue Nov 23 10:11:13 CET,0.0 0.463 0.744 0.922 1.054 1.183 1.307 1.426 1.614 1.699 1.791 1.865 2.045 2.121 2.27 2.431 2.575 2.632 2.758 2.886 3.044 3.142 3.237 3.383 3.519 3.647 3.767 3.874 4.036 4.186 4.311 4.45 4.565 4.669 4.81 4.969 5.11 5.276 5.461 5.63 5.776 5.928 6.102 6.247 6.392 6.523 6.595 6.576 6.446 6.197 5.593 4.59 3.625 2.825 2.123 1.444 0.82 0.265 -0.192 -0.652 -1.05 -1.417 -1.769 -2.102 -2.42 -2.701 -2.997 -3.274 -3.508 -3.749 -3.998 -4.199 -4.416 -4.651 -4.832 -5.011 -5.205 -5.409 -5.619 -5.758 -5.89 -6.104 -6.25 -6.403 -6.487 -6.659 -6.841 -7.034 -7.14 -7.365 -7.497 -7.629 -7.766 -8.046 -8.213 -8.387 -8.564 -8.774 -9.003 -9.348 -10.877 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_254_251.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_254_251.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_254_251.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_254_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_254_252.txt deleted file mode 100644 index f92bee80..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_254_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22505 ,KEBNE ,17069536,Fri Dec 24 06:57:25 CET,Fri Dec 24 08:24:48 CET,0.0 0.434 0.652 0.835 0.983 1.117 1.261 1.39 1.614 1.713 1.799 1.864 2.043 2.113 2.264 2.407 2.517 2.565 2.652 2.736 2.848 2.908 2.968 3.057 3.157 3.263 3.355 3.449 3.579 3.7 3.798 3.904 4.008 4.072 4.151 4.282 4.388 4.458 4.518 4.57 4.62 4.667 4.715 4.774 4.806 4.798 4.724 4.549 4.279 3.716 2.523 0.971 -0.303 -1.379 -2.287 -3.095 -3.808 -4.455 -5.031 -5.603 -6.059 -6.46 -6.858 -7.229 -7.61 -7.939 -8.269 -8.588 -8.853 -9.123 -9.41 -9.641 -9.885 -10.159 -10.371 -10.572 -10.786 -11.034 -11.279 -11.445 -11.628 -11.916 -12.11 -12.314 -12.427 -12.665 -12.915 -13.169 -13.291 -13.539 -13.7 -13.852 -14.003 -14.344 -14.55 -14.769 -15.008 -15.298 -15.627 -16.05 -17.643 -2 ,7540 ,KEBNE ,17069538,Fri Dec 24 07:03:45 CET,Fri Dec 24 08:29:44 CET,0.0 0.461 0.702 0.895 1.046 1.166 1.286 1.406 1.595 1.677 1.75 1.771 1.937 2.003 2.132 2.237 2.324 2.374 2.478 2.574 2.715 2.796 2.865 2.974 3.066 3.155 3.248 3.335 3.445 3.539 3.634 3.741 3.836 3.92 4.018 4.144 4.252 4.346 4.431 4.521 4.609 4.68 4.731 4.765 4.743 4.699 4.618 4.407 4.056 3.413 2.154 0.639 -0.624 -1.778 -2.821 -3.702 -4.427 -5.042 -5.587 -6.158 -6.633 -7.059 -7.449 -7.824 -8.209 -8.565 -8.919 -9.231 -9.496 -9.783 -10.079 -10.328 -10.61 -10.893 -11.105 -11.326 -11.554 -11.785 -12.043 -12.217 -12.379 -12.65 -12.864 -13.084 -13.197 -13.442 -13.699 -13.945 -14.062 -14.308 -14.467 -14.626 -14.797 -15.146 -15.324 -15.53 -15.76 -16.033 -16.391 -16.85 -17.977 -3 ,10127 ,KEBNE ,17069540,Fri Dec 24 07:09:02 CET,Fri Dec 24 08:35:45 CET,0.0 0.465 0.643 0.784 0.906 1.035 1.147 1.244 1.446 1.534 1.614 1.668 1.835 1.896 1.998 2.09 2.176 2.219 2.31 2.403 2.544 2.632 2.706 2.818 2.935 3.03 3.116 3.196 3.297 3.39 3.465 3.559 3.65 3.725 3.807 3.896 3.997 4.101 4.185 4.268 4.349 4.423 4.498 4.544 4.541 4.497 4.385 4.194 3.828 3.162 1.915 0.285 -1.166 -2.37 -3.346 -4.248 -5.052 -5.787 -6.426 -7.063 -7.593 -8.061 -8.501 -8.905 -9.295 -9.656 -10.033 -10.38 -10.68 -10.986 -11.287 -11.54 -11.808 -12.089 -12.304 -12.526 -12.766 -13.011 -13.269 -13.445 -13.625 -13.904 -14.092 -14.296 -14.406 -14.632 -14.868 -15.105 -15.221 -15.461 -15.603 -15.752 -15.904 -16.226 -16.415 -16.614 -16.872 -17.162 -17.46 -17.876 -19.333 -4 ,16967 ,KEBNE ,17069542,Fri Dec 24 07:17:34 CET,Fri Dec 24 08:43:57 CET,0.0 0.347 0.541 0.711 0.869 1.013 1.127 1.223 1.394 1.48 1.558 1.587 1.759 1.831 1.967 2.076 2.182 2.238 2.334 2.431 2.571 2.647 2.728 2.852 2.945 3.028 3.123 3.221 3.311 3.384 3.477 3.582 3.665 3.754 3.855 3.945 4.022 4.101 4.166 4.236 4.316 4.385 4.441 4.459 4.45 4.43 4.324 4.138 3.811 3.162 1.873 0.216 -1.115 -2.256 -3.269 -4.145 -4.893 -5.595 -6.226 -6.837 -7.381 -7.87 -8.343 -8.783 -9.19 -9.534 -9.864 -10.155 -10.411 -10.689 -10.966 -11.188 -11.419 -11.667 -11.863 -12.058 -12.256 -12.476 -12.712 -12.879 -13.065 -13.362 -13.555 -13.762 -13.867 -14.094 -14.316 -14.545 -14.671 -14.906 -15.042 -15.19 -15.349 -15.698 -15.892 -16.106 -16.35 -16.616 -16.899 -17.246 -18.263 -5 ,17938 ,KEBNE ,17069545,Fri Dec 24 07:18:38 CET,Fri Dec 24 08:46:27 CET,0.0 0.394 0.664 0.912 1.108 1.25 1.363 1.459 1.623 1.703 1.772 1.791 1.97 2.046 2.179 2.289 2.382 2.423 2.511 2.598 2.723 2.797 2.866 2.981 3.094 3.19 3.283 3.381 3.487 3.585 3.675 3.774 3.883 3.98 4.085 4.203 4.289 4.362 4.435 4.529 4.622 4.698 4.754 4.798 4.837 4.795 4.701 4.578 4.293 3.732 2.647 1.211 0.001 -1.072 -2.05 -2.934 -3.651 -4.272 -4.822 -5.384 -5.897 -6.352 -6.771 -7.171 -7.517 -7.818 -8.149 -8.482 -8.768 -9.019 -9.284 -9.527 -9.78 -10.037 -10.239 -10.455 -10.69 -10.923 -11.15 -11.304 -11.471 -11.762 -11.954 -12.151 -12.254 -12.465 -12.691 -12.921 -13.046 -13.299 -13.46 -13.601 -13.743 -14.05 -14.238 -14.46 -14.706 -14.992 -15.328 -15.749 -17.116 -6 ,16062 ,KEBNE ,17069546,Fri Dec 24 07:20:46 CET,Fri Dec 24 08:48:54 CET,0.0 0.685 0.934 1.141 1.283 1.386 1.487 1.587 1.773 1.849 1.916 1.942 2.106 2.154 2.244 2.354 2.458 2.5 2.589 2.681 2.804 2.878 2.952 3.056 3.147 3.231 3.303 3.371 3.465 3.56 3.65 3.751 3.848 3.944 4.051 4.145 4.21 4.296 4.396 4.47 4.532 4.593 4.648 4.688 4.7 4.681 4.585 4.378 4.024 3.38 2.198 0.6 -0.807 -1.982 -2.997 -3.911 -4.695 -5.388 -5.997 -6.619 -7.17 -7.646 -8.09 -8.52 -8.924 -9.282 -9.662 -10.003 -10.294 -10.597 -10.908 -11.168 -11.444 -11.736 -11.954 -12.176 -12.404 -12.641 -12.905 -13.089 -13.273 -13.552 -13.741 -13.94 -14.049 -14.272 -14.494 -14.752 -14.881 -15.127 -15.285 -15.442 -15.609 -15.958 -16.133 -16.347 -16.612 -16.863 -17.156 -17.645 -19.074 -7 ,16147 ,KEBNE ,17069548,Fri Dec 24 07:21:50 CET,Fri Dec 24 08:49:46 CET,0.0 0.663 0.925 1.137 1.318 1.467 1.587 1.69 1.85 1.93 2.013 2.047 2.217 2.279 2.406 2.528 2.631 2.677 2.765 2.844 2.952 3.018 3.082 3.186 3.289 3.391 3.475 3.545 3.65 3.747 3.829 3.946 4.064 4.163 4.273 4.379 4.461 4.535 4.58 4.629 4.696 4.752 4.816 4.911 4.975 4.932 4.82 4.597 4.204 3.549 2.305 0.69 -0.681 -1.884 -2.923 -3.832 -4.63 -5.369 -6.029 -6.693 -7.252 -7.74 -8.195 -8.61 -8.985 -9.337 -9.724 -10.069 -10.37 -10.698 -11.026 -11.279 -11.547 -11.825 -12.042 -12.275 -12.509 -12.75 -13.008 -13.182 -13.363 -13.657 -13.878 -14.112 -14.226 -14.452 -14.685 -14.931 -15.063 -15.326 -15.528 -15.678 -15.827 -16.183 -16.383 -16.598 -16.818 -17.058 -17.373 -17.817 -19.523 -8 ,6401 ,KEBNE ,17069550,Fri Dec 24 07:23:57 CET,Fri Dec 24 08:51:58 CET,0.0 0.573 0.793 0.963 1.102 1.249 1.39 1.5 1.683 1.775 1.869 1.926 2.1 2.161 2.293 2.421 2.53 2.576 2.668 2.764 2.886 2.963 3.042 3.166 3.297 3.419 3.512 3.594 3.697 3.794 3.887 3.985 4.073 4.17 4.258 4.335 4.42 4.524 4.63 4.729 4.815 4.887 4.927 4.95 4.958 4.926 4.865 4.73 4.433 3.863 2.771 1.396 0.211 -0.825 -1.712 -2.49 -3.181 -3.808 -4.365 -4.951 -5.501 -6.031 -6.517 -6.951 -7.346 -7.703 -8.069 -8.389 -8.671 -8.968 -9.287 -9.552 -9.826 -10.115 -10.337 -10.573 -10.822 -11.071 -11.331 -11.501 -11.682 -11.979 -12.187 -12.404 -12.513 -12.749 -12.988 -13.227 -13.356 -13.612 -13.768 -13.912 -14.068 -14.418 -14.621 -14.851 -15.078 -15.322 -15.636 -16.057 -17.445 -9 ,3125 ,KEBNE ,17069551,Fri Dec 24 07:25:01 CET,Fri Dec 24 08:52:48 CET,0.0 0.413 0.591 0.71 0.827 0.974 1.11 1.214 1.396 1.476 1.541 1.556 1.722 1.784 1.898 2.019 2.145 2.195 2.295 2.393 2.521 2.606 2.681 2.781 2.884 2.974 3.056 3.138 3.225 3.308 3.404 3.51 3.593 3.671 3.787 3.915 4.012 4.107 4.196 4.289 4.368 4.43 4.47 4.474 4.469 4.43 4.356 4.213 3.918 3.378 2.277 0.816 -0.378 -1.389 -2.268 -3.081 -3.784 -4.406 -4.978 -5.553 -6.045 -6.471 -6.878 -7.264 -7.624 -7.963 -8.321 -8.637 -8.913 -9.198 -9.494 -9.742 -10.003 -10.304 -10.542 -10.775 -11.021 -11.272 -11.523 -11.693 -11.879 -12.168 -12.35 -12.546 -12.649 -12.868 -13.102 -13.339 -13.468 -13.721 -13.866 -14.016 -14.183 -14.558 -14.754 -14.958 -15.193 -15.434 -15.708 -16.117 -17.473 -10 ,23336 ,KEBNE ,17069553,Fri Dec 24 07:27:10 CET,Fri Dec 24 08:55:09 CET,0.0 0.282 0.436 0.6 0.745 0.881 0.999 1.099 1.285 1.372 1.445 1.481 1.671 1.748 1.851 1.943 2.033 2.082 2.184 2.273 2.401 2.478 2.537 2.628 2.723 2.803 2.874 2.947 3.03 3.111 3.203 3.313 3.408 3.511 3.624 3.709 3.783 3.87 3.952 4.016 4.084 4.164 4.239 4.277 4.301 4.293 4.206 4.06 3.743 3.171 2.134 0.756 -0.474 -1.508 -2.42 -3.292 -4.019 -4.633 -5.173 -5.728 -6.188 -6.6 -7.023 -7.447 -7.838 -8.178 -8.539 -8.874 -9.163 -9.442 -9.732 -10.003 -10.28 -10.548 -10.76 -10.978 -11.207 -11.45 -11.7 -11.87 -12.044 -12.31 -12.496 -12.7 -12.808 -13.029 -13.262 -13.517 -13.652 -13.9 -14.045 -14.201 -14.36 -14.678 -14.865 -15.076 -15.317 -15.593 -15.91 -16.345 -17.824 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_256_67.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_256_67.txt deleted file mode 100644 index 6963eb9b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_256_67.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24552 ,KEBNE ,16658334,Tue Nov 23 08:46:56 CET,Tue Nov 23 10:15:12 CET,0.0 0.329 0.555 0.746 0.93 1.093 1.25 1.42 1.724 1.86 1.996 2.139 2.381 2.51 2.754 2.989 3.215 3.331 3.566 3.774 4.071 4.276 4.484 4.784 5.082 5.373 5.668 5.962 6.331 6.68 7.022 7.458 7.889 8.299 8.784 9.347 9.915 10.571 11.294 12.07 12.901 13.882 15.097 16.37 17.888 19.663 21.824 24.368 27.477 31.391 36.653 41.434 44.451 46.614 48.264 49.577 50.563 51.331 51.922 52.451 52.857 53.172 53.441 53.658 53.838 53.98 54.108 54.224 54.297 54.354 54.4 54.427 54.453 54.469 54.481 54.487 54.478 54.463 54.442 54.425 54.405 54.372 54.346 54.307 54.285 54.233 54.172 54.101 54.056 53.956 53.891 53.823 53.752 53.597 53.499 53.375 53.252 53.106 52.904 52.657 51.742 -2 ,3563 ,KEBNE ,16658335,Tue Nov 23 08:47:58 CET,Tue Nov 23 10:08:56 CET,0.0 0.529 0.788 1.003 1.182 1.357 1.503 1.64 1.919 2.055 2.181 2.309 2.541 2.662 2.903 3.127 3.343 3.451 3.671 3.889 4.191 4.39 4.592 4.891 5.176 5.457 5.733 6.005 6.37 6.737 7.104 7.559 8.006 8.436 8.935 9.516 10.09 10.738 11.454 12.233 13.086 14.088 15.313 16.602 18.133 19.893 22.015 24.547 27.709 31.709 37.014 41.83 45.056 47.319 48.969 50.236 51.188 51.975 52.568 53.061 53.439 53.759 54.021 54.231 54.417 54.576 54.717 54.823 54.896 54.971 55.037 55.074 55.11 55.127 55.135 55.138 55.133 55.125 55.097 55.066 55.03 54.985 54.949 54.893 54.863 54.815 54.762 54.686 54.641 54.545 54.493 54.437 54.372 54.202 54.093 53.976 53.846 53.67 53.46 53.184 52.412 -3 ,16252 ,KEBNE ,16658336,Tue Nov 23 08:47:58 CET,Tue Nov 23 10:08:46 CET,0.0 0.536 0.787 0.962 1.114 1.257 1.411 1.57 1.859 1.992 2.126 2.274 2.513 2.631 2.848 3.069 3.295 3.409 3.643 3.873 4.195 4.399 4.603 4.913 5.214 5.506 5.789 6.077 6.459 6.839 7.225 7.684 8.115 8.536 9.043 9.634 10.196 10.816 11.528 12.316 13.146 14.104 15.264 16.477 17.957 19.673 21.743 24.219 27.325 31.223 36.23 40.854 43.892 46.026 47.591 48.845 49.805 50.577 51.191 51.723 52.097 52.389 52.653 52.889 53.088 53.24 53.377 53.467 53.539 53.621 53.698 53.757 53.782 53.789 53.817 53.838 53.844 53.838 53.819 53.798 53.772 53.723 53.688 53.658 53.64 53.593 53.542 53.473 53.428 53.333 53.281 53.226 53.161 53.015 52.937 52.834 52.709 52.549 52.343 52.094 51.246 -4 ,31182 ,KEBNE ,16658337,Tue Nov 23 08:47:58 CET,Tue Nov 23 10:10:56 CET,0.0 0.658 0.895 1.074 1.235 1.397 1.543 1.674 1.938 2.067 2.199 2.342 2.572 2.691 2.927 3.154 3.375 3.485 3.703 3.911 4.217 4.43 4.641 4.931 5.217 5.505 5.779 6.053 6.421 6.778 7.14 7.59 8.035 8.47 8.993 9.596 10.176 10.828 11.55 12.333 13.184 14.17 15.329 16.519 17.984 19.697 21.731 24.26 27.46 31.437 36.739 41.615 44.774 47.018 48.698 49.983 50.908 51.623 52.183 52.679 53.049 53.334 53.6 53.845 54.048 54.187 54.294 54.389 54.461 54.526 54.591 54.644 54.686 54.715 54.73 54.73 54.729 54.718 54.697 54.674 54.641 54.582 54.548 54.515 54.492 54.441 54.382 54.322 54.288 54.197 54.153 54.091 54.026 53.868 53.768 53.664 53.543 53.382 53.162 52.932 52.398 -5 ,11473 ,KEBNE ,16658338,Tue Nov 23 08:47:58 CET,Tue Nov 23 10:10:25 CET,0.0 0.317 0.555 0.762 0.933 1.096 1.254 1.401 1.698 1.838 1.971 2.113 2.36 2.489 2.744 2.98 3.201 3.313 3.527 3.741 4.064 4.274 4.48 4.778 5.07 5.361 5.643 5.921 6.289 6.651 7.009 7.446 7.873 8.314 8.85 9.44 10.031 10.692 11.398 12.163 12.989 13.948 15.1 16.283 17.723 19.44 21.526 23.979 27.023 30.881 35.939 40.588 43.568 45.666 47.243 48.494 49.403 50.101 50.665 51.167 51.537 51.844 52.092 52.295 52.461 52.574 52.695 52.81 52.895 52.953 53.013 53.061 53.078 53.1 53.126 53.153 53.161 53.133 53.1 53.089 53.073 53.04 53.013 52.977 52.956 52.903 52.822 52.732 52.693 52.602 52.553 52.492 52.414 52.236 52.127 52.004 51.878 51.725 51.542 51.244 50.56 -6 ,10289 ,KEBNE ,16658339,Tue Nov 23 08:48:59 CET,Tue Nov 23 10:10:29 CET,0.0 0.745 1.015 1.237 1.415 1.586 1.743 1.89 2.168 2.309 2.442 2.574 2.815 2.933 3.159 3.391 3.629 3.743 3.959 4.179 4.509 4.721 4.93 5.232 5.522 5.81 6.099 6.388 6.758 7.118 7.489 7.95 8.391 8.823 9.33 9.913 10.478 11.107 11.8 12.56 13.394 14.365 15.527 16.711 18.168 19.924 21.999 24.426 27.542 31.557 36.776 41.637 44.874 47.155 48.834 50.115 51.062 51.8 52.374 52.886 53.255 53.551 53.805 53.994 54.154 54.299 54.412 54.493 54.578 54.656 54.715 54.757 54.794 54.818 54.82 54.791 54.766 54.766 54.743 54.707 54.675 54.628 54.579 54.521 54.491 54.43 54.366 54.297 54.25 54.14 54.065 54.005 53.946 53.786 53.687 53.583 53.46 53.322 53.137 52.803 52.023 -7 ,14988 ,KEBNE ,16658340,Tue Nov 23 08:48:59 CET,Tue Nov 23 10:11:32 CET,0.0 0.495 0.757 0.974 1.153 1.312 1.455 1.592 1.884 2.024 2.154 2.293 2.528 2.649 2.897 3.136 3.359 3.468 3.69 3.909 4.227 4.428 4.623 4.92 5.216 5.511 5.8 6.075 6.446 6.825 7.188 7.629 8.068 8.504 9.016 9.6 10.173 10.812 11.52 12.292 13.139 14.133 15.329 16.576 18.089 19.852 21.965 24.468 27.579 31.49 36.824 41.767 44.856 46.992 48.572 49.792 50.706 51.44 52.01 52.5 52.858 53.147 53.408 53.644 53.849 54.006 54.141 54.232 54.303 54.392 54.455 54.505 54.568 54.597 54.596 54.593 54.587 54.574 54.558 54.534 54.492 54.424 54.381 54.324 54.299 54.252 54.195 54.131 54.096 54.004 53.943 53.878 53.811 53.656 53.548 53.433 53.319 53.174 53.0 52.756 52.171 -8 ,16854 ,KEBNE ,16658341,Tue Nov 23 08:49:00 CET,Tue Nov 23 10:17:31 CET,0.0 0.571 0.811 1.001 1.163 1.32 1.47 1.617 1.901 2.036 2.169 2.312 2.545 2.662 2.901 3.126 3.333 3.439 3.648 3.858 4.174 4.377 4.581 4.886 5.173 5.446 5.724 5.998 6.356 6.714 7.072 7.509 7.939 8.383 8.909 9.487 10.054 10.687 11.393 12.185 13.025 13.997 15.204 16.441 17.896 19.629 21.738 24.24 27.387 31.451 36.785 41.674 44.928 47.19 48.807 50.019 50.928 51.66 52.226 52.729 53.102 53.409 53.662 53.87 54.054 54.2 54.346 54.442 54.49 54.538 54.593 54.626 54.64 54.664 54.68 54.676 54.668 54.645 54.62 54.609 54.587 54.539 54.5 54.447 54.417 54.352 54.29 54.228 54.19 54.098 54.046 53.98 53.906 53.741 53.64 53.53 53.38 53.208 53.011 52.745 52.092 -9 ,1626 ,KEBNE ,16658342,Tue Nov 23 08:49:00 CET,Tue Nov 23 10:16:42 CET,0.0 0.37 0.611 0.815 1.01 1.178 1.326 1.465 1.727 1.856 1.981 2.121 2.357 2.477 2.714 2.936 3.155 3.266 3.481 3.692 3.996 4.191 4.395 4.696 4.978 5.257 5.545 5.841 6.218 6.576 6.93 7.359 7.791 8.215 8.713 9.3 9.883 10.552 11.295 12.084 12.939 13.94 15.153 16.417 17.928 19.68 21.796 24.288 27.412 31.361 36.598 41.544 44.728 46.917 48.517 49.753 50.719 51.463 52.004 52.49 52.875 53.207 53.48 53.695 53.885 54.031 54.169 54.296 54.398 54.475 54.544 54.6 54.646 54.669 54.677 54.681 54.677 54.661 54.647 54.632 54.611 54.569 54.521 54.463 54.438 54.399 54.34 54.251 54.208 54.126 54.09 54.033 53.965 53.819 53.725 53.611 53.483 53.322 53.109 52.798 51.932 -10 ,29837 ,KEBNE ,16658343,Tue Nov 23 08:48:59 CET,Tue Nov 23 10:11:05 CET,0.0 0.482 0.76 0.963 1.114 1.256 1.403 1.547 1.811 1.943 2.06 2.179 2.411 2.535 2.777 2.998 3.213 3.32 3.542 3.759 4.08 4.285 4.489 4.799 5.099 5.39 5.674 5.954 6.318 6.692 7.053 7.488 7.925 8.363 8.869 9.43 9.986 10.623 11.332 12.114 12.986 13.998 15.204 16.455 17.969 19.736 21.855 24.37 27.508 31.431 36.58 41.301 44.303 46.339 47.834 49.009 49.907 50.647 51.243 51.778 52.176 52.487 52.743 52.953 53.141 53.297 53.444 53.572 53.663 53.728 53.784 53.824 53.852 53.866 53.877 53.895 53.905 53.888 53.878 53.871 53.849 53.795 53.756 53.725 53.707 53.654 53.586 53.506 53.465 53.373 53.326 53.268 53.202 53.048 52.972 52.868 52.72 52.575 52.408 52.165 51.342 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_266_224.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_266_224.txt deleted file mode 100644 index 238f3547..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_266_224.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29486 ,KEBNE ,16658344,Tue Nov 23 08:48:59 CET,Tue Nov 23 10:12:45 CET,0.0 0.501 0.707 0.824 0.919 1.007 1.087 1.168 1.303 1.365 1.428 1.474 1.597 1.656 1.769 1.865 1.96 2.004 2.085 2.182 2.353 2.46 2.544 2.67 2.803 2.916 3.018 3.127 3.29 3.45 3.58 3.722 3.868 4.015 4.185 4.371 4.55 4.75 4.982 5.232 5.468 5.712 5.963 6.219 6.542 6.824 7.113 7.41 7.598 7.665 7.416 6.519 5.498 4.639 3.856 3.131 2.487 1.884 1.367 0.842 0.387 -0.036 -0.451 -0.817 -1.152 -1.482 -1.841 -2.147 -2.395 -2.665 -2.977 -3.233 -3.487 -3.77 -3.997 -4.22 -4.438 -4.656 -4.902 -5.081 -5.264 -5.533 -5.736 -5.955 -6.065 -6.287 -6.518 -6.767 -6.894 -7.1 -7.315 -7.464 -7.633 -8.011 -8.229 -8.448 -8.663 -8.941 -9.298 -9.746 -11.43 -2 ,794 ,KEBNE ,16658345,Tue Nov 23 08:48:59 CET,Tue Nov 23 10:10:33 CET,0.0 0.74 0.932 1.098 1.263 1.414 1.56 1.706 1.958 2.066 2.154 2.28 2.431 2.5 2.664 2.827 2.963 3.025 3.14 3.257 3.433 3.542 3.638 3.777 3.926 4.073 4.215 4.343 4.499 4.659 4.813 4.978 5.148 5.33 5.534 5.745 5.927 6.134 6.379 6.618 6.827 7.058 7.328 7.605 7.901 8.154 8.386 8.656 8.885 8.882 8.495 7.701 6.89 6.151 5.373 4.602 3.949 3.344 2.83 2.321 1.87 1.465 1.069 0.696 0.335 -0.012 -0.362 -0.661 -0.915 -1.181 -1.472 -1.728 -1.993 -2.287 -2.504 -2.708 -2.931 -3.174 -3.426 -3.603 -3.799 -4.088 -4.284 -4.5 -4.607 -4.829 -5.085 -5.358 -5.502 -5.718 -5.935 -6.096 -6.275 -6.672 -6.883 -7.129 -7.422 -7.746 -8.142 -8.617 -10.195 -3 ,24339 ,KEBNE ,16658346,Tue Nov 23 08:50:01 CET,Tue Nov 23 10:15:06 CET,0.0 0.672 0.94 1.165 1.369 1.528 1.654 1.774 2.014 2.121 2.221 2.347 2.497 2.575 2.732 2.876 3.013 3.088 3.231 3.355 3.529 3.648 3.754 3.905 4.065 4.213 4.347 4.484 4.659 4.819 4.984 5.177 5.357 5.522 5.7 5.911 6.102 6.298 6.515 6.762 7.017 7.268 7.55 7.825 8.152 8.498 8.771 9.009 9.245 9.339 8.988 8.15 7.327 6.523 5.713 4.939 4.285 3.689 3.165 2.62 2.14 1.712 1.284 0.919 0.592 0.266 -0.067 -0.358 -0.622 -0.905 -1.206 -1.475 -1.756 -2.044 -2.268 -2.481 -2.706 -2.959 -3.221 -3.413 -3.614 -3.893 -4.082 -4.284 -4.393 -4.638 -4.874 -5.13 -5.271 -5.485 -5.714 -5.867 -6.034 -6.416 -6.62 -6.849 -7.093 -7.376 -7.763 -8.262 -9.901 -4 ,16310 ,KEBNE ,16658347,Tue Nov 23 08:50:01 CET,Tue Nov 23 10:13:47 CET,0.0 0.751 1.026 1.213 1.335 1.434 1.521 1.615 1.808 1.886 1.96 2.035 2.167 2.226 2.331 2.44 2.557 2.609 2.699 2.783 2.908 2.993 3.087 3.226 3.341 3.451 3.558 3.663 3.812 3.953 4.093 4.278 4.451 4.615 4.793 4.995 5.183 5.386 5.613 5.828 6.043 6.299 6.562 6.798 7.093 7.397 7.716 8.003 8.2 8.232 7.809 6.952 6.065 5.211 4.422 3.719 3.053 2.414 1.863 1.318 0.84 0.428 0.036 -0.366 -0.743 -1.1 -1.46 -1.767 -2.044 -2.32 -2.625 -2.895 -3.169 -3.44 -3.645 -3.865 -4.099 -4.334 -4.587 -4.764 -4.949 -5.24 -5.431 -5.637 -5.747 -5.965 -6.208 -6.477 -6.612 -6.824 -7.063 -7.221 -7.393 -7.796 -8.004 -8.217 -8.491 -8.803 -9.174 -9.629 -11.391 -5 ,12461 ,KEBNE ,16658348,Tue Nov 23 08:51:04 CET,Tue Nov 23 10:14:02 CET,0.0 1.268 1.424 1.59 1.761 1.89 1.986 2.071 2.24 2.33 2.425 2.552 2.706 2.798 2.966 3.112 3.249 3.312 3.449 3.588 3.779 3.908 4.026 4.176 4.32 4.461 4.59 4.716 4.885 5.042 5.192 5.372 5.549 5.713 5.893 6.111 6.337 6.572 6.8 7.016 7.235 7.476 7.752 8.023 8.3 8.55 8.808 9.072 9.293 9.407 9.12 8.274 7.361 6.494 5.722 5.018 4.327 3.666 3.113 2.586 2.15 1.748 1.347 0.962 0.61 0.287 -0.071 -0.4 -0.684 -0.978 -1.276 -1.506 -1.752 -2.044 -2.276 -2.512 -2.758 -3.014 -3.273 -3.441 -3.624 -3.927 -4.137 -4.347 -4.458 -4.709 -4.966 -5.235 -5.377 -5.596 -5.837 -5.995 -6.166 -6.519 -6.719 -6.956 -7.214 -7.482 -7.845 -8.396 -10.32 -6 ,20536 ,KEBNE ,16658349,Tue Nov 23 08:51:04 CET,Tue Nov 23 10:12:48 CET,0.0 0.602 0.87 1.06 1.196 1.313 1.415 1.496 1.645 1.72 1.793 1.873 2.02 2.094 2.235 2.378 2.511 2.568 2.675 2.78 2.946 3.061 3.165 3.313 3.475 3.649 3.812 3.951 4.107 4.257 4.418 4.605 4.778 4.95 5.16 5.387 5.589 5.798 6.019 6.26 6.499 6.754 7.035 7.286 7.574 7.884 8.151 8.385 8.585 8.564 8.216 7.487 6.616 5.779 4.965 4.193 3.534 2.952 2.43 1.906 1.469 1.078 0.681 0.273 -0.094 -0.414 -0.745 -1.028 -1.285 -1.571 -1.867 -2.114 -2.359 -2.606 -2.809 -3.027 -3.248 -3.491 -3.747 -3.92 -4.112 -4.393 -4.594 -4.811 -4.92 -5.151 -5.379 -5.627 -5.764 -5.974 -6.209 -6.378 -6.562 -6.971 -7.184 -7.403 -7.67 -7.969 -8.331 -8.902 -10.681 -7 ,21554 ,KEBNE ,16658350,Tue Nov 23 08:51:04 CET,Tue Nov 23 10:17:03 CET,0.0 0.788 1.082 1.28 1.442 1.57 1.687 1.804 2.013 2.09 2.17 2.282 2.427 2.508 2.664 2.809 2.95 3.018 3.142 3.269 3.469 3.594 3.713 3.881 4.025 4.16 4.295 4.424 4.592 4.77 4.939 5.132 5.305 5.454 5.625 5.818 5.989 6.168 6.38 6.61 6.818 7.041 7.311 7.564 7.845 8.107 8.353 8.636 8.826 8.811 8.431 7.609 6.758 5.908 5.127 4.391 3.744 3.138 2.613 2.112 1.653 1.212 0.805 0.412 0.02 -0.33 -0.675 -0.978 -1.243 -1.52 -1.796 -2.036 -2.3 -2.571 -2.782 -3.007 -3.242 -3.491 -3.76 -3.937 -4.113 -4.376 -4.569 -4.776 -4.878 -5.095 -5.349 -5.631 -5.767 -5.983 -6.228 -6.398 -6.573 -6.919 -7.11 -7.325 -7.568 -7.832 -8.151 -8.643 -10.313 -8 ,20230 ,KEBNE ,16658351,Tue Nov 23 08:52:05 CET,Tue Nov 23 10:13:59 CET,0.0 0.498 0.676 0.809 0.931 1.073 1.202 1.328 1.594 1.709 1.813 1.942 2.102 2.194 2.377 2.544 2.706 2.777 2.911 3.035 3.201 3.314 3.412 3.556 3.71 3.857 3.995 4.144 4.338 4.493 4.648 4.861 5.054 5.207 5.381 5.587 5.769 5.972 6.19 6.414 6.651 6.894 7.163 7.442 7.736 8.014 8.298 8.559 8.752 8.734 8.26 7.377 6.515 5.717 4.96 4.228 3.59 2.979 2.42 1.883 1.419 1.0 0.6 0.211 -0.153 -0.496 -0.845 -1.153 -1.42 -1.683 -1.978 -2.252 -2.529 -2.791 -2.993 -3.216 -3.456 -3.709 -3.968 -4.143 -4.332 -4.633 -4.838 -5.051 -5.158 -5.398 -5.66 -5.92 -6.049 -6.252 -6.493 -6.657 -6.826 -7.208 -7.422 -7.65 -7.892 -8.168 -8.502 -8.96 -10.624 -9 ,1550 ,KEBNE ,16658352,Tue Nov 23 08:53:07 CET,Tue Nov 23 10:16:36 CET,0.0 0.495 0.667 0.795 0.906 1.008 1.103 1.189 1.367 1.454 1.522 1.573 1.706 1.777 1.917 2.038 2.132 2.178 2.273 2.373 2.544 2.657 2.76 2.922 3.081 3.233 3.385 3.535 3.714 3.877 4.041 4.226 4.397 4.558 4.733 4.917 5.095 5.303 5.522 5.737 5.954 6.205 6.47 6.718 7.022 7.345 7.632 7.863 8.004 7.931 7.456 6.607 5.673 4.814 4.063 3.317 2.618 2.001 1.468 0.924 0.457 0.025 -0.397 -0.786 -1.131 -1.457 -1.825 -2.138 -2.405 -2.708 -3.01 -3.246 -3.512 -3.793 -4.01 -4.234 -4.453 -4.676 -4.915 -5.088 -5.266 -5.541 -5.759 -5.993 -6.107 -6.332 -6.559 -6.808 -6.937 -7.141 -7.384 -7.558 -7.737 -8.132 -8.356 -8.597 -8.86 -9.147 -9.484 -9.916 -11.877 -10 ,1573 ,KEBNE ,16658353,Tue Nov 23 08:53:07 CET,Tue Nov 23 10:18:17 CET,0.0 0.63 0.879 1.052 1.165 1.271 1.383 1.481 1.667 1.751 1.811 1.853 1.985 2.055 2.191 2.315 2.429 2.482 2.579 2.678 2.837 2.932 3.03 3.18 3.291 3.41 3.541 3.664 3.813 3.941 4.058 4.205 4.354 4.494 4.657 4.836 5.002 5.184 5.366 5.548 5.752 6.012 6.273 6.513 6.794 7.053 7.349 7.614 7.761 7.719 7.307 6.479 5.615 4.776 4.018 3.312 2.629 2.005 1.456 0.907 0.448 0.026 -0.376 -0.777 -1.143 -1.466 -1.812 -2.115 -2.378 -2.663 -2.954 -3.207 -3.479 -3.741 -3.959 -4.178 -4.409 -4.676 -4.959 -5.154 -5.343 -5.639 -5.837 -6.033 -6.138 -6.355 -6.582 -6.829 -6.961 -7.168 -7.392 -7.556 -7.729 -8.106 -8.317 -8.542 -8.788 -9.116 -9.519 -10.027 -11.81 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_266_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_266_235.txt deleted file mode 100644 index 3022b9a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_266_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30888 ,KEBNE ,16658354,Tue Nov 23 08:53:07 CET,Tue Nov 23 10:18:06 CET,0.0 0.982 1.26 1.488 1.679 1.832 1.959 2.086 2.306 2.4 2.489 2.581 2.711 2.777 2.912 3.029 3.138 3.188 3.28 3.369 3.509 3.605 3.678 3.774 3.88 3.987 4.089 4.166 4.245 4.312 4.389 4.491 4.575 4.647 4.71 4.755 4.777 4.799 4.836 4.859 4.849 4.804 4.703 4.562 4.337 4.028 3.567 2.878 1.876 0.374 -2.113 -5.144 -7.63 -9.608 -11.227 -12.654 -13.863 -14.931 -15.859 -16.742 -17.461 -18.098 -18.71 -19.282 -19.805 -20.283 -20.763 -21.19 -21.558 -21.939 -22.353 -22.704 -23.059 -23.423 -23.7 -23.98 -24.263 -24.539 -24.81 -25.006 -25.225 -25.56 -25.784 -26.016 -26.132 -26.365 -26.627 -26.918 -27.07 -27.311 -27.493 -27.644 -27.806 -28.141 -28.339 -28.573 -28.814 -29.053 -29.309 -29.646 -30.547 -2 ,24960 ,KEBNE ,16658355,Tue Nov 23 08:55:12 CET,Tue Nov 23 10:14:41 CET,0.0 0.681 0.999 1.232 1.456 1.664 1.813 1.918 2.122 2.224 2.317 2.426 2.567 2.627 2.758 2.89 2.99 3.03 3.117 3.203 3.32 3.394 3.464 3.567 3.662 3.763 3.862 3.943 4.041 4.119 4.188 4.267 4.329 4.393 4.447 4.488 4.534 4.56 4.577 4.589 4.566 4.509 4.386 4.224 3.998 3.664 3.189 2.54 1.542 -0.038 -2.652 -5.586 -7.89 -9.828 -11.419 -12.76 -13.919 -14.989 -15.903 -16.758 -17.464 -18.105 -18.712 -19.278 -19.795 -20.256 -20.741 -21.192 -21.588 -21.998 -22.406 -22.727 -23.052 -23.39 -23.665 -23.943 -24.228 -24.529 -24.827 -25.023 -25.221 -25.54 -25.778 -26.017 -26.132 -26.385 -26.646 -26.915 -27.057 -27.297 -27.531 -27.704 -27.882 -28.273 -28.485 -28.702 -28.935 -29.23 -29.579 -30.003 -31.226 -3 ,27539 ,KEBNE ,16658356,Tue Nov 23 08:56:12 CET,Tue Nov 23 10:19:26 CET,0.0 1.291 1.638 1.91 2.111 2.252 2.374 2.493 2.727 2.825 2.919 3.026 3.163 3.232 3.372 3.509 3.624 3.674 3.777 3.893 4.046 4.129 4.214 4.327 4.424 4.512 4.594 4.68 4.777 4.846 4.913 4.995 5.061 5.112 5.156 5.218 5.273 5.303 5.305 5.284 5.27 5.222 5.114 4.988 4.767 4.432 3.962 3.316 2.338 0.725 -1.863 -4.832 -7.234 -9.292 -10.995 -12.429 -13.668 -14.758 -15.647 -16.501 -17.234 -17.883 -18.517 -19.099 -19.613 -20.073 -20.571 -21.024 -21.405 -21.787 -22.171 -22.5 -22.835 -23.164 -23.438 -23.722 -23.997 -24.279 -24.572 -24.786 -25.014 -25.356 -25.575 -25.802 -25.92 -26.168 -26.429 -26.684 -26.816 -27.049 -27.242 -27.397 -27.561 -27.937 -28.15 -28.368 -28.606 -28.865 -29.149 -29.534 -31.019 -4 ,21807 ,KEBNE ,16658357,Tue Nov 23 08:57:16 CET,Tue Nov 23 10:20:54 CET,0.0 0.865 1.167 1.382 1.572 1.748 1.888 2.013 2.233 2.314 2.394 2.514 2.668 2.745 2.884 3.013 3.137 3.193 3.296 3.38 3.488 3.564 3.645 3.754 3.845 3.935 4.029 4.119 4.224 4.314 4.391 4.496 4.58 4.638 4.695 4.749 4.795 4.83 4.861 4.887 4.88 4.838 4.784 4.698 4.545 4.292 3.866 3.242 2.257 0.81 -1.647 -4.668 -7.08 -9.035 -10.66 -12.07 -13.267 -14.317 -15.236 -16.157 -16.955 -17.65 -18.287 -18.878 -19.413 -19.897 -20.406 -20.854 -21.229 -21.618 -22.029 -22.351 -22.675 -23.025 -23.297 -23.594 -23.891 -24.17 -24.46 -24.666 -24.872 -25.185 -25.41 -25.664 -25.789 -26.032 -26.299 -26.582 -26.722 -26.968 -27.184 -27.342 -27.52 -27.895 -28.088 -28.305 -28.563 -28.835 -29.117 -29.522 -30.604 -5 ,2772 ,KEBNE ,16658358,Tue Nov 23 08:57:16 CET,Tue Nov 23 10:21:37 CET,0.0 1.084 1.437 1.723 1.921 2.093 2.231 2.358 2.565 2.654 2.746 2.844 2.995 3.078 3.218 3.336 3.449 3.501 3.587 3.67 3.788 3.871 3.955 4.076 4.186 4.285 4.385 4.486 4.612 4.703 4.765 4.829 4.886 4.97 5.07 5.14 5.184 5.223 5.243 5.236 5.229 5.193 5.105 4.973 4.76 4.492 4.097 3.498 2.541 0.967 -1.586 -4.533 -6.906 -8.821 -10.469 -11.925 -13.129 -14.182 -15.091 -15.994 -16.776 -17.463 -18.088 -18.648 -19.166 -19.647 -20.153 -20.6 -20.969 -21.342 -21.731 -22.051 -22.372 -22.71 -22.984 -23.283 -23.589 -23.894 -24.206 -24.422 -24.645 -24.996 -25.232 -25.463 -25.581 -25.821 -26.064 -26.329 -26.47 -26.696 -26.889 -27.058 -27.232 -27.605 -27.803 -28.029 -28.268 -28.499 -28.767 -29.114 -30.279 -6 ,4486 ,KEBNE ,16658359,Tue Nov 23 08:59:18 CET,Tue Nov 23 10:22:27 CET,0.0 1.52 1.866 2.122 2.342 2.512 2.657 2.801 3.033 3.133 3.234 3.358 3.508 3.585 3.711 3.833 3.944 3.996 4.099 4.192 4.321 4.4 4.477 4.575 4.671 4.767 4.85 4.946 5.058 5.148 5.221 5.289 5.348 5.389 5.452 5.523 5.565 5.599 5.62 5.62 5.592 5.53 5.435 5.301 5.077 4.761 4.307 3.621 2.605 1.059 -1.643 -4.691 -6.98 -8.882 -10.524 -11.952 -13.147 -14.201 -15.074 -15.919 -16.666 -17.31 -17.921 -18.505 -19.052 -19.563 -20.084 -20.533 -20.906 -21.292 -21.693 -22.013 -22.35 -22.72 -23.007 -23.282 -23.541 -23.822 -24.132 -24.343 -24.563 -24.895 -25.11 -25.342 -25.466 -25.718 -25.994 -26.277 -26.414 -26.647 -26.865 -27.039 -27.21 -27.572 -27.779 -28.01 -28.254 -28.513 -28.847 -29.299 -30.842 -7 ,19852 ,KEBNE ,16658360,Tue Nov 23 09:00:21 CET,Tue Nov 23 10:21:05 CET,0.0 1.726 2.056 2.304 2.504 2.683 2.841 2.97 3.186 3.29 3.386 3.503 3.651 3.72 3.846 3.957 4.053 4.106 4.226 4.33 4.461 4.543 4.62 4.711 4.793 4.884 4.971 5.049 5.149 5.235 5.306 5.372 5.436 5.505 5.558 5.597 5.636 5.674 5.713 5.736 5.746 5.725 5.63 5.529 5.38 5.095 4.676 4.074 3.101 1.633 -0.856 -3.752 -6.075 -8.024 -9.68 -11.116 -12.301 -13.367 -14.319 -15.281 -16.04 -16.677 -17.284 -17.85 -18.373 -18.847 -19.352 -19.795 -20.158 -20.528 -20.904 -21.221 -21.562 -21.923 -22.203 -22.481 -22.765 -23.067 -23.374 -23.585 -23.803 -24.133 -24.352 -24.58 -24.698 -24.942 -25.196 -25.453 -25.585 -25.824 -26.046 -26.21 -26.371 -26.73 -26.928 -27.122 -27.342 -27.638 -27.997 -28.412 -29.493 -8 ,20271 ,KEBNE ,16658361,Tue Nov 23 09:01:21 CET,Tue Nov 23 10:23:05 CET,0.0 0.848 1.23 1.548 1.793 1.976 2.133 2.275 2.501 2.603 2.704 2.801 2.934 3.013 3.162 3.285 3.401 3.46 3.564 3.643 3.762 3.846 3.925 4.039 4.142 4.22 4.286 4.359 4.463 4.552 4.617 4.7 4.778 4.845 4.911 4.978 5.048 5.112 5.148 5.167 5.176 5.138 5.055 4.963 4.747 4.419 3.997 3.329 2.276 0.676 -1.92 -5.024 -7.473 -9.451 -11.1 -12.565 -13.823 -14.93 -15.883 -16.787 -17.557 -18.242 -18.857 -19.419 -19.959 -20.447 -20.936 -21.36 -21.714 -22.084 -22.48 -22.808 -23.149 -23.485 -23.729 -23.976 -24.237 -24.527 -24.837 -25.038 -25.239 -25.55 -25.766 -25.988 -26.111 -26.366 -26.627 -26.894 -27.027 -27.261 -27.45 -27.604 -27.773 -28.13 -28.34 -28.553 -28.789 -29.064 -29.383 -29.78 -30.827 -9 ,25490 ,KEBNE ,16658362,Tue Nov 23 09:03:24 CET,Tue Nov 23 10:25:17 CET,0.0 0.983 1.243 1.447 1.663 1.863 2.029 2.161 2.37 2.46 2.547 2.644 2.783 2.853 2.984 3.099 3.207 3.262 3.37 3.469 3.593 3.672 3.757 3.878 3.988 4.084 4.16 4.22 4.302 4.382 4.453 4.54 4.61 4.659 4.718 4.772 4.82 4.854 4.862 4.87 4.846 4.805 4.749 4.618 4.4 4.098 3.647 3.034 2.044 0.522 -1.916 -4.785 -7.125 -9.09 -10.722 -12.135 -13.331 -14.372 -15.274 -16.154 -16.898 -17.555 -18.156 -18.741 -19.275 -19.752 -20.264 -20.72 -21.116 -21.507 -21.888 -22.193 -22.508 -22.845 -23.101 -23.369 -23.654 -23.936 -24.228 -24.437 -24.659 -25.01 -25.249 -25.493 -25.615 -25.85 -26.092 -26.36 -26.499 -26.735 -26.937 -27.087 -27.248 -27.597 -27.791 -27.986 -28.198 -28.463 -28.761 -29.137 -30.412 -10 ,32730 ,KEBNE ,16658363,Tue Nov 23 09:03:24 CET,Tue Nov 23 10:26:35 CET,0.0 1.198 1.501 1.699 1.884 2.06 2.203 2.327 2.546 2.642 2.727 2.826 2.974 3.056 3.211 3.346 3.452 3.499 3.598 3.687 3.816 3.898 3.966 4.063 4.152 4.235 4.312 4.387 4.48 4.545 4.61 4.705 4.792 4.854 4.903 4.951 4.994 5.039 5.07 5.074 5.028 4.941 4.829 4.706 4.498 4.188 3.73 3.07 2.097 0.588 -1.888 -4.784 -7.145 -9.119 -10.749 -12.117 -13.27 -14.326 -15.23 -16.107 -16.844 -17.506 -18.127 -18.692 -19.208 -19.693 -20.206 -20.675 -21.088 -21.489 -21.88 -22.195 -22.522 -22.879 -23.152 -23.428 -23.713 -24.001 -24.306 -24.511 -24.717 -25.044 -25.275 -25.52 -25.64 -25.877 -26.132 -26.39 -26.524 -26.771 -26.997 -27.162 -27.338 -27.702 -27.899 -28.11 -28.369 -28.647 -28.94 -29.375 -30.828 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_289_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_289_231.txt deleted file mode 100644 index 14e3357f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_289_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4679 ,KEBNE ,16658364,Tue Nov 23 09:03:28 CET,Tue Nov 23 10:21:56 CET,0.0 0.611 0.876 1.065 1.236 1.392 1.51 1.618 1.831 1.92 2.002 2.066 2.253 2.333 2.484 2.609 2.729 2.789 2.9 3.007 3.163 3.268 3.364 3.494 3.611 3.725 3.839 3.943 4.095 4.241 4.363 4.5 4.637 4.783 4.95 5.128 5.294 5.457 5.634 5.834 6.045 6.273 6.508 6.731 6.968 7.204 7.439 7.667 7.908 8.083 8.043 7.735 7.334 6.907 6.504 6.147 5.803 5.468 5.183 4.883 4.599 4.338 4.095 3.87 3.649 3.433 3.219 3.038 2.884 2.717 2.544 2.387 2.22 2.054 1.93 1.801 1.647 1.489 1.331 1.22 1.112 0.939 0.827 0.708 0.64 0.509 0.362 0.191 0.103 -0.091 -0.181 -0.28 -0.389 -0.6 -0.701 -0.826 -0.99 -1.173 -1.348 -1.579 -2.052 -2 ,29694 ,KEBNE ,16658365,Tue Nov 23 09:04:28 CET,Tue Nov 23 10:23:13 CET,0.0 0.734 1.007 1.221 1.397 1.546 1.668 1.765 1.952 2.052 2.141 2.202 2.389 2.471 2.644 2.807 2.946 3.008 3.124 3.228 3.372 3.47 3.581 3.737 3.877 4.01 4.132 4.242 4.371 4.508 4.652 4.821 4.98 5.117 5.264 5.435 5.614 5.807 6.014 6.225 6.435 6.675 6.956 7.236 7.512 7.787 8.079 8.372 8.624 8.777 8.742 8.439 8.041 7.636 7.258 6.894 6.559 6.234 5.941 5.637 5.377 5.134 4.906 4.686 4.456 4.253 4.065 3.887 3.714 3.537 3.362 3.212 3.047 2.872 2.742 2.615 2.479 2.328 2.157 2.038 1.925 1.76 1.654 1.542 1.479 1.329 1.174 1.03 0.959 0.775 0.693 0.595 0.494 0.282 0.155 0.002 -0.191 -0.391 -0.602 -0.866 -1.4 -3 ,24283 ,KEBNE ,16658366,Tue Nov 23 09:05:29 CET,Tue Nov 23 10:27:04 CET,0.0 0.567 0.831 1.065 1.254 1.415 1.556 1.663 1.857 1.955 2.047 2.112 2.299 2.377 2.52 2.651 2.768 2.82 2.927 3.041 3.209 3.32 3.42 3.543 3.658 3.789 3.924 4.037 4.186 4.343 4.485 4.632 4.771 4.907 5.059 5.229 5.405 5.587 5.766 5.943 6.111 6.297 6.512 6.749 7.002 7.233 7.486 7.749 7.952 8.098 8.042 7.629 7.176 6.757 6.346 5.957 5.608 5.272 4.984 4.667 4.373 4.098 3.831 3.585 3.364 3.166 2.935 2.726 2.56 2.39 2.206 2.042 1.868 1.692 1.569 1.428 1.274 1.139 0.985 0.866 0.736 0.54 0.417 0.286 0.213 0.06 -0.094 -0.255 -0.346 -0.551 -0.621 -0.713 -0.826 -1.059 -1.18 -1.329 -1.515 -1.706 -1.931 -2.246 -3.049 -4 ,7604 ,KEBNE ,16658367,Tue Nov 23 09:05:28 CET,Tue Nov 23 10:28:48 CET,0.0 0.719 1.005 1.252 1.447 1.599 1.735 1.853 2.069 2.16 2.248 2.3 2.472 2.542 2.687 2.83 2.954 3.018 3.145 3.258 3.41 3.499 3.586 3.709 3.831 3.966 4.104 4.227 4.38 4.516 4.642 4.796 4.944 5.1 5.273 5.446 5.609 5.783 5.994 6.221 6.417 6.622 6.869 7.11 7.378 7.639 7.887 8.149 8.401 8.519 8.443 8.125 7.71 7.289 6.881 6.492 6.149 5.808 5.51 5.223 4.956 4.707 4.465 4.25 4.052 3.85 3.634 3.448 3.292 3.117 2.916 2.749 2.577 2.404 2.281 2.148 2.005 1.87 1.71 1.591 1.488 1.335 1.215 1.077 1.006 0.879 0.737 0.582 0.502 0.309 0.223 0.116 0.002 -0.261 -0.407 -0.538 -0.665 -0.845 -1.085 -1.361 -1.935 -5 ,11886 ,KEBNE ,16658368,Tue Nov 23 09:05:28 CET,Tue Nov 23 10:29:07 CET,0.0 0.569 0.777 0.912 1.044 1.18 1.313 1.431 1.629 1.73 1.83 1.903 2.086 2.152 2.285 2.422 2.561 2.626 2.739 2.847 3.017 3.125 3.221 3.352 3.47 3.585 3.7 3.812 3.961 4.09 4.203 4.349 4.498 4.637 4.796 4.966 5.123 5.305 5.506 5.702 5.892 6.126 6.376 6.608 6.883 7.138 7.391 7.663 7.92 8.085 8.053 7.743 7.311 6.83 6.432 6.067 5.681 5.33 5.028 4.716 4.451 4.219 4.007 3.795 3.584 3.396 3.185 2.982 2.822 2.668 2.492 2.329 2.169 2.009 1.874 1.725 1.575 1.43 1.286 1.175 1.058 0.9 0.793 0.682 0.619 0.468 0.297 0.11 0.02 -0.169 -0.256 -0.363 -0.472 -0.696 -0.819 -0.947 -1.092 -1.295 -1.573 -1.892 -2.52 -6 ,4295 ,KEBNE ,16658369,Tue Nov 23 09:06:35 CET,Tue Nov 23 10:25:02 CET,0.0 0.458 0.743 0.951 1.14 1.286 1.409 1.516 1.718 1.825 1.93 2.02 2.221 2.294 2.423 2.551 2.676 2.742 2.873 2.99 3.146 3.247 3.348 3.505 3.654 3.798 3.934 4.055 4.204 4.344 4.484 4.648 4.793 4.929 5.082 5.25 5.4 5.576 5.762 5.943 6.138 6.345 6.567 6.786 7.036 7.296 7.565 7.829 8.077 8.258 8.217 7.838 7.396 6.974 6.585 6.226 5.914 5.599 5.303 5.01 4.751 4.512 4.294 4.093 3.892 3.681 3.47 3.277 3.089 2.911 2.737 2.595 2.443 2.269 2.127 1.983 1.848 1.7 1.541 1.432 1.316 1.139 1.004 0.855 0.778 0.631 0.486 0.333 0.248 0.051 -0.014 -0.11 -0.222 -0.466 -0.606 -0.754 -0.898 -1.056 -1.241 -1.495 -2.25 -7 ,12323 ,KEBNE ,16658370,Tue Nov 23 09:07:32 CET,Tue Nov 23 10:31:31 CET,0.0 0.55 0.776 1.003 1.183 1.324 1.449 1.541 1.704 1.799 1.891 1.944 2.126 2.198 2.349 2.502 2.65 2.715 2.829 2.947 3.111 3.207 3.305 3.457 3.594 3.724 3.841 3.942 4.091 4.231 4.351 4.505 4.655 4.788 4.954 5.148 5.314 5.489 5.693 5.909 6.114 6.327 6.559 6.772 7.009 7.284 7.573 7.845 8.1 8.296 8.303 8.005 7.658 7.266 6.845 6.449 6.078 5.742 5.448 5.147 4.903 4.675 4.44 4.192 3.968 3.771 3.539 3.327 3.154 2.978 2.782 2.622 2.453 2.269 2.125 1.972 1.823 1.674 1.523 1.422 1.32 1.149 1.018 0.884 0.818 0.691 0.548 0.391 0.318 0.126 0.024 -0.083 -0.191 -0.435 -0.564 -0.701 -0.854 -1.027 -1.244 -1.582 -2.31 -8 ,13097 ,KEBNE ,16658371,Tue Nov 23 09:07:33 CET,Tue Nov 23 10:30:44 CET,0.0 0.694 1.005 1.215 1.387 1.539 1.679 1.796 2.017 2.115 2.191 2.242 2.438 2.512 2.644 2.79 2.929 2.989 3.099 3.198 3.347 3.446 3.535 3.654 3.769 3.903 4.034 4.152 4.302 4.431 4.551 4.711 4.865 5.005 5.165 5.335 5.495 5.672 5.849 6.038 6.252 6.474 6.702 6.961 7.265 7.556 7.846 8.136 8.376 8.489 8.39 8.074 7.702 7.275 6.856 6.478 6.128 5.811 5.527 5.215 4.961 4.724 4.482 4.259 4.043 3.833 3.63 3.458 3.301 3.143 2.971 2.821 2.661 2.488 2.352 2.207 2.046 1.886 1.721 1.611 1.494 1.303 1.179 1.044 0.975 0.82 0.655 0.5 0.414 0.211 0.122 0.029 -0.058 -0.26 -0.379 -0.501 -0.639 -0.804 -0.962 -1.208 -2.209 -9 ,30537 ,KEBNE ,16658372,Tue Nov 23 09:07:33 CET,Tue Nov 23 10:30:07 CET,0.0 0.439 0.698 0.9 1.041 1.171 1.285 1.391 1.618 1.715 1.795 1.865 2.053 2.127 2.286 2.424 2.549 2.611 2.729 2.851 3.017 3.11 3.205 3.353 3.485 3.605 3.721 3.847 4.003 4.141 4.284 4.454 4.622 4.779 4.94 5.113 5.288 5.488 5.677 5.859 6.05 6.268 6.518 6.758 7.02 7.279 7.574 7.869 8.152 8.355 8.302 7.976 7.543 7.126 6.756 6.361 5.969 5.586 5.277 4.965 4.668 4.423 4.18 3.94 3.727 3.534 3.333 3.158 3.006 2.824 2.629 2.466 2.298 2.129 1.996 1.85 1.703 1.549 1.385 1.274 1.16 0.981 0.865 0.747 0.676 0.517 0.364 0.21 0.132 -0.056 -0.126 -0.218 -0.309 -0.504 -0.623 -0.762 -0.912 -1.063 -1.234 -1.463 -2.015 -10 ,18987 ,KEBNE ,16658373,Tue Nov 23 09:08:34 CET,Tue Nov 23 10:30:12 CET,0.0 0.528 0.77 0.941 1.08 1.212 1.338 1.464 1.693 1.787 1.876 1.971 2.169 2.253 2.398 2.523 2.644 2.706 2.837 2.968 3.142 3.238 3.33 3.457 3.579 3.71 3.843 3.972 4.128 4.269 4.397 4.555 4.717 4.861 5.008 5.195 5.372 5.564 5.793 5.996 6.177 6.417 6.699 6.954 7.222 7.473 7.732 8.025 8.284 8.413 8.421 8.153 7.748 7.324 6.891 6.494 6.147 5.821 5.532 5.222 4.942 4.688 4.458 4.248 4.056 3.87 3.67 3.49 3.322 3.137 2.937 2.784 2.64 2.478 2.342 2.218 2.085 1.934 1.79 1.677 1.55 1.369 1.246 1.122 1.055 0.89 0.716 0.551 0.468 0.281 0.201 0.096 -0.006 -0.223 -0.333 -0.46 -0.628 -0.835 -1.091 -1.429 -1.894 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_289_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_289_336.txt deleted file mode 100644 index c5b0a6ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_289_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18535 ,KEBNE ,16658374,Tue Nov 23 09:09:39 CET,Tue Nov 23 10:28:45 CET,0.0 0.429 0.644 0.851 1.015 1.162 1.294 1.44 1.677 1.768 1.873 1.953 2.138 2.213 2.362 2.513 2.642 2.701 2.815 2.926 3.096 3.197 3.281 3.407 3.531 3.659 3.78 3.89 4.035 4.158 4.263 4.388 4.522 4.657 4.795 4.932 5.056 5.18 5.295 5.439 5.6 5.775 5.981 6.159 6.322 6.481 6.614 6.674 6.645 6.506 6.104 5.346 4.506 3.748 3.093 2.477 1.964 1.499 1.08 0.65 0.266 -0.088 -0.452 -0.803 -1.12 -1.415 -1.721 -1.993 -2.233 -2.48 -2.737 -2.948 -3.158 -3.381 -3.567 -3.757 -3.962 -4.185 -4.393 -4.529 -4.669 -4.869 -5.014 -5.18 -5.265 -5.429 -5.606 -5.8 -5.897 -6.122 -6.266 -6.398 -6.519 -6.807 -6.971 -7.139 -7.325 -7.539 -7.821 -8.184 -8.979 -2 ,7080 ,KEBNE ,16658375,Tue Nov 23 09:09:40 CET,Tue Nov 23 10:28:44 CET,0.0 0.559 0.792 0.993 1.166 1.303 1.42 1.511 1.671 1.753 1.841 1.925 2.107 2.179 2.314 2.425 2.53 2.586 2.699 2.8 2.955 3.071 3.18 3.316 3.44 3.559 3.687 3.819 3.962 4.086 4.209 4.364 4.531 4.69 4.83 4.961 5.1 5.261 5.414 5.547 5.683 5.821 5.953 6.089 6.234 6.348 6.481 6.612 6.67 6.574 6.133 5.366 4.631 3.91 3.245 2.592 2.002 1.501 1.046 0.579 0.191 -0.163 -0.526 -0.89 -1.226 -1.494 -1.775 -2.053 -2.293 -2.53 -2.767 -2.968 -3.175 -3.407 -3.593 -3.783 -3.976 -4.186 -4.406 -4.545 -4.68 -4.891 -5.051 -5.225 -5.315 -5.498 -5.688 -5.883 -5.982 -6.199 -6.295 -6.414 -6.542 -6.795 -6.941 -7.11 -7.294 -7.499 -7.813 -8.188 -8.996 -3 ,18323 ,KEBNE ,16658376,Tue Nov 23 09:09:35 CET,Tue Nov 23 10:32:20 CET,0.0 0.521 0.729 0.891 1.051 1.215 1.372 1.512 1.74 1.835 1.924 1.974 2.156 2.221 2.341 2.464 2.583 2.643 2.772 2.906 3.099 3.207 3.287 3.403 3.518 3.63 3.738 3.871 4.046 4.171 4.296 4.469 4.618 4.735 4.875 5.03 5.157 5.301 5.451 5.611 5.771 5.942 6.137 6.305 6.511 6.701 6.83 6.884 6.878 6.79 6.4 5.594 4.813 4.135 3.51 2.892 2.35 1.848 1.383 0.915 0.53 0.203 -0.141 -0.482 -0.784 -1.052 -1.344 -1.623 -1.85 -2.074 -2.321 -2.547 -2.785 -3.026 -3.221 -3.416 -3.599 -3.795 -3.998 -4.13 -4.27 -4.502 -4.672 -4.84 -4.92 -5.092 -5.274 -5.477 -5.594 -5.819 -5.918 -6.03 -6.148 -6.452 -6.636 -6.834 -7.025 -7.232 -7.496 -7.925 -9.042 -4 ,28006 ,KEBNE ,16658377,Tue Nov 23 09:09:35 CET,Tue Nov 23 10:31:18 CET,0.0 0.365 0.592 0.812 1.004 1.159 1.299 1.417 1.583 1.665 1.756 1.825 2.007 2.08 2.225 2.356 2.469 2.524 2.64 2.745 2.897 2.999 3.082 3.209 3.336 3.466 3.577 3.686 3.847 3.985 4.119 4.262 4.377 4.5 4.659 4.828 4.974 5.137 5.316 5.513 5.703 5.872 6.039 6.193 6.355 6.497 6.645 6.759 6.816 6.739 6.268 5.528 4.765 4.004 3.371 2.801 2.289 1.83 1.393 0.928 0.547 0.225 -0.077 -0.385 -0.69 -0.954 -1.22 -1.463 -1.675 -1.919 -2.188 -2.391 -2.603 -2.812 -2.968 -3.151 -3.34 -3.542 -3.754 -3.896 -4.044 -4.277 -4.437 -4.607 -4.696 -4.884 -5.076 -5.264 -5.364 -5.586 -5.689 -5.804 -5.927 -6.187 -6.361 -6.555 -6.734 -6.912 -7.111 -7.406 -8.258 -5 ,12872 ,KEBNE ,16658378,Tue Nov 23 09:10:37 CET,Tue Nov 23 10:32:41 CET,0.0 0.472 0.694 0.907 1.1 1.243 1.362 1.491 1.75 1.865 1.959 2.022 2.228 2.326 2.492 2.636 2.752 2.806 2.924 3.037 3.202 3.314 3.413 3.553 3.68 3.794 3.909 4.024 4.166 4.308 4.448 4.584 4.701 4.814 4.938 5.081 5.206 5.339 5.496 5.656 5.809 5.969 6.123 6.289 6.477 6.636 6.775 6.872 6.902 6.795 6.397 5.679 4.966 4.295 3.656 3.061 2.525 2.047 1.616 1.139 0.693 0.321 0.002 -0.323 -0.638 -0.906 -1.197 -1.461 -1.681 -1.909 -2.168 -2.395 -2.611 -2.827 -2.999 -3.18 -3.358 -3.553 -3.759 -3.894 -4.045 -4.285 -4.441 -4.597 -4.679 -4.869 -5.071 -5.285 -5.403 -5.631 -5.733 -5.846 -5.976 -6.246 -6.394 -6.565 -6.744 -6.94 -7.169 -7.465 -8.3 -6 ,16134 ,KEBNE ,16658379,Tue Nov 23 09:11:42 CET,Tue Nov 23 10:30:19 CET,0.0 0.483 0.732 0.912 1.069 1.219 1.344 1.468 1.701 1.805 1.892 1.951 2.144 2.231 2.39 2.533 2.671 2.739 2.861 2.966 3.114 3.213 3.317 3.465 3.597 3.721 3.845 3.963 4.107 4.237 4.342 4.452 4.561 4.685 4.834 4.996 5.139 5.277 5.42 5.576 5.737 5.881 6.025 6.18 6.332 6.466 6.588 6.681 6.719 6.58 6.123 5.356 4.573 3.811 3.127 2.484 1.878 1.35 0.93 0.492 0.105 -0.247 -0.604 -0.945 -1.246 -1.537 -1.838 -2.111 -2.362 -2.601 -2.859 -3.093 -3.322 -3.562 -3.745 -3.932 -4.135 -4.342 -4.553 -4.698 -4.852 -5.095 -5.247 -5.399 -5.486 -5.679 -5.883 -6.096 -6.201 -6.416 -6.515 -6.635 -6.764 -7.022 -7.158 -7.313 -7.509 -7.773 -8.095 -8.446 -9.292 -7 ,15309 ,KEBNE ,16658380,Tue Nov 23 09:12:40 CET,Tue Nov 23 10:34:19 CET,0.0 0.633 0.922 1.126 1.312 1.445 1.57 1.687 1.886 1.989 2.089 2.145 2.328 2.408 2.556 2.688 2.821 2.887 3.006 3.112 3.249 3.335 3.417 3.543 3.67 3.809 3.949 4.057 4.172 4.296 4.417 4.546 4.69 4.828 4.978 5.142 5.275 5.428 5.595 5.755 5.903 6.062 6.227 6.378 6.526 6.69 6.845 6.93 6.975 6.845 6.395 5.705 5.02 4.295 3.617 3.018 2.499 2.002 1.552 1.135 0.769 0.406 0.067 -0.219 -0.494 -0.756 -1.034 -1.302 -1.547 -1.8 -2.045 -2.247 -2.462 -2.688 -2.868 -3.035 -3.208 -3.41 -3.618 -3.761 -3.911 -4.128 -4.277 -4.448 -4.537 -4.703 -4.872 -5.05 -5.154 -5.381 -5.479 -5.597 -5.731 -6.058 -6.244 -6.422 -6.639 -6.861 -7.059 -7.346 -8.051 -8 ,28566 ,KEBNE ,16658381,Tue Nov 23 09:12:41 CET,Tue Nov 23 10:36:03 CET,0.0 0.458 0.697 0.879 1.045 1.205 1.338 1.451 1.673 1.776 1.875 1.948 2.125 2.187 2.313 2.45 2.582 2.64 2.747 2.853 2.999 3.095 3.188 3.323 3.457 3.578 3.684 3.783 3.912 4.038 4.172 4.342 4.479 4.593 4.718 4.851 4.985 5.139 5.336 5.528 5.662 5.821 6.026 6.194 6.321 6.433 6.545 6.608 6.605 6.457 5.932 5.123 4.33 3.534 2.867 2.264 1.683 1.145 0.708 0.293 -0.08 -0.426 -0.751 -1.069 -1.384 -1.671 -1.963 -2.211 -2.435 -2.682 -2.938 -3.141 -3.35 -3.589 -3.786 -3.972 -4.16 -4.354 -4.539 -4.684 -4.842 -5.072 -5.22 -5.367 -5.45 -5.629 -5.819 -6.012 -6.112 -6.337 -6.44 -6.552 -6.669 -6.942 -7.091 -7.248 -7.423 -7.629 -7.865 -8.152 -9.046 -9 ,18973 ,KEBNE ,16658382,Tue Nov 23 09:13:41 CET,Tue Nov 23 10:35:13 CET,0.0 0.487 0.739 0.933 1.127 1.293 1.44 1.586 1.825 1.93 2.031 2.095 2.276 2.343 2.468 2.616 2.762 2.819 2.929 3.038 3.203 3.325 3.424 3.55 3.692 3.841 3.97 4.067 4.188 4.318 4.442 4.58 4.712 4.839 4.985 5.161 5.327 5.487 5.66 5.901 6.119 6.271 6.456 6.645 6.851 7.046 7.193 7.253 7.21 7.08 6.609 5.741 4.964 4.248 3.568 2.92 2.391 1.949 1.542 1.109 0.744 0.419 0.099 -0.197 -0.477 -0.744 -1.023 -1.298 -1.548 -1.79 -2.039 -2.237 -2.441 -2.668 -2.85 -3.037 -3.234 -3.436 -3.647 -3.805 -3.963 -4.197 -4.353 -4.52 -4.606 -4.781 -4.964 -5.173 -5.289 -5.522 -5.645 -5.768 -5.898 -6.188 -6.355 -6.542 -6.724 -6.931 -7.217 -7.589 -8.408 -10 ,8771 ,KEBNE ,16658383,Tue Nov 23 09:14:44 CET,Tue Nov 23 10:38:31 CET,0.0 0.711 0.947 1.146 1.324 1.479 1.623 1.76 1.996 2.104 2.209 2.279 2.458 2.531 2.676 2.821 2.967 3.036 3.172 3.299 3.447 3.536 3.626 3.751 3.867 3.987 4.093 4.19 4.336 4.486 4.624 4.786 4.936 5.059 5.193 5.344 5.489 5.648 5.809 5.988 6.166 6.333 6.479 6.612 6.771 6.924 7.052 7.157 7.173 6.992 6.467 5.653 4.915 4.253 3.649 3.073 2.532 2.002 1.537 1.06 0.649 0.312 0.005 -0.329 -0.645 -0.927 -1.24 -1.51 -1.727 -1.941 -2.179 -2.383 -2.596 -2.842 -3.026 -3.2 -3.396 -3.608 -3.834 -3.987 -4.132 -4.359 -4.523 -4.684 -4.769 -4.943 -5.125 -5.324 -5.421 -5.634 -5.749 -5.868 -5.988 -6.239 -6.391 -6.567 -6.744 -6.948 -7.211 -7.562 -8.598 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_164.txt deleted file mode 100644 index b3c61491..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,274 ,KEBNE ,16658384,Tue Nov 23 09:14:43 CET,Tue Nov 23 10:36:51 CET,0.0 0.422 0.629 0.813 0.976 1.09 1.177 1.247 1.362 1.418 1.465 1.491 1.611 1.654 1.729 1.792 1.853 1.887 1.957 2.011 2.083 2.127 2.164 2.224 2.293 2.348 2.389 2.425 2.468 2.51 2.541 2.565 2.59 2.609 2.608 2.592 2.558 2.511 2.489 2.447 2.33 2.156 1.932 1.671 1.352 0.928 0.283 -0.571 -1.742 -3.554 -6.569 -10.022 -12.727 -14.868 -16.654 -18.228 -19.561 -20.712 -21.66 -22.607 -23.413 -24.085 -24.7 -25.286 -25.843 -26.332 -26.807 -27.22 -27.573 -27.948 -28.353 -28.686 -29.012 -29.344 -29.606 -29.869 -30.142 -30.413 -30.692 -30.897 -31.109 -31.425 -31.643 -31.862 -31.977 -32.221 -32.466 -32.721 -32.849 -33.086 -33.241 -33.39 -33.549 -33.852 -34.006 -34.189 -34.412 -34.659 -34.9 -35.164 -35.704 -2 ,15407 ,KEBNE ,16658385,Tue Nov 23 09:15:45 CET,Tue Nov 23 10:37:58 CET,0.0 0.378 0.542 0.661 0.751 0.84 0.928 1.011 1.167 1.23 1.284 1.321 1.437 1.483 1.572 1.647 1.717 1.749 1.809 1.86 1.928 1.974 2.017 2.073 2.128 2.17 2.209 2.254 2.303 2.337 2.371 2.405 2.42 2.436 2.462 2.493 2.516 2.509 2.472 2.402 2.32 2.2 1.993 1.746 1.421 0.965 0.337 -0.48 -1.684 -3.52 -6.459 -9.836 -12.522 -14.683 -16.464 -18.009 -19.313 -20.472 -21.47 -22.43 -23.231 -23.953 -24.63 -25.233 -25.774 -26.264 -26.76 -27.188 -27.562 -27.948 -28.326 -28.646 -28.978 -29.314 -29.576 -29.845 -30.112 -30.375 -30.649 -30.848 -31.056 -31.362 -31.564 -31.779 -31.893 -32.139 -32.386 -32.625 -32.752 -32.991 -33.158 -33.31 -33.47 -33.81 -33.989 -34.187 -34.397 -34.626 -34.88 -35.204 -35.9 -3 ,25255 ,KEBNE ,16658386,Tue Nov 23 09:15:45 CET,Tue Nov 23 10:39:23 CET,0.0 0.32 0.455 0.565 0.671 0.767 0.841 0.92 1.078 1.142 1.191 1.212 1.332 1.381 1.473 1.545 1.599 1.625 1.677 1.724 1.785 1.824 1.861 1.915 1.965 2.019 2.072 2.108 2.15 2.193 2.225 2.27 2.308 2.321 2.32 2.308 2.288 2.268 2.232 2.167 2.055 1.897 1.724 1.49 1.159 0.758 0.202 -0.592 -1.802 -3.673 -6.61 -9.958 -12.621 -14.728 -16.478 -18.02 -19.344 -20.477 -21.432 -22.393 -23.19 -23.857 -24.488 -25.09 -25.648 -26.141 -26.629 -27.055 -27.417 -27.806 -28.196 -28.503 -28.824 -29.163 -29.426 -29.691 -29.958 -30.228 -30.514 -30.703 -30.892 -31.179 -31.374 -31.595 -31.711 -31.941 -32.18 -32.42 -32.544 -32.784 -32.946 -33.086 -33.24 -33.571 -33.737 -33.933 -34.156 -34.367 -34.629 -35.029 -36.13 -4 ,22961 ,KEBNE ,16658387,Tue Nov 23 09:15:49 CET,Tue Nov 23 10:36:02 CET,0.0 0.743 0.903 1.036 1.145 1.246 1.336 1.404 1.535 1.604 1.666 1.708 1.825 1.872 1.967 2.052 2.128 2.161 2.215 2.275 2.375 2.434 2.489 2.554 2.593 2.633 2.677 2.718 2.761 2.782 2.796 2.82 2.833 2.832 2.839 2.838 2.822 2.794 2.745 2.67 2.576 2.458 2.294 2.093 1.792 1.37 0.79 -0.033 -1.265 -3.112 -6.066 -9.482 -12.21 -14.443 -16.257 -17.819 -19.159 -20.302 -21.269 -22.227 -23.016 -23.683 -24.308 -24.888 -25.421 -25.903 -26.405 -26.848 -27.219 -27.592 -27.982 -28.313 -28.645 -28.973 -29.233 -29.493 -29.752 -30.022 -30.29 -30.476 -30.668 -30.964 -31.171 -31.386 -31.499 -31.741 -32.002 -32.264 -32.396 -32.631 -32.774 -32.924 -33.087 -33.39 -33.536 -33.711 -33.927 -34.149 -34.417 -34.791 -35.466 -5 ,15229 ,KEBNE ,16658388,Tue Nov 23 09:17:51 CET,Tue Nov 23 10:40:58 CET,0.0 0.355 0.525 0.652 0.752 0.828 0.897 0.962 1.074 1.135 1.198 1.24 1.362 1.412 1.501 1.581 1.654 1.686 1.739 1.781 1.853 1.907 1.955 2.018 2.071 2.121 2.169 2.213 2.257 2.291 2.32 2.338 2.356 2.373 2.375 2.37 2.364 2.336 2.283 2.208 2.095 1.949 1.774 1.559 1.236 0.831 0.28 -0.542 -1.759 -3.585 -6.478 -9.829 -12.585 -14.808 -16.609 -18.175 -19.478 -20.617 -21.601 -22.539 -23.33 -24.041 -24.698 -25.292 -25.835 -26.327 -26.826 -27.259 -27.635 -28.017 -28.406 -28.727 -29.049 -29.383 -29.648 -29.918 -30.183 -30.459 -30.751 -30.949 -31.152 -31.463 -31.669 -31.875 -31.989 -32.232 -32.472 -32.714 -32.839 -33.079 -33.264 -33.423 -33.59 -33.928 -34.115 -34.309 -34.509 -34.744 -35.024 -35.358 -35.889 -6 ,15446 ,KEBNE ,16658389,Tue Nov 23 09:17:51 CET,Tue Nov 23 10:40:11 CET,0.0 0.381 0.536 0.67 0.781 0.876 0.971 1.057 1.196 1.256 1.316 1.349 1.458 1.499 1.589 1.677 1.753 1.786 1.854 1.915 1.995 2.042 2.084 2.154 2.202 2.234 2.265 2.301 2.354 2.393 2.418 2.434 2.436 2.436 2.44 2.449 2.436 2.413 2.372 2.281 2.168 2.035 1.846 1.603 1.247 0.765 0.126 -0.703 -1.852 -3.607 -6.594 -10.016 -12.647 -14.88 -16.722 -18.268 -19.594 -20.758 -21.729 -22.671 -23.444 -24.104 -24.729 -25.338 -25.885 -26.351 -26.839 -27.28 -27.669 -28.061 -28.45 -28.781 -29.126 -29.469 -29.737 -30.002 -30.261 -30.534 -30.834 -31.038 -31.233 -31.53 -31.734 -31.947 -32.059 -32.284 -32.517 -32.771 -32.912 -33.163 -33.319 -33.461 -33.61 -33.922 -34.118 -34.317 -34.516 -34.754 -35.02 -35.323 -36.116 -7 ,5560 ,KEBNE ,16658390,Tue Nov 23 09:17:51 CET,Tue Nov 23 10:39:44 CET,0.0 0.752 0.944 1.062 1.174 1.282 1.376 1.455 1.577 1.629 1.688 1.725 1.836 1.88 1.974 2.07 2.16 2.196 2.248 2.293 2.362 2.408 2.451 2.511 2.566 2.623 2.674 2.706 2.751 2.792 2.821 2.848 2.858 2.877 2.915 2.942 2.936 2.91 2.875 2.83 2.758 2.651 2.468 2.258 1.978 1.536 0.907 0.068 -1.121 -2.926 -5.861 -9.23 -11.915 -14.077 -15.869 -17.41 -18.709 -19.865 -20.843 -21.761 -22.538 -23.222 -23.859 -24.441 -24.956 -25.428 -25.927 -26.363 -26.733 -27.12 -27.511 -27.837 -28.184 -28.543 -28.817 -29.083 -29.342 -29.61 -29.906 -30.106 -30.305 -30.625 -30.85 -31.074 -31.187 -31.425 -31.665 -31.906 -32.038 -32.287 -32.468 -32.605 -32.748 -33.071 -33.244 -33.436 -33.642 -33.856 -34.123 -34.46 -35.162 -8 ,17809 ,KEBNE ,16658391,Tue Nov 23 09:17:51 CET,Tue Nov 23 10:39:49 CET,0.0 0.561 0.72 0.875 1.006 1.111 1.193 1.269 1.434 1.503 1.568 1.613 1.726 1.774 1.859 1.932 2.006 2.041 2.106 2.169 2.244 2.289 2.33 2.375 2.425 2.474 2.514 2.539 2.572 2.608 2.637 2.66 2.661 2.668 2.666 2.648 2.62 2.58 2.512 2.43 2.365 2.26 2.085 1.892 1.591 1.145 0.505 -0.349 -1.493 -3.334 -6.387 -9.79 -12.466 -14.653 -16.465 -18.022 -19.354 -20.522 -21.491 -22.415 -23.159 -23.813 -24.458 -25.071 -25.611 -26.096 -26.602 -27.042 -27.428 -27.816 -28.207 -28.53 -28.851 -29.168 -29.421 -29.695 -29.968 -30.238 -30.513 -30.709 -30.915 -31.239 -31.467 -31.698 -31.815 -32.051 -32.29 -32.536 -32.659 -32.902 -33.083 -33.225 -33.379 -33.702 -33.862 -34.043 -34.262 -34.535 -34.819 -35.137 -35.808 -9 ,15193 ,KEBNE ,16658392,Tue Nov 23 09:17:52 CET,Tue Nov 23 10:40:57 CET,0.0 0.542 0.746 0.903 1.019 1.135 1.241 1.324 1.479 1.546 1.6 1.616 1.726 1.769 1.838 1.903 1.976 2.008 2.058 2.105 2.179 2.228 2.27 2.33 2.397 2.452 2.498 2.552 2.613 2.658 2.69 2.727 2.752 2.757 2.746 2.735 2.726 2.688 2.619 2.547 2.456 2.318 2.153 1.942 1.592 1.173 0.6 -0.258 -1.46 -3.289 -6.295 -9.66 -12.429 -14.608 -16.367 -17.928 -19.198 -20.294 -21.23 -22.149 -22.944 -23.623 -24.262 -24.885 -25.44 -25.92 -26.417 -26.86 -27.243 -27.635 -28.023 -28.333 -28.659 -29.003 -29.264 -29.532 -29.809 -30.089 -30.366 -30.546 -30.735 -31.035 -31.242 -31.459 -31.571 -31.807 -32.058 -32.293 -32.408 -32.645 -32.822 -32.973 -33.12 -33.426 -33.594 -33.767 -33.96 -34.173 -34.432 -34.75 -35.667 -10 ,16385 ,KEBNE ,16658393,Tue Nov 23 09:17:52 CET,Tue Nov 23 10:40:12 CET,0.0 0.485 0.679 0.813 0.917 1.018 1.115 1.194 1.335 1.401 1.458 1.495 1.621 1.668 1.74 1.82 1.885 1.913 1.984 2.036 2.096 2.139 2.185 2.254 2.301 2.339 2.386 2.425 2.461 2.483 2.499 2.536 2.561 2.572 2.576 2.572 2.562 2.515 2.456 2.393 2.298 2.158 1.969 1.752 1.417 0.947 0.344 -0.489 -1.719 -3.503 -6.42 -9.856 -12.544 -14.734 -16.541 -18.114 -19.445 -20.6 -21.553 -22.456 -23.234 -23.926 -24.566 -25.157 -25.704 -26.182 -26.668 -27.105 -27.475 -27.848 -28.243 -28.571 -28.899 -29.237 -29.498 -29.766 -30.045 -30.334 -30.618 -30.819 -31.027 -31.339 -31.554 -31.786 -31.907 -32.149 -32.386 -32.63 -32.755 -32.984 -33.149 -33.29 -33.431 -33.759 -33.943 -34.13 -34.325 -34.561 -34.84 -35.133 -35.602 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_165.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_165.txt deleted file mode 100644 index 76e3c16a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_165.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30607 ,KEBNE ,16658394,Tue Nov 23 09:18:53 CET,Tue Nov 23 10:41:34 CET,0.0 0.305 0.463 0.562 0.642 0.702 0.783 0.869 0.957 0.991 1.035 1.049 1.153 1.189 1.247 1.292 1.348 1.377 1.416 1.437 1.464 1.482 1.49 1.497 1.509 1.518 1.533 1.57 1.615 1.625 1.608 1.581 1.564 1.545 1.504 1.436 1.363 1.264 1.137 0.985 0.81 0.582 0.251 -0.12 -0.587 -1.185 -1.95 -2.938 -4.341 -6.345 -9.409 -12.849 -15.497 -17.619 -19.361 -20.811 -22.019 -23.094 -24.007 -24.904 -25.626 -26.24 -26.83 -27.379 -27.863 -28.301 -28.764 -29.164 -29.495 -29.832 -30.175 -30.458 -30.753 -31.066 -31.321 -31.569 -31.804 -32.043 -32.288 -32.455 -32.638 -32.928 -33.128 -33.339 -33.449 -33.668 -33.89 -34.131 -34.253 -34.481 -34.643 -34.781 -34.925 -35.246 -35.417 -35.61 -35.817 -36.039 -36.285 -36.589 -37.352 -2 ,30144 ,KEBNE ,16658395,Tue Nov 23 09:18:53 CET,Tue Nov 23 10:41:47 CET,0.0 0.251 0.36 0.475 0.562 0.643 0.704 0.748 0.837 0.881 0.928 0.919 1.009 1.033 1.094 1.128 1.154 1.166 1.179 1.201 1.238 1.257 1.272 1.286 1.308 1.328 1.34 1.358 1.377 1.369 1.34 1.301 1.265 1.22 1.166 1.093 1.017 0.933 0.801 0.635 0.474 0.28 -0.013 -0.321 -0.712 -1.277 -2.05 -3.071 -4.479 -6.469 -9.597 -13.059 -15.693 -17.799 -19.512 -20.965 -22.159 -23.201 -24.092 -24.953 -25.673 -26.285 -26.842 -27.373 -27.874 -28.31 -28.746 -29.138 -29.467 -29.804 -30.152 -30.435 -30.727 -31.024 -31.251 -31.501 -31.761 -32.021 -32.291 -32.474 -32.653 -32.914 -33.103 -33.3 -33.402 -33.61 -33.822 -34.06 -34.182 -34.411 -34.548 -34.671 -34.811 -35.118 -35.278 -35.476 -35.692 -35.896 -36.12 -36.394 -36.981 -3 ,17408 ,KEBNE ,16658396,Tue Nov 23 09:19:54 CET,Tue Nov 23 10:43:36 CET,0.0 0.208 0.342 0.451 0.523 0.567 0.624 0.694 0.808 0.855 0.905 0.921 1.022 1.05 1.088 1.135 1.188 1.206 1.246 1.281 1.307 1.317 1.325 1.337 1.35 1.351 1.356 1.367 1.369 1.358 1.334 1.302 1.273 1.237 1.186 1.113 1.022 0.92 0.789 0.641 0.482 0.292 0.034 -0.315 -0.761 -1.301 -2.057 -3.043 -4.41 -6.455 -9.602 -13.059 -15.734 -17.795 -19.436 -20.87 -22.085 -23.123 -24.014 -24.901 -25.616 -26.234 -26.825 -27.366 -27.881 -28.345 -28.802 -29.2 -29.531 -29.871 -30.223 -30.509 -30.802 -31.106 -31.336 -31.574 -31.824 -32.087 -32.363 -32.541 -32.719 -32.994 -33.175 -33.367 -33.468 -33.674 -33.888 -34.121 -34.241 -34.464 -34.602 -34.744 -34.893 -35.206 -35.376 -35.557 -35.762 -35.999 -36.263 -36.577 -37.116 -4 ,22180 ,KEBNE ,16658397,Tue Nov 23 09:20:56 CET,Tue Nov 23 10:43:18 CET,0.0 0.354 0.507 0.634 0.731 0.812 0.886 0.946 1.032 1.065 1.099 1.081 1.181 1.215 1.258 1.294 1.334 1.354 1.388 1.428 1.48 1.498 1.503 1.506 1.511 1.515 1.517 1.515 1.505 1.495 1.479 1.446 1.401 1.354 1.305 1.244 1.162 1.059 0.924 0.77 0.599 0.371 0.075 -0.26 -0.708 -1.287 -2.034 -3.018 -4.443 -6.468 -9.568 -13.016 -15.678 -17.802 -19.513 -20.963 -22.173 -23.235 -24.133 -24.996 -25.704 -26.321 -26.896 -27.427 -27.923 -28.368 -28.822 -29.223 -29.564 -29.911 -30.246 -30.532 -30.837 -31.145 -31.385 -31.625 -31.873 -32.123 -32.373 -32.547 -32.727 -32.998 -33.187 -33.391 -33.495 -33.698 -33.913 -34.131 -34.245 -34.474 -34.604 -34.739 -34.88 -35.198 -35.375 -35.539 -35.708 -35.905 -36.139 -36.442 -36.853 -5 ,13818 ,KEBNE ,16658398,Tue Nov 23 09:20:56 CET,Tue Nov 23 10:44:16 CET,0.0 0.401 0.542 0.638 0.724 0.797 0.862 0.925 1.017 1.049 1.082 1.067 1.168 1.205 1.261 1.307 1.339 1.351 1.386 1.415 1.448 1.471 1.489 1.493 1.501 1.518 1.53 1.536 1.532 1.525 1.512 1.488 1.448 1.403 1.36 1.289 1.186 1.066 0.939 0.798 0.632 0.412 0.089 -0.293 -0.761 -1.343 -2.125 -3.151 -4.589 -6.633 -9.731 -13.12 -15.736 -17.812 -19.507 -20.97 -22.206 -23.275 -24.157 -25.007 -25.72 -26.34 -26.916 -27.463 -27.977 -28.419 -28.867 -29.28 -29.627 -29.977 -30.333 -30.615 -30.916 -31.234 -31.466 -31.705 -31.963 -32.224 -32.473 -32.639 -32.805 -33.078 -33.283 -33.49 -33.593 -33.782 -33.973 -34.179 -34.289 -34.515 -34.659 -34.791 -34.927 -35.201 -35.343 -35.513 -35.699 -35.902 -36.136 -36.458 -36.975 -6 ,10457 ,KEBNE ,16658399,Tue Nov 23 09:20:56 CET,Tue Nov 23 10:45:03 CET,0.0 0.312 0.495 0.608 0.713 0.798 0.856 0.908 1.012 1.054 1.083 1.079 1.18 1.208 1.245 1.273 1.289 1.299 1.327 1.355 1.387 1.405 1.434 1.472 1.49 1.488 1.478 1.485 1.493 1.488 1.478 1.451 1.422 1.393 1.348 1.296 1.22 1.1 0.959 0.808 0.626 0.384 0.085 -0.259 -0.735 -1.301 -2.049 -3.07 -4.501 -6.55 -9.712 -13.198 -15.857 -17.959 -19.651 -21.114 -22.344 -23.415 -24.312 -25.163 -25.872 -26.497 -27.079 -27.621 -28.132 -28.583 -29.03 -29.426 -29.764 -30.104 -30.442 -30.723 -31.014 -31.316 -31.552 -31.81 -32.08 -32.348 -32.609 -32.781 -32.957 -33.226 -33.414 -33.605 -33.711 -33.934 -34.157 -34.389 -34.504 -34.732 -34.872 -35.0 -35.13 -35.394 -35.549 -35.712 -35.876 -36.041 -36.243 -36.483 -36.863 -7 ,14083 ,KEBNE ,16658400,Tue Nov 23 09:21:59 CET,Tue Nov 23 10:46:17 CET,0.0 0.284 0.435 0.528 0.606 0.674 0.73 0.793 0.903 0.936 0.969 0.961 1.061 1.094 1.154 1.205 1.244 1.26 1.28 1.301 1.34 1.359 1.385 1.41 1.405 1.402 1.404 1.398 1.376 1.346 1.329 1.333 1.33 1.305 1.265 1.212 1.133 1.015 0.869 0.701 0.504 0.267 -0.041 -0.396 -0.855 -1.453 -2.228 -3.199 -4.567 -6.581 -9.702 -13.103 -15.703 -17.789 -19.477 -20.94 -22.191 -23.266 -24.131 -24.978 -25.716 -26.35 -26.929 -27.456 -27.949 -28.393 -28.833 -29.234 -29.572 -29.905 -30.25 -30.54 -30.837 -31.131 -31.356 -31.593 -31.846 -32.11 -32.396 -32.589 -32.771 -33.062 -33.271 -33.475 -33.572 -33.779 -34.001 -34.221 -34.335 -34.558 -34.683 -34.806 -34.946 -35.247 -35.411 -35.604 -35.803 -36.02 -36.264 -36.563 -37.036 -8 ,13504 ,KEBNE ,16658401,Tue Nov 23 09:23:00 CET,Tue Nov 23 10:44:55 CET,0.0 0.384 0.565 0.693 0.779 0.853 0.92 0.974 1.07 1.111 1.142 1.139 1.244 1.27 1.314 1.354 1.384 1.403 1.446 1.48 1.523 1.551 1.574 1.593 1.608 1.621 1.629 1.626 1.625 1.628 1.623 1.608 1.574 1.536 1.498 1.431 1.35 1.251 1.121 0.966 0.787 0.566 0.267 -0.075 -0.53 -1.095 -1.876 -2.907 -4.329 -6.407 -9.573 -13.054 -15.737 -17.859 -19.595 -21.079 -22.305 -23.373 -24.276 -25.141 -25.844 -26.446 -27.009 -27.54 -28.017 -28.444 -28.889 -29.277 -29.621 -29.974 -30.328 -30.615 -30.9 -31.194 -31.422 -31.637 -31.868 -32.126 -32.382 -32.56 -32.744 -33.019 -33.203 -33.399 -33.499 -33.71 -33.934 -34.155 -34.272 -34.504 -34.651 -34.786 -34.933 -35.246 -35.393 -35.552 -35.719 -35.899 -36.16 -36.512 -37.152 -9 ,18809 ,KEBNE ,16658402,Tue Nov 23 09:23:00 CET,Tue Nov 23 10:46:14 CET,0.0 0.415 0.55 0.658 0.76 0.857 0.92 0.983 1.093 1.145 1.199 1.211 1.318 1.352 1.402 1.439 1.471 1.49 1.532 1.57 1.61 1.625 1.642 1.667 1.684 1.695 1.703 1.704 1.701 1.689 1.669 1.644 1.614 1.571 1.509 1.427 1.335 1.23 1.124 0.981 0.788 0.542 0.209 -0.161 -0.623 -1.212 -2.011 -3.077 -4.514 -6.484 -9.558 -12.943 -15.548 -17.667 -19.385 -20.863 -22.104 -23.174 -24.055 -24.911 -25.64 -26.264 -26.852 -27.391 -27.884 -28.331 -28.775 -29.177 -29.523 -29.868 -30.226 -30.516 -30.806 -31.106 -31.343 -31.586 -31.828 -32.08 -32.338 -32.513 -32.688 -32.948 -33.128 -33.314 -33.414 -33.623 -33.831 -34.05 -34.17 -34.401 -34.538 -34.66 -34.794 -35.125 -35.293 -35.463 -35.647 -35.832 -36.105 -36.403 -37.14 -10 ,13326 ,KEBNE ,16658403,Tue Nov 23 09:24:01 CET,Tue Nov 23 10:47:43 CET,0.0 0.336 0.492 0.61 0.701 0.779 0.847 0.907 1.021 1.071 1.11 1.116 1.227 1.259 1.296 1.334 1.377 1.391 1.415 1.43 1.438 1.449 1.465 1.495 1.514 1.514 1.504 1.497 1.491 1.48 1.47 1.448 1.409 1.378 1.332 1.248 1.173 1.068 0.929 0.773 0.602 0.38 0.071 -0.285 -0.736 -1.291 -2.061 -3.066 -4.457 -6.473 -9.56 -13.01 -15.65 -17.721 -19.417 -20.884 -22.101 -23.164 -24.045 -24.902 -25.613 -26.213 -26.804 -27.357 -27.857 -28.318 -28.793 -29.216 -29.565 -29.906 -30.249 -30.533 -30.836 -31.137 -31.363 -31.606 -31.865 -32.129 -32.38 -32.544 -32.715 -32.984 -33.174 -33.367 -33.465 -33.68 -33.9 -34.114 -34.227 -34.462 -34.614 -34.755 -34.907 -35.202 -35.36 -35.533 -35.727 -35.934 -36.144 -36.386 -36.874 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_227.txt deleted file mode 100644 index b4b0aa17..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11514 ,TETRA ,17667934,Fri Dec 3 06:09:18 CET,Fri Dec 3 07:50:20 CET,0.0 0.558 0.783 1.007 1.185 1.327 1.454 1.558 1.755 1.857 1.958 2.064 2.223 2.317 2.492 2.641 2.787 2.865 3.011 3.154 3.354 3.47 3.583 3.742 3.894 4.045 4.188 4.322 4.501 4.679 4.846 5.056 5.255 5.442 5.67 5.931 6.19 6.468 6.76 7.075 7.407 7.771 8.184 8.582 9.043 9.586 10.189 10.826 11.554 12.366 13.191 13.633 13.741 13.763 13.699 13.548 13.37 13.189 13.004 12.793 12.609 12.434 12.267 12.093 11.913 11.752 11.576 11.406 11.259 11.12 10.969 10.83 10.685 10.538 10.426 10.312 10.189 10.054 9.913 9.82 9.722 9.57 9.466 9.365 9.309 9.182 9.058 8.926 8.853 8.714 8.616 8.534 8.446 8.237 8.111 7.971 7.815 7.636 7.427 7.172 6.367 -2 ,32035 ,TETRA ,17667935,Fri Dec 3 06:09:20 CET,Fri Dec 3 07:50:02 CET,0.0 0.593 0.792 0.952 1.085 1.206 1.336 1.465 1.684 1.782 1.871 1.974 2.123 2.203 2.345 2.489 2.645 2.715 2.835 2.951 3.134 3.252 3.362 3.538 3.693 3.822 3.961 4.108 4.306 4.509 4.698 4.908 5.109 5.302 5.523 5.778 6.011 6.268 6.551 6.834 7.145 7.499 7.898 8.301 8.774 9.292 9.87 10.493 11.184 11.971 12.86 13.372 13.459 13.424 13.348 13.218 13.081 12.913 12.713 12.507 12.312 12.119 11.949 11.799 11.655 11.512 11.338 11.165 11.033 10.897 10.745 10.616 10.488 10.349 10.246 10.131 10.01 9.908 9.793 9.706 9.619 9.478 9.373 9.267 9.208 9.081 8.946 8.819 8.761 8.617 8.506 8.421 8.329 8.127 8.025 7.906 7.767 7.619 7.418 7.17 6.717 -3 ,9054 ,TETRA ,17667936,Fri Dec 3 06:09:14 CET,Fri Dec 3 07:49:57 CET,0.0 0.323 0.576 0.732 0.865 1.01 1.148 1.267 1.477 1.576 1.662 1.748 1.889 1.965 2.131 2.293 2.438 2.509 2.651 2.775 2.949 3.067 3.177 3.329 3.473 3.624 3.773 3.91 4.091 4.271 4.451 4.664 4.872 5.076 5.327 5.598 5.84 6.102 6.372 6.664 6.984 7.338 7.743 8.142 8.602 9.127 9.689 10.318 11.055 11.857 12.734 13.234 13.36 13.339 13.256 13.145 13.004 12.813 12.628 12.441 12.266 12.121 11.988 11.835 11.676 11.533 11.383 11.244 11.111 10.974 10.836 10.705 10.575 10.444 10.343 10.243 10.138 10.018 9.885 9.792 9.683 9.481 9.341 9.216 9.154 9.024 8.89 8.743 8.666 8.531 8.444 8.369 8.276 8.042 7.925 7.798 7.656 7.514 7.336 7.125 6.483 -4 ,14539 ,TETRA ,17667937,Fri Dec 3 06:09:16 CET,Fri Dec 3 07:50:10 CET,0.0 0.44 0.637 0.836 1.008 1.16 1.299 1.414 1.618 1.72 1.817 1.94 2.095 2.177 2.329 2.476 2.615 2.683 2.812 2.932 3.121 3.242 3.357 3.524 3.691 3.862 4.019 4.16 4.34 4.507 4.668 4.877 5.098 5.306 5.54 5.809 6.063 6.351 6.664 6.977 7.282 7.624 8.0 8.375 8.843 9.372 9.972 10.58 11.282 12.098 12.914 13.394 13.551 13.558 13.496 13.34 13.143 12.961 12.766 12.546 12.36 12.184 12.013 11.857 11.706 11.546 11.382 11.251 11.139 11.012 10.856 10.725 10.6 10.468 10.358 10.235 10.109 9.978 9.832 9.731 9.639 9.491 9.379 9.282 9.23 9.109 8.973 8.815 8.735 8.599 8.516 8.433 8.333 8.101 7.979 7.839 7.681 7.502 7.277 7.018 6.405 -5 ,11824 ,TETRA ,17667938,Fri Dec 3 06:09:16 CET,Fri Dec 3 07:49:42 CET,0.0 0.757 0.981 1.165 1.331 1.476 1.612 1.752 2.006 2.111 2.215 2.322 2.47 2.558 2.727 2.885 3.041 3.113 3.25 3.383 3.573 3.696 3.819 3.996 4.155 4.306 4.451 4.593 4.776 4.949 5.122 5.33 5.525 5.715 5.93 6.188 6.45 6.737 7.03 7.335 7.663 8.043 8.492 8.919 9.389 9.872 10.444 11.099 11.816 12.605 13.402 13.878 14.013 14.014 13.933 13.771 13.612 13.453 13.3 13.121 12.928 12.719 12.516 12.348 12.207 12.07 11.916 11.788 11.648 11.491 11.342 11.212 11.071 10.927 10.826 10.71 10.579 10.439 10.297 10.205 10.11 9.967 9.864 9.754 9.695 9.559 9.407 9.245 9.159 9.012 8.897 8.793 8.682 8.465 8.352 8.229 8.096 7.961 7.792 7.54 7.007 -6 ,30153 ,TETRA ,17667939,Fri Dec 3 06:09:17 CET,Fri Dec 3 07:49:25 CET,0.0 0.492 0.692 0.843 0.99 1.134 1.279 1.402 1.615 1.716 1.822 1.94 2.085 2.163 2.328 2.494 2.64 2.706 2.823 2.935 3.097 3.202 3.312 3.475 3.625 3.77 3.91 4.045 4.225 4.405 4.575 4.768 4.951 5.134 5.354 5.61 5.858 6.137 6.43 6.736 7.077 7.445 7.86 8.284 8.775 9.297 9.869 10.489 11.202 11.989 12.761 13.241 13.366 13.305 13.207 13.063 12.867 12.669 12.505 12.339 12.181 12.029 11.861 11.682 11.52 11.367 11.205 11.06 10.932 10.797 10.64 10.505 10.375 10.22 10.092 9.972 9.86 9.739 9.596 9.495 9.394 9.236 9.129 9.017 8.96 8.845 8.722 8.588 8.511 8.366 8.263 8.174 8.079 7.853 7.727 7.601 7.451 7.265 7.041 6.744 6.022 -7 ,24453 ,TETRA ,17667940,Fri Dec 3 06:09:16 CET,Fri Dec 3 07:49:44 CET,0.0 0.334 0.567 0.776 0.964 1.112 1.238 1.36 1.574 1.672 1.77 1.886 2.043 2.128 2.283 2.432 2.574 2.637 2.756 2.872 3.047 3.16 3.272 3.443 3.611 3.772 3.922 4.065 4.259 4.451 4.635 4.856 5.07 5.278 5.527 5.797 6.036 6.288 6.554 6.838 7.131 7.493 7.938 8.356 8.826 9.356 9.948 10.56 11.235 12.025 12.925 13.442 13.582 13.595 13.494 13.344 13.171 12.986 12.808 12.582 12.374 12.173 11.965 11.794 11.65 11.514 11.36 11.21 11.067 10.922 10.781 10.656 10.528 10.395 10.281 10.163 10.049 9.924 9.793 9.709 9.614 9.443 9.331 9.218 9.152 9.008 8.874 8.73 8.65 8.499 8.36 8.255 8.158 7.961 7.845 7.709 7.564 7.409 7.237 7.019 6.487 -8 ,7723 ,TETRA ,17667941,Fri Dec 3 06:09:17 CET,Fri Dec 3 07:49:42 CET,0.0 0.499 0.753 0.926 1.091 1.235 1.349 1.462 1.662 1.752 1.836 1.924 2.076 2.156 2.322 2.482 2.62 2.685 2.805 2.933 3.118 3.231 3.351 3.519 3.674 3.83 3.982 4.12 4.284 4.447 4.624 4.843 5.054 5.269 5.51 5.767 6.024 6.31 6.601 6.91 7.23 7.572 7.96 8.372 8.872 9.389 9.963 10.584 11.248 12.045 12.921 13.397 13.476 13.421 13.305 13.125 12.946 12.776 12.605 12.416 12.237 12.071 11.913 11.752 11.589 11.43 11.257 11.096 10.959 10.808 10.628 10.487 10.349 10.226 10.134 10.02 9.909 9.799 9.675 9.585 9.496 9.357 9.254 9.146 9.09 8.977 8.863 8.733 8.659 8.517 8.424 8.337 8.238 8.039 7.934 7.804 7.651 7.489 7.277 7.01 6.324 -9 ,28755 ,TETRA ,17667942,Fri Dec 3 06:09:19 CET,Fri Dec 3 07:49:54 CET,0.0 0.504 0.697 0.864 1.014 1.152 1.281 1.398 1.614 1.716 1.818 1.925 2.077 2.158 2.313 2.47 2.619 2.697 2.85 2.981 3.167 3.282 3.394 3.562 3.716 3.863 4.003 4.146 4.343 4.535 4.714 4.931 5.128 5.31 5.536 5.792 6.034 6.286 6.56 6.863 7.189 7.546 7.951 8.343 8.792 9.314 9.91 10.559 11.296 12.138 12.967 13.418 13.57 13.581 13.482 13.344 13.19 13.025 12.864 12.685 12.508 12.324 12.145 11.982 11.829 11.686 11.544 11.415 11.298 11.168 11.027 10.9 10.761 10.635 10.539 10.433 10.322 10.208 10.079 9.991 9.901 9.745 9.641 9.533 9.475 9.356 9.221 9.069 8.991 8.847 8.74 8.653 8.561 8.349 8.237 8.125 7.996 7.847 7.687 7.482 6.777 -10 ,28493 ,TETRA ,17667943,Fri Dec 3 06:09:20 CET,Fri Dec 3 07:49:43 CET,0.0 0.29 0.492 0.666 0.788 0.901 1.007 1.112 1.303 1.397 1.501 1.624 1.775 1.848 1.979 2.119 2.262 2.332 2.486 2.631 2.829 2.953 3.07 3.229 3.383 3.544 3.7 3.835 4.005 4.174 4.351 4.582 4.789 4.985 5.213 5.457 5.689 5.926 6.203 6.512 6.842 7.207 7.62 8.055 8.536 9.05 9.603 10.206 10.947 11.766 12.633 13.159 13.284 13.227 13.131 13.023 12.882 12.703 12.503 12.301 12.13 11.968 11.802 11.654 11.503 11.352 11.198 11.058 10.936 10.813 10.686 10.566 10.429 10.278 10.158 10.039 9.93 9.809 9.675 9.583 9.496 9.37 9.271 9.165 9.115 9.005 8.868 8.71 8.635 8.497 8.406 8.328 8.246 8.043 7.928 7.816 7.694 7.547 7.371 7.168 6.858 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_235.txt deleted file mode 100644 index d28417e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31172 ,KEBNE ,16658404,Tue Nov 23 09:24:05 CET,Tue Nov 23 10:45:47 CET,0.0 0.309 0.464 0.571 0.683 0.791 0.88 0.948 1.063 1.125 1.19 1.239 1.362 1.418 1.513 1.591 1.668 1.702 1.765 1.825 1.912 1.967 2.015 2.087 2.154 2.219 2.282 2.34 2.412 2.476 2.526 2.565 2.59 2.63 2.678 2.712 2.742 2.763 2.774 2.791 2.789 2.756 2.692 2.591 2.443 2.228 1.904 1.41 0.665 -0.414 -2.225 -4.421 -6.184 -7.65 -8.891 -9.939 -10.816 -11.618 -12.308 -12.984 -13.555 -14.041 -14.485 -14.912 -15.312 -15.676 -16.044 -16.357 -16.639 -16.929 -17.21 -17.449 -17.709 -17.969 -18.167 -18.375 -18.599 -18.825 -19.058 -19.218 -19.377 -19.63 -19.807 -19.992 -20.082 -20.27 -20.482 -20.688 -20.788 -20.996 -21.139 -21.261 -21.383 -21.643 -21.796 -21.965 -22.145 -22.317 -22.519 -22.82 -23.644 -2 ,11152 ,KEBNE ,16658405,Tue Nov 23 09:24:02 CET,Tue Nov 23 10:46:08 CET,0.0 0.468 0.65 0.819 0.962 1.082 1.18 1.253 1.409 1.484 1.549 1.594 1.719 1.774 1.888 2.003 2.095 2.133 2.199 2.262 2.356 2.407 2.458 2.543 2.613 2.665 2.728 2.785 2.845 2.895 2.936 2.994 3.045 3.076 3.109 3.158 3.188 3.193 3.195 3.181 3.163 3.133 3.056 2.945 2.786 2.551 2.186 1.702 1.036 -0.023 -1.905 -4.088 -5.789 -7.202 -8.373 -9.397 -10.281 -11.059 -11.718 -12.382 -12.948 -13.437 -13.893 -14.318 -14.719 -15.103 -15.495 -15.818 -16.105 -16.39 -16.673 -16.919 -17.172 -17.433 -17.644 -17.861 -18.07 -18.295 -18.544 -18.706 -18.86 -19.096 -19.269 -19.447 -19.532 -19.716 -19.913 -20.116 -20.221 -20.431 -20.587 -20.713 -20.842 -21.127 -21.291 -21.463 -21.637 -21.837 -22.1 -22.392 -22.987 -3 ,8034 ,KEBNE ,16658406,Tue Nov 23 09:25:04 CET,Tue Nov 23 10:48:43 CET,0.0 0.489 0.647 0.76 0.854 0.956 1.052 1.147 1.303 1.365 1.43 1.497 1.627 1.669 1.742 1.82 1.897 1.931 1.999 2.073 2.199 2.262 2.303 2.369 2.437 2.501 2.559 2.622 2.695 2.75 2.808 2.865 2.908 2.943 2.988 3.04 3.078 3.111 3.134 3.132 3.1 3.066 2.993 2.888 2.737 2.5 2.191 1.747 1.037 -0.069 -1.924 -4.055 -5.744 -7.159 -8.334 -9.365 -10.262 -11.037 -11.692 -12.361 -12.931 -13.411 -13.858 -14.293 -14.693 -15.036 -15.388 -15.688 -15.956 -16.249 -16.546 -16.788 -17.041 -17.31 -17.515 -17.726 -17.932 -18.144 -18.375 -18.538 -18.708 -18.963 -19.14 -19.322 -19.409 -19.592 -19.793 -20.003 -20.113 -20.324 -20.477 -20.605 -20.739 -21.033 -21.183 -21.335 -21.52 -21.768 -22.031 -22.292 -22.921 -4 ,20440 ,KEBNE ,16658407,Tue Nov 23 09:25:04 CET,Tue Nov 23 10:47:15 CET,0.0 0.379 0.566 0.7 0.834 0.95 1.032 1.11 1.257 1.32 1.381 1.444 1.577 1.635 1.741 1.836 1.924 1.966 2.054 2.127 2.223 2.289 2.35 2.421 2.483 2.55 2.605 2.654 2.728 2.799 2.846 2.896 2.946 2.983 3.03 3.082 3.116 3.13 3.132 3.135 3.119 3.068 2.954 2.832 2.686 2.446 2.093 1.608 0.883 -0.26 -2.128 -4.233 -5.904 -7.331 -8.534 -9.576 -10.485 -11.28 -11.963 -12.625 -13.183 -13.669 -14.122 -14.559 -14.961 -15.324 -15.695 -16.025 -16.305 -16.615 -16.93 -17.172 -17.426 -17.711 -17.93 -18.139 -18.364 -18.595 -18.821 -18.976 -19.139 -19.384 -19.554 -19.725 -19.821 -20.028 -20.233 -20.445 -20.553 -20.762 -20.912 -21.036 -21.176 -21.471 -21.625 -21.788 -21.962 -22.165 -22.434 -22.776 -23.375 -5 ,10530 ,KEBNE ,16658408,Tue Nov 23 09:25:04 CET,Tue Nov 23 10:46:56 CET,0.0 0.477 0.666 0.792 0.913 1.032 1.141 1.239 1.384 1.445 1.503 1.545 1.658 1.7 1.796 1.883 1.948 1.978 2.051 2.119 2.204 2.264 2.33 2.411 2.468 2.527 2.58 2.619 2.663 2.711 2.764 2.831 2.882 2.916 2.958 3.023 3.076 3.089 3.094 3.092 3.075 3.045 2.993 2.908 2.756 2.525 2.179 1.725 1.049 -0.062 -1.961 -4.111 -5.818 -7.282 -8.533 -9.607 -10.495 -11.277 -11.934 -12.595 -13.16 -13.653 -14.128 -14.576 -14.977 -15.341 -15.725 -16.059 -16.352 -16.653 -16.964 -17.217 -17.47 -17.73 -17.932 -18.143 -18.361 -18.584 -18.827 -18.995 -19.149 -19.399 -19.584 -19.761 -19.854 -20.05 -20.259 -20.462 -20.57 -20.784 -20.94 -21.077 -21.216 -21.487 -21.636 -21.808 -21.971 -22.151 -22.421 -22.819 -23.645 -6 ,9045 ,KEBNE ,16658409,Tue Nov 23 09:25:04 CET,Tue Nov 23 10:48:24 CET,0.0 0.265 0.449 0.616 0.743 0.852 0.947 1.027 1.151 1.231 1.319 1.39 1.512 1.559 1.656 1.755 1.837 1.877 1.963 2.043 2.137 2.189 2.236 2.322 2.407 2.466 2.52 2.577 2.644 2.701 2.768 2.841 2.89 2.928 2.972 3.021 3.063 3.088 3.097 3.094 3.064 3.002 2.895 2.748 2.553 2.316 1.98 1.501 0.802 -0.288 -2.132 -4.255 -5.979 -7.419 -8.629 -9.707 -10.63 -11.432 -12.095 -12.75 -13.334 -13.841 -14.28 -14.706 -15.126 -15.492 -15.857 -16.187 -16.47 -16.766 -17.083 -17.349 -17.605 -17.857 -18.051 -18.257 -18.469 -18.697 -18.942 -19.096 -19.254 -19.503 -19.662 -19.841 -19.939 -20.136 -20.337 -20.553 -20.672 -20.885 -21.048 -21.188 -21.339 -21.647 -21.802 -21.967 -22.163 -22.384 -22.63 -22.985 -24.198 -7 ,11252 ,KEBNE ,16658410,Tue Nov 23 09:25:04 CET,Tue Nov 23 10:47:16 CET,0.0 0.39 0.619 0.794 0.908 1.012 1.111 1.189 1.33 1.4 1.461 1.503 1.629 1.681 1.774 1.86 1.94 1.978 2.043 2.097 2.176 2.234 2.293 2.373 2.439 2.495 2.542 2.591 2.65 2.687 2.72 2.777 2.821 2.865 2.913 2.933 2.949 2.968 2.976 2.958 2.927 2.893 2.834 2.727 2.564 2.328 1.976 1.444 0.647 -0.491 -2.341 -4.502 -6.21 -7.638 -8.849 -9.894 -10.792 -11.554 -12.192 -12.83 -13.381 -13.865 -14.315 -14.753 -15.167 -15.54 -15.911 -16.236 -16.516 -16.802 -17.108 -17.364 -17.619 -17.877 -18.073 -18.274 -18.499 -18.727 -18.953 -19.109 -19.263 -19.516 -19.706 -19.9 -19.996 -20.186 -20.385 -20.595 -20.706 -20.927 -21.088 -21.216 -21.35 -21.633 -21.79 -21.949 -22.114 -22.329 -22.575 -22.854 -23.884 -8 ,17904 ,KEBNE ,16658411,Tue Nov 23 09:25:04 CET,Tue Nov 23 10:46:46 CET,0.0 0.547 0.739 0.906 1.041 1.115 1.177 1.248 1.392 1.464 1.532 1.587 1.709 1.755 1.844 1.937 2.016 2.052 2.128 2.193 2.281 2.338 2.385 2.452 2.516 2.574 2.631 2.677 2.735 2.795 2.851 2.912 2.955 3.005 3.072 3.117 3.156 3.196 3.206 3.199 3.18 3.14 3.092 2.991 2.829 2.629 2.285 1.786 1.058 0.005 -1.791 -3.981 -5.696 -7.133 -8.367 -9.45 -10.37 -11.196 -11.878 -12.529 -13.082 -13.562 -14.008 -14.435 -14.835 -15.199 -15.586 -15.929 -16.221 -16.507 -16.793 -17.027 -17.275 -17.533 -17.724 -17.925 -18.138 -18.366 -18.611 -18.775 -18.945 -19.208 -19.379 -19.563 -19.653 -19.83 -20.034 -20.248 -20.361 -20.565 -20.702 -20.836 -20.969 -21.243 -21.409 -21.606 -21.82 -22.067 -22.374 -22.737 -23.529 -9 ,4011 ,KEBNE ,16658412,Tue Nov 23 09:25:04 CET,Tue Nov 23 10:47:12 CET,0.0 0.586 0.767 0.874 0.966 1.073 1.192 1.293 1.456 1.523 1.575 1.606 1.728 1.775 1.852 1.93 2.024 2.069 2.147 2.213 2.293 2.341 2.396 2.492 2.562 2.609 2.66 2.714 2.774 2.82 2.863 2.912 2.955 3.0 3.043 3.076 3.096 3.125 3.142 3.138 3.134 3.11 3.046 2.941 2.783 2.548 2.184 1.68 0.955 -0.166 -2.046 -4.235 -5.949 -7.385 -8.603 -9.661 -10.556 -11.346 -12.02 -12.666 -13.221 -13.744 -14.227 -14.644 -15.021 -15.366 -15.722 -16.045 -16.331 -16.625 -16.93 -17.187 -17.462 -17.726 -17.917 -18.115 -18.328 -18.552 -18.778 -18.933 -19.09 -19.339 -19.516 -19.697 -19.791 -19.986 -20.18 -20.39 -20.498 -20.699 -20.832 -20.963 -21.106 -21.4 -21.554 -21.707 -21.882 -22.079 -22.31 -22.666 -23.462 -10 ,18694 ,KEBNE ,16658413,Tue Nov 23 09:25:04 CET,Tue Nov 23 10:47:00 CET,0.0 0.247 0.42 0.55 0.644 0.735 0.814 0.885 1.025 1.087 1.14 1.184 1.315 1.37 1.452 1.522 1.596 1.629 1.692 1.762 1.852 1.902 1.947 2.019 2.091 2.151 2.21 2.261 2.313 2.361 2.396 2.446 2.496 2.54 2.586 2.617 2.637 2.656 2.666 2.648 2.632 2.6 2.504 2.368 2.189 1.952 1.622 1.171 0.453 -0.664 -2.474 -4.67 -6.469 -7.913 -9.128 -10.192 -11.09 -11.874 -12.571 -13.27 -13.841 -14.333 -14.807 -15.239 -15.615 -15.967 -16.344 -16.67 -16.95 -17.244 -17.547 -17.798 -18.053 -18.315 -18.516 -18.723 -18.943 -19.152 -19.369 -19.526 -19.685 -19.931 -20.094 -20.263 -20.348 -20.535 -20.741 -20.941 -21.044 -21.249 -21.417 -21.561 -21.703 -21.973 -22.104 -22.276 -22.475 -22.682 -22.913 -23.234 -24.156 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_252.txt deleted file mode 100644 index 4b53a6e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7362 ,KEBNE ,16658414,Tue Nov 23 09:26:06 CET,Tue Nov 23 10:48:51 CET,0.0 0.239 0.371 0.488 0.59 0.681 0.761 0.826 0.96 1.018 1.067 1.095 1.209 1.247 1.301 1.352 1.388 1.406 1.432 1.444 1.469 1.494 1.536 1.597 1.621 1.626 1.618 1.614 1.608 1.604 1.602 1.588 1.55 1.483 1.399 1.297 1.206 1.078 0.903 0.703 0.5 0.22 -0.193 -0.636 -1.204 -1.879 -2.779 -3.993 -5.65 -8.045 -11.816 -15.933 -19.027 -21.519 -23.631 -25.461 -26.953 -28.238 -29.321 -30.366 -31.26 -32.077 -32.831 -33.526 -34.165 -34.728 -35.31 -35.824 -36.266 -36.705 -37.151 -37.514 -37.886 -38.269 -38.57 -38.882 -39.203 -39.532 -39.849 -40.064 -40.293 -40.67 -40.931 -41.185 -41.32 -41.606 -41.896 -42.201 -42.352 -42.617 -42.84 -43.033 -43.213 -43.587 -43.804 -44.04 -44.3 -44.597 -44.943 -45.309 -46.144 -2 ,5953 ,KEBNE ,16658415,Tue Nov 23 09:26:06 CET,Tue Nov 23 10:48:09 CET,0.0 0.302 0.441 0.558 0.636 0.712 0.796 0.87 0.986 1.038 1.078 1.083 1.184 1.203 1.246 1.293 1.33 1.349 1.376 1.392 1.425 1.444 1.457 1.479 1.502 1.524 1.544 1.548 1.543 1.53 1.496 1.465 1.456 1.428 1.365 1.279 1.166 1.022 0.857 0.66 0.455 0.211 -0.159 -0.595 -1.168 -1.886 -2.834 -4.062 -5.759 -8.206 -11.94 -16.023 -19.175 -21.695 -23.749 -25.523 -27.017 -28.334 -29.44 -30.529 -31.472 -32.256 -32.974 -33.653 -34.267 -34.835 -35.408 -35.912 -36.339 -36.77 -37.222 -37.586 -37.958 -38.358 -38.677 -39.001 -39.318 -39.639 -39.983 -40.229 -40.493 -40.889 -41.146 -41.402 -41.533 -41.807 -42.102 -42.402 -42.546 -42.812 -43.021 -43.199 -43.389 -43.798 -44.009 -44.222 -44.476 -44.78 -45.126 -45.552 -46.282 -3 ,352 ,KEBNE ,16658416,Tue Nov 23 09:26:06 CET,Tue Nov 23 10:48:07 CET,0.0 0.382 0.55 0.669 0.764 0.85 0.925 0.995 1.129 1.182 1.233 1.261 1.367 1.406 1.464 1.501 1.542 1.561 1.577 1.603 1.659 1.674 1.685 1.703 1.706 1.704 1.697 1.672 1.638 1.628 1.618 1.575 1.518 1.457 1.374 1.27 1.156 1.002 0.826 0.625 0.373 0.062 -0.329 -0.762 -1.327 -2.077 -3.072 -4.335 -6.08 -8.529 -12.293 -16.423 -19.567 -22.088 -24.16 -25.952 -27.457 -28.768 -29.878 -30.957 -31.846 -32.633 -33.369 -34.043 -34.67 -35.221 -35.776 -36.271 -36.71 -37.187 -37.657 -38.018 -38.395 -38.782 -39.092 -39.411 -39.714 -40.024 -40.356 -40.588 -40.83 -41.212 -41.468 -41.718 -41.845 -42.116 -42.405 -42.708 -42.861 -43.136 -43.329 -43.487 -43.656 -44.052 -44.257 -44.469 -44.73 -45.019 -45.365 -45.818 -47.252 -4 ,5889 ,KEBNE ,16658417,Tue Nov 23 09:26:06 CET,Tue Nov 23 10:47:50 CET,0.0 0.399 0.561 0.688 0.786 0.875 0.961 1.022 1.108 1.147 1.195 1.217 1.326 1.354 1.387 1.441 1.491 1.51 1.543 1.558 1.584 1.617 1.653 1.706 1.746 1.751 1.755 1.763 1.765 1.759 1.736 1.684 1.625 1.581 1.528 1.453 1.337 1.183 1.012 0.817 0.581 0.265 -0.138 -0.596 -1.159 -1.86 -2.801 -3.975 -5.604 -7.988 -11.64 -15.745 -18.943 -21.47 -23.517 -25.264 -26.72 -27.986 -29.054 -30.092 -30.953 -31.715 -32.444 -33.11 -33.716 -34.264 -34.827 -35.322 -35.747 -36.175 -36.622 -36.991 -37.365 -37.752 -38.054 -38.364 -38.682 -39.01 -39.328 -39.543 -39.768 -40.127 -40.376 -40.639 -40.779 -41.061 -41.347 -41.64 -41.79 -42.066 -42.267 -42.448 -42.637 -43.043 -43.263 -43.493 -43.764 -44.051 -44.374 -44.832 -46.086 -5 ,2962 ,KEBNE ,16658418,Tue Nov 23 09:26:06 CET,Tue Nov 23 10:48:10 CET,0.0 0.287 0.446 0.584 0.682 0.764 0.828 0.882 0.981 1.021 1.058 1.049 1.148 1.174 1.212 1.245 1.268 1.285 1.341 1.394 1.454 1.488 1.526 1.567 1.581 1.59 1.596 1.595 1.595 1.589 1.569 1.547 1.506 1.45 1.362 1.265 1.171 1.027 0.858 0.642 0.389 0.08 -0.327 -0.74 -1.274 -1.99 -2.956 -4.195 -5.925 -8.419 -12.166 -16.215 -19.367 -21.929 -23.983 -25.759 -27.284 -28.597 -29.702 -30.792 -31.683 -32.481 -33.223 -33.919 -34.561 -35.113 -35.683 -36.18 -36.599 -37.032 -37.466 -37.812 -38.192 -38.591 -38.891 -39.204 -39.52 -39.841 -40.174 -40.409 -40.658 -41.044 -41.308 -41.572 -41.704 -41.981 -42.285 -42.596 -42.749 -43.034 -43.284 -43.462 -43.627 -43.991 -44.223 -44.468 -44.724 -45.01 -45.335 -45.786 -47.0 -6 ,2527 ,KEBNE ,16658419,Tue Nov 23 09:26:06 CET,Tue Nov 23 10:47:39 CET,0.0 0.542 0.746 0.893 1.008 1.08 1.148 1.214 1.344 1.407 1.464 1.498 1.6 1.623 1.665 1.715 1.763 1.784 1.818 1.845 1.871 1.888 1.913 1.939 1.95 1.955 1.955 1.959 1.963 1.956 1.93 1.89 1.857 1.794 1.709 1.604 1.463 1.314 1.152 0.955 0.712 0.389 -0.014 -0.45 -1.031 -1.74 -2.662 -3.914 -5.659 -8.039 -11.694 -15.791 -18.933 -21.475 -23.534 -25.304 -26.81 -28.135 -29.225 -30.287 -31.183 -31.943 -32.667 -33.341 -33.952 -34.508 -35.081 -35.577 -35.997 -36.432 -36.875 -37.24 -37.619 -38.019 -38.336 -38.648 -38.973 -39.329 -39.685 -39.918 -40.149 -40.505 -40.751 -41.014 -41.157 -41.439 -41.718 -42.012 -42.169 -42.459 -42.687 -42.868 -43.071 -43.499 -43.724 -43.962 -44.224 -44.51 -44.832 -45.273 -46.564 -7 ,30089 ,KEBNE ,16658420,Tue Nov 23 09:26:06 CET,Tue Nov 23 10:49:04 CET,0.0 0.529 0.705 0.833 0.938 1.013 1.059 1.1 1.203 1.258 1.307 1.313 1.414 1.455 1.529 1.586 1.648 1.679 1.724 1.754 1.778 1.796 1.81 1.833 1.845 1.831 1.826 1.814 1.79 1.787 1.774 1.725 1.666 1.607 1.551 1.491 1.399 1.264 1.123 0.941 0.716 0.47 0.122 -0.28 -0.793 -1.483 -2.438 -3.679 -5.372 -7.789 -11.499 -15.65 -18.818 -21.382 -23.514 -25.3 -26.764 -28.017 -29.075 -30.117 -30.991 -31.744 -32.457 -33.127 -33.746 -34.301 -34.877 -35.383 -35.811 -36.274 -36.765 -37.163 -37.552 -37.928 -38.222 -38.528 -38.848 -39.176 -39.506 -39.735 -39.962 -40.312 -40.557 -40.812 -40.943 -41.211 -41.486 -41.774 -41.924 -42.199 -42.409 -42.583 -42.768 -43.17 -43.4 -43.64 -43.89 -44.16 -44.468 -44.879 -46.188 -8 ,22867 ,KEBNE ,16658421,Tue Nov 23 09:26:06 CET,Tue Nov 23 10:50:32 CET,0.0 0.352 0.514 0.648 0.751 0.849 0.934 1.007 1.122 1.166 1.209 1.236 1.349 1.381 1.444 1.505 1.551 1.572 1.608 1.631 1.672 1.698 1.708 1.715 1.706 1.697 1.683 1.651 1.63 1.622 1.617 1.613 1.58 1.525 1.477 1.419 1.334 1.213 1.039 0.827 0.622 0.39 0.016 -0.449 -1.027 -1.724 -2.676 -3.956 -5.691 -8.185 -12.038 -16.248 -19.425 -21.928 -23.965 -25.7 -27.151 -28.445 -29.526 -30.582 -31.487 -32.26 -32.986 -33.678 -34.312 -34.876 -35.453 -35.959 -36.385 -36.813 -37.248 -37.626 -38.02 -38.417 -38.715 -39.006 -39.311 -39.637 -39.976 -40.201 -40.426 -40.791 -41.054 -41.328 -41.469 -41.754 -42.042 -42.335 -42.489 -42.767 -42.963 -43.128 -43.305 -43.7 -43.917 -44.156 -44.423 -44.704 -45.017 -45.471 -47.056 -9 ,23880 ,KEBNE ,16658422,Tue Nov 23 09:27:08 CET,Tue Nov 23 10:51:05 CET,0.0 0.347 0.526 0.668 0.758 0.826 0.891 0.965 1.097 1.133 1.154 1.15 1.256 1.288 1.344 1.378 1.419 1.446 1.49 1.541 1.604 1.623 1.632 1.631 1.624 1.633 1.636 1.625 1.606 1.591 1.563 1.495 1.428 1.364 1.292 1.219 1.12 0.991 0.838 0.64 0.412 0.122 -0.246 -0.66 -1.251 -1.993 -2.931 -4.209 -5.973 -8.404 -12.156 -16.207 -19.338 -21.93 -24.036 -25.815 -27.329 -28.648 -29.723 -30.771 -31.67 -32.458 -33.193 -33.871 -34.475 -35.025 -35.597 -36.099 -36.532 -36.965 -37.413 -37.772 -38.131 -38.514 -38.819 -39.141 -39.469 -39.799 -40.13 -40.361 -40.605 -40.975 -41.224 -41.488 -41.623 -41.883 -42.155 -42.466 -42.631 -42.905 -43.112 -43.297 -43.499 -43.923 -44.141 -44.379 -44.632 -44.926 -45.274 -45.71 -46.978 -10 ,29695 ,KEBNE ,16658423,Tue Nov 23 09:27:08 CET,Tue Nov 23 10:48:56 CET,0.0 0.322 0.48 0.613 0.717 0.82 0.925 1.003 1.124 1.172 1.214 1.234 1.34 1.383 1.468 1.539 1.588 1.605 1.655 1.703 1.75 1.777 1.787 1.78 1.778 1.784 1.794 1.795 1.793 1.778 1.746 1.712 1.689 1.658 1.58 1.474 1.385 1.267 1.112 0.912 0.689 0.412 0.02 -0.41 -0.935 -1.597 -2.556 -3.831 -5.529 -7.936 -11.673 -15.78 -18.924 -21.467 -23.557 -25.322 -26.81 -28.133 -29.253 -30.32 -31.185 -31.957 -32.704 -33.392 -34.008 -34.571 -35.157 -35.676 -36.115 -36.554 -37.008 -37.379 -37.756 -38.132 -38.431 -38.746 -39.061 -39.394 -39.739 -39.967 -40.193 -40.545 -40.798 -41.056 -41.186 -41.473 -41.771 -42.074 -42.232 -42.507 -42.714 -42.885 -43.063 -43.46 -43.672 -43.896 -44.141 -44.401 -44.714 -45.178 -46.449 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_57.txt deleted file mode 100644 index 6869b376..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_290_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5374 ,KEBNE ,17043722,Thu Dec 23 05:14:38 CET,Thu Dec 23 06:41:12 CET,0.0 0.29 0.459 0.609 0.743 0.848 0.948 1.051 1.262 1.358 1.437 1.525 1.666 1.732 1.875 2.023 2.154 2.212 2.328 2.448 2.624 2.736 2.844 2.989 3.121 3.256 3.4 3.534 3.701 3.852 4.008 4.195 4.362 4.528 4.725 4.959 5.165 5.372 5.594 5.838 6.12 6.448 6.815 7.16 7.541 7.943 8.416 8.933 9.478 10.063 10.674 10.989 11.006 10.846 10.657 10.474 10.27 10.074 9.899 9.685 9.473 9.274 9.085 8.91 8.734 8.559 8.365 8.191 8.039 7.886 7.741 7.601 7.45 7.304 7.178 7.047 6.914 6.784 6.66 6.571 6.464 6.299 6.189 6.064 6.002 5.895 5.777 5.643 5.566 5.41 5.298 5.212 5.108 4.836 4.691 4.562 4.432 4.28 4.082 3.813 3.289 -2 ,4662 ,KEBNE ,17043723,Thu Dec 23 05:14:38 CET,Thu Dec 23 06:42:28 CET,0.0 0.538 0.75 0.921 1.055 1.167 1.283 1.387 1.579 1.667 1.748 1.831 1.974 2.047 2.194 2.326 2.445 2.505 2.623 2.741 2.92 3.039 3.156 3.304 3.446 3.601 3.735 3.86 4.028 4.188 4.338 4.521 4.701 4.887 5.103 5.324 5.524 5.735 5.971 6.252 6.538 6.83 7.18 7.544 7.961 8.428 8.935 9.433 9.962 10.541 11.077 11.324 11.308 11.162 10.974 10.766 10.549 10.326 10.109 9.893 9.714 9.555 9.408 9.247 9.081 8.929 8.766 8.611 8.477 8.342 8.198 8.072 7.929 7.787 7.673 7.543 7.407 7.26 7.106 7.008 6.91 6.735 6.608 6.48 6.418 6.308 6.185 6.034 5.961 5.821 5.739 5.66 5.57 5.371 5.252 5.114 4.972 4.816 4.622 4.41 4.046 -3 ,30204 ,KEBNE ,17043724,Thu Dec 23 05:14:38 CET,Thu Dec 23 06:42:28 CET,0.0 0.568 0.743 0.892 1.028 1.149 1.269 1.372 1.564 1.658 1.744 1.843 1.987 2.061 2.188 2.312 2.426 2.48 2.591 2.699 2.858 2.964 3.06 3.219 3.382 3.532 3.677 3.812 3.987 4.144 4.278 4.452 4.633 4.805 5.003 5.207 5.402 5.619 5.862 6.132 6.389 6.687 7.092 7.481 7.879 8.285 8.733 9.256 9.858 10.487 11.12 11.464 11.499 11.421 11.197 10.95 10.725 10.49 10.282 10.056 9.834 9.617 9.425 9.252 9.076 8.904 8.728 8.564 8.414 8.261 8.096 7.961 7.837 7.711 7.602 7.481 7.359 7.249 7.131 7.038 6.94 6.785 6.674 6.56 6.505 6.37 6.22 6.089 6.021 5.879 5.764 5.675 5.595 5.404 5.278 5.141 4.986 4.815 4.624 4.379 3.726 -4 ,19796 ,KEBNE ,17043725,Thu Dec 23 05:14:38 CET,Thu Dec 23 06:42:51 CET,0.0 0.34 0.518 0.66 0.8 0.923 1.04 1.152 1.339 1.422 1.505 1.592 1.741 1.828 1.985 2.112 2.243 2.311 2.437 2.554 2.711 2.81 2.907 3.061 3.221 3.36 3.494 3.636 3.805 3.964 4.114 4.277 4.459 4.642 4.836 5.048 5.252 5.472 5.692 5.925 6.182 6.477 6.824 7.198 7.613 8.018 8.502 9.054 9.643 10.23 10.737 11.001 10.992 10.864 10.691 10.506 10.304 10.092 9.919 9.746 9.544 9.338 9.136 8.941 8.772 8.613 8.436 8.263 8.115 7.974 7.829 7.695 7.536 7.365 7.239 7.11 6.981 6.857 6.726 6.635 6.544 6.375 6.242 6.121 6.059 5.927 5.794 5.643 5.561 5.418 5.317 5.222 5.115 4.874 4.746 4.598 4.422 4.221 4.023 3.794 3.095 -5 ,24192 ,KEBNE ,17043726,Thu Dec 23 05:14:38 CET,Thu Dec 23 06:43:06 CET,0.0 0.345 0.549 0.694 0.82 0.94 1.046 1.149 1.346 1.435 1.521 1.61 1.749 1.822 1.962 2.099 2.226 2.289 2.424 2.542 2.708 2.821 2.921 3.046 3.173 3.303 3.438 3.56 3.712 3.861 3.999 4.18 4.367 4.545 4.743 4.964 5.179 5.408 5.649 5.9 6.164 6.458 6.792 7.142 7.564 8.011 8.496 8.992 9.536 10.149 10.719 11.003 10.976 10.77 10.542 10.308 10.066 9.825 9.596 9.352 9.13 8.939 8.767 8.592 8.424 8.266 8.097 7.94 7.774 7.599 7.437 7.3 7.161 7.019 6.906 6.792 6.663 6.503 6.323 6.213 6.105 5.931 5.819 5.698 5.634 5.506 5.361 5.201 5.121 4.963 4.828 4.731 4.643 4.438 4.316 4.171 4.001 3.819 3.609 3.329 2.65 -6 ,20024 ,KEBNE ,17043727,Thu Dec 23 05:14:38 CET,Thu Dec 23 06:42:39 CET,0.0 0.458 0.653 0.776 0.903 1.024 1.136 1.249 1.443 1.525 1.612 1.707 1.852 1.929 2.065 2.181 2.3 2.36 2.471 2.576 2.734 2.838 2.946 3.099 3.253 3.409 3.546 3.674 3.832 3.983 4.128 4.307 4.494 4.676 4.882 5.103 5.313 5.544 5.786 6.061 6.374 6.705 7.063 7.417 7.828 8.294 8.803 9.343 9.93 10.546 11.184 11.51 11.53 11.385 11.175 10.945 10.736 10.552 10.343 10.109 9.916 9.736 9.55 9.359 9.178 9.017 8.834 8.671 8.533 8.385 8.231 8.099 7.975 7.856 7.75 7.629 7.499 7.37 7.234 7.13 7.021 6.853 6.737 6.62 6.557 6.41 6.266 6.125 6.046 5.887 5.762 5.674 5.581 5.368 5.243 5.121 4.979 4.8 4.606 4.385 3.89 -7 ,939 ,KEBNE ,17043728,Thu Dec 23 05:14:38 CET,Thu Dec 23 06:42:58 CET,0.0 0.648 0.842 0.977 1.09 1.197 1.307 1.403 1.587 1.68 1.765 1.858 2.008 2.086 2.23 2.366 2.49 2.549 2.665 2.779 2.943 3.045 3.139 3.286 3.431 3.569 3.704 3.829 3.991 4.14 4.284 4.462 4.637 4.811 5.0 5.215 5.433 5.685 5.947 6.209 6.469 6.748 7.085 7.432 7.823 8.239 8.728 9.27 9.851 10.413 10.966 11.247 11.251 11.119 10.915 10.688 10.491 10.297 10.1 9.91 9.718 9.52 9.335 9.14 8.943 8.766 8.588 8.435 8.3 8.15 7.994 7.864 7.732 7.586 7.474 7.364 7.247 7.113 6.968 6.874 6.769 6.602 6.486 6.371 6.31 6.181 6.046 5.893 5.811 5.652 5.524 5.421 5.317 5.12 5.014 4.889 4.742 4.569 4.377 4.155 3.68 -8 ,12133 ,KEBNE ,17043729,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 06:47:47 CET,0.0 0.221 0.383 0.531 0.673 0.799 0.922 1.045 1.251 1.334 1.415 1.502 1.65 1.723 1.856 1.987 2.117 2.182 2.312 2.433 2.592 2.698 2.797 2.934 3.071 3.212 3.339 3.455 3.615 3.77 3.925 4.108 4.275 4.446 4.64 4.849 5.06 5.293 5.556 5.842 6.114 6.384 6.692 7.03 7.431 7.85 8.292 8.805 9.38 9.954 10.513 10.778 10.75 10.614 10.443 10.241 10.042 9.825 9.604 9.373 9.157 8.936 8.736 8.565 8.385 8.219 8.043 7.879 7.753 7.618 7.461 7.339 7.216 7.077 6.961 6.827 6.667 6.499 6.341 6.236 6.138 5.978 5.861 5.744 5.682 5.553 5.411 5.261 5.185 5.028 4.915 4.828 4.737 4.534 4.419 4.298 4.166 4.006 3.819 3.615 3.204 -9 ,31334 ,KEBNE ,17043730,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 06:47:28 CET,0.0 0.315 0.529 0.705 0.831 0.949 1.069 1.178 1.378 1.462 1.538 1.62 1.76 1.837 1.99 2.14 2.27 2.321 2.42 2.523 2.69 2.802 2.906 3.049 3.179 3.311 3.45 3.581 3.733 3.893 4.045 4.224 4.407 4.567 4.749 4.972 5.18 5.41 5.668 5.927 6.197 6.509 6.872 7.233 7.638 8.065 8.54 9.08 9.68 10.264 10.801 11.062 11.098 10.995 10.77 10.504 10.262 10.055 9.861 9.605 9.358 9.138 8.941 8.755 8.565 8.395 8.212 8.041 7.9 7.752 7.588 7.45 7.31 7.164 7.055 6.947 6.824 6.683 6.535 6.441 6.34 6.17 6.053 5.934 5.872 5.733 5.592 5.452 5.383 5.241 5.147 5.06 4.96 4.737 4.616 4.495 4.367 4.216 4.053 3.874 3.488 -10 ,28525 ,KEBNE ,17043731,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 06:45:58 CET,0.0 0.833 1.023 1.183 1.312 1.421 1.518 1.611 1.798 1.9 1.992 2.088 2.239 2.318 2.46 2.592 2.717 2.773 2.896 3.02 3.18 3.287 3.4 3.564 3.716 3.852 3.968 4.087 4.247 4.403 4.556 4.726 4.895 5.068 5.261 5.479 5.702 5.945 6.198 6.453 6.719 7.027 7.381 7.734 8.128 8.565 9.052 9.55 10.109 10.737 11.35 11.536 11.473 11.36 11.182 10.961 10.713 10.487 10.284 10.059 9.838 9.617 9.389 9.186 9.007 8.845 8.687 8.534 8.405 8.267 8.101 7.966 7.843 7.715 7.603 7.481 7.357 7.229 7.097 7.001 6.89 6.717 6.595 6.465 6.397 6.253 6.109 5.966 5.898 5.756 5.657 5.564 5.465 5.263 5.147 5.018 4.889 4.735 4.529 4.273 3.681 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_30_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_30_42.txt deleted file mode 100644 index aceecc2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_30_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31936 ,KEBNE ,16658434,Tue Nov 23 09:28:09 CET,Tue Nov 23 10:49:45 CET,0.0 1.232 1.652 1.903 2.123 2.321 2.508 2.655 2.887 3.004 3.126 3.299 3.461 3.56 3.741 3.908 4.053 4.12 4.248 4.369 4.535 4.635 4.734 4.879 5.009 5.136 5.262 5.381 5.525 5.662 5.792 5.938 6.081 6.222 6.386 6.565 6.721 6.882 7.041 7.198 7.36 7.533 7.693 7.806 7.907 7.958 7.914 7.759 7.441 6.734 5.4 3.751 2.242 0.924 -0.168 -1.087 -1.912 -2.664 -3.321 -3.972 -4.507 -4.972 -5.401 -5.81 -6.182 -6.519 -6.863 -7.168 -7.435 -7.7 -7.964 -8.178 -8.406 -8.653 -8.835 -9.014 -9.196 -9.398 -9.618 -9.766 -9.909 -10.134 -10.303 -10.468 -10.547 -10.72 -10.901 -11.078 -11.169 -11.338 -11.461 -11.564 -11.679 -11.931 -12.077 -12.247 -12.423 -12.581 -12.79 -13.102 -13.804 -2 ,6985 ,KEBNE ,16658435,Tue Nov 23 09:28:09 CET,Tue Nov 23 10:49:57 CET,0.0 0.872 1.236 1.527 1.747 1.935 2.114 2.266 2.526 2.643 2.757 2.901 3.051 3.14 3.305 3.467 3.631 3.706 3.841 3.967 4.14 4.252 4.362 4.507 4.632 4.752 4.872 4.993 5.148 5.296 5.438 5.605 5.754 5.883 6.016 6.156 6.294 6.454 6.616 6.779 6.925 7.045 7.164 7.287 7.391 7.396 7.359 7.197 6.831 6.223 4.991 3.224 1.803 0.602 -0.464 -1.411 -2.242 -2.961 -3.56 -4.173 -4.689 -5.136 -5.578 -5.995 -6.353 -6.673 -7.027 -7.341 -7.603 -7.864 -8.134 -8.371 -8.622 -8.882 -9.08 -9.285 -9.492 -9.698 -9.914 -10.061 -10.206 -10.44 -10.611 -10.781 -10.867 -11.049 -11.247 -11.434 -11.522 -11.696 -11.854 -11.962 -12.076 -12.328 -12.462 -12.616 -12.77 -12.921 -13.103 -13.339 -13.978 -3 ,24807 ,KEBNE ,16658436,Tue Nov 23 09:28:10 CET,Tue Nov 23 10:49:11 CET,0.0 1.414 1.728 1.96 2.149 2.307 2.462 2.607 2.848 2.962 3.071 3.215 3.372 3.47 3.659 3.824 3.977 4.05 4.18 4.307 4.481 4.589 4.698 4.85 4.986 5.126 5.263 5.379 5.512 5.641 5.771 5.933 6.076 6.217 6.38 6.54 6.701 6.876 7.029 7.166 7.294 7.427 7.558 7.653 7.706 7.704 7.62 7.446 7.12 6.418 5.124 3.517 2.101 0.797 -0.333 -1.297 -2.127 -2.859 -3.458 -4.051 -4.571 -5.019 -5.445 -5.855 -6.224 -6.56 -6.903 -7.203 -7.464 -7.733 -8.011 -8.239 -8.465 -8.694 -8.875 -9.06 -9.258 -9.461 -9.66 -9.797 -9.944 -10.175 -10.34 -10.519 -10.603 -10.77 -10.94 -11.11 -11.204 -11.386 -11.539 -11.655 -11.776 -12.064 -12.227 -12.389 -12.551 -12.727 -12.973 -13.297 -13.883 -4 ,7629 ,KEBNE ,16658437,Tue Nov 23 09:28:10 CET,Tue Nov 23 10:49:24 CET,0.0 1.207 1.56 1.802 1.997 2.182 2.355 2.518 2.813 2.942 3.066 3.229 3.382 3.474 3.64 3.776 3.917 3.991 4.126 4.258 4.449 4.566 4.677 4.834 4.975 5.1 5.231 5.353 5.502 5.645 5.779 5.929 6.068 6.204 6.35 6.503 6.656 6.805 6.941 7.075 7.202 7.359 7.524 7.621 7.676 7.686 7.635 7.458 7.076 6.405 5.095 3.42 1.988 0.696 -0.391 -1.326 -2.16 -2.912 -3.527 -4.092 -4.571 -5.012 -5.428 -5.826 -6.205 -6.54 -6.896 -7.217 -7.486 -7.762 -8.038 -8.259 -8.495 -8.731 -8.907 -9.102 -9.317 -9.532 -9.736 -9.879 -10.034 -10.264 -10.414 -10.581 -10.664 -10.833 -11.031 -11.22 -11.316 -11.493 -11.622 -11.74 -11.865 -12.121 -12.257 -12.409 -12.587 -12.801 -13.023 -13.217 -13.701 -5 ,21989 ,KEBNE ,16658438,Tue Nov 23 09:28:10 CET,Tue Nov 23 10:48:48 CET,0.0 1.271 1.609 1.848 2.063 2.254 2.411 2.55 2.793 2.923 3.055 3.207 3.357 3.439 3.601 3.766 3.916 3.984 4.132 4.26 4.439 4.553 4.658 4.814 4.953 5.083 5.219 5.348 5.51 5.662 5.794 5.947 6.086 6.227 6.384 6.558 6.721 6.878 7.028 7.169 7.326 7.506 7.669 7.789 7.877 7.892 7.818 7.603 7.223 6.616 5.372 3.671 2.239 0.996 -0.112 -1.11 -1.931 -2.642 -3.271 -3.897 -4.431 -4.897 -5.333 -5.725 -6.092 -6.432 -6.793 -7.11 -7.37 -7.636 -7.907 -8.128 -8.356 -8.607 -8.807 -8.998 -9.192 -9.398 -9.606 -9.756 -9.902 -10.114 -10.263 -10.421 -10.51 -10.7 -10.897 -11.094 -11.191 -11.373 -11.545 -11.669 -11.792 -12.04 -12.169 -12.317 -12.481 -12.661 -12.862 -13.072 -13.78 -6 ,3691 ,KEBNE ,16658439,Tue Nov 23 09:28:10 CET,Tue Nov 23 10:49:17 CET,0.0 1.387 1.68 1.916 2.136 2.33 2.494 2.641 2.92 3.042 3.15 3.284 3.434 3.526 3.68 3.814 3.963 4.033 4.166 4.307 4.512 4.642 4.755 4.889 5.016 5.148 5.27 5.385 5.544 5.69 5.812 5.961 6.119 6.27 6.42 6.572 6.702 6.832 6.968 7.116 7.26 7.392 7.527 7.648 7.753 7.831 7.84 7.681 7.319 6.695 5.416 3.721 2.282 0.954 -0.166 -1.139 -1.961 -2.657 -3.26 -3.852 -4.355 -4.821 -5.263 -5.659 -6.027 -6.369 -6.724 -7.04 -7.298 -7.558 -7.843 -8.082 -8.316 -8.548 -8.732 -8.918 -9.109 -9.308 -9.516 -9.662 -9.811 -10.032 -10.189 -10.359 -10.443 -10.616 -10.796 -10.98 -11.079 -11.254 -11.411 -11.533 -11.66 -11.933 -12.072 -12.222 -12.395 -12.605 -12.824 -13.073 -13.704 -7 ,2681 ,KEBNE ,16658440,Tue Nov 23 09:28:10 CET,Tue Nov 23 10:49:29 CET,0.0 0.943 1.307 1.603 1.837 2.03 2.204 2.353 2.593 2.699 2.809 2.958 3.108 3.194 3.375 3.536 3.674 3.743 3.869 3.984 4.157 4.267 4.375 4.534 4.667 4.792 4.913 5.027 5.182 5.325 5.474 5.656 5.795 5.91 6.047 6.196 6.329 6.476 6.618 6.766 6.926 7.081 7.236 7.354 7.422 7.436 7.406 7.275 6.983 6.43 5.216 3.507 2.06 0.839 -0.207 -1.142 -1.973 -2.72 -3.345 -3.941 -4.436 -4.89 -5.325 -5.713 -6.064 -6.385 -6.737 -7.054 -7.306 -7.568 -7.852 -8.085 -8.32 -8.555 -8.743 -8.937 -9.135 -9.338 -9.54 -9.678 -9.824 -10.062 -10.225 -10.393 -10.479 -10.648 -10.83 -11.023 -11.123 -11.299 -11.448 -11.569 -11.681 -11.905 -12.04 -12.188 -12.328 -12.468 -12.617 -12.845 -13.505 -8 ,32064 ,KEBNE ,16658441,Tue Nov 23 09:29:11 CET,Tue Nov 23 10:51:19 CET,0.0 1.121 1.407 1.647 1.855 2.022 2.169 2.302 2.569 2.702 2.817 2.938 3.084 3.173 3.35 3.522 3.678 3.752 3.885 4.012 4.19 4.297 4.406 4.561 4.701 4.831 4.955 5.076 5.222 5.362 5.517 5.697 5.844 5.973 6.097 6.239 6.401 6.565 6.709 6.844 6.974 7.093 7.214 7.299 7.346 7.368 7.312 7.089 6.749 6.109 4.776 3.143 1.7 0.433 -0.662 -1.635 -2.484 -3.226 -3.832 -4.456 -4.987 -5.447 -5.87 -6.272 -6.66 -6.987 -7.308 -7.605 -7.875 -8.15 -8.421 -8.64 -8.864 -9.102 -9.288 -9.477 -9.667 -9.871 -10.087 -10.228 -10.373 -10.604 -10.766 -10.93 -11.014 -11.196 -11.392 -11.6 -11.706 -11.884 -12.035 -12.155 -12.276 -12.556 -12.718 -12.892 -13.057 -13.249 -13.511 -13.782 -14.873 -9 ,13890 ,KEBNE ,16658442,Tue Nov 23 09:29:11 CET,Tue Nov 23 10:50:54 CET,0.0 0.999 1.3 1.537 1.746 1.915 2.051 2.19 2.478 2.599 2.703 2.827 2.98 3.07 3.247 3.423 3.57 3.637 3.773 3.896 4.073 4.193 4.305 4.461 4.614 4.748 4.877 5.01 5.165 5.297 5.42 5.558 5.697 5.844 6.002 6.175 6.348 6.499 6.632 6.786 6.938 7.074 7.227 7.346 7.435 7.481 7.425 7.244 6.887 6.18 4.805 3.086 1.594 0.322 -0.729 -1.659 -2.473 -3.212 -3.851 -4.483 -5.002 -5.454 -5.878 -6.252 -6.602 -6.933 -7.285 -7.587 -7.831 -8.091 -8.369 -8.592 -8.833 -9.085 -9.278 -9.484 -9.683 -9.883 -10.091 -10.222 -10.363 -10.595 -10.751 -10.917 -11.004 -11.181 -11.36 -11.563 -11.668 -11.847 -11.99 -12.106 -12.22 -12.456 -12.595 -12.759 -12.933 -13.124 -13.337 -13.61 -14.1 -10 ,12228 ,KEBNE ,16658443,Tue Nov 23 09:29:11 CET,Tue Nov 23 10:50:58 CET,0.0 0.989 1.335 1.598 1.848 2.041 2.19 2.327 2.574 2.683 2.795 2.969 3.128 3.216 3.377 3.526 3.674 3.744 3.89 4.033 4.218 4.329 4.434 4.578 4.704 4.839 4.985 5.116 5.28 5.421 5.538 5.699 5.854 5.986 6.134 6.293 6.439 6.586 6.745 6.895 7.036 7.19 7.357 7.506 7.617 7.669 7.631 7.498 7.234 6.618 5.304 3.576 2.145 0.95 -0.072 -0.987 -1.798 -2.549 -3.18 -3.75 -4.242 -4.695 -5.114 -5.52 -5.886 -6.214 -6.57 -6.888 -7.153 -7.42 -7.69 -7.911 -8.148 -8.39 -8.567 -8.754 -8.949 -9.153 -9.37 -9.521 -9.67 -9.892 -10.043 -10.193 -10.278 -10.457 -10.654 -10.867 -10.971 -11.149 -11.307 -11.427 -11.545 -11.78 -11.913 -12.057 -12.223 -12.417 -12.64 -12.895 -13.554 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_338_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_338_252.txt deleted file mode 100644 index 96d9eff8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_338_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,843 ,KEBNE ,16658444,Tue Nov 23 09:29:15 CET,Tue Nov 23 10:48:52 CET,0.0 0.669 0.947 1.137 1.298 1.447 1.579 1.692 1.907 2.002 2.1 2.168 2.363 2.44 2.593 2.737 2.871 2.937 3.07 3.197 3.35 3.446 3.56 3.72 3.85 3.98 4.113 4.238 4.395 4.555 4.715 4.883 5.036 5.187 5.353 5.539 5.713 5.901 6.111 6.33 6.56 6.797 7.035 7.267 7.551 7.849 8.14 8.383 8.582 8.697 8.604 8.166 7.601 7.102 6.653 6.207 5.811 5.414 5.056 4.707 4.4 4.136 3.88 3.617 3.384 3.176 2.961 2.768 2.589 2.393 2.189 2.027 1.853 1.678 1.556 1.425 1.259 1.089 0.931 0.809 0.677 0.483 0.35 0.206 0.135 -0.008 -0.178 -0.359 -0.458 -0.683 -0.768 -0.877 -1.0 -1.265 -1.395 -1.526 -1.677 -1.852 -2.053 -2.283 -2.663 -2 ,30734 ,KEBNE ,16658445,Tue Nov 23 09:29:11 CET,Tue Nov 23 10:52:31 CET,0.0 0.756 1.033 1.243 1.422 1.584 1.735 1.857 2.069 2.173 2.265 2.33 2.542 2.625 2.778 2.923 3.058 3.121 3.241 3.352 3.517 3.629 3.735 3.885 4.033 4.19 4.344 4.483 4.638 4.776 4.905 5.063 5.221 5.375 5.548 5.728 5.904 6.093 6.303 6.508 6.701 6.925 7.17 7.402 7.639 7.885 8.176 8.452 8.671 8.817 8.755 8.344 7.819 7.262 6.741 6.262 5.829 5.457 5.148 4.821 4.52 4.263 4.025 3.791 3.578 3.377 3.159 2.954 2.77 2.586 2.392 2.23 2.045 1.848 1.706 1.56 1.395 1.216 1.047 0.931 0.808 0.614 0.477 0.325 0.248 0.09 -0.076 -0.257 -0.356 -0.563 -0.628 -0.741 -0.849 -1.084 -1.226 -1.392 -1.589 -1.801 -2.049 -2.344 -2.81 -3 ,30838 ,KEBNE ,16658446,Tue Nov 23 09:29:11 CET,Tue Nov 23 10:51:45 CET,0.0 0.668 0.972 1.182 1.344 1.498 1.627 1.747 1.987 2.091 2.188 2.257 2.482 2.581 2.744 2.89 3.027 3.089 3.212 3.337 3.514 3.612 3.7 3.861 4.028 4.184 4.336 4.474 4.654 4.816 4.949 5.112 5.292 5.439 5.6 5.806 5.98 6.149 6.337 6.532 6.72 6.925 7.181 7.438 7.696 7.952 8.243 8.528 8.748 8.837 8.721 8.276 7.672 7.118 6.625 6.168 5.78 5.399 5.064 4.723 4.406 4.136 3.869 3.594 3.346 3.132 2.91 2.718 2.553 2.374 2.177 1.999 1.82 1.641 1.511 1.375 1.222 1.065 0.92 0.82 0.709 0.546 0.433 0.282 0.197 0.038 -0.119 -0.271 -0.348 -0.56 -0.636 -0.734 -0.836 -1.118 -1.279 -1.432 -1.608 -1.788 -2.027 -2.34 -2.93 -4 ,18687 ,KEBNE ,16658447,Tue Nov 23 09:29:10 CET,Tue Nov 23 10:52:32 CET,0.0 0.516 0.744 0.915 1.088 1.241 1.395 1.535 1.722 1.812 1.914 1.997 2.213 2.297 2.447 2.582 2.712 2.778 2.898 3.006 3.158 3.257 3.351 3.511 3.669 3.81 3.956 4.085 4.242 4.389 4.522 4.675 4.819 4.96 5.139 5.338 5.495 5.664 5.859 6.05 6.246 6.482 6.737 6.97 7.243 7.525 7.792 8.05 8.255 8.294 8.058 7.588 7.081 6.613 6.199 5.793 5.385 4.997 4.643 4.28 3.981 3.693 3.404 3.135 2.9 2.691 2.473 2.277 2.102 1.917 1.703 1.523 1.344 1.141 0.986 0.827 0.661 0.497 0.322 0.196 0.077 -0.091 -0.225 -0.378 -0.457 -0.615 -0.776 -0.943 -1.03 -1.247 -1.324 -1.436 -1.569 -1.839 -1.975 -2.137 -2.316 -2.515 -2.727 -2.972 -3.436 -5 ,21009 ,KEBNE ,16658448,Tue Nov 23 09:29:11 CET,Tue Nov 23 10:51:33 CET,0.0 0.617 0.874 1.051 1.204 1.339 1.47 1.6 1.819 1.93 2.039 2.121 2.321 2.389 2.53 2.677 2.83 2.902 3.022 3.133 3.305 3.426 3.534 3.681 3.839 3.984 4.111 4.235 4.401 4.575 4.734 4.887 5.026 5.158 5.304 5.479 5.668 5.873 6.071 6.261 6.469 6.691 6.924 7.152 7.394 7.642 7.913 8.179 8.42 8.567 8.44 7.93 7.402 6.924 6.451 5.973 5.555 5.17 4.797 4.447 4.158 3.863 3.578 3.317 3.067 2.839 2.614 2.425 2.251 2.05 1.844 1.662 1.471 1.267 1.107 0.946 0.766 0.595 0.423 0.301 0.191 0.022 -0.1 -0.231 -0.297 -0.426 -0.563 -0.715 -0.802 -1.012 -1.122 -1.256 -1.365 -1.578 -1.713 -1.863 -2.019 -2.193 -2.425 -2.752 -3.361 -6 ,11929 ,KEBNE ,16658449,Tue Nov 23 09:30:12 CET,Tue Nov 23 10:53:12 CET,0.0 0.345 0.581 0.774 0.932 1.063 1.196 1.318 1.558 1.668 1.769 1.836 2.045 2.139 2.322 2.482 2.621 2.684 2.817 2.953 3.122 3.216 3.334 3.502 3.636 3.775 3.909 4.029 4.192 4.347 4.475 4.621 4.771 4.924 5.094 5.291 5.472 5.655 5.856 6.065 6.266 6.471 6.71 6.964 7.249 7.527 7.789 8.008 8.199 8.322 8.181 7.726 7.252 6.786 6.346 5.91 5.5 5.124 4.773 4.423 4.114 3.836 3.569 3.305 3.068 2.849 2.623 2.428 2.264 2.101 1.92 1.75 1.566 1.382 1.24 1.104 0.959 0.79 0.615 0.499 0.379 0.178 0.032 -0.119 -0.199 -0.355 -0.485 -0.627 -0.718 -0.937 -1.003 -1.105 -1.208 -1.404 -1.526 -1.67 -1.831 -2.014 -2.264 -2.625 -3.274 -7 ,10692 ,KEBNE ,16658450,Tue Nov 23 09:30:12 CET,Tue Nov 23 10:53:27 CET,0.0 0.597 0.872 1.082 1.256 1.41 1.55 1.688 1.926 2.027 2.119 2.169 2.367 2.439 2.571 2.698 2.836 2.91 3.046 3.165 3.331 3.436 3.537 3.672 3.805 3.937 4.06 4.191 4.367 4.526 4.676 4.847 5.007 5.151 5.31 5.488 5.663 5.843 6.022 6.227 6.452 6.681 6.905 7.128 7.389 7.663 7.927 8.141 8.373 8.556 8.472 8.056 7.546 7.034 6.544 6.105 5.741 5.351 4.981 4.63 4.338 4.069 3.802 3.56 3.321 3.095 2.867 2.671 2.501 2.321 2.116 1.952 1.792 1.609 1.464 1.319 1.177 1.023 0.861 0.752 0.626 0.409 0.249 0.095 0.026 -0.126 -0.302 -0.491 -0.581 -0.784 -0.836 -0.937 -1.045 -1.282 -1.402 -1.544 -1.709 -1.904 -2.149 -2.465 -3.115 -8 ,27341 ,KEBNE ,16658451,Tue Nov 23 09:30:12 CET,Tue Nov 23 10:52:52 CET,0.0 0.526 0.792 0.995 1.177 1.347 1.495 1.621 1.811 1.901 2.002 2.08 2.287 2.363 2.521 2.701 2.867 2.943 3.076 3.187 3.347 3.457 3.553 3.674 3.793 3.906 4.009 4.111 4.248 4.39 4.53 4.7 4.866 5.035 5.228 5.429 5.616 5.801 5.997 6.18 6.379 6.618 6.859 7.081 7.346 7.643 7.937 8.191 8.406 8.567 8.549 8.143 7.634 7.183 6.737 6.275 5.882 5.495 5.123 4.773 4.477 4.205 3.936 3.675 3.436 3.234 3.028 2.829 2.656 2.473 2.264 2.084 1.909 1.72 1.567 1.422 1.265 1.094 0.927 0.822 0.704 0.518 0.38 0.221 0.146 -0.002 -0.159 -0.322 -0.419 -0.643 -0.721 -0.83 -0.954 -1.231 -1.39 -1.569 -1.755 -1.93 -2.146 -2.423 -2.873 -9 ,24448 ,KEBNE ,16658452,Tue Nov 23 09:30:12 CET,Tue Nov 23 10:51:25 CET,0.0 0.477 0.722 0.925 1.129 1.298 1.437 1.567 1.791 1.891 1.983 2.039 2.246 2.327 2.478 2.613 2.746 2.815 2.946 3.069 3.237 3.333 3.427 3.57 3.712 3.839 3.953 4.078 4.235 4.379 4.52 4.683 4.827 4.963 5.14 5.337 5.502 5.679 5.852 6.037 6.238 6.448 6.715 6.998 7.294 7.578 7.839 8.102 8.361 8.508 8.327 7.879 7.389 6.9 6.387 5.854 5.408 5.025 4.701 4.347 4.031 3.738 3.45 3.194 2.955 2.739 2.532 2.337 2.16 1.96 1.76 1.62 1.46 1.277 1.141 1.007 0.863 0.701 0.529 0.409 0.282 0.09 -0.036 -0.166 -0.237 -0.4 -0.566 -0.718 -0.805 -1.03 -1.124 -1.22 -1.323 -1.602 -1.745 -1.875 -2.025 -2.198 -2.383 -2.665 -3.195 -10 ,2055 ,KEBNE ,16658453,Tue Nov 23 09:30:12 CET,Tue Nov 23 10:52:54 CET,0.0 0.471 0.731 0.93 1.071 1.219 1.376 1.499 1.712 1.812 1.905 1.965 2.178 2.263 2.396 2.497 2.61 2.676 2.804 2.923 3.089 3.194 3.293 3.459 3.618 3.737 3.847 3.952 4.105 4.254 4.374 4.534 4.686 4.819 4.994 5.199 5.373 5.552 5.741 5.955 6.182 6.41 6.672 6.93 7.183 7.42 7.67 7.92 8.109 8.187 8.107 7.678 7.16 6.677 6.198 5.768 5.399 5.029 4.691 4.346 4.043 3.776 3.498 3.234 2.989 2.765 2.544 2.359 2.182 1.983 1.78 1.605 1.423 1.234 1.088 0.944 0.794 0.626 0.456 0.335 0.203 0.008 -0.131 -0.294 -0.379 -0.548 -0.709 -0.879 -0.963 -1.165 -1.242 -1.36 -1.481 -1.739 -1.887 -2.031 -2.168 -2.325 -2.523 -2.819 -3.309 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_338_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_338_336.txt deleted file mode 100644 index 093e56a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_338_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19301 ,KEBNE ,16658454,Tue Nov 23 09:30:12 CET,Tue Nov 23 10:52:45 CET,0.0 0.45 0.688 0.884 1.057 1.218 1.374 1.517 1.738 1.824 1.919 2.006 2.219 2.301 2.459 2.614 2.782 2.863 3.0 3.132 3.32 3.448 3.576 3.746 3.905 4.052 4.192 4.329 4.512 4.691 4.864 5.071 5.265 5.45 5.671 5.94 6.171 6.397 6.674 6.971 7.252 7.571 7.98 8.364 8.792 9.282 9.81 10.403 11.038 11.644 12.203 12.48 12.419 12.221 11.996 11.762 11.525 11.289 11.09 10.878 10.668 10.454 10.244 10.037 9.848 9.673 9.476 9.304 9.168 9.022 8.866 8.725 8.583 8.44 8.309 8.165 8.02 7.884 7.737 7.622 7.512 7.326 7.187 7.047 6.978 6.829 6.674 6.506 6.405 6.19 6.097 5.994 5.901 5.697 5.577 5.44 5.29 5.116 4.904 4.656 4.15 -2 ,11094 ,KEBNE ,16658455,Tue Nov 23 09:31:14 CET,Tue Nov 23 10:53:44 CET,0.0 0.463 0.678 0.858 1.025 1.157 1.274 1.387 1.604 1.716 1.819 1.898 2.121 2.215 2.383 2.561 2.733 2.801 2.931 3.073 3.291 3.42 3.537 3.72 3.884 4.035 4.173 4.305 4.488 4.677 4.859 5.073 5.28 5.476 5.709 5.958 6.185 6.437 6.707 6.982 7.267 7.588 7.968 8.343 8.753 9.229 9.776 10.316 10.872 11.48 12.147 12.426 12.407 12.289 12.079 11.84 11.626 11.417 11.209 10.974 10.766 10.599 10.424 10.23 10.045 9.892 9.741 9.586 9.449 9.3 9.141 9.011 8.86 8.694 8.577 8.45 8.307 8.159 8.006 7.891 7.769 7.591 7.478 7.36 7.296 7.158 6.997 6.823 6.731 6.523 6.448 6.343 6.237 6.001 5.874 5.729 5.546 5.339 5.102 4.819 4.3 -3 ,14251 ,KEBNE ,16658456,Tue Nov 23 09:31:14 CET,Tue Nov 23 10:54:28 CET,0.0 0.529 0.836 1.067 1.246 1.393 1.525 1.655 1.894 2.002 2.102 2.165 2.385 2.478 2.637 2.791 2.934 3.002 3.13 3.254 3.435 3.55 3.655 3.796 3.933 4.08 4.231 4.369 4.532 4.692 4.852 5.041 5.236 5.428 5.651 5.899 6.125 6.372 6.649 6.941 7.236 7.568 7.973 8.395 8.834 9.262 9.759 10.301 10.872 11.491 12.112 12.412 12.383 12.239 12.024 11.773 11.541 11.306 11.086 10.846 10.634 10.442 10.249 10.072 9.907 9.748 9.59 9.44 9.299 9.131 8.952 8.818 8.666 8.498 8.366 8.225 8.09 7.947 7.779 7.671 7.558 7.369 7.245 7.12 7.056 6.932 6.785 6.618 6.534 6.33 6.254 6.135 6.014 5.766 5.611 5.459 5.322 5.156 4.953 4.684 4.239 -4 ,1036 ,KEBNE ,16658457,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:53:44 CET,0.0 0.523 0.78 1.0 1.172 1.324 1.474 1.62 1.868 1.974 2.063 2.13 2.351 2.444 2.632 2.794 2.943 3.015 3.157 3.294 3.474 3.598 3.732 3.905 4.056 4.209 4.356 4.489 4.655 4.852 5.046 5.261 5.472 5.665 5.873 6.128 6.364 6.596 6.859 7.148 7.447 7.772 8.126 8.456 8.853 9.292 9.766 10.314 10.95 11.609 12.254 12.56 12.544 12.412 12.211 11.994 11.767 11.514 11.278 11.04 10.833 10.633 10.429 10.225 10.031 9.855 9.67 9.509 9.37 9.174 8.964 8.821 8.679 8.522 8.39 8.261 8.133 7.991 7.846 7.748 7.633 7.461 7.351 7.225 7.154 7.012 6.841 6.66 6.581 6.378 6.299 6.2 6.087 5.806 5.655 5.489 5.303 5.09 4.856 4.526 3.889 -5 ,7364 ,KEBNE ,16658458,Tue Nov 23 09:31:14 CET,Tue Nov 23 10:54:38 CET,0.0 0.701 0.984 1.202 1.369 1.524 1.68 1.833 2.116 2.229 2.326 2.393 2.601 2.681 2.835 2.987 3.139 3.211 3.355 3.501 3.716 3.847 3.973 4.154 4.318 4.477 4.642 4.8 4.985 5.154 5.329 5.54 5.741 5.953 6.199 6.462 6.699 6.955 7.233 7.512 7.805 8.12 8.466 8.817 9.243 9.708 10.19 10.714 11.299 11.946 12.55 12.827 12.816 12.685 12.526 12.308 12.085 11.863 11.662 11.461 11.262 11.059 10.862 10.678 10.5 10.314 10.127 9.948 9.789 9.645 9.481 9.331 9.177 9.022 8.901 8.78 8.658 8.528 8.381 8.267 8.15 7.965 7.833 7.696 7.624 7.471 7.303 7.113 7.015 6.805 6.736 6.635 6.512 6.243 6.109 5.984 5.836 5.641 5.412 5.098 4.622 -6 ,20357 ,KEBNE ,16658459,Tue Nov 23 09:31:14 CET,Tue Nov 23 10:54:23 CET,0.0 0.477 0.71 0.9 1.057 1.212 1.378 1.531 1.751 1.848 1.96 2.041 2.264 2.368 2.553 2.721 2.874 2.949 3.076 3.203 3.403 3.524 3.638 3.79 3.957 4.123 4.272 4.417 4.599 4.796 4.982 5.192 5.401 5.616 5.859 6.103 6.352 6.616 6.876 7.162 7.459 7.769 8.148 8.52 8.888 9.298 9.786 10.323 10.937 11.597 12.222 12.559 12.561 12.424 12.242 12.021 11.783 11.555 11.323 11.079 10.886 10.708 10.531 10.349 10.151 9.969 9.797 9.652 9.515 9.341 9.161 9.024 8.877 8.714 8.586 8.455 8.327 8.202 8.048 7.935 7.822 7.647 7.532 7.402 7.334 7.19 7.031 6.846 6.743 6.528 6.44 6.332 6.217 5.947 5.811 5.66 5.511 5.331 5.118 4.86 4.242 -7 ,25419 ,KEBNE ,16658460,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:54:12 CET,0.0 0.368 0.622 0.845 1.014 1.185 1.327 1.437 1.672 1.77 1.864 1.944 2.162 2.251 2.4 2.546 2.691 2.764 2.898 3.011 3.186 3.31 3.437 3.612 3.768 3.928 4.066 4.184 4.343 4.508 4.674 4.874 5.078 5.267 5.477 5.735 5.982 6.259 6.536 6.813 7.118 7.46 7.859 8.258 8.719 9.211 9.77 10.356 10.935 11.585 12.234 12.509 12.511 12.331 12.096 11.884 11.686 11.464 11.237 10.989 10.782 10.584 10.369 10.181 10.008 9.834 9.652 9.482 9.328 9.176 9.029 8.902 8.752 8.59 8.467 8.344 8.214 8.077 7.93 7.83 7.724 7.534 7.415 7.291 7.215 7.06 6.897 6.729 6.632 6.42 6.356 6.251 6.138 5.864 5.713 5.568 5.406 5.221 4.975 4.674 3.938 -8 ,28030 ,KEBNE ,16658461,Tue Nov 23 09:32:15 CET,Tue Nov 23 10:55:17 CET,0.0 0.484 0.716 0.916 1.092 1.243 1.384 1.512 1.754 1.865 1.972 2.056 2.276 2.379 2.554 2.701 2.835 2.904 3.043 3.182 3.381 3.504 3.626 3.795 3.948 4.108 4.265 4.425 4.629 4.796 4.954 5.144 5.33 5.53 5.77 6.011 6.224 6.462 6.732 7.016 7.287 7.605 7.988 8.367 8.791 9.258 9.777 10.308 10.936 11.57 12.15 12.414 12.386 12.215 12.003 11.783 11.558 11.337 11.139 10.9 10.662 10.442 10.245 10.046 9.847 9.672 9.513 9.379 9.239 9.085 8.918 8.762 8.612 8.478 8.355 8.221 8.093 7.953 7.798 7.694 7.588 7.403 7.272 7.148 7.081 6.931 6.78 6.605 6.513 6.309 6.238 6.152 6.069 5.871 5.749 5.582 5.384 5.21 5.016 4.76 4.115 -9 ,16907 ,KEBNE ,16658462,Tue Nov 23 09:32:15 CET,Tue Nov 23 10:54:37 CET,0.0 0.527 0.827 1.038 1.205 1.38 1.526 1.642 1.891 2.018 2.132 2.19 2.404 2.495 2.632 2.779 2.937 3.007 3.129 3.243 3.425 3.546 3.663 3.835 3.998 4.143 4.28 4.417 4.601 4.8 4.988 5.19 5.38 5.56 5.761 5.983 6.197 6.443 6.704 6.983 7.287 7.622 8.006 8.355 8.767 9.247 9.79 10.373 10.993 11.675 12.263 12.517 12.511 12.316 12.074 11.811 11.539 11.294 11.071 10.825 10.599 10.398 10.215 10.034 9.842 9.646 9.462 9.314 9.182 9.043 8.882 8.753 8.606 8.443 8.322 8.202 8.086 7.969 7.834 7.724 7.605 7.424 7.305 7.172 7.091 6.92 6.757 6.586 6.496 6.296 6.211 6.1 5.994 5.756 5.632 5.52 5.38 5.178 4.934 4.656 4.038 -10 ,25555 ,KEBNE ,16658463,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:53:51 CET,0.0 0.394 0.652 0.853 1.033 1.191 1.326 1.446 1.675 1.792 1.899 1.96 2.156 2.238 2.418 2.586 2.745 2.818 2.959 3.097 3.299 3.426 3.545 3.726 3.906 4.08 4.24 4.382 4.569 4.773 4.977 5.2 5.405 5.593 5.793 6.029 6.254 6.505 6.789 7.083 7.396 7.716 8.072 8.426 8.847 9.348 9.871 10.436 11.079 11.71 12.256 12.509 12.483 12.31 12.105 11.886 11.668 11.462 11.253 11.013 10.797 10.603 10.414 10.219 10.042 9.878 9.677 9.501 9.356 9.184 9.017 8.903 8.769 8.6 8.476 8.354 8.21 8.058 7.897 7.78 7.665 7.489 7.363 7.235 7.16 7.014 6.868 6.72 6.645 6.438 6.383 6.281 6.162 5.892 5.755 5.605 5.435 5.256 5.037 4.723 4.077 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_35_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_35_41.txt deleted file mode 100644 index 4a3970bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_35_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28340 ,KEBNE ,16658464,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:53:04 CET,0.0 0.704 1.056 1.322 1.529 1.701 1.864 2.014 2.272 2.401 2.521 2.67 2.828 2.932 3.151 3.346 3.52 3.598 3.742 3.88 4.093 4.252 4.402 4.591 4.782 4.968 5.118 5.254 5.43 5.59 5.751 5.959 6.145 6.316 6.507 6.724 6.943 7.152 7.372 7.614 7.865 8.128 8.402 8.695 8.997 9.246 9.462 9.663 9.846 9.916 9.647 8.96 8.214 7.545 6.942 6.364 5.824 5.313 4.873 4.438 4.051 3.678 3.317 2.983 2.658 2.362 2.047 1.757 1.505 1.24 0.972 0.75 0.533 0.309 0.117 -0.08 -0.29 -0.518 -0.74 -0.889 -1.046 -1.294 -1.464 -1.643 -1.737 -1.929 -2.146 -2.375 -2.491 -2.676 -2.872 -3.006 -3.131 -3.405 -3.576 -3.769 -3.958 -4.161 -4.398 -4.69 -5.6 -2 ,28460 ,KEBNE ,16658465,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:54:36 CET,0.0 1.184 1.554 1.813 2.024 2.234 2.436 2.602 2.86 2.974 3.086 3.237 3.405 3.513 3.732 3.934 4.107 4.195 4.367 4.515 4.718 4.845 4.971 5.163 5.335 5.488 5.654 5.81 6.016 6.222 6.395 6.604 6.782 6.939 7.128 7.317 7.516 7.733 7.949 8.216 8.493 8.756 9.024 9.298 9.584 9.837 10.096 10.357 10.56 10.55 10.212 9.563 8.865 8.212 7.619 7.054 6.549 6.05 5.601 5.176 4.77 4.359 4.016 3.715 3.422 3.149 2.836 2.539 2.268 2.009 1.763 1.546 1.319 1.08 0.889 0.688 0.489 0.292 0.076 -0.088 -0.256 -0.496 -0.663 -0.84 -0.943 -1.159 -1.362 -1.571 -1.681 -1.855 -2.049 -2.189 -2.329 -2.653 -2.837 -3.029 -3.226 -3.46 -3.753 -4.094 -4.969 -3 ,26588 ,KEBNE ,16658466,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:59:28 CET,0.0 0.733 1.05 1.277 1.468 1.682 1.893 2.059 2.316 2.435 2.548 2.694 2.86 2.96 3.148 3.319 3.48 3.561 3.712 3.86 4.082 4.218 4.344 4.53 4.718 4.89 5.042 5.184 5.345 5.513 5.691 5.894 6.1 6.289 6.518 6.798 7.039 7.252 7.462 7.706 7.946 8.176 8.432 8.67 8.913 9.165 9.407 9.632 9.798 9.814 9.529 8.826 8.061 7.345 6.73 6.165 5.638 5.136 4.693 4.247 3.856 3.51 3.172 2.847 2.547 2.267 1.939 1.651 1.419 1.155 0.874 0.635 0.412 0.185 0.005 -0.173 -0.379 -0.609 -0.846 -0.997 -1.147 -1.396 -1.578 -1.764 -1.854 -2.047 -2.247 -2.458 -2.578 -2.77 -2.973 -3.109 -3.254 -3.579 -3.759 -3.949 -4.15 -4.39 -4.658 -5.009 -5.964 -4 ,11428 ,KEBNE ,16658467,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:53:15 CET,0.0 0.687 1.026 1.247 1.437 1.613 1.766 1.898 2.164 2.288 2.397 2.542 2.71 2.821 3.031 3.213 3.383 3.466 3.621 3.767 3.973 4.097 4.223 4.415 4.599 4.768 4.922 5.064 5.248 5.449 5.633 5.838 6.046 6.241 6.463 6.7 6.895 7.096 7.316 7.572 7.819 8.055 8.322 8.564 8.828 9.037 9.23 9.437 9.597 9.599 9.314 8.662 7.96 7.324 6.702 6.131 5.599 5.087 4.663 4.233 3.837 3.474 3.127 2.796 2.461 2.135 1.812 1.553 1.34 1.118 0.89 0.692 0.469 0.227 0.024 -0.194 -0.409 -0.623 -0.842 -1.003 -1.168 -1.412 -1.596 -1.787 -1.885 -2.089 -2.318 -2.564 -2.676 -2.856 -3.05 -3.199 -3.351 -3.654 -3.825 -4.0 -4.182 -4.399 -4.693 -5.083 -5.849 -5 ,11033 ,KEBNE ,16658468,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:53:39 CET,0.0 0.561 0.887 1.153 1.386 1.581 1.756 1.917 2.191 2.3 2.402 2.55 2.715 2.817 3.007 3.183 3.371 3.467 3.653 3.829 4.055 4.19 4.323 4.496 4.666 4.841 5.006 5.169 5.372 5.546 5.706 5.927 6.146 6.333 6.53 6.743 6.958 7.182 7.401 7.635 7.896 8.163 8.439 8.703 8.942 9.167 9.403 9.659 9.853 9.852 9.583 8.954 8.207 7.524 6.919 6.34 5.83 5.338 4.884 4.438 4.058 3.701 3.337 2.996 2.687 2.408 2.113 1.82 1.58 1.341 1.08 0.874 0.644 0.391 0.202 0.009 -0.182 -0.365 -0.579 -0.744 -0.91 -1.169 -1.361 -1.55 -1.639 -1.839 -2.057 -2.27 -2.378 -2.562 -2.752 -2.878 -3.021 -3.332 -3.49 -3.671 -3.89 -4.123 -4.416 -4.827 -5.727 -6 ,19590 ,KEBNE ,16658469,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:53:35 CET,0.0 0.641 0.994 1.271 1.501 1.693 1.862 2.01 2.262 2.376 2.48 2.641 2.807 2.9 3.079 3.262 3.438 3.517 3.661 3.802 4.032 4.178 4.309 4.492 4.66 4.82 4.971 5.107 5.283 5.482 5.652 5.836 6.037 6.23 6.437 6.641 6.83 7.041 7.25 7.465 7.704 7.962 8.229 8.48 8.738 8.968 9.227 9.507 9.713 9.736 9.446 8.84 8.202 7.572 6.994 6.448 5.899 5.405 4.983 4.518 4.109 3.74 3.387 3.066 2.779 2.495 2.194 1.93 1.67 1.375 1.088 0.874 0.641 0.37 0.162 -0.038 -0.235 -0.431 -0.644 -0.799 -0.963 -1.211 -1.374 -1.554 -1.651 -1.846 -2.039 -2.25 -2.362 -2.553 -2.781 -2.924 -3.062 -3.37 -3.534 -3.717 -3.921 -4.158 -4.459 -4.824 -5.69 -7 ,5203 ,KEBNE ,16658470,Tue Nov 23 09:32:15 CET,Tue Nov 23 10:55:30 CET,0.0 0.759 1.112 1.413 1.642 1.818 1.986 2.147 2.414 2.528 2.646 2.817 2.987 3.087 3.27 3.45 3.626 3.71 3.866 4.015 4.225 4.352 4.477 4.673 4.859 5.017 5.159 5.298 5.487 5.667 5.835 6.012 6.178 6.365 6.57 6.79 7.002 7.215 7.446 7.682 7.907 8.16 8.44 8.68 8.926 9.167 9.409 9.622 9.788 9.868 9.642 8.938 8.157 7.458 6.822 6.218 5.676 5.173 4.745 4.298 3.918 3.577 3.245 2.93 2.62 2.312 1.985 1.728 1.503 1.247 0.981 0.771 0.548 0.299 0.113 -0.084 -0.302 -0.521 -0.744 -0.904 -1.072 -1.313 -1.469 -1.645 -1.749 -1.961 -2.184 -2.42 -2.533 -2.715 -2.923 -3.077 -3.232 -3.531 -3.696 -3.894 -4.123 -4.348 -4.591 -4.941 -5.778 -8 ,28498 ,KEBNE ,16658471,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:55:12 CET,0.0 0.716 1.012 1.223 1.425 1.625 1.791 1.934 2.224 2.359 2.485 2.656 2.818 2.922 3.137 3.33 3.486 3.559 3.701 3.833 4.03 4.163 4.287 4.458 4.623 4.789 4.963 5.127 5.319 5.51 5.679 5.878 6.085 6.273 6.484 6.701 6.9 7.105 7.305 7.53 7.792 8.078 8.375 8.656 8.936 9.195 9.468 9.713 9.855 9.89 9.643 8.996 8.236 7.492 6.796 6.173 5.622 5.112 4.694 4.261 3.851 3.467 3.104 2.77 2.466 2.179 1.849 1.556 1.319 1.068 0.823 0.613 0.378 0.132 -0.061 -0.258 -0.457 -0.653 -0.857 -1.003 -1.154 -1.406 -1.584 -1.767 -1.862 -2.05 -2.244 -2.453 -2.565 -2.749 -2.955 -3.101 -3.251 -3.569 -3.743 -3.943 -4.161 -4.385 -4.622 -4.957 -5.776 -9 ,1386 ,KEBNE ,16658472,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:54:42 CET,0.0 0.612 0.948 1.19 1.369 1.544 1.703 1.855 2.152 2.291 2.418 2.554 2.708 2.804 2.978 3.149 3.33 3.416 3.574 3.734 3.958 4.095 4.229 4.418 4.604 4.778 4.946 5.105 5.298 5.485 5.659 5.875 6.074 6.251 6.471 6.734 6.958 7.174 7.396 7.631 7.896 8.158 8.414 8.687 9.0 9.284 9.564 9.8 9.952 10.005 9.7 8.997 8.252 7.542 6.91 6.306 5.782 5.306 4.85 4.383 3.991 3.642 3.316 2.985 2.668 2.387 2.081 1.812 1.585 1.36 1.103 0.879 0.666 0.438 0.262 0.083 -0.109 -0.324 -0.553 -0.706 -0.857 -1.093 -1.262 -1.441 -1.539 -1.736 -1.965 -2.209 -2.318 -2.5 -2.708 -2.856 -2.998 -3.279 -3.439 -3.619 -3.831 -4.094 -4.388 -4.712 -5.541 -10 ,957 ,KEBNE ,16658473,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:54:43 CET,0.0 0.656 0.99 1.278 1.498 1.689 1.859 1.997 2.268 2.398 2.507 2.631 2.791 2.891 3.088 3.268 3.425 3.496 3.653 3.803 4.004 4.147 4.285 4.481 4.668 4.83 4.991 5.142 5.321 5.506 5.68 5.887 6.065 6.227 6.417 6.634 6.859 7.103 7.371 7.628 7.865 8.113 8.371 8.617 8.878 9.119 9.353 9.568 9.722 9.744 9.519 8.894 8.183 7.5 6.868 6.294 5.762 5.242 4.772 4.28 3.856 3.466 3.103 2.793 2.505 2.235 1.954 1.694 1.47 1.23 0.963 0.746 0.531 0.302 0.12 -0.072 -0.29 -0.505 -0.71 -0.869 -1.048 -1.313 -1.498 -1.686 -1.779 -1.983 -2.219 -2.456 -2.571 -2.743 -2.915 -3.056 -3.209 -3.52 -3.685 -3.862 -4.065 -4.293 -4.58 -4.954 -5.728 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_35_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_35_50.txt deleted file mode 100644 index e862805f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_35_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13706 ,KEBNE ,16658474,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:55:06 CET,0.0 0.689 0.944 1.139 1.297 1.436 1.558 1.67 1.877 1.965 2.049 2.143 2.286 2.368 2.515 2.652 2.781 2.84 2.958 3.083 3.257 3.362 3.459 3.604 3.738 3.863 3.995 4.122 4.284 4.439 4.586 4.763 4.934 5.091 5.261 5.452 5.636 5.836 6.046 6.258 6.471 6.705 6.968 7.208 7.466 7.755 8.022 8.231 8.44 8.48 8.059 7.32 6.595 5.848 5.161 4.569 4.013 3.465 2.964 2.459 2.026 1.625 1.225 0.854 0.509 0.185 -0.158 -0.451 -0.707 -0.993 -1.28 -1.508 -1.748 -2.006 -2.208 -2.408 -2.611 -2.828 -3.053 -3.208 -3.368 -3.629 -3.813 -3.99 -4.082 -4.269 -4.47 -4.702 -4.823 -5.003 -5.177 -5.313 -5.472 -5.799 -5.977 -6.18 -6.398 -6.636 -6.89 -7.263 -8.099 -2 ,2217 ,KEBNE ,16658475,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:53:50 CET,0.0 0.888 1.19 1.402 1.557 1.69 1.804 1.908 2.122 2.232 2.344 2.475 2.622 2.702 2.851 2.977 3.091 3.155 3.284 3.408 3.581 3.685 3.786 3.943 4.09 4.224 4.355 4.474 4.619 4.771 4.926 5.107 5.264 5.409 5.579 5.766 5.952 6.151 6.342 6.549 6.759 6.987 7.26 7.52 7.791 8.075 8.351 8.604 8.833 8.944 8.689 7.918 7.116 6.355 5.657 4.986 4.403 3.861 3.351 2.848 2.427 2.057 1.695 1.332 0.988 0.668 0.327 0.026 -0.225 -0.487 -0.78 -1.024 -1.266 -1.516 -1.719 -1.932 -2.141 -2.35 -2.573 -2.731 -2.901 -3.166 -3.338 -3.523 -3.625 -3.84 -4.066 -4.297 -4.42 -4.613 -4.811 -4.953 -5.105 -5.419 -5.591 -5.778 -5.972 -6.188 -6.455 -6.812 -7.788 -3 ,10104 ,KEBNE ,16658476,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:53:12 CET,0.0 0.602 0.871 1.054 1.221 1.354 1.473 1.588 1.807 1.907 1.995 2.12 2.281 2.362 2.499 2.625 2.752 2.812 2.925 3.042 3.216 3.317 3.415 3.564 3.698 3.822 3.947 4.068 4.228 4.382 4.518 4.683 4.85 5.007 5.171 5.361 5.552 5.757 5.966 6.164 6.368 6.58 6.824 7.074 7.35 7.609 7.838 8.07 8.235 8.231 7.889 7.198 6.4 5.572 4.819 4.145 3.559 3.025 2.575 2.125 1.721 1.332 0.94 0.577 0.255 -0.036 -0.349 -0.646 -0.902 -1.149 -1.425 -1.662 -1.89 -2.139 -2.344 -2.54 -2.737 -2.939 -3.162 -3.325 -3.478 -3.726 -3.897 -4.077 -4.179 -4.385 -4.604 -4.834 -4.951 -5.14 -5.357 -5.51 -5.666 -5.989 -6.172 -6.38 -6.606 -6.856 -7.147 -7.562 -8.588 -4 ,3391 ,KEBNE ,16658477,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:55:15 CET,0.0 0.641 1.009 1.211 1.353 1.489 1.617 1.745 1.995 2.099 2.193 2.302 2.448 2.527 2.67 2.817 2.955 3.018 3.138 3.252 3.41 3.498 3.591 3.747 3.885 4.015 4.143 4.252 4.393 4.536 4.669 4.839 5.007 5.161 5.335 5.515 5.672 5.846 6.051 6.271 6.475 6.711 6.983 7.234 7.523 7.807 8.085 8.375 8.596 8.612 8.318 7.675 6.91 6.15 5.453 4.841 4.278 3.735 3.231 2.723 2.292 1.888 1.514 1.179 0.869 0.568 0.233 -0.068 -0.337 -0.62 -0.9 -1.125 -1.356 -1.606 -1.797 -1.998 -2.217 -2.442 -2.691 -2.853 -3.004 -3.255 -3.424 -3.604 -3.703 -3.904 -4.112 -4.34 -4.451 -4.627 -4.839 -4.982 -5.117 -5.426 -5.602 -5.792 -5.993 -6.227 -6.518 -6.88 -7.933 -5 ,8868 ,KEBNE ,16658478,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:53:38 CET,0.0 0.473 0.697 0.891 1.055 1.189 1.307 1.421 1.632 1.723 1.807 1.906 2.055 2.139 2.29 2.43 2.567 2.629 2.742 2.848 2.996 3.097 3.2 3.356 3.507 3.642 3.76 3.865 3.997 4.137 4.285 4.462 4.629 4.786 4.962 5.141 5.298 5.488 5.692 5.89 6.099 6.339 6.617 6.879 7.177 7.448 7.724 8.034 8.246 8.315 8.128 7.43 6.663 5.921 5.201 4.555 3.983 3.475 3.037 2.579 2.168 1.793 1.411 1.06 0.75 0.432 0.088 -0.202 -0.445 -0.706 -0.978 -1.203 -1.445 -1.692 -1.871 -2.07 -2.298 -2.519 -2.725 -2.864 -3.022 -3.288 -3.471 -3.655 -3.746 -3.93 -4.139 -4.374 -4.494 -4.686 -4.913 -5.065 -5.224 -5.566 -5.746 -5.93 -6.125 -6.392 -6.694 -7.03 -7.808 -6 ,8336 ,KEBNE ,16658479,Tue Nov 23 09:32:15 CET,Tue Nov 23 10:55:34 CET,0.0 0.787 1.045 1.245 1.429 1.571 1.692 1.804 2.016 2.105 2.188 2.287 2.425 2.503 2.652 2.782 2.904 2.97 3.092 3.208 3.369 3.468 3.567 3.699 3.838 3.974 4.099 4.215 4.361 4.507 4.641 4.802 4.976 5.141 5.314 5.517 5.715 5.91 6.101 6.293 6.507 6.744 7.0 7.26 7.539 7.807 8.072 8.305 8.488 8.527 8.24 7.476 6.666 5.865 5.097 4.377 3.706 3.117 2.639 2.145 1.686 1.281 0.893 0.537 0.232 -0.06 -0.398 -0.697 -0.933 -1.185 -1.457 -1.679 -1.913 -2.152 -2.334 -2.539 -2.755 -2.967 -3.189 -3.356 -3.525 -3.791 -3.982 -4.162 -4.255 -4.458 -4.668 -4.891 -5.011 -5.196 -5.378 -5.516 -5.653 -5.948 -6.126 -6.312 -6.523 -6.777 -7.094 -7.506 -8.28 -7 ,22663 ,KEBNE ,16658480,Tue Nov 23 09:32:16 CET,Tue Nov 23 10:54:52 CET,0.0 0.593 0.835 1.035 1.205 1.359 1.481 1.592 1.817 1.912 1.996 2.095 2.236 2.311 2.448 2.579 2.708 2.773 2.894 3.007 3.17 3.272 3.372 3.515 3.648 3.777 3.903 4.02 4.163 4.299 4.433 4.59 4.736 4.879 5.032 5.204 5.37 5.528 5.703 5.889 6.062 6.267 6.515 6.739 6.958 7.185 7.394 7.536 7.616 7.538 7.061 6.17 5.279 4.426 3.619 2.872 2.202 1.6 1.123 0.649 0.238 -0.146 -0.54 -0.905 -1.231 -1.527 -1.843 -2.124 -2.366 -2.616 -2.878 -3.101 -3.338 -3.586 -3.773 -3.971 -4.177 -4.41 -4.652 -4.798 -4.949 -5.198 -5.368 -5.536 -5.633 -5.838 -6.061 -6.306 -6.426 -6.606 -6.794 -6.928 -7.071 -7.407 -7.6 -7.805 -8.012 -8.234 -8.509 -8.916 -9.813 -8 ,29864 ,KEBNE ,16658481,Tue Nov 23 09:33:17 CET,Tue Nov 23 10:54:16 CET,0.0 0.438 0.657 0.836 0.981 1.123 1.259 1.389 1.611 1.705 1.795 1.897 2.04 2.113 2.269 2.429 2.566 2.63 2.761 2.894 3.073 3.177 3.274 3.414 3.557 3.697 3.828 3.956 4.112 4.265 4.421 4.595 4.749 4.902 5.075 5.265 5.447 5.648 5.853 6.051 6.267 6.487 6.739 7.007 7.29 7.556 7.814 8.076 8.3 8.41 8.183 7.462 6.727 6.021 5.347 4.678 4.078 3.532 3.043 2.53 2.068 1.673 1.305 0.957 0.63 0.347 0.038 -0.252 -0.494 -0.756 -1.025 -1.239 -1.472 -1.711 -1.897 -2.094 -2.295 -2.516 -2.756 -2.914 -3.076 -3.319 -3.497 -3.697 -3.796 -3.99 -4.205 -4.437 -4.555 -4.742 -4.937 -5.072 -5.213 -5.528 -5.699 -5.887 -6.096 -6.306 -6.56 -6.924 -7.79 -9 ,26634 ,KEBNE ,16658482,Tue Nov 23 09:33:17 CET,Tue Nov 23 10:56:22 CET,0.0 0.584 0.809 0.981 1.128 1.262 1.377 1.492 1.739 1.841 1.924 2.021 2.165 2.238 2.377 2.515 2.649 2.712 2.84 2.967 3.13 3.227 3.32 3.455 3.595 3.729 3.852 3.973 4.133 4.294 4.443 4.608 4.759 4.9 5.063 5.236 5.403 5.601 5.796 6.012 6.248 6.494 6.756 6.985 7.241 7.499 7.754 7.986 8.198 8.29 8.003 7.333 6.634 5.89 5.176 4.514 3.908 3.347 2.832 2.292 1.851 1.483 1.126 0.789 0.474 0.171 -0.144 -0.42 -0.673 -0.945 -1.209 -1.415 -1.647 -1.896 -2.095 -2.295 -2.498 -2.725 -2.969 -3.135 -3.305 -3.572 -3.746 -3.937 -4.04 -4.247 -4.463 -4.688 -4.803 -4.994 -5.208 -5.34 -5.478 -5.786 -5.954 -6.128 -6.328 -6.553 -6.795 -7.117 -7.842 -10 ,303 ,KEBNE ,16658483,Tue Nov 23 09:33:17 CET,Tue Nov 23 11:03:49 CET,0.0 0.573 0.856 1.035 1.175 1.298 1.413 1.533 1.756 1.863 1.961 2.06 2.205 2.286 2.414 2.536 2.655 2.712 2.835 2.959 3.123 3.215 3.304 3.442 3.583 3.725 3.853 3.963 4.109 4.255 4.4 4.573 4.738 4.902 5.087 5.275 5.444 5.617 5.819 6.035 6.234 6.459 6.724 6.987 7.276 7.57 7.829 8.031 8.217 8.258 7.978 7.367 6.674 5.927 5.205 4.528 3.91 3.379 2.923 2.431 1.983 1.575 1.21 0.877 0.552 0.253 -0.066 -0.351 -0.602 -0.866 -1.134 -1.368 -1.624 -1.886 -2.081 -2.282 -2.489 -2.696 -2.916 -3.073 -3.236 -3.489 -3.666 -3.863 -3.965 -4.158 -4.359 -4.574 -4.686 -4.868 -5.07 -5.216 -5.37 -5.717 -5.909 -6.102 -6.315 -6.582 -6.867 -7.237 -8.515 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_35_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_35_54.txt deleted file mode 100644 index 3e09057a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_35_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24707 ,KEBNE ,17023807,Wed Dec 22 08:26:16 CET,Wed Dec 22 09:53:10 CET,0.0 1.359 1.752 2.07 2.316 2.527 2.703 2.865 3.193 3.347 3.474 3.627 3.804 3.917 4.115 4.312 4.488 4.568 4.735 4.893 5.099 5.228 5.34 5.499 5.647 5.791 5.941 6.074 6.25 6.411 6.544 6.706 6.862 7.01 7.162 7.308 7.465 7.656 7.8 7.917 8.041 8.166 8.321 8.432 8.425 8.4 8.328 8.035 7.504 6.514 4.732 2.486 0.508 -1.144 -2.544 -3.781 -4.823 -5.732 -6.516 -7.32 -8.013 -8.607 -9.182 -9.724 -10.221 -10.665 -11.133 -11.581 -11.968 -12.351 -12.738 -13.063 -13.406 -13.76 -14.032 -14.314 -14.599 -14.891 -15.211 -15.437 -15.649 -15.964 -16.18 -16.4 -16.518 -16.788 -17.076 -17.348 -17.489 -17.716 -17.924 -18.074 -18.233 -18.594 -18.78 -18.993 -19.244 -19.514 -19.841 -20.219 -20.992 -2 ,9417 ,KEBNE ,17023808,Wed Dec 22 08:27:19 CET,Wed Dec 22 09:51:49 CET,0.0 1.107 1.48 1.743 1.959 2.153 2.323 2.48 2.802 2.955 3.087 3.24 3.413 3.528 3.738 3.916 4.077 4.16 4.319 4.468 4.671 4.805 4.933 5.108 5.267 5.413 5.557 5.682 5.843 6.001 6.146 6.31 6.464 6.618 6.785 6.942 7.072 7.225 7.391 7.527 7.65 7.781 7.85 7.891 7.93 7.935 7.882 7.689 7.259 6.402 4.609 2.206 0.196 -1.544 -2.993 -4.263 -5.353 -6.312 -7.144 -7.967 -8.689 -9.334 -9.913 -10.454 -10.955 -11.397 -11.86 -12.266 -12.621 -12.986 -13.353 -13.663 -14.0 -14.37 -14.634 -14.895 -15.169 -15.442 -15.739 -15.945 -16.152 -16.492 -16.739 -16.978 -17.096 -17.339 -17.588 -17.862 -18.005 -18.237 -18.469 -18.633 -18.799 -19.145 -19.334 -19.524 -19.735 -19.99 -20.279 -20.637 -21.758 -3 ,4498 ,KEBNE ,17023809,Wed Dec 22 08:27:19 CET,Wed Dec 22 09:53:09 CET,0.0 1.056 1.45 1.777 2.05 2.279 2.462 2.627 2.943 3.081 3.207 3.386 3.55 3.647 3.848 4.038 4.205 4.281 4.416 4.551 4.753 4.875 4.986 5.158 5.324 5.469 5.61 5.749 5.919 6.079 6.245 6.435 6.581 6.712 6.877 7.069 7.217 7.365 7.549 7.745 7.909 8.053 8.187 8.26 8.298 8.29 8.173 7.902 7.403 6.432 4.649 2.383 0.44 -1.191 -2.636 -3.918 -4.983 -5.942 -6.765 -7.574 -8.298 -8.933 -9.51 -10.043 -10.53 -10.978 -11.473 -11.908 -12.275 -12.66 -13.053 -13.364 -13.677 -14.016 -14.28 -14.563 -14.859 -15.154 -15.479 -15.702 -15.904 -16.196 -16.412 -16.634 -16.743 -16.982 -17.256 -17.551 -17.708 -17.95 -18.163 -18.315 -18.484 -18.828 -19.016 -19.243 -19.487 -19.74 -20.055 -20.504 -21.378 -4 ,28488 ,KEBNE ,17023810,Wed Dec 22 08:27:19 CET,Wed Dec 22 09:51:46 CET,0.0 1.544 1.932 2.199 2.423 2.624 2.805 2.977 3.283 3.415 3.543 3.727 3.903 4.011 4.234 4.427 4.596 4.683 4.847 4.995 5.21 5.349 5.484 5.682 5.867 6.024 6.163 6.297 6.454 6.605 6.755 6.934 7.108 7.264 7.445 7.634 7.793 7.945 8.089 8.233 8.367 8.484 8.59 8.703 8.764 8.695 8.53 8.25 7.776 6.89 5.056 2.686 0.728 -0.963 -2.423 -3.697 -4.767 -5.719 -6.541 -7.335 -8.006 -8.619 -9.219 -9.789 -10.291 -10.734 -11.197 -11.614 -11.965 -12.338 -12.724 -13.025 -13.329 -13.655 -13.909 -14.172 -14.464 -14.76 -15.049 -15.256 -15.471 -15.806 -16.045 -16.289 -16.41 -16.672 -16.951 -17.23 -17.371 -17.602 -17.843 -18.013 -18.185 -18.572 -18.779 -18.987 -19.218 -19.45 -19.737 -20.116 -20.859 -5 ,9682 ,KEBNE ,17023811,Wed Dec 22 08:27:19 CET,Wed Dec 22 09:52:40 CET,0.0 0.9 1.293 1.604 1.849 2.065 2.252 2.426 2.752 2.882 2.995 3.153 3.319 3.423 3.624 3.808 3.975 4.055 4.199 4.338 4.557 4.688 4.801 4.967 5.129 5.288 5.437 5.57 5.733 5.875 6.01 6.176 6.338 6.485 6.637 6.8 6.947 7.116 7.301 7.46 7.58 7.686 7.796 7.857 7.864 7.813 7.654 7.379 6.835 5.869 4.049 1.611 -0.394 -2.01 -3.376 -4.623 -5.71 -6.632 -7.431 -8.235 -8.918 -9.514 -10.05 -10.57 -11.073 -11.534 -12.01 -12.423 -12.791 -13.182 -13.573 -13.888 -14.22 -14.57 -14.833 -15.106 -15.395 -15.698 -15.996 -16.192 -16.404 -16.726 -16.94 -17.17 -17.288 -17.527 -17.791 -18.076 -18.222 -18.453 -18.663 -18.815 -18.985 -19.372 -19.574 -19.788 -20.016 -20.277 -20.599 -20.987 -21.641 -6 ,732 ,KEBNE ,17023812,Wed Dec 22 08:27:19 CET,Wed Dec 22 09:53:43 CET,0.0 1.089 1.525 1.789 2.019 2.236 2.419 2.571 2.874 3.035 3.183 3.345 3.512 3.616 3.811 3.993 4.147 4.216 4.354 4.494 4.704 4.827 4.95 5.126 5.286 5.468 5.63 5.753 5.918 6.09 6.255 6.436 6.594 6.749 6.915 7.075 7.215 7.38 7.546 7.69 7.851 8.018 8.139 8.207 8.229 8.206 8.083 7.764 7.181 6.179 4.346 2.012 0.004 -1.664 -3.078 -4.363 -5.477 -6.468 -7.318 -8.14 -8.828 -9.42 -9.976 -10.506 -10.974 -11.411 -11.882 -12.272 -12.634 -13.036 -13.42 -13.742 -14.084 -14.423 -14.68 -14.945 -15.222 -15.512 -15.807 -16.014 -16.229 -16.573 -16.816 -17.071 -17.2 -17.451 -17.715 -17.993 -18.132 -18.358 -18.582 -18.742 -18.908 -19.263 -19.457 -19.667 -19.885 -20.153 -20.495 -20.89 -21.705 -7 ,9624 ,KEBNE ,17023813,Wed Dec 22 08:27:19 CET,Wed Dec 22 09:53:27 CET,0.0 0.993 1.39 1.684 1.97 2.195 2.382 2.565 2.891 3.048 3.184 3.348 3.518 3.612 3.8 3.991 4.17 4.251 4.407 4.558 4.764 4.896 5.019 5.182 5.335 5.485 5.614 5.738 5.926 6.094 6.247 6.414 6.569 6.717 6.871 7.044 7.203 7.372 7.551 7.73 7.888 8.013 8.128 8.241 8.283 8.242 8.102 7.796 7.246 6.226 4.433 2.107 0.104 -1.567 -2.975 -4.226 -5.326 -6.352 -7.265 -8.15 -8.904 -9.545 -10.119 -10.644 -11.12 -11.554 -12.013 -12.436 -12.804 -13.197 -13.603 -13.927 -14.254 -14.572 -14.814 -15.076 -15.36 -15.647 -15.946 -16.159 -16.365 -16.7 -16.943 -17.184 -17.306 -17.556 -17.793 -18.035 -18.184 -18.422 -18.616 -18.768 -18.94 -19.302 -19.486 -19.695 -19.944 -20.208 -20.482 -20.905 -21.911 -8 ,25566 ,KEBNE ,17023814,Wed Dec 22 08:27:19 CET,Wed Dec 22 09:53:15 CET,0.0 1.085 1.521 1.811 2.056 2.283 2.472 2.635 2.948 3.104 3.235 3.374 3.538 3.64 3.824 3.992 4.16 4.244 4.41 4.567 4.792 4.929 5.049 5.219 5.394 5.555 5.699 5.827 5.997 6.157 6.308 6.479 6.614 6.739 6.88 7.029 7.187 7.356 7.512 7.664 7.788 7.892 7.995 8.091 8.172 8.166 8.033 7.788 7.319 6.391 4.52 2.172 0.252 -1.374 -2.773 -4.087 -5.211 -6.21 -7.054 -7.837 -8.496 -9.102 -9.667 -10.187 -10.674 -11.094 -11.556 -12.002 -12.382 -12.76 -13.151 -13.484 -13.829 -14.182 -14.445 -14.722 -15.003 -15.28 -15.565 -15.765 -15.979 -16.311 -16.539 -16.769 -16.888 -17.139 -17.399 -17.669 -17.814 -18.048 -18.284 -18.455 -18.635 -19.038 -19.24 -19.434 -19.673 -19.963 -20.292 -20.75 -21.755 -9 ,22111 ,KEBNE ,17023815,Wed Dec 22 08:27:19 CET,Wed Dec 22 09:53:16 CET,0.0 1.114 1.477 1.749 1.972 2.171 2.348 2.505 2.788 2.926 3.067 3.244 3.416 3.525 3.714 3.893 4.072 4.158 4.32 4.455 4.644 4.764 4.889 5.08 5.243 5.404 5.559 5.693 5.868 6.029 6.181 6.374 6.558 6.723 6.886 7.069 7.227 7.378 7.541 7.699 7.844 7.978 8.093 8.187 8.225 8.182 8.098 7.871 7.338 6.387 4.509 2.087 0.091 -1.571 -2.967 -4.209 -5.264 -6.215 -7.038 -7.874 -8.587 -9.194 -9.777 -10.313 -10.838 -11.342 -11.829 -12.244 -12.595 -12.96 -13.34 -13.658 -13.994 -14.345 -14.615 -14.89 -15.177 -15.467 -15.757 -15.961 -16.173 -16.49 -16.705 -16.942 -17.069 -17.323 -17.585 -17.869 -18.01 -18.246 -18.51 -18.68 -18.848 -19.228 -19.444 -19.675 -19.92 -20.193 -20.521 -20.917 -21.886 -10 ,17131 ,KEBNE ,17023816,Wed Dec 22 08:27:19 CET,Wed Dec 22 09:51:53 CET,0.0 1.089 1.494 1.824 2.055 2.237 2.409 2.564 2.843 2.981 3.114 3.299 3.472 3.572 3.755 3.925 4.081 4.154 4.308 4.464 4.685 4.82 4.946 5.133 5.31 5.455 5.577 5.704 5.872 6.027 6.19 6.376 6.54 6.715 6.917 7.115 7.275 7.443 7.61 7.757 7.896 8.037 8.165 8.2 8.197 8.204 8.098 7.823 7.353 6.527 4.89 2.695 0.875 -0.675 -2.028 -3.199 -4.227 -5.159 -5.95 -6.736 -7.393 -7.983 -8.561 -9.093 -9.588 -10.036 -10.495 -10.912 -11.29 -11.685 -12.092 -12.421 -12.741 -13.079 -13.359 -13.651 -13.937 -14.228 -14.531 -14.734 -14.941 -15.265 -15.48 -15.701 -15.828 -16.086 -16.34 -16.608 -16.745 -16.967 -17.192 -17.357 -17.524 -17.885 -18.095 -18.32 -18.547 -18.786 -19.077 -19.464 -20.248 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_41_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_41_54.txt deleted file mode 100644 index 54549a40..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_41_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3244 ,KEBNE ,16658484,Tue Nov 23 09:33:16 CET,Tue Nov 23 10:54:18 CET,0.0 0.876 1.265 1.593 1.848 2.058 2.247 2.433 2.761 2.9 3.029 3.195 3.367 3.471 3.672 3.869 4.065 4.163 4.347 4.507 4.72 4.865 5.014 5.204 5.378 5.549 5.689 5.811 6.0 6.197 6.363 6.551 6.738 6.906 7.1 7.31 7.48 7.649 7.808 7.964 8.134 8.275 8.395 8.506 8.57 8.593 8.591 8.518 8.224 7.535 6.129 4.269 2.655 1.259 -0.001 -1.099 -1.997 -2.806 -3.504 -4.189 -4.81 -5.381 -5.91 -6.392 -6.839 -7.278 -7.735 -8.123 -8.448 -8.782 -9.129 -9.407 -9.697 -10.015 -10.25 -10.488 -10.746 -11.023 -11.318 -11.506 -11.68 -11.97 -12.18 -12.405 -12.525 -12.752 -12.989 -13.244 -13.372 -13.587 -13.779 -13.918 -14.061 -14.391 -14.578 -14.778 -15.001 -15.231 -15.504 -15.868 -16.59 -2 ,7070 ,KEBNE ,16658485,Tue Nov 23 09:33:17 CET,Tue Nov 23 10:54:06 CET,0.0 0.789 1.143 1.45 1.693 1.907 2.106 2.283 2.591 2.735 2.859 3.028 3.215 3.335 3.545 3.738 3.934 4.025 4.186 4.351 4.596 4.732 4.854 5.04 5.212 5.375 5.53 5.69 5.901 6.094 6.267 6.469 6.652 6.816 6.997 7.184 7.356 7.536 7.723 7.877 8.016 8.17 8.298 8.406 8.518 8.594 8.63 8.545 8.213 7.494 6.061 4.126 2.513 1.16 0.001 -1.014 -1.902 -2.7 -3.379 -4.066 -4.67 -5.185 -5.667 -6.149 -6.591 -6.964 -7.369 -7.745 -8.058 -8.387 -8.733 -9.014 -9.294 -9.579 -9.812 -10.05 -10.301 -10.574 -10.842 -11.024 -11.211 -11.51 -11.716 -11.926 -12.034 -12.26 -12.498 -12.749 -12.89 -13.111 -13.291 -13.43 -13.579 -13.9 -14.091 -14.302 -14.508 -14.723 -14.985 -15.354 -16.3 -3 ,15588 ,KEBNE ,16658486,Tue Nov 23 09:33:16 CET,Tue Nov 23 10:54:24 CET,0.0 1.25 1.619 1.896 2.144 2.365 2.553 2.73 3.029 3.174 3.317 3.489 3.657 3.757 3.946 4.122 4.306 4.401 4.567 4.713 4.934 5.076 5.199 5.374 5.547 5.718 5.883 6.035 6.228 6.417 6.591 6.779 6.95 7.116 7.307 7.515 7.703 7.905 8.117 8.312 8.481 8.62 8.746 8.849 8.941 9.015 9.01 8.866 8.499 7.75 6.378 4.587 3.026 1.724 0.574 -0.464 -1.343 -2.15 -2.864 -3.554 -4.138 -4.685 -5.188 -5.643 -6.074 -6.46 -6.859 -7.227 -7.551 -7.887 -8.237 -8.516 -8.799 -9.105 -9.351 -9.595 -9.838 -10.099 -10.389 -10.583 -10.782 -11.097 -11.298 -11.508 -11.616 -11.829 -12.056 -12.304 -12.434 -12.646 -12.826 -12.976 -13.149 -13.502 -13.692 -13.893 -14.102 -14.347 -14.648 -15.061 -15.839 -4 ,24039 ,KEBNE ,16658487,Tue Nov 23 09:34:18 CET,Tue Nov 23 10:55:30 CET,0.0 1.376 1.818 2.126 2.366 2.581 2.765 2.928 3.242 3.382 3.512 3.685 3.855 3.956 4.152 4.339 4.517 4.601 4.759 4.907 5.133 5.277 5.4 5.566 5.723 5.881 6.035 6.173 6.339 6.508 6.68 6.882 7.066 7.232 7.408 7.58 7.744 7.923 8.114 8.303 8.465 8.657 8.868 9.01 9.136 9.194 9.177 9.088 8.825 8.231 6.947 5.173 3.578 2.265 1.173 0.075 -0.914 -1.765 -2.49 -3.182 -3.761 -4.282 -4.776 -5.245 -5.691 -6.087 -6.513 -6.896 -7.219 -7.552 -7.894 -8.179 -8.466 -8.769 -8.996 -9.22 -9.452 -9.703 -9.984 -10.177 -10.375 -10.687 -10.904 -11.125 -11.233 -11.453 -11.681 -11.937 -12.079 -12.304 -12.508 -12.658 -12.82 -13.182 -13.375 -13.571 -13.794 -14.034 -14.303 -14.693 -15.445 -5 ,10254 ,KEBNE ,16658488,Tue Nov 23 09:34:18 CET,Tue Nov 23 10:56:23 CET,0.0 0.91 1.259 1.544 1.808 2.023 2.214 2.397 2.723 2.881 3.031 3.212 3.389 3.505 3.751 3.986 4.165 4.243 4.409 4.568 4.794 4.928 5.05 5.236 5.411 5.577 5.728 5.859 6.005 6.143 6.298 6.488 6.665 6.827 7.0 7.177 7.355 7.548 7.729 7.915 8.099 8.277 8.469 8.621 8.713 8.763 8.734 8.583 8.242 7.574 6.245 4.411 2.852 1.553 0.399 -0.642 -1.566 -2.384 -3.054 -3.738 -4.322 -4.848 -5.341 -5.79 -6.229 -6.646 -7.041 -7.388 -7.716 -8.045 -8.37 -8.641 -8.916 -9.188 -9.418 -9.661 -9.913 -10.184 -10.449 -10.632 -10.834 -11.16 -11.391 -11.623 -11.734 -11.968 -12.222 -12.487 -12.611 -12.822 -13.021 -13.167 -13.324 -13.656 -13.825 -14.027 -14.275 -14.535 -14.807 -15.209 -16.048 -6 ,17941 ,KEBNE ,16658489,Tue Nov 23 09:34:19 CET,Tue Nov 23 10:57:03 CET,0.0 1.154 1.572 1.863 2.121 2.337 2.546 2.749 3.082 3.218 3.344 3.515 3.694 3.799 3.994 4.177 4.331 4.405 4.571 4.724 4.922 5.061 5.193 5.369 5.527 5.68 5.844 5.999 6.174 6.327 6.473 6.648 6.795 6.94 7.123 7.32 7.496 7.677 7.851 8.01 8.173 8.357 8.538 8.663 8.792 8.85 8.815 8.711 8.388 7.685 6.283 4.423 2.886 1.557 0.344 -0.688 -1.549 -2.331 -3.024 -3.724 -4.31 -4.81 -5.3 -5.783 -6.218 -6.612 -7.023 -7.4 -7.718 -8.043 -8.406 -8.707 -9.0 -9.299 -9.537 -9.796 -10.064 -10.332 -10.604 -10.785 -10.98 -11.287 -11.494 -11.698 -11.806 -12.038 -12.274 -12.531 -12.665 -12.882 -13.068 -13.21 -13.371 -13.715 -13.903 -14.121 -14.354 -14.59 -14.86 -15.249 -16.154 -7 ,31834 ,KEBNE ,16658490,Tue Nov 23 09:34:18 CET,Tue Nov 23 10:56:31 CET,0.0 0.854 1.221 1.519 1.775 1.989 2.178 2.365 2.698 2.844 2.989 3.156 3.328 3.443 3.662 3.857 4.035 4.118 4.273 4.417 4.611 4.742 4.871 5.053 5.236 5.397 5.533 5.671 5.864 6.046 6.223 6.433 6.618 6.789 6.975 7.174 7.372 7.566 7.737 7.909 8.107 8.325 8.545 8.743 8.952 9.101 9.102 8.931 8.602 8.029 6.791 5.063 3.533 2.229 1.105 0.085 -0.787 -1.574 -2.259 -2.932 -3.503 -4.01 -4.48 -4.933 -5.394 -5.813 -6.23 -6.61 -6.947 -7.296 -7.651 -7.924 -8.218 -8.539 -8.784 -9.037 -9.3 -9.582 -9.876 -10.073 -10.264 -10.551 -10.754 -10.988 -11.11 -11.34 -11.568 -11.831 -11.972 -12.183 -12.369 -12.513 -12.677 -13.054 -13.244 -13.432 -13.645 -13.876 -14.139 -14.499 -15.497 -8 ,17109 ,KEBNE ,16658491,Tue Nov 23 09:34:18 CET,Tue Nov 23 10:56:51 CET,0.0 1.061 1.434 1.724 1.953 2.14 2.31 2.476 2.771 2.914 3.054 3.243 3.417 3.518 3.717 3.903 4.087 4.173 4.344 4.5 4.708 4.839 4.978 5.191 5.365 5.518 5.66 5.788 5.967 6.155 6.327 6.503 6.665 6.835 7.02 7.218 7.401 7.582 7.77 7.959 8.123 8.297 8.498 8.645 8.724 8.781 8.823 8.756 8.532 7.943 6.596 4.799 3.314 2.062 1.001 0.029 -0.871 -1.682 -2.356 -3.007 -3.581 -4.108 -4.62 -5.089 -5.499 -5.887 -6.315 -6.686 -7.003 -7.321 -7.629 -7.898 -8.186 -8.477 -8.725 -8.995 -9.261 -9.526 -9.787 -9.976 -10.173 -10.464 -10.672 -10.886 -10.996 -11.225 -11.463 -11.697 -11.816 -12.025 -12.212 -12.358 -12.504 -12.814 -12.984 -13.171 -13.382 -13.616 -13.891 -14.218 -15.266 -9 ,18643 ,KEBNE ,16658492,Tue Nov 23 09:34:18 CET,Tue Nov 23 10:56:46 CET,0.0 0.851 1.214 1.529 1.781 1.973 2.153 2.326 2.623 2.772 2.918 3.11 3.298 3.419 3.647 3.846 4.024 4.106 4.265 4.407 4.601 4.732 4.855 5.037 5.219 5.384 5.538 5.698 5.896 6.078 6.245 6.428 6.601 6.765 6.942 7.137 7.334 7.519 7.679 7.862 8.049 8.219 8.393 8.527 8.601 8.665 8.674 8.513 8.201 7.595 6.145 4.182 2.571 1.206 0.08 -0.906 -1.788 -2.622 -3.333 -4.031 -4.645 -5.194 -5.701 -6.158 -6.573 -6.956 -7.372 -7.738 -8.059 -8.388 -8.742 -9.04 -9.324 -9.627 -9.874 -10.132 -10.393 -10.652 -10.913 -11.094 -11.294 -11.608 -11.81 -12.023 -12.138 -12.369 -12.598 -12.835 -12.967 -13.183 -13.37 -13.521 -13.699 -14.061 -14.269 -14.494 -14.701 -14.936 -15.218 -15.612 -16.698 -10 ,23594 ,KEBNE ,16658493,Tue Nov 23 09:34:18 CET,Tue Nov 23 10:56:43 CET,0.0 0.768 1.172 1.476 1.743 1.972 2.195 2.4 2.734 2.87 2.989 3.158 3.341 3.454 3.671 3.853 4.015 4.091 4.238 4.386 4.59 4.715 4.845 5.034 5.214 5.386 5.54 5.686 5.864 6.038 6.202 6.395 6.579 6.742 6.918 7.099 7.26 7.441 7.65 7.835 8.008 8.202 8.358 8.449 8.562 8.671 8.668 8.492 8.132 7.483 6.156 4.333 2.734 1.36 0.197 -0.829 -1.693 -2.465 -3.174 -3.879 -4.472 -5.014 -5.544 -6.044 -6.512 -6.936 -7.371 -7.758 -8.08 -8.416 -8.765 -9.049 -9.345 -9.638 -9.865 -10.104 -10.363 -10.637 -10.92 -11.112 -11.293 -11.579 -11.787 -11.997 -12.104 -12.339 -12.591 -12.853 -12.988 -13.212 -13.422 -13.577 -13.745 -14.067 -14.236 -14.436 -14.644 -14.87 -15.161 -15.529 -16.155 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_42_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_42_35.txt deleted file mode 100644 index a6d0173a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_42_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13262 ,KEBNE ,16658494,Tue Nov 23 09:34:22 CET,Tue Nov 23 10:54:46 CET,0.0 1.012 1.408 1.677 1.904 2.116 2.284 2.456 2.808 2.965 3.124 3.36 3.566 3.682 3.904 4.12 4.323 4.428 4.648 4.852 5.139 5.313 5.468 5.69 5.907 6.124 6.326 6.538 6.816 7.057 7.289 7.579 7.857 8.119 8.441 8.792 9.121 9.479 9.849 10.249 10.676 11.15 11.696 12.224 12.816 13.475 14.243 15.064 15.949 16.98 18.13 18.832 19.07 19.086 18.988 18.82 18.607 18.386 18.169 17.972 17.782 17.589 17.406 17.225 17.05 16.852 16.603 16.402 16.228 16.045 15.857 15.68 15.499 15.321 15.173 15.025 14.873 14.702 14.529 14.414 14.292 14.102 13.957 13.791 13.707 13.528 13.35 13.165 13.057 12.884 12.711 12.582 12.436 12.128 11.976 11.814 11.63 11.396 11.1 10.683 9.833 -2 ,12012 ,KEBNE ,16658495,Tue Nov 23 09:34:18 CET,Tue Nov 23 10:56:55 CET,0.0 1.017 1.396 1.71 1.954 2.172 2.369 2.545 2.876 3.034 3.184 3.379 3.572 3.693 3.932 4.168 4.388 4.484 4.667 4.84 5.106 5.28 5.445 5.688 5.915 6.131 6.345 6.546 6.824 7.106 7.371 7.677 7.954 8.229 8.549 8.914 9.25 9.598 9.977 10.394 10.837 11.316 11.873 12.423 13.04 13.723 14.489 15.308 16.243 17.301 18.446 19.197 19.461 19.455 19.297 19.081 18.8 18.568 18.345 18.019 17.734 17.496 17.285 17.081 16.88 16.7 16.492 16.309 16.153 15.986 15.807 15.648 15.48 15.302 15.168 15.028 14.889 14.737 14.555 14.424 14.292 14.069 13.913 13.762 13.682 13.505 13.323 13.14 13.034 12.86 12.687 12.55 12.418 12.153 12.001 11.825 11.632 11.418 11.156 10.81 9.634 -3 ,2507 ,KEBNE ,16658496,Tue Nov 23 09:34:18 CET,Tue Nov 23 10:54:59 CET,0.0 1.06 1.458 1.768 2.037 2.244 2.432 2.607 2.933 3.085 3.228 3.423 3.623 3.744 3.972 4.193 4.41 4.523 4.734 4.916 5.168 5.333 5.498 5.734 5.958 6.181 6.407 6.624 6.892 7.133 7.362 7.646 7.92 8.183 8.48 8.812 9.129 9.474 9.863 10.279 10.716 11.174 11.679 12.203 12.804 13.468 14.203 15.017 15.945 16.995 18.097 18.794 19.074 19.097 19.007 18.888 18.747 18.58 18.377 18.147 17.955 17.771 17.557 17.345 17.172 16.997 16.787 16.588 16.426 16.254 16.053 15.876 15.683 15.478 15.319 15.165 15.006 14.83 14.643 14.513 14.389 14.2 14.051 13.874 13.785 13.624 13.455 13.26 13.147 12.974 12.821 12.692 12.549 12.259 12.104 11.931 11.722 11.487 11.212 10.821 9.901 -4 ,13850 ,KEBNE ,16658497,Tue Nov 23 09:35:18 CET,Tue Nov 23 10:57:14 CET,0.0 1.154 1.578 1.876 2.133 2.35 2.548 2.763 3.155 3.303 3.446 3.658 3.855 3.971 4.198 4.414 4.614 4.718 4.916 5.092 5.353 5.528 5.689 5.928 6.166 6.392 6.609 6.814 7.088 7.345 7.578 7.871 8.163 8.444 8.764 9.099 9.406 9.754 10.152 10.555 10.953 11.404 11.921 12.456 13.082 13.759 14.52 15.368 16.345 17.435 18.509 19.194 19.493 19.536 19.484 19.363 19.177 19.0 18.84 18.648 18.445 18.253 18.044 17.828 17.617 17.407 17.203 17.012 16.831 16.643 16.449 16.289 16.125 15.945 15.784 15.615 15.458 15.292 15.095 14.956 14.821 14.611 14.472 14.326 14.243 14.066 13.884 13.695 13.603 13.445 13.274 13.144 13.005 12.703 12.541 12.378 12.193 11.977 11.712 11.279 9.987 -5 ,20248 ,KEBNE ,16658498,Tue Nov 23 09:35:19 CET,Tue Nov 23 10:56:17 CET,0.0 1.135 1.564 1.869 2.116 2.334 2.533 2.719 3.043 3.202 3.367 3.584 3.789 3.917 4.167 4.374 4.562 4.664 4.87 5.068 5.342 5.522 5.703 5.964 6.196 6.438 6.677 6.878 7.129 7.373 7.609 7.904 8.191 8.462 8.776 9.119 9.438 9.797 10.189 10.588 11.012 11.491 12.025 12.558 13.191 13.871 14.647 15.513 16.476 17.564 18.714 19.485 19.779 19.819 19.758 19.616 19.44 19.221 18.999 18.772 18.558 18.35 18.129 17.923 17.736 17.55 17.333 17.14 16.978 16.799 16.599 16.43 16.236 16.021 15.866 15.694 15.508 15.321 15.133 15.005 14.877 14.679 14.535 14.385 14.307 14.148 13.973 13.781 13.685 13.525 13.387 13.269 13.125 12.817 12.658 12.499 12.307 12.085 11.844 11.522 10.384 -6 ,30146 ,KEBNE ,16658499,Tue Nov 23 09:35:19 CET,Tue Nov 23 10:58:05 CET,0.0 1.227 1.593 1.898 2.132 2.34 2.542 2.723 3.069 3.229 3.375 3.577 3.774 3.891 4.129 4.355 4.568 4.672 4.872 5.064 5.349 5.531 5.693 5.913 6.138 6.359 6.555 6.751 7.015 7.261 7.509 7.812 8.091 8.353 8.664 9.001 9.317 9.673 10.06 10.488 10.913 11.365 11.915 12.473 13.09 13.738 14.481 15.327 16.308 17.408 18.548 19.254 19.502 19.553 19.479 19.34 19.188 19.009 18.819 18.608 18.408 18.178 17.932 17.731 17.559 17.368 17.148 16.978 16.839 16.677 16.491 16.333 16.158 15.967 15.827 15.659 15.463 15.268 15.087 14.959 14.809 14.592 14.447 14.288 14.212 14.052 13.873 13.676 13.567 13.4 13.233 13.094 12.959 12.671 12.501 12.308 12.116 11.927 11.682 11.25 9.512 -7 ,23637 ,KEBNE ,16658500,Tue Nov 23 09:35:19 CET,Tue Nov 23 10:56:23 CET,0.0 1.041 1.447 1.752 2.002 2.227 2.416 2.57 2.882 3.045 3.189 3.364 3.569 3.702 3.946 4.182 4.412 4.52 4.728 4.929 5.198 5.371 5.547 5.79 6.028 6.262 6.483 6.704 6.997 7.279 7.525 7.792 8.065 8.356 8.67 9.009 9.351 9.738 10.153 10.561 10.982 11.464 12.015 12.566 13.25 13.987 14.786 15.616 16.518 17.542 18.633 19.374 19.652 19.731 19.661 19.519 19.371 19.22 19.0 18.733 18.552 18.386 18.161 17.928 17.743 17.56 17.353 17.18 17.022 16.842 16.655 16.497 16.335 16.158 16.005 15.854 15.695 15.504 15.313 15.191 15.053 14.849 14.717 14.567 14.48 14.297 14.11 13.902 13.799 13.63 13.459 13.335 13.208 12.913 12.739 12.56 12.375 12.183 11.921 11.523 10.021 -8 ,16314 ,KEBNE ,16658501,Tue Nov 23 09:35:19 CET,Tue Nov 23 10:58:12 CET,0.0 1.071 1.506 1.799 2.052 2.274 2.478 2.667 3.01 3.156 3.303 3.501 3.69 3.804 4.034 4.277 4.497 4.602 4.818 5.008 5.265 5.438 5.608 5.832 6.052 6.279 6.501 6.717 6.996 7.259 7.508 7.796 8.083 8.362 8.682 9.017 9.329 9.693 10.077 10.483 10.907 11.384 11.917 12.446 13.043 13.679 14.418 15.25 16.217 17.309 18.539 19.37 19.708 19.812 19.764 19.632 19.469 19.271 19.037 18.821 18.656 18.465 18.257 18.06 17.839 17.621 17.42 17.245 17.084 16.906 16.707 16.545 16.392 16.212 16.049 15.889 15.736 15.564 15.366 15.231 15.098 14.874 14.718 14.557 14.465 14.282 14.105 13.904 13.787 13.608 13.437 13.306 13.168 12.854 12.676 12.491 12.29 12.072 11.834 11.524 10.095 -9 ,13712 ,KEBNE ,16658502,Tue Nov 23 09:35:19 CET,Tue Nov 23 10:56:37 CET,0.0 1.327 1.75 2.05 2.291 2.501 2.707 2.905 3.25 3.412 3.563 3.769 3.973 4.099 4.327 4.531 4.741 4.846 5.037 5.218 5.494 5.671 5.852 6.127 6.375 6.612 6.843 7.053 7.324 7.59 7.832 8.127 8.419 8.683 8.993 9.336 9.658 10.007 10.375 10.766 11.184 11.674 12.237 12.769 13.378 14.052 14.822 15.662 16.605 17.663 18.803 19.509 19.792 19.845 19.76 19.633 19.483 19.284 19.092 18.889 18.707 18.539 18.341 18.116 17.894 17.695 17.482 17.285 17.122 16.94 16.729 16.557 16.367 16.164 16.01 15.857 15.696 15.513 15.336 15.206 15.067 14.868 14.713 14.541 14.456 14.273 14.088 13.926 13.842 13.683 13.523 13.404 13.281 12.987 12.812 12.622 12.421 12.178 11.86 11.428 10.396 -10 ,8684 ,KEBNE ,16658503,Tue Nov 23 09:35:19 CET,Tue Nov 23 10:56:36 CET,0.0 0.959 1.373 1.663 1.917 2.131 2.321 2.512 2.857 3.013 3.16 3.369 3.58 3.712 3.955 4.194 4.42 4.521 4.718 4.9 5.173 5.354 5.519 5.766 6.005 6.226 6.434 6.639 6.898 7.156 7.408 7.711 7.997 8.255 8.54 8.874 9.207 9.557 9.931 10.323 10.733 11.208 11.75 12.253 12.861 13.56 14.362 15.202 16.091 17.109 18.232 18.983 19.264 19.267 19.172 19.052 18.89 18.716 18.537 18.311 18.08 17.882 17.694 17.504 17.319 17.138 16.947 16.765 16.588 16.4 16.204 16.04 15.876 15.686 15.536 15.373 15.207 15.046 14.858 14.728 14.605 14.388 14.222 14.067 13.992 13.828 13.633 13.441 13.345 13.173 12.992 12.862 12.729 12.445 12.288 12.112 11.907 11.675 11.38 10.949 9.975 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_42_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_42_41.txt deleted file mode 100644 index 4fb30bbf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_42_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28166 ,KEBNE ,16658504,Tue Nov 23 09:36:20 CET,Tue Nov 23 10:57:49 CET,0.0 0.827 1.188 1.457 1.699 1.885 2.047 2.208 2.516 2.646 2.766 2.924 3.105 3.224 3.449 3.638 3.815 3.901 4.077 4.255 4.501 4.654 4.81 5.022 5.222 5.431 5.628 5.809 6.034 6.244 6.464 6.742 6.996 7.236 7.52 7.834 8.128 8.458 8.786 9.105 9.439 9.814 10.247 10.664 11.152 11.674 12.193 12.764 13.448 14.108 14.742 15.098 15.118 14.96 14.727 14.478 14.247 14.022 13.799 13.533 13.267 13.047 12.819 12.563 12.331 12.101 11.836 11.623 11.46 11.27 11.061 10.875 10.667 10.482 10.335 10.168 9.998 9.818 9.618 9.481 9.343 9.121 8.968 8.8 8.705 8.506 8.317 8.127 8.033 7.869 7.702 7.581 7.448 7.159 6.996 6.83 6.676 6.484 6.211 5.796 4.361 -2 ,4925 ,KEBNE ,16658505,Tue Nov 23 09:36:21 CET,Tue Nov 23 10:57:13 CET,0.0 1.247 1.647 1.939 2.19 2.389 2.553 2.713 2.999 3.133 3.266 3.446 3.633 3.743 3.961 4.174 4.37 4.464 4.645 4.809 5.05 5.204 5.357 5.573 5.777 5.968 6.149 6.33 6.561 6.776 6.985 7.25 7.485 7.709 7.985 8.278 8.533 8.821 9.144 9.463 9.788 10.165 10.587 10.998 11.488 12.035 12.604 13.222 13.928 14.615 15.268 15.549 15.476 15.278 15.06 14.827 14.56 14.262 13.999 13.694 13.416 13.195 12.986 12.766 12.561 12.381 12.173 11.973 11.792 11.597 11.393 11.23 11.064 10.88 10.721 10.558 10.398 10.225 10.034 9.901 9.766 9.543 9.378 9.223 9.146 8.977 8.798 8.602 8.494 8.31 8.143 8.026 7.883 7.536 7.349 7.147 6.94 6.719 6.468 6.167 5.378 -3 ,28896 ,KEBNE ,16658506,Tue Nov 23 09:36:21 CET,Tue Nov 23 10:57:50 CET,0.0 1.014 1.408 1.66 1.88 2.085 2.279 2.456 2.749 2.884 3.02 3.201 3.385 3.5 3.705 3.876 4.047 4.138 4.321 4.481 4.728 4.889 5.036 5.265 5.482 5.673 5.865 6.055 6.285 6.508 6.726 6.98 7.217 7.435 7.687 7.971 8.248 8.558 8.87 9.18 9.506 9.882 10.297 10.728 11.232 11.761 12.335 12.943 13.665 14.381 14.994 15.262 15.217 15.063 14.866 14.611 14.308 13.996 13.731 13.449 13.185 12.959 12.755 12.532 12.3 12.098 11.885 11.683 11.499 11.3 11.089 10.919 10.722 10.514 10.364 10.198 10.027 9.851 9.667 9.537 9.406 9.206 9.05 8.883 8.796 8.623 8.455 8.273 8.17 7.997 7.837 7.713 7.578 7.272 7.109 6.948 6.749 6.524 6.251 5.851 4.988 -4 ,1079 ,KEBNE ,16658507,Tue Nov 23 09:36:20 CET,Tue Nov 23 10:58:35 CET,0.0 0.701 1.038 1.265 1.477 1.667 1.841 2.007 2.324 2.468 2.601 2.785 2.974 3.082 3.3 3.508 3.701 3.788 3.964 4.142 4.4 4.557 4.695 4.901 5.106 5.29 5.467 5.65 5.877 6.089 6.285 6.535 6.791 7.037 7.319 7.63 7.927 8.229 8.565 8.931 9.27 9.624 10.025 10.435 10.886 11.377 11.926 12.534 13.186 13.867 14.607 14.913 14.856 14.689 14.431 14.114 13.839 13.608 13.355 13.072 12.836 12.618 12.384 12.119 11.86 11.61 11.348 11.134 10.966 10.789 10.579 10.404 10.232 10.047 9.891 9.742 9.587 9.41 9.218 9.087 8.956 8.739 8.591 8.444 8.364 8.193 8.017 7.825 7.72 7.551 7.402 7.281 7.151 6.887 6.736 6.554 6.359 6.143 5.872 5.503 4.657 -5 ,8066 ,KEBNE ,16658508,Tue Nov 23 09:37:25 CET,Tue Nov 23 10:58:42 CET,0.0 1.168 1.583 1.855 2.066 2.268 2.454 2.616 2.892 3.014 3.134 3.282 3.466 3.575 3.795 4.002 4.196 4.289 4.465 4.64 4.892 5.05 5.207 5.418 5.61 5.805 5.982 6.147 6.366 6.579 6.789 7.05 7.304 7.535 7.799 8.082 8.341 8.642 8.966 9.307 9.666 10.045 10.491 10.944 11.439 11.945 12.491 13.086 13.752 14.443 15.086 15.339 15.261 15.034 14.793 14.54 14.237 13.953 13.738 13.498 13.261 13.015 12.761 12.538 12.307 12.048 11.797 11.594 11.398 11.191 10.984 10.805 10.626 10.457 10.326 10.174 10.009 9.853 9.684 9.557 9.421 9.202 9.059 8.909 8.826 8.654 8.458 8.255 8.156 7.984 7.834 7.714 7.587 7.314 7.157 6.988 6.799 6.596 6.334 6.006 5.004 -6 ,6627 ,KEBNE ,16658509,Tue Nov 23 09:37:24 CET,Tue Nov 23 10:59:20 CET,0.0 1.114 1.434 1.692 1.915 2.117 2.315 2.495 2.777 2.905 3.033 3.198 3.385 3.503 3.728 3.95 4.157 4.247 4.417 4.577 4.793 4.934 5.074 5.279 5.486 5.687 5.881 6.065 6.281 6.498 6.725 7.011 7.275 7.509 7.779 8.056 8.32 8.627 8.946 9.262 9.589 9.949 10.375 10.827 11.304 11.787 12.316 12.89 13.534 14.224 14.946 15.244 15.209 15.004 14.729 14.504 14.254 13.994 13.777 13.516 13.236 13.006 12.801 12.577 12.344 12.144 11.927 11.702 11.52 11.325 11.114 10.939 10.748 10.552 10.395 10.219 10.032 9.833 9.636 9.51 9.381 9.181 9.042 8.884 8.789 8.577 8.37 8.166 8.061 7.891 7.726 7.596 7.462 7.167 7.01 6.853 6.683 6.463 6.186 5.839 4.721 -7 ,32618 ,KEBNE ,16658510,Tue Nov 23 09:37:24 CET,Tue Nov 23 10:58:37 CET,0.0 0.734 1.098 1.411 1.643 1.834 2.002 2.16 2.465 2.601 2.726 2.9 3.094 3.21 3.429 3.646 3.847 3.943 4.125 4.292 4.54 4.703 4.859 5.077 5.282 5.476 5.671 5.866 6.119 6.366 6.588 6.832 7.068 7.307 7.586 7.896 8.183 8.483 8.822 9.182 9.533 9.912 10.341 10.777 11.29 11.808 12.357 12.946 13.607 14.316 14.925 15.157 15.105 14.935 14.693 14.412 14.134 13.861 13.6 13.31 13.058 12.82 12.575 12.343 12.139 11.94 11.729 11.546 11.367 11.169 10.933 10.743 10.576 10.386 10.227 10.067 9.896 9.702 9.505 9.383 9.258 9.044 8.895 8.745 8.665 8.483 8.293 8.1 8.0 7.829 7.667 7.536 7.399 7.123 6.98 6.818 6.623 6.41 6.166 5.879 5.164 -8 ,14840 ,KEBNE ,16658511,Tue Nov 23 09:37:25 CET,Tue Nov 23 10:59:41 CET,0.0 0.841 1.185 1.437 1.65 1.838 2.018 2.196 2.517 2.654 2.791 2.968 3.152 3.268 3.494 3.705 3.897 3.987 4.165 4.328 4.545 4.684 4.817 5.012 5.213 5.405 5.594 5.779 6.01 6.245 6.48 6.744 6.998 7.246 7.52 7.822 8.103 8.41 8.734 9.092 9.472 9.875 10.302 10.685 11.148 11.695 12.274 12.869 13.509 14.128 14.709 14.936 14.909 14.756 14.467 14.169 13.897 13.622 13.378 13.123 12.886 12.668 12.445 12.185 11.925 11.694 11.465 11.257 11.076 10.881 10.665 10.486 10.286 10.078 9.916 9.748 9.582 9.418 9.242 9.103 8.957 8.731 8.584 8.431 8.34 8.147 7.953 7.756 7.657 7.488 7.32 7.188 7.045 6.746 6.578 6.394 6.196 5.987 5.743 5.404 4.421 -9 ,1058 ,KEBNE ,16658512,Tue Nov 23 09:37:24 CET,Tue Nov 23 10:59:00 CET,0.0 1.704 2.042 2.287 2.514 2.72 2.904 3.075 3.369 3.51 3.647 3.817 4.004 4.113 4.329 4.549 4.756 4.851 5.03 5.192 5.419 5.57 5.72 5.936 6.142 6.335 6.537 6.742 6.979 7.178 7.356 7.579 7.789 8.005 8.285 8.586 8.854 9.138 9.465 9.824 10.161 10.518 10.943 11.375 11.86 12.391 12.991 13.633 14.307 14.974 15.596 15.861 15.842 15.677 15.456 15.192 14.897 14.615 14.366 14.109 13.842 13.581 13.329 13.076 12.844 12.633 12.388 12.165 11.973 11.775 11.565 11.386 11.197 11.004 10.841 10.65 10.463 10.278 10.081 9.948 9.815 9.61 9.456 9.301 9.221 9.045 8.861 8.661 8.555 8.369 8.158 8.021 7.892 7.626 7.465 7.298 7.123 6.899 6.633 6.295 5.478 -10 ,136 ,KEBNE ,16658513,Tue Nov 23 09:37:24 CET,Tue Nov 23 10:58:02 CET,0.0 1.043 1.389 1.644 1.854 2.034 2.2 2.371 2.697 2.838 2.976 3.153 3.337 3.45 3.667 3.866 4.056 4.154 4.333 4.49 4.742 4.914 5.078 5.307 5.506 5.694 5.892 6.081 6.311 6.534 6.757 7.021 7.284 7.539 7.824 8.145 8.427 8.742 9.101 9.44 9.757 10.113 10.551 11.009 11.522 12.04 12.617 13.227 13.84 14.493 15.157 15.397 15.324 15.1 14.832 14.564 14.269 13.981 13.703 13.356 13.034 12.752 12.491 12.237 12.011 11.811 11.567 11.335 11.16 10.974 10.745 10.561 10.372 10.173 10.007 9.835 9.665 9.47 9.271 9.148 9.015 8.788 8.625 8.452 8.362 8.177 7.986 7.786 7.685 7.513 7.34 7.213 7.087 6.805 6.645 6.47 6.282 6.086 5.837 5.482 4.805 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_42_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_42_43.txt deleted file mode 100644 index 34119570..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_42_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9166 ,KEBNE ,16658514,Tue Nov 23 09:37:25 CET,Tue Nov 23 10:58:56 CET,0.0 0.56 0.901 1.16 1.372 1.568 1.755 1.908 2.175 2.315 2.454 2.62 2.8 2.908 3.127 3.338 3.526 3.616 3.806 3.988 4.225 4.374 4.533 4.77 4.982 5.181 5.398 5.598 5.836 6.068 6.278 6.539 6.812 7.079 7.385 7.708 8.001 8.316 8.643 8.987 9.353 9.788 10.294 10.773 11.325 11.969 12.714 13.529 14.427 15.417 16.503 17.186 17.481 17.573 17.525 17.363 17.147 16.946 16.78 16.582 16.388 16.214 16.018 15.813 15.611 15.44 15.284 15.123 14.958 14.761 14.535 14.367 14.208 14.028 13.884 13.735 13.575 13.412 13.243 13.119 12.985 12.778 12.641 12.496 12.417 12.239 12.046 11.852 11.746 11.573 11.422 11.306 11.181 10.896 10.732 10.548 10.362 10.161 9.89 9.526 8.83 -2 ,19562 ,KEBNE ,16658515,Tue Nov 23 09:37:23 CET,Tue Nov 23 10:58:56 CET,0.0 0.726 1.053 1.315 1.53 1.729 1.926 2.094 2.373 2.506 2.639 2.799 2.987 3.102 3.318 3.527 3.725 3.825 4.021 4.203 4.458 4.628 4.785 4.991 5.2 5.409 5.615 5.819 6.083 6.333 6.548 6.808 7.068 7.319 7.639 8.011 8.332 8.647 8.997 9.395 9.813 10.245 10.73 11.204 11.739 12.347 13.081 13.884 14.773 15.739 16.71 17.42 17.689 17.753 17.714 17.596 17.43 17.238 17.072 16.9 16.707 16.493 16.287 16.107 15.918 15.71 15.481 15.273 15.091 14.9 14.712 14.554 14.386 14.215 14.087 13.958 13.824 13.664 13.485 13.364 13.233 13.032 12.895 12.751 12.667 12.487 12.303 12.098 12.003 11.843 11.691 11.572 11.439 11.179 11.033 10.868 10.674 10.44 10.158 9.71 8.733 -3 ,32273 ,KEBNE ,16658516,Tue Nov 23 09:38:23 CET,Tue Nov 23 11:00:42 CET,0.0 0.945 1.3 1.578 1.801 1.992 2.162 2.313 2.578 2.716 2.853 3.033 3.225 3.346 3.585 3.813 4.021 4.116 4.304 4.475 4.717 4.872 5.022 5.244 5.461 5.678 5.883 6.078 6.324 6.546 6.763 7.03 7.302 7.572 7.864 8.207 8.547 8.894 9.252 9.626 9.995 10.414 10.915 11.439 12.049 12.68 13.363 14.129 15.026 16.006 17.048 17.697 17.874 17.872 17.813 17.678 17.495 17.317 17.145 16.965 16.777 16.569 16.364 16.157 15.974 15.797 15.592 15.4 15.23 15.045 14.832 14.651 14.472 14.292 14.147 14.003 13.869 13.713 13.53 13.406 13.274 13.056 12.901 12.744 12.659 12.484 12.319 12.14 12.044 11.884 11.714 11.594 11.478 11.225 11.071 10.905 10.733 10.536 10.3 10.021 9.371 -4 ,15388 ,KEBNE ,16658517,Tue Nov 23 09:38:23 CET,Tue Nov 23 10:59:41 CET,0.0 0.784 1.167 1.44 1.643 1.843 2.04 2.225 2.527 2.654 2.778 2.943 3.123 3.238 3.473 3.692 3.907 4.001 4.168 4.343 4.59 4.745 4.901 5.122 5.34 5.564 5.77 5.97 6.235 6.489 6.751 7.049 7.314 7.571 7.847 8.149 8.462 8.801 9.148 9.519 9.91 10.329 10.825 11.334 11.904 12.506 13.199 13.981 14.839 15.798 16.861 17.585 17.845 17.88 17.777 17.66 17.535 17.346 17.151 16.918 16.686 16.509 16.341 16.149 15.942 15.759 15.576 15.39 15.197 15.004 14.821 14.659 14.493 14.308 14.168 14.019 13.853 13.676 13.504 13.396 13.272 13.077 12.951 12.808 12.723 12.552 12.382 12.197 12.099 11.933 11.768 11.642 11.511 11.235 11.088 10.924 10.739 10.531 10.267 9.954 9.011 -5 ,28201 ,KEBNE ,16658518,Tue Nov 23 09:38:22 CET,Tue Nov 23 11:00:34 CET,0.0 0.948 1.307 1.633 1.907 2.125 2.329 2.502 2.789 2.925 3.055 3.236 3.426 3.533 3.755 3.972 4.173 4.274 4.473 4.656 4.91 5.079 5.249 5.486 5.705 5.918 6.111 6.305 6.559 6.8 7.04 7.31 7.568 7.814 8.097 8.433 8.756 9.11 9.472 9.824 10.179 10.572 11.055 11.553 12.122 12.723 13.386 14.133 15.008 16.039 17.073 17.673 17.907 17.926 17.824 17.672 17.507 17.321 17.139 16.937 16.738 16.561 16.381 16.182 15.963 15.763 15.581 15.399 15.244 15.09 14.903 14.752 14.582 14.389 14.249 14.088 13.91 13.751 13.585 13.453 13.323 13.126 12.981 12.836 12.757 12.579 12.393 12.195 12.092 11.926 11.773 11.65 11.522 11.257 11.098 10.925 10.739 10.52 10.254 9.936 9.303 -6 ,26768 ,KEBNE ,16658519,Tue Nov 23 09:38:23 CET,Tue Nov 23 11:00:06 CET,0.0 0.744 1.104 1.351 1.561 1.755 1.919 2.064 2.375 2.52 2.657 2.864 3.069 3.185 3.388 3.6 3.794 3.88 4.066 4.257 4.506 4.656 4.81 5.036 5.249 5.457 5.663 5.874 6.135 6.368 6.6 6.886 7.136 7.369 7.662 7.992 8.314 8.695 9.111 9.509 9.903 10.359 10.878 11.372 11.926 12.547 13.251 14.016 14.876 15.825 16.839 17.512 17.731 17.764 17.702 17.558 17.373 17.208 17.032 16.82 16.633 16.446 16.253 16.07 15.892 15.709 15.486 15.266 15.087 14.909 14.729 14.589 14.432 14.238 14.082 13.922 13.758 13.586 13.39 13.252 13.115 12.905 12.754 12.591 12.515 12.362 12.195 12.014 11.916 11.751 11.601 11.482 11.35 11.068 10.905 10.732 10.551 10.351 10.116 9.804 8.932 -7 ,12554 ,KEBNE ,16658520,Tue Nov 23 09:38:23 CET,Tue Nov 23 10:59:49 CET,0.0 0.815 1.211 1.524 1.773 1.978 2.155 2.326 2.637 2.78 2.929 3.106 3.292 3.4 3.612 3.824 4.017 4.109 4.294 4.471 4.706 4.861 5.024 5.247 5.454 5.663 5.865 6.058 6.308 6.562 6.816 7.104 7.372 7.629 7.949 8.32 8.663 9.036 9.426 9.805 10.19 10.627 11.136 11.648 12.186 12.755 13.429 14.192 15.055 15.978 17.014 17.677 17.912 17.943 17.842 17.719 17.566 17.388 17.228 17.051 16.884 16.702 16.492 16.274 16.071 15.895 15.706 15.53 15.352 15.169 14.976 14.804 14.644 14.483 14.345 14.199 14.059 13.908 13.745 13.619 13.481 13.263 13.105 12.942 12.856 12.689 12.528 12.35 12.256 12.092 11.918 11.79 11.659 11.39 11.237 11.075 10.912 10.708 10.46 10.168 9.296 -8 ,5327 ,KEBNE ,16658521,Tue Nov 23 09:38:23 CET,Tue Nov 23 10:59:54 CET,0.0 0.866 1.239 1.506 1.751 1.973 2.16 2.33 2.631 2.765 2.895 3.058 3.238 3.341 3.553 3.76 3.948 4.049 4.244 4.413 4.664 4.822 4.969 5.19 5.415 5.637 5.841 6.042 6.317 6.567 6.793 7.058 7.309 7.568 7.884 8.215 8.513 8.839 9.214 9.6 9.976 10.403 10.908 11.43 12.014 12.616 13.297 14.1 15.036 16.006 17.051 17.689 17.893 17.91 17.798 17.647 17.446 17.216 17.034 16.856 16.699 16.496 16.224 15.983 15.791 15.606 15.407 15.221 15.055 14.885 14.703 14.557 14.403 14.243 14.115 13.975 13.819 13.638 13.45 13.327 13.198 12.991 12.841 12.689 12.617 12.468 12.319 12.157 12.069 11.907 11.744 11.626 11.495 11.188 11.008 10.806 10.603 10.403 10.155 9.827 9.232 -9 ,21557 ,KEBNE ,16658522,Tue Nov 23 09:38:23 CET,Tue Nov 23 11:01:17 CET,0.0 0.606 0.959 1.229 1.465 1.665 1.848 2.008 2.29 2.427 2.552 2.722 2.92 3.043 3.267 3.467 3.664 3.764 3.954 4.129 4.377 4.54 4.686 4.893 5.108 5.322 5.532 5.739 6.0 6.241 6.469 6.74 7.004 7.266 7.569 7.899 8.203 8.541 8.926 9.314 9.702 10.134 10.625 11.096 11.604 12.182 12.865 13.604 14.428 15.334 16.346 17.026 17.249 17.334 17.34 17.22 17.051 16.889 16.728 16.543 16.36 16.17 15.982 15.813 15.646 15.457 15.242 15.061 14.914 14.75 14.574 14.413 14.229 14.053 13.906 13.753 13.592 13.415 13.252 13.14 13.002 12.762 12.603 12.425 12.334 12.169 11.986 11.798 11.706 11.548 11.413 11.309 11.198 10.944 10.806 10.658 10.473 10.233 9.938 9.59 8.937 -10 ,15208 ,KEBNE ,16658523,Tue Nov 23 09:38:23 CET,Tue Nov 23 11:02:40 CET,0.0 0.685 0.985 1.254 1.476 1.673 1.869 2.048 2.347 2.483 2.613 2.784 2.969 3.09 3.316 3.516 3.719 3.812 3.984 4.161 4.413 4.57 4.722 4.932 5.137 5.346 5.569 5.794 6.041 6.263 6.483 6.726 6.97 7.221 7.508 7.811 8.099 8.429 8.793 9.187 9.596 10.033 10.535 11.042 11.605 12.256 13.014 13.792 14.625 15.526 16.525 17.139 17.363 17.42 17.353 17.219 17.027 16.809 16.627 16.432 16.235 16.037 15.847 15.657 15.436 15.232 15.035 14.857 14.699 14.514 14.292 14.116 13.941 13.766 13.634 13.489 13.328 13.158 12.972 12.833 12.696 12.487 12.344 12.198 12.124 11.97 11.794 11.594 11.488 11.32 11.147 11.015 10.862 10.549 10.385 10.209 10.023 9.824 9.606 9.317 8.504 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_43_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_43_31.txt deleted file mode 100644 index 3f970e45..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_43_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24936 ,KEBNE ,16658524,Tue Nov 23 09:39:25 CET,Tue Nov 23 11:01:48 CET,0.0 0.893 1.222 1.491 1.719 1.913 2.105 2.284 2.588 2.739 2.886 3.089 3.275 3.401 3.657 3.893 4.108 4.218 4.452 4.682 5.002 5.199 5.392 5.682 5.963 6.234 6.488 6.732 7.054 7.377 7.69 8.083 8.476 8.844 9.286 9.796 10.284 10.838 11.438 12.091 12.794 13.58 14.527 15.499 16.663 18.005 19.638 21.532 23.77 26.641 30.397 33.632 35.673 37.099 38.077 38.79 39.36 39.754 40.02 40.26 40.402 40.502 40.584 40.639 40.688 40.715 40.726 40.728 40.715 40.699 40.671 40.636 40.586 40.535 40.492 40.439 40.378 40.312 40.24 40.18 40.116 40.02 39.947 39.866 39.812 39.697 39.595 39.467 39.398 39.305 39.165 39.073 38.979 38.756 38.629 38.497 38.338 38.129 37.854 37.464 36.273 -2 ,17533 ,KEBNE ,16658525,Tue Nov 23 09:39:24 CET,Tue Nov 23 11:02:11 CET,0.0 0.622 0.901 1.142 1.355 1.554 1.756 1.934 2.252 2.415 2.564 2.778 2.977 3.106 3.349 3.575 3.795 3.906 4.121 4.331 4.649 4.851 5.04 5.321 5.605 5.884 6.156 6.414 6.747 7.074 7.384 7.758 8.128 8.485 8.906 9.411 9.902 10.447 11.043 11.673 12.364 13.179 14.146 15.138 16.345 17.738 19.381 21.31 23.661 26.556 30.218 33.422 35.471 36.881 37.819 38.473 38.947 39.291 39.529 39.726 39.857 39.967 40.072 40.139 40.167 40.168 40.165 40.174 40.172 40.155 40.131 40.089 40.042 39.999 39.96 39.913 39.842 39.76 39.683 39.63 39.566 39.454 39.379 39.3 39.254 39.156 39.045 38.91 38.842 38.751 38.63 38.549 38.458 38.226 38.09 37.944 37.784 37.611 37.386 37.097 36.229 -3 ,11700 ,KEBNE ,16658526,Tue Nov 23 09:39:24 CET,Tue Nov 23 11:02:18 CET,0.0 0.657 0.993 1.273 1.5 1.691 1.859 2.032 2.361 2.517 2.666 2.866 3.051 3.173 3.415 3.637 3.847 3.96 4.184 4.399 4.719 4.916 5.099 5.362 5.631 5.899 6.157 6.411 6.758 7.096 7.415 7.814 8.214 8.598 9.03 9.519 10.017 10.576 11.188 11.868 12.588 13.388 14.356 15.35 16.529 17.871 19.479 21.356 23.667 26.606 30.323 33.615 35.645 37.024 38.052 38.77 39.26 39.627 39.887 40.103 40.249 40.349 40.41 40.451 40.499 40.518 40.506 40.486 40.467 40.447 40.409 40.369 40.32 40.239 40.16 40.088 40.023 39.941 39.85 39.783 39.715 39.604 39.52 39.435 39.383 39.26 39.14 39.005 38.93 38.828 38.697 38.616 38.522 38.313 38.167 38.002 37.844 37.633 37.385 37.081 36.423 -4 ,13804 ,KEBNE ,16658527,Tue Nov 23 09:39:24 CET,Tue Nov 23 11:01:54 CET,0.0 0.505 0.842 1.125 1.38 1.606 1.796 1.968 2.297 2.446 2.593 2.814 3.014 3.151 3.421 3.678 3.907 4.02 4.236 4.442 4.762 4.966 5.157 5.435 5.706 5.973 6.224 6.475 6.81 7.131 7.455 7.846 8.232 8.617 9.059 9.566 10.059 10.598 11.191 11.846 12.546 13.356 14.315 15.311 16.536 17.918 19.544 21.426 23.704 26.504 30.125 33.367 35.429 36.883 37.889 38.6 39.107 39.497 39.779 40.02 40.19 40.303 40.384 40.452 40.494 40.505 40.489 40.442 40.4 40.368 40.338 40.31 40.264 40.196 40.131 40.063 39.995 39.919 39.848 39.792 39.732 39.636 39.55 39.46 39.411 39.305 39.176 39.023 38.952 38.859 38.734 38.651 38.554 38.347 38.226 38.084 37.939 37.734 37.473 37.111 36.069 -5 ,32649 ,KEBNE ,16658528,Tue Nov 23 09:39:24 CET,Tue Nov 23 11:03:17 CET,0.0 0.887 1.229 1.502 1.741 1.94 2.147 2.34 2.67 2.815 2.947 3.156 3.349 3.476 3.714 3.937 4.16 4.27 4.488 4.708 5.018 5.214 5.404 5.685 5.96 6.223 6.487 6.749 7.08 7.401 7.719 8.107 8.502 8.885 9.321 9.822 10.303 10.843 11.455 12.101 12.783 13.592 14.546 15.533 16.739 18.122 19.73 21.609 23.905 26.721 30.366 33.602 35.621 36.969 37.968 38.686 39.176 39.549 39.837 40.058 40.221 40.369 40.47 40.516 40.517 40.524 40.539 40.537 40.524 40.474 40.401 40.344 40.28 40.227 40.176 40.106 40.04 39.967 39.877 39.814 39.747 39.641 39.566 39.475 39.424 39.319 39.205 39.075 38.997 38.892 38.74 38.649 38.552 38.311 38.173 38.016 37.839 37.648 37.413 37.117 36.4 -6 ,6399 ,KEBNE ,16658529,Tue Nov 23 09:39:25 CET,Tue Nov 23 11:00:43 CET,0.0 0.75 1.097 1.383 1.626 1.827 2.0 2.169 2.493 2.64 2.789 3.029 3.238 3.37 3.617 3.846 4.064 4.176 4.393 4.593 4.889 5.085 5.277 5.556 5.83 6.112 6.384 6.632 6.954 7.281 7.611 8.006 8.372 8.729 9.167 9.67 10.154 10.715 11.342 11.992 12.663 13.442 14.375 15.332 16.501 17.866 19.503 21.399 23.72 26.635 30.303 33.566 35.608 36.992 37.961 38.668 39.146 39.487 39.748 39.942 40.081 40.193 40.271 40.323 40.358 40.371 40.367 40.357 40.336 40.309 40.284 40.252 40.201 40.139 40.086 40.028 39.962 39.891 39.803 39.73 39.665 39.564 39.488 39.415 39.371 39.254 39.123 38.982 38.916 38.829 38.692 38.596 38.504 38.298 38.166 38.026 37.882 37.705 37.506 37.281 36.476 -7 ,10718 ,KEBNE ,16658530,Tue Nov 23 09:40:26 CET,Tue Nov 23 11:03:01 CET,0.0 0.465 0.781 1.041 1.271 1.482 1.682 1.876 2.225 2.376 2.518 2.74 2.94 3.068 3.311 3.559 3.806 3.921 4.146 4.37 4.675 4.876 5.078 5.353 5.624 5.897 6.157 6.408 6.744 7.075 7.39 7.773 8.152 8.518 8.951 9.448 9.933 10.465 11.041 11.672 12.357 13.151 14.101 15.076 16.221 17.554 19.169 21.034 23.36 26.271 29.938 33.21 35.258 36.584 37.536 38.298 38.885 39.301 39.584 39.845 39.993 40.084 40.175 40.253 40.302 40.323 40.336 40.318 40.307 40.286 40.242 40.215 40.181 40.126 40.069 40.01 39.958 39.895 39.816 39.755 39.681 39.557 39.475 39.376 39.321 39.225 39.124 39.004 38.938 38.848 38.738 38.657 38.567 38.344 38.204 38.058 37.915 37.741 37.514 37.214 36.492 -8 ,32330 ,KEBNE ,16658531,Tue Nov 23 09:40:26 CET,Tue Nov 23 11:02:44 CET,0.0 0.63 1.012 1.315 1.543 1.717 1.886 2.058 2.388 2.546 2.691 2.893 3.089 3.216 3.446 3.668 3.886 3.994 4.209 4.428 4.751 4.955 5.153 5.44 5.725 5.999 6.267 6.539 6.888 7.222 7.549 7.934 8.299 8.67 9.115 9.625 10.121 10.662 11.242 11.865 12.547 13.317 14.24 15.242 16.426 17.768 19.382 21.289 23.618 26.493 30.17 33.439 35.508 36.934 37.914 38.611 39.1 39.448 39.71 39.938 40.081 40.188 40.29 40.356 40.386 40.399 40.399 40.381 40.35 40.326 40.297 40.255 40.209 40.166 40.125 40.076 40.015 39.948 39.882 39.835 39.776 39.673 39.596 39.516 39.47 39.368 39.245 39.096 39.019 38.929 38.819 38.741 38.656 38.431 38.297 38.15 37.986 37.801 37.558 37.219 36.191 -9 ,21534 ,KEBNE ,16658532,Tue Nov 23 09:40:26 CET,Tue Nov 23 11:02:25 CET,0.0 0.899 1.239 1.519 1.744 1.933 2.115 2.291 2.608 2.751 2.893 3.125 3.328 3.453 3.695 3.932 4.167 4.283 4.496 4.696 4.995 5.194 5.389 5.665 5.936 6.204 6.46 6.715 7.055 7.382 7.694 8.069 8.441 8.809 9.252 9.752 10.225 10.763 11.38 12.043 12.737 13.537 14.464 15.41 16.547 17.862 19.469 21.382 23.705 26.533 30.212 33.5 35.574 37.03 38.037 38.797 39.373 39.815 40.136 40.396 40.559 40.667 40.763 40.82 40.859 40.879 40.862 40.836 40.816 40.788 40.76 40.731 40.685 40.635 40.585 40.529 40.467 40.397 40.33 40.272 40.206 40.105 40.029 39.938 39.891 39.791 39.676 39.548 39.478 39.384 39.251 39.168 39.069 38.847 38.726 38.587 38.442 38.278 38.077 37.825 37.218 -10 ,13892 ,KEBNE ,16658533,Tue Nov 23 09:40:26 CET,Tue Nov 23 11:03:00 CET,0.0 0.602 0.933 1.167 1.378 1.575 1.766 1.968 2.323 2.466 2.601 2.81 3.006 3.134 3.372 3.6 3.832 3.941 4.134 4.331 4.631 4.834 5.037 5.329 5.615 5.891 6.16 6.417 6.746 7.076 7.411 7.821 8.209 8.582 9.022 9.518 10.002 10.546 11.126 11.753 12.427 13.208 14.153 15.143 16.334 17.693 19.327 21.217 23.518 26.401 30.11 33.48 35.576 36.985 38.01 38.738 39.237 39.649 39.978 40.25 40.418 40.502 40.571 40.628 40.643 40.65 40.663 40.658 40.631 40.6 40.552 40.493 40.434 40.367 40.311 40.259 40.209 40.152 40.081 40.028 39.976 39.884 39.804 39.708 39.658 39.551 39.45 39.345 39.283 39.186 39.032 38.94 38.842 38.601 38.465 38.318 38.163 37.985 37.776 37.498 36.549 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_54_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_54_50.txt deleted file mode 100644 index e0e143a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_54_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20527 ,KEBNE ,16658534,Tue Nov 23 09:40:26 CET,Tue Nov 23 11:02:59 CET,0.0 0.57 0.858 1.089 1.282 1.444 1.593 1.741 2.009 2.13 2.245 2.377 2.567 2.673 2.877 3.075 3.258 3.345 3.522 3.697 3.941 4.1 4.265 4.495 4.71 4.92 5.123 5.33 5.603 5.86 6.103 6.39 6.669 6.951 7.278 7.661 8.031 8.438 8.891 9.361 9.862 10.435 11.079 11.751 12.573 13.485 14.487 15.605 16.958 18.535 20.272 21.568 22.198 22.468 22.554 22.513 22.412 22.291 22.175 22.032 21.872 21.712 21.551 21.373 21.196 21.035 20.842 20.652 20.494 20.33 20.149 19.984 19.813 19.642 19.507 19.368 19.232 19.075 18.899 18.783 18.65 18.436 18.295 18.134 18.052 17.891 17.705 17.511 17.411 17.234 17.061 16.93 16.787 16.506 16.339 16.155 15.951 15.709 15.405 14.983 13.995 -2 ,17809 ,KEBNE ,16658535,Tue Nov 23 09:40:26 CET,Tue Nov 23 11:03:04 CET,0.0 0.463 0.779 1.001 1.2 1.369 1.529 1.683 1.961 2.088 2.209 2.377 2.568 2.666 2.864 3.055 3.246 3.336 3.499 3.669 3.929 4.092 4.243 4.454 4.663 4.868 5.067 5.27 5.535 5.784 6.021 6.327 6.62 6.9 7.229 7.589 7.935 8.328 8.769 9.266 9.789 10.349 10.997 11.661 12.437 13.339 14.466 15.743 17.129 18.652 20.442 21.808 22.455 22.757 22.862 22.867 22.788 22.659 22.513 22.337 22.186 22.035 21.878 21.709 21.542 21.398 21.22 21.043 20.902 20.751 20.562 20.396 20.223 20.045 19.912 19.771 19.618 19.447 19.256 19.118 18.97 18.745 18.586 18.425 18.346 18.184 17.998 17.794 17.685 17.497 17.32 17.202 17.071 16.788 16.617 16.424 16.219 15.973 15.622 15.163 14.36 -3 ,9975 ,KEBNE ,16658536,Tue Nov 23 09:41:27 CET,Tue Nov 23 11:04:01 CET,0.0 0.508 0.764 0.972 1.133 1.281 1.428 1.569 1.857 1.996 2.127 2.269 2.451 2.553 2.759 2.955 3.136 3.229 3.411 3.586 3.849 4.011 4.164 4.386 4.595 4.796 4.992 5.194 5.47 5.739 5.99 6.276 6.545 6.811 7.126 7.487 7.834 8.215 8.641 9.092 9.557 10.117 10.767 11.383 12.117 12.978 14.019 15.185 16.472 17.905 19.529 20.735 21.301 21.497 21.548 21.484 21.353 21.211 21.05 20.887 20.751 20.612 20.451 20.302 20.17 20.026 19.856 19.684 19.515 19.323 19.131 18.985 18.839 18.674 18.529 18.385 18.238 18.072 17.905 17.797 17.671 17.459 17.315 17.151 17.067 16.891 16.705 16.53 16.427 16.245 16.076 15.959 15.839 15.52 15.347 15.178 14.963 14.699 14.379 13.942 13.019 -4 ,24319 ,KEBNE ,16658537,Tue Nov 23 09:41:27 CET,Tue Nov 23 11:03:48 CET,0.0 0.596 0.886 1.115 1.331 1.523 1.686 1.834 2.078 2.203 2.335 2.488 2.677 2.783 2.993 3.186 3.375 3.467 3.633 3.804 4.062 4.224 4.381 4.606 4.826 5.038 5.237 5.434 5.677 5.92 6.169 6.463 6.752 7.034 7.373 7.756 8.119 8.522 8.95 9.41 9.904 10.453 11.114 11.801 12.579 13.444 14.491 15.646 16.927 18.422 20.181 21.432 21.996 22.291 22.392 22.358 22.232 22.093 21.97 21.811 21.634 21.45 21.278 21.103 20.912 20.731 20.543 20.362 20.202 20.046 19.875 19.73 19.577 19.398 19.251 19.093 18.934 18.79 18.625 18.504 18.381 18.159 18.001 17.842 17.757 17.582 17.398 17.205 17.108 16.94 16.76 16.628 16.497 16.186 16.01 15.829 15.602 15.312 14.947 14.528 13.11 -5 ,13337 ,KEBNE ,16658538,Tue Nov 23 09:41:27 CET,Tue Nov 23 11:04:12 CET,0.0 0.652 0.908 1.115 1.321 1.502 1.652 1.801 2.071 2.193 2.317 2.478 2.673 2.784 2.992 3.187 3.372 3.459 3.621 3.779 4.024 4.188 4.346 4.565 4.77 4.979 5.187 5.394 5.671 5.932 6.174 6.474 6.764 7.038 7.374 7.762 8.122 8.521 8.97 9.454 9.96 10.513 11.149 11.828 12.643 13.546 14.594 15.81 17.146 18.619 20.401 21.721 22.293 22.541 22.595 22.524 22.396 22.252 22.143 21.977 21.775 21.591 21.408 21.212 21.025 20.86 20.688 20.525 20.374 20.203 20.013 19.857 19.697 19.534 19.404 19.264 19.107 18.929 18.748 18.627 18.502 18.3 18.157 17.994 17.907 17.73 17.534 17.309 17.191 17.01 16.832 16.71 16.578 16.263 16.081 15.882 15.664 15.387 15.069 14.652 13.17 -6 ,14548 ,KEBNE ,16658539,Tue Nov 23 09:42:28 CET,Tue Nov 23 11:05:57 CET,0.0 0.499 0.744 0.957 1.156 1.331 1.486 1.623 1.89 2.018 2.137 2.303 2.509 2.615 2.813 3.001 3.2 3.302 3.48 3.646 3.899 4.062 4.218 4.437 4.653 4.861 5.061 5.265 5.524 5.779 6.029 6.333 6.643 6.929 7.248 7.62 7.98 8.38 8.804 9.255 9.748 10.31 10.977 11.679 12.512 13.416 14.449 15.562 16.85 18.345 20.08 21.38 21.972 22.247 22.32 22.324 22.294 22.204 22.094 21.95 21.792 21.617 21.432 21.254 21.07 20.889 20.693 20.531 20.383 20.22 20.064 19.912 19.738 19.549 19.392 19.234 19.086 18.931 18.743 18.615 18.488 18.271 18.121 17.974 17.889 17.698 17.517 17.349 17.261 17.095 16.921 16.787 16.65 16.351 16.184 15.997 15.762 15.489 15.147 14.728 13.711 -7 ,1960 ,KEBNE ,16658540,Tue Nov 23 09:42:28 CET,Tue Nov 23 11:05:20 CET,0.0 0.434 0.697 0.944 1.147 1.324 1.498 1.656 1.927 2.051 2.172 2.323 2.513 2.617 2.813 3.01 3.194 3.278 3.446 3.61 3.851 4.004 4.143 4.365 4.585 4.788 4.98 5.171 5.432 5.683 5.914 6.193 6.475 6.751 7.076 7.432 7.766 8.141 8.534 8.962 9.437 9.96 10.574 11.208 11.979 12.834 13.749 14.756 15.982 17.413 19.072 20.336 20.879 21.108 21.187 21.132 20.99 20.853 20.716 20.537 20.375 20.231 20.052 19.875 19.72 19.567 19.374 19.184 19.026 18.878 18.726 18.578 18.418 18.246 18.107 17.966 17.817 17.654 17.474 17.352 17.215 17.0 16.858 16.72 16.649 16.48 16.301 16.11 15.995 15.806 15.612 15.476 15.343 15.029 14.84 14.647 14.42 14.129 13.804 13.422 12.602 -8 ,15771 ,KEBNE ,16658541,Tue Nov 23 09:42:28 CET,Tue Nov 23 11:05:13 CET,0.0 0.979 1.316 1.527 1.732 1.922 2.087 2.223 2.501 2.641 2.766 2.898 3.091 3.188 3.369 3.551 3.739 3.832 4.004 4.178 4.435 4.587 4.738 4.968 5.186 5.39 5.588 5.785 6.044 6.298 6.547 6.845 7.131 7.409 7.737 8.114 8.467 8.841 9.271 9.742 10.224 10.785 11.43 12.053 12.806 13.7 14.742 15.898 17.208 18.726 20.491 21.75 22.428 22.759 22.866 22.85 22.78 22.667 22.522 22.348 22.177 22.007 21.834 21.674 21.505 21.33 21.144 20.979 20.832 20.676 20.518 20.378 20.213 20.033 19.89 19.725 19.57 19.437 19.291 19.168 19.029 18.822 18.669 18.51 18.427 18.262 18.095 17.91 17.809 17.629 17.452 17.327 17.2 16.92 16.746 16.553 16.326 16.068 15.763 15.345 14.109 -9 ,12896 ,KEBNE ,16658542,Tue Nov 23 09:42:28 CET,Tue Nov 23 11:07:01 CET,0.0 1.019 1.329 1.563 1.754 1.926 2.084 2.227 2.515 2.65 2.774 2.927 3.122 3.229 3.423 3.613 3.797 3.886 4.063 4.234 4.47 4.628 4.795 5.037 5.252 5.452 5.646 5.831 6.072 6.31 6.548 6.853 7.148 7.419 7.736 8.111 8.474 8.862 9.277 9.726 10.19 10.725 11.376 12.021 12.745 13.548 14.503 15.614 16.903 18.311 19.856 20.938 21.45 21.717 21.807 21.761 21.651 21.502 21.372 21.221 21.063 20.93 20.781 20.602 20.422 20.26 20.082 19.899 19.738 19.586 19.433 19.286 19.102 18.924 18.804 18.67 18.529 18.366 18.179 18.066 17.943 17.737 17.59 17.422 17.332 17.158 16.985 16.796 16.693 16.518 16.358 16.238 16.096 15.799 15.626 15.43 15.219 14.961 14.647 14.192 13.071 -10 ,28184 ,KEBNE ,16658543,Tue Nov 23 09:42:28 CET,Tue Nov 23 11:05:10 CET,0.0 0.371 0.661 0.891 1.062 1.206 1.357 1.517 1.816 1.952 2.074 2.213 2.404 2.512 2.721 2.923 3.118 3.21 3.388 3.547 3.767 3.916 4.069 4.295 4.508 4.714 4.913 5.115 5.377 5.636 5.892 6.192 6.478 6.751 7.077 7.448 7.804 8.2 8.628 9.09 9.595 10.161 10.829 11.507 12.314 13.243 14.274 15.385 16.693 18.288 20.116 21.393 22.006 22.263 22.324 22.295 22.203 22.079 21.95 21.812 21.656 21.503 21.334 21.154 20.967 20.779 20.601 20.44 20.303 20.157 19.973 19.812 19.656 19.491 19.348 19.202 19.049 18.885 18.712 18.582 18.432 18.211 18.065 17.915 17.833 17.657 17.472 17.262 17.154 16.982 16.824 16.711 16.587 16.285 16.088 15.871 15.651 15.354 14.997 14.541 13.256 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_57_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_57_155.txt deleted file mode 100644 index b56b5ada..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_57_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23342 ,KEBNE ,16658544,Tue Nov 23 09:43:30 CET,Tue Nov 23 11:06:25 CET,0.0 0.52 0.792 0.988 1.118 1.238 1.358 1.456 1.633 1.711 1.782 1.849 1.976 2.05 2.189 2.303 2.404 2.456 2.571 2.676 2.811 2.891 2.962 3.061 3.17 3.275 3.366 3.467 3.6 3.709 3.806 3.92 4.02 4.111 4.206 4.313 4.425 4.563 4.685 4.773 4.869 4.976 5.072 5.131 5.156 5.153 5.113 4.983 4.733 4.297 3.393 2.177 1.152 0.273 -0.515 -1.223 -1.819 -2.356 -2.815 -3.259 -3.643 -3.996 -4.354 -4.688 -4.964 -5.221 -5.486 -5.718 -5.942 -6.192 -6.439 -6.639 -6.848 -7.074 -7.261 -7.439 -7.604 -7.77 -7.944 -8.073 -8.206 -8.409 -8.55 -8.686 -8.761 -8.932 -9.111 -9.286 -9.376 -9.55 -9.661 -9.778 -9.903 -10.153 -10.303 -10.454 -10.589 -10.742 -10.931 -11.164 -11.613 -2 ,22258 ,KEBNE ,16658545,Tue Nov 23 09:43:29 CET,Tue Nov 23 11:07:10 CET,0.0 0.489 0.663 0.804 0.922 1.015 1.105 1.194 1.379 1.466 1.542 1.612 1.748 1.814 1.926 2.036 2.126 2.169 2.254 2.339 2.477 2.566 2.653 2.775 2.886 2.987 3.086 3.173 3.272 3.365 3.47 3.585 3.674 3.763 3.867 3.971 4.086 4.215 4.321 4.41 4.491 4.596 4.677 4.717 4.743 4.756 4.746 4.703 4.571 4.187 3.357 2.163 1.12 0.283 -0.429 -1.102 -1.708 -2.251 -2.704 -3.143 -3.518 -3.883 -4.24 -4.555 -4.835 -5.101 -5.39 -5.627 -5.83 -6.048 -6.267 -6.446 -6.632 -6.829 -6.999 -7.175 -7.344 -7.529 -7.738 -7.876 -8.005 -8.205 -8.36 -8.521 -8.598 -8.753 -8.909 -9.076 -9.161 -9.333 -9.457 -9.558 -9.66 -9.896 -10.033 -10.174 -10.332 -10.514 -10.73 -11.004 -11.62 -3 ,573 ,KEBNE ,16658546,Tue Nov 23 09:43:30 CET,Tue Nov 23 11:07:35 CET,0.0 0.267 0.461 0.628 0.755 0.876 0.983 1.073 1.241 1.326 1.415 1.509 1.647 1.712 1.817 1.924 2.024 2.068 2.17 2.266 2.372 2.445 2.532 2.672 2.777 2.865 2.957 3.028 3.114 3.211 3.307 3.405 3.496 3.608 3.732 3.848 3.951 4.068 4.192 4.29 4.396 4.5 4.571 4.62 4.694 4.754 4.738 4.619 4.349 3.923 3.046 1.843 0.781 -0.161 -0.957 -1.666 -2.282 -2.83 -3.301 -3.776 -4.176 -4.53 -4.872 -5.192 -5.497 -5.772 -6.051 -6.307 -6.528 -6.752 -6.973 -7.149 -7.327 -7.52 -7.678 -7.841 -8.015 -8.197 -8.372 -8.49 -8.621 -8.823 -8.961 -9.104 -9.181 -9.346 -9.517 -9.693 -9.781 -9.958 -10.1 -10.228 -10.354 -10.614 -10.748 -10.877 -11.016 -11.163 -11.351 -11.602 -12.019 -4 ,11985 ,KEBNE ,16658547,Tue Nov 23 09:43:29 CET,Tue Nov 23 11:07:32 CET,0.0 0.589 0.815 0.966 1.086 1.202 1.308 1.399 1.552 1.621 1.697 1.781 1.914 1.975 2.095 2.211 2.32 2.375 2.479 2.58 2.732 2.83 2.914 3.025 3.14 3.249 3.341 3.42 3.523 3.624 3.72 3.824 3.924 4.02 4.122 4.24 4.359 4.496 4.628 4.745 4.85 4.944 5.035 5.114 5.184 5.195 5.142 5.015 4.748 4.284 3.398 2.163 1.063 0.114 -0.683 -1.364 -1.96 -2.492 -2.953 -3.408 -3.795 -4.147 -4.478 -4.78 -5.065 -5.335 -5.615 -5.871 -6.086 -6.305 -6.527 -6.714 -6.919 -7.116 -7.266 -7.427 -7.607 -7.789 -7.973 -8.109 -8.243 -8.45 -8.595 -8.746 -8.824 -8.988 -9.168 -9.355 -9.449 -9.625 -9.746 -9.859 -9.983 -10.251 -10.395 -10.542 -10.703 -10.873 -11.062 -11.322 -11.856 -5 ,1274 ,KEBNE ,16658548,Tue Nov 23 09:45:31 CET,Tue Nov 23 11:07:11 CET,0.0 0.276 0.43 0.579 0.723 0.856 0.965 1.072 1.248 1.322 1.396 1.461 1.589 1.648 1.766 1.867 1.966 2.02 2.134 2.241 2.376 2.451 2.525 2.637 2.744 2.836 2.911 3.002 3.128 3.239 3.338 3.457 3.578 3.677 3.774 3.881 3.992 4.106 4.204 4.299 4.394 4.491 4.592 4.652 4.658 4.624 4.595 4.538 4.322 3.876 3.016 1.839 0.807 -0.116 -0.914 -1.609 -2.204 -2.741 -3.223 -3.748 -4.205 -4.572 -4.91 -5.216 -5.491 -5.753 -6.03 -6.275 -6.491 -6.722 -6.952 -7.136 -7.336 -7.557 -7.724 -7.879 -8.042 -8.221 -8.418 -8.549 -8.675 -8.877 -9.028 -9.187 -9.266 -9.438 -9.623 -9.828 -9.927 -10.097 -10.212 -10.315 -10.434 -10.679 -10.804 -10.947 -11.109 -11.29 -11.492 -11.763 -12.168 -6 ,16067 ,KEBNE ,16658549,Tue Nov 23 09:45:32 CET,Tue Nov 23 11:10:46 CET,0.0 0.497 0.697 0.856 0.963 1.06 1.156 1.244 1.409 1.494 1.571 1.623 1.747 1.807 1.912 2.018 2.123 2.174 2.259 2.325 2.436 2.519 2.604 2.724 2.835 2.935 3.031 3.124 3.239 3.33 3.405 3.495 3.596 3.708 3.817 3.916 4.01 4.114 4.21 4.313 4.412 4.481 4.542 4.63 4.723 4.77 4.747 4.63 4.41 3.982 3.088 1.932 0.926 0.064 -0.685 -1.378 -1.971 -2.519 -3.012 -3.481 -3.888 -4.23 -4.537 -4.871 -5.179 -5.46 -5.758 -6.003 -6.212 -6.43 -6.654 -6.827 -7.018 -7.233 -7.405 -7.594 -7.776 -7.955 -8.145 -8.268 -8.391 -8.589 -8.731 -8.887 -8.963 -9.123 -9.301 -9.478 -9.562 -9.731 -9.838 -9.932 -10.041 -10.307 -10.445 -10.566 -10.702 -10.872 -11.037 -11.256 -11.978 -7 ,1871 ,KEBNE ,16658550,Tue Nov 23 09:45:36 CET,Tue Nov 23 11:02:05 CET,0.0 0.405 0.624 0.797 0.946 1.072 1.168 1.257 1.468 1.566 1.639 1.695 1.817 1.874 1.984 2.096 2.214 2.275 2.381 2.473 2.6 2.675 2.742 2.827 2.914 3.004 3.082 3.157 3.257 3.339 3.411 3.519 3.628 3.718 3.816 3.918 4.013 4.106 4.197 4.301 4.392 4.47 4.569 4.645 4.692 4.707 4.687 4.572 4.319 3.874 2.997 1.865 0.864 -0.036 -0.84 -1.544 -2.129 -2.644 -3.09 -3.545 -3.943 -4.31 -4.653 -4.98 -5.297 -5.585 -5.874 -6.107 -6.303 -6.522 -6.763 -6.957 -7.158 -7.386 -7.567 -7.74 -7.898 -8.06 -8.233 -8.36 -8.5 -8.727 -8.879 -9.031 -9.114 -9.278 -9.429 -9.593 -9.691 -9.883 -10.013 -10.109 -10.222 -10.48 -10.615 -10.766 -10.913 -11.077 -11.279 -11.514 -12.138 -8 ,11819 ,KEBNE ,16658551,Tue Nov 23 09:46:33 CET,Tue Nov 23 11:11:54 CET,0.0 0.448 0.619 0.76 0.881 0.983 1.072 1.155 1.323 1.408 1.487 1.558 1.695 1.769 1.902 2.015 2.118 2.164 2.256 2.355 2.495 2.578 2.65 2.757 2.862 2.959 3.045 3.124 3.232 3.329 3.415 3.531 3.646 3.744 3.848 3.943 4.018 4.123 4.246 4.338 4.41 4.49 4.623 4.779 4.87 4.887 4.84 4.718 4.482 4.048 3.187 1.983 0.919 -0.01 -0.788 -1.456 -2.043 -2.598 -3.068 -3.517 -3.905 -4.249 -4.563 -4.857 -5.138 -5.393 -5.652 -5.893 -6.11 -6.347 -6.577 -6.765 -6.966 -7.175 -7.343 -7.521 -7.706 -7.89 -8.07 -8.201 -8.345 -8.561 -8.713 -8.87 -8.953 -9.117 -9.275 -9.447 -9.541 -9.715 -9.847 -9.969 -10.095 -10.343 -10.469 -10.622 -10.798 -10.97 -11.148 -11.379 -11.989 -9 ,31793 ,KEBNE ,16658552,Tue Nov 23 09:46:33 CET,Tue Nov 23 11:08:25 CET,0.0 0.292 0.474 0.623 0.76 0.883 0.988 1.081 1.252 1.329 1.4 1.461 1.583 1.64 1.761 1.864 1.968 2.023 2.132 2.225 2.337 2.41 2.487 2.605 2.718 2.821 2.917 3.003 3.11 3.201 3.285 3.387 3.483 3.57 3.656 3.749 3.841 3.949 4.063 4.155 4.231 4.324 4.416 4.47 4.478 4.485 4.478 4.391 4.232 3.86 2.955 1.74 0.704 -0.212 -0.982 -1.637 -2.221 -2.771 -3.247 -3.709 -4.098 -4.438 -4.756 -5.073 -5.375 -5.636 -5.911 -6.169 -6.398 -6.643 -6.887 -7.082 -7.287 -7.489 -7.638 -7.794 -7.959 -8.123 -8.279 -8.395 -8.518 -8.704 -8.839 -8.977 -9.048 -9.196 -9.36 -9.536 -9.623 -9.792 -9.898 -10.001 -10.106 -10.337 -10.459 -10.588 -10.74 -10.887 -11.072 -11.35 -11.687 -10 ,7166 ,KEBNE ,16658553,Tue Nov 23 09:46:33 CET,Tue Nov 23 11:08:21 CET,0.0 0.468 0.689 0.869 1.022 1.148 1.259 1.376 1.59 1.681 1.757 1.826 1.953 2.012 2.135 2.251 2.36 2.412 2.505 2.594 2.735 2.822 2.895 2.999 3.101 3.195 3.289 3.38 3.495 3.598 3.69 3.802 3.908 4.007 4.1 4.194 4.304 4.407 4.508 4.609 4.69 4.8 4.885 4.905 4.909 4.892 4.873 4.776 4.506 3.993 3.066 1.912 0.897 -0.039 -0.869 -1.542 -2.122 -2.664 -3.119 -3.568 -3.963 -4.327 -4.651 -4.94 -5.224 -5.491 -5.762 -6.015 -6.237 -6.463 -6.725 -6.936 -7.138 -7.353 -7.522 -7.688 -7.864 -8.051 -8.238 -8.361 -8.484 -8.707 -8.87 -9.04 -9.126 -9.293 -9.467 -9.643 -9.735 -9.913 -10.024 -10.123 -10.221 -10.451 -10.585 -10.725 -10.875 -11.028 -11.199 -11.417 -11.907 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_57_290.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_57_290.txt deleted file mode 100644 index 0e2fc3f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_57_290.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23910 ,TETRA ,17675354,Sat Dec 4 16:25:59 CET,Sat Dec 4 18:08:25 CET,0.0 0.625 0.924 1.117 1.272 1.41 1.539 1.657 1.855 1.953 2.057 2.171 2.312 2.378 2.499 2.619 2.736 2.795 2.909 3.015 3.172 3.275 3.373 3.517 3.647 3.771 3.888 3.999 4.146 4.27 4.38 4.526 4.686 4.832 4.98 5.155 5.319 5.481 5.646 5.822 5.999 6.2 6.433 6.638 6.848 7.071 7.299 7.468 7.614 7.651 7.355 6.735 6.127 5.557 5.053 4.574 4.09 3.681 3.349 2.976 2.659 2.381 2.087 1.809 1.562 1.346 1.119 0.903 0.719 0.544 0.368 0.215 0.054 -0.121 -0.262 -0.404 -0.543 -0.692 -0.846 -0.942 -1.038 -1.195 -1.315 -1.443 -1.501 -1.617 -1.734 -1.854 -1.926 -2.069 -2.15 -2.233 -2.331 -2.537 -2.632 -2.73 -2.84 -2.956 -3.101 -3.28 -3.599 -2 ,16165 ,TETRA ,17675355,Sat Dec 4 16:26:52 CET,Sat Dec 4 18:11:14 CET,0.0 0.434 0.667 0.86 1.037 1.183 1.311 1.419 1.601 1.703 1.795 1.883 2.027 2.094 2.232 2.372 2.493 2.554 2.683 2.816 2.999 3.117 3.225 3.349 3.477 3.616 3.75 3.876 4.033 4.182 4.317 4.467 4.601 4.737 4.898 5.059 5.203 5.374 5.564 5.761 5.949 6.149 6.376 6.583 6.812 7.034 7.256 7.478 7.64 7.641 7.298 6.66 6.072 5.522 5.008 4.53 4.101 3.719 3.371 3.008 2.707 2.415 2.134 1.882 1.632 1.405 1.179 0.973 0.795 0.615 0.422 0.269 0.122 -0.03 -0.153 -0.281 -0.411 -0.551 -0.703 -0.807 -0.913 -1.085 -1.196 -1.308 -1.371 -1.502 -1.645 -1.797 -1.872 -2.007 -2.066 -2.143 -2.229 -2.426 -2.531 -2.656 -2.79 -2.92 -3.08 -3.288 -3.627 -3 ,20534 ,TETRA ,17675356,Sat Dec 4 16:26:54 CET,Sat Dec 4 18:11:08 CET,0.0 0.412 0.665 0.878 1.059 1.207 1.328 1.433 1.636 1.742 1.843 1.948 2.087 2.164 2.335 2.492 2.639 2.706 2.843 2.976 3.149 3.252 3.342 3.469 3.602 3.734 3.852 3.96 4.098 4.226 4.343 4.483 4.627 4.775 4.95 5.135 5.296 5.468 5.639 5.822 5.992 6.154 6.358 6.559 6.78 7.01 7.246 7.496 7.684 7.72 7.469 6.831 6.145 5.521 5.02 4.579 4.153 3.733 3.368 3.013 2.702 2.421 2.161 1.911 1.672 1.477 1.282 1.085 0.902 0.718 0.539 0.387 0.228 0.061 -0.063 -0.189 -0.328 -0.469 -0.617 -0.72 -0.823 -0.987 -1.092 -1.203 -1.262 -1.382 -1.506 -1.637 -1.705 -1.843 -1.948 -2.035 -2.108 -2.281 -2.385 -2.5 -2.628 -2.761 -2.89 -3.057 -3.34 -4 ,31748 ,TETRA ,17675357,Sat Dec 4 16:26:56 CET,Sat Dec 4 18:07:41 CET,0.0 0.55 0.781 0.987 1.134 1.257 1.385 1.513 1.743 1.85 1.952 2.065 2.214 2.292 2.445 2.616 2.784 2.85 2.967 3.075 3.228 3.335 3.433 3.566 3.701 3.826 3.944 4.061 4.201 4.332 4.464 4.624 4.764 4.9 5.067 5.238 5.39 5.559 5.729 5.91 6.109 6.296 6.505 6.721 6.931 7.137 7.364 7.54 7.647 7.669 7.416 6.865 6.264 5.674 5.138 4.665 4.252 3.863 3.527 3.19 2.893 2.63 2.367 2.115 1.89 1.673 1.441 1.234 1.048 0.863 0.692 0.538 0.371 0.201 0.06 -0.074 -0.209 -0.365 -0.519 -0.613 -0.706 -0.874 -0.998 -1.114 -1.175 -1.311 -1.457 -1.613 -1.687 -1.825 -1.924 -2.015 -2.1 -2.294 -2.403 -2.514 -2.631 -2.764 -2.897 -3.04 -3.34 -5 ,27383 ,TETRA ,17675358,Sat Dec 4 16:26:57 CET,Sat Dec 4 18:07:44 CET,0.0 0.39 0.614 0.817 0.997 1.16 1.302 1.428 1.654 1.758 1.856 1.961 2.107 2.193 2.357 2.5 2.618 2.675 2.789 2.902 3.056 3.15 3.242 3.378 3.525 3.66 3.774 3.88 4.017 4.157 4.291 4.444 4.603 4.757 4.908 5.066 5.234 5.42 5.586 5.749 5.926 6.125 6.358 6.564 6.782 7.004 7.239 7.488 7.663 7.673 7.393 6.83 6.29 5.756 5.235 4.744 4.298 3.892 3.551 3.206 2.889 2.592 2.325 2.102 1.9 1.703 1.483 1.287 1.12 0.947 0.775 0.633 0.477 0.309 0.173 0.047 -0.074 -0.213 -0.359 -0.459 -0.563 -0.733 -0.855 -0.983 -1.049 -1.183 -1.321 -1.472 -1.545 -1.684 -1.777 -1.861 -1.95 -2.139 -2.239 -2.339 -2.45 -2.601 -2.793 -2.993 -3.255 -6 ,4059 ,TETRA ,17675359,Sat Dec 4 16:26:51 CET,Sat Dec 4 18:07:10 CET,0.0 0.705 1.011 1.277 1.47 1.595 1.708 1.809 1.978 2.069 2.163 2.282 2.439 2.529 2.683 2.817 2.95 3.015 3.145 3.276 3.448 3.545 3.634 3.757 3.886 4.0 4.106 4.218 4.358 4.49 4.611 4.765 4.9 5.037 5.224 5.423 5.592 5.755 5.929 6.115 6.314 6.533 6.771 6.997 7.246 7.473 7.686 7.885 8.031 8.069 7.791 7.196 6.559 5.926 5.354 4.856 4.421 4.025 3.699 3.353 3.044 2.776 2.505 2.238 2.0 1.812 1.611 1.414 1.252 1.087 0.91 0.761 0.593 0.426 0.31 0.192 0.07 -0.063 -0.2 -0.293 -0.393 -0.555 -0.67 -0.789 -0.851 -0.975 -1.112 -1.261 -1.333 -1.484 -1.589 -1.673 -1.754 -1.93 -2.02 -2.128 -2.258 -2.38 -2.54 -2.711 -3.004 -7 ,18844 ,TETRA ,17675360,Sat Dec 4 16:29:54 CET,Sat Dec 4 18:08:40 CET,0.0 0.451 0.663 0.823 0.986 1.161 1.303 1.42 1.649 1.757 1.869 1.994 2.134 2.196 2.319 2.452 2.579 2.64 2.747 2.848 2.997 3.093 3.19 3.335 3.459 3.572 3.693 3.813 3.969 4.105 4.234 4.404 4.557 4.693 4.841 5.001 5.149 5.317 5.505 5.693 5.886 6.104 6.328 6.521 6.723 6.936 7.157 7.318 7.414 7.388 7.136 6.565 5.951 5.394 4.877 4.411 3.992 3.581 3.232 2.885 2.581 2.307 2.045 1.803 1.581 1.381 1.173 0.98 0.802 0.621 0.443 0.293 0.138 -0.015 -0.144 -0.285 -0.425 -0.563 -0.716 -0.824 -0.925 -1.085 -1.198 -1.308 -1.367 -1.496 -1.624 -1.757 -1.827 -1.973 -2.089 -2.191 -2.288 -2.485 -2.591 -2.709 -2.84 -2.977 -3.131 -3.313 -3.931 -8 ,12888 ,TETRA ,17675361,Sat Dec 4 16:29:54 CET,Sat Dec 4 18:12:40 CET,0.0 0.823 1.061 1.251 1.432 1.595 1.736 1.879 2.114 2.202 2.29 2.391 2.527 2.59 2.726 2.855 2.974 3.038 3.159 3.276 3.452 3.556 3.648 3.779 3.898 4.0 4.099 4.207 4.337 4.466 4.612 4.786 4.936 5.063 5.217 5.401 5.565 5.745 5.947 6.148 6.337 6.54 6.774 7.003 7.247 7.482 7.701 7.858 7.942 7.909 7.663 7.134 6.463 5.848 5.316 4.808 4.377 3.974 3.617 3.243 2.914 2.658 2.419 2.175 1.944 1.742 1.526 1.332 1.18 1.025 0.855 0.702 0.545 0.396 0.281 0.156 0.027 -0.115 -0.293 -0.412 -0.51 -0.664 -0.777 -0.893 -0.955 -1.074 -1.187 -1.316 -1.385 -1.519 -1.609 -1.691 -1.774 -1.961 -2.059 -2.169 -2.301 -2.42 -2.538 -2.708 -3.063 -9 ,24046 ,TETRA ,17675362,Sat Dec 4 16:30:49 CET,Sat Dec 4 18:12:37 CET,0.0 0.631 0.938 1.151 1.303 1.427 1.547 1.661 1.864 1.957 2.057 2.186 2.339 2.42 2.551 2.675 2.795 2.849 2.967 3.084 3.253 3.359 3.459 3.606 3.748 3.875 3.997 4.11 4.253 4.38 4.499 4.644 4.778 4.92 5.09 5.268 5.43 5.595 5.767 5.956 6.144 6.343 6.602 6.829 7.047 7.298 7.543 7.719 7.815 7.766 7.413 6.798 6.224 5.636 5.092 4.618 4.204 3.823 3.477 3.122 2.805 2.515 2.243 1.985 1.738 1.524 1.302 1.096 0.929 0.764 0.59 0.44 0.293 0.137 0.002 -0.129 -0.273 -0.419 -0.549 -0.647 -0.75 -0.911 -1.021 -1.128 -1.186 -1.32 -1.459 -1.588 -1.656 -1.8 -1.874 -1.947 -2.03 -2.205 -2.304 -2.422 -2.54 -2.657 -2.8 -2.956 -3.376 -10 ,9302 ,TETRA ,17675363,Sat Dec 4 16:33:55 CET,Sat Dec 4 18:17:24 CET,0.0 0.734 0.95 1.117 1.255 1.388 1.51 1.608 1.8 1.893 1.983 2.092 2.24 2.316 2.46 2.589 2.713 2.772 2.875 2.991 3.163 3.271 3.384 3.537 3.668 3.796 3.92 4.032 4.174 4.307 4.438 4.591 4.728 4.854 5.009 5.191 5.346 5.517 5.704 5.89 6.088 6.29 6.496 6.701 6.924 7.14 7.36 7.544 7.696 7.819 7.649 7.137 6.579 6.004 5.458 4.924 4.465 4.072 3.716 3.355 3.061 2.801 2.544 2.298 2.066 1.856 1.644 1.436 1.241 1.05 0.862 0.719 0.574 0.414 0.287 0.154 0.015 -0.133 -0.279 -0.377 -0.478 -0.642 -0.756 -0.868 -0.929 -1.07 -1.211 -1.34 -1.408 -1.549 -1.625 -1.703 -1.794 -2.021 -2.138 -2.242 -2.348 -2.461 -2.587 -2.756 -3.161 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_7a_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_7a_1.txt deleted file mode 100644 index 599f0e15..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_7a_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18995 ,KEBNE ,16658554,Tue Nov 23 09:46:33 CET,Tue Nov 23 11:11:35 CET,0.0 0.447 0.702 0.889 1.036 1.171 1.28 1.374 1.56 1.655 1.743 1.854 2.016 2.087 2.215 2.348 2.477 2.532 2.642 2.75 2.895 2.998 3.092 3.22 3.34 3.46 3.589 3.706 3.841 3.98 4.12 4.282 4.447 4.6 4.749 4.908 5.07 5.249 5.418 5.596 5.792 5.991 6.211 6.407 6.644 6.933 7.187 7.386 7.586 7.748 7.725 7.422 6.998 6.541 6.082 5.669 5.314 4.978 4.697 4.41 4.149 3.918 3.696 3.48 3.259 3.036 2.813 2.619 2.438 2.247 2.055 1.901 1.719 1.519 1.362 1.206 1.05 0.873 0.694 0.578 0.458 0.274 0.133 -0.019 -0.101 -0.263 -0.406 -0.577 -0.681 -0.867 -1.04 -1.154 -1.266 -1.532 -1.671 -1.804 -1.958 -2.167 -2.402 -2.693 -3.385 -2 ,12584 ,KEBNE ,16658555,Tue Nov 23 09:47:35 CET,Tue Nov 23 11:10:18 CET,0.0 0.522 0.733 0.918 1.076 1.219 1.352 1.464 1.644 1.73 1.822 1.918 2.07 2.148 2.284 2.402 2.519 2.579 2.699 2.802 2.935 3.024 3.12 3.257 3.375 3.483 3.599 3.72 3.857 3.984 4.119 4.269 4.401 4.529 4.666 4.824 4.969 5.124 5.3 5.498 5.709 5.914 6.132 6.352 6.597 6.833 7.08 7.309 7.503 7.623 7.589 7.303 6.909 6.497 6.083 5.685 5.314 4.963 4.666 4.351 4.047 3.77 3.486 3.224 2.974 2.745 2.513 2.288 2.091 1.908 1.727 1.56 1.383 1.2 1.063 0.919 0.763 0.595 0.419 0.303 0.188 -0.007 -0.15 -0.292 -0.374 -0.562 -0.754 -0.946 -1.047 -1.222 -1.356 -1.466 -1.585 -1.82 -1.944 -2.087 -2.246 -2.418 -2.627 -2.938 -3.935 -3 ,16181 ,KEBNE ,16658556,Tue Nov 23 09:47:35 CET,Tue Nov 23 11:13:39 CET,0.0 0.476 0.693 0.877 1.043 1.183 1.3 1.393 1.595 1.692 1.789 1.911 2.052 2.117 2.255 2.374 2.49 2.554 2.672 2.78 2.927 3.031 3.124 3.241 3.36 3.485 3.616 3.726 3.863 4.01 4.16 4.317 4.436 4.547 4.684 4.849 5.021 5.212 5.395 5.566 5.743 5.95 6.183 6.395 6.635 6.896 7.143 7.378 7.607 7.767 7.779 7.491 7.102 6.677 6.224 5.81 5.45 5.111 4.8 4.465 4.183 3.945 3.717 3.497 3.273 3.073 2.879 2.671 2.482 2.306 2.122 1.96 1.786 1.607 1.468 1.32 1.173 1.019 0.854 0.748 0.631 0.445 0.314 0.175 0.1 -0.064 -0.23 -0.4 -0.485 -0.642 -0.751 -0.86 -0.983 -1.236 -1.372 -1.516 -1.683 -1.874 -2.094 -2.383 -3.604 -4 ,12033 ,KEBNE ,16658557,Tue Nov 23 09:48:36 CET,Tue Nov 23 11:12:26 CET,0.0 0.578 0.849 1.05 1.191 1.318 1.441 1.556 1.763 1.855 1.94 2.027 2.175 2.257 2.422 2.573 2.718 2.789 2.907 3.005 3.153 3.247 3.334 3.46 3.577 3.693 3.811 3.92 4.055 4.201 4.332 4.479 4.62 4.74 4.883 5.065 5.221 5.365 5.532 5.714 5.894 6.098 6.35 6.582 6.806 7.042 7.285 7.516 7.735 7.865 7.828 7.536 7.131 6.678 6.221 5.792 5.414 5.06 4.73 4.396 4.125 3.88 3.646 3.427 3.211 2.991 2.757 2.544 2.353 2.165 1.971 1.818 1.664 1.497 1.362 1.219 1.058 0.89 0.732 0.61 0.472 0.265 0.13 -0.01 -0.082 -0.234 -0.397 -0.56 -0.638 -0.794 -0.915 -1.043 -1.184 -1.458 -1.605 -1.782 -2.003 -2.222 -2.449 -2.789 -3.471 -5 ,15702 ,KEBNE ,16658558,Tue Nov 23 09:48:36 CET,Tue Nov 23 11:13:16 CET,0.0 0.628 0.854 1.023 1.175 1.315 1.439 1.55 1.724 1.804 1.882 1.973 2.12 2.189 2.324 2.451 2.577 2.637 2.743 2.843 3.0 3.11 3.219 3.37 3.511 3.642 3.761 3.872 4.0 4.126 4.248 4.391 4.524 4.661 4.837 5.027 5.187 5.362 5.572 5.784 5.979 6.178 6.39 6.609 6.858 7.102 7.362 7.586 7.766 7.911 7.855 7.45 6.987 6.556 6.146 5.765 5.358 4.971 4.671 4.369 4.103 3.839 3.57 3.309 3.064 2.86 2.661 2.469 2.295 2.122 1.939 1.782 1.611 1.432 1.302 1.156 1.001 0.834 0.656 0.543 0.419 0.2 0.056 -0.081 -0.146 -0.286 -0.456 -0.639 -0.741 -0.905 -1.031 -1.153 -1.274 -1.545 -1.7 -1.853 -2.001 -2.161 -2.373 -2.677 -3.641 -6 ,49 ,KEBNE ,16658559,Tue Nov 23 09:49:38 CET,Tue Nov 23 11:12:45 CET,0.0 0.69 0.94 1.11 1.252 1.401 1.523 1.638 1.837 1.917 1.991 2.064 2.21 2.272 2.374 2.482 2.608 2.673 2.791 2.89 3.026 3.111 3.187 3.301 3.417 3.531 3.647 3.763 3.912 4.049 4.17 4.329 4.498 4.64 4.785 4.957 5.128 5.304 5.492 5.697 5.893 6.084 6.286 6.491 6.724 6.945 7.172 7.409 7.654 7.8 7.739 7.473 7.111 6.68 6.231 5.827 5.484 5.164 4.873 4.567 4.294 4.056 3.821 3.575 3.352 3.145 2.925 2.74 2.559 2.356 2.161 1.998 1.828 1.65 1.494 1.331 1.174 1.0 0.815 0.699 0.582 0.374 0.215 0.056 -0.015 -0.155 -0.312 -0.487 -0.59 -0.774 -0.908 -1.01 -1.123 -1.371 -1.507 -1.669 -1.836 -2.021 -2.224 -2.488 -3.217 -7 ,6001 ,KEBNE ,16658560,Tue Nov 23 09:49:39 CET,Tue Nov 23 11:14:30 CET,0.0 0.553 0.736 0.889 1.04 1.157 1.25 1.351 1.557 1.646 1.735 1.838 1.991 2.06 2.184 2.303 2.424 2.48 2.597 2.707 2.849 2.946 3.047 3.183 3.316 3.448 3.57 3.694 3.847 3.996 4.134 4.28 4.418 4.55 4.706 4.87 5.019 5.181 5.353 5.533 5.709 5.882 6.105 6.354 6.602 6.83 7.074 7.311 7.534 7.717 7.734 7.388 6.982 6.565 6.089 5.657 5.277 4.894 4.549 4.217 3.946 3.691 3.428 3.184 2.954 2.724 2.486 2.261 2.073 1.886 1.686 1.522 1.357 1.182 1.024 0.862 0.69 0.516 0.357 0.236 0.108 -0.08 -0.206 -0.345 -0.418 -0.572 -0.762 -0.964 -1.056 -1.218 -1.344 -1.454 -1.563 -1.81 -1.956 -2.116 -2.313 -2.526 -2.76 -3.037 -3.547 -8 ,3701 ,KEBNE ,16658561,Tue Nov 23 09:50:40 CET,Tue Nov 23 11:13:19 CET,0.0 0.447 0.703 0.913 1.077 1.219 1.341 1.46 1.663 1.749 1.827 1.898 2.043 2.12 2.256 2.393 2.536 2.598 2.712 2.82 2.974 3.071 3.163 3.299 3.445 3.586 3.708 3.81 3.931 4.053 4.166 4.316 4.462 4.591 4.734 4.881 5.027 5.19 5.376 5.592 5.827 6.089 6.356 6.579 6.829 7.089 7.362 7.633 7.851 8.014 8.051 7.744 7.34 6.905 6.494 6.134 5.766 5.406 5.093 4.743 4.425 4.161 3.89 3.625 3.403 3.186 2.959 2.772 2.62 2.456 2.269 2.106 1.936 1.755 1.617 1.473 1.318 1.159 0.981 0.857 0.739 0.554 0.408 0.254 0.181 0.04 -0.112 -0.288 -0.393 -0.581 -0.729 -0.845 -0.979 -1.278 -1.427 -1.582 -1.758 -1.972 -2.212 -2.515 -3.153 -9 ,28104 ,KEBNE ,16658562,Tue Nov 23 09:50:40 CET,Tue Nov 23 11:15:52 CET,0.0 0.353 0.578 0.772 0.935 1.071 1.208 1.34 1.537 1.62 1.697 1.782 1.924 1.994 2.154 2.293 2.415 2.473 2.575 2.681 2.839 2.937 3.037 3.182 3.318 3.442 3.562 3.676 3.826 3.975 4.102 4.247 4.383 4.509 4.657 4.811 4.956 5.12 5.307 5.503 5.71 5.935 6.153 6.365 6.61 6.867 7.116 7.337 7.549 7.692 7.626 7.271 6.87 6.458 6.029 5.591 5.188 4.852 4.562 4.233 3.947 3.695 3.463 3.241 3.007 2.787 2.58 2.407 2.244 2.078 1.909 1.729 1.524 1.343 1.214 1.064 0.903 0.744 0.57 0.443 0.311 0.127 0.014 -0.116 -0.19 -0.347 -0.504 -0.672 -0.763 -0.932 -1.053 -1.159 -1.281 -1.543 -1.686 -1.851 -2.03 -2.232 -2.467 -2.791 -3.466 -10 ,17721 ,KEBNE ,16658563,Tue Nov 23 09:50:40 CET,Tue Nov 23 11:13:29 CET,0.0 0.519 0.753 0.94 1.105 1.248 1.372 1.473 1.666 1.755 1.828 1.898 2.038 2.103 2.235 2.363 2.48 2.54 2.66 2.766 2.923 3.026 3.117 3.248 3.373 3.486 3.606 3.724 3.87 4.002 4.137 4.293 4.431 4.569 4.729 4.905 5.049 5.204 5.388 5.601 5.82 6.045 6.281 6.494 6.735 6.967 7.197 7.44 7.647 7.764 7.712 7.393 6.964 6.502 6.06 5.655 5.286 4.931 4.628 4.328 4.055 3.78 3.521 3.287 3.056 2.85 2.63 2.427 2.258 2.057 1.846 1.685 1.518 1.339 1.191 1.026 0.876 0.719 0.528 0.405 0.278 0.067 -0.076 -0.231 -0.306 -0.46 -0.612 -0.754 -0.833 -0.998 -1.117 -1.215 -1.314 -1.519 -1.648 -1.808 -1.982 -2.173 -2.409 -2.7 -3.419 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_7a_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_7a_41.txt deleted file mode 100644 index 17766cfa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_7a_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11266 ,KEBNE ,16658564,Tue Nov 23 09:51:42 CET,Tue Nov 23 11:12:55 CET,0.0 0.824 1.144 1.405 1.632 1.816 1.975 2.129 2.439 2.581 2.709 2.868 3.045 3.155 3.368 3.564 3.747 3.836 4.007 4.171 4.404 4.561 4.719 4.935 5.145 5.348 5.539 5.721 5.948 6.181 6.41 6.654 6.886 7.127 7.397 7.705 7.997 8.319 8.664 9.001 9.354 9.742 10.177 10.63 11.166 11.749 12.366 13.033 13.785 14.601 15.49 16.066 16.241 16.224 16.127 15.945 15.73 15.527 15.337 15.11 14.909 14.702 14.485 14.289 14.102 13.916 13.726 13.557 13.407 13.25 13.084 12.945 12.808 12.662 12.537 12.396 12.249 12.096 11.925 11.81 11.7 11.524 11.4 11.28 11.215 11.066 10.902 10.723 10.63 10.465 10.306 10.191 10.08 9.824 9.682 9.541 9.352 9.123 8.856 8.493 7.522 -2 ,24123 ,KEBNE ,16658565,Tue Nov 23 09:51:42 CET,Tue Nov 23 11:13:12 CET,0.0 0.729 1.089 1.322 1.53 1.722 1.892 2.05 2.367 2.507 2.635 2.801 2.984 3.092 3.292 3.486 3.667 3.752 3.918 4.092 4.34 4.49 4.637 4.853 5.068 5.268 5.464 5.677 5.941 6.171 6.409 6.682 6.933 7.185 7.463 7.78 8.073 8.372 8.725 9.099 9.449 9.848 10.311 10.774 11.29 11.817 12.443 13.135 13.887 14.686 15.615 16.203 16.259 16.169 16.031 15.842 15.601 15.374 15.172 14.932 14.7 14.492 14.287 14.091 13.91 13.738 13.555 13.389 13.237 13.077 12.912 12.778 12.625 12.459 12.334 12.188 12.041 11.897 11.729 11.621 11.509 11.312 11.181 11.035 10.958 10.805 10.629 10.431 10.329 10.163 10.016 9.897 9.766 9.502 9.36 9.212 9.042 8.806 8.509 8.145 7.085 -3 ,24607 ,KEBNE ,16658566,Tue Nov 23 09:52:44 CET,Tue Nov 23 11:17:38 CET,0.0 0.791 1.13 1.364 1.582 1.797 1.981 2.152 2.444 2.577 2.71 2.895 3.081 3.197 3.419 3.607 3.778 3.863 4.041 4.208 4.43 4.588 4.744 4.965 5.174 5.369 5.564 5.752 6.0 6.25 6.48 6.759 7.027 7.275 7.552 7.871 8.158 8.466 8.822 9.167 9.511 9.892 10.351 10.829 11.361 11.95 12.621 13.353 14.162 14.976 15.832 16.326 16.461 16.459 16.333 16.16 15.97 15.757 15.565 15.345 15.146 14.954 14.755 14.552 14.355 14.189 14.014 13.846 13.69 13.531 13.352 13.199 13.059 12.907 12.784 12.652 12.505 12.366 12.225 12.117 11.993 11.803 11.678 11.552 11.484 11.333 11.173 11.014 10.928 10.771 10.637 10.52 10.391 10.115 9.971 9.812 9.627 9.393 9.102 8.75 7.647 -4 ,21644 ,KEBNE ,16658567,Tue Nov 23 09:52:44 CET,Tue Nov 23 11:16:20 CET,0.0 0.515 0.812 1.072 1.263 1.427 1.584 1.727 2.002 2.13 2.245 2.39 2.572 2.686 2.883 3.063 3.251 3.343 3.501 3.662 3.911 4.06 4.214 4.434 4.635 4.842 5.03 5.207 5.453 5.664 5.853 6.109 6.377 6.627 6.907 7.226 7.53 7.85 8.179 8.519 8.856 9.248 9.718 10.19 10.731 11.308 11.958 12.675 13.498 14.407 15.36 15.93 16.055 16.011 15.884 15.676 15.468 15.275 15.073 14.833 14.619 14.44 14.258 14.054 13.859 13.682 13.496 13.318 13.147 12.977 12.803 12.652 12.499 12.345 12.224 12.098 11.962 11.815 11.65 11.534 11.41 11.212 11.085 10.938 10.857 10.699 10.527 10.333 10.236 10.077 9.941 9.827 9.694 9.401 9.256 9.113 8.955 8.773 8.576 8.302 7.486 -5 ,952 ,KEBNE ,16658568,Tue Nov 23 09:52:44 CET,Tue Nov 23 11:14:16 CET,0.0 0.781 1.126 1.412 1.657 1.855 2.018 2.177 2.497 2.647 2.777 2.958 3.155 3.267 3.471 3.674 3.873 3.959 4.114 4.289 4.555 4.707 4.854 5.076 5.296 5.508 5.7 5.882 6.117 6.344 6.549 6.807 7.089 7.351 7.634 7.935 8.239 8.592 8.977 9.378 9.75 10.14 10.604 11.063 11.604 12.203 12.884 13.607 14.396 15.255 16.079 16.572 16.739 16.734 16.615 16.439 16.249 16.026 15.782 15.535 15.307 15.088 14.908 14.74 14.556 14.354 14.137 13.97 13.825 13.668 13.505 13.363 13.214 13.052 12.918 12.772 12.626 12.493 12.355 12.238 12.113 11.922 11.778 11.631 11.564 11.411 11.246 11.071 10.97 10.805 10.657 10.545 10.428 10.165 10.018 9.846 9.652 9.448 9.213 8.873 7.725 -6 ,4989 ,KEBNE ,16658569,Tue Nov 23 09:52:43 CET,Tue Nov 23 11:14:01 CET,0.0 0.579 0.843 1.081 1.283 1.45 1.611 1.769 2.089 2.238 2.367 2.549 2.744 2.853 3.049 3.247 3.441 3.533 3.699 3.866 4.133 4.29 4.44 4.666 4.878 5.083 5.279 5.469 5.701 5.92 6.137 6.401 6.657 6.91 7.19 7.492 7.809 8.154 8.493 8.854 9.254 9.674 10.114 10.538 11.048 11.61 12.223 12.913 13.71 14.577 15.43 15.885 16.014 15.922 15.73 15.562 15.39 15.19 15.009 14.814 14.603 14.404 14.211 14.02 13.84 13.668 13.451 13.262 13.116 12.951 12.772 12.624 12.465 12.284 12.144 12.005 11.868 11.711 11.536 11.425 11.308 11.105 10.958 10.814 10.741 10.595 10.429 10.229 10.127 9.962 9.83 9.713 9.564 9.217 9.046 8.882 8.686 8.481 8.249 7.974 7.384 -7 ,11327 ,KEBNE ,16658570,Tue Nov 23 09:52:44 CET,Tue Nov 23 11:16:34 CET,0.0 0.436 0.749 0.98 1.171 1.345 1.492 1.641 1.927 2.063 2.201 2.377 2.555 2.661 2.859 3.053 3.248 3.344 3.528 3.698 3.943 4.095 4.253 4.475 4.674 4.872 5.054 5.231 5.459 5.679 5.905 6.186 6.436 6.671 6.943 7.235 7.515 7.825 8.154 8.494 8.885 9.364 9.966 10.559 11.111 11.678 12.327 13.019 13.76 14.545 15.4 15.926 16.059 16.046 15.946 15.8 15.611 15.408 15.212 14.996 14.805 14.619 14.434 14.247 14.068 13.898 13.699 13.522 13.365 13.185 13.009 12.865 12.686 12.485 12.36 12.24 12.1 11.952 11.784 11.669 11.551 11.357 11.22 11.056 10.973 10.818 10.66 10.48 10.384 10.226 10.086 9.97 9.852 9.59 9.442 9.295 9.125 8.926 8.701 8.431 7.558 -8 ,4748 ,KEBNE ,16658571,Tue Nov 23 09:52:44 CET,Tue Nov 23 11:14:19 CET,0.0 0.667 1.002 1.287 1.546 1.743 1.916 2.083 2.373 2.505 2.644 2.831 3.01 3.123 3.339 3.544 3.739 3.828 4.009 4.186 4.432 4.582 4.73 4.951 5.162 5.366 5.57 5.752 5.968 6.187 6.41 6.673 6.909 7.131 7.374 7.651 7.924 8.235 8.572 8.911 9.263 9.646 10.076 10.505 11.038 11.641 12.303 12.993 13.759 14.631 15.545 16.103 16.3 16.308 16.201 16.035 15.826 15.61 15.389 15.144 14.943 14.749 14.544 14.35 14.168 14.008 13.831 13.657 13.493 13.313 13.154 13.013 12.858 12.717 12.599 12.457 12.307 12.145 11.981 11.874 11.755 11.565 11.434 11.298 11.23 11.078 10.907 10.732 10.639 10.482 10.361 10.255 10.134 9.859 9.698 9.529 9.345 9.15 8.897 8.539 7.525 -9 ,21064 ,KEBNE ,16658572,Tue Nov 23 09:53:45 CET,Tue Nov 23 11:17:06 CET,0.0 0.644 0.959 1.223 1.444 1.625 1.799 1.962 2.246 2.381 2.514 2.686 2.873 2.992 3.222 3.432 3.643 3.741 3.92 4.09 4.325 4.471 4.61 4.83 5.057 5.271 5.469 5.647 5.888 6.112 6.329 6.595 6.827 7.05 7.322 7.65 7.951 8.26 8.607 8.985 9.348 9.751 10.225 10.685 11.193 11.741 12.388 13.082 13.816 14.641 15.528 16.083 16.265 16.257 16.137 15.975 15.787 15.575 15.378 15.172 14.98 14.763 14.542 14.357 14.18 14.015 13.848 13.677 13.509 13.327 13.129 12.968 12.821 12.678 12.556 12.421 12.274 12.12 11.962 11.855 11.743 11.562 11.429 11.295 11.228 11.078 10.914 10.727 10.627 10.46 10.31 10.196 10.085 9.832 9.673 9.493 9.307 9.103 8.848 8.441 7.484 -10 ,520 ,KEBNE ,16658573,Tue Nov 23 09:53:45 CET,Tue Nov 23 11:19:08 CET,0.0 0.634 0.929 1.179 1.389 1.581 1.765 1.931 2.219 2.352 2.48 2.655 2.844 2.954 3.149 3.327 3.505 3.595 3.766 3.929 4.151 4.295 4.454 4.686 4.899 5.106 5.303 5.491 5.737 5.974 6.181 6.429 6.679 6.934 7.215 7.493 7.78 8.086 8.406 8.787 9.175 9.587 10.056 10.517 11.071 11.672 12.34 13.061 13.854 14.711 15.539 15.988 16.106 16.055 15.924 15.739 15.521 15.294 15.089 14.873 14.681 14.48 14.276 14.095 13.904 13.723 13.549 13.384 13.211 13.028 12.844 12.684 12.521 12.359 12.234 12.099 11.953 11.796 11.626 11.514 11.397 11.21 11.072 10.913 10.834 10.692 10.546 10.379 10.29 10.134 10.009 9.897 9.779 9.538 9.4 9.238 9.03 8.8 8.519 8.126 7.172 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_7b_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_7b_1.txt deleted file mode 100644 index 0b8b25c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_7b_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11060 ,KEBNE ,16658574,Tue Nov 23 09:55:48 CET,Tue Nov 23 11:19:39 CET,0.0 0.521 0.726 0.896 1.066 1.208 1.317 1.428 1.627 1.705 1.783 1.863 2.009 2.087 2.242 2.389 2.526 2.593 2.723 2.846 3.026 3.141 3.25 3.406 3.548 3.686 3.825 3.963 4.139 4.293 4.437 4.605 4.755 4.894 5.064 5.255 5.445 5.664 5.881 6.098 6.336 6.612 6.91 7.202 7.508 7.805 8.116 8.41 8.665 8.807 8.653 7.954 7.107 6.329 5.67 5.039 4.471 3.958 3.491 3.012 2.599 2.245 1.916 1.607 1.322 1.044 0.746 0.493 0.268 0.023 -0.247 -0.466 -0.682 -0.925 -1.119 -1.308 -1.502 -1.697 -1.904 -2.043 -2.176 -2.399 -2.563 -2.726 -2.808 -2.982 -3.16 -3.355 -3.466 -3.651 -3.815 -3.944 -4.08 -4.382 -4.539 -4.694 -4.86 -5.058 -5.308 -5.624 -6.433 -2 ,28332 ,KEBNE ,16658575,Tue Nov 23 09:55:48 CET,Tue Nov 23 11:18:12 CET,0.0 0.429 0.677 0.874 1.03 1.156 1.278 1.389 1.601 1.714 1.823 1.958 2.109 2.189 2.338 2.474 2.607 2.67 2.789 2.895 3.064 3.183 3.301 3.47 3.612 3.745 3.867 3.994 4.181 4.356 4.516 4.706 4.895 5.079 5.277 5.487 5.689 5.915 6.182 6.442 6.657 6.874 7.152 7.451 7.763 8.088 8.414 8.715 8.953 9.082 8.857 8.144 7.355 6.598 5.904 5.301 4.743 4.215 3.766 3.314 2.904 2.524 2.158 1.796 1.473 1.2 0.918 0.649 0.41 0.18 -0.057 -0.262 -0.48 -0.702 -0.872 -1.048 -1.232 -1.433 -1.632 -1.768 -1.908 -2.122 -2.271 -2.434 -2.519 -2.686 -2.867 -3.079 -3.197 -3.394 -3.567 -3.693 -3.827 -4.118 -4.264 -4.411 -4.574 -4.781 -5.064 -5.372 -6.105 -3 ,24632 ,KEBNE ,16658576,Tue Nov 23 09:55:48 CET,Tue Nov 23 11:22:04 CET,0.0 0.603 0.826 1.005 1.165 1.309 1.444 1.564 1.783 1.883 1.976 2.082 2.237 2.31 2.447 2.579 2.709 2.771 2.884 2.999 3.176 3.292 3.407 3.557 3.689 3.825 3.959 4.095 4.276 4.436 4.575 4.738 4.899 5.057 5.224 5.417 5.599 5.796 6.009 6.22 6.468 6.76 7.07 7.367 7.707 8.079 8.467 8.829 9.179 9.366 9.101 8.428 7.712 7.01 6.38 5.78 5.196 4.683 4.232 3.765 3.394 3.029 2.659 2.33 2.011 1.727 1.444 1.184 0.954 0.717 0.477 0.286 0.085 -0.129 -0.297 -0.482 -0.672 -0.872 -1.074 -1.196 -1.328 -1.574 -1.752 -1.928 -2.015 -2.184 -2.367 -2.569 -2.674 -2.852 -2.991 -3.103 -3.228 -3.494 -3.647 -3.81 -3.989 -4.203 -4.44 -4.799 -5.629 -4 ,16846 ,KEBNE ,16658577,Tue Nov 23 09:56:54 CET,Tue Nov 23 11:20:08 CET,0.0 0.521 0.779 0.949 1.1 1.247 1.371 1.487 1.694 1.783 1.872 1.974 2.13 2.217 2.391 2.566 2.726 2.791 2.905 3.025 3.217 3.348 3.47 3.63 3.767 3.904 4.044 4.172 4.332 4.487 4.633 4.814 4.988 5.164 5.357 5.55 5.744 5.95 6.162 6.375 6.604 6.863 7.14 7.389 7.662 7.985 8.301 8.537 8.735 8.805 8.526 7.701 6.883 6.191 5.581 4.989 4.431 3.909 3.43 2.972 2.61 2.275 1.935 1.598 1.291 1.017 0.736 0.496 0.28 0.047 -0.197 -0.394 -0.594 -0.807 -0.974 -1.155 -1.342 -1.524 -1.71 -1.854 -2.007 -2.239 -2.4 -2.568 -2.657 -2.84 -3.028 -3.22 -3.329 -3.518 -3.689 -3.823 -3.955 -4.254 -4.425 -4.605 -4.803 -5.002 -5.252 -5.612 -6.384 -5 ,19741 ,KEBNE ,16658578,Tue Nov 23 09:57:52 CET,Tue Nov 23 11:19:30 CET,0.0 0.607 0.881 1.078 1.23 1.369 1.495 1.602 1.81 1.904 1.995 2.104 2.257 2.33 2.467 2.593 2.711 2.777 2.905 3.018 3.178 3.297 3.415 3.556 3.683 3.809 3.937 4.067 4.236 4.4 4.55 4.721 4.89 5.048 5.24 5.465 5.665 5.89 6.142 6.375 6.603 6.855 7.11 7.388 7.733 8.052 8.322 8.569 8.8 8.95 8.815 8.189 7.412 6.681 6.007 5.342 4.706 4.133 3.652 3.135 2.68 2.28 1.911 1.592 1.287 0.982 0.666 0.401 0.17 -0.074 -0.326 -0.535 -0.758 -0.992 -1.165 -1.347 -1.535 -1.722 -1.924 -2.067 -2.216 -2.438 -2.591 -2.765 -2.859 -3.035 -3.218 -3.427 -3.536 -3.722 -3.902 -4.038 -4.18 -4.509 -4.676 -4.848 -5.039 -5.242 -5.451 -5.768 -6.43 -6 ,14798 ,KEBNE ,16658579,Tue Nov 23 09:58:53 CET,Tue Nov 23 11:21:10 CET,0.0 0.535 0.795 0.993 1.153 1.331 1.479 1.598 1.827 1.933 2.028 2.13 2.282 2.357 2.507 2.665 2.814 2.875 2.996 3.124 3.295 3.404 3.507 3.655 3.802 3.937 4.069 4.197 4.356 4.511 4.67 4.843 5.0 5.165 5.358 5.572 5.77 5.959 6.15 6.361 6.584 6.842 7.141 7.425 7.751 8.057 8.357 8.633 8.878 9.042 8.795 8.107 7.411 6.71 6.08 5.508 4.964 4.414 3.933 3.475 3.065 2.672 2.33 2.031 1.729 1.453 1.16 0.896 0.672 0.434 0.183 -0.025 -0.255 -0.498 -0.669 -0.833 -1.004 -1.188 -1.377 -1.519 -1.667 -1.889 -2.062 -2.234 -2.308 -2.467 -2.654 -2.856 -2.968 -3.154 -3.324 -3.447 -3.573 -3.878 -4.038 -4.204 -4.394 -4.611 -4.869 -5.213 -6.397 -7 ,16670 ,KEBNE ,16658580,Tue Nov 23 09:58:54 CET,Tue Nov 23 11:22:46 CET,0.0 0.37 0.572 0.737 0.901 1.038 1.146 1.248 1.454 1.555 1.656 1.772 1.926 2.001 2.132 2.268 2.397 2.467 2.607 2.725 2.882 2.985 3.092 3.245 3.391 3.524 3.642 3.768 3.941 4.099 4.247 4.407 4.558 4.713 4.9 5.108 5.305 5.521 5.758 5.997 6.213 6.451 6.721 6.95 7.222 7.499 7.779 8.046 8.279 8.429 8.214 7.553 6.757 5.963 5.266 4.673 4.122 3.595 3.162 2.725 2.337 1.983 1.656 1.334 1.011 0.732 0.478 0.258 0.042 -0.2 -0.451 -0.654 -0.868 -1.099 -1.273 -1.444 -1.621 -1.797 -1.973 -2.112 -2.261 -2.483 -2.635 -2.809 -2.899 -3.074 -3.261 -3.455 -3.553 -3.727 -3.871 -3.987 -4.112 -4.388 -4.555 -4.743 -4.955 -5.172 -5.395 -5.688 -6.27 -8 ,31768 ,KEBNE ,16658581,Tue Nov 23 09:58:54 CET,Tue Nov 23 11:20:19 CET,0.0 0.635 0.912 1.119 1.283 1.426 1.543 1.652 1.884 1.988 2.08 2.182 2.336 2.42 2.57 2.693 2.813 2.871 2.987 3.102 3.267 3.371 3.469 3.623 3.776 3.917 4.046 4.163 4.324 4.497 4.653 4.832 4.998 5.157 5.355 5.575 5.78 5.99 6.201 6.447 6.712 6.969 7.23 7.457 7.723 8.018 8.32 8.61 8.837 8.905 8.698 8.043 7.355 6.68 5.997 5.358 4.795 4.235 3.741 3.303 2.923 2.573 2.215 1.878 1.571 1.261 0.925 0.652 0.417 0.165 -0.081 -0.283 -0.506 -0.735 -0.902 -1.08 -1.266 -1.456 -1.655 -1.792 -1.941 -2.176 -2.331 -2.485 -2.564 -2.741 -2.941 -3.147 -3.251 -3.434 -3.623 -3.782 -3.931 -4.212 -4.373 -4.552 -4.757 -4.967 -5.189 -5.511 -6.47 -9 ,8021 ,KEBNE ,16658582,Tue Nov 23 10:00:56 CET,Tue Nov 23 11:23:47 CET,0.0 0.537 0.778 0.963 1.117 1.26 1.382 1.494 1.692 1.781 1.873 1.978 2.128 2.216 2.4 2.563 2.692 2.751 2.87 2.981 3.137 3.238 3.34 3.49 3.629 3.756 3.885 4.019 4.181 4.326 4.471 4.65 4.81 4.961 5.134 5.336 5.548 5.77 6.012 6.264 6.496 6.757 7.063 7.333 7.636 7.929 8.202 8.536 8.774 8.858 8.646 8.023 7.36 6.571 5.816 5.182 4.611 4.071 3.592 3.135 2.749 2.39 2.064 1.753 1.433 1.159 0.878 0.618 0.397 0.172 -0.059 -0.253 -0.464 -0.698 -0.884 -1.069 -1.262 -1.473 -1.68 -1.824 -1.979 -2.217 -2.376 -2.548 -2.641 -2.82 -2.998 -3.195 -3.301 -3.485 -3.651 -3.782 -3.908 -4.182 -4.342 -4.509 -4.68 -4.886 -5.156 -5.51 -6.41 -10 ,22050 ,KEBNE ,16658583,Tue Nov 23 10:00:57 CET,Tue Nov 23 11:27:50 CET,0.0 0.546 0.738 0.907 1.039 1.154 1.268 1.396 1.626 1.729 1.822 1.927 2.085 2.168 2.325 2.463 2.583 2.639 2.744 2.849 3.013 3.116 3.213 3.357 3.511 3.661 3.8 3.94 4.111 4.254 4.391 4.572 4.734 4.884 5.064 5.256 5.428 5.619 5.844 6.062 6.274 6.529 6.822 7.09 7.351 7.645 7.969 8.212 8.41 8.475 8.185 7.459 6.651 5.97 5.311 4.682 4.142 3.595 3.098 2.639 2.272 1.936 1.603 1.285 0.979 0.694 0.398 0.15 -0.076 -0.328 -0.582 -0.799 -1.024 -1.26 -1.45 -1.636 -1.828 -2.028 -2.226 -2.367 -2.507 -2.723 -2.877 -3.032 -3.113 -3.291 -3.501 -3.723 -3.826 -4.011 -4.178 -4.294 -4.412 -4.682 -4.848 -5.034 -5.234 -5.471 -5.731 -6.028 -6.646 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_7b_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_7b_41.txt deleted file mode 100644 index 096c4481..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_7b_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23900 ,KEBNE ,16658584,Tue Nov 23 10:01:59 CET,Tue Nov 23 11:29:36 CET,0.0 1.096 1.45 1.721 1.931 2.109 2.254 2.412 2.747 2.888 3.012 3.16 3.348 3.467 3.683 3.864 4.042 4.134 4.309 4.464 4.688 4.845 4.995 5.222 5.448 5.663 5.863 6.059 6.308 6.538 6.746 6.99 7.227 7.455 7.726 8.037 8.319 8.602 8.942 9.305 9.657 10.079 10.551 10.967 11.494 12.145 12.844 13.566 14.349 15.145 15.845 16.04 15.821 15.422 15.091 14.731 14.308 13.935 13.622 13.271 12.951 12.678 12.422 12.173 11.905 11.649 11.392 11.177 10.992 10.783 10.552 10.363 10.165 9.95 9.781 9.615 9.433 9.245 9.052 8.913 8.776 8.548 8.382 8.221 8.139 7.958 7.765 7.574 7.469 7.292 7.122 7.008 6.886 6.602 6.449 6.273 6.081 5.86 5.564 5.167 4.064 -2 ,16449 ,KEBNE ,16658585,Tue Nov 23 10:03:00 CET,Tue Nov 23 11:24:54 CET,0.0 0.889 1.189 1.457 1.672 1.853 2.031 2.194 2.488 2.625 2.756 2.933 3.136 3.259 3.457 3.648 3.837 3.927 4.121 4.312 4.568 4.732 4.879 5.103 5.33 5.541 5.751 5.946 6.189 6.425 6.649 6.917 7.167 7.398 7.661 7.968 8.286 8.616 8.943 9.298 9.661 10.053 10.513 11.01 11.577 12.183 12.918 13.695 14.502 15.323 16.002 16.171 15.982 15.657 15.305 14.916 14.521 14.134 13.785 13.453 13.156 12.874 12.598 12.32 12.097 11.89 11.63 11.411 11.228 11.028 10.822 10.646 10.449 10.237 10.075 9.911 9.732 9.539 9.351 9.227 9.092 8.877 8.726 8.565 8.481 8.309 8.113 7.901 7.798 7.635 7.496 7.37 7.241 6.972 6.815 6.657 6.465 6.217 5.919 5.496 4.317 -3 ,28574 ,KEBNE ,16658586,Tue Nov 23 10:03:00 CET,Tue Nov 23 11:27:26 CET,0.0 1.02 1.391 1.632 1.838 2.022 2.191 2.354 2.648 2.776 2.901 3.082 3.278 3.406 3.646 3.85 4.042 4.137 4.313 4.476 4.724 4.911 5.087 5.311 5.531 5.751 5.941 6.116 6.341 6.572 6.814 7.088 7.347 7.593 7.843 8.136 8.454 8.769 9.077 9.41 9.748 10.138 10.585 11.012 11.514 12.124 12.804 13.485 14.226 15.065 15.767 15.862 15.651 15.334 14.975 14.575 14.185 13.8 13.459 13.118 12.808 12.51 12.225 11.951 11.68 11.419 11.163 10.943 10.732 10.508 10.285 10.098 9.918 9.748 9.587 9.401 9.223 9.041 8.851 8.715 8.572 8.34 8.177 8.019 7.936 7.749 7.554 7.364 7.265 7.097 6.944 6.819 6.677 6.369 6.19 5.995 5.789 5.539 5.216 4.842 3.929 -4 ,19970 ,KEBNE ,16658587,Tue Nov 23 10:03:00 CET,Tue Nov 23 11:24:09 CET,0.0 0.75 1.106 1.363 1.572 1.751 1.913 2.077 2.376 2.499 2.623 2.821 3.009 3.12 3.333 3.53 3.717 3.805 3.984 4.163 4.417 4.559 4.702 4.929 5.148 5.36 5.553 5.728 5.955 6.187 6.418 6.707 6.965 7.179 7.419 7.697 7.99 8.316 8.669 9.067 9.494 9.954 10.438 10.898 11.48 12.174 12.933 13.72 14.539 15.282 15.895 16.046 15.811 15.477 15.133 14.731 14.319 13.947 13.577 13.194 12.902 12.625 12.34 12.086 11.837 11.596 11.328 11.094 10.904 10.702 10.494 10.311 10.117 9.932 9.784 9.624 9.464 9.277 9.073 8.936 8.797 8.587 8.436 8.281 8.198 8.024 7.839 7.643 7.54 7.364 7.182 7.045 6.908 6.617 6.447 6.23 5.987 5.72 5.42 5.107 3.464 -5 ,17129 ,KEBNE ,16658588,Tue Nov 23 10:03:00 CET,Tue Nov 23 11:25:33 CET,0.0 0.8 1.115 1.372 1.589 1.785 1.959 2.12 2.423 2.568 2.707 2.883 3.069 3.184 3.388 3.601 3.805 3.899 4.084 4.268 4.533 4.688 4.845 5.084 5.303 5.512 5.707 5.892 6.151 6.415 6.664 6.949 7.202 7.435 7.708 8.019 8.306 8.633 8.992 9.361 9.732 10.117 10.567 11.013 11.546 12.178 12.867 13.556 14.318 15.103 15.848 16.109 15.915 15.578 15.169 14.751 14.415 14.109 13.812 13.5 13.195 12.898 12.612 12.348 12.095 11.839 11.54 11.286 11.096 10.891 10.688 10.516 10.336 10.146 9.986 9.816 9.642 9.451 9.238 9.106 8.976 8.744 8.585 8.436 8.351 8.164 7.976 7.782 7.677 7.497 7.33 7.204 7.067 6.775 6.616 6.442 6.24 6.016 5.738 5.407 4.208 -6 ,28241 ,KEBNE ,16658589,Tue Nov 23 10:04:02 CET,Tue Nov 23 11:27:17 CET,0.0 0.707 1.04 1.295 1.49 1.666 1.821 1.96 2.261 2.412 2.548 2.72 2.912 3.034 3.262 3.46 3.65 3.747 3.942 4.129 4.385 4.543 4.689 4.893 5.085 5.277 5.468 5.657 5.895 6.115 6.322 6.58 6.833 7.078 7.383 7.694 7.972 8.31 8.683 9.044 9.418 9.865 10.357 10.851 11.437 12.085 12.81 13.511 14.244 15.046 15.702 15.841 15.67 15.312 14.907 14.501 14.121 13.745 13.393 13.052 12.741 12.454 12.192 11.927 11.667 11.423 11.177 10.95 10.748 10.539 10.309 10.121 9.915 9.705 9.558 9.402 9.234 9.05 8.847 8.715 8.588 8.378 8.215 8.054 7.977 7.793 7.581 7.369 7.261 7.079 6.91 6.795 6.675 6.409 6.243 6.051 5.849 5.614 5.351 5.009 3.503 -7 ,7391 ,KEBNE ,16658590,Tue Nov 23 10:05:03 CET,Tue Nov 23 11:31:32 CET,0.0 0.89 1.225 1.472 1.663 1.822 1.986 2.15 2.443 2.584 2.714 2.884 3.079 3.189 3.397 3.621 3.824 3.912 4.079 4.236 4.465 4.622 4.768 4.985 5.196 5.408 5.625 5.816 6.053 6.287 6.512 6.789 7.059 7.298 7.57 7.873 8.154 8.453 8.772 9.142 9.571 10.056 10.563 11.054 11.642 12.287 13.032 13.862 14.713 15.494 16.117 16.324 16.146 15.772 15.407 15.002 14.573 14.188 13.861 13.52 13.198 12.919 12.656 12.381 12.125 11.901 11.662 11.435 11.231 11.021 10.793 10.606 10.417 10.215 10.052 9.882 9.723 9.551 9.349 9.213 9.082 8.873 8.716 8.552 8.473 8.303 8.109 7.917 7.82 7.644 7.467 7.34 7.198 6.896 6.719 6.525 6.326 6.087 5.809 5.461 4.512 -8 ,24732 ,KEBNE ,16658591,Tue Nov 23 10:05:03 CET,Tue Nov 23 11:32:26 CET,0.0 0.932 1.252 1.5 1.726 1.954 2.134 2.293 2.612 2.755 2.877 3.057 3.25 3.36 3.557 3.754 3.955 4.047 4.224 4.397 4.641 4.798 4.948 5.147 5.348 5.537 5.718 5.911 6.17 6.398 6.603 6.859 7.11 7.367 7.648 7.938 8.228 8.551 8.905 9.284 9.687 10.12 10.598 11.095 11.685 12.297 12.984 13.771 14.585 15.339 15.887 15.96 15.747 15.411 15.061 14.668 14.294 13.946 13.619 13.258 12.935 12.632 12.347 12.067 11.791 11.556 11.307 11.085 10.889 10.675 10.456 10.28 10.107 9.928 9.778 9.612 9.432 9.251 9.069 8.926 8.78 8.566 8.403 8.242 8.158 7.971 7.773 7.552 7.439 7.265 7.112 6.985 6.837 6.538 6.384 6.2 5.999 5.789 5.547 5.218 3.717 -9 ,12400 ,KEBNE ,16658592,Tue Nov 23 10:06:04 CET,Tue Nov 23 11:28:18 CET,0.0 0.821 1.178 1.434 1.654 1.857 2.041 2.202 2.49 2.637 2.783 2.972 3.168 3.28 3.488 3.686 3.875 3.971 4.161 4.334 4.578 4.741 4.893 5.097 5.295 5.49 5.684 5.866 6.082 6.298 6.516 6.781 7.032 7.283 7.581 7.905 8.228 8.587 8.947 9.305 9.677 10.081 10.555 11.03 11.562 12.133 12.765 13.522 14.405 15.23 15.798 15.948 15.801 15.462 15.064 14.659 14.294 13.932 13.59 13.242 12.916 12.634 12.365 12.1 11.856 11.618 11.338 11.077 10.868 10.66 10.446 10.271 10.08 9.877 9.715 9.539 9.371 9.206 9.023 8.899 8.765 8.561 8.413 8.242 8.152 7.968 7.798 7.613 7.503 7.325 7.158 7.034 6.908 6.617 6.447 6.274 6.096 5.878 5.611 5.205 3.915 -10 ,27232 ,KEBNE ,16658593,Tue Nov 23 10:06:04 CET,Tue Nov 23 11:28:28 CET,0.0 0.73 1.011 1.276 1.483 1.651 1.826 2.0 2.315 2.456 2.593 2.791 2.982 3.092 3.291 3.468 3.654 3.751 3.921 4.074 4.285 4.442 4.615 4.856 5.08 5.281 5.474 5.66 5.891 6.112 6.332 6.621 6.889 7.133 7.39 7.662 7.954 8.273 8.591 8.945 9.331 9.748 10.211 10.667 11.181 11.733 12.388 13.098 13.868 14.731 15.578 16.086 16.252 16.208 16.073 15.919 15.726 15.508 15.294 15.067 14.859 14.658 14.472 14.29 14.102 13.924 13.722 13.534 13.376 13.215 13.038 12.882 12.717 12.533 12.387 12.246 12.106 11.948 11.772 11.658 11.534 11.324 11.18 11.028 10.948 10.773 10.587 10.392 10.287 10.118 9.937 9.804 9.671 9.38 9.216 9.027 8.819 8.584 8.281 7.906 6.703 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_84_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_84_41.txt deleted file mode 100644 index 947e3446..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/hif2a/water/Summary_FEP_84_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23803 ,KEBNE ,16658594,Tue Nov 23 10:06:04 CET,Tue Nov 23 11:30:27 CET,0.0 0.67 0.97 1.213 1.457 1.658 1.825 1.992 2.302 2.441 2.566 2.724 2.887 2.989 3.173 3.348 3.527 3.611 3.773 3.932 4.15 4.294 4.434 4.63 4.807 4.971 5.127 5.279 5.471 5.657 5.845 6.052 6.244 6.426 6.643 6.891 7.114 7.335 7.571 7.846 8.144 8.447 8.768 9.084 9.413 9.704 9.963 10.219 10.499 10.689 10.554 9.951 9.289 8.675 8.105 7.574 7.107 6.703 6.353 5.998 5.675 5.38 5.107 4.86 4.63 4.41 4.177 3.971 3.802 3.636 3.463 3.312 3.153 2.989 2.862 2.734 2.593 2.439 2.285 2.185 2.083 1.916 1.803 1.692 1.632 1.509 1.385 1.257 1.188 1.044 0.943 0.859 0.776 0.583 0.473 0.354 0.208 0.021 -0.18 -0.389 -0.811 -2 ,3627 ,KEBNE ,16658595,Tue Nov 23 10:07:05 CET,Tue Nov 23 11:33:35 CET,0.0 0.873 1.202 1.43 1.629 1.801 1.969 2.117 2.379 2.503 2.618 2.786 2.955 3.059 3.263 3.457 3.642 3.727 3.882 4.034 4.253 4.391 4.528 4.723 4.894 5.048 5.2 5.353 5.552 5.743 5.933 6.16 6.365 6.552 6.762 6.997 7.219 7.461 7.724 8.013 8.304 8.604 8.948 9.288 9.629 9.935 10.222 10.47 10.716 10.869 10.608 9.911 9.191 8.522 7.954 7.454 7.017 6.595 6.229 5.866 5.536 5.261 5.021 4.788 4.56 4.351 4.135 3.931 3.749 3.575 3.391 3.232 3.054 2.87 2.747 2.614 2.472 2.337 2.204 2.106 1.999 1.836 1.721 1.601 1.542 1.425 1.299 1.161 1.091 0.957 0.867 0.779 0.696 0.533 0.422 0.306 0.188 0.026 -0.17 -0.393 -0.957 -3 ,6064 ,KEBNE ,16658596,Tue Nov 23 10:07:06 CET,Tue Nov 23 11:29:24 CET,0.0 0.67 0.973 1.243 1.484 1.664 1.822 1.975 2.229 2.347 2.471 2.651 2.816 2.911 3.105 3.3 3.47 3.554 3.723 3.873 4.087 4.228 4.357 4.547 4.725 4.892 5.05 5.197 5.391 5.566 5.74 5.954 6.16 6.353 6.574 6.805 7.004 7.241 7.494 7.745 7.999 8.291 8.64 8.933 9.211 9.523 9.839 10.13 10.36 10.45 10.274 9.682 9.021 8.446 7.913 7.413 6.982 6.56 6.182 5.814 5.507 5.227 4.946 4.697 4.474 4.254 4.01 3.803 3.635 3.47 3.299 3.144 2.993 2.847 2.727 2.599 2.465 2.336 2.209 2.112 2.0 1.835 1.731 1.619 1.559 1.429 1.283 1.139 1.065 0.916 0.819 0.731 0.632 0.44 0.336 0.223 0.081 -0.113 -0.309 -0.482 -0.879 -4 ,19461 ,KEBNE ,16658597,Tue Nov 23 10:08:07 CET,Tue Nov 23 11:35:34 CET,0.0 0.692 1.01 1.282 1.498 1.69 1.858 2.001 2.256 2.379 2.501 2.668 2.833 2.93 3.136 3.327 3.503 3.593 3.761 3.924 4.148 4.287 4.419 4.607 4.779 4.933 5.091 5.257 5.442 5.616 5.8 5.999 6.179 6.367 6.576 6.81 7.04 7.287 7.54 7.796 8.052 8.335 8.676 9.003 9.373 9.704 10.0 10.29 10.497 10.556 10.286 9.643 8.977 8.364 7.828 7.342 6.918 6.522 6.161 5.788 5.464 5.186 4.919 4.673 4.449 4.233 4.006 3.812 3.651 3.483 3.313 3.173 3.026 2.871 2.742 2.596 2.45 2.31 2.156 2.051 1.946 1.78 1.658 1.52 1.454 1.335 1.209 1.064 0.991 0.852 0.757 0.669 0.576 0.397 0.3 0.175 0.046 -0.096 -0.28 -0.477 -0.836 -5 ,31200 ,KEBNE ,16658598,Tue Nov 23 10:09:08 CET,Tue Nov 23 11:30:27 CET,0.0 0.763 1.118 1.38 1.615 1.83 1.996 2.153 2.473 2.609 2.723 2.892 3.059 3.157 3.336 3.495 3.654 3.734 3.891 4.039 4.252 4.4 4.539 4.733 4.913 5.087 5.26 5.423 5.637 5.841 6.038 6.272 6.483 6.686 6.925 7.166 7.373 7.629 7.876 8.101 8.346 8.621 8.935 9.234 9.568 9.89 10.157 10.393 10.587 10.646 10.426 9.889 9.294 8.701 8.166 7.686 7.259 6.85 6.503 6.146 5.782 5.477 5.234 4.997 4.765 4.565 4.357 4.156 3.987 3.823 3.653 3.498 3.33 3.162 3.034 2.911 2.777 2.629 2.478 2.371 2.265 2.107 2.002 1.888 1.826 1.691 1.562 1.432 1.352 1.202 1.088 1.0 0.91 0.713 0.606 0.494 0.375 0.244 0.111 -0.141 -0.594 -6 ,15127 ,KEBNE ,16658599,Tue Nov 23 10:09:08 CET,Tue Nov 23 11:29:16 CET,0.0 1.026 1.325 1.554 1.758 1.947 2.125 2.276 2.563 2.695 2.815 2.989 3.153 3.254 3.452 3.626 3.798 3.885 4.037 4.188 4.416 4.564 4.697 4.892 5.087 5.258 5.415 5.578 5.779 5.96 6.146 6.358 6.553 6.741 6.953 7.193 7.41 7.641 7.884 8.138 8.409 8.704 9.011 9.292 9.602 9.903 10.229 10.53 10.75 10.807 10.597 10.097 9.536 8.975 8.387 7.823 7.338 6.897 6.53 6.164 5.841 5.558 5.297 5.042 4.808 4.6 4.364 4.163 3.997 3.819 3.637 3.49 3.338 3.186 3.061 2.929 2.802 2.668 2.523 2.419 2.313 2.127 1.993 1.866 1.799 1.663 1.525 1.383 1.312 1.174 1.074 0.985 0.901 0.714 0.616 0.499 0.352 0.181 -0.023 -0.239 -0.638 -7 ,11641 ,KEBNE ,16658600,Tue Nov 23 10:10:09 CET,Tue Nov 23 11:31:09 CET,0.0 0.951 1.327 1.572 1.788 1.982 2.13 2.26 2.532 2.663 2.796 2.989 3.158 3.263 3.476 3.668 3.837 3.917 4.077 4.234 4.448 4.59 4.732 4.929 5.118 5.296 5.456 5.597 5.778 5.95 6.127 6.346 6.542 6.736 6.973 7.228 7.475 7.747 8.007 8.281 8.56 8.841 9.135 9.425 9.775 10.134 10.535 10.94 11.283 11.522 11.666 11.465 11.061 10.616 10.13 9.667 9.289 8.937 8.615 8.282 7.975 7.705 7.468 7.253 7.058 6.875 6.667 6.486 6.33 6.154 5.976 5.819 5.649 5.478 5.345 5.21 5.07 4.933 4.794 4.702 4.606 4.448 4.336 4.221 4.167 4.05 3.923 3.795 3.723 3.569 3.462 3.376 3.284 3.082 2.966 2.835 2.691 2.522 2.333 2.101 1.799 -8 ,25184 ,KEBNE ,16658601,Tue Nov 23 10:10:09 CET,Tue Nov 23 11:30:47 CET,0.0 0.933 1.271 1.542 1.763 1.959 2.144 2.3 2.573 2.701 2.838 3.045 3.211 3.311 3.506 3.702 3.885 3.966 4.116 4.251 4.442 4.57 4.706 4.906 5.077 5.245 5.415 5.572 5.762 5.951 6.138 6.343 6.538 6.751 6.993 7.237 7.47 7.705 7.95 8.212 8.479 8.771 9.087 9.392 9.755 10.13 10.477 10.789 11.04 11.177 11.041 10.508 9.881 9.295 8.761 8.242 7.749 7.283 6.897 6.531 6.21 5.925 5.667 5.42 5.194 4.995 4.776 4.572 4.396 4.204 4.001 3.837 3.688 3.546 3.434 3.311 3.181 3.043 2.899 2.799 2.686 2.518 2.41 2.304 2.249 2.135 2.0 1.849 1.778 1.638 1.524 1.438 1.352 1.174 1.074 0.938 0.803 0.658 0.445 0.197 -0.329 -9 ,10813 ,KEBNE ,16658602,Tue Nov 23 10:10:09 CET,Tue Nov 23 11:37:17 CET,0.0 0.776 1.095 1.366 1.612 1.809 1.986 2.147 2.417 2.532 2.641 2.814 2.987 3.092 3.303 3.494 3.661 3.743 3.9 4.055 4.278 4.41 4.538 4.734 4.919 5.093 5.246 5.389 5.585 5.774 5.935 6.128 6.325 6.51 6.722 6.954 7.173 7.406 7.647 7.899 8.164 8.458 8.795 9.117 9.475 9.857 10.211 10.572 10.921 11.044 10.872 10.325 9.662 9.032 8.466 7.927 7.464 7.06 6.712 6.375 6.068 5.774 5.523 5.305 5.088 4.858 4.607 4.407 4.239 4.066 3.883 3.725 3.562 3.402 3.267 3.121 2.979 2.837 2.699 2.606 2.507 2.36 2.265 2.155 2.095 1.98 1.854 1.718 1.645 1.508 1.43 1.352 1.276 1.096 0.996 0.87 0.724 0.597 0.439 0.262 -0.244 -10 ,1533 ,KEBNE ,16658603,Tue Nov 23 10:11:10 CET,Tue Nov 23 11:32:49 CET,0.0 1.155 1.514 1.806 2.053 2.233 2.395 2.541 2.813 2.952 3.081 3.235 3.393 3.488 3.676 3.858 4.024 4.104 4.259 4.418 4.638 4.773 4.908 5.093 5.273 5.443 5.593 5.739 5.934 6.119 6.286 6.494 6.709 6.91 7.138 7.398 7.637 7.883 8.142 8.395 8.65 8.942 9.276 9.578 9.881 10.188 10.503 10.797 11.042 11.19 11.017 10.469 9.899 9.337 8.813 8.321 7.889 7.518 7.155 6.779 6.469 6.194 5.929 5.67 5.438 5.233 5.006 4.793 4.611 4.428 4.245 4.089 3.926 3.753 3.618 3.486 3.349 3.199 3.037 2.925 2.808 2.641 2.539 2.431 2.369 2.237 2.109 1.977 1.908 1.765 1.655 1.567 1.479 1.281 1.167 1.053 0.934 0.764 0.563 0.336 0.014 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt deleted file mode 100644 index f2c76a7c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18951 ,KEBNE ,16652292,Sun Nov 21 22:19:47 CET,Mon Nov 22 00:07:58 CET,0.0 0.87 1.227 1.519 1.794 2.051 2.275 2.463 2.774 2.933 3.104 3.204 3.58 3.727 4.01 4.278 4.532 4.658 4.905 5.163 5.525 5.745 5.97 6.304 6.614 6.904 7.179 7.453 7.808 8.151 8.477 8.875 9.27 9.644 10.076 10.554 11.016 11.515 12.018 12.554 13.098 13.672 14.315 14.99 15.812 16.712 17.631 18.52 19.559 20.805 22.091 22.68 22.784 22.665 22.422 22.17 21.912 21.61 21.31 20.939 20.577 20.224 19.848 19.502 19.195 18.909 18.608 18.346 18.129 17.906 17.682 17.491 17.268 17.044 16.887 16.719 16.533 16.331 16.123 15.983 15.84 15.607 15.442 15.281 15.2 15.035 14.867 14.689 14.591 14.288 14.26 14.133 13.998 13.738 13.59 13.425 13.253 13.075 12.869 12.579 11.94 -2 ,12522 ,KEBNE ,16652293,Sun Nov 21 22:19:47 CET,Mon Nov 22 00:08:33 CET,0.0 1.069 1.467 1.747 1.987 2.229 2.461 2.67 3.053 3.242 3.42 3.53 3.906 4.063 4.364 4.634 4.89 5.021 5.284 5.53 5.873 6.1 6.313 6.623 6.945 7.245 7.527 7.813 8.198 8.547 8.868 9.26 9.656 10.045 10.479 10.98 11.48 12.015 12.592 13.215 13.878 14.651 15.538 16.403 17.354 18.295 19.37 20.585 21.952 23.5 24.898 25.547 25.634 25.493 25.303 24.948 24.478 24.054 23.641 23.195 22.825 22.497 22.186 21.857 21.538 21.268 20.989 20.727 20.492 20.228 19.965 19.768 19.566 19.358 19.193 19.026 18.846 18.647 18.466 18.341 18.193 17.957 17.79 17.626 17.54 17.357 17.177 16.985 16.872 16.559 16.534 16.407 16.272 15.99 15.834 15.66 15.462 15.258 15.041 14.76 14.091 -3 ,13875 ,KEBNE ,16652294,Sun Nov 21 22:19:47 CET,Mon Nov 22 00:07:28 CET,0.0 0.942 1.311 1.61 1.896 2.161 2.386 2.591 2.987 3.166 3.33 3.406 3.757 3.895 4.178 4.469 4.727 4.842 5.075 5.31 5.672 5.906 6.121 6.431 6.726 7.021 7.312 7.597 7.978 8.328 8.657 9.064 9.452 9.815 10.23 10.708 11.197 11.747 12.335 12.92 13.472 14.081 14.843 15.633 16.507 17.457 18.504 19.576 20.662 22.065 23.778 24.62 24.781 24.641 24.237 23.702 23.188 22.682 22.221 21.766 21.39 21.057 20.72 20.394 20.096 19.816 19.513 19.243 19.008 18.756 18.496 18.276 18.04 17.784 17.594 17.407 17.211 17.016 16.817 16.677 16.531 16.315 16.167 16.01 15.933 15.777 15.604 15.415 15.311 15.004 14.984 14.873 14.752 14.492 14.35 14.188 14.017 13.832 13.579 13.25 12.408 -4 ,32267 ,KEBNE ,16652295,Sun Nov 21 22:19:47 CET,Mon Nov 22 00:07:33 CET,0.0 1.128 1.505 1.829 2.082 2.303 2.526 2.749 3.161 3.343 3.518 3.64 4.026 4.197 4.509 4.792 5.059 5.182 5.415 5.632 5.957 6.181 6.388 6.672 6.948 7.228 7.496 7.759 8.117 8.448 8.756 9.138 9.517 9.892 10.324 10.783 11.229 11.713 12.242 12.817 13.398 14.031 14.84 15.703 16.601 17.502 18.522 19.709 21.127 22.621 24.176 25.25 25.295 24.901 24.456 23.987 23.515 23.019 22.613 22.226 21.852 21.513 21.207 20.908 20.603 20.311 20.011 19.742 19.507 19.257 18.998 18.773 18.538 18.315 18.144 17.967 17.763 17.545 17.339 17.205 17.061 16.812 16.633 16.464 16.38 16.201 16.01 15.805 15.704 15.395 15.357 15.229 15.099 14.826 14.673 14.49 14.288 14.058 13.792 13.436 12.206 -5 ,17252 ,KEBNE ,16652296,Sun Nov 21 22:19:47 CET,Mon Nov 22 00:08:26 CET,0.0 0.882 1.249 1.545 1.795 2.013 2.22 2.433 2.814 2.993 3.172 3.265 3.632 3.778 4.064 4.348 4.631 4.763 5.007 5.245 5.582 5.805 6.036 6.356 6.658 6.96 7.238 7.503 7.869 8.231 8.594 9.041 9.438 9.812 10.256 10.727 11.152 11.616 12.131 12.687 13.3 13.991 14.75 15.541 16.429 17.237 18.101 19.15 20.352 21.601 22.879 23.502 23.566 23.436 23.158 22.714 22.2 21.688 21.202 20.719 20.317 19.944 19.57 19.209 18.892 18.625 18.33 18.057 17.829 17.579 17.317 17.105 16.872 16.62 16.429 16.236 16.043 15.851 15.652 15.51 15.36 15.127 14.97 14.805 14.712 14.519 14.326 14.145 14.053 13.748 13.713 13.585 13.463 13.236 13.099 12.923 12.735 12.534 12.32 12.06 11.358 -6 ,6154 ,KEBNE ,16652297,Sun Nov 21 22:19:47 CET,Mon Nov 22 00:07:09 CET,0.0 1.129 1.521 1.825 2.078 2.304 2.514 2.709 3.09 3.274 3.452 3.567 3.949 4.102 4.389 4.668 4.925 5.047 5.292 5.524 5.85 6.062 6.272 6.584 6.894 7.193 7.476 7.749 8.11 8.463 8.804 9.214 9.624 10.008 10.451 10.955 11.434 11.985 12.587 13.236 13.917 14.674 15.568 16.427 17.327 18.307 19.478 20.691 21.88 23.014 24.049 24.491 24.468 24.319 24.066 23.626 23.1 22.646 22.224 21.746 21.34 20.975 20.622 20.3 19.999 19.706 19.407 19.147 18.913 18.663 18.399 18.183 17.961 17.735 17.577 17.414 17.224 17.026 16.833 16.693 16.535 16.295 16.14 15.985 15.909 15.741 15.559 15.368 15.266 14.964 14.965 14.852 14.73 14.474 14.33 14.179 14.002 13.8 13.58 13.339 12.831 -8 ,4147 ,KEBNE ,16652299,Sun Nov 21 22:19:47 CET,Mon Nov 22 00:08:54 CET,0.0 1.232 1.703 2.045 2.327 2.614 2.871 3.074 3.475 3.671 3.852 3.969 4.347 4.49 4.753 5.015 5.263 5.382 5.616 5.837 6.156 6.368 6.571 6.868 7.164 7.449 7.731 8.008 8.372 8.72 9.048 9.45 9.841 10.208 10.636 11.113 11.589 12.136 12.715 13.346 14.029 14.764 15.585 16.414 17.385 18.4 19.416 20.53 21.96 23.39 24.644 25.413 25.587 25.532 25.32 25.005 24.569 24.064 23.615 23.157 22.748 22.374 22.016 21.704 21.416 21.146 20.866 20.606 20.373 20.128 19.886 19.684 19.453 19.205 19.024 18.843 18.652 18.438 18.225 18.091 17.941 17.716 17.569 17.4 17.316 17.159 16.995 16.801 16.694 16.39 16.369 16.237 16.096 15.826 15.679 15.533 15.369 15.176 14.963 14.701 13.933 -10 ,568 ,KEBNE ,16652301,Sun Nov 21 22:20:48 CET,Mon Nov 22 00:08:56 CET,0.0 0.975 1.389 1.688 1.936 2.169 2.397 2.61 2.997 3.167 3.342 3.467 3.842 3.978 4.232 4.493 4.752 4.881 5.132 5.382 5.759 5.989 6.196 6.499 6.803 7.105 7.401 7.68 8.04 8.401 8.758 9.184 9.583 9.953 10.372 10.868 11.349 11.872 12.439 13.065 13.711 14.393 15.152 15.894 16.788 17.797 18.899 20.0 21.085 22.169 23.27 23.961 24.116 24.059 23.944 23.681 23.26 22.788 22.335 21.889 21.525 21.18 20.839 20.515 20.201 19.909 19.622 19.373 19.147 18.911 18.671 18.466 18.25 18.026 17.857 17.686 17.508 17.313 17.104 16.963 16.82 16.579 16.411 16.244 16.154 15.972 15.785 15.584 15.481 15.177 15.162 15.055 14.952 14.718 14.58 14.426 14.251 14.063 13.85 13.537 12.973 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index e95e9f16..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31918 ,KEBNE ,16652302,Sun Nov 21 22:20:48 CET,Mon Nov 22 00:09:25 CET,0.0 0.935 1.318 1.638 1.919 2.147 2.348 2.531 2.852 3.002 3.148 3.216 3.591 3.742 4.024 4.288 4.534 4.653 4.89 5.125 5.474 5.701 5.918 6.229 6.536 6.846 7.143 7.427 7.792 8.146 8.494 8.921 9.334 9.726 10.189 10.723 11.239 11.824 12.471 13.173 13.907 14.743 15.788 16.892 18.224 19.794 21.637 23.553 25.708 28.395 31.53 33.906 35.389 36.316 36.835 37.16 37.346 37.41 37.399 37.403 37.387 37.321 37.237 37.154 37.058 36.94 36.82 36.718 36.621 36.506 36.392 36.291 36.177 36.053 35.941 35.823 35.706 35.59 35.484 35.408 35.313 35.139 35.015 34.901 34.845 34.732 34.615 34.484 34.417 34.175 34.167 34.072 33.966 33.73 33.588 33.424 33.239 33.02 32.776 32.456 31.459 -2 ,9854 ,KEBNE ,16652303,Sun Nov 21 22:20:47 CET,Mon Nov 22 00:07:32 CET,0.0 1.126 1.478 1.773 2.07 2.308 2.504 2.691 3.032 3.204 3.383 3.469 3.839 3.992 4.285 4.531 4.748 4.855 5.067 5.281 5.596 5.801 6.003 6.332 6.679 6.994 7.294 7.574 7.932 8.289 8.623 9.046 9.487 9.912 10.381 10.904 11.397 11.94 12.555 13.21 13.895 14.664 15.574 16.536 17.725 19.107 20.646 22.276 24.142 26.372 29.197 31.608 32.96 33.709 34.123 34.403 34.606 34.701 34.747 34.773 34.768 34.757 34.725 34.662 34.597 34.525 34.428 34.339 34.253 34.16 34.069 33.994 33.901 33.793 33.707 33.622 33.531 33.421 33.293 33.205 33.103 32.915 32.771 32.642 32.582 32.439 32.268 32.103 32.023 31.753 31.689 31.568 31.474 31.259 31.106 30.955 30.771 30.557 30.349 30.011 28.718 -3 ,31437 ,KEBNE ,16652304,Sun Nov 21 22:20:48 CET,Mon Nov 22 00:08:23 CET,0.0 0.874 1.18 1.43 1.68 1.913 2.116 2.309 2.673 2.839 3.009 3.101 3.459 3.59 3.844 4.101 4.342 4.454 4.676 4.897 5.219 5.429 5.634 5.928 6.213 6.501 6.796 7.076 7.422 7.767 8.132 8.588 9.019 9.425 9.897 10.459 11.03 11.692 12.42 13.191 14.012 14.923 15.985 17.019 18.189 19.564 21.165 22.927 24.913 27.271 30.327 32.96 34.636 35.58 36.075 36.407 36.592 36.677 36.707 36.714 36.719 36.681 36.645 36.629 36.584 36.503 36.387 36.301 36.228 36.14 36.039 35.948 35.853 35.747 35.652 35.548 35.444 35.331 35.205 35.118 35.016 34.838 34.728 34.63 34.573 34.424 34.264 34.111 34.028 33.762 33.729 33.62 33.516 33.295 33.154 32.987 32.798 32.593 32.343 31.958 30.921 -4 ,17168 ,KEBNE ,16652305,Sun Nov 21 22:20:48 CET,Mon Nov 22 00:09:13 CET,0.0 0.909 1.258 1.545 1.792 2.003 2.218 2.441 2.841 3.022 3.205 3.305 3.677 3.832 4.123 4.384 4.636 4.761 5.0 5.229 5.586 5.825 6.047 6.378 6.701 7.01 7.3 7.581 7.942 8.292 8.636 9.057 9.465 9.861 10.326 10.852 11.37 11.948 12.586 13.288 14.035 14.88 15.831 16.726 17.726 18.819 20.117 21.65 23.443 25.575 28.191 30.302 31.497 32.214 32.669 32.981 33.172 33.269 33.3 33.31 33.302 33.274 33.229 33.16 33.087 33.002 32.903 32.803 32.709 32.602 32.479 32.388 32.285 32.164 32.069 31.969 31.869 31.767 31.655 31.568 31.484 31.348 31.246 31.133 31.07 30.943 30.818 30.68 30.601 30.339 30.301 30.187 30.077 29.862 29.734 29.587 29.408 29.186 28.919 28.531 27.209 -8 ,4712 ,KEBNE ,16652309,Sun Nov 21 22:20:48 CET,Mon Nov 22 00:07:49 CET,0.0 0.847 1.229 1.524 1.802 2.05 2.28 2.503 2.874 3.026 3.18 3.268 3.638 3.778 4.061 4.334 4.607 4.74 4.997 5.245 5.572 5.78 5.994 6.33 6.656 6.959 7.231 7.49 7.845 8.199 8.54 8.935 9.307 9.695 10.158 10.677 11.19 11.739 12.343 13.015 13.721 14.547 15.525 16.498 17.617 18.879 20.265 21.763 23.627 25.756 28.676 31.393 32.744 33.502 33.985 34.292 34.466 34.55 34.573 34.554 34.514 34.458 34.399 34.344 34.271 34.195 34.111 34.014 33.926 33.839 33.73 33.635 33.539 33.438 33.363 33.277 33.182 33.059 32.921 32.833 32.739 32.578 32.446 32.32 32.259 32.124 31.975 31.808 31.721 31.456 31.41 31.288 31.166 30.909 30.75 30.57 30.38 30.152 29.877 29.527 28.094 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt deleted file mode 100644 index c5237ad3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,12983 ,KEBNE ,17019329,Wed Dec 22 02:27:00 CET,Wed Dec 22 04:10:09 CET,0.0 1.154 1.505 1.774 1.982 2.171 2.341 2.49 2.76 2.888 3.008 2.989 3.334 3.444 3.642 3.826 4.022 4.124 4.303 4.467 4.728 4.897 5.043 5.253 5.471 5.692 5.899 6.101 6.368 6.622 6.876 7.177 7.445 7.705 8.016 8.365 8.684 9.043 9.455 9.882 10.316 10.806 11.401 12.036 12.738 13.452 14.306 15.235 16.141 17.058 18.01 18.359 17.999 17.398 16.828 16.31 15.831 15.363 14.936 14.485 14.074 13.691 13.33 12.965 12.614 12.302 11.978 11.725 11.534 11.319 11.079 10.888 10.694 10.478 10.311 10.143 9.97 9.78 9.559 9.409 9.256 9.008 8.846 8.687 8.592 8.399 8.201 7.982 7.873 7.526 7.474 7.317 7.164 6.876 6.73 6.557 6.364 6.14 5.841 5.412 3.797 -3 ,7189 ,KEBNE ,17019330,Wed Dec 22 02:27:00 CET,Wed Dec 22 04:10:34 CET,0.0 1.204 1.632 1.933 2.171 2.355 2.516 2.673 2.968 3.114 3.257 3.28 3.636 3.751 3.964 4.175 4.375 4.475 4.678 4.874 5.138 5.295 5.455 5.693 5.942 6.197 6.43 6.65 6.933 7.196 7.457 7.775 8.073 8.353 8.694 9.103 9.484 9.892 10.323 10.772 11.239 11.779 12.433 13.102 13.887 14.723 15.557 16.304 17.056 17.807 18.34 18.157 17.634 17.164 16.659 16.108 15.604 15.091 14.599 14.072 13.648 13.294 12.958 12.643 12.331 12.028 11.716 11.448 11.2 10.939 10.689 10.481 10.252 9.996 9.801 9.611 9.406 9.18 8.939 8.762 8.571 8.285 8.089 7.906 7.815 7.62 7.419 7.175 7.038 6.676 6.629 6.477 6.325 6.025 5.857 5.673 5.468 5.192 4.857 4.393 2.657 -4 ,17825 ,KEBNE ,17019331,Wed Dec 22 02:27:00 CET,Wed Dec 22 04:10:18 CET,0.0 1.716 2.144 2.438 2.677 2.894 3.096 3.265 3.555 3.69 3.818 3.821 4.186 4.31 4.531 4.737 4.936 5.023 5.19 5.365 5.623 5.789 5.945 6.164 6.381 6.59 6.78 6.967 7.217 7.461 7.699 8.0 8.285 8.556 8.883 9.243 9.597 10.004 10.427 10.842 11.283 11.805 12.412 13.012 13.744 14.561 15.461 16.422 17.459 18.55 19.557 20.221 20.475 20.292 19.93 19.578 19.215 18.783 18.362 17.97 17.643 17.358 17.098 16.842 16.565 16.27 15.941 15.65 15.394 15.135 14.866 14.64 14.424 14.212 14.041 13.853 13.636 13.398 13.167 13.015 12.861 12.621 12.453 12.285 12.195 11.998 11.798 11.578 11.453 11.102 11.067 10.935 10.798 10.463 10.286 10.098 9.857 9.596 9.295 8.92 6.932 -5 ,4776 ,KEBNE ,17019332,Wed Dec 22 02:27:00 CET,Wed Dec 22 04:09:37 CET,0.0 1.683 2.027 2.292 2.51 2.709 2.896 3.061 3.365 3.501 3.636 3.672 4.032 4.147 4.364 4.574 4.78 4.875 5.061 5.244 5.513 5.696 5.867 6.098 6.319 6.529 6.735 6.95 7.25 7.523 7.761 8.066 8.371 8.651 8.98 9.357 9.734 10.141 10.566 11.035 11.549 12.137 12.759 13.357 14.09 14.916 15.817 16.841 18.096 19.169 19.678 19.414 18.876 18.328 17.785 17.266 16.78 16.301 15.822 15.298 14.85 14.458 14.098 13.762 13.446 13.157 12.827 12.518 12.262 11.965 11.656 11.442 11.229 11.014 10.851 10.685 10.512 10.321 10.123 9.975 9.826 9.616 9.477 9.323 9.231 9.046 8.863 8.667 8.563 8.229 8.233 8.102 7.957 7.662 7.488 7.282 7.064 6.83 6.573 6.223 4.708 -6 ,20068 ,KEBNE ,17019333,Wed Dec 22 02:27:00 CET,Wed Dec 22 04:09:32 CET,0.0 1.387 1.774 2.037 2.292 2.54 2.745 2.922 3.252 3.391 3.519 3.523 3.868 3.975 4.188 4.386 4.582 4.679 4.862 5.041 5.285 5.447 5.61 5.842 6.071 6.292 6.497 6.689 6.932 7.183 7.427 7.716 8.018 8.325 8.663 9.014 9.339 9.692 10.068 10.478 10.938 11.465 12.087 12.686 13.357 14.087 14.824 15.554 16.367 17.035 17.295 16.982 16.444 15.906 15.374 14.841 14.338 13.837 13.376 12.93 12.51 12.132 11.809 11.499 11.219 10.936 10.623 10.367 10.153 9.92 9.661 9.44 9.212 8.98 8.801 8.613 8.411 8.202 7.987 7.842 7.689 7.445 7.271 7.089 6.995 6.785 6.563 6.347 6.238 5.898 5.887 5.763 5.615 5.243 5.052 4.851 4.626 4.38 4.097 3.688 1.617 -7 ,8953 ,KEBNE ,17019334,Wed Dec 22 02:27:00 CET,Wed Dec 22 04:09:50 CET,0.0 1.558 1.941 2.218 2.465 2.691 2.87 3.043 3.381 3.531 3.683 3.715 4.07 4.173 4.366 4.579 4.797 4.9 5.09 5.264 5.494 5.651 5.807 6.027 6.247 6.465 6.674 6.872 7.126 7.366 7.6 7.898 8.188 8.48 8.807 9.155 9.495 9.868 10.282 10.72 11.152 11.627 12.196 12.786 13.491 14.266 15.141 16.021 16.802 17.555 18.156 18.02 17.489 16.931 16.314 15.62 14.958 14.346 13.815 13.301 12.873 12.487 12.086 11.687 11.34 11.053 10.749 10.47 10.208 9.907 9.598 9.333 9.054 8.788 8.571 8.335 8.1 7.862 7.602 7.41 7.228 6.974 6.794 6.593 6.489 6.284 6.067 5.836 5.703 5.337 5.32 5.182 5.042 4.722 4.53 4.293 4.031 3.747 3.39 2.879 1.175 -8 ,8352 ,KEBNE ,17019335,Wed Dec 22 02:28:02 CET,Wed Dec 22 04:10:58 CET,0.0 1.207 1.549 1.796 1.994 2.164 2.323 2.482 2.769 2.896 3.028 3.033 3.39 3.51 3.714 3.897 4.084 4.185 4.383 4.564 4.827 4.99 5.158 5.41 5.653 5.879 6.074 6.254 6.5 6.752 6.998 7.297 7.59 7.871 8.195 8.547 8.88 9.279 9.711 10.153 10.616 11.114 11.687 12.296 13.021 13.743 14.505 15.378 16.301 17.232 17.96 18.402 18.693 18.714 18.549 18.216 17.823 17.518 17.225 16.876 16.58 16.305 16.023 15.759 15.487 15.215 14.952 14.698 14.446 14.174 13.877 13.642 13.418 13.204 13.025 12.815 12.599 12.376 12.132 11.95 11.761 11.471 11.268 11.068 10.972 10.776 10.562 10.313 10.175 9.812 9.775 9.62 9.455 9.108 8.909 8.706 8.483 8.22 7.883 7.419 5.391 -9 ,24848 ,KEBNE ,17019336,Wed Dec 22 02:28:02 CET,Wed Dec 22 04:10:41 CET,0.0 1.654 2.043 2.338 2.612 2.86 3.058 3.224 3.513 3.652 3.786 3.807 4.166 4.287 4.505 4.705 4.903 4.998 5.19 5.396 5.685 5.857 6.019 6.255 6.482 6.699 6.911 7.124 7.394 7.648 7.896 8.204 8.499 8.779 9.116 9.489 9.846 10.256 10.696 11.164 11.637 12.154 12.777 13.404 14.11 14.918 15.85 16.818 17.92 19.141 20.35 21.049 21.214 21.178 21.0 20.692 20.372 20.034 19.717 19.383 19.075 18.796 18.517 18.242 17.968 17.72 17.462 17.249 17.084 16.917 16.739 16.55 16.334 16.124 15.958 15.776 15.599 15.419 15.219 15.081 14.938 14.724 14.572 14.379 14.276 14.068 13.837 13.595 13.459 13.098 13.042 12.903 12.768 12.479 12.295 12.08 11.837 11.56 11.206 10.762 9.044 -10 ,22326 ,KEBNE ,17019337,Wed Dec 22 02:28:02 CET,Wed Dec 22 04:10:20 CET,0.0 1.918 2.334 2.618 2.867 3.088 3.283 3.481 3.837 3.991 4.134 4.161 4.526 4.642 4.856 5.076 5.302 5.411 5.61 5.786 6.027 6.191 6.352 6.562 6.757 6.953 7.144 7.341 7.609 7.864 8.098 8.385 8.687 8.977 9.29 9.65 9.992 10.361 10.746 11.135 11.561 12.057 12.63 13.196 13.837 14.507 15.314 16.237 17.211 18.284 19.383 19.893 19.827 19.538 19.247 18.965 18.638 18.235 17.766 17.24 16.822 16.451 16.071 15.705 15.365 15.047 14.7 14.385 14.118 13.854 13.583 13.351 13.109 12.855 12.665 12.467 12.25 12.029 11.791 11.624 11.463 11.193 10.991 10.78 10.67 10.439 10.19 9.958 9.843 9.493 9.423 9.253 9.075 8.712 8.531 8.322 8.052 7.76 7.441 7.014 5.522 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt deleted file mode 100644 index 55602e13..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3532 ,KEBNE ,16652322,Sun Nov 21 22:20:48 CET,Mon Nov 22 00:10:09 CET,0.0 0.808 1.023 1.201 1.353 1.481 1.597 1.721 1.955 2.054 2.153 2.154 2.417 2.504 2.676 2.836 2.988 3.059 3.179 3.306 3.483 3.592 3.699 3.848 3.997 4.146 4.288 4.424 4.597 4.755 4.914 5.106 5.293 5.478 5.692 5.932 6.159 6.399 6.638 6.89 7.15 7.445 7.81 8.191 8.622 9.06 9.553 10.115 10.706 11.316 11.904 12.211 12.232 12.126 11.969 11.762 11.551 11.32 11.094 10.86 10.658 10.492 10.335 10.18 10.003 9.826 9.666 9.532 9.41 9.265 9.108 8.979 8.846 8.71 8.598 8.48 8.376 8.27 8.155 8.076 7.995 7.863 7.761 7.657 7.606 7.487 7.361 7.242 7.174 6.926 6.962 6.882 6.795 6.623 6.518 6.397 6.261 6.112 5.945 5.737 5.018 -2 ,11950 ,KEBNE ,16652323,Sun Nov 21 22:20:48 CET,Mon Nov 22 00:10:50 CET,0.0 0.68 0.938 1.178 1.375 1.525 1.66 1.78 1.987 2.076 2.17 2.175 2.433 2.512 2.657 2.787 2.912 2.975 3.09 3.198 3.361 3.465 3.565 3.715 3.864 4.001 4.133 4.268 4.431 4.58 4.738 4.936 5.112 5.274 5.46 5.667 5.876 6.095 6.322 6.569 6.834 7.149 7.501 7.83 8.236 8.684 9.143 9.626 10.178 10.727 11.187 11.336 11.274 11.083 10.818 10.546 10.285 10.02 9.781 9.563 9.363 9.171 8.999 8.836 8.661 8.487 8.313 8.161 8.021 7.87 7.72 7.599 7.469 7.334 7.232 7.123 7.006 6.887 6.754 6.662 6.57 6.428 6.333 6.237 6.175 6.048 5.933 5.81 5.747 5.504 5.552 5.477 5.395 5.213 5.12 5.017 4.894 4.758 4.601 4.392 3.513 -3 ,13868 ,KEBNE ,16652324,Sun Nov 21 22:20:48 CET,Mon Nov 22 00:09:29 CET,0.0 0.914 1.184 1.375 1.553 1.729 1.873 1.998 2.219 2.316 2.411 2.426 2.695 2.782 2.947 3.098 3.228 3.288 3.417 3.538 3.706 3.818 3.919 4.077 4.234 4.385 4.528 4.663 4.843 5.013 5.183 5.387 5.573 5.749 5.941 6.158 6.38 6.622 6.874 7.128 7.39 7.703 8.076 8.443 8.861 9.308 9.781 10.316 10.916 11.542 12.099 12.337 12.335 12.216 12.037 11.82 11.611 11.397 11.193 10.988 10.811 10.65 10.483 10.309 10.13 9.96 9.79 9.648 9.517 9.382 9.253 9.143 9.021 8.893 8.79 8.675 8.563 8.447 8.315 8.225 8.129 7.969 7.862 7.752 7.696 7.59 7.466 7.334 7.271 7.031 7.045 6.963 6.883 6.71 6.609 6.491 6.343 6.18 6.018 5.803 4.963 -4 ,4405 ,KEBNE ,16652325,Sun Nov 21 22:21:50 CET,Mon Nov 22 00:10:30 CET,0.0 0.668 0.901 1.078 1.254 1.409 1.544 1.667 1.896 2.005 2.105 2.107 2.366 2.444 2.597 2.748 2.885 2.951 3.074 3.199 3.391 3.501 3.608 3.774 3.932 4.081 4.219 4.347 4.513 4.675 4.825 5.002 5.181 5.347 5.544 5.774 5.99 6.226 6.487 6.762 7.032 7.335 7.684 8.02 8.421 8.856 9.323 9.829 10.383 11.022 11.601 11.775 11.697 11.52 11.315 11.087 10.828 10.575 10.351 10.112 9.923 9.738 9.534 9.349 9.17 8.989 8.797 8.627 8.477 8.311 8.14 8.003 7.861 7.706 7.585 7.464 7.333 7.188 7.036 6.934 6.831 6.68 6.577 6.465 6.408 6.288 6.155 6.018 5.95 5.704 5.729 5.64 5.542 5.355 5.254 5.136 5.005 4.851 4.656 4.377 3.487 -6 ,23745 ,KEBNE ,16652327,Sun Nov 21 22:22:52 CET,Mon Nov 22 00:10:45 CET,0.0 1.081 1.356 1.541 1.709 1.851 1.967 2.075 2.285 2.384 2.482 2.489 2.748 2.831 3.006 3.167 3.311 3.378 3.511 3.645 3.832 3.949 4.067 4.23 4.383 4.539 4.682 4.814 4.993 5.166 5.331 5.534 5.734 5.924 6.139 6.366 6.582 6.827 7.096 7.386 7.679 8.006 8.368 8.714 9.133 9.593 10.088 10.612 11.177 11.814 12.474 12.745 12.703 12.553 12.354 12.108 11.854 11.609 11.387 11.155 10.957 10.753 10.546 10.347 10.157 9.99 9.812 9.653 9.507 9.358 9.211 9.084 8.938 8.787 8.673 8.566 8.463 8.342 8.203 8.108 8.019 7.876 7.772 7.662 7.6 7.475 7.349 7.221 7.147 6.895 6.934 6.868 6.797 6.619 6.517 6.411 6.29 6.144 5.968 5.716 4.894 -7 ,1103 ,KEBNE ,16652328,Sun Nov 21 22:22:52 CET,Mon Nov 22 00:11:39 CET,0.0 1.037 1.342 1.531 1.686 1.819 1.952 2.08 2.298 2.39 2.48 2.477 2.737 2.821 2.966 3.106 3.257 3.332 3.464 3.581 3.749 3.86 3.967 4.122 4.266 4.398 4.526 4.654 4.821 4.992 5.162 5.356 5.532 5.699 5.906 6.141 6.356 6.583 6.839 7.127 7.43 7.763 8.14 8.49 8.878 9.324 9.826 10.362 10.953 11.567 12.097 12.321 12.29 12.181 12.023 11.819 11.631 11.425 11.226 11.027 10.846 10.675 10.516 10.362 10.209 10.061 9.911 9.785 9.655 9.498 9.335 9.218 9.1 8.968 8.864 8.757 8.651 8.541 8.423 8.337 8.249 8.098 7.983 7.869 7.819 7.717 7.601 7.468 7.394 7.153 7.191 7.108 7.014 6.824 6.728 6.617 6.484 6.34 6.177 5.966 5.14 -8 ,31250 ,KEBNE ,16652329,Sun Nov 21 22:22:53 CET,Mon Nov 22 00:08:40 CET,0.0 1.038 1.265 1.446 1.592 1.724 1.847 1.963 2.16 2.242 2.322 2.299 2.555 2.629 2.771 2.907 3.033 3.096 3.223 3.342 3.512 3.624 3.734 3.898 4.044 4.178 4.309 4.439 4.604 4.767 4.925 5.105 5.286 5.47 5.67 5.884 6.091 6.333 6.593 6.848 7.108 7.413 7.774 8.146 8.588 9.074 9.56 10.009 10.478 10.935 11.351 11.546 11.477 11.258 11.004 10.752 10.489 10.235 10.011 9.77 9.567 9.386 9.225 9.084 8.942 8.797 8.639 8.495 8.366 8.221 8.071 7.943 7.811 7.676 7.562 7.445 7.329 7.2 7.061 6.969 6.879 6.741 6.635 6.518 6.456 6.329 6.2 6.071 6.001 5.747 5.772 5.698 5.612 5.414 5.308 5.196 5.069 4.934 4.771 4.546 3.827 -9 ,10340 ,KEBNE ,16652330,Sun Nov 21 22:22:56 CET,Mon Nov 22 00:06:34 CET,0.0 0.98 1.196 1.382 1.535 1.669 1.807 1.936 2.161 2.262 2.34 2.294 2.547 2.636 2.8 2.939 3.065 3.128 3.247 3.35 3.502 3.609 3.714 3.866 4.015 4.162 4.3 4.436 4.619 4.793 4.944 5.118 5.299 5.488 5.696 5.924 6.14 6.362 6.602 6.854 7.11 7.412 7.789 8.142 8.526 8.935 9.384 9.888 10.457 11.001 11.444 11.625 11.5 11.27 11.025 10.779 10.54 10.314 10.105 9.87 9.639 9.426 9.229 9.052 8.878 8.696 8.492 8.307 8.15 7.99 7.825 7.689 7.55 7.407 7.303 7.189 7.059 6.928 6.781 6.669 6.558 6.379 6.253 6.134 6.075 5.952 5.822 5.68 5.608 5.36 5.376 5.286 5.18 4.969 4.862 4.731 4.578 4.421 4.237 3.962 3.27 -10 ,20068 ,KEBNE ,16652331,Sun Nov 21 22:23:53 CET,Mon Nov 22 00:13:06 CET,0.0 0.775 1.025 1.211 1.366 1.5 1.619 1.732 1.929 2.019 2.112 2.126 2.392 2.467 2.607 2.752 2.898 2.97 3.092 3.194 3.344 3.445 3.547 3.695 3.841 3.981 4.113 4.243 4.408 4.571 4.729 4.904 5.082 5.26 5.451 5.653 5.851 6.066 6.292 6.546 6.796 7.063 7.382 7.704 8.076 8.487 8.941 9.389 9.912 10.479 10.903 11.026 10.926 10.723 10.493 10.246 9.983 9.702 9.457 9.216 8.986 8.791 8.61 8.426 8.25 8.099 7.935 7.778 7.65 7.513 7.366 7.254 7.139 7.005 6.899 6.789 6.674 6.556 6.433 6.347 6.261 6.122 6.015 5.896 5.837 5.725 5.61 5.485 5.416 5.162 5.163 5.078 4.987 4.792 4.695 4.59 4.471 4.325 4.146 3.936 3.262 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 39bed236..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,2489 ,KEBNE ,16652334,Sun Nov 21 22:23:54 CET,Mon Nov 22 00:12:13 CET,0.0 0.922 1.149 1.318 1.47 1.607 1.737 1.855 2.092 2.204 2.298 2.298 2.557 2.629 2.769 2.922 3.08 3.15 3.277 3.401 3.571 3.671 3.777 3.945 4.101 4.241 4.379 4.521 4.706 4.882 5.046 5.252 5.448 5.617 5.81 6.036 6.257 6.498 6.752 7.041 7.348 7.648 7.98 8.331 8.746 9.186 9.666 10.188 10.755 11.385 11.967 12.149 12.056 11.892 11.7 11.478 11.262 11.049 10.844 10.619 10.415 10.216 10.022 9.86 9.702 9.539 9.368 9.199 9.045 8.889 8.735 8.612 8.464 8.309 8.205 8.092 7.973 7.857 7.733 7.638 7.54 7.385 7.274 7.163 7.108 6.987 6.854 6.715 6.645 6.402 6.408 6.309 6.216 6.022 5.913 5.794 5.649 5.486 5.312 5.042 4.023 -4 ,19978 ,KEBNE ,16652335,Sun Nov 21 22:23:54 CET,Mon Nov 22 00:13:40 CET,0.0 0.799 1.019 1.18 1.329 1.461 1.583 1.696 1.902 2.001 2.089 2.088 2.351 2.435 2.592 2.738 2.874 2.936 3.063 3.181 3.356 3.466 3.558 3.7 3.851 3.994 4.128 4.255 4.419 4.586 4.739 4.919 5.098 5.269 5.465 5.685 5.889 6.109 6.34 6.58 6.844 7.154 7.523 7.886 8.27 8.651 9.079 9.557 10.099 10.669 11.157 11.252 11.101 10.884 10.668 10.435 10.199 9.978 9.76 9.524 9.325 9.124 8.918 8.725 8.542 8.378 8.206 8.055 7.916 7.766 7.619 7.491 7.351 7.191 7.065 6.947 6.824 6.697 6.574 6.494 6.413 6.267 6.161 6.053 5.998 5.886 5.762 5.632 5.57 5.324 5.335 5.25 5.166 4.967 4.863 4.745 4.609 4.456 4.273 4.053 3.306 -5 ,6965 ,KEBNE ,16652336,Sun Nov 21 22:24:56 CET,Mon Nov 22 00:13:55 CET,0.0 0.772 1.003 1.161 1.3 1.44 1.569 1.68 1.876 1.964 2.045 2.025 2.284 2.366 2.499 2.618 2.742 2.8 2.911 3.025 3.2 3.318 3.429 3.585 3.74 3.891 4.037 4.174 4.337 4.486 4.632 4.826 5.019 5.201 5.404 5.627 5.842 6.075 6.327 6.589 6.849 7.139 7.476 7.823 8.226 8.64 9.104 9.62 10.149 10.672 11.162 11.378 11.361 11.229 11.036 10.804 10.6 10.414 10.224 10.015 9.829 9.658 9.475 9.291 9.111 8.934 8.757 8.608 8.47 8.319 8.163 8.035 7.887 7.731 7.619 7.51 7.399 7.265 7.129 7.043 6.949 6.817 6.726 6.611 6.552 6.42 6.282 6.142 6.068 5.819 5.816 5.732 5.644 5.44 5.33 5.212 5.092 4.942 4.735 4.438 3.613 -6 ,24425 ,KEBNE ,16652337,Sun Nov 21 22:24:56 CET,Mon Nov 22 00:13:39 CET,0.0 0.704 0.929 1.118 1.296 1.437 1.569 1.688 1.881 1.973 2.064 2.051 2.309 2.384 2.522 2.657 2.789 2.85 2.963 3.066 3.207 3.303 3.397 3.531 3.664 3.81 3.954 4.081 4.251 4.423 4.578 4.771 4.968 5.151 5.355 5.587 5.808 6.046 6.294 6.55 6.826 7.134 7.494 7.862 8.272 8.731 9.269 9.795 10.362 10.994 11.585 11.821 11.821 11.705 11.507 11.283 11.06 10.845 10.648 10.419 10.203 10.002 9.797 9.593 9.414 9.257 9.069 8.905 8.786 8.668 8.527 8.395 8.253 8.1 7.981 7.867 7.757 7.646 7.524 7.434 7.337 7.171 7.054 6.942 6.888 6.773 6.647 6.503 6.43 6.187 6.191 6.102 6.011 5.811 5.699 5.581 5.459 5.328 5.16 4.943 4.236 -7 ,4628 ,KEBNE ,16652338,Sun Nov 21 22:24:56 CET,Mon Nov 22 00:13:05 CET,0.0 0.736 0.999 1.179 1.343 1.491 1.616 1.734 1.942 2.043 2.132 2.105 2.362 2.44 2.582 2.726 2.878 2.951 3.077 3.195 3.363 3.47 3.571 3.722 3.86 3.992 4.124 4.256 4.432 4.604 4.769 4.954 5.134 5.311 5.513 5.739 5.959 6.199 6.457 6.718 6.975 7.278 7.63 7.969 8.359 8.785 9.257 9.747 10.251 10.798 11.265 11.341 11.187 10.902 10.618 10.371 10.127 9.878 9.643 9.392 9.171 8.961 8.756 8.559 8.375 8.22 8.045 7.886 7.748 7.585 7.414 7.274 7.131 6.995 6.887 6.764 6.634 6.5 6.363 6.272 6.179 6.03 5.92 5.811 5.759 5.651 5.535 5.4 5.329 5.079 5.087 5.007 4.923 4.761 4.671 4.562 4.446 4.317 4.144 3.928 3.021 -9 ,32000 ,KEBNE ,16652340,Sun Nov 21 22:25:58 CET,Mon Nov 22 00:14:49 CET,0.0 0.793 1.041 1.193 1.337 1.478 1.595 1.695 1.881 1.971 2.06 2.035 2.28 2.356 2.51 2.648 2.778 2.84 2.957 3.069 3.221 3.318 3.419 3.567 3.702 3.825 3.947 4.078 4.248 4.402 4.547 4.726 4.91 5.09 5.298 5.521 5.722 5.949 6.208 6.477 6.746 7.03 7.369 7.723 8.122 8.555 9.04 9.563 10.099 10.621 11.113 11.28 11.198 11.026 10.815 10.562 10.297 10.053 9.848 9.63 9.443 9.268 9.079 8.895 8.717 8.563 8.403 8.242 8.099 7.958 7.801 7.649 7.49 7.337 7.224 7.11 6.984 6.846 6.706 6.611 6.507 6.356 6.249 6.136 6.086 5.983 5.877 5.768 5.705 5.467 5.496 5.41 5.314 5.122 5.016 4.883 4.742 4.603 4.435 4.176 3.229 -10 ,26426 ,KEBNE ,16652341,Sun Nov 21 22:25:59 CET,Mon Nov 22 00:13:51 CET,0.0 0.795 1.004 1.163 1.301 1.425 1.535 1.636 1.823 1.918 2.013 2.015 2.275 2.362 2.528 2.664 2.788 2.851 2.97 3.076 3.229 3.332 3.433 3.575 3.706 3.827 3.945 4.067 4.224 4.371 4.517 4.695 4.872 5.048 5.242 5.447 5.639 5.852 6.081 6.331 6.594 6.894 7.257 7.611 7.997 8.409 8.862 9.346 9.885 10.403 10.829 10.973 10.901 10.719 10.48 10.208 9.941 9.698 9.503 9.3 9.105 8.927 8.763 8.599 8.417 8.251 8.085 7.935 7.804 7.662 7.506 7.362 7.21 7.057 6.937 6.811 6.684 6.557 6.424 6.325 6.217 6.055 5.949 5.842 5.779 5.635 5.499 5.357 5.28 5.027 5.046 4.966 4.87 4.635 4.512 4.386 4.242 4.062 3.859 3.618 2.78 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt deleted file mode 100644 index ab8ce7ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7878 ,KEBNE ,16652342,Sun Nov 21 22:26:00 CET,Mon Nov 22 00:08:39 CET,0.0 0.868 1.158 1.369 1.533 1.681 1.826 1.95 2.169 2.263 2.348 2.314 2.588 2.662 2.817 2.971 3.1 3.166 3.302 3.428 3.605 3.722 3.832 3.991 4.138 4.271 4.397 4.526 4.697 4.845 4.993 5.177 5.346 5.51 5.705 5.92 6.119 6.337 6.573 6.812 7.057 7.321 7.616 7.889 8.194 8.556 8.949 9.285 9.534 9.628 9.443 8.846 8.034 7.208 6.464 5.798 5.203 4.612 4.066 3.516 3.064 2.63 2.181 1.768 1.374 1.012 0.657 0.328 0.019 -0.299 -0.623 -0.896 -1.175 -1.48 -1.707 -1.927 -2.163 -2.397 -2.648 -2.831 -3.021 -3.326 -3.528 -3.735 -3.849 -4.092 -4.355 -4.621 -4.762 -5.112 -5.228 -5.413 -5.601 -5.991 -6.212 -6.45 -6.731 -7.053 -7.412 -7.9 -9.78 -2 ,14140 ,KEBNE ,16652343,Sun Nov 21 22:26:03 CET,Mon Nov 22 00:05:43 CET,0.0 0.556 0.833 1.046 1.201 1.34 1.45 1.552 1.763 1.864 1.955 1.936 2.214 2.299 2.463 2.62 2.778 2.847 2.981 3.113 3.289 3.396 3.515 3.699 3.865 4.015 4.161 4.303 4.482 4.656 4.823 5.013 5.196 5.372 5.559 5.769 5.986 6.234 6.483 6.739 7.004 7.288 7.588 7.854 8.156 8.473 8.773 9.041 9.31 9.416 9.13 8.469 7.665 6.828 5.963 5.159 4.512 3.896 3.314 2.711 2.183 1.71 1.25 0.824 0.445 0.085 -0.289 -0.606 -0.893 -1.188 -1.506 -1.778 -2.053 -2.341 -2.57 -2.818 -3.085 -3.368 -3.659 -3.845 -4.043 -4.357 -4.575 -4.802 -4.917 -5.156 -5.388 -5.608 -5.73 -6.066 -6.168 -6.329 -6.502 -6.903 -7.14 -7.393 -7.665 -8.005 -8.405 -8.891 -10.09 -4 ,13005 ,KEBNE ,16652345,Sun Nov 21 22:27:00 CET,Mon Nov 22 00:10:50 CET,0.0 0.685 0.954 1.146 1.31 1.47 1.612 1.737 1.941 2.034 2.125 2.092 2.358 2.431 2.589 2.737 2.864 2.921 3.04 3.161 3.338 3.447 3.544 3.688 3.838 3.981 4.112 4.251 4.426 4.577 4.726 4.908 5.069 5.218 5.406 5.626 5.83 6.052 6.281 6.52 6.78 7.071 7.398 7.724 8.061 8.385 8.719 8.992 9.237 9.374 9.202 8.567 7.832 7.1 6.383 5.705 5.053 4.442 3.935 3.412 2.953 2.537 2.141 1.777 1.414 1.067 0.714 0.389 0.098 -0.231 -0.571 -0.839 -1.116 -1.389 -1.623 -1.89 -2.147 -2.419 -2.707 -2.895 -3.078 -3.349 -3.544 -3.759 -3.874 -4.104 -4.332 -4.594 -4.732 -5.066 -5.159 -5.322 -5.51 -5.937 -6.159 -6.386 -6.633 -6.94 -7.37 -7.939 -9.608 -5 ,9617 ,KEBNE ,16652346,Sun Nov 21 22:27:00 CET,Mon Nov 22 00:11:21 CET,0.0 0.74 0.986 1.159 1.309 1.447 1.571 1.682 1.892 1.98 2.059 2.026 2.296 2.371 2.522 2.66 2.779 2.832 2.94 3.054 3.223 3.328 3.429 3.581 3.735 3.881 4.027 4.157 4.319 4.485 4.628 4.797 4.956 5.109 5.278 5.471 5.672 5.901 6.145 6.392 6.639 6.925 7.264 7.546 7.813 8.111 8.422 8.732 9.056 9.24 8.962 8.148 7.355 6.621 5.886 5.19 4.552 3.936 3.398 2.848 2.374 1.942 1.493 1.051 0.658 0.287 -0.102 -0.434 -0.733 -1.052 -1.395 -1.664 -1.948 -2.247 -2.466 -2.689 -2.915 -3.168 -3.438 -3.625 -3.825 -4.126 -4.337 -4.571 -4.692 -4.944 -5.201 -5.477 -5.616 -5.955 -6.069 -6.22 -6.376 -6.754 -6.967 -7.221 -7.5 -7.789 -8.13 -8.624 -10.82 -6 ,578 ,KEBNE ,16652347,Sun Nov 21 22:27:00 CET,Mon Nov 22 00:11:21 CET,0.0 0.683 0.919 1.115 1.282 1.438 1.572 1.68 1.888 1.985 2.078 2.06 2.334 2.412 2.56 2.702 2.842 2.908 3.03 3.147 3.328 3.444 3.55 3.699 3.842 3.982 4.112 4.236 4.406 4.567 4.715 4.886 5.047 5.218 5.424 5.639 5.836 6.058 6.313 6.565 6.812 7.088 7.401 7.713 8.034 8.356 8.675 9.019 9.367 9.497 9.352 8.756 7.985 7.239 6.486 5.781 5.147 4.511 3.923 3.333 2.826 2.386 1.947 1.521 1.135 0.766 0.389 0.067 -0.223 -0.535 -0.86 -1.126 -1.383 -1.633 -1.835 -2.055 -2.287 -2.528 -2.799 -3.0 -3.204 -3.524 -3.746 -3.979 -4.101 -4.341 -4.585 -4.845 -4.989 -5.327 -5.395 -5.548 -5.728 -6.111 -6.338 -6.596 -6.862 -7.166 -7.538 -8.082 -10.005 -8 ,3859 ,KEBNE ,16652349,Sun Nov 21 22:27:00 CET,Mon Nov 22 00:11:23 CET,0.0 0.676 0.905 1.082 1.23 1.357 1.482 1.607 1.836 1.934 2.034 2.032 2.319 2.403 2.555 2.695 2.838 2.913 3.05 3.178 3.349 3.452 3.55 3.704 3.852 3.981 4.118 4.264 4.446 4.617 4.775 4.979 5.173 5.352 5.555 5.777 5.992 6.205 6.427 6.661 6.892 7.159 7.471 7.777 8.097 8.437 8.78 9.075 9.296 9.416 9.237 8.558 7.874 7.076 6.258 5.535 4.846 4.168 3.61 3.054 2.54 2.073 1.633 1.218 0.814 0.466 0.106 -0.231 -0.519 -0.816 -1.124 -1.383 -1.683 -2.009 -2.258 -2.513 -2.772 -3.041 -3.323 -3.525 -3.748 -4.097 -4.325 -4.563 -4.687 -4.932 -5.194 -5.469 -5.606 -5.952 -6.065 -6.228 -6.408 -6.829 -7.067 -7.325 -7.601 -7.936 -8.391 -8.913 -10.457 -9 ,20 ,KEBNE ,16652350,Sun Nov 21 22:27:00 CET,Mon Nov 22 00:11:00 CET,0.0 0.564 0.813 1.009 1.152 1.3 1.447 1.569 1.793 1.9 1.997 1.98 2.268 2.353 2.503 2.649 2.788 2.85 2.976 3.102 3.277 3.387 3.499 3.653 3.794 3.933 4.058 4.191 4.367 4.521 4.667 4.842 5.027 5.211 5.402 5.609 5.807 6.017 6.243 6.484 6.746 7.024 7.324 7.623 7.919 8.215 8.569 8.931 9.223 9.348 9.087 8.396 7.572 6.713 5.903 5.17 4.499 3.89 3.392 2.882 2.426 1.997 1.578 1.204 0.845 0.501 0.13 -0.226 -0.531 -0.884 -1.258 -1.519 -1.797 -2.091 -2.317 -2.571 -2.816 -3.066 -3.352 -3.551 -3.754 -4.056 -4.276 -4.535 -4.674 -4.958 -5.235 -5.528 -5.697 -6.063 -6.182 -6.359 -6.552 -7.007 -7.234 -7.462 -7.77 -8.131 -8.541 -9.065 -10.788 -10 ,2491 ,KEBNE ,16652351,Sun Nov 21 22:27:00 CET,Mon Nov 22 00:11:46 CET,0.0 0.469 0.7 0.896 1.063 1.207 1.327 1.437 1.652 1.751 1.843 1.831 2.108 2.181 2.332 2.474 2.612 2.68 2.811 2.925 3.084 3.198 3.305 3.451 3.587 3.722 3.858 3.982 4.146 4.322 4.478 4.653 4.831 5.003 5.197 5.42 5.635 5.872 6.124 6.384 6.631 6.869 7.179 7.531 7.875 8.194 8.563 8.95 9.31 9.487 9.252 8.566 7.765 6.958 6.148 5.394 4.746 4.138 3.597 3.064 2.585 2.137 1.7 1.268 0.852 0.476 0.074 -0.29 -0.586 -0.882 -1.185 -1.436 -1.709 -2.014 -2.245 -2.484 -2.723 -2.965 -3.23 -3.425 -3.633 -3.949 -4.186 -4.445 -4.569 -4.812 -5.071 -5.339 -5.489 -5.852 -5.997 -6.183 -6.382 -6.83 -7.058 -7.304 -7.598 -7.942 -8.353 -8.887 -10.617 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 25eb400c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15383 ,KEBNE ,16652352,Sun Nov 21 22:27:00 CET,Mon Nov 22 00:11:26 CET,0.0 1.633 2.054 2.304 2.49 2.659 2.826 2.986 3.252 3.369 3.487 3.519 3.824 3.938 4.139 4.316 4.48 4.56 4.724 4.88 5.11 5.258 5.393 5.592 5.79 5.991 6.19 6.377 6.624 6.863 7.082 7.353 7.623 7.892 8.196 8.522 8.832 9.18 9.553 9.941 10.4 10.937 11.515 12.123 12.834 13.634 14.595 15.627 16.779 18.109 19.538 20.421 20.772 20.885 20.85 20.741 20.586 20.39 20.166 19.88 19.607 19.342 19.078 18.84 18.613 18.379 18.152 17.951 17.757 17.558 17.342 17.154 16.956 16.74 16.558 16.352 16.132 15.922 15.713 15.569 15.414 15.137 14.954 14.794 14.703 14.484 14.24 13.953 13.803 13.495 13.36 13.18 12.981 12.545 12.305 12.036 11.731 11.324 10.868 10.299 7.964 -2 ,26531 ,KEBNE ,16652353,Sun Nov 21 22:27:00 CET,Mon Nov 22 00:11:49 CET,0.0 0.953 1.237 1.463 1.662 1.86 2.051 2.213 2.5 2.629 2.746 2.756 3.05 3.152 3.371 3.595 3.806 3.893 4.048 4.208 4.447 4.602 4.749 4.962 5.165 5.365 5.561 5.748 5.99 6.222 6.451 6.724 6.98 7.228 7.514 7.854 8.197 8.572 8.964 9.359 9.79 10.294 10.863 11.452 12.159 12.938 13.842 14.868 16.092 17.492 19.014 20.107 20.572 20.735 20.693 20.57 20.454 20.284 20.07 19.839 19.61 19.375 19.167 18.944 18.692 18.461 18.223 18.017 17.846 17.649 17.417 17.215 17.0 16.783 16.605 16.426 16.246 16.051 15.824 15.668 15.525 15.28 15.104 14.926 14.831 14.614 14.399 14.195 14.092 13.806 13.695 13.515 13.327 12.931 12.703 12.463 12.175 11.848 11.471 10.936 8.536 -3 ,3145 ,KEBNE ,16652354,Sun Nov 21 22:27:00 CET,Mon Nov 22 00:11:32 CET,0.0 1.198 1.581 1.911 2.187 2.374 2.551 2.717 3.006 3.156 3.303 3.388 3.708 3.819 4.036 4.247 4.444 4.542 4.741 4.921 5.161 5.32 5.473 5.69 5.901 6.109 6.303 6.484 6.728 6.971 7.199 7.475 7.756 8.024 8.327 8.66 9.013 9.435 9.884 10.371 10.874 11.391 11.974 12.559 13.252 14.033 14.89 15.852 16.967 18.21 19.624 20.649 21.064 21.149 21.099 20.965 20.768 20.54 20.299 20.06 19.823 19.599 19.396 19.174 18.92 18.681 18.439 18.224 18.036 17.838 17.633 17.46 17.278 17.073 16.906 16.729 16.534 16.32 16.104 15.963 15.808 15.552 15.375 15.19 15.092 14.876 14.62 14.36 14.232 13.909 13.737 13.565 13.375 12.945 12.714 12.448 12.078 11.619 11.122 10.482 7.828 -4 ,1625 ,KEBNE ,16652355,Sun Nov 21 22:27:00 CET,Mon Nov 22 00:11:37 CET,0.0 1.099 1.484 1.828 2.106 2.305 2.456 2.593 2.844 2.972 3.114 3.163 3.461 3.573 3.782 3.991 4.2 4.305 4.497 4.666 4.919 5.101 5.272 5.497 5.717 5.937 6.139 6.328 6.576 6.82 7.062 7.361 7.65 7.923 8.239 8.6 8.935 9.295 9.706 10.153 10.62 11.154 11.781 12.418 13.136 13.898 14.817 15.894 17.11 18.383 19.761 20.743 21.097 21.168 21.102 20.951 20.749 20.52 20.246 19.898 19.603 19.34 19.102 18.864 18.617 18.387 18.143 17.921 17.716 17.505 17.291 17.101 16.87 16.629 16.46 16.274 16.082 15.875 15.655 15.51 15.352 15.107 14.94 14.757 14.661 14.46 14.232 13.97 13.832 13.522 13.399 13.21 13.019 12.598 12.348 12.089 11.784 11.448 11.02 10.443 7.348 -5 ,8139 ,KEBNE ,16652356,Sun Nov 21 22:28:03 CET,Mon Nov 22 00:13:05 CET,0.0 0.898 1.272 1.579 1.815 2.008 2.206 2.376 2.657 2.782 2.918 3.013 3.324 3.429 3.655 3.889 4.116 4.222 4.433 4.626 4.889 5.051 5.208 5.446 5.665 5.873 6.07 6.275 6.576 6.869 7.139 7.45 7.734 8.008 8.311 8.638 8.968 9.332 9.718 10.131 10.58 11.098 11.691 12.289 12.987 13.756 14.625 15.605 16.747 18.076 19.655 20.81 21.213 21.279 21.16 20.884 20.592 20.34 20.117 19.881 19.649 19.375 19.107 18.88 18.64 18.411 18.187 17.985 17.784 17.555 17.346 17.154 16.933 16.724 16.569 16.411 16.244 16.06 15.849 15.702 15.55 15.297 15.114 14.91 14.799 14.581 14.346 14.085 13.953 13.645 13.515 13.347 13.175 12.763 12.546 12.294 12.002 11.646 11.208 10.633 8.426 -6 ,2670 ,KEBNE ,16652357,Sun Nov 21 22:28:02 CET,Mon Nov 22 00:12:45 CET,0.0 1.051 1.389 1.624 1.812 1.987 2.155 2.307 2.602 2.741 2.876 2.947 3.254 3.354 3.573 3.797 3.998 4.085 4.253 4.417 4.656 4.805 4.953 5.181 5.4 5.603 5.798 5.988 6.242 6.489 6.719 6.996 7.248 7.491 7.798 8.164 8.51 8.884 9.287 9.721 10.173 10.661 11.243 11.838 12.517 13.274 14.146 15.153 16.351 17.669 19.117 20.226 20.741 20.94 20.957 20.787 20.586 20.378 20.169 19.949 19.725 19.503 19.265 19.032 18.815 18.609 18.396 18.194 18.0 17.793 17.565 17.368 17.176 16.985 16.825 16.659 16.473 16.256 16.023 15.866 15.711 15.47 15.291 15.087 14.985 14.798 14.592 14.366 14.238 13.917 13.778 13.58 13.362 12.943 12.702 12.426 12.13 11.796 11.378 10.691 8.362 -7 ,861 ,KEBNE ,16652358,Sun Nov 21 22:28:03 CET,Mon Nov 22 00:12:49 CET,0.0 1.402 1.758 2.03 2.262 2.491 2.681 2.85 3.194 3.363 3.502 3.544 3.849 3.954 4.149 4.324 4.506 4.601 4.778 4.945 5.174 5.316 5.456 5.672 5.889 6.108 6.325 6.522 6.776 7.03 7.259 7.522 7.779 8.04 8.338 8.654 8.984 9.348 9.725 10.14 10.585 11.081 11.671 12.29 13.005 13.776 14.673 15.69 16.755 17.893 19.234 20.064 20.398 20.585 20.533 20.343 20.132 19.902 19.675 19.403 19.156 18.934 18.698 18.442 18.195 17.964 17.69 17.444 17.238 17.015 16.775 16.57 16.362 16.14 15.962 15.767 15.546 15.323 15.072 14.895 14.731 14.479 14.305 14.13 14.037 13.842 13.62 13.383 13.25 12.937 12.806 12.629 12.46 12.101 11.891 11.625 11.334 11.029 10.615 10.046 7.379 -8 ,11381 ,KEBNE ,16652359,Sun Nov 21 22:28:06 CET,Mon Nov 22 00:11:41 CET,0.0 0.875 1.159 1.422 1.644 1.838 2.004 2.15 2.433 2.551 2.664 2.703 3.025 3.144 3.339 3.524 3.706 3.802 3.985 4.152 4.403 4.572 4.728 4.947 5.163 5.374 5.603 5.844 6.153 6.441 6.705 7.014 7.317 7.595 7.895 8.234 8.572 8.933 9.307 9.716 10.142 10.618 11.189 11.78 12.483 13.282 14.188 15.246 16.472 17.809 19.183 20.123 20.615 20.806 20.746 20.581 20.406 20.215 20.038 19.805 19.585 19.376 19.143 18.92 18.676 18.43 18.199 17.989 17.784 17.562 17.326 17.111 16.876 16.662 16.504 16.319 16.109 15.909 15.709 15.53 15.334 15.064 14.877 14.666 14.555 14.331 14.109 13.865 13.734 13.412 13.269 13.093 12.909 12.482 12.23 11.946 11.619 11.271 10.847 10.242 8.48 -10 ,21490 ,KEBNE ,16652361,Sun Nov 21 22:28:03 CET,Mon Nov 22 00:12:25 CET,0.0 0.724 1.058 1.3 1.528 1.765 1.957 2.106 2.355 2.473 2.597 2.627 2.918 3.025 3.243 3.438 3.615 3.705 3.873 4.034 4.267 4.417 4.563 4.784 4.992 5.188 5.385 5.585 5.85 6.106 6.352 6.655 6.949 7.213 7.512 7.879 8.252 8.655 9.076 9.522 9.995 10.515 11.119 11.731 12.445 13.24 14.145 15.2 16.444 17.795 19.239 20.217 20.502 20.507 20.425 20.31 20.179 19.979 19.747 19.486 19.215 18.974 18.739 18.481 18.233 18.017 17.775 17.558 17.377 17.174 16.952 16.765 16.574 16.34 16.137 15.934 15.743 15.536 15.296 15.141 14.988 14.725 14.522 14.304 14.19 13.948 13.693 13.425 13.28 12.945 12.813 12.662 12.489 12.068 11.829 11.56 11.221 10.8 10.329 9.685 6.812 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 58c51710..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,846 ,KEBNE ,16652362,Sun Nov 21 22:28:03 CET,Mon Nov 22 00:17:15 CET,0.0 0.809 1.062 1.235 1.36 1.503 1.643 1.754 1.96 2.048 2.133 2.127 2.379 2.45 2.584 2.709 2.832 2.889 2.992 3.085 3.228 3.324 3.419 3.548 3.665 3.78 3.896 4.013 4.15 4.275 4.4 4.564 4.717 4.856 5.017 5.203 5.384 5.567 5.759 5.971 6.197 6.44 6.713 6.97 7.253 7.545 7.866 8.202 8.515 8.776 8.878 8.721 8.382 7.979 7.588 7.216 6.86 6.493 6.211 5.97 5.745 5.544 5.34 5.118 4.916 4.736 4.532 4.351 4.201 4.039 3.862 3.719 3.576 3.432 3.322 3.209 3.076 2.943 2.817 2.719 2.618 2.466 2.35 2.231 2.172 2.048 1.92 1.78 1.707 1.46 1.472 1.382 1.292 1.118 1.011 0.882 0.741 0.584 0.394 0.131 -0.634 -2 ,11363 ,KEBNE ,16652363,Sun Nov 21 22:28:02 CET,Mon Nov 22 00:16:30 CET,0.0 0.488 0.708 0.884 1.045 1.189 1.307 1.407 1.61 1.705 1.787 1.772 2.023 2.098 2.229 2.353 2.461 2.512 2.62 2.723 2.871 2.971 3.068 3.202 3.326 3.444 3.562 3.682 3.829 3.969 4.106 4.262 4.407 4.55 4.722 4.907 5.079 5.268 5.467 5.67 5.881 6.123 6.397 6.66 6.934 7.227 7.553 7.865 8.159 8.408 8.522 8.323 7.965 7.578 7.227 6.875 6.554 6.259 5.978 5.675 5.414 5.177 4.935 4.699 4.46 4.24 4.027 3.826 3.644 3.466 3.286 3.141 2.991 2.825 2.702 2.578 2.442 2.296 2.144 2.038 1.931 1.773 1.663 1.542 1.479 1.357 1.223 1.084 1.016 0.77 0.791 0.699 0.594 0.378 0.253 0.114 -0.03 -0.189 -0.376 -0.627 -2.618 -3 ,15724 ,KEBNE ,16652364,Sun Nov 21 22:28:02 CET,Mon Nov 22 00:16:31 CET,0.0 0.702 0.932 1.1 1.237 1.355 1.46 1.566 1.752 1.84 1.929 1.917 2.169 2.245 2.385 2.507 2.623 2.678 2.782 2.887 3.039 3.132 3.221 3.355 3.478 3.595 3.702 3.811 3.953 4.088 4.225 4.385 4.53 4.671 4.846 5.049 5.239 5.438 5.636 5.846 6.068 6.302 6.561 6.819 7.1 7.368 7.652 7.965 8.286 8.536 8.571 8.279 7.897 7.487 7.122 6.791 6.471 6.18 5.919 5.643 5.385 5.143 4.922 4.705 4.508 4.332 4.135 3.944 3.777 3.621 3.461 3.321 3.179 3.037 2.928 2.808 2.652 2.487 2.34 2.241 2.141 1.986 1.871 1.752 1.697 1.582 1.445 1.305 1.238 0.993 1.013 0.933 0.846 0.644 0.539 0.427 0.273 0.088 -0.128 -0.389 -1.111 -4 ,15856 ,KEBNE ,16652365,Sun Nov 21 22:28:03 CET,Mon Nov 22 00:16:35 CET,0.0 0.907 1.215 1.386 1.536 1.686 1.813 1.93 2.141 2.233 2.321 2.312 2.563 2.633 2.777 2.913 3.037 3.1 3.223 3.333 3.502 3.617 3.723 3.867 4.009 4.147 4.273 4.388 4.538 4.683 4.822 4.997 5.165 5.319 5.488 5.685 5.874 6.072 6.288 6.515 6.748 7.008 7.331 7.645 7.985 8.337 8.722 9.157 9.554 9.897 10.16 10.036 9.745 9.36 8.977 8.623 8.274 7.925 7.614 7.292 7.011 6.777 6.552 6.332 6.117 5.929 5.729 5.54 5.376 5.189 4.999 4.848 4.693 4.538 4.415 4.283 4.153 4.021 3.891 3.801 3.694 3.52 3.407 3.297 3.233 3.098 2.965 2.817 2.74 2.48 2.48 2.397 2.309 2.116 1.994 1.868 1.73 1.562 1.359 1.101 0.195 -5 ,28738 ,KEBNE ,16652366,Sun Nov 21 22:28:03 CET,Mon Nov 22 00:16:12 CET,0.0 0.909 1.177 1.351 1.491 1.623 1.735 1.829 1.997 2.08 2.159 2.134 2.379 2.446 2.561 2.677 2.798 2.858 2.965 3.06 3.205 3.302 3.392 3.521 3.653 3.778 3.893 4.006 4.149 4.286 4.412 4.557 4.697 4.833 4.986 5.161 5.333 5.513 5.717 5.933 6.154 6.407 6.675 6.923 7.208 7.507 7.825 8.175 8.547 8.878 9.048 8.922 8.664 8.343 7.987 7.631 7.29 6.969 6.695 6.407 6.143 5.913 5.704 5.518 5.335 5.159 4.98 4.815 4.671 4.527 4.379 4.243 4.096 3.952 3.841 3.722 3.601 3.467 3.319 3.218 3.113 2.94 2.814 2.688 2.624 2.485 2.358 2.24 2.169 1.919 1.922 1.828 1.739 1.537 1.416 1.281 1.135 0.977 0.793 0.535 -0.318 -6 ,6116 ,KEBNE ,16652367,Sun Nov 21 22:28:03 CET,Mon Nov 22 00:16:48 CET,0.0 0.622 0.82 0.982 1.128 1.256 1.364 1.456 1.626 1.705 1.779 1.739 1.976 2.04 2.165 2.282 2.389 2.446 2.565 2.674 2.817 2.905 2.991 3.121 3.248 3.366 3.471 3.581 3.734 3.866 3.987 4.134 4.273 4.415 4.583 4.762 4.937 5.133 5.331 5.53 5.745 5.988 6.263 6.521 6.814 7.127 7.451 7.794 8.172 8.466 8.583 8.369 8.048 7.737 7.411 7.054 6.727 6.432 6.16 5.864 5.611 5.376 5.144 4.934 4.731 4.542 4.358 4.198 4.052 3.896 3.737 3.607 3.456 3.299 3.18 3.058 2.934 2.788 2.635 2.532 2.423 2.251 2.138 2.024 1.96 1.816 1.678 1.542 1.467 1.222 1.232 1.138 1.05 0.858 0.75 0.625 0.47 0.298 0.11 -0.175 -1.085 -8 ,2291 ,KEBNE ,16652369,Sun Nov 21 22:28:03 CET,Mon Nov 22 00:16:11 CET,0.0 0.841 1.104 1.288 1.455 1.599 1.715 1.813 1.97 2.049 2.121 2.086 2.329 2.396 2.531 2.658 2.77 2.826 2.938 3.043 3.192 3.284 3.375 3.511 3.646 3.772 3.875 3.969 4.098 4.225 4.364 4.525 4.675 4.826 4.994 5.18 5.354 5.539 5.731 5.937 6.155 6.39 6.658 6.925 7.216 7.516 7.83 8.139 8.436 8.662 8.686 8.39 8.005 7.644 7.282 6.908 6.545 6.179 5.873 5.583 5.337 5.124 4.919 4.717 4.521 4.341 4.155 3.998 3.858 3.713 3.559 3.415 3.27 3.115 2.994 2.883 2.763 2.628 2.486 2.392 2.286 2.113 2.001 1.888 1.833 1.715 1.585 1.442 1.365 1.114 1.127 1.04 0.942 0.738 0.631 0.509 0.375 0.222 0.005 -0.345 -1.272 -9 ,2349 ,KEBNE ,16652370,Sun Nov 21 22:28:03 CET,Mon Nov 22 00:16:41 CET,0.0 0.8 0.99 1.129 1.248 1.367 1.481 1.587 1.799 1.894 1.977 1.97 2.214 2.281 2.405 2.523 2.637 2.692 2.8 2.901 3.048 3.15 3.248 3.39 3.52 3.641 3.756 3.867 4.011 4.151 4.296 4.468 4.624 4.778 4.955 5.144 5.331 5.53 5.729 5.944 6.172 6.413 6.684 6.963 7.302 7.673 8.041 8.41 8.759 9.048 9.221 9.07 8.717 8.338 7.983 7.636 7.298 6.962 6.661 6.376 6.129 5.902 5.682 5.465 5.266 5.078 4.882 4.707 4.554 4.405 4.244 4.095 3.943 3.795 3.681 3.57 3.455 3.331 3.197 3.097 2.994 2.844 2.732 2.599 2.534 2.4 2.254 2.11 2.036 1.788 1.799 1.715 1.628 1.41 1.292 1.164 1.016 0.845 0.631 0.355 -0.481 -10 ,28282 ,KEBNE ,16652371,Sun Nov 21 22:29:05 CET,Mon Nov 22 00:17:23 CET,0.0 0.877 1.131 1.304 1.46 1.588 1.694 1.795 1.966 2.052 2.139 2.129 2.375 2.441 2.565 2.691 2.819 2.873 2.97 3.074 3.224 3.317 3.419 3.555 3.679 3.801 3.915 4.027 4.177 4.314 4.444 4.602 4.746 4.884 5.035 5.206 5.374 5.551 5.745 5.962 6.178 6.414 6.678 6.921 7.193 7.509 7.842 8.168 8.501 8.819 8.985 8.772 8.409 8.032 7.679 7.33 6.99 6.695 6.44 6.162 5.923 5.701 5.487 5.284 5.085 4.9 4.709 4.535 4.386 4.228 4.057 3.911 3.755 3.594 3.478 3.365 3.253 3.126 2.97 2.868 2.772 2.614 2.492 2.369 2.31 2.172 2.012 1.862 1.785 1.529 1.553 1.464 1.365 1.187 1.092 0.965 0.819 0.678 0.501 0.251 -0.386 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 00119565..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21908 ,TETRA ,17982032,Tue Dec 21 08:28:37 CET,Tue Dec 21 10:44:37 CET,0.0 0.439 0.626 0.772 0.921 1.068 1.193 1.307 1.527 1.627 1.723 1.695 1.994 2.086 2.256 2.423 2.584 2.66 2.814 2.965 3.188 3.334 3.483 3.71 3.928 4.126 4.316 4.501 4.748 4.993 5.228 5.52 5.802 6.075 6.387 6.747 7.109 7.497 7.923 8.386 8.879 9.432 10.068 10.716 11.482 12.358 13.372 14.581 16.088 17.955 20.161 21.902 22.904 23.457 23.776 23.998 24.082 24.066 24.052 24.003 23.924 23.841 23.744 23.632 23.503 23.383 23.249 23.119 23.016 22.908 22.762 22.606 22.436 22.281 22.167 22.044 21.917 21.767 21.596 21.47 21.328 21.089 20.936 20.799 20.726 20.544 20.343 20.155 20.054 19.767 19.671 19.495 19.312 18.896 18.637 18.387 18.139 17.813 17.331 16.678 14.117 -2 ,15445 ,TETRA ,17982033,Tue Dec 21 08:28:35 CET,Tue Dec 21 10:44:22 CET,0.0 0.471 0.657 0.808 0.947 1.075 1.197 1.319 1.534 1.626 1.718 1.686 1.975 2.06 2.23 2.396 2.557 2.634 2.778 2.92 3.126 3.261 3.396 3.596 3.787 3.968 4.149 4.33 4.577 4.818 5.054 5.34 5.614 5.881 6.18 6.519 6.866 7.265 7.694 8.153 8.623 9.158 9.807 10.508 11.349 12.271 13.35 14.567 16.005 17.697 19.657 21.153 21.912 22.291 22.492 22.644 22.747 22.782 22.751 22.662 22.579 22.502 22.404 22.275 22.133 21.994 21.796 21.609 21.454 21.293 21.133 20.992 20.84 20.678 20.544 20.397 20.231 20.049 19.866 19.743 19.604 19.35 19.18 19.034 18.967 18.812 18.612 18.406 18.289 17.985 17.935 17.814 17.659 17.278 17.066 16.769 16.418 16.054 15.614 14.905 11.167 -3 ,27546 ,TETRA ,17982034,Tue Dec 21 08:28:35 CET,Tue Dec 21 10:44:51 CET,0.0 0.436 0.645 0.817 0.984 1.122 1.245 1.364 1.587 1.692 1.791 1.783 2.075 2.165 2.347 2.527 2.695 2.779 2.947 3.103 3.326 3.473 3.616 3.812 3.998 4.184 4.36 4.535 4.768 4.998 5.219 5.49 5.763 6.034 6.356 6.726 7.085 7.462 7.88 8.361 8.854 9.397 10.073 10.778 11.612 12.542 13.586 14.801 16.262 17.949 19.911 21.371 22.16 22.559 22.724 22.798 22.813 22.783 22.728 22.651 22.573 22.501 22.417 22.307 22.191 22.081 21.943 21.824 21.708 21.562 21.391 21.238 21.089 20.934 20.811 20.68 20.516 20.339 20.184 20.081 19.949 19.724 19.573 19.4 19.307 19.133 18.929 18.652 18.499 18.165 18.057 17.917 17.76 17.419 17.189 16.872 16.496 16.096 15.594 14.835 12.527 -4 ,17261 ,TETRA ,17982035,Tue Dec 21 08:28:35 CET,Tue Dec 21 10:43:33 CET,0.0 0.568 0.801 0.969 1.13 1.284 1.414 1.527 1.736 1.843 1.946 1.926 2.23 2.327 2.491 2.66 2.826 2.911 3.081 3.237 3.455 3.596 3.742 3.962 4.166 4.36 4.547 4.734 4.982 5.227 5.464 5.752 6.038 6.317 6.63 6.974 7.31 7.695 8.123 8.577 9.066 9.629 10.277 10.957 11.778 12.692 13.765 15.015 16.478 18.193 20.222 21.66 22.409 22.845 23.08 23.155 23.125 23.046 22.959 22.881 22.799 22.707 22.6 22.475 22.331 22.192 22.061 21.916 21.772 21.625 21.454 21.315 21.165 20.968 20.803 20.66 20.528 20.384 20.226 20.097 19.961 19.75 19.586 19.425 19.343 19.153 18.96 18.761 18.654 18.376 18.299 18.163 18.034 17.641 17.398 17.17 16.851 16.446 15.935 15.117 12.076 -5 ,17782 ,TETRA ,17982036,Tue Dec 21 08:28:38 CET,Tue Dec 21 10:43:11 CET,0.0 0.639 0.841 0.989 1.125 1.249 1.366 1.48 1.692 1.793 1.891 1.869 2.164 2.254 2.424 2.581 2.733 2.811 2.958 3.098 3.316 3.456 3.596 3.808 4.002 4.184 4.362 4.541 4.777 5.005 5.236 5.523 5.8 6.069 6.387 6.741 7.087 7.481 7.908 8.374 8.873 9.464 10.181 10.882 11.68 12.565 13.658 14.903 16.33 17.99 19.9 21.473 22.257 22.614 22.82 22.942 22.988 22.947 22.86 22.776 22.696 22.585 22.443 22.309 22.191 22.071 21.936 21.813 21.701 21.569 21.425 21.3 21.162 21.02 20.914 20.794 20.664 20.533 20.387 20.279 20.17 19.981 19.829 19.678 19.595 19.388 19.173 18.973 18.858 18.565 18.5 18.374 18.247 17.935 17.733 17.484 17.069 16.605 16.205 15.636 11.899 -6 ,15768 ,TETRA ,17982037,Tue Dec 21 08:28:35 CET,Tue Dec 21 10:45:57 CET,0.0 0.518 0.707 0.859 1.008 1.141 1.267 1.381 1.576 1.669 1.758 1.739 2.026 2.109 2.267 2.419 2.564 2.638 2.79 2.941 3.158 3.293 3.419 3.609 3.798 3.987 4.168 4.335 4.558 4.788 5.011 5.289 5.571 5.834 6.124 6.447 6.77 7.149 7.565 8.003 8.471 9.001 9.643 10.323 11.139 12.038 13.082 14.288 15.761 17.53 19.547 21.072 21.912 22.393 22.656 22.817 22.878 22.873 22.825 22.743 22.658 22.578 22.476 22.339 22.202 22.06 21.887 21.69 21.503 21.304 21.086 20.917 20.726 20.513 20.35 20.186 20.008 19.818 19.606 19.448 19.29 19.031 18.848 18.678 18.6 18.439 18.23 17.979 17.862 17.568 17.465 17.324 17.177 16.857 16.669 16.431 16.13 15.776 15.334 14.698 11.021 -7 ,14677 ,TETRA ,17982038,Tue Dec 21 08:28:36 CET,Tue Dec 21 10:45:23 CET,0.0 0.505 0.71 0.887 1.042 1.183 1.308 1.432 1.667 1.771 1.874 1.877 2.174 2.26 2.426 2.58 2.735 2.818 2.973 3.117 3.326 3.466 3.603 3.792 3.982 4.169 4.339 4.514 4.752 4.981 5.204 5.48 5.742 5.992 6.301 6.663 7.019 7.417 7.841 8.303 8.797 9.348 9.998 10.689 11.508 12.424 13.479 14.682 16.09 17.729 19.756 21.392 22.344 22.888 23.133 23.227 23.215 23.179 23.149 23.077 22.988 22.898 22.795 22.685 22.575 22.438 22.272 22.152 22.042 21.917 21.798 21.677 21.534 21.369 21.223 21.069 20.892 20.668 20.436 20.286 20.138 19.92 19.762 19.584 19.494 19.319 19.147 18.948 18.828 18.533 18.417 18.256 18.104 17.756 17.522 17.244 16.961 16.597 16.126 15.387 11.521 -8 ,27375 ,TETRA ,17982039,Tue Dec 21 08:28:39 CET,Tue Dec 21 10:43:44 CET,0.0 0.44 0.64 0.812 0.961 1.095 1.224 1.34 1.55 1.657 1.761 1.76 2.06 2.153 2.326 2.481 2.624 2.698 2.847 2.992 3.208 3.347 3.483 3.691 3.886 4.066 4.245 4.426 4.664 4.893 5.126 5.408 5.68 5.96 6.289 6.635 6.96 7.338 7.755 8.209 8.687 9.223 9.849 10.479 11.231 12.121 13.173 14.414 15.898 17.524 19.555 21.246 22.204 22.734 22.957 23.061 23.072 23.016 22.972 22.918 22.823 22.69 22.531 22.384 22.259 22.137 21.995 21.861 21.728 21.574 21.431 21.312 21.161 21.005 20.896 20.78 20.653 20.51 20.35 20.226 20.106 19.937 19.809 19.662 19.575 19.384 19.194 19.002 18.91 18.644 18.614 18.501 18.365 18.032 17.839 17.593 17.273 16.87 16.434 15.888 13.112 -9 ,17567 ,TETRA ,17982040,Tue Dec 21 08:28:35 CET,Tue Dec 21 10:43:04 CET,0.0 0.612 0.865 1.074 1.247 1.394 1.541 1.684 1.968 2.092 2.194 2.193 2.499 2.599 2.785 2.951 3.123 3.212 3.381 3.533 3.749 3.899 4.056 4.292 4.508 4.707 4.906 5.11 5.375 5.629 5.867 6.151 6.445 6.735 7.066 7.442 7.818 8.247 8.698 9.155 9.652 10.238 10.933 11.65 12.461 13.382 14.464 15.684 17.217 19.141 21.331 22.891 23.764 24.199 24.385 24.491 24.5 24.49 24.47 24.394 24.301 24.205 24.089 23.979 23.882 23.771 23.619 23.445 23.291 23.139 22.968 22.81 22.642 22.467 22.33 22.192 22.056 21.91 21.742 21.603 21.462 21.252 21.085 20.91 20.82 20.612 20.369 20.12 19.998 19.694 19.538 19.35 19.153 18.744 18.512 18.239 17.926 17.552 16.987 16.258 12.479 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index e3948580..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30333 ,KEBNE ,16652372,Sun Nov 21 22:29:06 CET,Mon Nov 22 00:16:25 CET,0.0 0.919 1.317 1.578 1.809 2.005 2.156 2.3 2.572 2.697 2.831 2.896 3.215 3.329 3.551 3.756 3.951 4.046 4.236 4.414 4.658 4.816 4.976 5.218 5.45 5.675 5.891 6.087 6.348 6.619 6.876 7.183 7.481 7.786 8.138 8.518 8.872 9.255 9.671 10.136 10.65 11.234 11.916 12.63 13.448 14.336 15.424 16.672 18.105 19.748 21.743 23.398 24.165 24.508 24.724 24.846 24.848 24.77 24.677 24.56 24.431 24.293 24.143 23.994 23.852 23.728 23.606 23.464 23.325 23.178 23.001 22.856 22.71 22.545 22.406 22.267 22.124 21.97 21.817 21.707 21.573 21.343 21.189 21.043 20.969 20.801 20.605 20.412 20.315 20.032 19.977 19.852 19.728 19.447 19.265 19.067 18.84 18.569 18.286 17.922 17.079 -2 ,3130 ,KEBNE ,16652373,Sun Nov 21 22:29:06 CET,Mon Nov 22 00:14:49 CET,0.0 0.736 1.052 1.289 1.509 1.699 1.86 2.038 2.375 2.521 2.654 2.683 2.994 3.102 3.316 3.516 3.701 3.786 3.97 4.163 4.428 4.596 4.758 5.003 5.233 5.446 5.658 5.878 6.174 6.446 6.7 7.003 7.299 7.598 7.965 8.377 8.76 9.174 9.623 10.111 10.634 11.214 11.928 12.649 13.453 14.32 15.337 16.549 17.932 19.552 21.429 22.919 23.731 24.117 24.305 24.393 24.417 24.393 24.316 24.204 24.088 23.993 23.898 23.776 23.643 23.515 23.374 23.246 23.139 23.015 22.865 22.735 22.609 22.479 22.374 22.267 22.161 22.06 21.949 21.873 21.789 21.636 21.532 21.42 21.358 21.216 21.069 20.923 20.837 20.563 20.517 20.369 20.212 19.869 19.662 19.444 19.21 18.973 18.717 18.338 16.948 -3 ,13968 ,KEBNE ,16652374,Sun Nov 21 22:29:06 CET,Mon Nov 22 00:15:02 CET,0.0 0.906 1.254 1.504 1.726 1.932 2.111 2.27 2.557 2.687 2.805 2.829 3.134 3.234 3.436 3.643 3.845 3.944 4.132 4.297 4.541 4.701 4.848 5.061 5.27 5.477 5.695 5.917 6.2 6.473 6.736 7.044 7.337 7.634 7.973 8.333 8.695 9.121 9.592 10.072 10.585 11.181 11.871 12.59 13.447 14.393 15.482 16.68 18.066 19.744 21.663 23.108 23.859 24.276 24.516 24.636 24.638 24.571 24.506 24.427 24.319 24.202 24.106 24.002 23.888 23.78 23.636 23.494 23.364 23.22 23.076 22.951 22.806 22.643 22.524 22.409 22.292 22.159 22.017 21.919 21.822 21.652 21.518 21.374 21.306 21.182 21.034 20.854 20.756 20.49 20.466 20.361 20.249 19.946 19.767 19.58 19.406 19.198 18.919 18.567 17.635 -4 ,2147 ,KEBNE ,16652375,Sun Nov 21 22:29:06 CET,Mon Nov 22 00:14:44 CET,0.0 0.723 1.072 1.319 1.516 1.695 1.861 2.004 2.276 2.402 2.538 2.613 2.924 3.027 3.223 3.427 3.627 3.723 3.907 4.076 4.311 4.466 4.625 4.864 5.088 5.294 5.485 5.68 5.937 6.178 6.413 6.7 6.983 7.261 7.582 7.949 8.333 8.746 9.189 9.682 10.216 10.826 11.529 12.266 13.125 14.04 15.1 16.301 17.66 19.324 21.374 22.978 23.793 24.187 24.375 24.464 24.507 24.49 24.443 24.399 24.342 24.272 24.172 24.06 23.951 23.843 23.704 23.559 23.429 23.282 23.098 22.932 22.773 22.636 22.529 22.411 22.303 22.187 22.052 21.953 21.858 21.698 21.584 21.463 21.394 21.253 21.096 20.919 20.825 20.551 20.521 20.404 20.284 20.018 19.861 19.683 19.473 19.24 18.956 18.597 17.659 -5 ,32291 ,KEBNE ,16652376,Sun Nov 21 22:29:10 CET,Mon Nov 22 00:12:05 CET,0.0 0.916 1.284 1.552 1.793 2.008 2.199 2.362 2.638 2.785 2.932 2.973 3.286 3.393 3.591 3.801 4.021 4.129 4.347 4.559 4.868 5.068 5.244 5.467 5.685 5.905 6.126 6.358 6.666 6.95 7.215 7.526 7.824 8.113 8.432 8.807 9.194 9.634 10.112 10.611 11.143 11.745 12.437 13.127 13.961 14.893 15.94 17.17 18.64 20.392 22.492 24.055 24.861 25.31 25.504 25.565 25.57 25.559 25.537 25.458 25.351 25.244 25.124 24.982 24.829 24.688 24.506 24.308 24.135 23.964 23.776 23.629 23.5 23.364 23.249 23.121 22.972 22.828 22.701 22.613 22.513 22.35 22.234 22.098 22.031 21.892 21.724 21.561 21.479 21.213 21.162 21.034 20.915 20.654 20.505 20.344 20.165 19.955 19.706 19.423 18.431 -6 ,16547 ,KEBNE ,16652377,Sun Nov 21 22:29:10 CET,Mon Nov 22 00:13:23 CET,0.0 0.738 1.087 1.342 1.555 1.746 1.926 2.086 2.366 2.498 2.622 2.671 2.984 3.09 3.299 3.487 3.671 3.766 3.949 4.117 4.365 4.527 4.679 4.907 5.124 5.327 5.535 5.745 6.017 6.283 6.535 6.86 7.174 7.462 7.798 8.183 8.578 9.019 9.471 9.941 10.442 10.991 11.64 12.325 13.154 14.119 15.263 16.503 17.902 19.609 21.643 23.175 23.984 24.421 24.623 24.721 24.712 24.62 24.528 24.439 24.336 24.22 24.111 23.976 23.827 23.702 23.552 23.418 23.303 23.165 23.031 22.934 22.813 22.66 22.547 22.435 22.316 22.19 22.032 21.913 21.805 21.657 21.551 21.436 21.379 21.244 21.08 20.897 20.8 20.531 20.515 20.415 20.303 20.032 19.852 19.646 19.446 19.222 18.92 18.548 17.418 -7 ,8622 ,KEBNE ,16652378,Sun Nov 21 22:29:09 CET,Mon Nov 22 00:12:50 CET,0.0 0.966 1.261 1.519 1.763 1.974 2.15 2.316 2.63 2.77 2.914 2.993 3.31 3.415 3.642 3.875 4.073 4.168 4.371 4.584 4.871 5.044 5.213 5.45 5.675 5.901 6.126 6.333 6.592 6.846 7.101 7.426 7.734 8.014 8.341 8.715 9.093 9.523 9.992 10.476 10.967 11.53 12.208 12.925 13.773 14.761 15.891 17.08 18.533 20.227 22.208 23.755 24.553 24.991 25.21 25.325 25.361 25.34 25.287 25.187 25.066 24.902 24.747 24.631 24.511 24.392 24.26 24.134 24.016 23.899 23.771 23.645 23.515 23.395 23.301 23.201 23.093 22.972 22.846 22.748 22.626 22.441 22.319 22.181 22.098 21.924 21.734 21.526 21.426 21.153 21.115 20.989 20.84 20.54 20.397 20.237 20.038 19.788 19.473 19.041 18.046 -8 ,23221 ,KEBNE ,16652379,Sun Nov 21 22:30:08 CET,Mon Nov 22 00:16:14 CET,0.0 0.85 1.155 1.399 1.609 1.823 2.039 2.23 2.523 2.639 2.751 2.774 3.079 3.174 3.357 3.537 3.713 3.801 3.966 4.117 4.339 4.488 4.639 4.863 5.086 5.299 5.494 5.683 5.943 6.205 6.469 6.77 7.043 7.325 7.649 7.998 8.347 8.736 9.169 9.653 10.168 10.76 11.476 12.178 12.989 13.969 15.099 16.281 17.697 19.503 21.557 22.986 23.734 24.132 24.275 24.331 24.35 24.337 24.288 24.175 24.049 23.926 23.801 23.687 23.567 23.434 23.301 23.182 23.071 22.944 22.805 22.691 22.559 22.412 22.298 22.187 22.069 21.944 21.817 21.72 21.609 21.433 21.316 21.195 21.126 20.966 20.803 20.627 20.533 20.261 20.201 20.064 19.922 19.626 19.452 19.249 19.032 18.783 18.472 18.059 16.729 -9 ,1599 ,KEBNE ,16652380,Sun Nov 21 22:30:08 CET,Mon Nov 22 00:17:30 CET,0.0 0.919 1.261 1.538 1.774 1.977 2.154 2.331 2.674 2.829 2.97 3.018 3.347 3.469 3.688 3.898 4.116 4.222 4.41 4.584 4.846 5.035 5.227 5.472 5.689 5.916 6.14 6.347 6.618 6.893 7.167 7.481 7.77 8.063 8.415 8.823 9.208 9.629 10.072 10.538 11.048 11.638 12.349 13.062 13.901 14.84 15.933 17.188 18.642 20.363 22.294 23.832 24.74 25.166 25.323 25.39 25.39 25.332 25.263 25.152 25.041 24.948 24.856 24.75 24.611 24.456 24.301 24.168 24.051 23.932 23.814 23.716 23.603 23.481 23.379 23.269 23.155 23.024 22.893 22.809 22.717 22.551 22.425 22.289 22.222 22.097 21.959 21.814 21.734 21.462 21.442 21.335 21.22 20.95 20.792 20.639 20.474 20.268 20.026 19.704 18.587 -10 ,2478 ,KEBNE ,16652381,Sun Nov 21 22:30:12 CET,Mon Nov 22 00:13:29 CET,0.0 1.143 1.445 1.719 1.956 2.147 2.319 2.491 2.819 2.961 3.086 3.133 3.455 3.569 3.781 3.989 4.183 4.281 4.473 4.652 4.912 5.078 5.237 5.465 5.688 5.896 6.1 6.31 6.585 6.85 7.108 7.412 7.703 7.977 8.309 8.698 9.068 9.488 9.937 10.414 10.932 11.506 12.179 12.887 13.715 14.61 15.683 16.912 18.33 19.997 21.958 23.549 24.343 24.724 24.921 25.046 25.085 25.064 24.997 24.884 24.769 24.654 24.542 24.422 24.293 24.174 24.048 23.918 23.79 23.654 23.51 23.383 23.257 23.114 22.997 22.882 22.752 22.603 22.449 22.345 22.242 22.07 21.942 21.81 21.74 21.598 21.437 21.26 21.167 20.899 20.862 20.75 20.635 20.362 20.208 20.032 19.828 19.574 19.277 18.924 17.823 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt deleted file mode 100644 index fb248f24..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23568 ,TETRA ,17982052,Tue Dec 21 08:28:43 CET,Tue Dec 21 10:48:22 CET,0.0 0.497 0.717 0.881 1.029 1.155 1.285 1.413 1.632 1.717 1.801 1.799 2.04 2.118 2.259 2.381 2.499 2.563 2.693 2.812 2.98 3.089 3.201 3.354 3.486 3.612 3.746 3.873 4.033 4.203 4.356 4.515 4.671 4.824 4.998 5.2 5.386 5.588 5.79 5.993 6.203 6.397 6.637 6.898 7.169 7.449 7.725 7.945 8.126 8.268 8.26 7.952 7.52 7.103 6.691 6.281 5.914 5.575 5.287 4.98 4.705 4.469 4.242 4.025 3.817 3.624 3.429 3.254 3.096 2.933 2.777 2.645 2.492 2.332 2.216 2.099 1.979 1.861 1.73 1.641 1.552 1.389 1.269 1.16 1.107 0.989 0.871 0.74 0.666 0.42 0.452 0.375 0.289 0.097 -0.003 -0.107 -0.226 -0.357 -0.511 -0.752 -1.558 -3 ,21532 ,TETRA ,17982054,Tue Dec 21 08:28:41 CET,Tue Dec 21 10:48:33 CET,0.0 0.45 0.672 0.846 1.018 1.2 1.362 1.485 1.68 1.771 1.859 1.86 2.111 2.201 2.381 2.533 2.682 2.756 2.883 2.989 3.147 3.252 3.354 3.503 3.641 3.777 3.908 4.03 4.185 4.328 4.453 4.604 4.764 4.919 5.078 5.237 5.393 5.561 5.737 5.937 6.167 6.414 6.673 6.926 7.197 7.472 7.784 8.099 8.324 8.411 8.273 7.843 7.374 6.913 6.482 6.08 5.712 5.371 5.087 4.798 4.544 4.316 4.097 3.886 3.674 3.471 3.264 3.083 2.93 2.76 2.579 2.437 2.294 2.144 2.018 1.892 1.779 1.658 1.515 1.419 1.329 1.187 1.085 0.972 0.912 0.792 0.67 0.537 0.469 0.228 0.243 0.156 0.077 -0.107 -0.215 -0.317 -0.427 -0.577 -0.742 -0.935 -1.518 -4 ,17715 ,TETRA ,17982055,Tue Dec 21 08:28:43 CET,Tue Dec 21 10:49:18 CET,0.0 0.425 0.613 0.786 0.938 1.077 1.207 1.326 1.532 1.624 1.717 1.725 1.973 2.041 2.169 2.287 2.402 2.459 2.567 2.666 2.812 2.915 3.007 3.123 3.242 3.372 3.504 3.63 3.789 3.938 4.065 4.215 4.363 4.494 4.628 4.773 4.907 5.06 5.235 5.418 5.6 5.815 6.058 6.283 6.533 6.786 7.027 7.245 7.465 7.575 7.489 7.137 6.667 6.223 5.813 5.421 5.045 4.68 4.362 4.02 3.723 3.483 3.238 3.008 2.814 2.631 2.436 2.263 2.109 1.949 1.785 1.651 1.516 1.369 1.246 1.115 0.983 0.847 0.708 0.615 0.522 0.375 0.272 0.157 0.096 -0.027 -0.157 -0.288 -0.356 -0.605 -0.567 -0.644 -0.73 -0.905 -1.017 -1.144 -1.295 -1.461 -1.602 -1.773 -2.354 -5 ,7244 ,TETRA ,17982056,Tue Dec 21 08:29:08 CET,Tue Dec 21 10:49:36 CET,0.0 0.504 0.802 1.031 1.194 1.352 1.502 1.621 1.822 1.922 2.021 2.027 2.273 2.349 2.487 2.606 2.728 2.79 2.911 3.026 3.193 3.304 3.409 3.556 3.692 3.825 3.957 4.079 4.224 4.372 4.518 4.685 4.849 5.009 5.2 5.402 5.573 5.759 5.96 6.187 6.417 6.641 6.909 7.153 7.391 7.65 7.926 8.208 8.478 8.633 8.579 8.227 7.797 7.319 6.843 6.409 6.022 5.688 5.388 5.061 4.785 4.532 4.3 4.094 3.891 3.706 3.505 3.328 3.183 3.017 2.842 2.709 2.57 2.424 2.312 2.19 2.064 1.94 1.803 1.705 1.616 1.475 1.375 1.275 1.225 1.125 1.017 0.897 0.834 0.589 0.614 0.54 0.455 0.261 0.153 0.044 -0.073 -0.22 -0.381 -0.577 -1.214 -7 ,18062 ,TETRA ,17982058,Tue Dec 21 08:29:09 CET,Tue Dec 21 10:49:03 CET,0.0 0.422 0.71 0.907 1.072 1.223 1.364 1.488 1.72 1.831 1.927 1.927 2.19 2.273 2.417 2.545 2.668 2.73 2.854 2.972 3.128 3.238 3.347 3.488 3.629 3.779 3.921 4.049 4.211 4.356 4.497 4.666 4.816 4.962 5.126 5.315 5.507 5.723 5.938 6.166 6.409 6.67 6.953 7.196 7.463 7.778 8.138 8.454 8.714 8.887 8.868 8.559 8.116 7.678 7.294 6.926 6.583 6.287 6.021 5.736 5.471 5.205 4.965 4.756 4.558 4.37 4.167 3.99 3.832 3.661 3.49 3.352 3.204 3.05 2.938 2.822 2.696 2.563 2.427 2.334 2.24 2.097 1.992 1.876 1.818 1.713 1.593 1.451 1.376 1.129 1.134 1.039 0.937 0.729 0.629 0.53 0.42 0.302 0.172 -0.003 -0.504 -8 ,31653 ,TETRA ,17982059,Tue Dec 21 08:29:09 CET,Tue Dec 21 10:50:34 CET,0.0 0.481 0.725 0.915 1.089 1.241 1.375 1.501 1.758 1.877 1.973 1.975 2.234 2.316 2.455 2.577 2.704 2.774 2.913 3.037 3.218 3.328 3.42 3.548 3.677 3.799 3.917 4.033 4.168 4.294 4.434 4.603 4.754 4.889 5.034 5.199 5.358 5.53 5.724 5.941 6.163 6.384 6.631 6.877 7.148 7.434 7.721 7.981 8.266 8.484 8.366 7.945 7.436 6.956 6.539 6.143 5.775 5.43 5.139 4.839 4.573 4.34 4.116 3.916 3.72 3.522 3.318 3.144 2.992 2.821 2.647 2.515 2.38 2.231 2.118 2.008 1.89 1.765 1.634 1.546 1.454 1.305 1.197 1.078 1.018 0.897 0.768 0.634 0.569 0.33 0.377 0.305 0.221 0.045 -0.045 -0.142 -0.26 -0.4 -0.548 -0.742 -1.319 -9 ,23889 ,TETRA ,17982060,Tue Dec 21 08:29:09 CET,Tue Dec 21 10:50:05 CET,0.0 0.462 0.738 0.961 1.134 1.267 1.378 1.495 1.7 1.79 1.884 1.867 2.109 2.187 2.347 2.495 2.631 2.697 2.811 2.91 3.069 3.181 3.286 3.439 3.581 3.703 3.823 3.947 4.104 4.257 4.393 4.548 4.706 4.868 5.054 5.259 5.459 5.667 5.858 6.058 6.291 6.541 6.806 7.06 7.344 7.654 7.974 8.261 8.55 8.772 8.753 8.407 7.973 7.534 7.114 6.737 6.416 6.107 5.807 5.509 5.254 5.03 4.805 4.581 4.381 4.197 3.995 3.808 3.651 3.481 3.297 3.153 3.007 2.856 2.735 2.613 2.491 2.355 2.222 2.135 2.045 1.898 1.79 1.677 1.61 1.47 1.335 1.18 1.107 0.852 0.838 0.745 0.655 0.459 0.349 0.235 0.107 -0.039 -0.212 -0.42 -0.957 -10 ,26371 ,TETRA ,17982061,Tue Dec 21 08:29:09 CET,Tue Dec 21 10:48:50 CET,0.0 0.459 0.678 0.876 1.038 1.19 1.337 1.47 1.702 1.799 1.882 1.881 2.134 2.206 2.342 2.482 2.624 2.693 2.822 2.939 3.109 3.222 3.328 3.475 3.616 3.749 3.873 4.004 4.169 4.317 4.451 4.594 4.733 4.876 5.039 5.226 5.407 5.59 5.784 5.999 6.213 6.431 6.667 6.875 7.1 7.337 7.589 7.876 8.197 8.444 8.453 8.173 7.801 7.407 7.016 6.643 6.279 5.929 5.621 5.285 5.007 4.785 4.574 4.369 4.176 4.009 3.834 3.672 3.539 3.397 3.239 3.104 2.969 2.832 2.718 2.592 2.453 2.307 2.171 2.082 1.99 1.846 1.731 1.606 1.547 1.42 1.285 1.15 1.083 0.834 0.862 0.781 0.686 0.498 0.398 0.286 0.161 -0.008 -0.208 -0.439 -1.158 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt deleted file mode 100644 index c8ae0121..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2961 ,KEBNE ,16652382,Sun Nov 21 22:30:10 CET,Mon Nov 22 00:14:10 CET,0.0 0.713 1.027 1.29 1.519 1.738 1.946 2.137 2.488 2.651 2.815 2.869 3.306 3.466 3.788 4.101 4.401 4.548 4.835 5.118 5.531 5.802 6.071 6.459 6.841 7.219 7.588 7.955 8.439 8.92 9.404 10.019 10.625 11.204 11.901 12.703 13.476 14.338 15.291 16.332 17.452 18.747 20.32 21.962 23.937 26.251 29.066 32.351 36.379 41.594 48.517 54.914 59.179 62.251 64.541 66.269 67.56 68.586 69.36 70.08 70.637 71.074 71.47 71.816 72.107 72.336 72.525 72.672 72.794 72.915 73.035 73.132 73.221 73.283 73.32 73.361 73.389 73.411 73.446 73.468 73.478 73.473 73.458 73.435 73.425 73.4 73.362 73.31 73.275 73.044 73.185 73.145 73.096 72.964 72.886 72.796 72.686 72.566 72.424 72.181 71.465 -3 ,12567 ,KEBNE ,16652384,Sun Nov 21 22:31:10 CET,Mon Nov 22 00:17:27 CET,0.0 0.574 0.845 1.09 1.33 1.56 1.768 1.96 2.324 2.493 2.662 2.706 3.138 3.287 3.593 3.912 4.226 4.373 4.652 4.916 5.308 5.568 5.826 6.217 6.604 6.984 7.358 7.72 8.193 8.66 9.126 9.71 10.274 10.822 11.472 12.237 12.994 13.836 14.773 15.787 16.889 18.163 19.696 21.301 23.231 25.464 28.19 31.484 35.581 40.738 47.532 53.737 57.869 60.829 63.019 64.717 65.997 67.016 67.81 68.537 69.087 69.522 69.911 70.254 70.528 70.746 70.96 71.127 71.252 71.376 71.489 71.564 71.643 71.715 71.76 71.802 71.822 71.83 71.847 71.851 71.848 71.84 71.817 71.78 71.766 71.748 71.727 71.699 71.667 71.425 71.558 71.512 71.468 71.345 71.259 71.163 71.061 70.932 70.743 70.456 69.809 -4 ,8101 ,KEBNE ,16652385,Sun Nov 21 22:31:10 CET,Mon Nov 22 00:18:00 CET,0.0 0.684 0.982 1.243 1.505 1.764 1.987 2.183 2.538 2.701 2.855 2.894 3.325 3.474 3.764 4.059 4.351 4.489 4.755 5.027 5.441 5.709 5.974 6.36 6.734 7.107 7.472 7.835 8.323 8.793 9.254 9.82 10.379 10.936 11.598 12.363 13.119 13.968 14.909 15.938 17.051 18.339 19.887 21.505 23.443 25.711 28.502 31.834 35.931 41.007 47.768 54.194 58.443 61.459 63.699 65.428 66.727 67.763 68.578 69.332 69.915 70.4 70.821 71.144 71.431 71.688 71.924 72.108 72.241 72.354 72.461 72.547 72.624 72.706 72.756 72.79 72.811 72.821 72.836 72.839 72.841 72.852 72.849 72.835 72.819 72.779 72.743 72.714 72.694 72.467 72.609 72.57 72.529 72.434 72.38 72.309 72.206 72.092 71.921 71.636 71.02 -5 ,13272 ,KEBNE ,16652386,Sun Nov 21 22:31:10 CET,Mon Nov 22 00:17:25 CET,0.0 0.671 0.955 1.213 1.453 1.668 1.9 2.115 2.487 2.674 2.851 2.897 3.332 3.488 3.807 4.116 4.408 4.554 4.838 5.114 5.531 5.81 6.071 6.454 6.838 7.207 7.57 7.938 8.418 8.894 9.37 9.946 10.517 11.076 11.747 12.539 13.33 14.208 15.169 16.199 17.311 18.615 20.165 21.774 23.727 26.011 28.788 32.14 36.294 41.457 48.442 54.887 59.032 62.004 64.214 65.897 67.15 68.151 68.954 69.682 70.232 70.698 71.097 71.439 71.73 71.971 72.203 72.39 72.539 72.681 72.797 72.869 72.931 72.98 73.014 73.039 73.056 73.069 73.079 73.08 73.068 73.035 73.019 73.008 72.995 72.955 72.901 72.839 72.807 72.574 72.702 72.659 72.607 72.447 72.366 72.299 72.211 72.08 71.907 71.639 71.094 -6 ,4930 ,KEBNE ,16652387,Sun Nov 21 22:31:11 CET,Mon Nov 22 00:18:24 CET,0.0 1.009 1.304 1.556 1.789 1.989 2.182 2.362 2.716 2.89 3.055 3.115 3.554 3.714 4.027 4.332 4.621 4.761 5.042 5.321 5.735 6.001 6.269 6.667 7.06 7.451 7.828 8.194 8.679 9.161 9.64 10.241 10.828 11.394 12.061 12.824 13.577 14.439 15.402 16.465 17.588 18.85 20.382 22.003 23.958 26.238 29.065 32.402 36.486 41.714 48.614 54.921 59.106 62.127 64.288 65.892 67.143 68.185 69.02 69.726 70.244 70.692 71.087 71.436 71.739 71.976 72.186 72.361 72.498 72.624 72.746 72.829 72.905 72.974 73.021 73.069 73.107 73.143 73.186 73.204 73.214 73.235 73.248 73.248 73.245 73.237 73.22 73.185 73.153 72.921 73.054 73.019 72.983 72.868 72.794 72.692 72.563 72.421 72.25 71.993 71.261 -8 ,23545 ,KEBNE ,16652389,Sun Nov 21 22:31:11 CET,Mon Nov 22 00:16:56 CET,0.0 0.775 1.097 1.357 1.577 1.805 2.014 2.207 2.589 2.773 2.942 2.991 3.434 3.595 3.925 4.241 4.53 4.67 4.932 5.201 5.618 5.892 6.157 6.553 6.952 7.333 7.705 8.068 8.543 9.011 9.476 10.052 10.608 11.165 11.817 12.561 13.304 14.138 15.068 16.103 17.227 18.505 20.047 21.66 23.618 25.908 28.669 31.952 36.004 41.194 48.164 54.647 58.914 61.915 64.125 65.861 67.202 68.255 69.084 69.833 70.393 70.841 71.249 71.617 71.928 72.177 72.419 72.617 72.761 72.89 73.019 73.125 73.213 73.296 73.356 73.41 73.463 73.509 73.531 73.534 73.545 73.559 73.556 73.547 73.539 73.504 73.466 73.431 73.415 73.197 73.321 73.278 73.236 73.131 73.074 72.992 72.883 72.782 72.66 72.436 71.836 -9 ,3329 ,KEBNE ,16652390,Sun Nov 21 22:31:10 CET,Mon Nov 22 00:17:25 CET,0.0 0.756 1.107 1.419 1.686 1.925 2.148 2.345 2.727 2.915 3.091 3.145 3.586 3.753 4.077 4.372 4.668 4.816 5.095 5.369 5.783 6.057 6.329 6.729 7.105 7.488 7.875 8.251 8.738 9.218 9.709 10.313 10.894 11.461 12.138 12.913 13.665 14.527 15.49 16.53 17.649 18.955 20.562 22.236 24.245 26.593 29.43 32.764 36.918 42.147 48.947 55.345 59.671 62.65 64.785 66.477 67.832 68.953 69.823 70.593 71.177 71.639 72.044 72.398 72.709 72.987 73.241 73.434 73.581 73.721 73.836 73.918 74.004 74.072 74.107 74.137 74.17 74.21 74.24 74.257 74.277 74.281 74.275 74.272 74.261 74.232 74.202 74.165 74.143 73.909 74.019 73.964 73.909 73.778 73.695 73.602 73.473 73.32 73.161 72.953 72.242 -10 ,24667 ,KEBNE ,16652391,Sun Nov 21 22:31:11 CET,Mon Nov 22 00:17:17 CET,0.0 0.584 0.88 1.148 1.393 1.611 1.803 1.996 2.38 2.553 2.72 2.765 3.201 3.36 3.664 3.969 4.273 4.417 4.699 4.996 5.44 5.71 5.972 6.383 6.785 7.164 7.535 7.91 8.392 8.866 9.345 9.936 10.502 11.05 11.702 12.456 13.202 14.046 14.985 16.013 17.13 18.411 19.96 21.621 23.618 25.899 28.627 31.828 35.766 40.842 47.633 53.774 57.846 60.714 62.852 64.547 65.841 66.88 67.667 68.373 68.939 69.393 69.776 70.102 70.391 70.653 70.879 71.048 71.179 71.305 71.436 71.534 71.625 71.702 71.749 71.795 71.83 71.85 71.87 71.877 71.882 71.885 71.869 71.846 71.837 71.811 71.786 71.751 71.724 71.494 71.644 71.602 71.548 71.425 71.354 71.272 71.173 71.04 70.874 70.637 70.003 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 3ffcf18c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,18836 ,KEBNE ,16652393,Sun Nov 21 22:32:13 CET,Mon Nov 22 00:18:39 CET,0.0 1.508 2.009 2.393 2.71 2.989 3.283 3.555 4.037 4.264 4.481 4.619 5.088 5.276 5.659 6.035 6.412 6.61 6.982 7.314 7.799 8.119 8.443 8.917 9.406 9.914 10.407 10.882 11.5 12.112 12.72 13.46 14.171 14.869 15.672 16.579 17.473 18.493 19.636 20.881 22.208 23.745 25.633 27.623 30.017 32.805 36.216 40.28 45.316 51.722 60.362 68.553 74.025 77.94 80.834 83.105 84.901 86.373 87.515 88.541 89.314 89.931 90.493 90.974 91.377 91.721 92.03 92.277 92.492 92.7 92.899 93.052 93.208 93.339 93.416 93.493 93.563 93.636 93.697 93.714 93.717 93.712 93.717 93.729 93.73 93.728 93.712 93.674 93.65 93.441 93.525 93.469 93.402 93.255 93.174 93.08 92.94 92.71 92.413 92.002 90.349 -3 ,7534 ,KEBNE ,16652394,Sun Nov 21 22:32:13 CET,Mon Nov 22 00:19:01 CET,0.0 1.604 2.058 2.417 2.726 2.974 3.225 3.49 3.974 4.189 4.402 4.563 5.044 5.249 5.649 6.046 6.418 6.592 6.946 7.3 7.792 8.118 8.451 8.93 9.399 9.863 10.332 10.793 11.393 11.986 12.575 13.288 13.984 14.675 15.485 16.399 17.297 18.321 19.486 20.725 22.002 23.503 25.351 27.299 29.715 32.546 35.961 40.04 45.081 51.541 60.238 68.383 73.886 77.836 80.772 83.054 84.789 86.183 87.233 88.177 88.919 89.534 90.076 90.525 90.911 91.249 91.572 91.844 92.063 92.271 92.456 92.582 92.701 92.808 92.87 92.913 92.951 92.972 92.986 92.994 93.007 93.005 92.992 92.99 92.988 92.972 92.941 92.894 92.864 92.661 92.754 92.698 92.647 92.535 92.475 92.358 92.182 92.013 91.814 91.487 89.648 -4 ,22973 ,KEBNE ,16652395,Sun Nov 21 22:32:12 CET,Mon Nov 22 00:17:52 CET,0.0 1.356 1.806 2.154 2.469 2.77 3.043 3.291 3.77 3.99 4.205 4.374 4.868 5.069 5.453 5.831 6.198 6.383 6.744 7.102 7.622 7.94 8.26 8.765 9.251 9.723 10.181 10.637 11.262 11.876 12.467 13.195 13.923 14.623 15.424 16.351 17.261 18.27 19.371 20.575 21.896 23.442 25.325 27.311 29.724 32.485 35.847 39.929 44.997 51.446 60.133 68.313 73.745 77.655 80.589 82.888 84.679 86.12 87.252 88.279 89.092 89.753 90.314 90.804 91.22 91.567 91.905 92.193 92.417 92.617 92.811 92.973 93.126 93.264 93.367 93.463 93.531 93.59 93.642 93.673 93.695 93.697 93.703 93.712 93.709 93.695 93.666 93.628 93.603 93.395 93.499 93.441 93.371 93.246 93.156 93.03 92.877 92.72 92.478 92.114 90.558 -5 ,21501 ,KEBNE ,16652396,Sun Nov 21 22:32:13 CET,Mon Nov 22 00:18:06 CET,0.0 1.008 1.478 1.881 2.228 2.525 2.788 3.053 3.538 3.758 3.984 4.144 4.626 4.821 5.183 5.549 5.916 6.084 6.407 6.736 7.231 7.548 7.863 8.337 8.804 9.261 9.714 10.156 10.723 11.281 11.838 12.526 13.194 13.858 14.639 15.524 16.401 17.403 18.526 19.757 21.091 22.654 24.567 26.569 28.97 31.768 35.189 39.272 44.335 50.798 59.547 67.734 73.142 77.022 79.904 82.183 83.969 85.4 86.49 87.462 88.231 88.888 89.462 89.963 90.388 90.732 91.069 91.354 91.579 91.777 91.965 92.103 92.232 92.358 92.44 92.52 92.604 92.686 92.752 92.772 92.789 92.81 92.801 92.787 92.778 92.743 92.717 92.693 92.661 92.442 92.512 92.443 92.362 92.185 92.092 91.979 91.834 91.663 91.455 91.128 89.526 -6 ,16820 ,KEBNE ,16652397,Sun Nov 21 22:32:13 CET,Mon Nov 22 00:18:17 CET,0.0 1.11 1.595 1.999 2.346 2.669 2.959 3.226 3.756 4.0 4.213 4.342 4.812 5.002 5.395 5.802 6.184 6.361 6.721 7.074 7.566 7.883 8.211 8.705 9.201 9.684 10.148 10.593 11.181 11.776 12.36 13.085 13.81 14.532 15.377 16.323 17.236 18.255 19.381 20.589 21.888 23.426 25.29 27.219 29.562 32.308 35.643 39.618 44.651 51.127 59.879 68.222 73.742 77.69 80.613 82.905 84.647 86.025 87.121 88.133 88.908 89.537 90.107 90.597 91.006 91.36 91.709 91.977 92.186 92.401 92.614 92.772 92.911 93.036 93.12 93.205 93.259 93.273 93.307 93.323 93.298 93.261 93.228 93.185 93.17 93.13 93.063 92.982 92.935 92.717 92.777 92.705 92.646 92.487 92.359 92.213 92.064 91.854 91.598 91.197 89.761 -7 ,5574 ,KEBNE ,16652398,Sun Nov 21 22:32:12 CET,Mon Nov 22 00:18:49 CET,0.0 1.229 1.7 2.08 2.398 2.703 2.999 3.269 3.774 4.024 4.258 4.427 4.912 5.11 5.489 5.863 6.229 6.405 6.746 7.075 7.563 7.892 8.234 8.757 9.265 9.755 10.233 10.699 11.303 11.901 12.48 13.186 13.902 14.618 15.461 16.421 17.375 18.413 19.542 20.785 22.101 23.618 25.5 27.48 29.822 32.55 35.91 39.915 44.867 51.178 59.795 67.984 73.474 77.391 80.253 82.505 84.285 85.754 86.898 87.939 88.732 89.365 89.919 90.378 90.768 91.106 91.419 91.682 91.881 92.068 92.252 92.379 92.507 92.636 92.715 92.771 92.81 92.843 92.869 92.883 92.885 92.87 92.858 92.822 92.797 92.744 92.669 92.6 92.566 92.344 92.423 92.38 92.301 92.102 92.001 91.854 91.687 91.523 91.315 90.925 89.086 -9 ,19992 ,KEBNE ,16652400,Sun Nov 21 22:32:13 CET,Mon Nov 22 00:19:50 CET,0.0 0.902 1.272 1.59 1.904 2.206 2.481 2.745 3.221 3.425 3.617 3.731 4.196 4.379 4.74 5.093 5.439 5.613 5.97 6.318 6.816 7.15 7.476 7.953 8.435 8.916 9.362 9.794 10.376 10.946 11.504 12.184 12.864 13.537 14.321 15.218 16.122 17.143 18.265 19.49 20.805 22.33 24.188 26.112 28.441 31.219 34.63 38.645 43.615 50.02 58.714 66.897 72.375 76.292 79.185 81.467 83.228 84.659 85.809 86.852 87.644 88.27 88.811 89.282 89.682 90.016 90.349 90.626 90.844 91.052 91.251 91.4 91.535 91.675 91.778 91.868 91.944 92.009 92.065 92.103 92.135 92.156 92.159 92.165 92.168 92.152 92.124 92.085 92.056 91.846 91.932 91.872 91.79 91.605 91.487 91.315 91.113 90.929 90.698 90.29 88.339 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt deleted file mode 100644 index 4ecfb651..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,7870 ,KEBNE ,16652404,Sun Nov 21 22:33:15 CET,Mon Nov 22 00:22:42 CET,0.0 1.963 2.754 3.328 3.768 4.151 4.482 4.752 5.214 5.453 5.666 5.84 6.161 6.294 6.547 6.78 6.997 7.098 7.289 7.466 7.707 7.865 8.019 8.24 8.445 8.632 8.809 8.969 9.169 9.362 9.524 9.711 9.898 10.081 10.277 10.491 10.7 10.93 11.178 11.431 11.686 11.996 12.356 12.683 13.042 13.435 13.885 14.3 14.643 14.889 14.939 14.56 14.016 13.378 12.793 12.32 11.884 11.477 11.128 10.757 10.436 10.129 9.829 9.549 9.272 9.015 8.734 8.478 8.256 8.026 7.782 7.586 7.397 7.188 7.017 6.837 6.652 6.454 6.246 6.119 5.982 5.739 5.55 5.36 5.272 5.094 4.916 4.73 4.623 4.328 4.237 4.096 3.957 3.651 3.482 3.292 3.065 2.78 2.413 1.969 -6.056 -4 ,21168 ,KEBNE ,16652405,Sun Nov 21 22:33:15 CET,Mon Nov 22 00:23:55 CET,0.0 2.674 3.493 4.087 4.554 4.907 5.186 5.429 5.81 5.974 6.143 6.281 6.593 6.725 6.958 7.165 7.356 7.453 7.648 7.826 8.067 8.224 8.381 8.592 8.787 8.981 9.164 9.339 9.57 9.782 9.972 10.195 10.407 10.609 10.825 11.057 11.271 11.526 11.818 12.096 12.372 12.691 13.033 13.344 13.705 14.064 14.382 14.69 15.015 15.291 15.325 14.981 14.567 14.144 13.76 13.39 12.976 12.548 12.175 11.813 11.483 11.181 10.919 10.677 10.444 10.236 10.02 9.817 9.634 9.447 9.243 9.07 8.882 8.659 8.487 8.319 8.155 7.99 7.823 7.71 7.576 7.363 7.218 7.062 6.982 6.808 6.593 6.373 6.268 5.985 5.932 5.793 5.631 5.268 5.073 4.867 4.649 4.402 4.095 3.625 -0.301 -5 ,9249 ,KEBNE ,16652406,Sun Nov 21 22:33:15 CET,Mon Nov 22 00:23:50 CET,0.0 3.215 4.061 4.574 4.991 5.307 5.547 5.764 6.134 6.311 6.485 6.621 6.934 7.066 7.288 7.504 7.716 7.818 8.019 8.206 8.475 8.635 8.776 8.969 9.139 9.307 9.484 9.652 9.863 10.066 10.248 10.452 10.648 10.84 11.056 11.313 11.568 11.819 12.088 12.373 12.666 12.99 13.353 13.693 14.04 14.404 14.797 15.192 15.632 16.074 16.33 16.193 15.891 15.513 15.099 14.72 14.376 14.071 13.78 13.445 13.124 12.841 12.593 12.356 12.15 11.944 11.679 11.436 11.25 11.069 10.869 10.701 10.518 10.323 10.175 10.014 9.846 9.686 9.522 9.398 9.257 9.033 8.889 8.752 8.681 8.538 8.381 8.198 8.105 7.834 7.794 7.686 7.572 7.286 7.111 6.934 6.748 6.548 6.317 6.011 2.773 -6 ,26925 ,KEBNE ,16652407,Sun Nov 21 22:33:19 CET,Mon Nov 22 00:20:41 CET,0.0 2.871 3.656 4.263 4.722 5.163 5.587 5.963 6.576 6.868 7.171 7.476 7.795 7.907 8.14 8.384 8.603 8.693 8.861 9.027 9.279 9.429 9.569 9.781 9.977 10.165 10.347 10.511 10.715 10.905 11.085 11.307 11.509 11.696 11.908 12.146 12.377 12.617 12.886 13.153 13.408 13.699 14.035 14.368 14.711 15.035 15.372 15.681 15.97 16.225 16.303 16.037 15.543 15.001 14.462 13.976 13.581 13.186 12.814 12.405 12.047 11.746 11.473 11.23 11.001 10.77 10.499 10.249 10.048 9.851 9.64 9.475 9.307 9.125 8.986 8.827 8.649 8.463 8.261 8.119 7.979 7.765 7.617 7.479 7.408 7.25 7.083 6.905 6.807 6.541 6.51 6.395 6.26 5.979 5.833 5.659 5.467 5.264 5.035 4.726 2.967 -7 ,11856 ,KEBNE ,16652408,Sun Nov 21 22:34:17 CET,Mon Nov 22 00:24:57 CET,0.0 2.289 3.014 3.451 3.765 4.086 4.382 4.606 4.97 5.13 5.284 5.377 5.681 5.799 6.013 6.203 6.386 6.477 6.651 6.823 7.068 7.228 7.387 7.603 7.808 8.023 8.223 8.399 8.621 8.825 9.014 9.243 9.46 9.66 9.886 10.153 10.419 10.691 10.979 11.289 11.617 11.963 12.315 12.661 13.088 13.548 14.081 14.655 15.235 15.852 16.362 16.442 16.285 16.002 15.648 15.292 14.963 14.655 14.384 14.101 13.845 13.613 13.368 13.115 12.875 12.647 12.399 12.164 11.949 11.733 11.516 11.334 11.144 10.927 10.759 10.607 10.451 10.27 10.066 9.936 9.809 9.593 9.43 9.268 9.192 9.023 8.839 8.634 8.513 8.222 8.143 8.002 7.862 7.575 7.405 7.212 6.978 6.735 6.479 6.053 3.56 -8 ,21557 ,KEBNE ,16652409,Sun Nov 21 22:34:17 CET,Mon Nov 22 00:24:48 CET,0.0 3.1 3.815 4.294 4.713 5.075 5.373 5.598 6.001 6.215 6.442 6.713 7.09 7.248 7.503 7.753 8.016 8.135 8.362 8.611 8.946 9.126 9.284 9.508 9.75 9.98 10.175 10.37 10.649 10.932 11.166 11.401 11.62 11.827 12.061 12.325 12.569 12.82 13.078 13.352 13.638 13.952 14.32 14.703 15.151 15.626 16.16 16.694 17.208 17.665 18.037 18.077 17.837 17.521 17.197 16.864 16.513 16.159 15.822 15.461 15.136 14.855 14.59 14.313 14.049 13.806 13.553 13.342 13.147 12.94 12.736 12.561 12.383 12.185 12.016 11.837 11.65 11.463 11.263 11.124 10.985 10.763 10.614 10.473 10.392 10.218 10.048 9.867 9.775 9.517 9.477 9.357 9.225 8.955 8.817 8.633 8.438 8.208 7.876 7.457 4.697 -10 ,32657 ,KEBNE ,16652411,Sun Nov 21 22:34:17 CET,Mon Nov 22 00:23:37 CET,0.0 3.225 3.751 4.133 4.503 4.803 5.056 5.268 5.618 5.774 5.913 6.044 6.368 6.493 6.724 6.928 7.107 7.189 7.348 7.504 7.719 7.852 7.982 8.175 8.364 8.535 8.686 8.834 9.021 9.207 9.387 9.593 9.792 9.987 10.211 10.474 10.722 10.973 11.253 11.551 11.833 12.139 12.49 12.83 13.225 13.625 14.021 14.423 14.836 15.178 15.268 15.047 14.701 14.276 13.817 13.317 12.882 12.495 12.101 11.687 11.355 11.051 10.745 10.447 10.181 9.948 9.692 9.457 9.265 9.062 8.83 8.642 8.462 8.279 8.134 7.986 7.829 7.677 7.512 7.369 7.213 6.993 6.851 6.704 6.623 6.446 6.254 6.038 5.928 5.635 5.539 5.413 5.281 4.973 4.819 4.638 4.425 4.128 3.729 3.213 1.432 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt deleted file mode 100644 index d6638945..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6774 ,KEBNE ,16652412,Sun Nov 21 22:34:17 CET,Mon Nov 22 00:24:05 CET,0.0 0.385 0.526 0.667 0.795 0.904 1.004 1.105 1.294 1.384 1.466 1.44 1.685 1.75 1.881 2.002 2.116 2.174 2.277 2.372 2.523 2.625 2.717 2.856 2.992 3.113 3.228 3.339 3.479 3.61 3.739 3.907 4.073 4.226 4.399 4.599 4.793 5.0 5.243 5.506 5.753 6.025 6.318 6.595 6.932 7.316 7.74 8.225 8.756 9.256 9.647 9.675 9.526 9.335 9.104 8.854 8.617 8.404 8.194 7.974 7.781 7.589 7.4 7.231 7.081 6.93 6.791 6.667 6.55 6.425 6.288 6.188 6.076 5.937 5.826 5.723 5.614 5.505 5.392 5.318 5.241 5.125 5.052 4.96 4.908 4.803 4.702 4.607 4.555 4.322 4.371 4.308 4.242 4.076 3.974 3.883 3.803 3.714 3.611 3.47 3.226 -2 ,30743 ,KEBNE ,16652413,Sun Nov 21 22:34:17 CET,Mon Nov 22 00:24:03 CET,0.0 0.276 0.433 0.587 0.717 0.828 0.923 0.999 1.146 1.225 1.298 1.268 1.517 1.595 1.729 1.862 1.996 2.057 2.174 2.28 2.424 2.523 2.618 2.766 2.922 3.07 3.21 3.35 3.523 3.666 3.797 3.972 4.145 4.303 4.487 4.702 4.903 5.111 5.348 5.609 5.865 6.142 6.447 6.725 7.053 7.44 7.866 8.311 8.804 9.32 9.776 9.937 9.875 9.722 9.522 9.339 9.14 8.903 8.716 8.527 8.331 8.161 7.991 7.816 7.657 7.514 7.358 7.21 7.086 6.964 6.826 6.695 6.555 6.41 6.318 6.234 6.133 6.029 5.91 5.829 5.767 5.661 5.576 5.496 5.452 5.35 5.241 5.121 5.06 4.826 4.873 4.807 4.74 4.59 4.499 4.403 4.299 4.175 4.05 3.937 3.739 -3 ,11948 ,KEBNE ,16652414,Sun Nov 21 22:35:18 CET,Mon Nov 22 00:26:58 CET,0.0 0.368 0.55 0.689 0.801 0.924 1.037 1.124 1.298 1.394 1.483 1.47 1.721 1.79 1.928 2.053 2.163 2.22 2.343 2.458 2.621 2.733 2.847 2.998 3.14 3.267 3.375 3.481 3.614 3.739 3.869 4.03 4.178 4.329 4.505 4.693 4.875 5.082 5.299 5.544 5.801 6.073 6.398 6.723 7.074 7.457 7.888 8.313 8.79 9.281 9.717 9.932 9.929 9.807 9.618 9.418 9.217 9.016 8.822 8.62 8.427 8.249 8.083 7.921 7.756 7.62 7.501 7.386 7.282 7.167 7.049 6.951 6.834 6.71 6.621 6.526 6.426 6.318 6.204 6.127 6.047 5.923 5.834 5.739 5.692 5.606 5.521 5.423 5.371 5.149 5.202 5.138 5.069 4.916 4.829 4.744 4.653 4.53 4.427 4.345 4.067 -4 ,10681 ,KEBNE ,16652415,Sun Nov 21 22:37:23 CET,Mon Nov 22 00:28:43 CET,0.0 0.315 0.495 0.648 0.789 0.922 1.023 1.103 1.27 1.355 1.429 1.389 1.623 1.687 1.803 1.917 2.029 2.089 2.207 2.317 2.474 2.566 2.649 2.768 2.899 3.027 3.156 3.285 3.457 3.628 3.777 3.949 4.113 4.266 4.456 4.668 4.865 5.094 5.342 5.607 5.887 6.199 6.534 6.864 7.255 7.679 8.101 8.515 9.025 9.577 10.053 10.19 10.072 9.877 9.668 9.457 9.246 9.04 8.848 8.647 8.446 8.252 8.076 7.903 7.728 7.574 7.416 7.29 7.177 7.06 6.947 6.85 6.749 6.629 6.521 6.412 6.314 6.22 6.116 6.048 5.979 5.854 5.764 5.678 5.629 5.535 5.441 5.33 5.277 5.054 5.111 5.047 4.978 4.824 4.751 4.669 4.553 4.436 4.335 4.199 4.008 -8 ,1315 ,KEBNE ,16652419,Sun Nov 21 22:37:25 CET,Mon Nov 22 00:25:34 CET,0.0 0.7 0.873 1.011 1.146 1.274 1.387 1.495 1.706 1.79 1.86 1.823 2.074 2.146 2.28 2.405 2.517 2.575 2.683 2.788 2.943 3.043 3.131 3.254 3.373 3.485 3.604 3.726 3.872 3.995 4.125 4.293 4.465 4.636 4.816 5.005 5.193 5.401 5.622 5.856 6.101 6.378 6.676 6.943 7.263 7.667 8.125 8.58 9.02 9.418 9.728 9.771 9.624 9.397 9.16 8.946 8.739 8.534 8.334 8.104 7.903 7.709 7.522 7.354 7.211 7.1 6.988 6.87 6.75 6.619 6.464 6.344 6.237 6.118 6.02 5.92 5.817 5.695 5.563 5.482 5.405 5.284 5.198 5.107 5.062 4.972 4.88 4.781 4.725 4.491 4.546 4.479 4.406 4.264 4.173 4.069 3.973 3.877 3.771 3.607 3.373 -9 ,28026 ,KEBNE ,16652420,Sun Nov 21 22:38:29 CET,Mon Nov 22 00:25:45 CET,0.0 0.687 0.907 1.058 1.234 1.385 1.505 1.611 1.826 1.921 1.998 1.979 2.233 2.316 2.475 2.604 2.725 2.782 2.898 3.019 3.172 3.272 3.371 3.507 3.643 3.782 3.91 4.031 4.202 4.36 4.503 4.669 4.827 4.99 5.179 5.385 5.584 5.805 6.037 6.281 6.549 6.854 7.192 7.511 7.875 8.252 8.687 9.206 9.753 10.253 10.714 11.011 11.06 10.909 10.651 10.404 10.165 9.884 9.607 9.363 9.159 8.978 8.814 8.636 8.459 8.307 8.141 7.988 7.853 7.711 7.572 7.451 7.328 7.203 7.112 7.021 6.916 6.81 6.692 6.602 6.521 6.392 6.3 6.215 6.171 6.065 5.953 5.848 5.791 5.554 5.6 5.531 5.462 5.318 5.246 5.165 5.075 4.983 4.866 4.736 4.595 -10 ,14266 ,KEBNE ,16652421,Sun Nov 21 22:39:27 CET,Mon Nov 22 00:29:01 CET,0.0 0.23 0.401 0.549 0.66 0.764 0.86 0.952 1.14 1.231 1.309 1.269 1.513 1.582 1.715 1.841 1.961 2.02 2.137 2.248 2.408 2.518 2.625 2.774 2.906 3.036 3.17 3.303 3.461 3.612 3.755 3.923 4.088 4.241 4.421 4.612 4.797 5.006 5.225 5.458 5.702 5.969 6.255 6.541 6.895 7.258 7.621 8.004 8.411 8.803 9.105 9.062 8.862 8.635 8.388 8.111 7.828 7.588 7.386 7.174 6.988 6.825 6.657 6.49 6.349 6.22 6.067 5.933 5.819 5.696 5.571 5.461 5.351 5.243 5.154 5.064 4.98 4.887 4.786 4.716 4.642 4.525 4.45 4.364 4.314 4.226 4.145 4.059 4.018 3.805 3.865 3.801 3.736 3.59 3.508 3.432 3.359 3.263 3.127 3.008 2.883 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt deleted file mode 100644 index 9a96198e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,1316 ,KEBNE ,16652423,Sun Nov 21 22:39:27 CET,Mon Nov 22 00:30:08 CET,0.0 0.505 0.63 0.759 0.88 0.985 1.069 1.137 1.276 1.344 1.405 1.343 1.566 1.614 1.723 1.828 1.92 1.967 2.056 2.151 2.303 2.394 2.48 2.606 2.731 2.861 2.982 3.084 3.219 3.355 3.487 3.641 3.78 3.917 4.088 4.291 4.485 4.698 4.915 5.129 5.37 5.638 5.945 6.277 6.645 7.033 7.453 7.897 8.445 9.024 9.49 9.639 9.56 9.404 9.24 9.044 8.818 8.603 8.406 8.2 8.013 7.842 7.667 7.49 7.308 7.14 6.982 6.835 6.701 6.57 6.437 6.326 6.221 6.11 6.019 5.922 5.819 5.707 5.588 5.5 5.407 5.264 5.165 5.063 5.009 4.901 4.805 4.705 4.644 4.406 4.439 4.368 4.299 4.147 4.023 3.881 3.755 3.641 3.538 3.412 3.166 -3 ,8254 ,KEBNE ,16652424,Sun Nov 21 22:39:31 CET,Mon Nov 22 00:29:42 CET,0.0 0.288 0.463 0.604 0.719 0.814 0.909 1.005 1.166 1.246 1.328 1.302 1.548 1.612 1.72 1.815 1.914 1.966 2.07 2.165 2.308 2.406 2.504 2.64 2.768 2.882 2.981 3.093 3.234 3.359 3.49 3.65 3.792 3.935 4.116 4.309 4.51 4.733 4.946 5.162 5.384 5.665 6.017 6.355 6.733 7.122 7.566 8.067 8.619 9.187 9.682 9.913 9.913 9.825 9.669 9.468 9.275 9.093 8.94 8.781 8.622 8.478 8.342 8.189 8.046 7.909 7.752 7.608 7.477 7.354 7.231 7.126 7.017 6.902 6.809 6.714 6.619 6.511 6.396 6.319 6.239 6.092 5.993 5.897 5.844 5.732 5.62 5.496 5.421 5.169 5.182 5.095 5.007 4.866 4.797 4.708 4.614 4.488 4.353 4.2 3.923 -5 ,16744 ,KEBNE ,16652426,Sun Nov 21 22:39:27 CET,Mon Nov 22 00:30:50 CET,0.0 0.524 0.651 0.738 0.814 0.888 0.951 1.025 1.193 1.278 1.36 1.335 1.579 1.641 1.755 1.867 1.987 2.043 2.137 2.225 2.36 2.443 2.527 2.647 2.765 2.883 3.0 3.111 3.247 3.379 3.5 3.641 3.782 3.933 4.109 4.299 4.476 4.669 4.882 5.101 5.331 5.601 5.92 6.224 6.559 6.949 7.401 7.849 8.316 8.87 9.45 9.663 9.622 9.494 9.308 9.067 8.821 8.601 8.408 8.213 8.034 7.862 7.673 7.483 7.319 7.164 7.006 6.88 6.747 6.603 6.478 6.371 6.257 6.146 6.059 5.96 5.859 5.754 5.648 5.579 5.501 5.377 5.292 5.193 5.138 5.019 4.903 4.792 4.73 4.489 4.516 4.445 4.382 4.242 4.156 4.065 3.967 3.847 3.689 3.504 3.112 -7 ,23276 ,KEBNE ,16652428,Sun Nov 21 22:40:29 CET,Mon Nov 22 00:30:34 CET,0.0 0.204 0.335 0.471 0.584 0.665 0.738 0.81 0.971 1.043 1.101 1.045 1.282 1.345 1.474 1.608 1.729 1.784 1.891 1.993 2.128 2.212 2.306 2.444 2.568 2.684 2.792 2.904 3.055 3.197 3.335 3.494 3.634 3.78 3.951 4.152 4.371 4.603 4.82 5.048 5.29 5.554 5.879 6.198 6.565 6.994 7.447 7.917 8.45 9.041 9.586 9.832 9.801 9.64 9.466 9.241 9.009 8.788 8.58 8.388 8.221 8.062 7.906 7.748 7.607 7.476 7.334 7.198 7.073 6.951 6.806 6.686 6.569 6.445 6.34 6.226 6.121 6.021 5.907 5.824 5.751 5.64 5.546 5.439 5.385 5.284 5.197 5.086 5.022 4.788 4.846 4.783 4.725 4.594 4.511 4.416 4.32 4.212 4.072 3.932 3.713 -8 ,10159 ,KEBNE ,16652429,Sun Nov 21 22:40:28 CET,Mon Nov 22 00:31:11 CET,0.0 0.192 0.317 0.443 0.56 0.672 0.759 0.837 0.97 1.041 1.115 1.074 1.317 1.376 1.492 1.609 1.715 1.77 1.867 1.954 2.094 2.192 2.286 2.417 2.533 2.648 2.751 2.858 3.013 3.158 3.301 3.469 3.625 3.776 3.966 4.179 4.37 4.576 4.809 5.073 5.344 5.633 5.952 6.269 6.62 6.996 7.431 7.884 8.368 8.921 9.431 9.601 9.602 9.481 9.315 9.141 8.951 8.775 8.602 8.419 8.266 8.101 7.931 7.781 7.635 7.485 7.326 7.194 7.069 6.93 6.788 6.659 6.514 6.363 6.257 6.155 6.057 5.953 5.836 5.748 5.657 5.525 5.424 5.328 5.281 5.163 5.038 4.91 4.843 4.601 4.656 4.596 4.523 4.365 4.279 4.194 4.105 3.99 3.848 3.682 3.493 -10 ,15632 ,KEBNE ,16652431,Sun Nov 21 22:40:32 CET,Mon Nov 22 00:29:08 CET,0.0 0.312 0.425 0.547 0.651 0.739 0.809 0.878 1.029 1.106 1.185 1.143 1.39 1.456 1.574 1.669 1.754 1.801 1.904 2.014 2.165 2.247 2.327 2.457 2.57 2.673 2.782 2.883 3.016 3.148 3.271 3.419 3.561 3.69 3.841 4.022 4.181 4.354 4.55 4.76 4.985 5.24 5.522 5.796 6.115 6.465 6.861 7.287 7.766 8.315 8.834 8.997 8.939 8.832 8.67 8.493 8.312 8.094 7.875 7.648 7.457 7.293 7.14 6.99 6.843 6.705 6.555 6.427 6.315 6.19 6.043 5.922 5.811 5.7 5.609 5.513 5.418 5.309 5.201 5.136 5.065 4.953 4.873 4.783 4.734 4.637 4.537 4.439 4.384 4.142 4.188 4.114 4.04 3.909 3.825 3.717 3.626 3.543 3.42 3.232 2.979 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index f8e634e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,13560 ,KEBNE ,16652433,Sun Nov 21 22:41:30 CET,Mon Nov 22 00:27:57 CET,0.0 1.207 1.503 1.731 1.927 2.098 2.262 2.405 2.653 2.76 2.87 2.912 3.161 3.246 3.413 3.557 3.678 3.732 3.854 3.985 4.169 4.273 4.366 4.507 4.64 4.769 4.882 4.983 5.104 5.211 5.323 5.445 5.551 5.665 5.809 5.965 6.104 6.259 6.411 6.568 6.737 6.914 7.069 7.194 7.327 7.444 7.554 7.61 7.525 7.206 6.409 5.246 4.273 3.472 2.743 2.039 1.402 0.83 0.344 -0.145 -0.559 -0.95 -1.339 -1.697 -2.038 -2.335 -2.636 -2.923 -3.174 -3.432 -3.711 -3.931 -4.157 -4.406 -4.607 -4.819 -5.037 -5.26 -5.484 -5.65 -5.816 -6.055 -6.229 -6.405 -6.502 -6.718 -6.927 -7.145 -7.267 -7.587 -7.737 -7.917 -8.108 -8.462 -8.651 -8.86 -9.102 -9.427 -9.852 -10.35 -11.696 -4 ,19801 ,KEBNE ,16652435,Sun Nov 21 22:42:32 CET,Mon Nov 22 00:29:20 CET,0.0 1.13 1.458 1.721 1.963 2.167 2.326 2.451 2.685 2.804 2.917 2.935 3.177 3.243 3.378 3.507 3.63 3.689 3.819 3.96 4.155 4.287 4.419 4.6 4.733 4.839 4.967 5.099 5.243 5.359 5.475 5.618 5.751 5.891 6.057 6.209 6.328 6.444 6.573 6.712 6.836 6.95 7.068 7.188 7.309 7.435 7.544 7.577 7.51 7.229 6.405 5.242 4.274 3.429 2.693 1.984 1.34 0.751 0.239 -0.295 -0.759 -1.146 -1.507 -1.857 -2.187 -2.493 -2.819 -3.091 -3.343 -3.606 -3.865 -4.081 -4.308 -4.539 -4.724 -4.924 -5.132 -5.343 -5.586 -5.755 -5.923 -6.229 -6.44 -6.653 -6.766 -7.0 -7.271 -7.54 -7.672 -8.002 -8.145 -8.328 -8.51 -8.93 -9.168 -9.41 -9.677 -10.007 -10.442 -10.931 -13.183 -5 ,171 ,KEBNE ,16652436,Sun Nov 21 22:42:32 CET,Mon Nov 22 00:29:09 CET,0.0 1.208 1.618 1.874 2.067 2.248 2.425 2.572 2.798 2.907 3.021 3.082 3.373 3.488 3.693 3.869 4.018 4.096 4.248 4.369 4.518 4.616 4.711 4.844 4.963 5.099 5.25 5.401 5.594 5.761 5.895 6.025 6.15 6.271 6.402 6.544 6.68 6.803 6.92 7.048 7.176 7.324 7.477 7.586 7.696 7.802 7.866 7.834 7.676 7.333 6.542 5.386 4.371 3.503 2.749 2.004 1.341 0.768 0.28 -0.227 -0.671 -1.057 -1.433 -1.792 -2.122 -2.441 -2.817 -3.147 -3.409 -3.663 -3.932 -4.177 -4.463 -4.778 -5.025 -5.267 -5.494 -5.72 -5.953 -6.123 -6.289 -6.537 -6.733 -6.946 -7.053 -7.276 -7.539 -7.847 -7.99 -8.315 -8.487 -8.683 -8.9 -9.344 -9.566 -9.811 -10.075 -10.385 -10.764 -11.382 -13.337 -6 ,26639 ,KEBNE ,16652437,Sun Nov 21 22:42:32 CET,Mon Nov 22 00:29:35 CET,0.0 1.167 1.471 1.713 1.902 2.056 2.205 2.337 2.547 2.653 2.765 2.812 3.08 3.176 3.338 3.48 3.634 3.702 3.809 3.917 4.086 4.188 4.282 4.4 4.507 4.623 4.739 4.838 4.985 5.133 5.24 5.357 5.471 5.577 5.701 5.847 5.961 6.089 6.242 6.385 6.516 6.639 6.781 6.919 7.046 7.133 7.185 7.169 7.028 6.701 5.965 4.901 3.913 3.03 2.26 1.583 0.97 0.409 -0.072 -0.581 -1.022 -1.401 -1.763 -2.099 -2.409 -2.701 -3.019 -3.306 -3.57 -3.845 -4.111 -4.335 -4.581 -4.843 -5.049 -5.251 -5.442 -5.664 -5.91 -6.064 -6.214 -6.46 -6.627 -6.8 -6.9 -7.124 -7.354 -7.584 -7.701 -7.998 -8.103 -8.256 -8.438 -8.89 -9.128 -9.368 -9.631 -9.953 -10.349 -10.903 -12.889 -7 ,26214 ,KEBNE ,16652438,Sun Nov 21 22:42:32 CET,Mon Nov 22 00:29:29 CET,0.0 1.123 1.486 1.724 1.903 2.041 2.189 2.362 2.636 2.733 2.828 2.846 3.097 3.17 3.319 3.464 3.594 3.651 3.768 3.874 4.012 4.111 4.208 4.348 4.486 4.621 4.734 4.835 4.972 5.095 5.222 5.375 5.498 5.609 5.731 5.87 6.013 6.16 6.302 6.443 6.576 6.703 6.839 6.951 7.064 7.188 7.263 7.241 7.126 6.847 6.162 5.063 3.986 3.083 2.316 1.57 0.912 0.302 -0.22 -0.722 -1.17 -1.586 -2.008 -2.392 -2.73 -3.035 -3.348 -3.627 -3.881 -4.158 -4.452 -4.686 -4.919 -5.162 -5.346 -5.533 -5.727 -5.949 -6.213 -6.395 -6.578 -6.855 -7.032 -7.216 -7.313 -7.524 -7.762 -8.031 -8.16 -8.453 -8.565 -8.733 -8.895 -9.256 -9.471 -9.721 -10.004 -10.296 -10.655 -11.111 -12.265 -9 ,17023 ,KEBNE ,16652440,Sun Nov 21 22:42:32 CET,Mon Nov 22 00:29:36 CET,0.0 0.971 1.265 1.49 1.688 1.875 2.043 2.173 2.408 2.525 2.631 2.655 2.924 3.009 3.137 3.262 3.389 3.449 3.55 3.65 3.787 3.872 3.959 4.087 4.202 4.308 4.412 4.514 4.65 4.777 4.885 5.026 5.171 5.294 5.416 5.545 5.663 5.79 5.923 6.064 6.219 6.381 6.539 6.668 6.789 6.855 6.912 6.942 6.855 6.565 5.77 4.666 3.684 2.782 2.017 1.317 0.682 0.096 -0.43 -0.935 -1.355 -1.744 -2.111 -2.45 -2.776 -3.087 -3.457 -3.816 -4.108 -4.405 -4.726 -4.994 -5.259 -5.533 -5.746 -5.953 -6.16 -6.39 -6.631 -6.789 -6.951 -7.198 -7.368 -7.567 -7.677 -7.912 -8.148 -8.385 -8.53 -8.859 -8.972 -9.14 -9.325 -9.708 -9.928 -10.161 -10.449 -10.777 -11.14 -11.639 -13.304 -10 ,14799 ,KEBNE ,16652441,Sun Nov 21 22:42:32 CET,Mon Nov 22 00:29:15 CET,0.0 0.935 1.238 1.465 1.674 1.861 2.019 2.139 2.348 2.437 2.518 2.544 2.796 2.866 3.01 3.15 3.28 3.343 3.466 3.586 3.743 3.829 3.908 4.024 4.132 4.249 4.375 4.493 4.639 4.777 4.901 5.054 5.201 5.334 5.479 5.639 5.797 5.961 6.114 6.264 6.408 6.539 6.682 6.822 6.95 7.023 7.053 7.078 7.053 6.801 6.054 4.869 3.784 2.882 2.109 1.356 0.674 0.094 -0.423 -0.955 -1.372 -1.733 -2.091 -2.436 -2.757 -3.05 -3.375 -3.667 -3.915 -4.162 -4.409 -4.604 -4.81 -5.039 -5.233 -5.457 -5.669 -5.867 -6.083 -6.246 -6.414 -6.661 -6.842 -7.045 -7.157 -7.362 -7.564 -7.801 -7.941 -8.264 -8.373 -8.522 -8.681 -9.049 -9.259 -9.495 -9.754 -10.069 -10.436 -10.879 -12.326 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt deleted file mode 100644 index 63c3fd50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27796 ,KEBNE ,16652442,Sun Nov 21 22:42:32 CET,Mon Nov 22 00:28:48 CET,0.0 0.691 0.872 0.996 1.09 1.172 1.243 1.308 1.431 1.483 1.529 1.457 1.666 1.698 1.761 1.824 1.883 1.906 1.944 1.978 2.009 2.03 2.051 2.079 2.103 2.126 2.153 2.17 2.185 2.207 2.228 2.241 2.236 2.233 2.222 2.188 2.148 2.096 2.023 1.943 1.843 1.69 1.495 1.279 0.989 0.602 0.072 -0.642 -1.693 -3.241 -5.657 -8.399 -10.5 -12.172 -13.583 -14.808 -15.878 -16.836 -17.635 -18.412 -19.054 -19.606 -20.216 -20.853 -21.428 -21.959 -22.506 -22.993 -23.426 -23.881 -24.359 -24.745 -25.137 -25.549 -25.882 -26.232 -26.575 -26.926 -27.288 -27.546 -27.808 -28.179 -28.423 -28.679 -28.823 -29.15 -29.495 -29.848 -30.053 -30.471 -30.748 -31.009 -31.28 -31.875 -32.206 -32.54 -32.927 -33.357 -33.834 -34.488 -42.279 -2 ,11465 ,KEBNE ,16652443,Sun Nov 21 22:42:36 CET,Mon Nov 22 00:29:34 CET,0.0 0.537 0.721 0.872 1.001 1.095 1.179 1.264 1.4 1.46 1.522 1.47 1.685 1.726 1.809 1.88 1.942 1.969 2.013 2.06 2.113 2.144 2.189 2.251 2.289 2.321 2.358 2.387 2.413 2.437 2.452 2.464 2.473 2.48 2.477 2.458 2.428 2.396 2.352 2.29 2.208 2.088 1.912 1.7 1.403 1.0 0.427 -0.341 -1.416 -3.096 -5.971 -9.301 -11.727 -13.5 -15.012 -16.482 -17.81 -18.951 -19.87 -20.701 -21.356 -21.939 -22.495 -23.002 -23.523 -24.06 -24.611 -25.077 -25.484 -25.907 -26.326 -26.687 -27.089 -27.496 -27.791 -28.098 -28.427 -28.765 -29.134 -29.383 -29.628 -30.006 -30.273 -30.569 -30.73 -31.066 -31.416 -31.792 -31.983 -32.357 -32.585 -32.82 -33.044 -33.515 -33.789 -34.084 -34.432 -34.876 -35.468 -36.23 -40.004 -3 ,4089 ,KEBNE ,16652444,Sun Nov 21 22:43:34 CET,Mon Nov 22 00:31:20 CET,0.0 0.593 0.779 0.92 1.023 1.113 1.183 1.244 1.357 1.411 1.458 1.372 1.566 1.6 1.674 1.736 1.783 1.807 1.858 1.904 1.962 1.997 2.025 2.054 2.08 2.105 2.132 2.154 2.176 2.197 2.209 2.216 2.21 2.2 2.184 2.161 2.133 2.085 2.019 1.934 1.823 1.674 1.481 1.261 0.95 0.528 -0.038 -0.761 -1.819 -3.445 -5.968 -8.808 -11.035 -12.893 -14.421 -15.675 -16.718 -17.637 -18.432 -19.229 -19.912 -20.489 -21.047 -21.637 -22.211 -22.732 -23.275 -23.764 -24.192 -24.646 -25.104 -25.469 -25.852 -26.225 -26.509 -26.816 -27.137 -27.493 -27.858 -28.107 -28.361 -28.798 -29.108 -29.409 -29.571 -29.894 -30.24 -30.627 -30.844 -31.258 -31.508 -31.742 -31.992 -32.569 -32.908 -33.252 -33.654 -34.064 -34.611 -35.489 -39.462 -4 ,635 ,KEBNE ,16652445,Sun Nov 21 22:43:34 CET,Mon Nov 22 00:29:24 CET,0.0 0.418 0.555 0.67 0.771 0.873 0.968 1.045 1.172 1.224 1.264 1.174 1.384 1.42 1.489 1.546 1.594 1.621 1.678 1.727 1.802 1.846 1.888 1.948 1.986 2.015 2.049 2.08 2.114 2.14 2.153 2.16 2.17 2.173 2.156 2.134 2.118 2.08 2.028 1.968 1.871 1.728 1.556 1.359 1.057 0.646 0.07 -0.703 -1.738 -3.224 -5.608 -8.346 -10.503 -12.266 -13.73 -14.988 -16.024 -16.929 -17.703 -18.505 -19.265 -19.982 -20.665 -21.292 -21.872 -22.463 -23.108 -23.674 -24.119 -24.523 -24.999 -25.444 -25.918 -26.375 -26.699 -27.03 -27.362 -27.702 -28.055 -28.301 -28.543 -28.937 -29.227 -29.531 -29.7 -30.045 -30.384 -30.755 -30.962 -31.371 -31.624 -31.843 -32.073 -32.62 -32.963 -33.337 -33.767 -34.309 -34.965 -35.834 -39.313 -5 ,5219 ,KEBNE ,16652446,Sun Nov 21 22:43:34 CET,Mon Nov 22 00:29:22 CET,0.0 0.53 0.677 0.811 0.928 1.03 1.12 1.193 1.323 1.381 1.432 1.363 1.569 1.608 1.686 1.768 1.845 1.874 1.916 1.957 2.018 2.061 2.097 2.137 2.172 2.2 2.222 2.247 2.289 2.319 2.332 2.339 2.342 2.341 2.335 2.318 2.29 2.267 2.225 2.149 2.058 1.933 1.763 1.565 1.302 0.945 0.434 -0.274 -1.302 -2.796 -5.187 -7.889 -9.998 -11.724 -13.134 -14.364 -15.43 -16.4 -17.226 -18.049 -18.772 -19.468 -20.134 -20.702 -21.255 -21.772 -22.309 -22.806 -23.238 -23.68 -24.12 -24.493 -24.887 -25.279 -25.579 -25.893 -26.217 -26.56 -26.945 -27.222 -27.507 -27.91 -28.172 -28.459 -28.613 -28.941 -29.295 -29.672 -29.889 -30.324 -30.627 -30.888 -31.177 -31.741 -32.049 -32.389 -32.748 -33.21 -33.819 -34.699 -41.576 -6 ,3484 ,KEBNE ,16652447,Sun Nov 21 22:43:34 CET,Mon Nov 22 00:29:51 CET,0.0 0.538 0.703 0.805 0.901 0.994 1.076 1.166 1.324 1.38 1.429 1.347 1.554 1.604 1.702 1.78 1.847 1.882 1.939 1.976 2.037 2.073 2.102 2.157 2.208 2.248 2.281 2.31 2.344 2.368 2.383 2.386 2.388 2.399 2.412 2.411 2.387 2.344 2.278 2.19 2.086 1.95 1.77 1.568 1.279 0.893 0.377 -0.335 -1.357 -2.828 -5.239 -8.02 -10.174 -11.943 -13.414 -14.684 -15.759 -16.739 -17.58 -18.372 -19.047 -19.706 -20.423 -21.107 -21.688 -22.218 -22.82 -23.356 -23.785 -24.196 -24.646 -25.06 -25.501 -25.936 -26.243 -26.549 -26.858 -27.196 -27.589 -27.861 -28.142 -28.567 -28.841 -29.118 -29.269 -29.605 -29.95 -30.294 -30.465 -30.836 -31.07 -31.32 -31.581 -32.182 -32.503 -32.848 -33.295 -33.772 -34.285 -35.066 -39.516 -7 ,10646 ,KEBNE ,16652448,Sun Nov 21 22:43:34 CET,Mon Nov 22 00:30:44 CET,0.0 0.546 0.712 0.834 0.936 1.024 1.098 1.167 1.297 1.358 1.417 1.358 1.558 1.59 1.661 1.728 1.791 1.82 1.872 1.923 1.993 2.025 2.05 2.087 2.113 2.149 2.191 2.213 2.235 2.263 2.284 2.29 2.289 2.286 2.272 2.244 2.211 2.158 2.094 2.014 1.911 1.78 1.597 1.373 1.078 0.701 0.16 -0.586 -1.634 -3.154 -5.585 -8.364 -10.541 -12.301 -13.762 -15.011 -16.103 -17.075 -17.9 -18.746 -19.508 -20.193 -20.818 -21.421 -22.019 -22.579 -23.179 -23.706 -24.121 -24.55 -24.996 -25.359 -25.75 -26.153 -26.46 -26.768 -27.095 -27.448 -27.817 -28.058 -28.3 -28.712 -29.012 -29.305 -29.449 -29.753 -30.077 -30.421 -30.593 -30.97 -31.213 -31.441 -31.689 -32.238 -32.533 -32.851 -33.195 -33.619 -34.229 -35.08 -41.125 -8 ,30330 ,KEBNE ,16652449,Sun Nov 21 22:43:34 CET,Mon Nov 22 00:29:40 CET,0.0 0.514 0.689 0.817 0.925 1.013 1.09 1.16 1.276 1.32 1.36 1.264 1.458 1.496 1.567 1.624 1.68 1.716 1.773 1.81 1.861 1.891 1.921 1.966 2.012 2.052 2.093 2.127 2.163 2.195 2.217 2.225 2.22 2.214 2.202 2.179 2.146 2.098 2.037 1.947 1.827 1.673 1.458 1.223 0.913 0.517 -0.019 -0.759 -1.833 -3.44 -5.985 -8.795 -10.971 -12.736 -14.196 -15.498 -16.598 -17.546 -18.337 -19.147 -19.907 -20.585 -21.18 -21.72 -22.2 -22.634 -23.142 -23.634 -24.066 -24.515 -24.971 -25.344 -25.749 -26.179 -26.516 -26.844 -27.159 -27.5 -27.863 -28.107 -28.374 -28.787 -29.073 -29.374 -29.526 -29.861 -30.21 -30.581 -30.785 -31.172 -31.41 -31.658 -31.906 -32.378 -32.643 -32.993 -33.358 -33.76 -34.213 -34.94 -38.457 -9 ,29078 ,KEBNE ,16652450,Sun Nov 21 22:45:41 CET,Mon Nov 22 00:28:32 CET,0.0 0.513 0.674 0.805 0.909 0.996 1.082 1.167 1.312 1.372 1.423 1.359 1.566 1.612 1.707 1.782 1.858 1.894 1.952 2.003 2.083 2.127 2.163 2.219 2.261 2.292 2.312 2.328 2.357 2.379 2.388 2.387 2.391 2.387 2.376 2.363 2.351 2.317 2.252 2.178 2.101 1.993 1.829 1.628 1.345 0.962 0.415 -0.339 -1.418 -2.997 -5.5 -8.371 -10.637 -12.456 -13.938 -15.175 -16.223 -17.29 -18.191 -18.996 -19.683 -20.283 -20.87 -21.415 -21.879 -22.337 -22.867 -23.343 -23.757 -24.198 -24.655 -25.024 -25.41 -25.813 -26.119 -26.438 -26.777 -27.107 -27.451 -27.699 -27.971 -28.439 -28.758 -29.07 -29.231 -29.547 -29.878 -30.23 -30.411 -30.784 -30.983 -31.205 -31.426 -31.902 -32.215 -32.553 -32.875 -33.256 -33.74 -34.443 -37.996 -10 ,1622 ,KEBNE ,16652451,Sun Nov 21 22:46:42 CET,Mon Nov 22 00:26:21 CET,0.0 0.673 0.837 0.957 1.061 1.146 1.225 1.3 1.413 1.459 1.498 1.412 1.617 1.653 1.746 1.825 1.879 1.906 1.965 2.019 2.101 2.15 2.19 2.245 2.29 2.328 2.355 2.376 2.406 2.437 2.462 2.481 2.495 2.497 2.492 2.485 2.464 2.425 2.368 2.303 2.223 2.102 1.933 1.735 1.464 1.102 0.602 -0.085 -1.078 -2.546 -4.877 -7.484 -9.566 -11.294 -12.708 -13.93 -14.982 -15.913 -16.793 -17.752 -18.512 -19.185 -19.785 -20.286 -20.796 -21.285 -21.746 -22.18 -22.605 -23.037 -23.489 -23.862 -24.249 -24.659 -24.961 -25.266 -25.596 -25.93 -26.297 -26.588 -26.882 -27.294 -27.564 -27.846 -28.004 -28.328 -28.688 -29.087 -29.279 -29.669 -29.919 -30.182 -30.453 -30.996 -31.308 -31.654 -32.011 -32.43 -33.007 -33.854 -37.225 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 90e8d5fc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,5764 ,TETRA ,17982133,Tue Dec 21 08:30:15 CET,Tue Dec 21 10:46:35 CET,0.0 0.803 1.106 1.329 1.509 1.675 1.829 1.964 2.215 2.337 2.461 2.52 2.786 2.874 3.039 3.193 3.339 3.409 3.532 3.656 3.832 3.939 4.043 4.2 4.346 4.485 4.613 4.727 4.876 5.021 5.16 5.328 5.482 5.626 5.805 5.995 6.154 6.333 6.518 6.707 6.904 7.106 7.34 7.58 7.839 8.094 8.34 8.561 8.768 8.862 8.603 7.969 7.321 6.732 6.187 5.667 5.202 4.77 4.398 4.021 3.691 3.386 3.084 2.816 2.57 2.323 2.06 1.785 1.506 1.209 0.903 0.646 0.385 0.114 -0.103 -0.318 -0.546 -0.782 -1.03 -1.207 -1.38 -1.647 -1.839 -2.048 -2.161 -2.396 -2.632 -2.878 -3.008 -3.308 -3.419 -3.572 -3.738 -4.115 -4.325 -4.553 -4.801 -5.077 -5.41 -5.819 -6.928 -4 ,7029 ,TETRA ,17982135,Tue Dec 21 08:30:15 CET,Tue Dec 21 10:42:55 CET,0.0 0.785 1.102 1.348 1.549 1.728 1.891 2.019 2.25 2.354 2.452 2.484 2.736 2.813 2.977 3.164 3.332 3.405 3.522 3.629 3.791 3.891 3.997 4.159 4.314 4.468 4.599 4.709 4.857 5.001 5.124 5.273 5.426 5.575 5.747 5.949 6.154 6.372 6.564 6.761 6.974 7.196 7.448 7.676 7.939 8.196 8.44 8.671 8.792 8.809 8.615 8.092 7.511 6.909 6.331 5.788 5.312 4.881 4.503 4.112 3.785 3.485 3.18 2.886 2.588 2.275 1.914 1.588 1.323 1.048 0.743 0.476 0.194 -0.084 -0.302 -0.527 -0.757 -0.998 -1.244 -1.418 -1.608 -1.91 -2.123 -2.348 -2.456 -2.662 -2.892 -3.138 -3.265 -3.562 -3.676 -3.831 -3.994 -4.344 -4.529 -4.735 -4.979 -5.262 -5.57 -5.967 -7.006 -5 ,27159 ,TETRA ,17982136,Tue Dec 21 08:30:16 CET,Tue Dec 21 10:47:07 CET,0.0 0.922 1.252 1.505 1.714 1.876 2.029 2.173 2.403 2.515 2.625 2.65 2.896 2.977 3.15 3.324 3.479 3.548 3.686 3.814 3.97 4.077 4.197 4.354 4.482 4.598 4.727 4.855 5.015 5.164 5.301 5.465 5.616 5.772 5.949 6.139 6.337 6.553 6.789 7.053 7.306 7.562 7.823 8.072 8.37 8.653 8.939 9.226 9.454 9.534 9.277 8.7 8.081 7.489 6.928 6.402 5.942 5.499 4.994 4.388 3.863 3.4 2.954 2.523 2.194 1.952 1.668 1.369 1.084 0.785 0.47 0.201 -0.076 -0.372 -0.596 -0.824 -1.066 -1.308 -1.573 -1.728 -1.881 -2.164 -2.357 -2.569 -2.682 -2.913 -3.141 -3.393 -3.534 -3.848 -3.981 -4.138 -4.303 -4.654 -4.853 -5.086 -5.34 -5.6 -5.904 -6.351 -7.592 -6 ,792 ,TETRA ,17982137,Tue Dec 21 08:30:13 CET,Tue Dec 21 10:47:19 CET,0.0 0.917 1.285 1.542 1.743 1.908 2.047 2.175 2.402 2.51 2.624 2.661 2.905 2.987 3.137 3.262 3.384 3.45 3.573 3.679 3.835 3.951 4.056 4.177 4.289 4.402 4.523 4.652 4.808 4.948 5.078 5.219 5.36 5.495 5.639 5.798 5.945 6.111 6.291 6.48 6.674 6.871 7.07 7.27 7.491 7.706 7.925 8.096 8.192 8.175 7.876 7.204 6.527 5.882 5.279 4.713 4.19 3.618 3.021 2.436 1.942 1.478 1.049 0.642 0.257 -0.086 -0.45 -0.762 -1.026 -1.318 -1.627 -1.886 -2.157 -2.442 -2.67 -2.919 -3.183 -3.447 -3.712 -3.886 -4.07 -4.375 -4.59 -4.808 -4.917 -5.146 -5.386 -5.639 -5.775 -6.083 -6.215 -6.39 -6.565 -6.92 -7.108 -7.314 -7.536 -7.788 -8.121 -8.525 -9.344 -7 ,3745 ,TETRA ,17982138,Tue Dec 21 08:30:14 CET,Tue Dec 21 10:48:10 CET,0.0 0.908 1.23 1.483 1.677 1.823 1.954 2.085 2.3 2.406 2.507 2.521 2.772 2.856 2.998 3.139 3.265 3.32 3.445 3.567 3.728 3.831 3.936 4.09 4.226 4.339 4.449 4.569 4.727 4.869 4.999 5.159 5.32 5.474 5.637 5.809 5.98 6.174 6.363 6.539 6.728 6.951 7.206 7.447 7.694 7.916 8.13 8.36 8.577 8.677 8.532 8.021 7.422 6.86 6.308 5.743 5.233 4.789 4.422 4.047 3.706 3.4 3.104 2.768 2.389 2.032 1.662 1.335 1.044 0.733 0.419 0.166 -0.105 -0.396 -0.619 -0.852 -1.094 -1.337 -1.592 -1.767 -1.948 -2.231 -2.422 -2.608 -2.712 -2.941 -3.187 -3.457 -3.597 -3.907 -4.012 -4.157 -4.315 -4.65 -4.842 -5.057 -5.277 -5.508 -5.798 -6.191 -7.361 -8 ,7878 ,TETRA ,17982139,Tue Dec 21 08:30:16 CET,Tue Dec 21 10:47:57 CET,0.0 0.82 1.176 1.45 1.642 1.817 1.974 2.098 2.315 2.419 2.516 2.52 2.767 2.848 2.996 3.126 3.259 3.331 3.475 3.599 3.76 3.874 3.988 4.148 4.3 4.446 4.577 4.692 4.834 4.973 5.123 5.31 5.487 5.653 5.84 6.044 6.225 6.408 6.603 6.804 7.016 7.256 7.518 7.757 7.997 8.253 8.527 8.754 8.909 8.935 8.645 8.054 7.45 6.824 6.251 5.683 5.026 4.322 3.776 3.321 2.897 2.451 2.07 1.775 1.448 1.148 0.819 0.48 0.19 -0.112 -0.426 -0.688 -0.954 -1.221 -1.434 -1.662 -1.903 -2.133 -2.376 -2.564 -2.754 -3.053 -3.268 -3.495 -3.611 -3.833 -4.069 -4.32 -4.455 -4.766 -4.903 -5.069 -5.24 -5.615 -5.831 -6.053 -6.294 -6.588 -6.916 -7.307 -8.293 -9 ,18810 ,TETRA ,17982140,Tue Dec 21 08:30:18 CET,Tue Dec 21 10:45:45 CET,0.0 0.933 1.271 1.496 1.667 1.816 1.962 2.093 2.318 2.423 2.526 2.55 2.805 2.89 3.043 3.186 3.309 3.363 3.479 3.601 3.791 3.9 3.983 4.113 4.245 4.364 4.474 4.583 4.735 4.884 5.03 5.21 5.374 5.526 5.688 5.866 6.035 6.211 6.395 6.588 6.779 6.97 7.208 7.459 7.716 7.953 8.201 8.416 8.584 8.689 8.465 7.823 7.111 6.456 5.862 5.294 4.798 4.334 3.933 3.548 3.207 2.909 2.543 2.157 1.808 1.46 1.094 0.759 0.459 0.175 -0.118 -0.385 -0.665 -0.952 -1.176 -1.412 -1.664 -1.906 -2.155 -2.338 -2.528 -2.834 -3.063 -3.294 -3.409 -3.645 -3.889 -4.149 -4.283 -4.603 -4.742 -4.893 -5.058 -5.419 -5.613 -5.827 -6.059 -6.329 -6.654 -7.035 -8.131 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index dac24b64..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5115 ,KEBNE ,16652452,Sun Nov 21 22:47:40 CET,Mon Nov 22 00:33:36 CET,0.0 1.19 1.525 1.771 1.988 2.151 2.297 2.455 2.704 2.799 2.886 2.897 3.135 3.199 3.316 3.432 3.552 3.608 3.709 3.808 3.947 4.032 4.114 4.231 4.331 4.422 4.524 4.623 4.741 4.845 4.939 5.064 5.177 5.269 5.384 5.51 5.627 5.734 5.831 5.932 6.032 6.149 6.248 6.291 6.31 6.309 6.247 6.09 5.783 5.2 4.063 2.57 1.268 0.135 -0.807 -1.666 -2.47 -3.179 -3.801 -4.452 -4.997 -5.463 -5.896 -6.336 -6.788 -7.173 -7.533 -7.855 -8.174 -8.544 -8.938 -9.266 -9.593 -9.942 -10.228 -10.501 -10.78 -11.089 -11.408 -11.627 -11.855 -12.209 -12.449 -12.698 -12.828 -13.089 -13.371 -13.67 -13.823 -14.163 -14.345 -14.533 -14.727 -15.135 -15.358 -15.6 -15.9 -16.227 -16.6 -17.133 -19.209 -2 ,32594 ,KEBNE ,16652453,Sun Nov 21 22:47:40 CET,Mon Nov 22 00:33:43 CET,0.0 0.752 1.036 1.267 1.427 1.57 1.718 1.859 2.104 2.221 2.336 2.37 2.616 2.701 2.865 2.997 3.11 3.162 3.27 3.38 3.517 3.599 3.681 3.796 3.902 4.007 4.1 4.178 4.285 4.391 4.504 4.656 4.792 4.913 5.05 5.193 5.334 5.467 5.575 5.685 5.807 5.922 6.038 6.122 6.164 6.177 6.125 5.958 5.662 5.057 3.84 2.298 1.006 -0.119 -1.107 -1.98 -2.745 -3.449 -4.033 -4.619 -5.151 -5.626 -6.067 -6.468 -6.834 -7.195 -7.633 -8.046 -8.406 -8.793 -9.19 -9.526 -9.881 -10.244 -10.526 -10.812 -11.111 -11.428 -11.761 -11.983 -12.208 -12.557 -12.799 -13.065 -13.2 -13.481 -13.774 -14.09 -14.268 -14.627 -14.837 -15.053 -15.275 -15.713 -15.962 -16.248 -16.569 -16.893 -17.258 -17.848 -20.224 -4 ,10276 ,KEBNE ,16652455,Sun Nov 21 22:47:40 CET,Mon Nov 22 00:33:34 CET,0.0 0.853 1.172 1.405 1.594 1.767 1.935 2.065 2.316 2.439 2.541 2.578 2.835 2.919 3.069 3.199 3.308 3.375 3.518 3.639 3.813 3.923 4.016 4.135 4.256 4.364 4.457 4.543 4.654 4.755 4.859 4.989 5.101 5.212 5.326 5.438 5.545 5.667 5.804 5.942 6.064 6.169 6.254 6.311 6.354 6.4 6.409 6.287 5.986 5.416 4.353 2.896 1.587 0.42 -0.597 -1.501 -2.265 -2.927 -3.63 -4.423 -5.078 -5.66 -6.22 -6.743 -7.232 -7.678 -8.129 -8.539 -8.895 -9.26 -9.634 -9.947 -10.276 -10.614 -10.865 -11.112 -11.382 -11.683 -12.002 -12.216 -12.436 -12.78 -13.011 -13.263 -13.402 -13.69 -13.998 -14.331 -14.504 -14.857 -15.056 -15.253 -15.445 -15.877 -16.113 -16.367 -16.681 -17.057 -17.491 -18.047 -20.208 -5 ,23473 ,KEBNE ,16652456,Sun Nov 21 22:47:40 CET,Mon Nov 22 00:33:41 CET,0.0 1.037 1.356 1.574 1.757 1.927 2.071 2.189 2.404 2.494 2.57 2.575 2.817 2.883 3.017 3.159 3.295 3.352 3.471 3.585 3.735 3.825 3.91 4.037 4.15 4.259 4.364 4.455 4.572 4.676 4.788 4.919 5.036 5.15 5.269 5.386 5.485 5.595 5.694 5.794 5.888 5.986 6.117 6.233 6.313 6.31 6.238 6.099 5.803 5.246 4.174 2.711 1.386 0.238 -0.734 -1.611 -2.349 -3.007 -3.578 -4.148 -4.642 -5.088 -5.509 -5.967 -6.388 -6.771 -7.228 -7.635 -7.983 -8.35 -8.715 -9.011 -9.344 -9.694 -9.955 -10.227 -10.507 -10.796 -11.093 -11.296 -11.513 -11.855 -12.093 -12.345 -12.48 -12.756 -13.04 -13.343 -13.506 -13.863 -14.062 -14.255 -14.449 -14.87 -15.111 -15.387 -15.711 -16.101 -16.568 -17.154 -19.214 -7 ,1000 ,KEBNE ,16652458,Sun Nov 21 22:47:44 CET,Mon Nov 22 00:33:51 CET,0.0 1.052 1.302 1.481 1.659 1.84 1.991 2.107 2.352 2.483 2.594 2.602 2.859 2.963 3.145 3.297 3.431 3.487 3.587 3.691 3.828 3.906 3.987 4.116 4.235 4.346 4.457 4.553 4.663 4.769 4.878 5.009 5.122 5.216 5.323 5.432 5.532 5.638 5.744 5.844 5.957 6.091 6.208 6.282 6.327 6.365 6.34 6.141 5.779 5.084 3.779 2.322 1.12 0.049 -0.91 -1.754 -2.491 -3.208 -3.815 -4.417 -5.041 -5.644 -6.195 -6.71 -7.183 -7.604 -8.042 -8.441 -8.79 -9.167 -9.568 -9.905 -10.254 -10.621 -10.899 -11.17 -11.455 -11.766 -12.097 -12.331 -12.569 -12.926 -13.174 -13.42 -13.543 -13.808 -14.098 -14.391 -14.542 -14.883 -15.077 -15.26 -15.441 -15.873 -16.109 -16.356 -16.635 -16.943 -17.296 -17.741 -19.607 -8 ,31245 ,KEBNE ,16652459,Sun Nov 21 22:48:41 CET,Mon Nov 22 00:35:30 CET,0.0 0.941 1.265 1.528 1.749 1.916 2.072 2.224 2.487 2.603 2.71 2.735 2.973 3.032 3.15 3.267 3.393 3.455 3.565 3.665 3.816 3.91 3.995 4.132 4.268 4.375 4.473 4.583 4.724 4.844 4.954 5.091 5.221 5.342 5.474 5.607 5.732 5.851 5.966 6.1 6.223 6.344 6.471 6.556 6.623 6.683 6.691 6.576 6.283 5.727 4.602 3.175 1.919 0.794 -0.142 -1.015 -1.779 -2.436 -3.022 -3.651 -4.28 -4.897 -5.471 -5.988 -6.474 -6.873 -7.3 -7.736 -8.089 -8.456 -8.848 -9.159 -9.49 -9.846 -10.14 -10.441 -10.745 -11.074 -11.413 -11.641 -11.869 -12.233 -12.495 -12.756 -12.891 -13.167 -13.452 -13.774 -13.946 -14.302 -14.48 -14.667 -14.888 -15.361 -15.598 -15.863 -16.154 -16.54 -17.061 -17.809 -20.225 -9 ,16325 ,KEBNE ,16652460,Sun Nov 21 22:49:43 CET,Mon Nov 22 00:37:40 CET,0.0 1.357 1.698 1.934 2.111 2.276 2.42 2.532 2.732 2.844 2.96 2.973 3.225 3.311 3.467 3.634 3.789 3.852 3.949 4.065 4.242 4.332 4.417 4.534 4.641 4.749 4.856 4.948 5.051 5.144 5.228 5.325 5.422 5.522 5.624 5.725 5.816 5.895 5.988 6.087 6.166 6.25 6.339 6.384 6.39 6.381 6.321 6.168 5.84 5.209 3.985 2.446 1.204 0.144 -0.756 -1.572 -2.314 -2.999 -3.672 -4.449 -5.16 -5.819 -6.386 -6.887 -7.372 -7.815 -8.275 -8.687 -9.043 -9.402 -9.791 -10.127 -10.47 -10.822 -11.094 -11.387 -11.696 -12.0 -12.314 -12.535 -12.76 -13.1 -13.345 -13.602 -13.739 -14.036 -14.348 -14.675 -14.838 -15.17 -15.328 -15.503 -15.688 -16.125 -16.381 -16.655 -16.958 -17.288 -17.646 -18.148 -19.754 -10 ,14107 ,KEBNE ,16652461,Sun Nov 21 22:49:43 CET,Mon Nov 22 00:36:05 CET,0.0 1.051 1.36 1.561 1.728 1.901 2.06 2.191 2.415 2.526 2.649 2.693 2.948 3.037 3.2 3.343 3.477 3.543 3.675 3.793 3.965 4.084 4.188 4.306 4.423 4.535 4.636 4.726 4.831 4.941 5.043 5.151 5.25 5.342 5.443 5.562 5.665 5.769 5.891 6.002 6.093 6.182 6.268 6.342 6.396 6.407 6.359 6.223 5.924 5.338 4.157 2.598 1.283 0.168 -0.825 -1.716 -2.483 -3.202 -3.8 -4.424 -5.049 -5.635 -6.186 -6.723 -7.221 -7.682 -8.161 -8.584 -8.956 -9.323 -9.713 -10.039 -10.368 -10.722 -10.996 -11.268 -11.546 -11.861 -12.199 -12.422 -12.659 -13.021 -13.253 -13.506 -13.64 -13.913 -14.198 -14.515 -14.688 -15.031 -15.209 -15.396 -15.585 -15.983 -16.212 -16.463 -16.745 -17.078 -17.487 -18.088 -19.594 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index c5178537..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30342 ,TETRA ,17982152,Tue Dec 21 08:30:45 CET,Tue Dec 21 10:46:49 CET,0.0 0.788 1.108 1.343 1.525 1.691 1.842 1.976 2.237 2.367 2.487 2.52 2.813 2.925 3.128 3.304 3.471 3.558 3.73 3.872 4.069 4.208 4.342 4.533 4.715 4.891 5.068 5.24 5.462 5.681 5.89 6.149 6.404 6.637 6.925 7.271 7.596 7.964 8.35 8.752 9.198 9.705 10.276 10.837 11.517 12.247 13.071 13.992 15.014 16.231 17.45 18.11 18.35 18.387 18.246 18.064 17.872 17.655 17.472 17.249 17.012 16.797 16.584 16.372 16.173 15.993 15.793 15.607 15.45 15.271 15.056 14.878 14.69 14.501 14.366 14.212 14.054 13.886 13.711 13.596 13.469 13.255 13.124 13.007 12.933 12.773 12.618 12.441 12.341 12.065 12.004 11.886 11.757 11.489 11.327 11.131 10.935 10.741 10.486 10.112 8.593 -2 ,21322 ,TETRA ,17982153,Tue Dec 21 08:30:45 CET,Tue Dec 21 10:47:44 CET,0.0 0.606 0.83 1.024 1.224 1.404 1.549 1.676 1.923 2.036 2.14 2.173 2.468 2.573 2.761 2.924 3.082 3.166 3.34 3.504 3.722 3.857 3.98 4.167 4.361 4.538 4.7 4.863 5.09 5.332 5.565 5.838 6.096 6.361 6.675 7.016 7.352 7.722 8.111 8.523 8.969 9.471 10.023 10.569 11.188 11.863 12.612 13.418 14.375 15.45 16.605 17.348 17.564 17.628 17.58 17.41 17.215 17.017 16.842 16.659 16.468 16.279 16.105 15.936 15.754 15.578 15.384 15.217 15.074 14.906 14.729 14.586 14.424 14.236 14.071 13.914 13.777 13.639 13.462 13.327 13.205 13.028 12.892 12.741 12.664 12.49 12.315 12.145 12.057 11.798 11.764 11.648 11.524 11.25 11.094 10.902 10.671 10.427 10.138 9.764 8.302 -3 ,7554 ,TETRA ,17982154,Tue Dec 21 08:30:45 CET,Tue Dec 21 10:47:54 CET,0.0 0.753 1.082 1.354 1.558 1.719 1.871 2.011 2.25 2.357 2.476 2.55 2.845 2.95 3.177 3.371 3.547 3.633 3.804 3.983 4.246 4.413 4.565 4.767 4.95 5.139 5.325 5.501 5.729 5.941 6.151 6.417 6.688 6.951 7.234 7.543 7.852 8.193 8.574 9.011 9.462 9.93 10.475 11.05 11.724 12.474 13.325 14.276 15.336 16.461 17.571 18.308 18.624 18.663 18.603 18.474 18.303 18.093 17.88 17.678 17.489 17.303 17.1 16.862 16.633 16.421 16.216 16.034 15.869 15.706 15.531 15.381 15.227 15.066 14.931 14.789 14.646 14.466 14.276 14.168 14.055 13.862 13.735 13.608 13.54 13.39 13.222 13.043 12.939 12.663 12.633 12.526 12.386 12.051 11.869 11.676 11.452 11.189 10.87 10.474 9.283 -4 ,19989 ,TETRA ,17982155,Tue Dec 21 08:30:46 CET,Tue Dec 21 10:47:43 CET,0.0 0.708 0.967 1.18 1.358 1.519 1.674 1.827 2.081 2.19 2.3 2.304 2.576 2.67 2.846 3.024 3.191 3.264 3.407 3.55 3.764 3.901 4.038 4.239 4.438 4.626 4.798 4.966 5.186 5.412 5.637 5.899 6.148 6.381 6.651 6.969 7.279 7.6 7.955 8.368 8.779 9.22 9.74 10.252 10.863 11.53 12.299 13.224 14.174 15.138 16.275 16.977 17.129 17.059 16.913 16.675 16.445 16.251 16.055 15.84 15.639 15.459 15.271 15.09 14.919 14.749 14.563 14.396 14.25 14.083 13.904 13.747 13.593 13.452 13.342 13.221 13.091 12.96 12.813 12.703 12.584 12.401 12.281 12.148 12.074 11.929 11.773 11.6 11.505 11.244 11.178 11.045 10.92 10.675 10.537 10.381 10.138 9.844 9.522 9.135 7.813 -5 ,9017 ,TETRA ,17982156,Tue Dec 21 08:30:45 CET,Tue Dec 21 10:47:41 CET,0.0 0.756 1.039 1.232 1.411 1.58 1.724 1.871 2.151 2.272 2.39 2.41 2.697 2.805 3.012 3.197 3.367 3.449 3.61 3.771 4.007 4.158 4.295 4.5 4.714 4.915 5.109 5.293 5.517 5.747 5.983 6.249 6.501 6.759 7.058 7.375 7.683 8.042 8.437 8.873 9.332 9.817 10.373 10.93 11.609 12.36 13.207 14.197 15.362 16.562 17.741 18.46 18.71 18.739 18.667 18.54 18.349 18.125 17.929 17.726 17.511 17.303 17.102 16.906 16.728 16.554 16.364 16.195 16.042 15.87 15.693 15.542 15.371 15.198 15.064 14.922 14.756 14.578 14.397 14.271 14.139 13.929 13.781 13.629 13.546 13.37 13.2 13.032 12.941 12.671 12.612 12.5 12.398 12.179 12.043 11.882 11.719 11.522 11.243 10.83 9.39 -6 ,10318 ,TETRA ,17982157,Tue Dec 21 08:30:45 CET,Tue Dec 21 10:47:12 CET,0.0 0.695 1.004 1.225 1.42 1.598 1.763 1.904 2.153 2.27 2.392 2.441 2.74 2.85 3.053 3.246 3.415 3.501 3.674 3.835 4.069 4.217 4.352 4.55 4.752 4.944 5.137 5.33 5.57 5.78 5.977 6.215 6.441 6.675 6.945 7.242 7.521 7.834 8.193 8.586 9.011 9.518 10.102 10.646 11.252 11.911 12.67 13.531 14.572 15.679 16.785 17.537 17.795 17.89 17.816 17.613 17.421 17.211 16.996 16.785 16.615 16.462 16.302 16.135 15.956 15.784 15.583 15.396 15.26 15.115 14.942 14.785 14.623 14.459 14.331 14.2 14.045 13.885 13.728 13.617 13.493 13.29 13.153 13.0 12.925 12.753 12.569 12.393 12.293 12.014 11.957 11.83 11.688 11.356 11.176 11.009 10.827 10.605 10.301 9.878 8.721 -7 ,4996 ,TETRA ,17982158,Tue Dec 21 08:30:45 CET,Tue Dec 21 10:47:32 CET,0.0 0.692 0.993 1.237 1.444 1.637 1.806 1.965 2.258 2.388 2.508 2.546 2.841 2.946 3.156 3.36 3.539 3.622 3.799 3.972 4.194 4.345 4.499 4.72 4.94 5.145 5.332 5.514 5.753 5.987 6.212 6.484 6.748 7.004 7.307 7.647 7.954 8.264 8.597 8.953 9.339 9.787 10.293 10.797 11.387 12.014 12.725 13.598 14.602 15.697 16.828 17.498 17.77 17.791 17.661 17.504 17.333 17.15 16.97 16.757 16.559 16.36 16.164 15.972 15.788 15.624 15.428 15.252 15.106 14.952 14.777 14.626 14.48 14.337 14.22 14.079 13.936 13.804 13.667 13.569 13.467 13.308 13.189 13.057 12.989 12.852 12.682 12.477 12.369 12.097 12.048 11.924 11.797 11.524 11.385 11.23 11.046 10.853 10.612 10.143 8.717 -8 ,5744 ,TETRA ,17982159,Tue Dec 21 08:30:45 CET,Tue Dec 21 10:46:58 CET,0.0 0.414 0.681 0.908 1.114 1.297 1.471 1.623 1.869 1.983 2.095 2.135 2.427 2.531 2.738 2.927 3.11 3.205 3.381 3.534 3.758 3.906 4.058 4.281 4.496 4.695 4.887 5.074 5.305 5.528 5.752 6.022 6.28 6.545 6.848 7.18 7.507 7.854 8.222 8.599 8.983 9.416 9.911 10.397 10.982 11.679 12.484 13.296 14.273 15.41 16.459 17.105 17.321 17.276 17.161 17.021 16.859 16.69 16.5 16.275 16.081 15.899 15.704 15.503 15.291 15.111 14.91 14.708 14.541 14.359 14.173 14.03 13.881 13.723 13.593 13.443 13.281 13.116 12.937 12.798 12.653 12.43 12.272 12.111 12.021 11.836 11.647 11.434 11.33 11.063 11.009 10.876 10.726 10.407 10.239 10.031 9.803 9.55 9.179 8.678 7.314 -10 ,12090 ,TETRA ,17982161,Tue Dec 21 08:30:48 CET,Tue Dec 21 10:46:22 CET,0.0 0.482 0.73 0.956 1.157 1.318 1.473 1.622 1.881 2.003 2.129 2.172 2.46 2.551 2.72 2.88 3.037 3.12 3.287 3.441 3.659 3.803 3.942 4.147 4.348 4.544 4.737 4.927 5.17 5.404 5.634 5.903 6.154 6.392 6.678 7.023 7.355 7.706 8.076 8.444 8.834 9.322 9.856 10.325 10.856 11.486 12.219 12.978 13.841 14.783 15.899 16.701 16.907 16.94 16.898 16.775 16.587 16.364 16.181 15.983 15.776 15.572 15.366 15.173 14.987 14.799 14.588 14.392 14.23 14.049 13.856 13.709 13.548 13.384 13.256 13.121 12.98 12.826 12.66 12.55 12.442 12.259 12.126 11.981 11.902 11.716 11.511 11.314 11.211 10.934 10.879 10.773 10.642 10.302 10.12 9.94 9.738 9.519 9.23 8.763 6.826 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt deleted file mode 100644 index 06a12abe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21537 ,KEBNE ,16652462,Sun Nov 21 22:49:43 CET,Mon Nov 22 00:36:20 CET,0.0 0.482 0.711 0.873 1.009 1.129 1.236 1.326 1.466 1.536 1.606 1.575 1.82 1.867 1.944 2.023 2.084 2.109 2.157 2.187 2.237 2.282 2.323 2.368 2.419 2.46 2.488 2.52 2.561 2.58 2.572 2.555 2.551 2.552 2.53 2.479 2.417 2.333 2.223 2.08 1.937 1.778 1.543 1.221 0.774 0.207 -0.605 -1.718 -3.254 -5.447 -8.994 -13.019 -16.12 -18.613 -20.653 -22.426 -23.897 -25.166 -26.262 -27.31 -28.174 -28.929 -29.631 -30.293 -30.897 -31.429 -31.984 -32.491 -32.933 -33.389 -33.837 -34.203 -34.589 -34.956 -35.23 -35.53 -35.848 -36.184 -36.534 -36.772 -37.015 -37.393 -37.651 -37.92 -38.058 -38.333 -38.613 -38.924 -39.093 -39.482 -39.597 -39.765 -39.942 -40.344 -40.561 -40.813 -41.091 -41.383 -41.752 -42.282 -44.096 -2 ,31306 ,KEBNE ,16652463,Sun Nov 21 22:50:44 CET,Mon Nov 22 00:37:30 CET,0.0 0.52 0.771 0.939 1.067 1.181 1.292 1.387 1.531 1.595 1.658 1.599 1.847 1.909 2.005 2.084 2.164 2.199 2.26 2.314 2.389 2.446 2.504 2.584 2.634 2.682 2.735 2.774 2.824 2.863 2.872 2.857 2.834 2.802 2.778 2.747 2.685 2.624 2.534 2.416 2.322 2.2 1.989 1.683 1.193 0.542 -0.343 -1.498 -3.107 -5.458 -9.188 -13.293 -16.427 -18.958 -21.041 -22.837 -24.314 -25.591 -26.692 -27.817 -28.745 -29.517 -30.241 -30.925 -31.533 -32.06 -32.614 -33.111 -33.549 -34.011 -34.485 -34.858 -35.216 -35.605 -35.917 -36.228 -36.559 -36.916 -37.278 -37.521 -37.778 -38.189 -38.473 -38.752 -38.888 -39.171 -39.469 -39.782 -39.947 -40.337 -40.485 -40.676 -40.881 -41.39 -41.663 -41.931 -42.21 -42.509 -42.875 -43.397 -45.465 -6 ,17188 ,KEBNE ,16652467,Sun Nov 21 22:50:44 CET,Mon Nov 22 00:36:49 CET,0.0 0.653 0.889 1.048 1.144 1.219 1.304 1.401 1.573 1.658 1.743 1.685 1.914 1.956 2.031 2.108 2.184 2.217 2.279 2.335 2.417 2.463 2.492 2.527 2.571 2.62 2.65 2.669 2.705 2.731 2.75 2.765 2.754 2.738 2.733 2.707 2.673 2.649 2.625 2.551 2.404 2.208 1.975 1.738 1.361 0.808 0.089 -0.867 -2.266 -4.476 -8.085 -12.155 -15.296 -17.811 -19.914 -21.7 -23.174 -24.465 -25.569 -26.646 -27.537 -28.323 -29.077 -29.772 -30.406 -30.973 -31.548 -32.077 -32.567 -33.06 -33.542 -33.955 -34.374 -34.79 -35.105 -35.437 -35.793 -36.139 -36.484 -36.722 -36.965 -37.349 -37.608 -37.857 -37.987 -38.273 -38.583 -38.926 -39.103 -39.494 -39.632 -39.82 -40.009 -40.457 -40.71 -40.984 -41.273 -41.594 -41.988 -42.473 -44.289 -7 ,25917 ,KEBNE ,16652468,Sun Nov 21 22:50:45 CET,Mon Nov 22 00:38:38 CET,0.0 0.99 1.169 1.33 1.472 1.603 1.708 1.803 1.975 2.052 2.124 2.064 2.3 2.348 2.443 2.532 2.602 2.626 2.669 2.708 2.758 2.782 2.802 2.825 2.842 2.873 2.907 2.936 2.965 2.978 2.998 3.025 3.043 3.062 3.081 3.086 3.078 3.073 3.023 2.915 2.797 2.639 2.377 2.065 1.635 1.004 0.138 -0.976 -2.5 -4.755 -8.38 -12.412 -15.6 -18.163 -20.243 -22.051 -23.563 -24.878 -25.957 -26.991 -27.891 -28.707 -29.473 -30.181 -30.819 -31.386 -31.968 -32.484 -32.924 -33.368 -33.817 -34.175 -34.534 -34.913 -35.216 -35.531 -35.845 -36.182 -36.554 -36.808 -37.067 -37.447 -37.699 -37.959 -38.093 -38.388 -38.724 -39.071 -39.235 -39.621 -39.775 -39.97 -40.163 -40.567 -40.767 -40.997 -41.291 -41.649 -42.028 -42.476 -44.184 -8 ,7950 ,KEBNE ,16652469,Sun Nov 21 22:50:44 CET,Mon Nov 22 00:37:14 CET,0.0 0.677 0.881 1.045 1.185 1.318 1.452 1.565 1.75 1.831 1.892 1.815 2.059 2.119 2.223 2.307 2.374 2.411 2.48 2.546 2.646 2.694 2.737 2.805 2.859 2.905 2.958 3.011 3.067 3.11 3.146 3.182 3.206 3.201 3.175 3.112 3.037 2.956 2.845 2.691 2.488 2.247 1.938 1.563 1.043 0.392 -0.445 -1.565 -3.163 -5.476 -9.114 -13.1 -16.182 -18.736 -20.832 -22.666 -24.185 -25.504 -26.637 -27.732 -28.643 -29.42 -30.164 -30.878 -31.511 -32.079 -32.668 -33.159 -33.565 -33.978 -34.417 -34.791 -35.182 -35.585 -35.891 -36.214 -36.533 -36.844 -37.169 -37.407 -37.677 -38.093 -38.357 -38.636 -38.781 -39.086 -39.402 -39.719 -39.886 -40.281 -40.397 -40.577 -40.772 -41.228 -41.48 -41.741 -42.016 -42.354 -42.755 -43.242 -44.831 -9 ,28448 ,KEBNE ,16652470,Sun Nov 21 22:50:44 CET,Mon Nov 22 00:37:11 CET,0.0 0.659 0.853 0.997 1.129 1.239 1.341 1.439 1.618 1.69 1.743 1.668 1.91 1.964 2.067 2.143 2.205 2.237 2.296 2.362 2.457 2.496 2.522 2.554 2.587 2.615 2.627 2.629 2.623 2.615 2.608 2.587 2.569 2.552 2.504 2.434 2.363 2.273 2.144 2.001 1.825 1.569 1.243 0.881 0.385 -0.271 -1.152 -2.314 -3.969 -6.305 -9.882 -13.917 -17.082 -19.656 -21.761 -23.523 -25.033 -26.346 -27.413 -28.475 -29.383 -30.184 -30.908 -31.569 -32.177 -32.713 -33.243 -33.711 -34.138 -34.586 -35.04 -35.414 -35.791 -36.168 -36.465 -36.776 -37.09 -37.416 -37.753 -37.975 -38.199 -38.549 -38.791 -39.031 -39.157 -39.433 -39.725 -40.027 -40.191 -40.585 -40.706 -40.884 -41.067 -41.479 -41.727 -42.0 -42.296 -42.627 -42.996 -43.548 -45.941 -10 ,31849 ,KEBNE ,16652471,Sun Nov 21 22:50:48 CET,Mon Nov 22 00:37:27 CET,0.0 0.501 0.675 0.831 0.957 1.065 1.17 1.269 1.406 1.461 1.518 1.426 1.65 1.689 1.766 1.837 1.9 1.933 2.001 2.075 2.176 2.214 2.245 2.297 2.34 2.374 2.411 2.455 2.505 2.527 2.544 2.552 2.536 2.518 2.5 2.47 2.425 2.362 2.288 2.192 2.042 1.818 1.509 1.148 0.648 0.025 -0.801 -1.96 -3.608 -5.995 -9.766 -13.896 -17.07 -19.627 -21.681 -23.469 -25.007 -26.355 -27.504 -28.633 -29.581 -30.385 -31.124 -31.799 -32.418 -32.984 -33.558 -34.05 -34.465 -34.886 -35.32 -35.68 -36.059 -36.454 -36.75 -37.059 -37.388 -37.715 -38.048 -38.278 -38.524 -38.903 -39.169 -39.475 -39.637 -39.961 -40.299 -40.641 -40.806 -41.193 -41.34 -41.547 -41.766 -42.24 -42.488 -42.76 -43.038 -43.316 -43.656 -44.171 -45.74 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index ac66e5c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21470 ,KEBNE ,16652472,Sun Nov 21 22:50:44 CET,Mon Nov 22 00:36:48 CET,0.0 0.799 1.159 1.459 1.72 1.947 2.151 2.357 2.744 2.923 3.089 3.173 3.562 3.707 4.009 4.31 4.603 4.741 5.001 5.266 5.661 5.917 6.166 6.529 6.882 7.241 7.584 7.908 8.335 8.752 9.17 9.693 10.201 10.694 11.298 11.992 12.645 13.396 14.22 15.093 16.068 17.225 18.619 20.011 21.691 23.688 26.102 28.945 32.445 36.906 42.897 48.499 52.107 54.595 56.386 57.799 58.926 59.8 60.423 60.987 61.445 61.805 62.119 62.383 62.588 62.737 62.875 63.0 63.091 63.154 63.189 63.208 63.228 63.246 63.256 63.247 63.224 63.206 63.175 63.135 63.077 63.003 62.959 62.887 62.85 62.763 62.67 62.596 62.56 62.346 62.384 62.3 62.202 62.007 61.878 61.686 61.46 61.247 60.988 60.434 58.116 -2 ,22584 ,KEBNE ,16652473,Sun Nov 21 22:50:44 CET,Mon Nov 22 00:36:53 CET,0.0 0.695 1.029 1.309 1.563 1.785 1.978 2.166 2.53 2.709 2.88 2.958 3.356 3.509 3.81 4.11 4.401 4.547 4.849 5.135 5.537 5.797 6.05 6.437 6.807 7.172 7.535 7.886 8.355 8.819 9.287 9.847 10.382 10.922 11.561 12.282 12.989 13.79 14.695 15.707 16.799 18.051 19.545 21.093 22.963 25.119 27.623 30.548 34.24 38.902 45.064 50.674 54.33 56.923 58.776 60.203 61.312 62.166 62.762 63.26 63.648 63.948 64.191 64.407 64.591 64.734 64.863 64.953 65.015 65.074 65.112 65.12 65.125 65.12 65.098 65.064 65.011 64.951 64.898 64.852 64.796 64.697 64.621 64.54 64.497 64.41 64.296 64.154 64.09 63.856 63.846 63.744 63.638 63.382 63.238 63.066 62.839 62.562 62.172 61.622 58.347 -4 ,22954 ,KEBNE ,16652475,Sun Nov 21 22:50:44 CET,Mon Nov 22 00:36:47 CET,0.0 0.807 1.183 1.516 1.798 2.05 2.268 2.461 2.817 2.995 3.172 3.257 3.663 3.823 4.145 4.454 4.734 4.871 5.155 5.43 5.825 6.098 6.364 6.749 7.124 7.477 7.831 8.194 8.682 9.148 9.612 10.2 10.797 11.386 12.043 12.791 13.54 14.381 15.331 16.363 17.436 18.648 20.121 21.66 23.504 25.643 28.216 31.226 34.906 39.607 45.807 51.38 55.026 57.635 59.547 61.02 62.128 62.969 63.584 64.124 64.555 64.908 65.178 65.403 65.59 65.733 65.871 65.965 66.014 66.045 66.069 66.086 66.09 66.078 66.05 66.0 65.954 65.902 65.82 65.754 65.691 65.579 65.495 65.393 65.343 65.244 65.105 64.946 64.862 64.586 64.498 64.361 64.211 63.911 63.75 63.538 63.293 62.985 62.628 62.197 60.035 -6 ,21772 ,KEBNE ,16652477,Sun Nov 21 22:51:46 CET,Mon Nov 22 00:38:05 CET,0.0 0.767 1.128 1.43 1.686 1.893 2.095 2.299 2.681 2.866 3.052 3.164 3.577 3.738 4.051 4.35 4.647 4.792 5.084 5.377 5.793 6.068 6.344 6.736 7.106 7.47 7.829 8.184 8.653 9.108 9.565 10.134 10.687 11.233 11.876 12.616 13.339 14.127 14.997 15.959 17.011 18.242 19.712 21.258 23.151 25.349 27.996 31.096 34.895 39.712 45.991 51.673 55.443 58.078 59.95 61.417 62.495 63.318 63.984 64.568 64.946 65.243 65.522 65.758 65.951 66.102 66.231 66.307 66.368 66.414 66.449 66.479 66.521 66.53 66.508 66.503 66.488 66.461 66.429 66.407 66.385 66.354 66.329 66.282 66.238 66.12 66.016 65.919 65.856 65.612 65.625 65.524 65.392 65.107 64.971 64.807 64.589 64.342 64.041 63.519 60.758 -7 ,16453 ,KEBNE ,16652478,Sun Nov 21 22:51:45 CET,Mon Nov 22 00:37:47 CET,0.0 0.765 1.105 1.386 1.644 1.882 2.097 2.302 2.695 2.881 3.058 3.142 3.557 3.726 4.049 4.371 4.674 4.821 5.106 5.384 5.797 6.054 6.312 6.709 7.085 7.449 7.803 8.147 8.61 9.075 9.532 10.083 10.627 11.166 11.795 12.504 13.184 13.954 14.811 15.743 16.769 17.979 19.425 20.937 22.792 24.952 27.531 30.578 34.393 39.079 45.219 50.845 54.432 56.929 58.722 60.079 61.107 61.951 62.596 63.144 63.574 63.903 64.168 64.416 64.629 64.759 64.84 64.927 65.01 65.069 65.109 65.135 65.141 65.13 65.122 65.101 65.056 65.005 64.928 64.877 64.834 64.752 64.68 64.602 64.563 64.465 64.338 64.207 64.135 63.884 63.895 63.795 63.678 63.431 63.265 63.065 62.849 62.572 62.193 61.701 58.861 -8 ,19108 ,KEBNE ,16652479,Sun Nov 21 22:51:45 CET,Mon Nov 22 00:39:21 CET,0.0 0.813 1.182 1.498 1.777 2.006 2.213 2.423 2.83 3.023 3.205 3.299 3.693 3.851 4.15 4.448 4.733 4.87 5.16 5.445 5.85 6.116 6.381 6.767 7.138 7.498 7.859 8.208 8.673 9.141 9.594 10.157 10.714 11.247 11.869 12.588 13.302 14.097 14.985 15.951 16.997 18.213 19.673 21.21 23.03 25.085 27.536 30.473 34.176 38.95 45.31 50.963 54.569 57.083 58.89 60.3 61.382 62.257 62.932 63.525 63.956 64.291 64.575 64.794 64.98 65.155 65.312 65.403 65.443 65.464 65.486 65.503 65.515 65.521 65.518 65.512 65.517 65.506 65.468 65.429 65.354 65.212 65.129 65.049 65.002 64.856 64.706 64.594 64.529 64.268 64.256 64.173 64.064 63.772 63.588 63.397 63.176 62.887 62.502 61.924 59.799 -9 ,19121 ,KEBNE ,16652480,Sun Nov 21 22:51:48 CET,Mon Nov 22 00:35:55 CET,0.0 1.053 1.397 1.677 1.921 2.153 2.375 2.577 2.962 3.138 3.303 3.386 3.773 3.924 4.244 4.554 4.835 4.978 5.274 5.558 5.958 6.22 6.478 6.85 7.222 7.585 7.936 8.288 8.769 9.233 9.669 10.208 10.745 11.287 11.937 12.67 13.361 14.146 15.05 16.033 17.081 18.283 19.749 21.301 23.185 25.335 27.924 31.003 34.807 39.577 45.73 51.276 54.872 57.398 59.243 60.676 61.779 62.638 63.282 63.876 64.317 64.653 64.943 65.186 65.399 65.572 65.722 65.836 65.908 65.975 66.037 66.075 66.111 66.137 66.147 66.152 66.138 66.098 66.039 65.988 65.946 65.884 65.822 65.738 65.698 65.628 65.528 65.378 65.29 65.026 65.01 64.909 64.808 64.58 64.383 64.132 63.863 63.561 63.221 62.675 59.554 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 7ceb4764..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24518 ,TETRA ,17982172,Tue Dec 21 08:30:48 CET,Tue Dec 21 10:48:38 CET,0.0 0.784 1.128 1.415 1.698 1.958 2.194 2.405 2.79 2.988 3.174 3.271 3.671 3.821 4.111 4.383 4.637 4.764 5.021 5.278 5.65 5.9 6.143 6.495 6.848 7.183 7.509 7.838 8.27 8.692 9.113 9.607 10.067 10.534 11.108 11.744 12.343 13.041 13.853 14.76 15.697 16.759 18.044 19.357 20.903 22.694 24.9 27.453 30.568 34.508 39.575 44.131 47.038 49.064 50.552 51.694 52.508 53.112 53.558 53.971 54.272 54.458 54.592 54.68 54.76 54.844 54.883 54.877 54.872 54.868 54.839 54.806 54.781 54.746 54.715 54.684 54.633 54.551 54.452 54.387 54.334 54.261 54.192 54.11 54.067 53.969 53.857 53.724 53.653 53.404 53.428 53.324 53.216 53.013 52.887 52.708 52.523 52.357 52.153 51.794 50.137 -2 ,6534 ,TETRA ,17982173,Tue Dec 21 08:30:49 CET,Tue Dec 21 10:48:02 CET,0.0 0.933 1.26 1.527 1.765 2.006 2.24 2.444 2.838 3.026 3.209 3.315 3.723 3.881 4.184 4.475 4.756 4.891 5.149 5.408 5.783 6.025 6.269 6.623 6.957 7.289 7.624 7.959 8.402 8.824 9.227 9.722 10.213 10.691 11.25 11.888 12.522 13.26 14.075 14.945 15.867 16.935 18.233 19.553 21.132 22.995 25.253 27.95 31.239 35.213 40.232 44.672 47.531 49.458 50.85 51.894 52.628 53.201 53.654 54.041 54.324 54.525 54.655 54.772 54.866 54.928 54.972 54.984 54.981 54.979 54.975 54.96 54.929 54.876 54.84 54.8 54.74 54.679 54.611 54.542 54.457 54.316 54.227 54.137 54.088 53.98 53.844 53.696 53.61 53.327 53.291 53.166 53.041 52.797 52.656 52.504 52.347 52.173 51.925 51.506 50.088 -3 ,25220 ,TETRA ,17982174,Tue Dec 21 08:30:48 CET,Tue Dec 21 10:47:59 CET,0.0 0.964 1.324 1.665 1.982 2.234 2.45 2.66 3.049 3.231 3.404 3.511 3.925 4.087 4.404 4.718 5.014 5.157 5.448 5.733 6.136 6.382 6.603 6.944 7.297 7.652 8.004 8.342 8.794 9.236 9.628 10.072 10.525 11.008 11.588 12.223 12.833 13.516 14.269 15.106 16.01 17.055 18.34 19.669 21.223 23.005 25.148 27.687 30.84 34.776 39.892 44.466 47.408 49.489 50.917 51.924 52.685 53.28 53.678 54.009 54.268 54.437 54.584 54.721 54.808 54.839 54.864 54.918 54.95 54.954 54.932 54.892 54.84 54.78 54.737 54.684 54.617 54.557 54.494 54.447 54.392 54.268 54.171 54.055 53.99 53.869 53.746 53.602 53.518 53.244 53.237 53.137 53.012 52.716 52.56 52.377 52.164 51.931 51.65 51.318 50.5 -4 ,7039 ,TETRA ,17982175,Tue Dec 21 08:30:49 CET,Tue Dec 21 10:48:05 CET,0.0 1.06 1.484 1.772 1.991 2.183 2.369 2.547 2.876 3.031 3.187 3.256 3.638 3.773 4.039 4.304 4.561 4.691 4.946 5.202 5.59 5.844 6.084 6.424 6.752 7.089 7.412 7.728 8.147 8.551 8.964 9.478 9.981 10.472 11.049 11.689 12.32 13.048 13.842 14.712 15.674 16.797 18.101 19.412 20.976 22.803 25.013 27.591 30.765 34.706 39.827 44.43 47.401 49.449 50.895 51.921 52.667 53.239 53.634 53.984 54.246 54.439 54.593 54.709 54.803 54.867 54.902 54.905 54.896 54.87 54.796 54.702 54.595 54.478 54.398 54.321 54.231 54.133 54.032 53.956 53.861 53.698 53.592 53.481 53.42 53.278 53.101 52.928 52.847 52.577 52.558 52.422 52.291 52.021 51.838 51.614 51.413 51.209 50.914 50.453 48.596 -5 ,5587 ,TETRA ,17982176,Tue Dec 21 08:30:50 CET,Tue Dec 21 10:48:04 CET,0.0 0.748 1.057 1.321 1.56 1.779 1.975 2.175 2.594 2.795 2.969 3.058 3.461 3.625 3.93 4.217 4.494 4.627 4.883 5.134 5.511 5.751 5.995 6.358 6.706 7.048 7.386 7.714 8.138 8.548 8.951 9.47 9.984 10.486 11.066 11.72 12.373 13.116 13.917 14.792 15.747 16.838 18.163 19.503 21.069 22.924 25.192 27.794 30.908 34.809 39.889 44.461 47.381 49.395 50.83 51.921 52.753 53.415 53.895 54.265 54.529 54.738 54.893 55.005 55.069 55.088 55.088 55.069 55.033 54.993 54.942 54.906 54.879 54.826 54.78 54.711 54.616 54.531 54.409 54.316 54.23 54.1 54.014 53.914 53.852 53.707 53.524 53.314 53.21 52.905 52.833 52.699 52.565 52.276 52.095 51.915 51.708 51.448 51.117 50.695 49.555 -6 ,5876 ,TETRA ,17982177,Tue Dec 21 08:30:53 CET,Tue Dec 21 10:47:49 CET,0.0 1.03 1.467 1.848 2.152 2.416 2.655 2.867 3.244 3.423 3.596 3.7 4.095 4.252 4.569 4.874 5.165 5.304 5.571 5.844 6.246 6.499 6.751 7.121 7.483 7.831 8.177 8.522 8.959 9.379 9.788 10.295 10.792 11.272 11.854 12.521 13.17 13.913 14.728 15.61 16.542 17.6 18.856 20.147 21.684 23.46 25.645 28.18 31.261 35.16 40.108 44.605 47.498 49.422 50.747 51.746 52.483 53.084 53.521 53.884 54.13 54.3 54.459 54.596 54.68 54.726 54.737 54.712 54.694 54.661 54.599 54.528 54.461 54.405 54.355 54.275 54.16 54.028 53.881 53.765 53.624 53.42 53.304 53.184 53.11 52.933 52.782 52.635 52.547 52.268 52.227 52.094 51.97 51.683 51.487 51.271 51.028 50.764 50.44 49.93 48.159 -7 ,3876 ,TETRA ,17982178,Tue Dec 21 08:30:49 CET,Tue Dec 21 10:48:22 CET,0.0 0.802 1.15 1.42 1.669 1.915 2.129 2.341 2.749 2.919 3.091 3.188 3.575 3.717 3.987 4.253 4.524 4.655 4.91 5.174 5.562 5.805 6.04 6.39 6.737 7.07 7.398 7.737 8.177 8.582 8.985 9.494 9.982 10.474 11.053 11.716 12.392 13.146 13.983 14.86 15.804 16.934 18.265 19.586 21.187 23.05 25.215 27.793 30.947 34.87 40.035 44.75 47.758 49.779 51.219 52.262 53.008 53.621 54.096 54.481 54.759 54.971 55.116 55.199 55.25 55.267 55.262 55.223 55.168 55.11 55.044 55.002 54.942 54.853 54.775 54.679 54.576 54.475 54.368 54.28 54.184 54.011 53.879 53.748 53.679 53.523 53.344 53.145 53.035 52.737 52.685 52.543 52.403 52.131 51.971 51.792 51.585 51.316 50.979 50.5 48.416 -8 ,30748 ,TETRA ,17982179,Tue Dec 21 08:30:51 CET,Tue Dec 21 10:48:43 CET,0.0 0.941 1.29 1.56 1.806 2.012 2.223 2.443 2.85 3.031 3.194 3.261 3.649 3.801 4.112 4.406 4.683 4.822 5.088 5.35 5.735 5.974 6.21 6.559 6.907 7.247 7.571 7.897 8.342 8.779 9.186 9.672 10.152 10.63 11.217 11.91 12.598 13.383 14.219 15.075 15.986 17.035 18.304 19.651 21.279 23.159 25.378 27.947 31.096 35.13 40.502 45.294 48.368 50.469 51.943 53.025 53.821 54.466 54.93 55.292 55.549 55.734 55.878 55.988 56.063 56.113 56.15 56.169 56.17 56.169 56.152 56.092 56.039 55.998 55.944 55.886 55.836 55.779 55.69 55.615 55.534 55.397 55.317 55.222 55.155 55.012 54.874 54.724 54.626 54.336 54.336 54.236 54.135 53.917 53.792 53.644 53.465 53.248 52.955 52.521 50.976 -9 ,29205 ,TETRA ,17982180,Tue Dec 21 08:30:53 CET,Tue Dec 21 10:47:56 CET,0.0 0.799 1.175 1.458 1.702 1.921 2.124 2.318 2.708 2.888 3.043 3.12 3.523 3.683 3.974 4.252 4.519 4.648 4.917 5.19 5.589 5.86 6.127 6.496 6.857 7.223 7.574 7.922 8.381 8.825 9.244 9.749 10.258 10.765 11.358 12.029 12.705 13.466 14.286 15.162 16.099 17.197 18.514 19.86 21.444 23.276 25.475 28.073 31.313 35.323 40.586 45.341 48.301 50.281 51.698 52.743 53.497 54.067 54.426 54.696 54.898 55.027 55.132 55.211 55.245 55.276 55.311 55.345 55.37 55.371 55.351 55.307 55.238 55.157 55.09 55.024 54.94 54.847 54.764 54.69 54.602 54.475 54.369 54.238 54.173 54.052 53.924 53.739 53.634 53.361 53.392 53.3 53.169 52.864 52.676 52.458 52.232 51.973 51.681 51.251 49.934 -10 ,17106 ,TETRA ,17982181,Tue Dec 21 08:30:49 CET,Tue Dec 21 10:47:50 CET,0.0 0.553 0.92 1.18 1.427 1.673 1.885 2.072 2.412 2.572 2.729 2.8 3.186 3.333 3.605 3.873 4.142 4.271 4.518 4.767 5.138 5.374 5.6 5.934 6.27 6.593 6.908 7.225 7.639 8.053 8.468 8.96 9.444 9.918 10.464 11.086 11.705 12.394 13.173 14.03 14.932 15.99 17.242 18.547 20.149 22.011 24.237 26.801 29.912 33.817 38.981 43.607 46.536 48.563 50.005 51.087 51.839 52.393 52.793 53.12 53.351 53.492 53.565 53.627 53.695 53.744 53.77 53.767 53.763 53.745 53.719 53.697 53.628 53.515 53.43 53.354 53.294 53.222 53.118 53.038 52.952 52.803 52.691 52.584 52.53 52.423 52.308 52.173 52.112 51.879 51.95 51.871 51.765 51.549 51.428 51.299 51.158 50.967 50.712 50.322 48.856 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 6f23c3aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,17548 ,KEBNE ,16652483,Sun Nov 21 22:51:46 CET,Mon Nov 22 00:37:50 CET,0.0 1.205 1.612 1.925 2.189 2.427 2.65 2.862 3.258 3.465 3.668 3.779 4.227 4.403 4.753 5.094 5.425 5.592 5.92 6.238 6.697 6.992 7.279 7.706 8.126 8.529 8.922 9.304 9.826 10.356 10.857 11.467 12.084 12.697 13.399 14.178 14.955 15.852 16.844 17.925 19.123 20.536 22.24 24.018 26.147 28.629 31.629 35.156 39.471 44.958 52.326 59.162 63.727 67.058 69.549 71.461 72.825 73.861 74.655 75.34 75.881 76.299 76.608 76.869 77.107 77.285 77.435 77.555 77.612 77.642 77.666 77.682 77.694 77.68 77.658 77.642 77.608 77.536 77.457 77.397 77.344 77.27 77.191 77.069 76.985 76.783 76.573 76.351 76.25 75.981 75.973 75.861 75.73 75.408 75.209 74.993 74.707 74.402 74.032 73.408 70.453 -3 ,13173 ,KEBNE ,16652484,Sun Nov 21 22:51:46 CET,Mon Nov 22 00:38:22 CET,0.0 0.683 1.074 1.417 1.7 1.938 2.165 2.397 2.832 3.042 3.256 3.394 3.842 4.028 4.38 4.703 5.037 5.201 5.516 5.829 6.285 6.587 6.871 7.262 7.661 8.078 8.49 8.893 9.416 9.94 10.467 11.103 11.732 12.377 13.136 13.976 14.79 15.709 16.735 17.876 19.12 20.546 22.267 24.077 26.228 28.685 31.678 35.14 39.401 44.999 52.482 59.244 63.745 67.062 69.524 71.396 72.814 73.911 74.676 75.375 75.907 76.325 76.706 77.024 77.254 77.416 77.57 77.678 77.717 77.745 77.753 77.75 77.741 77.693 77.667 77.65 77.625 77.59 77.539 77.497 77.445 77.35 77.291 77.217 77.164 77.03 76.866 76.701 76.609 76.313 76.247 76.124 75.973 75.619 75.418 75.194 74.954 74.61 74.144 73.505 71.118 -4 ,26389 ,KEBNE ,16652485,Sun Nov 21 22:51:46 CET,Mon Nov 22 00:39:08 CET,0.0 0.62 0.908 1.166 1.398 1.617 1.83 2.037 2.426 2.614 2.796 2.877 3.31 3.479 3.816 4.139 4.445 4.599 4.904 5.205 5.652 5.947 6.232 6.645 7.052 7.45 7.851 8.243 8.762 9.267 9.757 10.364 10.956 11.541 12.244 13.047 13.82 14.703 15.68 16.728 17.878 19.236 20.883 22.661 24.817 27.233 30.144 33.63 38.028 43.731 51.342 58.326 62.989 66.359 68.83 70.665 71.998 73.073 73.911 74.665 75.236 75.68 76.059 76.377 76.627 76.817 76.979 77.077 77.146 77.214 77.254 77.298 77.328 77.319 77.31 77.286 77.266 77.232 77.153 77.106 77.045 76.916 76.803 76.656 76.575 76.401 76.233 76.037 75.919 75.62 75.518 75.339 75.167 74.82 74.604 74.348 74.071 73.728 73.287 72.624 69.8 -5 ,11324 ,KEBNE ,16652486,Sun Nov 21 22:51:46 CET,Mon Nov 22 00:37:50 CET,0.0 0.932 1.35 1.696 2.012 2.287 2.526 2.743 3.142 3.344 3.54 3.656 4.097 4.269 4.614 4.953 5.28 5.44 5.748 6.058 6.54 6.852 7.152 7.593 8.021 8.434 8.84 9.245 9.767 10.273 10.761 11.36 11.954 12.54 13.251 14.084 14.887 15.78 16.782 17.881 19.059 20.431 22.087 23.797 25.877 28.36 31.363 34.891 39.282 44.87 52.433 59.531 64.206 67.543 69.995 71.929 73.417 74.593 75.481 76.233 76.774 77.19 77.535 77.801 78.011 78.176 78.307 78.393 78.451 78.502 78.554 78.589 78.604 78.597 78.592 78.57 78.518 78.455 78.39 78.342 78.29 78.212 78.153 78.1 78.068 77.967 77.85 77.691 77.587 77.314 77.318 77.209 77.117 76.909 76.74 76.501 76.25 75.986 75.623 75.084 73.183 -7 ,27043 ,KEBNE ,16652488,Sun Nov 21 22:52:47 CET,Mon Nov 22 00:39:32 CET,0.0 0.945 1.275 1.54 1.791 2.03 2.255 2.465 2.856 3.04 3.213 3.28 3.704 3.86 4.167 4.481 4.801 4.96 5.265 5.573 6.015 6.294 6.568 6.971 7.368 7.754 8.144 8.54 9.055 9.568 10.087 10.71 11.295 11.885 12.602 13.412 14.203 15.122 16.146 17.255 18.438 19.797 21.436 23.153 25.236 27.623 30.524 34.009 38.335 43.775 51.179 58.103 62.556 65.722 68.053 69.831 71.193 72.23 73.006 73.712 74.246 74.67 74.993 75.239 75.485 75.721 75.942 76.108 76.223 76.322 76.4 76.423 76.417 76.42 76.424 76.399 76.335 76.232 76.126 76.076 76.013 75.908 75.842 75.752 75.694 75.567 75.413 75.236 75.131 74.839 74.757 74.602 74.461 74.138 73.952 73.761 73.527 73.205 72.77 72.093 69.563 -9 ,15106 ,KEBNE ,16652490,Sun Nov 21 22:52:47 CET,Mon Nov 22 00:40:14 CET,0.0 0.873 1.229 1.519 1.784 2.025 2.243 2.455 2.887 3.096 3.282 3.38 3.829 4.004 4.353 4.689 5.002 5.15 5.437 5.731 6.156 6.426 6.704 7.14 7.567 7.97 8.366 8.761 9.281 9.786 10.274 10.886 11.499 12.115 12.846 13.671 14.46 15.328 16.31 17.391 18.555 19.91 21.546 23.27 25.358 27.805 30.743 34.205 38.55 44.031 51.284 58.081 62.609 65.848 68.202 70.017 71.448 72.603 73.499 74.324 74.936 75.428 75.851 76.175 76.424 76.635 76.847 76.985 77.06 77.103 77.141 77.154 77.155 77.16 77.147 77.092 76.968 76.842 76.74 76.648 76.537 76.399 76.302 76.166 76.101 75.971 75.793 75.562 75.451 75.145 75.018 74.835 74.668 74.354 74.119 73.847 73.582 73.289 72.904 72.334 70.215 -10 ,28623 ,KEBNE ,16652491,Sun Nov 21 22:52:47 CET,Mon Nov 22 00:40:07 CET,0.0 0.808 1.153 1.417 1.661 1.89 2.113 2.328 2.744 2.956 3.153 3.225 3.661 3.839 4.194 4.527 4.851 5.017 5.347 5.657 6.092 6.38 6.672 7.109 7.552 7.981 8.391 8.797 9.313 9.809 10.316 10.964 11.599 12.224 12.973 13.82 14.637 15.574 16.608 17.712 18.919 20.36 22.11 23.897 26.015 28.484 31.516 35.107 39.495 44.977 52.256 58.946 63.383 66.52 68.815 70.65 72.069 73.195 74.043 74.777 75.373 75.824 76.179 76.483 76.743 76.957 77.106 77.213 77.302 77.387 77.421 77.447 77.462 77.451 77.432 77.399 77.358 77.296 77.231 77.184 77.133 77.027 76.929 76.841 76.794 76.666 76.508 76.348 76.252 75.942 75.846 75.703 75.564 75.28 75.12 74.894 74.583 74.22 73.758 73.175 70.58 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt deleted file mode 100644 index 37b9193c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28503 ,KEBNE ,16652492,Sun Nov 21 22:52:47 CET,Mon Nov 22 00:40:48 CET,0.0 1.187 1.615 1.938 2.224 2.485 2.715 2.915 3.243 3.402 3.56 3.608 4.022 4.168 4.448 4.723 4.987 5.119 5.37 5.616 5.989 6.211 6.416 6.726 7.009 7.268 7.526 7.774 8.088 8.407 8.741 9.146 9.533 9.9 10.326 10.79 11.237 11.752 12.304 12.885 13.511 14.245 15.092 15.9 16.828 17.868 19.066 20.426 21.972 23.847 26.222 27.816 28.653 29.182 29.392 29.5 29.551 29.492 29.363 29.214 29.067 28.932 28.789 28.641 28.499 28.365 28.207 28.041 27.898 27.731 27.537 27.378 27.197 26.986 26.819 26.625 26.421 26.232 26.042 25.9 25.72 25.466 25.305 25.113 25.008 24.789 24.58 24.343 24.205 23.821 23.749 23.587 23.418 23.032 22.833 22.619 22.337 22.008 21.641 21.153 19.439 -2 ,24276 ,KEBNE ,16652493,Sun Nov 21 22:52:47 CET,Mon Nov 22 00:40:45 CET,0.0 1.451 1.875 2.208 2.512 2.768 2.994 3.191 3.523 3.691 3.852 3.878 4.285 4.425 4.687 4.941 5.191 5.311 5.534 5.766 6.108 6.319 6.518 6.817 7.122 7.411 7.684 7.952 8.308 8.64 8.965 9.389 9.82 10.238 10.703 11.221 11.719 12.248 12.811 13.423 14.068 14.79 15.623 16.465 17.466 18.585 19.833 21.249 22.879 24.722 27.016 28.828 29.799 30.372 30.653 30.751 30.77 30.723 30.653 30.545 30.419 30.291 30.135 29.952 29.767 29.592 29.399 29.219 29.066 28.907 28.717 28.533 28.34 28.146 27.998 27.862 27.718 27.543 27.346 27.213 27.081 26.851 26.67 26.493 26.397 26.182 25.958 25.7 25.559 25.171 25.121 24.963 24.802 24.474 24.275 24.05 23.769 23.461 23.127 22.681 20.711 -3 ,9988 ,KEBNE ,16652494,Sun Nov 21 22:52:47 CET,Mon Nov 22 00:40:37 CET,0.0 1.62 2.01 2.33 2.588 2.79 2.992 3.185 3.539 3.702 3.865 3.902 4.3 4.441 4.721 4.992 5.25 5.369 5.606 5.842 6.183 6.387 6.583 6.898 7.192 7.465 7.732 7.988 8.327 8.663 8.985 9.372 9.768 10.18 10.643 11.135 11.614 12.137 12.675 13.241 13.835 14.493 15.263 16.058 16.986 18.059 19.325 20.781 22.568 24.605 26.859 28.585 29.405 29.859 30.179 30.349 30.364 30.303 30.222 30.103 29.959 29.776 29.58 29.397 29.228 29.066 28.86 28.659 28.476 28.267 28.039 27.865 27.688 27.494 27.339 27.168 26.987 26.802 26.599 26.436 26.274 26.028 25.854 25.682 25.588 25.372 25.137 24.924 24.795 24.412 24.377 24.216 24.056 23.699 23.476 23.234 22.955 22.614 22.207 21.622 19.598 -4 ,27411 ,KEBNE ,16652495,Sun Nov 21 22:53:48 CET,Mon Nov 22 00:40:17 CET,0.0 0.971 1.353 1.602 1.839 2.067 2.278 2.468 2.798 2.956 3.132 3.196 3.61 3.752 4.025 4.275 4.505 4.621 4.851 5.069 5.398 5.611 5.805 6.084 6.373 6.641 6.902 7.163 7.494 7.823 8.132 8.524 8.902 9.256 9.694 10.162 10.6 11.101 11.656 12.251 12.867 13.539 14.311 15.114 16.08 17.144 18.373 19.774 21.363 23.194 25.392 27.106 27.976 28.374 28.579 28.701 28.735 28.697 28.605 28.448 28.28 28.102 27.929 27.759 27.565 27.369 27.166 26.969 26.771 26.572 26.369 26.195 25.999 25.777 25.606 25.434 25.26 25.063 24.845 24.695 24.544 24.306 24.116 23.917 23.825 23.629 23.407 23.16 23.029 22.647 22.581 22.432 22.269 21.901 21.715 21.461 21.15 20.828 20.446 19.954 17.893 -5 ,31101 ,KEBNE ,16652496,Sun Nov 21 22:53:48 CET,Mon Nov 22 00:41:57 CET,0.0 1.781 2.253 2.629 2.909 3.14 3.338 3.523 3.891 4.07 4.234 4.299 4.718 4.862 5.131 5.381 5.625 5.744 5.983 6.229 6.589 6.805 7.001 7.294 7.593 7.876 8.139 8.382 8.703 9.026 9.336 9.701 10.056 10.403 10.805 11.251 11.666 12.136 12.664 13.251 13.876 14.541 15.318 16.106 17.007 18.038 19.256 20.567 22.066 23.904 26.19 27.871 28.689 29.152 29.334 29.375 29.389 29.37 29.279 29.101 28.924 28.767 28.609 28.446 28.271 28.121 27.962 27.773 27.582 27.377 27.151 26.941 26.731 26.549 26.411 26.258 26.087 25.904 25.699 25.549 25.405 25.175 25.012 24.851 24.757 24.559 24.326 24.035 23.9 23.536 23.499 23.327 23.146 22.769 22.562 22.329 22.076 21.781 21.392 20.823 18.263 -6 ,7987 ,KEBNE ,16652497,Sun Nov 21 22:53:48 CET,Mon Nov 22 00:41:28 CET,0.0 1.406 1.747 2.01 2.293 2.577 2.826 3.05 3.431 3.608 3.779 3.818 4.223 4.359 4.608 4.844 5.098 5.224 5.446 5.66 5.984 6.197 6.393 6.679 6.962 7.24 7.5 7.761 8.118 8.433 8.722 9.089 9.47 9.823 10.206 10.649 11.086 11.577 12.122 12.695 13.266 13.953 14.912 15.927 16.979 18.025 19.212 20.547 22.114 23.996 26.259 28.038 28.977 29.485 29.705 29.777 29.777 29.725 29.579 29.418 29.274 29.095 28.901 28.734 28.59 28.405 28.206 28.045 27.887 27.694 27.474 27.304 27.134 26.946 26.789 26.621 26.431 26.218 26.022 25.905 25.771 25.523 25.34 25.16 25.073 24.886 24.675 24.468 24.36 23.999 23.974 23.815 23.642 23.234 23.011 22.789 22.536 22.221 21.795 21.236 19.227 -7 ,29684 ,KEBNE ,16652498,Sun Nov 21 22:53:48 CET,Mon Nov 22 00:41:56 CET,0.0 1.253 1.679 2.023 2.269 2.484 2.717 2.93 3.284 3.436 3.585 3.637 4.051 4.194 4.467 4.734 5.007 5.135 5.375 5.603 5.919 6.126 6.335 6.643 6.96 7.284 7.584 7.872 8.253 8.626 8.987 9.405 9.799 10.179 10.621 11.102 11.564 12.079 12.645 13.268 13.911 14.606 15.421 16.206 17.122 18.157 19.359 20.783 22.419 24.237 26.341 27.978 28.759 29.166 29.332 29.353 29.303 29.203 29.106 28.984 28.832 28.665 28.502 28.342 28.186 28.048 27.897 27.758 27.619 27.445 27.249 27.062 26.853 26.633 26.454 26.257 26.042 25.822 25.602 25.428 25.254 25.008 24.813 24.607 24.501 24.28 24.054 23.807 23.667 23.275 23.229 23.072 22.911 22.576 22.367 22.123 21.842 21.521 21.159 20.574 18.858 -9 ,29351 ,KEBNE ,16652500,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:42:45 CET,0.0 1.325 1.73 2.068 2.374 2.627 2.852 3.066 3.399 3.55 3.714 3.778 4.197 4.352 4.642 4.903 5.168 5.301 5.559 5.813 6.189 6.424 6.644 6.965 7.265 7.552 7.844 8.137 8.508 8.852 9.179 9.592 10.017 10.422 10.876 11.38 11.863 12.375 12.905 13.484 14.084 14.728 15.473 16.25 17.227 18.286 19.421 20.756 22.345 24.179 26.414 28.221 29.175 29.661 29.861 29.944 29.937 29.88 29.8 29.651 29.489 29.344 29.186 29.003 28.839 28.648 28.414 28.22 28.032 27.832 27.647 27.498 27.34 27.176 27.046 26.903 26.741 26.559 26.358 26.224 26.08 25.836 25.658 25.491 25.406 25.185 24.962 24.723 24.593 24.23 24.201 24.036 23.844 23.412 23.173 22.916 22.65 22.338 21.968 21.465 19.78 -10 ,27637 ,KEBNE ,16652501,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:42:27 CET,0.0 1.242 1.659 1.98 2.237 2.469 2.682 2.874 3.253 3.42 3.579 3.618 4.019 4.143 4.402 4.648 4.869 4.981 5.214 5.443 5.772 5.988 6.196 6.483 6.756 7.051 7.355 7.622 7.946 8.257 8.553 8.895 9.224 9.57 10.055 10.616 11.071 11.55 12.08 12.661 13.272 13.947 14.766 15.596 16.545 17.593 18.783 20.182 21.857 23.817 26.132 28.05 29.131 29.661 29.864 29.888 29.836 29.759 29.67 29.544 29.41 29.246 29.048 28.864 28.696 28.537 28.358 28.188 28.044 27.898 27.715 27.56 27.414 27.253 27.122 26.979 26.827 26.666 26.486 26.357 26.213 25.98 25.827 25.665 25.577 25.39 25.202 24.999 24.876 24.496 24.469 24.317 24.135 23.755 23.561 23.319 22.991 22.633 22.247 21.69 19.296 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt deleted file mode 100644 index add01890..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31134 ,KEBNE ,16652502,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:41:17 CET,0.0 0.709 1.11 1.469 1.772 2.049 2.316 2.573 3.073 3.311 3.538 3.723 4.203 4.416 4.838 5.248 5.64 5.833 6.217 6.59 7.139 7.5 7.855 8.375 8.886 9.386 9.887 10.377 11.016 11.658 12.281 13.042 13.802 14.551 15.438 16.423 17.382 18.494 19.734 21.089 22.544 24.237 26.265 28.261 30.547 33.171 36.375 40.271 45.156 51.308 59.485 67.085 72.109 75.639 78.21 80.204 81.754 83.013 83.999 84.876 85.54 86.08 86.495 86.819 87.117 87.376 87.615 87.812 87.972 88.121 88.26 88.336 88.394 88.446 88.474 88.492 88.506 88.505 88.485 88.475 88.456 88.417 88.382 88.31 88.264 88.177 88.065 87.925 87.852 87.606 87.573 87.469 87.35 87.026 86.842 86.626 86.329 85.982 85.556 84.932 82.024 -2 ,3106 ,KEBNE ,16652503,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:42:56 CET,0.0 1.05 1.48 1.825 2.127 2.428 2.72 2.99 3.495 3.724 3.941 4.128 4.601 4.81 5.217 5.621 6.004 6.186 6.558 6.932 7.466 7.814 8.154 8.653 9.154 9.652 10.137 10.607 11.229 11.853 12.478 13.249 14.001 14.739 15.617 16.625 17.606 18.721 19.966 21.27 22.658 24.312 26.306 28.306 30.677 33.446 36.76 40.756 45.75 51.993 60.205 67.859 72.874 76.522 79.222 81.194 82.684 83.886 84.836 85.719 86.41 86.956 87.432 87.847 88.187 88.457 88.687 88.876 89.041 89.187 89.284 89.348 89.408 89.444 89.466 89.486 89.492 89.479 89.448 89.428 89.401 89.311 89.236 89.18 89.159 89.089 88.984 88.848 88.759 88.499 88.435 88.319 88.181 87.79 87.563 87.29 86.953 86.577 86.077 85.361 82.192 -3 ,18612 ,KEBNE ,16652504,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:42:38 CET,0.0 1.115 1.505 1.866 2.188 2.463 2.732 2.995 3.506 3.748 3.976 4.176 4.655 4.864 5.271 5.662 6.039 6.226 6.607 6.984 7.531 7.886 8.23 8.738 9.248 9.76 10.262 10.75 11.404 12.037 12.647 13.409 14.174 14.922 15.803 16.827 17.847 18.985 20.222 21.571 23.024 24.665 26.6 28.569 30.9 33.629 36.948 40.927 45.936 52.331 60.78 68.577 73.747 77.469 80.241 82.382 83.968 85.196 86.104 86.926 87.576 88.098 88.54 88.907 89.216 89.479 89.71 89.869 90.0 90.124 90.217 90.251 90.269 90.278 90.284 90.278 90.241 90.209 90.189 90.159 90.122 90.048 89.933 89.77 89.697 89.573 89.414 89.224 89.118 88.848 88.765 88.616 88.423 87.952 87.681 87.421 87.145 86.759 86.224 85.411 82.002 -4 ,4047 ,KEBNE ,16652505,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:42:19 CET,0.0 0.989 1.406 1.76 2.067 2.362 2.643 2.918 3.452 3.7 3.934 4.116 4.587 4.787 5.197 5.616 6.019 6.219 6.61 6.979 7.517 7.879 8.236 8.753 9.262 9.757 10.249 10.742 11.383 12.007 12.612 13.329 14.05 14.788 15.66 16.661 17.635 18.727 19.946 21.274 22.705 24.394 26.44 28.562 31.132 34.154 37.753 41.834 46.733 52.898 61.068 68.646 73.653 77.273 79.963 82.022 83.58 84.817 85.736 86.545 87.175 87.661 88.108 88.495 88.777 89.005 89.223 89.408 89.535 89.632 89.716 89.774 89.819 89.848 89.864 89.874 89.85 89.789 89.722 89.659 89.589 89.511 89.46 89.388 89.333 89.192 89.038 88.874 88.791 88.54 88.51 88.411 88.285 87.935 87.684 87.376 87.07 86.706 86.184 85.323 82.318 -5 ,23019 ,KEBNE ,16652506,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:42:26 CET,0.0 1.121 1.545 1.914 2.257 2.557 2.819 3.081 3.578 3.815 4.049 4.247 4.729 4.941 5.342 5.726 6.109 6.297 6.664 7.026 7.573 7.934 8.282 8.797 9.314 9.825 10.332 10.826 11.468 12.109 12.745 13.524 14.282 15.024 15.903 16.909 17.903 19.019 20.245 21.603 23.072 24.714 26.617 28.589 30.964 33.724 37.056 40.993 45.871 51.965 59.975 67.409 72.379 76.017 78.718 80.767 82.304 83.504 84.415 85.256 85.928 86.468 86.919 87.288 87.599 87.878 88.123 88.292 88.424 88.55 88.664 88.737 88.799 88.846 88.867 88.892 88.901 88.893 88.888 88.874 88.844 88.765 88.686 88.594 88.539 88.426 88.318 88.164 88.081 87.836 87.808 87.715 87.599 87.289 87.039 86.76 86.473 86.113 85.55 84.636 80.062 -8 ,16875 ,KEBNE ,16652509,Sun Nov 21 22:54:55 CET,Mon Nov 22 00:41:11 CET,0.0 0.904 1.325 1.682 2.023 2.323 2.591 2.851 3.35 3.585 3.812 3.988 4.461 4.673 5.097 5.511 5.912 6.111 6.509 6.89 7.447 7.81 8.161 8.679 9.183 9.675 10.164 10.665 11.328 11.962 12.586 13.355 14.109 14.856 15.754 16.763 17.739 18.817 20.035 21.41 22.857 24.514 26.523 28.624 31.098 33.885 37.178 41.053 45.895 51.905 59.949 67.461 72.325 75.828 78.45 80.476 81.975 83.185 84.155 84.998 85.645 86.183 86.637 87.025 87.361 87.644 87.905 88.104 88.248 88.367 88.47 88.546 88.622 88.687 88.711 88.737 88.755 88.77 88.773 88.751 88.722 88.661 88.593 88.495 88.443 88.31 88.154 87.976 87.869 87.617 87.605 87.493 87.375 87.071 86.868 86.646 86.407 86.128 85.782 85.03 81.946 -9 ,16577 ,KEBNE ,16652510,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:41:24 CET,0.0 0.974 1.438 1.792 2.106 2.402 2.699 2.97 3.467 3.701 3.935 4.12 4.584 4.792 5.197 5.601 5.991 6.182 6.569 6.936 7.466 7.828 8.185 8.716 9.238 9.735 10.232 10.729 11.375 12.002 12.618 13.374 14.107 14.828 15.681 16.677 17.67 18.764 19.94 21.189 22.518 24.072 25.958 27.922 30.296 33.037 36.336 40.273 45.152 51.227 59.327 66.967 72.016 75.678 78.366 80.432 82.005 83.237 84.191 85.057 85.748 86.324 86.818 87.237 87.577 87.85 88.1 88.284 88.438 88.594 88.71 88.779 88.838 88.879 88.884 88.879 88.881 88.881 88.857 88.822 88.79 88.735 88.688 88.613 88.572 88.477 88.365 88.235 88.151 87.901 87.858 87.749 87.635 87.352 87.167 86.934 86.634 86.297 85.765 84.987 82.124 -10 ,16633 ,KEBNE ,16652511,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:42:41 CET,0.0 0.918 1.39 1.783 2.103 2.382 2.642 2.892 3.381 3.612 3.836 4.047 4.522 4.729 5.137 5.533 5.912 6.096 6.465 6.839 7.385 7.739 8.084 8.582 9.083 9.593 10.112 10.625 11.282 11.924 12.561 13.336 14.103 14.839 15.689 16.689 17.684 18.74 19.865 21.125 22.46 23.991 25.872 27.856 30.243 33.0 36.318 40.218 45.102 51.408 59.803 67.561 72.622 76.154 78.743 80.754 82.305 83.561 84.534 85.386 86.036 86.559 87.004 87.362 87.656 87.915 88.169 88.368 88.5 88.604 88.695 88.765 88.847 88.912 88.941 88.968 88.974 88.959 88.93 88.897 88.837 88.697 88.595 88.516 88.489 88.42 88.3 88.14 88.057 87.802 87.741 87.637 87.529 87.19 86.994 86.805 86.566 86.217 85.746 85.048 81.546 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index ee47ff20..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18943 ,KEBNE ,16652512,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:42:05 CET,0.0 0.846 1.176 1.443 1.68 1.893 2.08 2.254 2.595 2.754 2.903 2.97 3.329 3.467 3.731 3.986 4.239 4.356 4.586 4.813 5.139 5.352 5.554 5.856 6.168 6.496 6.812 7.105 7.488 7.866 8.23 8.654 9.073 9.482 9.955 10.49 11.015 11.607 12.266 12.985 13.752 14.648 15.717 16.814 18.129 19.65 21.465 23.608 26.292 29.703 34.13 38.084 40.646 42.391 43.561 44.355 44.909 45.326 45.623 45.861 46.007 46.111 46.205 46.267 46.308 46.31 46.282 46.26 46.221 46.171 46.108 46.05 45.999 45.927 45.864 45.801 45.736 45.651 45.553 45.471 45.373 45.219 45.1 44.977 44.913 44.775 44.627 44.468 44.37 44.093 44.041 43.941 43.828 43.534 43.371 43.165 42.906 42.64 42.318 41.879 39.755 -2 ,26436 ,KEBNE ,16652513,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:41:17 CET,0.0 0.83 1.157 1.406 1.63 1.816 1.988 2.158 2.462 2.609 2.758 2.822 3.178 3.316 3.593 3.853 4.109 4.234 4.477 4.712 5.046 5.268 5.486 5.797 6.095 6.382 6.676 6.967 7.349 7.735 8.102 8.544 8.968 9.383 9.875 10.444 11.009 11.646 12.352 13.096 13.888 14.804 15.909 17.071 18.491 20.147 22.102 24.363 27.095 30.562 35.143 39.207 41.725 43.375 44.435 45.212 45.789 46.17 46.453 46.711 46.866 46.946 46.976 46.999 47.022 47.017 46.991 46.946 46.887 46.827 46.774 46.706 46.621 46.532 46.449 46.368 46.288 46.192 46.1 46.018 45.909 45.748 45.632 45.498 45.426 45.263 45.067 44.867 44.772 44.506 44.431 44.309 44.196 43.927 43.778 43.599 43.383 43.103 42.757 42.315 40.264 -3 ,4892 ,KEBNE ,16652514,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:43:15 CET,0.0 0.714 1.067 1.323 1.561 1.77 1.973 2.158 2.477 2.633 2.787 2.852 3.201 3.331 3.588 3.826 4.062 4.18 4.412 4.641 4.97 5.183 5.403 5.717 5.997 6.273 6.552 6.825 7.19 7.562 7.919 8.341 8.757 9.169 9.658 10.228 10.788 11.411 12.114 12.899 13.73 14.679 15.81 16.982 18.421 20.075 22.002 24.27 27.058 30.615 35.134 38.995 41.546 43.19 44.2 44.964 45.597 46.074 46.401 46.647 46.807 46.927 47.014 47.071 47.085 47.083 47.068 47.018 46.972 46.923 46.861 46.801 46.718 46.633 46.566 46.492 46.404 46.301 46.181 46.108 46.041 45.909 45.796 45.661 45.594 45.429 45.256 45.093 45.003 44.728 44.674 44.553 44.421 44.159 43.988 43.769 43.513 43.247 42.967 42.533 40.756 -4 ,9075 ,KEBNE ,16652515,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:42:06 CET,0.0 0.726 1.089 1.381 1.597 1.8 1.995 2.176 2.504 2.659 2.82 2.905 3.269 3.425 3.714 3.948 4.175 4.295 4.543 4.778 5.09 5.285 5.483 5.771 6.048 6.338 6.63 6.903 7.276 7.651 8.012 8.461 8.916 9.348 9.836 10.404 10.972 11.621 12.327 13.079 13.868 14.777 15.924 17.142 18.587 20.257 22.256 24.554 27.357 30.889 35.449 39.376 41.883 43.564 44.642 45.449 46.026 46.442 46.737 46.983 47.139 47.223 47.289 47.352 47.393 47.399 47.388 47.371 47.329 47.276 47.209 47.148 47.081 47.008 46.94 46.851 46.743 46.635 46.534 46.467 46.397 46.283 46.196 46.091 46.034 45.914 45.77 45.607 45.511 45.241 45.183 45.049 44.908 44.588 44.407 44.206 43.973 43.685 43.336 42.848 40.404 -5 ,13287 ,KEBNE ,16652516,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:42:11 CET,0.0 0.67 0.967 1.212 1.426 1.616 1.791 1.965 2.294 2.445 2.596 2.698 3.06 3.182 3.426 3.672 3.906 4.016 4.226 4.424 4.729 4.931 5.131 5.424 5.705 5.985 6.254 6.513 6.862 7.206 7.545 7.967 8.389 8.8 9.283 9.854 10.405 11.021 11.7 12.435 13.238 14.163 15.26 16.426 17.857 19.467 21.305 23.436 26.124 29.495 33.826 37.785 40.364 42.036 43.199 44.075 44.702 45.185 45.553 45.831 45.976 46.055 46.102 46.122 46.116 46.1 46.062 46.012 45.956 45.888 45.804 45.712 45.608 45.509 45.447 45.383 45.293 45.199 45.095 45.016 44.922 44.766 44.668 44.563 44.504 44.359 44.195 44.029 43.935 43.658 43.605 43.507 43.405 43.131 42.972 42.766 42.511 42.24 41.92 41.517 39.282 -8 ,29291 ,KEBNE ,16652519,Sun Nov 21 22:54:50 CET,Mon Nov 22 00:42:14 CET,0.0 0.818 1.145 1.42 1.646 1.833 2.009 2.199 2.566 2.736 2.892 2.972 3.332 3.461 3.724 3.96 4.196 4.322 4.555 4.77 5.107 5.33 5.543 5.874 6.187 6.476 6.759 7.044 7.414 7.776 8.15 8.598 9.02 9.448 9.963 10.538 11.103 11.726 12.398 13.138 13.942 14.873 16.01 17.173 18.522 20.05 21.92 24.142 26.811 30.128 34.494 38.371 40.725 42.307 43.47 44.333 44.926 45.391 45.696 45.925 46.122 46.27 46.382 46.444 46.46 46.459 46.445 46.418 46.386 46.344 46.272 46.211 46.151 46.074 46.01 45.94 45.869 45.798 45.694 45.611 45.528 45.365 45.244 45.134 45.074 44.948 44.817 44.662 44.567 44.304 44.284 44.163 44.044 43.818 43.658 43.452 43.219 42.979 42.699 42.293 39.992 -9 ,21248 ,KEBNE ,16652520,Sun Nov 21 22:55:51 CET,Mon Nov 22 00:43:45 CET,0.0 0.644 0.968 1.239 1.476 1.698 1.901 2.093 2.457 2.613 2.764 2.846 3.208 3.336 3.584 3.825 4.052 4.167 4.398 4.628 4.969 5.184 5.386 5.676 5.965 6.248 6.53 6.821 7.199 7.562 7.936 8.391 8.823 9.254 9.76 10.34 10.913 11.554 12.265 13.053 13.908 14.857 15.989 17.205 18.649 20.269 22.156 24.364 27.14 30.612 35.114 39.241 41.89 43.632 44.791 45.645 46.272 46.75 47.092 47.353 47.523 47.646 47.733 47.771 47.801 47.805 47.761 47.731 47.711 47.67 47.61 47.548 47.471 47.384 47.281 47.156 47.037 46.917 46.808 46.731 46.651 46.521 46.411 46.283 46.214 46.08 45.94 45.787 45.706 45.458 45.448 45.318 45.18 44.909 44.751 44.554 44.31 44.058 43.723 43.17 40.289 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 1cfc4738..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3646 ,KEBNE ,16652522,Sun Nov 21 22:56:53 CET,Mon Nov 22 00:44:54 CET,0.0 1.023 1.378 1.668 1.924 2.144 2.342 2.525 2.881 3.058 3.221 3.298 3.652 3.784 4.035 4.261 4.478 4.587 4.813 5.045 5.387 5.609 5.823 6.136 6.439 6.73 7.034 7.342 7.715 8.069 8.429 8.866 9.286 9.701 10.166 10.661 11.165 11.741 12.356 13.025 13.738 14.565 15.569 16.6 17.79 19.115 20.717 22.659 24.942 27.67 31.174 34.235 36.007 37.092 37.756 38.124 38.364 38.556 38.672 38.745 38.771 38.732 38.677 38.61 38.529 38.441 38.31 38.189 38.092 37.979 37.849 37.748 37.64 37.494 37.37 37.252 37.136 37.007 36.875 36.779 36.662 36.479 36.36 36.222 36.15 35.993 35.825 35.65 35.561 35.297 35.278 35.167 35.048 34.744 34.567 34.371 34.157 33.894 33.572 33.148 31.381 -2 ,30513 ,KEBNE ,16652523,Sun Nov 21 22:57:55 CET,Mon Nov 22 00:45:22 CET,0.0 0.849 1.183 1.457 1.714 1.959 2.168 2.371 2.73 2.897 3.057 3.123 3.479 3.61 3.859 4.095 4.334 4.452 4.682 4.912 5.237 5.445 5.651 5.961 6.264 6.553 6.837 7.12 7.489 7.856 8.217 8.636 9.033 9.416 9.87 10.414 10.94 11.523 12.156 12.813 13.494 14.289 15.26 16.249 17.413 18.726 20.314 22.163 24.337 26.953 30.282 33.196 34.869 35.94 36.706 37.238 37.57 37.776 37.881 37.934 37.932 37.917 37.897 37.846 37.786 37.712 37.626 37.549 37.46 37.354 37.242 37.151 37.051 36.921 36.818 36.711 36.597 36.482 36.356 36.264 36.155 35.977 35.86 35.728 35.662 35.527 35.372 35.204 35.105 34.808 34.762 34.639 34.498 34.183 34.008 33.825 33.623 33.361 33.071 32.663 31.067 -4 ,32436 ,KEBNE ,16652525,Sun Nov 21 22:57:55 CET,Mon Nov 22 00:45:48 CET,0.0 1.183 1.603 1.912 2.173 2.388 2.586 2.793 3.175 3.348 3.524 3.627 3.991 4.128 4.386 4.641 4.896 5.023 5.267 5.506 5.863 6.085 6.301 6.624 6.929 7.229 7.517 7.782 8.141 8.503 8.846 9.265 9.683 10.088 10.575 11.128 11.644 12.223 12.851 13.556 14.34 15.202 16.218 17.269 18.505 19.864 21.46 23.344 25.623 28.329 31.617 34.454 36.186 37.266 37.928 38.388 38.7 38.886 38.991 39.064 39.08 39.046 38.97 38.872 38.781 38.677 38.564 38.477 38.38 38.269 38.158 38.06 37.96 37.844 37.739 37.627 37.506 37.382 37.238 37.13 37.025 36.861 36.733 36.604 36.534 36.365 36.181 35.982 35.874 35.571 35.488 35.352 35.211 34.886 34.716 34.521 34.292 34.039 33.751 33.307 31.474 -6 ,21686 ,KEBNE ,16652527,Sun Nov 21 22:57:55 CET,Mon Nov 22 00:45:11 CET,0.0 1.064 1.463 1.78 2.075 2.335 2.553 2.747 3.141 3.325 3.484 3.563 3.924 4.068 4.355 4.617 4.85 4.964 5.186 5.413 5.758 5.972 6.178 6.482 6.758 7.007 7.259 7.514 7.838 8.161 8.478 8.86 9.239 9.626 10.098 10.64 11.156 11.721 12.323 12.962 13.663 14.45 15.397 16.427 17.626 18.927 20.466 22.238 24.458 27.201 30.441 33.158 34.795 35.838 36.534 37.014 37.301 37.461 37.521 37.551 37.57 37.56 37.53 37.472 37.385 37.291 37.207 37.12 37.014 36.894 36.766 36.648 36.534 36.416 36.303 36.182 36.049 35.904 35.746 35.636 35.536 35.357 35.217 35.084 35.015 34.869 34.737 34.589 34.499 34.229 34.198 34.079 33.961 33.687 33.531 33.361 33.155 32.883 32.563 32.135 29.799 -7 ,16553 ,KEBNE ,16652528,Sun Nov 21 22:57:55 CET,Mon Nov 22 00:45:27 CET,0.0 1.033 1.376 1.67 1.939 2.189 2.407 2.599 2.96 3.128 3.302 3.401 3.751 3.876 4.153 4.446 4.731 4.869 5.112 5.348 5.699 5.914 6.123 6.427 6.717 7.006 7.3 7.585 7.942 8.291 8.636 9.065 9.49 9.908 10.404 10.98 11.542 12.158 12.816 13.54 14.336 15.219 16.264 17.351 18.609 20.008 21.728 23.778 26.171 29.036 32.565 35.462 37.226 38.37 39.044 39.417 39.63 39.782 39.874 39.896 39.879 39.852 39.798 39.728 39.654 39.578 39.476 39.38 39.301 39.195 39.064 38.959 38.85 38.727 38.629 38.532 38.428 38.295 38.149 38.052 37.945 37.776 37.656 37.524 37.45 37.297 37.145 36.982 36.898 36.614 36.565 36.443 36.314 36.05 35.9 35.731 35.543 35.324 35.023 34.586 33.076 -8 ,28906 ,KEBNE ,16652529,Sun Nov 21 22:58:56 CET,Mon Nov 22 00:47:54 CET,0.0 0.842 1.132 1.374 1.6 1.823 2.022 2.194 2.49 2.635 2.782 2.838 3.193 3.322 3.596 3.858 4.104 4.229 4.464 4.685 5.004 5.214 5.425 5.734 6.039 6.348 6.653 6.939 7.293 7.63 7.962 8.374 8.803 9.235 9.719 10.251 10.772 11.374 12.054 12.777 13.526 14.366 15.385 16.468 17.747 19.209 20.963 23.013 25.46 28.291 31.634 34.437 36.111 37.124 37.744 38.163 38.415 38.557 38.632 38.674 38.671 38.631 38.565 38.495 38.43 38.32 38.158 38.009 37.895 37.773 37.624 37.487 37.334 37.181 37.054 36.917 36.755 36.574 36.4 36.273 36.135 35.923 35.765 35.582 35.487 35.289 35.089 34.888 34.78 34.472 34.388 34.246 34.095 33.771 33.59 33.403 33.193 32.906 32.533 32.039 29.997 -9 ,580 ,KEBNE ,16652530,Sun Nov 21 22:58:56 CET,Mon Nov 22 00:47:32 CET,0.0 1.024 1.412 1.707 1.959 2.187 2.389 2.566 2.909 3.069 3.219 3.303 3.67 3.813 4.09 4.342 4.595 4.718 4.953 5.18 5.527 5.757 5.965 6.238 6.51 6.798 7.078 7.35 7.704 8.029 8.346 8.742 9.139 9.522 9.952 10.457 10.984 11.579 12.197 12.87 13.599 14.414 15.36 16.336 17.512 18.922 20.605 22.479 24.741 27.483 30.959 34.07 35.834 36.926 37.632 38.088 38.432 38.64 38.72 38.759 38.778 38.767 38.72 38.665 38.572 38.449 38.32 38.203 38.095 37.982 37.853 37.729 37.597 37.455 37.336 37.207 37.056 36.893 36.748 36.651 36.551 36.379 36.239 36.076 35.996 35.843 35.657 35.449 35.343 35.041 34.973 34.856 34.73 34.437 34.266 34.087 33.898 33.664 33.331 32.813 30.869 -10 ,15180 ,KEBNE ,16652531,Sun Nov 21 22:58:58 CET,Mon Nov 22 00:42:34 CET,0.0 0.882 1.223 1.495 1.736 1.954 2.16 2.357 2.704 2.855 3.006 3.076 3.434 3.576 3.876 4.165 4.419 4.542 4.784 5.044 5.43 5.658 5.872 6.185 6.505 6.815 7.119 7.426 7.831 8.215 8.584 9.019 9.439 9.864 10.364 10.923 11.455 12.034 12.655 13.321 14.032 14.856 15.846 16.897 18.162 19.537 21.142 23.033 25.344 28.199 31.646 34.422 36.039 37.082 37.811 38.339 38.669 38.868 38.968 39.0 38.996 38.964 38.893 38.789 38.672 38.548 38.415 38.274 38.13 37.979 37.833 37.704 37.545 37.386 37.278 37.158 37.005 36.845 36.676 36.546 36.405 36.186 36.044 35.881 35.788 35.608 35.419 35.205 35.092 34.799 34.74 34.599 34.453 34.142 33.962 33.762 33.547 33.315 33.008 32.565 30.774 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index e7910ef0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18861 ,KEBNE ,16652532,Sun Nov 21 22:58:56 CET,Mon Nov 22 00:46:17 CET,0.0 0.706 1.046 1.324 1.57 1.796 1.993 2.175 2.509 2.663 2.812 2.864 3.213 3.348 3.59 3.831 4.068 4.18 4.406 4.617 4.921 5.129 5.334 5.622 5.909 6.197 6.474 6.735 7.074 7.416 7.758 8.178 8.585 8.985 9.46 9.988 10.494 11.064 11.707 12.435 13.201 14.071 15.162 16.279 17.604 19.174 20.988 23.001 25.492 28.637 32.573 35.971 38.061 39.436 40.324 40.905 41.3 41.573 41.745 41.873 41.944 41.961 41.936 41.898 41.864 41.816 41.75 41.681 41.604 41.537 41.465 41.382 41.282 41.163 41.059 40.949 40.844 40.738 40.621 40.536 40.439 40.285 40.158 40.012 39.945 39.785 39.608 39.441 39.351 39.082 39.042 38.917 38.767 38.464 38.304 38.128 37.957 37.717 37.348 36.863 35.079 -2 ,22377 ,KEBNE ,16652533,Sun Nov 21 22:58:56 CET,Mon Nov 22 00:45:48 CET,0.0 0.631 0.937 1.22 1.47 1.687 1.902 2.105 2.459 2.62 2.778 2.846 3.197 3.336 3.587 3.828 4.06 4.172 4.403 4.616 4.923 5.123 5.318 5.614 5.906 6.193 6.46 6.721 7.075 7.421 7.762 8.168 8.555 8.947 9.41 9.914 10.402 10.962 11.571 12.213 12.905 13.732 14.72 15.717 16.915 18.274 19.88 21.771 24.041 26.896 30.608 34.011 36.078 37.253 37.986 38.484 38.809 39.031 39.163 39.258 39.323 39.353 39.357 39.354 39.334 39.29 39.206 39.116 39.051 38.988 38.909 38.817 38.724 38.639 38.544 38.441 38.35 38.253 38.141 38.051 37.959 37.81 37.703 37.595 37.537 37.412 37.266 37.084 36.976 36.704 36.674 36.57 36.466 36.217 36.071 35.892 35.674 35.412 35.091 34.605 32.645 -3 ,24509 ,KEBNE ,16652534,Sun Nov 21 22:58:57 CET,Mon Nov 22 00:44:31 CET,0.0 0.842 1.17 1.41 1.62 1.814 1.993 2.161 2.49 2.639 2.781 2.853 3.212 3.349 3.626 3.888 4.129 4.245 4.472 4.699 5.031 5.239 5.437 5.731 6.028 6.316 6.596 6.879 7.247 7.612 7.977 8.398 8.798 9.194 9.67 10.228 10.774 11.386 12.042 12.747 13.506 14.378 15.443 16.552 17.874 19.396 21.21 23.38 26.014 29.22 33.278 36.891 38.915 40.076 40.847 41.372 41.71 41.914 42.047 42.139 42.191 42.211 42.177 42.134 42.113 42.089 42.045 41.978 41.897 41.813 41.708 41.612 41.516 41.407 41.322 41.218 41.096 40.975 40.834 40.731 40.62 40.431 40.306 40.172 40.106 39.969 39.806 39.626 39.529 39.27 39.25 39.132 38.989 38.651 38.471 38.291 38.089 37.859 37.583 37.166 34.428 -4 ,23119 ,KEBNE ,16652535,Sun Nov 21 22:58:56 CET,Mon Nov 22 00:46:43 CET,0.0 0.743 1.029 1.263 1.484 1.706 1.907 2.095 2.447 2.605 2.758 2.834 3.206 3.355 3.613 3.874 4.141 4.258 4.479 4.698 5.048 5.279 5.491 5.799 6.118 6.437 6.723 6.996 7.36 7.71 8.046 8.471 8.897 9.309 9.778 10.332 10.88 11.485 12.16 12.891 13.637 14.434 15.374 16.339 17.498 18.844 20.452 22.366 24.607 27.266 30.583 33.433 35.21 36.393 37.073 37.522 37.857 38.079 38.221 38.31 38.348 38.34 38.309 38.275 38.231 38.178 38.111 38.026 37.944 37.852 37.755 37.674 37.568 37.44 37.339 37.241 37.143 37.028 36.889 36.789 36.691 36.528 36.413 36.301 36.241 36.124 35.987 35.813 35.722 35.465 35.44 35.322 35.188 34.907 34.754 34.574 34.364 34.111 33.816 33.454 32.116 -5 ,32336 ,KEBNE ,16652536,Sun Nov 21 23:00:02 CET,Mon Nov 22 00:47:05 CET,0.0 0.918 1.288 1.592 1.828 2.029 2.213 2.394 2.714 2.86 3.006 3.071 3.427 3.559 3.821 4.078 4.32 4.438 4.672 4.893 5.235 5.455 5.651 5.935 6.205 6.485 6.775 7.064 7.455 7.837 8.185 8.599 9.017 9.443 9.95 10.512 11.061 11.689 12.399 13.157 13.946 14.852 15.94 17.063 18.441 20.046 21.866 23.946 26.569 29.815 33.863 37.435 39.589 40.804 41.512 42.005 42.332 42.58 42.749 42.875 42.947 42.961 42.949 42.934 42.911 42.848 42.746 42.65 42.549 42.43 42.311 42.224 42.13 42.001 41.902 41.798 41.683 41.572 41.459 41.37 41.271 41.102 40.972 40.847 40.783 40.638 40.492 40.339 40.25 39.987 39.935 39.812 39.695 39.453 39.302 39.124 38.917 38.674 38.371 37.95 36.217 -6 ,1619 ,KEBNE ,16652537,Sun Nov 21 22:59:58 CET,Mon Nov 22 00:47:40 CET,0.0 0.93 1.255 1.503 1.715 1.902 2.083 2.258 2.57 2.721 2.863 2.908 3.242 3.371 3.634 3.883 4.117 4.227 4.441 4.654 4.963 5.153 5.343 5.623 5.91 6.19 6.45 6.715 7.064 7.394 7.716 8.11 8.51 8.92 9.386 9.907 10.421 10.977 11.567 12.22 12.948 13.792 14.768 15.759 16.973 18.392 20.032 21.873 24.103 26.894 30.39 33.398 35.302 36.598 37.457 37.983 38.317 38.54 38.668 38.766 38.817 38.839 38.859 38.844 38.791 38.731 38.657 38.591 38.523 38.442 38.353 38.271 38.167 38.046 37.958 37.869 37.771 37.661 37.555 37.486 37.409 37.278 37.176 37.069 37.015 36.87 36.709 36.569 36.49 36.242 36.209 36.098 35.98 35.654 35.483 35.307 35.088 34.832 34.484 33.984 31.777 -7 ,14939 ,KEBNE ,16652538,Sun Nov 21 23:00:59 CET,Mon Nov 22 00:48:47 CET,0.0 0.723 1.036 1.281 1.499 1.693 1.87 2.042 2.359 2.51 2.656 2.715 3.06 3.19 3.449 3.686 3.902 4.009 4.228 4.455 4.775 4.979 5.183 5.47 5.744 6.016 6.285 6.557 6.926 7.285 7.627 8.015 8.387 8.756 9.186 9.68 10.154 10.668 11.24 11.881 12.562 13.343 14.299 15.283 16.511 17.92 19.512 21.342 23.48 26.069 29.476 32.448 34.259 35.436 36.214 36.772 37.14 37.378 37.515 37.62 37.693 37.718 37.716 37.701 37.673 37.624 37.545 37.48 37.42 37.341 37.245 37.15 37.054 36.959 36.866 36.752 36.632 36.499 36.364 36.273 36.161 35.986 35.875 35.756 35.692 35.57 35.434 35.26 35.158 34.88 34.824 34.694 34.565 34.315 34.173 34.002 33.782 33.533 33.257 32.926 31.35 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 4908be86..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27585 ,KEBNE ,16652542,Sun Nov 21 23:02:01 CET,Mon Nov 22 00:50:14 CET,0.0 0.889 1.213 1.457 1.672 1.877 2.071 2.255 2.579 2.73 2.875 2.927 3.278 3.411 3.663 3.905 4.14 4.252 4.483 4.7 4.993 5.191 5.39 5.677 5.959 6.23 6.494 6.77 7.116 7.444 7.759 8.159 8.552 8.919 9.341 9.825 10.31 10.857 11.472 12.101 12.75 13.529 14.466 15.388 16.46 17.712 19.211 20.894 22.885 25.363 28.538 31.006 32.197 32.829 33.228 33.473 33.58 33.605 33.558 33.5 33.472 33.43 33.338 33.186 33.03 32.888 32.724 32.572 32.445 32.313 32.156 32.029 31.895 31.744 31.619 31.498 31.382 31.254 31.13 31.051 30.965 30.808 30.666 30.517 30.442 30.278 30.114 29.942 29.852 29.574 29.552 29.444 29.329 29.068 28.922 28.76 28.584 28.357 28.076 27.736 26.884 -2 ,12805 ,KEBNE ,16652543,Sun Nov 21 23:02:02 CET,Mon Nov 22 00:51:37 CET,0.0 0.692 1.063 1.384 1.66 1.881 2.08 2.27 2.594 2.737 2.883 2.955 3.311 3.438 3.679 3.924 4.172 4.294 4.533 4.775 5.118 5.321 5.509 5.8 6.083 6.36 6.635 6.891 7.231 7.573 7.909 8.331 8.74 9.131 9.582 10.082 10.558 11.086 11.661 12.273 12.921 13.676 14.589 15.528 16.638 17.911 19.386 21.076 23.185 25.809 28.993 31.602 33.203 34.17 34.717 34.994 35.097 35.148 35.142 35.044 34.941 34.844 34.689 34.51 34.354 34.211 34.053 33.894 33.761 33.61 33.436 33.307 33.167 33.015 32.899 32.777 32.654 32.533 32.412 32.329 32.238 32.089 31.983 31.857 31.792 31.659 31.508 31.35 31.27 31.0 30.969 30.849 30.733 30.459 30.307 30.138 29.938 29.688 29.376 29.008 28.242 -3 ,30 ,KEBNE ,16652544,Sun Nov 21 23:04:05 CET,Mon Nov 22 00:51:56 CET,0.0 0.608 0.868 1.107 1.318 1.5 1.676 1.848 2.198 2.36 2.507 2.576 2.926 3.056 3.295 3.509 3.721 3.832 4.047 4.256 4.579 4.786 4.987 5.278 5.564 5.838 6.09 6.33 6.647 6.965 7.29 7.701 8.094 8.461 8.884 9.36 9.822 10.344 10.918 11.558 12.228 12.981 13.903 14.867 16.002 17.253 18.74 20.487 22.52 24.915 28.037 30.834 32.262 32.898 33.238 33.372 33.387 33.381 33.317 33.204 33.115 33.017 32.913 32.806 32.69 32.579 32.445 32.327 32.242 32.151 32.041 31.944 31.833 31.704 31.6 31.495 31.371 31.21 31.026 30.907 30.802 30.635 30.498 30.34 30.261 30.109 29.933 29.733 29.641 29.363 29.361 29.261 29.151 28.915 28.766 28.605 28.445 28.222 27.977 27.689 26.847 -4 ,25318 ,KEBNE ,16652545,Sun Nov 21 23:07:10 CET,Mon Nov 22 00:53:12 CET,0.0 0.597 0.908 1.161 1.389 1.585 1.765 1.936 2.237 2.384 2.533 2.578 2.936 3.069 3.312 3.557 3.802 3.923 4.166 4.4 4.736 4.941 5.127 5.397 5.664 5.931 6.201 6.457 6.788 7.132 7.472 7.87 8.256 8.657 9.135 9.649 10.137 10.687 11.291 11.952 12.652 13.477 14.437 15.369 16.466 17.688 19.135 20.888 23.045 25.615 28.882 31.579 33.109 34.109 34.758 35.195 35.49 35.616 35.59 35.494 35.368 35.235 35.093 34.96 34.861 34.749 34.598 34.46 34.335 34.198 34.07 33.969 33.846 33.711 33.598 33.472 33.343 33.202 33.046 32.938 32.821 32.628 32.485 32.332 32.252 32.104 31.965 31.793 31.693 31.395 31.352 31.243 31.117 30.794 30.62 30.455 30.264 30.031 29.773 29.444 28.173 -5 ,9208 ,KEBNE ,16652546,Sun Nov 21 23:07:09 CET,Mon Nov 22 00:55:25 CET,0.0 0.693 0.989 1.224 1.445 1.636 1.799 1.959 2.233 2.364 2.504 2.558 2.904 3.025 3.275 3.516 3.727 3.825 4.03 4.233 4.52 4.713 4.909 5.202 5.487 5.755 6.011 6.259 6.601 6.92 7.235 7.636 8.006 8.366 8.816 9.351 9.865 10.414 10.988 11.594 12.224 12.943 13.82 14.741 15.802 16.987 18.427 20.143 22.2 24.676 27.75 30.297 31.849 32.608 32.861 33.009 33.111 33.18 33.23 33.235 33.169 33.052 32.915 32.777 32.644 32.536 32.403 32.255 32.135 31.997 31.836 31.699 31.556 31.406 31.285 31.157 31.023 30.885 30.738 30.636 30.534 30.385 30.265 30.123 30.055 29.909 29.746 29.563 29.467 29.18 29.16 29.055 28.935 28.702 28.588 28.462 28.291 28.079 27.857 27.569 26.861 -6 ,2622 ,KEBNE ,16652547,Sun Nov 21 23:07:10 CET,Mon Nov 22 00:56:54 CET,0.0 0.786 1.093 1.368 1.62 1.84 2.037 2.226 2.574 2.734 2.889 2.947 3.288 3.405 3.652 3.891 4.104 4.206 4.406 4.594 4.868 5.055 5.243 5.523 5.786 6.03 6.269 6.511 6.832 7.157 7.48 7.855 8.217 8.578 8.993 9.455 9.907 10.415 10.996 11.645 12.347 13.154 14.101 15.05 16.149 17.386 18.847 20.591 22.685 25.261 28.603 31.411 33.013 33.994 34.636 34.92 34.957 34.975 34.956 34.919 34.867 34.761 34.659 34.568 34.46 34.348 34.195 34.047 33.935 33.795 33.641 33.522 33.375 33.214 33.099 32.976 32.845 32.709 32.543 32.425 32.317 32.157 32.055 31.938 31.873 31.739 31.596 31.437 31.35 31.082 31.074 30.979 30.887 30.659 30.517 30.38 30.234 30.033 29.808 29.5 28.657 -7 ,10827 ,KEBNE ,16652548,Sun Nov 21 23:08:11 CET,Mon Nov 22 00:55:11 CET,0.0 0.806 1.154 1.395 1.6 1.783 1.966 2.145 2.457 2.606 2.752 2.83 3.19 3.316 3.574 3.828 4.05 4.159 4.384 4.605 4.913 5.099 5.277 5.547 5.814 6.066 6.317 6.566 6.875 7.172 7.477 7.863 8.244 8.612 9.043 9.541 10.01 10.521 11.095 11.728 12.403 13.171 14.095 15.035 16.149 17.356 18.766 20.441 22.47 24.988 28.057 30.255 31.326 31.982 32.395 32.641 32.771 32.833 32.803 32.749 32.719 32.664 32.523 32.375 32.249 32.118 31.991 31.857 31.716 31.563 31.397 31.26 31.132 30.999 30.886 30.755 30.603 30.442 30.275 30.164 30.045 29.868 29.749 29.602 29.532 29.395 29.216 29.031 28.944 28.661 28.608 28.493 28.379 28.127 27.984 27.817 27.608 27.37 27.09 26.733 25.978 -8 ,2841 ,KEBNE ,16652549,Sun Nov 21 23:09:12 CET,Mon Nov 22 00:55:02 CET,0.0 0.884 1.19 1.427 1.642 1.85 2.039 2.217 2.548 2.7 2.84 2.866 3.206 3.327 3.572 3.805 4.032 4.144 4.359 4.568 4.861 5.051 5.249 5.541 5.817 6.088 6.362 6.625 6.956 7.304 7.664 8.089 8.487 8.872 9.315 9.831 10.354 10.924 11.53 12.178 12.88 13.682 14.607 15.529 16.611 17.876 19.353 21.051 23.105 25.669 28.953 31.617 33.201 34.212 34.873 35.332 35.494 35.452 35.397 35.35 35.298 35.221 35.142 35.062 34.975 34.882 34.752 34.612 34.497 34.392 34.258 34.121 33.978 33.854 33.759 33.644 33.534 33.407 33.256 33.158 33.052 32.854 32.715 32.582 32.515 32.368 32.211 32.034 31.935 31.652 31.617 31.488 31.361 31.079 30.911 30.74 30.553 30.345 30.094 29.74 29.003 -9 ,25756 ,KEBNE ,16652550,Sun Nov 21 23:09:13 CET,Mon Nov 22 00:55:44 CET,0.0 0.632 0.973 1.27 1.512 1.706 1.885 2.046 2.33 2.474 2.616 2.661 3.003 3.122 3.372 3.615 3.838 3.942 4.148 4.356 4.67 4.873 5.069 5.361 5.652 5.94 6.215 6.473 6.795 7.108 7.439 7.838 8.218 8.597 9.025 9.51 10.008 10.562 11.166 11.825 12.516 13.292 14.164 15.055 16.157 17.426 18.929 20.642 22.624 24.994 28.002 30.579 32.154 33.165 33.814 34.262 34.509 34.531 34.461 34.354 34.251 34.172 34.062 33.926 33.805 33.671 33.517 33.381 33.261 33.145 33.011 32.894 32.77 32.638 32.518 32.366 32.216 32.073 31.927 31.826 31.708 31.517 31.4 31.272 31.2 31.058 30.897 30.723 30.633 30.355 30.294 30.159 30.032 29.773 29.626 29.45 29.26 29.061 28.81 28.431 27.446 -10 ,17658 ,KEBNE ,16652551,Sun Nov 21 23:10:14 CET,Mon Nov 22 00:58:05 CET,0.0 0.714 1.021 1.252 1.466 1.651 1.818 1.986 2.308 2.471 2.618 2.662 3.006 3.141 3.411 3.668 3.9 4.009 4.213 4.407 4.681 4.854 5.031 5.302 5.564 5.814 6.057 6.297 6.611 6.902 7.174 7.5 7.814 8.116 8.482 8.902 9.308 9.75 10.227 10.739 11.281 11.931 12.701 13.459 14.383 15.433 16.618 17.996 19.665 21.638 24.225 26.365 27.488 28.256 28.788 29.034 29.103 29.112 29.088 29.023 28.938 28.841 28.727 28.591 28.456 28.339 28.207 28.067 27.927 27.791 27.636 27.493 27.357 27.223 27.108 26.98 26.854 26.703 26.535 26.434 26.33 26.157 26.03 25.894 25.825 25.681 25.519 25.305 25.186 24.885 24.855 24.745 24.635 24.384 24.24 24.084 23.898 23.679 23.422 23.068 22.108 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 009950a4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17147 ,KEBNE ,16652552,Sun Nov 21 23:09:16 CET,Mon Nov 22 00:50:13 CET,0.0 0.615 0.943 1.209 1.426 1.615 1.806 1.981 2.285 2.439 2.601 2.707 3.08 3.217 3.488 3.761 4.027 4.15 4.391 4.64 4.992 5.221 5.452 5.783 6.097 6.396 6.69 6.98 7.369 7.747 8.119 8.576 9.017 9.459 9.985 10.599 11.188 11.836 12.562 13.359 14.219 15.216 16.409 17.643 19.101 20.777 22.816 25.252 28.305 32.144 37.177 41.822 44.805 46.886 48.392 49.562 50.519 51.281 51.84 52.345 52.714 52.995 53.244 53.444 53.603 53.723 53.822 53.891 53.955 54.028 54.081 54.118 54.146 54.161 54.173 54.18 54.193 54.199 54.177 54.165 54.148 54.112 54.096 54.078 54.067 54.02 53.956 53.883 53.842 53.641 53.735 53.69 53.638 53.502 53.426 53.344 53.247 53.12 52.956 52.747 52.193 -2 ,19922 ,KEBNE ,16652553,Sun Nov 21 23:10:14 CET,Mon Nov 22 00:57:28 CET,0.0 0.642 0.966 1.246 1.49 1.704 1.893 2.071 2.396 2.549 2.693 2.736 3.094 3.232 3.507 3.781 4.042 4.168 4.404 4.635 4.986 5.212 5.43 5.748 6.062 6.38 6.689 6.986 7.383 7.781 8.168 8.641 9.104 9.56 10.096 10.715 11.319 11.971 12.687 13.478 14.333 15.319 16.484 17.681 19.159 20.854 22.898 25.335 28.339 32.105 37.056 41.665 44.621 46.714 48.239 49.404 50.303 50.986 51.509 51.98 52.328 52.602 52.83 53.022 53.182 53.326 53.45 53.528 53.594 53.665 53.728 53.777 53.808 53.816 53.825 53.833 53.839 53.843 53.832 53.823 53.8 53.761 53.736 53.688 53.657 53.606 53.552 53.5 53.476 53.281 53.373 53.328 53.278 53.152 53.082 52.992 52.878 52.744 52.603 52.406 51.625 -6 ,14789 ,KEBNE ,16652557,Sun Nov 21 23:12:17 CET,Mon Nov 22 01:00:47 CET,0.0 0.908 1.252 1.534 1.791 2.017 2.228 2.426 2.791 2.959 3.123 3.21 3.58 3.726 3.996 4.254 4.498 4.624 4.887 5.136 5.499 5.73 5.956 6.296 6.618 6.941 7.272 7.586 7.991 8.39 8.771 9.233 9.684 10.128 10.661 11.276 11.883 12.565 13.32 14.132 14.999 16.02 17.26 18.523 20.004 21.714 23.775 26.28 29.371 33.101 38.003 42.63 45.733 47.918 49.472 50.679 51.614 52.355 52.896 53.374 53.773 54.108 54.365 54.577 54.768 54.908 55.017 55.114 55.204 55.269 55.329 55.378 55.413 55.439 55.456 55.47 55.465 55.446 55.426 55.405 55.375 55.326 55.291 55.26 55.247 55.202 55.14 55.068 55.029 54.827 54.916 54.874 54.826 54.698 54.623 54.551 54.461 54.317 54.126 53.905 53.381 -8 ,14463 ,KEBNE ,16652559,Sun Nov 21 23:13:18 CET,Mon Nov 22 01:01:56 CET,0.0 1.074 1.461 1.769 2.013 2.24 2.442 2.638 2.989 3.149 3.31 3.404 3.771 3.91 4.184 4.446 4.713 4.843 5.082 5.314 5.652 5.876 6.092 6.401 6.709 7.018 7.32 7.615 8.01 8.396 8.776 9.248 9.704 10.157 10.681 11.272 11.844 12.513 13.273 14.067 14.909 15.892 17.107 18.369 19.867 21.599 23.627 26.039 29.095 32.848 37.725 42.362 45.406 47.535 49.129 50.391 51.348 52.084 52.645 53.169 53.574 53.889 54.154 54.377 54.56 54.691 54.815 54.928 55.015 55.093 55.151 55.173 55.2 55.239 55.267 55.293 55.313 55.32 55.311 55.3 55.284 55.27 55.263 55.248 55.237 55.21 55.174 55.118 55.079 54.865 54.939 54.892 54.835 54.695 54.607 54.508 54.399 54.27 54.114 53.916 53.291 -10 ,676 ,KEBNE ,16652561,Sun Nov 21 23:14:32 CET,Mon Nov 22 00:58:34 CET,0.0 0.956 1.362 1.653 1.892 2.103 2.313 2.529 2.921 3.108 3.28 3.389 3.778 3.931 4.218 4.5 4.771 4.899 5.162 5.421 5.782 6.013 6.24 6.576 6.909 7.229 7.551 7.866 8.28 8.689 9.071 9.544 10.019 10.489 11.049 11.675 12.279 12.963 13.716 14.519 15.375 16.385 17.621 18.88 20.384 22.151 24.26 26.705 29.72 33.532 38.614 43.296 46.351 48.533 50.132 51.369 52.306 53.008 53.523 53.982 54.35 54.655 54.922 55.161 55.344 55.48 55.619 55.731 55.818 55.903 55.979 56.037 56.082 56.114 56.134 56.146 56.169 56.194 56.188 56.178 56.172 56.133 56.105 56.089 56.08 56.054 56.017 55.96 55.922 55.706 55.766 55.706 55.655 55.557 55.469 55.356 55.244 55.12 54.939 54.673 54.003 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt deleted file mode 100644 index 0295fd05..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,2467 ,KEBNE ,17019339,Wed Dec 22 02:28:02 CET,Wed Dec 22 04:09:46 CET,0.0 0.975 1.42 1.789 2.124 2.439 2.721 2.965 3.429 3.648 3.861 4.052 4.506 4.708 5.097 5.467 5.822 5.998 6.344 6.674 7.172 7.508 7.829 8.301 8.784 9.25 9.697 10.139 10.717 11.287 11.851 12.542 13.22 13.883 14.668 15.572 16.45 17.444 18.546 19.694 20.883 22.282 23.968 25.704 27.789 30.164 33.041 36.487 40.758 46.099 53.143 59.762 64.044 66.971 69.017 70.54 71.697 72.598 73.236 73.851 74.317 74.598 74.806 74.962 75.075 75.154 75.259 75.351 75.367 75.333 75.282 75.22 75.12 74.997 74.896 74.784 74.657 74.52 74.377 74.272 74.135 73.906 73.767 73.591 73.482 73.272 73.029 72.74 72.577 72.238 71.984 71.729 71.468 70.978 70.709 70.371 69.98 69.415 68.621 67.512 57.059 -3 ,19804 ,KEBNE ,17019340,Wed Dec 22 02:28:02 CET,Wed Dec 22 04:10:14 CET,0.0 1.125 1.588 1.944 2.251 2.524 2.779 3.015 3.47 3.704 3.928 4.095 4.541 4.74 5.12 5.493 5.852 6.025 6.367 6.706 7.2 7.516 7.832 8.305 8.769 9.232 9.682 10.118 10.698 11.268 11.834 12.53 13.205 13.87 14.651 15.542 16.425 17.432 18.541 19.74 21.03 22.464 24.094 25.767 27.791 30.152 33.04 36.478 40.705 46.038 53.102 59.478 63.647 66.618 68.779 70.414 71.587 72.479 73.169 73.78 74.2 74.453 74.656 74.862 75.004 75.102 75.168 75.176 75.159 75.14 75.105 75.058 74.992 74.922 74.874 74.817 74.73 74.619 74.485 74.375 74.239 73.966 73.745 73.502 73.386 73.154 72.86 72.462 72.256 71.924 71.745 71.533 71.284 70.69 70.391 70.065 69.649 69.153 68.492 67.546 63.412 -5 ,12712 ,KEBNE ,17019342,Wed Dec 22 02:28:02 CET,Wed Dec 22 04:08:49 CET,0.0 0.828 1.222 1.555 1.837 2.107 2.363 2.594 3.041 3.265 3.485 3.648 4.104 4.31 4.708 5.092 5.468 5.657 6.019 6.361 6.858 7.186 7.51 7.989 8.456 8.905 9.345 9.785 10.367 10.943 11.518 12.225 12.91 13.59 14.406 15.332 16.235 17.257 18.398 19.623 20.862 22.24 23.905 25.717 27.892 30.284 33.177 36.634 40.887 46.191 53.166 59.369 63.37 66.205 68.259 69.83 70.88 71.571 72.189 72.809 73.22 73.515 73.743 73.911 74.02 74.073 74.106 74.123 74.124 74.1 74.059 74.008 73.897 73.745 73.614 73.445 73.248 73.041 72.824 72.642 72.407 72.036 71.79 71.548 71.418 71.137 70.851 70.576 70.434 70.127 69.97 69.749 69.469 68.824 68.436 67.994 67.524 66.974 66.151 64.908 57.807 -6 ,2370 ,KEBNE ,17019343,Wed Dec 22 02:28:02 CET,Wed Dec 22 04:09:01 CET,0.0 0.941 1.356 1.693 1.996 2.295 2.576 2.836 3.316 3.546 3.773 3.945 4.396 4.6 4.985 5.36 5.741 5.923 6.259 6.593 7.09 7.421 7.747 8.218 8.68 9.143 9.6 10.041 10.621 11.194 11.758 12.457 13.136 13.802 14.597 15.515 16.406 17.387 18.473 19.663 20.944 22.424 24.206 26.059 28.3 30.862 33.803 37.116 41.142 46.284 53.254 59.568 63.584 66.379 68.325 69.825 71.004 71.95 72.658 73.265 73.722 74.044 74.321 74.549 74.711 74.85 74.964 75.038 75.087 75.085 75.065 75.023 74.949 74.868 74.758 74.658 74.545 74.402 74.291 74.217 74.138 73.934 73.736 73.534 73.426 73.176 72.915 72.657 72.516 72.18 71.93 71.711 71.46 70.915 70.618 70.303 69.948 69.472 68.779 67.728 58.986 -7 ,19795 ,KEBNE ,17019344,Wed Dec 22 02:28:02 CET,Wed Dec 22 04:09:43 CET,0.0 0.812 1.239 1.614 1.929 2.208 2.479 2.743 3.246 3.479 3.702 3.888 4.348 4.553 4.955 5.341 5.714 5.893 6.24 6.585 7.095 7.424 7.747 8.222 8.685 9.142 9.588 10.028 10.617 11.192 11.751 12.447 13.131 13.79 14.566 15.466 16.362 17.352 18.381 19.51 20.794 22.216 23.844 25.534 27.592 30.103 33.227 36.954 41.507 47.014 54.043 60.404 64.505 67.314 69.289 70.743 71.825 72.67 73.307 73.845 74.216 74.468 74.688 74.855 74.949 75.014 75.055 75.075 75.076 75.037 74.958 74.893 74.808 74.713 74.635 74.545 74.439 74.301 74.134 74.006 73.888 73.691 73.523 73.331 73.225 73.02 72.778 72.439 72.242 71.877 71.588 71.318 71.018 70.361 69.933 69.511 69.073 68.503 67.827 66.753 62.05 -8 ,25210 ,KEBNE ,17019345,Wed Dec 22 02:28:02 CET,Wed Dec 22 04:08:57 CET,0.0 0.818 1.216 1.563 1.883 2.165 2.428 2.682 3.176 3.41 3.627 3.798 4.246 4.445 4.831 5.206 5.575 5.753 6.099 6.44 6.929 7.248 7.574 8.057 8.521 8.975 9.429 9.873 10.452 11.026 11.584 12.258 12.924 13.591 14.384 15.288 16.173 17.176 18.289 19.494 20.769 22.236 24.025 25.817 27.851 30.197 33.032 36.371 40.569 45.902 52.984 59.493 63.7 66.649 68.769 70.323 71.481 72.395 73.008 73.514 73.903 74.185 74.393 74.54 74.653 74.73 74.78 74.803 74.792 74.727 74.631 74.571 74.481 74.343 74.225 74.09 73.958 73.832 73.676 73.543 73.389 73.148 72.942 72.713 72.614 72.397 72.092 71.71 71.495 71.102 70.787 70.521 70.22 69.59 69.246 68.805 68.283 67.693 66.959 65.879 59.468 -9 ,23397 ,KEBNE ,17019346,Wed Dec 22 02:28:02 CET,Wed Dec 22 04:08:52 CET,0.0 0.972 1.378 1.717 2.035 2.319 2.582 2.835 3.317 3.542 3.755 3.922 4.372 4.573 4.947 5.316 5.682 5.858 6.219 6.578 7.106 7.443 7.754 8.213 8.676 9.135 9.594 10.035 10.599 11.162 11.715 12.402 13.079 13.749 14.545 15.429 16.299 17.303 18.398 19.584 20.883 22.315 23.96 25.762 28.021 30.618 33.716 37.332 41.674 47.042 54.158 60.605 64.747 67.711 69.819 71.309 72.394 73.236 73.852 74.391 74.766 75.008 75.17 75.303 75.424 75.487 75.485 75.451 75.415 75.373 75.291 75.214 75.138 75.048 74.958 74.845 74.708 74.533 74.319 74.148 73.979 73.765 73.615 73.425 73.317 73.07 72.794 72.526 72.389 72.08 71.892 71.688 71.456 70.865 70.549 70.206 69.789 69.27 68.479 67.305 60.556 -10 ,4622 ,KEBNE ,17019347,Wed Dec 22 02:29:04 CET,Wed Dec 22 04:10:32 CET,0.0 0.835 1.244 1.588 1.903 2.182 2.438 2.686 3.155 3.383 3.604 3.779 4.223 4.422 4.812 5.189 5.559 5.74 6.09 6.431 6.929 7.25 7.571 8.039 8.495 8.954 9.408 9.851 10.419 10.976 11.531 12.234 12.931 13.609 14.423 15.322 16.166 17.135 18.194 19.289 20.436 21.756 23.342 24.967 26.955 29.289 32.124 35.485 39.679 45.124 52.277 58.737 62.851 65.686 67.783 69.252 70.292 71.181 71.839 72.339 72.735 73.029 73.209 73.338 73.429 73.476 73.505 73.507 73.477 73.424 73.344 73.252 73.142 72.999 72.89 72.772 72.596 72.405 72.22 72.08 71.939 71.715 71.514 71.287 71.176 70.957 70.665 70.342 70.19 69.875 69.715 69.504 69.278 68.785 68.483 68.157 67.747 67.243 66.65 65.763 62.562 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt deleted file mode 100644 index a4bf506a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,16830 ,KEBNE ,17019351,Wed Dec 22 02:29:04 CET,Wed Dec 22 04:12:11 CET,0.0 1.062 1.406 1.675 1.893 2.077 2.236 2.387 2.663 2.776 2.887 2.861 3.212 3.32 3.525 3.717 3.885 3.962 4.105 4.251 4.464 4.586 4.705 4.889 5.057 5.22 5.383 5.528 5.732 5.951 6.154 6.388 6.605 6.797 7.003 7.235 7.459 7.699 7.958 8.215 8.483 8.792 9.131 9.467 9.771 10.036 10.31 10.466 10.477 10.312 9.652 8.317 6.888 5.569 4.365 3.276 2.311 1.421 0.642 -0.144 -0.804 -1.429 -2.079 -2.668 -3.201 -3.712 -4.213 -4.648 -5.057 -5.481 -5.939 -6.332 -6.734 -7.156 -7.478 -7.781 -8.09 -8.458 -8.852 -9.129 -9.427 -9.887 -10.21 -10.559 -10.732 -11.087 -11.468 -11.859 -12.066 -12.547 -12.797 -13.062 -13.334 -13.95 -14.297 -14.661 -15.098 -15.607 -16.277 -17.224 -20.798 -3 ,10023 ,KEBNE ,17019352,Wed Dec 22 02:29:04 CET,Wed Dec 22 04:12:13 CET,0.0 0.919 1.225 1.433 1.642 1.834 2.015 2.2 2.5 2.633 2.77 2.751 3.104 3.212 3.403 3.587 3.766 3.85 4.017 4.165 4.37 4.498 4.614 4.785 4.952 5.129 5.301 5.454 5.645 5.842 6.041 6.265 6.465 6.65 6.852 7.072 7.289 7.537 7.789 8.036 8.315 8.615 8.93 9.244 9.569 9.87 10.162 10.399 10.531 10.429 9.707 8.408 7.087 5.829 4.707 3.63 2.632 1.79 1.074 0.318 -0.362 -0.999 -1.604 -2.198 -2.794 -3.313 -3.814 -4.272 -4.686 -5.106 -5.53 -5.894 -6.273 -6.704 -7.068 -7.421 -7.784 -8.177 -8.593 -8.883 -9.17 -9.613 -9.915 -10.21 -10.373 -10.739 -11.121 -11.518 -11.732 -12.196 -12.388 -12.642 -12.91 -13.527 -13.884 -14.261 -14.671 -15.173 -15.778 -16.574 -19.614 -4 ,16669 ,KEBNE ,17019353,Wed Dec 22 02:29:04 CET,Wed Dec 22 04:11:58 CET,0.0 1.026 1.302 1.566 1.786 1.967 2.128 2.271 2.53 2.656 2.782 2.779 3.132 3.234 3.431 3.611 3.783 3.873 4.05 4.195 4.386 4.515 4.649 4.862 5.052 5.236 5.418 5.589 5.814 6.011 6.189 6.389 6.592 6.797 7.018 7.236 7.446 7.694 7.959 8.232 8.498 8.785 9.09 9.379 9.697 9.996 10.273 10.505 10.651 10.507 9.722 8.439 7.138 5.81 4.61 3.511 2.549 1.723 0.976 0.207 -0.478 -1.137 -1.792 -2.391 -2.937 -3.444 -3.955 -4.43 -4.87 -5.311 -5.76 -6.138 -6.548 -6.975 -7.294 -7.624 -7.977 -8.369 -8.768 -9.033 -9.311 -9.765 -10.099 -10.455 -10.636 -10.995 -11.387 -11.798 -12.003 -12.476 -12.686 -12.95 -13.242 -13.916 -14.286 -14.657 -15.054 -15.489 -16.07 -16.871 -19.656 -5 ,606 ,KEBNE ,17019354,Wed Dec 22 02:29:04 CET,Wed Dec 22 04:11:49 CET,0.0 0.93 1.285 1.534 1.735 1.9 2.049 2.18 2.429 2.55 2.657 2.609 2.955 3.058 3.253 3.421 3.573 3.647 3.808 3.977 4.204 4.339 4.468 4.661 4.851 5.038 5.21 5.372 5.581 5.79 5.982 6.194 6.402 6.614 6.856 7.118 7.37 7.634 7.909 8.177 8.466 8.789 9.099 9.373 9.69 10.017 10.312 10.582 10.721 10.59 9.958 8.658 7.295 5.985 4.774 3.638 2.616 1.68 0.868 0.055 -0.657 -1.286 -1.904 -2.514 -3.063 -3.557 -4.084 -4.587 -5.04 -5.518 -5.994 -6.371 -6.79 -7.246 -7.605 -8.001 -8.384 -8.76 -9.166 -9.445 -9.727 -10.158 -10.465 -10.801 -10.983 -11.385 -11.82 -12.255 -12.475 -12.967 -13.218 -13.486 -13.761 -14.361 -14.693 -15.047 -15.452 -15.954 -16.567 -17.38 -20.14 -6 ,14005 ,KEBNE ,17019355,Wed Dec 22 02:29:08 CET,Wed Dec 22 04:05:13 CET,0.0 0.87 1.202 1.462 1.692 1.877 2.041 2.206 2.507 2.642 2.77 2.753 3.094 3.183 3.377 3.56 3.73 3.814 3.97 4.121 4.325 4.454 4.587 4.772 4.937 5.101 5.267 5.428 5.641 5.839 6.013 6.221 6.423 6.624 6.844 7.082 7.329 7.589 7.851 8.106 8.382 8.69 8.997 9.274 9.576 9.876 10.147 10.408 10.591 10.518 9.906 8.613 7.335 6.088 4.907 3.765 2.726 1.764 0.908 0.044 -0.67 -1.276 -1.886 -2.48 -3.023 -3.546 -4.138 -4.659 -5.079 -5.52 -6.005 -6.378 -6.764 -7.199 -7.535 -7.878 -8.229 -8.6 -8.971 -9.225 -9.503 -9.974 -10.299 -10.612 -10.785 -11.162 -11.552 -11.978 -12.201 -12.675 -12.904 -13.162 -13.439 -14.08 -14.438 -14.824 -15.278 -15.803 -16.412 -17.303 -20.628 -7 ,709 ,KEBNE ,17019356,Wed Dec 22 02:30:06 CET,Wed Dec 22 04:11:45 CET,0.0 0.934 1.322 1.602 1.806 1.977 2.127 2.253 2.484 2.597 2.71 2.682 3.038 3.142 3.333 3.514 3.691 3.775 3.947 4.113 4.339 4.473 4.601 4.775 4.943 5.123 5.3 5.479 5.704 5.909 6.1 6.323 6.528 6.715 6.919 7.154 7.389 7.633 7.875 8.13 8.393 8.672 9.0 9.337 9.692 10.022 10.338 10.586 10.742 10.631 9.899 8.54 7.046 5.643 4.454 3.415 2.489 1.601 0.79 -0.069 -0.79 -1.408 -2.006 -2.598 -3.193 -3.738 -4.302 -4.813 -5.249 -5.695 -6.143 -6.513 -6.921 -7.34 -7.654 -8.005 -8.37 -8.741 -9.117 -9.379 -9.664 -10.078 -10.351 -10.65 -10.815 -11.154 -11.513 -11.897 -12.095 -12.577 -12.794 -13.023 -13.266 -13.819 -14.132 -14.503 -14.91 -15.36 -15.91 -16.567 -18.929 -8 ,24791 ,KEBNE ,17019357,Wed Dec 22 02:30:06 CET,Wed Dec 22 04:12:34 CET,0.0 0.831 1.167 1.443 1.66 1.832 1.987 2.126 2.383 2.504 2.626 2.613 2.962 3.059 3.232 3.41 3.586 3.672 3.845 4.018 4.265 4.41 4.531 4.702 4.866 5.021 5.183 5.34 5.541 5.744 5.936 6.156 6.357 6.553 6.777 7.002 7.228 7.481 7.744 8.015 8.295 8.598 8.924 9.25 9.616 9.969 10.271 10.482 10.597 10.497 9.807 8.472 7.192 5.936 4.693 3.441 2.369 1.473 0.679 -0.115 -0.863 -1.592 -2.262 -2.88 -3.468 -4.011 -4.572 -5.053 -5.471 -5.939 -6.413 -6.803 -7.216 -7.641 -7.964 -8.278 -8.636 -9.04 -9.44 -9.718 -10.021 -10.47 -10.77 -11.11 -11.293 -11.651 -12.024 -12.454 -12.69 -13.172 -13.375 -13.627 -13.898 -14.524 -14.88 -15.276 -15.707 -16.214 -16.851 -17.661 -22.165 -9 ,30134 ,KEBNE ,17019358,Wed Dec 22 02:30:06 CET,Wed Dec 22 04:11:46 CET,0.0 1.126 1.472 1.751 1.994 2.171 2.336 2.485 2.738 2.866 2.999 2.97 3.307 3.396 3.578 3.75 3.928 4.015 4.168 4.325 4.545 4.682 4.821 5.009 5.188 5.366 5.522 5.662 5.846 6.027 6.193 6.396 6.597 6.794 7.03 7.285 7.518 7.778 8.047 8.317 8.582 8.863 9.181 9.512 9.864 10.179 10.492 10.731 10.855 10.683 9.926 8.598 7.258 5.93 4.686 3.591 2.61 1.715 0.938 0.107 -0.643 -1.295 -1.899 -2.49 -3.03 -3.543 -4.101 -4.583 -5.01 -5.456 -5.905 -6.279 -6.685 -7.091 -7.405 -7.761 -8.128 -8.508 -8.914 -9.191 -9.471 -9.906 -10.211 -10.557 -10.743 -11.137 -11.554 -11.978 -12.203 -12.728 -13.008 -13.29 -13.597 -14.287 -14.683 -15.103 -15.558 -16.083 -16.711 -17.578 -22.323 -10 ,24907 ,KEBNE ,17019359,Wed Dec 22 02:30:06 CET,Wed Dec 22 04:13:11 CET,0.0 0.656 0.945 1.177 1.379 1.552 1.71 1.85 2.099 2.224 2.345 2.303 2.649 2.744 2.912 3.091 3.266 3.348 3.515 3.666 3.859 3.986 4.119 4.311 4.492 4.659 4.818 4.975 5.167 5.342 5.519 5.738 5.948 6.15 6.367 6.599 6.806 7.034 7.289 7.563 7.839 8.131 8.479 8.793 9.115 9.429 9.759 10.002 10.059 9.833 8.936 7.447 5.95 4.587 3.371 2.182 1.111 0.221 -0.524 -1.314 -2.023 -2.679 -3.314 -3.899 -4.423 -4.91 -5.43 -5.899 -6.33 -6.795 -7.269 -7.672 -8.086 -8.509 -8.854 -9.216 -9.601 -10.002 -10.413 -10.698 -11.003 -11.459 -11.755 -12.083 -12.255 -12.603 -13.004 -13.444 -13.666 -14.16 -14.38 -14.644 -14.945 -15.609 -15.956 -16.337 -16.793 -17.332 -17.967 -18.855 -22.552 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt deleted file mode 100644 index 7ab3a1d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,29082 ,KEBNE ,16652583,Sun Nov 21 23:25:45 CET,Mon Nov 22 01:12:59 CET,0.0 1.448 1.936 2.229 2.454 2.684 2.901 3.086 3.4 3.548 3.677 3.736 4.048 4.177 4.446 4.673 4.867 4.962 5.17 5.395 5.713 5.903 6.069 6.33 6.594 6.839 7.075 7.31 7.603 7.885 8.174 8.499 8.806 9.119 9.474 9.856 10.223 10.639 11.086 11.529 11.998 12.536 13.181 13.856 14.649 15.522 16.536 17.635 18.87 20.386 22.243 23.807 24.683 25.166 25.469 25.614 25.652 25.634 25.597 25.579 25.55 25.485 25.41 25.332 25.213 25.099 24.992 24.882 24.792 24.699 24.58 24.473 24.37 24.263 24.179 24.093 23.993 23.889 23.786 23.696 23.597 23.441 23.332 23.228 23.168 23.049 22.937 22.814 22.749 22.514 22.516 22.438 22.354 22.131 22.02 21.907 21.778 21.612 21.391 21.086 20.305 -3 ,15668 ,KEBNE ,16652584,Sun Nov 21 23:25:46 CET,Mon Nov 22 01:09:20 CET,0.0 1.095 1.543 1.918 2.21 2.45 2.656 2.829 3.142 3.298 3.442 3.527 3.845 3.964 4.157 4.344 4.537 4.633 4.826 5.012 5.257 5.413 5.568 5.801 6.037 6.26 6.482 6.695 6.968 7.233 7.486 7.806 8.103 8.369 8.695 9.071 9.436 9.852 10.295 10.75 11.229 11.772 12.394 13.02 13.728 14.509 15.486 16.599 17.854 19.32 20.979 22.158 22.749 23.003 23.048 23.057 23.006 22.886 22.745 22.582 22.437 22.3 22.158 22.02 21.91 21.825 21.725 21.624 21.533 21.415 21.277 21.168 21.05 20.915 20.817 20.712 20.6 20.485 20.366 20.284 20.199 20.059 19.949 19.817 19.747 19.608 19.469 19.337 19.272 19.018 19.003 18.905 18.781 18.504 18.359 18.205 18.056 17.877 17.625 17.29 16.39 -4 ,22999 ,KEBNE ,16652585,Sun Nov 21 23:26:44 CET,Mon Nov 22 01:18:58 CET,0.0 1.226 1.655 1.992 2.268 2.465 2.632 2.81 3.164 3.335 3.49 3.584 3.897 4.006 4.228 4.461 4.697 4.807 5.024 5.225 5.508 5.694 5.857 6.086 6.315 6.542 6.777 7.006 7.3 7.598 7.874 8.188 8.505 8.812 9.141 9.518 9.899 10.317 10.745 11.2 11.685 12.197 12.799 13.447 14.218 15.078 16.118 17.322 18.628 20.031 21.712 23.098 23.863 24.256 24.408 24.472 24.49 24.471 24.41 24.306 24.212 24.112 23.982 23.839 23.711 23.604 23.47 23.347 23.239 23.11 22.985 22.889 22.78 22.655 22.558 22.469 22.374 22.253 22.125 22.028 21.898 21.674 21.518 21.373 21.305 21.161 21.011 20.857 20.766 20.487 20.477 20.392 20.305 20.107 19.977 19.825 19.646 19.432 19.193 18.856 17.802 -5 ,29110 ,KEBNE ,16652586,Sun Nov 21 23:27:45 CET,Mon Nov 22 01:19:17 CET,0.0 1.422 1.9 2.271 2.562 2.806 3.029 3.201 3.509 3.653 3.784 3.856 4.17 4.299 4.545 4.772 4.983 5.075 5.25 5.434 5.705 5.871 6.023 6.251 6.474 6.683 6.899 7.11 7.375 7.646 7.898 8.184 8.468 8.735 9.06 9.453 9.803 10.189 10.627 11.092 11.585 12.133 12.774 13.431 14.182 15.007 15.95 17.038 18.366 19.815 21.405 22.642 23.247 23.454 23.451 23.39 23.319 23.202 23.058 22.888 22.724 22.583 22.437 22.271 22.132 22.036 21.929 21.821 21.722 21.606 21.49 21.408 21.313 21.2 21.112 21.024 20.936 20.841 20.732 20.659 20.588 20.461 20.365 20.269 20.219 20.109 19.977 19.834 19.765 19.526 19.536 19.447 19.364 19.168 19.058 18.939 18.813 18.663 18.441 18.128 17.213 -8 ,27065 ,KEBNE ,16652589,Sun Nov 21 23:26:44 CET,Mon Nov 22 01:16:37 CET,0.0 2.126 2.588 2.929 3.222 3.504 3.755 3.983 4.376 4.55 4.706 4.8 5.111 5.23 5.475 5.711 5.938 6.044 6.234 6.418 6.692 6.871 7.048 7.297 7.529 7.746 7.96 8.172 8.443 8.697 8.942 9.24 9.531 9.82 10.156 10.516 10.862 11.261 11.696 12.146 12.606 13.149 13.799 14.448 15.247 16.122 17.07 18.134 19.395 20.849 22.532 23.791 24.436 24.76 24.883 24.885 24.879 24.887 24.848 24.779 24.7 24.613 24.52 24.428 24.34 24.238 24.114 24.007 23.921 23.812 23.683 23.577 23.467 23.358 23.278 23.186 23.087 22.983 22.857 22.759 22.652 22.513 22.423 22.328 22.277 22.155 22.023 21.901 21.845 21.609 21.639 21.562 21.469 21.236 21.087 20.946 20.807 20.64 20.435 20.121 18.976 -9 ,13685 ,KEBNE ,16652590,Sun Nov 21 23:26:44 CET,Mon Nov 22 01:17:55 CET,0.0 1.193 1.554 1.83 2.06 2.262 2.461 2.675 3.022 3.158 3.307 3.401 3.711 3.82 4.035 4.25 4.46 4.561 4.74 4.923 5.185 5.368 5.563 5.82 6.069 6.304 6.531 6.744 7.012 7.277 7.527 7.829 8.104 8.377 8.714 9.071 9.417 9.813 10.237 10.683 11.16 11.717 12.349 12.981 13.716 14.552 15.544 16.685 17.988 19.462 21.253 22.558 23.164 23.437 23.523 23.537 23.498 23.415 23.278 23.097 22.941 22.795 22.641 22.489 22.352 22.217 22.079 21.959 21.849 21.732 21.596 21.47 21.331 21.211 21.131 21.035 20.929 20.815 20.691 20.614 20.541 20.405 20.296 20.195 20.146 20.035 19.912 19.763 19.682 19.444 19.454 19.363 19.271 19.053 18.936 18.816 18.674 18.507 18.297 17.963 16.872 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 8f6f4345..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,8212 ,KEBNE ,17019361,Wed Dec 22 02:30:06 CET,Wed Dec 22 04:12:50 CET,0.0 0.422 0.68 0.89 1.079 1.261 1.422 1.569 1.853 1.985 2.119 2.153 2.49 2.605 2.833 3.046 3.253 3.356 3.565 3.769 4.069 4.273 4.467 4.743 5.012 5.289 5.57 5.834 6.173 6.497 6.805 7.186 7.568 7.947 8.407 8.937 9.436 9.987 10.613 11.313 12.056 12.906 13.924 14.991 16.29 17.791 19.599 21.733 24.333 27.52 31.763 35.693 38.18 39.878 41.044 41.879 42.489 42.974 43.333 43.614 43.821 43.987 44.115 44.212 44.284 44.322 44.333 44.346 44.347 44.304 44.254 44.209 44.151 44.107 44.071 44.008 43.928 43.841 43.75 43.687 43.616 43.483 43.366 43.241 43.188 43.09 42.962 42.844 42.769 42.491 42.453 42.339 42.233 41.996 41.844 41.678 41.486 41.267 40.99 40.536 38.099 -3 ,1739 ,KEBNE ,17019362,Wed Dec 22 02:30:06 CET,Wed Dec 22 04:12:39 CET,0.0 0.446 0.696 0.884 1.051 1.215 1.367 1.507 1.769 1.9 2.023 2.025 2.376 2.492 2.711 2.931 3.149 3.261 3.486 3.694 3.995 4.188 4.381 4.668 4.941 5.205 5.468 5.737 6.079 6.405 6.727 7.128 7.517 7.899 8.367 8.905 9.432 10.018 10.673 11.393 12.149 13.015 14.044 15.111 16.4 17.89 19.67 21.762 24.361 27.634 31.945 35.801 38.212 39.852 41.008 41.834 42.398 42.807 43.085 43.337 43.511 43.654 43.765 43.831 43.891 43.923 43.943 43.927 43.912 43.907 43.887 43.853 43.788 43.709 43.653 43.591 43.501 43.386 43.257 43.176 43.099 42.972 42.879 42.766 42.699 42.533 42.377 42.217 42.123 41.858 41.845 41.723 41.578 41.272 41.102 40.907 40.667 40.365 39.96 39.46 36.334 -4 ,26619 ,KEBNE ,17019363,Wed Dec 22 02:31:09 CET,Wed Dec 22 04:14:47 CET,0.0 0.602 0.83 1.015 1.199 1.367 1.516 1.657 1.905 2.024 2.148 2.169 2.506 2.616 2.83 3.033 3.233 3.327 3.512 3.7 3.984 4.174 4.357 4.631 4.908 5.179 5.441 5.695 6.029 6.364 6.7 7.105 7.494 7.868 8.317 8.837 9.336 9.897 10.524 11.223 11.99 12.869 13.929 15.045 16.382 17.908 19.738 21.919 24.625 28.006 32.516 36.773 39.424 41.179 42.469 43.539 44.363 44.929 45.312 45.637 45.879 46.051 46.183 46.29 46.384 46.461 46.518 46.547 46.554 46.535 46.506 46.479 46.44 46.396 46.36 46.318 46.267 46.191 46.083 46.005 45.923 45.755 45.626 45.503 45.436 45.306 45.147 44.946 44.839 44.539 44.475 44.365 44.251 43.99 43.835 43.631 43.372 43.075 42.681 42.123 39.94 -5 ,22824 ,KEBNE ,17019364,Wed Dec 22 02:31:09 CET,Wed Dec 22 04:13:31 CET,0.0 0.534 0.757 0.962 1.141 1.305 1.463 1.607 1.869 1.993 2.119 2.138 2.488 2.606 2.832 3.061 3.284 3.393 3.607 3.805 4.091 4.29 4.495 4.779 5.047 5.31 5.577 5.839 6.183 6.525 6.862 7.274 7.673 8.074 8.558 9.112 9.639 10.231 10.885 11.586 12.343 13.207 14.248 15.353 16.698 18.247 20.083 22.27 24.977 28.349 32.732 36.767 39.469 41.322 42.63 43.556 44.144 44.589 44.949 45.224 45.392 45.537 45.669 45.756 45.809 45.851 45.865 45.855 45.847 45.826 45.773 45.722 45.667 45.609 45.545 45.46 45.369 45.269 45.171 45.1 45.015 44.889 44.802 44.684 44.615 44.472 44.319 44.132 44.033 43.762 43.712 43.577 43.434 43.12 42.949 42.735 42.46 42.152 41.762 41.262 38.278 -6 ,25543 ,KEBNE ,17019365,Wed Dec 22 02:31:09 CET,Wed Dec 22 04:13:43 CET,0.0 0.487 0.73 0.933 1.111 1.275 1.423 1.574 1.873 2.005 2.135 2.158 2.504 2.624 2.873 3.12 3.348 3.457 3.664 3.86 4.152 4.345 4.533 4.813 5.089 5.356 5.616 5.873 6.21 6.551 6.903 7.34 7.756 8.145 8.614 9.167 9.698 10.288 10.94 11.657 12.427 13.315 14.386 15.465 16.719 18.189 19.996 22.188 24.888 28.272 32.773 36.909 39.513 41.234 42.486 43.448 44.11 44.582 44.918 45.191 45.374 45.499 45.595 45.66 45.69 45.69 45.715 45.739 45.754 45.767 45.753 45.728 45.679 45.607 45.556 45.503 45.439 45.351 45.242 45.175 45.107 44.979 44.871 44.743 44.676 44.533 44.368 44.195 44.105 43.851 43.859 43.753 43.616 43.292 43.127 42.949 42.753 42.473 42.142 41.734 39.793 -7 ,18601 ,KEBNE ,17019366,Wed Dec 22 02:31:09 CET,Wed Dec 22 04:13:06 CET,0.0 1.239 1.491 1.707 1.89 2.053 2.196 2.332 2.61 2.745 2.873 2.889 3.233 3.341 3.561 3.787 4.008 4.11 4.31 4.511 4.806 4.993 5.182 5.463 5.73 5.988 6.248 6.52 6.88 7.226 7.563 7.97 8.369 8.773 9.257 9.795 10.322 10.917 11.569 12.277 13.052 13.948 15.011 16.128 17.509 19.131 21.092 23.339 26.02 29.401 33.908 38.073 40.735 42.536 43.885 44.948 45.699 46.259 46.688 47.059 47.303 47.462 47.597 47.702 47.758 47.786 47.799 47.791 47.785 47.763 47.731 47.698 47.657 47.612 47.569 47.522 47.47 47.423 47.362 47.313 47.262 47.18 47.104 47.002 46.949 46.823 46.671 46.505 46.414 46.138 46.116 46.023 45.917 45.658 45.51 45.326 45.106 44.854 44.485 43.786 40.692 -8 ,3898 ,KEBNE ,17019367,Wed Dec 22 02:31:10 CET,Wed Dec 22 04:10:42 CET,0.0 0.551 0.799 0.992 1.173 1.338 1.489 1.638 1.917 2.04 2.163 2.169 2.51 2.631 2.863 3.078 3.287 3.395 3.607 3.807 4.1 4.289 4.477 4.756 5.03 5.305 5.575 5.84 6.197 6.546 6.876 7.272 7.657 8.044 8.51 9.037 9.556 10.134 10.785 11.505 12.27 13.152 14.225 15.337 16.649 18.166 19.989 22.112 24.733 28.07 32.568 36.709 39.355 41.181 42.449 43.376 44.027 44.515 44.88 45.171 45.379 45.526 45.621 45.688 45.739 45.786 45.832 45.827 45.783 45.732 45.69 45.634 45.576 45.532 45.48 45.406 45.338 45.269 45.166 45.08 44.962 44.765 44.659 44.574 44.53 44.401 44.241 44.072 43.983 43.711 43.661 43.553 43.443 43.146 42.962 42.77 42.536 42.241 41.899 41.397 39.425 -9 ,19972 ,KEBNE ,17019368,Wed Dec 22 02:31:08 CET,Wed Dec 22 04:15:20 CET,0.0 0.749 1.02 1.214 1.386 1.545 1.694 1.848 2.145 2.274 2.406 2.44 2.802 2.918 3.138 3.355 3.574 3.68 3.881 4.081 4.377 4.569 4.76 5.037 5.304 5.568 5.823 6.08 6.423 6.751 7.076 7.478 7.882 8.276 8.733 9.28 9.812 10.399 11.07 11.808 12.576 13.429 14.497 15.655 17.051 18.637 20.563 22.908 25.781 29.312 33.995 38.222 40.664 42.273 43.443 44.313 44.97 45.47 45.836 46.149 46.348 46.482 46.597 46.683 46.758 46.82 46.864 46.868 46.854 46.857 46.843 46.797 46.731 46.655 46.584 46.5 46.429 46.369 46.297 46.25 46.195 46.067 45.96 45.836 45.759 45.598 45.441 45.266 45.177 44.914 44.899 44.786 44.648 44.31 44.127 43.952 43.747 43.467 43.155 42.698 40.786 -10 ,9058 ,KEBNE ,17019369,Wed Dec 22 02:31:09 CET,Wed Dec 22 04:13:40 CET,0.0 0.486 0.712 0.891 1.05 1.195 1.33 1.474 1.754 1.877 1.994 2.006 2.352 2.467 2.679 2.89 3.09 3.185 3.372 3.563 3.849 4.034 4.218 4.489 4.757 5.018 5.28 5.535 5.851 6.161 6.478 6.869 7.247 7.618 8.059 8.567 9.069 9.634 10.26 10.951 11.685 12.508 13.478 14.52 15.849 17.376 19.202 21.364 23.986 27.311 31.66 35.428 37.815 39.527 40.765 41.64 42.212 42.626 42.953 43.248 43.465 43.601 43.682 43.737 43.765 43.792 43.822 43.844 43.866 43.871 43.863 43.84 43.789 43.727 43.679 43.625 43.541 43.438 43.338 43.275 43.216 43.125 43.043 42.925 42.859 42.717 42.547 42.357 42.257 41.991 41.936 41.79 41.663 41.407 41.232 41.027 40.779 40.508 40.205 39.693 37.258 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt deleted file mode 100644 index d7681fb5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31080 ,KEBNE ,16652602,Sun Nov 21 23:29:50 CET,Mon Nov 22 01:16:29 CET,0.0 1.157 1.566 1.883 2.166 2.416 2.641 2.858 3.244 3.42 3.582 3.648 4.013 4.16 4.453 4.731 5.002 5.135 5.387 5.627 5.975 6.216 6.447 6.788 7.127 7.433 7.721 7.993 8.336 8.68 9.014 9.413 9.811 10.194 10.644 11.155 11.634 12.164 12.741 13.363 14.011 14.719 15.577 16.466 17.499 18.655 20.085 21.718 23.559 25.789 28.646 31.066 32.513 33.472 34.091 34.408 34.476 34.46 34.418 34.341 34.265 34.178 34.081 33.988 33.867 33.733 33.609 33.51 33.419 33.298 33.151 33.052 32.969 32.879 32.796 32.691 32.587 32.492 32.38 32.288 32.177 31.991 31.87 31.753 31.699 31.583 31.435 31.281 31.201 30.926 30.952 30.848 30.737 30.489 30.347 30.2 30.013 29.785 29.505 29.099 27.691 -2 ,24786 ,KEBNE ,16652603,Sun Nov 21 23:29:50 CET,Mon Nov 22 01:16:38 CET,0.0 1.129 1.504 1.825 2.111 2.343 2.542 2.731 3.102 3.282 3.455 3.561 3.943 4.093 4.379 4.653 4.927 5.053 5.288 5.531 5.877 6.096 6.317 6.627 6.924 7.227 7.523 7.795 8.143 8.507 8.87 9.311 9.743 10.154 10.625 11.144 11.657 12.243 12.872 13.55 14.288 15.141 16.135 17.099 18.157 19.329 20.728 22.34 24.236 26.476 29.253 31.542 32.914 33.843 34.452 34.857 35.084 35.181 35.206 35.236 35.271 35.274 35.242 35.199 35.118 35.002 34.896 34.809 34.719 34.617 34.515 34.426 34.317 34.185 34.067 33.941 33.811 33.676 33.533 33.425 33.294 33.078 32.94 32.809 32.746 32.61 32.459 32.307 32.223 31.932 31.92 31.813 31.708 31.467 31.323 31.154 30.963 30.746 30.457 30.052 28.723 -3 ,28512 ,KEBNE ,16652604,Sun Nov 21 23:29:50 CET,Mon Nov 22 01:16:39 CET,0.0 0.821 1.23 1.547 1.817 2.073 2.308 2.516 2.926 3.126 3.309 3.391 3.756 3.912 4.214 4.487 4.745 4.869 5.118 5.343 5.652 5.872 6.092 6.409 6.716 7.001 7.267 7.534 7.889 8.231 8.564 8.98 9.377 9.761 10.213 10.72 11.235 11.81 12.433 13.111 13.846 14.689 15.648 16.625 17.802 19.164 20.744 22.532 24.699 27.164 30.032 32.413 33.754 34.629 35.244 35.651 35.938 36.116 36.191 36.251 36.254 36.23 36.2 36.152 36.074 35.971 35.848 35.705 35.574 35.438 35.291 35.168 35.03 34.883 34.776 34.655 34.523 34.382 34.223 34.118 34.02 33.847 33.699 33.54 33.47 33.334 33.189 33.025 32.939 32.643 32.616 32.501 32.378 32.111 31.955 31.774 31.587 31.381 31.108 30.688 29.198 -4 ,3907 ,KEBNE ,16652605,Sun Nov 21 23:30:52 CET,Mon Nov 22 01:17:11 CET,0.0 0.963 1.419 1.768 2.045 2.284 2.492 2.686 3.062 3.251 3.43 3.538 3.927 4.085 4.391 4.698 4.984 5.116 5.372 5.624 5.995 6.227 6.453 6.795 7.106 7.406 7.698 7.976 8.348 8.704 9.044 9.456 9.869 10.281 10.753 11.281 11.805 12.41 13.074 13.759 14.494 15.341 16.327 17.334 18.492 19.721 21.073 22.642 24.584 26.903 29.822 32.292 33.711 34.433 34.781 35.044 35.251 35.38 35.367 35.249 35.142 35.054 34.937 34.796 34.669 34.56 34.432 34.308 34.203 34.103 34.006 33.92 33.83 33.733 33.625 33.496 33.365 33.226 33.075 32.967 32.862 32.69 32.561 32.437 32.376 32.245 32.095 31.92 31.83 31.541 31.528 31.417 31.302 31.035 30.893 30.737 30.554 30.345 30.085 29.682 28.026 -7 ,23258 ,KEBNE ,16652608,Sun Nov 21 23:30:52 CET,Mon Nov 22 01:16:54 CET,0.0 1.211 1.65 2.003 2.292 2.535 2.753 2.96 3.38 3.569 3.744 3.861 4.26 4.431 4.725 5.007 5.282 5.41 5.647 5.891 6.258 6.498 6.734 7.064 7.385 7.703 8.016 8.312 8.694 9.06 9.42 9.844 10.253 10.67 11.166 11.744 12.295 12.901 13.554 14.235 14.968 15.816 16.818 17.828 19.033 20.329 21.728 23.304 25.164 27.375 30.152 32.583 33.989 34.778 35.27 35.646 35.886 36.011 36.075 36.148 36.183 36.128 36.032 35.915 35.785 35.649 35.502 35.368 35.247 35.121 34.965 34.848 34.74 34.601 34.487 34.35 34.179 34.004 33.836 33.737 33.641 33.494 33.381 33.261 33.209 33.089 32.951 32.813 32.734 32.432 32.423 32.314 32.198 31.919 31.767 31.592 31.38 31.165 30.893 30.486 28.744 -8 ,25194 ,KEBNE ,16652609,Sun Nov 21 23:30:51 CET,Mon Nov 22 01:17:20 CET,0.0 0.984 1.404 1.739 2.05 2.334 2.567 2.779 3.157 3.316 3.497 3.613 3.976 4.111 4.371 4.623 4.873 4.998 5.24 5.481 5.827 6.045 6.259 6.568 6.895 7.232 7.539 7.82 8.179 8.526 8.864 9.263 9.655 10.054 10.527 11.07 11.6 12.202 12.854 13.552 14.285 15.098 16.034 16.932 17.965 19.105 20.444 22.024 23.885 26.114 28.87 31.102 32.41 33.266 33.857 34.293 34.532 34.669 34.724 34.638 34.512 34.405 34.295 34.163 34.013 33.885 33.753 33.613 33.48 33.34 33.195 33.058 32.914 32.78 32.673 32.554 32.424 32.29 32.147 32.043 31.935 31.74 31.594 31.447 31.37 31.219 31.065 30.905 30.823 30.539 30.529 30.407 30.283 30.005 29.843 29.666 29.477 29.262 28.992 28.66 27.546 -9 ,3558 ,KEBNE ,16652610,Sun Nov 21 23:30:51 CET,Mon Nov 22 01:17:23 CET,0.0 0.811 1.194 1.537 1.815 2.063 2.29 2.502 2.883 3.063 3.241 3.361 3.75 3.909 4.206 4.476 4.739 4.869 5.128 5.378 5.739 5.981 6.208 6.529 6.836 7.127 7.42 7.708 8.074 8.416 8.758 9.196 9.62 10.03 10.505 11.048 11.575 12.158 12.793 13.46 14.174 14.975 15.905 16.826 17.878 19.032 20.365 21.914 23.783 25.987 28.641 30.925 32.295 33.154 33.672 33.997 34.209 34.345 34.44 34.496 34.486 34.456 34.432 34.382 34.292 34.205 34.127 34.045 33.942 33.822 33.697 33.586 33.47 33.336 33.228 33.116 32.985 32.861 32.739 32.646 32.548 32.385 32.267 32.141 32.082 31.95 31.797 31.646 31.565 31.271 31.256 31.147 31.036 30.774 30.62 30.444 30.257 30.052 29.784 29.438 28.028 -10 ,7075 ,KEBNE ,16652611,Sun Nov 21 23:30:51 CET,Mon Nov 22 01:17:45 CET,0.0 0.976 1.354 1.688 2.006 2.267 2.484 2.674 3.035 3.199 3.36 3.466 3.856 4.01 4.297 4.578 4.838 4.958 5.199 5.427 5.752 5.985 6.2 6.487 6.774 7.061 7.353 7.626 7.953 8.286 8.63 9.058 9.486 9.908 10.401 10.949 11.492 12.082 12.698 13.354 14.08 14.898 15.809 16.737 17.775 18.9 20.247 21.793 23.585 25.779 28.602 31.019 32.388 33.229 33.778 34.136 34.353 34.502 34.633 34.723 34.759 34.767 34.716 34.599 34.459 34.326 34.187 34.053 33.919 33.774 33.616 33.485 33.355 33.212 33.09 32.962 32.829 32.692 32.551 32.45 32.337 32.137 32.001 31.883 31.824 31.686 31.541 31.391 31.311 31.018 30.991 30.887 30.779 30.515 30.349 30.17 29.974 29.749 29.498 29.142 27.679 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2z_p38a-2y.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2z_p38a-2y.txt deleted file mode 100644 index 94de7b75..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2z_p38a-2y.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27648 ,KEBNE ,17019370,Wed Dec 22 02:32:11 CET,Wed Dec 22 04:17:14 CET,0.0 1.398 1.799 2.095 2.305 2.503 2.7 2.846 3.058 3.161 3.271 3.291 3.588 3.683 3.867 4.027 4.199 4.28 4.412 4.537 4.709 4.813 4.921 5.082 5.23 5.361 5.479 5.589 5.742 5.875 5.975 6.11 6.249 6.383 6.514 6.636 6.758 6.9 7.054 7.159 7.238 7.333 7.441 7.509 7.501 7.425 7.152 6.584 5.687 4.296 1.956 -0.854 -3.102 -4.959 -6.69 -8.261 -9.561 -10.72 -11.7 -12.668 -13.499 -14.219 -14.89 -15.525 -16.093 -16.6 -17.139 -17.601 -17.987 -18.391 -18.795 -19.122 -19.472 -19.823 -20.079 -20.362 -20.665 -20.972 -21.278 -21.48 -21.692 -22.013 -22.228 -22.457 -22.582 -22.845 -23.122 -23.404 -23.547 -23.929 -24.032 -24.201 -24.376 -24.76 -24.968 -25.185 -25.414 -25.66 -25.972 -26.374 -27.172 -2 ,7487 ,KEBNE ,17019371,Wed Dec 22 02:32:11 CET,Wed Dec 22 04:17:06 CET,0.0 1.836 2.262 2.516 2.713 2.923 3.114 3.276 3.536 3.649 3.748 3.727 4.01 4.088 4.246 4.401 4.537 4.595 4.71 4.831 4.994 5.093 5.192 5.343 5.493 5.618 5.736 5.837 5.968 6.097 6.209 6.342 6.447 6.545 6.688 6.837 6.949 7.071 7.184 7.271 7.337 7.39 7.44 7.472 7.443 7.33 7.13 6.75 5.934 4.448 2.036 -0.769 -3.047 -4.927 -6.454 -7.791 -9.023 -10.198 -11.194 -12.135 -12.943 -13.643 -14.294 -14.922 -15.497 -16.006 -16.543 -17.023 -17.423 -17.82 -18.227 -18.599 -19.007 -19.407 -19.705 -20.017 -20.352 -20.68 -20.998 -21.21 -21.426 -21.757 -21.983 -22.222 -22.343 -22.597 -22.879 -23.165 -23.309 -23.692 -23.782 -23.947 -24.126 -24.534 -24.752 -24.973 -25.211 -25.489 -25.862 -26.316 -27.581 -3 ,13266 ,KEBNE ,17019372,Wed Dec 22 02:32:11 CET,Wed Dec 22 04:17:20 CET,0.0 1.278 1.62 1.874 2.113 2.279 2.416 2.546 2.788 2.907 3.013 3.011 3.297 3.378 3.522 3.652 3.788 3.854 3.976 4.096 4.265 4.366 4.46 4.608 4.757 4.892 5.011 5.132 5.289 5.43 5.583 5.759 5.89 6.008 6.151 6.285 6.393 6.526 6.649 6.745 6.843 6.944 7.012 7.019 6.991 6.968 6.875 6.523 5.769 4.542 2.388 -0.323 -2.555 -4.47 -6.095 -7.465 -8.651 -9.735 -10.612 -11.473 -12.216 -12.837 -13.428 -13.995 -14.519 -14.99 -15.486 -15.937 -16.331 -16.749 -17.185 -17.531 -17.877 -18.248 -18.54 -18.833 -19.13 -19.434 -19.735 -19.947 -20.177 -20.536 -20.788 -21.047 -21.178 -21.44 -21.714 -21.993 -22.126 -22.501 -22.611 -22.793 -22.992 -23.398 -23.594 -23.837 -24.155 -24.479 -24.855 -25.338 -26.901 -4 ,24299 ,KEBNE ,17019373,Wed Dec 22 02:32:11 CET,Wed Dec 22 04:18:57 CET,0.0 1.222 1.56 1.819 2.022 2.21 2.394 2.552 2.817 2.934 3.039 3.048 3.34 3.43 3.597 3.734 3.861 3.931 4.078 4.203 4.369 4.478 4.576 4.711 4.832 4.938 5.041 5.146 5.284 5.407 5.525 5.681 5.807 5.921 6.05 6.185 6.307 6.417 6.534 6.659 6.781 6.824 6.773 6.676 6.527 6.303 5.879 5.268 4.43 3.105 0.704 -2.152 -4.473 -6.342 -7.877 -9.237 -10.392 -11.396 -12.313 -13.293 -14.148 -14.901 -15.591 -16.219 -16.786 -17.3 -17.822 -18.283 -18.68 -19.083 -19.503 -19.861 -20.216 -20.553 -20.825 -21.114 -21.394 -21.683 -21.987 -22.196 -22.404 -22.714 -22.933 -23.157 -23.27 -23.52 -23.782 -24.057 -24.197 -24.571 -24.674 -24.851 -25.023 -25.4 -25.623 -25.874 -26.144 -26.43 -26.752 -27.148 -28.073 -5 ,25261 ,KEBNE ,17019374,Wed Dec 22 02:32:11 CET,Wed Dec 22 04:17:45 CET,0.0 1.036 1.374 1.66 1.889 2.066 2.228 2.371 2.619 2.722 2.821 2.817 3.102 3.179 3.333 3.493 3.638 3.702 3.818 3.932 4.101 4.201 4.288 4.419 4.548 4.657 4.755 4.859 4.995 5.118 5.248 5.392 5.51 5.617 5.747 5.892 6.004 6.105 6.213 6.33 6.42 6.494 6.524 6.451 6.3 6.111 5.794 5.294 4.452 3.019 0.628 -2.173 -4.412 -6.267 -7.804 -9.192 -10.409 -11.477 -12.399 -13.336 -14.119 -14.786 -15.426 -15.998 -16.51 -16.983 -17.471 -17.909 -18.289 -18.69 -19.093 -19.43 -19.779 -20.119 -20.377 -20.644 -20.94 -21.259 -21.591 -21.825 -22.075 -22.463 -22.713 -22.958 -23.094 -23.389 -23.705 -24.024 -24.173 -24.555 -24.666 -24.835 -25.021 -25.45 -25.679 -25.909 -26.134 -26.374 -26.653 -26.997 -27.903 -6 ,154 ,KEBNE ,17019375,Wed Dec 22 02:33:12 CET,Wed Dec 22 04:18:24 CET,0.0 1.301 1.671 1.939 2.159 2.343 2.516 2.683 2.936 3.039 3.143 3.127 3.412 3.503 3.662 3.793 3.929 4.002 4.142 4.256 4.407 4.513 4.616 4.758 4.888 5.019 5.14 5.255 5.409 5.548 5.673 5.813 5.951 6.08 6.219 6.352 6.45 6.539 6.594 6.614 6.688 6.798 6.84 6.85 6.83 6.651 6.299 5.727 4.757 3.343 0.997 -1.758 -3.954 -5.792 -7.351 -8.761 -10.091 -11.291 -12.284 -13.261 -14.066 -14.791 -15.476 -16.075 -16.625 -17.115 -17.612 -18.062 -18.45 -18.867 -19.292 -19.633 -19.995 -20.36 -20.632 -20.917 -21.204 -21.502 -21.833 -22.065 -22.306 -22.682 -22.935 -23.199 -23.339 -23.614 -23.894 -24.173 -24.317 -24.703 -24.798 -24.961 -25.129 -25.501 -25.697 -25.908 -26.15 -26.434 -26.772 -27.203 -28.027 -7 ,7810 ,KEBNE ,17019376,Wed Dec 22 02:33:12 CET,Wed Dec 22 04:19:05 CET,0.0 1.28 1.7 1.993 2.185 2.352 2.516 2.658 2.915 3.033 3.142 3.143 3.426 3.508 3.668 3.808 3.939 4.0 4.114 4.225 4.39 4.486 4.579 4.724 4.855 4.973 5.082 5.181 5.308 5.435 5.552 5.675 5.773 5.872 5.975 6.074 6.198 6.331 6.425 6.468 6.502 6.564 6.58 6.569 6.511 6.289 5.878 5.248 4.292 2.864 0.468 -2.357 -4.569 -6.373 -7.872 -9.185 -10.305 -11.359 -12.329 -13.291 -14.114 -14.828 -15.485 -16.102 -16.667 -17.171 -17.679 -18.14 -18.545 -18.957 -19.371 -19.708 -20.062 -20.427 -20.71 -21.003 -21.305 -21.607 -21.926 -22.16 -22.394 -22.746 -22.985 -23.228 -23.352 -23.601 -23.861 -24.124 -24.265 -24.64 -24.708 -24.862 -25.03 -25.402 -25.604 -25.817 -26.058 -26.329 -26.617 -27.007 -27.752 -8 ,21529 ,KEBNE ,17019377,Wed Dec 22 02:33:16 CET,Wed Dec 22 04:12:20 CET,0.0 2.064 2.34 2.53 2.685 2.857 3.032 3.182 3.457 3.574 3.668 3.621 3.898 3.99 4.169 4.303 4.427 4.492 4.612 4.724 4.902 5.017 5.122 5.279 5.41 5.509 5.607 5.715 5.859 5.988 6.099 6.235 6.366 6.488 6.623 6.761 6.884 6.995 7.094 7.189 7.305 7.434 7.525 7.577 7.564 7.358 6.968 6.377 5.429 3.999 1.606 -1.199 -3.421 -5.271 -6.838 -8.192 -9.329 -10.353 -11.234 -12.073 -12.815 -13.507 -14.166 -14.789 -15.353 -15.853 -16.354 -16.8 -17.196 -17.596 -17.991 -18.328 -18.668 -19.023 -19.311 -19.606 -19.903 -20.201 -20.518 -20.732 -20.96 -21.312 -21.537 -21.772 -21.891 -22.138 -22.393 -22.658 -22.799 -23.168 -23.255 -23.416 -23.587 -23.948 -24.135 -24.328 -24.539 -24.831 -25.163 -25.519 -26.204 -9 ,16858 ,KEBNE ,17019378,Wed Dec 22 02:33:16 CET,Wed Dec 22 04:15:21 CET,0.0 1.258 1.631 1.886 2.097 2.28 2.448 2.595 2.831 2.954 3.084 3.122 3.421 3.511 3.68 3.839 3.993 4.064 4.201 4.317 4.489 4.589 4.678 4.807 4.919 5.04 5.158 5.265 5.405 5.545 5.667 5.786 5.901 6.004 6.117 6.262 6.409 6.537 6.614 6.675 6.7 6.7 6.687 6.622 6.474 6.23 5.871 5.316 4.382 2.885 0.453 -2.232 -4.401 -6.309 -7.911 -9.311 -10.576 -11.706 -12.65 -13.631 -14.537 -15.346 -16.083 -16.744 -17.332 -17.853 -18.39 -18.873 -19.277 -19.689 -20.111 -20.456 -20.81 -21.182 -21.472 -21.761 -22.054 -22.341 -22.626 -22.832 -23.043 -23.368 -23.596 -23.844 -23.98 -24.235 -24.495 -24.779 -24.918 -25.28 -25.35 -25.511 -25.683 -26.03 -26.213 -26.407 -26.613 -26.831 -27.08 -27.42 -28.033 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt deleted file mode 100644 index 0ca00df8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11644 ,KEBNE ,16652612,Sun Nov 21 23:30:51 CET,Mon Nov 22 01:19:01 CET,0.0 0.707 0.933 1.092 1.232 1.358 1.456 1.554 1.75 1.842 1.922 1.905 2.162 2.234 2.376 2.502 2.626 2.687 2.791 2.898 3.047 3.136 3.231 3.364 3.495 3.628 3.742 3.853 4.006 4.153 4.288 4.444 4.591 4.73 4.899 5.086 5.259 5.437 5.615 5.813 6.015 6.244 6.518 6.775 7.054 7.347 7.671 8.013 8.313 8.52 8.56 8.333 7.977 7.602 7.266 6.916 6.577 6.276 6.008 5.716 5.45 5.224 5.009 4.797 4.596 4.423 4.245 4.07 3.916 3.753 3.582 3.44 3.285 3.124 3.001 2.887 2.758 2.618 2.487 2.395 2.3 2.143 2.028 1.907 1.849 1.735 1.619 1.485 1.411 1.159 1.166 1.081 0.996 0.802 0.696 0.587 0.458 0.3 0.124 -0.101 -1.005 -2 ,26986 ,KEBNE ,16652613,Sun Nov 21 23:31:54 CET,Mon Nov 22 01:21:40 CET,0.0 0.676 0.899 1.088 1.242 1.379 1.497 1.611 1.832 1.928 2.004 1.975 2.234 2.304 2.435 2.565 2.687 2.745 2.862 2.975 3.127 3.222 3.318 3.456 3.584 3.702 3.817 3.933 4.098 4.264 4.415 4.592 4.753 4.911 5.094 5.297 5.493 5.691 5.899 6.111 6.322 6.566 6.845 7.089 7.363 7.672 8.011 8.376 8.731 9.008 9.145 8.947 8.618 8.255 7.887 7.528 7.177 6.87 6.615 6.337 6.077 5.838 5.613 5.404 5.211 5.03 4.835 4.648 4.492 4.343 4.179 4.038 3.885 3.724 3.602 3.473 3.334 3.189 3.041 2.945 2.84 2.671 2.543 2.407 2.345 2.218 2.093 1.967 1.896 1.644 1.665 1.579 1.478 1.252 1.142 1.03 0.892 0.74 0.572 0.363 -0.344 -3 ,21458 ,KEBNE ,16652614,Sun Nov 21 23:31:58 CET,Mon Nov 22 01:18:09 CET,0.0 0.602 0.81 0.966 1.13 1.286 1.413 1.52 1.7 1.79 1.88 1.867 2.123 2.194 2.33 2.458 2.598 2.669 2.799 2.914 3.076 3.179 3.274 3.417 3.552 3.679 3.805 3.925 4.074 4.22 4.374 4.568 4.738 4.889 5.062 5.266 5.461 5.665 5.884 6.1 6.301 6.531 6.803 7.06 7.335 7.635 7.967 8.306 8.676 9.014 9.095 8.836 8.511 8.169 7.844 7.523 7.214 6.91 6.637 6.366 6.126 5.887 5.647 5.425 5.226 5.038 4.846 4.679 4.53 4.374 4.202 4.056 3.9 3.737 3.616 3.498 3.368 3.228 3.09 2.988 2.873 2.699 2.58 2.458 2.398 2.28 2.146 1.987 1.909 1.66 1.677 1.586 1.487 1.277 1.168 1.043 0.894 0.716 0.496 0.245 -0.512 -4 ,429 ,KEBNE ,16652615,Sun Nov 21 23:31:54 CET,Mon Nov 22 01:20:44 CET,0.0 0.789 1.023 1.184 1.315 1.441 1.564 1.671 1.853 1.939 2.024 2.015 2.27 2.343 2.473 2.596 2.719 2.779 2.89 2.988 3.134 3.235 3.336 3.469 3.595 3.722 3.854 3.991 4.156 4.298 4.424 4.576 4.72 4.875 5.067 5.258 5.431 5.613 5.815 6.037 6.237 6.446 6.701 6.941 7.211 7.515 7.846 8.193 8.567 8.869 8.932 8.746 8.462 8.133 7.794 7.447 7.11 6.805 6.532 6.26 6.022 5.798 5.57 5.34 5.138 4.96 4.769 4.587 4.421 4.262 4.085 3.937 3.794 3.639 3.519 3.395 3.262 3.127 2.995 2.904 2.803 2.65 2.542 2.429 2.367 2.238 2.103 1.944 1.861 1.61 1.637 1.553 1.46 1.246 1.127 1.009 0.879 0.723 0.56 0.337 -0.409 -5 ,5731 ,KEBNE ,16652616,Sun Nov 21 23:31:54 CET,Mon Nov 22 01:20:13 CET,0.0 0.798 1.013 1.189 1.327 1.442 1.553 1.67 1.873 1.959 2.04 2.009 2.25 2.316 2.441 2.547 2.646 2.699 2.809 2.909 3.047 3.147 3.242 3.374 3.498 3.606 3.716 3.832 3.98 4.128 4.268 4.423 4.572 4.723 4.901 5.087 5.259 5.47 5.693 5.903 6.123 6.38 6.684 6.968 7.257 7.565 7.919 8.283 8.629 8.94 9.133 8.977 8.659 8.29 7.906 7.569 7.257 6.942 6.683 6.41 6.15 5.905 5.663 5.428 5.212 5.031 4.85 4.679 4.528 4.382 4.225 4.088 3.949 3.797 3.674 3.552 3.422 3.278 3.142 3.045 2.938 2.777 2.67 2.56 2.504 2.385 2.256 2.117 2.04 1.789 1.817 1.731 1.636 1.436 1.333 1.216 1.06 0.882 0.692 0.462 -0.283 -6 ,31459 ,KEBNE ,16652617,Sun Nov 21 23:31:54 CET,Mon Nov 22 01:21:01 CET,0.0 0.752 1.017 1.195 1.341 1.468 1.591 1.694 1.881 1.97 2.05 2.025 2.276 2.339 2.467 2.592 2.712 2.774 2.893 2.998 3.142 3.234 3.327 3.462 3.584 3.706 3.832 3.957 4.107 4.24 4.37 4.527 4.676 4.82 4.988 5.18 5.352 5.537 5.759 5.978 6.179 6.423 6.714 6.988 7.302 7.63 7.965 8.305 8.628 8.871 8.927 8.646 8.296 7.939 7.556 7.203 6.882 6.577 6.302 6.009 5.756 5.525 5.31 5.091 4.881 4.689 4.487 4.322 4.18 4.021 3.855 3.724 3.584 3.436 3.325 3.199 3.061 2.925 2.787 2.694 2.59 2.416 2.3 2.187 2.135 2.027 1.903 1.765 1.689 1.441 1.458 1.37 1.28 1.062 0.93 0.795 0.656 0.492 0.292 0.019 -1.067 -7 ,30894 ,KEBNE ,16652618,Sun Nov 21 23:31:54 CET,Mon Nov 22 01:20:16 CET,0.0 0.649 0.85 1.011 1.146 1.263 1.379 1.496 1.72 1.811 1.892 1.878 2.131 2.206 2.349 2.471 2.585 2.646 2.765 2.87 3.017 3.114 3.205 3.343 3.483 3.602 3.704 3.805 3.936 4.058 4.184 4.332 4.471 4.619 4.79 4.96 5.12 5.297 5.482 5.676 5.872 6.108 6.396 6.669 6.978 7.322 7.695 8.074 8.468 8.801 8.939 8.815 8.533 8.143 7.754 7.348 6.954 6.605 6.309 6.019 5.749 5.52 5.317 5.108 4.896 4.689 4.461 4.256 4.087 3.92 3.748 3.59 3.432 3.276 3.149 3.026 2.892 2.748 2.593 2.485 2.382 2.216 2.095 1.975 1.915 1.78 1.633 1.48 1.397 1.135 1.141 1.044 0.943 0.722 0.604 0.469 0.304 0.11 -0.092 -0.323 -1.351 -8 ,10174 ,KEBNE ,16652619,Sun Nov 21 23:31:54 CET,Mon Nov 22 01:20:52 CET,0.0 0.708 0.909 1.068 1.219 1.357 1.474 1.584 1.804 1.917 2.01 1.987 2.245 2.319 2.455 2.585 2.707 2.766 2.887 3.001 3.159 3.264 3.357 3.494 3.635 3.767 3.895 4.021 4.184 4.329 4.464 4.627 4.784 4.939 5.115 5.311 5.492 5.686 5.896 6.121 6.358 6.61 6.876 7.135 7.443 7.766 8.115 8.498 8.881 9.188 9.292 9.106 8.799 8.404 8.013 7.659 7.325 7.01 6.741 6.471 6.225 5.982 5.746 5.534 5.332 5.142 4.938 4.753 4.599 4.435 4.254 4.104 3.947 3.783 3.661 3.539 3.407 3.272 3.147 3.057 2.954 2.792 2.685 2.577 2.515 2.373 2.233 2.088 2.017 1.77 1.789 1.708 1.614 1.393 1.271 1.149 1.023 0.882 0.714 0.465 -0.452 -9 ,9722 ,KEBNE ,16652620,Sun Nov 21 23:31:54 CET,Mon Nov 22 01:20:35 CET,0.0 0.548 0.759 0.952 1.122 1.271 1.387 1.496 1.718 1.808 1.897 1.899 2.147 2.214 2.34 2.459 2.573 2.633 2.76 2.878 3.055 3.164 3.262 3.411 3.544 3.664 3.799 3.928 4.085 4.23 4.359 4.517 4.677 4.832 5.008 5.211 5.393 5.579 5.796 6.018 6.233 6.481 6.766 7.042 7.357 7.689 8.037 8.383 8.73 9.041 9.242 9.185 8.925 8.551 8.178 7.843 7.529 7.211 6.938 6.661 6.404 6.164 5.928 5.696 5.482 5.289 5.079 4.889 4.719 4.542 4.356 4.206 4.047 3.867 3.729 3.575 3.415 3.259 3.095 2.99 2.895 2.751 2.634 2.5 2.433 2.3 2.161 2.014 1.937 1.679 1.678 1.579 1.474 1.243 1.115 0.978 0.832 0.672 0.494 0.247 -0.648 -10 ,22586 ,KEBNE ,16652621,Sun Nov 21 23:31:54 CET,Mon Nov 22 01:20:48 CET,0.0 0.639 0.848 1.008 1.15 1.265 1.377 1.484 1.655 1.741 1.828 1.806 2.053 2.119 2.25 2.37 2.49 2.549 2.662 2.764 2.896 2.988 3.078 3.211 3.341 3.462 3.578 3.68 3.817 3.952 4.074 4.224 4.374 4.519 4.671 4.833 4.998 5.188 5.388 5.585 5.776 5.996 6.26 6.522 6.837 7.175 7.523 7.878 8.197 8.451 8.593 8.437 8.122 7.761 7.393 7.054 6.75 6.452 6.163 5.865 5.605 5.373 5.159 4.946 4.734 4.551 4.369 4.201 4.058 3.899 3.721 3.565 3.402 3.242 3.117 2.985 2.842 2.696 2.552 2.45 2.346 2.175 2.052 1.926 1.86 1.728 1.588 1.444 1.369 1.111 1.124 1.039 0.947 0.72 0.595 0.475 0.338 0.174 -0.015 -0.254 -0.945 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt deleted file mode 100644 index 68701682..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4276 ,KEBNE ,16652622,Sun Nov 21 23:31:54 CET,Mon Nov 22 01:20:42 CET,0.0 0.813 1.061 1.237 1.363 1.476 1.588 1.698 1.911 2.005 2.09 2.084 2.347 2.421 2.56 2.691 2.821 2.882 2.999 3.115 3.285 3.397 3.504 3.665 3.824 3.97 4.107 4.243 4.405 4.562 4.727 4.927 5.117 5.293 5.493 5.711 5.923 6.169 6.435 6.715 7.0 7.308 7.662 8.037 8.491 8.997 9.582 10.206 10.916 11.713 12.483 12.87 12.903 12.804 12.683 12.521 12.337 12.16 11.961 11.719 11.524 11.359 11.195 11.034 10.865 10.718 10.583 10.449 10.329 10.197 10.057 9.945 9.833 9.713 9.607 9.496 9.385 9.271 9.153 9.066 8.975 8.825 8.715 8.599 8.537 8.418 8.293 8.171 8.102 7.851 7.867 7.772 7.677 7.485 7.375 7.258 7.114 6.965 6.824 6.633 5.962 -2 ,10290 ,KEBNE ,16652623,Sun Nov 21 23:32:55 CET,Mon Nov 22 01:23:44 CET,0.0 0.521 0.77 0.943 1.089 1.222 1.344 1.46 1.664 1.753 1.839 1.827 2.084 2.169 2.326 2.461 2.592 2.658 2.786 2.904 3.067 3.178 3.289 3.457 3.624 3.775 3.914 4.048 4.22 4.397 4.573 4.788 4.989 5.165 5.372 5.62 5.865 6.136 6.434 6.757 7.083 7.427 7.815 8.195 8.636 9.123 9.669 10.279 10.982 11.736 12.525 12.964 13.037 12.99 12.896 12.749 12.565 12.386 12.225 12.035 11.863 11.705 11.549 11.409 11.261 11.108 10.947 10.801 10.676 10.541 10.388 10.248 10.11 9.981 9.876 9.762 9.631 9.499 9.378 9.29 9.19 9.027 8.914 8.802 8.746 8.633 8.492 8.345 8.271 8.026 8.055 7.971 7.882 7.691 7.594 7.495 7.382 7.214 7.009 6.793 6.128 -3 ,24809 ,KEBNE ,16652624,Sun Nov 21 23:32:55 CET,Mon Nov 22 01:22:35 CET,0.0 0.656 0.898 1.081 1.209 1.337 1.464 1.576 1.772 1.854 1.935 1.923 2.178 2.255 2.4 2.538 2.671 2.736 2.859 2.975 3.144 3.251 3.357 3.507 3.653 3.796 3.936 4.075 4.253 4.425 4.584 4.775 4.964 5.142 5.347 5.59 5.82 6.065 6.327 6.622 6.959 7.318 7.699 8.09 8.552 9.053 9.601 10.166 10.849 11.635 12.42 12.899 13.013 12.951 12.822 12.657 12.482 12.297 12.119 11.936 11.769 11.621 11.475 11.335 11.201 11.064 10.91 10.777 10.658 10.521 10.368 10.243 10.107 9.963 9.85 9.723 9.598 9.479 9.354 9.268 9.178 9.034 8.938 8.833 8.777 8.674 8.562 8.43 8.364 8.127 8.149 8.07 7.987 7.814 7.722 7.62 7.502 7.328 7.114 6.882 6.211 -4 ,10720 ,KEBNE ,16652625,Sun Nov 21 23:32:55 CET,Mon Nov 22 01:22:34 CET,0.0 0.637 0.849 0.999 1.133 1.254 1.354 1.462 1.683 1.773 1.857 1.848 2.107 2.183 2.322 2.455 2.589 2.654 2.785 2.908 3.078 3.192 3.299 3.461 3.619 3.762 3.894 4.02 4.185 4.349 4.512 4.704 4.888 5.067 5.27 5.5 5.718 5.959 6.218 6.486 6.768 7.093 7.479 7.849 8.276 8.75 9.285 9.912 10.621 11.412 12.219 12.623 12.732 12.727 12.603 12.397 12.196 11.999 11.792 11.587 11.427 11.258 11.09 10.947 10.818 10.673 10.516 10.382 10.252 10.109 9.95 9.823 9.695 9.562 9.458 9.343 9.235 9.13 9.006 8.916 8.826 8.679 8.567 8.456 8.404 8.287 8.149 7.995 7.913 7.661 7.673 7.586 7.503 7.331 7.228 7.114 6.99 6.845 6.679 6.464 5.688 -5 ,29981 ,KEBNE ,16652626,Sun Nov 21 23:32:55 CET,Mon Nov 22 01:21:33 CET,0.0 0.492 0.695 0.847 0.975 1.092 1.223 1.347 1.564 1.662 1.745 1.739 2.001 2.078 2.218 2.355 2.495 2.561 2.683 2.799 2.975 3.085 3.192 3.359 3.517 3.663 3.809 3.949 4.112 4.27 4.424 4.605 4.782 4.946 5.144 5.383 5.611 5.861 6.129 6.419 6.724 7.046 7.418 7.797 8.246 8.746 9.274 9.851 10.541 11.259 11.959 12.412 12.577 12.57 12.458 12.324 12.194 12.051 11.886 11.661 11.482 11.341 11.183 11.017 10.839 10.674 10.506 10.34 10.189 10.034 9.888 9.78 9.663 9.539 9.444 9.339 9.224 9.1 8.973 8.883 8.787 8.641 8.541 8.442 8.392 8.279 8.148 8.008 7.93 7.678 7.684 7.589 7.479 7.26 7.14 7.006 6.872 6.717 6.517 6.236 5.483 -6 ,8477 ,KEBNE ,16652627,Sun Nov 21 23:32:55 CET,Mon Nov 22 01:22:59 CET,0.0 0.645 0.856 1.038 1.211 1.352 1.464 1.573 1.791 1.886 1.976 1.982 2.243 2.33 2.507 2.662 2.798 2.869 3.01 3.14 3.318 3.438 3.549 3.699 3.852 3.999 4.148 4.291 4.462 4.631 4.801 5.011 5.209 5.394 5.604 5.835 6.062 6.32 6.594 6.883 7.179 7.494 7.898 8.311 8.751 9.244 9.801 10.378 11.004 11.706 12.478 12.864 12.937 12.857 12.693 12.533 12.352 12.145 11.944 11.713 11.507 11.331 11.168 11.004 10.846 10.704 10.56 10.43 10.296 10.146 9.996 9.868 9.734 9.596 9.49 9.388 9.283 9.16 9.023 8.922 8.816 8.664 8.566 8.462 8.405 8.284 8.161 8.031 7.959 7.706 7.719 7.632 7.532 7.306 7.18 7.058 6.917 6.749 6.568 6.351 5.722 -7 ,23272 ,KEBNE ,16652628,Sun Nov 21 23:33:57 CET,Mon Nov 22 01:23:42 CET,0.0 0.829 1.063 1.243 1.385 1.518 1.644 1.764 1.996 2.094 2.18 2.171 2.427 2.506 2.647 2.791 2.928 2.993 3.124 3.245 3.424 3.543 3.654 3.808 3.961 4.107 4.248 4.39 4.568 4.73 4.886 5.078 5.262 5.441 5.655 5.897 6.129 6.378 6.639 6.934 7.242 7.562 7.958 8.388 8.887 9.421 10.032 10.692 11.38 12.16 13.025 13.572 13.717 13.668 13.554 13.427 13.27 13.086 12.922 12.758 12.614 12.478 12.332 12.183 12.045 11.914 11.766 11.63 11.512 11.391 11.262 11.146 11.014 10.878 10.783 10.673 10.555 10.444 10.308 10.207 10.113 9.981 9.89 9.786 9.731 9.618 9.505 9.391 9.323 9.074 9.081 8.993 8.897 8.703 8.603 8.484 8.346 8.184 7.994 7.745 6.944 -8 ,1845 ,KEBNE ,16652629,Sun Nov 21 23:33:58 CET,Mon Nov 22 01:22:49 CET,0.0 0.711 0.946 1.111 1.267 1.411 1.538 1.659 1.878 1.98 2.08 2.089 2.36 2.442 2.584 2.727 2.857 2.918 3.041 3.164 3.333 3.441 3.551 3.711 3.868 4.02 4.167 4.304 4.486 4.664 4.827 5.021 5.213 5.398 5.599 5.837 6.067 6.316 6.577 6.853 7.165 7.527 7.937 8.337 8.811 9.332 9.889 10.504 11.238 12.067 12.851 13.286 13.409 13.377 13.275 13.132 12.974 12.804 12.636 12.449 12.273 12.117 11.973 11.812 11.65 11.495 11.344 11.213 11.099 10.987 10.86 10.739 10.61 10.496 10.415 10.312 10.201 10.091 9.981 9.905 9.821 9.692 9.6 9.498 9.442 9.318 9.189 9.059 8.994 8.758 8.778 8.696 8.614 8.421 8.307 8.171 7.993 7.789 7.584 7.322 6.63 -9 ,694 ,KEBNE ,16652630,Sun Nov 21 23:33:58 CET,Mon Nov 22 01:24:08 CET,0.0 0.592 0.815 0.986 1.128 1.266 1.404 1.53 1.754 1.854 1.941 1.944 2.206 2.284 2.431 2.565 2.701 2.767 2.891 3.015 3.191 3.304 3.413 3.58 3.742 3.893 4.039 4.186 4.373 4.552 4.733 4.942 5.146 5.338 5.547 5.778 6.002 6.257 6.552 6.853 7.155 7.494 7.882 8.276 8.711 9.176 9.74 10.366 11.036 11.774 12.558 13.049 13.144 13.087 12.972 12.819 12.661 12.492 12.315 12.121 11.947 11.771 11.596 11.427 11.259 11.107 10.937 10.788 10.657 10.502 10.344 10.226 10.104 9.98 9.883 9.777 9.672 9.557 9.43 9.336 9.235 9.083 8.977 8.857 8.793 8.677 8.565 8.44 8.366 8.105 8.105 8.019 7.922 7.703 7.59 7.478 7.346 7.209 7.02 6.763 6.142 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt deleted file mode 100644 index f1ef9a2e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14325 ,KEBNE ,16652632,Sun Nov 21 23:33:57 CET,Mon Nov 22 01:24:20 CET,0.0 0.247 0.432 0.573 0.718 0.837 0.929 1.021 1.178 1.247 1.311 1.274 1.516 1.571 1.684 1.799 1.911 1.963 2.07 2.17 2.306 2.389 2.475 2.612 2.731 2.845 2.955 3.065 3.213 3.336 3.452 3.605 3.762 3.918 4.094 4.305 4.521 4.73 4.942 5.166 5.372 5.605 5.889 6.158 6.466 6.774 7.06 7.33 7.592 7.752 7.666 7.32 6.893 6.427 6.001 5.634 5.282 4.972 4.709 4.391 4.092 3.829 3.566 3.33 3.128 2.944 2.756 2.573 2.404 2.241 2.074 1.928 1.782 1.63 1.512 1.4 1.285 1.15 1.002 0.896 0.784 0.627 0.52 0.406 0.354 0.249 0.122 -0.01 -0.071 -0.31 -0.287 -0.372 -0.457 -0.634 -0.744 -0.875 -1.008 -1.151 -1.323 -1.523 -2.175 -2 ,15387 ,KEBNE ,16652633,Sun Nov 21 23:33:58 CET,Mon Nov 22 01:24:28 CET,0.0 0.31 0.522 0.686 0.801 0.907 1.008 1.105 1.282 1.37 1.454 1.43 1.693 1.773 1.921 2.066 2.205 2.273 2.375 2.466 2.609 2.706 2.804 2.953 3.096 3.231 3.359 3.479 3.648 3.805 3.946 4.122 4.287 4.433 4.596 4.782 4.957 5.16 5.374 5.589 5.8 6.027 6.281 6.521 6.798 7.098 7.401 7.685 7.939 8.055 7.924 7.459 6.932 6.455 6.019 5.617 5.245 4.89 4.563 4.213 3.916 3.673 3.434 3.208 3.002 2.801 2.588 2.406 2.257 2.102 1.932 1.783 1.628 1.466 1.344 1.215 1.067 0.911 0.748 0.645 0.553 0.409 0.296 0.177 0.123 0.017 -0.101 -0.237 -0.307 -0.547 -0.527 -0.618 -0.699 -0.881 -0.988 -1.112 -1.243 -1.396 -1.562 -1.838 -2.558 -3 ,3285 ,KEBNE ,16652634,Sun Nov 21 23:33:57 CET,Mon Nov 22 01:24:20 CET,0.0 0.339 0.516 0.653 0.775 0.892 1.005 1.118 1.326 1.42 1.509 1.477 1.728 1.807 1.955 2.086 2.201 2.259 2.365 2.462 2.624 2.725 2.814 2.945 3.062 3.179 3.304 3.428 3.578 3.715 3.855 4.007 4.142 4.273 4.412 4.571 4.73 4.903 5.081 5.279 5.496 5.708 5.965 6.233 6.491 6.741 7.04 7.365 7.698 7.972 8.053 7.827 7.477 7.062 6.63 6.223 5.86 5.533 5.231 4.926 4.665 4.424 4.2 3.979 3.782 3.606 3.407 3.231 3.082 2.918 2.748 2.614 2.472 2.326 2.217 2.097 1.967 1.83 1.685 1.594 1.51 1.369 1.252 1.133 1.073 0.937 0.806 0.669 0.595 0.343 0.376 0.293 0.198 -0.021 -0.134 -0.248 -0.371 -0.497 -0.644 -0.884 -1.528 -4 ,16859 ,KEBNE ,16652635,Sun Nov 21 23:34:59 CET,Mon Nov 22 01:25:21 CET,0.0 0.38 0.596 0.782 0.931 1.082 1.224 1.329 1.505 1.586 1.662 1.631 1.889 1.964 2.099 2.238 2.359 2.41 2.512 2.616 2.757 2.853 2.954 3.108 3.242 3.357 3.489 3.622 3.773 3.91 4.039 4.196 4.35 4.489 4.651 4.826 4.99 5.182 5.386 5.574 5.76 5.971 6.219 6.457 6.7 6.945 7.216 7.478 7.727 7.894 7.884 7.564 7.166 6.799 6.391 5.999 5.67 5.33 5.01 4.699 4.455 4.233 4.005 3.789 3.575 3.387 3.2 3.015 2.851 2.679 2.502 2.353 2.197 2.05 1.936 1.82 1.703 1.576 1.448 1.356 1.251 1.097 0.994 0.883 0.827 0.712 0.583 0.454 0.387 0.138 0.164 0.082 -0.001 -0.18 -0.286 -0.416 -0.549 -0.683 -0.845 -1.064 -1.775 -6 ,23271 ,KEBNE ,16652637,Sun Nov 21 23:37:04 CET,Mon Nov 22 01:26:19 CET,0.0 0.376 0.535 0.635 0.732 0.849 0.97 1.081 1.291 1.373 1.441 1.412 1.664 1.727 1.84 1.945 2.052 2.106 2.22 2.326 2.465 2.566 2.666 2.798 2.925 3.04 3.15 3.261 3.402 3.554 3.698 3.859 3.998 4.119 4.266 4.44 4.606 4.786 4.962 5.137 5.337 5.559 5.793 6.028 6.284 6.537 6.791 7.017 7.212 7.407 7.446 7.118 6.7 6.307 5.925 5.53 5.175 4.844 4.556 4.262 4.0 3.761 3.528 3.318 3.125 2.936 2.746 2.579 2.43 2.278 2.102 1.956 1.82 1.677 1.561 1.436 1.31 1.184 1.049 0.959 0.857 0.69 0.586 0.481 0.428 0.317 0.183 0.038 -0.03 -0.278 -0.245 -0.327 -0.416 -0.606 -0.707 -0.813 -0.925 -1.056 -1.22 -1.409 -1.844 -7 ,17717 ,KEBNE ,16652638,Sun Nov 21 23:40:11 CET,Mon Nov 22 01:29:42 CET,0.0 0.4 0.565 0.718 0.883 1.04 1.164 1.263 1.441 1.533 1.621 1.606 1.865 1.948 2.096 2.234 2.37 2.435 2.564 2.69 2.865 2.968 3.069 3.215 3.345 3.47 3.598 3.716 3.86 3.997 4.125 4.293 4.45 4.591 4.775 4.994 5.182 5.369 5.572 5.787 6.01 6.242 6.516 6.763 7.032 7.328 7.625 7.914 8.148 8.299 8.261 7.95 7.566 7.133 6.717 6.322 5.959 5.645 5.369 5.066 4.8 4.556 4.316 4.1 3.915 3.734 3.525 3.341 3.183 3.02 2.847 2.692 2.525 2.371 2.256 2.13 2.001 1.862 1.716 1.616 1.513 1.343 1.228 1.114 1.05 0.907 0.755 0.613 0.539 0.284 0.304 0.215 0.128 -0.076 -0.195 -0.311 -0.428 -0.579 -0.77 -0.988 -1.579 -8 ,10356 ,KEBNE ,16652639,Sun Nov 21 23:40:12 CET,Mon Nov 22 01:29:14 CET,0.0 0.355 0.473 0.579 0.701 0.819 0.912 1.006 1.178 1.27 1.362 1.332 1.577 1.644 1.774 1.899 2.025 2.082 2.178 2.271 2.414 2.511 2.604 2.726 2.849 2.977 3.082 3.18 3.327 3.468 3.605 3.761 3.9 4.041 4.199 4.389 4.576 4.781 5.002 5.221 5.441 5.668 5.91 6.157 6.429 6.691 6.987 7.279 7.495 7.62 7.57 7.265 6.879 6.48 6.087 5.706 5.336 4.983 4.68 4.379 4.134 3.911 3.678 3.436 3.223 3.034 2.829 2.651 2.507 2.358 2.178 2.029 1.88 1.712 1.584 1.466 1.336 1.194 1.051 0.949 0.847 0.691 0.575 0.454 0.393 0.273 0.156 0.025 -0.044 -0.287 -0.266 -0.349 -0.44 -0.641 -0.752 -0.872 -1.011 -1.165 -1.349 -1.586 -2.26 -9 ,17588 ,KEBNE ,16652640,Sun Nov 21 23:41:14 CET,Mon Nov 22 01:31:54 CET,0.0 0.265 0.409 0.538 0.667 0.787 0.896 0.987 1.177 1.269 1.345 1.298 1.538 1.607 1.742 1.868 1.98 2.037 2.162 2.276 2.427 2.523 2.619 2.765 2.903 3.025 3.135 3.239 3.371 3.49 3.603 3.749 3.897 4.038 4.201 4.389 4.577 4.781 4.967 5.163 5.372 5.593 5.87 6.129 6.389 6.671 6.96 7.234 7.469 7.598 7.525 7.136 6.65 6.156 5.741 5.371 5.017 4.685 4.391 4.075 3.795 3.565 3.342 3.111 2.905 2.731 2.545 2.379 2.234 2.065 1.878 1.728 1.579 1.428 1.306 1.179 1.052 0.911 0.763 0.671 0.583 0.43 0.314 0.202 0.145 0.029 -0.096 -0.23 -0.303 -0.556 -0.553 -0.644 -0.736 -0.938 -1.045 -1.159 -1.281 -1.399 -1.565 -1.816 -2.483 -10 ,23198 ,KEBNE ,16652641,Sun Nov 21 23:43:19 CET,Mon Nov 22 01:32:14 CET,0.0 0.319 0.5 0.664 0.81 0.928 1.02 1.104 1.27 1.35 1.422 1.373 1.617 1.678 1.808 1.946 2.073 2.129 2.243 2.363 2.513 2.608 2.699 2.836 2.981 3.118 3.245 3.371 3.524 3.66 3.791 3.932 4.066 4.215 4.39 4.582 4.773 4.992 5.203 5.399 5.607 5.83 6.06 6.278 6.527 6.784 7.06 7.321 7.543 7.715 7.706 7.394 6.965 6.532 6.115 5.709 5.327 4.98 4.691 4.385 4.115 3.878 3.651 3.436 3.228 3.032 2.822 2.634 2.475 2.32 2.162 2.021 1.881 1.735 1.61 1.487 1.364 1.225 1.077 0.977 0.877 0.721 0.611 0.501 0.443 0.32 0.19 0.047 -0.028 -0.282 -0.264 -0.351 -0.444 -0.633 -0.734 -0.839 -0.959 -1.099 -1.274 -1.526 -2.154 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt deleted file mode 100644 index 934bc887..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8188 ,KEBNE ,16652642,Sun Nov 21 23:44:20 CET,Mon Nov 22 01:31:58 CET,0.0 1.376 1.705 1.998 2.204 2.366 2.511 2.632 2.847 2.944 3.039 3.024 3.265 3.332 3.459 3.602 3.75 3.805 3.893 3.982 4.118 4.21 4.285 4.377 4.463 4.565 4.675 4.766 4.866 4.959 5.063 5.176 5.269 5.361 5.472 5.581 5.67 5.753 5.842 5.95 6.061 6.169 6.247 6.288 6.301 6.251 6.11 5.859 5.452 4.808 3.682 2.214 0.954 -0.094 -1.01 -1.812 -2.485 -3.102 -3.646 -4.183 -4.66 -5.09 -5.493 -5.875 -6.243 -6.601 -6.972 -7.271 -7.52 -7.781 -8.064 -8.325 -8.59 -8.858 -9.073 -9.323 -9.582 -9.81 -10.046 -10.211 -10.395 -10.706 -10.902 -11.118 -11.248 -11.507 -11.739 -12.019 -12.173 -12.514 -12.639 -12.818 -13.004 -13.406 -13.646 -13.924 -14.234 -14.606 -15.085 -15.745 -17.817 -2 ,239 ,KEBNE ,16652643,Sun Nov 21 23:45:22 CET,Mon Nov 22 01:33:32 CET,0.0 0.939 1.236 1.443 1.605 1.768 1.933 2.073 2.32 2.446 2.558 2.59 2.86 2.949 3.101 3.232 3.355 3.409 3.521 3.615 3.729 3.808 3.89 4.008 4.109 4.203 4.291 4.372 4.481 4.574 4.657 4.75 4.856 4.958 5.058 5.178 5.295 5.409 5.497 5.576 5.646 5.696 5.734 5.759 5.78 5.775 5.695 5.513 5.221 4.66 3.436 1.833 0.575 -0.491 -1.421 -2.268 -3.017 -3.681 -4.233 -4.765 -5.258 -5.699 -6.097 -6.471 -6.832 -7.187 -7.551 -7.864 -8.132 -8.442 -8.76 -9.033 -9.338 -9.638 -9.86 -10.084 -10.336 -10.599 -10.848 -11.014 -11.202 -11.497 -11.694 -11.897 -12.01 -12.264 -12.503 -12.776 -12.945 -13.307 -13.471 -13.67 -13.862 -14.259 -14.482 -14.753 -15.09 -15.452 -15.875 -16.445 -18.945 -3 ,5132 ,KEBNE ,16652644,Sun Nov 21 23:45:22 CET,Mon Nov 22 01:32:35 CET,0.0 1.562 2.005 2.257 2.443 2.621 2.776 2.904 3.082 3.172 3.281 3.305 3.572 3.658 3.829 3.964 4.061 4.109 4.208 4.306 4.448 4.534 4.616 4.741 4.861 4.991 5.108 5.198 5.324 5.443 5.539 5.645 5.753 5.856 5.964 6.065 6.157 6.258 6.352 6.454 6.529 6.571 6.623 6.653 6.647 6.603 6.506 6.31 5.95 5.336 4.168 2.668 1.423 0.348 -0.601 -1.466 -2.213 -2.886 -3.493 -4.108 -4.59 -5.0 -5.382 -5.759 -6.133 -6.467 -6.804 -7.115 -7.412 -7.718 -8.009 -8.242 -8.483 -8.742 -8.961 -9.191 -9.438 -9.713 -9.968 -10.135 -10.321 -10.617 -10.831 -11.06 -11.178 -11.41 -11.634 -11.88 -12.035 -12.397 -12.574 -12.779 -12.995 -13.506 -13.799 -14.092 -14.396 -14.74 -15.114 -15.621 -17.667 -4 ,5313 ,KEBNE ,16652645,Sun Nov 21 23:45:23 CET,Mon Nov 22 01:33:29 CET,0.0 1.083 1.456 1.722 1.898 2.043 2.174 2.301 2.511 2.591 2.67 2.643 2.889 2.958 3.076 3.177 3.278 3.331 3.444 3.561 3.7 3.775 3.848 3.95 4.055 4.177 4.316 4.437 4.577 4.709 4.802 4.882 4.979 5.088 5.19 5.284 5.365 5.439 5.522 5.628 5.734 5.819 5.873 5.905 5.911 5.875 5.772 5.526 5.101 4.421 3.237 1.74 0.482 -0.599 -1.552 -2.373 -3.05 -3.652 -4.198 -4.771 -5.23 -5.637 -6.041 -6.428 -6.771 -7.08 -7.429 -7.771 -8.078 -8.372 -8.67 -8.939 -9.228 -9.523 -9.742 -9.953 -10.152 -10.35 -10.589 -10.769 -10.947 -11.25 -11.478 -11.695 -11.795 -11.987 -12.186 -12.434 -12.579 -12.937 -13.107 -13.29 -13.478 -13.872 -14.104 -14.364 -14.646 -15.037 -15.558 -16.292 -19.117 -5 ,16479 ,KEBNE ,16652646,Sun Nov 21 23:45:23 CET,Mon Nov 22 01:33:41 CET,0.0 1.123 1.455 1.68 1.854 2.008 2.153 2.295 2.529 2.629 2.726 2.733 2.998 3.071 3.189 3.306 3.422 3.476 3.576 3.672 3.802 3.873 3.936 4.04 4.144 4.23 4.335 4.449 4.573 4.679 4.772 4.873 4.951 5.037 5.147 5.253 5.342 5.428 5.516 5.627 5.75 5.857 5.929 5.952 5.958 5.933 5.848 5.677 5.356 4.799 3.687 2.203 0.984 -0.071 -0.994 -1.821 -2.566 -3.239 -3.827 -4.39 -4.844 -5.258 -5.678 -6.097 -6.499 -6.848 -7.178 -7.489 -7.763 -8.024 -8.281 -8.511 -8.741 -8.99 -9.2 -9.398 -9.606 -9.818 -10.053 -10.219 -10.387 -10.636 -10.788 -10.986 -11.096 -11.331 -11.59 -11.879 -12.035 -12.372 -12.518 -12.714 -12.919 -13.359 -13.582 -13.836 -14.171 -14.58 -15.056 -15.688 -18.269 -7 ,116 ,KEBNE ,16652648,Sun Nov 21 23:45:23 CET,Mon Nov 22 01:32:46 CET,0.0 1.196 1.474 1.672 1.846 2.01 2.154 2.268 2.462 2.57 2.681 2.713 2.977 3.038 3.157 3.275 3.382 3.433 3.533 3.632 3.768 3.845 3.912 4.007 4.101 4.196 4.283 4.365 4.465 4.558 4.652 4.753 4.854 4.946 5.041 5.171 5.283 5.385 5.477 5.55 5.623 5.683 5.74 5.782 5.803 5.791 5.687 5.48 5.165 4.576 3.429 2.02 0.852 -0.191 -1.124 -1.952 -2.625 -3.233 -3.776 -4.3 -4.776 -5.236 -5.659 -6.009 -6.32 -6.642 -6.988 -7.302 -7.566 -7.83 -8.112 -8.332 -8.55 -8.807 -9.019 -9.225 -9.434 -9.653 -9.888 -10.047 -10.207 -10.502 -10.737 -10.961 -11.067 -11.265 -11.485 -11.758 -11.894 -12.222 -12.321 -12.499 -12.697 -13.132 -13.391 -13.696 -14.018 -14.377 -14.811 -15.353 -17.968 -8 ,2079 ,KEBNE ,16652649,Sun Nov 21 23:45:23 CET,Mon Nov 22 01:33:41 CET,0.0 0.947 1.245 1.508 1.696 1.872 2.034 2.178 2.422 2.518 2.615 2.625 2.897 3.001 3.168 3.287 3.392 3.442 3.544 3.65 3.809 3.912 4.004 4.136 4.248 4.348 4.45 4.553 4.671 4.771 4.858 4.949 5.025 5.108 5.217 5.334 5.435 5.513 5.588 5.667 5.722 5.762 5.792 5.82 5.833 5.792 5.716 5.568 5.227 4.638 3.552 2.152 0.937 -0.135 -1.054 -1.845 -2.545 -3.213 -3.753 -4.269 -4.746 -5.194 -5.627 -6.061 -6.489 -6.876 -7.243 -7.526 -7.794 -8.095 -8.41 -8.689 -8.977 -9.249 -9.435 -9.625 -9.85 -10.1 -10.375 -10.575 -10.78 -11.12 -11.349 -11.559 -11.661 -11.892 -12.142 -12.424 -12.574 -12.904 -13.03 -13.233 -13.439 -13.855 -14.084 -14.343 -14.678 -15.055 -15.482 -16.067 -18.507 -9 ,958 ,KEBNE ,16652650,Sun Nov 21 23:45:23 CET,Mon Nov 22 01:34:23 CET,0.0 1.01 1.346 1.543 1.707 1.857 1.99 2.107 2.315 2.408 2.506 2.493 2.75 2.852 3.057 3.24 3.399 3.461 3.566 3.662 3.795 3.885 3.97 4.102 4.243 4.366 4.458 4.542 4.656 4.759 4.847 4.94 5.028 5.102 5.18 5.271 5.359 5.459 5.54 5.6 5.679 5.764 5.84 5.876 5.878 5.89 5.871 5.714 5.345 4.706 3.563 2.091 0.855 -0.192 -1.107 -1.924 -2.64 -3.29 -3.868 -4.456 -4.983 -5.458 -5.882 -6.283 -6.674 -7.01 -7.348 -7.648 -7.898 -8.198 -8.522 -8.796 -9.086 -9.362 -9.57 -9.792 -10.039 -10.297 -10.562 -10.76 -10.963 -11.252 -11.454 -11.657 -11.768 -12.014 -12.269 -12.539 -12.693 -13.068 -13.288 -13.502 -13.726 -14.269 -14.53 -14.749 -14.996 -15.302 -15.813 -16.629 -19.655 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 870fa6d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31638 ,KEBNE ,16652652,Sun Nov 21 23:45:23 CET,Mon Nov 22 01:33:07 CET,0.0 0.843 1.045 1.204 1.338 1.44 1.537 1.624 1.777 1.857 1.929 1.878 2.114 2.177 2.307 2.422 2.528 2.578 2.673 2.77 2.913 3.001 3.087 3.216 3.339 3.455 3.576 3.692 3.834 3.973 4.113 4.295 4.471 4.649 4.867 5.09 5.288 5.508 5.743 5.992 6.249 6.506 6.783 7.074 7.42 7.791 8.184 8.555 8.932 9.307 9.598 9.535 9.217 8.807 8.404 8.017 7.641 7.26 6.887 6.518 6.212 5.943 5.685 5.427 5.164 4.918 4.682 4.458 4.234 3.993 3.737 3.505 3.257 3.014 2.829 2.65 2.475 2.272 2.038 1.87 1.692 1.418 1.238 1.034 0.927 0.689 0.378 0.082 -0.044 -0.347 -0.456 -0.623 -0.81 -1.199 -1.428 -1.709 -2.025 -2.378 -2.821 -3.411 -5.327 -3 ,12215 ,KEBNE ,16652654,Sun Nov 21 23:45:23 CET,Mon Nov 22 01:33:09 CET,0.0 0.757 0.991 1.13 1.245 1.363 1.48 1.579 1.752 1.834 1.91 1.876 2.126 2.19 2.308 2.429 2.54 2.592 2.692 2.788 2.936 3.035 3.128 3.27 3.41 3.532 3.647 3.762 3.908 4.046 4.174 4.341 4.494 4.641 4.818 5.003 5.184 5.374 5.573 5.805 6.044 6.315 6.627 6.92 7.247 7.595 7.983 8.345 8.646 8.917 9.074 8.847 8.394 7.901 7.465 7.056 6.658 6.272 5.922 5.55 5.222 4.899 4.544 4.196 3.894 3.616 3.33 3.097 2.893 2.655 2.392 2.178 1.939 1.653 1.413 1.163 0.899 0.633 0.371 0.194 0.018 -0.265 -0.491 -0.714 -0.824 -1.043 -1.259 -1.494 -1.626 -1.961 -2.165 -2.375 -2.572 -3.012 -3.266 -3.526 -3.828 -4.169 -4.605 -5.187 -7.388 -4 ,5851 ,KEBNE ,16652655,Sun Nov 21 23:46:25 CET,Mon Nov 22 01:35:12 CET,0.0 0.655 0.837 0.973 1.086 1.184 1.277 1.371 1.554 1.635 1.708 1.677 1.93 2.0 2.146 2.284 2.412 2.48 2.609 2.717 2.868 2.959 3.05 3.187 3.32 3.448 3.567 3.686 3.832 3.97 4.107 4.264 4.414 4.56 4.725 4.912 5.101 5.311 5.525 5.733 5.954 6.198 6.482 6.778 7.09 7.403 7.768 8.18 8.604 8.958 9.105 8.929 8.593 8.223 7.869 7.489 7.109 6.759 6.445 6.081 5.768 5.476 5.177 4.901 4.649 4.413 4.152 3.929 3.741 3.533 3.306 3.132 2.965 2.744 2.551 2.385 2.218 2.042 1.856 1.701 1.53 1.262 1.059 0.851 0.747 0.518 0.262 0.014 -0.108 -0.412 -0.553 -0.717 -0.885 -1.261 -1.47 -1.718 -2.024 -2.389 -2.857 -3.531 -6.638 -5 ,22886 ,KEBNE ,16652656,Sun Nov 21 23:46:26 CET,Mon Nov 22 01:35:05 CET,0.0 0.65 0.879 1.037 1.17 1.308 1.442 1.546 1.721 1.808 1.902 1.895 2.152 2.223 2.364 2.493 2.62 2.684 2.813 2.93 3.086 3.186 3.272 3.412 3.557 3.689 3.824 3.955 4.125 4.289 4.434 4.615 4.784 4.942 5.123 5.32 5.511 5.712 5.934 6.184 6.441 6.715 7.024 7.328 7.697 8.104 8.562 9.029 9.407 9.755 10.088 10.111 9.873 9.513 9.1 8.684 8.293 7.918 7.552 7.147 6.785 6.48 6.178 5.864 5.58 5.302 5.011 4.769 4.56 4.36 4.146 3.939 3.709 3.469 3.291 3.102 2.888 2.665 2.45 2.282 2.08 1.763 1.553 1.356 1.263 1.044 0.805 0.556 0.413 0.093 -0.034 -0.192 -0.365 -0.792 -1.037 -1.306 -1.593 -1.932 -2.374 -3.0 -5.856 -6 ,25222 ,KEBNE ,16652657,Sun Nov 21 23:46:26 CET,Mon Nov 22 01:34:58 CET,0.0 0.56 0.735 0.865 0.983 1.098 1.203 1.294 1.456 1.534 1.606 1.567 1.807 1.867 1.981 2.095 2.208 2.263 2.373 2.487 2.653 2.749 2.838 2.971 3.095 3.211 3.329 3.442 3.579 3.71 3.842 4.006 4.162 4.317 4.5 4.694 4.875 5.083 5.306 5.535 5.777 6.054 6.376 6.691 7.027 7.36 7.714 8.124 8.56 8.913 9.108 8.861 8.384 7.91 7.478 7.048 6.653 6.264 5.922 5.56 5.221 4.937 4.683 4.432 4.164 3.887 3.594 3.347 3.138 2.919 2.681 2.487 2.275 2.03 1.828 1.628 1.437 1.247 1.055 0.914 0.759 0.502 0.324 0.132 0.031 -0.193 -0.44 -0.734 -0.92 -1.28 -1.503 -1.711 -1.887 -2.258 -2.484 -2.723 -2.993 -3.316 -3.74 -4.454 -6.987 -7 ,14961 ,KEBNE ,16652658,Sun Nov 21 23:46:26 CET,Mon Nov 22 01:35:20 CET,0.0 0.584 0.776 0.926 1.056 1.181 1.296 1.392 1.562 1.64 1.717 1.679 1.92 1.99 2.133 2.275 2.403 2.459 2.564 2.668 2.817 2.921 3.023 3.157 3.286 3.412 3.535 3.658 3.818 3.969 4.1 4.257 4.418 4.573 4.746 4.94 5.12 5.311 5.534 5.754 5.963 6.202 6.498 6.797 7.142 7.508 7.867 8.235 8.682 9.108 9.308 9.174 8.86 8.507 8.149 7.797 7.42 7.032 6.692 6.302 5.959 5.676 5.415 5.166 4.915 4.674 4.426 4.21 4.019 3.806 3.581 3.385 3.167 2.956 2.801 2.619 2.428 2.214 1.979 1.832 1.665 1.397 1.207 0.985 0.883 0.677 0.435 0.164 0.028 -0.286 -0.413 -0.565 -0.747 -1.182 -1.445 -1.706 -1.981 -2.335 -2.813 -3.496 -5.915 -8 ,18469 ,KEBNE ,16652659,Sun Nov 21 23:46:26 CET,Mon Nov 22 01:34:59 CET,0.0 0.57 0.762 0.903 1.035 1.147 1.247 1.354 1.531 1.61 1.69 1.641 1.879 1.942 2.063 2.177 2.279 2.329 2.428 2.527 2.677 2.77 2.86 2.995 3.127 3.245 3.35 3.453 3.588 3.721 3.846 4.009 4.166 4.307 4.467 4.649 4.817 5.009 5.229 5.445 5.673 5.929 6.217 6.495 6.812 7.17 7.552 7.92 8.299 8.68 8.905 8.792 8.511 8.127 7.737 7.341 6.978 6.625 6.282 5.92 5.609 5.326 5.028 4.72 4.419 4.142 3.837 3.56 3.341 3.104 2.85 2.648 2.428 2.199 2.008 1.81 1.614 1.406 1.205 1.08 0.94 0.68 0.497 0.319 0.228 0.013 -0.256 -0.557 -0.702 -1.027 -1.187 -1.352 -1.553 -1.983 -2.232 -2.555 -2.926 -3.311 -3.722 -4.287 -6.845 -10 ,26796 ,KEBNE ,16652661,Sun Nov 21 23:47:28 CET,Mon Nov 22 01:36:29 CET,0.0 0.551 0.772 0.936 1.073 1.193 1.3 1.389 1.556 1.638 1.715 1.685 1.935 1.997 2.117 2.235 2.345 2.398 2.502 2.6 2.742 2.835 2.924 3.053 3.176 3.304 3.423 3.529 3.669 3.805 3.945 4.115 4.271 4.42 4.593 4.794 4.988 5.196 5.42 5.64 5.87 6.144 6.45 6.746 7.053 7.372 7.741 8.137 8.528 8.801 8.947 8.851 8.467 7.995 7.597 7.205 6.825 6.453 6.074 5.67 5.338 5.041 4.745 4.45 4.176 3.934 3.662 3.405 3.197 2.996 2.775 2.583 2.377 2.155 1.968 1.777 1.594 1.382 1.158 1.017 0.87 0.642 0.466 0.264 0.16 -0.05 -0.281 -0.546 -0.696 -1.032 -1.188 -1.373 -1.572 -1.989 -2.226 -2.476 -2.755 -3.063 -3.428 -3.954 -7.203 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt deleted file mode 100644 index 6743517c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19112 ,KEBNE ,16652662,Sun Nov 21 23:47:28 CET,Mon Nov 22 01:36:44 CET,0.0 0.975 1.258 1.448 1.625 1.789 1.933 2.067 2.297 2.403 2.491 2.463 2.715 2.786 2.917 3.043 3.163 3.221 3.34 3.449 3.592 3.676 3.756 3.878 3.999 4.125 4.235 4.342 4.482 4.609 4.736 4.901 5.044 5.165 5.303 5.436 5.565 5.722 5.872 6.022 6.171 6.33 6.512 6.676 6.842 6.995 7.13 7.188 7.147 6.841 6.017 4.888 3.85 2.89 1.958 1.108 0.395 -0.274 -0.847 -1.38 -1.843 -2.264 -2.663 -3.043 -3.387 -3.682 -3.997 -4.294 -4.543 -4.789 -5.057 -5.278 -5.496 -5.724 -5.902 -6.094 -6.299 -6.5 -6.724 -6.913 -7.123 -7.447 -7.653 -7.855 -7.957 -8.168 -8.391 -8.604 -8.714 -9.015 -9.04 -9.161 -9.283 -9.56 -9.726 -9.908 -10.105 -10.339 -10.669 -11.06 -12.276 -2 ,8024 ,KEBNE ,16652663,Sun Nov 21 23:47:28 CET,Mon Nov 22 01:36:42 CET,0.0 0.848 1.154 1.373 1.546 1.695 1.831 1.948 2.149 2.239 2.333 2.346 2.626 2.716 2.859 2.997 3.135 3.199 3.321 3.441 3.62 3.735 3.847 4.005 4.143 4.263 4.371 4.482 4.621 4.738 4.852 4.98 5.096 5.21 5.343 5.509 5.67 5.838 5.992 6.141 6.285 6.414 6.571 6.726 6.878 7.017 7.12 7.151 7.035 6.679 5.834 4.586 3.483 2.505 1.665 0.877 0.138 -0.507 -1.023 -1.524 -1.957 -2.347 -2.72 -3.054 -3.353 -3.628 -3.922 -4.197 -4.438 -4.685 -4.932 -5.123 -5.325 -5.549 -5.727 -5.904 -6.081 -6.274 -6.474 -6.615 -6.762 -6.997 -7.171 -7.364 -7.469 -7.7 -7.923 -8.129 -8.243 -8.556 -8.612 -8.739 -8.888 -9.202 -9.361 -9.533 -9.736 -9.998 -10.344 -10.782 -12.028 -5 ,12171 ,KEBNE ,16652666,Sun Nov 21 23:56:48 CET,Mon Nov 22 01:44:54 CET,0.0 1.002 1.248 1.446 1.604 1.743 1.859 1.987 2.272 2.393 2.498 2.525 2.786 2.862 3.011 3.151 3.273 3.331 3.449 3.567 3.738 3.858 3.977 4.134 4.277 4.421 4.57 4.7 4.856 5.01 5.152 5.319 5.48 5.628 5.808 6.011 6.183 6.357 6.521 6.671 6.816 6.971 7.135 7.28 7.409 7.488 7.555 7.596 7.468 7.1 6.346 5.203 4.161 3.281 2.505 1.771 1.137 0.55 0.008 -0.533 -0.981 -1.371 -1.743 -2.081 -2.395 -2.69 -3.012 -3.306 -3.551 -3.803 -4.059 -4.263 -4.49 -4.732 -4.916 -5.102 -5.289 -5.49 -5.728 -5.894 -6.055 -6.295 -6.458 -6.634 -6.72 -6.904 -7.118 -7.344 -7.456 -7.758 -7.854 -8.016 -8.19 -8.588 -8.792 -8.994 -9.223 -9.467 -9.74 -10.101 -11.132 -6 ,4460 ,KEBNE ,16652667,Sun Nov 21 23:57:52 CET,Mon Nov 22 01:46:01 CET,0.0 0.557 0.799 0.996 1.177 1.34 1.487 1.619 1.866 1.98 2.089 2.128 2.392 2.46 2.582 2.693 2.804 2.859 2.952 3.045 3.187 3.28 3.372 3.496 3.618 3.743 3.862 3.964 4.077 4.185 4.291 4.413 4.532 4.653 4.797 4.937 5.065 5.254 5.493 5.717 5.92 6.153 6.397 6.625 6.864 7.08 7.275 7.401 7.409 7.249 6.666 5.582 4.547 3.663 2.882 2.175 1.57 1.03 0.528 -0.035 -0.55 -0.999 -1.406 -1.794 -2.172 -2.513 -2.858 -3.181 -3.46 -3.736 -4.002 -4.219 -4.464 -4.708 -4.892 -5.087 -5.287 -5.503 -5.731 -5.893 -6.055 -6.304 -6.478 -6.668 -6.762 -6.967 -7.202 -7.426 -7.544 -7.866 -7.985 -8.128 -8.261 -8.555 -8.726 -8.927 -9.131 -9.369 -9.67 -10.06 -10.96 -7 ,15249 ,KEBNE ,16652668,Sun Nov 21 23:59:55 CET,Mon Nov 22 01:48:16 CET,0.0 1.193 1.521 1.754 1.95 2.12 2.263 2.393 2.626 2.73 2.828 2.825 3.082 3.162 3.317 3.452 3.585 3.649 3.769 3.885 4.044 4.14 4.231 4.363 4.494 4.611 4.717 4.816 4.941 5.07 5.199 5.355 5.49 5.612 5.769 5.946 6.104 6.251 6.389 6.554 6.739 6.913 7.086 7.234 7.384 7.514 7.586 7.635 7.613 7.405 6.739 5.645 4.64 3.706 2.857 2.111 1.438 0.828 0.327 -0.184 -0.634 -1.04 -1.429 -1.786 -2.117 -2.423 -2.751 -3.057 -3.32 -3.589 -3.883 -4.119 -4.336 -4.57 -4.765 -4.97 -5.181 -5.402 -5.639 -5.805 -5.983 -6.25 -6.428 -6.624 -6.72 -6.917 -7.146 -7.379 -7.496 -7.81 -7.88 -8.016 -8.167 -8.525 -8.738 -8.98 -9.243 -9.51 -9.784 -10.176 -11.775 -8 ,30325 ,KEBNE ,16652669,Mon Nov 22 00:00:57 CET,Mon Nov 22 01:48:41 CET,0.0 0.821 1.134 1.37 1.566 1.733 1.877 2.005 2.256 2.371 2.477 2.505 2.775 2.851 2.982 3.093 3.201 3.256 3.38 3.502 3.674 3.79 3.903 4.059 4.208 4.357 4.49 4.609 4.763 4.915 5.058 5.248 5.432 5.58 5.726 5.873 6.039 6.237 6.443 6.653 6.849 7.076 7.35 7.594 7.828 8.018 8.17 8.266 8.237 8.037 7.413 6.348 5.367 4.468 3.597 2.799 2.117 1.514 1.013 0.501 0.048 -0.348 -0.715 -1.065 -1.415 -1.731 -2.065 -2.375 -2.625 -2.883 -3.159 -3.389 -3.632 -3.882 -4.064 -4.257 -4.472 -4.685 -4.907 -5.072 -5.238 -5.49 -5.664 -5.848 -5.948 -6.155 -6.357 -6.571 -6.687 -6.989 -7.082 -7.231 -7.373 -7.678 -7.849 -8.049 -8.288 -8.576 -8.914 -9.35 -10.616 -9 ,29293 ,KEBNE ,16652670,Mon Nov 22 00:00:57 CET,Mon Nov 22 01:48:45 CET,0.0 0.706 1.058 1.289 1.465 1.611 1.734 1.855 2.107 2.233 2.353 2.395 2.671 2.771 2.96 3.114 3.231 3.287 3.395 3.503 3.658 3.757 3.853 3.978 4.092 4.201 4.31 4.421 4.562 4.68 4.787 4.934 5.075 5.193 5.332 5.492 5.637 5.785 5.93 6.084 6.237 6.387 6.537 6.661 6.802 6.94 7.052 7.129 7.128 6.947 6.395 5.398 4.392 3.438 2.567 1.809 1.131 0.505 -0.053 -0.602 -1.027 -1.414 -1.789 -2.148 -2.498 -2.802 -3.112 -3.418 -3.685 -3.944 -4.217 -4.443 -4.676 -4.921 -5.111 -5.317 -5.531 -5.753 -5.981 -6.134 -6.291 -6.549 -6.749 -6.97 -7.081 -7.3 -7.536 -7.772 -7.888 -8.189 -8.248 -8.391 -8.553 -8.939 -9.155 -9.366 -9.598 -9.867 -10.189 -10.593 -11.444 -10 ,17099 ,KEBNE ,16652671,Mon Nov 22 00:03:01 CET,Mon Nov 22 01:51:12 CET,0.0 0.694 1.009 1.273 1.472 1.6 1.709 1.826 2.063 2.165 2.259 2.256 2.506 2.578 2.717 2.84 2.963 3.024 3.131 3.227 3.362 3.465 3.584 3.747 3.896 4.035 4.156 4.266 4.408 4.543 4.671 4.813 4.945 5.07 5.226 5.424 5.615 5.819 6.034 6.252 6.458 6.667 6.904 7.153 7.431 7.701 7.932 8.085 8.115 7.912 7.19 5.95 4.76 3.747 2.964 2.274 1.637 1.063 0.56 0.028 -0.419 -0.796 -1.136 -1.463 -1.775 -2.061 -2.378 -2.681 -2.938 -3.196 -3.477 -3.702 -3.913 -4.148 -4.345 -4.546 -4.751 -4.962 -5.19 -5.359 -5.527 -5.76 -5.932 -6.112 -6.194 -6.356 -6.541 -6.762 -6.876 -7.179 -7.237 -7.357 -7.483 -7.752 -7.895 -8.081 -8.328 -8.612 -8.938 -9.408 -10.856 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 69df5a19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24474 ,KEBNE ,17069314,Thu Dec 23 23:51:07 CET,Fri Dec 24 01:36:35 CET,0.0 0.906 1.148 1.311 1.447 1.574 1.688 1.788 1.977 2.071 2.154 2.131 2.403 2.488 2.627 2.758 2.887 2.949 3.064 3.174 3.339 3.447 3.55 3.691 3.825 3.959 4.096 4.222 4.374 4.521 4.663 4.836 5.003 5.164 5.349 5.563 5.776 6.007 6.249 6.514 6.792 7.095 7.447 7.79 8.186 8.611 9.056 9.534 10.098 10.681 11.115 11.217 11.123 10.925 10.697 10.446 10.194 9.941 9.714 9.463 9.241 9.049 8.838 8.636 8.438 8.256 8.052 7.857 7.71 7.558 7.388 7.244 7.09 6.933 6.816 6.695 6.567 6.434 6.301 6.21 6.109 5.925 5.799 5.675 5.604 5.456 5.31 5.163 5.084 4.82 4.83 4.751 4.654 4.429 4.304 4.17 4.008 3.825 3.589 3.273 2.127 -2 ,2640 ,KEBNE ,17069315,Thu Dec 23 23:51:07 CET,Fri Dec 24 01:36:28 CET,0.0 0.615 0.835 1.025 1.175 1.293 1.406 1.51 1.689 1.778 1.864 1.848 2.105 2.177 2.312 2.448 2.585 2.649 2.772 2.898 3.072 3.178 3.281 3.435 3.579 3.701 3.821 3.941 4.093 4.241 4.389 4.575 4.759 4.93 5.137 5.37 5.585 5.818 6.064 6.327 6.607 6.919 7.268 7.621 8.038 8.463 8.919 9.44 10.015 10.641 11.37 11.749 11.75 11.621 11.449 11.238 11.018 10.819 10.643 10.426 10.222 10.038 9.85 9.675 9.518 9.351 9.166 9.012 8.879 8.738 8.592 8.47 8.341 8.199 8.073 7.937 7.808 7.68 7.529 7.429 7.335 7.178 7.072 6.959 6.905 6.791 6.649 6.51 6.444 6.198 6.224 6.141 6.046 5.826 5.693 5.551 5.409 5.251 5.066 4.805 3.709 -3 ,21309 ,KEBNE ,17069316,Thu Dec 23 23:53:15 CET,Fri Dec 24 01:39:38 CET,0.0 0.745 0.963 1.135 1.28 1.399 1.517 1.621 1.818 1.914 2.0 1.986 2.249 2.327 2.467 2.59 2.713 2.772 2.886 3.002 3.177 3.291 3.398 3.545 3.678 3.813 3.952 4.081 4.251 4.431 4.6 4.781 4.953 5.129 5.343 5.58 5.816 6.069 6.336 6.616 6.894 7.204 7.558 7.922 8.346 8.796 9.287 9.815 10.418 11.068 11.651 11.882 11.818 11.662 11.48 11.231 10.957 10.701 10.495 10.284 10.093 9.909 9.716 9.533 9.364 9.203 9.043 8.9 8.765 8.617 8.462 8.34 8.204 8.057 7.949 7.841 7.724 7.591 7.469 7.385 7.283 7.112 7.001 6.886 6.823 6.698 6.574 6.441 6.365 6.102 6.093 5.999 5.901 5.695 5.586 5.46 5.308 5.148 4.963 4.703 3.749 -4 ,21701 ,KEBNE ,17069317,Thu Dec 23 23:54:20 CET,Fri Dec 24 01:41:13 CET,0.0 0.957 1.216 1.408 1.551 1.669 1.788 1.896 2.087 2.179 2.268 2.254 2.509 2.59 2.735 2.872 2.993 3.05 3.171 3.291 3.459 3.567 3.67 3.804 3.941 4.084 4.219 4.335 4.48 4.631 4.777 4.951 5.119 5.285 5.48 5.688 5.881 6.098 6.345 6.601 6.852 7.158 7.523 7.875 8.284 8.698 9.128 9.639 10.247 10.858 11.372 11.562 11.493 11.269 11.018 10.777 10.55 10.334 10.132 9.924 9.717 9.495 9.275 9.077 8.914 8.763 8.585 8.416 8.272 8.12 7.955 7.819 7.678 7.529 7.414 7.299 7.181 7.042 6.89 6.795 6.694 6.529 6.425 6.321 6.266 6.149 6.027 5.896 5.823 5.575 5.596 5.509 5.402 5.173 5.053 4.931 4.775 4.588 4.383 4.133 3.312 -5 ,14839 ,KEBNE ,17069318,Thu Dec 23 23:54:20 CET,Fri Dec 24 01:41:22 CET,0.0 1.192 1.419 1.594 1.747 1.882 1.986 2.088 2.284 2.373 2.452 2.417 2.672 2.749 2.9 3.046 3.169 3.227 3.343 3.466 3.639 3.738 3.835 3.981 4.127 4.266 4.399 4.529 4.695 4.852 4.998 5.17 5.344 5.52 5.71 5.92 6.123 6.345 6.582 6.83 7.098 7.396 7.738 8.102 8.517 8.952 9.444 9.96 10.499 11.063 11.644 11.946 11.93 11.802 11.646 11.48 11.275 11.034 10.829 10.611 10.411 10.228 10.027 9.841 9.68 9.517 9.341 9.196 9.07 8.933 8.784 8.662 8.534 8.397 8.3 8.193 8.074 7.965 7.849 7.757 7.665 7.532 7.433 7.315 7.254 7.134 7.009 6.871 6.798 6.553 6.573 6.488 6.393 6.188 6.09 5.993 5.877 5.715 5.527 5.282 4.287 -6 ,6668 ,KEBNE ,17069319,Thu Dec 23 23:57:29 CET,Fri Dec 24 01:43:28 CET,0.0 0.941 1.198 1.385 1.534 1.667 1.779 1.868 2.036 2.13 2.216 2.203 2.455 2.526 2.662 2.794 2.923 2.987 3.102 3.212 3.38 3.487 3.588 3.724 3.855 3.987 4.119 4.239 4.377 4.516 4.656 4.83 5.004 5.179 5.387 5.615 5.833 6.075 6.326 6.586 6.846 7.129 7.468 7.8 8.173 8.592 9.076 9.583 10.139 10.765 11.336 11.577 11.555 11.403 11.183 10.958 10.753 10.529 10.333 10.134 9.942 9.757 9.581 9.42 9.266 9.122 8.951 8.784 8.631 8.467 8.316 8.194 8.067 7.928 7.812 7.695 7.576 7.453 7.312 7.216 7.129 6.998 6.91 6.8 6.738 6.622 6.503 6.376 6.31 6.069 6.104 6.03 5.944 5.704 5.562 5.429 5.289 5.135 4.945 4.628 3.42 -7 ,20748 ,KEBNE ,17069320,Thu Dec 23 23:57:29 CET,Fri Dec 24 01:45:18 CET,0.0 0.643 0.871 1.063 1.212 1.343 1.471 1.579 1.764 1.853 1.939 1.934 2.197 2.279 2.422 2.56 2.695 2.758 2.886 3.014 3.197 3.312 3.417 3.569 3.715 3.854 3.988 4.119 4.287 4.441 4.579 4.749 4.925 5.095 5.289 5.5 5.702 5.935 6.183 6.436 6.697 6.971 7.299 7.64 8.019 8.447 8.929 9.428 9.984 10.608 11.198 11.498 11.51 11.37 11.17 10.93 10.678 10.428 10.201 9.977 9.772 9.566 9.375 9.199 9.039 8.898 8.741 8.593 8.457 8.31 8.143 8.003 7.868 7.728 7.618 7.501 7.378 7.235 7.087 7.003 6.923 6.785 6.692 6.583 6.515 6.365 6.19 6.012 5.941 5.7 5.705 5.612 5.524 5.327 5.221 5.111 4.977 4.796 4.597 4.367 3.552 -8 ,22327 ,KEBNE ,17069321,Thu Dec 23 23:57:29 CET,Fri Dec 24 01:42:51 CET,0.0 0.7 0.94 1.145 1.29 1.411 1.528 1.649 1.867 1.959 2.042 2.013 2.262 2.327 2.454 2.578 2.701 2.761 2.875 2.988 3.147 3.246 3.34 3.481 3.621 3.758 3.892 4.021 4.183 4.339 4.487 4.667 4.837 5.0 5.199 5.414 5.614 5.829 6.062 6.32 6.597 6.918 7.288 7.64 8.058 8.554 9.087 9.642 10.28 10.978 11.617 11.812 11.779 11.678 11.511 11.311 11.093 10.86 10.629 10.369 10.126 9.888 9.67 9.477 9.301 9.143 8.968 8.795 8.645 8.507 8.358 8.228 8.101 7.971 7.875 7.776 7.669 7.557 7.44 7.362 7.279 7.121 6.998 6.877 6.819 6.709 6.594 6.455 6.381 6.138 6.138 6.042 5.952 5.761 5.645 5.514 5.372 5.202 5.0 4.757 4.023 -9 ,27224 ,KEBNE ,17069322,Fri Dec 24 00:00:43 CET,Fri Dec 24 01:46:02 CET,0.0 0.773 1.007 1.179 1.316 1.439 1.547 1.654 1.852 1.943 2.031 2.021 2.272 2.34 2.47 2.599 2.719 2.775 2.886 2.994 3.145 3.24 3.333 3.468 3.593 3.718 3.843 3.96 4.112 4.273 4.432 4.601 4.76 4.917 5.105 5.328 5.537 5.767 6.006 6.248 6.502 6.797 7.134 7.455 7.838 8.235 8.688 9.191 9.702 10.25 10.759 10.934 10.876 10.745 10.559 10.315 10.067 9.822 9.613 9.418 9.235 9.043 8.841 8.646 8.467 8.295 8.103 7.93 7.783 7.621 7.451 7.316 7.188 7.055 6.943 6.826 6.701 6.568 6.423 6.312 6.199 6.03 5.913 5.792 5.731 5.61 5.481 5.347 5.279 5.028 5.024 4.937 4.846 4.619 4.506 4.382 4.231 4.058 3.843 3.541 2.598 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt deleted file mode 100644 index 71dc55c3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,19425 ,KEBNE ,16652673,Mon Nov 22 00:04:04 CET,Mon Nov 22 01:52:04 CET,0.0 6.554 6.971 7.307 7.58 7.836 8.068 8.26 8.589 8.748 8.908 8.953 9.31 9.421 9.661 9.877 10.047 10.131 10.272 10.411 10.65 10.798 10.919 11.071 11.224 11.404 11.594 11.759 11.936 12.084 12.223 12.405 12.589 12.75 12.928 13.126 13.309 13.501 13.676 13.825 13.993 14.192 14.453 14.685 14.812 14.91 14.968 14.965 14.851 14.464 13.593 12.434 11.423 10.539 9.721 8.955 8.256 7.595 7.03 6.482 6.0 5.589 5.23 4.87 4.492 4.126 3.76 3.456 3.19 2.908 2.608 2.354 2.087 1.796 1.553 1.285 1.019 0.771 0.535 0.374 0.203 -0.061 -0.248 -0.459 -0.569 -0.798 -1.061 -1.348 -1.506 -1.901 -1.948 -2.085 -2.234 -2.581 -2.762 -2.958 -3.194 -3.497 -3.83 -4.287 -6.672 -3 ,22189 ,KEBNE ,16652674,Mon Nov 22 00:06:08 CET,Mon Nov 22 01:53:39 CET,0.0 2.177 2.581 2.844 3.051 3.239 3.413 3.593 3.945 4.081 4.193 4.196 4.539 4.648 4.828 4.977 5.131 5.197 5.318 5.446 5.623 5.725 5.829 6.006 6.155 6.278 6.396 6.512 6.69 6.879 7.02 7.146 7.283 7.431 7.6 7.784 7.941 8.094 8.28 8.468 8.641 8.811 8.963 9.127 9.338 9.526 9.66 9.696 9.613 9.34 8.559 7.399 6.321 5.3 4.429 3.641 2.898 2.223 1.645 1.052 0.536 0.055 -0.392 -0.776 -1.136 -1.454 -1.779 -2.112 -2.399 -2.674 -2.971 -3.218 -3.493 -3.788 -3.998 -4.198 -4.406 -4.624 -4.837 -4.999 -5.18 -5.471 -5.686 -5.887 -5.979 -6.188 -6.434 -6.701 -6.835 -7.204 -7.24 -7.382 -7.545 -7.921 -8.12 -8.334 -8.566 -8.844 -9.233 -9.813 -12.056 -4 ,29276 ,KEBNE ,16652675,Mon Nov 22 00:06:12 CET,Mon Nov 22 01:49:10 CET,0.0 1.793 2.134 2.38 2.601 2.79 2.953 3.098 3.347 3.463 3.586 3.596 3.93 4.039 4.25 4.435 4.598 4.67 4.81 4.948 5.133 5.263 5.386 5.538 5.686 5.819 5.949 6.081 6.24 6.41 6.582 6.76 6.905 7.043 7.201 7.371 7.562 7.795 7.989 8.155 8.347 8.536 8.7 8.862 9.025 9.143 9.228 9.244 9.128 8.817 8.054 6.915 5.867 4.919 4.099 3.351 2.682 2.052 1.484 0.915 0.448 0.051 -0.334 -0.703 -1.06 -1.401 -1.74 -2.042 -2.33 -2.637 -2.925 -3.149 -3.398 -3.69 -3.931 -4.166 -4.403 -4.647 -4.89 -5.057 -5.224 -5.502 -5.714 -5.925 -6.031 -6.255 -6.5 -6.77 -6.906 -7.286 -7.356 -7.515 -7.692 -8.096 -8.305 -8.534 -8.824 -9.166 -9.552 -10.016 -12.032 -5 ,10309 ,KEBNE ,16652676,Mon Nov 22 00:07:11 CET,Mon Nov 22 01:54:57 CET,0.0 1.794 2.17 2.444 2.696 2.913 3.121 3.304 3.565 3.658 3.745 3.701 4.017 4.099 4.255 4.413 4.566 4.634 4.767 4.893 5.052 5.153 5.254 5.388 5.521 5.672 5.821 5.964 6.145 6.297 6.429 6.594 6.779 6.941 7.12 7.347 7.546 7.753 7.991 8.21 8.393 8.655 8.94 9.112 9.266 9.397 9.498 9.521 9.479 9.26 8.575 7.523 6.556 5.677 4.871 4.149 3.513 2.887 2.351 1.818 1.352 0.919 0.499 0.134 -0.2 -0.514 -0.851 -1.131 -1.389 -1.7 -2.006 -2.273 -2.553 -2.807 -3.02 -3.257 -3.477 -3.681 -3.894 -4.061 -4.239 -4.525 -4.749 -4.963 -5.056 -5.282 -5.539 -5.793 -5.911 -6.272 -6.343 -6.524 -6.721 -7.129 -7.376 -7.658 -7.988 -8.389 -8.86 -9.582 -12.251 -6 ,28329 ,KEBNE ,16652677,Mon Nov 22 00:07:10 CET,Mon Nov 22 01:55:15 CET,0.0 1.539 1.946 2.242 2.451 2.607 2.755 2.899 3.181 3.308 3.426 3.403 3.74 3.855 4.063 4.249 4.406 4.479 4.63 4.793 5.051 5.186 5.284 5.431 5.594 5.742 5.866 5.983 6.134 6.298 6.468 6.648 6.803 6.941 7.104 7.311 7.499 7.705 7.91 8.089 8.285 8.489 8.66 8.809 8.983 9.146 9.252 9.286 9.213 8.877 8.03 6.835 5.781 4.85 3.999 3.226 2.559 1.933 1.335 0.73 0.241 -0.186 -0.587 -0.953 -1.292 -1.603 -1.92 -2.205 -2.459 -2.747 -3.055 -3.31 -3.575 -3.853 -4.073 -4.292 -4.54 -4.803 -5.056 -5.227 -5.413 -5.688 -5.868 -6.076 -6.186 -6.407 -6.653 -6.911 -7.029 -7.387 -7.438 -7.57 -7.706 -8.062 -8.259 -8.483 -8.739 -9.002 -9.324 -9.881 -11.872 -8 ,17088 ,KEBNE ,16652679,Mon Nov 22 00:07:15 CET,Mon Nov 22 01:49:07 CET,0.0 1.851 2.198 2.467 2.665 2.857 3.025 3.165 3.401 3.501 3.603 3.577 3.905 4.006 4.206 4.367 4.492 4.556 4.69 4.816 4.991 5.093 5.186 5.334 5.474 5.598 5.716 5.832 5.986 6.124 6.246 6.39 6.526 6.649 6.788 6.931 7.08 7.258 7.433 7.62 7.808 7.981 8.147 8.303 8.452 8.566 8.65 8.695 8.685 8.491 7.844 6.784 5.784 4.921 4.17 3.477 2.846 2.263 1.744 1.195 0.717 0.302 -0.069 -0.414 -0.749 -1.057 -1.385 -1.688 -1.953 -2.229 -2.52 -2.778 -3.076 -3.398 -3.616 -3.828 -4.053 -4.291 -4.579 -4.776 -4.951 -5.227 -5.425 -5.639 -5.752 -6.011 -6.328 -6.666 -6.843 -7.255 -7.32 -7.481 -7.677 -8.102 -8.341 -8.602 -8.861 -9.11 -9.425 -9.864 -11.829 -9 ,31940 ,KEBNE ,16652680,Mon Nov 22 00:07:10 CET,Mon Nov 22 01:55:12 CET,0.0 1.285 1.57 1.757 1.963 2.159 2.308 2.439 2.674 2.777 2.869 2.844 3.176 3.269 3.449 3.639 3.825 3.919 4.083 4.221 4.439 4.585 4.724 4.888 5.04 5.21 5.376 5.524 5.706 5.885 6.052 6.241 6.406 6.553 6.723 6.911 7.089 7.268 7.463 7.665 7.866 8.08 8.284 8.452 8.634 8.831 8.994 9.123 9.124 8.825 8.105 7.018 5.987 5.044 4.194 3.408 2.738 2.085 1.483 0.867 0.364 -0.062 -0.492 -0.918 -1.317 -1.676 -2.055 -2.387 -2.662 -2.953 -3.259 -3.521 -3.791 -4.061 -4.283 -4.514 -4.768 -5.034 -5.286 -5.475 -5.669 -5.955 -6.184 -6.429 -6.551 -6.805 -7.047 -7.292 -7.436 -7.854 -8.014 -8.226 -8.444 -8.93 -9.164 -9.375 -9.615 -9.933 -10.39 -11.032 -13.06 -10 ,7632 ,KEBNE ,16652681,Mon Nov 22 00:07:10 CET,Mon Nov 22 01:54:39 CET,0.0 3.002 3.303 3.547 3.772 3.953 4.124 4.279 4.507 4.61 4.714 4.69 5.002 5.092 5.28 5.446 5.628 5.718 5.888 6.045 6.246 6.36 6.462 6.612 6.753 6.883 7.014 7.132 7.263 7.39 7.536 7.71 7.853 7.981 8.127 8.304 8.49 8.7 8.873 9.023 9.198 9.389 9.56 9.684 9.803 9.905 9.978 9.983 9.896 9.562 8.794 7.692 6.707 5.835 5.012 4.247 3.577 2.962 2.411 1.824 1.304 0.859 0.467 0.1 -0.247 -0.58 -0.947 -1.261 -1.526 -1.798 -2.076 -2.315 -2.557 -2.8 -3.013 -3.239 -3.447 -3.653 -3.885 -4.047 -4.201 -4.473 -4.678 -4.872 -4.983 -5.228 -5.492 -5.766 -5.894 -6.262 -6.294 -6.451 -6.611 -6.938 -7.12 -7.325 -7.576 -7.883 -8.286 -8.876 -11.839 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 1f1e8f29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28552 ,KEBNE ,16652682,Mon Nov 22 00:07:10 CET,Mon Nov 22 01:55:17 CET,0.0 1.658 2.103 2.428 2.679 2.89 3.092 3.275 3.609 3.777 3.961 4.076 4.475 4.643 4.955 5.262 5.557 5.697 5.964 6.205 6.555 6.792 7.019 7.335 7.638 7.951 8.263 8.559 8.954 9.343 9.717 10.19 10.663 11.116 11.631 12.222 12.811 13.458 14.188 14.982 15.837 16.819 17.962 19.16 20.605 22.263 24.224 26.443 29.134 32.406 36.447 40.06 42.388 44.034 45.207 46.03 46.591 46.983 47.214 47.386 47.522 47.603 47.63 47.611 47.571 47.529 47.474 47.414 47.349 47.282 47.206 47.119 47.014 46.909 46.792 46.639 46.494 46.328 46.144 46.024 45.9 45.73 45.605 45.431 45.343 45.164 44.953 44.74 44.628 44.359 44.336 44.207 44.061 43.701 43.445 43.146 42.824 42.411 41.903 41.357 38.629 -2 ,11838 ,KEBNE ,16652683,Mon Nov 22 00:08:12 CET,Mon Nov 22 01:55:37 CET,0.0 1.313 1.715 2.047 2.325 2.594 2.843 3.028 3.371 3.537 3.707 3.793 4.157 4.295 4.597 4.89 5.15 5.27 5.504 5.734 6.062 6.277 6.502 6.849 7.18 7.498 7.82 8.133 8.543 8.944 9.329 9.777 10.206 10.65 11.176 11.765 12.338 12.994 13.719 14.482 15.307 16.27 17.413 18.561 19.958 21.596 23.487 25.688 28.361 31.698 36.111 39.899 42.127 43.587 44.593 45.289 45.812 46.189 46.425 46.623 46.735 46.779 46.769 46.706 46.635 46.58 46.52 46.455 46.376 46.27 46.165 46.096 45.994 45.848 45.736 45.624 45.514 45.406 45.275 45.151 44.987 44.75 44.606 44.442 44.342 44.12 43.867 43.583 43.459 43.173 43.031 42.859 42.677 42.267 42.053 41.797 41.488 41.065 40.531 39.914 37.655 -3 ,3471 ,KEBNE ,16652684,Mon Nov 22 00:08:12 CET,Mon Nov 22 01:57:06 CET,0.0 1.64 2.103 2.48 2.781 3.032 3.24 3.43 3.811 3.986 4.15 4.244 4.64 4.806 5.114 5.391 5.636 5.763 6.014 6.253 6.617 6.842 7.052 7.361 7.664 7.959 8.244 8.53 8.927 9.322 9.691 10.153 10.62 11.067 11.596 12.188 12.777 13.462 14.206 15.011 15.864 16.812 17.946 19.125 20.553 22.235 24.185 26.483 29.294 32.625 36.73 40.332 42.673 44.242 45.276 45.95 46.422 46.779 47.006 47.193 47.339 47.438 47.484 47.51 47.511 47.492 47.472 47.445 47.41 47.357 47.273 47.171 47.043 46.914 46.814 46.721 46.63 46.51 46.346 46.244 46.136 45.908 45.753 45.591 45.496 45.282 45.055 44.808 44.681 44.39 44.3 44.138 43.93 43.478 43.243 42.978 42.67 42.276 41.752 40.98 38.475 -4 ,22520 ,KEBNE ,16652685,Mon Nov 22 00:08:13 CET,Mon Nov 22 01:56:51 CET,0.0 0.981 1.387 1.704 1.963 2.203 2.41 2.589 2.97 3.152 3.315 3.394 3.773 3.907 4.16 4.417 4.663 4.787 5.037 5.279 5.62 5.838 6.045 6.332 6.605 6.888 7.193 7.481 7.832 8.19 8.567 9.041 9.495 9.94 10.458 11.024 11.565 12.183 12.869 13.631 14.458 15.409 16.544 17.695 19.094 20.711 22.68 25.059 27.892 31.274 35.79 39.779 42.202 43.724 44.684 45.403 45.909 46.244 46.477 46.702 46.829 46.86 46.881 46.878 46.83 46.774 46.691 46.6 46.513 46.434 46.353 46.245 46.121 45.999 45.867 45.718 45.571 45.418 45.262 45.134 45.01 44.803 44.648 44.494 44.412 44.215 43.96 43.701 43.579 43.27 43.104 42.92 42.756 42.394 42.165 41.883 41.544 41.148 40.58 39.782 36.673 -5 ,23214 ,KEBNE ,16652686,Mon Nov 22 00:08:13 CET,Mon Nov 22 01:55:55 CET,0.0 1.625 2.014 2.306 2.535 2.749 2.968 3.186 3.586 3.761 3.914 3.975 4.34 4.484 4.764 5.043 5.307 5.429 5.683 5.936 6.298 6.522 6.733 7.048 7.355 7.657 7.958 8.255 8.654 9.047 9.409 9.841 10.27 10.708 11.247 11.854 12.437 13.071 13.767 14.554 15.408 16.369 17.499 18.655 20.035 21.655 23.595 25.856 28.64 32.052 36.341 40.102 42.429 43.994 45.068 45.822 46.354 46.737 46.995 47.182 47.279 47.343 47.386 47.393 47.407 47.43 47.42 47.382 47.347 47.303 47.237 47.158 47.06 46.976 46.898 46.81 46.71 46.585 46.446 46.35 46.25 46.069 45.937 45.802 45.732 45.564 45.376 45.151 45.022 44.696 44.531 44.366 44.176 43.723 43.444 43.159 42.864 42.52 42.078 41.526 39.636 -6 ,27700 ,KEBNE ,16652687,Mon Nov 22 00:08:12 CET,Mon Nov 22 01:56:16 CET,0.0 1.468 1.842 2.18 2.485 2.739 2.965 3.181 3.556 3.727 3.907 4.007 4.381 4.528 4.81 5.081 5.344 5.466 5.703 5.949 6.309 6.543 6.768 7.093 7.408 7.722 8.032 8.333 8.722 9.104 9.479 9.927 10.368 10.811 11.331 11.917 12.494 13.149 13.875 14.658 15.485 16.458 17.657 18.913 20.358 21.955 23.949 26.303 29.091 32.448 36.641 40.262 42.598 44.162 45.13 45.782 46.228 46.553 46.787 46.968 47.06 47.123 47.166 47.159 47.133 47.102 47.069 47.02 46.966 46.903 46.811 46.715 46.588 46.442 46.321 46.171 46.007 45.855 45.713 45.599 45.465 45.25 45.084 44.913 44.826 44.639 44.434 44.222 44.114 43.822 43.706 43.564 43.433 43.078 42.849 42.59 42.285 41.941 41.553 40.951 38.455 -7 ,8540 ,KEBNE ,16652688,Mon Nov 22 00:08:12 CET,Mon Nov 22 01:55:57 CET,0.0 1.535 1.918 2.194 2.453 2.7 2.927 3.137 3.511 3.686 3.854 3.96 4.356 4.502 4.766 5.013 5.24 5.357 5.603 5.835 6.178 6.404 6.623 6.955 7.273 7.581 7.888 8.176 8.539 8.909 9.279 9.73 10.161 10.589 11.108 11.68 12.245 12.896 13.603 14.383 15.236 16.205 17.356 18.56 19.979 21.576 23.505 25.8 28.62 32.024 36.218 39.863 42.126 43.599 44.626 45.383 45.888 46.264 46.527 46.751 46.894 46.939 46.941 46.934 46.901 46.866 46.816 46.735 46.655 46.565 46.449 46.328 46.201 46.069 45.951 45.83 45.687 45.533 45.392 45.296 45.199 45.029 44.894 44.723 44.633 44.458 44.264 44.047 43.942 43.655 43.539 43.394 43.234 42.862 42.651 42.411 42.177 41.868 41.492 41.027 38.313 -8 ,15212 ,KEBNE ,16652689,Mon Nov 22 00:08:12 CET,Mon Nov 22 01:55:59 CET,0.0 1.388 1.811 2.132 2.407 2.659 2.889 3.114 3.564 3.764 3.939 4.016 4.392 4.53 4.782 5.032 5.278 5.396 5.63 5.861 6.19 6.409 6.636 6.948 7.247 7.555 7.851 8.148 8.551 8.932 9.295 9.744 10.195 10.634 11.135 11.709 12.269 12.891 13.589 14.35 15.174 16.129 17.28 18.488 19.963 21.67 23.691 26.076 28.931 32.307 36.571 40.395 42.787 44.358 45.458 46.224 46.723 47.112 47.375 47.512 47.586 47.637 47.653 47.668 47.683 47.669 47.636 47.614 47.587 47.531 47.457 47.391 47.315 47.215 47.135 47.038 46.917 46.775 46.616 46.508 46.393 46.207 46.049 45.863 45.771 45.602 45.43 45.234 45.117 44.812 44.709 44.585 44.452 44.112 43.933 43.736 43.527 43.266 42.955 42.525 39.939 -9 ,17243 ,KEBNE ,16652690,Mon Nov 22 00:08:12 CET,Mon Nov 22 01:55:25 CET,0.0 1.444 1.858 2.194 2.449 2.678 2.901 3.1 3.472 3.659 3.826 3.893 4.264 4.404 4.662 4.911 5.181 5.321 5.596 5.858 6.239 6.492 6.742 7.11 7.45 7.777 8.088 8.381 8.77 9.146 9.514 9.983 10.453 10.9 11.428 12.05 12.654 13.338 14.077 14.877 15.701 16.646 17.826 19.01 20.41 22.039 24.037 26.368 29.209 32.699 37.071 40.922 43.216 44.76 45.836 46.58 47.084 47.465 47.758 47.958 48.084 48.181 48.229 48.229 48.198 48.162 48.14 48.104 48.019 47.906 47.793 47.705 47.597 47.487 47.4 47.29 47.182 47.066 46.885 46.736 46.59 46.361 46.211 46.067 45.99 45.824 45.656 45.476 45.372 45.08 44.961 44.788 44.594 44.128 43.864 43.583 43.271 42.945 42.487 41.802 39.532 -10 ,25518 ,KEBNE ,16652691,Mon Nov 22 00:09:15 CET,Mon Nov 22 01:56:50 CET,0.0 0.786 1.137 1.435 1.681 1.91 2.119 2.316 2.66 2.819 2.975 3.052 3.443 3.599 3.901 4.187 4.448 4.578 4.853 5.127 5.514 5.753 5.993 6.367 6.725 7.073 7.425 7.747 8.14 8.53 8.91 9.375 9.814 10.246 10.779 11.379 11.963 12.632 13.362 14.157 15.018 16.017 17.23 18.46 19.909 21.571 23.55 25.878 28.711 32.169 36.545 40.395 42.826 44.434 45.464 46.185 46.748 47.175 47.476 47.706 47.849 47.958 48.027 48.042 48.046 48.042 47.981 47.896 47.826 47.761 47.671 47.572 47.462 47.323 47.189 47.066 46.951 46.823 46.683 46.578 46.471 46.295 46.164 46.028 45.934 45.687 45.445 45.17 45.027 44.74 44.64 44.484 44.321 43.926 43.684 43.442 43.191 42.863 42.424 41.876 39.443 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt deleted file mode 100644 index 3d066c78..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1434 ,KEBNE ,16652692,Mon Nov 22 00:09:15 CET,Mon Nov 22 01:58:02 CET,0.0 0.789 1.051 1.264 1.471 1.644 1.804 1.97 2.229 2.345 2.442 2.407 2.676 2.761 2.919 3.078 3.216 3.275 3.402 3.527 3.7 3.81 3.919 4.07 4.204 4.337 4.47 4.596 4.76 4.923 5.06 5.22 5.381 5.512 5.649 5.82 5.998 6.185 6.358 6.517 6.706 6.908 7.038 7.134 7.207 7.166 7.075 6.929 6.465 5.385 3.089 -0.126 -2.544 -4.485 -6.313 -8.006 -9.427 -10.682 -11.796 -12.928 -13.864 -14.663 -15.43 -16.146 -16.796 -17.38 -17.992 -18.548 -19.051 -19.58 -20.111 -20.516 -20.936 -21.372 -21.711 -22.074 -22.449 -22.873 -23.322 -23.623 -23.932 -24.416 -24.747 -25.085 -25.257 -25.599 -25.98 -26.398 -26.614 -27.06 -27.285 -27.538 -27.8 -28.385 -28.735 -29.092 -29.462 -29.859 -30.331 -30.991 -33.616 -3 ,20 ,KEBNE ,16652694,Mon Nov 22 00:09:15 CET,Mon Nov 22 01:57:27 CET,0.0 0.807 1.074 1.266 1.447 1.606 1.724 1.822 2.032 2.144 2.256 2.293 2.582 2.664 2.792 2.927 3.069 3.134 3.255 3.374 3.549 3.661 3.762 3.888 4.013 4.147 4.275 4.401 4.568 4.726 4.88 5.049 5.195 5.339 5.498 5.674 5.87 6.074 6.243 6.425 6.614 6.767 6.893 7.004 7.098 7.072 6.908 6.643 6.021 4.791 2.417 -0.872 -3.624 -5.847 -7.743 -9.414 -10.79 -12.01 -13.126 -14.289 -15.238 -16.088 -16.911 -17.66 -18.351 -18.969 -19.607 -20.174 -20.646 -21.113 -21.601 -22.035 -22.508 -23.007 -23.386 -23.773 -24.174 -24.601 -25.045 -25.35 -25.672 -26.164 -26.543 -26.941 -27.126 -27.453 -27.779 -28.13 -28.306 -28.706 -28.85 -29.067 -29.304 -29.785 -30.067 -30.364 -30.692 -31.067 -31.481 -32.042 -34.018 -5 ,901 ,KEBNE ,16652696,Mon Nov 22 00:09:17 CET,Mon Nov 22 01:53:46 CET,0.0 0.602 0.846 1.064 1.242 1.397 1.533 1.672 1.916 2.026 2.132 2.121 2.386 2.46 2.604 2.741 2.882 2.955 3.079 3.178 3.313 3.413 3.516 3.654 3.794 3.933 4.064 4.198 4.374 4.537 4.682 4.85 4.99 5.115 5.257 5.426 5.589 5.747 5.914 6.079 6.258 6.462 6.682 6.79 6.817 6.876 6.854 6.638 6.212 5.39 3.444 0.908 -1.199 -3.033 -4.61 -6.025 -7.282 -8.448 -9.434 -10.378 -11.16 -11.851 -12.527 -13.174 -13.758 -14.265 -14.798 -15.284 -15.712 -16.179 -16.657 -17.031 -17.414 -17.823 -18.142 -18.479 -18.837 -19.202 -19.612 -19.916 -20.216 -20.666 -20.989 -21.338 -21.521 -21.904 -22.298 -22.711 -22.91 -23.336 -23.574 -23.815 -24.052 -24.548 -24.888 -25.285 -25.681 -26.108 -26.612 -27.307 -29.744 -6 ,9588 ,KEBNE ,16652697,Mon Nov 22 00:09:17 CET,Mon Nov 22 01:55:27 CET,0.0 0.938 1.203 1.451 1.669 1.82 1.96 2.096 2.316 2.403 2.496 2.495 2.763 2.836 2.983 3.132 3.271 3.338 3.469 3.595 3.773 3.879 3.987 4.147 4.284 4.417 4.55 4.686 4.852 4.995 5.13 5.279 5.426 5.58 5.727 5.868 6.023 6.18 6.321 6.476 6.628 6.765 6.92 7.065 7.192 7.3 7.322 7.087 6.543 5.529 3.568 1.121 -0.953 -2.927 -4.636 -6.091 -7.388 -8.569 -9.574 -10.595 -11.411 -12.065 -12.726 -13.387 -13.978 -14.502 -15.069 -15.561 -15.969 -16.414 -16.869 -17.223 -17.587 -17.977 -18.269 -18.558 -18.876 -19.217 -19.585 -19.831 -20.082 -20.483 -20.761 -21.066 -21.234 -21.596 -21.961 -22.341 -22.54 -22.972 -23.197 -23.409 -23.637 -24.152 -24.459 -24.851 -25.29 -25.734 -26.275 -27.032 -29.198 -7 ,519 ,KEBNE ,16652698,Mon Nov 22 00:09:15 CET,Mon Nov 22 01:58:19 CET,0.0 0.832 1.122 1.335 1.498 1.644 1.817 1.976 2.211 2.318 2.417 2.416 2.714 2.815 2.974 3.108 3.232 3.294 3.424 3.554 3.748 3.866 3.968 4.113 4.252 4.375 4.492 4.626 4.791 4.933 5.088 5.284 5.468 5.633 5.799 5.944 6.07 6.204 6.331 6.466 6.597 6.713 6.827 6.952 7.084 7.16 7.125 6.959 6.578 5.74 3.923 1.052 -1.606 -3.902 -5.989 -7.89 -9.49 -10.911 -12.083 -13.231 -14.186 -15.024 -15.808 -16.478 -17.105 -17.705 -18.351 -18.957 -19.467 -19.952 -20.461 -20.886 -21.311 -21.764 -22.133 -22.532 -22.931 -23.326 -23.748 -24.049 -24.34 -24.761 -25.058 -25.381 -25.548 -25.858 -26.181 -26.568 -26.768 -27.187 -27.403 -27.625 -27.834 -28.263 -28.501 -28.748 -29.035 -29.418 -29.876 -30.45 -33.408 -9 ,25752 ,KEBNE ,16652700,Mon Nov 22 00:09:15 CET,Mon Nov 22 01:58:18 CET,0.0 0.831 1.125 1.339 1.53 1.719 1.902 2.036 2.268 2.388 2.499 2.501 2.769 2.847 2.994 3.148 3.294 3.358 3.487 3.619 3.796 3.911 4.021 4.176 4.325 4.481 4.64 4.782 4.947 5.081 5.211 5.388 5.561 5.7 5.858 6.05 6.213 6.384 6.558 6.713 6.871 7.079 7.296 7.425 7.508 7.596 7.587 7.368 6.877 5.863 4.019 1.502 -0.702 -2.528 -4.188 -5.675 -6.903 -8.003 -8.999 -10.036 -10.942 -11.72 -12.415 -13.082 -13.747 -14.374 -15.034 -15.617 -16.129 -16.666 -17.221 -17.7 -18.198 -18.685 -19.044 -19.427 -19.842 -20.268 -20.709 -21.001 -21.306 -21.823 -22.178 -22.519 -22.704 -23.106 -23.503 -23.917 -24.137 -24.581 -24.806 -25.093 -25.399 -25.926 -26.213 -26.566 -26.932 -27.311 -27.789 -28.466 -31.509 -10 ,4519 ,KEBNE ,16652701,Mon Nov 22 00:10:17 CET,Mon Nov 22 01:59:24 CET,0.0 0.797 1.101 1.342 1.574 1.744 1.882 2.015 2.252 2.356 2.452 2.438 2.708 2.787 2.952 3.127 3.287 3.349 3.466 3.596 3.774 3.886 3.998 4.16 4.32 4.461 4.585 4.713 4.873 5.014 5.145 5.302 5.458 5.611 5.779 5.952 6.106 6.262 6.432 6.627 6.798 6.943 7.094 7.211 7.311 7.424 7.485 7.353 6.933 5.816 3.326 0.528 -1.751 -3.833 -5.635 -7.249 -8.623 -9.823 -10.858 -11.881 -12.792 -13.639 -14.426 -15.16 -15.847 -16.474 -17.112 -17.668 -18.166 -18.686 -19.198 -19.637 -20.101 -20.564 -20.91 -21.259 -21.629 -22.017 -22.416 -22.689 -22.978 -23.409 -23.702 -24.031 -24.203 -24.537 -24.875 -25.239 -25.432 -25.848 -26.032 -26.259 -26.507 -27.053 -27.372 -27.693 -28.07 -28.535 -29.086 -29.842 -33.452 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index b698c9e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,25116 ,KEBNE ,16652704,Mon Nov 22 00:10:17 CET,Mon Nov 22 01:57:57 CET,0.0 0.52 0.733 0.928 1.101 1.249 1.397 1.52 1.751 1.861 1.962 1.973 2.254 2.347 2.526 2.676 2.814 2.886 3.03 3.169 3.364 3.491 3.622 3.818 3.994 4.162 4.335 4.512 4.732 4.941 5.149 5.391 5.618 5.847 6.123 6.436 6.723 7.022 7.359 7.703 8.053 8.484 8.964 9.413 9.966 10.548 11.211 11.91 12.479 12.902 13.105 12.893 12.425 11.831 11.255 10.734 10.268 9.829 9.401 8.926 8.535 8.203 7.869 7.532 7.232 6.97 6.668 6.394 6.167 5.914 5.644 5.413 5.168 4.918 4.728 4.535 4.341 4.132 3.906 3.75 3.586 3.337 3.161 2.978 2.882 2.691 2.493 2.266 2.135 1.828 1.719 1.593 1.441 1.021 0.764 0.498 0.195 -0.194 -0.619 -1.2 -3.388 -5 ,4264 ,KEBNE ,16652706,Mon Nov 22 00:11:19 CET,Mon Nov 22 01:59:11 CET,0.0 0.466 0.644 0.821 0.993 1.157 1.309 1.424 1.626 1.72 1.82 1.831 2.111 2.204 2.383 2.542 2.686 2.755 2.884 3.008 3.2 3.321 3.44 3.623 3.798 3.974 4.143 4.296 4.5 4.702 4.898 5.136 5.363 5.594 5.858 6.148 6.437 6.735 7.048 7.388 7.76 8.17 8.636 9.125 9.71 10.373 11.094 11.778 12.488 13.17 13.573 13.392 12.937 12.451 11.956 11.447 10.959 10.488 10.098 9.728 9.384 9.059 8.745 8.441 8.127 7.835 7.536 7.266 7.043 6.812 6.567 6.336 6.095 5.873 5.697 5.491 5.277 5.057 4.814 4.627 4.422 4.116 3.901 3.69 3.589 3.373 3.135 2.879 2.754 2.461 2.367 2.23 2.063 1.616 1.377 1.131 0.874 0.518 0.031 -0.59 -2.464 -9 ,21946 ,KEBNE ,16652710,Mon Nov 22 00:11:19 CET,Mon Nov 22 01:58:59 CET,0.0 0.647 0.856 1.045 1.213 1.345 1.464 1.587 1.823 1.932 2.041 2.051 2.329 2.413 2.576 2.736 2.885 2.958 3.095 3.233 3.447 3.587 3.716 3.891 4.066 4.244 4.412 4.566 4.767 4.961 5.154 5.394 5.616 5.826 6.078 6.356 6.612 6.899 7.217 7.519 7.839 8.233 8.676 9.132 9.683 10.303 10.958 11.564 12.304 13.155 13.6 13.401 13.022 12.613 12.153 11.666 11.214 10.731 10.249 9.757 9.336 8.979 8.63 8.297 7.993 7.718 7.44 7.178 6.949 6.708 6.447 6.223 5.992 5.756 5.555 5.327 5.074 4.819 4.582 4.436 4.279 3.994 3.785 3.582 3.482 3.246 2.985 2.725 2.583 2.254 2.092 1.919 1.719 1.293 1.059 0.785 0.512 0.229 -0.148 -0.713 -3.285 -10 ,32634 ,KEBNE ,16652711,Mon Nov 22 00:11:19 CET,Mon Nov 22 01:58:29 CET,0.0 0.603 0.824 0.988 1.146 1.289 1.408 1.519 1.736 1.838 1.94 1.954 2.232 2.316 2.484 2.647 2.812 2.892 3.038 3.179 3.388 3.517 3.637 3.811 3.981 4.141 4.295 4.454 4.652 4.839 5.046 5.305 5.537 5.755 6.005 6.288 6.552 6.843 7.163 7.498 7.847 8.252 8.733 9.18 9.682 10.272 10.905 11.5 12.092 12.686 13.004 12.761 12.325 11.8 11.257 10.694 10.197 9.727 9.291 8.845 8.444 8.085 7.748 7.412 7.04 6.711 6.377 6.057 5.781 5.488 5.161 4.886 4.61 4.296 4.051 3.829 3.599 3.371 3.15 2.996 2.833 2.549 2.332 2.112 2.001 1.778 1.527 1.23 1.081 0.761 0.611 0.454 0.301 -0.085 -0.321 -0.586 -0.876 -1.194 -1.599 -2.128 -4.192 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 269f1cab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21724 ,KEBNE ,16652712,Mon Nov 22 00:11:19 CET,Mon Nov 22 02:00:49 CET,0.0 0.402 0.583 0.746 0.875 0.977 1.075 1.163 1.316 1.389 1.461 1.432 1.662 1.719 1.836 1.952 2.046 2.089 2.174 2.254 2.369 2.443 2.519 2.618 2.708 2.79 2.865 2.95 3.068 3.171 3.268 3.391 3.503 3.614 3.739 3.88 4.026 4.191 4.354 4.514 4.681 4.849 5.036 5.227 5.428 5.628 5.838 6.019 6.168 6.253 6.121 5.705 5.238 4.767 4.341 3.918 3.477 3.033 2.666 2.32 2.026 1.77 1.517 1.267 1.032 0.799 0.529 0.308 0.129 -0.037 -0.214 -0.386 -0.57 -0.75 -0.89 -1.035 -1.171 -1.331 -1.517 -1.66 -1.819 -2.061 -2.217 -2.362 -2.436 -2.595 -2.78 -2.989 -3.091 -3.366 -3.402 -3.518 -3.65 -3.932 -4.1 -4.307 -4.506 -4.706 -4.947 -5.278 -6.395 -2 ,17052 ,KEBNE ,16652713,Mon Nov 22 00:11:19 CET,Mon Nov 22 01:59:06 CET,0.0 0.466 0.66 0.808 0.922 1.023 1.113 1.201 1.36 1.433 1.506 1.461 1.688 1.741 1.844 1.956 2.066 2.116 2.203 2.281 2.401 2.479 2.555 2.664 2.756 2.838 2.919 3.0 3.111 3.218 3.318 3.453 3.582 3.694 3.824 3.965 4.096 4.231 4.367 4.516 4.682 4.858 5.037 5.214 5.42 5.64 5.87 6.091 6.298 6.414 6.245 5.767 5.254 4.72 4.189 3.712 3.327 2.936 2.57 2.209 1.88 1.576 1.27 0.985 0.723 0.478 0.209 -0.026 -0.213 -0.407 -0.637 -0.84 -1.033 -1.232 -1.401 -1.589 -1.776 -1.953 -2.148 -2.306 -2.474 -2.712 -2.88 -3.081 -3.186 -3.404 -3.615 -3.817 -3.914 -4.182 -4.23 -4.358 -4.494 -4.798 -4.971 -5.168 -5.369 -5.596 -5.901 -6.385 -8.269 -3 ,18578 ,KEBNE ,16652714,Mon Nov 22 00:12:21 CET,Mon Nov 22 02:01:02 CET,0.0 0.533 0.72 0.877 0.997 1.098 1.192 1.28 1.451 1.531 1.598 1.55 1.781 1.836 1.942 2.039 2.133 2.179 2.276 2.372 2.499 2.588 2.674 2.778 2.874 2.971 3.075 3.174 3.297 3.417 3.53 3.648 3.753 3.865 4.005 4.157 4.294 4.434 4.584 4.743 4.919 5.115 5.319 5.499 5.696 5.908 6.106 6.291 6.461 6.535 6.323 5.786 5.258 4.711 4.16 3.626 3.135 2.718 2.369 2.026 1.743 1.468 1.201 0.949 0.699 0.467 0.222 0.006 -0.169 -0.353 -0.55 -0.703 -0.863 -1.029 -1.167 -1.327 -1.482 -1.646 -1.832 -1.956 -2.094 -2.329 -2.482 -2.651 -2.743 -2.903 -3.081 -3.289 -3.402 -3.677 -3.713 -3.844 -3.979 -4.283 -4.45 -4.618 -4.822 -5.037 -5.32 -5.759 -6.659 -6 ,29039 ,KEBNE ,16652717,Mon Nov 22 00:12:21 CET,Mon Nov 22 02:00:56 CET,0.0 0.665 0.905 1.052 1.161 1.263 1.364 1.456 1.602 1.667 1.73 1.675 1.905 1.968 2.076 2.177 2.283 2.333 2.428 2.513 2.623 2.696 2.769 2.874 2.972 3.057 3.145 3.233 3.339 3.452 3.562 3.681 3.794 3.899 4.014 4.148 4.283 4.432 4.573 4.72 4.895 5.076 5.263 5.464 5.708 5.943 6.155 6.341 6.503 6.61 6.526 6.127 5.618 5.129 4.661 4.183 3.764 3.346 2.94 2.538 2.176 1.84 1.533 1.241 0.956 0.703 0.443 0.212 0.013 -0.213 -0.46 -0.657 -0.87 -1.098 -1.261 -1.424 -1.6 -1.796 -2.015 -2.152 -2.283 -2.517 -2.694 -2.877 -2.969 -3.153 -3.326 -3.509 -3.626 -3.934 -4.038 -4.184 -4.32 -4.593 -4.758 -4.955 -5.194 -5.476 -5.82 -6.264 -8.007 -7 ,31231 ,KEBNE ,16652718,Mon Nov 22 00:12:25 CET,Mon Nov 22 01:59:03 CET,0.0 0.53 0.7 0.83 0.948 1.049 1.128 1.194 1.341 1.411 1.478 1.435 1.671 1.734 1.843 1.946 2.046 2.095 2.182 2.264 2.384 2.467 2.552 2.67 2.781 2.875 2.963 3.049 3.163 3.273 3.37 3.482 3.592 3.704 3.835 3.982 4.129 4.292 4.454 4.623 4.796 4.974 5.179 5.379 5.603 5.814 6.01 6.208 6.37 6.451 6.32 5.886 5.408 4.947 4.48 4.019 3.629 3.234 2.875 2.532 2.245 1.983 1.702 1.425 1.177 0.961 0.734 0.526 0.339 0.142 -0.067 -0.251 -0.442 -0.632 -0.774 -0.921 -1.076 -1.255 -1.454 -1.59 -1.734 -1.964 -2.115 -2.272 -2.351 -2.512 -2.701 -2.897 -2.997 -3.29 -3.372 -3.507 -3.657 -3.998 -4.198 -4.394 -4.602 -4.864 -5.188 -5.611 -6.692 -8 ,14208 ,KEBNE ,16652719,Mon Nov 22 00:12:25 CET,Mon Nov 22 01:57:51 CET,0.0 0.54 0.731 0.856 0.955 1.051 1.139 1.219 1.362 1.429 1.494 1.454 1.692 1.753 1.857 1.951 2.043 2.088 2.184 2.277 2.403 2.477 2.545 2.649 2.747 2.836 2.922 3.012 3.126 3.227 3.322 3.438 3.56 3.682 3.814 3.951 4.077 4.219 4.371 4.526 4.685 4.868 5.073 5.27 5.492 5.715 5.946 6.154 6.314 6.414 6.301 5.874 5.347 4.795 4.305 3.865 3.429 3.008 2.633 2.227 1.884 1.594 1.321 1.064 0.818 0.585 0.353 0.144 -0.047 -0.239 -0.445 -0.611 -0.78 -0.972 -1.127 -1.287 -1.45 -1.616 -1.784 -1.901 -2.028 -2.23 -2.375 -2.519 -2.594 -2.762 -2.935 -3.101 -3.196 -3.474 -3.501 -3.608 -3.743 -4.079 -4.261 -4.446 -4.635 -4.886 -5.225 -5.623 -6.665 -9 ,18190 ,KEBNE ,16652720,Mon Nov 22 00:12:21 CET,Mon Nov 22 02:01:26 CET,0.0 0.511 0.698 0.823 0.922 1.007 1.09 1.172 1.324 1.402 1.485 1.445 1.674 1.73 1.842 1.944 2.038 2.086 2.181 2.274 2.415 2.502 2.582 2.705 2.823 2.932 3.039 3.153 3.303 3.444 3.578 3.725 3.851 3.97 4.103 4.244 4.382 4.536 4.696 4.864 5.038 5.232 5.433 5.624 5.859 6.078 6.28 6.506 6.682 6.747 6.626 6.251 5.776 5.241 4.763 4.265 3.771 3.319 2.943 2.572 2.252 1.948 1.635 1.348 1.093 0.853 0.598 0.39 0.201 -0.019 -0.243 -0.428 -0.616 -0.798 -0.951 -1.12 -1.292 -1.474 -1.648 -1.765 -1.89 -2.112 -2.269 -2.42 -2.505 -2.682 -2.862 -3.045 -3.145 -3.434 -3.517 -3.665 -3.799 -4.078 -4.243 -4.434 -4.656 -4.906 -5.219 -5.618 -6.76 -10 ,24844 ,KEBNE ,16652721,Mon Nov 22 00:12:21 CET,Mon Nov 22 02:00:36 CET,0.0 0.639 0.813 0.944 1.07 1.201 1.319 1.405 1.541 1.611 1.693 1.685 1.936 2.0 2.1 2.195 2.287 2.334 2.425 2.514 2.634 2.705 2.773 2.873 2.969 3.066 3.163 3.254 3.37 3.483 3.598 3.723 3.838 3.951 4.087 4.235 4.377 4.526 4.66 4.814 4.985 5.162 5.373 5.57 5.772 5.989 6.234 6.454 6.571 6.621 6.521 6.035 5.507 5.027 4.534 4.053 3.62 3.218 2.859 2.471 2.128 1.828 1.536 1.252 0.993 0.768 0.541 0.332 0.127 -0.082 -0.276 -0.436 -0.612 -0.808 -0.968 -1.145 -1.354 -1.566 -1.792 -1.934 -2.053 -2.25 -2.404 -2.572 -2.652 -2.813 -2.993 -3.17 -3.26 -3.54 -3.616 -3.736 -3.858 -4.129 -4.283 -4.451 -4.667 -4.953 -5.279 -5.655 -6.672 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt deleted file mode 100644 index 64930057..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8195 ,KEBNE ,16652722,Mon Nov 22 00:12:21 CET,Mon Nov 22 02:01:12 CET,0.0 2.433 3.035 3.445 3.783 4.066 4.303 4.509 4.842 4.997 5.148 5.235 5.533 5.658 5.908 6.126 6.324 6.414 6.584 6.754 6.984 7.118 7.249 7.452 7.65 7.836 8.013 8.186 8.41 8.621 8.816 9.046 9.263 9.474 9.718 9.971 10.213 10.483 10.776 11.097 11.424 11.776 12.148 12.5 12.889 13.301 13.745 14.218 14.701 15.091 15.281 15.143 14.865 14.489 14.057 13.577 13.129 12.752 12.424 12.108 11.859 11.627 11.392 11.158 10.936 10.734 10.521 10.331 10.165 9.982 9.77 9.587 9.406 9.202 9.029 8.856 8.701 8.548 8.368 8.256 8.149 7.958 7.812 7.647 7.551 7.347 7.155 6.965 6.858 6.574 6.537 6.446 6.327 6.023 5.87 5.708 5.516 5.295 5.001 4.548 2.053 -2 ,4035 ,KEBNE ,16652723,Mon Nov 22 00:12:21 CET,Mon Nov 22 02:02:36 CET,0.0 2.375 3.196 3.755 4.2 4.566 4.84 5.071 5.504 5.708 5.896 6.052 6.37 6.512 6.789 7.055 7.293 7.409 7.611 7.767 7.974 8.124 8.304 8.568 8.809 9.039 9.25 9.439 9.673 9.888 10.086 10.323 10.564 10.813 11.09 11.394 11.682 11.981 12.286 12.625 12.974 13.292 13.631 13.964 14.338 14.745 15.146 15.531 15.937 16.27 16.419 16.217 15.858 15.451 15.037 14.614 14.235 13.881 13.564 13.251 12.961 12.701 12.456 12.213 11.984 11.778 11.56 11.366 11.196 11.017 10.837 10.688 10.533 10.36 10.209 10.053 9.894 9.714 9.535 9.422 9.295 9.055 8.89 8.747 8.674 8.522 8.368 8.19 8.095 7.824 7.77 7.657 7.523 7.214 7.063 6.854 6.596 6.318 5.972 5.51 2.73 -3 ,10361 ,KEBNE ,16652724,Mon Nov 22 00:12:21 CET,Mon Nov 22 02:00:42 CET,0.0 2.575 3.251 3.689 3.995 4.232 4.449 4.673 5.101 5.286 5.449 5.564 5.874 5.988 6.21 6.43 6.63 6.724 6.895 7.05 7.278 7.427 7.566 7.762 7.95 8.124 8.289 8.449 8.651 8.85 9.05 9.28 9.499 9.706 9.927 10.187 10.458 10.729 11.001 11.283 11.561 11.904 12.321 12.7 13.112 13.545 14.013 14.546 15.118 15.625 15.956 15.819 15.488 15.114 14.721 14.36 14.047 13.724 13.429 13.135 12.855 12.592 12.328 12.076 11.856 11.649 11.4 11.178 11.007 10.824 10.622 10.468 10.315 10.144 10.005 9.861 9.711 9.559 9.396 9.279 9.155 8.962 8.827 8.68 8.607 8.446 8.279 8.118 8.035 7.766 7.739 7.631 7.509 7.261 7.12 6.933 6.719 6.471 6.172 5.798 1.289 -4 ,996 ,KEBNE ,16652725,Mon Nov 22 00:12:21 CET,Mon Nov 22 02:01:18 CET,0.0 1.732 2.301 2.675 3.049 3.457 3.757 3.986 4.377 4.527 4.68 4.786 5.081 5.19 5.401 5.607 5.791 5.875 6.033 6.192 6.422 6.558 6.686 6.875 7.072 7.263 7.431 7.588 7.796 7.995 8.182 8.396 8.599 8.799 9.026 9.272 9.497 9.735 9.999 10.294 10.597 10.913 11.269 11.62 12.011 12.451 12.95 13.46 13.964 14.468 14.783 14.564 14.179 13.743 13.315 12.956 12.635 12.31 12.024 11.742 11.478 11.22 10.957 10.695 10.457 10.239 10.001 9.79 9.612 9.415 9.21 9.053 8.899 8.732 8.599 8.464 8.327 8.18 8.023 7.912 7.79 7.597 7.461 7.321 7.249 7.083 6.899 6.711 6.614 6.342 6.307 6.198 6.079 5.805 5.648 5.467 5.259 5.002 4.692 4.25 1.555 -6 ,6418 ,KEBNE ,16652727,Mon Nov 22 00:12:21 CET,Mon Nov 22 02:01:24 CET,0.0 2.722 3.537 4.067 4.437 4.747 5.013 5.246 5.641 5.81 5.969 6.083 6.387 6.513 6.762 6.988 7.211 7.323 7.523 7.707 7.965 8.124 8.273 8.471 8.651 8.818 8.963 9.116 9.329 9.548 9.779 10.027 10.247 10.46 10.704 10.944 11.139 11.345 11.552 11.779 12.017 12.317 12.687 13.046 13.444 13.762 14.028 14.346 14.717 15.035 15.192 15.032 14.605 14.146 13.752 13.381 13.02 12.674 12.362 12.023 11.735 11.465 11.204 10.975 10.766 10.57 10.358 10.168 10.008 9.847 9.679 9.527 9.359 9.187 9.052 8.914 8.769 8.609 8.441 8.326 8.214 8.036 7.905 7.762 7.685 7.538 7.387 7.221 7.128 6.854 6.842 6.738 6.632 6.395 6.246 6.097 5.936 5.727 5.457 5.102 0.421 -7 ,4968 ,KEBNE ,16652728,Mon Nov 22 00:12:21 CET,Mon Nov 22 02:01:02 CET,0.0 4.367 5.04 5.438 5.75 6.021 6.269 6.489 6.877 7.047 7.197 7.301 7.592 7.704 7.914 8.118 8.332 8.434 8.634 8.813 9.045 9.192 9.326 9.513 9.701 9.882 10.041 10.19 10.383 10.58 10.75 10.933 11.108 11.274 11.459 11.655 11.839 12.046 12.249 12.454 12.677 12.918 13.193 13.424 13.667 13.95 14.259 14.544 14.809 15.001 14.99 14.688 14.272 13.849 13.42 13.004 12.628 12.27 11.961 11.653 11.36 11.077 10.825 10.598 10.376 10.164 9.959 9.783 9.61 9.411 9.193 9.014 8.826 8.633 8.483 8.33 8.187 8.047 7.906 7.811 7.704 7.532 7.415 7.293 7.228 7.086 6.927 6.766 6.688 6.423 6.371 6.247 6.133 5.902 5.768 5.622 5.456 5.263 5.036 4.678 2.977 -9 ,4220 ,KEBNE ,16652730,Mon Nov 22 00:12:21 CET,Mon Nov 22 02:01:06 CET,0.0 3.323 4.146 4.628 4.97 5.248 5.499 5.742 6.227 6.453 6.65 6.783 7.077 7.185 7.408 7.625 7.834 7.931 8.125 8.314 8.556 8.706 8.849 9.056 9.251 9.432 9.615 9.783 9.986 10.175 10.35 10.565 10.778 10.998 11.247 11.502 11.757 12.037 12.332 12.628 12.929 13.263 13.615 13.953 14.317 14.716 15.176 15.655 16.139 16.587 16.97 17.013 16.769 16.473 16.169 15.868 15.533 15.2 14.902 14.579 14.293 14.035 13.776 13.522 13.297 13.094 12.879 12.698 12.536 12.335 12.123 11.959 11.787 11.602 11.459 11.313 11.155 10.982 10.809 10.688 10.563 10.367 10.227 10.081 10.006 9.835 9.642 9.445 9.346 9.072 9.035 8.911 8.783 8.513 8.349 8.169 7.973 7.731 7.395 6.816 4.3 -10 ,2945 ,KEBNE ,16652731,Mon Nov 22 00:13:22 CET,Mon Nov 22 02:02:27 CET,0.0 3.451 4.381 4.925 5.331 5.726 6.074 6.345 6.811 7.018 7.218 7.41 7.732 7.874 8.14 8.388 8.618 8.726 8.933 9.122 9.389 9.551 9.696 9.904 10.107 10.299 10.49 10.676 10.913 11.13 11.333 11.61 11.868 12.096 12.364 12.655 12.932 13.226 13.523 13.832 14.143 14.47 14.863 15.242 15.665 16.142 16.63 17.111 17.633 18.123 18.438 18.37 18.119 17.784 17.408 17.032 16.665 16.319 16.014 15.713 15.43 15.147 14.892 14.651 14.418 14.207 13.971 13.751 13.562 13.366 13.154 12.976 12.795 12.6 12.447 12.297 12.138 11.966 11.797 11.678 11.546 11.354 11.226 11.102 11.041 10.9 10.73 10.545 10.456 10.196 10.171 10.054 9.925 9.676 9.53 9.36 9.187 8.979 8.674 8.286 5.88 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt deleted file mode 100644 index e730242c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22162 ,KEBNE ,16652732,Mon Nov 22 00:13:22 CET,Mon Nov 22 02:01:29 CET,0.0 2.842 3.411 3.846 4.134 4.383 4.608 4.795 5.11 5.243 5.371 5.432 5.71 5.808 6.017 6.189 6.353 6.436 6.562 6.681 6.874 6.993 7.096 7.223 7.331 7.438 7.537 7.606 7.688 7.78 7.864 7.942 8.003 8.054 8.102 8.128 8.141 8.171 8.179 8.15 8.065 7.935 7.736 7.466 7.086 6.502 5.697 4.629 3.039 0.665 -3.081 -7.36 -10.925 -13.884 -16.253 -18.216 -19.831 -21.251 -22.455 -23.686 -24.717 -25.611 -26.46 -27.21 -27.86 -28.469 -29.105 -29.648 -30.136 -30.644 -31.157 -31.577 -32.003 -32.437 -32.77 -33.126 -33.495 -33.854 -34.226 -34.495 -34.771 -35.193 -35.478 -35.77 -35.926 -36.253 -36.578 -36.926 -37.115 -37.53 -37.671 -37.877 -38.094 -38.576 -38.866 -39.159 -39.443 -39.75 -40.125 -40.713 -42.794 -2 ,22719 ,KEBNE ,16652733,Mon Nov 22 00:13:22 CET,Mon Nov 22 02:01:38 CET,0.0 3.062 3.606 3.985 4.338 4.644 4.872 5.067 5.416 5.559 5.684 5.784 6.083 6.193 6.407 6.624 6.831 6.926 7.088 7.232 7.432 7.554 7.674 7.839 7.979 8.09 8.183 8.275 8.38 8.456 8.519 8.584 8.621 8.65 8.703 8.738 8.753 8.773 8.753 8.725 8.674 8.552 8.389 8.168 7.798 7.267 6.531 5.555 4.113 1.941 -1.713 -6.028 -9.364 -12.082 -14.347 -16.259 -17.846 -19.263 -20.47 -21.649 -22.636 -23.501 -24.317 -25.063 -25.736 -26.337 -26.98 -27.538 -27.981 -28.437 -28.913 -29.3 -29.721 -30.174 -30.521 -30.87 -31.216 -31.578 -31.929 -32.164 -32.418 -32.81 -33.09 -33.383 -33.532 -33.83 -34.143 -34.493 -34.681 -35.089 -35.267 -35.476 -35.698 -36.188 -36.437 -36.713 -37.036 -37.392 -37.804 -38.343 -40.546 -3 ,11707 ,KEBNE ,16652734,Mon Nov 22 00:13:22 CET,Mon Nov 22 02:00:53 CET,0.0 2.268 2.721 3.029 3.302 3.548 3.756 3.961 4.357 4.518 4.658 4.717 5.003 5.119 5.322 5.531 5.751 5.839 5.972 6.091 6.257 6.355 6.46 6.608 6.718 6.814 6.91 6.999 7.104 7.21 7.301 7.401 7.502 7.607 7.695 7.76 7.832 7.901 7.955 7.936 7.816 7.623 7.387 7.124 6.742 6.218 5.447 4.395 2.965 0.759 -2.984 -7.357 -10.739 -13.419 -15.611 -17.505 -19.115 -20.538 -21.715 -22.841 -23.786 -24.624 -25.428 -26.179 -26.884 -27.513 -28.163 -28.742 -29.234 -29.746 -30.257 -30.676 -31.119 -31.571 -31.916 -32.281 -32.667 -33.049 -33.429 -33.696 -33.97 -34.383 -34.676 -34.972 -35.119 -35.422 -35.734 -36.081 -36.26 -36.674 -36.861 -37.082 -37.312 -37.821 -38.091 -38.388 -38.703 -39.019 -39.447 -40.049 -43.355 -4 ,16497 ,KEBNE ,16652735,Mon Nov 22 00:13:22 CET,Mon Nov 22 02:01:19 CET,0.0 2.179 2.752 3.183 3.536 3.812 4.04 4.233 4.572 4.713 4.84 4.892 5.172 5.282 5.483 5.682 5.867 5.94 6.045 6.169 6.354 6.442 6.523 6.639 6.734 6.816 6.908 6.999 7.105 7.215 7.316 7.418 7.494 7.543 7.602 7.647 7.667 7.683 7.664 7.608 7.518 7.377 7.2 6.98 6.616 6.123 5.374 4.308 2.8 0.626 -2.983 -7.27 -10.667 -13.448 -15.714 -17.676 -19.323 -20.75 -21.952 -23.103 -24.065 -24.917 -25.725 -26.472 -27.142 -27.742 -28.344 -28.864 -29.324 -29.814 -30.32 -30.721 -31.133 -31.564 -31.892 -32.233 -32.578 -32.929 -33.3 -33.555 -33.81 -34.209 -34.481 -34.767 -34.925 -35.23 -35.542 -35.881 -36.061 -36.48 -36.65 -36.87 -37.085 -37.531 -37.778 -38.05 -38.362 -38.716 -39.124 -39.774 -44.415 -5 ,1792 ,KEBNE ,16652736,Mon Nov 22 00:13:26 CET,Mon Nov 22 01:59:31 CET,0.0 2.682 3.315 3.77 4.161 4.501 4.775 4.973 5.296 5.447 5.587 5.637 5.923 6.025 6.193 6.358 6.532 6.612 6.748 6.882 7.05 7.148 7.251 7.42 7.601 7.74 7.835 7.916 8.017 8.118 8.211 8.297 8.358 8.415 8.483 8.551 8.59 8.603 8.595 8.579 8.531 8.406 8.156 7.833 7.385 6.819 6.068 5.057 3.638 1.437 -2.322 -6.626 -9.954 -12.69 -14.964 -16.879 -18.477 -19.889 -21.048 -22.18 -23.142 -23.989 -24.784 -25.527 -26.246 -26.89 -27.535 -28.109 -28.634 -29.199 -29.777 -30.239 -30.697 -31.159 -31.507 -31.857 -32.207 -32.576 -32.977 -33.248 -33.532 -33.971 -34.272 -34.595 -34.763 -35.1 -35.446 -35.829 -36.031 -36.454 -36.61 -36.812 -37.035 -37.535 -37.81 -38.1 -38.411 -38.773 -39.236 -39.853 -41.747 -7 ,17291 ,KEBNE ,16652738,Mon Nov 22 00:13:22 CET,Mon Nov 22 02:00:38 CET,0.0 2.035 2.581 2.984 3.318 3.59 3.793 3.96 4.242 4.372 4.497 4.563 4.838 4.926 5.084 5.221 5.364 5.429 5.535 5.644 5.792 5.89 5.982 6.104 6.209 6.295 6.382 6.469 6.592 6.711 6.797 6.861 6.9 6.937 6.981 7.019 7.032 7.018 6.97 6.89 6.791 6.627 6.385 6.098 5.711 5.204 4.475 3.469 1.912 -0.514 -4.294 -8.493 -11.806 -14.464 -16.661 -18.567 -20.186 -21.634 -22.838 -24.023 -25.048 -25.937 -26.763 -27.546 -28.248 -28.85 -29.462 -30.002 -30.487 -30.978 -31.457 -31.86 -32.264 -32.689 -33.026 -33.367 -33.728 -34.114 -34.507 -34.776 -35.068 -35.515 -35.816 -36.123 -36.278 -36.6 -36.952 -37.326 -37.511 -37.927 -38.105 -38.317 -38.532 -39.043 -39.336 -39.64 -39.936 -40.256 -40.669 -41.2 -42.753 -9 ,12067 ,KEBNE ,16652740,Mon Nov 22 00:14:25 CET,Mon Nov 22 02:02:28 CET,0.0 2.255 2.786 3.14 3.421 3.661 3.856 4.024 4.355 4.493 4.62 4.71 5.003 5.108 5.302 5.468 5.624 5.7 5.848 5.968 6.126 6.226 6.327 6.489 6.63 6.741 6.821 6.895 6.987 7.074 7.176 7.277 7.341 7.394 7.445 7.475 7.476 7.471 7.431 7.347 7.257 7.124 6.933 6.71 6.354 5.799 5.026 3.989 2.512 0.334 -3.308 -7.591 -10.986 -13.701 -15.906 -17.794 -19.374 -20.77 -21.976 -23.152 -24.148 -25.026 -25.832 -26.571 -27.252 -27.895 -28.577 -29.159 -29.645 -30.131 -30.632 -31.054 -31.473 -31.914 -32.278 -32.66 -33.037 -33.413 -33.795 -34.053 -34.33 -34.766 -35.049 -35.351 -35.506 -35.822 -36.163 -36.536 -36.729 -37.146 -37.33 -37.546 -37.752 -38.221 -38.483 -38.739 -39.054 -39.441 -39.915 -40.538 -42.53 -10 ,31389 ,KEBNE ,16652741,Mon Nov 22 00:14:25 CET,Mon Nov 22 02:01:57 CET,0.0 2.34 2.865 3.207 3.554 3.841 4.055 4.272 4.674 4.833 4.967 5.028 5.294 5.387 5.577 5.731 5.872 5.938 6.05 6.153 6.323 6.428 6.535 6.688 6.819 6.937 7.03 7.112 7.218 7.3 7.363 7.44 7.495 7.536 7.592 7.643 7.665 7.669 7.652 7.594 7.519 7.408 7.217 6.953 6.604 6.156 5.449 4.436 2.929 0.612 -3.134 -7.436 -10.843 -13.578 -15.805 -17.734 -19.379 -20.803 -22.003 -23.166 -24.14 -25.025 -25.887 -26.678 -27.383 -28.03 -28.687 -29.261 -29.756 -30.265 -30.803 -31.236 -31.669 -32.122 -32.46 -32.792 -33.139 -33.498 -33.874 -34.145 -34.422 -34.84 -35.131 -35.425 -35.582 -35.914 -36.242 -36.586 -36.774 -37.198 -37.366 -37.562 -37.764 -38.185 -38.399 -38.63 -38.912 -39.269 -39.683 -40.228 -41.894 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index ff97605a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2992 ,KEBNE ,16652742,Mon Nov 22 00:14:25 CET,Mon Nov 22 02:01:27 CET,0.0 0.418 0.688 0.96 1.208 1.393 1.526 1.654 1.884 1.98 2.073 2.089 2.354 2.44 2.589 2.724 2.858 2.92 3.042 3.165 3.344 3.456 3.566 3.72 3.863 4.007 4.152 4.286 4.457 4.618 4.767 4.957 5.147 5.317 5.514 5.752 5.981 6.234 6.498 6.777 7.081 7.407 7.767 8.117 8.512 8.94 9.418 9.921 10.395 10.79 11.002 10.787 10.383 9.964 9.526 9.083 8.668 8.268 7.924 7.556 7.206 6.879 6.558 6.26 5.985 5.74 5.492 5.266 5.085 4.889 4.663 4.477 4.278 4.065 3.908 3.744 3.561 3.349 3.129 2.984 2.84 2.592 2.404 2.213 2.123 1.949 1.747 1.528 1.401 1.108 1.041 0.898 0.735 0.406 0.211 -0.014 -0.257 -0.549 -0.918 -1.445 -4.233 -2 ,24604 ,KEBNE ,16652743,Mon Nov 22 00:14:24 CET,Mon Nov 22 02:03:03 CET,0.0 0.631 0.908 1.12 1.282 1.419 1.543 1.665 1.905 2.013 2.113 2.111 2.373 2.468 2.665 2.854 3.013 3.081 3.212 3.336 3.504 3.599 3.7 3.858 4.012 4.159 4.299 4.441 4.621 4.779 4.926 5.111 5.301 5.485 5.697 5.936 6.162 6.404 6.66 6.93 7.208 7.521 7.874 8.198 8.553 8.95 9.435 9.934 10.414 10.83 11.061 10.925 10.614 10.267 9.894 9.513 9.141 8.78 8.459 8.134 7.813 7.481 7.186 6.924 6.673 6.44 6.189 5.955 5.758 5.549 5.325 5.126 4.906 4.688 4.509 4.315 4.119 3.93 3.734 3.589 3.449 3.234 3.077 2.912 2.831 2.666 2.474 2.25 2.125 1.819 1.662 1.5 1.359 1.039 0.858 0.651 0.4 0.11 -0.286 -0.789 -2.286 -3 ,23484 ,KEBNE ,16652744,Mon Nov 22 00:14:28 CET,Mon Nov 22 02:00:03 CET,0.0 0.805 1.084 1.295 1.483 1.632 1.777 1.907 2.102 2.194 2.284 2.3 2.571 2.656 2.811 2.949 3.099 3.182 3.337 3.476 3.654 3.76 3.858 4.006 4.143 4.268 4.4 4.533 4.708 4.876 5.035 5.235 5.424 5.597 5.808 6.05 6.277 6.534 6.809 7.07 7.336 7.646 8.015 8.399 8.801 9.183 9.569 9.964 10.423 10.873 11.09 10.979 10.693 10.315 9.929 9.53 9.16 8.804 8.475 8.15 7.855 7.565 7.291 7.024 6.757 6.491 6.205 5.956 5.753 5.553 5.345 5.174 4.985 4.773 4.604 4.436 4.26 4.073 3.862 3.693 3.502 3.228 3.071 2.893 2.805 2.636 2.438 2.247 2.15 1.869 1.769 1.606 1.455 1.125 0.943 0.702 0.402 0.076 -0.348 -0.918 -5.632 -4 ,190 ,KEBNE ,16652745,Mon Nov 22 00:14:29 CET,Mon Nov 22 01:59:20 CET,0.0 0.63 0.94 1.197 1.374 1.518 1.669 1.805 2.023 2.129 2.226 2.239 2.503 2.587 2.747 2.892 3.028 3.092 3.22 3.347 3.523 3.631 3.74 3.896 4.037 4.167 4.297 4.424 4.585 4.747 4.907 5.094 5.271 5.438 5.63 5.86 6.083 6.311 6.558 6.839 7.131 7.435 7.758 8.084 8.488 8.924 9.372 9.831 10.296 10.715 10.992 10.891 10.584 10.206 9.795 9.37 8.931 8.507 8.169 7.823 7.488 7.179 6.882 6.616 6.379 6.138 5.846 5.575 5.348 5.112 4.865 4.651 4.442 4.234 4.064 3.887 3.691 3.484 3.272 3.123 2.963 2.69 2.525 2.372 2.282 2.077 1.852 1.621 1.5 1.204 1.116 0.971 0.802 0.402 0.181 -0.052 -0.288 -0.574 -0.941 -1.5 -3.683 -5 ,21228 ,KEBNE ,16652746,Mon Nov 22 00:14:27 CET,Mon Nov 22 01:59:39 CET,0.0 0.494 0.697 0.863 1.025 1.179 1.315 1.443 1.678 1.779 1.869 1.868 2.139 2.22 2.366 2.506 2.648 2.711 2.83 2.958 3.139 3.252 3.359 3.494 3.628 3.761 3.895 4.035 4.208 4.373 4.531 4.716 4.894 5.067 5.271 5.481 5.678 5.903 6.144 6.413 6.701 6.997 7.335 7.7 8.118 8.55 9.027 9.536 9.961 10.365 10.706 10.53 10.109 9.625 9.169 8.764 8.375 7.967 7.614 7.236 6.887 6.579 6.273 5.961 5.675 5.413 5.124 4.878 4.681 4.463 4.224 4.034 3.825 3.605 3.433 3.245 3.053 2.837 2.602 2.447 2.3 2.07 1.904 1.717 1.622 1.425 1.209 0.998 0.889 0.606 0.482 0.308 0.135 -0.263 -0.463 -0.658 -0.904 -1.202 -1.586 -2.231 -5.464 -6 ,2076 ,KEBNE ,16652747,Mon Nov 22 00:15:27 CET,Mon Nov 22 02:02:47 CET,0.0 0.918 1.202 1.385 1.56 1.741 1.88 1.995 2.222 2.323 2.418 2.423 2.678 2.753 2.911 3.067 3.216 3.285 3.415 3.542 3.725 3.843 3.952 4.127 4.29 4.428 4.559 4.684 4.85 5.015 5.17 5.356 5.531 5.703 5.906 6.121 6.318 6.539 6.787 7.054 7.347 7.676 8.041 8.415 8.835 9.261 9.751 10.245 10.687 11.146 11.479 11.406 11.071 10.672 10.292 9.914 9.556 9.165 8.798 8.417 8.063 7.75 7.474 7.21 6.955 6.722 6.471 6.228 5.981 5.719 5.473 5.246 5.003 4.758 4.568 4.379 4.195 3.991 3.77 3.627 3.482 3.262 3.113 2.942 2.852 2.67 2.479 2.276 2.157 1.868 1.75 1.591 1.447 1.097 0.873 0.637 0.377 0.065 -0.336 -0.893 -4.606 -7 ,27634 ,KEBNE ,16652748,Mon Nov 22 00:15:28 CET,Mon Nov 22 02:02:48 CET,0.0 0.75 0.995 1.212 1.384 1.537 1.7 1.845 2.046 2.142 2.241 2.254 2.515 2.598 2.764 2.902 3.033 3.101 3.239 3.367 3.543 3.654 3.765 3.931 4.075 4.206 4.331 4.459 4.634 4.803 4.968 5.162 5.328 5.499 5.712 5.94 6.159 6.416 6.688 6.958 7.238 7.575 7.949 8.278 8.643 9.059 9.536 9.992 10.454 10.876 11.126 11.002 10.676 10.269 9.862 9.473 9.094 8.699 8.317 7.928 7.581 7.27 6.978 6.689 6.418 6.172 5.907 5.642 5.41 5.206 4.998 4.82 4.627 4.413 4.248 4.065 3.872 3.679 3.472 3.315 3.16 2.926 2.734 2.531 2.439 2.247 2.035 1.808 1.683 1.371 1.217 1.034 0.823 0.371 0.125 -0.137 -0.413 -0.752 -1.192 -1.88 -5.085 -8 ,29794 ,KEBNE ,16652749,Mon Nov 22 00:15:27 CET,Mon Nov 22 02:02:41 CET,0.0 0.74 1.022 1.205 1.34 1.475 1.603 1.723 1.941 2.035 2.13 2.127 2.382 2.463 2.609 2.733 2.859 2.92 3.038 3.153 3.321 3.42 3.512 3.645 3.774 3.905 4.038 4.182 4.363 4.525 4.686 4.882 5.073 5.251 5.46 5.697 5.914 6.154 6.414 6.685 6.958 7.258 7.621 7.978 8.357 8.777 9.227 9.674 10.174 10.719 11.058 10.953 10.693 10.293 9.868 9.466 9.058 8.664 8.334 7.988 7.681 7.38 7.085 6.818 6.565 6.311 6.02 5.762 5.558 5.357 5.144 4.964 4.771 4.556 4.381 4.203 4.015 3.814 3.61 3.467 3.321 3.087 2.923 2.742 2.643 2.443 2.2 1.925 1.789 1.49 1.387 1.217 1.027 0.59 0.361 0.149 -0.067 -0.33 -0.686 -1.17 -4.473 -10 ,9379 ,KEBNE ,16652751,Mon Nov 22 00:16:30 CET,Mon Nov 22 02:05:00 CET,0.0 0.546 0.774 0.928 1.066 1.216 1.351 1.456 1.65 1.753 1.86 1.905 2.178 2.258 2.413 2.567 2.719 2.788 2.909 3.031 3.21 3.316 3.416 3.573 3.723 3.855 3.989 4.118 4.284 4.437 4.595 4.797 4.965 5.133 5.346 5.578 5.798 6.034 6.272 6.52 6.788 7.095 7.443 7.764 8.135 8.549 9.01 9.468 9.944 10.425 10.734 10.679 10.451 10.051 9.607 9.191 8.802 8.418 8.073 7.734 7.412 7.124 6.865 6.618 6.369 6.133 5.892 5.671 5.475 5.257 5.032 4.853 4.655 4.43 4.242 4.043 3.825 3.596 3.359 3.19 3.033 2.814 2.641 2.422 2.299 2.073 1.848 1.595 1.451 1.14 1.037 0.877 0.709 0.34 0.097 -0.206 -0.528 -0.923 -1.416 -1.976 -4.21 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt deleted file mode 100644 index 054ce67b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21068 ,KEBNE ,16652752,Mon Nov 22 00:17:32 CET,Mon Nov 22 02:06:40 CET,0.0 1.368 1.793 2.057 2.271 2.483 2.653 2.787 3.015 3.105 3.192 3.186 3.442 3.526 3.682 3.808 3.92 3.981 4.095 4.188 4.315 4.381 4.441 4.522 4.587 4.654 4.721 4.784 4.863 4.922 4.967 5.024 5.072 5.109 5.139 5.156 5.142 5.121 5.086 4.981 4.83 4.646 4.403 4.122 3.724 3.144 2.356 1.268 -0.288 -2.552 -6.269 -10.522 -13.85 -16.54 -18.806 -20.714 -22.295 -23.724 -24.912 -26.072 -27.046 -27.896 -28.679 -29.379 -30.024 -30.607 -31.219 -31.775 -32.237 -32.695 -33.173 -33.562 -33.948 -34.365 -34.695 -35.009 -35.333 -35.68 -36.039 -36.292 -36.541 -36.908 -37.167 -37.433 -37.566 -37.844 -38.134 -38.434 -38.591 -38.978 -39.078 -39.258 -39.457 -39.863 -40.075 -40.321 -40.625 -40.961 -41.291 -41.712 -42.844 -2 ,23281 ,KEBNE ,16652753,Mon Nov 22 00:16:30 CET,Mon Nov 22 02:05:32 CET,0.0 1.671 2.136 2.495 2.754 2.949 3.13 3.292 3.576 3.695 3.793 3.796 4.054 4.125 4.258 4.386 4.509 4.563 4.659 4.75 4.885 4.96 5.027 5.124 5.221 5.303 5.366 5.43 5.505 5.559 5.619 5.697 5.752 5.78 5.789 5.771 5.735 5.695 5.623 5.522 5.431 5.305 5.091 4.811 4.394 3.788 2.946 1.82 0.163 -2.285 -6.054 -10.342 -13.809 -16.643 -18.939 -20.835 -22.413 -23.826 -25.019 -26.192 -27.179 -28.041 -28.858 -29.613 -30.282 -30.879 -31.496 -32.029 -32.483 -32.955 -33.438 -33.829 -34.248 -34.669 -34.981 -35.315 -35.676 -36.052 -36.427 -36.669 -36.909 -37.267 -37.528 -37.809 -37.945 -38.232 -38.549 -38.872 -39.034 -39.436 -39.556 -39.733 -39.917 -40.331 -40.567 -40.846 -41.126 -41.395 -41.708 -42.1 -43.015 -5 ,5582 ,KEBNE ,16652756,Mon Nov 22 00:16:30 CET,Mon Nov 22 02:05:33 CET,0.0 1.194 1.514 1.789 2.01 2.209 2.384 2.515 2.743 2.838 2.922 2.913 3.177 3.27 3.435 3.564 3.688 3.748 3.847 3.925 4.038 4.1 4.152 4.234 4.304 4.372 4.432 4.495 4.576 4.645 4.705 4.785 4.858 4.895 4.927 4.955 4.971 4.966 4.906 4.826 4.728 4.578 4.346 4.042 3.609 3.012 2.184 1.151 -0.277 -2.5 -6.231 -10.468 -13.73 -16.389 -18.579 -20.464 -22.015 -23.369 -24.519 -25.639 -26.589 -27.428 -28.206 -28.925 -29.591 -30.183 -30.776 -31.284 -31.743 -32.24 -32.716 -33.097 -33.505 -33.933 -34.257 -34.587 -34.938 -35.3 -35.662 -35.903 -36.151 -36.531 -36.789 -37.061 -37.193 -37.463 -37.771 -38.098 -38.262 -38.652 -38.786 -38.977 -39.167 -39.561 -39.768 -39.999 -40.268 -40.549 -40.888 -41.4 -42.908 -6 ,8152 ,KEBNE ,16652757,Mon Nov 22 00:17:32 CET,Mon Nov 22 02:08:11 CET,0.0 1.061 1.459 1.731 1.945 2.104 2.247 2.385 2.609 2.709 2.812 2.803 3.048 3.122 3.252 3.371 3.464 3.505 3.587 3.654 3.758 3.83 3.904 4.015 4.11 4.185 4.254 4.308 4.365 4.419 4.456 4.488 4.513 4.548 4.592 4.605 4.578 4.544 4.521 4.488 4.41 4.322 4.222 4.029 3.719 3.321 2.713 1.783 0.275 -2.086 -5.854 -10.078 -13.363 -16.046 -18.27 -20.189 -21.833 -23.305 -24.537 -25.7 -26.671 -27.531 -28.328 -29.06 -29.732 -30.333 -30.947 -31.481 -31.927 -32.395 -32.866 -33.269 -33.698 -34.123 -34.445 -34.779 -35.135 -35.488 -35.827 -36.054 -36.295 -36.661 -36.916 -37.181 -37.317 -37.609 -37.919 -38.245 -38.408 -38.797 -38.887 -39.055 -39.241 -39.654 -39.866 -40.09 -40.342 -40.613 -40.949 -41.408 -42.592 -7 ,3076 ,KEBNE ,16652758,Mon Nov 22 00:17:32 CET,Mon Nov 22 02:07:31 CET,0.0 2.04 2.506 2.838 3.104 3.35 3.57 3.747 4.046 4.179 4.295 4.332 4.619 4.719 4.907 5.078 5.228 5.297 5.426 5.535 5.686 5.78 5.863 5.98 6.077 6.165 6.262 6.362 6.472 6.537 6.577 6.629 6.702 6.801 6.927 7.041 7.1 7.135 7.136 7.121 7.11 7.057 6.875 6.584 6.188 5.646 4.903 3.917 2.424 0.085 -3.609 -7.753 -11.018 -13.659 -15.816 -17.663 -19.239 -20.68 -21.856 -22.917 -23.789 -24.559 -25.306 -26.019 -26.656 -27.205 -27.764 -28.257 -28.685 -29.129 -29.574 -29.958 -30.375 -30.799 -31.114 -31.426 -31.751 -32.097 -32.471 -32.722 -32.971 -33.359 -33.636 -33.931 -34.075 -34.366 -34.659 -34.948 -35.089 -35.456 -35.529 -35.69 -35.857 -36.241 -36.456 -36.679 -36.954 -37.288 -37.679 -38.172 -40.302 -8 ,13133 ,KEBNE ,16652759,Mon Nov 22 00:17:32 CET,Mon Nov 22 02:07:04 CET,0.0 1.508 1.893 2.17 2.376 2.566 2.739 2.892 3.179 3.31 3.429 3.473 3.753 3.826 3.957 4.086 4.195 4.246 4.36 4.464 4.606 4.687 4.756 4.866 4.981 5.07 5.126 5.174 5.243 5.315 5.381 5.434 5.482 5.521 5.533 5.543 5.529 5.507 5.473 5.382 5.283 5.14 4.9 4.606 4.171 3.563 2.747 1.679 0.048 -2.401 -6.23 -10.625 -14.126 -16.936 -19.198 -21.165 -22.821 -24.264 -25.477 -26.628 -27.603 -28.462 -29.251 -29.978 -30.656 -31.271 -31.894 -32.435 -32.9 -33.377 -33.867 -34.275 -34.691 -35.107 -35.418 -35.735 -36.065 -36.409 -36.767 -37.013 -37.26 -37.645 -37.904 -38.176 -38.321 -38.63 -38.965 -39.313 -39.494 -39.9 -40.004 -40.184 -40.367 -40.759 -40.973 -41.19 -41.43 -41.697 -42.028 -42.466 -43.683 -9 ,22320 ,KEBNE ,16652760,Mon Nov 22 00:17:32 CET,Mon Nov 22 02:06:43 CET,0.0 1.322 1.631 1.858 2.045 2.209 2.363 2.491 2.727 2.851 2.965 2.978 3.249 3.331 3.488 3.639 3.776 3.844 3.97 4.079 4.229 4.325 4.414 4.538 4.641 4.722 4.8 4.868 4.942 5.011 5.07 5.118 5.149 5.167 5.161 5.15 5.132 5.104 5.075 5.012 4.908 4.738 4.49 4.267 3.983 3.528 2.832 1.855 0.421 -1.662 -5.084 -9.149 -12.389 -15.068 -17.336 -19.338 -20.98 -22.392 -23.553 -24.645 -25.576 -26.405 -27.176 -27.876 -28.523 -29.124 -29.719 -30.244 -30.7 -31.163 -31.631 -32.012 -32.415 -32.823 -33.142 -33.479 -33.822 -34.177 -34.544 -34.783 -35.016 -35.383 -35.645 -35.911 -36.042 -36.308 -36.607 -36.926 -37.083 -37.475 -37.596 -37.784 -38.001 -38.461 -38.678 -38.912 -39.173 -39.454 -39.768 -40.206 -41.527 -10 ,14163 ,KEBNE ,16652761,Mon Nov 22 00:17:33 CET,Mon Nov 22 02:07:11 CET,0.0 1.865 2.316 2.661 2.947 3.169 3.338 3.486 3.789 3.936 4.063 4.089 4.384 4.498 4.682 4.871 5.042 5.127 5.279 5.399 5.563 5.664 5.769 5.912 6.044 6.143 6.214 6.285 6.359 6.419 6.472 6.515 6.561 6.614 6.637 6.63 6.612 6.571 6.506 6.415 6.275 6.088 5.855 5.591 5.233 4.703 3.913 2.825 1.301 -0.949 -4.569 -8.686 -11.975 -14.63 -16.799 -18.635 -20.167 -21.533 -22.666 -23.797 -24.768 -25.589 -26.369 -27.111 -27.781 -28.372 -28.974 -29.527 -30.005 -30.49 -30.988 -31.384 -31.807 -32.255 -32.593 -32.926 -33.252 -33.588 -33.924 -34.159 -34.41 -34.798 -35.063 -35.332 -35.472 -35.768 -36.07 -36.364 -36.511 -36.891 -36.994 -37.173 -37.366 -37.764 -37.976 -38.215 -38.476 -38.754 -39.087 -39.55 -40.707 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 07b55831..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,21537 ,KEBNE ,16652763,Mon Nov 22 00:17:32 CET,Mon Nov 22 02:05:58 CET,0.0 1.071 1.378 1.624 1.821 1.991 2.145 2.287 2.538 2.643 2.745 2.759 3.027 3.109 3.259 3.412 3.565 3.644 3.817 3.987 4.209 4.342 4.482 4.702 4.898 5.069 5.221 5.357 5.528 5.695 5.861 6.076 6.285 6.479 6.701 6.932 7.151 7.395 7.648 7.918 8.2 8.523 8.911 9.305 9.797 10.323 10.854 11.386 11.979 12.655 13.231 13.499 13.406 13.155 12.884 12.585 12.325 12.047 11.795 11.558 11.299 11.06 10.828 10.594 10.391 10.184 9.96 9.748 9.573 9.42 9.243 9.097 8.935 8.727 8.546 8.367 8.183 7.998 7.806 7.666 7.524 7.3 7.127 6.942 6.855 6.656 6.397 6.117 5.974 5.651 5.53 5.374 5.202 4.803 4.58 4.301 3.978 3.619 3.238 2.631 -0.944 -3 ,22402 ,KEBNE ,16652764,Mon Nov 22 00:17:32 CET,Mon Nov 22 02:06:25 CET,0.0 0.927 1.234 1.465 1.623 1.754 1.89 2.017 2.24 2.348 2.444 2.433 2.698 2.782 2.947 3.097 3.238 3.31 3.449 3.589 3.786 3.905 4.017 4.189 4.35 4.5 4.652 4.791 4.973 5.157 5.325 5.532 5.734 5.92 6.15 6.409 6.635 6.88 7.167 7.464 7.76 8.097 8.486 8.882 9.352 9.871 10.427 10.968 11.57 12.207 12.755 12.959 12.829 12.537 12.236 11.941 11.616 11.27 10.959 10.637 10.325 10.023 9.743 9.486 9.239 9.014 8.746 8.495 8.291 8.066 7.806 7.59 7.369 7.121 6.939 6.758 6.56 6.35 6.115 5.954 5.802 5.542 5.366 5.197 5.099 4.87 4.629 4.393 4.28 3.994 3.877 3.717 3.553 3.191 2.987 2.799 2.603 2.311 1.926 1.458 -0.379 -5 ,22817 ,KEBNE ,16652766,Mon Nov 22 00:17:33 CET,Mon Nov 22 02:07:28 CET,0.0 0.764 1.067 1.294 1.487 1.672 1.821 1.955 2.203 2.323 2.43 2.44 2.717 2.822 3.026 3.204 3.366 3.441 3.57 3.693 3.892 4.019 4.135 4.313 4.48 4.633 4.776 4.915 5.097 5.276 5.445 5.647 5.862 6.069 6.29 6.54 6.783 7.044 7.314 7.608 7.915 8.253 8.648 9.034 9.494 9.998 10.543 11.157 11.823 12.508 13.141 13.397 13.271 12.974 12.639 12.312 11.986 11.632 11.28 10.921 10.636 10.347 10.064 9.821 9.59 9.366 9.114 8.87 8.658 8.45 8.218 8.016 7.801 7.552 7.366 7.189 6.992 6.771 6.539 6.376 6.203 5.925 5.715 5.483 5.352 5.102 4.844 4.548 4.403 4.086 3.943 3.763 3.537 3.088 2.87 2.594 2.273 1.957 1.59 1.016 -2.126 -6 ,28281 ,KEBNE ,16652767,Mon Nov 22 00:17:32 CET,Mon Nov 22 02:06:07 CET,0.0 0.943 1.242 1.468 1.668 1.855 2.007 2.133 2.365 2.463 2.566 2.601 2.869 2.954 3.112 3.253 3.397 3.46 3.579 3.702 3.883 4.014 4.146 4.321 4.491 4.662 4.824 4.979 5.172 5.353 5.523 5.728 5.919 6.105 6.335 6.595 6.833 7.096 7.394 7.695 8.0 8.344 8.729 9.127 9.625 10.148 10.684 11.287 11.96 12.585 13.093 13.265 13.176 12.973 12.678 12.339 12.023 11.716 11.437 11.141 10.862 10.601 10.352 10.121 9.878 9.643 9.419 9.201 9.001 8.819 8.625 8.452 8.272 8.085 7.937 7.777 7.592 7.388 7.169 7.003 6.839 6.596 6.441 6.289 6.204 6.015 5.804 5.597 5.493 5.199 5.078 4.922 4.742 4.343 4.122 3.898 3.645 3.332 3.004 2.501 -2.879 -7 ,25877 ,KEBNE ,16652768,Mon Nov 22 00:17:32 CET,Mon Nov 22 02:06:21 CET,0.0 1.112 1.453 1.707 1.908 2.064 2.206 2.35 2.608 2.736 2.866 2.935 3.228 3.331 3.52 3.683 3.82 3.889 4.039 4.19 4.402 4.531 4.653 4.827 4.987 5.142 5.287 5.425 5.624 5.832 6.021 6.239 6.441 6.626 6.849 7.1 7.348 7.629 7.938 8.266 8.588 8.932 9.323 9.708 10.128 10.601 11.112 11.63 12.236 12.918 13.552 13.765 13.656 13.43 13.13 12.784 12.45 12.116 11.786 11.455 11.177 10.906 10.631 10.375 10.111 9.871 9.624 9.361 9.128 8.891 8.627 8.4 8.183 7.96 7.792 7.627 7.454 7.282 7.087 6.941 6.778 6.489 6.298 6.098 5.983 5.762 5.55 5.303 5.152 4.813 4.618 4.441 4.259 3.861 3.66 3.425 3.157 2.806 2.322 1.631 -1.543 -8 ,17807 ,KEBNE ,16652769,Mon Nov 22 00:17:32 CET,Mon Nov 22 02:05:47 CET,0.0 0.844 1.085 1.313 1.505 1.659 1.804 1.925 2.131 2.234 2.334 2.372 2.659 2.753 2.922 3.082 3.247 3.328 3.472 3.607 3.794 3.905 4.014 4.174 4.341 4.492 4.634 4.787 4.983 5.169 5.348 5.554 5.749 5.955 6.196 6.441 6.671 6.938 7.218 7.502 7.804 8.132 8.516 8.889 9.298 9.74 10.261 10.853 11.478 12.112 12.658 12.795 12.623 12.373 12.114 11.833 11.505 11.175 10.877 10.547 10.238 9.932 9.61 9.297 9.017 8.781 8.525 8.25 8.003 7.761 7.505 7.277 7.023 6.764 6.566 6.341 6.105 5.857 5.617 5.472 5.32 5.076 4.912 4.761 4.674 4.454 4.222 3.994 3.88 3.609 3.534 3.395 3.232 2.823 2.624 2.423 2.178 1.915 1.529 0.961 -1.72 -9 ,18351 ,KEBNE ,16652770,Mon Nov 22 00:17:33 CET,Mon Nov 22 02:06:02 CET,0.0 0.943 1.24 1.462 1.642 1.816 1.98 2.123 2.379 2.496 2.602 2.632 2.902 2.994 3.17 3.339 3.501 3.576 3.709 3.843 4.056 4.185 4.302 4.478 4.667 4.85 5.018 5.178 5.368 5.558 5.748 5.967 6.186 6.393 6.63 6.889 7.124 7.4 7.705 7.998 8.296 8.634 9.027 9.418 9.854 10.338 10.881 11.486 12.161 12.796 13.339 13.511 13.362 13.125 12.805 12.407 12.043 11.689 11.351 11.002 10.664 10.337 10.024 9.722 9.432 9.173 8.878 8.581 8.354 8.142 7.917 7.718 7.503 7.268 7.077 6.88 6.669 6.459 6.239 6.069 5.888 5.621 5.447 5.267 5.164 4.936 4.689 4.428 4.294 3.977 3.8 3.628 3.457 3.044 2.788 2.49 2.186 1.859 1.451 0.904 -1.879 -10 ,20325 ,KEBNE ,16652771,Mon Nov 22 00:17:33 CET,Mon Nov 22 02:06:33 CET,0.0 0.884 1.208 1.448 1.625 1.794 1.935 2.049 2.263 2.356 2.444 2.442 2.7 2.786 2.943 3.092 3.236 3.3 3.432 3.572 3.769 3.888 4.006 4.174 4.32 4.457 4.59 4.728 4.909 5.079 5.244 5.434 5.621 5.802 6.019 6.268 6.499 6.762 7.04 7.328 7.635 7.965 8.337 8.706 9.116 9.571 10.119 10.683 11.248 11.841 12.337 12.441 12.273 12.01 11.712 11.368 10.997 10.688 10.446 10.132 9.849 9.606 9.356 9.12 8.906 8.697 8.437 8.199 7.99 7.776 7.53 7.305 7.078 6.824 6.609 6.401 6.211 6.003 5.792 5.637 5.447 5.161 4.981 4.793 4.684 4.441 4.173 3.898 3.772 3.469 3.283 3.089 2.914 2.513 2.306 2.077 1.796 1.435 0.964 0.387 -2.14 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt deleted file mode 100644 index c75065c6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,17382 ,KEBNE ,16652773,Mon Nov 22 00:18:35 CET,Mon Nov 22 01:43:25 CET,0.0 1.199 1.593 1.886 2.16 2.401 2.618 2.844 3.275 3.474 3.652 3.771 4.139 4.299 4.602 4.892 5.177 5.312 5.575 5.839 6.219 6.463 6.701 7.031 7.339 7.646 7.955 8.253 8.624 8.97 9.317 9.763 10.191 10.597 11.074 11.611 12.126 12.696 13.3 13.94 14.636 15.401 16.216 16.938 17.772 18.768 19.81 20.809 21.904 23.111 24.232 24.895 25.048 24.882 24.596 24.302 24.023 23.683 23.292 22.847 22.468 22.118 21.774 21.436 21.114 20.821 20.501 20.207 19.944 19.682 19.417 19.206 18.995 18.765 18.584 18.389 18.183 17.975 17.76 17.611 17.453 17.201 17.026 16.853 16.757 16.559 16.35 16.119 16.006 15.712 15.65 15.516 15.374 15.075 14.921 14.739 14.509 14.267 13.966 13.555 12.74 -3 ,8889 ,KEBNE ,16652774,Mon Nov 22 00:18:35 CET,Mon Nov 22 01:41:44 CET,0.0 0.727 1.062 1.333 1.575 1.811 2.013 2.189 2.526 2.681 2.833 2.93 3.28 3.414 3.682 3.944 4.204 4.334 4.589 4.828 5.167 5.385 5.602 5.914 6.21 6.503 6.793 7.066 7.421 7.776 8.114 8.529 8.941 9.348 9.838 10.391 10.918 11.504 12.128 12.757 13.44 14.247 15.157 16.068 17.067 18.015 18.972 19.971 21.071 22.302 23.583 24.255 24.406 24.299 24.018 23.566 23.012 22.511 22.081 21.618 21.206 20.813 20.442 20.108 19.793 19.498 19.185 18.901 18.655 18.391 18.115 17.885 17.649 17.408 17.211 17.014 16.818 16.61 16.389 16.228 16.066 15.824 15.659 15.489 15.407 15.233 15.058 14.881 14.79 14.512 14.493 14.385 14.272 14.001 13.848 13.711 13.573 13.413 13.219 12.968 12.332 -4 ,30628 ,KEBNE ,16652775,Mon Nov 22 00:18:35 CET,Mon Nov 22 01:41:44 CET,0.0 1.027 1.489 1.882 2.211 2.481 2.721 2.935 3.326 3.51 3.686 3.829 4.199 4.35 4.644 4.937 5.221 5.36 5.635 5.887 6.243 6.474 6.698 7.038 7.368 7.683 7.993 8.295 8.676 9.051 9.421 9.833 10.229 10.622 11.084 11.62 12.115 12.659 13.258 13.921 14.625 15.376 16.275 17.183 18.161 19.19 20.42 21.823 23.311 24.658 25.829 26.553 26.775 26.751 26.591 26.336 26.047 25.746 25.476 25.17 24.88 24.615 24.341 24.073 23.826 23.609 23.392 23.182 22.976 22.762 22.545 22.351 22.155 21.961 21.807 21.646 21.491 21.326 21.139 21.011 20.867 20.635 20.475 20.304 20.221 20.05 19.869 19.668 19.56 19.273 19.224 19.096 18.966 18.704 18.568 18.402 18.203 17.976 17.749 17.511 16.977 -5 ,13377 ,KEBNE ,16652776,Mon Nov 22 00:18:35 CET,Mon Nov 22 01:43:39 CET,0.0 0.816 1.128 1.393 1.639 1.859 2.059 2.236 2.568 2.746 2.917 3.018 3.375 3.51 3.769 4.028 4.282 4.403 4.647 4.888 5.24 5.467 5.691 6.026 6.348 6.668 6.983 7.276 7.643 7.998 8.351 8.784 9.192 9.576 10.034 10.556 11.062 11.623 12.248 12.895 13.549 14.333 15.205 15.978 16.87 17.935 19.198 20.562 22.049 23.503 24.741 25.359 25.454 25.281 25.007 24.558 24.062 23.592 23.142 22.69 22.29 21.936 21.595 21.257 20.933 20.62 20.3 20.02 19.761 19.497 19.222 18.998 18.778 18.541 18.356 18.169 17.977 17.779 17.554 17.393 17.226 16.973 16.812 16.643 16.56 16.392 16.187 15.965 15.864 15.587 15.577 15.472 15.359 15.106 14.97 14.824 14.665 14.493 14.295 14.043 13.395 -6 ,10266 ,KEBNE ,16652777,Mon Nov 22 00:18:35 CET,Mon Nov 22 01:43:38 CET,0.0 0.804 1.276 1.68 2.018 2.302 2.581 2.836 3.3 3.519 3.718 3.875 4.258 4.416 4.738 5.058 5.356 5.493 5.752 6.012 6.39 6.63 6.854 7.167 7.465 7.761 8.061 8.352 8.723 9.081 9.418 9.812 10.208 10.602 11.054 11.569 12.077 12.629 13.238 13.904 14.602 15.38 16.298 17.235 18.324 19.436 20.535 21.723 22.959 24.167 25.289 25.891 26.099 25.758 25.19 24.639 24.124 23.635 23.175 22.712 22.303 21.929 21.57 21.235 20.922 20.626 20.305 20.028 19.805 19.575 19.342 19.132 18.904 18.676 18.499 18.323 18.133 17.928 17.714 17.566 17.414 17.173 17.003 16.821 16.727 16.539 16.345 16.149 16.053 15.773 15.769 15.665 15.558 15.339 15.218 15.09 14.954 14.8 14.618 14.358 13.716 -7 ,28626 ,KEBNE ,16652778,Mon Nov 22 00:18:35 CET,Mon Nov 22 01:41:44 CET,0.0 0.653 1.052 1.419 1.762 2.05 2.303 2.544 2.958 3.149 3.336 3.472 3.843 4.006 4.323 4.606 4.88 5.017 5.276 5.527 5.88 6.096 6.311 6.642 6.961 7.269 7.574 7.869 8.242 8.589 8.935 9.361 9.764 10.151 10.602 11.118 11.618 12.18 12.788 13.436 14.142 14.947 15.891 16.81 17.785 18.748 19.847 21.191 22.572 23.844 25.332 26.164 26.191 26.007 25.748 25.443 25.108 24.689 24.241 23.777 23.399 23.039 22.666 22.324 22.013 21.731 21.447 21.183 20.943 20.691 20.425 20.199 19.964 19.733 19.542 19.332 19.123 18.915 18.682 18.52 18.372 18.147 17.984 17.813 17.726 17.545 17.357 17.164 17.061 16.771 16.741 16.612 16.479 16.233 16.102 15.954 15.786 15.587 15.346 15.072 14.604 -8 ,22866 ,KEBNE ,16652779,Mon Nov 22 00:19:37 CET,Mon Nov 22 01:42:52 CET,0.0 0.828 1.239 1.556 1.823 2.053 2.266 2.454 2.82 3.012 3.193 3.305 3.676 3.843 4.166 4.461 4.743 4.88 5.152 5.422 5.799 6.044 6.279 6.62 6.952 7.264 7.561 7.844 8.203 8.556 8.905 9.336 9.752 10.159 10.642 11.18 11.688 12.25 12.865 13.52 14.207 14.99 15.867 16.727 17.756 18.882 20.116 21.444 22.85 24.234 25.385 25.918 25.982 25.763 25.484 25.113 24.622 24.075 23.608 23.138 22.705 22.334 21.969 21.609 21.274 20.968 20.642 20.351 20.108 19.855 19.581 19.339 19.098 18.86 18.667 18.463 18.263 18.065 17.845 17.684 17.521 17.279 17.106 16.931 16.849 16.683 16.522 16.361 16.274 15.993 15.983 15.882 15.781 15.554 15.42 15.255 15.065 14.879 14.7 14.506 14.083 -9 ,31781 ,KEBNE ,16652780,Mon Nov 22 00:19:38 CET,Mon Nov 22 01:44:16 CET,0.0 0.788 1.141 1.428 1.682 1.917 2.129 2.337 2.719 2.885 3.056 3.208 3.587 3.747 4.062 4.366 4.652 4.784 5.047 5.306 5.686 5.935 6.162 6.504 6.846 7.161 7.464 7.76 8.149 8.532 8.906 9.342 9.753 10.151 10.607 11.158 11.699 12.26 12.894 13.598 14.321 15.088 15.912 16.702 17.619 18.65 19.858 21.187 22.557 23.83 25.133 25.916 26.026 25.932 25.723 25.436 25.163 24.869 24.598 24.29 23.993 23.728 23.473 23.225 22.981 22.764 22.529 22.312 22.123 21.923 21.704 21.528 21.347 21.157 21.013 20.852 20.684 20.529 20.367 20.254 20.13 19.931 19.81 19.682 19.615 19.484 19.345 19.189 19.113 18.853 18.858 18.761 18.662 18.433 18.315 18.2 18.07 17.914 17.72 17.484 16.92 -10 ,855 ,KEBNE ,16652781,Mon Nov 22 00:19:38 CET,Mon Nov 22 01:42:49 CET,0.0 0.949 1.338 1.614 1.834 2.037 2.237 2.431 2.803 2.988 3.175 3.323 3.695 3.85 4.157 4.46 4.755 4.89 5.144 5.388 5.744 5.977 6.202 6.534 6.854 7.159 7.438 7.713 8.084 8.443 8.794 9.235 9.677 10.102 10.589 11.115 11.649 12.27 12.906 13.557 14.251 15.065 16.015 16.949 18.061 19.315 20.677 22.054 23.511 24.938 26.156 26.801 26.851 26.731 26.535 26.269 25.982 25.683 25.346 24.896 24.464 24.062 23.68 23.332 23.004 22.703 22.4 22.134 21.897 21.664 21.412 21.189 20.962 20.74 20.571 20.38 20.176 19.969 19.768 19.636 19.497 19.28 19.137 18.997 18.924 18.772 18.614 18.443 18.361 18.089 18.094 17.996 17.891 17.668 17.546 17.421 17.29 17.132 16.946 16.724 16.096 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index be6936fe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,24297 ,KEBNE ,16652783,Mon Nov 22 00:19:38 CET,Mon Nov 22 01:42:28 CET,0.0 0.685 1.039 1.313 1.551 1.767 1.971 2.156 2.496 2.662 2.821 2.887 3.237 3.375 3.636 3.892 4.142 4.265 4.512 4.75 5.09 5.318 5.532 5.831 6.132 6.444 6.734 7.014 7.397 7.773 8.143 8.589 9.041 9.514 10.076 10.707 11.296 11.924 12.571 13.231 13.951 14.777 15.731 16.73 17.955 19.288 20.741 22.344 24.244 26.577 29.385 31.656 32.886 33.593 34.047 34.353 34.579 34.686 34.695 34.675 34.619 34.559 34.492 34.404 34.308 34.22 34.117 34.019 33.931 33.826 33.72 33.617 33.493 33.367 33.262 33.149 33.025 32.904 32.777 32.678 32.57 32.406 32.289 32.166 32.112 32.0 31.855 31.698 31.621 31.381 31.373 31.285 31.186 30.949 30.824 30.697 30.539 30.345 30.108 29.778 28.639 -4 ,23085 ,KEBNE ,16652785,Mon Nov 22 00:19:37 CET,Mon Nov 22 01:43:58 CET,0.0 0.933 1.264 1.539 1.766 1.962 2.151 2.331 2.652 2.796 2.941 3.013 3.355 3.478 3.713 3.96 4.218 4.345 4.595 4.828 5.176 5.409 5.639 5.993 6.344 6.666 6.964 7.25 7.621 8.0 8.373 8.817 9.257 9.705 10.211 10.779 11.361 12.032 12.769 13.562 14.401 15.33 16.433 17.595 18.987 20.549 22.298 24.066 25.984 28.175 30.806 32.949 34.162 34.947 35.439 35.705 35.827 35.887 35.904 35.887 35.871 35.843 35.77 35.688 35.599 35.508 35.415 35.318 35.219 35.112 34.978 34.858 34.738 34.607 34.497 34.382 34.263 34.126 34.002 33.916 33.815 33.665 33.542 33.388 33.306 33.145 32.975 32.792 32.695 32.436 32.373 32.248 32.109 31.785 31.607 31.418 31.204 30.973 30.657 30.256 28.926 -5 ,24987 ,KEBNE ,16652786,Mon Nov 22 00:20:40 CET,Mon Nov 22 01:45:04 CET,0.0 0.831 1.191 1.484 1.736 1.933 2.118 2.298 2.61 2.752 2.901 2.997 3.361 3.508 3.784 4.076 4.371 4.5 4.736 4.978 5.328 5.551 5.779 6.113 6.444 6.762 7.055 7.349 7.755 8.141 8.502 8.945 9.387 9.838 10.354 10.932 11.513 12.158 12.824 13.462 14.104 14.836 15.685 16.549 17.598 18.83 20.228 21.768 23.591 25.732 28.38 30.651 31.979 32.798 33.274 33.515 33.668 33.761 33.782 33.754 33.716 33.667 33.594 33.497 33.397 33.296 33.179 33.054 32.933 32.807 32.658 32.523 32.38 32.235 32.13 32.023 31.904 31.779 31.645 31.544 31.433 31.24 31.095 30.951 30.879 30.747 30.589 30.411 30.336 30.102 30.061 29.953 29.849 29.614 29.469 29.303 29.123 28.919 28.644 28.268 27.342 -6 ,6385 ,KEBNE ,16652787,Mon Nov 22 00:20:44 CET,Mon Nov 22 01:40:13 CET,0.0 0.767 1.086 1.335 1.565 1.781 1.987 2.186 2.522 2.671 2.817 2.88 3.228 3.375 3.668 3.951 4.222 4.352 4.595 4.834 5.187 5.403 5.638 6.005 6.35 6.677 6.988 7.288 7.691 8.103 8.505 8.995 9.471 9.919 10.433 11.024 11.603 12.235 12.878 13.558 14.294 15.151 16.209 17.3 18.614 20.087 21.782 23.698 25.773 28.097 30.884 33.054 34.322 35.096 35.521 35.773 35.936 36.007 36.028 36.03 36.003 35.949 35.859 35.767 35.693 35.608 35.484 35.37 35.274 35.168 35.043 34.929 34.813 34.693 34.602 34.499 34.386 34.263 34.122 34.028 33.942 33.807 33.693 33.58 33.526 33.406 33.278 33.136 33.053 32.812 32.819 32.734 32.643 32.402 32.239 32.075 31.901 31.7 31.464 31.069 30.231 -7 ,13728 ,KEBNE ,16652788,Mon Nov 22 00:21:46 CET,Mon Nov 22 01:43:52 CET,0.0 1.059 1.438 1.719 1.942 2.157 2.357 2.536 2.856 3.003 3.153 3.265 3.634 3.786 4.069 4.336 4.595 4.729 5.001 5.25 5.604 5.845 6.09 6.45 6.795 7.128 7.446 7.758 8.168 8.576 8.973 9.457 9.943 10.404 10.933 11.553 12.155 12.807 13.518 14.269 15.075 16.028 17.145 18.264 19.571 21.003 22.625 24.557 26.86 29.626 32.886 35.266 36.615 37.416 37.899 38.182 38.318 38.37 38.386 38.373 38.342 38.281 38.194 38.112 38.021 37.924 37.817 37.705 37.598 37.483 37.364 37.269 37.152 37.014 36.903 36.783 36.659 36.53 36.401 36.317 36.235 36.107 36.011 35.914 35.866 35.757 35.637 35.512 35.442 35.195 35.161 35.065 34.959 34.697 34.551 34.386 34.18 33.936 33.677 33.352 32.39 -8 ,16044 ,KEBNE ,16652789,Mon Nov 22 00:22:45 CET,Mon Nov 22 01:46:44 CET,0.0 0.731 1.039 1.285 1.507 1.7 1.892 2.073 2.432 2.605 2.758 2.841 3.197 3.335 3.617 3.895 4.168 4.298 4.551 4.81 5.168 5.393 5.613 5.929 6.246 6.558 6.858 7.147 7.525 7.895 8.255 8.698 9.138 9.579 10.092 10.675 11.244 11.87 12.545 13.282 14.069 14.916 15.899 16.94 18.157 19.492 21.101 22.904 24.921 27.542 30.712 33.067 34.414 35.167 35.594 35.839 35.991 36.067 36.067 36.039 35.998 35.94 35.853 35.756 35.66 35.564 35.452 35.342 35.249 35.151 35.03 34.927 34.811 34.681 34.578 34.459 34.321 34.183 34.048 33.936 33.806 33.612 33.475 33.33 33.25 33.094 32.956 32.78 32.678 32.423 32.355 32.239 32.127 31.855 31.694 31.513 31.299 31.045 30.742 30.327 29.074 -9 ,24539 ,KEBNE ,16652790,Mon Nov 22 00:23:48 CET,Mon Nov 22 01:46:14 CET,0.0 0.661 0.949 1.192 1.421 1.636 1.823 1.997 2.32 2.476 2.635 2.724 3.079 3.224 3.497 3.728 3.955 4.074 4.304 4.532 4.893 5.131 5.353 5.674 5.986 6.293 6.599 6.892 7.272 7.652 8.02 8.47 8.904 9.282 9.688 10.157 10.615 11.125 11.691 12.353 13.099 13.926 14.906 15.865 16.904 18.047 19.406 20.998 22.814 24.865 27.475 29.653 30.841 31.599 32.076 32.356 32.528 32.615 32.638 32.61 32.55 32.5 32.442 32.362 32.269 32.165 32.046 31.941 31.85 31.756 31.636 31.517 31.39 31.268 31.171 31.063 30.951 30.827 30.696 30.593 30.486 30.346 30.248 30.127 30.063 29.94 29.815 29.664 29.578 29.328 29.295 29.199 29.088 28.846 28.699 28.54 28.356 28.139 27.892 27.546 26.305 -10 ,21853 ,KEBNE ,16652791,Mon Nov 22 00:23:48 CET,Mon Nov 22 01:46:20 CET,0.0 0.982 1.303 1.573 1.807 2.004 2.182 2.361 2.71 2.856 2.997 3.078 3.448 3.616 3.923 4.206 4.464 4.59 4.842 5.083 5.423 5.635 5.844 6.16 6.464 6.772 7.093 7.411 7.817 8.196 8.569 9.033 9.487 9.914 10.425 11.023 11.599 12.236 12.905 13.626 14.416 15.342 16.469 17.615 18.996 20.545 22.271 24.128 26.271 28.728 31.693 34.121 35.504 36.405 36.918 37.206 37.374 37.452 37.451 37.43 37.401 37.336 37.259 37.185 37.103 37.006 36.9 36.799 36.7 36.597 36.473 36.361 36.246 36.121 36.015 35.906 35.793 35.658 35.505 35.391 35.278 35.119 34.995 34.863 34.792 34.647 34.509 34.344 34.249 33.99 33.933 33.836 33.743 33.546 33.426 33.269 33.068 32.861 32.63 32.336 31.503 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt deleted file mode 100644 index 99d91a85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15744 ,KEBNE ,17019380,Wed Dec 22 02:34:15 CET,Wed Dec 22 03:57:24 CET,0.0 1.029 1.344 1.6 1.821 1.995 2.158 2.321 2.608 2.74 2.876 2.922 3.283 3.411 3.651 3.866 4.054 4.151 4.348 4.543 4.82 4.985 5.143 5.381 5.625 5.858 6.088 6.311 6.579 6.84 7.095 7.404 7.696 7.98 8.322 8.698 9.051 9.434 9.859 10.297 10.765 11.314 11.922 12.515 13.22 14.032 14.971 15.975 17.115 18.396 19.77 20.5 20.667 20.608 20.321 19.994 19.659 19.269 18.885 18.48 18.1 17.74 17.43 17.16 16.9 16.645 16.368 16.122 15.908 15.661 15.386 15.152 14.889 14.608 14.379 14.143 13.911 13.675 13.426 13.266 13.098 12.805 12.621 12.445 12.356 12.169 11.95 11.724 11.609 11.282 11.254 11.124 10.982 10.655 10.473 10.272 10.054 9.82 9.584 9.214 7.837 -2 ,13383 ,KEBNE ,17019381,Wed Dec 22 02:34:18 CET,Wed Dec 22 03:53:17 CET,0.0 1.053 1.349 1.578 1.789 1.982 2.165 2.33 2.605 2.738 2.871 2.889 3.231 3.335 3.521 3.729 3.946 4.048 4.245 4.438 4.722 4.895 5.052 5.285 5.523 5.753 5.971 6.183 6.463 6.727 6.975 7.288 7.596 7.884 8.219 8.592 8.949 9.346 9.771 10.21 10.669 11.186 11.776 12.385 13.125 13.95 14.857 15.827 16.888 18.066 19.219 19.811 19.985 19.899 19.67 19.352 19.035 18.706 18.354 18.003 17.667 17.349 17.065 16.798 16.5 16.193 15.87 15.612 15.407 15.153 14.881 14.664 14.437 14.207 14.026 13.841 13.664 13.464 13.236 13.086 12.946 12.715 12.549 12.373 12.278 12.077 11.862 11.627 11.514 11.182 11.11 10.965 10.819 10.48 10.3 10.116 9.908 9.68 9.418 9.04 7.673 -3 ,27731 ,KEBNE ,17019382,Wed Dec 22 02:34:15 CET,Wed Dec 22 03:55:45 CET,0.0 1.187 1.513 1.769 1.989 2.18 2.354 2.524 2.824 2.967 3.111 3.15 3.489 3.594 3.799 3.999 4.179 4.268 4.462 4.645 4.908 5.082 5.248 5.495 5.731 5.956 6.167 6.373 6.646 6.909 7.161 7.456 7.739 8.02 8.346 8.718 9.073 9.462 9.884 10.327 10.812 11.357 11.949 12.549 13.265 14.054 14.954 15.965 17.122 18.349 19.576 20.334 20.447 20.049 19.48 18.945 18.434 17.941 17.509 17.048 16.619 16.221 15.84 15.489 15.165 14.853 14.521 14.22 13.955 13.695 13.434 13.21 12.979 12.727 12.518 12.313 12.11 11.884 11.647 11.496 11.339 11.075 10.894 10.712 10.613 10.403 10.19 9.969 9.844 9.514 9.499 9.37 9.232 8.92 8.747 8.553 8.359 8.159 7.884 7.481 6.02 -4 ,17334 ,KEBNE ,17019383,Wed Dec 22 02:34:14 CET,Wed Dec 22 03:57:14 CET,0.0 0.732 1.018 1.253 1.456 1.635 1.798 1.941 2.216 2.339 2.454 2.459 2.786 2.888 3.082 3.267 3.448 3.535 3.714 3.893 4.153 4.327 4.499 4.746 4.976 5.189 5.401 5.607 5.878 6.14 6.391 6.706 7.0 7.272 7.588 7.961 8.329 8.738 9.177 9.658 10.142 10.647 11.252 11.887 12.599 13.355 14.261 15.268 16.398 17.683 18.661 19.062 19.055 18.737 18.469 18.183 17.897 17.589 17.247 16.88 16.544 16.255 16.002 15.699 15.362 15.055 14.722 14.427 14.175 13.875 13.547 13.304 13.073 12.834 12.648 12.452 12.254 12.059 11.866 11.726 11.564 11.315 11.143 10.957 10.865 10.67 10.461 10.254 10.145 9.813 9.748 9.609 9.474 9.154 8.953 8.735 8.516 8.266 7.939 7.475 5.609 -5 ,25188 ,KEBNE ,17019384,Wed Dec 22 02:34:15 CET,Wed Dec 22 03:57:16 CET,0.0 1.279 1.558 1.807 2.03 2.217 2.386 2.54 2.835 2.977 3.111 3.147 3.497 3.615 3.85 4.072 4.275 4.377 4.559 4.731 4.993 5.16 5.32 5.557 5.795 6.026 6.247 6.453 6.714 6.961 7.199 7.504 7.809 8.103 8.43 8.796 9.154 9.536 9.945 10.375 10.818 11.342 11.966 12.587 13.3 14.078 14.971 15.989 17.148 18.44 19.78 20.285 20.221 20.109 19.992 19.79 19.491 19.186 18.895 18.561 18.276 18.019 17.729 17.43 17.166 16.917 16.617 16.299 16.015 15.729 15.446 15.237 15.038 14.832 14.655 14.464 14.252 14.02 13.778 13.608 13.438 13.17 12.97 12.771 12.677 12.475 12.245 11.984 11.852 11.518 11.48 11.341 11.192 10.88 10.714 10.53 10.332 10.095 9.8 9.421 8.029 -6 ,8441 ,KEBNE ,17019385,Wed Dec 22 02:34:15 CET,Wed Dec 22 03:56:06 CET,0.0 1.721 2.094 2.374 2.621 2.845 3.026 3.173 3.445 3.577 3.711 3.748 4.098 4.222 4.442 4.667 4.891 4.995 5.193 5.376 5.65 5.833 6.009 6.256 6.495 6.729 6.952 7.155 7.41 7.665 7.923 8.24 8.547 8.839 9.178 9.572 9.942 10.34 10.766 11.201 11.661 12.19 12.811 13.428 14.116 14.878 15.784 16.636 17.328 18.003 18.555 18.557 18.245 17.803 17.318 16.764 16.23 15.776 15.33 14.868 14.468 14.077 13.656 13.222 12.84 12.52 12.181 11.872 11.616 11.357 11.064 10.822 10.588 10.341 10.146 9.938 9.71 9.466 9.228 9.068 8.897 8.632 8.444 8.249 8.152 7.962 7.76 7.552 7.437 7.098 7.077 6.942 6.795 6.484 6.321 6.158 5.983 5.767 5.492 5.11 3.655 -7 ,24385 ,KEBNE ,17019386,Wed Dec 22 02:35:17 CET,Wed Dec 22 03:56:59 CET,0.0 1.242 1.55 1.778 1.96 2.147 2.333 2.498 2.776 2.908 3.037 3.05 3.386 3.498 3.72 3.931 4.146 4.251 4.437 4.619 4.897 5.077 5.247 5.494 5.73 5.962 6.19 6.412 6.7 6.974 7.233 7.547 7.849 8.14 8.481 8.849 9.19 9.587 10.027 10.495 10.981 11.502 12.109 12.716 13.432 14.251 15.146 16.094 17.139 18.28 19.553 20.371 20.447 20.262 20.035 19.681 19.234 18.735 18.225 17.707 17.275 16.879 16.499 16.136 15.805 15.482 15.119 14.801 14.533 14.265 13.986 13.736 13.46 13.192 12.995 12.794 12.579 12.347 12.104 11.94 11.783 11.55 11.381 11.209 11.128 10.947 10.761 10.556 10.439 10.105 10.074 9.944 9.8 9.48 9.303 9.113 8.912 8.668 8.367 7.973 6.796 -8 ,25966 ,KEBNE ,17019387,Wed Dec 22 02:35:17 CET,Wed Dec 22 03:58:51 CET,0.0 1.388 1.741 2.005 2.228 2.413 2.577 2.731 3.01 3.138 3.255 3.247 3.593 3.722 3.941 4.14 4.328 4.414 4.585 4.757 5.013 5.185 5.354 5.586 5.814 6.043 6.266 6.494 6.776 7.028 7.288 7.616 7.917 8.209 8.551 8.919 9.275 9.663 10.079 10.526 10.979 11.488 12.098 12.718 13.41 14.218 15.161 16.135 17.23 18.435 19.469 19.724 19.483 18.977 18.408 17.881 17.412 16.95 16.533 16.108 15.717 15.376 15.051 14.72 14.398 14.108 13.797 13.49 13.229 12.967 12.685 12.453 12.198 11.906 11.69 11.495 11.306 11.105 10.883 10.731 10.579 10.335 10.161 9.992 9.913 9.723 9.506 9.282 9.167 8.841 8.832 8.702 8.556 8.219 8.038 7.868 7.69 7.469 7.208 6.822 5.588 -9 ,3608 ,KEBNE ,17019388,Wed Dec 22 02:35:17 CET,Wed Dec 22 03:56:57 CET,0.0 1.31 1.634 1.889 2.1 2.272 2.43 2.587 2.884 3.015 3.133 3.137 3.467 3.573 3.781 3.976 4.155 4.242 4.419 4.598 4.871 5.05 5.212 5.448 5.679 5.897 6.115 6.341 6.629 6.891 7.153 7.477 7.78 8.062 8.396 8.785 9.147 9.536 9.961 10.405 10.871 11.401 12.014 12.604 13.299 14.105 14.966 15.914 17.044 18.226 19.398 20.061 20.249 20.18 19.956 19.674 19.343 18.926 18.555 18.234 17.94 17.652 17.313 16.972 16.709 16.476 16.194 15.912 15.665 15.418 15.143 14.917 14.681 14.415 14.198 13.974 13.762 13.529 13.289 13.122 12.929 12.618 12.41 12.21 12.112 11.906 11.683 11.452 11.336 11.006 10.93 10.773 10.602 10.249 10.077 9.89 9.666 9.395 9.089 8.685 6.552 -10 ,17055 ,KEBNE ,17019389,Wed Dec 22 02:35:21 CET,Wed Dec 22 03:53:08 CET,0.0 1.471 1.789 2.05 2.275 2.465 2.654 2.837 3.141 3.281 3.433 3.486 3.83 3.953 4.19 4.41 4.627 4.73 4.932 5.142 5.423 5.588 5.751 5.997 6.236 6.463 6.693 6.916 7.177 7.421 7.656 7.956 8.256 8.538 8.867 9.233 9.586 9.987 10.415 10.858 11.356 11.918 12.541 13.18 13.875 14.628 15.549 16.602 17.762 18.925 20.085 20.847 21.027 20.927 20.704 20.438 20.181 19.884 19.585 19.26 18.95 18.657 18.365 18.069 17.796 17.539 17.261 17.01 16.801 16.61 16.377 16.14 15.884 15.616 15.425 15.237 15.042 14.854 14.663 14.511 14.34 14.089 13.917 13.733 13.63 13.431 13.229 13.002 12.889 12.564 12.501 12.357 12.204 11.883 11.719 11.525 11.291 11.007 10.69 10.29 8.467 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt deleted file mode 100644 index d55ac07e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,2932 ,KEBNE ,16652804,Mon Nov 22 00:29:01 CET,Mon Nov 22 01:54:32 CET,0.0 0.635 0.867 1.041 1.184 1.307 1.423 1.529 1.729 1.83 1.927 1.928 2.171 2.247 2.405 2.553 2.685 2.749 2.886 3.024 3.222 3.35 3.472 3.642 3.795 3.945 4.101 4.252 4.437 4.615 4.791 5.006 5.202 5.386 5.596 5.838 6.07 6.325 6.606 6.897 7.198 7.524 7.895 8.262 8.69 9.156 9.656 10.16 10.676 11.206 11.669 11.762 11.597 11.321 11.017 10.702 10.408 10.132 9.869 9.576 9.321 9.097 8.867 8.642 8.445 8.27 8.07 7.884 7.731 7.559 7.37 7.224 7.073 6.914 6.789 6.645 6.499 6.36 6.209 6.093 5.972 5.8 5.691 5.571 5.502 5.36 5.221 5.074 4.994 4.753 4.723 4.621 4.514 4.287 4.169 4.045 3.92 3.782 3.614 3.401 2.882 -4 ,12099 ,KEBNE ,16652805,Mon Nov 22 00:29:01 CET,Mon Nov 22 01:52:35 CET,0.0 1.281 1.505 1.699 1.84 1.96 2.077 2.192 2.398 2.495 2.589 2.621 2.882 2.97 3.129 3.289 3.459 3.539 3.68 3.805 3.983 4.104 4.222 4.39 4.555 4.711 4.859 5.006 5.191 5.36 5.531 5.737 5.934 6.125 6.352 6.618 6.855 7.101 7.38 7.677 7.971 8.302 8.684 9.052 9.459 9.905 10.41 10.925 11.457 11.952 12.34 12.387 12.199 11.908 11.593 11.285 10.972 10.657 10.374 10.08 9.815 9.586 9.381 9.17 8.961 8.774 8.566 8.373 8.208 8.042 7.869 7.722 7.566 7.401 7.273 7.138 7.008 6.879 6.747 6.658 6.562 6.404 6.29 6.17 6.113 6.008 5.889 5.753 5.689 5.462 5.467 5.374 5.278 5.089 4.982 4.858 4.718 4.569 4.396 4.187 3.575 -5 ,31548 ,KEBNE ,16652806,Mon Nov 22 00:29:01 CET,Mon Nov 22 01:52:59 CET,0.0 0.921 1.179 1.366 1.516 1.65 1.77 1.88 2.08 2.175 2.263 2.265 2.515 2.601 2.758 2.907 3.064 3.142 3.29 3.422 3.597 3.713 3.834 4.008 4.176 4.337 4.49 4.638 4.814 4.992 5.171 5.396 5.608 5.79 5.996 6.231 6.464 6.72 6.991 7.272 7.562 7.88 8.257 8.622 9.023 9.471 9.942 10.422 10.944 11.479 11.917 12.006 11.826 11.546 11.267 10.977 10.663 10.359 10.098 9.807 9.544 9.309 9.078 8.858 8.662 8.482 8.286 8.109 7.96 7.791 7.608 7.461 7.309 7.148 7.02 6.9 6.78 6.643 6.504 6.411 6.317 6.164 6.059 5.957 5.901 5.78 5.655 5.528 5.456 5.22 5.228 5.149 5.069 4.883 4.781 4.669 4.532 4.361 4.152 3.919 3.271 -7 ,12982 ,KEBNE ,16652808,Mon Nov 22 00:29:05 CET,Mon Nov 22 01:50:22 CET,0.0 0.616 0.824 0.979 1.109 1.231 1.354 1.478 1.716 1.824 1.933 1.973 2.224 2.314 2.488 2.65 2.809 2.885 3.036 3.174 3.36 3.481 3.6 3.769 3.926 4.073 4.216 4.359 4.546 4.717 4.877 5.085 5.302 5.504 5.728 5.983 6.217 6.462 6.726 7.002 7.303 7.634 7.999 8.349 8.754 9.226 9.75 10.3 10.865 11.417 11.859 11.918 11.74 11.466 11.162 10.871 10.585 10.286 10.006 9.717 9.467 9.238 9.027 8.822 8.619 8.434 8.237 8.053 7.887 7.717 7.538 7.384 7.234 7.076 6.941 6.813 6.68 6.529 6.365 6.251 6.136 5.964 5.847 5.71 5.639 5.507 5.372 5.232 5.16 4.921 4.917 4.826 4.733 4.547 4.448 4.335 4.206 4.065 3.889 3.685 3.008 -8 ,21512 ,KEBNE ,16652809,Mon Nov 22 00:30:03 CET,Mon Nov 22 01:53:38 CET,0.0 0.609 0.831 0.987 1.128 1.257 1.368 1.493 1.773 1.895 2.003 2.053 2.311 2.401 2.575 2.737 2.897 2.972 3.103 3.232 3.429 3.556 3.676 3.851 4.024 4.184 4.34 4.492 4.674 4.844 5.017 5.231 5.432 5.623 5.835 6.068 6.295 6.555 6.828 7.112 7.416 7.753 8.131 8.49 8.902 9.344 9.827 10.338 10.876 11.401 11.855 11.97 11.796 11.519 11.218 10.903 10.585 10.259 9.982 9.706 9.445 9.196 8.958 8.737 8.514 8.309 8.105 7.93 7.78 7.606 7.42 7.274 7.116 6.948 6.818 6.684 6.549 6.411 6.267 6.159 6.045 5.871 5.743 5.61 5.541 5.405 5.251 5.084 5.009 4.777 4.785 4.696 4.611 4.431 4.332 4.222 4.096 3.958 3.801 3.618 3.079 -9 ,6004 ,KEBNE ,16652810,Mon Nov 22 00:30:03 CET,Mon Nov 22 01:53:45 CET,0.0 0.43 0.621 0.793 0.943 1.095 1.25 1.387 1.62 1.724 1.827 1.862 2.115 2.207 2.38 2.543 2.691 2.758 2.894 3.029 3.208 3.319 3.431 3.59 3.748 3.914 4.076 4.22 4.395 4.571 4.742 4.947 5.151 5.343 5.559 5.81 6.057 6.311 6.569 6.844 7.13 7.456 7.836 8.203 8.608 9.037 9.514 10.012 10.545 11.08 11.546 11.681 11.576 11.348 11.03 10.691 10.391 10.104 9.848 9.566 9.301 9.063 8.833 8.621 8.417 8.233 8.041 7.861 7.705 7.542 7.371 7.211 7.043 6.878 6.75 6.623 6.49 6.351 6.209 6.103 5.989 5.807 5.676 5.543 5.476 5.339 5.212 5.08 5.005 4.774 4.796 4.723 4.645 4.48 4.384 4.273 4.147 3.994 3.826 3.621 2.923 -10 ,19312 ,KEBNE ,16652811,Mon Nov 22 00:30:03 CET,Mon Nov 22 01:53:44 CET,0.0 0.679 0.925 1.102 1.255 1.402 1.533 1.645 1.851 1.936 2.015 2.016 2.27 2.353 2.502 2.637 2.763 2.828 2.952 3.067 3.224 3.33 3.442 3.616 3.774 3.923 4.081 4.228 4.409 4.587 4.765 4.974 5.172 5.362 5.583 5.822 6.037 6.269 6.53 6.827 7.138 7.465 7.823 8.206 8.666 9.12 9.613 10.114 10.649 11.179 11.56 11.61 11.418 11.152 10.87 10.579 10.299 10.016 9.74 9.437 9.178 8.949 8.729 8.521 8.311 8.113 7.907 7.721 7.564 7.399 7.219 7.063 6.909 6.733 6.594 6.467 6.331 6.194 6.065 5.974 5.875 5.719 5.615 5.509 5.45 5.324 5.199 5.07 5.006 4.774 4.779 4.7 4.613 4.431 4.34 4.229 4.107 3.977 3.817 3.61 3.045 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 74dfa9e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11908 ,KEBNE ,16652812,Mon Nov 22 00:30:03 CET,Mon Nov 22 01:55:35 CET,0.0 0.657 0.872 1.025 1.16 1.292 1.408 1.508 1.683 1.767 1.846 1.839 2.083 2.155 2.299 2.446 2.579 2.639 2.759 2.885 3.068 3.183 3.302 3.479 3.651 3.812 3.964 4.113 4.296 4.462 4.614 4.802 4.99 5.177 5.403 5.655 5.892 6.143 6.411 6.719 7.037 7.37 7.768 8.157 8.595 9.058 9.574 10.156 10.834 11.57 12.295 12.663 12.676 12.52 12.299 12.062 11.818 11.565 11.338 11.099 10.896 10.708 10.514 10.334 10.161 10.0 9.823 9.657 9.509 9.341 9.171 9.039 8.899 8.741 8.617 8.49 8.361 8.215 8.055 7.954 7.851 7.683 7.558 7.425 7.359 7.212 7.052 6.886 6.803 6.562 6.529 6.428 6.332 6.141 6.04 5.93 5.814 5.675 5.507 5.313 4.732 -2 ,32074 ,KEBNE ,16652813,Mon Nov 22 00:30:03 CET,Mon Nov 22 01:53:41 CET,0.0 0.841 1.06 1.259 1.427 1.584 1.739 1.895 2.167 2.283 2.391 2.426 2.676 2.758 2.922 3.086 3.242 3.317 3.464 3.593 3.78 3.913 4.034 4.206 4.378 4.54 4.682 4.823 5.016 5.198 5.37 5.575 5.78 5.977 6.2 6.447 6.687 6.956 7.236 7.532 7.844 8.191 8.599 8.988 9.415 9.892 10.426 11.001 11.628 12.256 12.891 13.176 13.145 13.002 12.81 12.543 12.27 12.037 11.827 11.585 11.357 11.156 10.959 10.759 10.566 10.404 10.236 10.07 9.921 9.771 9.616 9.485 9.344 9.196 9.077 8.948 8.812 8.672 8.516 8.413 8.313 8.147 8.03 7.91 7.849 7.725 7.583 7.432 7.365 7.142 7.156 7.078 6.996 6.813 6.704 6.59 6.457 6.304 6.135 5.941 5.418 -4 ,912 ,KEBNE ,16652815,Mon Nov 22 00:30:03 CET,Mon Nov 22 01:53:46 CET,0.0 0.634 0.847 1.0 1.129 1.245 1.348 1.441 1.613 1.7 1.791 1.805 2.052 2.13 2.277 2.418 2.545 2.606 2.728 2.841 3.003 3.11 3.219 3.378 3.529 3.681 3.831 3.977 4.174 4.361 4.533 4.741 4.948 5.145 5.38 5.652 5.885 6.133 6.403 6.686 6.984 7.316 7.721 8.127 8.568 9.035 9.569 10.144 10.769 11.378 11.95 12.23 12.223 12.076 11.874 11.645 11.407 11.168 10.925 10.654 10.419 10.218 10.023 9.826 9.639 9.463 9.267 9.089 8.945 8.8 8.637 8.497 8.346 8.186 8.062 7.935 7.81 7.671 7.521 7.42 7.312 7.124 6.986 6.853 6.785 6.64 6.5 6.358 6.281 6.044 6.012 5.906 5.796 5.545 5.416 5.303 5.176 5.02 4.834 4.583 3.887 -5 ,29692 ,KEBNE ,16652816,Mon Nov 22 00:30:03 CET,Mon Nov 22 01:54:01 CET,0.0 0.561 0.731 0.892 1.025 1.14 1.241 1.339 1.53 1.624 1.725 1.755 1.999 2.083 2.253 2.423 2.583 2.657 2.794 2.928 3.129 3.256 3.378 3.547 3.706 3.866 4.022 4.171 4.363 4.548 4.72 4.933 5.142 5.334 5.549 5.793 6.035 6.294 6.569 6.851 7.142 7.469 7.845 8.232 8.685 9.177 9.712 10.265 10.896 11.607 12.263 12.573 12.582 12.462 12.291 12.06 11.835 11.64 11.445 11.212 10.993 10.791 10.591 10.399 10.219 10.052 9.872 9.702 9.536 9.365 9.2 9.059 8.916 8.768 8.648 8.519 8.379 8.232 8.077 7.964 7.85 7.681 7.564 7.443 7.376 7.242 7.108 6.95 6.866 6.624 6.624 6.549 6.478 6.321 6.236 6.132 6.003 5.856 5.689 5.472 4.841 -6 ,18341 ,KEBNE ,16652817,Mon Nov 22 00:30:03 CET,Mon Nov 22 01:53:51 CET,0.0 1.07 1.393 1.645 1.854 2.052 2.214 2.333 2.552 2.657 2.761 2.78 3.036 3.136 3.318 3.467 3.612 3.685 3.812 3.931 4.116 4.247 4.369 4.531 4.686 4.844 5.005 5.154 5.344 5.527 5.701 5.917 6.128 6.325 6.541 6.777 7.002 7.243 7.507 7.787 8.075 8.388 8.757 9.15 9.6 10.087 10.632 11.228 11.873 12.549 13.157 13.442 13.463 13.303 13.093 12.835 12.58 12.35 12.122 11.871 11.655 11.453 11.258 11.073 10.893 10.721 10.525 10.356 10.218 10.075 9.909 9.771 9.622 9.459 9.34 9.215 9.078 8.935 8.794 8.694 8.59 8.436 8.328 8.212 8.152 8.033 7.901 7.749 7.671 7.431 7.411 7.32 7.232 7.036 6.928 6.822 6.708 6.57 6.392 6.15 5.472 -7 ,27787 ,KEBNE ,16652818,Mon Nov 22 00:30:11 CET,Mon Nov 22 01:52:06 CET,0.0 0.692 0.922 1.085 1.224 1.352 1.472 1.589 1.807 1.9 1.983 1.967 2.206 2.286 2.441 2.58 2.705 2.767 2.888 3.012 3.193 3.317 3.445 3.632 3.814 3.978 4.139 4.29 4.478 4.667 4.844 5.048 5.247 5.436 5.651 5.904 6.153 6.411 6.69 6.985 7.304 7.667 8.065 8.45 8.907 9.404 9.952 10.526 11.158 11.858 12.444 12.67 12.651 12.504 12.279 12.014 11.745 11.494 11.263 11.017 10.808 10.617 10.427 10.24 10.07 9.905 9.72 9.559 9.413 9.243 9.076 8.942 8.799 8.649 8.524 8.39 8.253 8.119 7.971 7.868 7.767 7.605 7.487 7.362 7.298 7.164 7.031 6.886 6.801 6.554 6.539 6.44 6.32 6.092 5.983 5.866 5.732 5.582 5.427 5.204 4.47 -8 ,8690 ,KEBNE ,16652819,Mon Nov 22 00:30:11 CET,Mon Nov 22 01:53:12 CET,0.0 0.591 0.826 1.001 1.135 1.252 1.355 1.478 1.732 1.843 1.947 1.967 2.222 2.322 2.508 2.683 2.848 2.923 3.064 3.196 3.379 3.502 3.626 3.798 3.956 4.111 4.271 4.418 4.589 4.762 4.933 5.142 5.354 5.552 5.76 5.994 6.225 6.474 6.741 7.035 7.345 7.681 8.066 8.441 8.879 9.367 9.914 10.53 11.214 11.909 12.581 12.859 12.81 12.67 12.495 12.262 12.006 11.75 11.54 11.337 11.152 10.968 10.783 10.605 10.435 10.268 10.085 9.925 9.783 9.629 9.465 9.326 9.184 9.037 8.924 8.813 8.709 8.595 8.462 8.372 8.288 8.154 8.055 7.949 7.89 7.775 7.666 7.548 7.472 7.23 7.23 7.149 7.06 6.869 6.772 6.673 6.553 6.423 6.267 6.073 5.484 -9 ,5249 ,KEBNE ,16652820,Mon Nov 22 00:30:07 CET,Mon Nov 22 01:52:52 CET,0.0 0.704 0.951 1.112 1.246 1.382 1.516 1.64 1.843 1.929 2.005 1.998 2.241 2.314 2.458 2.597 2.729 2.796 2.942 3.091 3.289 3.411 3.531 3.698 3.867 4.03 4.178 4.324 4.518 4.693 4.853 5.05 5.254 5.453 5.668 5.91 6.145 6.403 6.687 6.993 7.301 7.644 8.055 8.48 8.967 9.47 10.039 10.628 11.253 11.924 12.525 12.791 12.766 12.625 12.449 12.222 11.991 11.781 11.564 11.311 11.086 10.89 10.7 10.53 10.358 10.179 9.993 9.825 9.665 9.493 9.334 9.196 9.04 8.886 8.765 8.638 8.498 8.35 8.202 8.1 7.992 7.827 7.708 7.575 7.509 7.374 7.245 7.127 7.065 6.838 6.849 6.769 6.689 6.514 6.414 6.295 6.155 6.0 5.821 5.562 4.992 -10 ,12725 ,KEBNE ,16652821,Mon Nov 22 00:30:03 CET,Mon Nov 22 01:54:09 CET,0.0 0.542 0.831 1.067 1.258 1.428 1.574 1.704 1.942 2.051 2.147 2.177 2.432 2.522 2.686 2.841 2.996 3.065 3.202 3.34 3.534 3.654 3.771 3.944 4.113 4.28 4.441 4.59 4.783 4.97 5.144 5.342 5.528 5.712 5.931 6.177 6.421 6.691 6.979 7.277 7.585 7.934 8.336 8.727 9.177 9.663 10.182 10.769 11.406 12.049 12.692 12.951 12.915 12.805 12.604 12.351 12.109 11.847 11.597 11.336 11.116 10.926 10.734 10.552 10.372 10.199 10.021 9.857 9.718 9.569 9.401 9.256 9.099 8.935 8.807 8.68 8.549 8.402 8.243 8.132 8.022 7.846 7.722 7.602 7.538 7.395 7.24 7.078 6.992 6.745 6.728 6.64 6.548 6.366 6.259 6.139 6.018 5.882 5.722 5.513 4.958 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt deleted file mode 100644 index a1abd39b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5992 ,KEBNE ,16652822,Mon Nov 22 00:30:03 CET,Mon Nov 22 01:54:43 CET,0.0 0.451 0.658 0.811 0.938 1.076 1.21 1.331 1.536 1.628 1.717 1.72 1.987 2.066 2.218 2.37 2.525 2.604 2.746 2.874 3.066 3.198 3.317 3.488 3.653 3.798 3.934 4.082 4.279 4.462 4.627 4.822 5.017 5.205 5.414 5.624 5.824 6.052 6.291 6.539 6.815 7.119 7.428 7.716 8.023 8.344 8.669 8.967 9.236 9.375 9.184 8.49 7.698 6.935 6.159 5.331 4.618 3.987 3.399 2.818 2.304 1.804 1.341 0.929 0.544 0.18 -0.231 -0.603 -0.904 -1.194 -1.516 -1.806 -2.108 -2.414 -2.645 -2.89 -3.152 -3.422 -3.703 -3.896 -4.094 -4.402 -4.626 -4.861 -4.976 -5.216 -5.467 -5.742 -5.891 -6.232 -6.394 -6.582 -6.776 -7.17 -7.375 -7.597 -7.832 -8.098 -8.457 -8.933 -10.655 -2 ,19706 ,KEBNE ,16652823,Mon Nov 22 00:30:03 CET,Mon Nov 22 01:54:51 CET,0.0 0.516 0.733 0.918 1.058 1.186 1.323 1.447 1.665 1.775 1.874 1.881 2.153 2.238 2.4 2.558 2.707 2.777 2.912 3.05 3.254 3.378 3.493 3.663 3.832 3.998 4.147 4.272 4.44 4.613 4.78 4.97 5.143 5.31 5.486 5.695 5.91 6.14 6.372 6.605 6.846 7.113 7.417 7.703 8.032 8.378 8.706 9.024 9.282 9.378 9.122 8.327 7.483 6.665 5.859 5.047 4.314 3.641 3.06 2.521 2.026 1.572 1.132 0.718 0.312 -0.08 -0.453 -0.796 -1.12 -1.448 -1.778 -2.067 -2.377 -2.694 -2.94 -3.185 -3.448 -3.733 -4.021 -4.213 -4.42 -4.734 -4.95 -5.187 -5.309 -5.563 -5.819 -6.082 -6.222 -6.558 -6.713 -6.9 -7.103 -7.511 -7.746 -8.003 -8.259 -8.591 -8.998 -9.452 -11.421 -3 ,26627 ,KEBNE ,16652824,Mon Nov 22 00:30:03 CET,Mon Nov 22 01:54:55 CET,0.0 0.47 0.666 0.82 0.973 1.105 1.225 1.348 1.569 1.666 1.765 1.77 2.04 2.133 2.298 2.459 2.614 2.684 2.814 2.945 3.134 3.252 3.374 3.558 3.728 3.877 4.011 4.141 4.314 4.479 4.632 4.822 5.006 5.176 5.378 5.605 5.822 6.055 6.302 6.549 6.787 7.065 7.391 7.682 8.004 8.335 8.695 9.025 9.266 9.367 8.988 8.144 7.356 6.565 5.713 4.916 4.212 3.587 3.02 2.414 1.919 1.463 0.988 0.547 0.161 -0.19 -0.565 -0.928 -1.248 -1.571 -1.908 -2.179 -2.461 -2.756 -2.987 -3.239 -3.501 -3.759 -4.029 -4.216 -4.409 -4.721 -4.94 -5.171 -5.297 -5.564 -5.83 -6.112 -6.263 -6.604 -6.741 -6.906 -7.078 -7.479 -7.731 -7.976 -8.204 -8.499 -8.845 -9.318 -10.917 -4 ,29657 ,KEBNE ,16652825,Mon Nov 22 00:31:05 CET,Mon Nov 22 01:57:20 CET,0.0 0.528 0.759 0.953 1.117 1.256 1.393 1.537 1.785 1.884 1.988 2.006 2.275 2.355 2.522 2.69 2.835 2.905 3.045 3.174 3.355 3.472 3.578 3.743 3.895 4.03 4.176 4.318 4.503 4.675 4.832 5.026 5.21 5.391 5.603 5.821 6.023 6.242 6.468 6.696 6.939 7.222 7.555 7.859 8.171 8.519 8.888 9.202 9.409 9.462 9.134 8.359 7.512 6.619 5.823 5.094 4.411 3.793 3.243 2.68 2.168 1.677 1.235 0.817 0.404 0.036 -0.356 -0.703 -0.996 -1.312 -1.65 -1.934 -2.222 -2.533 -2.772 -3.022 -3.284 -3.55 -3.829 -4.019 -4.206 -4.494 -4.709 -4.941 -5.06 -5.298 -5.547 -5.825 -5.973 -6.305 -6.397 -6.534 -6.678 -7.041 -7.246 -7.454 -7.714 -8.022 -8.371 -8.872 -10.309 -5 ,18665 ,KEBNE ,16652826,Mon Nov 22 00:31:05 CET,Mon Nov 22 01:55:47 CET,0.0 0.446 0.676 0.895 1.076 1.23 1.384 1.526 1.773 1.886 1.987 2.011 2.281 2.368 2.555 2.729 2.884 2.959 3.099 3.231 3.435 3.565 3.68 3.852 4.017 4.17 4.312 4.44 4.615 4.783 4.939 5.132 5.32 5.503 5.712 5.929 6.13 6.359 6.591 6.814 7.068 7.362 7.676 7.979 8.321 8.674 9.022 9.347 9.642 9.801 9.534 8.749 7.856 6.943 6.13 5.379 4.697 4.048 3.448 2.845 2.32 1.849 1.411 0.97 0.555 0.203 -0.194 -0.553 -0.85 -1.159 -1.477 -1.735 -2.008 -2.306 -2.545 -2.799 -3.06 -3.325 -3.628 -3.845 -4.061 -4.382 -4.602 -4.831 -4.952 -5.221 -5.51 -5.802 -5.953 -6.301 -6.448 -6.622 -6.808 -7.202 -7.413 -7.632 -7.892 -8.217 -8.577 -8.995 -10.551 -6 ,24305 ,KEBNE ,16652827,Mon Nov 22 00:31:05 CET,Mon Nov 22 01:55:46 CET,0.0 0.629 0.857 1.031 1.174 1.302 1.441 1.563 1.768 1.874 1.972 1.961 2.213 2.282 2.431 2.59 2.745 2.817 2.955 3.088 3.284 3.401 3.51 3.678 3.835 3.993 4.144 4.278 4.457 4.612 4.753 4.933 5.113 5.296 5.494 5.712 5.931 6.173 6.43 6.693 6.952 7.237 7.568 7.875 8.205 8.536 8.871 9.196 9.448 9.48 9.132 8.352 7.451 6.618 5.857 5.109 4.438 3.791 3.201 2.591 2.039 1.548 1.094 0.647 0.222 -0.133 -0.511 -0.866 -1.16 -1.461 -1.782 -2.06 -2.367 -2.697 -2.948 -3.203 -3.47 -3.732 -4.007 -4.213 -4.428 -4.754 -4.97 -5.197 -5.325 -5.594 -5.878 -6.17 -6.309 -6.64 -6.763 -6.932 -7.102 -7.465 -7.683 -7.905 -8.157 -8.436 -8.761 -9.202 -10.592 -7 ,30711 ,KEBNE ,16652828,Mon Nov 22 00:31:05 CET,Mon Nov 22 01:57:26 CET,0.0 0.521 0.764 0.924 1.053 1.188 1.315 1.424 1.623 1.718 1.817 1.838 2.107 2.192 2.355 2.516 2.671 2.745 2.887 3.019 3.213 3.345 3.468 3.642 3.804 3.959 4.111 4.254 4.425 4.582 4.741 4.944 5.142 5.322 5.514 5.724 5.925 6.151 6.384 6.608 6.855 7.143 7.446 7.724 8.055 8.406 8.734 9.035 9.309 9.505 9.27 8.402 7.521 6.75 6.031 5.346 4.69 4.053 3.494 2.907 2.397 1.937 1.492 1.071 0.657 0.279 -0.103 -0.44 -0.743 -1.078 -1.422 -1.706 -1.986 -2.27 -2.508 -2.745 -2.985 -3.234 -3.497 -3.685 -3.885 -4.203 -4.438 -4.687 -4.807 -5.068 -5.335 -5.602 -5.747 -6.085 -6.186 -6.34 -6.535 -6.917 -7.102 -7.335 -7.589 -7.876 -8.231 -8.703 -10.06 -8 ,3475 ,KEBNE ,16652829,Mon Nov 22 00:32:07 CET,Mon Nov 22 01:57:08 CET,0.0 0.578 0.829 1.023 1.179 1.315 1.448 1.569 1.783 1.877 1.974 1.988 2.259 2.34 2.491 2.638 2.784 2.853 2.974 3.094 3.273 3.382 3.489 3.649 3.802 3.951 4.093 4.227 4.396 4.561 4.72 4.906 5.067 5.212 5.394 5.607 5.804 6.022 6.265 6.533 6.804 7.073 7.386 7.686 8.019 8.38 8.73 9.033 9.285 9.383 9.061 8.241 7.351 6.475 5.643 4.877 4.206 3.529 2.916 2.343 1.828 1.352 0.918 0.498 0.095 -0.268 -0.655 -1.004 -1.31 -1.627 -1.936 -2.204 -2.513 -2.822 -3.052 -3.286 -3.525 -3.782 -4.044 -4.226 -4.429 -4.753 -4.962 -5.19 -5.316 -5.556 -5.807 -6.096 -6.257 -6.599 -6.708 -6.866 -7.028 -7.377 -7.583 -7.828 -8.121 -8.432 -8.759 -9.262 -11.175 -9 ,22547 ,KEBNE ,16652830,Mon Nov 22 00:32:07 CET,Mon Nov 22 01:58:55 CET,0.0 0.735 0.941 1.1 1.233 1.355 1.467 1.57 1.76 1.854 1.947 1.945 2.212 2.291 2.436 2.573 2.706 2.767 2.888 3.017 3.223 3.364 3.491 3.656 3.801 3.941 4.087 4.232 4.407 4.572 4.728 4.915 5.104 5.279 5.48 5.713 5.917 6.135 6.366 6.598 6.853 7.134 7.429 7.706 8.021 8.383 8.775 9.076 9.334 9.504 9.377 8.685 7.769 6.889 6.053 5.288 4.607 3.962 3.403 2.829 2.332 1.895 1.461 1.033 0.634 0.272 -0.114 -0.468 -0.766 -1.066 -1.377 -1.638 -1.925 -2.223 -2.453 -2.703 -2.953 -3.213 -3.484 -3.673 -3.886 -4.218 -4.444 -4.687 -4.809 -5.06 -5.334 -5.625 -5.783 -6.13 -6.279 -6.445 -6.62 -7.016 -7.244 -7.505 -7.789 -8.124 -8.514 -9.019 -10.62 -10 ,32188 ,KEBNE ,16652831,Mon Nov 22 00:34:13 CET,Mon Nov 22 01:59:13 CET,0.0 0.371 0.605 0.803 0.953 1.078 1.188 1.299 1.537 1.641 1.729 1.706 1.969 2.05 2.187 2.326 2.453 2.51 2.627 2.742 2.909 3.018 3.128 3.28 3.417 3.55 3.684 3.815 3.987 4.156 4.314 4.49 4.663 4.835 5.034 5.27 5.49 5.71 5.949 6.199 6.438 6.707 7.032 7.331 7.636 7.944 8.257 8.542 8.782 8.892 8.573 7.72 6.852 6.013 5.184 4.42 3.723 3.053 2.469 1.892 1.401 0.94 0.471 0.025 -0.372 -0.721 -1.087 -1.422 -1.726 -2.035 -2.352 -2.623 -2.919 -3.229 -3.468 -3.719 -3.985 -4.27 -4.551 -4.748 -4.956 -5.277 -5.493 -5.715 -5.845 -6.123 -6.4 -6.669 -6.803 -7.137 -7.261 -7.419 -7.568 -7.896 -8.097 -8.317 -8.565 -8.855 -9.191 -9.655 -10.977 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 5fac051e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4270 ,KEBNE ,16652832,Mon Nov 22 00:34:13 CET,Mon Nov 22 01:58:42 CET,0.0 1.047 1.379 1.621 1.849 2.02 2.169 2.308 2.596 2.754 2.898 2.968 3.26 3.368 3.559 3.74 3.916 4.003 4.184 4.356 4.597 4.758 4.921 5.154 5.363 5.567 5.775 5.97 6.221 6.461 6.692 6.979 7.251 7.53 7.883 8.253 8.579 8.944 9.345 9.783 10.248 10.764 11.362 11.962 12.674 13.454 14.322 15.321 16.464 17.768 19.18 20.025 20.342 20.393 20.337 20.146 19.879 19.614 19.359 19.076 18.799 18.545 18.297 18.06 17.816 17.573 17.301 17.061 16.859 16.643 16.396 16.181 15.954 15.71 15.521 15.325 15.115 14.895 14.656 14.495 14.333 14.076 13.901 13.707 13.598 13.361 13.117 12.867 12.727 12.41 12.267 12.106 11.912 11.481 11.254 11.002 10.728 10.387 9.929 9.314 7.521 -2 ,18078 ,KEBNE ,16652833,Mon Nov 22 00:34:17 CET,Mon Nov 22 01:58:23 CET,0.0 1.041 1.356 1.639 1.904 2.106 2.263 2.426 2.741 2.873 2.99 3.029 3.321 3.43 3.641 3.858 4.063 4.154 4.33 4.501 4.747 4.901 5.051 5.28 5.489 5.69 5.897 6.099 6.349 6.587 6.82 7.095 7.369 7.634 7.932 8.281 8.627 9.003 9.397 9.817 10.273 10.791 11.389 12.003 12.722 13.527 14.461 15.494 16.671 18.007 19.522 20.545 20.883 20.932 20.84 20.616 20.359 20.139 19.883 19.54 19.267 19.042 18.788 18.515 18.257 18.019 17.747 17.477 17.249 17.012 16.77 16.546 16.293 16.021 15.795 15.567 15.339 15.101 14.836 14.649 14.467 14.193 13.987 13.776 13.657 13.385 13.132 12.873 12.733 12.424 12.257 12.084 11.916 11.539 11.312 11.015 10.688 10.324 9.872 9.262 6.836 -3 ,2865 ,KEBNE ,16652834,Mon Nov 22 00:34:13 CET,Mon Nov 22 01:58:34 CET,0.0 1.273 1.625 1.858 2.047 2.21 2.364 2.512 2.794 2.919 3.04 3.084 3.359 3.457 3.645 3.819 4.005 4.096 4.262 4.422 4.641 4.775 4.91 5.114 5.316 5.531 5.753 5.973 6.257 6.531 6.812 7.144 7.458 7.762 8.092 8.426 8.748 9.107 9.499 9.919 10.357 10.856 11.43 11.997 12.681 13.502 14.519 15.645 16.863 18.204 19.682 20.684 21.048 21.139 21.072 20.903 20.67 20.422 20.167 19.864 19.593 19.329 19.048 18.789 18.552 18.32 18.067 17.839 17.632 17.413 17.185 16.986 16.751 16.489 16.3 16.107 15.89 15.664 15.435 15.272 15.103 14.837 14.654 14.443 14.337 14.148 13.926 13.687 13.553 13.236 13.103 12.948 12.777 12.388 12.172 11.94 11.635 11.253 10.848 10.363 8.347 -4 ,11061 ,KEBNE ,16652835,Mon Nov 22 00:34:13 CET,Mon Nov 22 01:58:41 CET,0.0 0.957 1.283 1.503 1.726 1.934 2.126 2.3 2.57 2.683 2.788 2.799 3.072 3.173 3.364 3.528 3.693 3.777 3.932 4.077 4.3 4.453 4.606 4.821 5.035 5.26 5.46 5.654 5.911 6.154 6.377 6.644 6.918 7.179 7.489 7.843 8.182 8.546 8.93 9.347 9.802 10.306 10.876 11.469 12.176 12.961 13.858 14.853 16.002 17.282 18.619 19.508 19.909 20.043 20.017 19.847 19.606 19.353 19.118 18.859 18.604 18.371 18.14 17.908 17.673 17.444 17.204 16.974 16.756 16.527 16.281 16.08 15.875 15.639 15.45 15.258 15.045 14.812 14.574 14.403 14.231 13.954 13.745 13.548 13.449 13.257 13.051 12.805 12.679 12.381 12.231 12.072 11.909 11.536 11.314 11.071 10.773 10.445 10.077 9.434 6.949 -5 ,2178 ,KEBNE ,16652836,Mon Nov 22 00:36:18 CET,Mon Nov 22 02:00:52 CET,0.0 0.854 1.178 1.432 1.595 1.745 1.902 2.074 2.407 2.551 2.681 2.744 3.037 3.14 3.332 3.517 3.687 3.766 3.929 4.105 4.381 4.556 4.708 4.919 5.142 5.351 5.559 5.771 6.021 6.263 6.502 6.801 7.087 7.364 7.681 8.03 8.372 8.739 9.127 9.55 10.002 10.524 11.132 11.729 12.406 13.188 14.065 15.017 16.168 17.513 18.983 19.957 20.331 20.467 20.457 20.32 20.129 19.914 19.692 19.404 19.111 18.856 18.603 18.336 18.09 17.858 17.593 17.353 17.152 16.953 16.73 16.508 16.267 16.017 15.815 15.602 15.39 15.178 14.938 14.769 14.593 14.314 14.121 13.918 13.808 13.564 13.3 13.002 12.834 12.494 12.29 12.094 11.883 11.417 11.152 10.855 10.546 10.211 9.82 9.208 7.055 -6 ,2866 ,KEBNE ,16652837,Mon Nov 22 00:36:18 CET,Mon Nov 22 02:00:44 CET,0.0 0.805 1.135 1.365 1.555 1.727 1.874 2.018 2.313 2.456 2.582 2.628 2.906 3.004 3.206 3.396 3.58 3.669 3.843 4.018 4.265 4.419 4.574 4.82 5.068 5.29 5.483 5.672 5.926 6.166 6.393 6.67 6.949 7.222 7.537 7.888 8.213 8.565 8.954 9.381 9.828 10.331 10.922 11.537 12.25 13.025 13.928 14.951 16.133 17.494 19.005 20.012 20.402 20.493 20.416 20.191 19.902 19.617 19.391 19.138 18.872 18.615 18.37 18.116 17.878 17.658 17.394 17.142 16.914 16.687 16.476 16.284 16.056 15.823 15.633 15.442 15.251 15.045 14.832 14.659 14.473 14.192 13.992 13.785 13.671 13.43 13.182 12.941 12.804 12.487 12.326 12.158 11.964 11.487 11.217 10.906 10.551 10.183 9.748 9.184 6.271 -7 ,18483 ,KEBNE ,16652838,Mon Nov 22 00:36:20 CET,Mon Nov 22 01:59:27 CET,0.0 1.02 1.35 1.638 1.845 1.988 2.117 2.252 2.538 2.68 2.807 2.839 3.119 3.23 3.459 3.651 3.815 3.899 4.065 4.226 4.461 4.614 4.753 4.961 5.176 5.384 5.589 5.789 6.054 6.3 6.54 6.829 7.103 7.366 7.671 8.031 8.368 8.731 9.126 9.551 10.027 10.548 11.135 11.732 12.441 13.308 14.274 15.299 16.467 17.694 19.032 19.977 20.363 20.461 20.358 20.149 19.92 19.68 19.444 19.168 18.909 18.67 18.411 18.134 17.876 17.637 17.358 17.097 16.894 16.685 16.439 16.216 15.997 15.754 15.552 15.351 15.141 14.919 14.678 14.511 14.342 14.064 13.861 13.643 13.532 13.326 13.107 12.858 12.721 12.424 12.307 12.156 11.98 11.576 11.368 11.125 10.837 10.504 10.108 9.594 7.335 -9 ,3159 ,KEBNE ,16652840,Mon Nov 22 00:37:20 CET,Mon Nov 22 02:01:47 CET,0.0 0.934 1.263 1.528 1.765 1.955 2.123 2.295 2.594 2.718 2.834 2.871 3.164 3.282 3.512 3.741 3.958 4.053 4.214 4.382 4.665 4.838 4.989 5.204 5.407 5.607 5.804 5.99 6.246 6.501 6.738 7.03 7.315 7.592 7.915 8.279 8.616 8.972 9.356 9.765 10.19 10.672 11.274 11.889 12.588 13.381 14.293 15.268 16.41 17.722 19.134 20.156 20.505 20.573 20.541 20.385 20.148 19.902 19.666 19.386 19.094 18.814 18.569 18.356 18.138 17.916 17.669 17.442 17.248 17.039 16.782 16.556 16.333 16.096 15.901 15.697 15.457 15.197 14.966 14.83 14.673 14.416 14.238 14.052 13.96 13.75 13.527 13.288 13.171 12.892 12.746 12.575 12.39 11.959 11.717 11.453 11.163 10.852 10.477 9.924 7.565 -10 ,15200 ,KEBNE ,16652841,Mon Nov 22 00:37:20 CET,Mon Nov 22 02:01:59 CET,0.0 1.034 1.349 1.595 1.84 2.043 2.231 2.416 2.746 2.898 3.042 3.122 3.41 3.506 3.692 3.87 4.048 4.137 4.314 4.478 4.705 4.866 5.019 5.229 5.443 5.655 5.865 6.078 6.347 6.588 6.821 7.111 7.388 7.649 7.979 8.38 8.768 9.195 9.637 10.079 10.528 11.03 11.62 12.208 12.902 13.661 14.525 15.517 16.666 17.97 19.376 20.38 20.801 20.863 20.766 20.585 20.377 20.135 19.886 19.632 19.406 19.184 18.942 18.694 18.448 18.189 17.893 17.627 17.392 17.134 16.836 16.589 16.341 16.086 15.892 15.694 15.482 15.254 15.002 14.824 14.643 14.354 14.149 13.919 13.796 13.555 13.301 13.025 12.88 12.543 12.325 12.123 11.921 11.53 11.31 11.058 10.789 10.471 10.053 9.453 7.279 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 017e21b5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1044 ,KEBNE ,16652842,Mon Nov 22 00:37:20 CET,Mon Nov 22 02:00:59 CET,0.0 0.512 0.725 0.894 1.046 1.169 1.269 1.366 1.561 1.65 1.732 1.725 1.964 2.041 2.2 2.358 2.504 2.572 2.705 2.837 3.034 3.151 3.26 3.429 3.601 3.765 3.914 4.056 4.229 4.391 4.553 4.752 4.936 5.107 5.308 5.557 5.787 6.022 6.271 6.524 6.783 7.08 7.432 7.776 8.155 8.548 9.014 9.516 10.034 10.546 10.926 10.945 10.761 10.511 10.211 9.87 9.555 9.26 8.978 8.677 8.439 8.222 7.988 7.759 7.55 7.36 7.156 6.974 6.813 6.648 6.476 6.328 6.177 6.017 5.892 5.763 5.63 5.5 5.357 5.252 5.152 4.997 4.89 4.785 4.724 4.596 4.482 4.36 4.29 4.057 4.056 3.965 3.879 3.703 3.6 3.491 3.359 3.198 3.013 2.801 2.213 -2 ,13536 ,KEBNE ,16652843,Mon Nov 22 00:37:20 CET,Mon Nov 22 02:01:07 CET,0.0 0.626 0.804 0.942 1.079 1.203 1.329 1.448 1.652 1.743 1.826 1.837 2.083 2.161 2.305 2.441 2.567 2.622 2.731 2.846 3.015 3.121 3.224 3.379 3.543 3.692 3.832 3.968 4.148 4.32 4.476 4.67 4.859 5.035 5.236 5.454 5.655 5.877 6.121 6.383 6.663 6.981 7.329 7.667 8.038 8.449 8.927 9.39 9.871 10.385 10.77 10.79 10.606 10.298 9.974 9.643 9.323 9.034 8.786 8.53 8.294 8.083 7.872 7.651 7.442 7.25 7.044 6.862 6.699 6.524 6.346 6.193 6.038 5.887 5.765 5.639 5.5 5.354 5.211 5.114 5.014 4.858 4.755 4.65 4.592 4.473 4.345 4.2 4.123 3.885 3.886 3.805 3.712 3.504 3.407 3.306 3.191 3.063 2.911 2.704 2.078 -3 ,21358 ,KEBNE ,16652844,Mon Nov 22 00:37:20 CET,Mon Nov 22 02:01:12 CET,0.0 0.541 0.771 0.926 1.058 1.168 1.27 1.363 1.544 1.629 1.712 1.725 1.967 2.04 2.182 2.308 2.43 2.489 2.599 2.705 2.876 2.992 3.105 3.28 3.439 3.586 3.726 3.858 4.028 4.188 4.343 4.533 4.716 4.904 5.118 5.338 5.555 5.797 6.049 6.312 6.589 6.894 7.233 7.564 7.946 8.359 8.813 9.288 9.809 10.339 10.799 10.913 10.76 10.487 10.141 9.803 9.489 9.182 8.911 8.637 8.386 8.161 7.947 7.737 7.533 7.348 7.161 6.99 6.819 6.634 6.458 6.306 6.143 5.98 5.859 5.732 5.583 5.421 5.265 5.155 5.042 4.856 4.731 4.606 4.539 4.398 4.249 4.093 4.003 3.743 3.698 3.587 3.475 3.27 3.131 2.971 2.804 2.593 2.365 2.149 1.668 -4 ,6957 ,KEBNE ,16652845,Mon Nov 22 00:37:20 CET,Mon Nov 22 02:01:06 CET,0.0 0.611 0.815 0.974 1.108 1.228 1.345 1.466 1.697 1.808 1.912 1.932 2.179 2.281 2.458 2.605 2.741 2.803 2.932 3.069 3.267 3.387 3.503 3.668 3.817 3.969 4.114 4.25 4.417 4.581 4.749 4.948 5.138 5.322 5.529 5.75 5.956 6.183 6.423 6.677 6.943 7.223 7.54 7.869 8.254 8.661 9.114 9.593 10.109 10.634 11.04 11.1 10.929 10.624 10.293 9.968 9.648 9.337 9.061 8.789 8.552 8.336 8.126 7.915 7.709 7.516 7.302 7.118 6.961 6.785 6.609 6.445 6.256 6.078 5.957 5.828 5.687 5.544 5.383 5.273 5.161 4.993 4.879 4.748 4.675 4.505 4.324 4.154 4.079 3.845 3.847 3.769 3.691 3.522 3.425 3.323 3.202 3.048 2.882 2.699 2.071 -5 ,24743 ,KEBNE ,16652846,Mon Nov 22 00:37:20 CET,Mon Nov 22 02:01:11 CET,0.0 0.588 0.783 0.935 1.071 1.189 1.296 1.395 1.586 1.681 1.769 1.759 1.994 2.063 2.196 2.327 2.448 2.508 2.63 2.747 2.91 3.013 3.112 3.264 3.413 3.555 3.703 3.846 4.025 4.195 4.353 4.541 4.72 4.895 5.102 5.332 5.544 5.774 6.014 6.269 6.544 6.851 7.212 7.558 7.942 8.37 8.832 9.309 9.849 10.416 10.793 10.792 10.621 10.334 10.001 9.663 9.343 9.049 8.789 8.519 8.291 8.076 7.872 7.687 7.495 7.303 7.093 6.905 6.749 6.581 6.414 6.271 6.108 5.939 5.811 5.678 5.533 5.388 5.244 5.129 4.998 4.813 4.693 4.566 4.503 4.374 4.225 4.057 3.967 3.716 3.678 3.589 3.503 3.311 3.21 3.103 2.972 2.808 2.624 2.372 1.643 -6 ,10181 ,KEBNE ,16652847,Mon Nov 22 00:37:20 CET,Mon Nov 22 02:01:13 CET,0.0 0.606 0.8 0.949 1.077 1.195 1.313 1.42 1.61 1.695 1.769 1.745 1.981 2.054 2.193 2.34 2.491 2.566 2.709 2.853 3.058 3.178 3.282 3.434 3.593 3.737 3.876 4.021 4.202 4.363 4.518 4.706 4.888 5.069 5.271 5.488 5.7 5.938 6.193 6.456 6.728 7.028 7.367 7.719 8.113 8.55 9.07 9.59 10.088 10.6 11.06 11.156 10.943 10.659 10.38 10.082 9.782 9.501 9.251 8.974 8.723 8.491 8.268 8.057 7.859 7.668 7.468 7.288 7.12 6.935 6.754 6.608 6.448 6.29 6.168 6.05 5.933 5.81 5.681 5.585 5.483 5.328 5.231 5.132 5.077 4.962 4.839 4.706 4.634 4.401 4.403 4.321 4.24 4.067 3.971 3.862 3.739 3.595 3.413 3.169 2.354 -7 ,695 ,KEBNE ,16652848,Mon Nov 22 00:38:23 CET,Mon Nov 22 02:02:02 CET,0.0 0.727 1.029 1.298 1.53 1.727 1.896 2.037 2.287 2.415 2.54 2.59 2.84 2.924 3.096 3.266 3.408 3.475 3.602 3.721 3.9 4.018 4.134 4.299 4.457 4.61 4.75 4.891 5.078 5.247 5.409 5.609 5.799 5.968 6.163 6.378 6.58 6.819 7.089 7.367 7.646 7.948 8.297 8.654 9.049 9.469 9.931 10.399 10.884 11.357 11.737 11.749 11.537 11.242 10.914 10.584 10.26 9.963 9.72 9.451 9.192 8.956 8.721 8.486 8.276 8.092 7.892 7.712 7.556 7.386 7.208 7.072 6.93 6.773 6.651 6.521 6.381 6.244 6.116 6.025 5.925 5.779 5.669 5.55 5.492 5.371 5.242 5.112 5.044 4.812 4.831 4.755 4.671 4.471 4.359 4.244 4.137 4.01 3.839 3.6 3.083 -9 ,22862 ,KEBNE ,16652850,Mon Nov 22 00:38:27 CET,Mon Nov 22 02:02:11 CET,0.0 0.604 0.798 0.946 1.09 1.229 1.339 1.428 1.591 1.672 1.761 1.771 2.01 2.082 2.221 2.35 2.469 2.539 2.68 2.812 2.999 3.12 3.235 3.383 3.532 3.679 3.82 3.964 4.156 4.336 4.499 4.698 4.886 5.071 5.298 5.532 5.744 5.974 6.219 6.48 6.744 7.03 7.354 7.691 8.101 8.53 8.99 9.466 9.95 10.455 10.863 10.886 10.669 10.363 10.063 9.754 9.442 9.141 8.867 8.593 8.355 8.127 7.907 7.698 7.489 7.289 7.085 6.91 6.746 6.57 6.39 6.239 6.083 5.921 5.787 5.645 5.495 5.348 5.191 5.082 4.982 4.823 4.701 4.584 4.529 4.41 4.279 4.142 4.07 3.837 3.854 3.77 3.677 3.483 3.372 3.26 3.141 3.006 2.856 2.644 2.029 -10 ,11599 ,KEBNE ,16652851,Mon Nov 22 00:38:23 CET,Mon Nov 22 02:02:08 CET,0.0 0.514 0.715 0.895 1.036 1.165 1.289 1.393 1.58 1.671 1.754 1.754 1.996 2.073 2.21 2.334 2.455 2.511 2.616 2.725 2.904 3.02 3.129 3.285 3.437 3.584 3.726 3.862 4.035 4.205 4.374 4.56 4.727 4.899 5.105 5.329 5.535 5.762 6.008 6.268 6.536 6.838 7.19 7.533 7.928 8.351 8.817 9.328 9.863 10.375 10.804 10.924 10.772 10.506 10.203 9.872 9.556 9.267 9.019 8.746 8.496 8.281 8.075 7.872 7.673 7.49 7.293 7.107 6.95 6.779 6.604 6.467 6.311 6.145 6.02 5.885 5.745 5.598 5.443 5.34 5.236 5.08 4.963 4.828 4.762 4.644 4.521 4.375 4.295 4.057 4.06 3.973 3.883 3.717 3.62 3.514 3.406 3.279 3.125 2.919 2.166 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 86c068dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14184 ,TETRA ,17982552,Tue Dec 21 08:41:43 CET,Tue Dec 21 10:18:33 CET,0.0 0.608 0.822 0.972 1.086 1.201 1.315 1.421 1.614 1.704 1.793 1.769 2.042 2.131 2.305 2.462 2.606 2.679 2.828 2.971 3.164 3.291 3.416 3.6 3.784 3.955 4.116 4.276 4.501 4.727 4.936 5.184 5.437 5.701 6.016 6.376 6.731 7.122 7.53 7.969 8.456 8.986 9.596 10.219 10.969 11.813 12.777 13.868 15.141 16.638 18.381 19.681 20.354 20.689 20.801 20.821 20.775 20.68 20.584 20.45 20.291 20.132 19.975 19.834 19.696 19.544 19.364 19.198 19.056 18.911 18.75 18.6 18.433 18.239 18.071 17.901 17.734 17.548 17.354 17.222 17.066 16.82 16.648 16.454 16.37 16.196 15.984 15.764 15.645 15.353 15.243 15.099 14.935 14.542 14.328 14.061 13.716 13.292 12.728 11.98 8.594 -2 ,1219 ,TETRA ,17982553,Tue Dec 21 08:41:38 CET,Tue Dec 21 10:17:55 CET,0.0 0.557 0.77 0.939 1.089 1.212 1.329 1.442 1.652 1.747 1.834 1.825 2.101 2.188 2.347 2.499 2.642 2.71 2.849 2.989 3.191 3.317 3.445 3.629 3.81 3.997 4.175 4.348 4.574 4.785 4.99 5.241 5.485 5.733 6.035 6.383 6.722 7.091 7.483 7.903 8.351 8.87 9.485 10.112 10.852 11.674 12.655 13.769 15.039 16.509 18.259 19.59 20.255 20.606 20.781 20.801 20.752 20.683 20.589 20.46 20.337 20.192 20.017 19.847 19.683 19.523 19.345 19.199 19.075 18.918 18.746 18.588 18.408 18.234 18.1 17.956 17.792 17.615 17.436 17.311 17.17 16.927 16.75 16.561 16.459 16.237 16.035 15.837 15.721 15.425 15.332 15.211 15.057 14.678 14.465 14.15 13.781 13.402 12.969 12.29 8.384 -3 ,29340 ,TETRA ,17982554,Tue Dec 21 08:41:39 CET,Tue Dec 21 10:16:30 CET,0.0 0.36 0.552 0.708 0.849 0.976 1.091 1.199 1.411 1.509 1.603 1.595 1.868 1.953 2.122 2.272 2.409 2.479 2.619 2.753 2.945 3.069 3.192 3.376 3.563 3.744 3.924 4.099 4.333 4.575 4.8 5.071 5.331 5.584 5.888 6.227 6.558 6.943 7.363 7.797 8.259 8.791 9.405 10.038 10.812 11.682 12.687 13.847 15.199 16.747 18.559 19.882 20.513 20.823 20.976 21.036 21.006 20.931 20.818 20.706 20.587 20.43 20.266 20.108 19.958 19.813 19.645 19.479 19.333 19.172 18.976 18.812 18.651 18.487 18.345 18.163 17.973 17.777 17.565 17.417 17.26 17.011 16.835 16.64 16.526 16.274 16.016 15.728 15.573 15.27 15.116 14.934 14.745 14.334 14.101 13.825 13.498 13.132 12.612 11.823 4.105 -4 ,26217 ,TETRA ,17982555,Tue Dec 21 08:41:44 CET,Tue Dec 21 10:16:25 CET,0.0 0.398 0.587 0.742 0.871 0.989 1.095 1.197 1.391 1.483 1.575 1.562 1.831 1.908 2.065 2.211 2.356 2.431 2.576 2.708 2.9 3.029 3.153 3.328 3.502 3.679 3.855 4.02 4.233 4.445 4.652 4.92 5.195 5.459 5.765 6.122 6.471 6.839 7.247 7.698 8.171 8.704 9.332 9.963 10.699 11.557 12.585 13.742 15.091 16.617 18.305 19.65 20.383 20.72 20.853 20.878 20.841 20.756 20.62 20.448 20.291 20.146 19.993 19.816 19.632 19.464 19.277 19.095 18.933 18.762 18.566 18.406 18.242 18.058 17.917 17.767 17.599 17.423 17.233 17.101 16.97 16.759 16.608 16.454 16.375 16.192 15.973 15.708 15.554 15.228 15.106 14.96 14.765 14.349 14.108 13.833 13.535 13.178 12.69 11.921 8.445 -5 ,4034 ,TETRA ,17982556,Tue Dec 21 08:41:39 CET,Tue Dec 21 10:16:31 CET,0.0 0.547 0.733 0.874 0.992 1.103 1.207 1.303 1.483 1.573 1.662 1.636 1.906 1.985 2.129 2.273 2.421 2.492 2.632 2.771 2.974 3.105 3.229 3.416 3.609 3.797 3.982 4.164 4.404 4.636 4.86 5.126 5.378 5.635 5.941 6.289 6.639 7.015 7.413 7.841 8.292 8.809 9.437 10.081 10.82 11.665 12.66 13.813 15.182 16.746 18.539 19.837 20.507 20.831 20.969 20.999 20.96 20.875 20.76 20.608 20.437 20.274 20.107 19.947 19.801 19.651 19.462 19.276 19.112 18.941 18.783 18.643 18.467 18.263 18.095 17.918 17.743 17.563 17.362 17.229 17.086 16.838 16.664 16.484 16.383 16.149 15.928 15.708 15.58 15.279 15.163 15.022 14.869 14.483 14.237 13.966 13.679 13.332 12.922 12.297 8.874 -6 ,26657 ,TETRA ,17982557,Tue Dec 21 08:41:41 CET,Tue Dec 21 10:16:36 CET,0.0 0.505 0.676 0.821 0.957 1.08 1.19 1.3 1.519 1.62 1.719 1.71 1.985 2.067 2.222 2.369 2.508 2.577 2.707 2.835 3.03 3.161 3.289 3.473 3.657 3.839 4.019 4.191 4.42 4.653 4.875 5.148 5.419 5.694 6.016 6.378 6.72 7.096 7.521 7.964 8.427 8.941 9.545 10.185 10.937 11.765 12.748 13.876 15.214 16.776 18.539 19.884 20.521 20.846 21.018 21.041 20.976 20.899 20.79 20.637 20.491 20.345 20.185 20.025 19.872 19.723 19.566 19.401 19.254 19.1 18.94 18.809 18.663 18.486 18.341 18.187 18.018 17.83 17.634 17.501 17.347 17.087 16.916 16.736 16.642 16.443 16.219 15.967 15.838 15.554 15.414 15.237 15.055 14.65 14.391 14.085 13.74 13.376 12.954 12.252 8.127 -7 ,13766 ,TETRA ,17982558,Tue Dec 21 08:41:40 CET,Tue Dec 21 10:18:12 CET,0.0 0.397 0.586 0.738 0.874 0.999 1.111 1.215 1.419 1.519 1.61 1.597 1.862 1.938 2.084 2.226 2.361 2.424 2.557 2.69 2.876 2.999 3.122 3.294 3.469 3.644 3.813 3.981 4.204 4.421 4.631 4.882 5.12 5.361 5.641 5.965 6.292 6.641 7.037 7.463 7.904 8.428 9.067 9.704 10.454 11.316 12.321 13.51 14.876 16.34 18.044 19.346 19.922 20.214 20.35 20.372 20.305 20.166 20.029 19.873 19.708 19.549 19.387 19.216 19.051 18.895 18.698 18.519 18.365 18.19 18.013 17.862 17.691 17.497 17.352 17.206 17.054 16.883 16.705 16.587 16.442 16.209 16.078 15.941 15.86 15.69 15.485 15.269 15.145 14.846 14.726 14.569 14.394 13.998 13.779 13.513 13.196 12.808 12.285 11.516 8.072 -8 ,31567 ,TETRA ,17982559,Tue Dec 21 08:41:40 CET,Tue Dec 21 10:18:09 CET,0.0 0.5 0.673 0.828 0.947 1.061 1.178 1.286 1.486 1.577 1.662 1.639 1.908 1.987 2.147 2.302 2.441 2.511 2.646 2.778 2.976 3.109 3.241 3.433 3.631 3.815 3.994 4.183 4.433 4.67 4.907 5.204 5.488 5.756 6.048 6.374 6.698 7.069 7.47 7.901 8.376 8.905 9.503 10.119 10.874 11.716 12.671 13.753 15.026 16.486 18.151 19.4 20.009 20.279 20.337 20.307 20.26 20.195 20.082 19.937 19.813 19.681 19.536 19.391 19.238 19.088 18.92 18.755 18.605 18.45 18.286 18.147 17.987 17.804 17.655 17.488 17.33 17.173 16.972 16.816 16.672 16.454 16.305 16.136 16.03 15.823 15.622 15.382 15.252 14.959 14.816 14.624 14.431 14.05 13.813 13.544 13.233 12.851 12.369 11.613 8.435 -9 ,23965 ,TETRA ,17982560,Tue Dec 21 08:41:42 CET,Tue Dec 21 10:16:17 CET,0.0 0.582 0.765 0.899 1.024 1.147 1.261 1.364 1.556 1.652 1.748 1.741 2.016 2.102 2.257 2.407 2.553 2.624 2.764 2.898 3.107 3.246 3.389 3.602 3.801 3.994 4.189 4.383 4.629 4.862 5.089 5.364 5.634 5.902 6.211 6.554 6.884 7.251 7.661 8.105 8.57 9.108 9.739 10.381 11.14 11.976 12.968 14.071 15.307 16.806 18.735 20.15 20.742 21.016 21.158 21.165 21.089 20.998 20.898 20.75 20.596 20.44 20.292 20.14 19.975 19.816 19.626 19.456 19.313 19.157 18.983 18.828 18.656 18.452 18.294 18.142 17.961 17.738 17.51 17.369 17.233 17.005 16.833 16.652 16.566 16.398 16.203 15.988 15.881 15.591 15.498 15.373 15.228 14.892 14.684 14.437 14.166 13.831 13.347 12.609 9.066 -10 ,14996 ,TETRA ,17982561,Tue Dec 21 08:41:45 CET,Tue Dec 21 10:16:28 CET,0.0 0.389 0.564 0.733 0.88 1.01 1.13 1.236 1.448 1.548 1.638 1.615 1.883 1.965 2.13 2.28 2.429 2.501 2.639 2.775 2.975 3.104 3.23 3.417 3.594 3.778 3.966 4.149 4.387 4.619 4.843 5.115 5.376 5.625 5.926 6.283 6.623 6.983 7.377 7.798 8.25 8.774 9.393 10.033 10.784 11.636 12.631 13.768 15.112 16.648 18.375 19.653 20.273 20.557 20.66 20.685 20.67 20.586 20.458 20.309 20.146 19.986 19.819 19.654 19.497 19.322 19.134 18.966 18.804 18.629 18.44 18.265 18.083 17.907 17.774 17.617 17.451 17.29 17.109 16.976 16.825 16.582 16.41 16.225 16.131 15.937 15.728 15.492 15.367 15.079 14.993 14.847 14.672 14.268 14.045 13.778 13.422 13.001 12.528 11.782 7.311 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index e3e3a3e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25713 ,KEBNE ,16652852,Mon Nov 22 00:38:23 CET,Mon Nov 22 02:02:27 CET,0.0 0.848 1.167 1.43 1.649 1.817 1.958 2.117 2.433 2.581 2.715 2.76 3.059 3.168 3.403 3.636 3.844 3.944 4.133 4.32 4.597 4.769 4.932 5.183 5.434 5.669 5.894 6.123 6.416 6.689 6.953 7.269 7.575 7.866 8.215 8.629 9.017 9.435 9.887 10.359 10.883 11.504 12.241 13.008 13.877 14.815 15.902 17.142 18.566 20.212 22.16 23.69 24.521 24.956 25.15 25.223 25.22 25.149 25.029 24.886 24.752 24.611 24.485 24.377 24.256 24.117 23.956 23.797 23.658 23.508 23.356 23.24 23.112 22.967 22.846 22.717 22.585 22.439 22.275 22.16 22.043 21.872 21.756 21.633 21.563 21.408 21.234 21.032 20.928 20.667 20.598 20.46 20.328 20.049 19.901 19.748 19.584 19.364 19.086 18.776 17.759 -2 ,8851 ,KEBNE ,16652853,Mon Nov 22 00:38:22 CET,Mon Nov 22 02:03:57 CET,0.0 1.225 1.56 1.812 2.05 2.28 2.478 2.646 2.948 3.085 3.211 3.253 3.555 3.668 3.898 4.112 4.305 4.393 4.576 4.757 5.004 5.159 5.308 5.553 5.802 6.041 6.279 6.51 6.8 7.078 7.338 7.649 7.953 8.241 8.58 8.983 9.384 9.819 10.293 10.799 11.321 11.911 12.615 13.337 14.178 15.087 16.134 17.324 18.745 20.401 22.349 23.8 24.459 24.808 24.972 25.035 25.012 24.932 24.844 24.742 24.631 24.527 24.421 24.307 24.165 24.018 23.861 23.705 23.557 23.411 23.259 23.111 22.959 22.81 22.702 22.586 22.454 22.3 22.125 21.997 21.868 21.681 21.548 21.402 21.327 21.179 20.997 20.781 20.683 20.431 20.39 20.277 20.153 19.898 19.761 19.597 19.422 19.231 19.036 18.694 17.458 -3 ,22552 ,KEBNE ,16652854,Mon Nov 22 00:38:22 CET,Mon Nov 22 02:02:50 CET,0.0 0.831 1.153 1.401 1.596 1.777 1.952 2.103 2.372 2.492 2.604 2.628 2.928 3.034 3.222 3.427 3.651 3.758 3.947 4.137 4.406 4.577 4.75 4.999 5.228 5.446 5.664 5.881 6.148 6.403 6.662 6.99 7.316 7.621 7.968 8.364 8.746 9.179 9.652 10.145 10.644 11.225 11.955 12.687 13.517 14.443 15.507 16.734 18.205 19.894 21.848 23.389 24.16 24.553 24.765 24.84 24.813 24.752 24.677 24.552 24.43 24.316 24.185 24.05 23.907 23.749 23.58 23.424 23.281 23.14 22.984 22.851 22.709 22.548 22.411 22.253 22.1 21.945 21.768 21.644 21.519 21.322 21.187 21.047 20.971 20.796 20.602 20.397 20.275 20.002 19.96 19.843 19.717 19.463 19.323 19.154 18.963 18.701 18.38 18.008 17.077 -4 ,669 ,KEBNE ,16652855,Mon Nov 22 00:38:22 CET,Mon Nov 22 02:02:31 CET,0.0 1.065 1.51 1.849 2.146 2.403 2.594 2.77 3.085 3.233 3.382 3.471 3.778 3.901 4.131 4.332 4.525 4.62 4.819 5.017 5.288 5.467 5.638 5.876 6.107 6.336 6.556 6.773 7.056 7.325 7.575 7.868 8.17 8.477 8.843 9.259 9.663 10.107 10.574 11.059 11.567 12.162 12.872 13.589 14.398 15.329 16.461 17.725 19.156 20.838 22.879 24.368 25.104 25.523 25.744 25.85 25.848 25.796 25.709 25.574 25.421 25.29 25.163 25.026 24.902 24.78 24.642 24.505 24.385 24.251 24.102 23.982 23.847 23.697 23.575 23.449 23.32 23.173 23.012 22.898 22.782 22.599 22.464 22.321 22.251 22.108 21.94 21.751 21.648 21.367 21.25 21.113 20.976 20.661 20.488 20.316 20.129 19.897 19.647 19.315 18.438 -6 ,20406 ,KEBNE ,16652857,Mon Nov 22 00:39:25 CET,Mon Nov 22 02:04:59 CET,0.0 0.835 1.053 1.237 1.429 1.595 1.739 1.883 2.189 2.339 2.473 2.558 2.858 2.969 3.184 3.397 3.621 3.736 3.969 4.184 4.487 4.683 4.859 5.092 5.314 5.549 5.794 6.016 6.294 6.569 6.844 7.194 7.509 7.789 8.128 8.526 8.913 9.338 9.789 10.269 10.799 11.395 12.051 12.717 13.506 14.391 15.449 16.631 18.021 19.654 21.548 22.99 23.689 24.071 24.263 24.329 24.347 24.32 24.228 24.074 23.935 23.804 23.667 23.541 23.412 23.266 23.092 22.935 22.806 22.673 22.52 22.379 22.226 22.069 21.945 21.816 21.676 21.52 21.341 21.219 21.11 20.951 20.836 20.71 20.647 20.505 20.337 20.152 20.05 19.78 19.733 19.629 19.507 19.225 19.074 18.881 18.664 18.453 18.167 17.745 16.627 -7 ,16969 ,KEBNE ,16652858,Mon Nov 22 00:39:26 CET,Mon Nov 22 02:05:22 CET,0.0 0.808 1.127 1.4 1.619 1.788 1.959 2.146 2.476 2.612 2.738 2.775 3.074 3.186 3.395 3.587 3.767 3.853 4.019 4.19 4.461 4.635 4.803 5.053 5.306 5.556 5.796 6.023 6.304 6.574 6.836 7.15 7.451 7.756 8.106 8.489 8.876 9.317 9.778 10.268 10.784 11.372 12.079 12.791 13.629 14.585 15.666 16.867 18.27 19.888 21.953 23.573 24.351 24.768 24.98 25.049 25.043 25.015 24.943 24.826 24.712 24.601 24.473 24.328 24.179 24.033 23.874 23.74 23.62 23.487 23.336 23.209 23.082 22.933 22.809 22.675 22.522 22.369 22.219 22.109 21.986 21.79 21.657 21.497 21.418 21.283 21.131 20.958 20.871 20.612 20.556 20.445 20.314 20.007 19.847 19.666 19.473 19.263 18.996 18.642 17.906 -8 ,18894 ,KEBNE ,16652859,Mon Nov 22 00:39:26 CET,Mon Nov 22 02:04:58 CET,0.0 0.8 1.113 1.338 1.524 1.702 1.856 1.992 2.254 2.393 2.526 2.571 2.868 2.976 3.183 3.385 3.584 3.677 3.852 4.021 4.272 4.429 4.581 4.801 5.002 5.199 5.399 5.597 5.854 6.099 6.349 6.667 6.969 7.267 7.622 8.035 8.443 8.905 9.416 9.949 10.486 11.079 11.792 12.514 13.328 14.24 15.35 16.581 18.018 19.785 21.859 23.4 24.144 24.526 24.7 24.799 24.84 24.778 24.659 24.524 24.411 24.304 24.184 24.05 23.917 23.776 23.61 23.46 23.33 23.192 23.033 22.888 22.745 22.589 22.462 22.341 22.212 22.074 21.921 21.808 21.689 21.511 21.394 21.269 21.203 21.065 20.918 20.75 20.667 20.416 20.365 20.247 20.121 19.857 19.715 19.564 19.399 19.207 18.94 18.57 17.467 -9 ,20731 ,KEBNE ,16652860,Mon Nov 22 00:39:25 CET,Mon Nov 22 02:03:38 CET,0.0 0.818 1.069 1.323 1.566 1.779 1.96 2.12 2.43 2.587 2.729 2.792 3.095 3.213 3.45 3.669 3.872 3.974 4.168 4.343 4.599 4.763 4.922 5.17 5.422 5.664 5.882 6.089 6.353 6.614 6.88 7.198 7.501 7.795 8.149 8.566 8.958 9.368 9.828 10.332 10.871 11.495 12.197 12.877 13.692 14.627 15.669 16.855 18.309 20.051 22.116 23.651 24.446 24.869 25.082 25.192 25.213 25.141 25.055 24.943 24.819 24.698 24.541 24.377 24.229 24.088 23.928 23.785 23.656 23.515 23.373 23.254 23.111 22.943 22.815 22.692 22.544 22.371 22.191 22.076 21.962 21.767 21.637 21.51 21.437 21.282 21.13 20.959 20.861 20.596 20.554 20.44 20.329 20.109 19.975 19.83 19.672 19.452 19.188 18.866 17.86 -10 ,24375 ,KEBNE ,16652861,Mon Nov 22 00:40:28 CET,Mon Nov 22 02:04:40 CET,0.0 0.57 0.857 1.095 1.312 1.492 1.676 1.855 2.163 2.318 2.464 2.558 2.87 2.982 3.192 3.399 3.609 3.709 3.895 4.078 4.34 4.522 4.708 4.966 5.2 5.437 5.673 5.898 6.189 6.463 6.729 7.034 7.327 7.634 7.985 8.369 8.742 9.164 9.628 10.12 10.652 11.254 11.935 12.602 13.412 14.305 15.363 16.596 17.998 19.657 21.643 23.222 23.987 24.377 24.567 24.649 24.67 24.6 24.498 24.389 24.273 24.144 23.992 23.845 23.707 23.585 23.452 23.314 23.176 23.034 22.886 22.747 22.61 22.454 22.324 22.19 22.047 21.897 21.748 21.635 21.517 21.351 21.232 21.094 21.024 20.883 20.733 20.584 20.506 20.247 20.192 20.069 19.94 19.664 19.521 19.35 19.179 19.009 18.797 18.441 17.377 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt deleted file mode 100644 index 77260f1a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22475 ,TETRA ,17982572,Tue Dec 21 08:42:29 CET,Tue Dec 21 10:18:44 CET,0.0 0.36 0.528 0.652 0.772 0.868 0.955 1.049 1.216 1.294 1.381 1.372 1.587 1.645 1.762 1.885 2.005 2.059 2.158 2.26 2.416 2.507 2.596 2.728 2.843 2.951 3.057 3.159 3.299 3.44 3.572 3.728 3.889 4.042 4.207 4.385 4.544 4.715 4.899 5.088 5.287 5.514 5.772 6.021 6.295 6.564 6.832 7.066 7.252 7.331 7.219 6.839 6.338 5.819 5.328 4.883 4.49 4.123 3.79 3.433 3.126 2.855 2.59 2.353 2.141 1.934 1.714 1.531 1.366 1.185 0.999 0.856 0.704 0.536 0.405 0.267 0.135 0.007 -0.126 -0.214 -0.302 -0.455 -0.564 -0.678 -0.739 -0.856 -0.984 -1.118 -1.184 -1.421 -1.432 -1.513 -1.595 -1.764 -1.849 -1.944 -2.059 -2.194 -2.375 -2.591 -3.142 -2 ,11646 ,TETRA ,17982573,Tue Dec 21 08:42:26 CET,Tue Dec 21 10:18:42 CET,0.0 0.22 0.349 0.46 0.577 0.688 0.788 0.896 1.113 1.195 1.262 1.25 1.483 1.557 1.693 1.836 1.963 2.024 2.148 2.256 2.408 2.513 2.611 2.749 2.886 3.008 3.117 3.223 3.368 3.516 3.654 3.805 3.953 4.101 4.259 4.428 4.578 4.747 4.946 5.156 5.35 5.566 5.805 6.025 6.286 6.559 6.826 7.075 7.309 7.495 7.497 7.107 6.589 6.071 5.632 5.198 4.766 4.387 4.057 3.712 3.404 3.124 2.871 2.647 2.436 2.225 2.002 1.805 1.628 1.444 1.255 1.104 0.942 0.77 0.638 0.5 0.358 0.206 0.053 -0.053 -0.169 -0.354 -0.475 -0.598 -0.665 -0.796 -0.922 -1.047 -1.113 -1.342 -1.336 -1.424 -1.509 -1.686 -1.786 -1.884 -1.99 -2.117 -2.264 -2.442 -2.885 -3 ,15680 ,TETRA ,17982574,Tue Dec 21 08:42:28 CET,Tue Dec 21 10:18:17 CET,0.0 0.354 0.485 0.596 0.71 0.806 0.887 0.969 1.124 1.201 1.275 1.249 1.467 1.526 1.646 1.761 1.859 1.9 1.983 2.078 2.22 2.303 2.382 2.508 2.629 2.749 2.867 2.978 3.122 3.259 3.385 3.529 3.666 3.806 3.968 4.145 4.318 4.505 4.692 4.887 5.101 5.336 5.576 5.805 6.061 6.31 6.566 6.84 7.102 7.252 7.133 6.733 6.281 5.801 5.349 4.927 4.522 4.149 3.813 3.446 3.146 2.9 2.649 2.384 2.154 1.957 1.737 1.532 1.351 1.169 0.989 0.845 0.686 0.517 0.393 0.262 0.117 -0.038 -0.198 -0.306 -0.416 -0.589 -0.721 -0.853 -0.917 -1.047 -1.182 -1.335 -1.415 -1.65 -1.67 -1.764 -1.853 -2.032 -2.127 -2.233 -2.347 -2.477 -2.641 -2.833 -3.213 -4 ,20330 ,TETRA ,17982575,Tue Dec 21 08:42:25 CET,Tue Dec 21 10:18:47 CET,0.0 0.28 0.451 0.59 0.699 0.81 0.923 1.032 1.219 1.3 1.372 1.348 1.576 1.649 1.794 1.922 2.029 2.081 2.199 2.311 2.468 2.567 2.66 2.812 2.958 3.09 3.213 3.332 3.486 3.622 3.746 3.891 4.048 4.195 4.361 4.55 4.714 4.886 5.067 5.265 5.475 5.681 5.908 6.161 6.426 6.68 6.942 7.185 7.4 7.565 7.49 7.058 6.57 6.068 5.551 5.067 4.645 4.268 3.942 3.603 3.321 3.07 2.819 2.571 2.332 2.119 1.904 1.714 1.545 1.371 1.189 1.034 0.877 0.708 0.571 0.427 0.289 0.141 -0.017 -0.119 -0.233 -0.399 -0.507 -0.624 -0.682 -0.794 -0.912 -1.045 -1.113 -1.337 -1.318 -1.395 -1.486 -1.699 -1.8 -1.902 -2.01 -2.131 -2.278 -2.49 -3.008 -5 ,18092 ,TETRA ,17982576,Tue Dec 21 08:42:25 CET,Tue Dec 21 10:18:53 CET,0.0 0.328 0.536 0.686 0.798 0.897 0.991 1.077 1.257 1.34 1.415 1.4 1.623 1.696 1.835 1.949 2.051 2.104 2.201 2.289 2.424 2.515 2.608 2.738 2.871 3.012 3.14 3.257 3.405 3.553 3.685 3.83 3.983 4.124 4.274 4.447 4.62 4.807 4.995 5.19 5.395 5.634 5.903 6.152 6.428 6.717 7.008 7.249 7.461 7.643 7.626 7.247 6.776 6.301 5.842 5.402 5.005 4.652 4.326 3.97 3.649 3.367 3.112 2.876 2.66 2.464 2.235 2.019 1.842 1.657 1.452 1.291 1.134 0.965 0.834 0.702 0.571 0.437 0.302 0.207 0.107 -0.049 -0.149 -0.253 -0.312 -0.439 -0.564 -0.699 -0.775 -1.008 -0.988 -1.064 -1.144 -1.32 -1.415 -1.511 -1.633 -1.768 -1.925 -2.133 -2.607 -6 ,21967 ,TETRA ,17982577,Tue Dec 21 08:42:28 CET,Tue Dec 21 10:18:22 CET,0.0 0.369 0.521 0.652 0.767 0.857 0.957 1.067 1.274 1.369 1.454 1.463 1.698 1.769 1.912 2.05 2.179 2.241 2.363 2.481 2.633 2.726 2.826 2.968 3.11 3.245 3.369 3.484 3.629 3.774 3.906 4.061 4.218 4.359 4.505 4.676 4.839 5.019 5.225 5.436 5.63 5.829 6.066 6.299 6.539 6.78 7.059 7.331 7.558 7.686 7.579 7.141 6.626 6.129 5.666 5.222 4.8 4.434 4.112 3.766 3.47 3.203 2.952 2.712 2.487 2.28 2.049 1.848 1.68 1.492 1.304 1.153 0.985 0.802 0.665 0.532 0.398 0.25 0.081 -0.037 -0.149 -0.32 -0.447 -0.583 -0.653 -0.793 -0.944 -1.108 -1.196 -1.442 -1.467 -1.562 -1.659 -1.884 -2.018 -2.157 -2.318 -2.501 -2.733 -2.994 -3.502 -7 ,32690 ,TETRA ,17982578,Tue Dec 21 08:42:30 CET,Tue Dec 21 10:18:12 CET,0.0 0.381 0.562 0.751 0.907 1.042 1.172 1.291 1.519 1.618 1.72 1.761 2.004 2.085 2.228 2.367 2.495 2.555 2.665 2.762 2.908 3.004 3.093 3.218 3.341 3.459 3.577 3.689 3.823 3.955 4.088 4.252 4.405 4.545 4.713 4.904 5.067 5.245 5.434 5.627 5.836 6.066 6.306 6.515 6.75 7.0 7.249 7.478 7.711 7.896 7.858 7.451 6.959 6.473 5.965 5.474 5.072 4.705 4.37 4.014 3.695 3.404 3.135 2.895 2.664 2.432 2.193 1.996 1.821 1.639 1.445 1.279 1.113 0.948 0.812 0.663 0.513 0.37 0.212 0.095 -0.014 -0.189 -0.313 -0.428 -0.485 -0.607 -0.733 -0.867 -0.941 -1.174 -1.174 -1.25 -1.329 -1.511 -1.608 -1.712 -1.829 -1.953 -2.084 -2.256 -2.904 -8 ,31173 ,TETRA ,17982579,Tue Dec 21 08:42:27 CET,Tue Dec 21 10:18:02 CET,0.0 0.329 0.526 0.655 0.772 0.894 1.002 1.102 1.302 1.387 1.464 1.464 1.689 1.756 1.887 2.012 2.128 2.187 2.307 2.414 2.554 2.647 2.743 2.878 3.008 3.13 3.243 3.353 3.485 3.614 3.749 3.923 4.079 4.223 4.381 4.555 4.727 4.909 5.093 5.287 5.502 5.739 5.994 6.244 6.525 6.801 7.062 7.318 7.579 7.709 7.562 7.104 6.609 6.127 5.645 5.203 4.815 4.443 4.124 3.801 3.496 3.223 2.969 2.73 2.498 2.281 2.051 1.84 1.666 1.493 1.305 1.151 0.999 0.842 0.72 0.592 0.458 0.317 0.181 0.091 -0.012 -0.17 -0.268 -0.38 -0.442 -0.559 -0.676 -0.813 -0.887 -1.116 -1.105 -1.186 -1.271 -1.463 -1.57 -1.693 -1.815 -1.928 -2.073 -2.256 -2.701 -9 ,20677 ,TETRA ,17982580,Tue Dec 21 08:42:29 CET,Tue Dec 21 10:17:59 CET,0.0 0.398 0.552 0.692 0.826 0.947 1.06 1.162 1.326 1.412 1.497 1.494 1.716 1.78 1.9 2.013 2.117 2.167 2.264 2.352 2.483 2.57 2.672 2.832 2.972 3.101 3.222 3.339 3.478 3.613 3.757 3.928 4.083 4.221 4.373 4.551 4.708 4.87 5.06 5.253 5.442 5.66 5.902 6.123 6.364 6.626 6.904 7.148 7.371 7.511 7.448 7.099 6.606 6.101 5.622 5.163 4.748 4.355 4.017 3.687 3.402 3.136 2.868 2.597 2.353 2.149 1.928 1.727 1.562 1.39 1.193 1.027 0.864 0.696 0.558 0.417 0.271 0.12 -0.036 -0.157 -0.286 -0.468 -0.594 -0.725 -0.799 -0.954 -1.092 -1.25 -1.336 -1.573 -1.593 -1.682 -1.767 -1.94 -2.028 -2.122 -2.234 -2.371 -2.531 -2.72 -3.145 -10 ,4667 ,TETRA ,17982581,Tue Dec 21 08:42:31 CET,Tue Dec 21 10:18:47 CET,0.0 0.257 0.44 0.58 0.705 0.836 0.939 1.02 1.184 1.27 1.353 1.358 1.589 1.662 1.804 1.931 2.046 2.11 2.237 2.355 2.515 2.617 2.712 2.853 2.989 3.114 3.231 3.345 3.497 3.64 3.77 3.932 4.09 4.224 4.375 4.546 4.713 4.901 5.095 5.299 5.492 5.691 5.918 6.119 6.337 6.56 6.812 7.071 7.28 7.387 7.261 6.829 6.36 5.909 5.472 5.041 4.636 4.255 3.929 3.602 3.309 3.04 2.789 2.553 2.317 2.093 1.87 1.671 1.499 1.323 1.131 0.964 0.796 0.635 0.509 0.373 0.233 0.079 -0.082 -0.185 -0.297 -0.483 -0.61 -0.74 -0.807 -0.957 -1.131 -1.308 -1.392 -1.632 -1.656 -1.746 -1.841 -2.037 -2.136 -2.246 -2.355 -2.482 -2.648 -2.823 -3.276 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt deleted file mode 100644 index db50b536..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9125 ,KEBNE ,16652862,Mon Nov 22 00:40:28 CET,Mon Nov 22 02:06:39 CET,0.0 0.649 0.934 1.175 1.38 1.567 1.768 1.977 2.351 2.521 2.684 2.732 3.149 3.299 3.588 3.875 4.153 4.292 4.568 4.847 5.269 5.54 5.815 6.221 6.622 7.033 7.43 7.814 8.325 8.839 9.339 9.942 10.535 11.124 11.81 12.597 13.38 14.254 15.23 16.283 17.407 18.726 20.344 22.019 24.005 26.351 29.189 32.531 36.655 41.843 48.692 55.051 59.244 62.224 64.431 66.147 67.492 68.555 69.359 70.083 70.623 71.035 71.395 71.731 72.022 72.253 72.465 72.633 72.76 72.879 72.996 73.082 73.161 73.237 73.283 73.322 73.356 73.379 73.381 73.373 73.379 73.394 73.384 73.363 73.356 73.323 73.259 73.18 73.136 72.91 73.024 72.979 72.932 72.843 72.785 72.708 72.611 72.506 72.397 72.252 71.621 -2 ,16374 ,KEBNE ,16652863,Mon Nov 22 00:40:28 CET,Mon Nov 22 02:06:34 CET,0.0 0.453 0.726 0.985 1.221 1.458 1.689 1.906 2.314 2.495 2.676 2.782 3.218 3.39 3.718 4.035 4.343 4.498 4.814 5.118 5.549 5.835 6.111 6.509 6.905 7.303 7.696 8.078 8.587 9.09 9.581 10.171 10.755 11.332 11.999 12.778 13.557 14.408 15.352 16.39 17.498 18.807 20.414 22.079 24.098 26.479 29.331 32.649 36.757 41.974 48.907 55.382 59.72 62.789 65.003 66.721 68.035 69.09 69.907 70.601 71.133 71.585 71.992 72.333 72.618 72.864 73.081 73.243 73.382 73.523 73.655 73.749 73.83 73.893 73.938 73.987 74.024 74.048 74.074 74.09 74.105 74.118 74.114 74.108 74.105 74.088 74.052 74.001 73.974 73.758 73.887 73.846 73.801 73.714 73.666 73.592 73.502 73.411 73.295 73.155 72.667 -3 ,13318 ,KEBNE ,16652864,Mon Nov 22 00:40:28 CET,Mon Nov 22 02:06:38 CET,0.0 0.579 0.858 1.101 1.319 1.518 1.71 1.9 2.255 2.425 2.589 2.647 3.074 3.23 3.527 3.814 4.091 4.234 4.522 4.794 5.199 5.468 5.732 6.122 6.511 6.899 7.286 7.664 8.149 8.637 9.119 9.701 10.284 10.869 11.561 12.356 13.133 13.997 14.961 16.008 17.142 18.459 20.047 21.705 23.707 26.044 28.856 32.21 36.386 41.652 48.664 55.076 59.299 62.344 64.543 66.242 67.542 68.55 69.328 70.047 70.616 71.059 71.439 71.777 72.068 72.311 72.528 72.699 72.828 72.943 73.045 73.124 73.218 73.315 73.36 73.386 73.413 73.44 73.463 73.475 73.483 73.461 73.427 73.388 73.367 73.328 73.292 73.235 73.199 72.969 73.078 73.046 73.006 72.886 72.82 72.75 72.675 72.586 72.438 72.23 71.596 -4 ,30619 ,KEBNE ,16652865,Mon Nov 22 00:40:28 CET,Mon Nov 22 02:05:09 CET,0.0 0.6 0.907 1.156 1.392 1.609 1.799 1.989 2.37 2.539 2.699 2.748 3.169 3.319 3.614 3.905 4.186 4.326 4.602 4.878 5.281 5.543 5.808 6.207 6.608 6.997 7.389 7.775 8.266 8.748 9.228 9.822 10.416 11.007 11.699 12.493 13.273 14.158 15.121 16.17 17.311 18.638 20.265 21.939 23.925 26.228 29.055 32.433 36.602 41.941 49.039 55.507 59.762 62.755 64.938 66.622 67.927 68.985 69.785 70.52 71.114 71.569 71.946 72.273 72.547 72.79 73.019 73.205 73.356 73.491 73.625 73.719 73.79 73.846 73.881 73.918 73.946 73.949 73.946 73.948 73.937 73.9 73.87 73.841 73.827 73.781 73.726 73.664 73.636 73.424 73.53 73.481 73.425 73.298 73.235 73.16 73.082 72.979 72.832 72.609 71.983 -5 ,30165 ,KEBNE ,16652866,Mon Nov 22 00:41:30 CET,Mon Nov 22 02:07:48 CET,0.0 0.548 0.835 1.078 1.299 1.506 1.701 1.891 2.235 2.397 2.558 2.597 3.009 3.155 3.449 3.749 4.055 4.209 4.507 4.798 5.211 5.471 5.733 6.13 6.522 6.905 7.286 7.678 8.195 8.693 9.177 9.773 10.356 10.925 11.609 12.398 13.178 14.056 15.014 16.052 17.185 18.498 20.069 21.727 23.755 26.095 28.918 32.291 36.507 41.84 48.831 55.299 59.596 62.619 64.847 66.569 67.871 68.912 69.736 70.474 71.01 71.448 71.855 72.198 72.492 72.734 72.949 73.128 73.278 73.415 73.533 73.618 73.698 73.778 73.831 73.869 73.9 73.94 73.958 73.949 73.941 73.934 73.924 73.91 73.9 73.865 73.826 73.789 73.758 73.538 73.661 73.618 73.569 73.435 73.364 73.294 73.208 73.106 72.979 72.804 72.304 -6 ,7977 ,KEBNE ,16652867,Mon Nov 22 00:41:30 CET,Mon Nov 22 02:05:48 CET,0.0 0.566 0.885 1.151 1.363 1.566 1.771 1.96 2.322 2.503 2.674 2.744 3.177 3.34 3.657 3.957 4.245 4.392 4.687 4.975 5.402 5.682 5.955 6.36 6.762 7.161 7.552 7.936 8.426 8.908 9.402 10.017 10.609 11.174 11.844 12.621 13.385 14.253 15.22 16.283 17.429 18.747 20.333 21.997 24.018 26.364 29.212 32.567 36.705 41.961 48.977 55.559 59.837 62.818 64.96 66.667 68.023 69.12 69.96 70.674 71.232 71.705 72.131 72.47 72.751 72.989 73.201 73.387 73.54 73.678 73.789 73.862 73.929 73.995 74.033 74.054 74.08 74.091 74.091 74.092 74.088 74.088 74.081 74.069 74.059 74.021 73.966 73.908 73.884 73.672 73.795 73.754 73.708 73.593 73.523 73.461 73.408 73.341 73.221 73.003 72.444 -7 ,15479 ,KEBNE ,16652868,Mon Nov 22 00:41:30 CET,Mon Nov 22 02:07:45 CET,0.0 0.585 0.83 1.045 1.253 1.448 1.635 1.818 2.167 2.336 2.505 2.567 2.988 3.142 3.436 3.721 4.008 4.158 4.456 4.746 5.185 5.471 5.752 6.168 6.569 6.965 7.351 7.731 8.231 8.722 9.211 9.818 10.423 11.023 11.73 12.529 13.303 14.163 15.116 16.183 17.328 18.649 20.232 21.858 23.865 26.216 29.024 32.375 36.504 41.708 48.717 55.197 59.445 62.471 64.64 66.33 67.699 68.768 69.566 70.267 70.817 71.261 71.626 71.924 72.19 72.432 72.663 72.846 72.972 73.09 73.21 73.295 73.365 73.421 73.465 73.514 73.553 73.579 73.593 73.598 73.594 73.572 73.553 73.522 73.509 73.481 73.433 73.377 73.341 73.108 73.172 73.106 73.046 72.944 72.893 72.822 72.738 72.624 72.458 72.226 71.477 -8 ,4252 ,KEBNE ,16652869,Mon Nov 22 00:41:30 CET,Mon Nov 22 02:07:16 CET,0.0 0.657 0.929 1.164 1.393 1.61 1.805 1.992 2.351 2.523 2.684 2.738 3.16 3.317 3.611 3.91 4.216 4.363 4.653 4.954 5.406 5.693 5.971 6.374 6.77 7.158 7.538 7.913 8.411 8.905 9.394 9.984 10.564 11.147 11.843 12.646 13.418 14.286 15.264 16.314 17.437 18.758 20.356 22.013 24.028 26.388 29.197 32.527 36.715 41.968 48.918 55.458 59.765 62.779 64.981 66.705 68.053 69.155 69.986 70.707 71.255 71.681 72.062 72.384 72.661 72.905 73.132 73.297 73.433 73.567 73.685 73.775 73.852 73.919 73.969 74.011 74.047 74.075 74.103 74.122 74.13 74.114 74.092 74.075 74.065 74.027 73.964 73.901 73.866 73.643 73.77 73.734 73.686 73.569 73.499 73.425 73.336 73.221 73.091 72.907 72.358 -9 ,8763 ,KEBNE ,16652870,Mon Nov 22 00:41:30 CET,Mon Nov 22 02:07:35 CET,0.0 0.622 0.901 1.123 1.333 1.539 1.731 1.916 2.261 2.436 2.615 2.694 3.123 3.279 3.596 3.91 4.206 4.35 4.642 4.938 5.375 5.658 5.928 6.322 6.718 7.116 7.51 7.894 8.399 8.899 9.382 9.979 10.569 11.138 11.827 12.62 13.401 14.297 15.269 16.314 17.446 18.757 20.359 22.033 24.043 26.372 29.179 32.519 36.685 41.949 48.961 55.431 59.63 62.631 64.872 66.598 67.888 68.887 69.661 70.369 70.909 71.339 71.737 72.087 72.369 72.589 72.799 72.98 73.122 73.259 73.386 73.47 73.545 73.602 73.626 73.651 73.69 73.72 73.74 73.747 73.744 73.743 73.728 73.695 73.678 73.636 73.589 73.541 73.506 73.282 73.37 73.309 73.243 73.103 73.025 72.92 72.787 72.646 72.486 72.238 71.389 -10 ,4250 ,KEBNE ,16652871,Mon Nov 22 00:41:34 CET,Mon Nov 22 02:06:01 CET,0.0 0.618 0.904 1.142 1.346 1.55 1.756 1.949 2.296 2.465 2.634 2.683 3.094 3.243 3.538 3.823 4.11 4.251 4.529 4.805 5.211 5.476 5.732 6.111 6.491 6.866 7.235 7.596 8.082 8.564 9.041 9.636 10.219 10.792 11.469 12.243 13.02 13.909 14.883 15.933 17.077 18.421 20.038 21.693 23.682 25.998 28.81 32.179 36.385 41.694 48.76 55.32 59.556 62.543 64.779 66.498 67.794 68.823 69.63 70.356 70.923 71.379 71.761 72.107 72.412 72.674 72.913 73.083 73.213 73.345 73.461 73.54 73.616 73.676 73.714 73.755 73.786 73.815 73.844 73.849 73.839 73.826 73.805 73.769 73.754 73.723 73.684 73.651 73.628 73.401 73.506 73.469 73.429 73.321 73.255 73.171 73.083 72.985 72.837 72.649 72.104 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 6ef036b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12514 ,KEBNE ,16652872,Mon Nov 22 00:41:30 CET,Mon Nov 22 02:05:39 CET,0.0 0.878 1.288 1.672 1.985 2.256 2.525 2.791 3.292 3.523 3.739 3.893 4.361 4.562 4.957 5.37 5.775 5.974 6.354 6.7 7.212 7.544 7.863 8.342 8.814 9.278 9.741 10.2 10.789 11.376 11.96 12.688 13.42 14.153 15.014 15.967 16.892 17.953 19.144 20.428 21.779 23.352 25.279 27.271 29.673 32.464 35.821 39.826 44.867 51.406 60.23 68.526 74.063 78.037 81.03 83.374 85.179 86.642 87.775 88.804 89.599 90.241 90.809 91.277 91.677 92.034 92.367 92.614 92.8 92.977 93.125 93.225 93.321 93.389 93.44 93.496 93.54 93.576 93.599 93.618 93.628 93.613 93.586 93.545 93.529 93.494 93.428 93.354 93.321 93.119 93.188 93.126 93.048 92.893 92.788 92.655 92.493 92.279 92.031 91.643 90.345 -2 ,29608 ,KEBNE ,16652873,Mon Nov 22 00:41:30 CET,Mon Nov 22 02:05:27 CET,0.0 1.17 1.592 1.928 2.233 2.512 2.771 3.03 3.524 3.763 3.999 4.173 4.642 4.836 5.225 5.612 5.966 6.138 6.481 6.829 7.378 7.738 8.086 8.593 9.073 9.537 9.991 10.447 11.044 11.616 12.188 12.892 13.58 14.263 15.075 15.995 16.892 17.92 19.061 20.302 21.651 23.21 25.093 27.076 29.512 32.315 35.673 39.712 44.773 51.252 60.019 68.341 73.927 77.927 80.901 83.237 85.018 86.445 87.564 88.554 89.329 89.971 90.538 91.018 91.413 91.756 92.09 92.359 92.57 92.755 92.924 93.062 93.192 93.3 93.369 93.428 93.476 93.512 93.539 93.552 93.552 93.548 93.542 93.509 93.487 93.442 93.369 93.278 93.235 93.024 93.062 92.978 92.881 92.665 92.536 92.394 92.22 92.036 91.799 91.449 89.856 -3 ,2099 ,KEBNE ,16652874,Mon Nov 22 00:42:32 CET,Mon Nov 22 02:08:31 CET,0.0 0.959 1.386 1.756 2.07 2.349 2.617 2.886 3.416 3.656 3.892 4.102 4.579 4.788 5.186 5.581 5.971 6.16 6.531 6.879 7.374 7.697 8.015 8.477 8.948 9.409 9.863 10.319 10.927 11.552 12.163 12.898 13.626 14.349 15.205 16.184 17.133 18.167 19.283 20.532 21.901 23.47 25.377 27.355 29.777 32.681 36.199 40.386 45.61 52.271 61.112 69.325 74.792 78.664 81.489 83.726 85.46 86.864 87.96 88.947 89.718 90.345 90.904 91.37 91.77 92.113 92.424 92.68 92.896 93.097 93.268 93.403 93.549 93.677 93.755 93.821 93.871 93.914 93.95 93.97 93.986 94.002 94.008 94.003 93.997 93.982 93.959 93.925 93.901 93.707 93.792 93.742 93.686 93.535 93.427 93.293 93.153 93.005 92.818 92.541 91.473 -4 ,22978 ,KEBNE ,16652875,Mon Nov 22 00:42:32 CET,Mon Nov 22 02:08:19 CET,0.0 0.81 1.263 1.611 1.901 2.19 2.479 2.742 3.215 3.445 3.66 3.801 4.254 4.444 4.83 5.192 5.551 5.74 6.104 6.437 6.917 7.242 7.568 8.046 8.525 8.996 9.451 9.896 10.478 11.046 11.628 12.364 13.084 13.774 14.572 15.491 16.404 17.439 18.597 19.862 21.211 22.767 24.671 26.644 29.023 31.829 35.217 39.293 44.368 50.771 59.472 67.781 73.398 77.437 80.417 82.718 84.492 85.959 87.083 88.07 88.834 89.468 90.016 90.479 90.879 91.206 91.535 91.816 92.021 92.198 92.367 92.507 92.632 92.733 92.793 92.83 92.861 92.899 92.919 92.918 92.904 92.866 92.845 92.816 92.804 92.772 92.72 92.672 92.629 92.415 92.488 92.434 92.363 92.167 92.05 91.918 91.783 91.622 91.368 91.026 89.292 -5 ,27941 ,KEBNE ,16652876,Mon Nov 22 00:42:32 CET,Mon Nov 22 02:08:11 CET,0.0 1.126 1.561 1.923 2.264 2.56 2.83 3.074 3.571 3.82 4.04 4.188 4.666 4.886 5.308 5.704 6.103 6.288 6.637 7.008 7.536 7.874 8.213 8.699 9.161 9.625 10.092 10.539 11.137 11.742 12.348 13.082 13.768 14.443 15.244 16.157 17.059 18.073 19.21 20.473 21.824 23.395 25.298 27.264 29.667 32.462 35.848 39.921 45.04 51.531 60.318 68.545 74.019 77.993 80.952 83.286 85.076 86.489 87.596 88.614 89.405 90.049 90.614 91.089 91.475 91.807 92.147 92.411 92.617 92.819 92.988 93.109 93.228 93.319 93.378 93.446 93.508 93.558 93.571 93.568 93.566 93.529 93.493 93.462 93.443 93.394 93.326 93.224 93.167 92.949 93.006 92.954 92.886 92.712 92.604 92.461 92.306 92.12 91.847 91.514 90.368 -6 ,15080 ,KEBNE ,16652877,Mon Nov 22 00:42:32 CET,Mon Nov 22 02:08:19 CET,0.0 1.07 1.54 1.915 2.219 2.5 2.773 3.033 3.523 3.752 3.957 4.068 4.52 4.716 5.102 5.467 5.821 5.999 6.355 6.712 7.242 7.579 7.9 8.396 8.905 9.4 9.881 10.355 10.972 11.562 12.131 12.827 13.518 14.192 14.986 15.929 16.864 17.898 19.039 20.283 21.643 23.236 25.14 27.111 29.509 32.325 35.726 39.767 44.845 51.326 59.985 68.238 73.771 77.71 80.646 82.97 84.752 86.161 87.262 88.234 88.965 89.586 90.136 90.606 91.006 91.339 91.681 91.963 92.167 92.355 92.536 92.666 92.784 92.896 92.961 93.015 93.062 93.085 93.109 93.122 93.115 93.09 93.065 93.027 93.001 92.944 92.87 92.77 92.72 92.512 92.598 92.552 92.492 92.334 92.225 92.085 91.922 91.726 91.468 91.147 89.568 -7 ,21444 ,KEBNE ,16652878,Mon Nov 22 00:42:32 CET,Mon Nov 22 02:07:50 CET,0.0 0.935 1.26 1.525 1.751 1.975 2.203 2.421 2.832 3.022 3.207 3.297 3.738 3.918 4.278 4.644 4.996 5.17 5.511 5.842 6.321 6.635 6.954 7.431 7.891 8.339 8.782 9.221 9.796 10.363 10.932 11.637 12.335 13.028 13.856 14.808 15.731 16.765 17.928 19.194 20.556 22.154 24.086 26.08 28.495 31.354 34.834 38.961 44.092 50.615 59.366 67.501 72.958 76.925 79.875 82.181 83.979 85.456 86.578 87.574 88.36 89.004 89.555 90.027 90.435 90.767 91.077 91.336 91.549 91.738 91.889 92.004 92.115 92.214 92.279 92.331 92.383 92.439 92.481 92.482 92.482 92.482 92.473 92.444 92.42 92.374 92.3 92.207 92.16 91.954 92.001 91.912 91.809 91.6 91.473 91.307 91.107 90.892 90.64 90.18 88.417 -8 ,19404 ,KEBNE ,16652879,Mon Nov 22 00:42:32 CET,Mon Nov 22 02:07:52 CET,0.0 0.956 1.346 1.667 1.956 2.222 2.464 2.695 3.148 3.369 3.588 3.734 4.196 4.4 4.793 5.171 5.537 5.722 6.092 6.439 6.936 7.262 7.577 8.061 8.562 9.035 9.483 9.93 10.512 11.083 11.639 12.328 13.01 13.684 14.469 15.364 16.26 17.277 18.434 19.74 21.155 22.795 24.77 26.815 29.247 32.038 35.412 39.408 44.438 50.872 59.502 67.662 73.216 77.195 80.095 82.379 84.139 85.551 86.664 87.696 88.5 89.13 89.679 90.159 90.557 90.905 91.256 91.53 91.741 91.924 92.09 92.215 92.315 92.402 92.464 92.524 92.576 92.6 92.605 92.602 92.596 92.578 92.565 92.545 92.523 92.467 92.403 92.319 92.277 92.067 92.137 92.087 92.005 91.806 91.675 91.513 91.344 91.15 90.91 90.545 89.14 -9 ,25093 ,KEBNE ,16652880,Mon Nov 22 00:42:32 CET,Mon Nov 22 02:08:18 CET,0.0 1.74 2.153 2.475 2.788 3.075 3.336 3.587 4.053 4.278 4.493 4.64 5.101 5.304 5.706 6.091 6.465 6.644 6.99 7.334 7.836 8.163 8.499 9.006 9.503 9.985 10.444 10.903 11.52 12.121 12.723 13.469 14.192 14.87 15.651 16.564 17.47 18.503 19.663 20.928 22.279 23.83 25.721 27.712 30.135 32.956 36.351 40.424 45.481 51.942 60.688 68.898 74.365 78.306 81.246 83.532 85.292 86.715 87.85 88.882 89.696 90.36 90.935 91.411 91.795 92.136 92.451 92.701 92.908 93.113 93.301 93.427 93.533 93.633 93.705 93.764 93.815 93.856 93.873 93.882 93.885 93.877 93.875 93.86 93.85 93.827 93.782 93.71 93.679 93.482 93.544 93.475 93.388 93.177 93.045 92.901 92.748 92.582 92.353 91.992 90.749 -10 ,13457 ,KEBNE ,16652881,Mon Nov 22 00:42:32 CET,Mon Nov 22 02:08:11 CET,0.0 1.205 1.641 1.998 2.302 2.589 2.872 3.148 3.628 3.848 4.061 4.206 4.674 4.887 5.321 5.715 6.078 6.258 6.616 6.964 7.475 7.812 8.127 8.588 9.047 9.493 9.941 10.386 10.983 11.564 12.135 12.863 13.596 14.297 15.09 16.005 16.92 17.949 19.073 20.296 21.623 23.175 25.059 27.034 29.426 32.203 35.551 39.594 44.754 51.32 60.116 68.422 73.899 77.824 80.734 82.969 84.713 86.151 87.263 88.245 89.005 89.63 90.19 90.667 91.072 91.417 91.75 92.02 92.228 92.425 92.614 92.748 92.872 92.992 93.072 93.148 93.218 93.283 93.331 93.346 93.344 93.315 93.293 93.268 93.253 93.208 93.15 93.097 93.065 92.855 92.894 92.827 92.758 92.593 92.497 92.383 92.215 91.988 91.715 91.322 89.765 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt deleted file mode 100644 index a51313ff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1350 ,KEBNE ,16652882,Mon Nov 22 00:42:33 CET,Mon Nov 22 02:08:09 CET,0.0 2.192 2.764 3.145 3.484 3.799 4.056 4.287 4.71 4.908 5.1 5.311 5.635 5.783 6.057 6.321 6.579 6.687 6.897 7.119 7.431 7.627 7.805 8.049 8.279 8.492 8.699 8.899 9.147 9.368 9.576 9.831 10.07 10.287 10.548 10.84 11.101 11.395 11.69 11.973 12.291 12.677 13.099 13.455 13.844 14.292 14.789 15.255 15.669 16.023 16.142 15.9 15.503 15.043 14.611 14.192 13.786 13.401 13.07 12.741 12.431 12.142 11.882 11.646 11.421 11.208 10.972 10.755 10.562 10.362 10.156 9.969 9.77 9.58 9.428 9.271 9.112 8.948 8.781 8.651 8.512 8.295 8.154 8.015 7.933 7.769 7.61 7.446 7.354 7.099 7.055 6.942 6.826 6.561 6.407 6.249 6.053 5.815 5.538 5.184 3.102 -2 ,6589 ,KEBNE ,16652883,Mon Nov 22 00:42:33 CET,Mon Nov 22 02:08:12 CET,0.0 1.461 2.012 2.433 2.751 3.044 3.287 3.495 3.868 4.044 4.227 4.426 4.748 4.896 5.155 5.4 5.652 5.771 5.986 6.196 6.511 6.714 6.889 7.112 7.336 7.564 7.782 7.987 8.219 8.447 8.67 8.915 9.153 9.38 9.64 9.937 10.202 10.469 10.784 11.121 11.434 11.791 12.228 12.649 13.063 13.451 13.899 14.375 14.854 15.276 15.403 15.157 14.781 14.388 14.0 13.591 13.2 12.815 12.478 12.165 11.886 11.637 11.394 11.151 10.919 10.687 10.447 10.241 10.059 9.874 9.664 9.485 9.316 9.12 8.965 8.801 8.63 8.466 8.286 8.146 8.007 7.799 7.649 7.487 7.401 7.233 7.061 6.854 6.735 6.467 6.378 6.246 6.101 5.779 5.615 5.454 5.265 5.02 4.736 4.337 1.806 -3 ,23266 ,KEBNE ,16652884,Mon Nov 22 00:43:34 CET,Mon Nov 22 02:08:57 CET,0.0 1.884 2.499 2.945 3.317 3.63 3.885 4.144 4.606 4.81 4.995 5.17 5.48 5.626 5.892 6.139 6.383 6.503 6.743 6.957 7.221 7.396 7.582 7.853 8.086 8.288 8.488 8.693 8.958 9.2 9.421 9.666 9.887 10.115 10.38 10.671 10.958 11.26 11.569 11.883 12.182 12.516 12.91 13.287 13.72 14.187 14.626 15.04 15.54 16.012 16.234 16.125 15.847 15.436 14.998 14.591 14.208 13.848 13.541 13.222 12.942 12.665 12.389 12.146 11.891 11.661 11.431 11.209 11.006 10.794 10.575 10.402 10.226 10.035 9.883 9.715 9.543 9.374 9.199 9.074 8.937 8.717 8.569 8.413 8.336 8.176 8.001 7.815 7.717 7.463 7.388 7.269 7.158 6.882 6.726 6.565 6.376 6.144 5.87 5.504 3.24 -5 ,28679 ,KEBNE ,16652886,Mon Nov 22 00:43:35 CET,Mon Nov 22 02:09:28 CET,0.0 1.812 2.373 2.809 3.182 3.483 3.749 4.009 4.461 4.654 4.836 5.021 5.353 5.52 5.802 6.066 6.325 6.437 6.64 6.838 7.116 7.298 7.484 7.738 7.957 8.171 8.387 8.584 8.822 9.065 9.298 9.568 9.833 10.081 10.343 10.642 10.948 11.287 11.623 11.958 12.305 12.663 13.08 13.481 13.902 14.362 14.841 15.309 15.761 16.117 16.326 16.166 15.784 15.342 14.89 14.443 14.055 13.695 13.364 12.986 12.665 12.383 12.118 11.875 11.629 11.408 11.177 10.967 10.797 10.609 10.402 10.217 9.994 9.781 9.643 9.48 9.299 9.124 8.951 8.837 8.706 8.485 8.347 8.205 8.126 7.954 7.774 7.583 7.482 7.215 7.147 7.034 6.895 6.579 6.4 6.213 6.013 5.773 5.469 5.03 2.989 -6 ,28112 ,KEBNE ,16652887,Mon Nov 22 00:43:35 CET,Mon Nov 22 02:08:56 CET,0.0 1.466 2.045 2.503 2.869 3.176 3.446 3.701 4.185 4.37 4.537 4.735 5.047 5.182 5.445 5.709 5.972 6.096 6.317 6.507 6.771 6.956 7.152 7.425 7.669 7.891 8.092 8.284 8.544 8.788 9.015 9.284 9.529 9.768 10.031 10.316 10.604 10.926 11.279 11.631 11.955 12.319 12.734 13.107 13.492 13.887 14.312 14.72 15.102 15.444 15.563 15.37 15.001 14.57 14.167 13.744 13.355 12.979 12.645 12.31 11.996 11.711 11.439 11.175 10.936 10.722 10.486 10.268 10.071 9.856 9.652 9.49 9.307 9.1 8.935 8.769 8.615 8.441 8.237 8.093 7.929 7.701 7.546 7.372 7.282 7.097 6.92 6.736 6.632 6.373 6.308 6.206 6.107 5.823 5.659 5.493 5.308 5.084 4.77 4.373 1.696 -7 ,600 ,KEBNE ,16652888,Mon Nov 22 00:43:37 CET,Mon Nov 22 02:05:29 CET,0.0 1.617 2.221 2.641 3.0 3.318 3.592 3.837 4.244 4.421 4.582 4.714 5.016 5.157 5.425 5.673 5.888 5.997 6.213 6.413 6.711 6.9 7.083 7.328 7.543 7.744 7.944 8.141 8.396 8.632 8.853 9.119 9.367 9.599 9.874 10.182 10.471 10.782 11.111 11.447 11.799 12.173 12.569 12.945 13.34 13.77 14.213 14.644 15.138 15.603 15.859 15.684 15.315 14.895 14.484 14.072 13.713 13.392 13.05 12.692 12.378 12.092 11.813 11.518 11.249 11.027 10.801 10.599 10.415 10.218 10.0 9.816 9.637 9.439 9.291 9.14 8.971 8.802 8.621 8.484 8.336 8.103 7.947 7.788 7.7 7.53 7.359 7.176 7.076 6.813 6.747 6.643 6.523 6.242 6.091 5.903 5.671 5.425 5.104 4.611 0.986 -8 ,18140 ,KEBNE ,16652889,Mon Nov 22 00:43:35 CET,Mon Nov 22 02:08:38 CET,0.0 2.024 2.747 3.21 3.548 3.821 4.076 4.308 4.708 4.885 5.052 5.202 5.497 5.628 5.87 6.1 6.321 6.421 6.607 6.784 7.044 7.207 7.368 7.622 7.85 8.059 8.25 8.43 8.686 8.93 9.155 9.435 9.702 9.957 10.235 10.534 10.818 11.137 11.474 11.806 12.139 12.521 12.945 13.319 13.726 14.165 14.673 15.184 15.607 15.858 15.945 15.758 15.384 14.955 14.519 14.098 13.694 13.275 12.901 12.544 12.229 11.943 11.671 11.408 11.165 10.933 10.685 10.478 10.276 10.053 9.832 9.653 9.488 9.293 9.111 8.926 8.735 8.539 8.356 8.234 8.097 7.842 7.671 7.519 7.442 7.269 7.082 6.893 6.792 6.534 6.466 6.346 6.221 5.908 5.746 5.523 5.242 4.962 4.638 4.091 -0.656 -9 ,14462 ,KEBNE ,16652890,Mon Nov 22 00:43:35 CET,Mon Nov 22 02:09:15 CET,0.0 1.894 2.452 2.865 3.223 3.532 3.814 4.07 4.512 4.694 4.851 5.0 5.312 5.458 5.743 6.007 6.235 6.338 6.543 6.732 7.001 7.173 7.324 7.551 7.776 7.986 8.186 8.369 8.599 8.834 9.057 9.33 9.601 9.82 10.061 10.357 10.626 10.914 11.225 11.523 11.831 12.18 12.572 12.962 13.397 13.857 14.36 14.871 15.363 15.807 15.951 15.591 15.148 14.677 14.214 13.767 13.353 12.99 12.688 12.365 12.071 11.793 11.52 11.262 11.026 10.816 10.578 10.382 10.213 10.0 9.776 9.596 9.419 9.238 9.087 8.93 8.779 8.62 8.45 8.339 8.227 8.048 7.916 7.777 7.699 7.531 7.361 7.169 7.072 6.811 6.748 6.633 6.514 6.236 6.063 5.885 5.7 5.48 5.213 4.871 3.058 -10 ,26261 ,KEBNE ,16652891,Mon Nov 22 00:44:37 CET,Mon Nov 22 02:10:24 CET,0.0 1.574 2.105 2.521 2.906 3.254 3.512 3.737 4.166 4.349 4.524 4.68 4.973 5.106 5.357 5.594 5.812 5.917 6.123 6.329 6.628 6.8 6.963 7.211 7.439 7.657 7.856 8.043 8.287 8.511 8.731 8.99 9.241 9.479 9.746 10.053 10.337 10.634 10.945 11.267 11.594 11.949 12.349 12.725 13.169 13.643 14.123 14.587 15.067 15.487 15.641 15.395 15.005 14.624 14.239 13.825 13.453 13.125 12.788 12.413 12.105 11.852 11.604 11.352 11.123 10.904 10.66 10.427 10.22 10.017 9.807 9.637 9.453 9.247 9.08 8.912 8.755 8.589 8.411 8.285 8.147 7.933 7.792 7.649 7.576 7.424 7.262 7.086 6.985 6.724 6.66 6.539 6.42 6.155 5.994 5.819 5.622 5.398 5.153 4.823 2.147 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt deleted file mode 100644 index cba9a4cc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,27039 ,KEBNE ,16652893,Mon Nov 22 00:44:37 CET,Mon Nov 22 02:08:35 CET,0.0 0.509 0.706 0.88 1.042 1.182 1.336 1.469 1.663 1.752 1.835 1.847 2.084 2.156 2.291 2.424 2.552 2.614 2.732 2.84 2.983 3.074 3.165 3.293 3.417 3.54 3.655 3.769 3.926 4.076 4.218 4.378 4.531 4.694 4.881 5.08 5.271 5.47 5.686 5.92 6.142 6.387 6.69 6.995 7.309 7.655 8.048 8.45 8.888 9.275 9.49 9.435 9.211 8.913 8.599 8.253 7.914 7.62 7.38 7.126 6.891 6.685 6.496 6.322 6.16 6.006 5.84 5.693 5.56 5.404 5.251 5.133 5.012 4.895 4.802 4.695 4.586 4.48 4.355 4.266 4.182 4.047 3.953 3.86 3.812 3.718 3.618 3.513 3.461 3.247 3.291 3.233 3.173 3.027 2.953 2.884 2.801 2.689 2.578 2.459 2.275 -3 ,14766 ,KEBNE ,16652894,Mon Nov 22 00:45:40 CET,Mon Nov 22 02:11:12 CET,0.0 0.438 0.61 0.746 0.847 0.954 1.049 1.131 1.288 1.368 1.439 1.408 1.632 1.695 1.811 1.926 2.045 2.107 2.223 2.337 2.491 2.587 2.68 2.814 2.947 3.072 3.189 3.297 3.44 3.578 3.71 3.885 4.047 4.193 4.376 4.582 4.774 4.984 5.198 5.425 5.654 5.903 6.2 6.503 6.846 7.192 7.56 7.949 8.349 8.723 8.955 8.902 8.723 8.472 8.206 7.916 7.617 7.332 7.085 6.826 6.598 6.416 6.249 6.072 5.899 5.729 5.551 5.403 5.279 5.145 4.982 4.85 4.723 4.587 4.478 4.364 4.252 4.134 4.009 3.92 3.823 3.678 3.58 3.48 3.426 3.306 3.187 3.071 3.007 2.779 2.811 2.744 2.673 2.524 2.438 2.348 2.26 2.162 2.057 1.904 1.656 -4 ,24198 ,KEBNE ,16652895,Mon Nov 22 00:45:39 CET,Mon Nov 22 02:11:22 CET,0.0 0.35 0.517 0.643 0.754 0.848 0.922 0.997 1.162 1.242 1.315 1.275 1.486 1.546 1.655 1.75 1.858 1.915 2.024 2.131 2.294 2.394 2.493 2.65 2.796 2.928 3.063 3.195 3.35 3.503 3.649 3.814 3.98 4.142 4.334 4.546 4.728 4.93 5.141 5.359 5.602 5.866 6.159 6.457 6.792 7.14 7.521 7.917 8.325 8.736 9.107 9.139 8.892 8.602 8.316 8.022 7.737 7.467 7.24 7.004 6.785 6.586 6.388 6.199 6.024 5.856 5.677 5.514 5.365 5.208 5.044 4.908 4.767 4.618 4.5 4.382 4.263 4.138 4.01 3.918 3.823 3.69 3.611 3.528 3.483 3.389 3.291 3.19 3.13 2.902 2.926 2.858 2.789 2.643 2.564 2.472 2.379 2.286 2.173 2.014 1.772 -5 ,6924 ,KEBNE ,16652896,Mon Nov 22 00:45:40 CET,Mon Nov 22 02:11:06 CET,0.0 0.298 0.451 0.585 0.691 0.786 0.877 0.963 1.134 1.21 1.275 1.249 1.472 1.528 1.628 1.732 1.835 1.885 1.981 2.076 2.223 2.323 2.418 2.555 2.687 2.808 2.924 3.049 3.211 3.366 3.515 3.687 3.848 4.005 4.194 4.395 4.587 4.793 5.015 5.225 5.425 5.663 5.941 6.23 6.575 6.932 7.288 7.655 7.99 8.29 8.55 8.548 8.351 8.06 7.762 7.471 7.186 6.921 6.674 6.407 6.182 5.986 5.801 5.636 5.466 5.296 5.124 4.964 4.823 4.683 4.543 4.424 4.297 4.165 4.056 3.94 3.827 3.705 3.574 3.487 3.401 3.258 3.157 3.063 3.01 2.893 2.779 2.666 2.607 2.383 2.413 2.349 2.282 2.138 2.065 1.992 1.916 1.825 1.712 1.586 1.387 -6 ,6019 ,KEBNE ,16652897,Mon Nov 22 00:45:40 CET,Mon Nov 22 02:11:21 CET,0.0 0.256 0.375 0.494 0.601 0.692 0.775 0.864 1.017 1.082 1.145 1.099 1.312 1.368 1.483 1.584 1.678 1.725 1.829 1.931 2.081 2.187 2.293 2.435 2.569 2.692 2.809 2.924 3.073 3.225 3.369 3.539 3.708 3.871 4.055 4.254 4.44 4.639 4.845 5.057 5.279 5.533 5.843 6.144 6.453 6.797 7.201 7.641 8.095 8.518 8.859 8.896 8.736 8.466 8.136 7.82 7.552 7.285 7.035 6.779 6.557 6.348 6.114 5.894 5.693 5.508 5.322 5.158 5.018 4.865 4.708 4.587 4.468 4.336 4.226 4.113 3.986 3.857 3.738 3.656 3.56 3.408 3.314 3.224 3.173 3.059 2.946 2.836 2.782 2.565 2.591 2.525 2.464 2.351 2.291 2.216 2.12 2.013 1.913 1.83 1.678 -7 ,30888 ,KEBNE ,16652898,Mon Nov 22 00:46:42 CET,Mon Nov 22 02:12:14 CET,0.0 0.24 0.365 0.489 0.595 0.683 0.76 0.844 1.009 1.077 1.14 1.105 1.331 1.394 1.517 1.642 1.756 1.803 1.901 2.004 2.15 2.247 2.332 2.451 2.574 2.698 2.819 2.938 3.096 3.231 3.36 3.524 3.677 3.827 4.007 4.195 4.385 4.596 4.834 5.09 5.335 5.609 5.915 6.212 6.545 6.905 7.3 7.703 8.132 8.522 8.812 8.793 8.554 8.263 7.971 7.719 7.459 7.206 6.987 6.74 6.515 6.307 6.12 5.956 5.792 5.642 5.485 5.335 5.199 5.054 4.901 4.77 4.626 4.472 4.359 4.242 4.112 3.987 3.859 3.76 3.661 3.507 3.406 3.3 3.247 3.158 3.06 2.948 2.893 2.672 2.705 2.642 2.58 2.44 2.364 2.287 2.206 2.13 2.055 1.953 1.69 -8 ,18511 ,KEBNE ,16652899,Mon Nov 22 00:46:42 CET,Mon Nov 22 02:12:14 CET,0.0 0.311 0.473 0.623 0.74 0.841 0.938 1.035 1.222 1.304 1.386 1.38 1.599 1.668 1.811 1.942 2.06 2.115 2.226 2.325 2.457 2.544 2.635 2.779 2.921 3.05 3.18 3.305 3.454 3.597 3.737 3.902 4.056 4.212 4.398 4.596 4.772 4.97 5.197 5.431 5.652 5.898 6.177 6.46 6.791 7.154 7.569 7.995 8.441 8.871 9.191 9.161 8.924 8.581 8.227 7.891 7.587 7.34 7.129 6.899 6.684 6.478 6.28 6.084 5.888 5.718 5.537 5.371 5.235 5.103 4.962 4.838 4.711 4.581 4.469 4.349 4.23 4.098 3.955 3.87 3.792 3.67 3.585 3.507 3.47 3.387 3.291 3.184 3.132 2.919 2.961 2.897 2.835 2.7 2.628 2.555 2.482 2.396 2.297 2.182 1.713 -9 ,18341 ,KEBNE ,16652900,Mon Nov 22 00:46:42 CET,Mon Nov 22 02:11:58 CET,0.0 0.326 0.47 0.594 0.717 0.832 0.93 1.01 1.159 1.234 1.304 1.296 1.531 1.601 1.719 1.821 1.924 1.976 2.073 2.173 2.314 2.397 2.478 2.599 2.724 2.854 2.977 3.098 3.253 3.4 3.548 3.725 3.89 4.051 4.24 4.443 4.629 4.835 5.066 5.31 5.57 5.873 6.19 6.474 6.808 7.164 7.535 7.934 8.359 8.755 9.034 9.024 8.785 8.427 8.097 7.796 7.524 7.255 6.995 6.731 6.489 6.26 6.056 5.872 5.691 5.522 5.345 5.172 5.02 4.867 4.719 4.598 4.466 4.321 4.208 4.102 3.991 3.877 3.755 3.675 3.595 3.465 3.369 3.26 3.203 3.088 2.961 2.82 2.75 2.513 2.5 2.427 2.355 2.193 2.109 2.037 1.959 1.866 1.765 1.654 1.318 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt deleted file mode 100644 index bc86e7f9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23224 ,KEBNE ,16652902,Mon Nov 22 00:47:47 CET,Mon Nov 22 02:13:26 CET,0.0 0.211 0.37 0.476 0.56 0.632 0.71 0.788 0.935 1.008 1.085 1.063 1.287 1.345 1.483 1.629 1.756 1.818 1.94 2.058 2.23 2.344 2.45 2.599 2.745 2.893 3.032 3.164 3.339 3.5 3.654 3.846 4.024 4.186 4.371 4.576 4.774 5.007 5.244 5.479 5.735 6.023 6.368 6.724 7.134 7.586 8.07 8.593 9.211 9.855 10.442 10.688 10.641 10.465 10.265 10.042 9.795 9.56 9.367 9.158 8.96 8.793 8.629 8.459 8.292 8.122 7.949 7.803 7.681 7.561 7.431 7.315 7.19 7.055 6.955 6.851 6.729 6.614 6.5 6.412 6.322 6.176 6.074 5.974 5.922 5.81 5.688 5.545 5.468 5.237 5.261 5.193 5.125 4.984 4.91 4.831 4.745 4.661 4.561 4.463 4.215 -2 ,4955 ,KEBNE ,16652903,Mon Nov 22 00:47:43 CET,Mon Nov 22 02:13:59 CET,0.0 0.306 0.462 0.561 0.657 0.746 0.828 0.906 1.051 1.117 1.176 1.125 1.35 1.408 1.529 1.661 1.782 1.842 1.965 2.084 2.264 2.38 2.487 2.635 2.783 2.922 3.053 3.183 3.348 3.498 3.646 3.842 4.034 4.211 4.413 4.644 4.856 5.095 5.343 5.592 5.854 6.14 6.484 6.835 7.24 7.693 8.186 8.717 9.288 9.89 10.501 10.834 10.863 10.734 10.526 10.322 10.13 9.918 9.71 9.492 9.312 9.153 9.0 8.85 8.688 8.534 8.367 8.205 8.081 7.968 7.837 7.714 7.582 7.448 7.349 7.247 7.131 7.002 6.866 6.781 6.696 6.54 6.425 6.317 6.261 6.148 6.031 5.907 5.845 5.622 5.609 5.516 5.429 5.242 5.136 5.022 4.901 4.772 4.633 4.471 4.242 -3 ,21785 ,KEBNE ,16652904,Mon Nov 22 00:47:43 CET,Mon Nov 22 02:14:00 CET,0.0 0.191 0.352 0.46 0.563 0.654 0.74 0.827 0.976 1.051 1.123 1.07 1.29 1.344 1.458 1.583 1.715 1.779 1.896 2.012 2.199 2.312 2.408 2.549 2.691 2.828 2.964 3.098 3.278 3.449 3.608 3.803 3.987 4.154 4.349 4.566 4.777 5.008 5.243 5.499 5.781 6.083 6.431 6.79 7.205 7.674 8.192 8.723 9.257 9.801 10.328 10.609 10.614 10.498 10.331 10.143 9.962 9.76 9.575 9.378 9.173 8.995 8.819 8.648 8.496 8.346 8.174 8.017 7.892 7.76 7.605 7.484 7.375 7.256 7.16 7.057 6.954 6.845 6.723 6.642 6.557 6.399 6.29 6.191 6.141 6.027 5.908 5.775 5.706 5.478 5.464 5.383 5.314 5.179 5.116 5.052 4.949 4.826 4.71 4.59 4.307 -4 ,7762 ,KEBNE ,16652905,Mon Nov 22 00:48:50 CET,Mon Nov 22 02:11:28 CET,0.0 0.211 0.324 0.43 0.529 0.616 0.699 0.769 0.903 0.965 1.021 0.967 1.186 1.243 1.368 1.488 1.595 1.653 1.776 1.89 2.053 2.163 2.266 2.411 2.557 2.708 2.844 2.966 3.126 3.283 3.434 3.61 3.78 3.956 4.155 4.376 4.587 4.814 5.07 5.342 5.619 5.921 6.282 6.664 7.083 7.511 8.011 8.551 9.144 9.761 10.343 10.622 10.591 10.444 10.252 10.04 9.849 9.649 9.454 9.242 9.061 8.898 8.717 8.549 8.389 8.237 8.092 7.96 7.827 7.686 7.541 7.421 7.308 7.191 7.088 6.973 6.858 6.752 6.628 6.532 6.448 6.315 6.209 6.096 6.034 5.91 5.774 5.654 5.593 5.37 5.392 5.326 5.269 5.137 5.052 4.959 4.854 4.738 4.63 4.502 4.25 -5 ,28203 ,KEBNE ,16652906,Mon Nov 22 00:48:46 CET,Mon Nov 22 02:14:55 CET,0.0 0.23 0.373 0.472 0.573 0.695 0.813 0.921 1.137 1.232 1.317 1.322 1.565 1.639 1.77 1.895 2.016 2.074 2.193 2.308 2.467 2.569 2.662 2.799 2.938 3.072 3.204 3.333 3.487 3.634 3.79 3.977 4.143 4.304 4.503 4.725 4.941 5.179 5.442 5.718 5.99 6.289 6.63 6.971 7.38 7.841 8.354 8.917 9.524 10.114 10.659 10.946 10.923 10.775 10.599 10.411 10.218 10.0 9.787 9.556 9.353 9.16 8.97 8.793 8.624 8.471 8.312 8.159 8.027 7.903 7.771 7.649 7.526 7.396 7.281 7.173 7.067 6.948 6.826 6.747 6.671 6.54 6.442 6.343 6.297 6.2 6.101 5.994 5.937 5.724 5.79 5.74 5.679 5.541 5.463 5.381 5.293 5.183 5.071 4.961 4.803 -6 ,14932 ,KEBNE ,16652907,Mon Nov 22 00:48:46 CET,Mon Nov 22 02:15:24 CET,0.0 0.276 0.497 0.686 0.852 1.004 1.145 1.272 1.49 1.582 1.659 1.646 1.878 1.951 2.103 2.249 2.383 2.441 2.567 2.689 2.847 2.948 3.058 3.224 3.359 3.483 3.617 3.748 3.91 4.067 4.215 4.392 4.562 4.727 4.917 5.125 5.329 5.554 5.788 6.052 6.341 6.649 6.993 7.353 7.767 8.192 8.663 9.196 9.799 10.413 10.981 11.231 11.201 11.097 10.954 10.762 10.565 10.379 10.201 9.994 9.8 9.624 9.459 9.304 9.153 9.002 8.844 8.702 8.573 8.438 8.287 8.162 8.035 7.904 7.803 7.693 7.58 7.464 7.344 7.259 7.162 7.002 6.889 6.78 6.729 6.632 6.55 6.456 6.401 6.184 6.243 6.196 6.145 6.024 5.944 5.859 5.765 5.673 5.571 5.415 5.1 -8 ,17635 ,KEBNE ,16652909,Mon Nov 22 00:49:48 CET,Mon Nov 22 02:15:38 CET,0.0 0.248 0.397 0.514 0.606 0.706 0.806 0.902 1.072 1.144 1.214 1.192 1.421 1.492 1.645 1.787 1.931 2.0 2.12 2.242 2.415 2.52 2.614 2.753 2.896 3.026 3.152 3.274 3.437 3.597 3.744 3.914 4.089 4.256 4.445 4.674 4.892 5.123 5.387 5.658 5.933 6.261 6.626 6.971 7.376 7.825 8.32 8.848 9.428 10.041 10.662 10.966 10.99 10.887 10.704 10.495 10.311 10.11 9.906 9.7 9.51 9.332 9.175 9.032 8.882 8.753 8.617 8.464 8.329 8.194 8.048 7.926 7.794 7.662 7.566 7.453 7.33 7.211 7.092 7.005 6.912 6.774 6.671 6.572 6.52 6.407 6.3 6.171 6.105 5.892 5.956 5.905 5.844 5.701 5.629 5.565 5.493 5.419 5.336 5.223 5.028 -9 ,1670 ,KEBNE ,16652910,Mon Nov 22 00:50:50 CET,Mon Nov 22 02:16:49 CET,0.0 0.319 0.575 0.745 0.877 1.022 1.165 1.28 1.477 1.569 1.668 1.681 1.929 2.018 2.167 2.302 2.43 2.489 2.607 2.717 2.859 2.952 3.053 3.205 3.353 3.497 3.628 3.756 3.923 4.081 4.236 4.417 4.577 4.734 4.917 5.118 5.318 5.544 5.792 6.046 6.3 6.603 6.978 7.35 7.752 8.201 8.688 9.168 9.711 10.381 11.048 11.338 11.342 11.242 11.102 10.919 10.711 10.503 10.301 10.07 9.873 9.694 9.511 9.347 9.191 9.043 8.888 8.743 8.625 8.505 8.368 8.255 8.135 7.991 7.882 7.774 7.665 7.567 7.472 7.396 7.302 7.167 7.089 7.012 6.971 6.886 6.793 6.685 6.629 6.415 6.451 6.39 6.33 6.202 6.134 6.063 5.992 5.916 5.824 5.694 5.436 -10 ,30755 ,KEBNE ,16652911,Mon Nov 22 00:50:54 CET,Mon Nov 22 02:09:15 CET,0.0 0.637 0.963 1.194 1.373 1.502 1.611 1.721 1.939 2.048 2.14 2.135 2.376 2.448 2.573 2.692 2.817 2.88 2.998 3.106 3.253 3.352 3.448 3.591 3.725 3.852 3.98 4.109 4.271 4.416 4.564 4.746 4.928 5.113 5.317 5.548 5.766 5.995 6.238 6.482 6.732 7.027 7.393 7.745 8.161 8.622 9.112 9.637 10.19 10.787 11.425 11.705 11.693 11.565 11.379 11.175 10.96 10.737 10.528 10.324 10.127 9.938 9.766 9.602 9.438 9.271 9.099 8.953 8.825 8.688 8.544 8.421 8.293 8.16 8.066 7.975 7.883 7.788 7.689 7.621 7.543 7.421 7.341 7.248 7.2 7.101 7.008 6.91 6.856 6.636 6.675 6.612 6.544 6.389 6.305 6.235 6.16 6.082 5.985 5.859 5.62 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index df4158c4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22282 ,KEBNE ,16652912,Mon Nov 22 00:51:52 CET,Mon Nov 22 02:15:55 CET,0.0 1.475 1.778 2.025 2.246 2.416 2.562 2.692 2.931 3.046 3.14 3.172 3.42 3.503 3.646 3.796 3.965 4.039 4.151 4.269 4.442 4.545 4.653 4.827 4.985 5.123 5.255 5.381 5.522 5.651 5.799 5.98 6.155 6.328 6.521 6.693 6.832 7.008 7.179 7.343 7.505 7.649 7.805 7.938 8.047 8.153 8.214 8.173 8.018 7.615 6.793 5.65 4.564 3.553 2.668 1.883 1.162 0.495 -0.043 -0.543 -0.99 -1.426 -1.853 -2.253 -2.613 -2.937 -3.278 -3.588 -3.862 -4.145 -4.456 -4.752 -5.066 -5.35 -5.548 -5.764 -5.996 -6.245 -6.508 -6.682 -6.867 -7.166 -7.383 -7.627 -7.753 -7.998 -8.255 -8.522 -8.665 -8.98 -9.164 -9.356 -9.555 -10.001 -10.251 -10.516 -10.794 -11.098 -11.522 -12.19 -13.758 -2 ,19907 ,KEBNE ,16652913,Mon Nov 22 00:51:53 CET,Mon Nov 22 02:19:13 CET,0.0 1.0 1.289 1.479 1.638 1.776 1.908 2.048 2.284 2.382 2.47 2.477 2.706 2.787 2.948 3.088 3.228 3.304 3.441 3.573 3.765 3.866 3.965 4.114 4.252 4.393 4.524 4.638 4.783 4.94 5.088 5.234 5.356 5.472 5.615 5.79 5.96 6.13 6.293 6.439 6.581 6.723 6.874 7.02 7.148 7.243 7.327 7.346 7.212 6.861 6.07 4.877 3.798 2.848 1.979 1.216 0.552 -0.059 -0.605 -1.155 -1.632 -2.06 -2.447 -2.826 -3.202 -3.547 -3.886 -4.185 -4.464 -4.749 -5.032 -5.261 -5.502 -5.75 -5.938 -6.147 -6.369 -6.597 -6.845 -7.026 -7.215 -7.512 -7.723 -7.947 -8.069 -8.337 -8.598 -8.853 -9.007 -9.336 -9.491 -9.659 -9.836 -10.24 -10.476 -10.727 -11.033 -11.381 -11.827 -12.52 -14.763 -3 ,24666 ,KEBNE ,16652914,Mon Nov 22 00:52:53 CET,Mon Nov 22 02:17:02 CET,0.0 0.807 1.083 1.318 1.523 1.685 1.797 1.918 2.168 2.285 2.397 2.436 2.68 2.759 2.912 3.06 3.193 3.253 3.366 3.491 3.673 3.786 3.884 4.017 4.137 4.263 4.387 4.5 4.648 4.804 4.971 5.161 5.349 5.532 5.729 5.949 6.125 6.266 6.398 6.535 6.67 6.794 6.933 7.049 7.16 7.259 7.308 7.29 7.142 6.797 6.052 4.975 3.936 2.979 2.183 1.432 0.73 0.087 -0.483 -1.032 -1.473 -1.898 -2.303 -2.659 -3.004 -3.334 -3.683 -4.019 -4.32 -4.612 -4.894 -5.113 -5.344 -5.595 -5.805 -6.044 -6.307 -6.561 -6.82 -7.006 -7.202 -7.51 -7.719 -7.941 -8.059 -8.306 -8.554 -8.832 -8.992 -9.323 -9.517 -9.68 -9.847 -10.273 -10.538 -10.81 -11.098 -11.468 -11.949 -12.506 -14.059 -4 ,11184 ,KEBNE ,16652915,Mon Nov 22 00:52:54 CET,Mon Nov 22 02:18:28 CET,0.0 1.314 1.619 1.831 2.015 2.183 2.32 2.423 2.595 2.694 2.798 2.822 3.064 3.156 3.337 3.496 3.623 3.684 3.796 3.894 4.042 4.14 4.248 4.409 4.548 4.677 4.799 4.904 5.033 5.156 5.268 5.416 5.564 5.702 5.843 5.989 6.134 6.298 6.447 6.58 6.734 6.911 7.068 7.21 7.353 7.453 7.513 7.527 7.409 7.037 6.253 5.109 4.032 3.012 2.145 1.426 0.805 0.227 -0.281 -0.792 -1.231 -1.64 -2.022 -2.383 -2.759 -3.104 -3.444 -3.747 -4.022 -4.316 -4.607 -4.847 -5.104 -5.355 -5.553 -5.775 -6.024 -6.31 -6.602 -6.794 -6.984 -7.273 -7.491 -7.713 -7.822 -8.059 -8.308 -8.584 -8.728 -9.039 -9.233 -9.421 -9.612 -10.059 -10.312 -10.585 -10.885 -11.212 -11.581 -12.065 -13.359 -5 ,25378 ,KEBNE ,16652916,Mon Nov 22 00:52:54 CET,Mon Nov 22 02:18:25 CET,0.0 0.963 1.257 1.474 1.662 1.834 1.989 2.125 2.349 2.441 2.535 2.555 2.78 2.853 2.988 3.102 3.225 3.296 3.446 3.572 3.733 3.837 3.94 4.075 4.198 4.324 4.444 4.545 4.67 4.801 4.933 5.083 5.216 5.339 5.478 5.624 5.779 5.974 6.212 6.435 6.584 6.711 6.869 7.023 7.175 7.298 7.37 7.351 7.225 6.952 6.18 4.965 3.925 3.025 2.197 1.44 0.786 0.187 -0.346 -0.866 -1.301 -1.711 -2.108 -2.463 -2.812 -3.151 -3.497 -3.801 -4.076 -4.37 -4.674 -4.915 -5.156 -5.413 -5.618 -5.837 -6.072 -6.311 -6.557 -6.743 -6.94 -7.244 -7.471 -7.7 -7.81 -8.056 -8.328 -8.609 -8.753 -9.072 -9.247 -9.42 -9.605 -10.032 -10.282 -10.536 -10.825 -11.15 -11.558 -12.105 -14.059 -6 ,32595 ,KEBNE ,16652917,Mon Nov 22 00:53:56 CET,Mon Nov 22 02:17:58 CET,0.0 1.008 1.377 1.593 1.806 2.001 2.144 2.288 2.556 2.664 2.778 2.848 3.097 3.183 3.317 3.477 3.653 3.731 3.861 3.97 4.135 4.241 4.336 4.463 4.574 4.686 4.8 4.907 5.038 5.162 5.28 5.429 5.57 5.686 5.816 5.955 6.092 6.273 6.482 6.705 6.936 7.168 7.451 7.71 7.954 8.183 8.407 8.578 8.583 8.392 7.647 6.454 5.346 4.318 3.435 2.646 1.947 1.318 0.778 0.233 -0.243 -0.669 -1.093 -1.514 -1.885 -2.213 -2.558 -2.86 -3.134 -3.429 -3.727 -3.977 -4.249 -4.53 -4.736 -4.956 -5.196 -5.458 -5.72 -5.886 -6.061 -6.346 -6.575 -6.832 -6.953 -7.18 -7.425 -7.688 -7.829 -8.147 -8.34 -8.531 -8.721 -9.169 -9.438 -9.716 -10.005 -10.36 -10.823 -11.393 -12.862 -8 ,12527 ,KEBNE ,16652919,Mon Nov 22 00:56:00 CET,Mon Nov 22 02:19:57 CET,0.0 0.874 1.136 1.303 1.462 1.611 1.747 1.876 2.112 2.221 2.307 2.297 2.518 2.582 2.706 2.817 2.939 3.004 3.136 3.281 3.466 3.572 3.674 3.808 3.923 4.034 4.158 4.287 4.448 4.593 4.725 4.87 5.007 5.12 5.236 5.373 5.511 5.665 5.82 5.955 6.088 6.227 6.358 6.512 6.711 6.854 6.933 6.974 6.873 6.491 5.681 4.546 3.514 2.533 1.697 0.955 0.256 -0.392 -0.933 -1.475 -1.956 -2.388 -2.795 -3.178 -3.54 -3.875 -4.218 -4.534 -4.814 -5.098 -5.387 -5.636 -5.895 -6.161 -6.381 -6.617 -6.856 -7.099 -7.372 -7.551 -7.737 -8.05 -8.266 -8.489 -8.602 -8.841 -9.096 -9.365 -9.507 -9.824 -9.994 -10.167 -10.351 -10.749 -10.959 -11.191 -11.463 -11.776 -12.188 -12.79 -14.516 -9 ,27992 ,KEBNE ,16652920,Mon Nov 22 00:55:59 CET,Mon Nov 22 02:21:52 CET,0.0 0.73 0.997 1.21 1.391 1.536 1.661 1.778 1.991 2.103 2.212 2.265 2.51 2.587 2.714 2.832 2.969 3.045 3.202 3.347 3.522 3.626 3.728 3.881 4.03 4.163 4.282 4.39 4.531 4.673 4.803 4.954 5.102 5.263 5.453 5.624 5.754 5.899 6.079 6.246 6.373 6.509 6.681 6.848 6.989 7.088 7.14 7.156 7.094 6.765 5.909 4.731 3.649 2.719 1.9 1.142 0.488 -0.13 -0.675 -1.192 -1.65 -2.074 -2.466 -2.845 -3.192 -3.498 -3.84 -4.157 -4.43 -4.718 -5.008 -5.244 -5.509 -5.813 -6.038 -6.253 -6.482 -6.716 -6.962 -7.138 -7.321 -7.61 -7.804 -8.027 -8.152 -8.399 -8.651 -8.916 -9.054 -9.367 -9.534 -9.703 -9.872 -10.31 -10.568 -10.805 -11.067 -11.396 -11.777 -12.315 -14.089 -10 ,6852 ,KEBNE ,16652921,Mon Nov 22 00:55:59 CET,Mon Nov 22 02:20:07 CET,0.0 0.83 1.152 1.338 1.491 1.646 1.771 1.905 2.184 2.304 2.402 2.441 2.686 2.763 2.894 3.009 3.139 3.209 3.324 3.433 3.587 3.688 3.79 3.929 4.076 4.202 4.314 4.454 4.614 4.744 4.87 5.0 5.12 5.232 5.374 5.537 5.672 5.799 5.932 6.069 6.199 6.323 6.449 6.565 6.677 6.791 6.88 6.884 6.779 6.47 5.732 4.612 3.539 2.563 1.713 0.938 0.266 -0.36 -0.919 -1.466 -1.941 -2.365 -2.777 -3.181 -3.539 -3.861 -4.204 -4.513 -4.779 -5.067 -5.401 -5.674 -5.936 -6.2 -6.392 -6.599 -6.835 -7.083 -7.322 -7.485 -7.656 -7.908 -8.097 -8.313 -8.422 -8.646 -8.88 -9.125 -9.266 -9.574 -9.701 -9.857 -10.036 -10.453 -10.686 -10.936 -11.23 -11.586 -12.03 -12.55 -14.251 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt deleted file mode 100644 index ec02befd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28509 ,KEBNE ,16652922,Mon Nov 22 00:55:59 CET,Mon Nov 22 02:19:50 CET,0.0 0.832 1.123 1.303 1.451 1.589 1.718 1.828 1.998 2.071 2.135 2.092 2.283 2.328 2.42 2.5 2.57 2.597 2.644 2.696 2.768 2.812 2.849 2.904 2.959 3.002 3.035 3.062 3.101 3.133 3.152 3.172 3.18 3.182 3.179 3.168 3.147 3.106 3.047 2.963 2.848 2.696 2.494 2.27 1.982 1.59 1.039 0.283 -0.792 -2.331 -4.812 -7.68 -9.917 -11.748 -13.292 -14.633 -15.751 -16.722 -17.643 -18.658 -19.453 -20.098 -20.701 -21.241 -21.792 -22.357 -22.951 -23.471 -23.897 -24.302 -24.742 -25.128 -25.531 -25.944 -26.229 -26.544 -26.905 -27.285 -27.675 -27.937 -28.212 -28.638 -28.94 -29.265 -29.435 -29.779 -30.134 -30.5 -30.701 -31.09 -31.354 -31.602 -31.861 -32.432 -32.771 -33.149 -33.569 -34.052 -34.676 -35.626 -39.598 -2 ,30541 ,KEBNE ,16652923,Mon Nov 22 00:57:02 CET,Mon Nov 22 02:21:04 CET,0.0 0.65 0.906 1.114 1.269 1.379 1.483 1.585 1.753 1.818 1.867 1.822 2.026 2.079 2.174 2.258 2.331 2.366 2.435 2.503 2.606 2.662 2.705 2.762 2.808 2.857 2.908 2.944 2.986 3.019 3.048 3.069 3.072 3.077 3.072 3.053 3.027 2.986 2.934 2.854 2.748 2.626 2.457 2.241 1.943 1.539 0.981 0.226 -0.863 -2.452 -4.97 -7.82 -10.078 -11.907 -13.442 -14.796 -15.945 -16.93 -17.755 -18.615 -19.363 -19.988 -20.58 -21.198 -21.82 -22.379 -22.956 -23.428 -23.842 -24.305 -24.797 -25.211 -25.624 -26.072 -26.43 -26.786 -27.143 -27.512 -27.9 -28.17 -28.434 -28.835 -29.137 -29.449 -29.614 -29.972 -30.348 -30.739 -30.946 -31.338 -31.621 -31.864 -32.128 -32.735 -33.086 -33.47 -33.904 -34.389 -34.987 -35.878 -39.931 -3 ,1317 ,KEBNE ,16652924,Mon Nov 22 00:57:02 CET,Mon Nov 22 02:24:13 CET,0.0 0.713 1.004 1.187 1.336 1.461 1.576 1.684 1.867 1.941 2.002 1.968 2.167 2.219 2.314 2.401 2.472 2.505 2.567 2.631 2.717 2.762 2.809 2.885 2.939 2.996 3.05 3.088 3.127 3.148 3.17 3.206 3.228 3.23 3.228 3.242 3.232 3.193 3.146 3.07 2.968 2.843 2.658 2.431 2.111 1.697 1.176 0.437 -0.651 -2.248 -4.813 -7.707 -9.995 -11.87 -13.412 -14.748 -15.895 -16.917 -17.739 -18.55 -19.264 -19.901 -20.539 -21.191 -21.775 -22.293 -22.862 -23.365 -23.795 -24.26 -24.731 -25.101 -25.495 -25.921 -26.25 -26.583 -26.923 -27.289 -27.682 -27.939 -28.215 -28.652 -28.959 -29.299 -29.478 -29.82 -30.173 -30.584 -30.793 -31.181 -31.474 -31.721 -31.965 -32.53 -32.869 -33.26 -33.679 -34.162 -34.767 -35.574 -38.629 -5 ,22910 ,KEBNE ,16652926,Mon Nov 22 00:58:03 CET,Mon Nov 22 02:21:49 CET,0.0 0.807 1.052 1.246 1.392 1.502 1.607 1.702 1.841 1.91 1.984 1.951 2.145 2.184 2.278 2.381 2.457 2.486 2.545 2.601 2.679 2.726 2.759 2.803 2.854 2.901 2.94 2.98 3.018 3.044 3.068 3.098 3.114 3.111 3.113 3.112 3.096 3.057 2.999 2.926 2.833 2.708 2.535 2.334 2.025 1.601 1.034 0.281 -0.8 -2.424 -5.011 -7.88 -10.091 -11.902 -13.426 -14.768 -16.01 -17.09 -18.004 -18.931 -19.654 -20.277 -20.852 -21.461 -22.087 -22.62 -23.18 -23.711 -24.179 -24.669 -25.174 -25.595 -26.035 -26.473 -26.798 -27.131 -27.472 -27.838 -28.224 -28.488 -28.765 -29.212 -29.526 -29.865 -30.038 -30.374 -30.727 -31.125 -31.332 -31.712 -31.998 -32.244 -32.506 -33.083 -33.412 -33.767 -34.157 -34.63 -35.216 -36.099 -40.657 -7 ,6725 ,KEBNE ,16652928,Mon Nov 22 00:59:05 CET,Mon Nov 22 02:24:17 CET,0.0 0.722 0.925 1.093 1.201 1.303 1.403 1.482 1.617 1.679 1.739 1.719 1.927 1.982 2.084 2.169 2.238 2.27 2.335 2.389 2.454 2.498 2.535 2.597 2.649 2.686 2.728 2.769 2.81 2.834 2.855 2.879 2.896 2.909 2.913 2.891 2.859 2.807 2.748 2.676 2.575 2.459 2.299 2.105 1.82 1.422 0.882 0.139 -0.944 -2.508 -5.014 -7.917 -10.178 -11.995 -13.512 -14.826 -15.956 -16.979 -17.908 -18.821 -19.533 -20.156 -20.771 -21.389 -21.941 -22.459 -23.057 -23.556 -23.984 -24.457 -24.956 -25.375 -25.805 -26.227 -26.552 -26.859 -27.17 -27.536 -27.92 -28.185 -28.449 -28.857 -29.148 -29.457 -29.627 -30.0 -30.411 -30.815 -31.022 -31.426 -31.696 -31.932 -32.207 -32.84 -33.169 -33.528 -33.949 -34.446 -35.016 -35.757 -39.533 -8 ,10001 ,KEBNE ,16652929,Mon Nov 22 00:59:09 CET,Mon Nov 22 02:19:12 CET,0.0 0.788 1.017 1.167 1.307 1.434 1.545 1.631 1.759 1.818 1.874 1.828 2.029 2.079 2.172 2.247 2.3 2.331 2.404 2.47 2.55 2.591 2.626 2.681 2.73 2.775 2.819 2.855 2.891 2.929 2.961 2.993 3.008 3.003 3.0 2.995 2.984 2.958 2.903 2.826 2.742 2.626 2.44 2.21 1.888 1.49 0.934 0.133 -0.963 -2.554 -5.069 -7.944 -10.2 -12.014 -13.521 -14.834 -15.972 -16.966 -17.81 -18.626 -19.337 -19.976 -20.592 -21.23 -21.805 -22.332 -22.927 -23.453 -23.894 -24.332 -24.805 -25.21 -25.629 -26.06 -26.364 -26.675 -27.034 -27.429 -27.827 -28.086 -28.363 -28.819 -29.133 -29.477 -29.664 -30.042 -30.423 -30.82 -31.031 -31.42 -31.707 -31.962 -32.227 -32.775 -33.137 -33.543 -33.953 -34.442 -35.048 -35.947 -40.587 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index ec6207e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22119 ,TETRA ,17982653,Tue Dec 21 08:53:33 CET,Tue Dec 21 10:25:53 CET,0.0 0.875 1.221 1.474 1.692 1.881 2.057 2.224 2.519 2.65 2.767 2.831 3.076 3.178 3.381 3.569 3.76 3.845 3.994 4.14 4.333 4.446 4.561 4.73 4.89 5.045 5.188 5.319 5.483 5.629 5.766 5.932 6.102 6.272 6.48 6.716 6.914 7.12 7.339 7.563 7.791 8.033 8.265 8.492 8.769 9.032 9.29 9.547 9.744 9.799 9.564 8.979 8.344 7.743 7.171 6.6 6.124 5.686 5.298 4.839 4.337 3.931 3.608 3.322 3.058 2.785 2.459 2.117 1.808 1.501 1.179 0.903 0.613 0.32 0.088 -0.149 -0.398 -0.664 -0.934 -1.105 -1.281 -1.58 -1.793 -2.023 -2.14 -2.37 -2.627 -2.912 -3.059 -3.358 -3.533 -3.706 -3.883 -4.294 -4.52 -4.748 -5.011 -5.345 -5.735 -6.196 -7.59 -2 ,28197 ,TETRA ,17982654,Tue Dec 21 08:53:34 CET,Tue Dec 21 10:26:52 CET,0.0 0.972 1.388 1.715 1.972 2.182 2.372 2.553 2.857 2.99 3.13 3.216 3.462 3.557 3.736 3.913 4.082 4.158 4.295 4.424 4.621 4.745 4.859 5.026 5.201 5.363 5.495 5.616 5.779 5.944 6.092 6.285 6.466 6.616 6.797 7.017 7.216 7.422 7.64 7.85 8.067 8.303 8.581 8.845 9.111 9.39 9.665 9.906 10.128 10.24 10.042 9.462 8.842 8.242 7.681 7.135 6.649 6.211 5.813 5.409 5.066 4.74 4.391 4.042 3.714 3.431 3.116 2.791 2.484 2.151 1.804 1.53 1.243 0.98 0.784 0.559 0.314 0.053 -0.22 -0.415 -0.598 -0.877 -1.081 -1.298 -1.414 -1.655 -1.911 -2.172 -2.304 -2.601 -2.777 -2.95 -3.128 -3.519 -3.729 -3.951 -4.219 -4.564 -4.975 -5.489 -6.865 -3 ,8982 ,TETRA ,17982655,Tue Dec 21 08:54:32 CET,Tue Dec 21 10:31:28 CET,0.0 0.993 1.402 1.699 1.947 2.16 2.34 2.509 2.805 2.932 3.053 3.125 3.378 3.482 3.673 3.847 4.031 4.115 4.251 4.388 4.579 4.695 4.813 4.968 5.105 5.254 5.399 5.532 5.698 5.861 6.028 6.217 6.391 6.563 6.747 6.928 7.104 7.317 7.533 7.726 7.93 8.154 8.412 8.664 8.916 9.155 9.387 9.598 9.76 9.766 9.466 8.868 8.214 7.58 7.007 6.467 5.958 5.499 5.101 4.586 4.087 3.706 3.367 3.052 2.732 2.388 2.017 1.683 1.392 1.08 0.741 0.457 0.196 -0.038 -0.249 -0.487 -0.729 -0.985 -1.259 -1.459 -1.663 -1.959 -2.168 -2.405 -2.525 -2.781 -3.053 -3.332 -3.488 -3.794 -3.966 -4.139 -4.315 -4.738 -4.982 -5.231 -5.504 -5.799 -6.159 -6.687 -8.012 -4 ,24128 ,TETRA ,17982656,Tue Dec 21 08:54:32 CET,Tue Dec 21 10:31:40 CET,0.0 0.833 1.166 1.434 1.67 1.876 2.081 2.266 2.541 2.656 2.772 2.835 3.079 3.182 3.385 3.561 3.709 3.779 3.917 4.06 4.26 4.376 4.481 4.638 4.791 4.947 5.096 5.234 5.413 5.596 5.776 5.976 6.161 6.325 6.507 6.705 6.89 7.115 7.355 7.592 7.818 8.045 8.297 8.516 8.768 9.047 9.29 9.514 9.693 9.722 9.504 8.837 8.09 7.451 6.892 6.335 5.817 5.351 4.95 4.47 3.965 3.488 3.037 2.63 2.301 2.026 1.704 1.379 1.081 0.774 0.462 0.195 -0.083 -0.374 -0.601 -0.835 -1.082 -1.34 -1.597 -1.772 -1.964 -2.262 -2.472 -2.708 -2.825 -3.054 -3.304 -3.58 -3.723 -4.025 -4.215 -4.394 -4.583 -5.013 -5.246 -5.498 -5.784 -6.094 -6.453 -6.983 -8.508 -5 ,17780 ,TETRA ,17982657,Tue Dec 21 08:54:33 CET,Tue Dec 21 10:31:57 CET,0.0 1.154 1.533 1.817 2.049 2.264 2.452 2.606 2.869 2.999 3.129 3.22 3.475 3.576 3.76 3.942 4.119 4.193 4.328 4.458 4.653 4.781 4.907 5.093 5.255 5.404 5.548 5.686 5.856 6.03 6.19 6.351 6.508 6.673 6.854 7.044 7.219 7.401 7.587 7.789 8.017 8.257 8.512 8.739 8.983 9.264 9.535 9.773 9.977 10.043 9.852 9.323 8.717 8.09 7.506 6.96 6.464 5.886 5.324 4.83 4.411 3.98 3.574 3.245 2.924 2.58 2.239 1.933 1.636 1.327 0.988 0.706 0.446 0.171 -0.067 -0.31 -0.557 -0.813 -1.062 -1.236 -1.432 -1.738 -1.954 -2.177 -2.294 -2.546 -2.807 -3.076 -3.218 -3.518 -3.69 -3.875 -4.075 -4.495 -4.725 -4.969 -5.244 -5.578 -5.973 -6.457 -7.977 -6 ,29508 ,TETRA ,17982658,Tue Dec 21 08:54:34 CET,Tue Dec 21 10:31:20 CET,0.0 1.089 1.487 1.778 2.037 2.25 2.412 2.563 2.864 2.994 3.109 3.168 3.415 3.514 3.708 3.877 4.023 4.096 4.24 4.374 4.576 4.703 4.823 5.004 5.171 5.321 5.454 5.578 5.751 5.935 6.121 6.333 6.502 6.652 6.831 7.03 7.216 7.417 7.625 7.83 8.05 8.292 8.553 8.804 9.078 9.353 9.644 9.932 10.122 10.165 9.902 9.286 8.656 8.041 7.473 6.914 6.425 5.991 5.569 5.129 4.725 4.297 3.849 3.489 3.142 2.77 2.45 2.184 1.893 1.556 1.212 0.945 0.669 0.369 0.139 -0.076 -0.278 -0.504 -0.747 -0.927 -1.131 -1.44 -1.652 -1.883 -2.0 -2.236 -2.506 -2.809 -2.97 -3.284 -3.482 -3.667 -3.859 -4.275 -4.51 -4.769 -5.069 -5.39 -5.782 -6.372 -7.789 -7 ,19378 ,TETRA ,17982659,Tue Dec 21 08:54:32 CET,Tue Dec 21 10:31:25 CET,0.0 1.156 1.612 1.903 2.111 2.286 2.446 2.614 2.933 3.075 3.206 3.298 3.555 3.659 3.837 4.009 4.18 4.265 4.413 4.554 4.78 4.921 5.05 5.228 5.385 5.546 5.714 5.889 6.094 6.248 6.393 6.593 6.785 6.957 7.149 7.364 7.565 7.789 8.02 8.238 8.454 8.694 8.982 9.261 9.563 9.843 10.103 10.328 10.492 10.555 10.342 9.797 9.176 8.524 7.933 7.294 6.582 5.989 5.559 5.147 4.795 4.471 4.16 3.795 3.393 3.02 2.643 2.291 1.97 1.654 1.328 1.054 0.772 0.488 0.271 0.039 -0.211 -0.469 -0.742 -0.934 -1.13 -1.426 -1.629 -1.844 -1.958 -2.192 -2.441 -2.71 -2.859 -3.172 -3.353 -3.53 -3.703 -4.077 -4.311 -4.571 -4.855 -5.185 -5.597 -6.101 -7.201 -8 ,16462 ,TETRA ,17982660,Tue Dec 21 08:54:33 CET,Tue Dec 21 10:31:34 CET,0.0 1.189 1.62 1.913 2.159 2.372 2.575 2.741 3.018 3.147 3.275 3.363 3.62 3.719 3.905 4.088 4.256 4.334 4.487 4.644 4.863 4.988 5.112 5.296 5.452 5.608 5.758 5.889 6.064 6.224 6.369 6.552 6.726 6.886 7.074 7.284 7.456 7.633 7.828 8.029 8.247 8.483 8.728 8.961 9.229 9.509 9.783 10.034 10.272 10.387 10.179 9.563 8.875 8.257 7.673 7.13 6.644 6.213 5.848 5.468 5.121 4.726 4.352 4.0 3.609 3.235 2.84 2.49 2.193 1.88 1.536 1.246 0.966 0.68 0.447 0.202 -0.052 -0.311 -0.588 -0.785 -0.984 -1.291 -1.502 -1.721 -1.839 -2.074 -2.318 -2.59 -2.736 -3.039 -3.212 -3.383 -3.559 -3.922 -4.125 -4.36 -4.654 -5.0 -5.387 -5.866 -7.112 -9 ,2664 ,TETRA ,17982661,Tue Dec 21 08:54:35 CET,Tue Dec 21 10:32:19 CET,0.0 0.826 1.204 1.488 1.719 1.91 2.088 2.249 2.552 2.691 2.811 2.873 3.119 3.207 3.37 3.527 3.669 3.745 3.901 4.037 4.235 4.356 4.469 4.637 4.797 4.951 5.101 5.26 5.455 5.622 5.781 5.969 6.144 6.311 6.502 6.715 6.899 7.085 7.275 7.472 7.686 7.92 8.167 8.38 8.633 8.911 9.193 9.455 9.652 9.731 9.52 8.941 8.34 7.724 7.131 6.592 6.095 5.62 5.188 4.745 4.374 4.045 3.735 3.442 3.122 2.817 2.539 2.292 2.025 1.74 1.45 1.193 0.917 0.645 0.439 0.209 -0.03 -0.278 -0.535 -0.712 -0.903 -1.212 -1.422 -1.644 -1.76 -1.988 -2.24 -2.525 -2.675 -2.981 -3.17 -3.339 -3.504 -3.874 -4.088 -4.337 -4.626 -4.937 -5.296 -5.741 -7.047 -10 ,14800 ,TETRA ,17982662,Tue Dec 21 08:54:32 CET,Tue Dec 21 10:32:01 CET,0.0 1.162 1.528 1.793 2.008 2.219 2.407 2.573 2.865 3.003 3.133 3.202 3.442 3.539 3.736 3.902 4.068 4.152 4.301 4.441 4.64 4.767 4.888 5.06 5.223 5.373 5.522 5.681 5.879 6.056 6.217 6.388 6.558 6.734 6.928 7.115 7.29 7.498 7.716 7.929 8.157 8.397 8.649 8.89 9.14 9.382 9.609 9.817 9.998 10.089 9.905 9.265 8.327 7.331 6.578 5.868 5.255 4.768 4.342 3.913 3.532 3.199 2.893 2.561 2.179 1.819 1.451 1.111 0.813 0.492 0.182 -0.06 -0.331 -0.628 -0.858 -1.1 -1.359 -1.626 -1.903 -2.095 -2.296 -2.602 -2.823 -3.036 -3.141 -3.39 -3.653 -3.924 -4.069 -4.374 -4.528 -4.697 -4.88 -5.273 -5.495 -5.723 -5.966 -6.275 -6.697 -7.231 -8.689 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index a4bfbb80..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9709 ,KEBNE ,16652932,Mon Nov 22 01:01:08 CET,Mon Nov 22 02:26:57 CET,0.0 0.679 0.955 1.17 1.358 1.508 1.634 1.744 1.945 2.043 2.135 2.163 2.386 2.448 2.579 2.693 2.807 2.871 3.014 3.168 3.367 3.483 3.603 3.758 3.885 4.006 4.124 4.239 4.367 4.475 4.581 4.7 4.805 4.913 5.052 5.201 5.303 5.405 5.53 5.668 5.798 5.899 5.975 6.029 6.095 6.175 6.237 6.218 6.089 5.658 4.584 3.042 1.715 0.515 -0.589 -1.51 -2.29 -3.01 -3.65 -4.373 -5.058 -5.674 -6.261 -6.815 -7.326 -7.776 -8.232 -8.659 -9.031 -9.39 -9.78 -10.134 -10.508 -10.89 -11.175 -11.455 -11.748 -12.071 -12.418 -12.665 -12.916 -13.296 -13.567 -13.853 -14.0 -14.302 -14.629 -14.995 -15.188 -15.567 -15.885 -16.124 -16.346 -16.829 -17.12 -17.47 -17.843 -18.27 -18.8 -19.51 -22.191 -2 ,7477 ,KEBNE ,16652933,Mon Nov 22 01:02:10 CET,Mon Nov 22 02:28:04 CET,0.0 0.694 1.002 1.258 1.449 1.57 1.675 1.785 1.98 2.068 2.163 2.199 2.433 2.52 2.677 2.817 2.958 3.03 3.176 3.313 3.473 3.568 3.657 3.8 3.96 4.104 4.232 4.348 4.491 4.611 4.723 4.858 4.984 5.109 5.236 5.364 5.491 5.61 5.714 5.816 5.904 5.994 6.097 6.209 6.287 6.32 6.309 6.184 5.88 5.254 4.032 2.481 1.145 -0.036 -1.046 -1.978 -2.784 -3.488 -4.16 -4.917 -5.602 -6.227 -6.791 -7.243 -7.628 -7.979 -8.377 -8.787 -9.163 -9.55 -9.962 -10.317 -10.677 -11.055 -11.349 -11.651 -11.963 -12.294 -12.657 -12.905 -13.152 -13.535 -13.803 -14.094 -14.243 -14.544 -14.856 -15.197 -15.389 -15.735 -15.959 -16.182 -16.41 -16.921 -17.201 -17.519 -17.909 -18.329 -18.774 -19.356 -21.393 -3 ,12996 ,KEBNE ,16652934,Mon Nov 22 01:10:29 CET,Mon Nov 22 02:28:49 CET,0.0 0.615 0.914 1.148 1.343 1.507 1.627 1.722 1.922 2.036 2.137 2.154 2.385 2.458 2.583 2.695 2.799 2.848 2.956 3.077 3.267 3.394 3.507 3.681 3.853 4.006 4.142 4.277 4.421 4.518 4.621 4.753 4.887 5.003 5.118 5.246 5.358 5.472 5.585 5.709 5.844 5.954 6.063 6.181 6.264 6.276 6.198 6.016 5.697 5.099 3.895 2.318 0.988 -0.177 -1.212 -2.128 -3.037 -3.89 -4.553 -5.178 -5.707 -6.203 -6.677 -7.129 -7.61 -8.089 -8.548 -8.92 -9.241 -9.599 -9.966 -10.263 -10.619 -11.015 -11.308 -11.602 -11.907 -12.23 -12.582 -12.824 -13.068 -13.439 -13.697 -13.964 -14.103 -14.414 -14.748 -15.088 -15.274 -15.625 -15.867 -16.092 -16.333 -16.854 -17.137 -17.473 -17.879 -18.365 -18.941 -19.731 -22.23 -4 ,17333 ,KEBNE ,16652935,Mon Nov 22 01:11:27 CET,Mon Nov 22 02:35:45 CET,0.0 0.744 1.056 1.271 1.474 1.62 1.735 1.862 2.14 2.273 2.389 2.419 2.636 2.697 2.814 2.932 3.056 3.113 3.208 3.296 3.423 3.512 3.596 3.721 3.867 4.026 4.188 4.333 4.487 4.608 4.739 4.913 5.038 5.142 5.247 5.363 5.5 5.633 5.755 5.853 5.95 6.062 6.157 6.243 6.294 6.266 6.195 6.066 5.79 5.231 4.093 2.545 1.194 -0.016 -1.084 -2.038 -2.842 -3.576 -4.231 -4.895 -5.45 -5.926 -6.432 -6.97 -7.483 -7.953 -8.413 -8.772 -9.099 -9.463 -9.811 -10.119 -10.471 -10.837 -11.127 -11.419 -11.72 -12.027 -12.345 -12.574 -12.817 -13.202 -13.465 -13.737 -13.874 -14.165 -14.473 -14.813 -15.002 -15.353 -15.585 -15.795 -16.023 -16.572 -16.859 -17.15 -17.497 -17.897 -18.327 -18.876 -21.228 -5 ,20593 ,KEBNE ,16652936,Mon Nov 22 01:12:33 CET,Mon Nov 22 02:34:30 CET,0.0 0.823 1.1 1.321 1.529 1.704 1.868 1.995 2.188 2.281 2.37 2.394 2.627 2.703 2.846 2.977 3.085 3.14 3.26 3.388 3.543 3.63 3.736 3.893 4.009 4.129 4.262 4.382 4.504 4.612 4.734 4.873 4.996 5.109 5.224 5.341 5.453 5.572 5.69 5.797 5.887 5.982 6.103 6.194 6.223 6.216 6.176 6.04 5.716 5.097 3.847 2.248 0.839 -0.494 -1.664 -2.799 -3.868 -4.688 -5.314 -5.973 -6.536 -7.026 -7.524 -7.989 -8.389 -8.757 -9.147 -9.504 -9.853 -10.269 -10.669 -10.948 -11.26 -11.619 -11.898 -12.192 -12.506 -12.835 -13.181 -13.418 -13.654 -14.029 -14.293 -14.551 -14.681 -14.98 -15.311 -15.648 -15.832 -16.181 -16.428 -16.653 -16.882 -17.376 -17.657 -17.974 -18.328 -18.73 -19.164 -19.782 -22.789 -6 ,3312 ,KEBNE ,16652937,Mon Nov 22 01:13:32 CET,Mon Nov 22 02:37:44 CET,0.0 0.907 1.183 1.394 1.573 1.71 1.839 1.976 2.211 2.32 2.433 2.495 2.737 2.817 2.957 3.077 3.199 3.262 3.393 3.519 3.67 3.761 3.856 4.001 4.132 4.246 4.351 4.451 4.589 4.716 4.828 4.956 5.067 5.166 5.288 5.425 5.55 5.683 5.802 5.913 6.015 6.116 6.231 6.317 6.361 6.379 6.336 6.153 5.805 5.179 4.008 2.461 1.102 -0.072 -1.097 -2.016 -2.809 -3.61 -4.282 -4.943 -5.589 -6.12 -6.598 -7.089 -7.581 -8.058 -8.556 -9.005 -9.382 -9.727 -10.081 -10.386 -10.708 -11.038 -11.305 -11.598 -11.91 -12.226 -12.544 -12.778 -13.016 -13.392 -13.65 -13.919 -14.057 -14.35 -14.682 -15.046 -15.239 -15.602 -15.866 -16.082 -16.299 -16.808 -17.101 -17.411 -17.753 -18.135 -18.601 -19.313 -21.598 -7 ,18970 ,KEBNE ,16652938,Mon Nov 22 01:13:35 CET,Mon Nov 22 02:33:54 CET,0.0 0.777 1.086 1.29 1.445 1.601 1.748 1.881 2.147 2.266 2.364 2.379 2.592 2.662 2.809 2.96 3.116 3.18 3.293 3.422 3.619 3.745 3.854 3.989 4.114 4.234 4.368 4.492 4.613 4.721 4.825 4.963 5.093 5.191 5.298 5.423 5.539 5.65 5.755 5.866 5.971 6.071 6.166 6.239 6.292 6.287 6.228 6.095 5.798 5.233 4.055 2.476 1.103 -0.082 -1.118 -2.037 -2.836 -3.565 -4.189 -4.829 -5.419 -5.942 -6.434 -6.957 -7.432 -7.819 -8.212 -8.547 -8.854 -9.19 -9.58 -9.935 -10.297 -10.669 -10.963 -11.268 -11.576 -11.902 -12.241 -12.476 -12.724 -13.115 -13.384 -13.657 -13.797 -14.08 -14.4 -14.765 -14.957 -15.32 -15.568 -15.772 -16.001 -16.525 -16.811 -17.121 -17.469 -17.854 -18.335 -18.963 -21.732 -9 ,30067 ,KEBNE ,16652940,Mon Nov 22 01:14:34 CET,Mon Nov 22 02:38:45 CET,0.0 1.68 1.965 2.202 2.4 2.584 2.747 2.875 3.063 3.137 3.227 3.258 3.471 3.537 3.687 3.839 3.979 4.047 4.183 4.294 4.434 4.524 4.623 4.782 4.921 5.04 5.148 5.255 5.392 5.499 5.586 5.724 5.884 6.029 6.198 6.344 6.453 6.573 6.692 6.823 6.931 7.03 7.136 7.219 7.278 7.305 7.241 7.066 6.737 6.106 4.887 3.282 1.93 0.776 -0.217 -1.139 -1.952 -2.672 -3.294 -3.9 -4.41 -4.94 -5.524 -6.079 -6.596 -7.079 -7.577 -8.001 -8.376 -8.776 -9.195 -9.533 -9.882 -10.254 -10.547 -10.854 -11.17 -11.496 -11.846 -12.089 -12.335 -12.707 -12.958 -13.221 -13.361 -13.666 -13.984 -14.318 -14.493 -14.835 -15.078 -15.315 -15.563 -16.086 -16.384 -16.738 -17.127 -17.524 -17.999 -18.668 -20.536 -10 ,17414 ,KEBNE ,16652941,Mon Nov 22 01:14:38 CET,Mon Nov 22 02:35:46 CET,0.0 0.778 0.988 1.205 1.403 1.567 1.72 1.834 2.007 2.091 2.182 2.196 2.411 2.483 2.634 2.768 2.879 2.929 3.033 3.134 3.276 3.36 3.448 3.593 3.728 3.856 3.981 4.094 4.224 4.335 4.438 4.547 4.652 4.764 4.879 4.995 5.101 5.205 5.31 5.406 5.502 5.605 5.693 5.784 5.871 5.878 5.812 5.657 5.29 4.676 3.597 2.062 0.71 -0.465 -1.545 -2.686 -3.773 -4.681 -5.349 -5.954 -6.5 -7.023 -7.52 -8.013 -8.453 -8.85 -9.328 -9.771 -10.149 -10.558 -11.012 -11.359 -11.686 -12.043 -12.324 -12.616 -12.923 -13.245 -13.581 -13.809 -14.048 -14.426 -14.698 -14.983 -15.137 -15.474 -15.814 -16.155 -16.338 -16.704 -16.943 -17.143 -17.381 -17.926 -18.209 -18.499 -18.825 -19.221 -19.679 -20.289 -22.731 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 9f526bf5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23956 ,TETRA ,17982673,Tue Dec 21 08:54:38 CET,Tue Dec 21 10:32:10 CET,0.0 0.963 1.333 1.657 1.941 2.176 2.362 2.518 2.785 2.919 3.06 3.151 3.437 3.542 3.754 3.964 4.152 4.242 4.426 4.608 4.874 5.049 5.214 5.447 5.674 5.886 6.078 6.279 6.545 6.796 7.032 7.305 7.574 7.838 8.14 8.483 8.809 9.144 9.507 9.918 10.356 10.84 11.406 11.959 12.59 13.322 14.166 15.079 16.125 17.271 18.383 19.009 19.193 19.17 19.046 18.856 18.634 18.392 18.186 17.943 17.694 17.475 17.259 17.037 16.834 16.645 16.427 16.238 16.083 15.913 15.728 15.55 15.368 15.185 15.04 14.9 14.756 14.588 14.4 14.263 14.117 13.899 13.752 13.59 13.507 13.352 13.178 12.961 12.843 12.588 12.533 12.408 12.279 11.999 11.818 11.602 11.362 11.11 10.778 10.299 8.744 -2 ,15076 ,TETRA ,17982674,Tue Dec 21 08:54:39 CET,Tue Dec 21 10:32:09 CET,0.0 0.906 1.285 1.56 1.811 2.049 2.245 2.417 2.754 2.901 3.034 3.12 3.401 3.515 3.745 3.965 4.161 4.253 4.425 4.591 4.839 4.996 5.138 5.344 5.562 5.77 5.969 6.176 6.452 6.696 6.925 7.217 7.497 7.75 8.03 8.376 8.721 9.086 9.481 9.895 10.322 10.817 11.409 11.976 12.635 13.375 14.187 15.069 16.049 17.156 18.315 18.995 19.155 19.064 18.88 18.648 18.44 18.238 18.019 17.793 17.6 17.397 17.187 16.961 16.741 16.561 16.367 16.179 16.017 15.851 15.668 15.5 15.318 15.134 14.986 14.828 14.664 14.497 14.304 14.167 14.031 13.807 13.649 13.486 13.401 13.212 13.01 12.82 12.71 12.436 12.335 12.189 12.039 11.704 11.513 11.333 11.1 10.781 10.442 9.99 8.092 -3 ,28902 ,TETRA ,17982675,Tue Dec 21 08:54:36 CET,Tue Dec 21 10:33:08 CET,0.0 0.885 1.273 1.554 1.788 1.993 2.184 2.36 2.663 2.797 2.933 3.035 3.325 3.435 3.653 3.841 4.023 4.116 4.304 4.493 4.767 4.927 5.08 5.311 5.527 5.735 5.929 6.122 6.371 6.606 6.83 7.102 7.374 7.637 7.945 8.283 8.604 8.969 9.371 9.791 10.22 10.683 11.226 11.807 12.5 13.259 14.089 14.981 15.993 17.139 18.337 19.039 19.254 19.267 19.158 18.957 18.725 18.455 18.209 17.949 17.685 17.452 17.215 16.976 16.76 16.551 16.328 16.128 15.949 15.774 15.605 15.459 15.299 15.131 14.985 14.829 14.677 14.509 14.327 14.202 14.073 13.869 13.723 13.561 13.48 13.298 13.078 12.855 12.744 12.485 12.372 12.206 12.056 11.74 11.548 11.366 11.156 10.89 10.548 10.056 8.891 -4 ,21266 ,TETRA ,17982676,Tue Dec 21 08:54:39 CET,Tue Dec 21 10:33:03 CET,0.0 1.149 1.61 1.963 2.233 2.473 2.686 2.848 3.144 3.279 3.398 3.457 3.741 3.86 4.081 4.291 4.499 4.594 4.768 4.94 5.215 5.387 5.533 5.746 5.952 6.148 6.335 6.522 6.771 7.002 7.223 7.497 7.761 8.018 8.325 8.685 9.016 9.354 9.724 10.132 10.56 11.033 11.582 12.133 12.768 13.488 14.315 15.209 16.237 17.325 18.448 19.124 19.298 19.327 19.22 19.001 18.765 18.532 18.283 17.972 17.716 17.502 17.289 17.068 16.864 16.675 16.458 16.276 16.122 15.951 15.77 15.597 15.406 15.194 15.031 14.883 14.721 14.555 14.38 14.245 14.109 13.89 13.723 13.546 13.451 13.264 13.056 12.829 12.726 12.465 12.365 12.234 12.092 11.753 11.562 11.368 11.137 10.847 10.492 9.985 8.077 -5 ,19048 ,TETRA ,17982677,Tue Dec 21 08:54:40 CET,Tue Dec 21 10:32:16 CET,0.0 1.048 1.459 1.763 2.017 2.231 2.417 2.579 2.868 3.018 3.161 3.238 3.527 3.634 3.812 3.997 4.189 4.285 4.466 4.646 4.911 5.081 5.251 5.469 5.674 5.896 6.119 6.327 6.587 6.831 7.07 7.382 7.677 7.945 8.253 8.596 8.926 9.285 9.663 10.074 10.524 11.028 11.599 12.172 12.831 13.567 14.433 15.442 16.5 17.569 18.712 19.415 19.578 19.523 19.374 19.153 18.906 18.657 18.454 18.234 18.021 17.808 17.587 17.366 17.155 16.966 16.77 16.598 16.431 16.254 16.074 15.922 15.751 15.57 15.428 15.259 15.1 14.933 14.725 14.577 14.427 14.23 14.087 13.909 13.819 13.639 13.463 13.265 13.155 12.892 12.8 12.668 12.52 12.153 11.947 11.741 11.521 11.249 10.907 10.363 8.804 -6 ,20208 ,TETRA ,17982678,Tue Dec 21 08:54:38 CET,Tue Dec 21 10:32:09 CET,0.0 0.941 1.286 1.563 1.809 2.015 2.211 2.409 2.732 2.872 3.022 3.138 3.426 3.532 3.726 3.909 4.088 4.177 4.356 4.523 4.767 4.932 5.087 5.302 5.507 5.699 5.897 6.105 6.372 6.623 6.854 7.122 7.389 7.655 7.963 8.311 8.645 9.008 9.396 9.822 10.267 10.757 11.317 11.873 12.553 13.296 14.107 15.009 16.032 17.126 18.203 18.8 18.963 18.935 18.784 18.536 18.302 18.086 17.851 17.594 17.353 17.117 16.879 16.663 16.449 16.245 16.048 15.864 15.7 15.511 15.311 15.146 14.963 14.768 14.63 14.485 14.308 14.121 13.926 13.787 13.649 13.432 13.268 13.096 13.013 12.834 12.634 12.411 12.299 12.031 11.914 11.765 11.614 11.295 11.114 10.92 10.689 10.41 10.064 9.618 7.812 -7 ,17907 ,TETRA ,17982679,Tue Dec 21 08:54:37 CET,Tue Dec 21 10:26:13 CET,0.0 0.958 1.354 1.63 1.839 2.04 2.23 2.421 2.758 2.893 3.022 3.08 3.359 3.47 3.682 3.883 4.081 4.175 4.359 4.536 4.787 4.953 5.109 5.343 5.571 5.783 5.99 6.201 6.465 6.704 6.943 7.238 7.52 7.791 8.102 8.462 8.812 9.181 9.575 9.983 10.421 10.918 11.486 12.06 12.699 13.397 14.258 15.243 16.301 17.37 18.452 19.101 19.245 19.209 19.09 18.89 18.65 18.397 18.152 17.888 17.672 17.458 17.226 17.023 16.815 16.607 16.395 16.204 16.025 15.833 15.641 15.477 15.307 15.117 14.966 14.81 14.64 14.457 14.268 14.139 14.002 13.792 13.641 13.479 13.397 13.219 13.031 12.815 12.692 12.413 12.322 12.196 12.045 11.699 11.494 11.268 11.017 10.733 10.393 9.951 8.39 -8 ,17402 ,TETRA ,17982680,Tue Dec 21 08:55:23 CET,Tue Dec 21 10:32:31 CET,0.0 0.852 1.215 1.504 1.758 1.976 2.164 2.324 2.62 2.761 2.895 2.969 3.244 3.352 3.562 3.77 3.966 4.061 4.259 4.437 4.673 4.831 4.994 5.227 5.443 5.654 5.859 6.058 6.323 6.569 6.804 7.085 7.361 7.629 7.924 8.266 8.591 8.938 9.321 9.735 10.15 10.612 11.188 11.782 12.462 13.228 14.116 15.113 16.211 17.336 18.588 19.391 19.609 19.559 19.409 19.235 19.026 18.806 18.586 18.318 18.073 17.839 17.607 17.389 17.192 17.013 16.817 16.631 16.462 16.278 16.069 15.89 15.703 15.513 15.375 15.23 15.063 14.889 14.713 14.583 14.448 14.227 14.079 13.925 13.845 13.679 13.47 13.23 13.111 12.845 12.764 12.64 12.491 12.183 12.018 11.83 11.62 11.365 11.014 10.481 8.907 -9 ,24607 ,TETRA ,17982681,Tue Dec 21 08:55:25 CET,Tue Dec 21 10:32:51 CET,0.0 0.973 1.362 1.648 1.884 2.089 2.255 2.42 2.752 2.914 3.058 3.134 3.423 3.537 3.765 3.987 4.194 4.294 4.483 4.661 4.895 5.058 5.225 5.439 5.641 5.846 6.059 6.262 6.497 6.729 6.972 7.27 7.551 7.816 8.118 8.446 8.762 9.126 9.521 9.924 10.345 10.816 11.361 11.92 12.58 13.325 14.157 15.037 16.044 17.195 18.406 19.023 19.143 19.101 18.947 18.72 18.479 18.252 18.064 17.842 17.604 17.394 17.197 16.979 16.764 16.574 16.372 16.183 16.013 15.836 15.636 15.446 15.248 15.044 14.879 14.711 14.553 14.385 14.201 14.072 13.937 13.723 13.572 13.408 13.312 13.116 12.913 12.701 12.601 12.339 12.249 12.115 11.969 11.629 11.429 11.223 11.0 10.717 10.343 9.769 7.84 -10 ,8174 ,TETRA ,17982682,Tue Dec 21 08:55:25 CET,Tue Dec 21 10:32:53 CET,0.0 0.855 1.314 1.648 1.902 2.126 2.342 2.539 2.844 2.973 3.103 3.209 3.505 3.625 3.852 4.059 4.258 4.355 4.548 4.732 4.988 5.152 5.321 5.563 5.783 5.991 6.192 6.4 6.658 6.895 7.133 7.418 7.69 7.952 8.258 8.601 8.927 9.281 9.641 10.026 10.46 10.936 11.494 12.083 12.729 13.392 14.164 15.015 15.986 17.085 18.247 18.965 19.134 19.071 18.912 18.714 18.505 18.278 18.054 17.78 17.532 17.321 17.12 16.937 16.751 16.559 16.343 16.151 15.989 15.814 15.615 15.44 15.245 15.025 14.854 14.69 14.529 14.361 14.181 14.064 13.935 13.724 13.569 13.392 13.299 13.099 12.884 12.659 12.544 12.275 12.191 12.057 11.914 11.6 11.397 11.161 10.89 10.6 10.259 9.754 7.973 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt deleted file mode 100644 index b1b306c6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14795 ,KEBNE ,16652942,Mon Nov 22 01:15:36 CET,Mon Nov 22 02:40:39 CET,0.0 0.906 1.199 1.414 1.582 1.711 1.831 1.958 2.181 2.266 2.332 2.306 2.556 2.628 2.737 2.831 2.916 2.96 3.049 3.121 3.207 3.261 3.316 3.387 3.455 3.525 3.586 3.635 3.683 3.728 3.758 3.774 3.786 3.79 3.789 3.758 3.709 3.653 3.575 3.452 3.287 3.072 2.779 2.44 1.972 1.401 0.608 -0.544 -2.13 -4.416 -8.117 -12.295 -15.53 -18.15 -20.3 -22.143 -23.725 -25.11 -26.238 -27.346 -28.303 -29.129 -29.907 -30.628 -31.275 -31.866 -32.473 -33.014 -33.488 -33.967 -34.437 -34.821 -35.24 -35.676 -36.003 -36.335 -36.679 -37.025 -37.382 -37.625 -37.876 -38.283 -38.57 -38.865 -39.01 -39.314 -39.633 -39.977 -40.158 -40.543 -40.703 -40.9 -41.109 -41.575 -41.846 -42.146 -42.451 -42.782 -43.216 -43.801 -45.544 -2 ,6195 ,KEBNE ,16652943,Mon Nov 22 01:15:36 CET,Mon Nov 22 02:42:21 CET,0.0 1.6 1.926 2.16 2.33 2.465 2.578 2.683 2.896 2.989 3.075 3.052 3.278 3.338 3.457 3.57 3.69 3.739 3.809 3.878 3.986 4.052 4.111 4.186 4.24 4.292 4.343 4.375 4.421 4.466 4.507 4.553 4.584 4.587 4.554 4.509 4.457 4.388 4.301 4.174 4.013 3.819 3.544 3.218 2.747 2.134 1.295 0.147 -1.375 -3.614 -7.305 -11.478 -14.739 -17.404 -19.57 -21.411 -22.976 -24.353 -25.486 -26.59 -27.527 -28.338 -29.126 -29.86 -30.503 -31.081 -31.671 -32.183 -32.634 -33.11 -33.593 -33.975 -34.372 -34.796 -35.133 -35.495 -35.877 -36.254 -36.606 -36.848 -37.105 -37.503 -37.78 -38.073 -38.222 -38.538 -38.871 -39.237 -39.449 -39.873 -40.081 -40.293 -40.524 -41.029 -41.307 -41.616 -41.93 -42.272 -42.701 -43.235 -44.888 -3 ,25590 ,KEBNE ,16652944,Mon Nov 22 01:15:36 CET,Mon Nov 22 02:42:08 CET,0.0 0.714 1.06 1.257 1.428 1.589 1.715 1.826 2.033 2.106 2.17 2.117 2.346 2.415 2.536 2.65 2.749 2.795 2.876 2.933 3.015 3.063 3.11 3.177 3.241 3.306 3.36 3.41 3.481 3.537 3.577 3.618 3.661 3.684 3.663 3.609 3.545 3.475 3.407 3.32 3.176 2.954 2.656 2.305 1.811 1.188 0.371 -0.732 -2.276 -4.524 -8.217 -12.457 -15.745 -18.38 -20.546 -22.406 -23.955 -25.291 -26.436 -27.567 -28.509 -29.353 -30.151 -30.859 -31.489 -32.061 -32.668 -33.221 -33.69 -34.167 -34.646 -35.035 -35.443 -35.859 -36.176 -36.498 -36.824 -37.185 -37.579 -37.842 -38.097 -38.485 -38.754 -39.038 -39.182 -39.475 -39.791 -40.116 -40.288 -40.678 -40.874 -41.089 -41.304 -41.774 -42.036 -42.319 -42.626 -42.967 -43.354 -43.832 -45.444 -4 ,21227 ,KEBNE ,16652945,Mon Nov 22 01:15:36 CET,Mon Nov 22 02:40:45 CET,0.0 1.111 1.384 1.612 1.814 1.975 2.125 2.255 2.444 2.514 2.572 2.524 2.756 2.817 2.931 3.041 3.134 3.183 3.276 3.345 3.433 3.489 3.542 3.613 3.663 3.709 3.761 3.8 3.86 3.912 3.926 3.937 3.946 3.938 3.939 3.949 3.927 3.851 3.75 3.622 3.461 3.254 2.962 2.596 2.106 1.466 0.611 -0.47 -2.061 -4.486 -8.342 -12.564 -15.766 -18.387 -20.579 -22.432 -24.024 -25.424 -26.566 -27.678 -28.625 -29.469 -30.261 -30.998 -31.665 -32.241 -32.839 -33.396 -33.866 -34.335 -34.807 -35.183 -35.577 -35.988 -36.312 -36.643 -36.97 -37.314 -37.699 -37.954 -38.212 -38.633 -38.93 -39.226 -39.374 -39.683 -40.016 -40.354 -40.529 -40.923 -41.118 -41.331 -41.541 -41.981 -42.24 -42.516 -42.797 -43.17 -43.652 -44.243 -46.24 -6 ,20371 ,KEBNE ,16652947,Mon Nov 22 01:16:38 CET,Mon Nov 22 02:41:31 CET,0.0 0.978 1.284 1.475 1.651 1.809 1.932 2.029 2.191 2.261 2.334 2.299 2.521 2.579 2.705 2.833 2.946 2.99 3.068 3.149 3.244 3.295 3.341 3.397 3.46 3.523 3.567 3.605 3.653 3.696 3.733 3.759 3.768 3.763 3.763 3.752 3.727 3.682 3.591 3.478 3.327 3.116 2.821 2.478 2.018 1.415 0.618 -0.455 -2.038 -4.373 -7.985 -12.029 -15.253 -17.92 -20.104 -21.964 -23.572 -24.995 -26.153 -27.269 -28.245 -29.085 -29.854 -30.568 -31.228 -31.835 -32.443 -32.972 -33.435 -33.905 -34.372 -34.764 -35.185 -35.61 -35.935 -36.269 -36.606 -36.954 -37.312 -37.569 -37.833 -38.222 -38.495 -38.785 -38.929 -39.243 -39.573 -39.915 -40.104 -40.501 -40.684 -40.895 -41.115 -41.606 -41.859 -42.139 -42.446 -42.796 -43.237 -43.819 -45.848 -7 ,16768 ,KEBNE ,16652948,Mon Nov 22 01:16:38 CET,Mon Nov 22 02:41:24 CET,0.0 0.693 0.985 1.215 1.401 1.543 1.658 1.771 2.002 2.097 2.171 2.147 2.381 2.439 2.556 2.659 2.739 2.778 2.848 2.903 2.976 3.02 3.063 3.114 3.165 3.216 3.266 3.32 3.383 3.427 3.448 3.462 3.475 3.469 3.469 3.489 3.467 3.407 3.325 3.206 3.057 2.84 2.553 2.257 1.841 1.237 0.417 -0.664 -2.273 -4.615 -8.251 -12.348 -15.57 -18.196 -20.359 -22.218 -23.796 -25.187 -26.358 -27.481 -28.4 -29.2 -29.957 -30.674 -31.341 -31.934 -32.54 -33.098 -33.581 -34.057 -34.545 -34.944 -35.349 -35.778 -36.12 -36.458 -36.804 -37.155 -37.509 -37.757 -38.009 -38.403 -38.674 -38.966 -39.117 -39.401 -39.684 -40.002 -40.191 -40.605 -40.792 -40.993 -41.203 -41.67 -41.93 -42.221 -42.565 -42.926 -43.303 -43.828 -45.703 -8 ,24528 ,KEBNE ,16652949,Mon Nov 22 01:17:40 CET,Mon Nov 22 02:42:27 CET,0.0 0.867 1.209 1.474 1.641 1.77 1.907 2.029 2.224 2.313 2.402 2.395 2.628 2.694 2.802 2.908 3.009 3.049 3.127 3.197 3.277 3.324 3.381 3.455 3.496 3.543 3.607 3.649 3.671 3.703 3.731 3.739 3.752 3.761 3.761 3.758 3.724 3.677 3.621 3.514 3.341 3.118 2.826 2.485 2.047 1.44 0.575 -0.574 -2.172 -4.443 -8.079 -12.25 -15.538 -18.179 -20.328 -22.164 -23.712 -25.061 -26.208 -27.373 -28.339 -29.169 -29.956 -30.695 -31.382 -31.995 -32.622 -33.171 -33.619 -34.062 -34.532 -34.939 -35.352 -35.769 -36.092 -36.429 -36.771 -37.122 -37.487 -37.745 -38.02 -38.415 -38.682 -38.962 -39.111 -39.417 -39.723 -40.054 -40.223 -40.612 -40.818 -41.022 -41.221 -41.684 -41.937 -42.206 -42.528 -42.907 -43.349 -43.902 -45.518 -9 ,3444 ,KEBNE ,16652950,Mon Nov 22 01:17:40 CET,Mon Nov 22 02:42:40 CET,0.0 0.818 1.14 1.384 1.569 1.73 1.871 1.981 2.175 2.262 2.352 2.353 2.585 2.649 2.758 2.846 2.939 2.985 3.068 3.134 3.225 3.288 3.343 3.408 3.484 3.554 3.607 3.651 3.696 3.73 3.773 3.815 3.815 3.8 3.789 3.757 3.698 3.634 3.569 3.461 3.296 3.077 2.771 2.429 1.957 1.337 0.511 -0.632 -2.237 -4.541 -8.232 -12.365 -15.551 -18.201 -20.372 -22.239 -23.815 -25.181 -26.331 -27.453 -28.387 -29.194 -29.965 -30.676 -31.33 -31.916 -32.54 -33.098 -33.554 -34.025 -34.509 -34.923 -35.35 -35.772 -36.1 -36.441 -36.788 -37.147 -37.532 -37.794 -38.049 -38.463 -38.761 -39.053 -39.196 -39.497 -39.803 -40.137 -40.32 -40.704 -40.869 -41.069 -41.278 -41.745 -42.002 -42.288 -42.61 -43.011 -43.517 -44.132 -46.269 -10 ,13305 ,KEBNE ,16652951,Mon Nov 22 01:17:40 CET,Mon Nov 22 02:42:47 CET,0.0 0.802 1.1 1.295 1.45 1.589 1.728 1.861 2.073 2.173 2.26 2.215 2.443 2.498 2.58 2.663 2.755 2.799 2.88 2.943 3.017 3.061 3.104 3.172 3.234 3.292 3.336 3.382 3.435 3.453 3.463 3.466 3.46 3.461 3.45 3.41 3.364 3.303 3.22 3.104 2.948 2.744 2.455 2.104 1.619 1.03 0.273 -0.801 -2.363 -4.662 -8.347 -12.522 -15.788 -18.429 -20.56 -22.422 -24.019 -25.392 -26.533 -27.631 -28.546 -29.368 -30.148 -30.872 -31.531 -32.122 -32.744 -33.287 -33.741 -34.203 -34.678 -35.066 -35.472 -35.896 -36.232 -36.575 -36.903 -37.257 -37.634 -37.878 -38.126 -38.495 -38.747 -39.021 -39.171 -39.492 -39.818 -40.171 -40.368 -40.786 -41.022 -41.233 -41.457 -41.944 -42.183 -42.464 -42.812 -43.157 -43.549 -44.105 -46.117 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 6ae5360a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5859 ,KEBNE ,16652952,Mon Nov 22 01:17:40 CET,Mon Nov 22 02:43:08 CET,0.0 0.92 1.318 1.64 1.898 2.139 2.384 2.623 3.031 3.211 3.397 3.553 3.965 4.134 4.467 4.801 5.114 5.26 5.548 5.837 6.265 6.552 6.832 7.247 7.651 8.035 8.42 8.807 9.308 9.775 10.229 10.797 11.362 11.907 12.544 13.282 14.01 14.827 15.753 16.777 17.885 19.156 20.646 22.206 24.089 26.249 28.852 31.921 35.728 40.493 46.763 52.483 56.16 58.715 60.556 61.953 62.994 63.803 64.427 64.99 65.399 65.716 65.999 66.247 66.444 66.596 66.694 66.74 66.777 66.794 66.775 66.767 66.765 66.748 66.73 66.704 66.663 66.592 66.498 66.439 66.388 66.317 66.235 66.14 66.092 65.964 65.817 65.656 65.57 65.321 65.272 65.17 65.036 64.715 64.539 64.325 64.059 63.742 63.315 62.702 59.49 -2 ,10554 ,KEBNE ,16652953,Mon Nov 22 01:17:40 CET,Mon Nov 22 02:43:02 CET,0.0 0.877 1.239 1.544 1.854 2.134 2.363 2.573 2.988 3.185 3.367 3.482 3.871 4.035 4.365 4.686 4.99 5.145 5.453 5.751 6.188 6.466 6.738 7.132 7.521 7.911 8.306 8.698 9.184 9.648 10.107 10.689 11.261 11.806 12.448 13.19 13.926 14.748 15.643 16.642 17.73 18.978 20.474 22.034 23.908 26.07 28.7 31.795 35.581 40.32 46.592 52.267 55.922 58.481 60.312 61.66 62.688 63.503 64.118 64.646 65.047 65.368 65.621 65.835 66.008 66.132 66.24 66.328 66.391 66.441 66.466 66.48 66.486 66.455 66.411 66.348 66.282 66.214 66.143 66.097 66.041 65.92 65.815 65.72 65.671 65.575 65.471 65.326 65.228 64.976 64.923 64.806 64.674 64.325 64.131 63.899 63.617 63.291 62.856 62.225 58.736 -3 ,18727 ,KEBNE ,16652954,Mon Nov 22 01:17:40 CET,Mon Nov 22 02:43:08 CET,0.0 0.779 1.159 1.482 1.762 2.026 2.275 2.499 2.902 3.092 3.281 3.45 3.857 4.026 4.35 4.664 4.97 5.12 5.422 5.724 6.157 6.44 6.732 7.154 7.538 7.922 8.307 8.676 9.159 9.633 10.099 10.664 11.215 11.758 12.409 13.172 13.922 14.746 15.649 16.645 17.74 19.007 20.529 22.103 23.953 26.123 28.777 31.845 35.611 40.344 46.452 51.985 55.61 58.138 59.924 61.299 62.341 63.144 63.774 64.335 64.771 65.093 65.348 65.573 65.749 65.887 66.012 66.09 66.122 66.149 66.182 66.185 66.159 66.142 66.136 66.113 66.066 66.02 65.964 65.903 65.827 65.68 65.586 65.498 65.436 65.263 65.111 64.963 64.873 64.62 64.527 64.394 64.242 63.884 63.698 63.501 63.2 62.828 62.401 61.811 58.867 -4 ,32484 ,KEBNE ,16652955,Mon Nov 22 01:17:40 CET,Mon Nov 22 02:43:03 CET,0.0 0.795 1.174 1.493 1.781 2.052 2.306 2.529 2.937 3.139 3.338 3.477 3.884 4.058 4.387 4.723 5.041 5.193 5.492 5.792 6.226 6.502 6.783 7.198 7.594 7.971 8.346 8.719 9.191 9.654 10.123 10.704 11.277 11.842 12.493 13.244 13.987 14.818 15.723 16.703 17.782 19.042 20.573 22.157 24.055 26.203 28.776 31.871 35.707 40.525 46.766 52.352 55.918 58.409 60.206 61.605 62.663 63.46 64.059 64.597 64.991 65.288 65.547 65.756 65.91 66.019 66.13 66.223 66.29 66.329 66.344 66.358 66.353 66.322 66.292 66.265 66.234 66.195 66.14 66.094 66.041 65.944 65.873 65.788 65.733 65.608 65.469 65.334 65.266 65.041 65.006 64.892 64.771 64.472 64.295 64.086 63.837 63.557 63.206 62.585 59.239 -5 ,18829 ,KEBNE ,16652956,Mon Nov 22 01:17:40 CET,Mon Nov 22 02:42:55 CET,0.0 0.889 1.278 1.606 1.888 2.126 2.356 2.59 3.012 3.202 3.398 3.551 3.957 4.127 4.445 4.758 5.062 5.211 5.518 5.81 6.232 6.511 6.785 7.192 7.584 7.973 8.361 8.728 9.209 9.688 10.163 10.745 11.302 11.849 12.485 13.227 13.977 14.817 15.736 16.738 17.845 19.112 20.612 22.201 24.079 26.198 28.773 31.842 35.6 40.34 46.656 52.391 56.056 58.571 60.39 61.764 62.786 63.585 64.184 64.714 65.1 65.394 65.653 65.883 66.066 66.199 66.314 66.386 66.441 66.505 66.558 66.568 66.549 66.516 66.495 66.467 66.444 66.414 66.341 66.286 66.238 66.159 66.085 65.993 65.938 65.79 65.611 65.429 65.338 65.079 64.985 64.854 64.707 64.385 64.185 63.963 63.743 63.474 63.108 62.476 59.328 -6 ,20470 ,KEBNE ,16652957,Mon Nov 22 01:18:45 CET,Mon Nov 22 02:41:53 CET,0.0 0.752 1.116 1.405 1.673 1.921 2.145 2.36 2.767 2.966 3.159 3.286 3.683 3.848 4.18 4.504 4.823 4.978 5.287 5.594 6.016 6.294 6.572 6.97 7.364 7.756 8.128 8.491 8.977 9.453 9.916 10.494 11.056 11.597 12.25 13.029 13.79 14.616 15.524 16.507 17.574 18.837 20.365 21.953 23.837 26.015 28.621 31.674 35.499 40.338 46.663 52.376 56.014 58.587 60.456 61.853 62.898 63.731 64.387 64.954 65.375 65.714 65.978 66.194 66.384 66.518 66.62 66.692 66.748 66.792 66.802 66.806 66.804 66.774 66.753 66.733 66.706 66.679 66.639 66.585 66.511 66.404 66.321 66.224 66.168 66.051 65.927 65.781 65.706 65.473 65.412 65.293 65.133 64.767 64.593 64.366 64.097 63.815 63.437 62.782 60.046 -7 ,23172 ,KEBNE ,16652958,Mon Nov 22 01:18:41 CET,Mon Nov 22 02:45:30 CET,0.0 0.842 1.242 1.566 1.857 2.147 2.402 2.623 3.052 3.252 3.429 3.571 3.975 4.144 4.492 4.831 5.145 5.294 5.597 5.891 6.316 6.588 6.859 7.266 7.66 8.045 8.418 8.796 9.285 9.76 10.241 10.82 11.367 11.911 12.556 13.307 14.054 14.887 15.806 16.812 17.902 19.166 20.671 22.216 24.088 26.257 28.874 31.957 35.685 40.382 46.716 52.409 56.056 58.598 60.431 61.83 62.898 63.757 64.393 64.919 65.318 65.651 65.927 66.145 66.315 66.441 66.567 66.664 66.72 66.761 66.78 66.775 66.764 66.749 66.723 66.684 66.623 66.553 66.491 66.429 66.377 66.317 66.248 66.16 66.109 65.977 65.819 65.667 65.582 65.333 65.251 65.127 65.001 64.703 64.506 64.273 63.999 63.658 63.188 62.463 59.813 -8 ,4255 ,KEBNE ,16652959,Mon Nov 22 01:18:41 CET,Mon Nov 22 02:44:09 CET,0.0 0.836 1.243 1.549 1.802 2.036 2.276 2.496 2.91 3.116 3.301 3.408 3.807 3.978 4.306 4.634 4.95 5.104 5.409 5.707 6.125 6.399 6.67 7.066 7.467 7.871 8.255 8.621 9.103 9.568 10.032 10.611 11.172 11.72 12.362 13.107 13.841 14.666 15.588 16.583 17.671 18.952 20.478 22.045 23.923 26.093 28.707 31.798 35.672 40.537 46.776 52.373 55.969 58.497 60.318 61.696 62.718 63.521 64.163 64.692 65.09 65.434 65.724 65.971 66.17 66.318 66.422 66.494 66.555 66.609 66.654 66.68 66.671 66.638 66.606 66.575 66.552 66.506 66.428 66.371 66.299 66.17 66.091 66.013 65.966 65.85 65.729 65.579 65.486 65.247 65.212 65.108 64.987 64.688 64.525 64.336 64.104 63.828 63.438 62.856 60.602 -9 ,23138 ,KEBNE ,16652960,Mon Nov 22 01:19:44 CET,Mon Nov 22 02:47:08 CET,0.0 0.743 1.134 1.464 1.739 1.985 2.221 2.45 2.856 3.056 3.249 3.376 3.79 3.973 4.31 4.635 4.947 5.104 5.4 5.685 6.122 6.4 6.67 7.056 7.42 7.792 8.172 8.542 9.027 9.511 9.98 10.542 11.1 11.648 12.282 13.013 13.741 14.57 15.49 16.499 17.591 18.842 20.336 21.873 23.751 25.924 28.494 31.591 35.494 40.34 46.608 52.314 55.988 58.493 60.269 61.636 62.682 63.504 64.128 64.667 65.059 65.375 65.645 65.873 66.043 66.158 66.239 66.282 66.327 66.359 66.364 66.36 66.347 66.319 66.288 66.257 66.23 66.183 66.085 66.01 65.937 65.807 65.726 65.654 65.601 65.439 65.239 65.008 64.899 64.649 64.573 64.432 64.258 63.925 63.742 63.447 63.122 62.815 62.414 61.883 59.617 -10 ,31009 ,KEBNE ,16652961,Mon Nov 22 01:19:43 CET,Mon Nov 22 02:46:54 CET,0.0 0.855 1.264 1.569 1.848 2.113 2.358 2.586 3.03 3.24 3.431 3.577 3.976 4.142 4.48 4.803 5.114 5.267 5.562 5.854 6.289 6.577 6.854 7.253 7.648 8.031 8.404 8.78 9.272 9.749 10.224 10.818 11.402 11.971 12.633 13.366 14.072 14.881 15.799 16.776 17.841 19.103 20.593 22.137 23.995 26.12 28.67 31.751 35.611 40.403 46.654 52.276 55.909 58.48 60.292 61.664 62.711 63.535 64.144 64.653 65.027 65.334 65.619 65.853 66.037 66.204 66.354 66.457 66.528 66.578 66.611 66.627 66.626 66.606 66.588 66.567 66.537 66.486 66.414 66.363 66.293 66.155 66.045 65.925 65.856 65.732 65.614 65.451 65.372 65.139 65.084 64.963 64.842 64.588 64.408 64.187 63.958 63.682 63.289 62.711 59.835 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index a458900f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18757 ,TETRA ,17982693,Tue Dec 21 08:55:31 CET,Tue Dec 21 10:33:38 CET,0.0 0.786 1.206 1.557 1.838 2.091 2.322 2.548 2.985 3.179 3.353 3.473 3.877 4.044 4.381 4.709 5.01 5.154 5.447 5.735 6.139 6.403 6.666 7.053 7.431 7.806 8.156 8.506 8.963 9.399 9.833 10.371 10.904 11.422 12.043 12.756 13.443 14.214 15.079 16.016 17.007 18.138 19.49 20.909 22.622 24.583 26.912 29.653 33.011 37.193 42.642 47.529 50.609 52.697 54.152 55.244 56.037 56.638 57.087 57.488 57.772 57.969 58.145 58.266 58.338 58.407 58.462 58.493 58.492 58.482 58.471 58.46 58.44 58.386 58.321 58.255 58.195 58.115 58.015 57.941 57.867 57.758 57.667 57.556 57.501 57.382 57.229 57.075 56.985 56.719 56.718 56.616 56.488 56.18 55.996 55.812 55.585 55.274 54.931 54.499 52.244 -2 ,770 ,TETRA ,17982694,Tue Dec 21 08:55:27 CET,Tue Dec 21 10:33:56 CET,0.0 0.658 1.033 1.332 1.589 1.845 2.09 2.32 2.735 2.92 3.097 3.225 3.617 3.781 4.108 4.411 4.703 4.847 5.122 5.379 5.767 6.029 6.282 6.663 7.044 7.421 7.777 8.116 8.559 9.01 9.453 9.975 10.489 11.007 11.62 12.325 13.014 13.778 14.62 15.513 16.471 17.59 18.957 20.367 22.032 23.919 26.164 28.808 32.048 36.157 41.492 46.26 49.273 51.292 52.71 53.767 54.504 55.05 55.485 55.884 56.176 56.361 56.496 56.612 56.708 56.768 56.811 56.836 56.839 56.83 56.798 56.756 56.699 56.613 56.542 56.466 56.389 56.307 56.204 56.128 56.043 55.909 55.808 55.703 55.643 55.504 55.343 55.19 55.116 54.869 54.852 54.734 54.599 54.316 54.131 53.91 53.669 53.358 52.996 52.507 50.649 -3 ,4045 ,TETRA ,17982695,Tue Dec 21 08:55:29 CET,Tue Dec 21 10:33:53 CET,0.0 0.942 1.318 1.633 1.919 2.185 2.428 2.661 3.062 3.248 3.425 3.517 3.898 4.059 4.387 4.704 5.003 5.145 5.424 5.707 6.129 6.403 6.67 7.065 7.438 7.813 8.19 8.537 8.984 9.421 9.848 10.378 10.905 11.408 12.001 12.693 13.383 14.16 15.003 15.924 16.899 17.991 19.288 20.655 22.31 24.206 26.496 29.163 32.423 36.507 41.897 46.781 49.784 51.816 53.281 54.365 55.139 55.708 56.131 56.458 56.701 56.903 57.07 57.208 57.305 57.395 57.456 57.452 57.436 57.418 57.387 57.35 57.306 57.262 57.209 57.148 57.074 56.979 56.896 56.831 56.754 56.635 56.558 56.462 56.403 56.27 56.118 55.965 55.886 55.631 55.581 55.456 55.316 55.028 54.863 54.633 54.365 54.086 53.763 53.234 51.159 -4 ,19188 ,TETRA ,17982696,Tue Dec 21 08:55:28 CET,Tue Dec 21 10:27:39 CET,0.0 0.824 1.224 1.535 1.83 2.098 2.333 2.56 2.997 3.193 3.381 3.51 3.895 4.048 4.35 4.653 4.946 5.099 5.392 5.647 6.023 6.283 6.544 6.927 7.29 7.657 8.03 8.388 8.829 9.248 9.667 10.199 10.722 11.231 11.815 12.472 13.127 13.864 14.68 15.575 16.543 17.664 18.987 20.356 22.041 23.949 26.214 28.942 32.27 36.385 41.692 46.411 49.406 51.523 53.034 54.133 54.924 55.511 55.918 56.285 56.57 56.742 56.88 56.988 57.056 57.1 57.105 57.1 57.118 57.144 57.135 57.106 57.076 57.027 56.962 56.88 56.794 56.698 56.592 56.521 56.445 56.321 56.218 56.084 56.014 55.867 55.674 55.467 55.371 55.103 55.045 54.916 54.785 54.485 54.294 54.089 53.856 53.562 53.211 52.675 50.212 -5 ,28774 ,TETRA ,17982697,Tue Dec 21 08:56:20 CET,Tue Dec 21 10:31:28 CET,0.0 1.161 1.632 1.946 2.2 2.44 2.658 2.866 3.284 3.478 3.657 3.779 4.172 4.326 4.644 4.976 5.285 5.432 5.715 5.986 6.39 6.661 6.917 7.282 7.644 8.007 8.354 8.686 9.147 9.615 10.07 10.62 11.153 11.68 12.297 12.975 13.625 14.376 15.226 16.123 17.1 18.232 19.547 20.894 22.525 24.471 26.806 29.5 32.84 36.991 42.27 47.042 50.114 52.25 53.741 54.816 55.578 56.151 56.583 56.919 57.154 57.345 57.498 57.626 57.71 57.76 57.781 57.775 57.764 57.754 57.725 57.677 57.63 57.576 57.518 57.451 57.379 57.29 57.186 57.112 57.038 56.911 56.821 56.717 56.66 56.533 56.38 56.204 56.102 55.824 55.779 55.658 55.506 55.175 55.006 54.817 54.579 54.283 53.916 53.394 51.922 -6 ,1458 ,TETRA ,17982698,Tue Dec 21 08:57:29 CET,Tue Dec 21 10:35:45 CET,0.0 0.924 1.319 1.619 1.891 2.163 2.428 2.662 3.078 3.282 3.474 3.608 4.005 4.169 4.496 4.812 5.103 5.244 5.522 5.805 6.214 6.478 6.74 7.143 7.53 7.887 8.248 8.608 9.058 9.476 9.888 10.41 10.929 11.437 12.043 12.732 13.404 14.161 14.988 15.885 16.845 17.978 19.349 20.732 22.399 24.348 26.646 29.325 32.574 36.624 41.969 46.81 49.812 51.789 53.166 54.185 54.964 55.567 56.009 56.371 56.639 56.854 56.992 57.058 57.098 57.137 57.172 57.163 57.136 57.115 57.068 57.02 56.957 56.86 56.783 56.727 56.669 56.574 56.445 56.345 56.249 56.083 55.959 55.85 55.782 55.634 55.498 55.34 55.251 54.99 54.925 54.791 54.655 54.368 54.181 53.965 53.739 53.465 53.084 52.5 50.913 -7 ,27766 ,TETRA ,17982699,Tue Dec 21 08:59:33 CET,Tue Dec 21 10:32:54 CET,0.0 1.253 1.685 2.0 2.273 2.526 2.755 2.978 3.401 3.591 3.762 3.869 4.265 4.437 4.756 5.074 5.392 5.542 5.82 6.081 6.476 6.734 6.978 7.337 7.69 8.046 8.407 8.752 9.194 9.628 10.052 10.58 11.108 11.629 12.238 12.932 13.599 14.36 15.238 16.184 17.199 18.34 19.69 21.115 22.805 24.762 27.111 29.784 33.027 37.151 42.506 47.251 50.263 52.311 53.724 54.789 55.569 56.157 56.57 56.912 57.157 57.345 57.511 57.622 57.68 57.726 57.778 57.814 57.797 57.755 57.729 57.718 57.682 57.602 57.542 57.477 57.393 57.288 57.159 57.072 56.992 56.852 56.754 56.651 56.583 56.429 56.276 56.106 56.012 55.749 55.73 55.61 55.489 55.231 55.055 54.854 54.629 54.368 54.005 53.489 51.651 -8 ,22385 ,TETRA ,17982700,Tue Dec 21 09:00:27 CET,Tue Dec 21 10:32:53 CET,0.0 1.014 1.448 1.806 2.099 2.36 2.595 2.815 3.217 3.407 3.594 3.727 4.119 4.286 4.612 4.903 5.178 5.318 5.607 5.899 6.295 6.544 6.786 7.158 7.528 7.874 8.221 8.563 9.017 9.47 9.906 10.444 10.97 11.469 12.053 12.735 13.406 14.158 14.994 15.921 16.911 18.04 19.388 20.76 22.393 24.276 26.588 29.292 32.543 36.605 41.887 46.623 49.597 51.668 53.134 54.178 54.945 55.549 56.008 56.396 56.671 56.88 57.025 57.126 57.19 57.219 57.249 57.264 57.249 57.223 57.192 57.156 57.122 57.068 57.011 56.962 56.902 56.83 56.744 56.665 56.568 56.43 56.343 56.243 56.194 56.077 55.939 55.778 55.675 55.407 55.367 55.259 55.149 54.841 54.652 54.445 54.202 53.934 53.596 53.093 50.915 -9 ,26447 ,TETRA ,17982701,Tue Dec 21 09:04:32 CET,Tue Dec 21 10:43:28 CET,0.0 0.843 1.219 1.555 1.85 2.127 2.385 2.616 3.01 3.177 3.343 3.474 3.877 4.044 4.361 4.672 4.974 5.122 5.412 5.683 6.071 6.329 6.592 6.979 7.361 7.728 8.075 8.427 8.888 9.331 9.763 10.3 10.832 11.364 11.977 12.671 13.369 14.137 14.955 15.863 16.874 18.03 19.388 20.787 22.455 24.372 26.686 29.397 32.709 36.845 42.127 46.798 49.707 51.672 53.112 54.226 55.034 55.627 56.036 56.402 56.662 56.848 56.975 57.06 57.126 57.169 57.217 57.231 57.216 57.194 57.16 57.132 57.098 57.053 57.004 56.949 56.875 56.79 56.705 56.646 56.577 56.437 56.33 56.211 56.14 56.001 55.872 55.71 55.601 55.306 55.212 55.051 54.871 54.534 54.356 54.138 53.873 53.577 53.21 52.728 51.412 -10 ,661 ,TETRA ,17982702,Tue Dec 21 09:04:33 CET,Tue Dec 21 10:41:57 CET,0.0 0.754 1.19 1.518 1.769 2.02 2.265 2.476 2.861 3.047 3.241 3.385 3.777 3.936 4.259 4.589 4.904 5.054 5.345 5.637 6.069 6.342 6.607 6.988 7.365 7.737 8.094 8.434 8.876 9.326 9.774 10.31 10.83 11.351 11.964 12.652 13.314 14.058 14.882 15.754 16.695 17.803 19.143 20.546 22.217 24.096 26.367 29.053 32.325 36.419 41.711 46.498 49.477 51.484 52.901 53.983 54.825 55.452 55.895 56.267 56.512 56.705 56.863 56.952 56.988 57.01 57.037 57.046 57.056 57.059 57.035 56.977 56.913 56.857 56.803 56.749 56.685 56.608 56.511 56.435 56.361 56.226 56.134 56.052 55.992 55.839 55.687 55.535 55.458 55.208 55.177 55.059 54.942 54.693 54.525 54.322 54.098 53.818 53.468 52.938 51.418 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 61dd6ca8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12825 ,KEBNE ,16652962,Mon Nov 22 01:19:44 CET,Mon Nov 22 02:45:59 CET,0.0 1.205 1.592 1.93 2.27 2.562 2.824 3.074 3.552 3.776 3.982 4.115 4.56 4.757 5.107 5.447 5.787 5.95 6.271 6.592 7.075 7.387 7.682 8.12 8.557 8.975 9.392 9.814 10.359 10.869 11.359 11.993 12.626 13.253 14.002 14.868 15.726 16.666 17.668 18.762 19.973 21.432 23.206 25.013 27.175 29.696 32.757 36.33 40.759 46.387 53.791 60.651 65.149 68.284 70.508 72.19 73.43 74.362 75.07 75.706 76.216 76.604 76.898 77.157 77.347 77.469 77.587 77.657 77.692 77.733 77.745 77.726 77.703 77.657 77.594 77.546 77.51 77.433 77.35 77.286 77.193 77.048 76.958 76.855 76.79 76.634 76.465 76.283 76.173 75.893 75.837 75.704 75.531 75.13 74.911 74.644 74.323 73.954 73.501 72.796 69.062 -2 ,6726 ,KEBNE ,16652963,Mon Nov 22 01:20:45 CET,Mon Nov 22 02:46:59 CET,0.0 1.39 1.862 2.226 2.548 2.827 3.08 3.322 3.773 3.984 4.185 4.318 4.744 4.928 5.3 5.658 6.005 6.179 6.528 6.864 7.343 7.655 7.958 8.398 8.828 9.248 9.654 10.068 10.628 11.156 11.667 12.304 12.923 13.532 14.26 15.092 15.91 16.859 17.904 19.028 20.257 21.675 23.378 25.164 27.327 29.836 32.9 36.573 41.074 46.714 54.304 61.305 65.684 68.598 70.636 72.205 73.448 74.502 75.291 75.95 76.493 76.935 77.236 77.465 77.659 77.808 77.96 78.046 78.087 78.126 78.149 78.141 78.134 78.13 78.072 77.985 77.909 77.833 77.741 77.662 77.581 77.453 77.372 77.276 77.217 77.071 76.879 76.674 76.565 76.278 76.205 76.071 75.918 75.606 75.413 75.145 74.83 74.476 74.009 73.324 70.373 -3 ,12626 ,KEBNE ,16652964,Mon Nov 22 01:20:45 CET,Mon Nov 22 02:46:44 CET,0.0 1.05 1.537 1.891 2.166 2.418 2.66 2.921 3.441 3.669 3.861 3.997 4.439 4.632 5.014 5.381 5.731 5.896 6.219 6.543 7.018 7.323 7.615 8.044 8.482 8.93 9.362 9.79 10.382 10.966 11.512 12.17 12.843 13.519 14.29 15.154 15.992 16.925 17.96 19.097 20.337 21.775 23.487 25.258 27.376 29.801 32.733 36.225 40.599 46.067 53.321 60.081 64.521 67.63 69.798 71.381 72.577 73.536 74.281 74.95 75.455 75.856 76.184 76.459 76.671 76.83 76.972 77.065 77.131 77.167 77.183 77.193 77.172 77.137 77.1 77.038 76.973 76.914 76.835 76.766 76.7 76.591 76.481 76.331 76.251 76.092 75.929 75.731 75.616 75.34 75.285 75.153 74.995 74.637 74.425 74.163 73.835 73.432 72.916 72.227 69.408 -4 ,2310 ,KEBNE ,16652965,Mon Nov 22 01:20:45 CET,Mon Nov 22 02:46:53 CET,0.0 1.041 1.456 1.84 2.2 2.496 2.747 2.992 3.462 3.683 3.893 4.054 4.489 4.677 5.031 5.377 5.72 5.89 6.213 6.525 7.005 7.333 7.662 8.123 8.559 8.991 9.425 9.858 10.404 10.934 11.465 12.098 12.719 13.349 14.108 14.976 15.827 16.787 17.858 19.012 20.214 21.577 23.219 24.983 27.181 29.697 32.656 36.147 40.513 46.106 53.537 60.384 64.809 67.917 70.123 71.776 73.051 74.051 74.846 75.537 76.049 76.45 76.786 77.06 77.242 77.395 77.551 77.63 77.673 77.713 77.752 77.766 77.749 77.72 77.69 77.657 77.61 77.542 77.474 77.423 77.358 77.223 77.11 77.001 76.938 76.788 76.633 76.45 76.347 76.057 75.919 75.752 75.598 75.263 75.059 74.82 74.54 74.226 73.818 73.117 70.374 -5 ,8440 ,KEBNE ,16652966,Mon Nov 22 01:21:47 CET,Mon Nov 22 02:48:14 CET,0.0 1.103 1.538 1.9 2.225 2.514 2.775 3.016 3.499 3.734 3.949 4.094 4.53 4.717 5.082 5.448 5.795 5.959 6.283 6.601 7.076 7.387 7.695 8.155 8.589 9.011 9.432 9.851 10.391 10.909 11.42 12.06 12.694 13.311 14.055 14.907 15.748 16.719 17.797 18.945 20.173 21.615 23.354 25.148 27.283 29.763 32.822 36.457 40.929 46.539 53.98 60.945 65.409 68.403 70.661 72.422 73.627 74.544 75.278 75.949 76.452 76.816 77.104 77.334 77.517 77.675 77.81 77.884 77.923 77.973 78.024 78.022 77.99 77.952 77.915 77.871 77.81 77.74 77.666 77.606 77.533 77.377 77.258 77.15 77.09 76.941 76.789 76.623 76.522 76.25 76.175 76.021 75.84 75.464 75.256 74.986 74.663 74.299 73.822 73.131 70.946 -6 ,27588 ,KEBNE ,16652967,Mon Nov 22 01:21:47 CET,Mon Nov 22 02:49:28 CET,0.0 0.869 1.238 1.566 1.852 2.112 2.376 2.617 3.056 3.266 3.475 3.634 4.07 4.259 4.636 4.986 5.328 5.496 5.819 6.138 6.604 6.916 7.226 7.67 8.104 8.545 8.988 9.413 9.956 10.491 11.02 11.673 12.311 12.949 13.721 14.613 15.47 16.415 17.473 18.638 19.909 21.386 23.158 24.973 27.134 29.615 32.596 36.142 40.618 46.306 53.658 60.454 64.957 68.076 70.346 72.102 73.45 74.521 75.322 75.994 76.49 76.902 77.261 77.538 77.746 77.89 78.001 78.074 78.102 78.118 78.131 78.104 78.027 77.946 77.904 77.849 77.778 77.694 77.596 77.52 77.422 77.278 77.179 77.05 76.985 76.854 76.686 76.491 76.392 76.12 76.043 75.889 75.697 75.29 75.088 74.873 74.574 74.177 73.706 73.098 71.189 -7 ,11872 ,KEBNE ,16652968,Mon Nov 22 01:21:47 CET,Mon Nov 22 02:48:12 CET,0.0 0.8 1.229 1.558 1.839 2.117 2.367 2.588 3.02 3.238 3.441 3.577 4.015 4.202 4.565 4.926 5.271 5.437 5.753 6.062 6.524 6.828 7.129 7.566 7.99 8.422 8.852 9.264 9.807 10.349 10.881 11.537 12.175 12.801 13.543 14.383 15.202 16.132 17.161 18.292 19.55 20.996 22.703 24.475 26.607 29.1 32.097 35.648 40.058 45.688 53.234 60.106 64.549 67.714 69.973 71.676 72.945 73.91 74.654 75.304 75.767 76.112 76.364 76.546 76.727 76.895 77.039 77.149 77.22 77.269 77.29 77.292 77.284 77.258 77.228 77.189 77.139 77.084 76.997 76.925 76.86 76.723 76.593 76.446 76.378 76.238 76.064 75.883 75.787 75.505 75.391 75.244 75.095 74.754 74.545 74.288 73.993 73.638 73.163 72.448 69.689 -8 ,18398 ,KEBNE ,16652969,Mon Nov 22 01:21:47 CET,Mon Nov 22 02:48:04 CET,0.0 1.002 1.411 1.795 2.118 2.4 2.664 2.915 3.375 3.575 3.774 3.927 4.373 4.564 4.943 5.307 5.646 5.812 6.143 6.473 6.95 7.269 7.577 8.017 8.455 8.873 9.279 9.686 10.22 10.739 11.261 11.9 12.528 13.162 13.912 14.786 15.646 16.616 17.682 18.814 20.027 21.416 23.081 24.846 26.989 29.438 32.43 36.008 40.406 45.88 53.205 59.885 64.107 67.12 69.268 70.865 72.119 73.077 73.793 74.447 74.9 75.248 75.538 75.771 75.965 76.117 76.226 76.275 76.311 76.344 76.345 76.337 76.337 76.313 76.272 76.234 76.19 76.113 76.044 75.988 75.905 75.769 75.668 75.553 75.494 75.361 75.214 75.007 74.895 74.628 74.523 74.369 74.216 73.855 73.637 73.381 73.093 72.776 72.384 71.75 69.419 -9 ,7335 ,KEBNE ,16652970,Mon Nov 22 01:21:47 CET,Mon Nov 22 02:48:03 CET,0.0 0.981 1.373 1.706 2.052 2.361 2.636 2.895 3.346 3.542 3.749 3.914 4.355 4.537 4.883 5.216 5.562 5.742 6.083 6.404 6.884 7.195 7.502 7.947 8.386 8.822 9.24 9.65 10.191 10.73 11.269 11.928 12.562 13.196 13.935 14.772 15.609 16.548 17.593 18.745 19.996 21.401 23.083 24.877 27.035 29.522 32.531 36.088 40.472 46.003 53.351 60.12 64.549 67.67 69.891 71.553 72.795 73.753 74.451 75.043 75.482 75.837 76.141 76.392 76.596 76.735 76.844 76.917 76.949 76.976 76.994 77.017 77.024 76.988 76.942 76.888 76.843 76.786 76.704 76.634 76.536 76.365 76.264 76.143 76.075 75.955 75.807 75.602 75.491 75.206 75.115 74.969 74.822 74.492 74.28 74.025 73.726 73.377 72.879 72.163 69.448 -10 ,717 ,KEBNE ,16652971,Mon Nov 22 01:21:47 CET,Mon Nov 22 02:47:58 CET,0.0 0.975 1.403 1.729 2.036 2.321 2.59 2.824 3.256 3.47 3.679 3.822 4.244 4.42 4.769 5.088 5.4 5.563 5.893 6.213 6.684 6.994 7.291 7.715 8.143 8.578 9.009 9.423 9.955 10.475 10.992 11.636 12.286 12.942 13.706 14.547 15.377 16.329 17.365 18.506 19.741 21.154 22.864 24.676 26.864 29.376 32.415 36.041 40.508 46.169 53.682 60.643 65.262 68.597 70.922 72.595 73.847 74.796 75.516 76.137 76.603 76.951 77.235 77.449 77.604 77.721 77.811 77.847 77.877 77.933 77.975 78.003 78.008 77.975 77.939 77.877 77.786 77.698 77.619 77.564 77.477 77.297 77.177 77.064 76.999 76.868 76.725 76.548 76.435 76.133 76.027 75.885 75.742 75.395 75.169 74.914 74.641 74.335 73.919 73.251 70.935 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt deleted file mode 100644 index c1a71ce5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3285 ,KEBNE ,16652972,Mon Nov 22 01:21:47 CET,Mon Nov 22 02:49:54 CET,0.0 1.507 1.97 2.33 2.626 2.881 3.113 3.327 3.717 3.891 4.052 4.115 4.518 4.672 4.961 5.25 5.511 5.637 5.888 6.118 6.449 6.66 6.865 7.179 7.484 7.795 8.111 8.393 8.729 9.054 9.365 9.747 10.12 10.493 10.918 11.372 11.821 12.333 12.874 13.447 14.042 14.701 15.595 16.633 17.797 18.982 20.255 21.595 23.168 24.97 27.053 28.708 29.576 29.988 30.167 30.2 30.059 29.916 29.816 29.665 29.487 29.305 29.106 28.903 28.702 28.512 28.309 28.1 27.908 27.708 27.51 27.346 27.171 26.966 26.78 26.57 26.339 26.108 25.888 25.729 25.561 25.289 25.084 24.867 24.759 24.549 24.301 24.013 23.858 23.479 23.399 23.226 23.039 22.648 22.432 22.166 21.875 21.552 21.145 20.625 18.244 -2 ,24311 ,KEBNE ,16652973,Mon Nov 22 01:21:47 CET,Mon Nov 22 02:48:31 CET,0.0 1.233 1.69 2.038 2.335 2.627 2.885 3.125 3.585 3.794 3.99 4.089 4.486 4.623 4.895 5.149 5.406 5.543 5.789 6.021 6.364 6.576 6.791 7.117 7.43 7.733 8.029 8.312 8.658 8.993 9.31 9.703 10.09 10.461 10.889 11.381 11.877 12.407 12.954 13.538 14.15 14.808 15.586 16.388 17.318 18.333 19.522 20.889 22.458 24.267 26.356 27.935 28.71 29.032 29.178 29.217 29.142 29.02 28.893 28.732 28.581 28.428 28.221 28.002 27.791 27.606 27.409 27.222 27.056 26.864 26.651 26.462 26.257 26.044 25.869 25.688 25.495 25.284 25.05 24.883 24.71 24.418 24.218 24.009 23.896 23.681 23.446 23.173 23.041 22.672 22.584 22.426 22.248 21.834 21.623 21.4 21.112 20.758 20.32 19.674 17.599 -3 ,17297 ,KEBNE ,16652974,Mon Nov 22 01:21:47 CET,Mon Nov 22 02:48:29 CET,0.0 1.133 1.597 1.958 2.26 2.553 2.814 3.049 3.472 3.675 3.857 3.926 4.324 4.472 4.757 5.021 5.271 5.396 5.651 5.886 6.249 6.48 6.687 7.0 7.311 7.626 7.922 8.191 8.534 8.868 9.189 9.582 9.956 10.32 10.756 11.227 11.689 12.22 12.776 13.357 13.971 14.671 15.528 16.444 17.553 18.692 19.831 21.082 22.643 24.508 26.664 28.228 28.901 29.246 29.422 29.455 29.39 29.229 29.024 28.849 28.685 28.477 28.257 28.024 27.788 27.583 27.343 27.096 26.879 26.659 26.434 26.257 26.064 25.848 25.679 25.504 25.327 25.125 24.879 24.711 24.558 24.294 24.092 23.884 23.774 23.538 23.292 23.018 22.872 22.495 22.387 22.213 22.031 21.601 21.338 21.061 20.752 20.37 19.942 19.352 14.826 -4 ,6975 ,KEBNE ,16652975,Mon Nov 22 01:21:47 CET,Mon Nov 22 02:48:34 CET,0.0 1.387 1.884 2.249 2.521 2.765 3.007 3.237 3.636 3.804 3.972 4.037 4.43 4.584 4.878 5.159 5.428 5.559 5.814 6.053 6.381 6.599 6.823 7.141 7.43 7.727 8.026 8.308 8.665 8.994 9.314 9.721 10.152 10.568 11.017 11.552 12.087 12.624 13.18 13.799 14.429 15.092 15.846 16.606 17.496 18.505 19.701 21.12 22.835 24.775 26.898 28.426 29.132 29.427 29.527 29.547 29.473 29.364 29.228 29.05 28.843 28.613 28.389 28.184 27.999 27.773 27.512 27.31 27.112 26.861 26.595 26.378 26.171 25.95 25.757 25.563 25.344 25.098 24.865 24.701 24.53 24.276 24.097 23.892 23.777 23.545 23.296 22.999 22.856 22.486 22.395 22.22 22.017 21.594 21.355 21.088 20.785 20.39 19.946 19.423 16.52 -5 ,29536 ,KEBNE ,16652976,Mon Nov 22 01:22:49 CET,Mon Nov 22 02:50:32 CET,0.0 1.236 1.693 2.056 2.359 2.681 2.996 3.242 3.636 3.814 3.983 4.074 4.48 4.633 4.943 5.234 5.515 5.645 5.893 6.136 6.488 6.715 6.939 7.272 7.599 7.905 8.193 8.491 8.894 9.274 9.6 9.97 10.359 10.755 11.227 11.8 12.301 12.787 13.311 13.885 14.512 15.202 15.953 16.692 17.609 18.682 19.963 21.447 23.205 25.252 27.633 29.477 30.405 30.794 30.974 31.027 30.877 30.661 30.413 30.105 29.828 29.579 29.35 29.115 28.882 28.659 28.45 28.283 28.111 27.914 27.701 27.485 27.235 26.982 26.791 26.607 26.418 26.224 26.003 25.823 25.628 25.347 25.153 24.944 24.837 24.609 24.364 24.09 23.945 23.582 23.503 23.343 23.167 22.702 22.44 22.153 21.853 21.543 21.193 20.66 18.358 -6 ,16863 ,KEBNE ,16652977,Mon Nov 22 01:22:49 CET,Mon Nov 22 02:50:37 CET,0.0 1.122 1.588 1.975 2.286 2.539 2.785 3.009 3.415 3.595 3.762 3.849 4.25 4.399 4.68 4.957 5.222 5.341 5.574 5.807 6.144 6.375 6.61 6.923 7.214 7.492 7.761 8.044 8.414 8.746 9.059 9.454 9.867 10.243 10.639 11.111 11.57 12.065 12.614 13.187 13.793 14.496 15.331 16.18 17.14 18.22 19.473 20.806 22.363 24.215 26.365 28.073 28.963 29.399 29.566 29.6 29.555 29.423 29.24 29.032 28.828 28.649 28.479 28.302 28.104 27.897 27.684 27.503 27.321 27.106 26.898 26.708 26.512 26.316 26.126 25.931 25.76 25.568 25.359 25.207 25.039 24.8 24.602 24.365 24.258 24.036 23.77 23.49 23.356 22.991 22.92 22.759 22.578 22.152 21.923 21.681 21.4 21.09 20.731 20.199 18.41 -7 ,2065 ,KEBNE ,16652978,Mon Nov 22 01:23:51 CET,Mon Nov 22 02:52:09 CET,0.0 1.62 2.183 2.569 2.879 3.151 3.416 3.676 4.143 4.333 4.511 4.611 5.013 5.165 5.469 5.748 6.003 6.125 6.357 6.588 6.923 7.131 7.331 7.641 7.941 8.226 8.518 8.811 9.166 9.469 9.797 10.219 10.595 10.975 11.42 11.896 12.352 12.874 13.422 13.985 14.595 15.283 16.091 16.915 17.877 18.957 20.208 21.623 23.248 25.035 27.1 28.687 29.485 29.846 29.885 29.792 29.667 29.546 29.459 29.324 29.14 28.934 28.731 28.533 28.335 28.163 27.97 27.791 27.634 27.458 27.26 27.075 26.857 26.624 26.445 26.237 26.006 25.77 25.525 25.339 25.152 24.889 24.695 24.491 24.385 24.155 23.921 23.677 23.543 23.159 23.03 22.852 22.667 22.261 22.04 21.782 21.476 21.128 20.68 20.057 18.074 -8 ,23727 ,KEBNE ,16652979,Mon Nov 22 01:23:51 CET,Mon Nov 22 02:51:44 CET,0.0 1.601 2.051 2.392 2.664 2.908 3.153 3.396 3.802 3.987 4.165 4.265 4.676 4.83 5.137 5.453 5.748 5.879 6.115 6.339 6.689 6.922 7.144 7.45 7.747 8.041 8.321 8.595 8.972 9.325 9.661 10.092 10.518 10.91 11.357 11.852 12.305 12.812 13.338 13.882 14.461 15.159 15.995 16.798 17.758 18.795 19.961 21.349 22.919 24.689 26.788 28.449 29.307 29.737 29.91 29.984 29.97 29.862 29.702 29.486 29.311 29.13 28.897 28.665 28.446 28.236 28.005 27.774 27.567 27.365 27.125 26.888 26.61 26.329 26.151 25.95 25.723 25.489 25.25 25.098 24.937 24.674 24.497 24.306 24.199 23.979 23.745 23.485 23.351 22.976 22.882 22.707 22.517 22.102 21.868 21.635 21.35 20.988 20.568 20.018 18.215 -9 ,7578 ,KEBNE ,16652980,Mon Nov 22 01:23:51 CET,Mon Nov 22 02:50:36 CET,0.0 1.88 2.43 2.812 3.082 3.325 3.556 3.774 4.184 4.393 4.593 4.69 5.096 5.25 5.552 5.828 6.073 6.186 6.41 6.632 6.97 7.188 7.385 7.703 8.023 8.33 8.617 8.879 9.216 9.535 9.841 10.228 10.607 10.963 11.381 11.865 12.344 12.89 13.446 13.999 14.603 15.286 16.08 16.885 17.828 18.909 20.155 21.549 23.148 24.891 26.948 28.501 29.301 29.77 29.986 30.101 30.091 29.969 29.785 29.544 29.342 29.162 28.967 28.754 28.546 28.352 28.138 27.919 27.712 27.506 27.305 27.129 26.947 26.76 26.595 26.393 26.161 25.925 25.702 25.555 25.403 25.149 24.96 24.744 24.632 24.421 24.198 23.926 23.775 23.387 23.258 23.062 22.848 22.407 22.169 21.909 21.606 21.246 20.822 20.229 17.742 -10 ,29693 ,KEBNE ,16652981,Mon Nov 22 01:23:51 CET,Mon Nov 22 02:51:39 CET,0.0 1.543 1.951 2.322 2.676 2.97 3.203 3.403 3.816 4.003 4.175 4.261 4.651 4.798 5.099 5.371 5.62 5.747 6.009 6.247 6.572 6.777 6.987 7.32 7.63 7.899 8.18 8.488 8.89 9.243 9.56 9.944 10.318 10.706 11.147 11.598 12.05 12.58 13.126 13.7 14.304 14.987 15.775 16.549 17.489 18.538 19.712 21.056 22.728 24.838 27.183 28.847 29.676 29.999 30.058 30.017 29.924 29.808 29.67 29.507 29.341 29.184 28.99 28.771 28.568 28.377 28.166 27.959 27.787 27.593 27.382 27.206 26.992 26.759 26.58 26.383 26.179 25.973 25.762 25.608 25.441 25.182 24.998 24.817 24.724 24.489 24.236 23.981 23.837 23.462 23.392 23.241 23.072 22.665 22.443 22.182 21.862 21.52 21.12 20.575 19.043 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt deleted file mode 100644 index 1ac7d348..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,859 ,KEBNE ,16652982,Mon Nov 22 01:24:53 CET,Mon Nov 22 02:52:53 CET,0.0 1.121 1.586 1.979 2.355 2.694 3.004 3.301 3.841 4.09 4.339 4.569 5.034 5.257 5.688 6.109 6.514 6.712 7.102 7.484 8.047 8.426 8.785 9.304 9.821 10.322 10.82 11.314 11.948 12.578 13.185 13.929 14.686 15.443 16.341 17.356 18.35 19.441 20.637 21.9 23.27 24.947 26.979 29.094 31.666 34.619 38.051 41.988 46.807 52.992 61.289 68.813 73.71 77.173 79.731 81.742 83.274 84.483 85.389 86.186 86.829 87.351 87.78 88.128 88.404 88.636 88.846 88.999 89.135 89.267 89.366 89.435 89.487 89.506 89.513 89.507 89.499 89.497 89.455 89.405 89.347 89.23 89.123 88.995 88.925 88.781 88.625 88.47 88.391 88.137 88.0 87.852 87.676 87.2 86.959 86.72 86.372 85.973 85.539 84.863 82.055 -2 ,9653 ,KEBNE ,16652983,Mon Nov 22 01:24:53 CET,Mon Nov 22 02:52:28 CET,0.0 1.084 1.582 1.992 2.368 2.701 3.012 3.298 3.82 4.069 4.313 4.528 4.991 5.217 5.663 6.084 6.481 6.676 7.065 7.442 7.999 8.361 8.72 9.254 9.78 10.297 10.805 11.298 11.937 12.573 13.201 13.957 14.703 15.454 16.338 17.342 18.334 19.434 20.599 21.899 23.299 24.832 26.691 28.654 30.991 33.717 37.067 41.028 45.95 52.172 60.362 67.99 73.035 76.55 79.126 81.07 82.533 83.699 84.615 85.432 86.052 86.564 86.988 87.323 87.601 87.815 87.976 88.095 88.214 88.346 88.429 88.477 88.519 88.541 88.554 88.56 88.553 88.525 88.466 88.414 88.354 88.252 88.155 88.036 87.977 87.852 87.721 87.574 87.487 87.254 87.173 87.014 86.859 86.494 86.267 85.994 85.672 85.296 84.784 84.037 80.799 -3 ,380 ,KEBNE ,16652984,Mon Nov 22 01:24:53 CET,Mon Nov 22 02:52:34 CET,0.0 0.929 1.405 1.799 2.155 2.478 2.791 3.075 3.603 3.85 4.092 4.326 4.801 5.023 5.463 5.901 6.319 6.523 6.927 7.319 7.878 8.246 8.622 9.165 9.696 10.217 10.721 11.206 11.827 12.43 13.036 13.814 14.584 15.296 16.133 17.14 18.117 19.213 20.43 21.704 23.017 24.557 26.449 28.501 31.044 33.99 37.421 41.321 46.183 52.378 60.504 68.093 73.3 76.963 79.526 81.482 82.979 84.161 85.087 85.922 86.538 87.015 87.421 87.761 88.032 88.246 88.441 88.59 88.706 88.798 88.86 88.889 88.915 88.929 88.929 88.931 88.933 88.902 88.823 88.753 88.686 88.573 88.483 88.383 88.321 88.194 88.05 87.873 87.769 87.52 87.46 87.336 87.201 86.851 86.642 86.405 86.112 85.745 85.231 84.489 81.929 -4 ,30989 ,KEBNE ,16652985,Mon Nov 22 01:24:53 CET,Mon Nov 22 02:52:29 CET,0.0 1.305 1.828 2.238 2.582 2.894 3.191 3.471 3.989 4.235 4.477 4.694 5.177 5.415 5.857 6.27 6.667 6.864 7.254 7.643 8.209 8.576 8.935 9.467 9.998 10.52 11.026 11.519 12.167 12.813 13.455 14.229 14.989 15.743 16.632 17.594 18.502 19.541 20.716 22.029 23.468 25.167 27.194 29.19 31.538 34.262 37.531 41.437 46.279 52.396 60.48 68.1 73.104 76.623 79.241 81.261 82.796 84.028 84.966 85.773 86.39 86.875 87.285 87.658 87.966 88.186 88.383 88.53 88.644 88.75 88.827 88.886 88.942 88.973 88.975 88.975 88.961 88.923 88.882 88.842 88.793 88.665 88.561 88.457 88.398 88.265 88.103 87.907 87.793 87.536 87.448 87.305 87.142 86.789 86.551 86.258 85.939 85.594 85.072 84.23 80.791 -5 ,18310 ,KEBNE ,16652986,Mon Nov 22 01:25:55 CET,Mon Nov 22 02:54:02 CET,0.0 1.041 1.538 1.952 2.305 2.633 2.924 3.193 3.744 4.008 4.255 4.478 4.948 5.17 5.611 6.035 6.43 6.624 7.004 7.376 7.936 8.309 8.677 9.21 9.73 10.25 10.76 11.256 11.91 12.555 13.189 13.962 14.723 15.476 16.362 17.381 18.367 19.47 20.669 21.988 23.382 24.907 26.84 28.948 31.395 34.133 37.421 41.372 46.302 52.457 60.626 68.182 73.112 76.625 79.233 81.243 82.753 83.902 84.757 85.537 86.124 86.582 86.981 87.322 87.603 87.801 87.951 88.054 88.146 88.235 88.314 88.366 88.37 88.357 88.353 88.351 88.336 88.3 88.235 88.183 88.132 88.044 87.958 87.855 87.801 87.675 87.517 87.317 87.193 86.912 86.796 86.652 86.492 86.122 85.89 85.6 85.257 84.853 84.332 83.469 79.408 -6 ,1726 ,KEBNE ,16652987,Mon Nov 22 01:26:57 CET,Mon Nov 22 02:53:05 CET,0.0 1.089 1.59 2.007 2.366 2.693 3.001 3.305 3.851 4.113 4.366 4.595 5.066 5.286 5.712 6.133 6.557 6.757 7.139 7.512 8.066 8.439 8.804 9.34 9.862 10.368 10.871 11.375 12.033 12.673 13.298 14.059 14.771 15.472 16.308 17.27 18.253 19.317 20.448 21.674 23.018 24.615 26.589 28.7 31.248 34.131 37.492 41.408 46.303 52.488 60.652 68.27 73.205 76.639 79.179 81.178 82.701 83.891 84.787 85.587 86.186 86.665 87.072 87.432 87.758 87.979 88.154 88.299 88.41 88.496 88.572 88.629 88.66 88.678 88.679 88.669 88.624 88.552 88.491 88.446 88.401 88.3 88.206 88.116 88.066 87.927 87.755 87.584 87.491 87.237 87.137 87.001 86.845 86.429 86.193 85.905 85.61 85.25 84.691 83.888 80.722 -8 ,16613 ,KEBNE ,16652989,Mon Nov 22 01:29:01 CET,Mon Nov 22 02:55:13 CET,0.0 0.874 1.321 1.698 2.054 2.367 2.661 2.947 3.461 3.711 3.951 4.173 4.645 4.863 5.278 5.677 6.073 6.273 6.661 7.037 7.6 7.971 8.339 8.875 9.39 9.899 10.406 10.902 11.535 12.157 12.772 13.524 14.272 15.004 15.87 16.872 17.873 18.999 20.17 21.452 22.883 24.467 26.339 28.283 30.708 33.629 37.039 40.977 45.89 52.087 60.282 67.828 72.812 76.335 78.874 80.855 82.364 83.561 84.494 85.299 85.908 86.392 86.82 87.179 87.458 87.69 87.886 88.031 88.148 88.245 88.326 88.396 88.441 88.468 88.492 88.508 88.508 88.461 88.391 88.345 88.292 88.191 88.111 88.036 87.995 87.87 87.729 87.558 87.436 87.163 87.048 86.9 86.755 86.417 86.211 85.956 85.645 85.284 84.782 84.121 80.943 -9 ,26322 ,KEBNE ,16652990,Mon Nov 22 01:30:03 CET,Mon Nov 22 02:56:37 CET,0.0 1.028 1.535 1.918 2.26 2.587 2.897 3.181 3.687 3.932 4.173 4.385 4.852 5.076 5.507 5.915 6.316 6.513 6.897 7.286 7.854 8.22 8.587 9.128 9.659 10.161 10.65 11.145 11.805 12.451 13.077 13.853 14.612 15.354 16.228 17.242 18.223 19.31 20.544 21.864 23.291 24.963 26.967 29.085 31.542 34.263 37.551 41.489 46.391 52.572 60.798 68.342 73.3 76.773 79.291 81.26 82.746 83.931 84.835 85.62 86.22 86.698 87.124 87.462 87.714 87.908 88.103 88.249 88.336 88.427 88.496 88.533 88.565 88.59 88.603 88.607 88.594 88.561 88.497 88.452 88.401 88.267 88.169 88.065 88.004 87.866 87.725 87.579 87.493 87.238 87.148 87.01 86.823 86.435 86.216 85.978 85.683 85.312 84.836 84.101 81.341 -10 ,8519 ,KEBNE ,16652991,Mon Nov 22 01:30:03 CET,Mon Nov 22 02:56:04 CET,0.0 1.094 1.591 1.994 2.33 2.645 2.952 3.233 3.765 4.023 4.263 4.479 4.949 5.168 5.599 6.022 6.435 6.637 7.027 7.412 7.98 8.349 8.711 9.236 9.747 10.254 10.756 11.247 11.893 12.544 13.174 13.948 14.709 15.446 16.334 17.355 18.331 19.369 20.548 21.905 23.331 24.952 26.943 29.015 31.545 34.49 37.898 41.762 46.605 52.844 61.127 68.899 73.96 77.47 80.008 81.965 83.444 84.639 85.576 86.385 86.99 87.459 87.866 88.217 88.485 88.698 88.886 89.024 89.153 89.281 89.375 89.447 89.519 89.547 89.551 89.541 89.513 89.472 89.401 89.347 89.296 89.209 89.123 89.022 88.972 88.865 88.734 88.544 88.428 88.166 88.069 87.912 87.752 87.371 87.117 86.861 86.554 86.156 85.663 84.934 81.184 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 3d9dad0c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3104 ,KEBNE ,16652992,Mon Nov 22 01:32:06 CET,Mon Nov 22 02:59:16 CET,0.0 0.967 1.372 1.701 1.957 2.179 2.379 2.565 2.931 3.109 3.281 3.414 3.779 3.931 4.216 4.499 4.774 4.904 5.151 5.391 5.744 5.982 6.219 6.548 6.867 7.188 7.498 7.81 8.222 8.627 9.021 9.499 9.962 10.398 10.91 11.493 12.059 12.701 13.415 14.205 15.055 16.024 17.174 18.364 19.799 21.456 23.447 25.837 28.791 32.409 37.16 41.197 43.591 45.224 46.346 47.126 47.692 48.157 48.506 48.763 48.92 49.033 49.113 49.166 49.196 49.194 49.177 49.155 49.115 49.057 48.987 48.925 48.843 48.745 48.67 48.582 48.486 48.378 48.256 48.167 48.065 47.904 47.784 47.668 47.599 47.429 47.251 47.066 46.972 46.72 46.639 46.5 46.343 46.01 45.849 45.654 45.395 45.103 44.779 44.278 41.472 -2 ,28336 ,KEBNE ,16652993,Mon Nov 22 01:32:06 CET,Mon Nov 22 02:59:00 CET,0.0 0.983 1.395 1.713 1.974 2.203 2.43 2.651 3.028 3.202 3.368 3.473 3.832 3.989 4.292 4.58 4.841 4.96 5.208 5.461 5.826 6.059 6.28 6.607 6.935 7.245 7.544 7.837 8.218 8.588 8.954 9.403 9.853 10.302 10.822 11.409 11.977 12.61 13.306 14.07 14.903 15.886 17.046 18.221 19.628 21.287 23.255 25.495 28.241 31.626 36.048 39.964 42.305 43.927 45.09 45.913 46.483 46.916 47.254 47.518 47.677 47.8 47.897 47.958 47.994 47.99 47.961 47.944 47.918 47.863 47.806 47.762 47.688 47.589 47.505 47.418 47.319 47.216 47.105 47.023 46.941 46.784 46.657 46.514 46.447 46.306 46.141 45.964 45.871 45.619 45.541 45.406 45.247 44.928 44.759 44.569 44.331 44.027 43.634 43.122 40.743 -3 ,31446 ,KEBNE ,16652994,Mon Nov 22 01:32:06 CET,Mon Nov 22 02:57:46 CET,0.0 1.019 1.41 1.709 1.954 2.182 2.398 2.598 2.989 3.176 3.355 3.473 3.818 3.962 4.244 4.512 4.776 4.91 5.169 5.412 5.753 5.978 6.204 6.532 6.857 7.169 7.476 7.781 8.178 8.567 8.955 9.423 9.865 10.307 10.845 11.452 12.027 12.663 13.364 14.134 14.949 15.881 17.005 18.189 19.607 21.204 23.127 25.338 28.013 31.361 35.679 39.539 41.95 43.552 44.646 45.416 45.995 46.467 46.804 47.054 47.199 47.299 47.374 47.428 47.472 47.47 47.425 47.378 47.327 47.263 47.191 47.122 47.057 46.972 46.885 46.797 46.696 46.583 46.46 46.377 46.291 46.14 46.027 45.901 45.828 45.683 45.53 45.346 45.245 44.991 44.934 44.82 44.672 44.318 44.148 43.952 43.712 43.45 43.111 42.576 39.902 -5 ,30646 ,KEBNE ,16652996,Mon Nov 22 01:33:07 CET,Mon Nov 22 02:58:30 CET,0.0 0.734 1.109 1.421 1.669 1.878 2.087 2.305 2.704 2.886 3.054 3.148 3.495 3.644 3.923 4.186 4.442 4.568 4.819 5.072 5.447 5.678 5.901 6.226 6.536 6.841 7.147 7.46 7.871 8.243 8.599 9.05 9.495 9.932 10.441 11.026 11.614 12.286 13.01 13.771 14.588 15.547 16.696 17.89 19.334 20.976 22.968 25.276 28.07 31.62 36.211 40.182 42.526 44.104 45.262 46.126 46.727 47.15 47.438 47.643 47.801 47.923 48.001 48.067 48.11 48.134 48.14 48.103 48.049 47.99 47.92 47.866 47.796 47.704 47.623 47.536 47.449 47.338 47.224 47.15 47.06 46.902 46.786 46.657 46.587 46.447 46.305 46.145 46.06 45.817 45.754 45.625 45.481 45.17 44.999 44.805 44.567 44.267 43.892 43.41 41.089 -6 ,27258 ,KEBNE ,16652997,Mon Nov 22 01:33:08 CET,Mon Nov 22 02:58:35 CET,0.0 1.207 1.589 1.884 2.143 2.378 2.592 2.801 3.203 3.389 3.56 3.678 4.039 4.189 4.456 4.72 4.988 5.118 5.367 5.601 5.947 6.183 6.414 6.749 7.072 7.379 7.68 7.973 8.347 8.715 9.073 9.519 9.976 10.424 10.952 11.532 12.092 12.73 13.434 14.204 15.042 16.006 17.162 18.352 19.793 21.486 23.474 25.737 28.48 31.878 36.421 40.375 42.714 44.323 45.493 46.337 46.919 47.334 47.66 47.936 48.093 48.208 48.293 48.33 48.361 48.379 48.362 48.329 48.282 48.231 48.187 48.118 48.028 47.937 47.865 47.792 47.7 47.602 47.492 47.392 47.29 47.139 47.029 46.915 46.855 46.727 46.572 46.396 46.303 46.047 45.965 45.857 45.746 45.449 45.279 45.09 44.839 44.53 44.163 43.722 41.806 -7 ,17748 ,KEBNE ,16652998,Mon Nov 22 01:33:08 CET,Mon Nov 22 02:58:44 CET,0.0 1.16 1.576 1.851 2.091 2.348 2.586 2.775 3.122 3.283 3.434 3.524 3.87 4.018 4.303 4.575 4.843 4.974 5.237 5.493 5.851 6.08 6.309 6.632 6.933 7.229 7.533 7.841 8.24 8.631 9.007 9.46 9.918 10.362 10.881 11.478 12.068 12.734 13.477 14.28 15.148 16.145 17.307 18.51 19.977 21.65 23.633 25.961 28.8 32.281 36.809 40.772 43.217 44.854 45.931 46.784 47.432 47.876 48.181 48.429 48.606 48.701 48.743 48.785 48.801 48.797 48.774 48.729 48.685 48.63 48.543 48.456 48.368 48.28 48.207 48.126 48.03 47.91 47.782 47.698 47.609 47.456 47.338 47.209 47.14 46.982 46.823 46.652 46.552 46.3 46.231 46.094 45.967 45.69 45.522 45.32 45.08 44.797 44.418 43.807 41.32 -8 ,21501 ,KEBNE ,16652999,Mon Nov 22 01:34:09 CET,Mon Nov 22 02:59:43 CET,0.0 0.941 1.335 1.627 1.897 2.161 2.393 2.601 2.996 3.185 3.362 3.47 3.82 3.965 4.263 4.55 4.821 4.955 5.215 5.465 5.818 6.041 6.268 6.606 6.923 7.231 7.53 7.821 8.21 8.607 8.997 9.46 9.905 10.342 10.854 11.434 12.014 12.655 13.34 14.11 14.959 15.908 17.051 18.248 19.659 21.246 23.113 25.346 28.117 31.57 35.955 39.733 42.053 43.671 44.859 45.723 46.349 46.79 47.073 47.321 47.514 47.651 47.727 47.76 47.783 47.793 47.77 47.741 47.704 47.642 47.583 47.523 47.446 47.364 47.285 47.199 47.108 46.994 46.866 46.774 46.672 46.512 46.401 46.277 46.216 46.069 45.889 45.712 45.625 45.376 45.313 45.196 45.062 44.735 44.536 44.317 44.063 43.726 43.307 42.705 40.102 -9 ,12952 ,KEBNE ,16653000,Mon Nov 22 01:34:10 CET,Mon Nov 22 02:59:52 CET,0.0 0.804 1.213 1.499 1.763 2.007 2.225 2.426 2.812 2.992 3.163 3.275 3.621 3.756 4.011 4.257 4.502 4.627 4.867 5.104 5.476 5.717 5.944 6.29 6.622 6.932 7.231 7.526 7.91 8.276 8.641 9.092 9.544 9.992 10.511 11.096 11.666 12.312 13.03 13.8 14.615 15.556 16.677 17.836 19.229 20.879 22.908 25.27 28.101 31.542 35.993 39.955 42.342 43.897 44.968 45.799 46.4 46.812 47.11 47.379 47.562 47.674 47.756 47.828 47.887 47.91 47.892 47.852 47.808 47.751 47.681 47.613 47.547 47.467 47.391 47.306 47.206 47.094 46.967 46.87 46.768 46.628 46.527 46.402 46.337 46.187 46.012 45.831 45.734 45.485 45.42 45.292 45.152 44.856 44.675 44.474 44.264 44.007 43.604 43.042 41.073 -10 ,3646 ,KEBNE ,16653001,Mon Nov 22 01:34:10 CET,Mon Nov 22 02:59:59 CET,0.0 0.874 1.314 1.615 1.873 2.101 2.295 2.486 2.86 3.026 3.195 3.319 3.666 3.817 4.13 4.439 4.726 4.855 5.092 5.322 5.669 5.9 6.132 6.476 6.812 7.125 7.434 7.74 8.139 8.538 8.917 9.379 9.845 10.297 10.839 11.466 12.061 12.722 13.442 14.217 15.054 16.008 17.173 18.403 19.88 21.553 23.526 25.775 28.466 31.872 36.216 40.007 42.385 43.943 44.962 45.721 46.302 46.75 47.094 47.371 47.562 47.68 47.764 47.835 47.849 47.823 47.791 47.756 47.716 47.668 47.604 47.53 47.456 47.373 47.292 47.199 47.092 46.976 46.844 46.76 46.681 46.546 46.425 46.287 46.226 46.087 45.926 45.759 45.667 45.404 45.293 45.15 44.997 44.679 44.486 44.239 43.977 43.685 43.281 42.72 40.625 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index e9b22bbc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29474 ,KEBNE ,16653002,Mon Nov 22 01:34:10 CET,Mon Nov 22 03:00:23 CET,0.0 1.128 1.515 1.849 2.122 2.362 2.598 2.809 3.212 3.398 3.565 3.674 4.016 4.159 4.445 4.706 4.959 5.088 5.334 5.565 5.915 6.137 6.344 6.654 6.958 7.259 7.559 7.843 8.21 8.605 8.984 9.412 9.84 10.267 10.763 11.307 11.838 12.445 13.12 13.841 14.6 15.475 16.495 17.543 18.794 20.185 21.829 23.794 26.178 29.085 32.661 35.595 37.314 38.411 39.113 39.594 39.904 40.111 40.234 40.264 40.239 40.201 40.164 40.123 40.064 39.98 39.854 39.726 39.622 39.51 39.367 39.239 39.114 38.984 38.873 38.748 38.611 38.472 38.329 38.212 38.083 37.906 37.794 37.659 37.582 37.423 37.245 37.054 36.963 36.696 36.628 36.496 36.362 36.047 35.873 35.666 35.428 35.179 34.844 34.308 32.877 -2 ,24724 ,KEBNE ,16653003,Mon Nov 22 01:34:10 CET,Mon Nov 22 03:00:22 CET,0.0 0.884 1.341 1.68 1.963 2.217 2.451 2.669 3.069 3.247 3.415 3.54 3.893 4.038 4.318 4.6 4.876 5.012 5.277 5.53 5.897 6.127 6.354 6.682 6.999 7.309 7.599 7.887 8.269 8.645 9.009 9.437 9.854 10.258 10.736 11.29 11.82 12.412 13.045 13.73 14.492 15.386 16.449 17.511 18.774 20.215 21.893 23.774 26.019 28.75 32.182 35.127 36.854 37.967 38.671 39.12 39.43 39.657 39.797 39.857 39.86 39.822 39.748 39.674 39.599 39.507 39.385 39.275 39.184 39.076 38.946 38.83 38.692 38.551 38.433 38.301 38.162 38.016 37.858 37.741 37.626 37.452 37.326 37.188 37.113 36.956 36.776 36.585 36.484 36.209 36.145 36.011 35.862 35.538 35.365 35.146 34.896 34.642 34.3 33.749 31.976 -3 ,11550 ,KEBNE ,16653004,Mon Nov 22 01:34:10 CET,Mon Nov 22 03:00:22 CET,0.0 0.816 1.205 1.537 1.815 2.069 2.318 2.542 2.933 3.099 3.254 3.365 3.716 3.864 4.138 4.394 4.654 4.781 5.032 5.271 5.601 5.82 6.048 6.388 6.711 7.016 7.307 7.584 7.939 8.304 8.663 9.089 9.511 9.926 10.403 10.933 11.447 12.039 12.708 13.423 14.18 15.047 16.077 17.129 18.398 19.821 21.469 23.392 25.728 28.571 32.085 35.076 36.837 37.901 38.572 39.034 39.315 39.495 39.553 39.555 39.564 39.569 39.544 39.499 39.423 39.324 39.21 39.093 38.991 38.888 38.77 38.651 38.525 38.395 38.282 38.161 38.04 37.911 37.77 37.667 37.556 37.375 37.236 37.082 37.002 36.844 36.673 36.486 36.384 36.098 36.017 35.892 35.766 35.48 35.304 35.108 34.864 34.57 34.24 33.812 32.371 -4 ,26629 ,KEBNE ,16653005,Mon Nov 22 01:35:11 CET,Mon Nov 22 03:03:10 CET,0.0 1.058 1.433 1.709 1.966 2.206 2.408 2.605 2.984 3.168 3.357 3.503 3.86 4.008 4.307 4.595 4.855 4.979 5.229 5.487 5.847 6.075 6.298 6.61 6.916 7.235 7.554 7.856 8.241 8.609 8.977 9.435 9.881 10.307 10.8 11.381 11.958 12.575 13.238 13.96 14.735 15.595 16.578 17.597 18.84 20.287 21.993 23.956 26.335 29.23 32.716 35.64 37.389 38.448 39.128 39.578 39.814 39.939 39.999 40.006 39.972 39.952 39.94 39.888 39.806 39.723 39.616 39.502 39.407 39.3 39.177 39.056 38.923 38.787 38.673 38.538 38.408 38.276 38.116 38.011 37.909 37.729 37.589 37.428 37.348 37.197 37.024 36.837 36.731 36.44 36.366 36.245 36.099 35.776 35.597 35.39 35.152 34.876 34.561 34.126 32.64 -5 ,3443 ,KEBNE ,16653006,Mon Nov 22 01:35:11 CET,Mon Nov 22 03:01:17 CET,0.0 1.482 1.946 2.289 2.574 2.837 3.078 3.306 3.693 3.859 4.024 4.144 4.505 4.651 4.906 5.157 5.401 5.523 5.774 6.028 6.385 6.606 6.84 7.192 7.519 7.82 8.108 8.405 8.799 9.171 9.527 9.958 10.396 10.84 11.355 11.916 12.446 13.042 13.7 14.458 15.268 16.184 17.283 18.367 19.663 21.128 22.778 24.689 27.062 29.873 33.358 36.245 38.011 39.198 39.903 40.35 40.657 40.869 40.995 41.028 40.99 40.948 40.9 40.816 40.713 40.597 40.455 40.344 40.259 40.144 39.997 39.885 39.771 39.64 39.536 39.434 39.314 39.167 39.025 38.931 38.823 38.633 38.504 38.37 38.292 38.119 37.931 37.716 37.596 37.306 37.214 37.076 36.928 36.573 36.372 36.16 35.912 35.626 35.308 34.824 32.948 -6 ,10787 ,KEBNE ,16653007,Mon Nov 22 01:35:11 CET,Mon Nov 22 03:02:51 CET,0.0 1.221 1.666 1.995 2.302 2.584 2.815 3.003 3.335 3.489 3.64 3.736 4.087 4.245 4.529 4.802 5.066 5.192 5.452 5.698 6.077 6.322 6.543 6.865 7.171 7.466 7.759 8.047 8.411 8.761 9.121 9.565 9.99 10.416 10.913 11.464 12.002 12.6 13.257 13.973 14.73 15.593 16.623 17.68 18.922 20.338 22.037 23.941 26.138 28.819 32.247 35.128 36.854 38.009 38.77 39.247 39.545 39.735 39.839 39.917 39.958 39.947 39.905 39.862 39.815 39.752 39.65 39.53 39.434 39.327 39.215 39.125 39.007 38.872 38.77 38.663 38.545 38.414 38.262 38.15 38.028 37.834 37.699 37.563 37.492 37.343 37.19 37.019 36.912 36.635 36.584 36.465 36.327 35.993 35.822 35.633 35.412 35.137 34.785 34.305 32.558 -7 ,22935 ,KEBNE ,16653008,Mon Nov 22 01:35:11 CET,Mon Nov 22 03:02:46 CET,0.0 1.184 1.735 2.111 2.432 2.727 2.992 3.234 3.663 3.849 4.019 4.145 4.496 4.647 4.956 5.254 5.536 5.671 5.926 6.156 6.483 6.708 6.934 7.281 7.6 7.894 8.188 8.477 8.853 9.222 9.588 10.008 10.405 10.807 11.294 11.847 12.399 13.024 13.676 14.357 15.074 15.929 16.962 17.992 19.222 20.666 22.381 24.369 26.742 29.508 32.969 35.908 37.644 38.728 39.391 39.829 40.131 40.324 40.442 40.504 40.521 40.512 40.453 40.381 40.305 40.229 40.124 40.006 39.893 39.768 39.632 39.509 39.378 39.228 39.116 39.004 38.885 38.745 38.588 38.486 38.374 38.181 38.051 37.916 37.846 37.698 37.499 37.276 37.171 36.895 36.814 36.685 36.55 36.245 36.071 35.883 35.676 35.392 35.014 34.527 32.65 -8 ,27412 ,KEBNE ,16653009,Mon Nov 22 01:35:11 CET,Mon Nov 22 03:01:21 CET,0.0 1.076 1.525 1.89 2.198 2.465 2.681 2.878 3.256 3.43 3.604 3.726 4.087 4.252 4.545 4.809 5.069 5.198 5.449 5.682 6.029 6.264 6.5 6.838 7.146 7.44 7.731 8.007 8.374 8.756 9.12 9.545 9.982 10.419 10.905 11.453 12.006 12.616 13.295 14.028 14.796 15.713 16.832 17.965 19.258 20.698 22.429 24.41 26.777 29.63 33.232 36.294 38.091 39.193 39.882 40.313 40.542 40.67 40.732 40.775 40.794 40.78 40.735 40.656 40.584 40.512 40.41 40.316 40.226 40.112 39.981 39.885 39.783 39.643 39.521 39.405 39.284 39.155 39.029 38.932 38.822 38.638 38.496 38.352 38.277 38.119 37.962 37.784 37.68 37.392 37.308 37.185 37.057 36.792 36.612 36.373 36.136 35.887 35.554 35.044 33.631 -9 ,28076 ,KEBNE ,16653010,Mon Nov 22 01:35:11 CET,Mon Nov 22 03:02:43 CET,0.0 1.018 1.49 1.908 2.262 2.564 2.796 3.002 3.398 3.584 3.763 3.885 4.23 4.378 4.675 4.962 5.248 5.38 5.634 5.885 6.238 6.46 6.671 6.984 7.289 7.594 7.89 8.166 8.524 8.879 9.238 9.664 10.08 10.506 11.006 11.583 12.147 12.756 13.424 14.118 14.847 15.703 16.695 17.707 18.914 20.316 21.948 23.831 26.211 29.15 32.782 35.787 37.509 38.584 39.253 39.693 39.98 40.184 40.259 40.258 40.226 40.161 40.095 40.024 39.94 39.849 39.734 39.609 39.498 39.386 39.259 39.141 39.013 38.867 38.742 38.621 38.5 38.377 38.247 38.147 38.031 37.84 37.697 37.545 37.473 37.314 37.131 36.939 36.839 36.571 36.518 36.388 36.258 35.974 35.799 35.581 35.356 35.113 34.82 34.365 32.884 -10 ,14326 ,KEBNE ,16653011,Mon Nov 22 01:36:13 CET,Mon Nov 22 03:03:59 CET,0.0 0.983 1.52 1.88 2.163 2.427 2.656 2.866 3.257 3.429 3.598 3.723 4.073 4.223 4.512 4.784 5.046 5.171 5.42 5.667 6.027 6.272 6.517 6.865 7.186 7.489 7.777 8.07 8.452 8.825 9.19 9.618 10.048 10.477 10.972 11.531 12.079 12.7 13.377 14.108 14.917 15.832 16.907 18.009 19.329 20.824 22.453 24.344 26.779 29.72 33.286 36.249 37.928 39.01 39.722 40.159 40.452 40.623 40.685 40.671 40.611 40.556 40.502 40.422 40.33 40.255 40.162 40.076 39.986 39.872 39.75 39.637 39.522 39.4 39.302 39.2 39.08 38.936 38.782 38.677 38.553 38.358 38.227 38.095 38.027 37.875 37.716 37.53 37.424 37.149 37.087 36.971 36.842 36.552 36.366 36.153 35.915 35.621 35.255 34.721 33.225 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 1f0daa38..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26261 ,KEBNE ,16653012,Mon Nov 22 01:36:13 CET,Mon Nov 22 03:03:10 CET,0.0 0.636 1.01 1.304 1.567 1.822 2.053 2.283 2.694 2.865 3.035 3.174 3.53 3.688 3.983 4.257 4.52 4.647 4.914 5.175 5.534 5.766 5.992 6.315 6.62 6.923 7.231 7.517 7.894 8.277 8.645 9.095 9.531 9.952 10.446 11.016 11.562 12.161 12.811 13.523 14.318 15.201 16.224 17.266 18.503 19.948 21.652 23.61 26.032 28.968 32.567 35.639 37.396 38.442 39.113 39.59 39.924 40.147 40.238 40.252 40.25 40.229 40.211 40.197 40.151 40.083 39.991 39.891 39.8 39.707 39.612 39.522 39.428 39.318 39.212 39.101 38.981 38.852 38.712 38.608 38.497 38.321 38.204 38.077 38.006 37.853 37.691 37.494 37.379 37.111 36.987 36.834 36.676 36.326 36.104 35.877 35.661 35.396 35.065 34.553 32.962 -2 ,19068 ,KEBNE ,16653013,Mon Nov 22 01:37:15 CET,Mon Nov 22 03:04:05 CET,0.0 1.012 1.424 1.696 1.945 2.216 2.484 2.707 3.087 3.254 3.429 3.566 3.93 4.082 4.366 4.62 4.872 5.007 5.271 5.529 5.9 6.131 6.362 6.702 7.026 7.33 7.619 7.908 8.297 8.678 9.047 9.49 9.923 10.352 10.871 11.458 12.029 12.676 13.369 14.124 14.944 15.871 17.006 18.208 19.632 21.258 23.178 25.378 28.087 31.458 35.657 39.173 41.132 42.338 43.136 43.613 43.914 44.112 44.245 44.354 44.4 44.427 44.442 44.428 44.363 44.278 44.184 44.075 43.978 43.869 43.739 43.623 43.5 43.361 43.243 43.13 43.014 42.866 42.695 42.577 42.466 42.302 42.178 42.049 41.976 41.798 41.616 41.438 41.343 41.09 41.012 40.886 40.757 40.471 40.298 40.11 39.893 39.599 39.221 38.758 37.274 -3 ,2114 ,KEBNE ,16653014,Mon Nov 22 01:37:15 CET,Mon Nov 22 03:03:58 CET,0.0 0.994 1.421 1.704 1.954 2.184 2.401 2.604 2.956 3.141 3.316 3.433 3.789 3.943 4.245 4.516 4.747 4.862 5.091 5.317 5.678 5.909 6.121 6.429 6.73 7.038 7.351 7.649 8.015 8.366 8.731 9.18 9.599 10.009 10.493 11.057 11.612 12.221 12.873 13.566 14.302 15.158 16.179 17.251 18.518 19.94 21.673 23.618 25.953 28.776 32.256 35.201 36.821 37.857 38.569 39.039 39.326 39.524 39.664 39.748 39.771 39.755 39.706 39.649 39.6 39.535 39.443 39.334 39.245 39.151 39.027 38.915 38.798 38.685 38.588 38.486 38.361 38.225 38.081 37.974 37.859 37.654 37.5 37.358 37.287 37.105 36.909 36.714 36.613 36.36 36.274 36.134 35.99 35.692 35.518 35.349 35.132 34.842 34.461 33.974 32.505 -4 ,31884 ,KEBNE ,16653015,Mon Nov 22 01:37:15 CET,Mon Nov 22 03:03:55 CET,0.0 0.99 1.478 1.839 2.146 2.402 2.627 2.84 3.225 3.407 3.585 3.712 4.07 4.221 4.521 4.808 5.089 5.234 5.506 5.758 6.128 6.382 6.626 6.953 7.275 7.595 7.9 8.2 8.598 9.002 9.408 9.878 10.321 10.755 11.267 11.852 12.43 13.075 13.773 14.554 15.416 16.414 17.604 18.807 20.202 21.816 23.717 25.767 28.087 30.921 34.5 37.454 39.127 40.147 40.772 41.178 41.455 41.647 41.776 41.847 41.855 41.845 41.837 41.811 41.768 41.715 41.623 41.524 41.442 41.339 41.214 41.113 41.0 40.87 40.764 40.659 40.551 40.422 40.277 40.166 40.044 39.864 39.739 39.602 39.526 39.376 39.219 39.026 38.92 38.661 38.57 38.448 38.312 37.985 37.79 37.565 37.323 37.028 36.668 36.199 34.468 -6 ,22285 ,KEBNE ,16653017,Mon Nov 22 01:41:26 CET,Mon Nov 22 03:03:10 CET,0.0 0.748 1.099 1.418 1.691 1.934 2.162 2.362 2.722 2.9 3.069 3.188 3.544 3.689 3.968 4.247 4.517 4.651 4.91 5.155 5.52 5.754 5.989 6.326 6.636 6.945 7.255 7.553 7.94 8.322 8.698 9.171 9.631 10.071 10.576 11.156 11.738 12.387 13.112 13.921 14.782 15.751 16.906 18.068 19.462 21.091 23.0 25.098 27.477 30.406 34.098 37.214 39.02 40.167 40.914 41.391 41.706 41.932 42.078 42.153 42.17 42.159 42.112 42.037 41.975 41.916 41.816 41.714 41.617 41.531 41.447 41.343 41.228 41.122 41.031 40.923 40.815 40.702 40.564 40.456 40.342 40.17 40.043 39.902 39.83 39.676 39.499 39.305 39.202 38.94 38.861 38.737 38.6 38.273 38.083 37.869 37.644 37.388 37.033 36.5 34.787 -7 ,24371 ,KEBNE ,16653018,Mon Nov 22 01:42:22 CET,Mon Nov 22 03:07:43 CET,0.0 0.915 1.298 1.616 1.862 2.081 2.287 2.494 2.883 3.057 3.221 3.334 3.693 3.843 4.141 4.436 4.714 4.847 5.093 5.321 5.677 5.915 6.142 6.473 6.786 7.087 7.381 7.673 8.039 8.374 8.713 9.134 9.549 9.956 10.445 11.009 11.537 12.145 12.828 13.544 14.293 15.173 16.239 17.317 18.582 20.018 21.732 23.656 25.93 28.735 32.279 35.259 36.981 38.005 38.649 39.109 39.422 39.625 39.716 39.767 39.788 39.777 39.769 39.728 39.66 39.598 39.508 39.413 39.321 39.213 39.104 39.011 38.897 38.782 38.686 38.577 38.457 38.33 38.194 38.087 37.977 37.8 37.672 37.535 37.456 37.29 37.125 36.943 36.831 36.566 36.487 36.348 36.193 35.864 35.69 35.496 35.285 35.034 34.705 34.27 32.801 -8 ,7355 ,KEBNE ,16653019,Mon Nov 22 01:42:23 CET,Mon Nov 22 03:07:38 CET,0.0 0.948 1.356 1.676 1.94 2.185 2.401 2.592 2.991 3.19 3.367 3.472 3.827 3.986 4.304 4.591 4.843 4.972 5.225 5.475 5.86 6.102 6.325 6.643 6.953 7.248 7.527 7.808 8.175 8.526 8.877 9.304 9.715 10.132 10.611 11.146 11.689 12.299 12.973 13.709 14.484 15.382 16.412 17.469 18.766 20.198 21.921 23.954 26.407 29.368 32.994 36.122 37.978 39.144 39.87 40.329 40.625 40.835 40.969 41.047 41.09 41.103 41.072 41.021 40.956 40.869 40.759 40.651 40.557 40.467 40.363 40.261 40.144 40.015 39.917 39.812 39.694 39.566 39.42 39.321 39.221 39.043 38.891 38.723 38.642 38.471 38.287 38.092 37.99 37.735 37.656 37.531 37.391 37.081 36.906 36.685 36.434 36.15 35.816 35.349 33.384 -9 ,12477 ,KEBNE ,16653020,Mon Nov 22 01:42:23 CET,Mon Nov 22 03:07:53 CET,0.0 0.756 1.177 1.508 1.772 1.978 2.17 2.366 2.764 2.951 3.125 3.268 3.622 3.761 4.023 4.28 4.525 4.647 4.877 5.112 5.462 5.678 5.889 6.201 6.513 6.807 7.09 7.374 7.739 8.103 8.457 8.881 9.311 9.74 10.226 10.763 11.282 11.861 12.506 13.211 13.963 14.816 15.83 16.873 18.143 19.577 21.212 23.145 25.55 28.477 32.102 35.187 36.98 38.081 38.865 39.387 39.692 39.895 40.0 40.062 40.075 40.072 40.05 40.017 39.966 39.885 39.779 39.67 39.568 39.455 39.334 39.218 39.087 38.955 38.854 38.747 38.629 38.497 38.342 38.229 38.118 37.955 37.828 37.694 37.632 37.502 37.356 37.183 37.092 36.841 36.765 36.638 36.506 36.199 36.022 35.841 35.617 35.328 34.96 34.458 32.805 -10 ,18049 ,KEBNE ,16653021,Mon Nov 22 01:42:23 CET,Mon Nov 22 03:09:08 CET,0.0 0.805 1.177 1.495 1.776 2.029 2.264 2.471 2.839 3.01 3.172 3.266 3.619 3.776 4.069 4.336 4.611 4.749 5.0 5.242 5.61 5.857 6.106 6.445 6.754 7.052 7.351 7.65 8.037 8.407 8.768 9.233 9.707 10.162 10.662 11.194 11.731 12.339 12.981 13.68 14.444 15.326 16.372 17.456 18.736 20.171 21.851 23.826 26.244 29.129 32.611 35.555 37.285 38.36 39.077 39.535 39.811 39.982 40.078 40.154 40.203 40.213 40.184 40.135 40.067 40.0 39.928 39.838 39.742 39.636 39.532 39.435 39.328 39.204 39.097 38.988 38.867 38.735 38.591 38.483 38.372 38.191 38.051 37.917 37.849 37.683 37.518 37.332 37.208 36.932 36.848 36.72 36.584 36.278 36.117 35.932 35.673 35.388 35.054 34.524 32.068 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 4c1f0076..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18217 ,KEBNE ,16653022,Mon Nov 22 01:43:25 CET,Mon Nov 22 03:09:27 CET,0.0 1.132 1.524 1.821 2.076 2.315 2.541 2.749 3.125 3.313 3.474 3.593 3.958 4.109 4.413 4.693 4.938 5.055 5.306 5.561 5.928 6.158 6.374 6.681 6.984 7.278 7.569 7.853 8.216 8.576 8.933 9.368 9.78 10.179 10.651 11.183 11.707 12.304 12.926 13.584 14.316 15.161 16.149 17.163 18.356 19.685 21.281 23.12 25.257 27.883 31.036 33.578 35.085 36.017 36.611 36.952 37.043 37.017 36.97 36.878 36.762 36.642 36.476 36.292 36.143 35.978 35.78 35.606 35.456 35.289 35.108 34.964 34.808 34.655 34.534 34.399 34.255 34.099 33.921 33.799 33.682 33.485 33.348 33.198 33.116 32.95 32.774 32.573 32.465 32.183 32.086 31.942 31.789 31.474 31.315 31.164 30.976 30.712 30.417 30.029 28.68 -2 ,19748 ,KEBNE ,16653023,Mon Nov 22 01:43:25 CET,Mon Nov 22 03:09:37 CET,0.0 0.872 1.232 1.499 1.75 1.977 2.184 2.405 2.811 2.981 3.143 3.268 3.624 3.756 4.016 4.291 4.553 4.684 4.943 5.166 5.497 5.726 5.947 6.262 6.57 6.876 7.184 7.474 7.855 8.223 8.568 8.995 9.403 9.804 10.276 10.806 11.307 11.875 12.494 13.132 13.834 14.637 15.564 16.524 17.667 18.969 20.537 22.378 24.609 27.274 30.508 33.104 34.421 35.05 35.308 35.459 35.54 35.528 35.451 35.327 35.187 35.045 34.886 34.709 34.539 34.376 34.189 34.023 33.874 33.725 33.59 33.453 33.289 33.128 33.001 32.867 32.722 32.573 32.422 32.298 32.167 31.977 31.837 31.677 31.594 31.43 31.261 31.085 30.987 30.7 30.601 30.464 30.323 30.021 29.854 29.652 29.415 29.176 28.897 28.539 27.359 -3 ,22054 ,KEBNE ,16653024,Mon Nov 22 01:43:25 CET,Mon Nov 22 03:09:31 CET,0.0 1.185 1.594 1.875 2.097 2.297 2.477 2.658 3.022 3.186 3.338 3.446 3.805 3.952 4.249 4.525 4.783 4.911 5.151 5.379 5.727 5.95 6.161 6.477 6.79 7.095 7.383 7.668 8.04 8.394 8.75 9.182 9.601 9.999 10.428 10.904 11.365 11.876 12.447 13.075 13.726 14.44 15.318 16.297 17.443 18.75 20.262 21.87 23.916 26.586 29.807 32.426 34.015 34.796 35.112 35.351 35.488 35.532 35.514 35.45 35.36 35.261 35.167 35.055 34.918 34.793 34.661 34.531 34.408 34.268 34.13 34.022 33.901 33.768 33.653 33.527 33.387 33.232 33.076 32.959 32.824 32.599 32.445 32.288 32.2 32.017 31.831 31.635 31.538 31.259 31.193 31.067 30.928 30.632 30.454 30.24 29.998 29.738 29.386 28.917 27.979 -4 ,22924 ,KEBNE ,16653025,Mon Nov 22 01:43:25 CET,Mon Nov 22 03:09:26 CET,0.0 1.329 1.799 2.138 2.395 2.658 2.916 3.147 3.529 3.69 3.858 3.99 4.345 4.491 4.752 5.004 5.241 5.366 5.615 5.842 6.187 6.412 6.624 6.925 7.22 7.503 7.776 8.053 8.42 8.764 9.092 9.497 9.898 10.291 10.744 11.239 11.729 12.27 12.825 13.421 14.066 14.809 15.674 16.595 17.712 18.901 20.29 21.924 23.847 26.051 28.69 30.812 32.004 32.694 33.107 33.338 33.426 33.476 33.474 33.405 33.284 33.153 33.025 32.898 32.767 32.634 32.475 32.321 32.18 32.039 31.896 31.767 31.623 31.454 31.311 31.166 31.032 30.901 30.748 30.642 30.523 30.306 30.153 29.993 29.908 29.731 29.54 29.331 29.231 28.96 28.888 28.756 28.6 28.232 28.037 27.835 27.608 27.322 26.995 26.63 25.529 -5 ,21524 ,KEBNE ,16653026,Mon Nov 22 01:44:27 CET,Mon Nov 22 03:11:49 CET,0.0 0.699 1.058 1.356 1.599 1.842 2.048 2.232 2.589 2.763 2.929 3.019 3.377 3.539 3.822 4.089 4.35 4.474 4.719 4.964 5.331 5.566 5.789 6.112 6.438 6.769 7.078 7.37 7.756 8.137 8.497 8.935 9.357 9.758 10.233 10.765 11.284 11.862 12.509 13.237 14.0 14.838 15.827 16.829 18.015 19.367 20.98 22.837 24.99 27.628 30.853 33.235 34.401 35.091 35.423 35.558 35.595 35.608 35.576 35.485 35.381 35.242 35.076 34.885 34.689 34.516 34.332 34.154 33.994 33.836 33.684 33.564 33.425 33.249 33.114 32.986 32.841 32.682 32.515 32.398 32.275 32.09 31.966 31.82 31.744 31.589 31.408 31.22 31.127 30.868 30.822 30.692 30.552 30.24 30.055 29.849 29.63 29.357 29.023 28.567 27.569 -6 ,30415 ,KEBNE ,16653027,Mon Nov 22 01:44:26 CET,Mon Nov 22 03:11:51 CET,0.0 1.057 1.491 1.819 2.063 2.277 2.475 2.665 3.031 3.207 3.392 3.563 3.939 4.095 4.38 4.652 4.897 5.016 5.258 5.49 5.838 6.063 6.274 6.586 6.897 7.186 7.464 7.75 8.126 8.473 8.812 9.235 9.646 10.051 10.516 11.055 11.574 12.136 12.779 13.454 14.155 14.974 15.937 16.912 18.059 19.348 20.919 22.784 24.922 27.335 30.351 33.064 34.676 35.701 36.344 36.621 36.693 36.677 36.589 36.466 36.318 36.162 36.005 35.853 35.692 35.521 35.336 35.182 35.074 34.96 34.804 34.662 34.516 34.358 34.242 34.121 33.96 33.791 33.624 33.514 33.396 33.195 33.05 32.891 32.81 32.647 32.473 32.286 32.188 31.929 31.908 31.787 31.655 31.374 31.216 31.047 30.864 30.655 30.368 29.964 28.91 -7 ,30657 ,KEBNE ,16653028,Mon Nov 22 01:44:26 CET,Mon Nov 22 03:12:00 CET,0.0 1.069 1.484 1.809 2.077 2.334 2.56 2.765 3.157 3.345 3.527 3.641 3.987 4.138 4.422 4.673 4.918 5.04 5.276 5.496 5.837 6.067 6.285 6.595 6.886 7.169 7.459 7.744 8.115 8.466 8.814 9.251 9.666 10.07 10.547 11.066 11.555 12.097 12.705 13.385 14.072 14.848 15.761 16.684 17.76 18.926 20.306 21.87 23.705 25.914 28.577 30.802 32.088 32.799 33.079 33.197 33.252 33.2 33.115 32.995 32.835 32.671 32.523 32.393 32.256 32.109 31.953 31.81 31.672 31.52 31.345 31.189 31.024 30.85 30.717 30.569 30.415 30.256 30.077 29.952 29.817 29.602 29.445 29.27 29.19 29.033 28.854 28.656 28.551 28.278 28.202 28.065 27.925 27.615 27.436 27.233 26.997 26.714 26.408 25.981 24.266 -8 ,24039 ,KEBNE ,16653029,Mon Nov 22 01:44:26 CET,Mon Nov 22 03:12:21 CET,0.0 1.091 1.564 1.914 2.19 2.437 2.663 2.874 3.244 3.401 3.554 3.641 3.99 4.132 4.406 4.668 4.931 5.064 5.314 5.548 5.895 6.118 6.328 6.62 6.907 7.211 7.506 7.79 8.169 8.531 8.885 9.312 9.719 10.116 10.583 11.099 11.576 12.085 12.641 13.281 13.972 14.712 15.621 16.598 17.764 19.125 20.69 22.431 24.531 27.175 30.359 32.81 34.107 34.789 35.123 35.27 35.347 35.375 35.382 35.358 35.291 35.187 35.061 34.944 34.827 34.679 34.501 34.355 34.232 34.085 33.92 33.775 33.61 33.443 33.322 33.201 33.069 32.924 32.776 32.675 32.566 32.388 32.257 32.104 32.024 31.859 31.681 31.483 31.377 31.106 31.048 30.922 30.799 30.523 30.366 30.201 29.993 29.691 29.34 28.973 27.879 -9 ,9754 ,KEBNE ,16653030,Mon Nov 22 01:44:30 CET,Mon Nov 22 03:09:26 CET,0.0 0.88 1.323 1.66 1.91 2.13 2.35 2.554 2.922 3.1 3.269 3.372 3.747 3.915 4.209 4.461 4.703 4.826 5.067 5.296 5.626 5.84 6.043 6.341 6.639 6.93 7.216 7.488 7.837 8.187 8.536 8.966 9.378 9.778 10.242 10.753 11.239 11.759 12.319 12.925 13.572 14.309 15.176 16.044 17.076 18.251 19.619 21.175 22.996 25.168 27.738 29.794 30.945 31.582 31.972 32.232 32.359 32.414 32.395 32.322 32.248 32.154 32.033 31.919 31.807 31.678 31.519 31.37 31.237 31.088 30.922 30.764 30.59 30.429 30.312 30.184 30.033 29.854 29.654 29.529 29.412 29.227 29.091 28.941 28.861 28.673 28.479 28.294 28.193 27.923 27.862 27.725 27.581 27.26 27.089 26.91 26.695 26.451 26.168 25.781 24.699 -10 ,23007 ,KEBNE ,16653031,Mon Nov 22 01:45:28 CET,Mon Nov 22 03:11:25 CET,0.0 0.979 1.419 1.748 2.009 2.266 2.519 2.733 3.096 3.274 3.452 3.554 3.914 4.066 4.343 4.627 4.908 5.041 5.29 5.527 5.874 6.104 6.322 6.638 6.941 7.242 7.54 7.819 8.159 8.497 8.846 9.281 9.679 10.058 10.523 11.041 11.546 12.121 12.742 13.408 14.139 14.976 15.97 16.971 18.121 19.497 21.17 22.988 25.074 27.627 30.887 33.57 35.027 35.69 35.955 36.115 36.115 36.009 35.893 35.765 35.631 35.464 35.283 35.113 34.962 34.82 34.654 34.486 34.328 34.151 33.969 33.826 33.669 33.488 33.338 33.186 33.029 32.855 32.667 32.544 32.424 32.226 32.086 31.94 31.861 31.683 31.502 31.319 31.216 30.938 30.853 30.726 30.595 30.291 30.138 29.963 29.765 29.545 29.258 28.819 27.739 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index dd682634..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,16541 ,KEBNE ,16653035,Mon Nov 22 01:44:26 CET,Mon Nov 22 03:10:09 CET,0.0 1.144 1.622 1.984 2.318 2.617 2.881 3.116 3.504 3.686 3.862 4.004 4.384 4.539 4.861 5.17 5.454 5.592 5.872 6.147 6.52 6.767 7.014 7.374 7.717 8.044 8.369 8.682 9.091 9.511 9.925 10.423 10.912 11.393 11.957 12.599 13.224 13.939 14.734 15.571 16.447 17.473 18.723 20.009 21.574 23.391 25.565 28.101 31.249 35.255 40.481 45.229 48.263 50.368 51.907 53.084 53.986 54.704 55.251 55.714 56.044 56.315 56.551 56.748 56.91 57.038 57.163 57.27 57.354 57.413 57.451 57.482 57.5 57.515 57.523 57.525 57.527 57.508 57.461 57.419 57.381 57.307 57.237 57.168 57.134 57.056 56.979 56.897 56.845 56.636 56.656 56.581 56.509 56.36 56.252 56.127 55.997 55.818 55.567 55.241 54.453 -5 ,16753 ,KEBNE ,16653036,Mon Nov 22 01:45:28 CET,Mon Nov 22 03:11:09 CET,0.0 1.329 1.842 2.196 2.5 2.783 3.052 3.286 3.681 3.867 4.053 4.2 4.573 4.739 5.067 5.372 5.666 5.808 6.079 6.342 6.722 6.97 7.207 7.558 7.903 8.238 8.559 8.871 9.286 9.695 10.101 10.597 11.079 11.555 12.12 12.762 13.383 14.08 14.847 15.689 16.585 17.613 18.849 20.133 21.693 23.495 25.671 28.215 31.334 35.294 40.471 45.171 48.166 50.268 51.84 53.037 53.934 54.63 55.166 55.644 55.996 56.289 56.549 56.751 56.919 57.061 57.199 57.288 57.346 57.409 57.453 57.481 57.492 57.486 57.475 57.462 57.437 57.404 57.372 57.35 57.323 57.262 57.219 57.186 57.164 57.092 57.01 56.916 56.866 56.66 56.679 56.615 56.549 56.357 56.23 56.098 55.96 55.778 55.512 55.122 54.402 -6 ,16251 ,KEBNE ,16653037,Mon Nov 22 01:45:32 CET,Mon Nov 22 03:03:58 CET,0.0 0.948 1.383 1.735 2.07 2.364 2.619 2.841 3.238 3.436 3.628 3.796 4.175 4.326 4.617 4.903 5.198 5.34 5.609 5.879 6.264 6.51 6.746 7.098 7.441 7.76 8.082 8.396 8.816 9.238 9.652 10.148 10.63 11.107 11.667 12.311 12.943 13.644 14.418 15.257 16.154 17.175 18.403 19.684 21.236 23.047 25.176 27.649 30.78 34.781 40.008 44.747 47.813 49.931 51.431 52.583 53.483 54.202 54.744 55.232 55.602 55.902 56.15 56.35 56.514 56.639 56.736 56.796 56.84 56.897 56.949 56.983 57.012 57.027 57.03 57.026 57.003 56.971 56.94 56.916 56.893 56.852 56.813 56.764 56.74 56.683 56.609 56.517 56.465 56.264 56.305 56.242 56.172 55.995 55.882 55.745 55.581 55.368 55.114 54.788 53.983 -7 ,8173 ,KEBNE ,16653038,Mon Nov 22 01:46:30 CET,Mon Nov 22 03:10:51 CET,0.0 0.803 1.215 1.526 1.822 2.076 2.308 2.527 2.896 3.07 3.237 3.351 3.714 3.87 4.177 4.458 4.741 4.883 5.163 5.442 5.835 6.079 6.317 6.675 7.037 7.39 7.737 8.072 8.493 8.898 9.296 9.783 10.257 10.745 11.33 11.971 12.58 13.255 14.031 14.878 15.792 16.869 18.115 19.393 20.958 22.766 24.913 27.425 30.541 34.472 39.544 44.151 47.142 49.203 50.731 51.936 52.836 53.533 54.061 54.518 54.868 55.15 55.387 55.579 55.731 55.856 55.962 56.039 56.093 56.145 56.199 56.228 56.241 56.259 56.272 56.272 56.262 56.244 56.225 56.202 56.169 56.11 56.058 56.002 55.976 55.922 55.868 55.799 55.753 55.552 55.59 55.507 55.411 55.22 55.115 54.996 54.857 54.687 54.449 54.141 53.326 -8 ,15250 ,KEBNE ,16653039,Mon Nov 22 01:46:30 CET,Mon Nov 22 03:10:46 CET,0.0 1.126 1.633 2.033 2.366 2.639 2.88 3.102 3.495 3.684 3.865 4.006 4.377 4.534 4.843 5.138 5.414 5.549 5.816 6.073 6.441 6.684 6.931 7.305 7.678 8.029 8.365 8.707 9.148 9.577 9.998 10.497 10.986 11.464 12.01 12.637 13.276 13.985 14.755 15.608 16.517 17.556 18.808 20.087 21.61 23.389 25.526 28.046 31.142 34.995 39.993 44.521 47.468 49.554 51.068 52.218 53.086 53.776 54.318 54.805 55.153 55.422 55.668 55.871 56.034 56.165 56.266 56.333 56.388 56.452 56.512 56.546 56.565 56.562 56.557 56.559 56.547 56.52 56.497 56.477 56.456 56.402 56.351 56.307 56.285 56.223 56.135 56.034 55.983 55.779 55.806 55.736 55.657 55.487 55.396 55.281 55.124 54.941 54.718 54.413 53.585 -9 ,31832 ,KEBNE ,16653040,Mon Nov 22 01:46:30 CET,Mon Nov 22 03:10:33 CET,0.0 1.336 1.801 2.109 2.393 2.666 2.918 3.139 3.547 3.732 3.901 4.022 4.391 4.556 4.88 5.176 5.453 5.596 5.884 6.159 6.543 6.786 7.028 7.38 7.719 8.052 8.385 8.72 9.156 9.564 9.959 10.449 10.94 11.428 11.992 12.636 13.254 13.939 14.708 15.547 16.469 17.531 18.8 20.1 21.628 23.398 25.527 28.066 31.193 35.082 40.241 44.908 47.89 50.01 51.557 52.707 53.583 54.286 54.829 55.317 55.686 55.982 56.228 56.443 56.614 56.751 56.887 56.984 57.059 57.137 57.191 57.213 57.239 57.264 57.272 57.264 57.237 57.206 57.178 57.155 57.128 57.077 57.034 56.976 56.94 56.882 56.811 56.721 56.676 56.476 56.498 56.417 56.343 56.19 56.087 55.966 55.834 55.665 55.435 55.101 54.37 -10 ,5194 ,KEBNE ,16653041,Mon Nov 22 01:46:31 CET,Mon Nov 22 03:10:50 CET,0.0 1.035 1.486 1.88 2.196 2.475 2.73 2.958 3.374 3.569 3.758 3.904 4.272 4.43 4.748 5.046 5.345 5.488 5.759 6.017 6.391 6.63 6.866 7.224 7.582 7.937 8.278 8.611 9.027 9.437 9.845 10.336 10.823 11.295 11.849 12.489 13.102 13.784 14.554 15.392 16.301 17.363 18.622 19.916 21.484 23.273 25.424 27.999 31.168 35.06 40.184 44.911 47.975 50.14 51.689 52.848 53.717 54.413 54.95 55.444 55.813 56.09 56.318 56.508 56.682 56.834 56.969 57.057 57.116 57.174 57.214 57.233 57.255 57.281 57.292 57.294 57.283 57.253 57.212 57.183 57.14 57.059 57.011 56.963 56.941 56.897 56.83 56.738 56.694 56.486 56.498 56.427 56.349 56.153 56.043 55.917 55.761 55.565 55.297 54.945 53.757 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt deleted file mode 100644 index 28291fce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19187 ,KEBNE ,17019390,Wed Dec 22 02:36:18 CET,Wed Dec 22 04:02:42 CET,0.0 0.998 1.498 1.904 2.232 2.529 2.826 3.113 3.616 3.845 4.068 4.28 4.724 4.936 5.348 5.734 6.109 6.293 6.647 6.989 7.493 7.828 8.141 8.602 9.068 9.534 9.994 10.444 11.021 11.58 12.142 12.789 13.408 14.053 14.838 15.746 16.623 17.599 18.668 19.81 21.002 22.337 23.93 25.678 27.813 30.175 33.021 36.368 40.443 45.645 52.596 58.81 62.737 65.44 67.346 68.768 69.788 70.549 71.08 71.501 71.819 72.018 72.144 72.253 72.318 72.372 72.381 72.356 72.317 72.248 72.155 72.063 71.955 71.831 71.714 71.578 71.429 71.244 71.06 70.934 70.788 70.558 70.371 70.147 70.024 69.782 69.535 69.257 69.101 68.771 68.541 68.354 68.127 67.525 67.171 66.777 66.322 65.719 64.897 63.736 56.523 -2 ,11406 ,KEBNE ,17019391,Wed Dec 22 02:37:24 CET,Wed Dec 22 03:57:36 CET,0.0 0.871 1.342 1.741 2.078 2.379 2.661 2.928 3.427 3.665 3.89 4.079 4.514 4.715 5.099 5.483 5.857 6.038 6.391 6.736 7.232 7.559 7.887 8.366 8.835 9.296 9.749 10.19 10.772 11.345 11.9 12.599 13.286 13.94 14.703 15.582 16.452 17.429 18.499 19.624 20.777 22.096 23.702 25.449 27.578 29.961 32.788 36.099 40.155 45.282 52.114 58.292 62.233 64.955 66.871 68.192 69.114 69.842 70.394 70.868 71.208 71.432 71.589 71.698 71.762 71.809 71.869 71.871 71.827 71.783 71.725 71.656 71.572 71.445 71.33 71.208 71.084 70.953 70.798 70.686 70.552 70.31 70.155 69.989 69.904 69.68 69.375 69.056 68.888 68.563 68.286 68.04 67.784 67.213 66.887 66.51 66.058 65.54 64.913 63.948 59.446 -3 ,13878 ,KEBNE ,17019392,Wed Dec 22 02:37:20 CET,Wed Dec 22 04:01:44 CET,0.0 1.1 1.635 2.029 2.366 2.668 2.943 3.214 3.719 3.949 4.179 4.413 4.855 5.063 5.457 5.853 6.237 6.42 6.779 7.13 7.638 7.971 8.302 8.772 9.226 9.677 10.111 10.538 11.113 11.686 12.245 12.919 13.589 14.232 14.993 15.889 16.767 17.754 18.847 20.034 21.323 22.822 24.541 26.26 28.337 30.703 33.502 36.804 40.844 45.888 52.68 58.92 62.883 65.61 67.554 68.987 70.012 70.774 71.294 71.753 72.08 72.321 72.526 72.694 72.849 72.951 73.001 73.031 73.036 73.007 72.973 72.928 72.837 72.685 72.555 72.448 72.32 72.174 72.02 71.914 71.807 71.618 71.468 71.295 71.201 71.017 70.827 70.583 70.427 70.11 69.916 69.732 69.523 69.044 68.756 68.425 68.003 67.5 66.895 65.956 60.19 -4 ,29909 ,KEBNE ,17019393,Wed Dec 22 02:37:20 CET,Wed Dec 22 04:01:56 CET,0.0 0.969 1.454 1.847 2.179 2.466 2.725 2.982 3.464 3.693 3.926 4.149 4.584 4.79 5.207 5.607 5.985 6.171 6.536 6.895 7.416 7.745 8.071 8.565 9.025 9.466 9.916 10.356 10.924 11.479 12.001 12.653 13.332 13.99 14.767 15.675 16.514 17.456 18.522 19.657 20.846 22.166 23.879 25.657 27.677 30.047 32.883 36.208 40.342 45.706 52.752 58.963 62.941 65.64 67.499 68.874 69.898 70.71 71.297 71.752 72.093 72.357 72.55 72.675 72.755 72.847 72.92 72.93 72.917 72.89 72.836 72.748 72.628 72.488 72.364 72.241 72.112 71.97 71.829 71.717 71.595 71.415 71.268 71.097 71.005 70.804 70.547 70.256 70.093 69.751 69.451 69.215 68.963 68.4 68.061 67.678 67.232 66.672 65.946 64.846 59.941 -5 ,31561 ,KEBNE ,17019394,Wed Dec 22 02:38:22 CET,Wed Dec 22 04:03:00 CET,0.0 0.95 1.41 1.783 2.107 2.401 2.69 2.961 3.464 3.707 3.942 4.162 4.609 4.822 5.224 5.604 5.963 6.142 6.506 6.866 7.396 7.735 8.062 8.525 8.969 9.417 9.863 10.303 10.886 11.445 11.977 12.614 13.269 13.928 14.684 15.555 16.434 17.436 18.492 19.635 20.916 22.409 24.186 25.945 27.97 30.316 33.156 36.502 40.594 45.715 52.416 58.587 62.551 65.297 67.211 68.615 69.637 70.393 70.953 71.457 71.848 72.116 72.327 72.49 72.558 72.577 72.577 72.532 72.469 72.379 72.273 72.197 72.113 72.031 71.963 71.862 71.751 71.621 71.477 71.386 71.282 71.063 70.873 70.67 70.562 70.294 70.018 69.758 69.604 69.311 69.122 68.929 68.72 68.146 67.831 67.468 67.005 66.518 65.79 64.562 60.391 -6 ,31698 ,KEBNE ,17019395,Wed Dec 22 02:38:22 CET,Wed Dec 22 04:02:41 CET,0.0 1.14 1.622 2.029 2.386 2.701 2.977 3.244 3.748 3.981 4.201 4.396 4.836 5.043 5.436 5.824 6.212 6.401 6.76 7.112 7.623 7.949 8.279 8.771 9.247 9.714 10.169 10.617 11.2 11.779 12.35 13.039 13.72 14.39 15.185 16.109 16.985 17.95 19.033 20.217 21.49 22.97 24.731 26.506 28.61 31.062 33.963 37.285 41.433 46.597 53.33 59.543 63.559 66.335 68.25 69.619 70.659 71.479 72.097 72.599 72.955 73.247 73.491 73.666 73.786 73.874 73.904 73.9 73.878 73.835 73.766 73.683 73.58 73.433 73.312 73.184 73.065 72.926 72.704 72.54 72.378 72.135 71.948 71.713 71.585 71.324 71.026 70.687 70.491 70.133 69.886 69.656 69.366 68.701 68.351 67.976 67.538 66.97 66.215 65.162 59.656 -7 ,22089 ,KEBNE ,17019396,Wed Dec 22 02:38:22 CET,Wed Dec 22 04:02:50 CET,0.0 1.38 1.875 2.265 2.601 2.903 3.186 3.451 3.933 4.163 4.392 4.616 5.057 5.264 5.674 6.066 6.434 6.615 6.98 7.337 7.851 8.187 8.506 8.973 9.453 9.918 10.368 10.816 11.402 11.98 12.545 13.231 13.901 14.562 15.347 16.246 17.113 18.035 19.062 20.244 21.532 22.963 24.639 26.371 28.434 30.831 33.625 36.958 41.101 46.286 53.163 59.375 63.329 66.06 68.001 69.47 70.562 71.368 71.925 72.395 72.727 72.974 73.173 73.292 73.391 73.478 73.515 73.523 73.504 73.457 73.379 73.277 73.151 73.004 72.872 72.729 72.598 72.461 72.287 72.161 72.003 71.71 71.503 71.282 71.178 70.967 70.684 70.389 70.241 69.93 69.715 69.512 69.268 68.629 68.306 67.947 67.483 66.88 66.145 65.11 60.312 -8 ,24870 ,KEBNE ,17019397,Wed Dec 22 02:38:22 CET,Wed Dec 22 04:02:53 CET,0.0 1.08 1.579 1.986 2.323 2.634 2.927 3.192 3.698 3.945 4.187 4.405 4.842 5.053 5.458 5.842 6.214 6.398 6.752 7.097 7.608 7.941 8.275 8.755 9.215 9.678 10.138 10.587 11.161 11.725 12.285 12.977 13.658 14.322 15.105 16.005 16.88 17.872 18.971 20.138 21.403 22.808 24.462 26.221 28.299 30.625 33.413 36.758 40.916 46.13 52.888 58.981 62.84 65.548 67.489 68.904 69.913 70.657 71.157 71.537 71.843 72.121 72.332 72.463 72.538 72.574 72.591 72.576 72.522 72.452 72.359 72.252 72.124 71.973 71.846 71.71 71.56 71.391 71.194 71.045 70.881 70.604 70.384 70.14 70.029 69.82 69.574 69.296 69.151 68.84 68.572 68.343 68.108 67.574 67.294 66.973 66.55 66.004 65.251 64.191 58.232 -9 ,27619 ,KEBNE ,17019398,Wed Dec 22 02:38:22 CET,Wed Dec 22 04:02:58 CET,0.0 1.207 1.666 2.048 2.383 2.696 3.0 3.284 3.788 4.017 4.244 4.454 4.889 5.099 5.51 5.913 6.304 6.489 6.845 7.193 7.706 8.043 8.369 8.844 9.321 9.791 10.237 10.678 11.268 11.811 12.329 13.001 13.679 14.344 15.128 16.009 16.827 17.759 18.826 19.944 21.114 22.466 24.081 25.752 27.762 30.065 32.854 36.194 40.294 45.451 52.123 58.17 61.981 64.634 66.53 67.9 68.943 69.778 70.383 70.888 71.237 71.478 71.682 71.839 71.932 71.963 71.957 71.898 71.832 71.755 71.638 71.534 71.419 71.298 71.192 71.054 70.909 70.731 70.519 70.366 70.21 69.945 69.765 69.591 69.485 69.255 68.997 68.72 68.572 68.253 67.969 67.731 67.468 66.841 66.491 66.11 65.617 64.913 64.066 63.041 57.978 -10 ,32450 ,KEBNE ,17019399,Wed Dec 22 02:38:22 CET,Wed Dec 22 04:02:59 CET,0.0 1.067 1.544 1.907 2.24 2.543 2.826 3.102 3.597 3.825 4.042 4.241 4.677 4.877 5.271 5.663 6.037 6.217 6.57 6.91 7.399 7.722 8.045 8.52 9.004 9.481 9.94 10.372 10.935 11.511 12.069 12.761 13.438 14.096 14.884 15.77 16.618 17.513 18.497 19.611 20.776 22.119 23.849 25.706 27.924 30.36 33.179 36.528 40.602 45.741 52.491 58.529 62.42 65.139 67.018 68.383 69.46 70.284 70.812 71.229 71.517 71.73 71.906 72.02 72.083 72.127 72.144 72.117 72.075 72.016 71.908 71.778 71.635 71.508 71.417 71.307 71.197 71.078 70.936 70.826 70.687 70.464 70.299 70.116 70.029 69.835 69.595 69.317 69.173 68.885 68.67 68.444 68.216 67.668 67.322 66.955 66.523 65.957 65.175 63.947 57.323 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt deleted file mode 100644 index cb7fef43..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31017 ,KEBNE ,17019400,Wed Dec 22 02:38:22 CET,Wed Dec 22 04:04:07 CET,0.0 0.889 1.282 1.601 1.843 2.065 2.268 2.445 2.778 2.914 3.046 3.08 3.434 3.556 3.769 3.954 4.128 4.211 4.38 4.547 4.774 4.925 5.072 5.265 5.448 5.622 5.816 6.002 6.202 6.405 6.621 6.869 7.088 7.294 7.516 7.755 8.0 8.268 8.528 8.79 9.044 9.311 9.626 9.931 10.246 10.549 10.822 11.026 11.141 11.02 10.304 8.937 7.481 6.079 4.861 3.664 2.524 1.484 0.575 -0.321 -1.057 -1.711 -2.33 -2.928 -3.497 -4.03 -4.594 -5.079 -5.5 -5.948 -6.419 -6.814 -7.236 -7.693 -8.035 -8.38 -8.747 -9.143 -9.548 -9.822 -10.114 -10.573 -10.908 -11.247 -11.419 -11.791 -12.191 -12.618 -12.841 -13.324 -13.577 -13.844 -14.14 -14.794 -15.14 -15.531 -15.966 -16.479 -17.146 -18.035 -21.444 -2 ,13741 ,KEBNE ,17019401,Wed Dec 22 02:38:22 CET,Wed Dec 22 04:03:54 CET,0.0 1.077 1.453 1.707 1.937 2.148 2.343 2.515 2.82 2.952 3.075 3.104 3.463 3.572 3.771 3.972 4.139 4.221 4.399 4.567 4.805 4.963 5.125 5.343 5.552 5.75 5.93 6.109 6.332 6.537 6.731 6.973 7.189 7.39 7.639 7.895 8.117 8.377 8.645 8.921 9.208 9.504 9.829 10.133 10.453 10.741 10.993 11.149 11.16 10.874 10.061 8.689 7.145 5.731 4.497 3.359 2.311 1.304 0.366 -0.561 -1.332 -2.041 -2.695 -3.311 -3.891 -4.415 -4.96 -5.442 -5.866 -6.323 -6.801 -7.201 -7.623 -8.059 -8.402 -8.743 -9.106 -9.512 -9.92 -10.187 -10.467 -10.933 -11.264 -11.597 -11.772 -12.152 -12.564 -13.0 -13.213 -13.692 -13.962 -14.219 -14.488 -15.103 -15.454 -15.806 -16.235 -16.738 -17.309 -18.134 -21.484 -3 ,7528 ,KEBNE ,17019402,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:05:23 CET,0.0 1.246 1.665 1.998 2.228 2.422 2.602 2.779 3.128 3.289 3.428 3.449 3.793 3.914 4.15 4.362 4.563 4.662 4.856 5.034 5.273 5.416 5.548 5.753 5.951 6.139 6.324 6.491 6.695 6.887 7.076 7.304 7.504 7.697 7.942 8.204 8.433 8.695 8.964 9.228 9.503 9.787 10.073 10.352 10.672 10.992 11.273 11.505 11.609 11.409 10.531 9.009 7.598 6.232 4.945 3.698 2.547 1.521 0.668 -0.201 -0.964 -1.671 -2.352 -2.984 -3.569 -4.1 -4.687 -5.227 -5.696 -6.177 -6.66 -7.054 -7.444 -7.85 -8.191 -8.558 -8.929 -9.305 -9.702 -9.987 -10.298 -10.766 -11.086 -11.421 -11.593 -11.955 -12.342 -12.767 -13.003 -13.495 -13.778 -14.041 -14.307 -14.908 -15.267 -15.671 -16.108 -16.648 -17.318 -18.21 -21.447 -4 ,483 ,KEBNE ,17019403,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:05:20 CET,0.0 0.925 1.345 1.698 1.972 2.199 2.414 2.596 2.921 3.058 3.196 3.236 3.574 3.688 3.899 4.098 4.308 4.404 4.57 4.748 5.0 5.141 5.279 5.495 5.702 5.897 6.083 6.25 6.467 6.672 6.86 7.09 7.305 7.511 7.745 7.984 8.237 8.513 8.773 9.05 9.323 9.579 9.883 10.19 10.53 10.866 11.158 11.383 11.455 11.256 10.428 8.846 7.248 5.803 4.471 3.242 2.184 1.233 0.357 -0.544 -1.285 -1.942 -2.602 -3.251 -3.847 -4.387 -4.951 -5.455 -5.902 -6.373 -6.858 -7.264 -7.687 -8.124 -8.469 -8.83 -9.207 -9.609 -10.015 -10.306 -10.628 -11.124 -11.446 -11.775 -11.951 -12.332 -12.75 -13.173 -13.392 -13.869 -14.151 -14.426 -14.699 -15.353 -15.736 -16.148 -16.628 -17.249 -17.965 -18.954 -22.563 -5 ,4538 ,KEBNE ,17019404,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:05:26 CET,0.0 1.446 1.941 2.212 2.424 2.642 2.848 3.038 3.373 3.523 3.659 3.667 4.006 4.115 4.314 4.498 4.679 4.773 4.948 5.1 5.316 5.458 5.586 5.762 5.946 6.122 6.294 6.464 6.672 6.882 7.089 7.312 7.508 7.714 7.951 8.198 8.428 8.68 8.957 9.241 9.538 9.842 10.161 10.443 10.71 10.988 11.264 11.469 11.562 11.407 10.559 8.985 7.478 6.119 4.849 3.595 2.469 1.503 0.641 -0.252 -1.044 -1.732 -2.373 -3.009 -3.618 -4.165 -4.704 -5.204 -5.652 -6.109 -6.593 -6.991 -7.403 -7.847 -8.201 -8.572 -8.951 -9.337 -9.738 -10.029 -10.336 -10.8 -11.132 -11.482 -11.652 -12.008 -12.395 -12.821 -13.059 -13.55 -13.801 -14.061 -14.364 -14.995 -15.327 -15.699 -16.135 -16.653 -17.304 -18.154 -20.498 -6 ,29122 ,KEBNE ,17019405,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:05:12 CET,0.0 1.165 1.563 1.858 2.093 2.353 2.588 2.755 3.055 3.203 3.348 3.402 3.757 3.871 4.081 4.292 4.487 4.574 4.729 4.87 5.089 5.235 5.369 5.559 5.759 5.962 6.159 6.325 6.52 6.713 6.904 7.136 7.343 7.551 7.798 8.067 8.298 8.529 8.787 9.054 9.323 9.61 9.925 10.239 10.559 10.854 11.132 11.37 11.434 11.131 10.197 8.728 7.283 5.936 4.686 3.497 2.452 1.51 0.677 -0.193 -0.911 -1.562 -2.239 -2.861 -3.441 -3.987 -4.562 -5.061 -5.491 -5.964 -6.456 -6.858 -7.263 -7.696 -8.051 -8.401 -8.767 -9.163 -9.574 -9.853 -10.149 -10.619 -10.933 -11.246 -11.415 -11.786 -12.193 -12.63 -12.848 -13.305 -13.522 -13.762 -14.027 -14.655 -15.016 -15.417 -15.874 -16.388 -16.983 -17.829 -20.619 -7 ,18861 ,KEBNE ,17019406,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:05:12 CET,0.0 1.043 1.456 1.723 1.933 2.129 2.327 2.498 2.789 2.947 3.106 3.162 3.514 3.631 3.854 4.045 4.21 4.294 4.465 4.629 4.861 5.008 5.157 5.382 5.586 5.78 5.963 6.138 6.365 6.587 6.809 7.086 7.329 7.533 7.758 7.992 8.215 8.466 8.714 8.961 9.228 9.54 9.896 10.212 10.542 10.858 11.144 11.348 11.4 11.159 10.327 8.856 7.298 5.862 4.598 3.441 2.359 1.404 0.586 -0.318 -1.119 -1.819 -2.486 -3.089 -3.652 -4.189 -4.763 -5.292 -5.754 -6.243 -6.754 -7.195 -7.641 -8.066 -8.401 -8.758 -9.092 -9.432 -9.826 -10.095 -10.37 -10.846 -11.177 -11.514 -11.687 -12.041 -12.435 -12.851 -13.07 -13.535 -13.751 -14.022 -14.328 -15.002 -15.391 -15.786 -16.218 -16.761 -17.464 -18.358 -21.687 -8 ,13229 ,KEBNE ,17019407,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:06:51 CET,0.0 1.111 1.477 1.752 1.994 2.232 2.432 2.628 2.982 3.127 3.259 3.318 3.685 3.807 4.021 4.212 4.385 4.477 4.669 4.845 5.108 5.256 5.388 5.6 5.8 5.983 6.161 6.346 6.578 6.782 6.982 7.223 7.449 7.661 7.901 8.177 8.427 8.696 8.983 9.269 9.562 9.887 10.266 10.626 10.988 11.309 11.64 11.924 11.966 11.743 10.983 9.538 8.101 6.695 5.445 4.324 3.316 2.393 1.572 0.727 -0.021 -0.689 -1.315 -1.88 -2.418 -2.935 -3.474 -3.961 -4.374 -4.795 -5.229 -5.603 -6.013 -6.43 -6.751 -7.085 -7.417 -7.757 -8.11 -8.372 -8.649 -9.052 -9.328 -9.637 -9.8 -10.119 -10.47 -10.857 -11.048 -11.497 -11.755 -12.016 -12.285 -12.89 -13.23 -13.594 -13.972 -14.436 -14.992 -15.679 -18.977 -9 ,23898 ,KEBNE ,17019408,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:05:27 CET,0.0 0.922 1.274 1.571 1.826 2.026 2.211 2.38 2.685 2.825 2.953 2.957 3.296 3.404 3.61 3.808 3.989 4.078 4.254 4.438 4.686 4.825 4.967 5.184 5.383 5.572 5.745 5.906 6.114 6.303 6.48 6.704 6.941 7.154 7.366 7.613 7.855 8.12 8.416 8.692 8.929 9.211 9.541 9.857 10.201 10.516 10.812 11.028 11.095 10.906 10.056 8.485 7.015 5.711 4.488 3.323 2.274 1.278 0.4 -0.451 -1.205 -1.899 -2.551 -3.172 -3.738 -4.264 -4.835 -5.344 -5.784 -6.239 -6.714 -7.095 -7.492 -7.912 -8.248 -8.607 -8.98 -9.357 -9.747 -10.036 -10.33 -10.767 -11.068 -11.374 -11.544 -11.924 -12.303 -12.697 -12.929 -13.425 -13.672 -13.922 -14.21 -14.833 -15.166 -15.514 -15.897 -16.355 -16.885 -17.628 -20.256 -10 ,26211 ,KEBNE ,17019409,Wed Dec 22 02:39:27 CET,Wed Dec 22 04:04:27 CET,0.0 1.171 1.561 1.865 2.113 2.324 2.518 2.68 2.96 3.093 3.226 3.259 3.597 3.705 3.916 4.103 4.289 4.388 4.571 4.735 4.969 5.13 5.284 5.502 5.711 5.906 6.086 6.254 6.472 6.662 6.846 7.076 7.296 7.517 7.758 8.011 8.252 8.505 8.761 9.035 9.32 9.63 9.968 10.272 10.592 10.908 11.187 11.357 11.374 11.142 10.255 8.658 7.118 5.64 4.315 3.174 2.169 1.216 0.393 -0.482 -1.3 -1.964 -2.559 -3.176 -3.765 -4.317 -4.869 -5.36 -5.82 -6.28 -6.765 -7.181 -7.612 -8.069 -8.412 -8.755 -9.12 -9.504 -9.898 -10.185 -10.489 -10.936 -11.24 -11.58 -11.76 -12.138 -12.546 -12.959 -13.168 -13.637 -13.94 -14.23 -14.519 -15.15 -15.5 -15.914 -16.375 -16.866 -17.481 -18.324 -21.712 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt deleted file mode 100644 index a843a5f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,300 ,KEBNE ,16653062,Mon Nov 22 01:50:42 CET,Mon Nov 22 03:11:46 CET,0.0 1.657 2.023 2.299 2.551 2.764 2.954 3.119 3.398 3.537 3.68 3.772 4.074 4.195 4.434 4.68 4.902 5.012 5.231 5.434 5.716 5.9 6.073 6.322 6.566 6.805 7.038 7.263 7.565 7.847 8.114 8.432 8.73 9.019 9.36 9.761 10.144 10.572 11.05 11.564 12.086 12.661 13.32 13.99 14.817 15.773 16.827 17.927 19.235 20.841 22.813 24.357 25.135 25.574 25.814 25.939 25.982 25.954 25.902 25.821 25.723 25.616 25.501 25.387 25.283 25.189 25.094 25.007 24.907 24.778 24.642 24.536 24.43 24.313 24.221 24.124 24.009 23.897 23.778 23.687 23.579 23.397 23.282 23.175 23.121 23.006 22.878 22.732 22.655 22.411 22.368 22.258 22.138 21.896 21.774 21.665 21.544 21.391 21.193 20.874 19.842 -2 ,19163 ,KEBNE ,16653063,Mon Nov 22 01:51:39 CET,Mon Nov 22 03:15:12 CET,0.0 1.447 1.827 2.11 2.348 2.566 2.755 2.909 3.201 3.342 3.484 3.587 3.884 4.002 4.229 4.448 4.665 4.769 4.973 5.176 5.469 5.659 5.839 6.091 6.337 6.568 6.787 7.012 7.308 7.583 7.85 8.185 8.498 8.797 9.161 9.561 9.943 10.385 10.858 11.357 11.889 12.479 13.173 13.885 14.721 15.664 16.746 17.914 19.243 20.87 22.899 24.482 25.364 25.88 26.135 26.222 26.226 26.209 26.177 26.096 25.995 25.895 25.78 25.652 25.523 25.406 25.281 25.168 25.073 24.963 24.841 24.727 24.608 24.495 24.408 24.319 24.212 24.09 23.968 23.888 23.8 23.643 23.529 23.412 23.354 23.227 23.071 22.888 22.796 22.562 22.548 22.461 22.378 22.182 22.069 21.928 21.734 21.482 21.193 20.876 20.271 -4 ,4160 ,KEBNE ,16653065,Mon Nov 22 01:52:41 CET,Mon Nov 22 03:16:21 CET,0.0 1.337 1.678 1.984 2.241 2.454 2.649 2.828 3.15 3.312 3.462 3.547 3.85 3.986 4.238 4.472 4.702 4.805 4.997 5.183 5.433 5.595 5.767 6.032 6.276 6.51 6.748 6.975 7.265 7.546 7.823 8.164 8.485 8.78 9.131 9.527 9.902 10.321 10.777 11.252 11.762 12.364 13.06 13.765 14.59 15.552 16.655 17.82 19.215 20.884 22.752 24.108 24.764 25.091 25.227 25.275 25.33 25.314 25.243 25.159 25.051 24.914 24.743 24.57 24.4 24.242 24.073 23.918 23.775 23.62 23.469 23.358 23.244 23.128 23.035 22.919 22.798 22.675 22.546 22.461 22.371 22.221 22.123 22.035 21.991 21.891 21.782 21.662 21.591 21.354 21.338 21.248 21.163 20.979 20.872 20.754 20.628 20.459 20.231 19.941 18.942 -5 ,17230 ,KEBNE ,16653066,Mon Nov 22 01:52:45 CET,Mon Nov 22 03:14:08 CET,0.0 1.414 1.757 2.026 2.255 2.488 2.675 2.857 3.253 3.412 3.54 3.611 3.902 4.018 4.254 4.471 4.679 4.783 4.968 5.146 5.413 5.58 5.743 5.973 6.198 6.418 6.638 6.853 7.149 7.442 7.719 8.058 8.388 8.704 9.053 9.442 9.82 10.255 10.735 11.228 11.752 12.366 13.078 13.752 14.524 15.373 16.394 17.638 19.029 20.588 22.366 23.618 24.197 24.483 24.595 24.596 24.547 24.471 24.392 24.279 24.192 24.124 24.025 23.929 23.83 23.716 23.595 23.484 23.369 23.248 23.128 23.025 22.906 22.781 22.687 22.579 22.466 22.356 22.242 22.153 22.04 21.872 21.747 21.606 21.54 21.402 21.26 21.114 21.044 20.818 20.789 20.681 20.581 20.394 20.291 20.151 19.972 19.785 19.546 19.251 18.54 -6 ,13424 ,KEBNE ,16653067,Mon Nov 22 01:52:41 CET,Mon Nov 22 03:15:57 CET,0.0 1.166 1.61 1.914 2.172 2.398 2.603 2.785 3.148 3.323 3.485 3.607 3.912 4.042 4.268 4.476 4.689 4.797 5.002 5.195 5.482 5.656 5.822 6.073 6.32 6.558 6.792 7.02 7.311 7.592 7.888 8.258 8.585 8.891 9.262 9.667 10.045 10.474 10.927 11.402 11.91 12.492 13.182 13.881 14.693 15.581 16.591 17.758 19.126 20.697 22.531 24.006 24.81 25.197 25.39 25.517 25.578 25.567 25.517 25.441 25.346 25.265 25.185 25.063 24.934 24.824 24.707 24.599 24.481 24.329 24.163 24.027 23.872 23.708 23.592 23.487 23.391 23.292 23.192 23.112 23.023 22.881 22.783 22.685 22.634 22.534 22.441 22.336 22.272 22.047 22.031 21.944 21.861 21.67 21.564 21.441 21.29 21.109 20.882 20.574 19.601 -8 ,23772 ,KEBNE ,16653069,Mon Nov 22 01:53:43 CET,Mon Nov 22 03:18:42 CET,0.0 2.188 2.603 2.932 3.202 3.429 3.633 3.842 4.215 4.376 4.521 4.614 4.932 5.074 5.31 5.536 5.748 5.856 6.084 6.306 6.618 6.802 6.986 7.259 7.51 7.745 7.973 8.197 8.493 8.787 9.07 9.388 9.697 10.005 10.371 10.795 11.189 11.609 12.06 12.564 13.112 13.725 14.454 15.16 15.971 16.887 17.906 19.073 20.454 22.1 24.074 25.604 26.409 26.825 27.041 27.146 27.147 27.105 27.057 26.996 26.925 26.851 26.76 26.66 26.566 26.477 26.375 26.267 26.165 26.06 25.931 25.818 25.71 25.592 25.493 25.384 25.275 25.146 24.987 24.879 24.778 24.626 24.525 24.421 24.36 24.215 24.039 23.841 23.736 23.488 23.46 23.362 23.265 23.056 22.937 22.824 22.708 22.569 22.387 22.138 21.009 -9 ,21686 ,KEBNE ,16653070,Mon Nov 22 01:53:43 CET,Mon Nov 22 03:17:00 CET,0.0 1.263 1.592 1.865 2.103 2.3 2.498 2.688 2.997 3.141 3.289 3.399 3.71 3.836 4.067 4.274 4.478 4.579 4.759 4.937 5.212 5.394 5.571 5.842 6.11 6.376 6.629 6.86 7.15 7.418 7.68 7.993 8.302 8.617 8.972 9.363 9.76 10.188 10.648 11.138 11.654 12.241 12.926 13.621 14.431 15.346 16.388 17.582 18.965 20.539 22.357 23.825 24.682 25.176 25.447 25.549 25.565 25.54 25.49 25.426 25.336 25.219 25.117 25.023 24.917 24.83 24.735 24.638 24.543 24.437 24.322 24.208 24.082 23.956 23.864 23.76 23.645 23.528 23.41 23.326 23.242 23.115 23.003 22.871 22.803 22.672 22.533 22.387 22.32 22.093 22.105 22.031 21.947 21.77 21.67 21.543 21.373 21.159 20.924 20.663 19.468 -10 ,19174 ,KEBNE ,16653071,Mon Nov 22 01:53:43 CET,Mon Nov 22 03:17:14 CET,0.0 1.221 1.599 1.881 2.152 2.418 2.635 2.805 3.102 3.263 3.408 3.496 3.809 3.946 4.198 4.422 4.639 4.749 4.968 5.179 5.499 5.7 5.872 6.123 6.374 6.613 6.839 7.068 7.362 7.637 7.908 8.243 8.559 8.857 9.201 9.585 9.974 10.419 10.898 11.397 11.913 12.503 13.188 13.861 14.668 15.566 16.561 17.693 19.039 20.658 22.511 23.96 24.744 25.112 25.298 25.393 25.415 25.374 25.313 25.233 25.142 25.041 24.92 24.784 24.669 24.569 24.438 24.305 24.184 24.056 23.928 23.824 23.711 23.598 23.507 23.412 23.316 23.207 23.086 23.002 22.909 22.757 22.657 22.553 22.497 22.365 22.214 22.07 21.994 21.757 21.73 21.624 21.505 21.275 21.128 20.955 20.791 20.595 20.324 19.991 18.92 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 4acd9534..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3731 ,KEBNE ,17019410,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:00:06 CET,0.0 0.574 0.775 0.945 1.106 1.265 1.404 1.534 1.79 1.912 2.043 2.092 2.42 2.53 2.741 2.951 3.155 3.258 3.466 3.67 3.959 4.146 4.332 4.601 4.862 5.123 5.383 5.636 5.961 6.28 6.603 7.002 7.392 7.776 8.219 8.728 9.24 9.813 10.452 11.135 11.849 12.701 13.727 14.78 16.035 17.474 19.222 21.225 23.674 26.793 30.856 34.461 36.735 38.227 39.188 39.909 40.466 40.882 41.182 41.439 41.63 41.761 41.851 41.916 41.95 41.978 41.976 41.959 41.95 41.913 41.855 41.809 41.749 41.672 41.62 41.552 41.458 41.363 41.264 41.186 41.092 40.914 40.79 40.683 40.623 40.472 40.324 40.181 40.096 39.824 39.72 39.573 39.435 39.134 38.956 38.753 38.527 38.258 37.871 37.352 33.161 -2 ,13170 ,KEBNE ,17019411,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:00:10 CET,0.0 0.346 0.543 0.722 0.882 1.034 1.176 1.31 1.566 1.688 1.809 1.829 2.159 2.273 2.496 2.703 2.904 3.004 3.206 3.404 3.683 3.86 4.038 4.304 4.569 4.849 5.13 5.399 5.755 6.109 6.453 6.868 7.273 7.679 8.154 8.691 9.224 9.836 10.511 11.246 12.035 12.945 14.057 15.196 16.592 18.228 20.156 22.442 25.26 28.74 33.28 37.312 39.817 41.508 42.645 43.464 44.036 44.445 44.719 44.97 45.171 45.306 45.418 45.499 45.537 45.552 45.551 45.536 45.498 45.455 45.41 45.358 45.295 45.206 45.124 45.049 44.967 44.871 44.778 44.7 44.61 44.485 44.384 44.248 44.181 44.047 43.884 43.698 43.595 43.32 43.271 43.172 43.057 42.76 42.564 42.353 42.106 41.784 41.395 40.871 38.514 -3 ,24882 ,KEBNE ,17019412,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:00:17 CET,0.0 0.42 0.613 0.785 0.942 1.086 1.222 1.357 1.61 1.727 1.843 1.861 2.192 2.303 2.522 2.728 2.936 3.04 3.24 3.43 3.708 3.895 4.081 4.357 4.626 4.884 5.133 5.378 5.713 6.054 6.384 6.793 7.2 7.604 8.091 8.639 9.162 9.77 10.455 11.195 11.994 12.904 13.974 15.088 16.432 17.972 19.846 22.112 24.915 28.307 32.691 36.62 39.025 40.636 41.705 42.49 43.035 43.436 43.737 43.988 44.155 44.273 44.383 44.453 44.484 44.487 44.467 44.443 44.429 44.42 44.403 44.364 44.308 44.238 44.162 44.081 44.009 43.917 43.799 43.712 43.615 43.472 43.377 43.268 43.207 43.074 42.933 42.784 42.697 42.439 42.414 42.307 42.179 41.84 41.64 41.424 41.202 40.932 40.547 40.01 37.914 -4 ,26363 ,KEBNE ,17019413,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:00:10 CET,0.0 0.338 0.526 0.701 0.868 1.026 1.166 1.292 1.536 1.656 1.77 1.762 2.093 2.203 2.418 2.63 2.831 2.931 3.129 3.321 3.607 3.789 3.97 4.248 4.52 4.787 5.052 5.309 5.641 5.965 6.29 6.698 7.098 7.496 7.978 8.529 9.069 9.688 10.364 11.097 11.878 12.779 13.882 15.029 16.401 18.012 19.93 22.16 24.923 28.38 32.871 36.758 39.054 40.578 41.615 42.398 42.997 43.448 43.775 44.026 44.191 44.322 44.419 44.467 44.489 44.505 44.526 44.526 44.505 44.483 44.448 44.404 44.345 44.268 44.202 44.132 44.058 43.963 43.859 43.787 43.694 43.532 43.42 43.313 43.252 43.1 42.932 42.755 42.656 42.383 42.311 42.191 42.06 41.765 41.578 41.363 41.108 40.822 40.492 40.005 37.674 -5 ,17287 ,KEBNE ,17019414,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 03:59:59 CET,0.0 0.611 0.885 1.083 1.247 1.394 1.527 1.655 1.9 2.017 2.133 2.154 2.484 2.595 2.8 2.995 3.181 3.274 3.461 3.643 3.91 4.082 4.251 4.5 4.74 4.984 5.23 5.467 5.778 6.097 6.415 6.802 7.176 7.547 7.981 8.477 8.979 9.55 10.199 10.903 11.646 12.496 13.507 14.549 15.8 17.247 18.955 20.948 23.36 26.365 30.335 33.855 36.071 37.582 38.665 39.424 39.943 40.352 40.654 40.921 41.116 41.239 41.329 41.399 41.435 41.439 41.432 41.416 41.389 41.36 41.326 41.282 41.21 41.132 41.071 41.002 40.929 40.831 40.718 40.638 40.552 40.415 40.324 40.222 40.161 40.027 39.858 39.663 39.553 39.283 39.247 39.124 38.978 38.651 38.456 38.241 37.969 37.628 37.206 36.641 34.303 -6 ,10516 ,KEBNE ,17019415,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:00:04 CET,0.0 0.389 0.584 0.753 0.908 1.05 1.184 1.314 1.558 1.677 1.797 1.824 2.154 2.264 2.468 2.664 2.863 2.964 3.159 3.347 3.626 3.808 3.988 4.26 4.523 4.795 5.074 5.34 5.689 6.04 6.39 6.822 7.242 7.641 8.111 8.671 9.218 9.812 10.477 11.225 12.022 12.952 14.065 15.202 16.598 18.199 20.054 22.212 24.907 28.261 32.571 36.497 39.018 40.639 41.691 42.463 43.032 43.439 43.732 43.991 44.165 44.302 44.401 44.469 44.509 44.52 44.497 44.464 44.443 44.414 44.369 44.315 44.243 44.16 44.098 44.012 43.921 43.836 43.73 43.661 43.591 43.43 43.303 43.19 43.134 43.001 42.842 42.678 42.598 42.349 42.327 42.215 42.072 41.752 41.555 41.33 41.075 40.755 40.367 39.769 37.016 -7 ,28698 ,KEBNE ,17019416,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:00:08 CET,0.0 0.375 0.58 0.755 0.919 1.073 1.205 1.328 1.57 1.683 1.795 1.801 2.12 2.226 2.432 2.627 2.812 2.904 3.092 3.268 3.521 3.688 3.861 4.126 4.383 4.633 4.878 5.121 5.445 5.754 6.045 6.416 6.792 7.173 7.624 8.123 8.613 9.174 9.816 10.504 11.221 12.076 13.128 14.18 15.404 16.844 18.609 20.67 23.171 26.317 30.412 34.006 36.279 37.835 38.909 39.677 40.238 40.676 40.985 41.236 41.423 41.542 41.614 41.68 41.734 41.754 41.75 41.742 41.725 41.683 41.625 41.565 41.475 41.385 41.327 41.258 41.175 41.061 40.931 40.847 40.761 40.617 40.502 40.373 40.307 40.172 40.021 39.851 39.759 39.505 39.464 39.352 39.237 38.954 38.779 38.587 38.354 38.086 37.718 37.115 34.632 -8 ,22437 ,KEBNE ,17019417,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:00:10 CET,0.0 0.306 0.511 0.689 0.842 0.98 1.11 1.241 1.489 1.606 1.721 1.727 2.056 2.165 2.381 2.588 2.787 2.887 3.085 3.279 3.562 3.749 3.931 4.207 4.483 4.745 5.005 5.275 5.637 5.986 6.334 6.755 7.164 7.572 8.058 8.619 9.167 9.775 10.441 11.165 11.905 12.74 13.753 14.781 16.015 17.436 19.141 21.163 23.621 26.632 30.497 33.992 36.197 37.67 38.708 39.49 40.046 40.459 40.772 41.029 41.205 41.333 41.438 41.511 41.546 41.558 41.555 41.525 41.482 41.45 41.41 41.357 41.292 41.223 41.17 41.1 41.017 40.925 40.823 40.746 40.656 40.491 40.368 40.255 40.199 40.074 39.937 39.76 39.663 39.407 39.348 39.232 39.104 38.804 38.646 38.436 38.176 37.902 37.513 36.91 34.375 -9 ,8589 ,KEBNE ,17019418,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:00:23 CET,0.0 0.561 0.775 0.939 1.096 1.24 1.377 1.511 1.755 1.877 1.997 2.009 2.332 2.441 2.641 2.83 3.018 3.111 3.297 3.482 3.753 3.93 4.116 4.402 4.674 4.943 5.209 5.463 5.797 6.127 6.443 6.836 7.218 7.593 8.039 8.545 9.044 9.6 10.204 10.878 11.626 12.483 13.535 14.609 15.847 17.274 19.01 21.033 23.493 26.625 30.61 34.099 36.389 37.926 38.978 39.76 40.31 40.716 41.006 41.251 41.42 41.531 41.637 41.719 41.759 41.783 41.777 41.76 41.738 41.707 41.666 41.617 41.557 41.482 41.41 41.326 41.238 41.147 41.036 40.963 40.884 40.737 40.637 40.532 40.474 40.348 40.215 40.036 39.931 39.685 39.671 39.554 39.426 39.119 38.937 38.709 38.435 38.127 37.731 37.118 34.444 -10 ,16191 ,KEBNE ,17019419,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:00:03 CET,0.0 0.41 0.644 0.833 1.002 1.164 1.323 1.469 1.725 1.843 1.959 1.977 2.298 2.409 2.622 2.829 3.028 3.128 3.332 3.529 3.808 4.0 4.196 4.483 4.762 5.035 5.301 5.555 5.89 6.224 6.559 6.952 7.334 7.723 8.183 8.72 9.253 9.855 10.505 11.186 11.913 12.791 13.847 14.911 16.188 17.646 19.471 21.596 24.002 27.009 30.991 34.498 36.698 38.183 39.232 40.026 40.602 41.009 41.296 41.535 41.705 41.824 41.918 41.987 42.028 42.05 42.049 42.029 41.997 41.95 41.881 41.822 41.751 41.661 41.588 41.502 41.413 41.308 41.189 41.116 41.039 40.91 40.808 40.686 40.614 40.463 40.314 40.157 40.055 39.772 39.705 39.597 39.481 39.139 38.933 38.697 38.424 38.088 37.672 37.061 34.356 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt deleted file mode 100644 index babf238d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10710 ,KEBNE ,16653082,Mon Nov 22 01:54:45 CET,Mon Nov 22 03:18:06 CET,0.0 1.249 1.747 2.154 2.479 2.751 3.01 3.251 3.675 3.865 4.055 4.192 4.573 4.735 5.047 5.34 5.619 5.754 6.027 6.293 6.672 6.919 7.169 7.536 7.878 8.208 8.53 8.837 9.228 9.62 9.997 10.448 10.895 11.33 11.824 12.366 12.906 13.536 14.213 14.9 15.635 16.494 17.483 18.509 19.75 21.133 22.724 24.426 26.41 28.816 31.656 33.977 35.304 36.09 36.597 36.926 37.101 37.206 37.247 37.25 37.237 37.174 37.063 36.933 36.795 36.659 36.525 36.399 36.28 36.144 35.989 35.865 35.743 35.603 35.482 35.357 35.222 35.082 34.945 34.854 34.757 34.593 34.47 34.345 34.281 34.148 34.018 33.878 33.799 33.532 33.536 33.449 33.361 33.152 33.023 32.88 32.726 32.522 32.256 31.943 31.119 -2 ,4653 ,KEBNE ,16653083,Mon Nov 22 01:54:47 CET,Mon Nov 22 03:14:25 CET,0.0 0.964 1.339 1.655 1.937 2.201 2.452 2.68 3.101 3.299 3.484 3.59 3.957 4.107 4.392 4.672 4.95 5.087 5.344 5.596 5.974 6.206 6.419 6.743 7.093 7.441 7.768 8.076 8.458 8.83 9.196 9.646 10.08 10.49 10.95 11.476 12.016 12.612 13.25 13.932 14.646 15.45 16.392 17.365 18.505 19.807 21.372 23.106 25.031 27.311 30.143 32.157 33.08 33.603 33.923 34.121 34.187 34.224 34.276 34.295 34.241 34.154 34.083 34.016 33.918 33.774 33.611 33.504 33.403 33.277 33.138 33.01 32.887 32.757 32.65 32.533 32.405 32.267 32.113 32.007 31.896 31.723 31.607 31.477 31.407 31.261 31.102 30.935 30.849 30.573 30.572 30.482 30.382 30.159 30.042 29.903 29.741 29.562 29.349 29.063 28.128 -3 ,19482 ,KEBNE ,16653084,Mon Nov 22 01:54:45 CET,Mon Nov 22 03:19:38 CET,0.0 0.755 1.172 1.526 1.844 2.119 2.367 2.603 3.043 3.251 3.447 3.596 3.979 4.148 4.483 4.79 5.071 5.205 5.472 5.732 6.103 6.344 6.587 6.942 7.278 7.594 7.909 8.233 8.668 9.081 9.463 9.908 10.332 10.747 11.235 11.784 12.337 12.968 13.651 14.382 15.135 15.985 17.003 18.047 19.279 20.666 22.174 23.757 25.63 27.866 30.583 32.779 34.066 34.888 35.393 35.737 35.98 36.131 36.198 36.191 36.137 36.048 35.943 35.873 35.817 35.713 35.574 35.449 35.326 35.192 35.05 34.926 34.788 34.648 34.543 34.425 34.308 34.184 34.045 33.946 33.841 33.672 33.556 33.436 33.371 33.223 33.061 32.894 32.8 32.514 32.492 32.387 32.28 32.062 31.946 31.809 31.64 31.458 31.248 30.952 29.562 -4 ,3014 ,KEBNE ,16653085,Mon Nov 22 01:54:45 CET,Mon Nov 22 03:18:08 CET,0.0 0.935 1.27 1.572 1.832 2.071 2.313 2.551 2.98 3.182 3.37 3.516 3.904 4.07 4.379 4.674 4.964 5.11 5.38 5.631 5.984 6.21 6.437 6.775 7.098 7.403 7.71 8.015 8.41 8.797 9.17 9.614 10.059 10.5 11.009 11.596 12.142 12.727 13.372 14.081 14.858 15.736 16.745 17.731 18.828 20.012 21.405 23.006 24.868 27.054 29.795 32.125 33.429 34.279 34.815 35.158 35.391 35.448 35.4 35.333 35.236 35.147 35.078 34.999 34.921 34.835 34.72 34.605 34.479 34.337 34.201 34.079 33.942 33.784 33.661 33.543 33.428 33.308 33.165 33.064 32.959 32.793 32.685 32.578 32.519 32.388 32.256 32.121 32.041 31.771 31.778 31.68 31.574 31.315 31.161 31.008 30.853 30.688 30.484 30.191 29.466 -5 ,24797 ,KEBNE ,16653086,Mon Nov 22 01:54:45 CET,Mon Nov 22 03:18:08 CET,0.0 0.75 1.134 1.465 1.762 2.014 2.226 2.44 2.844 3.022 3.179 3.267 3.623 3.771 4.053 4.303 4.542 4.661 4.9 5.139 5.485 5.705 5.922 6.258 6.577 6.87 7.158 7.437 7.794 8.142 8.497 8.946 9.367 9.76 10.242 10.785 11.289 11.86 12.459 13.081 13.722 14.454 15.358 16.316 17.5 18.789 20.215 21.828 23.804 26.146 28.838 30.816 31.778 32.246 32.495 32.716 32.923 33.008 32.958 32.875 32.802 32.711 32.58 32.45 32.328 32.21 32.075 31.928 31.796 31.664 31.526 31.402 31.287 31.178 31.073 30.949 30.822 30.697 30.548 30.44 30.326 30.135 30.005 29.862 29.789 29.649 29.506 29.357 29.28 29.015 29.004 28.904 28.798 28.554 28.426 28.278 28.103 27.903 27.685 27.385 26.282 -6 ,11294 ,KEBNE ,16653087,Mon Nov 22 01:55:46 CET,Mon Nov 22 03:18:53 CET,0.0 1.018 1.401 1.677 1.919 2.154 2.365 2.554 2.914 3.087 3.254 3.345 3.706 3.842 4.11 4.384 4.65 4.774 5.019 5.258 5.606 5.844 6.08 6.42 6.741 7.046 7.351 7.658 8.048 8.419 8.777 9.21 9.658 10.099 10.596 11.139 11.654 12.227 12.866 13.577 14.341 15.216 16.231 17.262 18.473 19.836 21.364 22.996 24.888 27.109 29.866 32.169 33.527 34.397 34.905 35.246 35.485 35.614 35.621 35.531 35.426 35.304 35.156 35.031 34.931 34.816 34.67 34.528 34.395 34.25 34.09 33.957 33.831 33.702 33.586 33.452 33.311 33.169 33.016 32.898 32.771 32.579 32.455 32.337 32.277 32.149 31.995 31.8 31.694 31.402 31.377 31.267 31.144 30.837 30.668 30.486 30.286 30.066 29.794 29.371 27.837 -7 ,6621 ,KEBNE ,16653088,Mon Nov 22 01:55:46 CET,Mon Nov 22 03:19:06 CET,0.0 0.867 1.304 1.612 1.874 2.131 2.362 2.574 2.96 3.128 3.291 3.39 3.758 3.926 4.264 4.583 4.888 5.031 5.312 5.574 5.942 6.189 6.43 6.776 7.103 7.428 7.741 8.045 8.431 8.803 9.17 9.615 10.051 10.464 10.941 11.469 11.977 12.549 13.184 13.893 14.662 15.533 16.562 17.583 18.754 20.117 21.752 23.538 25.492 27.711 30.41 32.658 33.975 34.729 35.254 35.621 35.8 35.908 35.949 35.924 35.84 35.706 35.565 35.434 35.309 35.2 35.09 34.957 34.824 34.692 34.534 34.38 34.224 34.074 33.955 33.836 33.707 33.564 33.412 33.298 33.179 33.004 32.87 32.718 32.645 32.491 32.322 32.146 32.052 31.758 31.731 31.629 31.518 31.257 31.101 30.938 30.732 30.496 30.175 29.698 28.106 -8 ,7386 ,KEBNE ,16653089,Mon Nov 22 01:55:46 CET,Mon Nov 22 03:19:20 CET,0.0 0.86 1.276 1.603 1.897 2.139 2.351 2.554 2.928 3.102 3.272 3.387 3.757 3.897 4.169 4.445 4.728 4.868 5.135 5.396 5.778 6.019 6.245 6.573 6.895 7.204 7.506 7.797 8.17 8.544 8.907 9.343 9.772 10.196 10.673 11.199 11.72 12.311 12.965 13.663 14.398 15.255 16.27 17.284 18.5 19.904 21.532 23.333 25.322 27.54 30.259 32.516 33.844 34.7 35.242 35.569 35.777 35.907 35.958 35.965 35.916 35.822 35.71 35.594 35.47 35.338 35.192 35.059 34.94 34.811 34.673 34.557 34.432 34.296 34.188 34.067 33.928 33.778 33.619 33.506 33.4 33.239 33.116 32.987 32.921 32.785 32.634 32.479 32.392 32.119 32.114 32.008 31.902 31.679 31.557 31.414 31.24 31.033 30.809 30.499 29.503 -10 ,13726 ,KEBNE ,16653091,Mon Nov 22 01:55:46 CET,Mon Nov 22 03:19:05 CET,0.0 0.908 1.3 1.604 1.885 2.137 2.37 2.599 3.029 3.23 3.427 3.571 3.954 4.113 4.406 4.682 4.955 5.098 5.378 5.642 6.021 6.265 6.493 6.828 7.164 7.485 7.795 8.094 8.49 8.872 9.233 9.678 10.121 10.542 11.03 11.585 12.116 12.716 13.401 14.115 14.842 15.707 16.74 17.781 18.972 20.255 21.73 23.375 25.283 27.634 30.562 33.008 34.375 35.185 35.696 35.991 36.177 36.271 36.241 36.146 36.068 36.013 35.953 35.879 35.774 35.647 35.507 35.373 35.261 35.147 35.009 34.89 34.759 34.608 34.502 34.404 34.306 34.188 34.049 33.96 33.866 33.694 33.57 33.455 33.402 33.288 33.155 33.011 32.938 32.669 32.695 32.6 32.49 32.264 32.131 31.991 31.836 31.667 31.455 31.171 29.984 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2z_p38a-2y.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2z_p38a-2y.txt deleted file mode 100644 index d08ee586..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-2z_p38a-2y.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28172 ,KEBNE ,17019420,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:01:17 CET,0.0 2.066 2.402 2.609 2.802 2.985 3.155 3.304 3.559 3.675 3.782 3.8 4.077 4.173 4.35 4.509 4.664 4.735 4.869 5.008 5.217 5.341 5.45 5.607 5.747 5.876 5.995 6.093 6.223 6.357 6.469 6.602 6.746 6.879 7.016 7.165 7.298 7.416 7.528 7.659 7.769 7.865 7.951 7.991 8.041 8.039 7.857 7.362 6.482 5.171 2.991 0.277 -1.981 -3.851 -5.407 -6.785 -8.084 -9.297 -10.329 -11.349 -12.188 -12.911 -13.6 -14.248 -14.838 -15.37 -15.922 -16.42 -16.858 -17.317 -17.792 -18.187 -18.585 -18.973 -19.266 -19.573 -19.89 -20.219 -20.567 -20.796 -21.032 -21.4 -21.654 -21.928 -22.069 -22.345 -22.634 -22.952 -23.123 -23.51 -23.636 -23.82 -24.018 -24.397 -24.596 -24.806 -25.024 -25.262 -25.567 -25.953 -26.808 -2 ,17338 ,KEBNE ,17019421,Wed Dec 22 02:39:25 CET,Wed Dec 22 04:01:10 CET,0.0 1.097 1.5 1.812 2.04 2.224 2.389 2.527 2.764 2.863 2.941 2.929 3.196 3.277 3.431 3.57 3.7 3.759 3.88 4.006 4.173 4.268 4.355 4.48 4.596 4.706 4.806 4.896 5.021 5.139 5.235 5.325 5.416 5.508 5.595 5.681 5.762 5.832 5.872 5.911 5.95 5.973 5.956 5.904 5.774 5.5 5.106 4.554 3.686 2.207 -0.29 -3.073 -5.541 -7.816 -9.696 -11.324 -12.724 -13.914 -14.902 -15.882 -16.723 -17.457 -18.154 -18.807 -19.427 -19.982 -20.538 -21.042 -21.477 -21.922 -22.38 -22.748 -23.114 -23.496 -23.794 -24.107 -24.425 -24.738 -25.055 -25.273 -25.488 -25.823 -26.06 -26.297 -26.418 -26.68 -26.953 -27.241 -27.393 -27.759 -27.84 -28.006 -28.191 -28.583 -28.781 -28.987 -29.211 -29.463 -29.759 -30.128 -31.001 -3 ,19871 ,KEBNE ,17019422,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:02:09 CET,0.0 1.2 1.491 1.718 1.916 2.07 2.222 2.372 2.612 2.718 2.823 2.839 3.126 3.216 3.383 3.559 3.725 3.794 3.924 4.059 4.228 4.324 4.421 4.57 4.712 4.842 4.971 5.099 5.256 5.396 5.512 5.662 5.812 5.944 6.081 6.228 6.365 6.498 6.621 6.736 6.837 6.908 6.968 7.01 6.927 6.698 6.383 5.897 5.145 3.892 1.636 -1.08 -3.384 -5.527 -7.443 -9.063 -10.429 -11.685 -12.753 -13.751 -14.589 -15.339 -16.032 -16.676 -17.282 -17.829 -18.396 -18.907 -19.328 -19.753 -20.194 -20.563 -20.951 -21.348 -21.666 -21.989 -22.322 -22.682 -23.05 -23.298 -23.55 -23.944 -24.216 -24.491 -24.63 -24.932 -25.255 -25.582 -25.748 -26.123 -26.251 -26.432 -26.625 -27.057 -27.289 -27.539 -27.786 -28.033 -28.316 -28.697 -29.919 -4 ,9432 ,KEBNE ,17019423,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:02:44 CET,0.0 0.971 1.254 1.498 1.685 1.83 1.966 2.095 2.337 2.444 2.547 2.559 2.825 2.902 3.06 3.21 3.34 3.399 3.522 3.637 3.802 3.901 3.997 4.141 4.277 4.405 4.519 4.632 4.774 4.922 5.07 5.226 5.374 5.514 5.663 5.811 5.942 6.083 6.214 6.349 6.494 6.624 6.724 6.78 6.792 6.678 6.344 5.809 4.987 3.653 1.326 -1.448 -3.679 -5.55 -7.145 -8.651 -10.022 -11.232 -12.268 -13.307 -14.192 -14.941 -15.644 -16.318 -16.925 -17.469 -18.03 -18.511 -18.923 -19.352 -19.794 -20.153 -20.519 -20.904 -21.21 -21.511 -21.816 -22.141 -22.468 -22.692 -22.929 -23.308 -23.568 -23.828 -23.962 -24.227 -24.488 -24.754 -24.89 -25.252 -25.331 -25.496 -25.668 -26.014 -26.218 -26.443 -26.678 -26.925 -27.191 -27.545 -28.635 -5 ,19947 ,KEBNE ,17019424,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:03:48 CET,0.0 1.848 2.306 2.612 2.869 3.068 3.24 3.397 3.662 3.773 3.88 3.899 4.184 4.278 4.445 4.609 4.766 4.84 4.98 5.107 5.29 5.403 5.507 5.647 5.793 5.936 6.065 6.185 6.343 6.495 6.633 6.79 6.941 7.074 7.208 7.359 7.503 7.654 7.805 7.955 8.099 8.221 8.26 8.234 8.163 8.01 7.764 7.327 6.543 5.271 3.026 0.265 -1.991 -3.852 -5.476 -7.007 -8.364 -9.575 -10.586 -11.571 -12.414 -13.166 -13.875 -14.516 -15.129 -15.697 -16.253 -16.741 -17.165 -17.607 -18.057 -18.42 -18.786 -19.167 -19.468 -19.779 -20.096 -20.422 -20.766 -21.005 -21.245 -21.615 -21.871 -22.14 -22.286 -22.593 -22.904 -23.214 -23.384 -23.769 -23.904 -24.087 -24.271 -24.688 -24.915 -25.156 -25.441 -25.756 -26.134 -26.619 -27.844 -6 ,6288 ,KEBNE ,17019425,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:02:36 CET,0.0 1.028 1.301 1.517 1.691 1.836 1.96 2.072 2.294 2.391 2.482 2.454 2.701 2.766 2.893 3.009 3.112 3.165 3.28 3.381 3.518 3.608 3.692 3.814 3.94 4.057 4.149 4.224 4.322 4.42 4.508 4.6 4.673 4.737 4.828 4.929 5.001 5.064 5.118 5.15 5.172 5.165 5.114 5.032 4.882 4.65 4.275 3.713 2.817 1.291 -1.352 -4.437 -6.808 -8.725 -10.357 -11.762 -12.977 -14.096 -15.047 -15.952 -16.713 -17.396 -18.059 -18.655 -19.193 -19.678 -20.162 -20.58 -20.94 -21.313 -21.699 -22.021 -22.35 -22.689 -22.951 -23.227 -23.515 -23.818 -24.148 -24.374 -24.599 -24.962 -25.219 -25.476 -25.613 -25.901 -26.184 -26.499 -26.681 -27.07 -27.215 -27.39 -27.578 -28.005 -28.244 -28.527 -28.849 -29.193 -29.568 -29.992 -30.95 -7 ,17306 ,KEBNE ,17019426,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:02:07 CET,0.0 0.9 1.201 1.435 1.606 1.756 1.901 2.033 2.26 2.357 2.445 2.435 2.701 2.777 2.918 3.042 3.153 3.211 3.337 3.452 3.618 3.716 3.8 3.922 4.03 4.133 4.235 4.332 4.448 4.564 4.684 4.822 4.944 5.069 5.214 5.347 5.469 5.604 5.703 5.751 5.785 5.806 5.804 5.748 5.603 5.389 5.024 4.469 3.689 2.428 0.145 -2.606 -4.821 -6.684 -8.342 -9.91 -11.312 -12.555 -13.613 -14.634 -15.483 -16.224 -16.937 -17.612 -18.224 -18.781 -19.356 -19.863 -20.294 -20.733 -21.183 -21.549 -21.924 -22.313 -22.61 -22.913 -23.226 -23.549 -23.881 -24.113 -24.343 -24.685 -24.933 -25.205 -25.34 -25.615 -25.904 -26.2 -26.355 -26.736 -26.885 -27.061 -27.225 -27.603 -27.807 -28.021 -28.261 -28.514 -28.803 -29.181 -30.217 -8 ,18861 ,KEBNE ,17019427,Wed Dec 22 02:40:28 CET,Wed Dec 22 04:02:35 CET,0.0 1.643 2.105 2.433 2.67 2.859 3.026 3.169 3.487 3.639 3.755 3.78 4.064 4.156 4.332 4.494 4.642 4.709 4.831 4.954 5.131 5.249 5.37 5.535 5.681 5.817 5.944 6.062 6.21 6.356 6.485 6.627 6.775 6.907 7.047 7.203 7.354 7.503 7.651 7.812 7.969 8.121 8.198 8.174 8.037 7.803 7.467 6.958 6.213 4.928 2.572 -0.294 -2.573 -4.423 -6.017 -7.533 -9.004 -10.329 -11.366 -12.366 -13.23 -13.997 -14.711 -15.372 -15.999 -16.58 -17.149 -17.631 -18.063 -18.513 -18.967 -19.336 -19.718 -20.111 -20.415 -20.725 -21.038 -21.361 -21.702 -21.939 -22.173 -22.547 -22.806 -23.07 -23.22 -23.519 -23.815 -24.114 -24.268 -24.65 -24.763 -24.935 -25.13 -25.544 -25.778 -26.064 -26.359 -26.665 -27.012 -27.492 -28.622 -9 ,8999 ,KEBNE ,17019428,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:02:23 CET,0.0 0.935 1.231 1.458 1.646 1.812 1.959 2.084 2.293 2.39 2.488 2.496 2.763 2.849 3.024 3.17 3.31 3.375 3.495 3.599 3.754 3.87 3.984 4.147 4.295 4.418 4.539 4.657 4.798 4.934 5.062 5.205 5.329 5.452 5.594 5.739 5.863 5.977 6.065 6.104 6.155 6.263 6.364 6.363 6.244 6.043 5.708 5.226 4.403 3.06 0.755 -2.104 -4.367 -6.251 -7.925 -9.531 -10.951 -12.162 -13.192 -14.226 -15.082 -15.826 -16.518 -17.165 -17.755 -18.296 -18.865 -19.361 -19.788 -20.238 -20.72 -21.11 -21.49 -21.881 -22.195 -22.506 -22.804 -23.119 -23.457 -23.69 -23.931 -24.305 -24.559 -24.828 -24.969 -25.251 -25.546 -25.86 -26.025 -26.417 -26.552 -26.727 -26.909 -27.266 -27.457 -27.664 -27.902 -28.182 -28.491 -28.864 -29.79 -10 ,592 ,KEBNE ,17019429,Wed Dec 22 02:40:27 CET,Wed Dec 22 04:02:42 CET,0.0 1.762 2.162 2.472 2.723 2.936 3.134 3.307 3.608 3.745 3.859 3.883 4.167 4.257 4.434 4.598 4.75 4.827 4.971 5.096 5.266 5.374 5.48 5.628 5.757 5.888 6.016 6.129 6.275 6.416 6.54 6.674 6.807 6.936 7.08 7.232 7.355 7.471 7.587 7.667 7.746 7.865 7.957 7.999 8.011 7.972 7.821 7.438 6.681 5.362 3.047 0.262 -1.95 -3.788 -5.346 -6.803 -8.113 -9.279 -10.254 -11.22 -12.048 -12.778 -13.474 -14.112 -14.689 -15.228 -15.8 -16.305 -16.736 -17.18 -17.641 -18.015 -18.378 -18.749 -19.041 -19.342 -19.663 -20.0 -20.341 -20.571 -20.803 -21.185 -21.445 -21.69 -21.815 -22.071 -22.337 -22.607 -22.747 -23.104 -23.175 -23.334 -23.509 -23.865 -24.061 -24.282 -24.515 -24.77 -25.088 -25.489 -26.46 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt deleted file mode 100644 index fde5767d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10623 ,KEBNE ,16653092,Mon Nov 22 01:55:48 CET,Mon Nov 22 03:16:18 CET,0.0 0.571 0.778 0.948 1.08 1.197 1.318 1.441 1.646 1.735 1.818 1.79 2.021 2.082 2.205 2.333 2.455 2.51 2.615 2.73 2.898 3.009 3.127 3.299 3.448 3.576 3.718 3.87 4.034 4.185 4.333 4.504 4.67 4.823 5.004 5.206 5.402 5.624 5.85 6.088 6.334 6.592 6.89 7.186 7.513 7.833 8.156 8.509 8.85 9.106 9.191 8.923 8.507 8.066 7.653 7.245 6.861 6.494 6.174 5.857 5.567 5.291 5.012 4.756 4.529 4.31 4.072 3.868 3.684 3.499 3.322 3.169 2.999 2.813 2.671 2.521 2.368 2.206 2.021 1.902 1.789 1.606 1.487 1.376 1.321 1.204 1.07 0.925 0.855 0.615 0.618 0.527 0.432 0.249 0.15 0.031 -0.109 -0.265 -0.45 -0.678 -1.054 -2 ,25951 ,KEBNE ,16653093,Mon Nov 22 01:55:46 CET,Mon Nov 22 03:19:32 CET,0.0 0.909 1.121 1.325 1.505 1.65 1.792 1.926 2.144 2.249 2.342 2.353 2.606 2.696 2.856 3.0 3.143 3.212 3.334 3.46 3.646 3.757 3.869 4.03 4.185 4.334 4.467 4.61 4.797 4.949 5.083 5.252 5.426 5.588 5.757 5.943 6.128 6.344 6.586 6.839 7.1 7.38 7.685 7.97 8.277 8.607 8.983 9.371 9.758 10.085 10.211 10.004 9.644 9.225 8.817 8.419 8.037 7.691 7.381 7.046 6.756 6.5 6.247 6.009 5.794 5.589 5.37 5.168 4.993 4.818 4.635 4.477 4.31 4.13 3.986 3.843 3.696 3.541 3.378 3.26 3.133 2.935 2.804 2.663 2.587 2.43 2.277 2.139 2.073 1.835 1.838 1.753 1.659 1.444 1.321 1.192 1.055 0.894 0.698 0.476 0.021 -3 ,23125 ,KEBNE ,16653094,Mon Nov 22 01:55:46 CET,Mon Nov 22 03:19:38 CET,0.0 0.48 0.668 0.826 0.975 1.103 1.21 1.305 1.493 1.581 1.657 1.644 1.886 1.952 2.079 2.21 2.347 2.411 2.535 2.658 2.85 2.976 3.09 3.251 3.413 3.576 3.715 3.837 4.011 4.178 4.328 4.505 4.668 4.832 5.027 5.247 5.449 5.651 5.873 6.111 6.354 6.603 6.883 7.154 7.457 7.788 8.131 8.504 8.874 9.161 9.282 8.977 8.561 8.13 7.669 7.219 6.809 6.446 6.114 5.757 5.455 5.194 4.954 4.723 4.492 4.268 4.034 3.821 3.638 3.456 3.275 3.119 2.955 2.778 2.632 2.476 2.319 2.175 2.026 1.913 1.795 1.612 1.48 1.348 1.287 1.169 1.037 0.893 0.823 0.585 0.579 0.492 0.399 0.185 0.069 -0.054 -0.178 -0.308 -0.466 -0.669 -1.251 -4 ,15398 ,KEBNE ,16653095,Mon Nov 22 01:55:46 CET,Mon Nov 22 03:19:36 CET,0.0 0.522 0.712 0.863 0.994 1.106 1.2 1.288 1.462 1.54 1.614 1.599 1.841 1.92 2.082 2.243 2.385 2.443 2.559 2.678 2.85 2.961 3.067 3.216 3.356 3.491 3.63 3.759 3.925 4.092 4.249 4.434 4.606 4.769 4.948 5.144 5.341 5.56 5.774 5.986 6.207 6.446 6.728 7.01 7.324 7.661 8.019 8.361 8.71 9.023 9.12 8.861 8.499 8.095 7.671 7.249 6.859 6.513 6.215 5.9 5.62 5.37 5.124 4.872 4.641 4.443 4.219 4.009 3.827 3.641 3.456 3.294 3.116 2.93 2.791 2.653 2.501 2.34 2.176 2.062 1.943 1.761 1.639 1.512 1.446 1.309 1.175 1.027 0.952 0.711 0.714 0.62 0.514 0.318 0.217 0.106 -0.01 -0.146 -0.315 -0.548 -1.302 -5 ,238 ,KEBNE ,16653096,Mon Nov 22 01:55:46 CET,Mon Nov 22 03:19:30 CET,0.0 0.543 0.716 0.863 0.995 1.102 1.204 1.303 1.484 1.566 1.637 1.608 1.839 1.904 2.018 2.134 2.257 2.313 2.411 2.511 2.664 2.754 2.841 2.969 3.106 3.248 3.388 3.528 3.702 3.866 4.02 4.195 4.366 4.523 4.704 4.906 5.101 5.32 5.553 5.797 6.045 6.312 6.607 6.89 7.208 7.544 7.889 8.214 8.531 8.816 8.904 8.584 8.104 7.637 7.219 6.808 6.418 6.053 5.721 5.404 5.147 4.894 4.635 4.393 4.16 3.939 3.702 3.486 3.299 3.118 2.932 2.769 2.602 2.427 2.286 2.141 1.999 1.852 1.692 1.58 1.457 1.263 1.136 1.004 0.932 0.777 0.618 0.465 0.394 0.158 0.171 0.092 0.01 -0.179 -0.283 -0.4 -0.533 -0.676 -0.842 -1.047 -1.733 -6 ,12220 ,KEBNE ,16653097,Mon Nov 22 01:55:46 CET,Mon Nov 22 03:21:13 CET,0.0 0.742 0.927 1.092 1.23 1.348 1.48 1.62 1.871 1.987 2.092 2.119 2.369 2.444 2.585 2.724 2.851 2.91 3.027 3.15 3.328 3.435 3.546 3.702 3.853 4.003 4.136 4.265 4.441 4.596 4.75 4.948 5.128 5.288 5.465 5.668 5.863 6.082 6.305 6.52 6.739 6.993 7.314 7.628 7.965 8.325 8.683 9.039 9.42 9.733 9.793 9.516 9.125 8.692 8.265 7.865 7.485 7.108 6.775 6.429 6.122 5.842 5.576 5.338 5.112 4.897 4.678 4.477 4.306 4.14 3.955 3.8 3.633 3.452 3.313 3.165 3.015 2.857 2.692 2.584 2.46 2.256 2.115 1.969 1.896 1.731 1.559 1.369 1.27 1.012 0.968 0.862 0.754 0.51 0.37 0.218 0.026 -0.233 -0.526 -0.851 -1.583 -7 ,10820 ,KEBNE ,16653098,Mon Nov 22 01:55:46 CET,Mon Nov 22 03:19:36 CET,0.0 0.43 0.602 0.755 0.888 1.007 1.121 1.222 1.413 1.501 1.586 1.599 1.847 1.926 2.075 2.217 2.345 2.406 2.536 2.663 2.843 2.955 3.059 3.217 3.371 3.521 3.665 3.791 3.953 4.109 4.263 4.46 4.637 4.798 4.975 5.177 5.366 5.559 5.765 5.996 6.236 6.485 6.774 7.064 7.388 7.721 8.079 8.466 8.851 9.135 9.224 8.99 8.608 8.192 7.772 7.331 6.921 6.557 6.244 5.905 5.615 5.352 5.082 4.835 4.612 4.408 4.188 3.992 3.816 3.628 3.437 3.275 3.099 2.916 2.777 2.626 2.467 2.31 2.15 2.043 1.936 1.772 1.659 1.541 1.482 1.365 1.238 1.095 1.018 0.775 0.787 0.707 0.618 0.426 0.326 0.215 0.089 -0.048 -0.197 -0.396 -1.118 -8 ,20582 ,KEBNE ,16653099,Mon Nov 22 01:55:46 CET,Mon Nov 22 03:19:34 CET,0.0 0.736 0.935 1.111 1.257 1.379 1.484 1.578 1.771 1.869 1.956 1.944 2.179 2.248 2.379 2.503 2.618 2.674 2.788 2.887 3.025 3.126 3.233 3.383 3.528 3.671 3.801 3.927 4.084 4.232 4.384 4.563 4.732 4.89 5.066 5.275 5.476 5.687 5.915 6.171 6.438 6.697 6.981 7.26 7.558 7.872 8.209 8.576 8.931 9.191 9.296 9.027 8.622 8.2 7.742 7.3 6.944 6.594 6.255 5.926 5.627 5.356 5.097 4.844 4.616 4.403 4.18 3.98 3.809 3.626 3.43 3.271 3.106 2.932 2.796 2.651 2.504 2.354 2.191 2.077 1.963 1.776 1.641 1.503 1.429 1.289 1.128 0.944 0.862 0.617 0.59 0.503 0.407 0.202 0.092 -0.031 -0.147 -0.285 -0.466 -0.676 -1.279 -9 ,27141 ,KEBNE ,16653100,Mon Nov 22 01:56:48 CET,Mon Nov 22 03:20:36 CET,0.0 0.523 0.717 0.884 1.043 1.193 1.322 1.449 1.678 1.779 1.88 1.906 2.16 2.249 2.415 2.561 2.688 2.749 2.871 2.993 3.168 3.277 3.38 3.527 3.685 3.84 3.97 4.095 4.261 4.412 4.563 4.757 4.942 5.121 5.311 5.506 5.703 5.937 6.177 6.417 6.673 6.945 7.25 7.546 7.866 8.186 8.53 8.894 9.244 9.539 9.669 9.45 9.07 8.638 8.207 7.765 7.369 7.033 6.729 6.398 6.111 5.862 5.606 5.357 5.127 4.916 4.695 4.49 4.31 4.117 3.917 3.75 3.567 3.388 3.259 3.127 2.992 2.85 2.697 2.591 2.48 2.308 2.197 2.084 2.025 1.905 1.773 1.631 1.561 1.323 1.311 1.222 1.131 0.927 0.822 0.709 0.572 0.425 0.273 0.087 -0.431 -10 ,28303 ,KEBNE ,16653101,Mon Nov 22 01:56:49 CET,Mon Nov 22 03:20:38 CET,0.0 0.731 0.948 1.112 1.245 1.372 1.496 1.609 1.819 1.932 2.047 2.075 2.333 2.43 2.597 2.762 2.918 2.988 3.125 3.257 3.441 3.559 3.668 3.815 3.953 4.089 4.212 4.327 4.489 4.643 4.788 4.963 5.141 5.31 5.491 5.692 5.885 6.088 6.301 6.524 6.76 7.023 7.298 7.58 7.923 8.294 8.675 9.035 9.407 9.733 9.857 9.617 9.226 8.788 8.365 7.945 7.549 7.186 6.863 6.549 6.286 6.029 5.762 5.512 5.29 5.082 4.845 4.642 4.47 4.279 4.078 3.918 3.761 3.591 3.45 3.306 3.159 3.01 2.85 2.74 2.636 2.467 2.351 2.228 2.166 2.035 1.893 1.743 1.667 1.429 1.432 1.342 1.25 1.052 0.938 0.804 0.656 0.498 0.311 0.077 -0.7 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt deleted file mode 100644 index cee03677..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14563 ,KEBNE ,16653102,Mon Nov 22 01:56:48 CET,Mon Nov 22 03:20:40 CET,0.0 0.801 1.038 1.199 1.359 1.505 1.649 1.8 2.066 2.177 2.274 2.291 2.545 2.646 2.852 3.031 3.18 3.246 3.376 3.51 3.701 3.819 3.934 4.115 4.291 4.453 4.614 4.768 4.965 5.151 5.34 5.573 5.783 5.984 6.218 6.483 6.74 7.015 7.31 7.622 7.947 8.308 8.723 9.146 9.64 10.201 10.832 11.484 12.229 13.083 13.999 14.549 14.709 14.702 14.587 14.42 14.261 14.09 13.914 13.724 13.541 13.378 13.212 13.047 12.884 12.727 12.566 12.414 12.284 12.144 11.993 11.862 11.717 11.566 11.453 11.34 11.214 11.08 10.939 10.844 10.745 10.573 10.442 10.307 10.247 10.118 9.971 9.804 9.718 9.482 9.454 9.356 9.254 9.012 8.886 8.753 8.579 8.377 8.169 7.902 7.289 -2 ,20189 ,KEBNE ,16653103,Mon Nov 22 01:56:48 CET,Mon Nov 22 03:20:41 CET,0.0 0.4 0.589 0.756 0.901 1.018 1.133 1.239 1.433 1.525 1.61 1.625 1.883 1.976 2.144 2.305 2.454 2.525 2.66 2.79 2.984 3.109 3.232 3.407 3.574 3.733 3.887 4.042 4.242 4.424 4.607 4.827 5.034 5.243 5.486 5.75 6.008 6.29 6.586 6.885 7.204 7.588 8.02 8.447 8.954 9.518 10.146 10.804 11.568 12.44 13.318 13.871 14.057 14.028 13.908 13.784 13.634 13.439 13.239 13.033 12.832 12.65 12.489 12.323 12.149 11.988 11.816 11.649 11.503 11.361 11.218 11.097 10.961 10.818 10.71 10.594 10.464 10.335 10.207 10.123 10.041 9.906 9.815 9.718 9.669 9.559 9.437 9.319 9.259 9.044 9.071 9.001 8.923 8.755 8.667 8.566 8.448 8.312 8.16 7.981 7.475 -3 ,31630 ,KEBNE ,16653104,Mon Nov 22 01:56:48 CET,Mon Nov 22 03:20:40 CET,0.0 0.498 0.707 0.861 0.992 1.109 1.221 1.322 1.494 1.592 1.694 1.713 1.962 2.05 2.215 2.36 2.498 2.569 2.703 2.835 3.029 3.161 3.292 3.472 3.649 3.825 3.99 4.143 4.342 4.536 4.729 4.961 5.169 5.363 5.591 5.846 6.101 6.389 6.696 7.022 7.359 7.722 8.144 8.584 9.092 9.647 10.286 11.003 11.792 12.589 13.373 13.843 13.959 13.9 13.768 13.618 13.425 13.224 13.036 12.835 12.645 12.46 12.287 12.126 11.97 11.808 11.643 11.5 11.376 11.242 11.09 10.96 10.818 10.661 10.554 10.442 10.311 10.179 10.041 9.938 9.829 9.664 9.546 9.425 9.364 9.246 9.119 8.961 8.879 8.652 8.676 8.605 8.531 8.379 8.294 8.204 8.096 7.973 7.84 7.68 7.154 -4 ,3593 ,KEBNE ,16653105,Mon Nov 22 01:56:48 CET,Mon Nov 22 03:20:40 CET,0.0 0.54 0.821 1.048 1.245 1.421 1.565 1.7 1.946 2.057 2.168 2.197 2.451 2.539 2.712 2.878 3.034 3.109 3.249 3.381 3.584 3.719 3.847 4.037 4.219 4.39 4.562 4.718 4.904 5.089 5.273 5.485 5.683 5.883 6.118 6.381 6.629 6.907 7.204 7.512 7.834 8.199 8.625 9.055 9.567 10.134 10.754 11.413 12.186 13.043 13.896 14.39 14.536 14.531 14.443 14.312 14.152 13.964 13.791 13.607 13.439 13.275 13.094 12.925 12.768 12.607 12.421 12.26 12.133 11.994 11.838 11.714 11.581 11.426 11.309 11.194 11.082 10.959 10.821 10.722 10.619 10.469 10.358 10.246 10.193 10.086 9.974 9.858 9.792 9.573 9.603 9.531 9.452 9.284 9.187 9.081 8.963 8.833 8.685 8.494 7.971 -5 ,11642 ,KEBNE ,16653106,Mon Nov 22 01:57:51 CET,Mon Nov 22 03:21:31 CET,0.0 0.495 0.697 0.849 0.992 1.125 1.249 1.362 1.559 1.654 1.741 1.737 1.978 2.052 2.189 2.317 2.448 2.512 2.639 2.766 2.943 3.066 3.195 3.368 3.521 3.686 3.848 3.993 4.181 4.366 4.545 4.752 4.945 5.141 5.377 5.647 5.914 6.197 6.484 6.782 7.104 7.48 7.917 8.339 8.808 9.348 9.99 10.686 11.461 12.309 13.198 13.728 13.908 13.925 13.853 13.715 13.547 13.368 13.184 12.994 12.823 12.649 12.475 12.314 12.153 11.997 11.833 11.685 11.55 11.408 11.265 11.145 11.014 10.869 10.755 10.635 10.502 10.369 10.236 10.141 10.038 9.878 9.768 9.65 9.586 9.459 9.334 9.194 9.115 8.877 8.879 8.804 8.724 8.543 8.442 8.338 8.234 8.116 7.977 7.777 7.371 -6 ,31596 ,KEBNE ,16653107,Mon Nov 22 01:57:51 CET,Mon Nov 22 03:22:54 CET,0.0 0.412 0.614 0.799 0.95 1.062 1.17 1.276 1.481 1.574 1.659 1.657 1.907 1.996 2.157 2.308 2.443 2.511 2.665 2.816 3.023 3.153 3.283 3.469 3.633 3.793 3.958 4.12 4.326 4.517 4.697 4.911 5.116 5.321 5.558 5.826 6.099 6.392 6.693 7.018 7.348 7.715 8.154 8.578 9.07 9.616 10.239 10.924 11.666 12.462 13.278 13.758 13.907 13.898 13.805 13.661 13.498 13.333 13.168 12.978 12.793 12.624 12.456 12.279 12.121 11.973 11.81 11.66 11.518 11.354 11.183 11.058 10.924 10.774 10.661 10.546 10.424 10.29 10.152 10.053 9.943 9.764 9.646 9.534 9.476 9.361 9.241 9.099 9.024 8.8 8.818 8.736 8.647 8.465 8.364 8.263 8.156 8.028 7.877 7.687 7.303 -7 ,22426 ,KEBNE ,16653108,Mon Nov 22 01:57:51 CET,Mon Nov 22 03:22:55 CET,0.0 0.485 0.702 0.861 0.995 1.114 1.22 1.33 1.525 1.61 1.7 1.73 1.983 2.064 2.208 2.329 2.447 2.512 2.638 2.751 2.921 3.038 3.153 3.322 3.487 3.648 3.807 3.964 4.164 4.352 4.526 4.741 4.955 5.158 5.395 5.659 5.916 6.196 6.501 6.829 7.17 7.537 7.97 8.405 8.896 9.432 10.047 10.751 11.518 12.343 13.229 13.738 13.871 13.858 13.784 13.635 13.45 13.261 13.081 12.868 12.677 12.522 12.355 12.185 12.01 11.855 11.702 11.556 11.422 11.278 11.139 11.019 10.887 10.752 10.641 10.522 10.388 10.252 10.12 10.028 9.928 9.764 9.638 9.505 9.441 9.307 9.166 9.016 8.938 8.703 8.683 8.586 8.48 8.268 8.143 7.984 7.824 7.636 7.429 7.212 6.604 -8 ,8035 ,KEBNE ,16653109,Mon Nov 22 01:57:50 CET,Mon Nov 22 03:21:40 CET,0.0 0.535 0.734 0.902 1.033 1.149 1.265 1.378 1.595 1.697 1.805 1.849 2.102 2.194 2.377 2.554 2.719 2.797 2.954 3.099 3.304 3.425 3.546 3.723 3.9 4.076 4.246 4.407 4.603 4.789 4.973 5.2 5.406 5.602 5.837 6.103 6.368 6.657 6.963 7.272 7.598 7.986 8.422 8.841 9.308 9.834 10.454 11.146 11.911 12.754 13.651 14.148 14.289 14.289 14.184 14.038 13.872 13.678 13.488 13.296 13.124 12.952 12.771 12.594 12.426 12.272 12.107 11.952 11.818 11.684 11.539 11.41 11.275 11.136 11.027 10.912 10.79 10.653 10.508 10.411 10.309 10.146 10.032 9.914 9.856 9.732 9.608 9.488 9.428 9.206 9.221 9.148 9.065 8.878 8.775 8.66 8.544 8.413 8.267 8.078 7.564 -9 ,26102 ,KEBNE ,16653110,Mon Nov 22 01:57:51 CET,Mon Nov 22 03:23:08 CET,0.0 0.621 0.811 0.95 1.085 1.21 1.317 1.414 1.601 1.685 1.758 1.753 2.004 2.084 2.233 2.38 2.531 2.61 2.765 2.903 3.105 3.235 3.359 3.538 3.705 3.87 4.028 4.18 4.373 4.564 4.745 4.949 5.154 5.364 5.608 5.871 6.122 6.398 6.71 7.039 7.363 7.72 8.147 8.592 9.098 9.652 10.257 10.901 11.666 12.488 13.378 13.975 14.132 14.115 14.04 13.902 13.71 13.516 13.334 13.134 12.961 12.781 12.582 12.399 12.222 12.068 11.916 11.77 11.638 11.501 11.358 11.235 11.106 10.97 10.86 10.742 10.621 10.499 10.369 10.28 10.193 10.056 9.957 9.861 9.81 9.703 9.583 9.45 9.38 9.153 9.17 9.093 9.01 8.839 8.741 8.633 8.515 8.383 8.248 8.054 7.558 -10 ,25892 ,KEBNE ,16653111,Mon Nov 22 01:57:50 CET,Mon Nov 22 03:23:05 CET,0.0 0.41 0.578 0.738 0.877 0.992 1.1 1.204 1.393 1.481 1.565 1.558 1.8 1.877 2.022 2.17 2.319 2.389 2.521 2.649 2.841 2.972 3.1 3.285 3.46 3.636 3.803 3.963 4.179 4.378 4.562 4.785 4.989 5.189 5.433 5.717 5.984 6.267 6.564 6.881 7.219 7.582 8.015 8.457 8.954 9.495 10.125 10.817 11.602 12.454 13.314 13.832 13.97 13.971 13.908 13.763 13.609 13.451 13.279 13.079 12.895 12.725 12.563 12.407 12.247 12.098 11.941 11.799 11.667 11.536 11.398 11.264 11.127 10.992 10.882 10.769 10.662 10.553 10.439 10.356 10.266 10.132 10.05 9.95 9.893 9.782 9.664 9.539 9.472 9.243 9.248 9.174 9.101 8.947 8.859 8.772 8.684 8.57 8.431 8.248 7.88 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt deleted file mode 100644 index 3724d840..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9390 ,KEBNE ,16653112,Mon Nov 22 01:57:50 CET,Mon Nov 22 03:21:51 CET,0.0 0.694 1.028 1.286 1.479 1.633 1.756 1.863 2.09 2.191 2.279 2.276 2.523 2.601 2.738 2.878 3.003 3.066 3.204 3.324 3.48 3.573 3.67 3.822 3.949 4.074 4.203 4.32 4.464 4.606 4.737 4.909 5.08 5.231 5.404 5.597 5.791 6.005 6.237 6.481 6.709 6.941 7.204 7.473 7.79 8.115 8.458 8.814 9.164 9.42 9.465 9.261 8.919 8.528 8.146 7.774 7.414 7.064 6.765 6.471 6.194 5.944 5.715 5.491 5.278 5.085 4.876 4.685 4.523 4.35 4.173 4.029 3.875 3.708 3.576 3.448 3.31 3.173 3.034 2.93 2.814 2.631 2.512 2.39 2.325 2.184 2.03 1.868 1.784 1.533 1.516 1.434 1.354 1.165 1.066 0.964 0.839 0.702 0.556 0.371 -0.274 -2 ,8260 ,KEBNE ,16653113,Mon Nov 22 01:58:52 CET,Mon Nov 22 03:24:17 CET,0.0 0.207 0.367 0.506 0.625 0.714 0.809 0.904 1.064 1.141 1.218 1.208 1.445 1.525 1.686 1.826 1.955 2.019 2.141 2.256 2.411 2.506 2.602 2.75 2.897 3.037 3.16 3.276 3.427 3.569 3.697 3.85 4.004 4.157 4.34 4.54 4.725 4.928 5.147 5.375 5.601 5.834 6.098 6.355 6.65 6.992 7.374 7.744 8.094 8.396 8.492 8.23 7.842 7.461 7.076 6.654 6.272 5.946 5.652 5.335 5.078 4.853 4.623 4.399 4.193 4.004 3.805 3.626 3.465 3.29 3.111 2.969 2.811 2.642 2.516 2.384 2.25 2.118 1.968 1.861 1.759 1.586 1.465 1.342 1.275 1.136 0.993 0.847 0.775 0.545 0.566 0.484 0.407 0.253 0.171 0.075 -0.043 -0.176 -0.326 -0.515 -0.902 -4 ,5416 ,KEBNE ,16653115,Mon Nov 22 01:58:52 CET,Mon Nov 22 03:22:54 CET,0.0 0.346 0.512 0.653 0.772 0.875 0.959 1.05 1.235 1.318 1.396 1.36 1.588 1.66 1.787 1.89 1.993 2.04 2.134 2.233 2.371 2.457 2.535 2.65 2.777 2.902 3.023 3.14 3.296 3.44 3.571 3.726 3.877 4.028 4.197 4.382 4.562 4.76 4.97 5.194 5.432 5.711 6.023 6.299 6.605 6.911 7.254 7.648 7.997 8.23 8.273 8.061 7.74 7.384 7.0 6.599 6.243 5.915 5.626 5.33 5.074 4.835 4.586 4.344 4.127 3.94 3.739 3.563 3.412 3.249 3.081 2.93 2.77 2.619 2.498 2.356 2.2 2.044 1.886 1.775 1.673 1.514 1.393 1.273 1.215 1.102 0.981 0.852 0.784 0.552 0.574 0.494 0.415 0.25 0.162 0.062 -0.053 -0.176 -0.318 -0.502 -0.929 -5 ,12686 ,KEBNE ,16653116,Mon Nov 22 01:58:52 CET,Mon Nov 22 03:22:34 CET,0.0 0.197 0.339 0.47 0.597 0.71 0.808 0.907 1.081 1.161 1.244 1.243 1.48 1.551 1.678 1.809 1.943 1.999 2.11 2.226 2.393 2.496 2.599 2.744 2.884 3.017 3.147 3.277 3.438 3.581 3.715 3.884 4.042 4.2 4.382 4.564 4.738 4.933 5.14 5.361 5.584 5.824 6.113 6.397 6.699 7.01 7.337 7.672 8.026 8.314 8.428 8.271 7.942 7.563 7.207 6.873 6.558 6.247 5.965 5.685 5.425 5.169 4.925 4.706 4.508 4.325 4.124 3.939 3.781 3.616 3.433 3.279 3.132 2.979 2.857 2.723 2.578 2.434 2.293 2.197 2.088 1.929 1.826 1.711 1.649 1.515 1.369 1.212 1.129 0.885 0.873 0.777 0.692 0.509 0.415 0.323 0.206 0.084 -0.056 -0.243 -0.607 -6 ,16301 ,KEBNE ,16653117,Mon Nov 22 01:58:52 CET,Mon Nov 22 03:22:45 CET,0.0 0.374 0.553 0.679 0.795 0.894 0.98 1.067 1.248 1.331 1.405 1.377 1.599 1.661 1.776 1.874 1.975 2.024 2.131 2.233 2.364 2.454 2.547 2.692 2.835 2.967 3.09 3.209 3.358 3.498 3.628 3.782 3.93 4.077 4.252 4.444 4.626 4.823 5.037 5.263 5.47 5.699 5.981 6.258 6.57 6.89 7.233 7.587 7.92 8.187 8.305 8.086 7.751 7.397 7.014 6.6 6.22 5.873 5.575 5.291 5.03 4.793 4.566 4.338 4.114 3.891 3.673 3.495 3.341 3.189 3.023 2.883 2.732 2.555 2.423 2.29 2.146 1.991 1.836 1.72 1.606 1.437 1.312 1.189 1.124 0.979 0.821 0.659 0.573 0.321 0.309 0.219 0.119 -0.074 -0.168 -0.274 -0.399 -0.535 -0.682 -0.859 -1.299 -7 ,27638 ,KEBNE ,16653118,Mon Nov 22 01:58:56 CET,Mon Nov 22 03:22:45 CET,0.0 0.246 0.391 0.512 0.614 0.711 0.808 0.888 1.054 1.144 1.224 1.181 1.404 1.466 1.587 1.701 1.811 1.866 1.964 2.053 2.197 2.286 2.365 2.482 2.611 2.75 2.878 3.002 3.159 3.308 3.45 3.62 3.779 3.937 4.128 4.33 4.505 4.694 4.905 5.117 5.344 5.607 5.886 6.145 6.418 6.707 7.041 7.372 7.711 8.012 8.068 7.816 7.452 7.016 6.567 6.191 5.879 5.549 5.241 4.922 4.649 4.429 4.21 3.999 3.801 3.599 3.398 3.214 3.05 2.888 2.718 2.576 2.419 2.248 2.116 1.983 1.852 1.714 1.563 1.463 1.355 1.175 1.054 0.93 0.861 0.708 0.563 0.42 0.339 0.095 0.093 0.001 -0.103 -0.34 -0.459 -0.603 -0.788 -0.976 -1.187 -1.469 -2.508 -8 ,326 ,KEBNE ,16653119,Mon Nov 22 01:58:56 CET,Mon Nov 22 03:20:38 CET,0.0 0.603 0.802 0.952 1.115 1.286 1.419 1.53 1.725 1.818 1.911 1.905 2.149 2.233 2.388 2.531 2.661 2.727 2.852 2.964 3.123 3.225 3.329 3.484 3.635 3.773 3.898 4.008 4.149 4.29 4.434 4.615 4.774 4.927 5.109 5.309 5.49 5.681 5.896 6.123 6.351 6.607 6.905 7.199 7.501 7.823 8.216 8.597 8.961 9.265 9.402 9.203 8.893 8.573 8.222 7.838 7.495 7.177 6.892 6.584 6.31 6.084 5.862 5.645 5.433 5.25 5.055 4.859 4.693 4.529 4.356 4.219 4.077 3.919 3.797 3.662 3.514 3.377 3.233 3.121 3.002 2.816 2.693 2.571 2.505 2.372 2.23 2.082 2.001 1.744 1.715 1.614 1.502 1.272 1.143 0.993 0.845 0.681 0.494 0.227 -0.518 -9 ,18521 ,KEBNE ,16653120,Mon Nov 22 01:58:52 CET,Mon Nov 22 03:24:16 CET,0.0 0.306 0.458 0.568 0.676 0.781 0.884 0.973 1.117 1.198 1.291 1.295 1.532 1.602 1.744 1.878 2.001 2.058 2.175 2.296 2.476 2.586 2.683 2.819 2.95 3.072 3.198 3.327 3.467 3.606 3.754 3.915 4.072 4.239 4.42 4.61 4.791 4.988 5.201 5.438 5.67 5.903 6.166 6.422 6.723 7.045 7.373 7.705 8.014 8.241 8.317 8.091 7.686 7.234 6.8 6.395 6.031 5.673 5.366 5.071 4.81 4.558 4.323 4.106 3.886 3.684 3.485 3.304 3.132 2.956 2.782 2.636 2.478 2.313 2.183 2.042 1.901 1.763 1.619 1.515 1.402 1.227 1.106 0.978 0.912 0.781 0.628 0.472 0.399 0.162 0.157 0.059 -0.045 -0.264 -0.373 -0.486 -0.609 -0.74 -0.925 -1.147 -1.475 -10 ,18698 ,KEBNE ,16653121,Mon Nov 22 01:58:52 CET,Mon Nov 22 03:24:21 CET,0.0 0.336 0.531 0.661 0.775 0.875 0.96 1.044 1.202 1.278 1.363 1.368 1.618 1.699 1.837 1.97 2.095 2.153 2.267 2.381 2.56 2.683 2.799 2.964 3.117 3.253 3.369 3.478 3.628 3.782 3.927 4.088 4.245 4.386 4.549 4.745 4.936 5.153 5.376 5.594 5.819 6.073 6.366 6.665 7.011 7.343 7.686 8.056 8.413 8.711 8.861 8.664 8.329 7.955 7.584 7.204 6.837 6.518 6.224 5.923 5.655 5.409 5.177 4.958 4.759 4.569 4.353 4.151 3.982 3.808 3.626 3.481 3.323 3.16 3.033 2.899 2.762 2.618 2.464 2.364 2.257 2.077 1.957 1.83 1.763 1.62 1.479 1.35 1.287 1.057 1.072 0.994 0.91 0.72 0.623 0.521 0.417 0.29 0.137 -0.024 -0.434 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt deleted file mode 100644 index c8667965..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,18509 ,KEBNE ,16653123,Mon Nov 22 01:58:52 CET,Mon Nov 22 03:22:12 CET,0.0 1.254 1.625 1.903 2.147 2.344 2.499 2.633 2.853 2.967 3.079 3.102 3.349 3.436 3.569 3.681 3.791 3.852 3.974 4.082 4.242 4.341 4.424 4.53 4.639 4.767 4.893 4.995 5.104 5.205 5.306 5.405 5.495 5.588 5.687 5.798 5.896 5.996 6.094 6.187 6.279 6.372 6.456 6.483 6.491 6.485 6.401 6.214 5.887 5.278 4.08 2.592 1.324 0.236 -0.763 -1.677 -2.436 -3.12 -3.717 -4.328 -4.855 -5.323 -5.76 -6.165 -6.56 -6.911 -7.28 -7.615 -7.888 -8.188 -8.499 -8.759 -9.038 -9.323 -9.543 -9.756 -9.977 -10.238 -10.513 -10.685 -10.856 -11.167 -11.406 -11.642 -11.756 -11.992 -12.252 -12.544 -12.697 -13.028 -13.182 -13.359 -13.535 -13.934 -14.185 -14.455 -14.75 -15.136 -15.618 -16.237 -18.2 -3 ,2802 ,KEBNE ,16653124,Mon Nov 22 01:58:52 CET,Mon Nov 22 03:22:15 CET,0.0 0.737 1.098 1.382 1.584 1.741 1.877 2.011 2.242 2.344 2.441 2.439 2.686 2.776 2.93 3.069 3.195 3.251 3.361 3.465 3.613 3.705 3.804 3.95 4.076 4.185 4.296 4.401 4.518 4.641 4.766 4.909 5.036 5.143 5.254 5.376 5.493 5.616 5.738 5.866 5.981 6.089 6.206 6.302 6.385 6.41 6.38 6.253 5.95 5.321 4.014 2.309 0.897 -0.357 -1.471 -2.447 -3.308 -4.104 -4.767 -5.411 -5.982 -6.49 -6.965 -7.43 -7.884 -8.288 -8.659 -8.989 -9.273 -9.537 -9.823 -10.074 -10.343 -10.639 -10.864 -11.098 -11.356 -11.614 -11.868 -12.054 -12.248 -12.532 -12.739 -12.954 -13.08 -13.355 -13.617 -13.9 -14.044 -14.376 -14.547 -14.716 -14.903 -15.336 -15.55 -15.814 -16.142 -16.521 -16.934 -17.56 -19.868 -4 ,1078 ,KEBNE ,16653125,Mon Nov 22 01:59:54 CET,Mon Nov 22 03:23:13 CET,0.0 1.463 1.825 2.091 2.321 2.52 2.702 2.86 3.133 3.243 3.336 3.357 3.606 3.692 3.855 3.984 4.1 4.159 4.278 4.404 4.599 4.71 4.795 4.92 5.03 5.128 5.227 5.312 5.411 5.505 5.609 5.73 5.822 5.902 6.004 6.108 6.187 6.287 6.399 6.493 6.573 6.652 6.73 6.78 6.782 6.716 6.572 6.362 6.036 5.427 4.274 2.813 1.575 0.46 -0.507 -1.344 -2.096 -2.787 -3.377 -3.971 -4.484 -4.947 -5.4 -5.816 -6.194 -6.553 -6.941 -7.283 -7.603 -7.945 -8.269 -8.544 -8.831 -9.12 -9.366 -9.634 -9.893 -10.147 -10.412 -10.595 -10.79 -11.087 -11.285 -11.524 -11.659 -11.916 -12.177 -12.456 -12.591 -12.91 -13.097 -13.302 -13.508 -13.983 -14.25 -14.558 -14.931 -15.305 -15.735 -16.31 -18.675 -5 ,24021 ,KEBNE ,16653126,Mon Nov 22 01:59:54 CET,Mon Nov 22 03:24:38 CET,0.0 1.138 1.475 1.741 1.987 2.159 2.295 2.429 2.632 2.75 2.876 2.928 3.195 3.287 3.462 3.639 3.774 3.83 3.943 4.041 4.169 4.26 4.353 4.484 4.592 4.697 4.794 4.873 4.979 5.083 5.177 5.279 5.376 5.471 5.571 5.668 5.764 5.87 5.981 6.084 6.171 6.251 6.337 6.4 6.394 6.36 6.283 6.11 5.744 5.051 3.815 2.238 0.953 -0.131 -1.088 -1.931 -2.684 -3.347 -3.898 -4.47 -4.975 -5.422 -5.84 -6.22 -6.572 -6.936 -7.351 -7.715 -8.048 -8.415 -8.775 -9.049 -9.3 -9.559 -9.777 -9.998 -10.214 -10.44 -10.697 -10.884 -11.058 -11.37 -11.618 -11.848 -11.967 -12.228 -12.502 -12.805 -12.966 -13.318 -13.526 -13.724 -13.924 -14.393 -14.672 -14.967 -15.298 -15.669 -16.127 -16.777 -18.944 -6 ,18340 ,KEBNE ,16653127,Mon Nov 22 01:59:54 CET,Mon Nov 22 03:23:14 CET,0.0 0.762 1.12 1.376 1.611 1.833 2.019 2.166 2.395 2.5 2.607 2.659 2.914 3.002 3.172 3.334 3.479 3.534 3.641 3.752 3.926 4.052 4.161 4.288 4.397 4.495 4.593 4.695 4.82 4.94 5.051 5.162 5.255 5.378 5.55 5.724 5.875 6.036 6.21 6.392 6.569 6.705 6.792 6.833 6.844 6.814 6.704 6.5 6.164 5.575 4.387 2.849 1.561 0.448 -0.485 -1.338 -2.139 -2.824 -3.366 -3.925 -4.427 -4.86 -5.267 -5.671 -6.048 -6.397 -6.766 -7.093 -7.389 -7.694 -8.012 -8.27 -8.533 -8.812 -9.029 -9.255 -9.501 -9.762 -10.041 -10.236 -10.423 -10.741 -10.978 -11.198 -11.301 -11.539 -11.791 -12.061 -12.214 -12.559 -12.765 -12.989 -13.209 -13.625 -13.834 -14.073 -14.376 -14.74 -15.194 -15.894 -18.323 -7 ,28914 ,KEBNE ,16653128,Mon Nov 22 01:59:54 CET,Mon Nov 22 03:23:14 CET,0.0 1.132 1.527 1.798 2.005 2.169 2.321 2.476 2.731 2.836 2.935 2.969 3.229 3.314 3.455 3.581 3.717 3.786 3.917 4.05 4.219 4.313 4.407 4.527 4.622 4.723 4.853 4.984 5.117 5.225 5.33 5.438 5.534 5.624 5.725 5.842 5.944 6.038 6.133 6.237 6.324 6.401 6.476 6.507 6.497 6.461 6.36 6.163 5.846 5.236 3.993 2.45 1.181 0.033 -0.962 -1.828 -2.579 -3.231 -3.796 -4.369 -4.852 -5.298 -5.741 -6.159 -6.548 -6.888 -7.23 -7.541 -7.798 -8.071 -8.384 -8.655 -8.929 -9.202 -9.415 -9.649 -9.92 -10.196 -10.466 -10.648 -10.844 -11.164 -11.381 -11.602 -11.721 -11.99 -12.281 -12.556 -12.698 -13.039 -13.22 -13.402 -13.584 -13.986 -14.197 -14.446 -14.735 -15.109 -15.592 -16.222 -18.473 -8 ,12559 ,KEBNE ,16653129,Mon Nov 22 01:59:54 CET,Mon Nov 22 03:25:10 CET,0.0 1.105 1.463 1.714 1.933 2.105 2.25 2.391 2.644 2.752 2.863 2.911 3.159 3.253 3.428 3.574 3.703 3.758 3.867 3.966 4.101 4.198 4.288 4.405 4.532 4.635 4.728 4.831 4.956 5.075 5.172 5.263 5.358 5.462 5.577 5.682 5.769 5.851 5.921 6.009 6.104 6.184 6.246 6.273 6.275 6.241 6.135 5.927 5.568 4.918 3.787 2.345 1.008 -0.15 -1.146 -2.05 -2.833 -3.527 -4.112 -4.679 -5.16 -5.609 -6.056 -6.457 -6.821 -7.172 -7.529 -7.827 -8.086 -8.364 -8.663 -8.92 -9.184 -9.45 -9.658 -9.886 -10.13 -10.382 -10.647 -10.832 -11.026 -11.328 -11.528 -11.752 -11.872 -12.113 -12.365 -12.637 -12.781 -13.109 -13.264 -13.433 -13.611 -14.049 -14.332 -14.642 -14.946 -15.273 -15.675 -16.287 -18.405 -10 ,9073 ,KEBNE ,16653131,Mon Nov 22 01:59:54 CET,Mon Nov 22 03:23:12 CET,0.0 1.414 1.706 1.935 2.135 2.299 2.443 2.591 2.868 2.993 3.114 3.17 3.419 3.502 3.655 3.795 3.937 4.002 4.117 4.23 4.376 4.477 4.588 4.72 4.829 4.929 5.021 5.119 5.239 5.335 5.419 5.523 5.626 5.731 5.834 5.936 6.062 6.214 6.339 6.437 6.507 6.585 6.698 6.755 6.764 6.743 6.649 6.459 6.125 5.49 4.314 2.843 1.546 0.395 -0.568 -1.446 -2.229 -2.909 -3.492 -4.076 -4.564 -5.0 -5.435 -5.86 -6.248 -6.592 -6.943 -7.259 -7.531 -7.824 -8.151 -8.411 -8.69 -9.008 -9.238 -9.465 -9.708 -9.95 -10.209 -10.406 -10.615 -10.917 -11.116 -11.335 -11.456 -11.727 -12.005 -12.279 -12.425 -12.755 -12.917 -13.108 -13.304 -13.74 -13.985 -14.254 -14.563 -14.949 -15.402 -15.996 -18.288 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 346bbb8a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11720 ,KEBNE ,16653132,Mon Nov 22 01:59:56 CET,Mon Nov 22 03:20:27 CET,0.0 0.381 0.554 0.672 0.772 0.855 0.934 1.01 1.148 1.215 1.284 1.249 1.482 1.544 1.652 1.75 1.852 1.902 1.99 2.071 2.196 2.286 2.373 2.498 2.619 2.73 2.833 2.932 3.059 3.186 3.311 3.473 3.627 3.775 3.944 4.127 4.306 4.505 4.723 4.948 5.165 5.39 5.654 5.904 6.187 6.499 6.833 7.185 7.535 7.83 7.894 7.576 7.089 6.576 6.093 5.61 5.15 4.696 4.292 3.883 3.519 3.177 2.837 2.515 2.226 1.957 1.654 1.393 1.157 0.9 0.655 0.452 0.237 0.008 -0.17 -0.357 -0.561 -0.78 -1.025 -1.191 -1.356 -1.613 -1.788 -1.975 -2.087 -2.315 -2.545 -2.784 -2.903 -3.204 -3.36 -3.544 -3.741 -4.118 -4.357 -4.648 -4.903 -5.216 -5.706 -6.27 -8.072 -2 ,14008 ,KEBNE ,16653133,Mon Nov 22 01:59:57 CET,Mon Nov 22 03:20:54 CET,0.0 0.381 0.565 0.691 0.79 0.88 0.961 1.039 1.188 1.265 1.337 1.294 1.518 1.578 1.696 1.804 1.895 1.939 2.03 2.122 2.256 2.338 2.422 2.544 2.652 2.752 2.851 2.952 3.083 3.208 3.335 3.501 3.661 3.81 3.983 4.173 4.347 4.531 4.728 4.942 5.163 5.427 5.744 6.02 6.327 6.665 6.99 7.311 7.632 7.883 7.96 7.631 7.097 6.543 6.017 5.511 5.04 4.573 4.159 3.751 3.396 3.074 2.744 2.424 2.118 1.829 1.536 1.269 1.039 0.794 0.522 0.301 0.086 -0.158 -0.361 -0.567 -0.784 -1.017 -1.259 -1.431 -1.604 -1.865 -2.043 -2.227 -2.335 -2.565 -2.792 -3.027 -3.161 -3.466 -3.582 -3.747 -3.951 -4.396 -4.639 -4.924 -5.255 -5.612 -6.105 -6.757 -8.942 -3 ,32403 ,KEBNE ,16653134,Mon Nov 22 02:00:02 CET,Mon Nov 22 03:18:34 CET,0.0 0.527 0.698 0.824 0.942 1.043 1.14 1.234 1.398 1.464 1.524 1.482 1.709 1.77 1.882 1.983 2.071 2.113 2.194 2.275 2.409 2.495 2.574 2.69 2.8 2.904 3.004 3.103 3.237 3.364 3.486 3.629 3.772 3.92 4.09 4.285 4.473 4.667 4.862 5.077 5.316 5.58 5.865 6.14 6.437 6.737 7.079 7.438 7.74 7.939 7.954 7.629 7.121 6.582 6.068 5.567 5.115 4.691 4.301 3.904 3.557 3.242 2.924 2.615 2.328 2.055 1.764 1.505 1.269 1.015 0.755 0.527 0.291 0.057 -0.132 -0.352 -0.59 -0.817 -1.026 -1.177 -1.34 -1.594 -1.782 -1.975 -2.079 -2.288 -2.512 -2.763 -2.898 -3.203 -3.348 -3.528 -3.727 -4.1 -4.312 -4.552 -4.816 -5.13 -5.529 -6.126 -8.804 -4 ,18889 ,KEBNE ,16653135,Mon Nov 22 02:00:02 CET,Mon Nov 22 03:20:12 CET,0.0 0.428 0.564 0.682 0.782 0.87 0.95 1.029 1.169 1.233 1.295 1.245 1.469 1.528 1.635 1.735 1.832 1.878 1.962 2.044 2.171 2.252 2.33 2.447 2.557 2.666 2.783 2.906 3.061 3.206 3.345 3.508 3.66 3.811 3.989 4.172 4.341 4.532 4.741 4.973 5.217 5.471 5.743 5.984 6.265 6.576 6.887 7.222 7.574 7.848 7.919 7.546 7.038 6.554 6.089 5.633 5.191 4.763 4.375 3.984 3.628 3.271 2.909 2.59 2.306 2.039 1.752 1.471 1.216 0.944 0.651 0.41 0.168 -0.069 -0.255 -0.458 -0.662 -0.882 -1.112 -1.267 -1.436 -1.71 -1.888 -2.063 -2.159 -2.389 -2.627 -2.849 -2.972 -3.263 -3.348 -3.504 -3.699 -4.125 -4.374 -4.669 -5.027 -5.401 -5.768 -6.221 -7.976 -5 ,30712 ,KEBNE ,16653136,Mon Nov 22 01:59:56 CET,Mon Nov 22 03:20:26 CET,0.0 0.6 0.778 0.916 1.034 1.131 1.209 1.289 1.455 1.528 1.593 1.559 1.786 1.842 1.953 2.059 2.158 2.206 2.297 2.391 2.533 2.624 2.719 2.859 2.997 3.138 3.27 3.387 3.54 3.684 3.826 4.003 4.163 4.315 4.489 4.689 4.876 5.071 5.283 5.488 5.701 5.949 6.229 6.502 6.794 7.119 7.468 7.798 8.136 8.388 8.367 7.997 7.517 6.998 6.474 5.945 5.476 5.058 4.677 4.291 3.934 3.608 3.301 3.004 2.712 2.43 2.142 1.891 1.673 1.444 1.198 0.99 0.766 0.529 0.337 0.147 -0.051 -0.261 -0.464 -0.607 -0.779 -1.093 -1.316 -1.556 -1.675 -1.912 -2.193 -2.472 -2.598 -2.894 -3.042 -3.221 -3.423 -3.851 -4.069 -4.309 -4.594 -4.962 -5.417 -5.946 -8.409 -6 ,24158 ,KEBNE ,16653137,Mon Nov 22 02:00:56 CET,Mon Nov 22 03:23:03 CET,0.0 0.625 0.795 0.915 1.023 1.122 1.204 1.281 1.421 1.49 1.559 1.519 1.745 1.809 1.934 2.038 2.132 2.18 2.271 2.355 2.486 2.567 2.645 2.754 2.857 2.963 3.072 3.174 3.302 3.429 3.562 3.734 3.891 4.035 4.208 4.399 4.577 4.776 4.979 5.18 5.398 5.662 5.949 6.219 6.504 6.811 7.18 7.53 7.873 8.13 8.084 7.701 7.222 6.711 6.177 5.668 5.221 4.813 4.455 4.054 3.681 3.325 2.988 2.682 2.363 2.051 1.752 1.479 1.228 0.955 0.66 0.432 0.2 -0.03 -0.205 -0.391 -0.601 -0.819 -1.05 -1.222 -1.405 -1.712 -1.928 -2.154 -2.264 -2.496 -2.749 -3.008 -3.157 -3.465 -3.592 -3.777 -3.979 -4.42 -4.672 -4.943 -5.292 -5.689 -6.143 -6.792 -9.651 -7 ,1754 ,KEBNE ,16653138,Mon Nov 22 02:00:56 CET,Mon Nov 22 03:23:15 CET,0.0 0.363 0.503 0.618 0.714 0.8 0.883 0.961 1.096 1.159 1.222 1.184 1.409 1.466 1.577 1.686 1.795 1.847 1.946 2.036 2.167 2.257 2.344 2.471 2.594 2.711 2.826 2.937 3.078 3.216 3.356 3.52 3.682 3.844 4.013 4.192 4.372 4.566 4.779 5.0 5.224 5.482 5.766 6.043 6.334 6.646 7.026 7.375 7.694 7.958 8.022 7.673 7.135 6.615 6.102 5.577 5.114 4.657 4.252 3.87 3.517 3.176 2.845 2.537 2.263 2.002 1.711 1.437 1.195 0.957 0.706 0.491 0.255 0.003 -0.192 -0.383 -0.573 -0.789 -1.019 -1.185 -1.362 -1.625 -1.808 -2.0 -2.105 -2.338 -2.578 -2.815 -2.939 -3.24 -3.374 -3.528 -3.692 -4.088 -4.349 -4.643 -4.938 -5.246 -5.676 -6.262 -8.833 -8 ,13843 ,KEBNE ,16653139,Mon Nov 22 02:00:56 CET,Mon Nov 22 03:23:17 CET,0.0 0.517 0.679 0.81 0.914 1.011 1.106 1.193 1.347 1.419 1.487 1.451 1.677 1.735 1.853 1.959 2.051 2.098 2.2 2.297 2.426 2.504 2.583 2.696 2.795 2.895 3.004 3.121 3.273 3.417 3.555 3.721 3.881 4.033 4.212 4.412 4.596 4.792 4.99 5.199 5.425 5.662 5.932 6.222 6.555 6.887 7.24 7.602 7.973 8.293 8.343 7.978 7.496 6.974 6.455 5.99 5.549 5.108 4.72 4.312 3.956 3.642 3.338 3.027 2.724 2.457 2.168 1.902 1.671 1.421 1.16 0.95 0.722 0.465 0.263 0.076 -0.124 -0.36 -0.606 -0.783 -0.96 -1.205 -1.394 -1.599 -1.714 -1.994 -2.282 -2.579 -2.725 -3.033 -3.187 -3.356 -3.528 -3.929 -4.145 -4.367 -4.621 -4.934 -5.422 -6.095 -9.667 -10 ,1164 ,KEBNE ,16653141,Mon Nov 22 02:00:56 CET,Mon Nov 22 03:24:47 CET,0.0 0.447 0.582 0.707 0.82 0.915 1.007 1.096 1.253 1.323 1.388 1.336 1.557 1.609 1.71 1.808 1.892 1.936 2.026 2.112 2.24 2.324 2.403 2.503 2.603 2.705 2.805 2.895 3.006 3.119 3.234 3.379 3.53 3.674 3.84 4.035 4.209 4.39 4.592 4.814 5.041 5.292 5.578 5.855 6.181 6.52 6.857 7.182 7.483 7.678 7.719 7.486 7.018 6.478 5.986 5.52 5.087 4.658 4.273 3.881 3.492 3.13 2.816 2.529 2.248 1.983 1.693 1.43 1.21 0.985 0.746 0.535 0.302 0.073 -0.102 -0.303 -0.531 -0.767 -0.999 -1.16 -1.325 -1.559 -1.731 -1.939 -2.056 -2.29 -2.521 -2.763 -2.889 -3.188 -3.338 -3.514 -3.691 -4.07 -4.281 -4.519 -4.799 -5.103 -5.53 -6.175 -9.741 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt deleted file mode 100644 index a3ccd719..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11717 ,KEBNE ,16653142,Mon Nov 22 02:00:56 CET,Mon Nov 22 03:24:08 CET,0.0 0.724 1.066 1.301 1.501 1.713 1.911 2.072 2.332 2.425 2.498 2.486 2.725 2.798 2.929 3.05 3.164 3.218 3.321 3.419 3.566 3.669 3.777 3.922 4.039 4.156 4.273 4.39 4.546 4.682 4.803 4.932 5.057 5.188 5.332 5.476 5.618 5.766 5.925 6.091 6.251 6.425 6.613 6.798 6.995 7.16 7.274 7.298 7.203 6.91 6.164 5.088 4.058 3.037 2.135 1.379 0.711 0.071 -0.488 -1.054 -1.538 -1.952 -2.345 -2.706 -3.035 -3.357 -3.695 -3.997 -4.269 -4.53 -4.786 -5.009 -5.262 -5.529 -5.732 -5.934 -6.153 -6.382 -6.613 -6.772 -6.932 -7.205 -7.399 -7.593 -7.695 -7.91 -8.146 -8.361 -8.463 -8.755 -8.847 -8.983 -9.103 -9.366 -9.516 -9.687 -9.888 -10.13 -10.418 -10.789 -12.287 -2 ,8826 ,KEBNE ,16653143,Mon Nov 22 02:01:00 CET,Mon Nov 22 03:21:10 CET,0.0 0.708 0.923 1.072 1.21 1.33 1.431 1.525 1.703 1.786 1.868 1.847 2.08 2.153 2.285 2.393 2.506 2.57 2.691 2.795 2.942 3.048 3.149 3.295 3.442 3.596 3.746 3.862 4.0 4.128 4.248 4.396 4.55 4.707 4.853 5.0 5.152 5.317 5.485 5.642 5.792 5.967 6.148 6.288 6.434 6.562 6.653 6.676 6.59 6.321 5.642 4.511 3.411 2.438 1.568 0.783 0.082 -0.574 -1.134 -1.69 -2.182 -2.617 -3.017 -3.38 -3.728 -4.065 -4.408 -4.716 -4.987 -5.261 -5.552 -5.783 -6.02 -6.307 -6.541 -6.757 -6.966 -7.184 -7.418 -7.586 -7.765 -8.043 -8.228 -8.435 -8.543 -8.757 -8.977 -9.204 -9.323 -9.607 -9.663 -9.797 -9.921 -10.173 -10.327 -10.493 -10.67 -10.87 -11.105 -11.405 -12.882 -3 ,4388 ,KEBNE ,16653144,Mon Nov 22 02:01:57 CET,Mon Nov 22 03:25:25 CET,0.0 1.055 1.304 1.489 1.668 1.817 1.948 2.065 2.291 2.411 2.517 2.558 2.81 2.9 3.084 3.234 3.36 3.417 3.542 3.677 3.854 3.961 4.073 4.249 4.43 4.588 4.698 4.803 4.943 5.071 5.192 5.33 5.458 5.568 5.693 5.847 5.997 6.155 6.306 6.457 6.61 6.784 6.973 7.122 7.286 7.466 7.593 7.601 7.465 7.083 6.187 4.872 3.769 2.774 1.842 1.033 0.334 -0.322 -0.915 -1.5 -1.983 -2.396 -2.78 -3.157 -3.509 -3.823 -4.152 -4.467 -4.746 -5.026 -5.328 -5.582 -5.834 -6.085 -6.269 -6.468 -6.681 -6.906 -7.14 -7.299 -7.475 -7.757 -7.955 -8.148 -8.243 -8.442 -8.653 -8.896 -9.024 -9.328 -9.431 -9.578 -9.728 -10.018 -10.174 -10.353 -10.569 -10.782 -11.026 -11.4 -13.723 -4 ,17286 ,KEBNE ,16653145,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:25:24 CET,0.0 0.789 1.069 1.262 1.406 1.544 1.683 1.801 2.007 2.119 2.208 2.179 2.413 2.484 2.609 2.749 2.898 2.962 3.074 3.191 3.361 3.468 3.576 3.72 3.849 3.97 4.09 4.207 4.364 4.516 4.649 4.79 4.93 5.072 5.234 5.406 5.558 5.719 5.908 6.1 6.268 6.432 6.599 6.749 6.907 7.044 7.142 7.164 7.073 6.747 5.884 4.6 3.451 2.471 1.579 0.784 0.116 -0.489 -0.999 -1.521 -2.009 -2.446 -2.845 -3.22 -3.566 -3.884 -4.229 -4.547 -4.823 -5.098 -5.371 -5.598 -5.84 -6.09 -6.278 -6.473 -6.678 -6.89 -7.122 -7.275 -7.428 -7.674 -7.842 -8.014 -8.103 -8.298 -8.52 -8.735 -8.835 -9.118 -9.196 -9.345 -9.497 -9.828 -10.006 -10.187 -10.387 -10.606 -10.881 -11.284 -12.768 -5 ,16106 ,KEBNE ,16653146,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:25:16 CET,0.0 0.667 0.958 1.184 1.373 1.511 1.626 1.747 1.958 2.042 2.118 2.104 2.35 2.43 2.585 2.727 2.858 2.926 3.05 3.166 3.328 3.429 3.531 3.669 3.799 3.917 4.036 4.161 4.304 4.431 4.555 4.712 4.847 4.961 5.094 5.239 5.384 5.538 5.696 5.846 6.003 6.164 6.322 6.478 6.604 6.701 6.796 6.866 6.821 6.561 5.825 4.685 3.578 2.517 1.652 0.879 0.169 -0.456 -0.988 -1.522 -2.007 -2.461 -2.898 -3.296 -3.638 -3.948 -4.272 -4.554 -4.809 -5.088 -5.376 -5.616 -5.862 -6.111 -6.304 -6.492 -6.691 -6.907 -7.141 -7.295 -7.455 -7.716 -7.893 -8.079 -8.175 -8.381 -8.6 -8.83 -8.955 -9.251 -9.345 -9.499 -9.655 -9.98 -10.153 -10.334 -10.523 -10.751 -11.056 -11.425 -12.671 -6 ,8919 ,KEBNE ,16653147,Mon Nov 22 02:01:57 CET,Mon Nov 22 03:25:30 CET,0.0 0.848 1.079 1.254 1.408 1.556 1.694 1.811 1.994 2.081 2.168 2.174 2.425 2.512 2.667 2.797 2.935 3.005 3.12 3.236 3.404 3.51 3.62 3.778 3.924 4.056 4.173 4.292 4.458 4.609 4.736 4.882 5.016 5.141 5.296 5.457 5.597 5.752 5.923 6.101 6.266 6.438 6.629 6.791 6.939 7.091 7.235 7.302 7.248 6.93 6.151 5.031 3.908 2.897 2.079 1.332 0.614 -0.039 -0.572 -1.102 -1.574 -2.013 -2.425 -2.815 -3.2 -3.54 -3.873 -4.17 -4.424 -4.7 -4.998 -5.243 -5.485 -5.732 -5.925 -6.116 -6.329 -6.56 -6.791 -6.947 -7.101 -7.335 -7.512 -7.724 -7.835 -8.041 -8.269 -8.495 -8.606 -8.902 -8.952 -9.075 -9.229 -9.57 -9.732 -9.894 -10.089 -10.334 -10.613 -10.96 -12.108 -7 ,10075 ,KEBNE ,16653148,Mon Nov 22 02:01:57 CET,Mon Nov 22 03:25:19 CET,0.0 0.898 1.133 1.323 1.517 1.688 1.831 1.959 2.184 2.289 2.387 2.414 2.669 2.761 2.947 3.12 3.29 3.379 3.543 3.675 3.845 3.946 4.045 4.202 4.348 4.472 4.58 4.689 4.833 4.969 5.106 5.263 5.404 5.532 5.661 5.817 5.965 6.12 6.28 6.426 6.568 6.727 6.908 7.067 7.224 7.356 7.449 7.473 7.408 7.173 6.477 5.341 4.273 3.344 2.452 1.611 0.929 0.309 -0.246 -0.797 -1.273 -1.685 -2.052 -2.418 -2.776 -3.11 -3.457 -3.786 -4.084 -4.388 -4.699 -4.939 -5.184 -5.445 -5.639 -5.831 -6.047 -6.265 -6.489 -6.65 -6.819 -7.092 -7.267 -7.438 -7.527 -7.718 -7.915 -8.108 -8.215 -8.513 -8.607 -8.744 -8.882 -9.182 -9.343 -9.512 -9.702 -9.945 -10.208 -10.6 -11.766 -8 ,8808 ,KEBNE ,16653149,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:25:25 CET,0.0 0.801 1.158 1.373 1.527 1.659 1.779 1.892 2.092 2.179 2.26 2.243 2.483 2.562 2.743 2.914 3.051 3.117 3.255 3.4 3.618 3.752 3.877 4.057 4.22 4.366 4.498 4.613 4.757 4.89 5.009 5.148 5.273 5.389 5.521 5.667 5.806 5.954 6.11 6.254 6.406 6.568 6.743 6.903 7.058 7.201 7.331 7.422 7.392 7.123 6.424 5.312 4.203 3.194 2.307 1.512 0.807 0.173 -0.361 -0.909 -1.396 -1.828 -2.252 -2.648 -2.997 -3.308 -3.631 -3.916 -4.168 -4.435 -4.72 -4.978 -5.244 -5.5 -5.699 -5.907 -6.125 -6.353 -6.59 -6.756 -6.934 -7.202 -7.38 -7.583 -7.693 -7.899 -8.108 -8.326 -8.432 -8.725 -8.806 -8.935 -9.067 -9.349 -9.51 -9.699 -9.879 -10.073 -10.346 -10.729 -11.7 -9 ,6757 ,KEBNE ,16653150,Mon Nov 22 02:01:57 CET,Mon Nov 22 03:25:27 CET,0.0 0.844 1.122 1.329 1.527 1.701 1.842 1.966 2.201 2.302 2.399 2.427 2.675 2.767 2.949 3.104 3.24 3.3 3.42 3.536 3.694 3.796 3.894 4.026 4.15 4.271 4.392 4.513 4.669 4.832 5.001 5.194 5.359 5.503 5.646 5.779 5.906 6.056 6.206 6.372 6.556 6.737 6.934 7.093 7.248 7.388 7.481 7.527 7.455 7.142 6.289 5.061 3.953 2.913 2.048 1.27 0.558 -0.088 -0.637 -1.176 -1.631 -2.034 -2.42 -2.771 -3.104 -3.441 -3.791 -4.087 -4.35 -4.627 -4.921 -5.163 -5.414 -5.671 -5.86 -6.061 -6.277 -6.506 -6.739 -6.892 -7.048 -7.293 -7.46 -7.639 -7.747 -7.995 -8.247 -8.493 -8.613 -8.899 -8.986 -9.128 -9.276 -9.581 -9.749 -9.952 -10.173 -10.429 -10.757 -11.145 -12.314 -10 ,2756 ,KEBNE ,16653151,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:25:20 CET,0.0 0.756 1.058 1.301 1.508 1.664 1.816 1.943 2.179 2.298 2.402 2.425 2.672 2.756 2.926 3.109 3.283 3.355 3.481 3.607 3.806 3.933 4.054 4.223 4.368 4.5 4.621 4.73 4.875 5.019 5.155 5.306 5.443 5.571 5.717 5.867 5.989 6.127 6.285 6.452 6.608 6.765 6.946 7.084 7.206 7.312 7.393 7.406 7.316 6.961 6.067 4.804 3.636 2.605 1.733 0.917 0.209 -0.405 -0.957 -1.517 -1.988 -2.419 -2.833 -3.213 -3.558 -3.869 -4.195 -4.488 -4.748 -5.013 -5.29 -5.532 -5.784 -6.055 -6.256 -6.452 -6.665 -6.886 -7.108 -7.256 -7.417 -7.694 -7.898 -8.108 -8.21 -8.413 -8.628 -8.869 -9.002 -9.306 -9.414 -9.569 -9.73 -10.05 -10.214 -10.398 -10.601 -10.852 -11.156 -11.526 -12.788 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index f7673fce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31716 ,KEBNE ,17069324,Fri Dec 24 00:39:06 CET,Fri Dec 24 02:01:33 CET,0.0 0.574 0.796 0.998 1.189 1.348 1.511 1.674 1.934 2.045 2.158 2.198 2.444 2.525 2.681 2.837 2.99 3.066 3.219 3.349 3.526 3.656 3.781 3.954 4.114 4.263 4.414 4.563 4.756 4.947 5.128 5.329 5.515 5.704 5.937 6.191 6.436 6.712 7.008 7.316 7.63 7.991 8.403 8.801 9.237 9.73 10.316 10.919 11.551 12.201 12.746 12.899 12.773 12.581 12.338 12.054 11.782 11.493 11.209 10.917 10.658 10.425 10.191 9.963 9.751 9.573 9.395 9.223 9.06 8.884 8.697 8.541 8.383 8.225 8.102 7.961 7.813 7.648 7.473 7.356 7.235 7.049 6.921 6.79 6.721 6.571 6.414 6.252 6.157 5.901 5.849 5.741 5.636 5.384 5.239 5.085 4.92 4.734 4.518 4.187 3.144 -2 ,12091 ,KEBNE ,17069325,Fri Dec 24 00:42:21 CET,Fri Dec 24 02:06:46 CET,0.0 0.751 0.96 1.106 1.228 1.347 1.456 1.554 1.739 1.831 1.924 1.932 2.176 2.245 2.379 2.517 2.655 2.728 2.872 3.011 3.22 3.348 3.475 3.661 3.833 3.998 4.146 4.285 4.459 4.627 4.797 5.001 5.202 5.397 5.613 5.869 6.113 6.381 6.684 6.994 7.312 7.663 8.051 8.443 8.875 9.342 9.879 10.442 11.058 11.678 12.201 12.395 12.338 12.147 11.906 11.625 11.32 11.036 10.777 10.497 10.245 10.013 9.79 9.587 9.391 9.198 8.984 8.783 8.618 8.442 8.245 8.093 7.94 7.776 7.64 7.5 7.36 7.218 7.068 6.959 6.85 6.678 6.551 6.416 6.356 6.237 6.115 5.977 5.901 5.672 5.679 5.589 5.492 5.287 5.173 5.047 4.918 4.778 4.617 4.386 3.646 -3 ,29626 ,KEBNE ,17069326,Fri Dec 24 00:42:21 CET,Fri Dec 24 02:07:02 CET,0.0 0.493 0.691 0.855 0.996 1.113 1.235 1.348 1.539 1.621 1.703 1.7 1.944 2.016 2.146 2.267 2.384 2.444 2.567 2.696 2.888 3.007 3.124 3.293 3.453 3.614 3.769 3.907 4.091 4.272 4.443 4.649 4.856 5.064 5.295 5.562 5.818 6.084 6.361 6.653 6.979 7.339 7.74 8.151 8.607 9.113 9.701 10.307 10.952 11.621 12.256 12.518 12.434 12.215 11.969 11.712 11.428 11.144 10.904 10.633 10.373 10.12 9.885 9.685 9.483 9.27 9.052 8.873 8.715 8.537 8.349 8.192 8.023 7.857 7.727 7.594 7.459 7.302 7.133 7.011 6.889 6.71 6.582 6.467 6.404 6.255 6.1 5.94 5.857 5.622 5.62 5.524 5.425 5.222 5.117 5.01 4.882 4.728 4.562 4.342 3.719 -4 ,27695 ,KEBNE ,17069327,Fri Dec 24 00:42:21 CET,Fri Dec 24 02:06:35 CET,0.0 0.552 0.749 0.934 1.105 1.237 1.348 1.46 1.69 1.795 1.896 1.926 2.183 2.277 2.444 2.601 2.745 2.817 2.96 3.096 3.299 3.429 3.548 3.718 3.889 4.052 4.205 4.36 4.553 4.728 4.909 5.128 5.327 5.52 5.742 5.985 6.231 6.5 6.783 7.085 7.393 7.731 8.142 8.551 8.994 9.455 9.981 10.577 11.197 11.871 12.519 12.722 12.59 12.365 12.143 11.876 11.599 11.331 11.076 10.791 10.54 10.3 10.065 9.833 9.613 9.424 9.216 9.037 8.884 8.71 8.529 8.383 8.231 8.063 7.925 7.783 7.63 7.466 7.3 7.186 7.074 6.896 6.758 6.613 6.542 6.396 6.235 6.054 5.961 5.708 5.657 5.548 5.428 5.157 5.008 4.833 4.66 4.506 4.334 4.075 3.419 -5 ,17099 ,KEBNE ,17069328,Fri Dec 24 00:42:21 CET,Fri Dec 24 02:06:19 CET,0.0 0.604 0.801 0.954 1.076 1.198 1.314 1.432 1.652 1.746 1.833 1.821 2.059 2.133 2.274 2.409 2.536 2.596 2.714 2.828 2.997 3.113 3.232 3.408 3.569 3.728 3.894 4.056 4.255 4.434 4.617 4.843 5.052 5.252 5.481 5.737 5.991 6.263 6.532 6.813 7.118 7.463 7.847 8.224 8.676 9.189 9.746 10.323 10.962 11.635 12.219 12.389 12.267 12.064 11.827 11.553 11.252 10.96 10.713 10.447 10.2 9.977 9.762 9.562 9.378 9.2 9.0 8.824 8.673 8.513 8.348 8.204 8.046 7.884 7.764 7.632 7.49 7.349 7.196 7.084 6.965 6.775 6.646 6.509 6.435 6.278 6.107 5.94 5.86 5.619 5.606 5.525 5.43 5.22 5.12 4.991 4.843 4.683 4.499 4.293 3.425 -6 ,6426 ,KEBNE ,17069329,Fri Dec 24 00:43:26 CET,Fri Dec 24 02:07:52 CET,0.0 0.485 0.665 0.824 0.975 1.105 1.222 1.324 1.506 1.591 1.673 1.682 1.931 2.012 2.173 2.333 2.483 2.558 2.711 2.847 3.03 3.15 3.27 3.446 3.608 3.763 3.915 4.061 4.255 4.447 4.625 4.839 5.039 5.227 5.458 5.711 5.947 6.218 6.511 6.816 7.135 7.486 7.879 8.254 8.699 9.193 9.753 10.349 10.978 11.631 12.225 12.467 12.407 12.243 12.003 11.725 11.453 11.202 10.963 10.707 10.464 10.227 9.989 9.764 9.561 9.361 9.14 8.944 8.786 8.623 8.434 8.265 8.099 7.939 7.811 7.671 7.533 7.389 7.237 7.132 7.02 6.834 6.701 6.57 6.507 6.358 6.178 5.997 5.897 5.637 5.603 5.494 5.365 5.105 4.985 4.863 4.739 4.588 4.415 4.217 3.526 -7 ,16224 ,KEBNE ,17069330,Fri Dec 24 00:45:36 CET,Fri Dec 24 02:08:31 CET,0.0 0.539 0.746 0.899 1.023 1.135 1.245 1.352 1.552 1.65 1.743 1.75 2.008 2.106 2.283 2.442 2.606 2.683 2.815 2.943 3.131 3.252 3.369 3.533 3.693 3.848 3.991 4.137 4.334 4.525 4.704 4.915 5.114 5.31 5.53 5.779 6.027 6.294 6.585 6.885 7.198 7.558 7.984 8.391 8.859 9.367 9.906 10.517 11.178 11.78 12.313 12.496 12.411 12.2 11.934 11.651 11.349 11.036 10.743 10.449 10.208 9.976 9.744 9.528 9.319 9.119 8.897 8.694 8.527 8.359 8.173 8.013 7.847 7.67 7.537 7.4 7.26 7.115 6.957 6.846 6.737 6.569 6.446 6.32 6.254 6.124 6.0 5.863 5.783 5.544 5.52 5.421 5.314 5.068 4.936 4.81 4.661 4.493 4.283 4.0 3.394 -8 ,24031 ,KEBNE ,17069331,Fri Dec 24 00:46:41 CET,Fri Dec 24 02:09:10 CET,0.0 0.553 0.775 0.947 1.091 1.21 1.322 1.42 1.597 1.682 1.762 1.756 2.007 2.095 2.26 2.415 2.559 2.631 2.778 2.909 3.094 3.222 3.347 3.524 3.686 3.842 3.994 4.141 4.329 4.52 4.706 4.917 5.117 5.309 5.541 5.794 6.029 6.298 6.587 6.879 7.196 7.576 8.006 8.406 8.858 9.35 9.922 10.541 11.183 11.872 12.495 12.701 12.591 12.358 12.096 11.823 11.547 11.274 11.034 10.765 10.52 10.301 10.07 9.838 9.623 9.442 9.253 9.058 8.879 8.688 8.493 8.338 8.174 7.997 7.852 7.697 7.543 7.389 7.231 7.125 7.016 6.845 6.727 6.602 6.54 6.413 6.279 6.14 6.068 5.829 5.82 5.737 5.646 5.437 5.325 5.21 5.079 4.926 4.759 4.553 3.917 -9 ,5218 ,KEBNE ,17069332,Fri Dec 24 00:46:41 CET,Fri Dec 24 02:09:25 CET,0.0 0.646 0.876 1.046 1.213 1.385 1.542 1.686 1.929 2.037 2.138 2.179 2.439 2.529 2.699 2.862 3.015 3.088 3.231 3.362 3.545 3.665 3.791 3.971 4.134 4.287 4.44 4.592 4.788 4.97 5.146 5.36 5.58 5.783 5.995 6.233 6.469 6.726 7.001 7.292 7.587 7.936 8.348 8.755 9.218 9.704 10.257 10.864 11.492 12.115 12.657 12.868 12.83 12.679 12.454 12.165 11.861 11.571 11.324 11.06 10.816 10.591 10.372 10.146 9.934 9.749 9.552 9.37 9.202 9.022 8.831 8.684 8.541 8.393 8.262 8.114 7.972 7.828 7.672 7.558 7.445 7.266 7.13 6.988 6.911 6.762 6.62 6.473 6.398 6.162 6.148 6.053 5.959 5.751 5.635 5.511 5.383 5.247 5.066 4.796 3.993 -10 ,28004 ,KEBNE ,17069333,Fri Dec 24 00:48:48 CET,Fri Dec 24 02:11:36 CET,0.0 0.611 0.843 1.022 1.171 1.289 1.398 1.513 1.739 1.834 1.922 1.92 2.169 2.254 2.425 2.597 2.75 2.826 2.984 3.126 3.313 3.434 3.553 3.723 3.887 4.042 4.192 4.337 4.522 4.696 4.865 5.078 5.289 5.494 5.729 5.987 6.225 6.482 6.78 7.09 7.399 7.751 8.159 8.578 9.05 9.535 10.061 10.628 11.225 11.837 12.463 12.67 12.565 12.337 12.075 11.814 11.536 11.255 11.009 10.744 10.499 10.281 10.07 9.859 9.658 9.462 9.258 9.083 8.933 8.772 8.583 8.431 8.272 8.097 7.962 7.824 7.686 7.538 7.385 7.272 7.142 6.941 6.802 6.669 6.606 6.46 6.294 6.119 6.031 5.791 5.791 5.707 5.616 5.407 5.29 5.166 5.019 4.865 4.692 4.453 3.695 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt deleted file mode 100644 index d9640d92..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17041 ,KEBNE ,16653152,Mon Nov 22 02:01:57 CET,Mon Nov 22 03:25:16 CET,0.0 3.199 3.545 3.792 3.998 4.167 4.327 4.487 4.735 4.831 4.922 4.873 5.177 5.266 5.426 5.568 5.704 5.769 5.887 5.994 6.164 6.284 6.409 6.577 6.728 6.875 7.012 7.141 7.303 7.455 7.596 7.766 7.942 8.114 8.307 8.518 8.74 9.02 9.274 9.479 9.705 9.952 10.203 10.421 10.638 10.826 11.042 11.237 11.256 11.019 10.27 9.138 8.084 7.123 6.218 5.4 4.675 4.015 3.441 2.844 2.324 1.856 1.394 0.969 0.587 0.223 -0.175 -0.517 -0.799 -1.105 -1.423 -1.686 -1.985 -2.294 -2.521 -2.775 -3.044 -3.305 -3.594 -3.801 -4.011 -4.378 -4.64 -4.896 -5.029 -5.333 -5.658 -5.961 -6.12 -6.509 -6.615 -6.793 -6.983 -7.396 -7.631 -7.91 -8.224 -8.558 -8.993 -9.692 -12.348 -2 ,3450 ,KEBNE ,16653153,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:25:41 CET,0.0 1.453 1.813 2.05 2.241 2.419 2.608 2.783 3.072 3.2 3.33 3.362 3.675 3.769 3.962 4.145 4.329 4.425 4.597 4.75 4.974 5.138 5.296 5.488 5.689 5.871 6.008 6.134 6.294 6.493 6.693 6.875 7.044 7.221 7.398 7.591 7.788 7.995 8.187 8.365 8.54 8.739 8.976 9.222 9.473 9.666 9.814 9.846 9.786 9.514 8.718 7.527 6.408 5.434 4.587 3.775 3.05 2.405 1.86 1.321 0.811 0.339 -0.088 -0.498 -0.889 -1.254 -1.626 -1.941 -2.238 -2.557 -2.873 -3.142 -3.442 -3.751 -3.978 -4.247 -4.533 -4.818 -5.143 -5.378 -5.621 -6.014 -6.276 -6.556 -6.707 -7.0 -7.282 -7.58 -7.749 -8.146 -8.27 -8.43 -8.592 -8.997 -9.222 -9.447 -9.712 -10.01 -10.355 -10.808 -13.487 -3 ,7014 ,KEBNE ,16653154,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:25:33 CET,0.0 1.605 1.907 2.151 2.368 2.54 2.684 2.811 3.052 3.169 3.286 3.296 3.616 3.718 3.893 4.06 4.211 4.287 4.441 4.572 4.758 4.885 5.025 5.226 5.381 5.548 5.716 5.856 6.034 6.177 6.329 6.527 6.695 6.846 7.016 7.192 7.354 7.544 7.76 7.955 8.164 8.389 8.604 8.813 9.027 9.241 9.41 9.481 9.448 9.202 8.489 7.368 6.319 5.396 4.548 3.722 3.015 2.362 1.797 1.243 0.748 0.301 -0.129 -0.561 -0.971 -1.327 -1.703 -2.079 -2.392 -2.683 -2.996 -3.266 -3.553 -3.853 -4.111 -4.391 -4.64 -4.906 -5.205 -5.392 -5.584 -5.907 -6.127 -6.344 -6.454 -6.692 -6.95 -7.21 -7.355 -7.725 -7.825 -8.019 -8.228 -8.671 -8.891 -9.12 -9.379 -9.678 -10.042 -10.612 -13.098 -4 ,5676 ,KEBNE ,16653155,Mon Nov 22 02:01:57 CET,Mon Nov 22 03:25:36 CET,0.0 2.233 2.684 2.926 3.101 3.267 3.421 3.586 3.91 4.038 4.152 4.117 4.411 4.501 4.678 4.862 5.046 5.136 5.304 5.448 5.639 5.765 5.893 6.075 6.242 6.413 6.575 6.721 6.89 7.03 7.177 7.349 7.493 7.638 7.816 8.006 8.189 8.374 8.555 8.753 8.933 9.114 9.325 9.518 9.726 9.963 10.164 10.267 10.222 9.9 9.093 7.877 6.755 5.741 4.83 4.028 3.313 2.652 2.094 1.522 1.002 0.529 0.045 -0.391 -0.778 -1.158 -1.563 -1.929 -2.253 -2.578 -2.894 -3.161 -3.449 -3.749 -3.98 -4.209 -4.486 -4.812 -5.121 -5.312 -5.51 -5.815 -6.034 -6.258 -6.368 -6.619 -6.903 -7.236 -7.399 -7.758 -7.829 -8.01 -8.187 -8.507 -8.7 -8.943 -9.185 -9.465 -9.811 -10.207 -12.788 -5 ,13597 ,KEBNE ,16653156,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:25:21 CET,0.0 2.094 2.525 2.81 3.046 3.27 3.451 3.611 3.896 4.022 4.148 4.173 4.484 4.572 4.762 4.956 5.132 5.22 5.392 5.554 5.787 5.939 6.084 6.3 6.504 6.706 6.898 7.054 7.243 7.43 7.613 7.811 7.97 8.101 8.256 8.443 8.621 8.814 9.027 9.229 9.431 9.675 9.926 10.128 10.359 10.568 10.702 10.754 10.634 10.273 9.483 8.317 7.204 6.128 5.133 4.205 3.377 2.587 1.845 1.163 0.6 0.056 -0.426 -0.854 -1.286 -1.688 -2.085 -2.419 -2.711 -3.015 -3.334 -3.616 -3.892 -4.189 -4.44 -4.675 -4.918 -5.186 -5.477 -5.685 -5.898 -6.213 -6.448 -6.703 -6.829 -7.105 -7.387 -7.676 -7.827 -8.206 -8.299 -8.477 -8.702 -9.204 -9.473 -9.765 -10.102 -10.525 -11.012 -11.622 -14.611 -6 ,24279 ,KEBNE ,16653157,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:25:43 CET,0.0 1.939 2.323 2.553 2.756 2.951 3.117 3.256 3.521 3.659 3.782 3.79 4.108 4.202 4.374 4.554 4.735 4.812 4.957 5.098 5.312 5.449 5.58 5.774 5.963 6.148 6.319 6.463 6.616 6.757 6.913 7.151 7.376 7.546 7.723 7.907 8.085 8.276 8.475 8.684 8.878 9.054 9.238 9.431 9.628 9.807 9.965 10.067 10.069 9.859 9.126 7.952 6.82 5.79 4.907 4.12 3.414 2.778 2.212 1.625 1.109 0.628 0.193 -0.203 -0.587 -0.951 -1.341 -1.658 -1.932 -2.296 -2.68 -2.961 -3.253 -3.575 -3.826 -4.103 -4.415 -4.721 -4.999 -5.177 -5.363 -5.701 -5.934 -6.142 -6.273 -6.59 -6.919 -7.257 -7.431 -7.833 -7.951 -8.128 -8.328 -8.784 -9.03 -9.289 -9.615 -9.981 -10.377 -10.923 -12.964 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index c0854c1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20536 ,KEBNE ,16653162,Mon Nov 22 02:01:57 CET,Mon Nov 22 03:25:03 CET,0.0 2.853 3.264 3.578 3.859 4.12 4.366 4.589 4.981 5.155 5.315 5.412 5.776 5.929 6.232 6.515 6.782 6.919 7.2 7.452 7.788 8.017 8.251 8.618 8.975 9.295 9.611 9.914 10.301 10.686 11.065 11.525 11.963 12.396 12.909 13.503 14.094 14.763 15.494 16.256 17.082 18.051 19.202 20.403 21.836 23.474 25.465 27.791 30.548 33.935 38.319 42.104 44.449 46.012 47.034 47.754 48.25 48.599 48.802 48.909 48.941 48.972 49.032 49.058 49.048 49.019 48.966 48.898 48.83 48.741 48.632 48.538 48.445 48.337 48.216 48.056 47.891 47.727 47.565 47.441 47.288 47.045 46.883 46.732 46.655 46.479 46.271 46.051 45.939 45.66 45.542 45.385 45.198 44.769 44.529 44.236 43.894 43.472 42.881 42.049 38.633 -2 ,19362 ,KEBNE ,16653163,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:24:57 CET,0.0 0.99 1.411 1.718 1.969 2.184 2.404 2.631 3.041 3.242 3.437 3.573 3.945 4.089 4.377 4.665 4.938 5.071 5.344 5.614 5.973 6.194 6.422 6.755 7.077 7.394 7.715 8.032 8.431 8.839 9.249 9.751 10.246 10.708 11.227 11.813 12.395 13.057 13.777 14.566 15.423 16.395 17.569 18.789 20.238 21.896 23.89 26.193 28.993 32.472 36.87 40.717 43.027 44.539 45.57 46.266 46.776 47.178 47.432 47.599 47.725 47.801 47.839 47.858 47.848 47.818 47.723 47.634 47.562 47.47 47.381 47.3 47.207 47.096 46.977 46.846 46.734 46.616 46.483 46.379 46.259 46.064 45.915 45.739 45.651 45.467 45.258 45.03 44.906 44.6 44.418 44.219 44.015 43.654 43.449 43.194 42.924 42.603 42.157 41.541 38.679 -3 ,31103 ,KEBNE ,16653164,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:25:06 CET,0.0 1.076 1.477 1.818 2.083 2.297 2.513 2.721 3.089 3.266 3.447 3.58 3.948 4.1 4.39 4.657 4.924 5.054 5.305 5.551 5.903 6.141 6.369 6.695 7.03 7.353 7.658 7.968 8.374 8.763 9.158 9.632 10.088 10.539 11.058 11.657 12.235 12.882 13.615 14.398 15.239 16.216 17.364 18.539 19.975 21.598 23.523 25.844 28.644 32.006 36.282 39.988 42.293 43.838 44.867 45.635 46.176 46.539 46.776 46.956 47.07 47.153 47.204 47.207 47.181 47.148 47.101 47.048 46.995 46.925 46.808 46.711 46.618 46.504 46.425 46.339 46.21 46.058 45.922 45.821 45.712 45.557 45.439 45.317 45.251 45.076 44.892 44.684 44.555 44.259 44.11 43.938 43.764 43.378 43.167 42.934 42.643 42.234 41.789 41.232 38.969 -4 ,25865 ,KEBNE ,16653165,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:25:22 CET,0.0 2.36 2.764 3.099 3.387 3.632 3.85 4.06 4.425 4.595 4.772 4.912 5.291 5.452 5.777 6.074 6.343 6.475 6.73 6.983 7.342 7.575 7.804 8.13 8.442 8.737 9.037 9.346 9.742 10.127 10.507 10.984 11.453 11.9 12.421 13.013 13.59 14.239 14.962 15.754 16.599 17.568 18.719 19.917 21.36 22.996 24.941 27.25 30.049 33.435 37.869 41.729 44.044 45.616 46.672 47.419 47.95 48.292 48.509 48.718 48.847 48.91 48.958 48.977 48.982 48.976 48.92 48.853 48.794 48.715 48.611 48.517 48.41 48.301 48.209 48.093 47.97 47.833 47.692 47.608 47.504 47.295 47.14 46.971 46.889 46.7 46.477 46.241 46.099 45.782 45.64 45.498 45.33 44.878 44.626 44.374 44.091 43.71 43.242 42.553 40.283 -5 ,23110 ,KEBNE ,16653166,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:24:53 CET,0.0 1.401 1.761 2.048 2.276 2.479 2.686 2.895 3.27 3.444 3.597 3.663 4.02 4.162 4.428 4.679 4.924 5.043 5.267 5.492 5.829 6.044 6.259 6.578 6.892 7.202 7.508 7.818 8.241 8.661 9.047 9.503 9.966 10.411 10.923 11.509 12.096 12.766 13.481 14.243 15.08 16.068 17.227 18.392 19.793 21.437 23.393 25.654 28.413 31.778 36.003 39.645 41.906 43.408 44.416 45.126 45.632 45.983 46.223 46.431 46.526 46.554 46.565 46.568 46.544 46.494 46.436 46.363 46.265 46.156 46.052 45.962 45.864 45.742 45.629 45.519 45.415 45.299 45.149 45.049 44.944 44.727 44.561 44.392 44.309 44.132 43.94 43.702 43.569 43.29 43.207 43.082 42.942 42.583 42.372 42.156 41.901 41.58 41.193 40.611 37.201 -6 ,17783 ,KEBNE ,16653167,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:25:03 CET,0.0 1.586 2.012 2.317 2.623 2.901 3.153 3.39 3.772 3.953 4.134 4.273 4.652 4.81 5.106 5.381 5.637 5.768 6.019 6.256 6.613 6.839 7.055 7.376 7.696 8.008 8.316 8.624 9.025 9.424 9.807 10.264 10.713 11.155 11.68 12.285 12.866 13.517 14.246 15.028 15.849 16.789 17.935 19.127 20.565 22.214 24.169 26.435 29.167 32.548 36.939 40.816 43.143 44.64 45.658 46.384 46.863 47.2 47.441 47.605 47.738 47.771 47.754 47.769 47.745 47.717 47.671 47.552 47.414 47.307 47.22 47.137 47.034 46.906 46.797 46.691 46.556 46.38 46.227 46.125 45.985 45.74 45.576 45.396 45.294 45.084 44.87 44.664 44.551 44.267 44.155 44.007 43.818 43.366 43.13 42.879 42.611 42.312 41.931 41.32 38.314 -7 ,27597 ,KEBNE ,16653168,Mon Nov 22 02:01:58 CET,Mon Nov 22 03:24:53 CET,0.0 0.761 1.054 1.341 1.605 1.827 2.025 2.21 2.548 2.698 2.846 2.922 3.278 3.423 3.696 3.964 4.231 4.36 4.615 4.87 5.248 5.487 5.714 6.052 6.38 6.704 7.022 7.326 7.727 8.117 8.501 8.974 9.431 9.874 10.401 11.011 11.595 12.241 12.956 13.741 14.569 15.525 16.66 17.837 19.279 20.906 22.865 25.213 28.084 31.479 35.71 39.436 41.698 43.223 44.276 45.009 45.507 45.84 46.052 46.212 46.289 46.323 46.346 46.361 46.333 46.29 46.25 46.186 46.128 46.043 45.934 45.847 45.727 45.591 45.507 45.404 45.279 45.159 45.017 44.902 44.782 44.58 44.421 44.253 44.17 44.018 43.866 43.691 43.593 43.318 43.19 43.039 42.892 42.512 42.278 42.029 41.714 41.332 40.926 40.362 36.979 -8 ,25176 ,KEBNE ,16653169,Mon Nov 22 02:02:59 CET,Mon Nov 22 03:25:53 CET,0.0 0.975 1.297 1.552 1.817 2.064 2.298 2.522 2.896 3.064 3.233 3.373 3.768 3.932 4.234 4.521 4.805 4.95 5.217 5.465 5.804 6.026 6.26 6.606 6.937 7.245 7.546 7.841 8.225 8.605 8.976 9.434 9.875 10.305 10.822 11.417 11.999 12.653 13.383 14.184 15.04 16.008 17.149 18.324 19.718 21.341 23.317 25.617 28.373 31.774 36.146 39.922 42.241 43.803 44.861 45.601 46.068 46.385 46.601 46.757 46.852 46.915 46.93 46.913 46.879 46.844 46.821 46.752 46.635 46.497 46.378 46.29 46.188 46.062 45.939 45.809 45.691 45.552 45.388 45.26 45.106 44.87 44.718 44.556 44.467 44.276 44.047 43.801 43.684 43.389 43.237 43.059 42.896 42.588 42.37 42.116 41.824 41.484 41.051 40.414 38.23 -9 ,15859 ,KEBNE ,16653170,Mon Nov 22 02:02:59 CET,Mon Nov 22 03:25:51 CET,0.0 1.911 2.373 2.739 3.076 3.339 3.578 3.808 4.215 4.394 4.554 4.651 5.018 5.163 5.447 5.736 6.04 6.179 6.435 6.684 7.039 7.266 7.481 7.801 8.123 8.435 8.741 9.044 9.431 9.823 10.219 10.686 11.145 11.593 12.1 12.706 13.338 14.034 14.765 15.556 16.412 17.361 18.498 19.689 21.108 22.734 24.642 26.889 29.644 33.019 37.379 41.165 43.476 45.03 46.033 46.72 47.217 47.567 47.811 48.04 48.186 48.256 48.287 48.302 48.293 48.255 48.181 48.089 48.019 47.948 47.849 47.75 47.642 47.519 47.394 47.243 47.086 46.893 46.692 46.562 46.423 46.219 46.069 45.896 45.808 45.619 45.394 45.131 44.984 44.682 44.523 44.348 44.16 43.791 43.579 43.332 43.069 42.675 42.125 41.294 37.725 -10 ,4733 ,KEBNE ,16653171,Mon Nov 22 02:02:59 CET,Mon Nov 22 03:25:48 CET,0.0 1.576 1.948 2.235 2.493 2.754 2.993 3.187 3.55 3.739 3.926 4.055 4.415 4.56 4.841 5.123 5.412 5.554 5.812 6.052 6.42 6.658 6.881 7.23 7.591 7.922 8.231 8.537 8.936 9.331 9.712 10.177 10.636 11.074 11.578 12.146 12.711 13.369 14.114 14.902 15.73 16.689 17.852 19.078 20.535 22.215 24.209 26.497 29.249 32.682 37.082 40.787 43.044 44.561 45.593 46.3 46.76 47.096 47.334 47.512 47.622 47.69 47.714 47.711 47.711 47.686 47.634 47.579 47.515 47.447 47.368 47.275 47.14 46.983 46.871 46.743 46.581 46.405 46.235 46.109 45.96 45.736 45.578 45.4 45.308 45.127 44.932 44.689 44.556 44.263 44.112 43.918 43.697 43.233 42.994 42.748 42.443 42.04 41.565 40.961 38.005 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt deleted file mode 100644 index 939124cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12990 ,KEBNE ,16653172,Mon Nov 22 02:02:59 CET,Mon Nov 22 03:26:47 CET,0.0 1.014 1.381 1.648 1.891 2.097 2.288 2.448 2.723 2.846 2.962 3.018 3.29 3.379 3.562 3.738 3.893 3.963 4.115 4.26 4.45 4.571 4.693 4.868 5.019 5.176 5.321 5.449 5.617 5.778 5.932 6.108 6.274 6.432 6.599 6.773 6.943 7.113 7.294 7.494 7.656 7.798 7.969 8.119 8.192 8.206 8.19 8.036 7.579 6.649 4.802 2.275 0.031 -1.937 -3.614 -5.084 -6.374 -7.599 -8.726 -9.881 -10.893 -11.827 -12.712 -13.517 -14.261 -14.942 -15.648 -16.273 -16.793 -17.322 -17.875 -18.325 -18.788 -19.27 -19.666 -20.065 -20.456 -20.884 -21.342 -21.649 -21.961 -22.426 -22.739 -23.077 -23.237 -23.563 -23.942 -24.356 -24.56 -24.963 -25.178 -25.405 -25.636 -26.122 -26.396 -26.703 -27.057 -27.427 -27.846 -28.393 -30.347 -2 ,31255 ,KEBNE ,16653173,Mon Nov 22 02:02:59 CET,Mon Nov 22 03:26:50 CET,0.0 0.61 0.875 1.086 1.28 1.472 1.638 1.774 2.005 2.122 2.245 2.292 2.566 2.662 2.834 2.989 3.126 3.188 3.311 3.426 3.588 3.691 3.787 3.923 4.041 4.15 4.271 4.389 4.515 4.641 4.783 4.959 5.114 5.25 5.402 5.566 5.717 5.883 6.047 6.196 6.353 6.516 6.644 6.737 6.839 6.86 6.726 6.517 6.114 5.235 3.389 0.651 -2.071 -4.615 -6.833 -8.776 -10.387 -11.792 -12.984 -14.149 -15.168 -16.069 -16.918 -17.702 -18.422 -19.101 -19.804 -20.423 -20.943 -21.478 -22.059 -22.54 -23.024 -23.518 -23.888 -24.275 -24.689 -25.112 -25.547 -25.85 -26.149 -26.608 -26.93 -27.253 -27.419 -27.765 -28.132 -28.548 -28.778 -29.2 -29.423 -29.657 -29.912 -30.468 -30.787 -31.165 -31.58 -32.008 -32.544 -33.317 -37.049 -3 ,24546 ,KEBNE ,16653174,Mon Nov 22 02:02:59 CET,Mon Nov 22 03:26:56 CET,0.0 0.779 1.08 1.333 1.543 1.709 1.861 2.023 2.304 2.411 2.51 2.522 2.787 2.875 3.036 3.19 3.34 3.407 3.532 3.65 3.822 3.914 3.996 4.126 4.256 4.379 4.486 4.601 4.765 4.914 5.059 5.249 5.423 5.581 5.767 5.966 6.143 6.317 6.48 6.64 6.784 6.949 7.128 7.266 7.391 7.455 7.424 7.29 6.899 5.874 3.683 0.833 -1.696 -4.196 -6.44 -8.252 -9.718 -11.008 -12.134 -13.279 -14.226 -15.053 -15.83 -16.56 -17.262 -17.912 -18.608 -19.232 -19.773 -20.33 -20.894 -21.362 -21.829 -22.32 -22.717 -23.128 -23.553 -23.955 -24.353 -24.641 -24.951 -25.419 -25.722 -26.033 -26.204 -26.57 -26.93 -27.314 -27.53 -27.974 -28.276 -28.523 -28.772 -29.301 -29.591 -29.923 -30.313 -30.767 -31.303 -32.128 -35.127 -4 ,27146 ,KEBNE ,16653175,Mon Nov 22 02:02:58 CET,Mon Nov 22 03:26:54 CET,0.0 0.951 1.261 1.505 1.701 1.871 2.036 2.195 2.487 2.625 2.748 2.795 3.06 3.15 3.337 3.51 3.675 3.762 3.923 4.077 4.294 4.419 4.531 4.701 4.881 5.056 5.21 5.345 5.509 5.655 5.796 5.983 6.158 6.317 6.495 6.681 6.841 6.993 7.155 7.314 7.469 7.659 7.827 7.943 8.032 8.08 8.024 7.764 7.276 6.37 4.516 1.5 -1.484 -4.066 -6.151 -7.753 -9.022 -10.215 -11.277 -12.373 -13.259 -14.005 -14.718 -15.353 -15.962 -16.548 -17.149 -17.688 -18.14 -18.592 -19.093 -19.534 -19.984 -20.43 -20.78 -21.136 -21.489 -21.865 -22.254 -22.517 -22.778 -23.179 -23.47 -23.779 -23.944 -24.292 -24.649 -25.033 -25.247 -25.676 -25.884 -26.125 -26.404 -26.998 -27.32 -27.667 -28.069 -28.548 -29.121 -29.952 -33.58 -6 ,7745 ,KEBNE ,16653177,Mon Nov 22 02:02:59 CET,Mon Nov 22 03:26:57 CET,0.0 0.878 1.223 1.498 1.716 1.882 2.017 2.148 2.381 2.488 2.589 2.599 2.865 2.959 3.141 3.308 3.471 3.548 3.697 3.842 4.033 4.156 4.273 4.436 4.595 4.751 4.9 5.041 5.229 5.42 5.593 5.776 5.947 6.113 6.303 6.49 6.648 6.813 6.985 7.144 7.291 7.446 7.6 7.709 7.772 7.772 7.639 7.397 6.906 5.868 3.827 0.906 -1.574 -3.616 -5.466 -7.171 -8.615 -9.991 -11.315 -12.596 -13.594 -14.483 -15.345 -16.157 -16.917 -17.613 -18.319 -18.927 -19.466 -20.038 -20.606 -21.061 -21.521 -21.99 -22.365 -22.755 -23.15 -23.569 -24.008 -24.312 -24.631 -25.119 -25.443 -25.781 -25.955 -26.306 -26.67 -27.068 -27.284 -27.728 -28.025 -28.273 -28.541 -29.12 -29.424 -29.746 -30.082 -30.47 -30.985 -31.774 -35.107 -8 ,28575 ,KEBNE ,16653179,Mon Nov 22 02:03:03 CET,Mon Nov 22 03:26:53 CET,0.0 1.016 1.346 1.607 1.839 2.041 2.225 2.396 2.688 2.808 2.934 3.011 3.299 3.402 3.586 3.77 3.954 4.036 4.173 4.296 4.469 4.59 4.703 4.859 5.021 5.178 5.323 5.469 5.659 5.837 5.996 6.164 6.335 6.494 6.67 6.865 7.008 7.151 7.326 7.512 7.693 7.861 7.965 8.019 8.07 8.028 7.882 7.695 7.292 6.333 4.381 1.778 -0.443 -2.472 -4.387 -6.076 -7.552 -8.885 -10.029 -11.223 -12.299 -13.216 -14.004 -14.711 -15.373 -16.027 -16.736 -17.348 -17.862 -18.401 -18.986 -19.468 -19.946 -20.44 -20.828 -21.222 -21.611 -22.009 -22.438 -22.744 -23.055 -23.532 -23.853 -24.186 -24.358 -24.707 -25.103 -25.541 -25.762 -26.192 -26.423 -26.659 -26.921 -27.446 -27.721 -28.048 -28.398 -28.802 -29.318 -30.074 -33.445 -9 ,8625 ,KEBNE ,16653180,Mon Nov 22 02:02:59 CET,Mon Nov 22 03:26:45 CET,0.0 0.756 1.031 1.252 1.432 1.59 1.734 1.869 2.112 2.218 2.311 2.309 2.561 2.635 2.768 2.902 3.038 3.103 3.209 3.303 3.461 3.566 3.661 3.791 3.921 4.061 4.211 4.347 4.513 4.685 4.839 5.032 5.204 5.344 5.512 5.69 5.868 6.06 6.25 6.432 6.605 6.752 6.871 7.008 7.115 7.134 7.089 6.892 6.402 5.469 3.47 0.851 -1.306 -3.235 -4.889 -6.435 -7.925 -9.257 -10.41 -11.599 -12.614 -13.527 -14.394 -15.22 -16.013 -16.715 -17.414 -18.035 -18.575 -19.137 -19.722 -20.207 -20.706 -21.206 -21.583 -21.967 -22.37 -22.793 -23.214 -23.506 -23.81 -24.28 -24.606 -24.949 -25.128 -25.505 -25.899 -26.31 -26.516 -26.927 -27.158 -27.385 -27.605 -28.098 -28.369 -28.659 -29.003 -29.448 -30.043 -30.839 -33.948 -10 ,23319 ,KEBNE ,16653181,Mon Nov 22 02:02:59 CET,Mon Nov 22 03:27:06 CET,0.0 0.961 1.284 1.523 1.705 1.861 2.009 2.169 2.475 2.609 2.719 2.753 3.025 3.114 3.275 3.443 3.616 3.698 3.85 3.991 4.204 4.349 4.483 4.669 4.838 4.995 5.146 5.29 5.467 5.63 5.784 5.966 6.137 6.287 6.461 6.654 6.824 7.012 7.198 7.383 7.563 7.728 7.888 8.032 8.148 8.165 8.057 7.815 7.347 6.396 4.348 1.6 -0.83 -3.064 -5.006 -6.727 -8.301 -9.767 -11.013 -12.271 -13.325 -14.254 -15.16 -15.997 -16.75 -17.439 -18.191 -18.844 -19.385 -19.945 -20.49 -20.909 -21.345 -21.812 -22.174 -22.555 -22.943 -23.323 -23.716 -23.996 -24.299 -24.779 -25.119 -25.482 -25.667 -26.047 -26.479 -26.968 -27.208 -27.628 -27.852 -28.103 -28.378 -28.987 -29.32 -29.678 -30.085 -30.544 -31.079 -31.872 -35.504 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index c77370ad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28048 ,KEBNE ,16653182,Mon Nov 22 02:02:59 CET,Mon Nov 22 03:27:58 CET,0.0 0.387 0.574 0.717 0.855 0.98 1.095 1.208 1.412 1.504 1.601 1.617 1.878 1.97 2.156 2.334 2.508 2.593 2.757 2.91 3.13 3.268 3.396 3.578 3.753 3.92 4.087 4.258 4.475 4.682 4.889 5.136 5.366 5.594 5.861 6.153 6.434 6.742 7.079 7.431 7.8 8.224 8.704 9.165 9.692 10.295 11.02 11.742 12.395 13.032 13.458 13.243 12.779 12.218 11.663 11.112 10.566 10.047 9.577 9.099 8.671 8.273 7.88 7.499 7.145 6.827 6.487 6.168 5.888 5.6 5.297 5.046 4.787 4.505 4.285 4.072 3.834 3.578 3.315 3.133 2.955 2.663 2.451 2.228 2.112 1.862 1.587 1.309 1.175 0.867 0.7 0.531 0.344 -0.074 -0.303 -0.534 -0.797 -1.123 -1.48 -1.986 -4.279 -2 ,5191 ,KEBNE ,16653183,Mon Nov 22 02:02:59 CET,Mon Nov 22 03:26:31 CET,0.0 0.59 0.822 1.012 1.199 1.365 1.524 1.673 1.931 2.051 2.165 2.199 2.462 2.552 2.737 2.901 3.056 3.135 3.283 3.426 3.645 3.787 3.923 4.114 4.296 4.484 4.665 4.837 5.065 5.284 5.494 5.743 5.975 6.202 6.461 6.737 7.014 7.333 7.66 8.001 8.367 8.778 9.27 9.759 10.28 10.81 11.44 12.156 12.826 13.441 13.936 13.822 13.384 12.805 12.173 11.545 10.973 10.436 9.947 9.45 8.996 8.578 8.177 7.803 7.45 7.114 6.787 6.495 6.222 5.934 5.624 5.353 5.085 4.802 4.578 4.354 4.122 3.881 3.592 3.389 3.193 2.899 2.697 2.486 2.376 2.124 1.836 1.541 1.392 1.085 0.922 0.74 0.562 0.217 0.025 -0.24 -0.557 -0.895 -1.283 -1.794 -3.996 -3 ,28617 ,KEBNE ,16653184,Mon Nov 22 02:02:59 CET,Mon Nov 22 03:26:29 CET,0.0 0.397 0.569 0.744 0.932 1.096 1.238 1.38 1.637 1.755 1.866 1.924 2.208 2.306 2.479 2.631 2.777 2.852 3.006 3.151 3.366 3.519 3.657 3.843 4.035 4.219 4.394 4.572 4.797 5.006 5.216 5.468 5.694 5.91 6.169 6.469 6.767 7.093 7.434 7.776 8.15 8.589 9.093 9.59 10.161 10.755 11.393 12.112 12.912 13.685 14.214 14.063 13.597 13.022 12.389 11.732 11.119 10.581 10.131 9.647 9.205 8.829 8.475 8.127 7.784 7.477 7.152 6.869 6.625 6.343 6.032 5.785 5.541 5.291 5.086 4.871 4.65 4.392 4.108 3.922 3.736 3.429 3.213 2.99 2.875 2.633 2.363 2.067 1.926 1.636 1.499 1.326 1.128 0.733 0.521 0.256 -0.029 -0.346 -0.716 -1.24 -2.309 -4 ,3691 ,KEBNE ,16653185,Mon Nov 22 02:04:00 CET,Mon Nov 22 03:27:43 CET,0.0 0.436 0.644 0.82 0.96 1.085 1.206 1.326 1.55 1.65 1.738 1.728 1.98 2.056 2.21 2.355 2.495 2.562 2.706 2.856 3.068 3.204 3.338 3.534 3.719 3.907 4.098 4.27 4.482 4.687 4.884 5.122 5.347 5.566 5.822 6.116 6.392 6.688 7.027 7.376 7.74 8.154 8.633 9.133 9.681 10.253 10.88 11.548 12.287 12.985 13.494 13.382 12.927 12.385 11.767 11.158 10.592 10.031 9.553 9.088 8.662 8.25 7.859 7.489 7.144 6.834 6.509 6.214 5.94 5.634 5.322 5.066 4.808 4.559 4.353 4.118 3.878 3.634 3.371 3.184 2.986 2.697 2.508 2.307 2.206 1.984 1.758 1.541 1.415 1.12 0.989 0.829 0.642 0.237 0.032 -0.191 -0.469 -0.823 -1.245 -1.811 -4.025 -5 ,20546 ,KEBNE ,16653186,Mon Nov 22 02:04:00 CET,Mon Nov 22 03:29:13 CET,0.0 0.551 0.759 0.924 1.066 1.191 1.31 1.428 1.638 1.729 1.82 1.825 2.086 2.16 2.306 2.455 2.604 2.678 2.817 2.955 3.16 3.294 3.426 3.624 3.822 4.003 4.178 4.344 4.554 4.766 4.971 5.215 5.443 5.667 5.932 6.225 6.51 6.827 7.162 7.512 7.904 8.362 8.865 9.346 9.885 10.509 11.242 11.971 12.684 13.286 13.616 13.533 13.084 12.458 11.809 11.17 10.603 10.062 9.592 9.128 8.696 8.291 7.909 7.524 7.162 6.847 6.506 6.202 5.932 5.655 5.361 5.103 4.846 4.585 4.383 4.163 3.941 3.71 3.448 3.272 3.081 2.785 2.605 2.406 2.304 2.094 1.845 1.575 1.429 1.118 0.943 0.77 0.586 0.157 -0.077 -0.335 -0.661 -1.035 -1.457 -2.066 -4.285 -6 ,16961 ,KEBNE ,16653187,Mon Nov 22 02:05:02 CET,Mon Nov 22 03:28:35 CET,0.0 0.49 0.664 0.834 0.991 1.117 1.235 1.341 1.532 1.626 1.717 1.727 1.99 2.07 2.236 2.389 2.532 2.604 2.752 2.902 3.122 3.256 3.381 3.578 3.777 3.959 4.13 4.302 4.524 4.732 4.937 5.193 5.432 5.661 5.916 6.188 6.458 6.775 7.107 7.46 7.838 8.277 8.79 9.262 9.798 10.39 11.039 11.678 12.279 12.826 13.257 13.07 12.541 11.964 11.337 10.713 10.172 9.685 9.216 8.719 8.278 7.876 7.487 7.111 6.768 6.432 6.064 5.748 5.486 5.231 4.957 4.718 4.459 4.172 3.943 3.7 3.459 3.212 2.937 2.735 2.541 2.251 2.027 1.79 1.68 1.45 1.208 0.957 0.802 0.465 0.251 0.077 -0.092 -0.46 -0.663 -0.882 -1.138 -1.461 -1.901 -2.465 -4.339 -7 ,30994 ,KEBNE ,16653188,Mon Nov 22 02:05:02 CET,Mon Nov 22 03:30:02 CET,0.0 0.358 0.572 0.744 0.88 1.014 1.14 1.25 1.446 1.537 1.63 1.626 1.874 1.947 2.098 2.25 2.396 2.465 2.606 2.751 2.963 3.098 3.23 3.427 3.617 3.798 3.966 4.121 4.323 4.538 4.758 5.013 5.254 5.485 5.763 6.07 6.346 6.65 6.997 7.365 7.741 8.151 8.602 9.1 9.702 10.327 11.005 11.723 12.479 13.107 13.375 13.106 12.613 12.018 11.39 10.798 10.264 9.749 9.279 8.779 8.351 7.959 7.558 7.181 6.839 6.531 6.206 5.91 5.666 5.407 5.122 4.868 4.598 4.329 4.123 3.909 3.683 3.449 3.195 3.015 2.829 2.542 2.348 2.146 2.041 1.832 1.606 1.342 1.202 0.906 0.781 0.626 0.456 0.079 -0.146 -0.401 -0.673 -0.994 -1.39 -1.976 -4.09 -8 ,8300 ,KEBNE ,16653189,Mon Nov 22 02:06:04 CET,Mon Nov 22 03:30:56 CET,0.0 0.416 0.589 0.743 0.875 1.006 1.124 1.218 1.408 1.502 1.591 1.584 1.839 1.93 2.115 2.29 2.458 2.542 2.705 2.856 3.071 3.208 3.345 3.544 3.726 3.9 4.066 4.235 4.451 4.657 4.86 5.109 5.357 5.587 5.84 6.134 6.422 6.74 7.087 7.439 7.803 8.229 8.72 9.189 9.737 10.35 11.03 11.756 12.453 13.017 13.409 13.295 12.793 12.176 11.572 10.975 10.456 9.948 9.453 8.966 8.548 8.166 7.802 7.458 7.134 6.828 6.499 6.22 5.978 5.718 5.438 5.192 4.936 4.664 4.449 4.225 3.989 3.746 3.497 3.327 3.152 2.866 2.651 2.426 2.314 2.09 1.843 1.563 1.415 1.106 0.933 0.759 0.583 0.181 -0.045 -0.277 -0.554 -0.88 -1.271 -1.833 -3.982 -9 ,29520 ,KEBNE ,16653190,Mon Nov 22 02:06:04 CET,Mon Nov 22 03:29:37 CET,0.0 0.503 0.755 0.957 1.106 1.235 1.349 1.464 1.688 1.794 1.907 1.955 2.217 2.309 2.491 2.665 2.834 2.914 3.074 3.225 3.431 3.568 3.705 3.898 4.074 4.245 4.407 4.569 4.795 5.003 5.205 5.455 5.697 5.935 6.204 6.495 6.77 7.064 7.392 7.761 8.138 8.562 9.063 9.531 10.05 10.636 11.308 12.012 12.818 13.561 13.941 13.724 13.239 12.687 12.109 11.536 10.979 10.462 10.002 9.518 9.107 8.754 8.392 8.033 7.705 7.39 7.054 6.756 6.497 6.228 5.934 5.68 5.42 5.161 4.964 4.748 4.521 4.296 4.046 3.852 3.655 3.35 3.131 2.911 2.804 2.582 2.327 2.061 1.931 1.639 1.499 1.335 1.146 0.714 0.46 0.176 -0.125 -0.466 -0.909 -1.529 -3.813 -10 ,31363 ,KEBNE ,16653191,Mon Nov 22 02:06:04 CET,Mon Nov 22 03:31:00 CET,0.0 0.239 0.42 0.574 0.705 0.83 0.95 1.067 1.284 1.371 1.462 1.473 1.74 1.829 1.997 2.174 2.345 2.425 2.583 2.723 2.928 3.063 3.199 3.398 3.579 3.757 3.936 4.115 4.356 4.581 4.787 5.033 5.274 5.507 5.775 6.065 6.336 6.648 6.995 7.381 7.784 8.22 8.707 9.146 9.636 10.211 10.882 11.605 12.41 13.133 13.469 13.347 12.861 12.235 11.627 11.054 10.532 10.026 9.57 9.093 8.669 8.304 7.935 7.544 7.192 6.876 6.534 6.223 5.956 5.68 5.413 5.195 4.959 4.706 4.498 4.267 4.027 3.782 3.537 3.377 3.19 2.889 2.684 2.457 2.355 2.176 1.972 1.743 1.616 1.317 1.19 1.042 0.87 0.459 0.232 -0.031 -0.368 -0.747 -1.19 -1.808 -3.898 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index acc5c4dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15515 ,KEBNE ,16653192,Mon Nov 22 02:06:04 CET,Mon Nov 22 03:29:06 CET,0.0 0.315 0.453 0.569 0.672 0.763 0.849 0.92 1.061 1.128 1.184 1.131 1.343 1.395 1.496 1.587 1.671 1.712 1.79 1.866 1.974 2.049 2.126 2.224 2.312 2.403 2.49 2.574 2.686 2.789 2.884 3.0 3.096 3.186 3.305 3.43 3.547 3.681 3.82 3.969 4.13 4.309 4.494 4.663 4.85 5.048 5.243 5.401 5.502 5.504 5.257 4.606 3.909 3.268 2.718 2.181 1.683 1.223 0.808 0.401 0.046 -0.268 -0.576 -0.886 -1.171 -1.439 -1.727 -1.983 -2.201 -2.428 -2.672 -2.884 -3.112 -3.349 -3.536 -3.732 -3.935 -4.161 -4.396 -4.569 -4.747 -4.997 -5.179 -5.358 -5.447 -5.641 -5.839 -6.061 -6.178 -6.445 -6.512 -6.653 -6.812 -7.153 -7.337 -7.534 -7.732 -7.947 -8.246 -8.663 -9.69 -2 ,13720 ,KEBNE ,16653193,Mon Nov 22 02:06:04 CET,Mon Nov 22 03:29:09 CET,0.0 0.331 0.504 0.626 0.719 0.802 0.879 0.953 1.092 1.152 1.206 1.149 1.355 1.4 1.505 1.614 1.711 1.755 1.832 1.905 2.016 2.086 2.152 2.241 2.326 2.415 2.498 2.578 2.685 2.781 2.872 2.978 3.08 3.183 3.302 3.429 3.555 3.702 3.853 4.013 4.174 4.333 4.515 4.716 4.925 5.096 5.272 5.438 5.537 5.555 5.305 4.688 4.043 3.396 2.815 2.284 1.78 1.298 0.887 0.481 0.135 -0.168 -0.484 -0.803 -1.086 -1.345 -1.612 -1.857 -2.07 -2.296 -2.538 -2.751 -2.974 -3.19 -3.368 -3.572 -3.776 -3.983 -4.21 -4.364 -4.519 -4.76 -4.922 -5.09 -5.176 -5.354 -5.548 -5.764 -5.873 -6.147 -6.235 -6.372 -6.51 -6.803 -6.981 -7.198 -7.45 -7.724 -7.998 -8.347 -9.817 -3 ,7678 ,KEBNE ,16653194,Mon Nov 22 02:06:04 CET,Mon Nov 22 03:27:43 CET,0.0 0.35 0.526 0.664 0.77 0.869 0.967 1.043 1.167 1.224 1.281 1.243 1.453 1.502 1.598 1.688 1.776 1.822 1.912 1.997 2.12 2.2 2.274 2.387 2.491 2.589 2.69 2.788 2.911 3.027 3.138 3.269 3.388 3.497 3.634 3.783 3.914 4.053 4.193 4.349 4.517 4.682 4.84 4.995 5.171 5.359 5.547 5.697 5.772 5.732 5.463 4.823 4.141 3.502 2.919 2.384 1.902 1.437 1.031 0.607 0.228 -0.099 -0.419 -0.721 -0.992 -1.239 -1.513 -1.772 -1.994 -2.236 -2.48 -2.675 -2.876 -3.084 -3.257 -3.435 -3.618 -3.827 -4.054 -4.203 -4.366 -4.641 -4.837 -5.031 -5.121 -5.305 -5.495 -5.698 -5.805 -6.074 -6.134 -6.261 -6.403 -6.718 -6.887 -7.071 -7.287 -7.543 -7.867 -8.319 -9.882 -4 ,6187 ,KEBNE ,16653195,Mon Nov 22 02:06:04 CET,Mon Nov 22 03:27:34 CET,0.0 0.409 0.545 0.661 0.767 0.856 0.943 1.029 1.179 1.247 1.308 1.262 1.473 1.521 1.618 1.714 1.805 1.85 1.927 1.997 2.099 2.163 2.227 2.319 2.403 2.489 2.575 2.663 2.772 2.868 2.951 3.059 3.164 3.264 3.382 3.503 3.627 3.774 3.927 4.082 4.255 4.434 4.601 4.778 4.979 5.157 5.336 5.506 5.592 5.531 5.245 4.652 4.03 3.403 2.804 2.25 1.739 1.284 0.88 0.44 0.077 -0.243 -0.557 -0.835 -1.093 -1.34 -1.612 -1.866 -2.086 -2.317 -2.566 -2.771 -2.974 -3.192 -3.371 -3.563 -3.767 -3.97 -4.172 -4.307 -4.444 -4.666 -4.818 -4.974 -5.056 -5.223 -5.404 -5.608 -5.717 -5.988 -6.043 -6.157 -6.28 -6.601 -6.79 -6.984 -7.202 -7.448 -7.745 -8.133 -9.402 -5 ,25473 ,KEBNE ,16653196,Mon Nov 22 02:06:06 CET,Mon Nov 22 03:25:22 CET,0.0 0.356 0.525 0.655 0.766 0.862 0.937 1.005 1.135 1.2 1.265 1.225 1.438 1.489 1.581 1.669 1.757 1.797 1.875 1.953 2.063 2.128 2.194 2.305 2.411 2.512 2.625 2.732 2.869 2.996 3.103 3.242 3.371 3.487 3.616 3.754 3.881 4.035 4.204 4.366 4.53 4.715 4.917 5.095 5.283 5.47 5.65 5.78 5.856 5.813 5.485 4.868 4.233 3.611 3.031 2.492 1.997 1.54 1.13 0.711 0.355 0.011 -0.325 -0.619 -0.9 -1.168 -1.448 -1.716 -1.946 -2.177 -2.417 -2.616 -2.816 -3.029 -3.211 -3.399 -3.586 -3.78 -3.98 -4.121 -4.269 -4.504 -4.676 -4.872 -4.972 -5.168 -5.38 -5.623 -5.747 -6.023 -6.074 -6.191 -6.31 -6.584 -6.761 -6.951 -7.144 -7.347 -7.637 -8.081 -9.449 -6 ,19705 ,KEBNE ,16653197,Mon Nov 22 02:06:04 CET,Mon Nov 22 03:27:44 CET,0.0 0.534 0.732 0.871 0.974 1.06 1.145 1.221 1.353 1.418 1.478 1.422 1.63 1.681 1.784 1.881 1.969 2.009 2.083 2.151 2.254 2.319 2.378 2.463 2.543 2.624 2.705 2.782 2.878 2.966 3.055 3.168 3.271 3.373 3.501 3.649 3.791 3.94 4.091 4.248 4.402 4.574 4.778 4.972 5.148 5.311 5.488 5.654 5.764 5.731 5.407 4.789 4.161 3.524 2.94 2.411 1.934 1.49 1.095 0.692 0.334 0.004 -0.315 -0.626 -0.914 -1.182 -1.47 -1.718 -1.926 -2.136 -2.363 -2.569 -2.784 -3.003 -3.173 -3.347 -3.528 -3.725 -3.94 -4.084 -4.234 -4.493 -4.702 -4.92 -5.022 -5.219 -5.412 -5.615 -5.73 -6.013 -6.113 -6.263 -6.405 -6.706 -6.897 -7.089 -7.287 -7.538 -7.846 -8.219 -9.306 -7 ,23197 ,KEBNE ,16653198,Mon Nov 22 02:06:04 CET,Mon Nov 22 03:27:34 CET,0.0 0.381 0.533 0.648 0.747 0.84 0.924 1.005 1.155 1.226 1.295 1.264 1.478 1.527 1.623 1.711 1.798 1.84 1.916 1.99 2.093 2.164 2.233 2.327 2.414 2.495 2.574 2.651 2.761 2.861 2.966 3.102 3.227 3.348 3.482 3.638 3.778 3.934 4.096 4.249 4.415 4.596 4.786 4.96 5.131 5.293 5.471 5.628 5.734 5.706 5.354 4.73 4.096 3.476 2.928 2.397 1.885 1.416 1.015 0.605 0.258 -0.03 -0.315 -0.606 -0.887 -1.153 -1.442 -1.699 -1.924 -2.146 -2.364 -2.562 -2.783 -3.013 -3.193 -3.382 -3.573 -3.779 -4.003 -4.16 -4.317 -4.569 -4.744 -4.916 -5.006 -5.211 -5.446 -5.694 -5.814 -6.085 -6.145 -6.267 -6.413 -6.74 -6.91 -7.105 -7.314 -7.553 -7.858 -8.292 -9.409 -8 ,27855 ,KEBNE ,16653199,Mon Nov 22 02:06:04 CET,Mon Nov 22 03:27:36 CET,0.0 0.578 0.755 0.887 0.985 1.064 1.141 1.215 1.342 1.401 1.463 1.415 1.622 1.669 1.77 1.869 1.954 1.995 2.077 2.156 2.266 2.335 2.401 2.503 2.604 2.694 2.775 2.853 2.949 3.039 3.133 3.241 3.346 3.449 3.566 3.693 3.808 3.94 4.085 4.246 4.421 4.597 4.791 4.969 5.15 5.345 5.538 5.703 5.783 5.753 5.447 4.819 4.167 3.551 2.979 2.429 1.955 1.528 1.125 0.73 0.392 0.084 -0.229 -0.522 -0.791 -1.046 -1.313 -1.55 -1.752 -2.002 -2.274 -2.477 -2.692 -2.922 -3.091 -3.268 -3.46 -3.668 -3.897 -4.046 -4.195 -4.428 -4.588 -4.763 -4.858 -5.064 -5.276 -5.501 -5.618 -5.89 -5.957 -6.09 -6.232 -6.522 -6.686 -6.862 -7.075 -7.356 -7.669 -8.115 -9.231 -9 ,8159 ,KEBNE ,16653200,Mon Nov 22 02:06:04 CET,Mon Nov 22 03:27:39 CET,0.0 0.406 0.567 0.702 0.819 0.919 1.003 1.081 1.218 1.278 1.333 1.284 1.504 1.56 1.666 1.766 1.852 1.895 1.98 2.064 2.179 2.244 2.309 2.409 2.515 2.621 2.717 2.815 2.954 3.081 3.202 3.358 3.486 3.608 3.756 3.91 4.055 4.206 4.364 4.52 4.676 4.853 5.04 5.214 5.404 5.573 5.718 5.867 5.988 5.962 5.639 5.038 4.392 3.782 3.205 2.639 2.151 1.704 1.295 0.874 0.494 0.165 -0.14 -0.429 -0.712 -0.999 -1.282 -1.526 -1.741 -1.973 -2.212 -2.42 -2.633 -2.842 -3.005 -3.185 -3.379 -3.582 -3.817 -3.974 -4.124 -4.37 -4.545 -4.728 -4.825 -5.024 -5.239 -5.489 -5.609 -5.884 -5.98 -6.126 -6.292 -6.634 -6.829 -7.05 -7.267 -7.529 -7.9 -8.371 -9.684 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt deleted file mode 100644 index c9f3a276..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28387 ,KEBNE ,16653202,Mon Nov 22 02:06:03 CET,Mon Nov 22 03:29:59 CET,0.0 2.081 2.731 3.191 3.546 3.865 4.168 4.443 4.902 5.082 5.25 5.43 5.737 5.877 6.167 6.42 6.641 6.755 6.973 7.167 7.428 7.601 7.78 8.031 8.257 8.463 8.665 8.851 9.088 9.32 9.542 9.834 10.096 10.314 10.561 10.836 11.115 11.41 11.69 11.973 12.272 12.597 12.955 13.334 13.767 14.183 14.617 15.067 15.53 15.913 16.118 16.015 15.739 15.377 14.987 14.583 14.199 13.84 13.533 13.204 12.908 12.636 12.354 12.076 11.815 11.576 11.334 11.131 10.949 10.747 10.534 10.355 10.163 9.965 9.818 9.655 9.48 9.307 9.126 9.0 8.874 8.665 8.504 8.333 8.245 8.071 7.899 7.712 7.614 7.355 7.294 7.174 7.04 6.76 6.604 6.419 6.202 5.961 5.658 5.163 2.59 -2 ,3235 ,KEBNE ,16653203,Mon Nov 22 02:07:05 CET,Mon Nov 22 03:30:52 CET,0.0 2.134 2.883 3.389 3.795 4.169 4.483 4.751 5.234 5.456 5.659 5.839 6.143 6.283 6.551 6.808 7.041 7.153 7.382 7.588 7.885 8.088 8.279 8.547 8.787 8.993 9.184 9.386 9.644 9.875 10.108 10.387 10.634 10.878 11.147 11.425 11.692 11.989 12.309 12.635 12.95 13.285 13.673 14.029 14.452 14.959 15.476 15.955 16.38 16.779 17.131 17.005 16.597 16.165 15.732 15.328 14.969 14.61 14.28 13.93 13.621 13.333 13.045 12.784 12.532 12.289 12.046 11.816 11.609 11.391 11.16 10.979 10.789 10.575 10.415 10.263 10.096 9.921 9.737 9.602 9.461 9.243 9.08 8.918 8.834 8.642 8.429 8.228 8.129 7.862 7.8 7.684 7.566 7.31 7.163 6.997 6.798 6.553 6.253 5.766 1.383 -3 ,24327 ,KEBNE ,16653204,Mon Nov 22 02:07:05 CET,Mon Nov 22 03:32:06 CET,0.0 2.068 2.707 3.131 3.462 3.782 4.068 4.3 4.691 4.866 5.032 5.174 5.466 5.609 5.891 6.143 6.372 6.477 6.676 6.865 7.128 7.289 7.442 7.672 7.882 8.083 8.285 8.473 8.709 8.929 9.128 9.359 9.577 9.8 10.078 10.376 10.667 10.993 11.305 11.617 11.932 12.253 12.62 12.996 13.423 13.867 14.368 14.843 15.29 15.736 15.999 15.787 15.433 15.012 14.568 14.142 13.741 13.353 13.01 12.653 12.345 12.075 11.803 11.525 11.265 11.026 10.78 10.564 10.365 10.151 9.934 9.758 9.581 9.389 9.226 9.058 8.894 8.711 8.51 8.378 8.248 8.064 7.945 7.817 7.742 7.591 7.437 7.27 7.179 6.917 6.846 6.726 6.6 6.33 6.187 6.025 5.852 5.652 5.372 4.912 2.353 -4 ,31862 ,KEBNE ,16653205,Mon Nov 22 02:07:05 CET,Mon Nov 22 03:32:11 CET,0.0 1.597 2.209 2.65 3.02 3.342 3.642 3.908 4.327 4.503 4.678 4.838 5.139 5.265 5.498 5.749 6.005 6.117 6.315 6.519 6.802 6.969 7.126 7.362 7.593 7.801 7.999 8.195 8.435 8.658 8.881 9.146 9.392 9.623 9.88 10.147 10.386 10.645 10.921 11.224 11.546 11.885 12.273 12.648 13.038 13.431 13.869 14.401 14.952 15.389 15.621 15.451 15.107 14.701 14.305 13.889 13.482 13.115 12.774 12.409 12.083 11.786 11.515 11.267 11.028 10.802 10.564 10.348 10.148 9.949 9.755 9.577 9.387 9.192 9.04 8.889 8.729 8.56 8.386 8.266 8.131 7.922 7.784 7.635 7.557 7.383 7.203 7.027 6.927 6.67 6.609 6.481 6.357 6.101 5.934 5.736 5.518 5.277 5.009 4.65 1.061 -6 ,10527 ,KEBNE ,16653207,Mon Nov 22 02:07:05 CET,Mon Nov 22 03:32:22 CET,0.0 2.21 2.824 3.233 3.58 3.872 4.104 4.323 4.73 4.92 5.108 5.257 5.553 5.684 5.924 6.171 6.412 6.53 6.75 6.938 7.206 7.386 7.551 7.789 8.021 8.238 8.452 8.651 8.892 9.135 9.368 9.632 9.879 10.112 10.372 10.662 10.953 11.248 11.528 11.843 12.186 12.541 12.944 13.357 13.856 14.38 14.891 15.408 15.883 16.289 16.587 16.448 16.088 15.697 15.307 14.908 14.502 14.11 13.787 13.46 13.158 12.888 12.618 12.365 12.123 11.887 11.648 11.44 11.257 11.053 10.827 10.644 10.456 10.246 10.08 9.914 9.751 9.587 9.412 9.285 9.148 8.944 8.801 8.641 8.554 8.372 8.192 8.004 7.904 7.645 7.562 7.431 7.286 6.961 6.796 6.619 6.42 6.188 5.9 5.482 2.773 -7 ,11042 ,KEBNE ,16653208,Mon Nov 22 02:07:05 CET,Mon Nov 22 03:30:59 CET,0.0 1.887 2.644 3.143 3.54 3.835 4.091 4.326 4.738 4.923 5.088 5.243 5.54 5.663 5.929 6.173 6.389 6.494 6.704 6.9 7.168 7.35 7.531 7.788 8.026 8.244 8.434 8.606 8.841 9.073 9.297 9.585 9.855 10.084 10.331 10.582 10.809 11.091 11.406 11.712 12.038 12.405 12.823 13.246 13.698 14.168 14.634 15.063 15.506 15.93 16.215 15.981 15.555 15.126 14.698 14.297 13.908 13.535 13.214 12.874 12.573 12.29 12.015 11.749 11.482 11.242 11.0 10.777 10.586 10.387 10.158 9.969 9.783 9.585 9.42 9.246 9.067 8.886 8.698 8.567 8.431 8.219 8.072 7.912 7.824 7.638 7.455 7.273 7.179 6.925 6.867 6.756 6.631 6.323 6.154 5.972 5.756 5.513 5.2 4.728 1.745 -8 ,27207 ,KEBNE ,16653209,Mon Nov 22 02:07:10 CET,Mon Nov 22 03:30:42 CET,0.0 2.513 3.275 3.699 4.035 4.335 4.578 4.794 5.203 5.388 5.553 5.699 6.002 6.138 6.388 6.648 6.893 6.993 7.191 7.376 7.639 7.817 7.986 8.225 8.451 8.678 8.908 9.118 9.374 9.617 9.831 10.088 10.349 10.59 10.853 11.138 11.398 11.676 11.984 12.297 12.614 12.963 13.343 13.73 14.174 14.627 15.093 15.57 16.044 16.421 16.633 16.518 16.209 15.827 15.444 15.064 14.694 14.324 13.975 13.629 13.335 13.055 12.78 12.52 12.269 12.043 11.818 11.602 11.409 11.194 10.973 10.809 10.629 10.421 10.251 10.072 9.89 9.708 9.525 9.403 9.284 9.082 8.933 8.778 8.699 8.543 8.366 8.186 8.085 7.81 7.735 7.62 7.493 7.218 7.071 6.915 6.734 6.506 6.234 5.867 3.883 -9 ,32746 ,KEBNE ,16653210,Mon Nov 22 02:07:05 CET,Mon Nov 22 03:30:44 CET,0.0 2.031 2.728 3.235 3.62 3.951 4.25 4.524 5.02 5.245 5.435 5.636 5.962 6.113 6.403 6.649 6.863 6.973 7.191 7.38 7.631 7.793 7.957 8.189 8.414 8.628 8.82 9.01 9.272 9.511 9.716 9.944 10.164 10.393 10.668 10.97 11.252 11.544 11.851 12.185 12.523 12.879 13.267 13.635 14.042 14.47 14.929 15.404 15.886 16.314 16.585 16.447 16.084 15.65 15.223 14.825 14.45 14.103 13.785 13.445 13.144 12.869 12.609 12.358 12.123 11.908 11.682 11.465 11.272 11.075 10.864 10.687 10.511 10.332 10.187 10.022 9.846 9.67 9.478 9.343 9.211 9.017 8.883 8.741 8.671 8.52 8.347 8.169 8.07 7.809 7.754 7.641 7.511 7.229 7.086 6.914 6.719 6.508 6.237 5.814 4.026 -10 ,14133 ,KEBNE ,16653211,Mon Nov 22 02:07:05 CET,Mon Nov 22 03:30:50 CET,0.0 1.861 2.436 2.87 3.237 3.57 3.841 4.06 4.48 4.671 4.834 4.988 5.299 5.458 5.771 6.043 6.26 6.36 6.572 6.772 7.047 7.232 7.414 7.658 7.88 8.102 8.317 8.516 8.758 8.974 9.187 9.443 9.675 9.893 10.122 10.368 10.61 10.868 11.145 11.455 11.785 12.111 12.473 12.859 13.269 13.679 14.121 14.553 15.025 15.523 15.88 15.734 15.337 14.927 14.502 14.095 13.729 13.371 13.035 12.691 12.381 12.109 11.85 11.599 11.371 11.153 10.903 10.682 10.494 10.29 10.079 9.905 9.722 9.516 9.358 9.197 9.027 8.854 8.678 8.561 8.442 8.254 8.125 7.991 7.916 7.761 7.598 7.401 7.298 7.028 6.957 6.843 6.719 6.449 6.294 6.117 5.927 5.693 5.371 4.939 3.038 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt deleted file mode 100644 index 72fcdcc2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11952 ,KEBNE ,16653212,Mon Nov 22 02:07:05 CET,Mon Nov 22 03:30:44 CET,0.0 1.764 2.205 2.524 2.773 2.982 3.191 3.374 3.684 3.829 3.955 4.058 4.35 4.457 4.653 4.84 5.006 5.078 5.218 5.354 5.56 5.687 5.797 5.942 6.057 6.163 6.256 6.333 6.433 6.527 6.599 6.683 6.785 6.879 6.965 7.019 7.048 7.053 7.037 6.991 6.93 6.855 6.689 6.431 6.011 5.448 4.74 3.781 2.314 -0.047 -3.854 -8.165 -11.602 -14.437 -16.775 -18.784 -20.515 -22.02 -23.282 -24.514 -25.53 -26.406 -27.248 -28.052 -28.777 -29.417 -30.078 -30.668 -31.182 -31.699 -32.218 -32.637 -33.065 -33.516 -33.867 -34.226 -34.586 -34.96 -35.363 -35.628 -35.887 -36.296 -36.582 -36.874 -37.022 -37.32 -37.644 -37.999 -38.172 -38.561 -38.727 -38.926 -39.127 -39.574 -39.819 -40.1 -40.417 -40.744 -41.102 -41.54 -43.188 -2 ,28003 ,KEBNE ,16653213,Mon Nov 22 02:07:05 CET,Mon Nov 22 03:30:39 CET,0.0 1.985 2.444 2.869 3.25 3.511 3.733 3.938 4.308 4.482 4.63 4.726 4.991 5.084 5.287 5.48 5.65 5.735 5.888 6.007 6.169 6.283 6.395 6.537 6.652 6.769 6.899 7.008 7.125 7.237 7.336 7.423 7.483 7.533 7.593 7.67 7.749 7.851 7.942 7.955 7.89 7.771 7.584 7.36 7.018 6.508 5.774 4.762 3.251 0.973 -2.779 -7.095 -10.446 -13.196 -15.49 -17.518 -19.24 -20.729 -21.946 -23.131 -24.14 -25.032 -25.916 -26.726 -27.446 -28.097 -28.772 -29.383 -29.9 -30.423 -30.956 -31.387 -31.828 -32.277 -32.626 -32.992 -33.36 -33.731 -34.123 -34.405 -34.693 -35.129 -35.421 -35.724 -35.884 -36.22 -36.568 -36.923 -37.115 -37.534 -37.745 -37.958 -38.179 -38.657 -38.926 -39.193 -39.49 -39.856 -40.266 -40.826 -43.363 -4 ,29976 ,KEBNE ,16653215,Mon Nov 22 02:07:06 CET,Mon Nov 22 03:30:59 CET,0.0 2.062 2.64 3.034 3.354 3.677 3.939 4.146 4.532 4.704 4.856 4.97 5.256 5.367 5.571 5.746 5.913 5.998 6.152 6.304 6.493 6.603 6.706 6.837 6.958 7.069 7.177 7.285 7.425 7.54 7.631 7.748 7.845 7.917 7.986 8.03 8.06 8.076 8.042 7.97 7.877 7.76 7.589 7.355 6.969 6.45 5.765 4.759 3.237 1.003 -2.71 -7.135 -10.659 -13.459 -15.725 -17.695 -19.33 -20.761 -22.006 -23.253 -24.304 -25.215 -26.08 -26.904 -27.631 -28.263 -28.937 -29.537 -30.043 -30.557 -31.106 -31.549 -31.983 -32.455 -32.833 -33.219 -33.608 -33.999 -34.38 -34.633 -34.919 -35.362 -35.648 -35.956 -36.121 -36.461 -36.811 -37.16 -37.34 -37.732 -37.891 -38.083 -38.281 -38.712 -38.96 -39.243 -39.537 -39.872 -40.248 -40.763 -42.389 -6 ,26475 ,KEBNE ,16653217,Mon Nov 22 02:08:06 CET,Mon Nov 22 03:32:54 CET,0.0 2.974 3.576 3.991 4.312 4.599 4.86 5.067 5.401 5.539 5.662 5.723 5.991 6.093 6.283 6.442 6.581 6.652 6.779 6.888 7.057 7.163 7.252 7.411 7.581 7.717 7.834 7.943 8.11 8.282 8.404 8.483 8.552 8.625 8.679 8.713 8.74 8.755 8.736 8.691 8.618 8.477 8.326 8.166 7.846 7.345 6.613 5.623 4.144 1.814 -1.984 -6.346 -9.836 -12.719 -15.062 -17.04 -18.737 -20.233 -21.49 -22.717 -23.746 -24.647 -25.487 -26.274 -27.005 -27.661 -28.312 -28.879 -29.362 -29.848 -30.36 -30.785 -31.215 -31.666 -32.011 -32.367 -32.736 -33.12 -33.516 -33.773 -34.038 -34.453 -34.742 -35.041 -35.192 -35.504 -35.842 -36.225 -36.43 -36.844 -37.024 -37.238 -37.48 -38.025 -38.32 -38.646 -39.007 -39.429 -39.91 -40.504 -42.924 -7 ,25677 ,KEBNE ,16653218,Mon Nov 22 02:08:06 CET,Mon Nov 22 03:32:03 CET,0.0 4.934 5.51 5.95 6.293 6.579 6.817 7.03 7.404 7.553 7.7 7.822 8.094 8.196 8.392 8.573 8.744 8.823 8.968 9.105 9.285 9.39 9.493 9.627 9.742 9.857 9.968 10.068 10.177 10.263 10.335 10.421 10.502 10.569 10.657 10.756 10.809 10.822 10.796 10.745 10.682 10.58 10.388 10.125 9.744 9.211 8.487 7.468 5.978 3.681 -0.227 -4.791 -8.265 -11.021 -13.329 -15.303 -16.976 -18.448 -19.664 -20.858 -21.887 -22.785 -23.603 -24.337 -25.011 -25.626 -26.27 -26.838 -27.313 -27.802 -28.312 -28.739 -29.183 -29.638 -29.986 -30.336 -30.698 -31.079 -31.46 -31.715 -31.995 -32.448 -32.743 -33.041 -33.194 -33.502 -33.817 -34.153 -34.336 -34.733 -34.885 -35.091 -35.329 -35.798 -36.037 -36.31 -36.602 -36.93 -37.32 -37.805 -39.96 -8 ,3677 ,KEBNE ,16653219,Mon Nov 22 02:08:06 CET,Mon Nov 22 03:33:09 CET,0.0 2.105 2.629 2.969 3.23 3.453 3.657 3.842 4.175 4.323 4.482 4.624 4.906 5.026 5.237 5.416 5.59 5.665 5.794 5.93 6.131 6.257 6.37 6.519 6.655 6.786 6.898 6.979 7.071 7.154 7.246 7.346 7.406 7.455 7.492 7.515 7.54 7.566 7.565 7.513 7.414 7.257 7.059 6.806 6.389 5.824 5.052 4.032 2.539 0.162 -3.709 -8.046 -11.404 -14.127 -16.394 -18.373 -20.068 -21.55 -22.787 -23.984 -24.974 -25.845 -26.706 -27.503 -28.221 -28.867 -29.528 -30.142 -30.676 -31.203 -31.727 -32.159 -32.605 -33.051 -33.381 -33.718 -34.07 -34.44 -34.835 -35.111 -35.4 -35.848 -36.152 -36.472 -36.634 -36.959 -37.297 -37.647 -37.823 -38.219 -38.42 -38.633 -38.838 -39.29 -39.53 -39.789 -40.105 -40.468 -40.902 -41.441 -43.192 -9 ,12487 ,KEBNE ,16653220,Mon Nov 22 02:08:06 CET,Mon Nov 22 03:31:34 CET,0.0 1.462 2.021 2.419 2.763 3.036 3.258 3.451 3.776 3.915 4.051 4.178 4.471 4.594 4.821 5.002 5.16 5.244 5.408 5.566 5.783 5.883 5.957 6.084 6.225 6.365 6.481 6.574 6.694 6.799 6.886 6.977 7.046 7.095 7.138 7.189 7.227 7.237 7.265 7.295 7.24 7.12 6.917 6.63 6.229 5.695 4.947 3.884 2.354 0.046 -3.746 -8.005 -11.43 -14.25 -16.64 -18.678 -20.358 -21.86 -23.133 -24.407 -25.509 -26.438 -27.298 -28.124 -28.869 -29.542 -30.242 -30.853 -31.373 -31.899 -32.425 -32.865 -33.329 -33.81 -34.177 -34.557 -34.95 -35.333 -35.744 -36.024 -36.305 -36.75 -37.051 -37.355 -37.513 -37.854 -38.206 -38.564 -38.746 -39.147 -39.339 -39.559 -39.79 -40.287 -40.573 -40.891 -41.24 -41.627 -42.043 -42.645 -46.23 -10 ,28649 ,KEBNE ,16653221,Mon Nov 22 02:08:06 CET,Mon Nov 22 03:33:03 CET,0.0 2.488 2.92 3.224 3.484 3.733 3.931 4.095 4.399 4.539 4.673 4.747 5.016 5.114 5.29 5.475 5.658 5.73 5.85 5.97 6.129 6.222 6.319 6.461 6.578 6.683 6.786 6.876 6.983 7.086 7.178 7.281 7.382 7.46 7.513 7.558 7.573 7.553 7.527 7.509 7.462 7.342 7.145 6.896 6.52 5.967 5.197 4.094 2.531 0.253 -3.498 -7.782 -11.199 -13.981 -16.254 -18.251 -19.989 -21.518 -22.77 -23.964 -24.967 -25.857 -26.707 -27.47 -28.157 -28.79 -29.445 -30.03 -30.533 -31.029 -31.529 -31.964 -32.408 -32.852 -33.195 -33.555 -33.925 -34.3 -34.702 -34.979 -35.252 -35.683 -35.984 -36.282 -36.434 -36.757 -37.109 -37.492 -37.69 -38.105 -38.324 -38.551 -38.766 -39.213 -39.46 -39.726 -40.013 -40.296 -40.613 -41.094 -42.804 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 1f1d5c08..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13231 ,KEBNE ,16653222,Mon Nov 22 02:08:06 CET,Mon Nov 22 03:32:36 CET,0.0 0.605 0.833 0.997 1.16 1.316 1.435 1.541 1.734 1.822 1.906 1.909 2.152 2.224 2.377 2.534 2.666 2.721 2.83 2.941 3.092 3.195 3.309 3.466 3.603 3.737 3.873 4.02 4.215 4.383 4.543 4.74 4.934 5.122 5.335 5.569 5.781 6.005 6.259 6.533 6.824 7.144 7.499 7.857 8.259 8.673 9.107 9.546 9.989 10.412 10.66 10.425 10.021 9.575 9.122 8.663 8.201 7.743 7.352 6.956 6.599 6.262 5.937 5.638 5.358 5.078 4.772 4.515 4.285 4.049 3.808 3.595 3.365 3.121 2.923 2.716 2.485 2.231 1.978 1.798 1.603 1.314 1.115 0.912 0.812 0.605 0.389 0.148 0.025 -0.253 -0.358 -0.513 -0.676 -1.019 -1.225 -1.463 -1.712 -1.965 -2.298 -2.795 -5.59 -2 ,20088 ,KEBNE ,16653223,Mon Nov 22 02:08:06 CET,Mon Nov 22 03:32:43 CET,0.0 0.567 0.79 0.981 1.144 1.28 1.401 1.517 1.705 1.787 1.87 1.887 2.139 2.218 2.381 2.548 2.699 2.774 2.913 3.043 3.223 3.336 3.463 3.649 3.807 3.955 4.112 4.266 4.455 4.63 4.807 5.017 5.197 5.369 5.576 5.81 6.028 6.259 6.497 6.757 7.035 7.344 7.718 8.098 8.509 8.907 9.354 9.852 10.344 10.746 10.949 10.79 10.414 9.936 9.428 8.918 8.431 7.954 7.539 7.091 6.668 6.276 5.908 5.561 5.227 4.932 4.636 4.375 4.135 3.874 3.632 3.427 3.185 2.935 2.739 2.531 2.316 2.102 1.868 1.695 1.517 1.242 1.047 0.843 0.734 0.49 0.237 -0.015 -0.155 -0.463 -0.604 -0.761 -0.926 -1.285 -1.5 -1.74 -2.038 -2.358 -2.677 -3.157 -4.75 -3 ,23626 ,KEBNE ,16653224,Mon Nov 22 02:08:06 CET,Mon Nov 22 03:32:34 CET,0.0 0.397 0.632 0.776 0.912 1.041 1.159 1.283 1.532 1.641 1.749 1.789 2.032 2.115 2.301 2.476 2.621 2.689 2.823 2.953 3.148 3.273 3.381 3.539 3.708 3.866 4.014 4.157 4.336 4.514 4.688 4.896 5.092 5.262 5.462 5.7 5.921 6.159 6.426 6.7 6.987 7.315 7.666 8.002 8.401 8.822 9.255 9.725 10.228 10.689 11.017 10.866 10.441 9.938 9.485 9.054 8.597 8.162 7.783 7.359 6.972 6.636 6.306 5.969 5.635 5.334 5.052 4.804 4.579 4.325 4.057 3.856 3.654 3.43 3.252 3.055 2.843 2.64 2.427 2.27 2.096 1.799 1.589 1.379 1.27 1.049 0.831 0.601 0.467 0.168 0.009 -0.179 -0.375 -0.789 -1.019 -1.248 -1.484 -1.801 -2.232 -2.739 -4.629 -4 ,6379 ,KEBNE ,16653225,Mon Nov 22 02:08:06 CET,Mon Nov 22 03:32:49 CET,0.0 0.398 0.575 0.739 0.882 0.996 1.125 1.241 1.424 1.53 1.641 1.659 1.902 1.983 2.133 2.287 2.455 2.53 2.658 2.784 2.978 3.101 3.224 3.418 3.586 3.731 3.875 4.015 4.195 4.366 4.522 4.717 4.902 5.069 5.269 5.484 5.69 5.933 6.195 6.481 6.784 7.105 7.465 7.816 8.207 8.606 9.063 9.581 10.096 10.541 10.83 10.708 10.362 9.92 9.443 8.955 8.488 8.028 7.615 7.205 6.839 6.519 6.21 5.892 5.597 5.316 5.0 4.733 4.517 4.305 4.069 3.862 3.633 3.382 3.188 2.978 2.764 2.545 2.318 2.162 1.974 1.685 1.486 1.279 1.175 0.937 0.687 0.443 0.319 0.023 -0.156 -0.333 -0.53 -0.964 -1.188 -1.456 -1.767 -2.106 -2.483 -2.976 -4.874 -5 ,14165 ,KEBNE ,16653226,Mon Nov 22 02:09:08 CET,Mon Nov 22 03:34:05 CET,0.0 0.962 1.272 1.497 1.688 1.836 1.963 2.091 2.335 2.44 2.541 2.591 2.849 2.945 3.139 3.303 3.449 3.521 3.662 3.798 3.998 4.118 4.226 4.386 4.547 4.704 4.85 4.984 5.154 5.323 5.493 5.7 5.892 6.078 6.297 6.536 6.76 7.006 7.265 7.528 7.805 8.119 8.477 8.816 9.174 9.57 10.035 10.52 11.012 11.454 11.689 11.601 11.259 10.748 10.218 9.707 9.245 8.808 8.392 7.969 7.59 7.218 6.864 6.558 6.286 6.028 5.714 5.408 5.156 4.901 4.645 4.438 4.224 3.987 3.797 3.605 3.384 3.123 2.851 2.684 2.523 2.25 2.042 1.82 1.704 1.476 1.252 0.986 0.845 0.544 0.374 0.201 0.022 -0.336 -0.53 -0.77 -1.081 -1.397 -1.751 -2.253 -5.771 -6 ,14915 ,KEBNE ,16653227,Mon Nov 22 02:09:08 CET,Mon Nov 22 03:33:38 CET,0.0 0.337 0.537 0.706 0.845 0.969 1.117 1.276 1.545 1.664 1.777 1.829 2.091 2.188 2.349 2.494 2.653 2.733 2.875 3.013 3.209 3.323 3.428 3.589 3.757 3.911 4.056 4.2 4.38 4.552 4.724 4.929 5.121 5.308 5.522 5.753 5.977 6.227 6.489 6.757 7.038 7.359 7.733 8.093 8.485 8.89 9.337 9.817 10.286 10.69 10.841 10.565 10.147 9.726 9.284 8.803 8.351 7.919 7.534 7.137 6.787 6.46 6.135 5.829 5.551 5.301 5.039 4.795 4.572 4.339 4.092 3.886 3.689 3.465 3.277 3.082 2.862 2.624 2.384 2.217 2.037 1.753 1.559 1.363 1.263 1.051 0.807 0.531 0.4 0.12 -0.017 -0.17 -0.33 -0.688 -0.91 -1.15 -1.39 -1.682 -2.037 -2.622 -5.416 -7 ,16640 ,KEBNE ,16653228,Mon Nov 22 02:09:08 CET,Mon Nov 22 03:32:06 CET,0.0 0.547 0.799 0.982 1.115 1.232 1.34 1.45 1.652 1.739 1.828 1.831 2.066 2.139 2.263 2.381 2.512 2.574 2.692 2.823 3.025 3.154 3.27 3.433 3.6 3.757 3.895 4.034 4.219 4.393 4.567 4.774 4.959 5.129 5.333 5.571 5.795 6.038 6.3 6.58 6.876 7.221 7.611 7.952 8.334 8.746 9.188 9.639 10.043 10.389 10.651 10.507 10.106 9.52 8.885 8.287 7.76 7.29 6.852 6.405 6.021 5.69 5.38 5.077 4.789 4.527 4.234 3.955 3.711 3.453 3.202 2.997 2.76 2.516 2.322 2.106 1.878 1.645 1.4 1.223 1.042 0.781 0.609 0.412 0.311 0.104 -0.128 -0.373 -0.497 -0.781 -0.887 -1.034 -1.194 -1.539 -1.738 -1.959 -2.216 -2.508 -2.863 -3.369 -6.467 -8 ,29762 ,KEBNE ,16653229,Mon Nov 22 02:09:08 CET,Mon Nov 22 03:33:42 CET,0.0 0.623 0.882 1.068 1.226 1.381 1.503 1.607 1.798 1.884 1.974 1.988 2.23 2.312 2.473 2.633 2.782 2.849 2.984 3.118 3.315 3.44 3.548 3.702 3.86 4.022 4.18 4.323 4.512 4.691 4.863 5.067 5.263 5.453 5.663 5.899 6.121 6.355 6.601 6.864 7.149 7.457 7.803 8.152 8.538 8.964 9.432 9.904 10.37 10.763 10.987 10.754 10.254 9.726 9.252 8.79 8.308 7.844 7.455 7.049 6.705 6.382 6.047 5.747 5.452 5.178 4.897 4.627 4.389 4.139 3.874 3.655 3.409 3.152 2.954 2.74 2.519 2.294 2.073 1.918 1.734 1.452 1.264 1.062 0.956 0.734 0.506 0.274 0.145 -0.147 -0.25 -0.387 -0.551 -0.939 -1.148 -1.352 -1.621 -1.973 -2.374 -2.808 -5.664 -9 ,27434 ,KEBNE ,16653230,Mon Nov 22 02:09:08 CET,Mon Nov 22 03:33:32 CET,0.0 0.383 0.585 0.768 0.909 1.033 1.149 1.254 1.445 1.538 1.63 1.627 1.871 1.957 2.134 2.298 2.442 2.513 2.652 2.793 2.989 3.107 3.216 3.367 3.522 3.68 3.826 3.961 4.138 4.305 4.465 4.658 4.846 5.029 5.238 5.472 5.69 5.915 6.161 6.426 6.711 7.024 7.372 7.725 8.142 8.588 9.026 9.451 9.882 10.332 10.646 10.411 9.941 9.459 8.97 8.485 8.043 7.609 7.226 6.85 6.517 6.211 5.897 5.568 5.25 4.96 4.655 4.387 4.143 3.873 3.599 3.364 3.107 2.834 2.63 2.429 2.236 2.041 1.832 1.689 1.526 1.251 1.038 0.818 0.713 0.501 0.272 0.033 -0.094 -0.395 -0.576 -0.748 -0.916 -1.284 -1.481 -1.711 -1.984 -2.294 -2.708 -3.348 -5.308 -10 ,32469 ,KEBNE ,16653231,Mon Nov 22 02:09:09 CET,Mon Nov 22 03:33:40 CET,0.0 0.708 0.991 1.14 1.269 1.401 1.531 1.654 1.858 1.944 2.031 2.041 2.283 2.352 2.48 2.605 2.728 2.786 2.908 3.029 3.197 3.306 3.407 3.548 3.691 3.844 3.995 4.131 4.307 4.488 4.661 4.858 5.03 5.19 5.389 5.624 5.848 6.087 6.33 6.578 6.84 7.147 7.513 7.874 8.271 8.692 9.129 9.599 10.082 10.5 10.767 10.557 10.102 9.651 9.233 8.767 8.315 7.889 7.482 7.021 6.621 6.284 5.975 5.665 5.368 5.101 4.827 4.572 4.336 4.071 3.793 3.581 3.366 3.144 2.965 2.763 2.562 2.352 2.11 1.938 1.761 1.486 1.305 1.117 1.02 0.821 0.618 0.384 0.251 -0.042 -0.172 -0.327 -0.493 -0.826 -0.998 -1.211 -1.45 -1.718 -2.132 -2.733 -7.236 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt deleted file mode 100644 index f9ac59bd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30839 ,KEBNE ,16653232,Mon Nov 22 02:09:09 CET,Mon Nov 22 03:34:13 CET,0.0 1.033 1.351 1.59 1.768 1.911 2.032 2.139 2.352 2.456 2.554 2.549 2.78 2.851 2.968 3.075 3.18 3.225 3.308 3.391 3.516 3.586 3.644 3.73 3.836 3.94 4.015 4.084 4.181 4.263 4.328 4.395 4.448 4.497 4.529 4.537 4.536 4.524 4.491 4.437 4.355 4.21 3.949 3.673 3.315 2.778 2.044 0.974 -0.598 -2.891 -6.62 -10.937 -14.316 -17.037 -19.256 -21.148 -22.776 -24.206 -25.405 -26.57 -27.533 -28.358 -29.143 -29.879 -30.568 -31.193 -31.821 -32.368 -32.826 -33.285 -33.763 -34.163 -34.568 -34.982 -35.297 -35.618 -35.953 -36.303 -36.652 -36.872 -37.09 -37.441 -37.694 -37.946 -38.07 -38.33 -38.603 -38.89 -39.036 -39.393 -39.49 -39.653 -39.838 -40.231 -40.436 -40.647 -40.853 -41.097 -41.376 -41.773 -42.945 -2 ,18284 ,KEBNE ,16653233,Mon Nov 22 02:09:09 CET,Mon Nov 22 03:34:10 CET,0.0 1.407 1.692 1.892 2.049 2.186 2.308 2.433 2.639 2.726 2.811 2.804 3.042 3.124 3.285 3.421 3.553 3.617 3.729 3.831 3.975 4.048 4.109 4.206 4.291 4.37 4.425 4.471 4.532 4.59 4.639 4.672 4.697 4.73 4.762 4.779 4.784 4.762 4.721 4.67 4.582 4.452 4.235 3.942 3.514 2.935 2.158 1.104 -0.471 -2.801 -6.487 -10.774 -14.153 -16.867 -19.081 -21.0 -22.641 -24.083 -25.319 -26.515 -27.501 -28.336 -29.113 -29.855 -30.536 -31.14 -31.76 -32.307 -32.778 -33.271 -33.752 -34.137 -34.555 -34.979 -35.293 -35.61 -35.936 -36.278 -36.644 -36.902 -37.155 -37.547 -37.829 -38.126 -38.273 -38.548 -38.84 -39.149 -39.305 -39.675 -39.764 -39.931 -40.11 -40.481 -40.68 -40.879 -41.103 -41.377 -41.7 -42.069 -43.374 -3 ,17624 ,KEBNE ,16653234,Mon Nov 22 02:09:08 CET,Mon Nov 22 03:34:18 CET,0.0 1.653 2.065 2.295 2.47 2.619 2.76 2.872 3.042 3.121 3.203 3.208 3.452 3.525 3.672 3.823 3.964 4.026 4.138 4.242 4.374 4.447 4.509 4.603 4.707 4.799 4.863 4.934 5.026 5.086 5.146 5.216 5.265 5.284 5.287 5.303 5.309 5.286 5.252 5.175 5.068 4.902 4.621 4.312 3.897 3.319 2.514 1.47 0.007 -2.214 -5.996 -10.465 -13.908 -16.648 -18.939 -20.936 -22.564 -23.976 -25.159 -26.308 -27.274 -28.121 -28.911 -29.621 -30.27 -30.866 -31.502 -32.059 -32.517 -32.977 -33.452 -33.855 -34.261 -34.697 -35.031 -35.357 -35.701 -36.054 -36.424 -36.671 -36.921 -37.322 -37.6 -37.871 -38.004 -38.281 -38.555 -38.837 -38.99 -39.367 -39.475 -39.643 -39.822 -40.21 -40.433 -40.655 -40.876 -41.131 -41.429 -41.815 -43.103 -4 ,26014 ,KEBNE ,16653235,Mon Nov 22 02:09:09 CET,Mon Nov 22 03:34:15 CET,0.0 2.03 2.381 2.613 2.824 3.0 3.173 3.345 3.635 3.752 3.854 3.896 4.159 4.256 4.438 4.606 4.755 4.824 4.938 5.033 5.164 5.234 5.305 5.422 5.514 5.585 5.651 5.712 5.797 5.892 5.975 6.041 6.065 6.073 6.078 6.083 6.09 6.059 6.013 5.966 5.874 5.722 5.476 5.162 4.73 4.142 3.347 2.261 0.671 -1.659 -5.35 -9.652 -13.071 -15.823 -18.108 -20.055 -21.684 -23.112 -24.303 -25.468 -26.45 -27.325 -28.148 -28.884 -29.544 -30.14 -30.742 -31.265 -31.72 -32.186 -32.677 -33.096 -33.514 -33.948 -34.287 -34.626 -34.979 -35.324 -35.678 -35.925 -36.167 -36.535 -36.794 -37.074 -37.221 -37.517 -37.81 -38.111 -38.267 -38.632 -38.713 -38.877 -39.065 -39.485 -39.7 -39.899 -40.118 -40.361 -40.66 -41.056 -42.052 -5 ,28097 ,KEBNE ,16653236,Mon Nov 22 02:09:08 CET,Mon Nov 22 03:34:07 CET,0.0 1.561 1.945 2.241 2.466 2.637 2.797 2.93 3.14 3.239 3.332 3.318 3.551 3.62 3.743 3.865 3.993 4.055 4.162 4.255 4.378 4.459 4.537 4.642 4.746 4.839 4.923 4.994 5.086 5.156 5.214 5.3 5.36 5.394 5.414 5.415 5.38 5.33 5.269 5.187 5.08 4.925 4.707 4.43 4.028 3.486 2.726 1.644 0.066 -2.241 -5.994 -10.414 -13.83 -16.531 -18.77 -20.704 -22.346 -23.813 -25.015 -26.16 -27.145 -28.013 -28.809 -29.547 -30.228 -30.83 -31.414 -31.924 -32.385 -32.867 -33.369 -33.781 -34.198 -34.616 -34.929 -35.25 -35.579 -35.924 -36.275 -36.523 -36.788 -37.174 -37.451 -37.746 -37.893 -38.188 -38.495 -38.819 -38.987 -39.377 -39.521 -39.703 -39.895 -40.299 -40.519 -40.764 -41.023 -41.306 -41.63 -42.032 -43.298 -6 ,14783 ,KEBNE ,16653237,Mon Nov 22 02:09:09 CET,Mon Nov 22 03:34:07 CET,0.0 1.267 1.665 1.935 2.162 2.353 2.513 2.647 2.898 3.016 3.126 3.169 3.425 3.519 3.693 3.84 3.959 4.013 4.112 4.215 4.362 4.443 4.517 4.624 4.726 4.819 4.909 4.98 5.056 5.13 5.194 5.253 5.289 5.338 5.386 5.401 5.41 5.418 5.384 5.315 5.212 5.056 4.831 4.574 4.189 3.609 2.808 1.738 0.209 -2.118 -5.95 -10.273 -13.623 -16.322 -18.546 -20.475 -22.094 -23.539 -24.785 -26.005 -27.018 -27.898 -28.721 -29.474 -30.158 -30.763 -31.376 -31.928 -32.412 -32.913 -33.427 -33.849 -34.279 -34.704 -35.027 -35.361 -35.719 -36.087 -36.432 -36.677 -36.934 -37.324 -37.597 -37.868 -38.01 -38.303 -38.591 -38.877 -39.027 -39.39 -39.478 -39.645 -39.822 -40.197 -40.401 -40.609 -40.819 -41.077 -41.412 -41.793 -42.966 -7 ,26163 ,KEBNE ,16653238,Mon Nov 22 02:09:09 CET,Mon Nov 22 03:34:08 CET,0.0 0.944 1.281 1.524 1.701 1.857 2.01 2.131 2.356 2.453 2.523 2.493 2.722 2.795 2.957 3.091 3.209 3.265 3.355 3.432 3.532 3.603 3.672 3.766 3.854 3.949 4.046 4.125 4.219 4.31 4.377 4.44 4.496 4.524 4.556 4.581 4.57 4.55 4.547 4.535 4.451 4.307 4.108 3.851 3.465 2.922 2.173 1.096 -0.462 -2.799 -6.697 -11.048 -14.44 -17.186 -19.443 -21.424 -23.08 -24.527 -25.738 -26.903 -27.884 -28.748 -29.558 -30.294 -30.971 -31.584 -32.2 -32.729 -33.188 -33.662 -34.14 -34.542 -34.963 -35.379 -35.693 -36.028 -36.375 -36.72 -37.086 -37.329 -37.569 -37.943 -38.197 -38.457 -38.594 -38.911 -39.214 -39.486 -39.632 -39.991 -40.081 -40.256 -40.441 -40.813 -41.017 -41.24 -41.484 -41.751 -42.048 -42.442 -43.74 -8 ,9017 ,KEBNE ,16653239,Mon Nov 22 02:10:10 CET,Mon Nov 22 03:35:51 CET,0.0 1.516 1.87 2.09 2.272 2.45 2.616 2.761 3.033 3.157 3.283 3.368 3.631 3.715 3.87 4.012 4.151 4.219 4.333 4.431 4.566 4.65 4.728 4.825 4.901 4.968 5.036 5.112 5.223 5.313 5.407 5.52 5.573 5.605 5.64 5.664 5.655 5.627 5.608 5.557 5.445 5.281 5.06 4.782 4.41 3.89 3.111 2.028 0.465 -1.882 -5.754 -10.098 -13.507 -16.267 -18.506 -20.477 -22.129 -23.517 -24.672 -25.803 -26.762 -27.616 -28.403 -29.107 -29.766 -30.374 -30.99 -31.515 -31.969 -32.444 -32.923 -33.324 -33.745 -34.195 -34.526 -34.86 -35.219 -35.579 -35.955 -36.204 -36.452 -36.841 -37.102 -37.381 -37.535 -37.836 -38.118 -38.425 -38.604 -38.998 -39.144 -39.331 -39.533 -39.972 -40.199 -40.421 -40.645 -40.894 -41.18 -41.586 -42.595 -10 ,17135 ,KEBNE ,16653241,Mon Nov 22 02:10:09 CET,Mon Nov 22 03:35:24 CET,0.0 1.258 1.545 1.752 1.916 2.063 2.188 2.292 2.496 2.599 2.691 2.682 2.92 2.99 3.108 3.228 3.339 3.385 3.475 3.564 3.683 3.779 3.877 3.992 4.091 4.188 4.285 4.371 4.467 4.554 4.623 4.679 4.73 4.77 4.817 4.846 4.841 4.82 4.765 4.681 4.588 4.466 4.255 3.973 3.58 3.023 2.234 1.144 -0.463 -2.83 -6.628 -10.928 -14.292 -17.054 -19.334 -21.279 -22.894 -24.273 -25.439 -26.619 -27.625 -28.473 -29.258 -30.002 -30.671 -31.266 -31.885 -32.447 -32.914 -33.38 -33.866 -34.278 -34.7 -35.109 -35.418 -35.738 -36.064 -36.397 -36.747 -36.997 -37.259 -37.645 -37.925 -38.223 -38.369 -38.666 -38.956 -39.25 -39.399 -39.768 -39.855 -40.014 -40.186 -40.552 -40.759 -40.992 -41.238 -41.488 -41.772 -42.198 -43.764 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 8086d392..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29980 ,KEBNE ,16653242,Mon Nov 22 02:10:13 CET,Mon Nov 22 03:27:30 CET,0.0 0.57 0.82 1.032 1.212 1.36 1.489 1.605 1.8 1.896 2.009 2.092 2.366 2.473 2.692 2.892 3.076 3.155 3.293 3.433 3.648 3.786 3.914 4.091 4.256 4.419 4.585 4.748 4.951 5.138 5.309 5.516 5.716 5.906 6.128 6.369 6.598 6.85 7.123 7.404 7.703 8.044 8.416 8.788 9.203 9.623 10.098 10.624 11.169 11.586 11.76 11.633 11.285 10.82 10.338 9.87 9.421 8.973 8.58 8.191 7.838 7.472 7.096 6.762 6.467 6.179 5.875 5.597 5.348 5.089 4.824 4.6 4.365 4.122 3.926 3.72 3.507 3.283 3.044 2.874 2.702 2.443 2.254 2.047 1.945 1.724 1.491 1.259 1.138 0.853 0.687 0.475 0.272 -0.103 -0.334 -0.6 -0.892 -1.206 -1.588 -2.125 -4.017 -2 ,10142 ,KEBNE ,16653243,Mon Nov 22 02:11:11 CET,Mon Nov 22 03:35:56 CET,0.0 1.347 1.682 1.911 2.075 2.23 2.391 2.53 2.778 2.894 2.991 3.006 3.261 3.351 3.514 3.664 3.818 3.892 4.032 4.16 4.342 4.462 4.586 4.766 4.929 5.09 5.251 5.411 5.614 5.802 5.983 6.195 6.404 6.607 6.83 7.095 7.367 7.635 7.903 8.188 8.484 8.821 9.195 9.543 9.921 10.324 10.783 11.258 11.73 12.226 12.559 12.401 12.015 11.534 10.989 10.465 9.967 9.487 9.066 8.663 8.314 7.986 7.651 7.325 7.043 6.776 6.472 6.199 5.972 5.732 5.482 5.255 5.005 4.74 4.536 4.33 4.119 3.892 3.655 3.478 3.289 3.009 2.818 2.646 2.553 2.318 2.077 1.83 1.691 1.387 1.222 1.041 0.847 0.46 0.268 0.044 -0.239 -0.574 -0.944 -1.544 -4.953 -3 ,12933 ,KEBNE ,16653244,Mon Nov 22 02:11:11 CET,Mon Nov 22 03:35:43 CET,0.0 0.664 0.937 1.156 1.358 1.54 1.702 1.841 2.084 2.185 2.277 2.283 2.523 2.597 2.746 2.887 3.018 3.087 3.223 3.355 3.551 3.684 3.814 4.006 4.211 4.403 4.562 4.698 4.876 5.061 5.241 5.445 5.643 5.839 6.057 6.295 6.523 6.767 7.028 7.313 7.612 7.929 8.279 8.639 9.064 9.505 9.926 10.35 10.809 11.149 11.313 11.132 10.661 10.085 9.55 9.034 8.555 8.109 7.703 7.246 6.828 6.464 6.134 5.819 5.517 5.233 4.925 4.637 4.392 4.136 3.873 3.649 3.399 3.138 2.936 2.747 2.554 2.347 2.114 1.941 1.767 1.484 1.274 1.054 0.939 0.7 0.472 0.237 0.092 -0.219 -0.388 -0.564 -0.731 -1.086 -1.296 -1.542 -1.853 -2.176 -2.53 -3.11 -5.552 -5 ,80 ,KEBNE ,16653246,Mon Nov 22 02:12:13 CET,Mon Nov 22 03:36:42 CET,0.0 0.761 1.093 1.354 1.586 1.804 2.014 2.186 2.472 2.603 2.712 2.734 2.995 3.097 3.287 3.474 3.646 3.734 3.915 4.082 4.285 4.404 4.54 4.757 4.938 5.097 5.251 5.388 5.569 5.745 5.912 6.114 6.311 6.502 6.724 6.967 7.186 7.432 7.709 7.999 8.284 8.591 8.942 9.3 9.711 10.139 10.627 11.131 11.562 11.797 11.8 11.341 10.713 10.086 9.507 9.02 8.581 8.139 7.713 7.274 6.917 6.598 6.282 5.988 5.712 5.439 5.117 4.836 4.606 4.345 4.057 3.842 3.611 3.355 3.158 2.96 2.756 2.528 2.298 2.146 1.989 1.753 1.592 1.401 1.293 1.064 0.829 0.581 0.445 0.12 -0.044 -0.221 -0.436 -0.844 -1.075 -1.341 -1.613 -1.925 -2.365 -2.95 -4.98 -6 ,21259 ,KEBNE ,16653247,Mon Nov 22 02:12:17 CET,Mon Nov 22 03:34:10 CET,0.0 0.798 1.053 1.251 1.422 1.562 1.695 1.826 2.048 2.141 2.237 2.269 2.526 2.615 2.781 2.954 3.115 3.184 3.331 3.481 3.683 3.806 3.923 4.086 4.244 4.4 4.55 4.688 4.862 5.033 5.194 5.397 5.594 5.769 5.975 6.226 6.464 6.707 6.977 7.263 7.552 7.862 8.21 8.557 8.966 9.419 9.89 10.345 10.835 11.273 11.468 11.358 11.005 10.482 9.987 9.496 8.996 8.507 8.084 7.67 7.318 7.007 6.68 6.36 6.071 5.795 5.503 5.227 4.987 4.741 4.478 4.254 4.019 3.775 3.578 3.363 3.145 2.914 2.67 2.506 2.324 2.024 1.808 1.584 1.471 1.221 0.943 0.648 0.5 0.177 -0.023 -0.198 -0.389 -0.801 -1.026 -1.268 -1.536 -1.854 -2.289 -2.853 -6.654 -7 ,3157 ,KEBNE ,16653248,Mon Nov 22 02:12:13 CET,Mon Nov 22 03:36:35 CET,0.0 0.959 1.3 1.572 1.765 1.95 2.123 2.281 2.559 2.675 2.802 2.881 3.158 3.27 3.467 3.659 3.848 3.94 4.103 4.243 4.437 4.561 4.683 4.856 5.023 5.177 5.325 5.471 5.659 5.854 6.044 6.265 6.47 6.656 6.877 7.143 7.393 7.65 7.923 8.211 8.503 8.815 9.168 9.53 9.925 10.347 10.811 11.299 11.839 12.286 12.407 12.132 11.705 11.224 10.752 10.286 9.83 9.402 9.028 8.619 8.253 7.916 7.538 7.18 6.878 6.574 6.233 5.932 5.687 5.428 5.151 4.937 4.709 4.464 4.279 4.084 3.874 3.654 3.429 3.269 3.102 2.811 2.59 2.375 2.271 2.048 1.814 1.558 1.413 1.115 0.999 0.848 0.68 0.337 0.135 -0.083 -0.324 -0.648 -1.068 -1.635 -4.389 -8 ,22004 ,KEBNE ,16653249,Mon Nov 22 02:12:13 CET,Mon Nov 22 03:36:34 CET,0.0 0.831 1.217 1.487 1.689 1.87 2.018 2.154 2.405 2.516 2.622 2.688 2.96 3.07 3.281 3.469 3.635 3.718 3.872 3.996 4.182 4.307 4.426 4.59 4.754 4.917 5.063 5.2 5.388 5.575 5.758 5.976 6.167 6.351 6.565 6.787 7.013 7.268 7.542 7.841 8.134 8.438 8.787 9.138 9.517 9.926 10.375 10.832 11.324 11.742 12.003 11.913 11.505 10.961 10.439 9.921 9.412 8.947 8.58 8.214 7.865 7.514 7.152 6.824 6.511 6.221 5.937 5.676 5.428 5.169 4.91 4.698 4.482 4.251 4.056 3.842 3.625 3.398 3.154 2.982 2.802 2.529 2.326 2.115 1.999 1.761 1.53 1.266 1.117 0.8 0.616 0.421 0.214 -0.218 -0.469 -0.786 -1.124 -1.495 -1.965 -2.582 -4.176 -9 ,14909 ,KEBNE ,16653250,Mon Nov 22 02:12:12 CET,Mon Nov 22 03:37:11 CET,0.0 0.607 0.851 1.036 1.185 1.321 1.449 1.57 1.784 1.873 1.97 2.017 2.287 2.386 2.552 2.702 2.853 2.932 3.084 3.224 3.422 3.544 3.674 3.874 4.052 4.219 4.38 4.53 4.715 4.891 5.055 5.246 5.438 5.628 5.842 6.072 6.301 6.561 6.826 7.115 7.414 7.724 8.092 8.473 8.911 9.373 9.845 10.307 10.807 11.293 11.537 11.316 10.884 10.359 9.857 9.36 8.895 8.485 8.105 7.704 7.352 7.014 6.671 6.365 6.08 5.805 5.493 5.2 4.945 4.672 4.387 4.15 3.9 3.654 3.465 3.256 3.027 2.769 2.493 2.299 2.104 1.789 1.548 1.312 1.203 0.967 0.728 0.482 0.349 0.05 -0.104 -0.296 -0.489 -0.838 -1.043 -1.301 -1.606 -1.942 -2.305 -2.808 -6.082 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_19_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_19_23.txt deleted file mode 100644 index 09368522..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_19_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11508 ,KEBNE ,16676662,Wed Nov 24 12:51:38 CET,Wed Nov 24 14:48:56 CET,0.0 1.394 1.788 2.051 2.243 2.413 2.56 2.677 2.88 2.975 3.063 3.183 3.283 3.344 3.467 3.581 3.684 3.725 3.795 3.861 3.952 4.009 4.061 4.127 4.176 4.215 4.253 4.291 4.333 4.376 4.409 4.43 4.445 4.457 4.461 4.448 4.434 4.404 4.356 4.292 4.189 4.034 3.837 3.607 3.304 2.899 2.286 1.46 0.294 -1.377 -3.884 -6.624 -8.668 -10.327 -11.732 -12.991 -14.101 -15.072 -15.884 -16.67 -17.327 -17.914 -18.474 -18.983 -19.449 -19.861 -20.278 -20.652 -20.973 -21.292 -21.597 -21.842 -22.109 -22.396 -22.622 -22.854 -23.094 -23.337 -23.591 -23.774 -23.961 -24.249 -24.449 -24.661 -24.769 -24.988 -25.226 -25.479 -25.607 -25.813 -26.05 -26.209 -26.373 -26.732 -26.923 -27.142 -27.387 -27.657 -27.999 -28.44 -29.936 -2 ,24617 ,KEBNE ,16676663,Wed Nov 24 12:51:39 CET,Wed Nov 24 14:43:27 CET,0.0 1.46 1.851 2.096 2.285 2.447 2.595 2.726 2.927 3.013 3.1 3.225 3.327 3.384 3.495 3.607 3.7 3.741 3.828 3.899 3.991 4.045 4.093 4.161 4.222 4.274 4.318 4.357 4.404 4.441 4.465 4.477 4.482 4.487 4.484 4.464 4.428 4.375 4.318 4.243 4.141 4.007 3.811 3.58 3.249 2.816 2.218 1.42 0.308 -1.299 -3.791 -6.594 -8.743 -10.507 -11.94 -13.129 -14.143 -15.015 -15.742 -16.51 -17.189 -17.783 -18.312 -18.791 -19.246 -19.64 -20.028 -20.374 -20.664 -20.958 -21.269 -21.534 -21.82 -22.115 -22.337 -22.567 -22.814 -23.075 -23.351 -23.542 -23.737 -24.039 -24.239 -24.451 -24.558 -24.775 -25.014 -25.266 -25.392 -25.598 -25.823 -25.972 -26.133 -26.489 -26.678 -26.89 -27.132 -27.432 -27.787 -28.208 -30.007 -3 ,9202 ,KEBNE ,16676664,Wed Nov 24 12:51:46 CET,Wed Nov 24 14:43:33 CET,0.0 1.573 2.023 2.303 2.498 2.659 2.8 2.928 3.135 3.226 3.311 3.426 3.53 3.586 3.688 3.783 3.866 3.904 3.982 4.065 4.15 4.2 4.25 4.304 4.352 4.392 4.427 4.458 4.498 4.54 4.57 4.596 4.607 4.608 4.602 4.574 4.53 4.477 4.416 4.339 4.241 4.103 3.91 3.662 3.328 2.916 2.338 1.536 0.4 -1.219 -3.664 -6.392 -8.599 -10.414 -11.929 -13.204 -14.239 -15.149 -15.935 -16.724 -17.388 -17.976 -18.513 -18.989 -19.438 -19.844 -20.253 -20.62 -20.935 -21.272 -21.631 -21.907 -22.175 -22.459 -22.672 -22.884 -23.098 -23.321 -23.56 -23.727 -23.896 -24.182 -24.39 -24.604 -24.707 -24.899 -25.113 -25.357 -25.486 -25.685 -25.9 -26.049 -26.2 -26.539 -26.739 -26.952 -27.187 -27.461 -27.811 -28.312 -30.033 -4 ,23529 ,KEBNE ,16676665,Wed Nov 24 12:51:46 CET,Wed Nov 24 14:39:47 CET,0.0 1.569 1.926 2.183 2.398 2.568 2.704 2.826 3.017 3.098 3.179 3.285 3.389 3.453 3.59 3.717 3.812 3.85 3.916 3.976 4.069 4.127 4.176 4.241 4.295 4.345 4.384 4.419 4.463 4.491 4.513 4.536 4.552 4.559 4.558 4.547 4.523 4.479 4.418 4.343 4.239 4.086 3.879 3.638 3.301 2.852 2.249 1.439 0.3 -1.288 -3.72 -6.416 -8.482 -10.151 -11.506 -12.647 -13.62 -14.489 -15.217 -15.926 -16.52 -17.037 -17.52 -17.964 -18.372 -18.734 -19.106 -19.441 -19.727 -20.018 -20.317 -20.574 -20.834 -21.092 -21.302 -21.516 -21.732 -21.96 -22.195 -22.349 -22.515 -22.792 -22.992 -23.199 -23.309 -23.533 -23.751 -24.005 -24.141 -24.35 -24.576 -24.728 -24.88 -25.225 -25.424 -25.627 -25.85 -26.118 -26.455 -26.9 -28.825 -5 ,7415 ,KEBNE ,16676666,Wed Nov 24 12:51:39 CET,Wed Nov 24 14:43:40 CET,0.0 1.215 1.617 1.916 2.14 2.315 2.474 2.608 2.823 2.914 2.999 3.116 3.218 3.276 3.383 3.481 3.573 3.613 3.69 3.77 3.864 3.908 3.961 4.036 4.093 4.144 4.189 4.227 4.265 4.293 4.319 4.343 4.363 4.375 4.372 4.367 4.362 4.338 4.292 4.224 4.129 3.985 3.808 3.603 3.287 2.865 2.295 1.526 0.46 -1.053 -3.42 -6.03 -8.02 -9.62 -10.937 -12.064 -13.03 -13.878 -14.586 -15.281 -15.872 -16.409 -16.915 -17.371 -17.788 -18.173 -18.559 -18.885 -19.162 -19.448 -19.746 -19.985 -20.231 -20.488 -20.688 -20.896 -21.107 -21.318 -21.543 -21.703 -21.869 -22.129 -22.319 -22.522 -22.622 -22.817 -23.016 -23.239 -23.362 -23.551 -23.739 -23.884 -24.031 -24.349 -24.543 -24.779 -25.027 -25.29 -25.609 -26.057 -27.459 -6 ,3682 ,KEBNE ,16676667,Wed Nov 24 12:51:38 CET,Wed Nov 24 14:43:00 CET,0.0 1.434 1.819 2.101 2.324 2.488 2.624 2.74 2.95 3.035 3.108 3.2 3.308 3.378 3.502 3.603 3.69 3.733 3.815 3.891 3.992 4.055 4.107 4.173 4.234 4.282 4.323 4.358 4.397 4.428 4.452 4.483 4.498 4.506 4.512 4.5 4.468 4.419 4.357 4.268 4.162 4.028 3.823 3.564 3.215 2.782 2.193 1.408 0.29 -1.336 -3.803 -6.567 -8.727 -10.418 -11.81 -12.982 -13.941 -14.795 -15.511 -16.201 -16.77 -17.261 -17.737 -18.18 -18.585 -18.954 -19.322 -19.648 -19.931 -20.222 -20.535 -20.788 -21.052 -21.334 -21.547 -21.77 -22.004 -22.251 -22.51 -22.678 -22.841 -23.085 -23.26 -23.458 -23.565 -23.788 -24.015 -24.259 -24.392 -24.594 -24.801 -24.954 -25.116 -25.5 -25.705 -25.921 -26.169 -26.474 -26.848 -27.292 -28.921 -7 ,30342 ,KEBNE ,16676668,Wed Nov 24 12:52:39 CET,Wed Nov 24 14:44:37 CET,0.0 1.517 1.864 2.086 2.278 2.45 2.582 2.691 2.887 2.977 3.063 3.168 3.268 3.329 3.44 3.533 3.633 3.684 3.773 3.846 3.934 3.979 4.023 4.086 4.145 4.197 4.238 4.279 4.323 4.346 4.368 4.388 4.396 4.399 4.402 4.391 4.365 4.33 4.277 4.193 4.083 3.933 3.72 3.474 3.141 2.705 2.101 1.286 0.172 -1.42 -3.92 -6.707 -8.807 -10.484 -11.87 -13.073 -14.1 -14.992 -15.742 -16.47 -17.064 -17.574 -18.048 -18.492 -18.904 -19.275 -19.659 -19.998 -20.291 -20.591 -20.896 -21.144 -21.389 -21.65 -21.859 -22.079 -22.318 -22.562 -22.816 -22.99 -23.166 -23.453 -23.646 -23.838 -23.943 -24.168 -24.4 -24.636 -24.754 -24.943 -25.146 -25.289 -25.432 -25.733 -25.908 -26.105 -26.323 -26.575 -26.883 -27.366 -29.244 -8 ,534 ,KEBNE ,16676669,Wed Nov 24 12:52:39 CET,Wed Nov 24 14:44:38 CET,0.0 1.666 2.017 2.262 2.448 2.598 2.728 2.851 3.075 3.168 3.244 3.349 3.452 3.508 3.606 3.695 3.78 3.823 3.906 3.988 4.094 4.15 4.195 4.247 4.291 4.335 4.376 4.414 4.454 4.476 4.5 4.528 4.539 4.544 4.551 4.542 4.523 4.495 4.446 4.371 4.256 4.096 3.888 3.647 3.309 2.868 2.279 1.493 0.419 -1.187 -3.779 -6.671 -8.935 -10.772 -12.313 -13.611 -14.668 -15.565 -16.312 -17.04 -17.664 -18.199 -18.681 -19.173 -19.65 -20.06 -20.486 -20.855 -21.153 -21.477 -21.819 -22.093 -22.365 -22.653 -22.888 -23.13 -23.383 -23.64 -23.895 -24.068 -24.254 -24.545 -24.747 -24.963 -25.069 -25.287 -25.522 -25.757 -25.877 -26.072 -26.296 -26.449 -26.607 -26.962 -27.154 -27.363 -27.604 -27.886 -28.265 -28.784 -30.487 -9 ,12467 ,KEBNE ,16676670,Wed Nov 24 12:52:40 CET,Wed Nov 24 14:44:45 CET,0.0 1.409 1.777 2.048 2.246 2.4 2.532 2.646 2.847 2.933 3.011 3.108 3.204 3.264 3.39 3.505 3.601 3.641 3.712 3.78 3.864 3.913 3.958 4.02 4.075 4.128 4.194 4.252 4.296 4.327 4.357 4.395 4.407 4.403 4.396 4.375 4.333 4.268 4.186 4.075 3.946 3.775 3.552 3.323 3.001 2.574 2.003 1.238 0.107 -1.636 -4.343 -7.258 -9.501 -11.321 -12.818 -14.128 -15.224 -16.158 -16.934 -17.7 -18.345 -18.897 -19.419 -19.902 -20.35 -20.758 -21.171 -21.532 -21.83 -22.14 -22.464 -22.73 -23.003 -23.28 -23.491 -23.716 -23.954 -24.189 -24.43 -24.596 -24.771 -25.057 -25.257 -25.467 -25.569 -25.777 -26.013 -26.261 -26.394 -26.598 -26.811 -26.961 -27.128 -27.5 -27.692 -27.904 -28.15 -28.423 -28.728 -29.158 -31.755 -10 ,3556 ,KEBNE ,16676671,Wed Nov 24 12:52:40 CET,Wed Nov 24 14:47:25 CET,0.0 1.576 1.929 2.187 2.399 2.586 2.734 2.857 3.067 3.148 3.224 3.343 3.44 3.495 3.605 3.71 3.808 3.851 3.922 3.988 4.083 4.141 4.188 4.253 4.306 4.345 4.38 4.423 4.476 4.5 4.515 4.534 4.544 4.544 4.533 4.511 4.472 4.423 4.354 4.264 4.157 4.002 3.767 3.494 3.134 2.657 2.002 1.136 -0.071 -1.77 -4.422 -7.34 -9.498 -11.219 -12.662 -13.933 -15.054 -16.053 -16.857 -17.635 -18.306 -18.904 -19.467 -19.987 -20.461 -20.896 -21.351 -21.743 -22.074 -22.407 -22.746 -23.036 -23.322 -23.605 -23.826 -24.048 -24.284 -24.558 -24.832 -25.005 -25.185 -25.458 -25.654 -25.853 -25.958 -26.182 -26.42 -26.67 -26.794 -26.992 -27.196 -27.342 -27.513 -27.869 -28.087 -28.328 -28.568 -28.835 -29.147 -29.557 -30.877 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_19.txt deleted file mode 100644 index 7fa10929..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18225 ,KEBNE ,16674349,Tue Nov 23 15:06:03 CET,Tue Nov 23 16:19:22 CET,0.0 1.557 1.899 2.166 2.37 2.538 2.691 2.827 3.054 3.152 3.244 3.39 3.492 3.562 3.696 3.825 3.937 3.992 4.103 4.205 4.335 4.409 4.486 4.594 4.684 4.769 4.855 4.946 5.059 5.152 5.236 5.327 5.411 5.492 5.571 5.654 5.737 5.812 5.878 5.939 5.997 6.053 6.096 6.11 6.094 6.034 5.906 5.673 5.318 4.704 3.47 1.977 0.715 -0.372 -1.292 -2.118 -2.833 -3.464 -4.033 -4.609 -5.073 -5.486 -5.873 -6.223 -6.559 -6.872 -7.191 -7.477 -7.724 -7.981 -8.244 -8.468 -8.724 -8.986 -9.183 -9.393 -9.615 -9.841 -10.082 -10.248 -10.411 -10.676 -10.872 -11.067 -11.158 -11.351 -11.562 -11.78 -11.899 -12.061 -12.29 -12.433 -12.585 -12.927 -13.126 -13.352 -13.618 -13.925 -14.285 -14.745 -16.532 -2 ,29264 ,KEBNE ,16676673,Wed Nov 24 12:52:40 CET,Wed Nov 24 14:45:02 CET,0.0 1.597 2.022 2.32 2.545 2.726 2.887 3.025 3.252 3.349 3.449 3.604 3.702 3.779 3.923 4.046 4.167 4.225 4.337 4.443 4.604 4.7 4.782 4.898 5.001 5.09 5.173 5.261 5.373 5.47 5.55 5.642 5.73 5.808 5.881 5.958 6.033 6.108 6.178 6.235 6.286 6.319 6.342 6.344 6.304 6.223 6.064 5.824 5.456 4.806 3.523 1.937 0.648 -0.459 -1.41 -2.194 -2.869 -3.524 -4.071 -4.6 -5.064 -5.461 -5.84 -6.199 -6.538 -6.85 -7.166 -7.457 -7.706 -7.957 -8.213 -8.425 -8.648 -8.901 -9.108 -9.311 -9.511 -9.712 -9.926 -10.071 -10.221 -10.47 -10.643 -10.828 -10.926 -11.127 -11.338 -11.552 -11.666 -11.82 -12.04 -12.192 -12.359 -12.716 -12.915 -13.144 -13.393 -13.677 -14.016 -14.479 -16.232 -3 ,27488 ,KEBNE ,16674351,Tue Nov 23 15:06:04 CET,Tue Nov 23 16:59:07 CET,0.0 1.448 1.838 2.095 2.294 2.468 2.616 2.751 2.975 3.076 3.181 3.342 3.442 3.517 3.658 3.79 3.909 3.964 4.069 4.166 4.297 4.381 4.458 4.56 4.657 4.75 4.835 4.917 5.016 5.103 5.185 5.284 5.377 5.462 5.546 5.628 5.707 5.789 5.851 5.905 5.968 6.022 6.052 6.055 6.019 5.923 5.76 5.512 5.116 4.435 3.245 1.7 0.371 -0.735 -1.663 -2.504 -3.233 -3.865 -4.401 -4.928 -5.383 -5.786 -6.161 -6.536 -6.884 -7.181 -7.499 -7.777 -8.015 -8.272 -8.551 -8.781 -9.011 -9.244 -9.421 -9.606 -9.802 -10.017 -10.241 -10.393 -10.546 -10.81 -11.006 -11.209 -11.315 -11.512 -11.718 -11.955 -12.079 -12.249 -12.494 -12.653 -12.823 -13.176 -13.375 -13.597 -13.85 -14.125 -14.447 -14.919 -16.714 -4 ,18168 ,KEBNE ,16676675,Wed Nov 24 12:52:40 CET,Wed Nov 24 14:45:24 CET,0.0 1.274 1.645 1.898 2.092 2.248 2.399 2.535 2.768 2.89 2.994 3.131 3.224 3.298 3.436 3.55 3.654 3.707 3.807 3.898 4.023 4.104 4.184 4.295 4.395 4.487 4.566 4.64 4.734 4.829 4.928 5.045 5.142 5.227 5.315 5.404 5.49 5.575 5.641 5.69 5.744 5.802 5.854 5.88 5.863 5.803 5.675 5.441 5.084 4.429 3.187 1.717 0.538 -0.476 -1.398 -2.282 -3.032 -3.672 -4.222 -4.779 -5.27 -5.678 -6.05 -6.422 -6.775 -7.078 -7.396 -7.706 -7.972 -8.25 -8.548 -8.797 -9.036 -9.262 -9.442 -9.638 -9.847 -10.06 -10.275 -10.42 -10.572 -10.81 -10.985 -11.173 -11.27 -11.475 -11.69 -11.92 -12.042 -12.198 -12.427 -12.579 -12.736 -13.068 -13.251 -13.459 -13.704 -13.99 -14.327 -14.79 -16.783 -5 ,6954 ,KEBNE ,16674353,Tue Nov 23 15:06:03 CET,Tue Nov 23 17:03:29 CET,0.0 1.526 1.884 2.142 2.346 2.534 2.717 2.865 3.108 3.223 3.321 3.472 3.575 3.646 3.777 3.899 4.004 4.057 4.165 4.261 4.398 4.481 4.557 4.667 4.777 4.875 4.956 5.03 5.127 5.228 5.319 5.415 5.501 5.584 5.681 5.765 5.836 5.917 5.994 6.062 6.128 6.2 6.256 6.27 6.259 6.213 6.08 5.858 5.483 4.775 3.437 1.837 0.583 -0.529 -1.489 -2.314 -3.001 -3.614 -4.142 -4.668 -5.127 -5.546 -5.945 -6.31 -6.654 -6.958 -7.258 -7.526 -7.77 -8.046 -8.334 -8.562 -8.807 -9.067 -9.262 -9.462 -9.664 -9.868 -10.081 -10.236 -10.397 -10.648 -10.818 -11.002 -11.102 -11.313 -11.522 -11.728 -11.849 -12.023 -12.27 -12.416 -12.564 -12.889 -13.087 -13.32 -13.584 -13.883 -14.228 -14.677 -16.627 -6 ,794 ,KEBNE ,16674354,Tue Nov 23 15:06:04 CET,Tue Nov 23 16:59:30 CET,0.0 1.517 1.86 2.119 2.331 2.503 2.648 2.771 2.971 3.062 3.151 3.295 3.395 3.47 3.608 3.727 3.825 3.871 3.966 4.05 4.161 4.235 4.305 4.406 4.501 4.585 4.659 4.723 4.804 4.878 4.956 5.056 5.146 5.231 5.311 5.395 5.474 5.538 5.602 5.663 5.72 5.78 5.841 5.879 5.856 5.797 5.69 5.469 5.06 4.319 3.032 1.398 0.042 -1.046 -2.005 -2.861 -3.579 -4.262 -4.858 -5.424 -5.912 -6.363 -6.811 -7.244 -7.634 -7.973 -8.349 -8.688 -8.966 -9.252 -9.55 -9.793 -10.043 -10.309 -10.506 -10.712 -10.932 -11.152 -11.377 -11.533 -11.694 -11.95 -12.132 -12.323 -12.428 -12.647 -12.874 -13.145 -13.29 -13.47 -13.715 -13.858 -14.012 -14.356 -14.567 -14.817 -15.076 -15.355 -15.734 -16.282 -18.247 -7 ,27121 ,KEBNE ,16674355,Tue Nov 23 15:06:04 CET,Tue Nov 23 16:58:47 CET,0.0 1.521 1.891 2.13 2.321 2.481 2.638 2.782 3.022 3.136 3.234 3.382 3.487 3.561 3.698 3.828 3.937 3.988 4.088 4.182 4.323 4.413 4.491 4.6 4.705 4.797 4.891 4.982 5.08 5.174 5.264 5.36 5.449 5.539 5.633 5.722 5.809 5.904 5.986 6.06 6.119 6.185 6.226 6.226 6.211 6.137 5.974 5.725 5.328 4.684 3.535 2.015 0.762 -0.292 -1.184 -1.981 -2.7 -3.33 -3.866 -4.418 -4.897 -5.314 -5.704 -6.076 -6.428 -6.749 -7.059 -7.323 -7.572 -7.84 -8.113 -8.328 -8.552 -8.798 -8.99 -9.191 -9.403 -9.608 -9.834 -10.001 -10.16 -10.4 -10.576 -10.773 -10.872 -11.067 -11.275 -11.502 -11.621 -11.779 -12.011 -12.175 -12.345 -12.689 -12.887 -13.116 -13.391 -13.732 -14.125 -14.672 -16.484 -8 ,10992 ,KEBNE ,16676679,Wed Nov 24 12:52:41 CET,Wed Nov 24 14:45:57 CET,0.0 1.567 1.954 2.232 2.452 2.627 2.781 2.924 3.174 3.279 3.373 3.524 3.624 3.701 3.848 3.973 4.075 4.127 4.223 4.306 4.43 4.508 4.581 4.678 4.768 4.857 4.935 5.007 5.099 5.182 5.264 5.363 5.448 5.519 5.602 5.694 5.764 5.829 5.885 5.942 5.996 6.024 6.028 6.006 5.974 5.93 5.805 5.589 5.226 4.558 3.342 1.822 0.589 -0.462 -1.409 -2.223 -2.914 -3.533 -4.06 -4.604 -5.063 -5.477 -5.884 -6.259 -6.608 -6.917 -7.233 -7.53 -7.787 -8.047 -8.322 -8.549 -8.787 -9.044 -9.242 -9.444 -9.655 -9.874 -10.102 -10.257 -10.416 -10.664 -10.838 -11.017 -11.107 -11.302 -11.508 -11.736 -11.864 -12.032 -12.25 -12.387 -12.539 -12.863 -13.043 -13.244 -13.469 -13.736 -14.115 -14.636 -16.533 -9 ,9424 ,KEBNE ,16676680,Wed Nov 24 12:52:40 CET,Wed Nov 24 14:45:21 CET,0.0 1.323 1.671 1.911 2.114 2.292 2.448 2.587 2.807 2.902 2.997 3.162 3.267 3.339 3.471 3.604 3.727 3.78 3.879 3.974 4.108 4.192 4.273 4.386 4.479 4.566 4.651 4.739 4.846 4.929 5.009 5.116 5.211 5.282 5.357 5.445 5.523 5.601 5.688 5.774 5.85 5.921 5.962 5.982 5.985 5.921 5.783 5.573 5.214 4.543 3.338 1.788 0.492 -0.564 -1.46 -2.253 -2.952 -3.585 -4.127 -4.652 -5.121 -5.537 -5.937 -6.327 -6.676 -7.0 -7.334 -7.631 -7.887 -8.15 -8.446 -8.688 -8.948 -9.225 -9.43 -9.651 -9.871 -10.09 -10.326 -10.494 -10.667 -10.925 -11.111 -11.314 -11.415 -11.626 -11.857 -12.104 -12.228 -12.386 -12.629 -12.788 -12.955 -13.295 -13.49 -13.726 -13.985 -14.286 -14.692 -15.279 -17.247 -10 ,17252 ,KEBNE ,16676681,Wed Nov 24 12:52:40 CET,Wed Nov 24 14:45:11 CET,0.0 1.346 1.732 2.017 2.23 2.408 2.562 2.7 2.945 3.05 3.147 3.296 3.4 3.474 3.604 3.735 3.86 3.915 4.026 4.134 4.283 4.376 4.46 4.583 4.699 4.792 4.877 4.956 5.05 5.14 5.219 5.311 5.401 5.479 5.565 5.657 5.736 5.815 5.884 5.947 6.001 6.037 6.059 6.058 6.024 5.962 5.834 5.587 5.185 4.524 3.325 1.779 0.506 -0.582 -1.548 -2.404 -3.151 -3.796 -4.334 -4.88 -5.334 -5.722 -6.097 -6.466 -6.8 -7.103 -7.43 -7.713 -7.953 -8.211 -8.477 -8.687 -8.912 -9.154 -9.351 -9.56 -9.76 -9.958 -10.18 -10.337 -10.488 -10.733 -10.91 -11.091 -11.188 -11.392 -11.619 -11.872 -11.996 -12.164 -12.419 -12.56 -12.708 -13.09 -13.3 -13.51 -13.761 -14.048 -14.387 -14.892 -16.937 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_30.txt deleted file mode 100644 index e2682fc8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_30.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25419 ,KEBNE ,17023819,Wed Dec 22 08:27:19 CET,Wed Dec 22 10:20:53 CET,0.0 2.334 2.831 3.16 3.386 3.575 3.752 3.913 4.166 4.266 4.356 4.494 4.582 4.656 4.78 4.881 4.973 5.011 5.075 5.136 5.22 5.264 5.299 5.336 5.362 5.373 5.38 5.381 5.366 5.339 5.303 5.254 5.201 5.134 5.032 4.898 4.749 4.569 4.353 4.08 3.755 3.366 2.87 2.296 1.534 0.587 -0.671 -2.272 -4.428 -7.6 -12.452 -17.585 -21.431 -24.427 -26.864 -28.957 -30.722 -32.23 -33.472 -34.702 -35.71 -36.562 -37.353 -38.09 -38.771 -39.381 -39.998 -40.548 -41.021 -41.492 -41.985 -42.403 -42.83 -43.244 -43.547 -43.857 -44.192 -44.551 -44.907 -45.141 -45.389 -45.778 -46.054 -46.352 -46.501 -46.795 -47.108 -47.44 -47.612 -47.862 -48.148 -48.357 -48.574 -49.01 -49.26 -49.548 -49.889 -50.264 -50.684 -51.278 -54.009 -2 ,17214 ,KEBNE ,17023820,Wed Dec 22 08:28:20 CET,Wed Dec 22 10:22:16 CET,0.0 3.789 4.411 4.825 5.143 5.4 5.612 5.798 6.113 6.24 6.356 6.56 6.693 6.795 6.963 7.093 7.206 7.259 7.347 7.426 7.541 7.606 7.656 7.716 7.762 7.807 7.843 7.87 7.9 7.908 7.897 7.865 7.823 7.77 7.694 7.591 7.455 7.285 7.097 6.856 6.565 6.209 5.75 5.206 4.475 3.561 2.304 0.634 -1.618 -4.747 -9.552 -14.695 -18.593 -21.712 -24.205 -26.31 -28.048 -29.53 -30.792 -32.016 -33.022 -33.888 -34.692 -35.441 -36.106 -36.702 -37.325 -37.874 -38.347 -38.817 -39.281 -39.668 -40.069 -40.496 -40.83 -41.165 -41.499 -41.837 -42.183 -42.421 -42.667 -43.039 -43.304 -43.598 -43.748 -44.053 -44.372 -44.705 -44.873 -45.122 -45.45 -45.657 -45.866 -46.34 -46.597 -46.886 -47.208 -47.561 -48.012 -48.69 -51.289 -3 ,28867 ,KEBNE ,17023821,Wed Dec 22 08:28:20 CET,Wed Dec 22 10:22:05 CET,0.0 6.369 6.88 7.228 7.521 7.757 7.95 8.127 8.447 8.578 8.696 8.893 9.008 9.09 9.236 9.351 9.449 9.5 9.596 9.677 9.78 9.832 9.873 9.929 9.972 10.007 10.031 10.043 10.051 10.039 10.009 9.971 9.924 9.861 9.758 9.617 9.475 9.307 9.104 8.845 8.543 8.18 7.675 7.082 6.339 5.408 4.154 2.499 0.269 -2.883 -7.793 -12.99 -16.836 -19.846 -22.286 -24.361 -26.086 -27.582 -28.831 -30.05 -31.077 -31.976 -32.787 -33.52 -34.199 -34.809 -35.418 -35.966 -36.446 -36.927 -37.411 -37.804 -38.209 -38.622 -38.933 -39.251 -39.585 -39.93 -40.296 -40.562 -40.832 -41.235 -41.508 -41.797 -41.947 -42.247 -42.547 -42.87 -43.049 -43.307 -43.62 -43.824 -44.028 -44.461 -44.717 -45.019 -45.348 -45.718 -46.161 -46.772 -49.092 -4 ,22246 ,KEBNE ,17023822,Wed Dec 22 08:28:20 CET,Wed Dec 22 10:20:57 CET,0.0 6.694 7.361 7.838 8.213 8.534 8.807 9.046 9.434 9.605 9.758 10.011 10.166 10.295 10.489 10.632 10.753 10.796 10.87 10.938 11.027 11.081 11.128 11.177 11.207 11.237 11.256 11.26 11.264 11.262 11.253 11.222 11.164 11.097 11.022 10.918 10.779 10.594 10.379 10.124 9.82 9.435 8.931 8.371 7.645 6.733 5.526 3.92 1.72 -1.397 -6.194 -11.291 -15.113 -18.142 -20.572 -22.636 -24.395 -25.912 -27.156 -28.348 -29.333 -30.178 -30.96 -31.697 -32.369 -32.968 -33.581 -34.11 -34.565 -35.038 -35.526 -35.931 -36.346 -36.772 -37.104 -37.443 -37.787 -38.147 -38.526 -38.784 -39.042 -39.431 -39.696 -39.963 -40.102 -40.402 -40.705 -41.015 -41.179 -41.421 -41.715 -41.918 -42.137 -42.624 -42.89 -43.177 -43.5 -43.861 -44.314 -44.963 -47.697 -5 ,14361 ,KEBNE ,17023823,Wed Dec 22 08:28:20 CET,Wed Dec 22 10:20:12 CET,0.0 3.342 3.95 4.368 4.713 4.975 5.193 5.379 5.688 5.814 5.93 6.13 6.247 6.337 6.488 6.615 6.744 6.803 6.903 6.993 7.121 7.205 7.273 7.354 7.434 7.508 7.562 7.602 7.645 7.666 7.657 7.616 7.563 7.502 7.413 7.303 7.199 7.044 6.847 6.623 6.339 5.96 5.47 4.908 4.151 3.222 1.979 0.348 -1.863 -5.021 -9.887 -15.127 -19.013 -22.071 -24.501 -26.551 -28.282 -29.791 -31.077 -32.328 -33.344 -34.212 -35.001 -35.719 -36.405 -37.05 -37.686 -38.23 -38.702 -39.182 -39.676 -40.082 -40.499 -40.924 -41.246 -41.573 -41.91 -42.245 -42.58 -42.82 -43.083 -43.493 -43.768 -44.045 -44.186 -44.475 -44.781 -45.119 -45.294 -45.544 -45.833 -46.033 -46.254 -46.739 -46.999 -47.283 -47.621 -47.996 -48.441 -49.065 -51.897 -6 ,13513 ,KEBNE ,17023824,Wed Dec 22 08:28:20 CET,Wed Dec 22 10:22:17 CET,0.0 3.245 3.762 4.111 4.347 4.535 4.71 4.872 5.117 5.22 5.318 5.475 5.563 5.627 5.752 5.867 5.971 6.022 6.107 6.175 6.258 6.298 6.33 6.37 6.4 6.416 6.433 6.443 6.436 6.418 6.391 6.341 6.28 6.206 6.117 6.002 5.861 5.681 5.459 5.209 4.904 4.504 3.982 3.379 2.588 1.588 0.298 -1.331 -3.574 -6.755 -11.585 -16.761 -20.624 -23.684 -26.165 -28.243 -29.976 -31.462 -32.69 -33.877 -34.871 -35.737 -36.535 -37.253 -37.902 -38.489 -39.086 -39.626 -40.093 -40.565 -41.049 -41.445 -41.859 -42.279 -42.61 -42.964 -43.307 -43.638 -43.98 -44.212 -44.448 -44.825 -45.102 -45.403 -45.555 -45.872 -46.198 -46.515 -46.684 -46.938 -47.263 -47.47 -47.68 -48.16 -48.416 -48.678 -48.998 -49.381 -49.842 -50.471 -53.06 -7 ,17999 ,KEBNE ,17023825,Wed Dec 22 08:29:22 CET,Wed Dec 22 10:21:58 CET,0.0 3.382 3.998 4.37 4.672 4.943 5.152 5.325 5.608 5.726 5.84 6.014 6.115 6.188 6.313 6.421 6.519 6.568 6.666 6.749 6.848 6.907 6.966 7.042 7.095 7.13 7.153 7.172 7.196 7.196 7.172 7.125 7.063 6.996 6.909 6.799 6.667 6.492 6.288 6.035 5.739 5.379 4.87 4.275 3.503 2.541 1.275 -0.373 -2.609 -5.789 -10.652 -15.898 -19.824 -22.88 -25.331 -27.387 -29.102 -30.622 -31.899 -33.157 -34.207 -35.097 -35.923 -36.694 -37.402 -38.028 -38.688 -39.276 -39.768 -40.281 -40.807 -41.23 -41.667 -42.098 -42.425 -42.778 -43.138 -43.506 -43.888 -44.138 -44.389 -44.809 -45.102 -45.376 -45.516 -45.824 -46.157 -46.501 -46.671 -46.917 -47.236 -47.452 -47.683 -48.176 -48.437 -48.711 -49.045 -49.441 -49.898 -50.5 -53.014 -8 ,2125 ,KEBNE ,17023826,Wed Dec 22 08:29:22 CET,Wed Dec 22 10:21:59 CET,0.0 3.489 3.975 4.327 4.628 4.89 5.116 5.318 5.634 5.762 5.879 6.062 6.166 6.251 6.408 6.538 6.669 6.735 6.85 6.945 7.043 7.075 7.107 7.17 7.214 7.24 7.26 7.278 7.296 7.302 7.298 7.279 7.241 7.182 7.091 6.953 6.809 6.641 6.45 6.227 5.944 5.58 5.09 4.523 3.781 2.833 1.573 -0.08 -2.326 -5.462 -10.268 -15.467 -19.359 -22.413 -24.839 -26.923 -28.689 -30.207 -31.476 -32.679 -33.654 -34.504 -35.334 -36.12 -36.83 -37.467 -38.111 -38.657 -39.106 -39.583 -40.085 -40.484 -40.912 -41.369 -41.701 -42.027 -42.376 -42.733 -43.089 -43.338 -43.601 -44.006 -44.293 -44.595 -44.747 -45.065 -45.389 -45.73 -45.912 -46.168 -46.496 -46.724 -46.956 -47.406 -47.657 -47.954 -48.282 -48.688 -49.2 -49.859 -52.041 -9 ,19342 ,KEBNE ,17023827,Wed Dec 22 08:29:22 CET,Wed Dec 22 10:23:24 CET,0.0 4.373 5.035 5.462 5.77 6.028 6.272 6.488 6.842 7.006 7.143 7.338 7.464 7.556 7.712 7.854 7.997 8.063 8.169 8.26 8.38 8.456 8.535 8.648 8.745 8.811 8.855 8.887 8.927 8.964 9.001 9.04 9.052 9.057 9.048 9.006 8.963 8.881 8.715 8.471 8.173 7.801 7.281 6.692 5.963 5.055 3.831 2.258 0.082 -3.012 -7.733 -12.839 -16.645 -19.685 -22.121 -24.192 -25.931 -27.405 -28.615 -29.792 -30.78 -31.637 -32.445 -33.18 -33.829 -34.425 -35.068 -35.636 -36.119 -36.599 -37.077 -37.486 -37.915 -38.343 -38.674 -39.016 -39.352 -39.687 -40.033 -40.269 -40.509 -40.898 -41.164 -41.447 -41.597 -41.915 -42.24 -42.558 -42.73 -42.975 -43.251 -43.446 -43.661 -44.143 -44.416 -44.731 -45.079 -45.469 -45.925 -46.522 -48.93 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_19.txt deleted file mode 100644 index de8db469..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7159 ,KEBNE ,16676682,Wed Nov 24 12:52:40 CET,Wed Nov 24 14:45:35 CET,0.0 1.462 1.82 2.083 2.32 2.523 2.702 2.863 3.142 3.266 3.39 3.572 3.715 3.808 3.988 4.165 4.333 4.411 4.557 4.705 4.92 5.049 5.175 5.35 5.503 5.653 5.804 5.949 6.144 6.332 6.51 6.723 6.918 7.096 7.317 7.574 7.809 8.059 8.312 8.587 8.874 9.192 9.556 9.89 10.254 10.661 11.091 11.467 11.804 12.06 12.193 12.12 11.676 11.135 10.634 10.127 9.691 9.249 8.835 8.394 7.97 7.588 7.258 6.924 6.581 6.277 5.952 5.66 5.409 5.14 4.844 4.596 4.35 4.091 3.881 3.66 3.429 3.187 2.926 2.753 2.584 2.31 2.107 1.871 1.754 1.553 1.342 1.09 0.948 0.753 0.465 0.285 0.085 -0.373 -0.617 -0.869 -1.152 -1.483 -1.922 -2.683 -6.54 -2 ,31125 ,KEBNE ,16676683,Wed Nov 24 12:52:40 CET,Wed Nov 24 14:45:22 CET,0.0 2.16 2.624 2.918 3.143 3.331 3.504 3.655 3.923 4.042 4.156 4.327 4.475 4.584 4.78 4.949 5.11 5.188 5.341 5.487 5.69 5.82 5.953 6.153 6.343 6.52 6.679 6.825 7.012 7.194 7.378 7.605 7.819 8.044 8.299 8.552 8.783 9.03 9.312 9.593 9.852 10.16 10.545 10.932 11.358 11.773 12.18 12.617 13.035 13.372 13.495 13.232 12.756 12.177 11.577 11.038 10.578 10.132 9.763 9.377 8.996 8.632 8.287 7.964 7.653 7.365 7.078 6.834 6.623 6.398 6.146 5.926 5.701 5.461 5.267 5.064 4.825 4.59 4.377 4.203 4.012 3.716 3.514 3.323 3.216 2.963 2.703 2.425 2.258 2.048 1.713 1.505 1.279 0.727 0.432 0.145 -0.16 -0.577 -1.057 -1.696 -4.408 -3 ,9335 ,KEBNE ,16674361,Tue Nov 23 15:06:03 CET,Tue Nov 23 17:06:51 CET,0.0 1.274 1.665 1.966 2.211 2.405 2.589 2.766 3.061 3.191 3.312 3.506 3.663 3.769 3.967 4.141 4.31 4.389 4.536 4.683 4.895 5.024 5.149 5.329 5.498 5.658 5.82 5.974 6.16 6.336 6.511 6.732 6.941 7.133 7.349 7.582 7.791 8.036 8.325 8.631 8.959 9.347 9.766 10.128 10.534 10.99 11.541 12.101 12.558 12.9 13.136 12.951 12.497 11.92 11.388 10.879 10.38 9.944 9.559 9.157 8.803 8.484 8.169 7.862 7.562 7.288 7.001 6.739 6.498 6.232 5.935 5.687 5.421 5.123 4.907 4.674 4.436 4.198 3.924 3.729 3.547 3.248 3.004 2.757 2.635 2.372 2.117 1.858 1.706 1.493 1.15 0.946 0.721 0.258 -0.005 -0.317 -0.655 -1.027 -1.525 -2.205 -4.758 -4 ,17211 ,KEBNE ,16676685,Wed Nov 24 12:53:41 CET,Wed Nov 24 14:47:44 CET,0.0 1.509 1.906 2.196 2.433 2.643 2.831 2.987 3.258 3.382 3.495 3.667 3.811 3.911 4.111 4.295 4.462 4.545 4.709 4.864 5.078 5.214 5.347 5.527 5.698 5.867 6.02 6.165 6.355 6.539 6.734 6.968 7.185 7.397 7.638 7.893 8.133 8.4 8.69 8.985 9.269 9.568 9.919 10.276 10.656 11.04 11.482 11.972 12.478 12.981 13.21 12.84 12.235 11.566 10.928 10.319 9.755 9.244 8.797 8.346 7.95 7.572 7.203 6.868 6.538 6.218 5.883 5.561 5.27 4.986 4.699 4.437 4.15 3.853 3.623 3.363 3.099 2.854 2.589 2.399 2.212 1.903 1.676 1.443 1.329 1.1 0.824 0.525 0.376 0.185 -0.114 -0.301 -0.498 -0.976 -1.276 -1.586 -1.908 -2.286 -2.828 -3.709 -7.828 -5 ,4782 ,KEBNE ,16676686,Wed Nov 24 12:54:43 CET,Wed Nov 24 14:49:40 CET,0.0 1.421 1.821 2.09 2.311 2.503 2.673 2.836 3.121 3.243 3.363 3.554 3.704 3.796 3.976 4.153 4.321 4.403 4.559 4.709 4.926 5.055 5.175 5.346 5.506 5.655 5.802 5.947 6.136 6.328 6.51 6.72 6.926 7.119 7.339 7.613 7.882 8.171 8.478 8.782 9.079 9.404 9.792 10.193 10.605 11.01 11.434 11.875 12.376 12.855 13.161 12.938 12.488 12.024 11.541 11.046 10.584 10.127 9.71 9.305 8.963 8.639 8.292 7.96 7.656 7.369 7.07 6.822 6.608 6.361 6.09 5.871 5.642 5.407 5.211 4.995 4.784 4.541 4.266 4.082 3.896 3.621 3.433 3.222 3.105 2.851 2.594 2.34 2.19 2.003 1.743 1.569 1.381 0.943 0.676 0.339 -0.014 -0.404 -0.88 -1.602 -5.561 -6 ,28241 ,KEBNE ,16674364,Tue Nov 23 15:08:10 CET,Tue Nov 23 17:01:26 CET,0.0 1.281 1.652 1.937 2.179 2.375 2.55 2.709 3.0 3.129 3.247 3.422 3.571 3.674 3.856 4.031 4.195 4.274 4.423 4.565 4.774 4.904 5.032 5.228 5.404 5.572 5.742 5.898 6.093 6.277 6.456 6.656 6.84 7.023 7.245 7.502 7.746 8.003 8.273 8.548 8.807 9.113 9.486 9.832 10.2 10.648 11.18 11.697 12.162 12.52 12.702 12.392 11.869 11.287 10.738 10.216 9.761 9.364 8.983 8.591 8.254 7.96 7.661 7.352 7.047 6.739 6.442 6.2 5.989 5.766 5.502 5.27 5.041 4.792 4.583 4.375 4.165 3.961 3.756 3.601 3.441 3.176 2.986 2.789 2.68 2.461 2.231 1.988 1.838 1.625 1.301 1.1 0.884 0.462 0.236 -0.035 -0.351 -0.702 -1.149 -1.807 -5.084 -7 ,31699 ,KEBNE ,16674365,Tue Nov 23 15:08:10 CET,Tue Nov 23 17:04:02 CET,0.0 1.582 1.984 2.278 2.501 2.698 2.864 3.013 3.292 3.422 3.544 3.735 3.888 3.991 4.184 4.365 4.532 4.612 4.768 4.918 5.131 5.265 5.391 5.571 5.748 5.923 6.09 6.246 6.447 6.641 6.818 7.022 7.204 7.371 7.571 7.8 8.027 8.288 8.547 8.808 9.097 9.414 9.748 10.039 10.367 10.724 11.087 11.48 11.904 12.209 12.358 12.125 11.642 11.085 10.592 10.169 9.743 9.32 8.958 8.583 8.239 7.927 7.622 7.328 7.051 6.802 6.546 6.302 6.071 5.813 5.536 5.299 5.036 4.775 4.574 4.355 4.131 3.894 3.643 3.46 3.255 2.923 2.688 2.462 2.358 2.141 1.895 1.633 1.493 1.306 0.986 0.8 0.61 0.188 -0.043 -0.313 -0.656 -1.08 -1.63 -2.413 -6.352 -8 ,1010 ,KEBNE ,16674366,Tue Nov 23 15:11:18 CET,Tue Nov 23 17:04:41 CET,0.0 1.631 2.02 2.299 2.53 2.721 2.883 3.04 3.331 3.462 3.584 3.775 3.931 4.033 4.229 4.419 4.585 4.661 4.812 4.955 5.166 5.3 5.43 5.61 5.778 5.948 6.12 6.284 6.474 6.653 6.829 7.035 7.235 7.426 7.647 7.903 8.144 8.407 8.685 8.947 9.208 9.51 9.839 10.166 10.534 10.902 11.371 11.852 12.232 12.568 12.75 12.453 11.912 11.37 10.851 10.365 9.906 9.429 9.011 8.576 8.176 7.844 7.54 7.219 6.913 6.647 6.336 6.042 5.792 5.529 5.253 4.996 4.749 4.499 4.28 4.065 3.861 3.641 3.399 3.219 3.024 2.711 2.477 2.248 2.134 1.878 1.602 1.303 1.144 0.949 0.656 0.478 0.27 -0.222 -0.496 -0.801 -1.178 -1.581 -2.054 -2.779 -5.457 -9 ,1266 ,KEBNE ,16674367,Tue Nov 23 15:11:18 CET,Tue Nov 23 17:07:07 CET,0.0 1.645 2.025 2.299 2.532 2.729 2.896 3.058 3.367 3.503 3.626 3.798 3.939 4.034 4.21 4.381 4.544 4.622 4.768 4.913 5.124 5.26 5.394 5.591 5.778 5.948 6.1 6.244 6.43 6.603 6.767 6.954 7.137 7.312 7.507 7.733 7.959 8.201 8.462 8.734 8.998 9.29 9.643 10.017 10.437 10.821 11.18 11.565 12.002 12.36 12.429 12.055 11.578 11.088 10.565 10.037 9.572 9.183 8.848 8.431 8.013 7.644 7.3 6.986 6.684 6.403 6.116 5.858 5.634 5.388 5.105 4.852 4.586 4.309 4.105 3.899 3.672 3.443 3.23 3.076 2.91 2.626 2.417 2.208 2.097 1.856 1.612 1.349 1.202 1.014 0.72 0.546 0.37 -0.008 -0.225 -0.47 -0.764 -1.163 -1.697 -2.574 -6.041 -10 ,12098 ,KEBNE ,16674368,Tue Nov 23 15:11:18 CET,Tue Nov 23 17:07:41 CET,0.0 1.473 1.894 2.21 2.45 2.645 2.822 2.975 3.232 3.352 3.468 3.647 3.796 3.898 4.086 4.263 4.444 4.527 4.674 4.832 5.071 5.211 5.332 5.503 5.672 5.835 5.988 6.135 6.333 6.522 6.693 6.891 7.09 7.281 7.506 7.773 8.036 8.321 8.605 8.908 9.227 9.581 10.001 10.374 10.751 11.187 11.666 12.072 12.44 12.778 12.912 12.605 12.144 11.647 11.121 10.572 10.04 9.61 9.242 8.846 8.463 8.102 7.791 7.463 7.121 6.841 6.557 6.263 6.003 5.75 5.504 5.304 5.084 4.843 4.654 4.461 4.259 4.031 3.768 3.594 3.401 3.084 2.882 2.659 2.545 2.317 2.083 1.82 1.661 1.456 1.099 0.906 0.73 0.29 0.03 -0.288 -0.663 -1.074 -1.564 -2.279 -5.251 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_26.txt deleted file mode 100644 index e90fd9bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_26.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,6818 ,KEBNE ,16676693,Wed Nov 24 12:54:43 CET,Wed Nov 24 14:47:35 CET,0.0 1.382 1.777 2.077 2.322 2.53 2.716 2.887 3.185 3.314 3.433 3.619 3.775 3.883 4.07 4.241 4.409 4.487 4.641 4.796 5.005 5.14 5.263 5.429 5.59 5.742 5.89 6.028 6.192 6.364 6.55 6.747 6.911 7.071 7.261 7.441 7.585 7.755 7.946 8.136 8.304 8.449 8.621 8.782 8.898 8.999 9.051 9.013 8.842 8.332 7.197 5.619 4.227 3.045 2.003 0.997 0.095 -0.684 -1.358 -2.056 -2.646 -3.164 -3.683 -4.19 -4.661 -5.061 -5.459 -5.814 -6.121 -6.44 -6.761 -7.027 -7.319 -7.645 -7.903 -8.165 -8.442 -8.734 -9.034 -9.242 -9.457 -9.787 -10.018 -10.244 -10.362 -10.634 -10.903 -11.186 -11.338 -11.556 -11.827 -11.99 -12.175 -12.615 -12.853 -13.113 -13.406 -13.743 -14.165 -14.75 -17.529 -4 ,25788 ,KEBNE ,16676695,Wed Nov 24 12:55:44 CET,Wed Nov 24 14:48:21 CET,0.0 1.906 2.365 2.635 2.855 3.058 3.25 3.421 3.718 3.843 3.961 4.142 4.289 4.39 4.589 4.773 4.937 5.021 5.184 5.339 5.549 5.672 5.798 5.975 6.14 6.3 6.461 6.612 6.799 6.984 7.156 7.344 7.517 7.692 7.889 8.09 8.272 8.488 8.718 8.925 9.129 9.323 9.496 9.657 9.821 9.942 10.015 9.974 9.817 9.383 8.152 6.473 5.023 3.759 2.671 1.698 0.821 0.005 -0.69 -1.378 -1.977 -2.498 -2.966 -3.416 -3.86 -4.268 -4.664 -5.014 -5.333 -5.667 -6.022 -6.321 -6.639 -6.979 -7.217 -7.444 -7.694 -7.961 -8.243 -8.437 -8.64 -8.969 -9.199 -9.428 -9.548 -9.805 -10.093 -10.405 -10.559 -10.782 -11.094 -11.296 -11.496 -11.927 -12.17 -12.426 -12.709 -13.082 -13.557 -14.207 -16.263 -5 ,10376 ,KEBNE ,16676696,Wed Nov 24 12:55:43 CET,Wed Nov 24 14:48:46 CET,0.0 1.258 1.655 1.945 2.199 2.416 2.615 2.795 3.104 3.245 3.368 3.548 3.701 3.807 3.999 4.175 4.345 4.429 4.596 4.761 4.985 5.119 5.244 5.405 5.568 5.733 5.881 6.019 6.197 6.355 6.508 6.684 6.84 6.992 7.173 7.369 7.533 7.719 7.92 8.139 8.367 8.594 8.828 9.022 9.177 9.271 9.34 9.275 8.994 8.513 7.51 5.959 4.538 3.229 2.078 1.097 0.205 -0.613 -1.299 -1.968 -2.542 -3.045 -3.507 -3.953 -4.362 -4.74 -5.148 -5.517 -5.844 -6.191 -6.558 -6.863 -7.169 -7.486 -7.731 -7.976 -8.23 -8.484 -8.752 -8.948 -9.151 -9.483 -9.726 -9.984 -10.12 -10.398 -10.679 -10.981 -11.143 -11.37 -11.659 -11.861 -12.088 -12.565 -12.808 -13.084 -13.389 -13.748 -14.204 -14.82 -16.933 -6 ,20255 ,KEBNE ,16676697,Wed Nov 24 12:55:44 CET,Wed Nov 24 14:48:29 CET,0.0 1.621 2.053 2.365 2.609 2.815 3.0 3.173 3.472 3.617 3.756 3.957 4.111 4.217 4.414 4.603 4.787 4.871 5.023 5.167 5.368 5.494 5.617 5.792 5.956 6.113 6.263 6.416 6.607 6.772 6.917 7.097 7.282 7.446 7.626 7.817 7.967 8.131 8.329 8.532 8.712 8.888 9.06 9.167 9.234 9.296 9.326 9.231 8.926 8.348 7.242 5.572 4.077 2.782 1.659 0.703 -0.114 -0.882 -1.57 -2.231 -2.806 -3.317 -3.791 -4.263 -4.712 -5.119 -5.538 -5.92 -6.255 -6.592 -6.929 -7.211 -7.518 -7.838 -8.079 -8.329 -8.584 -8.842 -9.135 -9.336 -9.544 -9.899 -10.144 -10.383 -10.509 -10.782 -11.047 -11.313 -11.47 -11.701 -11.985 -12.184 -12.387 -12.821 -13.077 -13.349 -13.632 -13.993 -14.436 -15.022 -17.894 -7 ,30608 ,KEBNE ,16674375,Tue Nov 23 15:12:21 CET,Tue Nov 23 17:10:25 CET,0.0 1.323 1.728 2.02 2.257 2.475 2.677 2.86 3.159 3.294 3.419 3.602 3.755 3.861 4.052 4.24 4.417 4.495 4.645 4.789 5.002 5.137 5.27 5.477 5.661 5.825 5.979 6.117 6.299 6.489 6.667 6.868 7.066 7.248 7.432 7.626 7.807 8.022 8.265 8.514 8.759 9.009 9.269 9.455 9.587 9.723 9.833 9.816 9.58 9.002 7.804 6.146 4.67 3.455 2.476 1.527 0.632 -0.153 -0.789 -1.424 -1.998 -2.533 -3.038 -3.518 -3.981 -4.4 -4.837 -5.228 -5.547 -5.862 -6.209 -6.498 -6.799 -7.121 -7.361 -7.607 -7.877 -8.157 -8.45 -8.667 -8.885 -9.209 -9.434 -9.664 -9.78 -10.04 -10.333 -10.617 -10.755 -10.96 -11.233 -11.411 -11.596 -11.997 -12.224 -12.467 -12.729 -13.059 -13.474 -14.036 -15.828 -8 ,18112 ,KEBNE ,16674376,Tue Nov 23 15:12:25 CET,Tue Nov 23 17:06:21 CET,0.0 1.472 1.898 2.211 2.468 2.685 2.875 3.042 3.324 3.453 3.591 3.809 3.973 4.081 4.295 4.491 4.667 4.752 4.912 5.068 5.29 5.423 5.553 5.746 5.913 6.061 6.214 6.355 6.528 6.7 6.867 7.071 7.261 7.436 7.625 7.829 8.031 8.234 8.411 8.588 8.789 9.004 9.196 9.346 9.502 9.629 9.671 9.631 9.525 9.148 8.169 6.747 5.351 3.98 2.782 1.781 0.912 0.113 -0.574 -1.257 -1.85 -2.355 -2.831 -3.298 -3.727 -4.124 -4.543 -4.934 -5.264 -5.588 -5.939 -6.221 -6.508 -6.814 -7.045 -7.289 -7.551 -7.848 -8.164 -8.376 -8.591 -8.931 -9.18 -9.435 -9.566 -9.859 -10.158 -10.453 -10.619 -10.871 -11.196 -11.397 -11.602 -12.075 -12.335 -12.598 -12.895 -13.232 -13.655 -14.27 -16.164 -9 ,3681 ,KEBNE ,16674377,Tue Nov 23 15:12:20 CET,Tue Nov 23 17:05:24 CET,0.0 1.388 1.805 2.107 2.338 2.527 2.713 2.893 3.211 3.351 3.478 3.664 3.808 3.91 4.101 4.276 4.444 4.521 4.665 4.804 5.003 5.126 5.244 5.424 5.589 5.734 5.87 6.0 6.164 6.321 6.465 6.634 6.798 6.961 7.157 7.347 7.504 7.665 7.83 8.016 8.23 8.461 8.649 8.799 8.973 9.099 9.144 9.105 8.821 8.12 6.768 5.055 3.584 2.281 1.2 0.263 -0.597 -1.404 -2.1 -2.817 -3.453 -4.011 -4.528 -5.035 -5.509 -5.928 -6.355 -6.734 -7.066 -7.404 -7.755 -8.042 -8.329 -8.645 -8.898 -9.155 -9.419 -9.691 -9.972 -10.166 -10.382 -10.726 -10.947 -11.169 -11.289 -11.534 -11.802 -12.095 -12.255 -12.487 -12.773 -12.959 -13.144 -13.528 -13.766 -14.059 -14.376 -14.729 -15.156 -15.702 -17.274 -10 ,28272 ,KEBNE ,16674378,Tue Nov 23 15:12:21 CET,Tue Nov 23 17:08:16 CET,0.0 1.286 1.701 2.02 2.271 2.468 2.64 2.803 3.099 3.229 3.356 3.542 3.687 3.784 3.977 4.158 4.325 4.404 4.564 4.718 4.933 5.07 5.207 5.397 5.571 5.733 5.881 6.026 6.211 6.386 6.553 6.747 6.935 7.114 7.305 7.501 7.676 7.873 8.089 8.295 8.486 8.681 8.898 9.106 9.343 9.501 9.504 9.421 9.182 8.615 7.309 5.56 4.136 2.86 1.723 0.686 -0.204 -0.985 -1.692 -2.432 -3.04 -3.552 -4.023 -4.479 -4.909 -5.308 -5.728 -6.093 -6.423 -6.781 -7.164 -7.495 -7.824 -8.134 -8.366 -8.618 -8.912 -9.22 -9.517 -9.712 -9.907 -10.22 -10.44 -10.664 -10.778 -11.037 -11.312 -11.59 -11.736 -11.944 -12.222 -12.415 -12.617 -13.044 -13.289 -13.539 -13.806 -14.142 -14.565 -15.128 -16.872 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_30_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_30_19.txt deleted file mode 100644 index 8fd66de8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_30_19.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,3928 ,KEBNE ,16676703,Wed Nov 24 12:58:48 CET,Wed Nov 24 14:52:47 CET,0.0 2.452 2.97 3.356 3.666 3.916 4.151 4.358 4.713 4.88 5.042 5.283 5.504 5.639 5.908 6.167 6.415 6.529 6.749 6.969 7.28 7.479 7.674 7.953 8.217 8.478 8.734 8.987 9.322 9.638 9.947 10.323 10.682 11.032 11.451 11.933 12.396 12.914 13.483 14.096 14.757 15.518 16.416 17.341 18.471 19.772 21.318 23.171 25.474 28.33 32.099 35.545 37.766 39.317 40.444 41.307 41.95 42.45 42.803 43.1 43.311 43.469 43.606 43.707 43.782 43.841 43.877 43.884 43.887 43.879 43.863 43.826 43.73 43.598 43.483 43.371 43.274 43.177 43.065 42.979 42.9 42.771 42.655 42.523 42.459 42.326 42.155 41.946 41.828 41.667 41.431 41.284 41.133 40.777 40.565 40.33 40.061 39.716 39.275 38.678 35.229 -3 ,16952 ,KEBNE ,16676704,Wed Nov 24 12:57:47 CET,Wed Nov 24 14:50:54 CET,0.0 2.021 2.546 2.926 3.234 3.494 3.717 3.92 4.301 4.479 4.644 4.868 5.088 5.234 5.503 5.744 5.979 6.093 6.313 6.525 6.821 7.014 7.21 7.489 7.759 8.021 8.269 8.508 8.819 9.124 9.431 9.807 10.167 10.528 10.95 11.416 11.87 12.379 12.933 13.534 14.193 14.954 15.848 16.77 17.895 19.192 20.731 22.547 24.796 27.719 31.588 35.104 37.42 39.023 40.152 40.967 41.546 41.978 42.276 42.515 42.681 42.793 42.874 42.93 42.948 42.938 42.91 42.891 42.888 42.876 42.849 42.82 42.785 42.734 42.687 42.638 42.582 42.521 42.448 42.392 42.319 42.181 42.077 41.961 41.899 41.767 41.61 41.423 41.326 41.191 41.0 40.87 40.733 40.404 40.2 39.991 39.753 39.447 39.072 38.51 35.522 -4 ,31226 ,KEBNE ,16676705,Wed Nov 24 12:57:47 CET,Wed Nov 24 14:50:58 CET,0.0 1.773 2.235 2.569 2.864 3.144 3.383 3.592 3.969 4.138 4.296 4.519 4.73 4.864 5.121 5.361 5.6 5.713 5.931 6.143 6.448 6.642 6.832 7.107 7.38 7.643 7.89 8.134 8.453 8.767 9.079 9.457 9.826 10.195 10.622 11.096 11.554 12.072 12.64 13.246 13.903 14.657 15.55 16.484 17.618 18.909 20.444 22.251 24.463 27.286 31.095 34.514 36.686 38.202 39.296 40.127 40.759 41.255 41.612 41.92 42.13 42.279 42.4 42.463 42.497 42.514 42.479 42.419 42.355 42.277 42.216 42.161 42.086 41.997 41.911 41.817 41.714 41.593 41.46 41.363 41.258 41.069 40.922 40.767 40.687 40.532 40.346 40.123 40.007 39.846 39.624 39.483 39.336 38.99 38.778 38.537 38.234 37.875 37.459 36.841 32.02 -5 ,18942 ,KEBNE ,16676706,Wed Nov 24 12:57:47 CET,Wed Nov 24 14:50:25 CET,0.0 1.986 2.473 2.812 3.098 3.347 3.563 3.761 4.131 4.292 4.443 4.673 4.897 5.028 5.28 5.524 5.757 5.871 6.088 6.296 6.593 6.779 6.961 7.24 7.523 7.792 8.045 8.29 8.616 8.939 9.243 9.606 9.959 10.307 10.725 11.202 11.662 12.175 12.731 13.337 13.984 14.737 15.629 16.555 17.697 19.002 20.555 22.419 24.704 27.511 31.158 34.494 36.662 38.145 39.196 39.986 40.553 40.99 41.313 41.59 41.792 41.917 42.003 42.083 42.145 42.181 42.216 42.239 42.241 42.238 42.209 42.147 42.076 42.004 41.938 41.855 41.747 41.621 41.504 41.433 41.351 41.212 41.115 41.007 40.946 40.82 40.674 40.508 40.412 40.268 40.061 39.939 39.808 39.489 39.3 39.084 38.824 38.501 38.078 37.466 32.907 -6 ,21800 ,KEBNE ,16676707,Wed Nov 24 12:58:48 CET,Wed Nov 24 14:54:02 CET,0.0 2.134 2.709 3.131 3.428 3.683 3.909 4.111 4.485 4.652 4.813 5.043 5.257 5.39 5.659 5.917 6.156 6.27 6.493 6.71 7.021 7.217 7.407 7.689 7.96 8.217 8.466 8.708 9.022 9.331 9.643 10.027 10.398 10.758 11.17 11.639 12.104 12.621 13.191 13.796 14.436 15.19 16.101 17.03 18.136 19.398 20.915 22.736 25.047 27.927 31.665 35.133 37.409 39.008 40.172 41.068 41.703 42.171 42.526 42.807 43.02 43.208 43.354 43.463 43.544 43.597 43.642 43.658 43.659 43.662 43.654 43.637 43.617 43.577 43.529 43.47 43.402 43.324 43.242 43.185 43.109 42.975 42.879 42.772 42.716 42.593 42.463 42.315 42.233 42.109 41.912 41.771 41.617 41.284 41.098 40.878 40.595 40.256 39.86 39.318 33.887 -7 ,6086 ,KEBNE ,16676708,Wed Nov 24 12:58:48 CET,Wed Nov 24 14:52:05 CET,0.0 2.038 2.616 2.973 3.265 3.512 3.738 3.958 4.358 4.53 4.693 4.919 5.135 5.277 5.532 5.769 5.998 6.108 6.318 6.532 6.843 7.035 7.219 7.484 7.759 8.033 8.298 8.554 8.881 9.205 9.519 9.893 10.263 10.623 11.029 11.489 11.938 12.443 13.003 13.61 14.274 15.039 15.952 16.907 18.046 19.353 20.906 22.717 24.953 27.782 31.499 34.876 37.072 38.581 39.655 40.486 41.121 41.606 41.94 42.221 42.439 42.603 42.731 42.825 42.86 42.87 42.88 42.867 42.857 42.838 42.801 42.768 42.732 42.68 42.632 42.576 42.505 42.415 42.303 42.223 42.146 42.012 41.9 41.785 41.732 41.631 41.518 41.375 41.279 41.142 40.958 40.831 40.695 40.408 40.24 40.033 39.797 39.522 39.151 38.591 35.582 -8 ,18331 ,KEBNE ,16676709,Wed Nov 24 12:58:48 CET,Wed Nov 24 14:52:49 CET,0.0 1.678 2.101 2.409 2.667 2.902 3.112 3.311 3.69 3.852 3.996 4.205 4.428 4.571 4.831 5.073 5.301 5.407 5.611 5.822 6.145 6.342 6.533 6.813 7.102 7.394 7.67 7.942 8.264 8.561 8.865 9.239 9.589 9.93 10.334 10.803 11.254 11.746 12.293 12.89 13.538 14.282 15.174 16.106 17.227 18.51 20.044 21.851 24.065 26.863 30.625 34.137 36.38 37.909 38.988 39.835 40.466 40.9 41.228 41.546 41.774 41.952 42.097 42.207 42.294 42.341 42.369 42.391 42.396 42.378 42.342 42.304 42.25 42.18 42.122 42.045 41.957 41.876 41.785 41.712 41.638 41.517 41.422 41.324 41.265 41.115 40.937 40.733 40.623 40.475 40.265 40.122 39.968 39.62 39.395 39.131 38.856 38.535 38.162 37.607 34.113 -9 ,6504 ,KEBNE ,16676710,Wed Nov 24 12:58:50 CET,Wed Nov 24 14:51:49 CET,0.0 2.309 2.824 3.194 3.499 3.762 3.993 4.208 4.596 4.769 4.931 5.157 5.375 5.518 5.786 6.019 6.242 6.349 6.567 6.776 7.078 7.277 7.472 7.753 8.022 8.275 8.526 8.779 9.105 9.414 9.709 10.082 10.449 10.805 11.218 11.688 12.153 12.679 13.255 13.864 14.512 15.255 16.159 17.093 18.199 19.467 20.989 22.805 25.045 27.872 31.628 35.05 37.19 38.655 39.706 40.476 41.046 41.491 41.802 42.072 42.269 42.405 42.516 42.587 42.637 42.673 42.678 42.658 42.634 42.591 42.528 42.473 42.421 42.355 42.285 42.205 42.115 42.014 41.896 41.809 41.718 41.589 41.486 41.358 41.291 41.143 40.967 40.765 40.66 40.502 40.253 40.102 39.955 39.629 39.434 39.218 38.969 38.643 38.228 37.659 34.018 -10 ,15153 ,KEBNE ,16676711,Wed Nov 24 12:59:49 CET,Wed Nov 24 14:54:17 CET,0.0 2.72 3.237 3.592 3.887 4.127 4.35 4.571 4.948 5.116 5.276 5.499 5.713 5.853 6.121 6.38 6.619 6.735 6.961 7.175 7.49 7.693 7.882 8.16 8.428 8.687 8.944 9.194 9.522 9.846 10.156 10.535 10.902 11.265 11.686 12.156 12.623 13.135 13.694 14.315 14.984 15.753 16.669 17.612 18.743 20.043 21.6 23.4 25.614 28.467 32.203 35.639 37.94 39.53 40.671 41.522 42.119 42.551 42.864 43.136 43.338 43.501 43.638 43.744 43.827 43.885 43.909 43.91 43.902 43.882 43.85 43.815 43.77 43.704 43.649 43.594 43.525 43.438 43.34 43.268 43.185 43.04 42.94 42.833 42.764 42.618 42.463 42.293 42.203 42.068 41.854 41.723 41.59 41.288 41.115 40.892 40.619 40.33 39.96 39.419 36.001 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_23.txt deleted file mode 100644 index ff5fac5e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_23.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14049 ,KEBNE ,16674389,Tue Nov 23 15:14:27 CET,Tue Nov 23 16:25:25 CET,0.0 1.427 1.842 2.144 2.395 2.597 2.77 2.92 3.179 3.304 3.429 3.577 3.764 3.864 4.05 4.236 4.422 4.504 4.654 4.796 5.009 5.151 5.285 5.475 5.655 5.832 6.004 6.163 6.363 6.568 6.772 7.014 7.237 7.448 7.699 7.976 8.242 8.529 8.83 9.158 9.5 9.875 10.311 10.747 11.252 11.799 12.431 13.157 13.993 14.977 16.118 16.945 17.344 17.514 17.541 17.471 17.357 17.218 17.07 16.923 16.782 16.635 16.472 16.304 16.149 16.008 15.85 15.672 15.512 15.348 15.177 15.028 14.862 14.685 14.536 14.392 14.237 14.072 13.907 13.78 13.636 13.398 13.231 13.061 12.972 12.783 12.587 12.344 12.205 12.01 11.816 11.668 11.521 11.191 11.001 10.79 10.533 10.222 9.849 9.294 6.631 -2 ,18020 ,KEBNE ,16674390,Tue Nov 23 15:14:26 CET,Tue Nov 23 17:07:23 CET,0.0 1.339 1.782 2.113 2.353 2.567 2.758 2.917 3.193 3.315 3.43 3.579 3.774 3.88 4.081 4.27 4.438 4.519 4.679 4.83 5.041 5.177 5.305 5.492 5.677 5.855 6.023 6.177 6.369 6.553 6.739 6.965 7.179 7.384 7.613 7.871 8.131 8.417 8.717 9.034 9.379 9.767 10.206 10.658 11.178 11.743 12.409 13.169 14.038 14.985 16.01 16.759 17.135 17.329 17.423 17.402 17.309 17.216 17.131 17.021 16.89 16.755 16.615 16.466 16.285 16.096 15.892 15.7 15.529 15.33 15.104 14.919 14.744 14.552 14.389 14.23 14.062 13.88 13.664 13.513 13.372 13.128 12.943 12.751 12.653 12.458 12.267 12.045 11.907 11.698 11.472 11.305 11.111 10.684 10.46 10.218 9.969 9.669 9.272 8.728 6.82 -4 ,18587 ,KEBNE ,16674392,Tue Nov 23 15:14:26 CET,Tue Nov 23 17:07:06 CET,0.0 1.429 1.834 2.132 2.361 2.553 2.716 2.86 3.137 3.261 3.384 3.539 3.741 3.856 4.057 4.254 4.441 4.521 4.668 4.812 5.026 5.171 5.313 5.503 5.669 5.832 5.999 6.159 6.362 6.553 6.743 6.977 7.193 7.392 7.618 7.871 8.123 8.406 8.716 9.061 9.419 9.795 10.232 10.679 11.192 11.755 12.389 13.105 13.921 14.882 16.062 16.909 17.308 17.519 17.606 17.563 17.432 17.28 17.114 16.902 16.706 16.53 16.364 16.201 16.035 15.881 15.691 15.508 15.333 15.134 14.929 14.736 14.539 14.341 14.178 14.011 13.845 13.666 13.468 13.331 13.191 12.955 12.79 12.622 12.536 12.348 12.151 11.952 11.849 11.672 11.484 11.324 11.146 10.772 10.539 10.226 9.862 9.455 8.967 8.303 5.831 -5 ,23317 ,KEBNE ,16676716,Wed Nov 24 12:59:49 CET,Wed Nov 24 14:53:53 CET,0.0 1.382 1.808 2.108 2.343 2.545 2.719 2.868 3.148 3.277 3.393 3.535 3.724 3.828 4.033 4.222 4.393 4.473 4.625 4.767 4.969 5.106 5.236 5.415 5.592 5.762 5.927 6.085 6.282 6.474 6.658 6.883 7.104 7.311 7.538 7.79 8.037 8.307 8.602 8.919 9.258 9.654 10.094 10.527 11.052 11.636 12.302 13.053 13.926 14.93 16.013 16.809 17.177 17.299 17.335 17.274 17.134 16.96 16.797 16.618 16.44 16.281 16.115 15.939 15.763 15.599 15.428 15.239 15.054 14.876 14.679 14.521 14.359 14.181 14.039 13.881 13.728 13.577 13.406 13.28 13.145 12.923 12.779 12.626 12.535 12.343 12.145 11.937 11.821 11.621 11.389 11.241 11.073 10.674 10.458 10.226 9.973 9.645 9.249 8.706 6.632 -6 ,28363 ,KEBNE ,16676717,Wed Nov 24 13:00:50 CET,Wed Nov 24 14:57:46 CET,0.0 1.217 1.604 1.879 2.121 2.326 2.499 2.653 2.929 3.056 3.174 3.321 3.509 3.617 3.811 3.986 4.154 4.231 4.38 4.532 4.746 4.878 5.011 5.212 5.405 5.591 5.764 5.927 6.142 6.349 6.546 6.771 6.983 7.197 7.437 7.695 7.946 8.225 8.546 8.893 9.239 9.624 10.067 10.501 11.02 11.601 12.259 13.009 13.87 14.859 16.001 16.791 17.177 17.354 17.405 17.358 17.232 17.086 16.942 16.781 16.602 16.407 16.222 16.035 15.864 15.7 15.521 15.341 15.165 14.968 14.72 14.524 14.34 14.143 14.004 13.862 13.686 13.498 13.278 13.11 12.947 12.725 12.565 12.37 12.27 12.076 11.868 11.629 11.489 11.272 11.028 10.857 10.694 10.343 10.117 9.851 9.551 9.189 8.72 8.073 5.651 -7 ,14391 ,KEBNE ,16676718,Wed Nov 24 13:00:50 CET,Wed Nov 24 14:54:25 CET,0.0 1.617 2.029 2.321 2.564 2.772 2.947 3.103 3.384 3.518 3.645 3.801 3.996 4.094 4.277 4.444 4.602 4.683 4.836 4.971 5.173 5.311 5.436 5.612 5.79 5.963 6.13 6.291 6.499 6.701 6.889 7.11 7.323 7.529 7.773 8.052 8.314 8.588 8.875 9.18 9.511 9.884 10.303 10.724 11.227 11.792 12.431 13.131 13.948 14.919 15.997 16.766 17.147 17.314 17.356 17.293 17.168 17.028 16.888 16.716 16.564 16.436 16.287 16.131 15.971 15.82 15.651 15.489 15.354 15.201 15.043 14.896 14.731 14.564 14.419 14.26 14.098 13.937 13.777 13.654 13.516 13.314 13.168 12.999 12.912 12.73 12.519 12.29 12.169 11.979 11.813 11.679 11.537 11.212 11.023 10.808 10.548 10.209 9.735 9.023 5.952 -8 ,29449 ,KEBNE ,16676719,Wed Nov 24 13:00:50 CET,Wed Nov 24 14:54:16 CET,0.0 1.553 1.945 2.25 2.487 2.684 2.871 3.039 3.323 3.454 3.579 3.727 3.919 4.022 4.203 4.372 4.544 4.625 4.776 4.926 5.141 5.271 5.404 5.594 5.763 5.932 6.099 6.254 6.449 6.647 6.843 7.068 7.277 7.485 7.724 7.98 8.23 8.51 8.815 9.123 9.443 9.823 10.283 10.746 11.27 11.847 12.504 13.215 14.059 15.018 16.022 16.688 16.999 17.088 17.055 16.941 16.804 16.664 16.507 16.345 16.2 16.047 15.877 15.705 15.528 15.357 15.168 14.985 14.824 14.658 14.479 14.326 14.174 14.004 13.855 13.705 13.557 13.396 13.227 13.116 12.996 12.807 12.671 12.515 12.429 12.251 12.062 11.866 11.765 11.589 11.418 11.278 11.133 10.807 10.622 10.424 10.186 9.921 9.61 9.11 7.363 -9 ,2166 ,KEBNE ,16676720,Wed Nov 24 13:01:52 CET,Wed Nov 24 14:57:36 CET,0.0 1.224 1.598 1.865 2.093 2.295 2.469 2.632 2.934 3.064 3.18 3.31 3.488 3.586 3.768 3.939 4.097 4.174 4.318 4.454 4.65 4.782 4.915 5.101 5.277 5.444 5.605 5.763 5.965 6.156 6.342 6.561 6.769 6.977 7.222 7.489 7.745 8.026 8.324 8.635 8.964 9.337 9.775 10.212 10.73 11.331 11.994 12.71 13.535 14.498 15.674 16.579 16.984 17.163 17.207 17.167 17.082 16.957 16.802 16.618 16.437 16.237 16.034 15.831 15.637 15.459 15.251 15.069 14.905 14.691 14.466 14.298 14.131 13.955 13.812 13.663 13.496 13.324 13.16 13.053 12.934 12.725 12.581 12.425 12.341 12.157 11.957 11.751 11.641 11.463 11.261 11.089 10.887 10.45 10.224 9.972 9.685 9.343 8.895 8.221 5.082 -10 ,30560 ,KEBNE ,16676721,Wed Nov 24 13:02:53 CET,Wed Nov 24 14:56:29 CET,0.0 1.509 1.93 2.208 2.444 2.656 2.837 2.996 3.281 3.406 3.521 3.663 3.85 3.952 4.147 4.328 4.5 4.586 4.75 4.901 5.105 5.237 5.367 5.558 5.753 5.924 6.079 6.23 6.42 6.605 6.787 7.008 7.218 7.417 7.651 7.923 8.182 8.464 8.754 9.075 9.416 9.786 10.214 10.648 11.18 11.745 12.37 13.105 13.935 14.896 16.024 16.846 17.237 17.423 17.488 17.472 17.38 17.211 17.045 16.89 16.72 16.533 16.367 16.195 16.014 15.845 15.621 15.389 15.212 15.04 14.848 14.684 14.495 14.292 14.139 13.972 13.791 13.609 13.417 13.28 13.139 12.892 12.701 12.506 12.411 12.207 11.977 11.758 11.649 11.465 11.267 11.113 10.933 10.514 10.28 10.038 9.768 9.426 8.963 8.296 6.161 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_30.txt deleted file mode 100644 index 7aa1ed81..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_30.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20001 ,KEBNE ,16676722,Wed Nov 24 13:02:53 CET,Wed Nov 24 14:54:10 CET,0.0 2.59 3.13 3.534 3.855 4.107 4.329 4.537 4.909 5.08 5.245 5.458 5.662 5.792 6.038 6.255 6.465 6.57 6.771 6.956 7.203 7.353 7.503 7.728 7.938 8.13 8.305 8.472 8.679 8.872 9.06 9.283 9.507 9.724 9.963 10.226 10.473 10.749 11.054 11.356 11.66 11.999 12.352 12.681 13.067 13.469 13.87 14.298 14.782 15.15 15.233 14.945 14.494 13.983 13.525 13.109 12.699 12.333 12.009 11.661 11.367 11.094 10.79 10.491 10.235 10.007 9.754 9.506 9.29 9.083 8.867 8.673 8.464 8.244 8.063 7.88 7.693 7.499 7.302 7.166 7.023 6.784 6.611 6.432 6.334 6.107 5.867 5.629 5.495 5.266 5.028 4.859 4.683 4.314 4.108 3.862 3.575 3.231 2.803 2.166 -0.267 -2 ,23983 ,KEBNE ,16674400,Tue Nov 23 15:14:26 CET,Tue Nov 23 17:07:01 CET,0.0 2.327 2.926 3.352 3.662 3.898 4.157 4.399 4.772 4.947 5.12 5.351 5.57 5.716 5.988 6.217 6.422 6.526 6.738 6.933 7.21 7.386 7.552 7.786 8.019 8.231 8.425 8.618 8.856 9.07 9.271 9.518 9.751 9.971 10.235 10.53 10.794 11.082 11.387 11.693 12.001 12.329 12.695 13.064 13.468 13.866 14.294 14.722 15.141 15.506 15.668 15.416 15.021 14.609 14.197 13.797 13.39 12.983 12.61 12.225 11.909 11.613 11.316 11.027 10.749 10.492 10.224 9.975 9.736 9.495 9.248 9.033 8.8 8.565 8.385 8.183 7.98 7.758 7.504 7.325 7.148 6.885 6.699 6.493 6.388 6.184 5.953 5.702 5.568 5.35 5.13 4.979 4.814 4.405 4.167 3.916 3.638 3.32 2.91 2.358 0.122 -3 ,24442 ,KEBNE ,16674401,Tue Nov 23 15:14:26 CET,Tue Nov 23 17:10:17 CET,0.0 2.233 2.764 3.142 3.45 3.721 3.968 4.182 4.552 4.712 4.858 5.051 5.263 5.396 5.655 5.915 6.154 6.261 6.465 6.665 6.935 7.091 7.239 7.45 7.656 7.85 8.031 8.208 8.433 8.645 8.84 9.067 9.287 9.501 9.757 10.043 10.318 10.607 10.883 11.16 11.448 11.767 12.132 12.484 12.871 13.267 13.68 14.125 14.579 14.962 15.155 14.97 14.661 14.287 13.854 13.402 12.967 12.598 12.279 11.91 11.572 11.272 10.979 10.695 10.434 10.185 9.915 9.675 9.455 9.215 8.963 8.745 8.524 8.295 8.094 7.897 7.702 7.498 7.3 7.156 7.004 6.763 6.576 6.385 6.288 6.085 5.865 5.645 5.53 5.327 5.135 4.986 4.817 4.447 4.239 4.007 3.749 3.454 3.086 2.594 0.716 -4 ,28182 ,KEBNE ,16674402,Tue Nov 23 15:14:28 CET,Tue Nov 23 17:07:48 CET,0.0 3.558 4.343 4.861 5.258 5.617 5.947 6.243 6.754 6.977 7.189 7.507 7.755 7.906 8.185 8.44 8.682 8.799 9.041 9.266 9.56 9.756 9.936 10.189 10.439 10.659 10.882 11.109 11.385 11.651 11.912 12.214 12.493 12.756 13.057 13.381 13.695 14.042 14.407 14.797 15.199 15.573 15.928 16.284 16.661 17.007 17.403 17.839 18.285 18.681 18.907 18.767 18.419 18.012 17.59 17.148 16.721 16.321 15.935 15.521 15.174 14.879 14.594 14.314 14.024 13.731 13.433 13.176 12.955 12.728 12.499 12.294 12.055 11.791 11.596 11.412 11.216 11.01 10.791 10.63 10.449 10.165 9.982 9.791 9.691 9.479 9.247 8.985 8.841 8.617 8.414 8.277 8.12 7.748 7.533 7.289 7.012 6.655 6.245 5.685 3.088 -5 ,31657 ,KEBNE ,16674403,Tue Nov 23 15:14:27 CET,Tue Nov 23 17:08:12 CET,0.0 2.568 3.213 3.663 4.037 4.349 4.619 4.877 5.329 5.529 5.707 5.961 6.216 6.38 6.686 6.964 7.206 7.322 7.554 7.765 8.03 8.187 8.326 8.518 8.7 8.883 9.075 9.275 9.544 9.797 10.041 10.339 10.616 10.864 11.127 11.403 11.647 11.901 12.178 12.459 12.734 13.052 13.398 13.723 14.108 14.53 14.958 15.387 15.851 16.213 16.391 16.197 15.733 15.186 14.678 14.214 13.768 13.342 12.969 12.592 12.255 11.945 11.639 11.343 11.043 10.773 10.515 10.288 10.087 9.876 9.646 9.433 9.201 8.964 8.762 8.548 8.33 8.092 7.828 7.632 7.44 7.166 6.982 6.794 6.698 6.477 6.239 6.001 5.87 5.63 5.328 5.141 4.948 4.561 4.348 4.104 3.833 3.517 3.13 2.563 0.321 -6 ,15535 ,KEBNE ,16674404,Tue Nov 23 15:14:27 CET,Tue Nov 23 17:07:12 CET,0.0 3.579 4.332 4.856 5.258 5.647 6.011 6.287 6.72 6.91 7.08 7.303 7.514 7.647 7.891 8.111 8.326 8.435 8.644 8.836 9.098 9.263 9.423 9.655 9.881 10.09 10.288 10.476 10.709 10.931 11.142 11.4 11.638 11.865 12.129 12.41 12.667 12.941 13.255 13.579 13.893 14.245 14.631 14.986 15.394 15.815 16.262 16.742 17.208 17.597 17.785 17.649 17.317 16.881 16.461 16.045 15.624 15.217 14.869 14.493 14.126 13.777 13.447 13.146 12.872 12.617 12.35 12.115 11.9 11.663 11.417 11.215 10.998 10.768 10.587 10.401 10.215 10.03 9.819 9.655 9.493 9.228 9.032 8.823 8.714 8.502 8.271 8.018 7.878 7.648 7.396 7.23 7.05 6.663 6.451 6.222 5.975 5.664 5.26 4.686 2.579 -7 ,11486 ,KEBNE ,16674405,Tue Nov 23 15:14:26 CET,Tue Nov 23 17:06:50 CET,0.0 2.39 2.867 3.216 3.497 3.727 3.943 4.155 4.523 4.687 4.842 5.055 5.267 5.392 5.637 5.871 6.082 6.182 6.363 6.522 6.735 6.881 7.023 7.207 7.383 7.547 7.702 7.855 8.051 8.246 8.424 8.627 8.835 9.028 9.239 9.476 9.689 9.921 10.172 10.425 10.684 10.964 11.276 11.605 11.996 12.376 12.754 13.112 13.421 13.613 13.572 13.24 12.761 12.252 11.692 11.174 10.765 10.377 10.024 9.671 9.352 9.053 8.759 8.48 8.214 7.965 7.706 7.483 7.288 7.085 6.878 6.677 6.441 6.201 6.016 5.831 5.647 5.447 5.239 5.093 4.937 4.69 4.514 4.322 4.221 4.014 3.786 3.548 3.428 3.222 3.003 2.848 2.692 2.325 2.101 1.872 1.605 1.276 0.868 0.25 -1.847 -8 ,28312 ,KEBNE ,16674406,Tue Nov 23 15:14:26 CET,Tue Nov 23 17:06:45 CET,0.0 4.884 5.622 6.088 6.415 6.703 6.954 7.179 7.565 7.735 7.903 8.148 8.378 8.518 8.779 9.045 9.289 9.398 9.606 9.808 10.084 10.261 10.433 10.659 10.87 11.076 11.273 11.453 11.685 11.911 12.118 12.357 12.585 12.805 13.057 13.345 13.622 13.912 14.201 14.498 14.794 15.123 15.515 15.893 16.308 16.723 17.14 17.558 17.982 18.298 18.348 18.11 17.739 17.328 16.895 16.46 15.966 15.44 15.001 14.547 14.101 13.659 13.254 12.889 12.526 12.187 11.85 11.544 11.269 10.985 10.68 10.42 10.149 9.85 9.613 9.374 9.122 8.859 8.584 8.392 8.177 7.813 7.572 7.33 7.199 6.931 6.648 6.33 6.16 5.906 5.597 5.379 5.142 4.595 4.285 3.95 3.593 3.18 2.681 1.961 -0.66 -10 ,21642 ,KEBNE ,16676731,Wed Nov 24 13:04:57 CET,Wed Nov 24 14:57:22 CET,0.0 2.949 3.466 3.83 4.145 4.435 4.699 4.942 5.366 5.544 5.713 5.946 6.164 6.299 6.542 6.768 6.975 7.069 7.252 7.435 7.685 7.836 7.979 8.182 8.376 8.555 8.73 8.902 9.107 9.298 9.484 9.708 9.921 10.116 10.349 10.604 10.834 11.081 11.327 11.569 11.82 12.118 12.471 12.819 13.201 13.575 13.92 14.243 14.577 14.899 14.987 14.723 14.305 13.812 13.335 12.859 12.395 11.961 11.577 11.161 10.796 10.487 10.204 9.933 9.678 9.43 9.152 8.912 8.704 8.478 8.235 8.034 7.827 7.598 7.416 7.231 7.039 6.843 6.635 6.491 6.345 6.118 5.96 5.784 5.685 5.482 5.277 5.038 4.904 4.681 4.444 4.278 4.105 3.695 3.483 3.255 2.964 2.624 2.184 1.564 -0.614 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_24.txt deleted file mode 100644 index 783bcb0c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4534 ,KEBNE ,16676732,Wed Nov 24 13:05:59 CET,Wed Nov 24 14:58:13 CET,0.0 1.448 1.927 2.28 2.56 2.811 3.029 3.239 3.638 3.819 3.991 4.26 4.48 4.631 4.924 5.207 5.472 5.596 5.832 6.058 6.388 6.6 6.801 7.086 7.365 7.63 7.877 8.12 8.433 8.736 9.032 9.396 9.746 10.095 10.514 10.985 11.446 11.96 12.531 13.15 13.803 14.566 15.482 16.418 17.54 18.819 20.362 22.173 24.375 27.153 30.838 34.272 36.55 38.107 39.24 40.136 40.811 41.342 41.755 42.131 42.423 42.655 42.852 43.014 43.146 43.251 43.331 43.385 43.432 43.475 43.505 43.524 43.534 43.539 43.54 43.534 43.52 43.496 43.466 43.437 43.406 43.352 43.302 43.244 43.21 43.134 43.056 42.975 42.93 42.854 42.738 42.662 42.577 42.381 42.266 42.13 41.956 41.761 41.524 41.195 39.995 -2 ,21536 ,KEBNE ,16676733,Wed Nov 24 13:05:58 CET,Wed Nov 24 14:57:58 CET,0.0 1.668 2.143 2.494 2.784 3.049 3.291 3.508 3.89 4.065 4.228 4.47 4.683 4.824 5.094 5.358 5.608 5.726 5.961 6.184 6.484 6.674 6.854 7.128 7.399 7.657 7.912 8.158 8.475 8.78 9.078 9.451 9.813 10.162 10.571 11.039 11.506 12.025 12.584 13.2 13.864 14.617 15.52 16.455 17.562 18.836 20.346 22.14 24.404 27.188 30.826 34.227 36.478 38.058 39.197 40.07 40.719 41.23 41.641 42.022 42.308 42.525 42.702 42.846 42.962 43.044 43.116 43.177 43.228 43.267 43.289 43.303 43.306 43.304 43.305 43.292 43.269 43.236 43.194 43.163 43.125 43.048 42.993 42.937 42.906 42.841 42.77 42.683 42.63 42.556 42.457 42.378 42.3 42.122 42.013 41.889 41.741 41.561 41.343 41.011 39.908 -3 ,5901 ,KEBNE ,16674411,Tue Nov 23 15:17:35 CET,Tue Nov 23 17:10:00 CET,0.0 1.427 1.824 2.138 2.425 2.679 2.891 3.087 3.476 3.659 3.823 4.051 4.258 4.391 4.638 4.883 5.133 5.252 5.476 5.686 5.988 6.192 6.391 6.672 6.952 7.232 7.508 7.778 8.123 8.453 8.776 9.172 9.547 9.907 10.339 10.832 11.303 11.826 12.409 13.052 13.758 14.563 15.508 16.477 17.663 19.082 20.759 22.677 25.029 27.952 31.742 35.283 37.656 39.291 40.459 41.361 42.084 42.666 43.111 43.531 43.848 44.081 44.276 44.449 44.591 44.704 44.8 44.861 44.906 44.941 44.965 44.975 44.979 44.982 44.974 44.953 44.931 44.902 44.865 44.836 44.805 44.749 44.696 44.639 44.603 44.515 44.423 44.331 44.282 44.207 44.105 44.031 43.954 43.772 43.653 43.525 43.383 43.188 42.927 42.582 41.404 -4 ,3515 ,KEBNE ,16674412,Tue Nov 23 15:17:35 CET,Tue Nov 23 17:09:40 CET,0.0 1.471 1.897 2.223 2.499 2.751 2.973 3.173 3.535 3.701 3.866 4.122 4.334 4.475 4.746 4.995 5.239 5.361 5.6 5.828 6.156 6.37 6.578 6.883 7.184 7.474 7.737 8.003 8.364 8.699 9.02 9.415 9.816 10.189 10.606 11.101 11.604 12.157 12.737 13.333 13.966 14.7 15.573 16.479 17.566 18.794 20.253 22.006 24.216 27.039 30.722 34.083 36.305 37.892 39.025 39.893 40.545 41.073 41.482 41.838 42.113 42.318 42.494 42.647 42.763 42.846 42.915 42.967 43.002 43.029 43.055 43.073 43.081 43.077 43.064 43.049 43.036 43.015 42.981 42.954 42.919 42.85 42.8 42.744 42.708 42.623 42.537 42.434 42.381 42.307 42.194 42.115 42.028 41.841 41.718 41.575 41.431 41.247 41.001 40.645 39.45 -5 ,176 ,KEBNE ,16676736,Wed Nov 24 13:08:02 CET,Wed Nov 24 15:00:53 CET,0.0 1.378 1.819 2.144 2.42 2.67 2.901 3.11 3.471 3.64 3.806 4.061 4.277 4.421 4.69 4.947 5.205 5.333 5.579 5.804 6.117 6.323 6.533 6.846 7.156 7.449 7.734 8.013 8.367 8.708 9.038 9.443 9.841 10.239 10.695 11.187 11.656 12.171 12.734 13.349 14.025 14.817 15.751 16.716 17.878 19.179 20.734 22.58 24.861 27.775 31.6 35.173 37.532 39.192 40.417 41.335 42.027 42.574 42.995 43.357 43.626 43.845 44.039 44.211 44.346 44.449 44.536 44.598 44.643 44.684 44.721 44.738 44.739 44.731 44.724 44.713 44.7 44.678 44.647 44.624 44.598 44.541 44.481 44.417 44.385 44.315 44.243 44.157 44.107 44.031 43.926 43.862 43.788 43.616 43.5 43.363 43.227 43.041 42.795 42.468 41.085 -6 ,27738 ,KEBNE ,16676737,Wed Nov 24 13:08:02 CET,Wed Nov 24 15:00:09 CET,0.0 1.471 1.959 2.311 2.586 2.826 3.044 3.254 3.659 3.833 3.99 4.236 4.447 4.591 4.866 5.12 5.37 5.497 5.745 5.974 6.308 6.525 6.73 7.033 7.326 7.601 7.87 8.14 8.494 8.843 9.187 9.592 9.966 10.325 10.747 11.26 11.775 12.336 12.959 13.655 14.411 15.274 16.293 17.319 18.534 19.915 21.504 23.321 25.576 28.461 32.317 35.862 38.18 39.834 41.078 42.049 42.777 43.353 43.783 44.179 44.497 44.731 44.932 45.105 45.229 45.315 45.388 45.453 45.516 45.561 45.589 45.609 45.62 45.625 45.627 45.619 45.598 45.574 45.555 45.533 45.495 45.433 45.388 45.334 45.303 45.233 45.162 45.088 45.043 44.972 44.876 44.812 44.736 44.553 44.452 44.34 44.204 44.031 43.793 43.43 42.184 -7 ,23168 ,KEBNE ,16674415,Tue Nov 23 15:33:18 CET,Tue Nov 23 17:25:32 CET,0.0 1.655 2.061 2.381 2.662 2.916 3.144 3.348 3.728 3.902 4.064 4.312 4.525 4.669 4.951 5.22 5.469 5.587 5.816 6.037 6.345 6.548 6.753 7.05 7.338 7.613 7.877 8.137 8.476 8.807 9.13 9.527 9.916 10.292 10.745 11.263 11.744 12.278 12.87 13.521 14.228 15.039 15.989 16.983 18.185 19.545 21.139 23.021 25.393 28.353 32.183 35.721 38.056 39.725 40.981 41.96 42.691 43.251 43.679 44.068 44.346 44.554 44.722 44.861 44.985 45.089 45.178 45.247 45.297 45.344 45.377 45.386 45.392 45.381 45.362 45.354 45.342 45.323 45.295 45.269 45.243 45.193 45.147 45.091 45.061 44.984 44.896 44.802 44.751 44.675 44.576 44.504 44.422 44.234 44.121 43.987 43.824 43.632 43.405 43.099 41.914 -8 ,21266 ,KEBNE ,16676739,Wed Nov 24 13:09:04 CET,Wed Nov 24 15:01:43 CET,0.0 1.441 1.89 2.235 2.514 2.749 2.967 3.176 3.56 3.74 3.914 4.176 4.391 4.543 4.842 5.109 5.366 5.49 5.726 5.951 6.271 6.483 6.688 6.98 7.268 7.551 7.828 8.096 8.441 8.771 9.095 9.502 9.899 10.29 10.752 11.276 11.786 12.342 12.946 13.587 14.266 15.051 15.978 16.938 18.11 19.442 20.972 22.764 24.986 27.816 31.579 35.032 37.301 38.884 40.026 40.923 41.621 42.155 42.562 42.933 43.219 43.45 43.633 43.78 43.895 43.99 44.075 44.133 44.172 44.204 44.24 44.255 44.255 44.251 44.238 44.225 44.21 44.184 44.154 44.126 44.09 44.027 43.976 43.931 43.906 43.838 43.754 43.649 43.596 43.524 43.432 43.36 43.273 43.072 42.956 42.805 42.624 42.419 42.163 41.815 40.352 -9 ,8717 ,KEBNE ,16676740,Wed Nov 24 13:09:03 CET,Wed Nov 24 15:01:39 CET,0.0 1.389 1.798 2.123 2.392 2.624 2.841 3.036 3.4 3.573 3.734 3.986 4.201 4.342 4.612 4.875 5.122 5.238 5.464 5.684 6.008 6.218 6.421 6.728 7.035 7.332 7.616 7.888 8.235 8.567 8.89 9.295 9.687 10.065 10.51 11.001 11.475 11.988 12.538 13.153 13.811 14.557 15.458 16.396 17.508 18.774 20.288 22.088 24.326 27.144 30.892 34.415 36.791 38.452 39.642 40.587 41.322 41.896 42.313 42.69 42.982 43.193 43.366 43.507 43.625 43.727 43.807 43.857 43.89 43.926 43.961 43.976 43.984 43.985 43.979 43.966 43.946 43.924 43.9 43.879 43.846 43.793 43.756 43.712 43.686 43.624 43.561 43.478 43.423 43.347 43.244 43.173 43.103 42.936 42.815 42.678 42.536 42.356 42.116 41.793 40.4 -10 ,18928 ,KEBNE ,16674418,Tue Nov 23 15:51:09 CET,Tue Nov 23 17:45:10 CET,0.0 1.448 1.903 2.23 2.488 2.712 2.911 3.103 3.451 3.61 3.771 4.018 4.225 4.366 4.643 4.893 5.117 5.224 5.435 5.657 5.983 6.183 6.376 6.654 6.923 7.19 7.453 7.709 8.038 8.351 8.651 9.021 9.385 9.731 10.142 10.617 11.087 11.61 12.161 12.764 13.414 14.148 15.04 15.97 17.082 18.371 19.914 21.723 23.971 26.835 30.625 34.133 36.452 38.105 39.314 40.232 40.919 41.462 41.865 42.21 42.47 42.691 42.882 43.024 43.139 43.239 43.328 43.385 43.424 43.459 43.477 43.486 43.487 43.475 43.466 43.453 43.436 43.403 43.358 43.328 43.288 43.215 43.162 43.097 43.064 42.991 42.891 42.785 42.739 42.662 42.552 42.476 42.389 42.199 42.093 41.969 41.817 41.637 41.425 41.115 39.726 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_31.txt deleted file mode 100644 index db43927e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12132 ,KEBNE ,16676742,Wed Nov 24 13:09:04 CET,Wed Nov 24 15:01:58 CET,0.0 1.779 2.31 2.679 2.972 3.231 3.449 3.638 3.997 4.159 4.312 4.526 4.712 4.826 5.041 5.233 5.41 5.495 5.654 5.799 6.021 6.163 6.285 6.455 6.622 6.775 6.913 7.042 7.203 7.358 7.503 7.676 7.833 7.973 8.122 8.278 8.421 8.568 8.71 8.834 8.943 9.054 9.197 9.303 9.363 9.372 9.277 9.115 8.839 8.232 7.088 5.65 4.349 3.246 2.321 1.481 0.751 0.091 -0.47 -1.007 -1.472 -1.883 -2.258 -2.602 -2.933 -3.243 -3.56 -3.844 -4.085 -4.33 -4.602 -4.835 -5.064 -5.299 -5.481 -5.665 -5.86 -6.071 -6.287 -6.437 -6.597 -6.857 -7.038 -7.212 -7.3 -7.494 -7.697 -7.906 -8.014 -8.212 -8.406 -8.564 -8.724 -9.054 -9.232 -9.416 -9.642 -9.913 -10.212 -10.623 -12.291 -2 ,4943 ,KEBNE ,16674420,Tue Nov 23 15:51:11 CET,Tue Nov 23 17:44:20 CET,0.0 1.421 1.86 2.191 2.457 2.689 2.889 3.061 3.352 3.478 3.601 3.765 3.944 4.054 4.24 4.419 4.587 4.659 4.788 4.913 5.113 5.239 5.353 5.504 5.643 5.779 5.908 6.027 6.179 6.338 6.481 6.634 6.774 6.907 7.045 7.181 7.326 7.47 7.594 7.723 7.853 7.973 8.096 8.194 8.272 8.306 8.289 8.196 7.924 7.352 6.275 4.797 3.488 2.374 1.427 0.611 -0.09 -0.723 -1.265 -1.813 -2.276 -2.685 -3.057 -3.407 -3.74 -4.029 -4.335 -4.63 -4.888 -5.139 -5.395 -5.613 -5.842 -6.081 -6.267 -6.454 -6.647 -6.852 -7.061 -7.207 -7.358 -7.593 -7.758 -7.934 -8.025 -8.207 -8.406 -8.624 -8.737 -8.931 -9.103 -9.236 -9.379 -9.698 -9.864 -10.048 -10.255 -10.481 -10.791 -11.256 -12.876 -3 ,6378 ,KEBNE ,16676744,Wed Nov 24 13:10:05 CET,Wed Nov 24 15:04:11 CET,0.0 1.715 2.255 2.612 2.886 3.132 3.366 3.575 3.927 4.07 4.205 4.391 4.572 4.684 4.893 5.093 5.278 5.367 5.538 5.694 5.904 6.041 6.17 6.354 6.53 6.691 6.845 6.992 7.176 7.347 7.503 7.67 7.823 7.967 8.113 8.28 8.444 8.612 8.773 8.92 9.054 9.195 9.347 9.454 9.524 9.553 9.525 9.44 9.2 8.647 7.539 6.105 4.889 3.828 2.912 2.135 1.489 0.881 0.339 -0.21 -0.689 -1.095 -1.474 -1.835 -2.181 -2.499 -2.823 -3.117 -3.372 -3.637 -3.911 -4.142 -4.371 -4.613 -4.802 -4.988 -5.188 -5.397 -5.614 -5.773 -5.931 -6.161 -6.325 -6.501 -6.599 -6.802 -7.002 -7.209 -7.323 -7.524 -7.694 -7.836 -7.98 -8.298 -8.485 -8.683 -8.897 -9.144 -9.445 -9.907 -11.793 -4 ,8243 ,KEBNE ,16674422,Tue Nov 23 15:51:07 CET,Tue Nov 23 17:45:40 CET,0.0 1.677 2.119 2.463 2.733 2.963 3.164 3.336 3.648 3.785 3.918 4.113 4.292 4.397 4.584 4.759 4.925 5.009 5.16 5.291 5.476 5.594 5.711 5.874 6.033 6.181 6.309 6.43 6.599 6.761 6.902 7.064 7.213 7.354 7.508 7.665 7.797 7.927 8.071 8.214 8.333 8.456 8.6 8.729 8.832 8.897 8.917 8.818 8.559 8.059 6.91 5.386 4.173 3.111 2.196 1.394 0.712 0.125 -0.392 -0.903 -1.336 -1.737 -2.128 -2.494 -2.83 -3.129 -3.448 -3.739 -3.979 -4.232 -4.487 -4.699 -4.923 -5.161 -5.351 -5.538 -5.722 -5.911 -6.124 -6.282 -6.443 -6.679 -6.837 -7.001 -7.088 -7.275 -7.483 -7.711 -7.824 -8.022 -8.211 -8.353 -8.499 -8.816 -8.992 -9.185 -9.399 -9.673 -10.0 -10.428 -11.855 -5 ,18370 ,KEBNE ,16676746,Wed Nov 24 13:10:06 CET,Wed Nov 24 15:02:44 CET,0.0 1.828 2.31 2.622 2.891 3.112 3.299 3.473 3.792 3.933 4.057 4.21 4.378 4.483 4.68 4.864 5.027 5.102 5.253 5.389 5.569 5.681 5.788 5.94 6.086 6.225 6.353 6.471 6.631 6.783 6.91 7.048 7.168 7.274 7.406 7.567 7.707 7.856 8.012 8.148 8.282 8.408 8.506 8.593 8.664 8.684 8.666 8.57 8.291 7.677 6.516 5.003 3.742 2.694 1.801 1.041 0.389 -0.213 -0.757 -1.292 -1.735 -2.138 -2.518 -2.873 -3.206 -3.513 -3.83 -4.105 -4.341 -4.589 -4.843 -5.044 -5.252 -5.481 -5.662 -5.839 -6.022 -6.22 -6.423 -6.555 -6.696 -6.924 -7.091 -7.268 -7.357 -7.542 -7.744 -7.96 -8.069 -8.257 -8.429 -8.566 -8.707 -9.007 -9.183 -9.378 -9.589 -9.83 -10.11 -10.537 -12.274 -6 ,14753 ,KEBNE ,16674424,Tue Nov 23 15:52:10 CET,Tue Nov 23 17:45:23 CET,0.0 1.942 2.456 2.832 3.117 3.359 3.586 3.797 4.146 4.301 4.459 4.681 4.864 4.975 5.169 5.343 5.509 5.587 5.737 5.878 6.072 6.194 6.31 6.473 6.633 6.776 6.907 7.031 7.182 7.33 7.469 7.62 7.751 7.873 8.014 8.159 8.302 8.461 8.613 8.751 8.878 9.004 9.138 9.237 9.291 9.319 9.286 9.178 8.933 8.343 7.074 5.511 4.27 3.22 2.303 1.514 0.862 0.241 -0.339 -0.908 -1.365 -1.777 -2.172 -2.547 -2.903 -3.217 -3.539 -3.822 -4.054 -4.303 -4.566 -4.781 -5.007 -5.234 -5.405 -5.583 -5.763 -5.959 -6.166 -6.307 -6.453 -6.69 -6.851 -7.013 -7.103 -7.286 -7.474 -7.679 -7.789 -7.99 -8.165 -8.305 -8.449 -8.761 -8.945 -9.148 -9.36 -9.605 -9.904 -10.325 -11.849 -7 ,18981 ,KEBNE ,16676748,Wed Nov 24 13:11:07 CET,Wed Nov 24 15:03:44 CET,0.0 1.392 1.814 2.169 2.473 2.707 2.897 3.068 3.381 3.536 3.68 3.869 4.063 4.184 4.387 4.571 4.743 4.817 4.962 5.106 5.315 5.436 5.541 5.696 5.853 6.0 6.13 6.252 6.41 6.562 6.701 6.865 7.017 7.151 7.293 7.448 7.602 7.761 7.923 8.074 8.219 8.351 8.464 8.58 8.689 8.739 8.698 8.522 8.168 7.593 6.532 5.063 3.762 2.654 1.742 0.935 0.227 -0.395 -0.933 -1.477 -1.931 -2.326 -2.708 -3.084 -3.431 -3.748 -4.072 -4.353 -4.593 -4.847 -5.117 -5.337 -5.56 -5.794 -5.978 -6.167 -6.356 -6.551 -6.763 -6.916 -7.075 -7.319 -7.49 -7.677 -7.775 -7.975 -8.184 -8.407 -8.526 -8.73 -8.919 -9.063 -9.205 -9.507 -9.675 -9.867 -10.102 -10.374 -10.689 -11.107 -12.865 -8 ,4264 ,KEBNE ,16676749,Wed Nov 24 13:11:07 CET,Wed Nov 24 15:05:07 CET,0.0 1.851 2.334 2.704 2.982 3.212 3.418 3.595 3.891 4.03 4.162 4.342 4.512 4.613 4.802 4.982 5.14 5.215 5.357 5.492 5.685 5.805 5.925 6.097 6.254 6.401 6.539 6.675 6.844 6.993 7.136 7.298 7.427 7.553 7.698 7.844 7.985 8.127 8.288 8.452 8.588 8.72 8.824 8.878 8.903 8.88 8.752 8.551 8.26 7.655 6.389 4.775 3.46 2.345 1.378 0.539 -0.187 -0.846 -1.389 -1.898 -2.341 -2.733 -3.111 -3.466 -3.791 -4.099 -4.417 -4.707 -4.956 -5.207 -5.477 -5.703 -5.926 -6.149 -6.324 -6.51 -6.714 -6.934 -7.15 -7.291 -7.447 -7.696 -7.865 -8.04 -8.13 -8.319 -8.525 -8.739 -8.842 -9.029 -9.205 -9.34 -9.479 -9.797 -9.971 -10.158 -10.362 -10.594 -10.926 -11.358 -12.775 -9 ,24050 ,KEBNE ,16674427,Tue Nov 23 15:51:09 CET,Tue Nov 23 17:44:56 CET,0.0 1.888 2.431 2.831 3.118 3.362 3.592 3.8 4.163 4.323 4.461 4.64 4.833 4.951 5.159 5.339 5.499 5.578 5.733 5.874 6.065 6.189 6.315 6.486 6.632 6.779 6.918 7.042 7.192 7.333 7.464 7.618 7.767 7.908 8.064 8.22 8.367 8.531 8.678 8.811 8.934 9.039 9.146 9.218 9.241 9.211 9.158 9.041 8.724 8.093 6.879 5.315 4.012 2.94 2.006 1.145 0.401 -0.244 -0.813 -1.383 -1.853 -2.281 -2.687 -3.06 -3.402 -3.711 -4.024 -4.304 -4.554 -4.818 -5.089 -5.308 -5.531 -5.759 -5.939 -6.133 -6.336 -6.556 -6.788 -6.942 -7.094 -7.332 -7.502 -7.68 -7.771 -7.962 -8.157 -8.367 -8.484 -8.686 -8.874 -9.012 -9.15 -9.44 -9.608 -9.797 -10.004 -10.241 -10.546 -10.961 -12.314 -10 ,17127 ,KEBNE ,16674428,Tue Nov 23 15:51:08 CET,Tue Nov 23 17:45:30 CET,0.0 2.09 2.649 3.05 3.375 3.638 3.87 4.078 4.44 4.598 4.741 4.948 5.145 5.269 5.497 5.714 5.907 5.993 6.143 6.276 6.477 6.612 6.733 6.899 7.054 7.197 7.326 7.447 7.607 7.754 7.884 8.04 8.186 8.321 8.476 8.653 8.805 8.941 9.066 9.203 9.35 9.479 9.606 9.728 9.829 9.875 9.836 9.689 9.352 8.713 7.5 5.827 4.387 3.204 2.224 1.381 0.658 0.021 -0.53 -1.09 -1.573 -1.997 -2.383 -2.738 -3.078 -3.389 -3.713 -3.999 -4.242 -4.496 -4.766 -4.987 -5.21 -5.452 -5.636 -5.819 -6.013 -6.226 -6.447 -6.596 -6.749 -6.993 -7.167 -7.343 -7.435 -7.619 -7.813 -8.033 -8.153 -8.356 -8.522 -8.657 -8.806 -9.144 -9.33 -9.53 -9.76 -10.021 -10.331 -10.78 -12.394 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_34_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_34_26.txt deleted file mode 100644 index 87dcd99d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_34_26.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8224 ,KEBNE ,16674429,Tue Nov 23 15:51:07 CET,Tue Nov 23 17:47:09 CET,0.0 1.262 1.743 2.11 2.418 2.707 2.975 3.216 3.637 3.822 3.99 4.217 4.488 4.649 4.967 5.268 5.557 5.703 5.982 6.252 6.642 6.882 7.122 7.476 7.82 8.158 8.488 8.821 9.25 9.65 10.034 10.504 10.964 11.409 11.925 12.516 13.105 13.764 14.478 15.244 16.071 17.021 18.108 19.193 20.481 21.984 23.803 25.927 28.501 31.652 35.789 39.585 42.022 43.69 44.894 45.855 46.582 47.108 47.486 47.831 48.091 48.28 48.433 48.561 48.666 48.741 48.8 48.839 48.862 48.879 48.866 48.842 48.817 48.785 48.764 48.733 48.685 48.63 48.569 48.522 48.469 48.385 48.322 48.246 48.207 48.128 48.016 47.889 47.831 47.708 47.624 47.539 47.445 47.233 47.116 46.978 46.821 46.641 46.386 46.024 45.02 -3 ,14823 ,KEBNE ,16674431,Tue Nov 23 15:52:10 CET,Tue Nov 23 17:46:42 CET,0.0 1.338 1.794 2.153 2.454 2.734 2.991 3.223 3.649 3.854 4.05 4.31 4.593 4.76 5.081 5.385 5.676 5.819 6.111 6.4 6.793 7.038 7.28 7.628 7.976 8.313 8.633 8.954 9.368 9.752 10.117 10.565 10.998 11.424 11.923 12.481 13.031 13.643 14.305 15.021 15.795 16.699 17.793 18.886 20.166 21.682 23.526 25.677 28.282 31.551 35.869 39.799 42.255 43.991 45.234 46.145 46.87 47.442 47.843 48.185 48.44 48.64 48.814 48.956 49.054 49.135 49.204 49.24 49.26 49.264 49.26 49.252 49.239 49.223 49.205 49.172 49.132 49.094 49.043 49.003 48.956 48.864 48.793 48.718 48.68 48.595 48.489 48.368 48.305 48.178 48.075 47.991 47.896 47.683 47.559 47.407 47.241 47.053 46.829 46.533 45.569 -4 ,1350 ,KEBNE ,16676756,Wed Nov 24 13:12:08 CET,Wed Nov 24 15:04:16 CET,0.0 1.556 1.988 2.313 2.594 2.852 3.09 3.313 3.709 3.897 4.074 4.292 4.546 4.697 4.989 5.289 5.581 5.716 5.986 6.24 6.584 6.81 7.04 7.37 7.684 7.983 8.272 8.567 8.953 9.322 9.679 10.105 10.527 10.943 11.439 12.004 12.529 13.112 13.772 14.492 15.261 16.141 17.194 18.278 19.553 21.03 22.792 24.859 27.39 30.544 34.795 38.64 41.055 42.75 43.994 44.917 45.599 46.139 46.536 46.87 47.116 47.307 47.462 47.58 47.676 47.734 47.78 47.824 47.85 47.874 47.887 47.878 47.858 47.831 47.808 47.782 47.744 47.699 47.647 47.598 47.544 47.467 47.403 47.322 47.277 47.182 47.079 46.962 46.902 46.787 46.696 46.61 46.526 46.33 46.198 46.052 45.897 45.713 45.46 45.098 43.889 -5 ,14025 ,KEBNE ,16676757,Wed Nov 24 13:12:08 CET,Wed Nov 24 15:03:57 CET,0.0 1.224 1.668 1.983 2.259 2.502 2.722 2.937 3.34 3.525 3.696 3.918 4.186 4.342 4.634 4.921 5.187 5.315 5.57 5.818 6.188 6.439 6.686 7.046 7.391 7.703 7.996 8.294 8.683 9.049 9.401 9.836 10.268 10.69 11.173 11.726 12.282 12.898 13.573 14.283 15.032 15.899 16.943 18.021 19.302 20.777 22.535 24.602 27.188 30.414 34.594 38.451 40.937 42.683 43.958 44.92 45.628 46.172 46.573 46.943 47.222 47.41 47.567 47.693 47.773 47.831 47.895 47.939 47.955 47.957 47.938 47.923 47.909 47.873 47.844 47.811 47.769 47.726 47.672 47.629 47.578 47.488 47.423 47.351 47.313 47.225 47.135 47.032 46.975 46.847 46.75 46.668 46.575 46.367 46.253 46.117 45.966 45.792 45.547 45.186 44.085 -6 ,28369 ,KEBNE ,16674434,Tue Nov 23 15:54:15 CET,Tue Nov 23 17:50:21 CET,0.0 1.221 1.695 2.055 2.35 2.622 2.865 3.081 3.491 3.678 3.855 4.082 4.355 4.523 4.842 5.145 5.436 5.582 5.876 6.155 6.552 6.814 7.065 7.432 7.785 8.132 8.463 8.772 9.184 9.575 9.945 10.386 10.809 11.227 11.712 12.267 12.819 13.431 14.094 14.817 15.588 16.461 17.516 18.595 19.848 21.287 23.025 25.08 27.568 30.604 34.74 38.664 41.146 42.865 44.114 45.056 45.761 46.323 46.752 47.12 47.382 47.578 47.726 47.835 47.914 47.971 48.028 48.058 48.071 48.08 48.07 48.055 48.029 47.976 47.935 47.898 47.854 47.803 47.746 47.71 47.659 47.559 47.484 47.405 47.365 47.268 47.162 47.049 46.991 46.868 46.785 46.704 46.609 46.393 46.26 46.1 45.922 45.726 45.503 45.172 44.036 -7 ,25379 ,KEBNE ,16674435,Tue Nov 23 15:54:15 CET,Tue Nov 23 17:48:05 CET,0.0 1.459 1.916 2.278 2.594 2.871 3.106 3.319 3.71 3.887 4.056 4.273 4.541 4.699 4.998 5.281 5.552 5.681 5.927 6.172 6.52 6.737 6.954 7.275 7.588 7.909 8.221 8.518 8.903 9.275 9.631 10.068 10.499 10.925 11.425 11.983 12.534 13.156 13.827 14.549 15.318 16.188 17.244 18.336 19.639 21.149 22.919 25.012 27.624 30.887 35.173 39.046 41.557 43.327 44.593 45.528 46.248 46.824 47.231 47.579 47.85 48.052 48.207 48.34 48.454 48.532 48.597 48.653 48.69 48.709 48.718 48.717 48.705 48.681 48.646 48.601 48.554 48.501 48.438 48.384 48.332 48.244 48.167 48.077 48.031 47.937 47.83 47.7 47.63 47.501 47.412 47.326 47.236 47.041 46.925 46.784 46.621 46.433 46.2 45.89 44.856 -8 ,9236 ,KEBNE ,16676760,Wed Nov 24 13:14:11 CET,Wed Nov 24 15:08:28 CET,0.0 1.856 2.399 2.756 3.063 3.349 3.592 3.81 4.243 4.446 4.643 4.902 5.179 5.355 5.697 6.011 6.322 6.467 6.745 7.009 7.387 7.63 7.862 8.196 8.521 8.853 9.188 9.51 9.919 10.323 10.712 11.178 11.64 12.1 12.644 13.247 13.803 14.407 15.056 15.763 16.528 17.413 18.473 19.566 20.879 22.382 24.186 26.304 28.909 32.183 36.465 40.363 42.846 44.595 45.873 46.842 47.589 48.164 48.588 48.965 49.237 49.443 49.623 49.771 49.868 49.943 50.014 50.053 50.077 50.09 50.093 50.084 50.064 50.042 50.023 49.993 49.963 49.929 49.866 49.82 49.784 49.722 49.668 49.601 49.562 49.474 49.371 49.248 49.178 49.052 48.985 48.902 48.799 48.583 48.458 48.312 48.157 47.964 47.692 47.282 45.444 -9 ,17464 ,KEBNE ,16674437,Tue Nov 23 15:56:25 CET,Tue Nov 23 17:46:33 CET,0.0 1.571 2.007 2.346 2.641 2.905 3.155 3.402 3.846 4.056 4.261 4.522 4.8 4.965 5.287 5.592 5.881 6.021 6.289 6.554 6.952 7.201 7.442 7.789 8.131 8.462 8.776 9.079 9.469 9.854 10.226 10.692 11.145 11.586 12.133 12.769 13.377 14.073 14.848 15.663 16.515 17.454 18.547 19.715 21.126 22.705 24.556 26.709 29.356 32.618 36.866 40.718 43.208 44.926 46.159 47.114 47.82 48.379 48.793 49.156 49.429 49.623 49.782 49.913 50.014 50.09 50.155 50.195 50.219 50.233 50.234 50.218 50.19 50.166 50.144 50.115 50.095 50.059 49.989 49.936 49.885 49.796 49.727 49.658 49.624 49.549 49.449 49.331 49.278 49.166 49.087 49.01 48.926 48.737 48.625 48.492 48.34 48.171 47.932 47.554 46.204 -10 ,752 ,KEBNE ,16676762,Wed Nov 24 13:15:12 CET,Wed Nov 24 15:07:33 CET,0.0 1.259 1.71 2.078 2.381 2.647 2.89 3.108 3.501 3.676 3.841 4.059 4.315 4.461 4.74 5.02 5.291 5.421 5.676 5.919 6.278 6.511 6.737 7.058 7.363 7.666 7.96 8.239 8.594 8.95 9.307 9.741 10.158 10.558 11.037 11.589 12.125 12.73 13.399 14.109 14.859 15.736 16.795 17.859 19.108 20.585 22.348 24.359 26.81 29.889 33.931 37.688 40.13 41.806 43.013 43.937 44.63 45.155 45.534 45.86 46.107 46.308 46.483 46.616 46.713 46.792 46.849 46.881 46.912 46.926 46.924 46.923 46.901 46.872 46.856 46.828 46.791 46.754 46.699 46.654 46.604 46.518 46.453 46.379 46.338 46.251 46.153 46.054 46.002 45.881 45.779 45.699 45.622 45.427 45.305 45.162 45.008 44.824 44.578 44.226 42.971 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_29.txt deleted file mode 100644 index 81877b77..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18751 ,KEBNE ,16674449,Tue Nov 23 16:01:34 CET,Tue Nov 23 17:54:50 CET,0.0 1.536 2.036 2.401 2.71 2.985 3.239 3.48 3.912 4.112 4.313 4.591 4.865 5.032 5.352 5.649 5.942 6.096 6.392 6.662 7.058 7.32 7.575 7.94 8.302 8.671 9.029 9.359 9.774 10.183 10.595 11.111 11.624 12.135 12.739 13.433 14.117 14.854 15.639 16.515 17.488 18.61 19.94 21.292 22.912 24.784 27.005 29.671 33.013 37.105 42.431 47.417 50.767 53.179 54.983 56.372 57.392 58.218 58.875 59.486 59.969 60.358 60.687 60.969 61.211 61.398 61.573 61.718 61.829 61.923 62.001 62.057 62.116 62.166 62.194 62.213 62.223 62.225 62.213 62.2 62.186 62.146 62.107 62.062 62.035 61.971 61.899 61.818 61.776 61.694 61.633 61.572 61.514 61.358 61.258 61.142 61.005 60.832 60.601 60.287 59.245 -2 ,7578 ,KEBNE ,16676764,Wed Nov 24 13:15:13 CET,Wed Nov 24 15:08:33 CET,0.0 1.445 1.927 2.303 2.61 2.869 3.11 3.338 3.751 3.939 4.12 4.373 4.646 4.811 5.116 5.412 5.706 5.848 6.133 6.416 6.824 7.099 7.366 7.748 8.121 8.495 8.866 9.222 9.675 10.13 10.573 11.076 11.549 12.018 12.57 13.213 13.87 14.608 15.415 16.292 17.232 18.273 19.494 20.785 22.361 24.203 26.376 28.898 32.02 36.002 41.387 46.443 49.75 52.134 53.952 55.355 56.453 57.382 58.112 58.738 59.197 59.572 59.895 60.17 60.417 60.615 60.793 60.932 61.03 61.125 61.222 61.29 61.345 61.391 61.42 61.443 61.461 61.476 61.483 61.475 61.458 61.424 61.389 61.343 61.317 61.252 61.186 61.121 61.078 60.978 60.884 60.817 60.734 60.533 60.417 60.278 60.116 59.929 59.703 59.379 58.107 -3 ,13132 ,KEBNE ,16674451,Tue Nov 23 16:02:37 CET,Tue Nov 23 17:58:37 CET,0.0 1.19 1.635 1.995 2.32 2.595 2.859 3.107 3.549 3.748 3.94 4.211 4.479 4.64 4.96 5.271 5.572 5.72 6.01 6.291 6.696 6.963 7.22 7.584 7.928 8.26 8.587 8.91 9.335 9.75 10.149 10.633 11.108 11.577 12.13 12.752 13.358 14.041 14.792 15.609 16.485 17.494 18.733 20.023 21.518 23.244 25.336 27.797 30.848 34.742 39.991 44.923 48.241 50.612 52.377 53.751 54.795 55.623 56.265 56.854 57.322 57.709 58.024 58.296 58.54 58.735 58.915 59.049 59.148 59.248 59.339 59.398 59.447 59.495 59.524 59.549 59.565 59.567 59.559 59.545 59.521 59.48 59.448 59.406 59.386 59.347 59.297 59.226 59.18 59.086 59.007 58.933 58.847 58.662 58.551 58.43 58.283 58.114 57.909 57.572 56.487 -4 ,4115 ,KEBNE ,16676766,Wed Nov 24 13:16:13 CET,Wed Nov 24 15:09:37 CET,0.0 1.133 1.59 1.937 2.225 2.48 2.712 2.932 3.333 3.509 3.678 3.93 4.205 4.37 4.688 4.995 5.284 5.425 5.694 5.956 6.347 6.597 6.842 7.203 7.553 7.894 8.226 8.547 8.968 9.379 9.783 10.283 10.756 11.218 11.769 12.399 13.012 13.692 14.428 15.252 16.177 17.251 18.557 19.918 21.518 23.338 25.56 28.243 31.619 35.915 41.571 46.822 50.325 52.798 54.628 56.067 57.187 58.079 58.756 59.357 59.823 60.2 60.532 60.817 61.063 61.263 61.453 61.597 61.702 61.811 61.909 61.974 62.039 62.095 62.128 62.159 62.177 62.185 62.191 62.19 62.189 62.165 62.132 62.093 62.069 62.015 61.951 61.868 61.822 61.739 61.694 61.636 61.56 61.374 61.273 61.16 61.015 60.825 60.578 60.248 58.804 -5 ,5798 ,KEBNE ,16676767,Wed Nov 24 13:16:14 CET,Wed Nov 24 15:09:00 CET,0.0 1.233 1.68 2.027 2.329 2.623 2.894 3.148 3.595 3.79 3.982 4.261 4.546 4.719 5.041 5.355 5.66 5.81 6.102 6.375 6.775 7.039 7.302 7.685 8.046 8.383 8.708 9.028 9.437 9.841 10.239 10.712 11.194 11.689 12.268 12.93 13.586 14.318 15.124 16.005 16.948 18.036 19.351 20.7 22.253 24.014 26.122 28.623 31.807 35.932 41.483 46.639 50.043 52.489 54.292 55.722 56.824 57.691 58.346 58.919 59.38 59.751 60.062 60.329 60.555 60.746 60.916 61.059 61.184 61.292 61.385 61.448 61.501 61.537 61.558 61.577 61.589 61.595 61.584 61.57 61.553 61.508 61.468 61.427 61.405 61.354 61.294 61.229 61.187 61.094 61.035 60.972 60.9 60.727 60.615 60.488 60.349 60.163 59.931 59.557 58.272 -6 ,11888 ,KEBNE ,16676768,Wed Nov 24 13:16:14 CET,Wed Nov 24 15:10:37 CET,0.0 1.342 1.825 2.206 2.544 2.827 3.082 3.332 3.788 3.996 4.182 4.422 4.688 4.852 5.177 5.473 5.747 5.885 6.141 6.39 6.771 7.018 7.247 7.585 7.93 8.272 8.605 8.921 9.337 9.744 10.134 10.603 11.077 11.54 12.068 12.681 13.289 13.975 14.734 15.546 16.404 17.398 18.59 19.819 21.296 23.053 25.207 27.722 30.824 34.793 40.191 45.273 48.581 50.974 52.765 54.153 55.22 56.076 56.764 57.39 57.869 58.259 58.589 58.865 59.101 59.288 59.467 59.611 59.721 59.821 59.903 59.97 60.037 60.092 60.125 60.153 60.175 60.184 60.181 60.174 60.157 60.119 60.09 60.052 60.027 59.968 59.904 59.828 59.785 59.693 59.617 59.547 59.479 59.309 59.195 59.055 58.9 58.709 58.462 58.145 57.047 -7 ,31556 ,KEBNE ,16676769,Wed Nov 24 13:16:14 CET,Wed Nov 24 15:09:00 CET,0.0 1.389 1.851 2.237 2.552 2.831 3.085 3.318 3.768 3.975 4.168 4.424 4.701 4.869 5.184 5.492 5.79 5.936 6.214 6.478 6.873 7.133 7.389 7.769 8.137 8.48 8.819 9.158 9.601 10.03 10.439 10.951 11.466 11.954 12.515 13.164 13.796 14.517 15.325 16.197 17.121 18.167 19.41 20.672 22.165 23.902 26.001 28.515 31.612 35.496 40.815 45.871 49.221 51.629 53.418 54.795 55.85 56.72 57.398 58.004 58.48 58.869 59.201 59.469 59.689 59.863 60.021 60.15 60.243 60.333 60.424 60.482 60.532 60.585 60.617 60.639 60.659 60.659 60.636 60.627 60.621 60.601 60.574 60.528 60.502 60.444 60.376 60.291 60.244 60.155 60.087 60.018 59.939 59.779 59.684 59.542 59.368 59.157 58.905 58.598 57.598 -8 ,32648 ,KEBNE ,16674456,Tue Nov 23 16:02:37 CET,Tue Nov 23 17:58:43 CET,0.0 1.182 1.686 2.05 2.367 2.659 2.916 3.153 3.595 3.792 3.979 4.255 4.543 4.719 5.056 5.39 5.717 5.871 6.168 6.454 6.868 7.142 7.405 7.777 8.134 8.461 8.765 9.077 9.486 9.874 10.264 10.743 11.21 11.667 12.204 12.812 13.409 14.098 14.877 15.708 16.58 17.591 18.856 20.181 21.716 23.483 25.661 28.32 31.605 35.752 41.397 46.68 50.236 52.778 54.644 56.073 57.152 58.036 58.74 59.384 59.879 60.263 60.607 60.895 61.118 61.313 61.506 61.652 61.762 61.865 61.967 62.037 62.11 62.176 62.204 62.22 62.227 62.236 62.242 62.241 62.235 62.203 62.178 62.151 62.131 62.09 62.027 61.945 61.903 61.814 61.745 61.679 61.608 61.441 61.336 61.208 61.046 60.862 60.644 60.34 59.343 -9 ,21452 ,KEBNE ,16676771,Wed Nov 24 13:17:15 CET,Wed Nov 24 15:11:10 CET,0.0 1.345 1.841 2.24 2.568 2.858 3.131 3.387 3.843 4.044 4.244 4.519 4.795 4.972 5.3 5.604 5.894 6.04 6.332 6.615 7.026 7.287 7.541 7.916 8.284 8.643 8.993 9.324 9.749 10.166 10.575 11.079 11.572 12.055 12.628 13.284 13.908 14.588 15.329 16.123 17.007 18.05 19.263 20.511 22.019 23.788 25.918 28.436 31.567 35.508 40.747 45.641 48.933 51.315 53.058 54.425 55.466 56.281 56.916 57.49 57.929 58.284 58.597 58.867 59.105 59.289 59.449 59.585 59.693 59.791 59.877 59.939 59.992 60.031 60.054 60.077 60.086 60.086 60.084 60.08 60.061 60.019 59.987 59.938 59.913 59.857 59.792 59.713 59.665 59.567 59.485 59.42 59.349 59.186 59.066 58.918 58.771 58.61 58.399 58.093 57.136 -10 ,8763 ,KEBNE ,16676772,Wed Nov 24 13:17:15 CET,Wed Nov 24 15:10:08 CET,0.0 1.388 1.874 2.246 2.551 2.817 3.054 3.283 3.704 3.903 4.103 4.375 4.649 4.813 5.128 5.434 5.733 5.881 6.162 6.424 6.812 7.059 7.293 7.635 7.969 8.288 8.599 8.924 9.361 9.78 10.183 10.679 11.163 11.635 12.196 12.822 13.443 14.146 14.92 15.771 16.679 17.724 18.988 20.284 21.835 23.625 25.763 28.327 31.516 35.534 40.941 46.067 49.496 51.935 53.727 55.102 56.157 57.012 57.694 58.314 58.784 59.148 59.453 59.725 59.965 60.163 60.339 60.471 60.578 60.676 60.769 60.844 60.897 60.926 60.947 60.971 60.979 60.987 60.991 60.981 60.968 60.943 60.906 60.855 60.832 60.773 60.704 60.627 60.577 60.475 60.387 60.321 60.261 60.081 59.97 59.847 59.693 59.499 59.275 58.975 58.071 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_31.txt deleted file mode 100644 index 7cddd796..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7342 ,KEBNE ,17069415,Fri Dec 24 03:44:06 CET,Fri Dec 24 05:36:18 CET,0.0 1.803 2.302 2.662 2.965 3.227 3.468 3.678 4.048 4.216 4.381 4.605 4.852 4.998 5.275 5.528 5.767 5.883 6.122 6.338 6.627 6.814 6.999 7.28 7.554 7.813 8.054 8.286 8.581 8.871 9.152 9.488 9.825 10.151 10.525 10.942 11.342 11.783 12.251 12.767 13.318 13.916 14.632 15.368 16.239 17.238 18.367 19.573 20.956 22.627 24.616 26.123 26.897 27.316 27.519 27.589 27.568 27.498 27.408 27.3 27.214 27.113 26.953 26.798 26.65 26.452 26.25 26.114 25.978 25.809 25.627 25.486 25.351 25.177 25.022 24.879 24.716 24.527 24.339 24.207 24.07 23.849 23.691 23.522 23.421 23.222 23.035 22.821 22.704 22.494 22.309 22.163 21.998 21.658 21.473 21.262 21.019 20.754 20.393 19.861 18.102 -2 ,1857 ,KEBNE ,17069416,Fri Dec 24 03:45:11 CET,Fri Dec 24 05:37:18 CET,0.0 1.548 2.022 2.393 2.719 3.004 3.257 3.477 3.863 4.044 4.218 4.446 4.7 4.844 5.11 5.362 5.607 5.722 5.939 6.152 6.464 6.662 6.848 7.118 7.388 7.65 7.903 8.148 8.465 8.783 9.097 9.467 9.806 10.128 10.499 10.925 11.332 11.761 12.219 12.716 13.248 13.833 14.515 15.219 16.056 16.962 17.997 19.154 20.533 22.164 24.075 25.559 26.274 26.621 26.774 26.787 26.735 26.663 26.578 26.457 26.317 26.167 26.028 25.892 25.739 25.581 25.395 25.225 25.068 24.879 24.695 24.567 24.419 24.239 24.095 23.957 23.805 23.639 23.461 23.331 23.197 22.978 22.82 22.651 22.567 22.382 22.158 21.921 21.804 21.6 21.414 21.269 21.105 20.74 20.535 20.289 20.001 19.672 19.257 18.665 16.274 -3 ,17342 ,KEBNE ,17069418,Fri Dec 24 03:55:44 CET,Fri Dec 24 05:49:32 CET,0.0 1.569 2.08 2.437 2.732 3.004 3.233 3.447 3.843 4.029 4.217 4.466 4.714 4.861 5.143 5.401 5.649 5.762 5.977 6.187 6.494 6.696 6.885 7.154 7.414 7.674 7.931 8.176 8.489 8.781 9.07 9.428 9.772 10.104 10.479 10.903 11.31 11.734 12.197 12.697 13.231 13.875 14.604 15.32 16.166 17.091 18.174 19.412 20.848 22.448 24.373 25.841 26.56 26.969 27.134 27.162 27.131 27.028 26.917 26.789 26.636 26.472 26.286 26.092 25.911 25.74 25.563 25.381 25.21 25.038 24.848 24.691 24.527 24.337 24.186 24.018 23.839 23.664 23.473 23.34 23.201 22.964 22.795 22.614 22.517 22.313 22.097 21.867 21.754 21.556 21.37 21.227 21.081 20.756 20.568 20.358 20.092 19.772 19.406 18.905 16.991 -4 ,22992 ,KEBNE ,17069419,Fri Dec 24 03:55:45 CET,Fri Dec 24 05:48:18 CET,0.0 1.9 2.392 2.727 3.018 3.284 3.521 3.735 4.107 4.276 4.44 4.649 4.901 5.039 5.291 5.532 5.766 5.877 6.088 6.305 6.616 6.805 6.991 7.257 7.517 7.786 8.039 8.278 8.593 8.881 9.16 9.526 9.883 10.22 10.602 11.025 11.433 11.869 12.346 12.884 13.432 14.04 14.753 15.461 16.316 17.303 18.357 19.469 20.806 22.385 24.28 25.695 26.409 26.761 26.921 26.983 26.931 26.82 26.718 26.595 26.46 26.313 26.164 26.01 25.848 25.68 25.49 25.322 25.163 24.992 24.827 24.699 24.563 24.387 24.233 24.077 23.913 23.744 23.562 23.435 23.305 23.084 22.926 22.768 22.685 22.501 22.29 22.038 21.908 21.698 21.509 21.369 21.225 20.891 20.668 20.415 20.155 19.849 19.48 18.978 16.603 -5 ,17545 ,KEBNE ,17069421,Fri Dec 24 03:56:47 CET,Fri Dec 24 05:49:07 CET,0.0 1.545 2.101 2.492 2.798 3.092 3.356 3.579 3.961 4.141 4.314 4.522 4.772 4.91 5.174 5.428 5.666 5.781 6.0 6.201 6.491 6.68 6.863 7.136 7.392 7.633 7.872 8.106 8.418 8.714 8.999 9.358 9.698 10.026 10.413 10.844 11.265 11.752 12.266 12.787 13.351 13.975 14.71 15.445 16.272 17.226 18.284 19.437 20.872 22.603 24.516 26.038 26.895 27.391 27.677 27.796 27.804 27.741 27.646 27.481 27.34 27.234 27.094 26.942 26.782 26.616 26.446 26.272 26.122 25.984 25.831 25.691 25.531 25.368 25.25 25.106 24.95 24.781 24.595 24.471 24.334 24.114 23.943 23.758 23.67 23.503 23.323 23.114 22.998 22.792 22.609 22.467 22.311 21.99 21.811 21.599 21.356 21.068 20.707 20.179 18.052 -6 ,12907 ,KEBNE ,17069423,Fri Dec 24 03:57:49 CET,Fri Dec 24 05:49:54 CET,0.0 1.642 2.167 2.515 2.816 3.079 3.315 3.525 3.894 4.08 4.25 4.447 4.692 4.829 5.107 5.38 5.63 5.749 5.984 6.214 6.54 6.742 6.943 7.22 7.485 7.756 8.008 8.248 8.566 8.876 9.167 9.518 9.859 10.169 10.522 10.937 11.33 11.769 12.249 12.737 13.247 13.848 14.561 15.266 16.065 16.949 17.992 19.136 20.485 22.051 23.806 25.154 25.859 26.293 26.566 26.696 26.744 26.685 26.585 26.468 26.354 26.211 26.043 25.89 25.732 25.586 25.429 25.272 25.113 24.925 24.73 24.588 24.435 24.267 24.137 24.003 23.859 23.709 23.55 23.411 23.26 23.026 22.857 22.675 22.584 22.407 22.22 21.995 21.872 21.669 21.476 21.318 21.148 20.78 20.574 20.345 20.086 19.762 19.359 18.779 15.691 -7 ,5016 ,KEBNE ,17069425,Fri Dec 24 03:59:57 CET,Fri Dec 24 05:53:30 CET,0.0 1.687 2.17 2.52 2.807 3.072 3.309 3.513 3.87 4.026 4.178 4.38 4.615 4.74 4.981 5.209 5.432 5.545 5.757 5.944 6.234 6.428 6.607 6.861 7.104 7.328 7.546 7.764 8.044 8.315 8.584 8.913 9.224 9.522 9.864 10.245 10.604 10.987 11.414 11.875 12.362 12.915 13.573 14.229 15.0 15.901 16.964 18.11 19.366 20.813 22.609 24.051 24.786 25.174 25.366 25.422 25.434 25.395 25.305 25.199 25.064 24.929 24.793 24.659 24.523 24.4 24.27 24.14 24.017 23.876 23.717 23.576 23.425 23.284 23.178 23.045 22.91 22.774 22.617 22.502 22.376 22.173 22.033 21.888 21.814 21.62 21.385 21.15 21.024 20.82 20.646 20.505 20.349 19.974 19.743 19.499 19.225 18.914 18.509 17.97 15.891 -8 ,4585 ,KEBNE ,17069427,Fri Dec 24 03:59:56 CET,Fri Dec 24 05:53:32 CET,0.0 1.68 2.163 2.514 2.795 3.045 3.274 3.487 3.89 4.075 4.24 4.446 4.696 4.843 5.122 5.381 5.634 5.752 5.976 6.201 6.506 6.699 6.898 7.184 7.443 7.698 7.944 8.174 8.465 8.741 9.014 9.364 9.715 10.042 10.42 10.841 11.241 11.681 12.147 12.643 13.171 13.769 14.464 15.173 15.983 16.903 18.044 19.347 20.832 22.511 24.524 26.077 26.878 27.354 27.533 27.55 27.519 27.465 27.397 27.3 27.189 27.069 26.924 26.757 26.611 26.485 26.334 26.163 26.002 25.832 25.669 25.529 25.379 25.217 25.071 24.93 24.777 24.597 24.424 24.299 24.149 23.907 23.738 23.569 23.482 23.307 23.133 22.944 22.836 22.631 22.418 22.257 22.09 21.72 21.508 21.279 21.038 20.759 20.419 19.939 16.858 -9 ,13717 ,KEBNE ,17069430,Fri Dec 24 04:00:59 CET,Fri Dec 24 05:54:01 CET,0.0 1.922 2.41 2.798 3.143 3.427 3.667 3.887 4.281 4.462 4.632 4.849 5.107 5.252 5.533 5.798 6.029 6.149 6.399 6.616 6.916 7.107 7.29 7.573 7.849 8.102 8.341 8.578 8.892 9.192 9.481 9.84 10.182 10.501 10.862 11.269 11.676 12.127 12.6 13.096 13.609 14.227 14.986 15.706 16.485 17.382 18.493 19.735 21.183 22.793 24.649 26.129 26.985 27.483 27.724 27.809 27.789 27.683 27.558 27.449 27.337 27.216 27.086 26.949 26.796 26.625 26.443 26.284 26.13 25.953 25.745 25.573 25.406 25.231 25.091 24.939 24.787 24.629 24.459 24.332 24.188 23.966 23.816 23.657 23.571 23.381 23.179 22.985 22.881 22.688 22.52 22.378 22.208 21.808 21.602 21.385 21.129 20.82 20.449 19.956 17.971 -10 ,917 ,KEBNE ,17069432,Fri Dec 24 04:02:03 CET,Fri Dec 24 05:54:31 CET,0.0 1.483 1.939 2.289 2.603 2.878 3.122 3.345 3.756 3.937 4.102 4.312 4.56 4.697 4.957 5.218 5.469 5.583 5.811 6.035 6.355 6.577 6.791 7.09 7.378 7.656 7.915 8.153 8.468 8.771 9.059 9.404 9.735 10.056 10.419 10.818 11.228 11.696 12.2 12.74 13.274 13.88 14.637 15.385 16.247 17.236 18.351 19.532 20.889 22.525 24.491 25.901 26.497 26.829 26.99 27.039 27.034 27.017 27.001 26.925 26.832 26.7 26.524 26.385 26.236 26.076 25.918 25.752 25.602 25.423 25.225 25.082 24.946 24.807 24.68 24.525 24.357 24.182 23.993 23.86 23.718 23.484 23.328 23.165 23.076 22.868 22.653 22.433 22.314 22.107 21.914 21.769 21.61 21.241 21.026 20.796 20.544 20.226 19.809 19.199 16.707 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_33.txt deleted file mode 100644 index ae10fff2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28928 ,KEBNE ,16676773,Wed Nov 24 13:17:15 CET,Wed Nov 24 15:09:08 CET,0.0 1.504 1.925 2.236 2.497 2.732 2.945 3.132 3.463 3.618 3.772 3.956 4.191 4.32 4.568 4.8 5.024 5.135 5.346 5.554 5.866 6.067 6.256 6.53 6.808 7.086 7.355 7.612 7.94 8.251 8.549 8.918 9.288 9.655 10.091 10.604 11.086 11.615 12.212 12.846 13.513 14.269 15.198 16.144 17.254 18.501 19.934 21.635 23.705 26.212 29.391 32.114 33.782 34.912 35.724 36.327 36.719 36.982 37.19 37.343 37.41 37.434 37.435 37.42 37.395 37.367 37.291 37.192 37.124 37.053 36.965 36.864 36.744 36.641 36.549 36.439 36.33 36.217 36.094 35.997 35.886 35.708 35.593 35.476 35.406 35.247 35.075 34.871 34.761 34.58 34.389 34.245 34.102 33.818 33.646 33.436 33.155 32.811 32.374 31.662 28.692 -2 ,2683 ,KEBNE ,16676774,Wed Nov 24 13:17:15 CET,Wed Nov 24 15:11:00 CET,0.0 1.731 2.176 2.49 2.751 2.982 3.185 3.376 3.729 3.892 4.052 4.244 4.474 4.602 4.851 5.083 5.303 5.408 5.617 5.825 6.129 6.322 6.502 6.77 7.036 7.293 7.543 7.78 8.085 8.383 8.674 9.024 9.363 9.701 10.105 10.567 11.016 11.503 12.022 12.588 13.198 13.895 14.721 15.584 16.645 17.884 19.381 21.115 23.146 25.692 29.049 31.894 33.547 34.636 35.445 36.048 36.479 36.798 37.017 37.179 37.271 37.324 37.346 37.338 37.299 37.225 37.134 37.062 36.997 36.915 36.825 36.751 36.658 36.542 36.44 36.328 36.212 36.078 35.927 35.817 35.688 35.492 35.367 35.226 35.143 34.974 34.814 34.612 34.493 34.312 34.103 33.944 33.772 33.393 33.188 32.957 32.686 32.355 31.961 31.438 28.951 -3 ,4994 ,KEBNE ,16676775,Wed Nov 24 13:19:18 CET,Wed Nov 24 15:13:59 CET,0.0 1.282 1.713 2.054 2.337 2.577 2.796 2.996 3.347 3.504 3.652 3.843 4.081 4.21 4.464 4.704 4.93 5.043 5.265 5.475 5.777 5.97 6.156 6.424 6.689 6.947 7.195 7.434 7.738 8.041 8.331 8.688 9.044 9.388 9.794 10.24 10.661 11.129 11.643 12.204 12.82 13.543 14.418 15.335 16.438 17.669 19.097 20.81 22.919 25.556 28.952 31.854 33.552 34.629 35.386 35.963 36.38 36.691 36.894 37.016 37.065 37.069 37.056 37.028 37.0 36.975 36.923 36.858 36.788 36.685 36.57 36.467 36.352 36.215 36.106 36.016 35.923 35.809 35.688 35.592 35.482 35.326 35.216 35.084 35.008 34.832 34.639 34.437 34.318 34.122 33.928 33.795 33.635 33.273 33.062 32.839 32.56 32.199 31.774 31.177 28.881 -4 ,3543 ,KEBNE ,16676776,Wed Nov 24 13:19:18 CET,Wed Nov 24 15:13:13 CET,0.0 1.541 1.969 2.287 2.56 2.795 3.002 3.195 3.543 3.697 3.852 4.043 4.284 4.423 4.687 4.916 5.142 5.253 5.458 5.656 5.95 6.141 6.333 6.618 6.89 7.147 7.401 7.657 7.972 8.269 8.566 8.937 9.296 9.631 10.028 10.498 10.952 11.447 11.995 12.576 13.203 13.93 14.801 15.704 16.76 17.973 19.423 21.154 23.241 25.748 29.008 31.861 33.6 34.758 35.536 36.111 36.555 36.841 36.986 37.1 37.174 37.213 37.219 37.194 37.152 37.114 37.049 36.955 36.871 36.771 36.669 36.601 36.521 36.416 36.328 36.232 36.114 35.986 35.86 35.77 35.668 35.505 35.385 35.25 35.18 35.029 34.839 34.626 34.519 34.332 34.14 34.011 33.857 33.534 33.361 33.149 32.906 32.625 32.252 31.722 29.832 -5 ,22571 ,KEBNE ,16674463,Tue Nov 23 16:26:43 CET,Tue Nov 23 18:20:47 CET,0.0 1.325 1.768 2.103 2.364 2.607 2.843 3.056 3.417 3.577 3.724 3.902 4.143 4.282 4.541 4.787 5.022 5.135 5.352 5.568 5.891 6.094 6.285 6.562 6.829 7.094 7.347 7.583 7.902 8.216 8.524 8.894 9.24 9.58 9.987 10.455 10.906 11.402 11.946 12.53 13.155 13.866 14.706 15.596 16.688 17.925 19.372 21.063 23.091 25.589 28.822 31.722 33.517 34.709 35.528 36.118 36.538 36.832 37.052 37.2 37.279 37.337 37.356 37.337 37.293 37.26 37.22 37.151 37.074 36.974 36.869 36.785 36.688 36.57 36.471 36.376 36.267 36.129 35.976 35.874 35.765 35.576 35.426 35.264 35.185 35.029 34.862 34.69 34.588 34.415 34.243 34.102 33.956 33.617 33.409 33.195 32.956 32.652 32.25 31.698 29.643 -6 ,25476 ,KEBNE ,16674464,Tue Nov 23 16:26:44 CET,Tue Nov 23 18:19:26 CET,0.0 1.687 2.11 2.425 2.707 2.967 3.193 3.399 3.784 3.96 4.116 4.292 4.539 4.675 4.938 5.19 5.419 5.531 5.756 5.971 6.277 6.476 6.672 6.958 7.222 7.48 7.735 7.981 8.296 8.609 8.92 9.29 9.642 9.989 10.393 10.85 11.31 11.826 12.376 12.979 13.626 14.359 15.223 16.104 17.164 18.382 19.854 21.564 23.662 26.227 29.408 32.2 33.97 35.215 36.073 36.659 37.072 37.38 37.596 37.76 37.861 37.917 37.936 37.927 37.902 37.883 37.842 37.772 37.696 37.604 37.508 37.423 37.333 37.22 37.109 36.991 36.889 36.78 36.637 36.533 36.425 36.252 36.127 35.988 35.918 35.759 35.583 35.372 35.257 35.089 34.888 34.728 34.558 34.12 33.878 33.622 33.278 32.842 32.336 31.69 29.535 -7 ,27624 ,KEBNE ,16674465,Tue Nov 23 16:26:44 CET,Tue Nov 23 18:20:59 CET,0.0 1.238 1.679 1.983 2.243 2.486 2.7 2.891 3.239 3.402 3.556 3.751 3.994 4.124 4.373 4.619 4.858 4.968 5.18 5.384 5.679 5.871 6.06 6.339 6.609 6.872 7.124 7.368 7.677 7.974 8.264 8.623 8.981 9.328 9.739 10.212 10.666 11.18 11.735 12.333 12.967 13.697 14.593 15.516 16.578 17.761 19.196 20.864 22.859 25.371 28.634 31.528 33.326 34.504 35.328 35.925 36.354 36.659 36.873 37.015 37.06 37.088 37.112 37.13 37.119 37.086 37.051 36.996 36.941 36.875 36.786 36.713 36.62 36.504 36.416 36.315 36.202 36.082 35.956 35.876 35.779 35.611 35.488 35.335 35.257 35.089 34.906 34.711 34.601 34.417 34.241 34.121 33.98 33.631 33.409 33.174 32.939 32.646 32.223 31.618 28.999 -8 ,16190 ,KEBNE ,16676780,Wed Nov 24 13:21:21 CET,Wed Nov 24 15:13:46 CET,0.0 1.855 2.337 2.661 2.935 3.184 3.41 3.613 3.965 4.123 4.281 4.485 4.724 4.853 5.096 5.331 5.559 5.672 5.897 6.113 6.421 6.616 6.803 7.074 7.331 7.587 7.845 8.092 8.416 8.73 9.03 9.404 9.766 10.107 10.509 10.975 11.421 11.906 12.439 13.027 13.664 14.386 15.256 16.156 17.212 18.416 19.847 21.521 23.558 26.059 29.26 32.097 33.854 35.105 36.025 36.663 37.089 37.378 37.536 37.676 37.77 37.807 37.848 37.88 37.883 37.847 37.774 37.715 37.665 37.596 37.511 37.42 37.308 37.173 37.067 36.967 36.858 36.733 36.591 36.491 36.385 36.199 36.049 35.9 35.825 35.654 35.471 35.241 35.116 34.947 34.802 34.681 34.537 34.241 34.04 33.81 33.571 33.286 32.903 32.328 30.23 -9 ,22320 ,KEBNE ,16676781,Wed Nov 24 13:21:21 CET,Wed Nov 24 15:15:04 CET,0.0 1.54 1.963 2.285 2.552 2.785 2.99 3.176 3.527 3.691 3.841 4.032 4.271 4.406 4.671 4.921 5.153 5.262 5.473 5.685 5.994 6.188 6.377 6.652 6.916 7.176 7.433 7.679 7.996 8.308 8.606 8.962 9.322 9.671 10.083 10.573 11.034 11.533 12.086 12.693 13.339 14.081 14.962 15.868 16.971 18.227 19.717 21.427 23.427 25.86 29.099 32.015 33.787 34.938 35.705 36.242 36.621 36.889 37.037 37.127 37.181 37.23 37.272 37.259 37.203 37.146 37.086 37.026 36.942 36.843 36.726 36.609 36.491 36.35 36.235 36.127 36.017 35.882 35.726 35.62 35.5 35.297 35.152 34.992 34.905 34.709 34.479 34.233 34.106 33.916 33.682 33.499 33.321 32.935 32.699 32.416 32.087 31.709 31.276 30.698 28.272 -10 ,14756 ,KEBNE ,16676782,Wed Nov 24 13:21:21 CET,Wed Nov 24 15:15:35 CET,0.0 1.246 1.681 2.005 2.269 2.498 2.706 2.903 3.254 3.417 3.574 3.756 4.0 4.146 4.416 4.67 4.906 5.017 5.236 5.441 5.723 5.914 6.101 6.36 6.616 6.872 7.125 7.373 7.682 7.976 8.272 8.643 9.003 9.345 9.753 10.222 10.665 11.145 11.688 12.285 12.91 13.62 14.476 15.384 16.465 17.696 19.17 20.864 22.887 25.373 28.582 31.484 33.283 34.479 35.324 35.889 36.325 36.657 36.853 37.005 37.105 37.157 37.179 37.187 37.17 37.138 37.077 37.01 36.945 36.859 36.761 36.671 36.566 36.445 36.339 36.221 36.104 35.979 35.844 35.746 35.624 35.427 35.3 35.157 35.08 34.919 34.74 34.561 34.457 34.257 34.044 33.894 33.712 33.28 33.035 32.778 32.5 32.196 31.793 31.237 28.95 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_34.txt deleted file mode 100644 index fa9387a0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17487 ,KEBNE ,16674469,Tue Nov 23 16:26:44 CET,Tue Nov 23 18:18:31 CET,0.0 1.517 1.928 2.237 2.485 2.706 2.914 3.099 3.405 3.543 3.682 3.833 4.051 4.169 4.385 4.581 4.768 4.854 5.015 5.182 5.42 5.564 5.706 5.923 6.137 6.329 6.517 6.709 6.947 7.162 7.374 7.628 7.864 8.08 8.333 8.62 8.889 9.157 9.454 9.785 10.105 10.456 10.849 11.223 11.606 11.974 12.367 12.734 13.07 13.401 13.551 13.275 12.828 12.324 11.772 11.219 10.749 10.319 9.909 9.452 9.049 8.707 8.354 7.99 7.651 7.327 7.011 6.74 6.493 6.246 5.988 5.766 5.541 5.287 5.088 4.893 4.679 4.456 4.235 4.079 3.901 3.604 3.398 3.185 3.074 2.853 2.62 2.358 2.217 1.974 1.773 1.603 1.426 1.013 0.786 0.547 0.282 -0.029 -0.394 -0.892 -2.712 -2 ,16304 ,KEBNE ,16674470,Tue Nov 23 16:26:44 CET,Tue Nov 23 18:19:48 CET,0.0 1.542 1.987 2.293 2.546 2.759 2.946 3.114 3.419 3.558 3.692 3.865 4.097 4.213 4.443 4.651 4.833 4.922 5.098 5.273 5.511 5.652 5.799 6.008 6.208 6.399 6.582 6.753 6.97 7.176 7.371 7.601 7.832 8.071 8.331 8.593 8.835 9.105 9.387 9.664 9.947 10.302 10.746 11.153 11.627 12.133 12.632 13.173 13.695 14.115 14.363 14.116 13.59 12.981 12.405 11.896 11.426 10.981 10.592 10.164 9.755 9.385 9.059 8.764 8.456 8.142 7.811 7.524 7.282 7.013 6.726 6.5 6.268 6.029 5.834 5.623 5.4 5.164 4.921 4.755 4.57 4.272 4.064 3.856 3.748 3.507 3.245 2.966 2.815 2.543 2.295 2.101 1.902 1.471 1.213 0.929 0.637 0.289 -0.158 -0.718 -2.363 -3 ,8082 ,KEBNE ,16676785,Wed Nov 24 13:24:26 CET,Wed Nov 24 15:18:38 CET,0.0 1.204 1.6 1.894 2.131 2.348 2.551 2.736 3.058 3.199 3.34 3.506 3.725 3.842 4.064 4.273 4.473 4.565 4.736 4.909 5.16 5.321 5.477 5.693 5.899 6.098 6.29 6.466 6.694 6.925 7.151 7.424 7.669 7.897 8.165 8.442 8.713 9.004 9.325 9.673 9.971 10.297 10.686 11.088 11.501 11.892 12.331 12.75 13.156 13.416 13.402 13.078 12.474 11.809 11.224 10.649 10.122 9.638 9.203 8.756 8.372 7.973 7.584 7.264 6.953 6.652 6.336 6.047 5.791 5.52 5.252 5.037 4.811 4.569 4.369 4.157 3.939 3.712 3.467 3.301 3.121 2.827 2.624 2.413 2.308 2.087 1.844 1.59 1.451 1.191 1.001 0.838 0.651 0.23 0.004 -0.237 -0.525 -0.858 -1.257 -1.8 -4.235 -4 ,2939 ,KEBNE ,16674472,Tue Nov 23 16:26:45 CET,Tue Nov 23 18:22:44 CET,0.0 1.402 1.879 2.193 2.463 2.707 2.909 3.102 3.448 3.604 3.763 3.972 4.217 4.346 4.603 4.837 5.044 5.147 5.346 5.532 5.797 5.965 6.133 6.368 6.597 6.821 7.032 7.229 7.451 7.657 7.86 8.112 8.356 8.594 8.855 9.118 9.358 9.617 9.897 10.185 10.503 10.863 11.233 11.58 12.016 12.488 12.95 13.375 13.843 14.241 14.322 14.045 13.59 13.12 12.677 12.157 11.595 11.045 10.598 10.162 9.782 9.44 9.094 8.743 8.419 8.141 7.834 7.546 7.308 7.059 6.792 6.578 6.342 6.087 5.882 5.663 5.447 5.226 4.986 4.82 4.645 4.357 4.148 3.938 3.829 3.585 3.344 3.089 2.953 2.709 2.533 2.374 2.191 1.8 1.593 1.372 1.115 0.795 0.401 -0.114 -1.862 -5 ,31981 ,KEBNE ,16676787,Wed Nov 24 13:24:26 CET,Wed Nov 24 15:17:07 CET,0.0 1.47 1.908 2.235 2.507 2.768 2.986 3.173 3.523 3.677 3.835 4.025 4.25 4.371 4.605 4.826 5.044 5.148 5.339 5.522 5.79 5.959 6.121 6.342 6.541 6.736 6.926 7.109 7.344 7.569 7.794 8.065 8.303 8.521 8.773 9.064 9.325 9.589 9.88 10.189 10.512 10.861 11.251 11.618 12.019 12.478 12.976 13.414 13.814 14.167 14.356 14.068 13.457 12.829 12.26 11.718 11.182 10.667 10.217 9.7 9.245 8.872 8.527 8.203 7.895 7.611 7.29 7.012 6.788 6.541 6.249 6.003 5.763 5.5 5.286 5.052 4.802 4.545 4.261 4.073 3.905 3.65 3.459 3.247 3.136 2.918 2.692 2.444 2.308 2.065 1.87 1.711 1.527 1.12 0.921 0.707 0.459 0.139 -0.281 -0.835 -2.634 -6 ,6123 ,KEBNE ,16676788,Wed Nov 24 13:24:26 CET,Wed Nov 24 15:17:17 CET,0.0 1.425 1.795 2.093 2.339 2.54 2.721 2.893 3.215 3.36 3.496 3.654 3.878 3.994 4.219 4.429 4.623 4.715 4.892 5.057 5.29 5.44 5.587 5.793 5.985 6.175 6.367 6.548 6.781 7.006 7.212 7.464 7.707 7.935 8.195 8.484 8.742 9.026 9.347 9.69 10.028 10.385 10.818 11.237 11.672 12.08 12.441 12.841 13.24 13.498 13.48 13.027 12.499 11.995 11.467 10.942 10.435 9.921 9.507 9.1 8.709 8.346 7.988 7.62 7.27 6.952 6.611 6.312 6.07 5.792 5.489 5.251 4.996 4.717 4.512 4.304 4.079 3.851 3.607 3.428 3.235 2.914 2.7 2.489 2.377 2.15 1.909 1.644 1.507 1.253 1.051 0.895 0.741 0.4 0.184 -0.048 -0.314 -0.647 -1.039 -1.538 -2.995 -7 ,27774 ,KEBNE ,16676789,Wed Nov 24 13:25:28 CET,Wed Nov 24 15:19:23 CET,0.0 1.501 1.911 2.219 2.454 2.664 2.865 3.043 3.366 3.517 3.653 3.801 4.021 4.135 4.355 4.569 4.764 4.854 5.037 5.212 5.441 5.585 5.732 5.943 6.152 6.349 6.528 6.702 6.921 7.132 7.329 7.565 7.807 8.05 8.321 8.609 8.889 9.182 9.449 9.725 10.05 10.408 10.806 11.196 11.639 12.093 12.544 12.994 13.436 13.73 13.668 13.201 12.586 11.899 11.247 10.623 10.055 9.558 9.147 8.718 8.336 8.012 7.701 7.388 7.064 6.766 6.451 6.139 5.854 5.567 5.26 5.006 4.749 4.482 4.283 4.087 3.863 3.599 3.329 3.125 2.89 2.56 2.355 2.133 2.019 1.791 1.53 1.252 1.11 0.847 0.619 0.447 0.259 -0.168 -0.377 -0.622 -0.907 -1.228 -1.634 -2.272 -4.645 -8 ,31707 ,KEBNE ,16674476,Tue Nov 23 16:26:44 CET,Tue Nov 23 18:21:09 CET,0.0 1.606 2.011 2.319 2.564 2.78 2.978 3.141 3.433 3.577 3.713 3.867 4.088 4.21 4.448 4.662 4.868 4.964 5.141 5.314 5.553 5.705 5.854 6.072 6.292 6.506 6.7 6.88 7.109 7.323 7.525 7.76 7.988 8.216 8.473 8.743 8.997 9.287 9.613 9.958 10.303 10.687 11.101 11.457 11.848 12.265 12.696 13.092 13.452 13.711 13.766 13.454 12.912 12.342 11.799 11.218 10.708 10.277 9.871 9.444 9.041 8.668 8.293 7.91 7.538 7.19 6.831 6.505 6.224 5.93 5.615 5.36 5.101 4.846 4.654 4.452 4.225 3.989 3.757 3.584 3.377 3.021 2.778 2.534 2.417 2.189 1.945 1.683 1.541 1.296 1.103 0.942 0.766 0.357 0.136 -0.117 -0.409 -0.739 -1.132 -1.688 -3.6 -9 ,19360 ,KEBNE ,16674477,Tue Nov 23 16:26:44 CET,Tue Nov 23 18:19:18 CET,0.0 1.362 1.735 2.029 2.285 2.497 2.692 2.871 3.177 3.312 3.452 3.618 3.849 3.974 4.196 4.393 4.58 4.671 4.85 5.025 5.272 5.42 5.564 5.774 5.975 6.17 6.352 6.521 6.752 6.975 7.175 7.406 7.625 7.855 8.119 8.39 8.648 8.927 9.216 9.53 9.866 10.221 10.589 10.934 11.35 11.816 12.241 12.572 12.906 13.166 13.115 12.521 11.884 11.351 10.773 10.133 9.555 9.027 8.56 8.096 7.706 7.363 7.028 6.707 6.396 6.108 5.79 5.479 5.208 4.937 4.637 4.369 4.092 3.801 3.572 3.339 3.095 2.838 2.575 2.394 2.212 1.926 1.737 1.552 1.447 1.217 0.972 0.721 0.589 0.34 0.138 -0.026 -0.208 -0.613 -0.825 -1.058 -1.317 -1.611 -1.959 -2.465 -4.078 -10 ,31252 ,KEBNE ,16674478,Tue Nov 23 16:26:44 CET,Tue Nov 23 18:00:52 CET,0.0 1.553 1.982 2.271 2.5 2.704 2.892 3.072 3.401 3.543 3.677 3.821 4.026 4.128 4.328 4.514 4.691 4.781 4.957 5.119 5.358 5.515 5.655 5.845 6.033 6.218 6.403 6.588 6.823 7.046 7.256 7.512 7.757 7.982 8.234 8.521 8.773 9.047 9.382 9.731 10.057 10.422 10.844 11.237 11.69 12.163 12.592 12.933 13.248 13.504 13.454 12.993 12.439 11.861 11.262 10.647 10.14 9.7 9.262 8.805 8.404 8.02 7.627 7.249 6.905 6.584 6.251 5.961 5.714 5.446 5.163 4.941 4.712 4.465 4.267 4.062 3.838 3.613 3.384 3.224 3.054 2.773 2.577 2.368 2.263 2.057 1.838 1.593 1.461 1.214 0.993 0.815 0.626 0.183 -0.043 -0.265 -0.525 -0.833 -1.216 -1.796 -3.597 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_49.txt deleted file mode 100644 index 9c4431fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_49.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29265 ,KEBNE ,16674499,Tue Nov 23 16:37:11 CET,Tue Nov 23 18:30:12 CET,0.0 0.774 1.108 1.339 1.56 1.763 1.924 2.074 2.354 2.477 2.594 2.714 2.923 3.028 3.206 3.375 3.545 3.63 3.793 3.942 4.16 4.305 4.44 4.623 4.801 4.97 5.117 5.259 5.442 5.615 5.78 5.968 6.151 6.332 6.544 6.774 6.97 7.186 7.434 7.699 7.966 8.256 8.576 8.877 9.225 9.581 9.952 10.338 10.739 11.112 11.36 11.316 11.06 10.745 10.402 10.033 9.67 9.32 9.007 8.681 8.383 8.091 7.795 7.518 7.259 7.027 6.791 6.572 6.379 6.161 5.923 5.724 5.517 5.314 5.151 4.973 4.787 4.579 4.363 4.206 4.043 3.812 3.654 3.477 3.379 3.152 2.906 2.666 2.54 2.308 2.092 1.907 1.714 1.276 1.037 0.782 0.48 0.132 -0.309 -1.022 -3.675 -3 ,9935 ,KEBNE ,16674501,Tue Nov 23 16:37:11 CET,Tue Nov 23 18:30:11 CET,0.0 1.042 1.405 1.674 1.901 2.109 2.281 2.441 2.743 2.873 3.006 3.151 3.359 3.456 3.639 3.811 3.975 4.055 4.207 4.352 4.561 4.693 4.815 4.98 5.14 5.298 5.453 5.608 5.801 5.988 6.167 6.373 6.571 6.761 6.979 7.214 7.423 7.647 7.884 8.152 8.41 8.689 9.022 9.354 9.751 10.142 10.539 10.93 11.351 11.763 12.032 11.925 11.624 11.301 10.968 10.62 10.29 9.948 9.59 9.238 8.949 8.668 8.399 8.154 7.897 7.634 7.36 7.115 6.914 6.699 6.455 6.247 6.034 5.81 5.637 5.461 5.256 5.021 4.78 4.613 4.442 4.158 3.958 3.758 3.661 3.472 3.259 3.017 2.879 2.624 2.412 2.253 2.093 1.747 1.513 1.227 0.883 0.483 -0.014 -0.715 -3.556 -4 ,775 ,KEBNE ,16674502,Tue Nov 23 16:37:12 CET,Tue Nov 23 18:31:05 CET,0.0 1.229 1.61 1.863 2.091 2.289 2.467 2.64 2.947 3.084 3.217 3.357 3.563 3.663 3.861 4.059 4.239 4.32 4.487 4.637 4.84 4.973 5.097 5.264 5.429 5.583 5.726 5.865 6.036 6.203 6.36 6.547 6.74 6.926 7.132 7.358 7.571 7.803 8.043 8.293 8.549 8.828 9.143 9.455 9.81 10.189 10.599 11.018 11.43 11.771 11.95 11.788 11.46 11.018 10.6 10.231 9.854 9.489 9.161 8.808 8.494 8.189 7.865 7.566 7.292 7.03 6.76 6.514 6.284 6.025 5.756 5.538 5.304 5.06 4.869 4.659 4.416 4.164 3.897 3.705 3.523 3.255 3.069 2.858 2.733 2.487 2.24 1.966 1.824 1.57 1.326 1.156 1.002 0.651 0.425 0.169 -0.137 -0.503 -0.97 -1.688 -5.046 -5 ,12521 ,KEBNE ,16674503,Tue Nov 23 16:50:47 CET,Tue Nov 23 18:44:12 CET,0.0 0.936 1.302 1.598 1.855 2.066 2.255 2.42 2.702 2.834 2.954 3.07 3.276 3.377 3.562 3.736 3.915 4.004 4.17 4.318 4.539 4.676 4.797 4.985 5.164 5.329 5.484 5.637 5.84 6.035 6.207 6.402 6.591 6.776 6.988 7.214 7.431 7.664 7.899 8.157 8.432 8.728 9.071 9.396 9.752 10.114 10.501 10.917 11.326 11.717 11.99 11.887 11.57 11.173 10.79 10.386 10.02 9.697 9.383 9.047 8.731 8.449 8.194 7.924 7.65 7.404 7.134 6.897 6.71 6.502 6.26 6.056 5.835 5.585 5.401 5.227 5.04 4.846 4.636 4.47 4.302 4.019 3.822 3.63 3.526 3.313 3.081 2.824 2.676 2.418 2.194 2.003 1.787 1.325 1.072 0.797 0.484 0.094 -0.393 -1.054 -3.877 -6 ,2183 ,KEBNE ,16676798,Wed Nov 24 13:34:42 CET,Wed Nov 24 15:26:58 CET,0.0 0.952 1.32 1.596 1.828 2.023 2.197 2.359 2.663 2.796 2.919 3.062 3.273 3.374 3.56 3.74 3.906 3.985 4.141 4.29 4.488 4.611 4.736 4.907 5.062 5.221 5.374 5.516 5.694 5.87 6.033 6.224 6.403 6.573 6.777 7.002 7.211 7.427 7.673 7.941 8.202 8.484 8.799 9.117 9.472 9.831 10.232 10.669 11.075 11.405 11.624 11.588 11.373 11.043 10.66 10.275 9.913 9.571 9.229 8.876 8.58 8.302 8.018 7.735 7.445 7.149 6.856 6.606 6.377 6.142 5.908 5.722 5.524 5.301 5.122 4.918 4.706 4.5 4.281 4.132 3.974 3.716 3.526 3.315 3.2 2.971 2.759 2.508 2.368 2.128 1.909 1.738 1.56 1.173 0.93 0.669 0.378 -0.006 -0.485 -1.136 -3.775 -7 ,4210 ,KEBNE ,16674505,Tue Nov 23 17:02:17 CET,Tue Nov 23 18:54:14 CET,0.0 0.863 1.259 1.555 1.783 1.98 2.161 2.334 2.654 2.796 2.919 3.044 3.252 3.352 3.535 3.702 3.871 3.954 4.104 4.246 4.448 4.578 4.704 4.886 5.054 5.207 5.36 5.51 5.701 5.874 6.047 6.263 6.453 6.635 6.844 7.08 7.306 7.548 7.795 8.042 8.296 8.576 8.901 9.226 9.573 9.937 10.333 10.741 11.159 11.494 11.71 11.658 11.405 11.07 10.734 10.415 10.104 9.805 9.533 9.23 8.956 8.682 8.395 8.112 7.835 7.578 7.313 7.085 6.88 6.658 6.434 6.251 6.052 5.845 5.677 5.481 5.268 5.04 4.815 4.67 4.512 4.256 4.081 3.901 3.801 3.589 3.369 3.121 2.971 2.714 2.476 2.304 2.13 1.694 1.44 1.152 0.812 0.447 -0.035 -0.651 -3.258 -8 ,6857 ,KEBNE ,16676800,Wed Nov 24 13:34:42 CET,Wed Nov 24 15:26:31 CET,0.0 0.955 1.321 1.612 1.839 2.045 2.235 2.392 2.681 2.81 2.924 3.034 3.235 3.336 3.536 3.723 3.875 3.947 4.091 4.229 4.429 4.56 4.686 4.876 5.053 5.212 5.363 5.51 5.699 5.878 6.055 6.27 6.467 6.643 6.844 7.071 7.278 7.505 7.749 8.001 8.273 8.585 8.921 9.218 9.561 9.943 10.35 10.762 11.196 11.668 12.013 11.956 11.761 11.477 11.16 10.823 10.484 10.141 9.817 9.499 9.21 8.937 8.656 8.384 8.125 7.86 7.584 7.323 7.084 6.847 6.602 6.405 6.194 5.983 5.832 5.65 5.448 5.239 5.027 4.884 4.739 4.507 4.336 4.139 4.042 3.853 3.625 3.364 3.229 2.996 2.812 2.651 2.47 2.084 1.868 1.617 1.321 0.964 0.499 -0.173 -2.672 -9 ,13033 ,KEBNE ,16674507,Tue Nov 23 17:02:16 CET,Tue Nov 23 18:54:36 CET,0.0 1.014 1.355 1.623 1.835 2.019 2.19 2.334 2.593 2.727 2.856 3.01 3.225 3.32 3.496 3.676 3.85 3.928 4.074 4.21 4.414 4.55 4.683 4.876 5.053 5.219 5.37 5.52 5.716 5.888 6.053 6.252 6.436 6.614 6.827 7.052 7.253 7.471 7.713 7.968 8.224 8.507 8.828 9.141 9.489 9.848 10.25 10.658 11.016 11.335 11.554 11.408 11.012 10.612 10.224 9.793 9.381 8.982 8.63 8.247 7.906 7.633 7.359 7.073 6.799 6.543 6.255 5.988 5.758 5.518 5.26 5.036 4.798 4.558 4.366 4.154 3.932 3.677 3.406 3.222 3.04 2.753 2.548 2.341 2.237 2.024 1.756 1.457 1.3 1.028 0.793 0.616 0.413 -0.073 -0.333 -0.611 -0.967 -1.416 -2.011 -2.846 -6.815 -10 ,6507 ,KEBNE ,16676802,Wed Nov 24 13:36:44 CET,Wed Nov 24 15:30:38 CET,0.0 0.85 1.194 1.455 1.675 1.885 2.084 2.261 2.56 2.69 2.814 2.96 3.181 3.29 3.494 3.681 3.85 3.924 4.069 4.227 4.453 4.583 4.71 4.895 5.073 5.236 5.388 5.531 5.708 5.887 6.071 6.294 6.504 6.697 6.9 7.126 7.355 7.588 7.816 8.069 8.348 8.657 8.998 9.318 9.687 10.063 10.454 10.867 11.309 11.77 12.098 12.11 11.947 11.689 11.39 11.064 10.719 10.394 10.104 9.795 9.51 9.241 8.954 8.679 8.443 8.226 7.976 7.741 7.542 7.341 7.129 6.941 6.739 6.528 6.362 6.175 5.991 5.825 5.657 5.532 5.389 5.158 5.0 4.833 4.746 4.537 4.313 4.097 3.975 3.74 3.533 3.366 3.19 2.808 2.566 2.27 1.922 1.547 1.098 0.458 -1.869 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_62.txt deleted file mode 100644 index ffb0a6d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7922 ,KEBNE ,17023829,Wed Dec 22 08:29:22 CET,Wed Dec 22 10:21:04 CET,0.0 0.93 1.317 1.594 1.829 2.05 2.246 2.419 2.724 2.874 3.019 3.184 3.408 3.523 3.746 3.946 4.131 4.223 4.403 4.566 4.798 4.952 5.107 5.329 5.532 5.72 5.903 6.093 6.344 6.579 6.807 7.072 7.321 7.593 7.905 8.217 8.517 8.854 9.218 9.592 9.987 10.466 11.022 11.568 12.19 12.856 13.627 14.519 15.548 16.78 18.309 19.451 20.006 20.27 20.336 20.278 20.187 20.09 19.988 19.868 19.755 19.644 19.494 19.324 19.178 19.033 18.852 18.684 18.539 18.375 18.188 18.03 17.876 17.706 17.554 17.407 17.269 17.116 16.945 16.825 16.69 16.459 16.297 16.129 16.047 15.863 15.643 15.41 15.294 15.086 14.901 14.757 14.614 14.274 14.085 13.9 13.655 13.31 12.944 12.45 10.571 -2 ,9900 ,KEBNE ,17023830,Wed Dec 22 08:29:22 CET,Wed Dec 22 10:21:13 CET,0.0 0.744 1.089 1.357 1.574 1.775 1.968 2.153 2.476 2.611 2.74 2.895 3.123 3.241 3.448 3.643 3.829 3.92 4.102 4.279 4.527 4.678 4.822 5.029 5.222 5.409 5.599 5.78 6.027 6.272 6.496 6.761 7.011 7.258 7.536 7.842 8.138 8.456 8.804 9.164 9.546 9.983 10.491 11.021 11.637 12.325 13.087 13.89 14.804 15.885 17.137 18.071 18.506 18.658 18.7 18.673 18.597 18.458 18.31 18.125 17.908 17.711 17.515 17.328 17.157 16.981 16.79 16.617 16.459 16.293 16.118 15.965 15.791 15.594 15.435 15.277 15.122 14.953 14.766 14.636 14.488 14.229 14.04 13.853 13.758 13.559 13.343 13.104 12.981 12.76 12.55 12.398 12.23 11.803 11.583 11.348 11.076 10.773 10.385 9.855 7.493 -3 ,18971 ,KEBNE ,17023831,Wed Dec 22 08:29:22 CET,Wed Dec 22 10:21:41 CET,0.0 0.963 1.361 1.676 1.936 2.152 2.36 2.543 2.862 3.017 3.158 3.298 3.521 3.648 3.871 4.077 4.267 4.357 4.543 4.72 4.966 5.127 5.281 5.5 5.712 5.916 6.113 6.293 6.519 6.742 6.954 7.207 7.448 7.682 7.963 8.273 8.561 8.876 9.22 9.598 9.986 10.429 10.956 11.482 12.095 12.777 13.562 14.445 15.488 16.767 18.232 19.159 19.544 19.708 19.73 19.634 19.505 19.395 19.248 19.058 18.873 18.685 18.491 18.314 18.166 18.011 17.83 17.67 17.526 17.35 17.15 16.987 16.828 16.658 16.514 16.367 16.199 16.015 15.824 15.69 15.551 15.325 15.162 14.985 14.892 14.694 14.478 14.24 14.112 13.889 13.681 13.52 13.338 12.849 12.549 12.226 11.857 11.419 10.863 10.082 7.632 -4 ,4442 ,KEBNE ,17023832,Wed Dec 22 08:30:23 CET,Wed Dec 22 10:22:14 CET,0.0 0.853 1.221 1.481 1.703 1.911 2.098 2.264 2.568 2.706 2.835 2.985 3.203 3.311 3.528 3.717 3.896 3.985 4.144 4.302 4.554 4.709 4.845 5.049 5.25 5.435 5.612 5.786 6.011 6.229 6.434 6.674 6.925 7.172 7.439 7.735 8.015 8.329 8.689 9.073 9.462 9.897 10.392 10.882 11.491 12.173 12.929 13.784 14.81 16.003 17.443 18.482 18.916 19.097 19.094 19.017 18.942 18.789 18.598 18.424 18.256 18.098 17.949 17.782 17.591 17.388 17.172 16.974 16.8 16.634 16.475 16.349 16.189 16.0 15.862 15.705 15.535 15.348 15.145 15.01 14.885 14.68 14.528 14.367 14.277 14.078 13.854 13.621 13.495 13.279 13.081 12.922 12.756 12.402 12.214 12.016 11.783 11.475 11.058 10.497 8.457 -5 ,14969 ,KEBNE ,17023833,Wed Dec 22 08:30:23 CET,Wed Dec 22 10:24:33 CET,0.0 0.972 1.38 1.688 1.923 2.127 2.319 2.496 2.794 2.934 3.071 3.222 3.442 3.559 3.771 3.961 4.135 4.226 4.403 4.56 4.792 4.946 5.095 5.304 5.502 5.687 5.868 6.052 6.284 6.5 6.713 6.979 7.227 7.462 7.739 8.038 8.321 8.642 8.973 9.32 9.691 10.128 10.655 11.178 11.77 12.436 13.2 14.029 15.007 16.157 17.381 18.188 18.509 18.648 18.663 18.59 18.486 18.342 18.184 17.994 17.827 17.66 17.482 17.314 17.136 16.956 16.741 16.536 16.35 16.12 15.871 15.682 15.5 15.311 15.151 14.974 14.792 14.604 14.403 14.26 14.116 13.908 13.746 13.553 13.454 13.263 13.054 12.827 12.71 12.48 12.265 12.102 11.927 11.548 11.337 11.102 10.83 10.514 10.123 9.581 7.9 -6 ,4866 ,KEBNE ,17023834,Wed Dec 22 08:30:23 CET,Wed Dec 22 10:22:49 CET,0.0 1.046 1.394 1.665 1.901 2.126 2.336 2.512 2.823 2.966 3.095 3.252 3.472 3.582 3.806 4.013 4.198 4.287 4.464 4.627 4.847 4.995 5.145 5.347 5.544 5.743 5.927 6.105 6.338 6.562 6.774 7.035 7.291 7.522 7.792 8.11 8.405 8.723 9.076 9.447 9.845 10.324 10.863 11.39 11.998 12.671 13.458 14.317 15.324 16.488 17.802 18.725 19.156 19.343 19.382 19.329 19.25 19.123 18.986 18.856 18.699 18.535 18.364 18.178 18.011 17.846 17.638 17.463 17.305 17.126 16.953 16.81 16.663 16.497 16.358 16.221 16.073 15.902 15.71 15.57 15.423 15.197 15.046 14.891 14.812 14.627 14.424 14.216 14.097 13.889 13.704 13.552 13.395 13.001 12.781 12.556 12.287 11.96 11.58 11.114 9.86 -7 ,12375 ,KEBNE ,17023835,Wed Dec 22 08:31:25 CET,Wed Dec 22 10:24:19 CET,0.0 1.014 1.399 1.673 1.918 2.126 2.308 2.483 2.818 2.973 3.113 3.268 3.497 3.615 3.842 4.051 4.234 4.33 4.517 4.689 4.931 5.077 5.217 5.429 5.629 5.822 6.02 6.215 6.462 6.692 6.915 7.175 7.424 7.667 7.943 8.246 8.538 8.863 9.228 9.62 10.026 10.49 11.031 11.577 12.219 12.94 13.755 14.68 15.74 16.912 18.287 19.378 19.943 20.23 20.338 20.294 20.21 20.111 19.985 19.831 19.653 19.476 19.3 19.115 18.924 18.745 18.555 18.366 18.204 18.037 17.869 17.714 17.536 17.348 17.191 17.028 16.868 16.695 16.491 16.349 16.2 15.967 15.786 15.587 15.494 15.309 15.113 14.898 14.78 14.559 14.371 14.224 14.061 13.682 13.456 13.214 12.95 12.641 12.246 11.665 9.596 -8 ,31377 ,KEBNE ,17023836,Wed Dec 22 08:32:27 CET,Wed Dec 22 10:25:02 CET,0.0 1.124 1.506 1.78 2.022 2.254 2.456 2.627 2.93 3.072 3.208 3.364 3.576 3.683 3.897 4.103 4.292 4.381 4.558 4.73 4.978 5.13 5.283 5.509 5.706 5.897 6.09 6.272 6.498 6.709 6.925 7.183 7.422 7.659 7.95 8.271 8.556 8.877 9.234 9.601 9.992 10.442 10.939 11.437 12.05 12.726 13.489 14.331 15.295 16.468 17.812 18.696 19.091 19.263 19.287 19.201 19.06 18.911 18.75 18.576 18.401 18.2 18.005 17.808 17.604 17.423 17.223 17.039 16.895 16.734 16.539 16.37 16.179 15.97 15.819 15.66 15.484 15.294 15.089 14.947 14.811 14.606 14.445 14.272 14.184 13.987 13.778 13.543 13.417 13.2 13.018 12.868 12.702 12.349 12.14 11.917 11.67 11.365 11.002 10.483 8.496 -9 ,4380 ,KEBNE ,17023837,Wed Dec 22 08:32:26 CET,Wed Dec 22 10:25:06 CET,0.0 1.045 1.417 1.697 1.928 2.148 2.348 2.523 2.848 2.997 3.131 3.274 3.491 3.614 3.836 4.029 4.218 4.312 4.486 4.656 4.909 5.067 5.223 5.45 5.658 5.853 6.047 6.237 6.476 6.709 6.926 7.188 7.448 7.699 7.989 8.301 8.59 8.912 9.262 9.633 10.036 10.488 11.004 11.541 12.146 12.818 13.631 14.539 15.621 16.947 18.501 19.582 20.104 20.408 20.487 20.452 20.336 20.137 19.979 19.846 19.682 19.493 19.317 19.155 18.983 18.802 18.603 18.412 18.228 18.029 17.811 17.625 17.429 17.223 17.081 16.93 16.759 16.572 16.356 16.212 16.061 15.815 15.64 15.467 15.373 15.158 14.92 14.66 14.533 14.312 14.128 13.988 13.822 13.446 13.239 12.987 12.693 12.368 11.985 11.494 9.821 -10 ,18138 ,KEBNE ,17023838,Wed Dec 22 08:33:28 CET,Wed Dec 22 10:25:35 CET,0.0 0.936 1.311 1.613 1.875 2.078 2.249 2.43 2.754 2.901 3.043 3.193 3.409 3.523 3.737 3.937 4.125 4.214 4.385 4.556 4.808 4.964 5.113 5.326 5.532 5.733 5.922 6.098 6.33 6.567 6.795 7.058 7.306 7.549 7.834 8.15 8.458 8.805 9.169 9.553 9.96 10.416 10.953 11.494 12.127 12.837 13.657 14.569 15.641 16.822 18.084 19.062 19.539 19.765 19.827 19.777 19.685 19.568 19.463 19.321 19.147 18.975 18.8 18.6 18.424 18.252 18.02 17.817 17.647 17.453 17.218 17.002 16.782 16.565 16.391 16.208 16.01 15.804 15.593 15.433 15.27 15.018 14.845 14.663 14.569 14.381 14.186 13.973 13.838 13.607 13.4 13.237 13.06 12.68 12.476 12.259 12.014 11.701 11.331 10.84 9.403 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_63.txt deleted file mode 100644 index 25e63a1c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3883 ,KEBNE ,17069434,Fri Dec 24 04:02:03 CET,Fri Dec 24 05:55:52 CET,0.0 1.01 1.407 1.697 1.96 2.181 2.377 2.564 2.887 3.021 3.143 3.279 3.495 3.599 3.803 3.991 4.167 4.25 4.404 4.56 4.78 4.918 5.06 5.262 5.445 5.622 5.788 5.955 6.177 6.376 6.552 6.764 6.98 7.189 7.43 7.703 7.95 8.2 8.469 8.761 9.052 9.384 9.771 10.139 10.568 11.055 11.596 12.15 12.777 13.489 14.162 14.448 14.435 14.307 14.114 13.877 13.654 13.441 13.234 12.993 12.768 12.542 12.32 12.131 11.955 11.771 11.569 11.399 11.247 11.072 10.875 10.709 10.541 10.358 10.203 10.038 9.867 9.69 9.508 9.38 9.23 8.983 8.813 8.634 8.543 8.362 8.16 7.921 7.79 7.564 7.38 7.23 7.076 6.722 6.518 6.307 6.093 5.825 5.484 5.028 3.413 -2 ,13852 ,KEBNE ,17069436,Fri Dec 24 04:02:03 CET,Fri Dec 24 05:56:38 CET,0.0 0.968 1.346 1.639 1.894 2.106 2.289 2.453 2.754 2.891 3.017 3.177 3.415 3.536 3.757 3.956 4.134 4.217 4.375 4.535 4.764 4.899 5.034 5.229 5.419 5.597 5.765 5.922 6.114 6.309 6.501 6.727 6.941 7.143 7.384 7.67 7.932 8.182 8.449 8.763 9.084 9.435 9.845 10.236 10.66 11.125 11.662 12.216 12.763 13.326 13.945 14.256 14.211 13.984 13.704 13.459 13.218 12.948 12.696 12.417 12.171 11.968 11.777 11.57 11.353 11.144 10.927 10.728 10.558 10.379 10.179 10.011 9.829 9.634 9.485 9.319 9.14 8.957 8.768 8.638 8.5 8.285 8.126 7.963 7.88 7.699 7.497 7.273 7.16 6.948 6.799 6.654 6.5 6.168 5.98 5.771 5.52 5.213 4.852 4.421 2.9 -3 ,26691 ,KEBNE ,17069438,Fri Dec 24 04:04:08 CET,Fri Dec 24 05:56:06 CET,0.0 0.86 1.242 1.507 1.727 1.927 2.126 2.312 2.654 2.807 2.937 3.078 3.3 3.409 3.61 3.794 3.977 4.067 4.248 4.423 4.664 4.811 4.95 5.163 5.366 5.552 5.724 5.879 6.086 6.284 6.464 6.677 6.878 7.08 7.305 7.556 7.791 8.04 8.306 8.576 8.871 9.2 9.572 9.946 10.355 10.806 11.344 11.936 12.512 13.065 13.587 13.688 13.597 13.423 13.158 12.87 12.555 12.223 11.928 11.614 11.3 10.992 10.711 10.459 10.23 10.022 9.775 9.523 9.307 9.101 8.889 8.709 8.517 8.295 8.124 7.962 7.788 7.591 7.387 7.252 7.11 6.88 6.709 6.515 6.415 6.217 5.996 5.74 5.601 5.369 5.206 5.062 4.898 4.525 4.328 4.105 3.839 3.547 3.167 2.609 1.016 -4 ,23271 ,KEBNE ,17069440,Fri Dec 24 04:04:09 CET,Fri Dec 24 05:58:04 CET,0.0 1.013 1.39 1.696 1.961 2.178 2.362 2.536 2.827 2.957 3.086 3.228 3.443 3.554 3.767 3.963 4.15 4.238 4.409 4.581 4.814 4.961 5.099 5.281 5.454 5.626 5.795 5.961 6.156 6.333 6.511 6.715 6.904 7.088 7.305 7.56 7.801 8.073 8.363 8.659 8.971 9.319 9.715 10.1 10.549 11.024 11.557 12.148 12.821 13.538 14.194 14.501 14.492 14.363 14.188 13.971 13.723 13.474 13.221 12.94 12.708 12.495 12.29 12.105 11.919 11.742 11.547 11.337 11.138 10.949 10.763 10.601 10.434 10.266 10.124 9.97 9.803 9.624 9.442 9.306 9.172 8.968 8.812 8.642 8.554 8.376 8.18 7.948 7.825 7.611 7.424 7.26 7.096 6.763 6.564 6.331 6.055 5.734 5.347 4.799 3.151 -5 ,578 ,KEBNE ,17069442,Fri Dec 24 04:08:21 CET,Fri Dec 24 06:01:11 CET,0.0 1.15 1.506 1.794 2.044 2.252 2.445 2.624 2.95 3.086 3.214 3.366 3.587 3.7 3.916 4.13 4.332 4.422 4.59 4.746 4.96 5.093 5.224 5.42 5.607 5.786 5.953 6.109 6.305 6.496 6.678 6.9 7.121 7.316 7.536 7.795 8.042 8.315 8.615 8.917 9.212 9.557 9.978 10.374 10.804 11.284 11.824 12.392 13.039 13.675 14.186 14.419 14.423 14.284 14.053 13.773 13.491 13.207 12.948 12.665 12.395 12.155 11.938 11.737 11.535 11.345 11.128 10.918 10.746 10.565 10.36 10.184 9.996 9.792 9.64 9.488 9.317 9.138 8.96 8.839 8.71 8.499 8.336 8.152 8.056 7.857 7.659 7.445 7.324 7.091 6.897 6.747 6.596 6.264 6.045 5.794 5.519 5.201 4.829 4.294 2.598 -6 ,28496 ,KEBNE ,17069444,Fri Dec 24 04:13:38 CET,Fri Dec 24 06:07:54 CET,0.0 0.823 1.196 1.507 1.763 1.975 2.168 2.352 2.661 2.796 2.926 3.054 3.26 3.367 3.565 3.748 3.927 4.012 4.176 4.331 4.552 4.691 4.824 5.016 5.195 5.374 5.548 5.709 5.911 6.114 6.319 6.56 6.783 7.012 7.274 7.535 7.771 8.029 8.316 8.621 8.939 9.287 9.666 10.052 10.503 10.971 11.465 12.022 12.659 13.335 14.002 14.294 14.186 13.995 13.769 13.508 13.253 12.993 12.765 12.468 12.198 11.984 11.76 11.528 11.274 11.025 10.763 10.539 10.37 10.187 9.972 9.787 9.581 9.349 9.18 9.017 8.849 8.666 8.458 8.327 8.193 7.956 7.787 7.624 7.537 7.349 7.143 6.899 6.775 6.56 6.371 6.216 6.062 5.715 5.517 5.297 5.036 4.73 4.355 3.842 2.128 -7 ,28848 ,KEBNE ,17069446,Fri Dec 24 04:28:26 CET,Fri Dec 24 06:20:57 CET,0.0 0.891 1.211 1.46 1.673 1.88 2.069 2.236 2.544 2.689 2.827 2.976 3.189 3.303 3.517 3.71 3.885 3.965 4.122 4.278 4.501 4.637 4.776 4.982 5.172 5.356 5.525 5.687 5.905 6.111 6.297 6.519 6.732 6.939 7.164 7.415 7.651 7.914 8.213 8.509 8.811 9.157 9.538 9.916 10.36 10.835 11.359 11.895 12.473 13.084 13.683 13.884 13.767 13.629 13.408 13.101 12.819 12.564 12.312 12.026 11.759 11.507 11.261 11.036 10.809 10.586 10.366 10.144 9.945 9.754 9.557 9.399 9.23 9.027 8.86 8.691 8.517 8.337 8.143 8.013 7.877 7.648 7.474 7.29 7.199 7.006 6.799 6.587 6.477 6.256 6.055 5.896 5.744 5.397 5.173 4.927 4.658 4.317 3.902 3.397 1.754 -8 ,16898 ,KEBNE ,17069449,Fri Dec 24 04:36:55 CET,Fri Dec 24 06:29:48 CET,0.0 0.927 1.298 1.588 1.825 2.034 2.22 2.399 2.711 2.845 2.972 3.124 3.341 3.439 3.64 3.849 4.049 4.142 4.306 4.464 4.69 4.834 4.976 5.161 5.329 5.504 5.676 5.837 6.044 6.24 6.419 6.631 6.843 7.047 7.274 7.526 7.767 8.03 8.314 8.62 8.937 9.278 9.65 10.016 10.445 10.895 11.378 11.906 12.522 13.218 13.856 14.058 14.012 13.897 13.705 13.471 13.234 12.974 12.721 12.468 12.259 12.07 11.838 11.601 11.403 11.223 11.018 10.838 10.677 10.497 10.313 10.149 9.971 9.785 9.646 9.503 9.355 9.191 9.006 8.881 8.753 8.544 8.382 8.199 8.098 7.903 7.724 7.536 7.436 7.237 7.09 6.953 6.81 6.493 6.305 6.106 5.854 5.537 5.161 4.665 2.587 -9 ,30813 ,KEBNE ,17069451,Fri Dec 24 04:53:49 CET,Fri Dec 24 06:47:37 CET,0.0 1.066 1.455 1.762 1.999 2.202 2.376 2.542 2.857 2.998 3.123 3.27 3.489 3.598 3.809 4.002 4.176 4.265 4.434 4.587 4.802 4.934 5.063 5.254 5.43 5.6 5.772 5.929 6.129 6.327 6.511 6.728 6.935 7.137 7.371 7.617 7.854 8.12 8.399 8.678 8.956 9.268 9.625 9.972 10.356 10.776 11.236 11.716 12.257 12.852 13.472 13.806 13.837 13.721 13.517 13.275 13.023 12.778 12.535 12.239 11.975 11.732 11.499 11.262 11.029 10.837 10.629 10.406 10.209 10.026 9.826 9.655 9.484 9.287 9.109 8.935 8.752 8.557 8.366 8.223 8.069 7.818 7.648 7.469 7.367 7.163 6.96 6.714 6.587 6.372 6.192 6.042 5.888 5.519 5.319 5.123 4.899 4.616 4.254 3.703 1.875 -10 ,12131 ,KEBNE ,17069453,Fri Dec 24 04:55:55 CET,Fri Dec 24 06:47:58 CET,0.0 1.103 1.483 1.788 2.022 2.222 2.411 2.59 2.922 3.073 3.213 3.367 3.587 3.696 3.915 4.115 4.289 4.375 4.557 4.729 4.955 5.093 5.222 5.416 5.603 5.771 5.931 6.09 6.302 6.508 6.709 6.948 7.169 7.384 7.629 7.883 8.126 8.39 8.675 8.976 9.274 9.622 10.029 10.41 10.845 11.309 11.812 12.354 12.981 13.675 14.355 14.663 14.593 14.383 14.144 13.89 13.639 13.381 13.152 12.912 12.679 12.454 12.213 11.97 11.76 11.569 11.364 11.17 10.988 10.815 10.641 10.477 10.304 10.114 9.956 9.795 9.627 9.458 9.274 9.14 9.003 8.802 8.665 8.496 8.395 8.198 7.995 7.761 7.637 7.406 7.213 7.058 6.902 6.549 6.348 6.131 5.882 5.59 5.234 4.725 3.493 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_29.txt deleted file mode 100644 index cf130e95..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2102 ,KEBNE ,16676803,Wed Nov 24 13:36:44 CET,Wed Nov 24 15:29:17 CET,0.0 1.293 1.744 2.099 2.395 2.679 2.951 3.197 3.643 3.851 4.053 4.327 4.618 4.8 5.132 5.441 5.743 5.89 6.183 6.473 6.892 7.157 7.414 7.796 8.177 8.567 8.955 9.326 9.8 10.256 10.687 11.189 11.684 12.179 12.756 13.413 14.051 14.768 15.599 16.506 17.444 18.509 19.803 21.179 22.828 24.704 26.964 29.674 33.034 37.255 42.854 48.016 51.462 53.896 55.645 57.003 58.02 58.83 59.448 59.977 60.354 60.629 60.865 61.066 61.227 61.348 61.431 61.47 61.508 61.548 61.57 61.58 61.569 61.545 61.526 61.487 61.426 61.365 61.29 61.226 61.147 61.021 60.93 60.811 60.742 60.581 60.399 60.193 60.08 59.913 59.69 59.543 59.377 58.994 58.769 58.494 58.154 57.715 57.121 56.229 52.658 -2 ,25998 ,KEBNE ,16676804,Wed Nov 24 13:37:46 CET,Wed Nov 24 15:31:17 CET,0.0 1.496 1.997 2.358 2.668 2.963 3.237 3.481 3.924 4.134 4.334 4.602 4.892 5.076 5.422 5.745 6.057 6.21 6.511 6.799 7.222 7.502 7.773 8.167 8.553 8.93 9.301 9.664 10.127 10.56 10.977 11.487 11.985 12.474 13.047 13.708 14.365 15.085 15.881 16.752 17.67 18.733 19.993 21.303 22.895 24.742 26.979 29.621 32.943 37.198 42.776 47.981 51.429 53.881 55.677 57.023 58.041 58.839 59.454 59.989 60.391 60.696 60.936 61.155 61.317 61.429 61.543 61.632 61.696 61.745 61.776 61.787 61.785 61.774 61.744 61.692 61.634 61.555 61.455 61.391 61.322 61.16 61.037 60.921 60.857 60.725 60.563 60.366 60.26 60.095 59.836 59.658 59.46 58.986 58.723 58.448 58.114 57.681 57.082 56.2 52.634 -3 ,23066 ,KEBNE ,16676805,Wed Nov 24 13:37:46 CET,Wed Nov 24 15:28:55 CET,0.0 1.251 1.745 2.118 2.46 2.751 2.999 3.219 3.649 3.865 4.072 4.343 4.634 4.814 5.164 5.486 5.798 5.958 6.264 6.557 6.969 7.231 7.491 7.873 8.256 8.626 8.963 9.285 9.705 10.114 10.518 11.008 11.489 11.965 12.531 13.189 13.817 14.517 15.301 16.152 17.064 18.093 19.328 20.638 22.248 24.15 26.481 29.216 32.596 36.932 42.687 47.901 51.282 53.64 55.319 56.633 57.64 58.38 58.9 59.347 59.633 59.81 59.926 59.968 59.966 59.952 59.91 59.873 59.824 59.723 59.612 59.508 59.386 59.26 59.143 59.036 58.931 58.787 58.614 58.491 58.359 58.142 57.993 57.846 57.761 57.562 57.342 57.092 56.951 56.743 56.436 56.252 56.041 55.578 55.302 54.989 54.643 54.195 53.582 52.649 49.462 -4 ,31875 ,KEBNE ,16676806,Wed Nov 24 13:38:47 CET,Wed Nov 24 15:31:53 CET,0.0 1.482 1.93 2.272 2.573 2.83 3.063 3.297 3.737 3.94 4.131 4.372 4.638 4.802 5.125 5.434 5.732 5.879 6.165 6.445 6.847 7.107 7.366 7.746 8.111 8.457 8.795 9.129 9.576 10.026 10.469 10.999 11.497 11.969 12.523 13.18 13.823 14.527 15.305 16.151 17.061 18.151 19.499 20.907 22.59 24.498 26.75 29.392 32.739 37.037 42.656 47.829 51.252 53.62 55.321 56.561 57.421 58.094 58.603 59.035 59.339 59.576 59.759 59.885 59.966 59.982 59.962 59.961 59.964 59.939 59.868 59.787 59.685 59.57 59.479 59.364 59.216 59.046 58.858 58.719 58.582 58.376 58.228 58.064 57.977 57.792 57.579 57.358 57.234 57.051 56.772 56.594 56.391 55.93 55.656 55.326 54.94 54.467 53.862 52.961 49.327 -5 ,26408 ,KEBNE ,16676807,Wed Nov 24 13:38:47 CET,Wed Nov 24 15:29:40 CET,0.0 1.534 2.048 2.434 2.745 3.016 3.268 3.516 3.979 4.181 4.37 4.638 4.921 5.091 5.416 5.73 6.039 6.192 6.487 6.765 7.176 7.443 7.7 8.086 8.466 8.833 9.193 9.543 9.988 10.419 10.839 11.357 11.879 12.393 12.984 13.65 14.316 15.078 15.906 16.807 17.808 18.949 20.281 21.664 23.347 25.319 27.701 30.519 33.992 38.38 44.224 49.487 52.795 55.104 56.768 58.01 58.978 59.725 60.246 60.673 60.984 61.242 61.467 61.652 61.79 61.88 61.945 61.993 62.016 62.03 62.038 62.024 61.993 61.948 61.907 61.858 61.791 61.714 61.629 61.559 61.48 61.363 61.263 61.136 61.071 60.939 60.804 60.651 60.556 60.397 60.207 60.078 59.93 59.556 59.318 59.031 58.67 58.246 57.714 56.919 52.174 -6 ,29882 ,KEBNE ,16676808,Wed Nov 24 13:39:49 CET,Wed Nov 24 15:31:57 CET,0.0 1.233 1.728 2.104 2.405 2.677 2.939 3.177 3.611 3.828 4.032 4.314 4.604 4.79 5.15 5.48 5.782 5.931 6.217 6.484 6.876 7.142 7.404 7.775 8.128 8.483 8.818 9.134 9.557 9.978 10.384 10.867 11.347 11.824 12.384 13.013 13.615 14.301 15.076 15.914 16.826 17.891 19.175 20.501 22.08 23.895 26.069 28.663 31.871 35.981 41.404 46.317 49.62 51.923 53.578 54.813 55.672 56.32 56.829 57.252 57.562 57.816 58.026 58.163 58.248 58.3 58.294 58.239 58.178 58.105 58.005 57.914 57.816 57.713 57.62 57.498 57.367 57.235 57.073 56.952 56.821 56.584 56.409 56.207 56.094 55.864 55.622 55.363 55.24 55.075 54.82 54.634 54.439 54.011 53.735 53.421 53.054 52.594 52.022 51.196 47.752 -7 ,27341 ,KEBNE ,16676809,Wed Nov 24 13:39:49 CET,Wed Nov 24 15:30:33 CET,0.0 1.446 1.931 2.329 2.665 2.96 3.241 3.501 3.974 4.184 4.385 4.667 4.965 5.156 5.516 5.866 6.195 6.352 6.663 6.963 7.386 7.66 7.932 8.323 8.706 9.073 9.427 9.776 10.228 10.682 11.13 11.658 12.173 12.695 13.305 13.979 14.657 15.438 16.3 17.233 18.195 19.293 20.649 22.078 23.766 25.665 27.931 30.629 33.982 38.215 43.811 48.986 52.332 54.721 56.487 57.797 58.788 59.563 60.136 60.534 60.759 60.94 61.06 61.118 61.139 61.145 61.139 61.158 61.184 61.191 61.187 61.151 61.059 60.927 60.827 60.733 60.609 60.453 60.297 60.172 60.025 59.799 59.651 59.511 59.43 59.219 58.997 58.761 58.617 58.415 58.133 57.954 57.742 57.252 56.964 56.627 56.241 55.756 55.14 54.264 50.626 -8 ,7111 ,KEBNE ,16676810,Wed Nov 24 13:41:52 CET,Wed Nov 24 15:33:15 CET,0.0 1.466 1.968 2.35 2.683 2.978 3.227 3.453 3.886 4.09 4.285 4.568 4.859 5.033 5.369 5.705 6.029 6.181 6.481 6.771 7.196 7.473 7.743 8.138 8.526 8.914 9.288 9.652 10.134 10.603 11.056 11.605 12.139 12.665 13.293 14.001 14.676 15.442 16.284 17.178 18.15 19.312 20.704 22.12 23.829 25.783 28.151 30.951 34.343 38.602 44.159 49.346 52.769 55.206 57.003 58.311 59.233 59.946 60.496 60.979 61.324 61.585 61.803 61.994 62.141 62.212 62.253 62.28 62.3 62.306 62.288 62.264 62.221 62.168 62.126 62.071 62.02 61.961 61.879 61.813 61.735 61.594 61.482 61.346 61.281 61.156 60.994 60.825 60.724 60.555 60.344 60.189 60.021 59.627 59.361 59.067 58.729 58.281 57.663 56.758 53.063 -9 ,31712 ,KEBNE ,16676811,Wed Nov 24 13:48:00 CET,Wed Nov 24 15:41:59 CET,0.0 1.541 2.053 2.417 2.718 2.992 3.254 3.496 3.928 4.125 4.31 4.558 4.832 5.0 5.323 5.624 5.917 6.057 6.33 6.6 6.994 7.247 7.49 7.846 8.186 8.527 8.874 9.209 9.644 10.073 10.483 10.981 11.478 11.969 12.534 13.176 13.82 14.539 15.317 16.166 17.09 18.14 19.414 20.76 22.381 24.262 26.541 29.257 32.545 36.638 42.051 47.071 50.423 52.757 54.413 55.685 56.647 57.361 57.897 58.391 58.768 59.049 59.256 59.432 59.568 59.674 59.775 59.845 59.881 59.906 59.917 59.892 59.861 59.816 59.761 59.7 59.637 59.569 59.479 59.412 59.346 59.227 59.133 59.028 58.968 58.816 58.644 58.466 58.375 58.235 58.024 57.881 57.741 57.386 57.166 56.906 56.574 56.167 55.622 54.79 51.26 -10 ,25002 ,KEBNE ,16676812,Wed Nov 24 13:48:00 CET,Wed Nov 24 15:40:08 CET,0.0 1.28 1.753 2.107 2.387 2.659 2.928 3.166 3.612 3.825 4.017 4.274 4.552 4.723 5.058 5.38 5.672 5.816 6.098 6.371 6.785 7.048 7.306 7.681 8.032 8.359 8.685 9.008 9.429 9.845 10.256 10.759 11.24 11.719 12.292 12.94 13.566 14.263 15.038 15.883 16.826 17.939 19.249 20.614 22.246 24.103 26.388 29.122 32.507 36.821 42.516 47.678 51.029 53.388 55.112 56.348 57.218 57.925 58.454 58.936 59.278 59.456 59.524 59.555 59.579 59.579 59.564 59.519 59.477 59.449 59.403 59.345 59.264 59.147 59.027 58.899 58.767 58.624 58.46 58.346 58.226 58.015 57.85 57.686 57.607 57.424 57.238 57.038 56.909 56.724 56.452 56.269 56.051 55.545 55.259 54.92 54.52 54.053 53.435 52.505 49.132 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_35.txt deleted file mode 100644 index 83829eda..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30654 ,KEBNE ,16676813,Wed Nov 24 13:50:03 CET,Wed Nov 24 15:43:07 CET,0.0 1.483 1.887 2.19 2.436 2.655 2.841 3.013 3.307 3.434 3.557 3.678 3.883 3.985 4.178 4.364 4.543 4.631 4.796 4.943 5.155 5.296 5.428 5.615 5.791 5.962 6.141 6.313 6.522 6.71 6.887 7.099 7.305 7.506 7.733 7.977 8.205 8.449 8.691 8.953 9.235 9.562 9.97 10.365 10.788 11.226 11.709 12.158 12.566 12.93 13.14 12.906 12.371 11.732 11.155 10.64 10.115 9.567 9.051 8.514 8.038 7.609 7.198 6.786 6.39 6.036 5.68 5.37 5.094 4.815 4.532 4.278 3.986 3.645 3.358 3.065 2.783 2.49 2.162 1.929 1.677 1.254 0.948 0.632 0.472 0.126 -0.244 -0.633 -0.833 -1.138 -1.465 -1.695 -1.962 -2.551 -2.879 -3.27 -3.72 -4.266 -4.908 -5.862 -9.921 -2 ,13114 ,KEBNE ,16676814,Wed Nov 24 13:50:03 CET,Wed Nov 24 15:41:04 CET,0.0 1.566 2.04 2.392 2.648 2.862 3.061 3.234 3.525 3.659 3.791 3.952 4.179 4.286 4.489 4.683 4.888 4.987 5.175 5.349 5.567 5.698 5.828 6.027 6.222 6.406 6.577 6.741 6.947 7.143 7.33 7.545 7.76 7.968 8.186 8.433 8.682 8.95 9.228 9.506 9.8 10.12 10.485 10.87 11.33 11.81 12.288 12.76 13.257 13.726 14.07 14.052 13.769 13.36 12.914 12.43 11.935 11.465 11.058 10.635 10.239 9.884 9.543 9.207 8.887 8.589 8.272 7.997 7.75 7.458 7.147 6.893 6.636 6.371 6.162 5.944 5.703 5.441 5.176 4.992 4.787 4.443 4.208 3.979 3.857 3.593 3.302 2.98 2.815 2.535 2.265 2.068 1.842 1.304 1.0 0.661 0.278 -0.185 -0.785 -1.686 -5.27 -3 ,9247 ,KEBNE ,16676815,Wed Nov 24 13:51:05 CET,Wed Nov 24 15:46:07 CET,0.0 1.208 1.639 1.923 2.15 2.359 2.542 2.705 3.011 3.147 3.276 3.423 3.649 3.763 3.979 4.187 4.369 4.452 4.609 4.761 4.999 5.145 5.28 5.474 5.657 5.825 5.979 6.136 6.344 6.541 6.732 6.961 7.176 7.387 7.639 7.916 8.169 8.441 8.732 9.033 9.331 9.675 10.071 10.438 10.879 11.39 11.932 12.462 13.007 13.527 13.907 13.933 13.711 13.38 12.995 12.567 12.163 11.781 11.406 11.003 10.629 10.261 9.849 9.422 8.981 8.549 8.104 7.696 7.343 6.975 6.595 6.278 5.94 5.589 5.305 4.999 4.705 4.393 4.042 3.799 3.546 3.135 2.842 2.535 2.381 2.041 1.657 1.241 1.03 0.727 0.384 0.126 -0.151 -0.728 -1.042 -1.402 -1.829 -2.328 -2.952 -3.849 -7.793 -4 ,16583 ,KEBNE ,16676816,Wed Nov 24 13:51:05 CET,Wed Nov 24 15:52:28 CET,0.0 1.255 1.676 1.978 2.228 2.444 2.637 2.81 3.132 3.284 3.428 3.589 3.816 3.939 4.176 4.365 4.541 4.631 4.8 4.951 5.164 5.297 5.43 5.631 5.813 5.972 6.13 6.291 6.495 6.685 6.862 7.092 7.316 7.525 7.753 7.991 8.227 8.479 8.737 9.019 9.322 9.648 10.0 10.374 10.813 11.234 11.697 12.194 12.696 13.119 13.393 13.227 12.868 12.526 12.149 11.724 11.302 10.892 10.535 10.18 9.836 9.502 9.17 8.857 8.554 8.257 7.926 7.587 7.263 6.913 6.551 6.26 5.944 5.602 5.335 5.066 4.799 4.526 4.219 3.988 3.758 3.402 3.14 2.868 2.725 2.408 2.066 1.701 1.506 1.201 0.854 0.614 0.364 -0.162 -0.467 -0.808 -1.183 -1.636 -2.271 -3.238 -7.118 -5 ,2049 ,KEBNE ,16676817,Wed Nov 24 13:51:05 CET,Wed Nov 24 15:45:45 CET,0.0 1.16 1.543 1.818 2.052 2.271 2.478 2.647 2.945 3.093 3.231 3.384 3.615 3.726 3.933 4.129 4.316 4.404 4.58 4.738 4.943 5.084 5.231 5.433 5.619 5.796 5.969 6.141 6.354 6.545 6.73 6.971 7.2 7.413 7.656 7.925 8.187 8.453 8.724 9.009 9.287 9.588 9.944 10.295 10.7 11.126 11.54 11.939 12.401 12.943 13.313 13.197 12.799 12.303 11.845 11.435 11.051 10.674 10.35 9.918 9.427 8.953 8.529 8.132 7.727 7.34 6.886 6.482 6.158 5.831 5.498 5.208 4.883 4.537 4.262 3.975 3.696 3.392 3.058 2.829 2.589 2.208 1.936 1.633 1.482 1.174 0.817 0.454 0.272 -0.022 -0.309 -0.515 -0.738 -1.262 -1.559 -1.925 -2.365 -2.871 -3.513 -4.443 -8.699 -6 ,16766 ,KEBNE ,16676818,Wed Nov 24 13:51:05 CET,Wed Nov 24 15:43:38 CET,0.0 0.972 1.363 1.689 1.955 2.18 2.402 2.605 2.954 3.101 3.235 3.368 3.585 3.693 3.908 4.117 4.316 4.411 4.593 4.771 5.011 5.155 5.297 5.505 5.694 5.87 6.045 6.209 6.406 6.599 6.784 7.004 7.228 7.449 7.703 7.982 8.24 8.51 8.789 9.097 9.415 9.742 10.109 10.465 10.878 11.352 11.864 12.335 12.821 13.308 13.581 13.468 13.131 12.724 12.286 11.814 11.336 10.89 10.5 10.026 9.578 9.172 8.77 8.368 7.965 7.612 7.26 6.906 6.581 6.269 5.945 5.671 5.384 5.078 4.83 4.539 4.222 3.904 3.587 3.377 3.16 2.799 2.535 2.247 2.086 1.734 1.363 0.98 0.771 0.45 0.082 -0.175 -0.445 -1.043 -1.404 -1.805 -2.248 -2.815 -3.51 -4.463 -7.825 -7 ,19011 ,KEBNE ,16676819,Wed Nov 24 13:51:09 CET,Wed Nov 24 15:47:40 CET,0.0 1.258 1.661 1.972 2.221 2.435 2.632 2.818 3.14 3.284 3.428 3.591 3.824 3.938 4.144 4.339 4.516 4.599 4.763 4.922 5.162 5.318 5.45 5.646 5.85 6.043 6.221 6.386 6.599 6.8 6.996 7.221 7.433 7.638 7.87 8.121 8.357 8.627 8.915 9.208 9.497 9.815 10.193 10.56 10.975 11.436 11.916 12.394 12.891 13.367 13.776 13.739 13.354 12.873 12.427 11.96 11.431 10.925 10.507 10.085 9.708 9.362 9.016 8.686 8.368 8.053 7.732 7.434 7.175 6.906 6.602 6.353 6.093 5.826 5.614 5.381 5.146 4.882 4.598 4.408 4.209 3.898 3.669 3.416 3.287 3.015 2.725 2.434 2.269 1.977 1.681 1.463 1.237 0.723 0.415 0.069 -0.315 -0.798 -1.422 -2.358 -5.991 -8 ,23010 ,KEBNE ,16676820,Wed Nov 24 13:55:10 CET,Wed Nov 24 15:48:31 CET,0.0 1.284 1.722 2.053 2.309 2.552 2.771 2.963 3.304 3.46 3.608 3.769 3.998 4.121 4.355 4.563 4.756 4.844 5.009 5.173 5.406 5.546 5.682 5.88 6.07 6.256 6.439 6.608 6.82 7.024 7.209 7.439 7.66 7.872 8.117 8.377 8.62 8.884 9.169 9.471 9.788 10.144 10.537 10.914 11.35 11.814 12.304 12.794 13.305 13.783 14.152 14.119 13.797 13.425 13.079 12.748 12.383 12.011 11.662 11.287 10.945 10.627 10.313 10.0 9.716 9.465 9.19 8.925 8.668 8.383 8.097 7.862 7.604 7.33 7.115 6.89 6.649 6.387 6.124 5.946 5.762 5.45 5.223 4.994 4.884 4.658 4.413 4.137 3.978 3.703 3.434 3.234 3.023 2.515 2.206 1.861 1.451 0.968 0.393 -0.438 -3.958 -9 ,31861 ,KEBNE ,16676821,Wed Nov 24 13:55:10 CET,Wed Nov 24 15:46:21 CET,0.0 1.311 1.704 1.992 2.235 2.444 2.628 2.796 3.108 3.249 3.377 3.509 3.736 3.851 4.057 4.253 4.435 4.527 4.708 4.87 5.095 5.231 5.36 5.538 5.71 5.875 6.033 6.184 6.377 6.563 6.739 6.952 7.158 7.35 7.577 7.837 8.069 8.313 8.568 8.843 9.125 9.435 9.786 10.123 10.532 10.983 11.46 11.939 12.417 12.882 13.285 13.332 13.141 12.798 12.393 11.936 11.499 11.094 10.721 10.35 10.045 9.752 9.438 9.128 8.818 8.525 8.217 7.924 7.667 7.407 7.129 6.88 6.621 6.359 6.144 5.918 5.681 5.436 5.191 5.018 4.836 4.535 4.316 4.072 3.941 3.688 3.417 3.11 2.949 2.669 2.384 2.178 1.954 1.466 1.186 0.853 0.434 -0.08 -0.715 -1.634 -5.673 -10 ,5813 ,KEBNE ,16676822,Wed Nov 24 14:03:21 CET,Wed Nov 24 15:56:54 CET,0.0 1.192 1.586 1.888 2.133 2.349 2.538 2.728 3.101 3.255 3.393 3.548 3.774 3.891 4.112 4.32 4.518 4.616 4.802 4.97 5.212 5.368 5.519 5.736 5.934 6.118 6.298 6.474 6.706 6.924 7.129 7.365 7.591 7.815 8.073 8.358 8.627 8.917 9.226 9.559 9.903 10.269 10.663 11.02 11.4 11.818 12.287 12.737 13.202 13.647 13.937 13.776 13.312 12.838 12.337 11.784 11.293 10.849 10.405 9.914 9.502 9.129 8.698 8.234 7.797 7.419 7.049 6.71 6.414 6.099 5.755 5.471 5.162 4.821 4.549 4.269 3.986 3.696 3.395 3.161 2.888 2.459 2.172 1.874 1.72 1.408 1.071 0.703 0.514 0.223 -0.128 -0.383 -0.647 -1.261 -1.602 -1.983 -2.426 -2.954 -3.587 -4.502 -8.73 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_34.txt deleted file mode 100644 index 3c2858c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_34.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,9484 ,KEBNE ,16676826,Wed Nov 24 14:11:33 CET,Wed Nov 24 15:59:26 CET,0.0 0.926 1.241 1.484 1.697 1.878 2.041 2.193 2.462 2.58 2.69 2.803 3.002 3.105 3.299 3.467 3.618 3.692 3.834 3.967 4.154 4.27 4.383 4.557 4.72 4.863 4.999 5.134 5.314 5.483 5.648 5.842 6.022 6.196 6.394 6.6 6.774 6.963 7.157 7.36 7.588 7.831 8.071 8.285 8.519 8.727 8.89 8.986 8.99 8.746 8.04 7.04 6.026 5.014 4.054 3.202 2.483 1.813 1.209 0.614 0.116 -0.365 -0.867 -1.338 -1.761 -2.157 -2.555 -2.922 -3.265 -3.644 -4.041 -4.369 -4.698 -5.033 -5.313 -5.584 -5.872 -6.198 -6.512 -6.745 -7.029 -7.433 -7.707 -7.989 -8.138 -8.463 -8.8 -9.171 -9.386 -9.736 -10.143 -10.405 -10.668 -11.314 -11.746 -12.206 -12.731 -13.293 -13.937 -14.969 -20.772 -5 ,19664 ,KEBNE ,16676827,Wed Nov 24 14:11:33 CET,Wed Nov 24 15:58:57 CET,0.0 1.142 1.53 1.821 2.077 2.295 2.477 2.644 2.936 3.076 3.211 3.357 3.559 3.664 3.863 4.059 4.239 4.323 4.486 4.634 4.838 4.967 5.09 5.272 5.449 5.615 5.774 5.92 6.086 6.239 6.396 6.587 6.761 6.925 7.111 7.317 7.519 7.726 7.935 8.141 8.366 8.649 8.958 9.209 9.456 9.694 9.962 10.204 10.323 10.164 9.51 8.447 7.331 6.285 5.394 4.539 3.749 3.057 2.46 1.844 1.328 0.897 0.489 0.047 -0.405 -0.823 -1.265 -1.672 -1.997 -2.297 -2.639 -2.937 -3.256 -3.588 -3.831 -4.12 -4.476 -4.806 -5.111 -5.346 -5.602 -6.012 -6.313 -6.636 -6.808 -7.168 -7.534 -7.907 -8.112 -8.453 -8.888 -9.163 -9.437 -10.034 -10.398 -10.845 -11.322 -11.85 -12.477 -13.43 -21.254 -6 ,25389 ,KEBNE ,16676828,Wed Nov 24 14:11:33 CET,Wed Nov 24 15:59:22 CET,0.0 1.204 1.579 1.878 2.128 2.344 2.544 2.71 2.99 3.115 3.234 3.352 3.55 3.642 3.82 3.993 4.155 4.237 4.392 4.53 4.726 4.848 4.97 5.151 5.324 5.48 5.624 5.769 5.95 6.119 6.284 6.473 6.647 6.83 7.042 7.25 7.441 7.664 7.917 8.159 8.392 8.636 8.906 9.166 9.411 9.653 9.927 10.091 10.12 10.025 9.539 8.619 7.742 6.923 6.134 5.381 4.648 3.949 3.349 2.753 2.24 1.769 1.317 0.842 0.395 -0.019 -0.49 -0.867 -1.159 -1.473 -1.82 -2.109 -2.425 -2.78 -3.058 -3.36 -3.659 -3.988 -4.364 -4.627 -4.891 -5.288 -5.565 -5.837 -5.992 -6.319 -6.63 -6.967 -7.163 -7.472 -7.826 -8.092 -8.376 -8.969 -9.315 -9.755 -10.269 -10.88 -11.642 -12.834 -24.817 -10 ,5324 ,KEBNE ,16676832,Wed Nov 24 14:12:35 CET,Wed Nov 24 16:00:32 CET,0.0 1.12 1.467 1.713 1.919 2.087 2.236 2.374 2.658 2.786 2.89 2.999 3.197 3.29 3.457 3.62 3.776 3.848 3.992 4.133 4.33 4.446 4.551 4.697 4.845 4.995 5.132 5.262 5.427 5.588 5.747 5.925 6.081 6.236 6.423 6.623 6.807 6.999 7.2 7.411 7.626 7.854 8.092 8.301 8.515 8.736 8.957 9.097 9.134 8.914 8.15 6.919 5.72 4.665 3.707 2.829 2.085 1.397 0.777 0.162 -0.379 -0.871 -1.366 -1.838 -2.266 -2.679 -3.108 -3.482 -3.793 -4.138 -4.519 -4.811 -5.137 -5.506 -5.772 -6.058 -6.361 -6.65 -6.948 -7.166 -7.413 -7.843 -8.155 -8.488 -8.652 -9.005 -9.427 -9.898 -10.129 -10.441 -10.746 -10.971 -11.219 -11.797 -12.132 -12.533 -13.083 -13.741 -14.472 -15.488 -24.544 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_35.txt deleted file mode 100644 index 12043553..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_35.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5951 ,KEBNE ,16676833,Wed Nov 24 14:12:35 CET,Wed Nov 24 16:02:23 CET,0.0 1.603 2.069 2.424 2.703 2.92 3.112 3.283 3.585 3.722 3.849 3.999 4.207 4.318 4.531 4.727 4.914 5.0 5.161 5.311 5.524 5.666 5.794 5.972 6.142 6.291 6.44 6.589 6.782 6.956 7.104 7.289 7.469 7.643 7.838 8.047 8.245 8.468 8.7 8.939 9.189 9.458 9.745 9.999 10.276 10.545 10.806 11.0 11.064 10.914 10.248 9.025 7.901 6.84 5.889 5.022 4.222 3.446 2.752 2.083 1.502 0.998 0.5 0.005 -0.457 -0.894 -1.354 -1.76 -2.108 -2.457 -2.83 -3.158 -3.499 -3.852 -4.143 -4.446 -4.743 -5.054 -5.384 -5.634 -5.888 -6.251 -6.509 -6.792 -6.947 -7.305 -7.694 -8.122 -8.362 -8.688 -9.008 -9.22 -9.446 -9.999 -10.344 -10.755 -11.157 -11.609 -12.192 -13.041 -16.586 -2 ,22287 ,KEBNE ,16676834,Wed Nov 24 14:12:35 CET,Wed Nov 24 16:00:11 CET,0.0 1.67 2.159 2.521 2.843 3.113 3.336 3.534 3.865 4.009 4.156 4.341 4.566 4.68 4.881 5.075 5.268 5.365 5.551 5.709 5.922 6.067 6.21 6.392 6.569 6.745 6.907 7.062 7.256 7.443 7.619 7.828 8.028 8.201 8.381 8.579 8.782 9.012 9.243 9.488 9.727 9.969 10.237 10.508 10.828 11.142 11.454 11.698 11.78 11.704 11.322 10.393 9.319 8.286 7.351 6.481 5.698 5.03 4.481 3.922 3.417 2.943 2.487 2.044 1.621 1.235 0.825 0.436 0.088 -0.295 -0.701 -0.994 -1.269 -1.582 -1.856 -2.139 -2.458 -2.795 -3.133 -3.371 -3.617 -4.035 -4.337 -4.648 -4.803 -5.131 -5.483 -5.849 -6.051 -6.369 -6.697 -6.94 -7.201 -7.743 -8.071 -8.469 -8.926 -9.447 -10.083 -10.92 -13.792 -3 ,2839 ,KEBNE ,16676835,Wed Nov 24 14:13:36 CET,Wed Nov 24 16:01:32 CET,0.0 1.513 1.923 2.246 2.497 2.71 2.896 3.075 3.403 3.541 3.661 3.797 3.997 4.099 4.292 4.477 4.659 4.747 4.908 5.06 5.28 5.428 5.571 5.758 5.921 6.074 6.224 6.374 6.566 6.746 6.915 7.115 7.3 7.468 7.672 7.899 8.119 8.367 8.607 8.835 9.065 9.335 9.64 9.912 10.202 10.486 10.773 11.027 11.13 11.059 10.554 9.441 8.323 7.336 6.489 5.688 4.931 4.217 3.573 2.931 2.369 1.851 1.359 0.913 0.498 0.099 -0.324 -0.693 -1.034 -1.401 -1.776 -2.075 -2.371 -2.688 -2.99 -3.309 -3.616 -3.956 -4.307 -4.554 -4.81 -5.212 -5.5 -5.787 -5.937 -6.255 -6.607 -7.019 -7.224 -7.521 -7.848 -8.077 -8.349 -9.015 -9.409 -9.881 -10.433 -11.052 -11.778 -12.864 -24.594 -4 ,6586 ,KEBNE ,16676836,Wed Nov 24 14:14:37 CET,Wed Nov 24 16:04:26 CET,0.0 1.154 1.578 1.881 2.134 2.356 2.564 2.763 3.126 3.275 3.415 3.639 3.897 4.033 4.275 4.477 4.656 4.745 4.919 5.082 5.315 5.464 5.603 5.801 5.995 6.17 6.342 6.504 6.695 6.887 7.068 7.275 7.479 7.673 7.9 8.145 8.359 8.603 8.853 9.092 9.349 9.629 9.904 10.149 10.417 10.678 11.0 11.368 11.64 11.633 11.216 10.321 9.282 8.334 7.484 6.678 5.933 5.222 4.558 3.889 3.355 2.872 2.368 1.883 1.418 0.978 0.531 0.149 -0.177 -0.508 -0.86 -1.172 -1.493 -1.804 -2.049 -2.335 -2.658 -2.987 -3.293 -3.51 -3.749 -4.154 -4.46 -4.752 -4.895 -5.219 -5.545 -5.893 -6.089 -6.385 -6.71 -6.951 -7.217 -7.792 -8.11 -8.516 -8.967 -9.438 -10.041 -10.84 -20.592 -5 ,5254 ,KEBNE ,16676837,Wed Nov 24 14:15:39 CET,Wed Nov 24 16:05:43 CET,0.0 1.508 1.923 2.228 2.472 2.675 2.865 3.037 3.324 3.46 3.589 3.742 3.953 4.054 4.255 4.442 4.613 4.699 4.859 5.009 5.227 5.359 5.479 5.652 5.821 5.982 6.125 6.26 6.456 6.654 6.829 7.027 7.225 7.428 7.661 7.912 8.164 8.438 8.697 8.947 9.198 9.479 9.77 9.997 10.253 10.553 10.827 11.068 11.266 11.256 10.751 9.59 8.487 7.461 6.548 5.715 4.935 4.242 3.636 3.012 2.451 1.951 1.514 1.095 0.681 0.292 -0.109 -0.462 -0.773 -1.134 -1.551 -1.879 -2.204 -2.556 -2.82 -3.082 -3.374 -3.691 -4.013 -4.251 -4.53 -4.962 -5.262 -5.575 -5.735 -6.064 -6.411 -6.793 -6.992 -7.32 -7.704 -7.973 -8.292 -9.056 -9.454 -9.819 -10.211 -10.761 -11.47 -12.355 -24.371 -8 ,3163 ,KEBNE ,16676840,Wed Nov 24 14:17:42 CET,Wed Nov 24 16:06:03 CET,0.0 1.515 2.003 2.366 2.649 2.884 3.1 3.292 3.615 3.76 3.899 4.06 4.284 4.403 4.63 4.839 5.031 5.126 5.311 5.475 5.709 5.854 5.977 6.154 6.339 6.532 6.719 6.89 7.097 7.296 7.487 7.696 7.892 8.088 8.302 8.523 8.735 8.974 9.224 9.459 9.709 10.017 10.344 10.638 10.995 11.352 11.653 11.846 11.87 11.689 11.002 9.821 8.65 7.61 6.703 5.854 5.116 4.423 3.846 3.3 2.797 2.332 1.904 1.485 1.087 0.726 0.34 -0.035 -0.398 -0.757 -1.117 -1.405 -1.69 -2.001 -2.253 -2.536 -2.84 -3.134 -3.476 -3.75 -4.009 -4.397 -4.672 -4.935 -5.07 -5.355 -5.679 -6.059 -6.262 -6.571 -6.914 -7.143 -7.381 -7.932 -8.228 -8.542 -8.917 -9.35 -9.87 -10.607 -15.583 -9 ,6958 ,KEBNE ,16676841,Wed Nov 24 14:19:45 CET,Wed Nov 24 16:09:11 CET,0.0 1.945 2.392 2.695 2.938 3.171 3.394 3.599 3.972 4.145 4.316 4.529 4.752 4.871 5.112 5.33 5.528 5.623 5.795 5.951 6.172 6.314 6.457 6.676 6.894 7.094 7.278 7.455 7.661 7.85 8.029 8.239 8.444 8.63 8.842 9.078 9.296 9.522 9.753 9.982 10.198 10.434 10.695 10.943 11.219 11.491 11.773 12.037 12.188 12.102 11.634 10.7 9.639 8.569 7.6 6.781 6.041 5.315 4.651 3.984 3.419 2.909 2.433 1.981 1.546 1.139 0.706 0.327 -0.019 -0.417 -0.82 -1.14 -1.46 -1.785 -2.042 -2.302 -2.603 -2.925 -3.25 -3.474 -3.708 -4.143 -4.471 -4.781 -4.945 -5.294 -5.655 -6.048 -6.237 -6.532 -6.865 -7.104 -7.372 -7.98 -8.38 -8.818 -9.262 -9.845 -10.577 -11.682 -22.103 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_39.txt deleted file mode 100644 index fee65c8e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6806 ,KEBNE ,16676843,Wed Nov 24 14:38:13 CET,Wed Nov 24 16:29:43 CET,0.0 0.688 1.014 1.279 1.52 1.722 1.877 2.015 2.267 2.376 2.475 2.574 2.757 2.851 3.029 3.202 3.36 3.429 3.561 3.681 3.848 3.956 4.061 4.212 4.351 4.484 4.61 4.73 4.888 5.029 5.155 5.306 5.457 5.595 5.735 5.892 6.039 6.203 6.386 6.572 6.756 6.955 7.166 7.356 7.556 7.755 7.922 8.035 8.046 7.889 7.374 6.51 5.663 4.795 4.053 3.39 2.705 2.072 1.539 0.992 0.516 0.087 -0.319 -0.673 -0.996 -1.318 -1.672 -1.983 -2.266 -2.57 -2.883 -3.16 -3.448 -3.756 -4.001 -4.255 -4.513 -4.767 -5.039 -5.235 -5.432 -5.761 -6.003 -6.239 -6.363 -6.628 -6.903 -7.197 -7.352 -7.615 -7.888 -8.083 -8.301 -8.812 -9.096 -9.409 -9.747 -10.132 -10.625 -11.238 -13.089 -2 ,1769 ,KEBNE ,16676844,Wed Nov 24 14:41:25 CET,Wed Nov 24 16:29:20 CET,0.0 0.884 1.208 1.452 1.661 1.862 2.045 2.193 2.456 2.583 2.704 2.819 2.998 3.089 3.265 3.425 3.574 3.642 3.778 3.916 4.108 4.221 4.329 4.49 4.638 4.767 4.89 5.011 5.166 5.303 5.43 5.58 5.725 5.859 6.001 6.157 6.304 6.466 6.637 6.816 7.01 7.219 7.437 7.629 7.824 8.018 8.2 8.323 8.346 8.227 7.798 6.97 6.085 5.193 4.376 3.633 2.954 2.323 1.784 1.244 0.764 0.314 -0.114 -0.507 -0.87 -1.209 -1.573 -1.912 -2.207 -2.494 -2.794 -3.064 -3.353 -3.636 -3.856 -4.091 -4.34 -4.605 -4.884 -5.077 -5.285 -5.622 -5.854 -6.098 -6.233 -6.53 -6.853 -7.179 -7.342 -7.608 -7.883 -8.098 -8.323 -8.778 -9.046 -9.357 -9.686 -10.03 -10.465 -11.112 -13.039 -3 ,11784 ,KEBNE ,16676845,Wed Nov 24 14:42:24 CET,Wed Nov 24 16:35:11 CET,0.0 0.719 1.048 1.308 1.54 1.734 1.9 2.038 2.282 2.403 2.521 2.642 2.822 2.911 3.074 3.22 3.365 3.439 3.581 3.718 3.913 4.029 4.138 4.302 4.452 4.587 4.706 4.818 4.97 5.12 5.256 5.42 5.576 5.729 5.908 6.095 6.281 6.48 6.669 6.844 7.01 7.178 7.357 7.546 7.736 7.903 8.071 8.17 8.178 8.042 7.545 6.708 5.87 5.089 4.389 3.726 3.113 2.546 2.047 1.538 1.082 0.668 0.255 -0.153 -0.518 -0.866 -1.229 -1.542 -1.814 -2.102 -2.396 -2.641 -2.908 -3.19 -3.412 -3.651 -3.9 -4.15 -4.406 -4.589 -4.782 -5.077 -5.296 -5.536 -5.66 -5.927 -6.207 -6.5 -6.654 -6.908 -7.168 -7.378 -7.6 -8.057 -8.291 -8.545 -8.845 -9.182 -9.586 -10.229 -12.394 -4 ,31815 ,KEBNE ,16676846,Wed Nov 24 14:42:27 CET,Wed Nov 24 16:30:24 CET,0.0 0.753 1.076 1.31 1.502 1.676 1.832 1.977 2.23 2.34 2.448 2.562 2.746 2.84 3.01 3.172 3.322 3.386 3.512 3.635 3.799 3.904 4.006 4.142 4.271 4.4 4.523 4.637 4.787 4.931 5.062 5.219 5.37 5.51 5.673 5.852 6.008 6.177 6.362 6.549 6.729 6.917 7.116 7.293 7.485 7.647 7.802 7.931 7.943 7.823 7.398 6.622 5.808 5.003 4.262 3.554 2.9 2.332 1.863 1.394 0.984 0.609 0.23 -0.139 -0.48 -0.809 -1.147 -1.431 -1.681 -1.942 -2.227 -2.477 -2.726 -2.982 -3.19 -3.406 -3.641 -3.889 -4.152 -4.333 -4.524 -4.832 -5.043 -5.281 -5.406 -5.651 -5.915 -6.198 -6.347 -6.61 -6.873 -7.057 -7.244 -7.66 -7.897 -8.178 -8.491 -8.843 -9.286 -9.86 -11.416 -5 ,13539 ,KEBNE ,16676847,Wed Nov 24 14:43:29 CET,Wed Nov 24 16:30:08 CET,0.0 0.895 1.249 1.485 1.687 1.854 2.002 2.142 2.384 2.497 2.6 2.694 2.874 2.971 3.155 3.314 3.465 3.541 3.676 3.793 3.97 4.083 4.19 4.351 4.499 4.634 4.761 4.88 5.029 5.168 5.299 5.455 5.598 5.735 5.9 6.082 6.242 6.413 6.588 6.762 6.943 7.134 7.345 7.527 7.702 7.886 8.072 8.232 8.333 8.292 7.945 7.211 6.437 5.683 4.983 4.311 3.705 3.137 2.616 2.114 1.687 1.282 0.886 0.51 0.16 -0.177 -0.536 -0.85 -1.125 -1.41 -1.718 -1.989 -2.269 -2.551 -2.769 -3.001 -3.251 -3.528 -3.8 -3.975 -4.171 -4.496 -4.71 -4.932 -5.057 -5.305 -5.556 -5.832 -5.978 -6.216 -6.426 -6.61 -6.814 -7.245 -7.497 -7.758 -8.055 -8.427 -8.894 -9.508 -11.666 -6 ,13034 ,KEBNE ,16676848,Wed Nov 24 14:44:25 CET,Wed Nov 24 16:37:10 CET,0.0 0.706 1.064 1.333 1.564 1.774 1.956 2.127 2.426 2.554 2.667 2.779 2.971 3.076 3.257 3.417 3.573 3.645 3.78 3.914 4.094 4.21 4.317 4.461 4.599 4.73 4.855 4.976 5.124 5.26 5.404 5.582 5.731 5.867 6.016 6.179 6.341 6.504 6.673 6.857 7.036 7.221 7.415 7.582 7.77 7.991 8.248 8.463 8.589 8.605 8.275 7.564 6.829 6.081 5.377 4.732 4.161 3.653 3.197 2.709 2.292 1.946 1.607 1.247 0.883 0.536 0.178 -0.127 -0.399 -0.691 -0.984 -1.227 -1.492 -1.776 -1.989 -2.217 -2.46 -2.695 -2.939 -3.114 -3.296 -3.592 -3.813 -4.048 -4.167 -4.4 -4.653 -4.937 -5.094 -5.35 -5.596 -5.777 -5.967 -6.417 -6.689 -6.975 -7.28 -7.629 -8.083 -8.738 -10.511 -7 ,27458 ,KEBNE ,16676849,Wed Nov 24 14:44:25 CET,Wed Nov 24 16:36:58 CET,0.0 0.677 0.998 1.248 1.451 1.625 1.789 1.944 2.211 2.329 2.442 2.56 2.75 2.845 3.013 3.18 3.338 3.412 3.557 3.691 3.874 3.993 4.113 4.275 4.42 4.546 4.662 4.786 4.944 5.084 5.225 5.389 5.536 5.675 5.845 6.029 6.171 6.328 6.509 6.682 6.843 7.018 7.208 7.378 7.563 7.749 7.886 7.941 7.933 7.789 7.35 6.573 5.762 4.974 4.232 3.537 2.927 2.341 1.797 1.257 0.766 0.295 -0.133 -0.524 -0.9 -1.267 -1.637 -1.959 -2.257 -2.57 -2.895 -3.167 -3.451 -3.74 -3.963 -4.196 -4.435 -4.696 -4.987 -5.178 -5.367 -5.68 -5.901 -6.137 -6.26 -6.516 -6.792 -7.086 -7.244 -7.496 -7.733 -7.913 -8.103 -8.541 -8.797 -9.072 -9.37 -9.735 -10.202 -10.868 -12.778 -8 ,1542 ,KEBNE ,16676850,Wed Nov 24 14:44:29 CET,Wed Nov 24 16:35:44 CET,0.0 0.677 1.017 1.29 1.518 1.702 1.865 2.016 2.294 2.414 2.529 2.665 2.851 2.937 3.104 3.259 3.401 3.469 3.602 3.731 3.913 4.02 4.118 4.264 4.414 4.563 4.701 4.818 4.968 5.115 5.246 5.402 5.543 5.667 5.81 5.976 6.134 6.298 6.476 6.657 6.849 7.06 7.27 7.465 7.685 7.888 8.067 8.193 8.235 8.17 7.75 6.893 6.029 5.218 4.463 3.747 3.127 2.582 2.07 1.539 1.095 0.685 0.28 -0.113 -0.496 -0.844 -1.206 -1.527 -1.794 -2.079 -2.382 -2.635 -2.89 -3.151 -3.363 -3.594 -3.823 -4.048 -4.293 -4.472 -4.674 -5.012 -5.254 -5.512 -5.642 -5.905 -6.186 -6.492 -6.653 -6.906 -7.163 -7.351 -7.554 -8.005 -8.262 -8.559 -8.871 -9.225 -9.664 -10.267 -12.07 -9 ,5603 ,KEBNE ,16676851,Wed Nov 24 14:45:26 CET,Wed Nov 24 16:38:25 CET,0.0 0.901 1.264 1.533 1.743 1.928 2.084 2.229 2.508 2.626 2.731 2.837 3.025 3.126 3.314 3.486 3.642 3.714 3.861 3.996 4.167 4.271 4.37 4.515 4.658 4.798 4.928 5.051 5.213 5.364 5.5 5.669 5.821 5.957 6.118 6.293 6.455 6.629 6.803 6.978 7.17 7.369 7.577 7.775 7.98 8.177 8.351 8.48 8.547 8.455 8.047 7.293 6.522 5.793 5.085 4.413 3.79 3.214 2.704 2.19 1.75 1.339 0.955 0.588 0.239 -0.086 -0.425 -0.734 -1.006 -1.271 -1.561 -1.819 -2.095 -2.382 -2.607 -2.842 -3.081 -3.349 -3.63 -3.816 -4.005 -4.309 -4.537 -4.776 -4.898 -5.151 -5.425 -5.705 -5.851 -6.11 -6.375 -6.575 -6.791 -7.254 -7.513 -7.792 -8.1 -8.425 -8.823 -9.37 -11.014 -10 ,5233 ,KEBNE ,16676852,Wed Nov 24 14:45:26 CET,Wed Nov 24 16:37:40 CET,0.0 0.657 0.968 1.206 1.41 1.591 1.757 1.903 2.163 2.279 2.386 2.499 2.675 2.758 2.933 3.097 3.238 3.309 3.448 3.57 3.742 3.857 3.962 4.102 4.235 4.358 4.476 4.586 4.725 4.866 4.995 5.144 5.294 5.436 5.586 5.752 5.903 6.059 6.23 6.417 6.607 6.804 7.002 7.181 7.379 7.57 7.738 7.873 7.981 7.955 7.567 6.787 5.962 5.142 4.4 3.748 3.186 2.657 2.161 1.636 1.173 0.764 0.377 0.008 -0.35 -0.697 -1.045 -1.341 -1.608 -1.889 -2.18 -2.435 -2.702 -2.978 -3.2 -3.43 -3.675 -3.937 -4.214 -4.41 -4.611 -4.918 -5.128 -5.347 -5.464 -5.707 -5.973 -6.275 -6.438 -6.701 -6.967 -7.167 -7.389 -7.883 -8.138 -8.401 -8.712 -9.075 -9.511 -10.139 -11.98 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_43.txt deleted file mode 100644 index acc77bc2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11620 ,KEBNE ,16676853,Wed Nov 24 14:45:26 CET,Wed Nov 24 16:37:29 CET,0.0 1.254 1.695 2.003 2.262 2.484 2.681 2.869 3.206 3.339 3.454 3.587 3.777 3.87 4.037 4.201 4.367 4.447 4.596 4.736 4.945 5.077 5.2 5.37 5.529 5.68 5.807 5.924 6.083 6.23 6.364 6.523 6.675 6.825 6.993 7.18 7.358 7.548 7.74 7.921 8.119 8.326 8.522 8.715 8.913 9.105 9.288 9.403 9.455 9.432 9.036 8.252 7.446 6.648 5.961 5.303 4.669 4.058 3.5 2.925 2.454 2.049 1.652 1.238 0.816 0.429 0.048 -0.307 -0.622 -0.94 -1.281 -1.587 -1.918 -2.256 -2.514 -2.768 -3.038 -3.324 -3.611 -3.818 -4.045 -4.4 -4.655 -4.918 -5.055 -5.356 -5.674 -5.995 -6.163 -6.451 -6.765 -6.974 -7.192 -7.647 -7.914 -8.22 -8.563 -8.978 -9.537 -10.292 -13.091 -2 ,27381 ,KEBNE ,16676854,Wed Nov 24 14:45:26 CET,Wed Nov 24 16:38:53 CET,0.0 1.598 2.068 2.441 2.741 2.974 3.178 3.353 3.649 3.775 3.894 4.03 4.231 4.332 4.511 4.68 4.84 4.918 5.067 5.211 5.4 5.519 5.632 5.784 5.938 6.075 6.204 6.324 6.47 6.622 6.774 6.949 7.103 7.246 7.407 7.571 7.734 7.923 8.11 8.3 8.508 8.708 8.913 9.108 9.31 9.512 9.68 9.793 9.831 9.721 9.281 8.434 7.582 6.806 6.108 5.412 4.76 4.15 3.612 3.074 2.628 2.255 1.877 1.489 1.138 0.821 0.463 0.142 -0.13 -0.426 -0.745 -1.013 -1.285 -1.558 -1.769 -1.989 -2.222 -2.481 -2.774 -2.969 -3.168 -3.478 -3.687 -3.932 -4.06 -4.307 -4.592 -4.907 -5.057 -5.314 -5.583 -5.775 -5.984 -6.444 -6.689 -6.958 -7.273 -7.642 -8.122 -8.791 -11.73 -3 ,8238 ,KEBNE ,16676855,Wed Nov 24 14:46:29 CET,Wed Nov 24 16:39:02 CET,0.0 1.254 1.71 2.054 2.346 2.594 2.813 3.006 3.335 3.48 3.613 3.748 3.939 4.031 4.213 4.399 4.551 4.62 4.762 4.9 5.09 5.206 5.319 5.47 5.613 5.755 5.883 5.998 6.144 6.276 6.401 6.554 6.704 6.85 7.016 7.186 7.348 7.539 7.728 7.907 8.099 8.295 8.501 8.697 8.915 9.155 9.372 9.544 9.651 9.593 9.166 8.456 7.694 6.923 6.199 5.503 4.92 4.395 3.91 3.4 2.955 2.554 2.165 1.788 1.427 1.114 0.79 0.474 0.186 -0.099 -0.384 -0.641 -0.923 -1.215 -1.444 -1.686 -1.942 -2.197 -2.45 -2.64 -2.843 -3.151 -3.395 -3.657 -3.787 -4.04 -4.319 -4.651 -4.819 -5.071 -5.337 -5.546 -5.758 -6.197 -6.436 -6.731 -7.059 -7.386 -7.836 -8.437 -10.349 -4 ,20590 ,KEBNE ,16676856,Wed Nov 24 14:45:26 CET,Wed Nov 24 16:38:31 CET,0.0 1.44 1.872 2.228 2.525 2.752 2.948 3.126 3.423 3.558 3.69 3.852 4.055 4.157 4.339 4.514 4.679 4.758 4.909 5.048 5.242 5.359 5.478 5.659 5.821 5.967 6.1 6.222 6.379 6.531 6.674 6.843 7.006 7.172 7.357 7.548 7.724 7.904 8.095 8.293 8.486 8.703 8.955 9.177 9.408 9.627 9.815 9.976 10.105 10.154 9.849 9.063 8.256 7.476 6.739 6.045 5.403 4.848 4.361 3.828 3.365 2.948 2.544 2.157 1.8 1.478 1.144 0.843 0.583 0.315 0.026 -0.221 -0.478 -0.766 -1.009 -1.283 -1.575 -1.852 -2.123 -2.315 -2.527 -2.862 -3.091 -3.339 -3.469 -3.728 -4.013 -4.342 -4.513 -4.757 -5.005 -5.204 -5.41 -5.899 -6.17 -6.475 -6.825 -7.208 -7.657 -8.273 -10.494 -5 ,30388 ,KEBNE ,16676857,Wed Nov 24 14:45:30 CET,Wed Nov 24 16:36:35 CET,0.0 1.587 2.036 2.364 2.649 2.889 3.089 3.252 3.531 3.673 3.813 3.97 4.164 4.259 4.433 4.588 4.731 4.801 4.934 5.061 5.253 5.378 5.485 5.64 5.801 5.95 6.079 6.209 6.382 6.535 6.669 6.831 6.995 7.147 7.315 7.498 7.668 7.846 8.035 8.229 8.415 8.599 8.794 8.987 9.169 9.351 9.536 9.635 9.676 9.545 9.028 8.176 7.314 6.515 5.777 5.091 4.468 3.875 3.357 2.825 2.339 1.905 1.487 1.098 0.755 0.434 0.057 -0.281 -0.565 -0.866 -1.177 -1.444 -1.739 -2.071 -2.33 -2.586 -2.855 -3.147 -3.465 -3.677 -3.876 -4.183 -4.417 -4.69 -4.832 -5.128 -5.45 -5.796 -5.967 -6.235 -6.529 -6.761 -6.992 -7.468 -7.76 -8.073 -8.427 -8.838 -9.306 -9.964 -13.141 -6 ,28765 ,KEBNE ,16676858,Wed Nov 24 14:46:29 CET,Wed Nov 24 16:38:05 CET,0.0 1.339 1.801 2.149 2.42 2.639 2.832 2.996 3.268 3.386 3.505 3.647 3.839 3.938 4.115 4.286 4.444 4.513 4.653 4.795 4.987 5.101 5.211 5.385 5.536 5.665 5.786 5.899 6.047 6.194 6.328 6.485 6.632 6.763 6.911 7.076 7.236 7.414 7.606 7.791 7.959 8.138 8.342 8.532 8.728 8.923 9.136 9.336 9.461 9.377 8.947 8.198 7.42 6.662 5.935 5.247 4.614 4.013 3.449 2.912 2.477 2.06 1.661 1.29 0.938 0.604 0.254 -0.055 -0.33 -0.598 -0.879 -1.129 -1.384 -1.657 -1.883 -2.132 -2.376 -2.622 -2.877 -3.049 -3.233 -3.526 -3.733 -3.96 -4.082 -4.333 -4.595 -4.897 -5.06 -5.301 -5.517 -5.701 -5.908 -6.381 -6.656 -6.955 -7.276 -7.651 -8.129 -8.748 -10.875 -7 ,14253 ,KEBNE ,16676859,Wed Nov 24 14:46:29 CET,Wed Nov 24 16:40:03 CET,0.0 1.39 1.869 2.227 2.514 2.741 2.923 3.089 3.384 3.51 3.63 3.773 3.971 4.072 4.268 4.452 4.619 4.695 4.838 4.971 5.16 5.276 5.387 5.544 5.69 5.832 5.971 6.103 6.268 6.419 6.56 6.73 6.885 7.036 7.206 7.385 7.546 7.723 7.907 8.094 8.294 8.488 8.704 8.921 9.135 9.334 9.516 9.688 9.803 9.743 9.32 8.521 7.722 6.895 6.124 5.472 4.89 4.321 3.815 3.298 2.834 2.402 2.007 1.653 1.301 0.964 0.606 0.29 0.025 -0.249 -0.546 -0.81 -1.093 -1.398 -1.642 -1.895 -2.173 -2.454 -2.719 -2.905 -3.108 -3.435 -3.663 -3.91 -4.039 -4.306 -4.573 -4.853 -5.01 -5.281 -5.607 -5.826 -6.053 -6.576 -6.877 -7.206 -7.561 -7.986 -8.516 -9.229 -12.963 -8 ,12505 ,KEBNE ,16676860,Wed Nov 24 14:46:29 CET,Wed Nov 24 16:39:04 CET,0.0 1.622 2.098 2.425 2.699 2.937 3.134 3.305 3.588 3.718 3.842 3.975 4.167 4.271 4.451 4.615 4.776 4.85 4.995 5.13 5.317 5.427 5.53 5.691 5.838 5.976 6.124 6.258 6.42 6.58 6.723 6.879 7.024 7.173 7.343 7.511 7.674 7.858 8.051 8.234 8.399 8.577 8.779 8.973 9.2 9.414 9.586 9.712 9.767 9.665 9.201 8.336 7.475 6.717 6.014 5.347 4.753 4.173 3.654 3.159 2.725 2.296 1.862 1.449 1.061 0.695 0.33 -0.003 -0.309 -0.617 -0.907 -1.137 -1.405 -1.696 -1.921 -2.161 -2.408 -2.66 -2.927 -3.118 -3.315 -3.636 -3.862 -4.114 -4.248 -4.53 -4.819 -5.135 -5.302 -5.562 -5.852 -6.052 -6.274 -6.793 -7.064 -7.358 -7.718 -8.186 -8.703 -9.294 -12.107 -9 ,9803 ,KEBNE ,16676861,Wed Nov 24 14:46:29 CET,Wed Nov 24 16:39:07 CET,0.0 1.144 1.591 1.895 2.141 2.367 2.574 2.758 3.079 3.219 3.346 3.49 3.69 3.798 3.999 4.176 4.325 4.399 4.546 4.685 4.879 5.002 5.112 5.274 5.437 5.586 5.715 5.839 5.996 6.133 6.276 6.455 6.613 6.758 6.917 7.105 7.29 7.471 7.652 7.827 8.011 8.222 8.446 8.661 8.893 9.114 9.311 9.457 9.556 9.536 9.26 8.635 7.896 7.172 6.498 5.866 5.289 4.759 4.287 3.816 3.411 3.012 2.621 2.259 1.913 1.606 1.282 0.978 0.702 0.376 0.041 -0.205 -0.455 -0.728 -0.946 -1.176 -1.419 -1.663 -1.92 -2.105 -2.303 -2.611 -2.827 -3.048 -3.162 -3.41 -3.692 -4.01 -4.167 -4.421 -4.704 -4.905 -5.101 -5.526 -5.784 -6.06 -6.362 -6.759 -7.254 -7.842 -9.996 -10 ,19587 ,KEBNE ,16676862,Wed Nov 24 14:46:30 CET,Wed Nov 24 16:40:24 CET,0.0 1.56 2.041 2.359 2.624 2.858 3.042 3.203 3.493 3.619 3.733 3.855 4.045 4.14 4.31 4.459 4.612 4.69 4.832 4.962 5.145 5.263 5.38 5.551 5.708 5.85 5.983 6.105 6.262 6.409 6.543 6.709 6.873 7.023 7.186 7.361 7.521 7.692 7.875 8.065 8.257 8.447 8.649 8.833 9.041 9.269 9.474 9.648 9.755 9.655 9.216 8.439 7.577 6.763 6.053 5.36 4.718 4.136 3.61 3.048 2.574 2.137 1.675 1.263 0.908 0.585 0.231 -0.102 -0.388 -0.685 -0.99 -1.244 -1.525 -1.843 -2.089 -2.333 -2.59 -2.868 -3.172 -3.386 -3.615 -4.004 -4.269 -4.528 -4.668 -4.963 -5.267 -5.597 -5.769 -6.039 -6.328 -6.545 -6.771 -7.249 -7.533 -7.854 -8.238 -8.689 -9.179 -9.897 -12.739 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_20.txt deleted file mode 100644 index 0951f759..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_20.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7319 ,KEBNE ,16676863,Wed Nov 24 14:46:33 CET,Wed Nov 24 16:39:19 CET,0.0 1.36 1.846 2.176 2.433 2.672 2.896 3.094 3.425 3.569 3.709 3.87 4.081 4.2 4.412 4.621 4.821 4.909 5.076 5.237 5.465 5.614 5.756 5.964 6.162 6.34 6.514 6.68 6.882 7.076 7.257 7.469 7.679 7.892 8.146 8.415 8.642 8.895 9.168 9.425 9.69 10.003 10.365 10.695 11.054 11.449 11.843 12.202 12.507 12.706 12.706 12.19 11.47 10.771 10.072 9.404 8.835 8.326 7.884 7.412 6.975 6.58 6.215 5.865 5.527 5.224 4.902 4.61 4.365 4.105 3.815 3.573 3.314 3.041 2.838 2.621 2.397 2.17 1.922 1.748 1.561 1.276 1.086 0.882 0.78 0.586 0.383 0.169 0.053 -0.167 -0.343 -0.477 -0.628 -0.98 -1.177 -1.391 -1.596 -1.819 -2.106 -2.467 -3.5 -2 ,23652 ,KEBNE ,16676864,Wed Nov 24 14:46:29 CET,Wed Nov 24 16:40:24 CET,0.0 1.444 1.897 2.212 2.487 2.734 2.952 3.139 3.47 3.626 3.775 3.951 4.164 4.28 4.503 4.716 4.917 5.017 5.207 5.374 5.61 5.758 5.894 6.093 6.289 6.481 6.663 6.832 7.049 7.259 7.459 7.686 7.894 8.076 8.289 8.54 8.782 9.047 9.296 9.531 9.771 10.013 10.261 10.486 10.736 11.023 11.364 11.694 11.899 11.896 11.567 10.857 10.085 9.325 8.642 8.007 7.417 6.843 6.36 5.881 5.455 5.085 4.723 4.365 4.026 3.711 3.37 3.068 2.809 2.536 2.275 2.054 1.808 1.552 1.343 1.136 0.919 0.691 0.458 0.294 0.121 -0.157 -0.361 -0.572 -0.681 -0.908 -1.14 -1.384 -1.515 -1.749 -1.972 -2.137 -2.31 -2.688 -2.88 -3.086 -3.317 -3.593 -3.925 -4.359 -5.526 -3 ,10552 ,KEBNE ,16676865,Wed Nov 24 14:46:30 CET,Wed Nov 24 16:40:58 CET,0.0 1.733 2.177 2.517 2.808 3.052 3.266 3.461 3.798 3.952 4.106 4.313 4.535 4.667 4.906 5.126 5.342 5.446 5.635 5.813 6.065 6.221 6.374 6.598 6.804 6.998 7.183 7.362 7.591 7.798 7.986 8.206 8.411 8.611 8.838 9.075 9.297 9.544 9.801 10.057 10.328 10.63 10.955 11.258 11.615 11.949 12.237 12.521 12.776 12.932 12.897 12.487 11.873 11.213 10.561 9.895 9.292 8.758 8.291 7.825 7.416 7.039 6.667 6.281 5.926 5.629 5.317 5.022 4.765 4.504 4.232 3.993 3.746 3.49 3.281 3.065 2.846 2.611 2.374 2.215 2.033 1.736 1.54 1.332 1.224 1.005 0.768 0.528 0.394 0.151 -0.069 -0.227 -0.395 -0.784 -0.991 -1.222 -1.482 -1.765 -2.119 -2.563 -3.885 -4 ,27452 ,KEBNE ,16676866,Wed Nov 24 14:48:31 CET,Wed Nov 24 16:45:11 CET,0.0 1.239 1.675 2.018 2.295 2.526 2.726 2.905 3.225 3.373 3.506 3.649 3.855 3.975 4.199 4.4 4.586 4.676 4.846 5.008 5.24 5.379 5.507 5.693 5.876 6.059 6.222 6.373 6.573 6.766 6.948 7.161 7.354 7.537 7.748 7.988 8.222 8.472 8.741 9.0 9.266 9.582 9.929 10.24 10.571 10.897 11.199 11.501 11.724 11.718 11.404 10.691 9.942 9.206 8.502 7.858 7.271 6.738 6.269 5.768 5.328 4.939 4.56 4.194 3.852 3.531 3.192 2.885 2.617 2.354 2.072 1.82 1.56 1.302 1.102 0.892 0.669 0.44 0.214 0.052 -0.123 -0.414 -0.62 -0.825 -0.932 -1.144 -1.368 -1.628 -1.775 -2.019 -2.224 -2.387 -2.562 -2.948 -3.157 -3.389 -3.648 -3.958 -4.334 -4.762 -6.026 -5 ,26290 ,KEBNE ,16676867,Wed Nov 24 14:48:32 CET,Wed Nov 24 16:43:57 CET,0.0 1.455 1.889 2.232 2.532 2.803 3.058 3.283 3.664 3.832 3.977 4.166 4.389 4.511 4.757 5.002 5.24 5.351 5.554 5.737 5.998 6.166 6.325 6.546 6.755 6.952 7.141 7.322 7.554 7.778 7.99 8.23 8.448 8.651 8.886 9.146 9.379 9.633 9.907 10.193 10.46 10.714 10.991 11.257 11.557 11.903 12.254 12.579 12.897 13.051 12.772 11.992 11.152 10.445 9.831 9.228 8.689 8.185 7.724 7.223 6.785 6.393 6.006 5.634 5.286 4.954 4.603 4.306 4.051 3.782 3.494 3.26 3.02 2.746 2.522 2.296 2.06 1.814 1.571 1.404 1.222 0.934 0.744 0.552 0.452 0.238 0.007 -0.246 -0.378 -0.605 -0.828 -0.995 -1.161 -1.511 -1.703 -1.94 -2.199 -2.512 -2.882 -3.344 -4.691 -6 ,32348 ,KEBNE ,16676868,Wed Nov 24 14:48:31 CET,Wed Nov 24 16:42:24 CET,0.0 0.926 1.347 1.649 1.888 2.096 2.282 2.465 2.8 2.941 3.077 3.233 3.436 3.547 3.765 3.97 4.166 4.263 4.447 4.607 4.833 4.976 5.111 5.304 5.492 5.672 5.834 5.985 6.172 6.359 6.546 6.761 6.957 7.148 7.363 7.594 7.818 8.059 8.311 8.576 8.862 9.173 9.487 9.747 10.018 10.355 10.719 11.035 11.253 11.283 10.991 10.323 9.677 9.03 8.367 7.749 7.175 6.636 6.179 5.723 5.31 4.948 4.596 4.245 3.91 3.603 3.289 2.988 2.717 2.44 2.154 1.919 1.677 1.417 1.207 0.984 0.749 0.504 0.245 0.067 -0.116 -0.403 -0.607 -0.818 -0.925 -1.156 -1.411 -1.688 -1.831 -2.073 -2.278 -2.43 -2.599 -2.977 -3.179 -3.405 -3.646 -3.945 -4.346 -4.863 -6.122 -7 ,26020 ,KEBNE ,16676869,Wed Nov 24 14:48:31 CET,Wed Nov 24 16:43:34 CET,0.0 0.854 1.183 1.44 1.675 1.877 2.052 2.205 2.479 2.613 2.746 2.91 3.111 3.222 3.42 3.589 3.756 3.839 3.981 4.112 4.31 4.436 4.564 4.755 4.938 5.103 5.254 5.407 5.611 5.801 5.97 6.171 6.367 6.544 6.737 6.968 7.186 7.411 7.639 7.886 8.159 8.44 8.753 9.063 9.401 9.758 10.108 10.417 10.673 10.808 10.675 10.12 9.477 8.829 8.209 7.601 7.06 6.576 6.136 5.689 5.297 4.94 4.581 4.242 3.933 3.641 3.325 3.041 2.796 2.54 2.278 2.047 1.797 1.533 1.335 1.14 0.931 0.702 0.468 0.307 0.141 -0.122 -0.309 -0.495 -0.592 -0.803 -1.018 -1.241 -1.362 -1.577 -1.753 -1.902 -2.067 -2.432 -2.636 -2.849 -3.076 -3.328 -3.635 -4.018 -4.947 -8 ,6416 ,KEBNE ,16676870,Wed Nov 24 14:49:31 CET,Wed Nov 24 16:42:47 CET,0.0 0.827 1.189 1.431 1.656 1.844 2.022 2.199 2.517 2.666 2.81 2.978 3.174 3.274 3.458 3.656 3.857 3.943 4.104 4.254 4.478 4.622 4.757 4.958 5.135 5.291 5.44 5.586 5.77 5.946 6.121 6.324 6.513 6.683 6.879 7.092 7.291 7.522 7.761 7.987 8.241 8.527 8.824 9.118 9.449 9.793 10.14 10.428 10.58 10.543 10.374 9.846 9.106 8.413 7.755 7.113 6.508 5.937 5.43 4.903 4.429 4.009 3.617 3.225 2.857 2.52 2.163 1.857 1.592 1.318 1.036 0.792 0.53 0.249 0.037 -0.176 -0.402 -0.63 -0.865 -1.04 -1.222 -1.493 -1.685 -1.89 -1.996 -2.218 -2.455 -2.705 -2.836 -3.06 -3.253 -3.411 -3.581 -3.966 -4.184 -4.427 -4.685 -4.97 -5.285 -5.706 -6.904 -9 ,24179 ,KEBNE ,16676871,Wed Nov 24 14:49:31 CET,Wed Nov 24 16:44:04 CET,0.0 0.84 1.198 1.466 1.681 1.874 2.04 2.195 2.488 2.62 2.744 2.891 3.08 3.181 3.369 3.541 3.707 3.784 3.931 4.085 4.31 4.449 4.582 4.761 4.928 5.088 5.247 5.405 5.601 5.792 5.973 6.18 6.395 6.606 6.832 7.077 7.302 7.544 7.798 8.053 8.301 8.58 8.899 9.192 9.509 9.825 10.128 10.42 10.7 10.879 10.745 10.218 9.597 8.989 8.433 7.87 7.367 6.899 6.462 6.011 5.612 5.241 4.886 4.553 4.235 3.948 3.658 3.381 3.138 2.894 2.626 2.4 2.157 1.891 1.687 1.487 1.272 1.039 0.802 0.631 0.451 0.185 0.003 -0.186 -0.28 -0.482 -0.698 -0.929 -1.053 -1.269 -1.448 -1.596 -1.756 -2.098 -2.288 -2.498 -2.728 -2.998 -3.287 -3.678 -4.599 -10 ,23694 ,KEBNE ,16676872,Wed Nov 24 14:49:31 CET,Wed Nov 24 16:43:37 CET,0.0 1.386 1.834 2.179 2.457 2.697 2.915 3.111 3.461 3.618 3.76 3.922 4.13 4.248 4.465 4.663 4.859 4.955 5.138 5.309 5.551 5.709 5.855 6.052 6.232 6.406 6.579 6.756 6.981 7.181 7.372 7.605 7.819 8.027 8.274 8.547 8.801 9.069 9.352 9.64 9.928 10.238 10.58 10.912 11.284 11.675 12.071 12.438 12.668 12.626 12.335 11.799 11.201 10.57 9.938 9.342 8.799 8.267 7.783 7.298 6.909 6.552 6.179 5.822 5.49 5.195 4.875 4.573 4.308 4.028 3.73 3.477 3.221 2.964 2.764 2.563 2.349 2.113 1.867 1.687 1.496 1.218 1.032 0.839 0.729 0.493 0.251 -0.012 -0.144 -0.373 -0.582 -0.743 -0.92 -1.312 -1.545 -1.795 -2.045 -2.339 -2.667 -3.071 -4.378 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_43.txt deleted file mode 100644 index ee18a377..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18357 ,KEBNE ,16676873,Wed Nov 24 14:49:31 CET,Wed Nov 24 16:44:55 CET,0.0 1.088 1.52 1.84 2.085 2.266 2.431 2.585 2.862 2.998 3.118 3.239 3.43 3.535 3.722 3.889 4.039 4.103 4.224 4.35 4.537 4.659 4.774 4.939 5.097 5.248 5.394 5.522 5.682 5.829 5.96 6.116 6.256 6.396 6.561 6.742 6.92 7.096 7.274 7.451 7.619 7.818 8.047 8.253 8.493 8.76 9.023 9.214 9.281 9.175 8.711 7.864 7.002 6.224 5.537 4.922 4.37 3.819 3.319 2.82 2.346 1.911 1.496 1.085 0.71 0.355 -0.021 -0.358 -0.659 -0.972 -1.304 -1.583 -1.87 -2.181 -2.416 -2.651 -2.9 -3.155 -3.431 -3.634 -3.844 -4.179 -4.41 -4.646 -4.775 -5.052 -5.347 -5.667 -5.829 -6.089 -6.363 -6.56 -6.769 -7.225 -7.473 -7.781 -8.123 -8.519 -9.028 -9.733 -12.25 -2 ,15271 ,KEBNE ,16676874,Wed Nov 24 14:49:31 CET,Wed Nov 24 16:43:12 CET,0.0 1.333 1.769 2.062 2.297 2.488 2.675 2.85 3.141 3.284 3.425 3.582 3.784 3.882 4.07 4.249 4.415 4.498 4.647 4.784 4.984 5.105 5.215 5.367 5.512 5.646 5.768 5.884 6.032 6.173 6.308 6.472 6.636 6.789 6.966 7.155 7.319 7.498 7.691 7.894 8.092 8.313 8.558 8.762 8.984 9.202 9.393 9.531 9.622 9.608 9.298 8.57 7.754 6.998 6.318 5.663 5.066 4.498 3.97 3.448 2.973 2.518 2.101 1.709 1.341 1.012 0.663 0.339 0.064 -0.226 -0.54 -0.793 -1.057 -1.345 -1.584 -1.84 -2.114 -2.411 -2.707 -2.907 -3.112 -3.419 -3.633 -3.847 -3.956 -4.189 -4.438 -4.706 -4.851 -5.086 -5.309 -5.49 -5.681 -6.089 -6.323 -6.584 -6.892 -7.243 -7.655 -8.255 -10.673 -3 ,11664 ,KEBNE ,16676875,Wed Nov 24 14:49:31 CET,Wed Nov 24 16:49:38 CET,0.0 1.684 2.125 2.412 2.642 2.842 3.002 3.155 3.43 3.551 3.666 3.78 3.961 4.057 4.228 4.378 4.524 4.595 4.744 4.883 5.056 5.167 5.274 5.419 5.576 5.725 5.85 5.973 6.141 6.294 6.428 6.584 6.747 6.898 7.06 7.248 7.415 7.599 7.795 7.985 8.174 8.369 8.578 8.789 9.009 9.21 9.411 9.573 9.696 9.743 9.461 8.731 7.986 7.3 6.645 6.011 5.441 4.909 4.445 3.962 3.532 3.15 2.779 2.42 2.094 1.803 1.492 1.21 0.952 0.678 0.398 0.162 -0.086 -0.339 -0.537 -0.74 -0.954 -1.2 -1.458 -1.625 -1.799 -2.077 -2.265 -2.46 -2.561 -2.79 -3.041 -3.298 -3.436 -3.675 -3.907 -4.071 -4.246 -4.648 -4.875 -5.138 -5.423 -5.739 -6.129 -6.713 -8.928 -4 ,22693 ,KEBNE ,16676876,Wed Nov 24 14:49:31 CET,Wed Nov 24 16:43:07 CET,0.0 1.18 1.604 1.913 2.134 2.323 2.49 2.629 2.871 2.987 3.102 3.213 3.386 3.469 3.639 3.804 3.957 4.029 4.159 4.28 4.449 4.555 4.655 4.805 4.957 5.099 5.225 5.333 5.476 5.613 5.743 5.893 6.036 6.174 6.333 6.504 6.654 6.821 7.003 7.184 7.358 7.547 7.746 7.935 8.173 8.416 8.626 8.825 8.943 8.916 8.585 7.863 7.123 6.424 5.778 5.159 4.616 4.098 3.608 3.116 2.689 2.287 1.901 1.542 1.213 0.905 0.553 0.216 -0.082 -0.38 -0.688 -0.948 -1.208 -1.478 -1.688 -1.923 -2.181 -2.453 -2.751 -2.958 -3.157 -3.466 -3.693 -3.927 -4.051 -4.304 -4.576 -4.853 -4.994 -5.24 -5.459 -5.626 -5.806 -6.209 -6.455 -6.707 -6.987 -7.321 -7.713 -8.266 -10.672 -5 ,29209 ,KEBNE ,16676877,Wed Nov 24 14:49:31 CET,Wed Nov 24 16:43:19 CET,0.0 1.179 1.597 1.917 2.186 2.394 2.569 2.731 3.025 3.156 3.281 3.412 3.604 3.7 3.879 4.056 4.216 4.294 4.445 4.585 4.789 4.916 5.025 5.183 5.338 5.486 5.62 5.743 5.902 6.044 6.18 6.35 6.506 6.65 6.819 7.003 7.18 7.375 7.574 7.774 7.972 8.185 8.419 8.624 8.855 9.084 9.283 9.416 9.498 9.49 9.206 8.552 7.811 7.116 6.484 5.856 5.233 4.66 4.176 3.681 3.246 2.854 2.487 2.144 1.808 1.483 1.144 0.848 0.592 0.312 0.012 -0.225 -0.473 -0.74 -0.947 -1.177 -1.417 -1.651 -1.892 -2.068 -2.26 -2.571 -2.791 -3.021 -3.141 -3.402 -3.687 -3.974 -4.123 -4.376 -4.599 -4.759 -4.938 -5.363 -5.6 -5.864 -6.157 -6.522 -7.039 -7.691 -9.704 -6 ,4724 ,KEBNE ,16676878,Wed Nov 24 14:49:31 CET,Wed Nov 24 16:43:38 CET,0.0 1.325 1.726 2.025 2.282 2.494 2.666 2.823 3.092 3.224 3.352 3.486 3.677 3.779 3.97 4.138 4.298 4.371 4.504 4.632 4.81 4.923 5.039 5.195 5.337 5.471 5.603 5.73 5.88 6.027 6.171 6.342 6.496 6.639 6.808 6.994 7.164 7.348 7.542 7.741 7.947 8.149 8.339 8.51 8.727 8.977 9.192 9.346 9.453 9.405 8.991 8.269 7.553 6.848 6.153 5.485 4.904 4.356 3.867 3.343 2.892 2.492 2.106 1.754 1.422 1.108 0.782 0.475 0.202 -0.097 -0.422 -0.681 -0.95 -1.233 -1.454 -1.686 -1.931 -2.178 -2.426 -2.599 -2.777 -3.078 -3.308 -3.548 -3.671 -3.92 -4.165 -4.421 -4.558 -4.795 -5.027 -5.201 -5.388 -5.821 -6.062 -6.332 -6.647 -6.981 -7.358 -7.876 -10.083 -7 ,26598 ,KEBNE ,16676879,Wed Nov 24 14:50:33 CET,Wed Nov 24 16:46:05 CET,0.0 1.409 1.768 2.019 2.236 2.43 2.595 2.75 3.017 3.134 3.245 3.352 3.529 3.62 3.794 3.942 4.075 4.141 4.276 4.399 4.568 4.678 4.78 4.925 5.061 5.197 5.325 5.442 5.595 5.74 5.881 6.053 6.216 6.36 6.504 6.672 6.835 7.0 7.181 7.369 7.556 7.761 7.976 8.17 8.371 8.553 8.733 8.874 8.936 8.833 8.449 7.715 6.911 6.183 5.552 4.934 4.346 3.798 3.315 2.833 2.406 2.0 1.608 1.244 0.904 0.581 0.234 -0.068 -0.325 -0.598 -0.894 -1.158 -1.44 -1.731 -1.956 -2.18 -2.409 -2.656 -2.922 -3.105 -3.292 -3.593 -3.805 -4.023 -4.135 -4.363 -4.624 -4.923 -5.077 -5.325 -5.57 -5.744 -5.924 -6.33 -6.551 -6.802 -7.087 -7.439 -7.902 -8.559 -10.804 -8 ,6996 ,KEBNE ,16676880,Wed Nov 24 14:50:33 CET,Wed Nov 24 16:44:35 CET,0.0 1.204 1.619 1.944 2.183 2.391 2.584 2.739 2.998 3.121 3.238 3.352 3.521 3.61 3.777 3.92 4.059 4.127 4.257 4.38 4.555 4.669 4.767 4.908 5.05 5.184 5.317 5.436 5.582 5.727 5.867 6.036 6.189 6.329 6.482 6.647 6.808 6.984 7.165 7.342 7.499 7.692 7.919 8.122 8.351 8.549 8.73 8.884 8.995 8.973 8.581 7.823 7.052 6.316 5.656 5.04 4.437 3.891 3.448 2.994 2.564 2.154 1.763 1.4 1.051 0.74 0.421 0.121 -0.142 -0.421 -0.714 -0.966 -1.223 -1.482 -1.689 -1.921 -2.161 -2.397 -2.648 -2.83 -3.015 -3.302 -3.512 -3.732 -3.849 -4.098 -4.366 -4.656 -4.808 -5.057 -5.291 -5.466 -5.645 -6.055 -6.301 -6.573 -6.864 -7.207 -7.625 -8.238 -10.88 -9 ,3792 ,KEBNE ,16676881,Wed Nov 24 14:50:35 CET,Wed Nov 24 16:40:17 CET,0.0 1.351 1.751 2.047 2.309 2.532 2.717 2.874 3.155 3.289 3.41 3.536 3.728 3.823 3.992 4.14 4.293 4.367 4.501 4.63 4.814 4.927 5.037 5.188 5.327 5.462 5.593 5.718 5.877 6.024 6.153 6.311 6.46 6.597 6.764 6.943 7.102 7.273 7.449 7.632 7.818 8.005 8.208 8.431 8.666 8.863 9.05 9.188 9.247 9.204 8.84 8.025 7.26 6.614 5.965 5.321 4.756 4.224 3.735 3.234 2.804 2.409 2.032 1.679 1.346 1.04 0.708 0.423 0.18 -0.087 -0.366 -0.594 -0.84 -1.102 -1.298 -1.513 -1.746 -1.975 -2.209 -2.372 -2.542 -2.818 -3.011 -3.2 -3.299 -3.528 -3.783 -4.042 -4.176 -4.422 -4.643 -4.799 -4.967 -5.355 -5.578 -5.822 -6.091 -6.409 -6.8 -7.345 -9.589 -10 ,18770 ,KEBNE ,16676882,Wed Nov 24 14:51:34 CET,Wed Nov 24 16:45:43 CET,0.0 1.189 1.534 1.794 2.005 2.193 2.37 2.53 2.793 2.911 3.02 3.127 3.312 3.404 3.575 3.732 3.886 3.964 4.099 4.224 4.403 4.514 4.624 4.777 4.913 5.04 5.154 5.269 5.421 5.556 5.689 5.851 5.993 6.131 6.293 6.469 6.636 6.803 6.971 7.154 7.328 7.507 7.714 7.912 8.131 8.329 8.515 8.699 8.829 8.771 8.37 7.642 6.919 6.235 5.571 4.917 4.328 3.776 3.274 2.767 2.325 1.918 1.522 1.143 0.783 0.444 0.096 -0.215 -0.495 -0.787 -1.091 -1.351 -1.62 -1.888 -2.097 -2.323 -2.553 -2.791 -3.04 -3.214 -3.402 -3.689 -3.883 -4.097 -4.212 -4.456 -4.709 -4.962 -5.106 -5.35 -5.578 -5.751 -5.935 -6.387 -6.641 -6.904 -7.199 -7.538 -7.93 -8.525 -10.561 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_39.txt deleted file mode 100644 index d6e67a76..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29244 ,KEBNE ,16676883,Wed Nov 24 14:51:34 CET,Wed Nov 24 16:51:32 CET,0.0 0.866 1.232 1.525 1.769 1.981 2.157 2.313 2.598 2.725 2.849 2.994 3.193 3.29 3.469 3.637 3.796 3.875 4.027 4.169 4.367 4.504 4.643 4.834 5.025 5.204 5.365 5.519 5.712 5.896 6.082 6.31 6.515 6.703 6.918 7.159 7.389 7.647 7.921 8.206 8.507 8.847 9.219 9.55 9.927 10.371 10.823 11.258 11.754 12.298 12.761 12.825 12.617 12.282 11.918 11.512 11.08 10.7 10.389 10.057 9.742 9.453 9.175 8.9 8.635 8.381 8.1 7.855 7.657 7.458 7.245 7.062 6.865 6.659 6.49 6.304 6.113 5.913 5.703 5.558 5.403 5.15 4.979 4.799 4.705 4.514 4.312 4.107 3.993 3.763 3.559 3.406 3.218 2.742 2.476 2.224 1.989 1.714 1.336 0.774 -1.32 -2 ,20118 ,KEBNE ,16676884,Wed Nov 24 14:51:34 CET,Wed Nov 24 16:45:00 CET,0.0 1.211 1.645 1.938 2.182 2.392 2.58 2.748 3.061 3.208 3.341 3.488 3.693 3.799 4.01 4.204 4.39 4.481 4.646 4.79 5.012 5.16 5.29 5.477 5.659 5.829 5.998 6.155 6.347 6.537 6.716 6.923 7.129 7.331 7.554 7.789 8.004 8.249 8.515 8.783 9.069 9.394 9.742 10.089 10.474 10.873 11.316 11.782 12.233 12.637 12.883 12.741 12.473 12.11 11.713 11.336 10.976 10.64 10.322 9.965 9.647 9.347 9.041 8.76 8.513 8.271 8.015 7.803 7.612 7.392 7.155 6.955 6.743 6.523 6.357 6.19 6.013 5.816 5.603 5.468 5.322 5.087 4.931 4.75 4.652 4.452 4.246 4.032 3.917 3.703 3.524 3.372 3.219 2.874 2.679 2.46 2.199 1.934 1.591 1.055 -2.052 -3 ,17810 ,KEBNE ,16676885,Wed Nov 24 14:51:34 CET,Wed Nov 24 16:45:07 CET,0.0 1.08 1.474 1.773 1.995 2.19 2.383 2.555 2.853 2.995 3.135 3.311 3.531 3.638 3.838 4.028 4.202 4.284 4.443 4.593 4.811 4.948 5.078 5.271 5.464 5.642 5.799 5.953 6.145 6.316 6.482 6.695 6.903 7.091 7.305 7.557 7.796 8.05 8.32 8.589 8.874 9.206 9.572 9.914 10.296 10.699 11.119 11.529 11.965 12.375 12.622 12.536 12.231 11.829 11.476 11.151 10.802 10.468 10.157 9.807 9.483 9.209 8.944 8.662 8.397 8.148 7.881 7.646 7.435 7.229 7.017 6.83 6.633 6.438 6.289 6.124 5.946 5.77 5.562 5.389 5.226 4.985 4.809 4.632 4.548 4.375 4.189 3.953 3.8 3.557 3.379 3.222 3.062 2.733 2.548 2.323 2.07 1.786 1.452 0.924 -2.779 -4 ,5714 ,KEBNE ,16676886,Wed Nov 24 14:52:35 CET,Wed Nov 24 16:47:24 CET,0.0 0.926 1.321 1.599 1.835 2.049 2.24 2.41 2.709 2.85 2.986 3.132 3.342 3.452 3.653 3.845 4.029 4.112 4.271 4.419 4.641 4.78 4.904 5.083 5.264 5.435 5.591 5.75 5.95 6.14 6.321 6.534 6.741 6.935 7.159 7.406 7.626 7.852 8.1 8.362 8.63 8.927 9.256 9.587 9.973 10.391 10.825 11.273 11.748 12.147 12.458 12.467 12.262 11.982 11.659 11.304 10.926 10.537 10.185 9.825 9.515 9.219 8.932 8.659 8.392 8.149 7.914 7.705 7.52 7.313 7.07 6.868 6.661 6.436 6.268 6.099 5.908 5.7 5.479 5.34 5.2 4.968 4.81 4.646 4.558 4.37 4.159 3.903 3.769 3.543 3.355 3.205 3.065 2.717 2.51 2.294 2.034 1.738 1.404 0.899 -3.158 -5 ,2193 ,KEBNE ,16676887,Wed Nov 24 14:52:39 CET,Wed Nov 24 16:47:42 CET,0.0 1.536 1.99 2.311 2.573 2.785 2.969 3.151 3.503 3.648 3.784 3.958 4.169 4.279 4.497 4.706 4.889 4.976 5.15 5.315 5.546 5.688 5.819 6.001 6.167 6.324 6.488 6.65 6.843 7.03 7.218 7.436 7.636 7.825 8.051 8.303 8.527 8.779 9.05 9.322 9.601 9.906 10.243 10.573 10.946 11.308 11.711 12.117 12.468 12.779 12.945 12.763 12.398 11.987 11.557 11.13 10.752 10.412 10.1 9.755 9.446 9.168 8.893 8.622 8.357 8.112 7.882 7.693 7.522 7.337 7.13 6.943 6.746 6.538 6.37 6.196 6.01 5.811 5.608 5.474 5.318 5.052 4.862 4.648 4.532 4.316 4.086 3.835 3.717 3.493 3.298 3.138 2.971 2.595 2.375 2.147 1.899 1.596 1.207 0.651 -1.511 -6 ,15286 ,KEBNE ,16676888,Wed Nov 24 14:52:36 CET,Wed Nov 24 16:46:32 CET,0.0 1.13 1.606 1.935 2.196 2.425 2.628 2.81 3.114 3.252 3.385 3.541 3.753 3.862 4.067 4.262 4.445 4.528 4.68 4.819 5.031 5.167 5.291 5.477 5.657 5.829 6.0 6.155 6.353 6.553 6.725 6.928 7.13 7.331 7.556 7.784 7.997 8.23 8.474 8.734 9.012 9.316 9.636 9.93 10.275 10.638 11.043 11.476 11.909 12.323 12.545 12.388 12.032 11.645 11.304 10.899 10.471 10.103 9.778 9.403 9.079 8.789 8.521 8.268 7.991 7.708 7.405 7.132 6.884 6.63 6.373 6.157 5.937 5.705 5.538 5.373 5.197 5.006 4.794 4.647 4.482 4.215 4.036 3.84 3.737 3.528 3.301 3.04 2.899 2.646 2.433 2.264 2.097 1.744 1.53 1.27 0.944 0.586 0.175 -0.403 -6.068 -7 ,19777 ,KEBNE ,16676889,Wed Nov 24 14:52:35 CET,Wed Nov 24 16:46:50 CET,0.0 0.91 1.345 1.677 1.929 2.154 2.349 2.522 2.843 2.981 3.109 3.256 3.481 3.607 3.832 4.038 4.221 4.301 4.457 4.609 4.83 4.976 5.133 5.345 5.517 5.69 5.86 6.025 6.222 6.408 6.585 6.798 7.008 7.202 7.435 7.692 7.918 8.156 8.42 8.733 9.04 9.335 9.662 9.989 10.357 10.739 11.171 11.634 12.059 12.425 12.686 12.541 12.126 11.643 11.213 10.821 10.439 10.059 9.724 9.36 9.037 8.758 8.474 8.183 7.918 7.688 7.421 7.178 6.97 6.74 6.507 6.307 6.088 5.862 5.688 5.503 5.301 5.083 4.857 4.71 4.564 4.326 4.155 3.973 3.878 3.683 3.466 3.239 3.123 2.905 2.711 2.548 2.38 2.001 1.775 1.529 1.246 0.93 0.557 -0.037 -3.041 -8 ,9329 ,KEBNE ,16676890,Wed Nov 24 14:53:39 CET,Wed Nov 24 16:48:34 CET,0.0 0.684 1.021 1.267 1.481 1.676 1.85 2.017 2.335 2.477 2.615 2.77 2.975 3.088 3.299 3.484 3.671 3.761 3.92 4.068 4.285 4.425 4.557 4.733 4.907 5.086 5.248 5.398 5.577 5.758 5.947 6.166 6.37 6.559 6.769 7.007 7.23 7.461 7.707 7.964 8.23 8.507 8.848 9.209 9.575 9.949 10.38 10.804 11.166 11.465 11.605 11.437 11.151 10.804 10.375 9.93 9.508 9.089 8.729 8.374 8.052 7.756 7.469 7.185 6.904 6.633 6.361 6.13 5.936 5.726 5.49 5.293 5.068 4.82 4.632 4.431 4.223 4.0 3.772 3.617 3.44 3.155 2.964 2.768 2.664 2.443 2.207 1.96 1.834 1.601 1.407 1.251 1.086 0.727 0.502 0.249 -0.016 -0.32 -0.667 -1.161 -3.366 -9 ,12036 ,KEBNE ,16676891,Wed Nov 24 14:53:39 CET,Wed Nov 24 16:48:37 CET,0.0 1.208 1.636 1.944 2.189 2.394 2.581 2.75 3.058 3.203 3.337 3.488 3.71 3.826 4.029 4.226 4.424 4.517 4.69 4.847 5.074 5.221 5.352 5.532 5.703 5.867 6.022 6.172 6.361 6.546 6.731 6.943 7.147 7.346 7.558 7.79 8.018 8.276 8.538 8.804 9.086 9.38 9.702 10.032 10.417 10.82 11.25 11.674 12.105 12.537 12.869 12.86 12.631 12.324 11.992 11.623 11.245 10.857 10.497 10.132 9.837 9.577 9.321 9.073 8.817 8.577 8.317 8.092 7.89 7.668 7.448 7.274 7.098 6.895 6.719 6.536 6.352 6.163 5.955 5.811 5.672 5.455 5.301 5.142 5.061 4.896 4.711 4.486 4.357 4.129 3.984 3.848 3.691 3.348 3.177 2.981 2.759 2.491 2.153 1.675 -0.861 -10 ,30335 ,KEBNE ,16676892,Wed Nov 24 14:53:39 CET,Wed Nov 24 16:47:19 CET,0.0 1.104 1.548 1.864 2.11 2.341 2.528 2.692 3.003 3.139 3.269 3.42 3.623 3.74 3.948 4.132 4.309 4.395 4.566 4.722 4.937 5.081 5.223 5.416 5.582 5.748 5.909 6.06 6.256 6.435 6.604 6.806 7.0 7.195 7.418 7.653 7.875 8.112 8.355 8.619 8.902 9.193 9.503 9.814 10.183 10.569 10.978 11.441 11.978 12.491 12.827 12.856 12.655 12.304 11.909 11.475 11.031 10.635 10.308 9.967 9.643 9.355 9.082 8.804 8.529 8.279 8.017 7.777 7.56 7.33 7.102 6.909 6.709 6.482 6.291 6.096 5.897 5.69 5.475 5.327 5.164 4.905 4.731 4.546 4.451 4.252 4.04 3.8 3.667 3.438 3.248 3.098 2.929 2.559 2.349 2.1 1.83 1.495 1.032 0.473 -1.758 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_43.txt deleted file mode 100644 index 82a291e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15362 ,KEBNE ,16676893,Wed Nov 24 14:53:39 CET,Wed Nov 24 16:48:49 CET,0.0 1.312 1.715 2.007 2.238 2.444 2.62 2.774 3.043 3.168 3.291 3.405 3.603 3.7 3.868 4.028 4.188 4.262 4.4 4.536 4.73 4.85 4.965 5.132 5.29 5.435 5.581 5.726 5.901 6.063 6.224 6.417 6.586 6.748 6.942 7.164 7.376 7.601 7.84 8.083 8.336 8.634 8.971 9.262 9.576 9.945 10.366 10.798 11.21 11.587 11.876 11.869 11.637 11.263 10.871 10.507 10.159 9.822 9.513 9.213 8.946 8.679 8.408 8.141 7.9 7.687 7.455 7.221 7.003 6.792 6.556 6.358 6.157 5.933 5.762 5.58 5.38 5.166 4.949 4.804 4.649 4.411 4.241 4.055 3.957 3.752 3.531 3.28 3.145 2.927 2.748 2.586 2.41 2.035 1.83 1.603 1.354 1.057 0.699 0.183 -2.103 -2 ,30904 ,KEBNE ,16676894,Wed Nov 24 14:54:39 CET,Wed Nov 24 16:48:57 CET,0.0 1.238 1.672 1.961 2.198 2.416 2.612 2.79 3.104 3.243 3.375 3.512 3.71 3.808 3.996 4.164 4.321 4.399 4.547 4.687 4.886 5.008 5.127 5.306 5.475 5.633 5.792 5.944 6.124 6.293 6.456 6.642 6.814 6.983 7.192 7.418 7.618 7.847 8.088 8.337 8.613 8.91 9.223 9.544 9.911 10.279 10.666 11.051 11.455 11.853 12.116 12.042 11.789 11.484 11.154 10.796 10.435 10.074 9.759 9.415 9.105 8.842 8.591 8.348 8.104 7.871 7.624 7.392 7.187 6.951 6.71 6.533 6.339 6.128 5.963 5.789 5.608 5.413 5.202 5.057 4.902 4.642 4.459 4.28 4.181 3.966 3.762 3.543 3.417 3.194 3.003 2.857 2.698 2.324 2.124 1.898 1.572 1.193 0.806 0.198 -2.127 -3 ,26284 ,KEBNE ,16676895,Wed Nov 24 14:54:39 CET,Wed Nov 24 16:47:51 CET,0.0 1.635 2.055 2.367 2.618 2.839 3.019 3.174 3.443 3.567 3.691 3.831 4.035 4.138 4.327 4.5 4.667 4.745 4.884 5.016 5.204 5.322 5.445 5.621 5.783 5.946 6.094 6.226 6.399 6.563 6.714 6.899 7.089 7.275 7.484 7.7 7.899 8.122 8.352 8.59 8.834 9.106 9.432 9.764 10.106 10.46 10.853 11.236 11.6 11.938 12.176 12.009 11.63 11.255 10.882 10.497 10.156 9.832 9.537 9.226 8.947 8.69 8.429 8.172 7.935 7.724 7.481 7.251 7.068 6.891 6.708 6.531 6.339 6.149 6.0 5.841 5.666 5.485 5.308 5.172 5.026 4.804 4.645 4.472 4.378 4.184 3.973 3.75 3.63 3.401 3.191 3.033 2.881 2.523 2.296 2.044 1.784 1.493 1.107 0.616 -1.88 -4 ,1199 ,KEBNE ,16676896,Wed Nov 24 14:54:40 CET,Wed Nov 24 16:48:25 CET,0.0 1.204 1.587 1.859 2.096 2.33 2.533 2.699 2.968 3.104 3.233 3.356 3.552 3.645 3.825 3.995 4.155 4.232 4.382 4.52 4.718 4.84 4.951 5.116 5.285 5.436 5.584 5.734 5.919 6.09 6.247 6.424 6.586 6.747 6.934 7.137 7.333 7.555 7.793 8.036 8.295 8.598 8.953 9.276 9.613 9.953 10.339 10.749 11.144 11.54 11.838 11.765 11.49 11.137 10.794 10.502 10.209 9.925 9.667 9.36 9.087 8.822 8.534 8.258 7.99 7.742 7.484 7.241 7.039 6.825 6.577 6.37 6.162 5.938 5.764 5.601 5.427 5.233 5.021 4.877 4.728 4.485 4.315 4.136 4.037 3.819 3.599 3.372 3.249 3.018 2.819 2.666 2.49 2.118 1.922 1.697 1.449 1.156 0.775 0.253 -2.844 -5 ,4810 ,KEBNE ,16676897,Wed Nov 24 14:54:40 CET,Wed Nov 24 16:49:28 CET,0.0 1.39 1.884 2.246 2.52 2.739 2.927 3.1 3.438 3.6 3.744 3.888 4.098 4.202 4.387 4.561 4.731 4.81 4.959 5.102 5.304 5.437 5.57 5.753 5.916 6.063 6.208 6.353 6.54 6.716 6.884 7.085 7.277 7.465 7.682 7.908 8.11 8.339 8.594 8.852 9.113 9.398 9.709 10.007 10.341 10.707 11.095 11.494 11.914 12.29 12.583 12.556 12.329 12.048 11.746 11.441 11.131 10.816 10.49 10.146 9.875 9.638 9.408 9.177 8.948 8.73 8.471 8.213 7.992 7.764 7.516 7.305 7.086 6.867 6.696 6.512 6.316 6.116 5.901 5.744 5.583 5.336 5.162 4.968 4.866 4.662 4.44 4.209 4.092 3.876 3.689 3.533 3.375 3.026 2.823 2.606 2.359 2.084 1.74 1.245 -0.752 -6 ,8875 ,KEBNE ,16676898,Wed Nov 24 14:54:40 CET,Wed Nov 24 16:49:36 CET,0.0 1.258 1.643 1.924 2.153 2.348 2.511 2.658 2.94 3.066 3.184 3.302 3.505 3.607 3.792 3.955 4.11 4.188 4.344 4.495 4.7 4.828 4.945 5.103 5.261 5.412 5.558 5.701 5.877 6.05 6.22 6.414 6.604 6.792 7.005 7.244 7.461 7.702 7.949 8.193 8.464 8.745 9.061 9.388 9.755 10.147 10.548 10.94 11.37 11.757 11.983 11.845 11.471 11.119 10.771 10.409 10.07 9.71 9.37 9.001 8.673 8.405 8.15 7.901 7.672 7.448 7.204 6.977 6.766 6.542 6.32 6.143 5.941 5.721 5.562 5.401 5.226 5.038 4.84 4.707 4.562 4.323 4.158 3.981 3.885 3.691 3.49 3.274 3.157 2.94 2.764 2.62 2.477 2.13 1.918 1.685 1.44 1.162 0.834 0.337 -1.972 -7 ,31370 ,KEBNE ,16676899,Wed Nov 24 14:54:39 CET,Wed Nov 24 16:51:32 CET,0.0 1.221 1.599 1.893 2.129 2.32 2.493 2.643 2.889 3.006 3.119 3.24 3.438 3.528 3.701 3.863 4.011 4.083 4.233 4.377 4.552 4.667 4.789 4.957 5.113 5.268 5.426 5.583 5.765 5.919 6.073 6.261 6.437 6.604 6.796 7.011 7.211 7.436 7.686 7.95 8.213 8.495 8.819 9.125 9.467 9.837 10.237 10.649 11.059 11.471 11.758 11.641 11.349 10.969 10.536 10.14 9.802 9.472 9.185 8.865 8.59 8.347 8.094 7.857 7.641 7.43 7.207 6.991 6.769 6.524 6.262 6.032 5.801 5.57 5.389 5.21 5.035 4.851 4.645 4.499 4.346 4.119 3.974 3.808 3.713 3.5 3.261 3.029 2.913 2.699 2.545 2.399 2.244 1.916 1.719 1.503 1.266 0.982 0.626 0.147 -2.003 -8 ,18027 ,KEBNE ,16676900,Wed Nov 24 14:55:41 CET,Wed Nov 24 16:52:07 CET,0.0 1.359 1.763 2.059 2.297 2.505 2.682 2.838 3.12 3.247 3.367 3.48 3.674 3.766 3.941 4.115 4.271 4.345 4.479 4.606 4.795 4.914 5.032 5.204 5.366 5.521 5.673 5.817 5.993 6.163 6.322 6.516 6.703 6.875 7.076 7.296 7.514 7.75 7.982 8.229 8.482 8.776 9.13 9.455 9.793 10.15 10.548 10.95 11.368 11.797 12.139 12.186 12.001 11.698 11.348 11.002 10.689 10.348 10.017 9.672 9.369 9.11 8.851 8.6 8.36 8.134 7.894 7.672 7.468 7.245 7.017 6.827 6.632 6.426 6.256 6.072 5.878 5.679 5.475 5.329 5.173 4.936 4.77 4.58 4.477 4.263 4.048 3.821 3.696 3.482 3.305 3.164 3.014 2.668 2.46 2.213 1.923 1.584 1.19 0.645 -1.447 -9 ,16065 ,KEBNE ,16676901,Wed Nov 24 14:56:43 CET,Wed Nov 24 16:50:18 CET,0.0 1.561 1.941 2.221 2.444 2.631 2.821 2.995 3.28 3.406 3.521 3.635 3.836 3.934 4.112 4.283 4.434 4.503 4.644 4.778 4.976 5.097 5.211 5.381 5.534 5.684 5.833 5.973 6.152 6.321 6.475 6.666 6.845 7.019 7.223 7.449 7.671 7.909 8.157 8.418 8.685 8.969 9.305 9.626 9.976 10.341 10.719 11.131 11.565 11.946 12.207 12.128 11.899 11.65 11.352 11.026 10.701 10.361 10.043 9.725 9.429 9.153 8.886 8.623 8.374 8.138 7.882 7.646 7.427 7.193 6.953 6.76 6.549 6.321 6.143 5.957 5.763 5.57 5.367 5.219 5.066 4.835 4.669 4.487 4.396 4.209 4.001 3.775 3.658 3.441 3.26 3.114 2.963 2.616 2.398 2.151 1.886 1.548 1.102 0.497 -1.607 -10 ,2549 ,KEBNE ,16676902,Wed Nov 24 14:56:43 CET,Wed Nov 24 16:51:38 CET,0.0 1.291 1.715 2.011 2.245 2.446 2.626 2.793 3.085 3.216 3.337 3.47 3.675 3.773 3.954 4.134 4.294 4.369 4.515 4.652 4.851 4.972 5.088 5.264 5.438 5.602 5.755 5.896 6.063 6.229 6.405 6.616 6.807 6.988 7.189 7.399 7.596 7.814 8.048 8.3 8.556 8.855 9.215 9.539 9.867 10.201 10.571 10.963 11.381 11.799 12.093 12.084 11.865 11.527 11.157 10.816 10.493 10.162 9.854 9.553 9.299 9.05 8.797 8.546 8.313 8.102 7.866 7.64 7.438 7.237 7.03 6.852 6.657 6.452 6.294 6.122 5.936 5.738 5.524 5.376 5.226 4.992 4.826 4.647 4.551 4.35 4.136 3.908 3.783 3.556 3.367 3.218 3.066 2.716 2.525 2.308 2.063 1.818 1.512 1.048 -0.898 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_43_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_43_39.txt deleted file mode 100644 index 7c3fbace..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_43_39.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,432 ,KEBNE ,16676903,Wed Nov 24 14:56:43 CET,Wed Nov 24 16:49:32 CET,0.0 1.001 1.444 1.775 2.039 2.252 2.439 2.612 2.92 3.053 3.181 3.332 3.531 3.638 3.829 4.009 4.173 4.248 4.403 4.549 4.751 4.885 5.01 5.183 5.348 5.514 5.676 5.835 6.027 6.193 6.349 6.52 6.685 6.864 7.072 7.298 7.513 7.736 7.957 8.194 8.435 8.681 8.96 9.234 9.542 9.886 10.261 10.616 10.936 11.202 11.384 11.207 10.872 10.538 10.205 9.864 9.532 9.208 8.925 8.646 8.39 8.159 7.932 7.712 7.499 7.293 7.071 6.873 6.704 6.52 6.329 6.173 6.002 5.812 5.668 5.527 5.381 5.226 5.052 4.931 4.802 4.598 4.453 4.298 4.222 4.06 3.883 3.704 3.603 3.404 3.292 3.177 3.051 2.776 2.611 2.425 2.199 1.927 1.564 1.054 -0.591 -2 ,23582 ,KEBNE ,16674590,Tue Nov 23 17:25:19 CET,Tue Nov 23 19:16:25 CET,0.0 0.975 1.393 1.714 1.983 2.208 2.405 2.579 2.881 3.019 3.151 3.303 3.507 3.615 3.808 3.986 4.152 4.231 4.383 4.536 4.749 4.878 4.998 5.166 5.33 5.482 5.627 5.766 5.936 6.1 6.257 6.449 6.628 6.801 6.997 7.203 7.412 7.638 7.856 8.077 8.31 8.582 8.873 9.125 9.43 9.776 10.117 10.422 10.726 11.003 11.124 10.874 10.481 10.12 9.744 9.318 8.948 8.639 8.378 8.082 7.821 7.579 7.339 7.116 6.901 6.719 6.533 6.35 6.19 6.031 5.866 5.723 5.562 5.39 5.248 5.099 4.945 4.779 4.588 4.453 4.321 4.109 3.958 3.803 3.717 3.538 3.34 3.119 3.006 2.806 2.673 2.547 2.402 2.071 1.892 1.695 1.459 1.18 0.81 0.256 -1.18 -3 ,32529 ,KEBNE ,16676905,Wed Nov 24 14:57:44 CET,Wed Nov 24 16:50:18 CET,0.0 0.88 1.242 1.544 1.794 1.992 2.161 2.334 2.662 2.803 2.931 3.078 3.285 3.388 3.576 3.756 3.926 4.008 4.174 4.331 4.55 4.693 4.836 5.027 5.203 5.375 5.543 5.693 5.874 6.05 6.216 6.418 6.617 6.801 7.001 7.211 7.419 7.652 7.889 8.131 8.365 8.612 8.894 9.168 9.454 9.762 10.104 10.423 10.725 11.043 11.22 11.012 10.63 10.187 9.768 9.39 9.034 8.721 8.445 8.135 7.869 7.623 7.381 7.157 6.94 6.748 6.554 6.362 6.185 5.998 5.801 5.639 5.484 5.311 5.174 5.024 4.858 4.691 4.52 4.407 4.287 4.089 3.955 3.813 3.733 3.57 3.405 3.213 3.101 2.897 2.752 2.618 2.484 2.178 2.006 1.812 1.593 1.338 1.032 0.592 -0.999 -4 ,5510 ,KEBNE ,16676906,Wed Nov 24 14:57:44 CET,Wed Nov 24 16:51:37 CET,0.0 1.058 1.445 1.731 1.962 2.177 2.377 2.548 2.841 2.971 3.097 3.227 3.425 3.529 3.723 3.9 4.077 4.162 4.313 4.459 4.677 4.823 4.955 5.122 5.278 5.427 5.566 5.702 5.879 6.052 6.214 6.414 6.6 6.764 6.959 7.18 7.377 7.581 7.811 8.052 8.301 8.59 8.902 9.173 9.491 9.826 10.148 10.468 10.804 11.097 11.16 10.989 10.737 10.403 10.055 9.689 9.361 9.05 8.757 8.468 8.214 7.959 7.703 7.465 7.241 7.034 6.818 6.614 6.434 6.25 6.058 5.902 5.731 5.547 5.4 5.25 5.096 4.937 4.772 4.657 4.534 4.34 4.206 4.051 3.969 3.813 3.652 3.484 3.395 3.205 3.081 2.947 2.801 2.49 2.319 2.122 1.887 1.608 1.302 0.889 -0.587 -6 ,17685 ,KEBNE ,16674594,Tue Nov 23 17:25:19 CET,Tue Nov 23 19:16:55 CET,0.0 1.043 1.454 1.746 1.979 2.191 2.384 2.554 2.835 2.961 3.09 3.234 3.432 3.531 3.728 3.913 4.084 4.172 4.337 4.485 4.699 4.831 4.958 5.134 5.3 5.458 5.609 5.758 5.953 6.135 6.301 6.494 6.675 6.848 7.041 7.259 7.458 7.674 7.911 8.154 8.39 8.641 8.927 9.213 9.537 9.838 10.137 10.452 10.748 10.972 11.076 10.826 10.434 10.101 9.768 9.411 9.067 8.736 8.443 8.127 7.848 7.597 7.338 7.092 6.878 6.681 6.461 6.262 6.089 5.907 5.724 5.571 5.406 5.238 5.103 4.958 4.803 4.646 4.488 4.372 4.25 4.059 3.917 3.764 3.689 3.535 3.359 3.165 3.059 2.843 2.687 2.551 2.405 2.095 1.935 1.754 1.547 1.313 0.983 0.541 -1.16 -7 ,19675 ,KEBNE ,16674595,Tue Nov 23 17:25:19 CET,Tue Nov 23 19:17:56 CET,0.0 1.193 1.591 1.913 2.181 2.421 2.641 2.839 3.182 3.326 3.454 3.591 3.797 3.908 4.121 4.318 4.497 4.586 4.756 4.916 5.145 5.282 5.406 5.591 5.776 5.944 6.095 6.236 6.421 6.603 6.775 6.982 7.17 7.328 7.52 7.757 7.981 8.21 8.445 8.681 8.916 9.186 9.508 9.796 10.098 10.411 10.786 11.22 11.593 11.863 11.95 11.702 11.363 11.021 10.658 10.284 9.932 9.605 9.32 9.021 8.747 8.497 8.251 8.012 7.788 7.597 7.396 7.204 7.043 6.872 6.69 6.543 6.387 6.216 6.084 5.954 5.81 5.651 5.481 5.359 5.231 5.025 4.872 4.709 4.625 4.451 4.275 4.086 3.981 3.779 3.621 3.478 3.338 3.027 2.844 2.645 2.438 2.201 1.877 1.363 -0.402 -8 ,32318 ,KEBNE ,16676910,Wed Nov 24 15:00:47 CET,Wed Nov 24 16:53:24 CET,0.0 1.244 1.681 2.008 2.272 2.492 2.676 2.847 3.161 3.304 3.435 3.597 3.805 3.908 4.113 4.307 4.482 4.563 4.718 4.87 5.079 5.212 5.345 5.537 5.72 5.891 6.056 6.213 6.402 6.577 6.747 6.946 7.134 7.317 7.524 7.732 7.938 8.162 8.387 8.628 8.86 9.111 9.397 9.66 9.952 10.259 10.57 10.888 11.202 11.435 11.494 11.247 10.883 10.495 10.112 9.735 9.356 9.021 8.753 8.453 8.168 7.916 7.682 7.463 7.258 7.058 6.839 6.642 6.471 6.289 6.091 5.927 5.758 5.574 5.425 5.277 5.126 4.949 4.751 4.622 4.484 4.262 4.112 3.952 3.862 3.674 3.464 3.233 3.113 2.886 2.728 2.586 2.431 2.077 1.882 1.636 1.367 1.089 0.731 0.228 -1.114 -9 ,31984 ,KEBNE ,16676911,Wed Nov 24 15:00:48 CET,Wed Nov 24 16:54:09 CET,0.0 1.282 1.696 1.988 2.235 2.458 2.645 2.806 3.1 3.236 3.369 3.52 3.728 3.835 4.047 4.235 4.405 4.489 4.65 4.805 5.017 5.145 5.271 5.449 5.617 5.779 5.929 6.071 6.246 6.419 6.59 6.78 6.95 7.119 7.317 7.539 7.752 7.971 8.2 8.422 8.652 8.933 9.258 9.561 9.878 10.208 10.575 10.946 11.272 11.507 11.575 11.364 10.998 10.648 10.317 9.985 9.688 9.388 9.096 8.775 8.492 8.243 7.995 7.745 7.51 7.31 7.098 6.9 6.726 6.539 6.342 6.159 5.942 5.729 5.572 5.405 5.241 5.058 4.859 4.724 4.58 4.357 4.205 4.041 3.952 3.757 3.56 3.354 3.244 3.027 2.873 2.739 2.594 2.27 2.089 1.885 1.646 1.348 0.973 0.486 -0.921 -10 ,23500 ,KEBNE ,16674598,Tue Nov 23 17:26:21 CET,Tue Nov 23 19:18:18 CET,0.0 1.455 1.855 2.149 2.402 2.64 2.856 3.031 3.337 3.487 3.623 3.759 3.962 4.063 4.261 4.443 4.614 4.704 4.862 5.006 5.215 5.345 5.469 5.639 5.795 5.945 6.087 6.229 6.421 6.6 6.766 6.946 7.126 7.31 7.522 7.763 7.98 8.202 8.431 8.682 8.936 9.199 9.478 9.735 10.055 10.409 10.785 11.138 11.471 11.791 11.964 11.785 11.476 11.136 10.755 10.387 10.035 9.705 9.424 9.11 8.825 8.564 8.305 8.065 7.843 7.641 7.419 7.213 7.048 6.888 6.704 6.538 6.363 6.17 6.027 5.882 5.715 5.547 5.382 5.262 5.142 4.948 4.798 4.636 4.552 4.37 4.179 3.983 3.882 3.689 3.55 3.416 3.273 2.979 2.809 2.605 2.383 2.115 1.783 1.381 -0.623 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_44_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_44_43.txt deleted file mode 100644 index b61d3883..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_44_43.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2173 ,KEBNE ,16676913,Wed Nov 24 15:00:47 CET,Wed Nov 24 16:57:49 CET,0.0 1.704 2.207 2.646 3.026 3.272 3.476 3.659 3.972 4.113 4.249 4.392 4.597 4.702 4.919 5.12 5.307 5.396 5.556 5.714 5.935 6.068 6.2 6.389 6.555 6.718 6.874 7.023 7.214 7.399 7.58 7.788 7.985 8.173 8.385 8.611 8.826 9.06 9.293 9.529 9.783 10.061 10.349 10.636 10.997 11.433 11.896 12.342 12.81 13.223 13.479 13.451 13.131 12.73 12.365 11.982 11.606 11.24 10.91 10.583 10.312 10.084 9.846 9.586 9.35 9.141 8.91 8.699 8.511 8.299 8.067 7.882 7.694 7.483 7.318 7.146 6.966 6.771 6.563 6.423 6.273 6.036 5.878 5.714 5.625 5.44 5.239 5.015 4.885 4.655 4.492 4.35 4.216 3.924 3.752 3.556 3.324 3.066 2.765 2.328 1.396 -2 ,10682 ,KEBNE ,16674620,Tue Nov 23 17:38:59 CET,Tue Nov 23 19:32:22 CET,0.0 1.585 2.027 2.322 2.554 2.759 2.949 3.108 3.376 3.5 3.618 3.747 3.944 4.042 4.224 4.393 4.583 4.672 4.823 4.969 5.175 5.304 5.422 5.592 5.754 5.91 6.059 6.202 6.379 6.541 6.706 6.913 7.112 7.298 7.502 7.725 7.944 8.174 8.409 8.653 8.892 9.153 9.449 9.722 10.014 10.356 10.731 11.09 11.451 11.802 12.056 11.906 11.629 11.314 10.962 10.601 10.239 9.891 9.574 9.25 8.961 8.67 8.373 8.098 7.823 7.552 7.279 7.039 6.831 6.615 6.381 6.18 5.965 5.737 5.56 5.379 5.185 4.987 4.77 4.605 4.436 4.176 3.985 3.786 3.693 3.512 3.315 3.087 2.961 2.736 2.554 2.412 2.258 1.908 1.723 1.516 1.279 0.974 0.588 0.1 -1.381 -4 ,16912 ,KEBNE ,16674622,Tue Nov 23 17:38:58 CET,Tue Nov 23 19:30:58 CET,0.0 1.365 1.754 2.048 2.312 2.527 2.709 2.91 3.268 3.402 3.53 3.675 3.871 3.97 4.169 4.341 4.501 4.58 4.725 4.872 5.091 5.225 5.354 5.532 5.694 5.86 6.019 6.167 6.344 6.5 6.659 6.856 7.053 7.232 7.417 7.625 7.826 8.043 8.281 8.53 8.783 9.058 9.375 9.68 10.026 10.411 10.812 11.198 11.623 11.987 12.112 11.94 11.549 11.092 10.676 10.235 9.823 9.451 9.082 8.687 8.341 8.026 7.722 7.42 7.117 6.857 6.592 6.339 6.113 5.864 5.618 5.417 5.192 4.943 4.743 4.534 4.33 4.125 3.899 3.739 3.568 3.283 3.083 2.87 2.758 2.539 2.319 2.07 1.939 1.711 1.525 1.375 1.208 0.816 0.587 0.355 0.113 -0.182 -0.573 -1.04 -2.547 -5 ,16880 ,KEBNE ,16676917,Wed Nov 24 15:00:47 CET,Wed Nov 24 16:53:34 CET,0.0 1.971 2.404 2.718 2.971 3.18 3.36 3.516 3.792 3.92 4.047 4.185 4.395 4.504 4.711 4.889 5.055 5.139 5.293 5.43 5.638 5.772 5.89 6.061 6.226 6.382 6.531 6.669 6.835 6.996 7.159 7.354 7.538 7.71 7.903 8.125 8.332 8.546 8.768 9.011 9.268 9.548 9.853 10.141 10.453 10.766 11.117 11.447 11.755 12.016 12.094 11.868 11.504 11.076 10.617 10.169 9.746 9.335 8.975 8.613 8.285 7.951 7.638 7.35 7.066 6.814 6.529 6.269 6.053 5.824 5.58 5.373 5.162 4.952 4.779 4.59 4.399 4.198 3.983 3.839 3.691 3.454 3.278 3.09 2.988 2.77 2.554 2.321 2.191 1.965 1.736 1.539 1.355 1.001 0.806 0.591 0.344 0.049 -0.305 -0.758 -1.848 -6 ,17727 ,KEBNE ,16676918,Wed Nov 24 15:01:48 CET,Wed Nov 24 16:54:16 CET,0.0 1.664 2.143 2.47 2.715 2.919 3.094 3.267 3.582 3.718 3.851 4.001 4.208 4.317 4.521 4.72 4.905 4.987 5.143 5.292 5.511 5.654 5.786 5.969 6.14 6.306 6.46 6.616 6.815 6.987 7.156 7.366 7.562 7.744 7.953 8.178 8.394 8.648 8.901 9.137 9.388 9.669 9.998 10.319 10.676 11.042 11.404 11.746 12.089 12.383 12.538 12.422 12.133 11.734 11.351 10.959 10.562 10.213 9.9 9.58 9.281 8.987 8.72 8.451 8.189 7.957 7.717 7.496 7.291 7.077 6.865 6.686 6.486 6.289 6.136 5.974 5.818 5.653 5.462 5.336 5.206 4.982 4.822 4.662 4.583 4.417 4.234 4.032 3.922 3.718 3.566 3.435 3.303 2.988 2.799 2.599 2.387 2.126 1.813 1.438 0.459 -7 ,23006 ,KEBNE ,16676919,Wed Nov 24 15:01:48 CET,Wed Nov 24 16:56:16 CET,0.0 1.453 1.979 2.385 2.698 2.936 3.138 3.364 3.787 3.933 4.068 4.218 4.419 4.521 4.71 4.906 5.096 5.176 5.322 5.465 5.669 5.79 5.91 6.083 6.242 6.394 6.546 6.698 6.882 7.049 7.217 7.406 7.583 7.768 7.979 8.22 8.443 8.676 8.908 9.142 9.384 9.637 9.921 10.19 10.49 10.807 11.142 11.45 11.744 11.982 12.003 11.74 11.325 10.867 10.428 9.978 9.544 9.148 8.797 8.415 8.093 7.788 7.47 7.173 6.901 6.645 6.391 6.179 6.003 5.822 5.619 5.443 5.258 5.07 4.926 4.768 4.592 4.418 4.245 4.118 3.984 3.773 3.622 3.463 3.378 3.197 2.98 2.728 2.605 2.393 2.227 2.093 1.957 1.658 1.477 1.283 1.067 0.783 0.427 -0.024 -1.112 -8 ,23829 ,KEBNE ,16674626,Tue Nov 23 17:48:24 CET,Tue Nov 23 19:40:12 CET,0.0 1.876 2.341 2.665 2.939 3.152 3.329 3.544 3.928 4.059 4.182 4.317 4.519 4.623 4.816 4.986 5.139 5.218 5.379 5.531 5.732 5.856 5.971 6.13 6.29 6.441 6.582 6.717 6.896 7.071 7.234 7.421 7.596 7.769 7.971 8.189 8.382 8.592 8.831 9.083 9.346 9.643 9.96 10.252 10.576 10.911 11.27 11.645 11.99 12.257 12.353 12.107 11.697 11.227 10.774 10.347 9.937 9.538 9.201 8.864 8.557 8.28 7.995 7.701 7.427 7.176 6.918 6.675 6.45 6.218 5.983 5.793 5.588 5.355 5.165 4.972 4.769 4.557 4.336 4.191 4.044 3.804 3.636 3.459 3.369 3.184 2.987 2.761 2.637 2.421 2.257 2.124 1.975 1.635 1.441 1.238 1.015 0.766 0.478 0.078 -0.881 -9 ,24061 ,KEBNE ,16676921,Wed Nov 24 15:01:48 CET,Wed Nov 24 16:54:44 CET,0.0 1.504 2.06 2.44 2.72 2.939 3.13 3.309 3.617 3.752 3.882 4.015 4.213 4.317 4.501 4.666 4.827 4.908 5.076 5.237 5.454 5.591 5.723 5.906 6.077 6.241 6.398 6.561 6.751 6.924 7.102 7.308 7.491 7.662 7.859 8.078 8.296 8.534 8.774 9.003 9.232 9.504 9.825 10.107 10.427 10.777 11.175 11.596 11.989 12.349 12.581 12.406 12.027 11.638 11.261 10.868 10.503 10.178 9.895 9.598 9.326 9.076 8.824 8.573 8.336 8.117 7.888 7.675 7.487 7.29 7.074 6.891 6.694 6.479 6.311 6.141 5.971 5.786 5.586 5.447 5.298 5.062 4.899 4.715 4.618 4.428 4.236 4.034 3.926 3.726 3.578 3.441 3.298 2.987 2.807 2.596 2.35 2.105 1.833 1.444 0.051 -10 ,22168 ,KEBNE ,16674628,Tue Nov 23 17:48:24 CET,Tue Nov 23 19:28:40 CET,0.0 1.634 2.165 2.491 2.783 3.084 3.361 3.589 3.911 4.04 4.162 4.302 4.5 4.605 4.797 4.969 5.133 5.213 5.371 5.513 5.722 5.857 5.972 6.156 6.338 6.494 6.655 6.814 7.006 7.199 7.381 7.59 7.799 7.994 8.199 8.404 8.622 8.873 9.136 9.412 9.683 9.97 10.284 10.579 10.895 11.248 11.638 12.017 12.402 12.806 13.105 13.089 12.926 12.659 12.34 11.986 11.631 11.305 11.009 10.695 10.414 10.145 9.886 9.65 9.438 9.253 9.047 8.837 8.649 8.453 8.244 8.072 7.872 7.653 7.489 7.314 7.129 6.946 6.762 6.625 6.476 6.244 6.093 5.945 5.865 5.696 5.504 5.294 5.182 4.973 4.82 4.69 4.554 4.239 4.059 3.869 3.655 3.408 3.095 2.684 1.636 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_44.txt deleted file mode 100644 index 6ffd171f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20874 ,KEBNE ,16676923,Wed Nov 24 15:02:49 CET,Wed Nov 24 16:55:00 CET,0.0 0.862 1.193 1.443 1.666 1.864 2.032 2.185 2.461 2.584 2.697 2.815 2.99 3.078 3.226 3.371 3.519 3.588 3.723 3.859 4.041 4.151 4.259 4.413 4.558 4.683 4.8 4.915 5.052 5.176 5.293 5.432 5.563 5.701 5.848 5.983 6.093 6.214 6.337 6.438 6.545 6.682 6.825 6.906 6.959 7.008 7.051 7.045 6.881 6.459 5.553 4.294 3.181 2.25 1.47 0.716 0.031 -0.574 -1.09 -1.617 -2.084 -2.509 -2.917 -3.292 -3.633 -3.951 -4.302 -4.617 -4.886 -5.17 -5.481 -5.731 -5.974 -6.229 -6.437 -6.657 -6.888 -7.128 -7.382 -7.55 -7.724 -8.01 -8.21 -8.421 -8.526 -8.734 -8.964 -9.225 -9.36 -9.598 -9.816 -9.974 -10.142 -10.51 -10.712 -10.935 -11.185 -11.455 -11.759 -12.123 -13.105 -2 ,21600 ,KEBNE ,16676924,Wed Nov 24 15:02:50 CET,Wed Nov 24 16:56:12 CET,0.0 0.887 1.253 1.524 1.756 1.96 2.129 2.266 2.523 2.635 2.738 2.855 3.025 3.112 3.282 3.44 3.592 3.665 3.79 3.904 4.078 4.184 4.288 4.423 4.543 4.664 4.779 4.893 5.026 5.148 5.268 5.403 5.533 5.654 5.789 5.939 6.074 6.203 6.322 6.449 6.581 6.703 6.81 6.903 7.022 7.118 7.147 7.121 7.017 6.688 5.86 4.713 3.719 2.848 2.096 1.389 0.765 0.189 -0.321 -0.83 -1.271 -1.656 -2.022 -2.364 -2.688 -3.0 -3.349 -3.66 -3.912 -4.177 -4.462 -4.692 -4.92 -5.162 -5.362 -5.572 -5.788 -6.016 -6.262 -6.43 -6.606 -6.883 -7.08 -7.285 -7.389 -7.603 -7.829 -8.071 -8.206 -8.444 -8.651 -8.808 -8.977 -9.359 -9.572 -9.811 -10.091 -10.389 -10.765 -11.32 -12.758 -3 ,1024 ,KEBNE ,16676925,Wed Nov 24 15:03:51 CET,Wed Nov 24 16:56:37 CET,0.0 0.803 1.186 1.477 1.709 1.902 2.07 2.212 2.47 2.594 2.714 2.847 3.017 3.107 3.293 3.467 3.618 3.68 3.804 3.934 4.119 4.232 4.34 4.491 4.617 4.732 4.851 4.972 5.11 5.236 5.353 5.484 5.603 5.719 5.849 5.978 6.098 6.236 6.399 6.566 6.711 6.844 6.976 7.092 7.202 7.279 7.334 7.338 7.204 6.811 5.987 4.781 3.675 2.711 1.891 1.184 0.539 -0.079 -0.612 -1.127 -1.56 -1.964 -2.359 -2.72 -3.056 -3.355 -3.672 -3.973 -4.248 -4.543 -4.841 -5.084 -5.343 -5.626 -5.847 -6.067 -6.294 -6.534 -6.782 -6.96 -7.15 -7.458 -7.677 -7.898 -8.009 -8.242 -8.486 -8.751 -8.896 -9.136 -9.358 -9.518 -9.68 -10.042 -10.256 -10.513 -10.798 -11.118 -11.47 -11.969 -13.135 -4 ,19445 ,KEBNE ,16676926,Wed Nov 24 15:02:50 CET,Wed Nov 24 16:55:07 CET,0.0 0.972 1.297 1.556 1.78 1.981 2.156 2.312 2.584 2.698 2.809 2.941 3.119 3.207 3.385 3.543 3.675 3.746 3.88 4.001 4.168 4.278 4.379 4.507 4.641 4.774 4.898 5.01 5.142 5.27 5.391 5.534 5.668 5.796 5.94 6.098 6.25 6.405 6.547 6.687 6.842 7.013 7.197 7.333 7.459 7.588 7.671 7.658 7.525 7.179 6.325 5.179 4.178 3.25 2.386 1.615 0.953 0.347 -0.182 -0.714 -1.154 -1.566 -1.971 -2.337 -2.687 -3.015 -3.351 -3.656 -3.926 -4.208 -4.493 -4.73 -4.979 -5.233 -5.437 -5.652 -5.876 -6.116 -6.363 -6.532 -6.709 -6.999 -7.201 -7.412 -7.528 -7.755 -7.974 -8.223 -8.356 -8.588 -8.8 -8.975 -9.159 -9.545 -9.748 -9.96 -10.193 -10.475 -10.807 -11.197 -12.306 -5 ,29746 ,KEBNE ,16676927,Wed Nov 24 15:03:51 CET,Wed Nov 24 16:56:25 CET,0.0 0.826 1.22 1.494 1.733 1.939 2.126 2.293 2.578 2.701 2.815 2.939 3.124 3.228 3.41 3.58 3.736 3.804 3.946 4.075 4.242 4.354 4.459 4.596 4.725 4.847 4.961 5.075 5.209 5.339 5.474 5.629 5.764 5.886 6.021 6.156 6.288 6.445 6.592 6.721 6.843 6.981 7.13 7.268 7.393 7.486 7.506 7.426 7.26 6.89 6.087 4.95 3.88 2.937 2.096 1.335 0.676 0.095 -0.386 -0.888 -1.33 -1.705 -2.063 -2.413 -2.756 -3.07 -3.402 -3.708 -3.963 -4.225 -4.501 -4.739 -4.989 -5.252 -5.463 -5.677 -5.889 -6.117 -6.37 -6.545 -6.718 -6.997 -7.201 -7.405 -7.51 -7.744 -7.986 -8.238 -8.38 -8.623 -8.821 -8.981 -9.152 -9.524 -9.726 -9.953 -10.203 -10.492 -10.831 -11.26 -12.4 -6 ,8613 ,KEBNE ,16676928,Wed Nov 24 15:03:51 CET,Wed Nov 24 16:55:47 CET,0.0 1.077 1.441 1.69 1.905 2.102 2.267 2.407 2.653 2.763 2.87 2.988 3.156 3.247 3.408 3.549 3.689 3.756 3.879 3.994 4.164 4.272 4.37 4.514 4.643 4.766 4.896 5.016 5.157 5.293 5.41 5.542 5.674 5.801 5.946 6.1 6.23 6.356 6.492 6.625 6.752 6.87 6.992 7.102 7.191 7.268 7.306 7.276 7.107 6.715 5.943 4.866 3.829 2.866 2.066 1.355 0.696 0.114 -0.365 -0.857 -1.304 -1.707 -2.098 -2.471 -2.81 -3.103 -3.403 -3.688 -3.943 -4.219 -4.511 -4.75 -4.993 -5.245 -5.455 -5.669 -5.878 -6.104 -6.355 -6.529 -6.706 -6.976 -7.157 -7.345 -7.451 -7.681 -7.924 -8.184 -8.321 -8.548 -8.784 -8.959 -9.131 -9.508 -9.712 -9.93 -10.16 -10.43 -10.778 -11.226 -12.208 -7 ,21152 ,KEBNE ,16676929,Wed Nov 24 15:04:52 CET,Wed Nov 24 16:58:24 CET,0.0 0.923 1.299 1.569 1.8 1.987 2.157 2.319 2.588 2.7 2.806 2.938 3.118 3.211 3.389 3.544 3.69 3.76 3.897 4.026 4.206 4.315 4.415 4.556 4.688 4.815 4.94 5.051 5.183 5.308 5.426 5.57 5.701 5.817 5.946 6.079 6.202 6.336 6.473 6.594 6.703 6.818 6.943 7.061 7.172 7.239 7.255 7.195 7.041 6.719 5.905 4.75 3.743 2.838 2.075 1.379 0.717 0.104 -0.415 -0.926 -1.382 -1.806 -2.209 -2.581 -2.92 -3.233 -3.566 -3.861 -4.115 -4.378 -4.664 -4.908 -5.15 -5.408 -5.612 -5.818 -6.04 -6.28 -6.53 -6.7 -6.865 -7.132 -7.331 -7.534 -7.637 -7.857 -8.093 -8.343 -8.475 -8.695 -8.89 -9.042 -9.195 -9.539 -9.749 -9.983 -10.248 -10.571 -10.937 -11.376 -12.326 -8 ,32228 ,KEBNE ,16676930,Wed Nov 24 15:04:52 CET,Wed Nov 24 16:58:15 CET,0.0 0.874 1.238 1.525 1.754 1.953 2.13 2.278 2.541 2.661 2.772 2.9 3.087 3.186 3.377 3.542 3.692 3.761 3.895 4.024 4.191 4.303 4.416 4.566 4.706 4.834 4.957 5.073 5.211 5.344 5.474 5.627 5.753 5.867 6.001 6.138 6.265 6.404 6.529 6.663 6.81 6.962 7.125 7.247 7.34 7.423 7.475 7.433 7.307 6.96 6.067 4.877 3.877 2.95 2.126 1.4 0.764 0.183 -0.336 -0.859 -1.312 -1.726 -2.119 -2.472 -2.801 -3.117 -3.457 -3.748 -3.995 -4.262 -4.545 -4.776 -5.014 -5.271 -5.477 -5.686 -5.899 -6.12 -6.35 -6.52 -6.696 -6.966 -7.156 -7.362 -7.471 -7.69 -7.922 -8.168 -8.297 -8.534 -8.74 -8.89 -9.062 -9.423 -9.619 -9.847 -10.118 -10.413 -10.732 -11.145 -12.271 -9 ,29326 ,KEBNE ,16676931,Wed Nov 24 15:04:52 CET,Wed Nov 24 16:57:51 CET,0.0 1.149 1.574 1.848 2.066 2.267 2.443 2.599 2.884 3.015 3.138 3.273 3.451 3.543 3.705 3.851 3.989 4.059 4.205 4.339 4.516 4.625 4.725 4.874 5.016 5.154 5.286 5.401 5.549 5.69 5.821 5.971 6.107 6.233 6.369 6.516 6.657 6.812 6.977 7.149 7.314 7.458 7.612 7.761 7.897 8.002 8.063 8.078 7.983 7.636 6.798 5.621 4.605 3.688 2.87 2.139 1.501 0.929 0.406 -0.143 -0.613 -1.032 -1.428 -1.797 -2.158 -2.499 -2.852 -3.167 -3.435 -3.716 -4.008 -4.242 -4.485 -4.752 -4.962 -5.174 -5.399 -5.638 -5.888 -6.061 -6.233 -6.503 -6.696 -6.909 -7.019 -7.24 -7.475 -7.732 -7.871 -8.103 -8.311 -8.47 -8.637 -9.001 -9.224 -9.472 -9.719 -9.994 -10.329 -10.793 -12.388 -10 ,1040 ,KEBNE ,16676932,Wed Nov 24 15:05:56 CET,Wed Nov 24 16:58:31 CET,0.0 0.863 1.216 1.487 1.71 1.91 2.087 2.249 2.534 2.67 2.791 2.916 3.093 3.18 3.342 3.501 3.651 3.724 3.857 3.98 4.155 4.264 4.382 4.567 4.727 4.875 5.0 5.109 5.255 5.39 5.505 5.635 5.766 5.887 6.018 6.162 6.278 6.406 6.554 6.69 6.805 6.917 7.02 7.109 7.198 7.267 7.299 7.247 7.059 6.669 5.884 4.774 3.735 2.802 1.966 1.206 0.553 -0.055 -0.6 -1.131 -1.58 -1.977 -2.369 -2.747 -3.101 -3.434 -3.771 -4.064 -4.326 -4.601 -4.881 -5.111 -5.352 -5.612 -5.816 -6.036 -6.267 -6.497 -6.75 -6.928 -7.113 -7.406 -7.607 -7.818 -7.928 -8.16 -8.409 -8.678 -8.823 -9.069 -9.289 -9.448 -9.615 -9.99 -10.218 -10.487 -10.779 -11.097 -11.452 -11.91 -12.971 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_49.txt deleted file mode 100644 index 16c71b53..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_49.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22954 ,KEBNE ,16676933,Wed Nov 24 15:05:55 CET,Wed Nov 24 16:58:47 CET,0.0 0.654 0.992 1.258 1.459 1.629 1.789 1.943 2.215 2.332 2.447 2.567 2.736 2.816 2.969 3.11 3.245 3.31 3.423 3.529 3.691 3.79 3.881 4.008 4.124 4.235 4.335 4.436 4.564 4.676 4.781 4.897 4.995 5.076 5.153 5.235 5.325 5.417 5.507 5.581 5.64 5.704 5.77 5.805 5.799 5.742 5.589 5.317 4.897 4.184 2.747 0.933 -0.515 -1.735 -2.778 -3.722 -4.589 -5.393 -6.069 -6.716 -7.265 -7.754 -8.237 -8.699 -9.132 -9.555 -9.991 -10.372 -10.702 -11.046 -11.406 -11.705 -12.02 -12.337 -12.578 -12.826 -13.096 -13.387 -13.691 -13.908 -14.129 -14.464 -14.702 -14.951 -15.072 -15.332 -15.607 -15.887 -16.038 -16.296 -16.533 -16.711 -16.909 -17.328 -17.553 -17.802 -18.104 -18.46 -18.887 -19.448 -20.945 -2 ,13681 ,KEBNE ,16676934,Wed Nov 24 15:05:55 CET,Wed Nov 24 16:58:55 CET,0.0 0.809 1.155 1.45 1.682 1.861 2.026 2.177 2.433 2.544 2.653 2.774 2.946 3.029 3.173 3.308 3.433 3.494 3.606 3.705 3.843 3.931 4.017 4.138 4.246 4.352 4.453 4.553 4.678 4.779 4.868 4.971 5.062 5.148 5.248 5.346 5.425 5.49 5.565 5.668 5.753 5.815 5.858 5.867 5.848 5.766 5.632 5.39 4.913 4.179 2.826 1.052 -0.378 -1.594 -2.638 -3.571 -4.375 -5.094 -5.724 -6.354 -6.892 -7.375 -7.857 -8.312 -8.718 -9.073 -9.433 -9.761 -10.05 -10.359 -10.7 -10.984 -11.273 -11.563 -11.786 -12.024 -12.264 -12.513 -12.777 -12.968 -13.162 -13.468 -13.7 -13.94 -14.061 -14.316 -14.584 -14.852 -15.0 -15.25 -15.494 -15.668 -15.841 -16.244 -16.468 -16.705 -16.966 -17.267 -17.649 -18.13 -19.322 -3 ,30840 ,KEBNE ,16676935,Wed Nov 24 15:05:55 CET,Wed Nov 24 16:59:39 CET,0.0 0.773 1.12 1.368 1.568 1.742 1.902 2.042 2.28 2.39 2.5 2.628 2.801 2.889 3.045 3.191 3.332 3.396 3.512 3.612 3.754 3.846 3.932 4.062 4.181 4.294 4.4 4.498 4.621 4.724 4.826 4.948 5.057 5.172 5.298 5.416 5.524 5.626 5.704 5.791 5.874 5.951 6.034 6.078 6.057 5.975 5.817 5.548 5.107 4.313 2.91 1.196 -0.305 -1.623 -2.711 -3.687 -4.541 -5.299 -5.941 -6.564 -7.111 -7.612 -8.095 -8.536 -8.949 -9.333 -9.712 -10.052 -10.359 -10.675 -11.007 -11.288 -11.584 -11.896 -12.149 -12.401 -12.647 -12.916 -13.195 -13.396 -13.6 -13.905 -14.125 -14.358 -14.476 -14.718 -14.976 -15.264 -15.421 -15.668 -15.899 -16.071 -16.249 -16.627 -16.84 -17.08 -17.352 -17.664 -18.023 -18.485 -19.786 -4 ,20745 ,KEBNE ,16676936,Wed Nov 24 15:05:55 CET,Wed Nov 24 17:00:35 CET,0.0 0.745 1.059 1.312 1.529 1.721 1.88 2.02 2.277 2.398 2.522 2.65 2.827 2.917 3.074 3.212 3.344 3.405 3.525 3.635 3.774 3.866 3.959 4.089 4.201 4.301 4.396 4.482 4.593 4.699 4.795 4.909 5.013 5.108 5.206 5.292 5.369 5.451 5.533 5.605 5.656 5.7 5.735 5.734 5.715 5.667 5.518 5.261 4.852 4.131 2.813 1.161 -0.287 -1.534 -2.607 -3.562 -4.405 -5.183 -5.837 -6.484 -7.042 -7.549 -8.037 -8.492 -8.933 -9.318 -9.718 -10.095 -10.41 -10.733 -11.073 -11.36 -11.666 -11.978 -12.216 -12.46 -12.708 -12.977 -13.275 -13.482 -13.679 -13.991 -14.223 -14.473 -14.606 -14.867 -15.134 -15.416 -15.561 -15.815 -16.046 -16.219 -16.401 -16.83 -17.07 -17.336 -17.629 -17.98 -18.403 -18.959 -20.276 -5 ,4692 ,KEBNE ,16676937,Wed Nov 24 15:07:58 CET,Wed Nov 24 17:00:16 CET,0.0 0.721 1.043 1.306 1.55 1.759 1.923 2.07 2.323 2.443 2.558 2.671 2.841 2.927 3.094 3.246 3.383 3.448 3.56 3.683 3.858 3.949 4.03 4.154 4.278 4.384 4.48 4.573 4.688 4.791 4.891 5.011 5.118 5.217 5.338 5.464 5.55 5.632 5.717 5.799 5.872 5.93 5.973 6.003 6.021 5.994 5.85 5.596 5.184 4.398 2.987 1.216 -0.289 -1.556 -2.672 -3.708 -4.611 -5.396 -6.103 -6.812 -7.376 -7.865 -8.351 -8.819 -9.249 -9.661 -10.106 -10.495 -10.816 -11.14 -11.484 -11.77 -12.061 -12.374 -12.619 -12.877 -13.15 -13.428 -13.712 -13.902 -14.096 -14.429 -14.669 -14.911 -15.034 -15.291 -15.549 -15.829 -15.99 -16.253 -16.479 -16.654 -16.848 -17.292 -17.537 -17.801 -18.085 -18.41 -18.789 -19.305 -20.691 -6 ,27169 ,KEBNE ,16676938,Wed Nov 24 15:07:58 CET,Wed Nov 24 17:00:13 CET,0.0 0.904 1.246 1.502 1.727 1.918 2.085 2.232 2.491 2.609 2.721 2.846 3.016 3.099 3.264 3.403 3.529 3.59 3.71 3.823 3.972 4.057 4.138 4.27 4.39 4.495 4.588 4.676 4.813 4.942 5.049 5.174 5.294 5.409 5.543 5.684 5.8 5.9 5.982 6.068 6.157 6.224 6.27 6.298 6.313 6.254 6.074 5.786 5.352 4.651 3.356 1.669 0.247 -0.901 -1.897 -2.838 -3.65 -4.381 -5.023 -5.666 -6.222 -6.726 -7.203 -7.638 -8.048 -8.426 -8.821 -9.179 -9.493 -9.831 -10.185 -10.462 -10.743 -11.036 -11.261 -11.504 -11.761 -12.02 -12.289 -12.482 -12.686 -13.002 -13.226 -13.461 -13.582 -13.84 -14.109 -14.384 -14.526 -14.779 -15.016 -15.204 -15.395 -15.785 -16.001 -16.242 -16.524 -16.846 -17.238 -17.782 -19.045 -8 ,26623 ,KEBNE ,16676940,Wed Nov 24 15:08:59 CET,Wed Nov 24 17:03:36 CET,0.0 0.901 1.276 1.533 1.728 1.9 2.054 2.2 2.46 2.568 2.669 2.789 2.967 3.052 3.206 3.348 3.482 3.542 3.657 3.764 3.906 3.995 4.081 4.214 4.342 4.46 4.561 4.648 4.765 4.878 4.991 5.12 5.215 5.296 5.393 5.491 5.583 5.671 5.73 5.781 5.848 5.915 5.971 5.997 5.989 5.939 5.811 5.595 5.193 4.475 3.152 1.479 0.083 -1.088 -2.071 -2.948 -3.735 -4.475 -5.126 -5.798 -6.375 -6.877 -7.358 -7.817 -8.244 -8.627 -9.028 -9.386 -9.699 -10.021 -10.339 -10.61 -10.899 -11.206 -11.458 -11.721 -11.989 -12.265 -12.549 -12.747 -12.953 -13.266 -13.488 -13.741 -13.866 -14.11 -14.385 -14.679 -14.83 -15.091 -15.343 -15.529 -15.722 -16.15 -16.385 -16.626 -16.888 -17.208 -17.618 -18.169 -19.328 -9 ,9006 ,KEBNE ,16676941,Wed Nov 24 15:10:01 CET,Wed Nov 24 17:02:43 CET,0.0 0.716 1.064 1.319 1.523 1.726 1.909 2.066 2.324 2.425 2.522 2.631 2.808 2.9 3.06 3.199 3.324 3.384 3.503 3.616 3.766 3.862 3.959 4.089 4.201 4.303 4.391 4.473 4.579 4.68 4.771 4.874 4.968 5.054 5.153 5.247 5.317 5.399 5.468 5.526 5.584 5.624 5.652 5.654 5.61 5.485 5.27 4.962 4.498 3.752 2.348 0.537 -1.032 -2.326 -3.369 -4.28 -5.073 -5.833 -6.532 -7.236 -7.861 -8.419 -8.93 -9.391 -9.824 -10.215 -10.609 -10.969 -11.287 -11.614 -11.945 -12.225 -12.539 -12.863 -13.1 -13.349 -13.613 -13.884 -14.157 -14.351 -14.56 -14.88 -15.101 -15.332 -15.462 -15.735 -16.007 -16.301 -16.457 -16.71 -16.935 -17.116 -17.315 -17.739 -17.976 -18.22 -18.482 -18.789 -19.151 -19.618 -20.744 -10 ,9305 ,KEBNE ,16676942,Wed Nov 24 15:10:01 CET,Wed Nov 24 17:03:12 CET,0.0 0.759 1.115 1.385 1.615 1.812 1.981 2.123 2.383 2.503 2.611 2.722 2.89 2.976 3.147 3.313 3.457 3.515 3.625 3.735 3.907 4.019 4.121 4.253 4.368 4.475 4.567 4.653 4.765 4.866 4.964 5.081 5.183 5.277 5.385 5.493 5.587 5.67 5.761 5.853 5.927 5.99 6.034 6.066 6.101 6.085 5.971 5.743 5.332 4.608 3.306 1.64 0.199 -1.03 -2.086 -3.04 -3.865 -4.615 -5.262 -5.917 -6.507 -7.004 -7.475 -7.938 -8.367 -8.765 -9.168 -9.509 -9.819 -10.145 -10.469 -10.736 -11.034 -11.348 -11.583 -11.823 -12.068 -12.327 -12.608 -12.812 -13.021 -13.34 -13.571 -13.816 -13.942 -14.216 -14.494 -14.767 -14.904 -15.15 -15.401 -15.584 -15.768 -16.174 -16.408 -16.656 -16.925 -17.236 -17.606 -18.089 -19.299 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_44.txt deleted file mode 100644 index 6361155e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3148 ,KEBNE ,16676943,Wed Nov 24 15:10:01 CET,Wed Nov 24 17:03:40 CET,0.0 0.821 1.176 1.433 1.654 1.834 2.004 2.165 2.444 2.571 2.691 2.824 3.03 3.136 3.327 3.515 3.692 3.777 3.937 4.083 4.284 4.409 4.531 4.712 4.876 5.024 5.169 5.308 5.476 5.637 5.795 5.995 6.183 6.349 6.55 6.761 6.968 7.194 7.425 7.667 7.907 8.165 8.454 8.735 9.041 9.355 9.657 9.927 10.2 10.386 10.313 9.896 9.34 8.746 8.202 7.684 7.208 6.772 6.367 5.927 5.542 5.204 4.866 4.527 4.204 3.932 3.66 3.375 3.112 2.847 2.571 2.345 2.111 1.864 1.667 1.458 1.234 0.979 0.715 0.544 0.367 0.095 -0.099 -0.295 -0.399 -0.621 -0.867 -1.135 -1.267 -1.498 -1.734 -1.919 -2.119 -2.569 -2.81 -3.061 -3.344 -3.663 -4.033 -4.518 -5.989 -2 ,11235 ,KEBNE ,16676944,Wed Nov 24 15:11:02 CET,Wed Nov 24 17:03:55 CET,0.0 0.918 1.277 1.567 1.825 2.045 2.228 2.391 2.684 2.82 2.946 3.074 3.276 3.381 3.577 3.761 3.937 4.018 4.173 4.33 4.539 4.669 4.796 4.974 5.139 5.3 5.46 5.608 5.784 5.941 6.087 6.271 6.45 6.623 6.822 7.041 7.241 7.447 7.663 7.882 8.107 8.352 8.625 8.889 9.163 9.462 9.754 9.975 10.194 10.426 10.419 9.938 9.339 8.791 8.264 7.732 7.267 6.836 6.44 6.01 5.633 5.319 5.021 4.738 4.47 4.208 3.908 3.623 3.37 3.111 2.868 2.656 2.414 2.166 1.968 1.754 1.526 1.279 1.024 0.848 0.666 0.378 0.174 -0.031 -0.134 -0.361 -0.625 -0.901 -1.05 -1.301 -1.526 -1.7 -1.9 -2.344 -2.577 -2.832 -3.116 -3.429 -3.83 -4.359 -5.739 -3 ,4347 ,KEBNE ,16676945,Wed Nov 24 15:11:06 CET,Wed Nov 24 17:02:46 CET,0.0 0.808 1.156 1.427 1.645 1.847 2.031 2.194 2.489 2.629 2.755 2.865 3.053 3.152 3.329 3.504 3.681 3.764 3.929 4.078 4.272 4.395 4.521 4.714 4.89 5.058 5.214 5.356 5.535 5.704 5.86 6.042 6.221 6.389 6.571 6.773 6.979 7.199 7.439 7.685 7.927 8.202 8.507 8.789 9.074 9.353 9.645 9.926 10.172 10.317 10.23 9.763 9.177 8.602 8.042 7.479 6.974 6.516 6.107 5.686 5.314 4.94 4.549 4.179 3.848 3.551 3.233 2.942 2.686 2.435 2.176 1.957 1.73 1.465 1.25 1.038 0.816 0.583 0.337 0.165 -0.013 -0.289 -0.481 -0.684 -0.793 -1.025 -1.286 -1.563 -1.704 -1.941 -2.133 -2.295 -2.484 -2.886 -3.101 -3.346 -3.603 -3.884 -4.231 -4.703 -6.253 -4 ,8237 ,KEBNE ,16676946,Wed Nov 24 15:12:03 CET,Wed Nov 24 17:06:48 CET,0.0 0.824 1.187 1.481 1.713 1.91 2.084 2.238 2.538 2.679 2.81 2.952 3.16 3.268 3.463 3.646 3.829 3.907 4.051 4.201 4.409 4.537 4.659 4.831 4.991 5.144 5.29 5.438 5.63 5.805 5.969 6.154 6.337 6.511 6.699 6.909 7.102 7.298 7.519 7.766 8.001 8.232 8.48 8.724 8.986 9.249 9.519 9.773 10.017 10.136 9.953 9.503 9.021 8.464 7.857 7.302 6.794 6.303 5.861 5.393 4.991 4.639 4.299 3.97 3.656 3.367 3.051 2.784 2.556 2.284 1.987 1.747 1.486 1.22 1.022 0.797 0.563 0.321 0.055 -0.14 -0.336 -0.623 -0.828 -1.048 -1.164 -1.401 -1.653 -1.911 -2.047 -2.299 -2.538 -2.71 -2.887 -3.294 -3.533 -3.797 -4.086 -4.414 -4.816 -5.375 -6.973 -5 ,30181 ,KEBNE ,16676947,Wed Nov 24 15:12:03 CET,Wed Nov 24 17:09:04 CET,0.0 0.757 1.087 1.35 1.57 1.768 1.959 2.142 2.435 2.564 2.684 2.821 3.023 3.131 3.334 3.507 3.679 3.765 3.919 4.07 4.293 4.429 4.556 4.736 4.906 5.07 5.222 5.362 5.553 5.749 5.932 6.139 6.336 6.519 6.719 6.938 7.141 7.357 7.586 7.825 8.056 8.294 8.566 8.815 9.105 9.435 9.739 10.04 10.337 10.538 10.548 10.089 9.481 8.871 8.301 7.782 7.321 6.877 6.465 6.049 5.652 5.286 4.94 4.596 4.264 3.958 3.641 3.35 3.094 2.835 2.553 2.309 2.044 1.757 1.546 1.327 1.097 0.872 0.652 0.499 0.329 0.038 -0.165 -0.385 -0.497 -0.729 -0.979 -1.232 -1.378 -1.625 -1.823 -1.992 -2.176 -2.545 -2.765 -3.008 -3.273 -3.57 -3.947 -4.419 -5.749 -6 ,32243 ,KEBNE ,16676948,Wed Nov 24 15:14:05 CET,Wed Nov 24 17:07:19 CET,0.0 0.771 1.088 1.377 1.639 1.832 1.999 2.161 2.45 2.578 2.706 2.849 3.049 3.148 3.331 3.514 3.687 3.767 3.92 4.068 4.281 4.415 4.54 4.724 4.906 5.078 5.228 5.368 5.554 5.734 5.899 6.092 6.28 6.466 6.672 6.894 7.095 7.305 7.538 7.764 7.997 8.268 8.558 8.828 9.134 9.457 9.779 10.086 10.372 10.58 10.584 10.215 9.711 9.215 8.698 8.148 7.626 7.127 6.678 6.212 5.807 5.456 5.116 4.788 4.484 4.199 3.875 3.598 3.38 3.121 2.84 2.601 2.326 2.049 1.847 1.631 1.397 1.142 0.876 0.69 0.489 0.169 -0.044 -0.265 -0.388 -0.64 -0.909 -1.2 -1.353 -1.599 -1.833 -2.017 -2.199 -2.594 -2.822 -3.072 -3.345 -3.675 -4.066 -4.628 -6.587 -7 ,18581 ,KEBNE ,16676949,Wed Nov 24 15:14:05 CET,Wed Nov 24 17:08:21 CET,0.0 0.795 1.173 1.445 1.666 1.861 2.03 2.186 2.46 2.588 2.714 2.86 3.066 3.169 3.367 3.551 3.718 3.794 3.946 4.093 4.303 4.439 4.566 4.745 4.916 5.077 5.227 5.369 5.554 5.73 5.895 6.095 6.281 6.455 6.656 6.872 7.059 7.255 7.471 7.704 7.925 8.161 8.428 8.691 8.986 9.265 9.537 9.803 10.045 10.257 10.299 9.935 9.409 8.878 8.374 7.91 7.481 7.063 6.682 6.281 5.925 5.598 5.271 4.953 4.676 4.402 4.069 3.771 3.528 3.268 2.987 2.749 2.503 2.245 2.04 1.824 1.597 1.361 1.113 0.94 0.758 0.464 0.247 0.025 -0.081 -0.298 -0.536 -0.821 -0.974 -1.217 -1.433 -1.607 -1.793 -2.217 -2.464 -2.724 -2.995 -3.303 -3.633 -4.083 -5.431 -8 ,23790 ,KEBNE ,16676950,Wed Nov 24 15:14:05 CET,Wed Nov 24 17:07:04 CET,0.0 0.662 0.99 1.252 1.49 1.705 1.894 2.058 2.34 2.473 2.598 2.738 2.939 3.037 3.222 3.393 3.549 3.628 3.783 3.922 4.123 4.258 4.382 4.556 4.721 4.877 5.037 5.191 5.376 5.545 5.696 5.884 6.061 6.237 6.444 6.675 6.89 7.099 7.319 7.547 7.781 8.035 8.301 8.548 8.811 9.07 9.372 9.699 9.999 10.203 10.182 9.813 9.268 8.666 8.127 7.609 7.098 6.611 6.172 5.701 5.311 4.951 4.579 4.23 3.903 3.592 3.276 2.986 2.695 2.386 2.084 1.835 1.59 1.337 1.135 0.912 0.668 0.411 0.123 -0.064 -0.253 -0.571 -0.796 -1.022 -1.138 -1.381 -1.646 -1.935 -2.087 -2.33 -2.556 -2.73 -2.918 -3.359 -3.614 -3.887 -4.177 -4.544 -4.986 -5.54 -7.094 -9 ,18443 ,KEBNE ,16676951,Wed Nov 24 15:14:05 CET,Wed Nov 24 17:08:31 CET,0.0 0.794 1.142 1.425 1.633 1.822 2.013 2.181 2.462 2.594 2.714 2.847 3.045 3.157 3.364 3.556 3.74 3.823 3.974 4.116 4.309 4.428 4.551 4.735 4.905 5.059 5.212 5.363 5.535 5.688 5.837 6.015 6.189 6.361 6.541 6.746 6.942 7.153 7.39 7.623 7.864 8.118 8.362 8.607 8.889 9.172 9.461 9.743 9.998 10.167 10.107 9.673 9.142 8.617 8.081 7.558 7.058 6.594 6.203 5.775 5.407 5.086 4.778 4.464 4.178 3.93 3.643 3.366 3.114 2.848 2.57 2.342 2.11 1.867 1.677 1.479 1.271 1.048 0.799 0.624 0.441 0.163 -0.025 -0.22 -0.324 -0.544 -0.784 -1.049 -1.19 -1.429 -1.652 -1.822 -1.993 -2.372 -2.59 -2.84 -3.123 -3.439 -3.798 -4.257 -5.554 -10 ,22263 ,KEBNE ,16676952,Wed Nov 24 15:15:06 CET,Wed Nov 24 17:08:53 CET,0.0 0.874 1.283 1.572 1.797 1.997 2.172 2.335 2.672 2.818 2.944 3.096 3.297 3.403 3.595 3.772 3.941 4.022 4.176 4.322 4.522 4.648 4.775 4.969 5.151 5.318 5.472 5.61 5.78 5.942 6.099 6.286 6.461 6.623 6.815 7.018 7.216 7.446 7.682 7.914 8.134 8.372 8.642 8.897 9.168 9.46 9.763 10.044 10.327 10.544 10.487 10.053 9.552 9.028 8.528 8.049 7.551 7.1 6.701 6.243 5.855 5.514 5.194 4.899 4.601 4.316 4.024 3.756 3.494 3.205 2.921 2.694 2.449 2.182 1.976 1.768 1.55 1.323 1.094 0.93 0.749 0.44 0.221 -0.002 -0.121 -0.364 -0.612 -0.873 -1.009 -1.244 -1.451 -1.613 -1.791 -2.205 -2.433 -2.666 -2.925 -3.254 -3.655 -4.199 -5.828 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_49.txt deleted file mode 100644 index 4dc60b0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6623 ,KEBNE ,16676953,Wed Nov 24 15:15:06 CET,Wed Nov 24 17:13:00 CET,0.0 0.748 1.061 1.309 1.532 1.721 1.891 2.04 2.298 2.419 2.532 2.637 2.836 2.944 3.138 3.326 3.494 3.566 3.705 3.835 4.015 4.132 4.252 4.426 4.582 4.723 4.855 4.975 5.127 5.282 5.422 5.585 5.742 5.887 6.053 6.225 6.378 6.552 6.731 6.914 7.1 7.307 7.532 7.724 7.913 8.088 8.247 8.34 8.326 8.205 7.846 7.1 6.269 5.486 4.795 4.141 3.539 2.98 2.484 1.987 1.579 1.193 0.796 0.444 0.111 -0.204 -0.537 -0.842 -1.111 -1.404 -1.707 -1.957 -2.215 -2.461 -2.655 -2.862 -3.082 -3.327 -3.597 -3.802 -4.022 -4.353 -4.575 -4.823 -4.958 -5.23 -5.519 -5.829 -5.999 -6.281 -6.582 -6.79 -7.001 -7.453 -7.713 -8.025 -8.358 -8.712 -9.162 -9.74 -11.553 -2 ,29791 ,KEBNE ,16676954,Wed Nov 24 15:16:07 CET,Wed Nov 24 17:09:01 CET,0.0 0.877 1.22 1.467 1.677 1.865 2.029 2.177 2.474 2.608 2.722 2.839 3.024 3.109 3.278 3.446 3.594 3.663 3.798 3.918 4.09 4.201 4.3 4.436 4.57 4.701 4.832 4.949 5.09 5.239 5.384 5.551 5.703 5.838 5.992 6.165 6.326 6.496 6.675 6.862 7.051 7.255 7.459 7.63 7.799 7.939 8.057 8.208 8.329 8.206 7.665 6.749 5.845 5.035 4.305 3.632 3.026 2.472 1.997 1.496 1.057 0.665 0.268 -0.096 -0.428 -0.737 -1.048 -1.328 -1.577 -1.851 -2.145 -2.384 -2.633 -2.898 -3.117 -3.345 -3.592 -3.858 -4.12 -4.311 -4.518 -4.825 -5.047 -5.283 -5.405 -5.663 -5.926 -6.196 -6.349 -6.621 -6.904 -7.112 -7.324 -7.824 -8.106 -8.387 -8.693 -9.056 -9.502 -10.116 -12.107 -3 ,22488 ,KEBNE ,16676955,Wed Nov 24 15:16:07 CET,Wed Nov 24 17:10:20 CET,0.0 0.781 1.145 1.425 1.65 1.835 1.997 2.153 2.445 2.574 2.688 2.795 2.984 3.075 3.246 3.404 3.562 3.636 3.772 3.902 4.092 4.208 4.311 4.47 4.619 4.754 4.875 4.989 5.135 5.274 5.409 5.566 5.711 5.845 5.996 6.158 6.299 6.455 6.623 6.782 6.939 7.094 7.247 7.38 7.524 7.69 7.788 7.813 7.783 7.552 6.908 5.912 4.933 3.996 3.214 2.521 1.87 1.234 0.661 0.075 -0.448 -0.916 -1.355 -1.765 -2.145 -2.508 -2.898 -3.256 -3.583 -3.922 -4.26 -4.534 -4.832 -5.139 -5.369 -5.618 -5.87 -6.125 -6.395 -6.585 -6.793 -7.111 -7.33 -7.58 -7.716 -7.991 -8.28 -8.576 -8.733 -8.994 -9.262 -9.458 -9.653 -10.113 -10.38 -10.677 -11.006 -11.373 -11.821 -12.423 -14.59 -4 ,9103 ,KEBNE ,16676956,Wed Nov 24 15:16:07 CET,Wed Nov 24 17:12:27 CET,0.0 0.719 1.042 1.281 1.47 1.643 1.814 1.98 2.27 2.394 2.512 2.635 2.824 2.919 3.094 3.272 3.439 3.516 3.668 3.811 4.01 4.138 4.253 4.402 4.54 4.677 4.804 4.924 5.079 5.224 5.36 5.522 5.673 5.807 5.955 6.117 6.28 6.456 6.631 6.799 6.953 7.105 7.298 7.497 7.675 7.842 7.984 8.033 7.938 7.686 7.155 6.315 5.506 4.737 3.952 3.192 2.514 1.895 1.375 0.848 0.386 -0.017 -0.428 -0.851 -1.248 -1.584 -1.904 -2.202 -2.487 -2.788 -3.092 -3.362 -3.64 -3.922 -4.151 -4.381 -4.624 -4.898 -5.188 -5.379 -5.577 -5.898 -6.123 -6.359 -6.489 -6.755 -7.033 -7.341 -7.5 -7.763 -8.018 -8.211 -8.413 -8.856 -9.092 -9.35 -9.658 -10.018 -10.439 -11.041 -12.699 -5 ,2756 ,KEBNE ,16676957,Wed Nov 24 15:16:07 CET,Wed Nov 24 17:09:21 CET,0.0 0.687 1.032 1.283 1.482 1.671 1.851 2.011 2.284 2.411 2.536 2.662 2.843 2.936 3.129 3.297 3.448 3.518 3.659 3.793 3.982 4.094 4.192 4.337 4.478 4.619 4.756 4.885 5.044 5.195 5.344 5.52 5.668 5.785 5.929 6.083 6.216 6.366 6.529 6.695 6.86 7.038 7.223 7.381 7.549 7.723 7.883 7.953 7.898 7.684 7.047 6.092 5.24 4.415 3.647 2.965 2.363 1.79 1.281 0.751 0.291 -0.119 -0.521 -0.909 -1.297 -1.663 -2.044 -2.394 -2.699 -2.997 -3.326 -3.614 -3.912 -4.228 -4.459 -4.695 -4.962 -5.247 -5.544 -5.752 -5.959 -6.312 -6.569 -6.83 -6.963 -7.25 -7.547 -7.86 -8.032 -8.302 -8.568 -8.771 -8.984 -9.459 -9.741 -10.045 -10.377 -10.781 -11.263 -11.892 -14.471 -6 ,3653 ,KEBNE ,16676958,Wed Nov 24 15:17:09 CET,Wed Nov 24 17:11:41 CET,0.0 0.945 1.275 1.513 1.723 1.915 2.095 2.256 2.522 2.642 2.755 2.869 3.051 3.142 3.315 3.483 3.63 3.693 3.826 3.957 4.136 4.251 4.366 4.523 4.665 4.803 4.933 5.053 5.199 5.347 5.49 5.643 5.779 5.91 6.062 6.235 6.392 6.551 6.716 6.897 7.082 7.269 7.461 7.642 7.831 8.009 8.163 8.262 8.313 8.183 7.585 6.675 5.859 5.075 4.348 3.695 3.09 2.538 2.067 1.553 1.066 0.613 0.179 -0.223 -0.579 -0.913 -1.277 -1.616 -1.919 -2.216 -2.524 -2.801 -3.097 -3.4 -3.648 -3.915 -4.183 -4.461 -4.745 -4.943 -5.162 -5.492 -5.716 -5.947 -6.073 -6.343 -6.639 -6.983 -7.149 -7.411 -7.666 -7.871 -8.084 -8.515 -8.757 -9.048 -9.386 -9.751 -10.213 -10.85 -12.739 -7 ,26986 ,KEBNE ,16676959,Wed Nov 24 15:18:10 CET,Wed Nov 24 17:11:53 CET,0.0 0.776 1.113 1.389 1.615 1.799 1.968 2.12 2.392 2.52 2.643 2.765 2.961 3.058 3.238 3.413 3.579 3.658 3.804 3.943 4.142 4.27 4.387 4.542 4.694 4.839 4.976 5.119 5.288 5.434 5.578 5.753 5.915 6.064 6.239 6.424 6.585 6.758 6.952 7.159 7.361 7.558 7.772 7.991 8.214 8.413 8.581 8.659 8.621 8.396 7.765 6.702 5.685 4.788 4.0 3.267 2.578 1.936 1.37 0.798 0.313 -0.126 -0.546 -0.945 -1.325 -1.668 -2.042 -2.384 -2.681 -3.011 -3.354 -3.631 -3.933 -4.227 -4.446 -4.687 -4.955 -5.249 -5.55 -5.761 -5.977 -6.302 -6.532 -6.789 -6.927 -7.205 -7.494 -7.81 -7.977 -8.247 -8.517 -8.711 -8.917 -9.404 -9.681 -9.96 -10.287 -10.693 -11.188 -11.857 -13.998 -8 ,15904 ,KEBNE ,16676960,Wed Nov 24 15:17:08 CET,Wed Nov 24 17:09:27 CET,0.0 0.731 1.075 1.334 1.55 1.736 1.894 2.034 2.292 2.416 2.534 2.649 2.827 2.916 3.089 3.245 3.39 3.461 3.602 3.732 3.905 4.017 4.12 4.274 4.433 4.586 4.728 4.855 5.009 5.15 5.293 5.456 5.599 5.736 5.891 6.075 6.244 6.398 6.554 6.723 6.89 7.054 7.226 7.395 7.592 7.766 7.872 7.931 7.939 7.763 7.131 6.188 5.346 4.535 3.769 3.083 2.438 1.812 1.277 0.744 0.283 -0.14 -0.551 -0.931 -1.268 -1.585 -1.944 -2.266 -2.539 -2.827 -3.126 -3.394 -3.685 -3.992 -4.24 -4.488 -4.737 -4.99 -5.266 -5.485 -5.729 -6.097 -6.338 -6.584 -6.713 -6.988 -7.277 -7.568 -7.711 -7.96 -8.201 -8.391 -8.588 -9.025 -9.297 -9.595 -9.899 -10.253 -10.68 -11.264 -13.47 -9 ,3150 ,KEBNE ,16676961,Wed Nov 24 15:17:09 CET,Wed Nov 24 17:10:41 CET,0.0 0.799 1.133 1.375 1.589 1.779 1.943 2.096 2.374 2.499 2.612 2.719 2.907 3.01 3.205 3.378 3.529 3.601 3.743 3.876 4.064 4.178 4.282 4.434 4.576 4.716 4.853 4.967 5.108 5.258 5.391 5.534 5.677 5.826 5.996 6.171 6.333 6.506 6.678 6.852 7.037 7.239 7.437 7.599 7.776 7.975 8.116 8.193 8.206 8.043 7.495 6.582 5.717 4.855 4.068 3.345 2.672 2.065 1.522 0.964 0.464 0.003 -0.432 -0.83 -1.193 -1.557 -1.949 -2.274 -2.543 -2.834 -3.152 -3.414 -3.7 -4.024 -4.274 -4.521 -4.773 -5.043 -5.333 -5.538 -5.74 -6.048 -6.274 -6.517 -6.644 -6.907 -7.19 -7.505 -7.664 -7.915 -8.166 -8.361 -8.555 -8.997 -9.266 -9.564 -9.908 -10.308 -10.778 -11.406 -14.004 -10 ,9502 ,KEBNE ,16676962,Wed Nov 24 15:17:08 CET,Wed Nov 24 17:10:27 CET,0.0 0.977 1.286 1.528 1.733 1.92 2.079 2.217 2.471 2.598 2.729 2.864 3.057 3.15 3.313 3.476 3.623 3.686 3.805 3.917 4.082 4.184 4.282 4.423 4.559 4.696 4.824 4.948 5.107 5.255 5.391 5.537 5.679 5.817 5.969 6.135 6.286 6.447 6.612 6.773 6.939 7.097 7.25 7.39 7.523 7.639 7.736 7.819 7.795 7.55 6.948 5.988 5.062 4.18 3.373 2.648 1.967 1.317 0.775 0.208 -0.295 -0.735 -1.165 -1.567 -1.947 -2.298 -2.665 -3.01 -3.309 -3.62 -3.962 -4.236 -4.511 -4.811 -5.059 -5.322 -5.592 -5.883 -6.186 -6.384 -6.584 -6.906 -7.132 -7.362 -7.482 -7.727 -7.998 -8.293 -8.45 -8.722 -8.999 -9.202 -9.414 -9.875 -10.14 -10.424 -10.723 -11.102 -11.601 -12.237 -14.318 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_20.txt deleted file mode 100644 index ef203ee2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_20.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8082 ,KEBNE ,16676963,Wed Nov 24 15:17:08 CET,Wed Nov 24 17:11:20 CET,0.0 1.735 2.257 2.633 2.961 3.243 3.469 3.677 4.074 4.252 4.412 4.622 4.847 4.982 5.235 5.459 5.665 5.76 5.95 6.135 6.391 6.552 6.709 6.926 7.124 7.323 7.522 7.712 7.964 8.208 8.434 8.695 8.946 9.181 9.442 9.735 10.015 10.305 10.608 10.93 11.256 11.624 12.064 12.487 12.935 13.381 13.892 14.449 14.97 15.437 15.737 15.637 15.305 14.906 14.486 14.073 13.695 13.311 12.956 12.587 12.254 11.944 11.647 11.356 11.074 10.811 10.523 10.262 10.045 9.801 9.536 9.315 9.076 8.826 8.62 8.399 8.172 7.94 7.718 7.57 7.404 7.132 6.947 6.765 6.669 6.442 6.193 5.939 5.802 5.567 5.359 5.189 5.018 4.661 4.457 4.243 3.988 3.7 3.356 2.904 1.946 -2 ,31125 ,KEBNE ,16674660,Tue Nov 23 17:51:36 CET,Tue Nov 23 19:45:32 CET,0.0 2.644 3.129 3.52 3.851 4.127 4.367 4.57 4.931 5.1 5.258 5.452 5.68 5.814 6.07 6.311 6.538 6.644 6.856 7.051 7.325 7.504 7.669 7.903 8.132 8.352 8.555 8.751 9.007 9.248 9.473 9.742 9.997 10.242 10.525 10.832 11.113 11.413 11.748 12.107 12.463 12.844 13.269 13.672 14.116 14.599 15.141 15.681 16.178 16.653 17.02 16.917 16.572 16.154 15.742 15.348 14.944 14.539 14.164 13.763 13.411 13.094 12.797 12.518 12.242 11.985 11.708 11.449 11.203 10.948 10.683 10.458 10.238 10.013 9.828 9.627 9.427 9.216 8.988 8.827 8.662 8.395 8.182 7.934 7.81 7.573 7.335 7.084 6.946 6.704 6.485 6.321 6.131 5.695 5.471 5.24 4.988 4.697 4.33 3.804 2.096 -3 ,6318 ,KEBNE ,16676965,Wed Nov 24 15:18:11 CET,Wed Nov 24 17:11:52 CET,0.0 2.048 2.585 2.999 3.31 3.563 3.813 4.05 4.443 4.61 4.775 4.979 5.206 5.334 5.571 5.795 6.001 6.096 6.286 6.472 6.733 6.9 7.053 7.275 7.487 7.679 7.868 8.054 8.289 8.515 8.732 8.994 9.237 9.468 9.743 10.052 10.332 10.624 10.93 11.244 11.546 11.866 12.253 12.623 13.031 13.456 13.922 14.449 14.985 15.51 15.929 15.856 15.53 15.152 14.761 14.352 13.949 13.533 13.15 12.774 12.441 12.126 11.809 11.485 11.185 10.888 10.544 10.24 9.974 9.694 9.404 9.163 8.915 8.65 8.431 8.194 7.949 7.708 7.451 7.274 7.102 6.835 6.637 6.416 6.3 6.062 5.803 5.516 5.367 5.127 4.868 4.665 4.46 4.039 3.797 3.518 3.185 2.801 2.371 1.796 0.186 -4 ,13132 ,KEBNE ,16674662,Tue Nov 23 17:51:36 CET,Tue Nov 23 17:58:02 CET,0.0 2.275 2.819 3.211 3.533 3.805 4.049 4.263 4.641 4.817 4.981 5.182 5.416 5.555 5.815 6.053 6.265 6.363 6.559 6.746 7.001 7.152 7.301 7.533 7.747 7.94 8.126 8.309 8.535 8.751 8.962 9.217 9.451 9.669 9.928 10.224 10.51 10.807 11.11 11.419 11.741 12.105 12.537 12.955 13.403 13.891 14.44 14.986 15.489 15.964 16.314 16.294 16.042 15.637 15.206 14.731 14.268 13.846 13.469 13.064 12.686 12.346 12.026 11.732 11.447 11.174 10.876 10.594 10.359 10.11 9.849 9.628 9.378 9.118 8.905 8.676 8.456 8.233 7.995 7.827 7.647 7.367 7.165 6.943 6.825 6.578 6.326 6.048 5.898 5.652 5.391 5.191 4.993 4.555 4.302 4.031 3.719 3.331 2.881 2.312 0.813 -5 ,12332 ,KEBNE ,16676967,Wed Nov 24 15:18:09 CET,Wed Nov 24 17:11:06 CET,0.0 2.63 3.23 3.666 4.018 4.318 4.572 4.793 5.209 5.4 5.573 5.814 6.069 6.215 6.496 6.759 6.995 7.103 7.307 7.499 7.772 7.95 8.125 8.37 8.608 8.846 9.063 9.264 9.532 9.795 10.052 10.345 10.61 10.872 11.175 11.495 11.798 12.142 12.496 12.856 13.228 13.646 14.106 14.513 14.975 15.47 15.944 16.4 16.89 17.306 17.484 17.266 16.866 16.382 15.88 15.363 14.894 14.476 14.119 13.747 13.397 13.08 12.771 12.462 12.165 11.888 11.597 11.33 11.078 10.818 10.552 10.324 10.091 9.846 9.652 9.45 9.24 9.026 8.786 8.616 8.447 8.165 7.959 7.753 7.646 7.412 7.163 6.914 6.777 6.521 6.283 6.111 5.918 5.509 5.297 5.045 4.741 4.405 4.028 3.526 2.297 -7 ,5619 ,KEBNE ,16676969,Wed Nov 24 15:18:10 CET,Wed Nov 24 17:12:29 CET,0.0 1.74 2.256 2.659 2.993 3.281 3.525 3.731 4.105 4.275 4.426 4.639 4.875 5.002 5.244 5.47 5.682 5.783 5.975 6.162 6.426 6.587 6.746 6.987 7.213 7.419 7.613 7.796 8.03 8.255 8.473 8.736 8.981 9.216 9.48 9.769 10.05 10.344 10.647 10.959 11.273 11.634 12.052 12.47 12.943 13.429 13.95 14.468 14.989 15.503 15.839 15.766 15.478 15.12 14.728 14.301 13.911 13.536 13.196 12.844 12.506 12.187 11.872 11.569 11.293 11.039 10.787 10.546 10.314 10.07 9.805 9.585 9.36 9.116 8.928 8.737 8.534 8.311 8.088 7.932 7.759 7.488 7.303 7.113 7.01 6.783 6.521 6.241 6.102 5.865 5.641 5.471 5.28 4.864 4.615 4.313 4.002 3.653 3.174 2.565 1.176 -8 ,2077 ,KEBNE ,16676970,Wed Nov 24 15:18:10 CET,Wed Nov 24 17:10:43 CET,0.0 3.138 3.718 4.141 4.472 4.741 4.983 5.207 5.598 5.775 5.945 6.17 6.414 6.56 6.842 7.101 7.333 7.447 7.668 7.876 8.166 8.345 8.513 8.752 8.984 9.213 9.439 9.653 9.921 10.171 10.415 10.711 10.985 11.242 11.536 11.859 12.166 12.488 12.799 13.123 13.463 13.839 14.25 14.637 15.099 15.603 16.135 16.682 17.259 17.826 18.235 18.203 17.932 17.527 17.071 16.642 16.239 15.865 15.523 15.146 14.818 14.53 14.25 13.969 13.694 13.437 13.158 12.898 12.666 12.422 12.179 11.969 11.732 11.491 11.299 11.094 10.888 10.676 10.451 10.301 10.147 9.884 9.69 9.487 9.376 9.135 8.893 8.642 8.508 8.285 8.093 7.936 7.765 7.37 7.158 6.931 6.665 6.358 6.012 5.569 4.342 -9 ,7249 ,KEBNE ,16674667,Tue Nov 23 17:53:45 CET,Tue Nov 23 19:47:41 CET,0.0 2.226 2.703 3.065 3.367 3.63 3.854 4.057 4.427 4.598 4.757 4.945 5.165 5.296 5.549 5.773 5.987 6.093 6.289 6.481 6.765 6.937 7.097 7.326 7.548 7.761 7.958 8.154 8.404 8.646 8.879 9.135 9.38 9.622 9.896 10.188 10.449 10.742 11.059 11.375 11.709 12.098 12.543 12.971 13.437 13.928 14.474 15.058 15.666 16.234 16.724 16.793 16.508 16.17 15.828 15.432 15.022 14.638 14.305 13.952 13.633 13.336 13.036 12.742 12.461 12.196 11.917 11.644 11.397 11.158 10.924 10.723 10.51 10.288 10.112 9.92 9.704 9.472 9.238 9.075 8.899 8.631 8.457 8.27 8.164 7.948 7.726 7.484 7.352 7.12 6.922 6.771 6.612 6.242 6.027 5.793 5.52 5.191 4.724 4.092 2.32 -10 ,12015 ,KEBNE ,16674668,Tue Nov 23 17:53:43 CET,Tue Nov 23 19:46:41 CET,0.0 2.036 2.57 2.938 3.244 3.509 3.739 3.953 4.322 4.492 4.659 4.868 5.095 5.227 5.476 5.705 5.915 6.014 6.204 6.391 6.652 6.814 6.973 7.207 7.44 7.66 7.863 8.051 8.29 8.537 8.767 9.032 9.294 9.536 9.805 10.106 10.386 10.683 11.006 11.352 11.697 12.075 12.483 12.862 13.295 13.743 14.201 14.664 15.131 15.543 15.827 15.745 15.383 14.944 14.522 14.074 13.641 13.261 12.912 12.514 12.16 11.827 11.508 11.214 10.926 10.659 10.359 10.081 9.845 9.598 9.336 9.117 8.895 8.667 8.481 8.285 8.082 7.86 7.623 7.454 7.267 6.979 6.785 6.579 6.47 6.239 5.987 5.704 5.552 5.308 5.103 4.95 4.78 4.355 4.125 3.888 3.617 3.316 2.963 2.498 1.024 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_49.txt deleted file mode 100644 index 50b8f183..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3343 ,KEBNE ,16676973,Wed Nov 24 15:20:14 CET,Wed Nov 24 17:14:29 CET,0.0 0.799 1.171 1.471 1.7 1.906 2.084 2.238 2.509 2.64 2.76 2.887 3.084 3.184 3.363 3.524 3.666 3.734 3.876 4.012 4.209 4.331 4.446 4.609 4.761 4.905 5.034 5.158 5.318 5.471 5.616 5.789 5.952 6.092 6.253 6.428 6.58 6.743 6.917 7.098 7.278 7.462 7.669 7.864 8.064 8.239 8.423 8.589 8.674 8.615 8.173 7.361 6.518 5.741 5.014 4.285 3.643 3.046 2.523 2.002 1.565 1.167 0.752 0.359 0.007 -0.329 -0.688 -1.019 -1.321 -1.642 -1.98 -2.272 -2.578 -2.89 -3.121 -3.353 -3.595 -3.848 -4.127 -4.321 -4.528 -4.859 -5.098 -5.346 -5.471 -5.729 -6.002 -6.307 -6.466 -6.727 -7.001 -7.198 -7.408 -7.877 -8.131 -8.423 -8.743 -9.097 -9.562 -10.217 -11.854 -2 ,6858 ,KEBNE ,16676974,Wed Nov 24 15:19:11 CET,Wed Nov 24 17:13:29 CET,0.0 0.768 1.09 1.342 1.557 1.746 1.914 2.066 2.361 2.495 2.618 2.757 2.959 3.056 3.234 3.395 3.555 3.637 3.788 3.919 4.103 4.21 4.312 4.462 4.602 4.735 4.865 4.986 5.137 5.288 5.431 5.598 5.749 5.893 6.064 6.25 6.424 6.596 6.779 6.985 7.18 7.367 7.576 7.775 7.997 8.208 8.374 8.484 8.496 8.307 7.783 6.835 5.887 5.039 4.256 3.517 2.838 2.194 1.618 1.058 0.573 0.134 -0.272 -0.643 -0.996 -1.338 -1.699 -2.046 -2.349 -2.654 -2.983 -3.259 -3.534 -3.825 -4.065 -4.309 -4.549 -4.803 -5.077 -5.272 -5.477 -5.804 -6.047 -6.315 -6.447 -6.724 -7.015 -7.321 -7.492 -7.767 -8.038 -8.24 -8.446 -8.914 -9.182 -9.47 -9.801 -10.171 -10.606 -11.219 -12.842 -3 ,30541 ,KEBNE ,16676975,Wed Nov 24 15:20:14 CET,Wed Nov 24 17:14:30 CET,0.0 1.152 1.508 1.76 1.986 2.195 2.369 2.52 2.796 2.926 3.048 3.173 3.36 3.456 3.636 3.802 3.948 4.016 4.158 4.291 4.482 4.599 4.705 4.857 5.004 5.133 5.255 5.378 5.53 5.677 5.811 5.963 6.117 6.269 6.428 6.599 6.767 6.948 7.131 7.304 7.489 7.681 7.865 8.031 8.194 8.346 8.488 8.59 8.62 8.479 8.005 7.139 6.186 5.342 4.572 3.823 3.16 2.546 2.013 1.473 0.986 0.57 0.161 -0.25 -0.625 -0.976 -1.341 -1.676 -1.955 -2.234 -2.553 -2.825 -3.102 -3.395 -3.622 -3.86 -4.118 -4.385 -4.663 -4.858 -5.058 -5.371 -5.604 -5.848 -5.968 -6.225 -6.503 -6.801 -6.962 -7.23 -7.498 -7.7 -7.918 -8.393 -8.659 -8.954 -9.277 -9.66 -10.133 -10.821 -12.761 -4 ,24218 ,KEBNE ,16676976,Wed Nov 24 15:20:14 CET,Wed Nov 24 17:15:33 CET,0.0 0.78 1.103 1.375 1.606 1.804 1.983 2.146 2.429 2.557 2.679 2.802 3.003 3.105 3.286 3.451 3.606 3.68 3.818 3.951 4.14 4.251 4.351 4.503 4.655 4.79 4.912 5.032 5.186 5.326 5.473 5.652 5.806 5.943 6.104 6.284 6.447 6.621 6.801 6.985 7.161 7.355 7.549 7.721 7.924 8.092 8.236 8.374 8.453 8.358 7.866 6.983 6.081 5.243 4.484 3.733 3.067 2.507 2.027 1.536 1.108 0.683 0.249 -0.166 -0.559 -0.913 -1.299 -1.663 -1.978 -2.308 -2.634 -2.917 -3.231 -3.558 -3.819 -4.085 -4.347 -4.615 -4.912 -5.118 -5.324 -5.672 -5.922 -6.184 -6.32 -6.594 -6.881 -7.198 -7.364 -7.634 -7.889 -8.087 -8.307 -8.785 -9.05 -9.341 -9.652 -10.022 -10.491 -11.108 -12.932 -5 ,28442 ,KEBNE ,16676977,Wed Nov 24 15:21:15 CET,Wed Nov 24 17:16:41 CET,0.0 0.918 1.253 1.506 1.726 1.93 2.112 2.28 2.566 2.69 2.806 2.944 3.145 3.244 3.418 3.589 3.747 3.814 3.945 4.082 4.28 4.4 4.517 4.677 4.824 4.961 5.089 5.217 5.385 5.535 5.678 5.87 6.05 6.202 6.386 6.583 6.755 6.942 7.13 7.336 7.543 7.754 7.982 8.199 8.416 8.592 8.771 8.945 9.073 9.022 8.554 7.796 7.079 6.382 5.733 5.162 4.651 4.142 3.655 3.153 2.703 2.29 1.902 1.529 1.192 0.875 0.527 0.216 -0.067 -0.382 -0.706 -0.968 -1.237 -1.51 -1.725 -1.948 -2.175 -2.414 -2.668 -2.852 -3.044 -3.334 -3.552 -3.793 -3.916 -4.168 -4.437 -4.716 -4.868 -5.137 -5.391 -5.595 -5.816 -6.282 -6.535 -6.812 -7.108 -7.456 -7.934 -8.6 -10.276 -6 ,9902 ,KEBNE ,16676978,Wed Nov 24 15:27:22 CET,Wed Nov 24 17:19:41 CET,0.0 0.872 1.235 1.491 1.702 1.894 2.065 2.224 2.534 2.666 2.779 2.898 3.093 3.192 3.373 3.543 3.698 3.774 3.925 4.064 4.25 4.373 4.494 4.663 4.823 4.969 5.109 5.244 5.415 5.569 5.711 5.875 6.018 6.15 6.305 6.479 6.638 6.792 6.949 7.107 7.255 7.422 7.614 7.796 8.001 8.201 8.369 8.48 8.51 8.331 7.751 6.758 5.736 4.795 4.012 3.295 2.644 2.026 1.474 0.92 0.423 -0.03 -0.459 -0.871 -1.263 -1.622 -2.0 -2.337 -2.629 -2.936 -3.255 -3.521 -3.796 -4.098 -4.339 -4.579 -4.823 -5.089 -5.372 -5.559 -5.751 -6.049 -6.264 -6.505 -6.631 -6.892 -7.169 -7.463 -7.624 -7.886 -8.133 -8.323 -8.532 -9.008 -9.266 -9.542 -9.863 -10.223 -10.658 -11.2 -12.813 -7 ,24562 ,KEBNE ,16676979,Wed Nov 24 15:27:22 CET,Wed Nov 24 17:22:18 CET,0.0 0.824 1.185 1.453 1.669 1.874 2.059 2.221 2.493 2.616 2.73 2.857 3.05 3.14 3.311 3.468 3.619 3.694 3.842 3.977 4.155 4.273 4.384 4.534 4.677 4.811 4.944 5.067 5.22 5.376 5.518 5.68 5.831 5.967 6.124 6.295 6.445 6.619 6.817 6.997 7.158 7.335 7.547 7.746 7.948 8.136 8.323 8.473 8.543 8.47 8.003 7.095 6.171 5.356 4.58 3.802 3.108 2.502 1.958 1.387 0.887 0.436 0.01 -0.395 -0.775 -1.129 -1.506 -1.853 -2.157 -2.474 -2.817 -3.111 -3.423 -3.755 -4.004 -4.258 -4.531 -4.818 -5.117 -5.317 -5.525 -5.857 -6.08 -6.314 -6.441 -6.715 -6.991 -7.281 -7.437 -7.718 -8.005 -8.198 -8.401 -8.874 -9.134 -9.414 -9.729 -10.069 -10.5 -11.117 -12.891 -8 ,4115 ,KEBNE ,16676980,Wed Nov 24 15:27:21 CET,Wed Nov 24 17:20:58 CET,0.0 0.843 1.223 1.488 1.71 1.921 2.106 2.276 2.584 2.714 2.836 2.968 3.158 3.25 3.432 3.597 3.753 3.832 3.988 4.123 4.308 4.426 4.533 4.686 4.84 4.975 5.099 5.226 5.383 5.531 5.672 5.832 5.985 6.143 6.324 6.496 6.647 6.817 6.998 7.178 7.361 7.56 7.766 7.964 8.183 8.385 8.6 8.767 8.813 8.71 8.233 7.328 6.437 5.581 4.777 4.048 3.402 2.811 2.302 1.783 1.335 0.933 0.526 0.126 -0.254 -0.603 -0.964 -1.29 -1.593 -1.906 -2.214 -2.478 -2.767 -3.077 -3.325 -3.59 -3.863 -4.141 -4.413 -4.601 -4.801 -5.114 -5.33 -5.56 -5.686 -5.956 -6.241 -6.555 -6.716 -6.976 -7.255 -7.458 -7.668 -8.151 -8.412 -8.694 -9.025 -9.419 -9.881 -10.514 -11.964 -9 ,20180 ,KEBNE ,16676981,Wed Nov 24 15:27:21 CET,Wed Nov 24 17:20:30 CET,0.0 0.739 1.082 1.343 1.552 1.738 1.895 2.045 2.325 2.452 2.579 2.711 2.897 2.986 3.156 3.325 3.486 3.56 3.702 3.837 4.032 4.156 4.267 4.42 4.566 4.702 4.842 4.976 5.139 5.292 5.432 5.604 5.772 5.932 6.103 6.283 6.454 6.638 6.831 7.01 7.188 7.366 7.543 7.721 7.897 8.074 8.248 8.365 8.401 8.278 7.827 6.98 6.062 5.181 4.4 3.693 3.045 2.461 1.951 1.448 1.025 0.642 0.28 -0.081 -0.427 -0.735 -1.068 -1.385 -1.658 -1.94 -2.255 -2.53 -2.802 -3.082 -3.318 -3.575 -3.843 -4.114 -4.396 -4.588 -4.783 -5.113 -5.36 -5.617 -5.748 -6.035 -6.344 -6.656 -6.828 -7.108 -7.375 -7.565 -7.76 -8.19 -8.446 -8.763 -9.125 -9.526 -10.008 -10.659 -12.454 -10 ,2931 ,KEBNE ,16676982,Wed Nov 24 15:27:21 CET,Wed Nov 24 17:19:04 CET,0.0 0.834 1.191 1.485 1.722 1.922 2.097 2.25 2.531 2.655 2.769 2.899 3.097 3.19 3.361 3.526 3.692 3.771 3.917 4.056 4.246 4.365 4.477 4.642 4.803 4.947 5.082 5.209 5.37 5.525 5.671 5.851 6.014 6.169 6.347 6.546 6.722 6.887 7.082 7.286 7.47 7.661 7.856 8.039 8.244 8.429 8.574 8.7 8.796 8.756 8.304 7.44 6.607 5.844 5.117 4.412 3.79 3.247 2.752 2.203 1.705 1.238 0.814 0.438 0.076 -0.264 -0.599 -0.896 -1.166 -1.445 -1.752 -2.027 -2.307 -2.592 -2.81 -3.026 -3.266 -3.514 -3.767 -3.955 -4.147 -4.437 -4.646 -4.885 -5.013 -5.271 -5.56 -5.866 -6.02 -6.273 -6.505 -6.691 -6.898 -7.354 -7.594 -7.858 -8.168 -8.519 -8.941 -9.533 -11.241 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_39.txt deleted file mode 100644 index 32de2835..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15357 ,KEBNE ,16674669,Tue Nov 23 17:53:43 CET,Tue Nov 23 19:36:41 CET,0.0 1.414 1.838 2.14 2.417 2.672 2.889 3.084 3.427 3.578 3.716 3.864 4.086 4.201 4.414 4.619 4.821 4.914 5.075 5.228 5.439 5.575 5.715 5.913 6.095 6.27 6.444 6.611 6.823 7.029 7.226 7.457 7.678 7.894 8.139 8.41 8.663 8.935 9.224 9.529 9.855 10.221 10.638 11.057 11.541 12.075 12.65 13.245 13.906 14.629 15.291 15.633 15.679 15.589 15.431 15.223 15.009 14.81 14.639 14.41 14.182 13.992 13.811 13.629 13.454 13.281 13.097 12.938 12.796 12.644 12.469 12.307 12.148 11.99 11.863 11.729 11.584 11.429 11.256 11.133 11.014 10.822 10.676 10.511 10.429 10.262 10.09 9.912 9.816 9.621 9.501 9.382 9.244 8.911 8.739 8.559 8.336 8.076 7.788 7.376 6.064 -2 ,31602 ,KEBNE ,16674670,Tue Nov 23 17:53:43 CET,Tue Nov 23 19:48:52 CET,0.0 1.315 1.728 2.043 2.309 2.549 2.766 2.959 3.294 3.442 3.581 3.746 3.968 4.081 4.298 4.499 4.679 4.762 4.921 5.081 5.321 5.474 5.616 5.815 6.006 6.185 6.36 6.531 6.755 6.968 7.163 7.393 7.601 7.802 8.039 8.298 8.546 8.827 9.141 9.452 9.768 10.13 10.535 10.93 11.393 11.904 12.46 13.071 13.77 14.526 15.305 15.811 15.938 15.895 15.788 15.644 15.487 15.298 15.096 14.879 14.686 14.513 14.342 14.151 13.965 13.793 13.6 13.433 13.292 13.136 12.964 12.822 12.668 12.496 12.366 12.233 12.084 11.919 11.748 11.629 11.504 11.293 11.146 10.995 10.914 10.74 10.553 10.355 10.256 10.062 9.934 9.818 9.687 9.402 9.237 9.055 8.855 8.629 8.367 8.002 7.205 -3 ,20850 ,KEBNE ,16676985,Wed Nov 24 15:29:24 CET,Wed Nov 24 17:22:09 CET,0.0 1.36 1.81 2.134 2.401 2.633 2.829 3.01 3.348 3.508 3.655 3.81 4.027 4.129 4.329 4.521 4.696 4.782 4.945 5.102 5.339 5.491 5.64 5.838 6.02 6.199 6.361 6.517 6.723 6.928 7.13 7.364 7.568 7.759 7.993 8.247 8.488 8.772 9.076 9.368 9.679 10.024 10.412 10.82 11.285 11.784 12.355 12.959 13.623 14.342 15.062 15.429 15.505 15.485 15.395 15.259 15.088 14.898 14.733 14.555 14.37 14.188 14.005 13.824 13.643 13.47 13.292 13.129 12.981 12.818 12.646 12.509 12.369 12.206 12.069 11.937 11.81 11.67 11.514 11.403 11.282 11.099 10.971 10.83 10.753 10.575 10.387 10.208 10.116 9.923 9.777 9.649 9.514 9.227 9.066 8.885 8.692 8.477 8.205 7.873 6.994 -4 ,7741 ,KEBNE ,16676986,Wed Nov 24 15:29:24 CET,Wed Nov 24 17:23:45 CET,0.0 1.163 1.566 1.864 2.107 2.32 2.518 2.699 3.032 3.19 3.33 3.489 3.707 3.814 4.015 4.195 4.361 4.445 4.605 4.754 4.975 5.115 5.245 5.431 5.631 5.828 5.999 6.16 6.367 6.561 6.752 6.991 7.221 7.432 7.667 7.942 8.201 8.483 8.786 9.109 9.443 9.809 10.229 10.638 11.088 11.581 12.13 12.717 13.399 14.171 14.994 15.466 15.584 15.502 15.357 15.206 15.043 14.87 14.69 14.481 14.285 14.11 13.931 13.735 13.544 13.364 13.178 13.008 12.842 12.671 12.501 12.362 12.213 12.048 11.918 11.785 11.638 11.481 11.311 11.194 11.073 10.88 10.751 10.61 10.532 10.377 10.221 10.037 9.934 9.733 9.597 9.474 9.333 9.016 8.852 8.69 8.517 8.302 8.04 7.679 6.684 -5 ,22221 ,KEBNE ,16676987,Wed Nov 24 15:29:24 CET,Wed Nov 24 17:23:51 CET,0.0 0.98 1.364 1.673 1.946 2.19 2.396 2.584 2.919 3.053 3.187 3.351 3.571 3.685 3.894 4.089 4.271 4.356 4.524 4.672 4.879 5.017 5.152 5.345 5.528 5.703 5.871 6.032 6.235 6.426 6.62 6.857 7.067 7.254 7.483 7.761 8.021 8.296 8.591 8.904 9.225 9.579 9.993 10.399 10.864 11.391 11.976 12.585 13.271 14.062 14.85 15.229 15.274 15.23 15.138 14.976 14.781 14.574 14.376 14.154 13.949 13.762 13.581 13.402 13.225 13.061 12.883 12.725 12.595 12.45 12.292 12.154 11.994 11.826 11.698 11.564 11.415 11.261 11.097 10.979 10.862 10.684 10.557 10.423 10.352 10.183 10.005 9.818 9.723 9.531 9.407 9.286 9.155 8.874 8.703 8.498 8.291 8.077 7.797 7.397 6.403 -6 ,19183 ,KEBNE ,16676988,Wed Nov 24 15:29:24 CET,Wed Nov 24 17:23:49 CET,0.0 1.036 1.476 1.81 2.061 2.272 2.47 2.652 2.988 3.147 3.29 3.449 3.663 3.771 3.973 4.171 4.371 4.466 4.642 4.816 5.056 5.193 5.324 5.509 5.685 5.859 6.024 6.183 6.387 6.58 6.771 6.999 7.21 7.411 7.649 7.911 8.16 8.44 8.741 9.039 9.339 9.684 10.084 10.49 10.96 11.451 12.006 12.616 13.277 13.996 14.742 15.146 15.197 15.098 14.929 14.732 14.52 14.248 13.981 13.75 13.562 13.372 13.177 12.996 12.812 12.63 12.447 12.283 12.145 12.0 11.839 11.707 11.566 11.396 11.26 11.115 10.959 10.809 10.649 10.527 10.402 10.219 10.09 9.953 9.882 9.73 9.567 9.385 9.28 9.075 8.927 8.804 8.679 8.402 8.234 8.053 7.854 7.604 7.317 6.918 5.869 -7 ,24122 ,KEBNE ,16676989,Wed Nov 24 15:30:26 CET,Wed Nov 24 17:23:53 CET,0.0 1.141 1.557 1.885 2.136 2.363 2.575 2.756 3.067 3.223 3.378 3.537 3.755 3.873 4.118 4.349 4.546 4.637 4.807 4.975 5.213 5.356 5.496 5.701 5.895 6.081 6.265 6.441 6.654 6.856 7.047 7.27 7.49 7.708 7.953 8.223 8.473 8.741 9.029 9.319 9.614 9.959 10.365 10.757 11.209 11.701 12.266 12.911 13.63 14.361 14.998 15.216 15.102 14.885 14.635 14.337 14.056 13.794 13.554 13.297 13.068 12.837 12.608 12.41 12.217 12.044 11.86 11.675 11.511 11.345 11.157 10.989 10.822 10.657 10.522 10.375 10.223 10.066 9.895 9.777 9.641 9.42 9.272 9.111 9.03 8.857 8.65 8.422 8.311 8.101 7.934 7.796 7.653 7.344 7.171 6.97 6.736 6.464 6.124 5.637 4.397 -8 ,30928 ,KEBNE ,16676990,Wed Nov 24 15:31:27 CET,Wed Nov 24 17:25:32 CET,0.0 1.117 1.529 1.841 2.111 2.344 2.537 2.708 3.017 3.156 3.293 3.444 3.656 3.764 3.962 4.159 4.353 4.437 4.598 4.756 4.975 5.121 5.261 5.455 5.644 5.825 5.993 6.152 6.354 6.547 6.727 6.945 7.155 7.362 7.614 7.89 8.154 8.446 8.746 9.066 9.396 9.748 10.148 10.556 11.022 11.511 12.042 12.642 13.353 14.12 14.883 15.314 15.396 15.341 15.235 15.078 14.904 14.727 14.546 14.305 14.078 13.88 13.694 13.519 13.345 13.187 13.014 12.847 12.701 12.547 12.368 12.215 12.056 11.878 11.743 11.603 11.457 11.302 11.138 11.03 10.92 10.746 10.606 10.456 10.38 10.213 10.03 9.83 9.725 9.518 9.386 9.265 9.13 8.842 8.675 8.5 8.299 8.044 7.73 7.338 6.277 -9 ,9058 ,KEBNE ,16676991,Wed Nov 24 15:31:27 CET,Wed Nov 24 17:25:38 CET,0.0 1.242 1.65 1.95 2.207 2.427 2.616 2.794 3.132 3.289 3.429 3.592 3.811 3.927 4.134 4.325 4.525 4.616 4.776 4.931 5.16 5.31 5.452 5.656 5.855 6.039 6.211 6.385 6.597 6.794 6.986 7.218 7.451 7.668 7.917 8.197 8.464 8.752 9.057 9.379 9.702 10.058 10.457 10.841 11.31 11.852 12.445 13.07 13.749 14.512 15.272 15.626 15.677 15.622 15.5 15.329 15.136 14.964 14.802 14.61 14.434 14.264 14.097 13.932 13.767 13.609 13.421 13.25 13.103 12.944 12.78 12.645 12.505 12.356 12.228 12.092 11.954 11.797 11.629 11.508 11.388 11.21 11.073 10.924 10.846 10.684 10.509 10.297 10.183 9.976 9.835 9.709 9.57 9.253 9.074 8.876 8.655 8.4 8.092 7.712 6.703 -10 ,21547 ,KEBNE ,16676992,Wed Nov 24 15:31:27 CET,Wed Nov 24 17:24:37 CET,0.0 1.286 1.677 1.98 2.241 2.467 2.659 2.835 3.141 3.277 3.406 3.551 3.765 3.882 4.095 4.279 4.454 4.542 4.714 4.881 5.117 5.26 5.396 5.584 5.767 5.934 6.088 6.246 6.448 6.652 6.854 7.085 7.31 7.52 7.753 8.01 8.254 8.507 8.786 9.095 9.413 9.762 10.133 10.508 10.97 11.464 11.998 12.595 13.281 14.043 14.833 15.249 15.354 15.309 15.157 14.993 14.811 14.612 14.426 14.22 14.019 13.829 13.659 13.479 13.299 13.143 12.976 12.822 12.678 12.519 12.353 12.214 12.067 11.9 11.764 11.629 11.478 11.318 11.164 11.059 10.944 10.761 10.638 10.497 10.416 10.24 10.064 9.887 9.793 9.605 9.497 9.383 9.259 8.99 8.83 8.632 8.422 8.193 7.909 7.573 6.812 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_44.txt deleted file mode 100644 index 07a97676..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_44.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31657 ,KEBNE ,16676993,Wed Nov 24 15:32:28 CET,Wed Nov 24 17:26:30 CET,0.0 0.999 1.385 1.667 1.913 2.137 2.344 2.535 2.878 3.029 3.164 3.317 3.542 3.665 3.887 4.088 4.273 4.359 4.527 4.695 4.938 5.08 5.212 5.417 5.616 5.796 5.965 6.13 6.346 6.546 6.741 6.983 7.219 7.448 7.713 8.001 8.258 8.535 8.841 9.161 9.485 9.851 10.261 10.66 11.108 11.586 12.129 12.68 13.277 13.942 14.663 15.061 15.097 14.989 14.803 14.602 14.414 14.216 14.001 13.779 13.583 13.392 13.199 13.01 12.842 12.681 12.502 12.346 12.207 12.05 11.878 11.739 11.586 11.42 11.295 11.163 11.023 10.867 10.693 10.575 10.453 10.261 10.128 9.99 9.92 9.762 9.576 9.375 9.277 9.082 8.941 8.815 8.684 8.391 8.229 8.063 7.879 7.671 7.417 7.061 6.24 -3 ,19698 ,KEBNE ,16676995,Wed Nov 24 15:33:30 CET,Wed Nov 24 17:27:30 CET,0.0 1.283 1.721 2.069 2.363 2.603 2.812 3.004 3.343 3.503 3.654 3.828 4.06 4.185 4.433 4.681 4.918 5.021 5.216 5.414 5.701 5.881 6.045 6.273 6.492 6.704 6.911 7.108 7.359 7.601 7.829 8.085 8.338 8.59 8.854 9.145 9.417 9.72 10.064 10.403 10.746 11.127 11.589 12.06 12.548 13.071 13.696 14.358 15.077 15.903 16.754 17.282 17.416 17.328 17.144 16.925 16.694 16.478 16.272 16.047 15.845 15.621 15.396 15.196 15.007 14.831 14.647 14.477 14.332 14.186 14.019 13.873 13.717 13.549 13.422 13.288 13.145 12.996 12.835 12.713 12.582 12.381 12.249 12.112 12.041 11.896 11.734 11.547 11.446 11.246 11.102 10.974 10.848 10.58 10.428 10.244 10.046 9.823 9.527 9.161 8.337 -4 ,31865 ,KEBNE ,16676996,Wed Nov 24 15:40:40 CET,Wed Nov 24 17:34:03 CET,0.0 1.363 1.853 2.163 2.431 2.685 2.915 3.131 3.508 3.658 3.793 3.95 4.171 4.285 4.5 4.703 4.896 4.987 5.161 5.335 5.584 5.745 5.906 6.132 6.342 6.542 6.731 6.918 7.166 7.394 7.598 7.835 8.06 8.281 8.532 8.807 9.083 9.386 9.699 10.016 10.336 10.687 11.094 11.512 12.009 12.56 13.191 13.894 14.64 15.4 16.16 16.581 16.661 16.649 16.59 16.444 16.262 16.075 15.899 15.699 15.504 15.332 15.15 14.968 14.796 14.635 14.469 14.305 14.15 13.994 13.839 13.699 13.538 13.359 13.228 13.092 12.943 12.79 12.625 12.503 12.376 12.189 12.057 11.917 11.845 11.703 11.539 11.352 11.254 11.059 10.939 10.819 10.687 10.396 10.24 10.073 9.886 9.674 9.4 9.032 7.948 -5 ,27912 ,KEBNE ,16676997,Wed Nov 24 15:41:41 CET,Wed Nov 24 17:35:21 CET,0.0 0.95 1.334 1.633 1.905 2.137 2.348 2.545 2.884 3.029 3.173 3.355 3.575 3.685 3.909 4.116 4.323 4.42 4.596 4.775 5.028 5.18 5.326 5.535 5.729 5.904 6.085 6.265 6.488 6.701 6.901 7.149 7.398 7.627 7.882 8.153 8.416 8.71 9.0 9.304 9.637 10.014 10.453 10.885 11.377 11.918 12.529 13.17 13.839 14.57 15.343 15.873 16.094 16.117 15.997 15.812 15.626 15.422 15.223 15.018 14.81 14.596 14.38 14.174 13.987 13.821 13.637 13.465 13.315 13.152 12.979 12.829 12.666 12.497 12.37 12.244 12.116 11.979 11.826 11.721 11.612 11.425 11.285 11.133 11.047 10.868 10.678 10.469 10.367 10.17 10.032 9.907 9.77 9.466 9.306 9.127 8.924 8.688 8.419 8.07 7.188 -6 ,6504 ,KEBNE ,16676998,Wed Nov 24 15:42:43 CET,Wed Nov 24 17:41:45 CET,0.0 0.89 1.292 1.604 1.853 2.061 2.268 2.46 2.779 2.929 3.082 3.27 3.496 3.616 3.829 4.021 4.217 4.316 4.507 4.675 4.922 5.084 5.241 5.47 5.671 5.856 6.044 6.223 6.452 6.682 6.897 7.142 7.38 7.611 7.874 8.166 8.448 8.75 9.071 9.4 9.733 10.12 10.575 11.032 11.569 12.131 12.728 13.373 14.075 14.841 15.612 16.042 16.093 16.009 15.887 15.718 15.506 15.27 15.058 14.83 14.609 14.399 14.204 14.018 13.842 13.68 13.483 13.308 13.162 13.006 12.847 12.709 12.568 12.413 12.27 12.121 11.976 11.821 11.659 11.528 11.385 11.168 11.014 10.86 10.782 10.625 10.455 10.251 10.142 9.936 9.812 9.687 9.55 9.258 9.095 8.907 8.704 8.488 8.234 7.879 7.053 -7 ,29658 ,KEBNE ,16674685,Tue Nov 23 18:20:08 CET,Tue Nov 23 20:12:54 CET,0.0 1.114 1.545 1.866 2.128 2.363 2.58 2.769 3.09 3.242 3.382 3.526 3.742 3.858 4.086 4.289 4.479 4.573 4.766 4.946 5.192 5.348 5.496 5.71 5.907 6.092 6.271 6.458 6.693 6.9 7.094 7.331 7.561 7.77 8.013 8.28 8.532 8.81 9.095 9.393 9.727 10.08 10.483 10.899 11.377 11.905 12.494 13.134 13.83 14.517 15.193 15.569 15.575 15.455 15.304 15.144 14.975 14.778 14.57 14.342 14.14 13.958 13.775 13.589 13.404 13.228 13.05 12.887 12.737 12.574 12.404 12.263 12.103 11.928 11.793 11.645 11.493 11.346 11.186 11.071 10.952 10.755 10.606 10.452 10.378 10.22 10.042 9.852 9.755 9.564 9.45 9.338 9.217 8.947 8.787 8.611 8.429 8.227 7.971 7.606 6.554 -8 ,31296 ,KEBNE ,16677000,Wed Nov 24 15:43:45 CET,Wed Nov 24 17:37:38 CET,0.0 1.086 1.523 1.84 2.099 2.324 2.51 2.68 3.001 3.156 3.299 3.458 3.675 3.794 4.019 4.217 4.402 4.496 4.686 4.854 5.097 5.256 5.4 5.617 5.819 5.996 6.168 6.332 6.545 6.752 6.949 7.183 7.417 7.645 7.901 8.179 8.435 8.716 9.036 9.392 9.744 10.123 10.585 11.041 11.527 12.044 12.653 13.325 13.961 14.623 15.392 15.817 15.916 15.861 15.711 15.535 15.348 15.142 14.936 14.704 14.5 14.308 14.117 13.943 13.771 13.594 13.415 13.258 13.113 12.96 12.797 12.653 12.483 12.297 12.167 12.032 11.879 11.718 11.552 11.437 11.324 11.144 11.015 10.873 10.795 10.645 10.485 10.309 10.204 9.987 9.858 9.741 9.607 9.315 9.16 8.986 8.785 8.555 8.275 7.913 7.008 -9 ,12086 ,KEBNE ,16677001,Wed Nov 24 15:46:50 CET,Wed Nov 24 17:49:01 CET,0.0 1.002 1.413 1.709 1.961 2.173 2.36 2.545 2.891 3.042 3.181 3.354 3.582 3.698 3.918 4.133 4.345 4.449 4.642 4.815 5.047 5.199 5.347 5.552 5.746 5.936 6.114 6.277 6.495 6.707 6.913 7.164 7.408 7.628 7.873 8.151 8.421 8.729 9.04 9.364 9.716 10.09 10.517 10.95 11.432 11.947 12.537 13.179 13.84 14.554 15.319 15.737 15.815 15.728 15.575 15.362 15.116 14.896 14.699 14.464 14.256 14.059 13.86 13.67 13.488 13.31 13.111 12.933 12.777 12.608 12.442 12.308 12.16 12.003 11.876 11.733 11.582 11.42 11.243 11.123 11.009 10.825 10.688 10.548 10.473 10.304 10.12 9.923 9.824 9.635 9.517 9.405 9.277 9.0 8.849 8.685 8.506 8.309 8.086 7.768 6.992 -10 ,23592 ,KEBNE ,16674688,Tue Nov 23 18:23:19 CET,Tue Nov 23 20:18:31 CET,0.0 0.799 1.171 1.463 1.718 1.958 2.183 2.367 2.709 2.873 3.011 3.163 3.402 3.543 3.785 3.997 4.194 4.29 4.484 4.667 4.913 5.059 5.207 5.432 5.633 5.818 5.993 6.163 6.381 6.596 6.799 7.042 7.292 7.525 7.771 8.057 8.346 8.662 9.0 9.329 9.645 9.987 10.36 10.741 11.209 11.704 12.253 12.864 13.526 14.212 14.932 15.357 15.434 15.356 15.214 15.033 14.843 14.648 14.439 14.211 14.024 13.85 13.663 13.487 13.305 13.124 12.942 12.779 12.622 12.452 12.282 12.135 11.975 11.803 11.669 11.535 11.398 11.245 11.072 10.949 10.819 10.619 10.475 10.322 10.245 10.076 9.893 9.703 9.601 9.401 9.258 9.13 8.998 8.704 8.545 8.373 8.174 7.948 7.663 7.325 6.483 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_52_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_52_35.txt deleted file mode 100644 index 8685d99e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_52_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27865 ,KEBNE ,16677003,Wed Nov 24 15:46:50 CET,Wed Nov 24 17:48:02 CET,0.0 1.122 1.483 1.763 1.999 2.212 2.388 2.545 2.835 2.967 3.086 3.195 3.395 3.501 3.709 3.888 4.057 4.135 4.278 4.418 4.616 4.738 4.859 5.037 5.202 5.363 5.521 5.662 5.832 5.986 6.139 6.341 6.532 6.713 6.912 7.115 7.308 7.518 7.736 7.97 8.226 8.503 8.822 9.14 9.496 9.854 10.217 10.587 10.951 11.325 11.603 11.502 11.198 10.833 10.456 10.063 9.661 9.275 8.934 8.587 8.279 8.01 7.745 7.464 7.194 6.931 6.63 6.364 6.132 5.903 5.675 5.473 5.262 5.035 4.86 4.681 4.483 4.281 4.074 3.913 3.748 3.504 3.325 3.137 3.05 2.871 2.672 2.46 2.346 2.125 1.955 1.793 1.618 1.248 1.031 0.791 0.526 0.204 -0.177 -0.716 -3.089 -2 ,23016 ,KEBNE ,16677004,Wed Nov 24 15:48:53 CET,Wed Nov 24 17:44:16 CET,0.0 1.349 1.695 1.959 2.172 2.36 2.522 2.668 2.947 3.087 3.222 3.349 3.548 3.646 3.83 3.995 4.15 4.224 4.358 4.487 4.683 4.808 4.931 5.108 5.274 5.429 5.57 5.701 5.874 6.048 6.212 6.407 6.594 6.775 6.985 7.206 7.421 7.66 7.915 8.167 8.405 8.672 8.988 9.304 9.636 9.99 10.374 10.797 11.249 11.612 11.785 11.658 11.357 10.954 10.537 10.127 9.743 9.404 9.112 8.752 8.432 8.162 7.88 7.591 7.326 7.08 6.8 6.573 6.393 6.179 5.946 5.751 5.541 5.321 5.15 4.977 4.796 4.589 4.367 4.224 4.08 3.841 3.672 3.482 3.375 3.166 2.96 2.744 2.617 2.375 2.2 2.051 1.894 1.534 1.315 1.078 0.835 0.572 0.237 -0.243 -2.123 -3 ,8565 ,KEBNE ,16674751,Tue Nov 23 18:39:06 CET,Tue Nov 23 20:32:55 CET,0.0 0.791 1.113 1.365 1.579 1.778 1.944 2.089 2.362 2.488 2.615 2.759 2.974 3.081 3.263 3.443 3.621 3.703 3.865 4.01 4.203 4.327 4.454 4.641 4.816 4.973 5.121 5.265 5.445 5.611 5.776 5.97 6.153 6.338 6.558 6.8 7.04 7.295 7.539 7.801 8.06 8.307 8.584 8.87 9.185 9.529 9.882 10.233 10.602 10.91 11.041 10.794 10.445 10.064 9.644 9.207 8.765 8.333 7.953 7.577 7.234 6.933 6.678 6.416 6.139 5.885 5.617 5.375 5.17 4.948 4.705 4.494 4.271 4.047 3.867 3.673 3.485 3.306 3.116 2.973 2.816 2.547 2.355 2.152 2.046 1.83 1.584 1.327 1.205 0.978 0.794 0.647 0.486 0.098 -0.112 -0.335 -0.596 -0.905 -1.25 -1.753 -3.719 -4 ,14239 ,KEBNE ,16674752,Tue Nov 23 18:39:06 CET,Tue Nov 23 20:32:04 CET,0.0 0.963 1.304 1.561 1.783 1.984 2.155 2.315 2.612 2.744 2.86 2.97 3.174 3.273 3.461 3.63 3.793 3.875 4.02 4.161 4.363 4.485 4.598 4.764 4.93 5.082 5.229 5.38 5.569 5.752 5.925 6.114 6.288 6.455 6.642 6.855 7.074 7.318 7.56 7.791 8.034 8.313 8.621 8.918 9.245 9.593 9.959 10.315 10.65 10.941 11.094 10.955 10.624 10.205 9.796 9.383 8.962 8.566 8.212 7.845 7.525 7.247 6.966 6.674 6.39 6.131 5.87 5.639 5.444 5.232 4.983 4.775 4.571 4.351 4.175 3.99 3.788 3.578 3.37 3.23 3.078 2.834 2.654 2.465 2.373 2.19 2.0 1.791 1.671 1.435 1.266 1.114 0.939 0.597 0.399 0.172 -0.092 -0.422 -0.84 -1.427 -3.735 -5 ,9850 ,KEBNE ,16677007,Wed Nov 24 15:53:01 CET,Wed Nov 24 17:55:22 CET,0.0 1.066 1.486 1.777 2.009 2.203 2.372 2.523 2.797 2.926 3.043 3.159 3.365 3.46 3.634 3.806 3.966 4.037 4.178 4.313 4.501 4.619 4.733 4.898 5.055 5.201 5.34 5.48 5.659 5.823 5.975 6.157 6.33 6.497 6.684 6.893 7.098 7.322 7.571 7.828 8.08 8.36 8.677 8.969 9.292 9.637 9.994 10.367 10.79 11.198 11.461 11.338 11.029 10.617 10.242 9.893 9.514 9.15 8.846 8.546 8.246 7.947 7.659 7.401 7.172 6.961 6.727 6.5 6.29 6.058 5.821 5.631 5.434 5.219 5.054 4.875 4.691 4.507 4.303 4.16 4.013 3.779 3.616 3.447 3.355 3.148 2.926 2.699 2.578 2.35 2.185 2.046 1.905 1.522 1.292 1.051 0.771 0.45 0.09 -0.412 -1.922 -6 ,16871 ,KEBNE ,16674754,Tue Nov 23 18:39:06 CET,Tue Nov 23 20:31:59 CET,0.0 1.297 1.68 1.952 2.178 2.371 2.538 2.703 2.998 3.12 3.237 3.358 3.564 3.664 3.842 3.999 4.156 4.233 4.385 4.526 4.72 4.847 4.973 5.143 5.312 5.477 5.629 5.768 5.944 6.118 6.279 6.476 6.67 6.849 7.044 7.26 7.472 7.697 7.945 8.193 8.438 8.727 9.055 9.377 9.744 10.124 10.506 10.876 11.248 11.589 11.752 11.458 11.081 10.745 10.358 9.945 9.572 9.22 8.897 8.548 8.216 7.931 7.678 7.431 7.202 6.991 6.764 6.542 6.342 6.13 5.895 5.699 5.502 5.291 5.114 4.911 4.686 4.469 4.263 4.123 3.977 3.745 3.58 3.39 3.294 3.103 2.868 2.615 2.489 2.256 2.094 1.954 1.802 1.423 1.196 0.961 0.696 0.37 0.027 -0.465 -2.128 -7 ,19568 ,KEBNE ,16674755,Tue Nov 23 18:39:06 CET,Tue Nov 23 20:33:21 CET,0.0 0.894 1.261 1.524 1.749 1.961 2.151 2.324 2.628 2.758 2.882 3.007 3.22 3.326 3.527 3.697 3.856 3.931 4.073 4.206 4.394 4.511 4.629 4.804 4.964 5.114 5.251 5.389 5.566 5.737 5.901 6.089 6.27 6.441 6.643 6.868 7.072 7.294 7.525 7.755 7.98 8.235 8.561 8.882 9.212 9.551 9.956 10.363 10.724 11.063 11.217 10.999 10.613 10.176 9.707 9.251 8.862 8.5 8.141 7.765 7.456 7.171 6.878 6.593 6.327 6.09 5.841 5.608 5.409 5.193 4.946 4.738 4.531 4.315 4.147 3.966 3.777 3.59 3.381 3.221 3.056 2.795 2.61 2.413 2.318 2.127 1.925 1.717 1.596 1.368 1.213 1.076 0.921 0.566 0.371 0.155 -0.085 -0.382 -0.774 -1.308 -2.993 -8 ,6868 ,KEBNE ,16674756,Tue Nov 23 18:39:06 CET,Tue Nov 23 20:32:00 CET,0.0 0.845 1.195 1.449 1.674 1.872 2.042 2.195 2.489 2.619 2.743 2.876 3.083 3.174 3.343 3.495 3.65 3.732 3.88 4.011 4.207 4.334 4.45 4.613 4.775 4.925 5.063 5.193 5.365 5.529 5.68 5.864 6.048 6.228 6.431 6.659 6.864 7.096 7.346 7.595 7.857 8.14 8.461 8.77 9.108 9.467 9.846 10.223 10.617 10.969 11.175 11.018 10.677 10.277 9.846 9.428 9.042 8.679 8.367 8.061 7.784 7.504 7.232 6.988 6.752 6.528 6.281 6.046 5.848 5.639 5.404 5.211 5.018 4.802 4.628 4.451 4.259 4.04 3.812 3.658 3.487 3.203 3.018 2.833 2.734 2.528 2.303 2.057 1.933 1.699 1.512 1.367 1.22 0.878 0.667 0.446 0.194 -0.107 -0.442 -0.925 -2.426 -9 ,14595 ,KEBNE ,16674757,Tue Nov 23 18:39:06 CET,Tue Nov 23 20:33:09 CET,0.0 1.069 1.436 1.708 1.93 2.116 2.282 2.431 2.698 2.824 2.945 3.08 3.291 3.393 3.583 3.749 3.904 3.981 4.125 4.265 4.46 4.578 4.694 4.863 5.015 5.16 5.301 5.442 5.632 5.805 5.976 6.18 6.358 6.525 6.712 6.912 7.114 7.333 7.554 7.787 8.043 8.334 8.662 8.983 9.339 9.698 10.076 10.477 10.863 11.179 11.267 10.918 10.441 9.896 9.386 8.925 8.5 8.086 7.717 7.327 6.96 6.642 6.346 6.067 5.818 5.575 5.318 5.07 4.836 4.605 4.365 4.155 3.946 3.737 3.563 3.381 3.189 2.985 2.762 2.601 2.447 2.217 2.05 1.866 1.766 1.566 1.359 1.126 1.005 0.779 0.604 0.451 0.301 -0.025 -0.213 -0.418 -0.655 -0.927 -1.278 -1.784 -3.818 -10 ,25719 ,KEBNE ,16674758,Tue Nov 23 18:39:06 CET,Tue Nov 23 20:32:11 CET,0.0 1.044 1.414 1.695 1.932 2.128 2.293 2.443 2.73 2.858 2.975 3.092 3.298 3.398 3.582 3.751 3.914 3.995 4.141 4.284 4.497 4.624 4.749 4.924 5.079 5.228 5.379 5.521 5.691 5.849 6.007 6.2 6.386 6.562 6.758 6.988 7.2 7.417 7.644 7.876 8.13 8.43 8.762 9.065 9.431 9.828 10.237 10.632 11.004 11.334 11.549 11.441 11.1 10.698 10.31 9.888 9.458 9.067 8.739 8.378 8.041 7.734 7.45 7.187 6.923 6.692 6.452 6.228 6.035 5.823 5.584 5.386 5.189 4.981 4.82 4.64 4.44 4.23 4.002 3.851 3.706 3.467 3.296 3.114 3.012 2.814 2.59 2.331 2.199 1.966 1.783 1.63 1.469 1.102 0.894 0.665 0.396 0.091 -0.252 -0.749 -2.648 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_35.txt deleted file mode 100644 index 2be4f940..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22155 ,KEBNE ,16677013,Wed Nov 24 16:03:23 CET,Wed Nov 24 17:57:14 CET,0.0 0.798 1.112 1.386 1.603 1.783 1.941 2.088 2.349 2.459 2.565 2.671 2.875 2.97 3.146 3.307 3.463 3.542 3.703 3.848 4.05 4.177 4.297 4.46 4.616 4.774 4.92 5.063 5.25 5.423 5.587 5.791 5.988 6.17 6.375 6.598 6.812 7.059 7.319 7.584 7.865 8.178 8.549 8.918 9.327 9.746 10.178 10.655 11.17 11.632 11.968 11.962 11.687 11.258 10.792 10.35 9.956 9.57 9.189 8.756 8.337 7.961 7.625 7.302 6.999 6.716 6.413 6.128 5.858 5.57 5.266 5.01 4.747 4.476 4.258 4.029 3.788 3.526 3.252 3.067 2.867 2.555 2.322 2.065 1.932 1.663 1.368 1.036 0.86 0.579 0.288 0.067 -0.169 -0.722 -1.039 -1.381 -1.748 -2.16 -2.697 -3.541 -7.482 -2 ,26246 ,KEBNE ,16674760,Tue Nov 23 18:39:06 CET,Tue Nov 23 20:32:21 CET,0.0 1.138 1.512 1.774 2.007 2.204 2.357 2.498 2.769 2.895 3.007 3.103 3.302 3.394 3.572 3.738 3.893 3.965 4.106 4.242 4.432 4.552 4.666 4.826 4.978 5.124 5.268 5.404 5.577 5.746 5.902 6.09 6.281 6.463 6.677 6.907 7.117 7.337 7.57 7.818 8.09 8.397 8.716 9.025 9.396 9.803 10.223 10.661 11.152 11.686 12.092 12.121 11.895 11.542 11.137 10.743 10.37 9.97 9.613 9.19 8.792 8.454 8.101 7.735 7.376 7.047 6.707 6.395 6.142 5.885 5.583 5.318 5.032 4.722 4.486 4.25 4.011 3.751 3.462 3.262 3.044 2.69 2.443 2.185 2.05 1.763 1.442 1.091 0.911 0.623 0.314 0.094 -0.126 -0.597 -0.878 -1.221 -1.621 -2.086 -2.663 -3.562 -7.284 -3 ,12149 ,KEBNE ,16677015,Wed Nov 24 16:00:19 CET,Wed Nov 24 17:53:09 CET,0.0 1.007 1.362 1.633 1.847 2.036 2.214 2.375 2.659 2.778 2.888 2.988 3.196 3.295 3.489 3.672 3.834 3.908 4.062 4.21 4.403 4.525 4.643 4.811 4.987 5.153 5.296 5.441 5.63 5.8 5.969 6.166 6.347 6.525 6.731 6.965 7.182 7.411 7.651 7.904 8.172 8.471 8.819 9.181 9.591 10.015 10.496 10.984 11.527 12.043 12.449 12.511 12.278 11.876 11.419 10.964 10.565 10.217 9.897 9.552 9.236 8.924 8.604 8.309 8.027 7.756 7.467 7.19 6.941 6.695 6.44 6.238 6.037 5.806 5.604 5.384 5.152 4.897 4.625 4.428 4.227 3.91 3.683 3.455 3.341 3.117 2.887 2.617 2.46 2.193 1.918 1.709 1.497 1.041 0.775 0.453 0.105 -0.298 -0.836 -1.516 -4.107 -4 ,27630 ,KEBNE ,16674762,Tue Nov 23 19:03:06 CET,Tue Nov 23 20:55:56 CET,0.0 1.006 1.362 1.605 1.818 2.013 2.18 2.33 2.625 2.762 2.879 2.996 3.209 3.311 3.507 3.695 3.868 3.944 4.086 4.228 4.434 4.566 4.695 4.872 5.038 5.195 5.344 5.49 5.683 5.867 6.032 6.227 6.41 6.588 6.796 7.025 7.246 7.489 7.747 8.021 8.312 8.65 9.037 9.394 9.789 10.211 10.661 11.137 11.654 12.111 12.422 12.378 12.138 11.773 11.382 11.07 10.748 10.399 10.078 9.721 9.399 9.135 8.904 8.674 8.451 8.251 8.013 7.765 7.536 7.3 7.058 6.863 6.64 6.382 6.177 5.955 5.721 5.488 5.257 5.087 4.912 4.63 4.421 4.219 4.108 3.865 3.626 3.366 3.222 2.977 2.748 2.555 2.363 1.97 1.762 1.545 1.278 0.938 0.515 -0.094 -2.62 -5 ,29977 ,KEBNE ,16674763,Tue Nov 23 19:03:06 CET,Tue Nov 23 19:09:50 CET,0.0 0.725 1.039 1.291 1.496 1.676 1.844 1.996 2.265 2.384 2.493 2.607 2.817 2.917 3.097 3.257 3.411 3.488 3.637 3.781 3.978 4.096 4.215 4.385 4.538 4.676 4.811 4.944 5.121 5.298 5.461 5.665 5.852 6.025 6.247 6.482 6.697 6.938 7.179 7.429 7.682 7.96 8.293 8.613 8.979 9.382 9.798 10.235 10.692 11.116 11.325 11.165 10.881 10.485 9.976 9.455 8.987 8.535 8.147 7.738 7.342 6.983 6.603 6.212 5.867 5.554 5.206 4.899 4.642 4.373 4.1 3.862 3.598 3.311 3.091 2.873 2.637 2.383 2.13 1.958 1.76 1.424 1.183 0.926 0.789 0.505 0.206 -0.132 -0.321 -0.607 -0.893 -1.117 -1.355 -1.869 -2.163 -2.506 -2.897 -3.327 -3.83 -4.622 -7.505 -6 ,26467 ,KEBNE ,16674764,Tue Nov 23 19:03:06 CET,Tue Nov 23 20:55:31 CET,0.0 0.878 1.189 1.435 1.653 1.832 1.997 2.14 2.394 2.516 2.62 2.722 2.926 3.02 3.21 3.383 3.544 3.618 3.758 3.893 4.088 4.217 4.338 4.503 4.659 4.806 4.949 5.088 5.268 5.447 5.613 5.811 6.007 6.191 6.397 6.627 6.844 7.067 7.305 7.569 7.839 8.138 8.48 8.809 9.177 9.606 10.128 10.653 11.172 11.687 12.136 12.265 12.065 11.694 11.257 10.779 10.279 9.777 9.28 8.792 8.376 7.985 7.624 7.237 6.859 6.521 6.165 5.843 5.552 5.236 4.91 4.633 4.331 4.016 3.759 3.487 3.214 2.921 2.617 2.417 2.219 1.901 1.667 1.42 1.294 1.034 0.745 0.424 0.248 -0.042 -0.344 -0.559 -0.794 -1.316 -1.601 -1.914 -2.287 -2.721 -3.255 -4.015 -7.422 -7 ,23631 ,KEBNE ,16674765,Tue Nov 23 19:03:06 CET,Tue Nov 23 20:55:31 CET,0.0 0.935 1.262 1.502 1.703 1.877 2.041 2.185 2.453 2.58 2.695 2.792 2.994 3.086 3.253 3.411 3.568 3.642 3.784 3.922 4.107 4.225 4.344 4.517 4.678 4.832 4.977 5.117 5.303 5.476 5.637 5.829 6.023 6.218 6.436 6.68 6.904 7.136 7.387 7.662 7.939 8.24 8.588 8.928 9.328 9.76 10.224 10.725 11.225 11.733 12.216 12.31 12.144 11.841 11.458 11.078 10.756 10.402 10.032 9.659 9.321 8.982 8.643 8.305 7.99 7.726 7.425 7.117 6.848 6.556 6.244 5.996 5.733 5.454 5.231 4.997 4.761 4.515 4.241 4.05 3.856 3.555 3.344 3.104 2.977 2.716 2.431 2.115 1.94 1.654 1.374 1.17 0.952 0.451 0.166 -0.146 -0.505 -0.948 -1.518 -2.298 -4.973 -8 ,21761 ,KEBNE ,16677020,Wed Nov 24 16:05:26 CET,Wed Nov 24 18:01:48 CET,0.0 0.907 1.246 1.473 1.665 1.837 2.001 2.163 2.459 2.585 2.697 2.785 2.983 3.082 3.265 3.431 3.593 3.668 3.819 3.96 4.15 4.272 4.389 4.559 4.723 4.874 5.028 5.181 5.368 5.544 5.708 5.908 6.096 6.272 6.467 6.693 6.926 7.173 7.426 7.688 7.97 8.289 8.635 8.951 9.315 9.73 10.183 10.657 11.169 11.695 12.077 12.074 11.823 11.467 11.075 10.698 10.348 9.989 9.657 9.314 9.008 8.709 8.399 8.08 7.759 7.464 7.154 6.86 6.579 6.29 6.012 5.758 5.475 5.167 4.925 4.668 4.395 4.114 3.814 3.616 3.406 3.045 2.802 2.561 2.433 2.16 1.869 1.532 1.345 1.051 0.73 0.51 0.299 -0.166 -0.461 -0.803 -1.178 -1.628 -2.187 -2.918 -5.22 -9 ,12758 ,KEBNE ,16674767,Tue Nov 23 19:03:06 CET,Tue Nov 23 20:55:15 CET,0.0 1.127 1.425 1.648 1.845 2.028 2.205 2.359 2.614 2.737 2.859 2.966 3.167 3.265 3.446 3.605 3.762 3.839 3.98 4.107 4.3 4.42 4.536 4.702 4.86 5.017 5.167 5.31 5.492 5.668 5.835 6.039 6.236 6.423 6.642 6.883 7.101 7.328 7.569 7.832 8.112 8.408 8.734 9.057 9.416 9.786 10.197 10.662 11.155 11.637 12.041 12.041 11.861 11.599 11.251 10.842 10.409 9.985 9.634 9.248 8.872 8.536 8.196 7.858 7.555 7.269 6.952 6.669 6.419 6.132 5.828 5.601 5.358 5.09 4.877 4.645 4.403 4.15 3.868 3.661 3.436 3.075 2.837 2.596 2.46 2.173 1.872 1.552 1.387 1.109 0.819 0.602 0.38 -0.122 -0.404 -0.708 -1.051 -1.48 -2.032 -2.763 -5.704 -10 ,18042 ,KEBNE ,16674768,Tue Nov 23 19:06:16 CET,Tue Nov 23 21:00:45 CET,0.0 0.962 1.276 1.523 1.746 1.942 2.104 2.26 2.547 2.666 2.775 2.867 3.062 3.155 3.34 3.515 3.677 3.753 3.898 4.036 4.233 4.356 4.477 4.646 4.809 4.969 5.114 5.249 5.424 5.596 5.769 5.972 6.156 6.337 6.537 6.75 6.957 7.184 7.425 7.675 7.921 8.191 8.513 8.847 9.249 9.685 10.131 10.599 11.056 11.452 11.752 11.633 11.297 10.822 10.275 9.75 9.258 8.791 8.406 7.986 7.585 7.233 6.842 6.444 6.088 5.783 5.479 5.174 4.883 4.574 4.261 3.987 3.697 3.402 3.164 2.912 2.639 2.362 2.08 1.877 1.656 1.302 1.063 0.812 0.68 0.408 0.109 -0.215 -0.392 -0.687 -1.006 -1.238 -1.498 -2.092 -2.412 -2.756 -3.13 -3.537 -4.062 -4.719 -7.388 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_52.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_52.txt deleted file mode 100644 index 85d03a4e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_52.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15738 ,KEBNE ,16677023,Wed Nov 24 16:06:28 CET,Wed Nov 24 18:04:34 CET,0.0 1.133 1.513 1.783 2.028 2.241 2.418 2.579 2.862 2.985 3.107 3.238 3.46 3.577 3.792 3.985 4.154 4.233 4.402 4.571 4.789 4.915 5.042 5.234 5.424 5.607 5.771 5.922 6.126 6.327 6.519 6.737 6.93 7.115 7.325 7.561 7.801 8.071 8.366 8.683 8.996 9.328 9.688 10.015 10.373 10.777 11.217 11.634 12.064 12.458 12.7 12.598 12.335 11.925 11.432 10.973 10.536 10.078 9.697 9.327 8.956 8.602 8.273 7.951 7.632 7.334 7.043 6.788 6.539 6.274 6.001 5.764 5.497 5.22 5.011 4.804 4.592 4.364 4.13 3.967 3.794 3.517 3.321 3.114 3.003 2.757 2.512 2.255 2.115 1.867 1.649 1.486 1.313 0.903 0.681 0.432 0.132 -0.223 -0.656 -1.213 -3.741 -2 ,27797 ,KEBNE ,16674770,Tue Nov 23 19:06:16 CET,Tue Nov 23 21:00:56 CET,0.0 1.063 1.497 1.83 2.079 2.299 2.491 2.661 2.972 3.11 3.257 3.422 3.642 3.756 3.966 4.153 4.32 4.4 4.551 4.698 4.915 5.057 5.195 5.392 5.592 5.762 5.908 6.071 6.275 6.454 6.629 6.846 7.048 7.227 7.451 7.699 7.919 8.158 8.404 8.662 8.932 9.235 9.581 9.914 10.286 10.681 11.094 11.512 11.937 12.335 12.599 12.459 12.071 11.659 11.192 10.715 10.269 9.814 9.419 8.995 8.606 8.268 7.944 7.637 7.354 7.088 6.802 6.535 6.29 6.028 5.759 5.53 5.288 5.045 4.847 4.64 4.42 4.181 3.94 3.779 3.597 3.314 3.129 2.918 2.811 2.597 2.352 2.081 1.937 1.691 1.504 1.336 1.15 0.722 0.485 0.252 0.008 -0.289 -0.652 -1.185 -3.465 -3 ,3002 ,KEBNE ,16674771,Tue Nov 23 19:06:16 CET,Tue Nov 23 21:00:52 CET,0.0 1.218 1.654 1.979 2.245 2.47 2.681 2.87 3.192 3.326 3.444 3.575 3.791 3.905 4.132 4.315 4.489 4.578 4.734 4.883 5.093 5.217 5.339 5.523 5.705 5.869 6.031 6.188 6.373 6.547 6.723 6.942 7.145 7.336 7.554 7.793 8.013 8.258 8.522 8.801 9.084 9.396 9.743 10.062 10.457 10.892 11.345 11.767 12.117 12.466 12.755 12.701 12.459 12.125 11.733 11.319 10.918 10.561 10.217 9.837 9.5 9.185 8.884 8.614 8.358 8.098 7.816 7.569 7.35 7.102 6.835 6.617 6.394 6.163 5.991 5.815 5.62 5.407 5.173 5.008 4.841 4.569 4.372 4.178 4.078 3.845 3.596 3.337 3.206 2.975 2.771 2.595 2.423 2.03 1.799 1.559 1.279 0.939 0.526 -0.012 -2.024 -4 ,3898 ,KEBNE ,16674772,Tue Nov 23 19:06:16 CET,Tue Nov 23 20:59:51 CET,0.0 1.259 1.745 2.066 2.318 2.529 2.717 2.883 3.175 3.318 3.454 3.598 3.826 3.934 4.137 4.332 4.51 4.601 4.769 4.92 5.143 5.282 5.414 5.602 5.782 5.959 6.122 6.272 6.456 6.619 6.789 7.002 7.211 7.422 7.653 7.892 8.111 8.355 8.62 8.877 9.151 9.464 9.803 10.129 10.49 10.868 11.273 11.684 12.137 12.591 12.92 12.892 12.609 12.272 11.896 11.514 11.172 10.841 10.544 10.221 9.93 9.675 9.422 9.175 8.943 8.707 8.454 8.237 8.026 7.794 7.555 7.347 7.107 6.843 6.625 6.389 6.14 5.895 5.648 5.474 5.294 4.986 4.782 4.565 4.444 4.191 3.913 3.616 3.455 3.189 2.948 2.759 2.559 2.117 1.86 1.58 1.261 0.871 0.392 -0.282 -2.149 -6 ,14715 ,KEBNE ,16674774,Tue Nov 23 19:06:17 CET,Tue Nov 23 21:00:41 CET,0.0 1.014 1.454 1.79 2.03 2.231 2.418 2.587 2.914 3.065 3.203 3.332 3.541 3.649 3.854 4.047 4.235 4.321 4.484 4.639 4.856 5.002 5.141 5.313 5.479 5.656 5.829 5.994 6.187 6.366 6.535 6.741 6.94 7.14 7.372 7.621 7.852 8.095 8.352 8.626 8.901 9.188 9.518 9.857 10.246 10.646 11.082 11.533 11.982 12.418 12.752 12.676 12.344 11.933 11.548 11.151 10.743 10.348 9.984 9.639 9.343 9.023 8.685 8.353 8.036 7.755 7.47 7.235 7.026 6.781 6.508 6.271 6.004 5.73 5.549 5.348 5.12 4.897 4.653 4.486 4.313 4.021 3.815 3.582 3.462 3.217 2.949 2.681 2.551 2.317 2.088 1.891 1.689 1.273 1.048 0.773 0.448 0.101 -0.3 -0.864 -2.252 -7 ,6237 ,KEBNE ,16677029,Wed Nov 24 16:22:14 CET,Wed Nov 24 18:16:52 CET,0.0 1.045 1.389 1.637 1.827 2.001 2.179 2.339 2.594 2.708 2.825 2.929 3.131 3.232 3.418 3.592 3.765 3.841 3.991 4.129 4.309 4.437 4.561 4.756 4.944 5.109 5.275 5.433 5.635 5.829 6.013 6.222 6.418 6.613 6.827 7.056 7.282 7.529 7.78 8.047 8.331 8.625 8.931 9.239 9.607 9.99 10.389 10.805 11.24 11.594 11.778 11.64 11.374 11.081 10.683 10.226 9.842 9.537 9.243 8.896 8.592 8.305 8.005 7.715 7.454 7.228 6.968 6.704 6.481 6.242 5.974 5.754 5.54 5.308 5.118 4.92 4.712 4.505 4.298 4.146 3.971 3.703 3.521 3.324 3.218 2.987 2.75 2.495 2.355 2.12 1.937 1.777 1.599 1.213 1.0 0.767 0.512 0.196 -0.211 -0.771 -2.682 -8 ,1848 ,KEBNE ,16677030,Wed Nov 24 16:30:35 CET,Wed Nov 24 18:22:16 CET,0.0 0.997 1.391 1.689 1.944 2.184 2.394 2.57 2.867 3.011 3.145 3.289 3.505 3.611 3.821 4.007 4.171 4.25 4.405 4.556 4.766 4.895 5.018 5.196 5.364 5.524 5.691 5.868 6.076 6.26 6.443 6.662 6.873 7.077 7.325 7.582 7.79 8.023 8.287 8.576 8.863 9.163 9.495 9.801 10.163 10.567 10.983 11.376 11.758 12.144 12.398 12.282 12.013 11.717 11.393 11.051 10.717 10.346 9.998 9.631 9.305 9.024 8.733 8.453 8.203 7.978 7.734 7.502 7.269 7.003 6.748 6.565 6.352 6.117 5.938 5.741 5.534 5.312 5.071 4.905 4.727 4.436 4.244 4.043 3.936 3.714 3.467 3.198 3.048 2.793 2.575 2.401 2.21 1.768 1.515 1.243 0.944 0.589 0.176 -0.384 -2.19 -9 ,3301 ,KEBNE ,16677031,Wed Nov 24 16:31:37 CET,Wed Nov 24 18:20:08 CET,0.0 0.939 1.321 1.606 1.832 2.021 2.203 2.373 2.655 2.788 2.915 3.039 3.254 3.364 3.55 3.717 3.894 3.986 4.154 4.316 4.547 4.693 4.82 4.99 5.163 5.324 5.471 5.624 5.834 6.033 6.209 6.411 6.598 6.779 6.993 7.223 7.454 7.709 7.967 8.236 8.529 8.853 9.186 9.509 9.893 10.301 10.719 11.136 11.581 12.008 12.353 12.388 12.157 11.809 11.423 11.055 10.714 10.383 10.085 9.737 9.378 9.042 8.744 8.474 8.216 7.988 7.734 7.491 7.28 7.052 6.807 6.606 6.401 6.183 5.997 5.801 5.607 5.393 5.132 4.93 4.718 4.385 4.164 3.942 3.828 3.611 3.353 3.055 2.899 2.625 2.415 2.27 2.106 1.75 1.57 1.387 1.174 0.894 0.525 0.048 -1.599 -10 ,14628 ,KEBNE ,16674778,Tue Nov 23 19:16:43 CET,Tue Nov 23 21:09:01 CET,0.0 1.017 1.407 1.702 1.952 2.165 2.359 2.542 2.849 2.989 3.124 3.252 3.473 3.587 3.792 3.984 4.165 4.249 4.422 4.597 4.829 4.973 5.104 5.283 5.456 5.625 5.791 5.935 6.114 6.295 6.456 6.647 6.848 7.05 7.286 7.546 7.797 8.069 8.349 8.641 8.967 9.313 9.694 10.072 10.463 10.86 11.297 11.74 12.205 12.705 13.113 13.125 12.869 12.516 12.143 11.771 11.384 11.017 10.691 10.343 10.037 9.752 9.468 9.184 8.915 8.666 8.397 8.161 7.949 7.724 7.477 7.261 7.026 6.76 6.563 6.36 6.137 5.904 5.672 5.512 5.339 5.062 4.861 4.647 4.529 4.267 4.01 3.75 3.607 3.355 3.156 2.997 2.815 2.399 2.177 1.918 1.592 1.217 0.756 0.034 -3.069 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_35.txt deleted file mode 100644 index 1c189033..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24405 ,KEBNE ,16677033,Wed Nov 24 16:33:39 CET,Wed Nov 24 18:27:14 CET,0.0 0.889 1.271 1.514 1.713 1.896 2.055 2.203 2.494 2.623 2.741 2.846 3.051 3.153 3.337 3.508 3.68 3.764 3.919 4.06 4.261 4.384 4.499 4.676 4.849 5.008 5.161 5.306 5.485 5.658 5.833 6.046 6.24 6.426 6.643 6.886 7.105 7.343 7.603 7.866 8.133 8.436 8.8 9.172 9.612 10.06 10.525 11.007 11.525 12.078 12.532 12.595 12.385 12.037 11.66 11.246 10.803 10.384 10.029 9.623 9.235 8.885 8.55 8.218 7.893 7.592 7.257 6.967 6.703 6.412 6.125 5.878 5.621 5.35 5.108 4.851 4.611 4.376 4.121 3.933 3.737 3.443 3.225 2.995 2.88 2.629 2.356 2.065 1.901 1.607 1.311 1.111 0.917 0.468 0.199 -0.094 -0.434 -0.834 -1.334 -2.002 -5.272 -2 ,30636 ,KEBNE ,16677034,Wed Nov 24 16:35:44 CET,Wed Nov 24 18:31:49 CET,0.0 1.016 1.392 1.653 1.863 2.046 2.215 2.377 2.653 2.773 2.89 2.997 3.2 3.297 3.475 3.639 3.792 3.867 4.007 4.148 4.352 4.479 4.601 4.781 4.954 5.11 5.266 5.421 5.615 5.795 5.966 6.171 6.349 6.516 6.733 6.971 7.184 7.417 7.647 7.893 8.161 8.458 8.797 9.113 9.474 9.864 10.305 10.741 11.151 11.547 11.897 11.928 11.683 11.357 10.963 10.57 10.218 9.849 9.484 9.079 8.728 8.412 8.088 7.77 7.46 7.173 6.871 6.593 6.342 6.081 5.811 5.584 5.343 5.084 4.883 4.674 4.445 4.206 3.949 3.764 3.568 3.256 3.042 2.819 2.707 2.471 2.217 1.948 1.794 1.528 1.243 1.039 0.833 0.403 0.153 -0.172 -0.554 -0.986 -1.501 -2.258 -4.745 -3 ,15847 ,KEBNE ,16677035,Wed Nov 24 16:36:50 CET,Wed Nov 24 18:29:09 CET,0.0 0.767 1.09 1.348 1.564 1.747 1.911 2.062 2.323 2.441 2.557 2.663 2.869 2.966 3.156 3.341 3.512 3.595 3.752 3.895 4.096 4.234 4.367 4.549 4.719 4.88 5.038 5.191 5.39 5.577 5.758 5.979 6.18 6.366 6.587 6.827 7.055 7.302 7.558 7.826 8.097 8.4 8.768 9.124 9.5 9.897 10.361 10.865 11.404 11.931 12.332 12.356 12.058 11.609 11.137 10.681 10.246 9.82 9.44 9.047 8.679 8.324 7.996 7.698 7.403 7.128 6.82 6.545 6.308 6.052 5.788 5.561 5.311 5.029 4.803 4.568 4.33 4.092 3.838 3.652 3.451 3.141 2.912 2.656 2.531 2.29 2.024 1.711 1.551 1.281 1.018 0.832 0.631 0.164 -0.09 -0.364 -0.693 -1.071 -1.551 -2.253 -4.624 -4 ,22815 ,KEBNE ,16677036,Wed Nov 24 16:36:50 CET,Wed Nov 24 18:29:26 CET,0.0 0.757 1.088 1.349 1.569 1.754 1.935 2.094 2.364 2.49 2.612 2.732 2.951 3.053 3.24 3.408 3.566 3.649 3.806 3.953 4.168 4.306 4.445 4.636 4.808 4.972 5.125 5.285 5.492 5.679 5.865 6.083 6.284 6.482 6.698 6.945 7.184 7.424 7.686 7.975 8.257 8.559 8.927 9.288 9.7 10.107 10.531 10.991 11.474 11.946 12.365 12.448 12.229 11.907 11.535 11.158 10.769 10.381 10.027 9.641 9.294 8.98 8.668 8.345 8.023 7.735 7.44 7.174 6.941 6.687 6.414 6.166 5.912 5.662 5.463 5.254 5.032 4.803 4.56 4.391 4.204 3.899 3.69 3.468 3.341 3.061 2.787 2.513 2.369 2.111 1.846 1.636 1.436 1.02 0.763 0.465 0.148 -0.227 -0.726 -1.403 -3.913 -5 ,1859 ,KEBNE ,16677037,Wed Nov 24 16:37:48 CET,Wed Nov 24 18:30:11 CET,0.0 1.091 1.403 1.642 1.863 2.057 2.237 2.393 2.665 2.789 2.901 3.013 3.216 3.309 3.484 3.662 3.831 3.909 4.055 4.193 4.39 4.519 4.639 4.814 4.994 5.163 5.318 5.465 5.654 5.837 6.013 6.217 6.407 6.588 6.802 7.043 7.267 7.513 7.776 8.036 8.304 8.614 8.956 9.285 9.684 10.121 10.593 11.095 11.595 12.083 12.483 12.489 12.213 11.842 11.489 11.106 10.738 10.372 9.999 9.625 9.297 8.969 8.621 8.276 7.964 7.685 7.369 7.076 6.828 6.563 6.291 6.064 5.819 5.556 5.342 5.107 4.864 4.61 4.347 4.179 4.004 3.722 3.518 3.296 3.179 2.925 2.653 2.367 2.219 1.956 1.7 1.504 1.295 0.811 0.548 0.268 -0.092 -0.501 -0.956 -1.601 -3.926 -6 ,20747 ,KEBNE ,16677038,Wed Nov 24 16:37:49 CET,Wed Nov 24 18:31:11 CET,0.0 0.919 1.287 1.532 1.737 1.914 2.074 2.222 2.493 2.614 2.726 2.837 3.05 3.152 3.342 3.521 3.684 3.758 3.907 4.047 4.244 4.372 4.49 4.652 4.809 4.968 5.126 5.275 5.464 5.648 5.828 6.037 6.233 6.42 6.626 6.859 7.074 7.307 7.568 7.837 8.11 8.415 8.77 9.124 9.515 9.934 10.409 10.905 11.418 11.943 12.455 12.607 12.438 12.105 11.699 11.285 10.906 10.545 10.215 9.839 9.486 9.169 8.853 8.546 8.25 7.963 7.653 7.375 7.118 6.844 6.57 6.343 6.093 5.819 5.607 5.394 5.175 4.945 4.699 4.516 4.32 4.014 3.789 3.545 3.419 3.147 2.86 2.562 2.405 2.142 1.887 1.689 1.468 0.961 0.683 0.373 0.02 -0.381 -0.859 -1.543 -4.24 -7 ,10530 ,KEBNE ,16677039,Wed Nov 24 16:37:49 CET,Wed Nov 24 18:34:45 CET,0.0 0.852 1.144 1.405 1.646 1.837 2.006 2.158 2.411 2.526 2.638 2.744 2.949 3.045 3.221 3.402 3.58 3.66 3.815 3.964 4.164 4.297 4.437 4.629 4.803 4.973 5.134 5.277 5.457 5.63 5.788 5.978 6.16 6.347 6.57 6.812 7.042 7.282 7.53 7.783 8.048 8.355 8.709 9.041 9.407 9.806 10.23 10.658 11.126 11.561 11.883 11.879 11.568 11.133 10.715 10.287 9.851 9.431 9.037 8.633 8.264 7.922 7.581 7.257 6.963 6.68 6.363 6.078 5.817 5.531 5.23 4.986 4.73 4.441 4.206 3.957 3.704 3.442 3.18 3.0 2.813 2.501 2.265 2.024 1.902 1.655 1.387 1.093 0.936 0.66 0.372 0.175 -0.028 -0.485 -0.739 -1.013 -1.34 -1.75 -2.238 -2.867 -5.297 -8 ,25690 ,KEBNE ,16677040,Wed Nov 24 16:38:51 CET,Wed Nov 24 18:33:03 CET,0.0 0.918 1.285 1.551 1.764 1.954 2.124 2.274 2.539 2.655 2.765 2.874 3.087 3.188 3.368 3.542 3.705 3.78 3.93 4.074 4.285 4.423 4.553 4.736 4.904 5.061 5.224 5.381 5.569 5.751 5.931 6.14 6.326 6.522 6.752 6.991 7.218 7.463 7.723 7.998 8.293 8.631 9.021 9.393 9.792 10.226 10.723 11.258 11.785 12.284 12.712 12.804 12.614 12.285 11.894 11.48 11.095 10.721 10.344 9.936 9.61 9.311 9.0 8.692 8.381 8.099 7.812 7.544 7.309 7.06 6.805 6.603 6.383 6.135 5.937 5.729 5.5 5.25 4.997 4.824 4.636 4.337 4.129 3.9 3.777 3.533 3.276 2.997 2.848 2.581 2.319 2.138 1.952 1.487 1.229 0.961 0.668 0.324 -0.124 -0.786 -3.009 -9 ,17694 ,KEBNE ,16677041,Wed Nov 24 16:38:52 CET,Wed Nov 24 18:32:22 CET,0.0 1.118 1.507 1.779 2.008 2.217 2.409 2.583 2.884 3.015 3.14 3.276 3.489 3.594 3.791 3.972 4.137 4.217 4.375 4.529 4.749 4.881 5.01 5.203 5.38 5.541 5.689 5.833 6.029 6.226 6.4 6.603 6.804 6.994 7.204 7.436 7.653 7.873 8.127 8.408 8.675 8.972 9.334 9.681 10.068 10.476 10.909 11.348 11.824 12.332 12.654 12.548 12.257 11.931 11.591 11.204 10.783 10.346 9.949 9.525 9.159 8.845 8.524 8.218 7.931 7.653 7.359 7.094 6.855 6.579 6.297 6.088 5.855 5.59 5.386 5.165 4.925 4.687 4.452 4.276 4.073 3.753 3.534 3.298 3.169 2.906 2.644 2.355 2.204 1.938 1.661 1.465 1.257 0.805 0.539 0.237 -0.108 -0.518 -1.054 -1.8 -4.426 -10 ,27559 ,KEBNE ,16677042,Wed Nov 24 16:38:51 CET,Wed Nov 24 18:33:06 CET,0.0 0.923 1.303 1.581 1.788 1.966 2.138 2.291 2.538 2.656 2.776 2.898 3.107 3.2 3.374 3.549 3.705 3.777 3.916 4.053 4.262 4.395 4.523 4.7 4.859 5.015 5.17 5.311 5.487 5.661 5.834 6.047 6.247 6.441 6.654 6.871 7.08 7.322 7.588 7.875 8.16 8.48 8.849 9.176 9.521 9.904 10.343 10.81 11.32 11.841 12.256 12.332 12.092 11.703 11.312 10.915 10.522 10.142 9.783 9.405 9.086 8.792 8.48 8.177 7.889 7.625 7.363 7.11 6.864 6.612 6.357 6.147 5.922 5.668 5.463 5.242 5.009 4.777 4.527 4.347 4.162 3.852 3.629 3.398 3.27 3.01 2.76 2.472 2.306 2.034 1.793 1.607 1.408 0.94 0.661 0.356 0.013 -0.385 -0.86 -1.472 -4.08 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_57.txt deleted file mode 100644 index 43375429..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27643 ,KEBNE ,16677043,Wed Nov 24 16:39:54 CET,Wed Nov 24 18:33:07 CET,0.0 0.991 1.368 1.613 1.847 2.048 2.213 2.36 2.628 2.759 2.882 3.015 3.235 3.333 3.53 3.724 3.906 3.994 4.156 4.295 4.497 4.633 4.76 4.938 5.121 5.303 5.469 5.631 5.834 6.026 6.212 6.431 6.646 6.854 7.091 7.334 7.558 7.801 8.061 8.344 8.625 8.939 9.32 9.692 10.103 10.557 11.05 11.521 11.948 12.374 12.614 12.442 12.158 11.788 11.338 10.858 10.407 9.968 9.58 9.183 8.845 8.521 8.186 7.893 7.619 7.338 7.033 6.763 6.518 6.268 6.01 5.787 5.544 5.299 5.112 4.905 4.687 4.459 4.212 4.035 3.86 3.584 3.383 3.162 3.046 2.821 2.581 2.307 2.161 1.904 1.67 1.494 1.316 0.931 0.706 0.448 0.128 -0.256 -0.722 -1.38 -4.216 -2 ,4821 ,KEBNE ,16674780,Tue Nov 23 19:17:47 CET,Tue Nov 23 21:09:50 CET,0.0 1.058 1.453 1.734 1.965 2.169 2.349 2.506 2.755 2.875 2.996 3.12 3.34 3.447 3.644 3.826 3.984 4.061 4.214 4.365 4.581 4.715 4.849 5.038 5.201 5.354 5.505 5.656 5.85 6.027 6.206 6.433 6.646 6.854 7.092 7.35 7.588 7.829 8.085 8.352 8.647 8.997 9.389 9.74 10.127 10.56 11.02 11.496 11.984 12.446 12.854 12.906 12.663 12.295 11.852 11.408 10.979 10.57 10.222 9.857 9.525 9.232 8.945 8.65 8.359 8.089 7.811 7.567 7.351 7.092 6.819 6.605 6.39 6.156 5.96 5.754 5.542 5.326 5.093 4.924 4.748 4.478 4.28 4.065 3.954 3.714 3.443 3.167 3.028 2.769 2.54 2.371 2.182 1.756 1.514 1.231 0.913 0.53 0.039 -0.671 -3.155 -3 ,29273 ,KEBNE ,16674781,Tue Nov 23 19:17:46 CET,Tue Nov 23 21:10:04 CET,0.0 1.142 1.467 1.738 1.966 2.142 2.307 2.465 2.748 2.871 2.991 3.112 3.318 3.412 3.591 3.756 3.913 3.99 4.133 4.263 4.467 4.604 4.731 4.908 5.067 5.222 5.375 5.524 5.723 5.908 6.078 6.277 6.462 6.648 6.864 7.095 7.33 7.592 7.874 8.165 8.461 8.779 9.131 9.481 9.88 10.312 10.76 11.221 11.713 12.217 12.55 12.455 12.191 11.857 11.44 10.975 10.57 10.188 9.801 9.374 9.009 8.676 8.341 8.026 7.737 7.469 7.164 6.89 6.67 6.416 6.125 5.889 5.638 5.37 5.172 4.97 4.753 4.512 4.251 4.069 3.877 3.581 3.381 3.158 3.035 2.784 2.528 2.246 2.094 1.84 1.612 1.428 1.235 0.838 0.598 0.294 -0.014 -0.361 -0.819 -1.463 -4.183 -4 ,8379 ,KEBNE ,16674782,Tue Nov 23 19:17:47 CET,Tue Nov 23 21:09:51 CET,0.0 0.972 1.354 1.642 1.882 2.074 2.253 2.42 2.704 2.827 2.953 3.096 3.313 3.422 3.626 3.818 3.99 4.067 4.228 4.377 4.566 4.693 4.827 5.01 5.184 5.356 5.516 5.666 5.854 6.04 6.224 6.436 6.637 6.833 7.057 7.298 7.524 7.781 8.058 8.34 8.64 8.979 9.344 9.678 10.046 10.457 10.931 11.428 11.934 12.393 12.763 12.734 12.442 12.006 11.524 11.068 10.699 10.358 10.015 9.649 9.314 9.013 8.72 8.42 8.123 7.847 7.57 7.315 7.084 6.847 6.587 6.362 6.131 5.884 5.686 5.475 5.248 5.007 4.753 4.589 4.414 4.125 3.93 3.734 3.628 3.396 3.153 2.897 2.756 2.501 2.286 2.088 1.862 1.408 1.17 0.901 0.572 0.211 -0.221 -0.832 -3.19 -5 ,29319 ,KEBNE ,16674783,Tue Nov 23 19:17:51 CET,Tue Nov 23 21:09:53 CET,0.0 1.229 1.586 1.846 2.076 2.288 2.472 2.624 2.897 3.023 3.153 3.283 3.489 3.585 3.769 3.954 4.127 4.205 4.354 4.501 4.717 4.853 4.975 5.149 5.322 5.488 5.648 5.802 5.994 6.177 6.354 6.566 6.786 6.992 7.206 7.444 7.678 7.929 8.185 8.454 8.743 9.062 9.44 9.818 10.233 10.687 11.181 11.692 12.2 12.656 13.094 13.233 13.078 12.819 12.526 12.192 11.812 11.416 11.061 10.713 10.402 10.098 9.799 9.503 9.216 8.937 8.626 8.347 8.124 7.892 7.622 7.403 7.178 6.932 6.732 6.515 6.299 6.079 5.839 5.668 5.492 5.23 5.04 4.824 4.71 4.462 4.195 3.934 3.798 3.549 3.34 3.161 2.949 2.468 2.21 1.919 1.602 1.237 0.728 0.041 -2.612 -6 ,18018 ,KEBNE ,16674784,Tue Nov 23 19:18:52 CET,Tue Nov 23 21:11:01 CET,0.0 1.051 1.409 1.693 1.934 2.133 2.312 2.476 2.766 2.898 3.021 3.142 3.351 3.45 3.647 3.836 4.02 4.101 4.246 4.395 4.617 4.759 4.893 5.079 5.259 5.418 5.57 5.723 5.927 6.132 6.332 6.558 6.767 6.979 7.199 7.437 7.678 7.919 8.168 8.449 8.753 9.092 9.47 9.832 10.261 10.729 11.213 11.69 12.193 12.692 13.055 13.116 12.9 12.526 12.124 11.695 11.294 10.891 10.515 10.136 9.809 9.516 9.212 8.879 8.551 8.245 7.925 7.65 7.416 7.158 6.873 6.626 6.376 6.119 5.911 5.712 5.504 5.257 4.989 4.803 4.607 4.305 4.094 3.873 3.764 3.524 3.247 2.925 2.761 2.499 2.256 2.072 1.873 1.427 1.167 0.894 0.57 0.185 -0.285 -0.94 -3.238 -7 ,14802 ,KEBNE ,16674785,Tue Nov 23 19:18:51 CET,Tue Nov 23 21:11:41 CET,0.0 1.237 1.658 1.956 2.2 2.391 2.557 2.714 3.004 3.138 3.262 3.385 3.588 3.685 3.876 4.053 4.22 4.298 4.454 4.608 4.827 4.961 5.084 5.263 5.436 5.607 5.775 5.937 6.141 6.339 6.528 6.748 6.959 7.163 7.387 7.63 7.862 8.102 8.353 8.618 8.894 9.201 9.549 9.893 10.272 10.685 11.137 11.609 12.135 12.723 13.193 13.249 13.085 12.739 12.346 11.94 11.508 11.095 10.675 10.225 9.883 9.567 9.245 8.913 8.586 8.297 7.984 7.698 7.464 7.215 6.949 6.725 6.496 6.251 6.046 5.842 5.626 5.377 5.092 4.899 4.714 4.431 4.215 3.971 3.857 3.628 3.356 3.046 2.89 2.636 2.406 2.227 2.035 1.575 1.323 1.074 0.771 0.37 -0.109 -0.666 -2.352 -8 ,5389 ,KEBNE ,16674786,Tue Nov 23 19:18:52 CET,Tue Nov 23 21:11:59 CET,0.0 0.924 1.306 1.574 1.814 2.033 2.222 2.397 2.718 2.854 2.979 3.102 3.324 3.431 3.623 3.805 3.977 4.052 4.199 4.342 4.538 4.666 4.786 4.964 5.132 5.295 5.464 5.623 5.825 6.015 6.187 6.401 6.605 6.793 7.019 7.285 7.528 7.794 8.084 8.385 8.693 9.021 9.393 9.757 10.164 10.574 11.016 11.504 12.035 12.58 13.091 13.265 13.145 12.864 12.482 12.059 11.667 11.301 10.927 10.507 10.144 9.82 9.508 9.21 8.93 8.657 8.352 8.089 7.865 7.617 7.344 7.123 6.892 6.638 6.444 6.248 6.042 5.826 5.586 5.407 5.217 4.925 4.73 4.52 4.408 4.171 3.921 3.664 3.515 3.267 3.083 2.927 2.731 2.29 2.058 1.777 1.466 1.131 0.667 -0.016 -2.365 -9 ,14068 ,KEBNE ,16677051,Wed Nov 24 16:40:57 CET,Wed Nov 24 18:34:39 CET,0.0 1.215 1.568 1.833 2.057 2.264 2.448 2.61 2.909 3.038 3.152 3.251 3.458 3.563 3.764 3.946 4.112 4.189 4.337 4.49 4.712 4.843 4.963 5.133 5.298 5.463 5.616 5.776 5.978 6.156 6.318 6.513 6.717 6.908 7.125 7.372 7.604 7.854 8.119 8.405 8.726 9.079 9.443 9.785 10.184 10.619 11.117 11.665 12.229 12.71 13.042 13.108 12.889 12.528 12.136 11.682 11.238 10.835 10.484 10.11 9.758 9.436 9.115 8.803 8.514 8.241 7.936 7.644 7.389 7.13 6.85 6.626 6.389 6.135 5.945 5.747 5.535 5.303 5.057 4.88 4.705 4.44 4.242 4.026 3.916 3.683 3.423 3.147 3.002 2.751 2.536 2.363 2.179 1.744 1.501 1.208 0.876 0.485 -0.038 -0.721 -3.005 -10 ,17075 ,KEBNE ,16674788,Tue Nov 23 19:31:25 CET,Tue Nov 23 21:23:36 CET,0.0 1.001 1.404 1.672 1.906 2.125 2.311 2.484 2.784 2.914 3.043 3.181 3.397 3.495 3.682 3.863 4.033 4.116 4.268 4.407 4.616 4.754 4.893 5.09 5.275 5.46 5.638 5.797 5.994 6.181 6.357 6.569 6.772 6.978 7.214 7.464 7.702 7.965 8.238 8.517 8.797 9.115 9.506 9.884 10.295 10.747 11.242 11.751 12.328 12.873 13.218 13.177 12.936 12.648 12.322 11.921 11.523 11.144 10.775 10.394 10.044 9.715 9.397 9.071 8.766 8.46 8.116 7.803 7.522 7.237 6.954 6.727 6.475 6.205 6.01 5.805 5.581 5.351 5.114 4.945 4.757 4.462 4.263 4.064 3.962 3.727 3.472 3.218 3.083 2.833 2.6 2.391 2.169 1.716 1.466 1.172 0.842 0.439 -0.048 -0.631 -2.977 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_55_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_55_35.txt deleted file mode 100644 index d2797dac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_55_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18801 ,KEBNE ,16677053,Wed Nov 24 16:41:58 CET,Wed Nov 24 18:34:02 CET,0.0 1.127 1.519 1.822 2.05 2.249 2.431 2.593 2.851 2.961 3.067 3.169 3.36 3.455 3.641 3.805 3.958 4.03 4.18 4.322 4.51 4.622 4.737 4.908 5.063 5.21 5.341 5.462 5.608 5.751 5.887 6.047 6.206 6.357 6.534 6.741 6.928 7.106 7.297 7.517 7.729 7.952 8.204 8.449 8.727 9.003 9.262 9.501 9.724 9.867 9.782 9.361 8.879 8.404 7.928 7.467 7.078 6.706 6.367 6.026 5.714 5.427 5.152 4.894 4.655 4.437 4.206 3.992 3.809 3.616 3.392 3.195 3.006 2.816 2.667 2.522 2.358 2.176 1.994 1.864 1.733 1.529 1.382 1.234 1.159 0.996 0.817 0.621 0.508 0.291 0.165 0.042 -0.079 -0.356 -0.515 -0.692 -0.892 -1.152 -1.478 -1.888 -2.959 -2 ,29016 ,KEBNE ,16677054,Wed Nov 24 16:41:59 CET,Wed Nov 24 18:39:24 CET,0.0 1.288 1.658 1.929 2.152 2.337 2.507 2.662 2.926 3.041 3.154 3.275 3.468 3.563 3.749 3.914 4.065 4.138 4.273 4.402 4.597 4.712 4.814 4.961 5.113 5.263 5.397 5.514 5.657 5.81 5.959 6.132 6.298 6.45 6.631 6.838 7.017 7.207 7.405 7.602 7.811 8.033 8.272 8.504 8.751 9.011 9.301 9.572 9.772 9.87 9.756 9.347 8.869 8.373 7.888 7.433 7.048 6.68 6.346 6.014 5.724 5.462 5.205 4.953 4.719 4.509 4.289 4.086 3.913 3.726 3.53 3.379 3.214 3.031 2.885 2.723 2.55 2.369 2.188 2.065 1.93 1.71 1.561 1.406 1.321 1.139 0.954 0.771 0.678 0.481 0.357 0.238 0.111 -0.177 -0.34 -0.518 -0.715 -0.944 -1.221 -1.628 -2.614 -3 ,32546 ,KEBNE ,16677055,Wed Nov 24 16:43:02 CET,Wed Nov 24 18:37:52 CET,0.0 1.374 1.801 2.099 2.34 2.545 2.717 2.864 3.117 3.239 3.362 3.478 3.675 3.769 3.951 4.115 4.273 4.349 4.491 4.629 4.821 4.939 5.058 5.233 5.392 5.537 5.678 5.816 5.984 6.135 6.279 6.448 6.617 6.79 6.975 7.172 7.353 7.545 7.755 7.972 8.19 8.416 8.664 8.909 9.171 9.414 9.665 9.91 10.126 10.259 10.122 9.613 9.101 8.643 8.228 7.803 7.389 7.021 6.702 6.363 6.051 5.767 5.489 5.226 4.979 4.757 4.524 4.328 4.159 3.969 3.768 3.596 3.397 3.193 3.048 2.901 2.751 2.588 2.406 2.269 2.129 1.92 1.769 1.612 1.531 1.365 1.173 0.962 0.859 0.655 0.527 0.401 0.262 -0.033 -0.197 -0.395 -0.609 -0.845 -1.131 -1.547 -2.85 -4 ,23849 ,KEBNE ,16677056,Wed Nov 24 16:43:01 CET,Wed Nov 24 18:36:42 CET,0.0 1.74 2.197 2.51 2.75 2.936 3.113 3.271 3.546 3.68 3.802 3.912 4.109 4.204 4.389 4.557 4.708 4.783 4.934 5.078 5.267 5.387 5.51 5.676 5.829 5.975 6.109 6.233 6.391 6.542 6.688 6.865 7.037 7.205 7.402 7.62 7.818 8.021 8.223 8.438 8.659 8.886 9.127 9.38 9.652 9.905 10.162 10.418 10.687 10.848 10.742 10.328 9.833 9.307 8.823 8.391 7.99 7.615 7.278 6.925 6.612 6.308 6.014 5.754 5.501 5.257 4.999 4.777 4.588 4.394 4.184 4.001 3.811 3.606 3.446 3.287 3.124 2.951 2.769 2.651 2.523 2.291 2.132 1.972 1.888 1.719 1.532 1.323 1.22 1.019 0.897 0.774 0.636 0.337 0.157 -0.039 -0.226 -0.446 -0.737 -1.184 -2.496 -5 ,12718 ,KEBNE ,16677057,Wed Nov 24 16:44:04 CET,Wed Nov 24 18:37:46 CET,0.0 1.031 1.368 1.64 1.846 2.034 2.22 2.386 2.681 2.805 2.921 3.043 3.245 3.339 3.516 3.688 3.843 3.917 4.061 4.195 4.381 4.493 4.605 4.766 4.918 5.061 5.193 5.316 5.465 5.626 5.787 5.964 6.126 6.276 6.468 6.683 6.867 7.073 7.282 7.484 7.704 7.938 8.198 8.443 8.698 8.981 9.26 9.506 9.698 9.76 9.551 9.082 8.612 8.091 7.562 7.084 6.661 6.257 5.883 5.513 5.198 4.904 4.609 4.332 4.079 3.852 3.619 3.399 3.193 2.984 2.777 2.596 2.403 2.195 2.035 1.877 1.709 1.53 1.338 1.213 1.087 0.883 0.738 0.582 0.501 0.332 0.146 -0.046 -0.15 -0.37 -0.508 -0.646 -0.787 -1.089 -1.262 -1.454 -1.673 -1.918 -2.235 -2.669 -3.89 -6 ,30364 ,KEBNE ,16677058,Wed Nov 24 16:44:04 CET,Wed Nov 24 18:36:41 CET,0.0 1.208 1.588 1.881 2.111 2.312 2.478 2.623 2.884 3.004 3.115 3.226 3.422 3.517 3.707 3.879 4.034 4.109 4.253 4.384 4.577 4.707 4.828 4.992 5.143 5.287 5.427 5.564 5.731 5.889 6.041 6.214 6.376 6.538 6.718 6.905 7.079 7.278 7.486 7.684 7.892 8.122 8.378 8.607 8.865 9.144 9.412 9.671 9.895 10.014 9.922 9.525 9.057 8.562 8.074 7.632 7.25 6.9 6.595 6.262 5.954 5.674 5.403 5.155 4.914 4.681 4.434 4.213 4.019 3.808 3.591 3.419 3.242 3.045 2.887 2.732 2.58 2.418 2.242 2.117 1.988 1.79 1.649 1.5 1.421 1.243 1.059 0.86 0.759 0.556 0.435 0.308 0.174 -0.102 -0.256 -0.424 -0.619 -0.855 -1.15 -1.554 -2.731 -7 ,15646 ,KEBNE ,16677059,Wed Nov 24 16:44:04 CET,Wed Nov 24 18:39:45 CET,0.0 1.022 1.409 1.69 1.911 2.096 2.256 2.408 2.688 2.81 2.918 3.013 3.208 3.304 3.475 3.636 3.785 3.854 3.994 4.127 4.308 4.423 4.538 4.704 4.869 5.024 5.161 5.291 5.451 5.603 5.754 5.926 6.085 6.232 6.401 6.597 6.778 6.977 7.176 7.376 7.582 7.801 8.063 8.314 8.581 8.85 9.128 9.394 9.632 9.81 9.682 9.148 8.608 8.083 7.583 7.129 6.737 6.359 6.002 5.654 5.356 5.084 4.814 4.551 4.307 4.087 3.867 3.672 3.5 3.309 3.111 2.944 2.762 2.57 2.426 2.28 2.119 1.951 1.779 1.652 1.525 1.319 1.172 1.026 0.948 0.779 0.599 0.411 0.313 0.116 -0.006 -0.128 -0.253 -0.539 -0.706 -0.888 -1.076 -1.293 -1.567 -1.957 -3.329 -8 ,21097 ,KEBNE ,16677060,Wed Nov 24 16:44:05 CET,Wed Nov 24 18:37:55 CET,0.0 1.07 1.429 1.694 1.914 2.109 2.277 2.432 2.723 2.857 2.982 3.111 3.305 3.403 3.593 3.755 3.905 3.979 4.11 4.241 4.442 4.566 4.687 4.867 5.027 5.172 5.31 5.44 5.618 5.786 5.938 6.115 6.282 6.447 6.644 6.863 7.055 7.239 7.425 7.626 7.843 8.08 8.317 8.539 8.815 9.1 9.34 9.528 9.718 9.787 9.558 9.099 8.611 8.143 7.697 7.258 6.853 6.476 6.128 5.77 5.474 5.202 4.931 4.677 4.437 4.216 3.978 3.774 3.597 3.399 3.181 3.002 2.821 2.631 2.483 2.331 2.173 2.006 1.828 1.698 1.558 1.333 1.171 1.005 0.923 0.748 0.555 0.349 0.249 0.043 -0.104 -0.238 -0.367 -0.645 -0.812 -0.999 -1.21 -1.452 -1.754 -2.195 -3.491 -9 ,13966 ,KEBNE ,16677061,Wed Nov 24 16:44:05 CET,Wed Nov 24 18:40:01 CET,0.0 1.287 1.666 1.944 2.171 2.366 2.525 2.66 2.918 3.044 3.159 3.274 3.48 3.582 3.775 3.951 4.102 4.169 4.298 4.424 4.605 4.725 4.839 4.994 5.148 5.297 5.438 5.568 5.735 5.899 6.048 6.223 6.387 6.556 6.758 6.966 7.161 7.353 7.543 7.742 7.948 8.182 8.419 8.639 8.899 9.173 9.458 9.727 9.954 10.095 10.061 9.716 9.239 8.742 8.272 7.816 7.414 7.047 6.701 6.339 6.013 5.731 5.476 5.235 5.008 4.797 4.567 4.354 4.154 3.939 3.731 3.56 3.385 3.203 3.05 2.887 2.721 2.553 2.382 2.258 2.123 1.909 1.758 1.604 1.527 1.37 1.201 1.018 0.921 0.718 0.589 0.463 0.336 0.082 -0.069 -0.247 -0.444 -0.687 -0.978 -1.368 -2.677 -10 ,8710 ,KEBNE ,16677062,Wed Nov 24 16:44:05 CET,Wed Nov 24 18:39:00 CET,0.0 1.544 1.911 2.176 2.387 2.568 2.73 2.889 3.184 3.308 3.431 3.554 3.737 3.826 3.993 4.151 4.307 4.384 4.535 4.67 4.845 4.963 5.078 5.23 5.365 5.498 5.627 5.744 5.899 6.057 6.205 6.375 6.53 6.673 6.833 7.014 7.194 7.382 7.575 7.784 7.989 8.193 8.428 8.662 8.922 9.187 9.428 9.631 9.841 10.009 9.95 9.534 9.052 8.578 8.127 7.697 7.287 6.903 6.563 6.215 5.925 5.675 5.437 5.221 4.997 4.765 4.526 4.32 4.146 3.964 3.772 3.612 3.436 3.246 3.095 2.943 2.786 2.616 2.442 2.323 2.204 2.017 1.88 1.73 1.649 1.485 1.313 1.129 1.032 0.834 0.716 0.599 0.47 0.183 0.003 -0.2 -0.408 -0.647 -0.94 -1.33 -2.477 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_35.txt deleted file mode 100644 index f75a46d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6668 ,KEBNE ,16677063,Wed Nov 24 16:44:04 CET,Wed Nov 24 18:39:05 CET,0.0 1.144 1.482 1.76 1.998 2.188 2.352 2.502 2.794 2.919 3.034 3.133 3.334 3.433 3.623 3.802 3.97 4.05 4.208 4.355 4.553 4.679 4.8 4.974 5.143 5.312 5.479 5.635 5.815 5.981 6.14 6.328 6.505 6.676 6.868 7.086 7.293 7.514 7.753 7.997 8.262 8.542 8.837 9.125 9.438 9.759 10.12 10.503 10.878 11.235 11.44 11.348 11.117 10.811 10.478 10.145 9.812 9.506 9.209 8.892 8.63 8.391 8.145 7.891 7.647 7.44 7.226 7.007 6.823 6.639 6.431 6.259 6.078 5.889 5.75 5.601 5.442 5.279 5.11 4.992 4.864 4.645 4.489 4.334 4.251 4.074 3.882 3.673 3.567 3.356 3.218 3.094 2.965 2.668 2.505 2.326 2.105 1.836 1.509 1.04 -1.294 -2 ,27684 ,KEBNE ,16677064,Wed Nov 24 16:45:07 CET,Wed Nov 24 18:39:48 CET,0.0 1.129 1.522 1.795 2.016 2.218 2.394 2.556 2.855 2.982 3.099 3.223 3.429 3.529 3.714 3.879 4.026 4.099 4.253 4.407 4.623 4.753 4.87 5.041 5.21 5.366 5.511 5.651 5.829 6.002 6.172 6.374 6.551 6.717 6.916 7.138 7.342 7.56 7.802 8.064 8.326 8.595 8.88 9.164 9.501 9.872 10.276 10.672 11.067 11.458 11.722 11.636 11.395 11.064 10.708 10.379 10.043 9.698 9.372 9.045 8.776 8.537 8.306 8.082 7.854 7.627 7.403 7.208 7.034 6.844 6.642 6.474 6.29 6.097 5.949 5.793 5.627 5.458 5.292 5.175 5.046 4.837 4.69 4.541 4.463 4.302 4.12 3.907 3.803 3.598 3.464 3.343 3.215 2.915 2.745 2.559 2.358 2.123 1.812 1.369 -0.333 -3 ,1788 ,KEBNE ,16677065,Wed Nov 24 16:45:07 CET,Wed Nov 24 18:40:43 CET,0.0 1.047 1.45 1.743 1.964 2.147 2.319 2.475 2.748 2.872 2.984 3.092 3.289 3.384 3.58 3.762 3.931 4.008 4.15 4.292 4.488 4.608 4.728 4.895 5.052 5.207 5.366 5.515 5.692 5.863 6.025 6.209 6.38 6.545 6.74 6.963 7.164 7.372 7.585 7.809 8.057 8.334 8.632 8.927 9.263 9.598 9.968 10.344 10.68 10.976 11.134 10.976 10.682 10.352 10.01 9.67 9.34 9.003 8.703 8.407 8.14 7.874 7.614 7.376 7.157 6.949 6.729 6.517 6.332 6.148 5.959 5.792 5.601 5.407 5.261 5.115 4.954 4.782 4.61 4.485 4.355 4.162 4.025 3.863 3.779 3.604 3.41 3.209 3.105 2.89 2.74 2.603 2.463 2.164 1.989 1.807 1.611 1.378 1.082 0.668 -0.741 -4 ,16082 ,KEBNE ,16677066,Wed Nov 24 16:45:07 CET,Wed Nov 24 18:39:44 CET,0.0 1.115 1.486 1.753 1.973 2.152 2.32 2.48 2.746 2.865 2.975 3.07 3.27 3.369 3.548 3.71 3.872 3.954 4.112 4.26 4.458 4.578 4.694 4.863 5.027 5.186 5.341 5.484 5.659 5.826 5.987 6.187 6.384 6.563 6.76 6.981 7.197 7.425 7.663 7.929 8.197 8.466 8.763 9.073 9.428 9.793 10.163 10.535 10.906 11.226 11.408 11.233 10.912 10.557 10.161 9.751 9.392 9.072 8.779 8.482 8.234 7.986 7.737 7.501 7.27 7.058 6.839 6.633 6.448 6.263 6.078 5.918 5.731 5.527 5.37 5.212 5.042 4.865 4.684 4.552 4.416 4.203 4.053 3.891 3.807 3.629 3.43 3.217 3.11 2.895 2.741 2.609 2.473 2.168 2.001 1.813 1.589 1.344 1.051 0.645 -1.016 -5 ,10779 ,KEBNE ,16677067,Wed Nov 24 16:45:07 CET,Wed Nov 24 18:42:27 CET,0.0 1.283 1.656 1.949 2.172 2.36 2.521 2.663 2.92 3.04 3.155 3.271 3.482 3.58 3.766 3.942 4.106 4.184 4.338 4.488 4.692 4.812 4.928 5.106 5.267 5.413 5.563 5.705 5.885 6.058 6.219 6.408 6.583 6.749 6.953 7.177 7.383 7.599 7.828 8.073 8.319 8.593 8.91 9.222 9.568 9.936 10.329 10.706 11.108 11.503 11.748 11.644 11.364 11.071 10.751 10.425 10.122 9.821 9.554 9.276 9.015 8.787 8.576 8.359 8.149 7.956 7.753 7.57 7.405 7.224 7.028 6.873 6.703 6.513 6.37 6.225 6.065 5.897 5.726 5.602 5.471 5.265 5.121 4.976 4.899 4.737 4.558 4.347 4.239 4.033 3.889 3.757 3.623 3.339 3.18 2.996 2.787 2.548 2.238 1.815 0.012 -6 ,6696 ,KEBNE ,16677068,Wed Nov 24 16:46:10 CET,Wed Nov 24 18:44:23 CET,0.0 1.325 1.727 2.007 2.247 2.453 2.621 2.777 3.06 3.188 3.308 3.432 3.65 3.749 3.929 4.101 4.263 4.337 4.48 4.621 4.823 4.959 5.083 5.248 5.413 5.565 5.704 5.844 6.024 6.195 6.362 6.558 6.75 6.926 7.12 7.356 7.578 7.799 8.022 8.257 8.5 8.77 9.075 9.37 9.715 10.075 10.457 10.852 11.242 11.642 11.933 11.855 11.611 11.278 10.925 10.583 10.263 9.975 9.702 9.408 9.155 8.928 8.708 8.488 8.278 8.092 7.884 7.677 7.505 7.33 7.139 6.98 6.819 6.647 6.515 6.385 6.246 6.09 5.913 5.789 5.665 5.471 5.326 5.176 5.102 4.946 4.786 4.612 4.514 4.319 4.198 4.073 3.943 3.653 3.493 3.319 3.123 2.889 2.6 2.195 0.337 -7 ,30596 ,KEBNE ,16677069,Wed Nov 24 16:46:09 CET,Wed Nov 24 18:40:01 CET,0.0 1.003 1.37 1.631 1.84 2.009 2.165 2.324 2.614 2.741 2.864 2.99 3.188 3.281 3.46 3.625 3.789 3.865 4.004 4.141 4.341 4.471 4.593 4.751 4.906 5.07 5.226 5.373 5.561 5.739 5.909 6.111 6.303 6.484 6.68 6.892 7.104 7.326 7.556 7.799 8.059 8.348 8.668 8.983 9.328 9.673 10.029 10.375 10.745 11.111 11.372 11.282 10.993 10.629 10.205 9.792 9.435 9.097 8.778 8.456 8.18 7.925 7.672 7.431 7.211 7.013 6.799 6.601 6.421 6.236 6.042 5.871 5.697 5.515 5.367 5.197 5.012 4.833 4.653 4.532 4.402 4.19 4.056 3.909 3.83 3.66 3.465 3.263 3.154 2.945 2.803 2.677 2.556 2.268 2.093 1.903 1.698 1.46 1.169 0.746 -0.928 -8 ,23535 ,KEBNE ,16677070,Wed Nov 24 16:46:10 CET,Wed Nov 24 18:40:19 CET,0.0 1.022 1.363 1.609 1.82 2.014 2.181 2.347 2.634 2.754 2.871 2.977 3.169 3.258 3.435 3.601 3.753 3.822 3.955 4.085 4.264 4.376 4.487 4.651 4.804 4.947 5.083 5.215 5.385 5.553 5.709 5.896 6.079 6.244 6.445 6.672 6.88 7.105 7.35 7.606 7.864 8.152 8.469 8.756 9.072 9.395 9.738 10.115 10.477 10.804 11.031 10.967 10.704 10.323 9.932 9.566 9.209 8.875 8.598 8.302 8.044 7.821 7.585 7.357 7.152 6.947 6.724 6.525 6.355 6.184 5.988 5.81 5.632 5.445 5.298 5.162 5.022 4.865 4.692 4.558 4.418 4.22 4.083 3.935 3.856 3.688 3.499 3.298 3.201 3.001 2.87 2.747 2.609 2.305 2.144 1.961 1.757 1.52 1.18 0.705 -1.269 -9 ,2774 ,KEBNE ,16677071,Wed Nov 24 16:47:12 CET,Wed Nov 24 18:43:11 CET,0.0 0.899 1.307 1.615 1.841 2.035 2.191 2.337 2.598 2.724 2.849 2.954 3.152 3.244 3.408 3.566 3.722 3.798 3.948 4.093 4.294 4.422 4.544 4.713 4.876 5.038 5.199 5.34 5.505 5.684 5.854 6.039 6.23 6.419 6.622 6.848 7.058 7.28 7.514 7.766 8.019 8.286 8.611 8.922 9.261 9.619 10.001 10.384 10.759 11.077 11.266 11.15 10.885 10.568 10.238 9.91 9.582 9.247 8.943 8.633 8.364 8.12 7.897 7.686 7.476 7.282 7.082 6.899 6.738 6.575 6.403 6.256 6.095 5.914 5.77 5.613 5.448 5.283 5.108 4.975 4.835 4.628 4.485 4.337 4.259 4.094 3.92 3.738 3.643 3.432 3.307 3.186 3.05 2.743 2.556 2.341 2.099 1.823 1.487 1.03 -0.572 -10 ,18113 ,KEBNE ,16677072,Wed Nov 24 16:47:12 CET,Wed Nov 24 18:42:08 CET,0.0 1.046 1.385 1.656 1.888 2.092 2.27 2.436 2.728 2.852 2.97 3.083 3.297 3.397 3.571 3.741 3.912 3.991 4.138 4.277 4.464 4.581 4.691 4.847 4.992 5.132 5.278 5.413 5.58 5.742 5.894 6.087 6.27 6.439 6.633 6.845 7.052 7.279 7.503 7.733 7.97 8.229 8.525 8.816 9.144 9.479 9.82 10.171 10.559 10.929 11.12 10.985 10.716 10.363 10.014 9.674 9.319 8.997 8.721 8.419 8.147 7.899 7.643 7.404 7.183 6.967 6.737 6.53 6.35 6.166 5.977 5.815 5.638 5.451 5.304 5.15 4.986 4.81 4.622 4.494 4.364 4.161 4.023 3.869 3.79 3.633 3.465 3.284 3.18 2.968 2.845 2.719 2.583 2.271 2.094 1.912 1.708 1.475 1.184 0.755 -1.072 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_55.txt deleted file mode 100644 index fcf3222e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_55.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23618 ,KEBNE ,16677073,Wed Nov 24 16:47:12 CET,Wed Nov 24 18:41:16 CET,0.0 1.244 1.599 1.882 2.124 2.324 2.493 2.644 2.915 3.038 3.161 3.288 3.501 3.604 3.785 3.957 4.128 4.205 4.344 4.481 4.68 4.816 4.941 5.112 5.283 5.442 5.6 5.752 5.941 6.124 6.303 6.504 6.7 6.901 7.123 7.361 7.591 7.842 8.1 8.372 8.66 8.972 9.334 9.71 10.112 10.528 11.008 11.483 11.958 12.456 12.936 13.154 13.1 12.898 12.651 12.391 12.142 11.911 11.65 11.367 11.146 10.94 10.725 10.518 10.334 10.15 9.941 9.759 9.6 9.421 9.23 9.078 8.918 8.75 8.617 8.472 8.328 8.19 8.034 7.922 7.805 7.621 7.48 7.326 7.251 7.087 6.906 6.705 6.599 6.39 6.266 6.141 5.988 5.664 5.499 5.308 5.1 4.855 4.532 4.078 2.406 -2 ,13445 ,KEBNE ,16677074,Wed Nov 24 16:48:15 CET,Wed Nov 24 18:42:10 CET,0.0 1.107 1.506 1.777 1.993 2.196 2.376 2.536 2.809 2.94 3.071 3.199 3.402 3.508 3.709 3.885 4.043 4.124 4.278 4.415 4.606 4.734 4.855 5.023 5.191 5.359 5.515 5.653 5.832 6.006 6.172 6.377 6.567 6.752 6.974 7.214 7.442 7.685 7.93 8.194 8.473 8.772 9.117 9.465 9.864 10.289 10.765 11.282 11.811 12.356 12.886 13.118 13.049 12.831 12.584 12.317 12.05 11.789 11.554 11.301 11.071 10.86 10.648 10.444 10.245 10.07 9.894 9.725 9.584 9.434 9.263 9.106 8.941 8.769 8.626 8.489 8.356 8.205 8.04 7.921 7.797 7.612 7.483 7.339 7.255 7.08 6.906 6.726 6.631 6.427 6.303 6.184 6.035 5.68 5.505 5.328 5.13 4.899 4.584 4.143 2.644 -3 ,8661 ,KEBNE ,16674791,Tue Nov 23 19:37:44 CET,Tue Nov 23 21:32:07 CET,0.0 1.294 1.639 1.907 2.131 2.335 2.518 2.679 2.964 3.103 3.237 3.36 3.561 3.657 3.847 4.028 4.198 4.278 4.431 4.58 4.785 4.913 5.039 5.221 5.396 5.557 5.703 5.844 6.029 6.204 6.38 6.593 6.798 6.999 7.21 7.443 7.662 7.884 8.138 8.417 8.703 9.011 9.344 9.661 10.02 10.432 10.899 11.369 11.857 12.372 12.849 13.009 12.894 12.705 12.51 12.285 12.029 11.771 11.52 11.256 11.035 10.831 10.617 10.414 10.221 10.021 9.8 9.607 9.444 9.267 9.077 8.914 8.739 8.56 8.416 8.27 8.117 7.95 7.781 7.658 7.519 7.308 7.175 7.043 6.969 6.81 6.638 6.452 6.35 6.142 6.012 5.89 5.76 5.453 5.28 5.085 4.857 4.605 4.295 3.856 2.452 -4 ,28697 ,KEBNE ,16674792,Tue Nov 23 19:48:11 CET,Tue Nov 23 21:43:01 CET,0.0 0.777 1.152 1.423 1.651 1.851 2.03 2.184 2.467 2.59 2.702 2.825 3.027 3.124 3.32 3.502 3.663 3.745 3.897 4.033 4.229 4.356 4.484 4.671 4.841 5.006 5.168 5.319 5.5 5.669 5.833 6.023 6.206 6.381 6.594 6.832 7.042 7.273 7.536 7.807 8.076 8.359 8.69 9.041 9.437 9.864 10.317 10.804 11.319 11.803 12.249 12.401 12.314 12.13 11.917 11.654 11.387 11.141 10.898 10.624 10.381 10.156 9.922 9.713 9.522 9.336 9.129 8.948 8.79 8.607 8.415 8.246 8.063 7.891 7.763 7.619 7.466 7.298 7.116 7.0 6.887 6.703 6.558 6.395 6.314 6.155 5.98 5.78 5.674 5.469 5.323 5.189 5.059 4.768 4.597 4.412 4.201 3.956 3.661 3.263 1.626 -6 ,5992 ,KEBNE ,16677078,Wed Nov 24 16:49:17 CET,Wed Nov 24 18:44:43 CET,0.0 1.129 1.479 1.753 1.992 2.198 2.371 2.526 2.817 2.95 3.065 3.181 3.391 3.494 3.705 3.897 4.065 4.143 4.29 4.434 4.635 4.752 4.865 5.04 5.213 5.38 5.535 5.679 5.872 6.065 6.241 6.457 6.675 6.876 7.096 7.339 7.565 7.797 8.049 8.312 8.58 8.889 9.25 9.609 10.005 10.433 10.907 11.407 11.95 12.503 12.996 13.156 13.069 12.896 12.676 12.405 12.154 11.911 11.665 11.396 11.154 10.924 10.701 10.497 10.293 10.101 9.898 9.715 9.553 9.379 9.206 9.06 8.903 8.727 8.586 8.443 8.285 8.117 7.936 7.817 7.69 7.48 7.339 7.189 7.11 6.947 6.773 6.58 6.474 6.264 6.124 5.997 5.865 5.589 5.423 5.228 5.015 4.775 4.475 4.003 2.287 -7 ,17242 ,KEBNE ,16674795,Tue Nov 23 19:48:12 CET,Tue Nov 23 21:41:53 CET,0.0 1.245 1.655 1.98 2.214 2.405 2.593 2.773 3.07 3.204 3.332 3.452 3.657 3.758 3.945 4.115 4.276 4.35 4.499 4.642 4.844 4.972 5.094 5.26 5.425 5.586 5.735 5.884 6.069 6.238 6.403 6.613 6.817 6.999 7.201 7.431 7.656 7.903 8.163 8.432 8.699 8.987 9.327 9.67 10.051 10.461 10.919 11.38 11.879 12.408 12.88 13.058 13.01 12.879 12.667 12.4 12.138 11.863 11.594 11.321 11.082 10.853 10.622 10.399 10.168 9.95 9.739 9.55 9.382 9.207 9.022 8.864 8.701 8.523 8.385 8.247 8.093 7.935 7.777 7.667 7.541 7.339 7.207 7.066 6.986 6.805 6.627 6.432 6.325 6.125 6.003 5.87 5.729 5.427 5.259 5.075 4.859 4.606 4.296 3.836 2.144 -8 ,25025 ,KEBNE ,16674796,Tue Nov 23 19:48:12 CET,Tue Nov 23 21:43:09 CET,0.0 1.295 1.651 1.915 2.157 2.358 2.538 2.706 2.987 3.115 3.229 3.351 3.563 3.667 3.859 4.037 4.204 4.284 4.437 4.577 4.788 4.923 5.046 5.227 5.397 5.555 5.713 5.868 6.06 6.238 6.413 6.621 6.826 7.024 7.237 7.468 7.694 7.939 8.199 8.484 8.792 9.135 9.482 9.807 10.185 10.578 11.026 11.539 12.092 12.645 13.163 13.345 13.212 12.998 12.77 12.497 12.223 11.973 11.751 11.519 11.3 11.093 10.886 10.69 10.512 10.337 10.135 9.948 9.772 9.583 9.397 9.232 9.058 8.881 8.748 8.604 8.455 8.301 8.131 8.007 7.874 7.672 7.535 7.395 7.32 7.149 6.962 6.766 6.666 6.467 6.35 6.224 6.081 5.791 5.627 5.45 5.257 5.014 4.706 4.278 2.545 -9 ,29941 ,KEBNE ,16677081,Wed Nov 24 16:49:17 CET,Wed Nov 24 18:44:30 CET,0.0 1.075 1.419 1.683 1.902 2.094 2.266 2.427 2.71 2.843 2.97 3.108 3.322 3.427 3.622 3.806 3.98 4.057 4.202 4.342 4.54 4.671 4.796 4.975 5.144 5.299 5.454 5.612 5.805 5.982 6.159 6.367 6.557 6.734 6.932 7.155 7.363 7.584 7.838 8.105 8.379 8.702 9.059 9.392 9.763 10.164 10.619 11.077 11.558 12.075 12.483 12.554 12.465 12.28 12.038 11.769 11.505 11.224 10.957 10.681 10.412 10.165 9.944 9.728 9.527 9.331 9.122 8.948 8.782 8.588 8.392 8.237 8.084 7.917 7.779 7.643 7.496 7.33 7.165 7.051 6.93 6.736 6.591 6.444 6.37 6.216 6.04 5.849 5.761 5.566 5.428 5.298 5.166 4.874 4.704 4.517 4.332 4.1 3.769 3.339 1.792 -10 ,2936 ,KEBNE ,16674798,Tue Nov 23 19:48:12 CET,Tue Nov 23 21:41:51 CET,0.0 0.978 1.369 1.67 1.903 2.121 2.32 2.491 2.791 2.916 3.037 3.173 3.382 3.481 3.666 3.836 4.002 4.081 4.239 4.388 4.591 4.731 4.864 5.041 5.201 5.357 5.516 5.672 5.869 6.048 6.222 6.425 6.615 6.8 7.009 7.24 7.473 7.732 7.996 8.274 8.557 8.875 9.235 9.548 9.908 10.339 10.79 11.211 11.686 12.21 12.679 12.874 12.791 12.538 12.254 11.972 11.699 11.422 11.155 10.879 10.64 10.401 10.159 9.932 9.716 9.521 9.306 9.107 8.933 8.751 8.561 8.402 8.233 8.058 7.925 7.779 7.628 7.471 7.297 7.17 7.033 6.83 6.693 6.542 6.461 6.285 6.098 5.905 5.806 5.606 5.487 5.371 5.246 4.97 4.809 4.625 4.414 4.162 3.831 3.39 1.531 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_57_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_57_35.txt deleted file mode 100644 index 8b8f1f09..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_57_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29664 ,KEBNE ,16677083,Wed Nov 24 16:50:19 CET,Wed Nov 24 18:45:42 CET,0.0 1.32 1.68 1.971 2.21 2.388 2.552 2.701 2.97 3.097 3.215 3.336 3.547 3.652 3.849 4.02 4.175 4.256 4.404 4.542 4.745 4.869 4.986 5.153 5.318 5.481 5.633 5.77 5.935 6.1 6.267 6.465 6.642 6.813 7.014 7.238 7.443 7.647 7.873 8.122 8.372 8.626 8.907 9.183 9.483 9.801 10.152 10.516 10.851 11.149 11.353 11.169 10.811 10.41 10.02 9.64 9.275 8.935 8.648 8.365 8.082 7.821 7.583 7.353 7.138 6.929 6.699 6.486 6.294 6.099 5.898 5.725 5.536 5.334 5.173 5.0 4.836 4.674 4.505 4.387 4.255 4.04 3.893 3.743 3.663 3.494 3.313 3.109 2.999 2.789 2.647 2.514 2.373 2.077 1.904 1.694 1.457 1.187 0.883 0.461 -0.756 -2 ,3922 ,KEBNE ,16677084,Wed Nov 24 16:50:20 CET,Wed Nov 24 18:45:08 CET,0.0 0.966 1.309 1.561 1.798 1.995 2.168 2.325 2.594 2.718 2.832 2.958 3.171 3.268 3.447 3.628 3.792 3.869 4.014 4.15 4.353 4.483 4.607 4.782 4.948 5.103 5.245 5.387 5.567 5.729 5.883 6.065 6.241 6.417 6.607 6.819 7.042 7.292 7.531 7.76 7.993 8.244 8.543 8.818 9.113 9.437 9.798 10.147 10.492 10.822 10.962 10.78 10.514 10.135 9.734 9.365 9.023 8.718 8.434 8.139 7.858 7.571 7.298 7.037 6.783 6.546 6.303 6.086 5.888 5.675 5.466 5.292 5.098 4.902 4.752 4.592 4.425 4.251 4.058 3.918 3.777 3.555 3.396 3.235 3.147 2.958 2.767 2.573 2.467 2.255 2.109 1.975 1.838 1.543 1.369 1.184 0.972 0.714 0.431 0.067 -1.046 -3 ,17406 ,KEBNE ,16677085,Wed Nov 24 16:50:20 CET,Wed Nov 24 18:44:55 CET,0.0 1.156 1.519 1.774 1.976 2.169 2.363 2.531 2.82 2.953 3.077 3.206 3.417 3.515 3.708 3.896 4.062 4.139 4.284 4.416 4.604 4.729 4.857 5.034 5.189 5.343 5.494 5.639 5.817 5.982 6.149 6.352 6.53 6.699 6.896 7.113 7.317 7.529 7.755 8.005 8.268 8.536 8.828 9.125 9.46 9.788 10.098 10.382 10.666 10.926 11.127 11.004 10.607 10.177 9.776 9.372 8.999 8.647 8.345 8.08 7.837 7.585 7.333 7.089 6.859 6.658 6.445 6.239 6.051 5.852 5.654 5.491 5.313 5.119 4.966 4.799 4.629 4.451 4.253 4.115 3.984 3.773 3.608 3.435 3.348 3.165 2.966 2.749 2.634 2.415 2.266 2.125 1.99 1.694 1.516 1.312 1.101 0.875 0.572 0.157 -1.345 -4 ,10117 ,KEBNE ,16677086,Wed Nov 24 16:50:20 CET,Wed Nov 24 18:52:28 CET,0.0 1.105 1.458 1.719 1.936 2.122 2.294 2.442 2.705 2.825 2.943 3.073 3.282 3.378 3.562 3.738 3.905 3.984 4.139 4.285 4.485 4.607 4.718 4.888 5.052 5.202 5.351 5.489 5.664 5.839 6.003 6.188 6.366 6.534 6.727 6.944 7.129 7.32 7.536 7.76 7.988 8.246 8.538 8.834 9.149 9.462 9.823 10.222 10.587 10.861 10.977 10.717 10.311 9.859 9.375 8.911 8.515 8.167 7.87 7.546 7.245 6.974 6.714 6.474 6.24 6.012 5.774 5.559 5.374 5.185 4.978 4.801 4.612 4.418 4.269 4.104 3.926 3.746 3.56 3.425 3.288 3.076 2.927 2.776 2.693 2.509 2.32 2.11 2.002 1.796 1.677 1.554 1.431 1.148 0.977 0.799 0.607 0.369 0.07 -0.316 -1.359 -5 ,260 ,KEBNE ,16677087,Wed Nov 24 16:50:20 CET,Wed Nov 24 18:46:10 CET,0.0 1.13 1.499 1.79 2.023 2.209 2.374 2.529 2.792 2.908 3.028 3.152 3.357 3.463 3.662 3.846 4.02 4.094 4.241 4.385 4.576 4.696 4.819 5.005 5.166 5.308 5.444 5.584 5.767 5.934 6.09 6.277 6.452 6.624 6.824 7.034 7.234 7.445 7.649 7.877 8.114 8.375 8.681 8.96 9.269 9.585 9.939 10.309 10.648 10.919 11.003 10.783 10.405 9.999 9.606 9.204 8.831 8.49 8.182 7.871 7.589 7.327 7.079 6.838 6.612 6.411 6.188 5.974 5.789 5.588 5.365 5.187 5.001 4.801 4.646 4.482 4.306 4.122 3.943 3.822 3.689 3.472 3.313 3.138 3.051 2.869 2.675 2.467 2.362 2.163 2.053 1.931 1.79 1.481 1.306 1.114 0.906 0.673 0.381 -0.055 -1.67 -6 ,21328 ,KEBNE ,16677088,Wed Nov 24 16:51:22 CET,Wed Nov 24 18:48:35 CET,0.0 1.176 1.571 1.834 2.053 2.248 2.421 2.583 2.871 2.992 3.108 3.246 3.456 3.559 3.758 3.93 4.085 4.161 4.303 4.44 4.635 4.759 4.877 5.043 5.199 5.344 5.479 5.602 5.757 5.919 6.069 6.249 6.417 6.568 6.766 6.989 7.184 7.378 7.583 7.812 8.051 8.297 8.571 8.836 9.126 9.442 9.769 10.063 10.33 10.499 10.477 10.225 9.864 9.465 9.077 8.694 8.334 7.977 7.662 7.363 7.078 6.804 6.556 6.312 6.063 5.832 5.595 5.38 5.18 4.962 4.732 4.56 4.38 4.174 4.003 3.833 3.658 3.466 3.28 3.15 3.016 2.81 2.663 2.509 2.425 2.25 2.061 1.85 1.74 1.531 1.399 1.27 1.129 0.802 0.622 0.426 0.221 -0.018 -0.307 -0.696 -1.943 -7 ,20470 ,KEBNE ,16677089,Wed Nov 24 16:51:22 CET,Wed Nov 24 18:46:01 CET,0.0 1.165 1.54 1.819 2.055 2.262 2.437 2.596 2.872 2.995 3.119 3.25 3.452 3.546 3.719 3.886 4.051 4.126 4.277 4.423 4.626 4.756 4.876 5.046 5.202 5.346 5.491 5.624 5.795 5.969 6.133 6.326 6.508 6.679 6.869 7.082 7.288 7.511 7.742 7.985 8.231 8.48 8.771 9.054 9.358 9.666 9.977 10.316 10.671 10.977 11.102 10.897 10.578 10.198 9.799 9.432 9.063 8.66 8.308 7.959 7.639 7.359 7.091 6.836 6.595 6.362 6.126 5.913 5.724 5.534 5.327 5.139 4.929 4.71 4.536 4.358 4.181 4.013 3.85 3.731 3.591 3.359 3.205 3.053 2.977 2.804 2.613 2.405 2.302 2.092 1.953 1.821 1.685 1.381 1.198 0.997 0.782 0.53 0.235 -0.135 -1.178 -8 ,20221 ,KEBNE ,16677090,Wed Nov 24 16:51:22 CET,Wed Nov 24 18:45:05 CET,0.0 1.205 1.552 1.815 2.044 2.256 2.442 2.596 2.88 3.007 3.121 3.228 3.434 3.534 3.714 3.879 4.035 4.113 4.26 4.391 4.581 4.704 4.825 4.998 5.155 5.3 5.443 5.588 5.77 5.939 6.111 6.313 6.491 6.66 6.858 7.075 7.28 7.498 7.726 7.96 8.211 8.484 8.78 9.079 9.425 9.792 10.176 10.574 10.941 11.217 11.252 11.032 10.755 10.409 10.05 9.669 9.317 8.992 8.701 8.394 8.099 7.827 7.561 7.299 7.065 6.857 6.636 6.424 6.227 6.018 5.812 5.647 5.472 5.296 5.156 5.0 4.823 4.63 4.428 4.297 4.174 3.97 3.819 3.663 3.581 3.405 3.219 3.009 2.898 2.685 2.55 2.422 2.282 1.971 1.795 1.591 1.365 1.104 0.764 0.333 -1.015 -9 ,29144 ,KEBNE ,16677091,Wed Nov 24 16:52:24 CET,Wed Nov 24 18:47:22 CET,0.0 1.114 1.523 1.82 2.07 2.303 2.503 2.67 2.977 3.123 3.268 3.424 3.644 3.753 3.954 4.135 4.3 4.379 4.533 4.677 4.873 4.996 5.11 5.281 5.442 5.585 5.726 5.86 6.031 6.197 6.351 6.543 6.725 6.887 7.078 7.289 7.493 7.716 7.938 8.168 8.393 8.632 8.906 9.16 9.459 9.791 10.141 10.5 10.819 11.009 11.028 10.791 10.46 10.103 9.689 9.245 8.848 8.502 8.19 7.857 7.566 7.313 7.062 6.792 6.536 6.302 6.052 5.826 5.621 5.403 5.173 4.987 4.8 4.597 4.435 4.269 4.094 3.911 3.717 3.581 3.438 3.213 3.054 2.884 2.795 2.614 2.424 2.201 2.079 1.852 1.698 1.554 1.393 1.06 0.862 0.63 0.362 0.07 -0.261 -0.732 -2.181 -10 ,29466 ,KEBNE ,16677092,Wed Nov 24 16:52:24 CET,Wed Nov 24 18:48:13 CET,0.0 1.129 1.514 1.812 2.048 2.246 2.429 2.59 2.846 2.966 3.082 3.195 3.396 3.493 3.681 3.852 4.008 4.087 4.242 4.385 4.595 4.726 4.85 5.034 5.21 5.371 5.513 5.653 5.845 6.032 6.201 6.386 6.56 6.732 6.931 7.15 7.349 7.549 7.759 7.983 8.221 8.482 8.78 9.086 9.395 9.686 10.003 10.356 10.702 10.961 11.119 10.978 10.68 10.296 9.86 9.427 9.035 8.65 8.3 7.941 7.638 7.374 7.121 6.873 6.631 6.407 6.167 5.948 5.767 5.582 5.379 5.206 5.028 4.845 4.696 4.541 4.386 4.212 4.012 3.88 3.746 3.519 3.353 3.189 3.102 2.903 2.704 2.496 2.392 2.19 2.044 1.91 1.766 1.449 1.278 1.094 0.882 0.625 0.313 -0.109 -1.372 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_58.txt deleted file mode 100644 index 640d91ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2858 ,KEBNE ,16677093,Wed Nov 24 16:52:24 CET,Wed Nov 24 18:52:28 CET,0.0 0.75 1.068 1.32 1.529 1.705 1.868 2.019 2.275 2.39 2.5 2.635 2.815 2.897 3.05 3.195 3.321 3.382 3.508 3.627 3.802 3.915 4.011 4.142 4.268 4.38 4.489 4.602 4.749 4.877 4.988 5.109 5.224 5.336 5.458 5.582 5.694 5.816 5.942 6.078 6.219 6.341 6.431 6.484 6.531 6.522 6.46 6.354 6.143 5.658 4.616 3.26 2.048 1.001 0.075 -0.785 -1.519 -2.157 -2.695 -3.237 -3.699 -4.106 -4.497 -4.865 -5.2 -5.526 -5.88 -6.177 -6.426 -6.688 -6.963 -7.19 -7.426 -7.671 -7.857 -8.061 -8.281 -8.506 -8.745 -8.908 -9.074 -9.338 -9.519 -9.706 -9.806 -10.011 -10.239 -10.48 -10.601 -10.822 -10.987 -11.132 -11.288 -11.644 -11.843 -12.044 -12.275 -12.534 -12.846 -13.306 -14.472 -2 ,21584 ,KEBNE ,16677094,Wed Nov 24 16:52:23 CET,Wed Nov 24 18:53:57 CET,0.0 0.84 1.182 1.442 1.673 1.884 2.053 2.2 2.463 2.577 2.683 2.795 2.979 3.07 3.237 3.388 3.525 3.592 3.717 3.834 4.012 4.134 4.245 4.387 4.516 4.635 4.74 4.84 4.973 5.104 5.224 5.351 5.466 5.569 5.679 5.794 5.9 6.033 6.173 6.297 6.399 6.495 6.595 6.682 6.757 6.782 6.759 6.605 6.288 5.752 4.665 3.167 1.89 0.823 -0.105 -0.927 -1.635 -2.289 -2.874 -3.454 -3.953 -4.396 -4.812 -5.194 -5.539 -5.862 -6.222 -6.561 -6.848 -7.136 -7.45 -7.704 -7.964 -8.241 -8.452 -8.669 -8.906 -9.161 -9.419 -9.592 -9.769 -10.038 -10.233 -10.434 -10.539 -10.765 -11.004 -11.258 -11.385 -11.619 -11.81 -11.971 -12.142 -12.5 -12.705 -12.957 -13.238 -13.543 -13.909 -14.36 -15.671 -3 ,5197 ,KEBNE ,16677095,Wed Nov 24 16:52:24 CET,Wed Nov 24 18:48:32 CET,0.0 1.057 1.485 1.761 1.975 2.163 2.33 2.477 2.741 2.863 2.974 3.086 3.27 3.366 3.553 3.725 3.868 3.935 4.069 4.192 4.366 4.477 4.594 4.754 4.885 5.011 5.126 5.233 5.364 5.486 5.603 5.726 5.839 5.954 6.087 6.225 6.347 6.489 6.613 6.72 6.831 6.928 7.01 7.097 7.167 7.166 7.113 6.951 6.65 6.061 4.951 3.604 2.342 1.211 0.26 -0.567 -1.278 -1.921 -2.49 -3.08 -3.582 -4.026 -4.465 -4.877 -5.245 -5.579 -5.925 -6.234 -6.506 -6.786 -7.073 -7.316 -7.574 -7.84 -8.047 -8.262 -8.474 -8.7 -8.953 -9.124 -9.296 -9.575 -9.772 -9.974 -10.079 -10.291 -10.518 -10.762 -10.887 -11.125 -11.341 -11.515 -11.687 -12.039 -12.236 -12.472 -12.752 -13.079 -13.453 -13.916 -15.07 -4 ,26939 ,KEBNE ,16674812,Tue Nov 23 19:53:25 CET,Tue Nov 23 21:45:58 CET,0.0 0.914 1.289 1.595 1.824 1.999 2.162 2.315 2.574 2.696 2.813 2.931 3.113 3.204 3.373 3.526 3.671 3.741 3.868 3.979 4.147 4.256 4.356 4.489 4.607 4.721 4.831 4.931 5.051 5.166 5.279 5.413 5.536 5.651 5.764 5.887 6.004 6.117 6.246 6.374 6.489 6.588 6.658 6.727 6.808 6.857 6.831 6.698 6.376 5.779 4.685 3.248 2.059 1.027 0.118 -0.676 -1.378 -2.022 -2.561 -3.1 -3.575 -3.995 -4.391 -4.764 -5.128 -5.466 -5.803 -6.105 -6.389 -6.692 -6.985 -7.216 -7.459 -7.719 -7.924 -8.139 -8.353 -8.574 -8.819 -8.985 -9.151 -9.415 -9.598 -9.788 -9.89 -10.099 -10.316 -10.558 -10.688 -10.91 -11.091 -11.244 -11.404 -11.764 -11.964 -12.185 -12.448 -12.741 -13.085 -13.555 -14.621 -5 ,19753 ,KEBNE ,16674813,Tue Nov 23 19:53:26 CET,Tue Nov 23 21:46:05 CET,0.0 0.884 1.236 1.472 1.672 1.859 2.036 2.194 2.471 2.598 2.717 2.853 3.043 3.144 3.317 3.478 3.63 3.696 3.825 3.949 4.118 4.226 4.327 4.465 4.602 4.732 4.853 4.958 5.094 5.226 5.334 5.455 5.57 5.67 5.774 5.879 5.986 6.109 6.225 6.328 6.436 6.558 6.658 6.721 6.765 6.77 6.724 6.613 6.365 5.858 4.831 3.404 2.184 1.177 0.315 -0.469 -1.147 -1.766 -2.328 -2.899 -3.394 -3.83 -4.238 -4.615 -4.969 -5.297 -5.641 -5.954 -6.224 -6.495 -6.772 -7.017 -7.27 -7.519 -7.718 -7.929 -8.146 -8.37 -8.606 -8.777 -8.96 -9.244 -9.443 -9.654 -9.762 -9.973 -10.194 -10.446 -10.576 -10.813 -11.019 -11.18 -11.356 -11.732 -11.94 -12.167 -12.423 -12.716 -13.054 -13.569 -14.837 -6 ,13350 ,KEBNE ,16677098,Wed Nov 24 16:54:28 CET,Wed Nov 24 18:48:07 CET,0.0 1.194 1.577 1.861 2.095 2.307 2.5 2.661 2.946 3.075 3.187 3.304 3.491 3.579 3.742 3.906 4.052 4.116 4.241 4.363 4.53 4.626 4.718 4.85 4.985 5.118 5.237 5.351 5.496 5.625 5.746 5.884 6.013 6.125 6.249 6.39 6.519 6.659 6.788 6.897 7.003 7.112 7.22 7.307 7.368 7.391 7.371 7.26 6.983 6.456 5.407 3.985 2.753 1.726 0.836 0.015 -0.697 -1.361 -1.938 -2.498 -2.984 -3.422 -3.843 -4.236 -4.591 -4.914 -5.26 -5.574 -5.837 -6.104 -6.379 -6.603 -6.838 -7.089 -7.286 -7.496 -7.712 -7.938 -8.184 -8.352 -8.524 -8.798 -8.999 -9.217 -9.333 -9.571 -9.805 -10.054 -10.191 -10.429 -10.62 -10.776 -10.946 -11.327 -11.54 -11.797 -12.067 -12.339 -12.695 -13.156 -14.339 -7 ,9981 ,KEBNE ,16674815,Tue Nov 23 19:53:26 CET,Tue Nov 23 21:46:46 CET,0.0 0.874 1.216 1.485 1.702 1.892 2.076 2.25 2.506 2.62 2.73 2.836 3.014 3.106 3.276 3.433 3.589 3.661 3.789 3.905 4.071 4.175 4.279 4.439 4.599 4.746 4.861 4.969 5.119 5.252 5.363 5.492 5.608 5.714 5.827 5.954 6.071 6.181 6.292 6.397 6.49 6.586 6.702 6.802 6.862 6.867 6.805 6.643 6.352 5.796 4.62 3.104 1.88 0.803 -0.139 -0.964 -1.676 -2.345 -2.934 -3.476 -3.939 -4.359 -4.75 -5.14 -5.509 -5.838 -6.18 -6.482 -6.737 -7.0 -7.281 -7.511 -7.743 -7.991 -8.188 -8.388 -8.591 -8.819 -9.064 -9.233 -9.412 -9.682 -9.866 -10.059 -10.16 -10.379 -10.609 -10.843 -10.974 -11.221 -11.447 -11.614 -11.783 -12.146 -12.347 -12.566 -12.797 -13.062 -13.395 -13.873 -15.15 -8 ,14201 ,KEBNE ,16674816,Tue Nov 23 19:54:27 CET,Tue Nov 23 21:50:31 CET,0.0 0.944 1.295 1.544 1.777 1.984 2.147 2.287 2.538 2.651 2.756 2.886 3.073 3.165 3.352 3.527 3.676 3.741 3.856 3.97 4.137 4.237 4.327 4.459 4.596 4.726 4.839 4.94 5.072 5.195 5.303 5.433 5.548 5.643 5.743 5.873 6.0 6.117 6.231 6.35 6.467 6.573 6.661 6.726 6.791 6.802 6.744 6.618 6.33 5.758 4.713 3.265 2.0 0.916 -0.033 -0.883 -1.611 -2.266 -2.822 -3.348 -3.795 -4.21 -4.622 -5.01 -5.364 -5.701 -6.059 -6.373 -6.649 -6.929 -7.215 -7.45 -7.7 -7.965 -8.171 -8.39 -8.61 -8.84 -9.096 -9.272 -9.453 -9.737 -9.926 -10.126 -10.237 -10.454 -10.679 -10.919 -11.05 -11.29 -11.499 -11.665 -11.84 -12.236 -12.454 -12.687 -12.946 -13.241 -13.561 -13.952 -15.055 -9 ,10353 ,KEBNE ,16674817,Tue Nov 23 19:54:27 CET,Tue Nov 23 21:46:59 CET,0.0 0.758 1.137 1.386 1.586 1.759 1.916 2.059 2.304 2.416 2.525 2.646 2.825 2.92 3.091 3.235 3.37 3.433 3.548 3.66 3.821 3.92 4.018 4.165 4.302 4.428 4.543 4.648 4.78 4.908 5.03 5.156 5.265 5.374 5.503 5.638 5.751 5.868 5.968 6.068 6.178 6.28 6.381 6.45 6.473 6.45 6.384 6.261 5.999 5.503 4.486 3.046 1.792 0.735 -0.161 -0.984 -1.711 -2.332 -2.868 -3.409 -3.873 -4.287 -4.686 -5.071 -5.436 -5.769 -6.11 -6.424 -6.713 -7.017 -7.325 -7.574 -7.828 -8.091 -8.304 -8.527 -8.753 -8.987 -9.225 -9.387 -9.556 -9.829 -10.022 -10.229 -10.337 -10.555 -10.79 -11.057 -11.193 -11.428 -11.612 -11.768 -11.937 -12.296 -12.489 -12.711 -12.964 -13.253 -13.6 -14.055 -15.208 -10 ,26869 ,KEBNE ,16677102,Wed Nov 24 16:55:29 CET,Wed Nov 24 18:49:08 CET,0.0 0.867 1.224 1.51 1.728 1.91 2.081 2.24 2.512 2.627 2.736 2.853 3.036 3.127 3.297 3.454 3.606 3.677 3.803 3.919 4.078 4.177 4.279 4.427 4.567 4.689 4.791 4.89 5.032 5.156 5.265 5.397 5.521 5.632 5.762 5.911 6.039 6.18 6.308 6.413 6.523 6.63 6.751 6.861 6.932 6.971 6.961 6.842 6.576 6.03 4.972 3.554 2.292 1.181 0.215 -0.63 -1.356 -1.997 -2.559 -3.123 -3.606 -4.041 -4.469 -4.889 -5.263 -5.592 -5.951 -6.27 -6.538 -6.814 -7.107 -7.348 -7.599 -7.871 -8.078 -8.29 -8.512 -8.752 -9.001 -9.167 -9.339 -9.616 -9.815 -10.028 -10.142 -10.373 -10.6 -10.848 -10.992 -11.234 -11.42 -11.578 -11.757 -12.162 -12.378 -12.602 -12.858 -13.16 -13.513 -13.966 -15.472 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_62.txt deleted file mode 100644 index 75aae747..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_62.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21458 ,KEBNE ,16677103,Wed Nov 24 16:55:30 CET,Wed Nov 24 18:49:01 CET,0.0 0.917 1.275 1.563 1.804 2.006 2.178 2.328 2.608 2.732 2.842 2.979 3.173 3.273 3.474 3.66 3.839 3.923 4.08 4.228 4.433 4.562 4.68 4.852 5.013 5.159 5.299 5.436 5.605 5.773 5.935 6.126 6.315 6.491 6.691 6.911 7.117 7.353 7.6 7.834 8.089 8.387 8.703 8.996 9.32 9.653 10.011 10.385 10.749 11.011 11.072 10.855 10.447 9.934 9.393 8.868 8.384 7.915 7.473 7.03 6.659 6.333 6.01 5.681 5.378 5.099 4.805 4.53 4.286 4.033 3.768 3.536 3.293 3.044 2.852 2.645 2.423 2.201 1.968 1.804 1.628 1.351 1.157 0.952 0.842 0.611 0.366 0.096 -0.05 -0.285 -0.5 -0.663 -0.843 -1.236 -1.444 -1.676 -1.947 -2.245 -2.591 -3.114 -4.808 -3 ,31718 ,KEBNE ,16677105,Wed Nov 24 16:55:29 CET,Wed Nov 24 18:48:42 CET,0.0 0.87 1.179 1.422 1.635 1.831 2.012 2.174 2.463 2.597 2.716 2.838 3.025 3.127 3.32 3.493 3.659 3.745 3.91 4.057 4.254 4.388 4.515 4.669 4.819 4.967 5.114 5.258 5.435 5.6 5.756 5.941 6.117 6.283 6.471 6.671 6.859 7.068 7.295 7.546 7.793 8.057 8.352 8.619 8.912 9.238 9.586 9.903 10.191 10.387 10.308 9.836 9.27 8.642 8.063 7.515 6.99 6.511 6.092 5.649 5.23 4.842 4.467 4.097 3.752 3.44 3.104 2.818 2.573 2.307 2.02 1.773 1.521 1.259 1.049 0.833 0.607 0.374 0.127 -0.052 -0.249 -0.567 -0.771 -0.979 -1.1 -1.355 -1.618 -1.895 -2.042 -2.286 -2.516 -2.696 -2.885 -3.31 -3.55 -3.809 -4.122 -4.474 -4.852 -5.345 -7.131 -4 ,31405 ,KEBNE ,16677106,Wed Nov 24 16:56:32 CET,Wed Nov 24 18:51:44 CET,0.0 0.968 1.335 1.62 1.849 2.047 2.224 2.384 2.685 2.834 2.972 3.134 3.328 3.429 3.632 3.819 3.993 4.071 4.217 4.356 4.551 4.673 4.784 4.942 5.099 5.25 5.393 5.536 5.723 5.895 6.057 6.265 6.459 6.624 6.801 7.0 7.199 7.42 7.652 7.881 8.116 8.361 8.63 8.9 9.207 9.523 9.84 10.141 10.422 10.603 10.529 10.05 9.349 8.643 7.992 7.396 6.849 6.292 5.827 5.378 4.976 4.62 4.273 3.948 3.638 3.338 3.014 2.722 2.472 2.199 1.902 1.668 1.425 1.149 0.938 0.721 0.5 0.271 0.02 -0.151 -0.328 -0.623 -0.836 -1.059 -1.172 -1.411 -1.666 -1.948 -2.097 -2.343 -2.592 -2.783 -2.994 -3.421 -3.651 -3.927 -4.234 -4.588 -5.018 -5.605 -7.249 -5 ,6587 ,KEBNE ,16677107,Wed Nov 24 16:56:32 CET,Wed Nov 24 18:50:40 CET,0.0 0.797 1.127 1.377 1.589 1.769 1.947 2.115 2.425 2.562 2.681 2.819 3.006 3.097 3.277 3.445 3.602 3.678 3.831 3.98 4.187 4.318 4.44 4.618 4.792 4.961 5.128 5.272 5.453 5.625 5.783 5.975 6.158 6.33 6.529 6.745 6.946 7.159 7.396 7.649 7.895 8.168 8.471 8.759 9.072 9.361 9.635 9.905 10.14 10.291 10.212 9.666 9.043 8.404 7.81 7.263 6.751 6.281 5.844 5.384 5.0 4.659 4.319 3.98 3.658 3.366 3.052 2.749 2.49 2.222 1.95 1.732 1.497 1.24 1.037 0.816 0.582 0.358 0.119 -0.063 -0.24 -0.499 -0.688 -0.889 -0.992 -1.208 -1.45 -1.716 -1.854 -2.089 -2.292 -2.45 -2.634 -3.049 -3.277 -3.53 -3.824 -4.161 -4.573 -5.111 -6.339 -6 ,27524 ,KEBNE ,16677108,Wed Nov 24 16:56:32 CET,Wed Nov 24 18:49:59 CET,0.0 0.605 0.932 1.179 1.39 1.586 1.767 1.937 2.232 2.357 2.485 2.652 2.852 2.952 3.137 3.315 3.486 3.57 3.731 3.879 4.093 4.227 4.347 4.507 4.664 4.819 4.97 5.117 5.296 5.461 5.624 5.818 5.995 6.177 6.391 6.61 6.814 7.039 7.281 7.527 7.775 8.071 8.384 8.651 8.957 9.297 9.677 10.023 10.363 10.649 10.709 10.333 9.755 9.175 8.642 8.137 7.638 7.138 6.701 6.275 5.891 5.525 5.16 4.791 4.458 4.161 3.84 3.57 3.344 3.096 2.829 2.607 2.379 2.124 1.918 1.722 1.509 1.277 1.041 0.873 0.692 0.393 0.189 -0.02 -0.132 -0.368 -0.619 -0.894 -1.043 -1.288 -1.539 -1.726 -1.909 -2.305 -2.542 -2.792 -3.075 -3.405 -3.814 -4.368 -6.083 -7 ,1227 ,KEBNE ,16677109,Wed Nov 24 16:56:32 CET,Wed Nov 24 18:50:02 CET,0.0 0.876 1.237 1.488 1.697 1.896 2.083 2.25 2.536 2.664 2.786 2.914 3.105 3.204 3.381 3.56 3.728 3.804 3.957 4.109 4.335 4.469 4.598 4.784 4.944 5.092 5.237 5.375 5.556 5.728 5.901 6.112 6.297 6.471 6.667 6.882 7.081 7.292 7.513 7.737 7.963 8.211 8.482 8.729 9.037 9.389 9.716 10.014 10.3 10.532 10.492 9.965 9.351 8.764 8.195 7.62 7.083 6.577 6.135 5.698 5.328 4.991 4.659 4.342 4.05 3.784 3.5 3.237 2.997 2.739 2.47 2.244 2.01 1.769 1.574 1.362 1.147 0.917 0.647 0.462 0.268 -0.044 -0.257 -0.48 -0.597 -0.834 -1.094 -1.391 -1.545 -1.786 -2.035 -2.215 -2.409 -2.814 -3.031 -3.286 -3.567 -3.879 -4.242 -4.754 -6.353 -8 ,11096 ,KEBNE ,16677110,Wed Nov 24 16:56:32 CET,Wed Nov 24 18:50:21 CET,0.0 0.884 1.224 1.511 1.765 1.946 2.103 2.26 2.567 2.697 2.815 2.955 3.139 3.234 3.41 3.585 3.746 3.823 3.984 4.124 4.313 4.436 4.559 4.742 4.914 5.084 5.233 5.364 5.535 5.703 5.858 6.04 6.22 6.394 6.586 6.794 6.992 7.195 7.406 7.632 7.865 8.132 8.426 8.692 9.01 9.338 9.673 10.037 10.352 10.52 10.439 9.976 9.37 8.712 8.073 7.474 6.953 6.492 6.037 5.533 5.087 4.693 4.326 3.969 3.638 3.331 2.995 2.69 2.452 2.215 1.962 1.751 1.534 1.303 1.11 0.915 0.714 0.477 0.223 0.059 -0.12 -0.396 -0.586 -0.798 -0.905 -1.149 -1.427 -1.714 -1.871 -2.132 -2.414 -2.608 -2.803 -3.24 -3.505 -3.788 -4.097 -4.463 -4.893 -5.462 -7.611 -9 ,20654 ,KEBNE ,16677111,Wed Nov 24 16:57:37 CET,Wed Nov 24 18:52:31 CET,0.0 0.905 1.303 1.601 1.849 2.066 2.266 2.442 2.747 2.882 3.008 3.169 3.372 3.481 3.678 3.853 4.025 4.115 4.288 4.441 4.657 4.8 4.938 5.137 5.323 5.497 5.663 5.816 6.006 6.197 6.391 6.62 6.825 7.011 7.221 7.458 7.684 7.929 8.175 8.433 8.712 9.017 9.351 9.664 10.001 10.345 10.73 11.147 11.576 11.934 12.096 11.819 11.301 10.721 10.177 9.621 9.11 8.647 8.211 7.755 7.368 7.018 6.684 6.372 6.088 5.818 5.517 5.25 5.023 4.778 4.507 4.277 4.034 3.781 3.581 3.373 3.149 2.91 2.664 2.495 2.317 2.039 1.849 1.638 1.524 1.292 1.05 0.779 0.636 0.403 0.164 -0.006 -0.181 -0.609 -0.856 -1.119 -1.414 -1.746 -2.151 -2.72 -4.751 -10 ,3236 ,KEBNE ,16677112,Wed Nov 24 16:57:35 CET,Wed Nov 24 18:57:14 CET,0.0 0.798 1.143 1.412 1.645 1.832 2.007 2.167 2.442 2.585 2.728 2.88 3.072 3.176 3.385 3.588 3.771 3.852 4.011 4.162 4.369 4.495 4.621 4.801 4.961 5.119 5.272 5.421 5.612 5.793 5.961 6.153 6.335 6.511 6.711 6.938 7.16 7.387 7.611 7.845 8.102 8.374 8.661 8.958 9.296 9.619 9.937 10.23 10.564 10.858 10.847 10.496 10.014 9.465 8.842 8.243 7.761 7.335 6.9 6.406 6.0 5.645 5.277 4.924 4.6 4.307 3.986 3.683 3.422 3.154 2.881 2.655 2.417 2.162 1.958 1.74 1.518 1.294 1.07 0.91 0.73 0.446 0.248 0.042 -0.068 -0.3 -0.544 -0.803 -0.938 -1.164 -1.375 -1.54 -1.714 -2.113 -2.347 -2.591 -2.852 -3.167 -3.562 -4.039 -5.623 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_58.txt deleted file mode 100644 index 6e7f7f7c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8270 ,KEBNE ,16677113,Wed Nov 24 16:58:36 CET,Wed Nov 24 18:54:54 CET,0.0 1.254 1.687 2.04 2.323 2.561 2.769 2.955 3.298 3.45 3.585 3.73 3.952 4.067 4.281 4.473 4.663 4.76 4.949 5.121 5.361 5.515 5.662 5.866 6.06 6.255 6.435 6.598 6.809 7.003 7.195 7.428 7.643 7.859 8.099 8.346 8.592 8.862 9.15 9.472 9.827 10.229 10.663 11.067 11.533 12.038 12.61 13.227 13.904 14.659 15.467 15.825 15.732 15.499 15.205 14.866 14.521 14.165 13.842 13.484 13.149 12.854 12.567 12.277 11.999 11.731 11.443 11.18 10.941 10.68 10.376 10.118 9.869 9.618 9.408 9.183 8.958 8.714 8.451 8.275 8.094 7.8 7.583 7.344 7.221 6.986 6.741 6.458 6.304 6.044 5.775 5.582 5.377 4.923 4.676 4.402 4.102 3.722 3.204 2.413 -3.374 -2 ,15783 ,KEBNE ,16677114,Wed Nov 24 16:59:38 CET,Wed Nov 24 18:51:50 CET,0.0 1.199 1.649 2.041 2.385 2.677 2.943 3.167 3.497 3.635 3.765 3.913 4.137 4.248 4.47 4.684 4.878 4.97 5.151 5.319 5.543 5.684 5.821 6.021 6.207 6.39 6.573 6.744 6.956 7.157 7.349 7.588 7.816 8.026 8.28 8.564 8.819 9.096 9.384 9.678 9.987 10.345 10.765 11.156 11.603 12.113 12.659 13.253 13.908 14.566 15.216 15.457 15.368 15.172 14.935 14.633 14.324 14.026 13.739 13.44 13.162 12.883 12.587 12.282 12.001 11.748 11.471 11.21 10.981 10.753 10.531 10.341 10.118 9.895 9.716 9.501 9.277 9.054 8.819 8.656 8.484 8.187 7.975 7.757 7.645 7.419 7.161 6.882 6.736 6.481 6.233 6.045 5.843 5.397 5.111 4.744 4.327 3.837 3.214 2.373 -0.479 -3 ,30881 ,KEBNE ,16677115,Wed Nov 24 16:58:37 CET,Wed Nov 24 18:52:34 CET,0.0 2.206 2.811 3.202 3.442 3.649 3.845 4.015 4.323 4.476 4.617 4.773 4.988 5.102 5.327 5.526 5.711 5.792 5.948 6.102 6.32 6.455 6.58 6.762 6.941 7.119 7.285 7.447 7.659 7.862 8.052 8.277 8.499 8.709 8.945 9.22 9.483 9.747 10.011 10.303 10.63 10.99 11.382 11.767 12.213 12.725 13.323 13.92 14.536 15.229 15.97 16.442 16.495 16.342 16.165 15.939 15.688 15.455 15.195 14.848 14.529 14.25 13.974 13.696 13.451 13.222 12.965 12.724 12.502 12.263 12.016 11.801 11.557 11.293 11.098 10.913 10.706 10.472 10.227 10.057 9.872 9.58 9.381 9.154 9.032 8.777 8.508 8.223 8.072 7.822 7.591 7.41 7.216 6.786 6.528 6.221 5.877 5.508 5.055 4.416 2.293 -4 ,4732 ,KEBNE ,16677116,Wed Nov 24 16:58:37 CET,Wed Nov 24 19:00:00 CET,0.0 1.363 1.833 2.197 2.484 2.717 2.932 3.113 3.441 3.583 3.713 3.865 4.097 4.221 4.445 4.648 4.827 4.91 5.073 5.229 5.45 5.59 5.733 5.941 6.13 6.313 6.48 6.639 6.854 7.057 7.244 7.464 7.674 7.88 8.127 8.404 8.65 8.923 9.22 9.508 9.809 10.15 10.538 10.938 11.398 11.879 12.413 12.999 13.639 14.321 15.089 15.499 15.495 15.383 15.217 14.961 14.676 14.355 14.047 13.726 13.435 13.174 12.896 12.635 12.4 12.163 11.894 11.648 11.432 11.201 10.97 10.779 10.562 10.327 10.13 9.92 9.701 9.464 9.213 9.034 8.846 8.539 8.321 8.098 7.986 7.762 7.487 7.166 7.0 6.732 6.485 6.286 6.072 5.631 5.37 5.067 4.734 4.344 3.871 3.196 1.037 -5 ,32745 ,KEBNE ,16677117,Wed Nov 24 16:58:37 CET,Wed Nov 24 18:54:39 CET,0.0 1.197 1.667 2.001 2.262 2.5 2.713 2.897 3.207 3.339 3.469 3.614 3.836 3.946 4.157 4.358 4.541 4.628 4.797 4.962 5.199 5.345 5.487 5.691 5.869 6.028 6.187 6.349 6.569 6.786 6.979 7.21 7.44 7.644 7.873 8.126 8.375 8.654 8.953 9.261 9.586 9.95 10.34 10.733 11.194 11.686 12.23 12.824 13.489 14.196 14.906 15.246 15.243 15.091 14.875 14.603 14.322 14.018 13.718 13.415 13.141 12.867 12.582 12.313 12.053 11.799 11.531 11.294 11.092 10.874 10.634 10.426 10.208 9.99 9.809 9.596 9.377 9.149 8.902 8.726 8.516 8.175 7.958 7.724 7.6 7.334 7.036 6.71 6.548 6.296 6.054 5.872 5.673 5.206 4.927 4.629 4.293 3.89 3.405 2.762 0.279 -6 ,28594 ,KEBNE ,16677118,Wed Nov 24 16:58:37 CET,Wed Nov 24 18:54:25 CET,0.0 1.297 1.736 2.017 2.273 2.512 2.727 2.904 3.206 3.351 3.478 3.602 3.813 3.916 4.116 4.317 4.503 4.587 4.747 4.905 5.145 5.288 5.414 5.596 5.777 5.957 6.126 6.295 6.507 6.702 6.891 7.119 7.331 7.535 7.776 8.034 8.285 8.568 8.864 9.167 9.46 9.789 10.206 10.611 11.057 11.547 12.097 12.661 13.276 13.97 14.631 14.885 14.802 14.601 14.397 14.136 13.8 13.477 13.202 12.874 12.535 12.243 11.976 11.701 11.411 11.122 10.833 10.577 10.342 10.09 9.826 9.578 9.269 8.942 8.669 8.377 8.077 7.734 7.376 7.144 6.921 6.57 6.348 6.135 6.012 5.74 5.466 5.171 5.011 4.75 4.49 4.297 4.092 3.639 3.381 3.079 2.734 2.321 1.811 1.12 -1.411 -7 ,23194 ,KEBNE ,16677119,Wed Nov 24 16:59:38 CET,Wed Nov 24 18:52:48 CET,0.0 1.299 1.792 2.181 2.474 2.696 2.917 3.123 3.475 3.641 3.802 3.992 4.236 4.369 4.614 4.852 5.072 5.174 5.369 5.568 5.858 6.04 6.211 6.452 6.694 6.931 7.138 7.317 7.546 7.771 7.981 8.229 8.496 8.777 9.1 9.415 9.678 9.975 10.299 10.629 10.975 11.371 11.824 12.271 12.786 13.33 13.926 14.568 15.247 15.9 16.438 16.592 16.467 16.255 15.963 15.592 15.217 14.825 14.434 14.014 13.649 13.318 12.984 12.664 12.351 12.044 11.72 11.416 11.135 10.86 10.576 10.328 10.065 9.785 9.564 9.314 9.045 8.759 8.466 8.27 8.069 7.768 7.557 7.319 7.182 6.899 6.61 6.288 6.11 5.83 5.534 5.314 5.081 4.589 4.312 3.991 3.641 3.277 2.774 2.048 -0.267 -8 ,7808 ,KEBNE ,16677120,Wed Nov 24 16:59:38 CET,Wed Nov 24 19:01:04 CET,0.0 2.189 2.761 3.171 3.517 3.812 4.07 4.304 4.733 4.931 5.119 5.335 5.566 5.676 5.878 6.078 6.271 6.36 6.542 6.714 6.94 7.08 7.216 7.425 7.611 7.786 7.96 8.124 8.333 8.53 8.717 8.941 9.146 9.34 9.574 9.835 10.086 10.345 10.634 10.968 11.304 11.656 12.042 12.426 12.869 13.331 13.832 14.394 15.023 15.683 16.364 16.717 16.655 16.466 16.266 16.026 15.775 15.527 15.276 15.011 14.785 14.536 14.266 14.001 13.726 13.457 13.174 12.906 12.672 12.44 12.185 11.961 11.724 11.473 11.275 11.069 10.864 10.638 10.37 10.17 9.974 9.677 9.472 9.271 9.161 8.933 8.691 8.411 8.26 8.009 7.758 7.559 7.354 6.902 6.635 6.343 6.026 5.636 5.128 4.481 1.927 -9 ,25932 ,KEBNE ,16677121,Wed Nov 24 16:59:38 CET,Wed Nov 24 18:53:15 CET,0.0 2.275 2.849 3.3 3.669 3.971 4.217 4.453 4.896 5.093 5.278 5.516 5.787 5.941 6.227 6.494 6.741 6.858 7.071 7.267 7.516 7.649 7.782 7.982 8.17 8.36 8.54 8.707 8.922 9.123 9.311 9.535 9.752 9.965 10.213 10.48 10.738 11.022 11.32 11.627 11.94 12.305 12.72 13.13 13.606 14.097 14.62 15.22 15.923 16.671 17.26 17.239 16.854 16.52 16.269 15.971 15.669 15.387 15.12 14.811 14.534 14.277 13.998 13.722 13.469 13.229 12.957 12.697 12.486 12.277 12.027 11.808 11.591 11.373 11.197 10.991 10.777 10.571 10.343 10.18 10.012 9.729 9.518 9.299 9.182 8.94 8.703 8.451 8.307 8.049 7.809 7.621 7.415 6.968 6.711 6.415 6.095 5.722 5.262 4.637 2.087 -10 ,29384 ,KEBNE ,16677122,Wed Nov 24 17:00:40 CET,Wed Nov 24 18:54:35 CET,0.0 1.187 1.621 1.974 2.274 2.534 2.765 2.964 3.303 3.45 3.59 3.772 4.014 4.141 4.381 4.587 4.778 4.878 5.078 5.267 5.539 5.715 5.874 6.091 6.3 6.493 6.678 6.862 7.101 7.332 7.55 7.802 8.042 8.278 8.548 8.85 9.127 9.42 9.725 10.051 10.399 10.787 11.255 11.728 12.24 12.767 13.346 14.006 14.738 15.469 16.185 16.518 16.452 16.259 16.02 15.762 15.481 15.177 14.874 14.537 14.229 13.937 13.625 13.298 13.016 12.769 12.466 12.19 11.967 11.732 11.494 11.285 11.043 10.786 10.589 10.384 10.163 9.931 9.687 9.505 9.311 9.008 8.786 8.542 8.423 8.174 7.898 7.592 7.423 7.156 6.902 6.693 6.463 5.969 5.681 5.367 5.023 4.631 4.116 3.322 1.012 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_59.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_59.txt deleted file mode 100644 index 69bff5c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_59.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31457 ,KEBNE ,16677123,Wed Nov 24 17:00:40 CET,Wed Nov 24 18:53:00 CET,0.0 1.132 1.6 1.953 2.234 2.495 2.738 2.968 3.405 3.601 3.787 4.023 4.275 4.429 4.731 5.02 5.296 5.434 5.693 5.925 6.253 6.448 6.641 6.938 7.225 7.503 7.766 8.027 8.374 8.707 9.02 9.402 9.771 10.127 10.544 11.002 11.447 11.946 12.472 13.052 13.687 14.355 15.037 15.706 16.51 17.39 18.422 19.59 20.946 22.547 24.43 25.832 26.502 26.811 26.915 26.937 26.906 26.821 26.735 26.646 26.5 26.326 26.159 26.0 25.829 25.641 25.444 25.247 25.078 24.895 24.667 24.469 24.245 23.991 23.797 23.593 23.358 23.118 22.869 22.707 22.562 22.323 22.118 21.9 21.802 21.59 21.358 21.11 20.974 20.748 20.528 20.352 20.161 19.722 19.482 19.229 18.93 18.576 18.149 17.54 15.351 -2 ,8184 ,KEBNE ,16677124,Wed Nov 24 17:00:40 CET,Wed Nov 24 18:52:59 CET,0.0 2.374 3.019 3.464 3.814 4.116 4.387 4.64 5.102 5.313 5.498 5.723 5.982 6.118 6.367 6.601 6.821 6.927 7.136 7.345 7.649 7.84 8.017 8.278 8.521 8.751 8.982 9.205 9.486 9.754 10.026 10.353 10.664 10.955 11.283 11.666 12.039 12.426 12.821 13.254 13.706 14.209 14.819 15.463 16.201 17.05 18.076 19.184 20.491 22.028 23.867 25.354 26.132 26.569 26.814 26.983 27.052 27.021 26.956 26.844 26.724 26.586 26.431 26.282 26.134 25.99 25.819 25.675 25.556 25.414 25.25 25.105 24.947 24.779 24.638 24.489 24.337 24.171 23.987 23.856 23.719 23.485 23.316 23.153 23.07 22.9 22.707 22.467 22.317 22.064 21.767 21.552 21.333 20.859 20.588 20.29 19.944 19.543 19.073 18.334 15.73 -3 ,18527 ,KEBNE ,16677125,Wed Nov 24 17:01:42 CET,Wed Nov 24 18:57:25 CET,0.0 1.217 1.724 2.079 2.376 2.629 2.845 3.045 3.398 3.547 3.69 3.88 4.119 4.252 4.507 4.745 4.963 5.068 5.273 5.468 5.748 5.93 6.103 6.354 6.585 6.811 7.04 7.253 7.529 7.8 8.068 8.393 8.691 8.975 9.315 9.717 10.108 10.527 10.973 11.446 11.944 12.515 13.195 13.863 14.625 15.466 16.441 17.569 18.925 20.549 22.478 23.888 24.616 25.055 25.296 25.416 25.445 25.418 25.352 25.213 25.039 24.879 24.725 24.569 24.423 24.277 24.112 23.95 23.803 23.659 23.489 23.338 23.172 22.988 22.843 22.687 22.526 22.362 22.184 22.055 21.918 21.692 21.53 21.337 21.236 21.015 20.762 20.514 20.383 20.17 19.96 19.789 19.61 19.206 18.962 18.699 18.379 17.968 17.452 16.648 12.854 -4 ,17974 ,KEBNE ,16677126,Wed Nov 24 17:03:47 CET,Wed Nov 24 18:56:51 CET,0.0 1.422 1.939 2.312 2.62 2.873 3.111 3.327 3.724 3.897 4.056 4.258 4.508 4.647 4.897 5.143 5.388 5.499 5.704 5.912 6.214 6.401 6.586 6.849 7.102 7.341 7.567 7.788 8.083 8.37 8.64 8.961 9.261 9.538 9.853 10.239 10.614 10.998 11.41 11.841 12.303 12.828 13.45 14.076 14.804 15.61 16.543 17.639 18.897 20.392 22.228 23.68 24.52 24.995 25.203 25.281 25.288 25.238 25.159 25.056 24.973 24.875 24.738 24.608 24.463 24.282 24.087 23.94 23.802 23.639 23.467 23.322 23.141 22.897 22.676 22.44 22.184 21.927 21.69 21.512 21.309 20.977 20.737 20.512 20.409 20.189 19.961 19.722 19.583 19.352 19.125 18.958 18.775 18.304 18.032 17.713 17.329 16.861 16.206 15.303 11.746 -5 ,20172 ,KEBNE ,16677127,Wed Nov 24 17:03:48 CET,Wed Nov 24 18:59:12 CET,0.0 1.114 1.538 1.881 2.188 2.444 2.661 2.856 3.22 3.383 3.539 3.747 3.992 4.122 4.374 4.619 4.849 4.957 5.174 5.388 5.688 5.876 6.054 6.317 6.564 6.798 7.026 7.242 7.528 7.794 8.039 8.351 8.669 8.973 9.309 9.689 10.062 10.474 10.931 11.424 11.943 12.515 13.187 13.872 14.676 15.568 16.586 17.729 19.085 20.703 22.539 23.944 24.757 25.26 25.54 25.693 25.753 25.751 25.685 25.542 25.402 25.287 25.18 25.053 24.909 24.758 24.589 24.442 24.301 24.14 23.962 23.817 23.665 23.499 23.361 23.201 23.022 22.835 22.635 22.5 22.35 22.099 21.932 21.759 21.668 21.464 21.224 20.977 20.868 20.67 20.474 20.324 20.165 19.781 19.552 19.3 19.032 18.701 18.286 17.687 15.093 -6 ,32699 ,KEBNE ,16677128,Wed Nov 24 17:09:57 CET,Wed Nov 24 19:02:44 CET,0.0 1.156 1.641 2.045 2.385 2.635 2.86 3.079 3.476 3.651 3.817 4.02 4.259 4.391 4.645 4.891 5.131 5.243 5.457 5.666 5.965 6.151 6.33 6.58 6.82 7.063 7.29 7.506 7.795 8.074 8.337 8.649 8.944 9.232 9.562 9.927 10.282 10.674 11.092 11.549 12.036 12.571 13.189 13.833 14.592 15.434 16.407 17.549 18.914 20.509 22.379 23.868 24.721 25.179 25.413 25.555 25.62 25.606 25.577 25.528 25.433 25.307 25.173 25.04 24.894 24.741 24.578 24.429 24.273 24.099 23.911 23.751 23.578 23.392 23.254 23.111 22.956 22.796 22.607 22.473 22.345 22.126 21.957 21.764 21.666 21.445 21.197 20.947 20.799 20.542 20.259 20.064 19.855 19.376 19.106 18.797 18.441 18.025 17.509 16.645 13.814 -7 ,1207 ,KEBNE ,16677129,Wed Nov 24 17:03:48 CET,Wed Nov 24 18:57:59 CET,0.0 1.249 1.697 2.039 2.333 2.59 2.824 3.047 3.428 3.592 3.753 3.958 4.206 4.345 4.602 4.866 5.12 5.235 5.473 5.686 5.97 6.157 6.34 6.595 6.843 7.074 7.295 7.52 7.805 8.073 8.329 8.639 8.931 9.217 9.547 9.892 10.218 10.587 11.003 11.433 11.891 12.412 13.02 13.648 14.364 15.174 16.125 17.206 18.484 20.031 21.913 23.362 24.142 24.611 24.888 25.025 25.083 25.061 24.974 24.882 24.794 24.667 24.502 24.333 24.182 24.048 23.898 23.747 23.604 23.46 23.304 23.155 22.997 22.829 22.694 22.562 22.411 22.234 22.001 21.836 21.679 21.426 21.254 21.078 20.983 20.766 20.531 20.251 20.098 19.857 19.618 19.448 19.26 18.807 18.554 18.284 17.938 17.482 16.936 16.15 12.874 -8 ,26728 ,KEBNE ,16677130,Wed Nov 24 17:03:49 CET,Wed Nov 24 18:55:05 CET,0.0 2.548 3.118 3.511 3.796 4.054 4.296 4.507 4.888 5.067 5.229 5.416 5.659 5.787 6.023 6.25 6.472 6.578 6.781 6.978 7.255 7.427 7.596 7.851 8.1 8.333 8.551 8.773 9.049 9.304 9.557 9.872 10.176 10.467 10.807 11.178 11.52 11.901 12.344 12.823 13.309 13.86 14.488 15.103 15.823 16.654 17.669 18.829 20.179 21.76 23.676 25.212 26.077 26.582 26.856 27.02 27.095 27.099 27.067 26.982 26.876 26.769 26.635 26.484 26.344 26.199 26.02 25.85 25.703 25.546 25.385 25.255 25.098 24.906 24.752 24.59 24.407 24.221 24.028 23.883 23.729 23.485 23.298 23.113 23.021 22.836 22.652 22.412 22.267 22.034 21.825 21.665 21.485 21.113 20.893 20.609 20.276 19.865 19.352 18.639 16.364 -9 ,18118 ,KEBNE ,16677131,Wed Nov 24 17:10:59 CET,Wed Nov 24 19:03:34 CET,0.0 1.069 1.596 1.978 2.288 2.546 2.774 2.98 3.357 3.53 3.698 3.913 4.156 4.298 4.566 4.816 5.038 5.145 5.354 5.552 5.85 6.039 6.216 6.48 6.732 6.961 7.19 7.411 7.687 7.961 8.227 8.535 8.818 9.098 9.426 9.795 10.154 10.55 10.982 11.428 11.885 12.415 13.047 13.688 14.44 15.28 16.276 17.411 18.701 20.21 22.058 23.536 24.335 24.741 24.912 24.957 24.948 24.904 24.846 24.737 24.574 24.425 24.279 24.117 23.94 23.759 23.578 23.393 23.205 23.018 22.817 22.65 22.485 22.304 22.156 22.004 21.843 21.664 21.472 21.341 21.185 20.891 20.704 20.531 20.437 20.23 20.008 19.779 19.659 19.448 19.247 19.071 18.87 18.387 18.109 17.824 17.52 17.157 16.696 15.993 13.778 -10 ,5255 ,KEBNE ,16677132,Wed Nov 24 17:10:59 CET,Wed Nov 24 19:02:57 CET,0.0 2.251 2.889 3.354 3.746 4.083 4.386 4.665 5.17 5.388 5.586 5.852 6.104 6.237 6.497 6.737 6.962 7.069 7.275 7.468 7.752 7.94 8.126 8.398 8.643 8.877 9.116 9.339 9.615 9.886 10.145 10.467 10.782 11.078 11.413 11.788 12.142 12.538 12.964 13.421 13.924 14.494 15.143 15.795 16.565 17.394 18.369 19.51 20.814 22.386 24.327 25.829 26.662 27.2 27.504 27.663 27.73 27.733 27.705 27.64 27.551 27.439 27.317 27.181 27.025 26.851 26.66 26.491 26.332 26.172 26.015 25.878 25.715 25.528 25.38 25.231 25.077 24.895 24.7 24.561 24.407 24.175 24.017 23.842 23.746 23.549 23.336 23.113 22.992 22.778 22.549 22.377 22.201 21.737 21.495 21.256 20.953 20.618 20.225 19.664 17.449 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_33.txt deleted file mode 100644 index 0645f064..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_33.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7771 ,KEBNE ,17023839,Wed Dec 22 08:33:28 CET,Wed Dec 22 10:27:10 CET,0.0 2.618 3.229 3.695 4.051 4.35 4.629 4.884 5.347 5.568 5.78 6.068 6.335 6.501 6.804 7.085 7.355 7.485 7.739 7.978 8.312 8.524 8.723 9.002 9.268 9.519 9.766 10.014 10.326 10.616 10.898 11.237 11.57 11.902 12.281 12.695 13.09 13.525 14.01 14.558 15.156 15.83 16.609 17.349 18.17 19.111 20.247 21.535 23.008 24.844 27.113 28.813 29.671 30.126 30.367 30.476 30.52 30.495 30.38 30.216 30.087 29.938 29.772 29.633 29.504 29.375 29.228 29.092 28.972 28.831 28.67 28.513 28.337 28.167 28.042 27.902 27.742 27.584 27.401 27.252 27.103 26.865 26.694 26.525 26.443 26.238 25.999 25.759 25.626 25.417 25.153 24.982 24.818 24.434 24.214 23.974 23.701 23.407 23.034 22.495 20.527 -2 ,30688 ,KEBNE ,17023840,Wed Dec 22 08:34:31 CET,Wed Dec 22 10:27:30 CET,0.0 2.315 2.869 3.283 3.632 3.928 4.201 4.439 4.839 5.032 5.222 5.482 5.73 5.881 6.187 6.483 6.76 6.891 7.14 7.379 7.729 7.959 8.194 8.532 8.844 9.135 9.397 9.652 9.977 10.286 10.605 10.994 11.366 11.722 12.117 12.558 12.973 13.424 13.95 14.518 15.086 15.751 16.552 17.339 18.236 19.216 20.336 21.573 23.084 24.978 27.19 28.825 29.724 30.243 30.488 30.57 30.582 30.524 30.424 30.324 30.218 30.085 29.935 29.798 29.665 29.54 29.412 29.269 29.122 28.969 28.794 28.632 28.459 28.276 28.135 27.963 27.787 27.613 27.413 27.267 27.107 26.856 26.677 26.493 26.393 26.183 25.967 25.711 25.571 25.381 25.184 25.019 24.835 24.474 24.257 24.002 23.723 23.378 22.939 22.338 20.258 -4 ,25554 ,KEBNE ,17023842,Wed Dec 22 08:34:31 CET,Wed Dec 22 10:26:57 CET,0.0 2.346 2.924 3.361 3.728 4.031 4.302 4.547 4.978 5.181 5.366 5.613 5.86 6.018 6.328 6.604 6.854 6.974 7.218 7.453 7.782 7.993 8.204 8.509 8.796 9.072 9.327 9.578 9.911 10.225 10.532 10.89 11.232 11.572 11.962 12.397 12.823 13.297 13.817 14.391 15.007 15.704 16.569 17.432 18.368 19.407 20.633 21.962 23.48 25.377 27.584 29.318 30.343 30.868 31.109 31.174 31.131 31.066 30.977 30.858 30.746 30.609 30.442 30.307 30.195 30.053 29.879 29.722 29.568 29.391 29.219 29.076 28.922 28.764 28.621 28.463 28.296 28.109 27.913 27.768 27.62 27.382 27.206 27.021 26.919 26.713 26.495 26.274 26.153 25.951 25.743 25.6 25.443 25.09 24.897 24.676 24.406 24.069 23.689 23.182 21.269 -5 ,20774 ,KEBNE ,17023843,Wed Dec 22 08:34:31 CET,Wed Dec 22 10:26:12 CET,0.0 2.607 3.274 3.737 4.108 4.423 4.703 4.94 5.369 5.566 5.744 5.967 6.196 6.339 6.633 6.917 7.189 7.319 7.575 7.818 8.152 8.361 8.555 8.835 9.115 9.378 9.613 9.857 10.199 10.507 10.797 11.157 11.518 11.868 12.259 12.715 13.142 13.592 14.081 14.631 15.232 15.922 16.729 17.499 18.374 19.336 20.442 21.716 23.217 24.997 27.056 28.572 29.333 29.726 29.93 29.99 29.954 29.881 29.785 29.714 29.617 29.451 29.284 29.124 28.986 28.854 28.711 28.565 28.412 28.252 28.082 27.93 27.776 27.623 27.505 27.388 27.262 27.122 26.931 26.779 26.638 26.436 26.283 26.111 26.031 25.854 25.664 25.456 25.33 25.133 24.915 24.763 24.589 24.185 23.974 23.741 23.475 23.171 22.743 22.118 19.795 -6 ,6600 ,KEBNE ,17023844,Wed Dec 22 08:34:31 CET,Wed Dec 22 10:26:47 CET,0.0 3.439 4.188 4.64 5.004 5.337 5.628 5.862 6.277 6.485 6.682 6.942 7.206 7.37 7.674 7.965 8.24 8.37 8.614 8.85 9.2 9.429 9.642 9.936 10.23 10.507 10.766 11.024 11.377 11.716 12.033 12.398 12.759 13.126 13.559 14.024 14.437 14.904 15.432 16.008 16.585 17.223 17.993 18.752 19.591 20.516 21.653 22.993 24.611 26.411 28.559 30.45 31.508 32.098 32.449 32.622 32.687 32.731 32.7 32.564 32.432 32.322 32.207 32.085 31.952 31.83 31.7 31.558 31.435 31.278 31.086 30.924 30.75 30.565 30.408 30.236 30.059 29.869 29.661 29.51 29.362 29.123 28.935 28.738 28.637 28.428 28.199 27.937 27.797 27.597 27.392 27.244 27.071 26.668 26.435 26.16 25.863 25.547 25.092 24.434 21.962 -7 ,24441 ,KEBNE ,17023845,Wed Dec 22 08:34:31 CET,Wed Dec 22 10:27:00 CET,0.0 2.514 3.21 3.7 4.057 4.366 4.651 4.912 5.36 5.564 5.758 6.01 6.259 6.413 6.694 6.954 7.206 7.337 7.591 7.825 8.163 8.378 8.582 8.873 9.153 9.432 9.698 9.957 10.308 10.639 10.946 11.332 11.703 12.055 12.495 12.983 13.423 13.892 14.389 14.931 15.518 16.216 17.04 17.85 18.78 19.798 20.944 22.192 23.639 25.239 27.182 28.791 29.621 30.081 30.369 30.59 30.641 30.544 30.456 30.351 30.2 30.05 29.891 29.725 29.582 29.446 29.282 29.132 28.997 28.833 28.659 28.507 28.33 28.15 28.011 27.851 27.685 27.503 27.288 27.151 27.007 26.758 26.577 26.382 26.282 26.066 25.83 25.579 25.435 25.231 25.021 24.888 24.735 24.337 24.116 23.864 23.565 23.186 22.731 22.163 20.337 -8 ,32292 ,KEBNE ,17023846,Wed Dec 22 08:35:33 CET,Wed Dec 22 10:27:44 CET,0.0 2.439 3.027 3.421 3.719 3.988 4.241 4.491 4.958 5.157 5.347 5.614 5.874 6.034 6.333 6.607 6.86 6.985 7.23 7.459 7.781 7.979 8.175 8.456 8.723 8.988 9.247 9.495 9.824 10.139 10.437 10.813 11.182 11.53 11.941 12.414 12.842 13.313 13.811 14.332 14.887 15.53 16.291 17.02 17.904 18.926 20.087 21.428 23.043 24.893 27.082 28.809 29.775 30.36 30.696 30.904 31.014 31.037 31.0 30.942 30.871 30.773 30.645 30.473 30.295 30.168 30.062 29.927 29.776 29.613 29.438 29.314 29.174 28.991 28.856 28.707 28.536 28.365 28.186 28.07 27.944 27.702 27.527 27.353 27.263 27.066 26.86 26.639 26.522 26.325 26.062 25.865 25.657 25.251 25.025 24.752 24.448 24.074 23.567 22.92 20.804 -9 ,16336 ,KEBNE ,17023847,Wed Dec 22 08:35:33 CET,Wed Dec 22 10:28:14 CET,0.0 2.339 2.906 3.329 3.66 3.962 4.243 4.502 4.954 5.153 5.334 5.591 5.839 5.985 6.256 6.516 6.774 6.895 7.115 7.338 7.664 7.866 8.06 8.332 8.604 8.883 9.162 9.432 9.775 10.111 10.435 10.814 11.172 11.524 11.956 12.453 12.909 13.4 13.96 14.545 15.12 15.786 16.568 17.359 18.289 19.31 20.534 21.896 23.36 25.101 27.352 29.16 30.097 30.579 30.782 30.899 30.952 30.939 30.886 30.776 30.648 30.531 30.405 30.249 30.097 29.955 29.804 29.66 29.517 29.351 29.172 29.027 28.866 28.69 28.55 28.382 28.201 28.022 27.825 27.671 27.514 27.278 27.102 26.905 26.796 26.557 26.32 26.084 25.952 25.745 25.484 25.325 25.161 24.767 24.541 24.291 24.022 23.684 23.262 22.644 20.058 -10 ,13668 ,KEBNE ,17023848,Wed Dec 22 08:35:33 CET,Wed Dec 22 10:29:13 CET,0.0 2.233 2.835 3.288 3.654 3.951 4.219 4.464 4.871 5.055 5.243 5.505 5.745 5.89 6.182 6.452 6.709 6.833 7.064 7.281 7.59 7.793 8.003 8.303 8.587 8.853 9.106 9.355 9.676 9.993 10.296 10.655 11.004 11.349 11.75 12.186 12.603 13.057 13.555 14.147 14.759 15.371 16.109 16.882 17.748 18.724 19.903 21.234 22.8 24.554 26.502 28.099 28.963 29.418 29.656 29.753 29.764 29.728 29.654 29.506 29.347 29.219 29.097 28.94 28.755 28.575 28.385 28.227 28.069 27.875 27.695 27.554 27.394 27.228 27.092 26.936 26.782 26.637 26.454 26.309 26.169 25.957 25.798 25.629 25.53 25.3 25.084 24.861 24.746 24.558 24.306 24.13 23.947 23.572 23.355 23.1 22.828 22.474 22.039 21.458 19.495 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_44.txt deleted file mode 100644 index 7e0939e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_44.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2030 ,KEBNE ,17023849,Wed Dec 22 08:35:33 CET,Wed Dec 22 10:27:10 CET,0.0 0.929 1.285 1.546 1.78 1.99 2.184 2.371 2.7 2.844 2.978 3.136 3.348 3.464 3.68 3.864 4.012 4.088 4.245 4.391 4.595 4.724 4.842 5.008 5.171 5.319 5.457 5.596 5.775 5.943 6.105 6.295 6.469 6.626 6.798 6.987 7.155 7.328 7.505 7.688 7.874 8.056 8.258 8.47 8.721 8.936 9.093 9.222 9.28 9.204 8.748 7.944 7.181 6.456 5.806 5.231 4.721 4.262 3.862 3.458 3.118 2.801 2.483 2.198 1.922 1.651 1.367 1.125 0.919 0.69 0.459 0.274 0.084 -0.115 -0.271 -0.432 -0.607 -0.794 -0.986 -1.122 -1.26 -1.477 -1.637 -1.807 -1.895 -2.072 -2.277 -2.506 -2.62 -2.828 -2.983 -3.117 -3.254 -3.567 -3.747 -3.937 -4.171 -4.462 -4.79 -5.203 -6.346 -2 ,19692 ,KEBNE ,17023850,Wed Dec 22 08:35:37 CET,Wed Dec 22 10:21:32 CET,0.0 0.973 1.392 1.711 1.984 2.198 2.388 2.572 2.884 3.024 3.159 3.31 3.509 3.614 3.815 3.992 4.155 4.236 4.401 4.561 4.776 4.904 5.024 5.207 5.381 5.537 5.679 5.82 6.007 6.175 6.339 6.528 6.702 6.879 7.078 7.294 7.49 7.721 7.991 8.239 8.479 8.735 8.999 9.264 9.555 9.839 10.127 10.426 10.739 10.92 10.759 10.213 9.666 9.096 8.516 8.002 7.542 7.091 6.688 6.286 5.938 5.618 5.303 4.994 4.706 4.448 4.164 3.901 3.681 3.461 3.226 3.023 2.817 2.605 2.44 2.258 2.065 1.875 1.677 1.531 1.37 1.121 0.955 0.781 0.691 0.508 0.302 0.083 -0.029 -0.24 -0.412 -0.553 -0.695 -1.026 -1.214 -1.418 -1.647 -1.907 -2.245 -2.689 -3.692 -3 ,8575 ,KEBNE ,17023851,Wed Dec 22 08:35:33 CET,Wed Dec 22 10:27:55 CET,0.0 0.925 1.32 1.626 1.859 2.043 2.212 2.369 2.665 2.795 2.916 3.067 3.256 3.362 3.577 3.765 3.934 4.015 4.165 4.306 4.517 4.643 4.758 4.925 5.097 5.26 5.419 5.579 5.772 5.941 6.096 6.288 6.467 6.632 6.82 7.014 7.181 7.364 7.561 7.764 7.975 8.202 8.468 8.718 8.975 9.222 9.469 9.685 9.784 9.734 9.387 8.622 7.816 7.109 6.476 5.899 5.377 4.88 4.457 4.022 3.649 3.319 2.995 2.688 2.395 2.127 1.859 1.615 1.405 1.178 0.927 0.726 0.527 0.314 0.144 -0.033 -0.227 -0.426 -0.63 -0.776 -0.924 -1.145 -1.312 -1.498 -1.596 -1.805 -2.022 -2.248 -2.366 -2.589 -2.77 -2.907 -3.054 -3.387 -3.568 -3.766 -3.987 -4.245 -4.548 -4.945 -5.86 -4 ,11858 ,KEBNE ,17023852,Wed Dec 22 08:35:33 CET,Wed Dec 22 10:26:37 CET,0.0 1.059 1.448 1.74 1.995 2.203 2.394 2.561 2.838 2.968 3.09 3.242 3.446 3.55 3.744 3.917 4.076 4.152 4.3 4.447 4.649 4.771 4.891 5.056 5.21 5.363 5.507 5.642 5.815 5.972 6.131 6.314 6.472 6.627 6.814 7.01 7.184 7.377 7.576 7.773 7.972 8.198 8.449 8.661 8.88 9.065 9.213 9.361 9.434 9.376 9.04 8.324 7.593 6.897 6.238 5.646 5.132 4.657 4.256 3.858 3.494 3.148 2.81 2.497 2.213 1.954 1.679 1.425 1.199 0.972 0.747 0.555 0.363 0.167 0.0 -0.177 -0.359 -0.552 -0.76 -0.905 -1.049 -1.287 -1.464 -1.652 -1.742 -1.916 -2.105 -2.303 -2.416 -2.64 -2.81 -2.949 -3.102 -3.455 -3.649 -3.85 -4.067 -4.317 -4.605 -4.977 -5.918 -5 ,25261 ,KEBNE ,17023853,Wed Dec 22 08:37:38 CET,Wed Dec 22 10:29:28 CET,0.0 1.129 1.543 1.838 2.111 2.335 2.516 2.681 2.976 3.121 3.264 3.407 3.624 3.737 3.925 4.106 4.268 4.347 4.508 4.665 4.884 5.017 5.149 5.335 5.498 5.649 5.795 5.935 6.113 6.281 6.44 6.636 6.817 6.984 7.169 7.375 7.586 7.813 8.042 8.272 8.502 8.742 9.006 9.262 9.553 9.827 10.043 10.179 10.241 10.218 9.946 9.312 8.636 8.022 7.466 6.961 6.488 6.043 5.645 5.235 4.893 4.576 4.268 3.973 3.702 3.46 3.206 2.98 2.77 2.537 2.292 2.083 1.867 1.653 1.487 1.314 1.133 0.938 0.73 0.587 0.443 0.202 0.031 -0.144 -0.234 -0.411 -0.601 -0.823 -0.94 -1.147 -1.318 -1.471 -1.619 -1.918 -2.097 -2.297 -2.52 -2.786 -3.122 -3.571 -4.727 -6 ,9435 ,KEBNE ,17023854,Wed Dec 22 08:37:39 CET,Wed Dec 22 10:29:28 CET,0.0 0.935 1.298 1.557 1.776 1.992 2.195 2.387 2.733 2.876 3.012 3.179 3.39 3.505 3.724 3.933 4.115 4.196 4.348 4.491 4.698 4.827 4.944 5.113 5.284 5.453 5.609 5.756 5.945 6.125 6.292 6.486 6.669 6.83 7.011 7.215 7.396 7.584 7.79 7.994 8.191 8.412 8.667 8.916 9.17 9.408 9.63 9.755 9.794 9.691 9.263 8.488 7.731 7.042 6.416 5.807 5.27 4.792 4.372 3.93 3.533 3.194 2.888 2.604 2.333 2.082 1.823 1.581 1.371 1.157 0.932 0.741 0.532 0.31 0.139 -0.036 -0.224 -0.416 -0.614 -0.761 -0.916 -1.16 -1.33 -1.508 -1.603 -1.79 -1.991 -2.206 -2.32 -2.535 -2.702 -2.847 -3.001 -3.344 -3.542 -3.744 -3.986 -4.274 -4.589 -5.025 -6.127 -8 ,25147 ,KEBNE ,17023856,Wed Dec 22 08:37:38 CET,Wed Dec 22 10:30:42 CET,0.0 1.006 1.402 1.741 2.026 2.269 2.458 2.616 2.902 3.047 3.182 3.324 3.518 3.615 3.799 3.969 4.13 4.211 4.369 4.516 4.72 4.843 4.96 5.128 5.293 5.444 5.582 5.717 5.901 6.078 6.231 6.416 6.596 6.764 6.959 7.178 7.376 7.582 7.808 8.033 8.25 8.49 8.765 9.011 9.229 9.453 9.708 9.912 10.056 10.083 9.851 9.21 8.541 7.958 7.437 6.933 6.456 5.996 5.573 5.148 4.78 4.457 4.163 3.882 3.603 3.346 3.08 2.827 2.599 2.375 2.151 1.955 1.744 1.525 1.357 1.182 1.007 0.823 0.624 0.485 0.34 0.109 -0.062 -0.234 -0.32 -0.504 -0.708 -0.931 -1.046 -1.257 -1.43 -1.568 -1.714 -2.028 -2.21 -2.417 -2.645 -2.909 -3.238 -3.665 -5.074 -9 ,11696 ,KEBNE ,17023857,Wed Dec 22 08:37:39 CET,Wed Dec 22 10:29:40 CET,0.0 1.392 1.818 2.121 2.351 2.562 2.775 2.968 3.293 3.437 3.564 3.722 3.919 4.021 4.222 4.4 4.57 4.649 4.793 4.939 5.15 5.273 5.393 5.574 5.747 5.91 6.054 6.189 6.371 6.557 6.746 6.96 7.166 7.357 7.549 7.77 7.968 8.172 8.392 8.631 8.885 9.141 9.405 9.649 9.927 10.203 10.485 10.771 10.958 10.941 10.555 9.781 9.05 8.343 7.697 7.143 6.644 6.146 5.703 5.264 4.909 4.602 4.292 3.991 3.72 3.467 3.188 2.931 2.709 2.477 2.233 2.033 1.826 1.615 1.45 1.275 1.087 0.889 0.692 0.56 0.425 0.206 0.041 -0.127 -0.208 -0.392 -0.597 -0.808 -0.918 -1.123 -1.28 -1.423 -1.574 -1.895 -2.08 -2.298 -2.537 -2.805 -3.101 -3.505 -4.561 -10 ,27606 ,KEBNE ,17023858,Wed Dec 22 08:37:42 CET,Wed Dec 22 10:26:05 CET,0.0 0.951 1.34 1.63 1.865 2.063 2.247 2.42 2.733 2.874 3.009 3.179 3.379 3.483 3.673 3.857 4.042 4.128 4.295 4.457 4.694 4.833 4.955 5.142 5.322 5.48 5.639 5.793 5.967 6.132 6.3 6.493 6.659 6.805 6.974 7.16 7.335 7.539 7.755 7.964 8.165 8.382 8.626 8.852 9.104 9.343 9.56 9.742 9.831 9.895 9.702 9.03 8.295 7.613 6.996 6.423 5.924 5.481 5.089 4.67 4.318 4.007 3.698 3.405 3.127 2.874 2.611 2.357 2.14 1.923 1.691 1.497 1.291 1.067 0.893 0.716 0.538 0.361 0.167 0.027 -0.116 -0.344 -0.505 -0.679 -0.772 -0.959 -1.155 -1.375 -1.493 -1.702 -1.874 -2.023 -2.173 -2.49 -2.661 -2.844 -3.047 -3.282 -3.6 -4.024 -5.016 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_49.txt deleted file mode 100644 index f1151008..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25871 ,KEBNE ,16677133,Wed Nov 24 17:10:59 CET,Wed Nov 24 19:04:08 CET,0.0 0.765 1.137 1.409 1.641 1.861 2.047 2.203 2.471 2.582 2.693 2.832 3.032 3.135 3.313 3.478 3.634 3.711 3.859 3.993 4.183 4.319 4.441 4.58 4.703 4.823 4.946 5.062 5.208 5.347 5.474 5.624 5.758 5.874 6.0 6.138 6.268 6.402 6.527 6.659 6.805 6.947 7.075 7.196 7.314 7.37 7.34 7.238 7.045 6.586 5.563 4.209 3.038 2.018 1.131 0.329 -0.352 -0.966 -1.502 -2.018 -2.447 -2.829 -3.207 -3.562 -3.905 -4.224 -4.547 -4.84 -5.1 -5.369 -5.649 -5.875 -6.105 -6.351 -6.544 -6.746 -6.961 -7.181 -7.402 -7.553 -7.707 -7.961 -8.147 -8.328 -8.419 -8.627 -8.849 -9.072 -9.199 -9.431 -9.607 -9.757 -9.918 -10.276 -10.47 -10.679 -10.92 -11.202 -11.526 -11.972 -13.261 -2 ,4749 ,KEBNE ,16677134,Wed Nov 24 17:10:59 CET,Wed Nov 24 19:03:56 CET,0.0 0.8 1.175 1.455 1.681 1.902 2.095 2.253 2.519 2.637 2.751 2.874 3.07 3.165 3.345 3.512 3.668 3.744 3.882 4.008 4.188 4.3 4.405 4.547 4.667 4.789 4.917 5.036 5.178 5.32 5.46 5.623 5.77 5.899 6.03 6.161 6.298 6.449 6.597 6.741 6.871 7.01 7.158 7.26 7.358 7.44 7.464 7.389 7.175 6.749 5.797 4.477 3.363 2.392 1.495 0.671 -0.044 -0.697 -1.247 -1.795 -2.269 -2.669 -3.053 -3.419 -3.743 -4.047 -4.359 -4.623 -4.859 -5.112 -5.39 -5.623 -5.855 -6.104 -6.304 -6.497 -6.703 -6.924 -7.146 -7.306 -7.475 -7.737 -7.923 -8.119 -8.22 -8.427 -8.645 -8.868 -8.988 -9.225 -9.406 -9.552 -9.704 -10.035 -10.221 -10.433 -10.663 -10.912 -11.205 -11.64 -13.107 -3 ,3506 ,KEBNE ,16677135,Wed Nov 24 17:12:00 CET,Wed Nov 24 19:05:07 CET,0.0 0.622 0.934 1.189 1.397 1.58 1.746 1.902 2.193 2.325 2.447 2.578 2.766 2.862 3.025 3.176 3.325 3.393 3.525 3.644 3.818 3.931 4.03 4.183 4.331 4.463 4.584 4.692 4.835 4.974 5.092 5.225 5.354 5.483 5.621 5.755 5.876 5.993 6.113 6.248 6.379 6.514 6.649 6.757 6.869 6.95 6.961 6.881 6.712 6.36 5.445 4.034 2.763 1.725 0.893 0.124 -0.55 -1.157 -1.68 -2.199 -2.647 -3.037 -3.41 -3.784 -4.143 -4.459 -4.794 -5.09 -5.338 -5.595 -5.862 -6.095 -6.345 -6.59 -6.778 -6.978 -7.182 -7.402 -7.649 -7.818 -7.974 -8.223 -8.404 -8.598 -8.7 -8.917 -9.139 -9.367 -9.484 -9.716 -9.912 -10.055 -10.209 -10.549 -10.727 -10.927 -11.171 -11.437 -11.745 -12.162 -13.217 -4 ,31062 ,KEBNE ,16677136,Wed Nov 24 17:12:00 CET,Wed Nov 24 19:06:19 CET,0.0 0.984 1.29 1.524 1.733 1.915 2.08 2.229 2.485 2.602 2.71 2.813 3.004 3.102 3.276 3.448 3.611 3.684 3.817 3.943 4.112 4.216 4.319 4.458 4.583 4.711 4.834 4.947 5.097 5.245 5.386 5.553 5.706 5.845 5.989 6.144 6.301 6.455 6.609 6.773 6.934 7.094 7.265 7.428 7.588 7.729 7.818 7.811 7.725 7.462 6.672 5.458 4.296 3.236 2.319 1.486 0.752 0.104 -0.421 -0.947 -1.415 -1.819 -2.218 -2.613 -2.977 -3.31 -3.659 -3.96 -4.208 -4.473 -4.758 -4.997 -5.247 -5.503 -5.701 -5.91 -6.128 -6.36 -6.612 -6.782 -6.956 -7.228 -7.41 -7.597 -7.698 -7.924 -8.159 -8.406 -8.534 -8.77 -8.979 -9.143 -9.305 -9.653 -9.852 -10.068 -10.308 -10.598 -10.934 -11.37 -12.657 -5 ,15820 ,KEBNE ,16677137,Wed Nov 24 17:12:00 CET,Wed Nov 24 19:04:51 CET,0.0 0.78 1.095 1.346 1.576 1.768 1.927 2.072 2.322 2.438 2.547 2.671 2.857 2.944 3.111 3.269 3.409 3.475 3.61 3.737 3.908 4.014 4.118 4.266 4.404 4.536 4.658 4.771 4.904 5.022 5.137 5.281 5.418 5.546 5.688 5.825 5.953 6.101 6.234 6.354 6.496 6.634 6.756 6.87 6.959 7.013 7.036 6.984 6.808 6.409 5.474 4.206 3.127 2.153 1.293 0.521 -0.142 -0.759 -1.305 -1.823 -2.276 -2.694 -3.069 -3.416 -3.756 -4.073 -4.405 -4.701 -4.947 -5.199 -5.473 -5.709 -5.949 -6.202 -6.407 -6.622 -6.831 -7.045 -7.279 -7.434 -7.596 -7.86 -8.044 -8.232 -8.328 -8.531 -8.741 -8.967 -9.086 -9.31 -9.475 -9.622 -9.786 -10.172 -10.385 -10.591 -10.807 -11.082 -11.432 -11.894 -13.03 -6 ,27247 ,KEBNE ,16677138,Wed Nov 24 17:12:00 CET,Wed Nov 24 19:05:29 CET,0.0 0.852 1.191 1.464 1.709 1.919 2.09 2.245 2.535 2.659 2.775 2.903 3.091 3.184 3.351 3.503 3.652 3.725 3.865 3.994 4.17 4.279 4.386 4.536 4.676 4.811 4.933 5.058 5.215 5.358 5.502 5.67 5.822 5.968 6.13 6.292 6.451 6.635 6.819 7.005 7.178 7.356 7.559 7.74 7.913 8.067 8.194 8.254 8.18 7.867 7.123 5.985 4.943 4.024 3.236 2.548 1.926 1.303 0.735 0.181 -0.296 -0.712 -1.091 -1.444 -1.777 -2.081 -2.413 -2.715 -2.978 -3.251 -3.523 -3.754 -3.994 -4.232 -4.426 -4.637 -4.852 -5.073 -5.305 -5.476 -5.656 -5.925 -6.103 -6.291 -6.389 -6.593 -6.815 -7.07 -7.203 -7.438 -7.631 -7.78 -7.932 -8.264 -8.457 -8.667 -8.897 -9.168 -9.482 -9.883 -10.915 -7 ,13180 ,KEBNE ,16677139,Wed Nov 24 17:12:01 CET,Wed Nov 24 19:05:27 CET,0.0 1.076 1.401 1.646 1.867 2.049 2.204 2.355 2.629 2.749 2.861 2.977 3.153 3.24 3.407 3.558 3.694 3.758 3.876 3.985 4.145 4.248 4.347 4.495 4.628 4.743 4.853 4.953 5.085 5.216 5.336 5.468 5.587 5.7 5.815 5.945 6.075 6.201 6.336 6.483 6.638 6.795 6.924 7.024 7.103 7.162 7.159 7.068 6.854 6.377 5.362 3.972 2.783 1.777 0.926 0.163 -0.536 -1.181 -1.718 -2.245 -2.688 -3.065 -3.439 -3.795 -4.125 -4.429 -4.76 -5.059 -5.306 -5.57 -5.848 -6.079 -6.323 -6.583 -6.788 -7.002 -7.215 -7.429 -7.651 -7.804 -7.967 -8.226 -8.41 -8.603 -8.699 -8.893 -9.125 -9.384 -9.524 -9.769 -9.951 -10.097 -10.256 -10.624 -10.824 -11.039 -11.268 -11.532 -11.858 -12.332 -13.731 -8 ,4257 ,KEBNE ,16677140,Wed Nov 24 17:12:00 CET,Wed Nov 24 19:06:09 CET,0.0 1.159 1.578 1.888 2.119 2.309 2.478 2.631 2.916 3.039 3.155 3.287 3.479 3.574 3.753 3.916 4.059 4.127 4.268 4.399 4.573 4.684 4.788 4.938 5.082 5.217 5.34 5.452 5.593 5.719 5.835 5.979 6.114 6.236 6.37 6.513 6.647 6.796 6.95 7.107 7.251 7.386 7.526 7.638 7.736 7.823 7.852 7.781 7.59 7.192 6.276 4.882 3.601 2.524 1.674 0.919 0.212 -0.446 -1.002 -1.533 -1.977 -2.374 -2.769 -3.145 -3.489 -3.798 -4.115 -4.401 -4.643 -4.889 -5.149 -5.367 -5.612 -5.885 -6.098 -6.322 -6.543 -6.753 -6.973 -7.128 -7.292 -7.562 -7.752 -7.948 -8.052 -8.27 -8.503 -8.751 -8.884 -9.123 -9.323 -9.484 -9.64 -9.981 -10.185 -10.409 -10.657 -10.949 -11.287 -11.751 -12.868 -9 ,9940 ,KEBNE ,16677141,Wed Nov 24 17:13:01 CET,Wed Nov 24 19:06:53 CET,0.0 0.986 1.353 1.624 1.856 2.055 2.224 2.379 2.644 2.77 2.885 3.004 3.196 3.293 3.481 3.66 3.821 3.899 4.047 4.186 4.379 4.502 4.62 4.786 4.943 5.089 5.224 5.355 5.517 5.665 5.812 5.998 6.165 6.31 6.466 6.633 6.777 6.908 7.064 7.241 7.4 7.569 7.765 7.929 8.087 8.24 8.361 8.415 8.296 7.873 6.922 5.678 4.594 3.61 2.778 2.057 1.424 0.847 0.349 -0.163 -0.599 -0.983 -1.351 -1.694 -2.018 -2.321 -2.651 -2.942 -3.181 -3.444 -3.724 -3.957 -4.203 -4.464 -4.67 -4.873 -5.081 -5.297 -5.522 -5.675 -5.839 -6.105 -6.295 -6.497 -6.601 -6.825 -7.052 -7.286 -7.411 -7.639 -7.806 -7.949 -8.103 -8.455 -8.647 -8.85 -9.08 -9.377 -9.755 -10.268 -11.609 -10 ,1851 ,KEBNE ,16677142,Wed Nov 24 17:13:02 CET,Wed Nov 24 19:07:09 CET,0.0 0.945 1.288 1.557 1.789 1.989 2.171 2.322 2.587 2.702 2.813 2.933 3.115 3.203 3.384 3.552 3.705 3.775 3.91 4.034 4.206 4.316 4.425 4.574 4.712 4.846 4.966 5.081 5.228 5.358 5.48 5.624 5.764 5.907 6.066 6.222 6.363 6.521 6.68 6.832 6.964 7.089 7.209 7.299 7.371 7.414 7.407 7.338 7.168 6.83 6.116 4.816 3.55 2.469 1.543 0.756 0.082 -0.525 -1.019 -1.51 -1.951 -2.331 -2.69 -3.033 -3.361 -3.664 -3.975 -4.252 -4.497 -4.765 -5.055 -5.288 -5.525 -5.766 -5.962 -6.176 -6.4 -6.645 -6.892 -7.061 -7.237 -7.505 -7.701 -7.908 -8.013 -8.233 -8.464 -8.711 -8.837 -9.061 -9.24 -9.392 -9.551 -9.9 -10.095 -10.318 -10.569 -10.852 -11.195 -11.677 -13.183 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_58.txt deleted file mode 100644 index c935d51f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2038 ,KEBNE ,17023859,Wed Dec 22 08:37:39 CET,Wed Dec 22 10:29:15 CET,0.0 1.312 1.761 2.095 2.354 2.592 2.819 3.019 3.344 3.486 3.621 3.782 3.984 4.088 4.288 4.476 4.643 4.723 4.887 5.035 5.228 5.355 5.478 5.654 5.83 5.99 6.124 6.254 6.421 6.573 6.712 6.88 7.039 7.186 7.351 7.528 7.697 7.88 8.054 8.206 8.355 8.516 8.698 8.857 8.972 9.03 9.102 9.099 8.911 8.452 7.508 6.293 5.165 4.179 3.318 2.543 1.895 1.312 0.799 0.293 -0.143 -0.539 -0.905 -1.243 -1.554 -1.852 -2.173 -2.452 -2.684 -2.925 -3.178 -3.396 -3.627 -3.867 -4.048 -4.23 -4.429 -4.645 -4.865 -5.014 -5.177 -5.434 -5.609 -5.789 -5.886 -6.092 -6.302 -6.507 -6.617 -6.84 -7.005 -7.149 -7.3 -7.618 -7.798 -7.989 -8.205 -8.447 -8.728 -9.087 -9.843 -2 ,10788 ,KEBNE ,17023860,Wed Dec 22 08:37:39 CET,Wed Dec 22 10:29:26 CET,0.0 1.309 1.806 2.139 2.386 2.615 2.832 3.02 3.356 3.512 3.662 3.849 4.057 4.177 4.403 4.6 4.77 4.845 4.996 5.149 5.365 5.503 5.639 5.822 5.985 6.14 6.283 6.417 6.584 6.735 6.879 7.068 7.241 7.395 7.563 7.745 7.911 8.102 8.303 8.498 8.713 8.959 9.233 9.477 9.693 9.824 9.892 9.883 9.749 9.291 8.266 6.969 5.864 4.903 4.07 3.324 2.693 2.118 1.597 1.094 0.655 0.255 -0.137 -0.503 -0.827 -1.131 -1.463 -1.747 -1.983 -2.233 -2.496 -2.719 -2.947 -3.179 -3.357 -3.547 -3.753 -3.963 -4.179 -4.329 -4.48 -4.716 -4.889 -5.068 -5.158 -5.35 -5.564 -5.789 -5.901 -6.126 -6.302 -6.446 -6.593 -6.906 -7.094 -7.303 -7.518 -7.755 -8.036 -8.428 -9.508 -3 ,13961 ,KEBNE ,17023861,Wed Dec 22 08:37:39 CET,Wed Dec 22 10:29:39 CET,0.0 1.27 1.75 2.094 2.366 2.595 2.799 2.99 3.302 3.45 3.6 3.777 3.987 4.101 4.328 4.535 4.732 4.826 4.995 5.158 5.411 5.568 5.699 5.899 6.093 6.257 6.408 6.551 6.725 6.895 7.053 7.223 7.384 7.547 7.735 7.944 8.134 8.312 8.487 8.68 8.882 9.095 9.331 9.534 9.711 9.867 9.967 9.962 9.847 9.529 8.758 7.56 6.445 5.487 4.685 3.941 3.311 2.759 2.257 1.777 1.373 0.995 0.65 0.338 0.045 -0.232 -0.526 -0.782 -1.004 -1.245 -1.509 -1.723 -1.944 -2.174 -2.344 -2.518 -2.713 -2.916 -3.113 -3.253 -3.401 -3.638 -3.812 -3.99 -4.081 -4.267 -4.465 -4.69 -4.814 -5.037 -5.2 -5.335 -5.477 -5.809 -6.006 -6.217 -6.444 -6.711 -7.033 -7.471 -8.532 -4 ,16520 ,KEBNE ,17023862,Wed Dec 22 08:37:39 CET,Wed Dec 22 10:31:31 CET,0.0 1.192 1.681 2.067 2.343 2.572 2.781 2.979 3.323 3.48 3.628 3.791 3.999 4.118 4.334 4.521 4.705 4.79 4.936 5.075 5.281 5.419 5.553 5.732 5.899 6.047 6.18 6.309 6.477 6.633 6.769 6.929 7.084 7.226 7.378 7.551 7.715 7.877 8.057 8.261 8.45 8.625 8.787 8.934 9.079 9.168 9.175 9.089 8.854 8.312 7.265 5.888 4.762 3.79 2.937 2.16 1.462 0.855 0.352 -0.15 -0.596 -0.988 -1.343 -1.689 -2.023 -2.317 -2.615 -2.883 -3.117 -3.36 -3.617 -3.835 -4.06 -4.289 -4.473 -4.666 -4.866 -5.09 -5.316 -5.463 -5.622 -5.871 -6.041 -6.233 -6.337 -6.533 -6.734 -6.961 -7.079 -7.298 -7.459 -7.594 -7.732 -8.052 -8.232 -8.423 -8.63 -8.869 -9.161 -9.538 -10.51 -5 ,30104 ,KEBNE ,17023863,Wed Dec 22 08:37:38 CET,Wed Dec 22 10:30:18 CET,0.0 1.932 2.396 2.763 3.067 3.318 3.536 3.734 4.085 4.241 4.39 4.563 4.777 4.895 5.115 5.326 5.52 5.613 5.789 5.947 6.144 6.267 6.397 6.586 6.753 6.908 7.055 7.19 7.384 7.575 7.745 7.945 8.136 8.316 8.502 8.674 8.837 9.023 9.218 9.422 9.627 9.811 10.005 10.196 10.332 10.43 10.505 10.472 10.28 9.886 9.132 7.914 6.722 5.692 4.823 4.041 3.352 2.765 2.269 1.777 1.371 1.007 0.644 0.298 -0.014 -0.295 -0.594 -0.866 -1.092 -1.323 -1.573 -1.791 -2.018 -2.254 -2.435 -2.611 -2.796 -2.998 -3.21 -3.358 -3.512 -3.749 -3.914 -4.097 -4.188 -4.38 -4.597 -4.823 -4.938 -5.159 -5.308 -5.441 -5.589 -5.922 -6.096 -6.278 -6.481 -6.736 -7.054 -7.449 -8.373 -6 ,21740 ,KEBNE ,17023864,Wed Dec 22 08:37:39 CET,Wed Dec 22 10:32:03 CET,0.0 1.32 1.821 2.183 2.464 2.7 2.914 3.102 3.432 3.59 3.74 3.913 4.115 4.23 4.439 4.637 4.82 4.904 5.066 5.225 5.444 5.581 5.712 5.894 6.058 6.212 6.366 6.507 6.673 6.834 6.993 7.186 7.366 7.526 7.703 7.9 8.082 8.263 8.452 8.624 8.776 8.926 9.102 9.269 9.424 9.566 9.66 9.684 9.572 9.205 8.371 7.207 6.15 5.211 4.414 3.699 3.052 2.459 1.962 1.471 1.042 0.668 0.323 0.002 -0.301 -0.583 -0.888 -1.159 -1.384 -1.617 -1.873 -2.094 -2.321 -2.555 -2.739 -2.93 -3.14 -3.354 -3.568 -3.717 -3.87 -4.104 -4.266 -4.439 -4.529 -4.719 -4.923 -5.136 -5.244 -5.455 -5.613 -5.754 -5.898 -6.208 -6.375 -6.553 -6.747 -6.976 -7.259 -7.649 -8.488 -7 ,11411 ,KEBNE ,17023865,Wed Dec 22 08:38:41 CET,Wed Dec 22 10:30:24 CET,0.0 1.781 2.267 2.615 2.894 3.137 3.357 3.563 3.897 4.036 4.177 4.361 4.576 4.689 4.896 5.093 5.274 5.357 5.523 5.675 5.893 6.039 6.169 6.351 6.521 6.673 6.816 6.956 7.139 7.3 7.443 7.638 7.834 7.998 8.167 8.374 8.57 8.776 8.986 9.179 9.368 9.561 9.777 9.995 10.236 10.445 10.591 10.624 10.486 10.087 9.201 8.065 6.997 5.974 5.127 4.428 3.826 3.273 2.796 2.319 1.899 1.522 1.175 0.843 0.527 0.235 -0.071 -0.348 -0.598 -0.852 -1.104 -1.32 -1.547 -1.766 -1.934 -2.132 -2.342 -2.552 -2.781 -2.941 -3.098 -3.339 -3.51 -3.688 -3.78 -3.969 -4.172 -4.392 -4.509 -4.734 -4.882 -5.015 -5.154 -5.469 -5.646 -5.836 -6.039 -6.278 -6.582 -6.939 -7.663 -8 ,1168 ,KEBNE ,17023866,Wed Dec 22 08:38:41 CET,Wed Dec 22 10:31:24 CET,0.0 1.152 1.665 2.044 2.351 2.623 2.862 3.059 3.388 3.544 3.689 3.864 4.076 4.193 4.422 4.627 4.816 4.905 5.065 5.215 5.441 5.578 5.707 5.894 6.067 6.231 6.379 6.516 6.692 6.854 7.012 7.208 7.387 7.547 7.731 7.924 8.108 8.307 8.493 8.674 8.85 9.023 9.207 9.384 9.529 9.622 9.672 9.64 9.5 9.17 8.441 7.414 6.439 5.537 4.701 3.992 3.412 2.892 2.424 1.919 1.491 1.12 0.772 0.444 0.134 -0.149 -0.437 -0.698 -0.93 -1.169 -1.419 -1.633 -1.858 -2.099 -2.278 -2.455 -2.645 -2.838 -3.038 -3.178 -3.325 -3.555 -3.726 -3.911 -4.008 -4.204 -4.41 -4.632 -4.749 -4.974 -5.118 -5.253 -5.407 -5.757 -5.949 -6.147 -6.362 -6.624 -6.934 -7.335 -8.438 -9 ,31537 ,KEBNE ,17023867,Wed Dec 22 08:38:41 CET,Wed Dec 22 10:30:15 CET,0.0 1.269 1.737 2.072 2.349 2.605 2.827 3.015 3.342 3.492 3.641 3.821 4.034 4.152 4.371 4.586 4.779 4.862 5.025 5.181 5.402 5.536 5.657 5.825 5.998 6.159 6.308 6.45 6.631 6.802 6.955 7.135 7.312 7.478 7.655 7.83 7.986 8.161 8.354 8.525 8.67 8.849 9.014 9.152 9.296 9.377 9.415 9.414 9.297 8.937 8.063 6.819 5.727 4.773 3.977 3.26 2.613 2.037 1.528 1.015 0.574 0.182 -0.183 -0.528 -0.848 -1.152 -1.473 -1.749 -1.983 -2.228 -2.487 -2.697 -2.915 -3.142 -3.323 -3.521 -3.709 -3.902 -4.116 -4.263 -4.426 -4.684 -4.855 -5.029 -5.12 -5.304 -5.496 -5.707 -5.817 -6.025 -6.165 -6.297 -6.437 -6.745 -6.91 -7.09 -7.294 -7.516 -7.773 -8.139 -8.774 -10 ,26909 ,KEBNE ,17023868,Wed Dec 22 08:38:41 CET,Wed Dec 22 10:31:23 CET,0.0 1.82 2.341 2.704 2.985 3.246 3.497 3.709 4.039 4.199 4.358 4.527 4.748 4.882 5.101 5.307 5.508 5.605 5.793 5.961 6.197 6.341 6.474 6.662 6.849 7.02 7.172 7.326 7.518 7.691 7.858 8.045 8.219 8.385 8.571 8.77 8.943 9.132 9.346 9.545 9.713 9.901 10.12 10.3 10.462 10.608 10.716 10.76 10.712 10.492 9.855 8.824 7.878 7.075 6.363 5.669 5.014 4.422 3.948 3.469 3.03 2.657 2.318 1.995 1.689 1.406 1.103 0.833 0.599 0.361 0.106 -0.111 -0.334 -0.57 -0.758 -0.949 -1.147 -1.362 -1.581 -1.728 -1.877 -2.121 -2.3 -2.477 -2.568 -2.771 -2.981 -3.202 -3.313 -3.52 -3.694 -3.837 -3.976 -4.309 -4.497 -4.689 -4.907 -5.168 -5.448 -5.794 -6.694 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_63.txt deleted file mode 100644 index acc238fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8624 ,KEBNE ,17043735,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 07:11:32 CET,0.0 1.26 1.698 2.019 2.262 2.481 2.679 2.844 3.123 3.259 3.391 3.546 3.745 3.842 4.027 4.206 4.383 4.477 4.655 4.803 5.002 5.124 5.245 5.417 5.573 5.725 5.863 5.991 6.161 6.32 6.463 6.637 6.809 6.965 7.121 7.293 7.469 7.662 7.871 8.087 8.283 8.488 8.764 9.014 9.22 9.435 9.637 9.806 9.928 9.833 9.451 8.797 8.042 7.367 6.774 6.201 5.7 5.224 4.807 4.399 4.05 3.732 3.41 3.107 2.84 2.597 2.327 2.083 1.877 1.667 1.437 1.247 1.057 0.841 0.668 0.494 0.319 0.137 -0.063 -0.199 -0.34 -0.56 -0.713 -0.872 -0.956 -1.126 -1.307 -1.512 -1.615 -1.815 -1.963 -2.096 -2.229 -2.503 -2.652 -2.825 -3.031 -3.281 -3.577 -3.96 -4.788 -2 ,32589 ,KEBNE ,17043736,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 07:11:53 CET,0.0 0.713 1.039 1.285 1.492 1.689 1.873 2.039 2.334 2.467 2.596 2.748 2.935 3.039 3.229 3.399 3.56 3.638 3.786 3.919 4.097 4.209 4.32 4.47 4.612 4.755 4.889 5.017 5.172 5.315 5.454 5.619 5.782 5.933 6.087 6.256 6.42 6.601 6.792 6.975 7.153 7.344 7.521 7.661 7.821 7.977 8.118 8.192 8.181 8.042 7.52 6.637 5.819 5.081 4.401 3.794 3.265 2.776 2.36 1.932 1.558 1.225 0.897 0.585 0.306 0.058 -0.213 -0.456 -0.658 -0.862 -1.079 -1.257 -1.434 -1.639 -1.803 -1.966 -2.131 -2.311 -2.514 -2.65 -2.787 -3.009 -3.164 -3.322 -3.402 -3.581 -3.781 -3.983 -4.091 -4.301 -4.452 -4.584 -4.722 -5.02 -5.195 -5.396 -5.62 -5.879 -6.179 -6.559 -7.638 -3 ,24543 ,KEBNE ,17043737,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 07:11:10 CET,0.0 0.973 1.369 1.658 1.899 2.096 2.266 2.438 2.747 2.877 2.99 3.118 3.317 3.421 3.62 3.799 3.965 4.044 4.189 4.328 4.527 4.649 4.766 4.945 5.109 5.261 5.417 5.557 5.724 5.873 6.007 6.171 6.328 6.465 6.618 6.795 6.972 7.153 7.328 7.503 7.683 7.876 8.079 8.28 8.468 8.623 8.795 8.893 8.932 8.871 8.375 7.563 6.778 6.028 5.346 4.764 4.268 3.794 3.396 3.008 2.654 2.345 2.047 1.75 1.483 1.238 0.968 0.726 0.516 0.3 0.069 -0.122 -0.312 -0.515 -0.675 -0.844 -1.023 -1.21 -1.4 -1.533 -1.671 -1.873 -2.019 -2.179 -2.263 -2.44 -2.629 -2.827 -2.934 -3.146 -3.295 -3.421 -3.555 -3.849 -4.012 -4.188 -4.384 -4.605 -4.871 -5.214 -6.057 -4 ,27264 ,KEBNE ,17043738,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:13:17 CET,0.0 0.953 1.319 1.587 1.813 2.017 2.201 2.36 2.62 2.742 2.863 3.013 3.212 3.311 3.499 3.665 3.824 3.902 4.041 4.168 4.353 4.473 4.592 4.767 4.928 5.059 5.183 5.313 5.477 5.634 5.787 5.956 6.102 6.251 6.429 6.612 6.792 6.977 7.159 7.357 7.562 7.765 7.955 8.138 8.325 8.466 8.604 8.713 8.701 8.547 8.081 7.307 6.59 5.922 5.336 4.762 4.244 3.798 3.402 3.002 2.642 2.319 2.009 1.712 1.434 1.173 0.908 0.674 0.463 0.239 0.005 -0.184 -0.377 -0.58 -0.744 -0.918 -1.101 -1.296 -1.494 -1.626 -1.774 -2.006 -2.156 -2.313 -2.401 -2.586 -2.77 -2.969 -3.076 -3.282 -3.409 -3.527 -3.663 -3.98 -4.149 -4.321 -4.519 -4.766 -5.05 -5.412 -6.218 -5 ,9700 ,KEBNE ,17043739,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 07:11:13 CET,0.0 1.063 1.48 1.781 2.005 2.201 2.384 2.547 2.816 2.939 3.051 3.172 3.366 3.466 3.65 3.825 3.982 4.055 4.206 4.355 4.55 4.665 4.781 4.95 5.105 5.248 5.384 5.511 5.667 5.826 5.974 6.144 6.317 6.473 6.643 6.834 7.011 7.189 7.388 7.593 7.791 8.016 8.239 8.442 8.637 8.812 8.976 9.083 9.126 9.019 8.592 7.825 7.019 6.291 5.669 5.101 4.604 4.149 3.754 3.358 3.002 2.687 2.393 2.108 1.828 1.573 1.314 1.071 0.849 0.621 0.394 0.209 0.017 -0.185 -0.357 -0.539 -0.722 -0.91 -1.099 -1.237 -1.389 -1.624 -1.781 -1.949 -2.042 -2.224 -2.408 -2.609 -2.709 -2.905 -3.043 -3.175 -3.314 -3.613 -3.785 -3.959 -4.153 -4.406 -4.688 -5.034 -5.824 -6 ,18920 ,KEBNE ,17043740,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:13:10 CET,0.0 0.833 1.155 1.425 1.66 1.874 2.059 2.227 2.52 2.644 2.756 2.881 3.075 3.168 3.368 3.559 3.73 3.815 3.963 4.097 4.285 4.402 4.511 4.668 4.821 4.968 5.111 5.253 5.428 5.587 5.746 5.932 6.099 6.252 6.414 6.582 6.742 6.928 7.11 7.279 7.457 7.647 7.855 8.057 8.258 8.435 8.552 8.598 8.624 8.496 8.004 7.153 6.273 5.49 4.828 4.238 3.719 3.242 2.82 2.398 2.044 1.737 1.431 1.147 0.888 0.656 0.408 0.172 -0.027 -0.236 -0.464 -0.658 -0.859 -1.058 -1.215 -1.386 -1.57 -1.762 -1.96 -2.099 -2.233 -2.437 -2.588 -2.745 -2.827 -3.001 -3.193 -3.394 -3.497 -3.704 -3.85 -3.98 -4.115 -4.413 -4.574 -4.755 -4.959 -5.181 -5.428 -5.755 -6.495 -7 ,7134 ,KEBNE ,17043741,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:11:17 CET,0.0 0.844 1.26 1.575 1.823 2.039 2.231 2.403 2.703 2.837 2.956 3.082 3.279 3.38 3.569 3.738 3.894 3.967 4.109 4.246 4.43 4.543 4.654 4.811 4.963 5.111 5.249 5.383 5.551 5.697 5.832 5.999 6.158 6.306 6.476 6.672 6.852 7.033 7.211 7.393 7.569 7.745 7.939 8.123 8.31 8.489 8.656 8.752 8.767 8.662 8.248 7.501 6.718 5.963 5.338 4.761 4.242 3.773 3.353 2.937 2.584 2.26 1.949 1.661 1.395 1.156 0.903 0.668 0.458 0.239 0.018 -0.162 -0.353 -0.557 -0.721 -0.891 -1.065 -1.25 -1.45 -1.587 -1.729 -1.959 -2.121 -2.294 -2.387 -2.586 -2.783 -3.002 -3.118 -3.332 -3.481 -3.609 -3.745 -4.046 -4.197 -4.362 -4.564 -4.807 -5.094 -5.487 -6.426 -8 ,9047 ,KEBNE ,17043742,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:11:36 CET,0.0 1.068 1.461 1.743 1.99 2.198 2.376 2.543 2.842 2.972 3.096 3.229 3.422 3.53 3.731 3.902 4.063 4.138 4.289 4.441 4.64 4.763 4.885 5.039 5.174 5.311 5.442 5.572 5.744 5.904 6.057 6.233 6.394 6.546 6.711 6.881 7.041 7.211 7.381 7.551 7.728 7.914 8.102 8.262 8.436 8.591 8.72 8.799 8.827 8.724 8.261 7.536 6.829 6.161 5.521 4.937 4.443 3.983 3.584 3.186 2.829 2.511 2.213 1.923 1.643 1.384 1.125 0.899 0.695 0.479 0.256 0.073 -0.122 -0.324 -0.472 -0.631 -0.811 -0.994 -1.18 -1.316 -1.457 -1.665 -1.803 -1.953 -2.033 -2.198 -2.379 -2.584 -2.692 -2.9 -3.029 -3.15 -3.286 -3.581 -3.743 -3.914 -4.119 -4.376 -4.681 -5.087 -6.265 -9 ,15923 ,KEBNE ,17043743,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:11:15 CET,0.0 0.858 1.203 1.478 1.695 1.873 2.034 2.196 2.487 2.615 2.741 2.893 3.088 3.188 3.37 3.537 3.689 3.763 3.913 4.055 4.25 4.375 4.497 4.663 4.821 4.971 5.111 5.253 5.434 5.598 5.744 5.917 6.085 6.235 6.395 6.567 6.73 6.904 7.091 7.264 7.437 7.64 7.852 8.049 8.259 8.454 8.592 8.648 8.645 8.47 7.833 6.812 5.925 5.174 4.516 3.918 3.388 2.915 2.495 2.06 1.706 1.373 1.038 0.737 0.466 0.21 -0.057 -0.302 -0.517 -0.736 -0.969 -1.167 -1.366 -1.565 -1.728 -1.899 -2.077 -2.277 -2.481 -2.617 -2.752 -2.967 -3.124 -3.292 -3.385 -3.573 -3.76 -3.969 -4.087 -4.307 -4.457 -4.584 -4.715 -5.009 -5.17 -5.346 -5.558 -5.804 -6.084 -6.441 -7.664 -10 ,7543 ,KEBNE ,17043744,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:12:33 CET,0.0 1.105 1.527 1.855 2.13 2.364 2.56 2.737 3.055 3.188 3.315 3.46 3.659 3.758 3.952 4.144 4.322 4.406 4.559 4.693 4.876 4.997 5.113 5.29 5.462 5.611 5.757 5.9 6.084 6.26 6.41 6.592 6.771 6.935 7.112 7.31 7.514 7.701 7.874 8.064 8.25 8.461 8.684 8.872 9.037 9.155 9.252 9.31 9.266 9.017 8.436 7.544 6.702 5.99 5.397 4.817 4.285 3.807 3.389 2.975 2.614 2.277 1.96 1.669 1.398 1.157 0.91 0.685 0.485 0.264 0.034 -0.155 -0.356 -0.553 -0.703 -0.862 -1.036 -1.216 -1.404 -1.536 -1.668 -1.883 -2.032 -2.186 -2.27 -2.451 -2.645 -2.85 -2.958 -3.168 -3.321 -3.455 -3.584 -3.885 -4.056 -4.238 -4.452 -4.694 -4.976 -5.364 -6.231 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_62.txt deleted file mode 100644 index 191cd6b1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23735 ,KEBNE ,16677143,Wed Nov 24 17:13:01 CET,Wed Nov 24 19:10:34 CET,0.0 0.706 1.044 1.309 1.538 1.742 1.927 2.095 2.402 2.548 2.687 2.829 3.034 3.139 3.331 3.511 3.685 3.77 3.931 4.081 4.297 4.44 4.587 4.79 4.973 5.161 5.34 5.509 5.731 5.937 6.132 6.361 6.574 6.787 7.032 7.305 7.568 7.852 8.156 8.479 8.811 9.187 9.636 10.068 10.572 11.14 11.771 12.437 13.205 14.086 15.001 15.599 15.782 15.769 15.692 15.56 15.397 15.194 15.002 14.817 14.626 14.43 14.234 14.045 13.868 13.71 13.541 13.376 13.228 13.063 12.893 12.757 12.612 12.457 12.333 12.201 12.06 11.909 11.749 11.634 11.512 11.323 11.187 11.033 10.953 10.8 10.63 10.428 10.321 10.118 9.965 9.835 9.698 9.401 9.237 9.036 8.815 8.588 8.312 7.939 7.058 -2 ,599 ,KEBNE ,16677144,Wed Nov 24 17:13:02 CET,Wed Nov 24 19:07:43 CET,0.0 0.823 1.18 1.445 1.671 1.865 2.047 2.22 2.52 2.656 2.784 2.935 3.155 3.265 3.474 3.675 3.856 3.935 4.084 4.231 4.458 4.606 4.742 4.922 5.094 5.266 5.445 5.619 5.837 6.044 6.233 6.466 6.679 6.879 7.112 7.385 7.654 7.923 8.206 8.508 8.826 9.196 9.622 10.041 10.533 11.067 11.645 12.31 13.123 13.999 14.832 15.295 15.429 15.44 15.376 15.244 15.086 14.891 14.682 14.483 14.303 14.127 13.942 13.758 13.583 13.415 13.228 13.056 12.894 12.728 12.567 12.425 12.276 12.115 11.979 11.831 11.685 11.536 11.36 11.234 11.114 10.92 10.777 10.629 10.55 10.381 10.205 10.018 9.918 9.727 9.611 9.494 9.364 9.077 8.911 8.725 8.524 8.264 7.932 7.547 6.638 -3 ,24756 ,KEBNE ,16677145,Wed Nov 24 17:14:04 CET,Wed Nov 24 19:07:05 CET,0.0 0.818 1.101 1.353 1.589 1.795 1.973 2.13 2.418 2.548 2.685 2.84 3.04 3.137 3.321 3.493 3.658 3.744 3.912 4.061 4.272 4.407 4.537 4.72 4.895 5.072 5.245 5.419 5.65 5.86 6.048 6.271 6.489 6.701 6.939 7.191 7.438 7.713 7.996 8.294 8.615 8.973 9.387 9.789 10.235 10.754 11.353 11.997 12.709 13.515 14.4 14.984 15.188 15.147 14.968 14.744 14.54 14.356 14.191 14.002 13.834 13.68 13.503 13.328 13.147 12.968 12.783 12.614 12.472 12.325 12.168 12.024 11.856 11.689 11.565 11.434 11.29 11.137 10.975 10.853 10.727 10.524 10.382 10.232 10.155 9.996 9.827 9.646 9.553 9.369 9.242 9.123 8.991 8.682 8.51 8.323 8.107 7.871 7.614 7.285 6.318 -4 ,8809 ,KEBNE ,16677146,Wed Nov 24 17:14:04 CET,Wed Nov 24 19:07:20 CET,0.0 0.762 1.112 1.381 1.602 1.788 1.961 2.116 2.387 2.506 2.621 2.754 2.957 3.059 3.251 3.438 3.601 3.679 3.838 3.991 4.201 4.338 4.479 4.679 4.868 5.043 5.208 5.369 5.577 5.786 5.984 6.214 6.435 6.642 6.886 7.166 7.433 7.714 8.011 8.322 8.649 9.029 9.48 9.925 10.435 10.986 11.585 12.218 12.942 13.769 14.684 15.313 15.59 15.689 15.663 15.551 15.386 15.225 15.073 14.893 14.723 14.555 14.389 14.23 14.068 13.905 13.72 13.565 13.436 13.287 13.118 12.973 12.825 12.669 12.551 12.421 12.278 12.122 11.954 11.84 11.725 11.551 11.424 11.284 11.21 11.057 10.887 10.701 10.605 10.414 10.288 10.177 10.057 9.76 9.6 9.436 9.231 9.0 8.733 8.36 7.644 -5 ,15441 ,KEBNE ,16677147,Wed Nov 24 17:14:03 CET,Wed Nov 24 19:14:13 CET,0.0 0.877 1.226 1.509 1.743 1.941 2.11 2.268 2.559 2.692 2.814 2.946 3.154 3.262 3.461 3.645 3.819 3.898 4.051 4.196 4.416 4.565 4.706 4.89 5.049 5.211 5.375 5.536 5.746 5.947 6.142 6.369 6.575 6.77 6.993 7.244 7.491 7.762 8.04 8.341 8.686 9.083 9.522 9.945 10.414 10.928 11.534 12.147 12.795 13.553 14.375 14.9 15.094 15.115 15.02 14.848 14.656 14.458 14.266 14.032 13.817 13.638 13.453 13.263 13.073 12.897 12.711 12.544 12.408 12.254 12.087 11.945 11.786 11.623 11.496 11.36 11.221 11.072 10.913 10.799 10.684 10.504 10.359 10.206 10.132 9.972 9.785 9.592 9.496 9.302 9.171 9.047 8.915 8.654 8.494 8.304 8.1 7.882 7.611 7.227 6.35 -6 ,20014 ,KEBNE ,16674854,Tue Nov 23 21:02:27 CET,Tue Nov 23 22:54:22 CET,0.0 0.668 1.016 1.295 1.55 1.769 1.959 2.141 2.47 2.618 2.746 2.89 3.1 3.204 3.404 3.598 3.78 3.868 4.037 4.194 4.424 4.567 4.693 4.869 5.04 5.212 5.387 5.556 5.761 5.961 6.152 6.374 6.587 6.781 7.002 7.261 7.506 7.771 8.059 8.37 8.702 9.069 9.471 9.867 10.329 10.861 11.457 12.107 12.834 13.58 14.427 14.958 15.111 15.083 14.986 14.858 14.679 14.478 14.313 14.126 13.92 13.734 13.55 13.363 13.184 13.026 12.848 12.663 12.497 12.329 12.157 12.003 11.844 11.673 11.53 11.385 11.239 11.089 10.935 10.825 10.706 10.511 10.372 10.23 10.153 9.986 9.816 9.635 9.535 9.342 9.196 9.073 8.942 8.651 8.49 8.321 8.116 7.873 7.591 7.192 6.329 -7 ,27145 ,KEBNE ,16674855,Tue Nov 23 21:02:27 CET,Tue Nov 23 22:54:17 CET,0.0 0.962 1.332 1.601 1.822 2.014 2.19 2.361 2.675 2.815 2.941 3.069 3.28 3.389 3.602 3.794 3.97 4.058 4.221 4.375 4.592 4.736 4.878 5.073 5.254 5.43 5.597 5.759 5.976 6.179 6.373 6.607 6.837 7.055 7.302 7.584 7.84 8.132 8.445 8.758 9.104 9.469 9.867 10.267 10.725 11.229 11.796 12.437 13.14 13.895 14.72 15.212 15.332 15.283 15.146 14.97 14.787 14.599 14.425 14.235 14.032 13.828 13.649 13.474 13.301 13.133 12.945 12.766 12.598 12.428 12.277 12.149 11.998 11.834 11.703 11.565 11.424 11.28 11.122 11.009 10.889 10.69 10.552 10.411 10.337 10.183 10.02 9.844 9.749 9.551 9.409 9.293 9.161 8.865 8.697 8.498 8.276 8.024 7.729 7.359 6.655 -8 ,13671 ,KEBNE ,16677150,Wed Nov 24 17:14:04 CET,Wed Nov 24 19:09:07 CET,0.0 0.848 1.191 1.468 1.676 1.855 2.029 2.19 2.48 2.609 2.726 2.847 3.049 3.15 3.346 3.523 3.688 3.773 3.94 4.093 4.314 4.45 4.579 4.769 4.951 5.126 5.293 5.462 5.674 5.867 6.056 6.289 6.505 6.709 6.953 7.227 7.489 7.779 8.095 8.43 8.77 9.143 9.572 10.024 10.548 11.082 11.686 12.304 12.935 13.649 14.439 15.009 15.216 15.226 15.131 14.964 14.765 14.573 14.408 14.196 13.982 13.796 13.61 13.429 13.262 13.104 12.926 12.759 12.61 12.443 12.26 12.11 11.95 11.786 11.66 11.523 11.374 11.22 11.071 10.964 10.842 10.653 10.524 10.383 10.311 10.153 9.973 9.784 9.683 9.487 9.339 9.216 9.08 8.777 8.611 8.43 8.225 7.979 7.684 7.322 6.558 -9 ,13384 ,KEBNE ,16677151,Wed Nov 24 17:15:05 CET,Wed Nov 24 19:07:43 CET,0.0 0.919 1.304 1.565 1.792 1.989 2.161 2.322 2.638 2.773 2.896 3.046 3.252 3.35 3.542 3.731 3.912 4.001 4.168 4.317 4.532 4.675 4.814 5.024 5.222 5.393 5.554 5.712 5.918 6.118 6.311 6.533 6.737 6.937 7.178 7.453 7.723 8.014 8.31 8.627 8.967 9.341 9.755 10.166 10.653 11.179 11.756 12.398 13.106 13.894 14.718 15.202 15.358 15.353 15.282 15.153 15.005 14.858 14.708 14.517 14.338 14.172 13.996 13.811 13.632 13.464 13.271 13.098 12.942 12.781 12.621 12.486 12.336 12.179 12.055 11.921 11.781 11.618 11.439 11.321 11.194 10.985 10.837 10.684 10.599 10.42 10.25 10.075 9.98 9.794 9.679 9.562 9.425 9.143 8.993 8.82 8.613 8.35 8.045 7.673 6.67 -10 ,16205 ,KEBNE ,16674858,Tue Nov 23 21:02:27 CET,Tue Nov 23 22:54:16 CET,0.0 0.774 1.143 1.414 1.625 1.811 1.988 2.137 2.406 2.548 2.687 2.839 3.046 3.149 3.35 3.538 3.71 3.791 3.947 4.099 4.316 4.456 4.588 4.779 4.968 5.145 5.309 5.462 5.661 5.856 6.044 6.264 6.472 6.678 6.915 7.179 7.434 7.713 8.0 8.289 8.601 8.965 9.407 9.848 10.337 10.878 11.475 12.112 12.816 13.614 14.462 14.997 15.192 15.18 15.064 14.91 14.728 14.556 14.399 14.225 14.049 13.888 13.724 13.543 13.376 13.22 13.035 12.872 12.732 12.581 12.427 12.293 12.142 11.97 11.832 11.694 11.563 11.427 11.272 11.162 11.043 10.857 10.731 10.593 10.521 10.365 10.187 9.986 9.873 9.676 9.551 9.44 9.323 9.039 8.875 8.695 8.489 8.254 7.946 7.523 6.391 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_64.txt deleted file mode 100644 index eddfef35..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_64.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29529 ,KEBNE ,17043745,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:11:30 CET,0.0 1.003 1.408 1.715 1.964 2.177 2.363 2.532 2.834 2.973 3.101 3.239 3.449 3.559 3.745 3.906 4.075 4.156 4.304 4.446 4.629 4.74 4.848 5.008 5.163 5.314 5.458 5.6 5.789 5.961 6.112 6.281 6.433 6.581 6.766 6.974 7.16 7.333 7.49 7.65 7.805 7.969 8.136 8.279 8.452 8.631 8.774 8.804 8.703 8.417 7.696 6.644 5.748 4.967 4.267 3.625 3.056 2.526 2.05 1.58 1.169 0.795 0.448 0.13 -0.168 -0.448 -0.75 -1.03 -1.275 -1.52 -1.768 -1.983 -2.202 -2.42 -2.596 -2.78 -2.969 -3.176 -3.383 -3.522 -3.672 -3.911 -4.085 -4.261 -4.353 -4.55 -4.75 -4.959 -5.074 -5.302 -5.461 -5.611 -5.766 -6.103 -6.305 -6.52 -6.758 -7.016 -7.301 -7.695 -8.57 -3 ,31448 ,KEBNE ,17043747,Thu Dec 23 05:19:50 CET,Thu Dec 23 07:09:49 CET,0.0 0.983 1.376 1.674 1.923 2.152 2.355 2.532 2.855 3.004 3.141 3.28 3.488 3.597 3.785 3.955 4.128 4.207 4.349 4.483 4.662 4.779 4.895 5.059 5.213 5.373 5.521 5.643 5.798 5.945 6.08 6.243 6.401 6.543 6.695 6.864 7.012 7.17 7.335 7.482 7.617 7.759 7.927 8.066 8.207 8.341 8.408 8.452 8.422 8.157 7.493 6.535 5.702 4.94 4.235 3.597 3.054 2.573 2.141 1.689 1.296 0.951 0.618 0.304 0.01 -0.26 -0.549 -0.813 -1.047 -1.302 -1.556 -1.765 -1.985 -2.21 -2.383 -2.562 -2.746 -2.927 -3.123 -3.262 -3.408 -3.656 -3.842 -4.021 -4.104 -4.285 -4.488 -4.71 -4.827 -5.053 -5.22 -5.365 -5.515 -5.833 -6.026 -6.237 -6.458 -6.725 -7.02 -7.419 -8.125 -4 ,12896 ,KEBNE ,17043748,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:12:23 CET,0.0 1.011 1.481 1.818 2.054 2.273 2.469 2.644 2.966 3.107 3.239 3.369 3.571 3.68 3.893 4.088 4.249 4.331 4.493 4.633 4.826 4.951 5.073 5.224 5.37 5.525 5.668 5.798 5.954 6.114 6.262 6.415 6.561 6.704 6.859 7.02 7.169 7.329 7.486 7.642 7.792 7.945 8.111 8.254 8.419 8.573 8.656 8.649 8.532 8.268 7.625 6.63 5.742 4.967 4.285 3.652 3.064 2.519 2.049 1.578 1.168 0.804 0.471 0.171 -0.12 -0.395 -0.678 -0.936 -1.166 -1.39 -1.61 -1.803 -2.015 -2.237 -2.416 -2.602 -2.785 -2.981 -3.181 -3.32 -3.466 -3.693 -3.855 -4.034 -4.127 -4.304 -4.498 -4.722 -4.846 -5.077 -5.225 -5.358 -5.508 -5.841 -6.03 -6.23 -6.447 -6.727 -7.059 -7.473 -8.82 -5 ,29988 ,KEBNE ,17043749,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 07:13:35 CET,0.0 1.123 1.511 1.821 2.088 2.305 2.488 2.652 2.944 3.078 3.212 3.362 3.564 3.664 3.847 4.02 4.184 4.265 4.421 4.557 4.739 4.858 4.978 5.146 5.297 5.441 5.575 5.695 5.852 6.004 6.148 6.318 6.476 6.624 6.778 6.933 7.086 7.254 7.432 7.594 7.752 7.93 8.114 8.286 8.451 8.588 8.688 8.76 8.743 8.487 7.807 6.803 5.94 5.16 4.455 3.806 3.24 2.739 2.304 1.857 1.453 1.089 0.749 0.431 0.136 -0.14 -0.423 -0.664 -0.881 -1.121 -1.376 -1.582 -1.794 -2.024 -2.214 -2.412 -2.615 -2.819 -3.027 -3.178 -3.334 -3.572 -3.743 -3.923 -4.02 -4.23 -4.438 -4.662 -4.783 -5.013 -5.15 -5.293 -5.454 -5.81 -6.008 -6.225 -6.463 -6.722 -7.021 -7.412 -8.348 -6 ,3383 ,KEBNE ,17043750,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:12:21 CET,0.0 0.99 1.405 1.7 1.939 2.138 2.314 2.479 2.774 2.906 3.032 3.169 3.364 3.459 3.632 3.798 3.946 4.012 4.142 4.272 4.456 4.57 4.671 4.822 4.968 5.105 5.233 5.351 5.498 5.629 5.762 5.925 6.061 6.184 6.332 6.494 6.646 6.796 6.941 7.079 7.215 7.378 7.539 7.677 7.84 8.009 8.15 8.227 8.146 7.833 7.103 5.989 4.972 4.136 3.445 2.79 2.211 1.684 1.224 0.774 0.376 0.026 -0.298 -0.601 -0.896 -1.169 -1.452 -1.701 -1.932 -2.176 -2.424 -2.633 -2.842 -3.057 -3.223 -3.4 -3.593 -3.788 -3.979 -4.116 -4.258 -4.48 -4.632 -4.798 -4.893 -5.084 -5.267 -5.451 -5.552 -5.774 -5.934 -6.073 -6.213 -6.525 -6.708 -6.911 -7.127 -7.362 -7.63 -8.026 -9.071 -7 ,22853 ,KEBNE ,17043751,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 07:11:31 CET,0.0 0.969 1.355 1.65 1.905 2.116 2.294 2.468 2.771 2.902 3.03 3.171 3.383 3.488 3.674 3.852 4.018 4.102 4.26 4.396 4.584 4.699 4.809 4.968 5.123 5.274 5.414 5.549 5.71 5.861 6.02 6.19 6.347 6.51 6.68 6.839 6.981 7.124 7.271 7.416 7.573 7.736 7.885 8.025 8.148 8.247 8.34 8.352 8.26 8.008 7.331 6.263 5.273 4.405 3.643 2.969 2.403 1.895 1.457 1.019 0.644 0.299 -0.038 -0.347 -0.63 -0.894 -1.177 -1.431 -1.652 -1.886 -2.141 -2.347 -2.551 -2.778 -2.96 -3.131 -3.306 -3.497 -3.7 -3.848 -4.006 -4.258 -4.431 -4.603 -4.692 -4.882 -5.098 -5.315 -5.426 -5.654 -5.802 -5.943 -6.085 -6.392 -6.576 -6.779 -7.0 -7.251 -7.535 -7.903 -8.756 -8 ,8292 ,KEBNE ,17043752,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 07:11:35 CET,0.0 0.86 1.265 1.573 1.828 2.047 2.233 2.396 2.685 2.82 2.946 3.08 3.279 3.386 3.589 3.758 3.92 4.003 4.155 4.295 4.49 4.604 4.715 4.876 5.034 5.178 5.301 5.415 5.57 5.715 5.839 6.005 6.173 6.32 6.483 6.658 6.806 6.954 7.112 7.276 7.433 7.592 7.755 7.893 8.043 8.175 8.235 8.242 8.159 7.878 7.214 6.219 5.323 4.547 3.871 3.248 2.677 2.168 1.731 1.278 0.883 0.524 0.184 -0.136 -0.436 -0.701 -0.985 -1.25 -1.478 -1.716 -1.961 -2.167 -2.387 -2.599 -2.762 -2.933 -3.108 -3.295 -3.492 -3.636 -3.789 -4.03 -4.194 -4.369 -4.462 -4.647 -4.839 -5.057 -5.179 -5.41 -5.566 -5.701 -5.844 -6.177 -6.369 -6.581 -6.806 -7.065 -7.383 -7.772 -8.67 -9 ,31027 ,KEBNE ,17043753,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:11:15 CET,0.0 1.044 1.45 1.765 2.02 2.23 2.422 2.605 2.907 3.045 3.178 3.311 3.512 3.605 3.788 3.966 4.126 4.205 4.352 4.473 4.641 4.755 4.862 5.005 5.143 5.278 5.401 5.52 5.677 5.833 5.973 6.113 6.257 6.407 6.567 6.725 6.859 7.004 7.157 7.301 7.45 7.599 7.726 7.829 7.937 8.024 8.083 8.07 7.91 7.559 6.805 5.723 4.775 3.964 3.281 2.673 2.108 1.574 1.142 0.71 0.324 -0.025 -0.353 -0.665 -0.962 -1.221 -1.502 -1.77 -1.99 -2.21 -2.444 -2.634 -2.824 -3.033 -3.199 -3.377 -3.569 -3.764 -3.968 -4.112 -4.254 -4.478 -4.643 -4.816 -4.912 -5.121 -5.329 -5.549 -5.664 -5.889 -6.06 -6.202 -6.352 -6.694 -6.89 -7.093 -7.315 -7.58 -7.913 -8.37 -9.283 -10 ,1982 ,KEBNE ,17043754,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:11:16 CET,0.0 0.903 1.292 1.592 1.824 2.018 2.217 2.4 2.706 2.84 2.955 3.08 3.28 3.384 3.569 3.736 3.888 3.959 4.091 4.209 4.381 4.495 4.611 4.771 4.913 5.038 5.157 5.286 5.453 5.592 5.726 5.886 6.016 6.141 6.283 6.428 6.57 6.726 6.885 7.049 7.194 7.355 7.54 7.689 7.836 7.975 8.071 8.099 8.06 7.774 6.98 5.883 4.965 4.188 3.497 2.856 2.293 1.814 1.411 0.988 0.612 0.273 -0.042 -0.347 -0.646 -0.921 -1.229 -1.506 -1.74 -1.979 -2.214 -2.41 -2.624 -2.861 -3.048 -3.236 -3.426 -3.629 -3.842 -3.994 -4.149 -4.379 -4.544 -4.724 -4.824 -5.025 -5.221 -5.435 -5.554 -5.784 -5.922 -6.06 -6.207 -6.533 -6.718 -6.922 -7.139 -7.389 -7.681 -8.031 -8.994 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_65.txt deleted file mode 100644 index 990102d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2586 ,KEBNE ,17043755,Thu Dec 23 05:19:48 CET,Thu Dec 23 07:11:44 CET,0.0 0.952 1.353 1.633 1.861 2.056 2.245 2.415 2.697 2.823 2.943 3.065 3.264 3.367 3.547 3.723 3.9 3.98 4.133 4.277 4.466 4.578 4.689 4.841 4.974 5.095 5.208 5.327 5.484 5.629 5.757 5.899 6.04 6.176 6.327 6.494 6.646 6.785 6.938 7.102 7.254 7.415 7.589 7.742 7.89 7.988 8.053 8.073 7.897 7.465 6.611 5.42 4.37 3.412 2.576 1.853 1.226 0.644 0.157 -0.312 -0.728 -1.107 -1.469 -1.817 -2.147 -2.45 -2.77 -3.049 -3.302 -3.57 -3.84 -4.056 -4.275 -4.514 -4.694 -4.874 -5.072 -5.281 -5.495 -5.639 -5.796 -6.043 -6.209 -6.385 -6.481 -6.678 -6.884 -7.11 -7.233 -7.475 -7.637 -7.779 -7.935 -8.285 -8.472 -8.671 -8.894 -9.144 -9.434 -9.838 -11.004 -2 ,27560 ,KEBNE ,17043756,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:11:27 CET,0.0 0.994 1.381 1.684 1.931 2.133 2.312 2.472 2.762 2.901 3.031 3.17 3.375 3.474 3.66 3.828 3.98 4.05 4.196 4.328 4.49 4.59 4.69 4.849 4.998 5.129 5.259 5.378 5.528 5.675 5.814 5.981 6.135 6.273 6.414 6.565 6.708 6.875 7.047 7.197 7.337 7.489 7.637 7.751 7.878 8.011 8.117 8.15 8.041 7.713 6.886 5.653 4.655 3.799 3.037 2.37 1.771 1.208 0.722 0.226 -0.202 -0.568 -0.927 -1.28 -1.598 -1.887 -2.182 -2.46 -2.713 -2.961 -3.224 -3.446 -3.665 -3.882 -4.058 -4.252 -4.453 -4.656 -4.872 -5.028 -5.187 -5.428 -5.597 -5.775 -5.867 -6.062 -6.272 -6.496 -6.607 -6.828 -6.967 -7.101 -7.235 -7.542 -7.713 -7.897 -8.114 -8.346 -8.638 -9.054 -9.947 -3 ,20877 ,KEBNE ,17043757,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:10:50 CET,0.0 0.9 1.362 1.686 1.916 2.141 2.347 2.531 2.84 2.967 3.093 3.214 3.407 3.505 3.694 3.859 4.014 4.091 4.236 4.36 4.521 4.631 4.745 4.902 5.051 5.196 5.33 5.457 5.612 5.74 5.861 6.007 6.144 6.275 6.416 6.56 6.696 6.849 7.003 7.14 7.279 7.403 7.51 7.612 7.713 7.831 7.893 7.849 7.76 7.52 6.654 5.348 4.313 3.39 2.579 1.835 1.181 0.598 0.081 -0.445 -0.9 -1.3 -1.676 -2.027 -2.345 -2.646 -2.97 -3.249 -3.484 -3.722 -3.972 -4.187 -4.409 -4.636 -4.816 -5.005 -5.201 -5.395 -5.615 -5.782 -5.943 -6.185 -6.355 -6.541 -6.639 -6.829 -7.029 -7.249 -7.364 -7.59 -7.743 -7.89 -8.05 -8.409 -8.595 -8.788 -8.998 -9.265 -9.581 -9.963 -10.981 -4 ,4159 ,KEBNE ,17043758,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 07:11:13 CET,0.0 0.733 1.141 1.416 1.654 1.877 2.071 2.241 2.544 2.685 2.82 2.973 3.167 3.254 3.422 3.592 3.753 3.828 3.97 4.102 4.29 4.396 4.486 4.621 4.759 4.886 5.004 5.111 5.249 5.387 5.511 5.667 5.82 5.953 6.109 6.263 6.397 6.538 6.681 6.832 6.98 7.144 7.294 7.428 7.555 7.636 7.697 7.686 7.542 7.167 6.371 5.27 4.248 3.309 2.494 1.763 1.14 0.564 0.06 -0.434 -0.87 -1.249 -1.598 -1.933 -2.25 -2.53 -2.824 -3.091 -3.318 -3.551 -3.806 -4.018 -4.24 -4.48 -4.655 -4.829 -5.012 -5.211 -5.434 -5.589 -5.741 -5.978 -6.146 -6.322 -6.412 -6.601 -6.801 -7.018 -7.132 -7.364 -7.514 -7.65 -7.795 -8.136 -8.322 -8.515 -8.735 -8.989 -9.29 -9.696 -10.683 -5 ,27961 ,KEBNE ,17043759,Thu Dec 23 05:19:48 CET,Thu Dec 23 07:12:53 CET,0.0 1.005 1.398 1.686 1.907 2.099 2.267 2.417 2.713 2.849 2.972 3.098 3.293 3.385 3.561 3.726 3.879 3.949 4.08 4.205 4.388 4.508 4.617 4.764 4.897 5.019 5.138 5.252 5.4 5.545 5.676 5.817 5.94 6.055 6.187 6.338 6.464 6.589 6.735 6.879 7.022 7.167 7.298 7.435 7.598 7.731 7.843 7.872 7.755 7.414 6.546 5.327 4.266 3.386 2.654 1.976 1.355 0.783 0.29 -0.202 -0.619 -1.001 -1.381 -1.732 -2.048 -2.329 -2.613 -2.876 -3.099 -3.339 -3.603 -3.822 -4.054 -4.301 -4.495 -4.69 -4.893 -5.101 -5.318 -5.472 -5.627 -5.875 -6.053 -6.231 -6.327 -6.529 -6.735 -6.952 -7.069 -7.299 -7.443 -7.593 -7.756 -8.086 -8.26 -8.461 -8.709 -8.992 -9.316 -9.74 -10.805 -6 ,17031 ,KEBNE ,17043760,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:12:14 CET,0.0 0.963 1.282 1.542 1.753 1.935 2.099 2.25 2.538 2.67 2.793 2.938 3.142 3.239 3.421 3.587 3.745 3.818 3.958 4.091 4.286 4.41 4.522 4.679 4.831 4.963 5.084 5.2 5.34 5.47 5.593 5.743 5.878 6.004 6.154 6.315 6.473 6.638 6.801 6.959 7.117 7.28 7.42 7.538 7.656 7.732 7.749 7.678 7.48 7.152 6.424 5.335 4.348 3.477 2.741 2.049 1.412 0.816 0.312 -0.165 -0.572 -0.924 -1.249 -1.566 -1.89 -2.195 -2.507 -2.776 -3.01 -3.25 -3.496 -3.701 -3.922 -4.148 -4.316 -4.498 -4.69 -4.885 -5.094 -5.237 -5.381 -5.614 -5.787 -5.96 -6.046 -6.235 -6.44 -6.654 -6.77 -7.004 -7.154 -7.292 -7.441 -7.752 -7.913 -8.112 -8.353 -8.614 -8.909 -9.295 -10.739 -7 ,2739 ,KEBNE ,17043761,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:13:15 CET,0.0 0.971 1.361 1.66 1.913 2.113 2.279 2.439 2.737 2.865 2.989 3.133 3.339 3.446 3.643 3.799 3.948 4.02 4.143 4.261 4.438 4.552 4.664 4.819 4.962 5.102 5.246 5.377 5.516 5.654 5.792 5.943 6.081 6.217 6.378 6.546 6.706 6.871 7.02 7.156 7.292 7.423 7.544 7.666 7.784 7.85 7.883 7.835 7.643 7.271 6.378 5.121 4.072 3.15 2.346 1.613 0.964 0.383 -0.14 -0.674 -1.138 -1.557 -1.94 -2.29 -2.627 -2.934 -3.243 -3.519 -3.76 -4.006 -4.25 -4.473 -4.715 -4.954 -5.136 -5.324 -5.514 -5.709 -5.919 -6.069 -6.229 -6.477 -6.647 -6.839 -6.936 -7.148 -7.376 -7.6 -7.719 -7.95 -8.085 -8.223 -8.376 -8.697 -8.869 -9.07 -9.3 -9.545 -9.839 -10.26 -11.533 -8 ,27995 ,KEBNE ,17043762,Thu Dec 23 05:19:48 CET,Thu Dec 23 07:11:23 CET,0.0 0.962 1.325 1.588 1.82 2.009 2.17 2.327 2.59 2.717 2.849 2.972 3.156 3.244 3.408 3.569 3.719 3.792 3.938 4.075 4.251 4.352 4.449 4.593 4.731 4.861 4.988 5.109 5.248 5.37 5.494 5.651 5.799 5.918 6.028 6.159 6.28 6.395 6.518 6.65 6.774 6.898 7.036 7.154 7.258 7.366 7.458 7.435 7.29 6.966 6.12 4.892 3.858 2.963 2.192 1.484 0.887 0.384 -0.088 -0.576 -1.005 -1.386 -1.739 -2.074 -2.401 -2.705 -3.005 -3.278 -3.509 -3.76 -4.036 -4.255 -4.477 -4.704 -4.883 -5.069 -5.263 -5.472 -5.686 -5.824 -5.971 -6.215 -6.38 -6.552 -6.642 -6.838 -7.046 -7.256 -7.374 -7.605 -7.745 -7.887 -8.032 -8.333 -8.493 -8.67 -8.876 -9.12 -9.425 -9.831 -10.781 -9 ,27344 ,KEBNE ,17043763,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 07:11:56 CET,0.0 1.173 1.578 1.859 2.091 2.303 2.488 2.651 2.941 3.075 3.205 3.35 3.552 3.652 3.843 4.019 4.176 4.25 4.397 4.546 4.745 4.863 4.975 5.131 5.279 5.414 5.547 5.676 5.822 5.947 6.074 6.235 6.381 6.512 6.654 6.805 6.947 7.094 7.232 7.363 7.487 7.62 7.766 7.87 7.943 7.987 7.983 7.902 7.704 7.258 6.391 5.279 4.237 3.297 2.495 1.799 1.201 0.655 0.161 -0.335 -0.751 -1.133 -1.495 -1.83 -2.129 -2.405 -2.717 -2.998 -3.239 -3.487 -3.74 -3.947 -4.16 -4.387 -4.569 -4.753 -4.95 -5.168 -5.392 -5.55 -5.712 -5.954 -6.122 -6.293 -6.39 -6.601 -6.809 -7.025 -7.136 -7.36 -7.51 -7.649 -7.788 -8.117 -8.302 -8.5 -8.73 -8.977 -9.274 -9.668 -10.575 -10 ,23117 ,KEBNE ,17043764,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 07:11:17 CET,0.0 0.964 1.408 1.725 1.974 2.176 2.343 2.5 2.801 2.934 3.049 3.176 3.368 3.467 3.641 3.794 3.946 4.019 4.153 4.286 4.468 4.577 4.688 4.845 4.979 5.104 5.223 5.335 5.491 5.637 5.763 5.907 6.044 6.171 6.313 6.461 6.601 6.735 6.85 6.968 7.09 7.222 7.372 7.482 7.569 7.643 7.655 7.58 7.398 6.992 6.142 4.984 3.954 3.001 2.164 1.429 0.826 0.305 -0.148 -0.607 -1.017 -1.381 -1.737 -2.086 -2.421 -2.721 -3.02 -3.293 -3.527 -3.763 -4.009 -4.215 -4.432 -4.657 -4.828 -5.006 -5.2 -5.407 -5.615 -5.755 -5.907 -6.152 -6.32 -6.5 -6.595 -6.786 -6.985 -7.196 -7.307 -7.534 -7.685 -7.818 -7.963 -8.293 -8.474 -8.669 -8.886 -9.133 -9.429 -9.864 -11.162 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_64_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_64_63.txt deleted file mode 100644 index c18a9ed9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_64_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11981 ,KEBNE ,16674859,Tue Nov 23 21:11:49 CET,Tue Nov 23 23:04:27 CET,0.0 0.983 1.33 1.615 1.87 2.084 2.275 2.459 2.793 2.938 3.073 3.232 3.461 3.581 3.811 4.014 4.21 4.308 4.489 4.654 4.903 5.063 5.208 5.405 5.589 5.766 5.94 6.12 6.358 6.574 6.782 7.037 7.267 7.486 7.745 8.031 8.304 8.605 8.915 9.246 9.6 9.986 10.425 10.864 11.378 11.941 12.58 13.287 14.107 15.062 16.105 16.754 17.029 17.124 17.097 17.023 16.903 16.737 16.566 16.373 16.202 16.056 15.915 15.776 15.632 15.482 15.304 15.14 15.0 14.85 14.686 14.55 14.41 14.254 14.13 13.999 13.859 13.701 13.523 13.399 13.276 13.086 12.948 12.798 12.719 12.542 12.347 12.135 12.021 11.815 11.676 11.54 11.397 11.081 10.908 10.718 10.494 10.228 9.908 9.48 8.502 -2 ,17678 ,KEBNE ,16674860,Tue Nov 23 21:11:49 CET,Tue Nov 23 23:04:07 CET,0.0 1.061 1.493 1.808 2.057 2.27 2.473 2.674 3.017 3.165 3.304 3.458 3.68 3.795 4.004 4.184 4.37 4.464 4.637 4.79 5.004 5.144 5.282 5.494 5.703 5.903 6.086 6.26 6.487 6.689 6.888 7.129 7.351 7.566 7.815 8.098 8.36 8.649 8.972 9.301 9.644 10.027 10.456 10.895 11.399 11.959 12.577 13.23 13.953 14.706 15.548 16.188 16.467 16.496 16.418 16.312 16.222 16.127 16.003 15.842 15.679 15.536 15.399 15.255 15.114 14.972 14.811 14.653 14.513 14.376 14.229 14.1 13.963 13.812 13.69 13.556 13.411 13.253 13.085 12.975 12.865 12.695 12.563 12.416 12.342 12.186 12.01 11.815 11.714 11.516 11.381 11.263 11.136 10.83 10.651 10.477 10.283 10.044 9.756 9.381 8.348 -3 ,14044 ,KEBNE ,16674861,Tue Nov 23 21:11:50 CET,Tue Nov 23 23:04:03 CET,0.0 1.347 1.78 2.112 2.382 2.62 2.833 3.017 3.346 3.502 3.646 3.791 4.013 4.131 4.362 4.571 4.757 4.841 5.003 5.169 5.414 5.57 5.718 5.93 6.131 6.32 6.5 6.668 6.879 7.08 7.28 7.522 7.759 7.98 8.219 8.486 8.733 9.01 9.337 9.687 10.043 10.448 10.908 11.328 11.81 12.366 12.999 13.692 14.483 15.374 16.344 16.99 17.297 17.409 17.373 17.291 17.179 17.038 16.882 16.688 16.516 16.359 16.192 16.02 15.854 15.706 15.541 15.396 15.259 15.106 14.961 14.837 14.7 14.555 14.433 14.302 14.164 14.002 13.819 13.699 13.577 13.395 13.267 13.133 13.056 12.884 12.697 12.503 12.404 12.191 12.024 11.901 11.774 11.461 11.296 11.118 10.909 10.66 10.364 9.971 8.927 -4 ,12359 ,KEBNE ,16677156,Wed Nov 24 17:16:07 CET,Wed Nov 24 19:12:10 CET,0.0 1.04 1.449 1.738 1.991 2.215 2.421 2.613 2.966 3.131 3.282 3.432 3.661 3.778 3.996 4.198 4.378 4.463 4.64 4.811 5.038 5.189 5.34 5.551 5.758 5.956 6.141 6.316 6.532 6.741 6.954 7.203 7.433 7.656 7.908 8.2 8.479 8.768 9.079 9.424 9.795 10.197 10.644 11.092 11.618 12.207 12.896 13.634 14.457 15.39 16.368 17.038 17.301 17.334 17.272 17.157 16.987 16.793 16.626 16.446 16.274 16.121 15.958 15.795 15.644 15.473 15.282 15.124 14.987 14.847 14.692 14.55 14.393 14.219 14.072 13.917 13.76 13.603 13.439 13.322 13.2 13.008 12.856 12.693 12.616 12.446 12.259 12.064 11.958 11.758 11.642 11.518 11.382 11.077 10.909 10.724 10.512 10.274 9.988 9.587 8.508 -5 ,32110 ,KEBNE ,16677157,Wed Nov 24 17:16:07 CET,Wed Nov 24 19:11:27 CET,0.0 1.05 1.462 1.762 2.004 2.22 2.409 2.595 2.924 3.064 3.196 3.345 3.575 3.7 3.925 4.118 4.288 4.369 4.529 4.691 4.932 5.088 5.235 5.431 5.616 5.803 5.984 6.16 6.394 6.616 6.815 7.061 7.3 7.526 7.791 8.081 8.349 8.643 8.956 9.292 9.646 10.035 10.486 10.934 11.451 12.007 12.628 13.302 14.075 14.963 15.984 16.745 17.091 17.197 17.157 17.052 16.927 16.779 16.634 16.492 16.372 16.244 16.103 15.952 15.786 15.631 15.466 15.302 15.157 15.01 14.86 14.728 14.584 14.432 14.304 14.165 14.033 13.9 13.75 13.639 13.52 13.335 13.209 13.07 12.991 12.829 12.659 12.472 12.371 12.168 12.042 11.926 11.791 11.488 11.324 11.133 10.933 10.692 10.384 9.95 8.874 -6 ,926 ,KEBNE ,16677158,Wed Nov 24 17:16:08 CET,Wed Nov 24 19:11:10 CET,0.0 1.008 1.412 1.729 1.988 2.213 2.416 2.594 2.903 3.041 3.174 3.33 3.563 3.679 3.898 4.097 4.266 4.351 4.527 4.695 4.921 5.069 5.208 5.413 5.615 5.799 5.98 6.159 6.38 6.592 6.798 7.043 7.278 7.502 7.757 8.034 8.299 8.596 8.905 9.221 9.56 9.934 10.367 10.807 11.307 11.854 12.468 13.133 13.901 14.777 15.716 16.367 16.67 16.758 16.701 16.618 16.493 16.334 16.18 16.021 15.882 15.722 15.536 15.351 15.184 15.01 14.803 14.63 14.482 14.327 14.158 14.017 13.866 13.706 13.574 13.445 13.317 13.173 13.016 12.902 12.784 12.59 12.443 12.282 12.202 12.041 11.867 11.676 11.572 11.364 11.234 11.112 10.982 10.679 10.51 10.313 10.075 9.812 9.479 9.025 7.85 -7 ,22816 ,KEBNE ,16674865,Tue Nov 23 21:34:49 CET,Tue Nov 23 23:28:44 CET,0.0 0.942 1.419 1.755 2.015 2.244 2.433 2.599 2.898 3.033 3.163 3.32 3.546 3.664 3.881 4.07 4.251 4.337 4.505 4.663 4.875 5.015 5.155 5.35 5.543 5.735 5.908 6.074 6.281 6.48 6.674 6.899 7.122 7.347 7.602 7.864 8.121 8.413 8.716 9.042 9.386 9.765 10.211 10.646 11.146 11.696 12.314 12.969 13.705 14.562 15.542 16.223 16.458 16.508 16.451 16.334 16.192 16.065 15.959 15.825 15.694 15.569 15.431 15.283 15.131 14.978 14.818 14.665 14.529 14.388 14.231 14.095 13.953 13.803 13.679 13.54 13.386 13.23 13.08 12.966 12.844 12.665 12.541 12.406 12.336 12.194 12.016 11.812 11.708 11.5 11.35 11.212 11.077 10.801 10.635 10.448 10.239 9.995 9.667 9.164 8.003 -8 ,4364 ,KEBNE ,16674866,Tue Nov 23 21:42:08 CET,Tue Nov 23 23:34:55 CET,0.0 1.142 1.553 1.84 2.087 2.321 2.53 2.72 3.066 3.216 3.357 3.52 3.745 3.858 4.081 4.288 4.478 4.568 4.742 4.905 5.134 5.287 5.438 5.651 5.856 6.042 6.211 6.381 6.603 6.823 7.041 7.301 7.53 7.744 7.995 8.276 8.552 8.846 9.157 9.475 9.799 10.184 10.638 11.064 11.554 12.1 12.705 13.427 14.272 15.207 16.269 16.959 17.184 17.219 17.204 17.104 16.947 16.798 16.648 16.466 16.301 16.146 15.993 15.846 15.701 15.569 15.406 15.248 15.113 14.963 14.793 14.656 14.519 14.366 14.243 14.111 13.973 13.824 13.665 13.556 13.438 13.245 13.107 12.959 12.881 12.723 12.558 12.375 12.277 12.077 11.948 11.834 11.718 11.41 11.231 11.035 10.801 10.55 10.254 9.821 8.664 -9 ,27095 ,KEBNE ,16674867,Tue Nov 23 21:42:08 CET,Tue Nov 23 23:34:15 CET,0.0 0.796 1.166 1.461 1.707 1.918 2.102 2.28 2.594 2.732 2.866 3.012 3.232 3.343 3.552 3.761 3.956 4.045 4.226 4.397 4.633 4.791 4.943 5.147 5.343 5.538 5.723 5.899 6.13 6.356 6.56 6.788 7.01 7.229 7.478 7.746 8.012 8.306 8.613 8.946 9.29 9.655 10.108 10.576 11.087 11.647 12.283 13.02 13.868 14.757 15.799 16.557 16.788 16.799 16.742 16.64 16.532 16.375 16.209 16.042 15.891 15.742 15.599 15.454 15.304 15.165 15.002 14.845 14.708 14.556 14.389 14.249 14.109 13.972 13.867 13.747 13.618 13.488 13.342 13.232 13.116 12.925 12.78 12.635 12.564 12.408 12.23 12.037 11.939 11.746 11.629 11.513 11.382 11.104 10.952 10.775 10.578 10.336 10.058 9.683 8.817 -10 ,30826 ,KEBNE ,16677162,Wed Nov 24 17:21:20 CET,Wed Nov 24 19:13:21 CET,0.0 0.765 1.11 1.391 1.634 1.839 2.029 2.206 2.521 2.665 2.8 2.955 3.17 3.276 3.474 3.672 3.867 3.96 4.14 4.314 4.566 4.727 4.883 5.099 5.292 5.477 5.652 5.818 6.033 6.239 6.438 6.682 6.917 7.145 7.417 7.717 7.994 8.292 8.606 8.94 9.31 9.721 10.164 10.586 11.063 11.571 12.184 12.916 13.726 14.606 15.604 16.374 16.704 16.793 16.748 16.656 16.554 16.44 16.315 16.154 16.003 15.853 15.688 15.525 15.375 15.234 15.078 14.931 14.792 14.65 14.514 14.391 14.253 14.103 13.985 13.866 13.738 13.591 13.431 13.319 13.202 13.015 12.886 12.75 12.675 12.515 12.348 12.174 12.079 11.882 11.751 11.627 11.503 11.221 11.037 10.825 10.593 10.321 10.017 9.583 8.506 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_63.txt deleted file mode 100644 index 3e3868ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31807 ,KEBNE ,16677163,Wed Nov 24 17:21:20 CET,Wed Nov 24 19:14:13 CET,0.0 1.143 1.555 1.847 2.085 2.294 2.49 2.685 3.031 3.189 3.335 3.488 3.729 3.851 4.066 4.271 4.462 4.555 4.74 4.91 5.152 5.311 5.464 5.68 5.88 6.076 6.263 6.435 6.664 6.89 7.112 7.384 7.639 7.876 8.154 8.465 8.76 9.078 9.41 9.767 10.15 10.575 11.071 11.559 12.089 12.67 13.368 14.183 15.075 16.034 17.147 18.026 18.451 18.627 18.655 18.614 18.538 18.452 18.355 18.218 18.068 17.918 17.789 17.665 17.525 17.384 17.231 17.099 16.98 16.836 16.67 16.532 16.396 16.246 16.124 15.986 15.839 15.69 15.542 15.439 15.327 15.152 15.029 14.895 14.822 14.664 14.491 14.309 14.213 14.015 13.896 13.769 13.635 13.351 13.187 12.998 12.767 12.504 12.187 11.77 10.549 -2 ,9963 ,KEBNE ,16677164,Wed Nov 24 17:21:20 CET,Wed Nov 24 19:21:57 CET,0.0 0.834 1.2 1.492 1.758 1.977 2.166 2.338 2.651 2.794 2.928 3.069 3.298 3.413 3.636 3.845 4.041 4.136 4.318 4.49 4.737 4.898 5.047 5.259 5.458 5.646 5.827 5.998 6.217 6.44 6.664 6.933 7.181 7.417 7.713 8.05 8.362 8.682 9.025 9.401 9.782 10.2 10.68 11.171 11.757 12.379 13.067 13.857 14.821 15.916 17.08 17.955 18.427 18.609 18.637 18.607 18.544 18.461 18.369 18.231 18.077 17.916 17.744 17.594 17.451 17.31 17.163 17.019 16.888 16.755 16.604 16.475 16.336 16.187 16.072 15.945 15.816 15.684 15.542 15.442 15.326 15.126 14.984 14.841 14.769 14.621 14.459 14.275 14.173 13.972 13.857 13.737 13.611 13.344 13.19 13.011 12.815 12.594 12.29 11.849 10.795 -3 ,10531 ,KEBNE ,16674871,Tue Nov 23 21:44:13 CET,Tue Nov 23 23:38:46 CET,0.0 1.066 1.436 1.726 1.977 2.203 2.424 2.612 2.932 3.076 3.218 3.381 3.613 3.725 3.933 4.145 4.357 4.45 4.628 4.807 5.055 5.214 5.369 5.593 5.81 6.03 6.231 6.428 6.682 6.911 7.131 7.39 7.642 7.889 8.176 8.486 8.777 9.094 9.426 9.773 10.154 10.589 11.086 11.559 12.089 12.693 13.4 14.183 15.075 16.115 17.298 18.106 18.421 18.561 18.622 18.634 18.531 18.396 18.314 18.18 18.022 17.869 17.699 17.526 17.353 17.186 17.021 16.88 16.752 16.611 16.445 16.304 16.151 15.977 15.842 15.713 15.577 15.418 15.253 15.14 15.025 14.848 14.721 14.575 14.498 14.345 14.178 14.002 13.912 13.718 13.592 13.475 13.351 13.065 12.898 12.716 12.516 12.272 11.969 11.608 10.699 -4 ,27864 ,KEBNE ,16677166,Wed Nov 24 17:21:21 CET,Wed Nov 24 19:14:46 CET,0.0 0.938 1.307 1.586 1.85 2.086 2.298 2.492 2.831 2.985 3.121 3.257 3.493 3.609 3.823 4.029 4.229 4.324 4.508 4.691 4.951 5.105 5.247 5.452 5.648 5.832 6.012 6.183 6.399 6.62 6.831 7.077 7.319 7.556 7.818 8.112 8.398 8.716 9.067 9.427 9.796 10.199 10.667 11.143 11.711 12.356 13.063 13.824 14.73 15.816 17.059 17.958 18.414 18.646 18.702 18.679 18.631 18.492 18.296 18.091 17.929 17.772 17.594 17.422 17.267 17.119 16.965 16.824 16.689 16.542 16.397 16.269 16.116 15.96 15.833 15.701 15.568 15.408 15.229 15.109 14.996 14.807 14.668 14.523 14.446 14.287 14.127 13.96 13.869 13.678 13.572 13.459 13.334 13.046 12.883 12.696 12.503 12.274 11.967 11.594 10.733 -5 ,15466 ,KEBNE ,16677167,Wed Nov 24 17:21:28 CET,Wed Nov 24 19:13:19 CET,0.0 1.064 1.472 1.775 2.014 2.23 2.432 2.615 2.938 3.088 3.236 3.39 3.624 3.74 3.953 4.147 4.328 4.419 4.595 4.752 4.977 5.126 5.278 5.497 5.7 5.899 6.089 6.271 6.509 6.734 6.95 7.199 7.424 7.648 7.905 8.194 8.468 8.77 9.095 9.43 9.796 10.211 10.677 11.137 11.675 12.266 12.941 13.71 14.609 15.639 16.799 17.629 17.97 18.118 18.177 18.16 18.083 17.957 17.827 17.671 17.511 17.371 17.238 17.098 16.946 16.8 16.644 16.487 16.35 16.208 16.053 15.918 15.774 15.636 15.531 15.41 15.277 15.132 14.981 14.881 14.766 14.57 14.439 14.308 14.243 14.099 13.942 13.778 13.677 13.474 13.35 13.226 13.097 12.82 12.665 12.485 12.284 12.057 11.784 11.428 10.594 -6 ,10181 ,KEBNE ,16674874,Tue Nov 23 21:47:21 CET,Tue Nov 23 23:40:01 CET,0.0 0.82 1.244 1.544 1.773 1.991 2.186 2.357 2.678 2.837 2.991 3.135 3.364 3.484 3.708 3.915 4.098 4.184 4.36 4.534 4.773 4.925 5.069 5.273 5.476 5.678 5.864 6.049 6.303 6.534 6.743 6.984 7.205 7.427 7.692 7.985 8.263 8.563 8.883 9.21 9.551 9.937 10.393 10.846 11.357 11.958 12.656 13.406 14.246 15.198 16.368 17.31 17.712 17.829 17.82 17.788 17.751 17.666 17.549 17.418 17.296 17.163 17.025 16.89 16.76 16.638 16.499 16.366 16.238 16.098 15.952 15.828 15.69 15.541 15.418 15.293 15.17 15.031 14.873 14.766 14.652 14.462 14.331 14.192 14.121 13.969 13.804 13.636 13.542 13.338 13.22 13.11 12.989 12.705 12.544 12.362 12.163 11.937 11.654 11.256 9.874 -7 ,10627 ,KEBNE ,16677169,Wed Nov 24 17:29:40 CET,Wed Nov 24 19:23:56 CET,0.0 0.73 1.105 1.38 1.632 1.866 2.071 2.26 2.622 2.784 2.915 3.044 3.271 3.381 3.607 3.831 4.034 4.13 4.313 4.484 4.728 4.879 5.027 5.256 5.479 5.684 5.89 6.079 6.297 6.518 6.729 6.971 7.197 7.412 7.66 7.942 8.224 8.535 8.87 9.225 9.59 10.004 10.482 10.971 11.56 12.213 12.949 13.73 14.611 15.635 16.758 17.498 17.833 17.982 18.012 17.971 17.883 17.748 17.609 17.448 17.295 17.163 17.018 16.866 16.71 16.551 16.403 16.283 16.158 16.013 15.866 15.746 15.615 15.47 15.354 15.234 15.098 14.948 14.791 14.679 14.557 14.359 14.227 14.09 14.017 13.862 13.695 13.503 13.402 13.203 13.075 12.952 12.824 12.537 12.376 12.192 11.969 11.73 11.446 11.042 10.014 -8 ,13810 ,KEBNE ,16677170,Wed Nov 24 17:29:40 CET,Wed Nov 24 19:23:48 CET,0.0 0.663 1.054 1.357 1.6 1.818 2.016 2.2 2.525 2.681 2.833 2.987 3.208 3.315 3.518 3.715 3.901 3.993 4.174 4.34 4.585 4.737 4.879 5.086 5.281 5.467 5.644 5.817 6.044 6.261 6.465 6.707 6.94 7.168 7.436 7.73 8.016 8.327 8.651 9.001 9.362 9.77 10.255 10.732 11.294 11.947 12.694 13.521 14.464 15.478 16.669 17.561 17.974 18.164 18.193 18.136 18.013 17.864 17.741 17.594 17.431 17.287 17.154 17.006 16.849 16.69 16.526 16.379 16.249 16.101 15.94 15.815 15.684 15.538 15.43 15.312 15.183 15.054 14.912 14.806 14.686 14.486 14.352 14.218 14.146 13.991 13.829 13.65 13.556 13.365 13.244 13.123 12.992 12.684 12.517 12.335 12.129 11.906 11.641 11.246 10.192 -9 ,385 ,KEBNE ,16677171,Wed Nov 24 17:29:40 CET,Wed Nov 24 19:24:28 CET,0.0 0.972 1.398 1.695 1.936 2.16 2.361 2.542 2.882 3.036 3.178 3.339 3.585 3.712 3.94 4.146 4.345 4.439 4.618 4.802 5.059 5.214 5.365 5.583 5.789 5.985 6.179 6.361 6.592 6.829 7.051 7.306 7.549 7.775 8.033 8.343 8.664 8.993 9.335 9.687 10.04 10.442 10.914 11.407 11.981 12.572 13.248 14.06 15.013 16.099 17.377 18.332 18.76 18.935 18.967 18.918 18.845 18.745 18.655 18.552 18.392 18.232 18.089 17.939 17.778 17.63 17.471 17.318 17.185 17.035 16.876 16.752 16.613 16.443 16.305 16.172 16.039 15.892 15.735 15.621 15.505 15.32 15.179 15.038 14.968 14.816 14.65 14.461 14.363 14.157 14.014 13.889 13.756 13.458 13.294 13.125 12.932 12.695 12.385 12.031 11.196 -10 ,17227 ,KEBNE ,16677172,Wed Nov 24 17:29:40 CET,Wed Nov 24 19:24:06 CET,0.0 0.909 1.286 1.601 1.872 2.114 2.315 2.484 2.803 2.944 3.074 3.216 3.448 3.576 3.825 4.043 4.236 4.327 4.503 4.673 4.913 5.059 5.199 5.407 5.608 5.806 5.997 6.178 6.415 6.646 6.868 7.134 7.376 7.601 7.867 8.165 8.445 8.763 9.116 9.487 9.878 10.3 10.775 11.26 11.832 12.478 13.213 14.018 14.994 16.157 17.444 18.354 18.722 18.821 18.794 18.739 18.65 18.51 18.361 18.18 18.016 17.883 17.741 17.591 17.454 17.318 17.178 17.042 16.909 16.782 16.648 16.514 16.363 16.204 16.082 15.956 15.817 15.674 15.525 15.421 15.312 15.129 15.004 14.877 14.811 14.677 14.525 14.357 14.261 14.063 13.961 13.849 13.719 13.423 13.265 13.088 12.882 12.638 12.359 11.997 11.089 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_64.txt deleted file mode 100644 index 15a11724..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_64.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19311 ,KEBNE ,16674879,Tue Nov 23 22:05:11 CET,Tue Nov 23 23:58:18 CET,0.0 0.996 1.427 1.752 2.028 2.253 2.45 2.637 2.97 3.117 3.257 3.401 3.641 3.772 4.026 4.246 4.455 4.552 4.733 4.912 5.157 5.307 5.457 5.668 5.866 6.068 6.267 6.459 6.694 6.908 7.119 7.374 7.62 7.853 8.109 8.364 8.6 8.871 9.165 9.48 9.803 10.148 10.499 10.819 11.178 11.566 12.014 12.438 12.881 13.348 13.646 13.559 13.233 12.874 12.503 12.15 11.832 11.505 11.2 10.894 10.617 10.357 10.11 9.86 9.627 9.424 9.205 8.998 8.808 8.607 8.396 8.232 8.072 7.895 7.748 7.588 7.415 7.234 7.051 6.923 6.784 6.543 6.364 6.19 6.105 5.935 5.747 5.54 5.435 5.224 5.103 4.979 4.842 4.519 4.333 4.135 3.925 3.673 3.348 2.928 1.551 -2 ,16179 ,KEBNE ,16674880,Tue Nov 23 22:35:46 CET,Wed Nov 24 00:27:35 CET,0.0 1.304 1.761 2.083 2.337 2.558 2.749 2.937 3.286 3.445 3.594 3.757 3.991 4.107 4.342 4.573 4.8 4.899 5.078 5.25 5.472 5.61 5.75 5.956 6.157 6.348 6.521 6.686 6.907 7.11 7.304 7.554 7.779 7.98 8.218 8.473 8.718 9.001 9.285 9.566 9.857 10.18 10.578 10.956 11.336 11.752 12.222 12.708 13.146 13.551 13.824 13.684 13.37 13.023 12.691 12.345 12.015 11.712 11.439 11.148 10.891 10.666 10.442 10.224 10.007 9.797 9.585 9.393 9.218 9.041 8.859 8.7 8.537 8.367 8.233 8.09 7.929 7.757 7.584 7.464 7.331 7.113 6.964 6.82 6.738 6.564 6.374 6.161 6.051 5.821 5.653 5.504 5.363 5.073 4.902 4.701 4.473 4.202 3.871 3.457 2.321 -3 ,2090 ,KEBNE ,16674881,Tue Nov 23 22:37:53 CET,Wed Nov 24 00:33:08 CET,0.0 1.147 1.53 1.821 2.072 2.313 2.54 2.745 3.091 3.242 3.384 3.541 3.775 3.888 4.1 4.308 4.503 4.596 4.769 4.943 5.193 5.341 5.479 5.669 5.853 6.028 6.191 6.341 6.546 6.747 6.932 7.155 7.358 7.552 7.783 8.028 8.245 8.489 8.749 9.014 9.274 9.571 9.927 10.264 10.647 11.039 11.497 11.998 12.476 12.918 13.172 13.101 12.872 12.534 12.171 11.837 11.507 11.187 10.922 10.629 10.358 10.12 9.888 9.664 9.454 9.257 9.04 8.845 8.674 8.492 8.3 8.138 7.964 7.775 7.624 7.466 7.299 7.125 6.939 6.806 6.672 6.471 6.327 6.162 6.071 5.884 5.7 5.506 5.395 5.166 5.016 4.884 4.746 4.455 4.281 4.082 3.87 3.61 3.299 2.883 1.893 -4 ,15394 ,KEBNE ,16677176,Wed Nov 24 17:33:47 CET,Wed Nov 24 19:28:09 CET,0.0 1.141 1.636 1.992 2.292 2.554 2.783 2.987 3.331 3.479 3.617 3.797 4.042 4.165 4.406 4.645 4.858 4.951 5.137 5.315 5.558 5.717 5.878 6.088 6.291 6.482 6.66 6.824 7.019 7.231 7.45 7.696 7.917 8.117 8.345 8.616 8.867 9.12 9.399 9.703 10.028 10.386 10.812 11.206 11.571 11.974 12.43 12.855 13.286 13.761 14.105 14.008 13.693 13.362 13.035 12.683 12.356 12.034 11.719 11.393 11.109 10.86 10.63 10.403 10.176 9.967 9.751 9.547 9.364 9.17 8.963 8.797 8.63 8.439 8.288 8.139 7.977 7.803 7.615 7.48 7.345 7.131 6.977 6.812 6.725 6.547 6.356 6.154 6.049 5.833 5.7 5.565 5.425 5.122 4.943 4.743 4.535 4.309 4.034 3.63 2.516 -5 ,6102 ,KEBNE ,16674883,Tue Nov 23 22:55:49 CET,Tue Nov 23 23:06:49 CET,0.0 1.056 1.453 1.75 2.005 2.239 2.447 2.631 2.971 3.127 3.265 3.406 3.643 3.76 3.975 4.18 4.374 4.464 4.628 4.786 5.017 5.183 5.342 5.536 5.72 5.899 6.07 6.242 6.468 6.679 6.869 7.098 7.33 7.551 7.798 8.063 8.289 8.516 8.772 9.058 9.37 9.7 10.034 10.366 10.775 11.226 11.68 12.144 12.696 13.314 13.729 13.608 13.279 12.889 12.491 12.099 11.759 11.44 11.139 10.847 10.586 10.327 10.076 9.84 9.604 9.389 9.171 8.97 8.794 8.615 8.43 8.262 8.087 7.896 7.741 7.59 7.431 7.252 7.053 6.916 6.782 6.581 6.434 6.267 6.181 6.01 5.83 5.636 5.531 5.317 5.196 5.067 4.926 4.608 4.423 4.215 4.0 3.767 3.484 3.11 2.15 -6 ,15642 ,KEBNE ,16674884,Tue Nov 23 22:55:49 CET,Wed Nov 24 00:47:42 CET,0.0 0.825 1.262 1.602 1.89 2.125 2.329 2.518 2.837 2.99 3.139 3.311 3.555 3.682 3.919 4.128 4.324 4.422 4.601 4.763 4.987 5.133 5.277 5.489 5.692 5.887 6.068 6.245 6.479 6.693 6.893 7.124 7.344 7.562 7.814 8.087 8.334 8.587 8.865 9.189 9.526 9.858 10.218 10.581 10.99 11.422 11.902 12.375 12.787 13.102 13.286 13.201 12.934 12.568 12.241 11.949 11.643 11.331 11.032 10.717 10.441 10.184 9.925 9.676 9.45 9.237 9.005 8.798 8.623 8.439 8.229 8.046 7.855 7.664 7.512 7.35 7.186 7.009 6.821 6.688 6.549 6.325 6.169 6.005 5.917 5.741 5.548 5.335 5.224 5.007 4.875 4.741 4.596 4.263 4.083 3.901 3.683 3.429 3.127 2.745 1.894 -7 ,22335 ,KEBNE ,16674885,Tue Nov 23 22:55:49 CET,Wed Nov 24 00:47:35 CET,0.0 0.928 1.349 1.689 1.976 2.206 2.418 2.617 2.965 3.123 3.26 3.382 3.612 3.728 3.951 4.159 4.343 4.43 4.598 4.767 5.013 5.17 5.326 5.538 5.728 5.918 6.091 6.259 6.493 6.706 6.899 7.148 7.388 7.604 7.842 8.096 8.326 8.576 8.857 9.143 9.433 9.732 10.077 10.463 10.875 11.285 11.711 12.154 12.61 13.028 13.284 13.209 12.932 12.571 12.219 11.865 11.508 11.159 10.847 10.523 10.244 10.005 9.763 9.503 9.27 9.066 8.838 8.634 8.455 8.265 8.065 7.896 7.713 7.516 7.357 7.194 7.023 6.85 6.671 6.536 6.394 6.172 6.028 5.88 5.803 5.647 5.471 5.271 5.164 4.948 4.813 4.676 4.53 4.241 4.079 3.875 3.639 3.378 3.084 2.652 1.703 -9 ,28175 ,KEBNE ,16677181,Wed Nov 24 17:34:49 CET,Wed Nov 24 19:27:45 CET,0.0 0.807 1.199 1.497 1.753 1.993 2.195 2.382 2.714 2.858 3.001 3.176 3.412 3.526 3.755 3.973 4.167 4.257 4.427 4.592 4.833 4.989 5.138 5.348 5.544 5.726 5.891 6.046 6.256 6.456 6.643 6.866 7.081 7.286 7.514 7.765 8.005 8.265 8.536 8.813 9.104 9.412 9.76 10.12 10.505 10.909 11.398 11.905 12.373 12.78 13.07 12.961 12.628 12.264 11.849 11.418 11.056 10.741 10.445 10.12 9.828 9.562 9.306 9.061 8.824 8.597 8.364 8.165 7.988 7.797 7.595 7.42 7.239 7.048 6.903 6.752 6.59 6.42 6.232 6.101 5.972 5.757 5.591 5.422 5.336 5.156 4.961 4.735 4.62 4.405 4.268 4.135 3.997 3.643 3.444 3.245 3.019 2.76 2.46 2.113 1.357 -10 ,13213 ,KEBNE ,16674888,Tue Nov 23 23:06:18 CET,Wed Nov 24 00:58:35 CET,0.0 1.431 1.881 2.203 2.476 2.707 2.914 3.106 3.469 3.638 3.784 3.939 4.171 4.286 4.503 4.714 4.924 5.025 5.205 5.367 5.602 5.76 5.917 6.128 6.324 6.518 6.7 6.867 7.078 7.287 7.491 7.73 7.952 8.154 8.381 8.634 8.874 9.139 9.419 9.721 10.038 10.377 10.776 11.179 11.605 12.061 12.583 13.052 13.515 14.0 14.346 14.394 14.249 13.949 13.588 13.239 12.906 12.59 12.327 12.07 11.834 11.609 11.374 11.144 10.927 10.73 10.524 10.323 10.143 9.959 9.764 9.595 9.418 9.236 9.089 8.931 8.773 8.611 8.427 8.295 8.161 7.958 7.821 7.67 7.589 7.413 7.209 6.999 6.89 6.665 6.513 6.367 6.221 5.922 5.741 5.525 5.278 5.015 4.715 4.304 3.269 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_49.txt deleted file mode 100644 index c177e269..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,960 ,KEBNE ,16677183,Wed Nov 24 17:35:51 CET,Wed Nov 24 19:28:47 CET,0.0 0.844 1.239 1.557 1.821 2.067 2.287 2.48 2.833 2.996 3.147 3.304 3.58 3.725 3.999 4.245 4.478 4.59 4.806 5.016 5.323 5.514 5.7 5.983 6.26 6.517 6.765 7.007 7.312 7.605 7.893 8.258 8.613 8.934 9.322 9.77 10.218 10.717 11.231 11.797 12.411 13.118 13.967 14.828 15.868 17.04 18.407 19.995 21.828 24.009 26.724 28.964 30.294 31.135 31.647 31.966 32.142 32.221 32.215 32.16 32.072 31.991 31.894 31.788 31.7 31.592 31.445 31.309 31.182 31.05 30.924 30.809 30.671 30.52 30.394 30.246 30.085 29.914 29.727 29.594 29.467 29.255 29.094 28.921 28.83 28.611 28.368 28.136 28.021 27.773 27.528 27.363 27.172 26.657 26.377 26.088 25.71 25.242 24.721 23.992 20.333 -2 ,465 ,KEBNE ,16677184,Wed Nov 24 17:35:51 CET,Wed Nov 24 19:30:39 CET,0.0 0.886 1.291 1.598 1.849 2.063 2.264 2.456 2.813 2.978 3.129 3.299 3.568 3.701 3.956 4.194 4.419 4.529 4.742 4.951 5.249 5.443 5.629 5.887 6.147 6.405 6.644 6.871 7.171 7.469 7.759 8.1 8.423 8.74 9.121 9.566 10.001 10.494 11.028 11.586 12.195 12.887 13.656 14.449 15.444 16.572 17.852 19.299 21.091 23.362 26.305 28.724 30.122 31.05 31.643 32.023 32.215 32.315 32.387 32.423 32.418 32.38 32.317 32.232 32.133 32.043 31.948 31.841 31.718 31.586 31.447 31.329 31.202 31.062 30.953 30.822 30.694 30.568 30.403 30.279 30.154 29.951 29.801 29.658 29.58 29.417 29.246 29.049 28.947 28.741 28.588 28.419 28.234 27.816 27.526 27.193 26.879 26.468 25.856 24.987 22.07 -3 ,24243 ,KEBNE ,16677185,Wed Nov 24 17:35:51 CET,Wed Nov 24 19:28:38 CET,0.0 0.877 1.271 1.584 1.832 2.055 2.261 2.447 2.798 2.966 3.124 3.28 3.55 3.688 3.947 4.187 4.422 4.536 4.759 4.97 5.274 5.478 5.674 5.947 6.205 6.456 6.704 6.953 7.285 7.596 7.889 8.255 8.62 8.977 9.388 9.84 10.271 10.757 11.305 11.887 12.509 13.239 14.084 14.948 15.982 17.149 18.573 20.239 22.209 24.689 27.719 30.218 31.734 32.729 33.391 33.86 34.188 34.418 34.571 34.678 34.743 34.766 34.749 34.693 34.613 34.535 34.452 34.373 34.295 34.205 34.096 33.996 33.883 33.756 33.651 33.541 33.42 33.278 33.134 33.038 32.939 32.796 32.681 32.54 32.456 32.284 32.106 31.883 31.768 31.558 31.408 31.262 31.096 30.726 30.511 30.276 29.989 29.589 29.058 28.237 24.623 -4 ,30429 ,KEBNE ,16677186,Wed Nov 24 17:36:54 CET,Wed Nov 24 19:28:25 CET,0.0 0.98 1.409 1.729 2.007 2.255 2.467 2.658 3.019 3.186 3.344 3.512 3.776 3.903 4.156 4.397 4.617 4.726 4.944 5.154 5.448 5.639 5.821 6.084 6.341 6.584 6.83 7.084 7.405 7.716 8.013 8.367 8.717 9.052 9.441 9.885 10.319 10.798 11.316 11.87 12.458 13.134 13.94 14.763 15.738 16.85 18.154 19.646 21.528 23.816 26.576 28.93 30.288 31.131 31.672 32.066 32.322 32.481 32.581 32.634 32.644 32.629 32.584 32.507 32.416 32.323 32.224 32.138 32.051 31.936 31.789 31.662 31.528 31.397 31.307 31.2 31.091 30.981 30.848 30.744 30.625 30.429 30.282 30.125 30.043 29.87 29.694 29.495 29.386 29.173 29.008 28.864 28.715 28.353 28.133 27.829 27.43 27.055 26.629 25.998 23.242 -5 ,4294 ,KEBNE ,16677187,Wed Nov 24 17:37:56 CET,Wed Nov 24 19:30:26 CET,0.0 0.879 1.26 1.575 1.843 2.078 2.294 2.488 2.845 3.015 3.18 3.362 3.651 3.795 4.056 4.299 4.53 4.649 4.884 5.1 5.42 5.619 5.799 6.063 6.325 6.583 6.838 7.096 7.418 7.718 8.018 8.381 8.721 9.062 9.456 9.903 10.339 10.825 11.35 11.898 12.498 13.21 14.063 14.911 15.933 17.066 18.386 19.921 21.716 23.891 26.646 28.949 30.209 30.972 31.462 31.78 31.952 32.076 32.17 32.203 32.193 32.155 32.106 32.053 31.975 31.889 31.795 31.697 31.586 31.467 31.338 31.197 31.049 30.911 30.803 30.68 30.542 30.384 30.198 30.077 29.964 29.766 29.623 29.482 29.407 29.245 29.058 28.832 28.712 28.499 28.332 28.167 28.001 27.598 27.345 27.085 26.748 26.31 25.864 25.325 22.592 -6 ,29307 ,KEBNE ,16677188,Wed Nov 24 17:39:00 CET,Wed Nov 24 19:31:36 CET,0.0 0.904 1.292 1.617 1.896 2.139 2.368 2.571 2.921 3.084 3.243 3.41 3.68 3.82 4.087 4.335 4.571 4.685 4.913 5.132 5.448 5.65 5.835 6.099 6.358 6.618 6.87 7.112 7.416 7.711 8.006 8.364 8.708 9.039 9.428 9.858 10.288 10.779 11.297 11.857 12.475 13.187 14.015 14.841 15.818 16.934 18.25 19.825 21.746 24.009 26.75 29.046 30.431 31.332 31.954 32.394 32.683 32.868 32.976 33.051 33.087 33.058 32.984 32.912 32.835 32.753 32.64 32.519 32.426 32.325 32.211 32.111 31.995 31.873 31.763 31.639 31.512 31.351 31.155 31.03 30.912 30.704 30.554 30.4 30.316 30.116 29.9 29.687 29.577 29.359 29.202 29.061 28.909 28.518 28.216 27.897 27.602 27.288 26.894 26.222 23.58 -7 ,16769 ,KEBNE ,16677189,Wed Nov 24 17:42:10 CET,Wed Nov 24 19:36:27 CET,0.0 0.811 1.217 1.543 1.812 2.053 2.273 2.479 2.855 3.024 3.188 3.362 3.63 3.762 4.016 4.254 4.484 4.598 4.825 5.038 5.335 5.532 5.726 6.014 6.284 6.541 6.793 7.031 7.341 7.651 7.965 8.327 8.675 9.02 9.418 9.864 10.286 10.757 11.288 11.874 12.488 13.207 14.057 14.89 15.873 16.98 18.274 19.759 21.528 23.704 26.422 28.603 29.873 30.684 31.223 31.634 31.87 31.98 32.022 32.011 31.981 31.953 31.91 31.839 31.765 31.689 31.586 31.479 31.369 31.241 31.118 31.008 30.885 30.743 30.617 30.478 30.338 30.196 30.035 29.909 29.766 29.538 29.382 29.225 29.15 28.995 28.797 28.585 28.442 28.177 27.994 27.849 27.677 27.282 27.035 26.731 26.355 25.936 25.469 24.689 21.564 -8 ,29200 ,KEBNE ,16677190,Wed Nov 24 17:42:12 CET,Wed Nov 24 19:41:24 CET,0.0 0.855 1.248 1.563 1.836 2.077 2.289 2.495 2.879 3.047 3.201 3.367 3.645 3.782 4.039 4.287 4.526 4.637 4.845 5.051 5.362 5.565 5.751 6.024 6.301 6.559 6.799 7.034 7.346 7.652 7.943 8.299 8.651 8.99 9.389 9.842 10.278 10.77 11.289 11.835 12.443 13.156 14.01 14.863 15.843 16.954 18.275 19.775 21.51 23.713 26.646 29.086 30.469 31.364 31.986 32.432 32.706 32.873 32.984 33.031 33.021 32.987 32.925 32.845 32.768 32.685 32.582 32.476 32.379 32.286 32.181 32.077 31.959 31.831 31.708 31.564 31.431 31.299 31.147 31.024 30.887 30.682 30.54 30.386 30.306 30.14 29.95 29.75 29.653 29.444 29.267 29.087 28.891 28.469 28.24 27.983 27.675 27.351 26.883 26.187 23.571 -9 ,8517 ,KEBNE ,16677191,Wed Nov 24 17:45:19 CET,Wed Nov 24 19:38:35 CET,0.0 0.725 1.107 1.409 1.697 1.939 2.144 2.34 2.692 2.855 3.006 3.167 3.45 3.588 3.852 4.104 4.339 4.446 4.66 4.873 5.173 5.367 5.562 5.843 6.11 6.375 6.627 6.864 7.176 7.479 7.772 8.124 8.473 8.816 9.211 9.659 10.091 10.575 11.104 11.675 12.277 12.961 13.764 14.597 15.605 16.725 18.033 19.546 21.407 23.712 26.54 28.853 30.179 30.989 31.526 31.936 32.211 32.359 32.405 32.418 32.388 32.321 32.241 32.146 32.038 31.936 31.827 31.71 31.588 31.448 31.311 31.193 31.062 30.927 30.814 30.697 30.584 30.466 30.328 30.222 30.101 29.903 29.766 29.594 29.505 29.341 29.168 28.956 28.836 28.621 28.465 28.323 28.169 27.692 27.414 27.177 26.816 26.278 25.711 24.969 22.273 -10 ,22942 ,KEBNE ,16677192,Wed Nov 24 17:48:30 CET,Wed Nov 24 19:49:26 CET,0.0 0.989 1.427 1.776 2.055 2.299 2.52 2.727 3.088 3.261 3.427 3.585 3.86 3.997 4.252 4.491 4.711 4.827 5.055 5.274 5.588 5.788 5.979 6.252 6.516 6.773 7.029 7.269 7.58 7.883 8.18 8.541 8.897 9.255 9.66 10.089 10.506 10.984 11.516 12.091 12.692 13.4 14.253 15.089 16.051 17.167 18.566 20.179 21.995 24.179 26.987 29.394 30.858 31.794 32.409 32.849 33.128 33.31 33.439 33.516 33.528 33.495 33.441 33.387 33.331 33.254 33.147 33.038 32.929 32.808 32.678 32.557 32.426 32.29 32.182 32.057 31.921 31.766 31.591 31.477 31.364 31.165 31.013 30.857 30.778 30.616 30.442 30.246 30.145 29.933 29.78 29.636 29.478 29.105 28.885 28.648 28.39 28.068 27.609 26.958 24.347 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_65.txt deleted file mode 100644 index 047bb0d4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4367 ,KEBNE ,16677193,Wed Nov 24 17:48:30 CET,Wed Nov 24 19:43:47 CET,0.0 1.084 1.499 1.816 2.09 2.332 2.546 2.733 3.084 3.248 3.395 3.523 3.786 3.918 4.17 4.399 4.61 4.713 4.908 5.091 5.363 5.536 5.7 5.947 6.186 6.41 6.623 6.838 7.116 7.378 7.64 7.954 8.248 8.537 8.881 9.284 9.67 10.077 10.523 11.014 11.545 12.134 12.788 13.441 14.208 15.075 16.114 17.333 18.79 20.477 22.501 24.08 24.925 25.458 25.766 25.932 26.033 26.067 26.057 26.011 25.947 25.883 25.802 25.699 25.587 25.473 25.352 25.233 25.109 24.987 24.864 24.757 24.631 24.488 24.37 24.243 24.12 23.991 23.836 23.716 23.599 23.423 23.294 23.161 23.092 22.936 22.763 22.588 22.489 22.271 22.137 22.012 21.882 21.57 21.393 21.192 20.972 20.717 20.417 20.026 18.84 -2 ,25256 ,KEBNE ,16674900,Tue Nov 23 23:14:43 CET,Wed Nov 24 01:05:29 CET,0.0 0.996 1.437 1.735 1.974 2.189 2.396 2.596 2.939 3.087 3.227 3.356 3.619 3.746 3.977 4.187 4.386 4.485 4.679 4.863 5.127 5.291 5.452 5.69 5.912 6.132 6.351 6.557 6.819 7.078 7.333 7.64 7.941 8.226 8.552 8.941 9.321 9.736 10.177 10.632 11.127 11.707 12.387 13.079 13.906 14.848 15.916 17.104 18.534 20.246 22.321 24.035 25.007 25.625 25.994 26.196 26.305 26.355 26.346 26.282 26.193 26.105 26.016 25.931 25.847 25.748 25.631 25.511 25.401 25.283 25.154 25.046 24.931 24.792 24.666 24.524 24.377 24.23 24.077 23.972 23.86 23.673 23.537 23.396 23.317 23.138 22.96 22.79 22.695 22.475 22.335 22.198 22.053 21.742 21.561 21.372 21.162 20.899 20.536 20.085 19.11 -3 ,15916 ,KEBNE ,16677195,Wed Nov 24 17:49:32 CET,Wed Nov 24 19:52:06 CET,0.0 1.021 1.414 1.703 1.96 2.193 2.405 2.59 2.927 3.08 3.224 3.367 3.641 3.766 3.994 4.216 4.432 4.535 4.735 4.931 5.215 5.391 5.556 5.803 6.04 6.259 6.47 6.672 6.936 7.191 7.43 7.721 8.007 8.285 8.61 8.984 9.345 9.748 10.185 10.637 11.113 11.663 12.321 12.986 13.758 14.628 15.665 16.873 18.328 20.092 22.13 23.667 24.533 25.082 25.4 25.586 25.676 25.706 25.686 25.626 25.574 25.509 25.426 25.348 25.258 25.151 25.031 24.906 24.789 24.664 24.535 24.428 24.295 24.136 24.012 23.89 23.753 23.596 23.431 23.314 23.198 23.008 22.87 22.729 22.648 22.474 22.298 22.103 22.0 21.783 21.637 21.502 21.359 21.062 20.897 20.71 20.493 20.242 19.91 19.435 17.985 -4 ,18089 ,KEBNE ,16674902,Tue Nov 23 23:17:51 CET,Wed Nov 24 01:08:04 CET,0.0 0.973 1.387 1.7 1.96 2.176 2.391 2.596 2.932 3.077 3.223 3.368 3.63 3.76 4.011 4.242 4.466 4.575 4.785 4.982 5.272 5.462 5.638 5.889 6.13 6.372 6.617 6.84 7.121 7.412 7.681 7.996 8.31 8.604 8.954 9.346 9.723 10.15 10.599 11.068 11.558 12.119 12.79 13.486 14.31 15.201 16.229 17.417 18.871 20.665 22.78 24.491 25.491 26.075 26.435 26.64 26.695 26.68 26.658 26.604 26.499 26.388 26.275 26.166 26.062 25.958 25.841 25.719 25.594 25.462 25.316 25.184 25.047 24.894 24.77 24.643 24.51 24.372 24.225 24.119 24.003 23.804 23.672 23.538 23.461 23.296 23.118 22.922 22.825 22.609 22.485 22.36 22.219 21.9 21.736 21.505 21.236 20.958 20.595 20.109 18.623 -5 ,15702 ,KEBNE ,16677197,Wed Nov 24 17:51:38 CET,Wed Nov 24 19:44:35 CET,0.0 0.865 1.238 1.542 1.806 2.05 2.258 2.433 2.761 2.923 3.078 3.22 3.486 3.612 3.861 4.096 4.307 4.412 4.613 4.804 5.081 5.251 5.415 5.648 5.87 6.09 6.308 6.522 6.8 7.067 7.327 7.637 7.937 8.237 8.581 8.948 9.291 9.669 10.105 10.582 11.08 11.64 12.318 13.004 13.777 14.637 15.667 16.877 18.26 19.914 22.001 23.694 24.674 25.299 25.668 25.869 25.974 25.982 25.938 25.866 25.787 25.702 25.592 25.475 25.367 25.268 25.159 25.033 24.908 24.773 24.634 24.519 24.377 24.22 24.106 23.99 23.856 23.715 23.563 23.453 23.334 23.134 22.992 22.842 22.767 22.595 22.403 22.214 22.103 21.868 21.699 21.544 21.382 21.019 20.81 20.589 20.342 20.053 19.728 19.246 17.696 -6 ,492 ,KEBNE ,16677198,Wed Nov 24 17:53:46 CET,Wed Nov 24 19:47:00 CET,0.0 1.031 1.454 1.745 1.974 2.189 2.392 2.563 2.876 3.034 3.179 3.308 3.565 3.68 3.904 4.121 4.338 4.445 4.649 4.835 5.095 5.267 5.44 5.686 5.913 6.137 6.347 6.553 6.83 7.094 7.343 7.647 7.947 8.235 8.566 8.939 9.295 9.705 10.139 10.6 11.112 11.678 12.327 12.987 13.792 14.696 15.739 16.947 18.372 20.037 22.102 23.824 24.768 25.335 25.684 25.882 25.978 26.025 26.021 25.958 25.88 25.811 25.738 25.649 25.54 25.439 25.317 25.187 25.076 24.952 24.82 24.703 24.547 24.364 24.228 24.092 23.942 23.782 23.613 23.487 23.352 23.148 23.007 22.856 22.777 22.607 22.422 22.224 22.117 21.896 21.763 21.626 21.483 21.172 20.989 20.798 20.583 20.319 19.984 19.507 17.659 -7 ,16002 ,KEBNE ,16677199,Wed Nov 24 17:53:50 CET,Wed Nov 24 19:44:06 CET,0.0 1.067 1.463 1.784 2.057 2.279 2.479 2.66 2.996 3.145 3.275 3.406 3.659 3.773 3.996 4.211 4.414 4.509 4.704 4.897 5.162 5.332 5.504 5.756 5.992 6.211 6.42 6.629 6.9 7.166 7.427 7.736 8.041 8.329 8.665 9.04 9.385 9.774 10.21 10.676 11.148 11.692 12.352 13.007 13.769 14.642 15.666 16.871 18.318 20.008 22.017 23.653 24.569 25.132 25.483 25.691 25.824 25.891 25.872 25.797 25.72 25.618 25.505 25.404 25.305 25.198 25.084 24.977 24.865 24.732 24.594 24.477 24.335 24.183 24.065 23.946 23.814 23.675 23.528 23.42 23.302 23.087 22.93 22.769 22.689 22.537 22.375 22.194 22.094 21.883 21.773 21.642 21.493 21.177 21.004 20.804 20.583 20.324 19.973 19.477 18.031 -8 ,16704 ,KEBNE ,16674906,Tue Nov 23 23:28:29 CET,Wed Nov 24 01:20:43 CET,0.0 0.919 1.305 1.606 1.862 2.085 2.279 2.461 2.787 2.937 3.081 3.23 3.491 3.612 3.851 4.072 4.284 4.385 4.584 4.771 5.025 5.189 5.358 5.602 5.842 6.074 6.284 6.486 6.755 7.023 7.279 7.586 7.881 8.16 8.477 8.85 9.231 9.641 10.073 10.536 11.023 11.563 12.204 12.851 13.603 14.46 15.454 16.604 17.983 19.605 21.605 23.35 24.325 24.859 25.16 25.347 25.452 25.48 25.465 25.417 25.357 25.285 25.187 25.065 24.947 24.851 24.726 24.594 24.469 24.337 24.198 24.082 23.953 23.801 23.688 23.562 23.417 23.268 23.095 22.969 22.838 22.632 22.489 22.33 22.245 22.072 21.893 21.707 21.609 21.382 21.223 21.084 20.936 20.61 20.434 20.239 20.001 19.704 19.359 18.861 17.663 -9 ,5832 ,KEBNE ,16674907,Tue Nov 23 23:28:29 CET,Wed Nov 24 01:20:30 CET,0.0 1.07 1.48 1.786 2.037 2.27 2.476 2.659 2.999 3.163 3.318 3.474 3.727 3.839 4.06 4.274 4.476 4.571 4.76 4.949 5.212 5.376 5.541 5.778 6.008 6.234 6.445 6.651 6.937 7.206 7.449 7.758 8.069 8.367 8.714 9.096 9.448 9.831 10.256 10.726 11.235 11.82 12.498 13.176 13.996 14.916 15.959 17.181 18.655 20.386 22.498 24.19 25.115 25.688 26.047 26.275 26.428 26.508 26.506 26.466 26.399 26.309 26.216 26.117 26.021 25.931 25.812 25.684 25.566 25.436 25.301 25.188 25.062 24.906 24.784 24.665 24.535 24.378 24.211 24.1 23.976 23.789 23.663 23.518 23.438 23.254 23.059 22.875 22.768 22.54 22.39 22.25 22.104 21.772 21.577 21.359 21.122 20.84 20.48 19.998 18.532 -10 ,12383 ,KEBNE ,16677202,Wed Nov 24 17:55:53 CET,Wed Nov 24 19:48:51 CET,0.0 1.134 1.541 1.855 2.092 2.307 2.509 2.693 3.015 3.161 3.301 3.426 3.679 3.796 4.019 4.229 4.425 4.525 4.724 4.914 5.198 5.381 5.553 5.802 6.043 6.276 6.493 6.693 6.959 7.23 7.489 7.797 8.1 8.396 8.738 9.122 9.49 9.891 10.33 10.81 11.324 11.89 12.548 13.21 13.967 14.832 15.86 17.071 18.51 20.15 22.142 23.837 24.801 25.385 25.722 25.881 25.977 26.027 26.02 25.973 25.911 25.837 25.755 25.655 25.55 25.457 25.344 25.23 25.13 25.014 24.877 24.754 24.628 24.502 24.398 24.274 24.136 23.996 23.846 23.732 23.606 23.409 23.267 23.123 23.044 22.876 22.705 22.508 22.403 22.18 22.038 21.904 21.765 21.468 21.286 21.087 20.866 20.575 20.201 19.71 18.5 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_68.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_68.txt deleted file mode 100644 index 227a808b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_68.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14027 ,KEBNE ,16674909,Tue Nov 23 23:29:31 CET,Wed Nov 24 01:22:19 CET,0.0 1.307 1.749 2.108 2.401 2.643 2.862 3.055 3.428 3.598 3.744 3.889 4.144 4.275 4.533 4.767 4.987 5.088 5.28 5.468 5.718 5.877 6.046 6.296 6.52 6.73 6.931 7.124 7.371 7.617 7.872 8.174 8.447 8.721 9.045 9.389 9.715 10.078 10.466 10.886 11.325 11.784 12.3 12.84 13.474 14.158 14.926 15.756 16.687 17.735 18.824 19.461 19.647 19.644 19.537 19.36 19.166 18.96 18.767 18.551 18.349 18.164 17.973 17.774 17.587 17.409 17.207 17.023 16.868 16.707 16.532 16.377 16.219 16.055 15.924 15.776 15.619 15.457 15.28 15.157 15.035 14.848 14.707 14.55 14.466 14.292 14.111 13.921 13.821 13.597 13.473 13.337 13.198 12.901 12.728 12.534 12.337 12.128 11.857 11.462 10.47 -2 ,2406 ,KEBNE ,16674910,Tue Nov 23 23:29:32 CET,Wed Nov 24 01:21:15 CET,0.0 1.079 1.496 1.783 2.041 2.279 2.498 2.685 3.014 3.164 3.304 3.439 3.697 3.821 4.057 4.282 4.486 4.591 4.798 4.985 5.263 5.451 5.628 5.88 6.117 6.343 6.572 6.793 7.06 7.304 7.526 7.797 8.063 8.317 8.626 8.975 9.293 9.616 9.962 10.333 10.742 11.195 11.724 12.257 12.858 13.54 14.302 15.087 15.991 17.045 18.198 18.859 19.039 19.049 18.948 18.795 18.626 18.442 18.269 18.082 17.889 17.688 17.48 17.292 17.117 16.936 16.738 16.566 16.415 16.248 16.061 15.906 15.742 15.55 15.407 15.268 15.115 14.945 14.762 14.637 14.495 14.277 14.134 13.985 13.902 13.723 13.538 13.325 13.212 12.981 12.877 12.746 12.599 12.276 12.103 11.912 11.696 11.447 11.139 10.696 9.289 -3 ,16751 ,KEBNE ,16677205,Wed Nov 24 17:58:00 CET,Wed Nov 24 19:50:43 CET,0.0 1.275 1.769 2.113 2.368 2.588 2.794 2.992 3.335 3.483 3.633 3.794 4.061 4.189 4.436 4.682 4.934 5.048 5.25 5.453 5.746 5.93 6.105 6.349 6.594 6.842 7.073 7.289 7.549 7.788 8.021 8.295 8.562 8.826 9.126 9.474 9.807 10.151 10.516 10.909 11.313 11.76 12.305 12.87 13.5 14.166 14.926 15.765 16.666 17.637 18.693 19.369 19.567 19.576 19.487 19.322 19.128 18.92 18.722 18.506 18.322 18.143 17.947 17.74 17.541 17.363 17.171 17.01 16.865 16.697 16.527 16.38 16.208 16.025 15.891 15.755 15.609 15.459 15.297 15.178 15.051 14.847 14.704 14.559 14.476 14.297 14.12 13.921 13.813 13.575 13.431 13.296 13.161 12.85 12.675 12.466 12.223 11.95 11.625 11.165 9.834 -4 ,7121 ,KEBNE ,16674912,Tue Nov 23 23:29:31 CET,Wed Nov 24 01:24:24 CET,0.0 1.133 1.587 1.907 2.177 2.413 2.626 2.826 3.188 3.351 3.505 3.664 3.919 4.043 4.287 4.516 4.735 4.844 5.06 5.257 5.54 5.72 5.895 6.152 6.384 6.607 6.822 7.02 7.27 7.517 7.758 8.049 8.324 8.573 8.865 9.206 9.523 9.871 10.253 10.663 11.088 11.547 12.078 12.614 13.246 13.928 14.673 15.497 16.451 17.498 18.602 19.334 19.579 19.568 19.43 19.281 19.13 18.932 18.71 18.464 18.225 18.018 17.819 17.63 17.458 17.282 17.094 16.916 16.75 16.578 16.406 16.255 16.086 15.907 15.767 15.621 15.47 15.301 15.123 15.005 14.875 14.671 14.527 14.369 14.294 14.136 13.951 13.746 13.64 13.41 13.293 13.17 13.044 12.764 12.593 12.401 12.187 11.95 11.678 11.306 10.22 -5 ,19696 ,KEBNE ,16677207,Wed Nov 24 18:00:05 CET,Wed Nov 24 19:55:02 CET,0.0 1.188 1.618 1.951 2.239 2.493 2.714 2.919 3.302 3.477 3.634 3.792 4.069 4.198 4.443 4.68 4.9 5.004 5.205 5.388 5.661 5.845 6.017 6.26 6.494 6.728 6.944 7.152 7.426 7.682 7.939 8.243 8.521 8.793 9.129 9.498 9.834 10.193 10.569 10.974 11.403 11.892 12.465 13.016 13.647 14.325 15.038 15.884 16.9 17.995 19.19 19.966 20.248 20.275 20.165 19.984 19.814 19.629 19.435 19.231 19.02 18.812 18.615 18.41 18.221 18.062 17.882 17.718 17.562 17.377 17.177 17.014 16.848 16.675 16.543 16.413 16.268 16.092 15.907 15.787 15.656 15.437 15.284 15.123 15.038 14.868 14.694 14.491 14.381 14.153 14.06 13.933 13.794 13.469 13.28 13.078 12.843 12.573 12.236 11.826 10.395 -6 ,3650 ,KEBNE ,16677208,Wed Nov 24 18:00:05 CET,Wed Nov 24 19:53:23 CET,0.0 1.428 1.899 2.249 2.532 2.769 2.977 3.179 3.545 3.704 3.863 4.029 4.3 4.43 4.688 4.934 5.156 5.265 5.484 5.687 5.964 6.14 6.316 6.575 6.815 7.044 7.267 7.48 7.748 8.005 8.25 8.551 8.833 9.108 9.42 9.76 10.091 10.459 10.875 11.299 11.736 12.254 12.851 13.456 14.123 14.842 15.649 16.54 17.555 18.621 19.745 20.427 20.69 20.802 20.784 20.677 20.519 20.332 20.164 19.972 19.781 19.608 19.43 19.248 19.059 18.876 18.692 18.524 18.369 18.203 18.024 17.869 17.711 17.548 17.413 17.272 17.124 16.966 16.795 16.68 16.556 16.352 16.213 16.068 15.994 15.843 15.674 15.482 15.37 15.126 14.994 14.857 14.715 14.389 14.21 13.993 13.744 13.471 13.142 12.748 11.729 -7 ,11352 ,KEBNE ,16674915,Tue Nov 23 23:34:45 CET,Wed Nov 24 01:25:41 CET,0.0 1.095 1.504 1.814 2.111 2.378 2.595 2.795 3.169 3.344 3.507 3.667 3.937 4.068 4.315 4.55 4.765 4.872 5.072 5.265 5.538 5.704 5.867 6.106 6.337 6.559 6.768 6.968 7.221 7.469 7.712 7.994 8.268 8.537 8.84 9.183 9.511 9.864 10.237 10.65 11.11 11.603 12.15 12.692 13.279 13.882 14.61 15.476 16.411 17.427 18.518 19.195 19.463 19.523 19.445 19.269 19.05 18.853 18.655 18.419 18.216 18.031 17.843 17.657 17.49 17.323 17.124 16.946 16.794 16.63 16.441 16.277 16.118 15.954 15.816 15.66 15.49 15.323 15.143 15.018 14.898 14.7 14.553 14.385 14.298 14.122 13.942 13.732 13.615 13.371 13.237 13.111 12.982 12.685 12.516 12.322 12.085 11.809 11.461 10.96 9.342 -8 ,32677 ,KEBNE ,16674916,Tue Nov 23 23:35:48 CET,Wed Nov 24 01:27:50 CET,0.0 1.356 1.908 2.288 2.558 2.794 3.028 3.254 3.641 3.807 3.963 4.124 4.402 4.536 4.791 5.042 5.267 5.371 5.599 5.82 6.095 6.259 6.422 6.662 6.892 7.117 7.335 7.541 7.812 8.076 8.326 8.62 8.891 9.153 9.463 9.799 10.117 10.479 10.876 11.284 11.722 12.212 12.754 13.312 13.945 14.615 15.348 16.173 17.137 18.191 19.314 20.016 20.255 20.296 20.257 20.151 19.985 19.794 19.607 19.395 19.202 19.02 18.827 18.629 18.429 18.248 18.067 17.89 17.734 17.578 17.404 17.255 17.101 16.931 16.796 16.645 16.48 16.314 16.145 16.023 15.894 15.687 15.535 15.379 15.299 15.127 14.927 14.718 14.616 14.384 14.263 14.13 13.996 13.7 13.528 13.33 13.119 12.872 12.533 12.113 11.07 -9 ,9602 ,KEBNE ,16674917,Tue Nov 23 23:37:53 CET,Wed Nov 24 01:31:07 CET,0.0 1.198 1.647 1.989 2.284 2.532 2.748 2.95 3.318 3.488 3.646 3.808 4.078 4.208 4.445 4.679 4.897 5.003 5.219 5.42 5.69 5.866 6.039 6.287 6.527 6.751 6.951 7.151 7.421 7.683 7.929 8.237 8.526 8.795 9.109 9.456 9.781 10.123 10.48 10.863 11.285 11.755 12.272 12.793 13.416 14.108 14.87 15.682 16.607 17.573 18.544 19.214 19.476 19.501 19.379 19.195 19.005 18.814 18.613 18.396 18.186 17.974 17.761 17.542 17.35 17.19 17.019 16.854 16.697 16.526 16.347 16.189 16.015 15.831 15.683 15.531 15.377 15.215 15.046 14.926 14.795 14.576 14.425 14.269 14.186 14.012 13.834 13.645 13.54 13.306 13.193 13.066 12.935 12.629 12.458 12.265 12.034 11.746 11.41 11.005 9.534 -10 ,779 ,KEBNE ,16674918,Tue Nov 23 23:38:56 CET,Wed Nov 24 01:30:34 CET,0.0 1.024 1.475 1.808 2.108 2.36 2.575 2.775 3.143 3.304 3.456 3.598 3.862 3.996 4.251 4.488 4.711 4.819 5.025 5.223 5.501 5.674 5.848 6.104 6.352 6.585 6.806 7.016 7.276 7.527 7.769 8.053 8.327 8.59 8.896 9.237 9.565 9.941 10.345 10.766 11.211 11.696 12.252 12.819 13.469 14.153 14.918 15.768 16.692 17.683 18.775 19.53 19.792 19.808 19.724 19.6 19.445 19.247 19.033 18.814 18.612 18.412 18.22 18.033 17.846 17.673 17.484 17.303 17.141 16.966 16.795 16.654 16.499 16.333 16.201 16.06 15.903 15.743 15.584 15.466 15.336 15.123 14.968 14.804 14.719 14.549 14.373 14.173 14.069 13.839 13.715 13.579 13.436 13.143 12.975 12.791 12.578 12.294 11.947 11.526 10.217 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_49.txt deleted file mode 100644 index ac5df258..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4666 ,KEBNE ,16677213,Wed Nov 24 18:02:08 CET,Wed Nov 24 19:57:34 CET,0.0 0.995 1.383 1.669 1.924 2.147 2.338 2.518 2.84 2.982 3.125 3.29 3.555 3.686 3.934 4.168 4.385 4.492 4.689 4.882 5.163 5.338 5.513 5.776 6.021 6.246 6.471 6.688 6.974 7.248 7.506 7.818 8.127 8.429 8.768 9.143 9.503 9.913 10.363 10.862 11.391 11.958 12.598 13.251 14.041 14.951 16.03 17.276 18.726 20.352 22.123 23.432 24.163 24.592 24.86 24.974 24.965 24.93 24.86 24.735 24.622 24.505 24.354 24.203 24.059 23.91 23.749 23.595 23.447 23.289 23.124 22.985 22.832 22.651 22.511 22.361 22.178 21.991 21.801 21.664 21.523 21.306 21.149 20.986 20.902 20.725 20.456 20.138 20.014 19.798 19.612 19.443 19.269 18.883 18.647 18.301 17.861 17.466 16.968 16.116 12.858 -2 ,16442 ,KEBNE ,16677214,Wed Nov 24 18:03:09 CET,Wed Nov 24 19:56:50 CET,0.0 0.967 1.376 1.677 1.933 2.166 2.375 2.561 2.908 3.067 3.216 3.363 3.611 3.74 3.976 4.193 4.399 4.5 4.698 4.887 5.159 5.331 5.494 5.749 6.005 6.241 6.463 6.681 6.957 7.209 7.453 7.762 8.061 8.345 8.681 9.074 9.444 9.849 10.302 10.779 11.274 11.834 12.496 13.162 13.964 14.872 15.927 17.14 18.568 20.225 21.998 23.248 23.918 24.255 24.403 24.433 24.373 24.262 24.102 23.902 23.7 23.495 23.3 23.123 22.95 22.784 22.606 22.439 22.28 22.091 21.883 21.709 21.515 21.299 21.143 20.985 20.802 20.6 20.387 20.249 20.106 19.876 19.701 19.503 19.395 19.178 18.948 18.696 18.521 18.235 18.023 17.854 17.69 17.262 17.013 16.771 16.466 16.062 15.527 14.604 11.411 -3 ,22503 ,KEBNE ,16677215,Wed Nov 24 18:05:14 CET,Wed Nov 24 20:01:24 CET,0.0 0.8 1.161 1.462 1.708 1.925 2.123 2.322 2.698 2.861 3.023 3.205 3.458 3.582 3.802 4.024 4.241 4.345 4.547 4.738 5.002 5.173 5.344 5.604 5.853 6.087 6.309 6.518 6.796 7.068 7.321 7.629 7.926 8.207 8.537 8.907 9.267 9.661 10.098 10.587 11.091 11.657 12.33 12.999 13.811 14.739 15.726 16.831 18.13 19.642 21.377 22.616 23.267 23.563 23.673 23.696 23.672 23.618 23.512 23.363 23.231 23.105 22.932 22.755 22.595 22.438 22.277 22.116 21.961 21.799 21.637 21.497 21.323 21.125 20.973 20.806 20.623 20.428 20.222 20.089 19.955 19.749 19.582 19.33 19.195 18.982 18.774 18.521 18.392 18.18 18.027 17.837 17.622 17.221 16.999 16.728 16.399 15.964 15.388 14.589 12.381 -4 ,28195 ,KEBNE ,16677216,Wed Nov 24 18:05:13 CET,Wed Nov 24 19:56:46 CET,0.0 1.009 1.389 1.711 2.002 2.247 2.466 2.67 3.019 3.181 3.331 3.482 3.723 3.84 4.082 4.307 4.529 4.637 4.843 5.034 5.299 5.481 5.658 5.911 6.15 6.382 6.605 6.81 7.074 7.334 7.596 7.912 8.202 8.504 8.87 9.255 9.613 10.025 10.482 10.963 11.442 11.968 12.626 13.302 14.054 14.92 15.945 17.125 18.523 20.127 21.971 23.394 24.2 24.624 24.797 24.827 24.759 24.649 24.522 24.367 24.24 24.099 23.929 23.76 23.583 23.412 23.249 23.117 23.005 22.876 22.708 22.553 22.398 22.251 22.133 21.996 21.844 21.672 21.458 21.315 21.184 20.943 20.746 20.55 20.45 20.252 20.044 19.759 19.602 19.355 19.158 19.002 18.836 18.452 18.209 17.876 17.512 17.152 16.743 16.181 13.549 -5 ,24851 ,KEBNE ,16677217,Wed Nov 24 18:06:15 CET,Wed Nov 24 20:01:18 CET,0.0 0.775 1.159 1.423 1.669 1.902 2.094 2.267 2.591 2.746 2.892 3.044 3.297 3.421 3.655 3.886 4.116 4.228 4.434 4.622 4.896 5.077 5.256 5.51 5.751 5.984 6.213 6.435 6.723 6.995 7.256 7.574 7.873 8.151 8.471 8.845 9.212 9.615 10.045 10.512 10.997 11.534 12.205 12.891 13.676 14.575 15.555 16.619 17.913 19.392 21.033 22.221 22.782 23.056 23.141 23.104 23.004 22.881 22.742 22.544 22.356 22.186 21.98 21.77 21.581 21.394 21.189 20.986 20.799 20.593 20.371 20.188 19.997 19.799 19.634 19.45 19.255 19.05 18.837 18.687 18.53 18.272 18.097 17.921 17.822 17.601 17.349 17.083 16.942 16.699 16.482 16.314 16.126 15.658 15.423 15.172 14.885 14.547 14.092 13.256 10.412 -6 ,1357 ,KEBNE ,16677218,Wed Nov 24 18:08:19 CET,Wed Nov 24 20:09:07 CET,0.0 0.777 1.126 1.41 1.66 1.883 2.087 2.275 2.602 2.752 2.902 3.053 3.31 3.431 3.654 3.876 4.09 4.192 4.394 4.581 4.842 5.02 5.189 5.434 5.671 5.9 6.129 6.348 6.634 6.902 7.161 7.494 7.804 8.092 8.436 8.823 9.194 9.615 10.069 10.537 11.023 11.599 12.273 12.938 13.685 14.531 15.558 16.696 18.043 19.723 21.721 23.191 23.953 24.335 24.497 24.588 24.603 24.538 24.453 24.361 24.27 24.151 23.987 23.805 23.636 23.477 23.315 23.159 22.996 22.803 22.578 22.387 22.191 21.98 21.806 21.643 21.476 21.296 21.115 20.978 20.829 20.607 20.449 20.278 20.188 19.988 19.781 19.548 19.411 19.174 18.981 18.812 18.631 18.257 18.056 17.808 17.51 17.183 16.657 15.829 11.784 -7 ,31790 ,KEBNE ,16677219,Wed Nov 24 18:11:24 CET,Wed Nov 24 20:04:05 CET,0.0 0.705 1.089 1.395 1.658 1.871 2.067 2.252 2.583 2.742 2.894 3.048 3.304 3.436 3.691 3.92 4.137 4.242 4.438 4.619 4.896 5.081 5.246 5.481 5.707 5.93 6.145 6.352 6.624 6.881 7.136 7.444 7.742 8.036 8.368 8.749 9.124 9.541 10.0 10.477 10.982 11.585 12.294 12.963 13.736 14.593 15.554 16.653 18.002 19.611 21.457 22.934 23.724 24.092 24.271 24.36 24.377 24.361 24.278 24.152 24.018 23.865 23.693 23.508 23.333 23.176 23.024 22.877 22.733 22.588 22.433 22.277 22.107 21.905 21.745 21.588 21.399 21.199 20.992 20.855 20.72 20.5 20.314 20.108 20.007 19.807 19.59 19.312 19.17 18.947 18.778 18.64 18.493 18.137 17.908 17.641 17.256 16.676 15.907 14.866 11.473 -8 ,17461 ,KEBNE ,16677220,Wed Nov 24 18:15:30 CET,Wed Nov 24 20:07:07 CET,0.0 0.832 1.204 1.491 1.737 1.956 2.154 2.344 2.69 2.857 3.004 3.147 3.402 3.524 3.759 3.983 4.197 4.306 4.518 4.712 4.98 5.154 5.32 5.552 5.779 5.995 6.203 6.411 6.685 6.949 7.203 7.503 7.777 8.049 8.368 8.729 9.088 9.479 9.911 10.382 10.864 11.388 12.007 12.64 13.416 14.299 15.245 16.262 17.506 19.045 20.767 22.027 22.72 23.087 23.217 23.238 23.166 23.057 22.937 22.764 22.571 22.369 22.181 22.014 21.833 21.661 21.501 21.339 21.184 21.029 20.87 20.737 20.572 20.39 20.257 20.124 19.99 19.84 19.652 19.52 19.399 19.183 19.019 18.852 18.764 18.576 18.372 18.141 18.007 17.764 17.581 17.428 17.24 16.827 16.565 16.234 15.823 15.314 14.729 13.879 11.123 -9 ,7648 ,KEBNE ,16677221,Wed Nov 24 18:15:30 CET,Wed Nov 24 20:08:13 CET,0.0 0.736 1.123 1.444 1.71 1.941 2.155 2.357 2.713 2.871 3.016 3.169 3.427 3.565 3.822 4.05 4.259 4.358 4.562 4.764 5.044 5.229 5.405 5.651 5.889 6.117 6.34 6.556 6.833 7.103 7.364 7.673 7.972 8.266 8.596 8.954 9.314 9.714 10.13 10.581 11.079 11.648 12.313 13.013 13.824 14.695 15.707 16.854 18.156 19.611 21.326 22.702 23.359 23.655 23.818 23.913 23.927 23.857 23.742 23.555 23.384 23.231 23.042 22.865 22.702 22.543 22.378 22.22 22.078 21.926 21.742 21.575 21.419 21.251 21.097 20.941 20.781 20.604 20.406 20.272 20.139 19.908 19.742 19.56 19.465 19.278 19.052 18.78 18.628 18.35 18.056 17.867 17.694 17.318 17.008 16.658 16.364 16.008 15.469 14.661 11.133 -10 ,4873 ,KEBNE ,16677222,Wed Nov 24 18:15:31 CET,Wed Nov 24 20:08:36 CET,0.0 1.001 1.391 1.708 1.967 2.191 2.398 2.589 2.922 3.07 3.223 3.401 3.652 3.771 4.003 4.224 4.439 4.545 4.752 4.954 5.245 5.418 5.579 5.817 6.047 6.272 6.495 6.717 6.998 7.258 7.507 7.815 8.108 8.39 8.718 9.093 9.465 9.866 10.31 10.801 11.302 11.859 12.519 13.203 14.014 14.862 15.865 17.058 18.401 19.877 21.562 22.809 23.37 23.642 23.735 23.739 23.701 23.613 23.505 23.372 23.225 23.044 22.863 22.699 22.544 22.396 22.227 22.062 21.906 21.723 21.525 21.379 21.214 21.019 20.863 20.695 20.533 20.374 20.179 20.023 19.861 19.573 19.32 19.068 18.966 18.77 18.549 18.263 18.115 17.884 17.688 17.514 17.342 16.935 16.684 16.35 15.997 15.62 15.081 14.212 11.411 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_65.txt deleted file mode 100644 index b4659c6e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17796 ,KEBNE ,17023869,Wed Dec 22 08:38:45 CET,Wed Dec 22 10:28:26 CET,0.0 1.396 1.858 2.207 2.506 2.766 2.975 3.164 3.519 3.671 3.811 3.951 4.2 4.324 4.564 4.794 5.019 5.121 5.304 5.478 5.74 5.909 6.069 6.296 6.514 6.717 6.91 7.1 7.343 7.585 7.827 8.11 8.371 8.623 8.925 9.263 9.572 9.921 10.287 10.662 11.073 11.534 12.064 12.599 13.233 13.956 14.789 15.665 16.649 17.837 19.155 19.957 20.261 20.338 20.281 20.167 20.032 19.816 19.58 19.388 19.183 18.948 18.73 18.485 18.234 18.05 17.875 17.695 17.516 17.317 17.101 16.918 16.727 16.508 16.338 16.173 16.004 15.823 15.622 15.472 15.313 15.077 14.906 14.719 14.628 14.424 14.19 13.954 13.831 13.594 13.43 13.278 13.115 12.739 12.5 12.244 11.962 11.632 11.246 10.775 9.388 -2 ,829 ,KEBNE ,17023870,Wed Dec 22 08:38:45 CET,Wed Dec 22 10:26:31 CET,0.0 0.766 1.174 1.513 1.781 2.004 2.213 2.412 2.782 2.949 3.1 3.232 3.478 3.601 3.836 4.053 4.255 4.35 4.543 4.735 5.001 5.166 5.33 5.566 5.787 5.998 6.204 6.401 6.672 6.933 7.171 7.455 7.721 7.986 8.294 8.628 8.955 9.314 9.683 10.08 10.504 10.983 11.573 12.161 12.796 13.506 14.353 15.299 16.346 17.488 18.742 19.534 19.819 19.841 19.696 19.471 19.25 18.984 18.721 18.477 18.252 18.002 17.766 17.549 17.332 17.125 16.896 16.682 16.487 16.273 16.046 15.857 15.67 15.493 15.348 15.184 14.989 14.78 14.582 14.44 14.277 14.004 13.831 13.663 13.566 13.366 13.137 12.872 12.739 12.497 12.306 12.139 11.96 11.566 11.354 11.119 10.833 10.483 10.085 9.58 8.159 -3 ,23390 ,KEBNE ,17023871,Wed Dec 22 08:39:47 CET,Wed Dec 22 10:28:18 CET,0.0 1.397 1.818 2.13 2.405 2.655 2.866 3.057 3.42 3.579 3.722 3.871 4.118 4.246 4.496 4.714 4.921 5.024 5.218 5.399 5.665 5.839 5.999 6.229 6.447 6.652 6.855 7.051 7.301 7.539 7.764 8.042 8.306 8.544 8.827 9.161 9.478 9.827 10.203 10.59 11.013 11.486 12.009 12.537 13.142 13.83 14.637 15.534 16.56 17.723 18.939 19.667 19.906 19.839 19.656 19.466 19.262 19.008 18.746 18.483 18.267 18.06 17.796 17.542 17.307 17.081 16.84 16.607 16.402 16.184 15.937 15.737 15.538 15.337 15.173 14.981 14.788 14.587 14.366 14.222 14.067 13.809 13.633 13.444 13.348 13.139 12.913 12.691 12.574 12.339 12.165 12.012 11.835 11.416 11.191 10.956 10.661 10.305 9.89 9.295 7.375 -4 ,5130 ,KEBNE ,17023872,Wed Dec 22 08:40:47 CET,Wed Dec 22 10:32:20 CET,0.0 1.577 2.072 2.437 2.74 2.996 3.231 3.444 3.798 3.955 4.11 4.275 4.531 4.659 4.907 5.129 5.336 5.433 5.624 5.807 6.062 6.222 6.377 6.611 6.833 7.055 7.27 7.466 7.71 7.947 8.182 8.467 8.737 8.988 9.274 9.602 9.919 10.264 10.638 11.047 11.457 11.913 12.448 13.0 13.648 14.341 15.207 16.161 17.184 18.301 19.467 20.233 20.517 20.535 20.418 20.269 20.103 19.895 19.683 19.44 19.229 19.036 18.809 18.582 18.368 18.159 17.934 17.729 17.528 17.313 17.098 16.929 16.754 16.541 16.38 16.22 16.045 15.866 15.675 15.531 15.369 15.104 14.921 14.731 14.632 14.424 14.189 13.914 13.77 13.518 13.342 13.18 13.019 12.687 12.477 12.229 11.94 11.623 11.229 10.697 9.341 -5 ,2335 ,KEBNE ,17023873,Wed Dec 22 08:39:44 CET,Wed Dec 22 10:30:36 CET,0.0 0.937 1.383 1.705 1.975 2.218 2.433 2.635 3.0 3.153 3.29 3.429 3.693 3.831 4.062 4.278 4.492 4.598 4.798 4.985 5.243 5.405 5.56 5.782 6.009 6.233 6.437 6.633 6.885 7.118 7.336 7.602 7.872 8.136 8.424 8.746 9.059 9.405 9.791 10.2 10.644 11.147 11.7 12.267 12.933 13.608 14.349 15.161 16.121 17.267 18.496 19.279 19.568 19.576 19.465 19.313 19.125 18.894 18.673 18.435 18.208 17.986 17.76 17.535 17.311 17.124 16.917 16.694 16.491 16.289 16.084 15.902 15.705 15.51 15.357 15.19 15.014 14.831 14.635 14.479 14.315 14.069 13.884 13.688 13.592 13.395 13.183 12.95 12.818 12.561 12.367 12.203 12.004 11.586 11.371 11.14 10.875 10.546 10.152 9.659 8.046 -6 ,1475 ,KEBNE ,17023874,Wed Dec 22 08:39:43 CET,Wed Dec 22 10:31:26 CET,0.0 0.941 1.314 1.637 1.893 2.126 2.354 2.561 2.914 3.067 3.215 3.384 3.643 3.772 4.016 4.243 4.454 4.552 4.744 4.924 5.181 5.348 5.504 5.737 5.969 6.188 6.392 6.581 6.822 7.056 7.287 7.57 7.831 8.073 8.363 8.7 9.026 9.38 9.748 10.142 10.573 11.049 11.558 12.064 12.692 13.355 14.01 14.741 15.649 16.669 17.766 18.435 18.652 18.659 18.555 18.379 18.15 17.902 17.671 17.403 17.159 16.942 16.712 16.485 16.244 16.011 15.772 15.55 15.361 15.154 14.93 14.751 14.556 14.349 14.199 14.034 13.856 13.657 13.448 13.305 13.146 12.905 12.743 12.571 12.472 12.257 12.028 11.773 11.642 11.394 11.215 11.064 10.882 10.436 10.214 9.985 9.72 9.373 8.903 8.258 6.443 -7 ,15301 ,KEBNE ,17023875,Wed Dec 22 08:40:47 CET,Wed Dec 22 10:32:11 CET,0.0 1.458 1.962 2.314 2.604 2.866 3.091 3.285 3.619 3.77 3.917 4.084 4.342 4.468 4.709 4.931 5.135 5.231 5.418 5.599 5.859 6.025 6.187 6.419 6.635 6.849 7.059 7.251 7.501 7.729 7.95 8.238 8.512 8.77 9.063 9.393 9.71 10.048 10.418 10.835 11.269 11.738 12.285 12.827 13.502 14.278 15.12 16.006 16.944 17.946 19.106 19.901 20.156 20.206 20.15 20.011 19.828 19.628 19.39 19.1 18.84 18.603 18.361 18.099 17.849 17.61 17.343 17.113 16.93 16.708 16.454 16.258 16.063 15.851 15.667 15.477 15.289 15.09 14.875 14.724 14.569 14.331 14.15 13.951 13.85 13.639 13.413 13.168 13.038 12.795 12.604 12.425 12.233 11.845 11.626 11.385 11.115 10.793 10.394 9.844 8.214 -8 ,30169 ,KEBNE ,17023876,Wed Dec 22 08:40:51 CET,Wed Dec 22 10:31:23 CET,0.0 1.075 1.485 1.796 2.079 2.338 2.564 2.758 3.089 3.236 3.379 3.536 3.786 3.905 4.122 4.336 4.546 4.648 4.842 5.021 5.281 5.442 5.596 5.825 6.049 6.262 6.467 6.667 6.921 7.167 7.398 7.67 7.928 8.175 8.467 8.804 9.106 9.432 9.801 10.2 10.648 11.148 11.73 12.311 12.95 13.619 14.393 15.306 16.35 17.471 18.647 19.376 19.62 19.651 19.607 19.511 19.357 19.172 18.964 18.704 18.46 18.225 17.996 17.761 17.513 17.274 17.019 16.808 16.631 16.43 16.213 16.023 15.826 15.633 15.471 15.284 15.089 14.874 14.647 14.501 14.351 14.11 13.922 13.724 13.629 13.422 13.165 12.88 12.737 12.488 12.275 12.11 11.936 11.542 11.326 11.069 10.77 10.446 10.038 9.462 7.732 -9 ,32600 ,KEBNE ,17023877,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:35:53 CET,0.0 1.106 1.55 1.878 2.162 2.402 2.612 2.809 3.153 3.294 3.437 3.59 3.836 3.956 4.196 4.415 4.606 4.706 4.905 5.081 5.327 5.491 5.658 5.891 6.116 6.331 6.527 6.72 6.984 7.237 7.479 7.764 8.029 8.286 8.573 8.885 9.2 9.561 9.939 10.336 10.762 11.231 11.783 12.337 12.958 13.645 14.472 15.424 16.442 17.56 18.864 19.649 19.921 19.998 19.941 19.802 19.621 19.436 19.237 18.986 18.752 18.556 18.351 18.111 17.872 17.655 17.403 17.164 16.967 16.777 16.59 16.426 16.244 16.044 15.89 15.734 15.563 15.369 15.169 15.035 14.889 14.658 14.497 14.329 14.236 14.033 13.805 13.555 13.427 13.188 13.014 12.859 12.694 12.325 12.125 11.904 11.644 11.363 11.008 10.45 8.701 -10 ,19573 ,KEBNE ,17023878,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:34:16 CET,0.0 1.011 1.419 1.75 2.016 2.243 2.454 2.667 3.05 3.204 3.351 3.507 3.757 3.879 4.121 4.338 4.541 4.641 4.834 5.017 5.275 5.444 5.611 5.845 6.064 6.266 6.458 6.648 6.898 7.139 7.368 7.646 7.914 8.173 8.463 8.786 9.111 9.472 9.854 10.258 10.682 11.143 11.677 12.224 12.886 13.607 14.375 15.244 16.276 17.432 18.654 19.448 19.761 19.829 19.801 19.709 19.581 19.395 19.176 18.928 18.698 18.485 18.258 18.015 17.778 17.565 17.339 17.143 16.974 16.78 16.564 16.383 16.2 16.016 15.876 15.708 15.521 15.333 15.151 15.036 14.908 14.683 14.523 14.363 14.276 14.063 13.827 13.603 13.481 13.231 13.01 12.836 12.66 12.275 12.058 11.81 11.513 11.182 10.789 10.252 8.773 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_65.txt deleted file mode 100644 index 06c2ff88..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11746 ,KEBNE ,16677223,Wed Nov 24 18:16:32 CET,Wed Nov 24 20:08:44 CET,0.0 1.058 1.439 1.722 1.955 2.174 2.373 2.545 2.865 3.014 3.147 3.281 3.497 3.599 3.79 3.966 4.13 4.207 4.352 4.494 4.698 4.825 4.956 5.144 5.313 5.468 5.6 5.724 5.903 6.085 6.248 6.441 6.639 6.83 7.038 7.263 7.47 7.686 7.909 8.138 8.39 8.671 8.969 9.254 9.591 9.961 10.342 10.708 11.083 11.465 11.656 11.508 11.214 10.861 10.484 10.103 9.751 9.401 9.045 8.648 8.315 8.02 7.716 7.447 7.197 6.944 6.684 6.431 6.19 5.918 5.63 5.412 5.198 4.979 4.805 4.619 4.417 4.192 3.938 3.769 3.595 3.311 3.12 2.906 2.787 2.545 2.288 2.016 1.88 1.632 1.446 1.282 1.099 0.687 0.459 0.21 -0.065 -0.37 -0.761 -1.257 -2.8 -2 ,23669 ,KEBNE ,16677224,Wed Nov 24 18:17:34 CET,Wed Nov 24 20:11:11 CET,0.0 1.025 1.372 1.668 1.914 2.118 2.302 2.465 2.775 2.915 3.039 3.157 3.364 3.465 3.67 3.863 4.036 4.123 4.287 4.436 4.646 4.781 4.907 5.077 5.238 5.389 5.536 5.679 5.862 6.036 6.193 6.378 6.557 6.724 6.922 7.142 7.35 7.572 7.796 8.027 8.265 8.525 8.804 9.092 9.429 9.764 10.144 10.553 10.929 11.271 11.509 11.33 10.948 10.513 10.139 9.764 9.358 8.945 8.575 8.182 7.838 7.544 7.225 6.907 6.584 6.284 6.011 5.78 5.578 5.345 5.078 4.844 4.606 4.364 4.177 3.982 3.773 3.557 3.34 3.2 3.047 2.766 2.56 2.352 2.252 2.05 1.808 1.535 1.385 1.122 0.928 0.757 0.583 0.189 -0.044 -0.29 -0.547 -0.858 -1.241 -1.731 -3.143 -3 ,27039 ,KEBNE ,16677225,Wed Nov 24 18:20:42 CET,Wed Nov 24 20:08:07 CET,0.0 1.122 1.554 1.856 2.085 2.282 2.475 2.667 2.992 3.135 3.267 3.407 3.631 3.732 3.92 4.098 4.268 4.35 4.506 4.655 4.881 5.028 5.16 5.337 5.51 5.669 5.811 5.956 6.155 6.336 6.503 6.7 6.882 7.06 7.274 7.507 7.717 7.944 8.184 8.443 8.707 8.974 9.279 9.606 9.965 10.323 10.708 11.107 11.51 11.842 11.979 11.784 11.49 11.164 10.778 10.35 9.976 9.646 9.32 8.942 8.63 8.36 8.069 7.776 7.47 7.176 6.885 6.645 6.413 6.162 5.934 5.737 5.491 5.226 5.018 4.804 4.606 4.397 4.16 3.998 3.837 3.571 3.372 3.163 3.056 2.827 2.595 2.347 2.214 1.974 1.786 1.607 1.42 1.021 0.793 0.549 0.281 -0.016 -0.358 -0.827 -2.231 -4 ,25254 ,KEBNE ,16677226,Wed Nov 24 18:22:45 CET,Wed Nov 24 20:13:23 CET,0.0 1.063 1.448 1.738 1.989 2.203 2.401 2.584 2.882 3.008 3.124 3.243 3.455 3.558 3.753 3.936 4.098 4.175 4.338 4.493 4.694 4.828 4.956 5.135 5.312 5.489 5.647 5.784 5.95 6.103 6.262 6.453 6.625 6.782 6.963 7.163 7.353 7.568 7.794 8.032 8.281 8.57 8.891 9.185 9.507 9.851 10.252 10.675 11.066 11.411 11.623 11.445 11.138 10.776 10.397 10.038 9.701 9.315 8.948 8.649 8.385 8.123 7.844 7.547 7.263 6.995 6.716 6.468 6.252 6.023 5.777 5.563 5.333 5.079 4.882 4.683 4.454 4.218 3.968 3.788 3.611 3.329 3.139 2.959 2.86 2.636 2.389 2.112 1.969 1.718 1.536 1.375 1.189 0.757 0.525 0.282 0.015 -0.321 -0.744 -1.306 -2.851 -5 ,8318 ,KEBNE ,16677227,Wed Nov 24 18:24:49 CET,Wed Nov 24 20:14:40 CET,0.0 0.902 1.329 1.624 1.845 2.05 2.233 2.404 2.708 2.836 2.957 3.09 3.305 3.4 3.581 3.754 3.923 4.005 4.159 4.308 4.511 4.642 4.771 4.948 5.114 5.275 5.429 5.576 5.76 5.939 6.109 6.318 6.512 6.682 6.885 7.113 7.326 7.55 7.787 8.042 8.289 8.56 8.877 9.192 9.552 9.921 10.27 10.588 10.938 11.308 11.524 11.321 10.963 10.615 10.262 9.877 9.507 9.141 8.796 8.438 8.132 7.824 7.512 7.231 6.957 6.702 6.443 6.209 6.014 5.822 5.587 5.366 5.138 4.912 4.735 4.545 4.346 4.13 3.89 3.731 3.576 3.313 3.125 2.94 2.838 2.61 2.383 2.142 2.015 1.774 1.588 1.425 1.257 0.873 0.662 0.439 0.168 -0.131 -0.48 -0.936 -2.425 -6 ,13890 ,KEBNE ,16677228,Wed Nov 24 18:33:01 CET,Wed Nov 24 20:26:11 CET,0.0 1.166 1.61 1.902 2.146 2.356 2.542 2.72 3.032 3.16 3.279 3.406 3.623 3.724 3.908 4.078 4.235 4.315 4.482 4.637 4.848 4.978 5.096 5.269 5.432 5.587 5.742 5.888 6.072 6.246 6.411 6.615 6.81 6.977 7.173 7.387 7.581 7.811 8.057 8.301 8.559 8.829 9.139 9.46 9.787 10.091 10.438 10.795 11.173 11.537 11.771 11.631 11.298 10.919 10.547 10.213 9.866 9.494 9.148 8.8 8.488 8.186 7.896 7.626 7.342 7.054 6.739 6.442 6.193 5.962 5.739 5.53 5.304 5.07 4.86 4.638 4.41 4.184 3.963 3.801 3.633 3.344 3.124 2.916 2.82 2.613 2.388 2.137 1.999 1.745 1.54 1.374 1.199 0.799 0.572 0.323 0.05 -0.246 -0.634 -1.187 -2.757 -7 ,727 ,KEBNE ,16677229,Wed Nov 24 18:33:01 CET,Wed Nov 24 20:25:26 CET,0.0 1.18 1.616 1.94 2.204 2.416 2.601 2.774 3.084 3.225 3.359 3.488 3.704 3.817 4.037 4.241 4.43 4.52 4.693 4.853 5.076 5.211 5.336 5.515 5.691 5.856 6.004 6.143 6.327 6.509 6.678 6.883 7.086 7.27 7.467 7.696 7.908 8.135 8.379 8.623 8.877 9.157 9.463 9.742 10.063 10.407 10.76 11.14 11.541 11.888 12.071 11.916 11.571 11.129 10.682 10.239 9.835 9.459 9.076 8.63 8.24 7.923 7.613 7.306 7.041 6.795 6.497 6.236 6.023 5.795 5.562 5.37 5.158 4.933 4.757 4.564 4.357 4.131 3.893 3.727 3.556 3.295 3.102 2.889 2.775 2.547 2.309 2.041 1.901 1.652 1.464 1.299 1.122 0.746 0.541 0.303 0.036 -0.267 -0.674 -1.221 -2.63 -8 ,1649 ,KEBNE ,16677230,Wed Nov 24 18:34:02 CET,Wed Nov 24 20:25:37 CET,0.0 0.925 1.283 1.554 1.777 1.979 2.179 2.373 2.697 2.828 2.949 3.071 3.287 3.397 3.59 3.756 3.92 4.009 4.183 4.334 4.546 4.676 4.794 4.974 5.144 5.298 5.454 5.607 5.799 5.971 6.127 6.32 6.505 6.674 6.867 7.089 7.292 7.505 7.727 7.96 8.22 8.522 8.854 9.175 9.523 9.886 10.27 10.59 10.872 11.174 11.366 11.238 10.937 10.583 10.185 9.779 9.412 9.034 8.692 8.352 7.999 7.684 7.391 7.063 6.771 6.518 6.237 5.989 5.775 5.551 5.325 5.131 4.926 4.722 4.564 4.382 4.19 3.992 3.776 3.618 3.444 3.178 2.978 2.765 2.659 2.428 2.172 1.915 1.792 1.555 1.376 1.223 1.063 0.715 0.511 0.276 -0.007 -0.326 -0.689 -1.209 -2.577 -9 ,10616 ,KEBNE ,16677231,Wed Nov 24 18:34:02 CET,Wed Nov 24 20:27:23 CET,0.0 1.048 1.474 1.792 2.029 2.219 2.386 2.551 2.857 2.989 3.117 3.258 3.482 3.588 3.773 3.957 4.134 4.214 4.367 4.513 4.727 4.864 4.985 5.166 5.342 5.507 5.663 5.812 5.999 6.179 6.344 6.531 6.729 6.915 7.109 7.332 7.539 7.75 7.974 8.212 8.471 8.75 9.05 9.324 9.629 9.979 10.356 10.718 11.094 11.479 11.675 11.509 11.218 10.849 10.444 9.99 9.552 9.185 8.861 8.522 8.195 7.851 7.523 7.242 7.005 6.782 6.509 6.261 6.049 5.825 5.57 5.352 5.146 4.938 4.767 4.576 4.36 4.128 3.882 3.71 3.543 3.286 3.095 2.89 2.782 2.546 2.305 2.06 1.933 1.697 1.541 1.375 1.176 0.778 0.545 0.281 -0.004 -0.354 -0.735 -1.216 -2.807 -10 ,7612 ,KEBNE ,16677232,Wed Nov 24 18:34:02 CET,Wed Nov 24 20:27:11 CET,0.0 1.004 1.386 1.693 1.945 2.147 2.315 2.469 2.759 2.897 3.032 3.163 3.381 3.492 3.674 3.838 4.0 4.077 4.237 4.398 4.624 4.764 4.887 5.059 5.219 5.372 5.532 5.687 5.872 6.036 6.195 6.405 6.606 6.782 6.969 7.186 7.395 7.62 7.858 8.093 8.343 8.629 8.949 9.26 9.581 9.901 10.266 10.639 10.984 11.256 11.416 11.34 10.988 10.57 10.185 9.793 9.377 8.989 8.665 8.321 8.015 7.734 7.471 7.179 6.888 6.649 6.379 6.117 5.889 5.655 5.411 5.205 4.984 4.756 4.577 4.398 4.212 3.986 3.731 3.569 3.405 3.129 2.937 2.727 2.619 2.397 2.159 1.921 1.792 1.544 1.359 1.198 1.016 0.601 0.378 0.129 -0.155 -0.462 -0.861 -1.398 -3.318 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_70.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_70.txt deleted file mode 100644 index 9f44c321..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_70.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15755 ,KEBNE ,16674919,Tue Nov 23 23:38:57 CET,Wed Nov 24 01:32:57 CET,0.0 1.492 1.923 2.235 2.491 2.72 2.921 3.096 3.383 3.517 3.66 3.827 4.053 4.165 4.391 4.608 4.8 4.89 5.064 5.233 5.485 5.647 5.805 6.034 6.247 6.444 6.635 6.816 7.058 7.302 7.525 7.784 8.027 8.262 8.537 8.841 9.122 9.426 9.763 10.122 10.503 10.936 11.438 11.955 12.551 13.202 13.94 14.762 15.737 16.885 18.208 19.214 19.702 19.913 19.989 19.976 19.903 19.778 19.628 19.469 19.344 19.227 19.086 18.944 18.807 18.673 18.522 18.371 18.243 18.101 17.948 17.824 17.686 17.535 17.414 17.28 17.134 16.983 16.823 16.719 16.612 16.43 16.295 16.155 16.086 15.934 15.766 15.577 15.477 15.281 15.176 15.062 14.936 14.66 14.508 14.344 14.141 13.901 13.63 13.268 12.019 -2 ,24187 ,KEBNE ,16674920,Tue Nov 23 23:38:57 CET,Wed Nov 24 01:31:34 CET,0.0 1.414 1.806 2.113 2.402 2.637 2.822 2.993 3.302 3.435 3.563 3.705 3.93 4.045 4.252 4.451 4.637 4.724 4.899 5.067 5.301 5.455 5.603 5.808 6.005 6.191 6.372 6.561 6.802 7.02 7.225 7.477 7.719 7.945 8.213 8.514 8.802 9.129 9.477 9.835 10.214 10.625 11.096 11.574 12.133 12.765 13.462 14.242 15.183 16.29 17.542 18.428 18.867 19.117 19.239 19.251 19.199 19.121 19.042 18.937 18.83 18.714 18.58 18.456 18.33 18.199 18.058 17.922 17.795 17.664 17.528 17.411 17.28 17.134 17.018 16.897 16.769 16.632 16.484 16.389 16.29 16.118 15.994 15.862 15.792 15.642 15.48 15.295 15.194 14.998 14.849 14.718 14.58 14.252 14.075 13.888 13.667 13.4 13.105 12.698 11.527 -3 ,6334 ,KEBNE ,16674921,Tue Nov 23 23:39:59 CET,Wed Nov 24 01:32:01 CET,0.0 1.16 1.59 1.918 2.186 2.402 2.6 2.775 3.085 3.231 3.368 3.506 3.728 3.838 4.042 4.24 4.44 4.535 4.715 4.884 5.124 5.282 5.432 5.637 5.83 6.019 6.211 6.405 6.642 6.868 7.093 7.35 7.593 7.849 8.146 8.462 8.775 9.111 9.446 9.799 10.187 10.632 11.136 11.62 12.176 12.793 13.475 14.246 15.176 16.235 17.475 18.446 18.921 19.162 19.251 19.243 19.194 19.127 19.044 18.917 18.77 18.647 18.534 18.393 18.254 18.127 17.973 17.828 17.706 17.574 17.415 17.284 17.156 17.015 16.902 16.782 16.658 16.526 16.372 16.266 16.156 15.977 15.857 15.719 15.641 15.483 15.321 15.161 15.079 14.895 14.779 14.667 14.551 14.289 14.131 13.947 13.748 13.537 13.259 12.863 11.641 -4 ,28995 ,KEBNE ,16674922,Tue Nov 23 23:41:02 CET,Wed Nov 24 01:33:26 CET,0.0 1.243 1.673 1.97 2.213 2.418 2.604 2.776 3.085 3.226 3.355 3.492 3.71 3.822 4.043 4.254 4.446 4.539 4.723 4.899 5.138 5.282 5.422 5.624 5.814 6.002 6.195 6.374 6.596 6.814 7.02 7.262 7.493 7.723 7.996 8.301 8.587 8.9 9.252 9.622 10.007 10.448 10.952 11.461 12.063 12.719 13.458 14.272 15.197 16.29 17.634 18.647 19.079 19.23 19.283 19.262 19.186 19.093 18.98 18.854 18.73 18.587 18.443 18.298 18.14 17.991 17.834 17.695 17.575 17.44 17.294 17.168 17.025 16.864 16.736 16.616 16.494 16.354 16.203 16.099 15.988 15.802 15.681 15.559 15.491 15.348 15.197 15.027 14.937 14.745 14.623 14.505 14.38 14.095 13.93 13.752 13.543 13.292 12.991 12.58 11.188 -5 ,19091 ,KEBNE ,16674923,Tue Nov 23 23:48:21 CET,Wed Nov 24 01:43:22 CET,0.0 1.155 1.525 1.811 2.083 2.314 2.506 2.685 3.012 3.157 3.287 3.426 3.648 3.757 3.972 4.177 4.368 4.458 4.623 4.796 5.058 5.211 5.356 5.573 5.783 5.974 6.161 6.349 6.582 6.803 7.012 7.256 7.491 7.714 7.984 8.293 8.571 8.88 9.217 9.566 9.945 10.365 10.846 11.331 11.894 12.515 13.216 14.034 15.024 16.151 17.432 18.391 18.829 19.016 19.064 19.039 18.963 18.873 18.78 18.652 18.525 18.411 18.293 18.161 18.027 17.902 17.77 17.629 17.503 17.382 17.255 17.134 17.001 16.858 16.743 16.625 16.499 16.361 16.215 16.104 15.988 15.809 15.672 15.528 15.458 15.309 15.155 14.991 14.896 14.701 14.583 14.472 14.354 14.081 13.924 13.756 13.567 13.316 13.016 12.631 11.327 -6 ,3617 ,KEBNE ,16677238,Wed Nov 24 18:35:03 CET,Wed Nov 24 20:27:23 CET,0.0 1.379 1.783 2.101 2.375 2.596 2.781 2.952 3.274 3.424 3.56 3.69 3.912 4.025 4.247 4.444 4.632 4.727 4.904 5.071 5.31 5.463 5.607 5.819 6.03 6.233 6.427 6.612 6.844 7.061 7.275 7.531 7.781 8.024 8.299 8.602 8.894 9.215 9.557 9.924 10.322 10.78 11.317 11.839 12.429 13.075 13.785 14.576 15.495 16.567 17.818 18.755 19.201 19.399 19.472 19.474 19.434 19.367 19.285 19.176 19.056 18.931 18.801 18.666 18.549 18.438 18.313 18.189 18.063 17.929 17.796 17.679 17.544 17.395 17.273 17.141 17.002 16.862 16.716 16.614 16.509 16.338 16.218 16.078 16.003 15.848 15.679 15.508 15.427 15.245 15.136 15.03 14.916 14.645 14.48 14.28 14.06 13.84 13.566 13.201 12.168 -7 ,19834 ,KEBNE ,16674925,Tue Nov 23 23:58:49 CET,Wed Nov 24 01:50:38 CET,0.0 1.62 2.034 2.327 2.566 2.787 2.989 3.167 3.491 3.635 3.765 3.913 4.147 4.262 4.466 4.656 4.835 4.926 5.108 5.273 5.508 5.665 5.811 6.017 6.222 6.418 6.605 6.792 7.023 7.24 7.451 7.71 7.97 8.22 8.495 8.796 9.085 9.396 9.737 10.102 10.486 10.926 11.452 11.978 12.542 13.144 13.853 14.65 15.565 16.683 18.029 18.96 19.389 19.568 19.616 19.608 19.587 19.509 19.397 19.283 19.178 19.074 18.951 18.818 18.691 18.566 18.429 18.294 18.172 18.045 17.89 17.759 17.628 17.487 17.374 17.25 17.119 16.988 16.841 16.733 16.623 16.45 16.328 16.19 16.119 15.975 15.816 15.635 15.543 15.362 15.251 15.145 15.02 14.751 14.595 14.414 14.211 13.981 13.708 13.333 12.015 -8 ,838 ,KEBNE ,16674926,Wed Nov 24 00:09:20 CET,Wed Nov 24 02:00:00 CET,0.0 1.24 1.703 2.042 2.298 2.528 2.731 2.908 3.22 3.361 3.497 3.646 3.866 3.979 4.198 4.392 4.58 4.671 4.846 5.011 5.258 5.417 5.565 5.782 5.985 6.185 6.378 6.557 6.79 7.013 7.224 7.481 7.72 7.947 8.209 8.494 8.773 9.079 9.405 9.759 10.127 10.54 11.035 11.532 12.089 12.709 13.44 14.274 15.246 16.33 17.619 18.639 19.125 19.371 19.499 19.527 19.474 19.386 19.29 19.184 19.073 18.956 18.834 18.705 18.58 18.454 18.31 18.176 18.066 17.947 17.808 17.691 17.564 17.427 17.316 17.188 17.056 16.914 16.756 16.649 16.539 16.351 16.219 16.086 16.02 15.883 15.73 15.562 15.477 15.293 15.169 15.051 14.928 14.65 14.495 14.313 14.107 13.896 13.644 13.29 11.876 -9 ,9304 ,KEBNE ,16677241,Wed Nov 24 18:35:04 CET,Wed Nov 24 20:28:52 CET,0.0 1.137 1.548 1.843 2.081 2.292 2.482 2.651 2.955 3.095 3.223 3.353 3.575 3.686 3.899 4.107 4.31 4.402 4.574 4.736 4.973 5.133 5.281 5.494 5.706 5.902 6.083 6.262 6.504 6.73 6.939 7.193 7.434 7.67 7.943 8.233 8.516 8.831 9.158 9.504 9.866 10.274 10.755 11.255 11.843 12.489 13.21 14.002 14.965 16.091 17.354 18.26 18.686 18.863 18.916 18.928 18.901 18.798 18.685 18.58 18.478 18.362 18.226 18.094 17.968 17.853 17.722 17.587 17.46 17.334 17.213 17.104 16.977 16.839 16.727 16.612 16.492 16.364 16.213 16.108 16.005 15.832 15.707 15.566 15.492 15.33 15.15 14.972 14.879 14.684 14.578 14.466 14.339 14.065 13.91 13.732 13.52 13.282 12.991 12.55 11.286 -10 ,11528 ,KEBNE ,16674928,Wed Nov 24 00:31:11 CET,Wed Nov 24 02:22:26 CET,0.0 1.262 1.669 1.975 2.236 2.449 2.648 2.814 3.124 3.27 3.401 3.556 3.784 3.892 4.12 4.349 4.546 4.634 4.804 4.962 5.192 5.34 5.473 5.672 5.868 6.049 6.218 6.388 6.625 6.85 7.054 7.295 7.522 7.752 8.028 8.327 8.62 8.934 9.281 9.648 10.018 10.446 10.947 11.444 12.009 12.643 13.396 14.242 15.181 16.307 17.589 18.494 18.976 19.201 19.292 19.329 19.306 19.213 19.103 18.984 18.842 18.702 18.572 18.433 18.298 18.165 18.013 17.865 17.731 17.6 17.468 17.344 17.208 17.067 16.953 16.84 16.725 16.602 16.452 16.341 16.238 16.06 15.935 15.805 15.732 15.584 15.425 15.248 15.157 14.968 14.862 14.76 14.642 14.351 14.195 14.025 13.829 13.615 13.337 12.95 11.795 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_70_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_70_62.txt deleted file mode 100644 index 89681e56..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/protein/Summary_FEP_70_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10514 ,KEBNE ,16677243,Wed Nov 24 18:35:04 CET,Wed Nov 24 20:27:04 CET,0.0 0.847 1.219 1.512 1.757 1.971 2.163 2.343 2.665 2.803 2.936 3.097 3.303 3.407 3.599 3.792 3.988 4.078 4.243 4.405 4.631 4.766 4.903 5.102 5.283 5.451 5.612 5.772 5.966 6.15 6.337 6.558 6.768 6.982 7.223 7.489 7.732 7.997 8.288 8.602 8.932 9.295 9.716 10.123 10.579 11.059 11.648 12.315 13.002 13.714 14.414 14.742 14.748 14.614 14.388 14.107 13.842 13.594 13.355 13.079 12.823 12.58 12.338 12.112 11.893 11.675 11.448 11.251 11.06 10.84 10.604 10.408 10.217 10.008 9.833 9.647 9.449 9.228 8.992 8.833 8.665 8.395 8.207 8.023 7.931 7.726 7.496 7.248 7.126 6.92 6.734 6.572 6.402 6.032 5.812 5.563 5.291 4.956 4.534 3.964 1.911 -2 ,5460 ,KEBNE ,16677244,Wed Nov 24 18:35:04 CET,Wed Nov 24 20:27:23 CET,0.0 0.869 1.225 1.53 1.78 1.999 2.192 2.36 2.676 2.825 2.952 3.093 3.301 3.419 3.629 3.825 4.009 4.097 4.264 4.42 4.642 4.782 4.916 5.102 5.279 5.446 5.603 5.756 5.957 6.144 6.326 6.553 6.769 6.971 7.196 7.443 7.692 7.968 8.255 8.554 8.872 9.225 9.638 10.067 10.557 11.062 11.594 12.185 12.877 13.618 14.285 14.616 14.619 14.477 14.289 14.044 13.792 13.536 13.3 13.034 12.753 12.502 12.288 12.057 11.819 11.628 11.422 11.217 11.038 10.846 10.643 10.457 10.261 10.068 9.907 9.746 9.578 9.398 9.218 9.087 8.932 8.665 8.494 8.324 8.231 8.024 7.804 7.573 7.449 7.228 7.05 6.892 6.711 6.321 6.115 5.874 5.593 5.28 4.909 4.368 2.343 -3 ,14552 ,KEBNE ,16677245,Wed Nov 24 18:35:04 CET,Wed Nov 24 20:30:59 CET,0.0 1.08 1.487 1.804 2.04 2.237 2.421 2.613 2.969 3.115 3.246 3.402 3.617 3.73 3.955 4.163 4.351 4.438 4.599 4.756 4.991 5.134 5.27 5.484 5.683 5.87 6.046 6.209 6.417 6.612 6.805 7.039 7.253 7.462 7.7 7.956 8.221 8.517 8.832 9.147 9.465 9.824 10.229 10.625 11.08 11.578 12.148 12.782 13.46 14.181 14.912 15.282 15.327 15.255 15.103 14.905 14.7 14.449 14.174 13.88 13.632 13.404 13.169 12.949 12.736 12.494 12.233 12.03 11.845 11.641 11.432 11.261 11.075 10.871 10.695 10.503 10.316 10.121 9.907 9.765 9.617 9.373 9.201 9.022 8.923 8.7 8.479 8.252 8.121 7.884 7.662 7.489 7.298 6.89 6.669 6.43 6.158 5.82 5.394 4.743 2.035 -4 ,27245 ,KEBNE ,16677246,Wed Nov 24 18:36:05 CET,Wed Nov 24 20:31:43 CET,0.0 0.616 0.967 1.256 1.489 1.692 1.867 2.012 2.302 2.437 2.564 2.709 2.914 3.018 3.229 3.425 3.597 3.68 3.849 4.01 4.239 4.389 4.528 4.725 4.914 5.093 5.265 5.423 5.616 5.802 5.99 6.214 6.421 6.624 6.851 7.102 7.353 7.628 7.927 8.225 8.507 8.828 9.227 9.62 10.065 10.557 11.099 11.698 12.344 13.007 13.655 14.034 14.133 14.031 13.85 13.623 13.352 13.057 12.777 12.505 12.258 12.008 11.76 11.52 11.28 11.068 10.837 10.606 10.411 10.217 10.013 9.836 9.651 9.443 9.263 9.087 8.913 8.721 8.509 8.373 8.238 8.007 7.83 7.633 7.532 7.329 7.1 6.837 6.699 6.462 6.235 6.084 5.917 5.526 5.306 5.071 4.807 4.517 4.148 3.584 1.819 -5 ,1472 ,KEBNE ,16677247,Wed Nov 24 18:36:06 CET,Wed Nov 24 20:29:39 CET,0.0 0.743 1.063 1.307 1.525 1.719 1.892 2.061 2.371 2.508 2.636 2.787 2.998 3.105 3.31 3.499 3.679 3.768 3.944 4.112 4.331 4.463 4.594 4.792 4.983 5.158 5.327 5.489 5.681 5.868 6.053 6.275 6.489 6.687 6.917 7.172 7.416 7.676 7.95 8.241 8.544 8.876 9.271 9.668 10.094 10.551 11.077 11.616 12.24 12.976 13.699 13.988 13.949 13.839 13.643 13.373 13.07 12.741 12.433 12.149 11.92 11.706 11.487 11.255 11.029 10.824 10.587 10.35 10.154 9.962 9.75 9.578 9.416 9.223 9.053 8.885 8.707 8.518 8.316 8.168 8.013 7.761 7.569 7.355 7.245 7.019 6.773 6.523 6.397 6.172 5.948 5.778 5.6 5.19 4.96 4.694 4.366 3.988 3.55 2.958 0.304 -6 ,8400 ,KEBNE ,16677248,Wed Nov 24 18:36:05 CET,Wed Nov 24 20:29:37 CET,0.0 0.776 1.145 1.427 1.664 1.876 2.069 2.249 2.58 2.726 2.861 3.013 3.22 3.324 3.531 3.725 3.9 3.984 4.152 4.316 4.562 4.711 4.843 5.029 5.207 5.375 5.54 5.706 5.915 6.12 6.324 6.554 6.768 6.982 7.218 7.48 7.725 7.981 8.275 8.593 8.908 9.258 9.67 10.09 10.559 11.027 11.542 12.146 12.789 13.437 14.07 14.258 14.154 13.974 13.699 13.428 13.2 12.948 12.702 12.432 12.187 11.932 11.683 11.449 11.213 11.011 10.793 10.58 10.397 10.18 9.926 9.727 9.514 9.285 9.118 8.931 8.732 8.525 8.284 8.122 7.968 7.736 7.576 7.372 7.256 7.017 6.765 6.505 6.359 6.117 5.904 5.734 5.538 5.121 4.903 4.646 4.339 3.973 3.531 2.94 0.658 -7 ,22567 ,KEBNE ,16677249,Wed Nov 24 18:37:06 CET,Wed Nov 24 20:28:59 CET,0.0 0.77 1.118 1.382 1.622 1.834 2.027 2.203 2.495 2.633 2.775 2.925 3.129 3.239 3.437 3.627 3.813 3.898 4.044 4.185 4.401 4.542 4.677 4.866 5.045 5.215 5.384 5.549 5.755 5.953 6.148 6.392 6.619 6.821 7.06 7.349 7.618 7.891 8.184 8.498 8.821 9.194 9.635 10.058 10.525 11.025 11.588 12.275 13.106 13.988 14.889 15.387 15.401 15.283 15.212 15.059 14.877 14.688 14.46 14.228 14.023 13.822 13.627 13.437 13.244 13.019 12.793 12.627 12.468 12.294 12.115 11.951 11.76 11.539 11.375 11.209 11.029 10.838 10.627 10.469 10.299 10.05 9.887 9.706 9.608 9.413 9.202 8.963 8.834 8.605 8.384 8.214 8.034 7.636 7.399 7.14 6.858 6.532 6.158 5.609 3.414 -8 ,3515 ,KEBNE ,16677250,Wed Nov 24 18:37:07 CET,Wed Nov 24 20:30:04 CET,0.0 1.047 1.494 1.797 2.022 2.223 2.405 2.58 2.895 3.027 3.149 3.284 3.489 3.604 3.812 3.994 4.17 4.257 4.42 4.568 4.78 4.924 5.065 5.256 5.433 5.603 5.77 5.936 6.139 6.325 6.501 6.706 6.91 7.108 7.33 7.576 7.819 8.085 8.365 8.66 8.963 9.293 9.683 10.079 10.537 11.047 11.606 12.234 12.965 13.711 14.472 14.928 14.894 14.638 14.398 14.139 13.842 13.533 13.259 12.974 12.704 12.461 12.224 11.957 11.693 11.446 11.176 10.938 10.744 10.552 10.33 10.134 9.943 9.735 9.565 9.38 9.176 8.966 8.742 8.591 8.433 8.189 8.017 7.823 7.723 7.516 7.291 7.047 6.923 6.701 6.48 6.328 6.152 5.727 5.505 5.264 4.945 4.533 4.082 3.519 1.622 -9 ,17048 ,KEBNE ,16677251,Wed Nov 24 18:38:08 CET,Wed Nov 24 20:32:00 CET,0.0 0.704 1.056 1.351 1.594 1.812 2.018 2.191 2.497 2.639 2.786 2.961 3.173 3.283 3.487 3.678 3.849 3.932 4.104 4.264 4.475 4.613 4.749 4.94 5.116 5.287 5.468 5.64 5.847 6.046 6.235 6.463 6.685 6.9 7.149 7.432 7.687 7.956 8.251 8.561 8.886 9.256 9.677 10.082 10.547 11.055 11.651 12.291 12.984 13.73 14.471 14.901 14.996 14.902 14.72 14.503 14.268 14.025 13.775 13.491 13.242 13.021 12.801 12.544 12.288 12.033 11.743 11.492 11.299 11.096 10.856 10.648 10.428 10.216 10.065 9.891 9.693 9.479 9.259 9.105 8.948 8.708 8.537 8.354 8.248 8.027 7.825 7.601 7.47 7.233 7.015 6.853 6.652 6.18 5.925 5.663 5.394 5.046 4.578 3.927 1.835 -10 ,10896 ,KEBNE ,16677252,Wed Nov 24 18:38:08 CET,Wed Nov 24 20:30:37 CET,0.0 0.843 1.177 1.472 1.729 1.965 2.175 2.359 2.655 2.791 2.922 3.073 3.275 3.378 3.579 3.775 3.961 4.044 4.208 4.373 4.6 4.739 4.877 5.087 5.285 5.471 5.64 5.809 6.028 6.221 6.401 6.617 6.831 7.033 7.263 7.52 7.768 8.052 8.347 8.644 8.947 9.289 9.693 10.087 10.53 11.01 11.555 12.164 12.849 13.582 14.337 14.639 14.586 14.425 14.2 13.954 13.725 13.462 13.197 12.919 12.665 12.447 12.22 11.993 11.778 11.563 11.323 11.102 10.897 10.679 10.478 10.308 10.113 9.906 9.75 9.589 9.408 9.216 9.025 8.895 8.75 8.508 8.345 8.172 8.076 7.873 7.648 7.381 7.24 7.004 6.784 6.623 6.444 6.032 5.8 5.548 5.259 4.922 4.51 3.968 2.414 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_19_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_19_23.txt deleted file mode 100644 index ab4eaeee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_19_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4263 ,KEBNE ,16677253,Wed Nov 24 18:38:09 CET,Wed Nov 24 20:04:56 CET,0.0 1.712 2.052 2.264 2.443 2.588 2.716 2.831 3.007 3.089 3.167 3.274 3.364 3.43 3.544 3.65 3.748 3.785 3.851 3.916 4.009 4.059 4.104 4.165 4.224 4.281 4.322 4.358 4.408 4.445 4.474 4.504 4.529 4.541 4.538 4.535 4.529 4.507 4.479 4.431 4.364 4.282 4.159 3.998 3.754 3.428 2.984 2.359 1.443 0.053 -2.235 -4.855 -6.878 -8.493 -9.815 -10.991 -11.981 -12.846 -13.586 -14.288 -14.895 -15.448 -15.956 -16.419 -16.842 -17.218 -17.617 -17.974 -18.279 -18.605 -18.949 -19.225 -19.504 -19.8 -20.034 -20.274 -20.511 -20.752 -21.012 -21.196 -21.377 -21.65 -21.846 -22.053 -22.161 -22.398 -22.637 -22.877 -23.005 -23.185 -23.396 -23.538 -23.688 -24.022 -24.205 -24.403 -24.626 -24.876 -25.184 -25.602 -27.112 -2 ,18278 ,KEBNE ,16677254,Wed Nov 24 18:38:08 CET,Wed Nov 24 20:01:22 CET,0.0 1.018 1.33 1.553 1.728 1.872 1.997 2.126 2.353 2.442 2.519 2.632 2.72 2.783 2.886 2.972 3.05 3.088 3.166 3.234 3.322 3.372 3.415 3.486 3.546 3.582 3.62 3.663 3.704 3.734 3.768 3.802 3.831 3.854 3.86 3.858 3.848 3.829 3.793 3.74 3.677 3.575 3.423 3.24 2.989 2.658 2.202 1.593 0.678 -0.71 -2.899 -5.436 -7.449 -9.101 -10.469 -11.625 -12.627 -13.538 -14.282 -14.995 -15.594 -16.129 -16.647 -17.133 -17.565 -17.943 -18.332 -18.675 -18.973 -19.282 -19.592 -19.847 -20.114 -20.389 -20.604 -20.829 -21.059 -21.288 -21.523 -21.691 -21.87 -22.153 -22.348 -22.541 -22.637 -22.835 -23.047 -23.277 -23.4 -23.58 -23.804 -23.963 -24.14 -24.507 -24.69 -24.889 -25.11 -25.358 -25.657 -26.101 -27.793 -3 ,1967 ,KEBNE ,16677255,Wed Nov 24 18:38:12 CET,Wed Nov 24 19:57:53 CET,0.0 1.658 2.018 2.244 2.421 2.576 2.702 2.811 3.008 3.092 3.167 3.27 3.352 3.406 3.513 3.607 3.687 3.725 3.795 3.858 3.944 3.997 4.041 4.097 4.164 4.216 4.253 4.289 4.33 4.369 4.401 4.44 4.475 4.49 4.49 4.481 4.467 4.447 4.413 4.355 4.276 4.177 4.032 3.849 3.613 3.296 2.836 2.21 1.273 -0.141 -2.351 -4.951 -7.063 -8.738 -10.082 -11.248 -12.259 -13.118 -13.834 -14.555 -15.158 -15.692 -16.197 -16.667 -17.109 -17.498 -17.89 -18.249 -18.566 -18.904 -19.239 -19.501 -19.771 -20.048 -20.261 -20.487 -20.712 -20.937 -21.179 -21.343 -21.511 -21.776 -21.957 -22.135 -22.226 -22.422 -22.637 -22.865 -22.985 -23.165 -23.373 -23.512 -23.662 -23.964 -24.123 -24.306 -24.513 -24.74 -25.006 -25.439 -27.326 -4 ,30540 ,KEBNE ,16677256,Wed Nov 24 18:39:10 CET,Wed Nov 24 20:02:32 CET,0.0 1.418 1.79 2.042 2.208 2.351 2.465 2.56 2.738 2.813 2.882 2.983 3.068 3.125 3.216 3.297 3.369 3.402 3.459 3.516 3.603 3.649 3.691 3.746 3.794 3.848 3.898 3.934 3.98 4.019 4.05 4.085 4.113 4.134 4.149 4.149 4.128 4.102 4.066 3.998 3.917 3.805 3.635 3.46 3.248 2.939 2.505 1.9 0.964 -0.407 -2.654 -5.213 -7.188 -8.82 -10.209 -11.429 -12.425 -13.288 -14.035 -14.757 -15.373 -15.926 -16.444 -16.905 -17.325 -17.73 -18.141 -18.489 -18.789 -19.101 -19.422 -19.679 -19.945 -20.215 -20.423 -20.644 -20.866 -21.098 -21.347 -21.512 -21.677 -21.939 -22.127 -22.332 -22.435 -22.636 -22.853 -23.08 -23.197 -23.373 -23.57 -23.708 -23.855 -24.179 -24.358 -24.555 -24.78 -25.049 -25.379 -25.784 -27.08 -5 ,22562 ,KEBNE ,16674933,Wed Nov 24 00:32:13 CET,Wed Nov 24 01:53:55 CET,0.0 1.266 1.57 1.784 1.953 2.093 2.211 2.322 2.526 2.616 2.692 2.801 2.892 2.957 3.077 3.177 3.254 3.293 3.371 3.437 3.52 3.565 3.607 3.667 3.71 3.747 3.788 3.822 3.856 3.887 3.912 3.93 3.94 3.941 3.947 3.95 3.939 3.91 3.882 3.847 3.764 3.651 3.508 3.335 3.103 2.786 2.303 1.661 0.786 -0.588 -2.845 -5.395 -7.393 -9.024 -10.376 -11.528 -12.514 -13.396 -14.138 -14.841 -15.434 -15.977 -16.479 -16.94 -17.384 -17.792 -18.196 -18.551 -18.859 -19.167 -19.478 -19.727 -19.976 -20.234 -20.438 -20.649 -20.874 -21.114 -21.355 -21.521 -21.691 -21.949 -22.131 -22.317 -22.411 -22.606 -22.809 -23.04 -23.164 -23.345 -23.544 -23.683 -23.831 -24.139 -24.308 -24.5 -24.72 -24.948 -25.21 -25.585 -27.188 -6 ,27447 ,KEBNE ,16677258,Wed Nov 24 18:39:10 CET,Wed Nov 24 20:01:13 CET,0.0 1.185 1.482 1.71 1.913 2.08 2.204 2.311 2.493 2.573 2.645 2.748 2.838 2.898 3.003 3.096 3.182 3.221 3.292 3.353 3.44 3.493 3.539 3.607 3.666 3.722 3.776 3.823 3.878 3.919 3.952 3.988 4.019 4.034 4.047 4.057 4.063 4.06 4.031 3.975 3.903 3.806 3.652 3.467 3.21 2.859 2.381 1.747 0.826 -0.548 -2.721 -5.254 -7.271 -8.909 -10.276 -11.451 -12.432 -13.297 -14.029 -14.747 -15.357 -15.9 -16.415 -16.885 -17.323 -17.725 -18.118 -18.464 -18.772 -19.082 -19.404 -19.684 -19.965 -20.247 -20.465 -20.686 -20.91 -21.146 -21.394 -21.56 -21.732 -21.996 -22.171 -22.362 -22.464 -22.675 -22.9 -23.136 -23.254 -23.428 -23.626 -23.766 -23.915 -24.247 -24.43 -24.629 -24.844 -25.103 -25.407 -25.825 -27.447 -7 ,26609 ,KEBNE ,16674935,Wed Nov 24 00:33:16 CET,Wed Nov 24 01:54:45 CET,0.0 1.036 1.386 1.635 1.812 1.952 2.071 2.177 2.357 2.438 2.514 2.625 2.711 2.764 2.863 2.96 3.047 3.087 3.164 3.237 3.335 3.386 3.434 3.501 3.558 3.609 3.647 3.674 3.712 3.746 3.772 3.8 3.821 3.84 3.863 3.864 3.861 3.865 3.847 3.808 3.75 3.669 3.533 3.358 3.131 2.808 2.35 1.702 0.73 -0.714 -3.018 -5.58 -7.619 -9.276 -10.564 -11.692 -12.663 -13.526 -14.267 -14.98 -15.59 -16.128 -16.624 -17.093 -17.521 -17.894 -18.273 -18.606 -18.898 -19.201 -19.514 -19.771 -20.032 -20.296 -20.503 -20.714 -20.941 -21.178 -21.409 -21.574 -21.754 -22.026 -22.206 -22.395 -22.494 -22.702 -22.919 -23.147 -23.267 -23.447 -23.653 -23.799 -23.95 -24.273 -24.469 -24.678 -24.918 -25.237 -25.607 -26.05 -27.463 -8 ,16593 ,KEBNE ,16677260,Wed Nov 24 18:40:12 CET,Wed Nov 24 20:03:54 CET,0.0 1.405 1.715 1.936 2.116 2.262 2.391 2.508 2.702 2.787 2.858 2.958 3.038 3.089 3.192 3.286 3.366 3.402 3.469 3.54 3.629 3.679 3.725 3.784 3.827 3.863 3.899 3.931 3.971 4.011 4.044 4.076 4.103 4.122 4.124 4.117 4.115 4.098 4.072 4.036 3.968 3.859 3.714 3.543 3.279 2.954 2.552 1.947 0.98 -0.435 -2.671 -5.239 -7.273 -8.943 -10.348 -11.544 -12.528 -13.418 -14.17 -14.913 -15.539 -16.087 -16.607 -17.068 -17.499 -17.9 -18.317 -18.678 -18.979 -19.295 -19.619 -19.881 -20.159 -20.449 -20.67 -20.912 -21.164 -21.417 -21.675 -21.854 -22.046 -22.341 -22.547 -22.753 -22.856 -23.066 -23.305 -23.555 -23.682 -23.864 -24.084 -24.23 -24.376 -24.693 -24.875 -25.065 -25.275 -25.529 -25.83 -26.236 -27.931 -9 ,13358 ,KEBNE ,16677261,Wed Nov 24 18:40:12 CET,Wed Nov 24 20:03:16 CET,0.0 1.161 1.49 1.714 1.894 2.043 2.164 2.268 2.466 2.557 2.644 2.767 2.855 2.912 3.017 3.104 3.185 3.227 3.305 3.369 3.459 3.519 3.568 3.626 3.681 3.73 3.779 3.817 3.861 3.911 3.946 3.971 3.993 4.007 4.018 4.028 4.013 3.979 3.94 3.878 3.799 3.689 3.542 3.365 3.124 2.814 2.364 1.713 0.768 -0.63 -2.895 -5.476 -7.498 -9.107 -10.454 -11.599 -12.547 -13.404 -14.104 -14.789 -15.403 -15.939 -16.436 -16.898 -17.313 -17.689 -18.078 -18.417 -18.707 -19.007 -19.316 -19.567 -19.83 -20.1 -20.308 -20.522 -20.747 -20.979 -21.22 -21.386 -21.555 -21.822 -22.011 -22.21 -22.309 -22.506 -22.716 -22.93 -23.041 -23.227 -23.457 -23.592 -23.737 -24.053 -24.217 -24.397 -24.604 -24.845 -25.149 -25.57 -27.073 -10 ,13068 ,KEBNE ,16674938,Wed Nov 24 00:33:16 CET,Wed Nov 24 01:55:06 CET,0.0 1.52 1.816 2.031 2.21 2.358 2.472 2.57 2.735 2.81 2.88 2.976 3.058 3.115 3.217 3.316 3.407 3.444 3.516 3.581 3.663 3.708 3.749 3.81 3.861 3.904 3.948 3.986 4.024 4.06 4.083 4.1 4.124 4.144 4.147 4.127 4.11 4.096 4.063 4.0 3.9 3.771 3.627 3.469 3.222 2.873 2.393 1.745 0.806 -0.603 -2.83 -5.353 -7.41 -9.094 -10.459 -11.64 -12.646 -13.521 -14.257 -14.977 -15.589 -16.14 -16.65 -17.13 -17.585 -17.992 -18.402 -18.76 -19.066 -19.376 -19.687 -19.942 -20.211 -20.486 -20.7 -20.92 -21.143 -21.371 -21.608 -21.776 -21.95 -22.224 -22.427 -22.64 -22.746 -22.956 -23.171 -23.392 -23.503 -23.674 -23.877 -24.013 -24.162 -24.499 -24.675 -24.865 -25.085 -25.36 -25.689 -26.109 -27.767 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_19.txt deleted file mode 100644 index bbfdfd0f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26624 ,KEBNE ,16677263,Wed Nov 24 18:40:12 CET,Wed Nov 24 20:04:34 CET,0.0 1.639 1.931 2.144 2.318 2.47 2.606 2.73 2.939 3.035 3.123 3.282 3.371 3.438 3.568 3.684 3.795 3.855 3.964 4.05 4.17 4.248 4.323 4.428 4.523 4.61 4.691 4.765 4.855 4.936 5.017 5.124 5.225 5.31 5.4 5.509 5.608 5.694 5.771 5.836 5.893 5.945 5.985 6.011 6.024 5.978 5.854 5.616 5.186 4.482 3.176 1.565 0.172 -1.078 -2.13 -3.018 -3.778 -4.476 -5.077 -5.672 -6.187 -6.646 -7.083 -7.481 -7.841 -8.177 -8.531 -8.838 -9.099 -9.378 -9.666 -9.898 -10.139 -10.396 -10.594 -10.789 -10.986 -11.185 -11.403 -11.566 -11.742 -12.011 -12.205 -12.408 -12.505 -12.72 -12.956 -13.194 -13.314 -13.462 -13.71 -13.847 -13.985 -14.314 -14.495 -14.691 -14.906 -15.138 -15.453 -15.915 -18.272 -2 ,17163 ,KEBNE ,16674960,Wed Nov 24 00:36:24 CET,Wed Nov 24 01:58:27 CET,0.0 1.179 1.578 1.824 1.999 2.142 2.267 2.385 2.597 2.684 2.766 2.909 2.991 3.061 3.181 3.283 3.391 3.443 3.54 3.633 3.751 3.827 3.904 4.012 4.112 4.213 4.314 4.403 4.515 4.631 4.733 4.84 4.927 5.004 5.095 5.185 5.269 5.366 5.458 5.535 5.597 5.659 5.713 5.735 5.719 5.655 5.537 5.307 4.867 4.102 2.795 1.146 -0.248 -1.413 -2.441 -3.364 -4.152 -4.861 -5.455 -6.04 -6.552 -7.011 -7.458 -7.88 -8.241 -8.552 -8.888 -9.198 -9.456 -9.718 -9.996 -10.23 -10.472 -10.722 -10.922 -11.126 -11.339 -11.563 -11.797 -11.96 -12.125 -12.388 -12.573 -12.769 -12.869 -13.071 -13.303 -13.548 -13.673 -13.826 -14.067 -14.201 -14.347 -14.694 -14.889 -15.093 -15.34 -15.626 -15.948 -16.476 -18.648 -3 ,29053 ,KEBNE ,16677265,Wed Nov 24 18:40:12 CET,Wed Nov 24 20:05:16 CET,0.0 1.239 1.522 1.751 1.946 2.095 2.226 2.341 2.54 2.636 2.726 2.877 2.961 3.03 3.154 3.263 3.355 3.395 3.474 3.558 3.673 3.737 3.805 3.901 3.977 4.051 4.124 4.189 4.27 4.348 4.423 4.512 4.602 4.684 4.776 4.872 4.944 5.015 5.078 5.137 5.207 5.275 5.32 5.322 5.298 5.224 5.083 4.84 4.414 3.691 2.365 0.743 -0.628 -1.842 -2.871 -3.815 -4.626 -5.291 -5.87 -6.494 -7.027 -7.476 -7.901 -8.288 -8.648 -8.974 -9.308 -9.615 -9.877 -10.145 -10.433 -10.666 -10.902 -11.149 -11.347 -11.574 -11.803 -12.017 -12.233 -12.385 -12.547 -12.796 -12.968 -13.143 -13.235 -13.436 -13.653 -13.88 -14.0 -14.152 -14.39 -14.534 -14.68 -14.998 -15.193 -15.415 -15.658 -15.926 -16.24 -16.713 -18.498 -4 ,7414 ,KEBNE ,16677266,Wed Nov 24 18:40:12 CET,Wed Nov 24 20:06:59 CET,0.0 1.237 1.542 1.767 1.948 2.099 2.228 2.349 2.567 2.663 2.764 2.936 3.021 3.089 3.221 3.336 3.44 3.49 3.577 3.658 3.776 3.851 3.929 4.046 4.149 4.239 4.323 4.403 4.502 4.588 4.661 4.752 4.837 4.914 4.99 5.071 5.159 5.243 5.312 5.374 5.422 5.465 5.494 5.494 5.481 5.434 5.326 5.151 4.787 4.107 2.837 1.198 -0.199 -1.365 -2.367 -3.253 -4.025 -4.725 -5.308 -5.894 -6.412 -6.87 -7.314 -7.73 -8.102 -8.439 -8.788 -9.091 -9.355 -9.634 -9.914 -10.147 -10.399 -10.668 -10.874 -11.083 -11.302 -11.528 -11.759 -11.933 -12.118 -12.393 -12.581 -12.775 -12.875 -13.076 -13.298 -13.528 -13.645 -13.792 -14.038 -14.189 -14.354 -14.716 -14.912 -15.119 -15.345 -15.62 -15.998 -16.546 -18.532 -5 ,18338 ,KEBNE ,16674963,Wed Nov 24 00:36:24 CET,Wed Nov 24 01:58:02 CET,0.0 1.429 1.752 1.97 2.158 2.323 2.474 2.604 2.81 2.901 2.987 3.129 3.21 3.277 3.399 3.511 3.615 3.665 3.761 3.844 3.959 4.033 4.111 4.211 4.292 4.377 4.459 4.533 4.617 4.691 4.763 4.844 4.92 5.002 5.098 5.197 5.285 5.374 5.462 5.546 5.616 5.669 5.716 5.751 5.747 5.703 5.576 5.316 4.879 4.133 2.741 1.029 -0.391 -1.642 -2.69 -3.592 -4.397 -5.116 -5.718 -6.32 -6.826 -7.274 -7.705 -8.102 -8.464 -8.786 -9.123 -9.425 -9.674 -9.936 -10.215 -10.453 -10.707 -10.967 -11.158 -11.355 -11.567 -11.794 -12.026 -12.184 -12.353 -12.613 -12.793 -12.981 -13.078 -13.282 -13.5 -13.738 -13.865 -14.025 -14.308 -14.469 -14.636 -14.987 -15.18 -15.4 -15.639 -15.925 -16.248 -16.73 -18.442 -6 ,4899 ,KEBNE ,16674964,Wed Nov 24 00:36:24 CET,Wed Nov 24 01:58:00 CET,0.0 1.188 1.503 1.726 1.906 2.066 2.204 2.318 2.518 2.612 2.697 2.844 2.931 3.0 3.122 3.242 3.352 3.402 3.497 3.585 3.708 3.781 3.849 3.947 4.043 4.139 4.226 4.303 4.394 4.48 4.564 4.659 4.745 4.823 4.9 4.967 5.028 5.09 5.141 5.187 5.223 5.254 5.257 5.246 5.221 5.125 4.972 4.739 4.296 3.588 2.332 0.696 -0.71 -1.948 -3.002 -3.918 -4.687 -5.389 -6.009 -6.598 -7.095 -7.542 -7.971 -8.382 -8.75 -9.072 -9.419 -9.734 -10.005 -10.284 -10.578 -10.833 -11.1 -11.367 -11.58 -11.795 -12.013 -12.253 -12.51 -12.686 -12.862 -13.144 -13.336 -13.547 -13.656 -13.863 -14.098 -14.352 -14.471 -14.622 -14.879 -15.023 -15.181 -15.532 -15.722 -15.93 -16.176 -16.458 -16.8 -17.241 -19.133 -7 ,30424 ,KEBNE ,16674965,Wed Nov 24 00:36:24 CET,Wed Nov 24 01:57:59 CET,0.0 1.159 1.486 1.706 1.873 2.015 2.14 2.251 2.448 2.532 2.607 2.737 2.811 2.869 2.982 3.09 3.191 3.24 3.332 3.416 3.524 3.592 3.656 3.749 3.851 3.953 4.045 4.124 4.225 4.312 4.388 4.47 4.552 4.631 4.717 4.841 4.967 5.073 5.151 5.213 5.272 5.322 5.354 5.372 5.37 5.319 5.181 4.919 4.494 3.782 2.517 0.902 -0.495 -1.676 -2.702 -3.661 -4.476 -5.181 -5.791 -6.374 -6.871 -7.322 -7.749 -8.158 -8.543 -8.889 -9.247 -9.561 -9.827 -10.114 -10.418 -10.663 -10.91 -11.165 -11.36 -11.56 -11.77 -11.984 -12.199 -12.363 -12.54 -12.81 -13.004 -13.205 -13.307 -13.515 -13.73 -13.967 -14.098 -14.26 -14.516 -14.663 -14.828 -15.198 -15.408 -15.639 -15.901 -16.21 -16.583 -17.127 -19.526 -8 ,1576 ,KEBNE ,16677270,Wed Nov 24 18:42:16 CET,Wed Nov 24 20:05:24 CET,0.0 1.191 1.472 1.674 1.85 1.995 2.117 2.238 2.451 2.538 2.623 2.778 2.859 2.924 3.053 3.17 3.275 3.327 3.426 3.519 3.659 3.747 3.823 3.932 4.037 4.125 4.203 4.277 4.369 4.462 4.549 4.646 4.751 4.846 4.943 5.045 5.133 5.221 5.296 5.362 5.43 5.487 5.528 5.537 5.512 5.463 5.329 5.09 4.671 3.934 2.716 1.191 -0.216 -1.433 -2.456 -3.369 -4.163 -4.881 -5.497 -6.11 -6.623 -7.088 -7.528 -7.926 -8.309 -8.648 -8.982 -9.302 -9.576 -9.854 -10.155 -10.417 -10.68 -10.941 -11.147 -11.353 -11.556 -11.777 -12.026 -12.188 -12.348 -12.611 -12.799 -12.997 -13.099 -13.319 -13.554 -13.794 -13.919 -14.084 -14.382 -14.557 -14.751 -15.159 -15.373 -15.623 -15.917 -16.219 -16.539 -16.993 -18.706 -9 ,990 ,KEBNE ,16674967,Wed Nov 24 00:36:24 CET,Wed Nov 24 01:58:24 CET,0.0 1.102 1.431 1.68 1.862 2.002 2.133 2.251 2.461 2.554 2.636 2.775 2.857 2.925 3.053 3.164 3.262 3.311 3.412 3.51 3.642 3.72 3.79 3.887 3.975 4.065 4.153 4.239 4.354 4.451 4.546 4.658 4.749 4.84 4.938 5.03 5.122 5.219 5.311 5.388 5.446 5.513 5.57 5.594 5.594 5.546 5.42 5.179 4.728 3.95 2.555 0.81 -0.578 -1.728 -2.742 -3.639 -4.413 -5.107 -5.706 -6.302 -6.808 -7.276 -7.707 -8.097 -8.482 -8.839 -9.199 -9.525 -9.807 -10.091 -10.391 -10.637 -10.902 -11.173 -11.377 -11.595 -11.814 -12.036 -12.266 -12.419 -12.577 -12.842 -13.033 -13.235 -13.337 -13.548 -13.766 -13.992 -14.118 -14.274 -14.531 -14.682 -14.841 -15.21 -15.424 -15.648 -15.897 -16.188 -16.546 -17.082 -18.737 -10 ,102 ,KEBNE ,16677272,Wed Nov 24 18:43:17 CET,Wed Nov 24 20:06:05 CET,0.0 1.148 1.5 1.791 1.993 2.131 2.255 2.376 2.605 2.721 2.822 2.982 3.068 3.135 3.262 3.383 3.495 3.549 3.644 3.73 3.855 3.935 4.011 4.122 4.224 4.308 4.39 4.474 4.572 4.653 4.73 4.824 4.907 4.975 5.041 5.115 5.196 5.271 5.34 5.411 5.465 5.513 5.541 5.529 5.49 5.44 5.322 5.08 4.665 3.936 2.587 0.895 -0.511 -1.714 -2.714 -3.595 -4.375 -5.063 -5.666 -6.262 -6.772 -7.237 -7.687 -8.116 -8.497 -8.832 -9.177 -9.488 -9.762 -10.044 -10.341 -10.593 -10.85 -11.11 -11.314 -11.536 -11.769 -12.0 -12.24 -12.403 -12.567 -12.824 -13.008 -13.203 -13.302 -13.509 -13.733 -13.972 -14.095 -14.248 -14.511 -14.669 -14.819 -15.149 -15.35 -15.575 -15.823 -16.136 -16.492 -16.98 -18.655 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_30.txt deleted file mode 100644 index 1fd3cf55..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30643 ,KEBNE ,17023879,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:05:10 CET,0.0 2.695 3.243 3.614 3.917 4.159 4.384 4.581 4.891 5.019 5.136 5.354 5.467 5.564 5.722 5.857 5.967 6.015 6.116 6.203 6.323 6.398 6.454 6.525 6.592 6.652 6.705 6.752 6.794 6.82 6.839 6.839 6.827 6.821 6.777 6.693 6.61 6.493 6.34 6.14 5.89 5.574 5.135 4.626 3.969 3.117 2.007 0.553 -1.515 -4.462 -9.007 -13.992 -17.83 -20.897 -23.38 -25.55 -27.413 -28.995 -30.298 -31.59 -32.659 -33.571 -34.432 -35.238 -35.978 -36.653 -37.34 -37.947 -38.483 -39.011 -39.541 -39.997 -40.461 -40.918 -41.271 -41.636 -42.0 -42.376 -42.769 -43.024 -43.285 -43.7 -43.978 -44.267 -44.42 -44.744 -45.073 -45.421 -45.6 -45.841 -46.151 -46.35 -46.552 -46.99 -47.238 -47.515 -47.816 -48.14 -48.533 -49.071 -51.052 -2 ,1544 ,KEBNE ,17023880,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:05:27 CET,0.0 3.376 3.939 4.324 4.641 4.896 5.107 5.31 5.66 5.799 5.913 6.114 6.213 6.298 6.457 6.59 6.72 6.782 6.88 6.967 7.107 7.187 7.255 7.349 7.428 7.484 7.534 7.584 7.628 7.645 7.649 7.651 7.642 7.627 7.606 7.55 7.469 7.364 7.214 7.019 6.799 6.498 6.068 5.584 4.932 4.102 3.02 1.581 -0.422 -3.346 -7.87 -12.824 -16.675 -19.733 -22.211 -24.32 -26.065 -27.589 -28.856 -30.073 -31.102 -32.004 -32.85 -33.629 -34.343 -34.965 -35.586 -36.14 -36.629 -37.137 -37.649 -38.078 -38.505 -38.932 -39.275 -39.622 -39.967 -40.341 -40.748 -41.027 -41.32 -41.755 -42.052 -42.371 -42.535 -42.87 -43.214 -43.572 -43.764 -44.035 -44.417 -44.646 -44.876 -45.387 -45.675 -46.006 -46.379 -46.819 -47.371 -48.101 -51.233 -3 ,15041 ,KEBNE ,17023881,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:04:55 CET,0.0 2.791 3.257 3.62 3.892 4.128 4.343 4.521 4.799 4.914 5.022 5.223 5.323 5.397 5.546 5.677 5.782 5.83 5.912 5.982 6.077 6.138 6.193 6.269 6.331 6.374 6.407 6.427 6.442 6.451 6.455 6.444 6.429 6.403 6.346 6.266 6.183 6.089 5.962 5.793 5.579 5.283 4.876 4.386 3.739 2.916 1.813 0.368 -1.673 -4.645 -9.212 -14.195 -17.998 -21.071 -23.552 -25.637 -27.378 -28.911 -30.203 -31.426 -32.434 -33.325 -34.157 -34.914 -35.603 -36.224 -36.854 -37.409 -37.892 -38.389 -38.89 -39.295 -39.722 -40.166 -40.504 -40.855 -41.211 -41.573 -41.947 -42.195 -42.447 -42.847 -43.12 -43.398 -43.546 -43.858 -44.174 -44.498 -44.662 -44.897 -45.216 -45.426 -45.641 -46.08 -46.33 -46.618 -46.937 -47.299 -47.72 -48.326 -50.837 -4 ,21426 ,KEBNE ,17023882,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:05:10 CET,0.0 2.909 3.425 3.781 4.118 4.362 4.527 4.682 4.95 5.055 5.15 5.321 5.407 5.473 5.608 5.723 5.805 5.847 5.931 6.008 6.098 6.148 6.193 6.243 6.286 6.319 6.343 6.358 6.37 6.38 6.372 6.354 6.335 6.302 6.27 6.218 6.141 6.023 5.847 5.632 5.394 5.099 4.698 4.242 3.641 2.847 1.738 0.264 -1.75 -4.673 -9.286 -14.305 -18.105 -21.113 -23.563 -25.676 -27.459 -29.01 -30.295 -31.524 -32.551 -33.432 -34.251 -35.013 -35.701 -36.327 -36.974 -37.547 -38.033 -38.531 -39.038 -39.455 -39.884 -40.314 -40.657 -41.012 -41.362 -41.724 -42.094 -42.353 -42.618 -43.012 -43.297 -43.595 -43.747 -44.064 -44.376 -44.703 -44.884 -45.133 -45.457 -45.662 -45.867 -46.315 -46.562 -46.834 -47.143 -47.524 -47.989 -48.561 -51.429 -5 ,1463 ,KEBNE ,17023883,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:06:37 CET,0.0 3.197 3.735 4.099 4.376 4.609 4.801 4.978 5.261 5.373 5.472 5.648 5.748 5.832 5.975 6.101 6.221 6.278 6.386 6.489 6.625 6.707 6.774 6.853 6.922 6.977 7.022 7.069 7.124 7.153 7.166 7.162 7.146 7.132 7.097 7.018 6.929 6.815 6.673 6.48 6.244 5.944 5.532 5.064 4.408 3.557 2.467 1.012 -1.036 -3.945 -8.404 -13.281 -17.027 -20.021 -22.483 -24.57 -26.334 -27.885 -29.153 -30.371 -31.379 -32.251 -33.08 -33.878 -34.628 -35.288 -35.965 -36.547 -37.043 -37.575 -38.115 -38.56 -39.036 -39.532 -39.904 -40.277 -40.662 -41.064 -41.471 -41.739 -42.016 -42.445 -42.742 -43.044 -43.202 -43.536 -43.881 -44.245 -44.442 -44.718 -45.092 -45.33 -45.584 -46.137 -46.428 -46.746 -47.116 -47.542 -48.068 -48.809 -51.772 -6 ,9777 ,KEBNE ,17023884,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:05:18 CET,0.0 2.374 2.852 3.189 3.467 3.668 3.819 3.961 4.237 4.353 4.451 4.62 4.709 4.774 4.882 4.983 5.077 5.12 5.203 5.293 5.4 5.446 5.488 5.538 5.574 5.606 5.631 5.65 5.674 5.691 5.692 5.691 5.689 5.66 5.604 5.536 5.44 5.308 5.156 4.978 4.757 4.466 4.074 3.595 2.934 2.098 0.994 -0.427 -2.418 -5.381 -9.923 -14.849 -18.598 -21.583 -24.01 -26.08 -27.795 -29.271 -30.537 -31.785 -32.82 -33.709 -34.541 -35.315 -36.009 -36.63 -37.277 -37.84 -38.329 -38.847 -39.38 -39.831 -40.309 -40.797 -41.179 -41.569 -41.967 -42.373 -42.78 -43.061 -43.352 -43.806 -44.111 -44.412 -44.57 -44.916 -45.27 -45.647 -45.85 -46.119 -46.486 -46.718 -46.956 -47.489 -47.782 -48.1 -48.45 -48.86 -49.353 -50.03 -53.317 -7 ,12381 ,KEBNE ,17023885,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:05:27 CET,0.0 4.138 4.665 4.971 5.225 5.454 5.634 5.78 6.037 6.148 6.252 6.418 6.501 6.568 6.684 6.785 6.876 6.921 7.001 7.067 7.148 7.194 7.239 7.293 7.337 7.376 7.404 7.421 7.431 7.442 7.457 7.467 7.452 7.412 7.352 7.258 7.144 7.017 6.874 6.694 6.45 6.115 5.679 5.195 4.547 3.718 2.619 1.137 -0.935 -3.877 -8.448 -13.462 -17.27 -20.304 -22.767 -24.86 -26.598 -28.098 -29.374 -30.652 -31.728 -32.638 -33.476 -34.27 -34.994 -35.617 -36.265 -36.863 -37.364 -37.87 -38.383 -38.805 -39.24 -39.681 -40.012 -40.347 -40.684 -41.026 -41.384 -41.628 -41.879 -42.268 -42.538 -42.826 -42.98 -43.288 -43.591 -43.912 -44.084 -44.327 -44.615 -44.806 -45.017 -45.489 -45.745 -46.017 -46.319 -46.64 -47.054 -47.635 -50.058 -8 ,1677 ,KEBNE ,17023886,Wed Dec 22 08:42:52 CET,Wed Dec 22 10:05:02 CET,0.0 2.769 3.323 3.725 4.028 4.262 4.456 4.622 4.892 5.019 5.136 5.327 5.425 5.503 5.644 5.779 5.899 5.951 6.056 6.142 6.24 6.306 6.371 6.447 6.513 6.577 6.619 6.654 6.694 6.713 6.726 6.742 6.74 6.72 6.682 6.618 6.55 6.453 6.301 6.118 5.888 5.574 5.166 4.687 4.045 3.224 2.117 0.666 -1.357 -4.277 -8.826 -13.814 -17.559 -20.556 -23.011 -25.069 -26.754 -28.236 -29.486 -30.702 -31.717 -32.612 -33.44 -34.193 -34.888 -35.503 -36.128 -36.673 -37.123 -37.586 -38.076 -38.48 -38.887 -39.289 -39.605 -39.943 -40.289 -40.669 -41.054 -41.292 -41.54 -41.924 -42.179 -42.448 -42.591 -42.885 -43.185 -43.484 -43.642 -43.866 -44.146 -44.325 -44.513 -44.923 -45.148 -45.399 -45.682 -46.001 -46.371 -46.832 -49.066 -9 ,11960 ,KEBNE ,17023887,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:05:34 CET,0.0 2.945 3.553 3.928 4.248 4.51 4.704 4.864 5.138 5.264 5.386 5.605 5.709 5.797 5.95 6.075 6.194 6.256 6.37 6.481 6.628 6.705 6.771 6.865 6.942 6.99 7.022 7.049 7.083 7.108 7.117 7.116 7.107 7.083 7.042 6.984 6.907 6.791 6.62 6.415 6.183 5.87 5.437 4.94 4.27 3.392 2.256 0.779 -1.295 -4.205 -8.651 -13.628 -17.476 -20.529 -22.982 -25.036 -26.757 -28.265 -29.517 -30.725 -31.747 -32.656 -33.497 -34.258 -34.939 -35.557 -36.194 -36.745 -37.216 -37.688 -38.169 -38.58 -39.009 -39.441 -39.775 -40.128 -40.493 -40.854 -41.224 -41.484 -41.753 -42.171 -42.449 -42.73 -42.874 -43.167 -43.476 -43.808 -43.982 -44.23 -44.557 -44.767 -44.991 -45.492 -45.751 -46.031 -46.39 -46.811 -47.283 -47.901 -50.028 -10 ,9534 ,KEBNE ,17023888,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:05:02 CET,0.0 2.418 2.904 3.266 3.567 3.807 4.018 4.195 4.463 4.576 4.675 4.85 4.94 5.013 5.135 5.248 5.374 5.434 5.527 5.613 5.731 5.787 5.833 5.892 5.938 5.979 6.015 6.045 6.089 6.124 6.139 6.137 6.128 6.116 6.074 6.005 5.936 5.822 5.67 5.503 5.286 4.985 4.594 4.15 3.511 2.668 1.544 0.051 -2.001 -4.924 -9.496 -14.516 -18.396 -21.469 -23.913 -25.997 -27.725 -29.22 -30.455 -31.669 -32.711 -33.6 -34.419 -35.182 -35.879 -36.507 -37.161 -37.736 -38.218 -38.713 -39.219 -39.636 -40.074 -40.517 -40.855 -41.2 -41.551 -41.92 -42.295 -42.544 -42.805 -43.211 -43.505 -43.821 -43.973 -44.283 -44.624 -44.977 -45.144 -45.363 -45.637 -45.825 -46.021 -46.422 -46.646 -46.923 -47.248 -47.589 -47.961 -48.459 -50.484 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_19.txt deleted file mode 100644 index 006981cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15408 ,KEBNE ,16674969,Wed Nov 24 00:36:24 CET,Wed Nov 24 01:59:09 CET,0.0 1.194 1.523 1.778 1.991 2.186 2.37 2.515 2.771 2.898 3.012 3.188 3.316 3.406 3.583 3.749 3.907 3.982 4.123 4.264 4.472 4.599 4.715 4.881 5.041 5.203 5.367 5.518 5.703 5.884 6.056 6.271 6.491 6.689 6.915 7.182 7.431 7.682 7.965 8.286 8.599 8.95 9.386 9.803 10.226 10.637 11.096 11.626 12.161 12.602 12.826 12.565 11.97 11.301 10.669 10.057 9.49 8.939 8.441 7.917 7.465 7.088 6.726 6.364 6.01 5.687 5.339 5.022 4.748 4.461 4.162 3.922 3.671 3.392 3.174 2.949 2.715 2.484 2.249 2.072 1.879 1.593 1.384 1.155 1.038 0.785 0.509 0.2 0.039 -0.142 -0.482 -0.691 -0.908 -1.367 -1.632 -1.94 -2.293 -2.697 -3.171 -3.905 -7.749 -2 ,22781 ,KEBNE ,16674970,Wed Nov 24 00:36:24 CET,Wed Nov 24 01:58:39 CET,0.0 1.126 1.455 1.708 1.929 2.105 2.264 2.42 2.693 2.805 2.906 3.08 3.21 3.304 3.479 3.638 3.786 3.86 4.005 4.148 4.349 4.47 4.59 4.763 4.93 5.092 5.252 5.407 5.595 5.77 5.948 6.161 6.357 6.553 6.778 7.026 7.266 7.528 7.805 8.099 8.412 8.73 9.083 9.461 9.883 10.342 10.883 11.451 12.019 12.477 12.602 12.284 11.724 11.09 10.449 9.846 9.305 8.784 8.297 7.795 7.354 6.97 6.607 6.249 5.882 5.532 5.156 4.826 4.557 4.282 3.992 3.745 3.474 3.182 2.962 2.731 2.483 2.232 1.977 1.8 1.613 1.305 1.089 0.867 0.754 0.506 0.238 -0.07 -0.238 -0.423 -0.732 -0.914 -1.125 -1.623 -1.89 -2.177 -2.523 -2.968 -3.507 -4.228 -7.909 -3 ,28437 ,KEBNE ,16674971,Wed Nov 24 00:36:24 CET,Wed Nov 24 01:58:33 CET,0.0 1.525 1.854 2.102 2.31 2.485 2.64 2.79 3.064 3.185 3.295 3.474 3.601 3.693 3.874 4.04 4.196 4.269 4.406 4.541 4.737 4.865 4.985 5.159 5.331 5.493 5.651 5.803 5.994 6.182 6.362 6.571 6.776 6.97 7.186 7.43 7.667 7.94 8.258 8.573 8.889 9.239 9.621 9.994 10.413 10.873 11.375 11.896 12.379 12.735 12.864 12.526 11.917 11.24 10.62 10.014 9.439 8.902 8.408 7.917 7.501 7.12 6.737 6.373 6.045 5.73 5.398 5.101 4.848 4.581 4.306 4.066 3.803 3.528 3.317 3.101 2.854 2.597 2.343 2.166 1.983 1.684 1.462 1.236 1.122 0.874 0.602 0.316 0.163 -0.024 -0.331 -0.511 -0.711 -1.182 -1.446 -1.717 -2.052 -2.466 -2.975 -3.691 -6.881 -4 ,31310 ,KEBNE ,16677276,Wed Nov 24 18:45:21 CET,Wed Nov 24 20:09:34 CET,0.0 1.468 1.809 2.052 2.251 2.42 2.575 2.712 2.968 3.085 3.197 3.389 3.514 3.612 3.805 3.977 4.137 4.213 4.369 4.515 4.708 4.834 4.957 5.136 5.306 5.468 5.622 5.768 5.955 6.137 6.312 6.514 6.703 6.893 7.125 7.375 7.626 7.918 8.223 8.526 8.854 9.246 9.664 10.054 10.491 10.929 11.397 11.856 12.306 12.766 12.965 12.536 11.912 11.274 10.659 10.047 9.461 8.934 8.454 7.971 7.548 7.135 6.729 6.33 5.961 5.648 5.328 5.02 4.747 4.474 4.19 3.951 3.699 3.426 3.204 2.963 2.716 2.453 2.166 1.974 1.762 1.416 1.192 0.958 0.831 0.552 0.258 -0.05 -0.214 -0.398 -0.744 -0.953 -1.18 -1.71 -2.028 -2.358 -2.706 -3.101 -3.657 -4.473 -8.281 -5 ,27933 ,KEBNE ,16674973,Wed Nov 24 00:37:26 CET,Wed Nov 24 02:03:10 CET,0.0 1.398 1.773 2.027 2.263 2.468 2.65 2.831 3.155 3.294 3.416 3.625 3.771 3.882 4.076 4.248 4.42 4.501 4.657 4.807 5.019 5.155 5.287 5.474 5.645 5.817 5.994 6.161 6.36 6.552 6.739 6.954 7.154 7.341 7.561 7.833 8.101 8.378 8.665 8.966 9.281 9.642 10.055 10.414 10.827 11.307 11.786 12.241 12.707 13.08 13.134 12.756 12.176 11.541 10.941 10.351 9.793 9.27 8.791 8.308 7.895 7.513 7.12 6.727 6.362 6.046 5.707 5.375 5.077 4.793 4.5 4.239 3.967 3.68 3.463 3.241 3.007 2.753 2.475 2.294 2.115 1.842 1.642 1.403 1.276 1.035 0.78 0.487 0.327 0.148 -0.16 -0.355 -0.571 -1.034 -1.28 -1.579 -1.945 -2.37 -2.91 -3.68 -7.481 -6 ,6206 ,KEBNE ,16677278,Wed Nov 24 18:45:21 CET,Wed Nov 24 20:10:07 CET,0.0 1.482 1.836 2.091 2.288 2.455 2.61 2.751 2.982 3.104 3.226 3.398 3.516 3.603 3.776 3.937 4.086 4.155 4.29 4.423 4.61 4.725 4.838 5.001 5.161 5.318 5.466 5.607 5.788 5.96 6.129 6.333 6.536 6.727 6.936 7.176 7.408 7.673 7.984 8.318 8.652 9.005 9.415 9.814 10.233 10.665 11.122 11.563 12.018 12.515 12.591 12.03 11.392 10.763 10.141 9.566 9.007 8.477 8.005 7.47 7.016 6.634 6.258 5.882 5.527 5.199 4.854 4.543 4.257 3.971 3.666 3.417 3.168 2.897 2.681 2.434 2.176 1.901 1.616 1.428 1.224 0.913 0.698 0.46 0.338 0.083 -0.188 -0.484 -0.637 -0.819 -1.162 -1.354 -1.554 -2.012 -2.271 -2.558 -2.875 -3.25 -3.751 -4.512 -8.136 -7 ,19332 ,KEBNE ,16677279,Wed Nov 24 18:45:20 CET,Wed Nov 24 20:09:41 CET,0.0 1.523 1.86 2.13 2.333 2.521 2.68 2.817 3.064 3.172 3.275 3.442 3.566 3.653 3.814 3.971 4.126 4.201 4.351 4.49 4.686 4.811 4.937 5.118 5.284 5.445 5.595 5.745 5.939 6.118 6.287 6.502 6.716 6.912 7.134 7.387 7.632 7.89 8.159 8.443 8.738 9.065 9.434 9.798 10.22 10.671 11.163 11.673 12.143 12.497 12.593 12.125 11.453 10.795 10.163 9.559 8.998 8.465 8.001 7.531 7.114 6.721 6.341 5.985 5.632 5.285 4.942 4.652 4.388 4.107 3.804 3.554 3.287 2.993 2.77 2.548 2.316 2.066 1.8 1.616 1.426 1.129 0.914 0.681 0.56 0.307 0.031 -0.271 -0.428 -0.613 -0.944 -1.126 -1.316 -1.766 -2.018 -2.291 -2.608 -2.978 -3.465 -4.211 -7.447 -8 ,10336 ,KEBNE ,16677280,Wed Nov 24 18:45:20 CET,Wed Nov 24 20:09:45 CET,0.0 1.303 1.654 1.895 2.078 2.244 2.393 2.529 2.778 2.914 3.05 3.234 3.355 3.441 3.606 3.763 3.914 3.985 4.116 4.242 4.426 4.544 4.659 4.83 5.006 5.178 5.346 5.51 5.708 5.905 6.102 6.32 6.529 6.739 6.982 7.257 7.504 7.769 8.069 8.369 8.675 9.02 9.416 9.793 10.222 10.68 11.158 11.626 12.109 12.507 12.625 12.198 11.565 10.926 10.255 9.625 9.068 8.551 8.097 7.614 7.173 6.783 6.414 6.042 5.68 5.356 5.031 4.732 4.465 4.188 3.882 3.623 3.357 3.074 2.849 2.611 2.356 2.094 1.818 1.628 1.426 1.083 0.853 0.615 0.482 0.217 -0.059 -0.372 -0.549 -0.759 -1.099 -1.283 -1.488 -1.948 -2.203 -2.485 -2.805 -3.225 -3.751 -4.511 -7.415 -9 ,8916 ,KEBNE ,16677281,Wed Nov 24 18:45:21 CET,Wed Nov 24 20:10:28 CET,0.0 1.591 1.916 2.147 2.35 2.528 2.688 2.831 3.086 3.198 3.303 3.475 3.607 3.708 3.898 4.066 4.222 4.299 4.439 4.58 4.786 4.907 5.027 5.196 5.354 5.509 5.66 5.806 6.002 6.186 6.359 6.574 6.781 6.969 7.18 7.432 7.693 7.968 8.25 8.565 8.898 9.242 9.625 9.985 10.38 10.84 11.358 11.876 12.33 12.689 12.788 12.337 11.632 10.959 10.324 9.677 9.087 8.54 8.057 7.542 7.096 6.698 6.306 5.934 5.59 5.266 4.897 4.581 4.311 4.019 3.706 3.446 3.182 2.912 2.702 2.477 2.253 2.021 1.766 1.577 1.382 1.077 0.859 0.636 0.515 0.262 0.013 -0.259 -0.41 -0.597 -0.916 -1.09 -1.279 -1.693 -1.944 -2.256 -2.607 -3.02 -3.533 -4.255 -6.724 -10 ,15542 ,KEBNE ,16677282,Wed Nov 24 18:46:22 CET,Wed Nov 24 20:10:59 CET,0.0 1.128 1.485 1.741 1.957 2.145 2.304 2.445 2.704 2.82 2.928 3.1 3.221 3.313 3.508 3.697 3.868 3.95 4.106 4.259 4.476 4.619 4.756 4.934 5.104 5.266 5.425 5.584 5.784 5.97 6.148 6.365 6.575 6.777 7.004 7.265 7.512 7.783 8.081 8.38 8.695 9.037 9.408 9.796 10.251 10.74 11.233 11.743 12.314 12.804 13.04 12.676 11.986 11.286 10.624 10.026 9.463 8.896 8.419 7.928 7.479 7.084 6.693 6.296 5.941 5.619 5.282 4.978 4.681 4.379 4.071 3.816 3.558 3.277 3.05 2.824 2.597 2.355 2.083 1.891 1.689 1.383 1.171 0.946 0.825 0.579 0.313 0.009 -0.142 -0.336 -0.699 -0.91 -1.12 -1.578 -1.847 -2.146 -2.491 -2.917 -3.453 -4.188 -8.725 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_26.txt deleted file mode 100644 index 19a19187..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18335 ,KEBNE ,16674979,Wed Nov 24 00:40:34 CET,Wed Nov 24 02:06:00 CET,0.0 1.265 1.626 1.893 2.101 2.288 2.459 2.608 2.879 3.006 3.123 3.297 3.425 3.522 3.697 3.852 3.996 4.068 4.212 4.35 4.551 4.682 4.805 4.984 5.15 5.296 5.432 5.568 5.744 5.905 6.056 6.249 6.433 6.593 6.779 6.998 7.198 7.385 7.571 7.776 7.975 8.186 8.419 8.638 8.83 8.942 9.023 9.021 8.821 8.287 7.105 5.451 3.926 2.586 1.425 0.378 -0.526 -1.359 -2.079 -2.785 -3.427 -3.997 -4.512 -5.003 -5.457 -5.869 -6.296 -6.692 -7.064 -7.429 -7.776 -8.067 -8.363 -8.665 -8.892 -9.132 -9.39 -9.662 -9.951 -10.148 -10.336 -10.626 -10.843 -11.058 -11.166 -11.392 -11.633 -11.888 -12.023 -12.216 -12.469 -12.633 -12.814 -13.244 -13.485 -13.722 -13.985 -14.324 -14.752 -15.313 -17.191 -2 ,18835 ,KEBNE ,16674980,Wed Nov 24 00:41:37 CET,Wed Nov 24 02:06:27 CET,0.0 1.179 1.518 1.763 1.976 2.16 2.325 2.475 2.747 2.864 2.973 3.158 3.289 3.384 3.558 3.721 3.884 3.962 4.116 4.262 4.464 4.597 4.725 4.894 5.05 5.21 5.361 5.499 5.668 5.83 5.982 6.162 6.332 6.481 6.668 6.879 7.062 7.242 7.42 7.632 7.842 8.036 8.25 8.429 8.597 8.747 8.833 8.841 8.681 8.179 6.962 5.16 3.616 2.279 1.13 0.099 -0.793 -1.604 -2.335 -3.051 -3.651 -4.186 -4.71 -5.193 -5.626 -6.047 -6.488 -6.875 -7.22 -7.575 -7.95 -8.269 -8.599 -8.951 -9.219 -9.491 -9.78 -10.081 -10.386 -10.592 -10.797 -11.127 -11.358 -11.593 -11.713 -11.96 -12.227 -12.505 -12.651 -12.852 -13.14 -13.312 -13.486 -13.868 -14.082 -14.305 -14.57 -14.887 -15.262 -15.752 -17.564 -3 ,30223 ,KEBNE ,16674981,Wed Nov 24 00:43:42 CET,Wed Nov 24 02:08:02 CET,0.0 1.052 1.39 1.635 1.856 2.042 2.206 2.358 2.622 2.745 2.865 3.05 3.18 3.276 3.45 3.616 3.785 3.867 4.022 4.173 4.38 4.505 4.627 4.794 4.959 5.131 5.301 5.459 5.654 5.843 6.021 6.22 6.402 6.576 6.779 7.005 7.203 7.4 7.628 7.874 8.1 8.313 8.522 8.718 8.884 9.038 9.206 9.254 9.104 8.647 7.504 5.879 4.39 3.066 1.962 0.96 0.085 -0.696 -1.378 -2.074 -2.672 -3.196 -3.697 -4.146 -4.55 -4.937 -5.344 -5.729 -6.062 -6.389 -6.724 -7.007 -7.301 -7.6 -7.836 -8.083 -8.348 -8.625 -8.919 -9.13 -9.347 -9.671 -9.895 -10.147 -10.274 -10.529 -10.802 -11.087 -11.245 -11.457 -11.761 -11.958 -12.152 -12.586 -12.813 -13.051 -13.339 -13.686 -14.099 -14.648 -16.239 -4 ,11949 ,KEBNE ,16677286,Wed Nov 24 18:47:23 CET,Wed Nov 24 20:11:21 CET,0.0 1.106 1.473 1.731 1.937 2.12 2.284 2.436 2.712 2.833 2.954 3.156 3.286 3.384 3.584 3.767 3.925 4.003 4.147 4.288 4.502 4.634 4.759 4.933 5.098 5.256 5.398 5.542 5.745 5.943 6.117 6.308 6.498 6.681 6.868 7.083 7.284 7.456 7.633 7.822 8.01 8.21 8.41 8.578 8.747 8.904 9.032 9.105 9.002 8.496 7.348 5.664 4.153 2.846 1.697 0.673 -0.218 -1.023 -1.724 -2.407 -2.982 -3.513 -4.018 -4.493 -4.937 -5.333 -5.749 -6.117 -6.43 -6.778 -7.135 -7.426 -7.75 -8.075 -8.31 -8.543 -8.786 -9.058 -9.365 -9.581 -9.813 -10.195 -10.451 -10.687 -10.802 -11.041 -11.305 -11.594 -11.753 -11.972 -12.282 -12.471 -12.672 -13.104 -13.336 -13.58 -13.849 -14.157 -14.546 -15.087 -17.161 -5 ,22337 ,KEBNE ,16677287,Wed Nov 24 18:47:24 CET,Wed Nov 24 20:14:48 CET,0.0 1.113 1.454 1.696 1.907 2.085 2.246 2.396 2.655 2.774 2.893 3.08 3.215 3.311 3.485 3.666 3.839 3.918 4.074 4.224 4.419 4.537 4.651 4.817 4.971 5.11 5.25 5.405 5.616 5.805 5.976 6.174 6.361 6.544 6.761 7.008 7.23 7.455 7.689 7.942 8.149 8.393 8.698 8.94 9.154 9.298 9.382 9.373 9.209 8.78 7.716 6.05 4.55 3.188 2.001 0.998 0.109 -0.732 -1.448 -2.143 -2.74 -3.283 -3.805 -4.306 -4.741 -5.139 -5.584 -5.966 -6.297 -6.643 -7.002 -7.308 -7.627 -7.95 -8.193 -8.445 -8.716 -8.993 -9.273 -9.463 -9.66 -9.985 -10.21 -10.446 -10.567 -10.806 -11.046 -11.315 -11.465 -11.665 -11.93 -12.103 -12.295 -12.698 -12.925 -13.176 -13.465 -13.788 -14.165 -14.666 -16.309 -6 ,19026 ,KEBNE ,16677288,Wed Nov 24 18:48:28 CET,Wed Nov 24 20:12:01 CET,0.0 0.989 1.304 1.532 1.694 1.843 1.981 2.105 2.325 2.432 2.538 2.691 2.802 2.884 3.037 3.174 3.302 3.364 3.491 3.605 3.76 3.868 3.968 4.095 4.223 4.345 4.464 4.59 4.749 4.896 5.036 5.183 5.31 5.452 5.625 5.794 5.949 6.109 6.275 6.455 6.632 6.819 7.023 7.202 7.404 7.612 7.772 7.854 7.753 7.308 6.271 4.709 3.223 1.897 0.75 -0.28 -1.184 -2.02 -2.753 -3.504 -4.148 -4.687 -5.204 -5.708 -6.171 -6.593 -7.054 -7.455 -7.79 -8.151 -8.529 -8.831 -9.137 -9.477 -9.743 -10.007 -10.274 -10.542 -10.837 -11.037 -11.239 -11.549 -11.756 -11.966 -12.073 -12.3 -12.561 -12.843 -12.985 -13.182 -13.466 -13.638 -13.822 -14.24 -14.46 -14.694 -14.967 -15.282 -15.658 -16.206 -18.73 -7 ,11631 ,KEBNE ,16677289,Wed Nov 24 18:49:27 CET,Wed Nov 24 20:17:06 CET,0.0 1.412 1.773 2.029 2.251 2.445 2.623 2.784 3.064 3.19 3.309 3.501 3.631 3.731 3.929 4.111 4.272 4.349 4.511 4.658 4.843 4.965 5.08 5.247 5.404 5.553 5.697 5.84 6.024 6.186 6.345 6.539 6.71 6.865 7.026 7.211 7.383 7.558 7.739 7.922 8.097 8.265 8.452 8.63 8.832 9.032 9.158 9.131 8.903 8.396 7.29 5.702 4.237 2.912 1.784 0.756 -0.161 -0.989 -1.716 -2.431 -3.04 -3.585 -4.114 -4.621 -5.082 -5.496 -5.914 -6.296 -6.632 -6.973 -7.331 -7.644 -7.976 -8.315 -8.584 -8.853 -9.11 -9.369 -9.636 -9.825 -10.015 -10.304 -10.519 -10.754 -10.875 -11.126 -11.397 -11.682 -11.833 -12.038 -12.335 -12.513 -12.698 -13.095 -13.331 -13.602 -13.872 -14.18 -14.569 -15.136 -16.917 -8 ,6126 ,KEBNE ,16674986,Wed Nov 24 00:47:52 CET,Wed Nov 24 02:10:55 CET,0.0 1.29 1.668 1.942 2.169 2.375 2.563 2.731 3.01 3.135 3.258 3.443 3.568 3.664 3.84 4.002 4.161 4.24 4.385 4.519 4.712 4.841 4.975 5.157 5.319 5.467 5.609 5.754 5.938 6.101 6.244 6.419 6.579 6.721 6.894 7.075 7.224 7.392 7.567 7.735 7.903 8.095 8.29 8.421 8.531 8.637 8.715 8.75 8.615 8.091 6.943 5.341 3.831 2.5 1.366 0.339 -0.565 -1.378 -2.078 -2.799 -3.403 -3.949 -4.484 -4.983 -5.428 -5.811 -6.218 -6.593 -6.927 -7.27 -7.625 -7.928 -8.238 -8.555 -8.8 -9.05 -9.312 -9.6 -9.887 -10.079 -10.281 -10.588 -10.797 -11.012 -11.135 -11.403 -11.664 -11.934 -12.074 -12.266 -12.56 -12.74 -12.92 -13.325 -13.554 -13.79 -14.057 -14.377 -14.745 -15.251 -17.243 -9 ,7236 ,KEBNE ,16674987,Wed Nov 24 00:47:52 CET,Wed Nov 24 02:10:36 CET,0.0 1.291 1.685 1.972 2.19 2.371 2.541 2.703 2.994 3.121 3.235 3.422 3.557 3.658 3.847 4.021 4.183 4.261 4.403 4.543 4.747 4.873 5.004 5.174 5.323 5.468 5.605 5.743 5.92 6.087 6.239 6.415 6.578 6.732 6.922 7.127 7.313 7.502 7.699 7.901 8.083 8.281 8.506 8.668 8.8 8.944 9.057 9.085 8.962 8.467 7.276 5.665 4.196 2.869 1.716 0.67 -0.296 -1.133 -1.805 -2.473 -3.058 -3.576 -4.069 -4.551 -5.002 -5.405 -5.812 -6.158 -6.463 -6.803 -7.15 -7.429 -7.723 -8.032 -8.272 -8.513 -8.759 -9.018 -9.29 -9.489 -9.696 -10.036 -10.29 -10.531 -10.649 -10.914 -11.191 -11.494 -11.654 -11.86 -12.153 -12.336 -12.532 -12.937 -13.149 -13.384 -13.658 -13.992 -14.403 -14.918 -16.723 -10 ,12646 ,KEBNE ,16674988,Wed Nov 24 00:47:52 CET,Wed Nov 24 02:10:37 CET,0.0 1.144 1.481 1.727 1.949 2.147 2.309 2.458 2.718 2.829 2.941 3.131 3.262 3.357 3.54 3.708 3.863 3.942 4.092 4.237 4.439 4.564 4.681 4.834 4.983 5.136 5.282 5.42 5.603 5.782 5.953 6.161 6.342 6.505 6.705 6.914 7.104 7.315 7.52 7.712 7.889 8.067 8.262 8.439 8.629 8.797 8.885 8.876 8.731 8.206 6.955 5.283 3.815 2.503 1.335 0.305 -0.605 -1.431 -2.125 -2.826 -3.426 -3.966 -4.49 -4.986 -5.446 -5.864 -6.312 -6.75 -7.121 -7.466 -7.819 -8.106 -8.413 -8.743 -8.994 -9.251 -9.509 -9.77 -10.046 -10.235 -10.435 -10.766 -10.995 -11.234 -11.36 -11.615 -11.878 -12.174 -12.336 -12.552 -12.853 -13.026 -13.206 -13.612 -13.836 -14.078 -14.347 -14.674 -15.061 -15.587 -17.586 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_30_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_30_19.txt deleted file mode 100644 index 8e751ead..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_30_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,903 ,KEBNE ,16677293,Wed Nov 24 18:48:25 CET,Wed Nov 24 20:12:42 CET,0.0 1.448 1.911 2.231 2.496 2.729 2.941 3.142 3.51 3.671 3.819 4.025 4.223 4.355 4.609 4.88 5.134 5.247 5.466 5.67 5.975 6.169 6.352 6.623 6.883 7.143 7.404 7.656 7.992 8.322 8.63 9.0 9.357 9.692 10.09 10.56 11.026 11.537 12.089 12.687 13.318 14.055 14.961 15.894 17.0 18.254 19.755 21.506 23.609 26.26 29.796 32.954 34.9 36.194 37.092 37.773 38.267 38.621 38.861 39.057 39.178 39.252 39.308 39.337 39.345 39.349 39.351 39.339 39.321 39.299 39.253 39.21 39.175 39.122 39.067 39.004 38.927 38.835 38.731 38.658 38.58 38.442 38.334 38.227 38.168 38.034 37.887 37.709 37.616 37.498 37.296 37.176 37.036 36.703 36.517 36.304 36.056 35.753 35.384 34.855 30.653 -2 ,17662 ,KEBNE ,16677294,Wed Nov 24 18:49:27 CET,Wed Nov 24 20:11:40 CET,0.0 1.782 2.192 2.515 2.78 3.029 3.254 3.45 3.799 3.96 4.115 4.325 4.521 4.649 4.894 5.132 5.358 5.468 5.679 5.876 6.159 6.345 6.529 6.794 7.057 7.326 7.589 7.832 8.139 8.435 8.733 9.107 9.467 9.813 10.222 10.703 11.176 11.7 12.262 12.87 13.544 14.31 15.22 16.159 17.264 18.539 20.05 21.829 23.957 26.541 30.019 33.183 35.157 36.467 37.353 37.993 38.462 38.827 39.085 39.27 39.402 39.502 39.571 39.649 39.698 39.709 39.7 39.663 39.612 39.567 39.534 39.496 39.442 39.367 39.308 39.242 39.166 39.066 38.945 38.858 38.756 38.597 38.488 38.371 38.311 38.184 38.023 37.837 37.737 37.608 37.404 37.276 37.141 36.848 36.663 36.432 36.163 35.839 35.455 34.897 32.839 -3 ,9089 ,KEBNE ,16677295,Wed Nov 24 18:49:27 CET,Wed Nov 24 20:12:10 CET,0.0 1.641 2.108 2.437 2.691 2.91 3.11 3.293 3.614 3.774 3.933 4.16 4.379 4.544 4.85 5.148 5.431 5.564 5.808 6.053 6.41 6.618 6.817 7.109 7.389 7.66 7.932 8.197 8.535 8.858 9.169 9.565 9.952 10.314 10.728 11.198 11.654 12.163 12.732 13.345 13.987 14.715 15.571 16.467 17.563 18.796 20.255 21.996 24.13 26.782 30.263 33.417 35.445 36.84 37.784 38.451 38.902 39.231 39.486 39.712 39.882 39.998 40.078 40.137 40.173 40.192 40.194 40.185 40.158 40.105 40.052 40.009 39.953 39.88 39.812 39.726 39.633 39.533 39.414 39.332 39.253 39.104 38.985 38.868 38.803 38.654 38.505 38.347 38.257 38.132 37.932 37.817 37.69 37.373 37.182 36.968 36.726 36.439 36.04 35.494 31.183 -4 ,8302 ,KEBNE ,16677296,Wed Nov 24 18:49:27 CET,Wed Nov 24 20:12:36 CET,0.0 1.898 2.391 2.74 3.011 3.242 3.451 3.639 3.966 4.115 4.263 4.48 4.685 4.82 5.071 5.312 5.549 5.662 5.89 6.11 6.419 6.614 6.798 7.063 7.329 7.591 7.846 8.099 8.416 8.72 9.022 9.395 9.762 10.119 10.545 11.062 11.568 12.098 12.682 13.327 14.004 14.766 15.67 16.598 17.701 18.915 20.359 22.086 24.234 26.925 30.386 33.468 35.421 36.771 37.724 38.427 38.918 39.286 39.55 39.747 39.849 39.921 39.991 40.018 40.016 39.988 39.95 39.927 39.879 39.81 39.737 39.667 39.58 39.48 39.41 39.331 39.239 39.132 38.991 38.895 38.795 38.629 38.515 38.386 38.314 38.17 38.011 37.847 37.763 37.637 37.436 37.317 37.183 36.871 36.683 36.451 36.197 35.911 35.551 34.976 32.115 -5 ,11271 ,KEBNE ,16677297,Wed Nov 24 18:49:27 CET,Wed Nov 24 20:11:30 CET,0.0 1.513 1.982 2.34 2.628 2.858 3.061 3.252 3.598 3.759 3.911 4.133 4.338 4.469 4.714 4.952 5.182 5.299 5.532 5.748 6.078 6.3 6.503 6.782 7.058 7.337 7.605 7.86 8.198 8.523 8.832 9.211 9.583 9.956 10.395 10.874 11.344 11.877 12.451 13.07 13.741 14.506 15.39 16.296 17.395 18.681 20.194 21.944 24.147 26.888 30.382 33.471 35.48 36.861 37.791 38.475 38.958 39.327 39.592 39.772 39.897 39.982 40.038 40.088 40.089 40.053 40.013 39.971 39.923 39.866 39.803 39.744 39.66 39.567 39.503 39.424 39.345 39.276 39.191 39.112 39.031 38.894 38.78 38.662 38.608 38.489 38.331 38.146 38.049 37.918 37.713 37.589 37.446 37.127 36.944 36.737 36.472 36.178 35.826 35.254 32.372 -6 ,11888 ,KEBNE ,16677298,Wed Nov 24 18:49:27 CET,Wed Nov 24 20:15:15 CET,0.0 1.961 2.392 2.705 2.978 3.21 3.408 3.596 3.95 4.109 4.257 4.475 4.678 4.814 5.071 5.308 5.536 5.648 5.858 6.069 6.39 6.59 6.783 7.059 7.323 7.58 7.831 8.083 8.418 8.738 9.044 9.416 9.784 10.134 10.526 10.983 11.443 11.982 12.583 13.221 13.888 14.653 15.556 16.505 17.668 18.972 20.519 22.308 24.506 27.287 30.811 33.933 35.902 37.217 38.139 38.797 39.268 39.629 39.889 40.116 40.283 40.387 40.455 40.498 40.507 40.488 40.447 40.408 40.384 40.364 40.318 40.263 40.211 40.156 40.095 40.021 39.939 39.848 39.732 39.649 39.575 39.443 39.333 39.208 39.146 39.026 38.884 38.72 38.629 38.506 38.296 38.175 38.055 37.751 37.574 37.375 37.14 36.845 36.463 35.886 32.177 -7 ,22941 ,KEBNE ,16677299,Wed Nov 24 18:49:27 CET,Wed Nov 24 20:11:48 CET,0.0 1.569 2.107 2.506 2.799 3.037 3.253 3.448 3.797 3.962 4.126 4.394 4.618 4.768 5.045 5.29 5.516 5.629 5.843 6.049 6.351 6.539 6.721 6.987 7.252 7.518 7.78 8.031 8.356 8.678 8.985 9.352 9.718 10.079 10.51 11.006 11.462 11.97 12.544 13.162 13.819 14.589 15.505 16.418 17.507 18.803 20.36 22.143 24.302 27.008 30.49 33.568 35.483 36.791 37.748 38.445 38.939 39.303 39.553 39.758 39.891 39.968 40.011 40.037 40.056 40.069 40.06 40.038 40.016 39.978 39.93 39.884 39.834 39.77 39.706 39.621 39.529 39.435 39.31 39.228 39.148 38.999 38.889 38.761 38.697 38.575 38.429 38.253 38.159 38.031 37.83 37.711 37.578 37.248 37.05 36.833 36.592 36.305 35.943 35.441 32.563 -8 ,2377 ,KEBNE ,16677300,Wed Nov 24 18:49:26 CET,Wed Nov 24 20:12:11 CET,0.0 1.999 2.425 2.756 3.019 3.257 3.476 3.671 4.028 4.19 4.34 4.553 4.75 4.88 5.13 5.363 5.587 5.696 5.913 6.122 6.416 6.61 6.806 7.103 7.407 7.712 7.995 8.253 8.579 8.894 9.204 9.585 9.955 10.319 10.735 11.195 11.637 12.127 12.687 13.313 13.979 14.749 15.664 16.603 17.73 18.972 20.438 22.198 24.376 27.086 30.61 33.746 35.705 37.027 37.989 38.69 39.163 39.507 39.772 40.01 40.153 40.242 40.303 40.345 40.369 40.369 40.363 40.344 40.296 40.23 40.168 40.113 40.044 39.965 39.907 39.83 39.741 39.658 39.556 39.469 39.379 39.222 39.109 38.988 38.921 38.784 38.635 38.455 38.353 38.222 38.011 37.88 37.735 37.395 37.205 37.017 36.813 36.531 36.138 35.578 33.03 -9 ,10592 ,KEBNE ,16677301,Wed Nov 24 18:50:29 CET,Wed Nov 24 20:12:53 CET,0.0 1.919 2.462 2.876 3.214 3.503 3.757 4.002 4.452 4.635 4.793 5.017 5.217 5.346 5.599 5.839 6.068 6.179 6.389 6.593 6.894 7.091 7.28 7.551 7.812 8.067 8.314 8.556 8.877 9.187 9.491 9.871 10.246 10.603 11.008 11.478 11.949 12.462 13.013 13.6 14.233 14.997 15.917 16.84 17.958 19.26 20.763 22.458 24.608 27.287 30.623 33.706 35.669 37.006 37.979 38.66 39.113 39.491 39.768 39.977 40.126 40.224 40.281 40.308 40.328 40.333 40.306 40.283 40.263 40.226 40.183 40.123 40.039 39.946 39.865 39.782 39.699 39.61 39.497 39.405 39.314 39.175 39.063 38.946 38.887 38.742 38.585 38.412 38.317 38.195 37.989 37.863 37.726 37.369 37.165 36.939 36.704 36.411 36.052 35.538 32.935 -10 ,4692 ,KEBNE ,16677302,Wed Nov 24 18:50:29 CET,Wed Nov 24 20:12:44 CET,0.0 1.715 2.133 2.424 2.681 2.924 3.146 3.341 3.675 3.837 4.002 4.232 4.428 4.56 4.815 5.045 5.258 5.366 5.576 5.779 6.091 6.289 6.474 6.739 7.0 7.26 7.519 7.767 8.085 8.405 8.718 9.102 9.483 9.847 10.268 10.75 11.221 11.75 12.318 12.927 13.589 14.341 15.23 16.169 17.283 18.512 19.989 21.761 23.921 26.607 30.101 33.226 35.219 36.547 37.468 38.118 38.616 38.985 39.243 39.451 39.568 39.657 39.73 39.783 39.806 39.804 39.788 39.766 39.741 39.696 39.639 39.582 39.509 39.425 39.351 39.27 39.184 39.086 38.954 38.868 38.79 38.648 38.537 38.414 38.347 38.189 38.027 37.862 37.759 37.607 37.318 37.143 36.956 36.511 36.246 35.971 35.667 35.278 34.759 33.912 31.23 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_23.txt deleted file mode 100644 index 344334e2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8093 ,KEBNE ,16674999,Wed Nov 24 01:01:25 CET,Wed Nov 24 02:23:36 CET,0.0 1.036 1.338 1.602 1.822 1.994 2.147 2.286 2.535 2.646 2.753 2.882 3.037 3.133 3.313 3.475 3.622 3.692 3.83 3.968 4.167 4.286 4.403 4.577 4.74 4.896 5.047 5.191 5.373 5.545 5.712 5.923 6.129 6.325 6.549 6.8 7.049 7.326 7.623 7.94 8.283 8.669 9.101 9.55 10.061 10.625 11.284 12.014 12.845 13.707 14.662 15.309 15.505 15.522 15.43 15.265 15.095 14.912 14.735 14.544 14.36 14.19 14.001 13.806 13.626 13.458 13.29 13.132 12.986 12.82 12.65 12.517 12.373 12.22 12.087 11.947 11.807 11.639 11.447 11.319 11.183 10.968 10.815 10.647 10.552 10.362 10.175 9.976 9.877 9.716 9.508 9.359 9.199 8.853 8.667 8.453 8.2 7.917 7.544 7.029 4.767 -2 ,30220 ,KEBNE ,16675000,Wed Nov 24 01:01:26 CET,Wed Nov 24 02:32:25 CET,0.0 1.05 1.375 1.604 1.794 1.966 2.122 2.268 2.533 2.656 2.771 2.904 3.062 3.155 3.326 3.49 3.642 3.714 3.859 4.004 4.207 4.337 4.47 4.656 4.839 5.014 5.175 5.335 5.539 5.726 5.907 6.129 6.347 6.561 6.81 7.08 7.331 7.608 7.913 8.233 8.566 8.95 9.383 9.794 10.256 10.765 11.373 12.067 12.849 13.72 14.661 15.299 15.534 15.575 15.523 15.403 15.239 15.022 14.79 14.563 14.364 14.174 13.98 13.777 13.58 13.388 13.18 12.997 12.833 12.663 12.476 12.31 12.135 11.939 11.79 11.65 11.504 11.339 11.148 11.016 10.883 10.658 10.499 10.334 10.244 10.053 9.847 9.622 9.51 9.333 9.101 8.967 8.829 8.49 8.303 8.099 7.85 7.56 7.203 6.705 4.52 -3 ,15968 ,KEBNE ,16675001,Wed Nov 24 01:01:25 CET,Wed Nov 24 02:24:24 CET,0.0 1.366 1.688 1.922 2.125 2.309 2.472 2.628 2.912 3.041 3.17 3.338 3.511 3.623 3.826 4.013 4.188 4.267 4.42 4.57 4.784 4.924 5.061 5.265 5.452 5.626 5.795 5.96 6.177 6.385 6.579 6.799 7.017 7.235 7.488 7.755 7.996 8.262 8.554 8.854 9.164 9.518 9.946 10.377 10.875 11.422 12.038 12.726 13.51 14.388 15.357 16.016 16.217 16.214 16.114 15.958 15.791 15.592 15.402 15.197 14.981 14.769 14.559 14.358 14.168 13.978 13.785 13.61 13.443 13.274 13.103 12.954 12.792 12.619 12.482 12.329 12.154 11.977 11.793 11.668 11.541 11.325 11.163 10.99 10.902 10.732 10.54 10.332 10.222 10.049 9.848 9.719 9.58 9.238 9.041 8.818 8.567 8.292 7.956 7.483 5.534 -4 ,15735 ,KEBNE ,16677306,Wed Nov 24 18:52:32 CET,Wed Nov 24 20:17:29 CET,0.0 1.306 1.639 1.881 2.079 2.25 2.412 2.566 2.825 2.939 3.053 3.194 3.348 3.439 3.609 3.779 3.941 4.014 4.162 4.307 4.521 4.659 4.795 4.981 5.151 5.314 5.472 5.634 5.853 6.052 6.235 6.458 6.672 6.868 7.093 7.345 7.578 7.84 8.125 8.422 8.736 9.095 9.528 9.97 10.48 11.027 11.633 12.321 13.145 14.076 15.082 15.726 15.931 15.962 15.923 15.813 15.646 15.472 15.291 15.074 14.886 14.689 14.485 14.285 14.096 13.927 13.741 13.561 13.39 13.205 13.012 12.837 12.644 12.45 12.304 12.153 11.991 11.822 11.647 11.529 11.411 11.214 11.065 10.909 10.825 10.643 10.457 10.265 10.159 9.997 9.807 9.665 9.508 9.155 8.961 8.743 8.493 8.212 7.868 7.382 5.637 -5 ,29046 ,KEBNE ,16675003,Wed Nov 24 01:02:28 CET,Wed Nov 24 02:28:56 CET,0.0 1.43 1.765 2.006 2.201 2.371 2.534 2.679 2.929 3.042 3.144 3.275 3.436 3.527 3.703 3.869 4.034 4.114 4.259 4.391 4.588 4.723 4.845 5.019 5.181 5.329 5.477 5.624 5.814 5.99 6.163 6.37 6.561 6.748 6.966 7.216 7.456 7.712 7.992 8.297 8.607 8.955 9.367 9.776 10.251 10.786 11.391 12.04 12.831 13.751 14.67 15.299 15.532 15.517 15.377 15.209 15.025 14.816 14.614 14.398 14.182 13.966 13.756 13.545 13.352 13.171 12.963 12.773 12.591 12.394 12.181 12.011 11.841 11.642 11.482 11.32 11.149 10.966 10.782 10.65 10.499 10.264 10.105 9.94 9.853 9.651 9.433 9.19 9.063 8.88 8.628 8.476 8.324 7.986 7.801 7.609 7.373 7.072 6.695 6.181 3.935 -6 ,16607 ,KEBNE ,16677308,Wed Nov 24 18:53:34 CET,Wed Nov 24 20:16:59 CET,0.0 1.444 1.804 2.051 2.255 2.423 2.573 2.714 2.969 3.087 3.2 3.347 3.509 3.602 3.774 3.933 4.079 4.151 4.29 4.425 4.628 4.753 4.868 5.042 5.211 5.366 5.513 5.657 5.841 6.023 6.2 6.402 6.598 6.796 7.012 7.241 7.467 7.712 7.978 8.275 8.592 8.955 9.397 9.829 10.317 10.84 11.445 12.156 12.978 13.899 14.838 15.423 15.625 15.646 15.597 15.459 15.271 15.091 14.906 14.658 14.415 14.191 13.976 13.766 13.559 13.373 13.18 12.999 12.829 12.632 12.426 12.255 12.077 11.891 11.735 11.569 11.392 11.211 11.033 10.919 10.795 10.578 10.426 10.267 10.182 10.006 9.81 9.573 9.454 9.285 9.079 8.939 8.799 8.47 8.276 8.06 7.817 7.514 7.121 6.512 4.376 -7 ,15058 ,KEBNE ,16675005,Wed Nov 24 01:05:36 CET,Wed Nov 24 02:27:23 CET,0.0 1.14 1.491 1.741 1.946 2.119 2.273 2.409 2.653 2.77 2.875 3.008 3.166 3.252 3.416 3.573 3.716 3.787 3.934 4.071 4.262 4.388 4.506 4.668 4.825 4.976 5.125 5.285 5.499 5.698 5.884 6.103 6.313 6.51 6.74 6.995 7.24 7.506 7.811 8.144 8.481 8.855 9.277 9.688 10.175 10.712 11.314 11.975 12.732 13.613 14.593 15.249 15.469 15.482 15.405 15.244 15.065 14.896 14.709 14.481 14.275 14.091 13.89 13.682 13.501 13.318 13.108 12.931 12.779 12.6 12.411 12.258 12.107 11.947 11.815 11.678 11.521 11.347 11.155 11.021 10.88 10.657 10.51 10.349 10.266 10.088 9.88 9.664 9.547 9.369 9.156 9.013 8.862 8.516 8.32 8.106 7.874 7.574 7.161 6.612 4.661 -8 ,18057 ,KEBNE ,16675006,Wed Nov 24 01:08:43 CET,Wed Nov 24 02:30:27 CET,0.0 1.327 1.66 1.901 2.101 2.278 2.429 2.569 2.84 2.961 3.07 3.197 3.351 3.443 3.616 3.774 3.926 4.001 4.145 4.277 4.467 4.586 4.7 4.875 5.046 5.208 5.361 5.502 5.693 5.889 6.074 6.291 6.494 6.688 6.915 7.154 7.379 7.633 7.919 8.237 8.575 8.958 9.382 9.79 10.27 10.801 11.392 12.056 12.838 13.749 14.742 15.372 15.561 15.523 15.435 15.289 15.106 14.929 14.744 14.525 14.296 14.088 13.884 13.659 13.449 13.268 13.07 12.89 12.721 12.54 12.368 12.206 12.033 11.863 11.732 11.595 11.453 11.288 11.096 10.965 10.831 10.626 10.482 10.329 10.249 10.069 9.882 9.693 9.581 9.41 9.199 9.058 8.925 8.614 8.435 8.24 8.009 7.76 7.445 6.85 4.517 -9 ,26302 ,KEBNE ,16677311,Wed Nov 24 18:53:33 CET,Wed Nov 24 20:16:00 CET,0.0 1.314 1.675 1.909 2.108 2.286 2.438 2.575 2.825 2.936 3.04 3.175 3.341 3.437 3.606 3.777 3.941 4.013 4.16 4.3 4.493 4.618 4.736 4.908 5.073 5.231 5.386 5.53 5.709 5.878 6.047 6.251 6.432 6.611 6.831 7.096 7.357 7.635 7.941 8.263 8.575 8.901 9.293 9.709 10.176 10.699 11.329 12.02 12.797 13.675 14.675 15.315 15.532 15.578 15.519 15.401 15.249 15.078 14.906 14.684 14.461 14.257 14.07 13.879 13.682 13.477 13.258 13.062 12.891 12.703 12.503 12.36 12.212 12.047 11.913 11.772 11.618 11.443 11.257 11.132 10.999 10.769 10.612 10.453 10.367 10.191 9.997 9.786 9.677 9.507 9.318 9.19 9.054 8.735 8.549 8.349 8.121 7.855 7.493 6.992 5.481 -10 ,3810 ,KEBNE ,16675008,Wed Nov 24 01:18:04 CET,Wed Nov 24 02:41:27 CET,0.0 1.16 1.492 1.737 1.941 2.122 2.281 2.423 2.676 2.792 2.898 3.038 3.199 3.294 3.468 3.623 3.767 3.84 3.985 4.122 4.308 4.422 4.538 4.707 4.866 5.017 5.167 5.311 5.495 5.67 5.837 6.04 6.24 6.435 6.66 6.915 7.155 7.416 7.695 7.985 8.301 8.664 9.093 9.51 9.985 10.511 11.124 11.795 12.537 13.435 14.46 15.103 15.311 15.334 15.274 15.138 14.973 14.8 14.612 14.392 14.194 14.0 13.787 13.569 13.364 13.18 13.003 12.82 12.648 12.481 12.304 12.148 11.974 11.803 11.67 11.519 11.356 11.189 11.002 10.867 10.737 10.517 10.357 10.207 10.129 9.95 9.755 9.545 9.426 9.249 9.028 8.885 8.743 8.409 8.214 7.993 7.739 7.478 7.149 6.653 4.816 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_30.txt deleted file mode 100644 index eb23f692..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22479 ,KEBNE ,16675009,Wed Nov 24 01:21:10 CET,Wed Nov 24 02:44:13 CET,0.0 2.538 3.082 3.445 3.736 3.998 4.228 4.436 4.785 4.949 5.095 5.289 5.482 5.605 5.833 6.059 6.267 6.365 6.571 6.777 7.053 7.224 7.376 7.581 7.787 7.983 8.173 8.357 8.594 8.823 9.044 9.294 9.532 9.759 10.018 10.306 10.561 10.84 11.138 11.444 11.763 12.105 12.509 12.893 13.298 13.709 14.146 14.599 14.982 15.285 15.383 15.043 14.584 14.069 13.548 13.068 12.619 12.169 11.766 11.354 10.998 10.675 10.342 10.026 9.737 9.463 9.187 8.935 8.687 8.441 8.208 8.006 7.787 7.558 7.38 7.195 7.002 6.795 6.577 6.422 6.255 6.015 5.849 5.665 5.579 5.402 5.199 4.985 4.866 4.663 4.428 4.279 4.123 3.752 3.547 3.308 3.034 2.765 2.467 1.963 -0.398 -2 ,9953 ,KEBNE ,16677314,Wed Nov 24 18:53:34 CET,Wed Nov 24 20:17:35 CET,0.0 2.179 2.74 3.155 3.483 3.761 4.01 4.225 4.585 4.756 4.924 5.157 5.357 5.498 5.752 5.972 6.178 6.282 6.48 6.652 6.901 7.061 7.21 7.435 7.656 7.865 8.068 8.256 8.475 8.692 8.919 9.185 9.43 9.66 9.924 10.214 10.479 10.754 11.054 11.379 11.717 12.072 12.443 12.809 13.216 13.646 14.08 14.481 14.87 15.147 15.202 14.881 14.406 13.879 13.362 12.873 12.391 11.911 11.472 11.039 10.683 10.365 10.05 9.736 9.432 9.148 8.842 8.578 8.345 8.088 7.831 7.613 7.375 7.128 6.933 6.73 6.523 6.3 6.05 5.88 5.701 5.409 5.212 5.0 4.89 4.672 4.446 4.212 4.092 3.899 3.633 3.442 3.238 2.83 2.63 2.386 2.081 1.754 1.384 0.859 -1.937 -3 ,11632 ,KEBNE ,16675011,Wed Nov 24 01:22:13 CET,Wed Nov 24 02:44:28 CET,0.0 2.647 3.259 3.686 4.032 4.314 4.541 4.762 5.168 5.344 5.511 5.776 5.995 6.14 6.417 6.675 6.905 7.015 7.225 7.418 7.682 7.853 8.025 8.273 8.507 8.728 8.929 9.12 9.376 9.626 9.856 10.131 10.391 10.63 10.911 11.212 11.483 11.78 12.094 12.413 12.738 13.087 13.479 13.825 14.213 14.635 15.073 15.492 15.863 16.178 16.285 15.966 15.484 14.966 14.459 13.945 13.472 13.025 12.61 12.18 11.804 11.459 11.118 10.786 10.481 10.228 9.965 9.725 9.516 9.277 9.024 8.836 8.636 8.417 8.247 8.068 7.885 7.689 7.475 7.322 7.166 6.921 6.755 6.573 6.469 6.256 6.04 5.815 5.692 5.497 5.297 5.153 4.984 4.617 4.417 4.206 3.977 3.695 3.319 2.765 0.612 -4 ,893 ,KEBNE ,16675012,Wed Nov 24 01:22:12 CET,Wed Nov 24 02:44:47 CET,0.0 2.487 3.055 3.454 3.792 4.092 4.34 4.555 4.92 5.079 5.236 5.458 5.655 5.79 6.034 6.254 6.468 6.569 6.757 6.943 7.211 7.375 7.529 7.763 7.993 8.209 8.404 8.59 8.841 9.072 9.289 9.55 9.798 10.031 10.298 10.575 10.834 11.118 11.402 11.7 12.008 12.355 12.753 13.124 13.538 13.94 14.338 14.735 15.108 15.422 15.545 15.295 14.881 14.404 13.914 13.398 12.914 12.485 12.104 11.693 11.329 10.999 10.649 10.324 10.029 9.742 9.449 9.203 8.978 8.721 8.458 8.235 7.993 7.748 7.559 7.359 7.147 6.892 6.593 6.394 6.199 5.891 5.689 5.49 5.384 5.165 4.943 4.693 4.563 4.371 4.155 4.008 3.853 3.504 3.3 3.072 2.804 2.493 2.074 1.473 -0.435 -5 ,102 ,KEBNE ,16675013,Wed Nov 24 01:22:13 CET,Wed Nov 24 02:44:51 CET,0.0 2.151 2.737 3.158 3.488 3.751 3.982 4.203 4.587 4.751 4.91 5.167 5.377 5.51 5.769 6.001 6.205 6.302 6.495 6.686 6.951 7.11 7.258 7.472 7.684 7.893 8.099 8.292 8.518 8.736 8.956 9.217 9.467 9.701 9.964 10.263 10.55 10.846 11.147 11.465 11.805 12.171 12.578 12.969 13.383 13.806 14.231 14.628 15.05 15.411 15.458 15.155 14.713 14.227 13.75 13.23 12.727 12.271 11.877 11.491 11.149 10.825 10.503 10.192 9.923 9.681 9.426 9.197 8.981 8.749 8.511 8.311 8.109 7.901 7.731 7.557 7.381 7.184 6.97 6.822 6.671 6.422 6.242 6.061 5.958 5.74 5.525 5.305 5.177 4.974 4.775 4.638 4.501 4.161 3.955 3.733 3.49 3.21 2.88 2.397 0.764 -6 ,15958 ,KEBNE ,16675014,Wed Nov 24 01:23:15 CET,Wed Nov 24 02:47:15 CET,0.0 2.31 2.871 3.23 3.504 3.751 3.99 4.219 4.615 4.781 4.947 5.202 5.407 5.541 5.79 6.021 6.233 6.332 6.524 6.711 6.978 7.153 7.326 7.576 7.814 8.031 8.227 8.416 8.646 8.869 9.093 9.357 9.617 9.851 10.115 10.422 10.707 11.003 11.311 11.627 11.951 12.325 12.742 13.1 13.464 13.844 14.29 14.724 15.099 15.453 15.602 15.262 14.776 14.239 13.682 13.123 12.657 12.256 11.883 11.511 11.162 10.832 10.529 10.247 9.965 9.692 9.403 9.136 8.892 8.636 8.379 8.181 7.979 7.758 7.569 7.373 7.187 6.975 6.741 6.588 6.43 6.166 5.973 5.768 5.664 5.447 5.213 4.974 4.851 4.638 4.369 4.205 4.033 3.665 3.468 3.236 2.972 2.693 2.341 1.827 -0.6 -7 ,16802 ,KEBNE ,16677319,Wed Nov 24 18:55:37 CET,Wed Nov 24 20:19:52 CET,0.0 2.341 2.87 3.293 3.626 3.901 4.155 4.381 4.753 4.924 5.087 5.307 5.506 5.641 5.882 6.105 6.308 6.401 6.588 6.787 7.064 7.229 7.385 7.6 7.819 8.029 8.223 8.401 8.632 8.858 9.072 9.325 9.564 9.8 10.067 10.361 10.642 10.938 11.235 11.544 11.867 12.215 12.593 12.969 13.364 13.748 14.18 14.611 14.971 15.271 15.374 15.077 14.673 14.18 13.644 13.099 12.601 12.147 11.738 11.325 10.967 10.63 10.309 10.036 9.778 9.512 9.231 8.985 8.768 8.539 8.295 8.083 7.867 7.645 7.46 7.27 7.078 6.877 6.667 6.516 6.357 6.107 5.92 5.719 5.62 5.42 5.202 4.976 4.853 4.655 4.449 4.306 4.153 3.796 3.596 3.387 3.149 2.82 2.396 1.808 -0.818 -8 ,28845 ,KEBNE ,16677320,Wed Nov 24 18:55:37 CET,Wed Nov 24 20:22:46 CET,0.0 2.478 3.019 3.41 3.725 3.994 4.229 4.45 4.854 5.027 5.188 5.437 5.634 5.761 6.004 6.234 6.445 6.542 6.718 6.885 7.137 7.297 7.452 7.67 7.876 8.076 8.25 8.407 8.623 8.841 9.04 9.277 9.513 9.733 9.98 10.246 10.504 10.79 11.097 11.406 11.729 12.084 12.502 12.897 13.294 13.708 14.129 14.518 14.844 15.121 15.14 14.742 14.242 13.722 13.2 12.713 12.274 11.84 11.442 11.019 10.635 10.299 9.986 9.7 9.417 9.141 8.846 8.572 8.329 8.074 7.827 7.623 7.406 7.192 7.015 6.817 6.614 6.411 6.199 6.053 5.902 5.651 5.469 5.292 5.202 5.008 4.792 4.561 4.443 4.256 4.047 3.892 3.728 3.386 3.199 2.988 2.737 2.449 2.137 1.666 -0.088 -9 ,20993 ,KEBNE ,16677321,Wed Nov 24 18:55:41 CET,Wed Nov 24 20:17:58 CET,0.0 2.538 3.074 3.5 3.84 4.115 4.351 4.555 4.937 5.117 5.294 5.57 5.786 5.923 6.165 6.411 6.637 6.739 6.955 7.156 7.418 7.587 7.756 7.984 8.19 8.401 8.604 8.806 9.064 9.307 9.542 9.793 10.028 10.255 10.5 10.769 11.032 11.32 11.615 11.931 12.251 12.578 12.967 13.369 13.803 14.242 14.689 15.093 15.48 15.815 15.859 15.496 15.019 14.515 14.058 13.607 13.156 12.71 12.309 11.896 11.534 11.204 10.885 10.573 10.268 9.99 9.697 9.441 9.221 8.982 8.736 8.527 8.299 8.059 7.877 7.692 7.487 7.271 7.058 6.911 6.744 6.471 6.282 6.088 5.989 5.792 5.576 5.332 5.203 5.014 4.812 4.663 4.499 4.145 3.941 3.708 3.443 3.105 2.656 2.089 -2.773 -10 ,3162 ,KEBNE ,16677322,Wed Nov 24 18:57:42 CET,Wed Nov 24 20:21:25 CET,0.0 2.488 2.982 3.355 3.669 3.94 4.168 4.385 4.776 4.95 5.109 5.336 5.537 5.669 5.916 6.139 6.345 6.452 6.665 6.858 7.113 7.267 7.427 7.666 7.888 8.097 8.281 8.463 8.712 8.937 9.146 9.394 9.634 9.848 10.07 10.324 10.576 10.852 11.136 11.416 11.73 12.107 12.502 12.853 13.239 13.648 14.079 14.492 14.883 15.21 15.248 14.857 14.312 13.64 12.987 12.383 11.834 11.35 10.912 10.456 10.07 9.713 9.363 9.022 8.703 8.427 8.152 7.898 7.664 7.417 7.155 6.939 6.695 6.441 6.254 6.055 5.853 5.642 5.408 5.25 5.082 4.81 4.628 4.444 4.353 4.162 3.937 3.705 3.58 3.376 3.139 2.972 2.801 2.426 2.214 1.978 1.703 1.383 1.012 0.531 -2.044 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_24.txt deleted file mode 100644 index 59a6c4e3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17785 ,KEBNE ,16675019,Wed Nov 24 01:26:23 CET,Wed Nov 24 02:48:05 CET,0.0 1.232 1.598 1.879 2.121 2.341 2.554 2.752 3.11 3.272 3.43 3.677 3.862 3.992 4.239 4.471 4.698 4.803 5.004 5.212 5.515 5.702 5.887 6.185 6.485 6.764 7.033 7.303 7.648 7.972 8.295 8.7 9.09 9.457 9.88 10.358 10.831 11.369 11.961 12.598 13.271 14.037 14.971 15.923 17.048 18.366 19.935 21.743 23.96 26.774 30.427 33.682 35.803 37.294 38.369 39.177 39.773 40.235 40.579 40.883 41.108 41.259 41.397 41.518 41.604 41.68 41.749 41.79 41.823 41.857 41.881 41.904 41.922 41.93 41.937 41.94 41.932 41.91 41.876 41.85 41.824 41.762 41.705 41.657 41.635 41.576 41.498 41.405 41.355 41.296 41.203 41.141 41.068 40.891 40.79 40.679 40.546 40.387 40.179 39.897 38.914 -2 ,22296 ,KEBNE ,16677324,Wed Nov 24 18:57:42 CET,Wed Nov 24 20:26:15 CET,0.0 1.225 1.62 1.912 2.159 2.38 2.577 2.758 3.089 3.244 3.393 3.62 3.8 3.932 4.193 4.433 4.659 4.769 4.995 5.221 5.542 5.743 5.931 6.205 6.48 6.755 7.025 7.287 7.622 7.941 8.252 8.631 9.004 9.372 9.797 10.274 10.742 11.287 11.892 12.54 13.223 13.995 14.928 15.892 17.042 18.348 19.901 21.766 24.005 26.752 30.414 33.772 35.904 37.369 38.438 39.253 39.862 40.339 40.708 41.044 41.276 41.457 41.626 41.751 41.834 41.896 41.948 41.985 42.01 42.029 42.052 42.064 42.067 42.064 42.047 42.009 41.955 41.901 41.851 41.81 41.755 41.661 41.588 41.503 41.459 41.364 41.255 41.137 41.074 40.998 40.861 40.785 40.705 40.537 40.443 40.336 40.207 40.054 39.854 39.564 38.449 -3 ,11767 ,KEBNE ,16677325,Wed Nov 24 19:00:49 CET,Wed Nov 24 20:33:05 CET,0.0 1.16 1.551 1.852 2.093 2.308 2.504 2.68 3.019 3.185 3.337 3.56 3.743 3.877 4.136 4.382 4.618 4.727 4.934 5.14 5.442 5.637 5.822 6.102 6.384 6.648 6.904 7.155 7.479 7.797 8.106 8.488 8.867 9.245 9.694 10.189 10.666 11.208 11.81 12.459 13.149 13.943 14.904 15.883 17.022 18.332 19.895 21.707 23.946 26.726 30.321 33.596 35.728 37.22 38.28 39.086 39.702 40.201 40.572 40.884 41.116 41.29 41.441 41.561 41.652 41.724 41.779 41.814 41.84 41.855 41.85 41.847 41.832 41.8 41.775 41.75 41.72 41.673 41.617 41.579 41.543 41.486 41.442 41.389 41.359 41.297 41.222 41.132 41.084 41.026 40.912 40.835 40.759 40.599 40.505 40.394 40.263 40.112 39.904 39.614 38.561 -4 ,2122 ,KEBNE ,16677326,Wed Nov 24 19:00:49 CET,Wed Nov 24 20:24:57 CET,0.0 1.218 1.592 1.874 2.116 2.339 2.545 2.729 3.068 3.229 3.381 3.615 3.799 3.93 4.188 4.428 4.663 4.782 5.005 5.219 5.527 5.721 5.907 6.183 6.455 6.718 6.975 7.228 7.563 7.885 8.196 8.575 8.949 9.309 9.724 10.209 10.686 11.219 11.808 12.44 13.111 13.895 14.821 15.762 16.881 18.164 19.72 21.548 23.735 26.449 30.06 33.324 35.434 36.926 38.01 38.838 39.45 39.925 40.289 40.606 40.853 41.053 41.212 41.321 41.4 41.478 41.55 41.591 41.621 41.647 41.651 41.655 41.662 41.658 41.644 41.626 41.609 41.589 41.551 41.517 41.481 41.417 41.366 41.303 41.27 41.199 41.11 41.014 40.961 40.894 40.786 40.715 40.632 40.447 40.34 40.217 40.067 39.885 39.669 39.354 38.446 -5 ,31569 ,KEBNE ,16675023,Wed Nov 24 01:32:39 CET,Wed Nov 24 02:54:58 CET,0.0 0.996 1.388 1.703 1.957 2.176 2.368 2.543 2.876 3.04 3.195 3.422 3.61 3.75 4.008 4.242 4.465 4.576 4.795 5.007 5.313 5.512 5.705 5.986 6.262 6.536 6.803 7.06 7.396 7.72 8.034 8.411 8.78 9.15 9.581 10.069 10.545 11.085 11.676 12.305 12.991 13.785 14.721 15.677 16.805 18.103 19.686 21.541 23.752 26.474 30.038 33.291 35.434 36.94 38.008 38.842 39.448 39.893 40.236 40.533 40.762 40.942 41.084 41.21 41.321 41.406 41.475 41.527 41.563 41.586 41.603 41.614 41.615 41.609 41.602 41.586 41.567 41.526 41.469 41.439 41.404 41.343 41.308 41.264 41.234 41.17 41.102 41.018 40.971 40.911 40.804 40.741 40.678 40.526 40.431 40.319 40.194 40.039 39.829 39.535 38.346 -6 ,29077 ,KEBNE ,16677328,Wed Nov 24 19:01:51 CET,Wed Nov 24 20:32:22 CET,0.0 1.435 1.921 2.292 2.589 2.844 3.08 3.297 3.672 3.842 4.005 4.26 4.456 4.596 4.855 5.1 5.341 5.46 5.684 5.9 6.214 6.407 6.601 6.892 7.171 7.457 7.747 8.024 8.376 8.718 9.044 9.435 9.819 10.199 10.642 11.149 11.645 12.179 12.758 13.39 14.063 14.846 15.776 16.733 17.867 19.172 20.755 22.586 24.836 27.629 31.214 34.475 36.55 37.979 39.028 39.834 40.452 40.93 41.284 41.603 41.822 41.977 42.118 42.242 42.338 42.411 42.471 42.507 42.536 42.565 42.594 42.614 42.628 42.641 42.642 42.624 42.598 42.567 42.524 42.492 42.461 42.419 42.377 42.319 42.29 42.229 42.16 42.084 42.041 41.98 41.875 41.808 41.732 41.56 41.456 41.34 41.208 41.049 40.859 40.597 39.682 -7 ,26872 ,KEBNE ,16675025,Wed Nov 24 01:33:42 CET,Wed Nov 24 02:55:49 CET,0.0 1.287 1.65 1.936 2.192 2.418 2.621 2.809 3.156 3.317 3.473 3.722 3.908 4.039 4.291 4.526 4.755 4.869 5.094 5.306 5.615 5.815 6.004 6.281 6.551 6.808 7.069 7.33 7.657 7.984 8.312 8.693 9.058 9.433 9.88 10.375 10.859 11.399 11.993 12.63 13.307 14.082 14.998 15.94 17.043 18.324 19.887 21.704 23.916 26.686 30.336 33.671 35.795 37.263 38.332 39.163 39.781 40.251 40.593 40.883 41.096 41.268 41.414 41.517 41.604 41.671 41.704 41.72 41.729 41.73 41.727 41.721 41.701 41.667 41.645 41.631 41.61 41.58 41.546 41.519 41.49 41.434 41.392 41.354 41.331 41.284 41.236 41.173 41.139 41.089 41.009 40.954 40.89 40.749 40.665 40.562 40.448 40.322 40.15 39.88 39.087 -8 ,16203 ,KEBNE ,16675026,Wed Nov 24 01:33:42 CET,Wed Nov 24 02:56:30 CET,0.0 1.216 1.624 1.941 2.198 2.419 2.612 2.786 3.111 3.262 3.409 3.65 3.834 3.966 4.221 4.457 4.691 4.808 5.037 5.254 5.559 5.752 5.941 6.222 6.492 6.749 7.003 7.26 7.594 7.916 8.225 8.596 8.966 9.331 9.754 10.235 10.703 11.224 11.792 12.409 13.078 13.841 14.736 15.661 16.775 18.035 19.576 21.399 23.617 26.407 30.038 33.345 35.501 36.997 38.049 38.853 39.461 39.932 40.269 40.561 40.782 40.943 41.073 41.183 41.256 41.307 41.368 41.405 41.427 41.446 41.457 41.462 41.45 41.418 41.383 41.338 41.297 41.262 41.219 41.184 41.152 41.097 41.05 40.99 40.956 40.884 40.805 40.72 40.674 40.616 40.51 40.441 40.368 40.205 40.102 39.985 39.854 39.699 39.506 39.238 38.193 -9 ,4465 ,KEBNE ,16677331,Wed Nov 24 19:03:56 CET,Wed Nov 24 20:26:13 CET,0.0 1.05 1.456 1.754 1.993 2.209 2.41 2.598 2.936 3.092 3.243 3.472 3.655 3.787 4.033 4.275 4.512 4.624 4.847 5.065 5.37 5.564 5.757 6.052 6.332 6.609 6.882 7.137 7.473 7.803 8.131 8.532 8.921 9.308 9.759 10.273 10.775 11.322 11.913 12.55 13.221 13.976 14.879 15.823 16.949 18.23 19.806 21.652 23.882 26.678 30.307 33.586 35.731 37.234 38.308 39.114 39.71 40.172 40.513 40.833 41.076 41.258 41.412 41.526 41.612 41.681 41.733 41.772 41.8 41.81 41.813 41.819 41.801 41.775 41.755 41.728 41.7 41.658 41.606 41.578 41.555 41.501 41.449 41.386 41.353 41.286 41.213 41.128 41.077 41.01 40.905 40.836 40.759 40.59 40.492 40.375 40.232 40.075 39.871 39.569 38.688 -10 ,20041 ,KEBNE ,16675028,Wed Nov 24 01:43:07 CET,Wed Nov 24 02:58:53 CET,0.0 1.215 1.597 1.91 2.176 2.405 2.609 2.8 3.156 3.318 3.474 3.709 3.891 4.018 4.267 4.499 4.72 4.833 5.053 5.266 5.576 5.772 5.968 6.259 6.534 6.799 7.058 7.318 7.653 7.972 8.284 8.662 9.034 9.406 9.842 10.328 10.805 11.324 11.895 12.531 13.206 13.973 14.909 15.876 17.026 18.34 19.887 21.721 23.973 26.753 30.333 33.635 35.764 37.24 38.322 39.144 39.738 40.183 40.519 40.829 41.067 41.253 41.395 41.51 41.593 41.65 41.714 41.767 41.802 41.828 41.844 41.854 41.86 41.85 41.84 41.829 41.809 41.785 41.751 41.723 41.695 41.645 41.604 41.555 41.526 41.462 41.389 41.299 41.251 41.184 41.069 41.006 40.939 40.782 40.688 40.581 40.449 40.285 40.083 39.789 38.772 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_31.txt deleted file mode 100644 index 41e43c6e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5379 ,KEBNE ,16677333,Wed Nov 24 19:04:59 CET,Wed Nov 24 20:28:05 CET,0.0 1.976 2.374 2.669 2.893 3.077 3.247 3.396 3.65 3.773 3.894 4.068 4.22 4.316 4.49 4.66 4.814 4.881 5.018 5.151 5.332 5.444 5.554 5.711 5.856 5.999 6.136 6.259 6.407 6.549 6.684 6.835 6.973 7.109 7.252 7.387 7.505 7.639 7.783 7.916 8.038 8.169 8.31 8.411 8.509 8.604 8.645 8.577 8.35 7.884 6.839 5.332 4.032 2.905 1.913 1.029 0.294 -0.349 -0.896 -1.444 -1.908 -2.328 -2.738 -3.13 -3.484 -3.789 -4.12 -4.424 -4.682 -4.947 -5.225 -5.461 -5.7 -5.934 -6.109 -6.289 -6.474 -6.672 -6.89 -7.044 -7.2 -7.433 -7.597 -7.765 -7.85 -8.032 -8.23 -8.438 -8.545 -8.721 -8.905 -9.032 -9.158 -9.423 -9.577 -9.744 -9.923 -10.154 -10.475 -10.894 -12.35 -2 ,9758 ,KEBNE ,16675030,Wed Nov 24 01:51:24 CET,Wed Nov 24 03:13:19 CET,0.0 1.882 2.287 2.601 2.849 3.041 3.214 3.38 3.658 3.773 3.88 4.035 4.178 4.273 4.444 4.59 4.729 4.795 4.929 5.05 5.225 5.346 5.466 5.629 5.773 5.902 6.021 6.142 6.299 6.446 6.583 6.743 6.891 7.026 7.174 7.342 7.489 7.634 7.786 7.935 8.07 8.206 8.357 8.49 8.594 8.661 8.692 8.582 8.28 7.726 6.592 5.068 3.775 2.658 1.71 0.851 0.104 -0.546 -1.077 -1.581 -2.024 -2.427 -2.821 -3.196 -3.544 -3.873 -4.212 -4.501 -4.746 -5.004 -5.282 -5.502 -5.728 -5.965 -6.142 -6.317 -6.499 -6.689 -6.9 -7.051 -7.196 -7.41 -7.561 -7.732 -7.822 -8.001 -8.185 -8.388 -8.493 -8.664 -8.837 -8.964 -9.091 -9.368 -9.523 -9.69 -9.876 -10.089 -10.343 -10.721 -12.516 -3 ,8337 ,KEBNE ,16677335,Wed Nov 24 19:06:02 CET,Wed Nov 24 20:30:13 CET,0.0 1.772 2.209 2.475 2.708 2.902 3.06 3.204 3.457 3.567 3.683 3.852 3.996 4.081 4.233 4.373 4.514 4.586 4.72 4.84 5.008 5.114 5.215 5.353 5.48 5.614 5.736 5.846 5.991 6.13 6.266 6.424 6.57 6.715 6.875 7.053 7.209 7.365 7.524 7.677 7.833 7.998 8.165 8.299 8.433 8.539 8.561 8.493 8.296 7.724 6.575 5.179 3.944 2.86 1.937 1.121 0.398 -0.249 -0.799 -1.347 -1.833 -2.266 -2.661 -3.036 -3.394 -3.725 -4.062 -4.368 -4.632 -4.895 -5.17 -5.4 -5.644 -5.902 -6.097 -6.29 -6.492 -6.708 -6.929 -7.084 -7.243 -7.497 -7.683 -7.863 -7.96 -8.156 -8.343 -8.534 -8.633 -8.804 -8.98 -9.118 -9.265 -9.553 -9.713 -9.889 -10.074 -10.287 -10.559 -10.912 -12.221 -4 ,10463 ,KEBNE ,16675032,Wed Nov 24 01:53:29 CET,Wed Nov 24 03:15:26 CET,0.0 1.751 2.174 2.482 2.705 2.888 3.071 3.231 3.492 3.619 3.736 3.889 4.033 4.126 4.309 4.476 4.622 4.696 4.838 4.966 5.149 5.257 5.362 5.516 5.668 5.81 5.936 6.052 6.197 6.342 6.472 6.617 6.754 6.886 7.021 7.16 7.291 7.422 7.572 7.721 7.846 7.973 8.105 8.205 8.289 8.363 8.377 8.299 8.121 7.675 6.603 5.073 3.734 2.629 1.711 0.85 0.114 -0.513 -1.05 -1.559 -2.008 -2.408 -2.778 -3.138 -3.472 -3.775 -4.087 -4.354 -4.578 -4.813 -5.068 -5.284 -5.503 -5.723 -5.887 -6.054 -6.242 -6.443 -6.639 -6.775 -6.922 -7.159 -7.329 -7.514 -7.608 -7.794 -7.989 -8.191 -8.292 -8.461 -8.631 -8.756 -8.887 -9.184 -9.35 -9.53 -9.733 -9.96 -10.226 -10.59 -11.822 -5 ,4916 ,KEBNE ,16677337,Wed Nov 24 19:07:04 CET,Wed Nov 24 20:32:02 CET,0.0 1.689 2.109 2.39 2.608 2.8 2.989 3.162 3.456 3.592 3.714 3.871 4.029 4.136 4.313 4.481 4.649 4.73 4.884 5.024 5.218 5.337 5.446 5.596 5.736 5.871 5.993 6.113 6.272 6.407 6.535 6.683 6.818 6.957 7.107 7.255 7.391 7.536 7.681 7.811 7.953 8.114 8.252 8.356 8.455 8.543 8.584 8.522 8.29 7.79 6.707 5.281 4.023 2.888 1.917 1.068 0.351 -0.292 -0.858 -1.414 -1.9 -2.338 -2.747 -3.128 -3.461 -3.756 -4.077 -4.365 -4.623 -4.899 -5.17 -5.396 -5.63 -5.871 -6.067 -6.271 -6.488 -6.722 -6.959 -7.112 -7.261 -7.504 -7.675 -7.85 -7.942 -8.124 -8.309 -8.51 -8.619 -8.798 -8.982 -9.115 -9.248 -9.527 -9.686 -9.858 -10.055 -10.289 -10.568 -10.929 -12.186 -6 ,462 ,KEBNE ,16677338,Wed Nov 24 19:07:04 CET,Wed Nov 24 20:31:07 CET,0.0 1.746 2.141 2.429 2.661 2.866 3.049 3.201 3.461 3.588 3.724 3.943 4.114 4.233 4.465 4.67 4.846 4.925 5.084 5.237 5.43 5.551 5.665 5.83 5.986 6.13 6.272 6.407 6.575 6.737 6.88 7.04 7.189 7.329 7.498 7.672 7.826 7.995 8.166 8.33 8.489 8.639 8.777 8.919 9.05 9.12 9.16 9.145 8.964 8.459 7.398 6.014 4.725 3.598 2.647 1.775 1.025 0.385 -0.125 -0.638 -1.083 -1.476 -1.859 -2.219 -2.543 -2.839 -3.137 -3.408 -3.646 -3.894 -4.155 -4.37 -4.593 -4.825 -4.997 -5.168 -5.346 -5.53 -5.726 -5.86 -5.995 -6.222 -6.383 -6.547 -6.631 -6.798 -6.98 -7.174 -7.274 -7.444 -7.6 -7.719 -7.85 -8.132 -8.287 -8.457 -8.645 -8.862 -9.135 -9.522 -10.831 -7 ,28310 ,KEBNE ,16675035,Wed Nov 24 01:54:31 CET,Wed Nov 24 03:16:31 CET,0.0 1.625 2.064 2.408 2.677 2.888 3.073 3.226 3.499 3.625 3.743 3.914 4.066 4.159 4.333 4.498 4.653 4.726 4.864 4.993 5.169 5.286 5.398 5.547 5.694 5.835 5.964 6.087 6.244 6.391 6.521 6.663 6.794 6.92 7.068 7.234 7.399 7.565 7.736 7.91 8.084 8.269 8.421 8.548 8.668 8.738 8.782 8.724 8.47 7.892 6.739 5.245 3.982 2.869 1.895 1.065 0.345 -0.294 -0.827 -1.369 -1.849 -2.277 -2.671 -3.04 -3.393 -3.717 -4.035 -4.319 -4.578 -4.844 -5.108 -5.331 -5.563 -5.796 -5.978 -6.172 -6.371 -6.569 -6.78 -6.93 -7.086 -7.332 -7.494 -7.65 -7.729 -7.893 -8.068 -8.262 -8.362 -8.527 -8.684 -8.805 -8.93 -9.208 -9.365 -9.534 -9.719 -9.93 -10.195 -10.57 -11.995 -8 ,308 ,KEBNE ,16675036,Wed Nov 24 01:55:34 CET,Wed Nov 24 03:17:46 CET,0.0 1.986 2.578 2.944 3.197 3.401 3.582 3.738 4.015 4.142 4.269 4.448 4.59 4.682 4.87 5.042 5.202 5.277 5.413 5.545 5.744 5.868 5.986 6.152 6.308 6.45 6.59 6.73 6.901 7.056 7.202 7.375 7.534 7.678 7.835 8.014 8.185 8.353 8.523 8.69 8.829 8.978 9.169 9.307 9.398 9.458 9.436 9.351 9.162 8.711 7.618 6.047 4.753 3.662 2.709 1.89 1.221 0.615 0.081 -0.445 -0.892 -1.29 -1.679 -2.048 -2.383 -2.68 -2.989 -3.274 -3.52 -3.769 -4.022 -4.237 -4.463 -4.689 -4.862 -5.044 -5.232 -5.418 -5.618 -5.762 -5.905 -6.134 -6.303 -6.475 -6.565 -6.761 -6.955 -7.154 -7.259 -7.43 -7.592 -7.709 -7.834 -8.12 -8.281 -8.454 -8.65 -8.873 -9.125 -9.47 -10.946 -9 ,22809 ,KEBNE ,16677341,Wed Nov 24 19:08:07 CET,Wed Nov 24 20:30:44 CET,0.0 1.858 2.332 2.649 2.885 3.097 3.279 3.442 3.742 3.874 3.996 4.183 4.34 4.436 4.636 4.841 5.022 5.105 5.261 5.425 5.661 5.793 5.91 6.072 6.229 6.376 6.512 6.642 6.812 6.972 7.122 7.295 7.451 7.593 7.753 7.913 8.056 8.209 8.363 8.521 8.674 8.833 8.99 9.12 9.256 9.354 9.367 9.276 9.043 8.553 7.419 5.91 4.619 3.465 2.472 1.622 0.9 0.256 -0.289 -0.83 -1.299 -1.708 -2.097 -2.465 -2.815 -3.137 -3.456 -3.744 -4.002 -4.265 -4.522 -4.729 -4.953 -5.191 -5.373 -5.56 -5.754 -5.96 -6.164 -6.302 -6.449 -6.671 -6.822 -6.987 -7.073 -7.245 -7.435 -7.64 -7.746 -7.921 -8.089 -8.211 -8.333 -8.6 -8.752 -8.928 -9.125 -9.355 -9.658 -10.08 -11.542 -10 ,521 ,KEBNE ,16677342,Wed Nov 24 19:08:07 CET,Wed Nov 24 20:32:03 CET,0.0 1.465 1.853 2.113 2.33 2.531 2.705 2.9 3.271 3.403 3.518 3.684 3.836 3.933 4.115 4.286 4.442 4.512 4.65 4.78 4.954 5.07 5.182 5.347 5.499 5.628 5.757 5.879 6.026 6.172 6.309 6.469 6.616 6.745 6.9 7.062 7.194 7.327 7.46 7.603 7.739 7.877 8.035 8.164 8.281 8.372 8.4 8.335 8.104 7.558 6.445 5.014 3.737 2.596 1.623 0.788 0.071 -0.604 -1.193 -1.76 -2.223 -2.627 -3.012 -3.362 -3.685 -3.989 -4.301 -4.576 -4.82 -5.067 -5.318 -5.525 -5.744 -5.975 -6.154 -6.343 -6.543 -6.751 -6.956 -7.095 -7.245 -7.475 -7.633 -7.803 -7.892 -8.074 -8.268 -8.48 -8.584 -8.751 -8.924 -9.053 -9.185 -9.484 -9.647 -9.82 -10.027 -10.268 -10.545 -10.905 -12.044 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_34_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_34_26.txt deleted file mode 100644 index b3e4a433..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_34_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24232 ,KEBNE ,16677343,Wed Nov 24 19:08:07 CET,Wed Nov 24 20:31:42 CET,0.0 1.187 1.575 1.889 2.157 2.404 2.638 2.842 3.203 3.375 3.54 3.775 4.021 4.169 4.445 4.718 4.996 5.13 5.374 5.605 5.945 6.161 6.378 6.709 7.031 7.344 7.647 7.949 8.344 8.723 9.09 9.525 9.954 10.388 10.888 11.455 12.007 12.614 13.279 13.998 14.774 15.681 16.781 17.889 19.197 20.699 22.448 24.505 27.013 30.086 34.091 37.658 39.951 41.532 42.677 43.514 44.094 44.534 44.85 45.092 45.256 45.394 45.478 45.535 45.592 45.627 45.653 45.67 45.672 45.656 45.633 45.613 45.591 45.57 45.552 45.528 45.496 45.456 45.412 45.379 45.344 45.276 45.224 45.168 45.134 45.065 44.984 44.887 44.838 44.742 44.681 44.615 44.539 44.375 44.278 44.168 44.049 43.909 43.741 43.501 42.673 -2 ,18836 ,KEBNE ,16675040,Wed Nov 24 01:58:42 CET,Wed Nov 24 03:21:05 CET,0.0 1.245 1.659 1.965 2.23 2.47 2.69 2.89 3.271 3.454 3.627 3.855 4.093 4.239 4.528 4.809 5.079 5.21 5.469 5.727 6.087 6.319 6.55 6.876 7.185 7.492 7.788 8.082 8.468 8.847 9.235 9.7 10.137 10.57 11.076 11.658 12.227 12.85 13.532 14.267 15.052 15.961 17.038 18.14 19.496 21.057 22.863 24.936 27.488 30.589 34.508 38.128 40.441 42.019 43.127 43.955 44.576 45.042 45.39 45.686 45.891 46.045 46.174 46.285 46.369 46.425 46.463 46.485 46.503 46.514 46.509 46.491 46.469 46.454 46.427 46.386 46.344 46.31 46.271 46.235 46.196 46.119 46.064 46.014 45.986 45.919 45.842 45.76 45.711 45.607 45.524 45.448 45.361 45.152 45.029 44.904 44.766 44.603 44.39 44.102 42.67 -3 ,913 ,KEBNE ,16677345,Wed Nov 24 19:08:07 CET,Wed Nov 24 20:31:15 CET,0.0 1.086 1.477 1.795 2.07 2.319 2.547 2.758 3.143 3.313 3.475 3.7 3.931 4.068 4.347 4.618 4.878 5.006 5.261 5.506 5.857 6.082 6.295 6.604 6.917 7.231 7.534 7.822 8.201 8.573 8.94 9.386 9.81 10.225 10.73 11.299 11.849 12.462 13.114 13.824 14.606 15.532 16.628 17.741 19.078 20.581 22.38 24.503 27.024 30.112 34.099 37.678 39.954 41.486 42.568 43.339 43.885 44.312 44.625 44.902 45.106 45.256 45.376 45.477 45.548 45.598 45.633 45.642 45.649 45.643 45.625 45.601 45.558 45.513 45.483 45.442 45.379 45.318 45.264 45.231 45.2 45.136 45.083 45.035 45.012 44.957 44.884 44.801 44.757 44.657 44.585 44.523 44.451 44.295 44.205 44.095 43.974 43.84 43.678 43.429 42.51 -4 ,868 ,KEBNE ,16675042,Wed Nov 24 01:58:42 CET,Wed Nov 24 03:21:11 CET,0.0 1.4 1.797 2.104 2.389 2.645 2.872 3.073 3.449 3.623 3.786 4.01 4.243 4.382 4.652 4.921 5.187 5.314 5.573 5.824 6.175 6.407 6.63 6.96 7.286 7.598 7.902 8.201 8.591 8.966 9.324 9.764 10.192 10.613 11.116 11.678 12.226 12.855 13.546 14.299 15.12 16.047 17.137 18.264 19.578 21.108 22.939 25.012 27.491 30.564 34.608 38.244 40.517 42.054 43.128 43.89 44.436 44.853 45.146 45.404 45.597 45.721 45.817 45.908 45.973 46.005 46.035 46.048 46.036 46.018 45.998 45.982 45.939 45.872 45.827 45.78 45.722 45.647 45.56 45.506 45.441 45.328 45.259 45.174 45.12 45.015 44.909 44.8 44.736 44.62 44.522 44.445 44.357 44.163 44.056 43.931 43.781 43.616 43.424 43.139 42.076 -5 ,30611 ,KEBNE ,16675043,Wed Nov 24 01:58:41 CET,Wed Nov 24 03:21:14 CET,0.0 1.216 1.659 1.999 2.284 2.528 2.749 2.955 3.334 3.509 3.678 3.931 4.184 4.342 4.651 4.942 5.205 5.332 5.581 5.827 6.189 6.419 6.643 6.973 7.291 7.604 7.915 8.228 8.63 9.006 9.374 9.82 10.254 10.665 11.153 11.708 12.241 12.857 13.531 14.249 15.001 15.863 16.907 18.002 19.322 20.812 22.596 24.661 27.211 30.387 34.416 37.996 40.283 41.84 42.94 43.757 44.346 44.802 45.157 45.458 45.674 45.845 45.99 46.096 46.172 46.228 46.257 46.277 46.29 46.289 46.281 46.273 46.26 46.229 46.197 46.163 46.132 46.097 46.058 46.034 46.003 45.946 45.9 45.849 45.82 45.75 45.663 45.575 45.533 45.444 45.388 45.322 45.24 45.068 44.962 44.843 44.707 44.537 44.331 44.021 42.886 -6 ,9091 ,KEBNE ,16675044,Wed Nov 24 01:58:42 CET,Wed Nov 24 03:21:07 CET,0.0 1.371 1.809 2.129 2.421 2.673 2.9 3.103 3.469 3.645 3.816 4.05 4.298 4.449 4.731 4.997 5.259 5.391 5.646 5.88 6.214 6.436 6.661 6.99 7.303 7.62 7.94 8.245 8.636 9.032 9.433 9.916 10.376 10.825 11.342 11.913 12.46 13.078 13.773 14.531 15.336 16.241 17.293 18.385 19.694 21.228 23.067 25.163 27.718 30.859 34.878 38.472 40.758 42.348 43.45 44.271 44.891 45.372 45.724 46.039 46.268 46.415 46.526 46.594 46.642 46.686 46.719 46.735 46.738 46.744 46.743 46.738 46.724 46.693 46.663 46.623 46.579 46.531 46.471 46.432 46.394 46.318 46.254 46.183 46.14 46.045 45.95 45.841 45.781 45.676 45.578 45.497 45.402 45.192 45.084 44.965 44.828 44.655 44.4 44.074 42.965 -7 ,6103 ,KEBNE ,16675045,Wed Nov 24 01:58:41 CET,Wed Nov 24 03:20:45 CET,0.0 1.098 1.513 1.809 2.066 2.317 2.55 2.763 3.141 3.31 3.478 3.713 3.959 4.11 4.398 4.673 4.929 5.054 5.304 5.55 5.912 6.143 6.372 6.706 7.026 7.334 7.63 7.921 8.304 8.676 9.043 9.487 9.913 10.324 10.797 11.332 11.863 12.468 13.125 13.839 14.624 15.559 16.663 17.756 19.084 20.608 22.412 24.498 27.012 30.158 34.161 37.733 40.004 41.561 42.67 43.495 44.075 44.519 44.864 45.186 45.422 45.58 45.703 45.786 45.847 45.903 45.942 45.96 45.974 45.983 45.981 45.969 45.947 45.921 45.886 45.833 45.78 45.726 45.667 45.626 45.58 45.494 45.426 45.356 45.318 45.234 45.137 45.03 44.974 44.865 44.765 44.69 44.617 44.451 44.355 44.236 44.093 43.928 43.707 43.367 42.358 -8 ,22512 ,KEBNE ,16675046,Wed Nov 24 01:58:42 CET,Wed Nov 24 03:20:53 CET,0.0 1.301 1.724 2.092 2.392 2.641 2.866 3.07 3.45 3.629 3.801 4.033 4.278 4.433 4.728 4.998 5.26 5.39 5.648 5.896 6.249 6.48 6.701 7.028 7.359 7.686 7.999 8.31 8.735 9.143 9.529 9.991 10.442 10.895 11.405 11.991 12.573 13.194 13.871 14.603 15.385 16.297 17.4 18.53 19.854 21.367 23.147 25.217 27.756 30.882 34.875 38.441 40.734 42.269 43.329 44.096 44.658 45.098 45.413 45.673 45.866 46.008 46.116 46.188 46.245 46.292 46.313 46.33 46.333 46.314 46.289 46.249 46.195 46.138 46.087 46.032 45.978 45.918 45.851 45.804 45.758 45.683 45.622 45.554 45.514 45.428 45.339 45.229 45.169 45.061 44.979 44.909 44.834 44.648 44.541 44.42 44.279 44.117 43.911 43.591 42.486 -9 ,20328 ,KEBNE ,16677351,Wed Nov 24 19:10:12 CET,Wed Nov 24 20:34:37 CET,0.0 1.201 1.634 1.954 2.235 2.495 2.734 2.95 3.331 3.506 3.68 3.918 4.157 4.309 4.603 4.886 5.159 5.288 5.542 5.791 6.156 6.394 6.615 6.94 7.263 7.566 7.859 8.15 8.525 8.894 9.264 9.706 10.128 10.552 11.067 11.651 12.206 12.818 13.493 14.249 15.066 15.988 17.091 18.192 19.508 21.05 22.86 24.945 27.451 30.55 34.564 38.128 40.341 41.86 42.956 43.776 44.4 44.871 45.212 45.511 45.702 45.854 46.003 46.119 46.201 46.255 46.294 46.313 46.331 46.352 46.36 46.362 46.357 46.333 46.318 46.302 46.267 46.215 46.155 46.119 46.081 46.012 45.963 45.901 45.864 45.791 45.709 45.613 45.557 45.453 45.371 45.302 45.223 45.023 44.906 44.77 44.617 44.439 44.226 43.884 42.827 -10 ,28481 ,KEBNE ,16677352,Wed Nov 24 19:11:14 CET,Wed Nov 24 20:37:32 CET,0.0 1.228 1.632 1.94 2.206 2.446 2.674 2.892 3.284 3.463 3.634 3.873 4.118 4.272 4.565 4.841 5.113 5.247 5.504 5.754 6.115 6.347 6.566 6.891 7.212 7.522 7.829 8.136 8.525 8.899 9.267 9.715 10.146 10.567 11.075 11.648 12.194 12.807 13.484 14.231 15.042 15.968 17.07 18.178 19.497 21.041 22.853 24.936 27.464 30.539 34.519 38.094 40.281 41.786 42.864 43.636 44.223 44.689 45.021 45.286 45.482 45.628 45.737 45.82 45.873 45.903 45.908 45.906 45.903 45.886 45.861 45.842 45.815 45.768 45.721 45.667 45.606 45.523 45.445 45.4 45.347 45.243 45.158 45.081 45.038 44.937 44.826 44.702 44.636 44.511 44.367 44.27 44.174 43.955 43.83 43.7 43.554 43.379 43.163 42.853 41.843 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_29.txt deleted file mode 100644 index 3687d5fe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8834 ,KEBNE ,16675059,Wed Nov 24 02:00:46 CET,Wed Nov 24 03:28:03 CET,0.0 1.208 1.617 1.931 2.21 2.46 2.689 2.903 3.305 3.493 3.671 3.93 4.186 4.348 4.649 4.937 5.217 5.359 5.629 5.886 6.261 6.504 6.747 7.104 7.451 7.78 8.091 8.396 8.806 9.217 9.61 10.088 10.568 11.04 11.604 12.254 12.881 13.579 14.352 15.197 16.115 17.17 18.425 19.72 21.258 23.046 25.218 27.778 30.95 34.941 40.163 44.97 48.161 50.403 52.033 53.293 54.272 55.046 55.623 56.138 56.538 56.855 57.133 57.37 57.546 57.687 57.824 57.93 58.015 58.092 58.166 58.22 58.264 58.296 58.318 58.337 58.352 58.355 58.349 58.344 58.332 58.305 58.272 58.23 58.208 58.165 58.117 58.065 58.032 57.96 57.894 57.838 57.773 57.621 57.534 57.434 57.335 57.215 57.047 56.826 56.027 -2 ,12465 ,KEBNE ,16675060,Wed Nov 24 02:00:50 CET,Wed Nov 24 03:22:35 CET,0.0 1.044 1.483 1.82 2.092 2.337 2.564 2.769 3.158 3.349 3.53 3.776 4.028 4.196 4.513 4.808 5.095 5.234 5.496 5.751 6.133 6.375 6.61 6.962 7.301 7.635 7.954 8.262 8.67 9.078 9.483 9.986 10.474 10.943 11.494 12.117 12.733 13.44 14.223 15.095 16.029 17.065 18.318 19.621 21.161 22.93 25.057 27.556 30.631 34.547 39.742 44.519 47.681 49.942 51.611 52.884 53.858 54.631 55.219 55.759 56.173 56.499 56.783 57.037 57.236 57.4 57.553 57.656 57.733 57.803 57.861 57.9 57.931 57.947 57.953 57.959 57.954 57.95 57.941 57.926 57.91 57.884 57.869 57.841 57.817 57.763 57.705 57.632 57.59 57.519 57.457 57.403 57.344 57.198 57.111 57.01 56.878 56.719 56.513 56.222 55.205 -3 ,21041 ,KEBNE ,16675061,Wed Nov 24 02:00:46 CET,Wed Nov 24 03:23:56 CET,0.0 1.064 1.464 1.752 2.014 2.27 2.505 2.719 3.113 3.296 3.468 3.717 3.967 4.128 4.425 4.709 4.989 5.125 5.389 5.645 6.028 6.27 6.505 6.858 7.202 7.538 7.859 8.175 8.593 9.001 9.399 9.892 10.382 10.858 11.426 12.078 12.721 13.444 14.214 15.037 15.912 16.907 18.118 19.396 20.945 22.707 24.794 27.316 30.476 34.414 39.541 44.303 47.462 49.688 51.293 52.555 53.547 54.298 54.873 55.396 55.789 56.097 56.368 56.623 56.832 57.005 57.166 57.291 57.381 57.447 57.494 57.524 57.551 57.58 57.601 57.617 57.63 57.647 57.664 57.662 57.659 57.65 57.637 57.623 57.613 57.583 57.539 57.491 57.463 57.404 57.368 57.329 57.286 57.188 57.135 57.063 56.962 56.843 56.695 56.471 55.776 -4 ,21105 ,KEBNE ,16677356,Wed Nov 24 19:13:19 CET,Wed Nov 24 20:39:14 CET,0.0 0.954 1.308 1.577 1.836 2.084 2.31 2.53 2.927 3.111 3.289 3.528 3.765 3.92 4.228 4.525 4.81 4.949 5.218 5.471 5.842 6.087 6.326 6.667 7.005 7.348 7.672 7.985 8.401 8.804 9.206 9.712 10.213 10.715 11.297 11.938 12.564 13.274 14.051 14.898 15.809 16.853 18.084 19.367 20.911 22.695 24.856 27.378 30.489 34.392 39.602 44.462 47.631 49.851 51.465 52.723 53.682 54.438 55.016 55.561 56.013 56.376 56.675 56.917 57.117 57.286 57.455 57.589 57.691 57.786 57.866 57.92 57.966 58.01 58.039 58.066 58.088 58.094 58.085 58.075 58.064 58.04 58.016 57.983 57.959 57.9 57.837 57.768 57.728 57.657 57.598 57.547 57.482 57.327 57.241 57.138 57.017 56.877 56.677 56.359 55.408 -5 ,19528 ,KEBNE ,16675063,Wed Nov 24 02:00:46 CET,Wed Nov 24 03:25:19 CET,0.0 1.272 1.67 1.993 2.267 2.507 2.731 2.941 3.328 3.508 3.688 3.948 4.194 4.35 4.652 4.938 5.22 5.356 5.62 5.88 6.258 6.502 6.746 7.111 7.461 7.812 8.154 8.487 8.937 9.365 9.771 10.27 10.764 11.245 11.818 12.46 13.073 13.767 14.526 15.337 16.215 17.239 18.476 19.781 21.372 23.18 25.326 27.867 31.011 34.971 40.138 44.88 48.024 50.243 51.847 53.072 54.01 54.779 55.377 55.914 56.33 56.668 56.937 57.161 57.36 57.517 57.672 57.801 57.892 57.978 58.066 58.126 58.175 58.223 58.256 58.281 58.293 58.297 58.299 58.291 58.275 58.242 58.211 58.172 58.151 58.102 58.038 57.966 57.926 57.856 57.783 57.723 57.655 57.471 57.356 57.246 57.124 56.964 56.761 56.483 55.587 -6 ,2240 ,KEBNE ,16675064,Wed Nov 24 02:00:46 CET,Wed Nov 24 03:24:01 CET,0.0 1.196 1.664 2.049 2.356 2.64 2.895 3.127 3.56 3.769 3.975 4.287 4.553 4.723 5.048 5.365 5.67 5.818 6.104 6.379 6.768 7.024 7.281 7.657 8.021 8.376 8.718 9.052 9.486 9.9 10.296 10.792 11.28 11.761 12.327 12.972 13.601 14.289 15.046 15.856 16.727 17.761 19.002 20.271 21.795 23.549 25.685 28.213 31.304 35.218 40.446 45.274 48.456 50.726 52.371 53.656 54.661 55.451 56.066 56.611 57.033 57.384 57.685 57.938 58.119 58.252 58.393 58.49 58.562 58.64 58.707 58.749 58.783 58.813 58.838 58.859 58.873 58.878 58.876 58.861 58.842 58.815 58.787 58.748 58.728 58.688 58.635 58.559 58.519 58.451 58.376 58.316 58.252 58.1 58.016 57.922 57.793 57.622 57.429 57.161 56.146 -7 ,1722 ,KEBNE ,16677359,Wed Nov 24 19:14:22 CET,Wed Nov 24 20:37:35 CET,0.0 1.06 1.446 1.758 2.042 2.302 2.539 2.758 3.149 3.327 3.506 3.777 4.029 4.181 4.472 4.769 5.049 5.181 5.44 5.697 6.072 6.307 6.54 6.888 7.221 7.55 7.874 8.191 8.609 9.018 9.414 9.888 10.344 10.788 11.332 11.953 12.548 13.219 13.955 14.782 15.707 16.765 18.014 19.317 20.864 22.65 24.838 27.402 30.554 34.505 39.74 44.615 47.752 49.943 51.569 52.813 53.75 54.514 55.107 55.636 56.034 56.348 56.628 56.86 57.049 57.2 57.347 57.472 57.561 57.627 57.682 57.735 57.793 57.842 57.866 57.883 57.896 57.898 57.895 57.893 57.887 57.868 57.844 57.808 57.789 57.747 57.691 57.623 57.588 57.521 57.442 57.381 57.318 57.162 57.066 56.949 56.807 56.644 56.466 56.211 55.49 -8 ,11470 ,KEBNE ,16677360,Wed Nov 24 19:14:22 CET,Wed Nov 24 20:37:31 CET,0.0 1.255 1.637 1.954 2.232 2.466 2.679 2.882 3.263 3.444 3.623 3.874 4.114 4.268 4.571 4.857 5.135 5.273 5.541 5.807 6.185 6.424 6.662 7.008 7.352 7.686 8.008 8.321 8.735 9.149 9.552 10.025 10.491 10.964 11.517 12.143 12.762 13.448 14.187 14.993 15.898 16.96 18.203 19.502 21.096 22.919 25.053 27.524 30.632 34.636 39.876 44.693 47.87 50.131 51.785 53.054 54.03 54.81 55.405 55.931 56.317 56.631 56.909 57.149 57.352 57.509 57.661 57.786 57.877 57.966 58.044 58.099 58.151 58.188 58.209 58.229 58.244 58.247 58.245 58.243 58.235 58.22 58.209 58.193 58.182 58.15 58.095 58.027 57.986 57.911 57.854 57.796 57.73 57.584 57.486 57.363 57.219 57.055 56.857 56.57 55.685 -9 ,16171 ,KEBNE ,16675067,Wed Nov 24 02:10:04 CET,Wed Nov 24 03:33:18 CET,0.0 0.883 1.248 1.529 1.763 1.991 2.214 2.421 2.802 2.971 3.13 3.366 3.607 3.756 4.04 4.308 4.566 4.692 4.94 5.187 5.541 5.769 6.003 6.344 6.676 7.0 7.311 7.614 8.02 8.413 8.797 9.271 9.723 10.184 10.733 11.351 11.948 12.617 13.365 14.192 15.084 16.109 17.377 18.699 20.251 22.04 24.204 26.736 29.854 33.819 39.08 43.907 47.045 49.272 50.93 52.218 53.199 53.981 54.561 55.078 55.484 55.803 56.072 56.289 56.483 56.658 56.819 56.957 57.062 57.15 57.233 57.291 57.34 57.382 57.406 57.426 57.436 57.44 57.431 57.419 57.411 57.388 57.37 57.359 57.353 57.319 57.274 57.231 57.202 57.146 57.103 57.06 57.013 56.895 56.824 56.74 56.649 56.538 56.385 56.173 55.354 -10 ,9389 ,KEBNE ,16675068,Wed Nov 24 02:12:07 CET,Wed Nov 24 03:35:30 CET,0.0 1.193 1.587 1.913 2.199 2.449 2.68 2.901 3.305 3.489 3.667 3.932 4.175 4.326 4.632 4.928 5.201 5.334 5.601 5.864 6.245 6.492 6.73 7.071 7.404 7.728 8.049 8.378 8.81 9.216 9.612 10.096 10.567 11.026 11.575 12.206 12.824 13.535 14.317 15.164 16.084 17.125 18.365 19.672 21.255 23.055 25.18 27.712 30.831 34.759 39.976 44.783 47.971 50.258 51.909 53.167 54.132 54.891 55.471 55.986 56.38 56.702 56.982 57.233 57.452 57.613 57.756 57.878 57.972 58.048 58.101 58.132 58.154 58.166 58.169 58.176 58.177 58.16 58.132 58.113 58.097 58.062 58.026 57.985 57.96 57.913 57.868 57.807 57.773 57.708 57.652 57.595 57.53 57.375 57.282 57.179 57.046 56.898 56.697 56.414 55.436 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_31.txt deleted file mode 100644 index 4aa60edf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11415 ,KEBNE ,17069455,Fri Dec 24 04:56:58 CET,Fri Dec 24 06:20:03 CET,0.0 1.323 1.736 2.052 2.321 2.566 2.782 2.969 3.308 3.477 3.631 3.836 4.056 4.184 4.424 4.65 4.867 4.974 5.179 5.378 5.668 5.851 6.035 6.313 6.578 6.82 7.063 7.292 7.575 7.861 8.131 8.457 8.777 9.085 9.441 9.858 10.261 10.692 11.147 11.657 12.218 12.822 13.525 14.26 15.118 16.074 17.134 18.309 19.775 21.489 23.39 24.781 25.437 25.735 25.873 25.89 25.811 25.706 25.577 25.404 25.257 25.119 24.95 24.758 24.563 24.382 24.198 24.032 23.888 23.729 23.548 23.398 23.22 23.031 22.902 22.776 22.627 22.454 22.27 22.138 22.013 21.803 21.633 21.454 21.371 21.199 21.019 20.829 20.731 20.564 20.389 20.252 20.089 19.732 19.538 19.324 19.082 18.796 18.438 17.917 15.577 -2 ,26171 ,KEBNE ,17069458,Fri Dec 24 05:03:18 CET,Fri Dec 24 06:27:54 CET,0.0 1.575 1.999 2.336 2.628 2.867 3.072 3.265 3.612 3.767 3.915 4.108 4.33 4.465 4.711 4.939 5.158 5.261 5.462 5.665 5.968 6.168 6.366 6.651 6.921 7.184 7.434 7.685 8.014 8.312 8.599 8.942 9.271 9.602 9.987 10.408 10.813 11.268 11.763 12.286 12.831 13.452 14.171 14.891 15.744 16.685 17.742 18.938 20.32 21.929 23.805 25.219 25.907 26.225 26.337 26.326 26.249 26.108 25.954 25.775 25.599 25.429 25.238 25.056 24.885 24.726 24.553 24.39 24.243 24.084 23.915 23.759 23.593 23.422 23.281 23.131 22.977 22.822 22.662 22.552 22.43 22.219 22.067 21.896 21.806 21.621 21.427 21.22 21.105 20.928 20.753 20.618 20.474 20.121 19.913 19.696 19.466 19.19 18.803 18.256 16.401 -3 ,4372 ,KEBNE ,17069460,Fri Dec 24 05:06:26 CET,Fri Dec 24 06:30:56 CET,0.0 1.507 1.965 2.28 2.534 2.749 2.949 3.136 3.476 3.635 3.788 3.977 4.192 4.326 4.582 4.816 5.031 5.136 5.34 5.538 5.823 6.007 6.184 6.432 6.671 6.908 7.145 7.381 7.682 7.966 8.236 8.562 8.881 9.195 9.57 10.003 10.411 10.849 11.326 11.842 12.388 13.01 13.744 14.462 15.322 16.279 17.38 18.64 20.062 21.695 23.561 24.889 25.53 25.828 25.909 25.879 25.783 25.664 25.558 25.427 25.28 25.135 24.983 24.803 24.616 24.459 24.28 24.107 23.957 23.789 23.597 23.431 23.265 23.098 22.978 22.848 22.699 22.54 22.365 22.243 22.121 21.928 21.784 21.627 21.543 21.358 21.168 20.974 20.869 20.688 20.49 20.34 20.186 19.874 19.699 19.49 19.255 18.98 18.62 18.096 16.072 -4 ,9946 ,KEBNE ,17069461,Fri Dec 24 05:06:26 CET,Fri Dec 24 06:29:35 CET,0.0 1.477 1.912 2.211 2.443 2.647 2.839 3.031 3.367 3.509 3.642 3.818 4.033 4.158 4.385 4.594 4.809 4.913 5.105 5.295 5.572 5.75 5.929 6.19 6.43 6.658 6.879 7.095 7.381 7.662 7.924 8.227 8.523 8.826 9.181 9.563 9.926 10.329 10.774 11.257 11.768 12.362 13.096 13.832 14.674 15.61 16.671 17.859 19.29 20.945 22.768 24.053 24.661 24.994 25.097 25.063 24.987 24.878 24.749 24.586 24.422 24.26 24.081 23.898 23.744 23.598 23.441 23.287 23.135 22.982 22.821 22.68 22.526 22.366 22.245 22.112 21.963 21.799 21.641 21.528 21.401 21.208 21.065 20.899 20.807 20.622 20.443 20.243 20.137 19.959 19.764 19.636 19.498 19.15 18.965 18.776 18.522 18.212 17.861 17.404 15.873 -5 ,25681 ,KEBNE ,17069464,Fri Dec 24 05:17:56 CET,Fri Dec 24 06:40:35 CET,0.0 1.533 1.928 2.25 2.516 2.746 2.956 3.136 3.45 3.602 3.759 3.97 4.19 4.326 4.584 4.822 5.05 5.159 5.364 5.552 5.829 6.006 6.18 6.432 6.686 6.942 7.195 7.44 7.747 8.045 8.328 8.669 9.006 9.33 9.699 10.124 10.539 11.003 11.506 12.012 12.537 13.139 13.844 14.561 15.404 16.339 17.422 18.66 20.061 21.642 23.395 24.603 25.224 25.588 25.727 25.718 25.656 25.586 25.471 25.287 25.129 25.005 24.867 24.704 24.523 24.368 24.219 24.072 23.933 23.779 23.622 23.488 23.337 23.173 23.046 22.902 22.749 22.602 22.443 22.324 22.198 22.001 21.858 21.711 21.63 21.454 21.264 21.062 20.959 20.788 20.616 20.486 20.342 20.024 19.844 19.632 19.39 19.124 18.785 18.235 16.42 -6 ,31470 ,KEBNE ,17069466,Fri Dec 24 05:21:05 CET,Fri Dec 24 06:45:30 CET,0.0 1.353 1.763 2.061 2.32 2.548 2.746 2.933 3.287 3.45 3.608 3.821 4.042 4.168 4.415 4.651 4.868 4.974 5.182 5.377 5.664 5.856 6.045 6.307 6.556 6.796 7.023 7.25 7.547 7.831 8.103 8.426 8.739 9.044 9.407 9.82 10.215 10.652 11.136 11.658 12.199 12.797 13.492 14.224 15.056 15.944 17.041 18.231 19.576 21.244 23.188 24.664 25.352 25.666 25.803 25.805 25.696 25.548 25.433 25.3 25.134 24.965 24.806 24.659 24.51 24.35 24.17 23.995 23.835 23.677 23.517 23.377 23.203 23.019 22.88 22.733 22.579 22.404 22.228 22.115 21.991 21.796 21.657 21.499 21.418 21.255 21.073 20.876 20.777 20.615 20.447 20.313 20.175 19.868 19.702 19.523 19.309 19.048 18.723 18.255 16.593 -7 ,31333 ,KEBNE ,17069468,Fri Dec 24 05:23:10 CET,Fri Dec 24 06:47:24 CET,0.0 1.316 1.726 2.056 2.335 2.569 2.772 2.954 3.285 3.442 3.593 3.797 4.013 4.135 4.374 4.613 4.83 4.938 5.156 5.358 5.645 5.831 6.023 6.31 6.581 6.824 7.062 7.31 7.628 7.937 8.232 8.584 8.915 9.23 9.61 10.048 10.466 10.93 11.437 11.97 12.526 13.135 13.853 14.598 15.467 16.407 17.496 18.74 20.118 21.659 23.452 24.754 25.423 25.749 25.855 25.863 25.796 25.672 25.508 25.322 25.158 25.012 24.852 24.664 24.488 24.333 24.158 23.989 23.836 23.673 23.5 23.352 23.189 23.008 22.862 22.706 22.546 22.364 22.167 22.031 21.888 21.658 21.491 21.306 21.209 21.02 20.831 20.618 20.503 20.33 20.167 20.031 19.88 19.542 19.366 19.158 18.889 18.599 18.249 17.759 15.346 -8 ,15226 ,KEBNE ,17069469,Fri Dec 24 05:24:13 CET,Fri Dec 24 06:48:43 CET,0.0 1.174 1.509 1.788 2.026 2.233 2.417 2.589 2.909 3.046 3.179 3.349 3.561 3.686 3.919 4.139 4.348 4.446 4.632 4.815 5.077 5.244 5.41 5.655 5.886 6.105 6.319 6.534 6.81 7.073 7.331 7.646 7.945 8.228 8.563 8.962 9.36 9.784 10.231 10.699 11.21 11.801 12.498 13.214 14.033 14.939 16.012 17.247 18.652 20.296 22.23 23.607 24.229 24.458 24.491 24.462 24.397 24.268 24.129 23.995 23.847 23.699 23.552 23.396 23.237 23.07 22.886 22.725 22.58 22.425 22.269 22.135 21.981 21.809 21.68 21.55 21.401 21.237 21.061 20.937 20.812 20.607 20.447 20.279 20.19 20.014 19.821 19.598 19.483 19.306 19.125 18.978 18.819 18.469 18.279 18.091 17.88 17.593 17.209 16.725 14.958 -9 ,25059 ,KEBNE ,17069471,Fri Dec 24 05:26:19 CET,Fri Dec 24 06:50:35 CET,0.0 1.438 1.889 2.23 2.509 2.755 2.967 3.162 3.516 3.674 3.825 4.027 4.246 4.379 4.631 4.858 5.086 5.2 5.413 5.616 5.89 6.061 6.229 6.474 6.716 6.953 7.19 7.424 7.722 8.013 8.301 8.644 8.966 9.28 9.662 10.091 10.493 10.947 11.451 11.976 12.517 13.128 13.85 14.567 15.369 16.298 17.424 18.688 20.093 21.63 23.454 24.862 25.564 25.928 26.066 26.069 25.998 25.881 25.749 25.609 25.456 25.279 25.11 24.95 24.774 24.597 24.414 24.243 24.087 23.91 23.728 23.58 23.412 23.238 23.1 22.954 22.796 22.633 22.461 22.334 22.205 22.002 21.845 21.672 21.582 21.397 21.206 20.989 20.869 20.683 20.502 20.381 20.249 19.923 19.731 19.504 19.255 18.959 18.604 18.103 16.437 -10 ,31823 ,KEBNE ,17069474,Fri Dec 24 05:27:21 CET,Fri Dec 24 06:50:17 CET,0.0 1.654 2.08 2.397 2.662 2.886 3.092 3.288 3.648 3.807 3.96 4.172 4.395 4.536 4.791 5.019 5.234 5.338 5.547 5.743 6.02 6.21 6.392 6.651 6.901 7.141 7.376 7.605 7.908 8.203 8.481 8.816 9.138 9.454 9.828 10.257 10.67 11.099 11.543 12.027 12.54 13.111 13.79 14.477 15.302 16.242 17.302 18.47 19.827 21.409 23.26 24.59 25.264 25.646 25.786 25.784 25.704 25.605 25.486 25.306 25.15 25.002 24.823 24.637 24.459 24.278 24.074 23.897 23.742 23.57 23.392 23.25 23.097 22.926 22.793 22.658 22.51 22.348 22.173 22.051 21.93 21.733 21.578 21.419 21.342 21.184 21.0 20.793 20.686 20.515 20.35 20.211 20.057 19.736 19.563 19.374 19.156 18.899 18.599 18.13 16.564 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_33.txt deleted file mode 100644 index 9e1307df..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22117 ,KEBNE ,16675069,Wed Nov 24 02:12:07 CET,Wed Nov 24 03:34:18 CET,0.0 1.037 1.367 1.625 1.85 2.045 2.223 2.385 2.691 2.838 2.976 3.152 3.353 3.467 3.689 3.912 4.133 4.241 4.453 4.658 4.951 5.146 5.337 5.603 5.862 6.108 6.349 6.595 6.915 7.219 7.515 7.875 8.231 8.588 8.998 9.463 9.911 10.401 10.958 11.57 12.214 12.941 13.826 14.735 15.794 17.009 18.45 20.142 22.179 24.653 27.753 30.375 31.958 32.975 33.66 34.114 34.41 34.605 34.713 34.774 34.801 34.793 34.75 34.709 34.666 34.623 34.564 34.492 34.431 34.352 34.257 34.18 34.073 33.958 33.87 33.774 33.666 33.556 33.43 33.335 33.239 33.074 32.954 32.826 32.753 32.603 32.452 32.271 32.176 32.029 31.858 31.735 31.612 31.345 31.184 30.984 30.739 30.474 30.157 29.713 26.566 -2 ,28210 ,KEBNE ,16677364,Wed Nov 24 19:15:25 CET,Wed Nov 24 20:38:20 CET,0.0 1.248 1.613 1.901 2.145 2.359 2.548 2.716 3.037 3.193 3.334 3.51 3.726 3.851 4.08 4.302 4.518 4.626 4.838 5.038 5.324 5.508 5.686 5.944 6.199 6.456 6.707 6.953 7.271 7.571 7.862 8.22 8.567 8.901 9.289 9.744 10.207 10.709 11.252 11.856 12.498 13.23 14.093 14.981 16.079 17.314 18.757 20.462 22.538 25.084 28.299 30.956 32.542 33.627 34.365 34.84 35.1 35.261 35.368 35.408 35.408 35.392 35.354 35.32 35.263 35.188 35.105 35.029 34.956 34.867 34.744 34.641 34.534 34.404 34.304 34.184 34.059 33.925 33.772 33.672 33.563 33.383 33.264 33.13 33.059 32.918 32.756 32.577 32.474 32.312 32.142 32.01 31.854 31.518 31.333 31.136 30.91 30.651 30.325 29.822 26.633 -3 ,16744 ,KEBNE ,16675071,Wed Nov 24 02:21:22 CET,Wed Nov 24 03:45:15 CET,0.0 1.41 1.791 2.069 2.301 2.512 2.7 2.867 3.171 3.315 3.452 3.618 3.83 3.953 4.191 4.42 4.642 4.751 4.969 5.173 5.459 5.643 5.821 6.084 6.337 6.576 6.807 7.035 7.337 7.638 7.935 8.292 8.638 8.988 9.413 9.907 10.385 10.898 11.452 12.052 12.708 13.466 14.346 15.243 16.325 17.561 19.032 20.774 22.897 25.463 28.62 31.263 32.874 33.948 34.69 35.187 35.467 35.666 35.811 35.91 35.938 35.936 35.92 35.856 35.769 35.693 35.609 35.497 35.388 35.297 35.197 35.085 34.968 34.85 34.738 34.617 34.5 34.365 34.214 34.113 34.004 33.831 33.697 33.544 33.469 33.318 33.154 32.971 32.876 32.72 32.512 32.393 32.272 31.965 31.784 31.59 31.368 31.101 30.767 30.301 27.613 -4 ,3627 ,KEBNE ,16677366,Wed Nov 24 19:17:30 CET,Wed Nov 24 20:45:24 CET,0.0 1.349 1.754 2.051 2.277 2.473 2.662 2.834 3.158 3.311 3.449 3.621 3.832 3.956 4.19 4.405 4.608 4.707 4.9 5.088 5.369 5.563 5.751 6.019 6.28 6.533 6.778 7.015 7.329 7.634 7.924 8.28 8.638 8.999 9.426 9.904 10.367 10.894 11.453 12.037 12.678 13.426 14.301 15.182 16.245 17.477 18.924 20.608 22.662 25.152 28.322 31.091 32.785 33.847 34.543 35.031 35.362 35.583 35.69 35.748 35.802 35.856 35.876 35.875 35.849 35.797 35.721 35.642 35.575 35.498 35.408 35.312 35.211 35.108 35.024 34.924 34.81 34.698 34.56 34.454 34.345 34.16 34.028 33.895 33.825 33.664 33.49 33.307 33.207 33.053 32.863 32.722 32.575 32.252 32.06 31.85 31.61 31.307 30.941 30.396 28.449 -5 ,1933 ,KEBNE ,16677367,Wed Nov 24 19:20:39 CET,Wed Nov 24 20:45:01 CET,0.0 1.094 1.464 1.769 2.018 2.225 2.413 2.591 2.938 3.094 3.238 3.424 3.64 3.766 3.995 4.204 4.403 4.499 4.685 4.865 5.13 5.305 5.479 5.739 5.991 6.229 6.462 6.695 7.004 7.301 7.601 7.969 8.316 8.668 9.082 9.529 9.965 10.464 11.014 11.603 12.239 12.967 13.833 14.74 15.814 17.049 18.527 20.241 22.347 24.975 28.164 30.822 32.464 33.51 34.215 34.714 35.02 35.181 35.257 35.33 35.375 35.375 35.35 35.312 35.258 35.187 35.089 35.006 34.936 34.846 34.74 34.653 34.544 34.413 34.303 34.186 34.074 33.957 33.833 33.739 33.637 33.46 33.319 33.177 33.108 32.957 32.789 32.601 32.497 32.346 32.178 32.055 31.925 31.615 31.431 31.223 30.989 30.718 30.376 29.848 27.688 -6 ,7565 ,KEBNE ,16677368,Wed Nov 24 19:22:43 CET,Wed Nov 24 20:50:36 CET,0.0 1.118 1.486 1.748 1.97 2.179 2.377 2.561 2.894 3.042 3.18 3.362 3.57 3.696 3.948 4.201 4.445 4.554 4.757 4.959 5.251 5.439 5.623 5.889 6.148 6.401 6.648 6.884 7.197 7.507 7.802 8.162 8.517 8.861 9.272 9.738 10.183 10.69 11.254 11.854 12.491 13.224 14.088 14.989 16.063 17.289 18.735 20.42 22.47 24.976 28.193 30.959 32.572 33.598 34.329 34.821 35.149 35.358 35.461 35.527 35.568 35.579 35.549 35.496 35.432 35.371 35.3 35.227 35.167 35.089 34.993 34.899 34.797 34.695 34.598 34.481 34.349 34.209 34.084 33.997 33.889 33.706 33.581 33.446 33.37 33.202 33.001 32.791 32.686 32.521 32.342 32.216 32.078 31.765 31.584 31.4 31.176 30.89 30.551 30.06 28.072 -7 ,27443 ,KEBNE ,16675075,Wed Nov 24 02:25:30 CET,Wed Nov 24 03:48:46 CET,0.0 1.595 1.959 2.24 2.474 2.682 2.859 3.02 3.334 3.48 3.612 3.78 3.988 4.106 4.337 4.562 4.762 4.86 5.065 5.262 5.535 5.712 5.887 6.139 6.394 6.654 6.914 7.168 7.485 7.804 8.12 8.491 8.844 9.189 9.596 10.053 10.502 11.007 11.567 12.17 12.801 13.533 14.412 15.324 16.43 17.708 19.227 20.926 22.948 25.431 28.591 31.323 32.92 33.953 34.682 35.17 35.427 35.63 35.799 35.907 35.95 35.958 35.947 35.926 35.879 35.81 35.711 35.623 35.547 35.447 35.339 35.245 35.141 35.035 34.956 34.867 34.75 34.62 34.482 34.379 34.263 34.078 33.952 33.824 33.758 33.6 33.421 33.23 33.119 32.955 32.764 32.628 32.493 32.202 32.013 31.79 31.559 31.287 30.902 30.366 28.006 -8 ,7539 ,KEBNE ,16675076,Wed Nov 24 02:27:34 CET,Wed Nov 24 03:49:52 CET,0.0 1.23 1.625 1.938 2.185 2.395 2.593 2.768 3.074 3.219 3.361 3.54 3.749 3.877 4.121 4.348 4.567 4.674 4.879 5.072 5.355 5.543 5.725 5.986 6.248 6.509 6.763 7.006 7.313 7.621 7.915 8.269 8.614 8.946 9.34 9.793 10.243 10.756 11.305 11.891 12.518 13.251 14.141 15.052 16.138 17.374 18.862 20.59 22.638 25.194 28.438 31.154 32.827 33.929 34.631 35.097 35.372 35.536 35.634 35.674 35.685 35.68 35.647 35.612 35.581 35.523 35.442 35.359 35.271 35.17 35.059 34.955 34.837 34.707 34.596 34.492 34.379 34.248 34.115 34.014 33.895 33.702 33.564 33.419 33.347 33.197 33.03 32.851 32.751 32.59 32.394 32.264 32.123 31.788 31.601 31.403 31.172 30.881 30.505 29.98 27.686 -9 ,27682 ,KEBNE ,16677371,Wed Nov 24 19:24:48 CET,Wed Nov 24 20:49:05 CET,0.0 1.477 1.836 2.115 2.354 2.57 2.77 2.953 3.278 3.421 3.552 3.714 3.913 4.027 4.25 4.462 4.669 4.771 4.969 5.165 5.443 5.621 5.805 6.076 6.323 6.551 6.778 7.006 7.3 7.584 7.868 8.22 8.569 8.914 9.317 9.773 10.215 10.721 11.29 11.909 12.564 13.32 14.233 15.147 16.21 17.464 18.952 20.626 22.687 25.242 28.457 31.171 32.763 33.843 34.548 34.958 35.237 35.451 35.557 35.617 35.637 35.611 35.582 35.538 35.467 35.393 35.286 35.183 35.097 34.995 34.894 34.806 34.698 34.59 34.499 34.39 34.275 34.146 34.009 33.905 33.793 33.648 33.534 33.387 33.311 33.165 33.001 32.818 32.731 32.584 32.395 32.277 32.151 31.837 31.654 31.454 31.208 30.911 30.494 29.907 28.189 -10 ,30138 ,KEBNE ,16675078,Wed Nov 24 02:29:37 CET,Wed Nov 24 03:56:17 CET,0.0 1.221 1.596 1.871 2.102 2.299 2.48 2.653 2.98 3.133 3.275 3.461 3.683 3.814 4.069 4.304 4.521 4.627 4.832 5.026 5.316 5.508 5.69 5.953 6.208 6.458 6.708 6.953 7.265 7.57 7.872 8.241 8.604 8.955 9.365 9.837 10.297 10.803 11.347 11.943 12.59 13.319 14.182 15.088 16.169 17.384 18.835 20.545 22.642 25.19 28.373 31.03 32.618 33.7 34.357 34.82 35.166 35.422 35.598 35.692 35.736 35.785 35.803 35.77 35.719 35.652 35.565 35.495 35.437 35.365 35.28 35.195 35.095 34.971 34.872 34.777 34.656 34.522 34.387 34.284 34.168 33.98 33.844 33.688 33.606 33.455 33.289 33.09 32.982 32.813 32.618 32.487 32.353 32.055 31.882 31.698 31.472 31.19 30.839 30.331 28.065 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_34.txt deleted file mode 100644 index fde534dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19655 ,KEBNE ,16675079,Wed Nov 24 02:30:40 CET,Wed Nov 24 03:53:06 CET,0.0 0.843 1.122 1.354 1.554 1.73 1.889 2.035 2.301 2.418 2.531 2.657 2.842 2.948 3.147 3.317 3.484 3.568 3.728 3.875 4.078 4.21 4.335 4.515 4.698 4.876 5.039 5.196 5.398 5.583 5.778 6.025 6.25 6.46 6.682 6.935 7.191 7.473 7.798 8.15 8.485 8.84 9.256 9.644 10.102 10.62 11.131 11.622 12.126 12.507 12.54 12.118 11.588 10.977 10.377 9.805 9.253 8.754 8.318 7.87 7.467 7.102 6.746 6.366 5.988 5.654 5.317 5.015 4.717 4.371 4.024 3.749 3.463 3.18 2.97 2.749 2.508 2.266 2.033 1.864 1.686 1.409 1.221 1.036 0.931 0.708 0.464 0.205 0.077 -0.148 -0.362 -0.52 -0.685 -1.063 -1.29 -1.534 -1.8 -2.122 -2.493 -2.987 -4.812 -2 ,21573 ,KEBNE ,16675080,Wed Nov 24 02:30:43 CET,Wed Nov 24 03:47:20 CET,0.0 1.393 1.776 2.048 2.294 2.502 2.681 2.844 3.136 3.268 3.388 3.522 3.713 3.818 4.018 4.2 4.371 4.456 4.611 4.765 4.995 5.141 5.285 5.485 5.672 5.859 6.032 6.195 6.402 6.611 6.81 7.04 7.268 7.479 7.721 7.992 8.257 8.537 8.825 9.149 9.486 9.836 10.231 10.604 11.029 11.502 11.984 12.49 12.986 13.351 13.448 13.007 12.447 11.892 11.318 10.731 10.164 9.624 9.141 8.674 8.248 7.849 7.476 7.106 6.736 6.389 6.041 5.752 5.487 5.212 4.931 4.677 4.426 4.172 3.971 3.755 3.537 3.309 3.063 2.903 2.735 2.453 2.242 2.016 1.903 1.676 1.436 1.165 1.023 0.791 0.58 0.423 0.241 -0.173 -0.384 -0.623 -0.888 -1.185 -1.56 -2.1 -4.479 -3 ,22114 ,KEBNE ,16675081,Wed Nov 24 02:32:43 CET,Wed Nov 24 04:04:21 CET,0.0 1.3 1.677 1.936 2.165 2.366 2.536 2.694 2.975 3.104 3.231 3.38 3.574 3.679 3.877 4.055 4.231 4.318 4.484 4.645 4.87 5.01 5.149 5.342 5.521 5.7 5.875 6.047 6.264 6.47 6.684 6.946 7.168 7.373 7.614 7.877 8.138 8.419 8.716 9.03 9.342 9.683 10.095 10.484 10.916 11.368 11.82 12.289 12.74 13.06 13.138 12.881 12.41 11.766 11.148 10.58 10.067 9.581 9.12 8.615 8.182 7.799 7.414 7.07 6.739 6.414 6.084 5.801 5.556 5.29 5.006 4.765 4.52 4.27 4.066 3.843 3.616 3.387 3.141 2.965 2.785 2.516 2.336 2.133 2.022 1.81 1.582 1.329 1.194 0.963 0.745 0.574 0.392 0.023 -0.181 -0.405 -0.673 -1.004 -1.364 -1.89 -3.698 -4 ,6677 ,KEBNE ,16677376,Wed Nov 24 19:28:56 CET,Wed Nov 24 20:53:05 CET,0.0 1.254 1.559 1.79 1.99 2.18 2.346 2.488 2.741 2.866 2.985 3.11 3.295 3.392 3.574 3.75 3.917 3.996 4.147 4.293 4.507 4.645 4.778 4.96 5.134 5.306 5.478 5.642 5.851 6.042 6.213 6.437 6.658 6.863 7.113 7.379 7.613 7.86 8.138 8.442 8.738 9.056 9.432 9.822 10.262 10.682 11.117 11.576 12.055 12.446 12.492 12.064 11.492 10.845 10.268 9.765 9.234 8.712 8.274 7.808 7.396 7.03 6.681 6.347 6.034 5.739 5.44 5.169 4.931 4.683 4.403 4.171 3.918 3.638 3.43 3.221 2.995 2.757 2.52 2.356 2.18 1.901 1.717 1.524 1.421 1.193 0.949 0.694 0.566 0.346 0.142 -0.015 -0.177 -0.524 -0.709 -0.904 -1.127 -1.391 -1.697 -2.167 -3.629 -5 ,1529 ,KEBNE ,16677377,Wed Nov 24 19:28:56 CET,Wed Nov 24 20:53:09 CET,0.0 1.288 1.611 1.865 2.083 2.263 2.422 2.577 2.867 2.998 3.118 3.274 3.479 3.583 3.772 3.953 4.131 4.218 4.375 4.523 4.747 4.902 5.047 5.239 5.436 5.638 5.834 6.016 6.237 6.452 6.664 6.896 7.11 7.332 7.582 7.863 8.126 8.419 8.731 9.045 9.385 9.752 10.16 10.568 11.029 11.5 11.969 12.403 12.857 13.224 13.321 13.019 12.489 11.908 11.333 10.74 10.177 9.66 9.188 8.706 8.274 7.888 7.535 7.197 6.877 6.563 6.235 5.945 5.693 5.441 5.19 4.974 4.725 4.465 4.266 4.054 3.835 3.61 3.362 3.181 2.995 2.713 2.52 2.306 2.192 1.969 1.726 1.454 1.315 1.088 0.869 0.698 0.513 0.119 -0.089 -0.321 -0.574 -0.88 -1.271 -1.79 -3.336 -6 ,11199 ,KEBNE ,16677378,Wed Nov 24 19:28:56 CET,Wed Nov 24 20:53:34 CET,0.0 1.387 1.792 2.084 2.3 2.489 2.656 2.811 3.102 3.243 3.379 3.541 3.741 3.848 4.056 4.25 4.433 4.521 4.695 4.863 5.084 5.229 5.371 5.568 5.756 5.929 6.095 6.267 6.48 6.685 6.9 7.169 7.423 7.659 7.931 8.221 8.483 8.779 9.118 9.469 9.828 10.232 10.668 11.054 11.449 11.878 12.409 12.995 13.53 13.927 14.012 13.514 12.9 12.281 11.673 11.095 10.604 10.111 9.613 9.098 8.653 8.235 7.822 7.447 7.094 6.762 6.421 6.108 5.839 5.554 5.248 5.012 4.763 4.502 4.31 4.112 3.888 3.656 3.422 3.256 3.09 2.818 2.62 2.424 2.321 2.099 1.864 1.614 1.487 1.263 1.06 0.898 0.726 0.34 0.131 -0.093 -0.346 -0.626 -0.963 -1.466 -3.055 -7 ,17840 ,KEBNE ,16677379,Wed Nov 24 19:28:56 CET,Wed Nov 24 20:54:24 CET,0.0 1.187 1.535 1.776 1.982 2.168 2.339 2.502 2.804 2.933 3.052 3.198 3.395 3.505 3.718 3.929 4.129 4.221 4.397 4.564 4.811 4.969 5.121 5.334 5.528 5.718 5.903 6.087 6.329 6.56 6.781 7.033 7.275 7.512 7.767 8.047 8.329 8.636 8.959 9.294 9.603 9.929 10.307 10.676 11.116 11.574 12.028 12.473 12.896 13.225 13.279 12.857 12.286 11.616 10.959 10.392 9.882 9.377 8.916 8.451 8.049 7.647 7.237 6.867 6.525 6.224 5.915 5.62 5.364 5.108 4.825 4.575 4.322 4.076 3.884 3.682 3.469 3.23 2.982 2.815 2.636 2.353 2.154 1.943 1.837 1.622 1.396 1.161 1.03 0.803 0.596 0.436 0.278 -0.103 -0.327 -0.572 -0.846 -1.149 -1.494 -1.979 -3.599 -8 ,7058 ,KEBNE ,16677380,Wed Nov 24 19:28:56 CET,Wed Nov 24 20:52:04 CET,0.0 1.314 1.619 1.836 2.022 2.189 2.349 2.5 2.771 2.893 3.009 3.145 3.324 3.416 3.594 3.77 3.944 4.021 4.174 4.329 4.547 4.692 4.842 5.069 5.282 5.476 5.663 5.854 6.107 6.333 6.548 6.812 7.065 7.296 7.564 7.882 8.165 8.449 8.757 9.092 9.431 9.791 10.17 10.567 11.037 11.49 11.964 12.457 12.967 13.401 13.575 13.322 12.803 12.19 11.569 10.961 10.397 9.882 9.436 8.959 8.538 8.185 7.838 7.489 7.163 6.869 6.558 6.252 5.98 5.71 5.412 5.168 4.911 4.623 4.406 4.187 3.961 3.723 3.479 3.316 3.139 2.846 2.635 2.412 2.297 2.056 1.811 1.556 1.42 1.193 0.984 0.821 0.653 0.261 0.024 -0.236 -0.539 -0.886 -1.296 -1.889 -4.559 -9 ,2148 ,KEBNE ,16675087,Wed Nov 24 02:45:05 CET,Wed Nov 24 04:11:15 CET,0.0 1.287 1.623 1.876 2.089 2.266 2.424 2.576 2.861 2.996 3.119 3.254 3.445 3.544 3.731 3.912 4.087 4.172 4.333 4.493 4.731 4.884 5.037 5.264 5.473 5.663 5.849 6.035 6.268 6.487 6.707 6.974 7.233 7.476 7.745 8.049 8.322 8.626 8.978 9.345 9.714 10.09 10.505 10.915 11.374 11.83 12.282 12.741 13.224 13.65 13.794 13.407 12.86 12.245 11.621 11.026 10.472 9.965 9.522 9.058 8.673 8.312 7.934 7.568 7.221 6.907 6.589 6.301 6.031 5.76 5.483 5.245 5.002 4.748 4.548 4.342 4.119 3.876 3.63 3.452 3.261 2.96 2.756 2.555 2.453 2.237 1.998 1.736 1.602 1.387 1.19 1.029 0.874 0.556 0.368 0.157 -0.081 -0.367 -0.718 -1.171 -2.732 -10 ,5159 ,KEBNE ,16675088,Wed Nov 24 02:48:10 CET,Wed Nov 24 04:12:04 CET,0.0 1.221 1.561 1.844 2.101 2.317 2.51 2.685 3.003 3.151 3.288 3.459 3.666 3.781 4.014 4.231 4.426 4.522 4.697 4.856 5.092 5.242 5.393 5.624 5.855 6.068 6.265 6.461 6.715 6.953 7.181 7.447 7.697 7.932 8.185 8.492 8.79 9.071 9.359 9.678 10.002 10.36 10.78 11.164 11.599 12.084 12.608 13.145 13.633 14.017 14.144 13.765 13.176 12.567 11.974 11.332 10.722 10.19 9.757 9.31 8.895 8.503 8.118 7.749 7.412 7.105 6.778 6.486 6.235 5.962 5.664 5.411 5.157 4.896 4.664 4.422 4.195 3.96 3.684 3.486 3.295 3.004 2.801 2.589 2.475 2.235 1.985 1.714 1.567 1.329 1.085 0.9 0.7 0.28 0.035 -0.241 -0.538 -0.886 -1.278 -1.772 -3.244 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_49.txt deleted file mode 100644 index 292b347a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20989 ,KEBNE ,16675109,Wed Nov 24 02:53:19 CET,Wed Nov 24 04:17:28 CET,0.0 1.061 1.456 1.76 2.012 2.226 2.426 2.609 2.909 3.049 3.188 3.348 3.546 3.664 3.871 4.056 4.219 4.299 4.464 4.626 4.867 5.012 5.142 5.324 5.495 5.666 5.847 6.008 6.188 6.365 6.532 6.726 6.905 7.076 7.268 7.481 7.697 7.915 8.123 8.345 8.568 8.789 9.023 9.253 9.526 9.808 10.062 10.293 10.479 10.523 10.312 9.71 9.028 8.364 7.709 7.085 6.539 6.028 5.57 5.118 4.719 4.332 3.966 3.622 3.275 2.954 2.633 2.349 2.097 1.812 1.516 1.28 1.034 0.783 0.583 0.371 0.147 -0.106 -0.405 -0.607 -0.801 -1.118 -1.34 -1.565 -1.681 -1.926 -2.194 -2.502 -2.664 -2.903 -3.147 -3.34 -3.553 -4.06 -4.331 -4.607 -4.906 -5.265 -5.729 -6.448 -10.782 -2 ,13792 ,KEBNE ,16677384,Wed Nov 24 19:31:00 CET,Wed Nov 24 20:58:00 CET,0.0 0.83 1.191 1.494 1.757 1.975 2.164 2.346 2.67 2.809 2.947 3.118 3.318 3.43 3.636 3.815 3.981 4.067 4.24 4.399 4.621 4.764 4.897 5.091 5.275 5.437 5.583 5.727 5.91 6.084 6.253 6.441 6.635 6.829 7.033 7.257 7.463 7.685 7.925 8.165 8.415 8.677 8.958 9.225 9.527 9.839 10.123 10.374 10.601 10.724 10.51 9.915 9.225 8.521 7.87 7.245 6.683 6.171 5.717 5.279 4.896 4.524 4.178 3.832 3.479 3.16 2.833 2.542 2.283 2.006 1.712 1.457 1.177 0.886 0.679 0.473 0.241 -0.002 -0.252 -0.427 -0.621 -0.936 -1.161 -1.411 -1.551 -1.832 -2.122 -2.423 -2.568 -2.82 -3.096 -3.299 -3.512 -3.966 -4.209 -4.483 -4.826 -5.223 -5.683 -6.291 -8.441 -3 ,3435 ,KEBNE ,16677385,Wed Nov 24 19:30:59 CET,Wed Nov 24 20:55:51 CET,0.0 0.871 1.292 1.614 1.879 2.104 2.303 2.478 2.798 2.945 3.08 3.247 3.448 3.56 3.756 3.94 4.114 4.201 4.368 4.525 4.755 4.893 5.017 5.194 5.364 5.539 5.709 5.857 6.047 6.235 6.414 6.622 6.807 6.992 7.203 7.422 7.638 7.866 8.097 8.338 8.576 8.845 9.124 9.364 9.642 9.939 10.24 10.499 10.711 10.821 10.585 9.912 9.218 8.559 7.949 7.342 6.759 6.231 5.766 5.295 4.882 4.487 4.11 3.768 3.438 3.124 2.806 2.508 2.238 1.968 1.695 1.45 1.183 0.921 0.716 0.493 0.254 -0.008 -0.27 -0.445 -0.649 -0.968 -1.183 -1.417 -1.544 -1.808 -2.062 -2.336 -2.491 -2.75 -3.039 -3.242 -3.467 -3.962 -4.218 -4.491 -4.834 -5.241 -5.744 -6.529 -9.279 -4 ,30542 ,KEBNE ,16675112,Wed Nov 24 02:53:19 CET,Wed Nov 24 04:15:30 CET,0.0 1.197 1.663 1.973 2.237 2.479 2.684 2.863 3.168 3.305 3.44 3.599 3.794 3.907 4.117 4.322 4.507 4.592 4.752 4.898 5.1 5.234 5.369 5.546 5.709 5.876 6.027 6.163 6.344 6.518 6.692 6.898 7.084 7.264 7.473 7.693 7.898 8.117 8.345 8.59 8.828 9.068 9.337 9.605 9.902 10.211 10.533 10.825 11.065 11.21 11.023 10.483 9.857 9.207 8.579 7.969 7.42 6.936 6.503 6.018 5.571 5.184 4.826 4.494 4.179 3.874 3.563 3.289 3.043 2.777 2.5 2.263 2.002 1.733 1.521 1.302 1.074 0.84 0.588 0.404 0.213 -0.078 -0.285 -0.506 -0.618 -0.875 -1.16 -1.439 -1.591 -1.847 -2.111 -2.308 -2.52 -2.981 -3.25 -3.549 -3.888 -4.296 -4.846 -5.609 -9.105 -5 ,21609 ,KEBNE ,16677387,Wed Nov 24 19:32:01 CET,Wed Nov 24 20:58:44 CET,0.0 1.014 1.426 1.715 1.963 2.191 2.401 2.584 2.913 3.063 3.199 3.357 3.551 3.662 3.865 4.056 4.237 4.322 4.487 4.65 4.871 5.002 5.125 5.299 5.467 5.63 5.792 5.946 6.137 6.313 6.477 6.674 6.855 7.029 7.229 7.442 7.64 7.859 8.09 8.338 8.586 8.842 9.131 9.402 9.68 9.979 10.322 10.611 10.8 10.839 10.599 10.074 9.444 8.764 8.139 7.526 6.955 6.429 5.958 5.482 5.079 4.7 4.332 3.973 3.623 3.321 3.001 2.705 2.453 2.185 1.894 1.647 1.382 1.11 0.889 0.648 0.409 0.167 -0.087 -0.269 -0.473 -0.803 -1.03 -1.262 -1.374 -1.606 -1.883 -2.209 -2.38 -2.649 -2.919 -3.107 -3.326 -3.806 -4.078 -4.366 -4.71 -5.157 -5.689 -6.465 -9.504 -6 ,10905 ,KEBNE ,16677388,Wed Nov 24 19:37:11 CET,Wed Nov 24 21:03:39 CET,0.0 1.06 1.497 1.795 2.048 2.282 2.479 2.657 2.973 3.119 3.256 3.41 3.607 3.718 3.934 4.128 4.309 4.391 4.551 4.724 4.963 5.098 5.231 5.428 5.616 5.784 5.938 6.09 6.273 6.43 6.587 6.789 6.973 7.135 7.318 7.53 7.728 7.936 8.16 8.393 8.623 8.879 9.144 9.379 9.655 9.938 10.226 10.5 10.711 10.786 10.535 9.922 9.249 8.525 7.849 7.243 6.709 6.19 5.721 5.268 4.87 4.51 4.154 3.793 3.446 3.132 2.82 2.533 2.264 1.987 1.706 1.464 1.216 0.953 0.727 0.481 0.229 -0.024 -0.299 -0.49 -0.685 -1.01 -1.24 -1.471 -1.599 -1.855 -2.104 -2.386 -2.529 -2.759 -2.995 -3.193 -3.393 -3.802 -4.05 -4.321 -4.62 -4.944 -5.356 -6.008 -10.121 -7 ,28678 ,KEBNE ,16677389,Wed Nov 24 19:39:15 CET,Wed Nov 24 21:03:51 CET,0.0 0.769 1.144 1.439 1.705 1.928 2.119 2.307 2.65 2.805 2.94 3.097 3.296 3.418 3.641 3.829 3.996 4.079 4.244 4.403 4.626 4.764 4.888 5.063 5.241 5.406 5.556 5.7 5.898 6.073 6.223 6.413 6.598 6.759 6.926 7.111 7.305 7.53 7.751 7.986 8.215 8.448 8.722 8.975 9.239 9.503 9.767 10.007 10.215 10.3 10.092 9.5 8.828 8.157 7.503 6.859 6.296 5.777 5.275 4.77 4.349 3.965 3.581 3.223 2.892 2.588 2.266 1.971 1.724 1.466 1.187 0.942 0.682 0.412 0.205 -0.027 -0.278 -0.532 -0.807 -1.002 -1.2 -1.511 -1.742 -2.004 -2.14 -2.391 -2.655 -2.955 -3.108 -3.369 -3.646 -3.846 -4.063 -4.526 -4.776 -5.04 -5.356 -5.749 -6.295 -7.085 -9.708 -8 ,3698 ,KEBNE ,16677390,Wed Nov 24 19:42:22 CET,Wed Nov 24 21:12:03 CET,0.0 1.225 1.678 1.987 2.247 2.472 2.673 2.859 3.181 3.323 3.462 3.638 3.839 3.954 4.165 4.36 4.543 4.631 4.804 4.957 5.166 5.293 5.418 5.596 5.769 5.943 6.109 6.264 6.446 6.619 6.785 6.973 7.147 7.324 7.529 7.735 7.919 8.114 8.31 8.526 8.757 9.001 9.269 9.521 9.796 10.084 10.378 10.682 10.934 11.039 10.837 10.257 9.553 8.851 8.228 7.636 7.1 6.606 6.149 5.66 5.23 4.871 4.501 4.141 3.831 3.529 3.207 2.911 2.651 2.38 2.076 1.818 1.553 1.252 1.024 0.811 0.571 0.316 0.072 -0.108 -0.297 -0.595 -0.804 -1.024 -1.148 -1.403 -1.684 -1.993 -2.147 -2.398 -2.63 -2.802 -3.002 -3.446 -3.683 -3.966 -4.322 -4.737 -5.244 -5.923 -8.47 -9 ,2642 ,KEBNE ,16677391,Wed Nov 24 19:44:28 CET,Wed Nov 24 21:06:36 CET,0.0 0.962 1.337 1.637 1.889 2.11 2.306 2.479 2.801 2.947 3.074 3.239 3.433 3.539 3.742 3.92 4.089 4.176 4.334 4.484 4.707 4.845 4.979 5.164 5.334 5.505 5.661 5.807 5.995 6.178 6.356 6.559 6.749 6.926 7.118 7.329 7.526 7.746 7.972 8.193 8.42 8.667 8.958 9.232 9.514 9.802 10.107 10.352 10.56 10.731 10.556 9.972 9.3 8.635 8.05 7.474 6.925 6.434 6.002 5.559 5.153 4.758 4.386 4.037 3.695 3.385 3.059 2.754 2.485 2.206 1.909 1.659 1.406 1.14 0.928 0.707 0.482 0.234 -0.027 -0.203 -0.396 -0.697 -0.899 -1.111 -1.222 -1.461 -1.722 -2.01 -2.165 -2.426 -2.705 -2.895 -3.093 -3.531 -3.784 -4.069 -4.418 -4.818 -5.288 -6.0 -8.384 -10 ,5110 ,KEBNE ,16675118,Wed Nov 24 02:55:23 CET,Wed Nov 24 04:18:01 CET,0.0 0.969 1.37 1.699 1.977 2.201 2.397 2.568 2.879 3.011 3.136 3.3 3.502 3.612 3.81 3.988 4.154 4.242 4.41 4.563 4.779 4.906 5.028 5.213 5.397 5.572 5.739 5.895 6.092 6.276 6.446 6.646 6.832 7.011 7.218 7.442 7.653 7.884 8.123 8.354 8.582 8.826 9.11 9.389 9.677 9.956 10.226 10.476 10.705 10.808 10.567 9.969 9.335 8.721 8.102 7.48 6.893 6.38 5.935 5.474 5.078 4.693 4.304 3.948 3.619 3.317 2.978 2.669 2.414 2.156 1.882 1.645 1.402 1.128 0.906 0.681 0.431 0.181 -0.066 -0.24 -0.436 -0.757 -0.972 -1.205 -1.326 -1.586 -1.869 -2.146 -2.301 -2.561 -2.812 -2.992 -3.19 -3.627 -3.896 -4.186 -4.482 -4.861 -5.312 -5.956 -9.863 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_62.txt deleted file mode 100644 index c04f1e91..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14651 ,KEBNE ,17023889,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:05:19 CET,0.0 0.919 1.3 1.622 1.874 2.1 2.307 2.505 2.84 2.986 3.126 3.32 3.536 3.654 3.884 4.101 4.301 4.398 4.588 4.778 5.046 5.213 5.371 5.594 5.809 6.005 6.191 6.376 6.626 6.861 7.073 7.336 7.592 7.835 8.116 8.438 8.754 9.091 9.445 9.818 10.205 10.656 11.168 11.653 12.216 12.841 13.561 14.365 15.234 16.15 17.044 17.439 17.49 17.315 17.004 16.683 16.369 16.055 15.782 15.515 15.26 15.01 14.753 14.484 14.223 13.984 13.711 13.456 13.245 13.016 12.772 12.568 12.356 12.132 11.95 11.749 11.546 11.346 11.122 10.96 10.792 10.526 10.342 10.157 10.053 9.828 9.593 9.338 9.208 8.995 8.764 8.59 8.403 8.005 7.787 7.536 7.234 6.921 6.527 5.961 4.114 -2 ,6934 ,KEBNE ,17023890,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:06:48 CET,0.0 1.135 1.515 1.843 2.142 2.389 2.603 2.792 3.127 3.281 3.429 3.628 3.845 3.973 4.204 4.42 4.624 4.717 4.899 5.085 5.34 5.492 5.633 5.844 6.057 6.264 6.458 6.642 6.898 7.151 7.382 7.647 7.907 8.155 8.43 8.744 9.054 9.377 9.721 10.098 10.484 10.928 11.438 11.944 12.545 13.198 13.901 14.644 15.512 16.463 17.418 17.966 18.023 17.875 17.64 17.322 17.001 16.677 16.384 16.071 15.771 15.493 15.196 14.936 14.711 14.461 14.172 13.926 13.712 13.484 13.236 13.022 12.803 12.574 12.384 12.175 11.95 11.727 11.507 11.349 11.176 10.901 10.702 10.493 10.389 10.179 9.949 9.708 9.575 9.353 9.099 8.918 8.74 8.342 8.085 7.814 7.54 7.205 6.787 6.212 4.581 -3 ,23242 ,KEBNE ,17023891,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:05:25 CET,0.0 0.841 1.218 1.493 1.737 1.963 2.172 2.362 2.694 2.84 2.981 3.163 3.372 3.494 3.736 3.971 4.186 4.289 4.482 4.661 4.922 5.086 5.243 5.472 5.684 5.889 6.088 6.279 6.517 6.754 6.991 7.276 7.545 7.787 8.077 8.397 8.689 9.013 9.36 9.733 10.12 10.546 11.035 11.527 12.102 12.734 13.467 14.252 15.101 15.997 16.83 17.203 17.206 17.09 16.897 16.627 16.299 15.98 15.682 15.343 15.018 14.728 14.461 14.191 13.926 13.676 13.409 13.177 12.972 12.737 12.502 12.317 12.105 11.876 11.702 11.519 11.325 11.121 10.899 10.739 10.566 10.281 10.084 9.878 9.772 9.56 9.317 9.043 8.906 8.686 8.453 8.289 8.11 7.699 7.474 7.222 6.931 6.619 6.255 5.683 3.788 -4 ,24474 ,KEBNE ,17023892,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:07:12 CET,0.0 1.176 1.592 1.902 2.167 2.388 2.585 2.761 3.065 3.217 3.367 3.573 3.794 3.919 4.142 4.353 4.565 4.669 4.857 5.027 5.275 5.44 5.597 5.825 6.039 6.239 6.432 6.619 6.856 7.09 7.317 7.601 7.87 8.116 8.402 8.715 9.011 9.339 9.699 10.09 10.489 10.932 11.44 11.934 12.503 13.124 13.867 14.669 15.539 16.47 17.273 17.58 17.583 17.452 17.199 16.866 16.535 16.195 15.879 15.561 15.282 15.013 14.731 14.478 14.248 14.033 13.784 13.521 13.297 13.067 12.824 12.629 12.418 12.189 12.004 11.79 11.573 11.355 11.119 10.954 10.773 10.491 10.301 10.106 10.002 9.777 9.542 9.288 9.15 8.924 8.671 8.509 8.339 7.925 7.691 7.442 7.167 6.846 6.455 5.917 3.911 -5 ,30391 ,KEBNE ,17023893,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:05:25 CET,0.0 1.072 1.506 1.809 2.101 2.368 2.579 2.752 3.055 3.202 3.347 3.541 3.753 3.873 4.097 4.3 4.501 4.605 4.8 4.97 5.21 5.365 5.522 5.757 5.966 6.16 6.347 6.528 6.761 6.97 7.179 7.447 7.7 7.934 8.199 8.523 8.831 9.146 9.483 9.864 10.265 10.699 11.189 11.668 12.253 12.885 13.603 14.385 15.233 16.128 16.927 17.315 17.369 17.205 16.954 16.677 16.377 16.068 15.783 15.482 15.183 14.868 14.559 14.302 14.072 13.832 13.571 13.327 13.113 12.875 12.601 12.39 12.175 11.938 11.748 11.549 11.352 11.137 10.892 10.726 10.562 10.277 10.073 9.874 9.767 9.542 9.295 9.039 8.911 8.701 8.483 8.315 8.134 7.73 7.518 7.276 6.977 6.654 6.266 5.738 3.987 -6 ,5696 ,KEBNE ,17023894,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:06:42 CET,0.0 1.119 1.538 1.817 2.075 2.314 2.513 2.684 3.016 3.179 3.331 3.514 3.719 3.845 4.086 4.3 4.513 4.617 4.798 4.979 5.249 5.422 5.589 5.808 6.013 6.209 6.4 6.599 6.853 7.086 7.3 7.554 7.806 8.056 8.346 8.665 8.956 9.277 9.636 10.017 10.404 10.842 11.352 11.866 12.45 13.062 13.765 14.536 15.403 16.337 17.232 17.699 17.769 17.6 17.287 16.944 16.638 16.339 16.042 15.729 15.46 15.199 14.928 14.653 14.388 14.148 13.887 13.65 13.441 13.211 12.965 12.764 12.551 12.324 12.142 11.954 11.744 11.509 11.284 11.146 10.994 10.733 10.544 10.337 10.233 10.015 9.78 9.53 9.391 9.173 8.934 8.75 8.567 8.189 7.957 7.686 7.374 7.033 6.664 6.142 4.216 -7 ,8460 ,KEBNE ,17023895,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:05:16 CET,0.0 0.991 1.44 1.763 2.023 2.268 2.5 2.701 3.039 3.198 3.358 3.561 3.766 3.882 4.106 4.317 4.512 4.601 4.777 4.951 5.202 5.356 5.502 5.72 5.923 6.113 6.307 6.493 6.728 6.957 7.181 7.445 7.692 7.942 8.234 8.557 8.859 9.187 9.536 9.903 10.295 10.717 11.197 11.687 12.241 12.826 13.527 14.33 15.157 16.043 16.946 17.248 17.162 16.966 16.702 16.376 16.037 15.721 15.429 15.121 14.836 14.556 14.27 13.999 13.742 13.498 13.233 12.976 12.751 12.531 12.31 12.107 11.894 11.665 11.479 11.289 11.094 10.872 10.636 10.482 10.328 10.072 9.881 9.677 9.569 9.351 9.119 8.847 8.703 8.485 8.256 8.088 7.908 7.534 7.302 7.018 6.717 6.396 6.002 5.491 3.92 -8 ,376 ,KEBNE ,17023896,Wed Dec 22 08:42:52 CET,Wed Dec 22 10:05:27 CET,0.0 1.306 1.718 2.017 2.278 2.51 2.713 2.895 3.231 3.386 3.536 3.724 3.926 4.046 4.274 4.48 4.688 4.79 4.972 5.146 5.4 5.562 5.714 5.945 6.163 6.365 6.564 6.753 6.993 7.229 7.458 7.722 7.969 8.202 8.474 8.788 9.087 9.409 9.761 10.138 10.531 10.954 11.446 11.963 12.53 13.118 13.775 14.525 15.389 16.283 17.123 17.515 17.538 17.386 17.133 16.832 16.514 16.169 15.834 15.517 15.239 14.976 14.702 14.412 14.137 13.881 13.61 13.372 13.166 12.952 12.716 12.504 12.283 12.053 11.876 11.694 11.498 11.29 11.062 10.904 10.745 10.501 10.317 10.114 10.011 9.791 9.558 9.313 9.177 8.955 8.711 8.539 8.356 7.956 7.739 7.503 7.222 6.89 6.497 5.994 3.865 -9 ,176 ,KEBNE ,17023897,Wed Dec 22 08:42:52 CET,Wed Dec 22 10:05:28 CET,0.0 0.962 1.372 1.686 1.959 2.199 2.409 2.595 2.929 3.088 3.251 3.455 3.662 3.79 4.036 4.261 4.455 4.544 4.728 4.907 5.147 5.304 5.465 5.707 5.933 6.132 6.31 6.48 6.706 6.932 7.157 7.429 7.692 7.946 8.236 8.552 8.853 9.187 9.54 9.914 10.313 10.755 11.255 11.74 12.324 12.966 13.651 14.422 15.3 16.234 17.195 17.715 17.797 17.703 17.486 17.208 16.931 16.636 16.35 16.04 15.752 15.492 15.221 14.951 14.693 14.453 14.2 13.95 13.719 13.486 13.244 13.025 12.798 12.565 12.38 12.185 11.976 11.757 11.515 11.342 11.176 10.928 10.757 10.575 10.479 10.268 10.034 9.778 9.639 9.417 9.197 9.035 8.857 8.484 8.278 8.052 7.825 7.57 7.218 6.669 4.431 -10 ,6327 ,KEBNE ,17023898,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:05:25 CET,0.0 1.04 1.463 1.784 2.077 2.306 2.526 2.747 3.122 3.272 3.403 3.577 3.78 3.892 4.1 4.301 4.498 4.597 4.792 4.983 5.252 5.416 5.562 5.78 5.989 6.18 6.369 6.561 6.809 7.038 7.266 7.542 7.801 8.05 8.323 8.63 8.931 9.243 9.579 9.947 10.339 10.785 11.266 11.735 12.301 12.905 13.613 14.41 15.288 16.216 17.105 17.604 17.643 17.401 17.095 16.833 16.539 16.206 15.915 15.614 15.317 15.034 14.753 14.492 14.248 13.997 13.731 13.489 13.265 13.019 12.763 12.56 12.338 12.1 11.915 11.724 11.54 11.352 11.128 10.969 10.806 10.533 10.34 10.132 10.025 9.803 9.576 9.328 9.192 8.981 8.77 8.611 8.421 8.0 7.78 7.537 7.263 6.935 6.522 5.973 4.59 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_63.txt deleted file mode 100644 index 03b31ade..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29452 ,KEBNE ,17069476,Fri Dec 24 05:28:26 CET,Fri Dec 24 06:52:50 CET,0.0 1.008 1.391 1.672 1.898 2.1 2.276 2.434 2.733 2.872 3.002 3.173 3.371 3.481 3.695 3.896 4.078 4.162 4.333 4.496 4.731 4.887 5.038 5.258 5.465 5.666 5.85 6.018 6.228 6.431 6.627 6.855 7.069 7.277 7.527 7.802 8.056 8.318 8.599 8.895 9.192 9.544 9.956 10.328 10.752 11.241 11.747 12.29 12.876 13.399 13.796 13.793 13.49 13.108 12.718 12.324 11.924 11.543 11.195 10.839 10.539 10.244 9.927 9.614 9.343 9.116 8.865 8.612 8.392 8.164 7.926 7.723 7.509 7.274 7.086 6.893 6.678 6.455 6.235 6.083 5.923 5.681 5.513 5.331 5.236 5.033 4.804 4.552 4.422 4.207 3.991 3.848 3.7 3.343 3.127 2.895 2.616 2.292 1.897 1.364 -0.78 -2 ,24600 ,KEBNE ,17069477,Fri Dec 24 05:30:34 CET,Fri Dec 24 06:54:19 CET,0.0 1.183 1.71 2.066 2.351 2.587 2.778 2.951 3.275 3.421 3.561 3.733 3.934 4.057 4.29 4.513 4.722 4.82 5.004 5.169 5.401 5.543 5.679 5.88 6.074 6.266 6.442 6.606 6.825 7.037 7.237 7.466 7.676 7.88 8.131 8.403 8.64 8.901 9.19 9.507 9.821 10.149 10.517 10.875 11.284 11.718 12.238 12.79 13.32 13.846 14.312 14.387 14.152 13.777 13.392 12.997 12.591 12.235 11.917 11.547 11.217 10.935 10.67 10.386 10.095 9.839 9.571 9.322 9.099 8.875 8.646 8.442 8.219 7.986 7.808 7.625 7.414 7.186 6.977 6.834 6.688 6.451 6.269 6.067 5.954 5.714 5.485 5.254 5.128 4.921 4.713 4.542 4.365 3.982 3.765 3.523 3.244 2.933 2.568 2.041 0.006 -3 ,20221 ,KEBNE ,17069480,Fri Dec 24 05:44:11 CET,Fri Dec 24 07:06:27 CET,0.0 1.006 1.43 1.747 2.016 2.237 2.437 2.627 2.966 3.112 3.237 3.413 3.631 3.761 4.003 4.225 4.429 4.521 4.685 4.848 5.087 5.234 5.367 5.559 5.75 5.937 6.116 6.286 6.501 6.702 6.902 7.145 7.373 7.579 7.81 8.081 8.336 8.597 8.864 9.142 9.448 9.785 10.175 10.571 11.017 11.503 12.039 12.605 13.183 13.675 13.962 13.89 13.6 13.253 12.852 12.391 11.99 11.641 11.317 10.965 10.654 10.364 10.073 9.791 9.515 9.262 9.001 8.769 8.557 8.326 8.085 7.883 7.67 7.437 7.252 7.056 6.861 6.662 6.436 6.279 6.125 5.88 5.7 5.506 5.406 5.188 4.953 4.712 4.58 4.361 4.143 3.979 3.807 3.466 3.258 3.017 2.761 2.444 2.085 1.644 -0.649 -4 ,26093 ,KEBNE ,17069481,Fri Dec 24 05:49:29 CET,Fri Dec 24 07:11:52 CET,0.0 1.073 1.475 1.773 2.041 2.281 2.489 2.682 3.046 3.211 3.36 3.549 3.75 3.864 4.092 4.314 4.515 4.602 4.771 4.939 5.187 5.341 5.481 5.692 5.904 6.098 6.283 6.454 6.666 6.869 7.058 7.28 7.489 7.691 7.931 8.192 8.44 8.722 9.038 9.352 9.663 10.019 10.409 10.782 11.198 11.615 12.108 12.626 13.143 13.682 14.02 13.919 13.624 13.232 12.83 12.436 12.051 11.678 11.328 10.951 10.608 10.299 10.006 9.73 9.458 9.197 8.922 8.667 8.43 8.193 7.96 7.744 7.529 7.323 7.154 6.975 6.786 6.574 6.347 6.186 6.025 5.79 5.624 5.444 5.348 5.148 4.922 4.678 4.552 4.332 4.136 3.994 3.846 3.525 3.329 3.123 2.894 2.58 2.196 1.671 -0.344 -5 ,12734 ,KEBNE ,17069484,Fri Dec 24 05:53:48 CET,Fri Dec 24 07:17:40 CET,0.0 0.975 1.334 1.619 1.888 2.115 2.297 2.459 2.761 2.91 3.062 3.258 3.454 3.563 3.77 3.97 4.164 4.254 4.425 4.586 4.814 4.966 5.113 5.323 5.523 5.714 5.888 6.049 6.257 6.455 6.639 6.859 7.075 7.288 7.519 7.777 8.033 8.296 8.57 8.866 9.182 9.531 9.926 10.312 10.737 11.178 11.638 12.129 12.67 13.223 13.603 13.59 13.39 13.068 12.643 12.217 11.833 11.442 11.095 10.723 10.388 10.082 9.783 9.502 9.236 8.992 8.728 8.48 8.256 8.023 7.788 7.587 7.372 7.136 6.965 6.787 6.593 6.399 6.193 6.047 5.888 5.648 5.482 5.292 5.189 4.98 4.759 4.523 4.402 4.186 3.948 3.772 3.583 3.171 2.947 2.714 2.434 2.101 1.694 1.116 -0.57 -6 ,24082 ,KEBNE ,17069485,Fri Dec 24 05:54:56 CET,Fri Dec 24 07:17:18 CET,0.0 0.885 1.296 1.656 1.953 2.188 2.394 2.583 2.912 3.069 3.208 3.366 3.567 3.677 3.9 4.118 4.31 4.398 4.568 4.729 4.97 5.122 5.262 5.469 5.662 5.843 6.01 6.171 6.384 6.588 6.778 7.004 7.232 7.443 7.667 7.916 8.163 8.451 8.746 9.05 9.383 9.732 10.112 10.512 11.001 11.492 11.965 12.496 13.054 13.516 13.861 13.807 13.503 13.1 12.647 12.234 11.865 11.49 11.142 10.807 10.495 10.18 9.881 9.604 9.327 9.086 8.838 8.579 8.355 8.135 7.898 7.695 7.488 7.256 7.071 6.882 6.676 6.455 6.242 6.094 5.932 5.678 5.506 5.326 5.234 5.03 4.81 4.583 4.46 4.25 4.028 3.871 3.714 3.364 3.167 2.944 2.691 2.414 2.085 1.654 -0.128 -7 ,8254 ,KEBNE ,17069488,Fri Dec 24 05:57:05 CET,Fri Dec 24 07:21:09 CET,0.0 1.243 1.654 1.954 2.227 2.474 2.683 2.857 3.18 3.339 3.492 3.687 3.899 4.026 4.27 4.477 4.663 4.751 4.925 5.097 5.331 5.48 5.619 5.817 6.008 6.186 6.355 6.523 6.75 6.959 7.153 7.382 7.597 7.805 8.053 8.32 8.571 8.85 9.152 9.471 9.779 10.121 10.54 10.938 11.385 11.86 12.338 12.813 13.304 13.782 14.138 14.105 13.815 13.464 13.09 12.699 12.327 11.948 11.618 11.252 10.923 10.627 10.321 10.033 9.757 9.523 9.276 9.038 8.831 8.614 8.384 8.187 7.968 7.737 7.562 7.37 7.172 6.966 6.744 6.589 6.436 6.191 6.006 5.818 5.729 5.529 5.323 5.112 4.989 4.779 4.575 4.419 4.254 3.894 3.683 3.43 3.153 2.858 2.455 1.844 0.095 -8 ,13430 ,KEBNE ,17069490,Fri Dec 24 05:57:05 CET,Fri Dec 24 07:20:33 CET,0.0 1.18 1.669 1.988 2.255 2.492 2.682 2.866 3.225 3.37 3.504 3.688 3.9 4.01 4.205 4.402 4.604 4.701 4.859 5.014 5.24 5.377 5.514 5.711 5.904 6.093 6.275 6.455 6.683 6.893 7.091 7.323 7.545 7.755 7.987 8.241 8.475 8.718 8.991 9.288 9.585 9.925 10.307 10.681 11.106 11.543 12.036 12.567 13.101 13.563 13.856 13.728 13.338 12.925 12.546 12.174 11.791 11.412 11.08 10.731 10.423 10.133 9.846 9.556 9.271 9.02 8.749 8.499 8.265 8.018 7.796 7.616 7.418 7.196 7.007 6.825 6.643 6.43 6.208 6.06 5.913 5.688 5.525 5.342 5.246 5.049 4.83 4.582 4.451 4.235 4.021 3.868 3.693 3.299 3.073 2.826 2.561 2.259 1.909 1.412 0.055 -9 ,16494 ,KEBNE ,17069491,Fri Dec 24 05:58:08 CET,Fri Dec 24 07:20:17 CET,0.0 1.421 1.884 2.189 2.458 2.689 2.89 3.083 3.413 3.557 3.686 3.859 4.061 4.172 4.376 4.568 4.75 4.841 5.018 5.181 5.412 5.562 5.707 5.917 6.113 6.293 6.476 6.655 6.879 7.107 7.304 7.517 7.732 7.93 8.158 8.411 8.648 8.906 9.172 9.479 9.794 10.136 10.517 10.871 11.289 11.727 12.205 12.722 13.274 13.809 14.179 14.105 13.802 13.403 12.983 12.602 12.231 11.849 11.518 11.181 10.874 10.584 10.283 10.001 9.737 9.482 9.218 8.99 8.785 8.56 8.321 8.118 7.906 7.69 7.521 7.342 7.154 6.948 6.728 6.578 6.421 6.157 5.971 5.774 5.667 5.447 5.225 4.991 4.854 4.624 4.383 4.218 4.043 3.639 3.417 3.182 2.909 2.589 2.199 1.665 -0.057 -10 ,14180 ,KEBNE ,17069494,Fri Dec 24 06:03:25 CET,Fri Dec 24 07:25:56 CET,0.0 1.133 1.522 1.84 2.105 2.328 2.523 2.712 3.044 3.188 3.331 3.511 3.72 3.849 4.077 4.279 4.469 4.559 4.73 4.897 5.141 5.301 5.444 5.634 5.821 6.001 6.177 6.345 6.572 6.79 6.983 7.219 7.447 7.664 7.911 8.181 8.435 8.689 8.959 9.261 9.558 9.878 10.261 10.643 11.075 11.522 12.024 12.603 13.185 13.731 14.129 14.004 13.678 13.285 12.877 12.468 12.069 11.688 11.326 10.956 10.644 10.364 10.071 9.788 9.523 9.27 8.995 8.731 8.488 8.249 8.017 7.822 7.622 7.402 7.213 7.021 6.817 6.603 6.384 6.234 6.081 5.836 5.663 5.472 5.376 5.189 4.988 4.764 4.647 4.443 4.265 4.133 3.972 3.594 3.383 3.155 2.897 2.576 2.168 1.626 -0.229 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_29.txt deleted file mode 100644 index d57fc37e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29068 ,KEBNE ,16677393,Wed Nov 24 19:44:25 CET,Wed Nov 24 21:12:24 CET,0.0 0.903 1.302 1.605 1.872 2.126 2.361 2.574 2.953 3.139 3.323 3.582 3.839 4.005 4.32 4.614 4.897 5.041 5.321 5.597 5.992 6.239 6.49 6.861 7.221 7.594 7.968 8.31 8.741 9.177 9.615 10.144 10.662 11.166 11.761 12.443 13.094 13.825 14.633 15.52 16.491 17.613 18.945 20.328 22.006 23.914 26.187 28.897 32.225 36.434 42.134 47.308 50.585 52.933 54.667 55.971 56.914 57.657 58.216 58.722 59.083 59.329 59.532 59.701 59.856 59.957 60.023 60.055 60.069 60.098 60.126 60.152 60.163 60.147 60.126 60.087 60.034 59.98 59.902 59.836 59.772 59.667 59.569 59.434 59.365 59.228 59.077 58.888 58.78 58.649 58.417 58.269 58.099 57.693 57.445 57.166 56.868 56.511 55.986 55.141 50.727 -2 ,10774 ,KEBNE ,16677394,Wed Nov 24 19:45:26 CET,Wed Nov 24 21:11:03 CET,0.0 0.869 1.269 1.597 1.891 2.14 2.375 2.601 3.004 3.196 3.38 3.632 3.887 4.056 4.381 4.685 4.982 5.129 5.409 5.673 6.058 6.31 6.556 6.92 7.277 7.626 7.968 8.307 8.753 9.192 9.623 10.152 10.669 11.183 11.779 12.45 13.107 13.843 14.668 15.567 16.544 17.653 18.968 20.343 21.98 23.917 26.278 28.997 32.342 36.587 42.151 47.277 50.601 52.945 54.664 56.003 57.007 57.779 58.373 58.898 59.288 59.592 59.841 60.046 60.208 60.328 60.443 60.519 60.562 60.598 60.612 60.602 60.59 60.571 60.546 60.514 60.465 60.406 60.347 60.307 60.25 60.112 60.002 59.87 59.8 59.657 59.492 59.3 59.196 59.053 58.792 58.635 58.473 58.106 57.873 57.571 57.214 56.796 56.273 55.466 51.833 -3 ,1716 ,KEBNE ,16677395,Wed Nov 24 19:46:32 CET,Wed Nov 24 21:12:23 CET,0.0 1.115 1.508 1.836 2.105 2.339 2.565 2.782 3.188 3.373 3.551 3.813 4.067 4.224 4.533 4.836 5.126 5.266 5.542 5.809 6.202 6.462 6.719 7.091 7.443 7.79 8.141 8.496 8.946 9.356 9.768 10.296 10.809 11.309 11.897 12.575 13.257 14.019 14.86 15.758 16.712 17.829 19.177 20.573 22.24 24.165 26.477 29.177 32.496 36.739 42.318 47.422 50.77 53.119 54.787 56.076 57.083 57.856 58.421 58.899 59.265 59.546 59.768 59.953 60.115 60.227 60.301 60.37 60.409 60.405 60.391 60.377 60.341 60.284 60.236 60.172 60.085 59.998 59.898 59.826 59.749 59.611 59.502 59.376 59.312 59.171 59.007 58.822 58.718 58.57 58.327 58.192 58.038 57.645 57.422 57.145 56.793 56.359 55.796 54.972 51.609 -4 ,23203 ,KEBNE ,16677396,Wed Nov 24 19:47:29 CET,Wed Nov 24 21:11:46 CET,0.0 0.997 1.441 1.776 2.047 2.293 2.517 2.729 3.146 3.347 3.535 3.791 4.047 4.221 4.555 4.863 5.15 5.287 5.569 5.855 6.253 6.5 6.746 7.123 7.487 7.832 8.167 8.509 8.961 9.384 9.804 10.33 10.84 11.337 11.925 12.594 13.242 13.973 14.794 15.689 16.634 17.727 19.072 20.475 22.157 24.123 26.436 29.095 32.375 36.58 42.086 47.14 50.451 52.788 54.515 55.854 56.894 57.673 58.25 58.751 59.097 59.386 59.643 59.806 59.935 60.056 60.149 60.201 60.225 60.227 60.201 60.173 60.16 60.144 60.107 60.05 59.968 59.885 59.809 59.741 59.661 59.55 59.469 59.371 59.316 59.186 59.027 58.848 58.742 58.596 58.372 58.228 58.08 57.73 57.501 57.212 56.85 56.409 55.85 55.01 50.25 -5 ,26870 ,KEBNE ,16677397,Wed Nov 24 19:47:29 CET,Wed Nov 24 21:12:57 CET,0.0 1.129 1.579 1.897 2.177 2.427 2.665 2.896 3.327 3.521 3.698 3.95 4.214 4.389 4.709 5.014 5.317 5.465 5.751 6.022 6.409 6.664 6.908 7.265 7.622 7.972 8.323 8.668 9.108 9.539 9.965 10.488 11.005 11.512 12.097 12.773 13.426 14.141 14.924 15.778 16.724 17.81 19.118 20.486 22.131 24.072 26.342 28.98 32.323 36.551 42.2 47.419 50.745 53.071 54.758 56.047 57.016 57.758 58.324 58.846 59.251 59.568 59.856 60.099 60.282 60.44 60.558 60.619 60.669 60.714 60.727 60.714 60.69 60.651 60.635 60.615 60.574 60.517 60.449 60.396 60.335 60.212 60.112 60.01 59.96 59.84 59.701 59.534 59.442 59.319 59.124 58.984 58.823 58.425 58.181 57.909 57.595 57.212 56.707 56.0 53.096 -6 ,14578 ,KEBNE ,16677398,Wed Nov 24 19:49:33 CET,Wed Nov 24 21:18:22 CET,0.0 1.156 1.583 1.9 2.175 2.444 2.684 2.905 3.328 3.515 3.696 3.949 4.201 4.36 4.666 4.965 5.263 5.407 5.686 5.955 6.347 6.614 6.873 7.238 7.591 7.947 8.296 8.638 9.089 9.517 9.936 10.452 10.967 11.469 12.049 12.726 13.375 14.085 14.887 15.777 16.748 17.857 19.163 20.524 22.163 24.007 26.208 28.882 32.182 36.312 41.88 47.04 50.43 52.823 54.524 55.83 56.842 57.65 58.274 58.827 59.22 59.499 59.741 59.96 60.135 60.261 60.361 60.448 60.51 60.541 60.533 60.514 60.503 60.475 60.44 60.397 60.345 60.304 60.252 60.183 60.101 59.975 59.869 59.755 59.694 59.563 59.399 59.197 59.106 58.979 58.763 58.612 58.439 58.05 57.82 57.539 57.192 56.759 56.199 55.373 51.777 -7 ,29434 ,KEBNE ,16677399,Wed Nov 24 19:49:33 CET,Wed Nov 24 21:12:51 CET,0.0 0.844 1.268 1.587 1.865 2.129 2.373 2.598 3.025 3.221 3.399 3.659 3.919 4.078 4.393 4.694 4.975 5.113 5.392 5.662 6.074 6.354 6.621 7.009 7.399 7.79 8.158 8.506 8.963 9.417 9.861 10.395 10.925 11.433 12.022 12.719 13.411 14.176 14.997 15.891 16.866 17.992 19.348 20.749 22.418 24.344 26.61 29.27 32.634 36.875 42.469 47.626 51.01 53.401 55.107 56.414 57.416 58.191 58.756 59.24 59.608 59.909 60.152 60.329 60.448 60.56 60.661 60.72 60.758 60.771 60.763 60.756 60.753 60.736 60.703 60.66 60.62 60.571 60.494 60.429 60.369 60.247 60.143 60.043 59.982 59.846 59.702 59.514 59.404 59.261 59.03 58.87 58.694 58.313 58.094 57.845 57.534 57.146 56.583 55.686 52.139 -8 ,14407 ,KEBNE ,16677400,Wed Nov 24 19:49:33 CET,Wed Nov 24 21:14:04 CET,0.0 0.856 1.217 1.53 1.822 2.08 2.314 2.544 2.958 3.142 3.319 3.586 3.849 4.006 4.315 4.625 4.924 5.069 5.349 5.613 6.005 6.265 6.512 6.876 7.242 7.599 7.951 8.295 8.742 9.178 9.598 10.117 10.629 11.122 11.706 12.385 13.037 13.757 14.554 15.421 16.372 17.472 18.796 20.166 21.8 23.693 26.003 28.722 32.053 36.249 41.812 46.989 50.324 52.704 54.483 55.792 56.724 57.472 58.085 58.63 59.024 59.344 59.596 59.806 59.989 60.103 60.18 60.234 60.273 60.295 60.302 60.293 60.269 60.213 60.152 60.094 60.031 59.939 59.814 59.727 59.636 59.482 59.379 59.273 59.216 59.078 58.911 58.731 58.63 58.485 58.268 58.121 57.945 57.54 57.294 57.012 56.71 56.358 55.87 55.057 51.252 -9 ,12539 ,KEBNE ,16677401,Wed Nov 24 19:50:35 CET,Wed Nov 24 21:14:28 CET,0.0 0.705 1.048 1.355 1.637 1.887 2.117 2.336 2.758 2.956 3.141 3.394 3.649 3.81 4.123 4.426 4.712 4.853 5.136 5.409 5.806 6.063 6.32 6.695 7.048 7.391 7.732 8.064 8.494 8.928 9.358 9.876 10.381 10.861 11.424 12.08 12.716 13.432 14.208 15.062 15.976 17.017 18.3 19.633 21.235 23.1 25.318 27.947 31.287 35.476 40.963 46.076 49.36 51.678 53.407 54.736 55.741 56.499 57.047 57.509 57.881 58.207 58.478 58.706 58.881 59.015 59.13 59.196 59.239 59.27 59.267 59.254 59.257 59.241 59.203 59.146 59.085 59.02 58.95 58.895 58.825 58.698 58.605 58.489 58.423 58.295 58.142 57.969 57.872 57.73 57.493 57.349 57.184 56.804 56.586 56.311 55.97 55.55 54.993 54.165 50.715 -10 ,18181 ,KEBNE ,16677402,Wed Nov 24 19:50:35 CET,Wed Nov 24 21:15:07 CET,0.0 0.846 1.265 1.606 1.895 2.153 2.387 2.604 2.999 3.188 3.375 3.634 3.891 4.056 4.363 4.644 4.917 5.054 5.331 5.614 6.04 6.314 6.576 6.952 7.319 7.683 8.043 8.392 8.847 9.293 9.729 10.272 10.813 11.336 11.941 12.622 13.288 14.014 14.807 15.674 16.601 17.698 19.024 20.396 22.068 23.995 26.285 28.985 32.309 36.497 42.002 47.083 50.352 52.631 54.288 55.569 56.547 57.326 57.942 58.482 58.877 59.167 59.406 59.618 59.807 59.96 60.068 60.119 60.15 60.174 60.155 60.139 60.12 60.087 60.064 60.002 59.924 59.86 59.78 59.72 59.658 59.554 59.464 59.344 59.281 59.152 58.995 58.815 58.72 58.587 58.367 58.224 58.06 57.655 57.422 57.15 56.804 56.39 55.863 55.055 51.628 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_35.txt deleted file mode 100644 index a5aae003..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1904 ,KEBNE ,16677403,Wed Nov 24 19:50:35 CET,Wed Nov 24 21:17:24 CET,0.0 0.98 1.371 1.638 1.875 2.072 2.246 2.414 2.712 2.856 2.995 3.134 3.327 3.431 3.628 3.82 3.997 4.078 4.238 4.389 4.6 4.738 4.871 5.061 5.246 5.42 5.577 5.731 5.934 6.119 6.305 6.542 6.769 6.983 7.229 7.51 7.766 8.036 8.337 8.651 8.968 9.333 9.746 10.139 10.563 11.001 11.524 12.125 12.743 13.333 13.843 13.927 13.744 13.437 13.107 12.784 12.469 12.121 11.771 11.408 11.083 10.776 10.481 10.189 9.915 9.662 9.362 9.091 8.847 8.596 8.339 8.111 7.875 7.616 7.406 7.192 6.97 6.712 6.433 6.245 6.058 5.775 5.57 5.342 5.221 4.966 4.692 4.405 4.254 4.023 3.783 3.595 3.405 2.957 2.67 2.348 1.991 1.536 0.954 0.095 -3.179 -2 ,29413 ,KEBNE ,16677404,Wed Nov 24 19:51:37 CET,Wed Nov 24 21:16:03 CET,0.0 0.937 1.305 1.584 1.808 1.995 2.167 2.323 2.598 2.735 2.861 3.003 3.203 3.307 3.499 3.677 3.855 3.943 4.101 4.26 4.499 4.633 4.754 4.943 5.13 5.292 5.45 5.614 5.828 6.024 6.209 6.435 6.655 6.867 7.108 7.377 7.627 7.907 8.207 8.515 8.832 9.183 9.603 10.019 10.477 10.943 11.452 12.024 12.626 13.218 13.726 13.86 13.746 13.491 13.18 12.848 12.501 12.139 11.808 11.416 11.048 10.766 10.485 10.182 9.893 9.621 9.323 9.039 8.8 8.553 8.307 8.122 7.912 7.654 7.439 7.235 7.023 6.797 6.558 6.378 6.197 5.905 5.692 5.466 5.341 5.09 4.827 4.52 4.351 4.097 3.822 3.63 3.405 2.891 2.614 2.291 1.896 1.414 0.811 -0.063 -2.947 -3 ,30132 ,KEBNE ,16677405,Wed Nov 24 19:56:49 CET,Wed Nov 24 21:23:15 CET,0.0 0.936 1.286 1.548 1.758 1.947 2.122 2.282 2.579 2.709 2.837 3.0 3.198 3.306 3.513 3.696 3.859 3.939 4.095 4.246 4.47 4.614 4.747 4.935 5.112 5.282 5.443 5.601 5.801 5.99 6.175 6.407 6.633 6.837 7.07 7.331 7.588 7.861 8.143 8.442 8.746 9.062 9.433 9.808 10.251 10.733 11.239 11.812 12.44 13.076 13.602 13.687 13.495 13.202 12.87 12.534 12.165 11.836 11.567 11.253 10.97 10.693 10.423 10.131 9.854 9.62 9.359 9.11 8.863 8.621 8.379 8.161 7.927 7.69 7.501 7.3 7.097 6.876 6.642 6.47 6.288 5.985 5.76 5.536 5.413 5.161 4.903 4.609 4.443 4.184 3.903 3.708 3.481 2.96 2.682 2.367 1.976 1.54 0.981 0.143 -3.438 -4 ,24671 ,KEBNE ,16677406,Wed Nov 24 19:56:49 CET,Wed Nov 24 21:23:09 CET,0.0 1.018 1.414 1.695 1.926 2.132 2.318 2.485 2.783 2.917 3.042 3.199 3.394 3.495 3.694 3.873 4.037 4.115 4.269 4.422 4.639 4.782 4.92 5.109 5.293 5.473 5.635 5.79 5.986 6.18 6.381 6.621 6.85 7.068 7.312 7.593 7.855 8.136 8.428 8.726 9.047 9.423 9.858 10.269 10.748 11.263 11.816 12.4 12.974 13.557 14.102 14.233 14.067 13.784 13.451 13.091 12.755 12.432 12.132 11.821 11.523 11.217 10.915 10.626 10.342 10.08 9.769 9.497 9.257 8.974 8.704 8.493 8.257 7.995 7.776 7.556 7.349 7.12 6.86 6.674 6.485 6.196 5.992 5.761 5.639 5.396 5.121 4.817 4.647 4.38 4.083 3.868 3.635 3.138 2.85 2.538 2.186 1.725 1.134 0.251 -3.976 -5 ,31007 ,KEBNE ,16677407,Wed Nov 24 19:56:48 CET,Wed Nov 24 21:21:27 CET,0.0 1.05 1.416 1.676 1.888 2.096 2.273 2.425 2.715 2.848 2.972 3.111 3.3 3.399 3.597 3.782 3.954 4.036 4.193 4.344 4.556 4.69 4.827 5.018 5.191 5.36 5.531 5.693 5.902 6.104 6.289 6.508 6.729 6.944 7.19 7.467 7.734 8.032 8.336 8.648 8.984 9.341 9.752 10.181 10.627 11.078 11.588 12.144 12.734 13.329 13.885 14.002 13.798 13.47 13.122 12.771 12.408 12.026 11.683 11.339 11.013 10.702 10.418 10.139 9.87 9.631 9.36 9.098 8.88 8.651 8.41 8.194 7.954 7.71 7.518 7.317 7.103 6.884 6.664 6.51 6.337 6.022 5.797 5.565 5.453 5.225 4.949 4.651 4.503 4.26 3.961 3.741 3.521 3.04 2.723 2.375 1.986 1.508 0.917 0.012 -3.316 -6 ,31352 ,KEBNE ,16677408,Wed Nov 24 19:56:48 CET,Wed Nov 24 21:20:24 CET,0.0 0.843 1.208 1.497 1.73 1.927 2.096 2.252 2.544 2.672 2.79 2.922 3.109 3.209 3.417 3.604 3.774 3.864 4.037 4.199 4.427 4.564 4.692 4.879 5.069 5.253 5.422 5.589 5.799 5.996 6.184 6.405 6.62 6.826 7.066 7.339 7.599 7.871 8.149 8.437 8.751 9.105 9.523 9.944 10.416 10.912 11.459 12.029 12.65 13.3 13.856 14.051 13.873 13.569 13.237 12.864 12.482 12.113 11.779 11.412 11.087 10.812 10.541 10.254 9.971 9.729 9.475 9.217 8.982 8.722 8.449 8.226 7.991 7.768 7.594 7.396 7.195 6.993 6.781 6.626 6.453 6.162 5.948 5.734 5.624 5.368 5.075 4.765 4.611 4.365 4.07 3.868 3.662 3.158 2.855 2.502 2.13 1.666 1.05 0.254 -2.801 -7 ,28940 ,KEBNE ,16677409,Wed Nov 24 19:57:51 CET,Wed Nov 24 21:23:43 CET,0.0 0.869 1.202 1.476 1.694 1.878 2.053 2.215 2.495 2.623 2.745 2.892 3.087 3.196 3.405 3.59 3.758 3.842 4.015 4.173 4.393 4.536 4.666 4.861 5.054 5.23 5.394 5.552 5.755 5.953 6.14 6.36 6.57 6.777 7.017 7.272 7.517 7.782 8.072 8.373 8.67 9.008 9.405 9.79 10.224 10.721 11.257 11.797 12.405 13.016 13.56 13.727 13.585 13.302 12.95 12.563 12.173 11.823 11.515 11.166 10.838 10.558 10.296 10.009 9.731 9.49 9.211 8.975 8.79 8.576 8.35 8.156 7.937 7.691 7.489 7.281 7.06 6.84 6.607 6.439 6.267 5.996 5.796 5.561 5.437 5.183 4.904 4.613 4.458 4.213 3.94 3.726 3.495 3.015 2.746 2.432 2.029 1.558 0.966 0.056 -3.356 -8 ,6448 ,KEBNE ,16677410,Wed Nov 24 19:57:50 CET,Wed Nov 24 21:23:18 CET,0.0 1.005 1.36 1.622 1.848 2.073 2.269 2.437 2.731 2.865 2.99 3.12 3.313 3.412 3.609 3.797 3.967 4.049 4.209 4.365 4.581 4.716 4.848 5.041 5.228 5.404 5.577 5.746 5.956 6.158 6.348 6.574 6.796 7.017 7.273 7.544 7.803 8.101 8.417 8.73 9.06 9.434 9.862 10.28 10.73 11.218 11.771 12.349 12.998 13.665 14.223 14.383 14.197 13.86 13.526 13.199 12.865 12.523 12.205 11.864 11.537 11.221 10.924 10.621 10.334 10.073 9.779 9.498 9.229 8.946 8.645 8.4 8.167 7.916 7.708 7.501 7.278 7.021 6.74 6.55 6.37 6.098 5.897 5.663 5.542 5.288 4.996 4.7 4.547 4.302 4.008 3.801 3.606 3.142 2.837 2.502 2.127 1.635 1.004 0.149 -3.382 -9 ,254 ,KEBNE ,16677411,Wed Nov 24 19:57:50 CET,Wed Nov 24 21:21:07 CET,0.0 0.952 1.309 1.594 1.814 2.011 2.187 2.35 2.635 2.769 2.899 3.043 3.241 3.342 3.528 3.716 3.897 3.975 4.13 4.286 4.517 4.663 4.8 4.992 5.167 5.333 5.498 5.655 5.851 6.04 6.216 6.421 6.621 6.824 7.057 7.32 7.582 7.855 8.13 8.42 8.725 9.058 9.442 9.828 10.266 10.727 11.255 11.846 12.496 13.152 13.682 13.8 13.582 13.273 12.954 12.577 12.213 11.902 11.616 11.305 11.008 10.714 10.42 10.116 9.813 9.536 9.258 8.995 8.753 8.504 8.224 7.98 7.725 7.464 7.266 7.06 6.834 6.608 6.373 6.195 6.003 5.709 5.494 5.261 5.151 4.923 4.669 4.384 4.213 3.949 3.647 3.441 3.217 2.689 2.387 2.046 1.642 1.143 0.553 -0.255 -4.027 -10 ,11077 ,KEBNE ,16677412,Wed Nov 24 19:57:51 CET,Wed Nov 24 21:25:31 CET,0.0 0.734 1.002 1.229 1.427 1.594 1.755 1.912 2.192 2.313 2.433 2.589 2.789 2.902 3.112 3.299 3.472 3.558 3.726 3.881 4.082 4.198 4.309 4.479 4.644 4.798 4.952 5.104 5.298 5.477 5.655 5.887 6.102 6.303 6.538 6.799 7.049 7.329 7.63 7.935 8.262 8.637 9.072 9.49 9.963 10.493 11.045 11.594 12.183 12.735 13.139 13.211 13.048 12.782 12.474 12.117 11.796 11.498 11.202 10.89 10.58 10.257 9.939 9.58 9.171 8.791 8.394 8.021 7.69 7.362 7.008 6.708 6.408 6.099 5.869 5.669 5.484 5.281 5.045 4.866 4.684 4.391 4.184 3.978 3.868 3.637 3.375 3.083 2.94 2.712 2.449 2.266 2.078 1.631 1.363 1.056 0.694 0.289 -0.247 -1.042 -4.708 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_34.txt deleted file mode 100644 index 549a78a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_34.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12512 ,KEBNE ,16677413,Wed Nov 24 19:57:51 CET,Wed Nov 24 21:23:44 CET,0.0 0.794 1.106 1.333 1.524 1.688 1.828 1.951 2.178 2.286 2.389 2.502 2.666 2.749 2.912 3.054 3.19 3.258 3.379 3.488 3.65 3.755 3.855 4.001 4.14 4.265 4.381 4.495 4.654 4.809 4.96 5.132 5.286 5.432 5.593 5.771 5.931 6.104 6.294 6.489 6.664 6.832 7.005 7.175 7.353 7.487 7.568 7.542 7.365 6.93 5.949 4.43 3.04 1.806 0.694 -0.28 -1.148 -1.955 -2.667 -3.364 -3.927 -4.437 -4.957 -5.449 -5.896 -6.328 -6.811 -7.243 -7.603 -7.985 -8.385 -8.712 -9.054 -9.409 -9.685 -9.958 -10.239 -10.547 -10.858 -11.072 -11.31 -11.692 -11.945 -12.211 -12.362 -12.664 -12.984 -13.386 -13.603 -13.903 -14.243 -14.479 -14.736 -15.296 -15.628 -16.005 -16.425 -16.948 -17.673 -18.735 -27.075 -2 ,5283 ,KEBNE ,16677414,Wed Nov 24 19:57:51 CET,Wed Nov 24 21:26:42 CET,0.0 1.114 1.401 1.631 1.833 2.004 2.146 2.278 2.527 2.632 2.724 2.826 2.987 3.072 3.243 3.389 3.52 3.585 3.708 3.828 4.0 4.1 4.191 4.331 4.476 4.623 4.766 4.903 5.078 5.231 5.376 5.556 5.729 5.88 6.044 6.227 6.403 6.593 6.79 6.977 7.134 7.299 7.512 7.715 7.897 8.064 8.164 8.182 8.062 7.598 6.549 5.046 3.747 2.536 1.411 0.367 -0.572 -1.433 -2.188 -2.935 -3.547 -4.077 -4.57 -5.028 -5.458 -5.855 -6.293 -6.692 -7.026 -7.37 -7.752 -8.087 -8.432 -8.782 -9.037 -9.305 -9.606 -9.929 -10.228 -10.431 -10.691 -11.124 -11.399 -11.673 -11.81 -12.103 -12.442 -12.805 -12.994 -13.277 -13.617 -13.869 -14.133 -14.704 -15.024 -15.364 -15.777 -16.304 -16.994 -18.16 -22.509 -6 ,32765 ,KEBNE ,16677418,Wed Nov 24 20:01:58 CET,Wed Nov 24 21:29:18 CET,0.0 0.905 1.239 1.47 1.651 1.81 1.951 2.087 2.331 2.44 2.55 2.667 2.832 2.917 3.076 3.218 3.358 3.429 3.56 3.678 3.851 3.966 4.077 4.236 4.38 4.515 4.645 4.77 4.931 5.086 5.229 5.39 5.548 5.708 5.884 6.055 6.206 6.375 6.562 6.739 6.905 7.078 7.249 7.398 7.554 7.685 7.759 7.733 7.547 7.15 6.237 4.779 3.334 2.06 0.972 -0.019 -0.92 -1.765 -2.501 -3.247 -3.903 -4.464 -4.969 -5.447 -5.898 -6.342 -6.807 -7.176 -7.496 -7.866 -8.276 -8.62 -8.975 -9.349 -9.625 -9.895 -10.204 -10.554 -10.916 -11.172 -11.443 -11.862 -12.144 -12.401 -12.539 -12.847 -13.164 -13.502 -13.685 -13.965 -14.294 -14.539 -14.816 -15.395 -15.7 -16.045 -16.453 -16.949 -17.621 -18.664 -27.71 -7 ,32161 ,KEBNE ,16677419,Wed Nov 24 20:01:58 CET,Wed Nov 24 21:26:18 CET,0.0 0.751 1.047 1.271 1.452 1.618 1.767 1.897 2.137 2.247 2.349 2.464 2.632 2.712 2.861 3.005 3.147 3.219 3.362 3.486 3.661 3.773 3.878 4.035 4.184 4.315 4.432 4.543 4.69 4.825 4.947 5.094 5.239 5.381 5.529 5.696 5.865 6.039 6.212 6.398 6.574 6.735 6.934 7.129 7.309 7.435 7.512 7.504 7.354 6.987 6.048 4.587 3.147 1.921 0.865 -0.131 -0.987 -1.739 -2.396 -3.039 -3.605 -4.105 -4.548 -4.971 -5.367 -5.748 -6.16 -6.54 -6.876 -7.219 -7.599 -7.95 -8.309 -8.647 -8.923 -9.226 -9.534 -9.862 -10.2 -10.427 -10.657 -11.024 -11.297 -11.582 -11.73 -12.063 -12.438 -12.826 -13.026 -13.309 -13.633 -13.864 -14.128 -14.73 -15.066 -15.441 -15.89 -16.48 -17.209 -18.217 -28.124 -10 ,10634 ,KEBNE ,16677422,Wed Nov 24 20:02:59 CET,Wed Nov 24 21:27:17 CET,0.0 1.161 1.502 1.733 1.909 2.07 2.214 2.344 2.573 2.677 2.781 2.892 3.055 3.142 3.322 3.486 3.634 3.705 3.845 3.981 4.174 4.29 4.397 4.552 4.704 4.85 5.001 5.139 5.291 5.435 5.585 5.758 5.914 6.059 6.228 6.419 6.594 6.777 6.958 7.135 7.304 7.491 7.68 7.821 7.967 8.1 8.196 8.215 8.066 7.661 6.623 5.038 3.645 2.377 1.315 0.45 -0.35 -1.102 -1.745 -2.397 -2.948 -3.434 -3.932 -4.429 -4.89 -5.316 -5.744 -6.109 -6.442 -6.793 -7.156 -7.461 -7.784 -8.138 -8.413 -8.687 -8.98 -9.291 -9.613 -9.846 -10.102 -10.514 -10.791 -11.077 -11.238 -11.567 -11.898 -12.264 -12.453 -12.73 -13.098 -13.348 -13.613 -14.229 -14.549 -14.88 -15.269 -15.76 -16.393 -17.435 -25.03 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_35.txt deleted file mode 100644 index 0b9faf82..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_35.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8300 ,KEBNE ,16677423,Wed Nov 24 20:04:01 CET,Wed Nov 24 21:30:17 CET,0.0 1.6 2.033 2.349 2.592 2.797 2.98 3.149 3.454 3.584 3.7 3.847 4.028 4.128 4.336 4.541 4.727 4.81 4.97 5.124 5.331 5.456 5.587 5.768 5.923 6.076 6.229 6.381 6.565 6.733 6.901 7.109 7.312 7.499 7.708 7.944 8.16 8.379 8.606 8.832 9.075 9.332 9.585 9.821 10.071 10.339 10.503 10.557 10.56 10.324 9.565 8.28 6.932 5.695 4.563 3.533 2.631 1.805 1.077 0.329 -0.317 -0.866 -1.411 -1.972 -2.483 -2.906 -3.316 -3.698 -4.048 -4.412 -4.788 -5.108 -5.444 -5.785 -6.044 -6.324 -6.632 -6.963 -7.298 -7.514 -7.743 -8.121 -8.38 -8.652 -8.805 -9.123 -9.456 -9.826 -10.015 -10.295 -10.659 -10.894 -11.12 -11.641 -11.967 -12.305 -12.669 -13.15 -13.763 -14.672 -18.972 -2 ,9844 ,KEBNE ,16677424,Wed Nov 24 20:04:01 CET,Wed Nov 24 21:29:34 CET,0.0 1.494 1.901 2.196 2.433 2.641 2.828 2.994 3.287 3.426 3.567 3.75 3.945 4.057 4.253 4.43 4.595 4.674 4.826 4.973 5.178 5.302 5.419 5.59 5.752 5.904 6.051 6.19 6.36 6.517 6.665 6.853 7.039 7.213 7.413 7.629 7.81 7.985 8.183 8.405 8.627 8.863 9.133 9.358 9.579 9.799 9.955 10.044 9.99 9.631 8.709 7.392 6.13 4.926 3.837 2.799 1.882 1.054 0.333 -0.371 -0.974 -1.518 -2.03 -2.525 -3.021 -3.491 -3.983 -4.434 -4.839 -5.258 -5.663 -5.988 -6.324 -6.678 -6.971 -7.271 -7.58 -7.896 -8.24 -8.49 -8.75 -9.166 -9.443 -9.71 -9.851 -10.153 -10.464 -10.803 -10.985 -11.259 -11.593 -11.816 -12.032 -12.57 -12.905 -13.295 -13.747 -14.246 -14.817 -15.659 -21.685 -3 ,31435 ,KEBNE ,16677425,Wed Nov 24 20:04:02 CET,Wed Nov 24 21:29:25 CET,0.0 1.085 1.489 1.78 2.044 2.27 2.464 2.644 2.974 3.113 3.236 3.402 3.598 3.722 3.946 4.139 4.324 4.413 4.583 4.748 4.987 5.125 5.252 5.449 5.648 5.829 5.986 6.129 6.318 6.514 6.696 6.912 7.124 7.312 7.52 7.742 7.939 8.142 8.347 8.56 8.778 8.999 9.28 9.533 9.754 9.982 10.188 10.345 10.403 10.17 9.314 7.923 6.588 5.366 4.245 3.185 2.213 1.345 0.645 -0.049 -0.669 -1.265 -1.869 -2.418 -2.903 -3.35 -3.816 -4.22 -4.585 -4.969 -5.361 -5.694 -6.037 -6.384 -6.645 -6.912 -7.198 -7.509 -7.842 -8.063 -8.29 -8.66 -8.92 -9.192 -9.335 -9.65 -9.999 -10.356 -10.531 -10.799 -11.15 -11.381 -11.628 -12.196 -12.554 -12.947 -13.39 -13.892 -14.435 -15.281 -19.171 -4 ,27699 ,KEBNE ,16677426,Wed Nov 24 20:04:02 CET,Wed Nov 24 21:28:51 CET,0.0 1.522 1.948 2.236 2.476 2.677 2.854 3.013 3.3 3.431 3.562 3.722 3.907 4.031 4.273 4.485 4.666 4.748 4.912 5.065 5.284 5.439 5.581 5.757 5.915 6.066 6.221 6.364 6.542 6.714 6.873 7.064 7.248 7.422 7.617 7.83 8.033 8.256 8.498 8.733 8.966 9.21 9.459 9.695 9.936 10.12 10.245 10.295 10.201 9.93 9.115 7.665 6.314 5.15 4.064 3.046 2.171 1.344 0.639 -0.05 -0.678 -1.281 -1.879 -2.44 -2.936 -3.369 -3.825 -4.234 -4.598 -4.99 -5.373 -5.675 -5.997 -6.341 -6.63 -6.928 -7.213 -7.501 -7.809 -8.031 -8.267 -8.648 -8.92 -9.242 -9.412 -9.745 -10.101 -10.481 -10.678 -10.961 -11.259 -11.473 -11.719 -12.309 -12.658 -13.036 -13.475 -13.967 -14.536 -15.451 -27.491 -6 ,2888 ,KEBNE ,16677428,Wed Nov 24 20:05:03 CET,Wed Nov 24 21:34:34 CET,0.0 1.59 2.045 2.397 2.689 2.959 3.198 3.405 3.753 3.916 4.074 4.257 4.442 4.551 4.755 4.941 5.113 5.193 5.356 5.514 5.724 5.85 5.981 6.17 6.34 6.486 6.635 6.784 6.956 7.13 7.296 7.485 7.666 7.834 8.035 8.267 8.498 8.728 8.943 9.203 9.462 9.7 9.939 10.155 10.438 10.705 10.914 11.076 11.102 10.896 10.109 8.747 7.394 6.119 4.933 3.866 2.949 2.091 1.343 0.577 -0.088 -0.645 -1.161 -1.677 -2.201 -2.665 -3.106 -3.493 -3.842 -4.233 -4.643 -4.976 -5.316 -5.687 -5.991 -6.312 -6.645 -6.983 -7.326 -7.555 -7.784 -8.15 -8.398 -8.662 -8.805 -9.108 -9.454 -9.802 -9.971 -10.24 -10.549 -10.776 -11.009 -11.496 -11.791 -12.123 -12.482 -12.938 -13.544 -14.296 -23.887 -7 ,9031 ,KEBNE ,16677429,Wed Nov 24 20:05:03 CET,Wed Nov 24 21:31:55 CET,0.0 1.633 2.059 2.346 2.598 2.818 3.015 3.191 3.481 3.616 3.751 3.927 4.119 4.22 4.4 4.568 4.734 4.811 4.949 5.086 5.285 5.405 5.52 5.685 5.852 6.021 6.166 6.293 6.459 6.62 6.769 6.939 7.098 7.258 7.44 7.633 7.816 8.016 8.223 8.432 8.655 8.888 9.112 9.325 9.584 9.826 10.028 10.176 10.137 9.772 8.82 7.337 5.912 4.72 3.678 2.626 1.703 0.893 0.158 -0.592 -1.216 -1.789 -2.344 -2.869 -3.367 -3.806 -4.263 -4.665 -5.023 -5.399 -5.799 -6.156 -6.514 -6.876 -7.16 -7.444 -7.743 -8.074 -8.415 -8.627 -8.834 -9.181 -9.431 -9.713 -9.87 -10.188 -10.546 -10.932 -11.128 -11.425 -11.778 -11.995 -12.237 -12.786 -13.106 -13.473 -13.91 -14.431 -15.062 -15.843 -19.723 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_39.txt deleted file mode 100644 index a771e719..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9049 ,KEBNE ,16677433,Wed Nov 24 20:06:05 CET,Wed Nov 24 21:31:05 CET,0.0 0.945 1.346 1.643 1.885 2.083 2.263 2.43 2.72 2.856 2.987 3.156 3.335 3.433 3.633 3.826 4.008 4.094 4.251 4.395 4.591 4.716 4.846 5.024 5.188 5.346 5.49 5.618 5.776 5.927 6.063 6.232 6.398 6.551 6.727 6.918 7.095 7.282 7.467 7.659 7.861 8.069 8.294 8.515 8.743 8.958 9.138 9.256 9.302 9.099 8.456 7.422 6.382 5.458 4.649 3.878 3.18 2.537 1.955 1.369 0.872 0.403 -0.066 -0.517 -0.93 -1.309 -1.716 -2.072 -2.372 -2.685 -3.041 -3.36 -3.669 -3.977 -4.22 -4.474 -4.759 -5.056 -5.36 -5.576 -5.803 -6.154 -6.4 -6.665 -6.809 -7.104 -7.415 -7.745 -7.912 -8.175 -8.518 -8.76 -9.007 -9.528 -9.832 -10.169 -10.517 -10.922 -11.429 -12.124 -14.698 -2 ,2513 ,KEBNE ,16677434,Wed Nov 24 20:07:06 CET,Wed Nov 24 21:29:33 CET,0.0 1.411 1.876 2.19 2.458 2.666 2.851 3.016 3.298 3.433 3.567 3.738 3.925 4.031 4.223 4.392 4.554 4.635 4.778 4.921 5.14 5.268 5.388 5.571 5.723 5.851 5.987 6.125 6.293 6.456 6.612 6.791 6.953 7.102 7.286 7.504 7.696 7.907 8.128 8.332 8.55 8.765 8.978 9.179 9.369 9.55 9.711 9.799 9.832 9.715 9.162 8.173 7.2 6.297 5.489 4.719 3.99 3.339 2.784 2.218 1.718 1.258 0.803 0.36 -0.069 -0.474 -0.897 -1.254 -1.558 -1.891 -2.241 -2.521 -2.81 -3.125 -3.376 -3.644 -3.927 -4.204 -4.476 -4.685 -4.903 -5.22 -5.458 -5.714 -5.855 -6.162 -6.486 -6.823 -7.003 -7.28 -7.613 -7.839 -8.072 -8.574 -8.839 -9.139 -9.514 -9.969 -10.523 -11.276 -13.938 -3 ,20914 ,KEBNE ,16677435,Wed Nov 24 20:07:07 CET,Wed Nov 24 21:32:20 CET,0.0 1.11 1.497 1.779 1.991 2.184 2.348 2.489 2.775 2.912 3.044 3.187 3.353 3.442 3.607 3.772 3.943 4.019 4.155 4.292 4.502 4.632 4.749 4.909 5.058 5.218 5.37 5.507 5.688 5.858 6.011 6.192 6.37 6.532 6.715 6.923 7.097 7.28 7.498 7.707 7.889 8.08 8.3 8.51 8.713 8.902 9.088 9.256 9.328 9.185 8.609 7.634 6.665 5.707 4.823 4.027 3.314 2.663 2.101 1.522 1.028 0.57 0.1 -0.34 -0.754 -1.138 -1.528 -1.896 -2.225 -2.56 -2.908 -3.197 -3.508 -3.83 -4.072 -4.325 -4.6 -4.901 -5.225 -5.446 -5.66 -5.997 -6.236 -6.498 -6.631 -6.907 -7.207 -7.512 -7.684 -7.957 -8.257 -8.465 -8.695 -9.202 -9.469 -9.746 -10.061 -10.466 -10.97 -11.686 -14.218 -4 ,9697 ,KEBNE ,16677436,Wed Nov 24 20:08:08 CET,Wed Nov 24 21:31:30 CET,0.0 1.035 1.409 1.722 1.985 2.214 2.403 2.556 2.861 3.007 3.146 3.32 3.503 3.603 3.807 3.992 4.154 4.232 4.385 4.528 4.721 4.844 4.968 5.136 5.281 5.421 5.562 5.699 5.876 6.034 6.177 6.343 6.506 6.67 6.856 7.074 7.278 7.484 7.69 7.891 8.085 8.299 8.516 8.703 8.916 9.122 9.318 9.451 9.517 9.414 8.808 7.767 6.756 5.813 4.952 4.167 3.454 2.773 2.182 1.585 1.061 0.594 0.143 -0.293 -0.702 -1.069 -1.442 -1.785 -2.092 -2.4 -2.727 -2.998 -3.297 -3.624 -3.868 -4.134 -4.416 -4.697 -4.972 -5.173 -5.39 -5.728 -5.977 -6.238 -6.366 -6.637 -6.94 -7.282 -7.463 -7.722 -8.032 -8.252 -8.474 -8.985 -9.262 -9.541 -9.87 -10.25 -10.697 -11.311 -13.9 -5 ,30495 ,KEBNE ,16677437,Wed Nov 24 20:08:08 CET,Wed Nov 24 21:30:29 CET,0.0 0.912 1.29 1.584 1.817 2.026 2.216 2.389 2.683 2.813 2.938 3.094 3.271 3.367 3.569 3.772 3.964 4.048 4.199 4.338 4.515 4.62 4.73 4.91 5.086 5.238 5.381 5.519 5.693 5.858 6.01 6.194 6.369 6.525 6.703 6.893 7.063 7.249 7.447 7.663 7.891 8.128 8.365 8.583 8.784 8.955 9.134 9.273 9.312 9.168 8.613 7.625 6.594 5.673 4.898 4.158 3.449 2.793 2.224 1.642 1.146 0.714 0.282 -0.134 -0.512 -0.876 -1.274 -1.636 -1.968 -2.32 -2.663 -2.948 -3.247 -3.561 -3.805 -4.068 -4.344 -4.637 -4.952 -5.168 -5.391 -5.74 -5.987 -6.254 -6.397 -6.689 -6.998 -7.315 -7.488 -7.767 -8.112 -8.334 -8.565 -9.094 -9.383 -9.702 -10.089 -10.532 -11.081 -11.819 -13.949 -6 ,4406 ,KEBNE ,16677438,Wed Nov 24 20:09:10 CET,Wed Nov 24 21:34:45 CET,0.0 1.182 1.615 1.955 2.211 2.42 2.596 2.759 3.065 3.202 3.328 3.483 3.669 3.771 3.967 4.146 4.313 4.392 4.525 4.659 4.86 4.982 5.104 5.272 5.428 5.58 5.727 5.869 6.034 6.198 6.372 6.567 6.74 6.909 7.096 7.295 7.484 7.666 7.844 8.034 8.242 8.475 8.716 8.919 9.117 9.321 9.511 9.659 9.684 9.471 8.853 7.856 6.874 5.965 5.101 4.312 3.639 3.02 2.456 1.889 1.376 0.914 0.49 0.057 -0.348 -0.719 -1.125 -1.499 -1.823 -2.147 -2.501 -2.81 -3.119 -3.443 -3.69 -3.943 -4.214 -4.495 -4.804 -5.029 -5.263 -5.632 -5.898 -6.176 -6.324 -6.616 -6.901 -7.22 -7.386 -7.641 -7.944 -8.152 -8.375 -8.869 -9.145 -9.446 -9.775 -10.164 -10.636 -11.356 -14.721 -7 ,28396 ,KEBNE ,16677439,Wed Nov 24 20:09:10 CET,Wed Nov 24 21:31:56 CET,0.0 1.051 1.375 1.619 1.832 2.004 2.152 2.299 2.585 2.71 2.823 2.952 3.119 3.201 3.366 3.531 3.687 3.758 3.883 4.004 4.194 4.316 4.44 4.626 4.787 4.934 5.069 5.198 5.372 5.54 5.688 5.874 6.067 6.232 6.389 6.567 6.755 6.961 7.169 7.365 7.557 7.768 8.005 8.233 8.46 8.644 8.79 8.889 8.9 8.719 8.178 7.203 6.251 5.361 4.514 3.748 3.058 2.398 1.818 1.251 0.781 0.331 -0.121 -0.54 -0.935 -1.302 -1.715 -2.107 -2.434 -2.765 -3.106 -3.39 -3.701 -4.02 -4.261 -4.524 -4.809 -5.109 -5.404 -5.608 -5.842 -6.184 -6.416 -6.67 -6.796 -7.073 -7.378 -7.724 -7.908 -8.167 -8.464 -8.665 -8.892 -9.407 -9.683 -9.983 -10.326 -10.735 -11.241 -11.941 -14.061 -8 ,13366 ,KEBNE ,16677440,Wed Nov 24 20:09:11 CET,Wed Nov 24 21:32:03 CET,0.0 1.051 1.447 1.726 1.95 2.152 2.328 2.484 2.774 2.905 3.024 3.165 3.335 3.432 3.615 3.789 3.963 4.044 4.201 4.346 4.528 4.649 4.769 4.926 5.075 5.22 5.361 5.494 5.653 5.809 5.969 6.152 6.31 6.456 6.627 6.809 6.966 7.156 7.371 7.565 7.754 7.978 8.202 8.384 8.577 8.759 8.929 9.081 9.145 8.974 8.33 7.255 6.226 5.246 4.363 3.567 2.837 2.205 1.663 1.118 0.652 0.217 -0.213 -0.633 -1.03 -1.384 -1.756 -2.108 -2.434 -2.777 -3.13 -3.429 -3.743 -4.073 -4.325 -4.584 -4.855 -5.143 -5.45 -5.653 -5.869 -6.225 -6.475 -6.739 -6.876 -7.159 -7.445 -7.758 -7.926 -8.181 -8.476 -8.679 -8.9 -9.377 -9.643 -9.923 -10.222 -10.588 -11.086 -11.763 -13.764 -9 ,262 ,KEBNE ,16677441,Wed Nov 24 20:09:10 CET,Wed Nov 24 21:33:10 CET,0.0 1.134 1.577 1.875 2.119 2.324 2.492 2.661 2.95 3.063 3.181 3.336 3.51 3.603 3.785 3.952 4.101 4.174 4.324 4.474 4.685 4.816 4.932 5.078 5.212 5.344 5.487 5.634 5.802 5.955 6.114 6.312 6.484 6.63 6.809 7.003 7.172 7.341 7.506 7.681 7.874 8.103 8.356 8.577 8.801 9.001 9.158 9.295 9.356 9.172 8.546 7.57 6.669 5.766 4.919 4.166 3.467 2.803 2.221 1.651 1.165 0.725 0.292 -0.129 -0.525 -0.899 -1.289 -1.641 -1.948 -2.27 -2.608 -2.872 -3.161 -3.483 -3.73 -3.985 -4.263 -4.562 -4.857 -5.067 -5.288 -5.629 -5.871 -6.125 -6.256 -6.526 -6.826 -7.141 -7.306 -7.577 -7.885 -8.087 -8.3 -8.796 -9.078 -9.393 -9.746 -10.161 -10.666 -11.297 -13.995 -10 ,10509 ,KEBNE ,16677442,Wed Nov 24 20:09:11 CET,Wed Nov 24 21:33:29 CET,0.0 1.018 1.389 1.65 1.868 2.064 2.249 2.422 2.724 2.864 2.997 3.169 3.349 3.451 3.643 3.809 3.958 4.029 4.168 4.305 4.5 4.622 4.742 4.912 5.067 5.218 5.367 5.503 5.665 5.817 5.956 6.12 6.282 6.435 6.615 6.818 7.007 7.192 7.383 7.581 7.783 7.995 8.229 8.448 8.648 8.843 9.038 9.177 9.212 9.06 8.444 7.417 6.491 5.597 4.73 3.934 3.226 2.574 2.003 1.382 0.843 0.396 -0.035 -0.46 -0.861 -1.234 -1.639 -2.0 -2.315 -2.667 -3.035 -3.34 -3.644 -3.952 -4.2 -4.465 -4.741 -5.03 -5.334 -5.543 -5.74 -6.061 -6.299 -6.547 -6.689 -6.989 -7.3 -7.627 -7.801 -8.064 -8.378 -8.592 -8.82 -9.331 -9.629 -9.961 -10.321 -10.736 -11.247 -11.982 -14.458 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_43.txt deleted file mode 100644 index 7e3f0b6a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17833 ,KEBNE ,16677443,Wed Nov 24 20:09:14 CET,Wed Nov 24 21:27:33 CET,0.0 1.707 2.186 2.545 2.84 3.122 3.37 3.571 3.924 4.081 4.227 4.435 4.651 4.792 5.041 5.259 5.467 5.57 5.771 5.953 6.209 6.368 6.506 6.708 6.911 7.11 7.286 7.456 7.672 7.859 8.041 8.278 8.505 8.713 8.964 9.242 9.467 9.706 9.993 10.31 10.617 10.952 11.308 11.627 11.983 12.333 12.705 13.052 13.35 13.493 13.233 12.419 11.578 10.78 10.008 9.292 8.642 8.021 7.501 6.989 6.493 6.04 5.624 5.233 4.849 4.476 4.08 3.72 3.409 3.094 2.773 2.509 2.23 1.928 1.688 1.433 1.147 0.852 0.56 0.353 0.136 -0.216 -0.463 -0.719 -0.854 -1.135 -1.413 -1.705 -1.862 -2.098 -2.399 -2.608 -2.835 -3.376 -3.678 -3.988 -4.335 -4.765 -5.293 -5.985 -10.525 -2 ,26480 ,KEBNE ,16677444,Wed Nov 24 20:10:12 CET,Wed Nov 24 21:34:11 CET,0.0 1.673 2.161 2.523 2.812 3.041 3.248 3.45 3.818 3.991 4.157 4.37 4.586 4.715 4.944 5.16 5.359 5.46 5.649 5.826 6.07 6.22 6.366 6.582 6.781 6.962 7.14 7.313 7.53 7.737 7.942 8.17 8.379 8.572 8.79 9.033 9.279 9.551 9.801 10.054 10.337 10.678 11.072 11.416 11.775 12.158 12.545 12.889 13.172 13.33 13.066 12.404 11.676 10.888 10.125 9.441 8.827 8.229 7.703 7.172 6.684 6.246 5.846 5.456 5.089 4.748 4.376 4.05 3.758 3.444 3.124 2.855 2.564 2.265 2.032 1.797 1.564 1.299 1.004 0.795 0.575 0.243 0.011 -0.241 -0.374 -0.665 -0.978 -1.298 -1.463 -1.718 -2.068 -2.301 -2.537 -3.031 -3.304 -3.601 -3.924 -4.335 -4.885 -5.562 -7.614 -3 ,24959 ,KEBNE ,16677445,Wed Nov 24 20:10:12 CET,Wed Nov 24 21:34:45 CET,0.0 1.479 1.998 2.412 2.704 2.974 3.224 3.44 3.816 3.979 4.126 4.337 4.554 4.697 4.964 5.21 5.426 5.532 5.738 5.922 6.173 6.333 6.489 6.704 6.906 7.092 7.278 7.475 7.752 7.987 8.181 8.418 8.635 8.858 9.136 9.421 9.665 9.911 10.175 10.45 10.729 11.058 11.442 11.78 12.129 12.486 12.826 13.116 13.339 13.493 13.355 12.733 11.969 11.171 10.439 9.734 9.075 8.478 7.95 7.402 6.942 6.522 6.113 5.725 5.375 5.051 4.68 4.342 4.045 3.748 3.428 3.154 2.879 2.583 2.342 2.084 1.815 1.536 1.238 1.026 0.809 0.459 0.2 -0.058 -0.183 -0.439 -0.725 -1.038 -1.201 -1.449 -1.748 -1.954 -2.174 -2.655 -2.936 -3.267 -3.609 -3.985 -4.507 -5.255 -8.122 -4 ,4958 ,KEBNE ,16677446,Wed Nov 24 20:10:12 CET,Wed Nov 24 21:37:25 CET,0.0 1.724 2.219 2.562 2.838 3.088 3.301 3.495 3.873 4.042 4.197 4.404 4.612 4.744 5.007 5.225 5.422 5.525 5.722 5.899 6.165 6.339 6.494 6.703 6.911 7.112 7.301 7.482 7.708 7.932 8.144 8.378 8.61 8.823 9.061 9.331 9.57 9.843 10.157 10.445 10.728 11.06 11.416 11.753 12.145 12.542 12.919 13.279 13.611 13.831 13.721 13.041 12.231 11.448 10.719 9.981 9.26 8.607 8.047 7.499 7.052 6.643 6.224 5.801 5.397 5.039 4.663 4.317 4.007 3.674 3.325 3.037 2.737 2.403 2.141 1.882 1.624 1.357 1.057 0.841 0.619 0.283 0.044 -0.212 -0.352 -0.645 -0.946 -1.27 -1.446 -1.721 -2.031 -2.225 -2.444 -2.932 -3.219 -3.551 -3.932 -4.37 -4.931 -5.721 -8.346 -5 ,17696 ,KEBNE ,16677447,Wed Nov 24 20:10:12 CET,Wed Nov 24 21:34:16 CET,0.0 1.685 2.252 2.662 2.963 3.224 3.457 3.669 4.051 4.212 4.363 4.587 4.797 4.915 5.149 5.377 5.582 5.677 5.87 6.057 6.308 6.47 6.618 6.811 7.004 7.196 7.378 7.552 7.774 7.991 8.191 8.428 8.673 8.901 9.135 9.399 9.669 9.936 10.196 10.463 10.725 11.021 11.371 11.715 12.089 12.467 12.847 13.212 13.558 13.75 13.558 12.854 12.041 11.261 10.493 9.775 9.152 8.542 7.982 7.419 6.939 6.518 6.11 5.711 5.333 4.985 4.622 4.268 3.955 3.645 3.325 3.052 2.766 2.46 2.214 1.949 1.66 1.375 1.094 0.884 0.665 0.311 0.053 -0.207 -0.339 -0.616 -0.917 -1.238 -1.412 -1.671 -1.988 -2.183 -2.399 -2.916 -3.193 -3.478 -3.82 -4.227 -4.736 -5.481 -8.111 -6 ,11491 ,KEBNE ,16677448,Wed Nov 24 20:10:12 CET,Wed Nov 24 21:37:58 CET,0.0 1.246 1.713 2.114 2.424 2.691 2.913 3.114 3.483 3.645 3.793 3.976 4.167 4.292 4.526 4.722 4.917 5.019 5.205 5.379 5.626 5.776 5.92 6.128 6.322 6.498 6.663 6.833 7.053 7.251 7.446 7.673 7.879 8.069 8.288 8.543 8.78 9.049 9.336 9.616 9.893 10.187 10.511 10.846 11.257 11.665 12.032 12.375 12.672 12.808 12.537 11.695 10.845 10.067 9.325 8.631 7.993 7.365 6.822 6.291 5.807 5.369 4.943 4.544 4.176 3.838 3.474 3.138 2.841 2.517 2.179 1.897 1.599 1.284 1.042 0.787 0.509 0.208 -0.097 -0.299 -0.508 -0.845 -1.086 -1.333 -1.459 -1.735 -2.041 -2.334 -2.487 -2.748 -3.073 -3.269 -3.476 -3.929 -4.187 -4.508 -4.881 -5.33 -5.837 -6.535 -8.9 -7 ,14340 ,KEBNE ,16677449,Wed Nov 24 20:11:14 CET,Wed Nov 24 21:36:26 CET,0.0 1.577 2.164 2.57 2.883 3.148 3.383 3.601 3.994 4.172 4.328 4.519 4.717 4.838 5.078 5.304 5.508 5.607 5.794 5.967 6.216 6.366 6.508 6.716 6.91 7.084 7.257 7.419 7.609 7.817 8.028 8.254 8.463 8.669 8.906 9.152 9.371 9.619 9.884 10.146 10.407 10.73 11.1 11.412 11.772 12.139 12.505 12.882 13.208 13.399 13.18 12.492 11.741 11.014 10.323 9.618 8.981 8.401 7.871 7.33 6.854 6.427 6.013 5.601 5.213 4.864 4.507 4.174 3.869 3.551 3.215 2.945 2.665 2.354 2.105 1.845 1.574 1.297 0.997 0.788 0.575 0.23 -0.007 -0.268 -0.406 -0.677 -0.966 -1.274 -1.44 -1.691 -1.992 -2.206 -2.443 -2.959 -3.255 -3.558 -3.892 -4.314 -4.818 -5.58 -8.864 -8 ,2617 ,KEBNE ,16677450,Wed Nov 24 20:11:14 CET,Wed Nov 24 21:35:46 CET,0.0 1.561 2.049 2.427 2.757 3.013 3.22 3.433 3.832 4.011 4.187 4.43 4.638 4.77 5.02 5.242 5.456 5.556 5.742 5.933 6.199 6.362 6.508 6.713 6.915 7.11 7.292 7.453 7.654 7.846 8.042 8.272 8.497 8.712 8.949 9.213 9.444 9.705 9.999 10.287 10.566 10.874 11.217 11.535 11.9 12.266 12.63 12.943 13.262 13.502 13.351 12.708 11.926 11.18 10.446 9.756 9.154 8.584 8.08 7.536 7.06 6.633 6.203 5.792 5.389 5.012 4.624 4.287 3.997 3.693 3.367 3.097 2.831 2.544 2.309 2.064 1.811 1.545 1.261 1.058 0.84 0.505 0.265 -0.007 -0.147 -0.424 -0.713 -1.025 -1.19 -1.43 -1.71 -1.907 -2.12 -2.608 -2.877 -3.154 -3.495 -3.903 -4.405 -5.119 -8.553 -9 ,25029 ,KEBNE ,16677451,Wed Nov 24 20:11:14 CET,Wed Nov 24 21:33:24 CET,0.0 1.579 2.049 2.422 2.739 2.998 3.219 3.416 3.775 3.945 4.1 4.318 4.531 4.663 4.921 5.148 5.344 5.437 5.619 5.787 6.032 6.193 6.338 6.549 6.75 6.941 7.124 7.294 7.498 7.7 7.903 8.146 8.364 8.564 8.801 9.066 9.316 9.586 9.879 10.189 10.485 10.799 11.153 11.499 11.879 12.253 12.652 13.05 13.361 13.54 13.373 12.616 11.779 10.989 10.239 9.521 8.84 8.199 7.66 7.118 6.619 6.168 5.743 5.338 4.937 4.572 4.201 3.854 3.57 3.288 2.969 2.696 2.406 2.11 1.887 1.645 1.386 1.107 0.812 0.608 0.377 0.01 -0.22 -0.458 -0.597 -0.883 -1.172 -1.484 -1.642 -1.885 -2.183 -2.376 -2.581 -3.053 -3.308 -3.592 -3.951 -4.349 -4.866 -5.672 -9.274 -10 ,10915 ,KEBNE ,16677452,Wed Nov 24 20:11:14 CET,Wed Nov 24 21:35:09 CET,0.0 1.37 1.846 2.159 2.41 2.674 2.912 3.11 3.496 3.666 3.822 4.027 4.229 4.35 4.586 4.821 5.041 5.139 5.321 5.506 5.773 5.946 6.101 6.313 6.509 6.679 6.852 7.021 7.244 7.463 7.671 7.906 8.119 8.321 8.553 8.792 9.033 9.311 9.598 9.912 10.224 10.531 10.876 11.205 11.555 11.923 12.296 12.673 13.061 13.338 13.285 12.658 11.879 11.163 10.491 9.818 9.19 8.589 8.059 7.516 7.041 6.615 6.205 5.803 5.413 5.079 4.726 4.387 4.084 3.769 3.455 3.18 2.893 2.619 2.396 2.161 1.921 1.648 1.35 1.148 0.944 0.631 0.402 0.153 0.023 -0.259 -0.561 -0.878 -1.043 -1.294 -1.598 -1.802 -2.028 -2.507 -2.77 -3.048 -3.38 -3.783 -4.312 -5.049 -7.381 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_20.txt deleted file mode 100644 index 496e5c41..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_20.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2455 ,KEBNE ,16677453,Wed Nov 24 20:11:14 CET,Wed Nov 24 21:35:40 CET,0.0 1.448 1.848 2.135 2.399 2.646 2.874 3.07 3.399 3.557 3.71 3.899 4.088 4.201 4.404 4.598 4.786 4.877 5.046 5.206 5.444 5.599 5.757 5.97 6.148 6.332 6.509 6.667 6.864 7.07 7.269 7.499 7.716 7.925 8.161 8.416 8.649 8.903 9.176 9.435 9.707 10.056 10.489 10.867 11.206 11.56 11.937 12.291 12.591 12.742 12.6 11.975 11.25 10.553 9.897 9.253 8.671 8.158 7.7 7.208 6.773 6.358 5.97 5.612 5.263 4.95 4.616 4.319 4.059 3.776 3.489 3.243 2.988 2.74 2.538 2.325 2.107 1.875 1.635 1.475 1.308 1.034 0.837 0.636 0.528 0.303 0.051 -0.236 -0.373 -0.58 -0.792 -0.95 -1.115 -1.473 -1.672 -1.896 -2.159 -2.484 -2.861 -3.369 -4.69 -2 ,26840 ,KEBNE ,16677454,Wed Nov 24 20:12:15 CET,Wed Nov 24 21:35:12 CET,0.0 1.032 1.475 1.779 2.032 2.259 2.482 2.7 3.054 3.194 3.335 3.541 3.733 3.845 4.064 4.259 4.448 4.536 4.705 4.868 5.114 5.277 5.426 5.637 5.823 5.998 6.161 6.322 6.542 6.749 6.935 7.144 7.345 7.555 7.793 8.049 8.294 8.548 8.804 9.066 9.334 9.645 9.973 10.279 10.628 10.964 11.336 11.727 12.086 12.299 12.102 11.393 10.644 9.945 9.285 8.649 8.067 7.499 6.978 6.47 6.033 5.646 5.284 4.929 4.595 4.28 3.943 3.643 3.391 3.123 2.823 2.584 2.35 2.108 1.907 1.684 1.45 1.2 0.932 0.744 0.551 0.242 0.04 -0.166 -0.28 -0.508 -0.744 -1.011 -1.158 -1.374 -1.595 -1.76 -1.934 -2.328 -2.571 -2.839 -3.119 -3.417 -3.766 -4.213 -5.355 -3 ,19478 ,KEBNE ,16677455,Wed Nov 24 20:12:15 CET,Wed Nov 24 21:35:56 CET,0.0 0.867 1.276 1.609 1.885 2.122 2.336 2.535 2.868 3.013 3.156 3.355 3.542 3.651 3.869 4.077 4.277 4.373 4.558 4.732 4.987 5.137 5.273 5.476 5.676 5.87 6.041 6.206 6.414 6.623 6.833 7.066 7.291 7.517 7.756 7.993 8.225 8.477 8.753 9.035 9.309 9.604 9.907 10.191 10.524 10.862 11.16 11.451 11.729 11.856 11.703 11.136 10.431 9.722 9.055 8.424 7.846 7.289 6.789 6.283 5.823 5.412 5.032 4.669 4.323 4.007 3.677 3.368 3.102 2.841 2.568 2.337 2.089 1.833 1.638 1.428 1.203 0.971 0.725 0.562 0.392 0.1 -0.1 -0.304 -0.416 -0.647 -0.896 -1.164 -1.304 -1.531 -1.796 -1.962 -2.134 -2.55 -2.777 -3.04 -3.331 -3.624 -3.97 -4.427 -5.844 -4 ,19746 ,KEBNE ,16677456,Wed Nov 24 20:12:15 CET,Wed Nov 24 21:34:51 CET,0.0 0.919 1.326 1.633 1.896 2.126 2.346 2.547 2.907 3.078 3.228 3.423 3.619 3.744 3.968 4.182 4.38 4.47 4.653 4.831 5.093 5.263 5.423 5.639 5.846 6.032 6.193 6.367 6.597 6.814 7.009 7.218 7.42 7.607 7.826 8.092 8.339 8.597 8.868 9.144 9.416 9.705 10.037 10.371 10.716 11.047 11.407 11.721 11.966 12.068 11.815 11.153 10.396 9.653 8.943 8.28 7.717 7.208 6.741 6.23 5.778 5.388 5.022 4.668 4.324 4.003 3.679 3.392 3.137 2.862 2.57 2.325 2.067 1.795 1.591 1.377 1.145 0.917 0.679 0.502 0.316 0.035 -0.164 -0.377 -0.485 -0.711 -0.944 -1.194 -1.329 -1.541 -1.747 -1.905 -2.076 -2.439 -2.67 -2.932 -3.191 -3.485 -3.813 -4.219 -5.37 -5 ,10616 ,KEBNE ,16677457,Wed Nov 24 20:12:20 CET,Wed Nov 24 21:37:58 CET,0.0 1.011 1.462 1.779 2.032 2.257 2.467 2.656 2.982 3.121 3.259 3.468 3.672 3.8 4.022 4.235 4.45 4.556 4.75 4.92 5.15 5.29 5.425 5.624 5.818 5.989 6.164 6.343 6.551 6.751 6.943 7.179 7.405 7.61 7.842 8.102 8.344 8.602 8.88 9.163 9.443 9.739 10.061 10.369 10.692 11.009 11.36 11.691 11.975 12.147 11.961 11.36 10.635 9.884 9.175 8.518 7.959 7.432 6.936 6.425 5.996 5.608 5.225 4.854 4.511 4.203 3.867 3.553 3.28 3.003 2.702 2.45 2.197 1.929 1.713 1.496 1.272 1.03 0.778 0.606 0.425 0.126 -0.091 -0.311 -0.416 -0.631 -0.864 -1.12 -1.259 -1.478 -1.717 -1.882 -2.049 -2.44 -2.655 -2.883 -3.136 -3.404 -3.772 -4.332 -5.717 -6 ,30527 ,KEBNE ,16677458,Wed Nov 24 20:12:15 CET,Wed Nov 24 21:34:41 CET,0.0 0.999 1.466 1.781 2.047 2.291 2.506 2.695 3.04 3.206 3.357 3.559 3.757 3.871 4.071 4.266 4.466 4.563 4.745 4.923 5.165 5.309 5.445 5.644 5.845 6.034 6.221 6.391 6.585 6.779 6.971 7.195 7.392 7.583 7.817 8.078 8.313 8.567 8.834 9.09 9.358 9.661 10.004 10.308 10.626 10.944 11.235 11.542 11.804 11.991 11.872 11.257 10.575 9.889 9.282 8.693 8.129 7.593 7.118 6.642 6.224 5.839 5.456 5.089 4.743 4.429 4.111 3.819 3.558 3.292 3.009 2.766 2.515 2.258 2.055 1.838 1.607 1.363 1.12 0.959 0.79 0.509 0.296 0.078 -0.027 -0.255 -0.5 -0.756 -0.89 -1.101 -1.33 -1.505 -1.685 -2.038 -2.233 -2.457 -2.711 -2.998 -3.339 -3.804 -5.122 -7 ,17336 ,KEBNE ,16677459,Wed Nov 24 20:12:16 CET,Wed Nov 24 21:35:41 CET,0.0 1.215 1.689 2.034 2.317 2.551 2.768 2.963 3.292 3.457 3.611 3.82 4.017 4.131 4.35 4.562 4.767 4.865 5.041 5.218 5.481 5.649 5.811 6.014 6.193 6.374 6.554 6.716 6.931 7.142 7.335 7.568 7.788 8.001 8.242 8.492 8.726 8.988 9.266 9.543 9.804 10.077 10.38 10.681 11.022 11.395 11.747 12.033 12.318 12.507 12.31 11.69 11.014 10.331 9.668 9.031 8.445 7.907 7.423 6.929 6.502 6.123 5.761 5.406 5.07 4.765 4.442 4.149 3.899 3.636 3.341 3.09 2.84 2.586 2.384 2.168 1.947 1.723 1.484 1.309 1.126 0.831 0.621 0.417 0.309 0.072 -0.168 -0.428 -0.57 -0.785 -1.043 -1.221 -1.382 -1.743 -1.968 -2.206 -2.445 -2.752 -3.151 -3.649 -4.919 -8 ,21617 ,KEBNE ,16677460,Wed Nov 24 20:12:16 CET,Wed Nov 24 21:34:58 CET,0.0 0.833 1.205 1.494 1.755 1.981 2.181 2.366 2.692 2.831 2.957 3.135 3.321 3.433 3.659 3.875 4.071 4.174 4.368 4.547 4.794 4.946 5.094 5.3 5.501 5.687 5.862 6.036 6.259 6.468 6.656 6.868 7.081 7.295 7.521 7.769 7.995 8.232 8.489 8.756 9.044 9.377 9.742 10.064 10.399 10.715 11.061 11.405 11.715 11.923 11.794 11.214 10.51 9.783 9.107 8.488 7.9 7.352 6.879 6.388 5.968 5.596 5.24 4.896 4.558 4.255 3.948 3.663 3.4 3.119 2.829 2.59 2.34 2.086 1.879 1.644 1.41 1.176 0.911 0.724 0.533 0.238 0.036 -0.178 -0.291 -0.53 -0.77 -1.023 -1.159 -1.379 -1.618 -1.8 -1.998 -2.412 -2.653 -2.901 -3.149 -3.45 -3.832 -4.39 -5.854 -9 ,13105 ,KEBNE ,16677461,Wed Nov 24 20:12:15 CET,Wed Nov 24 21:34:55 CET,0.0 0.998 1.39 1.703 1.978 2.202 2.399 2.587 2.926 3.089 3.244 3.444 3.633 3.742 3.943 4.14 4.333 4.428 4.617 4.792 5.025 5.171 5.319 5.527 5.723 5.914 6.091 6.27 6.508 6.712 6.903 7.135 7.343 7.541 7.78 8.043 8.287 8.546 8.808 9.058 9.304 9.589 9.908 10.202 10.521 10.833 11.167 11.503 11.739 11.836 11.603 10.919 10.215 9.529 8.905 8.296 7.725 7.199 6.718 6.24 5.825 5.426 5.038 4.668 4.315 3.985 3.639 3.325 3.055 2.793 2.497 2.239 1.984 1.717 1.499 1.265 1.026 0.782 0.53 0.358 0.181 -0.1 -0.302 -0.512 -0.625 -0.856 -1.096 -1.368 -1.519 -1.744 -2.004 -2.191 -2.384 -2.824 -3.068 -3.313 -3.569 -3.861 -4.223 -4.799 -6.269 -10 ,18950 ,KEBNE ,16677462,Wed Nov 24 20:12:15 CET,Wed Nov 24 21:36:28 CET,0.0 1.15 1.593 1.882 2.097 2.305 2.517 2.713 3.036 3.176 3.314 3.506 3.695 3.809 4.027 4.231 4.424 4.515 4.674 4.826 5.067 5.213 5.35 5.571 5.786 5.967 6.136 6.304 6.523 6.732 6.918 7.128 7.315 7.496 7.709 7.949 8.18 8.43 8.685 8.939 9.192 9.466 9.805 10.126 10.452 10.793 11.141 11.448 11.715 11.909 11.747 11.112 10.392 9.654 8.975 8.324 7.709 7.167 6.692 6.202 5.779 5.374 4.974 4.608 4.257 3.925 3.574 3.267 3.009 2.73 2.44 2.209 1.965 1.7 1.488 1.271 1.044 0.814 0.57 0.403 0.235 -0.039 -0.249 -0.476 -0.588 -0.818 -1.067 -1.338 -1.479 -1.697 -1.938 -2.114 -2.284 -2.655 -2.878 -3.102 -3.354 -3.644 -3.982 -4.427 -5.578 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_43.txt deleted file mode 100644 index 4ae7c54e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23119 ,KEBNE ,16677463,Wed Nov 24 20:12:15 CET,Wed Nov 24 21:33:59 CET,0.0 1.074 1.46 1.778 2.044 2.267 2.471 2.644 2.95 3.092 3.219 3.366 3.54 3.641 3.827 4.015 4.199 4.277 4.427 4.567 4.762 4.887 5.013 5.203 5.374 5.527 5.674 5.82 6.006 6.173 6.333 6.524 6.698 6.859 7.053 7.281 7.47 7.653 7.871 8.118 8.36 8.625 8.917 9.171 9.464 9.76 10.022 10.23 10.38 10.432 10.264 9.612 8.825 8.129 7.532 6.924 6.336 5.802 5.329 4.828 4.373 3.976 3.58 3.201 2.858 2.534 2.192 1.878 1.587 1.295 1.01 0.748 0.471 0.192 -0.029 -0.247 -0.482 -0.733 -0.967 -1.132 -1.322 -1.627 -1.85 -2.099 -2.228 -2.492 -2.761 -3.038 -3.19 -3.422 -3.683 -3.873 -4.082 -4.562 -4.833 -5.091 -5.365 -5.747 -6.214 -6.818 -8.588 -2 ,17696 ,KEBNE ,16677464,Wed Nov 24 20:12:15 CET,Wed Nov 24 21:34:14 CET,0.0 1.078 1.456 1.755 2.03 2.282 2.484 2.67 2.991 3.126 3.247 3.403 3.583 3.692 3.892 4.081 4.261 4.345 4.498 4.637 4.822 4.929 5.039 5.221 5.399 5.559 5.713 5.862 6.059 6.258 6.444 6.644 6.823 6.994 7.172 7.371 7.58 7.805 8.021 8.249 8.504 8.774 9.049 9.289 9.551 9.795 10.046 10.296 10.488 10.527 10.192 9.511 8.765 8.038 7.396 6.744 6.119 5.564 5.046 4.503 4.051 3.638 3.238 2.872 2.526 2.192 1.839 1.52 1.253 0.982 0.684 0.421 0.157 -0.112 -0.333 -0.55 -0.784 -1.05 -1.307 -1.485 -1.673 -1.978 -2.196 -2.42 -2.542 -2.805 -3.076 -3.333 -3.478 -3.721 -4.015 -4.208 -4.404 -4.829 -5.059 -5.308 -5.586 -5.911 -6.303 -6.844 -9.015 -3 ,19782 ,KEBNE ,16677465,Wed Nov 24 20:12:15 CET,Wed Nov 24 21:35:47 CET,0.0 1.471 1.958 2.265 2.524 2.75 2.956 3.14 3.449 3.587 3.717 3.91 4.103 4.214 4.425 4.619 4.794 4.879 5.044 5.195 5.403 5.545 5.675 5.847 6.016 6.178 6.339 6.494 6.683 6.855 7.014 7.194 7.359 7.523 7.714 7.91 8.105 8.33 8.552 8.774 8.999 9.251 9.532 9.786 10.05 10.329 10.642 10.934 11.151 11.211 10.965 10.361 9.72 9.035 8.318 7.635 7.032 6.483 5.985 5.475 5.022 4.596 4.196 3.827 3.48 3.169 2.836 2.524 2.251 1.97 1.672 1.418 1.164 0.901 0.677 0.441 0.186 -0.082 -0.351 -0.541 -0.734 -1.035 -1.247 -1.471 -1.586 -1.822 -2.092 -2.401 -2.561 -2.785 -3.021 -3.2 -3.393 -3.803 -4.024 -4.286 -4.585 -4.921 -5.351 -5.928 -9.592 -4 ,18768 ,KEBNE ,16677466,Wed Nov 24 20:12:15 CET,Wed Nov 24 21:34:21 CET,0.0 0.812 1.175 1.455 1.712 1.929 2.113 2.273 2.553 2.704 2.854 3.04 3.222 3.333 3.543 3.723 3.891 3.97 4.121 4.275 4.488 4.613 4.736 4.906 5.058 5.212 5.366 5.514 5.697 5.875 6.046 6.231 6.396 6.553 6.743 6.956 7.139 7.343 7.565 7.787 8.009 8.254 8.522 8.782 9.072 9.351 9.604 9.815 9.977 9.963 9.65 8.95 8.199 7.541 6.959 6.405 5.846 5.269 4.729 4.189 3.727 3.312 2.903 2.512 2.153 1.817 1.469 1.162 0.898 0.629 0.332 0.07 -0.204 -0.492 -0.71 -0.932 -1.172 -1.427 -1.681 -1.863 -2.064 -2.376 -2.603 -2.865 -2.999 -3.261 -3.528 -3.807 -3.949 -4.162 -4.41 -4.586 -4.77 -5.205 -5.465 -5.738 -6.037 -6.393 -6.83 -7.405 -9.536 -5 ,4781 ,KEBNE ,16677467,Wed Nov 24 20:13:17 CET,Wed Nov 24 21:36:05 CET,0.0 1.22 1.623 1.918 2.175 2.395 2.594 2.785 3.105 3.242 3.373 3.554 3.743 3.851 4.063 4.266 4.46 4.552 4.711 4.857 5.068 5.2 5.331 5.514 5.683 5.843 5.987 6.127 6.306 6.467 6.629 6.82 7.006 7.188 7.379 7.578 7.769 7.977 8.204 8.438 8.658 8.9 9.154 9.401 9.704 10.012 10.302 10.568 10.76 10.821 10.511 9.798 9.053 8.307 7.619 6.962 6.359 5.799 5.31 4.792 4.356 3.969 3.577 3.185 2.823 2.506 2.166 1.854 1.591 1.301 0.987 0.739 0.488 0.211 -0.019 -0.259 -0.515 -0.785 -1.072 -1.263 -1.455 -1.767 -1.995 -2.231 -2.356 -2.609 -2.856 -3.114 -3.256 -3.494 -3.783 -3.97 -4.159 -4.558 -4.787 -5.061 -5.378 -5.76 -6.214 -6.881 -9.14 -6 ,464 ,KEBNE ,16677468,Wed Nov 24 20:13:17 CET,Wed Nov 24 21:36:23 CET,0.0 1.205 1.645 1.92 2.162 2.39 2.588 2.766 3.062 3.2 3.332 3.51 3.696 3.792 3.991 4.195 4.37 4.451 4.596 4.74 4.956 5.09 5.221 5.408 5.592 5.765 5.918 6.056 6.23 6.39 6.551 6.75 6.933 7.107 7.299 7.517 7.729 7.93 8.122 8.324 8.541 8.77 9.009 9.264 9.544 9.811 10.092 10.35 10.504 10.525 10.247 9.566 8.864 8.166 7.486 6.848 6.262 5.684 5.175 4.7 4.287 3.901 3.515 3.133 2.781 2.456 2.11 1.813 1.537 1.241 0.94 0.678 0.401 0.124 -0.092 -0.333 -0.58 -0.824 -1.088 -1.28 -1.486 -1.797 -2.008 -2.244 -2.365 -2.605 -2.876 -3.17 -3.329 -3.566 -3.828 -4.019 -4.237 -4.693 -4.933 -5.205 -5.491 -5.821 -6.269 -6.887 -8.786 -7 ,20705 ,KEBNE ,16677469,Wed Nov 24 20:13:17 CET,Wed Nov 24 21:36:59 CET,0.0 1.419 1.884 2.172 2.423 2.653 2.835 3.017 3.373 3.526 3.655 3.823 4.012 4.12 4.308 4.489 4.66 4.74 4.892 5.035 5.231 5.346 5.453 5.621 5.793 5.944 6.084 6.216 6.382 6.551 6.715 6.912 7.092 7.262 7.451 7.637 7.83 8.044 8.262 8.496 8.714 8.951 9.228 9.497 9.773 10.052 10.34 10.588 10.78 10.836 10.545 9.871 9.116 8.374 7.686 7.029 6.429 5.897 5.43 4.936 4.502 4.089 3.698 3.315 2.932 2.599 2.265 1.949 1.667 1.383 1.08 0.823 0.558 0.255 0.011 -0.233 -0.48 -0.732 -1.003 -1.196 -1.396 -1.726 -1.964 -2.199 -2.318 -2.558 -2.814 -3.107 -3.257 -3.477 -3.724 -3.897 -4.091 -4.523 -4.752 -5.007 -5.295 -5.63 -6.057 -6.623 -8.493 -8 ,5557 ,KEBNE ,16677470,Wed Nov 24 20:13:17 CET,Wed Nov 24 21:36:23 CET,0.0 1.216 1.597 1.873 2.123 2.344 2.524 2.698 2.993 3.128 3.25 3.404 3.584 3.693 3.917 4.122 4.297 4.379 4.54 4.697 4.909 5.039 5.164 5.339 5.511 5.68 5.839 5.991 6.177 6.352 6.514 6.715 6.899 7.069 7.272 7.49 7.676 7.873 8.103 8.325 8.548 8.803 9.073 9.303 9.533 9.755 9.973 10.178 10.312 10.31 10.015 9.295 8.47 7.729 7.062 6.435 5.874 5.311 4.792 4.284 3.849 3.436 3.047 2.68 2.309 1.977 1.646 1.344 1.085 0.813 0.519 0.265 -0.013 -0.301 -0.528 -0.755 -0.987 -1.233 -1.486 -1.677 -1.889 -2.216 -2.435 -2.658 -2.776 -3.027 -3.277 -3.547 -3.699 -3.922 -4.179 -4.384 -4.6 -5.022 -5.253 -5.53 -5.82 -6.155 -6.569 -7.148 -8.788 -9 ,20353 ,KEBNE ,16677471,Wed Nov 24 20:13:17 CET,Wed Nov 24 21:35:18 CET,0.0 1.004 1.418 1.735 1.949 2.121 2.311 2.496 2.798 2.936 3.065 3.238 3.421 3.524 3.718 3.902 4.07 4.152 4.321 4.487 4.702 4.83 4.963 5.152 5.317 5.472 5.618 5.777 5.98 6.152 6.312 6.492 6.671 6.846 7.031 7.235 7.43 7.639 7.861 8.085 8.298 8.519 8.778 9.028 9.308 9.602 9.914 10.207 10.406 10.45 10.195 9.607 8.873 8.122 7.429 6.766 6.157 5.569 5.051 4.513 4.061 3.685 3.331 2.97 2.603 2.257 1.883 1.552 1.269 0.975 0.681 0.422 0.144 -0.137 -0.362 -0.591 -0.822 -1.063 -1.315 -1.499 -1.704 -2.035 -2.261 -2.497 -2.623 -2.881 -3.155 -3.441 -3.591 -3.82 -4.099 -4.292 -4.486 -4.886 -5.114 -5.377 -5.684 -6.048 -6.461 -7.045 -8.698 -10 ,22045 ,KEBNE ,16677472,Wed Nov 24 20:13:17 CET,Wed Nov 24 21:36:36 CET,0.0 1.626 2.045 2.305 2.54 2.76 2.953 3.134 3.455 3.593 3.723 3.886 4.072 4.18 4.377 4.559 4.734 4.821 4.977 5.123 5.321 5.447 5.573 5.766 5.942 6.103 6.257 6.393 6.565 6.742 6.905 7.094 7.282 7.451 7.637 7.841 8.027 8.22 8.436 8.679 8.912 9.147 9.397 9.624 9.898 10.184 10.467 10.725 10.913 10.943 10.62 9.902 9.134 8.353 7.599 6.963 6.42 5.872 5.384 4.902 4.466 4.059 3.689 3.325 2.936 2.57 2.201 1.886 1.614 1.325 1.025 0.768 0.497 0.204 -0.034 -0.278 -0.528 -0.793 -1.076 -1.271 -1.464 -1.767 -1.984 -2.21 -2.327 -2.574 -2.842 -3.13 -3.281 -3.513 -3.778 -3.963 -4.172 -4.64 -4.898 -5.183 -5.482 -5.852 -6.313 -6.875 -8.674 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_39.txt deleted file mode 100644 index a3c00887..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21550 ,KEBNE ,16677473,Wed Nov 24 20:13:17 CET,Wed Nov 24 21:35:46 CET,0.0 1.043 1.488 1.821 2.075 2.326 2.563 2.744 3.066 3.219 3.369 3.588 3.806 3.931 4.169 4.372 4.561 4.654 4.828 5.002 5.25 5.404 5.555 5.767 5.961 6.136 6.304 6.466 6.661 6.843 7.032 7.269 7.493 7.707 7.946 8.205 8.442 8.696 8.97 9.251 9.535 9.858 10.222 10.579 10.972 11.365 11.823 12.285 12.697 13.012 13.06 12.646 12.069 11.434 10.858 10.333 9.826 9.29 8.819 8.347 7.905 7.521 7.151 6.791 6.452 6.152 5.834 5.526 5.255 4.968 4.679 4.445 4.191 3.921 3.717 3.487 3.239 2.984 2.718 2.546 2.365 2.061 1.853 1.641 1.521 1.273 1.008 0.719 0.578 0.347 0.076 -0.114 -0.317 -0.758 -0.999 -1.282 -1.605 -1.956 -2.386 -3.041 -5.463 -2 ,17179 ,KEBNE ,16677474,Wed Nov 24 20:13:17 CET,Wed Nov 24 21:35:42 CET,0.0 1.092 1.489 1.788 2.032 2.237 2.433 2.632 2.987 3.129 3.265 3.47 3.682 3.802 4.021 4.218 4.401 4.492 4.664 4.826 5.066 5.22 5.363 5.564 5.758 5.942 6.12 6.292 6.509 6.716 6.918 7.162 7.389 7.598 7.828 8.089 8.336 8.602 8.878 9.165 9.477 9.819 10.2 10.548 10.91 11.29 11.729 12.159 12.55 12.894 13.009 12.635 12.076 11.501 10.915 10.374 9.869 9.356 8.887 8.41 7.997 7.62 7.256 6.893 6.537 6.211 5.88 5.6 5.353 5.069 4.764 4.518 4.282 4.037 3.813 3.584 3.343 3.094 2.848 2.666 2.48 2.185 1.976 1.752 1.63 1.375 1.106 0.835 0.691 0.439 0.179 -0.004 -0.209 -0.607 -0.849 -1.144 -1.481 -1.858 -2.318 -2.965 -5.504 -3 ,19387 ,KEBNE ,16677475,Wed Nov 24 20:13:16 CET,Wed Nov 24 21:35:42 CET,0.0 1.168 1.57 1.888 2.172 2.424 2.635 2.814 3.158 3.327 3.478 3.673 3.879 3.999 4.22 4.427 4.619 4.709 4.883 5.049 5.283 5.431 5.584 5.806 6.006 6.199 6.38 6.549 6.764 6.968 7.176 7.43 7.668 7.883 8.121 8.385 8.628 8.889 9.153 9.424 9.711 10.031 10.387 10.737 11.112 11.488 11.911 12.371 12.841 13.199 13.258 12.827 12.288 11.702 11.091 10.529 10.04 9.549 9.099 8.632 8.204 7.838 7.479 7.12 6.784 6.457 6.106 5.807 5.553 5.289 5.019 4.785 4.541 4.278 4.068 3.853 3.638 3.418 3.174 2.997 2.814 2.527 2.315 2.098 1.981 1.712 1.411 1.123 0.983 0.751 0.49 0.306 0.113 -0.363 -0.62 -0.885 -1.182 -1.514 -1.935 -2.588 -4.97 -4 ,9379 ,KEBNE ,16677476,Wed Nov 24 20:13:17 CET,Wed Nov 24 21:35:47 CET,0.0 1.326 1.791 2.119 2.394 2.63 2.838 3.034 3.37 3.523 3.671 3.86 4.065 4.185 4.401 4.602 4.796 4.889 5.073 5.248 5.495 5.65 5.79 5.989 6.175 6.364 6.538 6.696 6.899 7.097 7.296 7.534 7.759 7.972 8.208 8.465 8.72 8.988 9.258 9.559 9.862 10.163 10.518 10.87 11.251 11.633 12.035 12.472 12.918 13.268 13.351 12.908 12.276 11.64 11.05 10.495 9.954 9.41 8.933 8.428 7.98 7.6 7.246 6.915 6.587 6.271 5.961 5.664 5.379 5.096 4.815 4.581 4.317 4.044 3.836 3.609 3.359 3.094 2.837 2.662 2.479 2.183 1.969 1.752 1.641 1.396 1.123 0.842 0.697 0.455 0.194 -0.005 -0.221 -0.698 -0.959 -1.273 -1.61 -1.949 -2.4 -3.032 -5.573 -5 ,7071 ,KEBNE ,16677477,Wed Nov 24 20:13:17 CET,Wed Nov 24 21:37:39 CET,0.0 1.369 1.836 2.179 2.435 2.662 2.877 3.069 3.388 3.539 3.69 3.876 4.076 4.189 4.399 4.607 4.797 4.884 5.053 5.216 5.455 5.607 5.753 5.954 6.147 6.337 6.525 6.702 6.919 7.127 7.313 7.527 7.737 7.94 8.181 8.449 8.692 8.946 9.213 9.501 9.796 10.114 10.498 10.848 11.205 11.588 12.006 12.452 12.93 13.345 13.388 12.911 12.306 11.654 11.061 10.501 9.945 9.428 8.988 8.52 8.084 7.696 7.314 6.952 6.619 6.305 5.981 5.682 5.405 5.112 4.812 4.587 4.348 4.075 3.868 3.66 3.431 3.186 2.932 2.749 2.555 2.253 2.045 1.813 1.702 1.47 1.202 0.923 0.771 0.53 0.285 0.11 -0.076 -0.502 -0.748 -1.036 -1.366 -1.768 -2.301 -3.002 -5.276 -6 ,7480 ,KEBNE ,16677478,Wed Nov 24 20:14:18 CET,Wed Nov 24 21:38:08 CET,0.0 1.321 1.776 2.104 2.388 2.611 2.805 3.0 3.359 3.512 3.655 3.848 4.052 4.176 4.408 4.611 4.8 4.891 5.071 5.248 5.492 5.644 5.789 6.002 6.195 6.372 6.558 6.74 6.969 7.172 7.358 7.581 7.788 7.985 8.213 8.475 8.738 9.023 9.295 9.555 9.832 10.148 10.525 10.881 11.255 11.644 12.022 12.405 12.814 13.146 13.239 12.79 12.176 11.538 10.911 10.345 9.794 9.236 8.758 8.275 7.859 7.481 7.099 6.725 6.383 6.068 5.752 5.472 5.218 4.954 4.668 4.424 4.163 3.887 3.675 3.458 3.228 2.978 2.711 2.528 2.337 2.014 1.785 1.555 1.43 1.176 0.917 0.628 0.478 0.243 -0.004 -0.193 -0.402 -0.838 -1.076 -1.36 -1.685 -2.048 -2.485 -3.117 -5.447 -7 ,25290 ,KEBNE ,16677479,Wed Nov 24 20:14:19 CET,Wed Nov 24 21:36:42 CET,0.0 1.001 1.438 1.746 1.994 2.219 2.43 2.622 2.938 3.081 3.226 3.406 3.615 3.753 4.002 4.217 4.409 4.501 4.683 4.852 5.076 5.215 5.358 5.573 5.765 5.942 6.107 6.261 6.459 6.654 6.845 7.068 7.296 7.512 7.743 7.994 8.232 8.479 8.731 9.015 9.308 9.625 10.001 10.358 10.724 11.093 11.496 11.913 12.303 12.622 12.66 12.182 11.588 10.975 10.367 9.796 9.266 8.738 8.265 7.827 7.47 7.106 6.734 6.406 6.099 5.794 5.465 5.16 4.899 4.626 4.34 4.087 3.802 3.521 3.311 3.094 2.866 2.635 2.402 2.227 2.022 1.697 1.475 1.256 1.144 0.898 0.632 0.344 0.197 -0.04 -0.269 -0.442 -0.631 -1.028 -1.267 -1.543 -1.851 -2.247 -2.757 -3.497 -6.511 -8 ,17437 ,KEBNE ,16677480,Wed Nov 24 20:14:18 CET,Wed Nov 24 21:36:23 CET,0.0 0.942 1.381 1.718 1.988 2.215 2.427 2.626 2.983 3.149 3.31 3.51 3.713 3.833 4.035 4.222 4.417 4.512 4.685 4.853 5.091 5.234 5.367 5.561 5.74 5.913 6.08 6.234 6.438 6.627 6.806 7.039 7.259 7.46 7.691 7.93 8.158 8.416 8.702 9.003 9.303 9.608 9.935 10.272 10.663 11.061 11.45 11.827 12.199 12.525 12.566 12.167 11.556 10.906 10.323 9.727 9.164 8.638 8.188 7.748 7.39 7.05 6.671 6.308 5.977 5.688 5.376 5.077 4.821 4.559 4.276 4.038 3.798 3.535 3.319 3.098 2.867 2.618 2.358 2.174 1.993 1.709 1.49 1.261 1.144 0.889 0.608 0.302 0.149 -0.083 -0.316 -0.5 -0.685 -1.102 -1.352 -1.613 -1.916 -2.313 -2.753 -3.304 -6.269 -9 ,4408 ,KEBNE ,16677481,Wed Nov 24 20:14:22 CET,Wed Nov 24 21:35:03 CET,0.0 1.203 1.674 2.062 2.356 2.598 2.816 3.01 3.347 3.502 3.649 3.826 4.023 4.147 4.39 4.606 4.796 4.89 5.087 5.262 5.482 5.626 5.771 5.981 6.179 6.362 6.527 6.686 6.914 7.132 7.32 7.543 7.754 7.964 8.202 8.446 8.681 8.938 9.211 9.5 9.808 10.136 10.481 10.821 11.2 11.585 12.007 12.474 12.931 13.25 13.25 12.834 12.258 11.622 11.027 10.44 9.869 9.327 8.85 8.376 7.953 7.569 7.206 6.866 6.549 6.254 5.929 5.61 5.338 5.073 4.78 4.527 4.266 4.0 3.8 3.591 3.375 3.138 2.868 2.68 2.496 2.204 1.992 1.773 1.658 1.413 1.161 0.881 0.723 0.481 0.226 0.031 -0.176 -0.621 -0.878 -1.177 -1.503 -1.87 -2.323 -3.059 -6.079 -10 ,19516 ,KEBNE ,16677482,Wed Nov 24 20:15:20 CET,Wed Nov 24 21:37:42 CET,0.0 1.184 1.619 1.932 2.207 2.451 2.664 2.857 3.195 3.348 3.492 3.68 3.889 4.005 4.226 4.439 4.637 4.733 4.918 5.099 5.349 5.502 5.647 5.851 6.029 6.196 6.365 6.529 6.75 6.974 7.179 7.414 7.638 7.863 8.114 8.363 8.588 8.836 9.115 9.406 9.699 10.017 10.358 10.67 11.029 11.434 11.866 12.257 12.608 12.896 12.918 12.52 11.957 11.318 10.704 10.087 9.541 9.057 8.623 8.171 7.759 7.381 7.007 6.649 6.327 6.035 5.707 5.405 5.151 4.887 4.601 4.346 4.075 3.801 3.59 3.371 3.145 2.918 2.676 2.504 2.325 2.011 1.783 1.552 1.431 1.191 0.929 0.645 0.503 0.265 0.007 -0.177 -0.373 -0.824 -1.087 -1.377 -1.695 -2.055 -2.465 -3.008 -4.801 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_43.txt deleted file mode 100644 index de604056..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22877 ,KEBNE ,16677483,Wed Nov 24 20:15:24 CET,Wed Nov 24 21:41:51 CET,0.0 1.578 1.98 2.28 2.535 2.762 2.97 3.162 3.492 3.652 3.813 4.047 4.261 4.374 4.6 4.809 4.998 5.085 5.251 5.41 5.638 5.782 5.921 6.137 6.34 6.522 6.693 6.858 7.072 7.267 7.443 7.659 7.878 8.093 8.333 8.603 8.851 9.097 9.365 9.656 9.958 10.315 10.707 11.066 11.467 11.876 12.336 12.852 13.39 13.896 14.355 14.474 14.29 13.964 13.595 13.279 12.973 12.652 12.332 11.969 11.655 11.383 11.121 10.852 10.587 10.341 10.077 9.833 9.609 9.365 9.129 8.947 8.758 8.535 8.344 8.159 7.981 7.798 7.6 7.458 7.306 7.067 6.888 6.69 6.599 6.4 6.168 5.926 5.797 5.591 5.377 5.211 5.05 4.712 4.496 4.257 3.998 3.703 3.345 2.857 0.995 -2 ,1483 ,KEBNE ,16677484,Wed Nov 24 20:16:22 CET,Wed Nov 24 21:38:40 CET,0.0 1.061 1.508 1.867 2.152 2.371 2.554 2.724 3.048 3.193 3.328 3.515 3.719 3.83 4.05 4.256 4.438 4.531 4.717 4.885 5.113 5.264 5.415 5.626 5.81 5.986 6.164 6.329 6.537 6.741 6.932 7.163 7.389 7.606 7.85 8.111 8.355 8.629 8.929 9.234 9.518 9.828 10.201 10.57 10.994 11.434 11.919 12.422 12.955 13.538 14.046 14.132 13.929 13.635 13.313 12.972 12.656 12.36 12.078 11.765 11.469 11.21 10.95 10.694 10.447 10.196 9.945 9.725 9.52 9.305 9.087 8.902 8.7 8.492 8.33 8.157 7.978 7.784 7.564 7.409 7.253 7.01 6.839 6.65 6.552 6.344 6.129 5.911 5.785 5.576 5.37 5.218 5.058 4.708 4.513 4.278 3.977 3.669 3.32 2.828 1.073 -3 ,8858 ,KEBNE ,16677485,Wed Nov 24 20:15:26 CET,Wed Nov 24 21:34:48 CET,0.0 1.328 1.743 2.041 2.293 2.523 2.752 2.963 3.324 3.478 3.612 3.793 3.992 4.105 4.325 4.534 4.729 4.818 4.992 5.163 5.407 5.551 5.692 5.895 6.073 6.246 6.418 6.59 6.807 7.002 7.184 7.403 7.611 7.807 8.043 8.329 8.6 8.882 9.194 9.5 9.789 10.116 10.49 10.855 11.258 11.686 12.163 12.669 13.211 13.754 14.178 14.232 14.029 13.782 13.514 13.174 12.833 12.514 12.2 11.875 11.588 11.305 11.026 10.751 10.481 10.252 9.986 9.736 9.538 9.322 9.102 8.913 8.707 8.494 8.331 8.157 7.97 7.77 7.558 7.414 7.249 6.972 6.79 6.608 6.52 6.339 6.124 5.863 5.722 5.504 5.289 5.132 4.957 4.59 4.382 4.139 3.874 3.579 3.241 2.759 0.88 -4 ,23212 ,KEBNE ,16677486,Wed Nov 24 20:15:20 CET,Wed Nov 24 21:37:10 CET,0.0 0.929 1.359 1.727 2.007 2.23 2.452 2.652 2.98 3.144 3.3 3.499 3.697 3.81 4.034 4.242 4.422 4.506 4.675 4.844 5.082 5.235 5.388 5.6 5.771 5.927 6.092 6.254 6.459 6.657 6.851 7.08 7.292 7.489 7.717 7.973 8.21 8.474 8.758 9.045 9.337 9.642 9.992 10.364 10.785 11.251 11.758 12.282 12.859 13.438 13.863 13.929 13.772 13.489 13.202 12.904 12.573 12.205 11.852 11.516 11.231 10.964 10.7 10.43 10.162 9.913 9.659 9.433 9.236 9.017 8.787 8.605 8.415 8.202 8.029 7.855 7.665 7.453 7.227 7.068 6.901 6.653 6.48 6.286 6.182 5.97 5.751 5.509 5.383 5.181 4.965 4.804 4.63 4.253 4.024 3.779 3.527 3.222 2.836 2.314 0.611 -5 ,20168 ,KEBNE ,16677487,Wed Nov 24 20:15:20 CET,Wed Nov 24 21:38:52 CET,0.0 1.038 1.496 1.826 2.087 2.315 2.522 2.707 3.024 3.18 3.321 3.487 3.694 3.815 4.027 4.222 4.405 4.492 4.652 4.807 5.031 5.164 5.295 5.502 5.694 5.876 6.049 6.221 6.439 6.643 6.837 7.055 7.262 7.458 7.687 7.949 8.189 8.444 8.71 8.989 9.303 9.665 10.055 10.405 10.787 11.212 11.703 12.23 12.749 13.261 13.66 13.764 13.641 13.357 13.029 12.701 12.349 11.979 11.66 11.314 10.989 10.733 10.479 10.215 9.953 9.697 9.425 9.183 8.979 8.767 8.531 8.331 8.122 7.905 7.73 7.536 7.327 7.11 6.895 6.745 6.587 6.34 6.17 5.991 5.896 5.694 5.474 5.237 5.109 4.906 4.7 4.546 4.391 4.048 3.854 3.629 3.361 3.067 2.705 2.206 0.098 -6 ,7619 ,KEBNE ,16677488,Wed Nov 24 20:16:22 CET,Wed Nov 24 21:38:27 CET,0.0 1.59 2.036 2.372 2.649 2.872 3.082 3.265 3.582 3.724 3.868 4.088 4.29 4.402 4.609 4.819 5.019 5.113 5.287 5.452 5.691 5.828 5.96 6.179 6.389 6.559 6.715 6.875 7.074 7.254 7.434 7.653 7.854 8.054 8.298 8.56 8.801 9.068 9.359 9.661 9.96 10.284 10.662 11.032 11.406 11.849 12.354 12.856 13.414 13.966 14.449 14.585 14.451 14.159 13.802 13.456 13.114 12.79 12.481 12.157 11.903 11.662 11.41 11.155 10.908 10.691 10.462 10.244 10.048 9.846 9.638 9.458 9.262 9.062 8.898 8.724 8.539 8.342 8.14 7.999 7.851 7.617 7.448 7.277 7.188 6.988 6.767 6.546 6.426 6.209 5.999 5.845 5.662 5.273 5.058 4.832 4.602 4.315 3.925 3.396 1.807 -7 ,4719 ,KEBNE ,16677489,Wed Nov 24 20:16:22 CET,Wed Nov 24 21:38:22 CET,0.0 1.219 1.678 2.007 2.274 2.516 2.731 2.907 3.218 3.361 3.494 3.656 3.853 3.979 4.208 4.395 4.583 4.678 4.859 5.029 5.264 5.413 5.552 5.757 5.95 6.133 6.3 6.463 6.687 6.891 7.078 7.297 7.503 7.703 7.944 8.222 8.481 8.756 9.023 9.308 9.625 9.968 10.352 10.699 11.083 11.539 12.038 12.557 13.134 13.682 14.079 14.138 13.947 13.615 13.259 12.899 12.565 12.245 11.952 11.637 11.339 11.059 10.78 10.505 10.243 10.007 9.761 9.537 9.344 9.145 8.928 8.749 8.561 8.329 8.141 7.961 7.772 7.563 7.349 7.201 7.036 6.764 6.576 6.386 6.291 6.099 5.867 5.593 5.471 5.27 5.049 4.895 4.724 4.362 4.15 3.903 3.64 3.327 2.956 2.429 0.62 -8 ,29895 ,KEBNE ,16677490,Wed Nov 24 20:17:23 CET,Wed Nov 24 21:40:29 CET,0.0 1.582 1.993 2.32 2.577 2.81 3.014 3.194 3.519 3.669 3.81 3.983 4.185 4.304 4.519 4.727 4.923 5.016 5.203 5.38 5.626 5.781 5.922 6.122 6.315 6.499 6.678 6.848 7.063 7.269 7.461 7.677 7.891 8.1 8.34 8.613 8.874 9.141 9.422 9.713 10.003 10.332 10.697 11.033 11.446 11.922 12.429 12.921 13.443 13.951 14.361 14.444 14.23 13.924 13.611 13.276 12.956 12.628 12.334 12.045 11.747 11.456 11.18 10.912 10.67 10.452 10.212 9.999 9.805 9.595 9.367 9.176 8.987 8.783 8.623 8.461 8.269 8.07 7.871 7.723 7.558 7.297 7.117 6.919 6.821 6.621 6.414 6.192 6.062 5.851 5.65 5.499 5.336 4.964 4.74 4.499 4.246 3.941 3.569 3.063 1.13 -9 ,29461 ,KEBNE ,16677491,Wed Nov 24 20:17:24 CET,Wed Nov 24 21:41:59 CET,0.0 1.171 1.595 1.895 2.17 2.428 2.641 2.81 3.12 3.27 3.41 3.571 3.763 3.871 4.075 4.263 4.436 4.523 4.689 4.845 5.072 5.217 5.356 5.557 5.737 5.904 6.071 6.243 6.453 6.647 6.847 7.094 7.31 7.501 7.728 7.975 8.208 8.466 8.753 9.044 9.329 9.669 10.069 10.429 10.842 11.295 11.755 12.25 12.81 13.361 13.793 13.868 13.679 13.389 13.058 12.724 12.397 12.063 11.761 11.446 11.152 10.879 10.591 10.301 10.047 9.816 9.568 9.344 9.147 8.943 8.725 8.525 8.302 8.068 7.892 7.714 7.529 7.331 7.115 6.975 6.83 6.587 6.41 6.233 6.147 5.957 5.735 5.49 5.36 5.154 4.951 4.794 4.636 4.303 4.109 3.891 3.635 3.348 2.978 2.49 0.618 -10 ,652 ,KEBNE ,16677492,Wed Nov 24 20:18:26 CET,Wed Nov 24 21:42:42 CET,0.0 1.363 1.806 2.095 2.334 2.561 2.763 2.935 3.244 3.382 3.522 3.717 3.911 4.022 4.242 4.453 4.652 4.746 4.922 5.083 5.318 5.473 5.614 5.808 5.995 6.178 6.358 6.534 6.75 6.946 7.134 7.357 7.557 7.76 8.006 8.258 8.506 8.782 9.041 9.323 9.651 10.004 10.364 10.722 11.152 11.606 12.101 12.65 13.219 13.776 14.216 14.292 14.112 13.82 13.498 13.102 12.677 12.316 12.019 11.701 11.424 11.182 10.937 10.679 10.424 10.179 9.925 9.704 9.52 9.319 9.087 8.888 8.67 8.445 8.28 8.102 7.909 7.703 7.495 7.352 7.187 6.934 6.769 6.593 6.5 6.302 6.092 5.857 5.723 5.511 5.296 5.137 4.975 4.624 4.414 4.18 3.91 3.612 3.229 2.638 0.01 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_43_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_43_39.txt deleted file mode 100644 index 00cbe000..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_43_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6773 ,KEBNE ,16677493,Wed Nov 24 20:18:26 CET,Wed Nov 24 21:40:22 CET,0.0 1.357 1.77 2.091 2.354 2.584 2.784 2.964 3.308 3.457 3.585 3.76 3.955 4.064 4.271 4.475 4.675 4.766 4.93 5.097 5.34 5.483 5.61 5.801 5.987 6.156 6.313 6.465 6.669 6.867 7.065 7.297 7.497 7.682 7.897 8.135 8.373 8.629 8.886 9.149 9.408 9.671 9.961 10.235 10.518 10.827 11.188 11.557 11.866 12.007 11.795 11.141 10.425 9.714 9.024 8.368 7.783 7.271 6.838 6.396 5.995 5.611 5.226 4.872 4.55 4.241 3.916 3.63 3.373 3.099 2.822 2.593 2.337 2.069 1.871 1.673 1.468 1.249 1.014 0.836 0.656 0.378 0.182 -0.011 -0.112 -0.336 -0.565 -0.809 -0.953 -1.187 -1.439 -1.619 -1.804 -2.204 -2.422 -2.655 -2.909 -3.241 -3.644 -4.141 -5.678 -2 ,2192 ,KEBNE ,16675200,Wed Nov 24 03:08:47 CET,Wed Nov 24 04:32:38 CET,0.0 1.327 1.812 2.154 2.416 2.649 2.853 3.039 3.397 3.556 3.696 3.888 4.084 4.19 4.387 4.57 4.749 4.84 5.012 5.167 5.384 5.52 5.656 5.857 6.039 6.207 6.371 6.52 6.705 6.898 7.071 7.255 7.441 7.638 7.857 8.078 8.28 8.498 8.737 8.991 9.245 9.518 9.827 10.123 10.439 10.742 11.069 11.362 11.572 11.667 11.458 10.818 10.12 9.455 8.817 8.234 7.7 7.173 6.704 6.241 5.834 5.449 5.079 4.742 4.422 4.127 3.816 3.527 3.275 3.011 2.725 2.495 2.278 2.049 1.858 1.65 1.441 1.215 0.967 0.81 0.646 0.379 0.2 -0.013 -0.139 -0.39 -0.63 -0.895 -1.046 -1.28 -1.507 -1.672 -1.844 -2.22 -2.442 -2.704 -2.987 -3.282 -3.639 -4.199 -5.892 -3 ,21547 ,KEBNE ,16677495,Wed Nov 24 20:18:26 CET,Wed Nov 24 21:41:39 CET,0.0 1.007 1.395 1.725 2.044 2.308 2.524 2.71 3.014 3.153 3.284 3.462 3.661 3.778 3.983 4.174 4.361 4.456 4.646 4.819 5.039 5.169 5.3 5.493 5.681 5.865 6.031 6.189 6.39 6.575 6.747 6.954 7.145 7.326 7.532 7.755 7.97 8.189 8.42 8.661 8.906 9.171 9.454 9.722 10.029 10.353 10.665 10.954 11.218 11.376 11.24 10.747 10.11 9.405 8.75 8.151 7.629 7.132 6.639 6.133 5.714 5.328 4.943 4.58 4.228 3.909 3.598 3.318 3.065 2.802 2.525 2.287 2.042 1.789 1.592 1.38 1.161 0.938 0.7 0.541 0.373 0.072 -0.139 -0.345 -0.448 -0.664 -0.912 -1.169 -1.298 -1.511 -1.722 -1.894 -2.069 -2.454 -2.671 -2.917 -3.188 -3.492 -3.875 -4.426 -5.839 -4 ,13891 ,KEBNE ,16677496,Wed Nov 24 20:18:29 CET,Wed Nov 24 21:39:54 CET,0.0 1.205 1.623 1.923 2.177 2.412 2.628 2.828 3.186 3.337 3.473 3.678 3.883 4.004 4.23 4.429 4.615 4.704 4.869 5.03 5.258 5.399 5.538 5.736 5.924 6.099 6.255 6.41 6.616 6.809 6.99 7.199 7.391 7.58 7.801 8.029 8.244 8.472 8.703 8.935 9.179 9.442 9.723 10.001 10.309 10.612 10.912 11.169 11.398 11.534 11.297 10.658 10.024 9.352 8.669 8.059 7.487 6.933 6.459 5.981 5.544 5.153 4.767 4.397 4.072 3.761 3.434 3.163 2.921 2.653 2.383 2.156 1.905 1.648 1.445 1.235 1.021 0.784 0.526 0.351 0.176 -0.086 -0.263 -0.46 -0.571 -0.787 -1.01 -1.249 -1.375 -1.597 -1.803 -1.963 -2.15 -2.578 -2.815 -3.059 -3.317 -3.605 -3.97 -4.462 -5.875 -5 ,3392 ,KEBNE ,16677497,Wed Nov 24 20:20:29 CET,Wed Nov 24 21:42:11 CET,0.0 1.128 1.569 1.891 2.167 2.391 2.583 2.759 3.074 3.223 3.359 3.519 3.71 3.82 4.028 4.227 4.411 4.496 4.673 4.84 5.064 5.214 5.357 5.549 5.72 5.883 6.041 6.202 6.416 6.614 6.796 7.003 7.199 7.383 7.596 7.826 8.032 8.256 8.499 8.746 8.984 9.256 9.565 9.85 10.158 10.459 10.771 11.086 11.344 11.455 11.274 10.641 9.939 9.225 8.556 7.947 7.368 6.843 6.399 5.935 5.528 5.162 4.807 4.468 4.152 3.872 3.571 3.287 3.026 2.751 2.473 2.248 2.001 1.744 1.551 1.342 1.113 0.877 0.654 0.499 0.326 0.06 -0.136 -0.346 -0.456 -0.68 -0.898 -1.141 -1.279 -1.503 -1.722 -1.882 -2.04 -2.412 -2.625 -2.849 -3.112 -3.436 -3.851 -4.399 -6.287 -6 ,27938 ,KEBNE ,16677498,Wed Nov 24 20:20:29 CET,Wed Nov 24 21:43:45 CET,0.0 0.896 1.365 1.736 2.018 2.253 2.459 2.643 2.962 3.095 3.22 3.395 3.594 3.711 3.929 4.147 4.335 4.412 4.568 4.726 4.949 5.086 5.213 5.403 5.591 5.757 5.915 6.069 6.263 6.446 6.627 6.847 7.056 7.255 7.465 7.685 7.898 8.131 8.37 8.618 8.874 9.153 9.46 9.751 10.068 10.389 10.694 10.981 11.257 11.389 11.207 10.574 9.9 9.247 8.588 7.96 7.347 6.796 6.358 5.894 5.483 5.12 4.773 4.435 4.106 3.804 3.486 3.191 2.938 2.685 2.406 2.164 1.919 1.67 1.472 1.268 1.07 0.846 0.59 0.421 0.251 -0.027 -0.224 -0.432 -0.543 -0.77 -1.002 -1.259 -1.397 -1.628 -1.845 -2.0 -2.171 -2.537 -2.732 -2.962 -3.25 -3.554 -3.89 -4.459 -6.083 -7 ,2454 ,KEBNE ,16677499,Wed Nov 24 20:20:29 CET,Wed Nov 24 21:43:54 CET,0.0 1.18 1.605 1.897 2.153 2.388 2.602 2.792 3.128 3.284 3.429 3.624 3.816 3.929 4.142 4.339 4.536 4.628 4.8 4.956 5.166 5.312 5.457 5.662 5.853 6.03 6.197 6.353 6.553 6.738 6.92 7.128 7.311 7.498 7.708 7.932 8.135 8.347 8.595 8.876 9.153 9.42 9.68 9.938 10.24 10.525 10.821 11.106 11.356 11.539 11.438 10.851 10.162 9.474 8.811 8.157 7.598 7.092 6.635 6.194 5.793 5.412 5.048 4.69 4.339 4.038 3.734 3.455 3.198 2.914 2.636 2.412 2.166 1.914 1.716 1.492 1.264 1.034 0.791 0.618 0.433 0.13 -0.077 -0.28 -0.387 -0.619 -0.869 -1.126 -1.26 -1.479 -1.669 -1.836 -2.019 -2.396 -2.602 -2.839 -3.091 -3.378 -3.758 -4.264 -5.784 -8 ,5068 ,KEBNE ,16675206,Wed Nov 24 03:08:47 CET,Wed Nov 24 04:31:55 CET,0.0 1.02 1.443 1.754 2.023 2.269 2.462 2.631 2.931 3.08 3.227 3.428 3.63 3.735 3.939 4.134 4.311 4.403 4.588 4.751 4.964 5.104 5.243 5.443 5.631 5.814 5.988 6.148 6.355 6.546 6.732 6.95 7.151 7.338 7.551 7.795 8.027 8.257 8.482 8.719 8.963 9.216 9.508 9.79 10.086 10.368 10.651 10.946 11.192 11.317 11.145 10.543 9.897 9.225 8.564 7.935 7.371 6.85 6.385 5.912 5.504 5.132 4.767 4.409 4.073 3.777 3.46 3.177 2.915 2.622 2.327 2.079 1.814 1.546 1.335 1.117 0.895 0.654 0.408 0.247 0.076 -0.204 -0.403 -0.609 -0.726 -0.963 -1.195 -1.462 -1.605 -1.825 -2.031 -2.198 -2.367 -2.698 -2.908 -3.182 -3.497 -3.86 -4.257 -4.736 -6.402 -9 ,9090 ,KEBNE ,16677501,Wed Nov 24 20:20:29 CET,Wed Nov 24 21:41:59 CET,0.0 1.337 1.822 2.158 2.414 2.645 2.844 3.028 3.371 3.516 3.645 3.817 4.013 4.134 4.358 4.551 4.746 4.843 5.019 5.179 5.408 5.548 5.675 5.851 6.034 6.211 6.373 6.535 6.736 6.913 7.071 7.263 7.45 7.629 7.838 8.061 8.272 8.507 8.743 8.989 9.254 9.538 9.851 10.14 10.438 10.743 11.038 11.284 11.507 11.593 11.358 10.776 10.127 9.453 8.776 8.143 7.602 7.126 6.683 6.209 5.79 5.398 5.019 4.676 4.364 4.077 3.777 3.499 3.244 2.988 2.719 2.481 2.227 1.957 1.752 1.535 1.303 1.072 0.839 0.667 0.482 0.201 0.006 -0.19 -0.293 -0.524 -0.786 -1.054 -1.182 -1.403 -1.622 -1.775 -1.929 -2.263 -2.476 -2.729 -2.999 -3.327 -3.743 -4.274 -5.59 -10 ,13195 ,KEBNE ,16675208,Wed Nov 24 03:08:47 CET,Wed Nov 24 04:32:01 CET,0.0 1.076 1.506 1.818 2.077 2.311 2.525 2.712 3.034 3.188 3.331 3.518 3.719 3.84 4.072 4.295 4.499 4.595 4.783 4.952 5.189 5.346 5.496 5.701 5.891 6.064 6.225 6.38 6.591 6.787 6.969 7.19 7.385 7.566 7.766 7.991 8.209 8.448 8.708 8.964 9.214 9.494 9.803 10.079 10.389 10.718 11.047 11.38 11.659 11.697 11.436 10.826 10.077 9.355 8.733 8.167 7.641 7.112 6.629 6.174 5.789 5.402 5.012 4.668 4.359 4.069 3.764 3.486 3.229 2.957 2.675 2.427 2.173 1.924 1.724 1.512 1.296 1.073 0.829 0.65 0.47 0.173 -0.049 -0.261 -0.375 -0.62 -0.86 -1.119 -1.263 -1.486 -1.693 -1.86 -2.04 -2.441 -2.651 -2.882 -3.165 -3.498 -3.899 -4.441 -6.028 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_44_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_44_43.txt deleted file mode 100644 index cc16d7d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_44_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32150 ,KEBNE ,16677503,Wed Nov 24 20:21:31 CET,Wed Nov 24 21:44:15 CET,0.0 1.325 1.782 2.178 2.509 2.779 3.038 3.267 3.644 3.812 3.976 4.192 4.393 4.522 4.746 4.953 5.165 5.26 5.44 5.615 5.866 6.019 6.154 6.359 6.564 6.748 6.916 7.084 7.306 7.515 7.717 7.963 8.197 8.417 8.671 8.944 9.206 9.485 9.787 10.112 10.446 10.817 11.234 11.628 12.052 12.504 12.989 13.516 14.114 14.715 15.225 15.327 15.103 14.831 14.541 14.225 13.921 13.612 13.328 13.024 12.729 12.462 12.196 11.929 11.677 11.443 11.207 10.985 10.777 10.563 10.347 10.162 9.971 9.77 9.601 9.424 9.23 9.025 8.82 8.669 8.505 8.251 8.081 7.909 7.815 7.611 7.392 7.158 7.027 6.808 6.592 6.441 6.273 5.895 5.695 5.489 5.248 4.919 4.55 4.091 2.907 -2 ,13969 ,KEBNE ,16677504,Wed Nov 24 20:21:30 CET,Wed Nov 24 21:45:01 CET,0.0 1.256 1.712 2.066 2.359 2.593 2.799 2.986 3.348 3.521 3.677 3.881 4.089 4.225 4.474 4.678 4.876 4.975 5.169 5.367 5.652 5.82 5.979 6.208 6.418 6.621 6.826 7.029 7.265 7.486 7.705 7.952 8.176 8.388 8.641 8.929 9.212 9.496 9.788 10.107 10.434 10.776 11.176 11.571 12.018 12.519 13.056 13.599 14.13 14.644 15.113 15.233 15.026 14.753 14.464 14.157 13.848 13.529 13.232 12.921 12.627 12.342 12.078 11.833 11.604 11.381 11.134 10.897 10.685 10.468 10.234 10.041 9.825 9.583 9.396 9.205 9.005 8.803 8.609 8.469 8.308 8.05 7.867 7.675 7.572 7.348 7.122 6.884 6.757 6.548 6.321 6.158 5.981 5.605 5.409 5.18 4.93 4.641 4.282 3.805 2.294 -3 ,3601 ,KEBNE ,16677505,Wed Nov 24 20:21:31 CET,Wed Nov 24 21:46:46 CET,0.0 1.627 2.204 2.64 2.961 3.23 3.473 3.691 4.06 4.218 4.367 4.597 4.817 4.944 5.202 5.431 5.624 5.724 5.924 6.111 6.358 6.513 6.673 6.911 7.118 7.307 7.491 7.673 7.906 8.121 8.33 8.581 8.823 9.041 9.284 9.567 9.835 10.127 10.429 10.739 11.066 11.409 11.808 12.214 12.667 13.152 13.649 14.171 14.695 15.18 15.588 15.622 15.432 15.159 14.851 14.538 14.208 13.891 13.607 13.293 13.008 12.694 12.356 12.086 11.848 11.621 11.392 11.173 10.958 10.739 10.533 10.354 10.16 9.953 9.788 9.624 9.452 9.262 9.044 8.888 8.728 8.49 8.334 8.17 8.082 7.884 7.663 7.434 7.304 7.088 6.889 6.741 6.569 6.214 6.019 5.805 5.549 5.235 4.888 4.446 3.102 -4 ,20613 ,KEBNE ,16677506,Wed Nov 24 20:21:31 CET,Wed Nov 24 21:47:20 CET,0.0 1.605 2.134 2.542 2.857 3.117 3.346 3.555 3.927 4.095 4.253 4.471 4.683 4.802 5.018 5.228 5.445 5.548 5.728 5.904 6.155 6.311 6.454 6.658 6.852 7.049 7.237 7.406 7.633 7.847 8.046 8.288 8.515 8.743 9.013 9.291 9.553 9.851 10.162 10.482 10.803 11.152 11.548 11.934 12.392 12.888 13.381 13.88 14.491 15.102 15.628 15.73 15.535 15.257 14.942 14.623 14.293 13.966 13.695 13.423 13.168 12.915 12.652 12.401 12.167 11.934 11.68 11.456 11.256 11.033 10.806 10.629 10.431 10.208 10.035 9.864 9.686 9.478 9.252 9.104 8.953 8.712 8.522 8.321 8.223 8.016 7.8 7.57 7.451 7.253 7.069 6.925 6.759 6.415 6.226 6.001 5.763 5.482 5.127 4.675 3.583 -5 ,16231 ,KEBNE ,16677507,Wed Nov 24 20:21:31 CET,Wed Nov 24 21:49:30 CET,0.0 1.639 2.081 2.419 2.722 3.007 3.246 3.444 3.82 3.978 4.109 4.303 4.508 4.635 4.874 5.087 5.294 5.391 5.583 5.757 5.996 6.156 6.315 6.535 6.742 6.933 7.102 7.269 7.493 7.716 7.94 8.203 8.449 8.674 8.911 9.177 9.434 9.724 10.024 10.312 10.627 10.996 11.415 11.823 12.282 12.735 13.234 13.774 14.308 14.814 15.198 15.27 15.103 14.85 14.564 14.257 13.958 13.639 13.313 12.961 12.654 12.371 12.109 11.869 11.628 11.395 11.15 10.926 10.737 10.53 10.29 10.086 9.889 9.691 9.529 9.347 9.155 8.957 8.737 8.588 8.435 8.189 8.02 7.833 7.728 7.521 7.313 7.078 6.947 6.732 6.517 6.365 6.197 5.793 5.573 5.344 5.068 4.745 4.381 3.871 2.778 -6 ,1594 ,KEBNE ,16675234,Wed Nov 24 03:17:00 CET,Wed Nov 24 04:40:51 CET,0.0 1.551 2.013 2.383 2.727 3.008 3.224 3.408 3.715 3.865 4.016 4.208 4.409 4.531 4.778 4.999 5.192 5.284 5.461 5.638 5.889 6.037 6.185 6.411 6.624 6.826 7.017 7.202 7.436 7.652 7.862 8.115 8.355 8.582 8.835 9.118 9.395 9.706 10.029 10.354 10.674 11.021 11.433 11.832 12.267 12.72 13.222 13.733 14.278 14.814 15.203 15.238 15.037 14.724 14.385 14.039 13.681 13.346 13.049 12.702 12.386 12.13 11.87 11.62 11.391 11.163 10.928 10.706 10.49 10.262 10.034 9.849 9.655 9.447 9.287 9.117 8.936 8.748 8.542 8.389 8.229 7.986 7.804 7.611 7.513 7.321 7.117 6.881 6.755 6.547 6.357 6.214 6.05 5.667 5.461 5.235 4.955 4.64 4.296 3.789 2.599 -7 ,3779 ,KEBNE ,16675235,Wed Nov 24 03:17:00 CET,Wed Nov 24 04:39:11 CET,0.0 1.368 1.85 2.193 2.497 2.753 2.974 3.173 3.547 3.721 3.886 4.124 4.331 4.446 4.67 4.882 5.08 5.176 5.361 5.538 5.802 5.97 6.131 6.353 6.549 6.746 6.937 7.118 7.36 7.577 7.768 8.0 8.228 8.46 8.724 8.996 9.273 9.574 9.88 10.204 10.531 10.878 11.283 11.68 12.112 12.593 13.132 13.693 14.247 14.766 15.175 15.197 15.006 14.733 14.431 14.125 13.801 13.457 13.151 12.833 12.547 12.301 12.058 11.804 11.552 11.336 11.113 10.878 10.672 10.466 10.242 10.055 9.853 9.621 9.442 9.265 9.091 8.913 8.709 8.557 8.406 8.175 8.003 7.815 7.718 7.518 7.299 7.054 6.922 6.712 6.505 6.353 6.188 5.814 5.6 5.375 5.133 4.855 4.495 3.932 2.644 -8 ,21452 ,KEBNE ,16675236,Wed Nov 24 03:17:00 CET,Wed Nov 24 04:40:36 CET,0.0 1.611 2.093 2.474 2.782 3.015 3.217 3.408 3.762 3.938 4.099 4.298 4.501 4.624 4.862 5.079 5.286 5.385 5.57 5.743 6.009 6.183 6.34 6.554 6.747 6.928 7.101 7.274 7.493 7.708 7.928 8.175 8.401 8.617 8.866 9.162 9.442 9.729 10.027 10.345 10.683 11.046 11.433 11.803 12.24 12.704 13.199 13.713 14.237 14.743 15.117 15.145 15.005 14.715 14.359 14.021 13.677 13.329 13.029 12.727 12.463 12.209 11.947 11.682 11.433 11.221 10.993 10.776 10.583 10.371 10.142 9.94 9.722 9.5 9.327 9.148 8.951 8.745 8.524 8.362 8.204 7.952 7.778 7.596 7.498 7.294 7.07 6.825 6.704 6.506 6.316 6.174 6.018 5.657 5.442 5.201 4.944 4.662 4.303 3.804 2.706 -9 ,28369 ,KEBNE ,16677511,Wed Nov 24 20:23:34 CET,Wed Nov 24 21:47:13 CET,0.0 1.501 2.062 2.42 2.717 2.988 3.205 3.398 3.776 3.943 4.106 4.348 4.569 4.704 4.963 5.207 5.435 5.538 5.728 5.901 6.137 6.291 6.453 6.692 6.896 7.079 7.267 7.454 7.69 7.911 8.113 8.35 8.584 8.805 9.063 9.35 9.598 9.87 10.182 10.5 10.822 11.171 11.569 11.991 12.455 12.947 13.489 14.036 14.6 15.116 15.58 15.716 15.537 15.251 14.935 14.611 14.274 13.925 13.627 13.33 13.044 12.772 12.494 12.212 11.965 11.748 11.506 11.285 11.091 10.883 10.652 10.466 10.276 10.058 9.891 9.716 9.525 9.325 9.122 8.976 8.816 8.577 8.414 8.234 8.138 7.942 7.733 7.497 7.371 7.161 6.952 6.8 6.639 6.288 6.074 5.824 5.556 5.265 4.897 4.435 3.336 -10 ,24373 ,KEBNE ,16675238,Wed Nov 24 03:17:01 CET,Wed Nov 24 04:38:14 CET,0.0 1.432 1.946 2.3 2.587 2.822 3.041 3.245 3.617 3.778 3.927 4.147 4.368 4.499 4.724 4.93 5.131 5.232 5.42 5.59 5.854 6.013 6.152 6.354 6.546 6.738 6.916 7.088 7.32 7.535 7.747 8.029 8.295 8.529 8.79 9.065 9.33 9.62 9.915 10.224 10.545 10.907 11.291 11.653 12.056 12.488 13.005 13.556 14.111 14.662 15.098 15.13 14.909 14.612 14.312 13.986 13.677 13.39 13.121 12.818 12.524 12.256 12.0 11.75 11.49 11.241 10.997 10.779 10.586 10.381 10.162 9.974 9.774 9.553 9.369 9.184 8.992 8.777 8.564 8.418 8.252 7.998 7.818 7.623 7.521 7.308 7.085 6.847 6.715 6.495 6.274 6.115 5.952 5.62 5.431 5.205 4.931 4.627 4.279 3.768 2.294 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_44.txt deleted file mode 100644 index 07b96fd2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19111 ,KEBNE ,16677513,Wed Nov 24 20:23:34 CET,Wed Nov 24 21:49:13 CET,0.0 1.066 1.491 1.77 2.003 2.197 2.391 2.584 2.893 3.019 3.138 3.291 3.463 3.566 3.778 3.972 4.133 4.206 4.353 4.504 4.717 4.856 4.984 5.138 5.286 5.432 5.568 5.689 5.836 5.979 6.119 6.288 6.447 6.603 6.779 6.956 7.117 7.279 7.45 7.625 7.786 7.953 8.141 8.307 8.449 8.551 8.631 8.68 8.608 8.342 7.719 6.697 5.73 4.884 4.152 3.493 2.892 2.327 1.814 1.311 0.882 0.496 0.136 -0.212 -0.546 -0.845 -1.157 -1.441 -1.68 -1.93 -2.198 -2.429 -2.673 -2.925 -3.113 -3.306 -3.516 -3.748 -3.989 -4.145 -4.317 -4.588 -4.768 -4.967 -5.076 -5.303 -5.53 -5.77 -5.9 -6.114 -6.319 -6.482 -6.656 -6.995 -7.195 -7.431 -7.696 -8.015 -8.417 -8.869 -9.888 -2 ,28340 ,KEBNE ,16677514,Wed Nov 24 20:23:38 CET,Wed Nov 24 21:41:38 CET,0.0 1.151 1.547 1.841 2.109 2.341 2.533 2.707 3.01 3.15 3.294 3.479 3.649 3.748 3.941 4.117 4.279 4.353 4.5 4.645 4.849 4.975 5.091 5.263 5.441 5.604 5.731 5.846 6.007 6.164 6.304 6.463 6.615 6.762 6.925 7.098 7.261 7.436 7.618 7.775 7.915 8.065 8.219 8.371 8.538 8.672 8.764 8.829 8.793 8.548 7.886 6.904 5.989 5.132 4.363 3.662 3.059 2.52 2.051 1.557 1.125 0.761 0.408 0.061 -0.269 -0.583 -0.91 -1.197 -1.452 -1.714 -1.981 -2.211 -2.447 -2.693 -2.893 -3.095 -3.297 -3.514 -3.741 -3.893 -4.049 -4.309 -4.504 -4.703 -4.807 -5.03 -5.268 -5.535 -5.679 -5.891 -6.087 -6.242 -6.404 -6.753 -6.965 -7.208 -7.458 -7.745 -8.102 -8.565 -9.625 -3 ,5219 ,KEBNE ,16677515,Wed Nov 24 20:24:35 CET,Wed Nov 24 21:46:27 CET,0.0 1.229 1.625 1.906 2.138 2.338 2.509 2.654 2.934 3.078 3.216 3.396 3.576 3.686 3.88 4.043 4.203 4.282 4.425 4.557 4.744 4.873 4.995 5.152 5.297 5.431 5.578 5.728 5.896 6.046 6.184 6.343 6.49 6.631 6.803 6.989 7.149 7.301 7.463 7.64 7.791 7.945 8.135 8.291 8.439 8.583 8.717 8.803 8.784 8.567 7.923 6.931 5.948 5.053 4.3 3.61 3.011 2.463 1.96 1.464 1.037 0.655 0.288 -0.064 -0.401 -0.711 -1.021 -1.293 -1.545 -1.807 -2.071 -2.296 -2.532 -2.777 -2.981 -3.196 -3.41 -3.639 -3.882 -4.054 -4.228 -4.502 -4.687 -4.871 -4.974 -5.182 -5.4 -5.653 -5.791 -6.001 -6.21 -6.371 -6.538 -6.911 -7.13 -7.375 -7.622 -7.892 -8.22 -8.68 -9.818 -4 ,22445 ,KEBNE ,16677516,Wed Nov 24 20:24:35 CET,Wed Nov 24 21:47:55 CET,0.0 1.048 1.457 1.784 2.042 2.238 2.427 2.601 2.895 3.034 3.17 3.342 3.52 3.631 3.842 4.027 4.202 4.286 4.441 4.589 4.791 4.92 5.044 5.218 5.392 5.549 5.696 5.838 6.009 6.171 6.329 6.513 6.682 6.833 6.994 7.187 7.372 7.552 7.742 7.933 8.122 8.344 8.577 8.752 8.915 9.061 9.183 9.248 9.22 9.002 8.313 7.319 6.429 5.577 4.777 4.056 3.447 2.892 2.405 1.895 1.454 1.077 0.705 0.355 0.039 -0.261 -0.574 -0.868 -1.134 -1.401 -1.681 -1.924 -2.173 -2.426 -2.623 -2.828 -3.044 -3.265 -3.503 -3.669 -3.838 -4.11 -4.306 -4.52 -4.629 -4.845 -5.085 -5.355 -5.498 -5.717 -5.931 -6.086 -6.249 -6.623 -6.831 -7.045 -7.284 -7.558 -7.89 -8.383 -9.647 -5 ,22643 ,KEBNE ,16677517,Wed Nov 24 20:24:35 CET,Wed Nov 24 21:46:52 CET,0.0 0.753 1.144 1.45 1.708 1.901 2.076 2.239 2.526 2.662 2.796 2.97 3.142 3.241 3.437 3.625 3.79 3.863 4.009 4.154 4.358 4.486 4.601 4.76 4.906 5.043 5.183 5.31 5.465 5.619 5.767 5.932 6.112 6.279 6.448 6.642 6.807 6.987 7.158 7.331 7.519 7.698 7.917 8.13 8.312 8.461 8.575 8.642 8.606 8.347 7.663 6.611 5.65 4.805 4.015 3.303 2.701 2.124 1.63 1.153 0.745 0.375 0.005 -0.336 -0.668 -0.989 -1.309 -1.592 -1.832 -2.074 -2.334 -2.565 -2.814 -3.06 -3.249 -3.461 -3.683 -3.928 -4.178 -4.338 -4.498 -4.751 -4.934 -5.124 -5.222 -5.428 -5.657 -5.897 -6.029 -6.246 -6.471 -6.628 -6.789 -7.16 -7.365 -7.596 -7.854 -8.141 -8.507 -8.993 -10.193 -6 ,2529 ,KEBNE ,16677518,Wed Nov 24 20:24:35 CET,Wed Nov 24 21:46:34 CET,0.0 1.059 1.457 1.746 1.994 2.21 2.393 2.55 2.834 2.968 3.101 3.281 3.457 3.561 3.758 3.948 4.123 4.204 4.364 4.51 4.719 4.853 4.965 5.128 5.292 5.434 5.568 5.698 5.859 6.015 6.18 6.378 6.537 6.68 6.845 7.005 7.147 7.296 7.445 7.614 7.787 7.956 8.128 8.298 8.477 8.628 8.743 8.777 8.711 8.471 7.826 6.796 5.822 4.965 4.22 3.515 2.875 2.3 1.81 1.332 0.914 0.529 0.152 -0.212 -0.569 -0.904 -1.241 -1.54 -1.803 -2.066 -2.34 -2.58 -2.82 -3.075 -3.276 -3.479 -3.695 -3.919 -4.159 -4.326 -4.505 -4.794 -4.989 -5.188 -5.293 -5.521 -5.756 -6.005 -6.143 -6.363 -6.61 -6.789 -6.968 -7.365 -7.585 -7.823 -8.078 -8.34 -8.644 -9.06 -10.034 -7 ,16459 ,KEBNE ,16677519,Wed Nov 24 20:24:35 CET,Wed Nov 24 21:48:12 CET,0.0 0.982 1.392 1.648 1.875 2.096 2.296 2.471 2.779 2.917 3.054 3.245 3.422 3.522 3.724 3.918 4.086 4.165 4.318 4.447 4.618 4.743 4.875 5.056 5.209 5.338 5.46 5.579 5.727 5.882 6.033 6.185 6.331 6.48 6.639 6.809 6.969 7.144 7.32 7.487 7.647 7.827 8.023 8.177 8.321 8.454 8.546 8.58 8.517 8.258 7.588 6.591 5.654 4.782 4.015 3.319 2.695 2.126 1.633 1.135 0.705 0.317 -0.055 -0.41 -0.744 -1.041 -1.346 -1.624 -1.868 -2.133 -2.401 -2.623 -2.861 -3.118 -3.326 -3.536 -3.749 -3.971 -4.21 -4.373 -4.54 -4.823 -5.022 -5.23 -5.339 -5.56 -5.787 -6.032 -6.169 -6.394 -6.637 -6.803 -6.977 -7.367 -7.574 -7.809 -8.072 -8.372 -8.736 -9.225 -10.191 -8 ,17099 ,KEBNE ,16677520,Wed Nov 24 20:24:36 CET,Wed Nov 24 21:48:12 CET,0.0 1.023 1.411 1.7 1.965 2.184 2.369 2.528 2.801 2.922 3.044 3.211 3.387 3.494 3.691 3.854 4.006 4.078 4.216 4.354 4.553 4.67 4.783 4.941 5.092 5.246 5.389 5.518 5.678 5.835 5.982 6.156 6.325 6.487 6.655 6.822 6.977 7.139 7.304 7.473 7.652 7.829 8.007 8.18 8.35 8.481 8.591 8.697 8.682 8.433 7.795 6.787 5.871 5.03 4.26 3.576 2.947 2.345 1.832 1.344 0.914 0.517 0.143 -0.21 -0.543 -0.839 -1.147 -1.426 -1.668 -1.923 -2.188 -2.408 -2.654 -2.919 -3.128 -3.335 -3.538 -3.76 -3.998 -4.164 -4.334 -4.6 -4.799 -5.005 -5.11 -5.338 -5.583 -5.831 -5.958 -6.166 -6.375 -6.535 -6.7 -7.085 -7.311 -7.536 -7.759 -8.034 -8.382 -8.829 -9.723 -9 ,940 ,KEBNE ,16677521,Wed Nov 24 20:24:37 CET,Wed Nov 24 21:52:49 CET,0.0 0.89 1.297 1.601 1.849 2.07 2.262 2.414 2.689 2.821 2.948 3.118 3.288 3.388 3.578 3.764 3.936 4.012 4.168 4.32 4.521 4.643 4.752 4.902 5.043 5.181 5.318 5.451 5.616 5.768 5.914 6.081 6.234 6.377 6.538 6.71 6.871 7.042 7.209 7.359 7.508 7.692 7.892 8.07 8.245 8.376 8.497 8.578 8.524 8.291 7.675 6.625 5.656 4.832 4.113 3.44 2.823 2.256 1.762 1.264 0.839 0.462 0.096 -0.259 -0.597 -0.903 -1.227 -1.507 -1.756 -2.023 -2.29 -2.515 -2.746 -2.986 -3.174 -3.361 -3.558 -3.777 -4.007 -4.17 -4.343 -4.602 -4.784 -4.976 -5.077 -5.294 -5.536 -5.803 -5.942 -6.167 -6.427 -6.593 -6.756 -7.111 -7.319 -7.555 -7.817 -8.104 -8.451 -8.904 -10.073 -10 ,17860 ,KEBNE ,16677522,Wed Nov 24 20:24:36 CET,Wed Nov 24 21:47:16 CET,0.0 1.141 1.557 1.881 2.154 2.385 2.586 2.773 3.086 3.222 3.349 3.518 3.691 3.796 4.015 4.209 4.36 4.428 4.573 4.712 4.918 5.054 5.173 5.337 5.493 5.634 5.766 5.89 6.064 6.229 6.374 6.548 6.701 6.845 7.02 7.209 7.365 7.523 7.694 7.877 8.074 8.255 8.413 8.582 8.767 8.929 9.056 9.129 9.091 8.815 8.156 7.16 6.239 5.381 4.574 3.852 3.239 2.673 2.163 1.647 1.214 0.831 0.45 0.093 -0.238 -0.545 -0.871 -1.159 -1.415 -1.682 -1.95 -2.188 -2.428 -2.674 -2.871 -3.065 -3.27 -3.492 -3.723 -3.885 -4.055 -4.319 -4.513 -4.719 -4.825 -5.045 -5.274 -5.527 -5.655 -5.86 -6.064 -6.216 -6.378 -6.758 -6.98 -7.212 -7.468 -7.762 -8.08 -8.522 -9.727 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_49.txt deleted file mode 100644 index e2c8f958..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26284 ,KEBNE ,16677523,Wed Nov 24 20:24:36 CET,Wed Nov 24 21:48:45 CET,0.0 0.956 1.31 1.614 1.858 2.059 2.239 2.394 2.652 2.772 2.883 3.028 3.2 3.299 3.483 3.643 3.795 3.868 4.013 4.144 4.319 4.435 4.548 4.696 4.829 4.955 5.077 5.188 5.313 5.435 5.554 5.69 5.825 5.956 6.088 6.217 6.341 6.471 6.598 6.721 6.835 6.938 7.049 7.138 7.212 7.231 7.165 7.012 6.673 6.044 4.745 3.032 1.574 0.259 -0.839 -1.827 -2.706 -3.495 -4.191 -4.851 -5.401 -5.916 -6.412 -6.865 -7.3 -7.702 -8.126 -8.508 -8.83 -9.17 -9.526 -9.831 -10.16 -10.482 -10.722 -10.97 -11.234 -11.508 -11.799 -12.015 -12.231 -12.577 -12.827 -13.082 -13.219 -13.5 -13.784 -14.096 -14.272 -14.54 -14.811 -15.011 -15.223 -15.702 -15.97 -16.243 -16.535 -16.879 -17.313 -17.876 -19.438 -2 ,32319 ,KEBNE ,16677524,Wed Nov 24 20:24:36 CET,Wed Nov 24 21:46:52 CET,0.0 0.851 1.184 1.458 1.671 1.855 2.02 2.169 2.441 2.576 2.709 2.884 3.05 3.14 3.308 3.463 3.61 3.68 3.818 3.941 4.106 4.219 4.321 4.468 4.616 4.745 4.862 4.975 5.12 5.263 5.397 5.536 5.659 5.78 5.908 6.035 6.149 6.278 6.401 6.505 6.602 6.711 6.824 6.888 6.938 6.963 6.905 6.758 6.457 5.828 4.509 2.748 1.266 -0.017 -1.129 -2.112 -2.996 -3.792 -4.454 -5.121 -5.716 -6.248 -6.757 -7.222 -7.645 -8.052 -8.49 -8.883 -9.225 -9.574 -9.925 -10.223 -10.535 -10.858 -11.111 -11.371 -11.636 -11.907 -12.197 -12.405 -12.616 -12.93 -13.165 -13.422 -13.556 -13.83 -14.116 -14.426 -14.591 -14.856 -15.133 -15.328 -15.54 -16.029 -16.303 -16.607 -16.928 -17.27 -17.666 -18.243 -19.793 -3 ,29051 ,KEBNE ,16677525,Wed Nov 24 20:24:40 CET,Wed Nov 24 21:43:05 CET,0.0 1.043 1.386 1.661 1.881 2.078 2.268 2.433 2.72 2.855 2.975 3.121 3.297 3.402 3.585 3.761 3.921 3.997 4.141 4.269 4.439 4.544 4.651 4.803 4.95 5.084 5.209 5.327 5.466 5.591 5.717 5.864 5.991 6.113 6.236 6.37 6.501 6.626 6.751 6.871 6.974 7.078 7.202 7.31 7.377 7.375 7.31 7.156 6.795 6.107 4.861 3.196 1.734 0.449 -0.678 -1.722 -2.626 -3.416 -4.107 -4.784 -5.364 -5.895 -6.403 -6.872 -7.317 -7.728 -8.157 -8.541 -8.875 -9.228 -9.594 -9.903 -10.216 -10.531 -10.783 -11.053 -11.337 -11.636 -11.926 -12.132 -12.36 -12.699 -12.936 -13.179 -13.299 -13.554 -13.826 -14.121 -14.293 -14.567 -14.845 -15.044 -15.265 -15.734 -15.993 -16.283 -16.58 -16.941 -17.402 -17.941 -19.345 -4 ,27244 ,KEBNE ,16677526,Wed Nov 24 20:24:40 CET,Wed Nov 24 21:45:47 CET,0.0 0.812 1.145 1.386 1.585 1.76 1.915 2.07 2.37 2.504 2.633 2.804 2.984 3.088 3.264 3.438 3.607 3.68 3.815 3.947 4.139 4.26 4.36 4.511 4.654 4.776 4.887 4.997 5.136 5.255 5.365 5.512 5.649 5.768 5.905 6.047 6.179 6.32 6.454 6.584 6.707 6.828 6.951 7.039 7.1 7.111 7.034 6.872 6.57 5.989 4.726 2.922 1.409 0.119 -1.029 -2.025 -2.875 -3.638 -4.311 -5.004 -5.605 -6.129 -6.617 -7.09 -7.536 -7.96 -8.386 -8.752 -9.087 -9.435 -9.782 -10.074 -10.382 -10.715 -10.983 -11.253 -11.527 -11.826 -12.134 -12.334 -12.539 -12.887 -13.134 -13.381 -13.511 -13.794 -14.091 -14.398 -14.566 -14.829 -15.109 -15.305 -15.51 -15.99 -16.238 -16.521 -16.867 -17.245 -17.688 -18.287 -19.896 -5 ,26764 ,KEBNE ,16677527,Wed Nov 24 20:25:38 CET,Wed Nov 24 21:49:34 CET,0.0 0.77 1.134 1.409 1.644 1.856 2.034 2.19 2.474 2.605 2.718 2.861 3.03 3.125 3.318 3.498 3.656 3.731 3.878 4.008 4.173 4.279 4.387 4.534 4.669 4.804 4.934 5.062 5.216 5.349 5.471 5.615 5.746 5.864 5.99 6.125 6.254 6.402 6.549 6.687 6.803 6.914 7.049 7.142 7.205 7.257 7.253 7.109 6.791 6.162 4.936 3.358 1.952 0.699 -0.39 -1.366 -2.221 -3.017 -3.69 -4.348 -4.93 -5.446 -5.949 -6.425 -6.88 -7.301 -7.731 -8.127 -8.459 -8.803 -9.172 -9.474 -9.789 -10.124 -10.384 -10.646 -10.913 -11.189 -11.491 -11.712 -11.931 -12.245 -12.456 -12.685 -12.816 -13.091 -13.382 -13.688 -13.85 -14.112 -14.41 -14.621 -14.849 -15.367 -15.648 -15.936 -16.255 -16.591 -17.016 -17.641 -19.126 -6 ,5510 ,KEBNE ,16677528,Wed Nov 24 20:25:38 CET,Wed Nov 24 21:48:36 CET,0.0 1.05 1.418 1.697 1.931 2.131 2.291 2.434 2.707 2.833 2.951 3.098 3.268 3.36 3.532 3.686 3.831 3.907 4.057 4.203 4.4 4.515 4.624 4.757 4.878 5.014 5.149 5.274 5.424 5.548 5.671 5.821 5.949 6.057 6.181 6.322 6.455 6.588 6.721 6.853 6.959 7.063 7.165 7.215 7.242 7.258 7.184 6.991 6.669 6.051 4.866 3.254 1.831 0.554 -0.538 -1.482 -2.373 -3.202 -3.908 -4.6 -5.206 -5.744 -6.251 -6.723 -7.154 -7.555 -7.963 -8.337 -8.682 -9.031 -9.374 -9.662 -9.965 -10.28 -10.522 -10.768 -11.025 -11.298 -11.607 -11.822 -12.036 -12.371 -12.607 -12.86 -12.991 -13.264 -13.565 -13.878 -14.037 -14.301 -14.603 -14.807 -15.017 -15.471 -15.714 -15.983 -16.294 -16.657 -17.066 -17.631 -19.157 -7 ,21977 ,KEBNE ,16677529,Wed Nov 24 20:26:40 CET,Wed Nov 24 21:48:28 CET,0.0 0.979 1.354 1.623 1.842 2.033 2.19 2.349 2.643 2.77 2.891 3.056 3.23 3.333 3.538 3.716 3.883 3.959 4.091 4.218 4.411 4.522 4.624 4.773 4.913 5.045 5.166 5.286 5.435 5.575 5.704 5.842 5.971 6.085 6.203 6.34 6.468 6.597 6.727 6.855 6.977 7.097 7.211 7.294 7.359 7.362 7.298 7.134 6.806 6.185 4.913 3.224 1.81 0.577 -0.496 -1.461 -2.336 -3.128 -3.79 -4.451 -5.022 -5.534 -6.027 -6.496 -6.947 -7.358 -7.779 -8.144 -8.465 -8.808 -9.171 -9.477 -9.799 -10.133 -10.39 -10.656 -10.929 -11.212 -11.501 -11.699 -11.906 -12.246 -12.493 -12.751 -12.887 -13.167 -13.457 -13.756 -13.923 -14.19 -14.461 -14.655 -14.869 -15.343 -15.601 -15.878 -16.184 -16.578 -17.066 -17.699 -19.23 -8 ,3546 ,KEBNE ,16677530,Wed Nov 24 20:26:41 CET,Wed Nov 24 21:49:39 CET,0.0 0.983 1.364 1.657 1.907 2.122 2.321 2.512 2.839 2.978 3.113 3.263 3.424 3.523 3.702 3.87 4.036 4.111 4.248 4.382 4.565 4.671 4.767 4.912 5.056 5.182 5.298 5.412 5.564 5.713 5.843 5.991 6.127 6.249 6.386 6.53 6.651 6.79 6.949 7.084 7.187 7.299 7.43 7.522 7.559 7.572 7.543 7.411 7.112 6.46 5.148 3.523 2.144 0.917 -0.167 -1.129 -1.984 -2.776 -3.46 -4.158 -4.762 -5.295 -5.803 -6.287 -6.735 -7.143 -7.574 -7.96 -8.298 -8.644 -8.992 -9.276 -9.581 -9.904 -10.155 -10.417 -10.695 -10.989 -11.292 -11.496 -11.703 -12.037 -12.275 -12.525 -12.66 -12.953 -13.246 -13.549 -13.715 -13.975 -14.255 -14.446 -14.648 -15.103 -15.35 -15.631 -15.939 -16.284 -16.739 -17.343 -19.425 -9 ,4360 ,KEBNE ,16677531,Wed Nov 24 20:26:40 CET,Wed Nov 24 21:47:54 CET,0.0 0.729 1.067 1.331 1.56 1.765 1.935 2.087 2.362 2.491 2.608 2.747 2.914 3.015 3.215 3.396 3.558 3.632 3.764 3.889 4.074 4.19 4.304 4.455 4.589 4.726 4.86 4.997 5.173 5.318 5.433 5.57 5.69 5.786 5.901 6.04 6.17 6.287 6.39 6.488 6.596 6.712 6.802 6.869 6.937 6.968 6.94 6.824 6.525 5.958 4.747 2.958 1.454 0.185 -0.93 -1.952 -2.823 -3.598 -4.276 -4.941 -5.534 -6.07 -6.576 -7.051 -7.493 -7.913 -8.349 -8.73 -9.07 -9.408 -9.761 -10.076 -10.4 -10.73 -10.98 -11.238 -11.513 -11.818 -12.127 -12.329 -12.551 -12.897 -13.145 -13.394 -13.519 -13.789 -14.069 -14.391 -14.564 -14.827 -15.125 -15.332 -15.538 -15.981 -16.231 -16.504 -16.806 -17.156 -17.62 -18.264 -19.727 -10 ,966 ,KEBNE ,16677532,Wed Nov 24 20:26:40 CET,Wed Nov 24 21:49:01 CET,0.0 0.955 1.344 1.644 1.907 2.11 2.293 2.468 2.77 2.91 3.038 3.181 3.338 3.426 3.588 3.735 3.87 3.935 4.067 4.199 4.405 4.521 4.626 4.79 4.941 5.074 5.196 5.306 5.449 5.58 5.694 5.839 5.981 6.096 6.222 6.37 6.495 6.62 6.757 6.892 7.002 7.109 7.21 7.274 7.301 7.315 7.276 7.112 6.815 6.214 4.919 3.23 1.831 0.61 -0.44 -1.385 -2.242 -3.029 -3.718 -4.413 -4.995 -5.519 -6.022 -6.497 -6.934 -7.318 -7.727 -8.086 -8.41 -8.767 -9.126 -9.424 -9.734 -10.051 -10.297 -10.559 -10.849 -11.153 -11.454 -11.667 -11.896 -12.247 -12.489 -12.738 -12.868 -13.147 -13.443 -13.763 -13.922 -14.168 -14.442 -14.649 -14.867 -15.358 -15.637 -15.952 -16.29 -16.645 -17.044 -17.577 -18.897 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_44.txt deleted file mode 100644 index f4d1216a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22238 ,KEBNE ,16677533,Wed Nov 24 20:26:41 CET,Wed Nov 24 21:51:02 CET,0.0 1.013 1.461 1.81 2.088 2.331 2.564 2.774 3.127 3.277 3.418 3.596 3.79 3.907 4.13 4.334 4.531 4.625 4.792 4.942 5.157 5.297 5.44 5.654 5.849 6.019 6.173 6.324 6.524 6.728 6.926 7.151 7.372 7.583 7.816 8.063 8.285 8.526 8.794 9.072 9.348 9.652 9.996 10.319 10.659 11.022 11.427 11.839 12.27 12.656 12.843 12.632 12.249 11.82 11.383 10.965 10.572 10.192 9.843 9.451 9.087 8.764 8.46 8.162 7.876 7.613 7.349 7.112 6.897 6.663 6.422 6.219 6.008 5.777 5.581 5.387 5.192 4.972 4.735 4.574 4.418 4.189 4.026 3.849 3.743 3.507 3.277 3.022 2.885 2.673 2.455 2.295 2.131 1.748 1.524 1.298 1.054 0.734 0.346 -0.183 -1.597 -2 ,5939 ,KEBNE ,16677534,Wed Nov 24 20:26:40 CET,Wed Nov 24 21:49:55 CET,0.0 1.165 1.584 1.925 2.174 2.397 2.619 2.814 3.132 3.288 3.44 3.629 3.828 3.936 4.137 4.337 4.525 4.609 4.777 4.941 5.171 5.318 5.458 5.659 5.858 6.044 6.224 6.395 6.604 6.801 6.991 7.224 7.443 7.638 7.86 8.101 8.319 8.573 8.86 9.144 9.412 9.709 10.065 10.391 10.762 11.166 11.569 11.944 12.321 12.682 12.896 12.732 12.334 11.905 11.474 11.028 10.608 10.206 9.824 9.43 9.088 8.772 8.473 8.191 7.922 7.668 7.399 7.147 6.921 6.679 6.426 6.23 6.017 5.781 5.601 5.42 5.225 5.01 4.771 4.601 4.431 4.163 3.981 3.801 3.705 3.492 3.263 3.022 2.893 2.678 2.454 2.299 2.134 1.756 1.55 1.322 1.076 0.799 0.443 -0.079 -1.356 -3 ,16637 ,KEBNE ,16677535,Wed Nov 24 20:26:42 CET,Wed Nov 24 21:47:13 CET,0.0 1.008 1.421 1.717 1.979 2.21 2.417 2.593 2.891 3.043 3.198 3.415 3.618 3.73 3.932 4.128 4.316 4.408 4.589 4.757 4.974 5.111 5.249 5.442 5.624 5.813 5.988 6.137 6.337 6.528 6.709 6.935 7.141 7.333 7.548 7.779 8.003 8.258 8.533 8.812 9.088 9.386 9.725 10.043 10.398 10.773 11.157 11.553 11.94 12.295 12.476 12.261 11.851 11.388 10.932 10.47 10.05 9.659 9.304 8.92 8.581 8.266 7.962 7.67 7.37 7.101 6.83 6.575 6.348 6.125 5.887 5.676 5.461 5.242 5.076 4.892 4.693 4.475 4.238 4.076 3.902 3.634 3.451 3.259 3.164 2.956 2.727 2.493 2.369 2.16 1.937 1.773 1.593 1.19 0.978 0.74 0.448 0.116 -0.238 -0.733 -2.421 -4 ,19748 ,KEBNE ,16677536,Wed Nov 24 20:26:44 CET,Wed Nov 24 21:48:23 CET,0.0 1.162 1.656 1.987 2.242 2.469 2.683 2.873 3.192 3.341 3.475 3.63 3.82 3.932 4.149 4.359 4.564 4.655 4.819 4.972 5.196 5.343 5.48 5.675 5.848 6.017 6.189 6.344 6.521 6.7 6.883 7.101 7.314 7.521 7.756 8.01 8.245 8.505 8.77 9.042 9.324 9.617 9.95 10.267 10.641 11.046 11.454 11.87 12.261 12.573 12.689 12.46 12.079 11.631 11.185 10.758 10.328 9.91 9.556 9.208 8.892 8.584 8.264 7.957 7.68 7.422 7.145 6.891 6.667 6.435 6.168 5.936 5.702 5.46 5.272 5.082 4.884 4.657 4.418 4.253 4.086 3.82 3.623 3.427 3.322 3.098 2.87 2.617 2.482 2.268 2.05 1.897 1.729 1.341 1.128 0.901 0.65 0.342 -0.039 -0.516 -1.741 -5 ,27740 ,KEBNE ,16677537,Wed Nov 24 20:26:40 CET,Wed Nov 24 21:49:17 CET,0.0 1.059 1.473 1.769 2.043 2.272 2.465 2.646 2.973 3.125 3.272 3.444 3.637 3.754 3.975 4.181 4.377 4.473 4.66 4.829 5.045 5.179 5.315 5.525 5.716 5.899 6.08 6.25 6.468 6.667 6.857 7.076 7.288 7.494 7.719 7.96 8.187 8.429 8.678 8.946 9.221 9.506 9.832 10.153 10.515 10.906 11.331 11.773 12.189 12.533 12.689 12.405 11.938 11.484 11.064 10.62 10.213 9.823 9.464 9.1 8.781 8.495 8.198 7.896 7.602 7.34 7.08 6.846 6.625 6.378 6.126 5.91 5.684 5.464 5.294 5.111 4.911 4.694 4.469 4.32 4.169 3.913 3.728 3.526 3.421 3.215 2.987 2.737 2.604 2.392 2.184 2.026 1.858 1.489 1.274 1.019 0.744 0.434 0.072 -0.35 -1.628 -6 ,32086 ,KEBNE ,16677538,Wed Nov 24 20:26:41 CET,Wed Nov 24 21:52:00 CET,0.0 0.921 1.357 1.674 1.938 2.171 2.368 2.529 2.834 2.968 3.096 3.278 3.477 3.594 3.823 4.034 4.217 4.305 4.479 4.644 4.876 5.024 5.169 5.368 5.557 5.748 5.932 6.098 6.301 6.487 6.673 6.9 7.105 7.299 7.519 7.767 8.006 8.257 8.517 8.782 9.056 9.366 9.709 10.025 10.362 10.729 11.153 11.587 12.003 12.372 12.606 12.425 11.976 11.496 11.041 10.586 10.165 9.757 9.392 9.008 8.66 8.352 8.032 7.722 7.447 7.186 6.905 6.654 6.435 6.193 5.946 5.75 5.532 5.299 5.127 4.943 4.748 4.542 4.308 4.132 3.955 3.7 3.523 3.333 3.237 3.026 2.787 2.543 2.409 2.188 1.962 1.81 1.652 1.284 1.077 0.839 0.56 0.227 -0.172 -0.674 -1.779 -7 ,3118 ,KEBNE ,16677539,Wed Nov 24 20:27:43 CET,Wed Nov 24 21:51:41 CET,0.0 1.155 1.502 1.776 2.002 2.199 2.396 2.587 2.905 3.045 3.184 3.371 3.582 3.701 3.91 4.114 4.307 4.403 4.587 4.76 4.998 5.15 5.291 5.489 5.672 5.846 6.022 6.181 6.389 6.591 6.769 6.991 7.212 7.415 7.631 7.867 8.086 8.32 8.581 8.849 9.123 9.412 9.746 10.095 10.457 10.843 11.233 11.634 12.084 12.471 12.643 12.412 12.048 11.6 11.136 10.702 10.275 9.845 9.461 9.055 8.699 8.388 8.089 7.787 7.502 7.251 6.971 6.721 6.504 6.261 6.01 5.797 5.573 5.349 5.172 4.985 4.787 4.576 4.343 4.174 3.997 3.734 3.553 3.341 3.231 3.012 2.783 2.545 2.415 2.202 1.98 1.811 1.641 1.27 1.049 0.812 0.559 0.26 -0.127 -0.619 -1.976 -8 ,10341 ,KEBNE ,16677540,Wed Nov 24 20:27:42 CET,Wed Nov 24 21:51:32 CET,0.0 1.289 1.739 2.083 2.351 2.591 2.797 2.988 3.325 3.474 3.615 3.804 3.999 4.1 4.299 4.493 4.681 4.773 4.937 5.09 5.329 5.483 5.628 5.821 6.009 6.202 6.381 6.554 6.773 6.969 7.16 7.375 7.582 7.791 8.032 8.295 8.521 8.759 9.016 9.281 9.555 9.866 10.217 10.56 10.94 11.299 11.674 12.059 12.44 12.765 12.904 12.719 12.332 11.901 11.465 11.033 10.626 10.22 9.84 9.46 9.136 8.828 8.534 8.267 8.009 7.756 7.489 7.24 7.008 6.763 6.514 6.293 6.063 5.842 5.669 5.481 5.276 5.062 4.836 4.664 4.497 4.252 4.072 3.893 3.796 3.573 3.33 3.076 2.936 2.709 2.473 2.314 2.152 1.771 1.551 1.307 1.038 0.736 0.369 -0.133 -1.405 -9 ,12896 ,KEBNE ,16677541,Wed Nov 24 20:27:42 CET,Wed Nov 24 21:50:15 CET,0.0 1.226 1.673 2.011 2.3 2.557 2.775 2.95 3.269 3.418 3.563 3.751 3.954 4.075 4.302 4.519 4.718 4.801 4.966 5.132 5.368 5.517 5.661 5.876 6.065 6.236 6.406 6.572 6.789 6.986 7.173 7.39 7.597 7.801 8.019 8.258 8.485 8.726 8.994 9.276 9.567 9.875 10.178 10.49 10.863 11.236 11.633 12.029 12.434 12.753 12.853 12.661 12.299 11.832 11.349 10.908 10.481 10.048 9.684 9.297 8.93 8.6 8.271 7.936 7.632 7.361 7.072 6.814 6.582 6.34 6.081 5.856 5.608 5.352 5.171 4.982 4.773 4.549 4.313 4.147 3.972 3.693 3.498 3.303 3.204 2.997 2.771 2.521 2.387 2.176 1.973 1.816 1.637 1.242 1.023 0.762 0.475 0.161 -0.26 -0.757 -2.094 -10 ,5586 ,KEBNE ,16677542,Wed Nov 24 20:27:42 CET,Wed Nov 24 21:49:52 CET,0.0 1.053 1.452 1.784 2.054 2.272 2.467 2.647 2.96 3.1 3.239 3.436 3.64 3.752 3.963 4.167 4.366 4.463 4.645 4.804 5.022 5.17 5.305 5.503 5.707 5.888 6.061 6.227 6.431 6.632 6.817 7.033 7.246 7.445 7.669 7.921 8.158 8.417 8.681 8.934 9.193 9.502 9.836 10.131 10.492 10.868 11.281 11.725 12.134 12.459 12.619 12.462 12.092 11.64 11.225 10.817 10.404 9.981 9.603 9.234 8.907 8.61 8.314 8.017 7.729 7.449 7.161 6.918 6.695 6.455 6.212 6.001 5.777 5.544 5.365 5.182 4.987 4.767 4.527 4.368 4.21 3.957 3.769 3.575 3.472 3.253 3.03 2.796 2.668 2.448 2.207 2.045 1.875 1.491 1.283 1.061 0.797 0.479 0.134 -0.347 -1.57 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_49.txt deleted file mode 100644 index 17508e69..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14352 ,KEBNE ,16677543,Wed Nov 24 20:27:43 CET,Wed Nov 24 21:51:05 CET,0.0 1.163 1.575 1.895 2.166 2.388 2.584 2.742 3.017 3.158 3.292 3.466 3.656 3.758 3.955 4.139 4.317 4.407 4.571 4.71 4.906 5.029 5.149 5.331 5.502 5.663 5.813 5.951 6.117 6.275 6.429 6.605 6.78 6.953 7.142 7.334 7.507 7.694 7.886 8.075 8.266 8.451 8.654 8.859 9.072 9.278 9.466 9.617 9.713 9.649 9.205 8.353 7.438 6.621 5.842 5.104 4.47 3.897 3.403 2.894 2.452 2.048 1.657 1.28 0.903 0.554 0.208 -0.115 -0.397 -0.684 -0.983 -1.239 -1.517 -1.798 -2.016 -2.253 -2.51 -2.776 -3.042 -3.224 -3.432 -3.764 -3.993 -4.244 -4.376 -4.647 -4.929 -5.222 -5.376 -5.624 -5.9 -6.101 -6.305 -6.756 -7.014 -7.301 -7.627 -8.023 -8.498 -9.133 -10.906 -2 ,1438 ,KEBNE ,16677544,Wed Nov 24 20:27:42 CET,Wed Nov 24 21:51:05 CET,0.0 1.039 1.489 1.86 2.137 2.361 2.571 2.756 3.068 3.201 3.32 3.446 3.62 3.713 3.897 4.082 4.257 4.338 4.499 4.65 4.849 4.969 5.083 5.25 5.411 5.566 5.719 5.858 6.016 6.163 6.31 6.494 6.672 6.843 7.029 7.23 7.405 7.582 7.777 7.975 8.179 8.391 8.604 8.804 8.997 9.161 9.323 9.479 9.583 9.53 9.084 8.209 7.347 6.513 5.772 5.087 4.429 3.828 3.323 2.809 2.346 1.922 1.501 1.1 0.733 0.394 0.03 -0.304 -0.6 -0.912 -1.217 -1.474 -1.761 -2.047 -2.271 -2.513 -2.761 -3.002 -3.261 -3.456 -3.661 -3.966 -4.179 -4.408 -4.53 -4.793 -5.067 -5.36 -5.511 -5.76 -6.038 -6.227 -6.428 -6.891 -7.136 -7.395 -7.699 -8.096 -8.566 -9.178 -11.024 -3 ,20218 ,KEBNE ,16677545,Wed Nov 24 20:27:42 CET,Wed Nov 24 21:51:18 CET,0.0 0.947 1.294 1.588 1.852 2.07 2.25 2.412 2.71 2.852 2.983 3.13 3.322 3.428 3.635 3.835 4.007 4.087 4.239 4.383 4.591 4.722 4.842 5.005 5.153 5.304 5.458 5.608 5.786 5.94 6.083 6.255 6.429 6.597 6.771 6.96 7.153 7.36 7.56 7.765 7.982 8.205 8.42 8.62 8.822 9.014 9.202 9.339 9.42 9.324 8.825 7.938 7.026 6.177 5.407 4.688 4.05 3.477 2.987 2.485 2.014 1.582 1.151 0.733 0.366 0.038 -0.318 -0.643 -0.92 -1.206 -1.503 -1.746 -1.996 -2.264 -2.474 -2.698 -2.948 -3.217 -3.488 -3.675 -3.866 -4.188 -4.431 -4.664 -4.775 -5.013 -5.304 -5.638 -5.801 -6.052 -6.33 -6.528 -6.733 -7.222 -7.488 -7.777 -8.105 -8.476 -8.947 -9.616 -11.382 -4 ,14384 ,KEBNE ,16677546,Wed Nov 24 20:27:42 CET,Wed Nov 24 21:50:36 CET,0.0 1.151 1.521 1.813 2.071 2.291 2.486 2.662 2.971 3.106 3.238 3.416 3.606 3.716 3.924 4.106 4.271 4.351 4.5 4.634 4.83 4.954 5.062 5.22 5.373 5.534 5.69 5.828 5.993 6.144 6.303 6.482 6.649 6.806 6.973 7.159 7.331 7.518 7.714 7.919 8.131 8.339 8.555 8.764 9.003 9.215 9.383 9.508 9.566 9.469 8.953 8.105 7.272 6.444 5.713 5.069 4.463 3.865 3.317 2.761 2.278 1.835 1.42 1.022 0.647 0.304 -0.061 -0.378 -0.657 -0.951 -1.257 -1.518 -1.812 -2.113 -2.334 -2.562 -2.808 -3.082 -3.364 -3.546 -3.726 -4.023 -4.242 -4.474 -4.596 -4.877 -5.187 -5.506 -5.667 -5.915 -6.178 -6.373 -6.569 -7.009 -7.282 -7.587 -7.913 -8.277 -8.72 -9.338 -11.422 -5 ,31208 ,KEBNE ,16677547,Wed Nov 24 20:27:42 CET,Wed Nov 24 21:50:35 CET,0.0 1.016 1.451 1.75 1.973 2.16 2.333 2.494 2.777 2.909 3.04 3.187 3.367 3.471 3.666 3.846 4.028 4.112 4.255 4.395 4.604 4.734 4.849 5.004 5.151 5.286 5.415 5.549 5.729 5.896 6.051 6.235 6.413 6.567 6.728 6.918 7.11 7.313 7.509 7.706 7.909 8.118 8.346 8.552 8.774 8.998 9.186 9.294 9.311 9.227 8.845 8.119 7.308 6.5 5.778 5.053 4.371 3.782 3.301 2.798 2.329 1.889 1.454 1.053 0.692 0.364 -0.008 -0.331 -0.607 -0.905 -1.197 -1.452 -1.73 -2.024 -2.266 -2.512 -2.787 -3.084 -3.377 -3.58 -3.794 -4.133 -4.378 -4.632 -4.758 -5.031 -5.33 -5.653 -5.821 -6.087 -6.375 -6.568 -6.767 -7.245 -7.525 -7.82 -8.17 -8.575 -9.023 -9.588 -11.527 -6 ,12444 ,KEBNE ,16677548,Wed Nov 24 20:27:42 CET,Wed Nov 24 21:49:55 CET,0.0 1.099 1.477 1.756 1.99 2.192 2.377 2.552 2.891 3.039 3.164 3.313 3.497 3.596 3.791 3.97 4.131 4.212 4.368 4.514 4.726 4.852 4.969 5.136 5.295 5.448 5.588 5.729 5.894 6.045 6.206 6.392 6.555 6.716 6.902 7.098 7.271 7.464 7.673 7.874 8.072 8.273 8.487 8.68 8.883 9.092 9.293 9.427 9.466 9.379 8.932 8.083 7.196 6.361 5.646 4.939 4.309 3.731 3.193 2.658 2.2 1.786 1.39 1.018 0.644 0.286 -0.082 -0.409 -0.702 -1.018 -1.349 -1.622 -1.9 -2.2 -2.436 -2.676 -2.935 -3.193 -3.456 -3.647 -3.839 -4.141 -4.361 -4.605 -4.731 -4.964 -5.23 -5.537 -5.707 -5.97 -6.233 -6.43 -6.639 -7.103 -7.369 -7.663 -7.978 -8.33 -8.816 -9.481 -11.662 -7 ,22400 ,KEBNE ,16677549,Wed Nov 24 20:27:43 CET,Wed Nov 24 21:50:39 CET,0.0 1.058 1.475 1.807 2.063 2.278 2.474 2.648 2.943 3.076 3.201 3.368 3.561 3.671 3.872 4.048 4.209 4.285 4.446 4.606 4.805 4.932 5.061 5.233 5.394 5.554 5.704 5.837 6.003 6.164 6.317 6.489 6.651 6.807 6.978 7.172 7.363 7.565 7.772 7.976 8.173 8.38 8.599 8.796 8.989 9.209 9.431 9.577 9.651 9.57 9.079 8.196 7.324 6.498 5.753 5.053 4.398 3.813 3.309 2.782 2.319 1.879 1.468 1.095 0.721 0.368 0.008 -0.322 -0.602 -0.873 -1.172 -1.422 -1.695 -2.005 -2.24 -2.48 -2.727 -2.99 -3.269 -3.455 -3.649 -3.963 -4.18 -4.411 -4.537 -4.79 -5.049 -5.334 -5.482 -5.724 -6.005 -6.202 -6.405 -6.858 -7.116 -7.41 -7.738 -8.107 -8.575 -9.196 -11.09 -8 ,29043 ,KEBNE ,16677550,Wed Nov 24 20:27:47 CET,Wed Nov 24 21:48:59 CET,0.0 1.143 1.539 1.848 2.088 2.295 2.481 2.655 2.981 3.13 3.269 3.435 3.623 3.729 3.923 4.111 4.286 4.368 4.527 4.675 4.88 5.007 5.128 5.307 5.47 5.615 5.751 5.875 6.042 6.204 6.361 6.545 6.708 6.862 7.035 7.231 7.407 7.583 7.783 7.999 8.195 8.394 8.608 8.805 9.013 9.208 9.407 9.574 9.655 9.592 9.136 8.204 7.319 6.543 5.818 5.114 4.49 3.944 3.448 2.934 2.483 2.04 1.599 1.195 0.822 0.482 0.11 -0.221 -0.493 -0.792 -1.118 -1.373 -1.639 -1.933 -2.168 -2.412 -2.659 -2.913 -3.175 -3.371 -3.584 -3.918 -4.148 -4.375 -4.495 -4.758 -5.044 -5.362 -5.53 -5.785 -6.059 -6.273 -6.497 -6.933 -7.185 -7.466 -7.77 -8.164 -8.622 -9.221 -11.351 -9 ,17494 ,KEBNE ,16677551,Wed Nov 24 20:28:44 CET,Wed Nov 24 21:55:33 CET,0.0 1.201 1.664 2.016 2.298 2.528 2.72 2.891 3.19 3.324 3.451 3.614 3.799 3.9 4.106 4.301 4.484 4.564 4.72 4.881 5.1 5.226 5.347 5.533 5.704 5.858 6.008 6.145 6.321 6.491 6.641 6.814 6.981 7.144 7.327 7.524 7.711 7.905 8.11 8.312 8.498 8.685 8.897 9.113 9.342 9.568 9.774 9.929 10.007 9.929 9.483 8.665 7.884 7.14 6.461 5.807 5.199 4.626 4.097 3.56 3.1 2.689 2.296 1.899 1.515 1.17 0.816 0.497 0.215 -0.087 -0.402 -0.656 -0.923 -1.207 -1.439 -1.689 -1.933 -2.162 -2.411 -2.6 -2.805 -3.139 -3.36 -3.579 -3.701 -3.951 -4.218 -4.51 -4.66 -4.902 -5.155 -5.349 -5.556 -6.001 -6.252 -6.54 -6.856 -7.22 -7.663 -8.232 -10.36 -10 ,6239 ,KEBNE ,16677552,Wed Nov 24 20:28:44 CET,Wed Nov 24 21:53:54 CET,0.0 1.003 1.387 1.695 1.941 2.139 2.33 2.501 2.795 2.933 3.065 3.23 3.416 3.517 3.712 3.896 4.062 4.141 4.292 4.433 4.633 4.76 4.879 5.042 5.205 5.355 5.499 5.64 5.813 5.972 6.123 6.298 6.453 6.597 6.776 6.991 7.182 7.368 7.56 7.752 7.944 8.149 8.373 8.588 8.801 8.996 9.175 9.321 9.343 9.197 8.762 7.968 7.135 6.344 5.614 4.909 4.243 3.63 3.099 2.579 2.113 1.681 1.273 0.883 0.515 0.169 -0.186 -0.5 -0.782 -1.079 -1.386 -1.654 -1.937 -2.218 -2.441 -2.685 -2.93 -3.194 -3.485 -3.677 -3.874 -4.187 -4.41 -4.642 -4.766 -5.035 -5.327 -5.653 -5.821 -6.081 -6.328 -6.515 -6.731 -7.191 -7.448 -7.732 -8.054 -8.443 -8.892 -9.479 -11.095 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_20.txt deleted file mode 100644 index a5a0ffe8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_20.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22360 ,KEBNE ,16675269,Wed Nov 24 03:22:09 CET,Wed Nov 24 04:44:00 CET,0.0 2.427 2.984 3.396 3.745 4.043 4.317 4.572 5.032 5.237 5.429 5.712 5.945 6.093 6.369 6.612 6.858 6.983 7.209 7.422 7.731 7.933 8.125 8.386 8.635 8.875 9.11 9.325 9.604 9.871 10.114 10.422 10.731 11.007 11.293 11.602 11.903 12.238 12.586 12.966 13.355 13.755 14.219 14.669 15.155 15.703 16.321 16.987 17.692 18.341 18.807 18.819 18.548 18.187 17.736 17.259 16.834 16.411 16.031 15.649 15.297 14.96 14.643 14.334 14.035 13.752 13.45 13.173 12.933 12.684 12.407 12.162 11.905 11.636 11.437 11.228 11.005 10.776 10.518 10.331 10.128 9.826 9.627 9.416 9.312 9.097 8.851 8.571 8.423 8.189 7.905 7.717 7.522 7.099 6.862 6.599 6.297 5.937 5.499 4.855 2.947 -2 ,32130 ,KEBNE ,16675270,Wed Nov 24 03:22:09 CET,Wed Nov 24 04:44:10 CET,0.0 1.895 2.481 2.929 3.295 3.597 3.866 4.107 4.498 4.672 4.835 5.078 5.306 5.445 5.713 5.975 6.219 6.337 6.558 6.764 7.048 7.216 7.383 7.638 7.885 8.121 8.35 8.569 8.842 9.088 9.33 9.627 9.906 10.179 10.488 10.832 11.169 11.511 11.866 12.247 12.641 13.077 13.572 14.053 14.556 15.101 15.722 16.36 17.002 17.627 18.096 18.104 17.783 17.378 16.945 16.491 16.087 15.683 15.302 14.902 14.537 14.194 13.855 13.531 13.231 12.944 12.635 12.356 12.101 11.83 11.551 11.307 11.054 10.802 10.599 10.373 10.13 9.892 9.641 9.455 9.256 8.952 8.737 8.502 8.385 8.138 7.855 7.566 7.418 7.19 6.94 6.77 6.58 6.142 5.898 5.599 5.264 4.903 4.483 3.915 2.349 -3 ,14367 ,KEBNE ,16677555,Wed Nov 24 20:28:44 CET,Wed Nov 24 21:52:18 CET,0.0 1.383 1.953 2.382 2.732 3.047 3.329 3.58 4.025 4.216 4.391 4.662 4.895 5.035 5.312 5.584 5.844 5.972 6.214 6.436 6.747 6.95 7.145 7.408 7.647 7.876 8.089 8.29 8.561 8.83 9.085 9.401 9.71 10.003 10.327 10.676 11.007 11.356 11.717 12.097 12.487 12.903 13.376 13.835 14.395 15.011 15.62 16.236 16.866 17.528 18.081 18.134 17.89 17.524 17.095 16.638 16.206 15.816 15.436 15.034 14.685 14.352 14.025 13.689 13.368 13.086 12.798 12.539 12.31 12.053 11.778 11.554 11.317 11.069 10.87 10.653 10.432 10.218 9.998 9.843 9.68 9.415 9.223 9.015 8.905 8.683 8.443 8.18 8.041 7.822 7.574 7.401 7.222 6.798 6.558 6.317 6.051 5.732 5.359 4.834 3.315 -4 ,19972 ,KEBNE ,16675272,Wed Nov 24 03:22:09 CET,Wed Nov 24 04:44:14 CET,0.0 2.872 3.54 4.056 4.423 4.725 5.002 5.242 5.666 5.861 6.043 6.294 6.528 6.674 6.932 7.186 7.437 7.553 7.774 7.977 8.259 8.444 8.629 8.896 9.144 9.372 9.584 9.791 10.069 10.339 10.601 10.907 11.189 11.452 11.754 12.082 12.385 12.716 13.062 13.425 13.796 14.206 14.665 15.122 15.649 16.207 16.829 17.459 18.114 18.776 19.225 19.229 18.957 18.525 18.065 17.605 17.168 16.749 16.37 15.978 15.619 15.284 14.952 14.637 14.341 14.065 13.778 13.505 13.263 13.017 12.755 12.537 12.315 12.074 11.878 11.675 11.471 11.247 10.996 10.828 10.665 10.4 10.195 9.98 9.871 9.648 9.421 9.173 9.033 8.817 8.595 8.428 8.236 7.748 7.478 7.19 6.883 6.541 6.111 5.571 4.14 -5 ,12003 ,KEBNE ,16675273,Wed Nov 24 03:22:08 CET,Wed Nov 24 04:44:45 CET,0.0 1.817 2.387 2.81 3.165 3.47 3.74 3.988 4.402 4.582 4.768 5.038 5.273 5.421 5.684 5.933 6.166 6.278 6.499 6.709 6.995 7.181 7.364 7.626 7.875 8.107 8.321 8.528 8.802 9.058 9.293 9.58 9.866 10.137 10.45 10.793 11.105 11.438 11.791 12.168 12.553 12.974 13.458 13.923 14.467 15.051 15.67 16.319 17.025 17.662 18.019 17.914 17.639 17.309 16.925 16.506 16.083 15.653 15.256 14.883 14.55 14.224 13.91 13.609 13.319 13.034 12.715 12.419 12.161 11.903 11.641 11.413 11.168 10.92 10.721 10.509 10.293 10.06 9.823 9.668 9.499 9.208 8.996 8.78 8.662 8.404 8.138 7.853 7.705 7.477 7.228 7.048 6.855 6.421 6.176 5.908 5.6 5.219 4.748 4.11 2.455 -6 ,19337 ,KEBNE ,16675274,Wed Nov 24 03:23:10 CET,Wed Nov 24 04:45:07 CET,0.0 1.519 2.045 2.439 2.777 3.093 3.374 3.631 4.071 4.272 4.47 4.754 5.009 5.183 5.491 5.757 5.997 6.112 6.34 6.55 6.846 7.043 7.243 7.524 7.791 8.05 8.281 8.495 8.778 9.042 9.28 9.554 9.803 10.05 10.357 10.698 11.01 11.345 11.705 12.092 12.477 12.894 13.377 13.849 14.387 14.951 15.592 16.283 16.945 17.584 18.119 18.129 17.859 17.466 17.023 16.579 16.152 15.735 15.329 14.913 14.529 14.142 13.766 13.438 13.157 12.906 12.627 12.365 12.134 11.874 11.593 11.369 11.13 10.859 10.657 10.449 10.231 10.008 9.763 9.591 9.417 9.131 8.922 8.698 8.582 8.343 8.082 7.792 7.641 7.406 7.143 6.957 6.764 6.316 6.063 5.802 5.487 5.12 4.655 4.006 2.388 -7 ,13210 ,KEBNE ,16677559,Wed Nov 24 20:30:48 CET,Wed Nov 24 21:52:50 CET,0.0 1.294 1.775 2.165 2.515 2.813 3.058 3.285 3.669 3.834 3.993 4.206 4.421 4.557 4.818 5.057 5.278 5.38 5.587 5.801 6.097 6.276 6.449 6.717 6.974 7.215 7.446 7.67 7.952 8.211 8.456 8.743 9.028 9.293 9.589 9.932 10.26 10.612 10.967 11.324 11.713 12.158 12.655 13.119 13.665 14.273 14.901 15.531 16.181 16.791 17.249 17.267 17.014 16.662 16.256 15.812 15.378 14.979 14.615 14.23 13.9 13.59 13.284 12.995 12.713 12.438 12.131 11.839 11.59 11.336 11.058 10.808 10.551 10.298 10.099 9.884 9.65 9.398 9.134 8.948 8.765 8.49 8.292 8.075 7.952 7.698 7.45 7.178 7.026 6.787 6.495 6.302 6.11 5.676 5.417 5.143 4.839 4.477 4.03 3.392 1.671 -8 ,21934 ,KEBNE ,16675276,Wed Nov 24 03:23:10 CET,Wed Nov 24 04:45:06 CET,0.0 1.956 2.578 2.987 3.317 3.594 3.842 4.087 4.494 4.672 4.845 5.075 5.298 5.45 5.732 5.983 6.222 6.333 6.553 6.765 7.054 7.229 7.406 7.668 7.916 8.158 8.383 8.593 8.864 9.131 9.378 9.663 9.934 10.2 10.517 10.869 11.196 11.545 11.928 12.335 12.737 13.155 13.633 14.126 14.689 15.276 15.926 16.607 17.304 17.981 18.497 18.509 18.205 17.767 17.299 16.83 16.376 15.922 15.523 15.122 14.775 14.462 14.154 13.857 13.563 13.294 13.009 12.751 12.535 12.294 12.029 11.797 11.555 11.31 11.105 10.884 10.664 10.444 10.211 10.039 9.845 9.542 9.333 9.118 9.011 8.782 8.542 8.29 8.149 7.923 7.689 7.523 7.329 6.862 6.613 6.349 6.056 5.722 5.322 4.792 3.361 -9 ,21768 ,KEBNE ,16675277,Wed Nov 24 03:23:10 CET,Wed Nov 24 04:44:56 CET,0.0 2.326 2.905 3.312 3.673 3.989 4.249 4.483 4.935 5.136 5.316 5.591 5.842 5.989 6.248 6.501 6.751 6.866 7.085 7.302 7.621 7.816 7.999 8.26 8.501 8.727 8.937 9.14 9.399 9.652 9.902 10.207 10.495 10.766 11.079 11.415 11.73 12.059 12.411 12.778 13.119 13.538 14.051 14.534 15.086 15.652 16.263 16.889 17.515 18.152 18.651 18.658 18.355 17.963 17.574 17.171 16.776 16.378 15.987 15.576 15.222 14.898 14.579 14.27 13.978 13.705 13.404 13.135 12.9 12.642 12.373 12.153 11.92 11.678 11.474 11.253 11.03 10.799 10.555 10.381 10.19 9.881 9.674 9.459 9.339 9.087 8.824 8.534 8.38 8.134 7.858 7.677 7.482 7.015 6.738 6.451 6.142 5.786 5.349 4.692 2.597 -10 ,4911 ,KEBNE ,16677562,Wed Nov 24 20:30:48 CET,Wed Nov 24 21:53:35 CET,0.0 1.5 2.009 2.433 2.798 3.079 3.325 3.552 3.974 4.158 4.315 4.521 4.734 4.871 5.143 5.396 5.637 5.748 5.953 6.162 6.445 6.607 6.77 7.02 7.264 7.503 7.728 7.955 8.238 8.495 8.749 9.058 9.349 9.613 9.913 10.246 10.567 10.917 11.276 11.645 12.019 12.424 12.896 13.386 13.928 14.492 15.12 15.777 16.503 17.236 17.766 17.787 17.527 17.133 16.675 16.227 15.808 15.404 15.031 14.629 14.268 13.942 13.618 13.31 13.015 12.736 12.45 12.183 11.941 11.683 11.421 11.197 10.953 10.705 10.515 10.308 10.084 9.855 9.621 9.455 9.284 9.016 8.819 8.604 8.495 8.272 8.031 7.771 7.626 7.398 7.16 6.988 6.8 6.411 6.191 5.933 5.633 5.26 4.806 4.197 2.546 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_49.txt deleted file mode 100644 index a116d2d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19409 ,KEBNE ,16677563,Wed Nov 24 20:30:52 CET,Wed Nov 24 21:53:43 CET,0.0 1.023 1.419 1.715 1.995 2.221 2.395 2.565 2.897 3.047 3.18 3.34 3.525 3.63 3.825 4.007 4.176 4.257 4.422 4.573 4.778 4.911 5.031 5.193 5.351 5.515 5.673 5.826 6.013 6.177 6.332 6.518 6.7 6.855 7.029 7.232 7.413 7.612 7.826 8.023 8.216 8.422 8.649 8.873 9.094 9.27 9.429 9.526 9.502 9.325 8.716 7.67 6.689 5.784 4.938 4.162 3.446 2.8 2.242 1.668 1.167 0.705 0.258 -0.157 -0.541 -0.911 -1.308 -1.669 -1.983 -2.305 -2.63 -2.906 -3.195 -3.501 -3.749 -4.014 -4.296 -4.588 -4.899 -5.114 -5.321 -5.653 -5.895 -6.14 -6.269 -6.537 -6.836 -7.151 -7.305 -7.558 -7.809 -7.989 -8.181 -8.608 -8.853 -9.139 -9.462 -9.811 -10.227 -10.814 -12.614 -2 ,26956 ,KEBNE ,16677564,Wed Nov 24 20:30:49 CET,Wed Nov 24 21:54:09 CET,0.0 1.05 1.455 1.758 2.006 2.223 2.407 2.584 2.913 3.051 3.185 3.361 3.553 3.668 3.887 4.084 4.251 4.334 4.496 4.639 4.842 4.97 5.095 5.272 5.435 5.6 5.763 5.909 6.092 6.265 6.423 6.609 6.778 6.927 7.101 7.304 7.512 7.719 7.916 8.116 8.313 8.525 8.749 8.946 9.14 9.338 9.496 9.589 9.618 9.462 8.844 7.778 6.774 5.849 4.994 4.218 3.495 2.815 2.244 1.655 1.127 0.668 0.237 -0.183 -0.593 -0.969 -1.361 -1.707 -2.011 -2.332 -2.662 -2.939 -3.242 -3.553 -3.792 -4.041 -4.3 -4.578 -4.864 -5.061 -5.27 -5.595 -5.82 -6.054 -6.176 -6.451 -6.755 -7.073 -7.239 -7.489 -7.764 -7.969 -8.169 -8.627 -8.884 -9.155 -9.465 -9.865 -10.381 -11.056 -13.081 -3 ,17734 ,KEBNE ,16677565,Wed Nov 24 20:30:48 CET,Wed Nov 24 21:54:16 CET,0.0 0.949 1.341 1.627 1.847 2.058 2.266 2.46 2.797 2.941 3.075 3.227 3.408 3.507 3.704 3.895 4.066 4.147 4.303 4.451 4.658 4.791 4.914 5.081 5.244 5.396 5.54 5.689 5.872 6.045 6.216 6.411 6.587 6.738 6.916 7.122 7.303 7.496 7.695 7.906 8.132 8.352 8.552 8.745 8.954 9.128 9.281 9.397 9.427 9.267 8.638 7.493 6.415 5.449 4.579 3.764 3.035 2.366 1.784 1.194 0.69 0.24 -0.19 -0.61 -1.018 -1.386 -1.777 -2.132 -2.441 -2.768 -3.094 -3.355 -3.644 -3.958 -4.207 -4.456 -4.714 -4.989 -5.28 -5.485 -5.691 -6.01 -6.238 -6.487 -6.621 -6.894 -7.162 -7.457 -7.615 -7.858 -8.114 -8.306 -8.509 -8.961 -9.225 -9.513 -9.82 -10.178 -10.647 -11.258 -12.999 -4 ,12431 ,KEBNE ,16677566,Wed Nov 24 20:31:49 CET,Wed Nov 24 21:55:38 CET,0.0 1.185 1.607 1.913 2.166 2.377 2.577 2.757 3.058 3.201 3.337 3.509 3.7 3.805 4.007 4.198 4.371 4.45 4.603 4.751 4.954 5.083 5.205 5.384 5.557 5.715 5.866 6.016 6.194 6.353 6.511 6.705 6.878 7.034 7.216 7.423 7.609 7.785 7.978 8.18 8.38 8.598 8.816 8.998 9.195 9.391 9.548 9.659 9.699 9.515 8.849 7.733 6.636 5.636 4.75 3.938 3.224 2.588 2.042 1.495 1.007 0.555 0.119 -0.302 -0.701 -1.058 -1.434 -1.779 -2.071 -2.381 -2.724 -3.003 -3.279 -3.57 -3.805 -4.061 -4.325 -4.608 -4.908 -5.105 -5.308 -5.623 -5.857 -6.11 -6.235 -6.508 -6.802 -7.105 -7.269 -7.537 -7.816 -8.012 -8.23 -8.728 -9.001 -9.279 -9.596 -9.985 -10.45 -11.088 -13.123 -5 ,7253 ,KEBNE ,16677567,Wed Nov 24 20:31:49 CET,Wed Nov 24 21:54:15 CET,0.0 1.011 1.439 1.72 1.957 2.187 2.387 2.549 2.852 2.996 3.121 3.265 3.458 3.575 3.796 3.993 4.163 4.242 4.39 4.532 4.749 4.886 5.007 5.176 5.336 5.499 5.655 5.795 5.974 6.139 6.29 6.455 6.617 6.785 6.967 7.156 7.336 7.532 7.735 7.949 8.154 8.354 8.587 8.804 9.0 9.175 9.345 9.478 9.512 9.332 8.742 7.712 6.73 5.833 4.958 4.161 3.473 2.811 2.224 1.648 1.143 0.669 0.205 -0.211 -0.597 -0.966 -1.344 -1.673 -1.978 -2.312 -2.663 -2.943 -3.23 -3.536 -3.771 -4.019 -4.27 -4.539 -4.832 -5.041 -5.264 -5.626 -5.877 -6.118 -6.244 -6.519 -6.81 -7.117 -7.282 -7.546 -7.821 -8.031 -8.264 -8.743 -9.026 -9.337 -9.674 -10.086 -10.545 -11.179 -13.186 -6 ,32486 ,KEBNE ,16677568,Wed Nov 24 20:31:49 CET,Wed Nov 24 21:54:53 CET,0.0 1.128 1.604 1.969 2.277 2.528 2.743 2.94 3.278 3.421 3.551 3.721 3.907 4.003 4.192 4.387 4.579 4.663 4.812 4.953 5.148 5.266 5.386 5.553 5.708 5.865 6.011 6.151 6.337 6.503 6.653 6.835 7.015 7.186 7.381 7.593 7.782 7.973 8.162 8.356 8.561 8.765 8.962 9.155 9.385 9.587 9.738 9.848 9.86 9.693 9.091 8.008 6.983 6.042 5.157 4.337 3.598 2.948 2.404 1.831 1.316 0.866 0.436 0.03 -0.374 -0.761 -1.146 -1.478 -1.777 -2.1 -2.444 -2.719 -3.006 -3.317 -3.551 -3.801 -4.055 -4.319 -4.61 -4.815 -5.025 -5.354 -5.585 -5.83 -5.958 -6.215 -6.495 -6.803 -6.971 -7.237 -7.519 -7.715 -7.922 -8.411 -8.69 -8.996 -9.341 -9.74 -10.2 -10.825 -12.78 -7 ,23171 ,KEBNE ,16677569,Wed Nov 24 20:31:49 CET,Wed Nov 24 21:54:19 CET,0.0 1.032 1.482 1.818 2.122 2.377 2.595 2.786 3.098 3.239 3.374 3.531 3.719 3.828 4.029 4.213 4.383 4.462 4.614 4.767 5.0 5.15 5.284 5.453 5.609 5.767 5.92 6.066 6.248 6.41 6.574 6.768 6.926 7.074 7.248 7.436 7.614 7.792 7.984 8.184 8.382 8.591 8.81 9.005 9.201 9.411 9.605 9.701 9.688 9.482 8.851 7.845 6.831 5.857 5.001 4.216 3.516 2.9 2.364 1.835 1.371 0.913 0.464 0.061 -0.312 -0.673 -1.055 -1.396 -1.698 -2.01 -2.336 -2.609 -2.9 -3.208 -3.454 -3.705 -3.948 -4.217 -4.521 -4.729 -4.945 -5.302 -5.546 -5.791 -5.922 -6.196 -6.483 -6.772 -6.928 -7.191 -7.482 -7.691 -7.907 -8.416 -8.696 -9.0 -9.367 -9.748 -10.148 -10.711 -12.466 -8 ,10386 ,KEBNE ,16677570,Wed Nov 24 20:31:49 CET,Wed Nov 24 21:57:31 CET,0.0 1.071 1.527 1.897 2.16 2.38 2.563 2.73 3.047 3.189 3.32 3.473 3.655 3.754 3.943 4.124 4.321 4.414 4.57 4.724 4.934 5.063 5.186 5.361 5.53 5.691 5.838 5.977 6.159 6.334 6.498 6.691 6.864 7.017 7.193 7.397 7.592 7.796 8.006 8.196 8.371 8.572 8.787 8.976 9.196 9.409 9.579 9.708 9.758 9.586 8.982 7.93 6.889 5.922 5.066 4.288 3.56 2.906 2.325 1.698 1.169 0.692 0.234 -0.164 -0.539 -0.906 -1.303 -1.66 -1.965 -2.279 -2.602 -2.88 -3.188 -3.496 -3.734 -4.002 -4.273 -4.55 -4.845 -5.054 -5.272 -5.614 -5.863 -6.109 -6.23 -6.502 -6.799 -7.114 -7.285 -7.555 -7.836 -8.034 -8.246 -8.719 -8.978 -9.265 -9.589 -9.956 -10.407 -10.999 -12.722 -9 ,9599 ,KEBNE ,16677571,Wed Nov 24 20:31:49 CET,Wed Nov 24 21:55:41 CET,0.0 1.127 1.557 1.87 2.126 2.343 2.534 2.705 2.995 3.123 3.248 3.413 3.604 3.711 3.916 4.101 4.267 4.349 4.513 4.665 4.879 5.01 5.139 5.326 5.496 5.665 5.826 5.966 6.147 6.315 6.465 6.653 6.831 7.006 7.198 7.383 7.555 7.747 7.949 8.137 8.305 8.491 8.711 8.924 9.139 9.3 9.418 9.51 9.519 9.337 8.723 7.639 6.626 5.702 4.808 3.995 3.266 2.597 2.026 1.432 0.917 0.467 0.022 -0.418 -0.817 -1.182 -1.585 -1.936 -2.223 -2.534 -2.872 -3.158 -3.452 -3.751 -3.988 -4.244 -4.526 -4.817 -5.123 -5.341 -5.559 -5.897 -6.143 -6.391 -6.52 -6.806 -7.092 -7.387 -7.552 -7.808 -8.07 -8.273 -8.485 -8.939 -9.2 -9.478 -9.798 -10.167 -10.604 -11.226 -13.007 -10 ,21657 ,KEBNE ,16677572,Wed Nov 24 20:31:50 CET,Wed Nov 24 21:58:34 CET,0.0 0.979 1.392 1.737 2.042 2.277 2.471 2.632 2.932 3.075 3.2 3.349 3.536 3.641 3.839 4.022 4.206 4.291 4.441 4.584 4.785 4.919 5.052 5.239 5.426 5.606 5.763 5.91 6.102 6.265 6.398 6.562 6.732 6.89 7.06 7.243 7.416 7.603 7.789 7.969 8.153 8.344 8.55 8.755 8.967 9.176 9.372 9.505 9.505 9.292 8.709 7.716 6.676 5.704 4.843 4.053 3.338 2.677 2.078 1.455 0.932 0.459 0.005 -0.427 -0.829 -1.2 -1.603 -1.96 -2.262 -2.582 -2.917 -3.191 -3.495 -3.823 -4.076 -4.341 -4.598 -4.861 -5.146 -5.352 -5.569 -5.909 -6.146 -6.404 -6.539 -6.813 -7.109 -7.411 -7.562 -7.815 -8.078 -8.285 -8.516 -8.991 -9.253 -9.542 -9.863 -10.232 -10.682 -11.307 -13.197 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_39.txt deleted file mode 100644 index b7e75e12..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,838 ,KEBNE ,16677573,Wed Nov 24 20:32:51 CET,Wed Nov 24 21:56:55 CET,0.0 1.046 1.473 1.801 2.088 2.321 2.522 2.713 3.082 3.254 3.402 3.581 3.804 3.928 4.148 4.36 4.573 4.677 4.875 5.073 5.356 5.526 5.687 5.919 6.144 6.357 6.551 6.743 7.002 7.245 7.47 7.747 8.021 8.272 8.552 8.877 9.185 9.524 9.89 10.257 10.615 11.011 11.501 11.988 12.517 13.144 13.848 14.573 15.406 16.32 17.171 17.464 17.435 17.305 17.064 16.802 16.516 16.191 15.909 15.62 15.355 15.102 14.849 14.593 14.336 14.108 13.857 13.624 13.428 13.217 13.003 12.825 12.619 12.402 12.242 12.073 11.891 11.708 11.52 11.383 11.237 11.015 10.869 10.712 10.628 10.448 10.239 10.015 9.899 9.692 9.514 9.372 9.209 8.863 8.672 8.446 8.211 7.899 7.517 7.094 5.894 -2 ,5826 ,KEBNE ,16677574,Wed Nov 24 20:32:51 CET,Wed Nov 24 21:57:38 CET,0.0 1.158 1.649 2.024 2.327 2.601 2.829 3.042 3.427 3.615 3.797 4.006 4.233 4.367 4.609 4.84 5.059 5.165 5.354 5.533 5.796 5.965 6.129 6.371 6.607 6.829 7.045 7.246 7.51 7.766 7.999 8.27 8.532 8.783 9.07 9.386 9.689 10.026 10.388 10.772 11.178 11.645 12.186 12.703 13.253 13.845 14.533 15.274 16.026 16.787 17.557 17.888 17.834 17.658 17.437 17.165 16.873 16.615 16.359 16.056 15.777 15.518 15.27 15.026 14.791 14.554 14.316 14.107 13.906 13.696 13.488 13.315 13.127 12.923 12.761 12.6 12.427 12.229 12.023 11.873 11.721 11.5 11.327 11.138 11.044 10.849 10.64 10.413 10.288 10.076 9.9 9.756 9.607 9.287 9.092 8.861 8.592 8.298 7.981 7.574 6.677 -3 ,14426 ,KEBNE ,16677575,Wed Nov 24 20:32:51 CET,Wed Nov 24 21:56:39 CET,0.0 1.25 1.682 2.002 2.309 2.584 2.817 3.017 3.359 3.525 3.691 3.903 4.127 4.252 4.478 4.693 4.913 5.017 5.209 5.396 5.654 5.813 5.975 6.212 6.435 6.651 6.852 7.044 7.299 7.539 7.768 8.046 8.301 8.54 8.831 9.168 9.488 9.815 10.165 10.538 10.909 11.312 11.763 12.222 12.779 13.396 14.07 14.821 15.623 16.458 17.262 17.565 17.525 17.384 17.169 16.879 16.566 16.252 15.969 15.672 15.403 15.168 14.94 14.719 14.501 14.287 14.059 13.842 13.658 13.464 13.249 13.067 12.869 12.665 12.511 12.359 12.197 12.016 11.823 11.69 11.55 11.329 11.167 10.993 10.903 10.706 10.493 10.265 10.15 9.95 9.748 9.594 9.446 9.104 8.913 8.706 8.47 8.198 7.841 7.358 6.325 -4 ,7281 ,KEBNE ,16677576,Wed Nov 24 20:32:51 CET,Wed Nov 24 21:57:11 CET,0.0 1.047 1.549 1.905 2.212 2.475 2.705 2.91 3.267 3.435 3.596 3.792 4.014 4.139 4.364 4.57 4.773 4.874 5.065 5.253 5.528 5.691 5.848 6.085 6.304 6.511 6.705 6.89 7.145 7.39 7.624 7.893 8.13 8.367 8.652 8.963 9.266 9.61 9.987 10.371 10.752 11.175 11.679 12.168 12.708 13.292 13.969 14.694 15.458 16.298 17.124 17.518 17.532 17.37 17.11 16.834 16.536 16.195 15.898 15.594 15.336 15.112 14.848 14.588 14.342 14.11 13.87 13.647 13.465 13.276 13.059 12.875 12.683 12.475 12.303 12.126 11.942 11.731 11.513 11.365 11.208 10.96 10.787 10.603 10.505 10.309 10.105 9.877 9.759 9.554 9.376 9.216 9.049 8.716 8.508 8.279 8.038 7.759 7.431 7.025 6.023 -5 ,12838 ,KEBNE ,16675283,Wed Nov 24 03:24:11 CET,Wed Nov 24 04:46:10 CET,0.0 1.337 1.761 2.087 2.366 2.618 2.839 3.047 3.427 3.591 3.739 3.931 4.154 4.284 4.534 4.765 4.985 5.091 5.285 5.461 5.711 5.884 6.051 6.271 6.48 6.692 6.898 7.096 7.337 7.564 7.789 8.053 8.311 8.566 8.856 9.166 9.475 9.831 10.213 10.613 11.003 11.414 11.887 12.377 12.941 13.573 14.263 14.957 15.767 16.656 17.494 17.83 17.727 17.524 17.292 16.997 16.703 16.417 16.14 15.825 15.55 15.306 15.05 14.799 14.562 14.339 14.101 13.877 13.671 13.465 13.251 13.061 12.859 12.644 12.478 12.309 12.135 11.941 11.727 11.582 11.435 11.201 11.033 10.854 10.765 10.576 10.37 10.127 9.999 9.784 9.587 9.438 9.281 8.949 8.759 8.55 8.322 8.059 7.727 7.313 6.25 -6 ,14693 ,KEBNE ,16677578,Wed Nov 24 20:33:52 CET,Wed Nov 24 21:57:31 CET,0.0 1.031 1.429 1.745 2.043 2.301 2.524 2.706 3.027 3.175 3.321 3.507 3.728 3.855 4.107 4.349 4.566 4.668 4.862 5.052 5.329 5.499 5.659 5.885 6.117 6.353 6.56 6.75 7.009 7.266 7.504 7.792 8.071 8.322 8.616 8.937 9.227 9.56 9.926 10.29 10.673 11.128 11.639 12.154 12.751 13.384 14.043 14.744 15.547 16.355 17.073 17.433 17.407 17.166 16.871 16.558 16.255 15.941 15.649 15.342 15.064 14.816 14.566 14.312 14.069 13.847 13.617 13.413 13.221 13.014 12.804 12.626 12.441 12.241 12.086 11.937 11.778 11.605 11.424 11.294 11.146 10.904 10.739 10.566 10.477 10.284 10.08 9.869 9.747 9.533 9.335 9.188 9.04 8.707 8.516 8.303 8.085 7.823 7.497 7.061 6.047 -7 ,18666 ,KEBNE ,16675285,Wed Nov 24 03:24:12 CET,Wed Nov 24 04:45:43 CET,0.0 1.385 1.797 2.15 2.449 2.714 2.948 3.148 3.517 3.678 3.835 4.044 4.266 4.39 4.618 4.841 5.051 5.148 5.345 5.532 5.804 5.982 6.141 6.372 6.598 6.81 7.018 7.218 7.464 7.703 7.94 8.218 8.486 8.735 9.019 9.349 9.649 9.971 10.325 10.691 11.082 11.538 12.051 12.533 13.092 13.693 14.353 15.108 15.959 16.88 17.758 18.159 18.162 17.964 17.701 17.443 17.203 16.932 16.67 16.383 16.103 15.845 15.601 15.357 15.112 14.895 14.665 14.438 14.241 14.046 13.832 13.64 13.439 13.233 13.075 12.913 12.731 12.543 12.35 12.212 12.073 11.847 11.679 11.5 11.407 11.216 11.019 10.803 10.689 10.485 10.298 10.165 10.032 9.732 9.556 9.347 9.111 8.838 8.517 8.123 7.065 -8 ,16750 ,KEBNE ,16675286,Wed Nov 24 03:24:12 CET,Wed Nov 24 04:46:00 CET,0.0 1.252 1.78 2.145 2.429 2.686 2.931 3.144 3.524 3.688 3.844 4.049 4.267 4.4 4.661 4.897 5.129 5.231 5.412 5.587 5.85 6.015 6.171 6.411 6.627 6.827 7.026 7.218 7.469 7.711 7.953 8.248 8.523 8.778 9.068 9.406 9.73 10.064 10.421 10.79 11.166 11.59 12.068 12.527 13.06 13.638 14.307 15.08 15.911 16.776 17.674 18.116 18.104 17.885 17.607 17.345 17.049 16.729 16.469 16.18 15.888 15.633 15.376 15.12 14.876 14.633 14.37 14.138 13.939 13.737 13.519 13.34 13.162 12.964 12.807 12.634 12.44 12.241 12.03 11.88 11.731 11.498 11.339 11.171 11.078 10.881 10.671 10.442 10.329 10.13 9.957 9.817 9.664 9.32 9.12 8.895 8.642 8.356 8.013 7.578 6.403 -9 ,5457 ,KEBNE ,16677581,Wed Nov 24 20:33:53 CET,Wed Nov 24 21:58:31 CET,0.0 1.55 2.076 2.466 2.793 3.08 3.303 3.514 3.9 4.061 4.219 4.432 4.666 4.805 5.073 5.318 5.547 5.655 5.863 6.06 6.33 6.499 6.671 6.914 7.133 7.341 7.536 7.728 7.973 8.209 8.44 8.714 8.978 9.228 9.517 9.824 10.105 10.434 10.793 11.17 11.538 11.956 12.459 12.954 13.513 14.098 14.774 15.506 16.271 17.073 17.882 18.238 18.171 17.977 17.741 17.469 17.19 16.88 16.578 16.258 15.985 15.745 15.499 15.26 15.039 14.819 14.575 14.366 14.186 14.0 13.806 13.623 13.428 13.229 13.073 12.908 12.734 12.541 12.332 12.19 12.038 11.8 11.634 11.462 11.379 11.195 10.982 10.749 10.628 10.419 10.222 10.07 9.898 9.531 9.328 9.104 8.862 8.584 8.246 7.794 6.566 -10 ,8914 ,KEBNE ,16675288,Wed Nov 24 03:26:17 CET,Wed Nov 24 04:49:53 CET,0.0 1.373 1.909 2.244 2.523 2.75 2.948 3.137 3.462 3.618 3.774 3.958 4.172 4.293 4.537 4.771 4.989 5.093 5.288 5.474 5.752 5.934 6.098 6.321 6.544 6.764 6.976 7.184 7.446 7.687 7.918 8.191 8.453 8.695 8.978 9.304 9.598 9.918 10.265 10.634 11.012 11.435 11.946 12.478 13.051 13.666 14.348 15.048 15.845 16.674 17.502 17.89 17.795 17.572 17.34 17.079 16.77 16.476 16.213 15.935 15.688 15.444 15.188 14.922 14.688 14.48 14.234 13.996 13.798 13.609 13.406 13.232 13.048 12.859 12.704 12.542 12.369 12.174 11.954 11.798 11.653 11.417 11.245 11.071 10.983 10.795 10.585 10.352 10.227 10.013 9.836 9.692 9.532 9.186 9.001 8.804 8.578 8.299 7.973 7.559 6.331 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_44.txt deleted file mode 100644 index e2f6e944..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23423 ,KEBNE ,16675289,Wed Nov 24 03:28:22 CET,Wed Nov 24 04:50:07 CET,0.0 1.385 1.905 2.267 2.601 2.902 3.153 3.378 3.793 3.98 4.138 4.324 4.552 4.689 4.941 5.178 5.403 5.513 5.726 5.936 6.231 6.41 6.583 6.824 7.048 7.272 7.489 7.695 7.972 8.24 8.478 8.769 9.047 9.292 9.58 9.899 10.203 10.542 10.898 11.273 11.682 12.149 12.691 13.22 13.82 14.481 15.187 15.918 16.76 17.699 18.603 19.038 19.133 19.07 18.904 18.718 18.511 18.299 18.105 17.895 17.693 17.504 17.31 17.084 16.853 16.642 16.421 16.229 16.07 15.913 15.738 15.579 15.417 15.259 15.126 14.974 14.803 14.62 14.44 14.314 14.18 13.962 13.805 13.647 13.568 13.406 13.221 13.027 12.93 12.748 12.591 12.465 12.327 12.003 11.816 11.618 11.391 11.123 10.821 10.453 9.507 -2 ,10015 ,KEBNE ,16675290,Wed Nov 24 03:28:22 CET,Wed Nov 24 04:54:29 CET,0.0 1.14 1.636 2.024 2.356 2.633 2.864 3.073 3.464 3.649 3.83 4.064 4.297 4.438 4.717 4.975 5.212 5.325 5.546 5.749 6.027 6.205 6.381 6.643 6.881 7.104 7.324 7.54 7.815 8.084 8.341 8.63 8.914 9.19 9.498 9.839 10.161 10.508 10.885 11.275 11.684 12.134 12.652 13.158 13.718 14.343 15.024 15.746 16.558 17.475 18.408 18.878 18.959 18.876 18.697 18.507 18.315 18.103 17.908 17.674 17.445 17.24 17.034 16.849 16.673 16.494 16.288 16.08 15.896 15.716 15.523 15.358 15.196 15.023 14.881 14.741 14.595 14.441 14.271 14.143 14.009 13.8 13.65 13.5 13.421 13.245 13.05 12.856 12.751 12.559 12.396 12.271 12.147 11.858 11.679 11.48 11.241 10.959 10.635 10.215 9.189 -3 ,1731 ,KEBNE ,16675291,Wed Nov 24 03:33:31 CET,Wed Nov 24 04:55:40 CET,0.0 1.158 1.609 1.995 2.323 2.609 2.852 3.072 3.474 3.653 3.828 4.062 4.304 4.465 4.742 4.973 5.206 5.319 5.529 5.726 6.001 6.187 6.363 6.616 6.871 7.103 7.312 7.516 7.785 8.035 8.267 8.546 8.803 9.044 9.334 9.67 9.995 10.344 10.728 11.12 11.503 11.943 12.47 12.972 13.533 14.153 14.855 15.611 16.43 17.318 18.227 18.732 18.875 18.825 18.703 18.523 18.272 18.033 17.825 17.592 17.381 17.183 16.969 16.749 16.54 16.346 16.152 15.972 15.812 15.643 15.453 15.297 15.14 14.962 14.818 14.666 14.505 14.322 14.121 13.983 13.853 13.655 13.507 13.348 13.264 13.085 12.901 12.704 12.604 12.425 12.276 12.156 12.023 11.711 11.544 11.359 11.128 10.876 10.573 10.137 9.166 -4 ,24631 ,KEBNE ,16677586,Wed Nov 24 20:35:07 CET,Wed Nov 24 21:54:19 CET,0.0 1.391 1.891 2.254 2.542 2.787 3.026 3.252 3.655 3.84 4.019 4.268 4.504 4.642 4.919 5.185 5.423 5.531 5.738 5.925 6.212 6.402 6.575 6.834 7.088 7.319 7.54 7.762 8.036 8.277 8.512 8.808 9.103 9.378 9.668 9.984 10.292 10.627 10.997 11.386 11.767 12.2 12.688 13.165 13.74 14.35 15.026 15.777 16.609 17.493 18.364 18.806 18.859 18.815 18.72 18.55 18.319 18.082 17.867 17.619 17.373 17.155 16.948 16.738 16.548 16.382 16.203 16.038 15.893 15.725 15.523 15.343 15.159 14.966 14.815 14.665 14.506 14.328 14.142 14.016 13.878 13.664 13.529 13.381 13.304 13.148 12.977 12.774 12.668 12.486 12.324 12.184 12.037 11.732 11.569 11.382 11.172 10.944 10.657 10.284 9.31 -5 ,17005 ,KEBNE ,16675293,Wed Nov 24 03:34:33 CET,Wed Nov 24 04:56:01 CET,0.0 1.157 1.633 2.002 2.314 2.571 2.8 3.025 3.433 3.62 3.791 4.013 4.256 4.406 4.692 4.968 5.221 5.332 5.539 5.731 6.009 6.19 6.367 6.623 6.862 7.098 7.321 7.527 7.794 8.065 8.313 8.588 8.864 9.131 9.426 9.75 10.057 10.397 10.746 11.124 11.532 11.964 12.461 12.944 13.498 14.123 14.804 15.543 16.366 17.264 18.185 18.687 18.782 18.692 18.552 18.359 18.125 17.892 17.671 17.434 17.223 17.012 16.813 16.611 16.413 16.23 16.032 15.861 15.704 15.537 15.366 15.215 15.043 14.857 14.714 14.571 14.424 14.268 14.098 13.971 13.827 13.608 13.467 13.317 13.237 13.076 12.904 12.726 12.627 12.441 12.284 12.156 12.017 11.7 11.522 11.333 11.123 10.888 10.587 10.159 9.015 -6 ,13276 ,KEBNE ,16677588,Wed Nov 24 20:35:07 CET,Wed Nov 24 21:54:30 CET,0.0 1.268 1.796 2.203 2.515 2.763 3.002 3.239 3.648 3.828 4.009 4.253 4.493 4.648 4.937 5.205 5.455 5.565 5.77 5.969 6.257 6.447 6.627 6.873 7.101 7.319 7.529 7.729 7.986 8.252 8.511 8.811 9.099 9.375 9.692 10.03 10.342 10.68 11.047 11.43 11.83 12.28 12.797 13.315 13.88 14.477 15.146 15.858 16.623 17.462 18.369 18.881 19.003 18.964 18.852 18.692 18.5 18.29 18.089 17.877 17.675 17.469 17.252 17.034 16.833 16.662 16.476 16.292 16.127 15.942 15.742 15.581 15.409 15.228 15.081 14.917 14.749 14.569 14.378 14.252 14.125 13.928 13.784 13.628 13.549 13.379 13.192 12.987 12.874 12.684 12.503 12.36 12.209 11.867 11.68 11.468 11.235 10.986 10.692 10.273 9.384 -7 ,16741 ,KEBNE ,16675295,Wed Nov 24 03:36:38 CET,Wed Nov 24 04:58:15 CET,0.0 1.132 1.648 2.04 2.337 2.589 2.843 3.081 3.479 3.656 3.823 4.052 4.293 4.432 4.697 4.951 5.194 5.308 5.526 5.733 5.997 6.176 6.359 6.611 6.844 7.078 7.305 7.531 7.824 8.083 8.324 8.615 8.893 9.157 9.462 9.801 10.121 10.453 10.809 11.191 11.596 12.052 12.572 13.086 13.661 14.285 14.979 15.718 16.517 17.368 18.188 18.649 18.79 18.754 18.614 18.425 18.228 18.005 17.792 17.561 17.345 17.155 16.964 16.772 16.573 16.375 16.178 16.011 15.854 15.685 15.502 15.35 15.193 15.006 14.859 14.703 14.533 14.357 14.173 14.052 13.93 13.722 13.559 13.398 13.317 13.134 12.946 12.757 12.654 12.47 12.316 12.189 12.064 11.789 11.621 11.435 11.229 10.987 10.686 10.315 9.436 -8 ,22388 ,KEBNE ,16675296,Wed Nov 24 03:38:47 CET,Wed Nov 24 05:04:18 CET,0.0 1.371 1.861 2.238 2.545 2.799 3.05 3.282 3.68 3.86 4.035 4.279 4.515 4.647 4.908 5.159 5.412 5.534 5.767 5.977 6.254 6.435 6.615 6.869 7.112 7.335 7.551 7.756 8.015 8.267 8.498 8.773 9.036 9.307 9.618 9.951 10.276 10.627 10.987 11.359 11.754 12.192 12.694 13.21 13.817 14.459 15.165 15.923 16.773 17.677 18.57 19.034 19.099 19.033 18.889 18.691 18.469 18.253 18.038 17.789 17.576 17.372 17.162 16.956 16.768 16.598 16.416 16.25 16.094 15.917 15.723 15.557 15.377 15.196 15.057 14.904 14.746 14.577 14.395 14.274 14.141 13.911 13.751 13.593 13.512 13.337 13.152 12.94 12.831 12.65 12.506 12.381 12.245 11.949 11.766 11.566 11.352 11.1 10.781 10.408 9.44 -9 ,6794 ,KEBNE ,16675297,Wed Nov 24 03:42:51 CET,Wed Nov 24 05:04:10 CET,0.0 1.411 1.989 2.396 2.721 2.995 3.242 3.472 3.862 4.039 4.21 4.43 4.67 4.822 5.091 5.34 5.571 5.681 5.902 6.114 6.403 6.581 6.75 6.999 7.23 7.457 7.679 7.88 8.161 8.431 8.661 8.965 9.247 9.49 9.776 10.101 10.415 10.756 11.121 11.505 11.91 12.359 12.888 13.406 13.973 14.585 15.314 16.094 16.888 17.744 18.662 19.185 19.318 19.337 19.221 19.025 18.816 18.6 18.372 18.108 17.894 17.699 17.498 17.303 17.104 16.901 16.702 16.524 16.351 16.183 16.013 15.861 15.702 15.537 15.399 15.241 15.081 14.93 14.755 14.63 14.504 14.305 14.166 14.021 13.943 13.76 13.573 13.376 13.262 13.071 12.912 12.772 12.623 12.299 12.124 11.941 11.732 11.467 11.165 10.823 9.779 -10 ,16633 ,KEBNE ,16677592,Wed Nov 24 20:36:58 CET,Wed Nov 24 21:59:18 CET,0.0 1.043 1.492 1.838 2.14 2.396 2.629 2.864 3.267 3.427 3.577 3.793 4.033 4.171 4.442 4.71 4.95 5.069 5.3 5.508 5.81 6.0 6.18 6.422 6.653 6.892 7.123 7.345 7.619 7.868 8.104 8.398 8.689 8.959 9.26 9.581 9.877 10.208 10.568 10.962 11.377 11.839 12.378 12.884 13.448 14.097 14.838 15.607 16.408 17.277 18.191 18.669 18.79 18.79 18.697 18.511 18.283 18.053 17.84 17.598 17.368 17.165 16.964 16.757 16.562 16.382 16.19 16.007 15.838 15.673 15.506 15.355 15.183 15.005 14.861 14.7 14.54 14.377 14.203 14.082 13.954 13.764 13.627 13.476 13.399 13.238 13.049 12.837 12.727 12.538 12.372 12.246 12.115 11.817 11.649 11.448 11.219 10.939 10.612 10.211 9.235 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_52_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_52_35.txt deleted file mode 100644 index 32fc179c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_52_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17117 ,KEBNE ,16677593,Wed Nov 24 20:36:58 CET,Wed Nov 24 22:02:15 CET,0.0 1.003 1.336 1.574 1.772 1.95 2.109 2.246 2.498 2.611 2.72 2.842 3.023 3.112 3.275 3.428 3.574 3.646 3.787 3.917 4.102 4.219 4.331 4.489 4.64 4.793 4.941 5.078 5.246 5.406 5.559 5.739 5.906 6.073 6.265 6.464 6.663 6.891 7.125 7.348 7.57 7.806 8.078 8.379 8.724 9.076 9.47 9.87 10.288 10.659 10.947 10.928 10.678 10.362 10.021 9.654 9.3 8.972 8.656 8.326 8.035 7.753 7.468 7.196 6.933 6.68 6.42 6.201 6.005 5.799 5.58 5.385 5.181 4.976 4.828 4.679 4.522 4.35 4.164 4.021 3.856 3.594 3.422 3.243 3.146 2.958 2.766 2.545 2.419 2.204 2.008 1.854 1.695 1.335 1.126 0.899 0.65 0.349 -0.031 -0.508 -1.976 -2 ,22176 ,KEBNE ,16677594,Wed Nov 24 20:37:01 CET,Wed Nov 24 21:59:11 CET,0.0 0.791 1.089 1.326 1.52 1.672 1.817 1.958 2.21 2.324 2.427 2.536 2.72 2.816 2.997 3.159 3.31 3.388 3.539 3.672 3.856 3.974 4.089 4.257 4.411 4.548 4.684 4.822 4.996 5.161 5.311 5.488 5.657 5.82 6.007 6.208 6.403 6.63 6.871 7.109 7.351 7.636 7.957 8.236 8.53 8.858 9.238 9.618 10.014 10.436 10.737 10.741 10.52 10.188 9.831 9.481 9.14 8.783 8.435 8.084 7.811 7.54 7.26 6.998 6.736 6.508 6.271 6.045 5.848 5.639 5.416 5.223 5.022 4.82 4.663 4.501 4.331 4.144 3.942 3.797 3.646 3.416 3.256 3.085 2.999 2.829 2.622 2.379 2.255 2.044 1.847 1.697 1.543 1.205 1.004 0.789 0.559 0.249 -0.191 -0.764 -2.394 -3 ,9950 ,KEBNE ,16675361,Wed Nov 24 03:55:11 CET,Wed Nov 24 05:22:47 CET,0.0 0.984 1.318 1.562 1.764 1.94 2.102 2.26 2.54 2.653 2.758 2.864 3.033 3.119 3.295 3.459 3.606 3.678 3.817 3.941 4.121 4.242 4.359 4.523 4.681 4.837 4.98 5.114 5.285 5.448 5.607 5.805 5.99 6.153 6.339 6.548 6.743 6.954 7.186 7.431 7.67 7.937 8.247 8.553 8.9 9.255 9.633 10.018 10.398 10.749 11.028 11.001 10.773 10.477 10.131 9.749 9.383 9.044 8.737 8.421 8.151 7.892 7.625 7.373 7.133 6.901 6.641 6.405 6.202 5.976 5.735 5.527 5.313 5.108 4.946 4.772 4.596 4.411 4.21 4.072 3.938 3.711 3.535 3.359 3.265 3.058 2.837 2.6 2.479 2.27 2.079 1.933 1.788 1.464 1.267 1.054 0.813 0.536 0.17 -0.441 -1.865 -4 ,12962 ,KEBNE ,16675362,Wed Nov 24 03:55:11 CET,Wed Nov 24 05:19:51 CET,0.0 0.888 1.181 1.399 1.587 1.757 1.911 2.047 2.287 2.401 2.512 2.622 2.801 2.893 3.058 3.213 3.359 3.431 3.571 3.702 3.89 4.012 4.126 4.282 4.433 4.588 4.736 4.871 5.037 5.194 5.348 5.533 5.708 5.867 6.056 6.285 6.486 6.698 6.923 7.147 7.369 7.605 7.883 8.165 8.489 8.835 9.214 9.62 10.043 10.46 10.772 10.736 10.504 10.213 9.885 9.559 9.233 8.873 8.545 8.227 7.934 7.672 7.419 7.161 6.913 6.666 6.406 6.181 5.985 5.78 5.568 5.394 5.205 4.997 4.829 4.653 4.463 4.269 4.069 3.93 3.775 3.522 3.364 3.196 3.102 2.891 2.668 2.454 2.334 2.121 1.913 1.762 1.615 1.272 1.065 0.825 0.575 0.311 -0.031 -0.528 -2.266 -5 ,1609 ,KEBNE ,16675363,Wed Nov 24 03:55:11 CET,Wed Nov 24 05:18:02 CET,0.0 0.644 0.94 1.192 1.402 1.575 1.721 1.856 2.1 2.206 2.308 2.419 2.598 2.69 2.866 3.035 3.182 3.254 3.401 3.537 3.72 3.838 3.956 4.125 4.277 4.417 4.559 4.696 4.872 5.042 5.198 5.381 5.561 5.727 5.905 6.107 6.304 6.516 6.747 6.981 7.212 7.485 7.799 8.118 8.494 8.88 9.296 9.724 10.204 10.666 10.931 10.833 10.543 10.164 9.754 9.349 8.978 8.63 8.3 7.949 7.664 7.405 7.118 6.827 6.562 6.315 6.065 5.846 5.641 5.426 5.204 5.011 4.816 4.61 4.436 4.26 4.086 3.89 3.68 3.541 3.389 3.142 2.978 2.808 2.719 2.521 2.284 2.012 1.873 1.661 1.47 1.323 1.162 0.795 0.592 0.374 0.129 -0.17 -0.525 -1.022 -2.497 -6 ,21467 ,KEBNE ,16677598,Wed Nov 24 20:37:59 CET,Wed Nov 24 22:04:15 CET,0.0 0.774 1.083 1.299 1.478 1.645 1.801 1.936 2.188 2.309 2.426 2.565 2.746 2.834 3.012 3.176 3.327 3.4 3.538 3.669 3.857 3.977 4.099 4.272 4.425 4.567 4.706 4.846 5.026 5.19 5.352 5.547 5.733 5.917 6.121 6.34 6.567 6.818 7.057 7.302 7.566 7.848 8.168 8.503 8.875 9.226 9.609 10.036 10.448 10.799 11.006 10.877 10.609 10.274 9.898 9.492 9.083 8.734 8.42 8.092 7.819 7.567 7.337 7.096 6.849 6.611 6.33 6.085 5.879 5.663 5.437 5.249 5.054 4.841 4.67 4.505 4.338 4.148 3.94 3.785 3.607 3.342 3.176 2.987 2.886 2.688 2.484 2.266 2.141 1.925 1.734 1.583 1.427 1.098 0.913 0.687 0.406 0.104 -0.263 -0.782 -2.474 -7 ,3735 ,KEBNE ,16675365,Wed Nov 24 03:55:15 CET,Wed Nov 24 05:12:26 CET,0.0 0.883 1.21 1.447 1.638 1.799 1.939 2.073 2.32 2.434 2.544 2.668 2.849 2.939 3.115 3.274 3.422 3.496 3.633 3.752 3.926 4.034 4.137 4.289 4.435 4.565 4.681 4.795 4.942 5.087 5.228 5.402 5.58 5.746 5.923 6.12 6.299 6.49 6.715 6.963 7.209 7.48 7.786 8.088 8.423 8.76 9.123 9.49 9.879 10.274 10.581 10.592 10.401 10.141 9.867 9.542 9.196 8.874 8.568 8.239 7.942 7.68 7.431 7.161 6.894 6.652 6.405 6.179 5.97 5.759 5.538 5.351 5.157 4.943 4.767 4.578 4.386 4.194 4.0 3.872 3.732 3.498 3.337 3.165 3.074 2.888 2.7 2.503 2.399 2.206 2.03 1.889 1.75 1.466 1.3 1.093 0.823 0.513 0.149 -0.395 -1.893 -8 ,1891 ,KEBNE ,16675366,Wed Nov 24 03:56:12 CET,Wed Nov 24 05:18:59 CET,0.0 0.689 0.952 1.142 1.304 1.456 1.587 1.715 1.943 2.045 2.142 2.242 2.419 2.511 2.678 2.826 2.972 3.045 3.19 3.323 3.508 3.628 3.74 3.895 4.039 4.185 4.335 4.476 4.649 4.807 4.959 5.133 5.303 5.472 5.657 5.852 6.05 6.277 6.511 6.763 7.027 7.316 7.63 7.92 8.244 8.571 8.939 9.311 9.693 10.092 10.341 10.314 10.089 9.746 9.39 9.028 8.679 8.366 8.102 7.792 7.494 7.234 6.968 6.708 6.476 6.262 6.029 5.814 5.624 5.42 5.212 5.026 4.816 4.595 4.418 4.242 4.057 3.844 3.623 3.486 3.341 3.096 2.914 2.724 2.63 2.429 2.216 1.982 1.856 1.646 1.467 1.311 1.129 0.725 0.51 0.278 0.032 -0.249 -0.63 -1.225 -3.096 -9 ,26827 ,KEBNE ,16675367,Wed Nov 24 03:56:12 CET,Wed Nov 24 05:19:30 CET,0.0 1.008 1.335 1.575 1.772 1.939 2.086 2.225 2.477 2.594 2.702 2.809 2.984 3.068 3.234 3.39 3.527 3.594 3.729 3.856 4.038 4.156 4.271 4.431 4.591 4.745 4.889 5.031 5.212 5.381 5.534 5.717 5.899 6.064 6.258 6.477 6.683 6.918 7.16 7.405 7.658 7.922 8.226 8.534 8.866 9.214 9.597 9.996 10.434 10.846 11.138 11.09 10.825 10.471 10.073 9.671 9.302 8.969 8.661 8.345 8.073 7.815 7.563 7.322 7.089 6.851 6.579 6.335 6.135 5.917 5.681 5.493 5.294 5.074 4.899 4.721 4.534 4.336 4.124 3.974 3.82 3.567 3.379 3.185 3.094 2.918 2.713 2.478 2.355 2.142 1.965 1.82 1.66 1.332 1.159 0.955 0.7 0.402 0.064 -0.456 -1.905 -10 ,18318 ,KEBNE ,16675368,Wed Nov 24 03:56:13 CET,Wed Nov 24 05:19:19 CET,0.0 0.696 1.012 1.239 1.43 1.599 1.748 1.889 2.152 2.267 2.372 2.474 2.653 2.744 2.912 3.075 3.237 3.311 3.445 3.566 3.741 3.859 3.97 4.131 4.289 4.44 4.58 4.71 4.883 5.052 5.202 5.382 5.559 5.726 5.922 6.125 6.31 6.527 6.77 7.019 7.253 7.499 7.795 8.08 8.377 8.704 9.097 9.521 9.955 10.383 10.74 10.747 10.511 10.209 9.879 9.516 9.14 8.794 8.479 8.151 7.881 7.634 7.386 7.139 6.907 6.667 6.39 6.153 5.958 5.746 5.503 5.305 5.105 4.902 4.743 4.575 4.394 4.201 4.005 3.87 3.732 3.494 3.32 3.148 3.058 2.873 2.688 2.494 2.385 2.176 1.984 1.842 1.693 1.366 1.18 0.991 0.802 0.565 0.246 -0.224 -1.624 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_35.txt deleted file mode 100644 index 94e45ba3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23149 ,KEBNE ,16675369,Wed Nov 24 03:56:12 CET,Wed Nov 24 05:20:57 CET,0.0 0.792 1.07 1.299 1.484 1.654 1.82 1.97 2.226 2.33 2.419 2.521 2.711 2.805 2.983 3.15 3.297 3.369 3.509 3.643 3.831 3.949 4.061 4.216 4.37 4.516 4.648 4.779 4.938 5.093 5.243 5.422 5.598 5.763 5.946 6.148 6.339 6.546 6.755 6.975 7.21 7.473 7.789 8.119 8.484 8.846 9.246 9.672 10.122 10.613 11.049 11.12 10.94 10.686 10.418 10.068 9.7 9.378 9.069 8.71 8.383 8.086 7.825 7.582 7.337 7.112 6.869 6.655 6.464 6.247 6.026 5.825 5.61 5.391 5.203 5.002 4.797 4.583 4.368 4.221 4.05 3.769 3.572 3.374 3.274 3.063 2.826 2.558 2.411 2.168 1.928 1.757 1.571 1.191 0.968 0.717 0.413 0.002 -0.451 -1.028 -3.307 -2 ,24183 ,KEBNE ,16677604,Wed Nov 24 20:40:03 CET,Wed Nov 24 22:06:41 CET,0.0 1.049 1.383 1.631 1.832 2.004 2.16 2.295 2.542 2.666 2.78 2.888 3.064 3.153 3.328 3.49 3.644 3.717 3.857 3.988 4.159 4.259 4.36 4.507 4.648 4.783 4.914 5.038 5.183 5.326 5.477 5.651 5.82 5.989 6.176 6.38 6.567 6.771 7.005 7.258 7.526 7.809 8.122 8.444 8.816 9.232 9.692 10.164 10.66 11.141 11.492 11.519 11.374 11.122 10.831 10.474 10.082 9.731 9.438 9.111 8.799 8.524 8.226 7.932 7.669 7.416 7.152 6.917 6.7 6.469 6.225 6.009 5.773 5.517 5.329 5.136 4.908 4.656 4.404 4.236 4.05 3.75 3.549 3.331 3.224 3.005 2.758 2.513 2.401 2.196 1.958 1.779 1.59 1.183 0.955 0.691 0.382 0.016 -0.464 -1.128 -3.816 -3 ,8735 ,KEBNE ,16677605,Wed Nov 24 20:40:03 CET,Wed Nov 24 22:06:54 CET,0.0 0.584 0.879 1.094 1.286 1.462 1.608 1.732 1.974 2.094 2.205 2.317 2.495 2.582 2.75 2.918 3.075 3.145 3.28 3.408 3.602 3.728 3.842 4.002 4.154 4.295 4.444 4.588 4.758 4.93 5.095 5.295 5.49 5.666 5.865 6.086 6.288 6.519 6.77 7.021 7.282 7.59 7.943 8.29 8.693 9.105 9.554 10.017 10.506 11.024 11.434 11.52 11.348 11.073 10.783 10.478 10.136 9.775 9.469 9.127 8.784 8.482 8.194 7.912 7.66 7.427 7.166 6.934 6.725 6.504 6.282 6.08 5.856 5.628 5.449 5.252 5.043 4.834 4.623 4.463 4.285 3.999 3.806 3.608 3.499 3.273 3.03 2.786 2.651 2.423 2.217 2.053 1.863 1.453 1.242 0.991 0.68 0.313 -0.128 -0.741 -3.171 -4 ,4252 ,KEBNE ,16675372,Wed Nov 24 03:58:17 CET,Wed Nov 24 05:26:53 CET,0.0 1.056 1.371 1.608 1.805 1.978 2.133 2.274 2.523 2.643 2.756 2.88 3.069 3.16 3.333 3.495 3.644 3.715 3.849 3.981 4.169 4.283 4.394 4.562 4.717 4.866 5.011 5.145 5.312 5.477 5.638 5.82 5.995 6.156 6.338 6.551 6.74 6.942 7.157 7.383 7.632 7.906 8.22 8.523 8.865 9.255 9.704 10.205 10.703 11.205 11.648 11.727 11.561 11.281 10.984 10.659 10.307 9.968 9.676 9.368 9.05 8.735 8.441 8.177 7.938 7.699 7.423 7.177 6.966 6.741 6.509 6.311 6.1 5.883 5.714 5.545 5.358 5.152 4.935 4.778 4.618 4.356 4.164 3.963 3.859 3.638 3.4 3.141 3.001 2.775 2.51 2.313 2.128 1.723 1.488 1.221 0.937 0.619 0.184 -0.388 -2.606 -5 ,11049 ,KEBNE ,16675373,Wed Nov 24 03:59:19 CET,Wed Nov 24 05:22:37 CET,0.0 0.506 0.736 0.915 1.064 1.196 1.323 1.446 1.672 1.77 1.865 1.962 2.141 2.23 2.4 2.56 2.698 2.763 2.89 3.01 3.179 3.289 3.399 3.559 3.708 3.844 3.972 4.104 4.276 4.432 4.582 4.756 4.927 5.093 5.273 5.476 5.676 5.892 6.117 6.353 6.595 6.867 7.167 7.467 7.826 8.204 8.639 9.084 9.569 10.098 10.541 10.632 10.44 10.136 9.781 9.395 9.045 8.702 8.39 8.062 7.749 7.452 7.177 6.895 6.603 6.344 6.078 5.836 5.613 5.382 5.14 4.932 4.724 4.512 4.343 4.168 3.973 3.763 3.551 3.4 3.24 2.976 2.791 2.595 2.492 2.284 2.068 1.829 1.697 1.475 1.242 1.071 0.888 0.497 0.258 -0.011 -0.306 -0.657 -1.105 -1.669 -3.764 -6 ,3950 ,KEBNE ,16675374,Wed Nov 24 03:59:19 CET,Wed Nov 24 05:26:08 CET,0.0 0.584 0.833 1.035 1.212 1.377 1.529 1.658 1.902 2.017 2.123 2.238 2.416 2.503 2.671 2.828 2.978 3.048 3.185 3.326 3.534 3.665 3.783 3.949 4.105 4.251 4.395 4.537 4.715 4.881 5.036 5.229 5.416 5.598 5.806 6.024 6.238 6.481 6.733 6.986 7.247 7.528 7.845 8.169 8.538 8.934 9.386 9.855 10.334 10.82 11.204 11.276 11.103 10.836 10.546 10.198 9.829 9.46 9.124 8.781 8.489 8.192 7.904 7.643 7.391 7.152 6.884 6.641 6.438 6.212 5.949 5.747 5.532 5.279 5.095 4.908 4.7 4.475 4.225 4.054 3.883 3.608 3.417 3.207 3.095 2.87 2.618 2.347 2.193 1.931 1.659 1.481 1.285 0.83 0.593 0.342 0.047 -0.291 -0.722 -1.313 -3.192 -7 ,13411 ,KEBNE ,16675375,Wed Nov 24 04:04:30 CET,Wed Nov 24 05:37:17 CET,0.0 0.765 1.025 1.199 1.347 1.488 1.622 1.755 1.989 2.088 2.183 2.293 2.467 2.55 2.704 2.835 2.967 3.034 3.163 3.294 3.478 3.583 3.681 3.822 3.954 4.092 4.233 4.364 4.53 4.684 4.831 5.019 5.205 5.384 5.595 5.825 6.035 6.252 6.488 6.75 7.018 7.307 7.654 7.986 8.352 8.764 9.194 9.643 10.15 10.629 11.013 11.084 10.884 10.559 10.224 9.85 9.482 9.153 8.839 8.489 8.17 7.897 7.619 7.328 7.059 6.808 6.531 6.263 6.035 5.802 5.546 5.311 5.069 4.832 4.641 4.439 4.247 4.049 3.826 3.662 3.496 3.253 3.088 2.92 2.827 2.622 2.385 2.13 1.997 1.782 1.582 1.425 1.252 0.8 0.547 0.301 0.016 -0.313 -0.71 -1.232 -3.485 -8 ,7955 ,KEBNE ,16677610,Wed Nov 24 20:41:04 CET,Wed Nov 24 22:06:45 CET,0.0 0.808 1.142 1.366 1.566 1.749 1.903 2.041 2.281 2.395 2.512 2.644 2.83 2.922 3.093 3.262 3.419 3.491 3.631 3.767 3.958 4.082 4.207 4.388 4.555 4.709 4.855 4.997 5.178 5.354 5.519 5.713 5.908 6.095 6.307 6.538 6.755 6.995 7.247 7.507 7.779 8.078 8.413 8.746 9.124 9.54 10.009 10.483 10.957 11.421 11.807 11.881 11.706 11.44 11.169 10.858 10.545 10.235 9.895 9.534 9.229 8.946 8.671 8.398 8.13 7.885 7.632 7.4 7.181 6.931 6.684 6.479 6.239 5.997 5.825 5.625 5.413 5.205 4.978 4.818 4.646 4.367 4.175 3.974 3.86 3.631 3.394 3.115 2.974 2.75 2.514 2.341 2.156 1.763 1.535 1.275 0.982 0.639 0.165 -0.458 -2.637 -9 ,11198 ,KEBNE ,16677611,Wed Nov 24 20:41:03 CET,Wed Nov 24 22:06:42 CET,0.0 0.729 1.002 1.213 1.388 1.536 1.667 1.792 2.018 2.122 2.222 2.335 2.512 2.597 2.769 2.936 3.097 3.175 3.316 3.449 3.639 3.76 3.878 4.047 4.207 4.372 4.536 4.682 4.861 5.029 5.188 5.383 5.563 5.726 5.925 6.151 6.365 6.593 6.826 7.07 7.321 7.603 7.937 8.256 8.619 9.017 9.433 9.848 10.298 10.787 11.25 11.34 11.173 10.92 10.592 10.201 9.843 9.486 9.126 8.747 8.394 8.083 7.804 7.546 7.311 7.069 6.781 6.516 6.292 6.067 5.836 5.634 5.412 5.169 4.976 4.784 4.598 4.397 4.159 4.006 3.853 3.604 3.426 3.235 3.141 2.961 2.755 2.502 2.371 2.156 1.939 1.771 1.59 1.186 0.939 0.672 0.382 0.036 -0.429 -1.097 -3.182 -10 ,11162 ,KEBNE ,16675378,Wed Nov 24 04:08:41 CET,Wed Nov 24 05:32:01 CET,0.0 0.945 1.264 1.515 1.719 1.898 2.051 2.19 2.446 2.57 2.686 2.807 2.99 3.081 3.258 3.42 3.57 3.645 3.784 3.913 4.104 4.232 4.349 4.514 4.683 4.845 4.992 5.126 5.297 5.456 5.611 5.803 5.99 6.167 6.365 6.573 6.76 6.972 7.206 7.45 7.696 7.961 8.267 8.566 8.902 9.271 9.686 10.117 10.53 10.918 11.258 11.265 11.022 10.721 10.42 10.099 9.763 9.407 9.059 8.71 8.406 8.115 7.818 7.523 7.245 7.001 6.752 6.525 6.338 6.141 5.922 5.729 5.501 5.242 5.044 4.842 4.62 4.393 4.159 3.992 3.825 3.555 3.362 3.175 3.073 2.85 2.607 2.327 2.175 1.939 1.701 1.522 1.34 0.968 0.753 0.488 0.161 -0.247 -0.755 -1.377 -4.307 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_52.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_52.txt deleted file mode 100644 index d67ad980..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_52.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26894 ,KEBNE ,16675379,Wed Nov 24 04:08:40 CET,Wed Nov 24 05:32:39 CET,0.0 0.882 1.217 1.498 1.751 1.978 2.179 2.349 2.672 2.823 2.952 3.112 3.311 3.428 3.654 3.847 4.032 4.122 4.287 4.461 4.711 4.862 5.017 5.239 5.44 5.629 5.809 5.976 6.179 6.368 6.559 6.774 6.981 7.188 7.427 7.696 7.932 8.183 8.453 8.734 9.021 9.322 9.661 9.976 10.303 10.658 11.043 11.467 11.919 12.298 12.533 12.381 12.094 11.759 11.359 10.942 10.562 10.215 9.902 9.585 9.283 9.001 8.745 8.478 8.221 7.994 7.735 7.501 7.297 7.079 6.848 6.652 6.454 6.237 6.069 5.888 5.692 5.509 5.298 5.134 4.968 4.716 4.536 4.356 4.267 4.059 3.842 3.629 3.512 3.31 3.144 3.0 2.835 2.461 2.236 1.992 1.714 1.385 1.018 0.524 -1.201 -2 ,5928 ,KEBNE ,16677614,Wed Nov 24 20:41:04 CET,Wed Nov 24 22:05:04 CET,0.0 0.976 1.357 1.628 1.87 2.104 2.301 2.472 2.788 2.937 3.08 3.276 3.487 3.602 3.817 4.02 4.21 4.296 4.457 4.621 4.869 5.009 5.148 5.369 5.567 5.75 5.925 6.101 6.305 6.493 6.682 6.897 7.098 7.285 7.515 7.779 8.004 8.233 8.5 8.79 9.078 9.396 9.747 10.076 10.449 10.847 11.283 11.742 12.201 12.623 12.922 12.817 12.539 12.232 11.886 11.51 11.147 10.805 10.496 10.155 9.851 9.578 9.31 9.042 8.787 8.55 8.298 8.078 7.868 7.652 7.426 7.232 7.035 6.821 6.643 6.456 6.26 6.046 5.826 5.676 5.512 5.253 5.084 4.913 4.82 4.619 4.386 4.125 3.984 3.75 3.549 3.41 3.255 2.905 2.709 2.481 2.233 1.935 1.568 1.035 -0.849 -3 ,19043 ,KEBNE ,16677615,Wed Nov 24 20:42:06 CET,Wed Nov 24 22:11:12 CET,0.0 0.854 1.241 1.543 1.795 2.01 2.191 2.359 2.67 2.81 2.937 3.076 3.266 3.377 3.584 3.767 3.928 4.007 4.165 4.327 4.561 4.702 4.832 5.013 5.189 5.362 5.541 5.715 5.928 6.121 6.306 6.534 6.735 6.914 7.113 7.343 7.582 7.842 8.124 8.412 8.699 9.016 9.376 9.71 10.073 10.497 10.994 11.482 11.953 12.411 12.68 12.521 12.14 11.66 11.178 10.758 10.355 9.966 9.636 9.271 8.924 8.591 8.276 7.992 7.718 7.465 7.191 6.94 6.722 6.496 6.262 6.065 5.859 5.64 5.472 5.292 5.095 4.887 4.673 4.527 4.377 4.135 3.967 3.784 3.684 3.487 3.286 3.074 2.959 2.752 2.544 2.385 2.213 1.834 1.636 1.438 1.196 0.904 0.559 0.131 -1.119 -4 ,25872 ,KEBNE ,16677616,Wed Nov 24 20:44:08 CET,Wed Nov 24 22:10:36 CET,0.0 0.91 1.308 1.594 1.819 2.0 2.184 2.357 2.652 2.79 2.918 3.083 3.284 3.388 3.565 3.732 3.884 3.957 4.097 4.229 4.422 4.539 4.655 4.823 4.993 5.168 5.336 5.507 5.702 5.882 6.069 6.296 6.508 6.696 6.914 7.162 7.381 7.612 7.881 8.16 8.44 8.744 9.094 9.431 9.804 10.192 10.579 10.99 11.443 11.899 12.215 12.16 11.945 11.616 11.224 10.858 10.51 10.183 9.884 9.532 9.221 8.966 8.71 8.453 8.207 7.975 7.736 7.524 7.339 7.145 6.935 6.763 6.597 6.411 6.261 6.1 5.913 5.714 5.518 5.387 5.236 4.984 4.809 4.621 4.525 4.334 4.136 3.911 3.794 3.592 3.402 3.253 3.095 2.739 2.515 2.269 2.035 1.745 1.374 0.82 -1.289 -5 ,11302 ,KEBNE ,16677617,Wed Nov 24 20:44:11 CET,Wed Nov 24 22:07:33 CET,0.0 1.414 1.861 2.185 2.436 2.647 2.843 3.028 3.36 3.508 3.651 3.827 4.026 4.138 4.354 4.545 4.71 4.786 4.943 5.097 5.314 5.456 5.595 5.795 5.979 6.159 6.331 6.481 6.673 6.854 7.033 7.248 7.446 7.638 7.865 8.118 8.355 8.611 8.871 9.133 9.403 9.732 10.106 10.461 10.847 11.253 11.707 12.172 12.642 13.032 13.261 13.127 12.827 12.463 12.044 11.652 11.308 10.941 10.615 10.299 10.001 9.717 9.441 9.176 8.918 8.664 8.392 8.15 7.954 7.761 7.551 7.37 7.179 6.974 6.798 6.615 6.441 6.251 6.053 5.923 5.783 5.552 5.38 5.207 5.122 4.94 4.735 4.512 4.395 4.191 4.04 3.916 3.776 3.474 3.295 3.088 2.871 2.611 2.283 1.858 0.404 -6 ,14845 ,KEBNE ,16675384,Wed Nov 24 04:15:58 CET,Wed Nov 24 05:39:32 CET,0.0 0.809 1.138 1.383 1.605 1.799 1.973 2.132 2.41 2.545 2.673 2.839 3.031 3.125 3.311 3.476 3.63 3.71 3.865 4.02 4.244 4.399 4.542 4.721 4.884 5.032 5.19 5.349 5.55 5.738 5.921 6.132 6.332 6.526 6.734 6.958 7.183 7.448 7.729 8.0 8.279 8.582 8.925 9.255 9.589 9.96 10.406 10.852 11.302 11.726 11.968 11.924 11.664 11.288 10.892 10.44 10.0 9.6 9.252 8.893 8.565 8.272 7.967 7.683 7.422 7.174 6.928 6.707 6.507 6.298 6.074 5.875 5.66 5.443 5.268 5.069 4.865 4.661 4.461 4.325 4.169 3.903 3.709 3.512 3.418 3.223 2.996 2.742 2.616 2.405 2.203 2.045 1.877 1.513 1.312 1.114 0.898 0.624 0.286 -0.159 -1.688 -7 ,766 ,KEBNE ,16675385,Wed Nov 24 04:15:58 CET,Wed Nov 24 05:39:42 CET,0.0 0.957 1.328 1.611 1.827 2.009 2.196 2.347 2.603 2.738 2.878 3.061 3.261 3.373 3.608 3.824 4.02 4.111 4.285 4.466 4.722 4.862 4.988 5.177 5.367 5.557 5.723 5.879 6.083 6.286 6.473 6.689 6.899 7.099 7.322 7.565 7.795 8.042 8.281 8.527 8.791 9.068 9.389 9.73 10.133 10.548 10.967 11.382 11.839 12.306 12.568 12.461 12.149 11.749 11.35 10.964 10.575 10.19 9.844 9.483 9.159 8.88 8.621 8.344 8.07 7.835 7.587 7.356 7.144 6.92 6.684 6.481 6.264 6.039 5.858 5.661 5.454 5.245 5.031 4.882 4.738 4.515 4.35 4.178 4.09 3.911 3.713 3.497 3.39 3.197 3.025 2.878 2.715 2.37 2.182 1.961 1.709 1.446 1.143 0.668 -0.911 -8 ,14694 ,KEBNE ,16675386,Wed Nov 24 04:16:02 CET,Wed Nov 24 05:34:50 CET,0.0 1.225 1.603 1.862 2.097 2.308 2.493 2.66 2.955 3.088 3.228 3.402 3.598 3.705 3.905 4.088 4.279 4.372 4.537 4.705 4.961 5.108 5.228 5.423 5.622 5.804 5.981 6.146 6.349 6.554 6.745 6.954 7.179 7.397 7.619 7.845 8.062 8.307 8.578 8.867 9.156 9.469 9.818 10.159 10.552 10.981 11.418 11.867 12.336 12.752 13.024 12.923 12.627 12.233 11.824 11.397 11.007 10.65 10.333 10.006 9.699 9.424 9.156 8.883 8.628 8.399 8.152 7.916 7.71 7.483 7.241 7.041 6.841 6.637 6.465 6.29 6.106 5.907 5.687 5.535 5.373 5.118 4.959 4.796 4.701 4.5 4.291 4.06 3.938 3.728 3.547 3.405 3.261 2.939 2.749 2.53 2.279 1.991 1.653 1.163 -0.377 -9 ,24468 ,KEBNE ,16677621,Wed Nov 24 20:49:17 CET,Wed Nov 24 22:15:14 CET,0.0 1.18 1.548 1.832 2.074 2.297 2.49 2.648 2.934 3.066 3.196 3.364 3.568 3.679 3.867 4.038 4.206 4.288 4.451 4.602 4.8 4.924 5.054 5.243 5.424 5.605 5.779 5.959 6.173 6.363 6.555 6.769 6.961 7.146 7.354 7.589 7.821 8.066 8.31 8.564 8.839 9.143 9.492 9.841 10.216 10.592 11.004 11.444 11.889 12.27 12.458 12.318 12.024 11.655 11.275 10.871 10.487 10.133 9.809 9.435 9.107 8.832 8.565 8.29 8.031 7.788 7.519 7.284 7.08 6.862 6.632 6.433 6.221 6.003 5.839 5.664 5.484 5.289 5.067 4.911 4.757 4.523 4.347 4.163 4.067 3.86 3.635 3.39 3.26 3.044 2.856 2.707 2.551 2.187 1.975 1.746 1.463 1.129 0.763 0.25 -1.196 -10 ,20660 ,KEBNE ,16675388,Wed Nov 24 04:18:03 CET,Wed Nov 24 05:43:34 CET,0.0 1.247 1.742 2.11 2.409 2.632 2.825 3.017 3.376 3.523 3.647 3.8 3.997 4.104 4.321 4.534 4.727 4.812 4.99 5.162 5.392 5.535 5.665 5.85 6.032 6.203 6.367 6.524 6.732 6.941 7.137 7.359 7.556 7.737 7.959 8.199 8.422 8.668 8.939 9.229 9.513 9.828 10.179 10.503 10.853 11.216 11.623 12.067 12.528 12.953 13.208 13.105 12.783 12.38 11.992 11.606 11.221 10.833 10.492 10.143 9.829 9.536 9.244 8.958 8.695 8.452 8.189 7.954 7.755 7.539 7.301 7.102 6.886 6.653 6.472 6.276 6.075 5.862 5.642 5.481 5.318 5.084 4.922 4.751 4.654 4.438 4.225 4.002 3.874 3.663 3.474 3.319 3.16 2.807 2.606 2.375 2.117 1.851 1.532 1.119 -0.339 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_35.txt deleted file mode 100644 index ed09e797..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5838 ,KEBNE ,16677623,Wed Nov 24 20:50:18 CET,Wed Nov 24 22:16:36 CET,0.0 0.811 1.102 1.326 1.519 1.691 1.847 1.993 2.243 2.339 2.424 2.506 2.677 2.756 2.905 3.052 3.181 3.24 3.358 3.475 3.655 3.776 3.893 4.062 4.217 4.363 4.512 4.663 4.844 5.008 5.177 5.386 5.577 5.76 5.968 6.203 6.423 6.653 6.899 7.158 7.443 7.759 8.093 8.422 8.811 9.233 9.69 10.2 10.729 11.232 11.666 11.83 11.74 11.496 11.201 10.931 10.652 10.35 10.063 9.748 9.463 9.174 8.892 8.635 8.378 8.14 7.886 7.651 7.442 7.213 6.962 6.749 6.513 6.263 6.071 5.875 5.651 5.409 5.169 5.01 4.843 4.565 4.376 4.178 4.073 3.843 3.589 3.33 3.19 2.95 2.698 2.523 2.34 1.94 1.714 1.451 1.156 0.828 0.416 -0.161 -1.643 -2 ,25811 ,KEBNE ,16677624,Wed Nov 24 20:51:20 CET,Wed Nov 24 22:17:46 CET,0.0 0.846 1.182 1.446 1.642 1.803 1.952 2.092 2.344 2.452 2.556 2.667 2.846 2.937 3.12 3.286 3.435 3.508 3.647 3.775 3.962 4.084 4.2 4.371 4.544 4.701 4.843 4.981 5.161 5.327 5.49 5.689 5.881 6.069 6.266 6.486 6.709 6.951 7.203 7.469 7.758 8.09 8.45 8.78 9.173 9.608 10.091 10.607 11.144 11.684 12.165 12.347 12.202 11.892 11.582 11.257 10.933 10.614 10.313 9.993 9.711 9.451 9.179 8.922 8.67 8.423 8.174 7.939 7.718 7.485 7.22 7.006 6.805 6.594 6.417 6.232 6.044 5.836 5.585 5.405 5.229 4.957 4.76 4.546 4.444 4.231 3.967 3.689 3.553 3.331 3.132 2.974 2.799 2.401 2.173 1.907 1.606 1.263 0.834 0.183 -1.991 -3 ,1779 ,KEBNE ,16677625,Wed Nov 24 20:51:20 CET,Wed Nov 24 22:15:25 CET,0.0 0.653 0.893 1.082 1.244 1.405 1.564 1.708 1.977 2.098 2.21 2.322 2.502 2.591 2.766 2.931 3.081 3.156 3.299 3.433 3.628 3.745 3.856 4.017 4.175 4.328 4.478 4.626 4.807 4.972 5.131 5.323 5.516 5.699 5.9 6.122 6.34 6.584 6.838 7.105 7.385 7.714 8.091 8.445 8.851 9.282 9.731 10.193 10.684 11.207 11.691 11.861 11.778 11.555 11.276 10.96 10.6 10.183 9.83 9.49 9.199 8.936 8.654 8.375 8.125 7.871 7.58 7.335 7.116 6.868 6.612 6.403 6.19 5.959 5.766 5.565 5.355 5.14 4.908 4.738 4.562 4.3 4.106 3.89 3.777 3.54 3.311 3.065 2.93 2.702 2.467 2.306 2.123 1.71 1.463 1.179 0.875 0.525 0.099 -0.465 -1.902 -4 ,23498 ,KEBNE ,16677626,Wed Nov 24 20:52:22 CET,Wed Nov 24 22:19:15 CET,0.0 0.843 1.13 1.343 1.533 1.705 1.853 1.991 2.231 2.346 2.462 2.599 2.793 2.888 3.06 3.226 3.383 3.457 3.606 3.741 3.94 4.073 4.19 4.358 4.526 4.683 4.832 4.977 5.162 5.341 5.509 5.701 5.878 6.041 6.238 6.468 6.679 6.911 7.173 7.444 7.713 7.992 8.329 8.679 9.07 9.488 9.936 10.411 10.94 11.504 11.981 12.15 12.067 11.841 11.561 11.23 10.88 10.571 10.308 10.013 9.717 9.431 9.156 8.883 8.62 8.381 8.125 7.883 7.654 7.404 7.153 6.946 6.721 6.471 6.287 6.102 5.892 5.684 5.471 5.312 5.133 4.854 4.667 4.466 4.359 4.121 3.856 3.58 3.446 3.23 3.018 2.856 2.671 2.251 2.011 1.735 1.425 1.077 0.7 0.127 -1.751 -5 ,15962 ,KEBNE ,16677627,Wed Nov 24 20:52:21 CET,Wed Nov 24 22:18:11 CET,0.0 0.964 1.23 1.434 1.629 1.795 1.933 2.064 2.304 2.414 2.525 2.655 2.838 2.929 3.1 3.268 3.422 3.492 3.631 3.763 3.957 4.082 4.201 4.367 4.533 4.692 4.838 4.973 5.146 5.318 5.483 5.677 5.868 6.053 6.265 6.5 6.71 6.934 7.188 7.458 7.731 8.042 8.398 8.741 9.134 9.545 10.003 10.503 11.053 11.64 12.174 12.329 12.184 11.925 11.63 11.32 10.989 10.658 10.345 10.003 9.697 9.412 9.128 8.852 8.59 8.357 8.113 7.873 7.648 7.397 7.139 6.928 6.704 6.478 6.307 6.141 5.956 5.734 5.488 5.324 5.162 4.894 4.71 4.518 4.412 4.191 3.95 3.69 3.559 3.34 3.095 2.917 2.729 2.312 2.084 1.821 1.519 1.17 0.7 0.06 -1.988 -6 ,6426 ,KEBNE ,16677628,Wed Nov 24 20:52:21 CET,Wed Nov 24 22:16:29 CET,0.0 0.701 0.995 1.222 1.42 1.594 1.735 1.87 2.14 2.253 2.357 2.486 2.673 2.762 2.932 3.094 3.251 3.326 3.467 3.6 3.792 3.918 4.042 4.219 4.381 4.54 4.689 4.827 5.006 5.175 5.332 5.52 5.705 5.882 6.097 6.334 6.551 6.797 7.058 7.31 7.561 7.856 8.195 8.526 8.917 9.352 9.836 10.345 10.886 11.455 11.944 12.118 12.013 11.771 11.493 11.199 10.886 10.579 10.312 10.016 9.748 9.493 9.23 8.957 8.691 8.454 8.191 7.929 7.704 7.482 7.237 7.021 6.805 6.585 6.393 6.181 5.967 5.76 5.538 5.373 5.2 4.921 4.728 4.532 4.425 4.19 3.946 3.689 3.551 3.322 3.082 2.91 2.727 2.315 2.083 1.826 1.531 1.183 0.777 0.211 -1.712 -7 ,29391 ,KEBNE ,16677629,Wed Nov 24 20:53:23 CET,Wed Nov 24 22:18:44 CET,0.0 0.674 0.967 1.196 1.4 1.575 1.734 1.882 2.159 2.28 2.383 2.456 2.619 2.694 2.836 2.976 3.107 3.173 3.307 3.436 3.617 3.73 3.846 4.007 4.155 4.295 4.433 4.572 4.749 4.908 5.051 5.231 5.41 5.585 5.797 6.038 6.262 6.499 6.752 7.016 7.288 7.587 7.932 8.298 8.712 9.16 9.644 10.135 10.656 11.212 11.74 11.926 11.833 11.584 11.249 10.901 10.599 10.315 10.036 9.711 9.404 9.123 8.834 8.545 8.277 8.032 7.771 7.526 7.311 7.091 6.857 6.654 6.438 6.217 6.036 5.838 5.625 5.403 5.183 5.029 4.869 4.623 4.443 4.247 4.143 3.927 3.716 3.482 3.354 3.149 2.955 2.791 2.603 2.204 1.983 1.738 1.478 1.159 0.732 0.201 -1.483 -8 ,31472 ,KEBNE ,16677630,Wed Nov 24 20:53:23 CET,Wed Nov 24 22:19:02 CET,0.0 0.758 1.057 1.289 1.473 1.638 1.786 1.925 2.181 2.291 2.393 2.5 2.681 2.772 2.942 3.087 3.232 3.31 3.459 3.604 3.799 3.915 4.034 4.197 4.345 4.496 4.654 4.808 4.997 5.17 5.328 5.523 5.711 5.882 6.083 6.31 6.534 6.786 7.041 7.299 7.559 7.846 8.205 8.59 9.011 9.413 9.835 10.307 10.827 11.359 11.873 12.052 11.933 11.711 11.445 11.159 10.872 10.557 10.259 9.944 9.647 9.379 9.127 8.856 8.584 8.333 8.07 7.828 7.605 7.38 7.147 6.944 6.736 6.522 6.354 6.168 5.975 5.772 5.549 5.395 5.231 4.987 4.809 4.595 4.485 4.26 4.016 3.765 3.634 3.403 3.149 2.959 2.761 2.346 2.108 1.852 1.586 1.282 0.871 0.275 -1.591 -9 ,15797 ,KEBNE ,16677631,Wed Nov 24 20:53:23 CET,Wed Nov 24 22:18:56 CET,0.0 0.906 1.19 1.405 1.594 1.765 1.917 2.057 2.302 2.415 2.52 2.623 2.806 2.896 3.079 3.248 3.402 3.475 3.615 3.754 3.949 4.067 4.185 4.371 4.55 4.709 4.855 4.999 5.181 5.348 5.512 5.712 5.903 6.088 6.292 6.529 6.764 7.009 7.254 7.523 7.802 8.112 8.474 8.806 9.159 9.567 10.042 10.519 11.016 11.508 11.987 12.19 12.084 11.839 11.55 11.197 10.853 10.52 10.207 9.878 9.573 9.285 8.994 8.718 8.471 8.236 7.966 7.72 7.502 7.284 7.057 6.837 6.597 6.355 6.163 5.963 5.758 5.542 5.313 5.155 4.982 4.716 4.53 4.326 4.22 4.003 3.779 3.527 3.386 3.157 2.914 2.75 2.577 2.153 1.906 1.629 1.325 0.988 0.553 -0.058 -1.992 -10 ,14330 ,KEBNE ,16677632,Wed Nov 24 20:53:23 CET,Wed Nov 24 22:18:18 CET,0.0 0.65 0.963 1.198 1.392 1.567 1.732 1.878 2.135 2.25 2.36 2.478 2.66 2.746 2.914 3.081 3.238 3.314 3.456 3.591 3.786 3.907 4.02 4.18 4.337 4.49 4.633 4.766 4.944 5.125 5.296 5.488 5.668 5.84 6.044 6.277 6.495 6.726 6.967 7.228 7.517 7.841 8.202 8.549 8.94 9.349 9.803 10.288 10.808 11.363 11.865 12.078 12.031 11.838 11.575 11.284 10.999 10.721 10.441 10.088 9.772 9.49 9.202 8.947 8.719 8.486 8.232 7.999 7.792 7.587 7.367 7.174 6.968 6.752 6.581 6.393 6.175 5.938 5.724 5.597 5.46 5.207 5.014 4.803 4.689 4.447 4.188 3.916 3.768 3.534 3.296 3.122 2.938 2.511 2.273 2.027 1.741 1.382 0.927 0.29 -2.02 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_57.txt deleted file mode 100644 index 0529e313..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10581 ,KEBNE ,16677633,Wed Nov 24 20:54:25 CET,Wed Nov 24 22:20:07 CET,0.0 1.079 1.526 1.879 2.13 2.332 2.513 2.669 2.967 3.112 3.237 3.395 3.605 3.719 3.94 4.141 4.312 4.396 4.565 4.725 4.941 5.08 5.218 5.422 5.604 5.769 5.938 6.107 6.316 6.515 6.712 6.948 7.181 7.396 7.629 7.888 8.134 8.409 8.714 9.021 9.334 9.681 10.077 10.462 10.889 11.348 11.849 12.394 12.957 13.537 14.058 14.104 13.85 13.506 13.165 12.826 12.497 12.175 11.856 11.504 11.197 10.897 10.597 10.326 10.074 9.829 9.554 9.319 9.128 8.928 8.703 8.491 8.269 8.06 7.888 7.688 7.488 7.278 7.041 6.871 6.707 6.453 6.271 6.074 5.967 5.766 5.562 5.313 5.18 4.957 4.711 4.53 4.352 3.969 3.753 3.528 3.254 2.936 2.537 2.005 0.283 -2 ,26940 ,KEBNE ,16677634,Wed Nov 24 20:54:25 CET,Wed Nov 24 22:20:34 CET,0.0 1.127 1.513 1.784 2.043 2.275 2.461 2.622 2.915 3.053 3.187 3.351 3.554 3.668 3.899 4.109 4.294 4.379 4.544 4.692 4.901 5.03 5.151 5.34 5.519 5.682 5.842 5.996 6.194 6.388 6.569 6.794 7.015 7.226 7.456 7.7 7.942 8.224 8.526 8.835 9.133 9.455 9.842 10.217 10.624 11.055 11.53 12.025 12.548 13.076 13.481 13.55 13.375 13.055 12.716 12.391 12.046 11.703 11.39 11.039 10.747 10.498 10.232 9.965 9.721 9.495 9.241 9.0 8.783 8.558 8.334 8.145 7.94 7.733 7.57 7.4 7.218 7.008 6.779 6.624 6.465 6.207 6.021 5.83 5.731 5.52 5.296 5.061 4.935 4.729 4.526 4.363 4.188 3.785 3.565 3.311 3.013 2.671 2.215 1.604 -0.071 -3 ,30372 ,KEBNE ,16677635,Wed Nov 24 20:55:26 CET,Wed Nov 24 22:22:16 CET,0.0 0.937 1.324 1.616 1.869 2.087 2.275 2.449 2.751 2.886 3.02 3.195 3.401 3.515 3.72 3.903 4.075 4.158 4.321 4.48 4.714 4.866 5.003 5.197 5.39 5.575 5.759 5.931 6.136 6.333 6.531 6.771 6.991 7.197 7.455 7.735 7.98 8.244 8.529 8.826 9.129 9.471 9.844 10.182 10.595 11.07 11.569 12.102 12.667 13.232 13.753 13.837 13.621 13.318 12.992 12.65 12.321 12.006 11.701 11.364 11.061 10.791 10.527 10.278 10.036 9.801 9.547 9.318 9.123 8.911 8.686 8.496 8.282 8.066 7.897 7.714 7.526 7.314 7.088 6.936 6.769 6.485 6.286 6.071 5.959 5.741 5.513 5.265 5.131 4.911 4.687 4.532 4.362 3.977 3.772 3.54 3.281 2.958 2.538 1.979 0.43 -4 ,4960 ,KEBNE ,16677636,Wed Nov 24 20:56:28 CET,Wed Nov 24 22:22:21 CET,0.0 1.081 1.489 1.769 1.998 2.201 2.392 2.569 2.874 3.007 3.136 3.283 3.478 3.586 3.795 3.986 4.163 4.253 4.424 4.566 4.759 4.885 5.006 5.192 5.383 5.553 5.718 5.879 6.072 6.263 6.45 6.676 6.881 7.076 7.313 7.559 7.789 8.05 8.332 8.627 8.938 9.297 9.706 10.078 10.485 10.92 11.422 11.993 12.586 13.196 13.695 13.783 13.661 13.431 13.133 12.755 12.387 12.057 11.743 11.402 11.097 10.832 10.595 10.344 10.087 9.857 9.601 9.375 9.178 8.961 8.737 8.538 8.324 8.103 7.923 7.731 7.54 7.343 7.108 6.942 6.788 6.533 6.343 6.158 6.065 5.877 5.675 5.455 5.335 5.125 4.934 4.786 4.622 4.273 4.061 3.818 3.535 3.203 2.831 2.324 0.893 -5 ,29850 ,KEBNE ,16675393,Wed Nov 24 04:20:08 CET,Wed Nov 24 05:47:13 CET,0.0 0.8 1.116 1.338 1.529 1.71 1.87 2.029 2.32 2.447 2.559 2.693 2.885 2.986 3.166 3.33 3.493 3.568 3.715 3.856 4.046 4.171 4.296 4.469 4.623 4.785 4.943 5.095 5.291 5.48 5.664 5.889 6.095 6.277 6.507 6.774 7.018 7.275 7.543 7.822 8.117 8.444 8.81 9.175 9.598 10.058 10.537 11.038 11.587 12.144 12.563 12.619 12.419 12.063 11.673 11.289 10.921 10.573 10.26 9.931 9.619 9.357 9.113 8.839 8.572 8.347 8.11 7.892 7.701 7.508 7.31 7.128 6.92 6.695 6.519 6.344 6.149 5.936 5.702 5.532 5.358 5.079 4.871 4.653 4.546 4.328 4.1 3.835 3.698 3.477 3.251 3.088 2.915 2.523 2.293 2.03 1.741 1.402 0.982 0.424 -1.107 -6 ,3622 ,KEBNE ,16675394,Wed Nov 24 04:23:17 CET,Wed Nov 24 05:54:27 CET,0.0 1.064 1.513 1.842 2.107 2.342 2.543 2.723 3.038 3.182 3.316 3.487 3.698 3.813 4.018 4.209 4.387 4.475 4.652 4.83 5.069 5.206 5.344 5.551 5.746 5.929 6.106 6.272 6.492 6.706 6.904 7.129 7.348 7.558 7.793 8.057 8.309 8.579 8.867 9.181 9.496 9.84 10.25 10.638 11.058 11.537 12.073 12.626 13.178 13.75 14.266 14.394 14.265 13.979 13.603 13.204 12.881 12.587 12.284 11.94 11.641 11.37 11.092 10.804 10.523 10.277 10.03 9.802 9.6 9.382 9.148 8.949 8.735 8.502 8.33 8.166 7.976 7.769 7.563 7.425 7.276 7.039 6.871 6.675 6.573 6.357 6.107 5.843 5.712 5.486 5.258 5.097 4.93 4.536 4.295 4.03 3.738 3.417 3.047 2.527 0.982 -7 ,16874 ,KEBNE ,16677639,Wed Nov 24 20:59:33 CET,Wed Nov 24 22:28:02 CET,0.0 1.011 1.384 1.68 1.92 2.135 2.333 2.495 2.775 2.91 3.05 3.235 3.436 3.54 3.746 3.943 4.122 4.21 4.386 4.561 4.804 4.957 5.099 5.294 5.486 5.66 5.834 6.018 6.244 6.447 6.638 6.866 7.087 7.308 7.566 7.845 8.095 8.37 8.678 8.997 9.3 9.641 10.045 10.433 10.868 11.335 11.848 12.4 12.98 13.538 14.02 14.074 13.872 13.576 13.239 12.881 12.537 12.176 11.834 11.477 11.155 10.875 10.61 10.339 10.07 9.824 9.568 9.321 9.109 8.902 8.679 8.492 8.29 8.067 7.886 7.687 7.48 7.276 7.06 6.899 6.724 6.466 6.273 6.049 5.941 5.725 5.493 5.25 5.119 4.899 4.678 4.514 4.341 3.971 3.768 3.539 3.28 2.993 2.629 2.107 0.272 -8 ,20365 ,KEBNE ,16675396,Wed Nov 24 04:29:32 CET,Wed Nov 24 05:53:05 CET,0.0 0.935 1.315 1.641 1.913 2.133 2.328 2.501 2.779 2.908 3.034 3.173 3.356 3.444 3.629 3.821 4.004 4.088 4.255 4.419 4.648 4.786 4.924 5.131 5.326 5.512 5.684 5.862 6.087 6.288 6.484 6.709 6.921 7.129 7.363 7.611 7.852 8.126 8.416 8.716 9.037 9.407 9.813 10.199 10.623 11.077 11.583 12.143 12.741 13.264 13.721 13.837 13.657 13.344 12.953 12.566 12.213 11.879 11.566 11.222 10.928 10.669 10.413 10.155 9.887 9.627 9.365 9.144 8.946 8.733 8.503 8.303 8.089 7.855 7.682 7.506 7.318 7.112 6.894 6.739 6.563 6.282 6.093 5.899 5.795 5.569 5.343 5.118 4.997 4.788 4.6 4.443 4.268 3.901 3.7 3.465 3.196 2.861 2.451 1.907 0.32 -9 ,28225 ,KEBNE ,16677641,Wed Nov 24 21:04:40 CET,Wed Nov 24 22:32:55 CET,0.0 0.941 1.361 1.674 1.939 2.146 2.334 2.507 2.781 2.916 3.051 3.222 3.422 3.53 3.738 3.934 4.111 4.196 4.367 4.521 4.747 4.896 5.033 5.231 5.423 5.601 5.777 5.951 6.166 6.383 6.605 6.864 7.089 7.295 7.532 7.794 8.044 8.317 8.613 8.928 9.252 9.599 9.984 10.36 10.794 11.251 11.72 12.238 12.812 13.367 13.792 13.852 13.684 13.406 13.068 12.741 12.388 12.027 11.717 11.378 11.076 10.791 10.497 10.216 9.954 9.712 9.451 9.209 9.0 8.778 8.549 8.349 8.12 7.886 7.714 7.539 7.354 7.15 6.915 6.756 6.594 6.321 6.127 5.918 5.814 5.609 5.365 5.099 4.96 4.734 4.514 4.352 4.181 3.798 3.585 3.358 3.084 2.733 2.326 1.791 -0.064 -10 ,13200 ,KEBNE ,16677642,Wed Nov 24 21:13:00 CET,Wed Nov 24 22:36:45 CET,0.0 0.928 1.341 1.664 1.905 2.113 2.31 2.487 2.801 2.947 3.076 3.232 3.441 3.556 3.759 3.956 4.141 4.232 4.423 4.597 4.84 4.984 5.113 5.301 5.492 5.677 5.854 6.025 6.236 6.419 6.594 6.804 7.01 7.216 7.457 7.724 7.967 8.241 8.538 8.852 9.172 9.502 9.876 10.26 10.693 11.146 11.656 12.176 12.733 13.353 13.895 14.038 13.863 13.564 13.236 12.9 12.508 12.134 11.816 11.462 11.138 10.841 10.547 10.262 10.002 9.745 9.476 9.235 9.023 8.793 8.544 8.339 8.105 7.856 7.671 7.468 7.245 7.029 6.817 6.662 6.501 6.254 6.073 5.892 5.808 5.629 5.397 5.125 4.987 4.76 4.565 4.407 4.228 3.836 3.608 3.362 3.069 2.742 2.361 1.862 -0.047 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_55_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_55_35.txt deleted file mode 100644 index 12144569..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_55_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16340 ,KEBNE ,16677643,Wed Nov 24 21:14:04 CET,Wed Nov 24 22:44:35 CET,0.0 0.784 1.081 1.315 1.51 1.695 1.854 1.992 2.237 2.352 2.458 2.569 2.745 2.838 3.0 3.151 3.3 3.37 3.512 3.645 3.826 3.939 4.054 4.221 4.371 4.509 4.64 4.77 4.926 5.069 5.209 5.378 5.542 5.698 5.873 6.073 6.268 6.483 6.711 6.933 7.153 7.409 7.709 7.976 8.258 8.534 8.839 9.138 9.386 9.501 9.269 8.613 7.929 7.294 6.691 6.099 5.563 5.119 4.738 4.336 3.988 3.68 3.395 3.114 2.835 2.581 2.315 2.072 1.865 1.658 1.437 1.242 1.028 0.801 0.627 0.442 0.25 0.05 -0.163 -0.312 -0.465 -0.7 -0.872 -1.048 -1.136 -1.326 -1.522 -1.743 -1.864 -2.076 -2.263 -2.401 -2.545 -2.844 -3.007 -3.189 -3.387 -3.596 -3.851 -4.19 -5.341 -2 ,11739 ,KEBNE ,16677644,Wed Nov 24 21:14:02 CET,Wed Nov 24 22:37:57 CET,0.0 0.907 1.23 1.478 1.681 1.863 2.018 2.162 2.427 2.543 2.652 2.772 2.942 3.027 3.186 3.324 3.457 3.526 3.656 3.771 3.93 4.038 4.148 4.304 4.454 4.594 4.73 4.862 5.023 5.17 5.312 5.484 5.649 5.813 6.005 6.216 6.41 6.626 6.846 7.069 7.296 7.552 7.842 8.096 8.353 8.614 8.883 9.106 9.312 9.452 9.292 8.739 8.093 7.481 6.935 6.383 5.898 5.473 5.091 4.702 4.358 4.052 3.76 3.48 3.209 2.966 2.713 2.481 2.278 2.058 1.827 1.632 1.428 1.213 1.047 0.875 0.697 0.521 0.342 0.218 0.088 -0.124 -0.276 -0.426 -0.499 -0.642 -0.799 -0.974 -1.062 -1.23 -1.359 -1.481 -1.605 -1.889 -2.052 -2.222 -2.401 -2.61 -2.865 -3.194 -3.857 -3 ,8636 ,KEBNE ,16677645,Wed Nov 24 21:14:02 CET,Wed Nov 24 22:40:01 CET,0.0 0.835 1.11 1.298 1.454 1.596 1.729 1.845 2.061 2.16 2.26 2.358 2.513 2.591 2.737 2.879 3.014 3.075 3.195 3.307 3.458 3.556 3.659 3.797 3.925 4.052 4.162 4.265 4.409 4.55 4.703 4.886 5.047 5.2 5.381 5.584 5.762 5.973 6.195 6.4 6.621 6.863 7.118 7.377 7.685 7.981 8.247 8.462 8.643 8.712 8.486 7.937 7.308 6.658 6.061 5.505 4.997 4.517 4.107 3.719 3.378 3.047 2.696 2.377 2.092 1.827 1.535 1.269 1.047 0.818 0.58 0.38 0.18 -0.027 -0.184 -0.347 -0.514 -0.682 -0.87 -1.0 -1.133 -1.345 -1.497 -1.654 -1.732 -1.899 -2.075 -2.263 -2.366 -2.555 -2.681 -2.795 -2.916 -3.198 -3.372 -3.557 -3.758 -3.98 -4.222 -4.573 -5.457 -4 ,20299 ,KEBNE ,16677646,Wed Nov 24 21:14:02 CET,Wed Nov 24 22:39:43 CET,0.0 1.019 1.387 1.646 1.855 2.037 2.198 2.345 2.61 2.728 2.837 2.956 3.134 3.232 3.412 3.57 3.714 3.786 3.912 4.037 4.221 4.334 4.448 4.637 4.832 5.009 5.174 5.338 5.54 5.713 5.875 6.071 6.257 6.429 6.618 6.824 7.018 7.214 7.411 7.635 7.871 8.117 8.393 8.673 8.972 9.216 9.463 9.739 9.972 10.085 9.912 9.326 8.678 8.045 7.437 6.879 6.385 5.898 5.475 5.059 4.69 4.357 4.041 3.752 3.46 3.186 2.917 2.673 2.459 2.24 2.009 1.82 1.634 1.438 1.283 1.118 0.946 0.766 0.577 0.452 0.325 0.129 -0.01 -0.156 -0.229 -0.38 -0.545 -0.724 -0.808 -0.975 -1.084 -1.193 -1.311 -1.569 -1.704 -1.852 -2.026 -2.219 -2.436 -2.722 -3.502 -5 ,10161 ,KEBNE ,16677647,Wed Nov 24 21:15:06 CET,Wed Nov 24 22:38:54 CET,0.0 1.092 1.425 1.659 1.859 2.04 2.194 2.318 2.548 2.66 2.773 2.893 3.061 3.152 3.316 3.466 3.617 3.692 3.836 3.962 4.13 4.235 4.341 4.489 4.615 4.731 4.85 4.963 5.105 5.246 5.382 5.544 5.697 5.853 6.031 6.218 6.39 6.591 6.818 7.039 7.275 7.534 7.79 8.055 8.365 8.664 8.95 9.234 9.481 9.598 9.44 8.916 8.332 7.749 7.15 6.58 6.093 5.649 5.233 4.805 4.447 4.122 3.823 3.534 3.253 3.007 2.753 2.517 2.304 2.084 1.861 1.673 1.483 1.28 1.115 0.955 0.794 0.615 0.414 0.275 0.138 -0.065 -0.215 -0.38 -0.462 -0.641 -0.838 -1.046 -1.151 -1.343 -1.504 -1.626 -1.763 -2.079 -2.264 -2.47 -2.688 -2.928 -3.176 -3.535 -4.599 -6 ,18717 ,KEBNE ,16677648,Wed Nov 24 21:15:06 CET,Wed Nov 24 22:39:41 CET,0.0 0.953 1.278 1.523 1.721 1.881 2.025 2.159 2.42 2.541 2.647 2.766 2.938 3.024 3.19 3.357 3.523 3.593 3.724 3.862 4.047 4.15 4.25 4.396 4.537 4.681 4.819 4.948 5.107 5.254 5.395 5.556 5.708 5.859 6.024 6.211 6.393 6.583 6.789 7.018 7.258 7.506 7.761 7.991 8.244 8.516 8.78 9.026 9.215 9.289 9.125 8.607 7.979 7.35 6.782 6.268 5.822 5.384 4.976 4.555 4.195 3.882 3.573 3.271 3.004 2.766 2.499 2.267 2.072 1.858 1.637 1.459 1.267 1.063 0.909 0.749 0.579 0.397 0.209 0.083 -0.043 -0.234 -0.373 -0.531 -0.612 -0.776 -0.957 -1.155 -1.254 -1.433 -1.551 -1.654 -1.765 -2.01 -2.154 -2.328 -2.518 -2.726 -2.986 -3.329 -4.523 -7 ,18510 ,KEBNE ,16677649,Wed Nov 24 21:15:10 CET,Wed Nov 24 22:37:28 CET,0.0 0.982 1.295 1.535 1.734 1.905 2.053 2.187 2.44 2.555 2.663 2.781 2.951 3.039 3.195 3.339 3.481 3.549 3.681 3.811 3.989 4.1 4.205 4.349 4.497 4.651 4.797 4.942 5.127 5.284 5.433 5.627 5.81 5.974 6.163 6.38 6.584 6.789 7.011 7.245 7.466 7.7 7.967 8.225 8.493 8.751 9.001 9.229 9.408 9.471 9.247 8.666 7.98 7.317 6.703 6.113 5.588 5.125 4.711 4.283 3.905 3.57 3.26 2.954 2.665 2.399 2.112 1.851 1.624 1.406 1.175 0.969 0.759 0.557 0.404 0.243 0.071 -0.11 -0.289 -0.418 -0.562 -0.791 -0.947 -1.105 -1.181 -1.343 -1.522 -1.707 -1.806 -1.989 -2.108 -2.223 -2.353 -2.645 -2.812 -2.982 -3.164 -3.381 -3.637 -3.986 -4.915 -8 ,4807 ,KEBNE ,16677650,Wed Nov 24 21:16:08 CET,Wed Nov 24 22:40:24 CET,0.0 0.662 0.921 1.137 1.325 1.479 1.609 1.729 1.946 2.04 2.129 2.229 2.395 2.479 2.641 2.797 2.942 3.007 3.136 3.262 3.446 3.559 3.671 3.837 3.986 4.119 4.236 4.35 4.5 4.644 4.779 4.942 5.101 5.25 5.42 5.619 5.807 6.014 6.235 6.461 6.686 6.912 7.155 7.402 7.686 7.976 8.241 8.461 8.649 8.736 8.58 8.039 7.413 6.805 6.239 5.687 5.192 4.745 4.347 3.962 3.635 3.329 3.025 2.72 2.436 2.189 1.934 1.715 1.535 1.341 1.134 0.955 0.757 0.542 0.37 0.199 0.03 -0.144 -0.335 -0.468 -0.606 -0.819 -0.965 -1.123 -1.207 -1.379 -1.559 -1.752 -1.852 -2.037 -2.164 -2.281 -2.407 -2.685 -2.837 -3.002 -3.19 -3.409 -3.654 -3.949 -4.812 -9 ,24033 ,KEBNE ,16677651,Wed Nov 24 21:17:12 CET,Wed Nov 24 22:41:47 CET,0.0 0.85 1.171 1.41 1.598 1.757 1.901 2.033 2.264 2.372 2.474 2.586 2.756 2.841 3.0 3.155 3.304 3.376 3.517 3.638 3.804 3.915 4.03 4.201 4.349 4.483 4.611 4.737 4.902 5.057 5.199 5.364 5.527 5.678 5.851 6.051 6.228 6.424 6.641 6.857 7.068 7.302 7.575 7.819 8.061 8.309 8.57 8.796 8.984 9.085 8.851 8.231 7.636 7.073 6.511 5.974 5.485 5.026 4.621 4.212 3.842 3.504 3.177 2.876 2.597 2.335 2.06 1.8 1.576 1.352 1.119 0.928 0.73 0.512 0.337 0.154 -0.032 -0.229 -0.448 -0.597 -0.751 -0.986 -1.137 -1.296 -1.377 -1.537 -1.71 -1.896 -1.99 -2.176 -2.318 -2.437 -2.563 -2.836 -2.988 -3.152 -3.339 -3.557 -3.825 -4.159 -5.224 -10 ,18858 ,KEBNE ,16677652,Wed Nov 24 21:18:15 CET,Wed Nov 24 22:45:10 CET,0.0 0.827 1.101 1.307 1.466 1.607 1.735 1.851 2.072 2.174 2.267 2.359 2.511 2.589 2.747 2.891 3.029 3.092 3.201 3.31 3.475 3.578 3.681 3.828 3.958 4.085 4.207 4.327 4.496 4.66 4.813 4.994 5.157 5.312 5.501 5.705 5.873 6.048 6.258 6.488 6.719 6.954 7.227 7.485 7.742 8.012 8.308 8.581 8.785 8.862 8.575 7.921 7.264 6.628 6.062 5.542 5.079 4.645 4.242 3.828 3.455 3.109 2.781 2.473 2.195 1.954 1.71 1.487 1.291 1.092 0.871 0.682 0.488 0.288 0.138 -0.023 -0.193 -0.374 -0.564 -0.702 -0.849 -1.065 -1.205 -1.357 -1.438 -1.596 -1.768 -1.964 -2.07 -2.261 -2.386 -2.509 -2.656 -2.959 -3.107 -3.271 -3.462 -3.68 -3.926 -4.258 -5.17 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_35.txt deleted file mode 100644 index 678433bd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15904 ,KEBNE ,16677653,Wed Nov 24 21:18:15 CET,Wed Nov 24 22:45:59 CET,0.0 0.872 1.156 1.371 1.566 1.741 1.91 2.072 2.336 2.45 2.555 2.673 2.857 2.951 3.13 3.307 3.478 3.558 3.71 3.855 4.065 4.199 4.322 4.498 4.678 4.849 5.025 5.188 5.378 5.55 5.717 5.921 6.123 6.314 6.505 6.714 6.924 7.167 7.43 7.681 7.927 8.2 8.517 8.833 9.179 9.541 9.919 10.316 10.743 11.103 11.306 11.17 10.826 10.425 10.036 9.65 9.282 8.931 8.622 8.32 8.046 7.784 7.526 7.28 7.045 6.831 6.609 6.411 6.224 6.032 5.837 5.66 5.475 5.268 5.11 4.955 4.79 4.616 4.426 4.296 4.171 3.962 3.811 3.664 3.581 3.398 3.222 3.053 2.955 2.761 2.61 2.476 2.335 2.021 1.842 1.643 1.419 1.158 0.851 0.481 -0.578 -2 ,19579 ,KEBNE ,16677654,Wed Nov 24 21:18:18 CET,Wed Nov 24 22:40:27 CET,0.0 0.973 1.288 1.519 1.707 1.873 2.027 2.164 2.404 2.518 2.628 2.746 2.925 3.011 3.181 3.342 3.484 3.559 3.707 3.84 4.028 4.15 4.267 4.43 4.58 4.728 4.874 5.006 5.173 5.341 5.508 5.7 5.875 6.042 6.246 6.483 6.699 6.925 7.183 7.464 7.731 8.01 8.311 8.603 8.945 9.304 9.69 10.085 10.472 10.81 10.946 10.728 10.377 9.981 9.607 9.262 8.913 8.557 8.247 7.92 7.626 7.359 7.09 6.82 6.574 6.366 6.14 5.927 5.718 5.502 5.304 5.14 4.962 4.784 4.653 4.514 4.37 4.211 4.043 3.927 3.793 3.577 3.431 3.279 3.204 3.046 2.876 2.702 2.607 2.426 2.292 2.172 2.044 1.766 1.616 1.462 1.287 1.083 0.824 0.453 -0.903 -3 ,32236 ,KEBNE ,16677655,Wed Nov 24 21:19:17 CET,Wed Nov 24 22:44:44 CET,0.0 0.744 1.015 1.23 1.39 1.53 1.656 1.776 2.003 2.106 2.204 2.304 2.474 2.555 2.708 2.845 2.968 3.028 3.144 3.251 3.41 3.514 3.618 3.769 3.918 4.063 4.196 4.324 4.487 4.645 4.813 5.02 5.21 5.392 5.591 5.817 6.031 6.254 6.496 6.745 6.995 7.263 7.581 7.91 8.267 8.621 9.006 9.391 9.776 10.135 10.311 10.074 9.688 9.272 8.863 8.466 8.05 7.637 7.289 6.946 6.647 6.395 6.15 5.895 5.654 5.443 5.207 4.967 4.774 4.588 4.371 4.188 4.012 3.815 3.648 3.491 3.344 3.175 3.001 2.885 2.766 2.553 2.391 2.24 2.154 1.968 1.785 1.592 1.491 1.294 1.143 1.012 0.869 0.562 0.387 0.201 0.015 -0.206 -0.511 -0.948 -2.544 -4 ,5130 ,KEBNE ,16677656,Wed Nov 24 21:22:27 CET,Wed Nov 24 22:43:26 CET,0.0 1.013 1.332 1.577 1.783 1.957 2.101 2.227 2.466 2.581 2.688 2.807 2.994 3.091 3.269 3.443 3.601 3.67 3.805 3.935 4.117 4.231 4.336 4.484 4.635 4.782 4.928 5.066 5.246 5.412 5.559 5.748 5.929 6.094 6.303 6.549 6.765 6.998 7.249 7.487 7.71 7.962 8.261 8.56 8.894 9.231 9.57 9.919 10.284 10.606 10.778 10.654 10.325 9.928 9.552 9.169 8.785 8.421 8.093 7.734 7.422 7.141 6.868 6.611 6.368 6.149 5.92 5.712 5.537 5.345 5.152 5.002 4.834 4.64 4.484 4.325 4.16 3.983 3.793 3.665 3.534 3.308 3.14 2.971 2.88 2.699 2.515 2.303 2.191 1.991 1.832 1.703 1.568 1.264 1.095 0.912 0.693 0.45 0.132 -0.315 -1.626 -5 ,12687 ,KEBNE ,16677657,Wed Nov 24 21:22:24 CET,Wed Nov 24 22:46:34 CET,0.0 0.772 1.084 1.321 1.516 1.685 1.838 1.983 2.246 2.368 2.483 2.603 2.787 2.882 3.046 3.194 3.335 3.409 3.557 3.693 3.878 3.99 4.1 4.266 4.42 4.57 4.717 4.848 5.008 5.165 5.324 5.514 5.704 5.899 6.115 6.347 6.567 6.8 7.033 7.272 7.528 7.805 8.114 8.417 8.733 9.07 9.425 9.757 10.12 10.472 10.683 10.564 10.241 9.812 9.381 8.962 8.572 8.226 7.891 7.523 7.218 6.94 6.656 6.39 6.151 5.933 5.699 5.47 5.252 5.032 4.821 4.641 4.447 4.235 4.061 3.88 3.688 3.482 3.29 3.156 3.008 2.787 2.652 2.51 2.426 2.248 2.062 1.848 1.729 1.527 1.348 1.204 1.062 0.778 0.62 0.447 0.257 0.027 -0.276 -0.687 -2.241 -6 ,10135 ,KEBNE ,16677658,Wed Nov 24 21:22:23 CET,Wed Nov 24 22:45:26 CET,0.0 0.864 1.223 1.468 1.666 1.84 1.99 2.127 2.348 2.453 2.563 2.672 2.852 2.944 3.108 3.26 3.403 3.464 3.576 3.694 3.872 3.978 4.075 4.212 4.341 4.472 4.601 4.72 4.872 5.015 5.147 5.306 5.47 5.633 5.814 6.003 6.186 6.391 6.605 6.832 7.061 7.313 7.619 7.919 8.254 8.586 8.931 9.293 9.681 10.086 10.299 10.097 9.728 9.301 8.897 8.509 8.141 7.765 7.413 7.058 6.744 6.473 6.204 5.936 5.698 5.472 5.227 5.005 4.815 4.625 4.4 4.192 3.978 3.773 3.633 3.487 3.336 3.182 3.007 2.886 2.763 2.565 2.42 2.262 2.182 2.013 1.833 1.633 1.523 1.324 1.178 1.048 0.905 0.607 0.448 0.276 0.073 -0.173 -0.471 -0.864 -2.756 -7 ,12786 ,KEBNE ,16677659,Wed Nov 24 21:22:23 CET,Wed Nov 24 22:47:08 CET,0.0 0.761 1.016 1.194 1.351 1.505 1.652 1.776 1.982 2.076 2.162 2.235 2.394 2.471 2.621 2.762 2.893 2.956 3.082 3.207 3.391 3.511 3.631 3.81 3.983 4.15 4.311 4.464 4.665 4.85 5.018 5.215 5.399 5.564 5.76 5.996 6.211 6.444 6.698 6.958 7.221 7.515 7.852 8.167 8.523 8.893 9.298 9.725 10.119 10.441 10.578 10.403 10.034 9.613 9.231 8.853 8.492 8.153 7.83 7.469 7.143 6.863 6.584 6.297 6.045 5.815 5.568 5.336 5.125 4.914 4.691 4.497 4.298 4.09 3.928 3.767 3.592 3.398 3.193 3.049 2.903 2.676 2.512 2.336 2.244 2.056 1.851 1.622 1.506 1.307 1.12 0.975 0.839 0.548 0.381 0.198 -0.016 -0.278 -0.588 -0.993 -2.301 -8 ,22642 ,KEBNE ,16677660,Wed Nov 24 21:22:23 CET,Wed Nov 24 22:46:12 CET,0.0 0.715 1.033 1.275 1.466 1.633 1.79 1.93 2.172 2.283 2.395 2.507 2.68 2.768 2.941 3.113 3.28 3.357 3.5 3.634 3.834 3.958 4.068 4.231 4.392 4.541 4.683 4.823 5.002 5.168 5.328 5.537 5.74 5.927 6.133 6.364 6.592 6.846 7.101 7.339 7.579 7.852 8.155 8.462 8.814 9.163 9.537 9.94 10.339 10.674 10.844 10.658 10.318 9.9 9.462 9.029 8.633 8.262 7.92 7.558 7.25 6.987 6.725 6.46 6.22 6.008 5.775 5.558 5.366 5.169 4.958 4.776 4.593 4.401 4.256 4.111 3.956 3.788 3.602 3.471 3.337 3.128 2.981 2.83 2.747 2.56 2.373 2.191 2.088 1.888 1.734 1.601 1.469 1.175 1.005 0.816 0.604 0.382 0.105 -0.289 -1.588 -9 ,26549 ,KEBNE ,16677661,Wed Nov 24 21:23:26 CET,Wed Nov 24 22:48:52 CET,0.0 0.996 1.36 1.624 1.838 2.016 2.182 2.336 2.604 2.718 2.826 2.947 3.128 3.215 3.376 3.539 3.696 3.767 3.897 4.023 4.214 4.336 4.452 4.622 4.787 4.941 5.081 5.218 5.404 5.575 5.732 5.917 6.087 6.248 6.446 6.671 6.876 7.093 7.334 7.578 7.806 8.058 8.371 8.693 9.043 9.414 9.806 10.184 10.58 10.936 11.082 10.827 10.452 10.06 9.665 9.279 8.931 8.578 8.211 7.852 7.552 7.267 6.994 6.73 6.47 6.219 5.96 5.747 5.565 5.372 5.151 4.964 4.776 4.571 4.413 4.26 4.102 3.935 3.757 3.622 3.488 3.277 3.114 2.945 2.858 2.673 2.466 2.229 2.096 1.886 1.718 1.587 1.449 1.124 0.932 0.727 0.484 0.226 -0.044 -0.405 -1.401 -10 ,18306 ,KEBNE ,16677662,Wed Nov 24 21:23:27 CET,Wed Nov 24 22:48:58 CET,0.0 1.126 1.437 1.664 1.852 2.025 2.185 2.329 2.59 2.703 2.808 2.925 3.105 3.193 3.36 3.519 3.665 3.734 3.864 3.987 4.163 4.276 4.392 4.561 4.719 4.865 5.002 5.132 5.3 5.468 5.636 5.842 6.037 6.216 6.419 6.646 6.858 7.078 7.322 7.583 7.84 8.133 8.441 8.723 9.057 9.428 9.822 10.217 10.608 10.953 11.124 10.923 10.559 10.171 9.775 9.374 8.976 8.613 8.287 7.946 7.658 7.406 7.16 6.899 6.653 6.442 6.216 5.996 5.794 5.592 5.389 5.221 5.035 4.836 4.679 4.524 4.373 4.202 4.023 3.891 3.754 3.557 3.423 3.271 3.188 3.029 2.849 2.638 2.524 2.325 2.175 2.042 1.89 1.543 1.374 1.199 0.989 0.743 0.429 -0.006 -1.561 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_55.txt deleted file mode 100644 index 7ffca1b4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23049 ,KEBNE ,16677663,Wed Nov 24 21:23:27 CET,Wed Nov 24 22:49:40 CET,0.0 0.909 1.252 1.506 1.713 1.896 2.059 2.203 2.465 2.588 2.704 2.84 3.028 3.125 3.305 3.478 3.638 3.717 3.861 4.005 4.221 4.35 4.482 4.67 4.838 4.999 5.16 5.326 5.55 5.767 5.965 6.194 6.419 6.629 6.865 7.136 7.408 7.702 7.999 8.302 8.617 8.98 9.403 9.815 10.275 10.761 11.319 11.928 12.567 13.198 13.848 14.191 14.166 13.967 13.676 13.346 13.028 12.747 12.501 12.209 11.957 11.738 11.508 11.256 11.015 10.823 10.626 10.427 10.253 10.069 9.854 9.664 9.473 9.292 9.15 8.994 8.828 8.659 8.488 8.364 8.241 8.049 7.91 7.776 7.709 7.568 7.43 7.284 7.194 7.011 6.871 6.753 6.628 6.357 6.198 6.015 5.806 5.563 5.276 4.918 3.487 -2 ,28036 ,KEBNE ,16677664,Wed Nov 24 21:24:29 CET,Wed Nov 24 22:50:35 CET,0.0 1.025 1.336 1.569 1.778 1.963 2.119 2.261 2.509 2.622 2.733 2.857 3.045 3.147 3.333 3.501 3.666 3.746 3.894 4.032 4.228 4.358 4.484 4.669 4.86 5.041 5.207 5.371 5.583 5.785 5.98 6.227 6.461 6.671 6.905 7.161 7.402 7.679 7.98 8.284 8.602 8.935 9.321 9.722 10.174 10.656 11.179 11.762 12.399 13.039 13.641 13.818 13.686 13.497 13.239 12.909 12.591 12.269 11.981 11.679 11.393 11.134 10.881 10.622 10.394 10.189 9.968 9.777 9.61 9.438 9.258 9.098 8.928 8.755 8.627 8.5 8.368 8.226 8.073 7.963 7.847 7.672 7.55 7.414 7.339 7.177 7.015 6.855 6.769 6.598 6.47 6.354 6.233 5.957 5.795 5.618 5.421 5.189 4.915 4.543 3.206 -3 ,18894 ,KEBNE ,16677665,Wed Nov 24 21:24:29 CET,Wed Nov 24 22:49:49 CET,0.0 1.005 1.344 1.579 1.79 1.977 2.142 2.292 2.549 2.665 2.775 2.894 3.075 3.168 3.348 3.516 3.675 3.755 3.911 4.049 4.241 4.375 4.506 4.685 4.857 5.023 5.182 5.333 5.526 5.716 5.893 6.103 6.3 6.483 6.686 6.909 7.14 7.408 7.694 8.002 8.336 8.688 9.078 9.472 9.935 10.453 10.993 11.555 12.197 12.874 13.496 13.743 13.667 13.428 13.111 12.803 12.519 12.249 12.01 11.741 11.492 11.228 10.954 10.711 10.503 10.301 10.07 9.857 9.656 9.457 9.258 9.079 8.899 8.724 8.584 8.428 8.259 8.082 7.888 7.754 7.62 7.409 7.252 7.069 6.975 6.801 6.622 6.428 6.326 6.145 6.004 5.878 5.742 5.469 5.319 5.137 4.933 4.697 4.417 4.036 2.662 -4 ,11942 ,KEBNE ,16677666,Wed Nov 24 21:25:30 CET,Wed Nov 24 22:48:25 CET,0.0 0.938 1.272 1.513 1.714 1.892 2.053 2.205 2.483 2.607 2.722 2.863 3.057 3.157 3.336 3.497 3.665 3.751 3.911 4.067 4.279 4.412 4.539 4.716 4.889 5.062 5.235 5.409 5.642 5.857 6.054 6.287 6.511 6.728 6.967 7.23 7.494 7.791 8.112 8.453 8.786 9.137 9.533 9.917 10.369 10.862 11.381 11.924 12.508 13.15 13.823 14.079 13.987 13.729 13.418 13.13 12.856 12.563 12.267 11.927 11.621 11.354 11.086 10.844 10.623 10.401 10.168 9.955 9.767 9.579 9.39 9.231 9.057 8.873 8.72 8.563 8.415 8.263 8.092 7.971 7.849 7.669 7.546 7.396 7.312 7.14 6.953 6.766 6.666 6.472 6.298 6.172 6.037 5.75 5.602 5.44 5.255 5.033 4.751 4.381 3.365 -5 ,28230 ,KEBNE ,16675403,Wed Nov 24 04:32:40 CET,Wed Nov 24 05:57:47 CET,0.0 0.877 1.218 1.457 1.663 1.843 2.009 2.157 2.422 2.541 2.653 2.787 2.974 3.073 3.257 3.42 3.576 3.656 3.813 3.962 4.16 4.284 4.41 4.59 4.769 4.943 5.102 5.259 5.46 5.644 5.82 6.035 6.248 6.453 6.689 6.954 7.196 7.447 7.725 8.023 8.327 8.667 9.082 9.502 9.974 10.475 11.018 11.627 12.298 12.983 13.592 13.784 13.69 13.472 13.191 12.868 12.55 12.236 11.943 11.644 11.362 11.079 10.814 10.57 10.327 10.095 9.856 9.658 9.485 9.297 9.108 8.944 8.76 8.567 8.416 8.246 8.071 7.888 7.693 7.566 7.437 7.231 7.093 6.957 6.887 6.727 6.545 6.353 6.254 6.081 5.96 5.841 5.703 5.381 5.212 5.045 4.863 4.63 4.345 3.944 2.549 -6 ,20819 ,KEBNE ,16675404,Wed Nov 24 04:33:42 CET,Wed Nov 24 05:59:21 CET,0.0 0.912 1.222 1.479 1.695 1.877 2.05 2.202 2.458 2.575 2.693 2.822 3.0 3.097 3.279 3.448 3.612 3.688 3.836 3.984 4.187 4.309 4.427 4.605 4.778 4.94 5.099 5.252 5.443 5.627 5.808 6.026 6.232 6.431 6.65 6.884 7.112 7.376 7.657 7.95 8.256 8.597 8.995 9.4 9.85 10.301 10.819 11.384 12.001 12.679 13.286 13.478 13.383 13.171 12.897 12.584 12.283 11.971 11.699 11.432 11.194 10.974 10.732 10.485 10.253 10.038 9.808 9.591 9.391 9.177 8.96 8.779 8.581 8.369 8.211 8.057 7.885 7.695 7.504 7.366 7.214 6.977 6.818 6.654 6.57 6.407 6.24 6.053 5.951 5.767 5.616 5.488 5.352 5.063 4.9 4.736 4.555 4.33 4.082 3.816 2.794 -7 ,3697 ,KEBNE ,16675405,Wed Nov 24 04:38:55 CET,Wed Nov 24 06:01:59 CET,0.0 1.007 1.324 1.554 1.744 1.913 2.077 2.246 2.553 2.693 2.829 2.996 3.202 3.315 3.526 3.731 3.92 4.011 4.181 4.347 4.592 4.74 4.878 5.082 5.279 5.459 5.626 5.794 6.011 6.212 6.403 6.626 6.844 7.057 7.304 7.571 7.814 8.089 8.385 8.684 8.986 9.336 9.728 10.096 10.536 11.04 11.622 12.225 12.908 13.623 14.214 14.43 14.357 14.111 13.801 13.493 13.2 12.907 12.625 12.328 12.062 11.818 11.583 11.353 11.118 10.898 10.676 10.469 10.281 10.087 9.9 9.741 9.547 9.348 9.199 9.042 8.869 8.677 8.465 8.329 8.192 7.955 7.787 7.614 7.533 7.372 7.2 7.01 6.903 6.718 6.576 6.458 6.336 6.07 5.917 5.73 5.52 5.288 5.03 4.685 3.53 -8 ,12623 ,KEBNE ,16677670,Wed Nov 24 21:27:34 CET,Wed Nov 24 22:55:22 CET,0.0 1.106 1.407 1.63 1.814 1.973 2.112 2.23 2.468 2.593 2.711 2.84 3.025 3.12 3.294 3.46 3.622 3.7 3.852 3.999 4.214 4.347 4.472 4.661 4.841 5.014 5.174 5.322 5.515 5.699 5.878 6.104 6.331 6.543 6.78 7.046 7.298 7.57 7.875 8.214 8.558 8.93 9.36 9.782 10.261 10.775 11.348 11.961 12.621 13.296 13.951 14.237 14.118 13.867 13.575 13.237 12.907 12.597 12.307 12.01 11.749 11.514 11.288 11.074 10.875 10.682 10.473 10.264 10.077 9.896 9.707 9.551 9.387 9.211 9.066 8.915 8.767 8.611 8.446 8.328 8.201 8.0 7.859 7.715 7.632 7.458 7.286 7.092 6.988 6.805 6.666 6.553 6.431 6.147 5.989 5.816 5.615 5.375 5.103 4.755 3.788 -9 ,10737 ,KEBNE ,16675407,Wed Nov 24 04:38:55 CET,Wed Nov 24 06:02:09 CET,0.0 0.86 1.216 1.475 1.675 1.846 2.002 2.151 2.421 2.54 2.658 2.796 2.985 3.082 3.275 3.44 3.589 3.662 3.803 3.951 4.152 4.273 4.393 4.571 4.745 4.914 5.07 5.218 5.404 5.578 5.754 5.974 6.178 6.365 6.574 6.836 7.109 7.396 7.697 7.992 8.29 8.645 9.054 9.448 9.906 10.428 11.004 11.608 12.218 12.818 13.367 13.591 13.503 13.246 12.945 12.651 12.386 12.093 11.821 11.539 11.263 11.008 10.766 10.548 10.337 10.126 9.892 9.682 9.498 9.31 9.115 8.948 8.788 8.619 8.488 8.362 8.228 8.09 7.947 7.835 7.717 7.539 7.415 7.284 7.214 7.072 6.92 6.755 6.667 6.493 6.349 6.224 6.095 5.815 5.662 5.492 5.277 5.029 4.769 4.412 3.163 -10 ,12721 ,KEBNE ,16675408,Wed Nov 24 04:38:55 CET,Wed Nov 24 06:01:54 CET,0.0 1.005 1.351 1.607 1.821 1.997 2.155 2.303 2.565 2.685 2.802 2.927 3.108 3.205 3.401 3.597 3.78 3.872 4.061 4.248 4.5 4.647 4.783 4.982 5.187 5.379 5.552 5.718 5.93 6.132 6.33 6.56 6.784 7.006 7.238 7.483 7.739 8.023 8.312 8.638 8.98 9.344 9.759 10.155 10.601 11.102 11.682 12.289 12.94 13.64 14.253 14.422 14.299 14.133 13.913 13.611 13.298 13.026 12.775 12.475 12.207 11.957 11.712 11.499 11.284 11.064 10.844 10.647 10.473 10.298 10.106 9.935 9.759 9.578 9.443 9.302 9.143 8.977 8.804 8.679 8.551 8.35 8.207 8.058 7.976 7.804 7.624 7.439 7.344 7.16 7.023 6.908 6.779 6.505 6.355 6.19 6.005 5.765 5.474 5.113 3.872 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_57_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_57_35.txt deleted file mode 100644 index 0aa35948..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_57_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31979 ,KEBNE ,16677673,Wed Nov 24 21:28:39 CET,Wed Nov 24 22:47:16 CET,0.0 0.848 1.188 1.416 1.598 1.772 1.923 2.058 2.311 2.428 2.532 2.638 2.82 2.917 3.082 3.24 3.398 3.47 3.601 3.73 3.921 4.037 4.146 4.314 4.472 4.615 4.749 4.881 5.055 5.226 5.392 5.572 5.735 5.898 6.063 6.237 6.412 6.617 6.858 7.103 7.345 7.613 7.914 8.214 8.556 8.922 9.332 9.74 10.111 10.402 10.56 10.352 9.963 9.566 9.149 8.73 8.346 7.984 7.658 7.306 6.984 6.689 6.416 6.161 5.911 5.677 5.433 5.21 5.017 4.812 4.589 4.398 4.203 3.998 3.836 3.666 3.489 3.306 3.13 3.012 2.882 2.677 2.536 2.393 2.315 2.15 1.978 1.774 1.663 1.471 1.305 1.171 1.031 0.745 0.583 0.412 0.226 -0.001 -0.272 -0.613 -1.669 -2 ,20081 ,KEBNE ,16677674,Wed Nov 24 21:29:37 CET,Wed Nov 24 22:55:09 CET,0.0 0.916 1.257 1.51 1.724 1.897 2.043 2.179 2.419 2.53 2.636 2.746 2.921 3.012 3.19 3.352 3.507 3.585 3.726 3.858 4.042 4.157 4.28 4.452 4.597 4.745 4.903 5.053 5.232 5.405 5.578 5.784 5.976 6.168 6.384 6.623 6.853 7.091 7.355 7.637 7.91 8.194 8.514 8.811 9.125 9.464 9.816 10.191 10.587 10.932 11.065 10.837 10.477 10.054 9.641 9.253 8.868 8.515 8.213 7.867 7.563 7.297 7.046 6.805 6.556 6.322 6.08 5.864 5.671 5.469 5.253 5.072 4.88 4.664 4.492 4.322 4.147 3.962 3.766 3.628 3.489 3.266 3.107 2.938 2.85 2.661 2.464 2.273 2.159 1.953 1.781 1.626 1.46 1.119 0.938 0.747 0.524 0.271 -0.035 -0.434 -1.507 -3 ,27876 ,KEBNE ,16677675,Wed Nov 24 21:29:37 CET,Wed Nov 24 22:53:30 CET,0.0 0.848 1.143 1.367 1.554 1.725 1.886 2.029 2.284 2.401 2.513 2.643 2.828 2.925 3.108 3.291 3.466 3.544 3.691 3.844 4.064 4.193 4.317 4.5 4.681 4.852 5.006 5.155 5.346 5.514 5.675 5.876 6.059 6.235 6.441 6.677 6.9 7.116 7.345 7.599 7.855 8.162 8.516 8.844 9.195 9.53 9.901 10.288 10.648 10.966 11.175 10.995 10.642 10.235 9.809 9.387 8.974 8.585 8.243 7.882 7.585 7.329 7.074 6.822 6.573 6.35 6.121 5.885 5.659 5.455 5.249 5.06 4.857 4.661 4.512 4.343 4.163 3.971 3.767 3.624 3.475 3.244 3.082 2.908 2.815 2.616 2.417 2.211 2.098 1.902 1.745 1.601 1.442 1.118 0.948 0.758 0.537 0.299 0.031 -0.381 -1.644 -4 ,25619 ,KEBNE ,16677676,Wed Nov 24 21:29:37 CET,Wed Nov 24 22:53:13 CET,0.0 1.058 1.377 1.612 1.804 1.965 2.121 2.267 2.517 2.634 2.747 2.851 3.017 3.099 3.263 3.406 3.539 3.599 3.711 3.821 3.985 4.092 4.189 4.342 4.494 4.631 4.774 4.914 5.086 5.25 5.398 5.575 5.738 5.889 6.076 6.273 6.442 6.637 6.856 7.085 7.333 7.612 7.931 8.249 8.602 8.951 9.284 9.625 9.991 10.349 10.519 10.238 9.876 9.467 9.013 8.565 8.15 7.772 7.433 7.073 6.739 6.415 6.112 5.83 5.573 5.338 5.098 4.9 4.718 4.499 4.26 4.062 3.851 3.625 3.454 3.28 3.098 2.911 2.712 2.579 2.437 2.188 2.024 1.866 1.779 1.565 1.338 1.121 1.009 0.811 0.629 0.487 0.346 0.045 -0.134 -0.337 -0.572 -0.834 -1.15 -1.588 -2.891 -5 ,30574 ,KEBNE ,16677677,Wed Nov 24 21:33:44 CET,Wed Nov 24 22:56:59 CET,0.0 0.707 1.022 1.278 1.497 1.69 1.869 2.039 2.325 2.453 2.582 2.735 2.933 3.045 3.233 3.383 3.524 3.599 3.734 3.868 4.077 4.21 4.338 4.518 4.684 4.854 5.013 5.158 5.343 5.518 5.677 5.857 6.053 6.256 6.479 6.722 6.956 7.209 7.472 7.737 8.033 8.357 8.7 9.023 9.383 9.755 10.141 10.559 10.973 11.291 11.459 11.284 10.91 10.493 10.077 9.692 9.316 8.945 8.614 8.274 7.959 7.666 7.39 7.12 6.872 6.639 6.387 6.168 5.98 5.774 5.556 5.386 5.212 5.029 4.876 4.714 4.543 4.373 4.191 4.058 3.925 3.699 3.537 3.37 3.279 3.088 2.891 2.674 2.549 2.341 2.176 2.043 1.908 1.621 1.45 1.236 0.998 0.737 0.394 -0.039 -1.257 -6 ,16147 ,KEBNE ,16677678,Wed Nov 24 21:33:44 CET,Wed Nov 24 22:58:48 CET,0.0 0.823 1.123 1.36 1.557 1.736 1.887 2.018 2.264 2.376 2.479 2.592 2.776 2.87 3.045 3.208 3.357 3.429 3.564 3.692 3.88 3.998 4.109 4.275 4.43 4.57 4.702 4.827 5.003 5.177 5.333 5.513 5.687 5.858 6.054 6.266 6.46 6.671 6.891 7.11 7.35 7.636 7.933 8.197 8.517 8.889 9.283 9.665 10.014 10.306 10.43 10.215 9.836 9.405 8.983 8.579 8.189 7.843 7.537 7.2 6.902 6.627 6.37 6.126 5.89 5.662 5.407 5.174 4.965 4.753 4.543 4.36 4.17 3.972 3.81 3.645 3.474 3.286 3.083 2.945 2.806 2.58 2.418 2.246 2.159 1.985 1.799 1.606 1.503 1.307 1.127 0.979 0.817 0.463 0.275 0.057 -0.195 -0.477 -0.804 -1.223 -2.544 -7 ,7230 ,KEBNE ,16677679,Wed Nov 24 21:33:44 CET,Wed Nov 24 22:58:16 CET,0.0 0.807 1.116 1.335 1.537 1.72 1.881 2.029 2.273 2.379 2.488 2.613 2.801 2.893 3.052 3.209 3.357 3.428 3.567 3.702 3.887 3.998 4.113 4.287 4.443 4.583 4.721 4.85 5.018 5.183 5.335 5.508 5.681 5.86 6.049 6.231 6.41 6.619 6.831 7.045 7.271 7.53 7.843 8.132 8.426 8.731 9.083 9.449 9.812 10.134 10.253 10.053 9.675 9.229 8.796 8.349 7.928 7.55 7.199 6.834 6.513 6.219 5.924 5.631 5.365 5.127 4.882 4.669 4.483 4.28 4.065 3.886 3.694 3.483 3.314 3.139 2.948 2.748 2.552 2.42 2.273 2.038 1.882 1.729 1.647 1.462 1.276 1.074 0.966 0.779 0.63 0.503 0.373 0.095 -0.058 -0.218 -0.414 -0.656 -0.944 -1.354 -2.33 -8 ,20939 ,KEBNE ,16677680,Wed Nov 24 21:33:44 CET,Wed Nov 24 22:56:31 CET,0.0 0.914 1.233 1.467 1.663 1.826 1.979 2.123 2.362 2.471 2.573 2.682 2.857 2.944 3.101 3.255 3.416 3.486 3.615 3.747 3.937 4.055 4.17 4.333 4.497 4.647 4.767 4.882 5.043 5.199 5.35 5.53 5.701 5.866 6.043 6.236 6.422 6.623 6.839 7.071 7.313 7.576 7.879 8.176 8.485 8.785 9.118 9.473 9.829 10.152 10.299 10.11 9.792 9.41 8.991 8.582 8.213 7.851 7.514 7.161 6.842 6.55 6.249 5.965 5.707 5.467 5.208 4.965 4.751 4.525 4.299 4.111 3.913 3.707 3.54 3.365 3.19 3.01 2.81 2.672 2.528 2.289 2.134 1.976 1.891 1.709 1.507 1.299 1.185 0.979 0.799 0.66 0.517 0.182 -0.009 -0.202 -0.417 -0.681 -1.02 -1.505 -2.888 -9 ,13923 ,KEBNE ,16677681,Wed Nov 24 21:33:44 CET,Wed Nov 24 22:57:52 CET,0.0 1.061 1.377 1.616 1.829 1.996 2.146 2.284 2.525 2.638 2.747 2.862 3.049 3.151 3.331 3.487 3.642 3.716 3.856 3.987 4.165 4.273 4.378 4.53 4.68 4.827 4.962 5.092 5.259 5.42 5.57 5.747 5.92 6.094 6.302 6.535 6.759 7.003 7.264 7.535 7.805 8.085 8.397 8.712 9.07 9.434 9.818 10.205 10.614 10.986 11.118 10.893 10.48 10.048 9.619 9.203 8.813 8.457 8.141 7.806 7.525 7.248 6.968 6.718 6.493 6.271 6.024 5.805 5.614 5.409 5.189 4.998 4.793 4.592 4.44 4.27 4.09 3.909 3.722 3.591 3.453 3.232 3.08 2.919 2.835 2.66 2.459 2.25 2.145 1.942 1.757 1.618 1.478 1.153 0.963 0.759 0.536 0.275 -0.051 -0.497 -1.707 -10 ,31516 ,KEBNE ,16677682,Wed Nov 24 21:33:45 CET,Wed Nov 24 23:02:26 CET,0.0 0.914 1.23 1.47 1.674 1.842 1.99 2.13 2.378 2.486 2.592 2.709 2.888 2.982 3.159 3.326 3.485 3.558 3.693 3.822 4.001 4.113 4.224 4.387 4.546 4.694 4.836 4.967 5.138 5.307 5.468 5.66 5.836 5.994 6.178 6.381 6.574 6.786 6.998 7.232 7.479 7.769 8.117 8.445 8.802 9.16 9.55 9.976 10.386 10.698 10.838 10.628 10.255 9.86 9.432 9.029 8.674 8.321 7.982 7.627 7.315 7.041 6.775 6.494 6.231 5.989 5.733 5.5 5.287 5.077 4.864 4.679 4.482 4.27 4.104 3.942 3.772 3.591 3.424 3.3 3.164 2.966 2.829 2.679 2.596 2.421 2.237 2.033 1.935 1.756 1.587 1.451 1.325 1.052 0.896 0.723 0.534 0.322 0.058 -0.307 -1.473 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_58.txt deleted file mode 100644 index 0af45c1c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10194 ,KEBNE ,16675419,Wed Nov 24 04:41:00 CET,Wed Nov 24 06:05:39 CET,0.0 1.199 1.614 1.872 2.097 2.307 2.492 2.653 2.937 3.073 3.199 3.363 3.539 3.635 3.803 3.969 4.131 4.204 4.347 4.486 4.661 4.773 4.888 5.055 5.205 5.344 5.476 5.594 5.746 5.89 6.029 6.19 6.325 6.456 6.601 6.747 6.891 7.047 7.205 7.389 7.567 7.723 7.869 7.979 8.09 8.185 8.256 8.246 8.083 7.691 6.805 5.521 4.367 3.374 2.491 1.702 1.005 0.373 -0.171 -0.705 -1.153 -1.578 -1.997 -2.383 -2.737 -3.062 -3.415 -3.725 -3.991 -4.276 -4.571 -4.819 -5.07 -5.32 -5.515 -5.715 -5.924 -6.156 -6.415 -6.593 -6.77 -7.052 -7.254 -7.465 -7.568 -7.778 -8.003 -8.252 -8.391 -8.62 -8.838 -8.997 -9.159 -9.52 -9.726 -9.958 -10.213 -10.484 -10.826 -11.284 -12.909 -2 ,5340 ,KEBNE ,16675420,Wed Nov 24 04:41:00 CET,Wed Nov 24 06:03:15 CET,0.0 0.864 1.253 1.559 1.807 2.015 2.196 2.37 2.673 2.798 2.92 3.07 3.244 3.343 3.529 3.699 3.851 3.927 4.079 4.212 4.396 4.519 4.634 4.794 4.95 5.096 5.227 5.358 5.518 5.657 5.794 5.946 6.087 6.228 6.382 6.539 6.671 6.81 6.958 7.107 7.253 7.418 7.574 7.686 7.8 7.914 8.009 7.982 7.774 7.373 6.489 5.173 3.968 2.935 2.034 1.212 0.51 -0.119 -0.662 -1.209 -1.683 -2.093 -2.492 -2.886 -3.249 -3.582 -3.932 -4.237 -4.498 -4.775 -5.062 -5.31 -5.571 -5.84 -6.054 -6.269 -6.492 -6.727 -6.978 -7.144 -7.316 -7.607 -7.811 -8.021 -8.124 -8.332 -8.562 -8.808 -8.943 -9.171 -9.377 -9.526 -9.69 -10.038 -10.229 -10.433 -10.649 -10.934 -11.272 -11.731 -13.05 -3 ,14055 ,KEBNE ,16675421,Wed Nov 24 04:41:00 CET,Wed Nov 24 06:03:12 CET,0.0 1.01 1.416 1.732 1.99 2.215 2.419 2.601 2.922 3.063 3.196 3.366 3.54 3.639 3.826 4.0 4.168 4.25 4.403 4.533 4.718 4.842 4.955 5.103 5.242 5.384 5.529 5.662 5.824 5.973 6.102 6.252 6.416 6.571 6.726 6.884 7.018 7.157 7.292 7.427 7.58 7.726 7.874 8.019 8.142 8.223 8.276 8.263 8.09 7.671 6.746 5.428 4.251 3.203 2.296 1.493 0.798 0.158 -0.402 -0.948 -1.407 -1.837 -2.252 -2.637 -2.993 -3.314 -3.666 -3.974 -4.228 -4.498 -4.783 -5.013 -5.247 -5.494 -5.695 -5.918 -6.155 -6.389 -6.624 -6.792 -6.963 -7.247 -7.454 -7.667 -7.778 -8.007 -8.246 -8.499 -8.637 -8.865 -9.085 -9.247 -9.415 -9.781 -9.996 -10.235 -10.481 -10.761 -11.127 -11.63 -12.955 -4 ,3031 ,KEBNE ,16677686,Wed Nov 24 21:33:45 CET,Wed Nov 24 22:56:45 CET,0.0 1.267 1.674 1.96 2.214 2.434 2.613 2.789 3.085 3.217 3.338 3.492 3.677 3.78 3.974 4.149 4.318 4.398 4.537 4.668 4.85 4.958 5.066 5.237 5.399 5.536 5.664 5.788 5.943 6.088 6.225 6.388 6.532 6.665 6.83 7.007 7.151 7.298 7.442 7.577 7.711 7.867 8.021 8.144 8.27 8.368 8.438 8.395 8.196 7.777 6.821 5.527 4.401 3.391 2.5 1.717 1.047 0.423 -0.127 -0.682 -1.147 -1.561 -1.973 -2.358 -2.714 -3.053 -3.4 -3.707 -3.98 -4.259 -4.549 -4.793 -5.048 -5.316 -5.524 -5.742 -5.972 -6.207 -6.441 -6.615 -6.803 -7.09 -7.285 -7.483 -7.587 -7.82 -8.064 -8.3 -8.427 -8.654 -8.878 -9.037 -9.204 -9.562 -9.761 -9.991 -10.265 -10.586 -10.967 -11.462 -13.014 -5 ,5285 ,KEBNE ,16677687,Wed Nov 24 21:33:45 CET,Wed Nov 24 22:58:32 CET,0.0 1.126 1.52 1.815 2.06 2.273 2.452 2.616 2.902 3.023 3.133 3.282 3.461 3.568 3.772 3.952 4.109 4.186 4.333 4.469 4.655 4.771 4.886 5.039 5.183 5.328 5.463 5.589 5.751 5.893 6.018 6.164 6.305 6.432 6.566 6.714 6.855 6.992 7.128 7.279 7.431 7.584 7.72 7.809 7.882 7.943 7.974 7.919 7.749 7.329 6.383 5.065 3.941 2.944 2.047 1.242 0.546 -0.087 -0.627 -1.166 -1.657 -2.101 -2.503 -2.87 -3.229 -3.577 -3.938 -4.259 -4.537 -4.82 -5.114 -5.356 -5.612 -5.878 -6.078 -6.289 -6.522 -6.771 -7.027 -7.203 -7.385 -7.662 -7.842 -8.035 -8.14 -8.359 -8.594 -8.852 -8.99 -9.22 -9.45 -9.606 -9.769 -10.161 -10.384 -10.614 -10.856 -11.139 -11.492 -11.954 -13.063 -6 ,22235 ,KEBNE ,16677688,Wed Nov 24 21:33:44 CET,Wed Nov 24 22:58:57 CET,0.0 1.12 1.561 1.866 2.141 2.375 2.581 2.777 3.116 3.255 3.378 3.534 3.709 3.809 4.0 4.172 4.325 4.398 4.543 4.674 4.844 4.951 5.06 5.224 5.377 5.522 5.656 5.778 5.94 6.109 6.268 6.447 6.604 6.75 6.901 7.048 7.194 7.345 7.501 7.658 7.812 8.0 8.197 8.346 8.487 8.582 8.593 8.506 8.304 7.904 7.01 5.741 4.594 3.578 2.684 1.859 1.13 0.489 -0.058 -0.611 -1.083 -1.498 -1.909 -2.306 -2.672 -3.011 -3.357 -3.666 -3.932 -4.213 -4.502 -4.74 -4.998 -5.258 -5.454 -5.662 -5.875 -6.1 -6.34 -6.501 -6.667 -6.926 -7.111 -7.307 -7.408 -7.623 -7.859 -8.12 -8.261 -8.482 -8.688 -8.848 -9.013 -9.375 -9.573 -9.783 -10.03 -10.329 -10.693 -11.168 -12.767 -7 ,21802 ,KEBNE ,16677689,Wed Nov 24 21:33:45 CET,Wed Nov 24 22:59:30 CET,0.0 1.107 1.591 1.884 2.145 2.363 2.539 2.712 3.036 3.181 3.307 3.461 3.641 3.741 3.921 4.091 4.245 4.32 4.465 4.597 4.774 4.888 4.998 5.166 5.322 5.462 5.599 5.729 5.886 6.033 6.177 6.34 6.488 6.63 6.787 6.952 7.111 7.27 7.438 7.603 7.741 7.883 8.047 8.199 8.344 8.447 8.476 8.441 8.274 7.867 6.98 5.702 4.586 3.619 2.776 2.011 1.309 0.676 0.131 -0.413 -0.879 -1.311 -1.735 -2.125 -2.476 -2.803 -3.154 -3.475 -3.763 -4.055 -4.333 -4.557 -4.807 -5.083 -5.293 -5.506 -5.73 -5.959 -6.196 -6.371 -6.554 -6.827 -7.018 -7.219 -7.325 -7.557 -7.794 -8.038 -8.171 -8.397 -8.622 -8.782 -8.945 -9.312 -9.524 -9.753 -9.996 -10.262 -10.578 -11.005 -12.675 -8 ,7203 ,KEBNE ,16675426,Wed Nov 24 04:44:12 CET,Wed Nov 24 06:05:25 CET,0.0 1.078 1.532 1.84 2.062 2.264 2.457 2.631 2.921 3.047 3.165 3.317 3.488 3.592 3.789 3.969 4.138 4.219 4.373 4.511 4.699 4.819 4.932 5.1 5.258 5.392 5.509 5.623 5.784 5.93 6.055 6.213 6.363 6.495 6.643 6.816 6.969 7.118 7.282 7.458 7.619 7.771 7.929 8.089 8.235 8.327 8.382 8.328 8.112 7.672 6.783 5.536 4.401 3.395 2.511 1.712 1.03 0.423 -0.12 -0.67 -1.14 -1.559 -1.969 -2.353 -2.694 -3.026 -3.363 -3.659 -3.936 -4.227 -4.526 -4.764 -5.018 -5.284 -5.488 -5.707 -5.934 -6.171 -6.414 -6.584 -6.762 -7.037 -7.226 -7.425 -7.532 -7.76 -7.991 -8.239 -8.374 -8.585 -8.778 -8.935 -9.111 -9.49 -9.69 -9.911 -10.164 -10.461 -10.814 -11.288 -12.622 -9 ,25943 ,KEBNE ,16675427,Wed Nov 24 04:45:10 CET,Wed Nov 24 06:07:27 CET,0.0 1.239 1.671 1.989 2.228 2.438 2.635 2.802 3.116 3.265 3.401 3.574 3.754 3.853 4.028 4.19 4.34 4.41 4.558 4.708 4.899 5.018 5.131 5.286 5.44 5.596 5.739 5.862 6.008 6.163 6.313 6.462 6.606 6.738 6.869 7.025 7.17 7.308 7.447 7.597 7.748 7.909 8.087 8.23 8.364 8.476 8.519 8.475 8.296 7.844 6.962 5.72 4.569 3.549 2.681 1.9 1.2 0.582 0.06 -0.469 -0.946 -1.372 -1.77 -2.156 -2.524 -2.865 -3.213 -3.505 -3.752 -4.015 -4.299 -4.541 -4.778 -5.033 -5.241 -5.446 -5.659 -5.878 -6.102 -6.259 -6.429 -6.706 -6.895 -7.086 -7.183 -7.382 -7.598 -7.821 -7.939 -8.147 -8.338 -8.492 -8.654 -9.009 -9.203 -9.407 -9.639 -9.938 -10.317 -10.782 -12.028 -10 ,2532 ,KEBNE ,16677692,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:00:41 CET,0.0 1.131 1.581 1.881 2.127 2.342 2.528 2.703 3.024 3.165 3.302 3.499 3.688 3.794 3.992 4.175 4.352 4.441 4.606 4.748 4.93 5.051 5.164 5.318 5.465 5.613 5.752 5.874 6.028 6.171 6.308 6.46 6.592 6.723 6.868 7.014 7.161 7.319 7.458 7.587 7.718 7.877 8.044 8.169 8.288 8.384 8.447 8.419 8.26 7.841 6.943 5.719 4.636 3.653 2.797 2.03 1.322 0.697 0.173 -0.368 -0.836 -1.248 -1.648 -2.034 -2.395 -2.735 -3.083 -3.385 -3.657 -3.936 -4.222 -4.45 -4.679 -4.938 -5.151 -5.365 -5.58 -5.81 -6.061 -6.233 -6.412 -6.693 -6.885 -7.097 -7.204 -7.418 -7.645 -7.884 -8.009 -8.228 -8.426 -8.572 -8.729 -9.095 -9.301 -9.53 -9.795 -10.118 -10.485 -10.977 -12.607 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_62.txt deleted file mode 100644 index dbfcb1e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4982 ,KEBNE ,16677693,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:00:51 CET,0.0 1.112 1.516 1.826 2.065 2.275 2.474 2.653 2.957 3.092 3.223 3.396 3.578 3.689 3.904 4.093 4.275 4.363 4.523 4.675 4.903 5.041 5.166 5.345 5.518 5.687 5.857 6.024 6.229 6.422 6.603 6.815 7.013 7.2 7.418 7.656 7.873 8.108 8.358 8.629 8.912 9.215 9.524 9.8 10.121 10.486 10.867 11.18 11.442 11.628 11.481 10.837 10.098 9.388 8.729 8.104 7.535 6.982 6.494 5.986 5.541 5.157 4.774 4.414 4.074 3.751 3.416 3.111 2.85 2.572 2.274 2.022 1.759 1.499 1.29 1.061 0.838 0.605 0.351 0.163 -0.027 -0.31 -0.512 -0.725 -0.843 -1.094 -1.358 -1.639 -1.785 -2.02 -2.279 -2.447 -2.621 -3.005 -3.227 -3.473 -3.759 -4.128 -4.536 -5.012 -6.264 -2 ,8807 ,KEBNE ,16677694,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:00:07 CET,0.0 1.273 1.689 2.011 2.24 2.44 2.633 2.805 3.126 3.279 3.422 3.598 3.79 3.914 4.134 4.341 4.54 4.635 4.802 4.952 5.169 5.312 5.455 5.651 5.831 6.014 6.186 6.346 6.552 6.739 6.924 7.15 7.355 7.542 7.752 7.989 8.215 8.461 8.731 8.996 9.262 9.543 9.853 10.18 10.542 10.908 11.271 11.614 11.973 12.243 12.154 11.57 10.902 10.251 9.627 9.032 8.458 7.918 7.457 6.978 6.538 6.135 5.745 5.367 5.026 4.72 4.375 4.062 3.793 3.514 3.218 2.972 2.73 2.462 2.253 2.047 1.826 1.59 1.342 1.16 0.96 0.654 0.435 0.195 0.073 -0.166 -0.425 -0.707 -0.845 -1.067 -1.324 -1.515 -1.718 -2.139 -2.38 -2.653 -2.944 -3.259 -3.642 -4.164 -5.673 -3 ,19052 ,KEBNE ,16677695,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:00:54 CET,0.0 0.861 1.255 1.569 1.842 2.069 2.27 2.442 2.749 2.897 3.042 3.242 3.434 3.549 3.762 3.952 4.135 4.222 4.393 4.552 4.77 4.91 5.042 5.235 5.428 5.607 5.785 5.961 6.174 6.362 6.543 6.764 6.958 7.14 7.349 7.595 7.828 8.074 8.329 8.596 8.859 9.128 9.449 9.765 10.096 10.434 10.795 11.134 11.419 11.572 11.447 10.864 10.15 9.429 8.761 8.121 7.568 7.065 6.597 6.109 5.671 5.279 4.903 4.534 4.178 3.847 3.505 3.215 2.957 2.667 2.363 2.114 1.862 1.594 1.376 1.153 0.908 0.653 0.399 0.224 0.04 -0.247 -0.45 -0.664 -0.777 -1.015 -1.278 -1.549 -1.689 -1.906 -2.128 -2.294 -2.468 -2.844 -3.061 -3.283 -3.537 -3.833 -4.205 -4.729 -6.597 -4 ,19306 ,KEBNE ,16677696,Wed Nov 24 21:37:52 CET,Wed Nov 24 23:01:13 CET,0.0 0.933 1.349 1.66 1.917 2.151 2.348 2.526 2.858 3.009 3.15 3.326 3.51 3.626 3.852 4.051 4.228 4.314 4.483 4.644 4.896 5.06 5.198 5.393 5.581 5.769 5.946 6.108 6.312 6.504 6.689 6.897 7.1 7.299 7.512 7.747 7.974 8.222 8.484 8.746 9.024 9.321 9.63 9.913 10.234 10.573 10.93 11.303 11.656 11.909 11.889 11.371 10.669 9.964 9.31 8.695 8.115 7.574 7.091 6.592 6.156 5.765 5.397 5.055 4.711 4.382 4.047 3.746 3.48 3.205 2.913 2.676 2.436 2.18 1.991 1.79 1.556 1.31 1.063 0.888 0.697 0.403 0.199 -0.013 -0.123 -0.358 -0.598 -0.867 -1.014 -1.244 -1.486 -1.663 -1.849 -2.271 -2.499 -2.741 -3.021 -3.343 -3.734 -4.273 -6.021 -5 ,16279 ,KEBNE ,16677697,Wed Nov 24 21:37:52 CET,Wed Nov 24 23:00:55 CET,0.0 0.906 1.335 1.635 1.907 2.145 2.353 2.541 2.873 3.022 3.158 3.342 3.53 3.641 3.846 4.049 4.235 4.318 4.478 4.633 4.865 5.016 5.166 5.366 5.541 5.719 5.883 6.033 6.225 6.412 6.592 6.807 7.019 7.216 7.431 7.668 7.89 8.125 8.362 8.606 8.863 9.133 9.446 9.753 10.061 10.379 10.74 11.074 11.369 11.596 11.557 11.059 10.375 9.656 8.978 8.345 7.758 7.196 6.703 6.213 5.807 5.456 5.098 4.732 4.398 4.097 3.779 3.478 3.206 2.925 2.628 2.387 2.131 1.862 1.662 1.443 1.201 0.957 0.71 0.532 0.337 0.033 -0.176 -0.399 -0.52 -0.76 -1.008 -1.27 -1.407 -1.636 -1.895 -2.077 -2.263 -2.667 -2.893 -3.15 -3.433 -3.763 -4.165 -4.712 -6.165 -6 ,32423 ,KEBNE ,16677698,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:00:29 CET,0.0 1.051 1.443 1.72 1.974 2.19 2.367 2.549 2.881 3.022 3.154 3.339 3.529 3.646 3.851 4.041 4.225 4.316 4.492 4.647 4.869 5.014 5.15 5.343 5.52 5.695 5.869 6.028 6.228 6.427 6.617 6.832 7.031 7.226 7.451 7.691 7.916 8.156 8.411 8.674 8.934 9.223 9.553 9.862 10.198 10.526 10.851 11.179 11.478 11.725 11.67 11.169 10.56 9.859 9.176 8.552 7.988 7.463 6.971 6.447 6.006 5.628 5.26 4.89 4.541 4.224 3.906 3.625 3.376 3.104 2.806 2.555 2.3 2.037 1.825 1.59 1.35 1.102 0.837 0.664 0.488 0.222 0.026 -0.204 -0.323 -0.561 -0.815 -1.084 -1.225 -1.453 -1.704 -1.882 -2.074 -2.471 -2.7 -2.968 -3.259 -3.58 -3.951 -4.431 -6.26 -7 ,23937 ,KEBNE ,16677699,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:01:50 CET,0.0 1.038 1.529 1.862 2.134 2.374 2.586 2.773 3.08 3.217 3.358 3.555 3.737 3.843 4.064 4.274 4.464 4.553 4.718 4.88 5.111 5.255 5.388 5.593 5.783 5.956 6.13 6.291 6.503 6.711 6.894 7.095 7.292 7.485 7.713 7.969 8.198 8.433 8.683 8.948 9.211 9.494 9.811 10.106 10.426 10.808 11.209 11.544 11.885 12.092 12.026 11.547 10.861 10.179 9.553 8.982 8.444 7.92 7.466 7.002 6.573 6.172 5.793 5.429 5.082 4.753 4.412 4.105 3.84 3.579 3.309 3.076 2.832 2.568 2.354 2.136 1.912 1.674 1.417 1.24 1.058 0.765 0.549 0.321 0.203 -0.04 -0.306 -0.589 -0.734 -0.96 -1.223 -1.401 -1.581 -1.997 -2.237 -2.505 -2.816 -3.176 -3.636 -4.248 -5.973 -8 ,10727 ,KEBNE ,16677700,Wed Nov 24 21:37:52 CET,Wed Nov 24 23:01:56 CET,0.0 1.033 1.45 1.758 2.022 2.257 2.468 2.647 2.957 3.108 3.247 3.439 3.632 3.742 3.951 4.135 4.304 4.385 4.539 4.706 4.954 5.099 5.237 5.436 5.623 5.803 5.977 6.14 6.338 6.529 6.721 6.951 7.166 7.358 7.58 7.831 8.062 8.317 8.607 8.899 9.165 9.444 9.767 10.112 10.488 10.838 11.234 11.6 11.933 12.181 12.102 11.59 10.874 10.136 9.471 8.85 8.261 7.712 7.24 6.738 6.287 5.887 5.498 5.131 4.809 4.506 4.164 3.849 3.578 3.296 3.001 2.757 2.498 2.229 2.012 1.786 1.565 1.336 1.08 0.893 0.702 0.389 0.175 -0.047 -0.168 -0.405 -0.651 -0.92 -1.07 -1.297 -1.545 -1.721 -1.899 -2.296 -2.521 -2.767 -3.046 -3.4 -3.853 -4.441 -6.195 -9 ,5756 ,KEBNE ,16677701,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:00:27 CET,0.0 1.209 1.728 2.092 2.382 2.618 2.829 3.015 3.325 3.465 3.603 3.79 3.983 4.1 4.314 4.516 4.709 4.798 4.96 5.106 5.322 5.468 5.6 5.781 5.951 6.111 6.269 6.425 6.63 6.826 7.006 7.226 7.444 7.647 7.864 8.093 8.323 8.581 8.839 9.105 9.371 9.646 9.944 10.236 10.576 10.936 11.322 11.714 12.054 12.286 12.181 11.677 11.041 10.302 9.595 8.938 8.362 7.82 7.341 6.849 6.426 6.043 5.67 5.32 4.987 4.667 4.315 4.002 3.728 3.449 3.171 2.934 2.679 2.427 2.238 2.034 1.824 1.591 1.331 1.155 0.964 0.643 0.424 0.202 0.082 -0.165 -0.429 -0.716 -0.859 -1.073 -1.296 -1.471 -1.662 -2.073 -2.323 -2.597 -2.89 -3.22 -3.614 -4.108 -5.629 -10 ,30077 ,KEBNE ,16677702,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:00:57 CET,0.0 1.125 1.496 1.826 2.123 2.359 2.556 2.736 3.053 3.189 3.314 3.485 3.669 3.774 3.981 4.196 4.395 4.481 4.648 4.808 5.046 5.192 5.32 5.51 5.7 5.874 6.034 6.194 6.412 6.622 6.807 7.029 7.231 7.414 7.632 7.869 8.104 8.356 8.599 8.866 9.137 9.42 9.746 10.07 10.427 10.784 11.136 11.487 11.782 11.919 11.801 11.243 10.618 9.995 9.347 8.729 8.129 7.552 7.058 6.568 6.16 5.793 5.439 5.094 4.77 4.46 4.115 3.808 3.554 3.287 2.993 2.747 2.491 2.219 1.994 1.76 1.521 1.278 1.036 0.857 0.661 0.359 0.148 -0.081 -0.197 -0.441 -0.693 -0.955 -1.099 -1.327 -1.589 -1.769 -1.961 -2.384 -2.617 -2.877 -3.163 -3.488 -3.878 -4.439 -6.275 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_58.txt deleted file mode 100644 index cefb087b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18346 ,KEBNE ,16677703,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:03:10 CET,0.0 1.741 2.276 2.688 3.025 3.299 3.537 3.761 4.14 4.305 4.461 4.621 4.816 4.943 5.198 5.43 5.652 5.763 5.982 6.201 6.506 6.692 6.853 7.071 7.282 7.478 7.666 7.848 8.086 8.306 8.531 8.797 9.022 9.243 9.504 9.779 10.049 10.35 10.67 11.004 11.352 11.752 12.183 12.611 13.185 13.849 14.537 15.308 16.139 16.894 17.484 17.485 17.18 16.711 16.18 15.65 15.14 14.634 14.179 13.779 13.492 13.245 12.977 12.71 12.479 12.247 11.976 11.751 11.567 11.361 11.15 10.969 10.769 10.555 10.383 10.209 10.018 9.818 9.598 9.44 9.282 9.028 8.845 8.641 8.538 8.305 8.027 7.719 7.558 7.303 6.979 6.77 6.562 6.09 5.822 5.533 5.199 4.793 4.281 3.643 0.701 -2 ,2385 ,KEBNE ,16677704,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:00:54 CET,0.0 1.779 2.355 2.758 3.077 3.35 3.611 3.833 4.216 4.406 4.592 4.807 5.01 5.13 5.361 5.581 5.795 5.893 6.093 6.312 6.636 6.838 7.023 7.272 7.497 7.71 7.928 8.157 8.437 8.678 8.893 9.141 9.382 9.604 9.855 10.139 10.41 10.717 11.045 11.366 11.696 12.06 12.492 12.927 13.402 13.911 14.455 15.029 15.716 16.42 16.857 16.885 16.758 16.556 16.295 16.009 15.735 15.44 15.149 14.837 14.537 14.252 13.966 13.696 13.44 13.198 12.94 12.695 12.485 12.275 12.045 11.846 11.63 11.402 11.227 11.027 10.808 10.57 10.321 10.153 9.98 9.694 9.471 9.219 9.084 8.822 8.549 8.235 8.073 7.839 7.592 7.409 7.205 6.745 6.516 6.271 5.979 5.607 5.08 4.373 1.771 -3 ,27729 ,KEBNE ,16677705,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:01:02 CET,0.0 1.413 1.983 2.38 2.697 2.974 3.196 3.368 3.678 3.828 3.969 4.148 4.359 4.469 4.694 4.927 5.171 5.294 5.519 5.74 6.058 6.255 6.443 6.726 6.978 7.192 7.393 7.583 7.809 8.015 8.214 8.456 8.674 8.873 9.103 9.36 9.597 9.858 10.161 10.478 10.784 11.116 11.508 11.893 12.31 12.773 13.292 13.838 14.444 15.039 15.548 15.721 15.629 15.435 15.179 14.877 14.57 14.276 14.003 13.685 13.381 13.094 12.814 12.562 12.325 12.08 11.812 11.57 11.375 11.161 10.909 10.704 10.493 10.27 10.082 9.865 9.641 9.423 9.18 9.011 8.844 8.595 8.405 8.193 8.087 7.856 7.587 7.274 7.098 6.831 6.51 6.302 6.11 5.672 5.409 5.113 4.764 4.336 3.79 3.109 0.709 -4 ,23725 ,KEBNE ,16677706,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:02:35 CET,0.0 1.757 2.278 2.694 3.058 3.37 3.62 3.844 4.259 4.446 4.598 4.752 4.952 5.084 5.333 5.549 5.752 5.854 6.066 6.26 6.521 6.69 6.867 7.127 7.364 7.568 7.749 7.923 8.147 8.362 8.569 8.829 9.075 9.302 9.559 9.844 10.129 10.487 10.897 11.334 11.788 12.193 12.591 13.016 13.483 13.961 14.492 15.044 15.663 16.3 16.843 17.05 16.953 16.705 16.403 16.084 15.766 15.418 15.073 14.718 14.402 14.126 13.858 13.58 13.307 13.056 12.765 12.501 12.282 12.046 11.803 11.591 11.368 11.13 10.936 10.728 10.503 10.275 10.044 9.881 9.711 9.421 9.196 8.949 8.821 8.551 8.256 7.945 7.784 7.53 7.231 7.029 6.821 6.366 6.114 5.844 5.521 5.117 4.61 3.855 1.241 -5 ,3082 ,KEBNE ,16677707,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:01:26 CET,0.0 1.681 2.173 2.571 2.909 3.206 3.464 3.688 4.067 4.246 4.422 4.667 4.908 5.054 5.326 5.552 5.748 5.857 6.073 6.255 6.498 6.655 6.802 7.004 7.203 7.398 7.568 7.728 7.943 8.152 8.352 8.582 8.804 9.013 9.25 9.534 9.8 10.065 10.355 10.673 11.016 11.397 11.804 12.191 12.629 13.112 13.638 14.209 14.83 15.441 15.961 16.072 15.918 15.667 15.377 15.088 14.769 14.441 14.143 13.815 13.525 13.261 12.991 12.727 12.477 12.243 11.992 11.748 11.525 11.288 11.043 10.832 10.611 10.379 10.192 10.007 9.813 9.594 9.355 9.192 9.019 8.741 8.548 8.345 8.239 8.009 7.744 7.46 7.309 7.06 6.758 6.55 6.336 5.844 5.579 5.282 4.922 4.516 4.014 3.34 -0.448 -6 ,29643 ,KEBNE ,16677708,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:02:40 CET,0.0 1.399 1.902 2.265 2.557 2.795 3.019 3.242 3.665 3.851 4.03 4.277 4.504 4.639 4.892 5.123 5.337 5.441 5.654 5.862 6.144 6.312 6.461 6.685 6.935 7.189 7.429 7.641 7.903 8.168 8.397 8.636 8.863 9.076 9.323 9.584 9.833 10.102 10.373 10.665 10.977 11.333 11.738 12.143 12.616 13.097 13.597 14.15 14.797 15.464 16.037 16.191 16.033 15.767 15.46 15.133 14.811 14.499 14.219 13.877 13.54 13.249 12.971 12.705 12.459 12.212 11.95 11.718 11.517 11.309 11.092 10.908 10.699 10.46 10.275 10.084 9.88 9.678 9.462 9.298 9.119 8.859 8.666 8.426 8.295 8.04 7.763 7.455 7.299 7.051 6.777 6.588 6.377 5.881 5.596 5.31 4.987 4.59 4.095 3.335 0.468 -7 ,18504 ,KEBNE ,16677709,Wed Nov 24 21:37:52 CET,Wed Nov 24 23:03:57 CET,0.0 1.448 1.837 2.14 2.424 2.705 2.955 3.165 3.508 3.672 3.818 3.998 4.204 4.315 4.526 4.742 4.96 5.062 5.256 5.447 5.719 5.878 6.021 6.213 6.392 6.568 6.738 6.902 7.106 7.301 7.489 7.715 7.919 8.114 8.356 8.64 8.906 9.183 9.479 9.79 10.102 10.446 10.843 11.227 11.664 12.139 12.654 13.207 13.824 14.466 15.012 15.203 15.095 14.875 14.625 14.313 13.985 13.673 13.39 13.079 12.772 12.499 12.242 11.983 11.734 11.501 11.246 11.015 10.808 10.574 10.331 10.116 9.879 9.635 9.444 9.24 9.038 8.839 8.622 8.45 8.246 7.911 7.678 7.436 7.311 7.053 6.785 6.505 6.366 6.145 5.934 5.767 5.565 5.077 4.787 4.484 4.121 3.699 3.197 2.416 -0.066 -8 ,13525 ,KEBNE ,16677710,Wed Nov 24 21:37:52 CET,Wed Nov 24 23:03:43 CET,0.0 1.935 2.409 2.742 3.014 3.268 3.514 3.738 4.127 4.287 4.447 4.678 4.916 5.05 5.284 5.492 5.688 5.789 5.992 6.197 6.497 6.685 6.865 7.121 7.351 7.545 7.721 7.891 8.109 8.337 8.558 8.798 9.032 9.252 9.508 9.864 10.249 10.651 11.026 11.368 11.724 12.104 12.506 12.9 13.377 13.886 14.453 15.063 15.717 16.396 16.948 17.122 17.008 16.752 16.483 16.185 15.868 15.544 15.237 14.903 14.542 14.159 13.798 13.459 13.12 12.807 12.517 12.274 12.048 11.822 11.588 11.373 11.129 10.871 10.681 10.484 10.277 10.06 9.827 9.665 9.492 9.216 9.011 8.786 8.662 8.397 8.124 7.826 7.664 7.411 7.123 6.921 6.71 6.237 5.957 5.657 5.33 4.942 4.443 3.761 1.536 -9 ,16906 ,KEBNE ,16677711,Wed Nov 24 21:37:52 CET,Wed Nov 24 23:02:52 CET,0.0 1.144 1.618 1.986 2.294 2.574 2.82 3.049 3.46 3.634 3.803 4.053 4.286 4.429 4.701 4.913 5.085 5.175 5.36 5.528 5.768 5.921 6.059 6.275 6.478 6.66 6.843 7.017 7.23 7.428 7.622 7.856 8.077 8.293 8.532 8.814 9.09 9.369 9.645 9.93 10.254 10.615 11.007 11.406 11.846 12.295 12.811 13.397 14.023 14.624 15.171 15.358 15.221 14.981 14.688 14.365 14.06 13.771 13.506 13.201 12.908 12.649 12.393 12.125 11.858 11.607 11.355 11.141 10.941 10.721 10.489 10.292 10.09 9.864 9.678 9.475 9.233 8.958 8.67 8.466 8.261 7.938 7.711 7.503 7.397 7.169 6.897 6.578 6.405 6.143 5.859 5.662 5.466 5.022 4.757 4.464 4.119 3.686 3.168 2.516 -0.024 -10 ,14598 ,KEBNE ,16677712,Wed Nov 24 21:37:52 CET,Wed Nov 24 23:02:07 CET,0.0 1.48 1.955 2.325 2.625 2.883 3.1 3.284 3.605 3.754 3.914 4.142 4.375 4.509 4.74 4.963 5.187 5.304 5.537 5.756 6.061 6.256 6.442 6.711 6.979 7.239 7.459 7.633 7.847 8.057 8.256 8.502 8.736 8.945 9.179 9.451 9.721 10.009 10.303 10.599 10.92 11.274 11.672 12.068 12.509 12.995 13.522 14.07 14.666 15.286 15.815 15.987 15.894 15.659 15.374 15.013 14.646 14.349 14.068 13.73 13.413 13.146 12.898 12.626 12.361 12.123 11.871 11.634 11.389 11.085 10.759 10.504 10.251 10.007 9.835 9.653 9.447 9.222 8.961 8.78 8.609 8.342 8.14 7.933 7.832 7.609 7.371 7.116 6.991 6.784 6.541 6.345 6.129 5.608 5.321 5.049 4.769 4.439 4.007 3.308 -0.938 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_59.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_59.txt deleted file mode 100644 index d9b6794a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_59.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26516 ,KEBNE ,16677713,Wed Nov 24 21:37:51 CET,Wed Nov 24 23:02:34 CET,0.0 1.684 2.247 2.633 2.952 3.249 3.524 3.763 4.174 4.365 4.549 4.808 5.062 5.226 5.534 5.816 6.087 6.209 6.424 6.624 6.923 7.126 7.314 7.568 7.798 8.024 8.251 8.471 8.755 9.027 9.296 9.615 9.906 10.188 10.517 10.889 11.245 11.63 12.065 12.515 12.987 13.531 14.153 14.792 15.553 16.374 17.301 18.359 19.595 21.009 22.646 23.887 24.525 24.844 24.999 25.069 25.046 24.95 24.835 24.685 24.514 24.346 24.193 24.043 23.892 23.758 23.594 23.416 23.25 23.067 22.883 22.72 22.524 22.308 22.149 21.987 21.791 21.561 21.305 21.129 20.939 20.647 20.463 20.29 20.201 20.005 19.787 19.531 19.382 19.147 18.848 18.661 18.469 17.988 17.72 17.453 17.162 16.801 16.374 15.832 13.158 -2 ,15064 ,KEBNE ,16677714,Wed Nov 24 21:37:52 CET,Wed Nov 24 23:01:56 CET,0.0 1.71 2.32 2.734 3.076 3.376 3.644 3.895 4.303 4.472 4.631 4.848 5.08 5.229 5.516 5.76 5.983 6.094 6.311 6.515 6.802 6.99 7.167 7.422 7.664 7.904 8.15 8.387 8.679 8.951 9.213 9.531 9.829 10.115 10.448 10.812 11.159 11.539 11.965 12.416 12.875 13.414 14.057 14.69 15.427 16.253 17.201 18.254 19.48 20.912 22.595 23.927 24.552 24.849 24.976 25.032 25.015 24.943 24.871 24.766 24.623 24.471 24.325 24.157 23.967 23.801 23.644 23.491 23.346 23.172 22.954 22.775 22.601 22.419 22.265 22.088 21.908 21.726 21.537 21.391 21.211 20.916 20.711 20.5 20.391 20.152 19.89 19.595 19.443 19.219 18.95 18.782 18.59 18.158 17.914 17.655 17.381 17.037 16.63 16.05 12.496 -3 ,30937 ,KEBNE ,16677715,Wed Nov 24 21:37:52 CET,Wed Nov 24 23:03:28 CET,0.0 1.763 2.281 2.694 3.035 3.343 3.617 3.859 4.305 4.512 4.697 4.949 5.2 5.353 5.644 5.928 6.191 6.319 6.569 6.806 7.134 7.349 7.56 7.835 8.111 8.402 8.677 8.928 9.242 9.534 9.804 10.137 10.489 10.862 11.3 11.787 12.251 12.754 13.276 13.844 14.44 15.07 15.764 16.421 17.173 18.007 18.958 20.043 21.288 22.746 24.427 25.672 26.326 26.657 26.761 26.748 26.707 26.654 26.573 26.442 26.281 26.122 25.957 25.773 25.584 25.409 25.218 25.029 24.853 24.67 24.474 24.296 24.099 23.901 23.757 23.6 23.426 23.234 23.041 22.9 22.752 22.534 22.375 22.201 22.103 21.882 21.639 21.383 21.242 21.019 20.741 20.55 20.349 19.883 19.614 19.343 19.021 18.62 18.131 17.42 13.958 -4 ,8229 ,KEBNE ,16677716,Wed Nov 24 21:37:52 CET,Wed Nov 24 23:06:21 CET,0.0 1.371 1.908 2.352 2.721 3.039 3.318 3.55 3.99 4.2 4.392 4.657 4.907 5.069 5.373 5.682 5.966 6.075 6.278 6.483 6.79 6.988 7.172 7.433 7.682 7.922 8.153 8.365 8.64 8.92 9.19 9.515 9.82 10.101 10.424 10.806 11.185 11.579 11.986 12.421 12.877 13.387 13.995 14.61 15.321 16.137 17.047 18.067 19.292 20.751 22.479 23.786 24.449 24.782 24.942 25.004 24.977 24.89 24.781 24.624 24.46 24.318 24.171 24.012 23.836 23.668 23.499 23.349 23.208 23.045 22.869 22.716 22.549 22.359 22.205 22.039 21.864 21.658 21.416 21.244 21.066 20.79 20.589 20.364 20.246 19.995 19.714 19.424 19.281 19.041 18.704 18.479 18.25 17.783 17.523 17.216 16.855 16.414 15.829 14.99 12.126 -5 ,6199 ,KEBNE ,16677717,Wed Nov 24 21:37:52 CET,Wed Nov 24 23:01:34 CET,0.0 1.873 2.43 2.855 3.185 3.467 3.719 3.948 4.377 4.558 4.725 4.942 5.16 5.287 5.523 5.749 5.983 6.103 6.325 6.521 6.802 6.987 7.168 7.429 7.686 7.928 8.152 8.372 8.659 8.926 9.197 9.53 9.825 10.109 10.446 10.81 11.164 11.569 11.999 12.45 12.931 13.469 14.108 14.837 15.747 16.717 17.828 19.116 20.576 22.194 23.846 24.81 25.14 25.182 25.114 24.908 24.638 24.343 24.036 23.74 23.544 23.39 23.238 23.091 22.927 22.771 22.613 22.457 22.305 22.133 21.951 21.796 21.63 21.429 21.232 21.014 20.791 20.582 20.385 20.236 20.079 19.827 19.646 19.465 19.363 19.125 18.878 18.621 18.472 18.237 17.936 17.743 17.536 17.031 16.746 16.436 16.09 15.691 15.18 14.433 10.105 -6 ,13768 ,KEBNE ,16677718,Wed Nov 24 21:38:53 CET,Wed Nov 24 23:02:19 CET,0.0 1.604 2.164 2.597 2.948 3.248 3.482 3.705 4.126 4.307 4.471 4.694 4.925 5.062 5.314 5.55 5.781 5.891 6.107 6.312 6.603 6.798 6.977 7.236 7.491 7.727 7.946 8.162 8.448 8.722 8.99 9.305 9.596 9.865 10.191 10.574 10.923 11.316 11.756 12.227 12.724 13.258 13.869 14.472 15.185 16.011 16.95 18.025 19.276 20.697 22.279 23.454 24.1 24.427 24.591 24.513 24.288 24.04 23.864 23.732 23.605 23.471 23.313 23.14 22.971 22.813 22.62 22.447 22.285 22.054 21.775 21.548 21.302 21.027 20.824 20.616 20.402 20.182 19.929 19.742 19.537 19.225 19.006 18.769 18.649 18.404 18.14 17.892 17.771 17.567 17.344 17.186 17.015 16.602 16.342 16.069 15.773 15.392 14.876 14.11 11.198 -7 ,4217 ,KEBNE ,16677719,Wed Nov 24 21:38:53 CET,Wed Nov 24 23:02:09 CET,0.0 2.32 2.928 3.314 3.651 3.956 4.218 4.458 4.903 5.109 5.304 5.587 5.842 6.005 6.305 6.56 6.777 6.886 7.116 7.334 7.629 7.814 7.984 8.235 8.482 8.725 8.959 9.172 9.444 9.72 9.996 10.316 10.601 10.865 11.191 11.581 11.951 12.336 12.764 13.232 13.706 14.249 14.897 15.538 16.275 17.106 18.06 19.119 20.323 21.744 23.443 24.678 25.278 25.621 25.782 25.807 25.755 25.675 25.579 25.451 25.325 25.206 25.07 24.907 24.734 24.586 24.425 24.253 24.107 23.944 23.746 23.588 23.426 23.225 23.034 22.831 22.628 22.398 22.158 21.981 21.787 21.485 21.259 21.024 20.905 20.678 20.453 20.202 20.07 19.87 19.649 19.484 19.3 18.87 18.617 18.338 18.039 17.672 17.192 16.465 10.918 -8 ,9161 ,KEBNE ,16677720,Wed Nov 24 21:38:53 CET,Wed Nov 24 23:03:30 CET,0.0 1.903 2.462 2.845 3.172 3.465 3.726 3.949 4.331 4.509 4.687 4.924 5.156 5.302 5.573 5.83 6.098 6.223 6.441 6.646 6.97 7.197 7.393 7.649 7.896 8.129 8.376 8.642 8.995 9.34 9.634 9.943 10.255 10.562 10.911 11.289 11.657 12.073 12.513 12.979 13.482 14.028 14.651 15.32 16.183 17.216 18.387 19.673 21.18 22.918 24.788 26.05 26.595 26.845 26.879 26.758 26.601 26.474 26.352 26.198 26.044 25.888 25.674 25.4 25.158 24.96 24.76 24.586 24.426 24.249 24.066 23.9 23.689 23.433 23.234 23.029 22.797 22.562 22.33 22.163 21.987 21.73 21.553 21.334 21.208 20.992 20.798 20.536 20.383 20.17 19.956 19.79 19.597 19.161 18.914 18.638 18.307 17.93 17.459 16.768 14.716 -9 ,2621 ,KEBNE ,16677721,Wed Nov 24 21:38:57 CET,Wed Nov 24 23:05:26 CET,0.0 1.896 2.459 2.85 3.178 3.459 3.704 3.939 4.392 4.598 4.785 5.059 5.318 5.478 5.785 6.07 6.324 6.443 6.693 6.94 7.293 7.52 7.75 8.082 8.376 8.633 8.857 9.076 9.374 9.668 9.981 10.345 10.652 10.952 11.301 11.696 12.076 12.496 12.958 13.431 13.923 14.487 15.132 15.776 16.531 17.373 18.343 19.441 20.739 22.305 23.987 24.994 25.334 25.391 25.324 25.149 24.945 24.722 24.494 24.223 23.976 23.726 23.453 23.185 22.928 22.677 22.397 22.136 21.899 21.674 21.426 21.198 21.01 20.839 20.684 20.514 20.331 20.126 19.908 19.75 19.587 19.336 19.165 18.998 18.91 18.703 18.461 18.211 18.092 17.881 17.614 17.425 17.237 16.868 16.625 16.321 16.007 15.651 15.148 14.429 11.368 -10 ,6931 ,KEBNE ,16677722,Wed Nov 24 21:38:53 CET,Wed Nov 24 23:02:26 CET,0.0 1.744 2.303 2.724 3.077 3.373 3.637 3.905 4.381 4.585 4.777 5.053 5.31 5.468 5.769 6.034 6.268 6.388 6.623 6.856 7.213 7.438 7.659 7.976 8.27 8.542 8.78 9.011 9.32 9.628 9.937 10.318 10.694 11.02 11.371 11.785 12.174 12.589 13.033 13.504 14.0 14.555 15.197 15.866 16.632 17.5 18.522 19.601 20.831 22.266 23.911 25.191 25.84 26.156 26.267 26.246 26.161 26.05 25.922 25.755 25.587 25.408 25.206 25.0 24.799 24.622 24.433 24.245 24.076 23.899 23.717 23.556 23.368 23.172 22.998 22.783 22.569 22.327 22.064 21.88 21.682 21.364 21.134 20.906 20.789 20.542 20.281 19.994 19.836 19.596 19.304 19.102 18.876 18.39 18.157 17.896 17.557 17.164 16.676 15.966 13.496 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_33.txt deleted file mode 100644 index ef8e931e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5695 ,KEBNE ,17023899,Wed Dec 22 08:42:52 CET,Wed Dec 22 10:04:44 CET,0.0 1.829 2.474 2.91 3.27 3.582 3.863 4.123 4.601 4.81 5.002 5.297 5.55 5.716 6.025 6.319 6.597 6.732 6.989 7.244 7.622 7.858 8.078 8.403 8.72 9.019 9.31 9.6 9.971 10.315 10.65 11.066 11.471 11.861 12.301 12.807 13.306 13.875 14.482 15.087 15.744 16.502 17.397 18.308 19.359 20.571 21.99 23.514 25.308 27.418 29.942 32.034 33.159 33.753 34.061 34.239 34.286 34.234 34.136 34.018 33.914 33.797 33.669 33.526 33.377 33.235 33.061 32.879 32.717 32.551 32.374 32.225 32.06 31.863 31.711 31.563 31.397 31.21 31.014 30.886 30.753 30.527 30.344 30.148 30.051 29.841 29.621 29.381 29.256 29.084 28.842 28.684 28.501 28.063 27.812 27.534 27.232 26.896 26.473 25.896 23.376 -2 ,22847 ,KEBNE ,17023900,Wed Dec 22 08:42:52 CET,Wed Dec 22 10:04:44 CET,0.0 2.199 2.829 3.264 3.617 3.909 4.175 4.43 4.892 5.099 5.292 5.584 5.826 5.99 6.308 6.597 6.859 6.988 7.243 7.495 7.856 8.08 8.307 8.63 8.945 9.254 9.545 9.838 10.218 10.586 10.938 11.357 11.746 12.118 12.568 13.076 13.575 14.107 14.663 15.286 15.962 16.719 17.591 18.484 19.565 20.777 22.232 23.917 25.823 27.964 30.383 32.247 33.197 33.714 34.002 34.144 34.177 34.143 34.065 33.936 33.812 33.683 33.543 33.383 33.213 33.048 32.857 32.684 32.537 32.369 32.165 31.997 31.835 31.663 31.523 31.374 31.205 31.019 30.816 30.677 30.536 30.304 30.14 29.972 29.885 29.679 29.445 29.196 29.065 28.88 28.625 28.468 28.299 27.906 27.679 27.386 27.076 26.755 26.31 25.684 23.459 -3 ,25894 ,KEBNE ,17023901,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:06:14 CET,0.0 2.062 2.729 3.207 3.59 3.923 4.228 4.489 4.936 5.146 5.346 5.63 5.87 6.028 6.351 6.662 6.959 7.106 7.387 7.649 8.011 8.233 8.452 8.782 9.112 9.423 9.709 9.986 10.339 10.676 11.003 11.412 11.816 12.202 12.653 13.173 13.664 14.204 14.785 15.415 16.099 16.878 17.787 18.664 19.706 20.878 22.219 23.801 25.678 27.827 30.419 32.539 33.641 34.239 34.63 34.844 34.901 34.882 34.834 34.737 34.611 34.49 34.351 34.199 34.051 33.895 33.723 33.56 33.4 33.222 33.042 32.905 32.746 32.555 32.41 32.263 32.106 31.933 31.749 31.613 31.46 31.189 31.003 30.821 30.726 30.519 30.288 30.041 29.904 29.715 29.455 29.284 29.097 28.696 28.467 28.218 27.945 27.611 27.131 26.471 24.307 -4 ,15806 ,KEBNE ,17023902,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:04:26 CET,0.0 1.808 2.46 2.964 3.326 3.626 3.899 4.151 4.615 4.839 5.058 5.373 5.619 5.782 6.095 6.393 6.687 6.828 7.103 7.377 7.772 8.017 8.25 8.591 8.917 9.228 9.529 9.821 10.2 10.556 10.903 11.32 11.716 12.103 12.547 13.033 13.513 14.048 14.609 15.201 15.859 16.627 17.496 18.4 19.497 20.691 22.09 23.698 25.541 27.697 30.331 32.48 33.609 34.242 34.59 34.753 34.827 34.814 34.739 34.624 34.489 34.331 34.182 34.036 33.872 33.704 33.518 33.339 33.163 32.986 32.791 32.623 32.449 32.24 32.079 31.923 31.755 31.566 31.349 31.192 31.029 30.792 30.622 30.434 30.339 30.125 29.888 29.641 29.513 29.337 29.09 28.926 28.747 28.333 28.088 27.81 27.496 27.133 26.678 26.064 23.789 -5 ,23880 ,KEBNE ,17023903,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:04:43 CET,0.0 1.778 2.444 2.899 3.298 3.648 3.936 4.19 4.657 4.877 5.084 5.394 5.644 5.806 6.132 6.458 6.762 6.903 7.172 7.438 7.823 8.06 8.282 8.601 8.908 9.212 9.513 9.79 10.165 10.552 10.917 11.332 11.715 12.082 12.516 13.014 13.505 14.049 14.627 15.235 15.884 16.668 17.58 18.46 19.479 20.606 21.952 23.504 25.322 27.41 29.859 31.765 32.788 33.336 33.536 33.618 33.665 33.638 33.568 33.469 33.344 33.191 33.034 32.882 32.727 32.566 32.38 32.212 32.063 31.9 31.703 31.534 31.368 31.193 31.053 30.891 30.721 30.547 30.355 30.214 30.069 29.84 29.674 29.497 29.398 29.201 29.009 28.778 28.644 28.459 28.206 28.048 27.87 27.468 27.247 26.991 26.703 26.345 25.866 25.207 23.318 -6 ,9495 ,KEBNE ,17023904,Wed Dec 22 08:42:51 CET,Wed Dec 22 10:04:37 CET,0.0 2.056 2.625 3.061 3.432 3.763 4.061 4.324 4.797 5.008 5.203 5.491 5.747 5.921 6.236 6.541 6.835 6.975 7.257 7.523 7.88 8.106 8.34 8.689 9.005 9.301 9.583 9.844 10.198 10.558 10.894 11.308 11.724 12.121 12.563 13.064 13.556 14.095 14.68 15.321 15.991 16.742 17.634 18.548 19.611 20.799 22.194 23.752 25.584 27.802 30.423 32.383 33.446 34.028 34.35 34.514 34.609 34.637 34.58 34.466 34.32 34.181 34.028 33.854 33.682 33.507 33.318 33.142 32.992 32.837 32.651 32.502 32.352 32.176 32.032 31.885 31.72 31.532 31.334 31.196 31.055 30.831 30.659 30.484 30.394 30.205 29.987 29.735 29.599 29.409 29.152 28.982 28.802 28.396 28.169 27.911 27.6 27.216 26.704 26.06 23.419 -7 ,27279 ,KEBNE ,17023905,Wed Dec 22 08:42:52 CET,Wed Dec 22 10:04:46 CET,0.0 2.059 2.668 3.112 3.477 3.812 4.123 4.389 4.851 5.06 5.252 5.536 5.796 5.976 6.309 6.621 6.911 7.052 7.328 7.578 7.918 8.149 8.387 8.731 9.05 9.35 9.638 9.915 10.278 10.636 10.981 11.396 11.786 12.164 12.623 13.139 13.611 14.146 14.731 15.357 16.007 16.74 17.633 18.525 19.571 20.756 22.135 23.722 25.639 27.853 30.354 32.301 33.397 34.049 34.387 34.533 34.562 34.522 34.466 34.388 34.289 34.179 34.048 33.904 33.739 33.574 33.394 33.23 33.087 32.931 32.765 32.612 32.428 32.235 32.088 31.926 31.762 31.573 31.366 31.233 31.085 30.839 30.666 30.477 30.376 30.168 29.94 29.69 29.564 29.384 29.127 28.953 28.77 28.372 28.143 27.88 27.579 27.212 26.741 26.113 23.792 -8 ,4227 ,KEBNE ,17023906,Wed Dec 22 08:42:52 CET,Wed Dec 22 10:04:16 CET,0.0 2.101 2.724 3.155 3.537 3.85 4.108 4.355 4.822 5.028 5.234 5.536 5.781 5.942 6.27 6.575 6.858 6.996 7.266 7.526 7.894 8.132 8.363 8.709 9.029 9.319 9.604 9.892 10.267 10.62 10.98 11.419 11.823 12.225 12.685 13.187 13.677 14.219 14.806 15.447 16.134 16.893 17.782 18.702 19.789 20.999 22.395 23.939 25.726 27.85 30.397 32.388 33.394 33.999 34.344 34.528 34.603 34.581 34.509 34.376 34.252 34.127 33.969 33.815 33.649 33.478 33.3 33.122 32.952 32.772 32.59 32.419 32.222 32.026 31.872 31.707 31.513 31.308 31.101 30.952 30.795 30.545 30.367 30.174 30.077 29.867 29.647 29.418 29.291 29.108 28.84 28.673 28.493 28.093 27.872 27.609 27.301 26.912 26.441 25.86 23.286 -9 ,30145 ,KEBNE ,17023907,Wed Dec 22 08:43:52 CET,Wed Dec 22 10:07:05 CET,0.0 1.753 2.33 2.752 3.134 3.479 3.785 4.042 4.483 4.713 4.924 5.2 5.454 5.62 5.945 6.267 6.555 6.692 6.948 7.197 7.59 7.837 8.059 8.382 8.684 8.975 9.272 9.566 9.948 10.313 10.667 11.089 11.479 11.862 12.305 12.796 13.28 13.805 14.383 15.014 15.685 16.454 17.341 18.239 19.297 20.491 21.884 23.389 25.126 27.166 29.502 31.372 32.34 32.861 33.164 33.311 33.343 33.332 33.265 33.132 32.981 32.848 32.699 32.52 32.34 32.163 31.97 31.799 31.649 31.473 31.287 31.13 30.946 30.755 30.604 30.437 30.261 30.084 29.897 29.767 29.634 29.415 29.253 29.078 28.985 28.793 28.581 28.337 28.205 28.027 27.791 27.628 27.454 27.027 26.781 26.522 26.226 25.882 25.409 24.652 22.087 -10 ,27206 ,KEBNE ,17023908,Wed Dec 22 08:43:52 CET,Wed Dec 22 10:07:08 CET,0.0 2.05 2.744 3.218 3.589 3.921 4.215 4.464 4.939 5.161 5.359 5.654 5.905 6.071 6.399 6.718 7.024 7.167 7.428 7.676 8.045 8.289 8.527 8.857 9.158 9.455 9.75 10.026 10.389 10.746 11.089 11.518 11.935 12.33 12.781 13.281 13.774 14.315 14.876 15.483 16.145 16.905 17.783 18.636 19.669 20.874 22.244 23.781 25.635 27.85 30.431 32.444 33.577 34.192 34.488 34.632 34.677 34.624 34.532 34.425 34.3 34.189 34.067 33.903 33.744 33.592 33.426 33.261 33.101 32.931 32.733 32.565 32.39 32.21 32.076 31.93 31.77 31.603 31.404 31.261 31.119 30.887 30.728 30.557 30.462 30.262 30.049 29.81 29.676 29.487 29.232 29.064 28.891 28.503 28.278 28.016 27.715 27.369 26.966 26.378 23.925 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_44.txt deleted file mode 100644 index 1dc7678f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7050 ,KEBNE ,17023909,Wed Dec 22 08:43:52 CET,Wed Dec 22 10:07:10 CET,0.0 0.947 1.427 1.76 2.054 2.305 2.514 2.706 3.04 3.191 3.337 3.545 3.746 3.862 4.067 4.265 4.459 4.55 4.732 4.898 5.131 5.283 5.434 5.637 5.823 6.008 6.182 6.346 6.557 6.748 6.928 7.145 7.348 7.536 7.758 8.023 8.27 8.505 8.738 9.005 9.279 9.559 9.878 10.181 10.509 10.84 11.132 11.415 11.685 11.828 11.676 11.045 10.333 9.657 9.02 8.394 7.87 7.431 7.034 6.602 6.216 5.86 5.523 5.214 4.91 4.629 4.338 4.079 3.861 3.626 3.368 3.15 2.932 2.704 2.518 2.316 2.102 1.876 1.659 1.514 1.356 1.095 0.917 0.742 0.64 0.43 0.218 -0.022 -0.147 -0.351 -0.566 -0.718 -0.878 -1.258 -1.455 -1.658 -1.904 -2.194 -2.51 -2.909 -3.875 -2 ,24711 ,KEBNE ,17023910,Wed Dec 22 08:43:52 CET,Wed Dec 22 10:05:35 CET,0.0 0.953 1.387 1.725 2.026 2.279 2.492 2.694 3.059 3.231 3.389 3.606 3.821 3.948 4.192 4.419 4.625 4.722 4.906 5.083 5.326 5.478 5.629 5.846 6.047 6.234 6.414 6.582 6.79 6.984 7.159 7.382 7.593 7.79 8.018 8.285 8.536 8.784 9.041 9.298 9.554 9.836 10.168 10.501 10.856 11.182 11.484 11.787 12.051 12.153 11.969 11.441 10.789 10.114 9.516 8.984 8.482 8.007 7.587 7.15 6.785 6.462 6.131 5.828 5.555 5.288 4.998 4.739 4.513 4.285 4.043 3.829 3.608 3.375 3.18 2.987 2.794 2.582 2.357 2.206 2.046 1.782 1.604 1.423 1.33 1.14 0.925 0.689 0.568 0.364 0.164 0.013 -0.136 -0.459 -0.65 -0.859 -1.098 -1.388 -1.748 -2.223 -3.342 -3 ,12807 ,KEBNE ,17023911,Wed Dec 22 08:43:52 CET,Wed Dec 22 10:07:18 CET,0.0 1.237 1.72 2.076 2.371 2.62 2.841 3.037 3.385 3.543 3.694 3.876 4.067 4.183 4.419 4.641 4.836 4.925 5.096 5.259 5.492 5.645 5.8 6.018 6.217 6.41 6.594 6.766 6.975 7.171 7.358 7.58 7.805 8.022 8.245 8.479 8.69 8.926 9.185 9.454 9.723 9.992 10.306 10.613 10.935 11.266 11.612 11.935 12.176 12.3 12.104 11.527 10.913 10.297 9.723 9.133 8.59 8.11 7.685 7.253 6.89 6.558 6.236 5.939 5.648 5.374 5.086 4.831 4.604 4.365 4.126 3.924 3.705 3.471 3.283 3.088 2.886 2.668 2.441 2.284 2.122 1.87 1.679 1.474 1.37 1.156 0.933 0.706 0.589 0.382 0.182 0.032 -0.125 -0.444 -0.627 -0.838 -1.094 -1.391 -1.726 -2.166 -3.149 -4 ,11038 ,KEBNE ,17023912,Wed Dec 22 08:43:52 CET,Wed Dec 22 10:05:46 CET,0.0 1.14 1.545 1.849 2.146 2.434 2.68 2.883 3.235 3.386 3.529 3.726 3.936 4.07 4.296 4.498 4.681 4.768 4.952 5.13 5.382 5.535 5.674 5.874 6.066 6.248 6.421 6.587 6.799 7.004 7.195 7.41 7.606 7.78 7.975 8.209 8.441 8.686 8.927 9.187 9.456 9.727 10.031 10.336 10.675 11.027 11.356 11.608 11.84 12.011 11.885 11.338 10.696 10.063 9.466 8.898 8.404 7.961 7.555 7.125 6.747 6.407 6.078 5.779 5.488 5.203 4.905 4.634 4.405 4.175 3.933 3.725 3.507 3.279 3.085 2.877 2.675 2.47 2.256 2.106 1.955 1.722 1.545 1.345 1.241 1.033 0.826 0.594 0.466 0.259 0.046 -0.109 -0.27 -0.597 -0.789 -1.013 -1.265 -1.551 -1.857 -2.244 -3.23 -5 ,1396 ,KEBNE ,17023913,Wed Dec 22 08:43:52 CET,Wed Dec 22 10:06:49 CET,0.0 0.976 1.41 1.725 1.992 2.231 2.449 2.661 3.022 3.185 3.35 3.573 3.786 3.917 4.147 4.351 4.536 4.632 4.825 5.006 5.253 5.401 5.555 5.77 5.973 6.166 6.339 6.514 6.748 6.952 7.146 7.384 7.606 7.814 8.042 8.283 8.508 8.747 9.01 9.268 9.53 9.827 10.14 10.45 10.777 11.091 11.41 11.704 11.931 12.056 11.85 11.257 10.644 10.024 9.447 8.894 8.408 7.955 7.533 7.106 6.738 6.405 6.083 5.776 5.491 5.228 4.93 4.664 4.442 4.204 3.956 3.746 3.532 3.301 3.117 2.927 2.728 2.527 2.308 2.15 1.984 1.728 1.553 1.364 1.263 1.049 0.822 0.584 0.46 0.247 0.035 -0.112 -0.272 -0.62 -0.817 -1.041 -1.295 -1.582 -1.89 -2.321 -3.497 -6 ,30712 ,KEBNE ,17023914,Wed Dec 22 08:43:52 CET,Wed Dec 22 10:07:12 CET,0.0 1.383 1.84 2.151 2.422 2.668 2.89 3.092 3.48 3.644 3.785 3.972 4.168 4.292 4.537 4.765 4.984 5.088 5.276 5.452 5.701 5.862 6.022 6.237 6.426 6.61 6.784 6.945 7.162 7.372 7.571 7.798 8.012 8.213 8.426 8.654 8.873 9.122 9.384 9.658 9.933 10.224 10.547 10.836 11.135 11.438 11.749 12.047 12.302 12.459 12.348 11.856 11.207 10.573 9.974 9.389 8.864 8.385 7.974 7.547 7.171 6.822 6.485 6.181 5.906 5.648 5.373 5.118 4.893 4.658 4.41 4.197 3.974 3.751 3.579 3.399 3.213 3.012 2.782 2.618 2.45 2.177 1.99 1.803 1.701 1.486 1.259 1.021 0.903 0.7 0.507 0.366 0.209 -0.145 -0.337 -0.56 -0.81 -1.09 -1.429 -1.863 -2.973 -7 ,27357 ,KEBNE ,17023915,Wed Dec 22 08:43:52 CET,Wed Dec 22 10:07:01 CET,0.0 1.402 1.823 2.176 2.477 2.705 2.912 3.119 3.494 3.658 3.804 3.995 4.201 4.329 4.565 4.785 4.984 5.079 5.259 5.441 5.689 5.832 5.968 6.166 6.363 6.562 6.753 6.926 7.14 7.332 7.514 7.745 7.952 8.143 8.368 8.622 8.866 9.121 9.391 9.658 9.922 10.205 10.517 10.803 11.108 11.45 11.802 12.12 12.381 12.493 12.333 11.854 11.205 10.558 9.947 9.351 8.84 8.379 7.936 7.476 7.093 6.762 6.451 6.14 5.824 5.53 5.234 4.978 4.766 4.536 4.279 4.076 3.865 3.63 3.448 3.258 3.059 2.855 2.639 2.48 2.312 2.056 1.877 1.691 1.599 1.409 1.209 0.981 0.846 0.633 0.455 0.306 0.143 -0.23 -0.435 -0.662 -0.918 -1.193 -1.532 -1.952 -2.9 -8 ,12637 ,KEBNE ,17023916,Wed Dec 22 08:44:54 CET,Wed Dec 22 10:07:56 CET,0.0 0.972 1.417 1.751 2.043 2.293 2.497 2.683 3.051 3.226 3.381 3.595 3.803 3.924 4.147 4.364 4.566 4.658 4.842 5.016 5.264 5.415 5.553 5.746 5.927 6.109 6.291 6.463 6.677 6.878 7.071 7.296 7.5 7.694 7.916 8.167 8.404 8.645 8.889 9.147 9.419 9.704 10.026 10.322 10.638 10.983 11.322 11.613 11.853 11.982 11.788 11.18 10.484 9.803 9.181 8.613 8.099 7.617 7.209 6.794 6.413 6.062 5.727 5.427 5.145 4.887 4.614 4.36 4.127 3.878 3.629 3.43 3.219 2.993 2.809 2.619 2.43 2.23 2.005 1.851 1.701 1.468 1.304 1.135 1.047 0.853 0.639 0.408 0.282 0.076 -0.111 -0.255 -0.417 -0.769 -0.951 -1.16 -1.395 -1.688 -2.069 -2.559 -3.817 -9 ,11897 ,KEBNE ,17023917,Wed Dec 22 08:44:54 CET,Wed Dec 22 10:07:49 CET,0.0 1.051 1.471 1.806 2.087 2.324 2.533 2.725 3.069 3.229 3.38 3.583 3.794 3.912 4.132 4.333 4.526 4.622 4.802 4.972 5.201 5.339 5.475 5.677 5.873 6.053 6.22 6.373 6.57 6.764 6.942 7.153 7.369 7.57 7.785 8.03 8.26 8.516 8.788 9.043 9.298 9.588 9.91 10.203 10.535 10.906 11.256 11.561 11.825 11.937 11.735 11.169 10.512 9.847 9.203 8.629 8.122 7.642 7.228 6.816 6.461 6.136 5.806 5.487 5.191 4.916 4.631 4.374 4.146 3.911 3.663 3.448 3.228 2.998 2.816 2.619 2.412 2.21 2.001 1.851 1.687 1.425 1.242 1.057 0.964 0.77 0.559 0.318 0.193 -0.01 -0.208 -0.353 -0.503 -0.834 -1.035 -1.26 -1.488 -1.75 -2.079 -2.515 -3.466 -10 ,10861 ,KEBNE ,17023918,Wed Dec 22 08:44:53 CET,Wed Dec 22 10:07:59 CET,0.0 1.263 1.714 2.043 2.341 2.583 2.801 3.002 3.338 3.486 3.638 3.865 4.079 4.215 4.465 4.671 4.865 4.957 5.144 5.315 5.553 5.711 5.856 6.053 6.244 6.436 6.613 6.773 6.987 7.193 7.385 7.614 7.832 8.035 8.266 8.507 8.725 8.975 9.239 9.503 9.772 10.072 10.4 10.694 11.034 11.39 11.746 12.055 12.332 12.535 12.412 11.782 11.044 10.387 9.78 9.176 8.641 8.173 7.77 7.366 7.01 6.67 6.334 6.012 5.715 5.443 5.153 4.896 4.676 4.434 4.18 3.977 3.762 3.53 3.35 3.171 2.98 2.782 2.58 2.435 2.279 2.031 1.856 1.674 1.575 1.361 1.135 0.877 0.744 0.536 0.321 0.162 -0.005 -0.373 -0.578 -0.796 -1.027 -1.288 -1.627 -2.039 -2.934 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_49.txt deleted file mode 100644 index adadc4c6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26582 ,KEBNE ,16677723,Wed Nov 24 21:38:53 CET,Wed Nov 24 23:00:45 CET,0.0 0.857 1.282 1.607 1.87 2.119 2.354 2.56 2.887 3.024 3.156 3.323 3.51 3.611 3.806 4.002 4.2 4.289 4.449 4.609 4.828 4.958 5.087 5.268 5.436 5.601 5.749 5.884 6.061 6.236 6.399 6.587 6.765 6.933 7.125 7.336 7.53 7.715 7.908 8.118 8.337 8.57 8.807 9.016 9.222 9.418 9.562 9.648 9.636 9.346 8.561 7.297 6.106 5.057 4.114 3.252 2.472 1.764 1.152 0.532 0.014 -0.453 -0.907 -1.329 -1.716 -2.07 -2.452 -2.809 -3.107 -3.41 -3.749 -4.021 -4.288 -4.576 -4.803 -5.038 -5.276 -5.511 -5.777 -5.975 -6.173 -6.476 -6.688 -6.921 -7.045 -7.3 -7.558 -7.825 -7.97 -8.21 -8.432 -8.593 -8.766 -9.157 -9.378 -9.626 -9.907 -10.227 -10.603 -11.129 -12.226 -2 ,7976 ,KEBNE ,16677724,Wed Nov 24 21:38:53 CET,Wed Nov 24 23:02:13 CET,0.0 1.081 1.537 1.866 2.131 2.359 2.564 2.745 3.061 3.213 3.36 3.537 3.72 3.832 4.054 4.246 4.414 4.493 4.652 4.81 5.02 5.148 5.27 5.438 5.617 5.782 5.925 6.058 6.234 6.415 6.57 6.743 6.91 7.063 7.238 7.428 7.593 7.768 7.952 8.164 8.402 8.644 8.891 9.103 9.311 9.506 9.668 9.755 9.708 9.41 8.6 7.269 6.057 5.01 4.117 3.281 2.479 1.78 1.203 0.608 0.076 -0.408 -0.856 -1.276 -1.671 -2.038 -2.427 -2.776 -3.079 -3.389 -3.721 -4.004 -4.288 -4.577 -4.8 -5.031 -5.275 -5.535 -5.813 -6.014 -6.22 -6.538 -6.762 -7.0 -7.119 -7.346 -7.584 -7.852 -8.003 -8.247 -8.453 -8.623 -8.808 -9.204 -9.419 -9.668 -9.955 -10.263 -10.64 -11.159 -12.635 -3 ,336 ,KEBNE ,16677725,Wed Nov 24 21:38:53 CET,Wed Nov 24 23:04:57 CET,0.0 0.763 1.147 1.459 1.736 1.956 2.146 2.321 2.621 2.764 2.902 3.062 3.249 3.358 3.566 3.761 3.938 4.025 4.187 4.332 4.534 4.662 4.781 4.954 5.123 5.284 5.441 5.586 5.77 5.947 6.097 6.274 6.46 6.635 6.822 7.04 7.236 7.439 7.642 7.828 8.021 8.233 8.468 8.663 8.845 9.041 9.192 9.231 9.166 8.874 7.932 6.436 5.145 4.05 3.071 2.188 1.45 0.758 0.147 -0.44 -0.947 -1.407 -1.849 -2.271 -2.657 -3.015 -3.387 -3.723 -4.017 -4.321 -4.642 -4.902 -5.177 -5.467 -5.688 -5.924 -6.17 -6.427 -6.701 -6.892 -7.079 -7.371 -7.579 -7.786 -7.9 -8.153 -8.4 -8.657 -8.804 -9.051 -9.306 -9.498 -9.694 -10.102 -10.335 -10.586 -10.857 -11.173 -11.565 -12.106 -13.419 -4 ,2848 ,KEBNE ,16677726,Wed Nov 24 21:39:55 CET,Wed Nov 24 23:02:06 CET,0.0 0.972 1.417 1.752 2.005 2.22 2.425 2.605 2.906 3.056 3.21 3.404 3.595 3.702 3.888 4.062 4.241 4.332 4.516 4.679 4.892 5.035 5.168 5.36 5.549 5.725 5.885 6.041 6.234 6.395 6.555 6.755 6.942 7.104 7.289 7.518 7.718 7.918 8.133 8.346 8.547 8.768 9.007 9.215 9.442 9.655 9.826 9.919 9.835 9.491 8.644 7.439 6.283 5.187 4.235 3.343 2.553 1.851 1.212 0.555 0.008 -0.477 -0.933 -1.361 -1.776 -2.148 -2.527 -2.873 -3.174 -3.49 -3.818 -4.085 -4.367 -4.664 -4.891 -5.12 -5.359 -5.612 -5.887 -6.077 -6.271 -6.58 -6.788 -6.996 -7.102 -7.331 -7.584 -7.848 -7.987 -8.227 -8.455 -8.625 -8.807 -9.189 -9.403 -9.643 -9.915 -10.208 -10.613 -11.208 -12.41 -5 ,16645 ,KEBNE ,16677727,Wed Nov 24 21:39:55 CET,Wed Nov 24 23:03:09 CET,0.0 1.005 1.441 1.748 2.024 2.256 2.448 2.63 2.939 3.08 3.211 3.366 3.548 3.653 3.852 4.039 4.207 4.286 4.448 4.601 4.801 4.921 5.034 5.21 5.388 5.552 5.705 5.851 6.046 6.227 6.381 6.564 6.728 6.88 7.058 7.247 7.425 7.624 7.818 8.001 8.194 8.408 8.633 8.84 9.043 9.221 9.372 9.491 9.468 9.09 8.187 6.928 5.693 4.588 3.632 2.728 1.932 1.231 0.634 0.014 -0.537 -1.036 -1.506 -1.94 -2.341 -2.705 -3.088 -3.421 -3.708 -4.022 -4.352 -4.629 -4.919 -5.208 -5.428 -5.652 -5.895 -6.161 -6.446 -6.646 -6.842 -7.135 -7.335 -7.551 -7.669 -7.915 -8.18 -8.467 -8.611 -8.847 -9.076 -9.245 -9.431 -9.828 -10.041 -10.281 -10.561 -10.885 -11.28 -11.816 -13.18 -6 ,26133 ,KEBNE ,16677728,Wed Nov 24 21:39:54 CET,Wed Nov 24 23:01:43 CET,0.0 1.176 1.568 1.854 2.098 2.348 2.573 2.757 3.08 3.221 3.347 3.511 3.702 3.813 4.02 4.219 4.401 4.486 4.645 4.791 4.99 5.121 5.255 5.433 5.591 5.751 5.905 6.052 6.242 6.415 6.579 6.77 6.941 7.095 7.269 7.464 7.651 7.831 8.018 8.216 8.406 8.608 8.842 9.044 9.253 9.476 9.631 9.698 9.667 9.389 8.613 7.382 6.203 5.131 4.173 3.296 2.519 1.821 1.189 0.539 -0.014 -0.507 -0.99 -1.435 -1.824 -2.184 -2.56 -2.889 -3.19 -3.502 -3.816 -4.07 -4.328 -4.607 -4.836 -5.073 -5.32 -5.578 -5.842 -6.024 -6.215 -6.513 -6.72 -6.938 -7.056 -7.309 -7.571 -7.841 -7.984 -8.222 -8.449 -8.618 -8.791 -9.183 -9.428 -9.685 -9.953 -10.295 -10.692 -11.174 -12.567 -7 ,31127 ,KEBNE ,16677729,Wed Nov 24 21:39:55 CET,Wed Nov 24 23:02:51 CET,0.0 0.844 1.281 1.614 1.882 2.112 2.312 2.5 2.857 3.005 3.135 3.302 3.488 3.596 3.791 3.969 4.157 4.251 4.418 4.569 4.795 4.946 5.077 5.251 5.417 5.573 5.721 5.861 6.035 6.202 6.361 6.54 6.712 6.874 7.062 7.285 7.478 7.676 7.892 8.085 8.265 8.483 8.719 8.913 9.084 9.221 9.36 9.424 9.362 9.087 8.292 6.904 5.604 4.51 3.566 2.705 1.946 1.265 0.655 0.033 -0.485 -0.943 -1.39 -1.823 -2.22 -2.583 -2.978 -3.34 -3.637 -3.939 -4.253 -4.506 -4.783 -5.08 -5.315 -5.559 -5.813 -6.081 -6.352 -6.536 -6.725 -7.025 -7.243 -7.471 -7.592 -7.846 -8.112 -8.398 -8.542 -8.774 -8.994 -9.163 -9.35 -9.768 -9.997 -10.266 -10.56 -10.874 -11.252 -11.733 -13.066 -8 ,4420 ,KEBNE ,16677730,Wed Nov 24 21:39:58 CET,Wed Nov 24 23:00:03 CET,0.0 0.853 1.273 1.576 1.837 2.06 2.255 2.424 2.717 2.85 2.971 3.144 3.336 3.445 3.666 3.876 4.062 4.146 4.304 4.454 4.672 4.804 4.936 5.12 5.277 5.435 5.591 5.736 5.914 6.078 6.239 6.423 6.587 6.737 6.913 7.11 7.297 7.504 7.721 7.925 8.119 8.335 8.567 8.77 8.968 9.157 9.3 9.358 9.327 9.071 8.246 7.037 5.867 4.737 3.749 2.854 2.047 1.326 0.724 0.1 -0.455 -0.929 -1.372 -1.802 -2.216 -2.6 -3.004 -3.35 -3.637 -3.941 -4.262 -4.519 -4.778 -5.054 -5.281 -5.528 -5.781 -6.033 -6.297 -6.479 -6.663 -6.958 -7.179 -7.415 -7.529 -7.763 -8.017 -8.284 -8.431 -8.671 -8.89 -9.065 -9.255 -9.649 -9.865 -10.108 -10.379 -10.701 -11.109 -11.602 -12.933 -9 ,30542 ,KEBNE ,16677731,Wed Nov 24 21:39:55 CET,Wed Nov 24 23:02:00 CET,0.0 1.055 1.473 1.795 2.049 2.269 2.462 2.641 2.966 3.103 3.226 3.367 3.54 3.638 3.834 4.024 4.207 4.293 4.45 4.599 4.817 4.953 5.081 5.265 5.438 5.596 5.739 5.87 6.049 6.231 6.397 6.591 6.776 6.945 7.139 7.35 7.534 7.728 7.945 8.167 8.381 8.6 8.839 9.066 9.288 9.489 9.654 9.73 9.676 9.4 8.629 7.374 6.172 5.132 4.191 3.304 2.531 1.84 1.228 0.615 0.09 -0.374 -0.813 -1.236 -1.637 -1.997 -2.359 -2.682 -2.988 -3.306 -3.624 -3.893 -4.181 -4.486 -4.714 -4.938 -5.175 -5.434 -5.711 -5.897 -6.084 -6.375 -6.584 -6.806 -6.923 -7.162 -7.408 -7.678 -7.82 -8.06 -8.299 -8.47 -8.656 -9.079 -9.304 -9.534 -9.802 -10.124 -10.52 -11.041 -12.33 -10 ,27272 ,KEBNE ,16677732,Wed Nov 24 21:39:54 CET,Wed Nov 24 23:02:08 CET,0.0 0.851 1.248 1.565 1.824 2.05 2.245 2.409 2.719 2.869 3.012 3.186 3.382 3.497 3.702 3.893 4.075 4.161 4.324 4.469 4.678 4.821 4.954 5.142 5.322 5.497 5.667 5.815 5.993 6.166 6.347 6.551 6.726 6.895 7.091 7.301 7.478 7.665 7.871 8.061 8.265 8.489 8.704 8.911 9.126 9.307 9.446 9.535 9.519 9.255 8.491 7.198 5.992 4.935 3.967 3.067 2.279 1.589 0.985 0.368 -0.157 -0.62 -1.054 -1.453 -1.824 -2.173 -2.547 -2.874 -3.158 -3.462 -3.786 -4.061 -4.341 -4.633 -4.857 -5.087 -5.329 -5.578 -5.849 -6.039 -6.23 -6.525 -6.737 -6.966 -7.086 -7.347 -7.621 -7.903 -8.054 -8.296 -8.514 -8.689 -8.878 -9.293 -9.526 -9.773 -10.053 -10.37 -10.774 -11.291 -12.731 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_58.txt deleted file mode 100644 index cf57ff87..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19045 ,KEBNE ,17023919,Wed Dec 22 08:44:54 CET,Wed Dec 22 10:07:13 CET,0.0 1.262 1.723 2.065 2.36 2.617 2.846 3.047 3.375 3.522 3.673 3.894 4.104 4.229 4.462 4.671 4.877 4.979 5.165 5.343 5.594 5.743 5.877 6.071 6.257 6.423 6.595 6.755 6.945 7.136 7.325 7.548 7.755 7.948 8.158 8.386 8.607 8.833 9.063 9.302 9.532 9.765 10.024 10.266 10.535 10.806 11.059 11.278 11.398 11.266 10.656 9.567 8.509 7.578 6.802 6.106 5.486 4.895 4.366 3.856 3.413 3.022 2.634 2.263 1.928 1.625 1.31 1.029 0.78 0.51 0.232 0.0 -0.234 -0.47 -0.658 -0.862 -1.078 -1.302 -1.548 -1.718 -1.879 -2.138 -2.318 -2.495 -2.591 -2.787 -2.994 -3.23 -3.355 -3.567 -3.771 -3.929 -4.089 -4.427 -4.62 -4.836 -5.07 -5.347 -5.668 -6.072 -7.233 -2 ,12591 ,KEBNE ,17023920,Wed Dec 22 08:44:54 CET,Wed Dec 22 10:07:18 CET,0.0 1.531 2.001 2.328 2.615 2.869 3.101 3.312 3.687 3.861 4.02 4.234 4.443 4.561 4.787 5.016 5.224 5.319 5.512 5.697 5.947 6.1 6.245 6.443 6.628 6.807 6.974 7.131 7.333 7.527 7.72 7.946 8.145 8.334 8.547 8.795 9.023 9.256 9.506 9.776 10.046 10.324 10.648 10.961 11.269 11.558 11.809 11.974 12.031 11.882 11.272 10.252 9.272 8.368 7.536 6.796 6.176 5.58 5.07 4.569 4.127 3.729 3.344 2.988 2.655 2.33 1.981 1.689 1.434 1.16 0.879 0.656 0.43 0.185 -0.01 -0.21 -0.409 -0.631 -0.873 -1.033 -1.195 -1.45 -1.628 -1.817 -1.918 -2.131 -2.349 -2.586 -2.713 -2.929 -3.126 -3.271 -3.427 -3.787 -3.996 -4.209 -4.433 -4.702 -5.064 -5.588 -6.739 -3 ,5684 ,KEBNE ,17023921,Wed Dec 22 08:44:54 CET,Wed Dec 22 10:07:00 CET,0.0 1.496 1.97 2.323 2.614 2.87 3.083 3.279 3.645 3.805 3.946 4.138 4.346 4.466 4.686 4.906 5.113 5.208 5.389 5.558 5.805 5.965 6.114 6.331 6.537 6.727 6.903 7.077 7.296 7.491 7.675 7.898 8.112 8.311 8.522 8.749 8.979 9.221 9.464 9.711 9.969 10.245 10.529 10.813 11.113 11.405 11.714 11.932 12.017 11.95 11.402 10.382 9.447 8.554 7.77 7.072 6.412 5.802 5.285 4.795 4.382 4.003 3.635 3.287 2.965 2.661 2.325 2.026 1.781 1.53 1.266 1.038 0.797 0.542 0.341 0.136 -0.079 -0.303 -0.54 -0.707 -0.877 -1.136 -1.322 -1.514 -1.611 -1.809 -2.023 -2.264 -2.394 -2.611 -2.813 -2.961 -3.114 -3.462 -3.654 -3.86 -4.107 -4.405 -4.765 -5.218 -6.314 -4 ,2297 ,KEBNE ,17023922,Wed Dec 22 08:44:54 CET,Wed Dec 22 10:06:48 CET,0.0 1.234 1.73 2.093 2.388 2.647 2.884 3.098 3.481 3.644 3.781 3.97 4.179 4.305 4.541 4.753 4.943 5.04 5.237 5.416 5.662 5.821 5.969 6.172 6.37 6.567 6.74 6.894 7.092 7.285 7.475 7.708 7.924 8.128 8.357 8.595 8.806 9.028 9.263 9.509 9.765 10.025 10.302 10.567 10.845 11.119 11.398 11.597 11.685 11.585 11.093 10.269 9.396 8.529 7.736 7.001 6.34 5.748 5.245 4.726 4.271 3.86 3.468 3.107 2.769 2.458 2.137 1.854 1.6 1.329 1.052 0.815 0.571 0.318 0.119 -0.089 -0.296 -0.498 -0.711 -0.862 -1.025 -1.278 -1.453 -1.645 -1.745 -1.938 -2.149 -2.384 -2.512 -2.725 -2.926 -3.081 -3.241 -3.571 -3.741 -3.922 -4.131 -4.384 -4.71 -5.141 -6.455 -5 ,10988 ,KEBNE ,17023923,Wed Dec 22 08:44:54 CET,Wed Dec 22 10:07:19 CET,0.0 1.043 1.531 1.911 2.232 2.512 2.743 2.95 3.316 3.482 3.632 3.831 4.041 4.169 4.414 4.632 4.825 4.921 5.101 5.267 5.514 5.678 5.833 6.046 6.239 6.427 6.614 6.79 6.998 7.195 7.399 7.632 7.831 8.023 8.252 8.495 8.719 8.967 9.234 9.495 9.752 10.043 10.36 10.629 10.864 11.115 11.411 11.631 11.741 11.599 11.064 10.2 9.274 8.401 7.626 6.911 6.283 5.735 5.263 4.788 4.361 3.971 3.6 3.227 2.87 2.543 2.205 1.916 1.667 1.413 1.146 0.92 0.686 0.431 0.223 0.014 -0.196 -0.411 -0.649 -0.82 -0.997 -1.264 -1.443 -1.638 -1.737 -1.94 -2.167 -2.402 -2.522 -2.729 -2.899 -3.043 -3.206 -3.561 -3.757 -3.977 -4.228 -4.54 -4.899 -5.336 -6.356 -6 ,19185 ,KEBNE ,17023924,Wed Dec 22 08:44:54 CET,Wed Dec 22 10:07:28 CET,0.0 1.131 1.612 2.001 2.307 2.553 2.771 2.977 3.35 3.507 3.65 3.856 4.067 4.19 4.429 4.657 4.858 4.952 5.129 5.297 5.549 5.716 5.868 6.069 6.26 6.44 6.617 6.792 7.006 7.208 7.404 7.634 7.841 8.04 8.272 8.53 8.762 8.992 9.233 9.485 9.74 10.004 10.295 10.57 10.863 11.152 11.436 11.689 11.81 11.711 11.158 10.092 9.069 8.143 7.302 6.551 5.89 5.306 4.834 4.346 3.9 3.515 3.147 2.791 2.466 2.177 1.866 1.569 1.321 1.071 0.804 0.575 0.337 0.098 -0.093 -0.299 -0.516 -0.741 -0.97 -1.128 -1.295 -1.55 -1.731 -1.925 -2.035 -2.273 -2.501 -2.737 -2.859 -3.063 -3.25 -3.401 -3.559 -3.902 -4.088 -4.297 -4.515 -4.768 -5.111 -5.584 -6.639 -7 ,16385 ,KEBNE ,17023925,Wed Dec 22 08:44:54 CET,Wed Dec 22 10:08:46 CET,0.0 1.603 2.118 2.485 2.785 3.028 3.254 3.466 3.84 4.012 4.169 4.35 4.543 4.654 4.864 5.073 5.265 5.354 5.532 5.713 5.972 6.124 6.258 6.457 6.654 6.841 7.016 7.178 7.397 7.602 7.782 7.99 8.185 8.372 8.576 8.815 9.055 9.304 9.567 9.831 10.071 10.32 10.626 10.915 11.239 11.567 11.849 12.074 12.187 12.058 11.541 10.582 9.602 8.722 7.937 7.218 6.588 6.002 5.488 4.984 4.536 4.129 3.758 3.401 3.047 2.732 2.422 2.135 1.88 1.607 1.316 1.085 0.848 0.603 0.414 0.207 -0.001 -0.211 -0.435 -0.592 -0.758 -1.026 -1.21 -1.391 -1.484 -1.675 -1.894 -2.143 -2.272 -2.49 -2.707 -2.866 -3.028 -3.371 -3.563 -3.771 -4.029 -4.337 -4.68 -5.097 -6.003 -8 ,16614 ,KEBNE ,17023926,Wed Dec 22 08:44:54 CET,Wed Dec 22 10:08:44 CET,0.0 1.555 2.047 2.418 2.719 2.958 3.159 3.359 3.732 3.897 4.048 4.239 4.439 4.561 4.772 4.958 5.145 5.234 5.401 5.564 5.801 5.949 6.086 6.304 6.514 6.694 6.865 7.039 7.254 7.449 7.641 7.866 8.071 8.264 8.484 8.713 8.933 9.171 9.422 9.681 9.947 10.214 10.495 10.772 11.069 11.362 11.64 11.852 11.93 11.798 11.247 10.291 9.314 8.424 7.64 6.902 6.262 5.676 5.159 4.66 4.241 3.829 3.423 3.063 2.734 2.415 2.076 1.786 1.541 1.29 1.032 0.812 0.567 0.307 0.109 -0.091 -0.299 -0.527 -0.764 -0.919 -1.08 -1.34 -1.527 -1.723 -1.826 -2.036 -2.242 -2.466 -2.591 -2.812 -3.014 -3.166 -3.321 -3.649 -3.829 -4.037 -4.287 -4.569 -4.912 -5.345 -6.417 -9 ,30120 ,KEBNE ,17023927,Wed Dec 22 08:45:55 CET,Wed Dec 22 10:07:53 CET,0.0 1.337 1.851 2.216 2.508 2.752 2.973 3.167 3.503 3.669 3.831 4.031 4.23 4.352 4.576 4.779 4.983 5.077 5.251 5.422 5.678 5.833 5.978 6.179 6.362 6.547 6.743 6.92 7.126 7.334 7.523 7.749 7.964 8.164 8.385 8.611 8.818 9.05 9.302 9.554 9.812 10.099 10.408 10.693 10.979 11.231 11.486 11.647 11.698 11.645 11.191 10.222 9.235 8.352 7.57 6.879 6.254 5.678 5.18 4.652 4.207 3.824 3.457 3.114 2.788 2.49 2.178 1.9 1.659 1.409 1.139 0.912 0.675 0.421 0.228 0.035 -0.179 -0.402 -0.622 -0.784 -0.968 -1.244 -1.436 -1.638 -1.741 -1.963 -2.195 -2.438 -2.564 -2.777 -2.976 -3.129 -3.294 -3.68 -3.897 -4.119 -4.358 -4.645 -5.004 -5.477 -6.451 -10 ,2219 ,KEBNE ,17023928,Wed Dec 22 08:45:55 CET,Wed Dec 22 10:08:03 CET,0.0 1.385 1.832 2.182 2.466 2.699 2.888 3.074 3.408 3.552 3.691 3.88 4.083 4.195 4.402 4.609 4.806 4.903 5.086 5.258 5.516 5.678 5.828 6.031 6.214 6.39 6.564 6.734 6.946 7.143 7.332 7.548 7.744 7.925 8.134 8.379 8.605 8.828 9.055 9.296 9.539 9.805 10.105 10.392 10.689 10.99 11.264 11.492 11.658 11.564 11.055 10.117 9.085 8.183 7.426 6.688 5.995 5.367 4.837 4.306 3.839 3.429 3.045 2.679 2.335 2.026 1.707 1.415 1.163 0.894 0.619 0.394 0.153 -0.099 -0.296 -0.495 -0.701 -0.921 -1.144 -1.291 -1.446 -1.697 -1.871 -2.061 -2.166 -2.381 -2.604 -2.846 -2.968 -3.171 -3.35 -3.498 -3.667 -4.02 -4.203 -4.415 -4.655 -4.916 -5.204 -5.679 -6.781 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_63.txt deleted file mode 100644 index 5497cfc4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20618 ,KEBNE ,17043765,Thu Dec 23 05:19:48 CET,Thu Dec 23 06:42:48 CET,0.0 1.207 1.635 1.953 2.238 2.472 2.683 2.87 3.204 3.354 3.492 3.692 3.899 4.018 4.233 4.429 4.612 4.702 4.877 5.05 5.286 5.42 5.557 5.759 5.947 6.113 6.268 6.424 6.614 6.786 6.951 7.147 7.334 7.515 7.716 7.928 8.129 8.35 8.582 8.831 9.083 9.346 9.643 9.904 10.145 10.398 10.648 10.807 10.899 10.907 10.646 9.977 9.281 8.609 7.957 7.36 6.845 6.396 6.004 5.619 5.281 4.949 4.615 4.304 4.023 3.766 3.486 3.234 3.021 2.785 2.525 2.311 2.093 1.864 1.695 1.533 1.355 1.157 0.946 0.794 0.64 0.415 0.253 0.087 0.0 -0.187 -0.39 -0.599 -0.706 -0.902 -1.078 -1.216 -1.361 -1.682 -1.863 -2.055 -2.291 -2.591 -2.972 -3.437 -4.295 -2 ,4702 ,KEBNE ,17043766,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 06:43:17 CET,0.0 0.963 1.434 1.78 2.062 2.301 2.52 2.728 3.098 3.266 3.433 3.655 3.854 3.967 4.176 4.369 4.553 4.641 4.803 4.955 5.186 5.343 5.491 5.69 5.864 6.031 6.197 6.359 6.558 6.746 6.922 7.102 7.268 7.427 7.617 7.825 8.033 8.266 8.491 8.73 8.974 9.225 9.526 9.815 10.092 10.366 10.629 10.834 10.998 11.042 10.785 10.173 9.472 8.78 8.165 7.615 7.127 6.672 6.254 5.815 5.44 5.123 4.796 4.48 4.202 3.943 3.667 3.411 3.197 2.977 2.737 2.537 2.334 2.124 1.964 1.792 1.604 1.407 1.185 1.031 0.879 0.646 0.488 0.322 0.235 0.061 -0.13 -0.341 -0.451 -0.641 -0.8 -0.935 -1.092 -1.445 -1.635 -1.833 -2.038 -2.28 -2.598 -2.978 -3.936 -3 ,9019 ,KEBNE ,17043767,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 06:41:30 CET,0.0 1.061 1.475 1.76 2.002 2.222 2.422 2.609 2.972 3.134 3.279 3.461 3.649 3.759 3.96 4.156 4.351 4.436 4.597 4.761 4.983 5.122 5.256 5.449 5.638 5.811 5.978 6.137 6.328 6.515 6.7 6.909 7.102 7.292 7.52 7.764 7.963 8.166 8.396 8.638 8.876 9.131 9.42 9.693 9.983 10.263 10.528 10.776 10.94 10.904 10.512 9.799 9.114 8.471 7.867 7.305 6.811 6.352 5.942 5.521 5.155 4.836 4.536 4.245 3.964 3.707 3.432 3.187 2.972 2.735 2.49 2.286 2.068 1.83 1.65 1.475 1.295 1.106 0.895 0.749 0.597 0.358 0.199 0.032 -0.061 -0.255 -0.454 -0.676 -0.793 -0.995 -1.184 -1.326 -1.467 -1.777 -1.957 -2.157 -2.374 -2.611 -2.887 -3.29 -4.287 -4 ,8563 ,KEBNE ,17043768,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 06:42:34 CET,0.0 1.001 1.442 1.762 2.023 2.253 2.491 2.703 3.03 3.183 3.33 3.496 3.679 3.788 3.998 4.198 4.381 4.472 4.648 4.803 5.031 5.177 5.312 5.511 5.7 5.87 6.026 6.181 6.381 6.561 6.725 6.913 7.093 7.274 7.476 7.698 7.906 8.131 8.363 8.593 8.824 9.068 9.347 9.626 9.887 10.098 10.304 10.507 10.661 10.68 10.424 9.77 9.042 8.352 7.739 7.173 6.673 6.215 5.8 5.38 5.021 4.668 4.324 4.019 3.737 3.468 3.195 2.952 2.736 2.513 2.265 2.06 1.857 1.63 1.439 1.24 1.051 0.866 0.666 0.525 0.38 0.15 -0.015 -0.187 -0.277 -0.46 -0.649 -0.85 -0.957 -1.152 -1.329 -1.464 -1.605 -1.941 -2.14 -2.345 -2.555 -2.802 -3.107 -3.477 -4.385 -5 ,3184 ,KEBNE ,17043769,Thu Dec 23 05:19:48 CET,Thu Dec 23 06:41:27 CET,0.0 1.196 1.651 2.006 2.315 2.55 2.738 2.92 3.229 3.368 3.509 3.702 3.911 4.032 4.235 4.431 4.618 4.706 4.868 5.013 5.223 5.358 5.493 5.681 5.853 6.024 6.196 6.358 6.553 6.74 6.918 7.122 7.312 7.478 7.666 7.883 8.072 8.277 8.494 8.719 8.954 9.217 9.497 9.74 9.992 10.247 10.507 10.734 10.928 10.956 10.625 9.912 9.183 8.526 7.913 7.32 6.778 6.279 5.861 5.458 5.089 4.743 4.412 4.103 3.83 3.57 3.273 3.02 2.807 2.574 2.329 2.132 1.932 1.719 1.554 1.375 1.188 1.002 0.798 0.653 0.499 0.26 0.097 -0.075 -0.161 -0.335 -0.529 -0.749 -0.861 -1.053 -1.229 -1.369 -1.53 -1.888 -2.087 -2.302 -2.532 -2.797 -3.105 -3.523 -4.496 -6 ,12566 ,KEBNE ,17043770,Thu Dec 23 05:19:48 CET,Thu Dec 23 06:41:27 CET,0.0 1.086 1.503 1.808 2.043 2.254 2.465 2.662 2.999 3.144 3.285 3.477 3.673 3.782 3.983 4.186 4.4 4.499 4.672 4.838 5.069 5.209 5.345 5.54 5.713 5.881 6.048 6.212 6.42 6.61 6.791 6.989 7.174 7.365 7.594 7.825 8.023 8.238 8.461 8.71 8.961 9.204 9.484 9.744 10.023 10.311 10.583 10.85 11.06 11.094 10.773 9.979 9.187 8.469 7.85 7.283 6.738 6.242 5.825 5.405 5.04 4.703 4.386 4.087 3.798 3.545 3.286 3.053 2.849 2.624 2.382 2.185 1.975 1.759 1.599 1.429 1.252 1.058 0.857 0.714 0.559 0.326 0.158 -0.018 -0.108 -0.306 -0.514 -0.73 -0.84 -1.034 -1.216 -1.361 -1.512 -1.855 -2.056 -2.267 -2.499 -2.759 -3.057 -3.452 -4.303 -7 ,21333 ,KEBNE ,17043771,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 06:42:51 CET,0.0 0.928 1.316 1.614 1.851 2.062 2.254 2.421 2.72 2.862 3.001 3.192 3.39 3.503 3.734 3.942 4.124 4.215 4.393 4.569 4.812 4.953 5.087 5.283 5.464 5.631 5.792 5.94 6.125 6.307 6.476 6.674 6.873 7.067 7.292 7.525 7.729 7.944 8.167 8.399 8.642 8.895 9.172 9.439 9.725 9.998 10.286 10.517 10.646 10.626 10.278 9.553 8.75 8.041 7.447 6.897 6.393 5.93 5.522 5.086 4.696 4.357 4.046 3.752 3.473 3.216 2.929 2.671 2.454 2.219 1.972 1.77 1.551 1.329 1.165 0.991 0.814 0.632 0.435 0.293 0.143 -0.101 -0.277 -0.461 -0.551 -0.737 -0.936 -1.142 -1.254 -1.448 -1.631 -1.769 -1.903 -2.21 -2.381 -2.563 -2.76 -2.987 -3.256 -3.579 -4.4 -8 ,28823 ,KEBNE ,17043772,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 06:41:38 CET,0.0 1.219 1.633 1.954 2.243 2.494 2.713 2.911 3.247 3.398 3.537 3.721 3.923 4.05 4.306 4.531 4.715 4.802 4.974 5.147 5.376 5.512 5.649 5.851 6.037 6.205 6.372 6.532 6.735 6.923 7.089 7.29 7.482 7.66 7.867 8.096 8.318 8.554 8.784 9.022 9.251 9.485 9.768 10.014 10.272 10.576 10.864 11.115 11.346 11.409 11.119 10.415 9.646 8.999 8.417 7.851 7.367 6.933 6.556 6.171 5.806 5.456 5.132 4.83 4.535 4.261 3.985 3.735 3.522 3.298 3.057 2.848 2.627 2.406 2.239 2.066 1.882 1.691 1.492 1.361 1.219 0.988 0.836 0.664 0.568 0.37 0.171 -0.047 -0.167 -0.37 -0.552 -0.687 -0.826 -1.133 -1.31 -1.527 -1.776 -2.052 -2.363 -2.817 -3.757 -9 ,22246 ,KEBNE ,17043773,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 06:41:16 CET,0.0 1.003 1.426 1.768 2.049 2.307 2.524 2.706 3.042 3.194 3.33 3.504 3.697 3.804 3.996 4.189 4.384 4.476 4.647 4.803 5.019 5.161 5.3 5.496 5.674 5.854 6.024 6.176 6.372 6.557 6.731 6.949 7.155 7.336 7.538 7.762 7.98 8.219 8.444 8.637 8.848 9.117 9.413 9.666 9.952 10.253 10.555 10.763 10.877 10.917 10.613 9.898 9.143 8.461 7.854 7.292 6.772 6.293 5.88 5.455 5.094 4.759 4.429 4.132 3.857 3.599 3.327 3.077 2.853 2.615 2.373 2.166 1.949 1.723 1.547 1.376 1.2 1.013 0.804 0.655 0.506 0.269 0.104 -0.073 -0.166 -0.353 -0.544 -0.751 -0.867 -1.068 -1.272 -1.423 -1.577 -1.916 -2.09 -2.271 -2.485 -2.741 -3.03 -3.356 -4.24 -10 ,12939 ,KEBNE ,17043774,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 06:42:28 CET,0.0 1.16 1.633 1.991 2.275 2.509 2.714 2.909 3.277 3.439 3.578 3.751 3.941 4.059 4.285 4.484 4.673 4.762 4.94 5.104 5.334 5.481 5.622 5.827 6.015 6.184 6.341 6.489 6.664 6.83 6.996 7.202 7.409 7.592 7.785 7.999 8.197 8.424 8.662 8.915 9.165 9.384 9.623 9.866 10.134 10.41 10.668 10.888 11.039 11.029 10.708 10.022 9.292 8.607 8.004 7.456 6.956 6.488 6.076 5.662 5.298 4.969 4.676 4.386 4.103 3.851 3.577 3.32 3.097 2.872 2.646 2.452 2.246 2.04 1.879 1.707 1.518 1.321 1.104 0.95 0.791 0.54 0.371 0.203 0.121 -0.062 -0.268 -0.477 -0.59 -0.791 -0.952 -1.093 -1.256 -1.603 -1.792 -1.991 -2.224 -2.494 -2.787 -3.184 -4.125 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_62.txt deleted file mode 100644 index 17f87399..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19278 ,KEBNE ,16675459,Wed Nov 24 04:47:15 CET,Wed Nov 24 06:08:47 CET,0.0 0.977 1.371 1.665 1.907 2.109 2.299 2.469 2.799 2.965 3.11 3.293 3.493 3.603 3.808 4.011 4.211 4.301 4.469 4.634 4.873 5.025 5.174 5.384 5.569 5.745 5.927 6.1 6.312 6.514 6.706 6.932 7.152 7.36 7.598 7.87 8.138 8.426 8.726 9.048 9.365 9.705 10.106 10.5 10.967 11.49 12.043 12.643 13.315 13.998 14.627 14.901 14.875 14.727 14.513 14.249 13.953 13.653 13.387 13.11 12.862 12.622 12.374 12.148 11.966 11.785 11.569 11.374 11.181 10.977 10.768 10.576 10.383 10.189 10.031 9.876 9.718 9.543 9.354 9.22 9.082 8.863 8.703 8.537 8.452 8.262 8.047 7.821 7.705 7.514 7.346 7.196 7.033 6.702 6.523 6.333 6.11 5.839 5.481 5.017 3.984 -2 ,137 ,KEBNE ,16675460,Wed Nov 24 04:47:16 CET,Wed Nov 24 06:08:31 CET,0.0 1.072 1.486 1.788 2.03 2.246 2.451 2.636 2.943 3.096 3.251 3.452 3.661 3.779 3.976 4.159 4.34 4.43 4.599 4.759 4.992 5.136 5.277 5.482 5.678 5.867 6.051 6.225 6.435 6.638 6.837 7.081 7.313 7.532 7.783 8.057 8.313 8.592 8.896 9.214 9.545 9.914 10.347 10.767 11.249 11.781 12.358 12.971 13.63 14.375 15.074 15.272 15.2 15.05 14.825 14.575 14.308 14.018 13.752 13.485 13.248 13.025 12.801 12.57 12.353 12.158 11.955 11.766 11.581 11.371 11.151 10.976 10.791 10.598 10.45 10.288 10.106 9.923 9.739 9.61 9.474 9.237 9.073 8.9 8.808 8.619 8.408 8.17 8.043 7.842 7.647 7.494 7.34 7.017 6.833 6.615 6.374 6.119 5.814 5.413 4.417 -3 ,29055 ,KEBNE ,16675461,Wed Nov 24 04:47:15 CET,Wed Nov 24 06:09:00 CET,0.0 1.089 1.548 1.87 2.127 2.35 2.55 2.724 3.039 3.188 3.325 3.503 3.702 3.821 4.052 4.255 4.443 4.532 4.696 4.855 5.085 5.224 5.361 5.567 5.761 5.943 6.117 6.292 6.519 6.734 6.935 7.168 7.395 7.621 7.875 8.151 8.408 8.684 8.978 9.283 9.598 9.944 10.334 10.736 11.225 11.742 12.308 12.97 13.707 14.445 15.142 15.412 15.356 15.194 15.0 14.751 14.442 14.135 13.874 13.59 13.346 13.111 12.876 12.636 12.39 12.17 11.945 11.74 11.552 11.352 11.156 10.988 10.811 10.625 10.481 10.331 10.17 9.995 9.8 9.662 9.51 9.27 9.113 8.948 8.863 8.695 8.511 8.301 8.178 7.974 7.76 7.592 7.431 7.102 6.915 6.71 6.473 6.203 5.866 5.409 4.134 -4 ,17267 ,KEBNE ,16675462,Wed Nov 24 04:47:15 CET,Wed Nov 24 06:08:38 CET,0.0 1.017 1.482 1.837 2.107 2.32 2.522 2.712 3.049 3.196 3.326 3.485 3.689 3.806 4.018 4.222 4.413 4.502 4.675 4.837 5.066 5.215 5.356 5.555 5.741 5.918 6.094 6.268 6.483 6.686 6.889 7.133 7.356 7.566 7.816 8.107 8.381 8.664 8.962 9.289 9.616 9.962 10.384 10.802 11.274 11.787 12.355 12.988 13.694 14.426 15.081 15.31 15.303 15.223 15.058 14.818 14.576 14.347 14.102 13.842 13.616 13.383 13.143 12.915 12.695 12.49 12.268 12.08 11.926 11.743 11.538 11.371 11.188 10.987 10.831 10.675 10.503 10.32 10.14 10.015 9.88 9.657 9.489 9.313 9.223 9.025 8.811 8.599 8.49 8.299 8.121 7.979 7.824 7.459 7.254 7.042 6.782 6.45 6.074 5.579 4.338 -5 ,2419 ,KEBNE ,16677737,Wed Nov 24 21:41:00 CET,Wed Nov 24 23:02:13 CET,0.0 0.906 1.291 1.574 1.806 2.013 2.201 2.369 2.656 2.799 2.954 3.168 3.371 3.49 3.712 3.911 4.102 4.191 4.361 4.526 4.754 4.901 5.048 5.258 5.458 5.642 5.816 5.982 6.191 6.389 6.583 6.822 7.049 7.266 7.519 7.786 8.03 8.322 8.656 8.993 9.305 9.648 10.057 10.477 10.947 11.441 12.025 12.661 13.347 14.06 14.752 15.047 15.026 14.911 14.727 14.456 14.172 13.899 13.636 13.348 13.095 12.871 12.644 12.408 12.176 11.96 11.726 11.518 11.341 11.146 10.937 10.758 10.573 10.387 10.237 10.079 9.907 9.727 9.545 9.416 9.276 9.047 8.886 8.719 8.631 8.432 8.234 8.029 7.911 7.713 7.524 7.387 7.246 6.882 6.676 6.464 6.223 5.932 5.6 5.122 4.071 -6 ,29467 ,KEBNE ,16677738,Wed Nov 24 21:45:05 CET,Wed Nov 24 23:08:29 CET,0.0 1.224 1.626 1.95 2.221 2.438 2.639 2.818 3.121 3.255 3.378 3.529 3.719 3.827 4.042 4.237 4.416 4.507 4.681 4.847 5.084 5.233 5.376 5.583 5.766 5.948 6.132 6.295 6.512 6.722 6.927 7.184 7.413 7.624 7.863 8.129 8.377 8.644 8.944 9.277 9.621 9.987 10.411 10.843 11.328 11.836 12.404 13.001 13.666 14.364 14.969 15.222 15.201 15.004 14.751 14.489 14.211 13.928 13.662 13.401 13.174 12.945 12.714 12.489 12.272 12.064 11.849 11.656 11.48 11.293 11.106 10.953 10.779 10.586 10.429 10.262 10.095 9.919 9.724 9.584 9.442 9.206 9.035 8.868 8.784 8.594 8.37 8.141 8.022 7.819 7.608 7.464 7.326 7.0 6.82 6.621 6.383 6.114 5.782 5.364 4.222 -7 ,20299 ,KEBNE ,16677739,Wed Nov 24 21:45:05 CET,Wed Nov 24 23:09:10 CET,0.0 1.023 1.408 1.695 1.929 2.134 2.33 2.506 2.811 2.968 3.112 3.271 3.465 3.574 3.784 3.973 4.156 4.25 4.429 4.607 4.846 4.996 5.142 5.338 5.535 5.734 5.918 6.086 6.297 6.498 6.692 6.927 7.148 7.357 7.598 7.879 8.146 8.432 8.734 9.047 9.378 9.748 10.177 10.625 11.112 11.623 12.199 12.792 13.432 14.125 14.769 15.089 15.066 14.898 14.702 14.462 14.215 13.947 13.688 13.423 13.169 12.93 12.701 12.475 12.248 12.043 11.842 11.657 11.484 11.289 11.067 10.874 10.685 10.501 10.361 10.216 10.049 9.858 9.66 9.517 9.373 9.152 8.992 8.823 8.733 8.547 8.348 8.127 7.997 7.781 7.575 7.435 7.302 6.986 6.788 6.582 6.349 6.057 5.686 5.231 4.171 -8 ,27828 ,KEBNE ,16675466,Wed Nov 24 04:48:17 CET,Wed Nov 24 06:09:37 CET,0.0 1.014 1.504 1.882 2.169 2.383 2.567 2.744 3.07 3.227 3.371 3.543 3.743 3.857 4.07 4.276 4.478 4.577 4.772 4.944 5.168 5.311 5.455 5.66 5.856 6.051 6.236 6.412 6.631 6.839 7.037 7.268 7.491 7.7 7.948 8.238 8.517 8.809 9.122 9.453 9.777 10.128 10.534 10.949 11.41 11.916 12.486 13.106 13.821 14.562 15.218 15.48 15.414 15.256 15.049 14.785 14.535 14.282 14.021 13.729 13.458 13.223 13.008 12.785 12.55 12.335 12.11 11.914 11.745 11.563 11.364 11.195 11.017 10.827 10.676 10.508 10.329 10.15 9.945 9.797 9.655 9.455 9.314 9.159 9.082 8.909 8.717 8.513 8.408 8.235 8.092 7.959 7.797 7.433 7.238 7.028 6.776 6.473 6.122 5.674 4.647 -9 ,31640 ,KEBNE ,16677741,Wed Nov 24 21:45:05 CET,Wed Nov 24 23:06:52 CET,0.0 0.877 1.219 1.494 1.746 1.959 2.143 2.309 2.618 2.759 2.887 3.06 3.262 3.383 3.6 3.789 3.982 4.073 4.245 4.412 4.652 4.801 4.946 5.16 5.369 5.565 5.752 5.932 6.155 6.362 6.558 6.783 6.997 7.203 7.45 7.732 8.0 8.282 8.569 8.885 9.215 9.582 10.001 10.397 10.866 11.4 11.974 12.576 13.226 13.914 14.626 14.986 14.966 14.792 14.566 14.305 14.053 13.8 13.531 13.235 12.975 12.735 12.497 12.258 12.037 11.843 11.622 11.407 11.216 11.013 10.815 10.65 10.461 10.267 10.128 9.982 9.819 9.649 9.475 9.355 9.218 8.982 8.817 8.652 8.567 8.39 8.18 7.958 7.852 7.661 7.482 7.334 7.183 6.841 6.64 6.41 6.16 5.889 5.579 5.156 3.993 -10 ,6602 ,KEBNE ,16677742,Wed Nov 24 21:45:05 CET,Wed Nov 24 23:06:16 CET,0.0 1.058 1.447 1.719 1.96 2.191 2.389 2.568 2.916 3.075 3.211 3.391 3.59 3.697 3.908 4.116 4.302 4.388 4.557 4.718 4.95 5.1 5.243 5.454 5.658 5.844 6.027 6.2 6.418 6.633 6.839 7.076 7.298 7.512 7.766 8.046 8.311 8.603 8.896 9.205 9.525 9.893 10.319 10.737 11.245 11.798 12.364 12.959 13.636 14.329 14.973 15.313 15.354 15.239 15.047 14.768 14.479 14.213 13.96 13.663 13.41 13.202 12.984 12.76 12.541 12.341 12.124 11.917 11.727 11.532 11.325 11.15 10.974 10.778 10.615 10.443 10.271 10.089 9.894 9.76 9.619 9.393 9.223 9.047 8.961 8.776 8.565 8.34 8.222 8.022 7.838 7.696 7.536 7.176 6.979 6.764 6.53 6.274 5.966 5.587 4.535 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_64.txt deleted file mode 100644 index 941627e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17245 ,KEBNE ,17043775,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 06:42:58 CET,0.0 1.43 1.86 2.202 2.486 2.702 2.895 3.072 3.388 3.537 3.675 3.839 4.03 4.133 4.348 4.548 4.721 4.8 4.944 5.088 5.297 5.419 5.532 5.697 5.857 6.008 6.147 6.286 6.456 6.604 6.758 6.94 7.11 7.277 7.459 7.659 7.842 8.035 8.241 8.437 8.627 8.825 9.015 9.186 9.378 9.559 9.725 9.832 9.82 9.616 8.984 7.955 7.011 6.166 5.425 4.77 4.188 3.654 3.187 2.72 2.303 1.928 1.567 1.226 0.924 0.64 0.334 0.057 -0.186 -0.44 -0.709 -0.942 -1.189 -1.429 -1.611 -1.798 -1.996 -2.199 -2.428 -2.599 -2.767 -3.026 -3.203 -3.383 -3.482 -3.692 -3.916 -4.156 -4.28 -4.502 -4.693 -4.846 -5.014 -5.394 -5.601 -5.822 -6.07 -6.373 -6.737 -7.147 -8.176 -2 ,26021 ,KEBNE ,17043776,Thu Dec 23 05:19:46 CET,Thu Dec 23 06:43:11 CET,0.0 1.365 1.815 2.107 2.351 2.567 2.754 2.932 3.252 3.389 3.518 3.693 3.891 4.001 4.208 4.39 4.55 4.622 4.76 4.9 5.106 5.242 5.36 5.527 5.703 5.868 6.011 6.138 6.294 6.457 6.62 6.802 6.962 7.108 7.27 7.451 7.624 7.806 7.977 8.141 8.324 8.521 8.719 8.901 9.089 9.253 9.382 9.473 9.484 9.28 8.613 7.553 6.614 5.789 5.047 4.389 3.808 3.255 2.765 2.288 1.889 1.505 1.13 0.783 0.458 0.174 -0.119 -0.382 -0.614 -0.874 -1.151 -1.367 -1.601 -1.857 -2.049 -2.244 -2.447 -2.657 -2.888 -3.06 -3.229 -3.494 -3.681 -3.867 -3.962 -4.172 -4.394 -4.618 -4.74 -4.953 -5.115 -5.259 -5.422 -5.786 -5.988 -6.2 -6.437 -6.712 -7.057 -7.537 -8.96 -3 ,25992 ,KEBNE ,17043777,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 06:41:24 CET,0.0 1.246 1.694 2.013 2.279 2.536 2.751 2.926 3.243 3.402 3.551 3.717 3.905 4.016 4.212 4.396 4.576 4.657 4.814 4.966 5.189 5.324 5.44 5.607 5.767 5.921 6.07 6.199 6.356 6.517 6.667 6.833 6.988 7.133 7.302 7.49 7.668 7.85 8.024 8.2 8.375 8.549 8.747 8.94 9.114 9.274 9.42 9.5 9.495 9.325 8.719 7.73 6.776 5.928 5.236 4.604 4.017 3.448 2.957 2.478 2.047 1.66 1.297 0.958 0.64 0.354 0.054 -0.216 -0.456 -0.713 -0.979 -1.193 -1.411 -1.638 -1.815 -2.007 -2.209 -2.419 -2.638 -2.788 -2.952 -3.208 -3.386 -3.582 -3.68 -3.89 -4.112 -4.354 -4.485 -4.704 -4.889 -5.034 -5.179 -5.496 -5.676 -5.878 -6.124 -6.392 -6.682 -7.132 -8.42 -4 ,31513 ,KEBNE ,17043778,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 06:41:15 CET,0.0 1.191 1.724 2.085 2.339 2.546 2.742 2.931 3.277 3.428 3.561 3.732 3.922 4.023 4.212 4.406 4.582 4.661 4.823 4.973 5.179 5.314 5.442 5.611 5.768 5.924 6.071 6.21 6.398 6.564 6.71 6.893 7.064 7.211 7.364 7.547 7.722 7.905 8.095 8.274 8.467 8.675 8.882 9.077 9.277 9.451 9.604 9.725 9.706 9.484 8.886 7.9 6.994 6.161 5.407 4.741 4.128 3.573 3.077 2.562 2.161 1.806 1.448 1.121 0.811 0.522 0.212 -0.069 -0.315 -0.588 -0.865 -1.088 -1.318 -1.557 -1.748 -1.937 -2.136 -2.359 -2.595 -2.757 -2.918 -3.165 -3.342 -3.531 -3.631 -3.839 -4.059 -4.295 -4.417 -4.639 -4.843 -4.999 -5.158 -5.496 -5.675 -5.892 -6.176 -6.475 -6.775 -7.192 -8.17 -5 ,24333 ,KEBNE ,17043779,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 06:41:49 CET,0.0 0.969 1.407 1.736 1.997 2.218 2.413 2.596 2.897 3.019 3.135 3.283 3.473 3.579 3.79 4.0 4.188 4.265 4.404 4.549 4.758 4.893 5.021 5.194 5.361 5.518 5.666 5.801 5.954 6.097 6.244 6.42 6.577 6.729 6.916 7.122 7.308 7.497 7.683 7.86 8.035 8.216 8.408 8.59 8.775 8.942 9.109 9.238 9.241 8.999 8.307 7.309 6.413 5.603 4.888 4.227 3.608 3.033 2.529 2.036 1.616 1.238 0.891 0.561 0.26 -0.012 -0.313 -0.59 -0.837 -1.095 -1.372 -1.595 -1.826 -2.067 -2.256 -2.459 -2.662 -2.866 -3.088 -3.241 -3.399 -3.655 -3.84 -4.027 -4.118 -4.299 -4.494 -4.709 -4.817 -5.022 -5.216 -5.366 -5.515 -5.859 -6.047 -6.26 -6.504 -6.793 -7.14 -7.597 -8.759 -6 ,24496 ,KEBNE ,17043780,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 06:41:24 CET,0.0 1.451 1.952 2.309 2.574 2.797 3.004 3.186 3.505 3.661 3.8 3.955 4.145 4.244 4.434 4.615 4.777 4.857 5.01 5.158 5.354 5.475 5.599 5.782 5.951 6.107 6.262 6.411 6.577 6.723 6.859 7.022 7.189 7.35 7.524 7.714 7.894 8.08 8.272 8.469 8.65 8.831 9.039 9.21 9.374 9.557 9.699 9.774 9.74 9.482 8.813 7.847 6.979 6.194 5.458 4.775 4.167 3.605 3.102 2.591 2.173 1.821 1.484 1.148 0.831 0.542 0.236 -0.039 -0.286 -0.546 -0.811 -1.035 -1.259 -1.493 -1.693 -1.892 -2.09 -2.314 -2.553 -2.713 -2.881 -3.155 -3.342 -3.539 -3.642 -3.85 -4.064 -4.302 -4.437 -4.667 -4.864 -5.014 -5.173 -5.516 -5.724 -5.956 -6.197 -6.465 -6.785 -7.227 -8.099 -7 ,19483 ,KEBNE ,17043781,Thu Dec 23 05:19:47 CET,Thu Dec 23 06:43:32 CET,0.0 1.282 1.699 2.01 2.25 2.467 2.669 2.861 3.184 3.32 3.447 3.614 3.811 3.908 4.092 4.286 4.468 4.552 4.707 4.85 5.05 5.17 5.283 5.445 5.6 5.754 5.901 6.03 6.196 6.36 6.515 6.695 6.876 7.042 7.197 7.366 7.547 7.731 7.912 8.1 8.28 8.464 8.654 8.841 9.056 9.267 9.46 9.557 9.502 9.253 8.665 7.742 6.822 5.969 5.206 4.547 3.952 3.388 2.887 2.4 1.999 1.634 1.286 0.956 0.632 0.338 0.033 -0.252 -0.503 -0.768 -1.04 -1.265 -1.517 -1.784 -1.992 -2.202 -2.413 -2.621 -2.839 -3.001 -3.172 -3.442 -3.626 -3.808 -3.905 -4.109 -4.324 -4.551 -4.672 -4.894 -5.084 -5.232 -5.392 -5.761 -5.969 -6.2 -6.461 -6.752 -7.079 -7.482 -8.497 -8 ,5517 ,KEBNE ,17043782,Thu Dec 23 05:21:49 CET,Thu Dec 23 06:44:57 CET,0.0 1.153 1.617 1.976 2.266 2.507 2.705 2.887 3.213 3.346 3.47 3.63 3.819 3.93 4.155 4.352 4.522 4.6 4.753 4.91 5.122 5.25 5.371 5.542 5.704 5.854 5.994 6.134 6.311 6.469 6.618 6.795 6.955 7.106 7.276 7.461 7.645 7.833 8.02 8.219 8.405 8.603 8.838 9.021 9.192 9.379 9.524 9.603 9.573 9.382 8.802 7.778 6.83 5.963 5.23 4.587 3.985 3.446 2.988 2.527 2.132 1.777 1.448 1.13 0.82 0.521 0.209 -0.054 -0.294 -0.556 -0.822 -1.038 -1.258 -1.488 -1.666 -1.858 -2.061 -2.282 -2.528 -2.684 -2.829 -3.072 -3.256 -3.444 -3.54 -3.744 -3.957 -4.178 -4.294 -4.505 -4.683 -4.834 -4.996 -5.364 -5.56 -5.785 -6.054 -6.346 -6.663 -7.074 -7.963 -9 ,30695 ,KEBNE ,17043783,Thu Dec 23 05:21:49 CET,Thu Dec 23 06:45:10 CET,0.0 0.825 1.217 1.519 1.782 2.031 2.248 2.422 2.757 2.916 3.052 3.216 3.41 3.521 3.735 3.935 4.123 4.207 4.359 4.511 4.725 4.851 4.966 5.132 5.293 5.449 5.594 5.73 5.902 6.062 6.208 6.385 6.557 6.716 6.89 7.083 7.269 7.45 7.64 7.829 8.007 8.201 8.424 8.65 8.844 8.999 9.133 9.213 9.172 8.95 8.33 7.346 6.428 5.578 4.846 4.162 3.563 3.044 2.556 2.045 1.607 1.229 0.876 0.551 0.235 -0.064 -0.366 -0.634 -0.872 -1.135 -1.418 -1.655 -1.904 -2.15 -2.336 -2.537 -2.748 -2.958 -3.173 -3.329 -3.503 -3.772 -3.947 -4.134 -4.233 -4.439 -4.665 -4.908 -5.029 -5.249 -5.437 -5.583 -5.733 -6.043 -6.226 -6.459 -6.721 -7.003 -7.329 -7.747 -8.762 -10 ,21668 ,KEBNE ,17043784,Thu Dec 23 05:21:49 CET,Thu Dec 23 06:44:48 CET,0.0 1.078 1.532 1.86 2.149 2.399 2.616 2.817 3.133 3.274 3.406 3.567 3.758 3.86 4.071 4.271 4.437 4.518 4.671 4.818 5.035 5.172 5.297 5.465 5.634 5.803 5.952 6.087 6.261 6.426 6.573 6.74 6.904 7.071 7.273 7.475 7.655 7.859 8.054 8.237 8.418 8.595 8.787 8.978 9.194 9.373 9.497 9.607 9.596 9.373 8.823 7.906 6.992 6.187 5.477 4.806 4.235 3.726 3.26 2.773 2.35 1.981 1.64 1.309 0.99 0.692 0.377 0.099 -0.139 -0.375 -0.629 -0.848 -1.069 -1.301 -1.495 -1.707 -1.928 -2.145 -2.358 -2.504 -2.663 -2.928 -3.107 -3.294 -3.396 -3.608 -3.832 -4.06 -4.179 -4.396 -4.6 -4.757 -4.911 -5.245 -5.428 -5.661 -5.934 -6.235 -6.588 -7.046 -8.23 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_65.txt deleted file mode 100644 index 1ead4731..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9374 ,KEBNE ,17043785,Thu Dec 23 05:21:49 CET,Thu Dec 23 06:44:49 CET,0.0 0.881 1.261 1.571 1.806 2.012 2.21 2.385 2.691 2.832 2.966 3.125 3.317 3.422 3.622 3.799 3.95 4.02 4.162 4.298 4.489 4.612 4.73 4.902 5.059 5.206 5.348 5.477 5.644 5.801 5.94 6.105 6.262 6.404 6.565 6.743 6.901 7.067 7.253 7.436 7.62 7.808 7.972 8.127 8.27 8.389 8.505 8.549 8.453 8.118 7.362 6.284 5.279 4.363 3.591 2.911 2.289 1.709 1.178 0.651 0.208 -0.191 -0.569 -0.929 -1.251 -1.541 -1.863 -2.148 -2.385 -2.623 -2.866 -3.086 -3.329 -3.58 -3.776 -3.976 -4.191 -4.412 -4.626 -4.779 -4.942 -5.199 -5.385 -5.57 -5.663 -5.883 -6.116 -6.339 -6.455 -6.67 -6.839 -6.982 -7.135 -7.479 -7.671 -7.873 -8.114 -8.409 -8.753 -9.173 -10.195 -2 ,27236 ,KEBNE ,17043786,Thu Dec 23 05:21:49 CET,Thu Dec 23 06:45:12 CET,0.0 1.121 1.549 1.859 2.114 2.337 2.526 2.707 3.016 3.142 3.26 3.404 3.59 3.7 3.907 4.096 4.264 4.341 4.502 4.639 4.811 4.935 5.057 5.221 5.375 5.519 5.661 5.794 5.961 6.123 6.272 6.444 6.603 6.751 6.906 7.059 7.198 7.353 7.536 7.726 7.889 8.059 8.229 8.378 8.537 8.663 8.76 8.797 8.715 8.466 7.738 6.577 5.549 4.631 3.796 3.025 2.35 1.755 1.258 0.745 0.3 -0.083 -0.462 -0.827 -1.157 -1.471 -1.802 -2.09 -2.336 -2.581 -2.841 -3.065 -3.3 -3.544 -3.728 -3.924 -4.134 -4.354 -4.585 -4.745 -4.91 -5.167 -5.346 -5.536 -5.63 -5.838 -6.065 -6.301 -6.432 -6.658 -6.837 -6.982 -7.143 -7.503 -7.697 -7.912 -8.159 -8.421 -8.727 -9.126 -10.124 -3 ,4081 ,KEBNE ,17043787,Thu Dec 23 05:21:49 CET,Thu Dec 23 06:45:32 CET,0.0 1.15 1.589 1.893 2.161 2.389 2.596 2.775 3.094 3.242 3.367 3.531 3.728 3.832 4.017 4.19 4.345 4.428 4.597 4.744 4.952 5.088 5.214 5.382 5.538 5.688 5.835 5.976 6.156 6.323 6.472 6.651 6.827 6.996 7.184 7.371 7.536 7.706 7.868 8.034 8.204 8.381 8.586 8.772 8.927 9.052 9.13 9.134 9.042 8.757 7.971 6.814 5.785 4.857 4.043 3.273 2.627 2.084 1.605 1.098 0.652 0.276 -0.092 -0.444 -0.761 -1.066 -1.396 -1.692 -1.947 -2.206 -2.469 -2.7 -2.952 -3.207 -3.406 -3.607 -3.812 -4.036 -4.267 -4.42 -4.577 -4.841 -5.032 -5.23 -5.331 -5.545 -5.766 -5.993 -6.111 -6.321 -6.463 -6.587 -6.734 -7.059 -7.231 -7.42 -7.642 -7.916 -8.246 -8.63 -9.562 -4 ,29153 ,KEBNE ,17043788,Thu Dec 23 05:21:50 CET,Thu Dec 23 06:45:07 CET,0.0 1.064 1.495 1.808 2.032 2.214 2.392 2.555 2.823 2.938 3.059 3.229 3.423 3.527 3.72 3.904 4.078 4.16 4.303 4.436 4.645 4.773 4.888 5.068 5.238 5.386 5.527 5.675 5.856 6.005 6.147 6.309 6.457 6.606 6.785 6.969 7.143 7.331 7.525 7.717 7.893 8.086 8.302 8.464 8.604 8.749 8.847 8.87 8.79 8.479 7.725 6.652 5.657 4.756 3.957 3.239 2.602 2.017 1.523 1.01 0.581 0.215 -0.158 -0.517 -0.857 -1.17 -1.49 -1.762 -2.015 -2.298 -2.586 -2.817 -3.052 -3.294 -3.484 -3.681 -3.887 -4.095 -4.313 -4.47 -4.638 -4.902 -5.073 -5.249 -5.34 -5.533 -5.74 -5.955 -6.063 -6.271 -6.441 -6.58 -6.726 -7.057 -7.229 -7.397 -7.582 -7.8 -8.1 -8.532 -9.616 -5 ,6921 ,KEBNE ,17043789,Thu Dec 23 05:21:49 CET,Thu Dec 23 06:45:16 CET,0.0 0.835 1.263 1.622 1.921 2.171 2.379 2.548 2.842 2.969 3.081 3.209 3.395 3.495 3.679 3.854 4.012 4.081 4.221 4.37 4.585 4.716 4.843 5.011 5.155 5.298 5.443 5.589 5.766 5.927 6.089 6.272 6.429 6.577 6.744 6.918 7.071 7.233 7.401 7.568 7.736 7.925 8.114 8.257 8.419 8.564 8.66 8.717 8.656 8.359 7.575 6.431 5.4 4.472 3.66 2.922 2.276 1.674 1.147 0.628 0.181 -0.21 -0.583 -0.933 -1.256 -1.555 -1.874 -2.165 -2.42 -2.684 -2.962 -3.194 -3.427 -3.676 -3.87 -4.068 -4.272 -4.48 -4.698 -4.851 -5.016 -5.274 -5.441 -5.612 -5.707 -5.907 -6.114 -6.337 -6.466 -6.692 -6.853 -6.991 -7.151 -7.488 -7.676 -7.888 -8.122 -8.413 -8.758 -9.159 -10.097 -6 ,7069 ,KEBNE ,17043790,Thu Dec 23 05:21:49 CET,Thu Dec 23 06:43:21 CET,0.0 1.093 1.496 1.816 2.095 2.333 2.538 2.717 3.033 3.191 3.337 3.473 3.655 3.762 3.949 4.124 4.296 4.378 4.542 4.692 4.895 5.02 5.143 5.312 5.463 5.607 5.746 5.877 6.049 6.208 6.353 6.531 6.69 6.858 7.041 7.226 7.407 7.583 7.767 7.952 8.128 8.303 8.484 8.655 8.825 8.953 9.023 9.025 8.923 8.654 7.983 6.931 5.952 5.097 4.318 3.61 2.952 2.333 1.808 1.288 0.852 0.465 0.086 -0.258 -0.568 -0.858 -1.163 -1.442 -1.69 -1.938 -2.188 -2.409 -2.661 -2.921 -3.113 -3.312 -3.523 -3.745 -3.987 -4.15 -4.309 -4.564 -4.73 -4.908 -5.003 -5.202 -5.416 -5.635 -5.752 -5.97 -6.15 -6.306 -6.474 -6.831 -7.029 -7.236 -7.469 -7.755 -8.109 -8.55 -9.392 -7 ,14118 ,KEBNE ,17043791,Thu Dec 23 05:21:49 CET,Thu Dec 23 06:43:21 CET,0.0 0.962 1.401 1.715 1.97 2.196 2.395 2.57 2.873 3.008 3.134 3.288 3.474 3.584 3.806 3.996 4.174 4.256 4.402 4.544 4.756 4.885 5.001 5.168 5.317 5.473 5.63 5.772 5.941 6.08 6.217 6.407 6.585 6.747 6.928 7.118 7.272 7.436 7.615 7.783 7.951 8.132 8.326 8.504 8.671 8.8 8.874 8.892 8.819 8.511 7.727 6.579 5.556 4.672 3.874 3.164 2.543 1.944 1.403 0.863 0.42 0.035 -0.345 -0.7 -1.02 -1.317 -1.625 -1.916 -2.173 -2.435 -2.724 -2.966 -3.222 -3.482 -3.67 -3.862 -4.072 -4.304 -4.545 -4.703 -4.86 -5.094 -5.252 -5.434 -5.531 -5.736 -5.973 -6.212 -6.331 -6.547 -6.73 -6.877 -7.033 -7.385 -7.585 -7.807 -8.048 -8.314 -8.636 -9.071 -10.172 -8 ,6492 ,KEBNE ,17043792,Thu Dec 23 05:21:50 CET,Thu Dec 23 06:43:13 CET,0.0 1.069 1.533 1.837 2.068 2.264 2.439 2.59 2.888 3.028 3.15 3.296 3.477 3.57 3.75 3.923 4.098 4.183 4.339 4.479 4.676 4.796 4.915 5.092 5.248 5.396 5.538 5.66 5.817 5.978 6.142 6.335 6.492 6.627 6.788 6.971 7.14 7.325 7.503 7.669 7.837 8.005 8.18 8.351 8.544 8.723 8.82 8.839 8.762 8.444 7.687 6.592 5.594 4.69 3.905 3.233 2.625 2.074 1.583 1.073 0.638 0.247 -0.125 -0.474 -0.8 -1.103 -1.411 -1.675 -1.918 -2.196 -2.484 -2.711 -2.949 -3.193 -3.378 -3.566 -3.765 -3.98 -4.206 -4.359 -4.518 -4.776 -4.963 -5.157 -5.26 -5.487 -5.719 -5.944 -6.055 -6.268 -6.448 -6.606 -6.769 -7.104 -7.282 -7.471 -7.701 -7.977 -8.322 -8.761 -9.943 -9 ,27842 ,KEBNE ,17043793,Thu Dec 23 05:21:49 CET,Thu Dec 23 06:45:14 CET,0.0 1.074 1.483 1.795 2.059 2.274 2.466 2.645 2.938 3.067 3.198 3.347 3.525 3.625 3.818 4.0 4.176 4.259 4.417 4.558 4.759 4.884 4.999 5.166 5.331 5.471 5.604 5.739 5.902 6.063 6.209 6.363 6.513 6.667 6.832 7.02 7.188 7.346 7.532 7.719 7.891 8.069 8.245 8.41 8.567 8.693 8.791 8.836 8.808 8.505 7.685 6.594 5.601 4.671 3.845 3.144 2.544 2.004 1.538 1.058 0.641 0.263 -0.102 -0.443 -0.762 -1.047 -1.351 -1.622 -1.866 -2.132 -2.398 -2.611 -2.843 -3.095 -3.289 -3.486 -3.686 -3.892 -4.121 -4.284 -4.446 -4.695 -4.879 -5.079 -5.177 -5.378 -5.592 -5.838 -5.97 -6.191 -6.37 -6.518 -6.666 -6.993 -7.176 -7.378 -7.615 -7.889 -8.236 -8.679 -9.654 -10 ,16392 ,KEBNE ,17043794,Thu Dec 23 05:21:49 CET,Thu Dec 23 06:43:21 CET,0.0 1.02 1.421 1.731 1.986 2.214 2.418 2.596 2.897 3.026 3.152 3.313 3.505 3.606 3.78 3.949 4.114 4.193 4.355 4.498 4.666 4.783 4.901 5.079 5.252 5.407 5.552 5.687 5.841 5.986 6.131 6.296 6.453 6.614 6.806 7.01 7.201 7.393 7.566 7.731 7.896 8.073 8.259 8.421 8.578 8.703 8.77 8.792 8.731 8.444 7.682 6.587 5.636 4.739 3.894 3.144 2.526 1.986 1.505 1.012 0.571 0.163 -0.232 -0.601 -0.939 -1.25 -1.563 -1.841 -2.085 -2.347 -2.64 -2.884 -3.114 -3.353 -3.546 -3.736 -3.935 -4.154 -4.385 -4.552 -4.724 -4.988 -5.167 -5.361 -5.466 -5.674 -5.891 -6.12 -6.245 -6.471 -6.668 -6.825 -6.992 -7.341 -7.521 -7.724 -7.941 -8.203 -8.536 -8.942 -10.047 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_64_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_64_63.txt deleted file mode 100644 index 7844db54..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_64_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20991 ,KEBNE ,16675469,Wed Nov 24 04:48:17 CET,Wed Nov 24 06:09:52 CET,0.0 1.078 1.553 1.885 2.134 2.365 2.577 2.778 3.129 3.285 3.437 3.625 3.846 3.975 4.22 4.454 4.675 4.77 4.945 5.117 5.363 5.518 5.677 5.913 6.126 6.325 6.523 6.721 6.981 7.225 7.448 7.706 7.973 8.225 8.495 8.809 9.111 9.432 9.768 10.106 10.467 10.909 11.423 11.911 12.461 13.05 13.717 14.46 15.268 16.154 17.085 17.669 17.851 17.801 17.68 17.542 17.383 17.203 17.02 16.829 16.646 16.457 16.274 16.084 15.893 15.722 15.533 15.363 15.209 15.037 14.857 14.704 14.536 14.353 14.205 14.054 13.901 13.739 13.559 13.428 13.292 13.077 12.93 12.772 12.683 12.508 12.318 12.109 12.003 11.808 11.645 11.501 11.341 11.025 10.845 10.643 10.418 10.159 9.829 9.4 8.452 -2 ,23587 ,KEBNE ,16677744,Wed Nov 24 21:45:05 CET,Wed Nov 24 23:06:37 CET,0.0 0.922 1.329 1.635 1.891 2.129 2.333 2.51 2.837 2.995 3.147 3.338 3.56 3.694 3.954 4.189 4.408 4.512 4.728 4.933 5.204 5.37 5.527 5.764 5.985 6.197 6.397 6.581 6.807 7.027 7.246 7.506 7.754 7.99 8.268 8.583 8.884 9.208 9.558 9.918 10.269 10.675 11.166 11.64 12.191 12.783 13.44 14.196 15.012 15.936 17.031 17.662 17.824 17.833 17.776 17.659 17.493 17.306 17.129 16.936 16.738 16.55 16.36 16.163 15.964 15.781 15.594 15.419 15.265 15.103 14.922 14.766 14.601 14.416 14.276 14.13 13.969 13.8 13.62 13.495 13.366 13.154 12.998 12.839 12.758 12.591 12.414 12.216 12.105 11.908 11.762 11.631 11.492 11.16 10.957 10.762 10.555 10.298 9.98 9.503 8.254 -3 ,32215 ,KEBNE ,16677745,Wed Nov 24 21:45:05 CET,Wed Nov 24 23:08:02 CET,0.0 1.2 1.577 1.907 2.212 2.48 2.713 2.912 3.263 3.429 3.578 3.749 3.959 4.073 4.292 4.513 4.723 4.819 4.991 5.153 5.403 5.568 5.728 5.951 6.16 6.367 6.564 6.754 7.016 7.263 7.478 7.738 7.992 8.226 8.492 8.794 9.071 9.376 9.719 10.09 10.471 10.882 11.361 11.855 12.438 13.088 13.822 14.615 15.501 16.482 17.532 18.15 18.364 18.377 18.295 18.171 18.031 17.854 17.654 17.435 17.24 17.047 16.847 16.654 16.474 16.319 16.157 15.999 15.857 15.691 15.503 15.344 15.167 14.995 14.866 14.712 14.553 14.399 14.231 14.113 13.995 13.814 13.673 13.502 13.406 13.205 13.004 12.788 12.681 12.495 12.317 12.168 12.009 11.683 11.517 11.328 11.093 10.802 10.466 10.043 9.047 -4 ,26119 ,KEBNE ,16677746,Wed Nov 24 21:45:05 CET,Wed Nov 24 23:08:07 CET,0.0 1.03 1.422 1.743 2.03 2.269 2.472 2.667 3.028 3.182 3.328 3.52 3.736 3.855 4.085 4.318 4.547 4.65 4.846 5.041 5.309 5.467 5.617 5.831 6.032 6.233 6.427 6.615 6.853 7.079 7.303 7.575 7.821 8.058 8.331 8.621 8.895 9.198 9.525 9.883 10.25 10.654 11.157 11.641 12.198 12.812 13.483 14.247 15.117 16.085 17.068 17.65 17.825 17.824 17.761 17.631 17.475 17.31 17.132 16.929 16.737 16.561 16.391 16.214 16.041 15.873 15.678 15.484 15.319 15.161 14.988 14.83 14.66 14.498 14.372 14.227 14.066 13.887 13.705 13.583 13.455 13.261 13.121 12.964 12.882 12.72 12.537 12.33 12.222 12.028 11.852 11.71 11.577 11.29 11.113 10.906 10.662 10.383 10.075 9.67 8.763 -5 ,17239 ,KEBNE ,16675473,Wed Nov 24 04:48:17 CET,Wed Nov 24 06:09:52 CET,0.0 1.108 1.585 1.94 2.21 2.459 2.671 2.867 3.236 3.397 3.547 3.736 3.968 4.104 4.35 4.57 4.784 4.889 5.083 5.26 5.505 5.666 5.823 6.044 6.265 6.474 6.668 6.855 7.086 7.303 7.519 7.783 8.04 8.281 8.56 8.869 9.148 9.452 9.786 10.142 10.493 10.892 11.38 11.862 12.395 12.938 13.561 14.295 15.16 16.121 17.092 17.699 17.888 17.863 17.795 17.705 17.57 17.389 17.222 17.04 16.85 16.666 16.491 16.313 16.119 15.94 15.769 15.618 15.486 15.339 15.165 14.999 14.816 14.626 14.491 14.356 14.215 14.064 13.895 13.769 13.636 13.436 13.297 13.142 13.056 12.872 12.69 12.489 12.378 12.189 12.023 11.891 11.749 11.423 11.239 11.026 10.776 10.457 10.091 9.652 8.401 -6 ,4625 ,KEBNE ,16675474,Wed Nov 24 04:50:21 CET,Wed Nov 24 06:13:32 CET,0.0 1.236 1.692 2.031 2.314 2.569 2.776 2.952 3.274 3.428 3.576 3.764 3.987 4.109 4.338 4.562 4.773 4.867 5.052 5.232 5.469 5.617 5.771 6.0 6.214 6.412 6.605 6.802 7.05 7.279 7.498 7.764 8.029 8.272 8.548 8.865 9.147 9.456 9.797 10.154 10.534 10.955 11.447 11.936 12.492 13.08 13.759 14.535 15.413 16.341 17.329 18.033 18.253 18.27 18.202 18.06 17.901 17.739 17.577 17.379 17.202 17.027 16.826 16.634 16.454 16.278 16.08 15.9 15.732 15.56 15.394 15.244 15.089 14.928 14.789 14.648 14.505 14.348 14.172 14.034 13.892 13.685 13.544 13.396 13.313 13.129 12.93 12.713 12.596 12.395 12.219 12.081 11.94 11.616 11.435 11.251 11.029 10.767 10.465 10.051 8.728 -7 ,3396 ,KEBNE ,16675475,Wed Nov 24 04:50:21 CET,Wed Nov 24 06:12:06 CET,0.0 1.118 1.572 1.906 2.185 2.419 2.632 2.839 3.196 3.364 3.527 3.731 3.955 4.083 4.334 4.558 4.76 4.857 5.052 5.236 5.498 5.665 5.825 6.059 6.288 6.506 6.71 6.904 7.147 7.382 7.604 7.862 8.106 8.353 8.641 8.945 9.223 9.533 9.873 10.235 10.609 11.02 11.516 12.006 12.548 13.139 13.814 14.543 15.349 16.286 17.288 17.902 18.068 18.059 17.972 17.854 17.72 17.524 17.335 17.134 16.933 16.738 16.537 16.326 16.129 15.955 15.765 15.595 15.451 15.282 15.093 14.945 14.782 14.6 14.462 14.317 14.159 13.99 13.813 13.692 13.57 13.368 13.218 13.066 12.984 12.803 12.6 12.384 12.274 12.079 11.925 11.79 11.642 11.308 11.104 10.894 10.667 10.391 10.07 9.584 7.906 -8 ,24429 ,KEBNE ,16675476,Wed Nov 24 04:55:34 CET,Wed Nov 24 06:21:19 CET,0.0 1.023 1.539 1.892 2.187 2.435 2.653 2.857 3.202 3.361 3.514 3.693 3.903 4.014 4.248 4.491 4.711 4.819 5.025 5.205 5.464 5.631 5.792 6.007 6.208 6.409 6.607 6.805 7.068 7.314 7.533 7.802 8.061 8.288 8.554 8.862 9.16 9.483 9.819 10.175 10.542 10.949 11.415 11.86 12.374 12.961 13.621 14.321 15.138 16.053 17.034 17.657 17.913 17.967 17.897 17.753 17.574 17.414 17.238 17.015 16.817 16.639 16.451 16.246 16.058 15.889 15.709 15.543 15.392 15.239 15.069 14.918 14.759 14.584 14.438 14.274 14.098 13.923 13.755 13.634 13.497 13.278 13.121 12.951 12.867 12.691 12.501 12.303 12.2 12.003 11.82 11.676 11.522 11.177 10.988 10.781 10.546 10.285 9.962 9.521 8.345 -9 ,28892 ,KEBNE ,16675477,Wed Nov 24 04:56:37 CET,Wed Nov 24 06:18:00 CET,0.0 1.159 1.6 1.911 2.163 2.403 2.632 2.842 3.222 3.382 3.532 3.729 3.957 4.091 4.331 4.556 4.762 4.862 5.061 5.248 5.5 5.66 5.808 6.017 6.229 6.443 6.647 6.826 7.054 7.279 7.509 7.786 8.041 8.284 8.547 8.841 9.116 9.417 9.758 10.122 10.503 10.923 11.37 11.813 12.366 12.999 13.698 14.446 15.277 16.159 17.135 17.794 18.01 18.045 18.026 17.921 17.772 17.605 17.414 17.184 16.98 16.789 16.594 16.416 16.252 16.077 15.879 15.705 15.56 15.408 15.23 15.075 14.926 14.761 14.625 14.486 14.33 14.162 13.991 13.871 13.745 13.541 13.394 13.237 13.157 12.997 12.827 12.631 12.517 12.314 12.136 11.987 11.823 11.475 11.283 11.066 10.835 10.566 10.249 9.845 8.905 -10 ,20614 ,KEBNE ,16675478,Wed Nov 24 04:56:36 CET,Wed Nov 24 06:19:00 CET,0.0 1.311 1.741 2.096 2.37 2.605 2.823 3.014 3.367 3.54 3.702 3.891 4.097 4.218 4.445 4.648 4.845 4.937 5.12 5.294 5.552 5.72 5.881 6.117 6.334 6.534 6.727 6.912 7.144 7.375 7.596 7.864 8.124 8.365 8.635 8.925 9.201 9.515 9.856 10.216 10.574 10.97 11.474 11.98 12.543 13.147 13.823 14.576 15.413 16.33 17.316 17.934 18.185 18.241 18.19 18.088 17.925 17.745 17.574 17.385 17.202 17.014 16.827 16.634 16.441 16.261 16.073 15.896 15.746 15.587 15.403 15.247 15.075 14.89 14.744 14.599 14.445 14.274 14.094 13.969 13.847 13.66 13.523 13.375 13.292 13.106 12.916 12.715 12.602 12.4 12.214 12.071 11.925 11.608 11.425 11.231 11.021 10.779 10.478 10.021 8.96 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_63.txt deleted file mode 100644 index 31bc093c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10217 ,KEBNE ,16675479,Wed Nov 24 04:56:37 CET,Wed Nov 24 06:17:58 CET,0.0 1.118 1.555 1.906 2.198 2.444 2.654 2.849 3.203 3.369 3.526 3.726 3.949 4.074 4.301 4.513 4.715 4.808 4.997 5.179 5.434 5.597 5.753 5.984 6.205 6.407 6.604 6.801 7.05 7.287 7.513 7.778 8.043 8.305 8.596 8.919 9.231 9.566 9.921 10.297 10.697 11.14 11.616 12.087 12.671 13.329 14.08 14.895 15.81 16.816 17.867 18.573 18.877 18.951 18.887 18.762 18.599 18.421 18.254 18.054 17.859 17.684 17.508 17.323 17.145 16.984 16.814 16.656 16.505 16.34 16.178 16.044 15.892 15.736 15.616 15.492 15.36 15.215 15.056 14.937 14.803 14.595 14.452 14.299 14.217 14.04 13.854 13.653 13.551 13.36 13.184 13.038 12.877 12.528 12.347 12.17 11.967 11.724 11.41 10.942 9.56 -2 ,14667 ,KEBNE ,16675480,Wed Nov 24 04:56:37 CET,Wed Nov 24 06:18:13 CET,0.0 1.023 1.468 1.802 2.091 2.344 2.557 2.748 3.093 3.252 3.396 3.58 3.804 3.926 4.154 4.366 4.566 4.669 4.871 5.055 5.316 5.481 5.635 5.848 6.054 6.25 6.444 6.632 6.872 7.114 7.346 7.608 7.858 8.115 8.408 8.717 9.01 9.328 9.679 10.051 10.442 10.878 11.358 11.835 12.398 13.005 13.706 14.494 15.442 16.524 17.626 18.381 18.69 18.764 18.731 18.63 18.478 18.313 18.132 17.943 17.792 17.649 17.477 17.307 17.15 16.987 16.815 16.653 16.498 16.337 16.175 16.033 15.878 15.714 15.585 15.435 15.277 15.13 14.972 14.861 14.75 14.567 14.422 14.26 14.175 14.006 13.816 13.605 13.499 13.309 13.15 13.027 12.899 12.58 12.398 12.201 11.979 11.704 11.363 10.963 9.84 -3 ,18277 ,KEBNE ,16677755,Wed Nov 24 21:47:08 CET,Wed Nov 24 23:09:01 CET,0.0 1.129 1.56 1.881 2.16 2.397 2.613 2.825 3.187 3.346 3.496 3.677 3.905 4.036 4.277 4.499 4.704 4.8 4.991 5.18 5.451 5.626 5.793 6.04 6.266 6.464 6.669 6.867 7.108 7.338 7.567 7.842 8.096 8.337 8.624 8.95 9.261 9.595 9.954 10.334 10.731 11.182 11.694 12.215 12.818 13.469 14.219 15.069 16.025 17.061 18.192 18.962 19.259 19.351 19.315 19.196 19.052 18.901 18.754 18.576 18.409 18.253 18.084 17.895 17.712 17.528 17.315 17.13 16.97 16.81 16.651 16.509 16.357 16.191 16.052 15.907 15.758 15.611 15.46 15.353 15.239 15.044 14.906 14.759 14.683 14.525 14.35 14.149 14.038 13.858 13.73 13.6 13.455 13.121 12.925 12.715 12.463 12.18 11.886 11.496 10.496 -4 ,22907 ,KEBNE ,16675482,Wed Nov 24 05:04:57 CET,Wed Nov 24 06:26:32 CET,0.0 1.161 1.616 1.956 2.231 2.461 2.671 2.854 3.182 3.346 3.511 3.716 3.942 4.067 4.303 4.522 4.715 4.808 5.001 5.186 5.448 5.619 5.78 5.999 6.201 6.395 6.593 6.793 7.046 7.28 7.515 7.803 8.068 8.322 8.612 8.933 9.237 9.57 9.933 10.311 10.704 11.154 11.668 12.151 12.716 13.331 14.014 14.786 15.68 16.73 17.828 18.503 18.778 18.861 18.822 18.711 18.575 18.425 18.268 18.086 17.911 17.746 17.602 17.459 17.284 17.117 16.935 16.753 16.605 16.467 16.312 16.171 16.027 15.873 15.752 15.626 15.48 15.32 15.154 15.049 14.94 14.75 14.606 14.454 14.377 14.224 14.062 13.88 13.783 13.595 13.436 13.311 13.173 12.88 12.711 12.51 12.297 12.043 11.73 11.324 10.155 -5 ,30711 ,KEBNE ,16677757,Wed Nov 24 21:47:08 CET,Wed Nov 24 23:13:15 CET,0.0 1.085 1.492 1.796 2.075 2.32 2.541 2.735 3.079 3.244 3.392 3.56 3.775 3.901 4.142 4.352 4.537 4.627 4.812 4.994 5.242 5.384 5.521 5.741 5.974 6.197 6.407 6.603 6.829 7.043 7.262 7.528 7.786 8.031 8.305 8.631 8.944 9.271 9.611 9.975 10.374 10.814 11.301 11.777 12.336 12.976 13.718 14.539 15.456 16.453 17.571 18.294 18.554 18.661 18.65 18.536 18.412 18.284 18.14 17.952 17.759 17.574 17.398 17.226 17.049 16.891 16.726 16.562 16.413 16.256 16.073 15.912 15.75 15.579 15.448 15.317 15.177 15.028 14.866 14.75 14.632 14.435 14.281 14.118 14.039 13.871 13.688 13.499 13.392 13.196 13.036 12.909 12.775 12.496 12.335 12.147 11.953 11.717 11.442 11.117 10.206 -6 ,10849 ,KEBNE ,16675484,Wed Nov 24 05:08:04 CET,Wed Nov 24 06:29:33 CET,0.0 0.843 1.268 1.632 1.924 2.166 2.376 2.562 2.896 3.049 3.198 3.376 3.589 3.711 3.955 4.189 4.41 4.518 4.717 4.908 5.183 5.353 5.519 5.756 5.972 6.187 6.4 6.604 6.854 7.088 7.321 7.588 7.825 8.055 8.327 8.629 8.919 9.247 9.597 9.966 10.337 10.746 11.259 11.77 12.363 13.009 13.722 14.543 15.468 16.519 17.665 18.412 18.73 18.82 18.776 18.674 18.542 18.374 18.197 17.975 17.788 17.641 17.473 17.284 17.106 16.934 16.753 16.6 16.457 16.293 16.122 15.97 15.815 15.658 15.53 15.397 15.258 15.114 14.958 14.845 14.718 14.522 14.379 14.207 14.121 13.948 13.764 13.557 13.449 13.254 13.091 12.97 12.843 12.561 12.406 12.235 12.022 11.761 11.467 11.076 10.017 -7 ,24343 ,KEBNE ,16677759,Wed Nov 24 21:47:08 CET,Wed Nov 24 23:08:59 CET,0.0 1.017 1.417 1.739 2.005 2.237 2.455 2.669 3.058 3.227 3.387 3.576 3.797 3.926 4.157 4.369 4.567 4.662 4.842 5.022 5.293 5.457 5.613 5.845 6.068 6.279 6.48 6.667 6.915 7.15 7.377 7.644 7.887 8.129 8.414 8.744 9.061 9.395 9.748 10.128 10.509 10.938 11.446 11.958 12.575 13.235 13.983 14.819 15.755 16.808 17.985 18.75 19.012 19.114 19.088 18.932 18.763 18.606 18.441 18.247 18.047 17.86 17.688 17.525 17.363 17.195 16.997 16.82 16.67 16.507 16.335 16.187 16.032 15.879 15.749 15.611 15.464 15.299 15.13 15.014 14.899 14.715 14.58 14.434 14.355 14.181 13.998 13.81 13.704 13.507 13.345 13.225 13.103 12.804 12.618 12.419 12.217 11.967 11.657 11.265 10.31 -8 ,36 ,KEBNE ,16675486,Wed Nov 24 05:18:21 CET,Wed Nov 24 06:39:42 CET,0.0 1.111 1.544 1.868 2.143 2.373 2.584 2.777 3.121 3.285 3.429 3.596 3.813 3.935 4.168 4.381 4.579 4.67 4.848 5.018 5.26 5.423 5.587 5.816 6.024 6.229 6.437 6.637 6.885 7.119 7.343 7.614 7.886 8.137 8.405 8.711 9.011 9.347 9.707 10.084 10.478 10.925 11.432 11.913 12.476 13.1 13.802 14.594 15.517 16.562 17.694 18.411 18.686 18.804 18.819 18.722 18.582 18.425 18.232 18.035 17.867 17.698 17.536 17.358 17.183 17.025 16.856 16.69 16.539 16.378 16.205 16.066 15.913 15.734 15.587 15.434 15.276 15.115 14.941 14.812 14.685 14.496 14.362 14.225 14.154 13.989 13.811 13.625 13.525 13.332 13.16 13.023 12.881 12.574 12.398 12.22 12.019 11.774 11.477 11.1 9.943 -9 ,9147 ,KEBNE ,16677761,Wed Nov 24 21:47:09 CET,Wed Nov 24 23:12:07 CET,0.0 0.992 1.447 1.789 2.05 2.296 2.523 2.719 3.054 3.206 3.338 3.486 3.701 3.821 4.039 4.238 4.433 4.529 4.717 4.891 5.121 5.266 5.413 5.635 5.853 6.069 6.273 6.466 6.725 6.975 7.201 7.472 7.741 7.989 8.264 8.572 8.878 9.217 9.577 9.964 10.376 10.828 11.328 11.827 12.412 13.04 13.727 14.508 15.43 16.527 17.72 18.487 18.78 18.882 18.887 18.786 18.651 18.503 18.353 18.17 17.984 17.795 17.589 17.407 17.235 17.068 16.882 16.71 16.563 16.401 16.226 16.081 15.935 15.788 15.673 15.548 15.403 15.237 15.059 14.932 14.806 14.614 14.479 14.35 14.278 14.109 13.93 13.73 13.618 13.416 13.252 13.129 13.005 12.728 12.558 12.343 12.108 11.838 11.495 11.071 10.067 -10 ,31851 ,KEBNE ,16677762,Wed Nov 24 21:49:12 CET,Wed Nov 24 23:10:52 CET,0.0 1.358 1.76 2.061 2.326 2.564 2.765 2.949 3.275 3.424 3.581 3.774 3.987 4.106 4.329 4.541 4.73 4.817 5.001 5.187 5.446 5.608 5.769 5.997 6.209 6.408 6.603 6.8 7.053 7.293 7.524 7.809 8.075 8.32 8.604 8.917 9.207 9.514 9.851 10.228 10.629 11.068 11.569 12.08 12.672 13.293 14.005 14.792 15.695 16.724 17.838 18.586 18.908 19.013 19.005 18.946 18.848 18.72 18.572 18.399 18.252 18.107 17.949 17.784 17.607 17.443 17.28 17.137 17.011 16.868 16.696 16.553 16.412 16.259 16.129 15.992 15.86 15.728 15.573 15.447 15.319 15.123 14.983 14.843 14.766 14.595 14.404 14.187 14.069 13.871 13.708 13.578 13.443 13.146 12.964 12.75 12.511 12.227 11.9 11.48 10.415 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_64.txt deleted file mode 100644 index 7c306565..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2586 ,KEBNE ,16677763,Wed Nov 24 21:49:12 CET,Wed Nov 24 23:12:58 CET,0.0 1.154 1.62 1.939 2.212 2.448 2.663 2.864 3.213 3.365 3.509 3.69 3.913 4.035 4.254 4.45 4.645 4.742 4.921 5.089 5.338 5.496 5.645 5.865 6.079 6.277 6.458 6.632 6.858 7.082 7.295 7.542 7.782 8.01 8.262 8.539 8.795 9.077 9.383 9.707 10.049 10.397 10.76 11.108 11.504 11.961 12.475 13.006 13.522 13.967 14.181 14.072 13.729 13.296 12.917 12.558 12.209 11.873 11.559 11.209 10.885 10.577 10.278 10.008 9.757 9.527 9.307 9.101 8.896 8.69 8.477 8.279 8.08 7.884 7.724 7.545 7.356 7.163 6.953 6.806 6.655 6.399 6.213 6.02 5.925 5.737 5.542 5.333 5.217 5.0 4.817 4.669 4.514 4.166 3.96 3.731 3.473 3.184 2.857 2.426 1.117 -2 ,15719 ,KEBNE ,16675490,Wed Nov 24 05:19:22 CET,Wed Nov 24 06:40:52 CET,0.0 0.945 1.396 1.742 2.022 2.276 2.506 2.708 3.054 3.208 3.364 3.555 3.778 3.908 4.158 4.403 4.64 4.751 4.947 5.134 5.393 5.556 5.714 5.931 6.134 6.329 6.503 6.665 6.871 7.063 7.253 7.49 7.718 7.924 8.147 8.405 8.652 8.933 9.242 9.567 9.888 10.217 10.601 10.987 11.419 11.869 12.335 12.833 13.37 13.906 14.301 14.248 13.91 13.474 13.103 12.758 12.384 12.001 11.664 11.327 11.008 10.707 10.428 10.172 9.922 9.684 9.444 9.223 9.022 8.807 8.584 8.392 8.184 7.958 7.785 7.622 7.448 7.266 7.065 6.915 6.762 6.522 6.357 6.184 6.089 5.897 5.698 5.47 5.342 5.113 4.909 4.757 4.592 4.238 4.05 3.856 3.636 3.363 3.041 2.594 1.236 -3 ,20989 ,KEBNE ,16675491,Wed Nov 24 05:20:23 CET,Wed Nov 24 06:42:10 CET,0.0 1.081 1.511 1.845 2.131 2.391 2.615 2.799 3.122 3.267 3.412 3.594 3.811 3.93 4.166 4.387 4.588 4.684 4.87 5.046 5.296 5.45 5.602 5.812 6.008 6.203 6.391 6.575 6.806 7.031 7.25 7.503 7.734 7.955 8.217 8.507 8.774 9.055 9.356 9.672 10.0 10.358 10.773 11.172 11.599 12.087 12.608 13.105 13.587 14.042 14.383 14.307 13.989 13.593 13.201 12.814 12.414 12.04 11.724 11.394 11.092 10.81 10.542 10.288 10.054 9.819 9.558 9.336 9.147 8.944 8.721 8.529 8.322 8.099 7.921 7.742 7.553 7.355 7.145 7.0 6.854 6.618 6.45 6.275 6.186 5.995 5.778 5.545 5.429 5.23 5.085 4.952 4.808 4.492 4.313 4.103 3.858 3.577 3.258 2.786 1.54 -4 ,5697 ,KEBNE ,16677766,Wed Nov 24 21:49:12 CET,Wed Nov 24 23:15:08 CET,0.0 1.152 1.636 1.999 2.292 2.531 2.755 2.962 3.305 3.455 3.591 3.741 3.953 4.076 4.312 4.538 4.749 4.841 5.013 5.187 5.417 5.562 5.701 5.888 6.072 6.255 6.432 6.598 6.816 7.029 7.238 7.484 7.718 7.946 8.197 8.472 8.733 9.02 9.329 9.644 9.969 10.346 10.756 11.134 11.558 11.99 12.445 12.91 13.353 13.747 14.061 13.981 13.718 13.386 12.981 12.56 12.183 11.841 11.509 11.136 10.823 10.544 10.266 10.003 9.756 9.523 9.271 9.033 8.821 8.605 8.385 8.199 7.985 7.759 7.589 7.408 7.226 7.029 6.816 6.671 6.525 6.295 6.126 5.949 5.856 5.659 5.454 5.232 5.108 4.875 4.671 4.527 4.384 4.061 3.856 3.636 3.418 3.155 2.805 2.323 1.062 -5 ,2315 ,KEBNE ,16677767,Wed Nov 24 21:49:12 CET,Wed Nov 24 23:12:48 CET,0.0 1.123 1.568 1.91 2.193 2.426 2.631 2.816 3.119 3.264 3.408 3.582 3.809 3.933 4.163 4.387 4.581 4.672 4.856 5.028 5.272 5.431 5.586 5.803 6.001 6.19 6.372 6.547 6.772 6.984 7.192 7.438 7.672 7.894 8.134 8.397 8.658 8.959 9.27 9.582 9.915 10.297 10.708 11.082 11.512 11.996 12.516 13.049 13.659 14.225 14.541 14.44 14.077 13.602 13.124 12.707 12.342 11.976 11.612 11.241 10.933 10.645 10.354 10.077 9.807 9.555 9.299 9.061 8.859 8.656 8.44 8.257 8.061 7.852 7.687 7.508 7.325 7.134 6.925 6.778 6.624 6.387 6.223 6.049 5.956 5.765 5.566 5.335 5.202 4.971 4.774 4.63 4.476 4.124 3.94 3.732 3.491 3.21 2.835 2.344 1.041 -6 ,4259 ,KEBNE ,16677768,Wed Nov 24 21:49:12 CET,Wed Nov 24 23:12:48 CET,0.0 1.139 1.572 1.909 2.19 2.431 2.641 2.84 3.181 3.337 3.496 3.697 3.917 4.034 4.268 4.481 4.687 4.792 4.984 5.153 5.381 5.527 5.684 5.919 6.127 6.334 6.531 6.711 6.94 7.153 7.364 7.616 7.844 8.059 8.307 8.588 8.85 9.121 9.404 9.724 10.077 10.452 10.864 11.273 11.717 12.172 12.684 13.218 13.738 14.215 14.543 14.421 14.113 13.762 13.36 12.957 12.537 12.138 11.807 11.458 11.123 10.816 10.533 10.271 10.018 9.777 9.519 9.286 9.089 8.876 8.634 8.428 8.224 8.008 7.835 7.655 7.472 7.284 7.086 6.949 6.808 6.592 6.436 6.272 6.186 5.99 5.771 5.538 5.42 5.214 5.057 4.908 4.735 4.365 4.178 3.973 3.738 3.45 3.128 2.731 1.862 -7 ,5253 ,KEBNE ,16677769,Wed Nov 24 21:49:12 CET,Wed Nov 24 23:11:44 CET,0.0 1.18 1.691 2.059 2.325 2.563 2.782 2.965 3.286 3.443 3.588 3.751 3.959 4.085 4.325 4.537 4.731 4.823 4.99 5.155 5.416 5.581 5.736 5.941 6.153 6.365 6.549 6.72 6.941 7.148 7.343 7.571 7.79 8.019 8.274 8.531 8.773 9.049 9.352 9.671 10.004 10.369 10.771 11.161 11.604 12.051 12.525 13.04 13.582 14.059 14.33 14.11 13.693 13.273 12.876 12.477 12.088 11.746 11.446 11.102 10.792 10.506 10.233 9.973 9.715 9.479 9.229 8.995 8.798 8.604 8.396 8.213 8.023 7.817 7.656 7.481 7.279 7.07 6.847 6.691 6.543 6.313 6.148 5.974 5.877 5.671 5.454 5.214 5.09 4.871 4.668 4.513 4.361 4.033 3.827 3.584 3.329 3.056 2.731 2.285 1.115 -8 ,9306 ,KEBNE ,16675496,Wed Nov 24 05:23:29 CET,Wed Nov 24 06:44:47 CET,0.0 1.253 1.726 2.04 2.3 2.539 2.749 2.942 3.302 3.466 3.621 3.816 4.036 4.16 4.399 4.622 4.833 4.929 5.109 5.277 5.526 5.697 5.853 6.06 6.255 6.448 6.642 6.821 7.049 7.273 7.489 7.742 7.969 8.166 8.398 8.685 8.944 9.218 9.514 9.827 10.144 10.488 10.881 11.252 11.664 12.124 12.617 13.092 13.598 14.113 14.438 14.334 14.023 13.655 13.31 12.963 12.587 12.198 11.879 11.549 11.236 10.95 10.672 10.41 10.155 9.924 9.67 9.427 9.214 9.001 8.778 8.584 8.379 8.16 7.987 7.8 7.609 7.411 7.193 7.04 6.877 6.623 6.447 6.266 6.171 5.96 5.755 5.544 5.413 5.193 5.02 4.872 4.716 4.374 4.184 3.971 3.724 3.434 3.106 2.644 1.366 -9 ,26183 ,KEBNE ,16677771,Wed Nov 24 21:49:17 CET,Wed Nov 24 23:09:47 CET,0.0 1.385 1.84 2.205 2.51 2.77 2.993 3.195 3.547 3.714 3.869 4.06 4.286 4.411 4.638 4.845 5.029 5.117 5.292 5.464 5.723 5.885 6.033 6.231 6.407 6.589 6.767 6.931 7.144 7.355 7.552 7.789 8.019 8.241 8.499 8.78 9.042 9.327 9.618 9.922 10.248 10.592 10.963 11.331 11.744 12.189 12.69 13.204 13.737 14.255 14.591 14.516 14.19 13.761 13.331 12.899 12.475 12.085 11.743 11.398 11.099 10.815 10.53 10.267 10.024 9.803 9.569 9.35 9.157 8.953 8.724 8.525 8.327 8.123 7.961 7.792 7.616 7.42 7.211 7.07 6.919 6.671 6.507 6.335 6.237 6.035 5.824 5.61 5.5 5.287 5.126 4.981 4.829 4.503 4.308 4.083 3.835 3.559 3.236 2.797 1.913 -10 ,9931 ,KEBNE ,16675498,Wed Nov 24 05:25:32 CET,Wed Nov 24 06:52:01 CET,0.0 1.303 1.83 2.193 2.458 2.681 2.886 3.088 3.446 3.594 3.734 3.907 4.121 4.239 4.462 4.674 4.879 4.977 5.173 5.363 5.612 5.754 5.891 6.099 6.296 6.485 6.683 6.864 7.077 7.293 7.503 7.735 7.953 8.163 8.392 8.652 8.912 9.195 9.496 9.806 10.126 10.48 10.862 11.211 11.614 12.067 12.521 13.02 13.585 14.069 14.332 14.197 13.892 13.546 13.193 12.848 12.502 12.135 11.806 11.446 11.125 10.84 10.551 10.273 10.025 9.788 9.534 9.313 9.119 8.908 8.685 8.491 8.29 8.061 7.871 7.687 7.496 7.29 7.077 6.928 6.774 6.534 6.365 6.185 6.09 5.889 5.681 5.472 5.354 5.13 4.939 4.795 4.652 4.316 4.113 3.895 3.638 3.325 2.973 2.583 1.578 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_49.txt deleted file mode 100644 index 2e3b5a64..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24419 ,KEBNE ,16677773,Wed Nov 24 21:49:13 CET,Wed Nov 24 23:14:32 CET,0.0 0.916 1.372 1.713 2.005 2.259 2.478 2.688 3.073 3.252 3.419 3.618 3.89 4.044 4.326 4.586 4.828 4.942 5.174 5.391 5.694 5.9 6.098 6.378 6.65 6.91 7.165 7.417 7.747 8.078 8.392 8.755 9.108 9.45 9.849 10.3 10.744 11.236 11.762 12.332 12.938 13.62 14.432 15.269 16.251 17.329 18.567 19.993 21.719 23.748 26.16 28.12 29.182 29.732 30.043 30.214 30.278 30.28 30.214 30.113 29.998 29.866 29.742 29.612 29.465 29.32 29.151 28.992 28.85 28.69 28.506 28.335 28.165 28.013 27.894 27.751 27.576 27.381 27.181 27.051 26.919 26.695 26.523 26.338 26.248 26.043 25.8 25.558 25.432 25.198 24.985 24.851 24.702 24.313 24.09 23.832 23.51 23.135 22.698 22.109 20.05 -2 ,31573 ,KEBNE ,16677774,Wed Nov 24 21:49:13 CET,Wed Nov 24 23:15:50 CET,0.0 1.107 1.545 1.867 2.144 2.398 2.624 2.831 3.241 3.426 3.597 3.792 4.047 4.185 4.439 4.696 4.943 5.065 5.307 5.537 5.868 6.072 6.267 6.558 6.84 7.105 7.362 7.604 7.912 8.219 8.52 8.884 9.23 9.567 9.967 10.425 10.864 11.354 11.887 12.445 13.03 13.692 14.482 15.286 16.212 17.278 18.53 19.915 21.607 23.644 26.051 27.94 28.961 29.475 29.755 29.942 29.999 29.992 29.954 29.876 29.774 29.65 29.509 29.37 29.231 29.096 28.928 28.734 28.572 28.425 28.255 28.096 27.934 27.756 27.603 27.439 27.271 27.089 26.882 26.732 26.58 26.342 26.162 25.977 25.885 25.675 25.448 25.213 25.084 24.863 24.659 24.481 24.285 23.901 23.691 23.427 23.123 22.76 22.331 21.793 18.863 -3 ,17074 ,KEBNE ,16677775,Wed Nov 24 21:49:13 CET,Wed Nov 24 23:11:28 CET,0.0 1.097 1.544 1.901 2.18 2.412 2.631 2.841 3.212 3.379 3.539 3.717 3.964 4.096 4.361 4.621 4.873 4.995 5.235 5.466 5.774 5.963 6.156 6.448 6.725 6.99 7.242 7.494 7.826 8.156 8.474 8.844 9.208 9.563 9.967 10.417 10.852 11.343 11.868 12.423 13.013 13.709 14.539 15.335 16.256 17.328 18.612 20.038 21.699 23.691 26.031 27.894 28.842 29.376 29.672 29.819 29.885 29.869 29.816 29.74 29.63 29.499 29.359 29.231 29.098 28.958 28.806 28.646 28.491 28.332 28.166 28.018 27.836 27.635 27.487 27.336 27.157 26.956 26.745 26.596 26.455 26.224 26.05 25.862 25.769 25.585 25.386 25.14 24.998 24.769 24.583 24.439 24.267 23.883 23.671 23.425 23.125 22.761 22.301 21.65 19.468 -4 ,17281 ,KEBNE ,16677776,Wed Nov 24 21:49:13 CET,Wed Nov 24 23:11:22 CET,0.0 1.074 1.558 1.907 2.194 2.449 2.677 2.89 3.279 3.455 3.62 3.807 4.065 4.207 4.476 4.742 4.987 5.101 5.334 5.569 5.894 6.091 6.289 6.57 6.843 7.111 7.362 7.604 7.924 8.239 8.542 8.907 9.264 9.618 10.042 10.504 10.945 11.434 11.957 12.501 13.086 13.77 14.566 15.375 16.34 17.466 18.754 20.199 21.907 23.882 26.281 28.139 29.074 29.582 29.877 29.982 30.026 30.037 29.973 29.87 29.748 29.623 29.486 29.348 29.203 29.058 28.885 28.712 28.566 28.405 28.224 28.067 27.898 27.719 27.573 27.415 27.248 27.06 26.847 26.701 26.557 26.316 26.134 25.954 25.863 25.652 25.426 25.206 25.082 24.849 24.639 24.491 24.33 23.959 23.758 23.533 23.267 22.924 22.475 21.777 19.399 -5 ,28325 ,KEBNE ,16677777,Wed Nov 24 21:49:17 CET,Wed Nov 24 23:08:39 CET,0.0 1.314 1.708 2.013 2.308 2.563 2.789 2.993 3.361 3.54 3.709 3.907 4.168 4.307 4.576 4.823 5.065 5.187 5.416 5.631 5.937 6.143 6.344 6.627 6.895 7.161 7.419 7.664 7.983 8.294 8.598 8.964 9.321 9.666 10.059 10.492 10.926 11.423 11.983 12.582 13.173 13.853 14.673 15.485 16.451 17.528 18.781 20.245 21.956 24.004 26.544 28.494 29.487 30.037 30.326 30.468 30.497 30.459 30.396 30.317 30.221 30.09 29.921 29.744 29.584 29.434 29.276 29.133 28.997 28.863 28.729 28.598 28.432 28.255 28.125 27.975 27.813 27.65 27.456 27.322 27.186 26.95 26.786 26.615 26.521 26.327 26.126 25.905 25.782 25.554 25.335 25.159 24.961 24.529 24.293 24.023 23.72 23.351 22.88 22.217 19.984 -6 ,25635 ,KEBNE ,16677778,Wed Nov 24 21:49:16 CET,Wed Nov 24 23:09:47 CET,0.0 0.834 1.237 1.571 1.851 2.095 2.314 2.517 2.914 3.098 3.265 3.476 3.74 3.884 4.174 4.432 4.682 4.81 5.047 5.28 5.62 5.829 6.029 6.323 6.607 6.879 7.137 7.385 7.716 8.043 8.36 8.734 9.094 9.443 9.833 10.281 10.724 11.217 11.744 12.323 12.955 13.657 14.477 15.332 16.336 17.424 18.673 20.053 21.738 23.807 26.174 28.036 29.07 29.617 29.893 30.028 30.074 30.077 30.014 29.907 29.805 29.697 29.571 29.432 29.28 29.113 28.952 28.809 28.649 28.472 28.301 28.139 27.967 27.793 27.653 27.51 27.351 27.169 26.989 26.859 26.697 26.436 26.264 26.095 26.004 25.798 25.588 25.367 25.236 24.996 24.748 24.575 24.394 23.971 23.733 23.494 23.196 22.825 22.354 21.697 19.305 -7 ,31534 ,KEBNE ,16677779,Wed Nov 24 21:49:15 CET,Wed Nov 24 23:09:08 CET,0.0 1.006 1.489 1.839 2.134 2.413 2.654 2.876 3.289 3.478 3.652 3.862 4.134 4.281 4.563 4.828 5.071 5.185 5.419 5.66 5.99 6.2 6.406 6.691 6.96 7.22 7.483 7.734 8.051 8.358 8.659 9.026 9.373 9.716 10.126 10.571 10.988 11.459 11.973 12.528 13.131 13.801 14.596 15.408 16.363 17.46 18.748 20.195 21.908 23.954 26.315 28.209 29.238 29.798 30.134 30.272 30.294 30.28 30.226 30.139 30.053 29.962 29.841 29.707 29.563 29.418 29.235 29.062 28.913 28.74 28.558 28.4 28.22 28.017 27.858 27.684 27.506 27.335 27.133 26.988 26.841 26.595 26.419 26.242 26.151 25.951 25.729 25.503 25.376 25.142 24.925 24.764 24.591 24.16 23.906 23.635 23.326 22.972 22.497 21.835 19.812 -8 ,28691 ,KEBNE ,16677780,Wed Nov 24 21:52:19 CET,Wed Nov 24 23:15:42 CET,0.0 1.27 1.785 2.158 2.439 2.666 2.888 3.097 3.473 3.659 3.831 4.037 4.309 4.456 4.733 4.989 5.227 5.343 5.568 5.78 6.091 6.297 6.502 6.794 7.078 7.355 7.622 7.876 8.194 8.497 8.79 9.153 9.49 9.82 10.221 10.681 11.137 11.615 12.117 12.674 13.29 13.986 14.782 15.587 16.562 17.656 18.888 20.287 21.944 23.883 26.26 28.178 29.162 29.733 30.039 30.191 30.25 30.242 30.197 30.135 30.039 29.923 29.796 29.661 29.518 29.375 29.211 29.037 28.886 28.729 28.547 28.391 28.222 28.029 27.87 27.701 27.533 27.366 27.175 27.042 26.898 26.641 26.464 26.297 26.215 26.026 25.802 25.537 25.4 25.18 24.929 24.736 24.564 24.163 23.929 23.675 23.369 23.026 22.525 21.767 19.584 -9 ,12893 ,KEBNE ,16677781,Wed Nov 24 21:52:19 CET,Wed Nov 24 23:15:18 CET,0.0 0.885 1.334 1.67 1.958 2.216 2.439 2.644 3.039 3.218 3.388 3.577 3.834 3.973 4.241 4.501 4.756 4.88 5.113 5.335 5.66 5.864 6.062 6.352 6.619 6.875 7.124 7.367 7.693 8.009 8.314 8.685 9.028 9.363 9.762 10.202 10.637 11.12 11.639 12.211 12.826 13.518 14.328 15.145 16.113 17.217 18.48 19.9 21.648 23.705 26.086 27.893 28.853 29.425 29.723 29.865 29.914 29.889 29.815 29.725 29.632 29.523 29.36 29.181 29.033 28.893 28.719 28.53 28.372 28.211 28.026 27.866 27.695 27.517 27.378 27.238 27.091 26.909 26.705 26.565 26.41 26.145 25.954 25.763 25.671 25.468 25.255 25.007 24.872 24.648 24.447 24.293 24.113 23.68 23.439 23.187 22.887 22.533 22.13 21.486 19.286 -10 ,22347 ,KEBNE ,16677782,Wed Nov 24 21:52:18 CET,Wed Nov 24 23:15:31 CET,0.0 1.194 1.634 1.968 2.244 2.483 2.701 2.913 3.315 3.498 3.665 3.853 4.105 4.238 4.501 4.761 5.01 5.132 5.367 5.588 5.895 6.092 6.285 6.565 6.845 7.109 7.371 7.632 7.954 8.258 8.559 8.927 9.28 9.627 10.028 10.476 10.915 11.407 11.928 12.482 13.101 13.795 14.593 15.411 16.388 17.471 18.728 20.154 21.826 23.785 26.12 28.007 29.045 29.617 29.907 30.088 30.169 30.172 30.117 30.046 29.96 29.827 29.679 29.527 29.369 29.233 29.076 28.903 28.75 28.593 28.428 28.28 28.117 27.948 27.809 27.657 27.497 27.323 27.142 27.003 26.834 26.583 26.416 26.236 26.138 25.925 25.702 25.471 25.342 25.114 24.918 24.746 24.545 24.072 23.82 23.551 23.233 22.864 22.401 21.772 18.43 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_65.txt deleted file mode 100644 index 3a0f9a85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32167 ,KEBNE ,16675509,Wed Nov 24 05:31:41 CET,Wed Nov 24 06:56:38 CET,0.0 1.09 1.559 1.877 2.136 2.378 2.608 2.813 3.183 3.349 3.507 3.712 3.978 4.116 4.363 4.599 4.831 4.94 5.14 5.332 5.622 5.804 5.98 6.24 6.488 6.721 6.951 7.181 7.476 7.75 8.018 8.361 8.685 8.992 9.355 9.76 10.142 10.559 11.013 11.494 12.003 12.575 13.23 13.902 14.7 15.593 16.608 17.785 19.164 20.736 22.609 24.088 24.915 25.368 25.59 25.715 25.782 25.771 25.722 25.663 25.585 25.478 25.362 25.251 25.136 25.024 24.905 24.8 24.693 24.56 24.422 24.306 24.173 24.03 23.928 23.824 23.705 23.57 23.431 23.338 23.234 23.043 22.9 22.75 22.672 22.519 22.356 22.156 22.046 21.84 21.692 21.56 21.427 21.126 20.949 20.754 20.53 20.282 19.959 19.474 18.076 -2 ,30966 ,KEBNE ,16677784,Wed Nov 24 21:52:20 CET,Wed Nov 24 23:16:38 CET,0.0 0.964 1.423 1.802 2.104 2.37 2.613 2.831 3.221 3.395 3.56 3.752 4.008 4.15 4.427 4.677 4.9 5.008 5.224 5.424 5.703 5.884 6.06 6.32 6.573 6.814 7.043 7.264 7.541 7.805 8.058 8.368 8.67 8.956 9.279 9.645 10.013 10.441 10.892 11.359 11.873 12.459 13.12 13.773 14.536 15.403 16.402 17.518 18.86 20.469 22.388 23.943 24.783 25.209 25.449 25.593 25.66 25.666 25.626 25.55 25.452 25.352 25.256 25.14 25.016 24.904 24.785 24.668 24.545 24.416 24.293 24.18 24.047 23.9 23.781 23.651 23.514 23.371 23.212 23.095 22.972 22.784 22.649 22.506 22.431 22.289 22.15 21.992 21.906 21.721 21.595 21.476 21.334 20.987 20.801 20.593 20.369 20.122 19.793 19.327 18.17 -3 ,13777 ,KEBNE ,16677785,Wed Nov 24 21:52:19 CET,Wed Nov 24 23:15:14 CET,0.0 0.905 1.278 1.6 1.869 2.091 2.305 2.508 2.879 3.05 3.209 3.391 3.639 3.768 4.017 4.258 4.494 4.604 4.802 4.988 5.276 5.463 5.65 5.922 6.165 6.402 6.623 6.846 7.148 7.438 7.712 8.035 8.348 8.645 8.985 9.375 9.753 10.169 10.617 11.095 11.603 12.17 12.835 13.503 14.276 15.143 16.161 17.336 18.722 20.295 22.158 23.679 24.523 24.998 25.257 25.383 25.414 25.394 25.359 25.304 25.232 25.157 25.05 24.924 24.802 24.674 24.524 24.396 24.287 24.163 24.033 23.921 23.797 23.665 23.561 23.455 23.324 23.166 23.009 22.899 22.782 22.606 22.462 22.305 22.232 22.069 21.888 21.695 21.59 21.388 21.259 21.138 21.004 20.711 20.546 20.33 20.075 19.79 19.439 18.965 17.695 -4 ,10560 ,KEBNE ,16675512,Wed Nov 24 05:32:43 CET,Wed Nov 24 06:54:12 CET,0.0 1.213 1.667 2.013 2.304 2.569 2.814 3.02 3.368 3.527 3.685 3.849 4.102 4.237 4.477 4.691 4.888 4.996 5.211 5.409 5.702 5.887 6.051 6.292 6.528 6.75 6.971 7.194 7.484 7.767 8.044 8.379 8.697 8.998 9.343 9.723 10.093 10.491 10.917 11.389 11.891 12.44 13.087 13.764 14.567 15.443 16.436 17.6 18.969 20.525 22.348 23.804 24.604 25.072 25.32 25.431 25.468 25.451 25.401 25.336 25.265 25.186 25.104 24.999 24.88 24.77 24.652 24.538 24.425 24.289 24.143 24.015 23.872 23.728 23.62 23.506 23.377 23.226 23.062 22.943 22.818 22.632 22.501 22.359 22.282 22.119 21.94 21.723 21.613 21.412 21.251 21.104 20.953 20.635 20.446 20.242 20.019 19.755 19.421 18.983 17.821 -5 ,24767 ,KEBNE ,16677787,Wed Nov 24 21:52:18 CET,Wed Nov 24 23:15:01 CET,0.0 0.982 1.42 1.763 2.046 2.292 2.511 2.719 3.101 3.28 3.444 3.622 3.875 4.009 4.27 4.511 4.732 4.84 5.052 5.261 5.556 5.744 5.928 6.189 6.434 6.665 6.885 7.099 7.375 7.645 7.905 8.214 8.521 8.814 9.162 9.557 9.926 10.348 10.811 11.307 11.813 12.388 13.058 13.713 14.492 15.373 16.364 17.457 18.757 20.312 22.184 23.664 24.466 24.941 25.213 25.364 25.42 25.41 25.373 25.317 25.246 25.151 25.048 24.936 24.809 24.687 24.563 24.456 24.35 24.222 24.074 23.943 23.807 23.65 23.524 23.413 23.289 23.145 23.001 22.897 22.787 22.599 22.458 22.305 22.223 22.065 21.891 21.681 21.576 21.378 21.238 21.115 20.976 20.664 20.488 20.291 20.077 19.82 19.486 18.999 17.817 -6 ,272 ,KEBNE ,16677788,Wed Nov 24 21:52:18 CET,Wed Nov 24 23:15:16 CET,0.0 1.089 1.524 1.847 2.149 2.423 2.654 2.859 3.2 3.361 3.524 3.712 3.961 4.093 4.336 4.568 4.799 4.91 5.121 5.326 5.616 5.792 5.966 6.228 6.485 6.722 6.934 7.144 7.415 7.678 7.934 8.238 8.532 8.822 9.161 9.552 9.93 10.346 10.803 11.296 11.806 12.368 13.041 13.726 14.538 15.427 16.403 17.571 18.953 20.567 22.465 23.926 24.749 25.228 25.503 25.65 25.701 25.7 25.69 25.681 25.645 25.566 25.459 25.338 25.213 25.086 24.939 24.802 24.681 24.559 24.434 24.317 24.174 24.028 23.912 23.78 23.636 23.488 23.323 23.2 23.068 22.85 22.706 22.572 22.503 22.355 22.192 22.017 21.917 21.716 21.574 21.443 21.307 20.996 20.818 20.614 20.384 20.132 19.849 19.482 18.506 -7 ,7262 ,KEBNE ,16675515,Wed Nov 24 05:33:45 CET,Wed Nov 24 06:55:42 CET,0.0 0.872 1.292 1.603 1.89 2.14 2.353 2.557 2.912 3.073 3.23 3.404 3.65 3.785 4.057 4.299 4.52 4.628 4.837 5.032 5.321 5.507 5.684 5.95 6.207 6.443 6.672 6.898 7.181 7.446 7.699 7.998 8.296 8.604 8.961 9.337 9.701 10.107 10.542 11.018 11.53 12.109 12.775 13.428 14.204 15.06 16.044 17.17 18.458 20.002 21.852 23.303 24.104 24.558 24.806 24.932 24.981 24.974 24.945 24.893 24.83 24.744 24.65 24.556 24.438 24.321 24.195 24.076 23.954 23.823 23.689 23.571 23.44 23.294 23.176 23.05 22.92 22.78 22.634 22.525 22.396 22.198 22.064 21.918 21.842 21.68 21.508 21.338 21.245 21.041 20.872 20.728 20.593 20.321 20.17 19.993 19.774 19.537 19.271 18.879 17.859 -8 ,5453 ,KEBNE ,16677790,Wed Nov 24 21:52:19 CET,Wed Nov 24 23:16:58 CET,0.0 0.959 1.405 1.751 2.029 2.309 2.579 2.801 3.171 3.344 3.506 3.689 3.936 4.068 4.331 4.572 4.794 4.903 5.112 5.315 5.614 5.8 5.976 6.237 6.492 6.734 6.967 7.2 7.495 7.769 8.042 8.373 8.673 8.957 9.302 9.695 10.071 10.492 10.942 11.402 11.885 12.44 13.108 13.816 14.627 15.531 16.574 17.706 19.058 20.631 22.444 23.878 24.66 25.138 25.432 25.584 25.652 25.647 25.58 25.5 25.416 25.31 25.197 25.087 24.978 24.87 24.741 24.605 24.48 24.354 24.22 24.104 23.971 23.829 23.724 23.615 23.497 23.366 23.226 23.123 23.018 22.846 22.72 22.577 22.494 22.326 22.156 21.964 21.858 21.655 21.494 21.355 21.217 20.899 20.711 20.509 20.283 20.023 19.689 19.229 17.963 -9 ,5781 ,KEBNE ,16675517,Wed Nov 24 05:35:52 CET,Wed Nov 24 06:52:34 CET,0.0 0.96 1.424 1.792 2.098 2.347 2.571 2.764 3.101 3.259 3.404 3.57 3.813 3.935 4.171 4.392 4.602 4.707 4.906 5.098 5.377 5.561 5.74 5.996 6.252 6.487 6.712 6.935 7.21 7.482 7.743 8.059 8.38 8.683 9.025 9.418 9.796 10.221 10.676 11.15 11.653 12.22 12.887 13.571 14.373 15.269 16.275 17.45 18.832 20.439 22.381 23.886 24.663 25.082 25.361 25.547 25.616 25.604 25.566 25.527 25.46 25.362 25.272 25.171 25.056 24.943 24.819 24.69 24.563 24.432 24.289 24.164 24.032 23.886 23.759 23.628 23.492 23.346 23.184 23.068 22.951 22.761 22.63 22.492 22.417 22.258 22.087 21.902 21.809 21.618 21.485 21.369 21.234 20.942 20.773 20.575 20.366 20.133 19.834 19.392 18.147 -10 ,12241 ,KEBNE ,16677792,Wed Nov 24 21:56:26 CET,Wed Nov 24 23:19:20 CET,0.0 0.967 1.425 1.758 2.028 2.264 2.476 2.668 3.023 3.196 3.358 3.533 3.786 3.926 4.201 4.45 4.66 4.764 4.976 5.179 5.445 5.61 5.782 6.036 6.277 6.515 6.746 6.957 7.236 7.521 7.792 8.098 8.387 8.674 9.014 9.409 9.805 10.232 10.686 11.178 11.691 12.288 12.965 13.629 14.4 15.267 16.29 17.443 18.777 20.364 22.255 23.742 24.527 24.97 25.249 25.409 25.454 25.451 25.43 25.382 25.315 25.225 25.135 25.028 24.896 24.776 24.651 24.525 24.397 24.256 24.109 23.974 23.828 23.672 23.552 23.422 23.28 23.14 23.0 22.899 22.794 22.632 22.514 22.383 22.309 22.139 21.948 21.751 21.652 21.462 21.355 21.248 21.119 20.824 20.668 20.497 20.29 20.059 19.748 19.291 18.129 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_68.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_68.txt deleted file mode 100644 index 3e27e996..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_68.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18114 ,KEBNE ,16677793,Wed Nov 24 21:56:26 CET,Wed Nov 24 23:18:39 CET,0.0 1.155 1.682 2.052 2.323 2.566 2.775 2.978 3.341 3.491 3.639 3.811 4.052 4.18 4.427 4.655 4.871 4.977 5.19 5.396 5.688 5.877 6.052 6.298 6.553 6.801 7.02 7.232 7.516 7.787 8.044 8.352 8.656 8.939 9.257 9.62 9.97 10.358 10.78 11.214 11.635 12.105 12.648 13.181 13.812 14.503 15.26 16.102 17.057 18.122 19.28 20.021 20.254 20.256 20.154 19.951 19.705 19.472 19.249 18.986 18.778 18.602 18.405 18.192 17.983 17.786 17.575 17.386 17.222 17.048 16.85 16.692 16.527 16.347 16.207 16.051 15.893 15.728 15.537 15.402 15.259 15.043 14.89 14.71 14.619 14.431 14.225 13.998 13.883 13.658 13.507 13.373 13.231 12.916 12.736 12.535 12.286 11.995 11.672 11.228 9.955 -2 ,6228 ,KEBNE ,16675520,Wed Nov 24 05:39:54 CET,Wed Nov 24 07:05:30 CET,0.0 1.301 1.748 2.104 2.413 2.683 2.909 3.123 3.516 3.698 3.87 4.067 4.315 4.441 4.703 4.951 5.174 5.282 5.486 5.679 5.97 6.157 6.325 6.561 6.8 7.036 7.249 7.46 7.743 8.014 8.27 8.564 8.854 9.127 9.425 9.772 10.132 10.521 10.919 11.349 11.811 12.32 12.879 13.432 14.073 14.772 15.585 16.464 17.431 18.511 19.562 20.147 20.289 20.275 20.16 19.971 19.81 19.62 19.378 19.129 18.936 18.75 18.558 18.368 18.164 17.97 17.773 17.588 17.423 17.239 17.06 16.908 16.731 16.545 16.393 16.24 16.095 15.949 15.788 15.672 15.549 15.355 15.219 15.066 14.984 14.818 14.64 14.443 14.341 14.132 14.017 13.907 13.788 13.533 13.384 13.195 12.975 12.723 12.413 12.028 11.116 -3 ,15889 ,KEBNE ,16675521,Wed Nov 24 05:39:54 CET,Wed Nov 24 07:02:06 CET,0.0 1.188 1.614 1.933 2.215 2.472 2.719 2.935 3.288 3.449 3.602 3.782 4.036 4.167 4.421 4.656 4.877 4.982 5.203 5.407 5.674 5.84 5.998 6.237 6.468 6.682 6.881 7.077 7.327 7.577 7.831 8.124 8.401 8.675 8.984 9.325 9.64 9.986 10.375 10.796 11.244 11.729 12.271 12.822 13.485 14.187 14.901 15.692 16.599 17.624 18.757 19.418 19.59 19.569 19.437 19.252 19.038 18.804 18.584 18.326 18.091 17.896 17.714 17.528 17.329 17.136 16.932 16.746 16.592 16.43 16.231 16.057 15.883 15.696 15.539 15.374 15.216 15.056 14.884 14.765 14.648 14.449 14.304 14.153 14.07 13.911 13.751 13.57 13.464 13.243 13.1 12.976 12.851 12.538 12.352 12.157 11.938 11.687 11.373 10.922 9.777 -4 ,26123 ,KEBNE ,16675522,Wed Nov 24 05:39:54 CET,Wed Nov 24 07:01:56 CET,0.0 1.168 1.576 1.9 2.197 2.478 2.709 2.919 3.305 3.48 3.642 3.813 4.078 4.217 4.46 4.696 4.938 5.053 5.265 5.473 5.774 5.969 6.149 6.398 6.636 6.866 7.087 7.301 7.586 7.867 8.12 8.413 8.7 8.97 9.284 9.637 9.968 10.323 10.707 11.124 11.564 12.042 12.588 13.157 13.79 14.477 15.266 16.107 17.051 18.065 19.147 19.848 20.11 20.144 20.045 19.892 19.706 19.496 19.271 19.043 18.858 18.671 18.469 18.267 18.071 17.882 17.667 17.458 17.288 17.125 16.936 16.772 16.601 16.425 16.284 16.124 15.95 15.776 15.604 15.478 15.351 15.147 14.997 14.841 14.757 14.586 14.384 14.146 14.027 13.807 13.675 13.556 13.425 13.126 12.964 12.792 12.593 12.357 12.084 11.738 10.86 -5 ,25789 ,KEBNE ,16675523,Wed Nov 24 05:42:59 CET,Wed Nov 24 07:05:28 CET,0.0 1.073 1.493 1.82 2.114 2.381 2.623 2.849 3.251 3.425 3.579 3.745 3.997 4.142 4.425 4.671 4.881 4.982 5.187 5.382 5.68 5.87 6.046 6.308 6.556 6.779 6.985 7.194 7.462 7.727 7.995 8.307 8.594 8.874 9.192 9.545 9.886 10.248 10.648 11.081 11.524 12.013 12.562 13.112 13.763 14.444 15.213 16.073 17.005 18.052 19.115 19.711 19.882 19.838 19.714 19.516 19.284 19.04 18.808 18.553 18.324 18.115 17.899 17.679 17.467 17.282 17.069 16.857 16.682 16.498 16.309 16.147 15.967 15.777 15.635 15.478 15.305 15.138 14.967 14.843 14.705 14.484 14.328 14.161 14.07 13.884 13.699 13.485 13.369 13.15 12.993 12.852 12.703 12.371 12.174 11.947 11.712 11.43 11.099 10.695 9.592 -6 ,768 ,KEBNE ,16675524,Wed Nov 24 05:43:01 CET,Wed Nov 24 06:59:14 CET,0.0 1.224 1.722 2.081 2.387 2.615 2.821 3.023 3.414 3.596 3.759 3.95 4.223 4.369 4.623 4.867 5.094 5.203 5.42 5.623 5.909 6.099 6.287 6.54 6.781 7.015 7.235 7.459 7.747 8.016 8.259 8.554 8.842 9.116 9.438 9.788 10.129 10.492 10.896 11.332 11.757 12.222 12.769 13.341 13.961 14.618 15.405 16.271 17.203 18.155 19.159 19.821 20.01 19.975 19.827 19.638 19.433 19.22 19.016 18.754 18.496 18.296 18.109 17.902 17.712 17.542 17.36 17.178 17.008 16.821 16.611 16.451 16.289 16.099 15.957 15.811 15.646 15.468 15.266 15.125 14.986 14.77 14.626 14.473 14.392 14.227 14.051 13.855 13.745 13.523 13.378 13.233 13.08 12.751 12.566 12.361 12.128 11.86 11.541 11.117 9.814 -7 ,21044 ,KEBNE ,16677799,Wed Nov 24 21:57:29 CET,Wed Nov 24 23:21:35 CET,0.0 1.08 1.576 1.927 2.222 2.48 2.695 2.892 3.23 3.394 3.549 3.714 3.959 4.094 4.369 4.622 4.848 4.954 5.162 5.368 5.666 5.846 6.015 6.274 6.51 6.728 6.945 7.162 7.437 7.687 7.937 8.249 8.541 8.815 9.134 9.497 9.852 10.234 10.61 11.002 11.419 11.899 12.475 13.043 13.679 14.331 15.089 15.957 16.893 17.909 18.988 19.643 19.835 19.843 19.707 19.473 19.243 19.039 18.843 18.618 18.413 18.219 18.014 17.797 17.577 17.367 17.157 16.98 16.822 16.637 16.423 16.247 16.073 15.878 15.725 15.572 15.409 15.23 15.053 14.934 14.804 14.605 14.465 14.318 14.245 14.088 13.899 13.679 13.565 13.346 13.199 13.055 12.894 12.544 12.349 12.147 11.924 11.67 11.352 10.873 9.464 -8 ,103 ,KEBNE ,16677800,Wed Nov 24 21:56:27 CET,Wed Nov 24 23:18:55 CET,0.0 1.07 1.5 1.867 2.175 2.436 2.678 2.895 3.263 3.438 3.599 3.777 4.027 4.159 4.411 4.648 4.861 4.967 5.174 5.37 5.65 5.826 5.996 6.25 6.492 6.709 6.928 7.156 7.435 7.678 7.913 8.196 8.456 8.715 9.025 9.364 9.691 10.041 10.423 10.845 11.281 11.767 12.335 12.895 13.504 14.165 14.933 15.773 16.697 17.718 18.797 19.502 19.72 19.682 19.564 19.407 19.233 19.034 18.808 18.57 18.372 18.181 17.991 17.81 17.625 17.439 17.249 17.089 16.942 16.769 16.584 16.431 16.272 16.101 15.958 15.806 15.649 15.482 15.315 15.207 15.087 14.873 14.713 14.54 14.454 14.283 14.092 13.879 13.77 13.548 13.412 13.288 13.152 12.845 12.67 12.476 12.255 11.985 11.662 11.235 10.096 -9 ,5245 ,KEBNE ,16675527,Wed Nov 24 05:44:01 CET,Wed Nov 24 07:06:37 CET,0.0 1.347 1.831 2.206 2.501 2.748 2.977 3.184 3.572 3.752 3.921 4.127 4.393 4.536 4.803 5.037 5.24 5.344 5.544 5.728 6.009 6.184 6.353 6.619 6.877 7.116 7.347 7.574 7.856 8.115 8.369 8.67 8.966 9.244 9.552 9.909 10.261 10.652 11.06 11.491 11.94 12.433 12.988 13.533 14.165 14.843 15.622 16.492 17.456 18.498 19.586 20.246 20.424 20.381 20.288 20.152 19.97 19.765 19.562 19.335 19.128 18.923 18.711 18.501 18.294 18.095 17.873 17.685 17.525 17.356 17.178 17.025 16.864 16.69 16.555 16.41 16.251 16.085 15.915 15.794 15.67 15.478 15.339 15.186 15.1 14.914 14.719 14.515 14.4 14.177 14.033 13.894 13.746 13.421 13.243 13.054 12.816 12.523 12.172 11.692 10.427 -10 ,23634 ,KEBNE ,16677802,Wed Nov 24 21:56:28 CET,Wed Nov 24 23:23:25 CET,0.0 1.17 1.584 1.889 2.159 2.407 2.623 2.829 3.223 3.396 3.557 3.737 3.983 4.11 4.367 4.61 4.818 4.923 5.135 5.326 5.584 5.751 5.916 6.152 6.377 6.6 6.823 7.029 7.294 7.552 7.796 8.089 8.36 8.625 8.939 9.289 9.633 10.0 10.388 10.806 11.222 11.668 12.208 12.769 13.398 14.075 14.801 15.591 16.546 17.612 18.693 19.288 19.437 19.415 19.286 19.114 18.922 18.702 18.489 18.254 18.046 17.841 17.614 17.411 17.227 17.044 16.845 16.667 16.506 16.322 16.131 15.968 15.784 15.591 15.447 15.303 15.149 14.977 14.798 14.669 14.533 14.325 14.166 13.993 13.907 13.731 13.544 13.342 13.224 12.999 12.864 12.74 12.605 12.28 12.09 11.89 11.671 11.399 11.059 10.642 9.385 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_49.txt deleted file mode 100644 index e16e5279..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4978 ,KEBNE ,16677803,Wed Nov 24 21:56:27 CET,Wed Nov 24 23:19:12 CET,0.0 0.943 1.331 1.641 1.911 2.152 2.386 2.593 2.952 3.12 3.273 3.457 3.695 3.83 4.104 4.345 4.564 4.673 4.884 5.079 5.36 5.533 5.703 5.953 6.191 6.421 6.633 6.838 7.114 7.381 7.638 7.947 8.241 8.527 8.856 9.222 9.571 9.964 10.407 10.884 11.362 11.883 12.498 13.138 13.895 14.694 15.605 16.656 17.855 19.248 20.79 21.784 22.157 22.235 22.154 22.014 21.881 21.73 21.54 21.317 21.111 20.905 20.681 20.453 20.231 20.026 19.799 19.575 19.385 19.181 18.949 18.757 18.567 18.346 18.169 17.99 17.803 17.608 17.392 17.227 17.044 16.766 16.575 16.38 16.284 16.073 15.82 15.559 15.417 15.157 14.884 14.694 14.496 14.063 13.775 13.446 13.099 12.664 12.176 11.527 9.165 -2 ,28776 ,KEBNE ,16677804,Wed Nov 24 21:56:28 CET,Wed Nov 24 23:19:50 CET,0.0 1.173 1.639 1.977 2.275 2.55 2.783 2.989 3.35 3.514 3.669 3.866 4.111 4.241 4.474 4.697 4.924 5.038 5.259 5.469 5.772 5.96 6.135 6.4 6.649 6.877 7.102 7.318 7.601 7.868 8.127 8.436 8.713 8.974 9.286 9.639 9.996 10.401 10.824 11.281 11.756 12.288 12.898 13.513 14.25 15.045 15.932 16.95 18.169 19.535 21.083 22.062 22.428 22.589 22.563 22.413 22.229 22.043 21.823 21.592 21.388 21.159 20.937 20.722 20.509 20.304 20.066 19.852 19.668 19.457 19.216 19.022 18.82 18.599 18.433 18.25 18.056 17.851 17.623 17.476 17.305 17.001 16.809 16.615 16.504 16.278 16.05 15.795 15.658 15.422 15.183 15.011 14.823 14.341 14.068 13.776 13.436 13.024 12.508 11.836 9.649 -3 ,10926 ,KEBNE ,16677805,Wed Nov 24 21:56:28 CET,Wed Nov 24 23:20:12 CET,0.0 1.097 1.553 1.899 2.171 2.393 2.595 2.79 3.144 3.313 3.481 3.688 3.938 4.074 4.326 4.57 4.797 4.903 5.111 5.309 5.593 5.769 5.938 6.196 6.446 6.682 6.906 7.122 7.408 7.691 7.955 8.26 8.549 8.831 9.164 9.529 9.872 10.256 10.681 11.14 11.619 12.152 12.81 13.49 14.246 15.057 15.988 17.05 18.266 19.617 21.06 22.1 22.512 22.629 22.645 22.558 22.412 22.217 22.018 21.82 21.629 21.419 21.202 20.986 20.773 20.559 20.323 20.12 19.936 19.733 19.515 19.317 19.101 18.882 18.711 18.529 18.335 18.136 17.926 17.773 17.621 17.389 17.217 17.024 16.915 16.665 16.41 16.139 15.995 15.766 15.556 15.386 15.186 14.723 14.472 14.2 13.864 13.477 13.033 12.359 9.524 -4 ,20971 ,KEBNE ,16677806,Wed Nov 24 21:56:28 CET,Wed Nov 24 23:19:38 CET,0.0 1.022 1.445 1.766 2.049 2.294 2.509 2.704 3.054 3.214 3.371 3.571 3.818 3.959 4.231 4.471 4.698 4.805 5.019 5.238 5.533 5.705 5.876 6.137 6.391 6.631 6.856 7.071 7.346 7.613 7.869 8.176 8.478 8.768 9.1 9.475 9.832 10.219 10.642 11.086 11.56 12.091 12.694 13.332 14.083 14.911 15.815 16.847 18.109 19.507 20.979 21.983 22.407 22.542 22.527 22.417 22.256 22.051 21.828 21.563 21.332 21.124 20.885 20.661 20.433 20.183 19.932 19.721 19.517 19.298 19.08 18.893 18.699 18.498 18.328 18.153 17.983 17.809 17.605 17.451 17.285 17.014 16.83 16.627 16.519 16.313 16.094 15.841 15.7 15.453 15.198 15.023 14.83 14.423 14.194 13.939 13.646 13.273 12.81 12.197 9.253 -5 ,30343 ,KEBNE ,16677807,Wed Nov 24 21:56:27 CET,Wed Nov 24 23:19:14 CET,0.0 1.027 1.463 1.785 2.055 2.297 2.515 2.709 3.057 3.223 3.378 3.57 3.814 3.946 4.209 4.462 4.686 4.793 5.013 5.218 5.508 5.709 5.901 6.161 6.405 6.657 6.907 7.129 7.416 7.695 7.948 8.246 8.548 8.844 9.173 9.535 9.878 10.258 10.674 11.128 11.611 12.146 12.767 13.407 14.16 15.006 15.968 16.98 18.14 19.44 20.91 21.867 22.191 22.306 22.311 22.214 22.043 21.825 21.606 21.38 21.164 20.952 20.74 20.503 20.274 20.058 19.821 19.622 19.426 19.218 19.011 18.831 18.645 18.422 18.233 18.042 17.835 17.619 17.399 17.237 17.067 16.799 16.612 16.413 16.304 16.076 15.848 15.603 15.472 15.233 14.973 14.785 14.601 14.209 13.955 13.667 13.349 13.005 12.555 11.831 8.484 -6 ,27646 ,KEBNE ,16677808,Wed Nov 24 21:56:27 CET,Wed Nov 24 23:18:39 CET,0.0 0.913 1.341 1.663 1.946 2.209 2.438 2.647 3.012 3.169 3.312 3.463 3.686 3.814 4.061 4.288 4.496 4.599 4.808 5.005 5.289 5.477 5.653 5.908 6.15 6.377 6.596 6.807 7.096 7.38 7.638 7.947 8.254 8.559 8.9 9.257 9.607 9.994 10.416 10.874 11.342 11.865 12.476 13.092 13.826 14.653 15.582 16.594 17.74 19.037 20.575 21.631 22.007 22.085 22.052 21.955 21.796 21.578 21.361 21.143 20.936 20.711 20.489 20.279 20.053 19.863 19.658 19.443 19.255 19.057 18.83 18.617 18.398 18.192 18.017 17.829 17.636 17.43 17.216 17.062 16.893 16.65 16.482 16.283 16.174 15.953 15.71 15.431 15.289 15.055 14.844 14.681 14.494 14.061 13.821 13.562 13.227 12.802 12.306 11.657 9.553 -7 ,22982 ,KEBNE ,16677809,Wed Nov 24 21:56:27 CET,Wed Nov 24 23:19:23 CET,0.0 0.903 1.359 1.706 1.99 2.228 2.447 2.657 3.021 3.199 3.367 3.565 3.807 3.939 4.19 4.423 4.641 4.746 4.952 5.15 5.431 5.606 5.783 6.039 6.281 6.52 6.743 6.951 7.222 7.481 7.736 8.045 8.335 8.62 8.967 9.344 9.689 10.085 10.523 10.99 11.487 12.035 12.661 13.291 14.0 14.787 15.74 16.793 17.986 19.399 20.99 22.061 22.454 22.545 22.503 22.397 22.23 22.037 21.861 21.646 21.423 21.204 20.959 20.722 20.513 20.31 20.108 19.916 19.731 19.528 19.323 19.139 18.925 18.705 18.524 18.346 18.168 17.968 17.746 17.579 17.409 17.153 16.973 16.779 16.678 16.467 16.217 15.934 15.781 15.541 15.315 15.143 14.961 14.526 14.266 13.982 13.636 13.206 12.685 12.005 9.45 -8 ,21386 ,KEBNE ,16677810,Wed Nov 24 21:56:28 CET,Wed Nov 24 23:20:01 CET,0.0 0.883 1.311 1.655 1.92 2.148 2.36 2.559 2.922 3.087 3.243 3.431 3.671 3.802 4.052 4.291 4.522 4.63 4.835 5.031 5.315 5.502 5.678 5.92 6.151 6.376 6.595 6.804 7.077 7.355 7.625 7.941 8.25 8.555 8.897 9.284 9.657 10.098 10.614 11.124 11.626 12.17 12.8 13.44 14.181 14.997 15.925 16.981 18.22 19.602 21.154 22.137 22.488 22.563 22.485 22.336 22.151 21.909 21.673 21.443 21.257 21.079 20.868 20.657 20.437 20.23 20.02 19.815 19.621 19.424 19.224 19.044 18.854 18.64 18.465 18.293 18.108 17.898 17.673 17.526 17.358 17.079 16.884 16.669 16.562 16.333 16.082 15.814 15.676 15.444 15.213 15.037 14.864 14.457 14.172 13.876 13.534 13.113 12.63 11.96 8.834 -9 ,12706 ,KEBNE ,16677811,Wed Nov 24 21:56:27 CET,Wed Nov 24 23:19:19 CET,0.0 0.946 1.342 1.646 1.91 2.142 2.363 2.575 2.915 3.065 3.227 3.433 3.679 3.82 4.083 4.319 4.539 4.641 4.831 5.02 5.302 5.484 5.659 5.92 6.173 6.41 6.631 6.856 7.155 7.426 7.672 7.968 8.26 8.548 8.885 9.265 9.625 10.01 10.441 10.918 11.408 11.948 12.564 13.166 13.857 14.63 15.539 16.558 17.717 19.064 20.637 21.687 22.11 22.33 22.397 22.317 22.143 21.935 21.73 21.501 21.311 21.129 20.918 20.698 20.474 20.252 20.019 19.819 19.639 19.44 19.208 19.014 18.819 18.604 18.43 18.237 18.037 17.825 17.599 17.435 17.255 16.98 16.793 16.6 16.494 16.274 16.05 15.805 15.669 15.446 15.23 15.059 14.888 14.442 14.187 13.947 13.654 13.254 12.779 12.049 9.163 -10 ,4889 ,KEBNE ,16677812,Wed Nov 24 21:56:27 CET,Wed Nov 24 23:18:54 CET,0.0 1.101 1.502 1.811 2.079 2.317 2.53 2.725 3.087 3.263 3.419 3.615 3.861 3.988 4.233 4.46 4.672 4.775 4.98 5.184 5.47 5.653 5.834 6.084 6.321 6.56 6.78 6.983 7.249 7.513 7.774 8.075 8.358 8.638 8.963 9.34 9.711 10.121 10.548 11.013 11.533 12.095 12.737 13.395 14.142 14.974 15.945 17.024 18.262 19.607 21.061 22.023 22.329 22.382 22.332 22.225 22.065 21.88 21.697 21.479 21.252 21.012 20.757 20.516 20.305 20.099 19.863 19.665 19.498 19.312 19.105 18.928 18.742 18.525 18.355 18.19 18.029 17.84 17.595 17.424 17.263 16.996 16.786 16.548 16.432 16.212 15.956 15.666 15.517 15.278 15.05 14.87 14.681 14.289 14.051 13.792 13.494 13.106 12.66 12.036 9.144 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_65.txt deleted file mode 100644 index b826592f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18729 ,KEBNE ,17023929,Wed Dec 22 08:45:55 CET,Wed Dec 22 10:08:03 CET,0.0 1.132 1.614 2.002 2.295 2.55 2.773 2.976 3.342 3.502 3.666 3.888 4.141 4.274 4.523 4.753 4.962 5.063 5.261 5.442 5.7 5.874 6.049 6.293 6.513 6.725 6.936 7.138 7.404 7.659 7.902 8.208 8.497 8.765 9.088 9.451 9.773 10.129 10.512 10.905 11.314 11.778 12.336 12.897 13.504 14.151 14.92 15.799 16.778 17.832 18.918 19.51 19.638 19.574 19.425 19.218 18.981 18.738 18.503 18.223 17.963 17.726 17.482 17.229 16.984 16.754 16.505 16.276 16.074 15.875 15.667 15.486 15.299 15.103 14.939 14.764 14.59 14.394 14.171 14.026 13.872 13.616 13.441 13.251 13.151 12.941 12.728 12.505 12.38 12.157 11.955 11.791 11.624 11.268 11.061 10.835 10.587 10.269 9.87 9.306 7.526 -2 ,20832 ,KEBNE ,17023930,Wed Dec 22 08:46:59 CET,Wed Dec 22 10:11:13 CET,0.0 1.116 1.579 1.948 2.247 2.481 2.712 2.934 3.302 3.466 3.621 3.83 4.073 4.199 4.451 4.682 4.891 4.989 5.184 5.369 5.637 5.816 5.988 6.235 6.468 6.685 6.9 7.114 7.387 7.644 7.888 8.193 8.49 8.759 9.07 9.426 9.764 10.154 10.576 10.996 11.424 11.919 12.519 13.128 13.811 14.528 15.347 16.254 17.239 18.241 19.254 19.864 20.012 19.936 19.755 19.554 19.32 19.075 18.829 18.51 18.225 17.969 17.703 17.456 17.219 16.995 16.751 16.536 16.355 16.173 15.976 15.792 15.585 15.373 15.212 15.028 14.827 14.627 14.422 14.272 14.108 13.857 13.683 13.506 13.42 13.238 13.034 12.798 12.675 12.455 12.261 12.113 11.951 11.561 11.335 11.1 10.82 10.488 10.107 9.579 8.024 -3 ,867 ,KEBNE ,17023931,Wed Dec 22 08:46:59 CET,Wed Dec 22 10:08:51 CET,0.0 1.196 1.65 1.965 2.228 2.471 2.707 2.915 3.25 3.398 3.547 3.745 3.991 4.124 4.365 4.594 4.81 4.921 5.133 5.33 5.615 5.78 5.941 6.179 6.402 6.627 6.852 7.079 7.362 7.616 7.854 8.148 8.439 8.699 9.004 9.355 9.691 10.072 10.473 10.885 11.318 11.808 12.371 12.951 13.632 14.349 15.179 16.099 17.098 18.151 19.217 19.847 20.0 19.972 19.801 19.562 19.319 19.056 18.789 18.497 18.226 17.977 17.744 17.52 17.292 17.069 16.831 16.615 16.421 16.212 16.002 15.816 15.612 15.397 15.221 15.027 14.819 14.612 14.391 14.244 14.095 13.842 13.664 13.481 13.381 13.16 12.932 12.686 12.554 12.325 12.131 11.984 11.827 11.455 11.237 10.992 10.702 10.353 9.946 9.398 7.901 -4 ,24558 ,KEBNE ,17023932,Wed Dec 22 08:46:59 CET,Wed Dec 22 10:10:35 CET,0.0 1.088 1.519 1.851 2.143 2.398 2.644 2.871 3.221 3.372 3.523 3.717 3.961 4.09 4.323 4.539 4.749 4.847 5.048 5.252 5.523 5.695 5.866 6.101 6.332 6.556 6.776 6.982 7.234 7.485 7.728 8.026 8.322 8.606 8.929 9.294 9.636 9.997 10.394 10.817 11.249 11.73 12.302 12.876 13.543 14.266 15.07 15.993 17.003 18.06 19.186 19.826 19.96 19.912 19.754 19.501 19.245 18.992 18.732 18.449 18.197 17.954 17.701 17.444 17.211 17.011 16.782 16.552 16.355 16.143 15.924 15.746 15.549 15.333 15.162 14.982 14.775 14.555 14.333 14.191 14.046 13.798 13.617 13.434 13.34 13.128 12.899 12.656 12.529 12.304 12.101 11.945 11.782 11.433 11.229 10.992 10.742 10.444 10.007 9.389 8.071 -5 ,19285 ,KEBNE ,17023933,Wed Dec 22 08:46:59 CET,Wed Dec 22 10:11:29 CET,0.0 1.328 1.79 2.14 2.429 2.687 2.925 3.142 3.514 3.681 3.837 4.021 4.254 4.382 4.63 4.863 5.072 5.168 5.358 5.544 5.813 5.975 6.131 6.378 6.618 6.846 7.068 7.278 7.544 7.801 8.046 8.344 8.636 8.909 9.22 9.575 9.901 10.265 10.672 11.084 11.512 12.0 12.556 13.093 13.728 14.451 15.245 16.091 17.062 18.104 19.157 19.705 19.804 19.681 19.471 19.255 19.033 18.765 18.496 18.222 17.992 17.768 17.544 17.346 17.143 16.933 16.711 16.508 16.322 16.122 15.918 15.749 15.561 15.35 15.175 14.99 14.807 14.614 14.398 14.242 14.081 13.837 13.657 13.469 13.374 13.17 12.941 12.693 12.567 12.345 12.159 12.006 11.846 11.481 11.261 11.005 10.704 10.38 9.978 9.452 7.108 -6 ,6243 ,KEBNE ,17023934,Wed Dec 22 08:48:00 CET,Wed Dec 22 10:11:25 CET,0.0 1.246 1.661 1.988 2.258 2.504 2.738 2.948 3.29 3.449 3.613 3.808 4.046 4.18 4.429 4.657 4.879 4.989 5.198 5.391 5.667 5.84 6.009 6.257 6.499 6.734 6.953 7.16 7.438 7.689 7.924 8.21 8.484 8.754 9.07 9.427 9.766 10.123 10.515 10.921 11.32 11.791 12.343 12.886 13.515 14.213 14.988 15.811 16.752 17.818 18.923 19.544 19.658 19.576 19.415 19.185 18.929 18.657 18.392 18.116 17.886 17.664 17.429 17.194 16.962 16.73 16.486 16.288 16.117 15.926 15.695 15.492 15.291 15.081 14.909 14.736 14.554 14.356 14.153 14.015 13.861 13.609 13.436 13.255 13.159 12.952 12.733 12.496 12.367 12.142 11.931 11.768 11.608 11.251 11.029 10.789 10.546 10.262 9.911 9.478 7.631 -7 ,2463 ,KEBNE ,17023935,Wed Dec 22 08:46:59 CET,Wed Dec 22 10:08:48 CET,0.0 1.249 1.687 2.028 2.312 2.56 2.782 2.981 3.344 3.505 3.66 3.839 4.073 4.204 4.458 4.697 4.91 5.014 5.22 5.407 5.683 5.86 6.031 6.29 6.534 6.751 6.96 7.168 7.434 7.692 7.939 8.229 8.508 8.78 9.091 9.44 9.795 10.167 10.554 10.988 11.435 11.929 12.486 13.038 13.684 14.394 15.187 16.064 17.061 18.078 19.143 19.809 19.973 19.945 19.787 19.554 19.313 19.039 18.769 18.505 18.266 18.02 17.765 17.504 17.247 17.014 16.758 16.521 16.339 16.147 15.928 15.753 15.564 15.349 15.177 14.991 14.799 14.616 14.416 14.271 14.125 13.901 13.732 13.543 13.447 13.251 13.034 12.788 12.662 12.444 12.263 12.114 11.956 11.577 11.352 11.118 10.864 10.566 10.214 9.748 8.286 -8 ,27182 ,KEBNE ,17023936,Wed Dec 22 08:46:59 CET,Wed Dec 22 10:10:15 CET,0.0 1.062 1.507 1.838 2.108 2.34 2.56 2.77 3.138 3.301 3.455 3.628 3.872 4.014 4.257 4.476 4.692 4.797 4.993 5.194 5.5 5.683 5.857 6.114 6.352 6.572 6.785 7.002 7.273 7.535 7.792 8.108 8.398 8.657 8.965 9.319 9.672 10.045 10.43 10.829 11.249 11.749 12.33 12.891 13.542 14.258 15.058 15.959 16.93 17.973 19.036 19.602 19.718 19.666 19.53 19.323 19.088 18.836 18.57 18.267 17.995 17.742 17.501 17.27 17.038 16.816 16.579 16.376 16.203 16.003 15.777 15.593 15.404 15.185 15.008 14.83 14.637 14.429 14.206 14.05 13.895 13.655 13.486 13.305 13.211 13.03 12.835 12.621 12.504 12.286 12.113 11.965 11.812 11.48 11.287 11.059 10.787 10.482 10.123 9.628 8.126 -9 ,15883 ,KEBNE ,17023937,Wed Dec 22 08:46:59 CET,Wed Dec 22 10:10:38 CET,0.0 1.321 1.828 2.188 2.478 2.727 2.956 3.159 3.509 3.661 3.812 4.015 4.265 4.395 4.629 4.854 5.078 5.183 5.381 5.57 5.834 6.005 6.177 6.426 6.656 6.877 7.093 7.304 7.571 7.829 8.071 8.362 8.648 8.925 9.239 9.571 9.89 10.258 10.66 11.08 11.52 12.012 12.557 13.109 13.777 14.534 15.355 16.17 17.099 18.185 19.342 20.025 20.204 20.143 19.957 19.719 19.472 19.202 18.948 18.682 18.423 18.167 17.921 17.684 17.466 17.265 17.034 16.824 16.648 16.464 16.253 16.072 15.877 15.667 15.507 15.327 15.139 14.964 14.772 14.626 14.478 14.254 14.092 13.899 13.8 13.597 13.367 13.12 12.992 12.771 12.577 12.415 12.244 11.907 11.71 11.479 11.233 10.966 10.592 10.028 8.365 -10 ,20532 ,KEBNE ,17023938,Wed Dec 22 08:46:59 CET,Wed Dec 22 10:10:54 CET,0.0 1.098 1.581 1.955 2.269 2.559 2.814 3.029 3.445 3.63 3.79 3.984 4.227 4.36 4.607 4.831 5.042 5.147 5.35 5.548 5.841 6.027 6.197 6.432 6.661 6.89 7.103 7.304 7.565 7.813 8.043 8.324 8.601 8.877 9.197 9.54 9.878 10.253 10.651 11.075 11.505 11.962 12.498 13.06 13.699 14.387 15.159 16.0 16.966 17.991 18.931 19.491 19.659 19.631 19.497 19.292 19.066 18.831 18.59 18.309 18.028 17.758 17.504 17.259 17.008 16.765 16.512 16.298 16.109 15.888 15.657 15.463 15.268 15.064 14.891 14.708 14.52 14.326 14.126 13.976 13.803 13.551 13.384 13.205 13.107 12.896 12.666 12.417 12.291 12.062 11.858 11.708 11.557 11.196 10.98 10.734 10.445 10.106 9.708 9.181 7.658 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_65.txt deleted file mode 100644 index 3825384a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30849 ,KEBNE ,16677813,Wed Nov 24 21:56:27 CET,Wed Nov 24 23:20:19 CET,0.0 0.879 1.24 1.494 1.711 1.899 2.073 2.229 2.523 2.652 2.767 2.908 3.103 3.202 3.39 3.562 3.717 3.791 3.935 4.082 4.301 4.436 4.566 4.756 4.935 5.099 5.25 5.391 5.581 5.772 5.942 6.141 6.331 6.511 6.715 6.938 7.143 7.37 7.617 7.857 8.105 8.373 8.672 8.974 9.287 9.62 9.998 10.341 10.653 10.882 10.794 10.321 9.818 9.3 8.782 8.284 7.813 7.382 6.979 6.554 6.207 5.894 5.614 5.336 5.048 4.775 4.469 4.201 3.967 3.706 3.439 3.23 2.997 2.74 2.543 2.344 2.135 1.904 1.654 1.486 1.321 1.056 0.86 0.648 0.536 0.304 0.06 -0.202 -0.341 -0.576 -0.782 -0.939 -1.12 -1.541 -1.777 -2.038 -2.319 -2.657 -3.068 -3.632 -6.329 -2 ,20098 ,KEBNE ,16677814,Wed Nov 24 21:57:28 CET,Wed Nov 24 23:19:50 CET,0.0 1.155 1.556 1.848 2.112 2.347 2.537 2.714 3.015 3.145 3.268 3.418 3.619 3.733 3.94 4.12 4.296 4.381 4.534 4.679 4.879 5.008 5.136 5.312 5.48 5.643 5.81 5.962 6.132 6.295 6.467 6.681 6.871 7.047 7.244 7.467 7.684 7.918 8.146 8.378 8.626 8.907 9.233 9.528 9.84 10.164 10.511 10.837 11.121 11.317 11.263 10.811 10.232 9.704 9.208 8.706 8.237 7.794 7.404 7.008 6.628 6.263 5.936 5.622 5.309 5.028 4.713 4.421 4.176 3.93 3.675 3.45 3.218 2.974 2.776 2.565 2.326 2.085 1.851 1.683 1.503 1.225 1.037 0.82 0.705 0.463 0.203 -0.036 -0.166 -0.388 -0.591 -0.766 -0.948 -1.32 -1.508 -1.739 -2.017 -2.316 -2.671 -3.206 -5.613 -3 ,30649 ,KEBNE ,16677815,Wed Nov 24 21:57:29 CET,Wed Nov 24 23:24:02 CET,0.0 1.126 1.546 1.873 2.134 2.348 2.539 2.712 3.016 3.152 3.285 3.45 3.65 3.757 3.951 4.136 4.319 4.397 4.557 4.711 4.902 5.031 5.166 5.348 5.515 5.686 5.84 5.98 6.157 6.322 6.49 6.706 6.896 7.075 7.296 7.534 7.743 7.974 8.216 8.461 8.721 9.001 9.307 9.599 9.923 10.273 10.66 11.011 11.295 11.503 11.48 11.095 10.63 10.125 9.616 9.155 8.724 8.267 7.847 7.423 7.051 6.717 6.378 6.036 5.738 5.473 5.197 4.941 4.7 4.439 4.148 3.908 3.663 3.414 3.226 3.031 2.82 2.607 2.395 2.243 2.088 1.839 1.646 1.448 1.344 1.121 0.887 0.641 0.511 0.295 0.114 -0.049 -0.227 -0.625 -0.855 -1.15 -1.457 -1.774 -2.169 -2.684 -4.57 -4 ,30417 ,KEBNE ,16677816,Wed Nov 24 21:57:28 CET,Wed Nov 24 23:21:48 CET,0.0 0.947 1.375 1.667 1.895 2.109 2.31 2.501 2.824 2.958 3.085 3.238 3.444 3.559 3.774 3.974 4.17 4.264 4.442 4.6 4.807 4.938 5.06 5.245 5.433 5.612 5.78 5.934 6.119 6.299 6.472 6.675 6.86 7.039 7.259 7.503 7.728 7.943 8.173 8.418 8.659 8.934 9.244 9.544 9.863 10.186 10.513 10.817 11.121 11.335 11.273 10.845 10.326 9.776 9.204 8.638 8.144 7.714 7.336 6.946 6.601 6.249 5.929 5.638 5.338 5.063 4.764 4.49 4.27 4.029 3.764 3.53 3.286 3.046 2.855 2.66 2.451 2.219 1.963 1.792 1.619 1.335 1.137 0.921 0.802 0.555 0.304 0.03 -0.115 -0.353 -0.568 -0.742 -0.933 -1.321 -1.546 -1.808 -2.106 -2.49 -2.924 -3.486 -6.148 -5 ,18851 ,KEBNE ,16677817,Wed Nov 24 21:58:30 CET,Wed Nov 24 23:23:33 CET,0.0 1.04 1.433 1.735 1.972 2.178 2.35 2.502 2.794 2.934 3.073 3.244 3.45 3.561 3.785 3.997 4.174 4.251 4.402 4.548 4.754 4.886 5.014 5.206 5.382 5.546 5.7 5.851 6.043 6.218 6.395 6.599 6.784 6.968 7.173 7.392 7.608 7.834 8.061 8.32 8.581 8.848 9.129 9.393 9.708 10.025 10.341 10.633 10.875 11.049 10.956 10.552 10.062 9.503 8.956 8.418 7.947 7.514 7.122 6.73 6.373 6.047 5.71 5.359 5.033 4.736 4.421 4.155 3.927 3.677 3.408 3.184 2.966 2.73 2.531 2.333 2.14 1.932 1.704 1.532 1.365 1.126 0.937 0.726 0.619 0.387 0.151 -0.105 -0.25 -0.477 -0.671 -0.825 -0.993 -1.354 -1.554 -1.806 -2.098 -2.438 -2.91 -3.612 -6.074 -6 ,5478 ,KEBNE ,16677818,Wed Nov 24 21:57:28 CET,Wed Nov 24 23:20:25 CET,0.0 1.294 1.729 2.055 2.318 2.559 2.763 2.934 3.254 3.406 3.54 3.693 3.899 4.014 4.224 4.418 4.602 4.696 4.87 5.027 5.252 5.395 5.523 5.698 5.864 6.021 6.17 6.326 6.529 6.712 6.882 7.082 7.272 7.458 7.678 7.901 8.109 8.338 8.579 8.83 9.063 9.317 9.614 9.909 10.265 10.641 10.995 11.293 11.584 11.803 11.747 11.351 10.841 10.269 9.721 9.195 8.721 8.277 7.873 7.467 7.113 6.796 6.488 6.179 5.897 5.627 5.344 5.106 4.879 4.639 4.403 4.199 3.965 3.725 3.53 3.322 3.115 2.896 2.677 2.518 2.333 2.043 1.834 1.622 1.512 1.289 1.062 0.815 0.673 0.433 0.226 0.06 -0.118 -0.508 -0.736 -1.001 -1.303 -1.639 -2.032 -2.593 -4.751 -7 ,19704 ,KEBNE ,16677819,Wed Nov 24 21:57:29 CET,Wed Nov 24 23:20:52 CET,0.0 0.871 1.28 1.586 1.824 2.024 2.216 2.387 2.69 2.83 2.958 3.105 3.297 3.404 3.634 3.841 4.007 4.09 4.251 4.393 4.617 4.758 4.886 5.073 5.25 5.417 5.583 5.75 5.951 6.117 6.282 6.49 6.679 6.85 7.043 7.262 7.473 7.691 7.909 8.146 8.391 8.643 8.927 9.205 9.494 9.809 10.167 10.506 10.785 10.97 10.968 10.64 10.178 9.646 9.119 8.624 8.156 7.714 7.33 6.902 6.515 6.179 5.848 5.523 5.216 4.949 4.653 4.389 4.166 3.915 3.642 3.41 3.174 2.928 2.737 2.544 2.339 2.113 1.859 1.685 1.507 1.219 1.026 0.828 0.726 0.513 0.281 0.045 -0.075 -0.297 -0.484 -0.638 -0.818 -1.214 -1.437 -1.686 -1.959 -2.288 -2.71 -3.268 -5.412 -8 ,27438 ,KEBNE ,16677820,Wed Nov 24 21:57:29 CET,Wed Nov 24 23:21:12 CET,0.0 0.861 1.269 1.605 1.89 2.105 2.304 2.488 2.79 2.921 3.048 3.215 3.413 3.511 3.695 3.873 4.054 4.148 4.322 4.472 4.683 4.818 4.941 5.119 5.293 5.449 5.603 5.766 5.961 6.137 6.309 6.511 6.705 6.894 7.114 7.351 7.567 7.774 7.98 8.203 8.426 8.673 8.97 9.27 9.592 9.912 10.259 10.598 10.86 11.023 10.996 10.582 9.995 9.419 8.896 8.389 7.938 7.508 7.071 6.641 6.276 5.913 5.57 5.242 4.931 4.64 4.329 4.059 3.819 3.588 3.347 3.125 2.896 2.65 2.458 2.258 2.038 1.801 1.566 1.409 1.239 0.983 0.802 0.611 0.508 0.288 0.049 -0.221 -0.364 -0.598 -0.804 -0.968 -1.151 -1.562 -1.802 -2.065 -2.344 -2.695 -3.105 -3.695 -6.334 -9 ,28816 ,KEBNE ,16677821,Wed Nov 24 21:57:28 CET,Wed Nov 24 23:19:55 CET,0.0 1.01 1.38 1.675 1.92 2.13 2.324 2.495 2.796 2.933 3.053 3.185 3.383 3.487 3.691 3.883 4.053 4.133 4.29 4.435 4.626 4.745 4.869 5.048 5.21 5.359 5.502 5.646 5.823 6.005 6.184 6.386 6.576 6.759 6.958 7.164 7.36 7.584 7.837 8.097 8.335 8.581 8.885 9.184 9.488 9.801 10.115 10.427 10.719 10.903 10.84 10.395 9.859 9.285 8.709 8.211 7.753 7.296 6.897 6.502 6.155 5.834 5.528 5.203 4.854 4.553 4.27 4.005 3.766 3.509 3.233 3.0 2.766 2.525 2.324 2.123 1.926 1.707 1.473 1.309 1.13 0.839 0.637 0.429 0.324 0.104 -0.152 -0.429 -0.559 -0.789 -1.007 -1.168 -1.363 -1.797 -2.014 -2.255 -2.529 -2.874 -3.334 -3.891 -5.701 -10 ,18468 ,KEBNE ,16677822,Wed Nov 24 21:57:39 CET,Wed Nov 24 23:17:12 CET,0.0 1.164 1.659 2.042 2.309 2.522 2.701 2.865 3.185 3.327 3.468 3.647 3.855 3.957 4.132 4.3 4.471 4.555 4.714 4.87 5.089 5.22 5.34 5.526 5.703 5.855 6.0 6.147 6.334 6.505 6.668 6.871 7.07 7.249 7.437 7.654 7.871 8.102 8.325 8.554 8.795 9.057 9.359 9.648 9.977 10.308 10.639 10.973 11.253 11.455 11.451 11.039 10.486 9.954 9.395 8.835 8.362 7.908 7.501 7.09 6.714 6.373 6.044 5.741 5.449 5.154 4.849 4.584 4.356 4.094 3.799 3.559 3.324 3.083 2.883 2.674 2.462 2.241 2.008 1.841 1.663 1.389 1.203 1.006 0.896 0.663 0.414 0.136 -0.009 -0.251 -0.508 -0.699 -0.879 -1.271 -1.487 -1.723 -2.014 -2.346 -2.763 -3.432 -5.397 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_70.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_70.txt deleted file mode 100644 index a5fd89dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_70.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13048 ,KEBNE ,16675529,Wed Nov 24 05:46:04 CET,Wed Nov 24 07:11:49 CET,0.0 0.787 1.151 1.409 1.616 1.806 1.981 2.142 2.435 2.574 2.698 2.83 3.025 3.124 3.309 3.486 3.658 3.743 3.913 4.067 4.287 4.432 4.572 4.762 4.943 5.128 5.314 5.491 5.722 5.937 6.134 6.381 6.622 6.855 7.115 7.386 7.651 7.947 8.266 8.606 8.957 9.347 9.811 10.297 10.858 11.475 12.185 12.986 13.925 14.995 16.225 17.191 17.667 17.886 17.938 17.873 17.779 17.66 17.521 17.363 17.22 17.07 16.913 16.76 16.611 16.468 16.307 16.16 16.048 15.941 15.813 15.693 15.558 15.422 15.316 15.204 15.082 14.941 14.791 14.686 14.577 14.417 14.307 14.175 14.1 13.947 13.798 13.642 13.556 13.39 13.276 13.164 13.042 12.787 12.648 12.479 12.292 12.09 11.839 11.495 10.484 -2 ,5678 ,KEBNE ,16675530,Wed Nov 24 05:48:07 CET,Wed Nov 24 07:14:08 CET,0.0 0.916 1.254 1.504 1.714 1.889 2.047 2.198 2.484 2.618 2.744 2.877 3.073 3.175 3.37 3.561 3.742 3.828 3.987 4.135 4.351 4.495 4.634 4.824 5.012 5.203 5.382 5.548 5.772 5.996 6.205 6.441 6.675 6.899 7.154 7.452 7.734 8.039 8.38 8.759 9.147 9.583 10.078 10.561 11.127 11.766 12.482 13.272 14.25 15.37 16.59 17.462 17.872 18.03 18.041 17.99 17.92 17.85 17.741 17.578 17.433 17.294 17.156 17.015 16.873 16.734 16.593 16.468 16.342 16.2 16.045 15.914 15.784 15.654 15.552 15.448 15.345 15.235 15.113 15.027 14.936 14.785 14.675 14.557 14.494 14.351 14.2 14.045 13.956 13.785 13.672 13.562 13.437 13.155 13.01 12.849 12.66 12.44 12.172 11.823 10.885 -3 ,25779 ,KEBNE ,16677825,Wed Nov 24 21:58:30 CET,Wed Nov 24 23:23:08 CET,0.0 0.789 1.118 1.367 1.565 1.742 1.905 2.06 2.351 2.476 2.589 2.722 2.918 3.021 3.215 3.403 3.582 3.668 3.832 3.982 4.204 4.349 4.492 4.699 4.896 5.092 5.278 5.467 5.716 5.938 6.144 6.394 6.65 6.897 7.177 7.503 7.797 8.103 8.441 8.792 9.168 9.623 10.165 10.683 11.268 11.909 12.622 13.431 14.379 15.478 16.709 17.551 17.923 18.097 18.125 18.084 18.028 17.941 17.836 17.694 17.543 17.403 17.262 17.101 16.937 16.786 16.626 16.484 16.357 16.212 16.066 15.953 15.83 15.689 15.578 15.465 15.34 15.21 15.081 14.982 14.873 14.705 14.579 14.44 14.369 14.218 14.054 13.883 13.799 13.635 13.509 13.395 13.279 13.031 12.882 12.701 12.509 12.298 12.042 11.681 10.756 -4 ,28955 ,KEBNE ,16675532,Wed Nov 24 05:54:17 CET,Wed Nov 24 07:17:20 CET,0.0 0.795 1.089 1.303 1.489 1.661 1.81 1.94 2.177 2.281 2.381 2.488 2.682 2.782 2.971 3.147 3.317 3.398 3.547 3.695 3.91 4.054 4.183 4.374 4.572 4.75 4.922 5.084 5.287 5.484 5.685 5.934 6.166 6.39 6.636 6.909 7.18 7.482 7.834 8.205 8.581 9.003 9.501 10.015 10.605 11.231 11.955 12.786 13.749 14.853 16.109 17.002 17.382 17.538 17.608 17.577 17.5 17.409 17.3 17.171 17.036 16.913 16.786 16.648 16.506 16.38 16.243 16.106 15.984 15.856 15.712 15.584 15.458 15.325 15.216 15.088 14.957 14.831 14.688 14.587 14.486 14.322 14.197 14.068 14.002 13.87 13.734 13.577 13.489 13.319 13.19 13.087 12.97 12.697 12.553 12.396 12.22 12.013 11.764 11.411 10.084 -5 ,11727 ,KEBNE ,16675533,Wed Nov 24 05:55:19 CET,Wed Nov 24 07:25:26 CET,0.0 1.231 1.66 1.99 2.252 2.455 2.646 2.823 3.136 3.275 3.399 3.553 3.763 3.885 4.123 4.347 4.557 4.653 4.835 5.008 5.239 5.392 5.55 5.763 5.967 6.173 6.374 6.56 6.798 7.031 7.236 7.472 7.698 7.91 8.164 8.446 8.715 9.038 9.391 9.737 10.098 10.523 11.015 11.491 12.038 12.645 13.354 14.148 15.096 16.216 17.496 18.368 18.705 18.82 18.818 18.772 18.692 18.561 18.432 18.284 18.105 17.93 17.778 17.616 17.443 17.298 17.156 16.999 16.85 16.7 16.55 16.428 16.287 16.131 16.013 15.891 15.759 15.621 15.464 15.35 15.236 15.058 14.939 14.812 14.741 14.599 14.453 14.286 14.192 14.013 13.881 13.771 13.655 13.396 13.24 13.078 12.91 12.701 12.445 12.086 11.094 -6 ,15322 ,KEBNE ,16677828,Wed Nov 24 21:58:34 CET,Wed Nov 24 23:22:24 CET,0.0 0.748 1.068 1.332 1.556 1.739 1.903 2.058 2.338 2.466 2.591 2.737 2.932 3.029 3.22 3.41 3.59 3.678 3.858 4.036 4.293 4.462 4.626 4.851 5.059 5.254 5.44 5.616 5.838 6.059 6.288 6.564 6.813 7.057 7.343 7.666 7.983 8.318 8.672 9.042 9.442 9.876 10.379 10.906 11.498 12.183 12.982 13.833 14.772 15.81 16.987 17.851 18.278 18.49 18.524 18.497 18.433 18.334 18.243 18.14 18.009 17.857 17.706 17.535 17.371 17.232 17.061 16.915 16.798 16.664 16.519 16.395 16.267 16.121 16.004 15.887 15.769 15.645 15.516 15.426 15.339 15.197 15.079 14.947 14.877 14.731 14.577 14.402 14.305 14.127 13.997 13.883 13.77 13.524 13.373 13.202 13.007 12.787 12.527 12.183 11.224 -7 ,8911 ,KEBNE ,16675535,Wed Nov 24 05:56:20 CET,Wed Nov 24 07:20:24 CET,0.0 1.106 1.435 1.66 1.861 2.052 2.217 2.368 2.641 2.77 2.9 3.044 3.244 3.347 3.539 3.731 3.917 4.0 4.151 4.307 4.529 4.674 4.815 5.015 5.208 5.391 5.572 5.742 5.951 6.155 6.362 6.609 6.843 7.061 7.314 7.599 7.871 8.166 8.486 8.844 9.213 9.613 10.099 10.599 11.168 11.808 12.549 13.386 14.372 15.49 16.707 17.573 17.967 18.101 18.113 18.054 17.953 17.822 17.669 17.487 17.319 17.163 17.003 16.838 16.674 16.528 16.374 16.222 16.083 15.933 15.772 15.634 15.487 15.342 15.222 15.086 14.945 14.803 14.649 14.536 14.421 14.252 14.12 13.981 13.914 13.778 13.627 13.452 13.358 13.181 13.045 12.936 12.823 12.57 12.426 12.272 12.101 11.892 11.626 11.267 10.457 -8 ,30133 ,KEBNE ,16675536,Wed Nov 24 05:58:23 CET,Wed Nov 24 07:23:11 CET,0.0 0.944 1.266 1.513 1.728 1.931 2.118 2.277 2.549 2.676 2.799 2.946 3.141 3.244 3.452 3.65 3.831 3.914 4.074 4.234 4.453 4.59 4.725 4.925 5.13 5.344 5.547 5.728 5.963 6.186 6.394 6.641 6.883 7.117 7.394 7.718 8.014 8.342 8.698 9.063 9.442 9.877 10.402 10.922 11.516 12.171 12.907 13.702 14.636 15.709 16.937 17.853 18.268 18.444 18.49 18.424 18.328 18.228 18.12 17.992 17.869 17.738 17.583 17.438 17.314 17.192 17.058 16.941 16.827 16.699 16.559 16.436 16.308 16.173 16.062 15.939 15.812 15.689 15.553 15.457 15.365 15.215 15.095 14.967 14.9 14.754 14.599 14.438 14.355 14.19 14.065 13.95 13.829 13.557 13.401 13.237 13.048 12.833 12.573 12.214 11.42 -9 ,10181 ,KEBNE ,16675537,Wed Nov 24 05:58:23 CET,Wed Nov 24 07:23:09 CET,0.0 1.041 1.389 1.648 1.855 2.033 2.198 2.347 2.615 2.742 2.866 3.014 3.211 3.311 3.505 3.695 3.87 3.952 4.118 4.285 4.51 4.647 4.782 4.974 5.159 5.338 5.507 5.662 5.858 6.053 6.246 6.492 6.735 6.963 7.221 7.511 7.789 8.1 8.433 8.794 9.197 9.638 10.132 10.631 11.223 11.888 12.652 13.49 14.44 15.531 16.76 17.6 18.023 18.233 18.315 18.302 18.219 18.104 17.971 17.823 17.67 17.515 17.353 17.192 17.034 16.884 16.722 16.565 16.427 16.279 16.122 15.991 15.85 15.704 15.585 15.456 15.327 15.188 15.044 14.95 14.845 14.673 14.56 14.436 14.371 14.242 14.099 13.934 13.843 13.668 13.527 13.421 13.31 13.04 12.899 12.747 12.577 12.375 12.127 11.82 10.959 -10 ,11840 ,KEBNE ,16677832,Wed Nov 24 21:58:30 CET,Wed Nov 24 23:24:56 CET,0.0 0.871 1.225 1.502 1.722 1.885 2.022 2.152 2.399 2.515 2.623 2.728 2.909 2.998 3.165 3.327 3.48 3.553 3.694 3.838 4.05 4.175 4.297 4.482 4.652 4.821 4.983 5.141 5.364 5.579 5.788 6.048 6.293 6.531 6.818 7.143 7.446 7.755 8.092 8.465 8.844 9.278 9.785 10.289 10.877 11.524 12.252 13.058 13.971 15.035 16.252 17.127 17.541 17.681 17.685 17.622 17.527 17.418 17.283 17.125 16.982 16.832 16.679 16.524 16.367 16.21 16.036 15.896 15.772 15.64 15.498 15.367 15.229 15.094 14.991 14.875 14.75 14.623 14.481 14.377 14.271 14.107 13.985 13.856 13.792 13.658 13.514 13.355 13.265 13.095 12.979 12.874 12.761 12.501 12.353 12.206 12.042 11.852 11.627 11.267 10.373 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_70_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_70_62.txt deleted file mode 100644 index 4bc69f08..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/pfkfb3/water/Summary_FEP_70_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10795 ,KEBNE ,16677833,Wed Nov 24 21:59:32 CET,Wed Nov 24 23:23:55 CET,0.0 1.101 1.551 1.87 2.136 2.364 2.562 2.744 3.072 3.228 3.374 3.556 3.754 3.864 4.061 4.258 4.46 4.554 4.729 4.901 5.141 5.289 5.433 5.637 5.835 6.018 6.185 6.35 6.559 6.76 6.948 7.169 7.389 7.6 7.827 8.081 8.336 8.611 8.907 9.217 9.526 9.863 10.232 10.592 10.99 11.411 11.913 12.445 12.978 13.485 13.917 13.931 13.63 13.258 12.804 12.304 11.873 11.482 11.122 10.755 10.422 10.096 9.764 9.473 9.198 8.933 8.663 8.406 8.181 7.94 7.681 7.461 7.221 6.96 6.754 6.548 6.327 6.094 5.862 5.7 5.525 5.241 5.048 4.848 4.742 4.535 4.304 4.011 3.855 3.632 3.394 3.215 3.026 2.617 2.374 2.101 1.807 1.445 1.012 0.468 -1.392 -2 ,21865 ,KEBNE ,16677834,Wed Nov 24 21:59:32 CET,Wed Nov 24 23:23:26 CET,0.0 1.107 1.522 1.831 2.089 2.319 2.532 2.724 3.038 3.178 3.316 3.5 3.7 3.814 4.029 4.236 4.424 4.52 4.711 4.87 5.087 5.227 5.367 5.578 5.777 5.956 6.123 6.29 6.5 6.701 6.9 7.122 7.325 7.517 7.745 8.011 8.259 8.524 8.816 9.129 9.441 9.776 10.157 10.535 10.967 11.427 11.911 12.405 12.936 13.435 13.765 13.68 13.38 12.995 12.579 12.131 11.67 11.235 10.843 10.447 10.09 9.76 9.446 9.125 8.813 8.538 8.249 7.982 7.742 7.491 7.219 6.993 6.752 6.496 6.306 6.106 5.892 5.671 5.436 5.264 5.091 4.818 4.637 4.458 4.364 4.182 3.989 3.736 3.599 3.392 3.173 3.017 2.854 2.459 2.229 1.989 1.708 1.348 0.879 0.226 -1.687 -3 ,23408 ,KEBNE ,16677835,Wed Nov 24 21:59:32 CET,Wed Nov 24 23:21:44 CET,0.0 1.103 1.548 1.884 2.144 2.366 2.585 2.771 3.065 3.195 3.321 3.494 3.684 3.802 4.037 4.256 4.448 4.534 4.708 4.876 5.109 5.255 5.392 5.586 5.775 5.954 6.131 6.308 6.537 6.762 6.968 7.194 7.407 7.608 7.844 8.095 8.33 8.597 8.876 9.158 9.471 9.829 10.224 10.62 11.076 11.523 12.0 12.537 13.093 13.616 13.947 13.798 13.399 12.919 12.456 11.963 11.473 11.025 10.644 10.238 9.865 9.546 9.221 8.909 8.624 8.343 8.032 7.767 7.541 7.282 7.0 6.766 6.525 6.29 6.112 5.918 5.714 5.498 5.259 5.093 4.913 4.635 4.445 4.24 4.132 3.906 3.66 3.397 3.261 3.043 2.837 2.678 2.499 2.088 1.849 1.592 1.302 0.954 0.548 0.004 -2.114 -4 ,4030 ,KEBNE ,16677836,Wed Nov 24 21:59:32 CET,Wed Nov 24 23:24:28 CET,0.0 1.111 1.558 1.904 2.175 2.4 2.622 2.809 3.093 3.228 3.365 3.533 3.719 3.832 4.048 4.258 4.459 4.553 4.74 4.915 5.157 5.303 5.448 5.668 5.866 6.045 6.213 6.372 6.587 6.798 6.992 7.219 7.432 7.631 7.861 8.127 8.375 8.634 8.926 9.245 9.561 9.899 10.28 10.643 11.054 11.5 11.98 12.478 12.974 13.467 13.807 13.731 13.381 12.903 12.429 11.979 11.573 11.174 10.782 10.375 10.001 9.666 9.358 9.066 8.786 8.519 8.232 7.964 7.719 7.454 7.175 6.94 6.686 6.429 6.24 6.04 5.821 5.589 5.357 5.201 5.031 4.749 4.558 4.363 4.262 4.048 3.81 3.547 3.397 3.159 2.913 2.749 2.558 2.13 1.913 1.673 1.381 1.046 0.636 0.017 -2.199 -5 ,2970 ,KEBNE ,16677837,Wed Nov 24 21:59:32 CET,Wed Nov 24 23:22:47 CET,0.0 1.112 1.572 1.892 2.15 2.377 2.582 2.768 3.098 3.248 3.39 3.573 3.771 3.89 4.106 4.303 4.491 4.585 4.765 4.934 5.172 5.319 5.464 5.665 5.863 6.068 6.25 6.413 6.625 6.824 7.015 7.244 7.465 7.674 7.904 8.166 8.412 8.68 8.963 9.255 9.558 9.888 10.262 10.623 11.015 11.438 11.93 12.441 12.954 13.415 13.723 13.625 13.287 12.882 12.462 12.033 11.605 11.183 10.803 10.407 10.057 9.732 9.423 9.133 8.843 8.566 8.272 8.009 7.785 7.559 7.321 7.109 6.884 6.655 6.475 6.276 6.056 5.829 5.587 5.407 5.226 4.961 4.766 4.559 4.45 4.208 3.955 3.674 3.525 3.302 3.072 2.906 2.714 2.307 2.096 1.85 1.553 1.211 0.783 0.225 -1.629 -6 ,25931 ,KEBNE ,16677838,Wed Nov 24 21:59:32 CET,Wed Nov 24 23:26:11 CET,0.0 0.9 1.261 1.525 1.781 2.047 2.268 2.458 2.793 2.935 3.075 3.268 3.469 3.58 3.792 3.993 4.182 4.273 4.443 4.606 4.843 4.994 5.137 5.333 5.521 5.708 5.885 6.053 6.272 6.471 6.658 6.893 7.124 7.342 7.585 7.859 8.127 8.391 8.67 8.969 9.265 9.592 9.974 10.351 10.764 11.224 11.731 12.27 12.789 13.24 13.628 13.588 13.332 12.996 12.579 12.116 11.685 11.304 10.978 10.628 10.289 9.972 9.668 9.369 9.067 8.782 8.487 8.217 7.975 7.715 7.435 7.216 6.992 6.745 6.549 6.342 6.131 5.914 5.666 5.484 5.294 5.005 4.812 4.612 4.511 4.29 4.041 3.782 3.642 3.422 3.215 3.051 2.873 2.501 2.285 2.022 1.718 1.369 0.943 0.339 -1.564 -7 ,17977 ,KEBNE ,16677839,Wed Nov 24 21:59:35 CET,Wed Nov 24 23:20:55 CET,0.0 0.947 1.387 1.692 1.936 2.161 2.367 2.556 2.892 3.039 3.164 3.336 3.544 3.668 3.888 4.103 4.298 4.392 4.571 4.73 4.954 5.098 5.243 5.453 5.647 5.826 5.998 6.17 6.379 6.574 6.759 6.973 7.179 7.378 7.611 7.875 8.122 8.382 8.663 8.959 9.258 9.588 9.97 10.337 10.73 11.182 11.739 12.279 12.778 13.226 13.508 13.374 13.001 12.526 12.068 11.619 11.167 10.742 10.358 9.94 9.574 9.274 8.977 8.674 8.379 8.1 7.796 7.525 7.296 7.046 6.791 6.589 6.376 6.139 5.945 5.75 5.539 5.316 5.081 4.908 4.727 4.447 4.25 4.051 3.948 3.713 3.435 3.154 3.013 2.789 2.548 2.367 2.188 1.815 1.575 1.284 0.972 0.638 0.192 -0.456 -2.191 -8 ,19935 ,KEBNE ,16677840,Wed Nov 24 22:00:33 CET,Wed Nov 24 23:25:07 CET,0.0 0.98 1.42 1.738 2.014 2.234 2.435 2.615 2.923 3.066 3.205 3.383 3.58 3.698 3.914 4.116 4.296 4.38 4.548 4.716 4.946 5.099 5.249 5.448 5.639 5.822 5.998 6.169 6.383 6.582 6.771 6.995 7.21 7.425 7.67 7.937 8.189 8.448 8.713 8.993 9.304 9.654 10.043 10.404 10.799 11.244 11.749 12.275 12.833 13.359 13.725 13.64 13.267 12.814 12.358 11.91 11.479 11.06 10.659 10.244 9.897 9.558 9.217 8.906 8.61 8.34 8.049 7.785 7.564 7.325 7.054 6.83 6.611 6.377 6.193 6.001 5.795 5.57 5.325 5.154 4.978 4.705 4.503 4.299 4.202 4.002 3.786 3.542 3.402 3.18 2.952 2.788 2.608 2.178 1.937 1.69 1.398 1.069 0.673 0.056 -2.03 -9 ,1292 ,KEBNE ,16677841,Wed Nov 24 22:00:33 CET,Wed Nov 24 23:25:25 CET,0.0 1.156 1.587 1.921 2.184 2.408 2.618 2.804 3.124 3.265 3.399 3.582 3.774 3.89 4.12 4.328 4.517 4.614 4.795 4.954 5.183 5.329 5.473 5.679 5.879 6.072 6.25 6.421 6.634 6.825 7.013 7.245 7.451 7.653 7.893 8.148 8.387 8.644 8.917 9.205 9.498 9.822 10.212 10.59 10.989 11.429 11.912 12.404 12.936 13.39 13.6 13.588 13.372 12.97 12.583 12.208 11.802 11.397 11.042 10.658 10.311 9.989 9.651 9.328 9.03 8.759 8.475 8.191 7.95 7.709 7.44 7.217 6.998 6.769 6.58 6.374 6.139 5.885 5.641 5.47 5.279 4.99 4.791 4.58 4.468 4.24 4.006 3.739 3.592 3.369 3.126 2.949 2.761 2.365 2.148 1.881 1.574 1.239 0.833 0.293 -2.128 -10 ,9413 ,KEBNE ,16677842,Wed Nov 24 22:00:33 CET,Wed Nov 24 23:23:00 CET,0.0 0.999 1.436 1.752 2.015 2.244 2.453 2.642 2.986 3.142 3.281 3.461 3.659 3.771 3.984 4.183 4.365 4.454 4.642 4.825 5.066 5.218 5.359 5.56 5.753 5.931 6.09 6.252 6.471 6.683 6.88 7.108 7.326 7.535 7.776 8.039 8.284 8.53 8.803 9.099 9.398 9.741 10.134 10.516 10.953 11.39 11.823 12.299 12.827 13.349 13.703 13.521 13.115 12.67 12.216 11.753 11.311 10.901 10.534 10.144 9.79 9.461 9.137 8.844 8.564 8.295 8.012 7.752 7.531 7.298 7.045 6.836 6.603 6.34 6.144 5.941 5.726 5.505 5.269 5.103 4.926 4.635 4.427 4.213 4.106 3.891 3.665 3.422 3.288 3.058 2.808 2.647 2.462 2.032 1.802 1.538 1.236 0.903 0.497 -0.077 -2.249 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_11_10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_11_10.txt deleted file mode 100644 index 3d935b99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_11_10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8741 ,KEBNE ,16677843,Wed Nov 24 22:01:35 CET,Thu Nov 25 00:02:25 CET,0.0 0.559 0.883 1.127 1.348 1.528 1.68 1.824 2.109 2.24 2.362 2.514 2.721 2.835 3.038 3.227 3.413 3.5 3.668 3.835 4.07 4.217 4.35 4.546 4.728 4.91 5.1 5.274 5.484 5.675 5.867 6.107 6.333 6.556 6.809 7.078 7.33 7.598 7.887 8.192 8.515 8.904 9.333 9.734 10.197 10.695 11.193 11.663 12.183 12.699 13.092 13.117 12.795 12.296 11.753 11.175 10.613 10.106 9.655 9.176 8.764 8.373 7.967 7.53 7.105 6.745 6.38 6.035 5.717 5.38 5.021 4.735 4.439 4.12 3.868 3.618 3.356 3.084 2.806 2.611 2.405 2.066 1.821 1.552 1.417 1.134 0.802 0.455 0.284 0.003 -0.295 -0.498 -0.706 -1.15 -1.41 -1.699 -2.032 -2.44 -2.967 -3.672 -6.876 -2 ,17508 ,KEBNE ,16675540,Wed Nov 24 06:00:27 CET,Wed Nov 24 08:02:45 CET,0.0 0.535 0.852 1.111 1.335 1.532 1.709 1.88 2.208 2.36 2.506 2.656 2.879 2.997 3.219 3.419 3.609 3.696 3.864 4.04 4.287 4.429 4.567 4.762 4.939 5.133 5.329 5.499 5.707 5.892 6.073 6.294 6.516 6.736 6.989 7.266 7.523 7.813 8.107 8.385 8.659 8.991 9.388 9.776 10.229 10.7 11.204 11.734 12.278 12.777 13.139 13.115 12.767 12.274 11.786 11.303 10.821 10.387 10.011 9.598 9.23 8.898 8.563 8.22 7.899 7.606 7.267 6.963 6.698 6.408 6.102 5.841 5.572 5.283 5.047 4.821 4.577 4.297 4.013 3.811 3.592 3.23 2.976 2.721 2.599 2.348 2.062 1.746 1.567 1.283 0.986 0.75 0.498 -0.013 -0.308 -0.654 -1.028 -1.45 -1.97 -2.659 -6.168 -3 ,21592 ,KEBNE ,16677845,Wed Nov 24 22:03:40 CET,Thu Nov 25 00:04:41 CET,0.0 0.717 1.064 1.32 1.534 1.718 1.887 2.053 2.373 2.515 2.646 2.784 3.006 3.122 3.338 3.539 3.734 3.834 4.027 4.205 4.459 4.626 4.794 5.038 5.251 5.445 5.643 5.83 6.062 6.289 6.513 6.772 7.003 7.21 7.453 7.73 7.983 8.263 8.561 8.872 9.172 9.468 9.814 10.16 10.527 10.954 11.438 11.906 12.42 12.891 13.123 12.931 12.456 11.898 11.316 10.73 10.235 9.789 9.341 8.862 8.464 8.096 7.714 7.342 6.976 6.637 6.292 5.983 5.713 5.41 5.063 4.766 4.473 4.169 3.932 3.678 3.41 3.148 2.87 2.67 2.463 2.13 1.887 1.635 1.506 1.228 0.915 0.581 0.412 0.139 -0.144 -0.342 -0.56 -1.055 -1.313 -1.63 -1.976 -2.347 -2.809 -3.401 -6.77 -4 ,24820 ,KEBNE ,16675542,Wed Nov 24 06:02:30 CET,Wed Nov 24 08:01:41 CET,0.0 0.666 0.995 1.264 1.487 1.684 1.851 2.015 2.316 2.461 2.602 2.745 2.964 3.075 3.253 3.42 3.586 3.67 3.826 3.972 4.195 4.342 4.467 4.636 4.807 4.964 5.115 5.262 5.445 5.624 5.801 6.013 6.201 6.368 6.566 6.786 6.999 7.232 7.474 7.725 7.993 8.281 8.57 8.84 9.154 9.536 9.973 10.344 10.653 10.846 10.676 10.069 9.411 8.73 7.993 7.225 6.575 5.998 5.477 4.982 4.58 4.165 3.696 3.262 2.888 2.542 2.179 1.857 1.572 1.275 0.956 0.687 0.411 0.11 -0.126 -0.357 -0.602 -0.857 -1.118 -1.295 -1.474 -1.759 -1.959 -2.162 -2.271 -2.509 -2.768 -3.04 -3.175 -3.412 -3.63 -3.788 -3.957 -4.329 -4.535 -4.765 -5.052 -5.398 -5.795 -6.309 -7.565 -5 ,22247 ,KEBNE ,16675543,Wed Nov 24 06:02:30 CET,Wed Nov 24 08:03:09 CET,0.0 0.614 1.014 1.32 1.588 1.824 2.004 2.169 2.483 2.62 2.75 2.897 3.1 3.202 3.392 3.592 3.775 3.86 4.033 4.194 4.411 4.557 4.703 4.918 5.12 5.3 5.474 5.642 5.861 6.068 6.263 6.509 6.756 6.983 7.216 7.487 7.767 8.056 8.363 8.677 8.982 9.327 9.718 10.094 10.53 11.019 11.51 11.998 12.551 13.038 13.349 13.249 12.872 12.432 11.947 11.404 10.863 10.338 9.846 9.322 8.87 8.455 8.036 7.614 7.2 6.818 6.429 6.057 5.727 5.402 5.073 4.802 4.517 4.226 3.996 3.734 3.465 3.219 2.967 2.783 2.585 2.272 2.028 1.755 1.621 1.354 1.081 0.773 0.601 0.328 0.071 -0.134 -0.351 -0.836 -1.119 -1.426 -1.748 -2.124 -2.627 -3.316 -6.512 -6 ,29005 ,KEBNE ,16675544,Wed Nov 24 06:02:30 CET,Wed Nov 24 08:02:34 CET,0.0 0.843 1.166 1.447 1.668 1.864 2.051 2.222 2.507 2.643 2.774 2.915 3.121 3.225 3.416 3.588 3.759 3.847 4.025 4.194 4.44 4.589 4.723 4.914 5.093 5.267 5.45 5.64 5.879 6.109 6.328 6.594 6.837 7.051 7.321 7.637 7.922 8.226 8.559 8.921 9.302 9.709 10.131 10.516 10.943 11.391 11.889 12.418 12.95 13.416 13.706 13.69 13.332 12.826 12.387 11.963 11.505 11.008 10.558 10.105 9.713 9.344 8.964 8.602 8.249 7.907 7.548 7.216 6.917 6.625 6.314 6.045 5.771 5.486 5.266 5.035 4.792 4.534 4.263 4.069 3.869 3.563 3.335 3.096 2.968 2.687 2.39 2.079 1.922 1.663 1.373 1.173 0.972 0.542 0.297 0.008 -0.311 -0.668 -1.117 -1.746 -4.554 -7 ,31505 ,KEBNE ,16677849,Wed Nov 24 22:03:40 CET,Thu Nov 25 00:04:46 CET,0.0 0.674 1.023 1.273 1.492 1.693 1.869 2.033 2.323 2.456 2.584 2.727 2.94 3.045 3.242 3.423 3.612 3.706 3.872 4.033 4.27 4.417 4.55 4.75 4.963 5.169 5.338 5.482 5.679 5.875 6.065 6.288 6.486 6.696 6.949 7.218 7.472 7.744 8.041 8.358 8.679 9.023 9.409 9.803 10.242 10.666 11.101 11.543 12.016 12.465 12.735 12.553 12.138 11.638 11.115 10.61 10.125 9.639 9.186 8.712 8.266 7.845 7.467 7.104 6.761 6.446 6.092 5.772 5.479 5.157 4.824 4.528 4.214 3.899 3.669 3.435 3.177 2.905 2.611 2.408 2.203 1.849 1.601 1.345 1.205 0.922 0.622 0.295 0.125 -0.133 -0.36 -0.532 -0.731 -1.215 -1.48 -1.779 -2.137 -2.514 -2.949 -3.543 -7.497 -8 ,24577 ,KEBNE ,16675546,Wed Nov 24 06:03:32 CET,Wed Nov 24 08:02:37 CET,0.0 0.889 1.237 1.518 1.761 1.966 2.141 2.295 2.582 2.71 2.839 2.988 3.181 3.29 3.504 3.695 3.879 3.97 4.149 4.319 4.545 4.691 4.826 5.013 5.199 5.374 5.533 5.684 5.884 6.074 6.246 6.45 6.652 6.847 7.087 7.363 7.603 7.841 8.09 8.354 8.625 8.935 9.285 9.616 9.985 10.348 10.707 11.091 11.524 11.896 11.932 11.464 10.854 10.193 9.544 8.911 8.334 7.81 7.34 6.848 6.415 6.027 5.645 5.274 4.932 4.604 4.245 3.92 3.626 3.324 3.0 2.717 2.434 2.121 1.868 1.628 1.401 1.155 0.874 0.678 0.47 0.101 -0.169 -0.443 -0.59 -0.891 -1.2 -1.524 -1.699 -1.986 -2.264 -2.471 -2.683 -3.127 -3.383 -3.676 -3.985 -4.331 -4.787 -5.421 -7.409 -9 ,31919 ,KEBNE ,16675547,Wed Nov 24 06:05:35 CET,Wed Nov 24 08:06:02 CET,0.0 0.519 0.829 1.086 1.335 1.547 1.734 1.914 2.24 2.382 2.513 2.657 2.871 2.975 3.174 3.36 3.534 3.622 3.79 3.954 4.195 4.344 4.478 4.668 4.848 5.029 5.212 5.379 5.579 5.77 5.945 6.151 6.343 6.523 6.731 6.964 7.198 7.456 7.709 7.953 8.22 8.518 8.823 9.103 9.455 9.831 10.179 10.49 10.775 11.001 11.014 10.557 9.959 9.379 8.83 8.289 7.786 7.334 6.921 6.48 6.089 5.731 5.389 5.074 4.753 4.412 4.061 3.772 3.528 3.276 3.004 2.75 2.472 2.196 1.968 1.73 1.498 1.263 1.024 0.859 0.683 0.417 0.232 0.028 -0.079 -0.303 -0.538 -0.791 -0.92 -1.151 -1.342 -1.511 -1.707 -2.154 -2.385 -2.615 -2.881 -3.226 -3.675 -4.315 -6.277 -10 ,13614 ,KEBNE ,16675548,Wed Nov 24 06:05:35 CET,Wed Nov 24 08:05:19 CET,0.0 0.511 0.776 0.991 1.183 1.352 1.513 1.675 1.978 2.105 2.219 2.345 2.549 2.649 2.85 3.036 3.201 3.285 3.441 3.597 3.831 3.976 4.114 4.307 4.49 4.669 4.835 4.989 5.19 5.375 5.546 5.758 5.972 6.17 6.387 6.608 6.81 7.05 7.318 7.595 7.889 8.201 8.521 8.813 9.153 9.511 9.904 10.258 10.542 10.761 10.707 10.223 9.629 9.042 8.487 7.966 7.382 6.761 6.193 5.584 5.092 4.693 4.295 3.88 3.503 3.174 2.808 2.455 2.158 1.864 1.559 1.298 1.013 0.724 0.508 0.28 0.027 -0.246 -0.542 -0.77 -0.997 -1.323 -1.54 -1.761 -1.878 -2.12 -2.385 -2.673 -2.823 -3.078 -3.358 -3.561 -3.763 -4.193 -4.448 -4.731 -5.037 -5.375 -5.746 -6.351 -8.705 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index d3f09cc7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20947 ,KEBNE ,16677853,Wed Nov 24 22:05:43 CET,Thu Nov 25 00:06:07 CET,0.0 0.975 1.291 1.552 1.761 1.935 2.098 2.248 2.51 2.62 2.724 2.818 3.021 3.112 3.266 3.412 3.563 3.633 3.771 3.901 4.08 4.188 4.287 4.446 4.602 4.745 4.889 5.014 5.166 5.321 5.462 5.627 5.798 5.957 6.128 6.319 6.505 6.693 6.863 7.039 7.233 7.446 7.669 7.861 8.091 8.328 8.529 8.647 8.657 8.531 7.953 6.836 5.741 4.752 3.865 3.068 2.327 1.637 1.056 0.479 -0.016 -0.466 -0.905 -1.354 -1.783 -2.17 -2.618 -3.017 -3.334 -3.662 -4.01 -4.307 -4.61 -4.934 -5.186 -5.437 -5.695 -5.96 -6.262 -6.476 -6.694 -7.018 -7.238 -7.48 -7.597 -7.838 -8.106 -8.4 -8.564 -8.834 -9.078 -9.262 -9.465 -9.918 -10.163 -10.432 -10.735 -11.087 -11.509 -12.119 -15.579 -2 ,7024 ,KEBNE ,16677854,Wed Nov 24 22:06:45 CET,Thu Nov 25 00:10:41 CET,0.0 0.779 1.117 1.369 1.588 1.777 1.945 2.1 2.369 2.488 2.588 2.66 2.848 2.942 3.133 3.319 3.479 3.552 3.695 3.835 4.03 4.147 4.256 4.411 4.564 4.707 4.862 5.003 5.167 5.326 5.455 5.618 5.797 5.966 6.144 6.33 6.504 6.677 6.85 7.043 7.238 7.461 7.696 7.887 8.125 8.369 8.564 8.669 8.675 8.544 8.087 7.124 6.065 5.137 4.329 3.529 2.774 2.095 1.502 0.862 0.313 -0.159 -0.608 -1.035 -1.455 -1.861 -2.29 -2.662 -3.007 -3.353 -3.702 -4.002 -4.297 -4.62 -4.879 -5.136 -5.405 -5.706 -6.029 -6.255 -6.489 -6.837 -7.072 -7.321 -7.458 -7.767 -8.101 -8.454 -8.63 -8.906 -9.176 -9.379 -9.616 -10.146 -10.423 -10.729 -11.075 -11.446 -11.877 -12.521 -15.02 -3 ,1333 ,KEBNE ,16677855,Wed Nov 24 22:06:46 CET,Thu Nov 25 00:10:21 CET,0.0 1.156 1.556 1.839 2.081 2.29 2.492 2.674 2.975 3.102 3.218 3.352 3.575 3.671 3.851 4.03 4.182 4.262 4.416 4.547 4.717 4.817 4.919 5.062 5.206 5.349 5.473 5.597 5.761 5.913 6.044 6.201 6.38 6.558 6.747 6.936 7.1 7.292 7.506 7.687 7.861 8.041 8.195 8.323 8.491 8.648 8.73 8.737 8.646 8.333 7.403 6.015 4.693 3.5 2.453 1.494 0.662 -0.101 -0.761 -1.392 -1.946 -2.456 -2.909 -3.372 -3.873 -4.358 -4.863 -5.303 -5.686 -6.076 -6.472 -6.815 -7.18 -7.535 -7.815 -8.118 -8.425 -8.733 -9.068 -9.312 -9.564 -9.944 -10.206 -10.472 -10.605 -10.89 -11.216 -11.551 -11.71 -11.986 -12.248 -12.453 -12.667 -13.15 -13.418 -13.7 -14.033 -14.436 -14.918 -15.597 -17.536 -4 ,12069 ,KEBNE ,16677856,Wed Nov 24 22:07:48 CET,Thu Nov 25 00:10:57 CET,0.0 0.78 1.104 1.344 1.551 1.747 1.917 2.06 2.322 2.437 2.535 2.63 2.823 2.912 3.079 3.223 3.355 3.422 3.563 3.699 3.894 4.008 4.107 4.245 4.389 4.533 4.675 4.814 4.982 5.142 5.295 5.455 5.608 5.753 5.902 6.054 6.187 6.328 6.488 6.669 6.829 6.99 7.178 7.333 7.457 7.584 7.716 7.765 7.661 7.298 6.413 5.126 3.985 2.975 2.054 1.141 0.286 -0.509 -1.253 -2.058 -2.76 -3.371 -3.95 -4.495 -4.983 -5.435 -5.922 -6.351 -6.723 -7.117 -7.523 -7.862 -8.212 -8.572 -8.858 -9.154 -9.46 -9.791 -10.135 -10.367 -10.612 -11.001 -11.294 -11.604 -11.76 -12.082 -12.4 -12.751 -12.949 -13.261 -13.583 -13.808 -14.033 -14.518 -14.803 -15.122 -15.484 -15.914 -16.445 -17.206 -19.503 -5 ,3277 ,KEBNE ,16677857,Wed Nov 24 22:07:47 CET,Thu Nov 25 00:10:06 CET,0.0 1.156 1.52 1.787 2.021 2.222 2.391 2.543 2.798 2.903 3.001 3.107 3.293 3.374 3.534 3.708 3.887 3.96 4.081 4.212 4.415 4.547 4.665 4.817 4.959 5.095 5.227 5.364 5.543 5.696 5.844 6.023 6.182 6.341 6.526 6.706 6.872 7.057 7.256 7.443 7.59 7.737 7.902 8.065 8.242 8.385 8.429 8.373 8.245 7.873 6.889 5.42 4.088 2.87 1.802 0.858 0.029 -0.722 -1.372 -2.035 -2.642 -3.191 -3.739 -4.248 -4.675 -5.084 -5.537 -5.968 -6.354 -6.736 -7.142 -7.482 -7.816 -8.165 -8.449 -8.741 -9.043 -9.354 -9.675 -9.891 -10.126 -10.508 -10.764 -11.015 -11.135 -11.388 -11.684 -12.021 -12.196 -12.48 -12.798 -13.021 -13.243 -13.722 -13.991 -14.293 -14.659 -15.098 -15.623 -16.349 -19.039 -6 ,31274 ,KEBNE ,16677858,Wed Nov 24 22:07:48 CET,Thu Nov 25 00:11:37 CET,0.0 1.401 1.764 2.036 2.263 2.472 2.669 2.822 3.087 3.212 3.327 3.44 3.636 3.736 3.907 4.069 4.22 4.285 4.424 4.56 4.74 4.852 4.96 5.112 5.268 5.427 5.574 5.713 5.895 6.087 6.263 6.444 6.601 6.743 6.925 7.155 7.353 7.544 7.743 7.932 8.105 8.28 8.438 8.594 8.747 8.889 9.012 9.013 8.857 8.479 7.634 6.353 5.107 3.963 2.978 2.082 1.262 0.477 -0.181 -0.804 -1.363 -1.884 -2.378 -2.845 -3.267 -3.645 -4.055 -4.421 -4.749 -5.085 -5.426 -5.728 -6.043 -6.366 -6.615 -6.875 -7.141 -7.395 -7.675 -7.876 -8.084 -8.416 -8.639 -8.872 -8.996 -9.261 -9.538 -9.835 -9.991 -10.248 -10.466 -10.644 -10.829 -11.223 -11.428 -11.677 -11.995 -12.348 -12.776 -13.419 -15.273 -7 ,32564 ,KEBNE ,16677859,Wed Nov 24 22:07:48 CET,Thu Nov 25 00:11:22 CET,0.0 1.105 1.479 1.754 1.968 2.126 2.264 2.401 2.651 2.767 2.869 2.959 3.15 3.235 3.396 3.55 3.702 3.774 3.913 4.046 4.233 4.359 4.484 4.66 4.811 4.957 5.095 5.221 5.37 5.521 5.686 5.89 6.085 6.256 6.457 6.672 6.863 7.077 7.301 7.532 7.76 7.972 8.202 8.44 8.655 8.832 9.003 9.132 9.197 9.152 8.703 7.7 6.645 5.679 4.839 4.081 3.391 2.702 2.048 1.411 0.888 0.394 -0.109 -0.582 -1.026 -1.437 -1.866 -2.245 -2.585 -2.952 -3.322 -3.633 -3.966 -4.314 -4.587 -4.882 -5.176 -5.464 -5.776 -6.002 -6.247 -6.638 -6.908 -7.181 -7.325 -7.616 -7.928 -8.289 -8.476 -8.782 -9.107 -9.338 -9.565 -10.058 -10.34 -10.652 -11.003 -11.384 -11.842 -12.479 -15.006 -8 ,29603 ,KEBNE ,16677860,Wed Nov 24 22:07:48 CET,Thu Nov 25 00:10:38 CET,0.0 1.271 1.692 1.988 2.213 2.421 2.613 2.768 3.043 3.178 3.295 3.395 3.586 3.693 3.886 4.045 4.2 4.275 4.419 4.566 4.768 4.887 5.003 5.177 5.345 5.502 5.648 5.791 5.978 6.141 6.299 6.503 6.687 6.861 7.073 7.308 7.525 7.757 7.987 8.187 8.374 8.586 8.772 8.91 9.022 9.137 9.297 9.441 9.465 9.222 8.425 7.214 6.109 5.105 4.238 3.388 2.574 1.847 1.232 0.575 0.001 -0.491 -0.954 -1.403 -1.831 -2.232 -2.666 -3.046 -3.361 -3.701 -4.058 -4.35 -4.66 -4.999 -5.266 -5.557 -5.868 -6.173 -6.483 -6.698 -6.948 -7.33 -7.562 -7.803 -7.934 -8.218 -8.519 -8.838 -9.01 -9.304 -9.551 -9.74 -9.965 -10.491 -10.769 -11.072 -11.392 -11.722 -12.133 -12.749 -15.96 -9 ,11777 ,KEBNE ,16677861,Wed Nov 24 22:07:52 CET,Thu Nov 25 00:08:10 CET,0.0 0.94 1.25 1.491 1.69 1.88 2.041 2.182 2.423 2.526 2.624 2.714 2.899 2.978 3.127 3.268 3.415 3.488 3.619 3.748 3.93 4.042 4.148 4.291 4.422 4.555 4.688 4.809 4.956 5.092 5.218 5.375 5.545 5.7 5.866 6.046 6.209 6.39 6.582 6.751 6.904 7.08 7.273 7.431 7.575 7.712 7.822 7.885 7.862 7.576 6.647 5.156 3.788 2.557 1.459 0.409 -0.542 -1.362 -2.049 -2.722 -3.324 -3.9 -4.454 -4.999 -5.539 -6.017 -6.502 -6.951 -7.348 -7.747 -8.159 -8.511 -8.87 -9.222 -9.479 -9.748 -10.034 -10.308 -10.599 -10.82 -11.038 -11.354 -11.574 -11.82 -11.95 -12.216 -12.53 -12.915 -13.121 -13.413 -13.71 -13.907 -14.114 -14.597 -14.875 -15.184 -15.515 -15.9 -16.367 -17.074 -19.399 -10 ,17722 ,KEBNE ,16677862,Wed Nov 24 22:07:48 CET,Thu Nov 25 00:11:19 CET,0.0 1.205 1.558 1.806 2.02 2.21 2.387 2.557 2.835 2.959 3.074 3.189 3.373 3.466 3.633 3.785 3.947 4.029 4.174 4.299 4.477 4.594 4.7 4.847 4.995 5.133 5.254 5.374 5.535 5.687 5.833 6.006 6.16 6.298 6.463 6.659 6.847 7.029 7.191 7.35 7.514 7.68 7.837 7.981 8.119 8.23 8.333 8.386 8.285 7.901 7.007 5.695 4.513 3.458 2.521 1.622 0.804 0.072 -0.578 -1.205 -1.709 -2.158 -2.583 -2.989 -3.38 -3.755 -4.181 -4.586 -4.959 -5.369 -5.788 -6.126 -6.496 -6.88 -7.162 -7.467 -7.797 -8.138 -8.479 -8.716 -8.96 -9.339 -9.616 -9.914 -10.058 -10.35 -10.682 -11.048 -11.238 -11.539 -11.874 -12.094 -12.326 -12.845 -13.145 -13.481 -13.85 -14.256 -14.732 -15.386 -17.417 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_4_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_4_3.txt deleted file mode 100644 index 397a358e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_4_3.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2729 ,KEBNE ,16677863,Wed Nov 24 22:07:48 CET,Thu Nov 25 00:10:13 CET,0.0 0.47 0.691 0.875 1.054 1.214 1.342 1.461 1.707 1.839 1.971 1.961 2.292 2.389 2.555 2.724 2.889 2.964 3.112 3.266 3.477 3.603 3.734 3.921 4.086 4.249 4.412 4.563 4.756 4.941 5.114 5.33 5.537 5.732 5.962 6.21 6.435 6.683 6.959 7.239 7.527 7.843 8.189 8.544 8.952 9.386 9.832 10.274 10.717 11.105 11.354 11.295 11.026 10.662 10.303 9.921 9.538 9.179 8.84 8.47 8.137 7.831 7.537 7.263 7.005 6.771 6.534 6.325 6.129 5.909 5.671 5.47 5.274 5.058 4.878 4.692 4.502 4.319 4.121 3.98 3.848 3.636 3.481 3.317 3.232 3.04 2.827 2.605 2.495 2.16 2.173 2.058 1.931 1.641 1.488 1.34 1.181 0.98 0.751 0.477 -0.123 -2 ,7829 ,KEBNE ,16677864,Wed Nov 24 22:08:49 CET,Thu Nov 25 00:11:46 CET,0.0 0.335 0.533 0.721 0.887 1.036 1.189 1.325 1.568 1.68 1.785 1.759 2.08 2.171 2.352 2.52 2.684 2.764 2.91 3.042 3.225 3.343 3.458 3.62 3.784 3.94 4.084 4.225 4.422 4.617 4.793 5.011 5.223 5.407 5.624 5.881 6.115 6.36 6.618 6.899 7.192 7.509 7.86 8.198 8.567 8.974 9.435 9.905 10.363 10.769 10.995 10.871 10.618 10.239 9.822 9.434 9.074 8.713 8.367 8.004 7.7 7.423 7.151 6.904 6.668 6.445 6.206 5.968 5.752 5.552 5.348 5.164 4.971 4.767 4.609 4.449 4.277 4.092 3.883 3.747 3.621 3.407 3.257 3.1 3.011 2.824 2.648 2.465 2.36 2.022 2.034 1.906 1.78 1.475 1.284 1.09 0.899 0.663 0.376 0.055 -0.42 -3 ,1018 ,KEBNE ,16677865,Wed Nov 24 22:09:51 CET,Thu Nov 25 00:13:38 CET,0.0 0.37 0.627 0.835 1.002 1.164 1.324 1.471 1.732 1.847 1.949 1.925 2.262 2.365 2.563 2.736 2.89 2.966 3.12 3.267 3.472 3.605 3.74 3.93 4.099 4.262 4.415 4.563 4.756 4.937 5.115 5.337 5.553 5.757 5.979 6.224 6.453 6.699 6.961 7.239 7.532 7.841 8.182 8.525 8.906 9.305 9.752 10.217 10.727 11.186 11.402 11.248 10.906 10.509 10.065 9.623 9.232 8.853 8.529 8.186 7.879 7.597 7.297 7.003 6.725 6.463 6.194 5.954 5.738 5.512 5.283 5.076 4.854 4.631 4.454 4.272 4.088 3.883 3.666 3.526 3.377 3.145 2.986 2.791 2.687 2.492 2.288 2.082 1.973 1.633 1.612 1.481 1.335 1.039 0.88 0.703 0.504 0.263 -0.003 -0.357 -0.892 -4 ,10698 ,KEBNE ,16677866,Wed Nov 24 22:10:56 CET,Thu Nov 25 00:13:13 CET,0.0 0.458 0.724 0.995 1.215 1.382 1.526 1.659 1.905 2.023 2.144 2.153 2.496 2.59 2.757 2.934 3.113 3.199 3.376 3.549 3.788 3.944 4.094 4.305 4.511 4.695 4.859 5.022 5.234 5.435 5.628 5.855 6.063 6.265 6.493 6.735 6.964 7.212 7.464 7.711 7.975 8.267 8.585 8.89 9.23 9.605 10.013 10.434 10.863 11.272 11.538 11.39 11.077 10.742 10.381 9.978 9.589 9.218 8.869 8.507 8.193 7.909 7.632 7.366 7.123 6.902 6.655 6.417 6.207 5.996 5.784 5.603 5.405 5.199 5.05 4.897 4.724 4.53 4.327 4.19 4.039 3.806 3.649 3.478 3.386 3.207 3.033 2.841 2.738 2.403 2.418 2.303 2.188 1.901 1.723 1.544 1.35 1.153 0.932 0.619 0.062 -5 ,26788 ,KEBNE ,16677867,Wed Nov 24 22:11:55 CET,Thu Nov 25 00:13:17 CET,0.0 0.741 1.033 1.261 1.468 1.641 1.795 1.945 2.222 2.344 2.458 2.43 2.775 2.882 3.07 3.245 3.413 3.488 3.635 3.781 3.993 4.133 4.262 4.447 4.635 4.809 4.973 5.131 5.328 5.51 5.691 5.912 6.111 6.295 6.494 6.727 6.959 7.203 7.461 7.723 7.998 8.312 8.67 9.018 9.414 9.819 10.259 10.726 11.228 11.71 12.001 11.89 11.559 11.142 10.702 10.278 9.891 9.492 9.152 8.826 8.513 8.216 7.927 7.651 7.412 7.189 6.95 6.737 6.532 6.313 6.09 5.912 5.718 5.505 5.35 5.182 5.004 4.831 4.647 4.52 4.388 4.17 4.019 3.851 3.758 3.57 3.391 3.199 3.095 2.757 2.751 2.641 2.516 2.16 1.96 1.774 1.565 1.347 1.128 0.769 -0.156 -6 ,24381 ,KEBNE ,16677868,Wed Nov 24 22:11:55 CET,Thu Nov 25 00:15:22 CET,0.0 0.377 0.618 0.818 0.999 1.184 1.343 1.49 1.78 1.908 2.023 1.99 2.323 2.42 2.602 2.765 2.912 2.983 3.133 3.284 3.487 3.612 3.737 3.908 4.072 4.238 4.391 4.533 4.718 4.894 5.061 5.269 5.471 5.665 5.901 6.158 6.398 6.672 6.979 7.282 7.568 7.91 8.294 8.648 9.043 9.452 9.887 10.352 10.826 11.277 11.643 11.644 11.359 11.003 10.63 10.225 9.88 9.574 9.289 8.97 8.681 8.417 8.166 7.943 7.727 7.518 7.299 7.095 6.912 6.734 6.546 6.381 6.218 6.039 5.888 5.723 5.551 5.375 5.182 5.046 4.912 4.709 4.554 4.391 4.312 4.144 3.959 3.772 3.676 3.338 3.316 3.194 3.074 2.778 2.617 2.458 2.298 2.124 1.925 1.677 1.234 -7 ,8412 ,KEBNE ,16677869,Wed Nov 24 22:11:55 CET,Thu Nov 25 00:12:23 CET,0.0 0.518 0.876 1.11 1.296 1.479 1.656 1.824 2.127 2.249 2.362 2.353 2.696 2.798 2.987 3.168 3.329 3.407 3.567 3.733 3.975 4.133 4.28 4.479 4.668 4.847 5.019 5.178 5.362 5.534 5.712 5.925 6.125 6.322 6.547 6.794 7.025 7.276 7.546 7.825 8.12 8.452 8.807 9.163 9.57 9.992 10.478 10.973 11.437 11.891 12.187 12.038 11.63 11.15 10.706 10.306 9.916 9.509 9.146 8.773 8.453 8.161 7.855 7.545 7.255 6.998 6.727 6.485 6.261 6.026 5.78 5.583 5.384 5.179 5.026 4.858 4.669 4.463 4.248 4.095 3.937 3.689 3.523 3.356 3.269 3.078 2.892 2.702 2.59 2.242 2.233 2.092 1.952 1.646 1.459 1.277 1.107 0.93 0.725 0.457 -0.155 -8 ,21052 ,KEBNE ,16677870,Wed Nov 24 22:16:02 CET,Thu Nov 25 00:17:41 CET,0.0 0.359 0.606 0.822 1.027 1.196 1.364 1.545 1.836 1.96 2.093 2.104 2.456 2.569 2.768 2.96 3.14 3.228 3.397 3.549 3.76 3.909 4.055 4.242 4.432 4.628 4.807 4.966 5.18 5.387 5.569 5.793 6.008 6.2 6.421 6.689 6.938 7.196 7.477 7.77 8.068 8.403 8.77 9.132 9.578 10.023 10.499 10.963 11.387 11.817 12.086 11.949 11.614 11.207 10.787 10.339 9.911 9.52 9.175 8.816 8.472 8.169 7.89 7.613 7.359 7.12 6.851 6.608 6.396 6.177 5.959 5.771 5.572 5.369 5.211 5.048 4.865 4.665 4.461 4.32 4.17 3.933 3.778 3.606 3.511 3.31 3.094 2.886 2.773 2.42 2.42 2.282 2.139 1.827 1.641 1.445 1.242 1.028 0.806 0.464 -0.085 -9 ,13823 ,KEBNE ,16677871,Wed Nov 24 22:16:03 CET,Thu Nov 25 00:17:04 CET,0.0 0.484 0.726 0.93 1.143 1.339 1.511 1.663 1.943 2.077 2.202 2.201 2.545 2.651 2.859 3.057 3.239 3.324 3.483 3.631 3.854 3.993 4.134 4.329 4.51 4.683 4.848 5.014 5.236 5.448 5.636 5.864 6.077 6.275 6.503 6.77 7.018 7.275 7.547 7.82 8.113 8.451 8.834 9.175 9.567 10.003 10.467 10.94 11.397 11.814 12.099 12.007 11.734 11.411 11.036 10.644 10.275 9.88 9.527 9.169 8.839 8.541 8.259 7.986 7.726 7.485 7.229 6.991 6.771 6.537 6.301 6.106 5.887 5.652 5.472 5.29 5.106 4.915 4.7 4.554 4.414 4.188 4.025 3.847 3.753 3.562 3.368 3.147 3.023 2.676 2.654 2.513 2.366 2.067 1.911 1.732 1.537 1.318 1.018 0.698 0.18 -10 ,7795 ,KEBNE ,16677872,Wed Nov 24 22:16:02 CET,Thu Nov 25 00:16:11 CET,0.0 0.494 0.776 1.016 1.221 1.421 1.588 1.736 2.016 2.142 2.256 2.243 2.591 2.703 2.93 3.13 3.309 3.394 3.557 3.712 3.927 4.063 4.196 4.396 4.595 4.784 4.958 5.116 5.312 5.5 5.678 5.885 6.076 6.269 6.486 6.72 6.958 7.21 7.47 7.743 8.01 8.313 8.685 9.049 9.436 9.83 10.267 10.701 11.126 11.579 11.895 11.81 11.558 11.237 10.875 10.46 10.058 9.697 9.39 9.049 8.739 8.461 8.18 7.913 7.666 7.446 7.214 6.986 6.782 6.573 6.336 6.138 5.936 5.724 5.566 5.396 5.215 5.023 4.822 4.69 4.547 4.296 4.116 3.941 3.858 3.69 3.492 3.278 3.177 2.838 2.829 2.687 2.543 2.256 2.096 1.912 1.699 1.463 1.214 0.896 0.35 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_7_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_7_6.txt deleted file mode 100644 index 0ce6ad16..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_7_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29851 ,KEBNE ,16677873,Wed Nov 24 22:17:04 CET,Thu Nov 25 00:17:05 CET,0.0 0.666 0.936 1.137 1.304 1.438 1.559 1.698 1.947 2.037 2.123 2.078 2.37 2.438 2.547 2.654 2.759 2.81 2.908 3.009 3.146 3.225 3.304 3.416 3.533 3.641 3.731 3.814 3.935 4.057 4.162 4.274 4.379 4.466 4.545 4.642 4.724 4.797 4.898 4.989 5.067 5.146 5.185 5.208 5.228 5.252 5.199 5.029 4.666 3.902 2.483 0.573 -1.155 -2.702 -4.08 -5.353 -6.481 -7.603 -8.664 -9.652 -10.454 -11.18 -11.886 -12.539 -13.135 -13.725 -14.355 -14.901 -15.358 -15.818 -16.304 -16.71 -17.121 -17.544 -17.888 -18.256 -18.63 -19.008 -19.408 -19.699 -19.998 -20.466 -20.794 -21.119 -21.291 -21.661 -22.061 -22.488 -22.695 -23.147 -23.385 -23.637 -23.889 -24.41 -24.699 -25.076 -25.53 -26.028 -26.605 -27.454 -30.524 -2 ,23742 ,KEBNE ,16677874,Wed Nov 24 22:17:04 CET,Thu Nov 25 00:18:46 CET,0.0 0.935 1.225 1.462 1.654 1.807 1.941 2.054 2.239 2.32 2.394 2.319 2.607 2.672 2.802 2.926 3.037 3.09 3.19 3.286 3.433 3.515 3.581 3.675 3.783 3.889 3.984 4.078 4.207 4.336 4.47 4.623 4.734 4.831 4.95 5.087 5.205 5.332 5.468 5.587 5.696 5.828 5.963 6.076 6.187 6.281 6.365 6.401 6.236 5.766 4.732 3.226 1.796 0.532 -0.563 -1.621 -2.604 -3.544 -4.377 -5.229 -5.995 -6.712 -7.452 -8.157 -8.786 -9.36 -9.96 -10.505 -10.986 -11.482 -12.003 -12.425 -12.861 -13.323 -13.685 -14.042 -14.405 -14.801 -15.235 -15.537 -15.835 -16.326 -16.702 -17.096 -17.3 -17.75 -18.242 -18.727 -18.959 -19.45 -19.704 -19.962 -20.245 -20.853 -21.185 -21.536 -21.948 -22.487 -23.081 -23.787 -26.403 -3 ,7002 ,KEBNE ,16677875,Wed Nov 24 22:17:04 CET,Thu Nov 25 00:19:34 CET,0.0 0.921 1.224 1.435 1.603 1.74 1.869 1.995 2.198 2.283 2.362 2.308 2.608 2.68 2.803 2.913 3.008 3.056 3.171 3.278 3.412 3.502 3.587 3.703 3.818 3.932 4.044 4.16 4.293 4.411 4.525 4.653 4.771 4.882 5.008 5.134 5.242 5.38 5.535 5.665 5.788 5.914 6.022 6.116 6.183 6.194 6.156 6.044 5.76 5.143 3.792 1.796 0.015 -1.541 -2.912 -4.177 -5.367 -6.512 -7.508 -8.51 -9.33 -10.04 -10.713 -11.302 -11.878 -12.45 -13.05 -13.547 -13.977 -14.481 -15.049 -15.539 -16.053 -16.574 -16.976 -17.388 -17.819 -18.275 -18.749 -19.088 -19.43 -19.951 -20.307 -20.685 -20.883 -21.268 -21.675 -22.121 -22.35 -22.833 -23.111 -23.393 -23.691 -24.345 -24.702 -25.096 -25.587 -26.15 -26.746 -27.566 -30.276 -4 ,26755 ,KEBNE ,16677876,Wed Nov 24 22:17:04 CET,Thu Nov 25 00:19:26 CET,0.0 1.022 1.348 1.544 1.724 1.886 2.014 2.13 2.341 2.431 2.514 2.441 2.726 2.803 2.942 3.068 3.187 3.24 3.337 3.429 3.563 3.654 3.74 3.844 3.95 4.054 4.145 4.232 4.333 4.412 4.488 4.595 4.695 4.797 4.925 5.043 5.135 5.224 5.315 5.417 5.522 5.616 5.678 5.71 5.727 5.719 5.638 5.432 5.074 4.379 2.994 1.119 -0.714 -2.477 -3.998 -5.364 -6.533 -7.557 -8.494 -9.444 -10.268 -11.031 -11.8 -12.533 -13.192 -13.821 -14.456 -15.015 -15.515 -16.011 -16.543 -16.982 -17.418 -17.877 -18.23 -18.607 -19.008 -19.422 -19.843 -20.134 -20.429 -20.861 -21.172 -21.503 -21.675 -22.031 -22.4 -22.826 -23.063 -23.551 -23.8 -24.044 -24.316 -24.961 -25.331 -25.731 -26.129 -26.567 -27.156 -28.005 -31.145 -5 ,2817 ,KEBNE ,16677877,Wed Nov 24 22:18:05 CET,Thu Nov 25 00:19:47 CET,0.0 0.906 1.212 1.413 1.565 1.707 1.837 1.952 2.15 2.239 2.324 2.251 2.539 2.615 2.764 2.887 2.989 3.036 3.131 3.228 3.366 3.452 3.532 3.636 3.735 3.824 3.908 3.999 4.111 4.231 4.36 4.505 4.632 4.742 4.872 5.022 5.162 5.302 5.434 5.558 5.683 5.838 6.032 6.181 6.302 6.401 6.462 6.46 6.274 5.789 4.535 2.689 1.048 -0.455 -1.798 -3.06 -4.149 -5.057 -5.869 -6.719 -7.45 -8.099 -8.73 -9.347 -9.948 -10.506 -11.077 -11.574 -11.987 -12.475 -13.077 -13.593 -14.11 -14.62 -15.006 -15.402 -15.819 -16.267 -16.755 -17.089 -17.451 -18.047 -18.458 -18.881 -19.087 -19.501 -19.94 -20.404 -20.637 -21.12 -21.388 -21.676 -21.969 -22.604 -22.987 -23.418 -23.865 -24.364 -25.037 -26.074 -29.593 -6 ,19516 ,KEBNE ,16677878,Wed Nov 24 22:18:10 CET,Thu Nov 25 00:16:38 CET,0.0 0.962 1.29 1.517 1.698 1.853 1.985 2.094 2.281 2.356 2.433 2.345 2.636 2.701 2.829 2.951 3.053 3.105 3.206 3.292 3.411 3.484 3.554 3.654 3.755 3.857 3.953 4.048 4.166 4.274 4.38 4.503 4.598 4.678 4.778 4.886 4.984 5.101 5.223 5.331 5.421 5.521 5.634 5.72 5.781 5.791 5.758 5.651 5.389 4.927 3.934 2.416 0.966 -0.568 -2.044 -3.425 -4.664 -5.74 -6.664 -7.59 -8.428 -9.182 -9.93 -10.685 -11.33 -11.882 -12.442 -12.922 -13.341 -13.791 -14.274 -14.679 -15.104 -15.553 -15.904 -16.282 -16.676 -17.057 -17.43 -17.703 -18.009 -18.482 -18.804 -19.135 -19.333 -19.792 -20.228 -20.662 -20.877 -21.339 -21.549 -21.804 -22.092 -22.699 -23.027 -23.434 -23.913 -24.435 -25.134 -26.194 -30.555 -7 ,20508 ,KEBNE ,16677879,Wed Nov 24 22:19:07 CET,Thu Nov 25 00:20:12 CET,0.0 0.798 1.082 1.28 1.439 1.57 1.676 1.772 1.951 2.037 2.117 2.039 2.321 2.379 2.489 2.587 2.686 2.736 2.827 2.91 3.011 3.083 3.155 3.266 3.374 3.461 3.551 3.641 3.742 3.847 3.954 4.069 4.172 4.259 4.36 4.481 4.583 4.692 4.813 4.932 5.028 5.06 5.08 5.124 5.125 5.057 4.891 4.634 4.292 3.591 2.062 -0.059 -1.952 -3.607 -5.064 -6.414 -7.665 -8.845 -9.854 -10.925 -11.905 -12.756 -13.553 -14.279 -14.897 -15.459 -16.071 -16.605 -17.075 -17.572 -18.098 -18.552 -19.016 -19.478 -19.845 -20.223 -20.591 -20.971 -21.374 -21.654 -21.959 -22.468 -22.833 -23.207 -23.407 -23.821 -24.236 -24.679 -24.914 -25.422 -25.741 -26.031 -26.321 -26.997 -27.407 -27.85 -28.313 -28.807 -29.438 -30.273 -33.042 -8 ,7887 ,KEBNE ,16677880,Wed Nov 24 22:19:07 CET,Thu Nov 25 00:20:09 CET,0.0 0.628 0.882 1.103 1.269 1.408 1.539 1.655 1.855 1.944 2.022 1.97 2.247 2.314 2.437 2.558 2.675 2.731 2.831 2.921 3.069 3.167 3.246 3.359 3.476 3.586 3.679 3.763 3.885 3.993 4.094 4.225 4.332 4.422 4.536 4.683 4.808 4.914 5.025 5.154 5.287 5.418 5.556 5.672 5.8 5.874 5.867 5.802 5.575 4.992 3.734 1.77 -0.173 -1.852 -3.228 -4.517 -5.724 -6.836 -7.814 -8.775 -9.593 -10.356 -11.109 -11.773 -12.356 -12.891 -13.462 -14.006 -14.49 -14.978 -15.464 -15.86 -16.307 -16.796 -17.157 -17.539 -17.994 -18.484 -18.966 -19.284 -19.601 -20.092 -20.444 -20.806 -21.0 -21.405 -21.823 -22.257 -22.481 -22.964 -23.23 -23.513 -23.809 -24.478 -24.859 -25.26 -25.718 -26.245 -26.879 -27.687 -30.289 -9 ,20704 ,KEBNE ,16677881,Wed Nov 24 22:20:09 CET,Thu Nov 25 00:22:14 CET,0.0 0.972 1.256 1.453 1.604 1.737 1.861 1.988 2.202 2.285 2.362 2.282 2.559 2.617 2.721 2.831 2.941 2.991 3.088 3.187 3.331 3.415 3.489 3.598 3.707 3.805 3.9 3.987 4.084 4.179 4.272 4.388 4.494 4.584 4.691 4.817 4.936 5.055 5.172 5.298 5.412 5.532 5.665 5.756 5.847 5.896 5.894 5.85 5.657 5.215 4.126 2.473 1.007 -0.335 -1.663 -2.893 -3.983 -5.019 -6.025 -7.084 -7.921 -8.659 -9.386 -10.089 -10.759 -11.366 -12.006 -12.569 -13.058 -13.616 -14.257 -14.786 -15.295 -15.81 -16.211 -16.632 -17.041 -17.441 -17.876 -18.183 -18.484 -18.967 -19.325 -19.702 -19.892 -20.306 -20.792 -21.31 -21.578 -22.105 -22.463 -22.785 -23.134 -23.878 -24.296 -24.758 -25.271 -25.834 -26.506 -27.464 -30.332 -10 ,14011 ,KEBNE ,16677882,Wed Nov 24 22:19:07 CET,Thu Nov 25 00:20:35 CET,0.0 0.921 1.252 1.498 1.696 1.853 1.978 2.095 2.299 2.387 2.473 2.422 2.693 2.755 2.874 2.99 3.097 3.142 3.239 3.333 3.455 3.535 3.617 3.742 3.855 3.951 4.039 4.128 4.234 4.331 4.424 4.532 4.627 4.707 4.798 4.898 5.005 5.11 5.208 5.311 5.406 5.523 5.662 5.763 5.848 5.898 5.907 5.887 5.669 5.134 4.026 2.467 1.101 -0.189 -1.546 -2.899 -4.048 -5.082 -5.94 -6.808 -7.607 -8.285 -8.922 -9.551 -10.205 -10.867 -11.517 -12.061 -12.525 -13.007 -13.511 -13.939 -14.415 -14.926 -15.318 -15.712 -16.12 -16.556 -17.009 -17.319 -17.653 -18.193 -18.569 -18.959 -19.147 -19.55 -20.016 -20.5 -20.742 -21.248 -21.574 -21.869 -22.172 -22.859 -23.254 -23.674 -24.171 -24.729 -25.355 -26.191 -28.843 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_7_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_7_Example-1.txt deleted file mode 100644 index e225654c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_7_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6333 ,KEBNE ,16677883,Wed Nov 24 22:19:07 CET,Thu Nov 25 00:20:10 CET,0.0 1.353 1.705 1.958 2.17 2.354 2.516 2.658 2.902 3.014 3.127 3.122 3.418 3.511 3.713 3.879 4.026 4.102 4.245 4.385 4.593 4.718 4.825 4.978 5.111 5.238 5.373 5.498 5.644 5.787 5.92 6.071 6.213 6.342 6.48 6.623 6.757 6.916 7.092 7.289 7.479 7.656 7.84 7.987 8.146 8.287 8.338 8.3 8.17 7.711 6.389 4.463 2.737 1.066 -0.41 -1.642 -2.749 -3.787 -4.667 -5.555 -6.334 -7.024 -7.663 -8.271 -8.825 -9.333 -9.894 -10.41 -10.849 -11.287 -11.743 -12.115 -12.49 -12.931 -13.285 -13.622 -13.97 -14.327 -14.685 -14.933 -15.187 -15.586 -15.894 -16.231 -16.406 -16.77 -17.146 -17.552 -17.777 -18.247 -18.468 -18.724 -19.001 -19.61 -19.947 -20.32 -20.755 -21.284 -21.922 -22.76 -25.929 -2 ,11629 ,KEBNE ,16677884,Wed Nov 24 22:20:09 CET,Thu Nov 25 00:21:55 CET,0.0 1.194 1.52 1.746 1.948 2.113 2.258 2.4 2.679 2.803 2.911 2.898 3.208 3.298 3.466 3.617 3.759 3.822 3.937 4.054 4.218 4.318 4.413 4.559 4.713 4.844 4.96 5.073 5.211 5.348 5.48 5.624 5.753 5.893 6.053 6.198 6.334 6.492 6.66 6.853 7.021 7.171 7.341 7.506 7.668 7.79 7.894 7.835 7.466 6.714 5.17 3.039 1.169 -0.446 -1.831 -3.147 -4.302 -5.274 -6.168 -7.137 -8.029 -8.879 -9.706 -10.477 -11.194 -11.877 -12.581 -13.185 -13.706 -14.236 -14.78 -15.214 -15.631 -16.088 -16.454 -16.843 -17.228 -17.576 -17.945 -18.205 -18.47 -18.892 -19.169 -19.454 -19.611 -19.948 -20.319 -20.711 -20.901 -21.334 -21.52 -21.753 -21.995 -22.513 -22.797 -23.114 -23.469 -23.849 -24.312 -24.969 -27.496 -3 ,30776 ,KEBNE ,16677885,Wed Nov 24 22:21:11 CET,Thu Nov 25 00:21:06 CET,0.0 1.366 1.76 2.044 2.281 2.494 2.685 2.846 3.141 3.274 3.389 3.401 3.731 3.839 4.043 4.227 4.393 4.482 4.65 4.802 5.014 5.155 5.289 5.467 5.64 5.798 5.958 6.118 6.297 6.454 6.598 6.772 6.953 7.122 7.302 7.484 7.646 7.83 8.03 8.22 8.415 8.636 8.856 9.054 9.265 9.431 9.522 9.523 9.427 8.961 7.677 5.88 4.095 2.408 0.994 -0.253 -1.33 -2.29 -3.148 -3.997 -4.717 -5.437 -6.146 -6.786 -7.38 -7.912 -8.46 -8.942 -9.348 -9.777 -10.223 -10.585 -10.96 -11.341 -11.648 -11.969 -12.293 -12.628 -13.019 -13.301 -13.576 -14.017 -14.324 -14.633 -14.79 -15.153 -15.561 -15.968 -16.163 -16.597 -16.769 -16.998 -17.239 -17.761 -18.067 -18.4 -18.749 -19.132 -19.604 -20.317 -22.916 -4 ,20905 ,KEBNE ,16677886,Wed Nov 24 22:21:11 CET,Thu Nov 25 00:20:09 CET,0.0 1.371 1.816 2.087 2.316 2.531 2.702 2.843 3.104 3.221 3.329 3.291 3.598 3.689 3.857 4.021 4.174 4.25 4.398 4.532 4.733 4.871 5.002 5.188 5.365 5.52 5.664 5.799 5.972 6.142 6.3 6.482 6.662 6.838 7.027 7.215 7.376 7.546 7.735 7.941 8.164 8.377 8.576 8.758 8.955 9.117 9.18 9.173 9.048 8.594 7.381 5.52 3.628 1.782 0.088 -1.402 -2.617 -3.647 -4.545 -5.473 -6.26 -6.953 -7.598 -8.209 -8.783 -9.32 -9.888 -10.405 -10.864 -11.339 -11.837 -12.244 -12.669 -13.117 -13.439 -13.75 -14.09 -14.465 -14.851 -15.107 -15.375 -15.804 -16.1 -16.395 -16.543 -16.854 -17.198 -17.581 -17.788 -18.239 -18.424 -18.646 -18.88 -19.395 -19.719 -20.083 -20.485 -20.922 -21.435 -22.223 -25.055 -5 ,9334 ,KEBNE ,16677887,Wed Nov 24 22:21:11 CET,Thu Nov 25 00:22:32 CET,0.0 1.263 1.686 1.952 2.163 2.361 2.521 2.666 2.967 3.094 3.206 3.19 3.495 3.575 3.728 3.864 4.005 4.077 4.214 4.339 4.496 4.605 4.718 4.879 5.031 5.173 5.317 5.465 5.65 5.821 5.992 6.2 6.376 6.541 6.751 6.982 7.182 7.398 7.629 7.871 8.078 8.269 8.502 8.693 8.864 9.021 9.172 9.256 9.209 8.812 7.742 6.066 4.421 3.006 1.632 0.251 -0.996 -2.119 -3.107 -4.128 -4.974 -5.726 -6.466 -7.096 -7.64 -8.18 -8.767 -9.285 -9.717 -10.145 -10.585 -10.96 -11.385 -11.856 -12.2 -12.549 -12.912 -13.275 -13.64 -13.885 -14.146 -14.582 -14.901 -15.224 -15.373 -15.695 -16.028 -16.378 -16.586 -17.047 -17.234 -17.458 -17.698 -18.31 -18.653 -19.033 -19.453 -19.899 -20.46 -21.293 -23.838 -6 ,16957 ,KEBNE ,16677888,Wed Nov 24 22:21:11 CET,Thu Nov 25 00:22:42 CET,0.0 1.402 1.819 2.127 2.385 2.594 2.759 2.912 3.214 3.347 3.485 3.53 3.819 3.907 4.086 4.26 4.428 4.508 4.657 4.797 4.997 5.131 5.274 5.475 5.661 5.827 5.973 6.12 6.302 6.466 6.607 6.768 6.912 7.037 7.182 7.334 7.486 7.647 7.799 7.965 8.139 8.316 8.498 8.659 8.788 8.856 8.915 8.831 8.492 7.928 6.802 4.944 3.062 1.387 -0.102 -1.433 -2.58 -3.656 -4.587 -5.507 -6.344 -7.128 -7.835 -8.48 -9.086 -9.64 -10.204 -10.681 -11.116 -11.602 -12.095 -12.495 -12.914 -13.352 -13.689 -14.023 -14.372 -14.758 -15.164 -15.431 -15.729 -16.217 -16.52 -16.816 -16.974 -17.324 -17.684 -18.045 -18.23 -18.677 -18.903 -19.137 -19.358 -19.827 -20.101 -20.401 -20.718 -21.154 -21.731 -22.496 -24.903 -7 ,16249 ,KEBNE ,16677889,Wed Nov 24 22:23:14 CET,Thu Nov 25 00:25:23 CET,0.0 1.051 1.422 1.703 1.909 2.077 2.24 2.394 2.655 2.762 2.859 2.85 3.146 3.239 3.407 3.566 3.724 3.798 3.935 4.068 4.26 4.366 4.473 4.638 4.794 4.938 5.075 5.2 5.341 5.47 5.607 5.782 5.944 6.093 6.264 6.455 6.618 6.782 6.958 7.144 7.324 7.515 7.748 7.944 8.112 8.322 8.54 8.723 8.852 8.666 7.714 6.171 4.766 3.387 2.219 1.073 -0.119 -1.114 -1.986 -2.977 -3.838 -4.564 -5.249 -5.904 -6.494 -7.025 -7.593 -8.091 -8.524 -8.993 -9.481 -9.878 -10.293 -10.73 -11.071 -11.435 -11.814 -12.181 -12.553 -12.826 -13.094 -13.487 -13.787 -14.132 -14.315 -14.709 -15.117 -15.534 -15.748 -16.201 -16.442 -16.714 -17.005 -17.619 -17.956 -18.334 -18.766 -19.26 -19.819 -20.602 -23.696 -8 ,1319 ,KEBNE ,16677890,Wed Nov 24 22:23:14 CET,Thu Nov 25 00:24:42 CET,0.0 1.322 1.712 1.981 2.171 2.351 2.521 2.675 2.957 3.077 3.178 3.137 3.453 3.544 3.717 3.882 4.023 4.084 4.216 4.334 4.487 4.588 4.677 4.815 4.958 5.08 5.192 5.307 5.465 5.609 5.738 5.88 6.005 6.117 6.261 6.428 6.568 6.702 6.837 7.001 7.161 7.318 7.472 7.592 7.714 7.787 7.808 7.73 7.426 6.871 5.61 3.68 1.985 0.475 -0.88 -2.122 -3.278 -4.353 -5.306 -6.287 -7.11 -7.82 -8.51 -9.149 -9.705 -10.224 -10.767 -11.248 -11.655 -12.078 -12.498 -12.842 -13.225 -13.603 -13.883 -14.184 -14.473 -14.776 -15.126 -15.363 -15.593 -15.964 -16.237 -16.526 -16.667 -16.95 -17.253 -17.581 -17.75 -18.17 -18.301 -18.511 -18.738 -19.23 -19.544 -19.942 -20.369 -20.792 -21.256 -21.868 -24.14 -9 ,8677 ,KEBNE ,16677891,Wed Nov 24 22:23:14 CET,Thu Nov 25 00:25:26 CET,0.0 1.217 1.565 1.833 2.078 2.29 2.467 2.615 2.882 3.0 3.106 3.08 3.402 3.493 3.658 3.812 3.954 4.022 4.159 4.281 4.45 4.555 4.663 4.818 4.959 5.103 5.245 5.383 5.557 5.726 5.889 6.047 6.184 6.33 6.519 6.723 6.894 7.076 7.267 7.438 7.58 7.714 7.882 8.058 8.215 8.328 8.415 8.406 8.233 7.676 6.286 4.452 2.849 1.317 -0.184 -1.502 -2.651 -3.716 -4.598 -5.476 -6.233 -6.909 -7.571 -8.171 -8.709 -9.257 -9.834 -10.329 -10.758 -11.19 -11.625 -11.99 -12.355 -12.723 -13.017 -13.315 -13.632 -13.983 -14.364 -14.62 -14.876 -15.267 -15.54 -15.835 -15.991 -16.313 -16.666 -17.031 -17.21 -17.643 -17.819 -18.031 -18.252 -18.72 -18.973 -19.276 -19.642 -20.117 -20.697 -21.434 -24.29 -10 ,4797 ,KEBNE ,16677892,Wed Nov 24 22:27:20 CET,Thu Nov 25 00:31:10 CET,0.0 1.212 1.567 1.821 2.031 2.227 2.421 2.582 2.823 2.936 3.048 3.021 3.337 3.441 3.62 3.779 3.942 4.023 4.167 4.31 4.515 4.64 4.761 4.924 5.076 5.219 5.349 5.475 5.638 5.797 5.948 6.129 6.306 6.485 6.691 6.896 7.072 7.244 7.435 7.622 7.787 7.962 8.136 8.283 8.458 8.621 8.731 8.777 8.681 8.178 7.077 5.431 3.669 2.157 0.854 -0.334 -1.383 -2.352 -3.2 -4.093 -4.885 -5.568 -6.212 -6.851 -7.491 -8.087 -8.711 -9.282 -9.785 -10.291 -10.796 -11.212 -11.624 -12.032 -12.367 -12.713 -13.055 -13.417 -13.799 -14.069 -14.343 -14.769 -15.064 -15.367 -15.53 -15.856 -16.195 -16.564 -16.752 -17.198 -17.42 -17.676 -17.928 -18.524 -18.857 -19.204 -19.578 -19.984 -20.469 -21.102 -23.749 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_6.txt deleted file mode 100644 index 74ea4057..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15083 ,KEBNE ,16677893,Wed Nov 24 22:28:22 CET,Thu Nov 25 00:32:08 CET,0.0 1.214 1.528 1.761 1.973 2.16 2.316 2.476 2.764 2.888 3.009 2.962 3.309 3.405 3.575 3.761 3.929 4.003 4.14 4.283 4.498 4.627 4.755 4.93 5.101 5.266 5.416 5.57 5.768 5.958 6.145 6.366 6.576 6.765 6.955 7.161 7.381 7.612 7.85 8.088 8.332 8.621 8.927 9.198 9.494 9.801 10.12 10.384 10.588 10.698 10.584 10.127 9.633 9.109 8.564 8.039 7.496 7.016 6.65 6.293 5.978 5.655 5.334 5.03 4.752 4.497 4.239 4.019 3.836 3.637 3.394 3.187 2.961 2.722 2.547 2.361 2.173 1.985 1.779 1.64 1.495 1.27 1.093 0.894 0.796 0.606 0.416 0.199 0.077 -0.29 -0.275 -0.413 -0.568 -0.926 -1.095 -1.272 -1.511 -1.799 -2.19 -2.778 -4.218 -2 ,26573 ,KEBNE ,16677894,Wed Nov 24 22:31:27 CET,Thu Nov 25 00:34:13 CET,0.0 1.045 1.411 1.666 1.894 2.073 2.214 2.36 2.625 2.73 2.836 2.795 3.12 3.208 3.379 3.536 3.677 3.739 3.862 4.001 4.204 4.327 4.449 4.62 4.766 4.897 5.022 5.139 5.282 5.424 5.579 5.772 5.952 6.119 6.316 6.52 6.694 6.878 7.056 7.266 7.498 7.74 8.029 8.298 8.566 8.858 9.16 9.418 9.678 9.887 9.905 9.58 9.098 8.526 7.993 7.55 7.114 6.666 6.291 5.935 5.615 5.304 4.98 4.658 4.335 4.043 3.756 3.503 3.28 3.056 2.819 2.612 2.378 2.104 1.892 1.697 1.489 1.258 1.028 0.86 0.689 0.435 0.257 0.076 -0.02 -0.249 -0.517 -0.801 -0.93 -1.304 -1.32 -1.462 -1.616 -1.973 -2.195 -2.44 -2.662 -2.893 -3.189 -3.609 -4.691 -3 ,11124 ,KEBNE ,16677895,Wed Nov 24 22:32:29 CET,Thu Nov 25 00:34:20 CET,0.0 1.283 1.644 1.916 2.126 2.321 2.501 2.647 2.916 3.045 3.157 3.109 3.45 3.545 3.732 3.892 4.026 4.094 4.224 4.345 4.522 4.642 4.76 4.919 5.064 5.213 5.349 5.465 5.623 5.77 5.911 6.097 6.277 6.433 6.591 6.763 6.935 7.131 7.33 7.526 7.735 7.978 8.263 8.537 8.825 9.098 9.387 9.678 9.922 10.07 10.05 9.679 9.181 8.68 8.219 7.773 7.354 6.948 6.586 6.221 5.891 5.585 5.27 4.966 4.708 4.466 4.187 3.951 3.748 3.522 3.287 3.1 2.89 2.657 2.465 2.273 2.082 1.892 1.687 1.538 1.398 1.182 1.026 0.853 0.758 0.567 0.36 0.144 0.029 -0.339 -0.354 -0.494 -0.65 -1.032 -1.246 -1.457 -1.676 -1.923 -2.234 -2.702 -4.125 -4 ,4180 ,KEBNE ,16677896,Wed Nov 24 22:33:30 CET,Thu Nov 25 00:36:20 CET,0.0 0.9 1.206 1.421 1.608 1.774 1.92 2.063 2.338 2.458 2.556 2.49 2.821 2.909 3.07 3.216 3.347 3.409 3.532 3.651 3.81 3.912 4.012 4.152 4.27 4.384 4.512 4.644 4.806 4.953 5.088 5.244 5.4 5.554 5.707 5.894 6.094 6.286 6.473 6.67 6.902 7.185 7.48 7.736 8.034 8.334 8.63 8.921 9.179 9.371 9.434 9.128 8.584 8.025 7.523 7.006 6.534 6.13 5.77 5.399 5.042 4.707 4.403 4.097 3.786 3.526 3.295 3.081 2.881 2.656 2.414 2.216 2.005 1.766 1.58 1.415 1.235 1.023 0.811 0.667 0.521 0.298 0.122 -0.085 -0.195 -0.396 -0.578 -0.782 -0.9 -1.259 -1.225 -1.341 -1.482 -1.818 -1.999 -2.221 -2.479 -2.779 -3.152 -3.636 -4.826 -5 ,25076 ,KEBNE ,16677897,Wed Nov 24 22:36:40 CET,Thu Nov 25 00:36:05 CET,0.0 0.877 1.216 1.438 1.613 1.761 1.877 2.001 2.264 2.373 2.476 2.424 2.747 2.821 2.98 3.132 3.259 3.32 3.449 3.572 3.74 3.848 3.946 4.094 4.235 4.357 4.476 4.592 4.751 4.907 5.041 5.194 5.347 5.492 5.653 5.825 5.995 6.192 6.403 6.629 6.859 7.098 7.349 7.589 7.868 8.179 8.472 8.751 9.032 9.245 9.241 8.839 8.348 7.814 7.27 6.802 6.381 5.973 5.571 5.162 4.842 4.545 4.239 3.942 3.635 3.348 3.061 2.789 2.566 2.351 2.125 1.939 1.749 1.533 1.352 1.172 0.996 0.816 0.625 0.499 0.363 0.143 -0.014 -0.198 -0.292 -0.493 -0.709 -0.924 -1.039 -1.405 -1.443 -1.589 -1.733 -2.09 -2.299 -2.536 -2.831 -3.155 -3.516 -3.983 -5.119 -6 ,25981 ,KEBNE ,16677898,Wed Nov 24 22:37:42 CET,Thu Nov 25 00:36:59 CET,0.0 1.033 1.355 1.608 1.806 1.964 2.103 2.234 2.481 2.595 2.695 2.633 2.97 3.07 3.243 3.381 3.519 3.585 3.721 3.861 4.053 4.161 4.266 4.427 4.575 4.706 4.839 4.968 5.136 5.299 5.452 5.637 5.797 5.945 6.127 6.344 6.543 6.744 6.97 7.204 7.44 7.703 8.001 8.288 8.6 8.911 9.216 9.56 9.87 10.103 10.153 9.8 9.311 8.787 8.273 7.772 7.317 6.87 6.502 6.129 5.762 5.422 5.101 4.792 4.493 4.204 3.903 3.641 3.414 3.183 2.941 2.733 2.513 2.29 2.122 1.948 1.751 1.541 1.315 1.163 1.008 0.769 0.605 0.42 0.309 0.069 -0.154 -0.377 -0.494 -0.856 -0.86 -0.989 -1.136 -1.472 -1.644 -1.82 -2.028 -2.293 -2.606 -3.001 -3.96 -7 ,18527 ,KEBNE ,16677899,Wed Nov 24 22:38:40 CET,Thu Nov 25 00:39:24 CET,0.0 0.647 1.013 1.277 1.481 1.643 1.792 1.93 2.178 2.293 2.405 2.362 2.69 2.777 2.939 3.085 3.23 3.305 3.443 3.563 3.725 3.839 3.958 4.129 4.289 4.439 4.578 4.726 4.926 5.104 5.261 5.439 5.611 5.771 5.95 6.153 6.346 6.564 6.789 7.005 7.209 7.449 7.735 8.002 8.307 8.655 9.03 9.359 9.681 9.965 9.946 9.514 9.001 8.446 7.879 7.368 6.947 6.532 6.128 5.708 5.357 5.047 4.723 4.401 4.106 3.836 3.54 3.262 3.028 2.791 2.532 2.304 2.076 1.84 1.641 1.454 1.276 1.083 0.89 0.758 0.617 0.386 0.229 0.068 -0.024 -0.223 -0.43 -0.671 -0.801 -1.183 -1.228 -1.374 -1.532 -1.883 -2.065 -2.275 -2.522 -2.814 -3.172 -3.678 -5.055 -8 ,18247 ,KEBNE ,16677900,Wed Nov 24 22:39:42 CET,Thu Nov 25 00:39:52 CET,0.0 0.702 1.074 1.334 1.529 1.71 1.871 2.017 2.278 2.386 2.49 2.441 2.79 2.884 3.078 3.248 3.398 3.473 3.613 3.751 3.943 4.055 4.166 4.328 4.471 4.606 4.739 4.865 5.027 5.183 5.334 5.516 5.698 5.885 6.091 6.3 6.491 6.687 6.893 7.108 7.307 7.521 7.797 8.071 8.367 8.697 9.008 9.304 9.583 9.71 9.579 9.177 8.703 8.176 7.619 7.076 6.615 6.185 5.779 5.374 5.014 4.681 4.383 4.12 3.866 3.624 3.36 3.116 2.914 2.7 2.469 2.264 2.048 1.83 1.66 1.479 1.283 1.082 0.868 0.709 0.545 0.292 0.121 -0.059 -0.163 -0.37 -0.58 -0.817 -0.944 -1.34 -1.376 -1.528 -1.672 -2.008 -2.224 -2.466 -2.725 -3.022 -3.406 -3.982 -5.391 -9 ,21282 ,KEBNE ,16677901,Wed Nov 24 22:39:45 CET,Thu Nov 25 00:37:12 CET,0.0 0.926 1.265 1.501 1.692 1.881 2.062 2.209 2.47 2.591 2.699 2.667 3.018 3.107 3.294 3.475 3.627 3.699 3.84 3.969 4.145 4.257 4.383 4.567 4.72 4.865 5.021 5.171 5.341 5.515 5.687 5.89 6.08 6.247 6.439 6.665 6.881 7.104 7.357 7.612 7.848 8.125 8.42 8.675 8.961 9.319 9.728 10.112 10.437 10.633 10.606 10.28 9.825 9.301 8.784 8.274 7.788 7.374 7.009 6.6 6.232 5.894 5.582 5.277 4.975 4.729 4.479 4.234 4.014 3.775 3.542 3.347 3.129 2.896 2.721 2.544 2.352 2.152 1.955 1.824 1.69 1.471 1.314 1.156 1.078 0.915 0.718 0.52 0.422 0.058 0.033 -0.105 -0.24 -0.541 -0.718 -0.907 -1.136 -1.409 -1.799 -2.346 -3.615 -10 ,7484 ,KEBNE ,16677902,Wed Nov 24 22:40:43 CET,Thu Nov 25 00:42:06 CET,0.0 0.986 1.329 1.568 1.739 1.881 2.026 2.169 2.422 2.538 2.645 2.591 2.931 3.011 3.158 3.302 3.444 3.511 3.651 3.775 3.936 4.04 4.141 4.294 4.437 4.578 4.726 4.863 5.014 5.155 5.293 5.442 5.58 5.73 5.901 6.087 6.265 6.447 6.637 6.848 7.076 7.316 7.573 7.819 8.11 8.429 8.751 9.071 9.357 9.571 9.606 9.302 8.811 8.257 7.772 7.285 6.819 6.433 6.091 5.681 5.33 5.044 4.78 4.525 4.277 4.042 3.79 3.569 3.391 3.202 2.988 2.793 2.582 2.381 2.219 2.046 1.858 1.648 1.429 1.287 1.141 0.884 0.71 0.538 0.45 0.278 0.092 -0.098 -0.191 -0.547 -0.542 -0.676 -0.821 -1.139 -1.299 -1.47 -1.685 -1.954 -2.274 -2.763 -3.997 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt deleted file mode 100644 index 0100dd9b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14548 ,KEBNE ,16675599,Wed Nov 24 06:10:43 CET,Wed Nov 24 08:10:07 CET,0.0 1.519 1.982 2.273 2.517 2.712 2.879 3.038 3.325 3.449 3.564 3.526 3.873 3.962 4.125 4.288 4.441 4.512 4.648 4.778 4.957 5.062 5.164 5.316 5.461 5.601 5.728 5.843 5.999 6.151 6.288 6.445 6.579 6.71 6.868 7.036 7.195 7.384 7.602 7.82 8.005 8.2 8.412 8.617 8.851 9.042 9.217 9.365 9.402 9.262 8.757 7.871 6.999 6.221 5.509 4.87 4.316 3.802 3.358 2.922 2.549 2.201 1.869 1.577 1.298 1.036 0.756 0.495 0.277 0.065 -0.155 -0.347 -0.541 -0.743 -0.905 -1.064 -1.23 -1.416 -1.61 -1.737 -1.871 -2.105 -2.264 -2.422 -2.504 -2.667 -2.852 -3.053 -3.147 -3.496 -3.472 -3.586 -3.701 -3.968 -4.132 -4.304 -4.498 -4.728 -4.994 -5.434 -6.757 -2 ,11739 ,KEBNE ,16677904,Wed Nov 24 22:40:47 CET,Thu Nov 25 00:39:57 CET,0.0 0.962 1.288 1.515 1.722 1.917 2.103 2.271 2.525 2.627 2.727 2.674 3.008 3.08 3.228 3.386 3.534 3.598 3.73 3.867 4.042 4.154 4.267 4.419 4.571 4.716 4.844 4.975 5.138 5.283 5.425 5.59 5.742 5.888 6.04 6.2 6.366 6.559 6.744 6.916 7.107 7.316 7.511 7.71 7.94 8.127 8.259 8.362 8.421 8.291 7.748 6.876 6.02 5.235 4.516 3.862 3.292 2.777 2.335 1.884 1.495 1.176 0.876 0.582 0.304 0.044 -0.235 -0.492 -0.712 -0.921 -1.123 -1.298 -1.503 -1.718 -1.881 -2.053 -2.23 -2.413 -2.607 -2.736 -2.873 -3.085 -3.255 -3.44 -3.519 -3.688 -3.884 -4.08 -4.184 -4.55 -4.52 -4.624 -4.728 -4.969 -5.109 -5.281 -5.473 -5.699 -5.975 -6.406 -7.924 -3 ,11813 ,KEBNE ,16675601,Wed Nov 24 06:11:44 CET,Wed Nov 24 08:13:35 CET,0.0 1.119 1.502 1.787 2.013 2.22 2.39 2.522 2.76 2.866 2.967 2.913 3.246 3.341 3.5 3.64 3.772 3.845 3.998 4.13 4.315 4.434 4.56 4.738 4.898 5.047 5.18 5.313 5.488 5.648 5.805 6.002 6.188 6.354 6.545 6.754 6.924 7.094 7.305 7.537 7.739 7.963 8.216 8.439 8.661 8.859 9.081 9.304 9.43 9.476 9.141 8.261 7.424 6.61 5.885 5.284 4.802 4.363 3.968 3.561 3.199 2.865 2.546 2.24 1.948 1.675 1.392 1.144 0.932 0.719 0.501 0.315 0.124 -0.066 -0.221 -0.396 -0.582 -0.766 -0.952 -1.089 -1.227 -1.425 -1.566 -1.715 -1.793 -1.954 -2.116 -2.296 -2.397 -2.765 -2.75 -2.871 -3.014 -3.323 -3.478 -3.646 -3.841 -4.095 -4.389 -4.772 -6.177 -4 ,12730 ,KEBNE ,16677906,Wed Nov 24 22:40:43 CET,Thu Nov 25 00:44:01 CET,0.0 1.396 1.788 2.068 2.255 2.407 2.548 2.688 2.93 3.039 3.154 3.125 3.467 3.556 3.727 3.908 4.066 4.128 4.263 4.4 4.559 4.657 4.763 4.916 5.064 5.204 5.332 5.449 5.588 5.724 5.854 6.007 6.152 6.297 6.458 6.619 6.774 6.949 7.132 7.323 7.524 7.733 7.93 8.093 8.28 8.452 8.568 8.66 8.686 8.511 7.998 7.205 6.396 5.618 4.949 4.344 3.773 3.245 2.811 2.378 1.993 1.658 1.339 1.042 0.77 0.519 0.252 0.007 -0.214 -0.45 -0.692 -0.889 -1.09 -1.293 -1.449 -1.617 -1.796 -1.976 -2.156 -2.288 -2.428 -2.641 -2.799 -2.976 -3.062 -3.221 -3.389 -3.563 -3.661 -4.012 -3.989 -4.104 -4.229 -4.521 -4.689 -4.876 -5.069 -5.291 -5.556 -5.943 -7.176 -5 ,26739 ,KEBNE ,16675603,Wed Nov 24 06:11:44 CET,Wed Nov 24 08:10:59 CET,0.0 1.212 1.619 1.931 2.169 2.37 2.545 2.705 2.994 3.121 3.236 3.187 3.534 3.632 3.813 3.994 4.158 4.229 4.371 4.509 4.685 4.804 4.919 5.081 5.246 5.395 5.534 5.667 5.838 5.994 6.134 6.29 6.434 6.59 6.765 6.942 7.12 7.318 7.52 7.718 7.919 8.134 8.366 8.622 8.921 9.19 9.444 9.685 9.868 9.854 9.482 8.829 8.098 7.427 6.826 6.28 5.782 5.292 4.872 4.469 4.103 3.758 3.44 3.134 2.852 2.608 2.36 2.134 1.922 1.702 1.497 1.319 1.114 0.904 0.738 0.576 0.415 0.23 0.033 -0.098 -0.239 -0.454 -0.594 -0.759 -0.844 -1.007 -1.168 -1.337 -1.439 -1.8 -1.765 -1.877 -1.99 -2.239 -2.385 -2.554 -2.742 -2.967 -3.241 -3.62 -4.85 -6 ,13104 ,KEBNE ,16675604,Wed Nov 24 06:11:44 CET,Wed Nov 24 08:14:00 CET,0.0 1.102 1.463 1.721 1.953 2.143 2.323 2.498 2.795 2.91 3.024 3.005 3.338 3.429 3.596 3.765 3.934 4.008 4.151 4.286 4.477 4.6 4.71 4.875 5.03 5.17 5.305 5.434 5.589 5.743 5.902 6.081 6.237 6.379 6.547 6.743 6.934 7.145 7.377 7.594 7.805 8.019 8.237 8.442 8.622 8.807 9.03 9.2 9.312 9.25 8.77 7.842 6.931 6.093 5.329 4.662 4.111 3.608 3.154 2.715 2.34 1.994 1.649 1.325 1.021 0.727 0.43 0.17 -0.067 -0.307 -0.554 -0.751 -0.947 -1.159 -1.333 -1.511 -1.695 -1.888 -2.087 -2.223 -2.354 -2.564 -2.715 -2.875 -2.958 -3.124 -3.309 -3.522 -3.626 -3.984 -3.966 -4.091 -4.222 -4.51 -4.666 -4.862 -5.081 -5.309 -5.593 -5.964 -7.159 -7 ,25799 ,KEBNE ,16675605,Wed Nov 24 06:11:44 CET,Wed Nov 24 08:10:56 CET,0.0 0.93 1.301 1.594 1.837 2.025 2.191 2.345 2.636 2.771 2.895 2.871 3.213 3.303 3.469 3.631 3.784 3.861 4.005 4.139 4.331 4.446 4.562 4.717 4.863 5.014 5.144 5.265 5.42 5.561 5.698 5.869 6.032 6.186 6.36 6.547 6.718 6.895 7.073 7.267 7.466 7.654 7.861 8.06 8.259 8.492 8.716 8.83 8.771 8.532 7.968 7.102 6.32 5.556 4.844 4.205 3.67 3.171 2.725 2.27 1.87 1.512 1.161 0.826 0.523 0.259 -0.003 -0.233 -0.447 -0.679 -0.913 -1.103 -1.294 -1.507 -1.684 -1.86 -2.04 -2.224 -2.42 -2.554 -2.695 -2.929 -3.096 -3.265 -3.352 -3.522 -3.694 -3.883 -3.976 -4.33 -4.308 -4.426 -4.533 -4.774 -4.919 -5.07 -5.24 -5.457 -5.74 -6.127 -7.536 -8 ,13556 ,KEBNE ,16677910,Wed Nov 24 22:44:51 CET,Thu Nov 25 00:51:51 CET,0.0 1.244 1.567 1.809 2.035 2.216 2.38 2.551 2.837 2.94 3.038 2.99 3.342 3.43 3.6 3.776 3.919 3.982 4.107 4.228 4.406 4.513 4.618 4.768 4.906 5.028 5.146 5.268 5.447 5.61 5.751 5.93 6.093 6.25 6.426 6.609 6.781 6.983 7.2 7.411 7.628 7.863 8.122 8.358 8.57 8.76 8.916 9.025 9.121 9.047 8.628 7.825 6.938 6.102 5.39 4.752 4.181 3.637 3.163 2.7 2.31 1.98 1.657 1.336 1.037 0.775 0.517 0.281 0.054 -0.179 -0.414 -0.601 -0.781 -0.969 -1.126 -1.303 -1.49 -1.679 -1.892 -2.044 -2.19 -2.408 -2.556 -2.721 -2.804 -2.969 -3.166 -3.392 -3.502 -3.87 -3.854 -3.994 -4.132 -4.428 -4.584 -4.749 -4.976 -5.253 -5.546 -5.925 -7.048 -9 ,2481 ,KEBNE ,16677911,Wed Nov 24 22:45:52 CET,Thu Nov 25 00:45:57 CET,0.0 1.157 1.545 1.811 2.002 2.19 2.375 2.527 2.767 2.887 3.005 2.976 3.314 3.396 3.569 3.748 3.897 3.964 4.099 4.233 4.43 4.545 4.65 4.797 4.946 5.102 5.255 5.403 5.57 5.709 5.859 6.03 6.156 6.291 6.461 6.646 6.824 7.008 7.18 7.349 7.544 7.755 8.0 8.23 8.455 8.68 8.895 9.072 9.137 8.977 8.447 7.618 6.842 6.115 5.423 4.786 4.235 3.728 3.26 2.783 2.394 2.058 1.745 1.451 1.162 0.88 0.579 0.326 0.124 -0.095 -0.324 -0.507 -0.7 -0.911 -1.073 -1.235 -1.397 -1.576 -1.763 -1.894 -2.029 -2.227 -2.378 -2.526 -2.601 -2.771 -2.943 -3.112 -3.208 -3.579 -3.568 -3.688 -3.821 -4.114 -4.273 -4.447 -4.651 -4.858 -5.089 -5.482 -6.775 -10 ,1952 ,KEBNE ,16677912,Wed Nov 24 22:45:52 CET,Thu Nov 25 00:49:22 CET,0.0 1.281 1.664 1.943 2.175 2.361 2.538 2.705 2.984 3.118 3.256 3.232 3.581 3.67 3.836 4.019 4.196 4.271 4.406 4.55 4.751 4.862 4.969 5.142 5.304 5.439 5.574 5.714 5.893 6.052 6.215 6.406 6.584 6.765 6.958 7.161 7.339 7.527 7.727 7.928 8.129 8.36 8.631 8.883 9.135 9.377 9.62 9.826 9.956 9.951 9.536 8.623 7.744 6.951 6.212 5.546 4.966 4.433 3.984 3.57 3.21 2.89 2.593 2.292 2.001 1.741 1.473 1.23 1.021 0.809 0.59 0.401 0.199 0.0 -0.146 -0.307 -0.477 -0.657 -0.852 -0.985 -1.117 -1.33 -1.491 -1.662 -1.751 -1.929 -2.113 -2.325 -2.438 -2.804 -2.789 -2.913 -3.051 -3.372 -3.552 -3.753 -3.99 -4.282 -4.638 -5.102 -6.402 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt deleted file mode 100644 index 89299359..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6814 ,KEBNE ,16677913,Wed Nov 24 22:46:54 CET,Thu Nov 25 00:50:52 CET,0.0 0.961 1.291 1.544 1.747 1.93 2.123 2.289 2.595 2.748 2.885 2.875 3.214 3.317 3.522 3.714 3.9 3.99 4.154 4.312 4.558 4.709 4.86 5.082 5.282 5.465 5.626 5.781 5.984 6.173 6.349 6.551 6.73 6.901 7.097 7.294 7.485 7.7 7.923 8.158 8.397 8.669 8.942 9.2 9.513 9.797 10.056 10.276 10.479 10.582 10.282 9.601 8.822 8.083 7.448 6.829 6.297 5.834 5.408 4.953 4.542 4.19 3.864 3.536 3.231 2.964 2.676 2.406 2.173 1.942 1.697 1.496 1.276 1.041 0.86 0.658 0.455 0.259 0.038 -0.131 -0.292 -0.525 -0.684 -0.853 -0.945 -1.135 -1.341 -1.615 -1.774 -2.171 -2.263 -2.453 -2.64 -3.034 -3.271 -3.579 -3.933 -4.355 -4.855 -5.472 -7.264 -2 ,23891 ,KEBNE ,16677914,Wed Nov 24 22:46:54 CET,Thu Nov 25 00:47:24 CET,0.0 0.629 0.983 1.259 1.496 1.705 1.885 2.056 2.388 2.549 2.699 2.71 3.075 3.181 3.389 3.592 3.789 3.883 4.061 4.223 4.438 4.574 4.706 4.902 5.094 5.276 5.434 5.573 5.758 5.943 6.116 6.32 6.516 6.696 6.897 7.142 7.373 7.606 7.867 8.141 8.422 8.726 9.078 9.404 9.743 10.095 10.452 10.751 10.971 11.011 10.602 9.8 9.091 8.371 7.692 7.106 6.547 5.991 5.485 4.98 4.523 4.098 3.722 3.37 3.033 2.702 2.327 1.998 1.721 1.435 1.143 0.911 0.658 0.361 0.132 -0.103 -0.344 -0.597 -0.857 -1.028 -1.213 -1.498 -1.692 -1.899 -2.0 -2.207 -2.444 -2.701 -2.833 -3.223 -3.269 -3.435 -3.604 -3.961 -4.167 -4.393 -4.642 -4.93 -5.293 -5.848 -8.192 -3 ,14704 ,KEBNE ,16675611,Wed Nov 24 06:11:44 CET,Wed Nov 24 08:10:57 CET,0.0 0.952 1.342 1.648 1.898 2.112 2.32 2.523 2.874 3.027 3.164 3.19 3.57 3.693 3.929 4.143 4.335 4.426 4.613 4.784 5.03 5.188 5.333 5.547 5.748 5.931 6.096 6.26 6.471 6.65 6.816 7.028 7.228 7.418 7.638 7.892 8.137 8.372 8.604 8.826 9.046 9.32 9.655 9.961 10.259 10.555 10.885 11.165 11.375 11.499 11.348 10.832 10.231 9.636 9.045 8.482 7.97 7.5 7.103 6.691 6.333 5.998 5.668 5.35 5.049 4.768 4.486 4.242 4.018 3.798 3.571 3.37 3.158 2.931 2.754 2.574 2.393 2.203 1.991 1.845 1.691 1.432 1.247 1.048 0.934 0.705 0.473 0.196 0.058 -0.332 -0.395 -0.555 -0.722 -1.105 -1.325 -1.587 -1.906 -2.259 -2.728 -3.406 -5.886 -4 ,26545 ,KEBNE ,16677916,Wed Nov 24 22:47:56 CET,Thu Nov 25 00:49:36 CET,0.0 0.648 0.895 1.122 1.345 1.561 1.754 1.927 2.238 2.379 2.519 2.522 2.88 2.996 3.22 3.416 3.606 3.701 3.882 4.062 4.296 4.439 4.579 4.775 4.964 5.143 5.315 5.475 5.67 5.854 6.043 6.268 6.458 6.643 6.866 7.105 7.323 7.558 7.806 8.063 8.307 8.573 8.861 9.132 9.457 9.783 10.125 10.45 10.742 10.973 10.952 10.517 9.922 9.255 8.648 8.088 7.569 7.059 6.6 6.125 5.721 5.366 5.025 4.693 4.362 4.044 3.717 3.441 3.205 2.95 2.662 2.421 2.177 1.932 1.751 1.569 1.377 1.168 0.941 0.766 0.575 0.288 0.1 -0.099 -0.2 -0.411 -0.638 -0.88 -1.009 -1.378 -1.402 -1.564 -1.736 -2.107 -2.316 -2.58 -2.898 -3.273 -3.767 -4.441 -7.431 -5 ,22924 ,KEBNE ,16677917,Wed Nov 24 22:48:00 CET,Thu Nov 25 00:42:48 CET,0.0 0.774 1.154 1.431 1.631 1.815 1.972 2.112 2.377 2.494 2.607 2.59 2.941 3.048 3.235 3.41 3.58 3.668 3.85 4.027 4.272 4.414 4.545 4.734 4.906 5.069 5.22 5.363 5.56 5.749 5.919 6.115 6.305 6.487 6.694 6.927 7.151 7.386 7.636 7.896 8.133 8.365 8.638 8.906 9.186 9.459 9.717 9.973 10.152 10.181 9.985 9.394 8.677 7.945 7.294 6.656 6.05 5.496 5.002 4.496 4.054 3.647 3.254 2.887 2.561 2.27 1.957 1.675 1.433 1.172 0.894 0.661 0.411 0.168 -0.009 -0.191 -0.403 -0.627 -0.834 -0.992 -1.159 -1.407 -1.577 -1.767 -1.874 -2.084 -2.313 -2.551 -2.668 -3.055 -3.127 -3.296 -3.48 -3.88 -4.097 -4.336 -4.611 -4.926 -5.349 -5.974 -7.867 -6 ,31935 ,KEBNE ,16677918,Wed Nov 24 22:48:57 CET,Thu Nov 25 00:51:20 CET,0.0 0.745 1.082 1.329 1.529 1.715 1.922 2.109 2.433 2.579 2.706 2.701 3.052 3.156 3.361 3.557 3.749 3.834 4.011 4.203 4.47 4.633 4.785 4.992 5.177 5.356 5.527 5.686 5.888 6.085 6.278 6.488 6.686 6.879 7.079 7.284 7.483 7.722 7.987 8.269 8.554 8.835 9.147 9.445 9.776 10.118 10.444 10.741 11.016 11.15 10.943 10.279 9.492 8.666 7.927 7.279 6.664 6.08 5.58 5.088 4.647 4.233 3.817 3.42 3.054 2.723 2.391 2.073 1.79 1.517 1.231 0.995 0.747 0.463 0.232 -0.001 -0.26 -0.539 -0.825 -1.028 -1.226 -1.547 -1.787 -2.023 -2.135 -2.357 -2.588 -2.839 -2.97 -3.347 -3.391 -3.568 -3.749 -4.163 -4.446 -4.809 -5.206 -5.639 -6.163 -6.844 -8.32 -7 ,30309 ,KEBNE ,16677919,Wed Nov 24 22:48:57 CET,Thu Nov 25 00:48:32 CET,0.0 0.948 1.309 1.569 1.8 1.999 2.161 2.322 2.622 2.761 2.896 2.897 3.26 3.373 3.576 3.761 3.94 4.029 4.194 4.347 4.566 4.702 4.842 5.041 5.226 5.406 5.576 5.747 5.957 6.147 6.336 6.563 6.764 6.938 7.137 7.361 7.558 7.767 8.003 8.264 8.532 8.807 9.114 9.439 9.776 10.069 10.296 10.458 10.558 10.499 10.087 9.373 8.63 7.844 7.136 6.516 5.983 5.493 5.027 4.528 4.13 3.795 3.449 3.114 2.801 2.504 2.178 1.883 1.632 1.374 1.123 0.917 0.688 0.433 0.224 -0.016 -0.269 -0.527 -0.788 -0.953 -1.122 -1.409 -1.619 -1.842 -1.956 -2.184 -2.434 -2.702 -2.84 -3.235 -3.336 -3.538 -3.74 -4.17 -4.408 -4.666 -4.948 -5.308 -5.753 -6.281 -7.974 -8 ,28415 ,KEBNE ,16677920,Wed Nov 24 22:48:58 CET,Thu Nov 25 00:47:45 CET,0.0 0.762 1.09 1.334 1.547 1.749 1.942 2.111 2.394 2.54 2.689 2.714 3.071 3.185 3.403 3.597 3.762 3.84 3.99 4.133 4.349 4.489 4.621 4.809 4.977 5.138 5.306 5.467 5.66 5.843 6.018 6.219 6.409 6.588 6.78 6.994 7.197 7.428 7.665 7.885 8.094 8.301 8.556 8.798 9.03 9.263 9.528 9.765 9.926 9.947 9.704 9.072 8.341 7.631 6.973 6.394 5.903 5.407 4.949 4.497 4.081 3.689 3.315 2.978 2.682 2.418 2.11 1.808 1.555 1.303 1.054 0.828 0.585 0.346 0.151 -0.042 -0.235 -0.447 -0.676 -0.837 -1.007 -1.281 -1.476 -1.685 -1.795 -2.021 -2.266 -2.533 -2.665 -3.044 -3.061 -3.216 -3.389 -3.796 -4.023 -4.264 -4.52 -4.803 -5.169 -5.736 -8.636 -9 ,7969 ,KEBNE ,16677921,Wed Nov 24 22:50:00 CET,Thu Nov 25 00:51:50 CET,0.0 0.756 1.11 1.408 1.657 1.876 2.081 2.261 2.594 2.742 2.868 2.849 3.207 3.317 3.545 3.755 3.942 4.033 4.201 4.368 4.603 4.742 4.874 5.072 5.261 5.44 5.612 5.777 5.989 6.179 6.351 6.551 6.742 6.921 7.124 7.349 7.557 7.771 7.991 8.229 8.457 8.693 8.947 9.19 9.491 9.795 10.082 10.344 10.538 10.574 10.333 9.699 9.066 8.516 7.961 7.352 6.809 6.298 5.816 5.36 4.978 4.632 4.275 3.926 3.597 3.287 2.973 2.707 2.494 2.26 1.998 1.783 1.567 1.361 1.189 0.99 0.787 0.588 0.361 0.189 0.024 -0.207 -0.378 -0.574 -0.678 -0.907 -1.154 -1.403 -1.534 -1.928 -1.98 -2.15 -2.336 -2.749 -2.998 -3.27 -3.563 -3.906 -4.329 -4.927 -7.177 -10 ,28510 ,KEBNE ,16677922,Wed Nov 24 22:50:00 CET,Thu Nov 25 00:52:17 CET,0.0 0.708 1.113 1.421 1.648 1.83 2.005 2.16 2.446 2.59 2.716 2.698 3.067 3.182 3.382 3.561 3.738 3.827 3.996 4.16 4.385 4.523 4.66 4.858 5.052 5.238 5.412 5.573 5.771 5.959 6.132 6.353 6.567 6.752 6.965 7.194 7.416 7.663 7.896 8.109 8.325 8.55 8.76 8.95 9.166 9.392 9.595 9.774 9.92 9.951 9.608 8.742 7.771 6.859 6.092 5.398 4.776 4.23 3.738 3.222 2.783 2.403 2.017 1.665 1.358 1.059 0.74 0.462 0.213 -0.057 -0.32 -0.549 -0.806 -1.069 -1.276 -1.498 -1.728 -1.962 -2.207 -2.38 -2.559 -2.832 -3.026 -3.247 -3.354 -3.582 -3.846 -4.115 -4.256 -4.647 -4.739 -4.919 -5.102 -5.543 -5.781 -6.027 -6.299 -6.609 -7.009 -7.589 -11.106 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt deleted file mode 100644 index 0e1aba72..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22114 ,KEBNE ,16675639,Wed Nov 24 06:18:55 CET,Wed Nov 24 08:18:31 CET,0.0 1.717 2.283 2.722 3.063 3.344 3.584 3.781 4.177 4.361 4.517 4.683 4.906 5.028 5.272 5.49 5.693 5.788 5.979 6.16 6.409 6.571 6.72 6.924 7.115 7.306 7.487 7.656 7.878 8.1 8.292 8.514 8.752 8.98 9.218 9.475 9.733 10.011 10.291 10.581 10.883 11.227 11.618 11.989 12.384 12.758 13.183 13.658 14.086 14.429 14.638 14.406 13.887 13.322 12.841 12.414 12.003 11.613 11.254 10.878 10.557 10.255 9.959 9.667 9.379 9.123 8.857 8.617 8.415 8.195 7.961 7.757 7.536 7.309 7.134 6.946 6.742 6.54 6.339 6.193 6.033 5.771 5.589 5.408 5.309 5.077 4.843 4.62 4.504 4.271 4.059 3.9 3.753 3.409 3.211 2.959 2.678 2.405 2.051 1.552 0.449 -2 ,8116 ,KEBNE ,16675640,Wed Nov 24 06:18:54 CET,Wed Nov 24 08:17:35 CET,0.0 1.556 2.14 2.546 2.876 3.143 3.359 3.555 3.964 4.151 4.307 4.493 4.731 4.855 5.09 5.314 5.52 5.624 5.824 6.011 6.272 6.441 6.61 6.847 7.053 7.238 7.428 7.619 7.862 8.092 8.293 8.53 8.77 8.994 9.247 9.521 9.785 10.059 10.339 10.635 10.944 11.281 11.639 11.992 12.397 12.835 13.299 13.735 14.207 14.61 14.788 14.593 14.182 13.734 13.267 12.813 12.41 12.023 11.676 11.315 10.976 10.641 10.329 10.043 9.76 9.498 9.221 8.962 8.745 8.518 8.276 8.061 7.825 7.577 7.384 7.185 6.976 6.768 6.557 6.394 6.224 5.972 5.801 5.614 5.505 5.279 5.05 4.802 4.662 4.408 4.21 4.041 3.854 3.45 3.247 3.034 2.8 2.485 2.034 1.488 -0.067 -3 ,30622 ,KEBNE ,16675641,Wed Nov 24 06:18:54 CET,Wed Nov 24 08:21:03 CET,0.0 1.503 2.029 2.43 2.755 3.028 3.265 3.493 3.929 4.128 4.318 4.546 4.804 4.954 5.219 5.462 5.687 5.784 5.974 6.169 6.438 6.601 6.76 6.981 7.187 7.389 7.596 7.785 8.021 8.254 8.466 8.698 8.921 9.139 9.384 9.653 9.911 10.189 10.456 10.739 11.049 11.384 11.772 12.148 12.565 13.005 13.426 13.809 14.185 14.491 14.567 14.316 13.949 13.522 13.059 12.578 12.126 11.727 11.357 10.939 10.589 10.287 9.975 9.682 9.407 9.144 8.879 8.622 8.374 8.122 7.869 7.662 7.457 7.234 7.056 6.871 6.67 6.454 6.22 6.048 5.876 5.634 5.465 5.272 5.174 4.961 4.728 4.472 4.332 4.084 3.904 3.741 3.562 3.151 2.918 2.672 2.41 2.104 1.739 1.214 -0.054 -4 ,12842 ,KEBNE ,16675642,Wed Nov 24 06:18:54 CET,Wed Nov 24 08:18:35 CET,0.0 2.301 2.836 3.186 3.477 3.734 3.955 4.18 4.578 4.747 4.901 5.065 5.293 5.422 5.672 5.919 6.134 6.234 6.451 6.652 6.916 7.079 7.244 7.482 7.697 7.907 8.101 8.29 8.521 8.723 8.927 9.184 9.43 9.658 9.903 10.171 10.427 10.698 11.0 11.312 11.609 11.945 12.333 12.709 13.103 13.497 13.931 14.421 14.926 15.285 15.426 15.141 14.713 14.282 13.832 13.372 12.943 12.528 12.118 11.683 11.321 10.997 10.685 10.389 10.099 9.83 9.553 9.301 9.079 8.85 8.607 8.397 8.178 7.934 7.734 7.55 7.375 7.179 6.963 6.818 6.666 6.407 6.229 6.057 5.962 5.77 5.542 5.288 5.167 4.924 4.721 4.565 4.395 3.987 3.766 3.524 3.252 2.951 2.613 2.14 0.487 -5 ,1408 ,KEBNE ,16675643,Wed Nov 24 06:19:56 CET,Wed Nov 24 08:18:43 CET,0.0 2.145 2.751 3.183 3.524 3.783 4.02 4.243 4.604 4.76 4.924 5.134 5.375 5.499 5.732 5.948 6.14 6.235 6.429 6.615 6.861 7.019 7.181 7.393 7.588 7.791 7.987 8.162 8.376 8.591 8.784 9.01 9.243 9.458 9.69 9.939 10.164 10.406 10.691 10.986 11.268 11.589 11.981 12.364 12.78 13.212 13.653 14.102 14.526 14.861 14.964 14.714 14.364 13.924 13.426 12.931 12.474 12.054 11.705 11.329 10.964 10.641 10.366 10.106 9.832 9.58 9.327 9.083 8.854 8.61 8.359 8.162 7.959 7.738 7.564 7.38 7.18 6.969 6.741 6.59 6.438 6.192 6.026 5.849 5.757 5.572 5.369 5.153 5.033 4.786 4.588 4.423 4.26 3.91 3.717 3.508 3.291 2.972 2.573 1.977 -0.461 -6 ,21776 ,KEBNE ,16675644,Wed Nov 24 06:19:55 CET,Wed Nov 24 08:20:48 CET,0.0 1.576 2.207 2.638 2.931 3.187 3.406 3.602 3.967 4.129 4.288 4.483 4.722 4.85 5.086 5.296 5.493 5.59 5.772 5.951 6.214 6.374 6.515 6.716 6.92 7.117 7.295 7.479 7.732 7.959 8.165 8.406 8.631 8.84 9.09 9.369 9.619 9.878 10.173 10.49 10.814 11.185 11.596 11.972 12.374 12.793 13.254 13.72 14.171 14.539 14.635 14.3 13.854 13.397 12.922 12.426 11.967 11.529 11.14 10.758 10.409 10.094 9.797 9.487 9.184 8.918 8.64 8.386 8.162 7.92 7.659 7.445 7.229 6.992 6.805 6.617 6.413 6.209 6.004 5.851 5.692 5.444 5.255 5.051 4.947 4.715 4.459 4.207 4.07 3.818 3.646 3.488 3.313 2.938 2.735 2.476 2.173 1.85 1.431 0.852 -0.576 -7 ,12321 ,KEBNE ,16675645,Wed Nov 24 06:19:56 CET,Wed Nov 24 08:18:55 CET,0.0 2.527 3.198 3.652 4.005 4.291 4.523 4.747 5.148 5.332 5.517 5.737 5.983 6.105 6.344 6.569 6.773 6.875 7.064 7.253 7.524 7.69 7.845 8.053 8.25 8.443 8.633 8.809 9.035 9.267 9.477 9.731 9.962 10.168 10.41 10.674 10.912 11.172 11.466 11.786 12.129 12.476 12.853 13.22 13.602 13.991 14.429 14.856 15.257 15.572 15.71 15.505 15.126 14.673 14.213 13.763 13.315 12.906 12.549 12.182 11.857 11.573 11.294 11.011 10.74 10.5 10.243 10.01 9.809 9.58 9.315 9.084 8.853 8.62 8.425 8.216 8.013 7.812 7.596 7.439 7.276 7.015 6.837 6.656 6.56 6.351 6.132 5.892 5.764 5.532 5.37 5.224 5.076 4.724 4.53 4.325 4.097 3.806 3.409 2.915 1.03 -8 ,2098 ,KEBNE ,16677930,Wed Nov 24 22:55:08 CET,Thu Nov 25 00:59:20 CET,0.0 1.372 1.883 2.236 2.532 2.818 3.077 3.302 3.701 3.885 4.058 4.248 4.476 4.59 4.819 5.047 5.272 5.377 5.57 5.762 6.017 6.179 6.343 6.576 6.795 7.001 7.197 7.379 7.612 7.843 8.06 8.297 8.525 8.739 8.974 9.255 9.51 9.78 10.077 10.372 10.651 10.943 11.307 11.676 12.08 12.503 12.965 13.441 13.912 14.315 14.525 14.282 13.779 13.225 12.706 12.197 11.7 11.221 10.801 10.397 10.046 9.685 9.321 9.007 8.722 8.451 8.162 7.898 7.661 7.412 7.161 6.944 6.717 6.493 6.316 6.117 5.911 5.709 5.482 5.316 5.157 4.917 4.73 4.525 4.42 4.197 3.951 3.681 3.544 3.293 3.086 2.926 2.78 2.417 2.184 1.942 1.667 1.329 0.931 0.386 -1.248 -9 ,21186 ,KEBNE ,16677931,Wed Nov 24 22:56:11 CET,Thu Nov 25 00:58:38 CET,0.0 1.149 1.629 2.048 2.415 2.668 2.897 3.106 3.514 3.699 3.859 4.042 4.279 4.402 4.641 4.863 5.061 5.159 5.351 5.529 5.781 5.935 6.074 6.286 6.502 6.701 6.889 7.081 7.323 7.535 7.74 7.982 8.201 8.415 8.654 8.93 9.177 9.426 9.703 9.983 10.259 10.587 10.982 11.371 11.782 12.21 12.676 13.109 13.514 13.864 14.02 13.782 13.36 12.86 12.335 11.845 11.417 10.998 10.639 10.262 9.902 9.57 9.244 8.947 8.678 8.414 8.138 7.878 7.636 7.391 7.129 6.913 6.689 6.45 6.267 6.067 5.863 5.665 5.447 5.293 5.128 4.864 4.683 4.496 4.399 4.186 3.966 3.726 3.597 3.35 3.158 3.0 2.83 2.409 2.169 1.899 1.6 1.284 0.918 0.419 -1.46 -10 ,30836 ,KEBNE ,16675648,Wed Nov 24 06:26:05 CET,Wed Nov 24 08:24:54 CET,0.0 1.33 1.807 2.164 2.478 2.729 2.952 3.162 3.554 3.748 3.933 4.133 4.375 4.507 4.758 4.991 5.192 5.283 5.461 5.634 5.887 6.054 6.216 6.445 6.664 6.858 7.045 7.228 7.45 7.663 7.861 8.09 8.311 8.521 8.763 9.036 9.289 9.543 9.8 10.066 10.354 10.687 11.061 11.431 11.82 12.21 12.66 13.126 13.608 13.988 14.091 13.864 13.396 12.864 12.29 11.749 11.293 10.866 10.504 10.125 9.784 9.473 9.168 8.885 8.607 8.339 8.046 7.78 7.567 7.333 7.066 6.844 6.62 6.389 6.217 6.031 5.828 5.62 5.383 5.207 5.032 4.757 4.561 4.341 4.217 3.965 3.703 3.431 3.294 3.031 2.799 2.623 2.431 2.003 1.772 1.503 1.193 0.823 0.387 -0.164 -1.886 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 7cb38c0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19255 ,KEBNE ,16677933,Wed Nov 24 22:57:13 CET,Thu Nov 25 00:57:55 CET,0.0 2.862 3.464 3.865 4.181 4.443 4.685 4.925 5.357 5.524 5.669 5.813 6.041 6.157 6.372 6.556 6.72 6.802 6.971 7.132 7.356 7.492 7.604 7.761 7.918 8.075 8.224 8.362 8.521 8.664 8.822 8.999 9.133 9.254 9.393 9.537 9.667 9.812 9.957 10.096 10.237 10.369 10.492 10.588 10.649 10.647 10.592 10.443 10.109 9.522 8.387 6.817 5.406 4.214 3.21 2.31 1.534 0.83 0.177 -0.504 -1.067 -1.533 -1.965 -2.395 -2.799 -3.167 -3.541 -3.889 -4.199 -4.515 -4.85 -5.129 -5.401 -5.689 -5.927 -6.159 -6.408 -6.676 -6.946 -7.125 -7.308 -7.605 -7.835 -8.075 -8.191 -8.437 -8.7 -8.969 -9.107 -9.381 -9.593 -9.778 -9.988 -10.43 -10.673 -10.926 -11.244 -11.646 -12.14 -12.821 -14.309 -2 ,31901 ,KEBNE ,16675650,Wed Nov 24 06:29:14 CET,Wed Nov 24 08:22:07 CET,0.0 2.527 3.18 3.615 3.961 4.251 4.501 4.733 5.123 5.295 5.458 5.639 5.891 6.023 6.264 6.489 6.695 6.792 6.982 7.164 7.44 7.599 7.732 7.931 8.105 8.272 8.449 8.603 8.786 8.958 9.116 9.314 9.509 9.691 9.89 10.106 10.291 10.477 10.667 10.846 11.032 11.251 11.469 11.63 11.784 11.932 12.037 12.016 11.841 11.481 10.61 9.22 7.936 6.805 5.836 4.953 4.168 3.48 2.891 2.288 1.769 1.308 0.855 0.417 0.016 -0.356 -0.75 -1.103 -1.406 -1.714 -2.042 -2.32 -2.608 -2.921 -3.171 -3.417 -3.676 -3.948 -4.222 -4.416 -4.621 -4.946 -5.171 -5.407 -5.528 -5.797 -6.101 -6.406 -6.562 -6.85 -7.082 -7.273 -7.477 -7.965 -8.24 -8.534 -8.858 -9.221 -9.655 -10.281 -11.979 -3 ,22971 ,KEBNE ,16675651,Wed Nov 24 06:30:12 CET,Wed Nov 24 08:29:31 CET,0.0 2.216 2.772 3.177 3.498 3.789 4.057 4.3 4.743 4.939 5.114 5.314 5.577 5.726 5.987 6.239 6.492 6.603 6.801 6.995 7.252 7.4 7.54 7.74 7.934 8.113 8.285 8.439 8.617 8.787 8.953 9.136 9.294 9.447 9.612 9.789 9.966 10.156 10.341 10.487 10.639 10.802 10.922 11.036 11.157 11.226 11.231 11.145 10.887 10.309 9.182 7.643 6.28 5.109 4.078 3.12 2.276 1.5 0.828 0.161 -0.412 -0.905 -1.352 -1.766 -2.156 -2.506 -2.884 -3.255 -3.58 -3.905 -4.231 -4.501 -4.802 -5.109 -5.353 -5.593 -5.829 -6.089 -6.353 -6.537 -6.744 -7.066 -7.282 -7.507 -7.625 -7.877 -8.147 -8.444 -8.596 -8.87 -9.085 -9.261 -9.44 -9.824 -10.034 -10.276 -10.573 -10.923 -11.421 -12.079 -14.007 -4 ,26273 ,KEBNE ,16677936,Wed Nov 24 22:57:12 CET,Thu Nov 25 00:58:00 CET,0.0 1.963 2.599 3.083 3.448 3.743 4.009 4.245 4.649 4.833 4.993 5.173 5.426 5.564 5.821 6.048 6.243 6.333 6.504 6.664 6.883 7.035 7.181 7.37 7.542 7.707 7.87 8.023 8.215 8.398 8.567 8.766 8.953 9.133 9.33 9.528 9.726 9.913 10.07 10.236 10.393 10.559 10.731 10.905 11.088 11.213 11.276 11.242 11.036 10.526 9.456 8.062 6.768 5.592 4.588 3.704 2.931 2.204 1.575 0.945 0.387 -0.1 -0.542 -0.961 -1.37 -1.745 -2.145 -2.508 -2.817 -3.149 -3.487 -3.761 -4.049 -4.342 -4.576 -4.814 -5.049 -5.291 -5.552 -5.735 -5.921 -6.242 -6.461 -6.681 -6.799 -7.032 -7.276 -7.543 -7.685 -7.952 -8.129 -8.289 -8.479 -8.874 -9.093 -9.332 -9.584 -9.899 -10.283 -10.768 -12.025 -5 ,25523 ,KEBNE ,16677937,Wed Nov 24 22:58:15 CET,Thu Nov 25 00:59:46 CET,0.0 1.822 2.389 2.776 3.073 3.352 3.606 3.821 4.17 4.317 4.459 4.629 4.859 4.97 5.184 5.382 5.559 5.643 5.804 5.958 6.181 6.315 6.453 6.667 6.855 7.014 7.176 7.339 7.528 7.693 7.842 8.024 8.223 8.405 8.584 8.773 8.939 9.127 9.334 9.533 9.731 9.934 10.135 10.308 10.458 10.591 10.673 10.61 10.355 9.8 8.613 7.006 5.621 4.384 3.31 2.376 1.568 0.842 0.229 -0.377 -0.888 -1.326 -1.749 -2.171 -2.561 -2.92 -3.299 -3.627 -3.904 -4.197 -4.502 -4.749 -5.028 -5.31 -5.512 -5.74 -5.986 -6.234 -6.491 -6.667 -6.85 -7.168 -7.4 -7.616 -7.724 -7.963 -8.22 -8.485 -8.625 -8.906 -9.101 -9.264 -9.457 -9.859 -10.065 -10.306 -10.585 -10.881 -11.257 -11.816 -13.098 -6 ,23292 ,KEBNE ,16677938,Wed Nov 24 22:58:15 CET,Thu Nov 25 00:59:52 CET,0.0 2.529 3.163 3.641 4.044 4.394 4.674 4.908 5.32 5.5 5.68 5.901 6.17 6.325 6.591 6.804 6.988 7.079 7.243 7.39 7.593 7.722 7.849 8.029 8.203 8.362 8.506 8.647 8.823 8.984 9.14 9.31 9.446 9.577 9.727 9.892 10.062 10.244 10.416 10.573 10.738 10.902 11.055 11.153 11.249 11.355 11.37 11.287 11.056 10.466 9.269 7.721 6.355 5.168 4.16 3.245 2.447 1.773 1.186 0.579 0.061 -0.397 -0.834 -1.264 -1.681 -2.039 -2.411 -2.767 -3.061 -3.371 -3.714 -4.009 -4.303 -4.593 -4.829 -5.086 -5.349 -5.607 -5.872 -6.053 -6.247 -6.549 -6.759 -6.994 -7.12 -7.365 -7.619 -7.912 -8.061 -8.332 -8.517 -8.683 -8.865 -9.255 -9.486 -9.748 -10.025 -10.342 -10.753 -11.366 -12.701 -7 ,14472 ,KEBNE ,16675655,Wed Nov 24 06:41:30 CET,Wed Nov 24 08:40:58 CET,0.0 1.996 2.533 2.942 3.263 3.533 3.763 3.972 4.331 4.485 4.643 4.83 5.073 5.203 5.445 5.651 5.835 5.926 6.105 6.263 6.493 6.646 6.784 6.975 7.168 7.36 7.524 7.669 7.857 8.022 8.184 8.377 8.56 8.719 8.88 9.064 9.229 9.39 9.557 9.722 9.869 10.003 10.118 10.221 10.311 10.401 10.468 10.354 10.013 9.411 8.24 6.708 5.344 4.08 2.978 2.034 1.208 0.439 -0.258 -0.945 -1.506 -2.004 -2.482 -2.935 -3.348 -3.728 -4.125 -4.472 -4.776 -5.092 -5.419 -5.698 -5.982 -6.272 -6.508 -6.757 -7.022 -7.3 -7.582 -7.782 -7.982 -8.283 -8.5 -8.742 -8.874 -9.148 -9.433 -9.743 -9.906 -10.195 -10.418 -10.589 -10.758 -11.174 -11.46 -11.771 -12.104 -12.533 -13.026 -13.682 -15.81 -8 ,27004 ,KEBNE ,16677940,Wed Nov 24 22:59:17 CET,Thu Nov 25 01:01:52 CET,0.0 2.685 3.29 3.634 3.902 4.133 4.338 4.532 4.895 5.054 5.216 5.391 5.626 5.76 5.999 6.216 6.401 6.489 6.678 6.844 7.067 7.203 7.327 7.515 7.688 7.854 8.012 8.156 8.338 8.518 8.684 8.859 9.031 9.183 9.344 9.524 9.686 9.84 10.009 10.192 10.34 10.512 10.725 10.879 11.0 11.059 11.078 10.999 10.685 10.064 8.859 7.237 5.803 4.576 3.537 2.605 1.796 1.065 0.398 -0.254 -0.785 -1.302 -1.824 -2.288 -2.717 -3.106 -3.48 -3.824 -4.143 -4.466 -4.794 -5.072 -5.361 -5.661 -5.911 -6.162 -6.405 -6.662 -6.933 -7.116 -7.301 -7.588 -7.795 -8.023 -8.143 -8.384 -8.631 -8.891 -9.025 -9.28 -9.476 -9.651 -9.836 -10.227 -10.449 -10.709 -10.984 -11.283 -11.657 -12.156 -13.487 -9 ,16634 ,KEBNE ,16675657,Wed Nov 24 06:42:31 CET,Wed Nov 24 08:42:12 CET,0.0 2.13 2.737 3.179 3.507 3.765 4.008 4.226 4.578 4.728 4.879 5.054 5.282 5.399 5.62 5.827 6.016 6.107 6.285 6.451 6.686 6.83 6.97 7.175 7.373 7.555 7.709 7.865 8.057 8.228 8.388 8.574 8.752 8.903 9.073 9.268 9.444 9.625 9.805 9.985 10.173 10.364 10.527 10.657 10.786 10.872 10.917 10.869 10.628 10.076 8.959 7.455 6.09 4.851 3.763 2.816 1.98 1.2 0.55 -0.059 -0.58 -1.058 -1.504 -1.927 -2.332 -2.708 -3.103 -3.454 -3.759 -4.073 -4.395 -4.68 -4.99 -5.299 -5.535 -5.786 -6.059 -6.339 -6.621 -6.818 -7.021 -7.358 -7.608 -7.853 -7.974 -8.232 -8.514 -8.831 -8.999 -9.285 -9.487 -9.665 -9.852 -10.252 -10.48 -10.762 -11.056 -11.39 -11.833 -12.412 -13.584 -10 ,19162 ,KEBNE ,16677942,Wed Nov 24 22:59:16 CET,Thu Nov 25 01:01:26 CET,0.0 1.93 2.467 2.809 3.084 3.337 3.561 3.762 4.137 4.304 4.445 4.595 4.831 4.944 5.169 5.37 5.547 5.632 5.793 5.937 6.144 6.284 6.414 6.595 6.776 6.93 7.064 7.218 7.414 7.578 7.732 7.909 8.078 8.251 8.441 8.622 8.784 8.956 9.131 9.305 9.476 9.654 9.847 9.998 10.104 10.192 10.259 10.218 9.983 9.423 8.244 6.6 5.177 3.991 2.975 2.031 1.191 0.43 -0.199 -0.821 -1.374 -1.883 -2.373 -2.825 -3.23 -3.614 -4.018 -4.368 -4.672 -4.985 -5.317 -5.598 -5.881 -6.174 -6.412 -6.664 -6.939 -7.219 -7.491 -7.679 -7.878 -8.194 -8.413 -8.64 -8.753 -8.993 -9.256 -9.528 -9.675 -9.945 -10.127 -10.289 -10.461 -10.843 -11.075 -11.337 -11.654 -12.024 -12.426 -12.985 -14.61 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt deleted file mode 100644 index 021b6ae0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16093 ,KEBNE ,16677943,Wed Nov 24 22:59:17 CET,Thu Nov 25 01:01:03 CET,0.0 1.069 1.424 1.667 1.854 2.013 2.156 2.285 2.513 2.606 2.682 2.727 2.915 2.988 3.137 3.27 3.39 3.443 3.545 3.663 3.831 3.926 4.008 4.133 4.254 4.363 4.474 4.574 4.691 4.798 4.901 5.011 5.104 5.194 5.284 5.363 5.442 5.519 5.605 5.706 5.785 5.833 5.839 5.801 5.677 5.441 5.032 4.421 3.47 2.017 -0.315 -3.124 -5.532 -7.539 -9.146 -10.526 -11.742 -12.849 -13.792 -14.757 -15.598 -16.307 -16.96 -17.554 -18.09 -18.599 -19.137 -19.601 -19.998 -20.407 -20.85 -21.249 -21.664 -22.087 -22.431 -22.776 -23.127 -23.501 -23.907 -24.215 -24.553 -25.089 -25.452 -25.813 -26.004 -26.429 -26.871 -27.322 -27.563 -27.921 -28.26 -28.508 -28.781 -29.395 -29.726 -30.099 -30.529 -31.013 -31.564 -32.351 -34.749 -2 ,14081 ,KEBNE ,16677944,Wed Nov 24 22:59:17 CET,Thu Nov 25 01:02:12 CET,0.0 1.044 1.361 1.617 1.842 2.015 2.169 2.298 2.509 2.599 2.691 2.773 2.964 3.042 3.192 3.326 3.453 3.519 3.654 3.77 3.907 3.988 4.066 4.188 4.296 4.389 4.468 4.536 4.638 4.746 4.84 4.951 5.035 5.104 5.191 5.273 5.333 5.383 5.456 5.53 5.574 5.56 5.534 5.519 5.404 5.166 4.768 4.176 3.314 2.055 -0.152 -2.772 -4.909 -6.744 -8.278 -9.685 -10.945 -12.051 -12.992 -13.913 -14.672 -15.339 -15.972 -16.576 -17.14 -17.664 -18.23 -18.728 -19.162 -19.62 -20.082 -20.456 -20.839 -21.246 -21.582 -21.934 -22.281 -22.635 -23.005 -23.266 -23.54 -23.971 -24.265 -24.582 -24.758 -25.153 -25.596 -26.04 -26.264 -26.612 -26.907 -27.135 -27.379 -27.924 -28.242 -28.618 -29.042 -29.532 -30.14 -30.885 -32.715 -3 ,10071 ,KEBNE ,16677945,Wed Nov 24 23:00:18 CET,Thu Nov 25 01:00:13 CET,0.0 0.945 1.256 1.491 1.697 1.863 2.017 2.162 2.403 2.511 2.614 2.68 2.881 2.973 3.152 3.278 3.38 3.44 3.556 3.666 3.813 3.889 3.959 4.075 4.185 4.286 4.381 4.469 4.581 4.681 4.765 4.859 4.939 4.998 5.05 5.087 5.131 5.191 5.245 5.284 5.276 5.233 5.15 5.025 4.831 4.55 4.19 3.694 2.85 1.415 -0.979 -3.679 -5.853 -7.683 -9.301 -10.806 -12.111 -13.258 -14.238 -15.234 -16.067 -16.781 -17.458 -18.084 -18.661 -19.198 -19.76 -20.251 -20.686 -21.149 -21.632 -22.039 -22.448 -22.854 -23.176 -23.51 -23.862 -24.23 -24.589 -24.84 -25.119 -25.542 -25.82 -26.101 -26.253 -26.586 -26.911 -27.252 -27.438 -27.77 -28.09 -28.328 -28.583 -29.162 -29.485 -29.834 -30.219 -30.656 -31.209 -31.989 -34.098 -4 ,7489 ,KEBNE ,16677946,Wed Nov 24 23:00:18 CET,Thu Nov 25 01:02:22 CET,0.0 1.136 1.512 1.762 1.961 2.126 2.266 2.382 2.585 2.668 2.743 2.802 2.992 3.073 3.215 3.336 3.452 3.501 3.589 3.669 3.781 3.859 3.937 4.036 4.117 4.197 4.279 4.361 4.449 4.518 4.581 4.645 4.712 4.776 4.827 4.862 4.887 4.923 4.972 5.003 4.995 4.969 4.92 4.832 4.694 4.462 4.07 3.492 2.653 1.303 -1.127 -4.072 -6.425 -8.357 -10.075 -11.652 -12.99 -14.134 -15.089 -16.046 -16.851 -17.563 -18.259 -18.92 -19.523 -20.068 -20.645 -21.151 -21.568 -22.006 -22.456 -22.82 -23.209 -23.623 -23.93 -24.24 -24.575 -24.922 -25.3 -25.569 -25.835 -26.264 -26.575 -26.898 -27.056 -27.397 -27.768 -28.173 -28.407 -28.765 -29.072 -29.314 -29.592 -30.171 -30.465 -30.762 -31.101 -31.551 -32.152 -32.918 -35.07 -5 ,19027 ,KEBNE ,16677947,Wed Nov 24 23:00:22 CET,Thu Nov 25 00:59:16 CET,0.0 0.92 1.327 1.598 1.787 1.96 2.113 2.241 2.448 2.555 2.657 2.73 2.908 2.98 3.131 3.245 3.342 3.389 3.471 3.557 3.686 3.769 3.853 3.975 4.082 4.172 4.257 4.33 4.422 4.516 4.601 4.693 4.751 4.8 4.858 4.916 4.961 4.997 5.035 5.049 5.018 4.99 4.937 4.832 4.65 4.361 3.931 3.29 2.315 0.928 -1.374 -4.191 -6.458 -8.413 -10.088 -11.559 -12.827 -13.975 -14.965 -15.926 -16.738 -17.441 -18.094 -18.716 -19.317 -19.864 -20.428 -20.947 -21.384 -21.82 -22.268 -22.632 -23.016 -23.423 -23.73 -24.05 -24.39 -24.742 -25.109 -25.351 -25.607 -26.018 -26.3 -26.595 -26.744 -27.064 -27.398 -27.756 -27.948 -28.274 -28.575 -28.839 -29.125 -29.712 -30.033 -30.393 -30.771 -31.202 -31.73 -32.445 -34.691 -6 ,2914 ,KEBNE ,16677948,Wed Nov 24 23:01:20 CET,Thu Nov 25 01:01:33 CET,0.0 1.028 1.368 1.633 1.86 2.037 2.181 2.319 2.55 2.661 2.767 2.831 3.024 3.094 3.219 3.37 3.492 3.533 3.616 3.704 3.83 3.916 4.008 4.122 4.199 4.267 4.338 4.401 4.478 4.56 4.634 4.696 4.741 4.77 4.794 4.83 4.856 4.868 4.86 4.833 4.781 4.691 4.604 4.489 4.275 3.979 3.54 2.916 1.994 0.609 -1.694 -4.42 -6.686 -8.67 -10.311 -11.702 -12.888 -13.92 -14.868 -15.895 -16.763 -17.491 -18.163 -18.799 -19.396 -19.954 -20.531 -21.051 -21.509 -21.973 -22.44 -22.842 -23.286 -23.739 -24.09 -24.462 -24.87 -25.298 -25.721 -26.0 -26.286 -26.773 -27.119 -27.462 -27.641 -28.019 -28.415 -28.831 -29.063 -29.451 -29.801 -30.067 -30.352 -30.937 -31.266 -31.635 -32.076 -32.582 -33.178 -34.058 -36.679 -7 ,28823 ,KEBNE ,16677949,Wed Nov 24 23:01:20 CET,Thu Nov 25 01:02:17 CET,0.0 1.123 1.506 1.778 1.994 2.17 2.323 2.453 2.668 2.767 2.854 2.907 3.083 3.151 3.273 3.368 3.461 3.508 3.592 3.667 3.768 3.836 3.914 4.022 4.113 4.186 4.248 4.323 4.422 4.505 4.569 4.642 4.724 4.785 4.854 4.933 4.977 5.009 5.036 5.031 4.997 4.973 4.915 4.798 4.6 4.315 3.889 3.305 2.449 1.097 -1.117 -3.758 -5.854 -7.722 -9.405 -10.818 -12.054 -13.197 -14.2 -15.198 -16.031 -16.78 -17.472 -18.096 -18.668 -19.195 -19.752 -20.238 -20.653 -21.096 -21.56 -21.953 -22.367 -22.807 -23.149 -23.492 -23.834 -24.18 -24.545 -24.813 -25.099 -25.523 -25.812 -26.119 -26.288 -26.661 -27.05 -27.485 -27.707 -28.059 -28.427 -28.679 -28.929 -29.471 -29.782 -30.13 -30.544 -31.019 -31.548 -32.251 -34.048 -8 ,1790 ,KEBNE ,16677950,Wed Nov 24 23:01:20 CET,Thu Nov 25 01:01:41 CET,0.0 0.94 1.297 1.566 1.789 1.968 2.138 2.309 2.583 2.685 2.788 2.873 3.063 3.137 3.267 3.376 3.489 3.538 3.628 3.721 3.846 3.92 4.002 4.118 4.224 4.326 4.412 4.485 4.568 4.628 4.679 4.755 4.82 4.876 4.923 4.954 5.001 5.054 5.064 5.035 5.024 5.0 4.947 4.87 4.702 4.511 4.226 3.725 2.939 1.631 -0.703 -3.5 -5.808 -7.774 -9.449 -10.915 -12.122 -13.182 -14.079 -14.931 -15.66 -16.31 -16.938 -17.538 -18.086 -18.574 -19.092 -19.573 -19.985 -20.413 -20.844 -21.206 -21.613 -22.016 -22.305 -22.625 -23.011 -23.427 -23.849 -24.14 -24.438 -24.923 -25.256 -25.573 -25.724 -26.031 -26.356 -26.702 -26.886 -27.209 -27.481 -27.702 -27.927 -28.434 -28.741 -29.072 -29.423 -29.851 -30.375 -31.189 -33.593 -9 ,14946 ,KEBNE ,16677951,Wed Nov 24 23:01:20 CET,Thu Nov 25 01:01:44 CET,0.0 1.278 1.646 1.944 2.162 2.314 2.454 2.585 2.822 2.913 2.992 3.031 3.21 3.276 3.406 3.537 3.654 3.709 3.81 3.907 4.058 4.147 4.222 4.345 4.451 4.529 4.616 4.706 4.803 4.885 4.959 5.043 5.119 5.191 5.282 5.368 5.422 5.469 5.481 5.467 5.447 5.395 5.284 5.133 4.942 4.716 4.378 3.85 3.052 1.762 -0.665 -3.582 -5.947 -8.083 -9.869 -11.367 -12.662 -13.829 -14.827 -15.833 -16.668 -17.385 -18.085 -18.764 -19.402 -19.994 -20.603 -21.132 -21.581 -22.028 -22.483 -22.865 -23.283 -23.721 -24.054 -24.4 -24.752 -25.116 -25.501 -25.768 -26.05 -26.491 -26.795 -27.109 -27.269 -27.59 -27.93 -28.321 -28.539 -28.899 -29.215 -29.466 -29.737 -30.289 -30.597 -30.937 -31.315 -31.758 -32.287 -33.058 -35.306 -10 ,26687 ,KEBNE ,16677952,Wed Nov 24 23:01:20 CET,Thu Nov 25 01:02:27 CET,0.0 0.832 1.266 1.544 1.756 1.925 2.076 2.202 2.441 2.553 2.658 2.771 2.96 3.043 3.189 3.324 3.454 3.527 3.668 3.779 3.924 4.02 4.12 4.268 4.406 4.521 4.611 4.692 4.808 4.913 4.994 5.097 5.185 5.269 5.369 5.468 5.548 5.617 5.703 5.784 5.836 5.889 5.911 5.885 5.79 5.633 5.352 4.769 3.849 2.524 0.269 -2.517 -4.83 -6.749 -8.374 -9.776 -10.993 -12.106 -13.025 -13.953 -14.748 -15.434 -16.094 -16.744 -17.356 -17.903 -18.474 -19.0 -19.445 -19.914 -20.381 -20.736 -21.126 -21.539 -21.871 -22.213 -22.548 -22.895 -23.249 -23.491 -23.754 -24.174 -24.477 -24.796 -24.955 -25.3 -25.685 -26.098 -26.323 -26.679 -27.002 -27.25 -27.533 -28.134 -28.443 -28.8 -29.202 -29.69 -30.333 -31.125 -33.015 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt deleted file mode 100644 index dd481b82..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1201 ,KEBNE ,16675679,Wed Nov 24 06:47:40 CET,Wed Nov 24 08:49:16 CET,0.0 1.427 1.94 2.345 2.686 2.976 3.232 3.466 3.87 4.049 4.225 4.44 4.722 4.867 5.131 5.389 5.626 5.743 5.98 6.205 6.532 6.742 6.933 7.202 7.472 7.737 7.981 8.211 8.514 8.815 9.096 9.41 9.719 10.017 10.353 10.726 11.098 11.531 11.972 12.424 12.9 13.428 14.056 14.704 15.465 16.291 17.241 18.355 19.658 21.085 22.574 23.656 24.156 24.356 24.396 24.323 24.194 24.03 23.826 23.598 23.426 23.287 23.144 22.983 22.812 22.648 22.462 22.275 22.11 21.948 21.764 21.603 21.435 21.259 21.125 20.978 20.823 20.664 20.496 20.381 20.247 20.008 19.847 19.683 19.593 19.386 19.169 18.948 18.831 18.61 18.443 18.299 18.149 17.808 17.611 17.389 17.127 16.824 16.447 15.956 14.287 -2 ,20384 ,KEBNE ,16675680,Wed Nov 24 06:48:42 CET,Wed Nov 24 08:48:05 CET,0.0 1.452 2.006 2.398 2.719 3.003 3.248 3.46 3.85 4.05 4.239 4.437 4.702 4.842 5.107 5.373 5.622 5.735 5.963 6.193 6.514 6.718 6.916 7.184 7.441 7.688 7.932 8.177 8.484 8.78 9.069 9.409 9.73 10.03 10.374 10.778 11.174 11.579 11.985 12.422 12.915 13.47 14.088 14.713 15.452 16.26 17.147 18.132 19.325 20.712 22.27 23.42 23.939 24.181 24.252 24.21 24.13 24.022 23.898 23.76 23.621 23.474 23.306 23.114 22.917 22.739 22.556 22.378 22.208 22.012 21.8 21.624 21.448 21.255 21.092 20.934 20.767 20.587 20.404 20.264 20.113 19.888 19.733 19.572 19.483 19.297 19.104 18.89 18.774 18.531 18.342 18.197 18.042 17.675 17.469 17.249 17.004 16.744 16.417 15.963 14.404 -3 ,7219 ,KEBNE ,16675681,Wed Nov 24 06:48:42 CET,Wed Nov 24 08:48:47 CET,0.0 1.739 2.4 2.832 3.175 3.468 3.726 3.996 4.495 4.704 4.904 5.129 5.409 5.565 5.866 6.143 6.361 6.46 6.66 6.857 7.143 7.324 7.497 7.748 7.988 8.218 8.447 8.685 8.984 9.247 9.512 9.849 10.173 10.475 10.814 11.198 11.578 11.994 12.45 12.934 13.436 14.011 14.654 15.282 16.001 16.81 17.749 18.817 20.056 21.339 22.718 23.673 24.046 24.183 24.228 24.214 24.138 23.995 23.856 23.715 23.551 23.397 23.243 23.086 22.926 22.774 22.613 22.454 22.298 22.135 21.948 21.789 21.622 21.427 21.28 21.12 20.946 20.773 20.594 20.461 20.31 20.094 19.935 19.758 19.675 19.497 19.285 19.038 18.909 18.655 18.461 18.303 18.117 17.7 17.486 17.237 16.953 16.623 16.147 15.504 13.192 -4 ,26529 ,KEBNE ,16677956,Wed Nov 24 23:01:20 CET,Thu Nov 25 01:02:35 CET,0.0 1.318 1.833 2.207 2.504 2.762 3.021 3.268 3.681 3.875 4.054 4.272 4.544 4.683 4.936 5.176 5.426 5.548 5.779 6.003 6.293 6.475 6.66 6.925 7.176 7.416 7.651 7.884 8.181 8.467 8.741 9.062 9.374 9.672 10.02 10.413 10.797 11.241 11.718 12.2 12.691 13.238 13.869 14.517 15.278 16.111 17.066 18.111 19.278 20.547 22.022 23.172 23.697 23.89 23.927 23.867 23.784 23.7 23.576 23.402 23.238 23.056 22.835 22.632 22.447 22.279 22.113 21.964 21.828 21.658 21.469 21.315 21.152 20.981 20.84 20.688 20.524 20.319 20.111 19.972 19.824 19.563 19.367 19.182 19.081 18.854 18.63 18.393 18.257 17.992 17.784 17.613 17.431 17.024 16.803 16.562 16.262 15.872 15.399 14.82 12.604 -5 ,10461 ,KEBNE ,16677957,Wed Nov 24 23:01:20 CET,Thu Nov 25 01:00:59 CET,0.0 1.521 2.039 2.442 2.815 3.142 3.413 3.664 4.134 4.339 4.512 4.716 4.985 5.12 5.385 5.646 5.9 6.016 6.231 6.443 6.769 6.98 7.177 7.445 7.695 7.947 8.186 8.402 8.681 8.965 9.243 9.568 9.872 10.171 10.514 10.907 11.301 11.727 12.161 12.624 13.109 13.628 14.244 14.848 15.528 16.295 17.202 18.201 19.288 20.485 21.741 22.585 22.925 22.994 22.967 22.9 22.761 22.599 22.445 22.267 22.098 21.926 21.755 21.587 21.423 21.276 21.111 20.954 20.799 20.622 20.439 20.283 20.12 19.954 19.828 19.692 19.528 19.343 19.156 19.03 18.897 18.677 18.526 18.36 18.272 18.081 17.854 17.607 17.487 17.255 17.116 16.967 16.807 16.451 16.266 16.054 15.801 15.494 15.104 14.562 12.652 -6 ,14567 ,KEBNE ,16675684,Wed Nov 24 06:49:47 CET,Wed Nov 24 08:42:30 CET,0.0 1.279 1.786 2.153 2.447 2.706 2.95 3.175 3.578 3.761 3.935 4.151 4.42 4.561 4.841 5.112 5.376 5.5 5.723 5.934 6.237 6.434 6.626 6.907 7.179 7.435 7.676 7.901 8.195 8.483 8.754 9.084 9.411 9.727 10.102 10.519 10.894 11.311 11.778 12.261 12.755 13.318 13.984 14.647 15.391 16.219 17.183 18.244 19.461 20.863 22.432 23.568 24.02 24.19 24.22 24.151 24.043 23.892 23.73 23.526 23.339 23.175 23.005 22.838 22.662 22.482 22.296 22.131 21.985 21.81 21.627 21.481 21.308 21.132 20.994 20.847 20.682 20.507 20.327 20.198 20.07 19.86 19.697 19.527 19.443 19.247 19.041 18.827 18.705 18.465 18.302 18.16 17.996 17.636 17.432 17.161 16.84 16.473 15.99 15.307 12.779 -7 ,5560 ,KEBNE ,16677959,Wed Nov 24 23:02:22 CET,Thu Nov 25 01:02:46 CET,0.0 1.405 1.947 2.364 2.726 3.028 3.255 3.469 3.848 4.019 4.187 4.364 4.631 4.768 5.045 5.301 5.531 5.643 5.872 6.096 6.391 6.575 6.751 6.998 7.243 7.497 7.73 7.943 8.222 8.484 8.753 9.084 9.384 9.668 10.003 10.399 10.771 11.156 11.566 12.006 12.479 13.041 13.695 14.299 15.012 15.817 16.756 17.797 18.937 20.216 21.615 22.577 22.987 23.134 23.154 23.085 22.987 22.863 22.727 22.565 22.405 22.249 22.074 21.896 21.724 21.543 21.326 21.138 20.969 20.763 20.538 20.354 20.158 19.951 19.791 19.633 19.469 19.279 19.068 18.931 18.792 18.569 18.413 18.239 18.146 17.935 17.707 17.471 17.344 17.127 16.996 16.861 16.71 16.325 16.074 15.792 15.505 15.181 14.713 13.993 11.531 -8 ,22164 ,KEBNE ,16677960,Wed Nov 24 23:02:22 CET,Thu Nov 25 01:04:25 CET,0.0 2.433 2.976 3.35 3.66 3.944 4.201 4.433 4.838 5.02 5.187 5.386 5.654 5.8 6.084 6.331 6.562 6.679 6.901 7.111 7.428 7.628 7.822 8.099 8.341 8.586 8.839 9.082 9.382 9.659 9.926 10.239 10.532 10.826 11.171 11.529 11.88 12.271 12.682 13.108 13.564 14.083 14.681 15.307 16.064 16.885 17.795 18.815 19.939 21.225 22.754 23.804 24.254 24.43 24.495 24.479 24.415 24.337 24.249 24.104 23.937 23.792 23.631 23.449 23.272 23.113 22.932 22.738 22.568 22.38 22.174 22.016 21.862 21.693 21.553 21.409 21.251 21.089 20.91 20.775 20.619 20.384 20.242 20.075 19.984 19.797 19.589 19.375 19.262 19.034 18.887 18.755 18.608 18.244 18.035 17.83 17.621 17.361 17.044 16.539 13.973 -9 ,18985 ,KEBNE ,16675687,Wed Nov 24 06:52:53 CET,Wed Nov 24 08:47:01 CET,0.0 1.79 2.369 2.8 3.13 3.435 3.706 3.933 4.325 4.502 4.67 4.868 5.164 5.328 5.63 5.926 6.195 6.317 6.552 6.789 7.106 7.309 7.511 7.776 8.031 8.28 8.507 8.724 9.009 9.282 9.556 9.893 10.215 10.536 10.932 11.382 11.784 12.197 12.663 13.153 13.652 14.236 14.898 15.543 16.268 17.067 17.994 19.011 20.244 21.671 23.275 24.477 24.998 25.196 25.255 25.186 25.026 24.875 24.724 24.548 24.393 24.226 24.055 23.884 23.713 23.549 23.359 23.176 23.015 22.842 22.657 22.51 22.362 22.208 22.074 21.922 21.757 21.58 21.387 21.247 21.109 20.897 20.744 20.576 20.488 20.32 20.139 19.934 19.824 19.605 19.454 19.311 19.163 18.83 18.634 18.409 18.135 17.798 17.342 16.699 14.453 -10 ,13442 ,KEBNE ,16677962,Wed Nov 24 23:02:22 CET,Thu Nov 25 01:02:05 CET,0.0 2.407 3.104 3.533 3.865 4.099 4.316 4.567 5.026 5.22 5.406 5.599 5.872 6.02 6.282 6.53 6.773 6.897 7.135 7.35 7.65 7.828 8.002 8.25 8.487 8.738 8.973 9.183 9.47 9.757 10.029 10.34 10.646 10.947 11.291 11.683 12.056 12.481 12.939 13.384 13.863 14.424 15.09 15.766 16.507 17.322 18.259 19.298 20.437 21.696 23.195 24.342 24.929 25.24 25.308 25.231 25.096 24.97 24.863 24.696 24.514 24.337 24.17 24.018 23.849 23.671 23.485 23.313 23.147 22.987 22.826 22.687 22.531 22.34 22.198 22.056 21.905 21.757 21.606 21.486 21.342 21.112 20.957 20.782 20.682 20.489 20.297 20.059 19.934 19.7 19.558 19.411 19.24 18.843 18.623 18.386 18.105 17.784 17.394 16.831 14.775 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt deleted file mode 100644 index 06f1815a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12934 ,KEBNE ,17023961,Wed Dec 22 08:46:59 CET,Wed Dec 22 10:46:08 CET,0.0 1.327 1.751 2.061 2.327 2.553 2.768 2.965 3.282 3.432 3.585 3.74 3.979 4.093 4.301 4.495 4.674 4.748 4.896 5.03 5.207 5.328 5.456 5.654 5.84 6.029 6.216 6.388 6.61 6.825 7.019 7.247 7.473 7.656 7.83 8.011 8.189 8.383 8.539 8.697 8.922 9.169 9.355 9.482 9.597 9.705 9.832 9.98 9.981 9.727 9.001 7.784 6.626 5.508 4.487 3.528 2.659 1.873 1.224 0.565 -0.033 -0.541 -1.03 -1.541 -2.025 -2.444 -2.868 -3.265 -3.625 -3.983 -4.393 -4.747 -5.09 -5.456 -5.76 -6.088 -6.427 -6.769 -7.118 -7.365 -7.642 -8.069 -8.348 -8.648 -8.807 -9.136 -9.49 -9.883 -10.093 -10.432 -10.725 -10.953 -11.218 -11.807 -12.148 -12.52 -12.923 -13.415 -14.031 -14.814 -18.278 -2 ,29 ,KEBNE ,17023962,Wed Dec 22 08:46:59 CET,Wed Dec 22 10:47:01 CET,0.0 1.34 1.719 2.032 2.287 2.487 2.668 2.835 3.188 3.349 3.482 3.618 3.84 3.947 4.153 4.324 4.491 4.569 4.727 4.896 5.14 5.279 5.413 5.611 5.781 5.935 6.094 6.236 6.401 6.581 6.765 6.963 7.135 7.301 7.495 7.701 7.912 8.134 8.355 8.586 8.815 9.057 9.316 9.559 9.771 9.991 10.238 10.404 10.4 10.09 9.183 7.712 6.341 5.155 4.121 3.172 2.377 1.681 1.008 0.261 -0.381 -0.968 -1.554 -2.114 -2.636 -3.097 -3.59 -4.017 -4.376 -4.8 -5.243 -5.601 -6.004 -6.425 -6.736 -7.065 -7.407 -7.742 -8.097 -8.352 -8.629 -9.075 -9.379 -9.696 -9.882 -10.325 -10.803 -11.303 -11.559 -11.949 -12.364 -12.672 -12.994 -13.699 -14.117 -14.588 -15.072 -15.626 -16.344 -17.325 -20.777 -3 ,22609 ,KEBNE ,17023963,Wed Dec 22 08:46:59 CET,Wed Dec 22 10:47:32 CET,0.0 0.923 1.283 1.559 1.791 2.007 2.197 2.354 2.636 2.764 2.888 2.999 3.235 3.345 3.536 3.71 3.878 3.951 4.084 4.203 4.353 4.452 4.56 4.72 4.865 4.988 5.101 5.21 5.338 5.448 5.562 5.719 5.874 6.034 6.213 6.394 6.552 6.727 6.899 7.051 7.286 7.578 7.801 7.962 8.124 8.249 8.36 8.402 8.265 7.851 6.815 5.24 3.898 2.737 1.673 0.684 -0.225 -1.058 -1.758 -2.47 -3.094 -3.654 -4.236 -4.787 -5.291 -5.763 -6.249 -6.685 -7.065 -7.458 -7.861 -8.199 -8.589 -9.008 -9.317 -9.652 -9.997 -10.361 -10.729 -10.968 -11.221 -11.651 -11.969 -12.291 -12.453 -12.79 -13.15 -13.536 -13.744 -14.086 -14.366 -14.595 -14.859 -15.448 -15.758 -16.098 -16.497 -16.949 -17.495 -18.364 -21.789 -4 ,17019 ,KEBNE ,17023964,Wed Dec 22 08:48:00 CET,Wed Dec 22 10:48:51 CET,0.0 1.006 1.408 1.719 1.919 2.104 2.276 2.423 2.687 2.806 2.921 3.008 3.229 3.334 3.526 3.705 3.892 3.989 4.175 4.342 4.581 4.722 4.841 5.018 5.189 5.353 5.523 5.684 5.895 6.093 6.27 6.481 6.7 6.888 7.099 7.343 7.531 7.7 7.899 8.154 8.408 8.684 8.989 9.241 9.485 9.706 9.891 10.037 10.031 9.708 8.899 7.62 6.409 5.247 4.169 3.146 2.175 1.275 0.533 -0.206 -0.837 -1.399 -1.974 -2.535 -3.06 -3.541 -4.057 -4.524 -4.916 -5.331 -5.784 -6.144 -6.49 -6.869 -7.185 -7.517 -7.854 -8.209 -8.611 -8.899 -9.187 -9.627 -9.953 -10.285 -10.447 -10.776 -11.125 -11.532 -11.744 -12.085 -12.432 -12.685 -12.954 -13.599 -13.965 -14.354 -14.81 -15.363 -16.0 -16.87 -19.575 -5 ,28608 ,KEBNE ,17023965,Wed Dec 22 08:48:00 CET,Wed Dec 22 10:48:02 CET,0.0 1.259 1.597 1.848 2.05 2.23 2.401 2.563 2.833 2.949 3.063 3.167 3.383 3.478 3.674 3.843 3.992 4.068 4.223 4.371 4.575 4.698 4.824 5.014 5.164 5.306 5.447 5.568 5.72 5.866 5.992 6.143 6.302 6.441 6.602 6.774 6.915 7.077 7.265 7.456 7.638 7.804 7.983 8.164 8.319 8.434 8.52 8.529 8.495 8.249 7.407 6.016 4.675 3.472 2.392 1.464 0.646 -0.161 -0.913 -1.707 -2.371 -2.926 -3.466 -3.995 -4.506 -4.965 -5.437 -5.854 -6.186 -6.546 -6.994 -7.387 -7.794 -8.201 -8.504 -8.803 -9.11 -9.449 -9.805 -10.042 -10.297 -10.738 -11.051 -11.371 -11.539 -11.899 -12.274 -12.672 -12.877 -13.218 -13.538 -13.777 -14.037 -14.668 -15.08 -15.532 -15.988 -16.563 -17.294 -18.196 -21.501 -6 ,8507 ,KEBNE ,17023966,Wed Dec 22 08:49:03 CET,Wed Dec 22 10:50:24 CET,0.0 0.901 1.259 1.508 1.721 1.915 2.09 2.239 2.471 2.579 2.684 2.776 3.003 3.106 3.276 3.426 3.547 3.607 3.753 3.906 4.107 4.223 4.337 4.5 4.624 4.734 4.836 4.931 5.061 5.193 5.333 5.507 5.668 5.82 5.975 6.165 6.368 6.57 6.78 6.995 7.206 7.436 7.696 7.935 8.181 8.398 8.543 8.603 8.496 8.11 7.198 5.841 4.469 3.258 2.267 1.335 0.489 -0.318 -1.037 -1.801 -2.491 -3.111 -3.703 -4.241 -4.724 -5.165 -5.638 -6.07 -6.445 -6.832 -7.26 -7.617 -7.977 -8.353 -8.639 -8.931 -9.258 -9.622 -10.016 -10.293 -10.575 -11.007 -11.311 -11.648 -11.822 -12.159 -12.522 -12.919 -13.13 -13.474 -13.774 -14.006 -14.273 -14.883 -15.22 -15.584 -15.987 -16.473 -17.092 -17.951 -21.236 -7 ,25206 ,KEBNE ,17023967,Wed Dec 22 08:49:03 CET,Wed Dec 22 10:48:47 CET,0.0 1.33 1.827 2.147 2.376 2.58 2.77 2.937 3.221 3.345 3.462 3.55 3.767 3.87 4.062 4.227 4.381 4.456 4.592 4.708 4.882 5.003 5.136 5.323 5.487 5.648 5.786 5.896 6.036 6.17 6.3 6.472 6.65 6.832 7.029 7.236 7.427 7.665 7.911 8.132 8.355 8.583 8.807 8.964 9.111 9.216 9.276 9.26 9.016 8.468 7.444 5.958 4.642 3.494 2.471 1.463 0.541 -0.258 -0.968 -1.724 -2.365 -2.927 -3.501 -4.05 -4.556 -5.025 -5.533 -6.003 -6.402 -6.816 -7.251 -7.614 -7.978 -8.347 -8.649 -8.973 -9.316 -9.658 -10.009 -10.27 -10.547 -10.968 -11.277 -11.595 -11.752 -12.091 -12.446 -12.845 -13.055 -13.388 -13.717 -13.972 -14.225 -14.803 -15.165 -15.563 -15.998 -16.524 -17.161 -18.061 -23.879 -8 ,9415 ,KEBNE ,17023968,Wed Dec 22 08:49:03 CET,Wed Dec 22 10:50:16 CET,0.0 1.15 1.546 1.828 2.061 2.273 2.459 2.619 2.91 3.032 3.144 3.244 3.457 3.552 3.728 3.89 4.039 4.11 4.241 4.368 4.545 4.658 4.775 4.924 5.047 5.165 5.278 5.394 5.541 5.672 5.796 5.951 6.1 6.241 6.395 6.561 6.726 6.914 7.105 7.293 7.474 7.655 7.859 8.041 8.211 8.328 8.401 8.453 8.332 7.852 6.842 5.447 4.151 3.012 1.991 1.015 0.137 -0.651 -1.347 -2.069 -2.722 -3.328 -3.898 -4.43 -4.938 -5.397 -5.847 -6.223 -6.561 -6.952 -7.361 -7.675 -8.029 -8.426 -8.721 -9.011 -9.313 -9.665 -10.048 -10.312 -10.574 -10.977 -11.271 -11.624 -11.816 -12.188 -12.598 -13.03 -13.256 -13.636 -14.022 -14.299 -14.606 -15.302 -15.682 -16.118 -16.605 -17.182 -17.917 -18.869 -22.712 -9 ,30678 ,KEBNE ,17023969,Wed Dec 22 08:49:03 CET,Wed Dec 22 10:48:46 CET,0.0 1.151 1.587 1.931 2.207 2.422 2.601 2.746 3.021 3.158 3.284 3.399 3.635 3.735 3.905 4.071 4.226 4.296 4.412 4.545 4.742 4.843 4.943 5.093 5.234 5.374 5.502 5.606 5.746 5.88 5.999 6.157 6.326 6.482 6.648 6.822 6.975 7.119 7.275 7.458 7.67 7.88 8.07 8.231 8.425 8.646 8.819 8.885 8.788 8.42 7.571 6.331 5.158 4.097 3.099 2.158 1.319 0.527 -0.171 -0.857 -1.454 -1.997 -2.523 -3.016 -3.461 -3.891 -4.391 -4.824 -5.178 -5.57 -5.993 -6.34 -6.71 -7.102 -7.398 -7.698 -8.017 -8.369 -8.728 -8.969 -9.223 -9.626 -9.9 -10.191 -10.355 -10.697 -11.04 -11.412 -11.615 -11.942 -12.233 -12.466 -12.72 -13.338 -13.696 -14.11 -14.599 -15.111 -15.716 -16.709 -20.667 -10 ,30811 ,KEBNE ,17023970,Wed Dec 22 08:50:05 CET,Wed Dec 22 10:51:04 CET,0.0 1.011 1.436 1.745 1.967 2.177 2.373 2.548 2.84 2.977 3.108 3.224 3.444 3.55 3.751 3.93 4.104 4.197 4.386 4.557 4.806 4.963 5.11 5.327 5.528 5.723 5.911 6.091 6.318 6.529 6.738 7.007 7.248 7.471 7.731 8.009 8.241 8.472 8.724 8.987 9.251 9.524 9.804 10.06 10.364 10.642 10.805 10.857 10.773 10.475 9.684 8.383 7.128 5.977 4.944 3.965 3.088 2.316 1.633 0.943 0.36 -0.162 -0.66 -1.134 -1.564 -1.968 -2.408 -2.803 -3.157 -3.53 -3.93 -4.27 -4.613 -4.966 -5.241 -5.528 -5.829 -6.136 -6.443 -6.66 -6.895 -7.264 -7.53 -7.808 -7.944 -8.229 -8.55 -8.903 -9.085 -9.412 -9.695 -9.915 -10.163 -10.722 -11.047 -11.417 -11.829 -12.301 -12.905 -13.726 -16.375 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt deleted file mode 100644 index 27ced745..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30740 ,KEBNE ,16677963,Wed Nov 24 23:02:23 CET,Thu Nov 25 01:04:36 CET,0.0 1.673 2.191 2.58 2.883 3.129 3.334 3.515 3.836 3.971 4.099 4.284 4.512 4.618 4.829 5.034 5.211 5.29 5.424 5.558 5.774 5.903 6.021 6.194 6.359 6.505 6.654 6.799 6.97 7.141 7.311 7.501 7.658 7.798 7.961 8.149 8.329 8.512 8.718 8.937 9.136 9.335 9.533 9.699 9.874 10.011 10.072 10.054 9.928 9.564 8.595 7.189 5.904 4.752 3.762 2.829 2.042 1.365 0.746 0.109 -0.432 -0.931 -1.416 -1.851 -2.257 -2.635 -3.037 -3.394 -3.693 -4.009 -4.345 -4.628 -4.914 -5.216 -5.445 -5.682 -5.932 -6.177 -6.45 -6.659 -6.883 -7.23 -7.48 -7.748 -7.88 -8.169 -8.474 -8.8 -8.974 -9.253 -9.508 -9.716 -9.935 -10.423 -10.687 -10.988 -11.333 -11.726 -12.215 -12.864 -14.923 -2 ,592 ,KEBNE ,16677964,Wed Nov 24 23:02:22 CET,Thu Nov 25 01:03:04 CET,0.0 1.171 1.714 2.148 2.464 2.714 2.927 3.142 3.523 3.677 3.819 3.976 4.197 4.306 4.549 4.777 4.961 5.044 5.201 5.358 5.58 5.718 5.85 6.036 6.212 6.369 6.529 6.693 6.881 7.062 7.235 7.429 7.616 7.797 7.99 8.194 8.38 8.574 8.797 9.027 9.236 9.449 9.668 9.861 10.049 10.23 10.403 10.483 10.423 10.1 9.212 7.883 6.661 5.569 4.611 3.737 2.973 2.265 1.64 1.01 0.477 0.013 -0.438 -0.87 -1.289 -1.685 -2.079 -2.424 -2.734 -3.052 -3.368 -3.638 -3.94 -4.262 -4.505 -4.753 -5.018 -5.277 -5.559 -5.759 -5.963 -6.276 -6.488 -6.724 -6.851 -7.117 -7.397 -7.694 -7.848 -8.112 -8.373 -8.574 -8.777 -9.214 -9.461 -9.76 -10.073 -10.391 -10.803 -11.403 -12.881 -3 ,19772 ,KEBNE ,16677965,Wed Nov 24 23:03:24 CET,Thu Nov 25 01:05:01 CET,0.0 1.312 1.799 2.196 2.516 2.762 2.965 3.151 3.467 3.602 3.737 3.92 4.134 4.244 4.454 4.667 4.871 4.963 5.127 5.287 5.514 5.651 5.77 5.947 6.122 6.275 6.419 6.577 6.779 6.951 7.103 7.276 7.444 7.612 7.791 7.971 8.14 8.328 8.527 8.704 8.849 9.033 9.222 9.368 9.525 9.653 9.694 9.606 9.385 8.991 8.081 6.676 5.437 4.354 3.412 2.557 1.78 1.095 0.516 -0.071 -0.564 -1.03 -1.497 -1.91 -2.298 -2.649 -3.019 -3.364 -3.649 -3.94 -4.256 -4.518 -4.786 -5.06 -5.28 -5.51 -5.745 -6.002 -6.27 -6.449 -6.638 -6.94 -7.157 -7.391 -7.509 -7.752 -8.015 -8.29 -8.437 -8.692 -8.926 -9.116 -9.315 -9.734 -9.967 -10.249 -10.562 -10.905 -11.335 -12.069 -14.255 -4 ,6730 ,KEBNE ,16677966,Wed Nov 24 23:02:22 CET,Thu Nov 25 01:03:34 CET,0.0 1.969 2.626 3.094 3.523 3.873 4.163 4.423 4.864 5.029 5.191 5.419 5.641 5.771 5.995 6.195 6.393 6.495 6.685 6.849 7.08 7.23 7.368 7.577 7.77 7.938 8.105 8.279 8.49 8.663 8.826 9.026 9.206 9.371 9.55 9.736 9.916 10.108 10.292 10.48 10.664 10.838 11.019 11.167 11.276 11.358 11.407 11.371 11.209 10.737 9.732 8.339 7.096 6.043 5.135 4.293 3.515 2.801 2.196 1.598 1.094 0.629 0.168 -0.248 -0.641 -1.008 -1.388 -1.745 -2.055 -2.374 -2.697 -2.963 -3.244 -3.532 -3.774 -4.022 -4.264 -4.525 -4.796 -4.978 -5.174 -5.484 -5.702 -5.938 -6.067 -6.331 -6.609 -6.906 -7.058 -7.323 -7.571 -7.753 -7.944 -8.364 -8.622 -8.934 -9.278 -9.646 -10.068 -10.631 -12.281 -5 ,3085 ,KEBNE ,16677967,Wed Nov 24 23:02:22 CET,Thu Nov 25 01:02:56 CET,0.0 1.89 2.638 3.135 3.48 3.742 3.973 4.174 4.501 4.632 4.763 4.936 5.14 5.239 5.451 5.654 5.84 5.927 6.1 6.257 6.449 6.574 6.705 6.89 7.044 7.178 7.321 7.465 7.652 7.822 7.965 8.132 8.304 8.471 8.668 8.874 9.058 9.256 9.443 9.631 9.806 9.963 10.136 10.287 10.408 10.506 10.571 10.581 10.458 10.077 9.193 7.822 6.541 5.432 4.475 3.606 2.826 2.119 1.515 0.877 0.324 -0.147 -0.607 -1.038 -1.431 -1.795 -2.18 -2.523 -2.812 -3.12 -3.45 -3.723 -4.008 -4.312 -4.553 -4.797 -5.064 -5.364 -5.665 -5.865 -6.072 -6.399 -6.639 -6.883 -7.011 -7.287 -7.576 -7.875 -8.026 -8.299 -8.544 -8.73 -8.938 -9.397 -9.658 -9.93 -10.229 -10.595 -11.047 -11.648 -12.987 -6 ,8485 ,KEBNE ,16677968,Wed Nov 24 23:02:22 CET,Thu Nov 25 01:03:19 CET,0.0 1.946 2.539 2.949 3.314 3.665 3.944 4.186 4.588 4.754 4.918 5.132 5.368 5.508 5.782 6.021 6.22 6.317 6.495 6.661 6.901 7.053 7.189 7.381 7.572 7.746 7.911 8.061 8.238 8.412 8.57 8.763 8.948 9.094 9.271 9.479 9.668 9.872 10.068 10.264 10.458 10.63 10.788 10.922 11.063 11.19 11.252 11.194 10.975 10.51 9.532 8.145 6.886 5.733 4.702 3.787 2.99 2.265 1.644 0.998 0.428 -0.07 -0.532 -0.959 -1.354 -1.707 -2.088 -2.434 -2.724 -3.029 -3.344 -3.604 -3.882 -4.179 -4.409 -4.646 -4.889 -5.156 -5.458 -5.667 -5.88 -6.214 -6.442 -6.679 -6.797 -7.045 -7.32 -7.612 -7.762 -8.023 -8.261 -8.458 -8.675 -9.11 -9.351 -9.621 -9.892 -10.254 -10.739 -11.344 -12.796 -7 ,6838 ,KEBNE ,16677969,Wed Nov 24 23:02:21 CET,Thu Nov 25 01:03:51 CET,0.0 1.672 2.309 2.791 3.138 3.445 3.734 3.985 4.436 4.624 4.786 4.995 5.237 5.375 5.634 5.865 6.085 6.186 6.375 6.548 6.786 6.935 7.076 7.28 7.466 7.636 7.798 7.944 8.133 8.329 8.519 8.735 8.936 9.113 9.308 9.536 9.747 9.97 10.189 10.408 10.614 10.815 11.065 11.313 11.527 11.695 11.817 11.866 11.79 11.449 10.573 9.248 8.022 6.873 5.776 4.84 4.054 3.326 2.669 1.963 1.362 0.836 0.342 -0.117 -0.53 -0.904 -1.31 -1.663 -1.971 -2.312 -2.678 -2.977 -3.281 -3.593 -3.823 -4.076 -4.348 -4.633 -4.933 -5.141 -5.366 -5.721 -5.972 -6.245 -6.388 -6.667 -6.944 -7.251 -7.426 -7.709 -7.972 -8.181 -8.413 -8.935 -9.215 -9.524 -9.864 -10.233 -10.681 -11.275 -13.171 -8 ,25482 ,KEBNE ,16677970,Wed Nov 24 23:02:22 CET,Thu Nov 25 01:03:23 CET,0.0 1.882 2.488 2.931 3.269 3.569 3.872 4.126 4.528 4.717 4.882 5.049 5.266 5.388 5.615 5.812 6.008 6.106 6.286 6.443 6.661 6.799 6.926 7.103 7.277 7.445 7.595 7.752 7.956 8.14 8.314 8.506 8.679 8.845 9.048 9.261 9.446 9.645 9.848 10.042 10.23 10.415 10.6 10.764 10.914 11.053 11.164 11.185 11.083 10.758 9.938 8.779 7.718 6.704 5.807 4.975 4.232 3.555 2.945 2.307 1.772 1.32 0.886 0.45 0.033 -0.319 -0.677 -1.002 -1.283 -1.577 -1.898 -2.168 -2.441 -2.742 -2.994 -3.257 -3.514 -3.786 -4.066 -4.261 -4.476 -4.8 -5.023 -5.276 -5.405 -5.685 -5.993 -6.288 -6.442 -6.72 -7.0 -7.204 -7.411 -7.838 -8.092 -8.362 -8.643 -8.986 -9.403 -9.931 -11.113 -9 ,14734 ,KEBNE ,16677971,Wed Nov 24 23:02:22 CET,Thu Nov 25 01:03:20 CET,0.0 1.432 1.966 2.362 2.69 2.961 3.184 3.377 3.713 3.865 4.007 4.179 4.403 4.526 4.754 4.973 5.196 5.295 5.463 5.626 5.841 5.982 6.113 6.284 6.459 6.627 6.786 6.943 7.135 7.308 7.471 7.662 7.849 8.031 8.229 8.431 8.615 8.837 9.086 9.322 9.538 9.728 9.895 10.047 10.191 10.295 10.357 10.312 10.146 9.758 8.742 7.216 5.883 4.681 3.612 2.705 1.906 1.155 0.511 -0.121 -0.665 -1.174 -1.651 -2.085 -2.501 -2.886 -3.298 -3.682 -4.003 -4.329 -4.677 -4.964 -5.261 -5.57 -5.824 -6.089 -6.354 -6.647 -6.951 -7.155 -7.368 -7.727 -7.987 -8.238 -8.36 -8.612 -8.898 -9.216 -9.382 -9.649 -9.909 -10.124 -10.352 -10.831 -11.082 -11.343 -11.646 -12.024 -12.466 -13.073 -14.477 -10 ,13513 ,KEBNE ,16677972,Wed Nov 24 23:03:23 CET,Thu Nov 25 01:05:46 CET,0.0 1.604 2.134 2.512 2.791 3.046 3.273 3.478 3.837 3.999 4.15 4.304 4.532 4.659 4.897 5.113 5.297 5.388 5.559 5.715 5.938 6.077 6.214 6.41 6.593 6.762 6.915 7.063 7.274 7.487 7.661 7.844 8.025 8.213 8.413 8.609 8.798 9.008 9.212 9.413 9.628 9.838 10.052 10.273 10.5 10.712 10.818 10.773 10.68 10.336 9.393 8.092 6.909 5.832 4.847 3.988 3.238 2.554 1.982 1.413 0.911 0.451 -0.001 -0.438 -0.855 -1.243 -1.634 -1.989 -2.306 -2.618 -2.937 -3.204 -3.476 -3.75 -3.975 -4.214 -4.465 -4.738 -5.019 -5.212 -5.434 -5.793 -6.025 -6.274 -6.417 -6.705 -6.979 -7.259 -7.412 -7.668 -7.88 -8.054 -8.233 -8.617 -8.838 -9.092 -9.368 -9.669 -10.077 -10.667 -12.272 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 04af5443..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9938 ,KEBNE ,16677973,Wed Nov 24 23:03:24 CET,Thu Nov 25 01:08:41 CET,0.0 2.35 2.927 3.293 3.607 3.891 4.113 4.284 4.577 4.717 4.858 4.996 5.21 5.338 5.562 5.737 5.912 5.994 6.145 6.296 6.481 6.591 6.687 6.826 6.96 7.069 7.173 7.28 7.4 7.513 7.614 7.723 7.829 7.918 8.005 8.099 8.198 8.289 8.362 8.418 8.462 8.48 8.435 8.329 8.161 7.916 7.534 7.008 6.2 4.938 2.708 -0.09 -2.383 -4.326 -5.958 -7.349 -8.536 -9.592 -10.489 -11.375 -12.134 -12.818 -13.469 -14.06 -14.595 -15.082 -15.594 -16.049 -16.44 -16.854 -17.277 -17.619 -17.968 -18.323 -18.597 -18.899 -19.216 -19.532 -19.855 -20.081 -20.304 -20.66 -20.923 -21.19 -21.329 -21.612 -21.911 -22.222 -22.388 -22.684 -22.944 -23.148 -23.351 -23.796 -24.054 -24.36 -24.695 -25.088 -25.619 -26.354 -28.046 -2 ,6391 ,KEBNE ,16677974,Wed Nov 24 23:03:24 CET,Thu Nov 25 01:05:17 CET,0.0 1.88 2.468 2.919 3.264 3.54 3.771 3.977 4.342 4.502 4.664 4.85 5.068 5.181 5.413 5.621 5.8 5.883 6.046 6.2 6.406 6.534 6.669 6.857 7.02 7.183 7.334 7.471 7.635 7.768 7.889 8.027 8.152 8.257 8.352 8.46 8.585 8.716 8.818 8.914 8.999 9.03 9.03 9.027 8.958 8.795 8.502 8.046 7.307 6.033 3.735 0.933 -1.387 -3.396 -5.108 -6.59 -7.867 -8.983 -9.936 -10.874 -11.649 -12.323 -12.977 -13.604 -14.181 -14.704 -15.223 -15.665 -16.044 -16.429 -16.841 -17.183 -17.534 -17.893 -18.162 -18.447 -18.752 -19.063 -19.373 -19.587 -19.811 -20.161 -20.41 -20.67 -20.803 -21.092 -21.394 -21.714 -21.891 -22.182 -22.413 -22.596 -22.788 -23.221 -23.469 -23.753 -24.049 -24.353 -24.721 -25.248 -26.615 -3 ,960 ,KEBNE ,16677975,Wed Nov 24 23:03:24 CET,Thu Nov 25 01:04:19 CET,0.0 2.136 2.692 3.119 3.438 3.697 3.925 4.139 4.533 4.701 4.844 4.997 5.216 5.327 5.552 5.768 5.947 6.03 6.191 6.35 6.576 6.706 6.818 6.968 7.114 7.246 7.357 7.458 7.599 7.727 7.841 7.997 8.122 8.223 8.335 8.434 8.52 8.604 8.68 8.729 8.754 8.744 8.689 8.638 8.512 8.248 7.89 7.344 6.458 5.077 2.743 -0.065 -2.377 -4.266 -5.844 -7.197 -8.368 -9.435 -10.317 -11.156 -11.887 -12.549 -13.187 -13.777 -14.312 -14.802 -15.299 -15.75 -16.149 -16.572 -17.004 -17.345 -17.712 -18.094 -18.378 -18.675 -18.989 -19.309 -19.633 -19.852 -20.075 -20.447 -20.712 -20.965 -21.096 -21.369 -21.648 -21.968 -22.132 -22.416 -22.658 -22.857 -23.067 -23.537 -23.803 -24.075 -24.418 -24.827 -25.262 -25.899 -27.673 -4 ,9092 ,KEBNE ,16677976,Wed Nov 24 23:03:28 CET,Thu Nov 25 01:03:40 CET,0.0 2.104 2.748 3.217 3.552 3.825 4.069 4.291 4.666 4.81 4.943 5.104 5.316 5.417 5.615 5.806 5.967 6.058 6.258 6.435 6.668 6.798 6.906 7.058 7.217 7.357 7.476 7.588 7.722 7.834 7.933 8.056 8.173 8.267 8.371 8.5 8.603 8.698 8.798 8.877 8.91 8.955 8.99 8.952 8.837 8.639 8.291 7.756 6.945 5.637 3.415 0.712 -1.463 -3.231 -4.741 -6.081 -7.177 -8.124 -8.967 -9.814 -10.537 -11.211 -11.874 -12.483 -13.045 -13.559 -14.092 -14.568 -14.975 -15.383 -15.795 -16.149 -16.508 -16.868 -17.157 -17.461 -17.773 -18.092 -18.412 -18.631 -18.87 -19.246 -19.502 -19.773 -19.914 -20.204 -20.499 -20.803 -20.963 -21.231 -21.469 -21.656 -21.844 -22.277 -22.517 -22.783 -23.085 -23.422 -23.868 -24.493 -26.097 -5 ,13814 ,KEBNE ,16677977,Wed Nov 24 23:03:24 CET,Thu Nov 25 01:05:29 CET,0.0 1.645 2.108 2.448 2.737 2.956 3.135 3.312 3.638 3.785 3.913 4.06 4.262 4.356 4.542 4.716 4.876 4.947 5.066 5.182 5.351 5.457 5.552 5.679 5.802 5.919 6.028 6.129 6.266 6.395 6.5 6.609 6.715 6.81 6.893 6.98 7.049 7.116 7.179 7.209 7.218 7.187 7.107 7.01 6.867 6.61 6.228 5.705 4.891 3.572 1.195 -1.774 -4.158 -5.975 -7.531 -8.948 -10.148 -11.254 -12.208 -13.142 -13.912 -14.6 -15.281 -15.907 -16.463 -16.967 -17.48 -17.919 -18.298 -18.689 -19.095 -19.455 -19.84 -20.236 -20.538 -20.853 -21.17 -21.473 -21.804 -22.051 -22.301 -22.667 -22.922 -23.207 -23.356 -23.67 -23.98 -24.309 -24.499 -24.811 -25.071 -25.274 -25.479 -25.911 -26.154 -26.426 -26.721 -27.044 -27.464 -28.025 -29.36 -6 ,21702 ,KEBNE ,16677978,Wed Nov 24 23:03:24 CET,Thu Nov 25 01:05:19 CET,0.0 1.606 2.043 2.37 2.649 2.904 3.109 3.283 3.605 3.754 3.893 4.04 4.25 4.357 4.532 4.706 4.883 4.971 5.134 5.275 5.47 5.578 5.67 5.798 5.918 6.04 6.165 6.271 6.388 6.504 6.589 6.685 6.795 6.898 7.0 7.094 7.176 7.266 7.344 7.411 7.469 7.473 7.457 7.444 7.352 7.155 6.849 6.36 5.592 4.335 2.161 -0.416 -2.57 -4.353 -5.833 -7.157 -8.312 -9.345 -10.228 -11.099 -11.834 -12.491 -13.115 -13.725 -14.311 -14.815 -15.328 -15.78 -16.171 -16.579 -16.991 -17.338 -17.706 -18.083 -18.38 -18.697 -19.014 -19.332 -19.653 -19.878 -20.129 -20.544 -20.822 -21.103 -21.25 -21.554 -21.869 -22.194 -22.378 -22.692 -22.953 -23.155 -23.381 -23.869 -24.126 -24.419 -24.748 -25.102 -25.536 -26.139 -27.619 -7 ,10313 ,KEBNE ,16677979,Wed Nov 24 23:03:24 CET,Thu Nov 25 01:04:20 CET,0.0 2.127 2.615 2.969 3.277 3.535 3.743 3.922 4.234 4.384 4.529 4.684 4.91 5.026 5.224 5.404 5.567 5.645 5.792 5.941 6.132 6.24 6.346 6.487 6.615 6.737 6.861 6.967 7.082 7.188 7.271 7.377 7.479 7.571 7.686 7.81 7.904 7.995 8.071 8.113 8.153 8.183 8.163 8.107 7.982 7.757 7.417 6.913 6.174 4.952 2.774 0.259 -1.794 -3.577 -5.12 -6.449 -7.589 -8.582 -9.443 -10.313 -11.046 -11.705 -12.316 -12.875 -13.384 -13.859 -14.374 -14.836 -15.209 -15.584 -16.005 -16.352 -16.696 -17.075 -17.366 -17.659 -17.987 -18.324 -18.669 -18.914 -19.162 -19.537 -19.803 -20.082 -20.227 -20.517 -20.813 -21.14 -21.314 -21.629 -21.941 -22.159 -22.392 -22.901 -23.17 -23.447 -23.769 -24.15 -24.615 -25.249 -26.643 -8 ,23696 ,KEBNE ,16677980,Wed Nov 24 23:03:24 CET,Thu Nov 25 01:05:53 CET,0.0 1.874 2.327 2.658 2.929 3.156 3.366 3.55 3.844 3.98 4.115 4.262 4.459 4.557 4.758 4.946 5.092 5.159 5.301 5.435 5.599 5.7 5.8 5.932 6.051 6.171 6.295 6.406 6.544 6.677 6.797 6.925 7.033 7.124 7.211 7.281 7.334 7.389 7.449 7.507 7.556 7.574 7.544 7.495 7.379 7.15 6.846 6.411 5.66 4.379 2.156 -0.356 -2.36 -4.109 -5.597 -6.913 -8.057 -9.078 -9.955 -10.831 -11.576 -12.251 -12.874 -13.436 -13.959 -14.429 -14.936 -15.382 -15.765 -16.171 -16.562 -16.882 -17.223 -17.579 -17.86 -18.143 -18.443 -18.758 -19.079 -19.306 -19.536 -19.901 -20.163 -20.439 -20.573 -20.839 -21.137 -21.474 -21.646 -21.933 -22.177 -22.369 -22.591 -23.099 -23.37 -23.67 -23.991 -24.331 -24.756 -25.442 -27.27 -9 ,11414 ,KEBNE ,16677981,Wed Nov 24 23:03:24 CET,Thu Nov 25 01:05:14 CET,0.0 1.954 2.479 2.87 3.159 3.41 3.652 3.855 4.175 4.314 4.447 4.581 4.777 4.877 5.077 5.274 5.453 5.536 5.683 5.818 6.009 6.124 6.242 6.428 6.586 6.719 6.835 6.951 7.105 7.242 7.37 7.501 7.625 7.747 7.879 8.012 8.103 8.192 8.278 8.346 8.395 8.455 8.495 8.463 8.365 8.153 7.8 7.324 6.542 5.221 2.946 0.128 -2.106 -3.925 -5.533 -6.981 -8.187 -9.26 -10.186 -11.099 -11.873 -12.555 -13.19 -13.781 -14.33 -14.838 -15.393 -15.892 -16.318 -16.751 -17.198 -17.565 -17.946 -18.339 -18.633 -18.936 -19.265 -19.607 -19.945 -20.182 -20.423 -20.8 -21.069 -21.343 -21.489 -21.795 -22.113 -22.447 -22.618 -22.908 -23.153 -23.36 -23.58 -24.073 -24.33 -24.591 -24.883 -25.217 -25.66 -26.246 -27.576 -10 ,21781 ,KEBNE ,16677982,Wed Nov 24 23:03:24 CET,Thu Nov 25 01:04:29 CET,0.0 1.665 2.131 2.466 2.754 3.004 3.201 3.374 3.705 3.862 4.014 4.191 4.398 4.491 4.659 4.826 4.987 5.062 5.21 5.347 5.53 5.646 5.761 5.921 6.065 6.212 6.349 6.465 6.606 6.731 6.847 6.98 7.096 7.196 7.309 7.441 7.545 7.621 7.688 7.735 7.749 7.737 7.666 7.559 7.395 7.157 6.811 6.237 5.293 3.907 1.633 -1.159 -3.494 -5.456 -7.078 -8.486 -9.673 -10.728 -11.677 -12.619 -13.376 -14.047 -14.685 -15.271 -15.814 -16.33 -16.866 -17.335 -17.748 -18.164 -18.584 -18.94 -19.313 -19.704 -19.997 -20.288 -20.59 -20.917 -21.273 -21.507 -21.739 -22.112 -22.386 -22.66 -22.799 -23.101 -23.417 -23.749 -23.917 -24.214 -24.464 -24.663 -24.876 -25.341 -25.595 -25.877 -26.173 -26.498 -26.877 -27.378 -28.689 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt deleted file mode 100644 index 831539a4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3940 ,KEBNE ,16677983,Wed Nov 24 23:03:24 CET,Thu Nov 25 01:04:44 CET,0.0 1.443 2.175 2.665 2.992 3.269 3.532 3.78 4.171 4.344 4.517 4.711 4.986 5.123 5.386 5.635 5.897 6.023 6.254 6.479 6.794 7.0 7.207 7.496 7.772 8.033 8.294 8.56 8.89 9.189 9.48 9.864 10.227 10.553 10.927 11.361 11.776 12.229 12.735 13.268 13.83 14.469 15.226 16.002 16.896 17.825 18.812 19.891 21.08 22.444 23.981 24.901 25.187 25.232 25.116 24.931 24.668 24.271 23.85 23.419 23.048 22.722 22.384 22.042 21.742 21.452 21.123 20.815 20.525 20.21 19.878 19.6 19.323 19.019 18.781 18.536 18.279 18.004 17.7 17.488 17.268 16.931 16.679 16.408 16.262 15.976 15.701 15.385 15.209 14.917 14.642 14.43 14.201 13.687 13.395 13.063 12.681 12.26 11.791 11.13 8.393 -2 ,5332 ,KEBNE ,16677984,Wed Nov 24 23:03:24 CET,Thu Nov 25 01:05:39 CET,0.0 1.675 2.31 2.75 3.1 3.399 3.662 3.928 4.412 4.617 4.811 5.044 5.341 5.504 5.811 6.112 6.403 6.534 6.774 7.003 7.345 7.559 7.752 8.025 8.291 8.545 8.798 9.052 9.371 9.688 10.014 10.379 10.73 11.086 11.48 11.914 12.333 12.809 13.332 13.88 14.455 15.105 15.832 16.556 17.427 18.368 19.415 20.603 22.001 23.534 25.13 26.019 26.112 25.949 25.685 25.326 24.921 24.507 24.129 23.717 23.34 23.001 22.656 22.318 22.004 21.69 21.344 21.04 20.769 20.47 20.154 19.894 19.602 19.285 19.04 18.777 18.484 18.166 17.84 17.629 17.417 17.08 16.843 16.589 16.455 16.164 15.839 15.504 15.339 15.077 14.827 14.616 14.395 13.917 13.649 13.368 13.062 12.652 12.128 11.461 8.758 -3 ,14784 ,KEBNE ,16677985,Wed Nov 24 23:04:26 CET,Thu Nov 25 01:06:37 CET,0.0 1.821 2.474 2.835 3.145 3.418 3.657 3.893 4.366 4.566 4.759 4.999 5.278 5.417 5.698 5.963 6.212 6.332 6.571 6.804 7.14 7.35 7.541 7.816 8.1 8.379 8.623 8.858 9.195 9.514 9.822 10.182 10.519 10.864 11.25 11.67 12.075 12.516 13.013 13.54 14.061 14.641 15.315 16.001 16.83 17.747 18.795 19.989 21.287 22.664 24.127 24.977 25.224 25.271 25.161 24.926 24.68 24.401 24.08 23.72 23.409 23.148 22.848 22.509 22.202 21.913 21.579 21.282 21.045 20.78 20.493 20.244 19.974 19.69 19.453 19.2 18.94 18.673 18.391 18.207 18.023 17.713 17.474 17.225 17.098 16.811 16.511 16.191 16.009 15.712 15.411 15.199 14.974 14.455 14.157 13.831 13.501 13.075 12.551 11.885 8.569 -4 ,2807 ,KEBNE ,16677986,Wed Nov 24 23:04:26 CET,Thu Nov 25 01:08:01 CET,0.0 1.343 1.88 2.32 2.637 2.898 3.175 3.444 3.905 4.086 4.241 4.421 4.706 4.859 5.137 5.398 5.654 5.781 6.029 6.256 6.567 6.766 6.952 7.224 7.493 7.771 8.036 8.278 8.62 8.946 9.243 9.597 9.942 10.291 10.691 11.15 11.605 12.089 12.597 13.14 13.695 14.327 15.107 15.885 16.786 17.798 18.935 20.173 21.571 23.148 24.83 25.945 26.339 26.297 26.089 25.802 25.495 25.159 24.746 24.321 23.958 23.6 23.254 22.923 22.612 22.346 22.071 21.782 21.497 21.196 20.9 20.641 20.366 20.08 19.847 19.605 19.344 19.05 18.738 18.524 18.301 17.934 17.669 17.395 17.246 16.922 16.574 16.21 16.016 15.708 15.395 15.165 14.93 14.411 14.116 13.79 13.416 12.949 12.393 11.723 9.338 -5 ,2229 ,KEBNE ,16677987,Wed Nov 24 23:04:26 CET,Thu Nov 25 01:06:35 CET,0.0 2.361 3.029 3.392 3.737 4.027 4.253 4.463 4.851 5.034 5.201 5.385 5.685 5.849 6.141 6.395 6.645 6.769 7.007 7.239 7.569 7.779 7.985 8.298 8.594 8.857 9.115 9.365 9.674 9.983 10.288 10.646 10.979 11.291 11.669 12.098 12.525 12.993 13.499 14.06 14.643 15.298 16.048 16.784 17.675 18.667 19.796 21.066 22.514 24.122 25.774 26.811 27.159 27.221 27.149 26.966 26.723 26.434 26.119 25.768 25.461 25.148 24.819 24.536 24.272 23.985 23.666 23.354 23.062 22.753 22.429 22.182 21.925 21.638 21.419 21.164 20.884 20.617 20.322 20.107 19.895 19.563 19.32 19.06 18.932 18.666 18.383 18.063 17.876 17.578 17.274 17.06 16.852 16.367 16.071 15.743 15.368 14.939 14.421 13.704 11.378 -6 ,1469 ,KEBNE ,16677988,Wed Nov 24 23:04:29 CET,Thu Nov 25 01:02:36 CET,0.0 1.48 2.01 2.416 2.745 3.058 3.323 3.543 3.935 4.11 4.272 4.465 4.749 4.893 5.172 5.441 5.696 5.816 6.039 6.258 6.58 6.784 6.984 7.281 7.565 7.836 8.094 8.339 8.653 8.957 9.256 9.613 9.957 10.292 10.685 11.128 11.562 12.043 12.556 13.101 13.667 14.303 15.032 15.762 16.644 17.619 18.719 19.97 21.385 22.997 24.709 25.69 25.933 25.87 25.749 25.516 25.21 24.87 24.52 24.203 23.94 23.658 23.36 23.069 22.79 22.509 22.184 21.881 21.619 21.354 21.054 20.785 20.495 20.185 19.939 19.671 19.399 19.117 18.826 18.631 18.419 18.048 17.779 17.518 17.38 17.098 16.805 16.49 16.326 16.037 15.74 15.514 15.289 14.809 14.524 14.206 13.84 13.396 12.853 12.131 9.031 -7 ,22166 ,KEBNE ,16677989,Wed Nov 24 23:04:25 CET,Thu Nov 25 01:07:23 CET,0.0 2.187 2.901 3.37 3.751 4.048 4.325 4.583 5.064 5.302 5.508 5.728 6.038 6.203 6.507 6.794 7.058 7.191 7.465 7.711 8.03 8.23 8.423 8.712 8.984 9.241 9.51 9.77 10.087 10.404 10.717 11.085 11.432 11.766 12.151 12.607 13.041 13.504 14.023 14.568 15.094 15.658 16.348 17.075 17.909 18.826 19.875 21.015 22.299 23.705 25.286 26.395 26.698 26.667 26.505 26.266 25.985 25.694 25.426 25.139 24.852 24.518 24.185 23.909 23.642 23.386 23.132 22.87 22.6 22.304 21.998 21.738 21.478 21.223 21.012 20.783 20.54 20.275 19.978 19.768 19.548 19.191 18.922 18.638 18.493 18.174 17.84 17.498 17.314 17.017 16.733 16.53 16.308 15.754 15.43 15.102 14.694 14.204 13.64 12.843 9.41 -8 ,7820 ,KEBNE ,16677990,Wed Nov 24 23:04:26 CET,Thu Nov 25 01:07:29 CET,0.0 1.851 2.473 2.906 3.238 3.527 3.8 4.049 4.507 4.713 4.911 5.144 5.442 5.605 5.921 6.205 6.471 6.602 6.862 7.109 7.439 7.649 7.857 8.149 8.418 8.677 8.947 9.212 9.544 9.856 10.154 10.519 10.865 11.197 11.579 12.014 12.447 12.933 13.453 13.981 14.543 15.221 16.033 16.81 17.671 18.59 19.613 20.741 22.046 23.451 24.879 25.662 25.788 25.632 25.263 24.836 24.458 24.067 23.658 23.2 22.792 22.39 22.017 21.671 21.321 20.989 20.604 20.245 19.952 19.671 19.385 19.163 18.921 18.604 18.339 18.053 17.741 17.414 17.062 16.827 16.598 16.219 15.957 15.693 15.566 15.307 14.994 14.668 14.508 14.234 13.997 13.815 13.611 13.104 12.788 12.46 12.127 11.721 11.2 10.531 8.316 -9 ,14226 ,KEBNE ,16677991,Wed Nov 24 23:05:27 CET,Thu Nov 25 01:10:08 CET,0.0 1.566 2.22 2.654 2.999 3.289 3.544 3.787 4.227 4.437 4.642 4.862 5.161 5.314 5.604 5.892 6.17 6.3 6.546 6.789 7.135 7.367 7.6 7.908 8.195 8.478 8.751 9.009 9.347 9.689 10.007 10.393 10.766 11.119 11.537 11.998 12.434 12.912 13.426 13.977 14.57 15.243 16.026 16.784 17.636 18.551 19.587 20.738 22.006 23.471 25.143 26.282 26.652 26.667 26.573 26.346 26.03 25.692 25.35 24.992 24.667 24.376 24.073 23.775 23.532 23.322 23.07 22.813 22.578 22.323 22.055 21.843 21.609 21.354 21.155 20.925 20.682 20.433 20.169 19.987 19.803 19.504 19.27 19.025 18.905 18.648 18.371 18.069 17.913 17.659 17.412 17.216 17.007 16.548 16.283 15.982 15.634 15.243 14.786 14.195 11.757 -10 ,21256 ,KEBNE ,16677992,Wed Nov 24 23:05:27 CET,Thu Nov 25 01:08:41 CET,0.0 1.639 2.231 2.652 3.001 3.31 3.589 3.851 4.334 4.55 4.747 4.988 5.294 5.461 5.772 6.063 6.336 6.468 6.73 6.969 7.298 7.511 7.714 7.99 8.274 8.559 8.833 9.097 9.432 9.742 10.027 10.384 10.728 11.063 11.448 11.884 12.305 12.756 13.236 13.738 14.299 14.946 15.663 16.373 17.191 18.073 19.092 20.257 21.572 23.063 24.75 25.797 26.148 26.184 26.03 25.794 25.543 25.274 24.99 24.653 24.337 24.027 23.738 23.472 23.185 22.908 22.601 22.313 22.054 21.76 21.415 21.136 20.86 20.562 20.321 20.061 19.81 19.551 19.247 19.039 18.83 18.481 18.241 18.007 17.886 17.621 17.34 17.033 16.878 16.618 16.369 16.172 15.958 15.476 15.196 14.887 14.536 14.137 13.621 12.901 10.122 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt deleted file mode 100644 index a8fde674..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9323 ,KEBNE ,16677993,Wed Nov 24 23:05:31 CET,Thu Nov 25 01:06:14 CET,0.0 1.711 2.229 2.615 2.91 3.165 3.394 3.614 3.982 4.135 4.283 4.436 4.693 4.822 5.057 5.265 5.468 5.569 5.774 5.968 6.235 6.402 6.558 6.791 7.012 7.203 7.391 7.581 7.831 8.061 8.277 8.543 8.789 9.022 9.286 9.578 9.854 10.15 10.46 10.798 11.143 11.472 11.854 12.273 12.755 13.25 13.719 14.16 14.615 14.994 15.003 14.364 13.533 12.685 11.882 11.115 10.412 9.772 9.167 8.504 7.944 7.436 6.935 6.456 6.001 5.594 5.171 4.768 4.422 4.066 3.687 3.362 3.018 2.678 2.42 2.142 1.845 1.543 1.236 1.009 0.774 0.416 0.165 -0.085 -0.214 -0.484 -0.778 -1.097 -1.265 -1.561 -1.798 -1.985 -2.181 -2.649 -2.91 -3.187 -3.503 -3.868 -4.321 -4.948 -7.707 -2 ,23664 ,KEBNE ,16677994,Wed Nov 24 23:06:33 CET,Thu Nov 25 01:08:54 CET,0.0 1.598 2.105 2.473 2.772 3.028 3.25 3.471 3.877 4.047 4.21 4.378 4.634 4.758 5.004 5.235 5.442 5.537 5.715 5.887 6.142 6.309 6.478 6.714 6.947 7.17 7.38 7.589 7.848 8.096 8.339 8.63 8.893 9.132 9.423 9.76 10.072 10.402 10.744 11.124 11.54 11.984 12.527 13.072 13.661 14.329 15.022 15.648 16.282 16.81 16.917 16.58 16.032 15.193 14.281 13.426 12.64 11.935 11.338 10.727 10.198 9.738 9.298 8.868 8.456 8.074 7.675 7.3 6.956 6.594 6.231 5.936 5.632 5.316 5.058 4.785 4.51 4.236 3.93 3.701 3.456 3.058 2.791 2.519 2.373 2.072 1.756 1.413 1.244 0.938 0.647 0.41 0.143 -0.449 -0.77 -1.122 -1.53 -1.988 -2.52 -3.263 -6.789 -3 ,28000 ,KEBNE ,16677995,Wed Nov 24 23:06:29 CET,Thu Nov 25 01:11:51 CET,0.0 1.501 1.991 2.352 2.662 2.937 3.159 3.377 3.788 3.951 4.098 4.261 4.523 4.648 4.899 5.139 5.36 5.462 5.661 5.856 6.127 6.303 6.468 6.704 6.938 7.154 7.364 7.569 7.83 8.083 8.345 8.636 8.896 9.164 9.457 9.798 10.136 10.47 10.805 11.137 11.495 11.903 12.34 12.777 13.27 13.778 14.361 15.015 15.613 15.977 16.084 15.734 15.07 14.35 13.685 13.121 12.575 12.021 11.528 10.983 10.464 9.974 9.491 9.043 8.617 8.203 7.775 7.391 7.051 6.723 6.382 6.059 5.732 5.412 5.153 4.861 4.545 4.251 3.96 3.749 3.531 3.182 2.943 2.692 2.549 2.238 1.917 1.59 1.424 1.131 0.855 0.638 0.421 -0.07 -0.344 -0.641 -0.959 -1.299 -1.736 -2.349 -4.739 -4 ,30669 ,KEBNE ,16677996,Wed Nov 24 23:06:29 CET,Thu Nov 25 01:07:23 CET,0.0 1.807 2.367 2.774 3.084 3.341 3.593 3.821 4.185 4.347 4.502 4.667 4.944 5.083 5.347 5.596 5.824 5.929 6.128 6.315 6.601 6.796 6.981 7.224 7.444 7.646 7.853 8.05 8.286 8.512 8.749 9.032 9.28 9.511 9.769 10.056 10.331 10.632 10.963 11.31 11.671 12.096 12.583 13.027 13.478 13.923 14.397 14.861 15.292 15.6 15.436 14.723 13.921 13.038 12.163 11.34 10.552 9.82 9.244 8.676 8.146 7.67 7.234 6.806 6.367 5.952 5.541 5.187 4.878 4.543 4.185 3.885 3.563 3.197 2.913 2.64 2.357 2.054 1.732 1.504 1.256 0.876 0.613 0.31 0.152 -0.16 -0.483 -0.842 -1.028 -1.325 -1.606 -1.815 -2.035 -2.53 -2.815 -3.123 -3.488 -3.898 -4.358 -4.973 -7.187 -5 ,7677 ,KEBNE ,16677997,Wed Nov 24 23:06:29 CET,Thu Nov 25 01:11:11 CET,0.0 1.678 2.171 2.524 2.851 3.13 3.387 3.626 3.996 4.169 4.338 4.49 4.74 4.871 5.123 5.338 5.532 5.626 5.817 6.014 6.289 6.451 6.608 6.838 7.054 7.257 7.458 7.662 7.92 8.165 8.404 8.686 8.953 9.192 9.466 9.773 10.06 10.394 10.745 11.072 11.395 11.752 12.171 12.566 12.989 13.468 13.98 14.477 14.968 15.419 15.57 15.119 14.475 13.764 13.053 12.368 11.724 11.118 10.577 10.047 9.575 9.129 8.698 8.253 7.802 7.394 6.982 6.608 6.281 5.944 5.585 5.286 4.994 4.696 4.448 4.181 3.901 3.608 3.295 3.08 2.875 2.536 2.282 2.017 1.882 1.613 1.352 1.074 0.91 0.615 0.339 0.119 -0.091 -0.522 -0.785 -1.089 -1.412 -1.821 -2.372 -3.102 -5.122 -6 ,26274 ,KEBNE ,16677998,Wed Nov 24 23:06:33 CET,Thu Nov 25 01:06:18 CET,0.0 1.787 2.268 2.641 2.955 3.218 3.445 3.645 3.988 4.151 4.311 4.477 4.748 4.883 5.153 5.413 5.641 5.745 5.943 6.129 6.399 6.564 6.728 6.971 7.202 7.417 7.613 7.799 8.046 8.294 8.525 8.793 9.061 9.31 9.581 9.893 10.194 10.518 10.865 11.226 11.606 12.036 12.515 12.953 13.429 13.918 14.441 14.965 15.43 15.851 16.075 15.616 14.952 14.215 13.47 12.744 12.08 11.446 10.838 10.243 9.741 9.29 8.845 8.405 7.987 7.593 7.193 6.833 6.507 6.168 5.817 5.528 5.229 4.914 4.669 4.425 4.176 3.906 3.611 3.408 3.197 2.855 2.611 2.348 2.208 1.908 1.592 1.287 1.122 0.823 0.558 0.356 0.151 -0.327 -0.605 -0.913 -1.262 -1.677 -2.188 -2.848 -5.438 -7 ,3895 ,KEBNE ,16677999,Wed Nov 24 23:08:31 CET,Thu Nov 25 01:11:21 CET,0.0 1.899 2.458 2.875 3.228 3.51 3.754 3.99 4.431 4.633 4.819 5.023 5.309 5.455 5.723 5.958 6.177 6.283 6.478 6.671 6.946 7.112 7.276 7.521 7.753 7.966 8.166 8.377 8.648 8.898 9.153 9.447 9.724 9.983 10.264 10.575 10.871 11.199 11.542 11.896 12.274 12.685 13.137 13.571 14.069 14.606 15.149 15.705 16.348 17.044 17.47 17.224 16.688 16.095 15.464 14.789 14.158 13.583 13.06 12.495 11.997 11.537 11.085 10.656 10.271 9.907 9.498 9.149 8.833 8.479 8.109 7.8 7.468 7.114 6.848 6.578 6.3 6.013 5.711 5.498 5.27 4.91 4.662 4.39 4.247 3.963 3.653 3.308 3.121 2.797 2.471 2.234 1.995 1.445 1.128 0.777 0.382 -0.09 -0.668 -1.507 -5.562 -8 ,28744 ,KEBNE ,16678000,Wed Nov 24 23:08:32 CET,Thu Nov 25 01:10:19 CET,0.0 1.663 2.151 2.502 2.794 3.05 3.271 3.467 3.833 4.002 4.153 4.313 4.57 4.709 4.999 5.243 5.456 5.565 5.783 5.986 6.269 6.442 6.617 6.876 7.121 7.35 7.561 7.761 8.018 8.265 8.491 8.756 9.028 9.29 9.564 9.876 10.19 10.54 10.898 11.26 11.642 12.042 12.502 12.95 13.446 13.936 14.398 14.885 15.319 15.646 15.825 15.446 14.833 14.118 13.323 12.561 11.861 11.178 10.559 9.927 9.365 8.865 8.401 7.961 7.559 7.189 6.79 6.431 6.119 5.811 5.492 5.214 4.913 4.59 4.324 4.034 3.737 3.42 3.085 2.867 2.633 2.269 2.014 1.736 1.598 1.31 1.006 0.681 0.509 0.211 -0.027 -0.217 -0.437 -0.943 -1.224 -1.529 -1.841 -2.185 -2.614 -3.19 -5.424 -9 ,14345 ,KEBNE ,16678001,Wed Nov 24 23:08:31 CET,Thu Nov 25 01:09:53 CET,0.0 2.332 2.936 3.356 3.709 4.032 4.308 4.554 4.993 5.185 5.365 5.587 5.874 6.019 6.274 6.51 6.745 6.859 7.071 7.261 7.549 7.745 7.928 8.19 8.439 8.677 8.897 9.101 9.358 9.605 9.84 10.101 10.346 10.585 10.873 11.214 11.535 11.868 12.231 12.619 13.013 13.451 13.943 14.417 14.961 15.543 16.194 16.866 17.53 18.164 18.543 18.263 17.54 16.785 16.152 15.517 14.812 14.104 13.496 12.904 12.406 11.95 11.471 11.018 10.61 10.213 9.784 9.394 9.045 8.678 8.302 7.987 7.662 7.318 7.036 6.75 6.456 6.143 5.806 5.561 5.318 4.971 4.733 4.463 4.325 4.045 3.735 3.391 3.216 2.913 2.659 2.461 2.221 1.672 1.4 1.116 0.768 0.374 -0.08 -0.666 -2.848 -10 ,29579 ,KEBNE ,16678002,Wed Nov 24 23:08:31 CET,Thu Nov 25 01:11:05 CET,0.0 1.906 2.39 2.749 3.055 3.33 3.575 3.796 4.192 4.365 4.534 4.721 5.005 5.144 5.401 5.64 5.864 5.969 6.16 6.351 6.649 6.849 7.027 7.27 7.506 7.713 7.904 8.099 8.355 8.601 8.831 9.106 9.381 9.642 9.935 10.229 10.511 10.842 11.195 11.59 11.998 12.42 12.89 13.321 13.777 14.259 14.762 15.269 15.773 16.148 16.2 15.639 14.886 14.131 13.379 12.637 11.918 11.216 10.582 9.903 9.309 8.764 8.241 7.771 7.34 6.938 6.518 6.139 5.806 5.471 5.124 4.817 4.471 4.106 3.829 3.554 3.258 2.936 2.599 2.363 2.122 1.75 1.492 1.217 1.074 0.768 0.44 0.093 -0.091 -0.406 -0.699 -0.906 -1.13 -1.635 -1.923 -2.238 -2.586 -3.005 -3.512 -4.16 -6.56 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt deleted file mode 100644 index e91fff30..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18290 ,KEBNE ,17023971,Wed Dec 22 08:50:05 CET,Wed Dec 22 10:50:36 CET,0.0 1.838 2.29 2.603 2.893 3.161 3.44 3.709 4.121 4.29 4.448 4.696 4.947 5.106 5.399 5.649 5.883 6.0 6.208 6.389 6.672 6.859 7.039 7.289 7.504 7.701 7.889 8.086 8.336 8.568 8.79 9.056 9.284 9.482 9.739 10.033 10.28 10.542 10.82 11.082 11.344 11.613 11.881 12.142 12.432 12.744 13.064 13.248 13.068 12.244 10.501 7.873 5.37 3.203 1.434 -0.062 -1.34 -2.533 -3.609 -4.685 -5.622 -6.43 -7.172 -7.877 -8.541 -9.151 -9.77 -10.318 -10.795 -11.266 -11.742 -12.151 -12.575 -13.008 -13.362 -13.731 -14.092 -14.451 -14.825 -15.104 -15.412 -15.868 -16.171 -16.505 -16.673 -17.004 -17.368 -17.758 -17.953 -18.279 -18.6 -18.834 -19.089 -19.617 -19.903 -20.223 -20.596 -21.017 -21.45 -22.068 -24.33 -2 ,13148 ,KEBNE ,17023972,Wed Dec 22 08:50:05 CET,Wed Dec 22 10:50:10 CET,0.0 2.788 3.305 3.654 3.957 4.222 4.449 4.648 5.016 5.179 5.321 5.491 5.708 5.841 6.1 6.326 6.518 6.609 6.784 6.943 7.171 7.332 7.495 7.727 7.963 8.198 8.405 8.588 8.799 8.99 9.168 9.385 9.609 9.836 10.09 10.359 10.654 11.01 11.331 11.618 11.908 12.225 12.581 12.92 13.272 13.557 13.804 13.921 13.727 13.148 11.784 9.436 7.312 5.317 3.562 2.022 0.604 -0.722 -1.882 -3.027 -3.991 -4.811 -5.578 -6.307 -6.985 -7.593 -8.226 -8.79 -9.263 -9.746 -10.271 -10.707 -11.141 -11.581 -11.91 -12.275 -12.668 -13.071 -13.486 -13.758 -14.041 -14.526 -14.865 -15.214 -15.394 -15.756 -16.143 -16.543 -16.753 -17.076 -17.386 -17.623 -17.888 -18.502 -18.854 -19.267 -19.725 -20.22 -20.792 -21.596 -24.484 -3 ,31280 ,KEBNE ,17023974,Wed Dec 22 08:50:05 CET,Wed Dec 22 10:49:26 CET,0.0 2.134 2.6 2.917 3.213 3.49 3.727 3.945 4.321 4.488 4.647 4.862 5.082 5.201 5.428 5.635 5.831 5.933 6.137 6.327 6.59 6.765 6.942 7.185 7.419 7.641 7.849 8.048 8.303 8.562 8.813 9.102 9.37 9.617 9.898 10.208 10.498 10.791 11.088 11.375 11.635 11.921 12.261 12.592 12.936 13.223 13.372 13.391 13.175 12.431 10.489 7.565 5.216 3.325 1.595 0.028 -1.327 -2.521 -3.53 -4.545 -5.459 -6.293 -7.082 -7.823 -8.508 -9.145 -9.779 -10.324 -10.798 -11.29 -11.807 -12.236 -12.679 -13.14 -13.495 -13.862 -14.252 -14.657 -15.079 -15.372 -15.674 -16.17 -16.516 -16.867 -17.041 -17.437 -17.885 -18.321 -18.548 -18.899 -19.259 -19.512 -19.789 -20.403 -20.74 -21.123 -21.562 -22.068 -22.675 -23.521 -26.182 -4 ,16127 ,KEBNE ,17023975,Wed Dec 22 08:51:06 CET,Wed Dec 22 10:50:16 CET,0.0 2.119 2.695 3.106 3.4 3.654 3.889 4.097 4.45 4.611 4.771 4.971 5.184 5.305 5.54 5.767 5.999 6.121 6.344 6.535 6.795 6.958 7.118 7.382 7.661 7.916 8.155 8.379 8.63 8.852 9.054 9.304 9.596 9.874 10.199 10.571 10.883 11.206 11.552 11.904 12.22 12.558 12.957 13.273 13.561 13.855 14.092 14.181 14.047 13.219 11.068 8.262 5.829 3.722 2.001 0.475 -0.926 -2.236 -3.338 -4.423 -5.334 -6.097 -6.808 -7.48 -8.114 -8.681 -9.27 -9.796 -10.252 -10.733 -11.246 -11.676 -12.094 -12.51 -12.834 -13.179 -13.554 -13.946 -14.367 -14.655 -14.918 -15.315 -15.592 -15.893 -16.058 -16.392 -16.723 -17.059 -17.245 -17.546 -17.857 -18.086 -18.309 -18.837 -19.169 -19.543 -19.957 -20.419 -20.985 -21.819 -24.514 -5 ,25110 ,KEBNE ,17023976,Wed Dec 22 08:51:07 CET,Wed Dec 22 10:50:20 CET,0.0 1.949 2.407 2.745 3.044 3.305 3.528 3.728 4.103 4.274 4.421 4.584 4.793 4.917 5.175 5.415 5.632 5.743 5.952 6.152 6.437 6.619 6.802 7.078 7.345 7.587 7.83 8.07 8.341 8.586 8.822 9.106 9.383 9.659 9.979 10.33 10.635 10.93 11.182 11.417 11.689 11.985 12.276 12.53 12.787 13.036 13.303 13.42 13.21 12.497 10.66 7.844 5.328 3.197 1.318 -0.335 -1.769 -3.078 -4.192 -5.271 -6.186 -7.019 -7.806 -8.562 -9.253 -9.862 -10.509 -11.1 -11.61 -12.126 -12.665 -13.105 -13.554 -14.032 -14.399 -14.765 -15.149 -15.57 -16.006 -16.288 -16.571 -17.037 -17.378 -17.715 -17.891 -18.257 -18.62 -19.007 -19.205 -19.532 -19.906 -20.164 -20.435 -21.021 -21.343 -21.695 -22.104 -22.562 -23.09 -23.807 -26.988 -6 ,20929 ,KEBNE ,17023977,Wed Dec 22 08:52:08 CET,Wed Dec 22 10:51:07 CET,0.0 1.876 2.396 2.746 3.037 3.309 3.557 3.773 4.129 4.297 4.445 4.629 4.849 4.978 5.23 5.468 5.69 5.794 6.005 6.211 6.479 6.648 6.81 7.042 7.262 7.466 7.678 7.903 8.19 8.477 8.742 9.027 9.3 9.541 9.81 10.091 10.333 10.612 10.863 11.086 11.319 11.55 11.874 12.18 12.446 12.703 12.735 12.524 12.034 11.03 8.833 5.829 3.413 1.296 -0.56 -2.158 -3.57 -4.829 -5.944 -7.073 -7.986 -8.759 -9.503 -10.233 -10.915 -11.547 -12.23 -12.825 -13.358 -13.945 -14.548 -15.031 -15.541 -16.091 -16.503 -16.916 -17.338 -17.778 -18.248 -18.573 -18.892 -19.395 -19.771 -20.155 -20.355 -20.76 -21.167 -21.614 -21.849 -22.207 -22.615 -22.892 -23.176 -23.819 -24.185 -24.608 -25.099 -25.6 -26.217 -27.177 -31.392 -7 ,8401 ,KEBNE ,17023978,Wed Dec 22 08:53:10 CET,Wed Dec 22 10:51:56 CET,0.0 1.699 2.154 2.523 2.813 3.066 3.29 3.493 3.876 4.04 4.196 4.397 4.615 4.742 4.991 5.216 5.401 5.479 5.642 5.82 6.078 6.236 6.38 6.587 6.782 6.967 7.145 7.313 7.548 7.785 8.001 8.241 8.489 8.722 8.969 9.247 9.471 9.672 9.928 10.238 10.538 10.866 11.195 11.456 11.683 11.865 12.057 12.207 12.042 11.165 8.998 6.102 3.691 1.5 -0.46 -2.102 -3.484 -4.771 -5.865 -6.887 -7.78 -8.59 -9.325 -10.001 -10.619 -11.22 -11.877 -12.446 -12.943 -13.433 -13.91 -14.307 -14.765 -15.278 -15.658 -16.026 -16.401 -16.803 -17.222 -17.509 -17.797 -18.236 -18.539 -18.852 -19.02 -19.375 -19.736 -20.116 -20.319 -20.629 -20.934 -21.158 -21.389 -21.899 -22.195 -22.534 -22.917 -23.341 -23.869 -24.608 -27.342 -8 ,24149 ,KEBNE ,17023979,Wed Dec 22 08:53:14 CET,Wed Dec 22 10:49:19 CET,0.0 2.32 2.807 3.152 3.435 3.671 3.877 4.059 4.41 4.585 4.738 4.937 5.186 5.342 5.615 5.868 6.102 6.211 6.426 6.635 6.909 7.076 7.252 7.502 7.725 7.936 8.146 8.366 8.636 8.889 9.143 9.421 9.674 9.927 10.217 10.519 10.798 11.099 11.439 11.778 12.094 12.478 12.973 13.406 13.698 13.855 13.979 13.946 13.581 12.899 11.445 8.943 6.541 4.379 2.506 0.848 -0.553 -1.798 -2.93 -4.093 -5.077 -5.951 -6.787 -7.596 -8.37 -9.063 -9.741 -10.293 -10.782 -11.332 -11.918 -12.408 -12.943 -13.481 -13.868 -14.271 -14.688 -15.108 -15.531 -15.847 -16.214 -16.792 -17.171 -17.556 -17.745 -18.144 -18.561 -18.98 -19.204 -19.565 -19.986 -20.275 -20.581 -21.246 -21.592 -21.974 -22.385 -22.836 -23.39 -24.188 -27.248 -9 ,28118 ,KEBNE ,17023980,Wed Dec 22 08:54:12 CET,Wed Dec 22 10:54:41 CET,0.0 1.922 2.393 2.731 2.986 3.239 3.466 3.648 4.009 4.165 4.284 4.446 4.655 4.758 4.945 5.142 5.336 5.419 5.573 5.72 5.947 6.102 6.26 6.51 6.753 6.968 7.17 7.364 7.62 7.877 8.124 8.379 8.588 8.8 9.043 9.306 9.57 9.845 10.093 10.336 10.597 10.85 11.07 11.259 11.437 11.548 11.638 11.595 11.205 10.392 8.535 5.832 3.444 1.383 -0.38 -1.896 -3.23 -4.479 -5.531 -6.556 -7.437 -8.247 -9.026 -9.752 -10.401 -10.967 -11.569 -12.113 -12.578 -13.1 -13.658 -14.09 -14.506 -14.957 -15.354 -15.738 -16.091 -16.471 -16.868 -17.144 -17.443 -17.92 -18.249 -18.592 -18.77 -19.133 -19.524 -19.934 -20.152 -20.495 -20.837 -21.066 -21.318 -21.906 -22.221 -22.566 -22.954 -23.422 -23.966 -24.615 -27.767 -10 ,32097 ,KEBNE ,17023981,Wed Dec 22 08:54:12 CET,Wed Dec 22 10:54:48 CET,0.0 1.711 2.159 2.474 2.733 2.953 3.181 3.393 3.753 3.919 4.078 4.284 4.51 4.641 4.884 5.107 5.311 5.409 5.601 5.778 6.024 6.177 6.33 6.561 6.771 6.968 7.189 7.4 7.628 7.854 8.096 8.378 8.62 8.862 9.15 9.479 9.794 10.092 10.382 10.707 11.054 11.433 11.807 12.067 12.271 12.423 12.554 12.666 12.616 11.848 9.781 6.915 4.336 2.043 0.075 -1.635 -3.083 -4.311 -5.412 -6.522 -7.447 -8.279 -9.054 -9.817 -10.546 -11.174 -11.788 -12.31 -12.737 -13.178 -13.665 -14.076 -14.498 -14.933 -15.288 -15.672 -16.061 -16.447 -16.843 -17.124 -17.41 -17.841 -18.15 -18.468 -18.629 -18.973 -19.339 -19.715 -19.906 -20.226 -20.578 -20.837 -21.101 -21.644 -21.934 -22.254 -22.622 -23.043 -23.546 -24.307 -27.077 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt deleted file mode 100644 index 8a9e4355..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24762 ,KEBNE ,16678003,Wed Nov 24 23:08:32 CET,Thu Nov 25 01:10:18 CET,0.0 0.75 1.11 1.395 1.686 1.945 2.154 2.344 2.708 2.872 3.031 3.223 3.502 3.643 3.924 4.185 4.411 4.527 4.766 4.998 5.337 5.54 5.724 6.011 6.296 6.564 6.827 7.084 7.406 7.714 8.019 8.389 8.748 9.088 9.476 9.917 10.344 10.816 11.307 11.816 12.36 12.977 13.685 14.392 15.211 16.11 17.129 18.259 19.529 21.007 22.843 24.181 24.81 25.127 25.272 25.24 25.135 25.039 24.906 24.66 24.416 24.212 24.006 23.81 23.639 23.483 23.29 23.116 22.959 22.783 22.596 22.441 22.274 22.081 21.931 21.779 21.609 21.425 21.226 21.064 20.896 20.642 20.46 20.262 20.153 19.92 19.668 19.393 19.243 18.991 18.733 18.551 18.344 17.873 17.618 17.353 17.072 16.759 16.354 15.783 13.927 -2 ,13944 ,KEBNE ,16678004,Wed Nov 24 23:09:34 CET,Thu Nov 25 01:11:13 CET,0.0 0.985 1.36 1.627 1.842 2.05 2.256 2.446 2.787 2.96 3.128 3.304 3.572 3.703 3.964 4.216 4.46 4.583 4.805 5.014 5.335 5.546 5.744 6.018 6.288 6.548 6.802 7.062 7.41 7.744 8.07 8.454 8.81 9.152 9.536 9.962 10.38 10.842 11.346 11.893 12.465 13.083 13.797 14.524 15.357 16.243 17.229 18.358 19.64 21.056 22.776 24.063 24.627 24.862 24.917 24.829 24.687 24.499 24.28 24.05 23.838 23.646 23.434 23.19 22.97 22.77 22.547 22.333 22.13 21.915 21.689 21.486 21.265 21.015 20.822 20.632 20.447 20.263 20.053 19.885 19.708 19.435 19.237 19.032 18.92 18.679 18.425 18.168 18.044 17.796 17.508 17.289 17.06 16.536 16.265 15.955 15.59 15.172 14.676 14.107 11.938 -3 ,7144 ,KEBNE ,16675711,Wed Nov 24 07:00:01 CET,Wed Nov 24 09:03:15 CET,0.0 0.652 0.997 1.276 1.529 1.758 1.966 2.177 2.618 2.807 2.964 3.157 3.42 3.56 3.844 4.102 4.339 4.465 4.715 4.947 5.262 5.46 5.652 5.909 6.156 6.412 6.666 6.919 7.248 7.572 7.88 8.234 8.581 8.913 9.284 9.701 10.093 10.525 11.004 11.529 12.081 12.68 13.367 14.069 14.886 15.815 16.871 18.04 19.421 21.0 22.768 24.039 24.67 24.955 25.039 25.008 24.91 24.788 24.646 24.462 24.278 24.101 23.915 23.711 23.512 23.322 23.113 22.921 22.746 22.558 22.356 22.191 22.015 21.828 21.682 21.517 21.332 21.136 20.941 20.797 20.643 20.402 20.231 20.054 19.954 19.749 19.534 19.266 19.104 18.844 18.644 18.464 18.269 17.823 17.557 17.244 16.853 16.423 15.897 15.192 12.365 -4 ,30614 ,KEBNE ,16675712,Wed Nov 24 07:00:00 CET,Wed Nov 24 09:01:13 CET,0.0 0.884 1.234 1.494 1.726 1.953 2.172 2.38 2.77 2.948 3.117 3.288 3.549 3.685 3.969 4.238 4.483 4.604 4.84 5.065 5.374 5.569 5.76 6.044 6.314 6.565 6.811 7.067 7.396 7.705 8.006 8.373 8.723 9.063 9.445 9.861 10.257 10.699 11.192 11.721 12.284 12.914 13.641 14.366 15.203 16.134 17.189 18.351 19.747 21.462 23.442 24.955 25.671 25.886 25.95 25.952 25.853 25.705 25.518 25.283 25.045 24.802 24.557 24.312 24.091 23.883 23.642 23.419 23.231 23.034 22.812 22.602 22.384 22.177 22.032 21.89 21.74 21.563 21.366 21.237 21.097 20.869 20.709 20.511 20.37 20.062 19.772 19.44 19.26 18.995 18.759 18.572 18.351 17.81 17.493 17.149 16.755 16.304 15.804 15.1 12.341 -5 ,100 ,KEBNE ,16675713,Wed Nov 24 07:00:01 CET,Wed Nov 24 09:02:25 CET,0.0 0.724 1.059 1.361 1.625 1.858 2.068 2.259 2.619 2.789 2.946 3.136 3.405 3.536 3.799 4.077 4.331 4.449 4.678 4.901 5.226 5.432 5.634 5.942 6.239 6.517 6.783 7.044 7.367 7.675 7.986 8.351 8.701 9.038 9.427 9.867 10.275 10.711 11.192 11.721 12.28 12.915 13.656 14.389 15.235 16.207 17.353 18.627 20.047 21.575 23.31 24.672 25.319 25.656 25.813 25.86 25.854 25.741 25.561 25.384 25.191 24.986 24.773 24.563 24.372 24.186 23.975 23.779 23.617 23.432 23.217 23.04 22.842 22.619 22.46 22.287 22.109 21.932 21.75 21.629 21.5 21.294 21.125 20.954 20.873 20.694 20.496 20.283 20.17 19.936 19.773 19.628 19.476 19.167 19.01 18.822 18.609 18.371 18.06 17.573 16.316 -6 ,26369 ,KEBNE ,16675714,Wed Nov 24 07:00:01 CET,Wed Nov 24 09:01:13 CET,0.0 0.823 1.161 1.465 1.755 2.008 2.236 2.449 2.862 3.053 3.237 3.482 3.761 3.917 4.233 4.535 4.811 4.942 5.202 5.436 5.759 5.979 6.197 6.507 6.804 7.091 7.362 7.608 7.928 8.238 8.53 8.883 9.227 9.563 9.949 10.389 10.813 11.277 11.777 12.298 12.849 13.474 14.207 14.92 15.742 16.654 17.663 18.777 20.064 21.531 23.225 24.457 25.1 25.415 25.453 25.34 25.21 25.066 24.882 24.649 24.418 24.207 23.986 23.742 23.508 23.291 23.055 22.847 22.653 22.435 22.199 21.997 21.803 21.599 21.43 21.25 21.061 20.858 20.631 20.481 20.329 20.08 19.914 19.757 19.678 19.511 19.324 19.112 18.995 18.758 18.592 18.434 18.264 17.907 17.723 17.496 17.23 16.951 16.551 15.945 14.65 -7 ,18314 ,KEBNE ,16678009,Wed Nov 24 23:09:33 CET,Thu Nov 25 01:12:15 CET,0.0 0.72 1.115 1.465 1.784 2.048 2.281 2.507 2.943 3.142 3.334 3.56 3.84 3.991 4.296 4.584 4.861 4.993 5.234 5.458 5.791 6.016 6.229 6.524 6.802 7.069 7.336 7.597 7.925 8.248 8.584 8.989 9.362 9.717 10.115 10.557 10.978 11.45 11.975 12.528 13.099 13.747 14.516 15.297 16.185 17.128 18.21 19.388 20.766 22.414 24.349 25.82 26.556 26.898 26.893 26.762 26.615 26.449 26.288 26.086 25.835 25.579 25.331 25.085 24.86 24.654 24.441 24.24 24.065 23.883 23.671 23.492 23.304 23.102 22.936 22.74 22.525 22.297 22.056 21.891 21.724 21.479 21.305 21.112 21.017 20.832 20.628 20.394 20.264 20.024 19.857 19.712 19.548 19.195 19.004 18.769 18.491 18.194 17.867 17.456 16.562 -8 ,5477 ,KEBNE ,16678010,Wed Nov 24 23:09:34 CET,Thu Nov 25 01:12:03 CET,0.0 0.676 0.979 1.291 1.604 1.877 2.115 2.322 2.677 2.837 3.001 3.216 3.483 3.635 3.918 4.177 4.423 4.545 4.781 5.006 5.319 5.531 5.742 6.044 6.334 6.597 6.851 7.095 7.41 7.711 7.998 8.348 8.683 9.021 9.428 9.88 10.305 10.773 11.277 11.824 12.41 13.069 13.823 14.575 15.473 16.461 17.556 18.798 20.229 21.814 23.683 25.214 26.006 26.407 26.539 26.435 26.25 26.05 25.86 25.675 25.479 25.261 25.044 24.807 24.551 24.326 24.106 23.911 23.735 23.534 23.315 23.13 22.942 22.745 22.58 22.412 22.244 22.06 21.852 21.715 21.583 21.357 21.195 21.019 20.925 20.735 20.528 20.3 20.178 19.952 19.809 19.655 19.494 19.169 18.965 18.706 18.43 18.122 17.734 17.185 15.242 -9 ,5208 ,KEBNE ,16678011,Wed Nov 24 23:09:34 CET,Thu Nov 25 01:11:52 CET,0.0 0.949 1.356 1.691 1.984 2.237 2.454 2.644 2.986 3.145 3.303 3.51 3.796 3.945 4.223 4.501 4.78 4.909 5.136 5.348 5.67 5.874 6.059 6.332 6.607 6.871 7.128 7.385 7.722 8.033 8.329 8.699 9.061 9.402 9.786 10.216 10.624 11.07 11.555 12.067 12.612 13.218 13.899 14.613 15.479 16.413 17.473 18.688 20.044 21.613 23.502 24.946 25.727 26.117 26.188 26.16 26.113 26.029 25.897 25.68 25.472 25.302 25.137 24.985 24.828 24.66 24.471 24.288 24.126 23.934 23.711 23.528 23.347 23.163 23.01 22.854 22.698 22.542 22.371 22.245 22.116 21.903 21.749 21.586 21.503 21.326 21.147 20.967 20.868 20.66 20.527 20.391 20.242 19.923 19.725 19.504 19.284 19.034 18.68 18.197 16.516 -10 ,4826 ,KEBNE ,16678012,Wed Nov 24 23:09:38 CET,Thu Nov 25 01:08:13 CET,0.0 0.939 1.306 1.608 1.868 2.086 2.274 2.459 2.814 2.981 3.135 3.312 3.593 3.746 4.041 4.326 4.596 4.718 4.958 5.188 5.496 5.683 5.869 6.154 6.426 6.683 6.93 7.163 7.455 7.751 8.052 8.42 8.771 9.114 9.518 9.967 10.394 10.875 11.406 11.96 12.539 13.18 13.91 14.663 15.524 16.436 17.488 18.679 20.063 21.684 23.636 25.125 25.875 26.278 26.464 26.501 26.428 26.306 26.153 25.957 25.79 25.595 25.366 25.099 24.778 24.505 24.266 24.018 23.775 23.533 23.307 23.119 22.909 22.651 22.431 22.22 22.016 21.768 21.476 21.276 21.074 20.761 20.531 20.286 20.16 19.903 19.627 19.334 19.181 18.922 18.687 18.514 18.327 17.842 17.559 17.236 16.87 16.459 15.991 15.435 14.305 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index f07f6b0d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15901 ,KEBNE ,16678013,Wed Nov 24 23:09:36 CET,Thu Nov 25 01:09:10 CET,0.0 2.053 2.689 3.178 3.557 3.867 4.146 4.404 4.839 5.021 5.193 5.401 5.689 5.833 6.109 6.387 6.661 6.79 7.032 7.259 7.565 7.761 7.947 8.211 8.473 8.724 8.956 9.179 9.465 9.738 10.01 10.349 10.668 10.957 11.289 11.662 12.01 12.392 12.798 13.218 13.664 14.151 14.691 15.217 15.843 16.548 17.31 18.134 19.124 20.326 21.564 22.378 22.702 22.637 22.463 22.314 22.095 21.861 21.636 21.385 21.139 20.878 20.632 20.4 20.153 19.923 19.684 19.444 19.226 19.021 18.824 18.657 18.485 18.302 18.147 17.962 17.77 17.588 17.386 17.233 17.056 16.788 16.601 16.399 16.3 16.096 15.883 15.645 15.521 15.28 15.112 14.968 14.794 14.403 14.2 13.961 13.668 13.335 12.905 12.205 9.721 -2 ,16566 ,KEBNE ,16678014,Wed Nov 24 23:10:35 CET,Thu Nov 25 01:13:14 CET,0.0 2.329 2.995 3.455 3.814 4.129 4.395 4.639 5.069 5.265 5.454 5.69 5.965 6.112 6.384 6.634 6.887 7.014 7.257 7.493 7.837 8.053 8.254 8.54 8.817 9.077 9.317 9.542 9.837 10.122 10.41 10.772 11.108 11.425 11.785 12.185 12.557 12.963 13.387 13.829 14.327 14.9 15.556 16.196 16.914 17.702 18.621 19.625 20.717 21.939 23.222 24.04 24.374 24.404 24.259 24.021 23.775 23.526 23.284 22.988 22.694 22.444 22.214 21.975 21.729 21.506 21.291 21.089 20.903 20.709 20.5 20.317 20.113 19.902 19.733 19.549 19.363 19.174 18.975 18.827 18.668 18.405 18.218 18.028 17.929 17.714 17.484 17.244 17.116 16.889 16.666 16.474 16.28 15.863 15.605 15.292 14.946 14.551 14.113 13.585 11.403 -3 ,21965 ,KEBNE ,16678015,Wed Nov 24 23:10:36 CET,Thu Nov 25 01:13:07 CET,0.0 1.951 2.541 2.978 3.313 3.598 3.858 4.089 4.497 4.688 4.867 5.073 5.353 5.503 5.772 6.042 6.306 6.43 6.668 6.901 7.224 7.428 7.634 7.925 8.206 8.469 8.706 8.93 9.227 9.516 9.788 10.124 10.45 10.761 11.117 11.531 11.928 12.347 12.798 13.277 13.778 14.318 14.935 15.551 16.267 17.034 17.898 18.862 19.957 21.183 22.546 23.417 23.629 23.606 23.465 23.258 23.011 22.758 22.531 22.258 22.003 21.733 21.451 21.2 20.944 20.704 20.459 20.221 20.005 19.79 19.554 19.339 19.104 18.872 18.696 18.503 18.298 18.078 17.836 17.667 17.494 17.226 17.041 16.834 16.72 16.485 16.243 15.981 15.836 15.574 15.355 15.177 14.983 14.581 14.367 14.13 13.86 13.535 13.144 12.561 10.585 -4 ,1770 ,KEBNE ,16678016,Wed Nov 24 23:10:39 CET,Thu Nov 25 01:10:14 CET,0.0 2.292 2.851 3.264 3.629 3.927 4.185 4.407 4.817 5.016 5.193 5.41 5.682 5.825 6.105 6.368 6.612 6.724 6.949 7.17 7.484 7.68 7.869 8.139 8.385 8.626 8.861 9.08 9.378 9.679 9.962 10.305 10.635 10.935 11.279 11.656 12.001 12.396 12.8 13.225 13.682 14.186 14.796 15.433 16.168 16.951 17.796 18.673 19.667 20.775 21.947 22.688 22.93 22.923 22.746 22.502 22.273 22.003 21.716 21.42 21.124 20.859 20.6 20.325 20.066 19.824 19.562 19.328 19.124 18.897 18.64 18.424 18.208 17.982 17.804 17.622 17.427 17.219 17.005 16.844 16.676 16.429 16.255 16.074 15.987 15.803 15.598 15.368 15.211 14.953 14.791 14.65 14.507 14.196 14.012 13.799 13.563 13.285 12.968 12.505 10.543 -5 ,447 ,KEBNE ,16678017,Wed Nov 24 23:10:40 CET,Thu Nov 25 01:12:16 CET,0.0 2.067 2.646 3.047 3.401 3.7 3.964 4.206 4.631 4.826 5.007 5.23 5.504 5.655 5.937 6.207 6.47 6.596 6.829 7.032 7.318 7.513 7.71 7.99 8.266 8.537 8.781 9.012 9.329 9.64 9.923 10.265 10.588 10.876 11.216 11.617 12.002 12.423 12.879 13.368 13.878 14.414 15.026 15.627 16.317 17.099 17.962 18.883 19.949 21.147 22.404 23.235 23.554 23.587 23.404 23.116 22.801 22.483 22.175 21.835 21.535 21.233 20.93 20.655 20.395 20.152 19.904 19.683 19.489 19.289 19.069 18.881 18.68 18.459 18.29 18.111 17.92 17.715 17.496 17.346 17.199 16.971 16.779 16.559 16.453 16.219 15.957 15.686 15.55 15.305 15.097 14.934 14.77 14.408 14.198 13.953 13.669 13.37 13.029 12.492 10.774 -6 ,28507 ,KEBNE ,16678018,Wed Nov 24 23:11:37 CET,Thu Nov 25 01:11:37 CET,0.0 1.633 2.19 2.61 2.943 3.239 3.498 3.725 4.16 4.362 4.55 4.771 5.041 5.19 5.456 5.697 5.927 6.041 6.27 6.486 6.787 6.981 7.164 7.423 7.682 7.932 8.17 8.395 8.674 8.967 9.263 9.606 9.917 10.219 10.584 10.981 11.368 11.794 12.238 12.699 13.184 13.724 14.302 14.855 15.473 16.144 16.956 17.846 18.874 20.059 21.189 21.835 21.981 21.881 21.707 21.454 21.177 20.853 20.529 20.252 20.014 19.774 19.522 19.273 19.046 18.827 18.582 18.352 18.156 17.958 17.733 17.532 17.294 17.037 16.849 16.649 16.438 16.197 15.943 15.784 15.623 15.357 15.172 14.997 14.907 14.705 14.499 14.268 14.145 13.907 13.745 13.601 13.441 13.089 12.908 12.7 12.433 12.111 11.761 11.279 8.776 -7 ,28873 ,KEBNE ,16678019,Wed Nov 24 23:11:37 CET,Thu Nov 25 01:14:16 CET,0.0 2.504 3.171 3.563 3.878 4.186 4.488 4.763 5.21 5.405 5.591 5.824 6.104 6.258 6.553 6.818 7.053 7.17 7.405 7.615 7.884 8.066 8.252 8.521 8.779 9.007 9.231 9.463 9.767 10.056 10.324 10.636 10.94 11.255 11.618 12.029 12.423 12.828 13.262 13.721 14.194 14.725 15.341 15.933 16.616 17.337 18.189 19.192 20.322 21.581 22.789 23.49 23.746 23.744 23.571 23.313 23.017 22.753 22.515 22.258 22.02 21.786 21.54 21.289 21.053 20.819 20.577 20.37 20.183 19.933 19.642 19.417 19.188 18.94 18.75 18.539 18.324 18.131 17.921 17.763 17.598 17.362 17.191 17.011 16.921 16.723 16.48 16.204 16.065 15.818 15.628 15.467 15.303 14.888 14.647 14.41 14.154 13.818 13.37 12.814 11.113 -8 ,19349 ,KEBNE ,16678020,Wed Nov 24 23:11:36 CET,Thu Nov 25 01:11:53 CET,0.0 2.882 3.596 4.077 4.453 4.774 5.06 5.327 5.786 5.991 6.181 6.411 6.702 6.862 7.148 7.409 7.661 7.777 7.995 8.207 8.526 8.737 8.921 9.176 9.434 9.679 9.914 10.142 10.439 10.735 11.014 11.361 11.703 12.021 12.373 12.755 13.125 13.535 13.971 14.431 14.92 15.476 16.132 16.764 17.451 18.213 19.092 20.058 21.185 22.47 23.865 24.729 24.973 24.943 24.811 24.593 24.34 24.12 23.879 23.595 23.348 23.104 22.848 22.609 22.386 22.166 21.925 21.691 21.487 21.277 21.059 20.878 20.685 20.475 20.304 20.128 19.941 19.738 19.52 19.358 19.186 18.926 18.74 18.53 18.419 18.207 17.991 17.745 17.612 17.371 17.187 17.034 16.865 16.401 16.117 15.849 15.574 15.235 14.873 14.455 12.457 -9 ,9616 ,KEBNE ,16678021,Wed Nov 24 23:11:37 CET,Thu Nov 25 01:14:36 CET,0.0 2.089 2.732 3.211 3.557 3.846 4.114 4.349 4.793 5.01 5.21 5.473 5.774 5.953 6.296 6.608 6.902 7.039 7.3 7.542 7.863 8.072 8.269 8.544 8.809 9.071 9.339 9.602 9.954 10.295 10.605 10.958 11.301 11.621 11.949 12.315 12.668 13.076 13.562 14.055 14.525 15.054 15.663 16.291 17.047 17.812 18.622 19.491 20.434 21.459 22.574 23.247 23.375 23.222 22.976 22.707 22.407 22.096 21.778 21.41 21.076 20.755 20.435 20.132 19.837 19.542 19.233 18.955 18.701 18.437 18.172 17.961 17.746 17.523 17.34 17.145 16.933 16.704 16.46 16.286 16.119 15.841 15.635 15.434 15.336 15.127 14.894 14.656 14.516 14.264 14.051 13.869 13.689 13.299 13.085 12.854 12.58 12.28 11.924 11.431 9.79 -10 ,20563 ,KEBNE ,16678022,Wed Nov 24 23:11:41 CET,Thu Nov 25 01:08:40 CET,0.0 2.089 2.661 3.068 3.405 3.71 3.972 4.21 4.642 4.836 5.036 5.266 5.539 5.691 5.985 6.248 6.5 6.628 6.871 7.106 7.436 7.637 7.826 8.091 8.335 8.567 8.805 9.037 9.331 9.625 9.909 10.242 10.552 10.843 11.178 11.561 11.923 12.304 12.713 13.138 13.571 14.08 14.707 15.332 16.02 16.77 17.622 18.552 19.557 20.572 21.566 22.061 22.125 22.019 21.785 21.493 21.2 20.885 20.619 20.319 20.006 19.72 19.449 19.208 18.96 18.696 18.427 18.199 18.003 17.778 17.539 17.355 17.155 16.943 16.782 16.617 16.449 16.265 16.046 15.882 15.684 15.315 15.102 14.934 14.841 14.634 14.395 14.142 14.022 13.786 13.622 13.47 13.304 12.841 12.563 12.32 12.067 11.736 11.277 10.748 8.787 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt deleted file mode 100644 index cbdec75c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3619 ,KEBNE ,16675719,Wed Nov 24 07:06:11 CET,Wed Nov 24 09:07:07 CET,0.0 0.989 1.391 1.641 1.846 2.051 2.24 2.409 2.707 2.834 2.958 2.937 3.308 3.422 3.651 3.859 4.045 4.128 4.279 4.428 4.658 4.807 4.943 5.149 5.348 5.524 5.693 5.854 6.072 6.274 6.464 6.691 6.893 7.086 7.327 7.617 7.877 8.129 8.378 8.634 8.897 9.186 9.517 9.844 10.202 10.598 11.033 11.433 11.829 12.19 12.334 12.148 11.749 11.288 10.798 10.32 9.927 9.543 9.18 8.799 8.459 8.127 7.81 7.523 7.245 6.971 6.689 6.452 6.229 5.993 5.76 5.55 5.337 5.131 4.959 4.787 4.617 4.438 4.245 4.099 3.946 3.713 3.53 3.328 3.233 3.022 2.784 2.534 2.421 2.05 2.069 1.924 1.759 1.37 1.153 0.936 0.67 0.352 -0.035 -0.558 -2.905 -2 ,6441 ,KEBNE ,16675720,Wed Nov 24 07:06:11 CET,Wed Nov 24 09:09:46 CET,0.0 0.98 1.384 1.67 1.923 2.137 2.313 2.482 2.785 2.93 3.066 3.05 3.414 3.526 3.727 3.918 4.106 4.189 4.342 4.506 4.739 4.881 5.005 5.176 5.355 5.523 5.689 5.855 6.067 6.268 6.446 6.654 6.859 7.057 7.28 7.529 7.762 8.025 8.303 8.586 8.875 9.178 9.52 9.837 10.17 10.525 10.862 11.204 11.581 11.847 11.837 11.38 10.793 10.196 9.643 9.106 8.602 8.157 7.776 7.356 6.988 6.677 6.378 6.058 5.741 5.469 5.177 4.92 4.703 4.469 4.235 4.032 3.821 3.609 3.431 3.242 3.039 2.839 2.653 2.51 2.354 2.109 1.935 1.758 1.671 1.509 1.341 1.129 0.996 0.603 0.582 0.42 0.253 -0.116 -0.318 -0.532 -0.783 -1.081 -1.452 -1.955 -3.651 -3 ,29015 ,KEBNE ,16678025,Wed Nov 24 23:11:37 CET,Thu Nov 25 01:13:20 CET,0.0 1.336 1.683 1.92 2.185 2.433 2.641 2.833 3.162 3.29 3.417 3.447 3.821 3.929 4.148 4.346 4.525 4.611 4.779 4.936 5.163 5.299 5.423 5.604 5.772 5.935 6.086 6.232 6.42 6.6 6.77 6.964 7.162 7.347 7.547 7.764 7.965 8.195 8.445 8.697 8.942 9.218 9.528 9.82 10.137 10.459 10.784 11.113 11.475 11.747 11.791 11.403 10.899 10.385 9.856 9.319 8.802 8.296 7.878 7.447 7.056 6.718 6.393 6.083 5.769 5.473 5.173 4.912 4.665 4.396 4.122 3.888 3.644 3.393 3.187 2.962 2.745 2.534 2.302 2.129 1.941 1.673 1.492 1.29 1.179 0.952 0.726 0.469 0.34 -0.046 -0.112 -0.29 -0.489 -0.929 -1.208 -1.521 -1.813 -2.123 -2.523 -3.115 -6.004 -4 ,28734 ,KEBNE ,16675722,Wed Nov 24 07:08:14 CET,Wed Nov 24 09:10:35 CET,0.0 0.744 1.141 1.427 1.642 1.844 2.015 2.181 2.493 2.629 2.764 2.757 3.119 3.217 3.417 3.609 3.788 3.871 4.033 4.194 4.411 4.551 4.68 4.873 5.069 5.249 5.419 5.578 5.782 5.967 6.14 6.347 6.547 6.741 6.969 7.215 7.43 7.656 7.886 8.126 8.378 8.649 8.923 9.191 9.539 9.898 10.257 10.622 10.916 11.085 10.99 10.492 9.821 9.129 8.52 7.96 7.467 7.015 6.593 6.163 5.787 5.452 5.126 4.796 4.469 4.161 3.844 3.567 3.338 3.11 2.853 2.629 2.401 2.159 1.966 1.761 1.552 1.32 1.066 0.897 0.723 0.437 0.222 0.006 -0.095 -0.295 -0.501 -0.731 -0.868 -1.274 -1.32 -1.482 -1.649 -2.024 -2.249 -2.506 -2.786 -3.097 -3.517 -4.192 -6.846 -5 ,21658 ,KEBNE ,16675723,Wed Nov 24 07:09:16 CET,Wed Nov 24 09:10:14 CET,0.0 0.927 1.25 1.515 1.756 1.961 2.135 2.296 2.587 2.725 2.854 2.861 3.234 3.346 3.559 3.757 3.937 4.029 4.203 4.366 4.626 4.787 4.929 5.125 5.325 5.521 5.691 5.849 6.056 6.243 6.413 6.604 6.785 6.976 7.196 7.423 7.643 7.874 8.107 8.357 8.594 8.838 9.123 9.404 9.691 9.98 10.284 10.579 10.835 11.014 11.004 10.589 9.986 9.304 8.643 8.05 7.498 6.967 6.514 6.07 5.663 5.287 4.949 4.597 4.231 3.914 3.597 3.309 3.049 2.78 2.502 2.278 2.051 1.805 1.61 1.413 1.208 0.983 0.743 0.578 0.396 0.104 -0.087 -0.288 -0.395 -0.617 -0.848 -1.105 -1.237 -1.629 -1.674 -1.834 -2.004 -2.415 -2.636 -2.856 -3.114 -3.427 -3.836 -4.521 -7.352 -6 ,24965 ,KEBNE ,16675724,Wed Nov 24 07:09:16 CET,Wed Nov 24 09:18:59 CET,0.0 1.156 1.561 1.865 2.098 2.311 2.497 2.664 2.963 3.092 3.21 3.182 3.519 3.611 3.792 3.959 4.127 4.208 4.362 4.514 4.742 4.879 5.012 5.209 5.388 5.563 5.738 5.906 6.102 6.276 6.448 6.66 6.861 7.048 7.256 7.482 7.688 7.906 8.145 8.39 8.622 8.88 9.185 9.493 9.842 10.176 10.495 10.82 11.093 11.232 11.162 10.726 10.117 9.466 8.856 8.313 7.838 7.386 6.98 6.555 6.17 5.835 5.523 5.217 4.928 4.655 4.355 4.09 3.849 3.598 3.359 3.156 2.944 2.719 2.535 2.348 2.16 1.948 1.725 1.572 1.411 1.174 1.001 0.816 0.723 0.53 0.333 0.108 -0.015 -0.392 -0.408 -0.56 -0.74 -1.119 -1.317 -1.545 -1.822 -2.153 -2.547 -3.139 -6.615 -7 ,26725 ,KEBNE ,16675725,Wed Nov 24 07:09:15 CET,Wed Nov 24 09:10:44 CET,0.0 0.624 0.909 1.136 1.305 1.478 1.64 1.775 2.005 2.117 2.221 2.166 2.5 2.588 2.755 2.902 3.063 3.144 3.286 3.418 3.601 3.73 3.859 4.032 4.194 4.36 4.522 4.674 4.868 5.051 5.234 5.454 5.658 5.855 6.089 6.35 6.614 6.919 7.247 7.592 7.943 8.316 8.737 9.146 9.619 10.043 10.381 10.727 11.053 11.258 11.149 10.66 10.022 9.4 8.83 8.274 7.757 7.269 6.84 6.409 6.026 5.677 5.33 4.983 4.652 4.357 4.041 3.752 3.527 3.295 3.026 2.785 2.535 2.279 2.083 1.875 1.647 1.389 1.122 0.952 0.774 0.502 0.317 0.11 0.002 -0.207 -0.43 -0.687 -0.819 -1.208 -1.272 -1.45 -1.635 -2.021 -2.218 -2.432 -2.685 -3.016 -3.447 -4.022 -6.485 -8 ,24780 ,KEBNE ,16675726,Wed Nov 24 07:12:21 CET,Wed Nov 24 09:15:42 CET,0.0 1.404 1.841 2.175 2.437 2.652 2.851 3.04 3.388 3.533 3.666 3.658 4.016 4.124 4.332 4.539 4.756 4.853 5.032 5.212 5.447 5.594 5.737 5.94 6.141 6.338 6.516 6.685 6.903 7.111 7.308 7.546 7.763 7.963 8.184 8.406 8.613 8.856 9.126 9.404 9.686 9.977 10.304 10.609 10.925 11.284 11.673 12.056 12.462 12.815 12.869 12.437 11.897 11.369 10.826 10.28 9.793 9.337 8.915 8.498 8.15 7.84 7.538 7.229 6.919 6.64 6.366 6.105 5.865 5.61 5.339 5.121 4.89 4.644 4.458 4.28 4.087 3.884 3.668 3.501 3.337 3.102 2.943 2.769 2.679 2.499 2.278 2.034 1.918 1.544 1.539 1.394 1.241 0.902 0.691 0.455 0.203 -0.101 -0.498 -1.04 -3.561 -9 ,23802 ,KEBNE ,16675727,Wed Nov 24 07:14:24 CET,Wed Nov 24 09:18:15 CET,0.0 0.891 1.189 1.436 1.627 1.794 1.96 2.099 2.338 2.452 2.568 2.539 2.892 2.988 3.183 3.364 3.536 3.625 3.784 3.948 4.189 4.326 4.446 4.62 4.794 4.949 5.098 5.243 5.436 5.63 5.81 6.017 6.216 6.406 6.616 6.853 7.089 7.342 7.6 7.885 8.164 8.459 8.793 9.108 9.468 9.808 10.148 10.501 10.833 11.143 11.348 11.102 10.657 10.164 9.647 9.169 8.724 8.27 7.838 7.403 7.036 6.703 6.379 6.061 5.779 5.529 5.253 4.99 4.765 4.527 4.271 4.049 3.827 3.616 3.448 3.269 3.082 2.881 2.665 2.514 2.349 2.092 1.929 1.75 1.642 1.415 1.177 0.923 0.795 0.421 0.396 0.243 0.077 -0.277 -0.478 -0.718 -1.008 -1.335 -1.724 -2.274 -4.543 -10 ,3551 ,KEBNE ,16678032,Wed Nov 24 23:13:40 CET,Thu Nov 25 01:16:08 CET,0.0 1.043 1.364 1.61 1.833 2.015 2.2 2.374 2.669 2.792 2.898 2.838 3.197 3.301 3.505 3.69 3.863 3.949 4.115 4.264 4.463 4.592 4.722 4.903 5.065 5.238 5.417 5.572 5.762 5.956 6.142 6.352 6.555 6.75 6.972 7.21 7.431 7.675 7.928 8.188 8.44 8.707 9.039 9.358 9.692 10.028 10.406 10.85 11.242 11.516 11.56 11.201 10.703 10.189 9.674 9.162 8.718 8.285 7.868 7.409 7.017 6.679 6.329 5.981 5.639 5.325 5.008 4.719 4.462 4.198 3.927 3.694 3.439 3.189 2.999 2.811 2.615 2.388 2.159 2.007 1.84 1.55 1.348 1.145 1.04 0.836 0.616 0.363 0.237 -0.143 -0.17 -0.346 -0.544 -0.943 -1.159 -1.444 -1.763 -2.13 -2.584 -3.192 -5.808 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 236cd68f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11885 ,KEBNE ,16675729,Wed Nov 24 07:17:29 CET,Wed Nov 24 09:17:07 CET,0.0 0.914 1.157 1.312 1.429 1.539 1.631 1.684 1.741 1.764 1.773 1.622 1.754 1.743 1.696 1.631 1.546 1.504 1.428 1.351 1.22 1.126 1.038 0.892 0.706 0.517 0.33 0.121 -0.178 -0.49 -0.811 -1.211 -1.599 -1.991 -2.486 -3.084 -3.697 -4.394 -5.168 -6.045 -7.029 -8.23 -9.765 -11.442 -13.528 -16.024 -19.206 -23.216 -28.526 -35.738 -46.242 -57.089 -64.984 -71.115 -75.972 -79.973 -83.24 -86.033 -88.358 -90.583 -92.396 -93.946 -95.385 -96.7 -97.863 -98.895 -99.957 -100.894 -101.668 -102.419 -103.18 -103.804 -104.447 -105.091 -105.574 -106.063 -106.556 -107.062 -107.573 -107.912 -108.255 -108.775 -109.138 -109.522 -109.716 -110.113 -110.515 -110.921 -111.129 -111.583 -111.789 -112.031 -112.268 -112.762 -113.028 -113.298 -113.587 -113.901 -114.271 -114.74 -115.915 -2 ,29166 ,KEBNE ,16678034,Wed Nov 24 23:13:40 CET,Thu Nov 25 01:16:41 CET,0.0 0.767 1.003 1.142 1.239 1.323 1.414 1.461 1.467 1.475 1.485 1.352 1.459 1.426 1.365 1.302 1.213 1.166 1.067 0.952 0.777 0.657 0.549 0.384 0.186 -0.02 -0.229 -0.434 -0.711 -0.997 -1.281 -1.666 -2.045 -2.411 -2.88 -3.457 -4.034 -4.706 -5.486 -6.366 -7.343 -8.521 -10.011 -11.628 -13.666 -16.183 -19.38 -23.317 -28.505 -35.642 -46.099 -56.908 -64.782 -70.847 -75.642 -79.624 -82.888 -85.664 -87.923 -90.045 -91.794 -93.33 -94.74 -96.037 -97.211 -98.214 -99.236 -100.133 -100.9 -101.672 -102.448 -103.075 -103.705 -104.342 -104.826 -105.32 -105.805 -106.301 -106.82 -107.158 -107.492 -108.009 -108.366 -108.737 -108.916 -109.275 -109.665 -110.072 -110.275 -110.723 -110.913 -111.138 -111.371 -111.866 -112.117 -112.387 -112.68 -113.006 -113.391 -113.833 -114.937 -3 ,15400 ,KEBNE ,16675731,Wed Nov 24 07:20:34 CET,Wed Nov 24 09:21:11 CET,0.0 0.948 1.204 1.341 1.442 1.53 1.593 1.646 1.719 1.734 1.743 1.636 1.775 1.765 1.754 1.738 1.688 1.653 1.578 1.502 1.38 1.297 1.203 1.043 0.88 0.71 0.545 0.38 0.137 -0.116 -0.385 -0.731 -1.079 -1.44 -1.879 -2.397 -2.937 -3.565 -4.275 -5.095 -6.022 -7.162 -8.611 -10.183 -12.185 -14.607 -17.636 -21.442 -26.534 -33.593 -43.957 -54.56 -62.266 -68.254 -73.02 -77.002 -80.243 -83.006 -85.26 -87.407 -89.2 -90.732 -92.151 -93.447 -94.599 -95.614 -96.65 -97.546 -98.29 -99.039 -99.804 -100.423 -101.061 -101.727 -102.252 -102.784 -103.313 -103.84 -104.35 -104.692 -105.039 -105.575 -105.944 -106.328 -106.522 -106.904 -107.295 -107.709 -107.929 -108.393 -108.578 -108.805 -109.042 -109.523 -109.769 -110.034 -110.349 -110.689 -111.038 -111.532 -112.651 -4 ,4564 ,KEBNE ,16678036,Wed Nov 24 23:14:42 CET,Thu Nov 25 01:17:58 CET,0.0 0.903 1.113 1.296 1.449 1.518 1.57 1.6 1.602 1.596 1.597 1.442 1.558 1.537 1.492 1.429 1.341 1.293 1.203 1.105 0.937 0.82 0.707 0.536 0.368 0.18 -0.012 -0.208 -0.5 -0.8 -1.093 -1.473 -1.871 -2.274 -2.751 -3.304 -3.898 -4.596 -5.392 -6.283 -7.27 -8.481 -10.015 -11.663 -13.712 -16.185 -19.348 -23.344 -28.626 -35.786 -46.133 -56.844 -64.682 -70.773 -75.619 -79.614 -82.85 -85.619 -87.891 -90.043 -91.831 -93.383 -94.811 -96.08 -97.214 -98.219 -99.232 -100.111 -100.858 -101.614 -102.372 -102.992 -103.635 -104.294 -104.79 -105.285 -105.772 -106.265 -106.777 -107.123 -107.48 -108.029 -108.393 -108.766 -108.957 -109.344 -109.741 -110.165 -110.38 -110.837 -111.018 -111.237 -111.468 -111.954 -112.2 -112.48 -112.791 -113.126 -113.505 -113.958 -115.163 -5 ,18620 ,KEBNE ,16678037,Wed Nov 24 23:15:43 CET,Thu Nov 25 01:17:46 CET,0.0 0.962 1.234 1.378 1.471 1.526 1.573 1.616 1.657 1.673 1.686 1.549 1.652 1.63 1.584 1.533 1.471 1.432 1.357 1.273 1.117 1.012 0.901 0.731 0.556 0.37 0.175 -0.023 -0.303 -0.604 -0.901 -1.274 -1.653 -2.035 -2.534 -3.124 -3.704 -4.377 -5.142 -5.995 -6.953 -8.12 -9.591 -11.185 -13.206 -15.651 -18.703 -22.572 -27.653 -34.546 -44.805 -55.546 -63.406 -69.432 -74.21 -78.228 -81.562 -84.357 -86.62 -88.79 -90.561 -92.074 -93.481 -94.78 -95.936 -96.968 -98.038 -98.942 -99.687 -100.446 -101.218 -101.851 -102.499 -103.147 -103.627 -104.112 -104.605 -105.112 -105.621 -105.953 -106.298 -106.821 -107.172 -107.534 -107.72 -108.103 -108.48 -108.876 -109.088 -109.538 -109.697 -109.91 -110.133 -110.644 -110.911 -111.171 -111.454 -111.753 -112.091 -112.554 -113.49 -6 ,32207 ,KEBNE ,16678038,Wed Nov 24 23:15:44 CET,Thu Nov 25 01:16:10 CET,0.0 1.0 1.231 1.37 1.466 1.516 1.555 1.59 1.62 1.626 1.625 1.474 1.583 1.568 1.519 1.433 1.347 1.303 1.206 1.11 0.958 0.846 0.74 0.575 0.395 0.203 0.01 -0.184 -0.465 -0.757 -1.055 -1.435 -1.822 -2.206 -2.67 -3.242 -3.837 -4.518 -5.303 -6.188 -7.168 -8.353 -9.851 -11.457 -13.49 -15.962 -19.097 -23.07 -28.342 -35.509 -45.94 -56.773 -64.689 -70.813 -75.677 -79.731 -83.032 -85.818 -88.112 -90.34 -92.169 -93.726 -95.172 -96.472 -97.639 -98.672 -99.71 -100.607 -101.365 -102.124 -102.894 -103.526 -104.152 -104.785 -105.269 -105.759 -106.266 -106.775 -107.287 -107.641 -107.995 -108.516 -108.879 -109.262 -109.454 -109.836 -110.23 -110.633 -110.841 -111.293 -111.485 -111.71 -111.944 -112.45 -112.73 -113.006 -113.292 -113.602 -113.976 -114.429 -115.376 -7 ,20882 ,KEBNE ,16678039,Wed Nov 24 23:15:44 CET,Thu Nov 25 01:16:11 CET,0.0 0.898 1.114 1.243 1.361 1.45 1.526 1.586 1.636 1.643 1.64 1.477 1.592 1.572 1.535 1.503 1.44 1.4 1.313 1.23 1.099 1.001 0.902 0.742 0.585 0.411 0.226 0.051 -0.199 -0.477 -0.767 -1.115 -1.452 -1.802 -2.247 -2.797 -3.371 -4.029 -4.781 -5.66 -6.641 -7.805 -9.256 -10.833 -12.816 -15.25 -18.374 -22.278 -27.416 -34.506 -44.908 -55.686 -63.523 -69.543 -74.311 -78.306 -81.597 -84.361 -86.595 -88.772 -90.582 -92.107 -93.51 -94.797 -95.943 -96.965 -98.014 -98.912 -99.658 -100.42 -101.208 -101.836 -102.477 -103.134 -103.621 -104.113 -104.614 -105.128 -105.659 -106.015 -106.367 -106.909 -107.278 -107.645 -107.828 -108.194 -108.572 -108.992 -109.218 -109.679 -109.873 -110.098 -110.326 -110.807 -111.065 -111.341 -111.633 -111.947 -112.297 -112.723 -113.669 -8 ,2420 ,KEBNE ,16675736,Wed Nov 24 07:55:45 CET,Wed Nov 24 09:56:33 CET,0.0 0.789 1.038 1.174 1.284 1.357 1.426 1.491 1.543 1.544 1.545 1.44 1.581 1.569 1.51 1.438 1.351 1.31 1.228 1.137 1.004 0.907 0.803 0.633 0.457 0.278 0.085 -0.109 -0.374 -0.654 -0.955 -1.336 -1.714 -2.101 -2.565 -3.131 -3.716 -4.388 -5.175 -6.076 -7.067 -8.263 -9.768 -11.372 -13.394 -15.855 -18.976 -22.884 -28.043 -35.19 -45.685 -56.553 -64.439 -70.51 -75.325 -79.307 -82.582 -85.4 -87.713 -89.905 -91.712 -93.262 -94.686 -95.978 -97.133 -98.155 -99.196 -100.102 -100.857 -101.616 -102.377 -102.988 -103.603 -104.246 -104.734 -105.219 -105.716 -106.217 -106.726 -107.071 -107.416 -107.944 -108.305 -108.666 -108.85 -109.223 -109.615 -110.024 -110.225 -110.676 -110.873 -111.108 -111.348 -111.823 -112.077 -112.342 -112.618 -112.925 -113.307 -113.771 -114.753 -9 ,32549 ,KEBNE ,16675737,Wed Nov 24 08:00:55 CET,Wed Nov 24 10:02:52 CET,0.0 0.83 1.077 1.205 1.299 1.367 1.415 1.449 1.487 1.494 1.49 1.339 1.461 1.453 1.424 1.356 1.28 1.24 1.155 1.065 0.914 0.817 0.719 0.554 0.388 0.21 0.006 -0.201 -0.489 -0.788 -1.087 -1.463 -1.831 -2.219 -2.703 -3.276 -3.871 -4.565 -5.351 -6.228 -7.207 -8.377 -9.845 -11.439 -13.433 -15.83 -18.886 -22.754 -27.885 -34.892 -45.11 -55.756 -63.521 -69.494 -74.24 -78.195 -81.468 -84.26 -86.549 -88.758 -90.561 -92.089 -93.51 -94.814 -95.992 -97.032 -98.066 -98.964 -99.723 -100.504 -101.298 -101.926 -102.558 -103.2 -103.683 -104.192 -104.718 -105.228 -105.744 -106.093 -106.436 -106.963 -107.329 -107.699 -107.884 -108.276 -108.699 -109.13 -109.342 -109.796 -109.983 -110.223 -110.473 -110.986 -111.246 -111.508 -111.789 -112.114 -112.481 -112.922 -113.912 -10 ,24809 ,KEBNE ,16675738,Wed Nov 24 08:01:57 CET,Wed Nov 24 10:00:41 CET,0.0 1.008 1.255 1.388 1.478 1.546 1.601 1.641 1.684 1.691 1.687 1.53 1.635 1.617 1.554 1.484 1.408 1.364 1.269 1.184 1.063 0.97 0.855 0.68 0.513 0.34 0.152 -0.046 -0.308 -0.575 -0.856 -1.229 -1.601 -1.967 -2.41 -2.947 -3.524 -4.201 -4.952 -5.802 -6.77 -7.937 -9.395 -10.975 -12.949 -15.325 -18.351 -22.198 -27.343 -34.357 -44.575 -55.195 -62.994 -69.003 -73.8 -77.842 -81.17 -84.019 -86.331 -88.527 -90.336 -91.875 -93.291 -94.583 -95.738 -96.756 -97.801 -98.706 -99.46 -100.227 -100.992 -101.616 -102.261 -102.919 -103.423 -103.928 -104.434 -104.946 -105.46 -105.801 -106.149 -106.692 -107.061 -107.43 -107.628 -108.016 -108.39 -108.787 -108.996 -109.456 -109.645 -109.864 -110.086 -110.572 -110.824 -111.108 -111.421 -111.742 -112.1 -112.547 -113.575 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt deleted file mode 100644 index 88b5b4ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21073 ,KEBNE ,16675749,Wed Nov 24 08:05:02 CET,Wed Nov 24 10:06:24 CET,0.0 0.624 0.786 0.935 1.107 1.258 1.37 1.47 1.673 1.783 1.899 1.878 2.225 2.304 2.46 2.618 2.78 2.865 3.019 3.167 3.39 3.531 3.668 3.869 4.06 4.227 4.382 4.527 4.712 4.892 5.065 5.26 5.46 5.653 5.847 6.073 6.292 6.52 6.776 7.045 7.287 7.548 7.857 8.144 8.461 8.777 9.072 9.343 9.577 9.744 9.559 8.875 8.151 7.4 6.686 6.076 5.542 5.0 4.523 4.051 3.651 3.279 2.906 2.575 2.275 1.988 1.669 1.379 1.134 0.896 0.644 0.413 0.186 -0.043 -0.241 -0.441 -0.643 -0.855 -1.073 -1.217 -1.365 -1.605 -1.775 -1.961 -2.059 -2.25 -2.449 -2.666 -2.772 -3.137 -3.125 -3.248 -3.385 -3.683 -3.849 -4.019 -4.212 -4.418 -4.649 -4.945 -5.4 -2 ,19145 ,KEBNE ,16678044,Wed Nov 24 23:16:45 CET,Thu Nov 25 01:17:44 CET,0.0 0.4 0.659 0.897 1.106 1.3 1.49 1.658 1.957 2.111 2.252 2.258 2.632 2.743 2.939 3.139 3.311 3.391 3.555 3.704 3.915 4.049 4.171 4.351 4.527 4.694 4.85 5.01 5.222 5.425 5.614 5.837 6.041 6.228 6.453 6.715 6.98 7.271 7.556 7.855 8.166 8.475 8.829 9.175 9.545 9.925 10.313 10.675 10.975 11.135 11.015 10.558 9.933 9.271 8.649 8.033 7.454 6.901 6.415 5.941 5.529 5.17 4.826 4.494 4.183 3.889 3.581 3.314 3.082 2.834 2.569 2.346 2.119 1.88 1.689 1.494 1.291 1.08 0.865 0.711 0.55 0.31 0.148 -0.008 -0.092 -0.278 -0.482 -0.699 -0.808 -1.168 -1.17 -1.306 -1.45 -1.731 -1.873 -2.017 -2.184 -2.398 -2.662 -2.983 -3.48 -3 ,6338 ,KEBNE ,16675751,Wed Nov 24 08:05:02 CET,Wed Nov 24 10:04:18 CET,0.0 0.768 1.068 1.292 1.47 1.633 1.791 1.936 2.182 2.293 2.402 2.365 2.717 2.818 3.003 3.192 3.378 3.471 3.646 3.802 4.003 4.139 4.275 4.459 4.643 4.818 4.988 5.135 5.317 5.506 5.681 5.891 6.102 6.295 6.501 6.742 6.976 7.226 7.481 7.717 7.971 8.263 8.589 8.883 9.18 9.486 9.82 10.136 10.372 10.464 10.217 9.572 8.831 8.17 7.57 6.977 6.421 5.905 5.45 4.991 4.6 4.233 3.892 3.567 3.231 2.94 2.662 2.409 2.184 1.954 1.711 1.502 1.278 1.04 0.859 0.666 0.47 0.271 0.054 -0.101 -0.264 -0.52 -0.697 -0.868 -0.954 -1.143 -1.34 -1.537 -1.638 -1.989 -1.958 -2.072 -2.203 -2.482 -2.62 -2.763 -2.92 -3.104 -3.33 -3.617 -4.29 -4 ,20736 ,KEBNE ,16678046,Wed Nov 24 23:16:45 CET,Thu Nov 25 01:17:12 CET,0.0 0.374 0.576 0.779 0.96 1.108 1.24 1.351 1.563 1.669 1.773 1.735 2.076 2.165 2.32 2.478 2.642 2.712 2.85 2.994 3.191 3.319 3.452 3.646 3.824 3.99 4.146 4.296 4.488 4.684 4.87 5.086 5.282 5.464 5.659 5.855 6.053 6.288 6.513 6.738 6.961 7.173 7.405 7.63 7.883 8.136 8.398 8.607 8.749 8.776 8.499 7.89 7.181 6.498 5.895 5.35 4.881 4.433 4.041 3.646 3.278 2.94 2.635 2.356 2.091 1.834 1.551 1.299 1.066 0.811 0.555 0.35 0.126 -0.116 -0.297 -0.483 -0.678 -0.87 -1.079 -1.232 -1.382 -1.625 -1.794 -1.956 -2.046 -2.247 -2.446 -2.657 -2.773 -3.147 -3.113 -3.244 -3.378 -3.631 -3.777 -3.955 -4.166 -4.385 -4.614 -4.865 -5.242 -5 ,773 ,KEBNE ,16678047,Wed Nov 24 23:16:46 CET,Thu Nov 25 01:20:11 CET,0.0 0.672 0.97 1.188 1.392 1.577 1.752 1.913 2.193 2.315 2.423 2.398 2.767 2.869 3.054 3.227 3.394 3.48 3.639 3.773 3.975 4.108 4.229 4.409 4.581 4.736 4.897 5.062 5.259 5.445 5.626 5.84 6.024 6.186 6.379 6.591 6.778 6.964 7.17 7.395 7.607 7.844 8.134 8.432 8.737 9.046 9.411 9.757 10.06 10.21 10.003 9.468 8.818 8.125 7.488 6.926 6.425 5.948 5.535 5.116 4.742 4.389 4.057 3.75 3.437 3.133 2.81 2.519 2.272 2.03 1.785 1.584 1.365 1.115 0.929 0.746 0.554 0.358 0.138 -0.012 -0.159 -0.392 -0.552 -0.722 -0.807 -0.99 -1.196 -1.412 -1.523 -1.88 -1.866 -1.994 -2.129 -2.42 -2.567 -2.724 -2.903 -3.116 -3.364 -3.686 -4.31 -6 ,22413 ,KEBNE ,16678048,Wed Nov 24 23:16:45 CET,Thu Nov 25 01:18:55 CET,0.0 0.347 0.62 0.841 1.038 1.215 1.386 1.538 1.796 1.92 2.031 2.004 2.372 2.493 2.714 2.892 3.044 3.125 3.284 3.428 3.633 3.753 3.861 4.04 4.22 4.382 4.526 4.662 4.845 5.016 5.183 5.4 5.596 5.77 5.979 6.228 6.458 6.691 6.959 7.237 7.487 7.744 8.037 8.312 8.611 8.927 9.245 9.485 9.648 9.708 9.441 8.791 8.08 7.349 6.703 6.111 5.573 5.058 4.573 4.084 3.67 3.297 2.935 2.578 2.24 1.95 1.644 1.369 1.135 0.896 0.646 0.419 0.186 -0.046 -0.232 -0.432 -0.634 -0.842 -1.062 -1.218 -1.395 -1.671 -1.849 -2.028 -2.12 -2.312 -2.515 -2.733 -2.855 -3.239 -3.229 -3.349 -3.474 -3.759 -3.921 -4.085 -4.256 -4.473 -4.728 -5.017 -5.721 -7 ,25368 ,KEBNE ,16678049,Wed Nov 24 23:17:47 CET,Thu Nov 25 01:19:27 CET,0.0 1.212 1.569 1.835 2.041 2.243 2.434 2.594 2.861 2.982 3.1 3.096 3.449 3.549 3.747 3.927 4.081 4.158 4.32 4.465 4.658 4.785 4.906 5.076 5.25 5.418 5.568 5.707 5.882 6.052 6.204 6.384 6.573 6.754 6.945 7.154 7.357 7.568 7.782 8.004 8.226 8.474 8.761 9.053 9.381 9.685 9.947 10.165 10.379 10.516 10.351 9.72 9.025 8.385 7.824 7.309 6.858 6.4 5.972 5.547 5.2 4.891 4.573 4.262 3.971 3.692 3.398 3.135 2.9 2.67 2.44 2.241 2.023 1.785 1.604 1.423 1.244 1.047 0.82 0.664 0.508 0.27 0.109 -0.064 -0.15 -0.324 -0.524 -0.738 -0.843 -1.191 -1.157 -1.275 -1.395 -1.64 -1.79 -1.967 -2.144 -2.338 -2.541 -2.797 -3.178 -8 ,11762 ,KEBNE ,16678050,Wed Nov 24 23:17:50 CET,Thu Nov 25 01:16:56 CET,0.0 0.634 0.917 1.171 1.384 1.58 1.775 1.932 2.208 2.346 2.471 2.433 2.797 2.899 3.081 3.256 3.429 3.519 3.693 3.862 4.086 4.218 4.357 4.554 4.73 4.905 5.082 5.255 5.478 5.703 5.924 6.177 6.411 6.634 6.879 7.143 7.394 7.665 7.931 8.198 8.5 8.847 9.242 9.579 9.919 10.289 10.66 10.98 11.195 11.211 10.955 10.297 9.577 8.957 8.383 7.793 7.233 6.711 6.26 5.83 5.472 5.13 4.796 4.481 4.161 3.88 3.592 3.329 3.094 2.842 2.585 2.359 2.111 1.86 1.67 1.477 1.281 1.071 0.839 0.671 0.506 0.261 0.085 -0.084 -0.165 -0.349 -0.554 -0.758 -0.858 -1.224 -1.201 -1.324 -1.454 -1.759 -1.914 -2.072 -2.264 -2.493 -2.764 -3.113 -3.709 -9 ,19708 ,KEBNE ,16675757,Wed Nov 24 08:08:06 CET,Wed Nov 24 10:06:31 CET,0.0 0.801 1.08 1.3 1.478 1.624 1.774 1.91 2.147 2.258 2.364 2.326 2.677 2.772 2.954 3.122 3.286 3.369 3.515 3.656 3.862 3.986 4.106 4.269 4.436 4.611 4.778 4.935 5.121 5.302 5.484 5.691 5.891 6.094 6.317 6.539 6.738 6.965 7.203 7.434 7.656 7.904 8.171 8.418 8.694 8.955 9.208 9.407 9.556 9.629 9.391 8.749 8.103 7.537 7.032 6.515 6.028 5.584 5.18 4.77 4.393 4.025 3.695 3.413 3.149 2.892 2.614 2.38 2.178 1.956 1.731 1.537 1.326 1.105 0.934 0.764 0.589 0.389 0.17 0.02 -0.131 -0.377 -0.561 -0.755 -0.852 -1.055 -1.26 -1.469 -1.58 -1.947 -1.945 -2.091 -2.243 -2.552 -2.713 -2.897 -3.096 -3.301 -3.551 -3.871 -4.402 -10 ,29958 ,KEBNE ,16678052,Wed Nov 24 23:18:48 CET,Thu Nov 25 01:18:21 CET,0.0 0.928 1.252 1.505 1.738 1.95 2.147 2.326 2.642 2.775 2.894 2.871 3.234 3.346 3.567 3.761 3.94 4.03 4.22 4.405 4.654 4.806 4.95 5.165 5.384 5.586 5.765 5.941 6.16 6.376 6.585 6.811 7.02 7.217 7.46 7.742 8.003 8.27 8.537 8.825 9.114 9.407 9.724 10.04 10.418 10.787 11.132 11.46 11.71 11.845 11.679 11.141 10.564 9.934 9.335 8.736 8.15 7.629 7.169 6.7 6.312 5.962 5.621 5.316 5.039 4.792 4.528 4.267 4.023 3.742 3.47 3.265 3.05 2.817 2.628 2.444 2.255 2.044 1.827 1.683 1.536 1.318 1.165 0.992 0.897 0.699 0.501 0.302 0.188 -0.206 -0.255 -0.402 -0.562 -0.884 -1.062 -1.25 -1.445 -1.689 -1.961 -2.3 -3.072 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt deleted file mode 100644 index cec50c52..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22683 ,KEBNE ,16678053,Wed Nov 24 23:18:48 CET,Thu Nov 25 01:18:47 CET,0.0 1.811 2.297 2.644 2.889 3.08 3.254 3.421 3.752 3.919 4.067 4.044 4.401 4.507 4.719 4.921 5.099 5.187 5.368 5.543 5.801 5.969 6.117 6.315 6.505 6.698 6.894 7.074 7.302 7.52 7.723 7.963 8.193 8.416 8.669 8.95 9.214 9.504 9.829 10.167 10.504 10.865 11.275 11.68 12.134 12.621 13.182 13.766 14.307 14.732 14.913 14.535 13.981 13.459 12.896 12.282 11.674 11.075 10.546 10.011 9.536 9.094 8.655 8.219 7.773 7.353 6.912 6.505 6.151 5.781 5.373 5.036 4.705 4.369 4.114 3.828 3.529 3.242 2.91 2.664 2.41 2.007 1.731 1.429 1.271 0.954 0.609 0.243 0.054 -0.402 -0.612 -0.855 -1.108 -1.646 -1.963 -2.309 -2.681 -3.078 -3.565 -4.354 -6.995 -2 ,18523 ,KEBNE ,16678054,Wed Nov 24 23:18:52 CET,Thu Nov 25 01:18:18 CET,0.0 1.6 2.038 2.346 2.59 2.801 2.989 3.15 3.445 3.58 3.704 3.695 4.053 4.161 4.365 4.564 4.76 4.851 5.023 5.187 5.419 5.565 5.709 5.926 6.122 6.296 6.465 6.619 6.81 7.016 7.213 7.445 7.668 7.882 8.109 8.365 8.612 8.874 9.172 9.492 9.808 10.119 10.464 10.81 11.224 11.686 12.141 12.576 13.047 13.433 13.457 12.892 12.173 11.49 10.841 10.212 9.603 8.984 8.413 7.786 7.221 6.736 6.264 5.783 5.321 4.912 4.469 4.064 3.717 3.365 3.008 2.7 2.368 2.027 1.752 1.451 1.129 0.783 0.429 0.175 -0.096 -0.529 -0.836 -1.154 -1.319 -1.668 -2.037 -2.431 -2.633 -3.077 -3.245 -3.459 -3.701 -4.333 -4.677 -5.005 -5.423 -5.954 -6.563 -7.366 -10.771 -3 ,26418 ,KEBNE ,16678055,Wed Nov 24 23:18:52 CET,Thu Nov 25 01:19:52 CET,0.0 1.624 2.058 2.346 2.602 2.831 3.014 3.183 3.516 3.665 3.792 3.779 4.133 4.254 4.477 4.665 4.836 4.917 5.075 5.217 5.422 5.556 5.683 5.876 6.054 6.212 6.367 6.525 6.739 6.955 7.149 7.369 7.59 7.796 8.029 8.294 8.536 8.796 9.085 9.372 9.659 9.988 10.377 10.757 11.175 11.62 12.071 12.47 12.929 13.425 13.722 13.505 13.032 12.495 11.939 11.356 10.812 10.317 9.857 9.325 8.803 8.329 7.852 7.374 6.931 6.525 6.051 5.636 5.31 4.914 4.499 4.206 3.912 3.599 3.368 3.14 2.858 2.521 2.181 1.959 1.729 1.367 1.108 0.841 0.688 0.366 0.061 -0.247 -0.421 -0.861 -0.997 -1.186 -1.409 -1.902 -2.154 -2.466 -2.866 -3.288 -3.738 -4.367 -8.69 -4 ,3656 ,KEBNE ,16678056,Wed Nov 24 23:18:52 CET,Thu Nov 25 01:17:08 CET,0.0 1.799 2.251 2.561 2.82 3.038 3.219 3.376 3.675 3.816 3.947 3.938 4.312 4.422 4.619 4.802 4.972 5.063 5.236 5.394 5.604 5.737 5.877 6.07 6.246 6.425 6.601 6.781 7.012 7.215 7.402 7.622 7.835 8.039 8.276 8.532 8.766 9.017 9.265 9.547 9.848 10.183 10.602 10.961 11.31 11.724 12.189 12.625 13.066 13.505 13.816 13.651 13.135 12.526 11.936 11.313 10.698 10.155 9.662 9.082 8.57 8.104 7.651 7.213 6.806 6.435 6.034 5.663 5.335 4.986 4.614 4.31 3.982 3.641 3.388 3.11 2.801 2.49 2.2 2.009 1.803 1.449 1.203 0.974 0.858 0.586 0.271 -0.061 -0.228 -0.64 -0.797 -1.02 -1.253 -1.763 -2.06 -2.377 -2.736 -3.178 -3.687 -4.306 -7.063 -5 ,3240 ,KEBNE ,16678057,Wed Nov 24 23:19:49 CET,Thu Nov 25 01:20:54 CET,0.0 1.396 1.874 2.227 2.49 2.715 2.924 3.103 3.401 3.539 3.67 3.659 4.004 4.107 4.328 4.537 4.748 4.842 5.001 5.149 5.372 5.533 5.687 5.897 6.106 6.302 6.474 6.632 6.832 7.03 7.228 7.474 7.702 7.913 8.163 8.444 8.7 8.984 9.295 9.611 9.946 10.308 10.709 11.112 11.543 12.001 12.526 13.034 13.495 13.779 13.799 13.421 12.827 12.15 11.442 10.748 10.086 9.459 8.921 8.346 7.818 7.333 6.85 6.401 5.997 5.635 5.263 4.912 4.594 4.267 3.921 3.639 3.351 3.03 2.769 2.501 2.217 1.926 1.627 1.426 1.236 0.928 0.686 0.409 0.269 -0.018 -0.327 -0.652 -0.825 -1.246 -1.383 -1.594 -1.816 -2.308 -2.584 -2.864 -3.177 -3.553 -4.06 -4.856 -7.456 -6 ,17377 ,KEBNE ,16678058,Wed Nov 24 23:19:50 CET,Thu Nov 25 01:21:12 CET,0.0 1.445 1.895 2.261 2.556 2.818 3.044 3.23 3.556 3.701 3.846 3.867 4.228 4.335 4.544 4.745 4.929 5.014 5.18 5.337 5.567 5.72 5.858 6.051 6.247 6.445 6.627 6.799 7.018 7.218 7.415 7.673 7.911 8.123 8.369 8.649 8.932 9.22 9.497 9.806 10.125 10.476 10.865 11.263 11.715 12.141 12.602 13.109 13.606 14.033 14.25 13.899 13.309 12.647 11.914 11.231 10.653 10.119 9.583 8.993 8.488 8.021 7.575 7.151 6.75 6.388 5.96 5.563 5.227 4.873 4.505 4.217 3.927 3.597 3.344 3.081 2.807 2.506 2.19 1.965 1.715 1.347 1.101 0.841 0.707 0.405 0.088 -0.23 -0.402 -0.837 -1.026 -1.242 -1.458 -1.968 -2.263 -2.597 -2.953 -3.346 -3.872 -4.682 -7.702 -7 ,11012 ,KEBNE ,16678059,Wed Nov 24 23:19:50 CET,Thu Nov 25 01:21:05 CET,0.0 1.665 2.146 2.515 2.821 3.065 3.25 3.407 3.703 3.845 3.977 3.975 4.331 4.444 4.657 4.839 5.002 5.083 5.242 5.401 5.621 5.756 5.885 6.094 6.295 6.473 6.646 6.817 7.03 7.237 7.431 7.643 7.837 8.045 8.304 8.573 8.807 9.066 9.358 9.666 9.986 10.321 10.69 11.037 11.411 11.841 12.317 12.805 13.341 13.814 14.05 13.818 13.316 12.706 12.077 11.437 10.806 10.22 9.715 9.173 8.685 8.228 7.769 7.364 7.014 6.694 6.349 6.012 5.707 5.382 5.036 4.765 4.465 4.119 3.846 3.561 3.259 2.941 2.589 2.338 2.099 1.75 1.5 1.23 1.078 0.766 0.473 0.159 -0.004 -0.425 -0.564 -0.767 -0.991 -1.531 -1.816 -2.086 -2.391 -2.756 -3.208 -3.865 -7.035 -8 ,13305 ,KEBNE ,16678060,Wed Nov 24 23:19:50 CET,Thu Nov 25 01:21:19 CET,0.0 1.434 1.922 2.256 2.521 2.747 2.939 3.126 3.469 3.618 3.752 3.74 4.094 4.204 4.422 4.61 4.775 4.859 5.022 5.174 5.378 5.509 5.652 5.869 6.05 6.215 6.371 6.521 6.724 6.915 7.092 7.309 7.52 7.718 7.935 8.163 8.386 8.642 8.916 9.195 9.496 9.839 10.203 10.545 10.972 11.439 11.932 12.47 13.004 13.467 13.771 13.587 13.149 12.62 12.04 11.446 10.907 10.381 9.901 9.335 8.756 8.214 7.703 7.256 6.85 6.448 6.033 5.662 5.336 5.001 4.623 4.29 3.952 3.608 3.335 3.076 2.816 2.54 2.238 2.007 1.766 1.394 1.141 0.871 0.729 0.425 0.093 -0.287 -0.499 -0.939 -1.1 -1.329 -1.558 -2.06 -2.334 -2.643 -3.016 -3.486 -4.03 -4.72 -7.52 -9 ,21485 ,KEBNE ,16678061,Wed Nov 24 23:19:50 CET,Thu Nov 25 01:20:53 CET,0.0 1.598 2.04 2.368 2.637 2.859 3.042 3.214 3.522 3.66 3.791 3.769 4.129 4.235 4.44 4.623 4.781 4.861 5.025 5.185 5.411 5.556 5.705 5.917 6.116 6.308 6.507 6.695 6.896 7.08 7.266 7.495 7.709 7.903 8.127 8.38 8.613 8.864 9.133 9.418 9.718 10.046 10.406 10.786 11.255 11.747 12.242 12.751 13.242 13.645 13.813 13.339 12.718 12.087 11.428 10.814 10.234 9.629 9.028 8.446 7.967 7.512 7.07 6.654 6.266 5.91 5.508 5.135 4.827 4.519 4.181 3.887 3.577 3.239 2.969 2.692 2.409 2.117 1.82 1.618 1.41 1.087 0.848 0.589 0.449 0.169 -0.106 -0.405 -0.577 -1.003 -1.129 -1.318 -1.519 -2.03 -2.3 -2.571 -2.886 -3.294 -3.814 -4.59 -7.63 -10 ,26141 ,KEBNE ,16678062,Wed Nov 24 23:19:54 CET,Thu Nov 25 01:20:31 CET,0.0 1.744 2.161 2.476 2.728 2.935 3.135 3.321 3.642 3.781 3.916 3.914 4.275 4.383 4.579 4.773 4.942 5.015 5.172 5.329 5.556 5.707 5.851 6.049 6.233 6.407 6.58 6.742 6.942 7.136 7.32 7.541 7.764 7.981 8.231 8.495 8.739 9.016 9.319 9.62 9.933 10.308 10.744 11.14 11.608 12.161 12.696 13.176 13.656 14.091 14.363 14.045 13.376 12.608 11.86 11.149 10.477 9.864 9.337 8.814 8.317 7.849 7.42 7.016 6.618 6.248 5.852 5.478 5.156 4.829 4.473 4.159 3.852 3.542 3.297 3.034 2.755 2.478 2.175 1.963 1.752 1.419 1.187 0.928 0.785 0.491 0.187 -0.153 -0.335 -0.764 -0.94 -1.159 -1.373 -1.889 -2.188 -2.505 -2.886 -3.35 -3.903 -4.631 -7.178 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt deleted file mode 100644 index 44fd25ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16777 ,KEBNE ,16678063,Wed Nov 24 23:19:50 CET,Thu Nov 25 01:21:25 CET,0.0 1.792 2.216 2.519 2.775 2.975 3.147 3.298 3.567 3.687 3.803 3.785 4.143 4.245 4.432 4.602 4.779 4.864 5.038 5.203 5.424 5.568 5.702 5.877 6.033 6.184 6.328 6.469 6.662 6.864 7.049 7.266 7.479 7.686 7.91 8.146 8.368 8.59 8.831 9.126 9.433 9.748 10.107 10.463 10.858 11.231 11.594 11.911 12.185 12.359 12.14 11.43 10.693 9.933 9.161 8.363 7.605 6.903 6.291 5.667 5.107 4.614 4.151 3.671 3.223 2.818 2.371 1.949 1.569 1.162 0.742 0.423 0.096 -0.269 -0.569 -0.865 -1.158 -1.47 -1.801 -2.038 -2.286 -2.677 -2.949 -3.22 -3.356 -3.628 -3.921 -4.223 -4.371 -4.781 -4.86 -5.053 -5.256 -5.675 -5.922 -6.197 -6.516 -6.914 -7.397 -8.089 -12.924 -2 ,26445 ,KEBNE ,16678064,Wed Nov 24 23:19:50 CET,Thu Nov 25 01:21:11 CET,0.0 2.538 3.069 3.442 3.737 3.972 4.17 4.361 4.694 4.846 4.982 4.962 5.326 5.43 5.622 5.819 6.012 6.103 6.273 6.44 6.674 6.831 6.985 7.194 7.391 7.575 7.748 7.918 8.142 8.358 8.549 8.768 8.988 9.19 9.432 9.701 9.946 10.205 10.466 10.737 11.023 11.34 11.7 12.048 12.426 12.844 13.288 13.743 14.151 14.347 14.176 13.56 12.811 12.001 11.176 10.332 9.577 8.888 8.252 7.622 7.083 6.59 6.106 5.655 5.221 4.788 4.352 3.975 3.625 3.246 2.85 2.517 2.18 1.816 1.533 1.246 0.935 0.6 0.253 0.024 -0.202 -0.543 -0.795 -1.074 -1.21 -1.484 -1.828 -2.204 -2.385 -2.805 -2.932 -3.15 -3.374 -3.852 -4.126 -4.433 -4.796 -5.238 -5.797 -6.55 -9.633 -3 ,16168 ,KEBNE ,16678065,Wed Nov 24 23:19:50 CET,Thu Nov 25 01:21:29 CET,0.0 1.645 2.16 2.509 2.805 3.055 3.243 3.41 3.714 3.847 3.971 3.978 4.351 4.467 4.694 4.875 5.041 5.125 5.293 5.451 5.685 5.841 5.979 6.16 6.326 6.504 6.684 6.85 7.05 7.239 7.418 7.641 7.862 8.069 8.315 8.589 8.848 9.123 9.4 9.681 9.966 10.282 10.667 11.042 11.449 11.913 12.398 12.851 13.223 13.388 13.164 12.402 11.497 10.515 9.518 8.589 7.668 6.801 6.052 5.261 4.605 4.021 3.444 2.914 2.425 1.965 1.482 1.049 0.66 0.259 -0.131 -0.464 -0.818 -1.186 -1.491 -1.8 -2.102 -2.405 -2.715 -2.945 -3.185 -3.563 -3.833 -4.109 -4.249 -4.541 -4.855 -5.197 -5.386 -5.844 -6.023 -6.251 -6.475 -6.944 -7.216 -7.52 -7.856 -8.255 -8.766 -9.524 -12.504 -4 ,15676 ,KEBNE ,16678066,Wed Nov 24 23:19:50 CET,Thu Nov 25 01:21:29 CET,0.0 2.082 2.605 2.919 3.174 3.388 3.556 3.722 4.041 4.183 4.307 4.274 4.64 4.752 4.952 5.128 5.305 5.387 5.538 5.695 5.909 6.036 6.173 6.387 6.58 6.763 6.944 7.125 7.359 7.573 7.775 7.999 8.203 8.402 8.643 8.933 9.201 9.467 9.747 10.086 10.444 10.786 11.177 11.589 12.012 12.413 12.828 13.213 13.56 13.802 13.796 13.459 12.913 12.188 11.4 10.578 9.827 9.176 8.594 8.007 7.5 6.988 6.445 5.953 5.508 5.091 4.668 4.266 3.912 3.543 3.143 2.798 2.443 2.088 1.81 1.515 1.209 0.899 0.58 0.356 0.129 -0.231 -0.472 -0.733 -0.88 -1.174 -1.469 -1.798 -1.979 -2.437 -2.621 -2.845 -3.068 -3.559 -3.855 -4.191 -4.529 -4.901 -5.384 -6.1 -9.444 -5 ,14375 ,KEBNE ,16678067,Wed Nov 24 23:20:51 CET,Thu Nov 25 01:23:04 CET,0.0 1.803 2.293 2.616 2.861 3.061 3.265 3.471 3.829 3.983 4.121 4.137 4.52 4.63 4.84 5.038 5.237 5.339 5.52 5.672 5.889 6.034 6.175 6.366 6.548 6.731 6.904 7.073 7.281 7.474 7.679 7.932 8.154 8.363 8.597 8.853 9.107 9.365 9.634 9.913 10.169 10.45 10.79 11.103 11.44 11.789 12.112 12.477 12.862 13.132 13.03 12.413 11.577 10.669 9.894 9.176 8.529 7.911 7.275 6.582 5.984 5.407 4.861 4.378 3.882 3.432 3.006 2.632 2.315 1.979 1.603 1.288 0.975 0.638 0.352 0.046 -0.273 -0.591 -0.918 -1.154 -1.402 -1.768 -2.021 -2.294 -2.424 -2.714 -3.042 -3.41 -3.617 -4.072 -4.224 -4.451 -4.703 -5.227 -5.514 -5.849 -6.23 -6.65 -7.14 -7.841 -10.099 -6 ,21769 ,KEBNE ,16678068,Wed Nov 24 23:20:51 CET,Thu Nov 25 01:22:11 CET,0.0 1.962 2.381 2.677 2.935 3.151 3.35 3.515 3.809 3.955 4.084 4.066 4.429 4.535 4.722 4.92 5.114 5.202 5.377 5.538 5.771 5.927 6.061 6.24 6.424 6.591 6.747 6.907 7.112 7.301 7.474 7.674 7.864 8.04 8.243 8.483 8.716 8.959 9.188 9.422 9.677 9.958 10.27 10.58 10.918 11.274 11.655 12.046 12.473 12.794 12.823 12.338 11.71 11.034 10.288 9.515 8.745 7.998 7.355 6.706 6.11 5.588 5.095 4.634 4.229 3.834 3.398 2.992 2.631 2.23 1.796 1.441 1.084 0.71 0.403 0.076 -0.251 -0.564 -0.879 -1.113 -1.376 -1.756 -1.997 -2.248 -2.377 -2.651 -2.971 -3.331 -3.517 -3.977 -4.113 -4.337 -4.572 -5.058 -5.325 -5.631 -5.98 -6.412 -6.911 -7.543 -9.481 -7 ,11880 ,KEBNE ,16678069,Wed Nov 24 23:20:51 CET,Thu Nov 25 01:22:09 CET,0.0 1.661 2.146 2.498 2.788 3.032 3.25 3.438 3.755 3.898 4.024 3.992 4.341 4.448 4.658 4.85 5.032 5.125 5.3 5.458 5.691 5.838 5.976 6.185 6.377 6.558 6.731 6.887 7.088 7.286 7.477 7.704 7.913 8.109 8.326 8.58 8.836 9.103 9.375 9.647 9.915 10.207 10.55 10.898 11.278 11.643 11.99 12.307 12.534 12.643 12.302 11.335 10.368 9.461 8.617 7.798 7.046 6.307 5.616 4.933 4.351 3.833 3.357 2.894 2.43 1.992 1.507 1.083 0.728 0.355 -0.04 -0.384 -0.739 -1.107 -1.397 -1.691 -2.005 -2.311 -2.61 -2.815 -3.021 -3.353 -3.59 -3.85 -3.995 -4.315 -4.633 -4.962 -5.135 -5.564 -5.708 -5.925 -6.155 -6.655 -6.95 -7.307 -7.685 -8.105 -8.651 -9.374 -12.008 -8 ,22412 ,KEBNE ,16678070,Wed Nov 24 23:20:51 CET,Thu Nov 25 01:22:01 CET,0.0 1.558 1.986 2.276 2.506 2.708 2.89 3.072 3.41 3.554 3.683 3.659 4.016 4.124 4.331 4.513 4.684 4.773 4.948 5.113 5.328 5.457 5.59 5.785 5.962 6.127 6.281 6.424 6.61 6.784 6.946 7.159 7.354 7.534 7.75 7.984 8.201 8.426 8.662 8.902 9.154 9.442 9.766 10.06 10.387 10.718 11.083 11.49 11.855 12.069 12.069 11.461 10.56 9.749 8.943 8.161 7.491 6.892 6.335 5.723 5.188 4.694 4.202 3.752 3.338 2.944 2.544 2.185 1.859 1.523 1.182 0.862 0.511 0.164 -0.111 -0.39 -0.696 -1.021 -1.337 -1.542 -1.75 -2.103 -2.375 -2.662 -2.801 -3.1 -3.414 -3.719 -3.883 -4.314 -4.461 -4.669 -4.883 -5.336 -5.583 -5.867 -6.22 -6.641 -7.174 -7.915 -10.376 -9 ,23113 ,KEBNE ,16678071,Wed Nov 24 23:20:51 CET,Thu Nov 25 01:23:37 CET,0.0 1.936 2.393 2.71 2.951 3.174 3.382 3.564 3.885 4.021 4.14 4.114 4.466 4.571 4.768 4.953 5.118 5.197 5.359 5.51 5.726 5.878 6.034 6.245 6.437 6.623 6.796 6.964 7.177 7.375 7.567 7.813 8.059 8.3 8.588 8.901 9.168 9.443 9.752 10.072 10.381 10.719 11.08 11.419 11.799 12.155 12.5 12.859 13.199 13.358 13.167 12.368 11.399 10.459 9.534 8.673 7.897 7.153 6.502 5.857 5.305 4.801 4.287 3.787 3.346 2.965 2.58 2.224 1.908 1.579 1.222 0.909 0.56 0.185 -0.104 -0.397 -0.69 -0.991 -1.309 -1.531 -1.755 -2.113 -2.373 -2.662 -2.81 -3.097 -3.397 -3.716 -3.89 -4.336 -4.452 -4.64 -4.844 -5.291 -5.545 -5.829 -6.155 -6.514 -6.932 -7.565 -10.225 -10 ,29142 ,KEBNE ,16678072,Wed Nov 24 23:20:55 CET,Thu Nov 25 01:22:50 CET,0.0 1.717 2.213 2.525 2.784 3.019 3.231 3.427 3.766 3.908 4.054 4.071 4.441 4.555 4.758 4.948 5.139 5.234 5.416 5.592 5.822 5.976 6.129 6.312 6.488 6.663 6.817 6.967 7.183 7.391 7.577 7.811 8.036 8.247 8.489 8.739 8.997 9.312 9.633 9.936 10.242 10.581 10.952 11.327 11.747 12.209 12.676 13.08 13.396 13.49 13.206 12.39 11.45 10.502 9.617 8.803 8.042 7.302 6.634 5.978 5.422 4.893 4.362 3.836 3.319 2.855 2.361 1.936 1.599 1.239 0.857 0.538 0.196 -0.156 -0.429 -0.724 -1.021 -1.328 -1.674 -1.922 -2.179 -2.577 -2.849 -3.137 -3.284 -3.58 -3.894 -4.22 -4.39 -4.825 -4.992 -5.206 -5.42 -5.895 -6.18 -6.484 -6.808 -7.187 -7.669 -8.335 -10.865 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt deleted file mode 100644 index e2a2b3ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13167 ,KEBNE ,16678073,Wed Nov 24 23:20:51 CET,Thu Nov 25 01:21:42 CET,0.0 1.086 1.413 1.666 1.866 2.039 2.207 2.377 2.69 2.829 2.948 2.931 3.282 3.381 3.568 3.738 3.904 3.986 4.148 4.296 4.509 4.647 4.771 4.954 5.147 5.331 5.49 5.648 5.862 6.063 6.253 6.487 6.71 6.925 7.183 7.459 7.731 8.019 8.325 8.673 9.027 9.442 9.925 10.373 10.873 11.426 11.99 12.57 13.233 13.934 14.574 14.756 14.561 14.202 13.855 13.519 13.146 12.764 12.444 12.124 11.823 11.549 11.28 11.019 10.769 10.541 10.302 10.08 9.896 9.704 9.486 9.296 9.114 8.918 8.761 8.613 8.463 8.303 8.137 8.017 7.882 7.672 7.526 7.378 7.305 7.15 6.975 6.78 6.675 6.319 6.333 6.2 6.066 5.784 5.617 5.436 5.229 4.978 4.704 4.244 2.876 -2 ,25851 ,KEBNE ,16678074,Wed Nov 24 23:20:52 CET,Thu Nov 25 01:22:38 CET,0.0 1.1 1.466 1.722 1.918 2.087 2.249 2.404 2.65 2.754 2.858 2.805 3.175 3.272 3.444 3.607 3.767 3.851 4.016 4.165 4.371 4.5 4.635 4.82 4.986 5.158 5.334 5.491 5.684 5.871 6.043 6.269 6.499 6.711 6.961 7.248 7.511 7.803 8.13 8.455 8.798 9.199 9.646 10.078 10.609 11.152 11.663 12.211 12.798 13.335 13.689 13.685 13.424 13.096 12.765 12.43 12.034 11.632 11.325 11.001 10.685 10.405 10.156 9.925 9.71 9.491 9.239 9.017 8.832 8.654 8.464 8.299 8.14 7.961 7.811 7.66 7.494 7.32 7.145 7.029 6.911 6.71 6.567 6.43 6.358 6.186 6.006 5.818 5.709 5.358 5.38 5.256 5.119 4.796 4.608 4.419 4.202 3.94 3.653 3.257 1.811 -3 ,20208 ,KEBNE ,16678075,Wed Nov 24 23:20:52 CET,Thu Nov 25 01:22:10 CET,0.0 1.072 1.389 1.613 1.807 1.993 2.179 2.337 2.591 2.705 2.818 2.781 3.135 3.231 3.4 3.579 3.767 3.845 3.984 4.124 4.347 4.495 4.632 4.826 4.999 5.168 5.358 5.538 5.747 5.958 6.157 6.392 6.633 6.878 7.151 7.422 7.684 7.984 8.308 8.653 9.012 9.403 9.878 10.366 10.911 11.489 12.114 12.762 13.402 13.98 14.44 14.64 14.536 14.151 13.691 13.284 12.889 12.461 12.101 11.754 11.425 11.115 10.801 10.492 10.223 9.98 9.706 9.463 9.265 9.061 8.85 8.669 8.476 8.283 8.136 7.981 7.811 7.626 7.422 7.276 7.142 6.923 6.756 6.579 6.489 6.3 6.1 5.906 5.803 5.447 5.465 5.349 5.227 4.899 4.708 4.512 4.288 4.047 3.763 3.383 2.289 -4 ,4842 ,KEBNE ,16678076,Wed Nov 24 23:20:52 CET,Thu Nov 25 01:26:57 CET,0.0 1.007 1.388 1.643 1.84 2.043 2.223 2.369 2.654 2.784 2.901 2.87 3.242 3.346 3.54 3.732 3.908 3.987 4.137 4.279 4.477 4.612 4.753 4.948 5.12 5.287 5.448 5.603 5.812 6.003 6.176 6.401 6.617 6.809 7.034 7.283 7.534 7.831 8.145 8.49 8.865 9.285 9.744 10.166 10.679 11.27 11.932 12.635 13.395 14.078 14.474 14.563 14.427 14.1 13.624 13.199 12.857 12.496 12.147 11.759 11.422 11.135 10.85 10.59 10.337 10.059 9.772 9.533 9.319 9.095 8.872 8.673 8.445 8.212 8.041 7.865 7.683 7.492 7.294 7.158 7.014 6.774 6.598 6.428 6.345 6.162 5.976 5.801 5.704 5.356 5.357 5.227 5.09 4.759 4.575 4.396 4.207 3.985 3.664 3.231 2.146 -5 ,26499 ,KEBNE ,16678077,Wed Nov 24 23:20:51 CET,Thu Nov 25 01:22:55 CET,0.0 1.333 1.69 1.929 2.138 2.318 2.484 2.623 2.892 3.014 3.12 3.071 3.438 3.546 3.76 3.967 4.145 4.226 4.38 4.525 4.744 4.89 5.041 5.259 5.449 5.623 5.802 5.978 6.195 6.409 6.616 6.868 7.11 7.34 7.605 7.888 8.163 8.489 8.823 9.176 9.558 9.979 10.468 10.93 11.428 11.987 12.634 13.332 14.099 14.87 15.447 15.409 15.156 14.82 14.451 14.062 13.66 13.278 12.935 12.572 12.232 11.916 11.611 11.334 11.094 10.874 10.632 10.391 10.178 9.958 9.718 9.534 9.351 9.162 9.024 8.872 8.694 8.504 8.316 8.2 8.073 7.836 7.673 7.509 7.427 7.257 7.056 6.847 6.741 6.376 6.387 6.271 6.15 5.843 5.661 5.446 5.206 4.954 4.646 4.232 3.04 -6 ,22506 ,KEBNE ,16678078,Wed Nov 24 23:22:54 CET,Thu Nov 25 01:24:48 CET,0.0 1.15 1.537 1.819 2.054 2.227 2.394 2.551 2.816 2.938 3.055 3.014 3.365 3.467 3.658 3.815 3.963 4.036 4.18 4.324 4.543 4.684 4.813 4.997 5.166 5.351 5.533 5.692 5.897 6.1 6.3 6.527 6.751 6.974 7.223 7.517 7.812 8.1 8.388 8.722 9.084 9.504 9.974 10.417 10.95 11.503 12.044 12.57 13.132 13.715 14.213 14.304 14.129 13.774 13.32 12.923 12.585 12.272 11.988 11.696 11.409 11.142 10.882 10.62 10.376 10.153 9.934 9.726 9.526 9.309 9.105 8.944 8.76 8.564 8.407 8.248 8.084 7.907 7.716 7.59 7.476 7.289 7.148 7.009 6.94 6.796 6.624 6.422 6.32 5.974 6.01 5.901 5.786 5.535 5.384 5.21 5.025 4.818 4.566 4.199 3.214 -7 ,15535 ,KEBNE ,16678079,Wed Nov 24 23:22:54 CET,Thu Nov 25 01:24:46 CET,0.0 0.891 1.229 1.468 1.663 1.834 2.0 2.147 2.379 2.488 2.603 2.59 2.952 3.051 3.223 3.374 3.519 3.596 3.762 3.922 4.137 4.271 4.4 4.593 4.787 4.966 5.131 5.286 5.492 5.7 5.909 6.164 6.392 6.6 6.838 7.105 7.365 7.637 7.918 8.225 8.557 8.932 9.354 9.749 10.199 10.729 11.377 12.012 12.674 13.376 13.862 13.791 13.448 13.07 12.616 12.099 11.594 11.174 10.83 10.451 10.119 9.828 9.559 9.3 9.053 8.815 8.545 8.289 8.068 7.86 7.656 7.485 7.304 7.108 6.943 6.775 6.618 6.435 6.233 6.103 5.965 5.752 5.606 5.445 5.362 5.198 5.025 4.834 4.724 4.372 4.342 4.193 4.044 3.694 3.523 3.306 3.046 2.792 2.504 2.085 0.687 -8 ,29793 ,KEBNE ,16678080,Wed Nov 24 23:22:54 CET,Thu Nov 25 01:25:02 CET,0.0 1.159 1.498 1.764 2.001 2.182 2.325 2.47 2.728 2.85 2.973 2.936 3.304 3.404 3.588 3.755 3.908 3.99 4.151 4.295 4.496 4.63 4.756 4.934 5.107 5.272 5.441 5.606 5.806 6.002 6.194 6.446 6.697 6.926 7.191 7.492 7.774 8.098 8.443 8.805 9.222 9.676 10.171 10.644 11.174 11.756 12.419 13.103 13.8 14.423 15.075 15.619 15.747 15.639 15.427 15.073 14.695 14.318 13.953 13.589 13.265 12.975 12.706 12.413 12.13 11.895 11.619 11.346 11.11 10.869 10.62 10.404 10.185 9.953 9.774 9.597 9.398 9.181 8.955 8.795 8.626 8.371 8.218 8.062 7.969 7.786 7.605 7.388 7.274 6.919 6.927 6.793 6.647 6.333 6.171 6.0 5.802 5.59 5.345 4.977 3.795 -9 ,20987 ,KEBNE ,16678081,Wed Nov 24 23:22:54 CET,Thu Nov 25 01:23:34 CET,0.0 1.071 1.42 1.675 1.886 2.07 2.247 2.392 2.634 2.76 2.876 2.832 3.184 3.287 3.495 3.678 3.838 3.916 4.078 4.238 4.467 4.62 4.758 4.937 5.11 5.294 5.482 5.656 5.869 6.075 6.285 6.55 6.8 7.018 7.251 7.508 7.753 8.014 8.282 8.578 8.904 9.267 9.69 10.125 10.651 11.195 11.779 12.381 12.982 13.6 14.085 14.162 13.87 13.43 13.012 12.621 12.253 11.894 11.579 11.262 10.956 10.67 10.422 10.183 9.936 9.717 9.512 9.322 9.136 8.924 8.688 8.483 8.285 8.096 7.947 7.785 7.619 7.458 7.285 7.166 7.034 6.821 6.667 6.5 6.421 6.252 6.073 5.889 5.789 5.444 5.477 5.361 5.228 4.918 4.756 4.565 4.321 4.072 3.793 3.433 1.898 -10 ,15066 ,KEBNE ,16678082,Wed Nov 24 23:22:57 CET,Thu Nov 25 01:26:10 CET,0.0 0.828 1.169 1.426 1.652 1.849 2.014 2.167 2.466 2.591 2.695 2.656 3.03 3.131 3.31 3.475 3.647 3.734 3.898 4.057 4.269 4.399 4.537 4.74 4.922 5.105 5.274 5.425 5.631 5.818 6.006 6.26 6.495 6.707 6.967 7.252 7.512 7.809 8.122 8.455 8.802 9.19 9.631 10.077 10.601 11.14 11.743 12.348 12.996 13.644 14.128 14.334 14.237 13.936 13.54 13.179 12.863 12.545 12.251 11.951 11.698 11.475 11.257 11.042 10.831 10.626 10.402 10.204 10.03 9.84 9.647 9.487 9.311 9.128 8.977 8.82 8.655 8.486 8.319 8.2 8.076 7.894 7.759 7.592 7.51 7.349 7.147 6.932 6.836 6.479 6.499 6.377 6.242 5.945 5.781 5.598 5.379 5.139 4.862 4.448 3.185 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt deleted file mode 100644 index 76b4faca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17152 ,KEBNE ,17023982,Wed Dec 22 08:55:13 CET,Wed Dec 22 10:57:32 CET,0.0 1.229 1.581 1.837 2.057 2.24 2.422 2.578 2.806 2.91 3.017 2.96 3.304 3.401 3.572 3.747 3.945 4.03 4.172 4.308 4.511 4.643 4.778 4.967 5.13 5.283 5.439 5.585 5.756 5.935 6.13 6.353 6.548 6.73 6.942 7.18 7.427 7.696 7.979 8.29 8.629 9.028 9.473 9.899 10.392 10.912 11.418 11.817 12.221 12.664 12.801 12.407 11.829 11.166 10.474 9.719 9.056 8.514 8.024 7.529 7.105 6.7 6.294 5.92 5.58 5.26 4.91 4.579 4.283 3.996 3.714 3.482 3.249 3.006 2.807 2.599 2.386 2.173 1.943 1.776 1.612 1.356 1.184 1.016 0.932 0.757 0.558 0.351 0.242 -0.126 -0.124 -0.257 -0.382 -0.661 -0.824 -1.004 -1.212 -1.493 -1.828 -2.272 -3.535 -2 ,11550 ,KEBNE ,17023983,Wed Dec 22 08:54:16 CET,Wed Dec 22 10:49:23 CET,0.0 1.113 1.516 1.772 1.97 2.146 2.307 2.453 2.72 2.838 2.95 2.92 3.293 3.387 3.559 3.738 3.918 4.002 4.151 4.293 4.523 4.67 4.796 4.982 5.161 5.338 5.515 5.692 5.923 6.12 6.296 6.523 6.758 6.974 7.21 7.471 7.73 8.029 8.343 8.652 8.963 9.334 9.775 10.185 10.621 11.062 11.529 11.989 12.414 12.677 12.692 12.375 11.764 11.052 10.445 9.893 9.325 8.741 8.236 7.725 7.28 6.906 6.547 6.188 5.847 5.537 5.212 4.929 4.678 4.407 4.129 3.893 3.642 3.369 3.153 2.937 2.707 2.458 2.215 2.046 1.866 1.615 1.444 1.243 1.138 0.93 0.717 0.483 0.353 -0.034 -0.04 -0.179 -0.324 -0.642 -0.82 -0.999 -1.193 -1.473 -1.797 -2.209 -3.827 -3 ,4558 ,KEBNE ,17023984,Wed Dec 22 08:55:13 CET,Wed Dec 22 10:56:30 CET,0.0 1.341 1.821 2.123 2.348 2.547 2.72 2.87 3.136 3.261 3.378 3.344 3.723 3.837 4.05 4.247 4.414 4.493 4.651 4.807 5.017 5.133 5.246 5.417 5.587 5.753 5.92 6.083 6.291 6.498 6.697 6.937 7.164 7.381 7.63 7.907 8.163 8.432 8.717 9.029 9.366 9.717 10.105 10.504 10.977 11.487 12.006 12.502 12.994 13.476 13.676 13.347 12.79 12.143 11.489 10.894 10.362 9.847 9.396 8.952 8.554 8.173 7.804 7.485 7.18 6.892 6.603 6.351 6.129 5.886 5.641 5.44 5.222 4.997 4.821 4.634 4.439 4.227 4.011 3.86 3.707 3.471 3.301 3.123 3.029 2.85 2.66 2.453 2.34 1.973 1.985 1.857 1.71 1.408 1.219 1.003 0.8 0.564 0.258 -0.152 -1.557 -4 ,32755 ,KEBNE ,17023985,Wed Dec 22 08:55:17 CET,Wed Dec 22 10:50:14 CET,0.0 1.262 1.67 1.956 2.171 2.356 2.527 2.696 3.009 3.154 3.3 3.297 3.658 3.76 3.943 4.124 4.31 4.398 4.552 4.696 4.898 5.027 5.151 5.33 5.5 5.668 5.826 5.972 6.169 6.363 6.545 6.758 6.96 7.142 7.341 7.562 7.77 7.999 8.241 8.488 8.763 9.063 9.392 9.704 10.013 10.349 10.697 11.027 11.393 11.61 11.464 11.02 10.531 9.973 9.37 8.772 8.248 7.769 7.361 6.888 6.405 5.962 5.547 5.172 4.811 4.49 4.193 3.919 3.675 3.435 3.185 2.977 2.772 2.562 2.382 2.192 1.982 1.765 1.566 1.427 1.276 1.01 0.837 0.672 0.578 0.394 0.197 -0.048 -0.177 -0.544 -0.538 -0.677 -0.818 -1.119 -1.301 -1.516 -1.734 -1.967 -2.268 -2.693 -3.935 -5 ,16608 ,KEBNE ,17023986,Wed Dec 22 08:55:14 CET,Wed Dec 22 10:50:18 CET,0.0 1.402 1.772 2.035 2.235 2.419 2.588 2.757 3.084 3.218 3.34 3.306 3.666 3.766 3.942 4.116 4.289 4.375 4.544 4.702 4.917 5.055 5.198 5.404 5.586 5.763 5.944 6.125 6.345 6.546 6.733 6.968 7.207 7.429 7.667 7.932 8.209 8.518 8.834 9.133 9.43 9.776 10.173 10.563 10.978 11.368 11.76 12.144 12.554 12.87 12.991 12.676 12.056 11.372 10.706 10.035 9.435 8.916 8.426 7.89 7.417 6.989 6.598 6.252 5.927 5.63 5.318 5.032 4.781 4.531 4.28 4.068 3.849 3.623 3.434 3.216 2.996 2.798 2.612 2.477 2.323 2.083 1.926 1.769 1.686 1.489 1.278 1.064 0.955 0.6 0.588 0.453 0.326 0.049 -0.117 -0.299 -0.494 -0.744 -1.073 -1.529 -2.875 -6 ,17571 ,KEBNE ,17023987,Wed Dec 22 08:55:17 CET,Wed Dec 22 10:50:16 CET,0.0 1.291 1.637 1.897 2.111 2.288 2.447 2.614 2.923 3.046 3.165 3.129 3.487 3.584 3.753 3.922 4.072 4.144 4.288 4.423 4.62 4.744 4.862 5.034 5.196 5.351 5.49 5.631 5.824 5.996 6.153 6.361 6.571 6.758 6.974 7.203 7.426 7.701 7.967 8.232 8.527 8.854 9.192 9.495 9.865 10.238 10.604 10.941 11.188 11.261 11.033 10.478 9.812 9.116 8.445 7.805 7.249 6.786 6.395 5.985 5.562 5.126 4.716 4.364 4.046 3.743 3.416 3.108 2.836 2.559 2.276 2.04 1.795 1.554 1.366 1.152 0.932 0.703 0.466 0.304 0.136 -0.117 -0.281 -0.447 -0.539 -0.746 -0.949 -1.16 -1.273 -1.642 -1.63 -1.759 -1.893 -2.186 -2.356 -2.563 -2.778 -2.995 -3.28 -3.734 -5.046 -7 ,6888 ,KEBNE ,17023988,Wed Dec 22 08:56:15 CET,Wed Dec 22 10:57:15 CET,0.0 1.237 1.589 1.836 2.074 2.291 2.463 2.6 2.847 2.969 3.093 3.062 3.422 3.522 3.709 3.877 4.045 4.131 4.291 4.44 4.648 4.779 4.903 5.067 5.223 5.38 5.529 5.66 5.833 6.02 6.194 6.388 6.584 6.795 7.038 7.287 7.53 7.787 8.035 8.305 8.565 8.811 9.12 9.492 9.922 10.312 10.68 11.035 11.333 11.534 11.616 11.3 10.683 9.978 9.333 8.721 8.154 7.646 7.203 6.75 6.338 5.958 5.609 5.29 4.996 4.709 4.392 4.111 3.871 3.603 3.312 3.073 2.823 2.569 2.381 2.188 1.979 1.757 1.519 1.358 1.199 0.97 0.814 0.622 0.529 0.351 0.145 -0.07 -0.173 -0.536 -0.531 -0.663 -0.798 -1.124 -1.3 -1.496 -1.701 -1.916 -2.228 -2.706 -3.954 -8 ,19534 ,KEBNE ,17023989,Wed Dec 22 09:01:24 CET,Wed Dec 22 11:01:36 CET,0.0 1.222 1.626 1.909 2.122 2.32 2.491 2.64 2.903 3.025 3.151 3.117 3.481 3.582 3.777 3.95 4.107 4.185 4.341 4.49 4.7 4.828 4.966 5.167 5.35 5.514 5.666 5.819 6.012 6.198 6.39 6.621 6.844 7.063 7.297 7.556 7.816 8.103 8.431 8.786 9.133 9.493 9.892 10.285 10.727 11.208 11.743 12.27 12.76 13.14 13.318 13.017 12.385 11.695 11.094 10.535 9.998 9.472 8.996 8.512 8.093 7.736 7.394 7.066 6.774 6.486 6.163 5.883 5.646 5.395 5.148 4.942 4.713 4.481 4.301 4.117 3.931 3.73 3.504 3.346 3.198 2.961 2.789 2.612 2.515 2.327 2.141 1.935 1.829 1.458 1.46 1.327 1.175 0.856 0.703 0.509 0.268 -0.013 -0.363 -0.807 -2.233 -9 ,18054 ,KEBNE ,17023990,Wed Dec 22 09:01:24 CET,Wed Dec 22 11:00:56 CET,0.0 0.981 1.345 1.611 1.829 2.035 2.224 2.392 2.68 2.826 2.973 2.962 3.325 3.426 3.622 3.807 3.98 4.054 4.191 4.324 4.506 4.623 4.745 4.921 5.091 5.262 5.426 5.575 5.776 5.993 6.19 6.405 6.611 6.812 7.054 7.323 7.557 7.83 8.138 8.445 8.741 9.064 9.428 9.768 10.128 10.52 10.974 11.43 11.825 12.029 11.948 11.518 10.919 10.165 9.487 8.902 8.37 7.885 7.416 6.917 6.486 6.085 5.7 5.366 5.048 4.72 4.381 4.078 3.805 3.516 3.214 2.979 2.749 2.498 2.291 2.083 1.878 1.667 1.442 1.282 1.126 0.879 0.684 0.488 0.391 0.191 -0.008 -0.227 -0.333 -0.69 -0.691 -0.814 -0.942 -1.257 -1.434 -1.617 -1.824 -2.075 -2.403 -2.831 -4.096 -10 ,27533 ,KEBNE ,17023991,Wed Dec 22 09:02:27 CET,Wed Dec 22 11:03:51 CET,0.0 1.299 1.714 2.026 2.263 2.446 2.62 2.781 3.072 3.203 3.312 3.294 3.675 3.773 3.974 4.175 4.357 4.445 4.604 4.76 4.995 5.135 5.268 5.475 5.669 5.84 6.017 6.193 6.393 6.581 6.766 6.994 7.214 7.429 7.685 7.964 8.231 8.52 8.806 9.093 9.38 9.683 10.064 10.463 10.885 11.3 11.762 12.232 12.61 12.868 12.722 12.108 11.523 10.917 10.29 9.629 8.985 8.415 7.967 7.526 7.137 6.8 6.466 6.138 5.849 5.587 5.305 5.051 4.829 4.59 4.324 4.108 3.881 3.61 3.398 3.184 2.957 2.739 2.523 2.364 2.194 1.943 1.772 1.578 1.477 1.283 1.07 0.854 0.74 0.369 0.356 0.227 0.094 -0.189 -0.345 -0.516 -0.706 -0.938 -1.256 -1.696 -3.123 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt deleted file mode 100644 index 61a882fe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21977 ,KEBNE ,16678083,Wed Nov 24 23:22:57 CET,Thu Nov 25 01:23:01 CET,0.0 1.154 1.579 1.907 2.161 2.387 2.61 2.818 3.164 3.307 3.443 3.6 3.82 3.937 4.154 4.374 4.593 4.699 4.889 5.061 5.317 5.484 5.643 5.865 6.081 6.303 6.515 6.711 6.964 7.208 7.441 7.737 8.044 8.347 8.696 9.067 9.401 9.767 10.141 10.526 10.959 11.452 11.996 12.511 13.123 13.772 14.503 15.365 16.287 17.17 17.942 18.19 17.989 17.711 17.39 16.989 16.559 16.049 15.462 14.825 14.328 13.923 13.548 13.192 12.846 12.526 12.166 11.849 11.596 11.322 11.026 10.774 10.507 10.227 10.001 9.766 9.506 9.211 8.9 8.689 8.476 8.157 7.94 7.717 7.601 7.365 7.104 6.815 6.667 6.39 6.113 5.913 5.71 5.267 5.014 4.747 4.482 4.169 3.782 3.247 1.296 -2 ,8196 ,KEBNE ,16678084,Wed Nov 24 23:22:58 CET,Thu Nov 25 01:24:50 CET,0.0 1.78 2.209 2.5 2.752 3.01 3.223 3.388 3.705 3.85 3.985 4.123 4.365 4.469 4.684 4.892 5.091 5.189 5.377 5.551 5.792 5.949 6.119 6.39 6.639 6.868 7.1 7.328 7.606 7.865 8.104 8.388 8.672 8.955 9.286 9.649 9.981 10.35 10.745 11.111 11.454 11.831 12.264 12.735 13.294 13.813 14.37 14.963 15.55 16.156 16.552 16.33 15.75 15.077 14.47 13.91 13.387 12.878 12.413 11.919 11.473 11.082 10.698 10.298 9.878 9.466 9.044 8.665 8.326 7.984 7.627 7.309 6.961 6.591 6.319 6.069 5.818 5.54 5.243 5.039 4.83 4.522 4.312 4.081 3.962 3.708 3.406 3.072 2.907 2.637 2.418 2.228 2.012 1.543 1.297 1.031 0.709 0.344 -0.079 -0.69 -3.147 -3 ,13683 ,KEBNE ,16678085,Wed Nov 24 23:22:53 CET,Thu Nov 25 01:23:15 CET,0.0 1.035 1.419 1.691 1.907 2.097 2.259 2.421 2.714 2.842 2.972 3.11 3.333 3.444 3.646 3.867 4.084 4.181 4.368 4.558 4.827 4.989 5.137 5.35 5.564 5.766 5.959 6.164 6.425 6.662 6.886 7.142 7.39 7.636 7.925 8.246 8.537 8.854 9.219 9.606 10.006 10.46 10.985 11.516 12.103 12.723 13.398 14.111 14.902 15.658 16.32 16.311 15.694 14.969 14.318 13.652 12.993 12.394 11.919 11.43 10.972 10.545 10.126 9.72 9.313 8.947 8.58 8.26 8.004 7.71 7.371 7.084 6.794 6.51 6.283 6.047 5.798 5.511 5.218 5.03 4.837 4.522 4.291 4.024 3.868 3.552 3.224 2.882 2.722 2.442 2.207 2.015 1.789 1.297 1.039 0.75 0.423 0.056 -0.378 -1.013 -3.377 -4 ,7761 ,KEBNE ,16678086,Wed Nov 24 23:22:53 CET,Thu Nov 25 01:24:30 CET,0.0 1.516 2.002 2.304 2.557 2.779 2.989 3.196 3.549 3.681 3.804 3.926 4.157 4.273 4.501 4.708 4.889 4.975 5.15 5.326 5.589 5.757 5.92 6.148 6.371 6.597 6.821 7.039 7.321 7.601 7.864 8.17 8.467 8.756 9.091 9.452 9.779 10.125 10.498 10.892 11.297 11.806 12.426 12.988 13.552 14.083 14.618 15.205 15.8 16.241 16.456 16.245 15.719 15.109 14.557 13.999 13.42 12.853 12.371 11.849 11.364 10.924 10.48 10.036 9.608 9.23 8.842 8.496 8.201 7.897 7.591 7.325 7.036 6.726 6.474 6.222 5.965 5.687 5.376 5.17 4.972 4.644 4.394 4.148 4.029 3.765 3.488 3.216 3.06 2.768 2.516 2.312 2.113 1.697 1.445 1.162 0.839 0.472 0.013 -0.644 -2.601 -5 ,16635 ,KEBNE ,16678087,Wed Nov 24 23:22:53 CET,Thu Nov 25 01:25:02 CET,0.0 1.452 1.804 2.077 2.304 2.511 2.706 2.872 3.16 3.286 3.405 3.548 3.776 3.907 4.166 4.409 4.633 4.743 4.939 5.113 5.379 5.559 5.734 5.996 6.225 6.405 6.584 6.765 7.002 7.244 7.485 7.749 8.007 8.258 8.534 8.889 9.238 9.575 9.947 10.36 10.778 11.277 11.867 12.433 13.048 13.679 14.384 15.148 15.998 16.735 17.212 17.198 16.798 16.224 15.61 14.977 14.383 13.773 13.25 12.774 12.354 11.953 11.576 11.254 10.93 10.601 10.224 9.878 9.624 9.357 9.046 8.794 8.52 8.206 7.952 7.672 7.379 7.084 6.754 6.534 6.316 6.003 5.8 5.579 5.466 5.2 4.876 4.546 4.389 4.118 3.876 3.701 3.534 3.15 2.921 2.647 2.351 2.009 1.536 0.888 -1.5 -6 ,5176 ,KEBNE ,16678088,Wed Nov 24 23:23:56 CET,Thu Nov 25 01:24:07 CET,0.0 1.046 1.398 1.673 1.908 2.114 2.296 2.453 2.751 2.894 3.016 3.16 3.388 3.497 3.71 3.914 4.109 4.209 4.422 4.632 4.924 5.099 5.254 5.48 5.708 5.927 6.136 6.328 6.585 6.847 7.093 7.372 7.641 7.903 8.219 8.59 8.93 9.277 9.654 10.076 10.521 10.983 11.517 12.043 12.599 13.196 13.866 14.601 15.439 16.251 16.67 16.362 15.659 14.951 14.238 13.456 12.775 12.2 11.681 11.183 10.751 10.305 9.856 9.435 9.033 8.662 8.263 7.867 7.483 7.069 6.645 6.305 5.963 5.599 5.306 5.022 4.734 4.413 4.065 3.808 3.545 3.164 2.898 2.613 2.469 2.176 1.855 1.511 1.337 1.046 0.751 0.536 0.306 -0.181 -0.432 -0.709 -1.017 -1.386 -1.848 -2.465 -4.477 -7 ,31240 ,KEBNE ,16678089,Wed Nov 24 23:23:56 CET,Thu Nov 25 01:27:17 CET,0.0 1.079 1.466 1.76 2.013 2.224 2.428 2.623 2.955 3.099 3.239 3.387 3.639 3.764 4.001 4.237 4.462 4.569 4.787 4.99 5.252 5.419 5.583 5.819 6.038 6.244 6.443 6.648 6.912 7.171 7.42 7.696 7.966 8.23 8.518 8.833 9.119 9.414 9.722 10.056 10.408 10.819 11.329 11.815 12.339 12.878 13.378 13.871 14.417 14.86 15.072 14.839 14.334 13.821 13.324 12.795 12.293 11.816 11.376 10.902 10.475 10.062 9.652 9.283 8.936 8.584 8.181 7.824 7.523 7.218 6.914 6.654 6.373 6.076 5.831 5.578 5.314 5.032 4.721 4.492 4.271 3.92 3.653 3.383 3.242 2.948 2.646 2.337 2.168 1.877 1.633 1.436 1.22 0.751 0.459 0.147 -0.165 -0.546 -1.041 -1.773 -4.015 -8 ,9894 ,KEBNE ,16678090,Wed Nov 24 23:23:55 CET,Thu Nov 25 01:25:12 CET,0.0 1.529 1.95 2.239 2.488 2.7 2.877 3.037 3.312 3.439 3.566 3.692 3.936 4.038 4.229 4.426 4.625 4.722 4.917 5.096 5.355 5.52 5.677 5.909 6.131 6.344 6.55 6.749 6.995 7.223 7.439 7.692 7.943 8.178 8.439 8.737 9.02 9.328 9.669 10.008 10.356 10.757 11.234 11.702 12.185 12.728 13.308 13.833 14.47 15.16 15.586 15.465 15.034 14.526 14.013 13.517 13.022 12.505 12.034 11.551 11.133 10.736 10.332 9.952 9.585 9.227 8.856 8.534 8.25 7.945 7.64 7.382 7.109 6.813 6.56 6.291 6.018 5.735 5.443 5.244 5.036 4.69 4.442 4.188 4.059 3.802 3.499 3.16 2.994 2.7 2.41 2.205 1.984 1.516 1.261 0.978 0.654 0.27 -0.178 -0.813 -2.78 -9 ,21799 ,KEBNE ,16678091,Wed Nov 24 23:23:56 CET,Thu Nov 25 01:25:40 CET,0.0 1.311 1.725 2.019 2.267 2.48 2.659 2.838 3.166 3.323 3.46 3.586 3.816 3.928 4.156 4.369 4.574 4.683 4.9 5.089 5.341 5.493 5.637 5.856 6.068 6.268 6.459 6.648 6.891 7.131 7.354 7.629 7.916 8.186 8.489 8.816 9.118 9.459 9.839 10.235 10.66 11.122 11.618 12.135 12.717 13.33 14.044 14.756 15.424 16.012 16.452 16.571 16.369 15.88 15.297 14.704 14.14 13.607 13.139 12.625 12.111 11.612 11.144 10.727 10.331 9.931 9.498 9.122 8.816 8.512 8.192 7.93 7.641 7.324 7.081 6.836 6.564 6.248 5.93 5.718 5.491 5.134 4.868 4.58 4.423 4.098 3.77 3.427 3.257 2.972 2.703 2.502 2.307 1.777 1.449 1.126 0.786 0.391 -0.116 -0.792 -3.123 -10 ,4209 ,KEBNE ,16678092,Wed Nov 24 23:23:56 CET,Thu Nov 25 01:25:32 CET,0.0 1.23 1.629 1.893 2.114 2.295 2.463 2.622 2.926 3.072 3.211 3.356 3.56 3.656 3.855 4.058 4.25 4.34 4.514 4.695 4.96 5.117 5.266 5.486 5.69 5.898 6.097 6.287 6.538 6.784 7.006 7.251 7.508 7.78 8.083 8.415 8.767 9.128 9.502 9.941 10.408 10.891 11.449 12.006 12.577 13.173 13.869 14.539 15.158 15.585 15.637 15.24 14.563 13.874 13.202 12.538 11.892 11.276 10.739 10.146 9.608 9.131 8.644 8.153 7.708 7.337 6.94 6.578 6.281 5.963 5.632 5.363 5.07 4.754 4.508 4.251 3.977 3.693 3.403 3.202 2.999 2.682 2.451 2.213 2.084 1.801 1.493 1.152 0.965 0.664 0.398 0.191 -0.036 -0.543 -0.804 -1.087 -1.422 -1.821 -2.292 -2.952 -5.042 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt deleted file mode 100644 index 2476b3db..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24217 ,KEBNE ,17023992,Wed Dec 22 09:02:27 CET,Wed Dec 22 11:02:26 CET,0.0 1.477 1.964 2.298 2.598 2.872 3.125 3.352 3.74 3.916 4.085 4.292 4.553 4.694 4.972 5.224 5.455 5.565 5.793 6.014 6.32 6.515 6.704 6.98 7.234 7.487 7.738 7.976 8.267 8.544 8.83 9.188 9.535 9.857 10.209 10.586 10.931 11.308 11.725 12.174 12.651 13.184 13.8 14.411 15.109 15.851 16.65 17.491 18.442 19.481 20.358 20.622 20.291 19.703 19.175 18.695 18.182 17.629 17.167 16.69 16.211 15.783 15.382 14.968 14.561 14.182 13.771 13.403 13.077 12.691 12.269 11.931 11.593 11.234 10.945 10.645 10.342 10.023 9.679 9.443 9.203 8.833 8.562 8.267 8.12 7.814 7.483 7.137 6.954 6.657 6.385 6.161 5.917 5.376 5.079 4.754 4.395 4.004 3.538 2.796 0.519 -2 ,14630 ,KEBNE ,17023993,Wed Dec 22 09:02:27 CET,Wed Dec 22 11:02:17 CET,0.0 1.746 2.359 2.695 2.954 3.202 3.444 3.654 4.016 4.186 4.339 4.523 4.754 4.879 5.11 5.335 5.551 5.658 5.863 6.055 6.318 6.475 6.627 6.85 7.063 7.267 7.463 7.663 7.937 8.183 8.408 8.695 8.996 9.281 9.586 9.926 10.251 10.605 10.975 11.368 11.781 12.246 12.776 13.297 13.898 14.5 15.164 15.935 16.752 17.476 18.043 17.89 17.229 16.49 15.725 14.981 14.317 13.692 13.128 12.463 11.777 11.138 10.562 10.051 9.608 9.231 8.851 8.501 8.167 7.808 7.436 7.114 6.787 6.46 6.197 5.919 5.634 5.327 5.01 4.787 4.541 4.165 3.901 3.626 3.489 3.196 2.873 2.523 2.344 2.055 1.795 1.592 1.379 0.882 0.587 0.254 -0.097 -0.503 -1.017 -1.818 -4.755 -3 ,1181 ,KEBNE ,17023994,Wed Dec 22 09:02:27 CET,Wed Dec 22 11:03:08 CET,0.0 1.26 1.736 2.107 2.41 2.68 2.932 3.192 3.642 3.827 3.992 4.186 4.43 4.585 4.902 5.219 5.502 5.618 5.848 6.056 6.334 6.524 6.701 6.932 7.169 7.414 7.647 7.876 8.174 8.466 8.752 9.092 9.42 9.724 10.057 10.441 10.803 11.197 11.616 12.06 12.545 13.065 13.634 14.176 14.791 15.469 16.285 17.243 18.26 19.192 19.884 19.921 19.488 18.81 17.979 17.133 16.372 15.617 14.934 14.233 13.615 13.078 12.55 12.054 11.583 11.131 10.67 10.253 9.864 9.473 9.096 8.75 8.398 8.062 7.791 7.488 7.153 6.814 6.455 6.18 5.894 5.506 5.252 4.985 4.849 4.588 4.325 4.031 3.872 3.583 3.36 3.175 2.945 2.411 2.153 1.845 1.456 0.975 0.325 -0.561 -4.237 -4 ,29263 ,KEBNE ,17023995,Wed Dec 22 09:03:29 CET,Wed Dec 22 11:03:16 CET,0.0 2.188 2.715 3.065 3.368 3.611 3.84 4.063 4.438 4.601 4.755 4.921 5.179 5.315 5.584 5.824 6.052 6.165 6.378 6.588 6.89 7.08 7.258 7.504 7.741 7.973 8.2 8.433 8.721 8.978 9.233 9.543 9.878 10.244 10.639 11.034 11.391 11.767 12.184 12.628 13.09 13.621 14.222 14.802 15.494 16.257 17.103 18.057 19.133 20.244 21.222 21.557 21.18 20.585 19.985 19.397 18.826 18.21 17.718 17.256 16.811 16.411 15.991 15.546 15.123 14.754 14.377 14.045 13.748 13.42 13.08 12.796 12.49 12.143 11.877 11.594 11.234 10.822 10.453 10.229 9.989 9.608 9.343 9.069 8.927 8.639 8.315 7.954 7.772 7.456 7.203 6.985 6.745 6.281 6.041 5.763 5.457 5.091 4.645 3.822 -0.284 -5 ,2972 ,KEBNE ,17023996,Wed Dec 22 09:06:33 CET,Wed Dec 22 11:07:07 CET,0.0 2.004 2.605 3.035 3.394 3.726 3.997 4.237 4.672 4.862 5.027 5.257 5.516 5.651 5.918 6.193 6.447 6.557 6.768 6.978 7.296 7.495 7.672 7.946 8.206 8.425 8.642 8.854 9.12 9.407 9.691 9.993 10.283 10.559 10.89 11.264 11.59 11.925 12.287 12.693 13.131 13.61 14.14 14.695 15.331 15.966 16.663 17.393 18.243 19.128 19.72 19.696 19.278 18.567 17.757 16.952 16.17 15.448 14.822 14.171 13.633 13.144 12.624 12.1 11.605 11.16 10.685 10.275 9.961 9.614 9.195 8.841 8.486 8.14 7.885 7.609 7.32 7.004 6.627 6.372 6.118 5.703 5.415 5.101 4.935 4.604 4.265 3.902 3.707 3.374 3.04 2.79 2.514 1.892 1.538 1.171 0.767 0.267 -0.367 -1.193 -3.949 -6 ,28533 ,KEBNE ,17023997,Wed Dec 22 09:06:35 CET,Wed Dec 22 11:04:00 CET,0.0 0.923 1.476 1.963 2.231 2.444 2.64 2.827 3.168 3.322 3.467 3.641 3.866 3.988 4.224 4.438 4.64 4.738 4.934 5.126 5.407 5.583 5.755 6.007 6.236 6.465 6.688 6.89 7.139 7.377 7.616 7.918 8.202 8.469 8.805 9.174 9.5 9.864 10.25 10.632 11.019 11.474 12.028 12.573 13.19 13.868 14.623 15.447 16.363 17.329 18.101 18.171 17.908 17.583 17.2 16.766 16.306 15.799 15.291 14.76 14.294 13.887 13.489 13.081 12.695 12.324 11.932 11.59 11.288 10.956 10.599 10.304 9.962 9.573 9.289 9.004 8.701 8.382 8.043 7.797 7.516 7.101 6.835 6.532 6.369 6.051 5.73 5.407 5.222 4.887 4.532 4.275 4.015 3.453 3.136 2.772 2.371 1.946 1.409 0.547 -2.727 -7 ,11866 ,KEBNE ,17023998,Wed Dec 22 09:06:37 CET,Wed Dec 22 11:01:41 CET,0.0 1.986 2.62 3.067 3.396 3.664 3.937 4.183 4.566 4.733 4.89 5.099 5.361 5.49 5.751 6.02 6.264 6.376 6.603 6.81 7.081 7.264 7.45 7.75 8.046 8.299 8.549 8.789 9.054 9.308 9.57 9.877 10.166 10.466 10.819 11.226 11.603 11.975 12.383 12.841 13.319 13.833 14.407 14.994 15.658 16.394 17.266 18.188 19.16 20.127 20.87 20.992 20.786 20.276 19.615 19.047 18.499 17.944 17.453 16.921 16.423 15.957 15.535 15.118 14.69 14.313 13.925 13.581 13.27 12.919 12.559 12.263 11.954 11.626 11.351 11.076 10.792 10.489 10.188 9.99 9.771 9.405 9.147 8.866 8.719 8.426 8.118 7.768 7.57 7.251 6.943 6.735 6.512 5.973 5.671 5.352 5.002 4.57 3.999 3.193 0.403 -8 ,31273 ,KEBNE ,17023999,Wed Dec 22 09:07:35 CET,Wed Dec 22 11:08:07 CET,0.0 1.977 2.432 2.782 3.078 3.337 3.559 3.749 4.129 4.309 4.47 4.676 4.938 5.08 5.336 5.59 5.835 5.954 6.182 6.395 6.696 6.897 7.091 7.374 7.64 7.882 8.115 8.341 8.651 8.935 9.201 9.54 9.848 10.132 10.451 10.816 11.167 11.539 11.944 12.391 12.875 13.412 14.011 14.611 15.3 16.078 16.969 17.918 18.994 20.086 20.951 21.104 20.813 20.394 19.794 19.095 18.398 17.713 17.059 16.41 15.899 15.41 14.903 14.427 13.962 13.504 13.029 12.597 12.223 11.843 11.444 11.106 10.755 10.366 10.05 9.739 9.419 9.084 8.73 8.485 8.224 7.806 7.515 7.207 7.042 6.701 6.367 6.008 5.813 5.503 5.167 4.942 4.699 4.17 3.88 3.523 3.085 2.614 2.056 1.3 -1.608 -9 ,30219 ,KEBNE ,17024000,Wed Dec 22 09:08:37 CET,Wed Dec 22 11:10:50 CET,0.0 1.703 2.159 2.476 2.76 3.008 3.221 3.43 3.846 4.043 4.209 4.399 4.645 4.784 5.041 5.268 5.495 5.615 5.841 6.045 6.336 6.53 6.715 6.979 7.227 7.46 7.704 7.944 8.232 8.499 8.754 9.047 9.329 9.61 9.95 10.328 10.683 11.075 11.485 11.927 12.39 12.916 13.552 14.162 14.87 15.683 16.57 17.49 18.491 19.432 20.09 20.158 19.77 19.13 18.541 17.966 17.302 16.661 16.129 15.59 15.089 14.599 14.125 13.663 13.22 12.815 12.379 11.957 11.593 11.226 10.833 10.529 10.204 9.854 9.591 9.33 9.061 8.762 8.432 8.188 7.944 7.556 7.282 7.005 6.85 6.527 6.206 5.852 5.656 5.339 5.053 4.843 4.619 4.128 3.857 3.537 3.187 2.816 2.29 1.495 -1.548 -10 ,7813 ,KEBNE ,17024001,Wed Dec 22 09:08:37 CET,Wed Dec 22 11:09:08 CET,0.0 1.355 1.798 2.156 2.447 2.709 2.95 3.154 3.488 3.646 3.807 3.978 4.205 4.325 4.56 4.775 4.979 5.08 5.285 5.465 5.714 5.878 6.032 6.263 6.494 6.709 6.915 7.115 7.377 7.641 7.89 8.183 8.476 8.748 9.068 9.434 9.769 10.13 10.511 10.914 11.337 11.822 12.396 12.96 13.596 14.234 14.908 15.658 16.489 17.327 18.087 18.291 17.981 17.449 16.727 16.0 15.405 14.839 14.299 13.732 13.214 12.746 12.309 11.869 11.425 10.991 10.532 10.062 9.63 9.225 8.817 8.493 8.169 7.82 7.527 7.226 6.94 6.647 6.331 6.095 5.846 5.465 5.198 4.916 4.759 4.437 4.11 3.757 3.564 3.259 2.945 2.705 2.448 1.891 1.573 1.229 0.857 0.412 -0.146 -0.973 -4.061 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt deleted file mode 100644 index 04474494..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6495 ,KEBNE ,16678093,Wed Nov 24 23:23:56 CET,Thu Nov 25 01:26:12 CET,0.0 1.11 1.564 1.92 2.181 2.407 2.594 2.781 3.146 3.301 3.442 3.59 3.82 3.937 4.149 4.327 4.484 4.559 4.702 4.836 5.037 5.177 5.306 5.477 5.638 5.788 5.942 6.097 6.286 6.478 6.67 6.887 7.097 7.299 7.52 7.746 7.96 8.197 8.432 8.673 8.924 9.215 9.58 9.942 10.377 10.922 11.454 11.923 12.398 12.749 12.855 12.629 12.283 11.808 11.274 10.771 10.288 9.834 9.465 9.083 8.72 8.379 8.033 7.697 7.4 7.139 6.866 6.604 6.356 6.085 5.821 5.602 5.368 5.137 4.963 4.766 4.549 4.327 4.102 3.947 3.758 3.467 3.263 3.042 2.938 2.72 2.483 2.225 2.099 1.873 1.695 1.548 1.399 1.046 0.833 0.587 0.294 -0.011 -0.357 -0.839 -1.963 -2 ,22761 ,KEBNE ,16678094,Wed Nov 24 23:23:56 CET,Thu Nov 25 01:26:06 CET,0.0 1.189 1.577 1.884 2.161 2.379 2.561 2.712 2.983 3.127 3.272 3.407 3.64 3.756 3.966 4.168 4.363 4.461 4.655 4.842 5.104 5.274 5.437 5.659 5.876 6.091 6.281 6.464 6.705 6.932 7.17 7.462 7.726 7.962 8.205 8.49 8.759 9.056 9.393 9.755 10.155 10.566 10.943 11.271 11.627 11.997 12.395 12.802 13.238 13.638 13.765 13.512 13.05 12.56 12.075 11.593 11.122 10.649 10.219 9.783 9.442 9.132 8.78 8.438 8.148 7.897 7.615 7.335 7.087 6.841 6.58 6.348 6.111 5.856 5.652 5.448 5.239 5.024 4.797 4.631 4.462 4.208 4.038 3.856 3.759 3.526 3.255 3.003 2.876 2.637 2.444 2.289 2.125 1.778 1.59 1.372 1.126 0.837 0.507 0.04 -1.24 -3 ,21750 ,KEBNE ,16678095,Wed Nov 24 23:23:56 CET,Thu Nov 25 01:26:58 CET,0.0 1.049 1.433 1.738 1.989 2.195 2.382 2.562 2.866 2.999 3.129 3.27 3.495 3.614 3.846 4.064 4.264 4.361 4.543 4.73 5.005 5.172 5.336 5.573 5.794 6.003 6.199 6.393 6.618 6.803 6.967 7.154 7.345 7.54 7.748 7.968 8.188 8.442 8.715 8.987 9.257 9.559 9.927 10.29 10.683 11.099 11.533 11.947 12.334 12.688 12.861 12.631 12.25 11.794 11.303 10.825 10.38 9.966 9.592 9.198 8.846 8.511 8.177 7.852 7.54 7.281 7.015 6.768 6.544 6.299 6.031 5.8 5.572 5.325 5.123 4.927 4.726 4.51 4.286 4.134 3.976 3.727 3.547 3.353 3.247 3.028 2.805 2.553 2.42 2.184 1.982 1.816 1.639 1.233 1.003 0.744 0.464 0.164 -0.225 -0.764 -2.29 -4 ,31916 ,KEBNE ,16678096,Wed Nov 24 23:25:58 CET,Thu Nov 25 01:28:22 CET,0.0 1.363 1.747 2.041 2.284 2.482 2.691 2.902 3.261 3.411 3.564 3.717 3.918 4.023 4.241 4.47 4.693 4.796 4.985 5.172 5.433 5.588 5.743 5.967 6.187 6.399 6.584 6.757 6.986 7.211 7.422 7.662 7.894 8.124 8.364 8.611 8.86 9.122 9.379 9.646 9.933 10.24 10.6 10.976 11.366 11.762 12.199 12.664 13.128 13.544 13.765 13.637 13.301 12.878 12.468 12.051 11.649 11.267 10.908 10.503 10.153 9.848 9.534 9.225 8.94 8.681 8.418 8.187 7.982 7.75 7.501 7.296 7.075 6.854 6.688 6.508 6.308 6.094 5.875 5.728 5.572 5.33 5.153 4.939 4.836 4.652 4.456 4.239 4.127 3.903 3.754 3.612 3.449 3.093 2.899 2.69 2.426 2.113 1.792 1.378 0.208 -5 ,4775 ,KEBNE ,16678097,Wed Nov 24 23:25:59 CET,Thu Nov 25 01:29:17 CET,0.0 1.08 1.434 1.74 2.016 2.249 2.435 2.615 2.985 3.16 3.306 3.467 3.694 3.807 4.015 4.207 4.396 4.483 4.631 4.767 4.962 5.087 5.213 5.39 5.566 5.74 5.895 6.038 6.238 6.429 6.589 6.773 6.959 7.154 7.375 7.611 7.831 8.079 8.352 8.626 8.898 9.202 9.526 9.842 10.21 10.591 10.992 11.427 11.853 12.143 12.252 11.973 11.551 11.118 10.663 10.214 9.783 9.352 8.971 8.583 8.244 7.931 7.617 7.296 6.992 6.72 6.437 6.186 5.959 5.715 5.451 5.22 4.978 4.709 4.508 4.315 4.106 3.9 3.692 3.536 3.377 3.123 2.944 2.778 2.686 2.478 2.265 2.046 1.922 1.688 1.518 1.38 1.236 0.892 0.707 0.486 0.231 -0.053 -0.401 -0.863 -2.037 -6 ,6477 ,KEBNE ,16678098,Wed Nov 24 23:25:59 CET,Thu Nov 25 01:29:23 CET,0.0 1.403 1.812 2.131 2.375 2.578 2.766 2.941 3.279 3.437 3.573 3.723 3.957 4.082 4.309 4.532 4.746 4.846 5.037 5.213 5.462 5.622 5.776 5.997 6.198 6.391 6.578 6.758 6.985 7.173 7.352 7.577 7.785 7.981 8.188 8.419 8.654 8.909 9.19 9.479 9.769 10.08 10.44 10.798 11.197 11.609 12.055 12.492 12.89 13.251 13.415 13.144 12.678 12.16 11.62 11.11 10.628 10.157 9.743 9.333 8.987 8.662 8.316 7.984 7.665 7.359 7.048 6.788 6.556 6.295 6.034 5.821 5.591 5.349 5.154 4.95 4.731 4.488 4.227 4.042 3.848 3.564 3.387 3.195 3.09 2.875 2.651 2.413 2.287 2.044 1.869 1.72 1.555 1.203 1.004 0.777 0.487 0.163 -0.183 -0.599 -1.775 -7 ,20257 ,KEBNE ,16678099,Wed Nov 24 23:25:59 CET,Thu Nov 25 01:31:56 CET,0.0 1.091 1.53 1.837 2.069 2.287 2.479 2.651 2.963 3.104 3.239 3.388 3.622 3.745 3.954 4.16 4.368 4.459 4.604 4.73 4.943 5.091 5.234 5.433 5.613 5.793 5.972 6.141 6.346 6.54 6.735 6.974 7.193 7.4 7.63 7.871 8.091 8.341 8.607 8.889 9.195 9.514 9.856 10.189 10.547 10.942 11.417 11.864 12.35 12.792 12.936 12.68 12.206 11.704 11.203 10.715 10.258 9.784 9.354 8.937 8.574 8.248 7.922 7.619 7.353 7.105 6.845 6.584 6.343 6.108 5.857 5.638 5.411 5.163 4.967 4.763 4.528 4.285 4.056 3.894 3.724 3.468 3.273 3.07 2.97 2.77 2.556 2.311 2.188 1.964 1.798 1.655 1.495 1.124 0.934 0.733 0.477 0.181 -0.135 -0.6 -2.168 -8 ,20128 ,KEBNE ,16678100,Wed Nov 24 23:25:58 CET,Thu Nov 25 01:28:50 CET,0.0 1.398 1.808 2.103 2.359 2.579 2.769 2.937 3.237 3.371 3.505 3.652 3.86 3.951 4.132 4.319 4.5 4.577 4.714 4.863 5.073 5.205 5.334 5.506 5.685 5.866 6.024 6.164 6.366 6.57 6.745 6.936 7.124 7.321 7.53 7.748 7.958 8.196 8.463 8.728 9.012 9.336 9.669 9.959 10.289 10.662 11.055 11.468 11.919 12.267 12.359 12.029 11.509 10.943 10.413 9.899 9.422 8.993 8.593 8.173 7.786 7.444 7.142 6.84 6.55 6.27 5.98 5.732 5.49 5.202 4.905 4.669 4.404 4.118 3.916 3.716 3.497 3.266 3.01 2.834 2.663 2.376 2.171 1.974 1.876 1.666 1.43 1.167 1.027 0.777 0.573 0.414 0.253 -0.098 -0.293 -0.498 -0.721 -0.991 -1.342 -1.781 -3.123 -9 ,22262 ,KEBNE ,16678101,Wed Nov 24 23:25:58 CET,Thu Nov 25 01:29:27 CET,0.0 1.263 1.705 2.025 2.272 2.468 2.645 2.798 3.074 3.196 3.31 3.433 3.632 3.73 3.908 4.078 4.244 4.324 4.475 4.618 4.839 4.975 5.098 5.273 5.437 5.601 5.771 5.941 6.151 6.341 6.528 6.749 6.953 7.155 7.378 7.616 7.848 8.094 8.368 8.669 8.943 9.23 9.572 9.902 10.281 10.697 11.132 11.589 12.066 12.425 12.614 12.415 11.947 11.451 10.968 10.462 9.997 9.569 9.182 8.769 8.408 8.09 7.768 7.441 7.129 6.862 6.561 6.282 6.048 5.79 5.517 5.297 5.068 4.815 4.618 4.421 4.224 4.008 3.748 3.563 3.378 3.093 2.906 2.714 2.607 2.373 2.132 1.882 1.751 1.504 1.304 1.149 0.991 0.636 0.426 0.189 -0.057 -0.343 -0.712 -1.144 -2.436 -10 ,30809 ,KEBNE ,16678102,Wed Nov 24 23:25:58 CET,Thu Nov 25 01:29:25 CET,0.0 1.45 1.901 2.24 2.517 2.749 2.94 3.125 3.437 3.57 3.707 3.865 4.092 4.216 4.443 4.652 4.851 4.946 5.133 5.308 5.555 5.719 5.877 6.09 6.307 6.507 6.69 6.871 7.109 7.34 7.549 7.798 8.034 8.241 8.475 8.746 9.001 9.254 9.503 9.772 10.047 10.334 10.666 11.02 11.421 11.808 12.205 12.627 13.059 13.389 13.501 13.232 12.752 12.253 11.765 11.268 10.811 10.38 9.974 9.556 9.2 8.882 8.577 8.283 7.99 7.702 7.395 7.137 6.926 6.689 6.447 6.25 6.029 5.796 5.606 5.404 5.201 4.982 4.738 4.572 4.408 4.145 3.965 3.779 3.682 3.486 3.269 3.022 2.896 2.669 2.492 2.337 2.164 1.768 1.552 1.341 1.135 0.885 0.558 0.134 -1.282 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index 32b94c77..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25467 ,KEBNE ,16678103,Wed Nov 24 23:27:00 CET,Thu Nov 25 01:31:26 CET,0.0 1.248 1.648 1.96 2.203 2.41 2.603 2.776 3.077 3.207 3.339 3.507 3.748 3.876 4.105 4.32 4.526 4.621 4.804 4.983 5.242 5.402 5.545 5.763 5.98 6.181 6.383 6.587 6.842 7.084 7.326 7.622 7.897 8.167 8.501 8.888 9.251 9.637 10.05 10.515 11.013 11.572 12.212 12.839 13.565 14.368 15.321 16.382 17.577 18.838 19.982 20.57 20.707 20.626 20.389 20.048 19.7 19.328 19.033 18.719 18.349 17.967 17.57 17.175 16.784 16.407 16.065 15.807 15.572 15.306 15.01 14.755 14.49 14.225 14.019 13.797 13.559 13.309 13.059 12.872 12.679 12.4 12.192 11.972 11.86 11.608 11.322 11.032 10.891 10.64 10.449 10.287 10.088 9.622 9.372 9.103 8.789 8.402 7.971 7.484 5.068 -2 ,2967 ,KEBNE ,16678104,Wed Nov 24 23:29:03 CET,Thu Nov 25 01:30:56 CET,0.0 1.173 1.588 1.891 2.121 2.317 2.491 2.656 2.984 3.143 3.286 3.431 3.658 3.783 4.005 4.227 4.454 4.555 4.738 4.909 5.152 5.316 5.485 5.732 5.967 6.195 6.415 6.618 6.865 7.105 7.354 7.656 7.938 8.209 8.539 8.912 9.269 9.656 10.084 10.56 11.053 11.592 12.215 12.857 13.639 14.51 15.484 16.575 17.811 19.222 20.751 21.734 22.038 22.059 21.959 21.744 21.439 21.078 20.761 20.44 20.135 19.862 19.577 19.294 19.03 18.789 18.526 18.287 18.071 17.833 17.592 17.379 17.122 16.865 16.684 16.493 16.29 16.069 15.84 15.689 15.529 15.285 15.13 14.962 14.866 14.669 14.461 14.244 14.131 13.894 13.751 13.624 13.48 13.145 12.944 12.724 12.456 12.128 11.679 10.898 8.775 -3 ,9335 ,KEBNE ,16678105,Wed Nov 24 23:30:05 CET,Thu Nov 25 01:30:34 CET,0.0 1.114 1.479 1.762 1.993 2.194 2.4 2.602 2.94 3.085 3.239 3.42 3.645 3.76 3.987 4.203 4.401 4.499 4.694 4.879 5.149 5.327 5.514 5.783 6.034 6.277 6.504 6.722 7.006 7.284 7.537 7.842 8.154 8.447 8.775 9.154 9.524 9.941 10.396 10.868 11.371 11.94 12.621 13.31 14.09 14.974 16.026 17.187 18.465 19.94 21.605 22.642 22.969 22.891 22.606 22.255 21.868 21.44 20.997 20.577 20.255 19.933 19.597 19.277 18.976 18.693 18.399 18.151 17.942 17.71 17.466 17.259 17.023 16.763 16.563 16.361 16.155 15.936 15.697 15.529 15.361 15.106 14.919 14.714 14.612 14.417 14.212 13.994 13.856 13.602 13.427 13.263 13.092 12.758 12.577 12.366 12.104 11.778 11.379 10.88 9.146 -4 ,20426 ,KEBNE ,16678106,Wed Nov 24 23:34:13 CET,Thu Nov 25 01:36:09 CET,0.0 1.279 1.703 2.012 2.261 2.462 2.66 2.846 3.166 3.313 3.456 3.621 3.847 3.962 4.182 4.381 4.583 4.688 4.886 5.058 5.31 5.477 5.639 5.876 6.11 6.325 6.529 6.736 6.995 7.242 7.49 7.795 8.083 8.371 8.708 9.078 9.436 9.823 10.236 10.662 11.112 11.635 12.293 12.974 13.747 14.582 15.536 16.59 17.768 19.135 20.676 21.701 22.138 22.257 22.118 21.9 21.682 21.423 21.172 20.922 20.695 20.473 20.185 19.845 19.534 19.266 18.996 18.758 18.543 18.295 18.01 17.774 17.511 17.202 16.981 16.796 16.591 16.328 16.064 15.898 15.722 15.464 15.271 15.061 14.962 14.739 14.485 14.213 14.076 13.834 13.607 13.427 13.233 12.805 12.579 12.313 11.984 11.638 11.242 10.668 8.764 -5 ,4952 ,KEBNE ,16678107,Wed Nov 24 23:35:15 CET,Thu Nov 25 01:37:05 CET,0.0 1.244 1.661 1.981 2.243 2.453 2.636 2.795 3.087 3.224 3.362 3.508 3.727 3.84 4.054 4.259 4.47 4.569 4.756 4.933 5.177 5.342 5.504 5.74 5.968 6.189 6.408 6.614 6.879 7.147 7.398 7.685 7.968 8.233 8.553 8.937 9.303 9.703 10.123 10.547 11.004 11.552 12.187 12.84 13.608 14.435 15.352 16.37 17.574 18.89 20.254 21.171 21.396 21.165 20.762 20.352 20.039 19.701 19.356 19.008 18.686 18.398 18.131 17.847 17.57 17.321 17.034 16.775 16.559 16.323 16.076 15.87 15.645 15.416 15.232 15.031 14.81 14.57 14.345 14.205 14.045 13.78 13.588 13.374 13.267 13.058 12.817 12.544 12.398 12.137 11.917 11.739 11.561 11.181 10.97 10.717 10.409 10.079 9.671 9.016 6.979 -6 ,3335 ,KEBNE ,16678108,Wed Nov 24 23:36:16 CET,Thu Nov 25 01:37:06 CET,0.0 1.334 1.697 1.976 2.232 2.455 2.656 2.843 3.172 3.342 3.496 3.65 3.875 3.994 4.211 4.427 4.626 4.72 4.914 5.098 5.353 5.525 5.697 5.932 6.163 6.388 6.599 6.81 7.081 7.351 7.614 7.935 8.251 8.544 8.876 9.252 9.614 10.012 10.453 10.927 11.419 11.967 12.581 13.195 13.962 14.791 15.704 16.71 17.915 19.288 20.647 21.464 21.663 21.498 21.203 20.903 20.594 20.277 19.964 19.606 19.275 18.947 18.582 18.266 17.972 17.663 17.337 17.058 16.823 16.575 16.32 16.091 15.842 15.58 15.371 15.161 14.911 14.614 14.343 14.193 14.03 13.749 13.538 13.305 13.191 12.989 12.797 12.594 12.483 12.244 12.057 11.915 11.766 11.395 11.168 10.927 10.672 10.368 9.983 9.447 7.613 -7 ,20831 ,KEBNE ,16678109,Wed Nov 24 23:36:17 CET,Thu Nov 25 01:37:14 CET,0.0 1.12 1.519 1.811 2.034 2.231 2.397 2.548 2.823 2.951 3.078 3.211 3.448 3.571 3.795 3.991 4.19 4.291 4.48 4.658 4.927 5.109 5.281 5.538 5.797 6.037 6.262 6.48 6.782 7.084 7.36 7.678 7.975 8.255 8.596 9.005 9.392 9.815 10.254 10.71 11.192 11.725 12.349 12.972 13.726 14.587 15.558 16.645 17.825 19.121 20.587 21.576 21.972 22.095 22.053 21.919 21.741 21.518 21.279 21.01 20.758 20.503 20.227 19.969 19.725 19.487 19.225 18.99 18.784 18.541 18.288 18.08 17.852 17.599 17.395 17.195 16.984 16.754 16.512 16.349 16.183 15.905 15.718 15.537 15.447 15.245 15.011 14.77 14.628 14.381 14.188 14.043 13.89 13.515 13.296 13.062 12.794 12.482 12.096 11.535 9.766 -8 ,12469 ,KEBNE ,16678110,Wed Nov 24 23:36:16 CET,Thu Nov 25 01:38:08 CET,0.0 1.109 1.52 1.833 2.062 2.248 2.417 2.584 2.893 3.042 3.188 3.35 3.576 3.692 3.937 4.17 4.38 4.482 4.697 4.896 5.158 5.328 5.502 5.751 6.005 6.254 6.485 6.701 6.951 7.207 7.467 7.764 8.05 8.334 8.656 9.051 9.454 9.877 10.319 10.819 11.36 11.955 12.636 13.268 13.957 14.736 15.64 16.648 17.859 19.207 20.575 21.445 21.774 21.811 21.584 21.249 20.942 20.68 20.436 20.129 19.855 19.619 19.367 19.064 18.771 18.532 18.268 18.006 17.761 17.494 17.194 16.957 16.734 16.477 16.252 15.99 15.715 15.443 15.148 14.946 14.758 14.498 14.326 14.128 14.016 13.798 13.58 13.325 13.192 12.943 12.727 12.553 12.368 11.983 11.776 11.54 11.275 10.972 10.585 10.072 8.698 -9 ,18303 ,KEBNE ,16675787,Wed Nov 24 08:12:12 CET,Wed Nov 24 10:11:47 CET,0.0 0.831 1.124 1.354 1.572 1.762 1.931 2.102 2.403 2.543 2.68 2.824 3.056 3.178 3.399 3.605 3.817 3.916 4.097 4.283 4.562 4.741 4.915 5.145 5.357 5.57 5.781 5.999 6.28 6.529 6.778 7.085 7.379 7.657 7.968 8.311 8.644 9.021 9.439 9.885 10.347 10.889 11.522 12.137 12.849 13.64 14.571 15.619 16.806 18.159 19.639 20.648 21.075 21.119 20.988 20.807 20.531 20.188 19.849 19.478 19.173 18.891 18.608 18.346 18.067 17.773 17.465 17.19 16.956 16.71 16.454 16.237 15.996 15.74 15.532 15.328 15.118 14.903 14.665 14.488 14.32 14.078 13.903 13.701 13.595 13.363 13.096 12.813 12.66 12.404 12.205 12.036 11.854 11.455 11.228 10.971 10.658 10.323 9.886 9.243 7.369 -10 ,31552 ,KEBNE ,16675788,Wed Nov 24 08:13:13 CET,Wed Nov 24 10:12:55 CET,0.0 1.088 1.453 1.734 1.962 2.174 2.372 2.56 2.911 3.064 3.196 3.343 3.566 3.68 3.894 4.096 4.281 4.373 4.554 4.724 4.983 5.149 5.314 5.562 5.786 5.993 6.199 6.404 6.688 6.968 7.25 7.581 7.872 8.157 8.489 8.842 9.177 9.567 9.991 10.445 10.907 11.422 12.058 12.713 13.44 14.203 15.096 16.117 17.308 18.663 20.092 20.941 21.197 21.159 20.993 20.758 20.466 20.161 19.866 19.546 19.241 18.942 18.64 18.351 18.087 17.837 17.552 17.292 17.076 16.845 16.603 16.402 16.191 15.978 15.793 15.579 15.37 15.14 14.878 14.7 14.523 14.243 14.041 13.843 13.739 13.509 13.277 13.04 12.91 12.671 12.52 12.375 12.212 11.86 11.676 11.454 11.186 10.867 10.508 10.001 8.061 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt deleted file mode 100644 index af50e515..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4884 ,KEBNE ,16678113,Wed Nov 24 23:39:21 CET,Thu Nov 25 01:42:07 CET,0.0 1.284 1.684 1.956 2.19 2.415 2.628 2.801 3.128 3.279 3.41 3.543 3.769 3.867 4.082 4.306 4.53 4.641 4.832 4.995 5.255 5.428 5.579 5.784 5.986 6.222 6.474 6.711 6.978 7.209 7.429 7.692 7.931 8.154 8.408 8.683 8.957 9.245 9.52 9.821 10.143 10.503 10.926 11.355 11.825 12.313 12.841 13.379 13.972 14.556 14.965 14.905 14.525 14.009 13.477 12.923 12.33 11.75 11.272 10.773 10.359 10.003 9.65 9.295 8.93 8.611 8.273 7.966 7.688 7.382 7.092 6.852 6.592 6.297 6.054 5.818 5.586 5.351 5.094 4.905 4.699 4.403 4.195 3.964 3.846 3.603 3.361 3.096 2.952 2.682 2.466 2.288 2.102 1.679 1.444 1.195 0.906 0.574 0.154 -0.423 -2.543 -2 ,12133 ,KEBNE ,16678114,Wed Nov 24 23:40:23 CET,Thu Nov 25 01:42:19 CET,0.0 1.335 1.786 2.117 2.374 2.568 2.759 2.935 3.242 3.388 3.514 3.632 3.863 3.967 4.17 4.366 4.553 4.645 4.816 4.977 5.21 5.353 5.486 5.668 5.85 6.042 6.232 6.423 6.665 6.89 7.114 7.36 7.597 7.837 8.131 8.455 8.73 9.026 9.346 9.686 10.038 10.434 10.932 11.382 11.821 12.305 12.862 13.453 14.079 14.8 15.258 14.942 14.414 13.876 13.328 12.779 12.227 11.722 11.269 10.77 10.345 9.95 9.554 9.209 8.893 8.539 8.149 7.823 7.545 7.279 7.015 6.785 6.541 6.296 6.089 5.852 5.597 5.337 5.065 4.871 4.665 4.339 4.117 3.886 3.767 3.553 3.322 3.045 2.904 2.661 2.479 2.307 2.122 1.695 1.465 1.21 0.861 0.468 0.038 -0.584 -2.248 -3 ,17805 ,KEBNE ,16675791,Wed Nov 24 08:13:13 CET,Wed Nov 24 10:12:26 CET,0.0 1.003 1.431 1.752 2.004 2.21 2.394 2.566 2.852 2.996 3.143 3.29 3.5 3.608 3.819 4.02 4.226 4.325 4.507 4.671 4.889 5.032 5.171 5.387 5.6 5.793 5.985 6.175 6.415 6.647 6.868 7.137 7.395 7.632 7.919 8.235 8.544 8.898 9.275 9.668 10.06 10.52 11.082 11.622 12.232 12.886 13.576 14.242 14.795 15.351 15.834 15.805 15.368 14.72 14.052 13.362 12.771 12.253 11.704 11.121 10.696 10.373 10.05 9.732 9.449 9.183 8.882 8.615 8.385 8.13 7.862 7.639 7.397 7.137 6.927 6.711 6.487 6.237 5.97 5.791 5.613 5.337 5.136 4.936 4.84 4.63 4.382 4.099 3.951 3.686 3.478 3.303 3.121 2.754 2.548 2.265 1.944 1.598 1.184 0.578 -1.473 -4 ,31793 ,KEBNE ,16678116,Wed Nov 24 23:42:26 CET,Thu Nov 25 01:42:48 CET,0.0 1.331 1.742 2.013 2.257 2.478 2.662 2.813 3.096 3.227 3.355 3.484 3.703 3.802 3.978 4.148 4.326 4.43 4.638 4.827 5.106 5.272 5.414 5.617 5.824 6.017 6.199 6.379 6.627 6.874 7.095 7.355 7.6 7.83 8.116 8.438 8.743 9.077 9.405 9.724 10.062 10.435 10.874 11.33 11.796 12.289 12.882 13.494 14.121 14.727 15.069 14.898 14.557 14.02 13.453 12.931 12.447 11.953 11.454 10.926 10.488 10.11 9.732 9.367 9.017 8.709 8.387 8.054 7.735 7.403 7.047 6.745 6.463 6.191 5.964 5.721 5.481 5.214 4.927 4.729 4.535 4.251 4.057 3.847 3.727 3.469 3.204 2.949 2.823 2.575 2.376 2.205 2.004 1.58 1.375 1.151 0.888 0.595 0.273 -0.197 -2.204 -6 ,17046 ,KEBNE ,16678118,Wed Nov 24 23:43:28 CET,Thu Nov 25 01:47:38 CET,0.0 1.538 1.907 2.21 2.455 2.665 2.854 3.021 3.336 3.484 3.632 3.762 3.985 4.082 4.281 4.482 4.668 4.759 4.936 5.098 5.321 5.46 5.591 5.799 6.031 6.249 6.429 6.599 6.834 7.067 7.272 7.518 7.796 8.056 8.325 8.614 8.87 9.148 9.45 9.755 10.06 10.429 10.894 11.339 11.81 12.325 12.875 13.454 14.078 14.643 15.019 14.978 14.706 14.321 13.905 13.494 13.101 12.719 12.371 11.968 11.594 11.272 10.945 10.606 10.272 9.963 9.646 9.373 9.143 8.898 8.639 8.415 8.17 7.916 7.715 7.505 7.283 7.049 6.803 6.63 6.441 6.125 5.926 5.737 5.637 5.426 5.195 4.948 4.82 4.571 4.386 4.209 4.016 3.604 3.381 3.144 2.898 2.586 2.19 1.652 -0.387 -7 ,32045 ,KEBNE ,16675795,Wed Nov 24 08:13:13 CET,Wed Nov 24 10:11:59 CET,0.0 1.24 1.625 1.901 2.122 2.322 2.504 2.654 2.921 3.052 3.183 3.329 3.554 3.658 3.862 4.052 4.218 4.293 4.448 4.602 4.819 4.959 5.101 5.305 5.499 5.692 5.882 6.064 6.29 6.499 6.697 6.948 7.203 7.426 7.672 7.961 8.248 8.568 8.883 9.211 9.575 9.969 10.411 10.827 11.283 11.788 12.331 12.885 13.471 14.024 14.424 14.535 14.39 14.093 13.789 13.439 13.067 12.658 12.243 11.837 11.499 11.202 10.907 10.594 10.278 9.988 9.684 9.414 9.207 9.004 8.751 8.511 8.26 7.985 7.764 7.545 7.312 7.067 6.804 6.623 6.445 6.16 5.953 5.738 5.627 5.402 5.17 4.902 4.762 4.506 4.284 4.114 3.955 3.573 3.342 3.083 2.795 2.492 2.104 1.586 -0.149 -8 ,3309 ,KEBNE ,16675796,Wed Nov 24 08:13:13 CET,Wed Nov 24 10:11:41 CET,0.0 1.296 1.684 1.985 2.233 2.444 2.635 2.816 3.138 3.285 3.426 3.541 3.784 3.917 4.156 4.381 4.586 4.679 4.874 5.057 5.317 5.501 5.672 5.918 6.144 6.318 6.48 6.649 6.876 7.089 7.284 7.521 7.751 7.981 8.255 8.552 8.822 9.119 9.439 9.779 10.132 10.523 10.965 11.408 11.908 12.403 12.94 13.486 13.979 14.441 14.773 14.638 14.306 13.925 13.563 13.178 12.801 12.426 12.056 11.69 11.374 11.07 10.753 10.426 10.131 9.863 9.578 9.324 9.106 8.859 8.574 8.344 8.111 7.86 7.659 7.439 7.206 6.977 6.744 6.58 6.398 6.113 5.924 5.717 5.606 5.386 5.142 4.86 4.728 4.495 4.339 4.171 3.97 3.537 3.298 3.048 2.779 2.487 2.124 1.571 -0.459 -9 ,14111 ,KEBNE ,16675797,Wed Nov 24 08:14:14 CET,Wed Nov 24 10:15:18 CET,0.0 1.213 1.671 1.986 2.273 2.526 2.732 2.894 3.182 3.312 3.441 3.58 3.812 3.926 4.161 4.382 4.599 4.712 4.899 5.053 5.293 5.448 5.589 5.813 6.038 6.236 6.427 6.603 6.823 7.036 7.236 7.477 7.717 7.957 8.22 8.5 8.788 9.112 9.454 9.786 10.106 10.456 10.917 11.379 11.829 12.311 12.891 13.504 14.139 14.803 15.484 15.777 15.654 15.338 14.974 14.622 14.265 13.892 13.515 13.098 12.732 12.425 12.116 11.808 11.527 11.269 10.985 10.711 10.449 10.18 9.911 9.66 9.4 9.136 8.923 8.703 8.475 8.239 7.985 7.795 7.604 7.342 7.146 6.938 6.836 6.601 6.354 6.109 5.983 5.741 5.55 5.377 5.201 4.807 4.567 4.292 3.986 3.642 3.202 2.555 0.436 -10 ,24872 ,KEBNE ,16675798,Wed Nov 24 08:14:14 CET,Wed Nov 24 10:15:30 CET,0.0 1.285 1.66 1.917 2.121 2.311 2.509 2.709 3.034 3.172 3.303 3.463 3.685 3.792 4.0 4.207 4.408 4.503 4.678 4.844 5.086 5.252 5.412 5.63 5.863 6.095 6.297 6.485 6.725 6.959 7.176 7.434 7.689 7.936 8.217 8.535 8.853 9.212 9.61 10.013 10.437 10.897 11.42 11.974 12.56 13.157 13.818 14.48 15.184 15.929 16.419 16.347 15.892 15.306 14.78 14.246 13.698 13.13 12.572 11.942 11.385 10.902 10.507 10.152 9.764 9.385 9.035 8.771 8.533 8.271 8.009 7.779 7.523 7.265 7.074 6.876 6.661 6.425 6.173 6.005 5.829 5.532 5.321 5.099 4.981 4.735 4.46 4.154 3.992 3.71 3.476 3.288 3.1 2.694 2.47 2.217 1.926 1.611 1.251 0.725 -1.131 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt deleted file mode 100644 index 35b16fcc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30031 ,KEBNE ,16678123,Wed Nov 24 23:47:33 CET,Thu Nov 25 01:47:51 CET,0.0 0.829 1.136 1.388 1.624 1.825 1.998 2.161 2.442 2.581 2.716 2.864 3.077 3.193 3.406 3.599 3.794 3.895 4.082 4.251 4.498 4.654 4.808 5.032 5.234 5.426 5.624 5.823 6.07 6.296 6.511 6.779 7.044 7.292 7.565 7.86 8.143 8.461 8.806 9.169 9.556 9.999 10.515 11.034 11.635 12.298 13.047 13.868 14.779 15.782 16.954 17.831 18.182 18.265 18.255 18.197 18.105 17.98 17.847 17.705 17.569 17.409 17.226 17.066 16.917 16.768 16.603 16.437 16.285 16.119 15.953 15.814 15.646 15.482 15.361 15.229 15.102 14.963 14.802 14.691 14.571 14.374 14.244 14.108 14.035 13.888 13.739 13.567 13.473 13.277 13.154 13.038 12.913 12.655 12.516 12.344 12.13 11.868 11.537 11.084 9.801 -2 ,24186 ,KEBNE ,16675810,Wed Nov 24 08:21:24 CET,Wed Nov 24 10:22:02 CET,0.0 0.564 0.969 1.253 1.492 1.704 1.921 2.116 2.434 2.577 2.719 2.884 3.102 3.207 3.419 3.625 3.82 3.913 4.103 4.283 4.518 4.661 4.805 5.03 5.241 5.439 5.646 5.847 6.084 6.322 6.548 6.808 7.057 7.293 7.556 7.845 8.14 8.468 8.824 9.187 9.574 10.02 10.524 11.024 11.607 12.253 12.97 13.714 14.565 15.61 16.739 17.463 17.733 17.83 17.844 17.764 17.657 17.51 17.344 17.157 16.975 16.803 16.63 16.447 16.252 16.08 15.924 15.792 15.674 15.535 15.374 15.234 15.073 14.9 14.768 14.633 14.499 14.339 14.167 14.06 13.95 13.772 13.636 13.491 13.421 13.282 13.121 12.941 12.84 12.631 12.519 12.407 12.286 12.012 11.835 11.621 11.411 11.211 10.939 10.528 9.442 -3 ,6944 ,KEBNE ,16678125,Thu Nov 25 00:05:02 CET,Thu Nov 25 02:06:49 CET,0.0 0.815 1.16 1.415 1.637 1.834 2.019 2.199 2.547 2.702 2.836 2.98 3.197 3.302 3.528 3.746 3.946 4.049 4.242 4.418 4.663 4.824 4.981 5.204 5.417 5.625 5.822 6.011 6.244 6.468 6.697 6.978 7.228 7.469 7.755 8.055 8.365 8.707 9.054 9.425 9.803 10.236 10.754 11.261 11.856 12.514 13.241 14.031 14.887 15.858 16.953 17.66 17.91 17.963 17.905 17.828 17.732 17.567 17.383 17.184 17.016 16.852 16.674 16.496 16.301 16.133 15.973 15.814 15.661 15.504 15.336 15.181 15.015 14.855 14.727 14.587 14.445 14.307 14.157 14.042 13.914 13.689 13.54 13.396 13.319 13.162 13.003 12.826 12.723 12.511 12.38 12.261 12.134 11.868 11.716 11.527 11.301 11.067 10.794 10.395 9.409 -4 ,15847 ,KEBNE ,16675812,Wed Nov 24 08:21:25 CET,Wed Nov 24 10:21:52 CET,0.0 0.665 1.026 1.294 1.533 1.767 1.977 2.156 2.478 2.623 2.764 2.932 3.15 3.263 3.479 3.68 3.87 3.964 4.149 4.323 4.582 4.759 4.919 5.144 5.374 5.593 5.782 5.963 6.204 6.426 6.654 6.94 7.206 7.455 7.733 8.052 8.359 8.681 9.036 9.427 9.832 10.264 10.749 11.272 11.889 12.525 13.233 13.999 14.872 15.845 16.882 17.606 17.893 17.952 17.906 17.8 17.669 17.513 17.346 17.141 16.94 16.762 16.594 16.419 16.245 16.091 15.923 15.757 15.619 15.477 15.312 15.173 15.033 14.879 14.755 14.629 14.49 14.325 14.16 14.056 13.942 13.736 13.595 13.453 13.373 13.208 13.036 12.851 12.758 12.561 12.453 12.344 12.228 11.955 11.79 11.601 11.414 11.196 10.922 10.508 9.222 -5 ,14406 ,KEBNE ,16675813,Wed Nov 24 08:21:25 CET,Wed Nov 24 10:20:40 CET,0.0 0.717 1.075 1.382 1.634 1.83 2.024 2.213 2.538 2.687 2.829 2.98 3.201 3.322 3.556 3.771 3.959 4.049 4.22 4.379 4.61 4.755 4.899 5.108 5.306 5.5 5.682 5.858 6.098 6.335 6.551 6.801 7.051 7.299 7.585 7.897 8.189 8.509 8.892 9.306 9.685 10.119 10.637 11.142 11.723 12.347 13.081 13.936 14.891 15.965 17.154 17.946 18.268 18.345 18.289 18.174 18.015 17.848 17.704 17.551 17.393 17.219 17.038 16.855 16.671 16.5 16.306 16.124 15.967 15.795 15.615 15.459 15.292 15.109 14.959 14.808 14.65 14.485 14.301 14.172 14.045 13.839 13.696 13.542 13.465 13.291 13.1 12.91 12.808 12.595 12.478 12.357 12.224 11.922 11.74 11.553 11.348 11.098 10.804 10.41 8.392 -6 ,603 ,KEBNE ,16675814,Wed Nov 24 08:21:24 CET,Wed Nov 24 10:23:09 CET,0.0 0.649 0.991 1.277 1.51 1.713 1.89 2.05 2.361 2.5 2.63 2.781 3.009 3.128 3.351 3.555 3.739 3.831 4.033 4.239 4.506 4.652 4.795 5.01 5.219 5.42 5.606 5.788 6.038 6.283 6.505 6.776 7.039 7.274 7.549 7.859 8.147 8.473 8.812 9.174 9.574 10.008 10.534 11.101 11.752 12.415 13.14 13.967 14.938 16.053 17.274 18.094 18.482 18.603 18.607 18.576 18.473 18.327 18.16 17.964 17.768 17.589 17.415 17.248 17.101 16.952 16.772 16.592 16.444 16.297 16.138 16.01 15.864 15.707 15.598 15.479 15.356 15.23 15.094 14.989 14.873 14.692 14.564 14.429 14.358 14.204 14.038 13.858 13.765 13.571 13.482 13.375 13.256 12.998 12.839 12.665 12.487 12.283 12.001 11.576 10.736 -7 ,27626 ,KEBNE ,16675815,Wed Nov 24 08:21:24 CET,Wed Nov 24 10:22:12 CET,0.0 0.546 0.855 1.12 1.353 1.565 1.763 1.951 2.264 2.405 2.541 2.681 2.911 3.021 3.223 3.427 3.623 3.711 3.875 4.033 4.271 4.423 4.581 4.822 5.043 5.249 5.445 5.64 5.891 6.125 6.347 6.613 6.862 7.098 7.38 7.69 7.998 8.327 8.667 9.033 9.429 9.877 10.394 10.897 11.464 12.114 12.86 13.661 14.571 15.608 16.798 17.564 17.843 17.932 17.907 17.834 17.733 17.607 17.471 17.291 17.129 16.997 16.857 16.704 16.552 16.401 16.223 16.07 15.942 15.783 15.625 15.503 15.363 15.226 15.117 14.993 14.862 14.719 14.575 14.483 14.388 14.23 14.111 13.98 13.914 13.774 13.617 13.454 13.363 13.159 13.044 12.929 12.796 12.518 12.373 12.217 12.032 11.809 11.537 11.107 9.826 -8 ,7038 ,KEBNE ,16675816,Wed Nov 24 08:22:30 CET,Wed Nov 24 10:14:34 CET,0.0 1.197 1.582 1.873 2.108 2.289 2.46 2.622 2.911 3.059 3.2 3.337 3.557 3.671 3.902 4.115 4.297 4.384 4.555 4.733 4.995 5.155 5.303 5.516 5.73 5.938 6.138 6.327 6.559 6.785 7.005 7.258 7.508 7.762 8.052 8.381 8.695 9.02 9.382 9.775 10.195 10.668 11.188 11.686 12.263 12.912 13.649 14.433 15.279 16.254 17.386 18.168 18.536 18.703 18.689 18.586 18.471 18.314 18.129 17.904 17.692 17.505 17.327 17.166 16.981 16.809 16.636 16.473 16.323 16.157 15.984 15.828 15.675 15.532 15.414 15.287 15.168 15.036 14.881 14.768 14.656 14.478 14.354 14.228 14.163 14.028 13.862 13.673 13.579 13.397 13.296 13.188 13.075 12.821 12.682 12.517 12.326 12.097 11.802 11.406 10.299 -9 ,30234 ,KEBNE ,16675817,Wed Nov 24 08:24:28 CET,Wed Nov 24 10:23:04 CET,0.0 0.638 0.985 1.246 1.467 1.661 1.828 1.995 2.312 2.448 2.578 2.749 2.971 3.079 3.305 3.507 3.69 3.783 3.967 4.139 4.371 4.523 4.674 4.89 5.101 5.305 5.504 5.704 5.964 6.197 6.415 6.682 6.939 7.199 7.487 7.796 8.096 8.429 8.793 9.175 9.574 10.016 10.529 11.049 11.626 12.243 12.965 13.782 14.688 15.748 16.896 17.69 18.087 18.238 18.244 18.155 17.997 17.814 17.653 17.487 17.332 17.183 17.019 16.857 16.707 16.563 16.394 16.219 16.064 15.886 15.702 15.563 15.413 15.253 15.13 15.007 14.879 14.743 14.593 14.474 14.352 14.169 14.037 13.889 13.817 13.675 13.521 13.353 13.265 13.082 12.995 12.886 12.76 12.469 12.314 12.154 11.961 11.74 11.457 11.076 9.844 -10 ,13246 ,KEBNE ,16678132,Thu Nov 25 00:08:07 CET,Thu Nov 25 02:12:49 CET,0.0 0.755 1.08 1.336 1.572 1.796 1.973 2.11 2.388 2.527 2.653 2.782 3.001 3.11 3.327 3.537 3.735 3.829 4.008 4.19 4.45 4.603 4.752 4.979 5.194 5.405 5.611 5.813 6.066 6.296 6.514 6.788 7.054 7.293 7.585 7.919 8.22 8.548 8.91 9.314 9.753 10.234 10.771 11.297 11.929 12.645 13.417 14.266 15.217 16.24 17.296 17.952 18.223 18.326 18.253 18.099 17.949 17.775 17.597 17.395 17.206 17.036 16.855 16.658 16.47 16.307 16.113 15.92 15.759 15.603 15.453 15.323 15.176 15.017 14.885 14.745 14.606 14.469 14.313 14.193 14.072 13.868 13.725 13.579 13.498 13.328 13.152 12.969 12.873 12.674 12.547 12.435 12.33 12.076 11.919 11.741 11.51 11.239 10.94 10.547 9.323 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt deleted file mode 100644 index d575a229..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24400 ,KEBNE ,17024002,Wed Dec 22 09:08:41 CET,Wed Dec 22 11:03:19 CET,0.0 0.817 1.034 1.159 1.244 1.296 1.322 1.341 1.349 1.333 1.31 1.131 1.183 1.136 1.04 0.932 0.796 0.733 0.611 0.462 0.242 0.098 -0.057 -0.304 -0.567 -0.832 -1.082 -1.346 -1.716 -2.094 -2.477 -2.952 -3.427 -3.919 -4.541 -5.28 -6.038 -6.904 -7.867 -8.95 -10.153 -11.594 -13.427 -15.424 -17.914 -20.931 -24.746 -29.492 -35.758 -44.324 -56.944 -70.017 -79.459 -86.74 -92.521 -97.241 -101.079 -104.386 -107.084 -109.678 -111.838 -113.671 -115.363 -116.901 -118.262 -119.481 -120.733 -121.82 -122.727 -123.655 -124.619 -125.396 -126.162 -126.92 -127.496 -128.087 -128.695 -129.301 -129.902 -130.311 -130.736 -131.4 -131.839 -132.278 -132.499 -132.95 -133.426 -133.917 -134.167 -134.665 -134.931 -135.191 -135.459 -136.028 -136.329 -136.652 -137.007 -137.395 -137.869 -138.444 -139.548 -2 ,19258 ,KEBNE ,17024003,Wed Dec 22 09:09:39 CET,Wed Dec 22 11:11:24 CET,0.0 0.911 1.144 1.272 1.345 1.409 1.459 1.475 1.445 1.424 1.411 1.254 1.315 1.267 1.172 1.077 0.955 0.888 0.762 0.633 0.441 0.298 0.139 -0.104 -0.346 -0.593 -0.856 -1.13 -1.493 -1.85 -2.215 -2.679 -3.162 -3.66 -4.261 -4.978 -5.714 -6.573 -7.568 -8.7 -9.953 -11.448 -13.315 -15.291 -17.745 -20.716 -24.471 -29.211 -35.503 -44.078 -56.506 -69.249 -78.482 -85.656 -91.368 -96.08 -99.898 -103.136 -105.785 -108.336 -110.457 -112.283 -113.999 -115.567 -116.941 -118.145 -119.368 -120.424 -121.301 -122.193 -123.118 -123.864 -124.63 -125.414 -126.006 -126.61 -127.214 -127.823 -128.449 -128.863 -129.285 -129.928 -130.359 -130.811 -131.044 -131.522 -132.027 -132.536 -132.794 -133.31 -133.629 -133.909 -134.194 -134.78 -135.086 -135.427 -135.818 -136.23 -136.684 -137.252 -138.576 -3 ,19037 ,KEBNE ,17024004,Wed Dec 22 09:10:42 CET,Wed Dec 22 11:11:27 CET,0.0 1.254 1.54 1.703 1.822 1.918 1.967 1.99 2.028 2.036 2.027 1.879 1.946 1.9 1.796 1.682 1.557 1.495 1.374 1.237 1.038 0.903 0.752 0.521 0.283 0.027 -0.234 -0.494 -0.855 -1.231 -1.61 -2.097 -2.598 -3.097 -3.69 -4.383 -5.109 -5.965 -6.933 -8.023 -9.225 -10.681 -12.527 -14.52 -17.005 -20.014 -23.847 -28.635 -34.984 -43.595 -55.967 -68.763 -78.048 -85.233 -90.945 -95.669 -99.55 -102.83 -105.505 -108.082 -110.248 -112.146 -113.889 -115.449 -116.859 -118.112 -119.361 -120.443 -121.351 -122.285 -123.243 -124.014 -124.797 -125.579 -126.168 -126.772 -127.375 -127.992 -128.643 -129.074 -129.486 -130.119 -130.566 -131.006 -131.237 -131.719 -132.199 -132.691 -132.946 -133.456 -133.745 -134.01 -134.291 -134.889 -135.204 -135.538 -135.924 -136.354 -136.803 -137.369 -138.827 -4 ,16305 ,KEBNE ,17024005,Wed Dec 22 09:10:42 CET,Wed Dec 22 11:11:29 CET,0.0 1.268 1.624 1.817 1.894 1.946 1.977 2.004 2.061 2.069 2.063 1.926 2.009 1.972 1.898 1.828 1.739 1.686 1.582 1.469 1.266 1.117 0.968 0.745 0.51 0.258 0.017 -0.231 -0.59 -0.96 -1.325 -1.775 -2.235 -2.716 -3.321 -4.049 -4.794 -5.654 -6.608 -7.664 -8.877 -10.357 -12.183 -14.14 -16.603 -19.614 -23.452 -28.244 -34.493 -43.043 -55.544 -68.393 -77.752 -85.003 -90.715 -95.442 -99.311 -102.622 -105.37 -107.993 -110.164 -112.03 -113.72 -115.234 -116.586 -117.779 -118.987 -120.046 -120.939 -121.841 -122.78 -123.54 -124.302 -125.085 -125.696 -126.316 -126.919 -127.54 -128.178 -128.605 -129.043 -129.722 -130.184 -130.638 -130.87 -131.358 -131.848 -132.33 -132.578 -133.086 -133.375 -133.655 -133.943 -134.53 -134.837 -135.164 -135.518 -135.928 -136.388 -136.921 -138.128 -5 ,5377 ,KEBNE ,17024006,Wed Dec 22 09:10:46 CET,Wed Dec 22 11:05:02 CET,0.0 0.841 1.071 1.204 1.295 1.339 1.372 1.39 1.363 1.34 1.325 1.17 1.235 1.197 1.124 1.022 0.912 0.853 0.725 0.585 0.365 0.219 0.071 -0.152 -0.378 -0.626 -0.881 -1.128 -1.476 -1.847 -2.226 -2.711 -3.209 -3.714 -4.306 -4.984 -5.673 -6.505 -7.46 -8.52 -9.733 -11.211 -13.074 -15.076 -17.572 -20.611 -24.438 -29.183 -35.378 -43.869 -56.323 -69.167 -78.472 -85.623 -91.279 -95.941 -99.727 -102.966 -105.634 -108.166 -110.256 -112.065 -113.727 -115.254 -116.622 -117.832 -119.085 -120.18 -121.116 -122.059 -123.018 -123.779 -124.53 -125.309 -125.906 -126.507 -127.111 -127.72 -128.342 -128.772 -129.207 -129.867 -130.324 -130.793 -131.034 -131.531 -132.038 -132.56 -132.82 -133.325 -133.626 -133.908 -134.192 -134.787 -135.121 -135.474 -135.839 -136.239 -136.722 -137.41 -138.732 -6 ,11318 ,KEBNE ,17024007,Wed Dec 22 09:12:45 CET,Wed Dec 22 11:11:46 CET,0.0 0.622 0.819 0.971 1.067 1.121 1.148 1.165 1.17 1.156 1.135 0.975 1.043 1.008 0.905 0.767 0.645 0.581 0.445 0.307 0.097 -0.047 -0.197 -0.431 -0.653 -0.893 -1.162 -1.431 -1.807 -2.195 -2.59 -3.082 -3.561 -4.023 -4.589 -5.293 -6.021 -6.877 -7.842 -8.913 -10.114 -11.553 -13.371 -15.37 -17.864 -20.86 -24.679 -29.457 -35.717 -44.22 -56.569 -69.305 -78.557 -85.706 -91.378 -96.1 -99.941 -103.186 -105.852 -108.421 -110.549 -112.363 -114.038 -115.547 -116.894 -118.088 -119.3 -120.36 -121.261 -122.174 -123.092 -123.834 -124.598 -125.377 -125.973 -126.585 -127.192 -127.805 -128.452 -128.892 -129.323 -129.979 -130.44 -130.903 -131.13 -131.592 -132.068 -132.548 -132.794 -133.286 -133.585 -133.88 -134.171 -134.77 -135.077 -135.404 -135.762 -136.132 -136.581 -137.165 -138.608 -7 ,12856 ,KEBNE ,17024008,Wed Dec 22 09:13:47 CET,Wed Dec 22 11:14:19 CET,0.0 0.898 1.167 1.361 1.526 1.648 1.713 1.748 1.805 1.823 1.827 1.668 1.729 1.68 1.608 1.542 1.454 1.394 1.265 1.151 0.956 0.816 0.677 0.45 0.201 -0.047 -0.296 -0.563 -0.94 -1.332 -1.722 -2.216 -2.724 -3.222 -3.814 -4.547 -5.302 -6.171 -7.169 -8.278 -9.481 -10.912 -12.749 -14.737 -17.243 -20.326 -24.222 -29.107 -35.546 -44.242 -56.832 -69.818 -79.369 -86.769 -92.631 -97.496 -101.488 -104.906 -107.714 -110.408 -112.624 -114.518 -116.273 -117.85 -119.257 -120.493 -121.732 -122.808 -123.703 -124.619 -125.556 -126.323 -127.106 -127.888 -128.475 -129.073 -129.684 -130.305 -130.934 -131.355 -131.778 -132.418 -132.865 -133.316 -133.541 -133.995 -134.452 -134.928 -135.179 -135.687 -135.955 -136.234 -136.531 -137.148 -137.472 -137.817 -138.187 -138.607 -139.077 -139.634 -140.934 -8 ,16002 ,KEBNE ,17024009,Wed Dec 22 09:13:48 CET,Wed Dec 22 11:13:03 CET,0.0 0.841 1.051 1.17 1.259 1.326 1.378 1.399 1.399 1.387 1.374 1.225 1.283 1.241 1.149 1.057 0.968 0.925 0.817 0.673 0.453 0.314 0.174 -0.064 -0.312 -0.56 -0.812 -1.066 -1.431 -1.8 -2.163 -2.627 -3.095 -3.587 -4.186 -4.889 -5.62 -6.485 -7.468 -8.572 -9.817 -11.322 -13.183 -15.187 -17.692 -20.719 -24.55 -29.295 -35.515 -43.976 -56.324 -69.092 -78.412 -85.635 -91.344 -96.081 -99.965 -103.3 -106.05 -108.657 -110.769 -112.557 -114.196 -115.693 -117.053 -118.249 -119.444 -120.488 -121.355 -122.222 -123.118 -123.858 -124.611 -125.379 -125.963 -126.555 -127.152 -127.748 -128.363 -128.778 -129.199 -129.852 -130.287 -130.722 -130.946 -131.408 -131.871 -132.347 -132.603 -133.108 -133.396 -133.658 -133.93 -134.517 -134.829 -135.16 -135.51 -135.9 -136.359 -136.932 -138.106 -9 ,11381 ,KEBNE ,17024010,Wed Dec 22 09:13:51 CET,Wed Dec 22 11:09:59 CET,0.0 1.119 1.331 1.439 1.494 1.531 1.56 1.565 1.537 1.51 1.478 1.325 1.404 1.361 1.257 1.144 1.03 0.966 0.837 0.709 0.49 0.33 0.174 -0.058 -0.298 -0.542 -0.783 -1.034 -1.379 -1.741 -2.111 -2.587 -3.084 -3.586 -4.19 -4.904 -5.637 -6.49 -7.46 -8.557 -9.792 -11.269 -13.131 -15.147 -17.698 -20.717 -24.461 -29.199 -35.45 -43.991 -56.486 -69.458 -78.871 -86.093 -91.804 -96.532 -100.505 -103.968 -106.834 -109.545 -111.741 -113.623 -115.357 -116.944 -118.368 -119.631 -120.901 -121.973 -122.864 -123.781 -124.74 -125.531 -126.324 -127.117 -127.722 -128.324 -128.924 -129.543 -130.182 -130.61 -131.046 -131.72 -132.172 -132.638 -132.878 -133.362 -133.851 -134.361 -134.617 -135.115 -135.398 -135.674 -135.955 -136.539 -136.853 -137.181 -137.553 -137.948 -138.399 -138.934 -140.015 -10 ,6221 ,KEBNE ,17024011,Wed Dec 22 09:15:52 CET,Wed Dec 22 11:16:22 CET,0.0 1.004 1.218 1.363 1.434 1.473 1.502 1.496 1.456 1.449 1.433 1.283 1.346 1.304 1.206 1.1 0.985 0.924 0.798 0.663 0.441 0.286 0.127 -0.117 -0.374 -0.643 -0.918 -1.189 -1.545 -1.911 -2.293 -2.771 -3.234 -3.703 -4.297 -5.003 -5.706 -6.532 -7.485 -8.564 -9.776 -11.255 -13.111 -15.079 -17.492 -20.439 -24.239 -28.979 -35.243 -43.787 -56.188 -69.004 -78.307 -85.444 -91.161 -95.919 -99.831 -103.238 -105.988 -108.539 -110.648 -112.456 -114.099 -115.6 -116.948 -118.137 -119.371 -120.45 -121.337 -122.239 -123.146 -123.868 -124.621 -125.398 -125.977 -126.559 -127.139 -127.738 -128.345 -128.736 -129.136 -129.748 -130.175 -130.614 -130.841 -131.294 -131.739 -132.196 -132.438 -132.94 -133.205 -133.483 -133.775 -134.364 -134.676 -135.016 -135.391 -135.817 -136.285 -136.815 -137.922 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt deleted file mode 100644 index f56e1863..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16324 ,KEBNE ,17069514,Fri Dec 24 06:32:05 CET,Fri Dec 24 08:33:09 CET,0.0 1.449 1.923 2.254 2.52 2.751 2.966 3.171 3.506 3.652 3.792 3.918 4.141 4.252 4.471 4.669 4.844 4.93 5.108 5.286 5.53 5.685 5.833 6.051 6.26 6.475 6.666 6.841 7.093 7.323 7.543 7.799 8.053 8.296 8.573 8.846 9.05 9.28 9.519 9.732 9.924 10.183 10.462 10.679 10.882 11.087 11.356 11.633 11.752 11.599 11.025 9.969 8.855 7.764 6.804 5.922 5.082 4.315 3.619 2.878 2.233 1.661 1.118 0.625 0.172 -0.244 -0.673 -1.061 -1.408 -1.784 -2.172 -2.477 -2.796 -3.117 -3.367 -3.635 -3.906 -4.202 -4.489 -4.692 -4.909 -5.243 -5.492 -5.751 -5.887 -6.174 -6.459 -6.756 -6.91 -7.19 -7.436 -7.637 -7.859 -8.328 -8.58 -8.854 -9.169 -9.528 -9.947 -10.562 -12.792 -2 ,32232 ,KEBNE ,17069516,Fri Dec 24 06:34:15 CET,Fri Dec 24 08:35:53 CET,0.0 1.51 1.959 2.245 2.508 2.754 2.981 3.198 3.601 3.791 3.954 4.128 4.374 4.503 4.749 4.982 5.205 5.305 5.483 5.662 5.909 6.077 6.248 6.49 6.722 6.948 7.167 7.383 7.654 7.88 8.108 8.392 8.654 8.88 9.115 9.392 9.636 9.911 10.217 10.522 10.803 11.11 11.447 11.754 12.099 12.385 12.652 12.866 12.99 12.999 12.633 11.607 10.443 9.271 8.242 7.368 6.587 5.858 5.195 4.517 3.938 3.413 2.898 2.395 1.926 1.52 1.126 0.781 0.465 0.137 -0.2 -0.49 -0.797 -1.114 -1.361 -1.63 -1.922 -2.243 -2.571 -2.79 -3.02 -3.342 -3.554 -3.804 -3.936 -4.215 -4.499 -4.781 -4.935 -5.205 -5.439 -5.631 -5.839 -6.288 -6.539 -6.811 -7.115 -7.503 -7.942 -8.478 -10.882 -3 ,29971 ,KEBNE ,17069518,Fri Dec 24 06:38:27 CET,Fri Dec 24 08:40:07 CET,0.0 1.183 1.651 2.009 2.303 2.54 2.741 2.939 3.283 3.432 3.575 3.708 3.918 4.022 4.213 4.401 4.579 4.671 4.837 4.994 5.227 5.358 5.484 5.69 5.885 6.058 6.232 6.395 6.613 6.829 7.035 7.291 7.521 7.705 7.883 8.091 8.295 8.526 8.766 9.04 9.319 9.547 9.825 10.092 10.36 10.733 11.111 11.283 11.307 11.125 10.495 9.417 8.279 7.154 6.107 5.19 4.337 3.479 2.749 2.056 1.449 0.88 0.326 -0.175 -0.624 -1.062 -1.518 -1.909 -2.253 -2.601 -2.948 -3.26 -3.593 -3.912 -4.157 -4.417 -4.692 -4.984 -5.289 -5.493 -5.716 -6.068 -6.307 -6.554 -6.683 -6.941 -7.189 -7.467 -7.624 -7.904 -8.141 -8.33 -8.534 -8.967 -9.202 -9.457 -9.725 -10.034 -10.439 -11.0 -12.479 -4 ,26254 ,KEBNE ,17069520,Fri Dec 24 06:39:30 CET,Fri Dec 24 08:39:47 CET,0.0 1.451 1.845 2.153 2.404 2.643 2.866 3.06 3.399 3.561 3.708 3.841 4.061 4.174 4.391 4.595 4.788 4.88 5.06 5.23 5.464 5.62 5.772 5.961 6.139 6.313 6.477 6.64 6.846 7.037 7.218 7.42 7.616 7.824 8.08 8.361 8.616 8.858 9.098 9.38 9.629 9.881 10.199 10.464 10.732 10.988 11.17 11.268 11.315 11.191 10.562 9.329 8.136 7.075 6.118 5.221 4.323 3.449 2.694 1.951 1.311 0.727 0.183 -0.314 -0.789 -1.227 -1.673 -2.091 -2.465 -2.832 -3.197 -3.5 -3.825 -4.182 -4.454 -4.724 -4.997 -5.299 -5.622 -5.832 -6.046 -6.39 -6.633 -6.878 -7.003 -7.27 -7.557 -7.879 -8.037 -8.3 -8.514 -8.681 -8.862 -9.264 -9.495 -9.757 -10.037 -10.368 -10.811 -11.41 -13.423 -5 ,12089 ,KEBNE ,17069522,Fri Dec 24 06:43:42 CET,Fri Dec 24 08:43:07 CET,0.0 1.345 1.75 2.062 2.324 2.552 2.731 2.899 3.207 3.351 3.489 3.625 3.852 3.962 4.178 4.372 4.548 4.637 4.819 5.005 5.292 5.479 5.649 5.867 6.063 6.262 6.463 6.664 6.908 7.106 7.286 7.506 7.694 7.865 8.085 8.319 8.537 8.773 9.006 9.253 9.515 9.773 10.05 10.333 10.656 10.954 11.233 11.479 11.581 11.581 11.194 10.197 9.174 8.159 7.21 6.415 5.664 4.881 4.164 3.451 2.855 2.341 1.852 1.371 0.89 0.43 -0.051 -0.472 -0.843 -1.25 -1.655 -1.981 -2.302 -2.624 -2.887 -3.154 -3.437 -3.751 -4.08 -4.299 -4.525 -4.874 -5.104 -5.332 -5.453 -5.71 -5.976 -6.27 -6.431 -6.714 -6.95 -7.143 -7.357 -7.787 -8.016 -8.282 -8.561 -8.897 -9.345 -9.926 -12.005 -6 ,26334 ,KEBNE ,17069523,Fri Dec 24 06:45:50 CET,Fri Dec 24 08:46:11 CET,0.0 1.322 1.76 2.074 2.321 2.537 2.754 2.95 3.255 3.385 3.52 3.671 3.901 4.021 4.261 4.51 4.744 4.852 5.067 5.281 5.556 5.709 5.856 6.059 6.256 6.453 6.641 6.816 7.026 7.217 7.416 7.684 7.942 8.191 8.465 8.747 9.0 9.257 9.532 9.794 10.059 10.37 10.69 10.983 11.287 11.572 11.828 12.038 12.135 12.002 11.427 10.418 9.279 8.249 7.318 6.462 5.748 5.089 4.485 3.843 3.273 2.781 2.311 1.841 1.419 1.035 0.607 0.222 -0.115 -0.46 -0.816 -1.118 -1.429 -1.75 -1.99 -2.255 -2.532 -2.8 -3.093 -3.309 -3.527 -3.86 -4.106 -4.361 -4.497 -4.783 -5.058 -5.334 -5.477 -5.733 -5.953 -6.14 -6.345 -6.788 -7.033 -7.32 -7.632 -7.969 -8.378 -8.946 -11.036 -7 ,7355 ,KEBNE ,17069526,Fri Dec 24 06:48:00 CET,Fri Dec 24 08:48:55 CET,0.0 1.241 1.704 2.042 2.291 2.49 2.694 2.892 3.232 3.374 3.494 3.621 3.839 3.963 4.207 4.442 4.654 4.748 4.914 5.057 5.262 5.404 5.548 5.747 5.942 6.119 6.275 6.431 6.654 6.877 7.07 7.291 7.506 7.713 7.953 8.218 8.457 8.693 8.922 9.155 9.381 9.649 9.98 10.286 10.609 10.882 11.166 11.511 11.829 11.981 11.82 11.111 10.167 9.219 8.308 7.465 6.711 6.062 5.496 4.905 4.364 3.845 3.316 2.813 2.364 1.948 1.503 1.094 0.752 0.414 0.06 -0.225 -0.525 -0.836 -1.078 -1.341 -1.62 -1.915 -2.237 -2.47 -2.688 -3.031 -3.298 -3.573 -3.718 -4.024 -4.341 -4.655 -4.812 -5.097 -5.345 -5.546 -5.748 -6.173 -6.436 -6.726 -7.03 -7.409 -7.848 -8.42 -10.439 -8 ,9081 ,KEBNE ,17069528,Fri Dec 24 06:49:02 CET,Fri Dec 24 08:48:04 CET,0.0 1.178 1.582 1.947 2.276 2.538 2.769 2.978 3.322 3.478 3.63 3.801 4.044 4.18 4.431 4.645 4.848 4.948 5.139 5.313 5.569 5.749 5.926 6.169 6.398 6.629 6.852 7.028 7.217 7.389 7.556 7.776 7.959 8.119 8.328 8.55 8.741 8.954 9.182 9.41 9.635 9.887 10.142 10.367 10.685 10.99 11.198 11.395 11.557 11.557 11.069 10.122 9.198 8.212 7.246 6.307 5.443 4.624 3.881 3.184 2.59 2.018 1.475 0.951 0.438 -0.005 -0.45 -0.853 -1.211 -1.578 -1.964 -2.294 -2.636 -2.99 -3.269 -3.559 -3.842 -4.132 -4.447 -4.67 -4.899 -5.256 -5.508 -5.762 -5.895 -6.166 -6.427 -6.698 -6.845 -7.128 -7.364 -7.552 -7.768 -8.232 -8.47 -8.734 -9.033 -9.371 -9.791 -10.274 -11.642 -9 ,10976 ,KEBNE ,17069529,Fri Dec 24 06:49:02 CET,Fri Dec 24 08:48:38 CET,0.0 1.361 1.849 2.152 2.394 2.606 2.786 2.947 3.224 3.354 3.485 3.632 3.855 3.966 4.169 4.396 4.622 4.72 4.917 5.109 5.351 5.486 5.62 5.822 6.024 6.221 6.398 6.566 6.748 6.911 7.09 7.3 7.506 7.704 7.91 8.146 8.365 8.571 8.772 8.978 9.161 9.369 9.637 9.885 10.142 10.381 10.616 10.887 11.127 11.085 10.615 9.777 8.92 8.04 7.205 6.428 5.717 5.048 4.46 3.873 3.344 2.813 2.298 1.842 1.395 0.995 0.581 0.189 -0.158 -0.517 -0.876 -1.166 -1.452 -1.745 -1.977 -2.226 -2.499 -2.795 -3.11 -3.322 -3.526 -3.857 -4.094 -4.329 -4.449 -4.702 -4.976 -5.286 -5.452 -5.731 -5.987 -6.205 -6.426 -6.869 -7.096 -7.367 -7.671 -7.981 -8.384 -8.946 -10.651 -10 ,24704 ,KEBNE ,17069531,Fri Dec 24 06:51:07 CET,Fri Dec 24 08:52:08 CET,0.0 1.501 1.949 2.235 2.455 2.64 2.816 2.988 3.289 3.416 3.546 3.689 3.923 4.044 4.247 4.438 4.62 4.705 4.871 5.021 5.225 5.359 5.49 5.688 5.883 6.06 6.225 6.378 6.577 6.768 6.953 7.191 7.411 7.607 7.864 8.182 8.429 8.684 8.966 9.192 9.447 9.735 10.041 10.345 10.577 10.741 10.873 10.996 11.042 10.852 10.21 9.058 8.053 7.085 6.141 5.375 4.724 4.08 3.496 2.895 2.374 1.925 1.512 1.093 0.695 0.352 -0.032 -0.394 -0.706 -1.038 -1.392 -1.69 -1.98 -2.28 -2.516 -2.743 -2.976 -3.24 -3.521 -3.722 -3.938 -4.264 -4.484 -4.718 -4.847 -5.108 -5.4 -5.727 -5.888 -6.162 -6.395 -6.587 -6.794 -7.229 -7.478 -7.762 -8.097 -8.469 -8.913 -9.529 -11.244 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt deleted file mode 100644 index 428d41fc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21784 ,KEBNE ,16675839,Wed Nov 24 08:32:41 CET,Wed Nov 24 10:31:53 CET,0.0 2.029 2.612 3.068 3.459 3.815 4.14 4.419 4.906 5.13 5.343 5.672 5.995 6.183 6.531 6.874 7.197 7.344 7.632 7.927 8.35 8.617 8.877 9.25 9.615 9.98 10.334 10.678 11.127 11.557 11.965 12.463 12.961 13.448 14.018 14.654 15.249 15.905 16.645 17.407 18.15 18.958 19.858 20.746 21.748 22.815 24.033 25.449 27.206 29.24 31.443 33.048 33.644 33.691 33.529 33.188 32.773 32.309 31.873 31.45 31.115 30.784 30.385 30.016 29.729 29.461 29.138 28.842 28.562 28.264 27.959 27.692 27.41 27.115 26.893 26.65 26.361 26.053 25.74 25.529 25.321 24.964 24.682 24.373 24.208 23.906 23.621 23.27 23.082 22.808 22.425 22.179 21.932 21.395 21.089 20.764 20.42 20.013 19.473 18.644 16.327 -2 ,5756 ,KEBNE ,16675840,Wed Nov 24 08:32:41 CET,Wed Nov 24 10:38:12 CET,0.0 1.703 2.308 2.717 3.005 3.241 3.482 3.72 4.144 4.355 4.563 4.831 5.093 5.242 5.548 5.889 6.252 6.422 6.737 7.032 7.456 7.715 7.95 8.294 8.615 8.924 9.232 9.547 9.96 10.333 10.681 11.11 11.553 11.997 12.52 13.121 13.684 14.274 14.93 15.647 16.393 17.254 18.261 19.279 20.493 21.814 23.332 25.14 27.169 29.341 31.739 33.234 33.611 33.475 33.219 32.952 32.681 32.419 32.136 31.772 31.429 31.11 30.745 30.391 30.074 29.749 29.372 29.038 28.764 28.499 28.206 27.96 27.726 27.475 27.287 27.07 26.809 26.544 26.298 26.132 25.949 25.63 25.393 25.162 25.044 24.789 24.51 24.211 24.056 23.803 23.53 23.348 23.166 22.781 22.557 22.303 22.023 21.697 21.303 20.719 18.958 -3 ,23766 ,KEBNE ,16675841,Wed Nov 24 08:33:43 CET,Wed Nov 24 10:32:34 CET,0.0 1.772 2.322 2.738 3.08 3.388 3.656 3.918 4.433 4.656 4.858 5.099 5.372 5.557 5.918 6.232 6.52 6.66 6.928 7.195 7.623 7.898 8.156 8.544 8.895 9.218 9.56 9.882 10.287 10.699 11.111 11.607 12.044 12.453 12.935 13.477 14.012 14.592 15.226 15.931 16.675 17.507 18.506 19.536 20.763 22.127 23.658 25.4 27.436 29.742 32.273 34.078 34.76 34.677 34.161 33.573 33.014 32.451 31.949 31.451 31.036 30.689 30.368 30.061 29.777 29.487 29.167 28.879 28.625 28.374 28.11 27.878 27.609 27.307 27.065 26.776 26.47 26.184 25.897 25.697 25.489 25.151 24.902 24.659 24.54 24.269 23.974 23.668 23.514 23.264 22.977 22.785 22.581 22.104 21.795 21.441 21.113 20.744 20.247 19.509 17.043 -5 ,17534 ,KEBNE ,16675843,Wed Nov 24 08:34:45 CET,Wed Nov 24 10:34:31 CET,0.0 1.757 2.394 2.906 3.318 3.682 4.008 4.312 4.874 5.12 5.356 5.717 6.036 6.238 6.606 6.963 7.314 7.481 7.801 8.09 8.466 8.689 8.92 9.282 9.644 10.01 10.353 10.69 11.152 11.594 12.009 12.488 12.968 13.47 14.037 14.663 15.271 15.965 16.668 17.356 18.109 18.964 19.947 21.029 22.427 24.019 25.725 27.502 29.585 31.918 34.421 35.975 36.749 37.14 37.052 36.833 36.468 35.94 35.452 34.924 34.431 33.971 33.551 33.128 32.709 32.347 31.984 31.656 31.324 30.95 30.569 30.26 29.945 29.604 29.331 29.048 28.748 28.434 28.119 27.902 27.675 27.308 27.021 26.711 26.553 26.224 25.876 25.496 25.288 24.984 24.632 24.41 24.167 23.596 23.284 22.941 22.556 22.124 21.527 20.698 17.65 -6 ,8646 ,KEBNE ,16675844,Wed Nov 24 08:35:50 CET,Wed Nov 24 10:39:33 CET,0.0 1.867 2.557 3.05 3.427 3.788 4.096 4.354 4.885 5.122 5.321 5.593 5.88 6.048 6.352 6.65 6.934 7.083 7.371 7.633 8.029 8.28 8.514 8.853 9.175 9.48 9.764 10.05 10.435 10.82 11.195 11.629 12.052 12.478 12.945 13.478 14.02 14.59 15.183 15.827 16.537 17.378 18.32 19.217 20.286 21.469 22.815 24.433 26.351 28.48 30.787 32.287 32.973 33.173 33.16 33.08 32.926 32.588 32.153 31.673 31.232 30.833 30.487 30.129 29.766 29.423 28.993 28.601 28.272 27.96 27.675 27.427 27.13 26.818 26.594 26.356 26.11 25.847 25.543 25.325 25.121 24.827 24.598 24.333 24.201 23.921 23.597 23.259 23.084 22.806 22.454 22.213 21.969 21.47 21.151 20.761 20.333 19.846 19.277 18.543 16.647 -7 ,28638 ,KEBNE ,16675845,Wed Nov 24 08:37:49 CET,Wed Nov 24 10:37:26 CET,0.0 2.374 3.01 3.492 3.903 4.272 4.58 4.85 5.332 5.553 5.775 6.07 6.365 6.531 6.86 7.181 7.489 7.634 7.911 8.197 8.634 8.906 9.172 9.573 9.955 10.313 10.66 11.024 11.508 11.95 12.357 12.853 13.365 13.863 14.413 15.007 15.612 16.306 17.047 17.843 18.672 19.554 20.532 21.506 22.714 24.069 25.516 27.083 28.9 31.131 33.76 35.712 36.767 37.407 37.646 37.511 37.213 36.877 36.522 36.137 35.801 35.499 35.245 34.981 34.685 34.39 34.053 33.735 33.436 33.13 32.811 32.536 32.223 31.901 31.668 31.375 31.021 30.668 30.355 30.155 29.918 29.534 29.258 28.98 28.848 28.536 28.209 27.835 27.61 27.305 26.884 26.604 26.302 25.65 25.293 24.901 24.473 24.011 23.453 22.687 20.171 -8 ,24018 ,KEBNE ,16678140,Thu Nov 25 00:11:13 CET,Thu Nov 25 02:14:52 CET,0.0 2.226 2.85 3.345 3.768 4.125 4.442 4.723 5.22 5.435 5.637 5.915 6.2 6.363 6.697 7.014 7.303 7.45 7.725 7.984 8.362 8.601 8.828 9.159 9.493 9.814 10.12 10.423 10.82 11.229 11.644 12.122 12.56 12.989 13.493 14.062 14.619 15.235 15.874 16.533 17.229 18.027 18.904 19.741 20.845 22.02 23.21 24.584 26.083 27.599 29.037 29.719 29.712 29.444 29.051 28.618 28.163 27.636 27.072 26.44 25.835 25.241 24.664 24.136 23.649 23.189 22.689 22.214 21.798 21.383 20.982 20.644 20.282 19.914 19.611 19.293 18.975 18.644 18.297 18.074 17.852 17.5 17.243 16.953 16.794 16.451 16.102 15.717 15.503 15.199 14.841 14.613 14.373 13.842 13.537 13.202 12.861 12.477 11.985 11.336 9.431 -9 ,20669 ,KEBNE ,16675847,Wed Nov 24 08:40:55 CET,Wed Nov 24 10:41:54 CET,0.0 2.447 3.144 3.647 4.06 4.434 4.764 5.068 5.599 5.826 6.053 6.415 6.758 6.966 7.362 7.707 8.003 8.151 8.465 8.786 9.239 9.514 9.782 10.197 10.611 10.998 11.339 11.652 12.054 12.453 12.858 13.345 13.798 14.236 14.777 15.39 15.972 16.629 17.344 18.123 18.929 19.805 20.845 21.908 23.2 24.66 26.228 27.905 29.91 32.192 34.529 36.056 36.77 37.061 36.981 36.595 36.161 35.718 35.285 34.808 34.36 33.922 33.496 33.097 32.709 32.378 32.019 31.668 31.381 31.118 30.806 30.515 30.224 29.919 29.676 29.43 29.18 28.898 28.606 28.408 28.197 27.842 27.594 27.343 27.212 26.954 26.652 26.278 26.077 25.788 25.445 25.196 24.923 24.405 24.138 23.803 23.427 23.069 22.57 21.808 19.015 -10 ,6488 ,KEBNE ,16675848,Wed Nov 24 08:41:56 CET,Wed Nov 24 10:40:56 CET,0.0 2.068 2.626 3.036 3.401 3.705 3.976 4.236 4.718 4.942 5.15 5.419 5.689 5.845 6.153 6.462 6.766 6.908 7.165 7.426 7.81 8.048 8.285 8.629 8.946 9.272 9.609 9.934 10.348 10.747 11.135 11.599 12.038 12.472 12.998 13.591 14.16 14.782 15.489 16.277 17.105 18.04 19.114 20.149 21.359 22.798 24.512 26.441 28.628 30.973 33.382 34.961 35.527 35.735 35.773 35.527 35.138 34.734 34.303 33.822 33.387 32.98 32.56 32.133 31.745 31.399 31.035 30.674 30.369 30.036 29.62 29.237 28.857 28.524 28.301 28.083 27.839 27.585 27.31 27.107 26.901 26.572 26.329 26.083 25.953 25.671 25.377 25.041 24.876 24.627 24.368 24.176 23.956 23.477 23.194 22.877 22.501 22.041 21.534 20.865 18.141 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt deleted file mode 100644 index cc73341c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14155 ,KEBNE ,16678143,Thu Nov 25 00:12:15 CET,Thu Nov 25 02:16:44 CET,0.0 0.533 0.787 0.993 1.179 1.345 1.498 1.647 1.951 2.091 2.209 2.336 2.551 2.665 2.877 3.063 3.244 3.34 3.526 3.696 3.949 4.117 4.275 4.505 4.726 4.934 5.129 5.318 5.566 5.799 6.029 6.309 6.566 6.817 7.105 7.412 7.711 8.046 8.395 8.75 9.139 9.591 10.097 10.579 11.122 11.714 12.41 13.147 13.921 14.73 15.471 15.802 15.714 15.475 15.232 14.953 14.643 14.334 14.046 13.721 13.425 13.153 12.882 12.594 12.273 11.98 11.71 11.474 11.26 11.036 10.81 10.625 10.424 10.215 10.04 9.846 9.642 9.436 9.226 9.084 8.939 8.705 8.54 8.352 8.252 8.032 7.788 7.532 7.396 7.158 6.989 6.821 6.631 6.222 5.991 5.738 5.464 5.156 4.783 4.233 1.925 -2 ,18830 ,KEBNE ,16678144,Thu Nov 25 00:12:15 CET,Thu Nov 25 02:16:34 CET,0.0 0.796 1.12 1.344 1.538 1.727 1.921 2.12 2.505 2.687 2.839 2.989 3.214 3.327 3.545 3.754 3.951 4.045 4.233 4.414 4.689 4.864 5.037 5.295 5.533 5.75 5.944 6.133 6.382 6.625 6.855 7.13 7.406 7.685 8.01 8.367 8.708 9.072 9.447 9.828 10.23 10.704 11.255 11.783 12.337 12.92 13.597 14.362 15.222 16.057 16.701 16.931 16.812 16.497 16.185 15.905 15.592 15.243 14.91 14.607 14.356 14.117 13.872 13.617 13.364 13.115 12.852 12.609 12.394 12.178 11.968 11.773 11.55 11.306 11.114 10.941 10.757 10.546 10.317 10.16 10.005 9.768 9.586 9.391 9.3 9.101 8.885 8.655 8.53 8.297 8.103 7.929 7.769 7.424 7.21 6.96 6.678 6.375 5.998 5.477 3.384 -3 ,31129 ,KEBNE ,16675851,Wed Nov 24 08:43:01 CET,Wed Nov 24 10:36:29 CET,0.0 1.297 1.782 2.179 2.531 2.81 3.025 3.217 3.564 3.719 3.86 4.032 4.275 4.406 4.634 4.827 5.02 5.116 5.304 5.494 5.776 5.96 6.145 6.406 6.642 6.858 7.063 7.272 7.559 7.846 8.125 8.452 8.742 9.019 9.337 9.675 10.006 10.362 10.743 11.148 11.589 12.076 12.608 13.115 13.708 14.39 15.119 15.846 16.616 17.391 18.005 18.222 18.1 17.84 17.55 17.202 16.795 16.39 16.048 15.68 15.308 14.984 14.676 14.348 14.016 13.693 13.325 12.961 12.658 12.371 12.073 11.822 11.556 11.281 11.054 10.807 10.571 10.326 10.054 9.873 9.694 9.421 9.237 9.032 8.922 8.689 8.436 8.174 8.038 7.783 7.563 7.391 7.211 6.835 6.623 6.369 6.091 5.785 5.409 4.836 2.927 -4 ,28220 ,KEBNE ,16678146,Thu Nov 25 00:13:17 CET,Thu Nov 25 02:14:36 CET,0.0 0.511 0.79 1.025 1.225 1.395 1.554 1.699 1.962 2.087 2.212 2.349 2.554 2.665 2.881 3.08 3.273 3.369 3.557 3.743 4.009 4.181 4.341 4.567 4.785 4.992 5.197 5.382 5.619 5.86 6.096 6.371 6.622 6.874 7.165 7.489 7.786 8.098 8.432 8.799 9.211 9.655 10.116 10.558 11.067 11.635 12.289 13.013 13.783 14.481 15.086 15.333 15.237 14.967 14.66 14.331 13.955 13.518 13.078 12.599 12.169 11.783 11.399 11.044 10.743 10.46 10.153 9.892 9.672 9.421 9.162 8.963 8.748 8.527 8.351 8.159 7.955 7.742 7.503 7.335 7.173 6.923 6.742 6.549 6.446 6.232 6.0 5.738 5.6 5.348 5.105 4.929 4.74 4.344 4.134 3.908 3.624 3.304 2.931 2.394 0.43 -5 ,13868 ,KEBNE ,16675853,Wed Nov 24 08:43:59 CET,Wed Nov 24 10:48:05 CET,0.0 0.583 0.887 1.134 1.368 1.567 1.737 1.895 2.192 2.335 2.471 2.623 2.835 2.943 3.156 3.356 3.554 3.655 3.836 4.006 4.253 4.417 4.578 4.799 5.005 5.215 5.421 5.621 5.877 6.113 6.341 6.623 6.891 7.152 7.463 7.813 8.138 8.463 8.808 9.186 9.578 10.01 10.491 10.961 11.487 12.057 12.749 13.502 14.167 14.74 15.293 15.341 15.043 14.669 14.22 13.744 13.27 12.841 12.441 11.985 11.558 11.179 10.821 10.489 10.187 9.909 9.607 9.306 9.039 8.763 8.474 8.238 7.991 7.727 7.526 7.312 7.091 6.852 6.589 6.408 6.219 5.916 5.689 5.458 5.344 5.106 4.84 4.546 4.398 4.146 3.909 3.74 3.583 3.211 2.986 2.737 2.463 2.173 1.8 1.19 -0.85 -6 ,9748 ,KEBNE ,16675854,Wed Nov 24 08:44:00 CET,Wed Nov 24 10:44:23 CET,0.0 0.795 1.098 1.323 1.54 1.744 1.926 2.091 2.394 2.531 2.656 2.805 3.025 3.149 3.363 3.573 3.781 3.875 4.048 4.224 4.481 4.643 4.805 5.04 5.268 5.487 5.699 5.91 6.17 6.419 6.673 6.984 7.271 7.535 7.839 8.178 8.514 8.871 9.235 9.645 10.092 10.592 11.155 11.659 12.21 12.803 13.438 14.106 14.825 15.599 16.207 16.329 16.218 15.944 15.61 15.268 14.927 14.576 14.242 13.865 13.508 13.196 12.918 12.652 12.383 12.127 11.836 11.578 11.358 11.118 10.855 10.627 10.397 10.162 9.981 9.793 9.592 9.362 9.114 8.947 8.779 8.515 8.33 8.129 8.015 7.785 7.541 7.269 7.134 6.901 6.696 6.531 6.36 5.977 5.747 5.491 5.222 4.906 4.515 3.98 2.231 -7 ,22153 ,KEBNE ,16675855,Wed Nov 24 08:48:07 CET,Wed Nov 24 10:48:08 CET,0.0 0.534 0.816 1.011 1.196 1.371 1.534 1.693 1.995 2.141 2.274 2.422 2.635 2.739 2.936 3.143 3.36 3.457 3.647 3.856 4.131 4.288 4.448 4.679 4.898 5.118 5.33 5.536 5.798 6.046 6.286 6.581 6.881 7.179 7.504 7.852 8.18 8.533 8.911 9.304 9.698 10.128 10.643 11.179 11.785 12.4 13.124 13.923 14.747 15.546 16.206 16.488 16.428 16.205 15.905 15.546 15.178 14.838 14.537 14.189 13.859 13.593 13.329 13.03 12.741 12.468 12.128 11.837 11.625 11.386 11.117 10.893 10.652 10.394 10.176 9.936 9.691 9.447 9.182 8.98 8.763 8.425 8.198 7.958 7.837 7.588 7.32 7.039 6.894 6.629 6.384 6.212 6.013 5.563 5.329 5.059 4.756 4.425 4.006 3.416 1.303 -8 ,14415 ,KEBNE ,16678150,Thu Nov 25 00:16:22 CET,Thu Nov 25 02:21:59 CET,0.0 1.073 1.467 1.775 2.022 2.233 2.434 2.62 2.96 3.118 3.268 3.432 3.686 3.82 4.042 4.277 4.503 4.605 4.791 4.985 5.274 5.45 5.622 5.881 6.138 6.377 6.592 6.792 7.073 7.352 7.608 7.906 8.181 8.453 8.773 9.127 9.473 9.835 10.226 10.63 11.016 11.444 11.947 12.426 12.949 13.531 14.201 14.892 15.579 16.313 16.984 17.248 17.194 16.981 16.732 16.448 16.132 15.784 15.453 15.106 14.77 14.431 14.077 13.753 13.478 13.212 12.918 12.643 12.39 12.15 11.904 11.675 11.442 11.212 11.025 10.816 10.608 10.399 10.175 10.011 9.837 9.557 9.343 9.117 9.003 8.79 8.567 8.318 8.185 7.949 7.758 7.607 7.431 7.054 6.839 6.584 6.306 5.98 5.575 4.984 2.883 -9 ,30454 ,KEBNE ,16678151,Thu Nov 25 00:16:22 CET,Thu Nov 25 02:18:30 CET,0.0 0.713 0.975 1.19 1.367 1.537 1.7 1.864 2.175 2.323 2.475 2.656 2.888 3.011 3.254 3.472 3.682 3.787 3.989 4.189 4.473 4.661 4.841 5.082 5.32 5.545 5.749 5.945 6.192 6.429 6.663 6.944 7.206 7.463 7.769 8.104 8.422 8.775 9.131 9.508 9.91 10.353 10.863 11.372 11.952 12.553 13.222 13.926 14.717 15.521 16.164 16.399 16.251 15.95 15.611 15.186 14.72 14.279 13.902 13.525 13.198 12.91 12.62 12.327 12.038 11.763 11.492 11.239 11.005 10.759 10.495 10.268 10.03 9.784 9.59 9.398 9.177 8.925 8.687 8.535 8.367 8.079 7.877 7.654 7.539 7.297 7.023 6.742 6.589 6.313 6.031 5.835 5.629 5.151 4.877 4.589 4.285 3.922 3.482 2.895 0.57 -10 ,27719 ,KEBNE ,16678152,Thu Nov 25 00:17:24 CET,Thu Nov 25 02:20:36 CET,0.0 0.332 0.573 0.771 0.953 1.133 1.296 1.446 1.746 1.879 2.0 2.122 2.333 2.449 2.695 2.932 3.155 3.256 3.442 3.629 3.889 4.05 4.217 4.462 4.701 4.943 5.174 5.393 5.677 5.953 6.209 6.509 6.793 7.054 7.354 7.694 8.022 8.389 8.777 9.173 9.6 10.087 10.611 11.1 11.664 12.297 13.001 13.741 14.563 15.422 16.219 16.539 16.477 16.222 15.87 15.501 15.154 14.814 14.453 14.073 13.738 13.415 13.099 12.785 12.484 12.204 11.906 11.608 11.324 11.036 10.741 10.464 10.181 9.921 9.715 9.486 9.243 8.975 8.682 8.48 8.272 7.938 7.7 7.452 7.325 7.068 6.802 6.512 6.35 6.088 5.856 5.683 5.482 5.007 4.741 4.465 4.175 3.821 3.394 2.734 0.531 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt deleted file mode 100644 index 21dcd0f2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9289 ,KEBNE ,16678153,Thu Nov 25 00:17:28 CET,Thu Nov 25 02:16:56 CET,0.0 1.16 1.521 1.746 1.952 2.136 2.281 2.406 2.624 2.722 2.811 2.875 3.061 3.128 3.268 3.407 3.522 3.574 3.689 3.783 3.887 3.958 4.025 4.115 4.191 4.273 4.356 4.43 4.528 4.617 4.689 4.777 4.86 4.938 5.032 5.112 5.167 5.229 5.29 5.338 5.348 5.31 5.26 5.23 5.156 4.972 4.693 4.247 3.493 2.309 0.263 -2.2 -4.207 -5.89 -7.292 -8.491 -9.49 -10.377 -11.146 -11.946 -12.611 -13.157 -13.679 -14.199 -14.664 -15.072 -15.515 -15.901 -16.223 -16.557 -16.894 -17.18 -17.48 -17.779 -18.006 -18.243 -18.49 -18.743 -19.004 -19.186 -19.382 -19.691 -19.907 -20.128 -20.239 -20.464 -20.705 -20.955 -21.082 -21.356 -21.526 -21.681 -21.828 -22.181 -22.39 -22.602 -22.845 -23.131 -23.489 -23.903 -25.182 -2 ,26507 ,KEBNE ,16678154,Thu Nov 25 00:18:26 CET,Thu Nov 25 02:19:32 CET,0.0 0.97 1.318 1.545 1.718 1.877 2.02 2.143 2.356 2.458 2.564 2.637 2.825 2.901 3.034 3.167 3.291 3.346 3.439 3.511 3.63 3.714 3.79 3.886 3.963 4.03 4.091 4.163 4.265 4.354 4.429 4.513 4.591 4.655 4.715 4.802 4.889 4.951 5.025 5.125 5.236 5.306 5.296 5.232 5.105 4.941 4.7 4.259 3.497 2.303 0.338 -2.001 -3.974 -5.675 -7.121 -8.33 -9.334 -10.221 -10.965 -11.678 -12.285 -12.816 -13.318 -13.799 -14.242 -14.647 -15.078 -15.455 -15.774 -16.098 -16.429 -16.7 -16.983 -17.286 -17.521 -17.757 -17.997 -18.247 -18.522 -18.712 -18.903 -19.21 -19.431 -19.654 -19.76 -19.993 -20.232 -20.467 -20.595 -20.863 -21.023 -21.171 -21.329 -21.698 -21.917 -22.148 -22.387 -22.646 -22.947 -23.391 -24.622 -3 ,7052 ,KEBNE ,16678155,Thu Nov 25 00:18:27 CET,Thu Nov 25 02:20:56 CET,0.0 0.943 1.26 1.502 1.683 1.829 1.964 2.094 2.332 2.429 2.514 2.555 2.758 2.83 2.951 3.064 3.168 3.223 3.331 3.422 3.545 3.617 3.69 3.794 3.884 3.969 4.052 4.135 4.235 4.315 4.376 4.445 4.518 4.589 4.664 4.737 4.798 4.85 4.887 4.926 4.945 4.939 4.939 4.91 4.814 4.636 4.349 3.907 3.202 2.092 0.197 -2.047 -3.845 -5.322 -6.577 -7.696 -8.643 -9.485 -10.222 -10.953 -11.582 -12.132 -12.64 -13.123 -13.575 -13.977 -14.4 -14.772 -15.09 -15.419 -15.742 -16.0 -16.27 -16.559 -16.79 -17.026 -17.275 -17.546 -17.831 -18.023 -18.225 -18.553 -18.769 -18.977 -19.08 -19.308 -19.561 -19.814 -19.955 -20.229 -20.394 -20.554 -20.725 -21.086 -21.271 -21.469 -21.704 -21.961 -22.271 -22.689 -23.629 -4 ,13110 ,KEBNE ,16678156,Thu Nov 25 00:19:28 CET,Thu Nov 25 02:22:13 CET,0.0 1.05 1.354 1.561 1.735 1.877 2.008 2.14 2.398 2.504 2.586 2.612 2.793 2.857 2.978 3.09 3.19 3.241 3.339 3.445 3.596 3.685 3.756 3.843 3.929 3.999 4.062 4.12 4.198 4.278 4.34 4.412 4.488 4.564 4.653 4.733 4.808 4.886 4.923 4.953 4.985 4.99 4.977 4.945 4.868 4.704 4.38 3.873 3.108 1.934 -0.087 -2.451 -4.362 -6.044 -7.453 -8.647 -9.684 -10.602 -11.367 -12.113 -12.75 -13.298 -13.799 -14.267 -14.692 -15.083 -15.499 -15.873 -16.194 -16.512 -16.85 -17.132 -17.418 -17.721 -17.957 -18.204 -18.455 -18.707 -18.976 -19.156 -19.342 -19.649 -19.864 -20.093 -20.209 -20.44 -20.676 -20.921 -21.043 -21.302 -21.499 -21.654 -21.808 -22.144 -22.335 -22.549 -22.788 -23.038 -23.328 -23.82 -25.144 -5 ,13384 ,KEBNE ,16675863,Wed Nov 24 08:54:19 CET,Wed Nov 24 10:57:31 CET,0.0 1.232 1.648 1.906 2.088 2.245 2.379 2.505 2.734 2.838 2.93 2.961 3.117 3.182 3.312 3.42 3.503 3.549 3.648 3.733 3.854 3.932 4.009 4.114 4.194 4.278 4.363 4.427 4.515 4.593 4.664 4.751 4.822 4.889 4.965 5.033 5.084 5.144 5.197 5.223 5.229 5.214 5.168 5.092 4.972 4.798 4.515 4.088 3.43 2.343 0.401 -2.024 -4.065 -5.73 -7.076 -8.249 -9.251 -10.151 -10.932 -11.673 -12.294 -12.857 -13.386 -13.878 -14.332 -14.744 -15.182 -15.585 -15.925 -16.264 -16.627 -16.918 -17.204 -17.502 -17.752 -18.015 -18.275 -18.55 -18.829 -19.012 -19.206 -19.511 -19.709 -19.915 -20.022 -20.235 -20.475 -20.737 -20.872 -21.14 -21.294 -21.454 -21.623 -21.959 -22.149 -22.358 -22.579 -22.839 -23.131 -23.541 -24.69 -6 ,26832 ,KEBNE ,16675864,Wed Nov 24 08:55:21 CET,Wed Nov 24 10:56:34 CET,0.0 0.587 0.912 1.146 1.355 1.527 1.66 1.787 2.028 2.124 2.209 2.269 2.454 2.518 2.629 2.742 2.854 2.906 3.01 3.101 3.207 3.275 3.354 3.459 3.542 3.618 3.696 3.764 3.853 3.946 4.039 4.147 4.233 4.31 4.395 4.481 4.55 4.607 4.655 4.703 4.728 4.741 4.739 4.677 4.573 4.406 4.086 3.661 3.016 1.866 -0.025 -2.207 -4.081 -5.683 -7.046 -8.26 -9.295 -10.172 -10.895 -11.607 -12.219 -12.766 -13.294 -13.804 -14.258 -14.659 -15.081 -15.458 -15.79 -16.127 -16.467 -16.76 -17.049 -17.33 -17.561 -17.807 -18.051 -18.301 -18.571 -18.749 -18.926 -19.232 -19.431 -19.625 -19.735 -19.969 -20.223 -20.479 -20.604 -20.863 -21.01 -21.156 -21.321 -21.713 -21.925 -22.142 -22.386 -22.661 -22.981 -23.385 -24.423 -7 ,16981 ,KEBNE ,16675865,Wed Nov 24 08:55:21 CET,Wed Nov 24 10:56:41 CET,0.0 0.76 1.085 1.339 1.54 1.697 1.837 1.959 2.164 2.243 2.333 2.418 2.603 2.675 2.805 2.908 2.997 3.04 3.126 3.214 3.316 3.38 3.453 3.557 3.654 3.748 3.83 3.893 3.976 4.067 4.143 4.216 4.302 4.379 4.444 4.514 4.572 4.616 4.653 4.697 4.723 4.716 4.688 4.66 4.543 4.319 4.02 3.557 2.775 1.542 -0.388 -2.668 -4.6 -6.227 -7.601 -8.794 -9.832 -10.782 -11.584 -12.382 -13.057 -13.636 -14.168 -14.659 -15.106 -15.504 -15.93 -16.318 -16.643 -16.975 -17.314 -17.596 -17.891 -18.204 -18.438 -18.674 -18.929 -19.194 -19.456 -19.635 -19.831 -20.124 -20.323 -20.54 -20.659 -20.9 -21.166 -21.461 -21.617 -21.9 -22.048 -22.215 -22.388 -22.766 -22.978 -23.196 -23.425 -23.707 -24.054 -24.52 -25.578 -8 ,23203 ,KEBNE ,16678160,Thu Nov 25 00:20:30 CET,Thu Nov 25 02:23:43 CET,0.0 0.867 1.208 1.475 1.693 1.894 2.064 2.199 2.47 2.586 2.678 2.753 2.951 3.035 3.174 3.302 3.432 3.491 3.599 3.714 3.858 3.946 4.036 4.169 4.291 4.403 4.531 4.652 4.79 4.931 5.059 5.19 5.314 5.425 5.533 5.645 5.736 5.815 5.897 5.945 5.942 5.917 5.862 5.775 5.619 5.392 5.035 4.498 3.662 2.361 0.183 -2.356 -4.348 -5.97 -7.352 -8.585 -9.626 -10.563 -11.356 -12.107 -12.75 -13.32 -13.837 -14.311 -14.749 -15.17 -15.613 -15.995 -16.316 -16.641 -16.984 -17.263 -17.566 -17.896 -18.152 -18.421 -18.7 -18.966 -19.212 -19.379 -19.56 -19.847 -20.054 -20.263 -20.376 -20.609 -20.836 -21.091 -21.225 -21.488 -21.629 -21.768 -21.921 -22.262 -22.443 -22.654 -22.898 -23.198 -23.561 -23.971 -25.262 -9 ,12613 ,KEBNE ,16675867,Wed Nov 24 08:59:28 CET,Wed Nov 24 10:58:47 CET,0.0 0.98 1.309 1.503 1.675 1.86 2.026 2.145 2.373 2.484 2.584 2.623 2.802 2.882 3.052 3.197 3.304 3.357 3.466 3.559 3.687 3.774 3.849 3.959 4.064 4.161 4.251 4.329 4.425 4.51 4.588 4.69 4.798 4.894 4.978 5.05 5.117 5.185 5.249 5.309 5.339 5.337 5.295 5.214 5.08 4.898 4.581 4.099 3.403 2.226 0.186 -2.267 -4.28 -5.955 -7.337 -8.526 -9.539 -10.428 -11.186 -11.929 -12.583 -13.161 -13.701 -14.195 -14.643 -15.048 -15.457 -15.823 -16.14 -16.461 -16.788 -17.075 -17.372 -17.673 -17.912 -18.164 -18.428 -18.689 -18.959 -19.144 -19.336 -19.646 -19.856 -20.074 -20.188 -20.416 -20.66 -20.921 -21.048 -21.308 -21.492 -21.652 -21.821 -22.179 -22.374 -22.609 -22.869 -23.143 -23.461 -23.852 -24.882 -10 ,28113 ,KEBNE ,16675868,Wed Nov 24 09:01:31 CET,Wed Nov 24 11:02:08 CET,0.0 1.139 1.453 1.658 1.819 1.959 2.086 2.189 2.35 2.427 2.515 2.574 2.748 2.818 2.958 3.073 3.165 3.211 3.293 3.362 3.476 3.548 3.611 3.701 3.79 3.878 3.965 4.05 4.147 4.231 4.307 4.392 4.462 4.515 4.581 4.643 4.686 4.728 4.759 4.787 4.807 4.803 4.773 4.716 4.611 4.459 4.175 3.718 3.056 1.953 -0.098 -2.598 -4.484 -5.998 -7.323 -8.517 -9.531 -10.42 -11.169 -11.892 -12.502 -13.055 -13.593 -14.081 -14.55 -15.001 -15.467 -15.882 -16.237 -16.606 -16.985 -17.3 -17.63 -17.959 -18.2 -18.458 -18.733 -19.012 -19.309 -19.52 -19.732 -20.055 -20.283 -20.507 -20.613 -20.853 -21.111 -21.375 -21.509 -21.768 -21.934 -22.096 -22.269 -22.622 -22.83 -23.054 -23.306 -23.595 -23.904 -24.298 -25.33 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt deleted file mode 100644 index 6cac9441..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19606 ,KEBNE ,16675869,Wed Nov 24 09:01:31 CET,Wed Nov 24 11:02:03 CET,0.0 0.557 0.802 0.994 1.166 1.333 1.501 1.656 1.938 2.063 2.17 2.167 2.517 2.627 2.837 3.019 3.189 3.277 3.458 3.634 3.894 4.056 4.214 4.439 4.642 4.835 5.018 5.195 5.422 5.629 5.82 6.057 6.282 6.5 6.762 7.039 7.303 7.599 7.912 8.249 8.61 9.005 9.481 9.956 10.465 11.032 11.667 12.344 13.156 14.082 14.949 15.41 15.553 15.495 15.351 15.179 14.985 14.768 14.563 14.341 14.102 13.879 13.666 13.46 13.277 13.106 12.925 12.751 12.598 12.429 12.237 12.072 11.891 11.698 11.543 11.38 11.214 11.039 10.853 10.721 10.585 10.371 10.225 10.079 9.994 9.797 9.596 9.394 9.284 8.941 8.95 8.812 8.662 8.32 8.126 7.927 7.682 7.388 7.023 6.494 4.637 -2 ,6766 ,KEBNE ,16678164,Thu Nov 25 00:21:32 CET,Thu Nov 25 02:23:12 CET,0.0 0.455 0.706 0.911 1.103 1.286 1.446 1.595 1.882 2.011 2.124 2.112 2.465 2.579 2.815 3.02 3.185 3.265 3.429 3.591 3.813 3.949 4.089 4.305 4.51 4.696 4.873 5.05 5.281 5.482 5.669 5.911 6.15 6.385 6.656 6.955 7.236 7.547 7.891 8.242 8.585 8.973 9.435 9.865 10.339 10.89 11.506 12.158 12.876 13.657 14.485 14.995 15.09 14.969 14.773 14.56 14.372 14.175 13.947 13.665 13.403 13.152 12.892 12.661 12.455 12.257 12.059 11.87 11.68 11.49 11.295 11.115 10.935 10.76 10.614 10.463 10.313 10.138 9.943 9.817 9.675 9.432 9.269 9.105 9.024 8.857 8.664 8.443 8.326 7.974 7.975 7.84 7.686 7.35 7.168 6.964 6.729 6.463 6.102 5.589 3.698 -3 ,22638 ,KEBNE ,16675871,Wed Nov 24 09:02:33 CET,Wed Nov 24 11:02:45 CET,0.0 0.32 0.529 0.709 0.85 0.995 1.139 1.269 1.5 1.613 1.726 1.69 2.032 2.133 2.339 2.535 2.706 2.787 2.94 3.082 3.301 3.442 3.571 3.754 3.931 4.097 4.253 4.407 4.608 4.808 4.993 5.197 5.391 5.586 5.816 6.066 6.311 6.58 6.867 7.171 7.505 7.899 8.346 8.779 9.264 9.779 10.347 10.921 11.539 12.232 12.949 13.328 13.384 13.234 12.966 12.675 12.404 12.123 11.863 11.599 11.348 11.115 10.889 10.67 10.463 10.264 10.047 9.868 9.712 9.528 9.343 9.178 8.984 8.783 8.631 8.481 8.31 8.131 7.948 7.817 7.664 7.401 7.217 7.03 6.928 6.717 6.515 6.294 6.168 5.793 5.729 5.565 5.392 5.014 4.795 4.561 4.31 3.958 3.49 2.795 0.289 -4 ,4653 ,KEBNE ,16675872,Wed Nov 24 09:03:35 CET,Wed Nov 24 11:06:13 CET,0.0 0.667 1.066 1.34 1.55 1.743 1.929 2.093 2.375 2.509 2.649 2.649 3.001 3.112 3.33 3.533 3.723 3.818 4.007 4.178 4.42 4.579 4.73 4.954 5.168 5.373 5.577 5.763 5.994 6.214 6.432 6.687 6.921 7.165 7.459 7.772 8.07 8.393 8.735 9.095 9.46 9.862 10.339 10.799 11.323 11.893 12.517 13.184 13.889 14.642 15.421 15.902 15.983 15.921 15.769 15.523 15.278 15.042 14.809 14.524 14.272 14.043 13.8 13.564 13.334 13.116 12.892 12.694 12.513 12.319 12.104 11.917 11.727 11.515 11.347 11.166 10.973 10.778 10.577 10.435 10.286 10.052 9.888 9.718 9.622 9.427 9.238 9.002 8.865 8.499 8.475 8.331 8.166 7.817 7.621 7.392 7.115 6.779 6.372 5.815 4.072 -5 ,17913 ,KEBNE ,16675873,Wed Nov 24 09:03:35 CET,Wed Nov 24 11:04:57 CET,0.0 0.601 0.894 1.117 1.299 1.453 1.589 1.726 1.967 2.07 2.162 2.096 2.416 2.498 2.664 2.832 2.98 3.051 3.194 3.33 3.524 3.644 3.766 3.956 4.135 4.299 4.451 4.597 4.788 4.978 5.154 5.361 5.569 5.773 6.01 6.263 6.504 6.768 7.042 7.334 7.645 7.983 8.37 8.745 9.152 9.603 10.142 10.73 11.353 12.056 12.8 13.172 13.221 13.119 12.957 12.781 12.562 12.355 12.192 12.001 11.797 11.589 11.371 11.162 10.981 10.813 10.633 10.464 10.317 10.174 10.033 9.908 9.761 9.597 9.457 9.297 9.119 8.925 8.731 8.611 8.483 8.261 8.105 7.957 7.882 7.698 7.505 7.313 7.207 6.86 6.816 6.672 6.528 6.231 6.065 5.874 5.653 5.4 5.088 4.646 3.124 -6 ,16237 ,KEBNE ,16675874,Wed Nov 24 09:04:37 CET,Wed Nov 24 11:06:40 CET,0.0 0.549 0.789 1.004 1.21 1.403 1.575 1.732 2.036 2.177 2.295 2.268 2.623 2.733 2.94 3.134 3.319 3.411 3.578 3.732 3.957 4.107 4.25 4.452 4.644 4.817 4.979 5.142 5.355 5.556 5.748 5.974 6.202 6.428 6.662 6.914 7.169 7.447 7.741 8.051 8.378 8.735 9.157 9.587 10.069 10.599 11.218 11.921 12.703 13.575 14.556 15.128 15.311 15.3 15.23 15.174 15.084 14.954 14.806 14.639 14.494 14.367 14.241 14.128 14.014 13.894 13.746 13.601 13.468 13.31 13.145 13.015 12.896 12.765 12.65 12.536 12.421 12.3 12.171 12.076 11.956 11.763 11.636 11.494 11.415 11.252 11.099 10.95 10.869 10.55 10.597 10.505 10.389 10.126 9.977 9.813 9.633 9.415 9.124 8.637 7.289 -7 ,31499 ,KEBNE ,16675875,Wed Nov 24 09:05:38 CET,Wed Nov 24 11:06:44 CET,0.0 0.634 0.965 1.219 1.446 1.657 1.85 2.015 2.303 2.427 2.553 2.553 2.909 3.014 3.201 3.389 3.572 3.665 3.853 4.016 4.233 4.38 4.529 4.742 4.946 5.135 5.311 5.485 5.712 5.927 6.13 6.371 6.606 6.835 7.103 7.395 7.67 7.982 8.326 8.678 9.031 9.425 9.871 10.321 10.848 11.396 12.007 12.662 13.372 14.123 14.805 15.167 15.24 15.13 14.935 14.673 14.401 14.154 13.93 13.708 13.518 13.338 13.136 12.932 12.751 12.585 12.408 12.246 12.111 11.981 11.826 11.688 11.535 11.349 11.198 11.049 10.896 10.746 10.593 10.467 10.329 10.137 10.006 9.859 9.779 9.618 9.464 9.294 9.202 8.879 8.913 8.81 8.694 8.431 8.275 8.087 7.861 7.587 7.252 6.832 5.686 -8 ,26545 ,KEBNE ,16675876,Wed Nov 24 09:07:41 CET,Wed Nov 24 11:08:25 CET,0.0 0.432 0.696 0.947 1.151 1.329 1.508 1.66 1.924 2.061 2.194 2.193 2.541 2.649 2.861 3.059 3.256 3.355 3.543 3.713 3.95 4.103 4.247 4.457 4.67 4.876 5.075 5.268 5.505 5.714 5.907 6.147 6.397 6.637 6.903 7.204 7.507 7.84 8.186 8.537 8.885 9.289 9.776 10.247 10.745 11.267 11.884 12.558 13.29 14.061 14.824 15.327 15.51 15.482 15.356 15.176 14.962 14.757 14.543 14.275 14.047 13.843 13.62 13.409 13.209 13.011 12.803 12.601 12.427 12.25 12.064 11.915 11.744 11.545 11.384 11.215 11.046 10.873 10.702 10.583 10.442 10.228 10.078 9.915 9.83 9.648 9.464 9.263 9.148 8.8 8.782 8.644 8.492 8.146 7.956 7.738 7.477 7.183 6.798 6.293 4.285 -9 ,1941 ,KEBNE ,16675877,Wed Nov 24 09:07:42 CET,Wed Nov 24 11:08:11 CET,0.0 0.428 0.693 0.924 1.102 1.263 1.408 1.535 1.738 1.835 1.94 1.916 2.246 2.332 2.512 2.686 2.85 2.934 3.096 3.24 3.442 3.574 3.698 3.873 4.056 4.234 4.393 4.552 4.757 4.948 5.138 5.372 5.585 5.791 6.028 6.274 6.525 6.802 7.08 7.38 7.704 8.05 8.449 8.878 9.38 9.927 10.533 11.193 11.934 12.762 13.597 14.114 14.262 14.197 14.007 13.762 13.519 13.264 13.011 12.755 12.531 12.31 12.078 11.856 11.65 11.452 11.251 11.065 10.894 10.725 10.527 10.345 10.158 9.96 9.823 9.676 9.509 9.343 9.173 9.049 8.927 8.739 8.593 8.427 8.344 8.179 8.005 7.805 7.695 7.359 7.357 7.218 7.071 6.745 6.573 6.395 6.157 5.867 5.538 5.084 3.401 -10 ,9513 ,KEBNE ,16675878,Wed Nov 24 09:10:47 CET,Wed Nov 24 11:13:21 CET,0.0 0.358 0.588 0.827 1.005 1.17 1.321 1.46 1.742 1.868 1.992 1.998 2.338 2.436 2.639 2.843 3.043 3.136 3.308 3.475 3.707 3.85 3.994 4.192 4.391 4.588 4.774 4.948 5.159 5.364 5.568 5.827 6.079 6.328 6.615 6.915 7.195 7.485 7.792 8.136 8.497 8.885 9.312 9.735 10.216 10.717 11.314 11.985 12.683 13.454 14.241 14.629 14.639 14.536 14.381 14.172 13.934 13.726 13.557 13.356 13.16 12.968 12.784 12.607 12.439 12.281 12.108 11.938 11.778 11.607 11.432 11.285 11.14 11.004 10.892 10.757 10.606 10.455 10.306 10.194 10.079 9.896 9.756 9.611 9.531 9.361 9.176 8.97 8.863 8.518 8.522 8.393 8.245 7.922 7.715 7.478 7.229 6.97 6.627 6.103 4.214 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt deleted file mode 100644 index b5b58921..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4866 ,KEBNE ,16675879,Wed Nov 24 09:10:47 CET,Wed Nov 24 11:12:37 CET,0.0 0.581 0.918 1.178 1.401 1.605 1.774 1.936 2.266 2.43 2.572 2.59 2.96 3.085 3.309 3.521 3.741 3.853 4.048 4.224 4.489 4.661 4.844 5.115 5.361 5.602 5.825 6.03 6.298 6.563 6.816 7.113 7.392 7.652 7.939 8.257 8.548 8.847 9.195 9.568 9.937 10.354 10.831 11.297 11.824 12.402 13.029 13.683 14.398 15.113 15.755 16.047 16.015 15.84 15.593 15.302 15.014 14.71 14.454 14.198 13.945 13.709 13.478 13.248 13.028 12.817 12.595 12.394 12.213 12.024 11.839 11.683 11.504 11.304 11.145 10.982 10.814 10.637 10.455 10.329 10.195 9.975 9.814 9.654 9.571 9.391 9.192 8.963 8.841 8.482 8.455 8.327 8.2 7.873 7.675 7.462 7.217 6.949 6.58 6.003 4.451 -2 ,23025 ,KEBNE ,16678174,Thu Nov 25 00:32:49 CET,Thu Nov 25 02:38:02 CET,0.0 0.453 0.739 1.008 1.243 1.425 1.594 1.75 2.041 2.175 2.304 2.341 2.71 2.829 3.05 3.257 3.449 3.545 3.734 3.92 4.178 4.329 4.485 4.729 4.957 5.163 5.36 5.553 5.797 6.028 6.25 6.502 6.741 6.983 7.26 7.586 7.908 8.247 8.603 8.97 9.329 9.718 10.176 10.641 11.166 11.737 12.354 12.984 13.66 14.432 15.208 15.594 15.59 15.474 15.306 15.051 14.797 14.542 14.277 14.0 13.754 13.511 13.274 13.046 12.825 12.621 12.395 12.184 12.007 11.811 11.602 11.432 11.252 11.064 10.92 10.763 10.59 10.416 10.231 10.096 9.961 9.76 9.616 9.464 9.379 9.199 9.017 8.803 8.685 8.327 8.31 8.188 8.042 7.703 7.5 7.287 7.051 6.772 6.426 5.879 3.945 -3 ,17696 ,KEBNE ,16678175,Thu Nov 25 00:32:49 CET,Thu Nov 25 02:38:22 CET,0.0 0.641 0.944 1.186 1.417 1.626 1.783 1.922 2.181 2.299 2.427 2.451 2.817 2.935 3.15 3.367 3.564 3.66 3.847 4.034 4.295 4.452 4.611 4.849 5.078 5.289 5.487 5.687 5.95 6.208 6.454 6.734 7.002 7.269 7.556 7.84 8.12 8.442 8.794 9.158 9.537 9.967 10.432 10.887 11.433 12.008 12.622 13.331 14.109 14.877 15.612 15.959 15.988 15.862 15.637 15.362 15.073 14.787 14.537 14.274 14.034 13.82 13.591 13.372 13.173 12.98 12.778 12.583 12.405 12.217 12.028 11.862 11.68 11.488 11.341 11.189 11.018 10.83 10.629 10.488 10.351 10.137 9.985 9.825 9.737 9.565 9.39 9.193 9.084 8.738 8.759 8.634 8.481 8.156 7.959 7.728 7.49 7.228 6.91 6.455 4.571 -4 ,24568 ,KEBNE ,16678176,Thu Nov 25 00:34:51 CET,Thu Nov 25 02:37:48 CET,0.0 0.623 0.961 1.224 1.439 1.616 1.769 1.94 2.255 2.391 2.527 2.52 2.876 2.99 3.206 3.406 3.58 3.658 3.839 4.019 4.254 4.409 4.551 4.751 4.945 5.126 5.294 5.459 5.68 5.904 6.122 6.37 6.619 6.855 7.126 7.427 7.701 8.008 8.327 8.652 9.001 9.395 9.855 10.29 10.729 11.197 11.771 12.414 13.111 13.866 14.647 15.051 15.037 14.865 14.628 14.363 14.091 13.795 13.519 13.213 12.916 12.656 12.419 12.179 11.937 11.712 11.48 11.282 11.108 10.919 10.721 10.55 10.374 10.187 10.034 9.87 9.701 9.526 9.336 9.194 9.045 8.807 8.64 8.479 8.398 8.226 8.039 7.824 7.702 7.34 7.298 7.154 7.01 6.697 6.521 6.316 6.082 5.801 5.458 4.986 3.291 -5 ,22598 ,KEBNE ,16675883,Wed Nov 24 09:16:57 CET,Wed Nov 24 11:17:01 CET,0.0 0.58 0.874 1.119 1.34 1.522 1.703 1.905 2.241 2.398 2.551 2.58 2.95 3.07 3.29 3.502 3.716 3.816 4.012 4.208 4.485 4.654 4.823 5.086 5.328 5.547 5.769 5.985 6.245 6.478 6.707 6.983 7.256 7.53 7.834 8.147 8.43 8.724 9.041 9.391 9.767 10.19 10.632 11.083 11.649 12.209 12.81 13.483 14.241 15.035 15.795 16.14 16.124 15.997 15.781 15.488 15.198 14.923 14.666 14.381 14.12 13.863 13.612 13.385 13.168 12.962 12.738 12.536 12.358 12.156 11.949 11.784 11.6 11.404 11.25 11.085 10.91 10.736 10.561 10.427 10.283 10.077 9.935 9.787 9.706 9.535 9.349 9.142 9.042 8.702 8.681 8.54 8.389 8.088 7.919 7.723 7.504 7.253 6.928 6.444 4.569 -6 ,20324 ,KEBNE ,16678178,Thu Nov 25 00:37:56 CET,Thu Nov 25 02:41:42 CET,0.0 0.457 0.85 1.141 1.393 1.64 1.851 2.035 2.37 2.521 2.671 2.726 3.087 3.204 3.432 3.654 3.872 3.976 4.182 4.372 4.641 4.806 4.957 5.183 5.402 5.613 5.816 6.016 6.271 6.506 6.735 7.013 7.28 7.539 7.843 8.197 8.518 8.833 9.158 9.517 9.894 10.323 10.823 11.278 11.773 12.308 12.943 13.651 14.441 15.246 15.931 16.228 16.24 16.11 15.855 15.562 15.273 14.992 14.738 14.448 14.194 13.965 13.739 13.505 13.275 13.068 12.843 12.631 12.453 12.273 12.069 11.9 11.732 11.542 11.397 11.24 11.059 10.872 10.678 10.544 10.406 10.198 10.05 9.881 9.795 9.627 9.45 9.243 9.133 8.789 8.739 8.586 8.427 8.069 7.873 7.686 7.481 7.23 6.91 6.39 4.605 -7 ,25086 ,KEBNE ,16675885,Wed Nov 24 09:18:59 CET,Wed Nov 24 11:22:17 CET,0.0 0.87 1.226 1.482 1.691 1.876 2.041 2.19 2.479 2.622 2.757 2.776 3.135 3.261 3.51 3.736 3.933 4.033 4.223 4.388 4.626 4.775 4.916 5.129 5.334 5.516 5.693 5.869 6.103 6.329 6.548 6.811 7.055 7.283 7.554 7.874 8.162 8.469 8.791 9.128 9.491 9.871 10.294 10.733 11.259 11.825 12.417 12.974 13.56 14.252 14.9 15.123 15.047 14.827 14.528 14.238 13.952 13.656 13.411 13.155 12.898 12.63 12.374 12.129 11.874 11.647 11.433 11.239 11.065 10.893 10.712 10.565 10.413 10.249 10.105 9.951 9.806 9.647 9.479 9.368 9.244 9.036 8.899 8.743 8.662 8.504 8.316 8.12 8.025 7.685 7.669 7.521 7.381 7.108 6.957 6.772 6.533 6.265 5.963 5.539 3.902 -8 ,7891 ,KEBNE ,16678180,Thu Nov 25 00:38:01 CET,Thu Nov 25 02:37:03 CET,0.0 0.703 1.022 1.249 1.424 1.586 1.742 1.912 2.219 2.353 2.481 2.493 2.856 2.971 3.177 3.373 3.561 3.646 3.816 3.979 4.216 4.375 4.521 4.727 4.915 5.083 5.26 5.43 5.641 5.852 6.058 6.298 6.524 6.738 6.972 7.243 7.524 7.811 8.103 8.421 8.759 9.133 9.564 10.025 10.548 11.087 11.706 12.363 13.093 13.889 14.65 15.051 15.096 14.996 14.84 14.654 14.426 14.165 13.93 13.692 13.479 13.265 13.064 12.88 12.713 12.559 12.389 12.217 12.056 11.895 11.721 11.558 11.394 11.238 11.102 10.958 10.81 10.659 10.489 10.367 10.242 10.046 9.912 9.767 9.694 9.539 9.374 9.204 9.112 8.777 8.775 8.639 8.498 8.201 8.024 7.808 7.566 7.281 6.932 6.409 4.614 -9 ,26232 ,KEBNE ,16678181,Thu Nov 25 00:40:00 CET,Thu Nov 25 02:41:59 CET,0.0 0.655 0.989 1.217 1.432 1.634 1.83 1.999 2.282 2.422 2.548 2.543 2.895 2.992 3.176 3.338 3.524 3.617 3.783 3.949 4.179 4.321 4.459 4.668 4.868 5.065 5.254 5.422 5.624 5.812 6.004 6.246 6.473 6.693 6.957 7.237 7.507 7.828 8.178 8.545 8.93 9.351 9.82 10.267 10.79 11.387 12.041 12.734 13.492 14.275 15.017 15.404 15.418 15.272 15.079 14.809 14.532 14.263 13.991 13.715 13.478 13.253 13.003 12.747 12.512 12.296 12.061 11.843 11.664 11.486 11.287 11.107 10.915 10.73 10.589 10.439 10.284 10.122 9.944 9.811 9.664 9.44 9.288 9.117 9.029 8.845 8.655 8.456 8.349 8.002 7.97 7.848 7.711 7.385 7.191 6.953 6.676 6.369 6.009 5.472 3.9 -10 ,14155 ,KEBNE ,16675888,Wed Nov 24 09:22:06 CET,Wed Nov 24 11:24:21 CET,0.0 0.792 1.09 1.347 1.601 1.814 1.976 2.129 2.442 2.58 2.719 2.751 3.121 3.244 3.476 3.693 3.894 3.992 4.18 4.368 4.646 4.819 4.984 5.21 5.426 5.638 5.836 6.021 6.262 6.487 6.708 6.976 7.225 7.469 7.754 8.068 8.381 8.719 9.052 9.391 9.758 10.168 10.628 11.083 11.614 12.198 12.868 13.607 14.375 15.179 15.952 16.361 16.402 16.273 16.096 15.837 15.551 15.295 15.065 14.824 14.579 14.331 14.106 13.882 13.668 13.476 13.274 13.09 12.922 12.74 12.549 12.388 12.206 12.008 11.857 11.696 11.522 11.344 11.155 11.017 10.875 10.655 10.501 10.346 10.268 10.102 9.924 9.734 9.636 9.304 9.319 9.184 9.036 8.698 8.495 8.278 8.03 7.701 7.291 6.773 4.921 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt deleted file mode 100644 index b8d8c165..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29482 ,KEBNE ,17024012,Wed Dec 22 09:14:49 CET,Wed Dec 22 11:14:32 CET,0.0 1.817 2.471 2.945 3.307 3.637 3.914 4.148 4.588 4.788 4.969 5.046 5.434 5.58 5.876 6.155 6.413 6.534 6.752 6.968 7.288 7.475 7.653 7.918 8.189 8.447 8.678 8.915 9.237 9.531 9.808 10.154 10.494 10.816 11.189 11.606 12.013 12.448 12.898 13.381 13.874 14.418 15.101 15.798 16.53 17.295 18.146 19.049 19.909 20.647 21.214 21.007 20.362 19.704 19.005 18.358 17.794 17.226 16.736 16.26 15.837 15.456 15.065 14.68 14.333 13.995 13.645 13.344 13.066 12.764 12.432 12.12 11.788 11.463 11.206 10.939 10.66 10.36 10.048 9.828 9.585 9.201 8.933 8.652 8.51 8.211 7.882 7.532 7.356 6.925 6.787 6.577 6.365 5.875 5.596 5.307 4.962 4.558 4.062 3.377 1.472 -2 ,16654 ,KEBNE ,17024013,Wed Dec 22 09:15:52 CET,Wed Dec 22 11:15:10 CET,0.0 1.594 2.166 2.593 2.945 3.261 3.547 3.803 4.265 4.47 4.661 4.784 5.198 5.365 5.676 5.965 6.249 6.388 6.656 6.915 7.285 7.507 7.717 8.026 8.328 8.623 8.918 9.201 9.544 9.876 10.216 10.591 10.91 11.235 11.613 12.027 12.445 12.92 13.4 13.895 14.41 14.972 15.58 16.116 16.712 17.355 18.0 18.595 19.18 19.646 19.545 18.712 17.81 16.857 15.915 15.003 14.24 13.535 12.882 12.269 11.76 11.324 10.892 10.455 10.023 9.608 9.2 8.844 8.508 8.134 7.764 7.464 7.143 6.832 6.604 6.365 6.12 5.858 5.583 5.401 5.205 4.889 4.661 4.426 4.306 4.043 3.748 3.43 3.273 2.843 2.697 2.501 2.29 1.832 1.591 1.338 1.049 0.709 0.268 -0.348 -2.032 -3 ,27642 ,KEBNE ,17024014,Wed Dec 22 09:15:52 CET,Wed Dec 22 11:15:05 CET,0.0 2.102 2.637 3.065 3.386 3.642 3.879 4.122 4.557 4.755 4.937 5.042 5.454 5.626 5.945 6.238 6.514 6.64 6.89 7.138 7.473 7.676 7.88 8.184 8.462 8.727 8.992 9.259 9.592 9.903 10.22 10.596 10.929 11.253 11.636 12.06 12.474 12.933 13.42 13.926 14.455 15.063 15.741 16.384 17.118 17.887 18.763 19.781 20.812 21.615 22.003 21.741 21.123 20.376 19.677 19.045 18.383 17.726 17.142 16.54 16.042 15.599 15.193 14.816 14.443 14.097 13.735 13.406 13.101 12.745 12.365 12.081 11.819 11.56 11.348 11.121 10.885 10.645 10.392 10.205 10.0 9.7 9.501 9.27 9.147 8.918 8.685 8.424 8.282 7.877 7.786 7.603 7.415 7.024 6.797 6.524 6.215 5.884 5.458 4.86 2.689 -4 ,32350 ,KEBNE ,17024015,Wed Dec 22 09:17:55 CET,Wed Dec 22 11:17:41 CET,0.0 2.138 2.822 3.328 3.704 4.031 4.31 4.549 4.985 5.201 5.407 5.526 5.942 6.104 6.402 6.666 6.911 7.031 7.279 7.514 7.838 8.042 8.241 8.541 8.822 9.076 9.325 9.582 9.916 10.232 10.555 10.949 11.31 11.65 12.044 12.473 12.862 13.32 13.847 14.408 15.021 15.691 16.442 17.19 18.018 18.962 20.024 21.078 22.128 23.0 23.342 23.106 22.574 21.936 21.313 20.652 20.027 19.439 18.942 18.426 17.976 17.582 17.2 16.825 16.443 16.104 15.749 15.437 15.178 14.888 14.535 14.198 13.841 13.456 13.147 12.843 12.545 12.243 11.941 11.73 11.497 11.119 10.834 10.531 10.379 10.042 9.701 9.343 9.155 8.708 8.504 8.271 8.035 7.534 7.264 6.963 6.61 6.218 5.712 5.017 3.322 -5 ,14053 ,KEBNE ,17024016,Wed Dec 22 09:17:55 CET,Wed Dec 22 11:16:41 CET,0.0 1.581 2.181 2.616 2.952 3.229 3.491 3.732 4.184 4.389 4.577 4.671 5.073 5.239 5.539 5.824 6.092 6.218 6.488 6.745 7.106 7.319 7.507 7.778 8.033 8.284 8.53 8.766 9.085 9.404 9.712 10.072 10.405 10.728 11.1 11.491 11.876 12.312 12.778 13.278 13.824 14.448 15.206 15.926 16.692 17.507 18.42 19.463 20.431 21.269 21.933 21.766 21.024 20.205 19.431 18.719 18.088 17.43 16.815 16.205 15.666 15.18 14.711 14.241 13.766 13.339 12.928 12.552 12.228 11.896 11.547 11.262 10.966 10.648 10.391 10.127 9.859 9.574 9.282 9.074 8.857 8.53 8.297 8.067 7.943 7.666 7.371 7.059 6.9 6.489 6.395 6.209 6.012 5.58 5.334 5.059 4.738 4.346 3.887 3.275 1.303 -6 ,5141 ,KEBNE ,17024017,Wed Dec 22 09:17:55 CET,Wed Dec 22 11:18:06 CET,0.0 1.574 2.208 2.674 3.051 3.364 3.616 3.847 4.274 4.47 4.655 4.755 5.167 5.331 5.644 5.953 6.25 6.386 6.643 6.891 7.244 7.471 7.682 7.975 8.251 8.53 8.809 9.073 9.408 9.739 10.053 10.43 10.792 11.132 11.544 12.025 12.471 12.943 13.45 13.981 14.531 15.143 15.822 16.503 17.35 18.229 19.15 20.147 21.063 21.95 22.736 22.565 21.993 21.322 20.57 19.823 19.13 18.457 17.837 17.177 16.554 15.947 15.353 14.789 14.286 13.846 13.375 12.952 12.589 12.215 11.829 11.496 11.146 10.795 10.527 10.252 9.954 9.636 9.316 9.097 8.88 8.533 8.274 8.012 7.881 7.591 7.285 6.974 6.819 6.406 6.297 6.12 5.939 5.518 5.289 5.043 4.767 4.443 4.022 3.455 1.86 -7 ,4025 ,KEBNE ,17024018,Wed Dec 22 09:17:55 CET,Wed Dec 22 11:17:21 CET,0.0 1.598 2.154 2.594 2.952 3.251 3.523 3.777 4.243 4.438 4.604 4.713 5.129 5.299 5.599 5.871 6.139 6.267 6.509 6.746 7.1 7.334 7.565 7.895 8.204 8.504 8.783 9.054 9.409 9.745 10.072 10.461 10.826 11.162 11.544 11.978 12.38 12.83 13.329 13.849 14.373 14.926 15.579 16.166 16.777 17.408 18.062 18.701 19.338 19.947 20.192 19.703 18.943 18.142 17.336 16.518 15.761 15.062 14.442 13.844 13.331 12.841 12.337 11.838 11.367 10.918 10.448 10.064 9.751 9.414 9.06 8.751 8.396 8.031 7.774 7.524 7.274 7.022 6.727 6.519 6.304 5.933 5.665 5.41 5.28 4.978 4.648 4.297 4.12 3.687 3.54 3.326 3.099 2.616 2.364 2.052 1.646 1.183 0.631 -0.114 -2.617 -8 ,10088 ,KEBNE ,17024019,Wed Dec 22 09:17:59 CET,Wed Dec 22 11:15:57 CET,0.0 1.959 2.556 2.96 3.294 3.591 3.871 4.137 4.581 4.765 4.935 5.016 5.41 5.577 5.895 6.197 6.477 6.61 6.853 7.092 7.452 7.665 7.881 8.199 8.478 8.752 9.043 9.324 9.649 9.961 10.269 10.646 11.023 11.386 11.794 12.26 12.693 13.131 13.607 14.115 14.628 15.213 15.876 16.542 17.327 18.145 19.06 19.967 20.911 21.9 22.609 22.443 21.859 21.225 20.562 19.889 19.185 18.51 17.936 17.366 16.905 16.489 16.034 15.573 15.174 14.79 14.386 14.04 13.731 13.409 13.077 12.81 12.529 12.236 12.015 11.789 11.551 11.289 11.012 10.817 10.608 10.283 10.06 9.84 9.725 9.464 9.21 8.951 8.8 8.407 8.365 8.206 8.035 7.668 7.451 7.185 6.887 6.592 6.241 5.709 3.944 -9 ,16173 ,KEBNE ,17024020,Wed Dec 22 09:17:59 CET,Wed Dec 22 11:14:44 CET,0.0 1.575 2.178 2.608 2.961 3.248 3.496 3.746 4.19 4.396 4.595 4.704 5.11 5.277 5.609 5.899 6.17 6.3 6.518 6.74 7.073 7.283 7.487 7.774 8.024 8.25 8.484 8.709 8.996 9.278 9.533 9.828 10.127 10.414 10.726 11.065 11.378 11.735 12.134 12.54 12.947 13.406 13.941 14.434 14.946 15.468 15.967 16.464 17.157 18.056 18.768 18.7 18.174 17.383 16.58 15.812 15.011 14.203 13.528 12.798 12.109 11.523 10.965 10.453 10.002 9.568 9.081 8.649 8.284 7.887 7.459 7.107 6.752 6.408 6.15 5.874 5.563 5.216 4.873 4.635 4.387 4.006 3.732 3.455 3.31 3.042 2.781 2.48 2.313 1.871 1.725 1.503 1.291 0.837 0.56 0.269 -0.059 -0.461 -0.935 -1.551 -3.934 -10 ,15522 ,KEBNE ,17024021,Wed Dec 22 09:18:57 CET,Wed Dec 22 11:18:07 CET,0.0 2.487 3.077 3.519 3.872 4.184 4.437 4.666 5.095 5.272 5.435 5.51 5.906 6.048 6.317 6.572 6.808 6.922 7.172 7.412 7.72 7.91 8.1 8.375 8.627 8.842 9.047 9.265 9.554 9.83 10.087 10.39 10.681 10.981 11.381 11.858 12.306 12.775 13.283 13.828 14.302 14.734 15.279 15.84 16.401 16.963 17.505 18.002 18.467 18.757 18.642 17.993 17.169 16.285 15.407 14.564 13.827 13.138 12.514 11.854 11.287 10.781 10.309 9.897 9.501 9.132 8.758 8.427 8.148 7.852 7.531 7.255 6.957 6.659 6.451 6.228 5.973 5.689 5.368 5.145 4.921 4.577 4.341 4.101 3.981 3.73 3.462 3.179 3.032 2.622 2.558 2.384 2.186 1.752 1.511 1.236 0.923 0.556 0.098 -0.495 -2.245 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt deleted file mode 100644 index b2e3e1af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18400 ,KEBNE ,16678183,Thu Nov 25 00:41:05 CET,Thu Nov 25 02:39:20 CET,0.0 1.789 2.472 2.97 3.417 3.845 4.237 4.598 5.284 5.597 5.909 6.3 6.845 7.139 7.708 8.253 8.767 9.013 9.506 9.98 10.671 11.138 11.61 12.311 12.991 13.658 14.325 14.988 15.846 16.687 17.529 18.575 19.594 20.597 21.784 23.129 24.452 25.957 27.628 29.468 31.487 33.853 36.724 39.72 43.384 47.704 52.958 59.28 67.387 77.964 92.574 106.905 116.856 124.21 129.791 134.312 137.913 140.884 143.236 145.397 147.13 148.567 149.831 150.947 151.935 152.798 153.661 154.395 155.0 155.597 156.194 156.638 157.057 157.48 157.798 158.104 158.396 158.679 158.95 159.122 159.288 159.528 159.692 159.859 159.934 160.073 160.215 160.354 160.416 160.368 160.486 160.496 160.505 160.488 160.467 160.438 160.379 160.269 160.112 159.867 158.529 -2 ,10867 ,KEBNE ,16675890,Wed Nov 24 09:25:12 CET,Wed Nov 24 11:27:56 CET,0.0 1.998 2.578 3.098 3.566 3.955 4.334 4.717 5.415 5.726 6.025 6.386 6.924 7.213 7.765 8.29 8.802 9.059 9.561 10.054 10.777 11.251 11.728 12.418 13.097 13.773 14.442 15.095 15.953 16.811 17.658 18.698 19.725 20.736 21.93 23.306 24.668 26.201 27.901 29.794 31.86 34.253 37.164 40.239 44.004 48.37 53.671 60.114 68.317 78.983 93.672 107.975 117.889 125.237 130.884 135.425 139.013 141.975 144.329 146.495 148.223 149.669 150.963 152.094 153.071 153.919 154.769 155.494 156.084 156.662 157.219 157.658 158.106 158.558 158.896 159.222 159.532 159.834 160.138 160.343 160.533 160.792 160.972 161.163 161.254 161.417 161.576 161.721 161.785 161.762 161.979 162.042 162.084 162.117 162.106 162.059 161.964 161.794 161.585 161.271 159.736 -3 ,4654 ,KEBNE ,16678185,Thu Nov 25 00:44:05 CET,Thu Nov 25 02:42:57 CET,0.0 1.586 2.197 2.662 3.071 3.467 3.81 4.127 4.764 5.062 5.347 5.658 6.171 6.434 6.945 7.463 7.965 8.204 8.68 9.14 9.816 10.276 10.725 11.378 12.021 12.673 13.33 13.959 14.789 15.615 16.438 17.469 18.474 19.449 20.613 21.972 23.326 24.846 26.528 28.413 30.483 32.887 35.767 38.779 42.499 46.915 52.309 58.786 66.982 77.587 92.143 106.287 116.104 123.422 128.974 133.415 136.968 139.959 142.367 144.562 146.312 147.794 149.132 150.307 151.35 152.252 153.132 153.883 154.483 155.078 155.675 156.15 156.617 157.058 157.39 157.719 158.033 158.334 158.632 158.842 159.049 159.346 159.537 159.714 159.806 159.998 160.171 160.311 160.372 160.336 160.495 160.524 160.552 160.597 160.61 160.599 160.569 160.507 160.366 160.134 159.144 -4 ,21403 ,KEBNE ,16678186,Thu Nov 25 00:44:06 CET,Thu Nov 25 02:46:17 CET,0.0 1.238 1.886 2.391 2.808 3.182 3.515 3.83 4.463 4.772 5.06 5.378 5.902 6.177 6.714 7.252 7.776 8.024 8.496 8.959 9.647 10.089 10.53 11.193 11.849 12.499 13.133 13.771 14.623 15.455 16.275 17.283 18.267 19.242 20.405 21.745 23.073 24.574 26.25 28.096 30.121 32.492 35.358 38.379 42.048 46.34 51.614 58.003 66.118 76.726 91.536 105.956 115.899 123.3 129.003 133.576 137.155 140.125 142.486 144.684 146.474 147.966 149.284 150.468 151.528 152.434 153.325 154.078 154.702 155.328 155.941 156.423 156.893 157.357 157.695 158.017 158.333 158.639 158.933 159.119 159.3 159.556 159.708 159.849 159.916 160.052 160.181 160.289 160.33 160.289 160.471 160.514 160.54 160.576 160.58 160.573 160.542 160.44 160.279 160.048 159.156 -5 ,27471 ,KEBNE ,16675893,Wed Nov 24 09:48:55 CET,Wed Nov 24 11:49:24 CET,0.0 1.817 2.512 3.026 3.463 3.885 4.277 4.627 5.288 5.611 5.926 6.301 6.835 7.11 7.646 8.189 8.719 8.976 9.487 9.987 10.727 11.206 11.673 12.369 13.068 13.754 14.416 15.077 15.95 16.81 17.664 18.717 19.758 20.783 21.992 23.381 24.759 26.323 28.046 29.922 31.945 34.297 37.185 40.23 43.947 48.334 53.698 60.137 68.259 78.822 93.457 107.653 117.444 124.726 130.314 134.798 138.305 141.209 143.561 145.743 147.486 148.943 150.234 151.376 152.389 153.238 154.055 154.762 155.344 155.917 156.476 156.918 157.361 157.798 158.119 158.422 158.714 158.994 159.259 159.436 159.614 159.853 160.002 160.145 160.212 160.344 160.465 160.58 160.623 160.557 160.684 160.708 160.737 160.712 160.655 160.592 160.511 160.362 160.179 159.889 158.208 -6 ,26633 ,KEBNE ,16675894,Wed Nov 24 09:52:01 CET,Wed Nov 24 11:53:31 CET,0.0 1.823 2.419 2.941 3.426 3.829 4.2 4.566 5.242 5.552 5.867 6.254 6.79 7.078 7.616 8.145 8.662 8.913 9.412 9.91 10.652 11.132 11.601 12.293 12.971 13.642 14.318 14.987 15.85 16.71 17.554 18.597 19.636 20.65 21.851 23.23 24.593 26.146 27.865 29.75 31.787 34.176 37.098 40.144 43.875 48.276 53.694 60.204 68.406 79.136 93.855 108.003 117.69 124.853 130.313 134.708 138.258 141.198 143.546 145.733 147.464 148.905 150.197 151.322 152.319 153.196 154.059 154.793 155.403 156.006 156.585 157.023 157.447 157.852 158.149 158.445 158.739 159.028 159.306 159.499 159.687 159.924 160.073 160.228 160.302 160.439 160.557 160.678 160.736 160.691 160.849 160.879 160.907 160.956 160.955 160.918 160.849 160.739 160.574 160.203 158.666 -7 ,30976 ,KEBNE ,16675895,Wed Nov 24 09:52:01 CET,Wed Nov 24 11:54:25 CET,0.0 1.512 2.105 2.571 2.976 3.354 3.699 4.004 4.568 4.848 5.136 5.454 5.963 6.222 6.714 7.195 7.685 7.919 8.376 8.836 9.51 9.955 10.398 11.045 11.688 12.328 12.958 13.604 14.47 15.32 16.167 17.191 18.203 19.211 20.411 21.79 23.171 24.742 26.466 28.356 30.406 32.787 35.663 38.683 42.379 46.743 52.104 58.572 66.764 77.465 92.329 106.754 116.723 124.089 129.656 134.144 137.738 140.746 143.139 145.329 147.085 148.55 149.882 151.065 152.105 153.009 153.887 154.62 155.197 155.753 156.302 156.719 157.132 157.547 157.849 158.14 158.429 158.716 159.003 159.188 159.35 159.58 159.721 159.86 159.932 160.064 160.189 160.301 160.344 160.31 160.497 160.541 160.56 160.574 160.558 160.506 160.447 160.364 160.216 159.958 159.035 -8 ,11986 ,KEBNE ,16678190,Thu Nov 25 00:46:08 CET,Thu Nov 25 02:48:23 CET,0.0 1.224 1.741 2.178 2.578 2.938 3.294 3.632 4.254 4.553 4.85 5.185 5.69 5.95 6.452 6.973 7.477 7.711 8.162 8.616 9.304 9.752 10.191 10.836 11.469 12.094 12.718 13.348 14.186 15.016 15.839 16.862 17.853 18.832 20.008 21.362 22.702 24.201 25.876 27.73 29.73 32.075 34.917 37.888 41.533 45.84 51.101 57.424 65.444 75.854 90.324 104.501 114.311 121.536 127.012 131.435 134.95 137.881 140.225 142.386 144.121 145.585 146.908 148.06 149.071 149.945 150.81 151.55 152.135 152.704 153.272 153.706 154.123 154.534 154.836 155.143 155.441 155.717 155.991 156.162 156.319 156.521 156.638 156.771 156.839 156.972 157.099 157.204 157.237 157.185 157.342 157.352 157.368 157.373 157.355 157.311 157.227 157.095 156.875 156.474 154.408 -9 ,29847 ,KEBNE ,16675897,Wed Nov 24 09:52:02 CET,Wed Nov 24 11:52:25 CET,0.0 1.803 2.488 3.011 3.457 3.9 4.324 4.71 5.439 5.779 6.096 6.467 7.012 7.295 7.861 8.445 9.001 9.265 9.78 10.278 11.017 11.512 11.999 12.712 13.426 14.121 14.79 15.465 16.359 17.225 18.077 19.126 20.16 21.193 22.431 23.845 25.226 26.801 28.553 30.463 32.519 34.884 37.764 40.819 44.523 48.838 54.122 60.572 68.73 79.218 93.784 108.006 117.842 125.111 130.625 135.072 138.63 141.563 143.89 146.068 147.804 149.247 150.56 151.715 152.702 153.562 154.42 155.14 155.711 156.276 156.85 157.3 157.74 158.148 158.443 158.745 159.042 159.335 159.63 159.813 159.984 160.23 160.38 160.513 160.573 160.681 160.779 160.883 160.92 160.856 161.0 161.024 161.044 161.045 161.016 160.962 160.894 160.798 160.604 160.252 158.864 -10 ,6749 ,KEBNE ,16675898,Wed Nov 24 09:52:02 CET,Wed Nov 24 11:52:49 CET,0.0 1.726 2.413 2.942 3.433 3.873 4.254 4.631 5.333 5.662 5.98 6.346 6.887 7.178 7.754 8.299 8.824 9.09 9.598 10.093 10.843 11.331 11.806 12.517 13.219 13.904 14.576 15.245 16.123 16.987 17.832 18.854 19.877 20.896 22.09 23.458 24.803 26.332 28.056 29.929 31.942 34.309 37.2 40.24 43.933 48.263 53.535 59.897 67.967 78.468 92.906 107.057 116.91 124.16 129.662 134.102 137.669 140.631 142.971 145.14 146.896 148.359 149.664 150.818 151.837 152.709 153.554 154.297 154.925 155.535 156.133 156.586 157.019 157.46 157.789 158.106 158.409 158.689 158.982 159.191 159.376 159.624 159.796 159.965 160.045 160.198 160.322 160.411 160.45 160.402 160.542 160.563 160.585 160.607 160.601 160.561 160.486 160.39 160.227 159.938 158.374 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_11_10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_11_10.txt deleted file mode 100644 index 0bc914a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_11_10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24181 ,KEBNE ,16678193,Thu Nov 25 00:46:08 CET,Thu Nov 25 02:09:45 CET,0.0 0.751 1.096 1.375 1.629 1.833 2.015 2.184 2.474 2.612 2.738 2.843 3.082 3.204 3.429 3.617 3.807 3.899 4.059 4.224 4.456 4.59 4.727 4.927 5.114 5.293 5.489 5.687 5.929 6.157 6.368 6.613 6.825 7.031 7.283 7.581 7.873 8.176 8.497 8.835 9.173 9.53 9.937 10.37 10.901 11.432 11.9 12.409 12.93 13.374 13.688 13.449 12.958 12.481 12.015 11.551 11.087 10.623 10.2 9.742 9.367 9.048 8.712 8.358 8.03 7.744 7.435 7.143 6.899 6.652 6.375 6.146 5.902 5.635 5.418 5.179 4.93 4.675 4.412 4.249 4.088 3.817 3.616 3.402 3.279 3.026 2.782 2.513 2.366 2.102 1.896 1.719 1.537 1.125 0.889 0.626 0.328 -0.042 -0.553 -1.176 -3.298 -2 ,10271 ,KEBNE ,16678194,Thu Nov 25 00:48:11 CET,Thu Nov 25 02:13:28 CET,0.0 0.691 1.053 1.326 1.601 1.855 2.071 2.27 2.59 2.728 2.86 2.979 3.217 3.33 3.554 3.77 3.96 4.046 4.205 4.355 4.583 4.737 4.891 5.11 5.306 5.505 5.709 5.896 6.156 6.418 6.64 6.881 7.108 7.328 7.582 7.869 8.17 8.503 8.819 9.123 9.454 9.804 10.217 10.608 11.022 11.495 12.019 12.528 13.049 13.603 13.845 13.626 13.182 12.69 12.22 11.741 11.293 10.856 10.464 10.059 9.691 9.349 9.027 8.715 8.389 8.101 7.793 7.486 7.222 6.951 6.676 6.446 6.194 5.932 5.733 5.507 5.262 4.992 4.708 4.536 4.358 4.059 3.861 3.662 3.558 3.341 3.084 2.804 2.663 2.401 2.214 2.049 1.878 1.497 1.277 1.022 0.738 0.425 0.035 -0.54 -2.76 -3 ,18339 ,KEBNE ,16678195,Thu Nov 25 00:48:11 CET,Thu Nov 25 02:11:50 CET,0.0 0.712 1.06 1.315 1.512 1.693 1.862 2.023 2.293 2.416 2.545 2.65 2.879 2.984 3.19 3.392 3.576 3.663 3.839 4.006 4.233 4.372 4.509 4.712 4.908 5.11 5.311 5.505 5.749 5.988 6.221 6.491 6.728 6.938 7.186 7.464 7.745 8.064 8.402 8.752 9.102 9.47 9.853 10.209 10.604 11.062 11.589 12.113 12.625 13.099 13.389 13.166 12.715 12.174 11.66 11.159 10.676 10.24 9.833 9.386 8.976 8.615 8.271 7.929 7.621 7.333 6.995 6.669 6.383 6.1 5.803 5.564 5.324 5.052 4.828 4.601 4.385 4.158 3.904 3.711 3.507 3.212 3.014 2.801 2.684 2.441 2.17 1.885 1.753 1.504 1.299 1.127 0.959 0.565 0.339 0.094 -0.17 -0.495 -0.903 -1.422 -2.808 -4 ,26009 ,KEBNE ,16678196,Thu Nov 25 00:48:11 CET,Thu Nov 25 02:12:49 CET,0.0 0.742 1.07 1.325 1.545 1.727 1.889 2.049 2.342 2.467 2.589 2.731 2.99 3.127 3.359 3.558 3.756 3.852 4.028 4.194 4.45 4.607 4.75 4.953 5.144 5.336 5.525 5.702 5.922 6.141 6.352 6.579 6.793 7.006 7.247 7.515 7.769 8.053 8.374 8.714 9.069 9.443 9.831 10.213 10.63 11.102 11.635 12.177 12.774 13.264 13.428 13.123 12.692 12.209 11.719 11.232 10.761 10.308 9.859 9.381 8.987 8.619 8.252 7.924 7.617 7.322 7.018 6.755 6.5 6.222 5.934 5.699 5.471 5.226 5.026 4.814 4.607 4.388 4.138 3.965 3.781 3.492 3.298 3.08 2.964 2.722 2.45 2.18 2.037 1.759 1.534 1.354 1.163 0.759 0.538 0.283 0.013 -0.292 -0.728 -1.344 -3.355 -5 ,11592 ,KEBNE ,16678197,Thu Nov 25 00:48:11 CET,Thu Nov 25 02:11:50 CET,0.0 0.454 0.75 0.966 1.16 1.348 1.519 1.676 2.0 2.158 2.3 2.424 2.663 2.775 2.985 3.188 3.383 3.479 3.678 3.855 4.09 4.231 4.375 4.583 4.787 4.991 5.162 5.337 5.592 5.837 6.044 6.28 6.501 6.721 6.978 7.232 7.495 7.802 8.116 8.438 8.761 9.095 9.471 9.831 10.241 10.691 11.175 11.686 12.17 12.577 12.786 12.533 12.038 11.492 10.996 10.519 10.061 9.625 9.236 8.837 8.485 8.146 7.815 7.484 7.147 6.836 6.515 6.23 5.983 5.711 5.437 5.216 4.963 4.694 4.496 4.292 4.066 3.841 3.603 3.431 3.272 3.036 2.86 2.656 2.552 2.332 2.104 1.868 1.721 1.437 1.201 1.012 0.821 0.418 0.209 -0.023 -0.29 -0.569 -0.949 -1.481 -3.094 -6 ,13277 ,KEBNE ,16678198,Thu Nov 25 00:50:14 CET,Thu Nov 25 02:14:53 CET,0.0 0.681 1.05 1.344 1.588 1.805 1.995 2.177 2.496 2.644 2.794 2.916 3.159 3.277 3.476 3.683 3.874 3.963 4.136 4.305 4.551 4.701 4.843 5.043 5.241 5.436 5.622 5.806 6.022 6.23 6.443 6.698 6.95 7.18 7.445 7.763 8.059 8.366 8.703 9.061 9.414 9.813 10.245 10.634 11.055 11.509 12.014 12.506 12.984 13.44 13.672 13.436 13.022 12.54 11.997 11.445 10.938 10.46 10.039 9.606 9.225 8.892 8.586 8.281 7.986 7.704 7.387 7.101 6.867 6.599 6.268 5.992 5.739 5.492 5.291 5.075 4.857 4.622 4.351 4.161 3.955 3.645 3.444 3.222 3.106 2.86 2.604 2.319 2.171 1.901 1.674 1.497 1.315 0.894 0.646 0.373 0.086 -0.227 -0.614 -1.223 -3.309 -7 ,7685 ,KEBNE ,16678199,Thu Nov 25 00:50:15 CET,Thu Nov 25 02:16:51 CET,0.0 0.84 1.165 1.418 1.631 1.823 2.007 2.17 2.476 2.626 2.768 2.904 3.161 3.284 3.505 3.717 3.915 4.015 4.207 4.378 4.64 4.812 4.963 5.174 5.364 5.558 5.772 5.971 6.227 6.452 6.641 6.865 7.086 7.326 7.604 7.884 8.145 8.416 8.706 9.04 9.393 9.761 10.167 10.549 10.946 11.4 11.981 12.568 13.12 13.596 13.873 13.73 13.322 12.839 12.303 11.767 11.261 10.793 10.376 9.942 9.586 9.245 8.894 8.571 8.281 8.011 7.714 7.449 7.212 6.948 6.658 6.419 6.181 5.931 5.739 5.541 5.327 5.097 4.84 4.659 4.464 4.175 3.989 3.787 3.678 3.44 3.196 2.939 2.812 2.569 2.389 2.222 2.047 1.67 1.446 1.191 0.939 0.639 0.276 -0.168 -1.617 -8 ,28293 ,KEBNE ,16675906,Wed Nov 24 09:52:02 CET,Wed Nov 24 11:14:45 CET,0.0 0.767 1.162 1.442 1.672 1.877 2.079 2.281 2.639 2.806 2.965 3.099 3.326 3.437 3.642 3.822 4.002 4.09 4.26 4.438 4.682 4.826 4.986 5.218 5.413 5.592 5.764 5.926 6.15 6.372 6.583 6.834 7.077 7.316 7.588 7.889 8.165 8.467 8.781 9.093 9.414 9.761 10.159 10.563 11.004 11.451 11.889 12.349 12.863 13.27 13.466 13.182 12.7 12.239 11.754 11.212 10.697 10.251 9.869 9.451 9.063 8.721 8.399 8.083 7.769 7.476 7.181 6.899 6.652 6.409 6.144 5.924 5.698 5.45 5.242 5.022 4.792 4.559 4.323 4.15 3.973 3.693 3.494 3.288 3.183 2.96 2.71 2.458 2.317 2.049 1.863 1.693 1.512 1.115 0.902 0.67 0.387 0.064 -0.346 -0.965 -3.731 -9 ,2870 ,KEBNE ,16675907,Wed Nov 24 09:52:03 CET,Wed Nov 24 11:15:13 CET,0.0 0.538 0.841 1.118 1.351 1.537 1.709 1.861 2.135 2.261 2.388 2.515 2.756 2.863 3.074 3.287 3.508 3.618 3.811 3.985 4.234 4.399 4.566 4.795 4.99 5.16 5.331 5.517 5.759 5.983 6.198 6.442 6.661 6.875 7.129 7.411 7.68 7.969 8.307 8.671 9.019 9.368 9.746 10.142 10.576 11.05 11.605 12.144 12.625 13.012 13.163 12.939 12.521 12.025 11.554 11.074 10.612 10.185 9.803 9.409 9.041 8.7 8.375 8.056 7.765 7.491 7.195 6.934 6.69 6.432 6.155 5.933 5.707 5.449 5.25 5.038 4.788 4.517 4.259 4.074 3.858 3.523 3.308 3.096 2.984 2.744 2.477 2.164 1.995 1.71 1.5 1.321 1.128 0.729 0.502 0.236 -0.068 -0.42 -0.83 -1.342 -3.085 -10 ,12477 ,KEBNE ,16678202,Thu Nov 25 00:52:18 CET,Thu Nov 25 02:17:35 CET,0.0 1.132 1.517 1.805 2.023 2.209 2.392 2.559 2.823 2.952 3.079 3.2 3.443 3.552 3.763 3.963 4.158 4.251 4.427 4.606 4.842 4.979 5.12 5.335 5.548 5.742 5.918 6.094 6.325 6.546 6.761 7.01 7.24 7.472 7.755 8.095 8.429 8.743 9.023 9.345 9.694 10.041 10.427 10.81 11.225 11.66 12.117 12.579 13.069 13.562 13.875 13.69 13.27 12.757 12.251 11.746 11.255 10.793 10.355 9.908 9.537 9.183 8.828 8.509 8.227 7.959 7.656 7.376 7.114 6.823 6.53 6.302 6.057 5.783 5.568 5.348 5.118 4.879 4.634 4.468 4.304 4.032 3.813 3.592 3.491 3.283 3.048 2.778 2.641 2.382 2.196 2.024 1.827 1.405 1.174 0.925 0.632 0.299 -0.074 -0.557 -2.686 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index 2bf06cbb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,618 ,KEBNE ,16678203,Thu Nov 25 00:52:19 CET,Thu Nov 25 02:23:08 CET,0.0 0.915 1.282 1.53 1.742 1.935 2.116 2.288 2.584 2.715 2.835 2.936 3.168 3.265 3.442 3.624 3.79 3.864 4.009 4.145 4.325 4.446 4.579 4.776 4.952 5.104 5.252 5.403 5.591 5.771 5.943 6.16 6.349 6.497 6.678 6.876 7.038 7.229 7.45 7.664 7.88 8.117 8.381 8.631 8.892 9.116 9.305 9.415 9.383 9.153 8.422 7.176 6.06 5.114 4.269 3.482 2.784 2.153 1.601 1.035 0.535 0.088 -0.353 -0.778 -1.142 -1.48 -1.844 -2.183 -2.482 -2.779 -3.101 -3.378 -3.649 -3.923 -4.137 -4.356 -4.583 -4.822 -5.082 -5.267 -5.446 -5.719 -5.923 -6.145 -6.259 -6.48 -6.724 -7.002 -7.139 -7.408 -7.576 -7.739 -7.923 -8.325 -8.549 -8.806 -9.087 -9.416 -9.799 -10.361 -12.044 -2 ,18733 ,KEBNE ,16678204,Thu Nov 25 00:53:19 CET,Thu Nov 25 02:18:47 CET,0.0 1.125 1.474 1.748 1.965 2.171 2.372 2.546 2.828 2.942 3.064 3.199 3.428 3.527 3.721 3.902 4.082 4.16 4.295 4.435 4.641 4.773 4.904 5.089 5.251 5.412 5.582 5.732 5.897 6.04 6.176 6.343 6.508 6.686 6.884 7.086 7.284 7.487 7.693 7.908 8.109 8.304 8.508 8.719 8.955 9.168 9.368 9.507 9.528 9.305 8.653 7.586 6.578 5.652 4.798 4.04 3.383 2.766 2.214 1.661 1.156 0.69 0.247 -0.158 -0.53 -0.879 -1.248 -1.575 -1.857 -2.15 -2.457 -2.712 -2.976 -3.272 -3.504 -3.735 -3.973 -4.219 -4.464 -4.642 -4.831 -5.137 -5.357 -5.586 -5.704 -5.947 -6.216 -6.483 -6.618 -6.897 -7.062 -7.225 -7.407 -7.818 -8.067 -8.332 -8.597 -8.91 -9.308 -9.856 -11.985 -3 ,26031 ,KEBNE ,16678205,Thu Nov 25 00:53:19 CET,Thu Nov 25 02:20:01 CET,0.0 1.173 1.619 1.969 2.223 2.418 2.612 2.788 3.068 3.208 3.349 3.446 3.673 3.781 3.962 4.125 4.291 4.381 4.555 4.696 4.9 5.041 5.167 5.334 5.501 5.661 5.798 5.922 6.104 6.283 6.435 6.617 6.793 6.969 7.177 7.413 7.652 7.891 8.107 8.31 8.493 8.68 8.892 9.109 9.361 9.571 9.726 9.831 9.836 9.648 9.062 8.076 7.072 6.1 5.216 4.446 3.762 3.124 2.581 2.028 1.53 1.086 0.673 0.282 -0.086 -0.418 -0.768 -1.085 -1.377 -1.691 -2.014 -2.287 -2.566 -2.852 -3.084 -3.324 -3.58 -3.853 -4.107 -4.281 -4.463 -4.768 -4.999 -5.237 -5.361 -5.591 -5.835 -6.101 -6.248 -6.536 -6.728 -6.902 -7.078 -7.477 -7.7 -7.956 -8.245 -8.572 -8.993 -9.595 -12.167 -4 ,4640 ,KEBNE ,16678206,Thu Nov 25 00:54:21 CET,Thu Nov 25 02:21:27 CET,0.0 1.097 1.478 1.817 2.113 2.321 2.493 2.665 2.964 3.096 3.237 3.349 3.562 3.663 3.851 4.042 4.22 4.302 4.482 4.645 4.858 4.999 5.137 5.336 5.509 5.657 5.792 5.926 6.111 6.295 6.462 6.649 6.833 7.003 7.193 7.397 7.569 7.789 8.015 8.19 8.375 8.603 8.855 9.064 9.298 9.509 9.686 9.828 9.865 9.664 8.966 7.929 6.943 5.995 5.138 4.35 3.626 2.981 2.431 1.884 1.417 1.0 0.608 0.226 -0.144 -0.479 -0.831 -1.145 -1.429 -1.732 -2.057 -2.324 -2.579 -2.842 -3.044 -3.273 -3.513 -3.766 -4.044 -4.24 -4.451 -4.77 -4.973 -5.193 -5.307 -5.54 -5.797 -6.078 -6.223 -6.503 -6.68 -6.848 -7.025 -7.434 -7.681 -7.939 -8.212 -8.514 -8.881 -9.404 -11.085 -5 ,721 ,KEBNE ,16678207,Thu Nov 25 00:54:21 CET,Thu Nov 25 02:18:34 CET,0.0 0.822 1.214 1.496 1.729 1.95 2.135 2.31 2.632 2.776 2.909 3.015 3.246 3.349 3.541 3.715 3.872 3.945 4.088 4.217 4.387 4.506 4.622 4.788 4.947 5.088 5.23 5.36 5.515 5.684 5.852 6.028 6.18 6.328 6.505 6.716 6.918 7.122 7.338 7.552 7.774 8.054 8.326 8.529 8.731 8.906 9.054 9.18 9.211 8.983 8.315 7.244 6.245 5.325 4.476 3.725 3.071 2.447 1.875 1.32 0.824 0.376 -0.036 -0.45 -0.849 -1.197 -1.558 -1.901 -2.197 -2.511 -2.861 -3.151 -3.426 -3.715 -3.931 -4.134 -4.379 -4.645 -4.914 -5.109 -5.302 -5.606 -5.827 -6.049 -6.159 -6.38 -6.61 -6.896 -7.053 -7.332 -7.505 -7.684 -7.882 -8.297 -8.519 -8.756 -9.029 -9.36 -9.773 -10.318 -12.579 -6 ,6835 ,KEBNE ,16678208,Thu Nov 25 00:54:21 CET,Thu Nov 25 02:18:01 CET,0.0 0.525 0.849 1.109 1.318 1.5 1.673 1.835 2.117 2.241 2.357 2.446 2.67 2.77 2.961 3.128 3.276 3.357 3.519 3.676 3.891 4.024 4.154 4.334 4.506 4.68 4.842 4.984 5.155 5.339 5.53 5.734 5.903 6.052 6.247 6.457 6.655 6.877 7.094 7.295 7.49 7.706 7.931 8.145 8.357 8.539 8.69 8.793 8.801 8.617 8.003 6.938 5.89 4.947 4.134 3.391 2.706 2.051 1.506 0.975 0.513 0.063 -0.393 -0.797 -1.155 -1.486 -1.856 -2.204 -2.508 -2.818 -3.143 -3.405 -3.666 -3.955 -4.186 -4.415 -4.663 -4.914 -5.156 -5.337 -5.53 -5.824 -6.033 -6.273 -6.399 -6.657 -6.924 -7.193 -7.332 -7.623 -7.827 -7.999 -8.174 -8.555 -8.786 -9.05 -9.358 -9.688 -10.04 -10.491 -12.148 -7 ,13248 ,KEBNE ,16678209,Thu Nov 25 00:55:23 CET,Thu Nov 25 02:19:57 CET,0.0 0.882 1.252 1.536 1.796 2.005 2.167 2.326 2.62 2.743 2.872 2.987 3.207 3.306 3.493 3.662 3.817 3.896 4.059 4.217 4.441 4.577 4.697 4.865 5.021 5.189 5.364 5.517 5.696 5.856 6.006 6.187 6.363 6.536 6.74 6.964 7.138 7.308 7.525 7.754 7.964 8.185 8.413 8.614 8.815 9.037 9.24 9.344 9.346 9.129 8.475 7.416 6.4 5.44 4.575 3.812 3.145 2.52 1.959 1.381 0.884 0.434 -0.009 -0.396 -0.744 -1.078 -1.432 -1.779 -2.066 -2.339 -2.644 -2.906 -3.184 -3.491 -3.725 -3.953 -4.188 -4.432 -4.678 -4.855 -5.051 -5.348 -5.563 -5.781 -5.883 -6.113 -6.367 -6.632 -6.767 -7.041 -7.246 -7.426 -7.604 -7.955 -8.164 -8.407 -8.688 -9.045 -9.49 -10.051 -12.209 -8 ,13830 ,KEBNE ,16678210,Thu Nov 25 00:55:23 CET,Thu Nov 25 02:20:12 CET,0.0 0.744 1.121 1.408 1.653 1.854 2.028 2.191 2.488 2.613 2.733 2.842 3.074 3.172 3.368 3.543 3.702 3.779 3.917 4.044 4.233 4.362 4.486 4.661 4.823 4.975 5.129 5.289 5.483 5.653 5.811 5.989 6.159 6.324 6.516 6.727 6.924 7.143 7.361 7.56 7.759 7.963 8.193 8.404 8.607 8.829 9.024 9.111 9.096 8.923 8.266 7.157 6.165 5.261 4.44 3.721 3.073 2.436 1.882 1.322 0.835 0.389 -0.037 -0.429 -0.819 -1.178 -1.533 -1.829 -2.111 -2.423 -2.734 -3.013 -3.308 -3.593 -3.815 -4.059 -4.313 -4.566 -4.832 -5.025 -5.228 -5.539 -5.748 -5.955 -6.071 -6.342 -6.628 -6.896 -7.029 -7.314 -7.497 -7.659 -7.836 -8.208 -8.425 -8.678 -8.96 -9.27 -9.659 -10.173 -11.434 -9 ,28254 ,KEBNE ,16678211,Thu Nov 25 00:56:26 CET,Thu Nov 25 02:20:50 CET,0.0 0.741 1.141 1.442 1.663 1.877 2.064 2.219 2.494 2.619 2.74 2.847 3.077 3.176 3.364 3.551 3.728 3.806 3.957 4.1 4.303 4.435 4.558 4.738 4.918 5.082 5.229 5.371 5.555 5.724 5.887 6.089 6.286 6.468 6.672 6.892 7.084 7.29 7.523 7.766 7.991 8.215 8.428 8.611 8.816 9.038 9.261 9.382 9.391 9.282 8.729 7.65 6.614 5.669 4.837 4.115 3.469 2.849 2.312 1.776 1.311 0.887 0.478 0.084 -0.293 -0.629 -0.996 -1.339 -1.641 -1.951 -2.273 -2.561 -2.876 -3.187 -3.411 -3.64 -3.906 -4.196 -4.477 -4.664 -4.859 -5.19 -5.41 -5.622 -5.735 -5.976 -6.235 -6.509 -6.656 -6.939 -7.109 -7.272 -7.456 -7.863 -8.098 -8.349 -8.618 -8.962 -9.387 -9.875 -11.663 -10 ,30761 ,KEBNE ,16678212,Thu Nov 25 00:57:30 CET,Thu Nov 25 02:19:18 CET,0.0 0.724 1.105 1.407 1.647 1.88 2.088 2.253 2.545 2.681 2.808 2.934 3.174 3.288 3.494 3.693 3.888 3.974 4.131 4.272 4.461 4.582 4.697 4.855 5.031 5.209 5.377 5.542 5.737 5.911 6.078 6.28 6.461 6.615 6.801 7.004 7.18 7.375 7.566 7.769 7.987 8.2 8.416 8.597 8.79 9.001 9.208 9.376 9.415 9.209 8.612 7.568 6.536 5.652 4.844 4.076 3.408 2.804 2.263 1.682 1.156 0.668 0.224 -0.175 -0.545 -0.903 -1.296 -1.635 -1.933 -2.246 -2.553 -2.807 -3.081 -3.364 -3.58 -3.808 -4.044 -4.295 -4.564 -4.744 -4.938 -5.242 -5.447 -5.672 -5.788 -6.033 -6.286 -6.559 -6.719 -7.023 -7.246 -7.443 -7.629 -7.996 -8.21 -8.439 -8.705 -9.034 -9.421 -9.937 -11.282 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_4_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_4_3.txt deleted file mode 100644 index 76af1721..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_4_3.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10010 ,KEBNE ,16678213,Thu Nov 25 00:58:29 CET,Thu Nov 25 02:21:48 CET,0.0 0.548 0.849 1.082 1.278 1.441 1.592 1.741 1.999 2.11 2.227 2.192 2.549 2.643 2.825 2.993 3.171 3.26 3.439 3.594 3.777 3.901 4.023 4.2 4.374 4.534 4.682 4.818 5.004 5.191 5.358 5.54 5.703 5.864 6.066 6.289 6.495 6.726 6.951 7.2 7.474 7.762 8.119 8.485 8.847 9.201 9.581 9.956 10.327 10.636 10.779 10.579 10.212 9.806 9.408 8.993 8.59 8.226 7.893 7.549 7.249 6.956 6.692 6.424 6.147 5.911 5.658 5.435 5.229 5.01 4.791 4.602 4.408 4.205 4.037 3.853 3.651 3.445 3.233 3.089 2.944 2.696 2.523 2.359 2.273 2.089 1.882 1.66 1.544 1.16 1.141 0.993 0.852 0.514 0.33 0.15 -0.078 -0.328 -0.633 -1.06 -1.906 -2 ,31312 ,KEBNE ,16678214,Thu Nov 25 00:58:29 CET,Thu Nov 25 02:22:03 CET,0.0 0.706 1.099 1.358 1.557 1.742 1.902 2.044 2.3 2.421 2.535 2.468 2.82 2.908 3.085 3.271 3.443 3.517 3.648 3.775 3.966 4.087 4.204 4.374 4.531 4.674 4.816 4.958 5.152 5.354 5.543 5.761 5.972 6.179 6.396 6.622 6.845 7.076 7.311 7.566 7.838 8.13 8.451 8.752 9.095 9.47 9.86 10.245 10.631 10.985 11.198 10.984 10.598 10.194 9.744 9.319 8.964 8.609 8.28 7.948 7.629 7.325 7.03 6.735 6.473 6.248 6.003 5.77 5.566 5.337 5.088 4.892 4.69 4.481 4.322 4.156 3.969 3.762 3.55 3.394 3.233 2.997 2.83 2.657 2.566 2.385 2.185 1.957 1.84 1.463 1.486 1.35 1.189 0.853 0.69 0.518 0.313 0.051 -0.261 -0.632 -1.593 -3 ,2595 ,KEBNE ,16678215,Thu Nov 25 00:58:29 CET,Thu Nov 25 02:21:33 CET,0.0 0.77 1.069 1.298 1.477 1.644 1.822 1.98 2.243 2.376 2.503 2.456 2.817 2.914 3.114 3.282 3.435 3.517 3.665 3.793 3.986 4.115 4.231 4.407 4.598 4.786 4.965 5.115 5.298 5.473 5.627 5.817 6.008 6.201 6.428 6.657 6.878 7.13 7.394 7.679 7.977 8.279 8.581 8.865 9.208 9.588 9.949 10.349 10.804 11.177 11.334 11.124 10.734 10.327 9.927 9.466 9.029 8.64 8.29 7.937 7.638 7.351 7.055 6.776 6.528 6.305 6.07 5.851 5.659 5.464 5.253 5.07 4.884 4.679 4.51 4.336 4.155 3.974 3.794 3.661 3.512 3.273 3.108 2.928 2.834 2.653 2.466 2.268 2.156 1.779 1.8 1.666 1.53 1.242 1.064 0.866 0.63 0.344 0.03 -0.359 -1.542 -4 ,22626 ,KEBNE ,16678216,Thu Nov 25 00:58:29 CET,Thu Nov 25 02:21:19 CET,0.0 0.584 0.869 1.114 1.324 1.516 1.685 1.836 2.12 2.256 2.387 2.367 2.731 2.827 3.009 3.181 3.333 3.399 3.525 3.654 3.836 3.953 4.073 4.26 4.441 4.601 4.755 4.911 5.1 5.272 5.441 5.623 5.813 6.012 6.227 6.455 6.665 6.894 7.13 7.363 7.583 7.855 8.203 8.524 8.861 9.23 9.639 10.028 10.422 10.788 10.934 10.707 10.324 9.897 9.474 9.057 8.675 8.301 7.938 7.566 7.255 6.962 6.674 6.402 6.144 5.91 5.661 5.436 5.236 5.024 4.807 4.625 4.435 4.24 4.081 3.904 3.705 3.489 3.285 3.155 3.018 2.8 2.645 2.474 2.381 2.197 2.013 1.804 1.679 1.296 1.299 1.153 1.005 0.673 0.479 0.253 0.005 -0.254 -0.56 -0.922 -1.84 -5 ,10343 ,KEBNE ,16678217,Thu Nov 25 00:59:31 CET,Thu Nov 25 02:25:34 CET,0.0 0.732 1.055 1.283 1.456 1.623 1.774 1.917 2.2 2.334 2.456 2.412 2.773 2.882 3.081 3.265 3.449 3.529 3.673 3.829 4.046 4.173 4.299 4.476 4.651 4.826 4.984 5.136 5.336 5.504 5.664 5.876 6.073 6.256 6.459 6.678 6.889 7.118 7.363 7.632 7.922 8.245 8.576 8.885 9.269 9.645 10.01 10.4 10.808 11.126 11.216 11.042 10.706 10.238 9.779 9.33 8.897 8.525 8.203 7.841 7.525 7.248 6.966 6.689 6.439 6.212 5.96 5.733 5.518 5.289 5.062 4.869 4.654 4.42 4.25 4.07 3.886 3.692 3.484 3.348 3.194 2.946 2.774 2.607 2.524 2.336 2.134 1.911 1.793 1.419 1.43 1.288 1.133 0.792 0.606 0.406 0.208 0.004 -0.293 -0.723 -1.75 -6 ,32284 ,KEBNE ,16678218,Thu Nov 25 00:59:31 CET,Thu Nov 25 02:26:08 CET,0.0 0.886 1.209 1.455 1.644 1.819 1.996 2.154 2.412 2.527 2.652 2.621 2.98 3.073 3.258 3.442 3.615 3.696 3.857 4.007 4.211 4.342 4.469 4.664 4.851 5.019 5.177 5.331 5.526 5.708 5.877 6.088 6.298 6.471 6.659 6.876 7.089 7.319 7.561 7.822 8.084 8.371 8.701 9.002 9.345 9.73 10.129 10.54 10.958 11.294 11.406 11.17 10.794 10.406 10.012 9.588 9.195 8.821 8.475 8.119 7.81 7.534 7.258 6.979 6.73 6.509 6.247 5.996 5.783 5.561 5.333 5.152 4.956 4.742 4.575 4.403 4.227 4.041 3.851 3.715 3.569 3.341 3.176 3.004 2.915 2.732 2.535 2.301 2.181 1.807 1.804 1.662 1.523 1.217 1.042 0.863 0.672 0.45 0.161 -0.201 -1.221 -7 ,8849 ,KEBNE ,16678219,Thu Nov 25 00:59:35 CET,Thu Nov 25 02:21:07 CET,0.0 1.011 1.345 1.593 1.798 1.963 2.124 2.279 2.531 2.639 2.74 2.682 3.039 3.128 3.295 3.448 3.597 3.67 3.817 3.966 4.184 4.316 4.451 4.645 4.815 4.979 5.139 5.292 5.492 5.683 5.853 6.047 6.235 6.405 6.598 6.83 7.054 7.276 7.509 7.776 8.059 8.354 8.7 9.036 9.376 9.735 10.129 10.517 10.894 11.272 11.484 11.242 10.81 10.374 9.936 9.512 9.133 8.78 8.469 8.112 7.768 7.449 7.145 6.874 6.611 6.354 6.098 5.872 5.672 5.461 5.224 5.018 4.814 4.609 4.452 4.294 4.123 3.928 3.709 3.561 3.406 3.158 2.997 2.841 2.755 2.566 2.385 2.203 2.105 1.733 1.725 1.584 1.424 1.071 0.885 0.674 0.427 0.156 -0.102 -0.447 -1.638 -8 ,31195 ,KEBNE ,16678220,Thu Nov 25 01:00:32 CET,Thu Nov 25 02:23:37 CET,0.0 0.589 0.847 1.043 1.254 1.467 1.646 1.793 2.059 2.195 2.319 2.287 2.658 2.748 2.916 3.077 3.226 3.307 3.468 3.617 3.828 3.954 4.078 4.267 4.443 4.622 4.793 4.939 5.146 5.345 5.521 5.737 5.938 6.127 6.341 6.555 6.76 7.011 7.28 7.541 7.818 8.111 8.409 8.719 9.066 9.401 9.766 10.123 10.489 10.831 10.987 10.777 10.422 9.952 9.482 9.086 8.703 8.297 7.927 7.563 7.25 6.975 6.698 6.395 6.111 5.862 5.608 5.396 5.2 4.98 4.756 4.564 4.36 4.145 3.973 3.793 3.602 3.403 3.198 3.054 2.899 2.66 2.496 2.32 2.228 2.029 1.813 1.587 1.469 1.087 1.071 0.919 0.772 0.479 0.321 0.147 -0.071 -0.334 -0.625 -1.035 -1.979 -9 ,23909 ,KEBNE ,16678221,Thu Nov 25 01:00:32 CET,Thu Nov 25 02:25:22 CET,0.0 0.937 1.24 1.469 1.677 1.849 2.015 2.169 2.423 2.54 2.654 2.611 2.97 3.061 3.23 3.396 3.567 3.65 3.815 3.963 4.168 4.301 4.42 4.591 4.761 4.919 5.052 5.175 5.348 5.526 5.7 5.909 6.107 6.28 6.475 6.708 6.934 7.177 7.438 7.698 7.952 8.214 8.545 8.884 9.223 9.59 10.008 10.435 10.839 11.17 11.358 11.182 10.814 10.397 9.974 9.556 9.179 8.802 8.431 8.072 7.766 7.466 7.157 6.891 6.657 6.43 6.189 5.954 5.745 5.53 5.315 5.134 4.932 4.722 4.548 4.365 4.193 4.005 3.775 3.619 3.471 3.233 3.07 2.887 2.792 2.616 2.428 2.226 2.119 1.735 1.718 1.561 1.398 1.056 0.869 0.67 0.465 0.24 -0.051 -0.472 -1.442 -10 ,4083 ,KEBNE ,16678222,Thu Nov 25 01:00:32 CET,Thu Nov 25 02:26:53 CET,0.0 0.521 0.845 1.072 1.249 1.396 1.545 1.693 1.967 2.099 2.221 2.188 2.561 2.659 2.846 3.022 3.176 3.253 3.411 3.555 3.742 3.867 3.988 4.158 4.333 4.503 4.641 4.771 4.945 5.106 5.276 5.497 5.707 5.893 6.082 6.291 6.507 6.759 7.03 7.286 7.536 7.813 8.109 8.41 8.763 9.136 9.555 9.952 10.298 10.6 10.791 10.633 10.256 9.848 9.426 8.991 8.598 8.237 7.909 7.569 7.243 6.957 6.702 6.442 6.186 5.945 5.694 5.47 5.275 5.08 4.864 4.664 4.455 4.242 4.082 3.911 3.723 3.526 3.311 3.15 2.982 2.735 2.577 2.414 2.325 2.136 1.929 1.708 1.601 1.227 1.205 1.05 0.895 0.564 0.376 0.159 -0.078 -0.338 -0.667 -1.081 -2.057 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_7_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_7_6.txt deleted file mode 100644 index 5819046f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_7_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20186 ,KEBNE ,16678223,Thu Nov 25 01:00:32 CET,Thu Nov 25 02:24:49 CET,0.0 1.273 1.649 1.889 2.066 2.236 2.386 2.506 2.751 2.88 2.986 2.936 3.256 3.337 3.495 3.632 3.76 3.823 3.928 4.026 4.184 4.295 4.397 4.531 4.658 4.772 4.866 4.959 5.087 5.2 5.3 5.424 5.54 5.643 5.749 5.868 5.997 6.15 6.276 6.38 6.497 6.616 6.722 6.788 6.841 6.85 6.782 6.59 6.182 5.517 4.283 2.343 0.538 -1.051 -2.467 -3.773 -4.926 -5.964 -6.876 -7.857 -8.753 -9.575 -10.348 -11.061 -11.755 -12.403 -13.07 -13.676 -14.203 -14.742 -15.313 -15.797 -16.299 -16.834 -17.25 -17.652 -18.067 -18.485 -18.925 -19.239 -19.548 -20.05 -20.428 -20.829 -21.032 -21.443 -21.86 -22.309 -22.541 -23.068 -23.367 -23.668 -23.981 -24.681 -25.066 -25.449 -25.885 -26.438 -27.14 -28.052 -31.424 -2 ,24652 ,KEBNE ,16678224,Thu Nov 25 01:01:33 CET,Thu Nov 25 02:26:05 CET,0.0 0.698 1.075 1.362 1.586 1.781 1.962 2.116 2.362 2.468 2.562 2.501 2.815 2.888 3.03 3.165 3.299 3.358 3.457 3.559 3.709 3.808 3.893 3.998 4.103 4.215 4.333 4.432 4.541 4.659 4.78 4.911 5.024 5.133 5.256 5.389 5.509 5.625 5.73 5.845 5.976 6.1 6.208 6.27 6.313 6.363 6.339 6.195 5.815 5.085 3.69 1.671 -0.073 -1.665 -3.198 -4.559 -5.806 -6.998 -8.004 -9.07 -9.972 -10.725 -11.455 -12.183 -12.885 -13.503 -14.127 -14.689 -15.184 -15.705 -16.282 -16.769 -17.237 -17.688 -18.046 -18.44 -18.838 -19.257 -19.73 -20.081 -20.448 -21.021 -21.423 -21.818 -22.017 -22.447 -22.913 -23.416 -23.666 -24.192 -24.456 -24.749 -25.076 -25.8 -26.193 -26.608 -27.077 -27.611 -28.284 -29.185 -32.244 -3 ,1703 ,KEBNE ,16678225,Thu Nov 25 01:01:33 CET,Thu Nov 25 02:24:02 CET,0.0 1.254 1.65 1.934 2.162 2.328 2.497 2.669 2.925 3.034 3.123 3.038 3.348 3.426 3.57 3.695 3.802 3.864 3.986 4.091 4.222 4.305 4.385 4.503 4.627 4.731 4.815 4.917 5.071 5.195 5.298 5.432 5.581 5.726 5.857 5.973 6.109 6.264 6.38 6.47 6.556 6.642 6.719 6.771 6.783 6.742 6.64 6.442 6.039 5.288 3.8 1.848 0.141 -1.497 -3.002 -4.407 -5.641 -6.765 -7.79 -8.864 -9.751 -10.52 -11.305 -12.046 -12.72 -13.337 -14.0 -14.61 -15.123 -15.648 -16.185 -16.627 -17.089 -17.587 -17.974 -18.361 -18.781 -19.207 -19.644 -19.966 -20.291 -20.759 -21.101 -21.482 -21.675 -22.079 -22.518 -22.991 -23.235 -23.753 -24.006 -24.306 -24.635 -25.354 -25.769 -26.225 -26.692 -27.225 -27.956 -28.985 -33.133 -4 ,29560 ,KEBNE ,16678226,Thu Nov 25 01:01:34 CET,Thu Nov 25 02:25:48 CET,0.0 0.739 1.068 1.304 1.506 1.673 1.794 1.914 2.164 2.286 2.398 2.386 2.726 2.808 2.956 3.114 3.253 3.311 3.418 3.516 3.668 3.773 3.87 3.995 4.111 4.225 4.333 4.431 4.548 4.652 4.754 4.875 4.972 5.057 5.158 5.269 5.376 5.486 5.605 5.733 5.848 5.943 6.037 6.108 6.144 6.164 6.128 5.978 5.641 4.981 3.682 1.801 -0.065 -1.746 -3.182 -4.618 -5.942 -7.054 -8.023 -9.083 -10.023 -10.855 -11.641 -12.389 -13.071 -13.696 -14.349 -14.942 -15.454 -15.957 -16.478 -16.943 -17.441 -17.933 -18.309 -18.697 -19.105 -19.551 -19.998 -20.293 -20.617 -21.163 -21.541 -21.931 -22.138 -22.577 -23.039 -23.518 -23.751 -24.259 -24.513 -24.825 -25.152 -25.854 -26.253 -26.663 -27.147 -27.696 -28.369 -29.381 -33.418 -5 ,13622 ,KEBNE ,16678227,Thu Nov 25 01:02:35 CET,Thu Nov 25 02:25:36 CET,0.0 0.933 1.307 1.568 1.789 1.967 2.121 2.258 2.489 2.589 2.682 2.632 2.952 3.029 3.169 3.322 3.461 3.525 3.656 3.774 3.932 4.032 4.12 4.24 4.356 4.456 4.56 4.675 4.81 4.916 5.015 5.141 5.26 5.364 5.469 5.59 5.705 5.823 5.951 6.072 6.204 6.329 6.427 6.508 6.589 6.644 6.631 6.494 6.175 5.515 4.103 2.077 0.216 -1.465 -2.933 -4.28 -5.525 -6.664 -7.644 -8.641 -9.558 -10.4 -11.19 -11.939 -12.674 -13.346 -14.028 -14.617 -15.111 -15.636 -16.18 -16.65 -17.124 -17.589 -17.949 -18.319 -18.718 -19.145 -19.611 -19.935 -20.265 -20.785 -21.153 -21.527 -21.714 -22.116 -22.55 -22.997 -23.237 -23.776 -24.083 -24.391 -24.696 -25.385 -25.79 -26.243 -26.77 -27.391 -28.133 -29.175 -32.761 -6 ,23774 ,KEBNE ,16678228,Thu Nov 25 01:02:35 CET,Thu Nov 25 02:25:45 CET,0.0 0.579 0.898 1.167 1.405 1.605 1.772 1.912 2.155 2.275 2.377 2.331 2.652 2.73 2.87 2.997 3.118 3.182 3.304 3.413 3.567 3.665 3.764 3.89 3.997 4.106 4.201 4.297 4.436 4.554 4.648 4.767 4.882 4.987 5.103 5.227 5.329 5.419 5.519 5.638 5.751 5.845 5.94 6.01 6.067 6.057 5.967 5.811 5.49 4.793 3.413 1.552 -0.208 -1.819 -3.267 -4.657 -5.943 -7.093 -8.054 -9.07 -10.01 -10.86 -11.658 -12.393 -13.078 -13.733 -14.424 -14.998 -15.485 -16.003 -16.531 -16.98 -17.466 -17.968 -18.367 -18.752 -19.132 -19.559 -20.026 -20.339 -20.66 -21.174 -21.533 -21.895 -22.086 -22.505 -22.932 -23.382 -23.636 -24.17 -24.455 -24.774 -25.104 -25.782 -26.16 -26.6 -27.101 -27.669 -28.35 -29.259 -32.397 -7 ,28024 ,KEBNE ,16678229,Thu Nov 25 01:02:35 CET,Thu Nov 25 02:27:18 CET,0.0 0.865 1.156 1.384 1.608 1.791 1.947 2.074 2.291 2.397 2.526 2.504 2.819 2.894 3.036 3.177 3.314 3.369 3.473 3.58 3.72 3.809 3.892 4.007 4.119 4.238 4.349 4.447 4.571 4.683 4.778 4.89 5.017 5.142 5.275 5.404 5.519 5.65 5.784 5.896 5.996 6.107 6.224 6.283 6.316 6.33 6.244 6.091 5.803 5.158 3.804 1.969 0.242 -1.334 -2.806 -4.223 -5.416 -6.483 -7.443 -8.434 -9.317 -10.113 -10.897 -11.65 -12.332 -12.945 -13.598 -14.192 -14.713 -15.249 -15.789 -16.258 -16.758 -17.281 -17.683 -18.083 -18.493 -18.915 -19.351 -19.669 -20.016 -20.55 -20.894 -21.231 -21.417 -21.846 -22.282 -22.736 -22.991 -23.518 -23.748 -24.033 -24.347 -25.033 -25.413 -25.83 -26.293 -26.829 -27.48 -28.398 -32.247 -8 ,28245 ,KEBNE ,16678230,Thu Nov 25 01:02:35 CET,Thu Nov 25 02:26:01 CET,0.0 0.834 1.177 1.426 1.627 1.801 1.942 2.076 2.308 2.409 2.495 2.409 2.717 2.794 2.938 3.07 3.193 3.254 3.383 3.499 3.642 3.73 3.813 3.932 4.057 4.17 4.28 4.386 4.509 4.624 4.74 4.87 4.991 5.109 5.237 5.362 5.471 5.584 5.684 5.779 5.877 5.988 6.107 6.194 6.252 6.27 6.228 6.066 5.699 5.033 3.706 1.837 0.129 -1.46 -2.963 -4.303 -5.486 -6.62 -7.617 -8.637 -9.544 -10.354 -11.119 -11.837 -12.499 -13.106 -13.739 -14.306 -14.83 -15.382 -15.951 -16.429 -16.938 -17.441 -17.805 -18.203 -18.631 -19.077 -19.524 -19.843 -20.188 -20.7 -21.056 -21.442 -21.64 -22.054 -22.49 -22.974 -23.23 -23.757 -24.02 -24.316 -24.641 -25.355 -25.752 -26.209 -26.741 -27.306 -27.977 -28.895 -31.701 -9 ,2827 ,KEBNE ,16678231,Thu Nov 25 01:02:35 CET,Thu Nov 25 02:26:04 CET,0.0 1.221 1.619 1.894 2.106 2.294 2.459 2.584 2.795 2.894 2.989 2.924 3.238 3.314 3.442 3.571 3.695 3.751 3.854 3.957 4.097 4.186 4.275 4.395 4.513 4.64 4.751 4.842 4.969 5.082 5.183 5.301 5.416 5.518 5.611 5.713 5.825 5.951 6.076 6.191 6.318 6.473 6.586 6.64 6.688 6.709 6.67 6.504 6.162 5.547 4.214 2.265 0.433 -1.337 -2.808 -4.085 -5.301 -6.453 -7.461 -8.422 -9.254 -10.02 -10.776 -11.514 -12.209 -12.842 -13.496 -14.086 -14.616 -15.191 -15.745 -16.177 -16.628 -17.111 -17.506 -17.927 -18.355 -18.802 -19.287 -19.625 -19.973 -20.502 -20.859 -21.243 -21.446 -21.867 -22.311 -22.77 -23.008 -23.536 -23.825 -24.105 -24.423 -25.12 -25.505 -25.944 -26.422 -26.991 -27.736 -28.691 -31.804 -10 ,13507 ,KEBNE ,16678232,Thu Nov 25 01:02:35 CET,Thu Nov 25 02:26:25 CET,0.0 1.019 1.472 1.772 1.988 2.179 2.343 2.493 2.753 2.873 2.993 2.971 3.294 3.376 3.531 3.683 3.825 3.887 4.012 4.131 4.283 4.367 4.455 4.585 4.702 4.811 4.92 5.028 5.164 5.276 5.378 5.512 5.638 5.749 5.854 5.956 6.061 6.181 6.287 6.396 6.506 6.612 6.724 6.807 6.84 6.821 6.74 6.6 6.309 5.559 4.028 2.091 0.357 -1.209 -2.583 -3.896 -5.111 -6.313 -7.373 -8.382 -9.261 -10.056 -10.829 -11.607 -12.33 -12.949 -13.576 -14.165 -14.709 -15.277 -15.837 -16.283 -16.75 -17.222 -17.585 -17.982 -18.418 -18.865 -19.313 -19.617 -19.94 -20.445 -20.801 -21.194 -21.393 -21.798 -22.233 -22.683 -22.921 -23.456 -23.738 -24.041 -24.361 -25.055 -25.476 -25.931 -26.403 -26.955 -27.654 -28.625 -31.366 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_7_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_7_Example-1.txt deleted file mode 100644 index c776689f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_7_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12096 ,KEBNE ,16678233,Thu Nov 25 01:02:35 CET,Thu Nov 25 02:25:38 CET,0.0 1.003 1.434 1.733 1.951 2.148 2.328 2.512 2.842 2.981 3.114 3.114 3.444 3.541 3.724 3.896 4.067 4.153 4.32 4.469 4.682 4.823 4.951 5.128 5.292 5.433 5.567 5.703 5.885 6.048 6.194 6.368 6.53 6.683 6.874 7.076 7.246 7.426 7.615 7.785 7.934 8.108 8.295 8.471 8.634 8.723 8.768 8.764 8.555 7.971 6.593 4.58 2.799 1.181 -0.321 -1.847 -3.273 -4.482 -5.497 -6.518 -7.417 -8.248 -9.003 -9.682 -10.305 -10.873 -11.466 -12.017 -12.512 -12.994 -13.487 -13.927 -14.403 -14.875 -15.223 -15.59 -15.982 -16.377 -16.803 -17.106 -17.399 -17.842 -18.157 -18.509 -18.69 -19.034 -19.408 -19.797 -19.988 -20.473 -20.721 -20.992 -21.246 -21.838 -22.182 -22.593 -23.041 -23.471 -24.037 -24.936 -28.837 -2 ,327 ,KEBNE ,16678234,Thu Nov 25 01:02:35 CET,Thu Nov 25 02:26:29 CET,0.0 0.875 1.305 1.64 1.908 2.138 2.329 2.494 2.805 2.942 3.074 3.088 3.432 3.525 3.699 3.888 4.06 4.144 4.314 4.457 4.644 4.765 4.88 5.051 5.22 5.365 5.497 5.629 5.795 5.956 6.113 6.29 6.44 6.571 6.729 6.901 7.069 7.249 7.442 7.629 7.789 7.962 8.138 8.318 8.507 8.638 8.71 8.666 8.48 8.019 6.872 5.061 3.315 1.563 -0.017 -1.464 -2.745 -3.884 -4.904 -5.944 -6.871 -7.676 -8.372 -9.072 -9.747 -10.338 -10.968 -11.537 -12.028 -12.548 -13.077 -13.495 -13.931 -14.397 -14.766 -15.143 -15.541 -15.942 -16.331 -16.605 -16.897 -17.361 -17.671 -17.983 -18.154 -18.522 -18.918 -19.304 -19.5 -19.979 -20.172 -20.429 -20.694 -21.259 -21.556 -21.866 -22.239 -22.748 -23.369 -24.2 -27.11 -3 ,21276 ,KEBNE ,16678235,Thu Nov 25 01:02:35 CET,Thu Nov 25 02:25:45 CET,0.0 1.457 1.837 2.132 2.363 2.568 2.774 2.964 3.332 3.494 3.638 3.669 4.004 4.093 4.273 4.447 4.618 4.706 4.876 5.021 5.197 5.317 5.443 5.602 5.766 5.933 6.076 6.21 6.374 6.517 6.649 6.827 7.016 7.173 7.344 7.522 7.679 7.852 8.046 8.234 8.399 8.574 8.76 8.933 9.081 9.169 9.207 9.216 9.094 8.601 7.474 5.736 3.961 2.271 0.81 -0.554 -1.816 -3.022 -4.104 -5.144 -6.007 -6.774 -7.528 -8.235 -8.867 -9.446 -10.065 -10.608 -11.067 -11.546 -12.055 -12.485 -12.923 -13.382 -13.753 -14.138 -14.52 -14.902 -15.313 -15.608 -15.9 -16.346 -16.665 -17.001 -17.18 -17.552 -17.93 -18.314 -18.538 -19.038 -19.212 -19.448 -19.72 -20.334 -20.644 -20.994 -21.411 -21.902 -22.457 -23.27 -26.966 -4 ,782 ,KEBNE ,16678236,Thu Nov 25 01:02:35 CET,Thu Nov 25 02:28:23 CET,0.0 1.4 1.895 2.197 2.45 2.671 2.861 3.042 3.353 3.481 3.603 3.608 3.96 4.068 4.273 4.482 4.684 4.77 4.908 5.037 5.235 5.353 5.467 5.635 5.783 5.921 6.064 6.197 6.345 6.499 6.649 6.81 6.972 7.133 7.315 7.511 7.678 7.862 8.068 8.264 8.44 8.622 8.82 9.003 9.184 9.339 9.413 9.386 9.233 8.717 7.267 5.101 3.175 1.494 0.056 -1.342 -2.681 -3.82 -4.796 -5.873 -6.798 -7.575 -8.296 -8.978 -9.634 -10.241 -10.869 -11.447 -11.936 -12.437 -12.952 -13.367 -13.802 -14.236 -14.573 -14.928 -15.282 -15.642 -16.034 -16.307 -16.579 -17.038 -17.354 -17.673 -17.842 -18.223 -18.639 -19.036 -19.243 -19.746 -19.95 -20.188 -20.476 -21.118 -21.483 -21.911 -22.347 -22.79 -23.321 -24.043 -26.905 -5 ,27541 ,KEBNE ,16678237,Thu Nov 25 01:02:35 CET,Thu Nov 25 02:28:54 CET,0.0 1.005 1.403 1.704 1.953 2.169 2.357 2.525 2.815 2.943 3.065 3.056 3.39 3.481 3.658 3.828 3.986 4.065 4.213 4.34 4.531 4.654 4.772 4.949 5.112 5.264 5.41 5.555 5.724 5.875 6.048 6.267 6.464 6.634 6.818 7.021 7.196 7.384 7.604 7.839 8.054 8.253 8.454 8.635 8.78 8.889 8.981 8.961 8.721 8.09 6.692 4.752 2.953 1.286 -0.296 -1.766 -3.047 -4.237 -5.248 -6.213 -7.075 -7.881 -8.628 -9.325 -9.985 -10.597 -11.233 -11.784 -12.24 -12.718 -13.238 -13.66 -14.085 -14.534 -14.894 -15.266 -15.643 -16.042 -16.451 -16.734 -17.03 -17.499 -17.828 -18.151 -18.311 -18.632 -19.007 -19.45 -19.683 -20.186 -20.386 -20.624 -20.883 -21.454 -21.766 -22.121 -22.499 -22.988 -23.652 -24.536 -27.871 -6 ,19302 ,KEBNE ,16678238,Thu Nov 25 01:03:36 CET,Thu Nov 25 02:26:25 CET,0.0 0.952 1.374 1.707 1.947 2.148 2.328 2.503 2.806 2.933 3.053 3.034 3.365 3.463 3.633 3.799 3.98 4.071 4.246 4.401 4.6 4.736 4.866 5.029 5.192 5.357 5.492 5.61 5.795 5.97 6.117 6.283 6.431 6.585 6.77 6.944 7.111 7.311 7.509 7.685 7.856 8.023 8.206 8.385 8.53 8.629 8.657 8.547 8.282 7.68 6.216 4.196 2.43 0.76 -0.844 -2.346 -3.673 -4.9 -5.945 -6.994 -7.909 -8.731 -9.504 -10.197 -10.849 -11.455 -12.077 -12.625 -13.097 -13.592 -14.125 -14.572 -15.02 -15.469 -15.816 -16.185 -16.577 -16.97 -17.381 -17.668 -17.959 -18.426 -18.764 -19.175 -19.379 -19.732 -20.101 -20.494 -20.702 -21.182 -21.364 -21.65 -21.952 -22.554 -22.907 -23.285 -23.694 -24.174 -24.743 -25.507 -27.895 -7 ,30181 ,KEBNE ,16678239,Thu Nov 25 01:03:36 CET,Thu Nov 25 02:27:15 CET,0.0 0.869 1.27 1.551 1.771 1.963 2.124 2.262 2.535 2.669 2.792 2.778 3.134 3.245 3.417 3.583 3.757 3.834 3.974 4.125 4.331 4.45 4.565 4.716 4.863 5.014 5.154 5.285 5.451 5.605 5.743 5.921 6.104 6.268 6.453 6.678 6.887 7.095 7.277 7.445 7.61 7.766 7.961 8.116 8.251 8.363 8.363 8.264 7.981 7.438 6.271 4.445 2.727 1.08 -0.482 -1.987 -3.31 -4.511 -5.56 -6.604 -7.526 -8.351 -9.095 -9.775 -10.42 -11.031 -11.65 -12.17 -12.645 -13.129 -13.609 -14.026 -14.483 -14.973 -15.347 -15.735 -16.121 -16.515 -16.945 -17.239 -17.545 -18.021 -18.357 -18.707 -18.882 -19.239 -19.626 -20.037 -20.246 -20.735 -20.922 -21.171 -21.447 -22.031 -22.384 -22.796 -23.25 -23.747 -24.324 -25.121 -28.178 -8 ,6615 ,KEBNE ,16678240,Thu Nov 25 01:03:40 CET,Thu Nov 25 02:23:11 CET,0.0 0.961 1.375 1.723 1.96 2.135 2.31 2.48 2.791 2.93 3.056 3.053 3.381 3.474 3.667 3.856 4.038 4.116 4.261 4.409 4.609 4.738 4.87 5.039 5.196 5.352 5.497 5.627 5.794 5.956 6.101 6.284 6.463 6.615 6.79 6.993 7.167 7.341 7.511 7.676 7.862 8.06 8.257 8.445 8.618 8.723 8.792 8.78 8.573 8.005 6.465 4.335 2.156 0.199 -1.334 -2.769 -4.043 -5.187 -6.201 -7.238 -8.106 -8.859 -9.569 -10.261 -10.92 -11.519 -12.149 -12.685 -13.138 -13.612 -14.126 -14.564 -15.002 -15.458 -15.831 -16.227 -16.618 -17.025 -17.452 -17.741 -18.037 -18.487 -18.792 -19.109 -19.27 -19.594 -19.948 -20.322 -20.514 -20.989 -21.146 -21.366 -21.631 -22.233 -22.577 -22.987 -23.444 -23.912 -24.476 -25.316 -28.006 -9 ,4776 ,KEBNE ,16678241,Thu Nov 25 01:03:36 CET,Thu Nov 25 02:29:24 CET,0.0 1.6 2.005 2.347 2.584 2.779 2.951 3.108 3.405 3.543 3.665 3.641 3.978 4.08 4.272 4.439 4.599 4.676 4.817 4.958 5.164 5.293 5.415 5.571 5.723 5.884 6.042 6.194 6.375 6.542 6.7 6.882 7.055 7.206 7.37 7.545 7.701 7.87 8.051 8.24 8.455 8.674 8.851 8.998 9.159 9.293 9.374 9.431 9.333 8.847 7.648 5.726 3.756 1.945 0.357 -1.109 -2.459 -3.675 -4.721 -5.776 -6.707 -7.547 -8.315 -9.031 -9.696 -10.306 -10.939 -11.496 -11.962 -12.424 -12.899 -13.31 -13.756 -14.22 -14.583 -14.956 -15.344 -15.75 -16.141 -16.41 -16.692 -17.105 -17.406 -17.777 -17.967 -18.333 -18.713 -19.108 -19.325 -19.833 -20.077 -20.335 -20.593 -21.2 -21.554 -21.929 -22.355 -22.858 -23.439 -24.212 -27.116 -10 ,21570 ,KEBNE ,16678242,Thu Nov 25 01:03:36 CET,Thu Nov 25 02:27:18 CET,0.0 1.577 2.061 2.384 2.636 2.844 3.022 3.193 3.507 3.651 3.78 3.757 4.104 4.219 4.42 4.617 4.787 4.865 5.027 5.186 5.405 5.529 5.647 5.827 5.994 6.148 6.302 6.442 6.621 6.795 6.943 7.107 7.269 7.439 7.637 7.838 7.987 8.138 8.327 8.51 8.673 8.848 9.028 9.186 9.34 9.435 9.482 9.49 9.332 8.791 7.468 5.544 3.68 2.012 0.465 -1.005 -2.304 -3.505 -4.512 -5.49 -6.357 -7.163 -7.931 -8.644 -9.329 -9.957 -10.583 -11.144 -11.641 -12.134 -12.622 -13.021 -13.444 -13.896 -14.271 -14.666 -15.042 -15.416 -15.812 -16.09 -16.384 -16.86 -17.181 -17.513 -17.692 -18.066 -18.439 -18.82 -19.013 -19.495 -19.701 -19.942 -20.197 -20.763 -21.11 -21.513 -21.92 -22.396 -23.005 -23.826 -27.013 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_6.txt deleted file mode 100644 index df944b1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30103 ,KEBNE ,16678243,Thu Nov 25 01:03:36 CET,Thu Nov 25 02:28:29 CET,0.0 1.082 1.472 1.747 1.984 2.217 2.424 2.608 2.921 3.053 3.182 3.143 3.525 3.633 3.821 3.987 4.147 4.22 4.364 4.499 4.683 4.812 4.932 5.1 5.272 5.442 5.6 5.751 5.931 6.091 6.249 6.46 6.664 6.847 7.059 7.282 7.483 7.709 7.945 8.203 8.457 8.705 8.983 9.261 9.563 9.862 10.203 10.537 10.819 11.027 10.98 10.592 10.074 9.479 8.895 8.333 7.842 7.39 6.969 6.541 6.186 5.829 5.464 5.126 4.819 4.552 4.261 3.974 3.735 3.498 3.234 3.012 2.79 2.56 2.363 2.141 1.909 1.683 1.462 1.302 1.124 0.832 0.639 0.462 0.37 0.167 -0.043 -0.272 -0.401 -0.807 -0.798 -0.958 -1.136 -1.523 -1.74 -1.971 -2.233 -2.558 -2.926 -3.427 -4.493 -2 ,3981 ,KEBNE ,16678244,Thu Nov 25 01:03:36 CET,Thu Nov 25 02:26:28 CET,0.0 0.709 1.143 1.47 1.735 1.944 2.108 2.296 2.675 2.824 2.951 2.898 3.289 3.404 3.579 3.754 3.919 3.999 4.152 4.285 4.463 4.58 4.697 4.876 5.055 5.222 5.382 5.546 5.741 5.905 6.077 6.291 6.476 6.633 6.832 7.052 7.266 7.511 7.744 7.962 8.186 8.427 8.684 8.954 9.268 9.596 9.946 10.296 10.671 10.961 10.899 10.408 9.818 9.237 8.68 8.126 7.624 7.143 6.718 6.288 5.9 5.541 5.189 4.86 4.543 4.241 3.936 3.651 3.391 3.127 2.867 2.646 2.388 2.136 1.941 1.731 1.522 1.307 1.077 0.909 0.735 0.473 0.281 0.067 -0.034 -0.24 -0.47 -0.736 -0.874 -1.289 -1.317 -1.482 -1.661 -2.039 -2.256 -2.484 -2.74 -3.026 -3.377 -3.858 -5.096 -3 ,17036 ,KEBNE ,16678245,Thu Nov 25 01:03:36 CET,Thu Nov 25 02:26:54 CET,0.0 0.744 1.099 1.378 1.603 1.787 1.94 2.075 2.35 2.493 2.619 2.566 2.939 3.041 3.226 3.401 3.564 3.64 3.803 3.943 4.123 4.25 4.379 4.557 4.731 4.897 5.037 5.169 5.35 5.534 5.727 5.957 6.176 6.37 6.568 6.783 6.991 7.225 7.479 7.748 7.995 8.256 8.566 8.834 9.135 9.473 9.823 10.159 10.432 10.584 10.475 9.97 9.377 8.776 8.2 7.674 7.217 6.752 6.329 5.901 5.516 5.137 4.781 4.454 4.147 3.869 3.571 3.292 3.045 2.789 2.482 2.227 1.993 1.747 1.551 1.357 1.159 0.956 0.729 0.559 0.382 0.129 -0.042 -0.241 -0.351 -0.57 -0.802 -1.064 -1.219 -1.653 -1.662 -1.823 -1.992 -2.395 -2.646 -2.899 -3.171 -3.483 -3.844 -4.368 -5.922 -4 ,6257 ,KEBNE ,16678246,Thu Nov 25 01:03:36 CET,Thu Nov 25 02:26:25 CET,0.0 1.033 1.412 1.683 1.891 2.074 2.235 2.39 2.694 2.829 2.951 2.918 3.311 3.419 3.602 3.771 3.921 3.995 4.139 4.289 4.497 4.629 4.758 4.944 5.124 5.279 5.421 5.571 5.78 5.976 6.137 6.319 6.514 6.699 6.889 7.111 7.332 7.561 7.81 8.109 8.406 8.661 8.934 9.203 9.498 9.821 10.17 10.464 10.713 10.876 10.747 10.244 9.667 9.042 8.467 7.931 7.417 6.932 6.496 6.032 5.654 5.331 4.993 4.669 4.368 4.072 3.753 3.463 3.224 2.974 2.717 2.511 2.28 2.019 1.808 1.593 1.385 1.175 0.956 0.799 0.627 0.361 0.176 -0.019 -0.123 -0.339 -0.557 -0.789 -0.926 -1.353 -1.369 -1.53 -1.701 -2.107 -2.333 -2.583 -2.878 -3.193 -3.526 -4.013 -5.269 -5 ,29519 ,KEBNE ,16678247,Thu Nov 25 01:03:36 CET,Thu Nov 25 02:27:59 CET,0.0 1.257 1.761 2.107 2.32 2.512 2.691 2.861 3.17 3.307 3.436 3.437 3.838 3.943 4.146 4.336 4.511 4.592 4.746 4.887 5.086 5.216 5.345 5.537 5.713 5.868 6.011 6.149 6.327 6.513 6.696 6.891 7.075 7.253 7.452 7.677 7.888 8.108 8.34 8.599 8.868 9.151 9.442 9.712 10.023 10.36 10.734 11.056 11.339 11.585 11.54 11.091 10.565 10.033 9.488 8.978 8.516 8.063 7.654 7.206 6.785 6.405 6.048 5.707 5.382 5.086 4.79 4.536 4.3 4.053 3.807 3.588 3.349 3.103 2.914 2.708 2.503 2.297 2.065 1.894 1.71 1.435 1.238 1.034 0.927 0.696 0.467 0.203 0.06 -0.366 -0.407 -0.574 -0.75 -1.122 -1.331 -1.573 -1.84 -2.133 -2.511 -3.017 -3.935 -6 ,3993 ,KEBNE ,16678248,Thu Nov 25 01:03:36 CET,Thu Nov 25 02:26:25 CET,0.0 0.922 1.291 1.555 1.781 1.994 2.172 2.326 2.584 2.702 2.814 2.783 3.176 3.272 3.465 3.65 3.82 3.896 4.03 4.168 4.36 4.491 4.625 4.808 4.988 5.146 5.277 5.411 5.596 5.779 5.953 6.151 6.33 6.486 6.674 6.917 7.146 7.371 7.583 7.798 8.051 8.333 8.632 8.91 9.254 9.599 9.89 10.193 10.491 10.64 10.479 10.031 9.479 8.88 8.347 7.863 7.383 6.887 6.457 6.023 5.634 5.288 4.952 4.621 4.305 4.029 3.736 3.449 3.192 2.944 2.698 2.471 2.227 1.99 1.789 1.58 1.369 1.128 0.871 0.719 0.568 0.308 0.135 -0.058 -0.165 -0.375 -0.607 -0.876 -1.019 -1.442 -1.473 -1.637 -1.803 -2.143 -2.338 -2.567 -2.85 -3.169 -3.513 -3.937 -4.944 -7 ,6898 ,KEBNE ,16678249,Thu Nov 25 01:04:38 CET,Thu Nov 25 02:27:37 CET,0.0 0.765 1.14 1.484 1.766 1.997 2.2 2.395 2.746 2.887 3.007 2.944 3.313 3.413 3.607 3.803 3.983 4.063 4.214 4.352 4.546 4.673 4.796 4.967 5.137 5.294 5.44 5.592 5.792 5.973 6.141 6.347 6.538 6.709 6.92 7.175 7.403 7.641 7.884 8.143 8.412 8.689 8.969 9.255 9.608 9.961 10.324 10.657 10.933 11.138 11.096 10.617 10.028 9.413 8.845 8.324 7.842 7.362 6.929 6.472 6.062 5.713 5.372 5.036 4.723 4.438 4.123 3.833 3.586 3.333 3.084 2.863 2.615 2.363 2.156 1.945 1.746 1.529 1.299 1.133 0.946 0.647 0.446 0.251 0.151 -0.055 -0.279 -0.515 -0.645 -1.061 -1.077 -1.244 -1.424 -1.82 -2.05 -2.288 -2.542 -2.853 -3.241 -3.734 -4.755 -8 ,21626 ,KEBNE ,16678250,Thu Nov 25 01:04:37 CET,Thu Nov 25 02:28:01 CET,0.0 1.15 1.546 1.851 2.101 2.304 2.476 2.636 2.934 3.065 3.19 3.143 3.522 3.637 3.838 4.014 4.193 4.278 4.438 4.597 4.814 4.946 5.082 5.276 5.45 5.61 5.77 5.925 6.128 6.31 6.464 6.663 6.866 7.048 7.248 7.484 7.705 7.956 8.217 8.466 8.704 8.966 9.266 9.533 9.827 10.128 10.456 10.783 11.077 11.274 11.221 10.784 10.22 9.608 9.012 8.453 7.938 7.466 7.055 6.616 6.236 5.914 5.595 5.274 4.967 4.678 4.382 4.122 3.874 3.615 3.367 3.165 2.944 2.668 2.446 2.227 2.001 1.765 1.5 1.325 1.152 0.884 0.699 0.492 0.38 0.158 -0.071 -0.328 -0.468 -0.887 -0.895 -1.049 -1.218 -1.603 -1.818 -2.044 -2.303 -2.599 -2.969 -3.518 -4.988 -9 ,193 ,KEBNE ,16678251,Thu Nov 25 01:04:38 CET,Thu Nov 25 02:29:20 CET,0.0 0.698 1.042 1.334 1.58 1.795 1.996 2.159 2.428 2.554 2.681 2.662 3.046 3.147 3.333 3.52 3.703 3.784 3.931 4.062 4.263 4.404 4.527 4.692 4.871 5.037 5.183 5.33 5.514 5.687 5.858 6.043 6.221 6.411 6.629 6.862 7.074 7.29 7.511 7.742 7.983 8.25 8.556 8.859 9.21 9.573 9.927 10.294 10.616 10.805 10.696 10.27 9.73 9.124 8.577 8.038 7.509 7.006 6.576 6.154 5.749 5.369 5.033 4.728 4.416 4.103 3.788 3.519 3.29 3.05 2.783 2.559 2.318 2.057 1.857 1.648 1.433 1.195 0.933 0.766 0.597 0.33 0.142 -0.064 -0.163 -0.369 -0.597 -0.842 -0.974 -1.378 -1.375 -1.529 -1.703 -2.107 -2.321 -2.547 -2.805 -3.101 -3.468 -4.003 -5.725 -10 ,7107 ,KEBNE ,16678252,Thu Nov 25 01:04:37 CET,Thu Nov 25 02:28:07 CET,0.0 0.744 1.112 1.388 1.623 1.812 1.975 2.123 2.42 2.572 2.7 2.64 3.02 3.126 3.309 3.475 3.631 3.708 3.856 4.003 4.209 4.319 4.426 4.61 4.78 4.939 5.09 5.233 5.418 5.593 5.772 5.978 6.152 6.318 6.522 6.747 6.948 7.164 7.404 7.645 7.903 8.206 8.521 8.832 9.173 9.529 9.886 10.199 10.482 10.662 10.584 10.091 9.5 8.926 8.385 7.83 7.315 6.877 6.48 6.045 5.681 5.353 5.017 4.705 4.413 4.125 3.817 3.554 3.319 3.052 2.775 2.543 2.297 2.046 1.852 1.645 1.415 1.182 0.956 0.8 0.633 0.364 0.176 -0.023 -0.125 -0.335 -0.563 -0.827 -0.967 -1.378 -1.367 -1.528 -1.713 -2.093 -2.304 -2.535 -2.791 -3.087 -3.461 -3.995 -5.171 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt deleted file mode 100644 index d2181f79..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31553 ,KEBNE ,16675959,Wed Nov 24 09:57:10 CET,Wed Nov 24 11:22:22 CET,0.0 0.701 0.997 1.261 1.47 1.645 1.82 1.98 2.241 2.353 2.461 2.386 2.737 2.812 2.984 3.153 3.311 3.387 3.547 3.706 3.922 4.071 4.217 4.402 4.558 4.702 4.838 4.973 5.158 5.344 5.507 5.69 5.881 6.06 6.25 6.453 6.644 6.839 7.052 7.279 7.526 7.813 8.089 8.312 8.533 8.733 8.914 9.068 9.159 9.04 8.463 7.529 6.653 5.844 5.077 4.345 3.694 3.11 2.602 2.095 1.66 1.266 0.886 0.536 0.207 -0.102 -0.442 -0.745 -0.984 -1.232 -1.495 -1.726 -1.983 -2.242 -2.424 -2.611 -2.809 -3.026 -3.263 -3.42 -3.568 -3.808 -3.984 -4.153 -4.241 -4.448 -4.679 -4.912 -5.035 -5.438 -5.422 -5.566 -5.714 -6.058 -6.246 -6.443 -6.683 -6.958 -7.256 -7.644 -8.369 -2 ,26939 ,KEBNE ,16678254,Thu Nov 25 01:04:38 CET,Thu Nov 25 02:29:46 CET,0.0 0.646 0.963 1.205 1.421 1.605 1.761 1.901 2.161 2.282 2.402 2.348 2.714 2.804 2.992 3.152 3.311 3.397 3.542 3.667 3.853 3.961 4.063 4.233 4.389 4.528 4.671 4.814 5.008 5.207 5.388 5.584 5.751 5.915 6.113 6.315 6.494 6.696 6.916 7.141 7.376 7.614 7.859 8.07 8.276 8.484 8.649 8.799 8.901 8.766 8.174 7.169 6.236 5.377 4.603 3.894 3.259 2.684 2.202 1.713 1.265 0.856 0.475 0.111 -0.222 -0.51 -0.827 -1.11 -1.355 -1.626 -1.928 -2.178 -2.43 -2.685 -2.877 -3.067 -3.269 -3.495 -3.727 -3.889 -4.06 -4.321 -4.502 -4.695 -4.794 -5.006 -5.221 -5.444 -5.566 -5.966 -5.936 -6.087 -6.25 -6.588 -6.782 -7.009 -7.258 -7.511 -7.824 -8.244 -9.531 -3 ,29482 ,KEBNE ,16675961,Wed Nov 24 09:57:10 CET,Wed Nov 24 11:20:13 CET,0.0 0.527 0.855 1.138 1.382 1.591 1.787 1.981 2.322 2.457 2.574 2.507 2.876 2.975 3.163 3.344 3.51 3.588 3.754 3.919 4.134 4.257 4.369 4.534 4.701 4.857 5.013 5.178 5.372 5.539 5.704 5.903 6.096 6.273 6.467 6.675 6.867 7.059 7.252 7.467 7.671 7.877 8.123 8.354 8.63 8.893 9.074 9.225 9.333 9.231 8.656 7.613 6.587 5.684 4.918 4.213 3.573 3.002 2.502 2.0 1.583 1.202 0.816 0.45 0.118 -0.2 -0.54 -0.834 -1.091 -1.347 -1.608 -1.838 -2.076 -2.326 -2.522 -2.735 -2.955 -3.16 -3.369 -3.529 -3.693 -3.936 -4.112 -4.281 -4.37 -4.582 -4.816 -5.083 -5.217 -5.628 -5.629 -5.771 -5.924 -6.297 -6.497 -6.699 -6.935 -7.178 -7.488 -7.905 -8.865 -4 ,5281 ,KEBNE ,16678256,Thu Nov 25 01:05:39 CET,Thu Nov 25 02:30:09 CET,0.0 1.264 1.576 1.818 2.047 2.237 2.391 2.521 2.751 2.863 2.975 2.931 3.311 3.41 3.607 3.785 3.934 4.007 4.172 4.336 4.543 4.662 4.782 4.969 5.154 5.32 5.465 5.61 5.797 5.975 6.145 6.339 6.511 6.677 6.88 7.082 7.276 7.484 7.682 7.875 8.075 8.304 8.569 8.823 9.074 9.286 9.481 9.672 9.736 9.579 9.028 8.124 7.258 6.419 5.615 4.871 4.247 3.706 3.223 2.747 2.332 1.942 1.546 1.184 0.881 0.577 0.243 -0.032 -0.272 -0.52 -0.782 -1.0 -1.238 -1.496 -1.68 -1.872 -2.066 -2.275 -2.512 -2.671 -2.834 -3.105 -3.296 -3.487 -3.585 -3.785 -3.998 -4.252 -4.376 -4.775 -4.761 -4.9 -5.037 -5.359 -5.551 -5.762 -6.009 -6.304 -6.642 -7.094 -8.21 -5 ,19033 ,KEBNE ,16675963,Wed Nov 24 09:58:12 CET,Wed Nov 24 11:22:06 CET,0.0 0.82 1.116 1.369 1.578 1.76 1.928 2.08 2.325 2.427 2.536 2.475 2.847 2.931 3.086 3.25 3.411 3.487 3.636 3.775 3.976 4.115 4.248 4.433 4.61 4.791 4.98 5.133 5.313 5.513 5.7 5.892 6.067 6.236 6.433 6.67 6.896 7.132 7.368 7.573 7.765 7.995 8.253 8.477 8.675 8.882 9.074 9.166 9.183 9.06 8.5 7.509 6.584 5.739 4.968 4.261 3.639 3.046 2.525 2.009 1.568 1.183 0.8 0.439 0.114 -0.195 -0.512 -0.804 -1.076 -1.346 -1.612 -1.83 -2.059 -2.315 -2.517 -2.729 -2.943 -3.159 -3.403 -3.573 -3.743 -4.001 -4.177 -4.362 -4.456 -4.645 -4.83 -5.036 -5.16 -5.568 -5.547 -5.686 -5.831 -6.156 -6.343 -6.56 -6.81 -7.066 -7.377 -7.826 -8.622 -6 ,5689 ,KEBNE ,16675964,Wed Nov 24 09:58:11 CET,Wed Nov 24 11:22:26 CET,0.0 0.863 1.232 1.543 1.772 1.934 2.083 2.235 2.528 2.655 2.76 2.679 3.049 3.143 3.314 3.457 3.609 3.696 3.86 4.004 4.216 4.352 4.479 4.662 4.834 5.001 5.162 5.298 5.469 5.653 5.825 6.014 6.18 6.352 6.564 6.778 6.982 7.195 7.403 7.616 7.837 8.058 8.286 8.505 8.708 8.895 9.103 9.292 9.362 9.22 8.665 7.673 6.737 5.891 5.126 4.45 3.825 3.25 2.768 2.262 1.794 1.356 0.967 0.616 0.265 -0.036 -0.336 -0.613 -0.853 -1.099 -1.348 -1.546 -1.767 -2.026 -2.225 -2.433 -2.638 -2.847 -3.067 -3.217 -3.384 -3.644 -3.823 -4.01 -4.105 -4.301 -4.509 -4.733 -4.859 -5.275 -5.29 -5.448 -5.603 -5.922 -6.102 -6.298 -6.525 -6.778 -7.079 -7.547 -9.289 -7 ,8570 ,KEBNE ,16675965,Wed Nov 24 10:01:17 CET,Wed Nov 24 11:25:00 CET,0.0 0.716 1.049 1.29 1.493 1.659 1.802 1.939 2.197 2.325 2.439 2.36 2.73 2.821 2.994 3.152 3.298 3.37 3.511 3.642 3.811 3.913 4.018 4.171 4.312 4.449 4.601 4.751 4.931 5.108 5.271 5.463 5.668 5.852 6.045 6.261 6.443 6.635 6.861 7.085 7.308 7.561 7.827 8.063 8.307 8.552 8.792 8.965 9.015 8.895 8.368 7.43 6.468 5.585 4.859 4.183 3.555 3.007 2.517 1.99 1.554 1.179 0.792 0.436 0.117 -0.197 -0.51 -0.771 -1.002 -1.248 -1.519 -1.749 -1.982 -2.212 -2.391 -2.594 -2.809 -3.012 -3.222 -3.368 -3.524 -3.796 -3.987 -4.186 -4.298 -4.52 -4.73 -4.955 -5.075 -5.481 -5.477 -5.623 -5.786 -6.153 -6.337 -6.554 -6.813 -7.097 -7.461 -7.903 -8.735 -8 ,13133 ,KEBNE ,16675966,Wed Nov 24 10:03:21 CET,Wed Nov 24 11:28:38 CET,0.0 0.617 0.952 1.239 1.489 1.711 1.915 2.091 2.41 2.549 2.685 2.67 3.052 3.146 3.332 3.51 3.662 3.74 3.898 4.034 4.224 4.357 4.487 4.681 4.868 5.02 5.151 5.297 5.484 5.642 5.8 5.985 6.162 6.343 6.537 6.746 6.941 7.143 7.341 7.57 7.822 8.048 8.264 8.498 8.751 8.968 9.196 9.374 9.427 9.288 8.768 7.824 6.874 6.004 5.235 4.535 3.898 3.335 2.847 2.33 1.889 1.491 1.097 0.736 0.395 0.095 -0.205 -0.483 -0.722 -0.974 -1.244 -1.465 -1.691 -1.934 -2.125 -2.323 -2.541 -2.776 -3.031 -3.194 -3.351 -3.621 -3.803 -3.996 -4.1 -4.301 -4.516 -4.751 -4.871 -5.262 -5.231 -5.376 -5.529 -5.852 -6.039 -6.241 -6.474 -6.753 -7.069 -7.488 -8.372 -9 ,18730 ,KEBNE ,16675967,Wed Nov 24 10:04:22 CET,Wed Nov 24 11:27:30 CET,0.0 0.67 1.007 1.276 1.513 1.735 1.912 2.075 2.371 2.51 2.633 2.548 2.913 2.995 3.16 3.31 3.445 3.507 3.633 3.766 3.97 4.091 4.205 4.371 4.525 4.681 4.829 4.974 5.156 5.336 5.518 5.729 5.931 6.122 6.318 6.527 6.719 6.924 7.141 7.375 7.62 7.864 8.167 8.435 8.673 8.934 9.157 9.321 9.391 9.271 8.779 7.792 6.811 5.895 5.107 4.431 3.824 3.228 2.687 2.151 1.696 1.296 0.922 0.561 0.215 -0.089 -0.411 -0.708 -0.953 -1.211 -1.483 -1.711 -1.954 -2.201 -2.385 -2.58 -2.799 -3.03 -3.245 -3.392 -3.559 -3.82 -4.007 -4.198 -4.296 -4.487 -4.696 -4.917 -5.033 -5.448 -5.447 -5.592 -5.737 -6.041 -6.222 -6.433 -6.66 -6.935 -7.311 -7.784 -8.633 -10 ,4145 ,KEBNE ,16675968,Wed Nov 24 10:04:22 CET,Wed Nov 24 11:27:51 CET,0.0 0.743 1.069 1.344 1.574 1.764 1.93 2.054 2.274 2.391 2.514 2.453 2.827 2.928 3.103 3.245 3.385 3.459 3.594 3.727 3.907 4.018 4.13 4.289 4.439 4.575 4.707 4.833 4.989 5.136 5.278 5.445 5.607 5.757 5.946 6.158 6.346 6.567 6.785 6.975 7.169 7.411 7.689 7.916 8.162 8.399 8.612 8.786 8.842 8.664 8.033 7.074 6.152 5.328 4.624 3.943 3.312 2.733 2.232 1.736 1.295 0.902 0.519 0.152 -0.196 -0.522 -0.845 -1.143 -1.411 -1.669 -1.935 -2.16 -2.385 -2.616 -2.8 -2.994 -3.202 -3.417 -3.658 -3.819 -3.972 -4.237 -4.419 -4.596 -4.687 -4.875 -5.079 -5.302 -5.422 -5.82 -5.783 -5.925 -6.086 -6.455 -6.652 -6.851 -7.099 -7.406 -7.741 -8.137 -8.951 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt deleted file mode 100644 index 3e63d373..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10947 ,KEBNE ,16678263,Thu Nov 25 01:05:39 CET,Thu Nov 25 02:30:22 CET,0.0 0.648 0.929 1.192 1.435 1.636 1.84 2.029 2.312 2.442 2.568 2.529 2.907 3.006 3.191 3.366 3.55 3.638 3.797 3.945 4.163 4.307 4.448 4.657 4.843 5.03 5.226 5.402 5.618 5.821 6.003 6.207 6.419 6.629 6.855 7.102 7.35 7.629 7.914 8.192 8.451 8.729 9.068 9.388 9.696 9.98 10.269 10.545 10.761 10.803 10.464 9.773 9.079 8.365 7.675 7.006 6.411 5.856 5.346 4.829 4.413 4.043 3.65 3.285 2.934 2.588 2.216 1.882 1.608 1.334 1.054 0.816 0.562 0.277 0.059 -0.168 -0.421 -0.696 -0.988 -1.172 -1.351 -1.644 -1.867 -2.13 -2.257 -2.535 -2.851 -3.144 -3.291 -3.723 -3.778 -3.971 -4.173 -4.576 -4.796 -5.075 -5.403 -5.762 -6.195 -6.747 -8.166 -2 ,11332 ,KEBNE ,16678264,Thu Nov 25 01:06:40 CET,Thu Nov 25 02:31:21 CET,0.0 0.698 1.022 1.261 1.451 1.63 1.798 1.946 2.226 2.365 2.487 2.418 2.787 2.883 3.073 3.254 3.418 3.503 3.664 3.822 4.064 4.212 4.344 4.532 4.715 4.898 5.072 5.238 5.452 5.648 5.841 6.091 6.334 6.534 6.74 6.968 7.197 7.462 7.743 8.015 8.294 8.6 8.919 9.204 9.524 9.833 10.137 10.431 10.628 10.686 10.423 9.736 8.975 8.214 7.528 6.882 6.283 5.712 5.194 4.69 4.254 3.849 3.448 3.055 2.676 2.335 1.99 1.661 1.386 1.105 0.789 0.526 0.256 -0.028 -0.265 -0.513 -0.753 -0.989 -1.234 -1.413 -1.599 -1.889 -2.098 -2.321 -2.447 -2.7 -2.96 -3.254 -3.403 -3.845 -3.919 -4.09 -4.295 -4.762 -5.006 -5.266 -5.566 -5.947 -6.387 -6.959 -8.258 -3 ,19783 ,KEBNE ,16678265,Thu Nov 25 01:06:41 CET,Thu Nov 25 02:31:31 CET,0.0 0.743 0.985 1.195 1.397 1.59 1.768 1.938 2.219 2.344 2.462 2.398 2.767 2.865 3.07 3.267 3.451 3.537 3.699 3.847 4.048 4.207 4.37 4.57 4.757 4.935 5.111 5.272 5.451 5.637 5.823 6.043 6.246 6.452 6.691 6.927 7.158 7.396 7.631 7.879 8.136 8.449 8.82 9.151 9.467 9.752 10.05 10.308 10.518 10.588 10.205 9.475 8.704 7.944 7.23 6.55 5.944 5.379 4.895 4.408 3.977 3.577 3.185 2.81 2.463 2.138 1.789 1.463 1.181 0.892 0.582 0.335 0.087 -0.191 -0.412 -0.632 -0.865 -1.096 -1.324 -1.496 -1.691 -1.984 -2.204 -2.439 -2.547 -2.775 -3.023 -3.303 -3.478 -3.931 -3.981 -4.173 -4.366 -4.789 -5.04 -5.308 -5.635 -6.026 -6.512 -7.182 -8.908 -4 ,15758 ,KEBNE ,16678266,Thu Nov 25 01:07:41 CET,Thu Nov 25 02:31:15 CET,0.0 0.638 0.922 1.115 1.314 1.53 1.719 1.858 2.097 2.206 2.313 2.27 2.654 2.752 2.942 3.118 3.271 3.343 3.508 3.675 3.89 4.028 4.158 4.338 4.519 4.695 4.861 5.013 5.208 5.386 5.557 5.773 5.998 6.221 6.447 6.693 6.938 7.189 7.441 7.715 7.982 8.264 8.599 8.914 9.229 9.568 9.913 10.183 10.4 10.486 10.252 9.538 8.739 7.959 7.249 6.597 6.001 5.424 4.904 4.37 3.909 3.499 3.115 2.765 2.414 2.097 1.775 1.46 1.178 0.879 0.569 0.322 0.06 -0.213 -0.428 -0.658 -0.892 -1.14 -1.396 -1.581 -1.776 -2.08 -2.297 -2.527 -2.647 -2.906 -3.178 -3.446 -3.59 -4.019 -4.06 -4.234 -4.427 -4.879 -5.126 -5.399 -5.739 -6.163 -6.654 -7.242 -8.522 -5 ,7237 ,KEBNE ,16678267,Thu Nov 25 01:06:40 CET,Thu Nov 25 02:31:39 CET,0.0 0.72 1.025 1.26 1.447 1.606 1.741 1.87 2.117 2.237 2.352 2.292 2.656 2.753 2.948 3.117 3.27 3.35 3.502 3.653 3.881 4.024 4.165 4.369 4.562 4.727 4.886 5.05 5.257 5.448 5.626 5.837 6.037 6.256 6.521 6.794 7.029 7.261 7.508 7.776 8.046 8.318 8.618 8.931 9.259 9.561 9.88 10.194 10.444 10.508 10.217 9.54 8.796 8.068 7.402 6.767 6.163 5.612 5.119 4.599 4.156 3.779 3.414 3.051 2.693 2.373 2.045 1.718 1.426 1.125 0.816 0.567 0.301 0.02 -0.204 -0.438 -0.676 -0.916 -1.168 -1.35 -1.538 -1.823 -2.031 -2.268 -2.387 -2.625 -2.887 -3.158 -3.301 -3.73 -3.793 -3.975 -4.169 -4.659 -4.922 -5.185 -5.521 -5.9 -6.355 -6.962 -8.206 -6 ,26316 ,KEBNE ,16678268,Thu Nov 25 01:06:44 CET,Thu Nov 25 02:26:29 CET,0.0 0.764 1.044 1.307 1.53 1.698 1.844 1.976 2.213 2.338 2.463 2.424 2.811 2.919 3.125 3.33 3.521 3.609 3.775 3.929 4.151 4.289 4.425 4.63 4.84 5.044 5.236 5.427 5.669 5.885 6.072 6.281 6.51 6.737 6.967 7.209 7.441 7.694 7.942 8.192 8.448 8.738 9.078 9.371 9.69 10.02 10.314 10.586 10.791 10.844 10.582 9.898 9.208 8.488 7.76 7.113 6.516 5.94 5.424 4.911 4.471 4.037 3.627 3.273 2.942 2.637 2.31 2.003 1.733 1.434 1.116 0.858 0.581 0.287 0.069 -0.14 -0.36 -0.585 -0.815 -0.981 -1.154 -1.439 -1.646 -1.857 -1.963 -2.182 -2.412 -2.658 -2.796 -3.223 -3.267 -3.443 -3.639 -4.043 -4.258 -4.52 -4.834 -5.202 -5.604 -6.134 -7.653 -7 ,20331 ,KEBNE ,16675975,Wed Nov 24 11:20:22 CET,Wed Nov 24 12:42:00 CET,0.0 0.586 0.893 1.135 1.35 1.53 1.669 1.808 2.087 2.204 2.309 2.247 2.634 2.738 2.936 3.122 3.282 3.362 3.514 3.661 3.873 4.004 4.136 4.329 4.508 4.674 4.839 4.998 5.203 5.409 5.587 5.787 5.995 6.203 6.427 6.661 6.897 7.152 7.42 7.713 7.993 8.295 8.634 8.943 9.274 9.576 9.905 10.228 10.447 10.501 10.186 9.512 8.757 7.993 7.27 6.584 5.985 5.451 4.975 4.467 4.028 3.641 3.273 2.922 2.558 2.195 1.836 1.524 1.255 0.989 0.701 0.432 0.154 -0.129 -0.353 -0.581 -0.811 -1.052 -1.318 -1.507 -1.696 -1.983 -2.186 -2.399 -2.507 -2.742 -2.99 -3.262 -3.413 -3.841 -3.884 -4.05 -4.218 -4.625 -4.887 -5.179 -5.478 -5.815 -6.245 -6.834 -8.091 -8 ,27527 ,KEBNE ,16678270,Thu Nov 25 01:07:41 CET,Thu Nov 25 02:30:51 CET,0.0 0.885 1.245 1.511 1.715 1.869 2.031 2.221 2.542 2.671 2.794 2.74 3.115 3.213 3.403 3.594 3.773 3.862 4.041 4.208 4.422 4.551 4.682 4.864 5.042 5.224 5.406 5.577 5.79 5.997 6.19 6.408 6.609 6.798 7.037 7.292 7.525 7.79 8.06 8.335 8.621 8.922 9.213 9.499 9.834 10.175 10.459 10.68 10.849 10.904 10.668 9.916 9.07 8.313 7.624 6.967 6.366 5.793 5.266 4.705 4.232 3.814 3.418 3.053 2.688 2.351 2.015 1.715 1.437 1.135 0.839 0.602 0.338 0.057 -0.168 -0.411 -0.66 -0.903 -1.162 -1.343 -1.531 -1.835 -2.045 -2.262 -2.368 -2.591 -2.843 -3.128 -3.277 -3.702 -3.772 -3.955 -4.117 -4.485 -4.734 -5.025 -5.332 -5.709 -6.144 -6.672 -7.728 -9 ,20744 ,KEBNE ,16678271,Thu Nov 25 01:07:42 CET,Thu Nov 25 02:32:17 CET,0.0 0.811 1.169 1.452 1.659 1.837 2.007 2.149 2.435 2.566 2.672 2.621 3.003 3.104 3.288 3.471 3.638 3.725 3.905 4.07 4.282 4.415 4.549 4.737 4.908 5.074 5.235 5.388 5.589 5.776 5.959 6.181 6.387 6.602 6.863 7.118 7.347 7.596 7.846 8.106 8.369 8.66 8.952 9.218 9.531 9.839 10.136 10.447 10.717 10.812 10.54 9.838 9.061 8.292 7.584 6.925 6.324 5.759 5.265 4.775 4.343 3.95 3.562 3.194 2.855 2.534 2.183 1.861 1.588 1.308 1.018 0.764 0.489 0.211 0.002 -0.218 -0.451 -0.695 -0.957 -1.134 -1.314 -1.593 -1.796 -2.021 -2.135 -2.403 -2.692 -2.978 -3.125 -3.556 -3.598 -3.76 -3.945 -4.349 -4.57 -4.82 -5.119 -5.476 -5.946 -6.589 -8.346 -10 ,18017 ,KEBNE ,16675978,Wed Nov 24 11:20:22 CET,Wed Nov 24 12:42:12 CET,0.0 0.849 1.208 1.444 1.611 1.763 1.894 2.02 2.307 2.44 2.554 2.485 2.85 2.938 3.128 3.309 3.482 3.57 3.73 3.889 4.117 4.255 4.392 4.598 4.792 4.973 5.146 5.306 5.514 5.704 5.873 6.093 6.308 6.525 6.772 7.013 7.239 7.49 7.761 8.036 8.291 8.589 8.926 9.231 9.554 9.872 10.195 10.446 10.643 10.766 10.51 9.813 9.014 8.196 7.466 6.807 6.158 5.518 4.98 4.457 4.02 3.616 3.209 2.825 2.472 2.149 1.807 1.503 1.24 0.942 0.614 0.348 0.082 -0.19 -0.399 -0.606 -0.836 -1.081 -1.342 -1.528 -1.734 -2.044 -2.238 -2.446 -2.558 -2.795 -3.041 -3.3 -3.441 -3.874 -3.953 -4.158 -4.368 -4.803 -5.048 -5.318 -5.626 -5.975 -6.407 -7.006 -8.586 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt deleted file mode 100644 index 280c1cd3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30220 ,KEBNE ,16678273,Thu Nov 25 01:07:41 CET,Thu Nov 25 02:33:27 CET,0.0 1.423 2.07 2.567 2.94 3.259 3.552 3.832 4.351 4.584 4.79 5.027 5.328 5.485 5.768 6.043 6.302 6.417 6.649 6.887 7.21 7.402 7.597 7.868 8.098 8.318 8.523 8.726 8.995 9.241 9.478 9.75 9.985 10.203 10.469 10.762 11.026 11.307 11.608 11.949 12.303 12.685 13.107 13.49 13.958 14.443 14.897 15.36 15.796 16.161 16.362 16.141 15.663 15.138 14.595 14.04 13.58 13.154 12.743 12.324 11.945 11.579 11.234 10.921 10.625 10.34 10.03 9.749 9.517 9.266 8.984 8.747 8.481 8.177 7.954 7.725 7.479 7.217 6.94 6.741 6.514 6.13 5.844 5.551 5.411 5.123 4.802 4.447 4.255 3.934 3.683 3.489 3.267 2.771 2.499 2.177 1.811 1.399 0.921 0.241 -1.099 -2 ,11430 ,KEBNE ,16676000,Wed Nov 24 11:23:26 CET,Wed Nov 24 12:45:06 CET,0.0 1.907 2.608 3.102 3.459 3.786 4.072 4.322 4.797 5.013 5.205 5.437 5.747 5.916 6.19 6.45 6.714 6.835 7.044 7.246 7.555 7.747 7.923 8.173 8.414 8.636 8.842 9.04 9.296 9.529 9.761 10.046 10.334 10.623 10.906 11.202 11.502 11.817 12.134 12.45 12.767 13.127 13.527 13.904 14.341 14.816 15.267 15.697 16.138 16.487 16.629 16.325 15.839 15.327 14.849 14.382 13.902 13.44 13.037 12.612 12.223 11.883 11.567 11.268 10.981 10.697 10.395 10.137 9.902 9.631 9.326 9.057 8.794 8.545 8.342 8.113 7.88 7.64 7.368 7.188 7.008 6.705 6.49 6.262 6.145 5.907 5.646 5.367 5.209 4.916 4.722 4.546 4.347 3.889 3.639 3.374 3.067 2.711 2.282 1.639 0.344 -3 ,10743 ,KEBNE ,16678275,Thu Nov 25 01:08:46 CET,Thu Nov 25 02:29:15 CET,0.0 1.545 2.251 2.788 3.202 3.554 3.877 4.161 4.63 4.817 5.0 5.248 5.544 5.705 6.024 6.319 6.601 6.73 6.956 7.167 7.454 7.624 7.788 8.031 8.255 8.484 8.735 8.973 9.24 9.472 9.692 9.971 10.258 10.519 10.787 11.099 11.385 11.674 11.976 12.273 12.568 12.91 13.336 13.749 14.19 14.593 15.028 15.506 15.951 16.308 16.447 16.229 15.808 15.261 14.719 14.212 13.731 13.279 12.869 12.449 12.084 11.738 11.402 11.084 10.788 10.526 10.231 9.941 9.701 9.44 9.15 8.918 8.675 8.422 8.244 8.058 7.839 7.599 7.337 7.152 6.966 6.654 6.442 6.218 6.088 5.81 5.496 5.126 4.936 4.613 4.321 4.107 3.899 3.439 3.173 2.881 2.544 2.137 1.611 0.867 -0.54 -4 ,28340 ,KEBNE ,16678276,Thu Nov 25 01:34:37 CET,Thu Nov 25 02:58:52 CET,0.0 2.316 3.095 3.613 4.062 4.477 4.812 5.063 5.476 5.675 5.879 6.116 6.413 6.573 6.852 7.102 7.337 7.458 7.686 7.897 8.192 8.376 8.549 8.78 9.033 9.292 9.505 9.7 9.983 10.25 10.481 10.749 10.995 11.235 11.521 11.841 12.131 12.429 12.743 13.075 13.41 13.761 14.159 14.538 14.962 15.402 15.851 16.278 16.692 17.079 17.278 17.047 16.631 16.133 15.642 15.217 14.799 14.362 13.952 13.486 13.065 12.723 12.404 12.07 11.747 11.459 11.162 10.882 10.611 10.317 10.014 9.755 9.496 9.239 9.045 8.834 8.603 8.362 8.104 7.919 7.729 7.415 7.198 6.987 6.874 6.613 6.331 6.046 5.895 5.599 5.386 5.208 5.017 4.582 4.326 4.055 3.75 3.359 2.844 2.137 -0.283 -5 ,27121 ,KEBNE ,16678277,Thu Nov 25 01:34:34 CET,Thu Nov 25 02:57:35 CET,0.0 1.621 2.315 2.842 3.263 3.615 3.927 4.203 4.665 4.87 5.054 5.264 5.559 5.731 6.054 6.348 6.609 6.725 6.953 7.166 7.458 7.643 7.819 8.069 8.302 8.532 8.772 8.999 9.265 9.507 9.744 10.018 10.268 10.51 10.773 11.06 11.331 11.62 11.94 12.271 12.607 12.986 13.413 13.809 14.234 14.68 15.146 15.606 16.044 16.409 16.575 16.299 15.885 15.425 14.942 14.441 13.954 13.494 13.069 12.615 12.222 11.871 11.508 11.156 10.832 10.538 10.223 9.937 9.71 9.463 9.168 8.923 8.689 8.438 8.229 8.012 7.775 7.521 7.27 7.089 6.885 6.557 6.327 6.107 6.003 5.773 5.516 5.238 5.09 4.81 4.636 4.483 4.307 3.869 3.612 3.309 2.954 2.546 2.08 1.44 0.061 -6 ,12055 ,KEBNE ,16676004,Wed Nov 24 11:23:30 CET,Wed Nov 24 12:47:30 CET,0.0 1.849 2.526 3.007 3.417 3.778 4.089 4.371 4.847 5.054 5.257 5.508 5.809 5.953 6.222 6.515 6.768 6.899 7.193 7.462 7.826 8.037 8.224 8.485 8.734 8.98 9.206 9.421 9.694 9.948 10.189 10.478 10.742 10.982 11.27 11.58 11.87 12.188 12.501 12.804 13.115 13.476 13.888 14.272 14.723 15.178 15.651 16.138 16.595 16.974 17.109 16.876 16.429 15.905 15.414 14.944 14.501 14.076 13.709 13.299 12.895 12.521 12.18 11.857 11.549 11.267 10.982 10.72 10.475 10.218 9.934 9.677 9.392 9.108 8.903 8.683 8.448 8.218 7.962 7.759 7.561 7.28 7.083 6.864 6.745 6.506 6.228 5.95 5.802 5.503 5.254 5.055 4.851 4.379 4.105 3.826 3.501 3.093 2.626 2.014 0.328 -7 ,9848 ,KEBNE ,16678279,Thu Nov 25 01:34:36 CET,Thu Nov 25 03:00:54 CET,0.0 1.892 2.615 3.138 3.607 4.009 4.345 4.669 5.199 5.403 5.603 5.861 6.164 6.317 6.606 6.881 7.139 7.274 7.522 7.74 8.044 8.242 8.429 8.684 8.912 9.121 9.332 9.559 9.846 10.098 10.32 10.573 10.833 11.09 11.372 11.677 11.963 12.252 12.555 12.888 13.243 13.595 13.977 14.354 14.76 15.19 15.644 16.109 16.56 16.959 17.11 16.814 16.355 15.849 15.337 14.827 14.365 13.917 13.497 13.07 12.696 12.364 12.045 11.744 11.464 11.178 10.866 10.605 10.364 10.101 9.829 9.608 9.369 9.103 8.905 8.704 8.479 8.22 7.956 7.779 7.589 7.273 7.05 6.827 6.712 6.487 6.239 5.945 5.787 5.506 5.29 5.096 4.888 4.413 4.13 3.793 3.452 3.106 2.644 1.994 0.633 -8 ,27558 ,KEBNE ,16676006,Wed Nov 24 11:23:27 CET,Wed Nov 24 12:45:18 CET,0.0 2.644 3.444 4.052 4.518 4.898 5.206 5.459 5.903 6.104 6.295 6.551 6.87 7.045 7.354 7.607 7.841 7.954 8.172 8.375 8.664 8.861 9.037 9.276 9.513 9.742 9.965 10.179 10.449 10.691 10.911 11.189 11.462 11.702 11.979 12.311 12.61 12.921 13.242 13.57 13.912 14.285 14.685 15.059 15.479 15.912 16.352 16.78 17.198 17.558 17.677 17.356 16.894 16.393 15.887 15.406 14.948 14.516 14.131 13.722 13.37 13.045 12.691 12.361 12.079 11.813 11.532 11.27 11.015 10.761 10.505 10.274 10.038 9.781 9.586 9.392 9.183 8.963 8.73 8.559 8.365 8.049 7.821 7.575 7.46 7.255 7.008 6.664 6.474 6.161 5.89 5.68 5.479 5.038 4.802 4.534 4.206 3.821 3.366 2.735 0.911 -9 ,23872 ,KEBNE ,16676007,Wed Nov 24 11:23:26 CET,Wed Nov 24 12:45:40 CET,0.0 1.89 2.605 3.122 3.553 3.888 4.174 4.436 4.917 5.143 5.361 5.604 5.878 6.022 6.289 6.535 6.762 6.873 7.096 7.314 7.624 7.811 7.987 8.238 8.478 8.711 8.934 9.134 9.377 9.626 9.865 10.139 10.397 10.633 10.916 11.233 11.535 11.84 12.127 12.435 12.754 13.1 13.509 13.915 14.34 14.758 15.198 15.637 16.093 16.507 16.657 16.367 15.895 15.36 14.863 14.365 13.905 13.469 13.057 12.637 12.275 11.928 11.592 11.275 10.955 10.656 10.351 10.076 9.834 9.573 9.308 9.075 8.811 8.549 8.351 8.14 7.914 7.667 7.4 7.222 7.041 6.75 6.539 6.324 6.215 5.981 5.721 5.44 5.287 4.993 4.752 4.565 4.375 3.912 3.65 3.379 3.069 2.692 2.222 1.589 0.056 -10 ,23925 ,KEBNE ,16676008,Wed Nov 24 11:23:26 CET,Wed Nov 24 12:45:43 CET,0.0 2.33 3.14 3.693 4.15 4.522 4.848 5.126 5.56 5.753 5.944 6.189 6.51 6.692 6.993 7.271 7.525 7.641 7.855 8.058 8.362 8.563 8.747 8.988 9.225 9.445 9.655 9.852 10.083 10.318 10.561 10.873 11.161 11.44 11.769 12.076 12.35 12.66 12.974 13.265 13.576 13.937 14.353 14.748 15.135 15.536 15.973 16.445 16.912 17.291 17.41 17.109 16.663 16.174 15.644 15.097 14.625 14.216 13.841 13.445 13.095 12.755 12.404 12.07 11.768 11.472 11.155 10.881 10.636 10.37 10.096 9.871 9.618 9.339 9.125 8.905 8.678 8.459 8.241 8.074 7.893 7.617 7.408 7.185 7.073 6.822 6.555 6.274 6.124 5.837 5.614 5.428 5.227 4.748 4.453 4.119 3.771 3.402 2.938 2.276 0.678 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt deleted file mode 100644 index b46c3ccb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26529 ,KEBNE ,16676009,Wed Nov 24 11:23:26 CET,Wed Nov 24 12:47:13 CET,0.0 2.525 3.173 3.638 4.025 4.379 4.665 4.91 5.369 5.561 5.729 5.917 6.189 6.324 6.565 6.785 7.004 7.109 7.298 7.471 7.707 7.86 8.008 8.212 8.414 8.609 8.774 8.93 9.135 9.318 9.511 9.764 9.996 10.198 10.407 10.627 10.814 10.989 11.18 11.392 11.576 11.744 11.906 12.029 12.141 12.237 12.292 12.256 12.067 11.605 10.531 8.96 7.52 6.278 5.231 4.297 3.475 2.677 1.968 1.297 0.752 0.27 -0.207 -0.681 -1.123 -1.524 -1.941 -2.295 -2.617 -2.979 -3.351 -3.656 -3.983 -4.315 -4.565 -4.831 -5.106 -5.396 -5.696 -5.903 -6.132 -6.522 -6.779 -7.021 -7.159 -7.458 -7.756 -8.073 -8.251 -8.57 -8.793 -8.989 -9.215 -9.751 -10.042 -10.358 -10.691 -11.062 -11.535 -12.157 -13.591 -2 ,15182 ,KEBNE ,16676010,Wed Nov 24 11:24:27 CET,Wed Nov 24 12:47:25 CET,0.0 2.881 3.659 4.138 4.533 4.915 5.253 5.557 6.082 6.284 6.447 6.623 6.883 7.011 7.258 7.48 7.687 7.79 7.992 8.188 8.45 8.609 8.765 8.999 9.21 9.402 9.586 9.756 9.956 10.132 10.301 10.497 10.685 10.864 11.052 11.246 11.422 11.623 11.817 11.974 12.132 12.314 12.5 12.652 12.773 12.872 12.945 12.901 12.687 12.191 11.05 9.459 8.067 6.858 5.793 4.817 3.98 3.258 2.618 1.949 1.376 0.86 0.36 -0.106 -0.537 -0.939 -1.358 -1.757 -2.106 -2.435 -2.773 -3.058 -3.371 -3.698 -3.938 -4.197 -4.47 -4.763 -5.075 -5.287 -5.505 -5.871 -6.13 -6.38 -6.517 -6.81 -7.124 -7.478 -7.666 -8.004 -8.311 -8.531 -8.743 -9.274 -9.577 -9.901 -10.219 -10.554 -11.028 -11.728 -13.127 -3 ,30447 ,KEBNE ,16676011,Wed Nov 24 11:24:27 CET,Wed Nov 24 12:51:41 CET,0.0 2.835 3.521 3.984 4.32 4.609 4.89 5.145 5.553 5.733 5.913 6.109 6.374 6.503 6.758 6.997 7.204 7.304 7.511 7.708 7.955 8.098 8.244 8.448 8.645 8.84 9.009 9.165 9.362 9.539 9.698 9.877 10.06 10.244 10.432 10.625 10.8 10.994 11.206 11.401 11.582 11.763 11.945 12.1 12.237 12.365 12.438 12.385 12.169 11.632 10.443 8.811 7.375 6.144 5.072 4.108 3.259 2.48 1.818 1.173 0.615 0.108 -0.385 -0.837 -1.258 -1.657 -2.073 -2.444 -2.753 -3.08 -3.469 -3.788 -4.097 -4.419 -4.655 -4.9 -5.175 -5.492 -5.827 -6.071 -6.308 -6.643 -6.897 -7.159 -7.297 -7.58 -7.861 -8.176 -8.353 -8.669 -8.897 -9.111 -9.33 -9.813 -10.089 -10.385 -10.742 -11.164 -11.658 -12.373 -14.43 -4 ,28028 ,KEBNE ,16678286,Thu Nov 25 01:37:40 CET,Thu Nov 25 03:01:31 CET,0.0 3.078 3.763 4.242 4.612 4.914 5.186 5.442 5.896 6.093 6.266 6.444 6.711 6.843 7.089 7.323 7.542 7.637 7.824 8.015 8.27 8.421 8.563 8.757 8.945 9.134 9.308 9.461 9.654 9.84 10.017 10.22 10.407 10.592 10.79 10.989 11.16 11.344 11.527 11.711 11.911 12.114 12.325 12.498 12.629 12.713 12.781 12.738 12.464 11.905 10.787 9.237 7.838 6.584 5.505 4.557 3.72 2.96 2.261 1.576 1.01 0.469 -0.085 -0.58 -1.009 -1.413 -1.841 -2.211 -2.531 -2.876 -3.243 -3.562 -3.888 -4.202 -4.446 -4.707 -4.977 -5.274 -5.613 -5.853 -6.081 -6.417 -6.65 -6.894 -7.024 -7.295 -7.594 -7.915 -8.081 -8.409 -8.672 -8.902 -9.143 -9.619 -9.874 -10.169 -10.528 -10.979 -11.535 -12.26 -14.545 -5 ,27110 ,KEBNE ,16676013,Wed Nov 24 11:24:28 CET,Wed Nov 24 12:46:23 CET,0.0 3.417 4.166 4.632 4.983 5.291 5.553 5.776 6.152 6.317 6.478 6.639 6.9 7.028 7.284 7.524 7.731 7.839 8.052 8.241 8.501 8.657 8.808 9.034 9.242 9.417 9.58 9.743 9.944 10.131 10.305 10.515 10.721 10.905 11.096 11.304 11.509 11.74 11.952 12.138 12.325 12.528 12.718 12.851 12.971 13.06 13.098 13.051 12.826 12.274 11.147 9.581 8.181 6.929 5.866 4.908 4.044 3.291 2.643 1.987 1.435 0.927 0.426 -0.048 -0.481 -0.877 -1.283 -1.632 -1.941 -2.264 -2.612 -2.917 -3.23 -3.541 -3.781 -4.035 -4.303 -4.581 -4.885 -5.11 -5.339 -5.693 -5.944 -6.196 -6.33 -6.619 -6.923 -7.252 -7.424 -7.75 -8.019 -8.237 -8.461 -8.933 -9.204 -9.503 -9.813 -10.214 -10.773 -11.5 -13.542 -6 ,26802 ,KEBNE ,16676014,Wed Nov 24 11:24:28 CET,Wed Nov 24 12:47:48 CET,0.0 2.432 3.104 3.538 3.884 4.199 4.465 4.705 5.11 5.274 5.442 5.642 5.918 6.072 6.386 6.646 6.854 6.956 7.148 7.326 7.567 7.722 7.869 8.067 8.268 8.453 8.627 8.802 9.013 9.225 9.421 9.634 9.837 10.003 10.168 10.369 10.57 10.774 10.982 11.19 11.391 11.588 11.793 11.975 12.117 12.194 12.209 12.153 11.93 11.386 10.244 8.663 7.283 6.08 5.012 4.034 3.165 2.403 1.75 1.074 0.484 -0.034 -0.54 -1.023 -1.454 -1.844 -2.264 -2.634 -2.953 -3.298 -3.644 -3.929 -4.245 -4.598 -4.882 -5.179 -5.482 -5.774 -6.079 -6.303 -6.524 -6.853 -7.088 -7.351 -7.481 -7.746 -8.062 -8.393 -8.556 -8.868 -9.118 -9.336 -9.571 -10.084 -10.37 -10.676 -11.01 -11.416 -11.889 -12.511 -14.127 -7 ,16869 ,KEBNE ,16678289,Thu Nov 25 01:38:38 CET,Thu Nov 25 03:02:51 CET,0.0 2.701 3.493 4.032 4.402 4.688 4.955 5.199 5.632 5.824 5.989 6.166 6.441 6.576 6.841 7.079 7.288 7.392 7.616 7.839 8.117 8.27 8.418 8.627 8.816 8.988 9.15 9.305 9.509 9.695 9.846 10.023 10.195 10.387 10.635 10.868 11.042 11.248 11.469 11.664 11.852 12.041 12.25 12.426 12.562 12.656 12.689 12.635 12.431 11.915 10.791 9.218 7.858 6.651 5.631 4.71 3.868 3.112 2.428 1.737 1.173 0.685 0.229 -0.224 -0.674 -1.077 -1.496 -1.88 -2.208 -2.534 -2.892 -3.202 -3.531 -3.885 -4.152 -4.417 -4.694 -4.991 -5.306 -5.512 -5.726 -6.069 -6.304 -6.553 -6.68 -6.96 -7.252 -7.56 -7.737 -8.071 -8.344 -8.561 -8.791 -9.308 -9.595 -9.908 -10.269 -10.71 -11.213 -11.835 -13.283 -8 ,9493 ,KEBNE ,16676016,Wed Nov 24 11:24:30 CET,Wed Nov 24 12:46:30 CET,0.0 2.821 3.512 3.98 4.332 4.648 4.952 5.231 5.743 5.974 6.181 6.398 6.676 6.821 7.061 7.262 7.458 7.552 7.734 7.922 8.182 8.346 8.519 8.736 8.919 9.109 9.283 9.444 9.644 9.821 9.982 10.161 10.329 10.532 10.775 11.002 11.2 11.384 11.565 11.731 11.889 12.061 12.245 12.389 12.514 12.613 12.632 12.528 12.289 11.752 10.57 9.026 7.667 6.429 5.341 4.383 3.533 2.789 2.134 1.443 0.858 0.343 -0.144 -0.624 -1.065 -1.456 -1.9 -2.312 -2.655 -2.994 -3.352 -3.649 -3.966 -4.303 -4.56 -4.826 -5.098 -5.374 -5.675 -5.888 -6.113 -6.481 -6.728 -6.975 -7.104 -7.388 -7.718 -8.084 -8.271 -8.614 -8.923 -9.151 -9.371 -9.834 -10.085 -10.371 -10.714 -11.118 -11.606 -12.311 -14.232 -9 ,27398 ,KEBNE ,16676017,Wed Nov 24 11:24:28 CET,Wed Nov 24 12:47:00 CET,0.0 3.113 3.875 4.346 4.712 4.999 5.255 5.494 5.893 6.067 6.236 6.41 6.674 6.807 7.053 7.286 7.503 7.602 7.796 7.978 8.236 8.397 8.545 8.749 8.942 9.12 9.284 9.441 9.651 9.863 10.046 10.25 10.44 10.618 10.822 11.034 11.235 11.417 11.584 11.769 11.959 12.149 12.332 12.509 12.668 12.774 12.827 12.77 12.546 12.073 10.977 9.411 8.005 6.771 5.708 4.765 3.923 3.157 2.506 1.857 1.291 0.766 0.269 -0.209 -0.677 -1.1 -1.521 -1.904 -2.246 -2.586 -2.943 -3.24 -3.549 -3.872 -4.12 -4.377 -4.652 -4.937 -5.242 -5.454 -5.677 -6.035 -6.283 -6.546 -6.681 -6.967 -7.269 -7.588 -7.764 -8.089 -8.339 -8.546 -8.747 -9.168 -9.422 -9.727 -10.083 -10.501 -10.985 -11.627 -13.213 -10 ,25785 ,KEBNE ,16676018,Wed Nov 24 11:25:29 CET,Wed Nov 24 12:50:03 CET,0.0 1.787 2.4 2.79 3.12 3.428 3.702 3.95 4.412 4.609 4.792 5.02 5.306 5.444 5.692 5.902 6.104 6.212 6.427 6.618 6.876 7.03 7.18 7.423 7.627 7.8 7.959 8.098 8.28 8.453 8.631 8.857 9.056 9.23 9.411 9.615 9.812 10.0 10.186 10.382 10.556 10.726 10.909 11.067 11.198 11.286 11.315 11.219 10.976 10.457 9.33 7.814 6.464 5.196 4.082 3.126 2.299 1.552 0.907 0.266 -0.286 -0.772 -1.25 -1.72 -2.16 -2.575 -2.999 -3.374 -3.715 -4.051 -4.396 -4.697 -5.02 -5.354 -5.606 -5.884 -6.177 -6.466 -6.751 -6.95 -7.166 -7.511 -7.754 -8.012 -8.152 -8.444 -8.746 -9.097 -9.282 -9.61 -9.867 -10.077 -10.304 -10.821 -11.071 -11.311 -11.618 -12.026 -12.57 -13.37 -15.228 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt deleted file mode 100644 index 62d22f58..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30227 ,KEBNE ,16678293,Thu Nov 25 01:40:40 CET,Thu Nov 25 03:04:16 CET,0.0 1.011 1.38 1.652 1.892 2.127 2.329 2.506 2.832 2.971 3.098 3.186 3.418 3.537 3.759 3.965 4.168 4.264 4.442 4.591 4.796 4.933 5.061 5.246 5.42 5.586 5.727 5.837 5.986 6.141 6.286 6.457 6.598 6.745 6.926 7.078 7.18 7.269 7.364 7.47 7.543 7.592 7.638 7.67 7.63 7.467 7.184 6.752 6.014 4.783 2.66 0.034 -2.166 -3.987 -5.514 -6.899 -8.139 -9.294 -10.225 -11.079 -11.804 -12.448 -13.068 -13.65 -14.214 -14.764 -15.344 -15.868 -16.326 -16.803 -17.278 -17.661 -18.051 -18.446 -18.774 -19.114 -19.445 -19.8 -20.203 -20.495 -20.803 -21.304 -21.675 -22.039 -22.213 -22.591 -22.985 -23.395 -23.607 -23.974 -24.246 -24.483 -24.739 -25.325 -25.691 -26.078 -26.47 -26.921 -27.503 -28.397 -30.716 -2 ,550 ,KEBNE ,16678294,Thu Nov 25 01:40:40 CET,Thu Nov 25 03:04:09 CET,0.0 1.362 1.807 2.105 2.374 2.642 2.866 3.044 3.324 3.456 3.585 3.695 3.931 4.032 4.218 4.398 4.562 4.633 4.776 4.909 5.097 5.232 5.367 5.547 5.706 5.853 5.978 6.092 6.244 6.379 6.523 6.691 6.834 6.96 7.08 7.194 7.288 7.41 7.536 7.627 7.708 7.784 7.842 7.824 7.747 7.623 7.314 6.791 6.036 4.8 2.562 -0.228 -2.431 -4.205 -5.738 -7.176 -8.393 -9.459 -10.38 -11.264 -12.037 -12.764 -13.458 -14.097 -14.695 -15.263 -15.828 -16.32 -16.753 -17.186 -17.648 -18.052 -18.485 -18.925 -19.275 -19.635 -20.004 -20.409 -20.843 -21.142 -21.436 -21.9 -22.237 -22.577 -22.754 -23.119 -23.482 -23.887 -24.109 -24.496 -24.829 -25.092 -25.385 -26.052 -26.405 -26.789 -27.217 -27.684 -28.241 -29.078 -31.28 -3 ,14785 ,KEBNE ,16678295,Thu Nov 25 01:40:40 CET,Thu Nov 25 03:03:58 CET,0.0 0.713 1.082 1.395 1.64 1.859 2.071 2.26 2.594 2.745 2.876 2.963 3.199 3.313 3.507 3.695 3.89 3.976 4.134 4.29 4.517 4.662 4.802 5.013 5.207 5.372 5.508 5.625 5.785 5.931 6.063 6.231 6.381 6.518 6.665 6.819 6.97 7.129 7.279 7.395 7.486 7.534 7.539 7.533 7.467 7.321 7.074 6.625 5.851 4.643 2.53 -0.158 -2.375 -4.195 -5.8 -7.203 -8.366 -9.423 -10.323 -11.205 -11.99 -12.688 -13.319 -13.904 -14.441 -14.981 -15.583 -16.102 -16.538 -16.982 -17.42 -17.781 -18.174 -18.61 -18.95 -19.296 -19.655 -20.013 -20.407 -20.683 -20.965 -21.424 -21.756 -22.125 -22.317 -22.702 -23.105 -23.522 -23.734 -24.105 -24.415 -24.695 -25.008 -25.662 -26.014 -26.404 -26.826 -27.328 -27.994 -28.939 -31.068 -4 ,20114 ,KEBNE ,16678296,Thu Nov 25 01:40:40 CET,Thu Nov 25 03:04:36 CET,0.0 0.819 1.186 1.474 1.72 1.949 2.141 2.315 2.644 2.792 2.913 2.992 3.231 3.355 3.591 3.797 3.987 4.075 4.237 4.383 4.568 4.69 4.806 4.962 5.118 5.261 5.387 5.511 5.676 5.818 5.961 6.148 6.323 6.477 6.645 6.809 6.916 7.019 7.11 7.184 7.27 7.356 7.393 7.399 7.321 7.148 6.893 6.467 5.77 4.648 2.548 -0.143 -2.354 -4.213 -5.798 -7.167 -8.344 -9.405 -10.363 -11.324 -12.057 -12.728 -13.42 -14.047 -14.622 -15.141 -15.684 -16.191 -16.657 -17.143 -17.62 -18.01 -18.424 -18.851 -19.202 -19.584 -19.935 -20.293 -20.69 -20.974 -21.258 -21.701 -22.022 -22.349 -22.528 -22.926 -23.321 -23.732 -23.955 -24.341 -24.66 -24.916 -25.188 -25.746 -26.055 -26.422 -26.845 -27.334 -27.916 -28.712 -31.023 -5 ,4696 ,KEBNE ,16678297,Thu Nov 25 01:41:41 CET,Thu Nov 25 03:04:58 CET,0.0 0.822 1.167 1.423 1.65 1.862 2.049 2.213 2.499 2.628 2.752 2.874 3.123 3.232 3.406 3.582 3.749 3.826 3.98 4.134 4.361 4.521 4.658 4.821 4.989 5.131 5.26 5.389 5.532 5.664 5.801 5.965 6.135 6.301 6.469 6.641 6.798 6.938 7.037 7.144 7.231 7.263 7.334 7.364 7.3 7.174 6.933 6.548 5.891 4.65 2.4 -0.265 -2.45 -4.3 -5.902 -7.281 -8.427 -9.442 -10.295 -11.164 -11.917 -12.576 -13.205 -13.796 -14.347 -14.858 -15.392 -15.86 -16.259 -16.701 -17.209 -17.611 -18.001 -18.434 -18.765 -19.104 -19.476 -19.855 -20.242 -20.526 -20.836 -21.317 -21.636 -21.979 -22.156 -22.507 -22.892 -23.3 -23.517 -23.897 -24.224 -24.485 -24.767 -25.386 -25.727 -26.098 -26.518 -27.006 -27.549 -28.295 -30.393 -6 ,25881 ,KEBNE ,16678298,Thu Nov 25 01:41:42 CET,Thu Nov 25 03:05:58 CET,0.0 0.795 1.143 1.45 1.725 1.97 2.181 2.359 2.682 2.825 2.945 3.022 3.27 3.396 3.647 3.869 4.069 4.168 4.359 4.541 4.786 4.927 5.063 5.266 5.428 5.568 5.707 5.824 5.979 6.135 6.267 6.434 6.592 6.718 6.822 6.939 7.075 7.189 7.295 7.396 7.471 7.546 7.597 7.581 7.516 7.364 7.085 6.696 5.981 4.721 2.587 -0.047 -2.208 -4.023 -5.54 -6.872 -8.073 -9.179 -10.149 -11.113 -11.885 -12.562 -13.245 -13.885 -14.496 -15.082 -15.657 -16.146 -16.583 -17.048 -17.505 -17.856 -18.242 -18.691 -19.058 -19.43 -19.797 -20.186 -20.584 -20.853 -21.132 -21.594 -21.923 -22.236 -22.389 -22.727 -23.106 -23.511 -23.729 -24.113 -24.458 -24.729 -25.021 -25.668 -26.008 -26.386 -26.815 -27.312 -27.907 -28.68 -30.948 -7 ,17084 ,KEBNE ,16678299,Thu Nov 25 01:41:41 CET,Thu Nov 25 03:05:45 CET,0.0 0.922 1.323 1.605 1.843 2.057 2.259 2.449 2.76 2.891 3.015 3.127 3.371 3.477 3.66 3.836 4.018 4.105 4.256 4.388 4.571 4.694 4.827 5.031 5.211 5.361 5.484 5.602 5.781 5.932 6.054 6.2 6.335 6.467 6.616 6.778 6.903 6.999 7.091 7.185 7.277 7.345 7.375 7.366 7.309 7.155 6.91 6.487 5.742 4.505 2.269 -0.5 -2.666 -4.402 -5.874 -7.16 -8.32 -9.402 -10.311 -11.185 -11.903 -12.533 -13.161 -13.754 -14.304 -14.828 -15.375 -15.889 -16.332 -16.763 -17.24 -17.645 -18.08 -18.52 -18.854 -19.21 -19.564 -19.927 -20.311 -20.576 -20.857 -21.29 -21.582 -21.92 -22.101 -22.473 -22.859 -23.283 -23.516 -23.914 -24.274 -24.54 -24.815 -25.408 -25.724 -26.069 -26.466 -26.911 -27.448 -28.215 -30.107 -8 ,7480 ,KEBNE ,16678300,Thu Nov 25 01:41:42 CET,Thu Nov 25 03:05:45 CET,0.0 1.37 1.849 2.233 2.542 2.801 3.006 3.157 3.452 3.594 3.717 3.819 4.056 4.161 4.362 4.546 4.701 4.774 4.914 5.04 5.238 5.368 5.487 5.65 5.792 5.925 6.06 6.19 6.353 6.494 6.623 6.777 6.926 7.068 7.201 7.335 7.447 7.551 7.648 7.738 7.835 7.923 7.965 7.964 7.916 7.76 7.465 6.98 6.215 5.008 2.857 0.245 -1.907 -3.805 -5.428 -6.855 -8.083 -9.229 -10.204 -11.137 -11.939 -12.633 -13.286 -13.906 -14.47 -14.969 -15.532 -16.057 -16.491 -16.94 -17.428 -17.817 -18.209 -18.633 -18.96 -19.301 -19.664 -20.044 -20.443 -20.732 -21.046 -21.555 -21.893 -22.23 -22.405 -22.767 -23.149 -23.584 -23.829 -24.224 -24.576 -24.852 -25.142 -25.758 -26.106 -26.509 -26.968 -27.477 -28.051 -28.801 -30.986 -9 ,16830 ,KEBNE ,16678301,Thu Nov 25 01:42:42 CET,Thu Nov 25 03:07:10 CET,0.0 0.88 1.236 1.51 1.732 1.935 2.12 2.296 2.634 2.779 2.913 3.052 3.296 3.396 3.584 3.778 3.949 4.026 4.187 4.327 4.501 4.604 4.711 4.884 5.069 5.228 5.367 5.514 5.696 5.847 5.999 6.17 6.302 6.438 6.597 6.752 6.889 7.04 7.176 7.285 7.377 7.431 7.405 7.389 7.363 7.193 6.892 6.445 5.687 4.414 2.177 -0.528 -2.734 -4.617 -6.246 -7.679 -8.853 -9.85 -10.747 -11.681 -12.479 -13.162 -13.803 -14.411 -14.97 -15.484 -16.013 -16.537 -17.01 -17.457 -17.92 -18.323 -18.756 -19.23 -19.58 -19.926 -20.316 -20.737 -21.149 -21.404 -21.668 -22.117 -22.436 -22.773 -22.951 -23.329 -23.707 -24.126 -24.351 -24.723 -25.058 -25.34 -25.625 -26.26 -26.639 -27.046 -27.458 -27.928 -28.496 -29.191 -30.897 -10 ,13671 ,KEBNE ,16678302,Thu Nov 25 01:42:43 CET,Thu Nov 25 03:06:26 CET,0.0 0.732 1.1 1.412 1.65 1.839 2.012 2.159 2.44 2.565 2.678 2.768 2.996 3.095 3.264 3.431 3.602 3.68 3.827 3.967 4.141 4.244 4.355 4.532 4.705 4.864 4.991 5.112 5.244 5.356 5.48 5.601 5.721 5.843 5.984 6.128 6.235 6.341 6.426 6.504 6.601 6.7 6.733 6.654 6.496 6.319 6.064 5.595 4.822 3.525 1.299 -1.237 -3.286 -5.078 -6.627 -7.984 -9.167 -10.225 -11.112 -12.003 -12.816 -13.527 -14.159 -14.762 -15.333 -15.858 -16.427 -16.954 -17.395 -17.839 -18.304 -18.679 -19.066 -19.487 -19.798 -20.158 -20.585 -21.002 -21.402 -21.674 -21.977 -22.482 -22.846 -23.23 -23.423 -23.785 -24.16 -24.562 -24.782 -25.171 -25.489 -25.75 -26.031 -26.641 -26.983 -27.373 -27.798 -28.244 -28.761 -29.475 -31.369 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt deleted file mode 100644 index 5f46572b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32301 ,KEBNE ,16676039,Wed Nov 24 11:27:32 CET,Wed Nov 24 12:49:32 CET,0.0 1.824 2.527 3.061 3.487 3.83 4.157 4.454 4.931 5.15 5.385 5.699 6.063 6.259 6.568 6.855 7.138 7.275 7.538 7.774 8.113 8.328 8.532 8.824 9.109 9.38 9.642 9.9 10.225 10.543 10.839 11.187 11.527 11.846 12.208 12.629 13.053 13.514 13.96 14.442 14.982 15.554 16.203 16.857 17.606 18.449 19.419 20.454 21.636 23.008 24.57 25.671 26.128 26.279 26.314 26.285 26.172 25.966 25.768 25.567 25.375 25.183 24.965 24.751 24.557 24.368 24.137 23.927 23.737 23.513 23.294 23.13 22.95 22.747 22.582 22.409 22.219 22.011 21.807 21.67 21.522 21.267 21.077 20.879 20.768 20.541 20.303 20.055 19.926 19.642 19.438 19.264 19.062 18.652 18.432 18.17 17.872 17.515 17.06 16.446 14.104 -2 ,9774 ,KEBNE ,16676040,Wed Nov 24 11:27:32 CET,Wed Nov 24 12:49:20 CET,0.0 1.802 2.48 2.989 3.4 3.749 4.104 4.417 4.87 5.072 5.278 5.542 5.865 6.039 6.398 6.699 6.963 7.091 7.343 7.594 7.943 8.172 8.393 8.697 8.984 9.259 9.525 9.776 10.097 10.412 10.713 11.059 11.388 11.706 12.063 12.457 12.835 13.247 13.71 14.207 14.711 15.285 15.969 16.609 17.332 18.162 19.087 20.073 21.219 22.547 24.055 25.088 25.549 25.729 25.733 25.644 25.505 25.338 25.15 24.943 24.752 24.552 24.346 24.147 23.962 23.772 23.543 23.325 23.144 22.947 22.735 22.561 22.369 22.166 22.013 21.842 21.644 21.433 21.212 21.062 20.908 20.662 20.482 20.286 20.184 19.971 19.745 19.501 19.371 19.087 18.848 18.63 18.382 17.871 17.613 17.331 17.018 16.669 16.235 15.646 13.269 -3 ,27270 ,KEBNE ,16678305,Thu Nov 25 01:43:47 CET,Thu Nov 25 03:13:39 CET,0.0 1.978 2.698 3.225 3.627 3.962 4.267 4.571 5.123 5.367 5.583 5.85 6.173 6.347 6.661 6.947 7.225 7.361 7.627 7.88 8.211 8.423 8.644 8.964 9.262 9.526 9.778 10.042 10.389 10.709 11.015 11.398 11.766 12.127 12.559 13.029 13.446 13.883 14.346 14.84 15.348 15.908 16.569 17.228 17.981 18.799 19.725 20.776 21.973 23.279 24.79 25.92 26.416 26.608 26.649 26.603 26.496 26.358 26.213 26.028 25.821 25.628 25.423 25.197 24.96 24.708 24.428 24.203 24.033 23.855 23.655 23.478 23.284 23.073 22.897 22.713 22.533 22.343 22.135 21.99 21.843 21.589 21.413 21.233 21.133 20.918 20.675 20.42 20.296 20.031 19.872 19.711 19.517 19.053 18.8 18.535 18.231 17.864 17.386 16.7 13.919 -4 ,19473 ,KEBNE ,16678306,Thu Nov 25 01:43:50 CET,Thu Nov 25 03:10:21 CET,0.0 1.63 2.278 2.806 3.258 3.614 3.929 4.22 4.716 4.947 5.15 5.39 5.723 5.917 6.265 6.565 6.857 6.993 7.257 7.517 7.883 8.106 8.332 8.658 8.951 9.213 9.472 9.732 10.052 10.346 10.64 11.006 11.351 11.692 12.083 12.507 12.915 13.341 13.779 14.273 14.798 15.358 16.005 16.649 17.385 18.217 19.153 20.196 21.396 22.779 24.33 25.405 25.862 26.001 26.024 25.963 25.826 25.669 25.495 25.273 25.082 24.918 24.742 24.538 24.337 24.146 23.934 23.74 23.568 23.381 23.172 22.997 22.816 22.618 22.447 22.27 22.093 21.903 21.703 21.568 21.416 21.159 20.975 20.788 20.693 20.488 20.244 19.945 19.791 19.517 19.341 19.168 18.975 18.557 18.332 18.073 17.807 17.495 17.078 16.453 14.279 -5 ,16463 ,KEBNE ,16676043,Wed Nov 24 11:27:32 CET,Wed Nov 24 12:49:51 CET,0.0 1.994 2.728 3.31 3.757 4.148 4.503 4.812 5.356 5.615 5.867 6.19 6.537 6.716 7.034 7.331 7.61 7.752 8.058 8.325 8.69 8.928 9.142 9.446 9.75 10.045 10.305 10.541 10.852 11.169 11.489 11.868 12.219 12.542 12.903 13.301 13.683 14.1 14.56 15.07 15.604 16.173 16.807 17.447 18.181 19.013 19.983 21.012 22.184 23.539 25.047 26.072 26.521 26.719 26.745 26.657 26.495 26.306 26.143 25.955 25.754 25.569 25.381 25.178 24.977 24.783 24.573 24.366 24.186 23.992 23.775 23.575 23.366 23.164 22.999 22.825 22.647 22.439 22.211 22.057 21.896 21.65 21.478 21.292 21.192 20.971 20.731 20.496 20.374 20.104 19.908 19.727 19.533 19.087 18.83 18.558 18.256 17.866 17.426 16.867 15.031 -6 ,29659 ,KEBNE ,16676044,Wed Nov 24 11:27:32 CET,Wed Nov 24 12:49:21 CET,0.0 2.282 2.992 3.492 3.91 4.272 4.608 4.903 5.392 5.598 5.787 6.02 6.329 6.486 6.809 7.106 7.38 7.512 7.768 8.016 8.377 8.6 8.824 9.157 9.444 9.728 10.015 10.276 10.593 10.884 11.176 11.543 11.896 12.244 12.637 13.052 13.451 13.888 14.354 14.835 15.336 15.917 16.599 17.258 17.992 18.798 19.729 20.784 21.989 23.344 24.788 25.778 26.264 26.506 26.561 26.509 26.395 26.234 26.054 25.846 25.654 25.454 25.244 25.031 24.816 24.619 24.422 24.238 24.068 23.877 23.674 23.492 23.29 23.08 22.915 22.75 22.579 22.39 22.194 22.047 21.888 21.642 21.458 21.264 21.164 20.931 20.652 20.34 20.168 19.851 19.587 19.386 19.206 18.827 18.585 18.308 18.005 17.64 17.153 16.477 14.284 -7 ,19159 ,KEBNE ,16676045,Wed Nov 24 11:27:31 CET,Wed Nov 24 12:52:14 CET,0.0 2.475 3.36 3.978 4.444 4.81 5.105 5.384 5.935 6.17 6.38 6.633 6.958 7.126 7.442 7.74 8.014 8.144 8.391 8.639 9.013 9.24 9.458 9.767 10.053 10.32 10.568 10.815 11.12 11.415 11.717 12.068 12.401 12.735 13.12 13.532 13.918 14.347 14.799 15.266 15.764 16.338 16.983 17.612 18.359 19.187 20.125 21.128 22.294 23.658 25.157 26.2 26.645 26.802 26.86 26.827 26.694 26.513 26.338 26.137 25.933 25.742 25.544 25.33 25.116 24.921 24.708 24.504 24.321 24.125 23.909 23.724 23.527 23.338 23.193 23.025 22.845 22.659 22.433 22.253 22.058 21.749 21.555 21.371 21.27 21.053 20.857 20.614 20.458 20.166 20.005 19.838 19.664 19.331 19.11 18.853 18.568 18.219 17.784 17.165 15.227 -8 ,22320 ,KEBNE ,16676046,Wed Nov 24 11:27:31 CET,Wed Nov 24 12:49:08 CET,0.0 1.292 1.932 2.439 2.846 3.217 3.547 3.841 4.32 4.527 4.732 4.979 5.285 5.446 5.769 6.066 6.34 6.472 6.731 6.982 7.329 7.547 7.767 8.078 8.366 8.644 8.924 9.203 9.562 9.928 10.264 10.637 10.983 11.303 11.683 12.11 12.525 12.961 13.411 13.909 14.438 15.01 15.667 16.337 17.097 17.913 18.837 19.88 21.063 22.451 24.07 25.195 25.686 25.875 25.89 25.799 25.652 25.476 25.314 25.107 24.908 24.724 24.516 24.296 24.089 23.879 23.64 23.423 23.231 23.028 22.821 22.659 22.477 22.266 22.095 21.925 21.757 21.566 21.35 21.196 21.034 20.785 20.611 20.427 20.324 20.094 19.86 19.597 19.454 19.157 18.905 18.69 18.45 17.925 17.641 17.333 16.953 16.485 15.887 15.09 12.25 -9 ,29227 ,KEBNE ,16676047,Wed Nov 24 11:27:32 CET,Wed Nov 24 12:49:41 CET,0.0 1.777 2.521 3.084 3.565 4.018 4.394 4.711 5.301 5.542 5.75 6.018 6.348 6.527 6.86 7.175 7.453 7.579 7.839 8.102 8.473 8.707 8.925 9.23 9.521 9.809 10.083 10.339 10.664 10.97 11.264 11.612 11.947 12.265 12.63 13.035 13.418 13.857 14.317 14.782 15.274 15.842 16.516 17.196 17.97 18.791 19.722 20.782 21.982 23.297 24.771 25.822 26.242 26.417 26.47 26.386 26.237 26.078 25.906 25.689 25.464 25.242 25.036 24.848 24.661 24.465 24.238 24.035 23.861 23.682 23.493 23.326 23.14 22.942 22.791 22.623 22.446 22.275 22.079 21.928 21.777 21.532 21.357 21.168 21.069 20.869 20.627 20.359 20.226 19.956 19.769 19.612 19.442 19.052 18.825 18.562 18.242 17.877 17.42 16.768 14.911 -10 ,11862 ,KEBNE ,16676048,Wed Nov 24 11:27:32 CET,Wed Nov 24 12:49:27 CET,0.0 2.349 3.057 3.549 3.972 4.372 4.756 5.101 5.66 5.902 6.125 6.361 6.69 6.871 7.184 7.475 7.745 7.873 8.133 8.39 8.722 8.932 9.134 9.429 9.724 10.006 10.267 10.523 10.857 11.172 11.481 11.843 12.174 12.482 12.853 13.268 13.648 14.059 14.519 15.019 15.533 16.099 16.749 17.391 18.146 18.989 19.95 21.022 22.267 23.693 25.195 26.245 26.72 26.86 26.841 26.742 26.619 26.457 26.288 26.115 25.927 25.717 25.48 25.263 25.067 24.866 24.655 24.473 24.31 24.108 23.882 23.703 23.525 23.334 23.181 23.017 22.83 22.624 22.398 22.243 22.089 21.835 21.643 21.45 21.351 21.145 20.929 20.683 20.551 20.28 20.102 19.943 19.772 19.406 19.186 18.902 18.583 18.219 17.761 17.067 14.476 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt deleted file mode 100644 index b92b70bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30040 ,KEBNE ,17024022,Wed Dec 22 09:18:57 CET,Wed Dec 22 10:40:54 CET,0.0 0.874 1.248 1.572 1.84 2.065 2.269 2.454 2.82 2.985 3.139 3.257 3.529 3.662 3.909 4.137 4.348 4.45 4.648 4.836 5.102 5.26 5.408 5.632 5.839 6.028 6.228 6.432 6.679 6.905 7.128 7.425 7.717 7.954 8.199 8.46 8.702 8.962 9.243 9.527 9.805 10.103 10.4 10.675 10.973 11.24 11.441 11.562 11.527 11.217 10.352 9.044 7.762 6.65 5.691 4.715 3.876 3.136 2.485 1.823 1.223 0.698 0.198 -0.289 -0.733 -1.146 -1.615 -2.009 -2.337 -2.678 -3.028 -3.361 -3.714 -4.053 -4.334 -4.642 -4.964 -5.313 -5.669 -5.918 -6.189 -6.597 -6.895 -7.205 -7.36 -7.683 -8.029 -8.427 -8.638 -8.997 -9.3 -9.567 -9.835 -10.445 -10.807 -11.185 -11.617 -12.129 -12.776 -13.691 -17.278 -2 ,2163 ,KEBNE ,17024023,Wed Dec 22 09:19:01 CET,Wed Dec 22 10:38:24 CET,0.0 1.339 1.803 2.148 2.444 2.709 2.928 3.105 3.432 3.591 3.74 3.852 4.12 4.24 4.455 4.641 4.815 4.896 5.057 5.216 5.442 5.581 5.711 5.915 6.103 6.275 6.448 6.614 6.826 7.024 7.2 7.425 7.656 7.859 8.086 8.333 8.56 8.812 9.063 9.324 9.604 9.878 10.147 10.429 10.728 10.976 11.177 11.323 11.406 11.236 10.465 9.18 7.997 6.956 6.004 5.129 4.348 3.626 2.97 2.316 1.752 1.232 0.751 0.281 -0.167 -0.568 -1.026 -1.443 -1.769 -2.095 -2.469 -2.813 -3.193 -3.581 -3.862 -4.166 -4.472 -4.795 -5.148 -5.39 -5.652 -6.102 -6.411 -6.723 -6.884 -7.211 -7.585 -7.979 -8.177 -8.55 -8.876 -9.138 -9.42 -10.026 -10.373 -10.75 -11.175 -11.717 -12.358 -13.141 -16.172 -3 ,14985 ,KEBNE ,17024024,Wed Dec 22 09:18:57 CET,Wed Dec 22 10:40:46 CET,0.0 1.222 1.657 1.996 2.298 2.544 2.757 2.952 3.28 3.424 3.57 3.697 3.971 4.101 4.342 4.563 4.764 4.858 5.045 5.232 5.498 5.646 5.786 6.003 6.216 6.433 6.631 6.822 7.094 7.349 7.578 7.817 8.055 8.286 8.536 8.825 9.084 9.359 9.628 9.915 10.223 10.551 10.872 11.14 11.458 11.717 11.885 12.024 12.081 11.903 11.2 9.924 8.631 7.455 6.454 5.541 4.722 3.955 3.258 2.577 2.011 1.475 0.949 0.461 0.016 -0.4 -0.86 -1.262 -1.601 -1.969 -2.346 -2.65 -2.987 -3.346 -3.624 -3.897 -4.186 -4.514 -4.889 -5.154 -5.427 -5.853 -6.138 -6.441 -6.603 -6.948 -7.318 -7.731 -7.959 -8.354 -8.686 -8.935 -9.183 -9.763 -10.113 -10.502 -10.925 -11.474 -12.147 -13.07 -16.7 -4 ,4094 ,KEBNE ,17024025,Wed Dec 22 09:18:57 CET,Wed Dec 22 10:40:48 CET,0.0 0.891 1.282 1.587 1.85 2.067 2.271 2.467 2.809 2.965 3.114 3.254 3.536 3.675 3.943 4.167 4.374 4.478 4.677 4.864 5.131 5.326 5.505 5.723 5.948 6.171 6.388 6.604 6.862 7.085 7.304 7.566 7.801 8.019 8.241 8.492 8.757 9.036 9.305 9.6 9.891 10.184 10.511 10.794 11.083 11.378 11.632 11.77 11.749 11.519 10.716 9.415 8.195 7.058 6.047 5.072 4.169 3.424 2.816 2.158 1.581 1.07 0.576 0.103 -0.408 -0.862 -1.311 -1.718 -2.041 -2.421 -2.861 -3.22 -3.593 -3.955 -4.234 -4.558 -4.899 -5.242 -5.613 -5.886 -6.153 -6.534 -6.808 -7.1 -7.266 -7.626 -7.98 -8.359 -8.567 -8.948 -9.275 -9.531 -9.808 -10.383 -10.706 -11.076 -11.517 -12.045 -12.648 -13.507 -16.091 -5 ,21603 ,KEBNE ,17024026,Wed Dec 22 09:18:57 CET,Wed Dec 22 10:40:41 CET,0.0 1.101 1.526 1.85 2.144 2.409 2.657 2.882 3.259 3.422 3.569 3.743 4.047 4.176 4.419 4.631 4.836 4.943 5.127 5.31 5.588 5.761 5.916 6.149 6.397 6.622 6.83 7.03 7.265 7.48 7.685 7.936 8.18 8.401 8.653 8.942 9.207 9.465 9.731 10.008 10.305 10.627 10.956 11.253 11.563 11.873 12.068 12.182 12.279 12.154 11.401 10.15 8.913 7.736 6.725 5.748 4.841 4.042 3.337 2.65 2.083 1.588 1.118 0.645 0.189 -0.243 -0.711 -1.144 -1.546 -1.944 -2.322 -2.646 -3.007 -3.405 -3.698 -4.034 -4.4 -4.739 -5.085 -5.32 -5.565 -5.955 -6.247 -6.583 -6.763 -7.124 -7.485 -7.857 -8.06 -8.434 -8.746 -8.992 -9.254 -9.857 -10.206 -10.609 -11.083 -11.602 -12.209 -13.04 -16.258 -6 ,20796 ,KEBNE ,17024027,Wed Dec 22 09:18:57 CET,Wed Dec 22 10:40:51 CET,0.0 1.476 1.974 2.287 2.561 2.839 3.088 3.291 3.624 3.773 3.928 4.071 4.339 4.451 4.682 4.905 5.124 5.232 5.435 5.63 5.893 6.054 6.207 6.434 6.653 6.859 7.044 7.212 7.456 7.69 7.884 8.117 8.36 8.586 8.825 9.087 9.323 9.564 9.842 10.094 10.342 10.619 10.915 11.159 11.385 11.637 11.846 11.937 11.894 11.603 10.805 9.53 8.319 7.277 6.351 5.469 4.675 3.934 3.289 2.631 2.049 1.534 1.014 0.524 0.089 -0.314 -0.751 -1.193 -1.568 -1.932 -2.346 -2.705 -3.063 -3.417 -3.695 -3.969 -4.267 -4.602 -4.95 -5.204 -5.456 -5.861 -6.163 -6.47 -6.629 -6.977 -7.371 -7.79 -7.995 -8.364 -8.679 -8.931 -9.197 -9.821 -10.179 -10.56 -11.003 -11.506 -12.182 -13.167 -16.084 -7 ,27733 ,KEBNE ,17024028,Wed Dec 22 09:18:57 CET,Wed Dec 22 10:40:41 CET,0.0 1.356 1.842 2.18 2.44 2.673 2.894 3.112 3.528 3.709 3.862 4.002 4.272 4.4 4.651 4.884 5.116 5.225 5.411 5.579 5.832 5.994 6.143 6.364 6.59 6.795 6.976 7.165 7.394 7.602 7.798 8.023 8.224 8.414 8.638 8.858 9.072 9.306 9.551 9.815 10.084 10.361 10.682 10.987 11.247 11.454 11.664 11.844 11.962 11.881 11.156 9.822 8.593 7.526 6.49 5.562 4.733 3.936 3.255 2.59 2.004 1.449 0.913 0.387 -0.113 -0.57 -1.072 -1.508 -1.852 -2.21 -2.6 -2.922 -3.241 -3.585 -3.851 -4.158 -4.49 -4.814 -5.197 -5.47 -5.721 -6.094 -6.376 -6.685 -6.843 -7.179 -7.536 -7.918 -8.137 -8.524 -8.86 -9.132 -9.413 -10.007 -10.351 -10.768 -11.233 -11.784 -12.431 -13.251 -16.547 -8 ,26295 ,KEBNE ,17024029,Wed Dec 22 09:19:59 CET,Wed Dec 22 10:41:57 CET,0.0 1.115 1.512 1.846 2.119 2.349 2.562 2.763 3.121 3.278 3.415 3.531 3.798 3.919 4.156 4.376 4.58 4.676 4.874 5.072 5.351 5.528 5.684 5.892 6.096 6.283 6.453 6.615 6.828 7.045 7.251 7.507 7.784 8.02 8.24 8.499 8.746 9.0 9.262 9.527 9.806 10.093 10.39 10.679 10.965 11.175 11.346 11.488 11.553 11.414 10.762 9.534 8.319 7.21 6.153 5.164 4.295 3.501 2.829 2.098 1.394 0.799 0.226 -0.339 -0.856 -1.329 -1.789 -2.181 -2.517 -2.866 -3.223 -3.53 -3.88 -4.248 -4.518 -4.793 -5.101 -5.432 -5.782 -6.043 -6.322 -6.759 -7.07 -7.411 -7.584 -7.921 -8.293 -8.688 -8.897 -9.266 -9.569 -9.817 -10.102 -10.713 -11.032 -11.396 -11.823 -12.324 -12.882 -13.69 -16.978 -9 ,22808 ,KEBNE ,17024030,Wed Dec 22 09:19:59 CET,Wed Dec 22 10:41:53 CET,0.0 0.878 1.281 1.608 1.865 2.098 2.301 2.484 2.813 2.966 3.118 3.281 3.562 3.694 3.947 4.163 4.365 4.47 4.665 4.841 5.09 5.242 5.386 5.597 5.817 6.026 6.21 6.39 6.608 6.83 7.054 7.293 7.525 7.757 8.013 8.28 8.546 8.818 9.078 9.365 9.623 9.874 10.187 10.486 10.776 11.04 11.317 11.51 11.508 11.221 10.441 9.089 7.813 6.709 5.709 4.774 3.941 3.196 2.491 1.751 1.161 0.641 0.14 -0.339 -0.777 -1.164 -1.588 -1.973 -2.341 -2.726 -3.101 -3.41 -3.73 -4.085 -4.395 -4.731 -5.056 -5.39 -5.744 -5.984 -6.238 -6.661 -6.954 -7.237 -7.387 -7.72 -8.086 -8.475 -8.656 -9.008 -9.336 -9.592 -9.863 -10.49 -10.833 -11.216 -11.641 -12.133 -12.788 -13.721 -17.615 -10 ,28382 ,KEBNE ,17024031,Wed Dec 22 09:19:59 CET,Wed Dec 22 10:41:57 CET,0.0 1.116 1.508 1.829 2.102 2.331 2.536 2.724 3.075 3.237 3.393 3.547 3.825 3.952 4.185 4.408 4.615 4.709 4.902 5.088 5.336 5.508 5.686 5.927 6.152 6.357 6.558 6.756 6.99 7.209 7.418 7.663 7.885 8.09 8.34 8.62 8.856 9.101 9.361 9.625 9.905 10.224 10.51 10.741 10.989 11.211 11.454 11.631 11.636 11.448 10.637 9.317 8.122 6.969 5.905 4.966 4.175 3.421 2.742 2.033 1.412 0.861 0.31 -0.183 -0.672 -1.134 -1.61 -2.03 -2.371 -2.731 -3.111 -3.442 -3.8 -4.161 -4.443 -4.748 -5.056 -5.385 -5.751 -6.009 -6.273 -6.722 -7.047 -7.381 -7.553 -7.897 -8.249 -8.596 -8.785 -9.147 -9.434 -9.692 -9.981 -10.605 -10.958 -11.327 -11.782 -12.335 -12.919 -13.708 -16.522 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt deleted file mode 100644 index bcc0a38e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21686 ,KEBNE ,16678313,Thu Nov 25 01:49:55 CET,Thu Nov 25 03:15:45 CET,0.0 1.713 2.365 2.832 3.187 3.515 3.809 4.071 4.536 4.725 4.903 5.154 5.429 5.57 5.848 6.091 6.305 6.413 6.634 6.853 7.14 7.317 7.487 7.711 7.931 8.152 8.355 8.533 8.756 8.972 9.192 9.459 9.691 9.896 10.099 10.315 10.528 10.744 10.948 11.143 11.351 11.589 11.833 12.031 12.23 12.431 12.588 12.641 12.549 12.235 11.406 10.136 8.961 7.89 6.945 6.087 5.283 4.552 3.949 3.344 2.823 2.345 1.873 1.433 1.02 0.628 0.209 -0.176 -0.533 -0.895 -1.233 -1.531 -1.85 -2.16 -2.442 -2.769 -3.097 -3.461 -3.824 -4.048 -4.284 -4.627 -4.853 -5.096 -5.223 -5.497 -5.8 -6.128 -6.299 -6.61 -6.883 -7.109 -7.354 -7.857 -8.135 -8.441 -8.798 -9.216 -9.748 -10.516 -13.122 -2 ,30578 ,KEBNE ,16678314,Thu Nov 25 01:51:58 CET,Thu Nov 25 03:14:36 CET,0.0 1.451 2.238 2.774 3.169 3.517 3.826 4.103 4.56 4.785 4.995 5.186 5.441 5.582 5.848 6.073 6.292 6.403 6.614 6.821 7.089 7.245 7.405 7.642 7.857 8.062 8.25 8.417 8.615 8.814 9.025 9.271 9.494 9.696 9.91 10.134 10.361 10.602 10.835 11.084 11.341 11.593 11.832 12.028 12.232 12.413 12.531 12.611 12.584 12.276 11.479 10.232 9.03 7.934 6.956 6.08 5.326 4.625 4.003 3.375 2.824 2.322 1.846 1.393 0.955 0.567 0.169 -0.203 -0.519 -0.84 -1.187 -1.487 -1.793 -2.112 -2.373 -2.647 -2.932 -3.225 -3.533 -3.746 -3.969 -4.32 -4.558 -4.808 -4.94 -5.221 -5.542 -5.895 -6.071 -6.369 -6.613 -6.819 -7.038 -7.512 -7.783 -8.109 -8.47 -8.86 -9.362 -10.095 -12.485 -3 ,20200 ,KEBNE ,16678315,Thu Nov 25 01:51:58 CET,Thu Nov 25 03:15:01 CET,0.0 1.785 2.467 2.958 3.315 3.615 3.908 4.179 4.629 4.823 5.011 5.222 5.493 5.639 5.905 6.149 6.385 6.49 6.677 6.857 7.102 7.253 7.401 7.627 7.854 8.081 8.312 8.509 8.732 8.944 9.133 9.358 9.564 9.758 9.993 10.258 10.507 10.749 10.967 11.188 11.418 11.638 11.869 12.092 12.296 12.443 12.58 12.678 12.635 12.316 11.459 10.219 9.054 7.967 7.001 6.16 5.402 4.659 4.028 3.425 2.888 2.39 1.909 1.467 1.066 0.668 0.21 -0.201 -0.558 -0.923 -1.277 -1.569 -1.885 -2.21 -2.459 -2.718 -2.99 -3.268 -3.541 -3.741 -3.965 -4.334 -4.611 -4.879 -5.009 -5.293 -5.607 -5.973 -6.171 -6.504 -6.825 -7.067 -7.34 -8.011 -8.377 -8.745 -9.139 -9.591 -10.158 -10.965 -12.841 -4 ,30962 ,KEBNE ,16678316,Thu Nov 25 01:51:59 CET,Thu Nov 25 03:15:08 CET,0.0 1.791 2.508 3.044 3.459 3.811 4.113 4.392 4.909 5.133 5.331 5.585 5.891 6.063 6.377 6.674 6.952 7.07 7.286 7.488 7.762 7.93 8.081 8.29 8.49 8.701 8.908 9.097 9.327 9.526 9.711 9.929 10.135 10.332 10.54 10.741 10.942 11.186 11.418 11.644 11.884 12.111 12.34 12.553 12.779 12.977 13.15 13.274 13.206 12.849 11.992 10.657 9.392 8.269 7.305 6.458 5.682 4.951 4.323 3.707 3.18 2.7 2.248 1.819 1.414 1.032 0.623 0.26 -0.056 -0.394 -0.742 -1.042 -1.355 -1.68 -1.94 -2.195 -2.464 -2.759 -3.054 -3.251 -3.458 -3.791 -4.051 -4.328 -4.469 -4.757 -5.044 -5.354 -5.524 -5.825 -6.058 -6.261 -6.493 -6.993 -7.28 -7.612 -7.985 -8.419 -8.934 -9.682 -11.506 -5 ,14395 ,KEBNE ,16678317,Thu Nov 25 01:51:58 CET,Thu Nov 25 03:17:51 CET,0.0 1.929 2.62 3.074 3.446 3.758 4.001 4.211 4.637 4.862 5.086 5.353 5.649 5.805 6.076 6.325 6.558 6.665 6.87 7.067 7.328 7.495 7.656 7.86 8.06 8.278 8.485 8.668 8.901 9.118 9.326 9.567 9.767 9.946 10.155 10.387 10.603 10.818 11.017 11.235 11.467 11.687 11.906 12.125 12.345 12.518 12.638 12.708 12.639 12.289 11.451 10.164 8.994 7.951 7.031 6.181 5.409 4.716 4.119 3.503 2.955 2.466 2.012 1.569 1.146 0.764 0.362 -0.004 -0.326 -0.671 -1.023 -1.308 -1.599 -1.879 -2.146 -2.462 -2.794 -3.132 -3.452 -3.687 -3.937 -4.335 -4.634 -4.954 -5.113 -5.395 -5.674 -5.995 -6.162 -6.459 -6.702 -6.903 -7.119 -7.588 -7.848 -8.165 -8.538 -8.97 -9.519 -10.224 -12.322 -6 ,17663 ,KEBNE ,16678318,Thu Nov 25 01:51:59 CET,Thu Nov 25 03:18:27 CET,0.0 2.169 2.879 3.361 3.757 4.096 4.396 4.644 5.034 5.213 5.396 5.605 5.865 5.995 6.241 6.465 6.672 6.778 6.988 7.202 7.534 7.729 7.898 8.138 8.371 8.582 8.775 8.95 9.162 9.372 9.569 9.805 10.027 10.231 10.466 10.706 10.923 11.152 11.381 11.631 11.885 12.1 12.297 12.511 12.757 12.973 13.141 13.229 13.199 12.909 12.008 10.708 9.526 8.44 7.449 6.534 5.763 5.069 4.447 3.826 3.289 2.822 2.34 1.864 1.453 1.079 0.687 0.337 0.023 -0.318 -0.667 -0.97 -1.309 -1.653 -1.9 -2.154 -2.419 -2.691 -2.988 -3.206 -3.433 -3.786 -4.029 -4.293 -4.436 -4.726 -5.032 -5.376 -5.563 -5.883 -6.151 -6.354 -6.583 -7.112 -7.407 -7.735 -8.1 -8.536 -9.05 -9.732 -11.195 -7 ,6218 ,KEBNE ,16678319,Thu Nov 25 01:53:00 CET,Thu Nov 25 03:19:33 CET,0.0 1.692 2.272 2.704 3.068 3.407 3.7 3.948 4.388 4.572 4.749 4.982 5.263 5.424 5.719 5.965 6.182 6.299 6.517 6.715 7.016 7.188 7.347 7.597 7.825 8.023 8.216 8.393 8.595 8.778 8.952 9.156 9.36 9.563 9.788 10.028 10.249 10.475 10.706 10.927 11.137 11.371 11.625 11.811 11.993 12.188 12.373 12.484 12.451 12.171 11.33 10.034 8.839 7.739 6.746 5.871 5.096 4.374 3.727 3.065 2.525 2.051 1.57 1.109 0.697 0.332 -0.06 -0.437 -0.763 -1.106 -1.468 -1.771 -2.093 -2.423 -2.684 -2.947 -3.215 -3.509 -3.818 -4.022 -4.236 -4.568 -4.787 -5.036 -5.169 -5.443 -5.767 -6.094 -6.256 -6.566 -6.835 -7.037 -7.27 -7.803 -8.091 -8.436 -8.856 -9.307 -9.784 -10.507 -12.738 -8 ,23948 ,KEBNE ,16678320,Thu Nov 25 01:54:06 CET,Thu Nov 25 03:15:32 CET,0.0 1.466 2.213 2.783 3.206 3.533 3.821 4.105 4.574 4.765 4.944 5.145 5.403 5.542 5.82 6.069 6.295 6.399 6.579 6.762 7.043 7.213 7.371 7.599 7.825 8.028 8.204 8.367 8.582 8.801 9.003 9.218 9.418 9.606 9.821 10.076 10.314 10.554 10.798 11.032 11.237 11.453 11.678 11.878 12.069 12.224 12.354 12.403 12.314 12.003 11.18 9.872 8.651 7.547 6.562 5.67 4.9 4.215 3.599 2.992 2.466 1.961 1.49 1.044 0.613 0.229 -0.167 -0.525 -0.837 -1.178 -1.53 -1.814 -2.122 -2.446 -2.699 -2.971 -3.26 -3.554 -3.852 -4.048 -4.266 -4.625 -4.863 -5.127 -5.268 -5.549 -5.86 -6.194 -6.367 -6.673 -6.924 -7.132 -7.359 -7.877 -8.163 -8.464 -8.804 -9.226 -9.777 -10.543 -12.209 -9 ,30599 ,KEBNE ,16678321,Thu Nov 25 01:55:06 CET,Thu Nov 25 03:15:25 CET,0.0 1.529 2.175 2.657 3.044 3.365 3.656 3.94 4.459 4.687 4.892 5.115 5.394 5.548 5.817 6.054 6.272 6.381 6.585 6.77 7.026 7.182 7.344 7.584 7.807 8.01 8.195 8.366 8.588 8.799 8.988 9.209 9.432 9.633 9.845 10.085 10.304 10.529 10.755 10.987 11.218 11.462 11.704 11.913 12.113 12.289 12.421 12.475 12.403 12.09 11.286 10.021 8.819 7.699 6.707 5.846 5.075 4.362 3.751 3.134 2.57 2.065 1.605 1.17 0.758 0.367 -0.051 -0.436 -0.769 -1.107 -1.475 -1.764 -2.058 -2.393 -2.664 -2.941 -3.221 -3.518 -3.819 -4.028 -4.257 -4.615 -4.854 -5.105 -5.244 -5.524 -5.827 -6.175 -6.355 -6.669 -6.954 -7.175 -7.418 -7.981 -8.326 -8.696 -9.098 -9.573 -10.113 -10.852 -12.803 -10 ,29871 ,KEBNE ,16678322,Thu Nov 25 01:56:06 CET,Thu Nov 25 03:19:44 CET,0.0 1.639 2.285 2.741 3.112 3.438 3.7 3.942 4.409 4.621 4.825 5.066 5.36 5.526 5.829 6.088 6.308 6.419 6.625 6.801 7.065 7.24 7.394 7.625 7.858 8.062 8.243 8.425 8.654 8.86 9.05 9.275 9.488 9.698 9.93 10.153 10.351 10.557 10.785 11.034 11.294 11.557 11.805 12.019 12.224 12.398 12.524 12.574 12.505 12.212 11.448 10.199 9.032 7.986 7.001 6.079 5.28 4.556 3.928 3.328 2.805 2.326 1.884 1.452 1.04 0.668 0.256 -0.119 -0.433 -0.78 -1.182 -1.509 -1.825 -2.172 -2.446 -2.727 -3.042 -3.378 -3.724 -3.958 -4.198 -4.578 -4.838 -5.112 -5.246 -5.5 -5.814 -6.172 -6.349 -6.649 -6.901 -7.109 -7.334 -7.858 -8.163 -8.483 -8.834 -9.25 -9.77 -10.485 -12.183 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 20dad0e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10486 ,KEBNE ,16678323,Thu Nov 25 01:57:08 CET,Thu Nov 25 03:22:43 CET,0.0 2.64 3.249 3.662 4.015 4.355 4.632 4.86 5.227 5.386 5.54 5.709 5.959 6.089 6.332 6.551 6.739 6.833 7.032 7.204 7.422 7.556 7.675 7.843 8.001 8.144 8.278 8.402 8.573 8.747 8.889 9.042 9.19 9.33 9.481 9.621 9.74 9.859 9.977 10.09 10.181 10.246 10.288 10.292 10.247 10.097 9.807 9.344 8.563 7.323 5.198 2.574 0.428 -1.433 -3.024 -4.394 -5.59 -6.643 -7.54 -8.423 -9.161 -9.827 -10.466 -11.075 -11.624 -12.11 -12.611 -13.038 -13.416 -13.829 -14.25 -14.589 -14.962 -15.355 -15.649 -15.958 -16.279 -16.619 -16.957 -17.192 -17.456 -17.871 -18.158 -18.454 -18.612 -18.975 -19.357 -19.743 -19.946 -20.289 -20.563 -20.776 -21.011 -21.544 -21.822 -22.131 -22.496 -22.874 -23.336 -24.028 -25.58 -2 ,11979 ,KEBNE ,16678324,Thu Nov 25 02:04:20 CET,Thu Nov 25 03:26:55 CET,0.0 2.451 3.053 3.484 3.803 4.049 4.288 4.516 4.863 5.009 5.156 5.345 5.62 5.755 5.974 6.165 6.349 6.438 6.612 6.773 6.988 7.124 7.266 7.454 7.622 7.776 7.91 8.03 8.183 8.332 8.462 8.616 8.76 8.879 9.03 9.187 9.317 9.448 9.544 9.631 9.701 9.747 9.772 9.765 9.713 9.574 9.307 8.833 8.04 6.801 4.659 1.935 -0.283 -2.089 -3.644 -5.02 -6.18 -7.22 -8.149 -9.065 -9.808 -10.458 -11.08 -11.678 -12.224 -12.7 -13.203 -13.662 -14.069 -14.5 -14.924 -15.276 -15.66 -16.053 -16.358 -16.667 -16.993 -17.344 -17.691 -17.937 -18.199 -18.594 -18.864 -19.161 -19.312 -19.595 -19.908 -20.268 -20.451 -20.783 -21.068 -21.321 -21.579 -22.114 -22.405 -22.715 -23.098 -23.571 -24.123 -24.893 -27.478 -3 ,9653 ,KEBNE ,16678325,Thu Nov 25 02:06:25 CET,Thu Nov 25 03:28:49 CET,0.0 2.126 2.751 3.21 3.537 3.785 4.009 4.224 4.604 4.771 4.918 5.049 5.297 5.425 5.639 5.829 6.015 6.107 6.284 6.441 6.658 6.785 6.902 7.061 7.196 7.325 7.444 7.559 7.715 7.877 8.025 8.193 8.335 8.45 8.577 8.699 8.824 8.954 9.068 9.175 9.272 9.333 9.362 9.376 9.323 9.173 8.864 8.392 7.694 6.486 4.304 1.646 -0.523 -2.331 -3.871 -5.239 -6.401 -7.431 -8.332 -9.237 -10.01 -10.702 -11.358 -11.962 -12.511 -13.004 -13.534 -13.995 -14.383 -14.801 -15.239 -15.607 -15.989 -16.387 -16.695 -17.018 -17.358 -17.7 -18.073 -18.333 -18.582 -18.953 -19.224 -19.514 -19.664 -19.98 -20.317 -20.68 -20.864 -21.188 -21.442 -21.672 -21.912 -22.454 -22.788 -23.156 -23.541 -23.969 -24.475 -25.198 -27.129 -4 ,22937 ,KEBNE ,16678326,Thu Nov 25 02:07:26 CET,Thu Nov 25 03:30:23 CET,0.0 2.578 3.272 3.743 4.085 4.374 4.648 4.886 5.276 5.442 5.593 5.746 5.991 6.111 6.334 6.537 6.732 6.823 6.99 7.141 7.335 7.461 7.582 7.754 7.931 8.096 8.237 8.378 8.545 8.688 8.831 8.995 9.125 9.243 9.37 9.504 9.626 9.74 9.84 9.925 10.008 10.077 10.107 10.092 10.032 9.902 9.642 9.175 8.386 7.153 5.012 2.373 0.227 -1.567 -3.075 -4.394 -5.552 -6.613 -7.511 -8.418 -9.2 -9.869 -10.485 -11.074 -11.637 -12.137 -12.662 -13.128 -13.513 -13.946 -14.425 -14.812 -15.189 -15.562 -15.857 -16.173 -16.501 -16.838 -17.183 -17.42 -17.666 -18.053 -18.325 -18.632 -18.796 -19.115 -19.441 -19.794 -19.982 -20.318 -20.579 -20.802 -21.04 -21.561 -21.85 -22.175 -22.561 -22.966 -23.451 -24.148 -25.695 -5 ,19320 ,KEBNE ,16678327,Thu Nov 25 02:07:26 CET,Thu Nov 25 03:33:14 CET,0.0 2.606 3.348 3.935 4.382 4.718 5.025 5.301 5.786 5.994 6.178 6.352 6.603 6.732 6.956 7.174 7.367 7.458 7.629 7.776 7.982 8.106 8.227 8.407 8.578 8.736 8.878 8.999 9.145 9.284 9.42 9.587 9.743 9.875 10.005 10.147 10.27 10.387 10.506 10.624 10.714 10.778 10.825 10.833 10.773 10.638 10.394 9.915 9.122 7.911 5.858 3.3 1.132 -0.71 -2.247 -3.597 -4.767 -5.806 -6.675 -7.502 -8.232 -8.907 -9.537 -10.126 -10.669 -11.158 -11.685 -12.172 -12.587 -13.002 -13.447 -13.826 -14.204 -14.585 -14.884 -15.195 -15.506 -15.836 -16.192 -16.423 -16.667 -17.084 -17.386 -17.685 -17.831 -18.135 -18.46 -18.805 -18.996 -19.344 -19.615 -19.835 -20.066 -20.562 -20.859 -21.198 -21.576 -22.007 -22.497 -23.153 -24.642 -6 ,14780 ,KEBNE ,16678328,Thu Nov 25 02:07:26 CET,Thu Nov 25 03:29:23 CET,0.0 2.452 3.106 3.53 3.864 4.149 4.373 4.581 4.964 5.14 5.3 5.469 5.723 5.849 6.058 6.258 6.453 6.542 6.724 6.896 7.12 7.256 7.373 7.521 7.67 7.824 7.961 8.08 8.238 8.394 8.525 8.68 8.846 8.99 9.126 9.266 9.396 9.541 9.656 9.756 9.847 9.901 9.909 9.884 9.825 9.711 9.456 8.992 8.293 7.079 4.909 2.284 0.099 -1.727 -3.26 -4.619 -5.806 -6.855 -7.737 -8.615 -9.338 -9.987 -10.618 -11.211 -11.779 -12.287 -12.804 -13.292 -13.716 -14.135 -14.597 -14.987 -15.371 -15.769 -16.075 -16.373 -16.689 -17.038 -17.392 -17.638 -17.905 -18.324 -18.606 -18.891 -19.038 -19.346 -19.679 -20.042 -20.228 -20.559 -20.818 -21.021 -21.237 -21.719 -22.004 -22.318 -22.659 -23.065 -23.58 -24.277 -26.289 -7 ,25851 ,KEBNE ,16678329,Thu Nov 25 02:07:26 CET,Thu Nov 25 03:29:55 CET,0.0 1.805 2.431 2.838 3.169 3.454 3.719 3.958 4.319 4.473 4.621 4.775 5.027 5.153 5.38 5.58 5.761 5.845 6.01 6.174 6.396 6.533 6.663 6.848 7.015 7.161 7.308 7.453 7.635 7.799 7.947 8.114 8.256 8.389 8.524 8.659 8.788 8.922 9.059 9.177 9.259 9.324 9.358 9.341 9.276 9.15 8.907 8.463 7.706 6.467 4.355 1.762 -0.43 -2.26 -3.803 -5.178 -6.363 -7.408 -8.293 -9.157 -9.908 -10.589 -11.219 -11.82 -12.368 -12.857 -13.377 -13.841 -14.256 -14.686 -15.12 -15.487 -15.871 -16.259 -16.553 -16.851 -17.176 -17.523 -17.874 -18.112 -18.366 -18.773 -19.045 -19.332 -19.489 -19.813 -20.171 -20.557 -20.744 -21.071 -21.342 -21.57 -21.801 -22.308 -22.597 -22.916 -23.261 -23.662 -24.192 -24.915 -26.604 -8 ,26067 ,KEBNE ,16678330,Thu Nov 25 02:09:30 CET,Thu Nov 25 03:32:40 CET,0.0 2.017 2.629 3.027 3.355 3.631 3.864 4.094 4.571 4.794 5.009 5.28 5.557 5.684 5.907 6.109 6.322 6.427 6.609 6.767 7.0 7.148 7.273 7.449 7.625 7.791 7.93 8.064 8.235 8.376 8.497 8.643 8.781 8.915 9.084 9.27 9.416 9.545 9.668 9.773 9.848 9.893 9.917 9.89 9.777 9.588 9.315 8.905 8.25 7.142 5.053 2.491 0.375 -1.453 -3.019 -4.392 -5.545 -6.56 -7.446 -8.356 -9.14 -9.829 -10.468 -11.074 -11.637 -12.134 -12.655 -13.106 -13.486 -13.897 -14.342 -14.697 -15.052 -15.442 -15.746 -16.052 -16.368 -16.704 -17.068 -17.328 -17.603 -17.997 -18.262 -18.552 -18.704 -19.03 -19.374 -19.737 -19.921 -20.251 -20.529 -20.743 -20.96 -21.456 -21.735 -22.032 -22.383 -22.788 -23.296 -23.992 -25.255 -9 ,17878 ,KEBNE ,16678331,Thu Nov 25 02:09:34 CET,Thu Nov 25 03:30:04 CET,0.0 1.724 2.312 2.702 3.039 3.33 3.578 3.803 4.186 4.36 4.525 4.685 4.926 5.056 5.312 5.541 5.746 5.838 6.003 6.156 6.346 6.47 6.605 6.787 6.952 7.093 7.222 7.356 7.53 7.687 7.835 7.985 8.122 8.265 8.406 8.524 8.621 8.718 8.819 8.915 9.004 9.056 9.075 9.088 9.034 8.9 8.651 8.203 7.46 6.269 4.17 1.574 -0.589 -2.384 -3.89 -5.222 -6.366 -7.384 -8.27 -9.153 -9.894 -10.559 -11.189 -11.766 -12.301 -12.813 -13.352 -13.813 -14.2 -14.604 -15.036 -15.414 -15.804 -16.188 -16.487 -16.799 -17.131 -17.478 -17.83 -18.07 -18.317 -18.699 -18.961 -19.241 -19.397 -19.726 -20.053 -20.401 -20.595 -20.941 -21.23 -21.463 -21.699 -22.244 -22.577 -22.907 -23.239 -23.629 -24.134 -24.883 -26.942 -10 ,32337 ,KEBNE ,16678332,Thu Nov 25 02:10:31 CET,Thu Nov 25 03:32:33 CET,0.0 1.838 2.401 2.788 3.1 3.357 3.599 3.808 4.141 4.31 4.488 4.692 4.941 5.064 5.317 5.547 5.75 5.849 6.041 6.225 6.474 6.621 6.757 6.947 7.122 7.288 7.44 7.582 7.759 7.914 8.069 8.24 8.374 8.507 8.643 8.772 8.895 9.016 9.122 9.216 9.298 9.365 9.412 9.4 9.345 9.222 8.937 8.498 7.772 6.538 4.369 1.719 -0.439 -2.301 -3.897 -5.274 -6.446 -7.471 -8.345 -9.223 -9.963 -10.616 -11.235 -11.817 -12.362 -12.856 -13.371 -13.847 -14.256 -14.688 -15.14 -15.502 -15.871 -16.255 -16.553 -16.855 -17.169 -17.486 -17.828 -18.075 -18.328 -18.727 -19.011 -19.302 -19.453 -19.764 -20.069 -20.409 -20.597 -20.938 -21.243 -21.494 -21.758 -22.323 -22.618 -22.943 -23.339 -23.753 -24.241 -24.887 -26.297 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt deleted file mode 100644 index 0732ea69..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13796 ,KEBNE ,16678333,Thu Nov 25 02:10:32 CET,Thu Nov 25 03:34:35 CET,0.0 1.591 2.202 2.662 3.061 3.438 3.767 4.046 4.56 4.796 5.006 5.246 5.563 5.732 6.1 6.442 6.737 6.875 7.141 7.393 7.752 7.983 8.221 8.541 8.83 9.123 9.403 9.675 10.029 10.358 10.691 11.086 11.443 11.79 12.181 12.63 13.06 13.521 14.024 14.543 15.089 15.73 16.453 17.151 17.968 18.865 19.885 21.001 22.258 23.506 24.574 25.159 25.194 25.003 24.694 24.363 24.04 23.713 23.411 23.064 22.713 22.37 22.028 21.672 21.323 21.009 20.688 20.384 20.113 19.839 19.547 19.282 19.004 18.728 18.504 18.26 18.018 17.755 17.467 17.272 17.071 16.753 16.521 16.282 16.165 15.914 15.636 15.334 15.167 14.859 14.607 14.408 14.181 13.655 13.372 13.06 12.715 12.318 11.861 11.203 8.293 -2 ,31612 ,KEBNE ,16678334,Thu Nov 25 02:11:32 CET,Thu Nov 25 03:33:31 CET,0.0 1.674 2.384 2.903 3.337 3.706 4.03 4.328 4.859 5.097 5.324 5.604 5.947 6.132 6.467 6.775 7.079 7.223 7.499 7.769 8.146 8.387 8.629 8.973 9.288 9.583 9.86 10.127 10.471 10.801 11.125 11.533 11.917 12.28 12.684 13.138 13.584 14.065 14.573 15.102 15.654 16.279 17.02 17.763 18.597 19.494 20.558 21.79 23.13 24.538 26.005 26.97 27.264 27.254 27.09 26.82 26.509 26.189 25.875 25.518 25.198 24.91 24.615 24.296 23.984 23.715 23.442 23.172 22.93 22.683 22.416 22.191 21.944 21.659 21.43 21.196 20.941 20.672 20.393 20.202 20.007 19.691 19.457 19.211 19.085 18.827 18.539 18.216 18.048 17.742 17.468 17.256 17.021 16.488 16.225 15.951 15.652 15.253 14.749 14.099 10.938 -3 ,12556 ,KEBNE ,16678335,Thu Nov 25 02:11:32 CET,Thu Nov 25 03:37:35 CET,0.0 1.76 2.438 2.973 3.41 3.793 4.156 4.486 5.083 5.34 5.569 5.851 6.202 6.381 6.72 7.055 7.392 7.55 7.819 8.049 8.382 8.607 8.835 9.164 9.489 9.817 10.122 10.399 10.73 11.062 11.39 11.777 12.158 12.517 12.923 13.372 13.786 14.254 14.783 15.33 15.884 16.505 17.203 17.901 18.758 19.701 20.749 21.892 23.091 24.443 25.958 26.855 27.114 26.998 26.686 26.321 25.944 25.572 25.214 24.815 24.461 24.112 23.749 23.395 23.062 22.76 22.446 22.157 21.893 21.613 21.314 21.049 20.759 20.462 20.236 19.989 19.737 19.483 19.206 19.004 18.799 18.46 18.217 17.966 17.841 17.599 17.313 16.982 16.815 16.522 16.302 16.104 15.893 15.41 15.132 14.86 14.528 14.106 13.607 12.888 9.945 -4 ,23099 ,KEBNE ,16678336,Thu Nov 25 02:11:33 CET,Thu Nov 25 03:35:01 CET,0.0 1.543 2.3 2.818 3.209 3.533 3.821 4.117 4.666 4.906 5.12 5.343 5.662 5.829 6.148 6.47 6.779 6.92 7.191 7.475 7.871 8.1 8.321 8.647 8.962 9.263 9.546 9.802 10.128 10.46 10.781 11.171 11.545 11.886 12.284 12.734 13.167 13.659 14.191 14.733 15.3 15.952 16.702 17.429 18.272 19.196 20.275 21.478 22.767 24.104 25.306 25.89 25.949 25.735 25.482 25.181 24.827 24.508 24.208 23.86 23.522 23.185 22.851 22.528 22.209 21.91 21.575 21.273 21.024 20.746 20.431 20.169 19.906 19.637 19.425 19.188 18.937 18.691 18.423 18.224 18.018 17.681 17.419 17.149 17.025 16.776 16.479 16.154 15.989 15.689 15.421 15.214 14.99 14.465 14.176 13.851 13.493 13.068 12.528 11.742 7.764 -5 ,28469 ,KEBNE ,16678337,Thu Nov 25 02:12:35 CET,Thu Nov 25 03:35:14 CET,0.0 1.483 2.146 2.646 3.062 3.392 3.644 3.893 4.369 4.603 4.852 5.157 5.482 5.63 5.939 6.254 6.562 6.728 7.034 7.304 7.703 7.959 8.183 8.49 8.78 9.057 9.347 9.626 9.972 10.299 10.612 10.992 11.362 11.715 12.118 12.559 12.992 13.495 14.018 14.563 15.137 15.766 16.515 17.25 18.065 18.989 19.998 21.104 22.401 23.821 25.363 26.299 26.577 26.611 26.436 26.077 25.663 25.255 24.883 24.502 24.155 23.808 23.457 23.125 22.804 22.487 22.149 21.848 21.587 21.29 20.969 20.724 20.472 20.2 19.995 19.769 19.527 19.279 19.011 18.834 18.652 18.357 18.144 17.912 17.793 17.546 17.283 16.98 16.813 16.512 16.272 16.067 15.837 15.334 15.058 14.743 14.367 13.925 13.342 12.548 9.587 -6 ,14261 ,KEBNE ,16678338,Thu Nov 25 02:12:34 CET,Thu Nov 25 03:34:36 CET,0.0 2.204 2.913 3.427 3.869 4.252 4.561 4.836 5.316 5.527 5.748 6.014 6.336 6.508 6.832 7.128 7.418 7.56 7.841 8.091 8.423 8.649 8.87 9.196 9.51 9.8 10.074 10.349 10.694 11.025 11.339 11.701 12.07 12.435 12.853 13.316 13.758 14.234 14.749 15.327 15.948 16.559 17.24 17.944 18.72 19.608 20.659 21.789 23.035 24.345 25.725 26.685 26.983 26.967 26.846 26.614 26.322 26.025 25.719 25.335 24.978 24.655 24.344 24.032 23.719 23.424 23.094 22.785 22.515 22.235 21.936 21.683 21.416 21.13 20.895 20.65 20.396 20.13 19.862 19.668 19.462 19.163 18.952 18.695 18.562 18.296 18.0 17.684 17.513 17.21 16.982 16.786 16.566 16.062 15.772 15.459 15.115 14.688 14.166 13.447 10.964 -7 ,7066 ,KEBNE ,16678339,Thu Nov 25 02:13:36 CET,Thu Nov 25 03:36:29 CET,0.0 1.671 2.243 2.694 3.076 3.42 3.731 4.008 4.496 4.719 4.93 5.174 5.519 5.722 6.095 6.448 6.792 6.957 7.277 7.582 8.024 8.302 8.569 8.943 9.297 9.637 9.967 10.266 10.616 10.946 11.264 11.638 11.999 12.358 12.768 13.209 13.653 14.147 14.636 15.145 15.688 16.279 16.999 17.764 18.588 19.467 20.485 21.588 22.828 24.143 25.379 26.072 26.163 25.976 25.689 25.329 24.944 24.555 24.205 23.803 23.429 23.101 22.764 22.411 22.071 21.767 21.433 21.126 20.867 20.591 20.285 20.029 19.761 19.469 19.245 19.013 18.753 18.487 18.224 18.034 17.823 17.481 17.245 17.007 16.882 16.619 16.335 16.014 15.847 15.541 15.293 15.092 14.876 14.417 14.151 13.818 13.451 13.048 12.539 11.807 8.347 -8 ,3113 ,KEBNE ,16678340,Thu Nov 25 02:13:36 CET,Thu Nov 25 03:40:06 CET,0.0 2.099 2.874 3.41 3.837 4.19 4.494 4.755 5.208 5.462 5.697 5.932 6.261 6.448 6.798 7.109 7.4 7.546 7.81 8.054 8.41 8.643 8.876 9.201 9.516 9.814 10.098 10.376 10.726 11.058 11.379 11.758 12.096 12.43 12.845 13.288 13.698 14.166 14.652 15.168 15.741 16.364 17.076 17.795 18.617 19.507 20.516 21.657 22.918 24.37 25.962 26.839 27.027 26.925 26.71 26.432 26.125 25.779 25.45 25.115 24.77 24.422 24.096 23.78 23.472 23.18 22.849 22.521 22.235 21.944 21.643 21.398 21.137 20.862 20.654 20.422 20.169 19.9 19.596 19.378 19.129 18.686 18.379 18.051 17.883 17.59 17.305 16.976 16.799 16.491 16.26 16.079 15.888 15.409 15.11 14.818 14.49 14.084 13.573 12.829 9.89 -9 ,15156 ,KEBNE ,16678341,Thu Nov 25 02:13:36 CET,Thu Nov 25 03:37:28 CET,0.0 2.022 2.784 3.282 3.69 4.064 4.368 4.64 5.16 5.388 5.603 5.846 6.174 6.34 6.648 6.947 7.242 7.384 7.654 7.9 8.245 8.463 8.68 9.017 9.338 9.623 9.901 10.186 10.566 10.92 11.251 11.683 12.103 12.501 12.993 13.557 14.051 14.549 15.06 15.592 16.147 16.77 17.51 18.246 19.088 20.011 21.038 22.195 23.507 24.93 26.411 27.343 27.639 27.591 27.382 27.095 26.784 26.449 26.113 25.756 25.439 25.132 24.826 24.534 24.236 23.939 23.609 23.325 23.083 22.819 22.545 22.3 22.029 21.737 21.508 21.274 21.027 20.756 20.449 20.233 20.027 19.697 19.467 19.238 19.116 18.86 18.593 18.306 18.154 17.857 17.613 17.416 17.2 16.695 16.406 16.083 15.693 15.257 14.773 14.093 11.443 -10 ,18791 ,KEBNE ,16678342,Thu Nov 25 02:14:38 CET,Thu Nov 25 03:38:36 CET,0.0 1.466 2.11 2.624 3.08 3.435 3.721 4.018 4.601 4.864 5.109 5.425 5.789 5.978 6.294 6.591 6.901 7.045 7.317 7.585 7.957 8.184 8.393 8.697 8.997 9.3 9.614 9.896 10.226 10.578 10.923 11.282 11.611 11.962 12.378 12.819 13.234 13.675 14.157 14.675 15.242 15.912 16.665 17.423 18.297 19.204 20.247 21.401 22.693 24.133 25.642 26.547 26.821 26.807 26.663 26.427 26.143 25.821 25.473 25.107 24.745 24.384 24.058 23.731 23.425 23.121 22.77 22.465 22.198 21.908 21.607 21.37 21.108 20.811 20.581 20.344 20.104 19.86 19.596 19.396 19.191 18.875 18.638 18.376 18.239 17.956 17.653 17.328 17.162 16.872 16.62 16.421 16.223 15.776 15.499 15.187 14.825 14.404 13.865 13.071 10.098 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 7060b607..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1287 ,KEBNE ,16678343,Thu Nov 25 02:14:38 CET,Thu Nov 25 03:39:37 CET,0.0 2.274 2.921 3.365 3.705 3.987 4.233 4.463 4.911 5.121 5.339 5.588 5.906 6.068 6.368 6.659 6.937 7.065 7.302 7.515 7.819 8.014 8.199 8.477 8.739 8.986 9.246 9.488 9.773 10.033 10.281 10.582 10.885 11.191 11.52 11.871 12.211 12.561 12.917 13.296 13.682 14.108 14.617 15.081 15.568 16.122 16.708 17.28 17.894 18.428 18.389 17.652 16.799 15.926 15.072 14.24 13.481 12.766 12.134 11.502 10.937 10.439 9.976 9.526 9.079 8.668 8.254 7.867 7.529 7.177 6.802 6.476 6.141 5.821 5.565 5.295 5.006 4.704 4.388 4.164 3.927 3.555 3.312 3.055 2.915 2.621 2.315 1.987 1.806 1.474 1.2 0.978 0.732 0.189 -0.093 -0.4 -0.733 -1.131 -1.653 -2.407 -5.073 -2 ,32416 ,KEBNE ,16678344,Thu Nov 25 02:15:40 CET,Thu Nov 25 03:39:37 CET,0.0 2.007 2.574 3.003 3.381 3.685 3.949 4.201 4.654 4.849 5.02 5.208 5.522 5.674 5.959 6.218 6.462 6.583 6.811 7.028 7.354 7.56 7.752 8.026 8.296 8.556 8.795 9.02 9.296 9.551 9.798 10.103 10.397 10.672 10.981 11.313 11.642 12.007 12.376 12.756 13.184 13.656 14.178 14.669 15.198 15.78 16.418 17.082 17.676 17.982 18.017 17.593 16.86 15.991 15.099 14.268 13.554 12.887 12.285 11.653 11.089 10.606 10.132 9.655 9.217 8.824 8.399 8.009 7.676 7.332 6.946 6.617 6.276 5.931 5.671 5.405 5.117 4.798 4.483 4.271 4.049 3.715 3.469 3.209 3.078 2.783 2.449 2.079 1.893 1.564 1.306 1.09 0.857 0.347 0.061 -0.256 -0.595 -0.978 -1.525 -2.244 -4.372 -3 ,30693 ,KEBNE ,16678345,Thu Nov 25 02:15:40 CET,Thu Nov 25 03:41:13 CET,0.0 1.608 2.226 2.674 3.047 3.34 3.604 3.854 4.291 4.507 4.71 4.935 5.267 5.434 5.736 6.028 6.29 6.406 6.626 6.822 7.118 7.31 7.508 7.795 8.056 8.303 8.537 8.752 9.025 9.301 9.568 9.875 10.165 10.445 10.762 11.103 11.418 11.76 12.12 12.491 12.882 13.343 13.843 14.301 14.833 15.397 15.994 16.573 17.088 17.397 17.226 16.562 15.838 15.005 14.164 13.395 12.732 12.085 11.471 10.828 10.259 9.75 9.251 8.776 8.331 7.933 7.513 7.125 6.781 6.421 6.065 5.769 5.448 5.1 4.828 4.552 4.274 3.985 3.676 3.461 3.226 2.86 2.613 2.353 2.216 1.928 1.619 1.282 1.104 0.787 0.541 0.323 0.09 -0.428 -0.725 -1.051 -1.389 -1.778 -2.269 -2.937 -6.832 -4 ,6713 ,KEBNE ,16678346,Thu Nov 25 02:15:40 CET,Thu Nov 25 03:38:37 CET,0.0 1.7 2.285 2.722 3.095 3.418 3.7 3.951 4.397 4.604 4.805 5.022 5.331 5.483 5.76 6.024 6.263 6.374 6.591 6.8 7.093 7.288 7.474 7.731 7.98 8.211 8.432 8.666 8.968 9.235 9.477 9.764 10.045 10.328 10.659 11.012 11.345 11.69 12.043 12.414 12.799 13.245 13.75 14.259 14.839 15.41 15.976 16.496 16.995 17.441 17.544 17.102 16.377 15.609 14.829 14.025 13.323 12.687 12.105 11.507 11.004 10.533 10.035 9.528 9.072 8.661 8.203 7.802 7.457 7.094 6.717 6.41 6.088 5.732 5.454 5.178 4.893 4.593 4.27 4.047 3.806 3.416 3.142 2.86 2.725 2.423 2.105 1.78 1.602 1.275 1.004 0.774 0.541 0.02 -0.265 -0.567 -0.931 -1.398 -1.93 -2.585 -5.16 -5 ,12065 ,KEBNE ,16678347,Thu Nov 25 02:15:40 CET,Thu Nov 25 03:42:19 CET,0.0 2.845 3.561 4.074 4.44 4.73 4.999 5.262 5.71 5.897 6.079 6.289 6.627 6.817 7.162 7.467 7.734 7.854 8.079 8.293 8.599 8.796 8.974 9.245 9.51 9.756 9.993 10.211 10.5 10.774 11.032 11.343 11.622 11.893 12.207 12.558 12.896 13.253 13.612 13.985 14.386 14.846 15.375 15.857 16.343 16.831 17.353 17.873 18.44 18.964 19.228 18.86 18.158 17.391 16.582 15.797 15.114 14.463 13.883 13.304 12.788 12.303 11.834 11.395 10.972 10.581 10.174 9.814 9.491 9.14 8.797 8.504 8.172 7.835 7.575 7.295 6.997 6.689 6.371 6.155 5.932 5.578 5.319 5.038 4.89 4.593 4.304 3.981 3.802 3.489 3.252 3.031 2.805 2.329 2.052 1.748 1.422 1.043 0.526 -0.171 -2.105 -6 ,9724 ,KEBNE ,16678348,Thu Nov 25 02:15:40 CET,Thu Nov 25 03:41:17 CET,0.0 2.184 2.863 3.317 3.694 4.015 4.287 4.541 5.008 5.207 5.385 5.58 5.905 6.08 6.375 6.647 6.931 7.072 7.34 7.593 7.929 8.135 8.331 8.611 8.875 9.117 9.343 9.558 9.852 10.135 10.383 10.67 10.962 11.253 11.563 11.892 12.22 12.58 12.959 13.348 13.75 14.192 14.68 15.159 15.696 16.272 16.911 17.56 18.127 18.396 18.176 17.394 16.538 15.745 14.976 14.237 13.582 12.95 12.355 11.736 11.197 10.715 10.236 9.783 9.379 9.008 8.61 8.259 7.95 7.619 7.28 6.983 6.669 6.369 6.137 5.872 5.584 5.289 4.994 4.796 4.589 4.246 3.989 3.714 3.567 3.245 2.911 2.561 2.382 2.056 1.799 1.586 1.36 0.849 0.561 0.238 -0.117 -0.499 -0.986 -1.67 -4.318 -7 ,18231 ,KEBNE ,16678349,Thu Nov 25 02:16:41 CET,Thu Nov 25 03:42:27 CET,0.0 1.678 2.262 2.685 3.048 3.363 3.616 3.838 4.248 4.43 4.594 4.771 5.074 5.231 5.524 5.792 6.051 6.168 6.404 6.634 6.936 7.126 7.307 7.566 7.82 8.061 8.285 8.507 8.787 9.032 9.279 9.6 9.912 10.204 10.526 10.864 11.186 11.554 11.932 12.324 12.722 13.149 13.661 14.17 14.725 15.299 15.897 16.487 17.089 17.63 17.737 17.18 16.434 15.674 14.963 14.213 13.462 12.748 12.123 11.488 10.949 10.465 9.976 9.515 9.1 8.702 8.272 7.9 7.554 7.18 6.813 6.502 6.177 5.84 5.576 5.313 5.021 4.704 4.393 4.182 3.955 3.589 3.334 3.067 2.932 2.638 2.321 1.991 1.819 1.494 1.228 1.015 0.79 0.285 0.008 -0.296 -0.663 -1.104 -1.548 -2.237 -4.515 -8 ,218 ,KEBNE ,16678350,Thu Nov 25 02:17:43 CET,Thu Nov 25 03:42:13 CET,0.0 1.736 2.284 2.698 3.048 3.343 3.609 3.853 4.28 4.479 4.668 4.867 5.179 5.328 5.606 5.878 6.132 6.255 6.506 6.741 7.064 7.267 7.454 7.714 7.962 8.202 8.424 8.64 8.918 9.174 9.428 9.747 10.048 10.326 10.635 10.977 11.303 11.66 12.049 12.436 12.839 13.287 13.775 14.256 14.802 15.407 16.049 16.659 17.296 17.834 18.0 17.551 16.823 16.039 15.277 14.505 13.8 13.175 12.614 12.006 11.476 11.003 10.546 10.11 9.684 9.305 8.92 8.551 8.231 7.908 7.561 7.261 6.931 6.589 6.332 6.062 5.77 5.478 5.172 4.959 4.75 4.413 4.167 3.901 3.765 3.494 3.198 2.876 2.714 2.404 2.172 1.979 1.769 1.207 0.877 0.511 0.071 -0.462 -1.144 -1.94 -4.586 -9 ,18296 ,KEBNE ,16678351,Thu Nov 25 02:17:44 CET,Thu Nov 25 03:41:58 CET,0.0 1.543 2.112 2.61 3.042 3.37 3.651 3.903 4.366 4.566 4.742 4.933 5.237 5.393 5.703 5.977 6.251 6.38 6.61 6.83 7.132 7.314 7.488 7.749 8.001 8.244 8.476 8.699 8.978 9.254 9.522 9.837 10.144 10.437 10.781 11.148 11.471 11.813 12.185 12.587 12.995 13.444 13.942 14.397 14.92 15.478 16.052 16.646 17.203 17.5 17.415 16.738 15.879 14.983 14.134 13.335 12.588 11.895 11.284 10.661 10.123 9.643 9.198 8.786 8.38 8.003 7.6 7.242 6.946 6.625 6.269 5.98 5.675 5.358 5.117 4.87 4.607 4.316 4.013 3.804 3.585 3.235 2.979 2.712 2.581 2.297 1.988 1.657 1.476 1.139 0.848 0.619 0.395 -0.112 -0.403 -0.724 -1.078 -1.493 -2.012 -2.703 -5.13 -10 ,10683 ,KEBNE ,16678352,Thu Nov 25 02:17:43 CET,Thu Nov 25 03:43:26 CET,0.0 2.327 3.004 3.459 3.818 4.124 4.413 4.678 5.081 5.251 5.428 5.627 5.939 6.082 6.357 6.664 6.971 7.101 7.316 7.522 7.818 8.022 8.224 8.488 8.73 8.969 9.205 9.439 9.732 10.005 10.265 10.568 10.866 11.153 11.481 11.826 12.149 12.509 12.883 13.272 13.689 14.143 14.653 15.149 15.694 16.267 16.891 17.476 18.007 18.445 18.619 18.267 17.533 16.693 15.903 15.134 14.388 13.709 13.138 12.558 12.054 11.594 11.147 10.73 10.34 9.968 9.568 9.224 8.924 8.595 8.239 7.918 7.584 7.253 7.003 6.748 6.475 6.18 5.87 5.658 5.44 5.093 4.843 4.58 4.443 4.136 3.802 3.462 3.29 2.957 2.673 2.465 2.247 1.733 1.43 1.1 0.758 0.383 -0.096 -0.811 -3.234 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt deleted file mode 100644 index 4c4a6e12..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15370 ,KEBNE ,17024032,Wed Dec 22 09:19:59 CET,Wed Dec 22 10:41:09 CET,0.0 2.09 2.629 2.977 3.328 3.69 3.987 4.212 4.598 4.765 4.918 5.112 5.385 5.54 5.81 6.085 6.349 6.472 6.705 6.924 7.241 7.44 7.626 7.874 8.104 8.337 8.57 8.78 9.031 9.271 9.497 9.765 10.029 10.28 10.529 10.795 11.076 11.371 11.653 11.997 12.398 12.78 13.12 13.41 13.742 14.045 14.229 14.326 14.346 13.865 12.278 10.0 7.902 6.095 4.541 3.108 1.871 0.739 -0.255 -1.191 -1.963 -2.673 -3.342 -3.982 -4.58 -5.125 -5.694 -6.174 -6.599 -7.058 -7.531 -7.912 -8.282 -8.674 -8.997 -9.327 -9.658 -10.003 -10.364 -10.609 -10.85 -11.262 -11.558 -11.852 -12.008 -12.314 -12.624 -12.942 -13.112 -13.431 -13.684 -13.898 -14.131 -14.681 -14.979 -15.277 -15.601 -15.96 -16.394 -17.011 -18.908 -2 ,18146 ,KEBNE ,17024033,Wed Dec 22 09:19:59 CET,Wed Dec 22 10:41:00 CET,0.0 2.045 2.555 2.967 3.279 3.528 3.751 3.96 4.342 4.518 4.689 4.905 5.154 5.281 5.531 5.772 5.991 6.102 6.326 6.537 6.824 7.001 7.184 7.459 7.697 7.905 8.109 8.31 8.566 8.81 9.038 9.301 9.571 9.836 10.137 10.454 10.755 11.09 11.396 11.69 11.98 12.255 12.554 12.884 13.291 13.652 13.946 14.119 14.02 13.497 12.115 9.927 7.862 5.99 4.42 2.98 1.708 0.608 -0.364 -1.345 -2.188 -2.92 -3.615 -4.306 -4.939 -5.489 -6.056 -6.561 -6.973 -7.395 -7.845 -8.226 -8.623 -9.016 -9.331 -9.669 -9.989 -10.319 -10.677 -10.925 -11.174 -11.57 -11.856 -12.141 -12.281 -12.554 -12.863 -13.187 -13.346 -13.668 -13.957 -14.183 -14.408 -14.93 -15.236 -15.562 -15.898 -16.284 -16.786 -17.457 -20.174 -3 ,12535 ,KEBNE ,17024034,Wed Dec 22 09:19:59 CET,Wed Dec 22 10:41:09 CET,0.0 1.749 2.217 2.594 2.932 3.219 3.483 3.709 4.106 4.287 4.433 4.588 4.83 4.959 5.226 5.505 5.747 5.852 6.059 6.268 6.576 6.771 6.953 7.225 7.5 7.752 7.99 8.235 8.529 8.789 9.04 9.326 9.605 9.853 10.093 10.371 10.653 10.948 11.284 11.634 11.975 12.319 12.648 12.904 13.178 13.478 13.697 13.775 13.571 12.919 11.389 9.022 6.761 4.816 3.195 1.727 0.439 -0.728 -1.721 -2.683 -3.513 -4.248 -4.916 -5.534 -6.114 -6.646 -7.198 -7.704 -8.15 -8.595 -9.048 -9.429 -9.816 -10.227 -10.549 -10.882 -11.219 -11.561 -11.93 -12.179 -12.429 -12.807 -13.081 -13.377 -13.536 -13.867 -14.208 -14.583 -14.771 -15.108 -15.384 -15.577 -15.788 -16.248 -16.49 -16.783 -17.122 -17.485 -17.966 -18.722 -21.447 -4 ,5603 ,KEBNE ,17024035,Wed Dec 22 09:19:59 CET,Wed Dec 22 10:41:27 CET,0.0 1.999 2.548 2.968 3.326 3.627 3.888 4.109 4.504 4.686 4.855 5.046 5.296 5.437 5.722 5.971 6.183 6.286 6.497 6.703 7.001 7.192 7.375 7.632 7.855 8.063 8.294 8.551 8.883 9.183 9.431 9.685 9.934 10.188 10.49 10.817 11.103 11.429 11.76 12.075 12.389 12.667 12.964 13.287 13.622 13.876 14.06 14.167 14.145 13.646 12.137 9.768 7.568 5.714 4.098 2.616 1.294 0.102 -0.915 -1.922 -2.776 -3.514 -4.195 -4.818 -5.413 -5.975 -6.534 -7.002 -7.416 -7.865 -8.335 -8.725 -9.127 -9.542 -9.86 -10.182 -10.518 -10.878 -11.252 -11.507 -11.754 -12.17 -12.464 -12.741 -12.89 -13.194 -13.507 -13.838 -14.014 -14.332 -14.578 -14.789 -15.006 -15.466 -15.722 -16.013 -16.329 -16.694 -17.106 -17.67 -20.208 -5 ,4822 ,KEBNE ,17024036,Wed Dec 22 09:19:59 CET,Wed Dec 22 10:41:06 CET,0.0 2.19 2.808 3.204 3.496 3.75 3.988 4.199 4.551 4.715 4.887 5.1 5.366 5.529 5.839 6.111 6.355 6.462 6.667 6.856 7.147 7.345 7.516 7.769 7.997 8.209 8.431 8.646 8.917 9.148 9.35 9.625 9.913 10.164 10.411 10.673 10.941 11.252 11.548 11.825 12.17 12.534 12.846 13.123 13.414 13.713 14.006 14.161 14.089 13.613 12.209 9.884 7.703 5.807 4.124 2.621 1.358 0.224 -0.742 -1.708 -2.526 -3.23 -3.902 -4.544 -5.131 -5.661 -6.227 -6.73 -7.154 -7.582 -8.039 -8.416 -8.799 -9.198 -9.492 -9.805 -10.138 -10.484 -10.849 -11.1 -11.353 -11.737 -12.004 -12.293 -12.445 -12.731 -13.006 -13.316 -13.502 -13.834 -14.069 -14.261 -14.466 -14.974 -15.273 -15.586 -15.928 -16.337 -16.813 -17.432 -19.684 -6 ,3035 ,KEBNE ,17024037,Wed Dec 22 09:19:59 CET,Wed Dec 22 10:41:02 CET,0.0 1.777 2.353 2.781 3.085 3.356 3.603 3.829 4.211 4.371 4.52 4.695 4.951 5.095 5.357 5.604 5.853 5.971 6.208 6.437 6.73 6.911 7.093 7.355 7.597 7.81 8.012 8.224 8.503 8.757 8.987 9.265 9.538 9.796 10.071 10.366 10.664 11.005 11.341 11.663 11.982 12.31 12.655 12.936 13.232 13.573 13.829 13.959 13.913 13.344 11.676 9.304 7.3 5.471 3.845 2.425 1.199 0.054 -0.961 -1.958 -2.806 -3.565 -4.276 -4.918 -5.535 -6.107 -6.685 -7.178 -7.594 -8.027 -8.472 -8.843 -9.232 -9.624 -9.926 -10.266 -10.611 -10.949 -11.305 -11.556 -11.808 -12.199 -12.479 -12.769 -12.91 -13.194 -13.506 -13.841 -14.015 -14.331 -14.601 -14.828 -15.045 -15.525 -15.794 -16.076 -16.388 -16.8 -17.363 -18.015 -20.375 -7 ,5502 ,KEBNE ,17024038,Wed Dec 22 09:19:59 CET,Wed Dec 22 10:41:24 CET,0.0 1.756 2.311 2.709 3.024 3.321 3.573 3.785 4.16 4.329 4.482 4.647 4.905 5.059 5.312 5.531 5.741 5.845 6.059 6.27 6.564 6.748 6.929 7.204 7.444 7.651 7.858 8.061 8.334 8.588 8.84 9.131 9.394 9.644 9.916 10.199 10.44 10.698 10.991 11.324 11.668 12.003 12.36 12.667 12.999 13.297 13.495 13.616 13.528 13.019 11.545 9.247 7.148 5.304 3.657 2.168 0.85 -0.33 -1.303 -2.285 -3.12 -3.874 -4.592 -5.242 -5.834 -6.365 -6.925 -7.429 -7.865 -8.323 -8.792 -9.165 -9.546 -9.946 -10.255 -10.582 -10.929 -11.283 -11.653 -11.916 -12.176 -12.543 -12.808 -13.113 -13.264 -13.546 -13.843 -14.156 -14.323 -14.65 -14.884 -15.082 -15.305 -15.808 -16.08 -16.399 -16.766 -17.176 -17.632 -18.257 -20.766 -8 ,11346 ,KEBNE ,17024039,Wed Dec 22 09:19:59 CET,Wed Dec 22 10:41:47 CET,0.0 2.389 2.968 3.37 3.716 4.003 4.241 4.454 4.828 4.996 5.154 5.339 5.605 5.752 6.007 6.267 6.536 6.658 6.863 7.061 7.347 7.527 7.697 7.935 8.176 8.401 8.629 8.863 9.149 9.405 9.622 9.874 10.135 10.402 10.707 11.033 11.326 11.636 11.988 12.37 12.699 13.029 13.438 13.858 14.291 14.6 14.802 14.929 14.77 14.125 12.635 10.523 8.559 6.741 5.134 3.643 2.312 1.128 0.153 -0.782 -1.605 -2.339 -3.02 -3.663 -4.251 -4.796 -5.363 -5.852 -6.272 -6.704 -7.127 -7.482 -7.856 -8.252 -8.561 -8.867 -9.18 -9.502 -9.853 -10.095 -10.326 -10.702 -10.975 -11.251 -11.391 -11.677 -11.969 -12.295 -12.465 -12.786 -13.046 -13.251 -13.481 -14.01 -14.303 -14.624 -14.981 -15.362 -15.854 -16.507 -18.424 -9 ,18679 ,KEBNE ,17024040,Wed Dec 22 09:21:01 CET,Wed Dec 22 10:42:27 CET,0.0 1.746 2.257 2.685 3.005 3.285 3.551 3.774 4.218 4.43 4.616 4.871 5.147 5.31 5.607 5.878 6.141 6.266 6.497 6.706 7.01 7.211 7.389 7.646 7.89 8.129 8.364 8.59 8.877 9.138 9.381 9.661 9.924 10.166 10.451 10.782 11.078 11.376 11.716 12.088 12.447 12.827 13.292 13.713 14.079 14.462 14.832 15.087 15.062 14.552 13.125 10.91 8.901 7.043 5.392 3.944 2.657 1.456 0.44 -0.534 -1.36 -2.101 -2.8 -3.446 -4.04 -4.565 -5.124 -5.625 -6.053 -6.494 -6.932 -7.3 -7.684 -8.074 -8.384 -8.714 -9.057 -9.416 -9.806 -10.075 -10.338 -10.733 -10.997 -11.277 -11.431 -11.746 -12.098 -12.48 -12.66 -12.972 -13.195 -13.388 -13.592 -14.093 -14.383 -14.673 -14.999 -15.375 -15.827 -16.508 -18.788 -10 ,26996 ,KEBNE ,17024041,Wed Dec 22 09:21:01 CET,Wed Dec 22 10:42:09 CET,0.0 2.335 2.878 3.312 3.642 3.935 4.175 4.387 4.769 4.936 5.104 5.309 5.562 5.691 5.949 6.196 6.421 6.527 6.717 6.922 7.212 7.389 7.559 7.783 8.014 8.25 8.473 8.683 8.953 9.213 9.454 9.742 10.004 10.231 10.5 10.821 11.134 11.471 11.831 12.23 12.601 12.907 13.318 13.817 14.29 14.63 14.872 15.02 14.875 14.332 12.915 10.677 8.638 6.774 5.181 3.744 2.416 1.2 0.148 -0.86 -1.688 -2.418 -3.105 -3.757 -4.359 -4.902 -5.442 -5.905 -6.322 -6.761 -7.216 -7.601 -7.985 -8.387 -8.71 -9.021 -9.342 -9.693 -10.062 -10.307 -10.546 -10.929 -11.195 -11.471 -11.62 -11.923 -12.226 -12.554 -12.732 -13.052 -13.293 -13.507 -13.72 -14.202 -14.505 -14.802 -15.116 -15.483 -15.943 -16.616 -18.669 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt deleted file mode 100644 index 55da5446..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,23454 ,KEBNE ,16676070,Wed Nov 24 11:29:37 CET,Wed Nov 24 12:52:30 CET,0.0 0.976 1.413 1.779 2.1 2.377 2.611 2.838 3.253 3.447 3.635 3.83 4.138 4.3 4.613 4.887 5.148 5.272 5.513 5.767 6.16 6.396 6.603 6.903 7.191 7.471 7.73 7.978 8.296 8.601 8.904 9.261 9.616 9.965 10.35 10.783 11.218 11.679 12.156 12.671 13.206 13.797 14.512 15.217 16.063 17.009 18.021 19.106 20.319 21.731 23.386 24.562 25.043 25.232 25.267 25.196 25.06 24.927 24.8 24.589 24.334 24.111 23.893 23.698 23.524 23.345 23.145 22.95 22.767 22.562 22.34 22.146 21.948 21.756 21.602 21.426 21.241 21.057 20.861 20.72 20.566 20.329 20.168 19.989 19.895 19.7 19.479 19.237 19.11 18.849 18.693 18.548 18.387 18.016 17.797 17.536 17.269 16.983 16.613 16.13 14.483 -4 ,27362 ,KEBNE ,16676072,Wed Nov 24 11:29:35 CET,Wed Nov 24 12:56:46 CET,0.0 1.172 1.613 1.997 2.333 2.629 2.895 3.156 3.617 3.805 3.988 4.203 4.514 4.676 4.968 5.235 5.497 5.623 5.882 6.127 6.462 6.677 6.883 7.211 7.532 7.807 8.051 8.287 8.602 8.91 9.215 9.584 9.95 10.299 10.695 11.144 11.58 12.07 12.573 13.096 13.653 14.274 15.02 15.742 16.543 17.456 18.466 19.546 20.841 22.326 23.969 25.165 25.656 25.829 25.819 25.679 25.466 25.283 25.101 24.864 24.646 24.435 24.241 24.027 23.792 23.599 23.396 23.189 23.002 22.816 22.608 22.417 22.237 22.048 21.894 21.741 21.559 21.332 21.103 20.961 20.809 20.548 20.367 20.182 20.079 19.871 19.663 19.445 19.331 19.086 18.925 18.764 18.581 18.185 17.976 17.733 17.444 17.114 16.769 16.277 14.646 -6 ,5283 ,KEBNE ,16676074,Wed Nov 24 11:29:34 CET,Wed Nov 24 12:52:27 CET,0.0 0.978 1.399 1.743 2.081 2.378 2.635 2.882 3.343 3.548 3.738 3.946 4.263 4.425 4.712 4.985 5.254 5.379 5.619 5.848 6.176 6.386 6.597 6.912 7.2 7.469 7.738 8.007 8.35 8.682 8.993 9.353 9.717 10.065 10.452 10.896 11.336 11.817 12.312 12.811 13.333 13.914 14.59 15.286 16.102 16.973 17.969 19.109 20.382 21.833 23.554 24.64 24.997 25.089 25.036 24.916 24.729 24.517 24.283 24.002 23.742 23.487 23.223 22.982 22.765 22.557 22.319 22.089 21.878 21.66 21.432 21.216 20.975 20.723 20.537 20.348 20.149 19.95 19.757 19.606 19.441 19.191 19.004 18.817 18.725 18.522 18.299 18.068 17.939 17.679 17.534 17.378 17.205 16.84 16.639 16.414 16.15 15.839 15.454 14.959 13.495 -8 ,22156 ,KEBNE ,16678360,Thu Nov 25 02:18:45 CET,Thu Nov 25 03:45:24 CET,0.0 1.08 1.458 1.764 2.032 2.275 2.487 2.693 3.094 3.27 3.446 3.638 3.93 4.077 4.363 4.633 4.885 5.007 5.252 5.488 5.823 6.039 6.249 6.535 6.814 7.089 7.359 7.618 7.94 8.243 8.544 8.922 9.297 9.653 10.05 10.482 10.907 11.386 11.893 12.448 13.031 13.653 14.389 15.123 15.916 16.822 17.873 19.013 20.327 21.788 23.375 24.48 24.949 25.114 25.118 25.013 24.834 24.628 24.417 24.193 24.007 23.836 23.653 23.459 23.28 23.087 22.837 22.605 22.409 22.206 21.987 21.811 21.63 21.443 21.274 21.09 20.889 20.668 20.455 20.303 20.144 19.916 19.755 19.574 19.476 19.251 19.015 18.781 18.658 18.403 18.243 18.09 17.926 17.554 17.34 17.106 16.843 16.544 16.195 15.68 13.917 -9 ,32241 ,KEBNE ,16676077,Wed Nov 24 11:29:33 CET,Wed Nov 24 12:52:56 CET,0.0 0.977 1.431 1.79 2.11 2.378 2.626 2.886 3.35 3.544 3.72 3.888 4.181 4.335 4.648 4.954 5.24 5.37 5.606 5.83 6.167 6.383 6.581 6.862 7.153 7.452 7.743 8.028 8.378 8.699 9.006 9.377 9.757 10.125 10.525 10.977 11.406 11.856 12.358 12.899 13.435 14.028 14.728 15.423 16.254 17.193 18.23 19.371 20.663 22.111 23.813 24.95 25.419 25.631 25.691 25.654 25.547 25.396 25.246 25.027 24.796 24.574 24.348 24.125 23.899 23.695 23.482 23.291 23.135 22.962 22.764 22.586 22.391 22.155 21.961 21.777 21.585 21.378 21.153 20.998 20.841 20.586 20.398 20.203 20.105 19.912 19.7 19.47 19.352 19.101 18.95 18.788 18.616 18.255 18.048 17.815 17.573 17.286 16.887 16.319 14.61 -10 ,29183 ,KEBNE ,16678362,Thu Nov 25 02:18:45 CET,Thu Nov 25 03:41:45 CET,0.0 1.058 1.516 1.87 2.199 2.473 2.687 2.893 3.283 3.459 3.626 3.804 4.094 4.248 4.533 4.788 5.04 5.16 5.389 5.616 5.947 6.154 6.351 6.627 6.895 7.159 7.43 7.694 8.014 8.325 8.627 8.987 9.339 9.676 10.048 10.461 10.864 11.323 11.811 12.329 12.877 13.479 14.174 14.883 15.709 16.615 17.61 18.718 20.039 21.503 23.105 24.258 24.757 24.892 24.886 24.798 24.65 24.47 24.27 24.043 23.84 23.646 23.45 23.254 23.022 22.79 22.561 22.331 22.123 21.926 21.724 21.548 21.346 21.111 20.928 20.752 20.574 20.375 20.167 20.022 19.867 19.606 19.423 19.24 19.146 18.943 18.726 18.507 18.397 18.152 18.002 17.856 17.691 17.31 17.097 16.86 16.567 16.247 15.845 15.245 13.384 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index f1ff7e99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26157 ,KEBNE ,16678363,Thu Nov 25 02:18:45 CET,Thu Nov 25 03:45:02 CET,0.0 1.629 2.167 2.565 2.922 3.24 3.525 3.782 4.212 4.391 4.571 4.762 5.077 5.256 5.591 5.903 6.198 6.327 6.555 6.774 7.091 7.303 7.514 7.84 8.142 8.429 8.724 8.998 9.351 9.679 10.0 10.39 10.724 11.05 11.435 11.871 12.308 12.77 13.255 13.777 14.316 14.874 15.524 16.208 16.989 17.84 18.769 19.779 20.886 22.08 23.402 24.115 24.276 24.259 24.096 23.789 23.469 23.175 22.923 22.67 22.398 22.13 21.867 21.616 21.391 21.161 20.905 20.686 20.472 20.236 19.983 19.772 19.568 19.341 19.151 18.961 18.774 18.574 18.362 18.206 18.041 17.792 17.621 17.443 17.351 17.157 16.933 16.69 16.561 16.292 16.126 15.955 15.789 15.463 15.277 15.062 14.798 14.472 14.135 13.734 12.192 -3 ,8840 ,KEBNE ,16678365,Thu Nov 25 02:19:47 CET,Thu Nov 25 03:44:04 CET,0.0 0.912 1.411 1.82 2.166 2.507 2.809 3.085 3.633 3.866 4.087 4.366 4.693 4.86 5.178 5.485 5.778 5.917 6.183 6.433 6.802 7.056 7.288 7.588 7.858 8.113 8.375 8.648 8.99 9.3 9.597 9.96 10.307 10.631 11.002 11.406 11.777 12.205 12.702 13.227 13.803 14.45 15.152 15.839 16.612 17.432 18.323 19.283 20.316 21.394 22.456 23.118 23.357 23.349 23.173 22.913 22.595 22.288 22.029 21.695 21.39 21.136 20.888 20.615 20.329 20.06 19.785 19.549 19.357 19.163 18.943 18.754 18.562 18.374 18.231 18.074 17.904 17.713 17.486 17.329 17.176 16.92 16.745 16.574 16.484 16.281 16.051 15.801 15.676 15.42 15.28 15.117 14.947 14.598 14.417 14.209 13.929 13.625 13.298 12.847 11.078 -4 ,28798 ,KEBNE ,16678366,Thu Nov 25 02:19:47 CET,Thu Nov 25 03:46:19 CET,0.0 1.432 2.003 2.457 2.802 3.088 3.37 3.625 4.108 4.328 4.53 4.785 5.126 5.3 5.602 5.89 6.171 6.307 6.576 6.834 7.166 7.369 7.575 7.864 8.133 8.404 8.685 8.968 9.312 9.628 9.952 10.34 10.692 11.036 11.462 11.953 12.385 12.839 13.363 13.923 14.504 15.143 15.869 16.538 17.273 18.117 19.08 20.092 21.227 22.446 23.687 24.485 24.66 24.588 24.442 24.228 23.97 23.687 23.415 23.142 22.858 22.571 22.31 22.042 21.779 21.548 21.293 21.046 20.818 20.589 20.365 20.154 19.924 19.712 19.552 19.379 19.189 18.986 18.761 18.606 18.44 18.153 17.956 17.768 17.673 17.464 17.243 17.017 16.898 16.639 16.446 16.274 16.111 15.73 15.53 15.318 15.073 14.774 14.407 13.915 12.204 -5 ,14663 ,KEBNE ,16678367,Thu Nov 25 02:19:49 CET,Thu Nov 25 03:39:57 CET,0.0 2.103 2.674 3.081 3.474 3.822 4.14 4.43 4.952 5.189 5.394 5.641 5.97 6.141 6.445 6.714 6.979 7.116 7.379 7.639 8.008 8.226 8.437 8.765 9.072 9.349 9.603 9.859 10.211 10.541 10.865 11.254 11.611 11.94 12.325 12.788 13.221 13.681 14.187 14.7 15.226 15.828 16.498 17.144 17.861 18.616 19.435 20.355 21.403 22.51 23.657 24.315 24.466 24.407 24.192 23.878 23.569 23.296 23.046 22.726 22.436 22.17 21.893 21.651 21.409 21.166 20.923 20.695 20.478 20.251 20.024 19.833 19.605 19.346 19.152 18.954 18.745 18.543 18.351 18.204 18.044 17.8 17.625 17.446 17.352 17.135 16.91 16.699 16.569 16.29 16.142 16.0 15.842 15.489 15.293 15.065 14.797 14.49 14.14 13.713 11.741 -6 ,4971 ,KEBNE ,16678368,Thu Nov 25 02:20:48 CET,Thu Nov 25 03:45:51 CET,0.0 1.191 1.717 2.147 2.504 2.821 3.106 3.36 3.815 4.018 4.22 4.477 4.808 4.978 5.296 5.58 5.843 5.975 6.237 6.49 6.852 7.091 7.31 7.624 7.93 8.217 8.507 8.786 9.123 9.442 9.75 10.099 10.415 10.737 11.115 11.536 11.938 12.362 12.852 13.377 13.894 14.454 15.099 15.754 16.517 17.348 18.266 19.266 20.351 21.517 22.733 23.439 23.666 23.603 23.388 23.136 22.813 22.496 22.206 21.851 21.563 21.32 21.069 20.826 20.589 20.355 20.096 19.858 19.649 19.427 19.192 19.006 18.806 18.579 18.412 18.239 18.057 17.86 17.636 17.485 17.33 17.079 16.894 16.709 16.613 16.395 16.185 15.967 15.835 15.565 15.431 15.268 15.087 14.716 14.524 14.321 14.073 13.792 13.478 13.1 11.818 -7 ,2505 ,KEBNE ,16678369,Thu Nov 25 02:20:48 CET,Thu Nov 25 03:44:12 CET,0.0 1.411 1.99 2.449 2.809 3.126 3.411 3.675 4.16 4.38 4.604 4.879 5.206 5.393 5.746 6.052 6.327 6.459 6.73 6.979 7.303 7.525 7.755 8.073 8.356 8.609 8.889 9.181 9.526 9.846 10.153 10.525 10.902 11.264 11.652 12.066 12.483 12.945 13.418 13.925 14.453 15.033 15.705 16.378 17.154 17.994 18.93 19.926 21.07 22.336 23.599 24.37 24.582 24.525 24.326 24.04 23.752 23.477 23.197 22.881 22.628 22.399 22.143 21.882 21.638 21.407 21.151 20.908 20.681 20.439 20.192 19.994 19.772 19.518 19.316 19.11 18.894 18.677 18.449 18.28 18.114 17.844 17.648 17.448 17.345 17.138 16.92 16.691 16.57 16.303 16.138 15.971 15.809 15.444 15.226 14.983 14.695 14.417 14.133 13.712 11.772 -8 ,29024 ,KEBNE ,16678370,Thu Nov 25 02:20:48 CET,Thu Nov 25 03:44:34 CET,0.0 1.438 2.042 2.508 2.881 3.191 3.493 3.784 4.272 4.476 4.664 4.856 5.161 5.311 5.6 5.922 6.228 6.363 6.624 6.885 7.273 7.527 7.757 8.064 8.359 8.648 8.927 9.193 9.526 9.849 10.15 10.512 10.887 11.253 11.662 12.098 12.505 12.95 13.427 13.935 14.464 15.054 15.724 16.364 17.099 17.92 18.858 19.929 21.107 22.255 23.482 24.348 24.596 24.582 24.409 24.108 23.8 23.498 23.194 22.858 22.556 22.298 22.045 21.775 21.503 21.256 20.993 20.754 20.561 20.343 20.107 19.903 19.663 19.417 19.237 19.04 18.823 18.616 18.433 18.299 18.152 17.925 17.756 17.559 17.453 17.25 17.031 16.78 16.649 16.388 16.252 16.089 15.903 15.519 15.3 15.071 14.827 14.538 14.156 13.652 11.877 -9 ,15915 ,KEBNE ,16678371,Thu Nov 25 02:20:48 CET,Thu Nov 25 03:44:03 CET,0.0 1.497 2.063 2.444 2.766 3.055 3.339 3.596 4.048 4.259 4.459 4.708 5.033 5.189 5.501 5.815 6.112 6.254 6.514 6.759 7.112 7.339 7.57 7.91 8.231 8.526 8.804 9.072 9.421 9.737 10.032 10.415 10.79 11.129 11.499 11.93 12.324 12.736 13.184 13.653 14.155 14.712 15.357 16.011 16.801 17.656 18.623 19.66 20.709 21.836 23.002 23.653 23.75 23.666 23.474 23.217 22.975 22.704 22.414 22.108 21.806 21.503 21.199 20.915 20.67 20.442 20.182 19.937 19.71 19.49 19.256 19.031 18.799 18.578 18.417 18.24 18.045 17.829 17.602 17.442 17.269 17.013 16.829 16.638 16.542 16.33 16.102 15.869 15.749 15.488 15.319 15.165 15.026 14.702 14.509 14.304 14.067 13.785 13.432 12.951 11.483 -10 ,15618 ,KEBNE ,16678372,Thu Nov 25 02:21:50 CET,Thu Nov 25 03:46:41 CET,0.0 1.565 2.13 2.527 2.888 3.199 3.477 3.724 4.174 4.382 4.564 4.774 5.108 5.29 5.626 5.948 6.251 6.392 6.661 6.918 7.286 7.53 7.756 8.072 8.392 8.691 8.972 9.238 9.561 9.884 10.191 10.559 10.907 11.222 11.599 12.055 12.503 12.975 13.45 13.924 14.445 15.059 15.756 16.418 17.118 17.887 18.779 19.757 20.852 22.065 23.287 23.957 24.19 24.139 23.966 23.753 23.496 23.196 22.9 22.597 22.333 22.092 21.822 21.55 21.305 21.045 20.747 20.502 20.286 20.035 19.763 19.55 19.32 19.063 18.865 18.659 18.45 18.227 17.989 17.83 17.667 17.409 17.236 17.048 16.949 16.745 16.505 16.238 16.096 15.822 15.663 15.5 15.323 14.937 14.719 14.463 14.186 13.873 13.497 13.001 11.789 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt deleted file mode 100644 index 79c4301e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19248 ,KEBNE ,16678373,Thu Nov 25 02:21:50 CET,Thu Nov 25 03:45:47 CET,0.0 0.581 0.878 1.099 1.277 1.436 1.578 1.718 1.971 2.081 2.178 2.069 2.446 2.547 2.741 2.918 3.075 3.154 3.304 3.441 3.633 3.744 3.853 4.034 4.216 4.382 4.547 4.705 4.895 5.067 5.23 5.436 5.623 5.81 6.027 6.254 6.465 6.684 6.935 7.218 7.495 7.767 8.065 8.393 8.815 9.229 9.609 9.995 10.354 10.628 10.691 10.301 9.741 9.138 8.541 7.976 7.465 6.973 6.563 6.142 5.746 5.38 5.031 4.696 4.371 4.064 3.737 3.437 3.172 2.894 2.591 2.353 2.106 1.852 1.66 1.448 1.227 0.989 0.743 0.578 0.409 0.14 -0.057 -0.257 -0.36 -0.57 -0.79 -1.073 -1.219 -1.651 -1.691 -1.861 -2.041 -2.395 -2.6 -2.823 -3.068 -3.381 -3.765 -4.228 -5.435 -2 ,18724 ,KEBNE ,16676080,Wed Nov 24 11:29:40 CET,Wed Nov 24 12:51:39 CET,0.0 0.764 1.136 1.426 1.679 1.874 2.057 2.219 2.503 2.632 2.745 2.678 3.065 3.171 3.375 3.572 3.753 3.836 4.002 4.172 4.404 4.544 4.682 4.873 5.046 5.217 5.399 5.572 5.778 5.984 6.179 6.393 6.595 6.791 7.021 7.282 7.537 7.817 8.097 8.378 8.672 9.004 9.349 9.696 10.086 10.478 10.866 11.196 11.477 11.68 11.669 11.277 10.783 10.233 9.693 9.191 8.724 8.266 7.862 7.451 7.097 6.762 6.401 6.048 5.73 5.44 5.121 4.84 4.596 4.32 4.01 3.753 3.496 3.241 3.037 2.825 2.596 2.35 2.114 1.949 1.769 1.494 1.311 1.111 0.998 0.77 0.551 0.302 0.162 -0.256 -0.232 -0.367 -0.523 -0.908 -1.137 -1.403 -1.699 -2.003 -2.363 -2.856 -4.099 -3 ,8126 ,KEBNE ,16678375,Thu Nov 25 02:21:50 CET,Thu Nov 25 03:43:21 CET,0.0 0.636 0.852 1.079 1.291 1.453 1.578 1.711 1.961 2.069 2.177 2.106 2.481 2.583 2.783 2.952 3.102 3.177 3.333 3.485 3.689 3.81 3.94 4.125 4.293 4.45 4.61 4.774 4.997 5.204 5.372 5.563 5.751 5.933 6.161 6.422 6.657 6.905 7.178 7.464 7.722 7.99 8.302 8.599 8.932 9.296 9.666 10.03 10.362 10.589 10.583 10.178 9.61 9.045 8.503 7.945 7.388 6.872 6.443 6.007 5.591 5.204 4.826 4.476 4.155 3.841 3.516 3.23 2.97 2.692 2.41 2.184 1.949 1.699 1.499 1.27 1.021 0.772 0.534 0.363 0.174 -0.124 -0.325 -0.522 -0.622 -0.825 -1.057 -1.302 -1.422 -1.831 -1.854 -2.019 -2.187 -2.547 -2.735 -2.933 -3.183 -3.498 -3.859 -4.351 -5.433 -4 ,22804 ,KEBNE ,16676082,Wed Nov 24 11:29:34 CET,Wed Nov 24 12:51:43 CET,0.0 0.778 1.107 1.346 1.54 1.717 1.879 2.016 2.223 2.32 2.419 2.316 2.679 2.76 2.914 3.074 3.246 3.33 3.481 3.618 3.817 3.938 4.055 4.244 4.419 4.581 4.738 4.884 5.081 5.265 5.44 5.645 5.827 5.995 6.191 6.42 6.639 6.872 7.115 7.39 7.662 7.949 8.269 8.576 8.969 9.398 9.812 10.221 10.606 10.871 10.874 10.418 9.789 9.134 8.553 7.984 7.451 6.958 6.506 6.041 5.624 5.253 4.885 4.507 4.138 3.805 3.464 3.169 2.931 2.67 2.385 2.15 1.903 1.642 1.43 1.2 0.961 0.719 0.482 0.319 0.137 -0.159 -0.366 -0.588 -0.711 -0.982 -1.268 -1.548 -1.685 -2.111 -2.143 -2.317 -2.492 -2.864 -3.071 -3.298 -3.547 -3.847 -4.231 -4.7 -5.809 -5 ,24377 ,KEBNE ,16678377,Thu Nov 25 02:21:50 CET,Thu Nov 25 03:44:29 CET,0.0 0.717 0.896 1.052 1.178 1.315 1.464 1.59 1.83 1.946 2.057 1.974 2.358 2.456 2.614 2.773 2.925 2.993 3.117 3.247 3.446 3.565 3.671 3.828 3.992 4.155 4.31 4.46 4.655 4.841 5.021 5.234 5.426 5.63 5.882 6.127 6.364 6.632 6.919 7.223 7.517 7.829 8.179 8.537 8.92 9.301 9.711 10.111 10.496 10.804 10.849 10.438 9.895 9.309 8.71 8.166 7.656 7.15 6.745 6.333 5.949 5.581 5.198 4.823 4.476 4.153 3.816 3.503 3.236 2.992 2.739 2.518 2.274 2.017 1.828 1.641 1.456 1.249 1.026 0.867 0.707 0.48 0.302 0.097 -0.012 -0.244 -0.468 -0.684 -0.803 -1.21 -1.194 -1.352 -1.52 -1.879 -2.076 -2.282 -2.519 -2.812 -3.237 -3.894 -5.688 -6 ,29789 ,KEBNE ,16676084,Wed Nov 24 11:29:35 CET,Wed Nov 24 12:51:32 CET,0.0 0.801 1.121 1.347 1.504 1.654 1.81 1.961 2.21 2.32 2.436 2.372 2.745 2.843 3.019 3.19 3.353 3.425 3.559 3.683 3.87 3.992 4.12 4.314 4.499 4.683 4.872 5.041 5.25 5.465 5.665 5.884 6.09 6.314 6.567 6.816 7.052 7.321 7.609 7.891 8.181 8.516 8.923 9.279 9.629 9.988 10.38 10.778 11.092 11.324 11.348 10.971 10.378 9.799 9.22 8.633 8.106 7.594 7.118 6.658 6.259 5.903 5.55 5.211 4.883 4.557 4.218 3.913 3.656 3.396 3.121 2.894 2.656 2.407 2.209 1.983 1.745 1.517 1.277 1.104 0.928 0.657 0.475 0.286 0.154 -0.148 -0.406 -0.646 -0.768 -1.177 -1.214 -1.39 -1.565 -1.962 -2.192 -2.442 -2.706 -2.995 -3.342 -3.806 -4.903 -7 ,5152 ,KEBNE ,16676085,Wed Nov 24 11:29:34 CET,Wed Nov 24 12:51:44 CET,0.0 0.581 0.807 1.009 1.175 1.304 1.433 1.565 1.792 1.893 1.99 1.91 2.299 2.407 2.598 2.775 2.943 3.022 3.172 3.318 3.53 3.67 3.809 3.995 4.179 4.355 4.521 4.69 4.898 5.096 5.283 5.501 5.726 5.941 6.175 6.446 6.697 6.954 7.229 7.515 7.813 8.126 8.514 8.908 9.295 9.704 10.128 10.502 10.818 11.042 11.025 10.615 10.117 9.593 9.052 8.491 7.986 7.541 7.104 6.651 6.238 5.847 5.481 5.133 4.808 4.505 4.186 3.896 3.642 3.388 3.118 2.883 2.636 2.388 2.212 2.028 1.824 1.616 1.416 1.278 1.128 0.882 0.703 0.51 0.412 0.197 -0.047 -0.308 -0.45 -0.884 -0.926 -1.092 -1.254 -1.66 -1.882 -2.111 -2.381 -2.685 -3.064 -3.528 -4.87 -8 ,6831 ,KEBNE ,16678380,Thu Nov 25 02:21:50 CET,Thu Nov 25 03:48:39 CET,0.0 0.862 1.178 1.441 1.677 1.894 2.069 2.232 2.523 2.644 2.753 2.689 3.082 3.198 3.409 3.596 3.762 3.848 4.022 4.179 4.408 4.558 4.712 4.933 5.122 5.285 5.436 5.589 5.804 6.002 6.185 6.422 6.646 6.845 7.091 7.376 7.632 7.916 8.204 8.5 8.808 9.126 9.473 9.811 10.189 10.584 10.998 11.387 11.77 12.074 12.087 11.672 11.103 10.471 9.874 9.325 8.821 8.339 7.883 7.387 6.949 6.552 6.178 5.836 5.52 5.217 4.895 4.625 4.391 4.138 3.852 3.61 3.35 3.069 2.857 2.647 2.426 2.198 1.968 1.81 1.654 1.415 1.242 1.048 0.951 0.735 0.509 0.287 0.159 -0.266 -0.276 -0.423 -0.591 -0.968 -1.18 -1.422 -1.672 -1.969 -2.332 -2.824 -4.071 -9 ,8823 ,KEBNE ,16678381,Thu Nov 25 02:22:52 CET,Thu Nov 25 03:45:28 CET,0.0 0.918 1.253 1.5 1.693 1.875 2.047 2.198 2.46 2.58 2.693 2.613 2.995 3.097 3.295 3.482 3.656 3.74 3.911 4.065 4.282 4.42 4.557 4.735 4.884 5.037 5.2 5.368 5.573 5.752 5.917 6.118 6.315 6.495 6.709 6.971 7.222 7.487 7.782 8.099 8.416 8.765 9.15 9.518 9.924 10.322 10.748 11.196 11.612 11.919 11.911 11.47 10.911 10.326 9.739 9.153 8.588 8.065 7.621 7.155 6.741 6.363 5.985 5.638 5.328 5.054 4.755 4.45 4.178 3.899 3.612 3.379 3.131 2.89 2.707 2.494 2.266 2.035 1.78 1.606 1.444 1.18 0.985 0.79 0.69 0.474 0.23 -0.019 -0.147 -0.567 -0.572 -0.741 -0.923 -1.301 -1.516 -1.753 -2.002 -2.297 -2.66 -3.11 -4.245 -10 ,5187 ,KEBNE ,16676088,Wed Nov 24 11:29:36 CET,Wed Nov 24 12:53:09 CET,0.0 0.782 1.09 1.362 1.578 1.757 1.92 2.069 2.345 2.477 2.61 2.589 2.989 3.103 3.301 3.502 3.697 3.788 3.949 4.102 4.343 4.494 4.642 4.852 5.049 5.232 5.422 5.608 5.823 6.02 6.215 6.45 6.659 6.861 7.079 7.318 7.545 7.793 8.067 8.351 8.639 8.939 9.288 9.63 10.014 10.439 10.877 11.286 11.669 11.949 11.912 11.515 10.963 10.355 9.756 9.195 8.673 8.176 7.719 7.22 6.791 6.392 5.999 5.64 5.313 5.027 4.711 4.413 4.161 3.883 3.587 3.345 3.099 2.822 2.596 2.386 2.179 1.953 1.691 1.503 1.312 1.009 0.803 0.592 0.472 0.208 -0.064 -0.334 -0.466 -0.901 -0.977 -1.152 -1.336 -1.754 -2.006 -2.274 -2.546 -2.888 -3.318 -3.936 -5.644 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 377e571f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28118 ,KEBNE ,16678383,Thu Nov 25 02:22:52 CET,Thu Nov 25 03:46:14 CET,0.0 0.968 1.268 1.459 1.597 1.684 1.746 1.81 1.911 1.933 1.947 1.81 1.957 1.947 1.926 1.899 1.862 1.84 1.789 1.724 1.605 1.52 1.434 1.286 1.119 0.953 0.774 0.582 0.33 0.068 -0.225 -0.597 -0.958 -1.332 -1.79 -2.349 -2.919 -3.576 -4.332 -5.191 -6.186 -7.369 -8.828 -10.422 -12.475 -15.021 -18.252 -22.286 -27.564 -34.774 -45.352 -56.355 -64.405 -70.683 -75.663 -79.79 -83.192 -86.09 -88.485 -90.781 -92.693 -94.353 -95.847 -97.176 -98.405 -99.516 -100.604 -101.54 -102.348 -103.162 -103.97 -104.615 -105.297 -106.021 -106.568 -107.119 -107.664 -108.229 -108.811 -109.197 -109.596 -110.203 -110.614 -111.02 -111.224 -111.641 -112.071 -112.522 -112.757 -113.274 -113.483 -113.724 -113.978 -114.524 -114.805 -115.092 -115.408 -115.829 -116.278 -116.76 -118.01 -2 ,30352 ,KEBNE ,16676090,Wed Nov 24 11:29:34 CET,Wed Nov 24 12:51:16 CET,0.0 0.642 0.948 1.148 1.285 1.377 1.444 1.495 1.551 1.568 1.582 1.441 1.601 1.607 1.59 1.541 1.485 1.46 1.396 1.325 1.213 1.125 1.034 0.88 0.731 0.58 0.408 0.213 -0.055 -0.332 -0.616 -0.964 -1.33 -1.713 -2.175 -2.727 -3.282 -3.938 -4.718 -5.587 -6.569 -7.78 -9.298 -10.928 -12.97 -15.465 -18.663 -22.707 -27.992 -35.186 -45.873 -56.977 -65.088 -71.389 -76.375 -80.502 -83.883 -86.81 -89.229 -91.508 -93.375 -95.01 -96.516 -97.877 -99.136 -100.277 -101.407 -102.369 -103.185 -104.002 -104.831 -105.511 -106.205 -106.923 -107.468 -108.0 -108.529 -109.079 -109.649 -110.037 -110.417 -110.994 -111.399 -111.815 -112.014 -112.41 -112.843 -113.32 -113.56 -114.062 -114.264 -114.505 -114.763 -115.313 -115.603 -115.901 -116.209 -116.565 -116.951 -117.441 -118.508 -3 ,14343 ,KEBNE ,16676091,Wed Nov 24 11:30:35 CET,Wed Nov 24 12:52:22 CET,0.0 0.695 0.974 1.151 1.278 1.374 1.459 1.521 1.595 1.619 1.636 1.494 1.651 1.64 1.609 1.578 1.546 1.524 1.463 1.392 1.272 1.186 1.086 0.92 0.768 0.603 0.42 0.239 -0.023 -0.3 -0.571 -0.92 -1.294 -1.669 -2.124 -2.684 -3.257 -3.927 -4.705 -5.573 -6.559 -7.768 -9.26 -10.884 -12.953 -15.467 -18.647 -22.663 -28.013 -35.273 -45.911 -56.949 -64.978 -71.194 -76.147 -80.264 -83.676 -86.58 -88.961 -91.291 -93.218 -94.822 -96.293 -97.648 -98.88 -99.977 -101.068 -102.019 -102.845 -103.677 -104.511 -105.199 -105.896 -106.587 -107.114 -107.665 -108.231 -108.811 -109.385 -109.767 -110.166 -110.759 -111.144 -111.547 -111.764 -112.219 -112.682 -113.158 -113.4 -113.917 -114.146 -114.407 -114.673 -115.224 -115.503 -115.792 -116.117 -116.47 -116.863 -117.326 -118.01 -4 ,26916 ,KEBNE ,16678386,Thu Nov 25 02:22:52 CET,Thu Nov 25 03:49:16 CET,0.0 0.799 1.144 1.341 1.488 1.606 1.678 1.75 1.88 1.913 1.932 1.802 1.953 1.946 1.907 1.845 1.795 1.77 1.706 1.635 1.522 1.434 1.339 1.201 1.054 0.895 0.73 0.546 0.286 0.026 -0.239 -0.591 -0.955 -1.305 -1.746 -2.302 -2.868 -3.523 -4.267 -5.134 -6.13 -7.31 -8.804 -10.452 -12.493 -14.977 -18.19 -22.19 -27.463 -34.734 -45.395 -56.476 -64.644 -70.923 -75.879 -80.02 -83.411 -86.315 -88.707 -91.01 -92.92 -94.539 -96.004 -97.349 -98.581 -99.674 -100.767 -101.712 -102.512 -103.322 -104.162 -104.849 -105.534 -106.214 -106.731 -107.26 -107.817 -108.404 -108.995 -109.38 -109.753 -110.337 -110.753 -111.172 -111.384 -111.824 -112.272 -112.744 -112.991 -113.51 -113.753 -114.013 -114.281 -114.873 -115.174 -115.478 -115.812 -116.184 -116.606 -117.193 -118.56 -5 ,5921 ,KEBNE ,16676093,Wed Nov 24 11:30:35 CET,Wed Nov 24 13:01:52 CET,0.0 1.112 1.358 1.548 1.69 1.795 1.879 1.932 2.004 2.032 2.055 1.909 2.058 2.042 2.013 1.964 1.902 1.872 1.801 1.716 1.574 1.477 1.383 1.245 1.104 0.938 0.759 0.582 0.337 0.082 -0.16 -0.487 -0.87 -1.262 -1.721 -2.264 -2.843 -3.533 -4.32 -5.204 -6.178 -7.345 -8.845 -10.485 -12.543 -15.038 -18.209 -22.22 -27.57 -34.855 -45.479 -56.539 -64.639 -70.961 -75.974 -80.114 -83.494 -86.364 -88.737 -90.991 -92.849 -94.469 -95.961 -97.328 -98.565 -99.649 -100.76 -101.735 -102.561 -103.396 -104.233 -104.921 -105.612 -106.298 -106.829 -107.376 -107.921 -108.478 -109.056 -109.438 -109.818 -110.397 -110.814 -111.239 -111.446 -111.864 -112.29 -112.728 -112.958 -113.479 -113.696 -113.946 -114.21 -114.743 -115.045 -115.372 -115.689 -116.021 -116.409 -116.897 -117.797 -6 ,21317 ,KEBNE ,16676094,Wed Nov 24 11:30:35 CET,Wed Nov 24 12:54:27 CET,0.0 1.208 1.496 1.691 1.833 1.936 2.005 2.07 2.171 2.193 2.205 2.06 2.21 2.201 2.167 2.121 2.079 2.051 1.97 1.881 1.741 1.65 1.561 1.408 1.241 1.06 0.874 0.69 0.424 0.143 -0.143 -0.505 -0.862 -1.234 -1.692 -2.251 -2.831 -3.489 -4.25 -5.139 -6.138 -7.328 -8.842 -10.483 -12.527 -15.033 -18.209 -22.196 -27.525 -34.815 -45.492 -56.553 -64.647 -70.917 -75.864 -79.992 -83.388 -86.274 -88.661 -90.967 -92.87 -94.49 -95.982 -97.34 -98.553 -99.635 -100.731 -101.692 -102.505 -103.322 -104.152 -104.829 -105.506 -106.189 -106.731 -107.272 -107.809 -108.374 -108.943 -109.321 -109.713 -110.312 -110.698 -111.092 -111.308 -111.771 -112.247 -112.698 -112.929 -113.452 -113.682 -113.938 -114.192 -114.725 -115.023 -115.348 -115.673 -116.02 -116.44 -116.94 -118.001 -7 ,29080 ,KEBNE ,16676095,Wed Nov 24 11:30:36 CET,Wed Nov 24 12:52:26 CET,0.0 1.035 1.318 1.505 1.645 1.773 1.858 1.921 2.03 2.064 2.089 1.949 2.1 2.09 2.055 2.021 1.966 1.931 1.862 1.793 1.678 1.59 1.502 1.349 1.171 0.998 0.812 0.62 0.377 0.13 -0.137 -0.496 -0.845 -1.196 -1.658 -2.218 -2.787 -3.462 -4.232 -5.091 -6.076 -7.252 -8.724 -10.345 -12.398 -14.901 -18.095 -22.108 -27.445 -34.7 -45.318 -56.406 -64.495 -70.763 -75.695 -79.796 -83.2 -86.151 -88.566 -90.861 -92.774 -94.399 -95.876 -97.243 -98.498 -99.609 -100.723 -101.703 -102.532 -103.347 -104.162 -104.842 -105.552 -106.263 -106.798 -107.354 -107.921 -108.498 -109.101 -109.503 -109.891 -110.477 -110.869 -111.27 -111.483 -111.923 -112.373 -112.841 -113.09 -113.615 -113.855 -114.116 -114.384 -114.938 -115.242 -115.574 -115.904 -116.263 -116.678 -117.145 -117.912 -8 ,8748 ,KEBNE ,16678390,Thu Nov 25 02:23:53 CET,Thu Nov 25 03:47:54 CET,0.0 0.848 1.159 1.372 1.526 1.64 1.715 1.768 1.824 1.853 1.874 1.722 1.875 1.873 1.847 1.797 1.75 1.729 1.681 1.616 1.498 1.407 1.315 1.178 1.026 0.863 0.687 0.493 0.23 -0.049 -0.317 -0.664 -1.028 -1.391 -1.832 -2.367 -2.945 -3.6 -4.35 -5.22 -6.179 -7.35 -8.865 -10.485 -12.537 -15.061 -18.247 -22.244 -27.532 -34.776 -45.443 -56.529 -64.632 -70.908 -75.892 -80.05 -83.459 -86.37 -88.788 -91.114 -93.029 -94.658 -96.149 -97.501 -98.719 -99.8 -100.892 -101.847 -102.664 -103.485 -104.316 -105.0 -105.69 -106.378 -106.897 -107.419 -107.951 -108.508 -109.091 -109.478 -109.853 -110.428 -110.824 -111.236 -111.451 -111.88 -112.33 -112.804 -113.045 -113.568 -113.8 -114.054 -114.315 -114.91 -115.233 -115.554 -115.895 -116.264 -116.649 -117.044 -117.689 -9 ,17775 ,KEBNE ,16678391,Thu Nov 25 02:23:58 CET,Thu Nov 25 03:42:28 CET,0.0 0.822 1.126 1.328 1.47 1.567 1.655 1.733 1.802 1.817 1.83 1.684 1.849 1.843 1.836 1.81 1.749 1.714 1.648 1.566 1.421 1.325 1.227 1.084 0.927 0.772 0.608 0.416 0.162 -0.088 -0.348 -0.685 -1.041 -1.415 -1.88 -2.448 -3.025 -3.685 -4.45 -5.333 -6.328 -7.529 -9.046 -10.681 -12.744 -15.257 -18.445 -22.439 -27.726 -34.994 -45.718 -56.817 -64.914 -71.271 -76.299 -80.428 -83.783 -86.685 -89.079 -91.359 -93.244 -94.855 -96.321 -97.647 -98.838 -99.917 -101.035 -101.987 -102.785 -103.608 -104.453 -105.141 -105.832 -106.521 -107.038 -107.563 -108.104 -108.67 -109.234 -109.601 -109.975 -110.552 -110.953 -111.351 -111.549 -111.974 -112.437 -112.916 -113.15 -113.657 -113.889 -114.151 -114.422 -114.996 -115.292 -115.593 -115.915 -116.26 -116.609 -117.023 -117.683 -10 ,14217 ,KEBNE ,16678392,Thu Nov 25 02:23:54 CET,Thu Nov 25 03:47:06 CET,0.0 0.864 1.125 1.318 1.429 1.521 1.607 1.68 1.759 1.775 1.787 1.646 1.798 1.792 1.773 1.731 1.674 1.646 1.569 1.485 1.35 1.245 1.146 0.995 0.834 0.665 0.479 0.29 0.045 -0.228 -0.516 -0.864 -1.209 -1.571 -2.02 -2.552 -3.105 -3.77 -4.545 -5.406 -6.381 -7.576 -9.083 -10.744 -12.84 -15.354 -18.528 -22.57 -27.952 -35.232 -45.948 -57.174 -65.346 -71.611 -76.566 -80.672 -84.056 -86.955 -89.347 -91.634 -93.507 -95.141 -96.677 -98.061 -99.302 -100.405 -101.495 -102.448 -103.255 -104.069 -104.915 -105.595 -106.269 -106.975 -107.521 -108.052 -108.589 -109.139 -109.701 -110.072 -110.439 -111.023 -111.434 -111.843 -112.047 -112.489 -112.962 -113.442 -113.685 -114.213 -114.449 -114.715 -115.0 -115.586 -115.887 -116.183 -116.497 -116.843 -117.259 -117.811 -118.802 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt deleted file mode 100644 index da661664..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18549 ,KEBNE ,16676109,Wed Nov 24 11:32:38 CET,Wed Nov 24 12:54:01 CET,0.0 0.367 0.583 0.773 0.944 1.084 1.227 1.371 1.649 1.771 1.883 1.835 2.218 2.317 2.501 2.664 2.81 2.89 3.054 3.197 3.409 3.548 3.682 3.869 4.041 4.202 4.359 4.524 4.752 4.953 5.131 5.342 5.529 5.72 5.949 6.195 6.428 6.672 6.923 7.181 7.455 7.755 8.089 8.389 8.701 9.055 9.421 9.731 9.964 10.033 9.736 9.034 8.279 7.542 6.841 6.21 5.635 5.073 4.587 4.101 3.686 3.298 2.93 2.596 2.276 1.978 1.669 1.389 1.141 0.885 0.619 0.386 0.146 -0.093 -0.269 -0.448 -0.644 -0.857 -1.085 -1.239 -1.392 -1.636 -1.805 -1.977 -2.062 -2.243 -2.448 -2.658 -2.766 -3.152 -3.1 -3.226 -3.357 -3.624 -3.771 -3.938 -4.141 -4.367 -4.62 -4.932 -5.488 -2 ,1261 ,KEBNE ,16676110,Wed Nov 24 11:32:42 CET,Wed Nov 24 12:50:35 CET,0.0 0.296 0.483 0.654 0.827 0.98 1.094 1.199 1.429 1.541 1.658 1.598 1.976 2.069 2.24 2.402 2.557 2.638 2.787 2.93 3.143 3.27 3.388 3.55 3.7 3.841 3.975 4.104 4.28 4.448 4.599 4.784 4.966 5.136 5.357 5.619 5.845 6.079 6.332 6.579 6.831 7.149 7.496 7.806 8.138 8.446 8.739 9.052 9.321 9.415 9.125 8.377 7.618 6.885 6.216 5.581 4.999 4.474 4.014 3.532 3.107 2.713 2.315 1.953 1.642 1.355 1.036 0.755 0.509 0.254 -0.009 -0.228 -0.463 -0.721 -0.912 -1.098 -1.286 -1.473 -1.67 -1.809 -1.959 -2.199 -2.367 -2.545 -2.638 -2.826 -3.031 -3.243 -3.35 -3.753 -3.751 -3.886 -4.007 -4.258 -4.406 -4.572 -4.759 -4.969 -5.22 -5.521 -6.239 -3 ,5130 ,KEBNE ,16678395,Thu Nov 25 02:24:55 CET,Thu Nov 25 03:48:04 CET,0.0 0.367 0.526 0.69 0.845 0.975 1.08 1.185 1.41 1.511 1.6 1.48 1.846 1.928 2.083 2.237 2.378 2.444 2.569 2.692 2.885 3.009 3.113 3.271 3.435 3.604 3.777 3.932 4.122 4.299 4.47 4.699 4.924 5.12 5.346 5.603 5.842 6.103 6.362 6.619 6.887 7.163 7.47 7.783 8.109 8.43 8.798 9.12 9.334 9.373 9.039 8.324 7.547 6.802 6.124 5.503 4.953 4.441 3.994 3.516 3.074 2.696 2.36 2.033 1.712 1.402 1.084 0.804 0.546 0.271 0.004 -0.217 -0.456 -0.692 -0.872 -1.069 -1.276 -1.484 -1.683 -1.82 -1.977 -2.226 -2.395 -2.583 -2.678 -2.871 -3.081 -3.277 -3.37 -3.759 -3.725 -3.85 -3.986 -4.289 -4.436 -4.593 -4.802 -5.032 -5.279 -5.558 -6.043 -4 ,3490 ,KEBNE ,16678396,Thu Nov 25 02:24:55 CET,Thu Nov 25 03:48:34 CET,0.0 0.28 0.465 0.615 0.773 0.909 1.018 1.138 1.35 1.437 1.519 1.404 1.763 1.847 2.001 2.146 2.276 2.335 2.456 2.584 2.799 2.931 3.046 3.228 3.404 3.575 3.737 3.888 4.082 4.272 4.457 4.663 4.855 5.057 5.292 5.532 5.749 5.992 6.282 6.57 6.827 7.119 7.446 7.75 8.09 8.422 8.763 9.131 9.433 9.495 9.238 8.609 7.849 7.085 6.416 5.798 5.196 4.609 4.121 3.644 3.229 2.863 2.509 2.179 1.873 1.597 1.307 1.04 0.808 0.568 0.31 0.097 -0.131 -0.386 -0.572 -0.753 -0.942 -1.148 -1.371 -1.523 -1.678 -1.912 -2.07 -2.23 -2.316 -2.494 -2.659 -2.857 -2.965 -3.352 -3.314 -3.435 -3.565 -3.859 -4.022 -4.183 -4.352 -4.551 -4.782 -5.066 -5.867 -5 ,11220 ,KEBNE ,16678397,Thu Nov 25 02:24:55 CET,Thu Nov 25 03:47:54 CET,0.0 0.796 1.104 1.342 1.553 1.739 1.906 2.052 2.295 2.411 2.533 2.504 2.889 2.979 3.14 3.304 3.483 3.574 3.73 3.878 4.101 4.232 4.35 4.522 4.681 4.837 5.012 5.181 5.389 5.569 5.726 5.925 6.111 6.282 6.471 6.675 6.861 7.063 7.288 7.521 7.756 8.029 8.344 8.632 8.964 9.334 9.672 9.941 10.165 10.28 10.08 9.406 8.629 7.877 7.164 6.491 5.901 5.362 4.888 4.413 4.015 3.639 3.254 2.904 2.587 2.282 1.951 1.655 1.396 1.138 0.879 0.662 0.448 0.23 0.053 -0.134 -0.33 -0.527 -0.738 -0.887 -1.043 -1.29 -1.45 -1.619 -1.711 -1.897 -2.083 -2.279 -2.389 -2.785 -2.727 -2.841 -2.967 -3.241 -3.398 -3.589 -3.789 -3.982 -4.216 -4.51 -5.037 -6 ,29977 ,KEBNE ,16678398,Thu Nov 25 02:24:54 CET,Thu Nov 25 03:46:13 CET,0.0 0.511 0.742 0.923 1.084 1.2 1.315 1.431 1.621 1.715 1.802 1.678 2.025 2.094 2.237 2.383 2.529 2.596 2.725 2.848 3.025 3.131 3.229 3.379 3.531 3.676 3.815 3.959 4.138 4.309 4.488 4.698 4.896 5.093 5.311 5.545 5.777 6.029 6.289 6.554 6.814 7.117 7.468 7.767 8.078 8.409 8.729 9.027 9.317 9.469 9.224 8.553 7.83 7.069 6.33 5.682 5.143 4.615 4.144 3.685 3.276 2.892 2.528 2.199 1.884 1.567 1.239 0.971 0.743 0.51 0.265 0.042 -0.192 -0.417 -0.604 -0.828 -1.051 -1.275 -1.51 -1.664 -1.819 -2.059 -2.243 -2.441 -2.533 -2.719 -2.936 -3.167 -3.283 -3.677 -3.636 -3.777 -3.921 -4.211 -4.382 -4.559 -4.747 -4.984 -5.265 -5.616 -6.581 -7 ,26609 ,KEBNE ,16678399,Thu Nov 25 02:24:55 CET,Thu Nov 25 03:49:03 CET,0.0 0.54 0.758 0.937 1.092 1.235 1.373 1.489 1.687 1.781 1.883 1.815 2.182 2.269 2.448 2.604 2.75 2.822 2.969 3.118 3.324 3.45 3.578 3.752 3.911 4.079 4.242 4.389 4.577 4.755 4.927 5.144 5.344 5.531 5.743 5.988 6.236 6.501 6.761 7.012 7.275 7.563 7.878 8.184 8.531 8.887 9.26 9.645 9.945 10.055 9.827 9.153 8.435 7.711 7.018 6.362 5.757 5.21 4.712 4.178 3.73 3.355 2.976 2.597 2.266 1.974 1.669 1.406 1.169 0.908 0.644 0.418 0.184 -0.045 -0.228 -0.415 -0.608 -0.827 -1.043 -1.188 -1.35 -1.606 -1.783 -1.961 -2.053 -2.243 -2.443 -2.658 -2.767 -3.161 -3.126 -3.255 -3.39 -3.681 -3.829 -4.003 -4.198 -4.395 -4.61 -4.907 -5.867 -8 ,27603 ,KEBNE ,16676116,Wed Nov 24 11:33:43 CET,Wed Nov 24 12:50:43 CET,0.0 0.402 0.632 0.859 1.026 1.152 1.265 1.368 1.561 1.655 1.748 1.641 2.002 2.081 2.233 2.381 2.523 2.587 2.721 2.846 2.998 3.1 3.207 3.348 3.482 3.614 3.753 3.885 4.045 4.2 4.344 4.52 4.709 4.914 5.154 5.404 5.635 5.896 6.162 6.431 6.696 6.967 7.291 7.625 7.97 8.293 8.626 8.942 9.217 9.341 9.115 8.48 7.72 6.927 6.225 5.648 5.12 4.594 4.125 3.653 3.254 2.888 2.535 2.205 1.876 1.561 1.215 0.901 0.645 0.393 0.137 -0.08 -0.31 -0.557 -0.747 -0.938 -1.128 -1.337 -1.547 -1.685 -1.83 -2.063 -2.223 -2.391 -2.486 -2.689 -2.891 -3.093 -3.196 -3.588 -3.531 -3.642 -3.762 -4.011 -4.153 -4.32 -4.524 -4.753 -4.982 -5.293 -5.989 -9 ,15084 ,KEBNE ,16676117,Wed Nov 24 11:33:40 CET,Wed Nov 24 12:54:51 CET,0.0 0.539 0.863 1.156 1.371 1.55 1.71 1.852 2.125 2.237 2.339 2.272 2.643 2.739 2.919 3.09 3.261 3.34 3.494 3.635 3.833 3.959 4.078 4.26 4.438 4.613 4.786 4.938 5.135 5.335 5.517 5.717 5.901 6.083 6.311 6.584 6.835 7.089 7.335 7.579 7.854 8.138 8.447 8.771 9.104 9.43 9.763 10.056 10.264 10.342 10.042 9.312 8.519 7.75 7.072 6.419 5.842 5.337 4.873 4.379 3.962 3.59 3.234 2.892 2.559 2.262 1.953 1.665 1.416 1.171 0.913 0.697 0.483 0.252 0.065 -0.137 -0.349 -0.555 -0.764 -0.918 -1.069 -1.299 -1.462 -1.63 -1.713 -1.887 -2.092 -2.301 -2.409 -2.81 -2.793 -2.924 -3.057 -3.332 -3.477 -3.627 -3.799 -4.005 -4.252 -4.535 -5.267 -10 ,11015 ,KEBNE ,16676118,Wed Nov 24 11:33:40 CET,Wed Nov 24 12:54:54 CET,0.0 0.464 0.668 0.858 1.02 1.156 1.27 1.376 1.59 1.705 1.82 1.777 2.157 2.245 2.405 2.563 2.713 2.79 2.943 3.08 3.292 3.429 3.547 3.717 3.891 4.059 4.215 4.358 4.543 4.742 4.93 5.134 5.332 5.516 5.727 5.966 6.185 6.418 6.664 6.926 7.19 7.47 7.791 8.106 8.419 8.733 9.061 9.355 9.605 9.705 9.431 8.771 8.03 7.286 6.616 5.979 5.388 4.854 4.394 3.907 3.489 3.125 2.774 2.43 2.092 1.784 1.472 1.198 0.954 0.7 0.43 0.201 -0.022 -0.24 -0.425 -0.624 -0.813 -1.019 -1.244 -1.402 -1.572 -1.835 -2.013 -2.202 -2.299 -2.48 -2.662 -2.871 -2.984 -3.38 -3.325 -3.439 -3.562 -3.843 -3.988 -4.149 -4.338 -4.517 -4.732 -5.023 -5.735 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 27b3b1a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23561 ,KEBNE ,16678403,Thu Nov 25 02:25:56 CET,Thu Nov 25 03:48:01 CET,0.0 1.219 1.652 2.014 2.353 2.62 2.847 3.058 3.416 3.577 3.733 3.729 4.128 4.251 4.486 4.691 4.881 4.975 5.173 5.362 5.601 5.742 5.874 6.086 6.309 6.503 6.682 6.857 7.068 7.276 7.492 7.741 7.975 8.206 8.462 8.751 9.031 9.317 9.614 9.945 10.309 10.718 11.179 11.6 12.075 12.611 13.192 13.789 14.371 14.882 15.159 15.022 14.621 14.138 13.682 13.188 12.709 12.25 11.785 11.294 10.878 10.514 10.165 9.829 9.519 9.217 8.872 8.573 8.307 8.016 7.716 7.467 7.204 6.917 6.691 6.46 6.223 5.978 5.724 5.55 5.37 5.072 4.844 4.591 4.463 4.216 3.954 3.663 3.508 3.07 2.971 2.759 2.545 2.093 1.825 1.531 1.184 0.762 0.297 -0.401 -2.563 -2 ,9209 ,KEBNE ,16678404,Thu Nov 25 02:25:56 CET,Thu Nov 25 03:49:16 CET,0.0 1.199 1.675 2.028 2.312 2.554 2.772 2.971 3.316 3.486 3.648 3.625 4.021 4.135 4.34 4.538 4.738 4.834 5.012 5.176 5.417 5.571 5.719 5.927 6.127 6.324 6.51 6.68 6.899 7.109 7.31 7.564 7.805 8.044 8.316 8.621 8.921 9.23 9.529 9.846 10.191 10.554 10.954 11.34 11.778 12.247 12.745 13.282 13.858 14.372 14.726 14.579 14.159 13.677 13.187 12.686 12.226 11.777 11.359 10.917 10.524 10.168 9.804 9.432 9.106 8.816 8.486 8.173 7.894 7.611 7.312 7.07 6.822 6.534 6.298 6.067 5.829 5.58 5.308 5.107 4.897 4.583 4.379 4.157 4.035 3.803 3.547 3.263 3.109 2.66 2.56 2.368 2.163 1.712 1.474 1.167 0.777 0.349 -0.159 -0.821 -2.722 -3 ,22131 ,KEBNE ,16678405,Thu Nov 25 02:25:56 CET,Thu Nov 25 03:50:58 CET,0.0 1.749 2.245 2.601 2.897 3.12 3.326 3.507 3.828 3.997 4.15 4.14 4.544 4.656 4.887 5.094 5.282 5.374 5.557 5.747 6.021 6.19 6.342 6.543 6.731 6.907 7.075 7.231 7.441 7.651 7.846 8.072 8.284 8.513 8.786 9.063 9.315 9.596 9.93 10.282 10.592 10.934 11.354 11.747 12.18 12.657 13.186 13.715 14.222 14.681 14.923 14.689 14.26 13.796 13.326 12.851 12.399 11.901 11.454 11.001 10.59 10.201 9.806 9.466 9.154 8.851 8.531 8.242 7.975 7.697 7.412 7.171 6.919 6.651 6.428 6.184 5.935 5.68 5.417 5.226 5.03 4.74 4.528 4.287 4.163 3.909 3.634 3.347 3.187 2.744 2.666 2.476 2.276 1.825 1.56 1.259 0.919 0.524 0.045 -0.591 -2.729 -4 ,5665 ,KEBNE ,16678406,Thu Nov 25 02:25:56 CET,Thu Nov 25 03:48:00 CET,0.0 1.326 1.751 2.076 2.374 2.65 2.91 3.109 3.44 3.604 3.753 3.724 4.114 4.234 4.455 4.646 4.842 4.934 5.097 5.263 5.52 5.689 5.85 6.052 6.248 6.451 6.636 6.812 7.029 7.226 7.42 7.657 7.894 8.139 8.409 8.692 8.958 9.233 9.522 9.835 10.167 10.553 10.983 11.377 11.815 12.295 12.834 13.4 13.939 14.438 14.756 14.583 14.193 13.71 13.212 12.732 12.24 11.749 11.32 10.874 10.488 10.116 9.732 9.369 9.025 8.702 8.357 8.048 7.772 7.496 7.225 6.977 6.722 6.462 6.236 6.002 5.757 5.483 5.2 5.011 4.808 4.48 4.258 4.033 3.909 3.655 3.379 3.046 2.883 2.457 2.375 2.176 1.972 1.49 1.208 0.917 0.604 0.266 -0.146 -0.79 -3.121 -5 ,19594 ,KEBNE ,16678407,Thu Nov 25 02:25:57 CET,Thu Nov 25 03:50:02 CET,0.0 1.261 1.792 2.179 2.535 2.86 3.068 3.244 3.592 3.761 3.907 3.888 4.291 4.417 4.647 4.854 5.046 5.141 5.341 5.526 5.759 5.911 6.063 6.282 6.51 6.723 6.924 7.119 7.36 7.583 7.796 8.069 8.327 8.555 8.802 9.074 9.336 9.627 9.942 10.25 10.566 10.92 11.343 11.774 12.24 12.707 13.197 13.7 14.231 14.705 14.986 14.928 14.617 14.16 13.661 13.135 12.659 12.205 11.782 11.326 10.899 10.507 10.136 9.777 9.439 9.125 8.792 8.467 8.167 7.879 7.58 7.315 7.04 6.769 6.56 6.337 6.122 5.884 5.61 5.431 5.245 4.93 4.706 4.482 4.363 4.113 3.846 3.553 3.39 2.942 2.876 2.695 2.486 2.048 1.794 1.48 1.124 0.729 0.245 -0.44 -2.855 -6 ,32093 ,KEBNE ,16678408,Thu Nov 25 02:27:00 CET,Thu Nov 25 03:49:27 CET,0.0 1.195 1.712 2.059 2.323 2.57 2.803 3.003 3.338 3.495 3.646 3.632 4.034 4.145 4.362 4.582 4.765 4.862 5.062 5.228 5.476 5.635 5.775 5.976 6.164 6.348 6.537 6.724 6.953 7.162 7.357 7.585 7.813 8.028 8.269 8.54 8.815 9.111 9.402 9.7 10.033 10.414 10.811 11.229 11.702 12.171 12.677 13.205 13.755 14.254 14.569 14.379 13.97 13.516 13.061 12.598 12.137 11.673 11.214 10.755 10.368 10.024 9.678 9.31 8.97 8.674 8.359 8.059 7.781 7.488 7.183 6.929 6.666 6.386 6.172 5.95 5.7 5.437 5.17 4.989 4.791 4.461 4.239 4.015 3.892 3.625 3.348 3.042 2.89 2.469 2.366 2.167 1.973 1.537 1.29 1.007 0.665 0.239 -0.233 -0.8 -3.607 -7 ,22560 ,KEBNE ,16678409,Thu Nov 25 02:27:01 CET,Thu Nov 25 03:52:51 CET,0.0 1.159 1.632 1.992 2.303 2.562 2.799 3.002 3.339 3.492 3.627 3.624 4.04 4.161 4.383 4.587 4.78 4.878 5.061 5.221 5.439 5.583 5.725 5.933 6.133 6.325 6.512 6.704 6.939 7.139 7.346 7.612 7.845 8.062 8.307 8.566 8.831 9.126 9.432 9.749 10.085 10.471 10.895 11.286 11.725 12.207 12.702 13.189 13.714 14.196 14.523 14.433 14.011 13.548 13.048 12.544 12.069 11.597 11.184 10.747 10.345 9.971 9.62 9.284 8.955 8.646 8.314 8.009 7.741 7.467 7.171 6.911 6.64 6.358 6.147 5.918 5.657 5.397 5.144 4.97 4.793 4.499 4.271 4.033 3.913 3.66 3.395 3.113 2.963 2.536 2.465 2.269 2.067 1.623 1.361 1.076 0.757 0.365 -0.118 -0.762 -3.025 -8 ,17319 ,KEBNE ,16678410,Thu Nov 25 02:26:58 CET,Thu Nov 25 03:51:20 CET,0.0 1.046 1.566 1.964 2.26 2.51 2.719 2.904 3.223 3.375 3.519 3.5 3.894 4.007 4.223 4.423 4.608 4.698 4.868 5.024 5.246 5.391 5.541 5.757 5.956 6.144 6.325 6.505 6.734 6.933 7.137 7.396 7.626 7.846 8.109 8.396 8.665 8.96 9.275 9.614 9.938 10.282 10.7 11.124 11.568 12.009 12.478 12.97 13.49 14.015 14.428 14.342 13.91 13.352 12.778 12.258 11.777 11.28 10.832 10.365 9.921 9.496 9.102 8.76 8.433 8.102 7.757 7.465 7.214 6.949 6.65 6.401 6.153 5.863 5.623 5.359 5.077 4.798 4.513 4.328 4.135 3.828 3.613 3.386 3.266 2.994 2.69 2.363 2.202 1.766 1.689 1.507 1.293 0.832 0.576 0.28 -0.072 -0.467 -0.956 -1.639 -3.49 -9 ,2824 ,KEBNE ,16678411,Thu Nov 25 02:26:58 CET,Thu Nov 25 03:50:09 CET,0.0 1.295 1.789 2.127 2.414 2.658 2.868 3.068 3.414 3.568 3.728 3.736 4.138 4.257 4.486 4.691 4.884 4.982 5.159 5.309 5.533 5.692 5.84 6.052 6.251 6.437 6.627 6.801 7.022 7.234 7.436 7.673 7.907 8.164 8.466 8.784 9.079 9.375 9.684 10.017 10.352 10.704 11.093 11.463 11.872 12.327 12.807 13.319 13.884 14.413 14.792 14.721 14.319 13.785 13.262 12.773 12.293 11.84 11.414 10.957 10.567 10.171 9.765 9.404 9.074 8.76 8.43 8.136 7.881 7.614 7.328 7.059 6.765 6.476 6.248 6.013 5.769 5.51 5.226 5.037 4.852 4.541 4.306 4.059 3.934 3.677 3.407 3.123 2.978 2.559 2.502 2.323 2.128 1.646 1.366 1.052 0.715 0.308 -0.19 -0.813 -2.854 -10 ,24284 ,KEBNE ,16678412,Thu Nov 25 02:26:58 CET,Thu Nov 25 03:49:29 CET,0.0 1.727 2.147 2.502 2.815 3.068 3.274 3.454 3.779 3.92 4.063 4.052 4.454 4.576 4.796 5.0 5.216 5.322 5.487 5.623 5.852 6.015 6.18 6.405 6.595 6.775 6.956 7.136 7.353 7.566 7.795 8.063 8.304 8.551 8.841 9.126 9.383 9.666 9.97 10.311 10.642 10.974 11.35 11.737 12.194 12.685 13.224 13.791 14.364 14.881 15.215 15.112 14.772 14.312 13.822 13.324 12.827 12.338 11.895 11.441 11.02 10.636 10.259 9.892 9.573 9.264 8.93 8.646 8.399 8.131 7.826 7.561 7.301 7.03 6.801 6.559 6.308 6.044 5.768 5.578 5.387 5.06 4.824 4.583 4.458 4.211 3.957 3.679 3.523 3.082 3.007 2.819 2.623 2.156 1.885 1.588 1.255 0.863 0.384 -0.252 -2.768 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt deleted file mode 100644 index 034896f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1278 ,KEBNE ,16678413,Thu Nov 25 02:28:00 CET,Thu Nov 25 03:52:03 CET,0.0 1.519 2.02 2.381 2.655 2.902 3.124 3.306 3.611 3.754 3.892 3.874 4.276 4.392 4.617 4.839 5.035 5.127 5.314 5.484 5.716 5.866 6.016 6.248 6.479 6.695 6.889 7.058 7.287 7.513 7.703 7.932 8.174 8.423 8.709 9.01 9.279 9.57 9.877 10.194 10.539 10.906 11.278 11.628 12.023 12.422 12.846 13.301 13.751 14.078 14.166 13.797 13.222 12.582 11.941 11.295 10.638 9.989 9.429 8.891 8.445 8.005 7.568 7.166 6.762 6.384 5.99 5.624 5.31 4.963 4.59 4.292 3.98 3.658 3.393 3.096 2.795 2.491 2.178 1.966 1.743 1.376 1.118 0.857 0.719 0.395 0.071 -0.24 -0.419 -0.88 -0.983 -1.202 -1.437 -1.952 -2.227 -2.551 -2.927 -3.363 -3.834 -4.489 -6.364 -2 ,18508 ,KEBNE ,16678414,Thu Nov 25 02:27:00 CET,Thu Nov 25 03:49:58 CET,0.0 1.032 1.459 1.807 2.09 2.329 2.545 2.741 3.073 3.213 3.352 3.338 3.743 3.86 4.075 4.282 4.481 4.573 4.745 4.929 5.211 5.378 5.527 5.73 5.911 6.088 6.254 6.407 6.61 6.798 6.987 7.215 7.427 7.634 7.873 8.137 8.397 8.686 8.972 9.248 9.538 9.883 10.278 10.666 11.111 11.55 11.986 12.468 12.937 13.266 13.335 12.923 12.331 11.709 11.061 10.38 9.739 9.112 8.573 8.053 7.575 7.114 6.666 6.229 5.832 5.448 5.001 4.599 4.264 3.936 3.591 3.29 2.991 2.678 2.42 2.157 1.877 1.584 1.276 1.061 0.84 0.469 0.214 -0.031 -0.164 -0.471 -0.804 -1.139 -1.326 -1.809 -1.906 -2.119 -2.35 -2.846 -3.128 -3.451 -3.794 -4.148 -4.618 -5.339 -7.48 -3 ,12337 ,KEBNE ,16678415,Thu Nov 25 02:27:01 CET,Thu Nov 25 03:49:22 CET,0.0 1.251 1.704 2.063 2.353 2.597 2.81 2.998 3.339 3.49 3.632 3.612 4.009 4.124 4.344 4.569 4.769 4.86 5.048 5.235 5.491 5.642 5.79 5.996 6.177 6.355 6.529 6.706 6.926 7.15 7.387 7.655 7.879 8.083 8.319 8.57 8.812 9.075 9.359 9.661 9.979 10.348 10.757 11.166 11.628 12.066 12.546 13.012 13.416 13.773 13.815 13.406 12.851 12.161 11.383 10.666 10.088 9.545 9.021 8.471 7.995 7.561 7.119 6.677 6.258 5.881 5.513 5.147 4.803 4.476 4.159 3.887 3.581 3.266 3.023 2.763 2.49 2.216 1.921 1.701 1.473 1.13 0.881 0.606 0.472 0.192 -0.115 -0.443 -0.616 -1.08 -1.184 -1.378 -1.586 -2.057 -2.34 -2.657 -3.012 -3.445 -3.978 -4.676 -6.888 -4 ,18065 ,KEBNE ,16678416,Thu Nov 25 02:26:58 CET,Thu Nov 25 03:49:26 CET,0.0 1.385 1.834 2.162 2.444 2.681 2.891 3.086 3.408 3.566 3.73 3.759 4.168 4.307 4.563 4.767 4.956 5.045 5.216 5.374 5.603 5.77 5.926 6.123 6.301 6.486 6.68 6.859 7.094 7.323 7.526 7.77 8.004 8.224 8.489 8.782 9.043 9.32 9.625 9.949 10.308 10.687 11.067 11.436 11.839 12.268 12.726 13.196 13.656 13.981 13.982 13.568 12.929 12.212 11.54 10.913 10.32 9.762 9.264 8.759 8.308 7.888 7.459 7.021 6.608 6.23 5.843 5.474 5.15 4.79 4.406 4.113 3.801 3.475 3.231 2.98 2.72 2.434 2.121 1.906 1.684 1.327 1.067 0.789 0.651 0.377 0.09 -0.239 -0.414 -0.864 -0.929 -1.123 -1.335 -1.829 -2.132 -2.455 -2.812 -3.26 -3.826 -4.588 -6.768 -5 ,9161 ,KEBNE ,16678417,Thu Nov 25 02:26:58 CET,Thu Nov 25 03:51:22 CET,0.0 1.423 1.897 2.239 2.514 2.75 2.956 3.16 3.574 3.748 3.889 3.867 4.261 4.383 4.621 4.819 4.999 5.094 5.28 5.451 5.675 5.818 5.963 6.167 6.381 6.581 6.764 6.942 7.173 7.401 7.617 7.867 8.09 8.291 8.518 8.775 9.018 9.29 9.582 9.89 10.227 10.628 11.079 11.48 11.895 12.323 12.807 13.269 13.666 13.994 14.075 13.719 13.068 12.253 11.511 10.818 10.124 9.516 9.01 8.453 7.948 7.486 7.024 6.593 6.21 5.851 5.458 5.098 4.795 4.469 4.119 3.824 3.516 3.196 2.934 2.672 2.407 2.13 1.835 1.611 1.382 1.041 0.796 0.53 0.39 0.11 -0.181 -0.483 -0.642 -1.1 -1.21 -1.444 -1.692 -2.237 -2.538 -2.859 -3.21 -3.62 -4.183 -5.04 -7.909 -6 ,2612 ,KEBNE ,16678418,Thu Nov 25 02:26:57 CET,Thu Nov 25 03:49:26 CET,0.0 1.649 2.119 2.443 2.727 2.985 3.204 3.392 3.715 3.865 4.004 3.97 4.362 4.471 4.683 4.884 5.068 5.158 5.342 5.524 5.769 5.913 6.051 6.261 6.478 6.69 6.888 7.075 7.322 7.539 7.721 7.946 8.148 8.332 8.558 8.815 9.045 9.28 9.565 9.87 10.18 10.525 10.898 11.256 11.658 12.094 12.557 13.037 13.524 13.919 14.041 13.574 12.965 12.38 11.784 11.146 10.538 9.966 9.43 8.814 8.293 7.851 7.401 6.997 6.615 6.235 5.836 5.472 5.138 4.789 4.444 4.165 3.877 3.574 3.319 3.059 2.79 2.496 2.201 1.998 1.78 1.425 1.163 0.89 0.754 0.478 0.178 -0.138 -0.301 -0.759 -0.879 -1.105 -1.342 -1.874 -2.167 -2.463 -2.811 -3.27 -3.847 -4.575 -6.609 -7 ,1022 ,KEBNE ,16678419,Thu Nov 25 02:27:01 CET,Thu Nov 25 03:49:28 CET,0.0 1.606 2.142 2.548 2.846 3.119 3.376 3.579 3.92 4.092 4.245 4.248 4.659 4.769 4.971 5.185 5.393 5.49 5.679 5.862 6.129 6.296 6.445 6.649 6.84 7.022 7.205 7.388 7.613 7.838 8.057 8.311 8.552 8.763 9.003 9.276 9.532 9.814 10.119 10.432 10.76 11.121 11.494 11.851 12.262 12.678 13.115 13.561 13.998 14.336 14.399 14.038 13.461 12.832 12.174 11.526 10.952 10.404 9.877 9.336 8.867 8.429 8.019 7.616 7.215 6.835 6.441 6.093 5.788 5.451 5.092 4.795 4.472 4.138 3.896 3.64 3.363 3.085 2.795 2.583 2.371 2.048 1.798 1.524 1.381 1.083 0.763 0.36 0.145 -0.336 -0.45 -0.645 -0.851 -1.338 -1.633 -1.947 -2.33 -2.807 -3.359 -4.123 -7.114 -8 ,2152 ,KEBNE ,16678420,Thu Nov 25 02:27:00 CET,Thu Nov 25 03:51:15 CET,0.0 2.203 2.817 3.243 3.539 3.783 3.995 4.192 4.544 4.695 4.84 4.857 5.265 5.371 5.575 5.802 6.016 6.107 6.285 6.455 6.684 6.833 6.982 7.204 7.419 7.612 7.788 7.943 8.151 8.365 8.563 8.813 9.051 9.255 9.478 9.752 10.025 10.314 10.603 10.891 11.178 11.494 11.867 12.221 12.608 13.033 13.499 13.928 14.347 14.688 14.759 14.394 13.813 13.187 12.589 12.001 11.434 10.88 10.369 9.855 9.37 8.889 8.431 8.028 7.671 7.318 6.931 6.6 6.293 5.955 5.615 5.305 4.956 4.6 4.349 4.107 3.854 3.574 3.26 3.045 2.829 2.491 2.251 1.999 1.872 1.6 1.32 1.032 0.868 0.407 0.332 0.141 -0.066 -0.535 -0.806 -1.143 -1.512 -1.89 -2.351 -2.978 -4.885 -9 ,2510 ,KEBNE ,16678421,Thu Nov 25 02:26:58 CET,Thu Nov 25 03:51:22 CET,0.0 1.62 2.056 2.364 2.644 2.898 3.128 3.33 3.685 3.856 4.008 3.995 4.396 4.535 4.793 5.018 5.228 5.321 5.492 5.664 5.913 6.069 6.216 6.43 6.642 6.821 6.99 7.157 7.383 7.612 7.828 8.068 8.297 8.523 8.76 9.027 9.29 9.584 9.893 10.203 10.551 10.916 11.271 11.634 12.046 12.483 12.985 13.487 13.979 14.388 14.519 14.143 13.584 12.935 12.253 11.569 10.899 10.271 9.755 9.229 8.722 8.268 7.847 7.442 7.065 6.703 6.3 5.955 5.651 5.308 4.957 4.675 4.384 4.031 3.743 3.483 3.22 2.926 2.597 2.36 2.116 1.743 1.488 1.234 1.109 0.822 0.506 0.19 0.024 -0.439 -0.55 -0.755 -0.973 -1.455 -1.731 -2.074 -2.449 -2.867 -3.377 -3.991 -5.73 -10 ,8172 ,KEBNE ,16678422,Thu Nov 25 02:27:02 CET,Thu Nov 25 03:46:03 CET,0.0 1.351 1.815 2.165 2.444 2.662 2.881 3.106 3.464 3.614 3.762 3.75 4.157 4.274 4.502 4.733 4.936 5.028 5.207 5.36 5.595 5.766 5.916 6.128 6.335 6.526 6.718 6.905 7.119 7.33 7.545 7.796 8.022 8.232 8.474 8.736 8.998 9.277 9.564 9.883 10.211 10.548 10.928 11.285 11.66 12.036 12.447 12.873 13.314 13.708 13.844 13.488 12.888 12.222 11.605 11.014 10.445 9.9 9.361 8.815 8.327 7.847 7.389 6.951 6.54 6.18 5.789 5.425 5.111 4.758 4.404 4.13 3.813 3.48 3.233 2.98 2.699 2.38 2.068 1.855 1.631 1.289 1.054 0.785 0.642 0.377 0.105 -0.196 -0.361 -0.813 -0.901 -1.109 -1.32 -1.806 -2.086 -2.363 -2.664 -3.053 -3.575 -4.293 -6.299 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 8ea738fc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20754 ,KEBNE ,16678423,Thu Nov 25 02:27:06 CET,Thu Nov 25 03:46:55 CET,0.0 1.113 1.508 1.818 2.089 2.336 2.557 2.728 3.014 3.151 3.288 3.288 3.708 3.837 4.069 4.268 4.47 4.574 4.764 4.941 5.184 5.337 5.498 5.734 5.958 6.176 6.384 6.632 6.951 7.203 7.429 7.699 7.954 8.2 8.496 8.815 9.107 9.419 9.773 10.147 10.53 11.008 11.552 12.028 12.571 13.168 13.834 14.484 15.121 15.835 16.432 16.519 16.317 15.972 15.573 15.138 14.714 14.329 13.987 13.631 13.312 13.03 12.749 12.47 12.205 11.973 11.73 11.505 11.314 11.107 10.872 10.675 10.488 10.292 10.133 9.97 9.793 9.604 9.41 9.28 9.136 8.911 8.758 8.585 8.498 8.32 8.104 7.868 7.752 7.358 7.364 7.228 7.086 6.775 6.602 6.406 6.175 5.896 5.564 5.052 3.601 -2 ,7171 ,KEBNE ,16678424,Thu Nov 25 02:27:59 CET,Thu Nov 25 03:50:09 CET,0.0 1.111 1.538 1.845 2.125 2.359 2.58 2.769 3.059 3.207 3.358 3.367 3.787 3.912 4.145 4.382 4.615 4.725 4.935 5.121 5.38 5.55 5.712 5.94 6.156 6.364 6.561 6.761 7.031 7.281 7.523 7.799 8.054 8.301 8.61 8.954 9.244 9.583 9.949 10.33 10.747 11.192 11.664 12.161 12.745 13.336 13.992 14.686 15.381 16.07 16.728 16.881 16.665 16.326 15.9 15.495 15.14 14.798 14.482 14.136 13.823 13.527 13.242 12.984 12.747 12.518 12.259 12.027 11.822 11.586 11.346 11.158 10.963 10.766 10.612 10.437 10.244 10.033 9.817 9.682 9.548 9.322 9.149 8.966 8.873 8.692 8.488 8.256 8.143 7.757 7.782 7.641 7.489 7.164 6.976 6.785 6.575 6.325 6.019 5.548 3.949 -3 ,2717 ,KEBNE ,16678425,Thu Nov 25 02:27:59 CET,Thu Nov 25 03:49:47 CET,0.0 0.744 1.174 1.503 1.764 2.011 2.254 2.465 2.807 2.962 3.116 3.115 3.529 3.65 3.87 4.081 4.294 4.405 4.62 4.813 5.071 5.23 5.388 5.608 5.816 6.018 6.21 6.402 6.645 6.878 7.097 7.357 7.625 7.894 8.2 8.542 8.874 9.222 9.576 9.964 10.397 10.88 11.393 11.86 12.402 12.991 13.615 14.234 14.909 15.644 16.173 16.207 15.997 15.65 15.287 14.916 14.525 14.127 13.795 13.452 13.125 12.845 12.565 12.269 11.997 11.759 11.501 11.257 11.035 10.798 10.558 10.351 10.14 9.916 9.732 9.547 9.358 9.167 8.967 8.821 8.67 8.45 8.291 8.109 8.017 7.823 7.582 7.331 7.222 6.828 6.829 6.677 6.506 6.154 5.97 5.746 5.485 5.224 4.898 4.422 3.403 -4 ,17996 ,KEBNE ,16678426,Thu Nov 25 02:27:59 CET,Thu Nov 25 03:50:13 CET,0.0 0.98 1.418 1.751 1.992 2.193 2.399 2.596 2.969 3.146 3.305 3.301 3.704 3.816 4.047 4.276 4.484 4.576 4.755 4.951 5.225 5.385 5.541 5.771 5.999 6.214 6.408 6.594 6.828 7.055 7.287 7.567 7.829 8.081 8.385 8.724 9.045 9.398 9.784 10.181 10.576 11.022 11.538 12.043 12.618 13.253 13.941 14.634 15.405 16.17 16.79 16.917 16.708 16.375 15.99 15.572 15.165 14.763 14.41 14.066 13.76 13.486 13.201 12.917 12.641 12.385 12.144 11.919 11.698 11.483 11.274 11.088 10.875 10.653 10.479 10.281 10.077 9.895 9.719 9.586 9.43 9.185 9.027 8.86 8.766 8.567 8.363 8.147 8.02 7.618 7.646 7.516 7.375 7.013 6.784 6.543 6.266 5.944 5.616 5.194 3.805 -5 ,2749 ,KEBNE ,16678427,Thu Nov 25 02:28:00 CET,Thu Nov 25 03:50:30 CET,0.0 0.742 1.13 1.439 1.7 1.928 2.144 2.339 2.727 2.893 3.031 3.008 3.402 3.513 3.73 3.945 4.152 4.25 4.451 4.631 4.881 5.048 5.214 5.452 5.663 5.85 6.045 6.244 6.5 6.735 6.958 7.243 7.498 7.739 8.036 8.37 8.692 9.045 9.414 9.804 10.208 10.643 11.128 11.584 12.136 12.767 13.388 14.07 14.881 15.639 16.206 16.299 16.152 15.886 15.549 15.191 14.819 14.473 14.171 13.855 13.567 13.297 13.021 12.732 12.466 12.213 11.919 11.672 11.472 11.263 11.031 10.836 10.634 10.402 10.222 10.049 9.876 9.691 9.487 9.345 9.195 8.941 8.75 8.568 8.478 8.279 8.084 7.878 7.764 7.383 7.413 7.267 7.114 6.789 6.62 6.431 6.219 5.961 5.63 5.168 3.985 -6 ,17374 ,KEBNE ,16678428,Thu Nov 25 02:27:59 CET,Thu Nov 25 03:53:46 CET,0.0 0.957 1.403 1.746 2.032 2.27 2.476 2.666 2.967 3.113 3.259 3.23 3.63 3.741 3.963 4.195 4.413 4.511 4.69 4.873 5.16 5.345 5.515 5.744 5.959 6.153 6.331 6.507 6.764 7.027 7.266 7.555 7.82 8.068 8.381 8.72 9.028 9.364 9.716 10.07 10.444 10.86 11.326 11.811 12.38 12.983 13.595 14.222 14.939 15.626 16.199 16.398 16.238 15.906 15.517 15.134 14.761 14.394 14.083 13.743 13.4 13.092 12.803 12.529 12.246 11.99 11.726 11.48 11.277 11.069 10.851 10.65 10.432 10.209 10.027 9.837 9.649 9.471 9.291 9.149 8.992 8.749 8.571 8.384 8.286 8.086 7.892 7.693 7.587 7.2 7.219 7.082 6.942 6.638 6.481 6.293 6.061 5.794 5.447 4.995 4.121 -7 ,25557 ,KEBNE ,16678429,Thu Nov 25 02:29:01 CET,Thu Nov 25 03:51:20 CET,0.0 0.8 1.218 1.533 1.82 2.059 2.28 2.482 2.845 2.997 3.139 3.12 3.52 3.635 3.856 4.06 4.252 4.346 4.523 4.69 4.936 5.097 5.257 5.499 5.72 5.928 6.147 6.35 6.59 6.838 7.075 7.331 7.577 7.823 8.097 8.386 8.665 9.02 9.405 9.782 10.186 10.615 11.123 11.622 12.134 12.734 13.421 14.134 14.849 15.52 16.078 16.183 15.988 15.618 15.17 14.736 14.344 13.953 13.615 13.277 12.977 12.703 12.427 12.162 11.924 11.698 11.431 11.183 10.974 10.759 10.526 10.327 10.115 9.895 9.72 9.531 9.334 9.131 8.931 8.804 8.657 8.406 8.245 8.07 7.971 7.758 7.551 7.329 7.212 6.82 6.834 6.706 6.567 6.229 6.044 5.841 5.604 5.312 4.943 4.503 3.456 -8 ,456 ,KEBNE ,16678430,Thu Nov 25 02:29:01 CET,Thu Nov 25 03:52:46 CET,0.0 0.822 1.253 1.575 1.85 2.076 2.255 2.438 2.789 2.937 3.085 3.103 3.524 3.657 3.882 4.082 4.287 4.388 4.585 4.775 5.028 5.19 5.352 5.574 5.79 6.003 6.209 6.398 6.64 6.889 7.125 7.399 7.66 7.927 8.239 8.558 8.848 9.155 9.497 9.894 10.306 10.76 11.287 11.782 12.326 12.944 13.657 14.366 15.05 15.694 16.246 16.432 16.249 15.874 15.516 15.186 14.834 14.471 14.143 13.809 13.486 13.191 12.911 12.638 12.386 12.152 11.875 11.627 11.423 11.205 10.977 10.787 10.582 10.36 10.185 9.999 9.821 9.626 9.405 9.254 9.104 8.873 8.711 8.535 8.436 8.224 8.002 7.786 7.682 7.299 7.317 7.175 7.031 6.675 6.464 6.247 6.015 5.756 5.411 4.961 4.205 -9 ,3755 ,KEBNE ,16678431,Thu Nov 25 02:29:04 CET,Thu Nov 25 03:52:06 CET,0.0 0.76 1.206 1.495 1.752 1.996 2.203 2.378 2.704 2.853 2.985 2.97 3.386 3.509 3.72 3.943 4.153 4.247 4.441 4.621 4.863 5.025 5.19 5.418 5.631 5.841 6.037 6.221 6.463 6.719 6.965 7.245 7.503 7.765 8.092 8.418 8.705 9.042 9.43 9.837 10.245 10.699 11.22 11.704 12.243 12.798 13.409 14.092 14.786 15.484 16.038 16.159 15.966 15.591 15.21 14.837 14.471 14.119 13.787 13.443 13.144 12.846 12.552 12.275 12.002 11.754 11.496 11.258 11.05 10.841 10.624 10.428 10.231 10.033 9.862 9.683 9.504 9.314 9.102 8.956 8.813 8.588 8.421 8.235 8.145 7.957 7.741 7.508 7.389 6.982 6.99 6.858 6.699 6.362 6.187 5.985 5.749 5.469 5.148 4.694 3.649 -10 ,17164 ,KEBNE ,16678432,Thu Nov 25 02:29:04 CET,Thu Nov 25 03:51:31 CET,0.0 0.726 1.171 1.496 1.754 1.984 2.189 2.356 2.652 2.787 2.933 2.929 3.332 3.446 3.672 3.895 4.101 4.201 4.387 4.569 4.835 4.994 5.149 5.378 5.58 5.765 5.958 6.142 6.376 6.628 6.871 7.138 7.403 7.66 7.962 8.286 8.577 8.922 9.298 9.7 10.122 10.578 11.071 11.532 12.037 12.574 13.222 13.963 14.707 15.442 16.098 16.211 16.005 15.673 15.272 14.853 14.46 14.072 13.724 13.381 13.08 12.807 12.548 12.294 12.033 11.789 11.56 11.348 11.148 10.924 10.668 10.47 10.276 10.047 9.867 9.697 9.51 9.304 9.104 8.973 8.821 8.577 8.411 8.243 8.158 7.968 7.772 7.574 7.47 7.079 7.116 7.003 6.87 6.555 6.376 6.174 5.957 5.71 5.406 4.952 3.963 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt deleted file mode 100644 index dc128edc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10276 ,KEBNE ,17024042,Wed Dec 22 09:21:01 CET,Wed Dec 22 10:43:11 CET,0.0 1.042 1.405 1.678 1.914 2.162 2.378 2.551 2.876 3.036 3.197 3.208 3.623 3.744 3.963 4.157 4.357 4.461 4.636 4.782 4.996 5.143 5.282 5.496 5.715 5.917 6.118 6.302 6.541 6.786 7.009 7.271 7.512 7.729 7.995 8.293 8.565 8.853 9.186 9.528 9.852 10.206 10.587 10.955 11.36 11.768 12.215 12.667 13.006 13.146 13.077 12.584 11.813 11.053 10.352 9.707 9.118 8.544 8.054 7.563 7.102 6.658 6.242 5.877 5.55 5.238 4.905 4.633 4.396 4.109 3.814 3.606 3.389 3.135 2.924 2.705 2.494 2.286 2.051 1.878 1.705 1.455 1.26 1.045 0.934 0.697 0.45 0.175 0.043 -0.369 -0.392 -0.547 -0.705 -1.062 -1.282 -1.531 -1.796 -2.089 -2.413 -2.88 -3.882 -2 ,17807 ,KEBNE ,17024043,Wed Dec 22 09:21:01 CET,Wed Dec 22 10:42:55 CET,0.0 1.084 1.509 1.838 2.087 2.31 2.517 2.703 3.038 3.192 3.335 3.32 3.723 3.842 4.085 4.308 4.509 4.612 4.813 4.984 5.208 5.344 5.496 5.732 5.943 6.14 6.327 6.511 6.742 6.952 7.143 7.38 7.627 7.859 8.121 8.416 8.685 8.955 9.239 9.549 9.873 10.23 10.682 11.1 11.496 11.908 12.341 12.768 13.123 13.341 13.162 12.394 11.613 10.882 10.174 9.5 8.884 8.327 7.843 7.343 6.879 6.455 6.069 5.701 5.359 5.065 4.762 4.463 4.196 3.931 3.652 3.415 3.163 2.919 2.743 2.542 2.321 2.09 1.858 1.692 1.507 1.222 1.037 0.846 0.742 0.539 0.324 0.085 -0.038 -0.452 -0.451 -0.608 -0.777 -1.101 -1.275 -1.474 -1.712 -1.981 -2.308 -2.711 -3.885 -3 ,28966 ,KEBNE ,17024044,Wed Dec 22 09:21:01 CET,Wed Dec 22 10:43:26 CET,0.0 1.645 2.025 2.309 2.555 2.763 2.937 3.094 3.382 3.515 3.655 3.611 4.001 4.099 4.283 4.473 4.662 4.747 4.916 5.095 5.334 5.477 5.631 5.853 6.035 6.204 6.384 6.563 6.775 6.969 7.154 7.374 7.598 7.827 8.086 8.355 8.618 8.907 9.204 9.496 9.796 10.138 10.515 10.88 11.298 11.758 12.198 12.565 12.891 13.06 12.78 12.057 11.265 10.453 9.714 9.019 8.339 7.715 7.193 6.678 6.246 5.832 5.421 5.048 4.697 4.37 4.012 3.683 3.413 3.14 2.842 2.59 2.338 2.084 1.891 1.692 1.478 1.263 1.041 0.888 0.728 0.45 0.251 0.048 -0.063 -0.292 -0.514 -0.749 -0.885 -1.308 -1.312 -1.461 -1.624 -1.96 -2.136 -2.331 -2.564 -2.845 -3.159 -3.583 -4.511 -4 ,11776 ,KEBNE ,17024045,Wed Dec 22 09:21:01 CET,Wed Dec 22 10:44:47 CET,0.0 0.79 1.129 1.375 1.595 1.814 2.0 2.166 2.48 2.621 2.745 2.699 3.097 3.198 3.387 3.571 3.753 3.847 4.043 4.224 4.465 4.628 4.793 5.011 5.22 5.433 5.616 5.786 6.013 6.223 6.436 6.692 6.916 7.14 7.405 7.688 7.945 8.223 8.531 8.86 9.201 9.586 10.024 10.414 10.823 11.219 11.663 12.135 12.538 12.802 12.671 12.058 11.316 10.564 9.828 9.128 8.511 7.939 7.466 7.009 6.563 6.148 5.75 5.372 5.031 4.712 4.383 4.108 3.857 3.559 3.234 3.0 2.772 2.513 2.305 2.093 1.876 1.66 1.44 1.27 1.082 0.785 0.586 0.388 0.291 0.078 -0.146 -0.368 -0.486 -0.894 -0.903 -1.04 -1.184 -1.542 -1.757 -1.98 -2.224 -2.497 -2.852 -3.332 -4.273 -5 ,3574 ,KEBNE ,17024046,Wed Dec 22 09:21:05 CET,Wed Dec 22 10:40:27 CET,0.0 0.918 1.375 1.703 1.955 2.183 2.376 2.57 2.929 3.077 3.222 3.215 3.619 3.738 3.959 4.153 4.34 4.435 4.624 4.8 5.046 5.2 5.339 5.538 5.736 5.927 6.118 6.291 6.505 6.723 6.916 7.141 7.376 7.597 7.862 8.184 8.453 8.718 8.995 9.307 9.66 10.022 10.401 10.74 11.158 11.597 11.994 12.426 12.861 13.141 12.98 12.295 11.456 10.625 9.928 9.248 8.593 8.003 7.505 7.018 6.593 6.209 5.813 5.419 5.074 4.755 4.416 4.115 3.842 3.561 3.27 3.037 2.803 2.54 2.334 2.125 1.909 1.686 1.455 1.294 1.116 0.846 0.667 0.485 0.388 0.174 -0.062 -0.306 -0.434 -0.85 -0.852 -0.998 -1.151 -1.48 -1.652 -1.851 -2.096 -2.376 -2.708 -3.176 -4.228 -6 ,10320 ,KEBNE ,17024047,Wed Dec 22 09:21:01 CET,Wed Dec 22 10:43:12 CET,0.0 1.206 1.604 1.861 2.079 2.27 2.439 2.606 2.897 3.02 3.137 3.07 3.455 3.55 3.727 3.904 4.072 4.151 4.307 4.456 4.675 4.811 4.946 5.162 5.389 5.599 5.776 5.941 6.151 6.366 6.582 6.838 7.07 7.302 7.577 7.858 8.125 8.405 8.697 9.003 9.304 9.621 9.984 10.344 10.732 11.127 11.564 11.981 12.298 12.427 12.216 11.568 10.803 10.03 9.324 8.679 8.107 7.585 7.095 6.592 6.147 5.738 5.373 5.02 4.692 4.382 4.043 3.743 3.475 3.209 2.937 2.699 2.458 2.198 1.989 1.788 1.585 1.364 1.132 0.975 0.811 0.56 0.385 0.19 0.09 -0.099 -0.304 -0.552 -0.695 -1.111 -1.098 -1.247 -1.409 -1.785 -2.005 -2.231 -2.474 -2.79 -3.14 -3.567 -4.528 -7 ,29583 ,KEBNE ,17024048,Wed Dec 22 09:21:01 CET,Wed Dec 22 10:43:20 CET,0.0 0.715 1.04 1.313 1.538 1.773 1.987 2.156 2.416 2.527 2.642 2.583 2.977 3.086 3.289 3.488 3.686 3.782 3.965 4.133 4.364 4.508 4.655 4.871 5.083 5.288 5.475 5.653 5.87 6.067 6.258 6.485 6.716 6.951 7.205 7.478 7.737 8.017 8.307 8.602 8.9 9.247 9.631 9.995 10.432 10.872 11.327 11.793 12.215 12.493 12.379 11.669 10.867 10.091 9.358 8.676 8.072 7.514 7.002 6.486 6.062 5.689 5.301 4.91 4.556 4.239 3.923 3.633 3.374 3.106 2.816 2.578 2.339 2.084 1.881 1.676 1.465 1.252 1.023 0.859 0.69 0.419 0.232 0.038 -0.059 -0.241 -0.464 -0.734 -0.869 -1.286 -1.297 -1.46 -1.62 -1.961 -2.167 -2.382 -2.624 -2.909 -3.224 -3.719 -4.766 -8 ,17129 ,KEBNE ,17024049,Wed Dec 22 09:21:01 CET,Wed Dec 22 10:43:10 CET,0.0 1.189 1.56 1.823 2.037 2.244 2.43 2.595 2.901 3.04 3.175 3.139 3.542 3.66 3.876 4.078 4.262 4.356 4.528 4.698 4.953 5.103 5.246 5.445 5.635 5.825 6.007 6.171 6.385 6.603 6.812 7.058 7.292 7.521 7.782 8.056 8.324 8.605 8.885 9.179 9.492 9.845 10.227 10.598 11.007 11.423 11.847 12.269 12.622 12.793 12.654 12.034 11.311 10.542 9.81 9.143 8.564 8.018 7.488 6.948 6.491 6.077 5.69 5.311 4.936 4.618 4.308 4.014 3.738 3.44 3.155 2.911 2.648 2.387 2.183 1.974 1.751 1.532 1.312 1.154 0.994 0.741 0.569 0.383 0.284 0.08 -0.145 -0.394 -0.523 -0.938 -0.934 -1.08 -1.238 -1.585 -1.781 -2.012 -2.256 -2.508 -2.815 -3.26 -4.489 -9 ,18524 ,KEBNE ,17024050,Wed Dec 22 09:21:05 CET,Wed Dec 22 10:39:09 CET,0.0 0.774 1.092 1.335 1.551 1.729 1.881 2.03 2.309 2.441 2.575 2.523 2.911 3.019 3.227 3.43 3.635 3.733 3.932 4.131 4.391 4.555 4.722 4.947 5.133 5.32 5.503 5.68 5.909 6.119 6.334 6.595 6.832 7.056 7.309 7.587 7.886 8.199 8.503 8.828 9.136 9.459 9.847 10.224 10.64 11.053 11.477 11.903 12.26 12.473 12.364 11.754 10.993 10.248 9.545 8.881 8.321 7.797 7.312 6.82 6.39 6.007 5.634 5.272 4.93 4.615 4.28 3.969 3.707 3.432 3.143 2.907 2.669 2.423 2.219 2.005 1.791 1.579 1.362 1.204 1.028 0.76 0.571 0.369 0.269 0.061 -0.156 -0.414 -0.555 -0.968 -0.97 -1.12 -1.282 -1.672 -1.876 -2.084 -2.315 -2.58 -2.92 -3.426 -5.446 -10 ,22562 ,KEBNE ,17024051,Wed Dec 22 09:21:05 CET,Wed Dec 22 10:39:15 CET,0.0 1.231 1.634 1.933 2.154 2.348 2.529 2.686 2.976 3.104 3.221 3.168 3.562 3.662 3.862 4.052 4.231 4.317 4.478 4.623 4.83 4.966 5.09 5.27 5.457 5.631 5.783 5.931 6.133 6.333 6.523 6.761 6.973 7.159 7.4 7.683 7.951 8.266 8.615 8.958 9.314 9.711 10.139 10.531 10.953 11.384 11.865 12.325 12.631 12.759 12.588 11.949 11.155 10.315 9.568 8.907 8.311 7.731 7.206 6.684 6.226 5.813 5.429 5.065 4.705 4.374 4.022 3.71 3.447 3.178 2.898 2.665 2.434 2.166 1.956 1.752 1.539 1.321 1.06 0.873 0.703 0.446 0.273 0.083 -0.025 -0.231 -0.445 -0.678 -0.791 -1.197 -1.197 -1.338 -1.495 -1.835 -2.03 -2.231 -2.432 -2.701 -3.02 -3.44 -4.402 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt deleted file mode 100644 index 02a0204e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29188 ,KEBNE ,16678433,Thu Nov 25 02:29:01 CET,Thu Nov 25 03:52:45 CET,0.0 1.34 1.774 2.112 2.402 2.64 2.866 3.09 3.5 3.67 3.821 3.974 4.263 4.408 4.657 4.863 5.075 5.189 5.399 5.581 5.848 6.014 6.167 6.396 6.635 6.863 7.083 7.308 7.599 7.85 8.078 8.386 8.673 8.923 9.227 9.603 9.968 10.362 10.778 11.182 11.586 12.026 12.554 13.115 13.747 14.35 14.968 15.646 16.324 17.001 17.539 17.57 17.243 16.767 16.262 15.745 15.149 14.523 13.978 13.409 12.913 12.464 11.994 11.556 11.178 10.807 10.412 10.066 9.759 9.406 9.008 8.694 8.388 8.064 7.8 7.528 7.26 6.962 6.623 6.391 6.151 5.756 5.495 5.209 5.058 4.787 4.514 4.205 4.035 3.713 3.451 3.242 3.015 2.511 2.222 1.888 1.544 1.164 0.702 0.038 -1.64 -2 ,32470 ,KEBNE ,16678434,Thu Nov 25 02:29:04 CET,Thu Nov 25 03:51:33 CET,0.0 1.131 1.512 1.83 2.099 2.338 2.563 2.766 3.112 3.265 3.409 3.552 3.838 3.961 4.175 4.368 4.561 4.667 4.865 5.051 5.328 5.504 5.675 5.931 6.18 6.41 6.624 6.831 7.104 7.357 7.605 7.922 8.222 8.492 8.82 9.193 9.51 9.851 10.238 10.664 11.095 11.556 12.092 12.626 13.241 13.888 14.533 15.167 15.838 16.505 16.947 16.817 16.392 15.917 15.414 14.92 14.396 13.813 13.266 12.656 12.155 11.721 11.254 10.814 10.435 10.089 9.703 9.278 8.875 8.528 8.173 7.867 7.549 7.191 6.92 6.652 6.371 6.072 5.759 5.548 5.33 4.947 4.676 4.411 4.271 3.971 3.659 3.324 3.126 2.773 2.447 2.203 1.95 1.413 1.119 0.794 0.446 0.046 -0.435 -1.025 -2.681 -3 ,17096 ,KEBNE ,16678435,Thu Nov 25 02:29:05 CET,Thu Nov 25 03:50:52 CET,0.0 0.861 1.26 1.562 1.814 2.055 2.271 2.456 2.784 2.945 3.109 3.289 3.568 3.68 3.889 4.117 4.355 4.466 4.691 4.907 5.177 5.347 5.52 5.773 6.003 6.209 6.418 6.631 6.898 7.151 7.396 7.685 7.962 8.243 8.59 8.965 9.304 9.701 10.106 10.531 10.987 11.454 12.009 12.571 13.165 13.781 14.456 15.169 15.923 16.637 17.219 17.236 16.885 16.399 15.823 15.196 14.634 14.122 13.624 13.088 12.619 12.187 11.748 11.314 10.918 10.564 10.195 9.846 9.529 9.203 8.837 8.52 8.208 7.875 7.605 7.335 7.053 6.74 6.408 6.176 5.925 5.562 5.314 5.046 4.911 4.627 4.334 4.017 3.847 3.526 3.267 3.055 2.841 2.364 2.092 1.808 1.483 1.093 0.624 0.01 -1.47 -4 ,11224 ,KEBNE ,16678436,Thu Nov 25 02:29:01 CET,Thu Nov 25 03:53:09 CET,0.0 1.351 1.81 2.195 2.528 2.785 2.983 3.183 3.548 3.704 3.862 4.014 4.286 4.404 4.634 4.855 5.065 5.169 5.362 5.557 5.849 6.024 6.201 6.45 6.674 6.885 7.084 7.294 7.593 7.896 8.158 8.471 8.782 9.046 9.365 9.733 10.066 10.432 10.839 11.271 11.717 12.227 12.791 13.302 13.859 14.486 15.185 15.938 16.752 17.617 18.305 18.249 17.863 17.344 16.768 16.19 15.631 15.086 14.56 13.998 13.506 13.086 12.657 12.16 11.699 11.306 10.838 10.418 10.048 9.648 9.267 8.946 8.606 8.257 7.974 7.667 7.348 7.023 6.67 6.429 6.192 5.801 5.521 5.238 5.096 4.805 4.493 4.17 4.009 3.693 3.437 3.222 2.99 2.497 2.211 1.895 1.562 1.198 0.693 -0.009 -1.772 -5 ,9089 ,KEBNE ,16678437,Thu Nov 25 02:29:04 CET,Thu Nov 25 03:53:33 CET,0.0 0.981 1.358 1.656 1.88 2.081 2.262 2.459 2.825 2.982 3.138 3.302 3.593 3.722 3.965 4.186 4.393 4.505 4.728 4.935 5.231 5.425 5.603 5.849 6.092 6.335 6.547 6.754 7.073 7.373 7.62 7.895 8.163 8.424 8.72 9.068 9.433 9.863 10.288 10.678 11.077 11.574 12.163 12.725 13.325 13.98 14.691 15.422 16.243 17.0 17.635 17.653 17.244 16.692 16.107 15.588 15.074 14.55 14.074 13.544 13.1 12.704 12.307 11.917 11.508 11.112 10.693 10.319 10.003 9.657 9.273 8.981 8.687 8.354 8.085 7.796 7.47 7.127 6.78 6.537 6.296 5.919 5.645 5.375 5.239 4.953 4.662 4.338 4.159 3.838 3.545 3.315 3.097 2.641 2.361 2.043 1.718 1.32 0.85 0.235 -1.76 -6 ,28648 ,KEBNE ,16678438,Thu Nov 25 02:30:02 CET,Thu Nov 25 03:53:37 CET,0.0 2.145 2.623 2.961 3.246 3.509 3.755 3.963 4.317 4.499 4.672 4.813 5.089 5.233 5.512 5.751 5.957 6.058 6.262 6.456 6.729 6.899 7.072 7.311 7.532 7.766 7.992 8.209 8.491 8.73 8.958 9.249 9.532 9.822 10.158 10.504 10.834 11.195 11.585 12.014 12.436 12.9 13.412 13.89 14.462 15.131 15.844 16.556 17.274 17.986 18.545 18.472 18.092 17.636 17.082 16.514 15.976 15.41 14.875 14.302 13.777 13.328 12.91 12.479 12.087 11.737 11.35 11.011 10.716 10.407 10.057 9.75 9.443 9.116 8.855 8.582 8.29 7.985 7.672 7.45 7.223 6.874 6.627 6.357 6.212 5.893 5.532 5.149 4.958 4.637 4.408 4.193 3.965 3.446 3.155 2.843 2.505 2.113 1.59 0.923 -0.524 -7 ,31388 ,KEBNE ,16678439,Thu Nov 25 02:30:02 CET,Thu Nov 25 03:51:59 CET,0.0 0.714 1.061 1.326 1.562 1.801 2.026 2.213 2.54 2.69 2.831 2.976 3.258 3.383 3.614 3.844 4.072 4.194 4.433 4.638 4.914 5.09 5.259 5.502 5.737 5.959 6.171 6.366 6.61 6.869 7.131 7.43 7.7 7.977 8.33 8.678 8.997 9.365 9.759 10.171 10.581 11.044 11.568 12.073 12.639 13.285 13.99 14.712 15.466 16.154 16.648 16.678 16.374 15.97 15.476 14.826 14.224 13.696 13.225 12.703 12.23 11.796 11.333 10.9 10.516 10.141 9.73 9.388 9.097 8.746 8.319 7.938 7.545 7.146 6.844 6.555 6.278 5.988 5.665 5.426 5.191 4.848 4.601 4.34 4.199 3.924 3.65 3.34 3.171 2.853 2.614 2.416 2.202 1.737 1.478 1.191 0.85 0.442 -0.013 -0.533 -2.118 -8 ,5552 ,KEBNE ,16678440,Thu Nov 25 02:30:03 CET,Thu Nov 25 03:52:57 CET,0.0 1.091 1.539 1.87 2.113 2.322 2.516 2.7 3.035 3.186 3.331 3.471 3.753 3.882 4.117 4.337 4.537 4.637 4.836 5.028 5.318 5.521 5.701 5.923 6.152 6.39 6.617 6.826 7.078 7.34 7.612 7.952 8.265 8.528 8.835 9.195 9.548 9.934 10.32 10.709 11.138 11.613 12.137 12.675 13.268 13.846 14.482 15.143 15.855 16.581 17.106 17.064 16.636 16.086 15.538 14.949 14.352 13.793 13.279 12.735 12.237 11.802 11.391 10.969 10.581 10.236 9.85 9.463 9.129 8.802 8.458 8.161 7.855 7.529 7.272 7.018 6.741 6.438 6.133 5.93 5.709 5.349 5.097 4.833 4.694 4.4 4.075 3.702 3.502 3.166 2.88 2.658 2.428 1.944 1.671 1.358 1.025 0.611 0.084 -0.613 -2.65 -9 ,18313 ,KEBNE ,16678441,Thu Nov 25 02:30:02 CET,Thu Nov 25 03:53:56 CET,0.0 1.243 1.647 1.968 2.258 2.482 2.674 2.857 3.22 3.401 3.566 3.723 4.012 4.151 4.397 4.629 4.855 4.96 5.171 5.382 5.675 5.863 6.041 6.281 6.496 6.697 6.906 7.114 7.373 7.621 7.866 8.184 8.486 8.751 9.057 9.39 9.763 10.182 10.566 10.993 11.442 11.902 12.44 12.987 13.571 14.177 14.825 15.448 16.099 16.757 17.132 16.947 16.484 15.977 15.504 14.975 14.421 13.879 13.397 12.918 12.484 12.068 11.655 11.261 10.895 10.533 10.118 9.74 9.416 9.076 8.725 8.419 8.086 7.732 7.467 7.203 6.901 6.587 6.283 6.078 5.853 5.493 5.237 4.939 4.777 4.464 4.146 3.8 3.623 3.287 2.988 2.767 2.547 2.048 1.756 1.46 1.131 0.736 0.259 -0.324 -1.76 -10 ,6723 ,KEBNE ,16678442,Thu Nov 25 02:30:06 CET,Thu Nov 25 03:49:12 CET,0.0 0.83 1.222 1.49 1.741 1.958 2.174 2.375 2.727 2.911 3.074 3.212 3.487 3.615 3.871 4.125 4.348 4.448 4.647 4.855 5.145 5.32 5.49 5.729 5.971 6.198 6.406 6.612 6.862 7.098 7.344 7.628 7.889 8.167 8.491 8.846 9.192 9.585 9.977 10.346 10.762 11.265 11.86 12.436 13.083 13.781 14.528 15.25 15.967 16.735 17.325 17.295 16.935 16.47 15.962 15.432 14.852 14.262 13.735 13.164 12.685 12.275 11.82 11.355 10.918 10.46 9.982 9.593 9.234 8.859 8.475 8.1 7.662 7.245 6.945 6.631 6.3 5.949 5.575 5.316 5.06 4.675 4.415 4.142 3.992 3.669 3.344 3.009 2.83 2.503 2.244 2.032 1.808 1.302 1.016 0.714 0.365 -0.057 -0.553 -1.285 -3.638 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt deleted file mode 100644 index e2ac8fa6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7300 ,KEBNE ,17024052,Wed Dec 22 09:21:01 CET,Wed Dec 22 10:45:29 CET,0.0 1.311 1.786 2.148 2.465 2.736 2.978 3.206 3.603 3.778 3.944 4.133 4.431 4.582 4.859 5.114 5.376 5.504 5.739 5.946 6.228 6.416 6.604 6.88 7.148 7.406 7.651 7.898 8.235 8.562 8.871 9.247 9.602 9.937 10.315 10.714 11.105 11.537 11.998 12.484 12.983 13.554 14.178 14.762 15.43 16.148 16.878 17.571 18.259 18.84 18.946 18.42 17.638 16.657 15.706 14.838 14.008 13.244 12.587 11.877 11.233 10.607 9.991 9.388 8.831 8.359 7.866 7.43 7.054 6.656 6.228 5.859 5.467 5.049 4.718 4.371 4.011 3.657 3.268 2.983 2.702 2.249 1.911 1.565 1.397 1.022 0.595 0.163 -0.064 -0.432 -0.754 -1.026 -1.329 -1.988 -2.315 -2.664 -3.091 -3.573 -4.124 -4.855 -6.948 -3 ,9026 ,KEBNE ,17024054,Wed Dec 22 09:21:01 CET,Wed Dec 22 10:43:48 CET,0.0 1.473 1.958 2.353 2.708 2.999 3.242 3.464 3.85 4.02 4.194 4.39 4.686 4.832 5.115 5.375 5.62 5.742 5.972 6.187 6.497 6.698 6.893 7.163 7.429 7.698 7.948 8.19 8.495 8.765 9.043 9.396 9.713 10.019 10.398 10.827 11.217 11.614 12.017 12.455 12.97 13.545 14.165 14.756 15.377 15.991 16.701 17.456 18.12 18.714 18.8 18.084 17.101 16.052 15.099 14.151 13.274 12.509 11.853 11.137 10.482 9.925 9.37 8.824 8.324 7.866 7.392 6.954 6.56 6.149 5.725 5.363 4.975 4.56 4.236 3.91 3.568 3.199 2.813 2.553 2.291 1.874 1.579 1.273 1.108 0.745 0.351 -0.061 -0.279 -0.652 -1.001 -1.261 -1.547 -2.168 -2.487 -2.857 -3.275 -3.739 -4.299 -5.044 -7.611 -4 ,32628 ,KEBNE ,17024055,Wed Dec 22 09:22:03 CET,Wed Dec 22 10:44:39 CET,0.0 1.727 2.274 2.665 2.981 3.269 3.507 3.718 4.129 4.308 4.464 4.64 4.946 5.106 5.382 5.636 5.881 5.997 6.222 6.45 6.802 7.028 7.231 7.525 7.82 8.108 8.375 8.628 8.966 9.277 9.565 9.906 10.23 10.543 10.913 11.328 11.705 12.124 12.582 13.036 13.47 13.969 14.61 15.219 15.845 16.528 17.259 17.975 18.637 19.158 19.4 18.805 17.865 16.858 15.878 14.955 14.115 13.331 12.625 11.905 11.293 10.736 10.169 9.623 9.123 8.67 8.189 7.746 7.363 6.961 6.531 6.158 5.788 5.41 5.098 4.779 4.463 4.098 3.692 3.432 3.162 2.724 2.415 2.081 1.907 1.552 1.161 0.784 0.606 0.243 -0.129 -0.402 -0.684 -1.321 -1.685 -2.073 -2.482 -2.962 -3.573 -4.382 -6.385 -5 ,29186 ,KEBNE ,17024056,Wed Dec 22 09:22:03 CET,Wed Dec 22 10:44:36 CET,0.0 1.396 1.839 2.221 2.519 2.764 2.975 3.188 3.604 3.789 3.969 4.16 4.45 4.593 4.877 5.158 5.412 5.526 5.75 5.97 6.282 6.497 6.717 7.009 7.278 7.546 7.801 8.046 8.369 8.673 8.947 9.278 9.59 9.894 10.263 10.677 11.044 11.431 11.855 12.318 12.792 13.299 13.871 14.409 14.996 15.655 16.348 16.997 17.609 18.146 18.301 17.989 17.364 16.426 15.491 14.627 13.822 12.997 12.23 11.467 10.82 10.238 9.689 9.174 8.676 8.192 7.702 7.266 6.863 6.437 5.982 5.602 5.212 4.793 4.443 4.061 3.661 3.259 2.876 2.602 2.303 1.83 1.49 1.145 0.963 0.58 0.212 -0.187 -0.415 -0.793 -1.157 -1.43 -1.689 -2.298 -2.657 -3.033 -3.447 -3.912 -4.483 -5.251 -7.569 -7 ,18784 ,KEBNE ,17024058,Wed Dec 22 09:22:03 CET,Wed Dec 22 10:44:48 CET,0.0 1.492 1.907 2.247 2.528 2.773 3.013 3.249 3.629 3.812 3.994 4.16 4.46 4.603 4.856 5.123 5.377 5.498 5.746 5.987 6.317 6.519 6.721 7.02 7.302 7.572 7.812 8.041 8.365 8.684 8.977 9.325 9.667 9.996 10.391 10.817 11.218 11.68 12.149 12.608 13.085 13.629 14.292 14.944 15.692 16.535 17.422 18.351 19.246 19.95 20.222 19.854 19.159 18.216 17.247 16.272 15.408 14.644 13.957 13.211 12.561 12.001 11.46 10.917 10.377 9.89 9.394 8.944 8.544 8.13 7.692 7.324 6.935 6.507 6.192 5.847 5.453 5.049 4.643 4.354 4.045 3.561 3.219 2.851 2.664 2.287 1.89 1.485 1.269 0.901 0.574 0.313 0.043 -0.518 -0.836 -1.174 -1.585 -2.118 -2.735 -3.555 -5.903 -8 ,13132 ,KEBNE ,17024059,Wed Dec 22 09:22:03 CET,Wed Dec 22 10:44:26 CET,0.0 1.622 2.08 2.434 2.718 2.968 3.204 3.416 3.802 3.983 4.158 4.333 4.616 4.769 5.069 5.333 5.576 5.696 5.936 6.164 6.486 6.691 6.896 7.199 7.483 7.755 8.014 8.26 8.592 8.916 9.227 9.598 9.963 10.319 10.694 11.101 11.494 11.911 12.358 12.832 13.352 13.897 14.485 15.091 15.791 16.521 17.225 17.893 18.638 19.219 19.196 18.631 17.781 16.771 15.806 14.903 14.071 13.285 12.567 11.809 11.161 10.562 9.967 9.421 8.896 8.422 7.922 7.45 7.045 6.633 6.203 5.842 5.489 5.12 4.805 4.491 4.147 3.745 3.345 3.081 2.804 2.354 2.028 1.68 1.492 1.102 0.711 0.294 0.084 -0.261 -0.597 -0.881 -1.169 -1.742 -2.106 -2.523 -2.941 -3.434 -4.027 -4.796 -6.884 -9 ,18545 ,KEBNE ,17024060,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:44:51 CET,0.0 1.261 1.74 2.125 2.448 2.716 2.975 3.22 3.656 3.851 4.026 4.214 4.511 4.657 4.922 5.162 5.393 5.518 5.768 6.01 6.35 6.553 6.762 7.073 7.358 7.625 7.896 8.157 8.469 8.751 9.032 9.386 9.703 10.006 10.364 10.761 11.118 11.504 11.938 12.404 12.874 13.394 14.016 14.63 15.325 16.04 16.792 17.559 18.325 18.86 18.897 18.241 17.411 16.516 15.544 14.612 13.791 13.01 12.306 11.595 10.98 10.398 9.804 9.258 8.729 8.237 7.74 7.313 6.942 6.552 6.132 5.75 5.348 4.953 4.647 4.324 3.966 3.596 3.226 2.961 2.682 2.223 1.898 1.555 1.368 0.984 0.59 0.17 -0.053 -0.43 -0.791 -1.063 -1.332 -1.953 -2.294 -2.656 -3.039 -3.481 -4.038 -4.784 -6.966 -10 ,26850 ,KEBNE ,17024061,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:45:11 CET,0.0 1.96 2.49 2.856 3.171 3.43 3.65 3.871 4.31 4.512 4.696 4.893 5.199 5.359 5.659 5.931 6.188 6.305 6.508 6.722 7.063 7.277 7.478 7.757 8.016 8.283 8.542 8.785 9.103 9.401 9.682 10.017 10.351 10.676 11.039 11.445 11.844 12.258 12.686 13.163 13.657 14.197 14.86 15.529 16.241 16.994 17.795 18.546 19.245 19.804 19.921 19.228 18.271 17.301 16.323 15.355 14.518 13.749 13.063 12.33 11.668 11.105 10.559 10.037 9.553 9.086 8.583 8.109 7.671 7.244 6.809 6.421 5.998 5.531 5.185 4.844 4.488 4.119 3.734 3.451 3.152 2.741 2.449 2.135 1.974 1.611 1.208 0.765 0.537 0.154 -0.203 -0.45 -0.703 -1.311 -1.671 -2.035 -2.426 -2.921 -3.52 -4.307 -6.493 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt deleted file mode 100644 index a12f756a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30551 ,KEBNE ,16678443,Thu Nov 25 02:30:02 CET,Thu Nov 25 03:53:33 CET,0.0 1.203 1.6 1.906 2.171 2.391 2.6 2.799 3.119 3.247 3.365 3.45 3.711 3.834 4.056 4.255 4.454 4.548 4.718 4.878 5.107 5.251 5.395 5.607 5.812 6.02 6.212 6.382 6.609 6.81 7.005 7.252 7.511 7.807 8.143 8.478 8.749 9.017 9.312 9.629 9.946 10.274 10.647 11.01 11.404 11.799 12.206 12.633 13.04 13.324 13.345 13.012 12.527 11.984 11.44 10.89 10.352 9.832 9.385 8.938 8.532 8.159 7.794 7.44 7.096 6.743 6.36 6.03 5.755 5.49 5.229 5.01 4.786 4.554 4.337 4.109 3.901 3.663 3.389 3.204 3.025 2.734 2.482 2.2 2.076 1.847 1.609 1.358 1.216 0.918 0.737 0.566 0.382 -0.026 -0.253 -0.496 -0.771 -1.075 -1.431 -1.895 -3.005 -2 ,24211 ,KEBNE ,16678444,Thu Nov 25 02:30:02 CET,Thu Nov 25 03:53:57 CET,0.0 1.39 1.828 2.136 2.377 2.613 2.844 3.038 3.336 3.49 3.645 3.772 4.031 4.151 4.389 4.627 4.855 4.958 5.154 5.335 5.579 5.745 5.901 6.11 6.286 6.441 6.611 6.807 7.037 7.236 7.433 7.656 7.909 8.188 8.516 8.868 9.159 9.437 9.728 10.023 10.321 10.632 10.98 11.342 11.763 12.196 12.63 13.056 13.494 13.91 14.061 13.689 13.165 12.65 12.102 11.569 11.079 10.588 10.155 9.695 9.306 8.98 8.658 8.342 8.028 7.727 7.4 7.111 6.87 6.607 6.336 6.094 5.843 5.591 5.392 5.184 4.94 4.656 4.366 4.184 4.002 3.714 3.496 3.271 3.156 2.926 2.696 2.457 2.328 2.036 1.854 1.679 1.499 1.111 0.897 0.65 0.387 0.106 -0.27 -0.767 -1.855 -3 ,2700 ,KEBNE ,16678445,Thu Nov 25 02:31:03 CET,Thu Nov 25 03:54:45 CET,0.0 1.001 1.416 1.748 2.011 2.23 2.451 2.645 2.991 3.155 3.301 3.44 3.712 3.84 4.092 4.339 4.584 4.704 4.926 5.138 5.45 5.64 5.818 6.066 6.302 6.517 6.687 6.849 7.097 7.355 7.605 7.873 8.098 8.316 8.57 8.862 9.125 9.399 9.739 10.109 10.444 10.798 11.18 11.518 11.916 12.34 12.771 13.228 13.671 14.054 14.233 13.945 13.466 12.925 12.393 11.855 11.335 10.853 10.425 9.995 9.604 9.233 8.874 8.531 8.209 7.906 7.593 7.307 7.037 6.766 6.509 6.29 6.04 5.788 5.584 5.354 5.121 4.872 4.612 4.43 4.242 3.924 3.686 3.459 3.347 3.128 2.911 2.662 2.521 2.217 2.005 1.832 1.646 1.239 1.028 0.804 0.567 0.27 -0.106 -0.632 -2.093 -4 ,12918 ,KEBNE ,16678446,Thu Nov 25 02:31:04 CET,Thu Nov 25 03:55:47 CET,0.0 0.861 1.252 1.577 1.838 2.077 2.285 2.466 2.797 2.949 3.116 3.291 3.567 3.691 3.913 4.128 4.332 4.435 4.651 4.864 5.137 5.29 5.429 5.631 5.809 5.981 6.163 6.338 6.567 6.78 6.973 7.222 7.457 7.681 7.93 8.202 8.488 8.785 9.113 9.468 9.808 10.174 10.575 10.93 11.328 11.781 12.239 12.689 13.134 13.494 13.621 13.322 12.836 12.244 11.644 11.062 10.566 10.055 9.574 9.109 8.694 8.332 7.985 7.642 7.312 7.002 6.666 6.38 6.141 5.876 5.595 5.352 5.104 4.85 4.643 4.441 4.231 3.996 3.767 3.606 3.428 3.141 2.932 2.71 2.594 2.349 2.103 1.849 1.713 1.43 1.267 1.081 0.876 0.486 0.273 0.023 -0.254 -0.557 -0.934 -1.416 -2.67 -5 ,1144 ,KEBNE ,16678447,Thu Nov 25 02:31:04 CET,Thu Nov 25 03:55:23 CET,0.0 0.958 1.342 1.663 1.923 2.135 2.334 2.538 2.916 3.077 3.234 3.425 3.702 3.815 4.04 4.266 4.466 4.57 4.799 5.02 5.319 5.498 5.654 5.874 6.072 6.255 6.431 6.595 6.812 7.011 7.199 7.445 7.724 7.985 8.227 8.468 8.706 8.98 9.283 9.605 9.929 10.263 10.63 10.984 11.384 11.817 12.259 12.711 13.193 13.589 13.736 13.409 12.88 12.331 11.774 11.232 10.722 10.248 9.82 9.362 8.944 8.566 8.195 7.826 7.468 7.113 6.735 6.37 6.045 5.745 5.481 5.262 5.025 4.759 4.544 4.329 4.094 3.844 3.606 3.442 3.259 2.964 2.75 2.52 2.403 2.168 1.944 1.704 1.559 1.265 1.092 0.921 0.745 0.359 0.127 -0.113 -0.349 -0.643 -1.04 -1.535 -2.692 -6 ,12472 ,KEBNE ,16678448,Thu Nov 25 02:31:04 CET,Thu Nov 25 03:53:06 CET,0.0 1.015 1.469 1.794 2.05 2.269 2.469 2.675 3.041 3.186 3.324 3.455 3.722 3.855 4.119 4.345 4.554 4.662 4.863 5.052 5.336 5.51 5.682 5.945 6.198 6.431 6.659 6.892 7.192 7.474 7.742 8.054 8.308 8.554 8.841 9.128 9.396 9.673 9.962 10.266 10.584 10.919 11.299 11.695 12.126 12.531 12.96 13.397 13.839 14.257 14.433 14.155 13.64 13.022 12.402 11.799 11.242 10.722 10.261 9.807 9.409 9.028 8.67 8.336 7.946 7.553 7.167 6.853 6.616 6.358 6.068 5.82 5.561 5.292 5.086 4.877 4.651 4.397 4.103 3.913 3.74 3.455 3.266 3.063 2.95 2.724 2.485 2.221 2.084 1.803 1.616 1.437 1.254 0.835 0.6 0.365 0.083 -0.238 -0.629 -1.122 -2.685 -7 ,19078 ,KEBNE ,16678449,Thu Nov 25 02:31:04 CET,Thu Nov 25 03:54:41 CET,0.0 0.753 1.24 1.622 1.917 2.132 2.317 2.496 2.798 2.938 3.074 3.173 3.431 3.548 3.781 4.0 4.195 4.284 4.463 4.634 4.874 5.027 5.168 5.362 5.56 5.759 5.937 6.119 6.362 6.577 6.776 7.01 7.238 7.465 7.726 8.011 8.301 8.632 8.981 9.322 9.639 10.014 10.43 10.818 11.243 11.688 12.155 12.572 13.023 13.421 13.493 13.137 12.674 12.132 11.574 11.056 10.538 9.993 9.545 9.122 8.741 8.375 8.015 7.663 7.325 7.019 6.701 6.419 6.169 5.901 5.613 5.36 5.069 4.757 4.52 4.274 4.02 3.757 3.483 3.298 3.107 2.797 2.587 2.378 2.277 2.079 1.852 1.584 1.443 1.155 0.978 0.824 0.668 0.296 0.065 -0.172 -0.422 -0.706 -1.077 -1.557 -2.694 -8 ,2272 ,KEBNE ,16678450,Thu Nov 25 02:31:04 CET,Thu Nov 25 03:55:12 CET,0.0 0.855 1.234 1.548 1.815 2.04 2.248 2.446 2.771 2.939 3.113 3.269 3.537 3.669 3.929 4.161 4.38 4.489 4.686 4.87 5.122 5.263 5.393 5.594 5.796 5.972 6.134 6.311 6.578 6.85 7.115 7.429 7.726 8.014 8.342 8.705 9.043 9.411 9.768 10.07 10.394 10.749 11.127 11.562 12.199 12.954 13.64 14.183 14.645 15.022 15.158 14.86 14.392 13.853 13.284 12.751 12.258 11.773 11.335 10.88 10.499 10.16 9.834 9.519 9.208 8.9 8.57 8.267 7.996 7.738 7.459 7.215 6.963 6.704 6.5 6.284 6.049 5.789 5.514 5.329 5.146 4.842 4.622 4.409 4.297 4.049 3.789 3.504 3.347 3.051 2.882 2.698 2.497 2.102 1.883 1.621 1.333 1.035 0.696 0.215 -0.942 -9 ,32691 ,KEBNE ,16678451,Thu Nov 25 02:31:04 CET,Thu Nov 25 03:54:54 CET,0.0 1.033 1.45 1.776 2.021 2.243 2.452 2.629 2.948 3.113 3.264 3.407 3.695 3.836 4.103 4.347 4.563 4.677 4.893 5.069 5.301 5.443 5.581 5.802 6.044 6.287 6.521 6.743 7.004 7.254 7.518 7.851 8.137 8.397 8.739 9.07 9.325 9.603 9.91 10.244 10.555 10.852 11.207 11.583 11.996 12.444 12.927 13.361 13.779 14.145 14.268 13.961 13.457 12.912 12.364 11.828 11.359 10.932 10.526 10.067 9.67 9.315 8.966 8.617 8.291 7.991 7.669 7.389 7.112 6.826 6.57 6.339 6.083 5.798 5.56 5.326 5.092 4.833 4.56 4.381 4.185 3.886 3.69 3.477 3.362 3.136 2.919 2.688 2.556 2.279 2.116 1.938 1.739 1.341 1.134 0.882 0.596 0.276 -0.103 -0.568 -1.932 -10 ,7906 ,KEBNE ,16678452,Thu Nov 25 02:32:05 CET,Thu Nov 25 03:56:07 CET,0.0 0.876 1.302 1.636 1.897 2.123 2.336 2.537 2.878 3.03 3.181 3.323 3.603 3.738 3.968 4.178 4.391 4.496 4.698 4.897 5.173 5.345 5.515 5.745 5.969 6.166 6.333 6.507 6.731 6.937 7.165 7.477 7.749 7.97 8.203 8.452 8.692 8.957 9.245 9.542 9.855 10.196 10.574 10.963 11.379 11.789 12.243 12.731 13.206 13.578 13.685 13.355 12.839 12.262 11.69 11.13 10.623 10.151 9.716 9.242 8.797 8.388 7.995 7.627 7.303 7.011 6.696 6.409 6.164 5.884 5.571 5.314 5.058 4.81 4.6 4.362 4.134 3.907 3.671 3.506 3.336 3.073 2.87 2.642 2.524 2.274 2.015 1.732 1.581 1.292 1.119 0.959 0.796 0.422 0.188 -0.059 -0.342 -0.684 -1.046 -1.515 -2.617 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index 4222586f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15477 ,KEBNE ,16678453,Thu Nov 25 02:32:05 CET,Thu Nov 25 03:55:29 CET,0.0 1.081 1.467 1.803 2.082 2.33 2.565 2.777 3.118 3.27 3.418 3.562 3.844 3.979 4.24 4.486 4.716 4.823 5.022 5.225 5.544 5.747 5.942 6.229 6.506 6.76 7.003 7.249 7.558 7.845 8.118 8.462 8.812 9.159 9.547 9.954 10.343 10.776 11.234 11.712 12.213 12.8 13.519 14.22 14.969 15.727 16.605 17.564 18.581 19.656 20.667 21.113 21.01 20.76 20.481 20.088 19.688 19.286 18.893 18.499 18.135 17.7 17.189 16.696 16.265 15.875 15.482 15.14 14.822 14.49 14.161 13.899 13.622 13.327 13.095 12.845 12.575 12.315 12.043 11.814 11.567 11.218 10.979 10.718 10.587 10.354 10.124 9.859 9.696 9.379 9.128 8.922 8.713 8.297 8.064 7.787 7.461 7.09 6.687 6.063 3.822 -2 ,13572 ,KEBNE ,16676140,Wed Nov 24 11:35:43 CET,Wed Nov 24 12:58:41 CET,0.0 0.632 0.946 1.197 1.443 1.664 1.849 2.023 2.355 2.511 2.664 2.823 3.1 3.229 3.486 3.744 3.974 4.079 4.285 4.493 4.826 5.051 5.249 5.529 5.804 6.067 6.324 6.562 6.866 7.164 7.46 7.821 8.154 8.472 8.849 9.266 9.663 10.102 10.579 11.062 11.534 12.079 12.723 13.352 14.074 14.92 15.87 16.788 17.804 18.98 20.114 20.541 20.456 20.146 19.701 19.294 18.902 18.47 18.088 17.667 17.273 16.914 16.555 16.214 15.877 15.565 15.241 14.934 14.669 14.375 14.076 13.858 13.589 13.295 13.084 12.869 12.66 12.426 12.159 11.98 11.79 11.461 11.224 10.977 10.848 10.577 10.3 9.995 9.83 9.528 9.287 9.105 8.884 8.333 8.047 7.756 7.455 7.104 6.689 6.168 4.617 -3 ,30731 ,KEBNE ,16678455,Thu Nov 25 02:32:06 CET,Thu Nov 25 03:56:27 CET,0.0 1.145 1.541 1.821 2.072 2.306 2.511 2.704 3.041 3.199 3.351 3.485 3.757 3.88 4.123 4.379 4.623 4.73 4.943 5.159 5.46 5.643 5.832 6.127 6.399 6.651 6.886 7.119 7.444 7.76 8.04 8.365 8.707 9.035 9.399 9.826 10.238 10.699 11.174 11.684 12.246 12.868 13.591 14.316 15.15 16.083 17.163 18.383 19.802 21.348 22.824 23.482 23.554 23.389 23.128 22.795 22.398 21.965 21.552 21.121 20.706 20.331 19.975 19.599 19.219 18.837 18.439 18.075 17.751 17.41 17.057 16.79 16.518 16.214 15.971 15.719 15.467 15.211 14.951 14.781 14.605 14.294 14.075 13.86 13.746 13.496 13.195 12.884 12.735 12.433 12.183 11.985 11.776 11.291 11.014 10.747 10.439 10.04 9.58 9.007 7.376 -4 ,5415 ,KEBNE ,16678456,Thu Nov 25 02:32:05 CET,Thu Nov 25 03:56:21 CET,0.0 1.016 1.441 1.796 2.078 2.293 2.484 2.66 2.97 3.128 3.29 3.438 3.715 3.843 4.082 4.309 4.531 4.637 4.85 5.068 5.369 5.561 5.759 6.048 6.316 6.571 6.815 7.06 7.384 7.695 8.008 8.381 8.721 9.042 9.414 9.846 10.267 10.713 11.185 11.712 12.302 12.935 13.573 14.176 14.873 15.641 16.542 17.527 18.607 19.701 20.751 21.272 21.214 20.933 20.59 20.201 19.812 19.432 19.045 18.594 18.184 17.816 17.458 17.125 16.821 16.531 16.21 15.872 15.55 15.214 14.849 14.55 14.274 13.987 13.735 13.473 13.196 12.887 12.564 12.34 12.115 11.777 11.545 11.326 11.208 10.935 10.668 10.414 10.263 9.969 9.783 9.598 9.395 8.957 8.696 8.423 8.137 7.775 7.316 6.797 5.397 -5 ,30042 ,KEBNE ,16676143,Wed Nov 24 11:35:43 CET,Wed Nov 24 12:58:51 CET,0.0 0.863 1.268 1.597 1.853 2.082 2.282 2.457 2.786 2.944 3.103 3.241 3.499 3.625 3.873 4.127 4.384 4.507 4.724 4.91 5.195 5.386 5.572 5.841 6.118 6.388 6.621 6.842 7.144 7.456 7.757 8.103 8.422 8.74 9.125 9.559 9.957 10.394 10.867 11.349 11.84 12.407 13.079 13.729 14.474 15.301 16.241 17.274 18.309 19.308 20.27 20.643 20.565 20.33 19.962 19.499 19.052 18.641 18.246 17.819 17.465 17.133 16.782 16.445 16.118 15.771 15.422 15.13 14.882 14.597 14.232 13.908 13.591 13.303 13.093 12.883 12.659 12.414 12.137 11.948 11.755 11.416 11.171 10.907 10.775 10.511 10.226 9.913 9.743 9.442 9.206 9.009 8.818 8.399 8.142 7.851 7.525 7.153 6.731 6.151 4.272 -6 ,27065 ,KEBNE ,16676144,Wed Nov 24 11:35:44 CET,Wed Nov 24 12:58:35 CET,0.0 1.519 1.999 2.315 2.553 2.781 3.005 3.22 3.587 3.747 3.894 4.024 4.305 4.44 4.687 4.914 5.137 5.243 5.448 5.651 5.942 6.13 6.322 6.604 6.863 7.103 7.342 7.595 7.934 8.244 8.524 8.865 9.183 9.486 9.846 10.271 10.683 11.115 11.588 12.092 12.594 13.165 13.864 14.527 15.246 16.004 16.843 17.782 18.871 20.018 20.978 21.363 21.315 21.073 20.73 20.297 19.831 19.389 18.983 18.548 18.146 17.774 17.403 17.051 16.743 16.456 16.132 15.836 15.571 15.277 14.964 14.708 14.465 14.223 14.016 13.806 13.591 13.357 13.111 12.935 12.742 12.417 12.165 11.915 11.793 11.523 11.228 10.906 10.744 10.452 10.25 10.067 9.875 9.449 9.192 8.909 8.573 8.185 7.735 7.12 5.318 -7 ,15546 ,KEBNE ,16676145,Wed Nov 24 11:35:44 CET,Wed Nov 24 13:00:08 CET,0.0 0.658 1.012 1.35 1.651 1.898 2.117 2.297 2.617 2.787 2.948 3.109 3.391 3.51 3.774 4.03 4.258 4.38 4.617 4.84 5.151 5.336 5.522 5.795 6.05 6.316 6.576 6.817 7.126 7.433 7.737 8.099 8.444 8.78 9.154 9.559 9.971 10.425 10.915 11.461 12.042 12.67 13.407 14.156 14.985 15.921 17.02 18.182 19.476 20.886 22.468 23.375 23.442 23.263 22.968 22.558 22.135 21.746 21.368 20.96 20.617 20.286 19.959 19.623 19.29 18.985 18.652 18.339 18.061 17.774 17.461 17.209 16.951 16.665 16.444 16.213 15.99 15.745 15.461 15.261 15.049 14.712 14.476 14.233 14.11 13.851 13.556 13.234 13.07 12.779 12.548 12.356 12.158 11.706 11.435 11.132 10.828 10.482 10.054 9.512 7.893 -8 ,28018 ,KEBNE ,16678460,Thu Nov 25 02:34:09 CET,Thu Nov 25 03:58:52 CET,0.0 0.72 1.114 1.405 1.63 1.837 2.04 2.243 2.61 2.777 2.929 3.08 3.35 3.475 3.746 4.009 4.234 4.346 4.564 4.762 5.073 5.288 5.479 5.736 6.006 6.264 6.514 6.766 7.068 7.338 7.614 7.964 8.288 8.587 8.934 9.35 9.761 10.19 10.657 11.188 11.73 12.301 12.963 13.662 14.499 15.377 16.32 17.297 18.366 19.548 20.622 20.978 20.848 20.617 20.325 19.943 19.541 19.131 18.736 18.312 17.931 17.573 17.183 16.816 16.482 16.151 15.802 15.48 15.167 14.817 14.475 14.204 13.928 13.664 13.451 13.217 12.98 12.711 12.416 12.209 11.991 11.657 11.414 11.154 11.031 10.799 10.525 10.209 10.058 9.775 9.545 9.349 9.153 8.707 8.451 8.165 7.865 7.514 7.064 6.491 4.96 -9 ,18244 ,KEBNE ,16676147,Wed Nov 24 11:35:44 CET,Wed Nov 24 12:57:28 CET,0.0 0.773 1.155 1.44 1.696 1.931 2.135 2.33 2.681 2.83 2.978 3.122 3.397 3.532 3.788 4.009 4.209 4.316 4.533 4.731 5.025 5.212 5.395 5.65 5.895 6.162 6.422 6.651 6.938 7.227 7.512 7.865 8.198 8.517 8.897 9.308 9.705 10.137 10.615 11.134 11.653 12.221 12.876 13.516 14.202 14.96 15.881 16.915 18.024 19.083 20.154 20.669 20.612 20.306 19.867 19.437 19.055 18.677 18.267 17.845 17.495 17.15 16.787 16.439 16.128 15.828 15.493 15.191 14.933 14.674 14.402 14.176 13.936 13.659 13.426 13.179 12.938 12.699 12.433 12.238 12.027 11.676 11.428 11.204 11.097 10.83 10.513 10.197 10.033 9.73 9.486 9.292 9.094 8.681 8.441 8.157 7.86 7.485 7.021 6.409 3.961 -10 ,29699 ,KEBNE ,16678462,Thu Nov 25 02:36:12 CET,Thu Nov 25 04:00:22 CET,0.0 0.67 1.025 1.272 1.506 1.733 1.941 2.126 2.453 2.623 2.792 2.961 3.241 3.369 3.607 3.833 4.062 4.179 4.405 4.622 4.941 5.133 5.313 5.583 5.846 6.097 6.341 6.577 6.871 7.158 7.437 7.788 8.139 8.475 8.85 9.272 9.688 10.151 10.636 11.14 11.648 12.183 12.831 13.501 14.25 15.057 15.96 16.926 18.022 19.141 20.149 20.49 20.374 20.192 19.933 19.589 19.131 18.682 18.309 17.883 17.473 17.118 16.756 16.366 16.017 15.718 15.4 15.11 14.839 14.538 14.226 13.989 13.765 13.505 13.287 13.032 12.753 12.472 12.189 12.002 11.807 11.492 11.257 11.009 10.89 10.659 10.405 10.115 9.962 9.663 9.444 9.271 9.068 8.591 8.302 7.983 7.671 7.335 6.892 6.256 4.471 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt deleted file mode 100644 index d14fb35a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26595 ,KEBNE ,16678463,Thu Nov 25 02:38:15 CET,Thu Nov 25 04:00:59 CET,0.0 1.133 1.572 1.834 2.064 2.3 2.524 2.738 3.137 3.321 3.487 3.638 3.925 4.059 4.304 4.516 4.73 4.838 5.041 5.247 5.541 5.705 5.865 6.122 6.374 6.606 6.826 7.032 7.282 7.524 7.762 8.042 8.295 8.527 8.796 9.114 9.437 9.791 10.155 10.516 10.9 11.322 11.786 12.259 12.793 13.37 14.035 14.712 15.355 15.908 16.274 16.295 16.042 15.687 15.268 14.793 14.336 13.869 13.455 13.0 12.557 12.171 11.817 11.482 11.156 10.833 10.509 10.228 9.966 9.671 9.364 9.124 8.871 8.599 8.392 8.175 7.934 7.678 7.419 7.239 7.046 6.743 6.526 6.308 6.188 5.937 5.68 5.385 5.227 4.932 4.72 4.531 4.346 3.926 3.682 3.431 3.146 2.797 2.379 1.774 0.161 -2 ,31817 ,KEBNE ,16676150,Wed Nov 24 11:35:43 CET,Wed Nov 24 12:56:27 CET,0.0 0.87 1.359 1.73 2.034 2.283 2.489 2.699 3.081 3.245 3.399 3.538 3.814 3.932 4.148 4.383 4.63 4.745 4.945 5.127 5.377 5.538 5.714 5.976 6.224 6.461 6.672 6.86 7.117 7.375 7.625 7.93 8.196 8.435 8.732 9.094 9.416 9.737 10.092 10.47 10.877 11.317 11.804 12.311 12.852 13.41 14.046 14.708 15.388 16.016 16.495 16.493 16.125 15.673 15.178 14.645 14.151 13.69 13.209 12.694 12.283 11.921 11.552 11.175 10.817 10.501 10.165 9.854 9.57 9.283 9.003 8.756 8.501 8.217 7.994 7.765 7.525 7.281 7.024 6.842 6.65 6.351 6.13 5.902 5.783 5.515 5.25 4.983 4.824 4.514 4.316 4.14 3.962 3.528 3.267 2.985 2.681 2.331 1.903 1.366 -0.244 -3 ,2644 ,KEBNE ,16676151,Wed Nov 24 11:35:44 CET,Wed Nov 24 12:57:02 CET,0.0 1.139 1.541 1.874 2.165 2.405 2.626 2.841 3.228 3.386 3.531 3.664 3.93 4.059 4.316 4.558 4.782 4.893 5.094 5.275 5.522 5.687 5.877 6.132 6.351 6.605 6.877 7.103 7.343 7.6 7.88 8.197 8.471 8.724 9.025 9.367 9.697 10.052 10.428 10.84 11.273 11.706 12.191 12.668 13.151 13.686 14.326 15.021 15.733 16.428 16.992 16.99 16.653 16.188 15.694 15.22 14.743 14.241 13.778 13.287 12.876 12.519 12.146 11.787 11.426 11.072 10.708 10.37 10.056 9.736 9.409 9.131 8.854 8.573 8.354 8.128 7.896 7.661 7.416 7.226 7.024 6.721 6.509 6.296 6.18 5.91 5.628 5.337 5.178 4.869 4.642 4.458 4.263 3.825 3.578 3.331 3.071 2.763 2.368 1.814 0.507 -4 ,25682 ,KEBNE ,16676152,Wed Nov 24 11:35:43 CET,Wed Nov 24 12:59:18 CET,0.0 1.016 1.437 1.773 2.058 2.312 2.527 2.725 3.076 3.244 3.403 3.547 3.815 3.928 4.153 4.374 4.583 4.69 4.894 5.071 5.328 5.496 5.648 5.864 6.089 6.306 6.515 6.727 6.976 7.215 7.464 7.75 8.018 8.277 8.585 8.938 9.26 9.591 9.935 10.279 10.64 11.04 11.482 11.951 12.472 13.009 13.645 14.306 15.016 15.699 16.202 16.197 15.875 15.456 14.999 14.522 14.046 13.582 13.174 12.747 12.325 11.932 11.569 11.223 10.887 10.581 10.25 9.941 9.686 9.41 9.092 8.84 8.583 8.311 8.082 7.835 7.599 7.348 7.084 6.895 6.702 6.402 6.179 5.931 5.797 5.531 5.266 4.992 4.837 4.541 4.344 4.164 3.976 3.538 3.282 2.991 2.686 2.331 1.925 1.393 -0.168 -5 ,25489 ,KEBNE ,16678467,Thu Nov 25 02:39:16 CET,Thu Nov 25 04:06:17 CET,0.0 0.971 1.402 1.708 1.958 2.227 2.47 2.667 3.015 3.166 3.303 3.423 3.704 3.852 4.152 4.429 4.672 4.78 5.011 5.277 5.648 5.867 6.074 6.336 6.543 6.744 6.942 7.122 7.364 7.609 7.833 8.097 8.368 8.627 8.92 9.252 9.563 9.915 10.28 10.633 11.016 11.478 11.999 12.465 12.978 13.528 14.171 14.88 15.605 16.255 16.773 16.837 16.534 16.129 15.706 15.246 14.765 14.3 13.868 13.416 13.036 12.658 12.258 11.889 11.556 11.257 10.936 10.643 10.36 10.047 9.742 9.481 9.211 8.958 8.766 8.558 8.331 8.074 7.798 7.618 7.438 7.145 6.936 6.709 6.592 6.355 6.091 5.812 5.67 5.375 5.173 4.989 4.793 4.347 4.095 3.844 3.575 3.232 2.801 2.235 0.866 -6 ,25320 ,KEBNE ,16676154,Wed Nov 24 11:36:45 CET,Wed Nov 24 12:57:55 CET,0.0 1.201 1.702 2.024 2.299 2.568 2.791 2.97 3.325 3.497 3.665 3.827 4.111 4.26 4.534 4.808 5.064 5.165 5.358 5.539 5.78 5.943 6.105 6.362 6.623 6.846 7.052 7.256 7.511 7.742 7.97 8.244 8.522 8.785 9.068 9.396 9.719 10.077 10.443 10.814 11.2 11.634 12.152 12.63 13.155 13.708 14.32 15.014 15.662 16.269 16.743 16.693 16.39 16.036 15.611 15.171 14.762 14.344 13.93 13.435 12.993 12.592 12.21 11.862 11.547 11.251 10.934 10.651 10.375 10.067 9.766 9.509 9.229 8.944 8.729 8.498 8.264 8.028 7.761 7.581 7.396 7.094 6.873 6.61 6.478 6.234 5.966 5.684 5.537 5.253 5.079 4.901 4.709 4.274 4.043 3.788 3.471 3.1 2.657 2.077 0.085 -7 ,3464 ,KEBNE ,16678469,Thu Nov 25 02:40:22 CET,Thu Nov 25 04:00:20 CET,0.0 1.273 1.731 2.056 2.33 2.576 2.783 2.97 3.326 3.481 3.622 3.74 4.003 4.131 4.391 4.607 4.793 4.887 5.095 5.324 5.659 5.874 6.072 6.335 6.56 6.761 6.947 7.131 7.394 7.645 7.872 8.16 8.451 8.704 8.987 9.35 9.71 10.127 10.561 10.929 11.293 11.726 12.225 12.685 13.226 13.858 14.551 15.289 16.042 16.646 17.163 17.282 16.992 16.569 16.116 15.618 15.154 14.696 14.245 13.798 13.401 13.012 12.636 12.294 11.954 11.637 11.298 10.961 10.668 10.389 10.116 9.866 9.594 9.311 9.082 8.826 8.56 8.301 8.024 7.829 7.626 7.302 7.061 6.789 6.653 6.399 6.135 5.842 5.693 5.402 5.214 5.032 4.821 4.351 4.121 3.861 3.573 3.255 2.842 2.269 0.878 -8 ,9491 ,KEBNE ,16678470,Thu Nov 25 02:41:21 CET,Thu Nov 25 04:04:42 CET,0.0 1.315 1.788 2.155 2.443 2.689 2.919 3.133 3.52 3.683 3.843 4.031 4.323 4.458 4.692 4.916 5.144 5.251 5.461 5.655 5.935 6.129 6.327 6.581 6.789 6.997 7.193 7.369 7.61 7.842 8.042 8.303 8.566 8.843 9.168 9.494 9.788 10.108 10.469 10.846 11.238 11.705 12.206 12.659 13.194 13.792 14.444 15.104 15.748 16.388 16.894 16.855 16.511 16.078 15.555 15.002 14.515 14.044 13.595 13.148 12.777 12.42 12.054 11.706 11.386 11.092 10.756 10.424 10.135 9.848 9.511 9.188 8.84 8.476 8.226 7.987 7.735 7.47 7.175 6.975 6.756 6.415 6.201 5.981 5.871 5.632 5.341 5.043 4.897 4.608 4.401 4.205 4.018 3.615 3.383 3.119 2.815 2.462 2.035 1.505 -0.131 -9 ,8687 ,KEBNE ,16678471,Thu Nov 25 02:42:22 CET,Thu Nov 25 04:04:34 CET,0.0 0.944 1.412 1.75 2.019 2.24 2.438 2.629 2.967 3.125 3.283 3.431 3.712 3.868 4.175 4.448 4.727 4.85 5.05 5.247 5.546 5.737 5.911 6.159 6.402 6.625 6.825 7.019 7.294 7.562 7.813 8.138 8.428 8.681 8.997 9.337 9.631 9.958 10.305 10.671 11.069 11.503 12.006 12.537 13.079 13.619 14.283 14.978 15.619 16.237 16.751 16.74 16.377 15.98 15.578 15.127 14.678 14.235 13.805 13.358 12.965 12.604 12.263 11.944 11.614 11.298 10.98 10.685 10.421 10.142 9.846 9.596 9.341 9.073 8.856 8.62 8.36 8.096 7.841 7.665 7.473 7.164 6.94 6.691 6.561 6.292 6.03 5.752 5.593 5.29 5.075 4.874 4.662 4.227 3.989 3.717 3.404 3.032 2.592 1.995 0.723 -10 ,22929 ,KEBNE ,16676158,Wed Nov 24 11:38:49 CET,Wed Nov 24 12:59:41 CET,0.0 1.138 1.554 1.888 2.151 2.384 2.623 2.833 3.194 3.371 3.547 3.723 4.022 4.155 4.389 4.634 4.867 4.968 5.167 5.365 5.657 5.851 6.022 6.252 6.482 6.689 6.879 7.078 7.342 7.602 7.855 8.145 8.409 8.674 8.982 9.353 9.7 10.011 10.337 10.699 11.095 11.574 12.143 12.676 13.261 13.921 14.57 15.207 15.9 16.599 17.209 17.19 16.837 16.402 15.917 15.402 14.938 14.505 14.106 13.685 13.3 12.954 12.625 12.304 11.977 11.658 11.313 11.003 10.741 10.479 10.191 9.941 9.685 9.404 9.17 8.933 8.694 8.434 8.167 7.981 7.774 7.441 7.226 7.002 6.879 6.62 6.352 6.072 5.919 5.63 5.447 5.268 5.079 4.652 4.414 4.148 3.825 3.456 3.045 2.537 1.203 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt deleted file mode 100644 index 7b457960..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27295 ,KEBNE ,16676169,Wed Nov 24 11:40:51 CET,Wed Nov 24 13:02:09 CET,0.0 0.678 1.033 1.354 1.624 1.835 2.016 2.189 2.511 2.664 2.805 2.938 3.21 3.337 3.572 3.799 4.002 4.102 4.303 4.503 4.799 4.972 5.142 5.391 5.627 5.861 6.079 6.273 6.524 6.781 7.021 7.308 7.588 7.856 8.163 8.494 8.807 9.146 9.515 9.892 10.297 10.811 11.413 12.016 12.708 13.388 14.117 14.891 15.821 16.86 17.907 18.581 18.787 18.769 18.657 18.495 18.283 18.057 17.857 17.629 17.407 17.2 16.979 16.766 16.558 16.349 16.142 15.965 15.804 15.616 15.398 15.228 15.05 14.851 14.7 14.552 14.396 14.229 14.061 13.93 13.777 13.545 13.342 13.072 12.937 12.697 12.451 12.22 12.116 11.884 11.739 11.567 11.37 11.008 10.829 10.629 10.425 10.193 9.931 9.566 8.82 -2 ,28297 ,KEBNE ,16676170,Wed Nov 24 11:40:51 CET,Wed Nov 24 13:03:35 CET,0.0 0.763 1.142 1.405 1.629 1.83 2.006 2.165 2.473 2.621 2.761 2.894 3.154 3.281 3.516 3.738 3.96 4.066 4.262 4.436 4.692 4.87 5.037 5.267 5.502 5.736 5.946 6.148 6.414 6.682 6.946 7.245 7.527 7.81 8.141 8.515 8.881 9.261 9.65 10.061 10.486 10.989 11.574 12.129 12.751 13.425 14.198 15.025 15.98 17.017 18.055 18.742 18.999 19.021 18.923 18.749 18.543 18.31 18.075 17.827 17.617 17.422 17.204 16.987 16.79 16.6 16.388 16.2 16.043 15.868 15.683 15.511 15.304 15.107 14.955 14.793 14.611 14.411 14.217 14.071 13.938 13.734 13.566 13.387 13.299 13.127 12.94 12.726 12.617 12.377 12.196 12.057 11.913 11.545 11.335 11.129 10.912 10.67 10.375 9.999 8.981 -3 ,30860 ,KEBNE ,16676171,Wed Nov 24 11:40:51 CET,Wed Nov 24 13:02:45 CET,0.0 0.513 0.823 1.088 1.338 1.55 1.726 1.91 2.23 2.372 2.509 2.624 2.874 2.994 3.241 3.472 3.691 3.79 3.984 4.173 4.424 4.589 4.75 4.976 5.192 5.41 5.625 5.835 6.112 6.372 6.62 6.918 7.204 7.472 7.773 8.105 8.412 8.749 9.13 9.535 9.962 10.448 11.011 11.557 12.176 12.882 13.65 14.486 15.462 16.533 17.625 18.235 18.431 18.414 18.28 18.12 17.957 17.732 17.466 17.188 16.973 16.78 16.581 16.38 16.193 16.023 15.808 15.583 15.4 15.235 15.064 14.928 14.786 14.627 14.498 14.355 14.199 14.024 13.835 13.701 13.543 13.289 13.095 12.898 12.813 12.633 12.451 12.246 12.125 11.889 11.78 11.662 11.524 11.183 11.005 10.821 10.588 10.305 9.973 9.527 8.184 -4 ,9788 ,KEBNE ,16676172,Wed Nov 24 11:40:55 CET,Wed Nov 24 12:56:07 CET,0.0 0.78 1.144 1.43 1.676 1.897 2.082 2.244 2.546 2.684 2.814 2.936 3.2 3.332 3.583 3.823 4.048 4.151 4.347 4.548 4.822 4.989 5.165 5.419 5.652 5.862 6.061 6.272 6.551 6.816 7.085 7.413 7.713 7.988 8.301 8.654 8.996 9.383 9.783 10.201 10.648 11.136 11.7 12.251 12.851 13.505 14.293 15.128 15.955 16.92 18.092 18.795 18.983 18.941 18.791 18.62 18.429 18.21 17.999 17.775 17.54 17.289 17.052 16.846 16.66 16.466 16.228 16.014 15.839 15.64 15.408 15.22 15.031 14.82 14.64 14.458 14.265 14.062 13.863 13.723 13.569 13.333 13.169 12.992 12.901 12.721 12.546 12.35 12.234 11.993 11.863 11.718 11.534 11.105 10.899 10.697 10.489 10.237 9.88 9.408 8.023 -5 ,9162 ,KEBNE ,16676173,Wed Nov 24 11:41:52 CET,Wed Nov 24 13:03:13 CET,0.0 0.733 1.079 1.342 1.56 1.76 1.955 2.117 2.411 2.563 2.708 2.839 3.101 3.227 3.467 3.694 3.902 3.998 4.186 4.37 4.62 4.776 4.945 5.195 5.423 5.638 5.855 6.078 6.357 6.626 6.876 7.16 7.424 7.686 8.005 8.343 8.645 8.997 9.388 9.797 10.23 10.708 11.262 11.812 12.41 13.08 13.842 14.657 15.564 16.58 17.669 18.33 18.594 18.66 18.58 18.442 18.266 18.057 17.872 17.646 17.432 17.254 17.066 16.864 16.656 16.468 16.28 16.111 15.957 15.792 15.617 15.448 15.253 15.056 14.91 14.756 14.599 14.43 14.231 14.1 13.975 13.782 13.634 13.467 13.381 13.206 13.007 12.793 12.687 12.45 12.242 12.079 11.935 11.624 11.443 11.254 11.044 10.774 10.399 9.872 8.524 -6 ,28687 ,KEBNE ,16678478,Thu Nov 25 02:46:28 CET,Thu Nov 25 04:09:13 CET,0.0 0.589 0.955 1.215 1.443 1.653 1.85 2.015 2.302 2.449 2.595 2.736 2.988 3.106 3.343 3.563 3.772 3.879 4.111 4.333 4.628 4.824 5.001 5.249 5.499 5.724 5.929 6.136 6.409 6.654 6.881 7.155 7.414 7.658 7.948 8.283 8.612 9.036 9.483 9.877 10.284 10.741 11.294 11.84 12.435 13.129 13.94 14.835 15.807 16.806 17.925 18.631 18.801 18.769 18.654 18.479 18.261 18.044 17.854 17.647 17.455 17.258 17.044 16.819 16.608 16.413 16.208 16.034 15.882 15.719 15.532 15.359 15.176 14.991 14.842 14.684 14.529 14.364 14.167 14.038 13.908 13.658 13.488 13.317 13.224 12.993 12.739 12.514 12.409 12.185 12.053 11.902 11.738 11.387 11.2 10.991 10.746 10.487 10.215 9.886 9.098 -7 ,25652 ,KEBNE ,16676175,Wed Nov 24 11:42:54 CET,Wed Nov 24 13:05:57 CET,0.0 0.83 1.15 1.445 1.71 1.927 2.122 2.334 2.728 2.882 3.008 3.131 3.407 3.538 3.771 3.981 4.179 4.282 4.483 4.678 4.975 5.162 5.333 5.592 5.842 6.074 6.283 6.489 6.768 7.023 7.27 7.569 7.858 8.133 8.439 8.792 9.123 9.485 9.906 10.33 10.758 11.255 11.804 12.316 12.902 13.568 14.364 15.215 16.157 17.208 18.282 19.004 19.251 19.268 19.18 19.014 18.82 18.603 18.405 18.219 18.019 17.819 17.619 17.406 17.209 17.012 16.784 16.578 16.414 16.245 16.062 15.904 15.714 15.509 15.344 15.172 15.009 14.829 14.64 14.524 14.394 14.149 13.968 13.794 13.702 13.483 13.263 13.042 12.922 12.675 12.529 12.396 12.25 11.886 11.683 11.466 11.236 10.985 10.677 10.295 9.474 -8 ,27174 ,KEBNE ,16676176,Wed Nov 24 11:42:53 CET,Wed Nov 24 13:04:21 CET,0.0 0.645 1.075 1.409 1.645 1.858 2.057 2.226 2.511 2.657 2.811 2.955 3.211 3.326 3.555 3.803 4.037 4.145 4.362 4.56 4.832 5.001 5.168 5.403 5.619 5.834 6.042 6.247 6.508 6.75 6.976 7.258 7.544 7.819 8.127 8.469 8.793 9.156 9.562 10.014 10.482 10.99 11.576 12.117 12.765 13.463 14.204 15.027 15.894 16.835 17.849 18.548 18.813 18.861 18.759 18.58 18.392 18.178 17.973 17.762 17.545 17.323 17.069 16.791 16.548 16.352 16.169 16.004 15.836 15.644 15.43 15.248 15.055 14.853 14.692 14.533 14.374 14.192 14.006 13.875 13.729 13.495 13.323 13.135 13.041 12.843 12.645 12.438 12.33 12.095 11.943 11.809 11.666 11.304 11.111 10.923 10.697 10.407 10.081 9.653 8.477 -9 ,5770 ,KEBNE ,16676177,Wed Nov 24 11:42:53 CET,Wed Nov 24 13:03:57 CET,0.0 0.631 0.969 1.25 1.475 1.677 1.869 2.048 2.36 2.51 2.67 2.83 3.076 3.191 3.44 3.684 3.907 4.014 4.207 4.374 4.632 4.804 4.97 5.214 5.448 5.676 5.89 6.087 6.329 6.575 6.843 7.173 7.464 7.749 8.113 8.511 8.864 9.267 9.701 10.127 10.555 11.056 11.6 12.118 12.742 13.426 14.182 15.04 15.987 16.979 18.047 18.759 19.035 19.057 18.975 18.831 18.637 18.442 18.255 18.022 17.791 17.59 17.392 17.167 16.961 16.761 16.524 16.33 16.174 16.008 15.823 15.67 15.515 15.337 15.19 15.03 14.829 14.632 14.438 14.294 14.155 13.921 13.749 13.58 13.487 13.286 13.08 12.865 12.737 12.482 12.363 12.227 12.073 11.697 11.483 11.268 11.02 10.737 10.439 10.005 8.565 -10 ,27997 ,KEBNE ,16678482,Thu Nov 25 02:48:31 CET,Thu Nov 25 04:09:55 CET,0.0 0.696 0.972 1.187 1.405 1.613 1.789 1.965 2.288 2.452 2.614 2.759 3.014 3.132 3.347 3.55 3.744 3.842 4.046 4.245 4.515 4.691 4.873 5.122 5.348 5.569 5.772 5.969 6.232 6.48 6.723 7.022 7.315 7.591 7.901 8.285 8.652 9.023 9.427 9.865 10.315 10.794 11.388 11.999 12.667 13.385 14.142 14.952 15.872 16.869 17.926 18.606 18.808 18.799 18.694 18.543 18.367 18.176 17.992 17.776 17.569 17.362 17.146 16.934 16.744 16.569 16.359 16.169 16.001 15.809 15.609 15.437 15.257 15.058 14.906 14.766 14.623 14.47 14.289 14.152 14.016 13.809 13.639 13.457 13.375 13.195 12.97 12.739 12.63 12.393 12.264 12.139 12.001 11.677 11.487 11.273 11.048 10.793 10.464 10.002 8.549 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt deleted file mode 100644 index f07559e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18009 ,KEBNE ,17024062,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:43:45 CET,0.0 1.167 1.477 1.616 1.713 1.783 1.851 1.893 1.891 1.89 1.887 1.723 1.832 1.802 1.726 1.629 1.533 1.486 1.378 1.266 1.1 0.976 0.842 0.644 0.422 0.187 -0.046 -0.289 -0.625 -0.966 -1.309 -1.761 -2.235 -2.701 -3.277 -3.978 -4.699 -5.535 -6.482 -7.569 -8.776 -10.244 -12.104 -14.114 -16.628 -19.656 -23.512 -28.351 -34.72 -43.398 -56.098 -69.336 -79.019 -86.484 -92.377 -97.301 -101.361 -104.811 -107.645 -110.373 -112.622 -114.549 -116.348 -118.001 -119.467 -120.76 -122.084 -123.227 -124.195 -125.195 -126.203 -127.023 -127.846 -128.657 -129.279 -129.918 -130.559 -131.211 -131.864 -132.302 -132.753 -133.44 -133.908 -134.41 -134.668 -135.166 -135.664 -136.209 -136.496 -137.055 -137.359 -137.653 -137.96 -138.588 -138.917 -139.269 -139.64 -140.04 -140.505 -141.012 -141.931 -2 ,23701 ,KEBNE ,17024063,Wed Dec 22 09:22:08 CET,Wed Dec 22 10:42:53 CET,0.0 1.115 1.439 1.672 1.849 1.949 2.019 2.065 2.113 2.117 2.111 1.965 2.084 2.07 2.033 1.962 1.874 1.826 1.712 1.611 1.467 1.359 1.236 1.021 0.8 0.563 0.321 0.085 -0.248 -0.604 -0.962 -1.43 -1.906 -2.366 -2.945 -3.663 -4.4 -5.241 -6.204 -7.307 -8.544 -10.033 -11.885 -13.86 -16.353 -19.366 -23.155 -27.984 -34.402 -43.129 -55.924 -69.085 -78.643 -86.098 -91.99 -96.888 -100.917 -104.347 -107.199 -109.945 -112.174 -114.075 -115.853 -117.484 -118.938 -120.222 -121.519 -122.642 -123.601 -124.594 -125.611 -126.423 -127.233 -128.051 -128.66 -129.273 -129.894 -130.541 -131.239 -131.71 -132.171 -132.899 -133.404 -133.92 -134.177 -134.681 -135.205 -135.739 -136.004 -136.541 -136.814 -137.113 -137.434 -138.091 -138.438 -138.814 -139.209 -139.627 -140.061 -140.564 -141.57 -3 ,2719 ,KEBNE ,17024064,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:40:06 CET,0.0 1.044 1.279 1.409 1.495 1.564 1.608 1.634 1.667 1.676 1.677 1.512 1.615 1.586 1.512 1.414 1.314 1.263 1.157 1.041 0.841 0.713 0.59 0.386 0.168 -0.066 -0.316 -0.569 -0.906 -1.268 -1.64 -2.095 -2.564 -3.035 -3.616 -4.298 -5.005 -5.835 -6.771 -7.867 -9.115 -10.612 -12.481 -14.487 -17.005 -20.05 -23.914 -28.777 -35.204 -43.914 -56.637 -69.838 -79.436 -86.831 -92.657 -97.5 -101.478 -104.889 -107.742 -110.471 -112.694 -114.611 -116.386 -117.989 -119.43 -120.705 -122.014 -123.18 -124.146 -125.105 -126.078 -126.877 -127.702 -128.539 -129.165 -129.779 -130.398 -131.036 -131.7 -132.166 -132.634 -133.321 -133.804 -134.316 -134.563 -135.056 -135.576 -136.096 -136.354 -136.908 -137.216 -137.512 -137.81 -138.423 -138.757 -139.11 -139.498 -139.92 -140.381 -140.9 -141.73 -4 ,31252 ,KEBNE ,17024065,Wed Dec 22 09:22:03 CET,Wed Dec 22 10:44:03 CET,0.0 0.755 0.994 1.171 1.296 1.374 1.442 1.512 1.571 1.573 1.571 1.421 1.535 1.5 1.441 1.363 1.268 1.218 1.109 0.992 0.811 0.681 0.552 0.365 0.152 -0.072 -0.298 -0.542 -0.889 -1.234 -1.585 -2.044 -2.529 -3.019 -3.605 -4.304 -5.023 -5.849 -6.764 -7.801 -9.002 -10.479 -12.325 -14.321 -16.829 -19.882 -23.794 -28.676 -35.111 -43.879 -56.608 -69.677 -79.188 -86.603 -92.502 -97.386 -101.441 -104.898 -107.714 -110.39 -112.631 -114.582 -116.366 -117.975 -119.436 -120.751 -122.065 -123.184 -124.133 -125.111 -126.087 -126.867 -127.667 -128.489 -129.122 -129.76 -130.408 -131.088 -131.77 -132.216 -132.67 -133.373 -133.851 -134.329 -134.575 -135.082 -135.596 -136.129 -136.41 -136.975 -137.285 -137.584 -137.89 -138.559 -138.924 -139.3 -139.673 -140.069 -140.52 -141.027 -141.832 -5 ,4466 ,KEBNE ,17024066,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:44:03 CET,0.0 0.844 1.145 1.35 1.474 1.554 1.622 1.662 1.708 1.734 1.744 1.6 1.728 1.709 1.643 1.548 1.447 1.395 1.275 1.163 1.002 0.883 0.748 0.518 0.283 0.047 -0.199 -0.451 -0.777 -1.107 -1.448 -1.882 -2.346 -2.837 -3.438 -4.153 -4.858 -5.679 -6.644 -7.71 -8.917 -10.389 -12.212 -14.194 -16.696 -19.708 -23.503 -28.312 -34.654 -43.301 -56.061 -69.262 -78.81 -86.149 -91.977 -96.835 -100.84 -104.294 -107.129 -109.86 -112.181 -114.15 -115.904 -117.51 -118.959 -120.24 -121.539 -122.673 -123.646 -124.636 -125.643 -126.468 -127.307 -128.158 -128.797 -129.431 -130.074 -130.737 -131.4 -131.851 -132.328 -133.042 -133.524 -134.025 -134.285 -134.798 -135.29 -135.803 -136.074 -136.62 -136.905 -137.201 -137.503 -138.129 -138.472 -138.831 -139.217 -139.625 -140.075 -140.639 -141.528 -6 ,28633 ,KEBNE ,17024067,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:44:05 CET,0.0 0.991 1.212 1.348 1.467 1.549 1.601 1.625 1.664 1.679 1.672 1.488 1.594 1.564 1.498 1.421 1.334 1.279 1.148 1.027 0.847 0.716 0.586 0.386 0.166 -0.06 -0.301 -0.551 -0.907 -1.265 -1.622 -2.082 -2.558 -3.057 -3.656 -4.357 -5.084 -5.907 -6.864 -7.972 -9.182 -10.617 -12.431 -14.425 -16.958 -20.041 -23.903 -28.768 -35.209 -43.927 -56.692 -69.868 -79.521 -87.013 -92.936 -97.824 -101.811 -105.227 -108.049 -110.76 -112.969 -114.847 -116.596 -118.195 -119.657 -120.948 -122.235 -123.365 -124.331 -125.313 -126.327 -127.164 -128.005 -128.842 -129.46 -130.078 -130.713 -131.367 -132.037 -132.493 -132.966 -133.711 -134.213 -134.708 -134.959 -135.478 -136.024 -136.573 -136.849 -137.398 -137.692 -138.001 -138.323 -138.998 -139.337 -139.683 -140.085 -140.527 -141.006 -141.569 -142.418 -7 ,2859 ,KEBNE ,17024068,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:43:24 CET,0.0 0.621 0.852 0.99 1.116 1.225 1.298 1.347 1.386 1.389 1.381 1.213 1.319 1.294 1.22 1.122 1.035 0.987 0.862 0.74 0.57 0.441 0.298 0.075 -0.155 -0.4 -0.652 -0.892 -1.211 -1.551 -1.9 -2.34 -2.808 -3.287 -3.859 -4.547 -5.268 -6.114 -7.078 -8.168 -9.372 -10.799 -12.614 -14.614 -17.145 -20.214 -24.08 -28.936 -35.331 -44.04 -56.73 -69.798 -79.342 -86.771 -92.702 -97.679 -101.748 -105.195 -108.011 -110.7 -112.934 -114.838 -116.6 -118.226 -119.689 -120.98 -122.282 -123.412 -124.353 -125.299 -126.258 -127.051 -127.869 -128.682 -129.314 -129.959 -130.607 -131.278 -131.975 -132.443 -132.915 -133.614 -134.07 -134.563 -134.824 -135.356 -135.894 -136.435 -136.712 -137.257 -137.515 -137.806 -138.111 -138.722 -139.053 -139.421 -139.825 -140.243 -140.652 -141.252 -142.769 -8 ,24424 ,KEBNE ,17024069,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:43:58 CET,0.0 1.15 1.442 1.624 1.776 1.866 1.918 1.956 2.002 2.01 2.013 1.869 1.978 1.947 1.884 1.797 1.689 1.631 1.519 1.399 1.193 1.051 0.919 0.721 0.513 0.304 0.077 -0.163 -0.483 -0.83 -1.172 -1.612 -2.083 -2.565 -3.152 -3.855 -4.573 -5.381 -6.314 -7.411 -8.65 -10.135 -11.982 -13.968 -16.461 -19.511 -23.38 -28.194 -34.591 -43.366 -56.201 -69.453 -79.055 -86.438 -92.312 -97.205 -101.201 -104.615 -107.441 -110.14 -112.373 -114.296 -116.068 -117.692 -119.18 -120.509 -121.818 -122.936 -123.871 -124.836 -125.84 -126.655 -127.464 -128.289 -128.937 -129.582 -130.232 -130.909 -131.588 -132.03 -132.477 -133.195 -133.669 -134.129 -134.365 -134.832 -135.321 -135.854 -136.119 -136.662 -136.955 -137.245 -137.546 -138.166 -138.494 -138.847 -139.231 -139.632 -140.091 -140.661 -141.523 -9 ,3954 ,KEBNE ,17024070,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:43:47 CET,0.0 0.925 1.254 1.43 1.543 1.63 1.705 1.749 1.775 1.775 1.778 1.624 1.734 1.716 1.68 1.627 1.55 1.505 1.415 1.316 1.136 1.004 0.876 0.67 0.456 0.235 0.003 -0.228 -0.528 -0.838 -1.184 -1.644 -2.11 -2.599 -3.192 -3.849 -4.519 -5.336 -6.285 -7.362 -8.582 -10.063 -11.909 -13.872 -16.389 -19.471 -23.332 -28.171 -34.551 -43.28 -56.04 -69.19 -78.734 -86.122 -91.964 -96.826 -100.832 -104.278 -107.1 -109.783 -111.985 -113.893 -115.675 -117.321 -118.821 -120.141 -121.481 -122.651 -123.642 -124.631 -125.617 -126.411 -127.198 -127.993 -128.602 -129.22 -129.84 -130.489 -131.184 -131.652 -132.123 -132.852 -133.356 -133.868 -134.117 -134.628 -135.148 -135.682 -135.958 -136.507 -136.821 -137.132 -137.445 -138.135 -138.533 -138.924 -139.302 -139.727 -140.185 -140.695 -141.839 -10 ,31119 ,KEBNE ,17024071,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:44:03 CET,0.0 0.744 1.03 1.195 1.29 1.355 1.416 1.469 1.546 1.558 1.56 1.431 1.56 1.548 1.521 1.476 1.392 1.345 1.249 1.15 0.988 0.869 0.736 0.526 0.303 0.072 -0.164 -0.414 -0.754 -1.106 -1.461 -1.91 -2.354 -2.813 -3.411 -4.109 -4.823 -5.658 -6.606 -7.708 -8.947 -10.428 -12.257 -14.239 -16.768 -19.843 -23.731 -28.608 -35.026 -43.755 -56.393 -69.434 -78.974 -86.385 -92.278 -97.201 -101.264 -104.739 -107.568 -110.263 -112.497 -114.394 -116.154 -117.754 -119.2 -120.502 -121.81 -122.945 -123.898 -124.859 -125.826 -126.606 -127.394 -128.196 -128.811 -129.428 -130.059 -130.723 -131.408 -131.869 -132.341 -133.054 -133.525 -134.004 -134.254 -134.784 -135.321 -135.867 -136.149 -136.704 -137.022 -137.331 -137.64 -138.295 -138.639 -138.994 -139.375 -139.801 -140.245 -140.765 -141.653 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt deleted file mode 100644 index 24cb8ff7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4634 ,KEBNE ,17069533,Fri Dec 24 06:54:16 CET,Fri Dec 24 08:17:59 CET,0.0 1.094 1.507 1.858 2.156 2.401 2.622 2.822 3.19 3.374 3.546 3.726 4.012 4.152 4.402 4.636 4.853 4.952 5.145 5.333 5.59 5.774 5.966 6.234 6.487 6.756 7.014 7.235 7.529 7.784 7.998 8.281 8.572 8.837 9.106 9.391 9.651 9.918 10.195 10.474 10.786 11.166 11.567 11.908 12.266 12.678 13.098 13.436 13.805 13.973 13.606 12.817 11.884 10.91 10.044 9.235 8.494 7.823 7.233 6.673 6.187 5.698 5.226 4.788 4.385 3.997 3.579 3.203 2.853 2.501 2.145 1.846 1.546 1.249 1.032 0.781 0.506 0.239 -0.03 -0.233 -0.45 -0.79 -1.039 -1.297 -1.434 -1.718 -1.993 -2.298 -2.474 -2.786 -2.995 -3.188 -3.401 -3.863 -4.114 -4.381 -4.657 -4.972 -5.391 -5.972 -7.746 -2 ,16494 ,KEBNE ,17069535,Fri Dec 24 06:55:20 CET,Fri Dec 24 08:17:58 CET,0.0 1.167 1.708 2.113 2.423 2.667 2.875 3.076 3.459 3.633 3.8 4.001 4.282 4.421 4.658 4.869 5.083 5.184 5.383 5.576 5.838 6.013 6.194 6.454 6.716 6.96 7.15 7.326 7.559 7.783 8.02 8.3 8.537 8.765 9.03 9.314 9.581 9.863 10.171 10.5 10.803 11.119 11.466 11.789 12.15 12.532 13.004 13.422 13.696 13.798 13.436 12.498 11.478 10.533 9.704 8.94 8.187 7.503 6.939 6.332 5.779 5.293 4.846 4.403 3.942 3.513 3.094 2.73 2.406 2.072 1.728 1.431 1.108 0.791 0.549 0.294 0.03 -0.26 -0.575 -0.797 -1.016 -1.346 -1.569 -1.806 -1.942 -2.21 -2.481 -2.773 -2.919 -3.213 -3.4 -3.569 -3.765 -4.239 -4.496 -4.742 -5.02 -5.362 -5.789 -6.367 -8.133 -3 ,6936 ,KEBNE ,17069537,Fri Dec 24 06:58:28 CET,Fri Dec 24 08:21:33 CET,0.0 1.485 1.984 2.289 2.547 2.791 3.034 3.244 3.596 3.763 3.908 4.035 4.301 4.445 4.722 4.969 5.184 5.282 5.457 5.623 5.873 6.036 6.208 6.489 6.736 6.964 7.213 7.462 7.736 7.969 8.203 8.491 8.765 9.047 9.369 9.671 9.947 10.248 10.571 10.907 11.244 11.605 11.998 12.402 12.825 13.217 13.573 13.882 14.135 14.196 13.827 12.834 11.732 10.721 9.826 8.986 8.195 7.446 6.826 6.174 5.484 4.864 4.31 3.788 3.289 2.787 2.251 1.811 1.447 1.068 0.687 0.359 0.033 -0.288 -0.532 -0.773 -1.028 -1.316 -1.626 -1.828 -2.03 -2.372 -2.625 -2.885 -3.017 -3.28 -3.547 -3.84 -4.001 -4.308 -4.513 -4.696 -4.896 -5.348 -5.597 -5.882 -6.214 -6.581 -6.983 -7.5 -9.082 -4 ,19536 ,KEBNE ,17069539,Fri Dec 24 07:06:54 CET,Fri Dec 24 08:29:21 CET,0.0 1.48 1.99 2.376 2.667 2.896 3.114 3.308 3.65 3.822 3.971 4.103 4.372 4.499 4.74 4.981 5.219 5.334 5.533 5.719 6.011 6.198 6.366 6.604 6.836 7.051 7.26 7.461 7.717 7.975 8.217 8.523 8.834 9.117 9.42 9.723 9.994 10.26 10.526 10.807 11.116 11.48 11.891 12.251 12.587 12.974 13.384 13.728 14.034 14.12 13.739 12.843 11.849 10.922 10.013 9.159 8.452 7.771 7.142 6.515 5.962 5.45 4.966 4.501 4.074 3.69 3.277 2.918 2.595 2.238 1.875 1.59 1.285 0.958 0.704 0.459 0.198 -0.089 -0.387 -0.614 -0.839 -1.166 -1.409 -1.674 -1.815 -2.111 -2.421 -2.72 -2.861 -3.164 -3.373 -3.545 -3.734 -4.153 -4.396 -4.672 -4.97 -5.309 -5.72 -6.278 -7.849 -5 ,1541 ,KEBNE ,17069541,Fri Dec 24 07:12:13 CET,Fri Dec 24 08:33:32 CET,0.0 1.331 1.953 2.338 2.635 2.9 3.122 3.327 3.683 3.839 3.997 4.152 4.4 4.515 4.759 4.988 5.211 5.33 5.542 5.729 5.996 6.171 6.338 6.569 6.802 7.046 7.301 7.523 7.77 8.012 8.254 8.519 8.77 9.053 9.355 9.653 9.929 10.216 10.505 10.792 11.105 11.461 11.855 12.232 12.643 13.095 13.592 14.002 14.324 14.557 14.347 13.47 12.55 11.694 10.808 9.94 9.177 8.472 7.899 7.298 6.73 6.227 5.746 5.277 4.86 4.486 4.061 3.685 3.332 2.952 2.574 2.269 1.96 1.632 1.376 1.109 0.846 0.574 0.268 0.072 -0.13 -0.477 -0.706 -0.94 -1.067 -1.37 -1.676 -1.97 -2.142 -2.463 -2.694 -2.892 -3.095 -3.524 -3.778 -4.041 -4.328 -4.716 -5.174 -5.692 -7.002 -6 ,7046 ,KEBNE ,17069543,Fri Dec 24 07:17:34 CET,Fri Dec 24 08:38:57 CET,0.0 1.393 1.939 2.358 2.665 2.934 3.171 3.384 3.765 3.935 4.096 4.269 4.549 4.71 5.011 5.28 5.513 5.613 5.817 5.999 6.255 6.444 6.641 6.906 7.131 7.353 7.592 7.814 8.064 8.281 8.478 8.695 8.921 9.147 9.4 9.715 10.014 10.331 10.654 10.95 11.243 11.534 11.842 12.169 12.522 12.853 13.178 13.495 13.794 13.882 13.509 12.628 11.647 10.678 9.791 8.951 8.186 7.517 6.911 6.302 5.787 5.295 4.811 4.367 3.965 3.569 3.117 2.729 2.394 2.031 1.665 1.374 1.078 0.779 0.545 0.303 0.03 -0.265 -0.557 -0.774 -0.997 -1.322 -1.557 -1.803 -1.923 -2.167 -2.429 -2.709 -2.859 -3.158 -3.342 -3.515 -3.696 -4.102 -4.32 -4.563 -4.838 -5.135 -5.488 -6.03 -7.908 -7 ,2253 ,KEBNE ,17069544,Fri Dec 24 07:18:38 CET,Fri Dec 24 08:41:25 CET,0.0 1.196 1.627 1.983 2.281 2.521 2.734 2.934 3.325 3.485 3.627 3.784 4.048 4.178 4.445 4.694 4.913 5.008 5.187 5.374 5.647 5.833 6.021 6.288 6.532 6.757 6.976 7.185 7.445 7.693 7.954 8.277 8.554 8.794 9.057 9.359 9.646 9.941 10.221 10.534 10.877 11.245 11.67 12.086 12.498 12.887 13.323 13.676 13.924 14.075 13.802 13.039 12.291 11.446 10.593 9.83 9.148 8.498 7.845 7.084 6.365 5.697 5.119 4.673 4.258 3.86 3.46 3.104 2.787 2.451 2.083 1.783 1.488 1.16 0.907 0.656 0.386 0.103 -0.19 -0.391 -0.601 -0.928 -1.159 -1.403 -1.529 -1.774 -2.04 -2.362 -2.528 -2.828 -3.043 -3.222 -3.41 -3.848 -4.097 -4.396 -4.702 -5.029 -5.441 -6.044 -7.671 -8 ,26296 ,KEBNE ,17069547,Fri Dec 24 07:20:46 CET,Fri Dec 24 08:43:17 CET,0.0 0.879 1.303 1.642 1.934 2.174 2.412 2.631 2.998 3.177 3.341 3.497 3.759 3.882 4.13 4.367 4.608 4.72 4.92 5.129 5.436 5.608 5.756 6.0 6.263 6.507 6.735 6.955 7.236 7.499 7.724 7.965 8.19 8.426 8.674 8.917 9.205 9.541 9.892 10.294 10.696 11.064 11.443 11.862 12.298 12.67 13.154 13.644 13.967 14.164 13.982 13.215 12.33 11.431 10.605 9.852 9.099 8.214 7.359 6.611 6.068 5.552 4.988 4.423 3.86 3.338 2.829 2.364 1.946 1.539 1.103 0.723 0.348 -0.024 -0.326 -0.637 -0.941 -1.275 -1.645 -1.891 -2.144 -2.529 -2.774 -3.01 -3.128 -3.383 -3.659 -3.988 -4.171 -4.481 -4.695 -4.867 -5.049 -5.466 -5.697 -5.938 -6.207 -6.54 -6.924 -7.446 -9.1 -9 ,16743 ,KEBNE ,17069549,Fri Dec 24 07:22:55 CET,Fri Dec 24 08:46:29 CET,0.0 1.383 1.903 2.29 2.598 2.854 3.074 3.255 3.584 3.74 3.903 4.096 4.37 4.503 4.752 4.989 5.213 5.321 5.546 5.763 6.071 6.258 6.423 6.665 6.911 7.142 7.358 7.571 7.827 8.056 8.293 8.615 8.927 9.206 9.49 9.783 10.069 10.381 10.712 11.045 11.358 11.705 12.1 12.449 12.797 13.16 13.556 13.927 14.199 14.246 13.853 12.948 12.047 11.111 10.158 9.265 8.476 7.777 7.19 6.543 5.991 5.549 5.105 4.668 4.247 3.859 3.436 3.052 2.74 2.403 2.053 1.772 1.479 1.175 0.93 0.684 0.423 0.131 -0.178 -0.401 -0.618 -0.939 -1.177 -1.443 -1.579 -1.838 -2.094 -2.389 -2.548 -2.84 -3.03 -3.202 -3.388 -3.837 -4.081 -4.327 -4.617 -4.965 -5.356 -5.883 -8.296 -10 ,26110 ,KEBNE ,17069552,Fri Dec 24 07:26:06 CET,Fri Dec 24 08:47:29 CET,0.0 1.565 2.054 2.441 2.768 3.03 3.254 3.466 3.832 4.009 4.189 4.388 4.656 4.788 5.053 5.303 5.553 5.664 5.842 6.025 6.299 6.459 6.602 6.842 7.093 7.31 7.498 7.686 7.94 8.193 8.451 8.737 9.001 9.241 9.52 9.809 10.046 10.333 10.666 10.991 11.295 11.612 11.948 12.244 12.585 12.985 13.388 13.742 14.02 14.07 13.694 12.844 11.876 10.967 10.113 9.29 8.536 7.783 7.162 6.566 6.022 5.549 5.084 4.643 4.224 3.827 3.412 3.045 2.737 2.414 2.064 1.779 1.472 1.126 0.867 0.6 0.318 0.032 -0.284 -0.501 -0.729 -1.088 -1.312 -1.553 -1.683 -1.942 -2.198 -2.499 -2.655 -2.933 -3.126 -3.319 -3.53 -3.993 -4.249 -4.536 -4.835 -5.175 -5.616 -6.204 -7.96 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt deleted file mode 100644 index 52079833..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25654 ,KEBNE ,16678483,Thu Nov 25 02:49:33 CET,Thu Nov 25 04:13:29 CET,0.0 2.458 3.059 3.467 3.817 4.122 4.396 4.654 5.123 5.336 5.529 5.752 6.051 6.205 6.513 6.833 7.137 7.278 7.55 7.812 8.19 8.423 8.638 8.983 9.324 9.638 9.95 10.253 10.647 11.015 11.359 11.769 12.183 12.582 13.038 13.554 14.048 14.592 15.19 15.82 16.472 17.242 18.143 19.017 20.011 21.116 22.39 23.822 25.528 27.483 29.49 30.729 31.2 31.273 30.924 30.343 29.844 29.358 28.862 28.342 27.873 27.451 27.035 26.615 26.221 25.885 25.529 25.185 24.886 24.578 24.24 23.95 23.661 23.379 23.147 22.889 22.596 22.271 21.941 21.706 21.443 21.039 20.761 20.468 20.317 20.009 19.691 19.344 19.149 18.834 18.485 18.247 18.024 17.491 17.187 16.851 16.49 16.113 15.629 14.957 12.807 -2 ,8502 ,KEBNE ,16676200,Wed Nov 24 11:45:58 CET,Wed Nov 24 13:07:09 CET,0.0 1.392 1.984 2.434 2.808 3.124 3.389 3.636 4.065 4.274 4.476 4.714 5.029 5.204 5.504 5.79 6.072 6.206 6.466 6.722 7.116 7.367 7.589 7.915 8.242 8.556 8.855 9.136 9.493 9.861 10.229 10.68 11.1 11.497 11.958 12.481 12.993 13.541 14.129 14.774 15.463 16.231 17.113 17.985 19.009 20.159 21.484 22.954 24.624 26.552 28.64 29.869 30.332 30.427 30.263 29.956 29.529 29.064 28.694 28.286 27.898 27.533 27.144 26.768 26.415 26.075 25.715 25.4 25.119 24.81 24.481 24.206 23.907 23.577 23.313 23.053 22.792 22.519 22.227 22.02 21.781 21.344 21.036 20.747 20.603 20.296 19.969 19.612 19.434 19.132 18.786 18.552 18.308 17.729 17.414 17.076 16.697 16.282 15.766 15.091 12.957 -3 ,15938 ,KEBNE ,16678485,Thu Nov 25 02:49:34 CET,Thu Nov 25 04:12:33 CET,0.0 1.417 1.969 2.399 2.742 3.051 3.336 3.589 4.008 4.214 4.421 4.664 4.974 5.15 5.496 5.81 6.109 6.254 6.539 6.797 7.142 7.385 7.627 7.959 8.283 8.601 8.922 9.245 9.649 10.024 10.368 10.767 11.152 11.541 12.028 12.565 13.069 13.63 14.222 14.875 15.571 16.334 17.228 18.127 19.188 20.406 21.777 23.278 25.009 26.906 28.832 29.885 30.037 29.895 29.522 29.114 28.719 28.285 27.889 27.451 27.039 26.653 26.243 25.836 25.457 25.091 24.708 24.365 24.056 23.738 23.417 23.153 22.87 22.561 22.312 22.049 21.787 21.516 21.223 21.021 20.805 20.455 20.207 19.923 19.769 19.458 19.13 18.78 18.593 18.291 18.004 17.783 17.546 17.028 16.736 16.405 16.037 15.607 15.064 14.358 12.18 -4 ,28225 ,KEBNE ,16678486,Thu Nov 25 02:50:35 CET,Thu Nov 25 04:13:57 CET,0.0 1.896 2.488 2.917 3.292 3.636 3.93 4.176 4.601 4.806 5.016 5.279 5.595 5.771 6.086 6.397 6.692 6.837 7.121 7.379 7.744 7.975 8.214 8.554 8.863 9.163 9.469 9.779 10.165 10.519 10.85 11.264 11.676 12.068 12.537 13.08 13.592 14.152 14.749 15.409 16.121 16.899 17.778 18.675 19.801 21.044 22.417 23.909 25.585 27.451 29.437 30.617 30.979 31.044 30.882 30.564 30.154 29.723 29.333 28.887 28.448 28.054 27.681 27.313 26.939 26.531 26.071 25.659 25.335 25.035 24.703 24.432 24.161 23.866 23.637 23.39 23.107 22.832 22.562 22.361 22.142 21.781 21.515 21.219 21.069 20.769 20.432 20.072 19.88 19.576 19.264 19.028 18.763 18.193 17.889 17.562 17.19 16.747 16.235 15.588 13.44 -5 ,13129 ,KEBNE ,16678487,Thu Nov 25 02:50:35 CET,Thu Nov 25 04:14:38 CET,0.0 1.453 1.979 2.368 2.724 3.038 3.315 3.589 4.108 4.323 4.513 4.731 5.033 5.205 5.542 5.872 6.198 6.344 6.602 6.855 7.214 7.449 7.684 8.014 8.336 8.668 8.985 9.269 9.644 10.003 10.354 10.783 11.172 11.562 12.022 12.525 13.024 13.567 14.146 14.791 15.487 16.269 17.155 18.026 19.075 20.228 21.517 22.963 24.591 26.496 28.65 30.018 30.479 30.4 30.121 29.774 29.425 29.055 28.647 28.173 27.711 27.287 26.884 26.511 26.15 25.807 25.429 25.085 24.794 24.425 24.0 23.654 23.299 22.948 22.688 22.404 22.094 21.786 21.472 21.263 21.042 20.681 20.421 20.125 19.969 19.674 19.378 19.033 18.853 18.575 18.314 18.098 17.853 17.35 17.073 16.753 16.405 15.976 15.474 14.81 12.622 -6 ,30024 ,KEBNE ,16678488,Thu Nov 25 02:52:38 CET,Thu Nov 25 04:14:55 CET,0.0 1.862 2.416 2.862 3.224 3.53 3.79 4.031 4.499 4.719 4.916 5.135 5.429 5.584 5.89 6.201 6.513 6.662 6.933 7.181 7.549 7.812 8.073 8.42 8.762 9.093 9.394 9.681 10.061 10.441 10.808 11.241 11.674 12.083 12.528 13.022 13.502 14.053 14.665 15.312 15.983 16.723 17.597 18.54 19.629 20.817 22.154 23.614 25.254 27.08 29.215 30.506 30.758 30.609 30.358 30.012 29.638 29.189 28.733 28.249 27.806 27.409 27.016 26.649 26.294 25.952 25.599 25.265 24.97 24.669 24.327 24.035 23.737 23.431 23.189 22.919 22.598 22.276 21.981 21.768 21.539 21.146 20.845 20.538 20.383 20.055 19.717 19.362 19.169 18.847 18.496 18.257 18.016 17.492 17.209 16.903 16.512 16.065 15.562 14.971 12.343 -7 ,27241 ,KEBNE ,16676205,Wed Nov 24 11:46:58 CET,Wed Nov 24 13:08:14 CET,0.0 1.833 2.436 2.852 3.188 3.501 3.806 4.082 4.546 4.751 4.933 5.12 5.417 5.589 5.935 6.259 6.559 6.701 6.964 7.227 7.631 7.883 8.112 8.459 8.811 9.131 9.427 9.712 10.082 10.44 10.805 11.238 11.642 12.045 12.507 13.006 13.482 14.024 14.621 15.275 15.968 16.72 17.577 18.488 19.568 20.732 22.036 23.542 25.311 27.286 29.439 30.844 31.13 30.813 30.486 30.183 29.838 29.401 28.941 28.501 28.108 27.732 27.328 26.938 26.604 26.28 25.91 25.57 25.281 24.981 24.654 24.372 24.028 23.654 23.408 23.157 22.893 22.629 22.338 22.122 21.891 21.514 21.232 20.92 20.763 20.456 20.097 19.702 19.506 19.203 18.875 18.625 18.375 17.788 17.45 17.111 16.739 16.322 15.871 15.218 12.581 -8 ,24597 ,KEBNE ,16678490,Thu Nov 25 02:52:39 CET,Thu Nov 25 04:18:45 CET,0.0 2.433 3.037 3.452 3.782 4.093 4.383 4.634 5.043 5.239 5.449 5.706 6.005 6.171 6.482 6.773 7.056 7.192 7.46 7.722 8.098 8.34 8.573 8.896 9.215 9.531 9.839 10.131 10.501 10.872 11.216 11.62 12.028 12.433 12.893 13.412 13.938 14.52 15.139 15.799 16.469 17.245 18.156 19.028 20.063 21.235 22.557 24.082 25.827 27.681 29.524 30.646 30.876 30.696 30.379 29.948 29.483 29.028 28.622 28.165 27.73 27.317 26.896 26.516 26.167 25.827 25.472 25.15 24.844 24.516 24.159 23.832 23.49 23.128 22.833 22.537 22.214 21.865 21.526 21.292 21.034 20.627 20.375 20.128 19.995 19.716 19.421 19.088 18.906 18.608 18.292 18.055 17.793 17.231 16.929 16.601 16.221 15.782 15.227 14.508 12.687 -9 ,32185 ,KEBNE ,16676207,Wed Nov 24 11:46:59 CET,Wed Nov 24 13:08:31 CET,0.0 1.532 2.112 2.531 2.846 3.143 3.411 3.655 4.093 4.292 4.482 4.739 5.066 5.238 5.567 5.915 6.252 6.401 6.654 6.895 7.258 7.481 7.699 8.038 8.387 8.711 8.995 9.275 9.654 10.024 10.372 10.796 11.21 11.597 12.052 12.569 13.084 13.672 14.293 14.967 15.656 16.384 17.264 18.188 19.267 20.415 21.707 23.207 24.954 26.864 28.689 29.695 29.908 29.724 29.345 28.938 28.383 27.725 27.154 26.638 26.185 25.709 25.198 24.666 24.173 23.728 23.26 22.838 22.469 22.091 21.683 21.374 21.061 20.696 20.405 20.099 19.79 19.461 19.103 18.865 18.619 18.209 17.95 17.675 17.517 17.2 16.86 16.485 16.294 16.013 15.751 15.531 15.294 14.812 14.525 14.208 13.867 13.444 12.956 12.239 9.382 -10 ,23550 ,KEBNE ,16676208,Wed Nov 24 11:46:59 CET,Wed Nov 24 13:15:45 CET,0.0 1.721 2.246 2.64 2.984 3.299 3.587 3.841 4.285 4.487 4.682 4.913 5.208 5.371 5.681 5.95 6.198 6.329 6.585 6.837 7.195 7.417 7.637 7.963 8.29 8.595 8.881 9.163 9.532 9.885 10.237 10.681 11.105 11.508 11.974 12.515 13.038 13.594 14.185 14.819 15.524 16.327 17.233 18.172 19.279 20.47 21.827 23.398 25.179 26.973 28.681 29.551 29.744 29.757 29.618 29.294 28.924 28.562 28.2 27.766 27.36 26.984 26.596 26.226 25.851 25.483 25.08 24.709 24.394 24.056 23.653 23.288 22.934 22.596 22.343 22.098 21.851 21.595 21.315 21.107 20.878 20.495 20.219 19.924 19.774 19.478 19.163 18.825 18.64 18.319 18.001 17.792 17.568 17.055 16.751 16.413 16.032 15.578 15.035 14.276 11.691 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt deleted file mode 100644 index fda32a35..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27832 ,KEBNE ,16676209,Wed Nov 24 11:46:58 CET,Wed Nov 24 13:10:20 CET,0.0 1.176 1.628 2.003 2.32 2.582 2.807 3.018 3.392 3.568 3.739 3.905 4.165 4.295 4.563 4.804 5.01 5.11 5.307 5.495 5.767 5.945 6.114 6.344 6.571 6.805 7.033 7.251 7.53 7.783 8.019 8.305 8.576 8.844 9.171 9.529 9.866 10.235 10.62 11.023 11.46 11.948 12.462 12.96 13.517 14.102 14.77 15.49 16.278 17.063 17.62 17.65 17.426 17.08 16.669 16.266 15.876 15.472 15.097 14.705 14.333 14.007 13.717 13.415 13.117 12.825 12.503 12.216 11.964 11.698 11.428 11.21 10.982 10.735 10.519 10.276 10.034 9.796 9.558 9.405 9.227 8.936 8.735 8.523 8.415 8.16 7.889 7.635 7.503 7.234 7.052 6.896 6.731 6.307 6.047 5.789 5.507 5.177 4.801 4.314 2.827 -2 ,3635 ,KEBNE ,16678494,Thu Nov 25 02:54:42 CET,Thu Nov 25 04:17:22 CET,0.0 0.776 1.121 1.414 1.654 1.852 2.051 2.233 2.554 2.71 2.865 3.015 3.264 3.374 3.611 3.836 4.04 4.145 4.344 4.526 4.782 4.955 5.129 5.361 5.591 5.819 6.027 6.228 6.499 6.766 7.016 7.317 7.605 7.875 8.194 8.565 8.906 9.271 9.673 10.078 10.501 10.984 11.539 12.099 12.714 13.343 14.014 14.667 15.386 16.105 16.687 16.843 16.632 16.297 15.925 15.518 15.139 14.763 14.397 14.03 13.717 13.396 13.056 12.731 12.435 12.155 11.849 11.6 11.388 11.128 10.814 10.547 10.287 10.032 9.838 9.651 9.456 9.238 9.004 8.836 8.665 8.385 8.182 7.986 7.871 7.619 7.386 7.143 7.007 6.736 6.567 6.41 6.234 5.816 5.591 5.348 5.073 4.746 4.303 3.692 2.076 -3 ,3495 ,KEBNE ,16676211,Wed Nov 24 11:47:02 CET,Wed Nov 24 13:10:39 CET,0.0 0.819 1.188 1.448 1.66 1.874 2.079 2.265 2.601 2.759 2.909 3.058 3.323 3.444 3.683 3.914 4.143 4.25 4.451 4.666 4.966 5.151 5.333 5.601 5.863 6.109 6.329 6.545 6.818 7.069 7.318 7.62 7.91 8.187 8.501 8.854 9.189 9.537 9.913 10.305 10.707 11.156 11.646 12.109 12.66 13.264 13.955 14.674 15.385 16.079 16.615 16.787 16.68 16.37 16.011 15.647 15.239 14.843 14.48 14.098 13.73 13.397 13.088 12.791 12.494 12.206 11.92 11.673 11.462 11.232 10.987 10.761 10.506 10.209 9.966 9.744 9.528 9.294 9.036 8.869 8.688 8.373 8.147 7.905 7.782 7.549 7.311 7.048 6.917 6.654 6.475 6.303 6.109 5.685 5.449 5.182 4.884 4.565 4.184 3.605 2.027 -4 ,11139 ,KEBNE ,16678496,Thu Nov 25 02:56:44 CET,Thu Nov 25 04:22:03 CET,0.0 0.882 1.273 1.589 1.862 2.085 2.274 2.447 2.777 2.925 3.055 3.178 3.433 3.563 3.817 4.045 4.262 4.372 4.591 4.795 5.068 5.241 5.415 5.671 5.918 6.156 6.372 6.58 6.851 7.11 7.359 7.656 7.941 8.21 8.518 8.861 9.184 9.545 9.932 10.328 10.758 11.236 11.78 12.311 12.89 13.516 14.202 14.89 15.602 16.364 17.053 17.241 17.076 16.8 16.477 16.073 15.668 15.259 14.865 14.462 14.114 13.814 13.512 13.206 12.914 12.626 12.341 12.089 11.845 11.587 11.317 11.075 10.825 10.562 10.357 10.155 9.949 9.713 9.46 9.275 9.068 8.745 8.521 8.285 8.163 7.909 7.632 7.349 7.212 6.953 6.792 6.631 6.465 6.087 5.87 5.629 5.353 5.039 4.655 4.122 2.644 -5 ,24254 ,KEBNE ,16676213,Wed Nov 24 11:48:00 CET,Wed Nov 24 13:09:58 CET,0.0 1.016 1.393 1.678 1.908 2.125 2.326 2.505 2.832 2.988 3.151 3.341 3.609 3.735 3.981 4.211 4.441 4.553 4.766 4.968 5.269 5.457 5.621 5.867 6.101 6.319 6.531 6.736 7.014 7.288 7.558 7.867 8.148 8.417 8.721 9.07 9.411 9.777 10.157 10.558 10.981 11.443 11.959 12.456 13.018 13.616 14.296 15.023 15.773 16.521 17.104 17.249 17.058 16.714 16.3 15.855 15.451 15.054 14.711 14.382 14.08 13.778 13.491 13.209 12.923 12.658 12.374 12.11 11.869 11.62 11.363 11.151 10.917 10.653 10.438 10.212 9.99 9.761 9.52 9.351 9.173 8.874 8.657 8.423 8.306 8.063 7.814 7.574 7.428 7.134 6.928 6.767 6.597 6.177 5.944 5.683 5.355 5.001 4.627 4.17 2.858 -6 ,24992 ,KEBNE ,16678498,Thu Nov 25 02:57:45 CET,Thu Nov 25 04:20:14 CET,0.0 1.032 1.479 1.799 2.086 2.325 2.527 2.723 3.057 3.214 3.365 3.509 3.775 3.904 4.173 4.425 4.648 4.759 4.966 5.18 5.484 5.662 5.839 6.081 6.31 6.54 6.763 6.967 7.226 7.47 7.727 8.065 8.362 8.631 8.941 9.3 9.644 10.015 10.409 10.819 11.246 11.689 12.215 12.771 13.366 13.994 14.676 15.385 16.153 16.95 17.596 17.743 17.588 17.209 16.736 16.32 15.941 15.552 15.196 14.797 14.431 14.109 13.794 13.478 13.204 12.923 12.608 12.341 12.104 11.862 11.615 11.401 11.166 10.902 10.688 10.479 10.278 10.071 9.842 9.681 9.496 9.176 8.951 8.73 8.61 8.363 8.126 7.865 7.733 7.474 7.297 7.142 6.991 6.641 6.422 6.168 5.876 5.534 5.135 4.589 3.343 -7 ,7624 ,KEBNE ,16676215,Wed Nov 24 11:49:01 CET,Wed Nov 24 13:11:04 CET,0.0 0.773 1.12 1.415 1.648 1.851 2.064 2.277 2.63 2.778 2.911 3.05 3.319 3.451 3.689 3.915 4.142 4.251 4.45 4.637 4.907 5.086 5.264 5.519 5.748 5.974 6.204 6.415 6.67 6.92 7.168 7.452 7.747 8.041 8.341 8.677 9.012 9.369 9.73 10.126 10.567 11.033 11.533 12.003 12.55 13.185 13.901 14.649 15.433 16.157 16.716 16.812 16.604 16.293 15.933 15.511 15.084 14.666 14.272 13.913 13.587 13.249 12.934 12.628 12.329 12.042 11.741 11.483 11.237 10.971 10.707 10.471 10.21 9.953 9.746 9.512 9.276 9.048 8.807 8.64 8.474 8.189 7.973 7.752 7.636 7.383 7.113 6.843 6.703 6.419 6.212 6.031 5.837 5.433 5.205 4.945 4.643 4.317 3.956 3.441 1.923 -8 ,9081 ,KEBNE ,16676216,Wed Nov 24 11:50:03 CET,Wed Nov 24 13:11:45 CET,0.0 0.71 1.063 1.353 1.592 1.817 2.013 2.18 2.49 2.64 2.783 2.909 3.163 3.284 3.507 3.723 3.939 4.05 4.268 4.464 4.739 4.915 5.084 5.329 5.565 5.793 6.02 6.243 6.523 6.788 7.042 7.345 7.63 7.911 8.24 8.611 8.965 9.345 9.742 10.162 10.598 11.069 11.587 12.082 12.645 13.239 13.903 14.605 15.362 16.091 16.756 17.026 16.872 16.6 16.243 15.83 15.442 15.033 14.658 14.271 13.92 13.619 13.314 12.998 12.702 12.421 12.131 11.869 11.638 11.392 11.131 10.92 10.675 10.4 10.179 9.961 9.748 9.509 9.237 9.048 8.855 8.557 8.355 8.145 8.032 7.791 7.547 7.275 7.123 6.845 6.642 6.466 6.29 5.898 5.655 5.411 5.155 4.825 4.449 3.971 2.619 -9 ,2243 ,KEBNE ,16678501,Thu Nov 25 02:57:46 CET,Thu Nov 25 04:20:17 CET,0.0 1.042 1.463 1.818 2.115 2.351 2.566 2.769 3.131 3.282 3.43 3.598 3.866 3.996 4.25 4.471 4.669 4.768 4.961 5.143 5.415 5.59 5.762 6.014 6.242 6.458 6.669 6.873 7.121 7.365 7.627 7.941 8.23 8.505 8.817 9.149 9.451 9.782 10.145 10.52 10.911 11.355 11.851 12.355 12.959 13.592 14.253 14.945 15.668 16.346 16.867 17.007 16.82 16.473 16.075 15.66 15.239 14.836 14.469 14.093 13.782 13.468 13.152 12.858 12.55 12.258 11.954 11.671 11.43 11.183 10.92 10.692 10.45 10.188 9.979 9.774 9.563 9.317 9.033 8.832 8.629 8.322 8.097 7.861 7.745 7.511 7.25 6.966 6.817 6.526 6.335 6.166 5.992 5.625 5.42 5.192 4.934 4.631 4.255 3.74 2.215 -10 ,19029 ,KEBNE ,16678502,Thu Nov 25 02:57:49 CET,Thu Nov 25 04:19:00 CET,0.0 0.78 1.193 1.475 1.695 1.893 2.084 2.27 2.592 2.736 2.876 3.016 3.276 3.397 3.63 3.864 4.096 4.21 4.424 4.627 4.911 5.088 5.269 5.521 5.752 5.963 6.163 6.367 6.629 6.893 7.156 7.458 7.746 8.028 8.344 8.695 9.031 9.395 9.778 10.179 10.599 11.072 11.606 12.132 12.739 13.356 14.017 14.754 15.55 16.367 17.06 17.205 16.964 16.638 16.295 15.909 15.526 15.159 14.835 14.469 14.127 13.785 13.459 13.133 12.773 12.455 12.136 11.875 11.665 11.434 11.173 10.941 10.685 10.419 10.226 10.01 9.775 9.546 9.326 9.155 8.954 8.66 8.48 8.289 8.177 7.952 7.735 7.494 7.36 7.091 6.898 6.71 6.513 6.051 5.792 5.526 5.238 4.925 4.539 4.084 2.686 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt deleted file mode 100644 index a39266b8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25896 ,KEBNE ,16676219,Wed Nov 24 11:50:03 CET,Wed Nov 24 13:11:33 CET,0.0 0.719 1.06 1.372 1.637 1.845 2.014 2.152 2.405 2.52 2.619 2.686 2.92 3.012 3.184 3.364 3.542 3.609 3.73 3.872 4.068 4.175 4.271 4.411 4.555 4.687 4.796 4.898 5.035 5.17 5.279 5.397 5.511 5.607 5.732 5.877 5.978 6.078 6.179 6.26 6.302 6.344 6.389 6.371 6.3 6.159 5.893 5.497 4.858 3.811 1.871 -0.564 -2.502 -4.085 -5.475 -6.712 -7.785 -8.756 -9.565 -10.345 -11.021 -11.616 -12.168 -12.713 -13.223 -13.653 -14.087 -14.494 -14.848 -15.199 -15.566 -15.887 -16.228 -16.562 -16.82 -17.092 -17.369 -17.663 -17.977 -18.182 -18.387 -18.715 -18.929 -19.151 -19.269 -19.502 -19.766 -20.082 -20.246 -20.568 -20.73 -20.903 -21.077 -21.423 -21.625 -21.865 -22.148 -22.438 -22.776 -23.185 -24.046 -2 ,19332 ,KEBNE ,16678504,Thu Nov 25 02:58:47 CET,Thu Nov 25 04:21:44 CET,0.0 1.019 1.372 1.634 1.845 2.024 2.187 2.347 2.626 2.748 2.868 2.935 3.156 3.242 3.4 3.554 3.698 3.761 3.876 4.008 4.239 4.378 4.486 4.609 4.735 4.88 5.004 5.096 5.2 5.296 5.409 5.546 5.66 5.756 5.858 5.976 6.067 6.162 6.285 6.392 6.443 6.478 6.514 6.508 6.447 6.331 6.104 5.733 5.087 3.983 2.056 -0.22 -2.104 -3.76 -5.131 -6.319 -7.393 -8.341 -9.13 -9.913 -10.586 -11.168 -11.713 -12.227 -12.707 -13.137 -13.581 -13.988 -14.342 -14.723 -15.112 -15.428 -15.748 -16.072 -16.336 -16.616 -16.892 -17.172 -17.456 -17.651 -17.855 -18.177 -18.414 -18.655 -18.772 -19.016 -19.279 -19.564 -19.716 -20.024 -20.176 -20.335 -20.496 -20.876 -21.098 -21.337 -21.601 -21.873 -22.192 -22.563 -23.622 -3 ,22148 ,KEBNE ,16678505,Thu Nov 25 02:59:52 CET,Thu Nov 25 04:21:01 CET,0.0 0.759 1.098 1.384 1.615 1.795 1.95 2.097 2.358 2.465 2.572 2.618 2.833 2.925 3.098 3.256 3.402 3.467 3.583 3.691 3.854 3.959 4.051 4.18 4.307 4.425 4.525 4.607 4.714 4.833 4.951 5.08 5.192 5.296 5.408 5.526 5.651 5.756 5.837 5.919 5.986 6.05 6.082 6.085 6.067 5.95 5.718 5.36 4.705 3.642 1.785 -0.616 -2.56 -4.156 -5.502 -6.68 -7.709 -8.648 -9.448 -10.216 -10.871 -11.46 -12.02 -12.573 -13.101 -13.571 -14.046 -14.46 -14.814 -15.167 -15.533 -15.84 -16.166 -16.514 -16.766 -17.021 -17.279 -17.539 -17.804 -17.994 -18.198 -18.503 -18.72 -18.951 -19.085 -19.384 -19.666 -19.947 -20.111 -20.442 -20.607 -20.778 -20.952 -21.333 -21.54 -21.763 -22.021 -22.318 -22.638 -22.999 -23.888 -4 ,23371 ,KEBNE ,16678506,Thu Nov 25 02:59:53 CET,Thu Nov 25 04:22:44 CET,0.0 0.786 1.169 1.438 1.664 1.866 2.095 2.31 2.591 2.737 2.873 2.961 3.186 3.271 3.443 3.598 3.744 3.814 3.951 4.083 4.264 4.373 4.461 4.585 4.715 4.831 4.931 5.021 5.143 5.256 5.352 5.458 5.561 5.664 5.774 5.893 6.007 6.12 6.206 6.282 6.343 6.388 6.414 6.389 6.318 6.192 5.979 5.614 4.98 3.913 2.078 -0.214 -2.117 -3.708 -5.067 -6.248 -7.259 -8.2 -8.998 -9.76 -10.424 -11.033 -11.618 -12.176 -12.685 -13.15 -13.623 -14.03 -14.405 -14.805 -15.197 -15.511 -15.828 -16.143 -16.392 -16.656 -16.929 -17.204 -17.495 -17.712 -17.935 -18.254 -18.479 -18.704 -18.812 -19.062 -19.334 -19.604 -19.738 -20.035 -20.209 -20.389 -20.571 -20.959 -21.171 -21.392 -21.641 -21.98 -22.369 -22.823 -24.089 -5 ,29018 ,KEBNE ,16676223,Wed Nov 24 11:53:07 CET,Wed Nov 24 13:14:19 CET,0.0 0.814 1.186 1.461 1.694 1.907 2.092 2.259 2.528 2.644 2.768 2.876 3.106 3.189 3.364 3.529 3.667 3.729 3.852 3.963 4.108 4.197 4.273 4.382 4.502 4.621 4.729 4.845 4.987 5.109 5.218 5.343 5.473 5.593 5.714 5.821 5.919 6.029 6.126 6.228 6.327 6.401 6.443 6.442 6.405 6.295 6.055 5.653 4.989 3.896 2.019 -0.275 -2.159 -3.754 -5.132 -6.331 -7.335 -8.245 -9.051 -9.871 -10.557 -11.152 -11.719 -12.245 -12.72 -13.138 -13.579 -13.985 -14.34 -14.704 -15.076 -15.38 -15.695 -16.028 -16.281 -16.529 -16.797 -17.086 -17.379 -17.601 -17.829 -18.151 -18.371 -18.602 -18.725 -18.984 -19.258 -19.54 -19.686 -19.995 -20.162 -20.328 -20.504 -20.915 -21.158 -21.408 -21.66 -21.947 -22.288 -22.713 -23.522 -6 ,6443 ,KEBNE ,16678508,Thu Nov 25 03:00:50 CET,Thu Nov 25 04:22:17 CET,0.0 0.605 1.004 1.35 1.602 1.807 1.983 2.139 2.398 2.509 2.615 2.685 2.897 2.98 3.153 3.295 3.43 3.491 3.604 3.708 3.857 3.949 4.032 4.15 4.266 4.387 4.496 4.595 4.713 4.821 4.934 5.063 5.17 5.266 5.373 5.483 5.568 5.644 5.717 5.792 5.872 5.941 5.958 5.913 5.861 5.786 5.645 5.329 4.738 3.747 1.865 -0.417 -2.313 -3.937 -5.322 -6.57 -7.638 -8.558 -9.348 -10.133 -10.793 -11.391 -11.961 -12.498 -12.989 -13.422 -13.88 -14.298 -14.65 -15.009 -15.38 -15.676 -15.985 -16.336 -16.618 -16.891 -17.168 -17.457 -17.75 -17.956 -18.187 -18.535 -18.752 -18.989 -19.11 -19.353 -19.614 -19.88 -20.028 -20.347 -20.53 -20.698 -20.873 -21.275 -21.492 -21.7 -21.929 -22.203 -22.518 -22.93 -23.786 -7 ,30267 ,KEBNE ,16676225,Wed Nov 24 11:53:07 CET,Wed Nov 24 13:14:33 CET,0.0 0.678 1.047 1.333 1.554 1.767 1.967 2.129 2.417 2.544 2.652 2.701 2.921 3.018 3.205 3.377 3.532 3.594 3.705 3.824 3.992 4.089 4.173 4.301 4.418 4.524 4.637 4.742 4.866 4.977 5.092 5.245 5.374 5.475 5.584 5.692 5.788 5.885 5.963 6.032 6.107 6.179 6.241 6.27 6.27 6.16 5.954 5.63 4.971 3.947 2.123 -0.236 -2.141 -3.732 -5.189 -6.482 -7.543 -8.511 -9.338 -10.143 -10.845 -11.443 -11.999 -12.543 -13.058 -13.517 -13.977 -14.37 -14.717 -15.079 -15.455 -15.777 -16.106 -16.449 -16.713 -16.968 -17.234 -17.507 -17.777 -17.962 -18.155 -18.466 -18.7 -18.957 -19.082 -19.331 -19.591 -19.859 -20.002 -20.311 -20.503 -20.684 -20.847 -21.186 -21.366 -21.569 -21.811 -22.097 -22.452 -22.948 -24.434 -8 ,19826 ,KEBNE ,16678510,Thu Nov 25 03:00:50 CET,Thu Nov 25 04:24:09 CET,0.0 0.883 1.233 1.529 1.767 1.945 2.106 2.254 2.536 2.657 2.765 2.851 3.077 3.165 3.336 3.481 3.626 3.685 3.797 3.93 4.123 4.224 4.312 4.445 4.563 4.686 4.805 4.906 5.028 5.146 5.265 5.402 5.529 5.639 5.749 5.86 5.948 6.057 6.174 6.262 6.341 6.389 6.419 6.43 6.395 6.268 6.033 5.686 5.097 4.029 2.074 -0.235 -2.123 -3.739 -5.133 -6.343 -7.365 -8.295 -9.091 -9.86 -10.516 -11.126 -11.71 -12.254 -12.766 -13.23 -13.704 -14.126 -14.503 -14.893 -15.3 -15.64 -15.978 -16.315 -16.569 -16.834 -17.111 -17.389 -17.676 -17.88 -18.093 -18.432 -18.666 -18.922 -19.053 -19.313 -19.582 -19.859 -19.992 -20.285 -20.416 -20.572 -20.74 -21.105 -21.319 -21.549 -21.796 -22.077 -22.406 -22.833 -23.556 -9 ,7109 ,KEBNE ,16676227,Wed Nov 24 11:54:08 CET,Wed Nov 24 13:15:23 CET,0.0 0.743 1.138 1.412 1.627 1.814 1.979 2.126 2.392 2.514 2.621 2.654 2.868 2.951 3.094 3.22 3.35 3.417 3.541 3.659 3.824 3.926 4.021 4.152 4.275 4.394 4.509 4.615 4.767 4.917 5.033 5.152 5.257 5.37 5.498 5.594 5.674 5.777 5.871 5.953 6.041 6.107 6.125 6.112 6.055 5.916 5.717 5.371 4.689 3.557 1.612 -0.758 -2.732 -4.343 -5.683 -6.851 -7.854 -8.788 -9.606 -10.407 -11.089 -11.671 -12.228 -12.748 -13.211 -13.648 -14.119 -14.558 -14.958 -15.346 -15.715 -16.019 -16.325 -16.639 -16.892 -17.144 -17.409 -17.684 -17.972 -18.176 -18.377 -18.69 -18.924 -19.173 -19.293 -19.537 -19.804 -20.106 -20.265 -20.583 -20.748 -20.918 -21.091 -21.458 -21.665 -21.887 -22.143 -22.412 -22.729 -23.159 -24.061 -10 ,17915 ,KEBNE ,16678512,Thu Nov 25 03:01:51 CET,Thu Nov 25 04:24:03 CET,0.0 0.635 0.967 1.223 1.419 1.583 1.722 1.854 2.115 2.229 2.322 2.38 2.61 2.703 2.882 3.038 3.169 3.23 3.353 3.478 3.663 3.772 3.862 3.988 4.103 4.194 4.286 4.394 4.528 4.64 4.738 4.846 4.95 5.056 5.183 5.309 5.401 5.494 5.584 5.656 5.702 5.744 5.788 5.776 5.717 5.626 5.432 5.072 4.429 3.377 1.535 -0.742 -2.571 -4.14 -5.498 -6.687 -7.727 -8.669 -9.473 -10.255 -10.918 -11.501 -12.053 -12.565 -13.056 -13.537 -14.042 -14.491 -14.856 -15.212 -15.594 -15.903 -16.216 -16.54 -16.794 -17.067 -17.334 -17.595 -17.899 -18.119 -18.33 -18.659 -18.875 -19.093 -19.218 -19.488 -19.764 -20.044 -20.19 -20.498 -20.668 -20.846 -21.025 -21.422 -21.66 -21.897 -22.137 -22.43 -22.777 -23.196 -24.449 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt deleted file mode 100644 index 69ec8367..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7326 ,KEBNE ,16676229,Wed Nov 24 11:54:09 CET,Wed Nov 24 13:15:29 CET,0.0 0.664 0.998 1.227 1.439 1.629 1.794 1.955 2.265 2.399 2.514 2.455 2.824 2.922 3.097 3.28 3.459 3.544 3.708 3.862 4.09 4.239 4.382 4.597 4.802 4.98 5.151 5.316 5.519 5.722 5.921 6.163 6.401 6.623 6.867 7.137 7.406 7.7 8.006 8.332 8.678 9.071 9.515 9.936 10.422 10.989 11.619 12.267 13.01 13.834 14.657 15.139 15.297 15.335 15.257 15.05 14.77 14.5 14.291 14.083 13.88 13.689 13.482 13.265 13.09 12.921 12.706 12.504 12.336 12.157 11.964 11.796 11.633 11.459 11.312 11.173 11.034 10.876 10.695 10.563 10.433 10.232 10.086 9.923 9.833 9.644 9.451 9.254 9.158 8.806 8.851 8.717 8.557 8.238 8.045 7.811 7.558 7.287 6.911 6.354 4.797 -2 ,12912 ,KEBNE ,16678514,Thu Nov 25 03:01:51 CET,Thu Nov 25 04:26:06 CET,0.0 0.666 0.971 1.223 1.422 1.596 1.779 1.95 2.239 2.371 2.501 2.491 2.869 2.973 3.163 3.325 3.481 3.562 3.728 3.88 4.108 4.255 4.39 4.577 4.761 4.947 5.128 5.305 5.528 5.73 5.916 6.154 6.379 6.596 6.841 7.11 7.368 7.658 7.987 8.332 8.688 9.069 9.496 9.915 10.406 10.96 11.569 12.232 12.968 13.762 14.598 15.04 15.115 15.037 14.891 14.706 14.51 14.294 14.086 13.886 13.703 13.515 13.34 13.158 12.959 12.771 12.555 12.353 12.183 12.017 11.845 11.699 11.541 11.379 11.245 11.09 10.938 10.784 10.611 10.493 10.373 10.17 10.013 9.827 9.729 9.549 9.369 9.191 9.095 8.732 8.758 8.624 8.47 8.107 7.899 7.653 7.407 7.127 6.784 6.35 5.24 -3 ,8358 ,KEBNE ,16678515,Thu Nov 25 03:01:52 CET,Thu Nov 25 04:27:30 CET,0.0 0.91 1.236 1.473 1.695 1.9 2.071 2.22 2.491 2.627 2.771 2.755 3.123 3.226 3.432 3.613 3.778 3.855 4.0 4.149 4.381 4.532 4.674 4.869 5.062 5.25 5.424 5.591 5.822 6.04 6.241 6.482 6.708 6.93 7.186 7.467 7.751 8.071 8.386 8.725 9.065 9.428 9.865 10.3 10.799 11.313 11.913 12.605 13.387 14.234 15.077 15.607 15.735 15.664 15.536 15.365 15.187 15.02 14.845 14.622 14.411 14.219 14.01 13.791 13.599 13.435 13.246 13.07 12.919 12.753 12.582 12.444 12.275 12.092 11.951 11.8 11.659 11.502 11.338 11.226 11.102 10.895 10.744 10.584 10.501 10.337 10.149 9.939 9.818 9.435 9.448 9.315 9.173 8.822 8.639 8.429 8.169 7.87 7.48 7.0 5.743 -4 ,8959 ,KEBNE ,16678516,Thu Nov 25 03:02:52 CET,Thu Nov 25 04:26:44 CET,0.0 0.635 0.955 1.2 1.4 1.57 1.728 1.876 2.156 2.281 2.397 2.364 2.746 2.85 3.041 3.215 3.391 3.481 3.644 3.798 4.048 4.2 4.343 4.563 4.756 4.931 5.112 5.302 5.544 5.755 5.948 6.182 6.403 6.614 6.862 7.145 7.412 7.701 8.007 8.33 8.671 9.055 9.499 9.935 10.424 10.939 11.514 12.115 12.793 13.558 14.389 14.924 15.08 15.025 14.854 14.673 14.49 14.278 14.063 13.816 13.601 13.406 13.218 13.039 12.849 12.668 12.479 12.307 12.138 11.968 11.8 11.658 11.509 11.327 11.175 11.023 10.864 10.697 10.517 10.388 10.258 10.053 9.896 9.719 9.633 9.467 9.268 9.052 8.944 8.565 8.588 8.464 8.329 8.028 7.846 7.633 7.379 7.089 6.726 6.238 5.248 -5 ,32666 ,KEBNE ,16676233,Wed Nov 24 11:56:11 CET,Wed Nov 24 13:19:41 CET,0.0 0.727 1.067 1.351 1.554 1.723 1.879 2.031 2.316 2.452 2.571 2.518 2.9 3.011 3.204 3.395 3.592 3.695 3.892 4.069 4.318 4.471 4.615 4.811 4.999 5.183 5.371 5.552 5.765 5.961 6.163 6.397 6.613 6.851 7.13 7.426 7.703 7.988 8.308 8.657 9.001 9.393 9.863 10.316 10.822 11.355 11.953 12.629 13.384 14.189 15.033 15.511 15.605 15.549 15.38 15.159 14.961 14.74 14.52 14.311 14.141 13.973 13.777 13.577 13.398 13.23 13.026 12.838 12.688 12.531 12.363 12.229 12.08 11.887 11.728 11.579 11.424 11.254 11.068 10.939 10.815 10.63 10.49 10.321 10.227 10.047 9.852 9.637 9.513 9.109 9.093 8.952 8.802 8.441 8.229 8.014 7.797 7.557 7.2 6.717 5.664 -6 ,12030 ,KEBNE ,16676234,Wed Nov 24 11:58:13 CET,Wed Nov 24 13:21:22 CET,0.0 0.62 0.936 1.194 1.393 1.564 1.721 1.876 2.166 2.295 2.414 2.349 2.718 2.822 3.015 3.197 3.378 3.465 3.63 3.797 4.052 4.211 4.347 4.537 4.727 4.916 5.102 5.268 5.473 5.682 5.877 6.095 6.31 6.537 6.795 7.068 7.327 7.615 7.94 8.293 8.661 9.058 9.487 9.93 10.422 10.941 11.545 12.202 12.938 13.714 14.519 15.098 15.311 15.3 15.213 15.065 14.869 14.68 14.482 14.265 14.09 13.913 13.725 13.535 13.339 13.148 12.963 12.799 12.635 12.454 12.277 12.133 11.964 11.783 11.647 11.512 11.363 11.205 11.049 10.946 10.831 10.592 10.43 10.282 10.207 10.046 9.866 9.667 9.559 9.183 9.175 9.023 8.86 8.529 8.353 8.133 7.858 7.534 7.15 6.691 5.691 -7 ,13964 ,KEBNE ,16676235,Wed Nov 24 11:58:14 CET,Wed Nov 24 13:21:02 CET,0.0 0.624 0.936 1.189 1.418 1.613 1.799 1.959 2.234 2.37 2.491 2.45 2.826 2.926 3.117 3.295 3.472 3.557 3.722 3.882 4.115 4.269 4.409 4.602 4.796 4.978 5.139 5.296 5.502 5.691 5.88 6.114 6.34 6.573 6.852 7.165 7.437 7.706 8.008 8.34 8.649 8.991 9.417 9.84 10.332 10.876 11.476 12.115 12.839 13.644 14.454 14.949 15.116 15.085 14.935 14.741 14.53 14.298 14.079 13.856 13.649 13.463 13.284 13.074 12.865 12.678 12.477 12.314 12.169 11.997 11.813 11.659 11.499 11.335 11.201 11.061 10.919 10.768 10.601 10.477 10.35 10.161 10.02 9.859 9.777 9.616 9.436 9.234 9.125 8.74 8.74 8.597 8.434 8.072 7.861 7.643 7.421 7.139 6.744 6.262 5.279 -8 ,19025 ,KEBNE ,16678520,Thu Nov 25 03:02:53 CET,Thu Nov 25 04:24:51 CET,0.0 0.59 0.873 1.103 1.308 1.494 1.666 1.838 2.149 2.282 2.409 2.363 2.736 2.841 3.045 3.251 3.459 3.554 3.729 3.895 4.125 4.266 4.398 4.583 4.771 4.954 5.126 5.302 5.536 5.741 5.924 6.157 6.385 6.594 6.833 7.104 7.37 7.66 7.964 8.275 8.6 8.975 9.43 9.859 10.301 10.816 11.434 12.105 12.837 13.666 14.529 15.043 15.161 15.108 14.95 14.72 14.504 14.305 14.117 13.889 13.691 13.516 13.323 13.128 12.944 12.76 12.559 12.407 12.276 12.114 11.931 11.781 11.622 11.446 11.309 11.172 11.019 10.852 10.669 10.539 10.412 10.203 10.05 9.885 9.791 9.598 9.403 9.188 9.071 8.69 8.673 8.517 8.359 7.994 7.785 7.564 7.31 6.986 6.607 6.117 4.428 -9 ,5434 ,KEBNE ,16678521,Thu Nov 25 03:03:55 CET,Thu Nov 25 04:26:54 CET,0.0 0.536 0.853 1.106 1.311 1.514 1.705 1.854 2.108 2.229 2.359 2.31 2.689 2.803 3.001 3.182 3.35 3.432 3.597 3.75 3.965 4.114 4.262 4.459 4.645 4.826 4.999 5.174 5.406 5.621 5.827 6.076 6.299 6.515 6.776 7.049 7.283 7.544 7.856 8.181 8.524 8.93 9.367 9.789 10.278 10.808 11.387 12.037 12.807 13.593 14.38 14.85 14.955 14.906 14.795 14.624 14.396 14.166 13.966 13.758 13.52 13.29 13.103 12.927 12.771 12.61 12.418 12.241 12.096 11.942 11.762 11.616 11.457 11.289 11.156 10.998 10.849 10.703 10.524 10.399 10.267 10.053 9.915 9.769 9.686 9.5 9.304 9.096 8.976 8.592 8.586 8.436 8.282 7.907 7.695 7.489 7.252 6.97 6.615 6.14 4.935 -10 ,24913 ,KEBNE ,16678522,Thu Nov 25 03:03:55 CET,Thu Nov 25 04:26:57 CET,0.0 0.846 1.135 1.366 1.564 1.742 1.902 2.055 2.335 2.456 2.569 2.52 2.888 2.994 3.185 3.353 3.507 3.579 3.735 3.891 4.114 4.261 4.396 4.608 4.81 4.979 5.157 5.335 5.561 5.783 5.99 6.226 6.45 6.659 6.893 7.169 7.446 7.751 8.056 8.365 8.701 9.071 9.495 9.905 10.376 10.918 11.545 12.216 12.943 13.729 14.536 15.011 15.129 15.074 14.981 14.862 14.678 14.451 14.227 13.991 13.78 13.585 13.399 13.209 13.023 12.851 12.65 12.454 12.288 12.122 11.933 11.765 11.602 11.429 11.273 11.112 10.951 10.778 10.604 10.476 10.339 10.131 9.969 9.793 9.705 9.517 9.316 9.093 8.977 8.594 8.574 8.431 8.29 7.981 7.799 7.597 7.359 7.074 6.736 6.251 4.719 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt deleted file mode 100644 index 7b09cc87..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26321 ,KEBNE ,16676239,Wed Nov 24 12:02:19 CET,Wed Nov 24 13:23:53 CET,0.0 0.723 1.114 1.468 1.738 1.951 2.156 2.353 2.72 2.877 3.017 3.016 3.411 3.524 3.734 3.939 4.13 4.222 4.403 4.58 4.836 4.992 5.14 5.359 5.56 5.749 5.934 6.12 6.364 6.591 6.792 7.039 7.282 7.521 7.81 8.14 8.434 8.724 9.059 9.415 9.765 10.182 10.682 11.18 11.73 12.334 13.016 13.724 14.504 15.376 16.23 16.666 16.772 16.718 16.56 16.377 16.168 15.944 15.757 15.569 15.383 15.172 14.944 14.727 14.525 14.332 14.14 13.982 13.813 13.629 13.46 13.317 13.17 13.017 12.888 12.741 12.575 12.402 12.227 12.105 11.981 11.776 11.615 11.448 11.361 11.183 11.011 10.815 10.708 10.337 10.348 10.214 10.072 9.741 9.564 9.365 9.135 8.851 8.49 8.004 7.074 -2 ,25568 ,KEBNE ,16676240,Wed Nov 24 12:04:22 CET,Wed Nov 24 13:25:44 CET,0.0 0.899 1.306 1.624 1.875 2.102 2.309 2.487 2.8 2.951 3.105 3.11 3.496 3.61 3.824 4.026 4.23 4.328 4.502 4.69 4.957 5.109 5.258 5.467 5.679 5.893 6.108 6.314 6.556 6.794 7.023 7.306 7.582 7.828 8.092 8.397 8.687 9.006 9.36 9.719 10.082 10.475 10.947 11.421 11.941 12.527 13.209 13.926 14.689 15.508 16.336 16.831 16.987 16.937 16.771 16.598 16.398 16.193 16.005 15.767 15.548 15.345 15.142 14.941 14.752 14.558 14.309 14.102 13.946 13.772 13.582 13.432 13.273 13.102 12.959 12.806 12.657 12.492 12.307 12.179 12.053 11.835 11.67 11.503 11.415 11.24 11.053 10.853 10.749 10.373 10.387 10.252 10.109 9.786 9.609 9.414 9.191 8.902 8.573 8.19 7.212 -3 ,26548 ,KEBNE ,16676241,Wed Nov 24 12:05:24 CET,Wed Nov 24 13:26:29 CET,0.0 0.822 1.232 1.553 1.806 2.028 2.209 2.373 2.665 2.801 2.941 2.945 3.334 3.443 3.665 3.887 4.09 4.184 4.366 4.538 4.802 4.982 5.148 5.37 5.581 5.781 5.985 6.182 6.426 6.675 6.903 7.167 7.423 7.673 7.956 8.267 8.55 8.873 9.256 9.639 9.995 10.377 10.831 11.295 11.864 12.494 13.144 13.838 14.638 15.479 16.31 16.78 16.899 16.862 16.685 16.448 16.223 16.014 15.813 15.558 15.345 15.179 14.999 14.803 14.624 14.435 14.202 13.988 13.822 13.655 13.47 13.298 13.113 12.932 12.78 12.621 12.455 12.289 12.129 12.011 11.887 11.696 11.554 11.394 11.314 11.139 10.952 10.745 10.629 10.258 10.278 10.145 10.002 9.686 9.503 9.276 9.024 8.742 8.41 7.954 6.741 -4 ,10941 ,KEBNE ,16678526,Thu Nov 25 03:04:57 CET,Thu Nov 25 04:27:26 CET,0.0 0.911 1.335 1.645 1.885 2.108 2.32 2.504 2.823 2.978 3.124 3.113 3.501 3.617 3.831 4.015 4.201 4.298 4.498 4.688 4.95 5.127 5.295 5.516 5.723 5.913 6.103 6.297 6.556 6.797 7.026 7.3 7.563 7.812 8.084 8.398 8.706 9.026 9.353 9.686 10.042 10.468 10.941 11.381 11.875 12.409 13.04 13.74 14.495 15.291 16.125 16.607 16.76 16.74 16.603 16.406 16.192 15.974 15.776 15.538 15.305 15.105 14.91 14.71 14.508 14.318 14.094 13.886 13.735 13.576 13.408 13.275 13.11 12.927 12.782 12.636 12.491 12.322 12.137 12.014 11.873 11.651 11.512 11.362 11.279 11.09 10.894 10.688 10.578 10.195 10.182 10.023 9.852 9.492 9.294 9.093 8.882 8.63 8.286 7.779 6.54 -5 ,496 ,KEBNE ,16678527,Thu Nov 25 03:04:57 CET,Thu Nov 25 04:27:23 CET,0.0 0.672 1.007 1.314 1.566 1.774 1.962 2.142 2.463 2.614 2.757 2.755 3.151 3.28 3.537 3.743 3.925 4.018 4.202 4.386 4.648 4.806 4.961 5.189 5.398 5.608 5.816 5.993 6.223 6.456 6.682 6.954 7.213 7.455 7.739 8.052 8.334 8.648 9.0 9.359 9.728 10.143 10.614 11.086 11.618 12.186 12.801 13.485 14.286 15.184 16.109 16.647 16.75 16.671 16.545 16.363 16.162 15.947 15.699 15.434 15.226 15.044 14.867 14.686 14.499 14.312 14.102 13.906 13.732 13.549 13.344 13.166 12.987 12.797 12.658 12.522 12.369 12.214 12.057 11.937 11.811 11.617 11.466 11.32 11.252 11.094 10.918 10.732 10.634 10.264 10.285 10.152 9.995 9.619 9.4 9.168 8.908 8.617 8.268 7.805 6.821 -6 ,11533 ,KEBNE ,16676244,Wed Nov 24 12:13:36 CET,Wed Nov 24 13:36:34 CET,0.0 0.834 1.197 1.487 1.724 1.94 2.137 2.318 2.643 2.787 2.921 2.909 3.301 3.417 3.626 3.837 4.046 4.145 4.332 4.518 4.77 4.92 5.07 5.294 5.503 5.691 5.872 6.052 6.276 6.489 6.694 6.945 7.193 7.457 7.764 8.088 8.397 8.731 9.084 9.452 9.833 10.254 10.733 11.216 11.765 12.336 13.001 13.771 14.62 15.51 16.376 16.838 16.931 16.893 16.778 16.566 16.336 16.121 15.938 15.749 15.562 15.369 15.16 14.96 14.768 14.597 14.427 14.262 14.115 13.955 13.756 13.592 13.434 13.261 13.109 12.947 12.781 12.619 12.451 12.325 12.19 11.967 11.816 11.671 11.593 11.422 11.244 11.046 10.942 10.557 10.496 10.34 10.209 9.895 9.686 9.477 9.227 8.911 8.52 8.004 6.956 -7 ,14482 ,KEBNE ,16676245,Wed Nov 24 12:49:35 CET,Wed Nov 24 14:10:49 CET,0.0 0.932 1.362 1.624 1.893 2.14 2.313 2.484 2.785 2.925 3.072 3.082 3.474 3.589 3.817 4.032 4.235 4.328 4.498 4.659 4.903 5.057 5.204 5.435 5.66 5.873 6.073 6.254 6.481 6.702 6.909 7.175 7.449 7.705 7.995 8.303 8.592 8.898 9.227 9.591 9.966 10.378 10.867 11.355 11.889 12.429 13.07 13.813 14.613 15.457 16.349 16.908 17.052 17.009 16.862 16.65 16.433 16.225 16.041 15.815 15.593 15.379 15.16 14.975 14.787 14.596 14.389 14.2 14.039 13.88 13.705 13.538 13.367 13.186 13.053 12.914 12.75 12.58 12.402 12.281 12.16 11.959 11.818 11.662 11.578 11.406 11.229 11.034 10.926 10.557 10.601 10.473 10.333 10.033 9.855 9.644 9.383 9.097 8.77 8.334 7.372 -8 ,13568 ,KEBNE ,16678530,Thu Nov 25 03:05:59 CET,Thu Nov 25 04:29:05 CET,0.0 0.741 1.084 1.369 1.611 1.842 2.047 2.234 2.575 2.707 2.826 2.815 3.212 3.328 3.526 3.736 3.946 4.047 4.243 4.415 4.649 4.807 4.965 5.178 5.38 5.575 5.777 5.979 6.206 6.441 6.681 6.959 7.21 7.452 7.726 8.029 8.323 8.65 9.004 9.354 9.72 10.163 10.661 11.103 11.622 12.228 12.9 13.604 14.376 15.208 16.034 16.445 16.558 16.547 16.419 16.236 16.051 15.848 15.651 15.427 15.214 15.0 14.802 14.609 14.418 14.251 14.059 13.89 13.739 13.567 13.37 13.201 13.023 12.838 12.709 12.577 12.424 12.255 12.085 11.971 11.849 11.638 11.475 11.308 11.226 11.052 10.868 10.672 10.565 10.182 10.15 10.003 9.855 9.501 9.293 9.07 8.849 8.603 8.233 7.665 6.47 -9 ,7260 ,KEBNE ,16676247,Wed Nov 24 12:49:36 CET,Wed Nov 24 14:10:55 CET,0.0 0.765 1.172 1.45 1.675 1.883 2.074 2.25 2.554 2.703 2.849 2.83 3.209 3.316 3.528 3.764 3.988 4.086 4.276 4.463 4.731 4.899 5.064 5.303 5.532 5.744 5.93 6.101 6.322 6.542 6.763 7.031 7.294 7.536 7.802 8.107 8.419 8.775 9.116 9.449 9.793 10.192 10.697 11.198 11.725 12.276 12.902 13.575 14.342 15.212 16.074 16.556 16.688 16.675 16.555 16.386 16.204 15.992 15.79 15.584 15.393 15.184 14.97 14.788 14.607 14.434 14.253 14.077 13.914 13.735 13.553 13.401 13.233 13.05 12.915 12.765 12.598 12.427 12.257 12.143 12.022 11.822 11.67 11.508 11.42 11.232 11.028 10.835 10.742 10.357 10.357 10.217 10.08 9.815 9.637 9.415 9.183 8.918 8.508 7.982 6.841 -10 ,29321 ,KEBNE ,16676248,Wed Nov 24 12:49:36 CET,Wed Nov 24 14:11:05 CET,0.0 0.798 1.214 1.5 1.723 1.934 2.114 2.284 2.591 2.73 2.874 2.865 3.258 3.368 3.562 3.754 3.961 4.063 4.258 4.444 4.701 4.864 5.012 5.223 5.434 5.637 5.839 6.034 6.272 6.496 6.696 6.951 7.217 7.457 7.718 8.035 8.336 8.657 9.016 9.394 9.788 10.212 10.693 11.17 11.708 12.285 12.928 13.621 14.418 15.294 16.151 16.616 16.713 16.666 16.529 16.333 16.147 15.965 15.746 15.474 15.247 15.043 14.813 14.591 14.392 14.206 14.015 13.835 13.683 13.511 13.313 13.15 12.972 12.785 12.649 12.504 12.344 12.185 12.008 11.881 11.749 11.519 11.356 11.206 11.134 10.968 10.795 10.615 10.522 10.149 10.158 10.034 9.903 9.59 9.385 9.152 8.883 8.547 8.133 7.664 6.732 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt deleted file mode 100644 index 149e907b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14756 ,KEBNE ,17024072,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:43:34 CET,0.0 1.902 2.455 2.844 3.183 3.494 3.753 3.958 4.318 4.495 4.668 4.721 5.138 5.285 5.56 5.805 6.036 6.152 6.39 6.633 6.965 7.165 7.369 7.671 7.968 8.252 8.513 8.762 9.09 9.405 9.705 10.064 10.417 10.766 11.153 11.582 12.006 12.459 12.951 13.48 14.025 14.654 15.384 16.076 16.859 17.656 18.487 19.356 20.328 21.375 21.967 21.568 20.869 20.119 19.349 18.628 17.998 17.39 16.82 16.239 15.746 15.284 14.829 14.405 14.018 13.665 13.285 12.918 12.601 12.304 12.009 11.747 11.47 11.184 10.962 10.732 10.486 10.234 9.96 9.762 9.558 9.245 9.027 8.78 8.654 8.41 8.144 7.856 7.706 7.267 7.189 7.012 6.813 6.32 6.064 5.799 5.484 5.128 4.704 4.076 2.342 -2 ,22538 ,KEBNE ,17024073,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:43:10 CET,0.0 1.459 2.045 2.436 2.71 2.994 3.284 3.54 3.968 4.141 4.304 4.337 4.745 4.893 5.195 5.474 5.734 5.861 6.104 6.331 6.64 6.845 7.047 7.334 7.608 7.874 8.138 8.396 8.712 9.003 9.304 9.688 10.043 10.37 10.744 11.185 11.61 12.067 12.58 13.108 13.616 14.183 14.864 15.589 16.412 17.221 18.08 18.987 20.036 21.082 21.714 21.355 20.623 19.826 19.02 18.238 17.586 17.018 16.451 15.867 15.371 14.896 14.445 14.037 13.646 13.262 12.87 12.531 12.221 11.885 11.528 11.24 10.936 10.62 10.387 10.137 9.882 9.615 9.343 9.164 8.969 8.652 8.435 8.211 8.097 7.861 7.61 7.343 7.202 6.775 6.725 6.533 6.32 5.889 5.628 5.359 5.09 4.765 4.381 3.85 1.681 -3 ,3458 ,KEBNE ,17024074,Wed Dec 22 09:22:03 CET,Wed Dec 22 10:43:36 CET,0.0 1.737 2.284 2.695 3.061 3.361 3.623 3.865 4.278 4.469 4.65 4.723 5.15 5.298 5.59 5.883 6.154 6.284 6.529 6.761 7.1 7.314 7.515 7.795 8.065 8.341 8.605 8.849 9.163 9.477 9.785 10.141 10.474 10.801 11.174 11.6 12.024 12.48 12.959 13.461 13.997 14.597 15.282 16.029 16.92 17.771 18.613 19.493 20.443 21.261 21.553 21.154 20.508 19.829 19.118 18.37 17.69 17.069 16.536 16.012 15.526 15.077 14.632 14.21 13.83 13.47 13.078 12.712 12.409 12.101 11.763 11.477 11.192 10.901 10.672 10.427 10.179 9.92 9.652 9.462 9.262 8.946 8.723 8.499 8.386 8.14 7.873 7.592 7.44 7.001 6.948 6.768 6.569 6.119 5.858 5.585 5.282 4.917 4.509 3.934 1.445 -4 ,4308 ,KEBNE ,17024075,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:43:20 CET,0.0 1.455 2.028 2.441 2.775 3.058 3.314 3.553 3.959 4.143 4.327 4.41 4.847 5.007 5.288 5.542 5.793 5.918 6.155 6.387 6.715 6.924 7.14 7.433 7.704 7.99 8.265 8.516 8.838 9.14 9.43 9.799 10.154 10.494 10.866 11.259 11.65 12.107 12.607 13.127 13.674 14.292 14.998 15.657 16.397 17.222 18.108 18.973 19.797 20.524 20.84 20.484 19.882 19.181 18.45 17.73 17.073 16.458 15.911 15.343 14.843 14.392 13.946 13.51 13.128 12.766 12.351 11.979 11.655 11.337 10.996 10.702 10.413 10.109 9.869 9.63 9.38 9.12 8.859 8.675 8.482 8.168 7.943 7.72 7.608 7.365 7.095 6.815 6.678 6.239 6.182 6.024 5.85 5.438 5.197 4.931 4.626 4.295 3.868 3.185 1.588 -5 ,16320 ,KEBNE ,17024076,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:43:12 CET,0.0 1.862 2.472 2.879 3.189 3.492 3.765 4.022 4.493 4.68 4.85 4.892 5.311 5.463 5.75 6.005 6.249 6.371 6.622 6.869 7.215 7.432 7.628 7.911 8.185 8.452 8.715 8.964 9.274 9.57 9.87 10.249 10.603 10.944 11.345 11.771 12.191 12.65 13.122 13.651 14.227 14.848 15.525 16.205 17.005 17.9 18.88 19.873 20.838 21.551 21.911 21.624 20.912 20.108 19.364 18.65 17.976 17.319 16.759 16.221 15.747 15.317 14.898 14.471 14.063 13.706 13.341 13.003 12.709 12.4 12.074 11.812 11.539 11.247 11.023 10.788 10.539 10.29 10.028 9.854 9.677 9.36 9.123 8.882 8.77 8.542 8.287 8.011 7.868 7.438 7.375 7.199 7.016 6.64 6.416 6.138 5.808 5.412 4.917 4.268 2.645 -6 ,11984 ,KEBNE ,17024077,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:43:31 CET,0.0 1.247 1.855 2.287 2.633 2.908 3.149 3.388 3.825 4.015 4.207 4.301 4.739 4.893 5.148 5.399 5.653 5.773 6.003 6.225 6.537 6.74 6.944 7.237 7.516 7.776 8.026 8.273 8.595 8.892 9.175 9.538 9.878 10.196 10.569 10.981 11.378 11.839 12.357 12.874 13.372 13.958 14.657 15.276 15.992 16.84 17.705 18.503 19.387 20.225 20.804 20.818 20.269 19.513 18.741 18.019 17.401 16.78 16.177 15.567 15.034 14.557 14.1 13.662 13.262 12.89 12.505 12.174 11.888 11.588 11.259 10.981 10.701 10.413 10.183 9.948 9.701 9.437 9.167 8.983 8.787 8.487 8.282 8.055 7.93 7.667 7.403 7.12 6.969 6.537 6.479 6.293 6.101 5.669 5.424 5.17 4.884 4.543 4.108 3.507 1.506 -7 ,30932 ,KEBNE ,17024078,Wed Dec 22 09:22:04 CET,Wed Dec 22 10:43:15 CET,0.0 1.864 2.398 2.83 3.187 3.477 3.717 3.927 4.311 4.499 4.678 4.76 5.194 5.34 5.611 5.877 6.145 6.273 6.508 6.717 7.008 7.213 7.424 7.729 8.022 8.29 8.542 8.795 9.115 9.424 9.723 10.084 10.445 10.787 11.17 11.622 12.05 12.505 13.0 13.534 14.076 14.688 15.373 16.06 16.862 17.666 18.525 19.413 20.358 21.218 21.603 21.18 20.491 19.733 19.06 18.426 17.832 17.225 16.658 16.093 15.595 15.143 14.715 14.303 13.911 13.563 13.192 12.836 12.521 12.21 11.897 11.631 11.353 11.068 10.843 10.616 10.36 10.088 9.837 9.663 9.472 9.167 8.946 8.712 8.589 8.339 8.092 7.828 7.683 7.252 7.193 7.008 6.815 6.392 6.155 5.909 5.619 5.291 4.887 4.29 2.735 -8 ,22989 ,KEBNE ,17024079,Wed Dec 22 09:23:05 CET,Wed Dec 22 10:45:10 CET,0.0 1.761 2.261 2.655 3.022 3.328 3.589 3.822 4.213 4.401 4.577 4.618 5.042 5.207 5.509 5.774 6.025 6.147 6.39 6.612 6.939 7.148 7.347 7.643 7.916 8.166 8.42 8.668 8.995 9.316 9.629 10.001 10.34 10.672 11.057 11.483 11.884 12.312 12.772 13.265 13.784 14.381 15.106 15.843 16.644 17.438 18.302 19.19 20.03 20.864 21.455 21.276 20.697 19.985 19.264 18.581 17.925 17.299 16.762 16.198 15.714 15.28 14.869 14.486 14.095 13.717 13.337 13.001 12.696 12.371 12.018 11.728 11.441 11.151 10.937 10.71 10.46 10.191 9.924 9.733 9.529 9.207 8.968 8.73 8.612 8.364 8.11 7.824 7.675 7.264 7.251 7.069 6.862 6.443 6.213 5.938 5.631 5.277 4.829 4.207 2.629 -9 ,16611 ,KEBNE ,17024080,Wed Dec 22 09:23:05 CET,Wed Dec 22 10:45:53 CET,0.0 1.318 1.865 2.261 2.605 2.899 3.165 3.389 3.765 3.941 4.119 4.222 4.663 4.82 5.104 5.356 5.603 5.719 5.942 6.177 6.527 6.742 6.937 7.225 7.504 7.762 8.031 8.303 8.643 8.96 9.243 9.577 9.928 10.284 10.682 11.11 11.515 11.958 12.45 12.979 13.535 14.156 14.894 15.63 16.454 17.331 18.333 19.36 20.234 21.062 21.603 21.281 20.612 19.864 19.115 18.4 17.714 17.054 16.498 15.934 15.412 14.946 14.533 14.138 13.769 13.437 13.077 12.75 12.459 12.131 11.796 11.529 11.237 10.925 10.675 10.411 10.153 9.902 9.644 9.453 9.245 8.921 8.675 8.421 8.304 8.082 7.83 7.545 7.398 6.966 6.906 6.727 6.551 6.161 5.928 5.654 5.347 5.027 4.598 3.952 2.335 -10 ,12558 ,KEBNE ,17024081,Wed Dec 22 09:23:05 CET,Wed Dec 22 10:44:18 CET,0.0 1.981 2.497 2.875 3.221 3.528 3.771 3.991 4.384 4.571 4.759 4.835 5.263 5.418 5.702 5.961 6.198 6.315 6.542 6.766 7.086 7.284 7.482 7.763 8.022 8.275 8.526 8.779 9.112 9.438 9.739 10.088 10.431 10.755 11.118 11.524 11.938 12.4 12.918 13.487 14.061 14.67 15.362 16.047 16.803 17.595 18.515 19.503 20.384 21.134 21.588 21.373 20.898 20.247 19.525 18.752 18.025 17.394 16.859 16.333 15.854 15.392 14.952 14.54 14.147 13.785 13.404 13.064 12.784 12.499 12.2 11.954 11.696 11.409 11.165 10.901 10.619 10.337 10.06 9.877 9.699 9.414 9.207 8.959 8.834 8.59 8.311 8.002 7.838 7.402 7.35 7.158 6.953 6.529 6.298 6.051 5.773 5.394 4.964 4.413 2.798 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt deleted file mode 100644 index e8e3ba7c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9375 ,KEBNE ,16678533,Thu Nov 25 03:05:58 CET,Thu Nov 25 04:29:43 CET,0.0 1.06 1.665 2.166 2.564 2.959 3.352 3.698 4.367 4.693 4.989 5.287 5.844 6.134 6.689 7.212 7.71 7.966 8.474 8.974 9.72 10.199 10.671 11.377 12.083 12.799 13.51 14.2 15.091 15.958 16.809 17.865 18.915 19.953 21.17 22.577 23.964 25.532 27.295 29.215 31.299 33.738 36.711 39.827 43.589 47.995 53.396 59.939 68.265 79.133 94.169 108.685 118.65 126.021 131.657 136.203 139.829 142.821 145.196 147.41 149.149 150.567 151.85 152.992 154.003 154.887 155.748 156.484 157.078 157.645 158.217 158.676 159.124 159.564 159.884 160.188 160.496 160.795 161.07 161.25 161.428 161.679 161.846 162.001 162.071 162.218 162.354 162.478 162.53 162.459 162.638 162.656 162.665 162.659 162.636 162.6 162.549 162.476 162.324 162.075 161.112 -2 ,15476 ,KEBNE ,16676250,Wed Nov 24 12:50:37 CET,Wed Nov 24 14:12:24 CET,0.0 1.025 1.555 1.984 2.386 2.753 3.105 3.452 4.085 4.394 4.702 5.029 5.595 5.883 6.447 6.974 7.469 7.711 8.203 8.698 9.415 9.888 10.358 11.055 11.756 12.434 13.091 13.741 14.6 15.443 16.275 17.335 18.397 19.419 20.611 22.011 23.415 24.989 26.733 28.673 30.779 33.223 36.191 39.263 42.985 47.373 52.761 59.293 67.539 78.245 93.077 107.513 117.469 124.862 130.518 135.061 138.658 141.637 144.006 146.183 147.936 149.425 150.752 151.934 152.97 153.834 154.683 155.423 156.042 156.651 157.239 157.688 158.114 158.522 158.831 159.148 159.454 159.749 160.036 160.23 160.433 160.725 160.897 161.057 161.132 161.26 161.375 161.473 161.518 161.462 161.673 161.695 161.694 161.697 161.689 161.646 161.567 161.459 161.324 161.068 160.206 -3 ,1142 ,KEBNE ,16676251,Wed Nov 24 12:50:37 CET,Wed Nov 24 14:12:12 CET,0.0 1.392 1.94 2.424 2.869 3.273 3.654 4.008 4.681 5.013 5.332 5.684 6.243 6.511 7.048 7.584 8.11 8.37 8.883 9.395 10.17 10.666 11.141 11.843 12.53 13.199 13.867 14.524 15.39 16.25 17.086 18.108 19.121 20.125 21.314 22.694 24.054 25.608 27.35 29.252 31.318 33.707 36.632 39.713 43.429 47.792 53.163 59.702 68.028 78.906 93.988 108.546 118.545 125.927 131.548 136.084 139.677 142.637 145.004 147.168 148.916 150.387 151.705 152.861 153.857 154.735 155.605 156.35 156.954 157.547 158.141 158.596 159.021 159.433 159.767 160.104 160.422 160.727 161.006 161.181 161.355 161.608 161.77 161.918 161.99 162.123 162.238 162.355 162.41 162.355 162.555 162.587 162.607 162.61 162.592 162.563 162.518 162.448 162.339 162.061 161.104 -4 ,25260 ,KEBNE ,16678536,Thu Nov 25 03:07:01 CET,Thu Nov 25 04:31:36 CET,0.0 1.41 1.963 2.416 2.849 3.248 3.599 3.933 4.569 4.889 5.186 5.457 6.002 6.27 6.796 7.316 7.824 8.082 8.584 9.073 9.783 10.256 10.73 11.442 12.126 12.777 13.447 14.134 15.035 15.909 16.772 17.823 18.857 19.882 21.091 22.484 23.868 25.451 27.215 29.15 31.23 33.653 36.603 39.704 43.512 47.949 53.349 59.927 68.251 79.03 93.959 108.557 118.617 126.059 131.716 136.252 139.869 142.866 145.252 147.477 149.237 150.683 151.99 153.149 154.162 155.025 155.877 156.613 157.21 157.772 158.339 158.797 159.249 159.694 160.02 160.346 160.669 160.993 161.312 161.501 161.671 161.91 162.059 162.207 162.28 162.428 162.575 162.692 162.748 162.689 162.888 162.935 162.972 162.98 162.957 162.915 162.839 162.712 162.535 162.258 161.44 -5 ,15362 ,KEBNE ,16676253,Wed Nov 24 12:50:37 CET,Wed Nov 24 14:12:09 CET,0.0 0.87 1.404 1.857 2.294 2.714 3.104 3.472 4.164 4.486 4.804 5.169 5.735 6.015 6.567 7.121 7.683 7.951 8.458 8.97 9.742 10.236 10.706 11.407 12.103 12.804 13.494 14.146 15.007 15.877 16.738 17.792 18.843 19.899 21.139 22.552 23.948 25.514 27.262 29.203 31.306 33.752 36.716 39.807 43.593 48.019 53.398 59.95 68.265 79.032 93.975 108.471 118.426 125.762 131.354 135.881 139.479 142.429 144.787 146.998 148.768 150.241 151.556 152.715 153.722 154.581 155.442 156.177 156.779 157.373 157.953 158.412 158.855 159.286 159.606 159.919 160.221 160.519 160.808 160.997 161.189 161.463 161.627 161.782 161.862 162.003 162.121 162.198 162.204 162.112 162.281 162.296 162.297 162.273 162.249 162.209 162.139 162.018 161.821 161.525 160.595 -6 ,11226 ,KEBNE ,16676254,Wed Nov 24 12:50:37 CET,Wed Nov 24 14:12:09 CET,0.0 0.921 1.503 1.971 2.39 2.78 3.144 3.492 4.161 4.489 4.804 5.143 5.7 5.976 6.498 7.004 7.529 7.793 8.303 8.794 9.52 10.018 10.517 11.239 11.934 12.604 13.271 13.926 14.783 15.626 16.457 17.496 18.538 19.596 20.857 22.285 23.681 25.242 26.966 28.881 30.982 33.417 36.41 39.551 43.34 47.805 53.216 59.712 67.956 78.71 93.648 108.197 118.204 125.594 131.187 135.666 139.245 142.23 144.612 146.806 148.586 150.08 151.404 152.586 153.633 154.523 155.396 156.128 156.724 157.315 157.898 158.355 158.817 159.285 159.618 159.93 160.231 160.529 160.81 160.997 161.187 161.439 161.592 161.739 161.81 161.948 162.084 162.207 162.263 162.194 162.383 162.418 162.423 162.403 162.386 162.364 162.32 162.23 162.06 161.733 160.275 -7 ,28057 ,KEBNE ,16676255,Wed Nov 24 12:50:37 CET,Wed Nov 24 14:14:46 CET,0.0 0.911 1.484 1.965 2.414 2.839 3.206 3.54 4.216 4.549 4.87 5.217 5.787 6.088 6.648 7.192 7.736 8.005 8.56 9.091 9.843 10.336 10.812 11.521 12.22 12.903 13.586 14.265 15.158 16.05 16.905 17.946 18.978 20.005 21.225 22.609 23.986 25.568 27.302 29.182 31.265 33.735 36.749 39.885 43.688 48.132 53.517 60.067 68.474 79.407 94.419 108.962 118.958 126.343 131.961 136.491 140.096 143.056 145.426 147.638 149.397 150.859 152.167 153.336 154.346 155.189 156.035 156.778 157.399 158.004 158.59 159.049 159.495 159.936 160.264 160.579 160.877 161.165 161.444 161.625 161.812 162.081 162.241 162.389 162.456 162.583 162.702 162.814 162.869 162.81 163.019 163.057 163.084 163.028 162.944 162.882 162.814 162.72 162.588 162.34 161.467 -8 ,19324 ,KEBNE ,16678540,Thu Nov 25 03:07:01 CET,Thu Nov 25 04:30:52 CET,0.0 1.283 1.902 2.461 2.935 3.341 3.749 4.157 4.887 5.217 5.528 5.849 6.414 6.716 7.273 7.808 8.342 8.608 9.14 9.648 10.352 10.817 11.277 11.952 12.637 13.326 14.003 14.687 15.595 16.457 17.299 18.35 19.388 20.425 21.66 23.076 24.486 26.071 27.825 29.768 31.861 34.282 37.213 40.338 44.177 48.651 54.093 60.616 68.89 79.714 94.776 109.355 119.381 126.817 132.469 137.005 140.585 143.542 145.891 148.059 149.83 151.297 152.592 153.745 154.75 155.62 156.478 157.204 157.812 158.409 158.981 159.434 159.885 160.307 160.592 160.876 161.177 161.466 161.73 161.898 162.06 162.294 162.448 162.588 162.662 162.8 162.912 163.035 163.083 162.999 163.131 163.146 163.172 163.187 163.167 163.11 163.025 162.948 162.831 162.56 161.737 -9 ,6056 ,KEBNE ,16678541,Thu Nov 25 03:08:02 CET,Thu Nov 25 04:31:51 CET,0.0 0.902 1.429 1.889 2.308 2.698 3.083 3.462 4.153 4.474 4.788 5.124 5.677 5.961 6.542 7.118 7.656 7.914 8.41 8.896 9.621 10.097 10.59 11.334 12.041 12.727 13.392 14.041 14.915 15.8 16.67 17.717 18.753 19.787 21.007 22.39 23.75 25.314 27.048 28.981 31.109 33.56 36.548 39.705 43.554 47.998 53.395 59.956 68.278 79.134 94.127 108.675 118.701 126.078 131.712 136.238 139.836 142.803 145.16 147.352 149.099 150.589 151.932 153.101 154.105 154.973 155.845 156.574 157.174 157.772 158.345 158.77 159.203 159.636 159.939 160.242 160.543 160.834 161.114 161.289 161.451 161.672 161.82 161.978 162.052 162.209 162.348 162.44 162.494 162.44 162.62 162.641 162.663 162.668 162.631 162.584 162.506 162.386 162.208 161.963 160.836 -10 ,1070 ,KEBNE ,16678542,Thu Nov 25 03:08:03 CET,Thu Nov 25 04:34:44 CET,0.0 1.249 1.849 2.336 2.787 3.187 3.532 3.87 4.547 4.879 5.19 5.527 6.086 6.374 6.929 7.466 8.001 8.254 8.76 9.267 9.992 10.482 10.963 11.653 12.343 13.014 13.698 14.392 15.287 16.153 16.996 18.056 19.12 20.155 21.37 22.777 24.151 25.701 27.443 29.379 31.473 33.9 36.878 40.008 43.807 48.285 53.755 60.338 68.682 79.565 94.615 109.22 119.245 126.603 132.173 136.672 140.281 143.252 145.603 147.781 149.525 150.998 152.321 153.465 154.467 155.341 156.221 156.972 157.587 158.186 158.787 159.26 159.704 160.153 160.493 160.819 161.127 161.412 161.686 161.874 162.054 162.306 162.478 162.645 162.724 162.878 163.027 163.148 163.197 163.141 163.342 163.379 163.394 163.377 163.357 163.321 163.265 163.178 163.017 162.711 161.747 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 0574e11b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26153 ,TETRA ,17584940,Sat Nov 27 11:31:15 CET,Sat Nov 27 13:40:49 CET,0.0 1.441 2.036 2.451 2.79 3.074 3.339 3.603 4.081 4.286 4.477 4.665 4.963 5.119 5.437 5.735 5.991 6.105 6.336 6.579 6.931 7.149 7.362 7.663 7.937 8.208 8.49 8.764 9.111 9.452 9.786 10.171 10.526 10.853 11.226 11.656 12.084 12.547 13.019 13.503 13.971 14.47 15.036 15.58 16.166 16.792 17.505 18.191 18.868 19.48 19.766 19.316 18.418 17.437 16.499 15.564 14.748 14.025 13.365 12.649 12.005 11.461 10.93 10.427 9.96 9.526 9.063 8.634 8.276 7.924 7.568 7.262 6.938 6.615 6.348 6.065 5.776 5.457 5.116 4.885 4.647 4.26 3.992 3.72 3.572 3.235 2.883 2.515 2.311 1.946 1.695 1.489 1.263 0.773 0.498 0.171 -0.166 -0.513 -0.932 -1.395 -2.581 -2 ,27003 ,TETRA ,17584941,Sat Nov 27 11:31:14 CET,Sat Nov 27 13:38:58 CET,0.0 2.076 2.643 3.088 3.454 3.752 3.997 4.204 4.621 4.817 4.994 5.213 5.535 5.71 6.038 6.346 6.646 6.785 7.037 7.266 7.583 7.792 8.003 8.311 8.612 8.898 9.159 9.413 9.748 10.057 10.346 10.7 11.044 11.357 11.701 12.072 12.445 12.868 13.303 13.752 14.202 14.683 15.231 15.819 16.538 17.231 17.89 18.49 18.882 19.022 18.894 18.304 17.373 16.312 15.345 14.455 13.643 12.889 12.236 11.569 10.948 10.391 9.883 9.39 8.907 8.445 7.962 7.531 7.162 6.793 6.411 6.084 5.731 5.366 5.09 4.812 4.508 4.186 3.867 3.651 3.422 3.075 2.841 2.592 2.461 2.186 1.889 1.583 1.432 1.127 0.952 0.777 0.583 0.135 -0.104 -0.373 -0.691 -1.039 -1.409 -1.922 -3.059 -3 ,5780 ,TETRA ,17584942,Sat Nov 27 11:31:16 CET,Sat Nov 27 13:40:30 CET,0.0 1.528 2.045 2.42 2.731 3.021 3.291 3.526 3.951 4.146 4.318 4.49 4.775 4.923 5.241 5.561 5.84 5.964 6.207 6.441 6.79 7.014 7.226 7.53 7.815 8.084 8.343 8.598 8.919 9.225 9.514 9.856 10.186 10.497 10.85 11.248 11.628 12.019 12.447 12.884 13.3 13.789 14.397 14.978 15.581 16.21 16.897 17.57 18.199 18.674 18.694 17.998 17.048 15.995 14.959 13.96 13.056 12.223 11.476 10.71 10.047 9.456 8.885 8.342 7.836 7.368 6.868 6.414 6.042 5.671 5.274 4.951 4.617 4.227 3.923 3.622 3.312 3.017 2.739 2.537 2.313 1.965 1.725 1.479 1.353 1.1 0.834 0.525 0.362 0.056 -0.14 -0.334 -0.538 -0.986 -1.223 -1.471 -1.734 -2.028 -2.366 -2.837 -3.982 -4 ,17843 ,TETRA ,17584943,Sat Nov 27 11:31:14 CET,Sat Nov 27 13:29:33 CET,0.0 1.494 2.049 2.473 2.787 3.034 3.287 3.527 3.989 4.193 4.378 4.612 4.932 5.111 5.467 5.777 6.069 6.207 6.478 6.729 7.086 7.321 7.535 7.84 8.138 8.429 8.709 8.983 9.332 9.668 9.995 10.386 10.767 11.113 11.5 11.947 12.381 12.838 13.31 13.812 14.309 14.845 15.465 16.04 16.626 17.225 17.931 18.689 19.402 19.998 20.128 19.578 18.836 17.907 17.06 16.254 15.505 14.821 14.198 13.557 12.975 12.459 11.96 11.487 11.062 10.667 10.247 9.877 9.554 9.203 8.838 8.545 8.243 7.923 7.675 7.419 7.15 6.859 6.55 6.335 6.11 5.778 5.553 5.321 5.204 4.948 4.684 4.419 4.274 3.98 3.815 3.638 3.457 3.079 2.88 2.663 2.429 2.146 1.778 1.352 0.315 -5 ,30776 ,TETRA ,17584944,Sat Nov 27 11:31:14 CET,Sat Nov 27 13:25:13 CET,0.0 1.61 2.149 2.62 2.972 3.254 3.502 3.728 4.169 4.372 4.554 4.737 5.042 5.206 5.528 5.814 6.077 6.211 6.479 6.728 7.067 7.281 7.487 7.787 8.077 8.353 8.618 8.871 9.2 9.508 9.803 10.146 10.468 10.812 11.213 11.62 11.982 12.378 12.806 13.253 13.699 14.2 14.814 15.423 16.108 16.86 17.701 18.551 19.431 20.271 20.7 20.207 19.287 18.268 17.286 16.395 15.631 14.925 14.245 13.511 12.879 12.319 11.785 11.279 10.782 10.314 9.836 9.381 8.982 8.591 8.168 7.808 7.458 7.094 6.8 6.5 6.194 5.885 5.566 5.343 5.105 4.719 4.454 4.183 4.047 3.771 3.473 3.162 2.989 2.659 2.455 2.263 2.061 1.619 1.364 1.099 0.827 0.52 0.119 -0.394 -1.777 -6 ,28128 ,TETRA ,17584945,Sat Nov 27 11:31:14 CET,Sat Nov 27 13:33:52 CET,0.0 1.779 2.377 2.805 3.188 3.525 3.79 4.001 4.41 4.619 4.803 4.992 5.299 5.464 5.77 6.049 6.309 6.442 6.712 6.958 7.294 7.505 7.729 8.067 8.367 8.63 8.882 9.136 9.466 9.784 10.091 10.447 10.77 11.083 11.46 11.873 12.24 12.64 13.074 13.531 13.977 14.437 14.998 15.566 16.166 16.809 17.478 18.077 18.528 18.753 18.464 17.513 16.362 15.197 14.126 13.148 12.296 11.518 10.857 10.161 9.532 8.94 8.371 7.83 7.301 6.825 6.35 5.896 5.485 5.075 4.666 4.33 3.967 3.586 3.296 2.999 2.687 2.358 2.019 1.782 1.534 1.137 0.861 0.582 0.438 0.148 -0.159 -0.516 -0.7 -1.024 -1.24 -1.454 -1.685 -2.189 -2.474 -2.782 -3.138 -3.563 -4.039 -4.635 -6.082 -7 ,5689 ,TETRA ,17584946,Sat Nov 27 11:31:14 CET,Sat Nov 27 13:40:27 CET,0.0 1.73 2.222 2.596 2.93 3.221 3.473 3.71 4.159 4.364 4.544 4.744 5.067 5.244 5.556 5.847 6.124 6.253 6.498 6.738 7.094 7.328 7.548 7.861 8.16 8.441 8.73 8.998 9.311 9.63 9.935 10.3 10.651 10.978 11.353 11.787 12.195 12.627 13.104 13.632 14.13 14.587 15.13 15.639 16.178 16.823 17.472 18.036 18.523 18.813 18.772 18.009 16.989 15.937 14.96 14.083 13.266 12.508 11.834 11.122 10.496 9.929 9.394 8.891 8.415 7.986 7.526 7.098 6.733 6.349 5.95 5.625 5.283 4.934 4.671 4.402 4.127 3.848 3.549 3.332 3.101 2.728 2.458 2.173 2.024 1.72 1.422 1.112 0.947 0.631 0.414 0.237 0.057 -0.346 -0.57 -0.828 -1.124 -1.473 -1.911 -2.434 -3.509 -8 ,26248 ,TETRA ,17584947,Sat Nov 27 11:31:52 CET,Sat Nov 27 13:38:51 CET,0.0 1.731 2.262 2.686 3.022 3.287 3.531 3.777 4.208 4.392 4.564 4.757 5.068 5.23 5.54 5.857 6.154 6.293 6.56 6.821 7.202 7.434 7.643 7.942 8.245 8.533 8.792 9.037 9.349 9.647 9.946 10.314 10.652 10.971 11.358 11.79 12.201 12.669 13.15 13.618 14.104 14.649 15.256 15.879 16.651 17.352 17.964 18.559 19.148 19.665 19.681 19.053 18.174 17.213 16.206 15.192 14.292 13.489 12.782 12.037 11.363 10.775 10.229 9.703 9.204 8.724 8.205 7.735 7.355 6.988 6.593 6.249 5.879 5.481 5.188 4.891 4.592 4.31 4.019 3.811 3.593 3.256 3.009 2.742 2.601 2.313 2.018 1.709 1.541 1.212 0.985 0.792 0.573 0.042 -0.247 -0.545 -0.856 -1.182 -1.589 -2.121 -3.186 -9 ,31185 ,TETRA ,17584948,Sat Nov 27 11:31:15 CET,Sat Nov 27 13:39:49 CET,0.0 1.632 2.192 2.577 2.889 3.214 3.514 3.761 4.182 4.372 4.556 4.74 5.043 5.203 5.509 5.806 6.063 6.183 6.427 6.663 7.0 7.209 7.427 7.77 8.079 8.357 8.62 8.864 9.181 9.503 9.809 10.171 10.517 10.859 11.262 11.702 12.131 12.592 13.078 13.588 14.12 14.714 15.355 15.926 16.621 17.404 18.228 19.042 19.832 20.524 20.931 20.756 20.017 19.063 18.115 17.198 16.402 15.66 14.977 14.277 13.66 13.104 12.59 12.077 11.583 11.151 10.712 10.333 10.0 9.634 9.234 8.902 8.568 8.219 7.943 7.655 7.351 7.05 6.744 6.522 6.296 5.972 5.746 5.503 5.37 5.08 4.774 4.466 4.304 3.977 3.748 3.553 3.336 2.859 2.617 2.344 2.07 1.775 1.411 0.915 -0.214 -10 ,27091 ,TETRA ,17584949,Sat Nov 27 11:31:16 CET,Sat Nov 27 13:40:39 CET,0.0 1.618 2.131 2.53 2.869 3.165 3.416 3.637 4.015 4.184 4.354 4.542 4.839 4.975 5.249 5.529 5.784 5.91 6.164 6.403 6.75 6.967 7.18 7.484 7.765 8.038 8.301 8.568 8.919 9.243 9.55 9.933 10.294 10.642 11.047 11.471 11.881 12.291 12.683 13.096 13.506 13.928 14.466 15.056 15.701 16.392 17.177 17.91 18.574 19.156 19.311 18.696 17.899 17.136 16.35 15.499 14.64 13.802 13.062 12.315 11.684 11.114 10.566 10.043 9.56 9.139 8.712 8.333 7.984 7.605 7.217 6.901 6.587 6.277 6.027 5.762 5.501 5.224 4.919 4.701 4.467 4.114 3.875 3.639 3.519 3.258 2.991 2.708 2.548 2.221 1.99 1.794 1.586 1.138 0.883 0.628 0.375 0.063 -0.303 -0.788 -2.187 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt deleted file mode 100644 index f68a443f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29639 ,TETRA ,17584950,Sat Nov 27 11:31:17 CET,Sat Nov 27 13:51:13 CET,0.0 3.901 4.83 5.487 6.02 6.487 6.914 7.311 8.017 8.34 8.63 8.821 9.389 9.643 10.113 10.544 10.954 11.134 11.456 11.773 12.226 12.516 12.808 13.214 13.575 13.928 14.272 14.593 14.99 15.38 15.753 16.172 16.555 16.925 17.375 17.866 18.302 18.77 19.229 19.699 20.196 20.696 21.25 21.766 22.293 22.823 23.354 23.897 24.419 24.662 24.202 23.076 21.829 20.587 19.469 18.399 17.41 16.515 15.751 14.97 14.269 13.561 12.807 12.077 11.391 10.766 10.186 9.711 9.256 8.749 8.247 7.855 7.449 7.002 6.591 6.161 5.756 5.322 4.877 4.576 4.259 3.747 3.388 3.023 2.829 2.423 2.014 1.585 1.348 0.77 0.6 0.357 0.101 -0.453 -0.758 -1.083 -1.428 -1.814 -2.288 -2.874 -4.197 -2 ,21082 ,TETRA ,17584951,Sat Nov 27 11:31:52 CET,Sat Nov 27 13:31:53 CET,0.0 3.883 4.789 5.465 6.024 6.521 6.965 7.315 7.919 8.239 8.574 8.811 9.338 9.558 9.986 10.357 10.704 10.87 11.196 11.524 11.997 12.305 12.607 13.025 13.422 13.774 14.1 14.429 14.837 15.202 15.558 15.983 16.381 16.731 17.112 17.548 17.953 18.382 18.855 19.341 19.801 20.351 21.0 21.6 22.256 22.944 23.681 24.342 24.775 24.96 24.541 23.255 21.878 20.606 19.447 18.35 17.294 16.282 15.42 14.594 13.894 13.265 12.661 12.104 11.573 11.027 10.4 9.863 9.404 8.931 8.472 8.068 7.632 7.172 6.818 6.457 6.07 5.631 5.179 4.897 4.606 4.115 3.761 3.386 3.192 2.792 2.337 1.844 1.597 1.024 0.799 0.516 0.205 -0.414 -0.728 -1.086 -1.537 -2.125 -2.83 -3.719 -7.825 -3 ,20480 ,TETRA ,17584952,Sat Nov 27 11:31:16 CET,Sat Nov 27 13:50:57 CET,0.0 3.652 4.495 5.1 5.587 6.043 6.446 6.808 7.457 7.765 8.071 8.302 8.852 9.076 9.53 9.924 10.294 10.469 10.806 11.128 11.593 11.901 12.192 12.608 12.99 13.35 13.698 14.031 14.448 14.839 15.202 15.644 16.078 16.474 16.878 17.332 17.778 18.244 18.709 19.155 19.628 20.133 20.676 21.199 21.759 22.323 22.87 23.354 23.703 23.806 23.357 22.162 20.869 19.635 18.509 17.495 16.592 15.743 14.942 14.096 13.37 12.705 12.073 11.495 10.956 10.445 9.916 9.438 8.998 8.518 8.001 7.586 7.165 6.678 6.286 5.89 5.465 5.024 4.567 4.246 3.913 3.393 3.027 2.642 2.442 2.025 1.589 1.109 0.836 0.241 -0.005 -0.315 -0.667 -1.484 -1.922 -2.395 -2.959 -3.593 -4.281 -5.135 -8.027 -4 ,32054 ,TETRA ,17584953,Sat Nov 27 11:31:19 CET,Sat Nov 27 13:50:58 CET,0.0 4.088 5.067 5.731 6.262 6.773 7.248 7.637 8.323 8.648 8.944 9.146 9.695 9.917 10.334 10.745 11.136 11.311 11.652 11.977 12.41 12.679 12.93 13.286 13.63 13.962 14.286 14.576 14.935 15.27 15.592 15.986 16.355 16.722 17.14 17.593 18.038 18.521 19.009 19.513 19.996 20.497 20.997 21.431 21.93 22.429 22.936 23.387 23.765 23.926 23.479 22.264 20.912 19.6 18.309 16.973 15.803 14.822 13.985 13.164 12.377 11.601 10.832 10.075 9.361 8.706 8.037 7.43 6.921 6.384 5.773 5.276 4.772 4.244 3.836 3.421 2.996 2.558 2.109 1.793 1.453 0.903 0.516 0.095 -0.126 -0.563 -1.009 -1.464 -1.698 -2.284 -2.517 -2.812 -3.12 -3.78 -4.16 -4.59 -5.034 -5.538 -6.186 -7.048 -11.419 -5 ,31470 ,TETRA ,17584954,Sat Nov 27 11:31:54 CET,Sat Nov 27 13:45:34 CET,0.0 6.639 7.512 8.159 8.658 9.12 9.554 9.944 10.624 10.929 11.222 11.447 12.015 12.257 12.713 13.121 13.495 13.68 14.041 14.381 14.842 15.112 15.376 15.768 16.116 16.442 16.767 17.079 17.49 17.889 18.259 18.679 19.075 19.442 19.862 20.338 20.753 21.201 21.671 22.133 22.621 23.18 23.779 24.302 24.836 25.398 25.966 26.444 26.882 27.11 26.753 25.682 24.49 23.322 22.245 21.206 20.226 19.303 18.452 17.564 16.811 16.157 15.528 14.89 14.264 13.696 13.095 12.538 12.015 11.44 10.841 10.343 9.847 9.363 8.981 8.57 8.116 7.619 7.119 6.789 6.446 5.898 5.524 5.14 4.943 4.525 4.058 3.542 3.271 2.666 2.417 2.116 1.786 1.015 0.613 0.217 -0.256 -0.782 -1.455 -2.365 -6.346 -6 ,14755 ,TETRA ,17584955,Sat Nov 27 11:32:29 CET,Sat Nov 27 13:43:17 CET,0.0 3.526 4.474 5.212 5.801 6.289 6.735 7.136 7.818 8.137 8.441 8.662 9.226 9.454 9.868 10.266 10.659 10.843 11.202 11.544 12.029 12.318 12.6 13.008 13.388 13.765 14.117 14.445 14.864 15.285 15.68 16.147 16.606 17.048 17.556 18.085 18.537 18.975 19.385 19.837 20.341 20.844 21.393 21.926 22.463 22.961 23.454 23.858 24.127 24.283 23.925 22.859 21.731 20.574 19.448 18.32 17.236 16.168 15.141 14.095 13.202 12.403 11.634 10.908 10.243 9.655 9.033 8.482 8.02 7.519 7.008 6.564 6.076 5.551 5.142 4.757 4.363 3.943 3.498 3.184 2.853 2.296 1.907 1.514 1.311 0.886 0.441 -0.03 -0.286 -0.871 -1.067 -1.349 -1.656 -2.322 -2.685 -3.081 -3.528 -4.074 -4.754 -5.637 -8.907 -7 ,9741 ,TETRA ,17584956,Sat Nov 27 11:31:53 CET,Sat Nov 27 13:54:52 CET,0.0 3.09 3.816 4.376 4.876 5.264 5.607 5.934 6.53 6.786 7.026 7.171 7.721 7.939 8.327 8.686 9.045 9.221 9.542 9.849 10.285 10.551 10.817 11.195 11.559 11.933 12.289 12.624 13.044 13.434 13.794 14.197 14.556 14.899 15.297 15.735 16.163 16.609 17.063 17.55 18.047 18.545 19.058 19.563 20.151 20.725 21.207 21.595 21.881 21.95 21.504 20.296 18.986 17.79 16.639 15.495 14.349 13.185 12.155 11.163 10.293 9.555 8.881 8.213 7.581 6.998 6.355 5.729 5.189 4.642 4.064 3.579 3.063 2.516 2.087 1.631 1.172 0.721 0.249 -0.091 -0.443 -0.977 -1.362 -1.779 -1.989 -2.432 -2.904 -3.377 -3.619 -4.213 -4.438 -4.727 -5.075 -5.915 -6.366 -6.837 -7.368 -7.962 -8.684 -9.657 -13.841 -8 ,23390 ,TETRA ,17584957,Sat Nov 27 11:31:55 CET,Sat Nov 27 13:54:52 CET,0.0 3.03 3.977 4.629 5.158 5.609 6.012 6.377 7.027 7.337 7.605 7.755 8.29 8.515 8.973 9.408 9.793 9.972 10.313 10.639 11.092 11.367 11.645 12.043 12.399 12.735 13.05 13.368 13.779 14.166 14.549 14.991 15.399 15.8 16.246 16.738 17.186 17.638 18.148 18.633 19.08 19.636 20.276 20.813 21.348 21.94 22.604 23.185 23.646 23.83 23.393 22.252 21.004 19.82 18.662 17.505 16.451 15.516 14.728 13.952 13.259 12.633 12.053 11.499 10.96 10.448 9.866 9.284 8.804 8.352 7.875 7.488 7.093 6.644 6.29 5.943 5.561 5.162 4.769 4.477 4.153 3.633 3.261 2.862 2.65 2.244 1.839 1.401 1.168 0.595 0.389 0.106 -0.196 -0.861 -1.227 -1.632 -2.083 -2.608 -3.271 -4.161 -7.566 -9 ,19209 ,TETRA ,17584958,Sat Nov 27 11:31:54 CET,Sat Nov 27 13:38:45 CET,0.0 3.999 4.959 5.675 6.258 6.748 7.169 7.593 8.321 8.623 8.905 9.109 9.657 9.887 10.323 10.729 11.114 11.296 11.664 12.037 12.532 12.831 13.126 13.541 13.924 14.28 14.63 14.95 15.369 15.781 16.145 16.574 16.999 17.432 17.922 18.423 18.865 19.346 19.842 20.32 20.8 21.367 22.019 22.574 23.116 23.673 24.221 24.723 25.209 25.497 25.267 24.255 22.96 21.6 20.372 19.276 18.311 17.409 16.6 15.753 14.975 14.277 13.612 12.985 12.406 11.877 11.347 10.867 10.432 9.971 9.436 8.953 8.455 7.933 7.525 7.109 6.674 6.203 5.686 5.315 4.943 4.395 4.012 3.6 3.386 2.935 2.416 1.886 1.636 1.058 0.772 0.413 0.057 -0.598 -0.928 -1.291 -1.71 -2.212 -2.773 -3.471 -5.75 -10 ,6876 ,TETRA ,17584959,Sat Nov 27 11:31:54 CET,Sat Nov 27 13:48:00 CET,0.0 6.848 7.808 8.492 9.048 9.486 9.887 10.26 10.956 11.289 11.589 11.795 12.363 12.603 13.042 13.44 13.811 13.997 14.369 14.714 15.168 15.444 15.716 16.143 16.557 16.917 17.24 17.57 17.982 18.35 18.697 19.127 19.536 19.922 20.365 20.874 21.334 21.809 22.336 22.818 23.269 23.814 24.434 24.971 25.581 26.252 26.936 27.552 28.074 28.368 27.946 26.825 25.584 24.322 23.224 22.174 21.169 20.24 19.457 18.601 17.824 17.187 16.56 15.933 15.339 14.808 14.241 13.689 13.192 12.669 12.128 11.662 11.15 10.644 10.278 9.896 9.487 9.051 8.582 8.27 7.962 7.485 7.161 6.819 6.635 6.247 5.849 5.423 5.198 4.63 4.45 4.197 3.923 3.299 2.935 2.52 2.073 1.592 1.051 0.255 -3.03 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt deleted file mode 100644 index 85f1131a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27821 ,TETRA ,17584960,Sat Nov 27 11:31:54 CET,Sat Nov 27 13:49:09 CET,0.0 2.097 2.849 3.361 3.825 4.264 4.643 4.984 5.609 5.896 6.166 6.365 6.924 7.164 7.627 8.054 8.445 8.64 9.031 9.414 9.97 10.326 10.673 11.159 11.626 12.078 12.509 12.913 13.401 13.88 14.355 14.937 15.524 16.098 16.745 17.46 18.16 18.913 19.714 20.569 21.437 22.433 23.602 24.737 26.032 27.396 28.73 30.008 31.284 32.321 32.83 31.985 30.429 28.702 27.003 25.313 23.802 22.48 21.279 20.061 19.023 18.097 17.207 16.372 15.588 14.839 14.063 13.407 12.865 12.281 11.636 11.092 10.537 9.978 9.532 9.061 8.584 8.093 7.565 7.191 6.82 6.252 5.864 5.473 5.271 4.847 4.406 3.958 3.715 3.129 2.913 2.629 2.34 1.702 1.358 0.989 0.578 0.13 -0.415 -1.107 -2.892 -2 ,13050 ,TETRA ,17584961,Sat Nov 27 11:31:56 CET,Sat Nov 27 13:49:00 CET,0.0 1.785 2.436 2.97 3.449 3.856 4.235 4.582 5.205 5.486 5.757 5.978 6.533 6.784 7.259 7.707 8.141 8.354 8.756 9.135 9.69 10.047 10.391 10.888 11.367 11.83 12.28 12.721 13.281 13.813 14.33 14.974 15.591 16.18 16.865 17.62 18.353 19.15 19.962 20.84 21.776 22.754 23.832 24.872 25.973 27.132 28.468 29.762 31.09 32.308 32.605 31.328 29.564 27.803 26.022 24.355 22.868 21.507 20.33 19.128 18.081 17.133 16.222 15.364 14.556 13.796 12.996 12.3 11.701 11.09 10.453 9.937 9.406 8.826 8.367 7.899 7.428 6.94 6.419 6.065 5.699 5.123 4.727 4.308 4.09 3.63 3.15 2.669 2.424 1.833 1.595 1.295 0.98 0.298 -0.077 -0.501 -0.951 -1.431 -2.059 -2.874 -5.098 -3 ,9520 ,TETRA ,17584962,Sat Nov 27 11:31:54 CET,Sat Nov 27 13:48:57 CET,0.0 2.149 2.868 3.384 3.867 4.28 4.649 5.026 5.692 6.002 6.291 6.501 7.101 7.372 7.87 8.34 8.777 8.972 9.36 9.741 10.291 10.64 10.971 11.448 11.91 12.368 12.81 13.235 13.769 14.259 14.727 15.286 15.849 16.427 17.058 17.726 18.399 19.159 19.94 20.706 21.487 22.38 23.406 24.46 25.717 27.065 28.514 29.869 31.107 31.927 31.679 30.395 28.671 26.882 25.142 23.43 21.971 20.665 19.506 18.347 17.363 16.47 15.59 14.763 14.006 13.312 12.577 11.921 11.344 10.741 10.109 9.589 9.07 8.527 8.089 7.618 7.138 6.646 6.135 5.788 5.439 4.907 4.52 4.111 3.902 3.459 2.991 2.492 2.234 1.634 1.411 1.123 0.817 0.138 -0.236 -0.617 -1.028 -1.504 -2.094 -2.89 -4.73 -4 ,18307 ,TETRA ,17584963,Sat Nov 27 11:31:56 CET,Sat Nov 27 13:49:30 CET,0.0 1.759 2.441 2.947 3.404 3.791 4.145 4.48 5.073 5.354 5.641 5.87 6.446 6.689 7.154 7.6 8.015 8.219 8.616 8.996 9.539 9.901 10.248 10.74 11.213 11.65 12.063 12.475 13.019 13.551 14.056 14.647 15.211 15.759 16.415 17.156 17.857 18.599 19.384 20.197 21.049 22.014 23.115 24.139 25.121 26.095 27.187 28.201 29.061 29.656 29.518 28.235 26.51 24.735 23.037 21.479 20.087 18.797 17.676 16.511 15.482 14.499 13.549 12.688 11.899 11.195 10.435 9.736 9.127 8.5 7.855 7.321 6.759 6.159 5.706 5.255 4.79 4.295 3.789 3.453 3.109 2.566 2.178 1.777 1.579 1.171 0.717 0.229 -0.03 -0.63 -0.841 -1.135 -1.426 -2.023 -2.348 -2.708 -3.12 -3.627 -4.254 -5.022 -7.053 -5 ,6971 ,TETRA ,17584964,Sat Nov 27 11:31:55 CET,Sat Nov 27 13:45:36 CET,0.0 1.832 2.545 3.063 3.515 3.953 4.339 4.673 5.308 5.614 5.906 6.113 6.684 6.923 7.38 7.849 8.301 8.511 8.899 9.265 9.809 10.162 10.495 10.965 11.417 11.848 12.255 12.659 13.215 13.74 14.244 14.857 15.425 15.974 16.617 17.343 18.054 18.843 19.668 20.489 21.358 22.33 23.395 24.425 25.583 26.861 28.232 29.518 30.528 31.089 31.026 29.783 28.011 26.181 24.471 22.858 21.402 20.021 18.803 17.622 16.573 15.615 14.719 13.874 13.075 12.341 11.612 10.968 10.391 9.776 9.124 8.579 8.023 7.443 6.988 6.519 6.042 5.55 5.028 4.673 4.313 3.739 3.339 2.938 2.729 2.298 1.854 1.372 1.118 0.533 0.322 0.019 -0.294 -0.967 -1.329 -1.721 -2.17 -2.668 -3.235 -3.938 -5.538 -6 ,27561 ,TETRA ,17584965,Sat Nov 27 11:31:54 CET,Sat Nov 27 13:49:17 CET,0.0 1.886 2.532 3.022 3.453 3.86 4.269 4.636 5.25 5.543 5.827 6.054 6.629 6.87 7.337 7.769 8.179 8.39 8.799 9.179 9.726 10.066 10.383 10.839 11.294 11.73 12.125 12.531 13.06 13.545 14.011 14.539 15.053 15.574 16.166 16.805 17.412 18.079 18.797 19.553 20.344 21.237 22.284 23.283 24.378 25.543 26.826 28.132 29.312 30.428 30.786 29.622 27.91 26.037 24.344 22.757 21.316 19.989 18.783 17.555 16.512 15.591 14.712 13.873 13.088 12.382 11.634 10.958 10.356 9.717 9.069 8.547 8.027 7.484 7.034 6.57 6.11 5.624 5.114 4.766 4.409 3.855 3.458 3.036 2.818 2.377 1.923 1.439 1.185 0.602 0.398 0.115 -0.195 -0.895 -1.264 -1.65 -2.072 -2.544 -3.092 -3.788 -5.177 -7 ,29019 ,TETRA ,17584966,Sat Nov 27 11:31:54 CET,Sat Nov 27 13:46:46 CET,0.0 1.379 2.016 2.559 3.046 3.456 3.829 4.192 4.843 5.143 5.419 5.617 6.19 6.436 6.904 7.358 7.788 7.99 8.389 8.779 9.32 9.659 10.0 10.506 11.003 11.479 11.939 12.383 12.941 13.466 13.957 14.566 15.161 15.733 16.402 17.132 17.807 18.568 19.391 20.237 21.1 22.061 23.161 24.243 25.453 26.662 27.947 29.265 30.611 31.875 32.342 31.351 29.77 27.963 26.307 24.756 23.303 21.956 20.746 19.502 18.419 17.461 16.559 15.704 14.906 14.169 13.39 12.681 12.074 11.461 10.827 10.3 9.754 9.178 8.724 8.266 7.793 7.292 6.772 6.416 6.052 5.51 5.14 4.749 4.546 4.131 3.668 3.159 2.898 2.3 2.071 1.785 1.484 0.787 0.384 -0.021 -0.413 -0.883 -1.484 -2.3 -4.36 -8 ,18298 ,TETRA ,17584967,Sat Nov 27 11:31:54 CET,Sat Nov 27 13:33:14 CET,0.0 1.376 2.038 2.567 3.019 3.441 3.829 4.188 4.859 5.166 5.453 5.687 6.277 6.524 6.994 7.426 7.843 8.05 8.443 8.833 9.412 9.782 10.128 10.633 11.125 11.582 12.024 12.457 13.014 13.544 14.059 14.688 15.286 15.865 16.538 17.289 18.004 18.773 19.573 20.429 21.331 22.341 23.511 24.616 25.832 27.162 28.598 29.977 31.332 32.505 32.899 31.55 29.817 28.192 26.514 24.867 23.366 21.95 20.695 19.427 18.37 17.416 16.459 15.551 14.722 13.986 13.225 12.518 11.911 11.295 10.65 10.109 9.563 9.025 8.6 8.158 7.688 7.183 6.673 6.322 5.947 5.347 4.937 4.521 4.306 3.867 3.396 2.891 2.631 2.022 1.792 1.486 1.169 0.495 0.12 -0.27 -0.7 -1.168 -1.678 -2.367 -4.231 -9 ,6606 ,TETRA ,17584968,Sat Nov 27 11:31:56 CET,Sat Nov 27 13:49:28 CET,0.0 1.929 2.64 3.121 3.562 3.979 4.368 4.724 5.352 5.652 5.942 6.173 6.751 6.994 7.455 7.906 8.337 8.542 8.943 9.329 9.891 10.253 10.6 11.098 11.576 12.05 12.511 12.94 13.466 13.975 14.471 15.078 15.676 16.238 16.889 17.626 18.301 19.035 19.861 20.747 21.637 22.637 23.774 24.868 26.067 27.273 28.544 29.748 30.928 31.684 31.55 30.332 28.405 26.396 24.615 22.946 21.416 20.016 18.81 17.59 16.552 15.614 14.701 13.836 13.019 12.272 11.506 10.84 10.257 9.637 8.992 8.461 7.906 7.33 6.871 6.404 5.939 5.454 4.937 4.569 4.197 3.622 3.227 2.827 2.62 2.178 1.703 1.201 0.943 0.356 0.138 -0.147 -0.441 -1.105 -1.479 -1.872 -2.28 -2.74 -3.313 -4.072 -5.939 -10 ,17440 ,TETRA ,17584969,Sat Nov 27 11:31:57 CET,Sat Nov 27 13:48:22 CET,0.0 1.767 2.516 3.042 3.524 3.944 4.322 4.676 5.307 5.596 5.877 6.088 6.662 6.902 7.353 7.807 8.225 8.422 8.807 9.179 9.71 10.034 10.346 10.806 11.237 11.642 12.035 12.421 12.93 13.415 13.882 14.445 14.965 15.478 16.109 16.802 17.435 18.097 18.761 19.468 20.205 20.978 21.899 22.835 23.848 24.941 26.106 27.198 28.132 28.778 28.699 27.311 25.692 23.91 22.131 20.58 19.238 17.986 16.826 15.602 14.501 13.502 12.568 11.695 10.873 10.144 9.375 8.663 8.056 7.436 6.799 6.286 5.735 5.138 4.681 4.215 3.746 3.27 2.762 2.397 2.023 1.443 1.04 0.62 0.407 -0.027 -0.477 -0.946 -1.193 -1.777 -1.994 -2.285 -2.596 -3.304 -3.692 -4.067 -4.453 -4.948 -5.552 -6.247 -7.807 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt deleted file mode 100644 index d003c9ff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12854 ,TETRA ,17584970,Sat Nov 27 11:31:55 CET,Sat Nov 27 13:37:38 CET,0.0 1.232 1.656 1.957 2.228 2.487 2.726 2.94 3.314 3.498 3.666 3.821 4.097 4.226 4.47 4.711 4.932 5.031 5.22 5.397 5.642 5.795 5.944 6.164 6.371 6.573 6.77 6.957 7.178 7.38 7.581 7.806 8.02 8.218 8.424 8.649 8.863 9.079 9.283 9.477 9.659 9.83 9.972 10.061 10.094 10.053 9.896 9.488 8.76 7.48 4.995 1.755 -1.026 -3.442 -5.539 -7.365 -8.945 -10.444 -11.736 -13.008 -14.078 -15.011 -15.908 -16.739 -17.497 -18.182 -18.908 -19.566 -20.129 -20.692 -21.278 -21.764 -22.273 -22.816 -23.23 -23.653 -24.08 -24.518 -24.983 -25.315 -25.665 -26.187 -26.535 -26.887 -27.068 -27.452 -27.87 -28.312 -28.547 -28.973 -29.317 -29.601 -29.887 -30.471 -30.787 -31.151 -31.533 -31.965 -32.488 -33.118 -34.61 -2 ,10894 ,TETRA ,17584971,Sat Nov 27 11:31:55 CET,Sat Nov 27 13:51:14 CET,0.0 0.996 1.372 1.689 1.966 2.196 2.385 2.565 2.925 3.084 3.225 3.353 3.647 3.784 4.025 4.247 4.462 4.57 4.775 4.951 5.197 5.355 5.506 5.73 5.95 6.149 6.335 6.503 6.704 6.903 7.09 7.298 7.489 7.665 7.863 8.083 8.257 8.43 8.598 8.759 8.933 9.126 9.319 9.477 9.615 9.635 9.54 9.225 8.534 7.295 4.843 1.448 -1.498 -4.03 -6.216 -8.171 -9.858 -11.386 -12.671 -13.935 -15.022 -15.97 -16.856 -17.696 -18.479 -19.167 -19.878 -20.515 -21.063 -21.645 -22.242 -22.737 -23.262 -23.79 -24.196 -24.613 -25.037 -25.486 -25.948 -26.265 -26.594 -27.101 -27.453 -27.839 -28.043 -28.458 -28.891 -29.346 -29.581 -30.001 -30.315 -30.588 -30.871 -31.5 -31.85 -32.222 -32.612 -33.046 -33.577 -34.278 -36.196 -3 ,9534 ,TETRA ,17584972,Sat Nov 27 11:31:55 CET,Sat Nov 27 13:52:22 CET,0.0 1.101 1.457 1.72 1.967 2.219 2.445 2.644 3.003 3.165 3.317 3.457 3.728 3.847 4.078 4.292 4.494 4.593 4.797 4.991 5.258 5.424 5.574 5.794 5.999 6.192 6.375 6.549 6.772 6.98 7.167 7.381 7.592 7.781 7.983 8.203 8.395 8.614 8.827 8.993 9.159 9.335 9.513 9.641 9.67 9.587 9.386 9.056 8.348 7.005 4.485 1.265 -1.47 -3.885 -5.95 -7.796 -9.38 -10.815 -12.064 -13.3 -14.379 -15.313 -16.176 -16.975 -17.702 -18.366 -19.046 -19.66 -20.197 -20.769 -21.386 -21.893 -22.414 -22.939 -23.338 -23.76 -24.228 -24.737 -25.239 -25.576 -25.904 -26.407 -26.775 -27.159 -27.355 -27.765 -28.19 -28.618 -28.841 -29.262 -29.579 -29.847 -30.131 -30.791 -31.16 -31.554 -32.003 -32.474 -33.043 -33.74 -35.921 -4 ,20455 ,TETRA ,17584973,Sat Nov 27 11:31:57 CET,Sat Nov 27 13:52:21 CET,0.0 0.922 1.375 1.733 2.03 2.276 2.47 2.649 3.022 3.197 3.356 3.506 3.797 3.933 4.175 4.394 4.603 4.699 4.887 5.079 5.345 5.51 5.667 5.888 6.105 6.3 6.477 6.649 6.869 7.065 7.236 7.445 7.655 7.842 8.038 8.261 8.474 8.689 8.896 9.099 9.301 9.447 9.567 9.674 9.714 9.648 9.455 9.06 8.338 6.958 4.393 1.238 -1.499 -3.83 -5.86 -7.693 -9.284 -10.698 -11.917 -13.147 -14.183 -15.097 -15.963 -16.802 -17.59 -18.277 -18.992 -19.614 -20.143 -20.688 -21.261 -21.757 -22.253 -22.753 -23.145 -23.544 -23.969 -24.429 -24.904 -25.239 -25.592 -26.139 -26.507 -26.874 -27.069 -27.471 -27.892 -28.331 -28.553 -28.979 -29.289 -29.557 -29.837 -30.448 -30.788 -31.128 -31.532 -31.998 -32.499 -33.198 -35.376 -5 ,15494 ,TETRA ,17584974,Sat Nov 27 11:31:59 CET,Sat Nov 27 13:52:25 CET,0.0 0.563 0.896 1.189 1.424 1.623 1.817 1.992 2.326 2.488 2.646 2.809 3.072 3.193 3.449 3.676 3.882 3.985 4.175 4.36 4.634 4.797 4.945 5.159 5.365 5.569 5.771 5.948 6.156 6.368 6.575 6.796 6.987 7.171 7.39 7.643 7.871 8.11 8.354 8.585 8.824 9.079 9.342 9.543 9.649 9.685 9.588 9.24 8.565 7.334 4.942 1.79 -1.012 -3.513 -5.672 -7.576 -9.165 -10.514 -11.707 -12.921 -13.951 -14.881 -15.752 -16.558 -17.306 -17.984 -18.695 -19.335 -19.887 -20.439 -20.991 -21.451 -21.927 -22.432 -22.833 -23.249 -23.675 -24.116 -24.587 -24.904 -25.217 -25.73 -26.086 -26.432 -26.611 -27.003 -27.418 -27.87 -28.11 -28.52 -28.833 -29.093 -29.366 -29.981 -30.325 -30.7 -31.101 -31.544 -32.096 -32.819 -34.939 -6 ,32498 ,TETRA ,17584975,Sat Nov 27 11:31:56 CET,Sat Nov 27 13:52:43 CET,0.0 1.338 1.822 2.181 2.485 2.758 3.008 3.225 3.623 3.804 3.971 4.162 4.458 4.596 4.849 5.089 5.311 5.42 5.619 5.807 6.083 6.255 6.426 6.672 6.894 7.095 7.278 7.447 7.666 7.881 8.085 8.333 8.553 8.741 8.952 9.197 9.424 9.637 9.822 10.003 10.187 10.376 10.527 10.618 10.676 10.642 10.483 10.124 9.411 8.094 5.532 2.256 -0.545 -2.951 -5.096 -7.129 -8.896 -10.428 -11.729 -13.025 -14.152 -15.128 -16.017 -16.852 -17.607 -18.304 -19.036 -19.686 -20.249 -20.817 -21.418 -21.933 -22.467 -23.001 -23.408 -23.836 -24.275 -24.723 -25.195 -25.525 -25.86 -26.362 -26.723 -27.107 -27.301 -27.718 -28.156 -28.602 -28.831 -29.246 -29.537 -29.799 -30.071 -30.63 -30.948 -31.287 -31.655 -32.106 -32.678 -33.48 -35.562 -7 ,746 ,TETRA ,17584976,Sat Nov 27 11:31:56 CET,Sat Nov 27 13:52:48 CET,0.0 1.106 1.552 1.856 2.116 2.338 2.558 2.773 3.141 3.311 3.468 3.617 3.911 4.052 4.321 4.576 4.808 4.92 5.135 5.328 5.603 5.775 5.927 6.154 6.37 6.58 6.782 6.952 7.175 7.395 7.578 7.789 8.004 8.208 8.421 8.653 8.872 9.088 9.304 9.526 9.748 9.972 10.134 10.232 10.339 10.348 10.164 9.812 9.175 7.836 5.29 2.206 -0.574 -3.041 -5.034 -6.839 -8.511 -10.006 -11.292 -12.589 -13.653 -14.543 -15.39 -16.195 -16.96 -17.663 -18.371 -18.997 -19.534 -20.093 -20.673 -21.152 -21.659 -22.191 -22.593 -23.004 -23.448 -23.904 -24.358 -24.664 -24.984 -25.503 -25.874 -26.265 -26.465 -26.857 -27.267 -27.731 -27.981 -28.415 -28.763 -29.05 -29.341 -29.956 -30.292 -30.641 -31.061 -31.554 -32.103 -32.784 -34.341 -8 ,22302 ,TETRA ,17584977,Sat Nov 27 11:31:56 CET,Sat Nov 27 13:54:35 CET,0.0 1.121 1.65 2.017 2.309 2.558 2.773 2.992 3.366 3.529 3.688 3.83 4.103 4.234 4.502 4.731 4.933 5.032 5.233 5.438 5.707 5.866 6.023 6.259 6.487 6.703 6.911 7.103 7.328 7.535 7.74 7.975 8.19 8.39 8.605 8.836 9.025 9.228 9.47 9.705 9.936 10.153 10.334 10.473 10.557 10.554 10.442 10.162 9.57 8.394 6.076 2.982 0.272 -2.142 -4.15 -5.907 -7.469 -8.894 -10.154 -11.417 -12.479 -13.427 -14.311 -15.131 -15.904 -16.607 -17.351 -18.019 -18.59 -19.176 -19.778 -20.287 -20.809 -21.322 -21.714 -22.131 -22.56 -23.01 -23.476 -23.795 -24.13 -24.633 -24.987 -25.36 -25.549 -25.938 -26.349 -26.803 -27.032 -27.446 -27.774 -28.045 -28.314 -28.903 -29.237 -29.607 -29.988 -30.418 -30.923 -31.606 -33.937 -9 ,17724 ,TETRA ,17584978,Sat Nov 27 11:31:59 CET,Sat Nov 27 13:54:35 CET,0.0 1.212 1.63 1.966 2.257 2.523 2.763 2.966 3.307 3.473 3.642 3.803 4.089 4.219 4.448 4.681 4.916 5.023 5.23 5.42 5.692 5.862 6.012 6.234 6.453 6.663 6.859 7.043 7.274 7.481 7.659 7.873 8.087 8.285 8.507 8.725 8.92 9.145 9.369 9.565 9.745 9.924 10.093 10.21 10.257 10.235 10.082 9.759 9.112 7.775 5.168 1.843 -1.056 -3.571 -5.748 -7.709 -9.369 -10.88 -12.213 -13.528 -14.629 -15.594 -16.506 -17.356 -18.138 -18.841 -19.565 -20.223 -20.79 -21.379 -22.002 -22.505 -23.014 -23.548 -23.953 -24.369 -24.812 -25.267 -25.752 -26.081 -26.406 -26.903 -27.252 -27.62 -27.809 -28.216 -28.64 -29.094 -29.332 -29.75 -30.048 -30.317 -30.61 -31.241 -31.588 -31.973 -32.391 -32.856 -33.396 -34.091 -35.658 -10 ,725 ,TETRA ,17584979,Sat Nov 27 11:32:01 CET,Sat Nov 27 13:52:02 CET,0.0 0.889 1.313 1.666 1.95 2.194 2.417 2.631 3.041 3.22 3.379 3.542 3.823 3.946 4.184 4.416 4.64 4.747 4.942 5.137 5.408 5.571 5.735 5.976 6.195 6.392 6.584 6.76 6.975 7.184 7.379 7.593 7.799 7.995 8.198 8.415 8.61 8.797 8.988 9.188 9.381 9.549 9.708 9.866 9.999 10.04 9.998 9.745 9.046 7.665 5.145 1.955 -0.942 -3.487 -5.698 -7.657 -9.313 -10.788 -12.035 -13.241 -14.272 -15.219 -16.136 -16.97 -17.743 -18.447 -19.17 -19.816 -20.36 -20.925 -21.515 -22.008 -22.515 -23.029 -23.426 -23.835 -24.256 -24.706 -25.186 -25.51 -25.838 -26.344 -26.715 -27.101 -27.294 -27.717 -28.154 -28.581 -28.815 -29.232 -29.521 -29.782 -30.07 -30.714 -31.05 -31.395 -31.809 -32.283 -32.815 -33.475 -35.163 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 758b646c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1372 ,TETRA ,17584980,Sat Nov 27 11:31:56 CET,Sat Nov 27 13:48:06 CET,0.0 0.428 0.753 1.025 1.297 1.561 1.758 2.097 2.265 2.429 2.62 2.914 3.047 3.293 3.541 3.764 3.871 4.079 4.271 4.541 4.712 4.883 5.148 5.392 5.62 5.839 6.048 6.317 6.567 6.816 7.117 7.393 7.654 7.953 8.279 8.588 8.917 9.273 9.631 9.97 10.337 10.779 11.196 11.619 12.085 12.55 12.944 13.206 13.291 12.953 11.896 10.717 9.629 8.608 7.59 6.689 5.86 5.073 4.281 3.592 2.971 2.355 1.731 1.154 0.628 0.073 -0.427 -0.862 -1.323 -1.834 -2.264 -2.712 -3.172 -3.507 -3.863 -4.264 -4.682 -5.124 -5.453 -5.803 -6.356 -6.735 -7.128 -7.324 -7.742 -8.241 -8.775 -9.024 -9.433 -9.913 -10.244 -10.57 -11.367 -11.878 -12.46 -13.116 -13.8 -14.657 -16.181 -2 ,20831 ,TETRA ,17584981,Sat Nov 27 11:31:59 CET,Sat Nov 27 13:49:00 CET,0.0 0.344 0.616 0.835 1.046 1.27 1.468 1.808 1.957 2.099 2.236 2.496 2.607 2.822 3.036 3.238 3.337 3.53 3.712 3.982 4.157 4.31 4.53 4.746 4.94 5.125 5.31 5.546 5.777 5.998 6.254 6.501 6.732 7.0 7.308 7.593 7.879 8.173 8.498 8.84 9.211 9.639 10.037 10.433 10.821 11.205 11.518 11.718 11.699 11.143 9.914 8.545 7.224 6.095 5.065 4.132 3.235 2.44 1.671 0.973 0.287 -0.402 -1.036 -1.632 -2.22 -2.855 -3.413 -3.885 -4.372 -4.878 -5.288 -5.726 -6.223 -6.629 -7.024 -7.421 -7.847 -8.299 -8.623 -8.962 -9.493 -9.857 -10.245 -10.451 -10.854 -11.313 -11.882 -12.167 -12.585 -13.006 -13.3 -13.617 -14.333 -14.765 -15.271 -15.718 -16.213 -17.003 -18.122 -3 ,23136 ,TETRA ,17584982,Sat Nov 27 11:32:00 CET,Sat Nov 27 13:49:00 CET,0.0 0.383 0.678 0.933 1.153 1.338 1.533 1.888 2.042 2.186 2.303 2.585 2.73 2.991 3.219 3.438 3.544 3.746 3.932 4.197 4.372 4.535 4.769 4.985 5.188 5.388 5.58 5.833 6.077 6.31 6.584 6.844 7.095 7.39 7.729 8.059 8.389 8.714 9.051 9.405 9.842 10.4 11.006 11.642 12.173 12.61 12.961 13.189 13.128 12.476 11.288 10.047 8.739 7.51 6.358 5.329 4.409 3.551 2.621 1.825 1.132 0.467 -0.143 -0.743 -1.316 -1.937 -2.508 -2.979 -3.479 -4.003 -4.425 -4.869 -5.359 -5.739 -6.117 -6.501 -6.905 -7.359 -7.677 -7.997 -8.503 -8.87 -9.252 -9.442 -9.859 -10.292 -10.753 -10.995 -11.391 -11.83 -12.138 -12.5 -13.396 -13.894 -14.422 -15.003 -15.654 -16.604 -18.007 -4 ,15027 ,TETRA ,17584983,Sat Nov 27 11:31:56 CET,Sat Nov 27 13:49:35 CET,0.0 0.467 0.801 1.063 1.29 1.503 1.705 2.045 2.201 2.355 2.502 2.787 2.912 3.154 3.386 3.604 3.713 3.914 4.114 4.4 4.576 4.753 5.004 5.234 5.459 5.678 5.886 6.161 6.437 6.684 6.971 7.255 7.517 7.818 8.154 8.479 8.836 9.189 9.545 9.914 10.29 10.701 11.095 11.535 12.012 12.508 12.949 13.295 13.484 13.174 12.154 10.994 9.835 8.721 7.681 6.673 5.74 4.996 4.238 3.549 2.92 2.289 1.701 1.161 0.661 0.132 -0.346 -0.745 -1.182 -1.667 -2.068 -2.525 -3.006 -3.354 -3.7 -4.069 -4.501 -4.974 -5.313 -5.661 -6.215 -6.583 -6.934 -7.106 -7.49 -7.947 -8.501 -8.823 -9.28 -9.769 -10.125 -10.498 -11.34 -11.838 -12.37 -12.965 -13.698 -14.597 -15.939 -5 ,13234 ,TETRA ,17584984,Sat Nov 27 11:31:59 CET,Sat Nov 27 13:49:32 CET,0.0 0.424 0.759 1.012 1.23 1.422 1.605 1.972 2.147 2.3 2.453 2.726 2.85 3.108 3.351 3.553 3.654 3.856 4.04 4.321 4.509 4.684 4.935 5.171 5.382 5.584 5.788 6.047 6.303 6.543 6.811 7.072 7.343 7.663 8.011 8.333 8.649 8.961 9.296 9.683 10.108 10.541 10.945 11.351 11.797 12.247 12.58 12.854 12.951 12.57 11.415 10.024 8.73 7.584 6.46 5.394 4.404 3.529 2.619 1.861 1.212 0.569 -0.056 -0.639 -1.189 -1.809 -2.359 -2.817 -3.285 -3.783 -4.235 -4.713 -5.187 -5.549 -5.904 -6.292 -6.722 -7.136 -7.426 -7.735 -8.236 -8.607 -9.012 -9.222 -9.641 -10.108 -10.608 -10.863 -11.285 -11.744 -12.079 -12.463 -13.342 -13.872 -14.462 -15.166 -16.005 -17.11 -18.677 -6 ,735 ,TETRA ,17584985,Sat Nov 27 11:32:30 CET,Sat Nov 27 13:47:01 CET,0.0 0.357 0.644 0.911 1.149 1.359 1.549 1.885 2.029 2.172 2.306 2.578 2.704 2.933 3.154 3.364 3.461 3.649 3.826 4.075 4.235 4.386 4.609 4.828 5.039 5.242 5.443 5.7 5.938 6.175 6.452 6.701 6.939 7.23 7.55 7.834 8.144 8.474 8.789 9.11 9.464 9.849 10.241 10.69 11.165 11.657 12.073 12.404 12.484 11.989 10.934 9.728 8.509 7.396 6.234 5.208 4.341 3.53 2.709 2.002 1.339 0.682 0.055 -0.556 -1.139 -1.768 -2.355 -2.871 -3.392 -3.916 -4.364 -4.871 -5.4 -5.795 -6.208 -6.641 -7.096 -7.573 -7.904 -8.252 -8.836 -9.256 -9.705 -9.937 -10.412 -10.937 -11.468 -11.738 -12.166 -12.607 -12.935 -13.272 -14.009 -14.456 -14.957 -15.623 -16.473 -17.445 -18.68 -7 ,7052 ,TETRA ,17584986,Sat Nov 27 11:32:31 CET,Sat Nov 27 13:49:11 CET,0.0 0.438 0.738 0.991 1.197 1.39 1.596 1.957 2.121 2.27 2.381 2.64 2.762 3.004 3.236 3.452 3.558 3.763 3.967 4.257 4.434 4.611 4.88 5.137 5.373 5.588 5.799 6.077 6.338 6.579 6.845 7.091 7.33 7.612 7.936 8.251 8.604 8.982 9.373 9.778 10.192 10.593 10.97 11.419 11.845 12.246 12.577 12.82 12.884 12.408 11.265 9.965 8.723 7.604 6.52 5.522 4.607 3.77 2.915 2.195 1.556 0.941 0.341 -0.237 -0.777 -1.36 -1.86 -2.302 -2.772 -3.235 -3.631 -4.044 -4.482 -4.85 -5.238 -5.628 -6.044 -6.502 -6.804 -7.095 -7.57 -7.921 -8.311 -8.517 -8.932 -9.384 -9.908 -10.203 -10.654 -11.165 -11.514 -11.844 -12.64 -13.082 -13.53 -14.081 -14.796 -15.591 -16.632 -8 ,515 ,TETRA ,17584987,Sat Nov 27 11:32:30 CET,Sat Nov 27 13:47:17 CET,0.0 0.454 0.8 1.101 1.373 1.609 1.826 2.199 2.372 2.55 2.741 3.033 3.17 3.442 3.684 3.912 4.025 4.243 4.452 4.759 4.961 5.151 5.422 5.684 5.934 6.176 6.415 6.727 7.016 7.286 7.623 7.943 8.243 8.577 8.951 9.335 9.763 10.208 10.66 11.11 11.581 12.137 12.64 13.107 13.564 13.963 14.219 14.373 14.352 13.726 12.341 10.857 9.458 8.195 7.02 5.942 4.921 4.006 3.087 2.321 1.635 0.969 0.335 -0.273 -0.84 -1.437 -1.974 -2.451 -2.941 -3.47 -3.92 -4.365 -4.825 -5.21 -5.612 -6.013 -6.468 -6.968 -7.314 -7.693 -8.345 -8.797 -9.239 -9.459 -9.913 -10.393 -10.893 -11.153 -11.57 -12.031 -12.343 -12.678 -13.472 -13.907 -14.364 -14.895 -15.521 -16.39 -17.649 -9 ,14455 ,TETRA ,17584988,Sat Nov 27 11:32:31 CET,Sat Nov 27 13:49:50 CET,0.0 0.37 0.676 0.953 1.206 1.406 1.595 1.95 2.106 2.25 2.392 2.683 2.811 3.043 3.271 3.491 3.597 3.794 3.979 4.249 4.423 4.6 4.861 5.104 5.333 5.547 5.75 6.011 6.262 6.513 6.811 7.069 7.317 7.618 7.944 8.247 8.564 8.894 9.228 9.56 9.935 10.359 10.764 11.2 11.615 12.004 12.369 12.634 12.687 12.243 11.046 9.774 8.589 7.486 6.491 5.581 4.687 3.911 3.138 2.466 1.864 1.289 0.667 -0.023 -0.716 -1.436 -2.043 -2.551 -3.04 -3.512 -3.89 -4.279 -4.686 -5.013 -5.373 -5.782 -6.202 -6.67 -7.023 -7.381 -7.986 -8.423 -8.825 -9.019 -9.428 -9.855 -10.313 -10.557 -11.0 -11.529 -11.894 -12.298 -13.155 -13.623 -14.129 -14.738 -15.506 -16.519 -17.867 -10 ,22931 ,TETRA ,17584989,Sat Nov 27 11:32:30 CET,Sat Nov 27 13:30:54 CET,0.0 0.426 0.746 1.007 1.238 1.456 1.649 1.978 2.126 2.261 2.374 2.649 2.775 3.005 3.228 3.441 3.538 3.728 3.938 4.224 4.401 4.599 4.867 5.084 5.297 5.515 5.722 5.982 6.243 6.505 6.811 7.084 7.341 7.625 7.933 8.243 8.581 8.906 9.246 9.595 9.962 10.417 10.854 11.332 11.84 12.271 12.645 12.958 13.007 12.51 11.384 10.117 8.885 7.793 6.74 5.77 4.907 4.15 3.365 2.646 1.983 1.389 0.833 0.285 -0.224 -0.737 -1.195 -1.608 -2.049 -2.55 -3.002 -3.466 -3.938 -4.302 -4.674 -5.046 -5.455 -5.927 -6.261 -6.617 -7.226 -7.664 -8.12 -8.35 -8.808 -9.285 -9.808 -10.092 -10.549 -11.066 -11.449 -11.863 -12.702 -13.195 -13.725 -14.251 -14.956 -15.89 -17.017 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt deleted file mode 100644 index d4692453..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7593 ,TETRA ,17584990,Sat Nov 27 11:32:30 CET,Sat Nov 27 13:50:23 CET,0.0 4.265 5.251 5.941 6.595 7.178 7.673 8.132 8.939 9.294 9.626 9.928 10.568 10.87 11.411 11.906 12.407 12.646 13.084 13.493 14.064 14.445 14.826 15.372 15.903 16.411 16.894 17.344 17.917 18.493 19.081 19.761 20.369 20.933 21.583 22.316 23.026 23.821 24.685 25.604 26.525 27.499 28.595 29.677 30.858 32.06 33.387 34.742 36.045 37.069 37.353 36.429 34.96 33.464 32.125 30.877 29.729 28.575 27.548 26.492 25.464 24.487 23.513 22.576 21.701 20.904 20.091 19.32 18.634 17.946 17.21 16.584 15.907 15.205 14.661 14.107 13.573 12.996 12.375 11.948 11.495 10.767 10.265 9.753 9.504 9.015 8.465 7.856 7.566 6.954 6.621 6.266 5.906 5.134 4.717 4.26 3.744 3.163 2.434 1.458 -5.457 -2 ,29265 ,TETRA ,17584991,Sat Nov 27 11:32:33 CET,Sat Nov 27 13:50:24 CET,0.0 3.466 4.351 4.975 5.489 5.935 6.321 6.686 7.346 7.634 7.913 8.158 8.723 8.971 9.428 9.856 10.286 10.489 10.853 11.196 11.686 11.977 12.261 12.69 13.111 13.505 13.881 14.25 14.72 15.167 15.596 16.138 16.663 17.153 17.672 18.214 18.758 19.326 19.9 20.515 21.134 21.781 22.539 23.259 23.991 24.813 25.639 26.398 27.131 27.579 27.47 26.239 24.695 23.207 21.864 20.562 19.352 18.174 17.167 16.183 15.323 14.504 13.663 12.883 12.179 11.529 10.821 10.148 9.555 8.957 8.323 7.788 7.247 6.696 6.259 5.797 5.327 4.841 4.318 3.962 3.609 3.035 2.614 2.168 1.931 1.402 0.85 0.261 -0.054 -0.702 -1.044 -1.388 -1.766 -2.619 -3.071 -3.565 -4.137 -4.775 -5.593 -6.575 -8.83 -3 ,22180 ,TETRA ,17584992,Sat Nov 27 11:32:34 CET,Sat Nov 27 13:44:53 CET,0.0 2.884 3.938 4.76 5.428 5.977 6.454 6.895 7.656 8.008 8.365 8.681 9.304 9.589 10.145 10.658 11.138 11.374 11.808 12.228 12.87 13.256 13.613 14.132 14.601 15.049 15.467 15.888 16.507 17.097 17.653 18.307 18.831 19.281 19.828 20.44 20.992 21.563 22.163 22.761 23.349 23.979 24.717 25.466 26.239 26.942 27.703 28.493 29.119 29.45 29.107 27.798 26.486 25.227 23.941 22.648 21.454 20.371 19.386 18.375 17.489 16.632 15.777 14.938 14.12 13.347 12.494 11.766 11.193 10.615 9.992 9.47 8.934 8.386 7.978 7.555 7.109 6.641 6.154 5.81 5.443 4.866 4.456 4.008 3.772 3.289 2.769 2.232 1.969 1.386 1.142 0.802 0.42 -0.46 -0.927 -1.373 -1.835 -2.369 -3.022 -3.898 -6.324 -4 ,15688 ,TETRA ,17584993,Sat Nov 27 11:32:30 CET,Sat Nov 27 13:30:19 CET,0.0 4.34 5.541 6.465 7.24 7.818 8.305 8.78 9.672 10.071 10.447 10.811 11.471 11.775 12.348 12.878 13.389 13.659 14.18 14.668 15.362 15.784 16.196 16.805 17.401 17.938 18.404 18.854 19.435 20.002 20.555 21.204 21.813 22.407 23.103 23.834 24.549 25.337 26.083 26.834 27.592 28.419 29.38 30.363 31.415 32.289 33.028 33.76 34.399 34.72 34.348 33.088 31.68 30.324 28.964 27.564 26.324 25.208 24.248 23.247 22.312 21.477 20.658 19.85 19.056 18.325 17.592 16.951 16.376 15.723 15.044 14.491 13.913 13.32 12.871 12.394 11.882 11.345 10.768 10.368 9.978 9.403 9.003 8.57 8.337 7.85 7.349 6.829 6.566 5.98 5.72 5.401 5.078 4.302 3.872 3.468 3.039 2.541 1.933 1.16 -1.308 -5 ,28388 ,TETRA ,17584994,Sat Nov 27 11:32:31 CET,Sat Nov 27 13:43:47 CET,0.0 4.401 5.538 6.377 7.088 7.648 8.131 8.598 9.446 9.805 10.13 10.455 11.082 11.361 11.917 12.422 12.879 13.1 13.524 13.939 14.539 14.93 15.314 15.892 16.436 16.931 17.427 17.89 18.449 18.988 19.507 20.129 20.736 21.326 21.966 22.63 23.29 24.062 24.89 25.704 26.502 27.429 28.473 29.392 30.361 31.335 32.408 33.479 34.402 35.139 35.311 34.428 33.184 31.921 30.649 29.396 28.187 26.992 25.944 24.814 23.772 22.801 21.897 21.062 20.249 19.412 18.463 17.667 16.993 16.318 15.612 15.011 14.42 13.82 13.355 12.867 12.369 11.865 11.342 10.971 10.583 9.961 9.516 9.057 8.82 8.327 7.813 7.279 7.013 6.416 6.131 5.811 5.473 4.733 4.314 3.877 3.369 2.743 2.028 1.014 -2.099 -6 ,26712 ,TETRA ,17584995,Sat Nov 27 11:32:31 CET,Sat Nov 27 13:50:32 CET,0.0 4.215 5.366 6.188 6.846 7.419 7.92 8.374 9.19 9.548 9.861 10.096 10.678 10.926 11.363 11.769 12.167 12.375 12.789 13.173 13.701 14.033 14.386 14.93 15.382 15.801 16.222 16.61 17.089 17.548 17.99 18.493 18.966 19.429 19.963 20.512 21.025 21.593 22.137 22.728 23.374 24.064 24.867 25.633 26.427 27.199 27.983 28.703 29.37 29.771 29.516 28.302 26.897 25.524 24.258 23.008 21.841 20.663 19.527 18.463 17.619 16.866 16.094 15.352 14.654 13.962 13.23 12.606 12.06 11.476 10.857 10.317 9.739 9.109 8.63 8.165 7.671 7.155 6.627 6.259 5.878 5.27 4.839 4.386 4.146 3.646 3.101 2.506 2.211 1.591 1.263 0.918 0.552 -0.237 -0.666 -1.126 -1.648 -2.22 -2.85 -3.668 -6.072 -7 ,3601 ,TETRA ,17584996,Sat Nov 27 11:32:34 CET,Sat Nov 27 13:50:35 CET,0.0 6.563 7.43 8.118 8.667 9.128 9.541 9.939 10.676 10.991 11.286 11.505 12.06 12.298 12.771 13.212 13.646 13.848 14.206 14.542 15.041 15.351 15.655 16.115 16.57 17.02 17.436 17.831 18.313 18.731 19.098 19.514 19.937 20.373 20.829 21.318 21.826 22.387 23.006 23.649 24.243 24.867 25.65 26.413 27.271 28.273 29.192 29.969 30.711 31.21 31.22 30.423 29.224 27.88 26.548 25.332 24.187 23.113 22.16 21.025 20.042 19.228 18.456 17.749 17.028 16.324 15.579 14.919 14.31 13.637 12.96 12.421 11.86 11.251 10.783 10.318 9.838 9.32 8.791 8.438 8.067 7.467 7.052 6.619 6.39 5.951 5.495 4.955 4.67 4.041 3.726 3.395 3.03 2.171 1.741 1.332 0.845 0.226 -0.492 -1.522 -4.489 -8 ,7984 ,TETRA ,17584997,Sat Nov 27 11:32:36 CET,Sat Nov 27 13:48:22 CET,0.0 6.063 7.306 8.116 8.738 9.279 9.772 10.229 11.068 11.461 11.815 12.134 12.77 13.077 13.679 14.206 14.691 14.937 15.402 15.827 16.477 16.875 17.228 17.756 18.251 18.707 19.164 19.608 20.177 20.691 21.179 21.795 22.382 22.96 23.641 24.39 25.105 25.848 26.612 27.421 28.281 29.249 30.333 31.389 32.548 33.733 34.929 36.049 37.074 37.911 38.146 37.323 35.948 34.419 33.011 31.564 30.2 28.958 27.766 26.521 25.543 24.728 23.923 23.135 22.391 21.671 20.917 20.274 19.721 19.13 18.522 18.032 17.506 16.937 16.495 16.036 15.582 15.133 14.652 14.318 13.959 13.373 12.969 12.526 12.302 11.85 11.373 10.856 10.57 9.943 9.586 9.209 8.814 7.924 7.429 6.936 6.419 5.83 5.21 4.326 0.928 -9 ,13640 ,TETRA ,17584998,Sat Nov 27 11:32:31 CET,Sat Nov 27 13:50:37 CET,0.0 3.357 4.221 4.896 5.447 5.945 6.415 6.815 7.558 7.925 8.265 8.52 9.12 9.413 9.939 10.397 10.829 11.021 11.364 11.717 12.219 12.524 12.828 13.275 13.693 14.085 14.477 14.851 15.314 15.771 16.199 16.658 17.072 17.47 17.962 18.534 19.075 19.708 20.331 20.918 21.5 22.095 22.822 23.537 24.355 25.227 26.098 26.992 27.853 28.327 28.09 27.011 25.592 24.163 22.851 21.633 20.384 19.065 17.96 16.933 16.023 15.152 14.287 13.403 12.52 11.729 10.976 10.307 9.697 9.086 8.465 7.946 7.397 6.819 6.364 5.88 5.377 4.864 4.333 3.971 3.602 2.976 2.525 2.061 1.805 1.26 0.72 0.14 -0.173 -0.805 -1.113 -1.45 -1.824 -2.627 -3.084 -3.609 -4.205 -4.861 -5.563 -6.559 -9.899 -10 ,18323 ,TETRA ,17584999,Sat Nov 27 11:32:31 CET,Sat Nov 27 13:50:46 CET,0.0 6.629 7.563 8.174 8.659 9.114 9.544 9.932 10.633 10.937 11.217 11.435 12.014 12.26 12.704 13.127 13.532 13.726 14.109 14.472 14.971 15.274 15.59 16.055 16.445 16.823 17.191 17.543 18.011 18.466 18.899 19.37 19.81 20.28 20.863 21.516 22.098 22.665 23.214 23.792 24.413 25.108 25.912 26.677 27.526 28.394 29.177 29.921 30.712 31.215 31.077 30.083 28.719 27.268 25.936 24.698 23.457 22.215 21.124 20.053 19.188 18.362 17.449 16.566 15.754 15.007 14.277 13.594 12.97 12.303 11.645 11.127 10.542 9.927 9.466 8.985 8.463 7.87 7.269 6.884 6.487 5.86 5.401 4.9 4.645 4.145 3.627 3.07 2.773 2.141 1.815 1.469 1.096 0.28 -0.154 -0.637 -1.167 -1.775 -2.512 -3.489 -6.831 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index da9fc28f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11020 ,TETRA ,17585000,Sat Nov 27 11:32:31 CET,Sat Nov 27 13:55:24 CET,0.0 0.905 1.473 1.929 2.289 2.625 2.939 3.224 3.729 3.962 4.194 4.325 4.854 5.068 5.467 5.847 6.232 6.413 6.746 7.077 7.541 7.824 8.106 8.507 8.869 9.212 9.556 9.885 10.286 10.669 11.062 11.521 11.93 12.331 12.789 13.319 13.841 14.374 14.914 15.484 16.084 16.758 17.527 18.24 18.975 19.755 20.622 21.474 22.311 22.971 23.081 22.422 21.442 20.321 19.202 18.17 17.243 16.363 15.501 14.601 13.813 13.074 12.349 11.586 10.867 10.192 9.475 8.848 8.285 7.729 7.178 6.694 6.164 5.586 5.111 4.644 4.18 3.685 3.175 2.826 2.458 1.888 1.477 1.025 0.797 0.348 -0.116 -0.617 -0.874 -1.462 -1.726 -2.037 -2.364 -3.121 -3.546 -3.999 -4.51 -5.07 -5.723 -6.569 -8.96 -2 ,4047 ,TETRA ,17585001,Sat Nov 27 11:32:33 CET,Sat Nov 27 13:55:56 CET,0.0 1.159 1.638 2.018 2.361 2.662 2.944 3.197 3.686 3.921 4.133 4.198 4.71 4.901 5.27 5.624 5.96 6.124 6.445 6.743 7.17 7.446 7.71 8.091 8.454 8.807 9.17 9.515 9.928 10.326 10.737 11.21 11.625 12.048 12.579 13.129 13.603 14.118 14.681 15.294 15.9 16.53 17.229 17.913 18.703 19.528 20.402 21.298 22.156 22.901 23.3 22.962 22.211 21.333 20.432 19.476 18.62 17.828 17.073 16.309 15.614 14.903 14.203 13.593 13.047 12.526 11.957 11.394 10.848 10.282 9.679 9.163 8.645 8.089 7.631 7.201 6.789 6.347 5.882 5.55 5.19 4.624 4.204 3.753 3.53 3.059 2.561 2.064 1.809 1.222 0.963 0.649 0.314 -0.395 -0.784 -1.224 -1.688 -2.191 -2.761 -3.53 -5.989 -3 ,29288 ,TETRA ,17585002,Sat Nov 27 11:32:35 CET,Sat Nov 27 13:41:54 CET,0.0 0.911 1.378 1.775 2.125 2.444 2.746 3.041 3.576 3.82 4.069 4.216 4.751 4.963 5.356 5.732 6.084 6.26 6.623 6.962 7.416 7.704 7.994 8.403 8.798 9.184 9.548 9.893 10.317 10.738 11.148 11.628 12.126 12.612 13.131 13.696 14.235 14.791 15.374 16.02 16.693 17.396 18.127 18.807 19.534 20.282 21.086 21.9 22.677 23.288 23.488 22.678 21.604 20.484 19.328 18.199 17.18 16.303 15.541 14.701 13.946 13.223 12.548 11.955 11.393 10.845 10.216 9.641 9.124 8.561 7.941 7.43 6.919 6.407 6.02 5.576 5.079 4.562 4.024 3.674 3.325 2.741 2.314 1.873 1.657 1.218 0.743 0.219 -0.057 -0.648 -0.9 -1.21 -1.552 -2.334 -2.756 -3.193 -3.688 -4.276 -4.924 -5.709 -7.766 -4 ,10672 ,TETRA ,17585003,Sat Nov 27 11:32:33 CET,Sat Nov 27 13:54:11 CET,0.0 1.143 1.683 2.103 2.474 2.812 3.122 3.391 3.887 4.117 4.331 4.426 4.953 5.143 5.498 5.847 6.187 6.357 6.692 7.011 7.461 7.743 8.013 8.399 8.781 9.154 9.503 9.845 10.28 10.687 11.081 11.545 11.979 12.371 12.824 13.346 13.82 14.336 14.886 15.426 16.006 16.666 17.4 18.09 18.833 19.625 20.44 21.263 22.084 22.726 22.889 22.255 21.293 20.338 19.458 18.537 17.671 16.848 16.105 15.344 14.682 14.041 13.38 12.77 12.2 11.639 11.013 10.452 9.944 9.366 8.746 8.254 7.726 7.155 6.709 6.252 5.799 5.34 4.844 4.497 4.146 3.588 3.192 2.762 2.543 2.097 1.649 1.194 0.945 0.365 0.112 -0.197 -0.524 -1.252 -1.629 -2.027 -2.49 -3.006 -3.611 -4.449 -6.73 -5 ,2995 ,TETRA ,17585004,Sat Nov 27 11:32:34 CET,Sat Nov 27 13:51:48 CET,0.0 1.032 1.522 1.937 2.301 2.626 2.92 3.199 3.746 3.998 4.234 4.372 4.918 5.118 5.506 5.889 6.251 6.426 6.738 7.019 7.437 7.724 8.002 8.373 8.74 9.109 9.464 9.805 10.211 10.605 10.991 11.431 11.849 12.246 12.709 13.252 13.759 14.272 14.796 15.372 16.004 16.676 17.375 18.035 18.772 19.526 20.318 21.139 21.945 22.608 22.821 22.181 21.237 20.184 19.107 18.032 16.974 15.996 15.154 14.179 13.23 12.366 11.55 10.816 10.195 9.659 9.052 8.498 8.014 7.463 6.9 6.468 5.981 5.437 5.019 4.578 4.118 3.634 3.125 2.782 2.426 1.854 1.453 1.041 0.817 0.35 -0.121 -0.625 -0.893 -1.5 -1.754 -2.055 -2.383 -3.114 -3.508 -3.932 -4.375 -4.886 -5.555 -6.392 -8.618 -6 ,3133 ,TETRA ,17585005,Sat Nov 27 11:32:33 CET,Sat Nov 27 13:58:15 CET,0.0 1.22 1.765 2.148 2.483 2.81 3.111 3.395 3.932 4.176 4.401 4.518 5.033 5.227 5.591 5.928 6.256 6.417 6.738 7.062 7.531 7.825 8.105 8.511 8.888 9.241 9.583 9.913 10.333 10.725 11.093 11.541 11.971 12.399 12.904 13.439 13.943 14.489 15.059 15.651 16.28 16.986 17.722 18.379 19.102 19.889 20.702 21.434 22.153 22.766 22.868 22.198 21.231 20.14 19.063 18.018 16.987 15.973 15.091 14.183 13.377 12.648 11.923 11.206 10.51 9.826 9.119 8.479 7.895 7.274 6.637 6.136 5.613 5.067 4.617 4.145 3.671 3.165 2.633 2.265 1.883 1.284 0.851 0.4 0.177 -0.278 -0.76 -1.256 -1.533 -2.159 -2.434 -2.749 -3.082 -3.811 -4.236 -4.711 -5.217 -5.772 -6.41 -7.191 -9.109 -7 ,15728 ,TETRA ,17585006,Sat Nov 27 11:32:32 CET,Sat Nov 27 13:52:07 CET,0.0 1.371 1.943 2.371 2.748 3.082 3.395 3.689 4.192 4.423 4.654 4.787 5.328 5.531 5.899 6.236 6.582 6.752 7.076 7.388 7.826 8.103 8.378 8.777 9.16 9.526 9.868 10.2 10.63 11.047 11.442 11.879 12.3 12.736 13.249 13.788 14.305 14.851 15.394 15.943 16.526 17.212 17.958 18.644 19.398 20.209 21.048 21.903 22.748 23.319 23.294 22.468 21.434 20.372 19.365 18.398 17.461 16.528 15.729 14.971 14.261 13.57 12.934 12.341 11.782 11.262 10.652 10.04 9.516 8.965 8.352 7.861 7.365 6.819 6.375 5.899 5.418 4.933 4.401 4.029 3.659 3.085 2.681 2.264 2.038 1.56 1.087 0.582 0.316 -0.277 -0.56 -0.886 -1.209 -1.932 -2.357 -2.812 -3.278 -3.803 -4.402 -5.195 -7.459 -8 ,20795 ,TETRA ,17585007,Sat Nov 27 11:32:33 CET,Sat Nov 27 13:34:30 CET,0.0 0.809 1.275 1.673 2.026 2.333 2.637 2.942 3.498 3.753 3.982 4.094 4.624 4.826 5.222 5.596 5.954 6.126 6.461 6.785 7.244 7.542 7.825 8.229 8.636 9.024 9.393 9.757 10.219 10.662 11.081 11.558 12.025 12.5 13.026 13.587 14.115 14.677 15.276 15.916 16.561 17.227 17.973 18.7 19.467 20.212 21.0 21.752 22.487 23.173 23.409 22.803 21.821 20.786 19.875 18.897 17.894 16.976 16.143 15.265 14.459 13.673 12.913 12.227 11.583 10.97 10.311 9.716 9.194 8.628 8.031 7.531 6.994 6.421 5.974 5.495 4.986 4.455 3.911 3.548 3.193 2.599 2.164 1.721 1.488 1.027 0.555 0.029 -0.276 -0.908 -1.197 -1.517 -1.856 -2.609 -3.018 -3.459 -3.938 -4.478 -5.109 -5.917 -7.746 -9 ,6465 ,TETRA ,17585008,Sat Nov 27 11:32:33 CET,Sat Nov 27 13:51:53 CET,0.0 1.668 2.306 2.768 3.127 3.436 3.727 4.002 4.512 4.743 4.961 5.051 5.564 5.763 6.144 6.503 6.824 6.977 7.299 7.622 8.078 8.361 8.639 9.048 9.437 9.804 10.154 10.489 10.936 11.374 11.774 12.257 12.715 13.136 13.607 14.144 14.647 15.162 15.72 16.307 16.875 17.48 18.175 18.831 19.516 20.196 20.989 21.837 22.641 23.313 23.511 22.977 22.121 21.121 20.209 19.321 18.44 17.587 16.809 15.985 15.271 14.636 13.967 13.293 12.671 12.111 11.515 10.959 10.474 9.977 9.395 8.886 8.387 7.839 7.406 6.964 6.482 5.968 5.46 5.117 4.737 4.132 3.715 3.29 3.078 2.635 2.143 1.636 1.376 0.771 0.487 0.173 -0.161 -0.879 -1.275 -1.702 -2.186 -2.733 -3.342 -4.169 -6.27 -10 ,18621 ,TETRA ,17585009,Sat Nov 27 11:32:33 CET,Sat Nov 27 13:39:13 CET,0.0 1.394 1.991 2.454 2.81 3.11 3.403 3.688 4.198 4.429 4.653 4.759 5.284 5.478 5.873 6.228 6.565 6.731 7.049 7.363 7.813 8.089 8.359 8.778 9.18 9.544 9.88 10.217 10.651 11.049 11.434 11.896 12.339 12.771 13.287 13.843 14.345 14.883 15.445 16.019 16.651 17.369 18.136 18.823 19.569 20.377 21.218 22.018 22.845 23.582 23.87 23.375 22.577 21.693 20.773 19.868 19.016 18.17 17.362 16.558 15.865 15.202 14.58 13.94 13.317 12.78 12.182 11.618 11.145 10.664 10.125 9.647 9.136 8.592 8.201 7.806 7.387 6.94 6.448 6.105 5.752 5.216 4.864 4.476 4.26 3.803 3.306 2.8 2.532 1.91 1.656 1.353 1.05 0.349 -0.065 -0.491 -0.954 -1.457 -2.005 -2.752 -4.996 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt deleted file mode 100644 index 66b98cc2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15279 ,TETRA ,17585010,Sat Nov 27 11:32:33 CET,Sat Nov 27 13:53:59 CET,0.0 1.53 2.203 2.701 3.154 3.564 3.951 4.308 4.958 5.251 5.521 5.736 6.314 6.548 7.004 7.448 7.867 8.071 8.455 8.823 9.351 9.677 9.983 10.448 10.923 11.366 11.784 12.215 12.768 13.273 13.752 14.33 14.88 15.397 16.02 16.739 17.43 18.179 18.961 19.779 20.64 21.557 22.607 23.684 24.837 26.105 27.43 28.588 29.589 30.134 29.85 28.15 25.848 23.534 21.427 19.598 18.061 16.665 15.394 14.055 12.908 11.893 10.904 9.937 9.037 8.234 7.396 6.644 5.984 5.302 4.6 3.993 3.366 2.712 2.184 1.656 1.115 0.546 -0.03 -0.44 -0.877 -1.555 -2.011 -2.473 -2.714 -3.195 -3.679 -4.228 -4.53 -5.18 -5.537 -5.902 -6.267 -7.093 -7.592 -8.139 -8.703 -9.338 -10.112 -11.034 -13.76 -2 ,13618 ,TETRA ,17585011,Sat Nov 27 11:32:35 CET,Sat Nov 27 13:55:25 CET,0.0 1.442 2.102 2.625 3.084 3.491 3.853 4.189 4.821 5.109 5.398 5.646 6.233 6.488 6.944 7.36 7.757 7.95 8.32 8.696 9.237 9.558 9.878 10.351 10.808 11.249 11.671 12.087 12.63 13.158 13.693 14.344 14.905 15.41 16.021 16.739 17.415 18.109 18.846 19.631 20.445 21.362 22.425 23.415 24.504 25.688 26.952 28.233 29.433 30.287 30.098 28.398 26.203 24.09 22.185 20.325 18.616 17.095 15.796 14.429 13.25 12.216 11.216 10.243 9.327 8.535 7.703 6.915 6.245 5.576 4.849 4.243 3.645 3.005 2.516 2.015 1.476 0.916 0.33 -0.085 -0.506 -1.158 -1.639 -2.187 -2.464 -3.016 -3.595 -4.188 -4.509 -5.168 -5.479 -5.795 -6.125 -6.986 -7.475 -7.987 -8.549 -9.154 -9.933 -11.017 -14.01 -3 ,3364 ,TETRA ,17585012,Sat Nov 27 11:32:38 CET,Sat Nov 27 13:38:49 CET,0.0 2.175 2.912 3.533 4.057 4.502 4.886 5.23 5.858 6.143 6.431 6.657 7.212 7.438 7.882 8.311 8.737 8.958 9.398 9.784 10.294 10.654 11.017 11.51 11.964 12.401 12.846 13.291 13.844 14.34 14.796 15.346 15.899 16.468 17.156 17.912 18.594 19.338 20.141 21.005 21.888 22.815 23.819 24.789 25.938 27.135 28.329 29.44 30.424 31.114 30.883 29.449 27.617 25.632 23.832 22.161 20.563 19.046 17.75 16.454 15.303 14.253 13.249 12.276 11.337 10.492 9.646 8.887 8.22 7.542 6.838 6.225 5.578 4.923 4.415 3.887 3.352 2.794 2.199 1.784 1.352 0.673 0.206 -0.264 -0.517 -1.04 -1.559 -2.121 -2.437 -3.087 -3.392 -3.732 -4.108 -4.924 -5.349 -5.793 -6.292 -6.925 -7.744 -8.835 -12.215 -4 ,24728 ,TETRA ,17585013,Sat Nov 27 11:32:33 CET,Sat Nov 27 13:33:10 CET,0.0 1.922 2.554 3.063 3.509 3.885 4.221 4.555 5.176 5.463 5.755 5.997 6.565 6.791 7.208 7.652 8.07 8.27 8.67 9.042 9.571 9.926 10.271 10.743 11.207 11.679 12.139 12.572 13.135 13.684 14.218 14.869 15.482 16.037 16.657 17.362 18.012 18.698 19.454 20.254 21.019 21.857 22.878 23.888 24.994 26.157 27.37 28.643 29.837 30.47 30.407 29.207 27.658 26.043 24.367 22.619 21.0 19.505 18.184 16.843 15.683 14.657 13.665 12.714 11.839 11.039 10.206 9.438 8.775 8.107 7.407 6.823 6.21 5.59 5.114 4.597 4.053 3.491 2.904 2.51 2.099 1.465 1.021 0.527 0.283 -0.203 -0.73 -1.26 -1.538 -2.18 -2.494 -2.808 -3.167 -4.005 -4.461 -4.962 -5.484 -6.103 -6.819 -7.853 -11.711 -5 ,20397 ,TETRA ,17585014,Sat Nov 27 11:32:33 CET,Sat Nov 27 13:31:54 CET,0.0 1.654 2.279 2.82 3.294 3.712 4.085 4.43 5.064 5.358 5.629 5.828 6.416 6.686 7.207 7.703 8.127 8.329 8.736 9.107 9.634 9.993 10.34 10.813 11.28 11.773 12.276 12.772 13.369 13.902 14.433 15.071 15.705 16.296 16.934 17.673 18.321 18.971 19.694 20.451 21.241 22.103 23.019 23.858 24.787 25.75 26.774 27.836 28.751 29.366 29.127 27.492 25.331 23.227 21.357 19.549 17.85 16.295 14.97 13.651 12.511 11.492 10.515 9.572 8.679 7.858 6.991 6.213 5.556 4.837 4.063 3.45 2.824 2.163 1.652 1.12 0.564 0.002 -0.59 -0.995 -1.395 -2.029 -2.469 -2.934 -3.212 -3.768 -4.272 -4.792 -5.065 -5.699 -6.0 -6.353 -6.709 -7.44 -7.874 -8.378 -8.937 -9.549 -10.225 -11.143 -14.009 -6 ,22913 ,TETRA ,17585015,Sat Nov 27 11:32:34 CET,Sat Nov 27 13:52:36 CET,0.0 1.6 2.29 2.85 3.336 3.769 4.15 4.489 5.111 5.41 5.699 5.922 6.497 6.752 7.24 7.704 8.147 8.351 8.755 9.179 9.815 10.206 10.566 11.084 11.592 12.092 12.584 13.062 13.649 14.189 14.689 15.265 15.814 16.332 16.915 17.563 18.195 18.877 19.562 20.309 21.11 21.963 22.933 23.919 25.027 26.225 27.471 28.612 29.637 30.267 30.233 28.971 26.946 24.853 23.198 21.621 20.025 18.497 17.159 15.815 14.679 13.682 12.716 11.775 10.873 10.057 9.201 8.433 7.766 7.072 6.352 5.767 5.15 4.472 3.937 3.405 2.857 2.275 1.671 1.263 0.834 0.157 -0.292 -0.744 -0.98 -1.511 -2.059 -2.611 -2.919 -3.566 -3.856 -4.192 -4.56 -5.382 -5.826 -6.292 -6.788 -7.384 -8.097 -8.986 -11.659 -7 ,21349 ,TETRA ,17585016,Sat Nov 27 11:33:02 CET,Sat Nov 27 13:41:15 CET,0.0 2.115 2.753 3.279 3.753 4.16 4.514 4.852 5.488 5.789 6.091 6.349 6.939 7.189 7.66 8.088 8.495 8.702 9.125 9.521 10.05 10.379 10.702 11.153 11.582 11.999 12.396 12.783 13.277 13.781 14.271 14.832 15.388 15.939 16.536 17.195 17.861 18.579 19.355 20.139 20.9 21.778 22.802 23.786 24.919 26.114 27.344 28.526 29.511 30.21 30.134 28.76 26.81 24.735 22.925 21.201 19.56 17.984 16.593 15.259 14.141 13.138 12.152 11.171 10.254 9.432 8.573 7.785 7.121 6.463 5.763 5.172 4.555 3.905 3.403 2.893 2.347 1.788 1.219 0.791 0.332 -0.349 -0.807 -1.295 -1.543 -2.05 -2.612 -3.197 -3.498 -4.167 -4.496 -4.828 -5.17 -5.945 -6.37 -6.807 -7.313 -7.938 -8.652 -9.54 -12.299 -8 ,23255 ,TETRA ,17585017,Sat Nov 27 11:33:02 CET,Sat Nov 27 13:54:06 CET,0.0 1.475 2.158 2.673 3.134 3.542 3.908 4.259 4.91 5.199 5.476 5.689 6.25 6.501 6.984 7.429 7.847 8.057 8.475 8.86 9.399 9.753 10.08 10.52 10.94 11.335 11.726 12.138 12.713 13.255 13.733 14.296 14.824 15.316 15.884 16.513 17.117 17.796 18.552 19.315 20.086 20.958 21.964 22.964 24.054 25.184 26.358 27.524 28.605 29.281 29.124 27.862 26.099 24.193 22.386 20.666 19.144 17.724 16.449 15.156 14.03 13.002 12.005 11.089 10.226 9.422 8.585 7.813 7.156 6.479 5.754 5.153 4.541 3.891 3.373 2.856 2.323 1.748 1.159 0.748 0.327 -0.315 -0.791 -1.285 -1.539 -2.119 -2.756 -3.381 -3.716 -4.391 -4.693 -5.05 -5.434 -6.273 -6.741 -7.245 -7.764 -8.352 -9.085 -10.135 -13.332 -9 ,12473 ,TETRA ,17585018,Sat Nov 27 11:33:02 CET,Sat Nov 27 13:53:24 CET,0.0 1.909 2.62 3.151 3.594 4.009 4.395 4.732 5.341 5.634 5.917 6.145 6.723 6.966 7.432 7.877 8.313 8.521 8.925 9.309 9.841 10.174 10.485 10.934 11.399 11.867 12.33 12.771 13.321 13.871 14.399 15.017 15.617 16.205 16.863 17.521 18.135 18.84 19.611 20.404 21.242 22.172 23.205 24.23 25.343 26.527 27.811 28.956 29.896 30.579 30.686 29.242 27.149 25.156 23.352 21.497 19.758 18.201 16.864 15.499 14.322 13.276 12.256 11.295 10.404 9.565 8.677 7.891 7.207 6.495 5.749 5.127 4.504 3.865 3.378 2.868 2.302 1.724 1.132 0.715 0.288 -0.411 -0.941 -1.493 -1.761 -2.319 -2.897 -3.47 -3.754 -4.396 -4.809 -5.189 -5.586 -6.462 -6.903 -7.366 -7.893 -8.528 -9.296 -10.333 -14.329 -10 ,20139 ,TETRA ,17585019,Sat Nov 27 11:33:03 CET,Sat Nov 27 13:53:07 CET,0.0 1.504 2.111 2.611 3.047 3.45 3.842 4.217 4.884 5.179 5.455 5.655 6.23 6.479 6.958 7.399 7.798 7.991 8.373 8.732 9.271 9.613 9.925 10.393 10.859 11.296 11.71 12.104 12.572 13.042 13.547 14.151 14.717 15.24 15.823 16.451 17.03 17.652 18.315 19.012 19.749 20.586 21.521 22.428 23.379 24.256 25.118 25.917 26.589 26.894 26.237 24.373 22.418 20.454 18.557 16.717 15.003 13.467 12.126 10.75 9.556 8.476 7.43 6.415 5.5 4.683 3.824 3.046 2.383 1.694 0.962 0.378 -0.22 -0.851 -1.355 -1.888 -2.435 -2.998 -3.584 -3.984 -4.427 -5.129 -5.587 -6.042 -6.275 -6.783 -7.349 -7.937 -8.218 -8.841 -9.159 -9.541 -9.921 -10.71 -11.153 -11.602 -12.129 -12.811 -13.588 -14.537 -17.182 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 489e5360..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21159 ,TETRA ,17585020,Sat Nov 27 11:33:06 CET,Sat Nov 27 13:48:19 CET,0.0 0.422 0.807 1.125 1.383 1.626 1.865 2.302 2.507 2.718 2.916 3.267 3.435 3.761 4.076 4.384 4.528 4.801 5.068 5.467 5.72 5.971 6.346 6.7 7.042 7.383 7.72 8.144 8.546 8.94 9.429 9.895 10.348 10.882 11.485 12.078 12.734 13.417 14.129 14.895 15.786 16.81 17.804 19.012 20.43 22.037 23.756 25.702 27.98 30.542 32.29 33.082 33.411 33.45 33.324 33.145 32.911 32.626 32.269 31.908 31.595 31.285 31.012 30.773 30.51 30.174 29.828 29.522 29.181 28.83 28.551 28.238 27.889 27.616 27.335 27.032 26.711 26.339 26.094 25.845 25.428 25.153 24.847 24.686 24.37 24.028 23.655 23.461 23.103 22.791 22.522 22.196 21.433 21.031 20.59 20.072 19.432 18.609 17.432 -2 ,25450 ,TETRA ,17585021,Sat Nov 27 11:33:04 CET,Sat Nov 27 13:50:50 CET,0.0 0.414 0.751 1.041 1.296 1.524 1.745 2.158 2.35 2.543 2.744 3.115 3.287 3.62 3.959 4.289 4.445 4.743 5.026 5.436 5.7 5.968 6.351 6.705 7.059 7.403 7.729 8.143 8.546 8.929 9.396 9.874 10.35 10.902 11.515 12.11 12.777 13.492 14.25 15.059 15.984 17.095 18.19 19.458 20.839 22.358 24.137 26.237 28.645 31.409 33.491 34.489 34.916 35.052 35.007 34.823 34.606 34.427 34.167 33.863 33.564 33.252 32.963 32.677 32.38 32.04 31.734 31.482 31.193 30.866 30.574 30.284 29.998 29.735 29.425 29.054 28.655 28.274 28.012 27.726 27.281 26.964 26.594 26.392 25.975 25.533 25.046 24.772 24.328 23.812 23.459 23.107 22.298 21.849 21.321 20.644 19.868 18.927 17.531 -3 ,24020 ,TETRA ,17585022,Sat Nov 27 11:33:03 CET,Sat Nov 27 13:53:40 CET,0.0 0.526 0.933 1.221 1.442 1.67 1.878 2.236 2.428 2.622 2.782 3.135 3.302 3.625 3.936 4.243 4.4 4.706 4.992 5.398 5.659 5.906 6.254 6.6 6.951 7.29 7.61 8.026 8.423 8.814 9.29 9.747 10.192 10.705 11.298 11.869 12.491 13.184 13.955 14.774 15.7 16.808 17.891 19.099 20.473 22.119 24.006 26.232 28.686 31.434 33.56 34.521 34.89 34.956 34.898 34.781 34.598 34.356 34.08 33.813 33.542 33.25 32.955 32.633 32.272 31.917 31.643 31.403 31.139 30.853 30.589 30.293 29.967 29.698 29.388 29.06 28.733 28.359 28.085 27.798 27.317 27.015 26.75 26.603 26.271 25.922 25.535 25.329 24.959 24.628 24.334 23.969 23.155 22.712 22.192 21.617 20.936 20.007 18.538 -4 ,3515 ,TETRA ,17585023,Sat Nov 27 11:33:06 CET,Sat Nov 27 13:49:32 CET,0.0 0.485 0.844 1.159 1.429 1.668 1.909 2.361 2.55 2.733 2.91 3.272 3.45 3.783 4.09 4.391 4.537 4.812 5.088 5.484 5.73 5.973 6.331 6.669 7.017 7.351 7.657 8.064 8.454 8.845 9.338 9.819 10.281 10.799 11.379 11.955 12.589 13.265 13.997 14.767 15.645 16.698 17.764 18.995 20.332 21.862 23.597 25.587 27.94 30.696 32.651 33.589 33.949 34.038 33.982 33.729 33.366 33.021 32.661 32.283 31.898 31.517 31.131 30.763 30.403 30.03 29.691 29.37 29.03 28.669 28.357 27.988 27.595 27.327 27.065 26.764 26.425 26.064 25.824 25.582 25.199 24.932 24.632 24.456 24.06 23.6 23.073 22.827 22.448 22.02 21.713 21.417 20.788 20.429 20.02 19.516 18.888 18.11 17.061 -5 ,19882 ,TETRA ,17585024,Sat Nov 27 11:33:07 CET,Sat Nov 27 13:50:08 CET,0.0 0.488 0.872 1.2 1.49 1.747 1.988 2.427 2.633 2.838 3.069 3.459 3.649 3.998 4.302 4.6 4.748 5.031 5.312 5.713 5.964 6.206 6.558 6.912 7.262 7.605 7.93 8.347 8.771 9.18 9.674 10.149 10.608 11.144 11.731 12.295 12.917 13.573 14.293 15.083 15.991 17.073 18.151 19.401 20.808 22.414 24.252 26.421 28.887 31.654 33.579 34.354 34.597 34.678 34.638 34.554 34.433 34.231 33.946 33.66 33.364 33.046 32.738 32.411 32.064 31.71 31.38 31.086 30.788 30.444 30.146 29.86 29.585 29.34 29.057 28.767 28.471 28.149 27.907 27.654 27.21 26.887 26.539 26.325 25.866 25.381 24.874 24.623 24.192 23.66 23.297 22.93 22.158 21.709 21.198 20.624 20.024 19.258 17.994 -6 ,9811 ,TETRA ,17585025,Sat Nov 27 11:33:07 CET,Sat Nov 27 13:49:08 CET,0.0 0.463 0.827 1.172 1.474 1.761 2.029 2.473 2.676 2.871 3.065 3.436 3.607 3.955 4.29 4.607 4.766 5.073 5.365 5.8 6.083 6.357 6.767 7.167 7.557 7.932 8.289 8.75 9.209 9.649 10.168 10.697 11.227 11.829 12.512 13.185 13.923 14.709 15.545 16.458 17.51 18.675 19.764 20.997 22.384 23.989 25.767 27.838 30.176 32.72 34.567 35.444 35.877 35.991 35.895 35.751 35.543 35.251 34.912 34.622 34.313 33.972 33.649 33.315 32.978 32.647 32.345 32.053 31.745 31.392 31.083 30.774 30.436 30.163 29.883 29.583 29.265 28.915 28.671 28.446 28.069 27.78 27.469 27.315 26.998 26.631 26.241 26.032 25.678 25.344 25.077 24.828 24.253 23.917 23.539 23.008 22.351 21.52 20.192 -7 ,23323 ,TETRA ,17585026,Sat Nov 27 11:33:04 CET,Sat Nov 27 13:50:10 CET,0.0 0.401 0.737 1.049 1.332 1.599 1.848 2.304 2.521 2.721 2.907 3.27 3.433 3.759 4.067 4.365 4.51 4.803 5.083 5.488 5.75 5.997 6.372 6.753 7.116 7.463 7.797 8.231 8.641 9.026 9.489 9.944 10.397 10.916 11.495 12.058 12.678 13.359 14.092 14.866 15.742 16.759 17.787 19.012 20.381 21.906 23.634 25.659 27.958 30.664 32.736 33.768 34.201 34.283 34.247 34.151 33.991 33.765 33.474 33.203 32.94 32.649 32.334 32.02 31.71 31.367 31.05 30.754 30.408 30.02 29.698 29.385 29.067 28.795 28.518 28.237 27.943 27.644 27.401 27.103 26.584 26.228 25.842 25.652 25.275 24.85 24.397 24.153 23.764 23.348 23.048 22.736 22.036 21.601 21.101 20.622 19.951 18.939 17.561 -8 ,10514 ,TETRA ,17585027,Sat Nov 27 11:33:05 CET,Sat Nov 27 13:54:11 CET,0.0 0.395 0.742 1.095 1.387 1.639 1.892 2.331 2.54 2.731 2.862 3.214 3.39 3.758 4.096 4.404 4.551 4.854 5.149 5.557 5.813 6.055 6.417 6.785 7.146 7.506 7.852 8.287 8.723 9.157 9.682 10.179 10.648 11.183 11.785 12.367 13.007 13.696 14.437 15.237 16.126 17.165 18.226 19.482 20.887 22.469 24.228 26.279 28.607 31.191 33.108 34.039 34.483 34.629 34.594 34.455 34.196 33.917 33.648 33.384 33.105 32.797 32.467 32.136 31.823 31.484 31.176 30.902 30.604 30.292 30.026 29.742 29.43 29.182 28.932 28.67 28.384 28.092 27.879 27.63 27.26 26.991 26.636 26.457 26.148 25.821 25.421 25.185 24.777 24.352 24.056 23.714 22.921 22.49 22.008 21.358 20.591 19.766 18.514 -9 ,30448 ,TETRA ,17585028,Sat Nov 27 11:33:04 CET,Sat Nov 27 13:48:11 CET,0.0 0.446 0.779 1.087 1.373 1.641 1.879 2.354 2.588 2.787 2.936 3.287 3.457 3.795 4.131 4.45 4.595 4.877 5.16 5.595 5.873 6.123 6.474 6.811 7.135 7.458 7.785 8.22 8.645 9.059 9.556 10.029 10.497 11.039 11.635 12.21 12.859 13.568 14.313 15.099 15.986 17.018 18.033 19.23 20.618 22.247 24.058 26.09 28.395 31.056 32.829 33.464 33.714 33.76 33.625 33.367 33.081 32.766 32.399 32.105 31.823 31.512 31.223 30.945 30.664 30.35 30.064 29.797 29.488 29.184 28.929 28.648 28.326 28.07 27.792 27.488 27.136 26.735 26.481 26.257 25.929 25.659 25.339 25.15 24.722 24.278 23.779 23.531 23.148 22.785 22.509 22.197 21.509 21.103 20.661 20.188 19.612 18.876 17.766 -10 ,30230 ,TETRA ,17585029,Sat Nov 27 11:33:04 CET,Sat Nov 27 13:48:59 CET,0.0 0.4 0.719 1.021 1.3 1.545 1.764 2.184 2.375 2.557 2.728 3.079 3.251 3.574 3.885 4.191 4.337 4.621 4.898 5.319 5.579 5.82 6.17 6.505 6.835 7.159 7.478 7.904 8.309 8.696 9.171 9.626 10.073 10.603 11.201 11.798 12.471 13.165 13.889 14.645 15.51 16.539 17.563 18.742 20.069 21.627 23.313 25.248 27.53 30.078 31.765 32.426 32.655 32.668 32.55 32.361 32.129 31.88 31.608 31.316 31.023 30.728 30.418 30.097 29.774 29.436 29.114 28.842 28.55 28.213 27.919 27.611 27.309 27.045 26.754 26.469 26.158 25.8 25.55 25.306 24.918 24.63 24.321 24.161 23.837 23.48 23.047 22.8 22.402 22.028 21.72 21.358 20.524 20.03 19.462 18.725 17.879 16.827 15.137 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt deleted file mode 100644 index 803a7fc0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6041 ,TETRA ,17585030,Sat Nov 27 11:33:06 CET,Sat Nov 27 13:49:51 CET,0.0 0.428 0.826 1.157 1.423 1.684 1.937 2.378 2.575 2.772 2.962 3.326 3.497 3.856 4.231 4.586 4.749 5.059 5.36 5.792 6.073 6.354 6.774 7.18 7.569 7.94 8.309 8.798 9.273 9.734 10.294 10.845 11.381 12.006 12.711 13.383 14.123 14.934 15.82 16.785 17.905 19.249 20.622 22.22 24.023 26.178 28.671 31.626 35.21 39.498 42.999 45.105 46.484 47.332 47.861 48.202 48.373 48.445 48.489 48.439 48.285 48.127 47.993 47.864 47.724 47.548 47.382 47.216 47.03 46.836 46.658 46.457 46.22 46.037 45.854 45.649 45.418 45.171 45.014 44.857 44.588 44.379 44.146 44.024 43.731 43.378 42.996 42.796 42.471 42.131 41.885 41.636 41.013 40.628 40.213 39.762 39.202 38.488 37.504 -2 ,29785 ,TETRA ,17585031,Sat Nov 27 11:33:08 CET,Sat Nov 27 13:48:59 CET,0.0 0.419 0.777 1.104 1.376 1.621 1.843 2.253 2.451 2.647 2.831 3.202 3.39 3.776 4.145 4.488 4.65 4.968 5.277 5.713 6.011 6.305 6.719 7.12 7.502 7.872 8.241 8.724 9.197 9.671 10.25 10.803 11.341 11.979 12.699 13.414 14.182 15.007 15.899 16.844 17.955 19.283 20.613 22.183 23.955 26.042 28.527 31.507 35.067 39.5 43.121 45.203 46.458 47.239 47.766 48.093 48.273 48.342 48.35 48.299 48.199 48.063 47.903 47.744 47.574 47.367 47.164 46.986 46.783 46.547 46.337 46.104 45.869 45.677 45.472 45.258 45.022 44.767 44.585 44.368 43.977 43.702 43.398 43.245 42.935 42.56 42.113 41.89 41.563 41.307 41.102 40.841 40.225 39.904 39.561 39.11 38.483 37.751 36.728 -3 ,13077 ,TETRA ,17585032,Sat Nov 27 11:33:06 CET,Sat Nov 27 13:50:17 CET,0.0 0.429 0.762 1.064 1.358 1.617 1.859 2.317 2.524 2.721 2.907 3.268 3.451 3.79 4.102 4.409 4.565 4.876 5.172 5.58 5.852 6.131 6.531 6.921 7.306 7.68 8.045 8.518 8.985 9.444 9.989 10.528 11.07 11.708 12.425 13.094 13.829 14.67 15.576 16.538 17.646 18.965 20.319 21.888 23.63 25.695 28.167 31.137 34.741 39.304 42.91 44.966 46.288 47.045 47.42 47.611 47.742 47.808 47.836 47.819 47.761 47.675 47.557 47.421 47.274 47.103 46.932 46.734 46.504 46.275 46.084 45.901 45.705 45.547 45.369 45.156 44.929 44.688 44.525 44.361 44.092 43.898 43.684 43.567 43.33 43.076 42.777 42.617 42.331 42.086 41.87 41.633 41.121 40.86 40.544 40.179 39.719 38.953 37.832 -4 ,24173 ,TETRA ,17585033,Sat Nov 27 11:33:06 CET,Sat Nov 27 13:49:02 CET,0.0 0.418 0.768 1.065 1.335 1.594 1.837 2.282 2.482 2.68 2.859 3.219 3.387 3.708 4.024 4.34 4.499 4.805 5.085 5.502 5.773 6.035 6.436 6.832 7.207 7.562 7.908 8.365 8.814 9.252 9.802 10.342 10.862 11.471 12.17 12.84 13.588 14.411 15.295 16.238 17.296 18.561 19.867 21.43 23.233 25.347 27.737 30.569 34.025 38.217 41.589 43.584 44.831 45.557 45.973 46.203 46.306 46.335 46.262 46.123 46.002 45.87 45.699 45.508 45.309 45.062 44.805 44.575 44.343 44.08 43.84 43.578 43.317 43.116 42.889 42.627 42.349 42.079 41.878 41.641 41.272 41.034 40.781 40.65 40.353 40.02 39.652 39.453 39.135 38.844 38.626 38.403 37.834 37.47 37.08 36.658 36.172 35.561 34.669 -5 ,9325 ,TETRA ,17585034,Sat Nov 27 11:33:07 CET,Sat Nov 27 13:50:27 CET,0.0 0.381 0.737 1.061 1.336 1.598 1.853 2.318 2.523 2.722 2.927 3.298 3.476 3.837 4.192 4.518 4.674 4.971 5.269 5.714 5.999 6.275 6.666 7.047 7.44 7.83 8.21 8.707 9.194 9.667 10.227 10.768 11.304 11.936 12.654 13.358 14.12 14.933 15.822 16.759 17.834 19.092 20.366 21.871 23.575 25.613 28.002 30.849 34.216 38.323 41.649 43.598 44.739 45.392 45.794 46.006 46.067 46.051 46.02 45.926 45.784 45.637 45.466 45.252 45.04 44.797 44.537 44.294 44.048 43.804 43.571 43.301 43.006 42.756 42.508 42.285 42.052 41.778 41.588 41.396 41.073 40.849 40.615 40.493 40.23 39.957 39.672 39.506 39.191 38.899 38.676 38.409 37.707 37.338 36.934 36.445 35.897 35.181 34.093 -6 ,13261 ,TETRA ,17585035,Sat Nov 27 11:34:47 CET,Sat Nov 27 13:52:19 CET,0.0 0.412 0.748 1.06 1.337 1.603 1.859 2.31 2.519 2.713 2.903 3.282 3.473 3.842 4.187 4.514 4.672 4.978 5.278 5.716 5.999 6.284 6.698 7.098 7.486 7.869 8.238 8.713 9.186 9.644 10.201 10.752 11.292 11.945 12.685 13.384 14.15 15.0 15.92 16.886 18.002 19.312 20.639 22.232 24.033 26.107 28.476 31.29 34.729 38.976 42.354 44.23 45.379 46.108 46.569 46.797 46.899 46.943 46.921 46.835 46.708 46.558 46.411 46.249 46.087 45.904 45.681 45.453 45.21 44.947 44.713 44.478 44.251 44.054 43.834 43.616 43.368 43.064 42.853 42.643 42.321 42.101 41.848 41.72 41.42 41.064 40.728 40.541 40.204 39.895 39.639 39.373 38.816 38.466 38.066 37.596 37.048 36.392 35.403 -7 ,27942 ,TETRA ,17585036,Sat Nov 27 11:34:50 CET,Sat Nov 27 13:51:57 CET,0.0 0.403 0.753 1.073 1.356 1.609 1.852 2.305 2.514 2.72 2.924 3.293 3.485 3.845 4.179 4.517 4.683 4.998 5.296 5.737 6.025 6.308 6.721 7.123 7.523 7.912 8.286 8.764 9.242 9.709 10.266 10.806 11.344 11.97 12.662 13.335 14.093 14.925 15.821 16.797 17.907 19.203 20.545 22.136 23.919 26.018 28.436 31.297 34.813 39.251 42.925 45.06 46.358 47.186 47.737 48.031 48.198 48.292 48.308 48.287 48.214 48.087 47.967 47.822 47.637 47.428 47.219 47.029 46.826 46.586 46.368 46.12 45.842 45.643 45.445 45.226 44.939 44.608 44.398 44.2 43.893 43.662 43.416 43.276 42.978 42.689 42.382 42.223 41.924 41.666 41.453 41.224 40.648 40.35 39.981 39.494 39.023 38.454 37.55 -8 ,23646 ,TETRA ,17585037,Sat Nov 27 11:34:47 CET,Sat Nov 27 13:52:20 CET,0.0 0.477 0.844 1.128 1.382 1.612 1.839 2.259 2.459 2.656 2.843 3.211 3.391 3.733 4.06 4.379 4.534 4.835 5.132 5.566 5.847 6.123 6.528 6.913 7.285 7.655 8.004 8.453 8.909 9.358 9.9 10.427 10.942 11.554 12.27 12.968 13.715 14.51 15.391 16.341 17.412 18.705 20.048 21.643 23.481 25.592 27.981 30.843 34.229 38.31 41.732 43.655 44.715 45.318 45.677 45.867 45.95 45.924 45.794 45.629 45.456 45.273 45.092 44.893 44.68 44.43 44.2 44.003 43.784 43.513 43.264 42.991 42.69 42.462 42.241 42.03 41.807 41.547 41.345 41.127 40.773 40.515 40.248 40.108 39.834 39.517 39.137 38.923 38.58 38.279 38.065 37.832 37.254 36.906 36.455 35.917 35.378 34.771 33.966 -9 ,4137 ,TETRA ,17585038,Sat Nov 27 11:34:49 CET,Sat Nov 27 13:53:05 CET,0.0 0.468 0.829 1.138 1.416 1.675 1.922 2.384 2.604 2.815 3.031 3.402 3.578 3.929 4.26 4.589 4.753 5.07 5.378 5.812 6.084 6.358 6.781 7.194 7.592 7.977 8.344 8.821 9.298 9.753 10.309 10.863 11.391 12.003 12.707 13.401 14.188 15.042 15.949 16.928 18.072 19.425 20.815 22.473 24.315 26.498 29.065 32.082 35.715 40.099 43.643 45.791 47.12 47.88 48.382 48.685 48.829 48.91 48.922 48.851 48.78 48.703 48.586 48.469 48.344 48.163 47.972 47.807 47.637 47.441 47.265 47.067 46.82 46.596 46.38 46.165 45.934 45.675 45.483 45.285 44.947 44.686 44.428 44.304 44.043 43.758 43.441 43.27 42.971 42.72 42.506 42.283 41.819 41.539 41.145 40.645 40.067 39.319 38.152 -10 ,28936 ,TETRA ,17585039,Sat Nov 27 11:34:48 CET,Sat Nov 27 13:52:20 CET,0.0 0.422 0.82 1.148 1.428 1.697 1.93 2.349 2.548 2.748 2.967 3.353 3.546 3.889 4.204 4.515 4.668 4.973 5.272 5.695 5.966 6.236 6.638 7.04 7.43 7.807 8.181 8.67 9.143 9.596 10.146 10.686 11.205 11.827 12.541 13.22 13.979 14.82 15.724 16.687 17.773 19.029 20.359 21.955 23.675 25.727 28.111 30.921 34.344 38.669 42.177 44.053 45.175 45.88 46.277 46.515 46.666 46.706 46.652 46.537 46.42 46.284 46.103 45.868 45.641 45.406 45.171 44.949 44.706 44.454 44.241 43.993 43.716 43.506 43.276 43.043 42.803 42.519 42.324 42.125 41.79 41.557 41.287 41.141 40.849 40.546 40.224 40.037 39.712 39.432 39.214 38.969 38.413 38.103 37.769 37.348 36.861 36.324 35.674 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index fbc855f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26811 ,TETRA ,17618506,Tue Nov 30 14:21:09 CET,Tue Nov 30 16:38:25 CET,0.0 1.377 1.952 2.407 2.826 3.224 3.577 3.919 4.567 4.852 5.133 5.306 5.948 6.209 6.722 7.213 7.699 7.942 8.41 8.862 9.525 9.954 10.367 10.972 11.575 12.181 12.782 13.364 14.101 14.824 15.536 16.417 17.279 18.109 19.101 20.253 21.37 22.603 23.955 25.406 26.926 28.669 30.778 32.936 35.492 38.428 41.93 45.981 50.805 56.572 63.676 69.672 73.175 75.415 76.85 77.789 78.42 78.759 78.887 78.952 78.882 78.678 78.42 78.185 77.934 77.663 77.351 77.039 76.792 76.532 76.19 75.873 75.542 75.185 74.9 74.613 74.3 73.943 73.557 73.291 73.018 72.545 72.19 71.809 71.608 71.2 70.765 70.29 70.036 69.449 69.189 68.876 68.515 67.548 66.963 66.328 65.676 64.919 63.839 62.146 57.106 -2 ,18388 ,TETRA ,17618507,Tue Nov 30 14:21:09 CET,Tue Nov 30 16:31:39 CET,0.0 1.156 1.712 2.201 2.657 3.082 3.458 3.813 4.478 4.784 5.077 5.261 5.921 6.19 6.716 7.215 7.695 7.922 8.37 8.82 9.481 9.913 10.338 10.978 11.604 12.214 12.81 13.382 14.136 14.897 15.631 16.516 17.396 18.255 19.264 20.433 21.58 22.858 24.258 25.764 27.38 29.257 31.514 33.835 36.606 39.747 43.419 47.553 52.504 58.685 66.381 72.918 76.659 78.848 80.227 81.128 81.686 82.047 82.243 82.243 82.105 81.976 81.864 81.749 81.591 81.352 81.034 80.724 80.423 80.099 79.798 79.544 79.202 78.803 78.493 78.168 77.806 77.418 77.024 76.75 76.455 75.968 75.63 75.279 75.083 74.668 74.229 73.752 73.504 72.92 72.62 72.254 71.894 71.184 70.732 70.158 69.428 68.623 67.744 66.588 61.688 -3 ,22777 ,TETRA ,17618508,Tue Nov 30 14:21:11 CET,Tue Nov 30 16:38:49 CET,0.0 1.204 1.775 2.269 2.715 3.092 3.433 3.766 4.417 4.723 5.01 5.169 5.833 6.093 6.61 7.113 7.601 7.843 8.317 8.789 9.479 9.928 10.363 10.989 11.616 12.229 12.818 13.387 14.133 14.86 15.572 16.462 17.321 18.168 19.184 20.344 21.449 22.69 24.077 25.575 27.194 29.044 31.234 33.538 36.27 39.337 43.012 47.189 52.161 58.416 66.325 72.828 76.678 79.152 80.723 81.799 82.52 82.91 83.103 83.201 83.174 83.101 82.962 82.766 82.558 82.35 82.135 81.906 81.673 81.421 81.088 80.772 80.463 80.131 79.823 79.484 79.131 78.752 78.356 78.069 77.765 77.3 76.97 76.62 76.443 76.04 75.567 75.055 74.8 74.224 73.948 73.619 73.266 72.419 71.957 71.435 70.83 70.125 69.235 67.913 62.356 -4 ,27200 ,TETRA ,17618509,Tue Nov 30 14:22:06 CET,Tue Nov 30 16:38:24 CET,0.0 1.242 1.81 2.252 2.675 3.07 3.439 3.781 4.426 4.722 5.002 5.177 5.816 6.073 6.588 7.083 7.562 7.797 8.259 8.721 9.397 9.822 10.248 10.876 11.476 12.063 12.633 13.198 13.951 14.7 15.421 16.309 17.184 18.051 19.082 20.236 21.354 22.609 23.971 25.43 27.005 28.83 30.987 33.185 35.836 38.877 42.483 46.681 51.676 57.709 65.264 71.479 75.0 77.07 78.294 79.184 79.827 80.226 80.485 80.622 80.586 80.497 80.4 80.271 80.085 79.863 79.58 79.288 79.025 78.74 78.403 78.093 77.794 77.487 77.221 76.953 76.678 76.352 75.96 75.682 75.399 74.942 74.626 74.301 74.12 73.722 73.306 72.868 72.629 72.026 71.672 71.293 70.865 69.948 69.468 68.953 68.394 67.711 66.719 65.148 56.252 -5 ,341 ,TETRA ,17618510,Tue Nov 30 14:22:06 CET,Tue Nov 30 16:36:48 CET,0.0 1.378 1.988 2.461 2.895 3.307 3.688 4.037 4.683 4.996 5.298 5.505 6.172 6.451 6.998 7.509 8.009 8.259 8.748 9.217 9.903 10.348 10.786 11.425 12.036 12.63 13.223 13.804 14.56 15.308 16.06 16.974 17.85 18.711 19.723 20.878 22.02 23.317 24.733 26.255 27.874 29.709 31.91 34.156 36.87 40.07 43.814 48.122 53.382 59.979 68.292 75.122 79.091 81.67 83.358 84.413 85.098 85.557 85.838 86.005 86.038 85.961 85.757 85.443 85.089 84.761 84.398 84.065 83.786 83.482 83.163 82.895 82.604 82.291 82.015 81.717 81.396 81.046 80.694 80.456 80.198 79.735 79.38 78.996 78.797 78.388 77.927 77.448 77.201 76.613 76.319 75.983 75.612 74.774 74.306 73.787 73.204 72.539 71.698 70.552 60.951 -6 ,24526 ,TETRA ,17618512,Tue Nov 30 14:22:06 CET,Tue Nov 30 16:31:16 CET,0.0 1.213 1.848 2.333 2.736 3.118 3.489 3.831 4.46 4.754 5.045 5.223 5.885 6.159 6.697 7.209 7.686 7.923 8.395 8.847 9.513 9.955 10.401 11.056 11.694 12.322 12.931 13.532 14.32 15.071 15.788 16.669 17.543 18.421 19.462 20.638 21.767 23.017 24.395 25.899 27.518 29.388 31.601 33.841 36.531 39.554 43.041 47.144 52.174 58.392 66.196 72.737 76.622 78.991 80.351 81.221 81.732 82.015 82.147 82.114 82.07 82.023 81.886 81.691 81.492 81.278 80.987 80.742 80.488 80.201 79.914 79.629 79.312 78.966 78.677 78.387 78.11 77.801 77.427 77.145 76.866 76.441 76.137 75.821 75.655 75.277 74.83 74.335 74.083 73.496 73.225 72.896 72.464 71.434 70.81 70.068 69.271 68.379 67.209 65.789 60.21 -7 ,23580 ,TETRA ,17618513,Tue Nov 30 14:22:05 CET,Tue Nov 30 16:27:39 CET,0.0 1.023 1.583 2.086 2.519 2.919 3.293 3.642 4.31 4.643 4.971 5.166 5.83 6.11 6.651 7.17 7.672 7.922 8.398 8.858 9.554 10.011 10.451 11.094 11.72 12.331 12.936 13.523 14.272 15.007 15.72 16.577 17.424 18.284 19.309 20.474 21.59 22.849 24.261 25.757 27.352 29.206 31.471 33.849 36.661 39.828 43.577 47.905 53.011 59.015 66.154 72.134 75.77 77.971 79.304 80.251 80.867 81.216 81.381 81.456 81.428 81.29 81.14 80.973 80.778 80.575 80.303 80.014 79.771 79.477 79.126 78.841 78.515 78.199 77.99 77.77 77.493 77.171 76.821 76.582 76.346 75.952 75.674 75.353 75.163 74.746 74.28 73.823 73.583 73.029 72.799 72.478 72.125 71.188 70.583 69.907 69.102 68.103 66.931 65.403 53.022 -8 ,22226 ,TETRA ,17618514,Tue Nov 30 14:23:07 CET,Tue Nov 30 16:38:16 CET,0.0 1.215 1.84 2.369 2.815 3.221 3.595 3.959 4.636 4.946 5.236 5.411 6.073 6.345 6.885 7.406 7.914 8.16 8.629 9.096 9.784 10.236 10.68 11.317 11.933 12.528 13.118 13.706 14.467 15.22 15.97 16.884 17.769 18.621 19.607 20.758 21.905 23.163 24.562 26.104 27.727 29.574 31.796 34.082 36.844 40.077 43.853 48.091 53.176 59.488 67.435 74.194 78.274 80.903 82.541 83.511 84.097 84.44 84.584 84.603 84.53 84.385 84.19 83.918 83.586 83.289 83.016 82.794 82.575 82.307 82.037 81.815 81.522 81.141 80.823 80.465 80.085 79.712 79.335 79.076 78.797 78.314 77.976 77.619 77.433 77.066 76.625 76.148 75.906 75.326 75.097 74.817 74.522 73.812 73.406 72.963 72.417 71.741 70.734 69.168 63.105 -9 ,24424 ,TETRA ,17618515,Tue Nov 30 14:23:08 CET,Tue Nov 30 16:36:50 CET,0.0 1.068 1.642 2.146 2.604 3.015 3.397 3.75 4.385 4.676 4.965 5.16 5.821 6.094 6.622 7.137 7.637 7.876 8.344 8.81 9.504 9.965 10.417 11.059 11.672 12.263 12.848 13.425 14.177 14.916 15.646 16.531 17.385 18.251 19.273 20.429 21.565 22.812 24.177 25.676 27.296 29.163 31.37 33.649 36.347 39.406 43.051 47.303 52.516 58.935 66.838 73.231 76.959 79.42 81.008 82.005 82.689 83.169 83.453 83.659 83.716 83.699 83.676 83.593 83.465 83.338 83.155 82.938 82.725 82.456 82.121 81.837 81.538 81.199 80.928 80.657 80.359 80.018 79.671 79.419 79.134 78.665 78.33 77.963 77.766 77.338 76.861 76.363 76.081 75.453 75.102 74.744 74.386 73.453 72.876 72.294 71.633 70.736 69.684 67.949 61.421 -10 ,31956 ,TETRA ,17618516,Tue Nov 30 14:23:07 CET,Tue Nov 30 16:41:09 CET,0.0 0.907 1.475 1.941 2.355 2.739 3.112 3.459 4.096 4.394 4.69 4.887 5.537 5.797 6.3 6.799 7.301 7.548 8.025 8.484 9.148 9.58 10.006 10.644 11.272 11.883 12.474 13.06 13.838 14.608 15.374 16.29 17.168 18.035 19.048 20.211 21.359 22.609 23.993 25.508 27.113 28.959 31.119 33.31 35.962 38.993 42.608 46.909 52.055 58.29 66.102 72.567 76.323 78.651 80.082 80.996 81.528 81.82 82.002 82.075 82.071 82.022 81.883 81.74 81.534 81.256 80.943 80.633 80.349 80.027 79.664 79.344 78.999 78.632 78.344 78.026 77.645 77.231 76.811 76.515 76.171 75.637 75.288 74.883 74.661 74.226 73.81 73.381 73.157 72.601 72.376 72.051 71.695 70.967 70.568 70.13 69.593 68.963 68.287 67.306 62.991 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt deleted file mode 100644 index d87a9877..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14303 ,TETRA ,17664512,Thu Dec 2 13:36:12 CET,Thu Dec 2 15:49:24 CET,0.0 1.645 2.318 2.852 3.301 3.701 4.096 4.482 5.206 5.553 5.896 6.165 6.862 7.161 7.731 8.29 8.842 9.121 9.659 10.178 10.974 11.495 11.992 12.71 13.393 14.063 14.708 15.322 16.108 16.858 17.579 18.454 19.308 20.133 21.099 22.209 23.311 24.552 25.877 27.29 28.826 30.584 32.67 34.801 37.314 40.221 43.699 47.713 52.567 58.403 65.82 72.168 75.846 78.135 79.583 80.559 81.248 81.732 82.016 82.187 82.273 82.311 82.212 82.029 81.835 81.599 81.37 81.155 80.901 80.606 80.282 79.979 79.644 79.294 79.009 78.711 78.382 78.025 77.656 77.4 77.129 76.687 76.379 76.066 75.899 75.514 75.11 74.73 74.53 73.989 73.767 73.475 73.199 72.627 72.302 71.912 71.409 70.754 70.025 68.969 66.076 -2 ,11898 ,TETRA ,17664513,Thu Dec 2 13:36:12 CET,Thu Dec 2 15:41:29 CET,0.0 1.481 2.217 2.84 3.362 3.805 4.228 4.653 5.406 5.739 6.066 6.299 6.992 7.298 7.897 8.458 8.978 9.236 9.742 10.237 10.981 11.463 11.926 12.598 13.25 13.905 14.544 15.163 15.966 16.771 17.582 18.554 19.468 20.36 21.417 22.627 23.797 25.097 26.543 28.082 29.715 31.621 33.881 36.195 38.982 42.165 45.877 49.972 54.815 60.763 68.183 74.457 78.071 80.349 81.746 82.692 83.406 83.795 83.946 84.03 84.018 83.945 83.814 83.63 83.433 83.236 83.002 82.742 82.477 82.189 81.86 81.562 81.271 80.979 80.747 80.486 80.182 79.866 79.533 79.293 79.04 78.631 78.337 78.022 77.862 77.53 77.179 76.78 76.568 76.052 75.898 75.594 75.251 74.547 74.155 73.67 73.109 72.46 71.596 70.468 66.697 -3 ,25051 ,TETRA ,17664514,Thu Dec 2 13:36:13 CET,Thu Dec 2 16:11:25 CET,0.0 1.659 2.418 3.059 3.586 4.054 4.493 4.884 5.595 5.943 6.282 6.559 7.259 7.574 8.187 8.757 9.275 9.53 10.028 10.528 11.259 11.732 12.208 12.899 13.602 14.298 14.968 15.607 16.408 17.187 17.972 18.926 19.828 20.702 21.733 22.926 24.085 25.366 26.788 28.333 29.923 31.753 33.999 36.306 39.046 42.198 45.931 50.237 55.449 61.898 70.084 77.141 81.374 83.946 85.566 86.627 87.27 87.675 87.825 87.889 87.952 87.85 87.681 87.518 87.342 87.195 86.976 86.68 86.429 86.171 85.842 85.55 85.232 84.882 84.593 84.299 83.961 83.563 83.161 82.888 82.602 82.09 81.698 81.304 81.12 80.768 80.382 79.964 79.733 79.148 78.844 78.541 78.261 77.678 77.365 77.011 76.57 76.089 75.397 74.337 70.958 -4 ,27067 ,TETRA ,17664515,Thu Dec 2 13:36:13 CET,Thu Dec 2 15:54:15 CET,0.0 1.586 2.259 2.795 3.284 3.728 4.137 4.538 5.257 5.601 5.945 6.202 6.888 7.191 7.791 8.356 8.892 9.154 9.691 10.211 10.931 11.398 11.86 12.553 13.229 13.865 14.487 15.099 15.903 16.687 17.452 18.375 19.259 20.109 21.088 22.233 23.387 24.668 26.061 27.577 29.187 31.044 33.248 35.48 38.079 40.975 44.46 48.525 53.377 59.272 66.826 73.221 76.854 79.15 80.708 81.768 82.41 82.8 82.985 83.072 83.065 82.974 82.856 82.744 82.587 82.384 82.137 81.888 81.664 81.395 81.108 80.862 80.579 80.275 80.049 79.809 79.532 79.235 78.897 78.643 78.362 77.921 77.63 77.326 77.152 76.779 76.386 75.948 75.711 75.127 74.847 74.515 74.142 73.356 72.966 72.542 72.058 71.475 70.706 69.687 65.688 -5 ,2778 ,TETRA ,17664516,Thu Dec 2 13:36:13 CET,Thu Dec 2 15:50:30 CET,0.0 1.614 2.316 2.937 3.491 3.968 4.413 4.845 5.666 6.03 6.36 6.614 7.312 7.617 8.188 8.747 9.298 9.553 10.052 10.556 11.275 11.731 12.175 12.836 13.49 14.117 14.719 15.31 16.114 16.901 17.638 18.553 19.438 20.281 21.276 22.399 23.503 24.757 26.109 27.573 29.143 30.91 33.01 35.157 37.721 40.593 44.002 48.004 52.799 58.692 66.199 72.493 76.105 78.462 80.026 81.067 81.793 82.225 82.419 82.539 82.602 82.613 82.544 82.421 82.288 82.142 81.917 81.64 81.376 81.071 80.729 80.462 80.165 79.817 79.514 79.204 78.899 78.559 78.207 77.969 77.695 77.23 76.914 76.593 76.424 76.064 75.669 75.229 74.995 74.424 74.227 73.94 73.624 72.926 72.504 71.976 71.373 70.753 70.013 69.001 66.287 -6 ,21658 ,TETRA ,17664517,Thu Dec 2 13:36:13 CET,Thu Dec 2 15:59:32 CET,0.0 1.839 2.6 3.182 3.691 4.134 4.558 4.955 5.673 6.021 6.359 6.612 7.295 7.581 8.14 8.689 9.217 9.483 10.021 10.532 11.244 11.72 12.21 12.915 13.59 14.244 14.872 15.476 16.257 17.028 17.777 18.676 19.567 20.462 21.496 22.639 23.747 24.982 26.357 27.817 29.35 31.132 33.271 35.455 38.032 40.998 44.46 48.446 53.311 59.253 66.767 73.213 77.019 79.393 80.938 81.907 82.542 83.019 83.292 83.458 83.528 83.521 83.471 83.378 83.26 83.117 82.908 82.711 82.497 82.127 81.69 81.372 81.037 80.666 80.409 80.187 79.939 79.645 79.312 79.067 78.787 78.363 78.09 77.805 77.654 77.331 76.972 76.57 76.358 75.811 75.636 75.369 75.086 74.402 73.994 73.577 73.112 72.515 71.754 70.734 67.399 -7 ,28753 ,TETRA ,17664518,Thu Dec 2 13:36:13 CET,Thu Dec 2 15:38:31 CET,0.0 1.94 2.715 3.321 3.817 4.28 4.732 5.16 5.932 6.317 6.697 6.966 7.671 7.982 8.58 9.164 9.715 9.993 10.558 11.087 11.826 12.305 12.801 13.512 14.167 14.824 15.45 16.05 16.848 17.635 18.397 19.316 20.22 21.104 22.137 23.314 24.431 25.682 27.11 28.646 30.297 32.18 34.325 36.452 38.976 41.952 45.53 49.67 54.631 60.569 67.77 73.689 77.224 79.479 80.881 81.671 82.074 82.266 82.313 82.304 82.237 82.095 81.945 81.801 81.633 81.445 81.202 80.937 80.693 80.451 80.164 79.876 79.54 79.176 78.872 78.548 78.229 77.89 77.524 77.264 76.983 76.53 76.226 75.924 75.761 75.398 74.991 74.556 74.334 73.774 73.602 73.34 73.043 72.365 71.996 71.612 71.203 70.753 70.119 69.174 66.491 -8 ,25808 ,TETRA ,17664519,Thu Dec 2 13:36:14 CET,Thu Dec 2 15:53:42 CET,0.0 1.673 2.462 3.097 3.651 4.154 4.601 5.008 5.757 6.116 6.457 6.704 7.418 7.737 8.331 8.913 9.481 9.752 10.289 10.827 11.626 12.138 12.607 13.28 13.961 14.628 15.264 15.884 16.693 17.479 18.243 19.171 20.108 21.017 22.049 23.254 24.412 25.685 27.126 28.719 30.416 32.312 34.54 36.812 39.489 42.507 45.987 50.009 54.891 60.866 68.414 74.888 78.822 81.204 82.714 83.827 84.607 85.119 85.449 85.673 85.733 85.741 85.708 85.578 85.36 85.159 84.975 84.773 84.594 84.415 84.148 83.889 83.625 83.328 83.084 82.824 82.553 82.254 81.937 81.707 81.446 81.017 80.701 80.384 80.226 79.875 79.495 79.054 78.816 78.256 78.019 77.733 77.459 76.817 76.459 76.046 75.573 75.072 74.418 73.484 70.839 -9 ,18644 ,TETRA ,17664520,Thu Dec 2 13:36:14 CET,Thu Dec 2 15:38:16 CET,0.0 1.844 2.581 3.16 3.61 4.021 4.41 4.793 5.509 5.847 6.191 6.474 7.169 7.481 8.083 8.664 9.226 9.502 10.04 10.555 11.297 11.777 12.248 12.97 13.661 14.311 14.966 15.62 16.468 17.306 18.107 19.062 20.018 20.976 22.091 23.314 24.504 25.86 27.366 28.885 30.444 32.252 34.396 36.551 39.096 42.074 45.667 49.777 54.597 60.533 68.065 74.436 78.185 80.609 82.228 83.22 83.748 84.081 84.285 84.28 84.113 83.985 83.886 83.761 83.571 83.364 83.164 82.953 82.732 82.461 82.097 81.771 81.465 81.127 80.838 80.541 80.251 79.927 79.568 79.327 79.082 78.704 78.427 78.111 77.932 77.537 77.134 76.729 76.495 75.939 75.773 75.519 75.249 74.549 74.078 73.587 73.126 72.569 71.849 70.788 67.185 -10 ,26519 ,TETRA ,17664521,Thu Dec 2 13:36:14 CET,Thu Dec 2 16:11:51 CET,0.0 1.597 2.384 2.985 3.508 3.972 4.406 4.819 5.543 5.888 6.226 6.483 7.178 7.479 8.043 8.573 9.084 9.345 9.855 10.332 11.033 11.486 11.931 12.592 13.234 13.856 14.456 15.043 15.824 16.588 17.325 18.224 19.1 19.946 20.951 22.1 23.18 24.382 25.727 27.152 28.657 30.414 32.55 34.677 37.184 40.09 43.481 47.448 52.287 58.259 65.714 72.108 75.981 78.383 79.949 80.955 81.548 81.891 82.062 82.181 82.196 82.15 82.011 81.76 81.501 81.255 80.947 80.634 80.337 80.013 79.661 79.384 79.107 78.789 78.535 78.277 78.026 77.774 77.496 77.286 77.055 76.68 76.396 76.071 75.902 75.562 75.174 74.767 74.57 74.047 73.873 73.592 73.334 72.805 72.455 72.031 71.6 71.108 70.471 69.584 66.629 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt deleted file mode 100644 index bf84aa3c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19538 ,KEBNE ,17024102,Wed Dec 22 09:23:05 CET,Wed Dec 22 11:13:28 CET,0.0 1.128 1.683 2.143 2.579 2.979 3.354 3.706 4.345 4.662 4.972 5.15 5.809 6.086 6.621 7.112 7.585 7.816 8.264 8.699 9.317 9.718 10.122 10.726 11.314 11.9 12.49 13.066 13.802 14.504 15.181 16.028 16.869 17.691 18.674 19.786 20.846 22.053 23.411 24.88 26.452 28.241 30.366 32.546 35.151 38.146 41.681 45.744 50.727 56.976 64.958 72.05 76.425 79.213 81.087 82.469 83.462 84.166 84.662 85.072 85.332 85.495 85.513 85.458 85.397 85.318 85.154 84.943 84.755 84.551 84.34 84.131 83.886 83.618 83.409 83.184 82.923 82.655 82.349 82.115 81.86 81.438 81.125 80.799 80.635 80.27 79.871 79.499 79.31 78.787 78.564 78.274 77.993 77.385 77.023 76.598 76.106 75.542 74.843 73.918 71.104 -2 ,10687 ,KEBNE ,17024103,Wed Dec 22 09:23:05 CET,Wed Dec 22 11:12:59 CET,0.0 1.478 2.151 2.665 3.11 3.496 3.861 4.214 4.888 5.211 5.514 5.684 6.334 6.61 7.133 7.63 8.12 8.359 8.83 9.29 9.947 10.368 10.771 11.356 11.935 12.509 13.078 13.623 14.317 15.014 15.717 16.581 17.414 18.221 19.165 20.228 21.278 22.46 23.765 25.183 26.701 28.469 30.581 32.758 35.384 38.366 41.92 46.066 51.05 57.233 65.143 72.017 76.236 79.01 80.844 82.179 83.202 83.992 84.536 84.997 85.277 85.381 85.394 85.344 85.265 85.142 84.99 84.85 84.671 84.459 84.254 84.068 83.851 83.613 83.412 83.184 82.912 82.625 82.326 82.116 81.899 81.557 81.317 81.04 80.892 80.57 80.206 79.802 79.596 79.072 78.859 78.62 78.354 77.709 77.356 76.95 76.53 76.076 75.471 74.704 72.32 -3 ,2244 ,KEBNE ,17024104,Wed Dec 22 09:23:07 CET,Wed Dec 22 11:08:52 CET,0.0 1.339 1.967 2.531 3.017 3.425 3.795 4.166 4.852 5.149 5.444 5.65 6.307 6.564 7.079 7.573 8.045 8.269 8.704 9.144 9.806 10.235 10.641 11.241 11.838 12.414 12.991 13.57 14.318 15.049 15.751 16.601 17.432 18.265 19.277 20.447 21.582 22.848 24.255 25.759 27.379 29.275 31.528 33.837 36.577 39.697 43.361 47.572 52.74 59.05 66.975 73.847 78.04 80.804 82.585 83.77 84.649 85.266 85.605 85.845 85.999 86.098 86.186 86.219 86.191 86.149 86.04 85.898 85.77 85.615 85.434 85.265 85.068 84.853 84.664 84.442 84.185 83.872 83.533 83.308 83.078 82.727 82.449 82.131 81.974 81.675 81.349 80.931 80.719 80.216 80.032 79.772 79.483 78.797 78.406 78.008 77.555 77.017 76.365 75.498 72.983 -4 ,16329 ,KEBNE ,17024105,Wed Dec 22 09:23:09 CET,Wed Dec 22 11:09:21 CET,0.0 0.921 1.451 1.926 2.376 2.788 3.154 3.492 4.132 4.439 4.75 4.965 5.632 5.892 6.41 6.911 7.386 7.621 8.084 8.535 9.186 9.61 10.033 10.664 11.286 11.882 12.454 13.023 13.776 14.508 15.233 16.106 16.949 17.785 18.779 19.939 21.055 22.284 23.633 25.056 26.561 28.304 30.351 32.463 35.051 38.048 41.581 45.615 50.515 56.672 64.615 71.485 75.702 78.54 80.472 81.764 82.657 83.376 83.826 84.095 84.218 84.223 84.2 84.191 84.127 83.958 83.714 83.471 83.263 83.085 82.873 82.662 82.427 82.199 82.009 81.781 81.528 81.239 80.948 80.745 80.532 80.162 79.867 79.539 79.366 79.029 78.677 78.302 78.089 77.548 77.314 77.026 76.737 76.111 75.736 75.302 74.824 74.273 73.598 72.684 70.599 -5 ,25641 ,KEBNE ,17024106,Wed Dec 22 09:23:05 CET,Wed Dec 22 11:09:18 CET,0.0 1.613 2.235 2.731 3.163 3.561 3.929 4.256 4.867 5.153 5.432 5.608 6.258 6.519 7.021 7.506 7.975 8.206 8.66 9.091 9.725 10.141 10.543 11.136 11.715 12.295 12.861 13.404 14.118 14.806 15.475 16.301 17.133 17.949 18.882 19.936 20.993 22.206 23.531 24.942 26.436 28.144 30.206 32.326 34.885 37.85 41.337 45.422 50.386 56.403 64.21 71.027 75.196 78.025 79.927 81.194 82.072 82.686 83.04 83.277 83.429 83.534 83.58 83.542 83.456 83.32 83.117 82.891 82.644 82.4 82.172 81.984 81.79 81.601 81.444 81.253 81.0 80.713 80.456 80.294 80.121 79.8 79.549 79.258 79.1 78.799 78.468 78.051 77.828 77.296 77.072 76.801 76.531 75.924 75.568 75.187 74.747 74.259 73.638 72.715 69.815 -6 ,18808 ,KEBNE ,17024107,Wed Dec 22 09:24:07 CET,Wed Dec 22 11:14:03 CET,0.0 1.402 2.089 2.664 3.149 3.58 3.965 4.321 4.984 5.3 5.604 5.81 6.461 6.724 7.237 7.728 8.214 8.455 8.928 9.372 10.013 10.432 10.85 11.468 12.078 12.686 13.278 13.861 14.632 15.391 16.138 17.012 17.833 18.628 19.581 20.68 21.74 22.931 24.238 25.633 27.136 28.909 31.004 33.134 35.716 38.704 42.263 46.388 51.422 57.605 65.439 72.169 76.352 79.184 80.98 82.147 82.941 83.502 83.845 84.051 84.193 84.288 84.332 84.336 84.252 84.112 83.978 83.819 83.651 83.444 83.194 83.024 82.836 82.566 82.341 82.111 81.847 81.571 81.263 81.028 80.802 80.446 80.17 79.868 79.707 79.347 78.939 78.498 78.265 77.733 77.55 77.281 76.998 76.378 75.996 75.558 75.082 74.548 73.906 73.053 70.542 -7 ,28676 ,KEBNE ,17024108,Wed Dec 22 09:25:12 CET,Wed Dec 22 11:15:49 CET,0.0 0.943 1.464 1.937 2.357 2.728 3.085 3.41 4.012 4.305 4.58 4.749 5.422 5.684 6.204 6.721 7.202 7.431 7.876 8.324 8.998 9.427 9.844 10.442 11.036 11.641 12.226 12.792 13.532 14.251 14.968 15.866 16.746 17.587 18.561 19.668 20.758 21.964 23.269 24.711 26.266 28.046 30.156 32.308 34.868 37.827 41.368 45.463 50.428 56.6 64.41 71.24 75.406 78.115 79.95 81.283 82.228 82.862 83.219 83.45 83.626 83.706 83.743 83.761 83.687 83.572 83.441 83.319 83.207 83.045 82.825 82.618 82.406 82.189 81.996 81.758 81.472 81.194 80.872 80.625 80.359 79.899 79.564 79.206 79.017 78.626 78.221 77.771 77.533 76.985 76.76 76.482 76.165 75.438 75.05 74.656 74.204 73.643 72.923 71.968 69.916 -8 ,10803 ,KEBNE ,17024109,Wed Dec 22 09:24:06 CET,Wed Dec 22 11:14:52 CET,0.0 1.474 2.133 2.634 3.075 3.496 3.887 4.25 4.932 5.254 5.566 5.772 6.454 6.728 7.245 7.751 8.24 8.476 8.941 9.404 10.087 10.522 10.947 11.572 12.165 12.751 13.334 13.901 14.639 15.351 16.052 16.914 17.751 18.571 19.534 20.65 21.751 22.97 24.3 25.75 27.302 29.051 31.144 33.316 35.924 38.928 42.499 46.675 51.793 58.1 66.094 73.044 77.301 80.245 82.294 83.684 84.546 85.119 85.553 85.843 85.922 85.967 85.985 85.952 85.881 85.788 85.695 85.547 85.341 85.112 84.873 84.684 84.474 84.201 83.981 83.744 83.472 83.18 82.878 82.65 82.383 81.953 81.642 81.318 81.151 80.791 80.396 79.98 79.76 79.219 78.981 78.691 78.392 77.729 77.338 76.894 76.409 75.835 75.143 74.223 71.852 -9 ,14968 ,KEBNE ,17024110,Wed Dec 22 09:24:07 CET,Wed Dec 22 11:14:59 CET,0.0 1.085 1.643 2.139 2.602 3.004 3.356 3.691 4.337 4.646 4.948 5.157 5.814 6.079 6.596 7.094 7.577 7.806 8.253 8.687 9.33 9.75 10.161 10.765 11.359 11.935 12.499 13.064 13.8 14.522 15.233 16.103 16.944 17.764 18.721 19.805 20.867 22.04 23.333 24.755 26.261 28.016 30.14 32.332 34.929 37.892 41.435 45.542 50.654 57.002 65.049 72.279 76.822 79.77 81.702 83.09 84.109 84.878 85.403 85.794 86.047 86.208 86.289 86.29 86.257 86.215 86.138 86.013 85.901 85.805 85.646 85.456 85.248 85.029 84.82 84.612 84.388 84.114 83.8 83.569 83.327 82.944 82.68 82.378 82.218 81.879 81.526 81.147 80.936 80.405 80.175 79.877 79.59 78.951 78.587 78.187 77.754 77.264 76.605 75.791 73.821 -10 ,11130 ,KEBNE ,17024111,Wed Dec 22 09:24:06 CET,Wed Dec 22 11:13:42 CET,0.0 1.008 1.584 2.087 2.543 2.94 3.287 3.629 4.27 4.576 4.864 5.021 5.676 5.942 6.463 6.956 7.445 7.689 8.159 8.618 9.288 9.719 10.139 10.752 11.35 11.937 12.513 13.075 13.8 14.495 15.169 16.017 16.865 17.698 18.671 19.758 20.818 21.991 23.285 24.699 26.204 27.934 29.997 32.108 34.608 37.457 40.873 44.951 49.944 56.048 63.852 70.918 75.361 78.228 80.119 81.505 82.495 83.161 83.616 83.973 84.178 84.28 84.294 84.262 84.233 84.197 84.102 83.974 83.873 83.767 83.639 83.523 83.385 83.212 83.016 82.792 82.58 82.375 82.164 81.997 81.814 81.451 81.181 80.948 80.804 80.486 80.192 79.839 79.65 79.173 79.07 78.82 78.544 77.911 77.566 77.179 76.69 76.112 75.334 74.134 70.696 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index 45592a67..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18382 ,TETRA ,17585060,Sat Nov 27 11:35:45 CET,Sat Nov 27 13:55:40 CET,0.0 0.82 1.228 1.572 1.873 2.181 2.47 2.718 3.177 3.398 3.608 3.688 4.17 4.343 4.667 4.957 5.235 5.375 5.651 5.921 6.307 6.534 6.751 7.071 7.384 7.692 7.968 8.239 8.593 8.92 9.247 9.648 10.03 10.396 10.809 11.253 11.676 12.146 12.649 13.166 13.697 14.284 14.934 15.547 16.246 17.006 17.842 18.735 19.584 20.307 20.725 20.363 19.641 18.764 17.861 16.956 16.047 15.175 14.417 13.642 12.852 12.138 11.514 10.916 10.313 9.727 9.124 8.566 8.085 7.596 7.079 6.607 6.073 5.522 5.113 4.684 4.206 3.718 3.219 2.852 2.461 1.857 1.448 1.031 0.815 0.35 -0.142 -0.669 -0.946 -1.538 -1.796 -2.121 -2.466 -3.181 -3.571 -4.019 -4.496 -5.032 -5.705 -6.55 -8.926 -2 ,31756 ,TETRA ,17585061,Sat Nov 27 11:35:48 CET,Sat Nov 27 13:55:51 CET,0.0 0.968 1.401 1.776 2.105 2.394 2.665 2.928 3.379 3.577 3.761 3.815 4.291 4.466 4.788 5.093 5.367 5.492 5.738 5.972 6.311 6.533 6.747 7.051 7.341 7.627 7.904 8.169 8.503 8.819 9.136 9.516 9.886 10.253 10.667 11.121 11.571 12.069 12.575 13.086 13.628 14.222 14.866 15.507 16.242 17.05 17.908 18.727 19.493 20.146 20.509 20.178 19.479 18.642 17.775 16.751 15.73 14.831 14.04 13.212 12.421 11.729 11.073 10.402 9.757 9.174 8.554 8.001 7.524 7.008 6.484 6.056 5.586 5.067 4.679 4.294 3.866 3.394 2.917 2.582 2.232 1.689 1.307 0.912 0.713 0.284 -0.191 -0.704 -0.969 -1.577 -1.885 -2.21 -2.543 -3.298 -3.726 -4.188 -4.702 -5.296 -5.97 -6.866 -9.515 -3 ,28773 ,TETRA ,17585062,Sat Nov 27 11:35:46 CET,Sat Nov 27 14:03:02 CET,0.0 0.903 1.384 1.786 2.13 2.433 2.691 2.918 3.345 3.547 3.738 3.804 4.284 4.453 4.794 5.116 5.416 5.559 5.818 6.067 6.433 6.664 6.893 7.23 7.552 7.86 8.16 8.452 8.812 9.144 9.472 9.862 10.214 10.555 10.965 11.435 11.888 12.371 12.857 13.372 13.923 14.527 15.217 15.872 16.599 17.364 18.135 18.922 19.746 20.423 20.681 20.158 19.273 18.278 17.22 16.146 15.119 14.12 13.209 12.269 11.432 10.653 9.872 9.129 8.466 7.844 7.163 6.575 6.061 5.525 4.977 4.497 3.992 3.46 3.04 2.601 2.131 1.643 1.149 0.801 0.421 -0.193 -0.616 -1.057 -1.288 -1.762 -2.264 -2.785 -3.05 -3.647 -3.921 -4.241 -4.605 -5.438 -5.892 -6.373 -6.909 -7.555 -8.349 -9.412 -12.11 -4 ,25466 ,TETRA ,17585063,Sat Nov 27 11:35:47 CET,Sat Nov 27 13:56:25 CET,0.0 1.004 1.441 1.811 2.138 2.426 2.685 2.927 3.378 3.591 3.791 3.871 4.341 4.504 4.818 5.117 5.41 5.548 5.821 6.097 6.477 6.712 6.946 7.271 7.573 7.862 8.149 8.424 8.764 9.099 9.419 9.803 10.167 10.499 10.871 11.286 11.718 12.189 12.65 13.154 13.712 14.351 15.084 15.763 16.501 17.31 18.17 19.013 19.835 20.542 20.891 20.632 20.039 19.249 18.263 17.261 16.291 15.268 14.345 13.446 12.678 11.979 11.277 10.585 9.911 9.264 8.588 7.999 7.506 6.986 6.427 5.962 5.462 4.916 4.497 4.067 3.613 3.132 2.634 2.287 1.931 1.36 0.947 0.523 0.304 -0.165 -0.656 -1.172 -1.453 -2.063 -2.38 -2.738 -3.102 -3.886 -4.347 -4.834 -5.347 -5.944 -6.659 -7.577 -10.281 -5 ,6731 ,TETRA ,17585064,Sat Nov 27 11:35:45 CET,Sat Nov 27 13:53:58 CET,0.0 1.072 1.599 1.986 2.331 2.655 2.942 3.212 3.728 3.974 4.194 4.295 4.775 4.95 5.31 5.641 5.953 6.106 6.404 6.693 7.111 7.382 7.631 7.974 8.321 8.66 8.982 9.291 9.679 10.049 10.408 10.825 11.217 11.598 12.041 12.514 12.935 13.383 13.88 14.416 14.958 15.544 16.189 16.824 17.556 18.29 19.027 19.806 20.585 21.252 21.498 20.853 19.889 18.853 17.79 16.71 15.689 14.726 13.837 12.893 12.067 11.32 10.591 9.864 9.176 8.559 7.919 7.325 6.786 6.228 5.645 5.156 4.623 4.063 3.617 3.136 2.66 2.165 1.635 1.275 0.894 0.297 -0.087 -0.484 -0.709 -1.183 -1.664 -2.158 -2.421 -3.02 -3.283 -3.587 -3.909 -4.661 -5.082 -5.531 -6.03 -6.604 -7.322 -8.218 -10.293 -6 ,4609 ,TETRA ,17585065,Sat Nov 27 11:35:47 CET,Sat Nov 27 13:58:08 CET,0.0 1.266 1.765 2.121 2.451 2.782 3.067 3.307 3.73 3.938 4.148 4.253 4.729 4.894 5.22 5.525 5.815 5.958 6.235 6.497 6.871 7.114 7.355 7.684 7.985 8.278 8.566 8.842 9.199 9.559 9.904 10.306 10.667 10.99 11.364 11.79 12.21 12.667 13.144 13.646 14.163 14.706 15.327 15.96 16.669 17.42 18.229 19.027 19.836 20.649 21.001 20.355 19.374 18.303 17.267 16.232 15.299 14.441 13.642 12.769 11.931 11.158 10.419 9.74 9.124 8.526 7.873 7.273 6.755 6.202 5.6 5.11 4.599 4.067 3.653 3.213 2.749 2.281 1.775 1.41 1.037 0.451 0.059 -0.348 -0.56 -1.013 -1.519 -2.034 -2.294 -2.892 -3.16 -3.482 -3.807 -4.559 -5.013 -5.506 -6.011 -6.556 -7.286 -8.223 -10.444 -7 ,4251 ,TETRA ,17585066,Sat Nov 27 11:35:47 CET,Sat Nov 27 13:56:37 CET,0.0 0.722 1.164 1.542 1.891 2.211 2.486 2.736 3.211 3.424 3.619 3.689 4.172 4.345 4.682 5.009 5.321 5.473 5.755 6.012 6.387 6.627 6.854 7.178 7.492 7.81 8.118 8.405 8.758 9.092 9.427 9.819 10.163 10.496 10.9 11.349 11.792 12.275 12.762 13.259 13.762 14.321 14.985 15.626 16.329 17.1 17.963 18.805 19.601 20.274 20.649 20.095 19.128 18.093 17.056 16.006 15.038 14.093 13.209 12.325 11.563 10.842 10.124 9.417 8.743 8.113 7.416 6.808 6.298 5.765 5.192 4.716 4.231 3.704 3.29 2.874 2.429 1.951 1.466 1.121 0.751 0.187 -0.206 -0.637 -0.862 -1.329 -1.822 -2.36 -2.637 -3.225 -3.493 -3.81 -4.143 -4.884 -5.311 -5.767 -6.272 -6.894 -7.643 -8.661 -10.846 -8 ,32764 ,TETRA ,17585067,Sat Nov 27 11:35:47 CET,Sat Nov 27 14:01:46 CET,0.0 1.274 1.77 2.13 2.41 2.672 2.915 3.144 3.567 3.761 3.955 4.008 4.471 4.629 4.935 5.243 5.556 5.705 5.978 6.219 6.552 6.774 6.99 7.3 7.607 7.903 8.179 8.454 8.818 9.152 9.472 9.869 10.254 10.622 11.034 11.482 11.92 12.398 12.877 13.366 13.862 14.401 15.023 15.649 16.34 17.047 17.813 18.591 19.329 19.95 20.151 19.618 18.811 17.886 16.934 15.989 15.1 14.236 13.435 12.604 11.863 11.175 10.508 9.87 9.254 8.672 8.038 7.471 6.971 6.409 5.817 5.348 4.872 4.375 3.971 3.548 3.143 2.721 2.258 1.939 1.593 1.029 0.634 0.232 0.033 -0.386 -0.847 -1.317 -1.569 -2.166 -2.43 -2.743 -3.065 -3.769 -4.169 -4.621 -5.125 -5.704 -6.452 -7.4 -9.817 -9 ,23410 ,TETRA ,17585069,Sat Nov 27 11:35:48 CET,Sat Nov 27 13:56:04 CET,0.0 1.136 1.601 1.976 2.278 2.547 2.799 3.045 3.503 3.705 3.89 3.945 4.421 4.585 4.894 5.19 5.463 5.601 5.887 6.162 6.542 6.778 7.006 7.355 7.692 7.997 8.289 8.575 8.942 9.29 9.63 10.046 10.449 10.836 11.29 11.781 12.234 12.711 13.189 13.695 14.238 14.834 15.52 16.235 17.021 17.841 18.741 19.59 20.383 21.106 21.451 20.847 19.875 18.852 17.826 16.785 15.812 14.912 14.068 13.164 12.348 11.604 10.903 10.223 9.568 8.942 8.293 7.709 7.207 6.7 6.163 5.736 5.279 4.764 4.372 3.987 3.591 3.138 2.654 2.334 1.982 1.396 0.983 0.557 0.34 -0.131 -0.649 -1.179 -1.443 -2.032 -2.311 -2.637 -2.957 -3.674 -4.113 -4.591 -5.08 -5.654 -6.318 -7.127 -8.864 -10 ,32087 ,TETRA ,17585070,Sat Nov 27 11:35:47 CET,Sat Nov 27 13:41:57 CET,0.0 1.138 1.61 1.971 2.275 2.552 2.813 3.058 3.507 3.716 3.909 3.971 4.459 4.623 4.953 5.262 5.539 5.679 5.953 6.205 6.558 6.793 7.029 7.363 7.68 7.983 8.274 8.548 8.903 9.253 9.584 9.982 10.363 10.711 11.108 11.548 11.961 12.421 12.914 13.433 13.964 14.549 15.207 15.838 16.547 17.291 18.107 18.988 19.9 20.598 20.782 20.177 19.226 18.191 17.173 16.177 15.24 14.358 13.55 12.66 11.833 11.104 10.416 9.744 9.107 8.522 7.88 7.312 6.824 6.284 5.712 5.243 4.755 4.224 3.803 3.382 2.949 2.492 2.009 1.673 1.326 0.776 0.369 -0.055 -0.266 -0.713 -1.185 -1.696 -1.97 -2.564 -2.795 -3.082 -3.403 -4.094 -4.513 -4.99 -5.482 -6.026 -6.667 -7.549 -10.398 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt deleted file mode 100644 index 9d5e3419..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30063 ,TETRA ,17585071,Sat Nov 27 11:35:48 CET,Sat Nov 27 13:44:00 CET,0.0 1.536 2.204 2.79 3.273 3.669 4.044 4.368 4.974 5.262 5.524 5.739 6.288 6.519 6.965 7.376 7.752 7.937 8.309 8.671 9.176 9.493 9.821 10.29 10.721 11.125 11.484 11.82 12.277 12.74 13.205 13.724 14.188 14.649 15.19 15.799 16.378 16.987 17.624 18.264 18.927 19.71 20.563 21.324 22.135 23.016 24.007 24.969 25.905 26.787 27.299 26.833 25.848 24.654 23.471 22.244 21.065 19.995 19.073 18.148 17.333 16.585 15.858 15.168 14.551 13.981 13.338 12.746 12.25 11.739 11.184 10.723 10.238 9.721 9.34 8.95 8.525 8.078 7.622 7.311 6.991 6.518 6.187 5.826 5.645 5.278 4.894 4.48 4.248 3.679 3.492 3.223 2.932 2.312 1.971 1.608 1.231 0.765 0.21 -0.434 -1.818 -2 ,28709 ,TETRA ,17585072,Sat Nov 27 11:35:47 CET,Sat Nov 27 13:57:30 CET,0.0 1.323 2.009 2.581 3.041 3.456 3.84 4.188 4.833 5.121 5.387 5.611 6.153 6.388 6.838 7.253 7.649 7.85 8.235 8.589 9.094 9.422 9.74 10.191 10.622 11.045 11.46 11.854 12.367 12.873 13.346 13.919 14.47 14.986 15.577 16.22 16.809 17.465 18.176 18.886 19.6 20.388 21.296 22.187 23.186 24.217 25.286 26.327 27.255 28.031 28.333 27.508 26.282 25.005 23.666 22.357 21.151 20.007 18.997 17.975 17.091 16.3 15.547 14.85 14.224 13.641 13.029 12.482 11.989 11.475 10.939 10.483 10.003 9.512 9.13 8.73 8.326 7.912 7.464 7.136 6.816 6.337 5.993 5.64 5.448 5.047 4.648 4.233 4.015 3.455 3.289 3.042 2.784 2.194 1.885 1.554 1.168 0.725 0.247 -0.347 -1.897 -3 ,1336 ,TETRA ,17585073,Sat Nov 27 11:36:46 CET,Sat Nov 27 13:57:09 CET,0.0 1.531 2.122 2.614 3.046 3.44 3.825 4.175 4.801 5.081 5.348 5.567 6.119 6.355 6.783 7.191 7.581 7.769 8.146 8.506 9.033 9.356 9.644 10.075 10.5 10.902 11.282 11.649 12.129 12.581 13.008 13.511 13.979 14.435 14.973 15.574 16.144 16.75 17.384 18.056 18.756 19.514 20.359 21.175 22.073 23.039 24.098 25.225 26.359 27.25 27.669 27.17 26.195 25.106 23.96 22.8 21.678 20.582 19.574 18.572 17.736 16.949 16.187 15.467 14.758 14.111 13.468 12.918 12.43 11.906 11.354 10.899 10.442 9.937 9.533 9.144 8.746 8.327 7.904 7.608 7.289 6.783 6.436 6.076 5.892 5.506 5.112 4.691 4.46 3.892 3.702 3.432 3.15 2.522 2.182 1.818 1.399 0.944 0.44 -0.224 -2.125 -4 ,31415 ,TETRA ,17585074,Sat Nov 27 11:37:45 CET,Sat Nov 27 14:02:10 CET,0.0 1.384 2.038 2.499 2.885 3.226 3.565 3.911 4.513 4.782 5.045 5.227 5.751 5.952 6.337 6.711 7.066 7.244 7.609 7.956 8.446 8.769 9.068 9.498 9.923 10.307 10.69 11.072 11.544 11.991 12.433 12.959 13.439 13.914 14.485 15.116 15.681 16.287 16.937 17.601 18.285 19.047 19.942 20.797 21.681 22.655 23.687 24.593 25.475 26.253 26.549 25.804 24.613 23.316 22.045 20.849 19.735 18.645 17.668 16.682 15.85 15.11 14.384 13.673 13.002 12.418 11.811 11.253 10.773 10.259 9.713 9.279 8.824 8.331 7.951 7.57 7.183 6.786 6.357 6.057 5.755 5.273 4.929 4.581 4.406 4.032 3.645 3.252 3.051 2.514 2.388 2.14 1.88 1.327 0.999 0.621 0.211 -0.236 -0.733 -1.398 -2.95 -5 ,29968 ,TETRA ,17585075,Sat Nov 27 11:37:45 CET,Sat Nov 27 13:59:03 CET,0.0 1.812 2.425 2.922 3.375 3.749 4.108 4.449 5.016 5.27 5.502 5.657 6.193 6.409 6.806 7.186 7.558 7.747 8.118 8.458 8.945 9.256 9.557 9.993 10.41 10.794 11.16 11.528 11.998 12.448 12.883 13.391 13.872 14.316 14.83 15.406 15.932 16.495 17.098 17.716 18.329 18.991 19.75 20.501 21.36 22.215 23.11 24.028 24.813 25.366 25.361 24.417 23.106 21.764 20.547 19.339 18.189 17.124 16.17 15.177 14.317 13.575 12.861 12.194 11.576 10.974 10.339 9.758 9.26 8.734 8.179 7.742 7.297 6.826 6.433 6.021 5.625 5.22 4.789 4.498 4.199 3.731 3.404 3.048 2.861 2.482 2.079 1.662 1.434 0.875 0.73 0.456 0.167 -0.445 -0.777 -1.153 -1.593 -2.084 -2.648 -3.292 -5.21 -6 ,31518 ,TETRA ,17585076,Sat Nov 27 11:36:46 CET,Sat Nov 27 13:56:27 CET,0.0 1.362 2.083 2.629 3.058 3.431 3.77 4.101 4.739 5.02 5.28 5.499 6.046 6.273 6.711 7.115 7.502 7.693 8.069 8.453 9.003 9.348 9.672 10.115 10.537 10.939 11.327 11.718 12.229 12.691 13.11 13.606 14.096 14.586 15.174 15.807 16.362 16.957 17.578 18.207 18.884 19.632 20.435 21.202 22.067 23.009 23.965 24.873 25.763 26.385 26.432 25.694 24.604 23.332 22.015 20.755 19.678 18.738 17.875 16.987 16.234 15.544 14.876 14.231 13.602 13.01 12.387 11.82 11.334 10.834 10.307 9.881 9.436 8.963 8.59 8.189 7.776 7.356 6.927 6.638 6.335 5.854 5.507 5.158 4.979 4.599 4.205 3.764 3.525 2.984 2.799 2.537 2.273 1.686 1.359 1.011 0.624 0.17 -0.362 -1.035 -2.647 -7 ,4239 ,TETRA ,17585077,Sat Nov 27 11:36:45 CET,Sat Nov 27 13:57:06 CET,0.0 1.35 1.995 2.48 2.905 3.292 3.629 3.953 4.54 4.801 5.065 5.225 5.746 5.968 6.394 6.794 7.168 7.349 7.688 8.025 8.517 8.815 9.105 9.524 9.937 10.338 10.723 11.119 11.635 12.089 12.491 12.989 13.488 13.976 14.548 15.165 15.73 16.345 17.005 17.667 18.354 19.127 19.996 20.802 21.67 22.575 23.528 24.472 25.36 26.157 26.274 25.459 24.406 23.174 22.016 20.83 19.618 18.448 17.441 16.54 15.793 15.077 14.38 13.698 13.036 12.444 11.838 11.286 10.801 10.293 9.754 9.287 8.786 8.252 7.869 7.511 7.116 6.685 6.25 5.953 5.647 5.166 4.828 4.477 4.293 3.915 3.513 3.077 2.856 2.311 2.159 1.901 1.629 1.01 0.679 0.347 -0.017 -0.42 -0.896 -1.512 -3.1 -8 ,13986 ,TETRA ,17585078,Sat Nov 27 11:36:48 CET,Sat Nov 27 13:57:22 CET,0.0 1.398 1.937 2.32 2.718 3.099 3.451 3.78 4.354 4.614 4.874 5.08 5.609 5.829 6.253 6.666 7.054 7.233 7.578 7.924 8.447 8.776 9.095 9.566 10.017 10.433 10.794 11.136 11.583 12.014 12.434 12.93 13.395 13.862 14.415 15.03 15.605 16.199 16.813 17.445 18.096 18.84 19.711 20.568 21.525 22.489 23.509 24.486 25.402 26.194 26.525 25.987 24.94 23.744 22.654 21.582 20.467 19.397 18.513 17.638 16.858 16.121 15.391 14.706 14.089 13.521 12.905 12.337 11.86 11.368 10.827 10.369 9.89 9.38 8.993 8.601 8.2 7.79 7.347 7.036 6.716 6.207 5.85 5.457 5.252 4.843 4.416 3.949 3.703 3.133 2.967 2.723 2.452 1.846 1.52 1.173 0.806 0.392 -0.139 -0.805 -2.344 -9 ,8627 ,TETRA ,17585079,Sat Nov 27 11:36:49 CET,Sat Nov 27 13:56:47 CET,0.0 1.602 2.34 2.962 3.474 3.871 4.225 4.563 5.157 5.419 5.672 5.843 6.39 6.625 7.081 7.494 7.889 8.079 8.439 8.789 9.29 9.602 9.91 10.358 10.763 11.157 11.545 11.929 12.412 12.845 13.247 13.73 14.193 14.628 15.12 15.688 16.23 16.799 17.393 18.015 18.694 19.449 20.284 21.125 22.054 22.96 23.864 24.774 25.732 26.47 26.553 25.606 24.302 22.961 21.673 20.41 19.338 18.294 17.321 16.384 15.539 14.769 14.037 13.366 12.769 12.206 11.618 11.079 10.58 10.06 9.528 9.094 8.639 8.17 7.8 7.426 7.048 6.635 6.189 5.881 5.561 5.052 4.689 4.312 4.119 3.73 3.344 2.91 2.677 2.124 1.976 1.72 1.454 0.875 0.561 0.22 -0.159 -0.591 -1.128 -1.892 -3.749 -10 ,29033 ,TETRA ,17585080,Sat Nov 27 11:36:47 CET,Sat Nov 27 13:58:05 CET,0.0 1.294 1.862 2.353 2.798 3.2 3.56 3.883 4.489 4.768 5.033 5.23 5.757 5.977 6.414 6.821 7.194 7.371 7.69 8.009 8.482 8.777 9.075 9.523 9.953 10.362 10.748 11.119 11.585 12.023 12.446 12.943 13.42 13.877 14.409 14.996 15.552 16.156 16.797 17.482 18.177 18.964 19.828 20.637 21.548 22.462 23.454 24.425 25.387 26.164 26.458 25.893 24.905 23.789 22.658 21.536 20.453 19.431 18.531 17.588 16.705 15.921 15.194 14.514 13.875 13.276 12.635 12.051 11.561 11.072 10.565 10.13 9.667 9.193 8.818 8.423 8.031 7.609 7.146 6.84 6.538 6.059 5.718 5.358 5.176 4.806 4.403 3.992 3.776 3.227 3.04 2.759 2.464 1.862 1.571 1.26 0.892 0.476 -0.043 -0.688 -2.014 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index 7d938e33..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31388 ,TETRA ,17585081,Sat Nov 27 11:36:49 CET,Sat Nov 27 13:57:58 CET,0.0 1.295 1.783 2.184 2.524 2.837 3.121 3.38 3.85 4.062 4.27 4.501 4.847 5.032 5.352 5.636 5.914 6.049 6.306 6.564 6.95 7.2 7.442 7.793 8.125 8.43 8.725 9.019 9.378 9.708 10.042 10.456 10.845 11.222 11.659 12.148 12.607 13.117 13.677 14.243 14.813 15.457 16.239 16.985 17.796 18.655 19.64 20.711 21.795 22.934 23.912 24.134 23.895 23.479 22.956 22.393 21.901 21.424 20.949 20.462 20.016 19.565 19.145 18.797 18.469 18.154 17.821 17.519 17.242 16.952 16.642 16.358 16.05 15.728 15.482 15.231 14.974 14.697 14.41 14.217 14.01 13.67 13.431 13.19 13.068 12.821 12.538 12.224 12.065 11.766 11.543 11.356 11.158 10.727 10.497 10.253 9.98 9.672 9.303 8.814 7.71 -2 ,25073 ,TETRA ,17585082,Sat Nov 27 11:38:45 CET,Sat Nov 27 13:36:20 CET,0.0 1.164 1.643 1.989 2.304 2.611 2.909 3.17 3.62 3.84 4.047 4.26 4.596 4.771 5.088 5.392 5.685 5.825 6.101 6.378 6.776 7.025 7.264 7.602 7.931 8.244 8.543 8.843 9.232 9.599 9.944 10.358 10.745 11.11 11.545 12.025 12.484 12.989 13.531 14.109 14.718 15.357 16.116 16.899 17.735 18.639 19.649 20.741 21.899 23.075 24.185 24.538 24.297 23.918 23.489 23.042 22.602 22.164 21.75 21.299 20.884 20.507 20.15 19.792 19.431 19.1 18.763 18.451 18.173 17.87 17.554 17.288 17.005 16.703 16.461 16.198 15.932 15.686 15.416 15.218 15.022 14.723 14.503 14.256 14.126 13.872 13.594 13.286 13.125 12.812 12.575 12.378 12.166 11.691 11.428 11.15 10.873 10.576 10.222 9.718 8.235 -3 ,8980 ,TETRA ,17585083,Sat Nov 27 11:38:45 CET,Sat Nov 27 13:59:32 CET,0.0 1.364 1.855 2.258 2.635 2.94 3.193 3.432 3.9 4.115 4.318 4.549 4.883 5.057 5.412 5.738 6.041 6.189 6.469 6.73 7.106 7.349 7.578 7.92 8.251 8.561 8.858 9.133 9.481 9.821 10.151 10.555 10.938 11.298 11.743 12.243 12.706 13.225 13.778 14.349 14.939 15.587 16.357 17.087 17.891 18.819 19.845 20.931 22.127 23.342 24.463 24.932 24.753 24.338 23.88 23.422 22.972 22.491 22.035 21.544 21.115 20.737 20.336 19.936 19.575 19.241 18.889 18.575 18.298 18.01 17.704 17.443 17.162 16.859 16.614 16.36 16.104 15.844 15.574 15.386 15.182 14.829 14.579 14.332 14.209 13.946 13.659 13.353 13.195 12.887 12.712 12.542 12.354 11.921 11.69 11.445 11.162 10.848 10.48 9.969 8.528 -4 ,21047 ,TETRA ,17585084,Sat Nov 27 11:38:45 CET,Sat Nov 27 14:03:19 CET,0.0 1.445 2.018 2.435 2.783 3.083 3.348 3.595 4.063 4.288 4.499 4.727 5.063 5.236 5.567 5.878 6.185 6.337 6.61 6.868 7.237 7.478 7.717 8.052 8.377 8.696 8.998 9.283 9.653 10.002 10.328 10.72 11.097 11.471 11.905 12.375 12.826 13.323 13.856 14.421 15.015 15.69 16.446 17.182 18.029 18.926 19.911 20.953 22.075 23.237 24.272 24.635 24.453 24.095 23.636 23.149 22.693 22.212 21.774 21.326 20.9 20.483 20.074 19.693 19.322 18.955 18.566 18.222 17.915 17.592 17.253 16.967 16.673 16.372 16.137 15.891 15.619 15.323 15.025 14.824 14.613 14.262 14.021 13.77 13.634 13.35 13.047 12.729 12.563 12.241 12.024 11.846 11.658 11.206 10.946 10.678 10.389 10.065 9.669 9.158 7.936 -5 ,9431 ,TETRA ,17585085,Sat Nov 27 11:38:46 CET,Sat Nov 27 14:04:20 CET,0.0 1.052 1.46 1.804 2.118 2.392 2.649 2.892 3.304 3.498 3.694 3.906 4.233 4.402 4.712 4.998 5.271 5.407 5.675 5.944 6.329 6.567 6.798 7.13 7.44 7.741 8.047 8.346 8.712 9.073 9.432 9.843 10.223 10.599 11.032 11.491 11.934 12.433 12.978 13.535 14.079 14.69 15.402 16.108 16.936 17.864 18.9 19.992 21.159 22.308 23.353 23.733 23.575 23.198 22.727 22.224 21.735 21.254 20.809 20.334 19.911 19.53 19.156 18.785 18.42 18.085 17.736 17.416 17.14 16.843 16.513 16.24 15.958 15.661 15.432 15.189 14.933 14.659 14.372 14.181 13.979 13.649 13.415 13.169 13.042 12.771 12.481 12.181 12.021 11.707 11.452 11.244 11.041 10.625 10.4 10.156 9.892 9.585 9.192 8.734 7.576 -6 ,16461 ,TETRA ,17585086,Sat Nov 27 11:38:46 CET,Sat Nov 27 14:03:47 CET,0.0 0.892 1.42 1.821 2.168 2.507 2.805 3.058 3.52 3.751 3.962 4.198 4.554 4.747 5.09 5.407 5.738 5.898 6.198 6.48 6.868 7.12 7.362 7.711 8.043 8.359 8.684 8.983 9.34 9.679 10.01 10.428 10.826 11.198 11.628 12.108 12.57 13.084 13.641 14.224 14.808 15.456 16.217 16.963 17.803 18.675 19.614 20.647 21.733 22.799 23.751 24.005 23.782 23.37 22.923 22.47 22.005 21.524 21.081 20.603 20.162 19.777 19.414 19.048 18.68 18.333 17.956 17.623 17.345 17.049 16.733 16.472 16.198 15.896 15.658 15.414 15.166 14.914 14.652 14.469 14.276 13.964 13.719 13.449 13.321 13.065 12.785 12.494 12.343 12.038 11.824 11.625 11.421 10.988 10.734 10.459 10.165 9.84 9.439 8.933 7.696 -7 ,19835 ,TETRA ,17585087,Sat Nov 27 11:38:46 CET,Sat Nov 27 14:00:19 CET,0.0 1.347 1.794 2.153 2.486 2.79 3.054 3.282 3.716 3.925 4.125 4.345 4.68 4.851 5.176 5.483 5.768 5.91 6.186 6.447 6.817 7.052 7.289 7.639 7.98 8.315 8.628 8.907 9.264 9.626 9.971 10.388 10.782 11.166 11.626 12.125 12.615 13.155 13.714 14.3 14.91 15.581 16.324 17.069 17.934 18.862 19.872 20.964 22.185 23.409 24.461 24.906 24.811 24.469 24.049 23.568 23.122 22.68 22.239 21.771 21.344 20.926 20.525 20.138 19.756 19.417 19.058 18.728 18.441 18.128 17.809 17.548 17.255 16.959 16.735 16.48 16.202 15.919 15.648 15.466 15.275 14.964 14.73 14.487 14.362 14.106 13.843 13.558 13.415 13.13 12.944 12.765 12.567 12.123 11.888 11.626 11.31 10.954 10.544 9.979 8.511 -8 ,23205 ,TETRA ,17585088,Sat Nov 27 11:38:46 CET,Sat Nov 27 14:03:29 CET,0.0 1.113 1.644 2.049 2.37 2.667 2.959 3.215 3.622 3.816 4.01 4.226 4.555 4.733 5.066 5.378 5.671 5.815 6.097 6.374 6.781 7.028 7.265 7.615 7.941 8.26 8.573 8.877 9.271 9.651 10.009 10.411 10.794 11.168 11.606 12.081 12.523 13.03 13.57 14.125 14.729 15.428 16.217 16.97 17.824 18.739 19.757 20.851 22.016 23.181 24.143 24.503 24.364 24.0 23.539 23.056 22.574 22.13 21.719 21.257 20.854 20.49 20.118 19.764 19.446 19.135 18.791 18.478 18.209 17.928 17.625 17.357 17.061 16.761 16.525 16.274 16.018 15.742 15.453 15.26 15.061 14.746 14.515 14.278 14.157 13.907 13.632 13.345 13.198 12.906 12.712 12.512 12.31 11.888 11.639 11.371 11.103 10.792 10.422 9.974 8.638 -9 ,32617 ,TETRA ,17585089,Sat Nov 27 11:38:46 CET,Sat Nov 27 14:00:52 CET,0.0 0.973 1.453 1.858 2.205 2.512 2.795 3.049 3.516 3.739 3.941 4.168 4.506 4.681 5.026 5.353 5.662 5.818 6.116 6.387 6.745 6.962 7.181 7.501 7.81 8.12 8.425 8.715 9.081 9.427 9.759 10.167 10.546 10.907 11.335 11.819 12.285 12.799 13.331 13.869 14.448 15.116 15.894 16.662 17.524 18.433 19.433 20.502 21.673 22.957 24.13 24.523 24.471 24.196 23.787 23.372 22.96 22.497 22.054 21.6 21.212 20.839 20.437 20.06 19.702 19.352 18.976 18.632 18.333 18.027 17.709 17.451 17.192 16.905 16.67 16.437 16.199 15.949 15.69 15.497 15.276 14.934 14.713 14.488 14.372 14.123 13.856 13.551 13.387 13.088 12.875 12.686 12.491 12.077 11.85 11.601 11.312 10.987 10.599 10.11 9.075 -10 ,9639 ,TETRA ,17585090,Sat Nov 27 11:38:46 CET,Sat Nov 27 13:59:24 CET,0.0 0.953 1.441 1.85 2.205 2.501 2.761 3.001 3.444 3.647 3.838 4.035 4.364 4.528 4.842 5.15 5.439 5.575 5.837 6.086 6.442 6.675 6.898 7.223 7.548 7.845 8.121 8.401 8.765 9.124 9.459 9.838 10.207 10.573 11.005 11.484 11.936 12.435 12.987 13.574 14.162 14.787 15.515 16.266 17.084 17.95 18.946 19.988 21.114 22.256 23.22 23.594 23.495 23.187 22.782 22.33 21.881 21.43 20.961 20.453 20.021 19.625 19.22 18.842 18.497 18.159 17.806 17.498 17.225 16.929 16.611 16.334 16.044 15.755 15.531 15.29 15.031 14.767 14.489 14.297 14.099 13.77 13.531 13.288 13.164 12.908 12.627 12.318 12.16 11.854 11.625 11.435 11.245 10.807 10.562 10.277 9.957 9.636 9.239 8.725 7.456 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt deleted file mode 100644 index d777bf1c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3056 ,TETRA ,17585091,Sat Nov 27 11:38:46 CET,Sat Nov 27 14:02:28 CET,0.0 0.728 1.176 1.55 1.851 2.117 2.352 2.558 2.938 3.099 3.245 3.398 3.706 3.848 4.126 4.4 4.652 4.766 4.988 5.194 5.47 5.646 5.822 6.069 6.29 6.493 6.692 6.892 7.146 7.365 7.568 7.806 8.024 8.23 8.458 8.701 8.925 9.164 9.392 9.614 9.86 10.107 10.334 10.512 10.647 10.727 10.741 10.576 10.072 9.071 7.196 4.747 2.617 0.77 -0.816 -2.216 -3.502 -4.685 -5.679 -6.701 -7.57 -8.34 -9.088 -9.814 -10.496 -11.077 -11.691 -12.248 -12.722 -13.218 -13.764 -14.212 -14.663 -15.148 -15.516 -15.906 -16.309 -16.724 -17.175 -17.493 -17.825 -18.325 -18.671 -19.037 -19.222 -19.619 -20.05 -20.486 -20.692 -21.092 -21.408 -21.671 -21.96 -22.6 -22.939 -23.315 -23.754 -24.236 -24.796 -25.575 -27.811 -2 ,28413 ,TETRA ,17585092,Sat Nov 27 11:38:46 CET,Sat Nov 27 14:00:16 CET,0.0 0.867 1.398 1.825 2.165 2.472 2.743 2.963 3.341 3.524 3.699 3.875 4.182 4.32 4.588 4.854 5.106 5.222 5.442 5.649 5.924 6.087 6.242 6.491 6.722 6.922 7.117 7.314 7.576 7.816 8.023 8.25 8.456 8.647 8.874 9.123 9.35 9.591 9.835 10.107 10.359 10.607 10.853 11.03 11.21 11.321 11.309 11.137 10.715 9.862 8.099 5.774 3.722 1.82 0.208 -1.221 -2.527 -3.72 -4.756 -5.74 -6.578 -7.374 -8.115 -8.798 -9.435 -10.027 -10.671 -11.237 -11.702 -12.209 -12.77 -13.226 -13.686 -14.165 -14.547 -14.939 -15.336 -15.738 -16.165 -16.486 -16.836 -17.365 -17.712 -18.073 -18.263 -18.652 -19.049 -19.471 -19.711 -20.137 -20.47 -20.747 -21.027 -21.648 -22.014 -22.405 -22.834 -23.316 -23.907 -24.627 -25.943 -3 ,24703 ,TETRA ,17585093,Sat Nov 27 11:38:46 CET,Sat Nov 27 14:03:19 CET,0.0 1.447 1.931 2.297 2.581 2.833 3.077 3.311 3.739 3.924 4.102 4.297 4.619 4.766 5.038 5.294 5.538 5.65 5.855 6.047 6.317 6.498 6.677 6.923 7.139 7.344 7.546 7.745 8.003 8.239 8.461 8.713 8.943 9.175 9.429 9.688 9.923 10.165 10.405 10.644 10.888 11.14 11.394 11.599 11.756 11.843 11.873 11.815 11.519 10.861 9.506 7.336 5.224 3.393 1.79 0.26 -1.142 -2.393 -3.451 -4.489 -5.352 -6.133 -6.907 -7.647 -8.332 -8.954 -9.601 -10.165 -10.662 -11.186 -11.719 -12.155 -12.605 -13.096 -13.491 -13.907 -14.347 -14.774 -15.194 -15.489 -15.812 -16.339 -16.707 -17.069 -17.26 -17.647 -18.028 -18.439 -18.661 -19.064 -19.379 -19.651 -19.926 -20.566 -20.91 -21.271 -21.741 -22.264 -22.843 -23.535 -25.427 -4 ,23749 ,TETRA ,17585094,Sat Nov 27 11:38:49 CET,Sat Nov 27 14:04:17 CET,0.0 0.887 1.301 1.638 1.948 2.216 2.448 2.648 3.035 3.228 3.409 3.596 3.917 4.074 4.359 4.627 4.894 5.021 5.259 5.478 5.783 5.979 6.174 6.476 6.757 7.018 7.274 7.511 7.81 8.11 8.391 8.722 9.044 9.324 9.623 9.975 10.29 10.62 10.982 11.354 11.73 12.107 12.516 12.877 13.273 13.676 14.014 14.221 14.217 13.794 12.33 9.875 7.552 5.452 3.596 1.913 0.44 -0.867 -1.997 -3.125 -4.078 -4.883 -5.613 -6.298 -6.934 -7.504 -8.117 -8.691 -9.178 -9.674 -10.175 -10.581 -11.011 -11.472 -11.834 -12.196 -12.58 -12.993 -13.425 -13.729 -14.023 -14.478 -14.81 -15.16 -15.344 -15.717 -16.134 -16.606 -16.836 -17.242 -17.545 -17.805 -18.083 -18.701 -19.045 -19.409 -19.826 -20.33 -20.858 -21.56 -23.83 -5 ,25681 ,TETRA ,17585095,Sat Nov 27 11:39:46 CET,Sat Nov 27 13:59:26 CET,0.0 1.026 1.432 1.773 2.088 2.364 2.601 2.813 3.184 3.341 3.496 3.647 3.954 4.101 4.388 4.649 4.881 4.99 5.201 5.405 5.682 5.848 6.01 6.239 6.451 6.676 6.901 7.098 7.331 7.55 7.762 8.0 8.21 8.405 8.632 8.877 9.098 9.344 9.593 9.849 10.171 10.589 11.077 11.488 11.838 12.158 12.478 12.739 12.856 12.365 10.677 8.119 5.733 3.556 1.657 0.027 -1.423 -2.788 -3.982 -5.154 -6.16 -7.045 -7.916 -8.733 -9.468 -10.129 -10.813 -11.453 -12.024 -12.6 -13.181 -13.648 -14.136 -14.659 -15.077 -15.524 -15.981 -16.426 -16.877 -17.193 -17.531 -18.085 -18.449 -18.806 -18.993 -19.38 -19.807 -20.25 -20.478 -20.89 -21.243 -21.547 -21.864 -22.525 -22.854 -23.22 -23.64 -24.12 -24.708 -25.574 -28.905 -6 ,22635 ,TETRA ,17585096,Sat Nov 27 11:39:46 CET,Sat Nov 27 14:00:05 CET,0.0 1.462 1.986 2.414 2.724 2.989 3.241 3.459 3.835 4.008 4.177 4.346 4.645 4.787 5.064 5.31 5.534 5.646 5.872 6.092 6.39 6.575 6.745 6.976 7.194 7.396 7.59 7.78 8.01 8.222 8.443 8.713 8.95 9.169 9.408 9.66 9.898 10.149 10.39 10.634 10.872 11.081 11.288 11.471 11.633 11.732 11.76 11.664 11.318 10.559 8.907 6.366 4.102 2.084 0.309 -1.3 -2.767 -4.126 -5.312 -6.472 -7.436 -8.299 -9.122 -9.906 -10.634 -11.262 -11.91 -12.49 -13.007 -13.538 -14.073 -14.51 -14.956 -15.422 -15.781 -16.176 -16.62 -17.082 -17.53 -17.836 -18.15 -18.622 -18.946 -19.288 -19.463 -19.826 -20.217 -20.64 -20.866 -21.27 -21.571 -21.84 -22.109 -22.693 -23.013 -23.342 -23.715 -24.177 -24.758 -25.548 -27.51 -7 ,31724 ,TETRA ,17585097,Sat Nov 27 11:39:48 CET,Sat Nov 27 13:58:31 CET,0.0 1.318 1.87 2.218 2.521 2.809 3.044 3.262 3.676 3.857 4.02 4.171 4.472 4.618 4.892 5.131 5.359 5.464 5.672 5.878 6.166 6.343 6.513 6.747 6.968 7.171 7.357 7.548 7.8 8.046 8.271 8.524 8.763 8.992 9.241 9.488 9.716 9.959 10.21 10.462 10.706 10.979 11.265 11.463 11.612 11.708 11.668 11.458 11.043 10.208 8.439 6.016 3.909 2.113 0.528 -1.008 -2.379 -3.57 -4.554 -5.519 -6.359 -7.124 -7.861 -8.548 -9.182 -9.757 -10.389 -10.958 -11.424 -11.928 -12.482 -12.929 -13.395 -13.87 -14.23 -14.615 -15.0 -15.391 -15.818 -16.121 -16.436 -16.935 -17.27 -17.602 -17.776 -18.166 -18.576 -18.993 -19.214 -19.629 -19.96 -20.223 -20.485 -21.053 -21.397 -21.745 -22.102 -22.506 -23.021 -23.764 -25.382 -8 ,3136 ,TETRA ,17585098,Sat Nov 27 11:39:46 CET,Sat Nov 27 14:06:59 CET,0.0 0.966 1.457 1.854 2.168 2.445 2.689 2.92 3.335 3.509 3.669 3.813 4.124 4.282 4.567 4.829 5.07 5.191 5.43 5.641 5.93 6.123 6.323 6.618 6.887 7.136 7.376 7.611 7.912 8.197 8.467 8.792 9.104 9.399 9.725 10.067 10.372 10.715 11.094 11.479 11.851 12.233 12.65 13.065 13.555 13.962 14.267 14.504 14.446 13.643 11.606 8.841 6.53 4.373 2.377 0.629 -0.822 -2.141 -3.312 -4.492 -5.569 -6.532 -7.41 -8.231 -9.003 -9.68 -10.378 -11.021 -11.579 -12.141 -12.704 -13.179 -13.664 -14.181 -14.61 -15.051 -15.489 -15.924 -16.386 -16.705 -17.021 -17.519 -17.862 -18.222 -18.413 -18.798 -19.194 -19.628 -19.859 -20.286 -20.677 -20.984 -21.293 -21.969 -22.32 -22.699 -23.147 -23.643 -24.267 -25.08 -27.254 -9 ,21391 ,TETRA ,17585099,Sat Nov 27 11:39:46 CET,Sat Nov 27 13:53:39 CET,0.0 0.81 1.308 1.688 2.023 2.3 2.551 2.787 3.2 3.397 3.584 3.763 4.078 4.244 4.548 4.835 5.106 5.235 5.494 5.738 6.055 6.261 6.47 6.763 7.037 7.305 7.555 7.793 8.104 8.395 8.661 8.985 9.293 9.577 9.904 10.253 10.578 10.941 11.311 11.687 12.07 12.467 12.925 13.303 13.668 14.007 14.237 14.35 14.252 13.617 11.83 9.324 7.111 5.117 3.27 1.511 0.018 -1.244 -2.262 -3.266 -4.13 -4.913 -5.669 -6.379 -7.034 -7.612 -8.233 -8.787 -9.268 -9.782 -10.311 -10.76 -11.222 -11.663 -12.022 -12.42 -12.823 -13.24 -13.69 -13.995 -14.296 -14.759 -15.097 -15.448 -15.619 -15.984 -16.388 -16.815 -17.03 -17.432 -17.743 -17.997 -18.273 -18.907 -19.251 -19.604 -19.983 -20.418 -20.966 -21.712 -23.883 -10 ,11233 ,TETRA ,17585100,Sat Nov 27 11:39:46 CET,Sat Nov 27 14:01:51 CET,0.0 1.116 1.567 1.888 2.173 2.441 2.684 2.901 3.305 3.498 3.685 3.891 4.2 4.353 4.637 4.896 5.152 5.278 5.528 5.777 6.127 6.338 6.545 6.852 7.133 7.395 7.645 7.883 8.182 8.469 8.746 9.063 9.347 9.612 9.92 10.264 10.586 10.937 11.305 11.658 12.016 12.415 12.817 13.185 13.594 13.929 14.157 14.281 14.136 13.532 11.964 9.419 6.996 4.83 2.992 1.382 -0.062 -1.379 -2.519 -3.636 -4.578 -5.435 -6.249 -7.036 -7.797 -8.478 -9.174 -9.79 -10.315 -10.872 -11.468 -11.963 -12.455 -12.954 -13.345 -13.769 -14.224 -14.679 -15.136 -15.461 -15.794 -16.302 -16.673 -17.069 -17.27 -17.677 -18.113 -18.562 -18.799 -19.239 -19.614 -19.907 -20.215 -20.878 -21.233 -21.61 -22.032 -22.559 -23.172 -24.024 -26.489 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt deleted file mode 100644 index a8da4037..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8934 ,KEBNE ,17024112,Wed Dec 22 09:24:06 CET,Wed Dec 22 11:17:35 CET,0.0 1.19 1.704 2.09 2.41 2.704 2.984 3.23 3.66 3.867 4.067 4.269 4.595 4.758 5.056 5.352 5.643 5.786 6.046 6.296 6.66 6.897 7.13 7.463 7.786 8.096 8.39 8.668 9.019 9.365 9.695 10.09 10.469 10.836 11.25 11.692 12.116 12.589 13.099 13.61 14.132 14.718 15.385 16.026 16.748 17.544 18.404 19.279 20.079 20.73 21.229 21.007 20.312 19.555 18.782 17.976 17.238 16.515 15.815 15.132 14.557 14.014 13.485 12.996 12.529 12.087 11.628 11.211 10.858 10.487 10.096 9.792 9.461 9.113 8.855 8.578 8.267 7.938 7.609 7.392 7.17 6.81 6.563 6.308 6.173 5.9 5.604 5.28 5.113 4.775 4.535 4.332 4.119 3.681 3.455 3.203 2.908 2.548 2.16 1.631 0.419 -2 ,11332 ,KEBNE ,17024113,Wed Dec 22 09:24:06 CET,Wed Dec 22 11:18:39 CET,0.0 0.987 1.462 1.853 2.195 2.504 2.78 3.04 3.528 3.745 3.949 4.184 4.531 4.708 5.041 5.359 5.666 5.81 6.074 6.33 6.71 6.956 7.191 7.518 7.817 8.102 8.375 8.643 9.0 9.34 9.66 10.044 10.417 10.773 11.179 11.623 12.029 12.465 12.945 13.45 13.975 14.582 15.266 15.928 16.711 17.56 18.432 19.299 20.15 20.827 21.053 20.483 19.664 18.832 18.016 17.216 16.489 15.829 15.24 14.612 14.02 13.476 12.959 12.462 11.985 11.541 11.085 10.677 10.32 9.949 9.561 9.235 8.888 8.522 8.244 7.951 7.641 7.33 7.017 6.797 6.552 6.16 5.893 5.626 5.487 5.192 4.881 4.55 4.384 4.067 3.864 3.658 3.441 2.944 2.683 2.394 2.076 1.735 1.36 0.885 -0.335 -3 ,27286 ,KEBNE ,17024114,Wed Dec 22 09:24:09 CET,Wed Dec 22 11:15:07 CET,0.0 1.051 1.537 1.907 2.248 2.565 2.859 3.14 3.631 3.859 4.086 4.367 4.714 4.895 5.242 5.573 5.889 6.037 6.32 6.584 6.967 7.22 7.46 7.793 8.095 8.391 8.694 9.001 9.411 9.786 10.135 10.556 10.952 11.326 11.754 12.223 12.693 13.218 13.746 14.321 14.933 15.576 16.304 16.987 17.678 18.394 19.181 19.934 20.664 21.374 21.811 21.344 20.503 19.648 18.696 17.803 17.072 16.372 15.713 15.031 14.436 13.884 13.363 12.88 12.415 11.985 11.534 11.126 10.757 10.37 9.971 9.633 9.287 8.933 8.657 8.365 8.056 7.726 7.388 7.155 6.916 6.564 6.321 6.047 5.898 5.606 5.312 4.974 4.796 4.479 4.287 4.096 3.893 3.455 3.215 2.969 2.694 2.385 2.007 1.529 0.255 -4 ,19946 ,KEBNE ,17024115,Wed Dec 22 09:25:08 CET,Wed Dec 22 11:18:17 CET,0.0 0.955 1.422 1.825 2.157 2.454 2.721 2.975 3.457 3.672 3.885 4.145 4.481 4.647 4.982 5.314 5.631 5.782 6.067 6.341 6.744 6.996 7.245 7.605 7.945 8.278 8.599 8.9 9.273 9.627 9.988 10.433 10.845 11.236 11.696 12.228 12.728 13.234 13.745 14.282 14.865 15.542 16.317 17.027 17.807 18.675 19.587 20.412 21.215 22.048 22.556 22.232 21.522 20.72 19.955 19.191 18.439 17.707 17.049 16.378 15.809 15.31 14.82 14.341 13.862 13.422 12.993 12.596 12.228 11.838 11.444 11.121 10.771 10.412 10.141 9.857 9.556 9.244 8.918 8.686 8.448 8.08 7.832 7.573 7.434 7.128 6.795 6.462 6.294 5.966 5.727 5.512 5.31 4.882 4.627 4.357 4.076 3.732 3.302 2.771 1.224 -5 ,27840 ,KEBNE ,17024116,Wed Dec 22 09:25:12 CET,Wed Dec 22 11:15:18 CET,0.0 1.204 1.71 2.09 2.44 2.733 2.991 3.24 3.668 3.885 4.1 4.309 4.644 4.817 5.137 5.425 5.696 5.831 6.084 6.324 6.697 6.939 7.167 7.483 7.782 8.069 8.358 8.641 8.993 9.324 9.65 10.052 10.443 10.833 11.273 11.773 12.25 12.763 13.313 13.872 14.48 15.178 15.928 16.646 17.473 18.336 19.188 20.059 21.019 21.996 22.645 22.36 21.734 20.969 20.1 19.199 18.414 17.685 17.049 16.412 15.863 15.336 14.795 14.295 13.84 13.419 12.964 12.561 12.221 11.864 11.486 11.166 10.82 10.459 10.181 9.89 9.596 9.3 8.977 8.746 8.508 8.132 7.863 7.582 7.443 7.146 6.822 6.49 6.321 5.995 5.801 5.611 5.408 4.954 4.716 4.464 4.175 3.838 3.434 2.927 1.811 -6 ,10045 ,KEBNE ,17024117,Wed Dec 22 09:26:10 CET,Wed Dec 22 11:20:24 CET,0.0 1.375 1.955 2.368 2.744 3.073 3.355 3.6 4.042 4.249 4.451 4.684 5.019 5.195 5.536 5.861 6.17 6.321 6.613 6.893 7.28 7.522 7.753 8.087 8.403 8.692 8.955 9.212 9.57 9.917 10.248 10.641 11.009 11.361 11.779 12.256 12.685 13.139 13.622 14.115 14.636 15.217 15.891 16.593 17.351 18.087 18.902 19.77 20.557 21.045 21.175 20.792 20.022 19.133 18.222 17.361 16.566 15.824 15.171 14.487 13.895 13.35 12.811 12.292 11.798 11.364 10.92 10.501 10.126 9.732 9.329 9.003 8.664 8.306 8.02 7.713 7.408 7.103 6.787 6.565 6.318 5.928 5.666 5.398 5.259 4.983 4.698 4.381 4.201 3.865 3.643 3.444 3.237 2.775 2.507 2.218 1.916 1.563 1.163 0.674 -0.436 -7 ,3869 ,KEBNE ,17024118,Wed Dec 22 09:26:10 CET,Wed Dec 22 11:20:20 CET,0.0 0.838 1.292 1.663 2.001 2.31 2.585 2.848 3.332 3.553 3.774 4.037 4.383 4.55 4.883 5.216 5.524 5.668 5.956 6.242 6.652 6.903 7.149 7.517 7.865 8.195 8.518 8.831 9.231 9.601 9.954 10.39 10.803 11.206 11.669 12.177 12.653 13.17 13.711 14.299 14.902 15.529 16.28 16.989 17.737 18.554 19.429 20.257 21.146 21.975 22.43 22.212 21.571 20.798 20.016 19.21 18.443 17.753 17.137 16.49 15.933 15.416 14.906 14.425 13.95 13.507 13.054 12.644 12.305 11.957 11.562 11.216 10.867 10.507 10.222 9.931 9.625 9.299 8.959 8.725 8.487 8.135 7.901 7.647 7.511 7.235 6.937 6.6 6.428 6.111 5.901 5.712 5.517 5.085 4.836 4.573 4.298 3.984 3.63 3.147 2.147 -8 ,9274 ,KEBNE ,17024119,Wed Dec 22 09:26:10 CET,Wed Dec 22 11:19:49 CET,0.0 1.437 2.0 2.411 2.747 3.055 3.332 3.588 4.073 4.291 4.492 4.715 5.049 5.217 5.54 5.844 6.138 6.278 6.543 6.814 7.257 7.541 7.788 8.137 8.453 8.75 9.042 9.312 9.66 9.994 10.326 10.728 11.102 11.466 11.88 12.342 12.778 13.259 13.784 14.31 14.832 15.398 16.069 16.736 17.466 18.226 19.003 19.84 20.705 21.314 21.583 21.374 20.792 20.053 19.236 18.463 17.801 17.167 16.57 15.949 15.389 14.886 14.404 13.943 13.507 13.09 12.63 12.221 11.87 11.501 11.124 10.792 10.438 10.075 9.792 9.495 9.183 8.845 8.497 8.27 8.031 7.652 7.399 7.129 6.99 6.709 6.41 6.101 5.931 5.586 5.374 5.177 4.963 4.497 4.251 3.967 3.626 3.264 2.842 2.309 1.133 -9 ,7858 ,KEBNE ,17024120,Wed Dec 22 09:26:10 CET,Wed Dec 22 11:20:14 CET,0.0 0.872 1.38 1.804 2.143 2.482 2.786 3.035 3.51 3.743 3.968 4.223 4.554 4.739 5.108 5.449 5.769 5.92 6.207 6.483 6.873 7.118 7.361 7.717 8.047 8.36 8.663 8.96 9.336 9.689 10.032 10.445 10.862 11.287 11.754 12.266 12.754 13.26 13.778 14.322 14.91 15.564 16.278 16.926 17.629 18.416 19.262 20.056 20.789 21.431 21.866 21.587 20.883 20.043 19.158 18.282 17.492 16.754 16.081 15.373 14.74 14.185 13.664 13.167 12.692 12.26 11.818 11.404 11.054 10.699 10.309 9.994 9.671 9.334 9.069 8.785 8.478 8.168 7.845 7.613 7.383 7.028 6.775 6.499 6.352 6.054 5.745 5.416 5.245 4.918 4.693 4.49 4.282 3.772 3.48 3.169 2.825 2.46 2.059 1.555 0.619 -10 ,8902 ,KEBNE ,17024121,Wed Dec 22 09:26:10 CET,Wed Dec 22 11:20:16 CET,0.0 1.137 1.662 2.064 2.459 2.816 3.133 3.429 3.947 4.176 4.387 4.615 4.953 5.131 5.489 5.848 6.196 6.356 6.646 6.927 7.336 7.59 7.829 8.184 8.537 8.87 9.197 9.506 9.883 10.256 10.614 11.034 11.449 11.861 12.33 12.838 13.329 13.842 14.361 14.939 15.571 16.265 17.06 17.84 18.672 19.587 20.537 21.438 22.332 23.172 23.712 23.343 22.568 21.793 21.006 20.173 19.378 18.637 18.016 17.397 16.846 16.343 15.837 15.334 14.86 14.439 13.969 13.538 13.19 12.834 12.449 12.118 11.775 11.424 11.149 10.856 10.542 10.215 9.884 9.659 9.425 9.062 8.81 8.54 8.401 8.114 7.806 7.473 7.299 6.959 6.725 6.528 6.335 5.861 5.579 5.282 4.977 4.613 4.153 3.62 2.346 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt deleted file mode 100644 index c3cc3260..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12989 ,KEBNE ,17024122,Wed Dec 22 09:26:10 CET,Wed Dec 22 11:20:58 CET,0.0 1.478 2.096 2.561 2.934 3.251 3.553 3.841 4.347 4.589 4.819 5.1 5.464 5.654 6.012 6.361 6.692 6.847 7.135 7.413 7.829 8.097 8.357 8.736 9.096 9.426 9.742 10.062 10.474 10.853 11.215 11.659 12.071 12.483 12.988 13.531 14.033 14.586 15.189 15.799 16.409 17.082 17.888 18.68 19.546 20.522 21.588 22.643 23.653 24.573 25.34 25.433 24.983 24.3 23.588 22.949 22.33 21.683 21.066 20.413 19.824 19.277 18.757 18.276 17.822 17.399 16.957 16.559 16.209 15.838 15.447 15.136 14.804 14.448 14.169 13.866 13.548 13.218 12.863 12.608 12.354 11.983 11.708 11.409 11.259 10.962 10.636 10.284 10.114 9.791 9.56 9.35 9.117 8.613 8.321 8.007 7.664 7.297 6.873 6.299 4.708 -2 ,24736 ,KEBNE ,17024123,Wed Dec 22 09:26:10 CET,Wed Dec 22 11:20:02 CET,0.0 1.255 1.799 2.23 2.606 2.916 3.215 3.516 4.05 4.284 4.503 4.791 5.159 5.363 5.761 6.124 6.463 6.625 6.944 7.251 7.659 7.925 8.193 8.59 8.965 9.323 9.671 10.007 10.432 10.825 11.201 11.649 12.078 12.489 12.964 13.515 14.071 14.696 15.352 16.016 16.702 17.463 18.344 19.228 20.276 21.392 22.579 23.878 25.152 26.468 27.756 28.021 27.607 27.079 26.402 25.62 24.881 24.126 23.445 22.724 22.128 21.613 21.081 20.564 20.082 19.646 19.19 18.788 18.431 18.038 17.626 17.298 16.962 16.605 16.327 16.043 15.766 15.456 15.114 14.889 14.656 14.291 14.035 13.759 13.614 13.325 13.027 12.708 12.538 12.202 11.957 11.74 11.515 11.022 10.751 10.463 10.128 9.764 9.341 8.821 7.634 -3 ,13874 ,KEBNE ,17024124,Wed Dec 22 09:26:14 CET,Wed Dec 22 11:16:32 CET,0.0 1.222 1.837 2.288 2.652 2.964 3.25 3.533 4.045 4.294 4.539 4.831 5.206 5.405 5.766 6.119 6.459 6.628 6.963 7.27 7.707 7.995 8.261 8.638 9.016 9.372 9.697 10.012 10.432 10.837 11.222 11.675 12.11 12.548 13.072 13.65 14.18 14.748 15.346 15.972 16.648 17.419 18.324 19.184 20.124 21.141 22.325 23.634 25.035 26.497 27.596 27.811 27.535 26.945 26.18 25.361 24.614 23.911 23.251 22.597 22.011 21.448 20.91 20.41 19.945 19.512 19.082 18.698 18.341 17.946 17.531 17.19 16.829 16.455 16.167 15.878 15.567 15.226 14.876 14.635 14.388 14.009 13.742 13.471 13.327 13.013 12.694 12.36 12.185 11.856 11.629 11.416 11.186 10.707 10.456 10.166 9.839 9.499 9.112 8.619 7.578 -4 ,31501 ,KEBNE ,17024125,Wed Dec 22 09:26:10 CET,Wed Dec 22 11:19:16 CET,0.0 1.641 2.141 2.555 2.943 3.289 3.599 3.867 4.31 4.533 4.752 5.008 5.358 5.546 5.912 6.261 6.585 6.737 7.033 7.32 7.73 7.992 8.247 8.609 8.954 9.284 9.614 9.934 10.323 10.693 11.057 11.5 11.919 12.32 12.776 13.297 13.797 14.326 14.873 15.447 16.079 16.764 17.557 18.373 19.299 20.266 21.31 22.466 23.652 24.757 25.664 25.88 25.502 24.856 24.121 23.382 22.667 21.954 21.293 20.648 20.075 19.514 18.976 18.477 18.01 17.564 17.104 16.706 16.348 15.966 15.569 15.239 14.912 14.578 14.305 14.007 13.701 13.388 13.063 12.835 12.596 12.23 11.984 11.729 11.593 11.3 10.977 10.644 10.482 10.158 9.911 9.697 9.468 8.995 8.736 8.435 8.14 7.803 7.376 6.804 5.057 -5 ,4825 ,KEBNE ,17024126,Wed Dec 22 09:26:10 CET,Wed Dec 22 11:20:46 CET,0.0 1.151 1.723 2.179 2.587 2.937 3.235 3.498 3.982 4.218 4.432 4.662 5.014 5.199 5.55 5.896 6.215 6.368 6.672 6.961 7.364 7.616 7.86 8.225 8.583 8.925 9.26 9.593 10.029 10.448 10.839 11.28 11.691 12.091 12.561 13.123 13.671 14.268 14.904 15.572 16.275 17.027 17.851 18.642 19.575 20.602 21.69 22.819 23.993 25.191 26.189 26.257 25.813 25.154 24.356 23.557 22.836 22.194 21.589 20.902 20.325 19.803 19.271 18.754 18.268 17.823 17.353 16.926 16.541 16.147 15.745 15.403 15.039 14.673 14.388 14.086 13.766 13.435 13.099 12.862 12.617 12.206 11.904 11.606 11.456 11.145 10.819 10.47 10.288 9.95 9.711 9.498 9.266 8.778 8.491 8.171 7.842 7.462 6.978 6.363 4.529 -6 ,28092 ,KEBNE ,17024127,Wed Dec 22 09:26:10 CET,Wed Dec 22 11:19:58 CET,0.0 1.572 2.12 2.579 2.961 3.282 3.565 3.838 4.352 4.589 4.815 5.067 5.419 5.609 5.975 6.304 6.623 6.785 7.094 7.377 7.773 8.033 8.286 8.658 9.016 9.35 9.668 9.98 10.389 10.789 11.173 11.627 12.056 12.467 12.935 13.442 13.941 14.51 15.095 15.681 16.303 17.035 17.869 18.685 19.619 20.613 21.759 23.009 24.299 25.423 26.049 26.103 25.79 25.216 24.498 23.771 23.107 22.394 21.745 21.072 20.458 19.936 19.441 18.971 18.508 18.062 17.606 17.185 16.815 16.446 16.048 15.712 15.367 15.013 14.731 14.431 14.125 13.801 13.459 13.222 12.977 12.589 12.312 12.009 11.851 11.54 11.222 10.879 10.702 10.365 10.136 9.92 9.692 9.208 8.932 8.636 8.302 7.938 7.512 6.955 5.603 -7 ,31509 ,KEBNE ,17024128,Wed Dec 22 09:26:10 CET,Wed Dec 22 11:20:47 CET,0.0 1.547 2.106 2.567 2.935 3.3 3.632 3.916 4.395 4.611 4.82 5.06 5.409 5.59 5.951 6.297 6.62 6.778 7.08 7.369 7.774 8.023 8.274 8.648 9.0 9.327 9.631 9.929 10.333 10.715 11.087 11.534 11.947 12.335 12.796 13.311 13.794 14.319 14.901 15.523 16.166 16.916 17.773 18.588 19.495 20.502 21.682 22.919 24.165 25.406 26.612 27.025 26.694 26.178 25.601 24.93 24.233 23.548 22.918 22.268 21.666 21.099 20.577 20.095 19.659 19.25 18.811 18.408 18.06 17.69 17.287 16.965 16.625 16.263 15.981 15.687 15.389 15.084 14.747 14.505 14.265 13.876 13.593 13.301 13.153 12.869 12.578 12.253 12.08 11.749 11.5 11.28 11.066 10.6 10.343 10.068 9.729 9.369 8.974 8.41 6.942 -8 ,564 ,KEBNE ,17024129,Wed Dec 22 09:26:10 CET,Wed Dec 22 11:20:04 CET,0.0 1.635 2.187 2.635 3.033 3.383 3.691 3.985 4.539 4.809 5.051 5.287 5.632 5.822 6.185 6.525 6.855 7.012 7.327 7.63 8.033 8.3 8.563 8.928 9.288 9.629 9.958 10.276 10.694 11.094 11.459 11.895 12.317 12.723 13.177 13.679 14.172 14.702 15.283 15.935 16.608 17.337 18.178 19.012 19.964 20.98 22.089 23.312 24.611 25.765 26.565 26.478 25.775 24.935 24.145 23.347 22.561 21.814 21.161 20.479 19.843 19.253 18.678 18.142 17.655 17.217 16.749 16.322 15.96 15.581 15.175 14.837 14.5 14.146 13.872 13.598 13.301 12.975 12.622 12.378 12.136 11.764 11.497 11.211 11.064 10.746 10.406 10.051 9.863 9.52 9.254 9.027 8.795 8.287 8.015 7.715 7.385 7.014 6.593 6.064 4.49 -9 ,1214 ,KEBNE ,17024130,Wed Dec 22 09:27:12 CET,Wed Dec 22 11:21:53 CET,0.0 1.053 1.57 2.019 2.392 2.699 2.974 3.229 3.716 3.951 4.179 4.444 4.792 4.973 5.318 5.637 5.951 6.104 6.396 6.675 7.07 7.331 7.593 7.975 8.331 8.662 8.983 9.291 9.691 10.085 10.467 10.913 11.331 11.732 12.195 12.723 13.24 13.805 14.4 15.002 15.621 16.334 17.127 17.872 18.742 19.663 20.618 21.681 22.889 24.093 25.22 25.414 24.83 24.05 23.251 22.507 21.836 21.171 20.534 19.867 19.277 18.745 18.224 17.722 17.256 16.832 16.404 16.012 15.643 15.247 14.844 14.511 14.155 13.794 13.517 13.214 12.898 12.568 12.222 11.984 11.734 11.348 11.073 10.785 10.643 10.35 10.033 9.681 9.499 9.153 8.904 8.686 8.458 7.982 7.69 7.351 7.02 6.654 6.199 5.593 3.925 -10 ,25737 ,KEBNE ,17024131,Wed Dec 22 09:27:13 CET,Wed Dec 22 11:20:39 CET,0.0 1.659 2.235 2.681 3.045 3.361 3.651 3.916 4.395 4.613 4.817 5.049 5.381 5.562 5.92 6.247 6.551 6.699 6.991 7.288 7.735 8.015 8.281 8.655 9.006 9.334 9.642 9.941 10.327 10.703 11.059 11.488 11.895 12.286 12.752 13.275 13.79 14.36 14.942 15.545 16.185 16.869 17.652 18.437 19.312 20.284 21.377 22.498 23.641 24.633 25.237 25.129 24.567 23.878 23.17 22.411 21.678 20.991 20.357 19.684 19.059 18.473 17.925 17.408 16.938 16.503 16.04 15.631 15.275 14.888 14.482 14.162 13.826 13.47 13.191 12.908 12.608 12.286 11.954 11.729 11.489 11.11 10.85 10.561 10.412 10.117 9.793 9.459 9.283 8.938 8.705 8.503 8.296 7.827 7.554 7.256 6.932 6.55 6.125 5.527 3.421 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index acb20e0b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3307 ,KEBNE ,17024132,Wed Dec 22 09:27:12 CET,Wed Dec 22 11:16:44 CET,0.0 0.393 0.719 0.995 1.247 1.468 1.676 2.078 2.267 2.44 2.582 2.891 3.059 3.358 3.618 3.877 4.004 4.237 4.46 4.773 4.988 5.197 5.486 5.777 6.058 6.323 6.583 6.915 7.215 7.5 7.838 8.169 8.499 8.894 9.327 9.718 10.161 10.642 11.128 11.637 12.229 12.88 13.509 14.246 14.991 15.748 16.557 17.354 18.048 18.446 18.188 17.559 16.686 15.822 15.023 14.266 13.553 12.861 12.118 11.464 10.846 10.259 9.702 9.162 8.66 8.17 7.733 7.339 6.937 6.507 6.137 5.736 5.304 4.941 4.562 4.195 3.839 3.46 3.17 2.841 2.288 1.895 1.503 1.287 0.794 0.289 -0.263 -0.563 -1.027 -1.548 -1.906 -2.281 -3.097 -3.58 -4.149 -4.781 -5.447 -6.278 -7.63 -2 ,21185 ,KEBNE ,17024133,Wed Dec 22 09:27:13 CET,Wed Dec 22 11:16:25 CET,0.0 0.388 0.663 0.921 1.168 1.395 1.588 1.921 2.094 2.279 2.449 2.754 2.898 3.168 3.426 3.676 3.799 4.011 4.2 4.491 4.687 4.882 5.166 5.441 5.72 5.992 6.25 6.597 6.921 7.214 7.553 7.895 8.241 8.642 9.085 9.501 9.94 10.378 10.842 11.318 11.845 12.495 13.134 13.838 14.607 15.466 16.333 17.191 17.95 18.31 17.889 17.124 16.326 15.585 14.788 13.921 13.07 12.341 11.583 10.848 10.169 9.553 8.999 8.467 7.958 7.464 7.029 6.629 6.202 5.735 5.338 4.924 4.484 4.133 3.741 3.316 2.885 2.456 2.16 1.863 1.408 1.063 0.657 0.43 -0.047 -0.528 -1.02 -1.29 -1.735 -2.203 -2.511 -2.896 -3.784 -4.233 -4.742 -5.349 -6.089 -7.15 -8.743 -3 ,14340 ,KEBNE ,17024134,Wed Dec 22 09:27:13 CET,Wed Dec 22 11:16:48 CET,0.0 0.498 0.851 1.136 1.398 1.648 1.889 2.286 2.47 2.655 2.83 3.141 3.287 3.571 3.833 4.074 4.194 4.419 4.638 4.966 5.172 5.369 5.651 5.917 6.175 6.432 6.688 7.015 7.336 7.636 7.974 8.285 8.593 8.961 9.368 9.763 10.184 10.62 11.103 11.614 12.161 12.767 13.353 14.06 14.799 15.507 16.274 17.166 17.915 18.084 17.52 16.747 15.86 14.975 14.166 13.411 12.617 11.873 11.097 10.397 9.792 9.202 8.626 8.103 7.619 7.101 6.622 6.197 5.766 5.326 4.962 4.577 4.158 3.827 3.466 3.065 2.65 2.206 1.886 1.557 1.053 0.696 0.306 0.103 -0.319 -0.728 -1.158 -1.403 -1.817 -2.281 -2.589 -2.921 -3.797 -4.311 -4.877 -5.556 -6.33 -7.28 -8.539 -4 ,19406 ,KEBNE ,17024135,Wed Dec 22 09:27:13 CET,Wed Dec 22 11:15:55 CET,0.0 0.462 0.805 1.091 1.31 1.523 1.737 2.12 2.292 2.447 2.594 2.901 3.046 3.312 3.559 3.796 3.913 4.135 4.352 4.662 4.86 5.065 5.374 5.67 5.948 6.224 6.499 6.852 7.213 7.553 7.918 8.255 8.587 8.977 9.406 9.806 10.248 10.726 11.23 11.744 12.292 12.907 13.529 14.244 15.011 15.842 16.663 17.447 18.19 18.657 18.296 17.601 16.828 16.014 15.163 14.325 13.477 12.677 11.824 11.097 10.44 9.832 9.285 8.753 8.263 7.73 7.234 6.773 6.265 5.766 5.358 4.931 4.466 4.091 3.708 3.313 2.9 2.452 2.122 1.779 1.256 0.884 0.486 0.272 -0.188 -0.68 -1.165 -1.413 -1.834 -2.295 -2.615 -2.964 -3.808 -4.298 -4.834 -5.462 -6.219 -7.126 -8.388 -5 ,8657 ,KEBNE ,17024136,Wed Dec 22 09:27:12 CET,Wed Dec 22 11:16:56 CET,0.0 0.409 0.733 1.048 1.33 1.572 1.796 2.173 2.351 2.526 2.702 3.004 3.142 3.403 3.67 3.94 4.063 4.296 4.531 4.888 5.103 5.299 5.59 5.876 6.144 6.394 6.635 6.943 7.248 7.547 7.905 8.256 8.598 8.982 9.402 9.789 10.206 10.674 11.17 11.676 12.209 12.813 13.431 14.12 14.858 15.682 16.519 17.432 18.192 18.408 17.828 17.066 16.33 15.521 14.674 13.89 13.132 12.458 11.769 11.152 10.601 10.09 9.574 9.07 8.614 8.079 7.584 7.166 6.731 6.275 5.911 5.532 5.107 4.722 4.28 3.845 3.393 2.906 2.577 2.255 1.748 1.37 0.975 0.76 0.292 -0.191 -0.751 -1.05 -1.504 -2.024 -2.362 -2.733 -3.594 -4.097 -4.643 -5.281 -6.024 -7.038 -8.508 -6 ,10910 ,KEBNE ,17024137,Wed Dec 22 09:27:12 CET,Wed Dec 22 11:16:50 CET,0.0 0.468 0.799 1.077 1.317 1.553 1.758 2.097 2.27 2.453 2.634 2.946 3.1 3.392 3.657 3.904 4.027 4.266 4.482 4.801 5.001 5.19 5.482 5.779 6.058 6.31 6.536 6.84 7.144 7.428 7.758 8.077 8.396 8.779 9.209 9.614 10.037 10.468 10.932 11.45 12.024 12.625 13.198 13.886 14.596 15.313 16.1 16.949 17.655 17.902 17.358 16.502 15.606 14.675 13.74 12.88 12.081 11.397 10.672 9.997 9.414 8.874 8.348 7.844 7.346 6.786 6.281 5.832 5.365 4.915 4.558 4.152 3.703 3.376 3.051 2.702 2.299 1.871 1.596 1.306 0.834 0.515 0.191 0.009 -0.381 -0.779 -1.227 -1.481 -1.897 -2.273 -2.552 -2.89 -3.648 -4.133 -4.671 -5.213 -5.846 -6.614 -8.143 -7 ,28987 ,KEBNE ,17024138,Wed Dec 22 09:27:13 CET,Wed Dec 22 11:16:51 CET,0.0 0.487 0.848 1.121 1.355 1.569 1.767 2.131 2.299 2.468 2.631 2.934 3.077 3.358 3.631 3.87 3.99 4.245 4.477 4.796 4.995 5.191 5.48 5.757 6.012 6.255 6.498 6.813 7.115 7.405 7.76 8.096 8.409 8.779 9.181 9.554 9.967 10.402 10.857 11.325 11.824 12.404 12.982 13.597 14.209 14.894 15.616 16.331 17.094 17.472 17.084 16.475 15.757 14.993 14.162 13.345 12.617 11.989 11.291 10.656 10.027 9.363 8.767 8.237 7.78 7.308 6.835 6.413 5.977 5.515 5.14 4.702 4.157 3.734 3.294 2.806 2.291 1.723 1.34 0.954 0.313 -0.113 -0.553 -0.799 -1.281 -1.779 -2.363 -2.666 -3.127 -3.614 -3.912 -4.234 -5.031 -5.511 -6.06 -6.681 -7.465 -8.477 -10.137 -8 ,11432 ,KEBNE ,17024139,Wed Dec 22 09:27:13 CET,Wed Dec 22 11:17:08 CET,0.0 0.337 0.622 0.85 1.055 1.255 1.439 1.8 1.974 2.12 2.229 2.526 2.658 2.906 3.152 3.395 3.511 3.753 3.983 4.294 4.502 4.712 5.004 5.263 5.525 5.792 6.041 6.358 6.67 6.973 7.332 7.659 7.985 8.383 8.811 9.203 9.633 10.101 10.59 11.082 11.606 12.21 12.836 13.531 14.259 15.095 15.993 16.893 17.763 18.448 18.237 17.558 16.753 15.967 15.217 14.48 13.763 13.121 12.384 11.713 11.119 10.517 9.965 9.473 9.023 8.536 8.084 7.693 7.26 6.791 6.414 6.022 5.594 5.263 4.93 4.563 4.177 3.74 3.413 3.1 2.62 2.279 1.895 1.7 1.275 0.817 0.372 0.12 -0.29 -0.719 -1.031 -1.373 -2.298 -2.837 -3.365 -4.017 -4.77 -5.726 -7.187 -9 ,18055 ,KEBNE ,17024140,Wed Dec 22 09:27:13 CET,Wed Dec 22 11:16:53 CET,0.0 0.435 0.791 1.103 1.333 1.55 1.763 2.121 2.296 2.471 2.652 2.967 3.108 3.372 3.628 3.88 4.0 4.24 4.47 4.793 5.009 5.227 5.54 5.837 6.124 6.401 6.678 7.041 7.385 7.696 8.054 8.417 8.783 9.194 9.621 10.005 10.414 10.868 11.344 11.85 12.433 13.058 13.671 14.42 15.217 16.057 16.851 17.617 18.284 18.552 18.062 17.244 16.377 15.528 14.712 13.977 13.239 12.574 11.859 11.203 10.631 10.073 9.504 8.96 8.467 7.949 7.471 7.049 6.602 6.131 5.726 5.276 4.808 4.459 4.11 3.74 3.343 2.918 2.626 2.345 1.872 1.514 1.155 0.957 0.526 0.089 -0.361 -0.593 -0.986 -1.413 -1.738 -2.078 -2.838 -3.279 -3.857 -4.513 -5.175 -6.043 -7.365 -10 ,9229 ,KEBNE ,17024141,Wed Dec 22 09:27:13 CET,Wed Dec 22 11:17:08 CET,0.0 0.408 0.738 1.02 1.297 1.537 1.736 2.104 2.291 2.473 2.654 2.971 3.122 3.412 3.699 3.965 4.091 4.337 4.566 4.904 5.138 5.362 5.674 5.984 6.279 6.574 6.858 7.213 7.543 7.846 8.222 8.593 8.942 9.327 9.724 10.082 10.464 10.899 11.379 11.888 12.47 13.09 13.698 14.403 15.125 15.908 16.674 17.352 17.96 18.195 17.639 16.746 15.743 14.778 13.872 12.987 12.154 11.413 10.635 9.991 9.433 8.896 8.364 7.857 7.404 6.906 6.425 5.991 5.553 5.092 4.689 4.261 3.822 3.498 3.171 2.829 2.454 2.018 1.705 1.377 0.865 0.531 0.189 0.01 -0.36 -0.754 -1.228 -1.492 -1.906 -2.304 -2.575 -2.883 -3.688 -4.197 -4.71 -5.332 -6.016 -6.815 -8.153 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index c5299dd8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22130 ,TETRA ,17585101,Sat Nov 27 11:39:46 CET,Sat Nov 27 13:59:16 CET,0.0 1.021 1.515 1.903 2.231 2.514 2.783 3.037 3.489 3.702 3.915 4.135 4.478 4.653 4.977 5.287 5.586 5.733 6.018 6.287 6.661 6.894 7.121 7.453 7.766 8.07 8.368 8.656 9.025 9.388 9.731 10.134 10.526 10.901 11.325 11.789 12.237 12.73 13.247 13.815 14.402 15.032 15.772 16.49 17.321 18.237 19.261 20.358 21.586 22.822 23.919 24.394 24.312 23.982 23.521 23.007 22.487 21.939 21.434 20.925 20.496 20.11 19.704 19.285 18.874 18.505 18.136 17.798 17.494 17.176 16.846 16.572 16.289 15.982 15.729 15.467 15.193 14.903 14.601 14.4 14.192 13.84 13.583 13.331 13.198 12.925 12.653 12.35 12.193 11.892 11.699 11.51 11.318 10.899 10.667 10.419 10.142 9.819 9.404 8.85 7.648 -2 ,2769 ,TETRA ,17585102,Sat Nov 27 11:39:48 CET,Sat Nov 27 13:59:43 CET,0.0 1.182 1.711 2.113 2.43 2.696 2.953 3.202 3.663 3.872 4.064 4.276 4.615 4.804 5.155 5.46 5.751 5.893 6.164 6.42 6.785 7.019 7.245 7.576 7.901 8.203 8.485 8.757 9.115 9.475 9.829 10.255 10.654 11.032 11.467 11.936 12.386 12.89 13.422 13.991 14.584 15.231 15.978 16.727 17.582 18.494 19.504 20.594 21.757 22.949 24.115 24.633 24.38 23.898 23.298 22.663 22.122 21.585 21.101 20.626 20.205 19.784 19.35 18.931 18.547 18.2 17.824 17.473 17.174 16.86 16.52 16.228 15.913 15.599 15.366 15.121 14.864 14.591 14.302 14.103 13.9 13.566 13.324 13.066 12.935 12.666 12.359 12.035 11.871 11.553 11.32 11.122 10.913 10.472 10.223 9.941 9.646 9.326 8.932 8.482 7.318 -3 ,26712 ,TETRA ,17585103,Sat Nov 27 11:39:47 CET,Sat Nov 27 13:53:18 CET,0.0 1.449 1.969 2.358 2.717 3.021 3.286 3.544 4.023 4.236 4.432 4.631 4.959 5.129 5.465 5.784 6.077 6.21 6.478 6.746 7.13 7.375 7.606 7.94 8.26 8.574 8.875 9.169 9.536 9.88 10.219 10.627 11.025 11.416 11.861 12.337 12.793 13.308 13.855 14.419 15.003 15.643 16.386 17.125 17.917 18.788 19.849 20.996 22.166 23.317 24.444 24.922 24.793 24.438 23.955 23.41 22.869 22.372 21.92 21.419 20.962 20.535 20.107 19.684 19.311 18.96 18.555 18.194 17.879 17.553 17.209 16.925 16.634 16.32 16.081 15.848 15.607 15.337 15.048 14.846 14.63 14.284 14.042 13.79 13.66 13.394 13.1 12.759 12.584 12.263 12.053 11.864 11.657 11.202 10.954 10.694 10.409 10.057 9.671 9.219 8.059 -4 ,26810 ,TETRA ,17585104,Sat Nov 27 11:39:47 CET,Sat Nov 27 13:59:16 CET,0.0 1.189 1.712 2.099 2.428 2.727 2.994 3.254 3.718 3.922 4.132 4.379 4.72 4.895 5.22 5.519 5.817 5.964 6.247 6.511 6.886 7.141 7.392 7.74 8.074 8.387 8.677 8.964 9.337 9.69 10.036 10.465 10.862 11.236 11.682 12.168 12.617 13.11 13.633 14.208 14.795 15.415 16.139 16.833 17.666 18.636 19.68 20.773 21.947 23.191 24.326 24.733 24.632 24.267 23.798 23.244 22.661 22.116 21.624 21.083 20.583 20.099 19.598 19.101 18.648 18.249 17.835 17.478 17.149 16.81 16.479 16.196 15.912 15.615 15.367 15.11 14.848 14.558 14.248 14.038 13.815 13.47 13.241 12.995 12.864 12.586 12.307 12.002 11.837 11.52 11.308 11.115 10.907 10.46 10.198 9.92 9.603 9.234 8.778 8.156 6.79 -5 ,7841 ,TETRA ,17585105,Sat Nov 27 11:39:47 CET,Sat Nov 27 14:03:11 CET,0.0 1.217 1.723 2.071 2.382 2.693 2.97 3.216 3.657 3.859 4.056 4.271 4.597 4.77 5.103 5.416 5.704 5.842 6.126 6.4 6.775 7.008 7.239 7.583 7.902 8.202 8.496 8.774 9.128 9.467 9.802 10.194 10.564 10.927 11.345 11.827 12.281 12.774 13.322 13.915 14.536 15.219 16.002 16.751 17.606 18.553 19.633 20.804 22.076 23.432 24.776 25.438 25.378 24.901 24.298 23.712 23.146 22.576 22.047 21.46 20.914 20.449 20.011 19.599 19.204 18.826 18.424 18.064 17.746 17.408 17.065 16.774 16.458 16.118 15.855 15.582 15.285 14.984 14.685 14.472 14.256 13.909 13.651 13.393 13.265 12.995 12.709 12.413 12.266 11.972 11.732 11.523 11.309 10.844 10.601 10.335 10.044 9.696 9.241 8.663 6.886 -6 ,15985 ,TETRA ,17585106,Sat Nov 27 11:39:48 CET,Sat Nov 27 14:03:10 CET,0.0 1.345 1.915 2.347 2.679 2.964 3.237 3.468 3.889 4.091 4.297 4.551 4.887 5.061 5.409 5.733 6.033 6.173 6.439 6.71 7.098 7.339 7.576 7.92 8.25 8.573 8.862 9.134 9.514 9.886 10.225 10.63 11.025 11.397 11.839 12.336 12.804 13.308 13.842 14.421 15.021 15.695 16.46 17.19 18.017 18.916 19.924 21.009 22.191 23.428 24.533 24.753 24.497 24.117 23.596 22.959 22.35 21.783 21.245 20.69 20.197 19.726 19.242 18.78 18.338 17.93 17.516 17.141 16.822 16.496 16.153 15.858 15.538 15.202 14.945 14.679 14.395 14.1 13.8 13.583 13.348 12.995 12.756 12.498 12.362 12.08 11.798 11.515 11.36 11.041 10.791 10.584 10.375 9.95 9.727 9.477 9.188 8.869 8.485 7.976 7.131 -7 ,695 ,TETRA ,17585107,Sat Nov 27 11:39:47 CET,Sat Nov 27 14:03:24 CET,0.0 1.288 1.853 2.262 2.616 2.962 3.249 3.517 4.04 4.262 4.467 4.699 5.038 5.215 5.538 5.841 6.141 6.28 6.548 6.817 7.191 7.427 7.656 7.987 8.305 8.608 8.913 9.224 9.6 9.936 10.262 10.67 11.065 11.435 11.863 12.358 12.853 13.379 13.914 14.473 15.058 15.705 16.456 17.196 18.018 18.876 19.834 20.952 22.173 23.417 24.673 25.142 25.082 24.777 24.32 23.84 23.342 22.843 22.375 21.859 21.416 21.027 20.633 20.244 19.868 19.523 19.167 18.84 18.544 18.231 17.91 17.64 17.361 17.073 16.841 16.599 16.347 16.05 15.74 15.547 15.334 14.992 14.756 14.496 14.366 14.101 13.813 13.506 13.348 13.044 12.833 12.641 12.44 12.013 11.76 11.484 11.183 10.867 10.506 9.973 8.461 -8 ,16852 ,TETRA ,17585108,Sat Nov 27 11:39:47 CET,Sat Nov 27 13:59:31 CET,0.0 1.01 1.457 1.848 2.218 2.527 2.778 3.036 3.536 3.755 3.967 4.206 4.543 4.709 5.026 5.336 5.635 5.778 6.06 6.325 6.698 6.941 7.175 7.515 7.845 8.158 8.453 8.743 9.116 9.461 9.797 10.208 10.604 10.982 11.416 11.902 12.347 12.839 13.389 13.95 14.528 15.167 15.914 16.626 17.429 18.302 19.23 20.28 21.499 22.743 23.847 24.28 24.129 23.686 23.158 22.623 22.098 21.575 21.069 20.536 20.035 19.539 19.084 18.656 18.231 17.835 17.431 17.078 16.754 16.415 16.068 15.771 15.452 15.118 14.857 14.584 14.296 14.003 13.703 13.494 13.281 12.935 12.678 12.406 12.27 11.989 11.682 11.368 11.208 10.9 10.694 10.498 10.294 9.857 9.63 9.393 9.104 8.728 8.296 7.753 6.3 -9 ,3022 ,TETRA ,17585109,Sat Nov 27 11:39:50 CET,Sat Nov 27 14:02:16 CET,0.0 1.15 1.61 1.971 2.289 2.588 2.847 3.091 3.548 3.77 3.979 4.198 4.53 4.7 5.043 5.366 5.672 5.829 6.126 6.393 6.793 7.045 7.271 7.586 7.889 8.194 8.49 8.775 9.154 9.51 9.828 10.22 10.613 11.0 11.443 11.917 12.369 12.87 13.413 13.997 14.602 15.289 16.064 16.821 17.699 18.616 19.636 20.761 21.972 23.132 24.17 24.464 24.131 23.646 23.036 22.322 21.651 21.017 20.47 19.914 19.414 18.952 18.473 17.994 17.553 17.163 16.74 16.342 16.005 15.66 15.294 14.997 14.696 14.355 14.084 13.807 13.526 13.251 12.954 12.739 12.52 12.176 11.932 11.683 11.552 11.282 11.013 10.723 10.562 10.256 10.036 9.831 9.626 9.199 8.97 8.719 8.421 8.079 7.712 7.214 6.228 -10 ,19453 ,TETRA ,17585110,Sat Nov 27 11:39:48 CET,Sat Nov 27 14:02:15 CET,0.0 1.108 1.623 2.003 2.329 2.62 2.874 3.116 3.584 3.786 3.975 4.191 4.516 4.684 5.001 5.304 5.599 5.738 6.018 6.282 6.655 6.902 7.14 7.495 7.841 8.159 8.462 8.761 9.151 9.506 9.826 10.218 10.602 10.973 11.389 11.85 12.3 12.805 13.368 13.953 14.555 15.224 15.975 16.714 17.57 18.483 19.504 20.613 21.765 22.98 24.169 24.7 24.604 24.242 23.751 23.272 22.828 22.333 21.851 21.351 20.876 20.408 19.965 19.545 19.133 18.754 18.349 17.98 17.669 17.335 16.968 16.663 16.347 16.016 15.765 15.496 15.221 14.944 14.662 14.459 14.227 13.86 13.609 13.342 13.207 12.929 12.633 12.327 12.173 11.88 11.669 11.482 11.287 10.84 10.592 10.335 10.056 9.731 9.336 8.86 7.714 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3265004.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3265004.txt deleted file mode 100644 index bb4f5b0f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3265004.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3689 ,KEBNE ,17043801,Thu Dec 23 05:23:54 CET,Thu Dec 23 07:17:03 CET,0.0 1.44 2.028 2.472 2.842 3.158 3.437 3.679 4.121 4.349 4.583 4.845 5.176 5.36 5.718 6.045 6.353 6.503 6.79 7.055 7.441 7.705 7.965 8.329 8.679 9.013 9.332 9.635 10.014 10.391 10.772 11.232 11.679 12.1 12.57 13.1 13.601 14.144 14.727 15.331 15.954 16.639 17.417 18.209 19.176 20.262 21.384 22.504 23.629 24.632 25.35 25.219 24.551 23.752 22.913 22.084 21.307 20.634 20.044 19.363 18.72 18.138 17.601 17.108 16.644 16.206 15.738 15.323 14.954 14.562 14.147 13.798 13.445 13.076 12.792 12.499 12.193 11.876 11.551 11.33 11.092 10.701 10.437 10.158 10.008 9.703 9.39 9.06 8.883 8.55 8.326 8.127 7.914 7.437 7.189 6.944 6.657 6.329 5.967 5.506 4.47 -2 ,29466 ,KEBNE ,17043802,Thu Dec 23 05:23:54 CET,Thu Dec 23 07:17:46 CET,0.0 1.035 1.521 1.885 2.207 2.513 2.8 3.078 3.591 3.815 4.038 4.315 4.667 4.837 5.166 5.51 5.84 5.998 6.302 6.587 6.994 7.256 7.513 7.872 8.206 8.521 8.837 9.145 9.534 9.926 10.306 10.737 11.157 11.589 12.101 12.671 13.207 13.767 14.347 14.945 15.598 16.355 17.185 17.978 18.879 19.868 20.852 21.872 22.943 24.017 24.948 24.932 24.474 23.758 22.98 22.175 21.355 20.616 19.977 19.324 18.74 18.191 17.669 17.158 16.693 16.27 15.796 15.364 15.002 14.647 14.275 13.952 13.628 13.284 12.998 12.699 12.394 12.089 11.761 11.533 11.298 10.9 10.616 10.327 10.184 9.88 9.556 9.231 9.064 8.734 8.485 8.272 8.061 7.612 7.375 7.121 6.839 6.536 6.186 5.728 4.568 -3 ,18939 ,KEBNE ,17043803,Thu Dec 23 05:23:54 CET,Thu Dec 23 07:17:34 CET,0.0 1.366 1.926 2.347 2.714 3.057 3.345 3.589 4.063 4.289 4.505 4.742 5.077 5.248 5.598 5.938 6.26 6.417 6.725 7.018 7.419 7.668 7.913 8.26 8.597 8.938 9.265 9.573 9.98 10.367 10.735 11.178 11.611 12.038 12.503 13.007 13.475 13.97 14.476 14.988 15.532 16.154 16.844 17.514 18.263 19.032 20.027 21.22 22.439 23.624 24.49 24.408 23.744 22.982 22.27 21.464 20.644 19.872 19.181 18.45 17.771 17.161 16.605 16.075 15.547 15.056 14.597 14.193 13.822 13.426 13.014 12.681 12.326 11.943 11.649 11.35 11.043 10.72 10.384 10.155 9.913 9.547 9.309 9.045 8.905 8.622 8.318 7.993 7.824 7.505 7.285 7.092 6.891 6.44 6.194 5.921 5.614 5.273 4.889 4.371 3.066 -4 ,10226 ,KEBNE ,17043804,Thu Dec 23 05:23:54 CET,Thu Dec 23 07:18:08 CET,0.0 1.151 1.641 2.027 2.376 2.687 2.963 3.212 3.672 3.89 4.108 4.35 4.699 4.883 5.227 5.555 5.859 6.012 6.315 6.594 6.992 7.251 7.5 7.866 8.219 8.557 8.881 9.185 9.579 9.958 10.322 10.763 11.176 11.573 12.031 12.528 12.986 13.503 14.065 14.653 15.278 15.968 16.785 17.565 18.428 19.404 20.44 21.445 22.498 23.557 24.398 24.302 23.666 22.9 22.05 21.232 20.448 19.679 19.012 18.312 17.727 17.206 16.687 16.209 15.755 15.309 14.8 14.349 13.991 13.614 13.211 12.881 12.535 12.176 11.897 11.599 11.296 10.988 10.678 10.461 10.221 9.852 9.588 9.311 9.17 8.883 8.576 8.241 8.071 7.734 7.495 7.282 7.051 6.589 6.342 6.076 5.775 5.421 5.013 4.494 3.171 -5 ,16469 ,KEBNE ,17043805,Thu Dec 23 05:23:54 CET,Thu Dec 23 07:17:20 CET,0.0 1.27 1.768 2.197 2.553 2.874 3.169 3.442 3.911 4.13 4.35 4.597 4.94 5.116 5.451 5.791 6.111 6.262 6.561 6.844 7.235 7.484 7.734 8.084 8.409 8.726 9.031 9.333 9.734 10.115 10.479 10.923 11.331 11.72 12.175 12.68 13.185 13.732 14.297 14.912 15.579 16.289 17.063 17.791 18.604 19.564 20.663 21.829 23.058 24.182 25.005 25.029 24.557 23.843 23.054 22.264 21.496 20.766 20.099 19.419 18.839 18.302 17.758 17.222 16.74 16.288 15.817 15.408 15.042 14.658 14.244 13.897 13.554 13.204 12.928 12.631 12.318 11.996 11.656 11.424 11.184 10.813 10.557 10.292 10.157 9.868 9.569 9.258 9.089 8.747 8.529 8.34 8.14 7.677 7.417 7.147 6.841 6.491 6.085 5.553 4.097 -6 ,28768 ,KEBNE ,17043806,Thu Dec 23 05:23:54 CET,Thu Dec 23 07:17:21 CET,0.0 1.458 2.007 2.415 2.77 3.078 3.337 3.566 3.996 4.213 4.419 4.651 4.984 5.159 5.508 5.841 6.157 6.31 6.618 6.912 7.328 7.595 7.857 8.231 8.574 8.909 9.24 9.558 9.97 10.363 10.736 11.198 11.649 12.066 12.545 13.095 13.586 14.097 14.652 15.254 15.894 16.614 17.444 18.26 19.195 20.147 21.194 22.342 23.472 24.489 25.347 25.421 24.989 24.408 23.609 22.712 21.878 21.094 20.407 19.711 19.1 18.539 17.999 17.481 16.993 16.543 16.066 15.641 15.257 14.853 14.458 14.12 13.745 13.354 13.054 12.758 12.455 12.124 11.788 11.569 11.34 10.96 10.679 10.382 10.229 9.9 9.559 9.211 9.024 8.682 8.457 8.259 8.043 7.574 7.315 7.041 6.727 6.383 6.039 5.572 4.491 -7 ,9812 ,KEBNE ,17043807,Thu Dec 23 05:23:54 CET,Thu Dec 23 07:17:01 CET,0.0 1.028 1.505 1.905 2.231 2.518 2.802 3.071 3.547 3.768 3.97 4.193 4.531 4.715 5.074 5.393 5.693 5.844 6.14 6.422 6.815 7.08 7.338 7.695 8.056 8.407 8.739 9.053 9.453 9.836 10.212 10.686 11.144 11.579 12.077 12.614 13.105 13.64 14.237 14.884 15.538 16.249 17.055 17.852 18.787 19.788 20.828 21.929 23.098 24.238 25.09 25.111 24.74 24.181 23.45 22.602 21.788 21.029 20.331 19.593 18.966 18.407 17.864 17.37 16.895 16.442 15.98 15.567 15.198 14.814 14.412 14.074 13.723 13.36 13.086 12.797 12.488 12.147 11.796 11.567 11.322 10.924 10.652 10.377 10.234 9.938 9.616 9.266 9.09 8.763 8.558 8.364 8.162 7.711 7.454 7.183 6.878 6.546 6.171 5.661 4.432 -8 ,25266 ,KEBNE ,17043808,Thu Dec 23 05:23:54 CET,Thu Dec 23 07:14:06 CET,0.0 1.279 1.771 2.161 2.533 2.857 3.145 3.425 3.937 4.161 4.372 4.612 4.966 5.158 5.503 5.824 6.132 6.282 6.579 6.861 7.272 7.533 7.784 8.139 8.465 8.788 9.101 9.405 9.797 10.176 10.551 11.004 11.436 11.835 12.301 12.834 13.329 13.882 14.483 15.105 15.739 16.47 17.284 18.029 18.892 19.789 20.676 21.546 22.442 23.319 23.91 23.711 23.0 22.136 21.315 20.543 19.858 19.19 18.534 17.829 17.21 16.678 16.173 15.694 15.22 14.771 14.322 13.913 13.54 13.141 12.719 12.377 12.031 11.672 11.385 11.078 10.764 10.437 10.094 9.86 9.615 9.238 8.979 8.708 8.574 8.294 7.993 7.646 7.456 7.114 6.906 6.711 6.499 6.05 5.785 5.487 5.17 4.803 4.383 3.863 2.344 -9 ,21617 ,KEBNE ,17043809,Thu Dec 23 05:24:55 CET,Thu Dec 23 07:17:12 CET,0.0 1.009 1.453 1.81 2.131 2.412 2.666 2.921 3.397 3.62 3.833 4.056 4.39 4.568 4.913 5.243 5.567 5.725 6.034 6.336 6.752 7.004 7.253 7.617 7.946 8.258 8.575 8.89 9.293 9.667 10.025 10.477 10.905 11.299 11.763 12.297 12.804 13.325 13.873 14.46 15.083 15.785 16.593 17.407 18.34 19.316 20.399 21.613 22.717 23.675 24.561 24.613 24.133 23.468 22.788 22.089 21.414 20.779 20.176 19.537 18.957 18.426 17.943 17.463 17.01 16.606 16.18 15.798 15.46 15.104 14.726 14.411 14.088 13.757 13.497 13.219 12.918 12.601 12.277 12.053 11.821 11.464 11.209 10.931 10.787 10.5 10.2 9.87 9.694 9.355 9.121 8.913 8.706 8.254 7.997 7.725 7.426 7.07 6.611 6.044 4.883 -10 ,31724 ,KEBNE ,17043810,Thu Dec 23 05:24:55 CET,Thu Dec 23 07:17:31 CET,0.0 1.253 1.763 2.184 2.526 2.832 3.123 3.393 3.861 4.069 4.273 4.513 4.861 5.046 5.393 5.722 6.039 6.187 6.466 6.746 7.147 7.403 7.654 8.014 8.359 8.685 9.012 9.326 9.724 10.121 10.512 10.975 11.41 11.83 12.321 12.864 13.35 13.883 14.486 15.095 15.719 16.43 17.243 18.041 18.935 19.862 20.882 22.07 23.321 24.389 25.205 25.317 24.865 24.166 23.407 22.67 21.989 21.286 20.653 20.03 19.494 18.991 18.459 17.944 17.48 17.055 16.626 16.238 15.89 15.532 15.146 14.814 14.468 14.117 13.846 13.559 13.243 12.913 12.589 12.356 12.111 11.756 11.512 11.242 11.101 10.808 10.508 10.183 10.004 9.662 9.419 9.215 9.008 8.539 8.278 7.997 7.687 7.345 6.954 6.41 4.805 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index 3d780a57..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3067 ,TETRA ,17585111,Sat Nov 27 11:40:45 CET,Sat Nov 27 14:04:22 CET,0.0 1.46 2.03 2.427 2.735 3.011 3.302 3.59 4.096 4.325 4.545 4.802 5.137 5.305 5.64 5.97 6.287 6.441 6.723 6.979 7.36 7.618 7.863 8.212 8.551 8.871 9.178 9.483 9.88 10.268 10.646 11.084 11.5 11.907 12.368 12.88 13.377 13.912 14.474 15.064 15.662 16.333 17.138 17.906 18.745 19.647 20.586 21.526 22.521 23.39 23.834 23.492 22.691 21.841 21.072 20.315 19.583 18.874 18.226 17.546 16.969 16.436 15.908 15.42 14.966 14.54 14.07 13.635 13.279 12.925 12.539 12.209 11.873 11.527 11.25 10.967 10.657 10.319 9.972 9.734 9.479 9.088 8.82 8.52 8.365 8.052 7.726 7.406 7.241 6.908 6.682 6.484 6.262 5.755 5.479 5.2 4.902 4.561 4.127 3.56 2.065 -2 ,10493 ,TETRA ,17585112,Sat Nov 27 11:40:48 CET,Sat Nov 27 14:03:49 CET,0.0 1.485 2.038 2.484 2.862 3.197 3.505 3.791 4.297 4.52 4.721 4.948 5.287 5.467 5.806 6.107 6.392 6.529 6.803 7.06 7.431 7.68 7.916 8.242 8.549 8.849 9.149 9.436 9.798 10.155 10.508 10.933 11.344 11.731 12.168 12.666 13.153 13.69 14.252 14.84 15.425 16.046 16.752 17.451 18.27 19.146 20.057 21.03 21.981 22.837 23.618 23.608 23.024 22.298 21.566 20.839 20.156 19.549 18.984 18.377 17.85 17.354 16.881 16.423 15.985 15.579 15.134 14.746 14.416 14.073 13.71 13.402 13.074 12.721 12.452 12.171 11.878 11.563 11.222 10.994 10.765 10.396 10.135 9.874 9.74 9.457 9.152 8.827 8.651 8.318 8.089 7.889 7.672 7.185 6.927 6.641 6.306 5.938 5.456 4.776 3.207 -3 ,22213 ,TETRA ,17585113,Sat Nov 27 11:40:45 CET,Sat Nov 27 14:07:38 CET,0.0 1.485 2.046 2.548 2.934 3.264 3.555 3.828 4.327 4.55 4.775 5.025 5.363 5.556 5.925 6.251 6.566 6.71 6.985 7.274 7.688 7.938 8.183 8.55 8.891 9.209 9.523 9.832 10.227 10.595 10.953 11.393 11.826 12.25 12.728 13.254 13.76 14.293 14.837 15.439 16.095 16.816 17.627 18.385 19.207 20.088 21.059 22.087 23.187 24.202 24.947 24.845 24.179 23.472 22.736 21.999 21.341 20.701 20.124 19.505 18.956 18.46 17.947 17.431 16.969 16.566 16.129 15.729 15.382 15.031 14.664 14.343 14.007 13.662 13.385 13.095 12.792 12.482 12.158 11.924 11.683 11.308 11.041 10.764 10.622 10.331 10.023 9.684 9.511 9.191 8.946 8.735 8.517 8.022 7.76 7.494 7.181 6.811 6.387 5.818 4.66 -4 ,2005 ,TETRA ,17585114,Sat Nov 27 11:40:45 CET,Sat Nov 27 14:05:13 CET,0.0 1.406 1.996 2.399 2.724 3.026 3.298 3.529 3.949 4.161 4.363 4.604 4.942 5.125 5.464 5.779 6.085 6.23 6.513 6.792 7.195 7.45 7.698 8.06 8.411 8.745 9.061 9.369 9.754 10.134 10.51 10.96 11.397 11.806 12.273 12.792 13.3 13.852 14.435 15.046 15.662 16.324 17.099 17.867 18.71 19.593 20.519 21.487 22.486 23.364 24.019 23.898 23.145 22.292 21.445 20.569 19.785 19.08 18.451 17.782 17.211 16.698 16.182 15.652 15.151 14.718 14.254 13.832 13.447 13.055 12.67 12.345 12.008 11.655 11.367 11.072 10.771 10.446 10.099 9.857 9.614 9.232 8.959 8.673 8.525 8.217 7.895 7.554 7.382 7.064 6.791 6.57 6.349 5.88 5.611 5.305 4.975 4.574 4.132 3.556 1.866 -5 ,4706 ,TETRA ,17585115,Sat Nov 27 11:40:45 CET,Sat Nov 27 14:03:14 CET,0.0 1.867 2.433 2.862 3.218 3.537 3.827 4.083 4.546 4.78 5.004 5.262 5.601 5.777 6.13 6.465 6.776 6.926 7.22 7.507 7.928 8.201 8.45 8.806 9.166 9.505 9.816 10.11 10.483 10.843 11.2 11.626 12.028 12.429 12.907 13.445 13.947 14.493 15.072 15.644 16.258 16.986 17.812 18.604 19.487 20.429 21.442 22.474 23.505 24.36 24.795 24.398 23.604 22.713 21.829 20.982 20.184 19.422 18.754 18.089 17.506 16.959 16.419 15.913 15.449 15.025 14.572 14.145 13.775 13.379 12.925 12.544 12.178 11.807 11.511 11.203 10.881 10.565 10.237 9.996 9.748 9.357 9.094 8.832 8.691 8.366 8.018 7.689 7.52 7.203 6.988 6.776 6.54 6.07 5.814 5.531 5.223 4.868 4.47 3.876 2.316 -6 ,23142 ,TETRA ,17585116,Sat Nov 27 11:40:48 CET,Sat Nov 27 14:03:22 CET,0.0 1.426 1.976 2.452 2.842 3.152 3.441 3.736 4.274 4.507 4.728 4.968 5.305 5.49 5.84 6.15 6.446 6.596 6.89 7.175 7.584 7.836 8.08 8.44 8.789 9.12 9.433 9.741 10.133 10.501 10.854 11.284 11.695 12.083 12.531 13.032 13.508 14.03 14.598 15.219 15.859 16.538 17.283 18.004 18.823 19.674 20.579 21.52 22.549 23.493 24.068 23.953 23.432 22.776 22.074 21.317 20.6 19.934 19.306 18.63 18.06 17.55 17.054 16.581 16.125 15.708 15.255 14.853 14.503 14.133 13.751 13.429 13.089 12.729 12.451 12.166 11.87 11.564 11.237 11.001 10.759 10.39 10.136 9.864 9.722 9.435 9.127 8.814 8.651 8.332 8.088 7.88 7.666 7.209 6.949 6.624 6.281 5.922 5.468 4.855 3.007 -7 ,28265 ,TETRA ,17585117,Sat Nov 27 11:41:45 CET,Sat Nov 27 13:57:06 CET,0.0 1.259 1.812 2.214 2.57 2.926 3.241 3.512 3.988 4.2 4.407 4.637 4.958 5.13 5.478 5.814 6.128 6.283 6.576 6.854 7.258 7.521 7.783 8.162 8.504 8.819 9.134 9.444 9.839 10.208 10.566 11.003 11.423 11.824 12.276 12.784 13.307 13.901 14.525 15.178 15.839 16.552 17.344 18.079 18.898 19.777 20.753 21.758 22.895 24.024 24.698 24.574 24.016 23.305 22.513 21.732 20.993 20.281 19.629 18.93 18.322 17.769 17.234 16.725 16.231 15.766 15.288 14.877 14.52 14.134 13.729 13.396 13.051 12.697 12.418 12.121 11.815 11.5 11.169 10.94 10.699 10.322 10.06 9.784 9.643 9.342 9.019 8.697 8.525 8.202 7.949 7.749 7.537 7.041 6.759 6.453 6.128 5.772 5.329 4.783 3.474 -8 ,19067 ,TETRA ,17585118,Sat Nov 27 11:41:45 CET,Sat Nov 27 14:02:52 CET,0.0 1.41 1.928 2.322 2.698 3.048 3.346 3.61 4.099 4.327 4.551 4.822 5.174 5.36 5.715 6.056 6.378 6.533 6.832 7.111 7.5 7.752 7.999 8.355 8.697 9.022 9.341 9.651 10.037 10.401 10.759 11.201 11.623 12.023 12.492 13.016 13.517 14.059 14.637 15.244 15.851 16.496 17.226 17.946 18.751 19.626 20.624 21.621 22.676 23.723 24.333 24.206 23.668 22.96 22.257 21.535 20.803 20.091 19.453 18.815 18.251 17.743 17.25 16.761 16.291 15.856 15.394 14.971 14.603 14.224 13.837 13.508 13.158 12.803 12.531 12.246 11.95 11.64 11.316 11.086 10.844 10.458 10.191 9.924 9.787 9.492 9.164 8.81 8.625 8.291 8.029 7.796 7.558 7.081 6.833 6.576 6.278 5.934 5.559 5.096 3.753 -9 ,17949 ,TETRA ,17585119,Sat Nov 27 11:41:47 CET,Sat Nov 27 14:02:51 CET,0.0 1.321 1.837 2.295 2.658 2.99 3.271 3.531 4.001 4.21 4.425 4.69 5.031 5.212 5.56 5.903 6.228 6.383 6.675 6.961 7.372 7.629 7.887 8.256 8.596 8.924 9.245 9.559 9.963 10.357 10.723 11.138 11.538 11.931 12.379 12.846 13.294 13.814 14.381 14.993 15.641 16.316 17.064 17.837 18.719 19.703 20.809 21.918 23.029 23.922 24.391 24.139 23.411 22.573 21.741 20.926 20.213 19.512 18.845 18.174 17.593 17.048 16.509 16.003 15.532 15.095 14.637 14.239 13.879 13.482 13.073 12.741 12.404 12.043 11.76 11.469 11.159 10.826 10.461 10.218 9.98 9.612 9.355 9.082 8.938 8.634 8.312 7.974 7.799 7.472 7.207 6.996 6.772 6.278 6.018 5.762 5.476 5.137 4.743 4.243 2.978 -10 ,29141 ,TETRA ,17585120,Sat Nov 27 11:41:47 CET,Sat Nov 27 14:03:08 CET,0.0 1.167 1.727 2.149 2.492 2.801 3.096 3.386 3.918 4.143 4.352 4.593 4.922 5.1 5.451 5.78 6.091 6.236 6.525 6.807 7.226 7.491 7.735 8.087 8.412 8.718 9.021 9.322 9.706 10.081 10.457 10.902 11.327 11.726 12.158 12.641 13.119 13.656 14.244 14.858 15.473 16.146 16.95 17.746 18.61 19.459 20.304 21.161 22.017 22.804 23.251 22.941 22.269 21.51 20.776 20.037 19.311 18.599 17.97 17.315 16.733 16.224 15.745 15.291 14.828 14.384 13.93 13.522 13.158 12.782 12.394 12.073 11.746 11.419 11.168 10.89 10.595 10.271 9.919 9.685 9.446 9.064 8.804 8.533 8.395 8.098 7.781 7.463 7.296 6.968 6.709 6.498 6.277 5.815 5.56 5.279 4.965 4.602 4.181 3.656 2.081 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt deleted file mode 100644 index d3d8779e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5928 ,TETRA ,17585121,Sat Nov 27 11:41:47 CET,Sat Nov 27 14:03:07 CET,0.0 1.105 1.576 1.988 2.311 2.602 2.867 3.114 3.588 3.812 4.029 4.252 4.574 4.739 5.057 5.366 5.654 5.796 6.079 6.343 6.721 6.963 7.189 7.516 7.84 8.145 8.438 8.727 9.101 9.456 9.784 10.172 10.552 10.92 11.337 11.794 12.235 12.715 13.228 13.761 14.324 14.954 15.671 16.374 17.17 17.945 18.73 19.57 20.373 21.015 21.192 20.495 19.413 18.238 17.152 16.106 15.111 14.204 13.438 12.663 11.978 11.357 10.743 10.147 9.604 9.102 8.561 8.085 7.682 7.255 6.813 6.452 6.08 5.697 5.393 5.061 4.724 4.39 4.019 3.759 3.501 3.095 2.802 2.499 2.348 2.045 1.735 1.402 1.218 0.86 0.6 0.386 0.175 -0.265 -0.509 -0.77 -1.072 -1.436 -1.88 -2.464 -3.706 -2 ,17569 ,TETRA ,17585122,Sat Nov 27 11:41:48 CET,Sat Nov 27 14:03:53 CET,0.0 1.229 1.781 2.19 2.527 2.835 3.124 3.374 3.822 4.038 4.253 4.505 4.837 5.017 5.369 5.699 6.009 6.158 6.431 6.677 7.036 7.27 7.496 7.827 8.146 8.453 8.755 9.05 9.421 9.758 10.092 10.508 10.908 11.288 11.711 12.193 12.659 13.149 13.66 14.209 14.787 15.394 16.071 16.734 17.495 18.335 19.214 20.116 21.025 21.653 21.799 21.246 20.328 19.27 18.195 17.205 16.296 15.402 14.602 13.781 13.069 12.451 11.871 11.305 10.753 10.25 9.733 9.273 8.888 8.484 8.036 7.643 7.257 6.872 6.555 6.234 5.9 5.543 5.188 4.944 4.68 4.268 3.975 3.671 3.519 3.191 2.853 2.503 2.323 1.979 1.71 1.486 1.253 0.754 0.481 0.191 -0.148 -0.557 -1.023 -1.603 -3.003 -3 ,6340 ,TETRA ,17585123,Sat Nov 27 11:42:44 CET,Sat Nov 27 14:04:48 CET,0.0 0.6 1.061 1.429 1.715 1.984 2.243 2.481 2.907 3.103 3.3 3.521 3.854 4.015 4.31 4.591 4.868 5.001 5.257 5.501 5.857 6.088 6.312 6.639 6.944 7.237 7.529 7.816 8.172 8.513 8.859 9.276 9.65 9.99 10.379 10.819 11.235 11.687 12.184 12.711 13.226 13.787 14.429 15.027 15.735 16.503 17.301 18.143 19.006 19.805 20.109 19.484 18.561 17.511 16.412 15.357 14.435 13.551 12.752 11.944 11.21 10.532 9.886 9.309 8.781 8.281 7.765 7.309 6.915 6.494 6.046 5.671 5.283 4.878 4.566 4.249 3.927 3.593 3.239 2.995 2.741 2.348 2.07 1.776 1.624 1.295 0.957 0.609 0.429 0.089 -0.133 -0.328 -0.56 -1.078 -1.347 -1.638 -1.951 -2.31 -2.72 -3.249 -4.612 -4 ,26443 ,TETRA ,17585124,Sat Nov 27 11:42:44 CET,Sat Nov 27 14:04:39 CET,0.0 1.158 1.661 2.037 2.366 2.67 2.941 3.203 3.678 3.882 4.074 4.278 4.608 4.785 5.115 5.423 5.719 5.863 6.144 6.412 6.794 7.035 7.268 7.609 7.932 8.238 8.53 8.805 9.147 9.472 9.795 10.186 10.576 10.957 11.392 11.859 12.273 12.743 13.243 13.766 14.316 14.896 15.537 16.159 16.856 17.635 18.443 19.119 19.786 20.409 20.538 19.863 18.879 17.793 16.652 15.582 14.639 13.704 12.85 12.002 11.298 10.662 10.051 9.45 8.856 8.339 7.83 7.364 6.95 6.522 6.063 5.672 5.274 4.863 4.542 4.209 3.872 3.527 3.165 2.924 2.661 2.242 1.966 1.67 1.512 1.194 0.862 0.499 0.309 -0.05 -0.303 -0.522 -0.754 -1.251 -1.513 -1.797 -2.11 -2.455 -2.841 -3.331 -4.553 -5 ,19788 ,TETRA ,17585125,Sat Nov 27 11:42:46 CET,Sat Nov 27 14:04:38 CET,0.0 1.019 1.445 1.786 2.091 2.373 2.626 2.853 3.287 3.491 3.681 3.905 4.23 4.397 4.731 5.05 5.345 5.484 5.761 6.033 6.405 6.635 6.86 7.195 7.517 7.828 8.123 8.407 8.777 9.138 9.482 9.881 10.269 10.646 11.085 11.557 12.009 12.511 13.022 13.561 14.133 14.762 15.481 16.17 16.911 17.632 18.365 19.149 19.864 20.273 20.19 19.324 18.217 17.071 15.985 14.942 13.946 13.018 12.206 11.376 10.62 9.944 9.327 8.754 8.218 7.722 7.204 6.742 6.337 5.905 5.453 5.081 4.702 4.312 4.006 3.687 3.342 2.974 2.595 2.343 2.085 1.667 1.383 1.088 0.936 0.624 0.287 -0.06 -0.24 -0.585 -0.806 -1.011 -1.233 -1.752 -2.031 -2.332 -2.653 -2.997 -3.365 -3.889 -5.235 -6 ,26004 ,TETRA ,17585126,Sat Nov 27 11:42:46 CET,Sat Nov 27 14:05:44 CET,0.0 1.526 2.048 2.458 2.793 3.078 3.344 3.587 4.025 4.226 4.416 4.602 4.915 5.073 5.391 5.707 5.99 6.118 6.366 6.599 6.937 7.16 7.375 7.677 7.955 8.22 8.477 8.731 9.059 9.365 9.65 9.985 10.311 10.616 10.946 11.337 11.718 12.109 12.512 12.922 13.362 13.851 14.393 14.907 15.432 16.023 16.739 17.422 18.06 18.553 18.48 17.703 16.659 15.504 14.421 13.369 12.388 11.479 10.684 9.854 9.123 8.456 7.83 7.272 6.731 6.219 5.706 5.254 4.86 4.451 4.023 3.655 3.273 2.889 2.601 2.308 1.993 1.669 1.333 1.102 0.871 0.487 0.198 -0.106 -0.257 -0.563 -0.89 -1.235 -1.41 -1.757 -2.014 -2.238 -2.47 -2.93 -3.176 -3.443 -3.758 -4.105 -4.459 -4.905 -5.931 -7 ,12103 ,TETRA ,17585127,Sat Nov 27 11:42:46 CET,Sat Nov 27 14:06:01 CET,0.0 1.711 2.282 2.694 3.026 3.316 3.616 3.881 4.336 4.548 4.751 5.013 5.35 5.514 5.837 6.151 6.445 6.589 6.874 7.144 7.518 7.756 7.987 8.311 8.628 8.95 9.257 9.545 9.923 10.294 10.639 11.049 11.436 11.796 12.223 12.697 13.138 13.626 14.135 14.645 15.166 15.755 16.398 16.992 17.64 18.381 19.2 19.922 20.502 20.826 20.689 19.859 18.767 17.623 16.537 15.464 14.516 13.657 12.839 12.008 11.309 10.665 10.03 9.433 8.868 8.358 7.838 7.359 6.931 6.484 6.033 5.67 5.282 4.878 4.574 4.268 3.96 3.632 3.289 3.047 2.794 2.402 2.126 1.834 1.68 1.36 1.037 0.699 0.52 0.162 -0.097 -0.295 -0.508 -0.997 -1.248 -1.495 -1.803 -2.187 -2.628 -3.18 -4.373 -8 ,214 ,TETRA ,17585128,Sat Nov 27 11:42:46 CET,Sat Nov 27 13:50:12 CET,0.0 1.134 1.631 2.029 2.4 2.73 3.016 3.269 3.743 3.963 4.166 4.398 4.733 4.916 5.268 5.593 5.889 6.029 6.308 6.578 6.958 7.203 7.445 7.795 8.132 8.446 8.738 9.025 9.398 9.756 10.103 10.507 10.9 11.278 11.707 12.183 12.628 13.121 13.663 14.206 14.762 15.403 16.083 16.705 17.395 18.109 18.876 19.62 20.325 20.889 21.029 20.234 19.132 18.089 17.017 15.947 15.003 14.11 13.292 12.445 11.724 11.096 10.495 9.924 9.367 8.847 8.311 7.833 7.424 7.009 6.567 6.196 5.824 5.431 5.111 4.778 4.441 4.092 3.733 3.493 3.246 2.862 2.577 2.278 2.127 1.82 1.5 1.154 0.97 0.626 0.37 0.151 -0.081 -0.566 -0.815 -1.086 -1.399 -1.752 -2.169 -2.674 -3.879 -9 ,20680 ,TETRA ,17585129,Sat Nov 27 11:43:45 CET,Sat Nov 27 14:10:13 CET,0.0 1.389 1.96 2.393 2.714 3.015 3.296 3.545 4.021 4.247 4.458 4.681 5.008 5.183 5.53 5.846 6.134 6.27 6.533 6.794 7.171 7.421 7.656 7.99 8.323 8.622 8.898 9.175 9.551 9.919 10.268 10.677 11.054 11.399 11.815 12.286 12.731 13.218 13.726 14.264 14.795 15.338 15.956 16.622 17.371 18.145 18.999 19.849 20.657 21.295 21.435 20.781 19.854 18.875 17.859 16.84 15.956 15.082 14.272 13.458 12.767 12.15 11.53 10.938 10.401 9.904 9.361 8.884 8.467 8.034 7.601 7.25 6.891 6.506 6.205 5.902 5.572 5.221 4.873 4.636 4.386 4.002 3.737 3.457 3.314 2.996 2.657 2.327 2.157 1.824 1.609 1.402 1.181 0.734 0.492 0.233 -0.047 -0.366 -0.713 -1.182 -2.146 -10 ,13522 ,TETRA ,17585130,Sat Nov 27 11:44:45 CET,Sat Nov 27 14:07:02 CET,0.0 1.233 1.717 2.107 2.447 2.748 3.009 3.246 3.671 3.87 4.056 4.265 4.597 4.768 5.085 5.397 5.688 5.821 6.086 6.344 6.732 6.974 7.191 7.52 7.85 8.151 8.451 8.749 9.116 9.458 9.795 10.203 10.578 10.95 11.381 11.848 12.303 12.8 13.331 13.884 14.446 15.023 15.651 16.293 17.022 17.775 18.55 19.292 19.967 20.428 20.564 19.735 18.435 17.245 16.174 15.112 14.101 13.173 12.367 11.566 10.88 10.258 9.645 9.051 8.485 7.971 7.45 6.985 6.579 6.16 5.732 5.372 4.991 4.596 4.29 3.958 3.609 3.259 2.902 2.656 2.401 2.015 1.753 1.472 1.316 0.992 0.673 0.331 0.153 -0.181 -0.417 -0.621 -0.838 -1.303 -1.533 -1.776 -2.067 -2.419 -2.866 -3.439 -4.914 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 9047b939..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12313 ,TETRA ,17585131,Sat Nov 27 11:45:45 CET,Sat Nov 27 13:53:40 CET,0.0 1.146 1.601 1.92 2.186 2.427 2.635 2.84 3.199 3.351 3.489 3.597 3.845 3.963 4.179 4.378 4.571 4.659 4.83 4.997 5.253 5.421 5.564 5.766 5.973 6.165 6.342 6.504 6.704 6.892 7.086 7.32 7.512 7.674 7.86 8.067 8.257 8.471 8.695 8.909 9.106 9.297 9.52 9.698 9.83 9.926 9.956 9.84 9.537 8.893 7.448 5.544 3.881 2.448 1.171 0.003 -0.989 -1.877 -2.624 -3.396 -4.079 -4.7 -5.312 -5.908 -6.473 -6.985 -7.511 -7.989 -8.405 -8.835 -9.305 -9.7 -10.118 -10.596 -11.017 -11.466 -11.916 -12.39 -12.897 -13.256 -13.622 -14.186 -14.565 -14.939 -15.141 -15.576 -16.016 -16.469 -16.702 -17.096 -17.459 -17.733 -18.029 -18.674 -19.043 -19.445 -19.906 -20.434 -21.055 -21.844 -24.092 -2 ,14894 ,TETRA ,17585132,Sat Nov 27 11:45:45 CET,Sat Nov 27 13:54:43 CET,0.0 1.398 1.814 2.102 2.326 2.504 2.668 2.816 3.083 3.217 3.337 3.425 3.645 3.748 3.95 4.136 4.315 4.397 4.56 4.726 4.944 5.087 5.224 5.392 5.543 5.69 5.832 5.972 6.153 6.32 6.475 6.675 6.863 7.017 7.194 7.388 7.564 7.76 7.95 8.129 8.292 8.438 8.588 8.754 8.935 9.056 9.074 8.931 8.603 7.968 6.603 4.749 3.13 1.733 0.568 -0.496 -1.472 -2.362 -3.155 -3.973 -4.686 -5.317 -5.916 -6.468 -6.972 -7.44 -7.943 -8.4 -8.787 -9.182 -9.596 -9.942 -10.304 -10.688 -10.974 -11.254 -11.556 -11.876 -12.192 -12.41 -12.645 -13.003 -13.247 -13.505 -13.644 -13.954 -14.267 -14.612 -14.804 -15.147 -15.414 -15.63 -15.848 -16.342 -16.668 -17.035 -17.385 -17.741 -18.166 -18.756 -20.565 -3 ,28888 ,TETRA ,17585133,Sat Nov 27 11:46:45 CET,Sat Nov 27 13:55:23 CET,0.0 1.365 1.78 2.118 2.4 2.617 2.816 2.993 3.283 3.423 3.564 3.718 3.978 4.099 4.329 4.542 4.732 4.826 4.998 5.158 5.393 5.555 5.705 5.899 6.1 6.298 6.473 6.634 6.835 7.033 7.233 7.46 7.654 7.841 8.055 8.309 8.571 8.837 9.074 9.282 9.475 9.687 9.917 10.115 10.276 10.371 10.42 10.341 10.083 9.523 8.248 6.481 4.887 3.409 2.033 0.745 -0.412 -1.443 -2.288 -3.113 -3.792 -4.384 -4.971 -5.516 -6.027 -6.542 -7.106 -7.601 -8.008 -8.424 -8.873 -9.246 -9.636 -10.057 -10.405 -10.755 -11.079 -11.419 -11.772 -12.01 -12.268 -12.698 -12.999 -13.308 -13.474 -13.825 -14.173 -14.527 -14.708 -15.042 -15.306 -15.527 -15.772 -16.319 -16.604 -16.918 -17.302 -17.739 -18.268 -19.03 -21.818 -4 ,19587 ,TETRA ,17585134,Sat Nov 27 11:46:46 CET,Sat Nov 27 13:36:56 CET,0.0 0.956 1.298 1.559 1.779 1.986 2.162 2.315 2.584 2.712 2.84 2.951 3.186 3.299 3.511 3.696 3.87 3.952 4.109 4.259 4.461 4.584 4.705 4.872 5.023 5.173 5.309 5.442 5.623 5.801 5.968 6.166 6.366 6.542 6.729 6.947 7.146 7.338 7.537 7.753 7.96 8.178 8.395 8.571 8.71 8.764 8.794 8.719 8.373 7.689 6.372 4.502 2.812 1.335 0.04 -1.112 -2.107 -3.012 -3.802 -4.666 -5.504 -6.279 -6.956 -7.553 -8.091 -8.58 -9.156 -9.705 -10.176 -10.636 -11.114 -11.514 -11.92 -12.362 -12.709 -13.059 -13.428 -13.821 -14.208 -14.47 -14.744 -15.159 -15.448 -15.758 -15.915 -16.264 -16.657 -17.091 -17.327 -17.712 -18.011 -18.245 -18.488 -19.013 -19.329 -19.684 -20.064 -20.45 -20.914 -21.602 -24.284 -5 ,2739 ,TETRA ,17585135,Sat Nov 27 11:46:46 CET,Sat Nov 27 13:54:54 CET,0.0 1.248 1.669 1.968 2.211 2.435 2.637 2.83 3.186 3.339 3.481 3.608 3.856 3.964 4.149 4.327 4.51 4.607 4.793 4.966 5.222 5.382 5.53 5.738 5.942 6.125 6.285 6.434 6.632 6.827 7.026 7.257 7.46 7.653 7.849 8.058 8.264 8.49 8.707 8.911 9.09 9.265 9.473 9.674 9.824 9.913 9.958 9.87 9.59 8.99 7.678 5.747 4.063 2.594 1.255 0.077 -0.924 -1.826 -2.612 -3.423 -4.114 -4.706 -5.312 -5.899 -6.459 -6.971 -7.479 -7.947 -8.352 -8.766 -9.229 -9.632 -10.034 -10.452 -10.779 -11.111 -11.442 -11.792 -12.181 -12.449 -12.717 -13.116 -13.395 -13.699 -13.853 -14.183 -14.532 -14.868 -15.046 -15.379 -15.599 -15.802 -16.035 -16.56 -16.854 -17.192 -17.562 -17.967 -18.465 -19.209 -21.362 -6 ,25856 ,TETRA ,17585136,Sat Nov 27 11:46:50 CET,Sat Nov 27 13:56:06 CET,0.0 1.093 1.493 1.792 2.037 2.268 2.497 2.705 3.094 3.28 3.451 3.637 3.907 4.049 4.311 4.546 4.761 4.868 5.073 5.258 5.549 5.73 5.893 6.136 6.361 6.571 6.777 6.975 7.215 7.437 7.655 7.918 8.138 8.329 8.536 8.75 8.944 9.152 9.366 9.579 9.774 9.947 10.151 10.348 10.532 10.67 10.746 10.718 10.465 9.831 8.566 6.671 4.972 3.492 2.156 0.964 -0.067 -1.018 -1.839 -2.658 -3.356 -3.963 -4.575 -5.185 -5.728 -6.193 -6.651 -7.048 -7.402 -7.784 -8.192 -8.55 -8.941 -9.348 -9.672 -10.023 -10.395 -10.77 -11.132 -11.371 -11.617 -11.982 -12.243 -12.551 -12.717 -13.071 -13.428 -13.765 -13.96 -14.331 -14.62 -14.838 -15.063 -15.557 -15.811 -16.083 -16.401 -16.774 -17.19 -17.685 -19.679 -7 ,6182 ,TETRA ,17585137,Sat Nov 27 11:46:47 CET,Sat Nov 27 13:54:54 CET,0.0 1.08 1.448 1.742 1.981 2.197 2.378 2.539 2.846 2.988 3.12 3.248 3.489 3.597 3.789 3.971 4.153 4.237 4.408 4.57 4.797 4.942 5.081 5.271 5.443 5.605 5.748 5.889 6.075 6.256 6.431 6.622 6.793 6.946 7.119 7.316 7.489 7.657 7.833 8.011 8.173 8.334 8.476 8.598 8.715 8.775 8.762 8.653 8.368 7.717 6.381 4.53 2.855 1.398 0.164 -0.95 -1.929 -2.824 -3.641 -4.493 -5.229 -5.847 -6.411 -6.961 -7.475 -7.923 -8.377 -8.806 -9.196 -9.599 -9.996 -10.33 -10.691 -11.06 -11.354 -11.665 -11.981 -12.316 -12.648 -12.874 -13.128 -13.52 -13.778 -14.03 -14.169 -14.474 -14.775 -15.08 -15.25 -15.576 -15.843 -16.063 -16.263 -16.727 -17.031 -17.386 -17.763 -18.204 -18.72 -19.383 -21.859 -8 ,7470 ,TETRA ,17585138,Sat Nov 27 11:46:48 CET,Sat Nov 27 13:55:21 CET,0.0 1.168 1.551 1.835 2.083 2.332 2.536 2.719 3.062 3.196 3.318 3.406 3.65 3.761 3.977 4.165 4.346 4.445 4.637 4.805 5.031 5.171 5.304 5.498 5.689 5.87 6.038 6.196 6.399 6.606 6.796 6.993 7.184 7.371 7.577 7.8 8.018 8.259 8.484 8.683 8.873 9.055 9.225 9.37 9.498 9.571 9.612 9.601 9.39 8.749 7.319 5.41 3.776 2.287 0.923 -0.287 -1.352 -2.278 -3.062 -3.889 -4.649 -5.336 -5.975 -6.634 -7.253 -7.754 -8.251 -8.697 -9.079 -9.466 -9.892 -10.255 -10.615 -11.002 -11.299 -11.595 -11.932 -12.298 -12.681 -12.925 -13.162 -13.558 -13.856 -14.178 -14.335 -14.644 -14.973 -15.324 -15.513 -15.855 -16.136 -16.377 -16.628 -17.198 -17.52 -17.875 -18.275 -18.696 -19.18 -19.803 -21.641 -9 ,6449 ,TETRA ,17585139,Sat Nov 27 11:46:47 CET,Sat Nov 27 13:55:04 CET,0.0 1.188 1.591 1.908 2.16 2.415 2.623 2.785 3.109 3.265 3.413 3.561 3.822 3.964 4.218 4.448 4.673 4.778 4.964 5.125 5.38 5.552 5.716 5.954 6.186 6.397 6.588 6.767 6.973 7.189 7.419 7.65 7.849 8.052 8.268 8.519 8.778 9.023 9.265 9.509 9.705 9.9 10.136 10.367 10.579 10.709 10.748 10.646 10.343 9.674 8.261 6.437 4.817 3.346 2.051 0.921 -0.06 -0.964 -1.763 -2.572 -3.239 -3.847 -4.428 -4.963 -5.483 -5.98 -6.549 -7.089 -7.555 -8.038 -8.488 -8.842 -9.245 -9.667 -9.983 -10.305 -10.634 -10.983 -11.355 -11.612 -11.875 -12.277 -12.551 -12.838 -12.988 -13.305 -13.636 -13.999 -14.212 -14.577 -14.888 -15.133 -15.367 -15.87 -16.148 -16.465 -16.868 -17.257 -17.727 -18.475 -20.747 -10 ,1306 ,TETRA ,17585140,Sat Nov 27 11:46:47 CET,Sat Nov 27 13:43:05 CET,0.0 0.997 1.339 1.604 1.825 2.031 2.215 2.386 2.71 2.866 3.016 3.151 3.393 3.506 3.723 3.926 4.13 4.23 4.416 4.595 4.838 4.978 5.101 5.279 5.444 5.587 5.729 5.868 6.051 6.231 6.388 6.565 6.747 6.926 7.14 7.405 7.645 7.865 8.068 8.245 8.419 8.612 8.815 8.974 9.087 9.137 9.141 9.028 8.748 8.158 6.818 4.938 3.254 1.791 0.516 -0.639 -1.665 -2.573 -3.361 -4.17 -4.869 -5.488 -6.069 -6.621 -7.135 -7.598 -8.082 -8.514 -8.878 -9.266 -9.671 -10.0 -10.343 -10.696 -10.975 -11.268 -11.565 -11.865 -12.178 -12.39 -12.603 -12.951 -13.208 -13.483 -13.622 -13.902 -14.201 -14.539 -14.716 -15.029 -15.259 -15.457 -15.662 -16.103 -16.357 -16.65 -16.978 -17.355 -17.816 -18.43 -21.29 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt deleted file mode 100644 index 3d2fb689..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31712 ,TETRA ,17585141,Sat Nov 27 11:47:45 CET,Sat Nov 27 13:55:55 CET,0.0 1.031 1.489 1.839 2.151 2.464 2.74 2.973 3.365 3.546 3.735 3.949 4.27 4.449 4.779 5.063 5.329 5.463 5.733 5.986 6.35 6.583 6.8 7.106 7.407 7.706 8.001 8.281 8.629 8.969 9.294 9.663 10.011 10.359 10.769 11.214 11.636 12.088 12.527 12.957 13.414 13.935 14.519 15.063 15.679 16.353 17.049 17.709 18.297 18.688 18.703 18.161 17.364 16.55 15.77 15.033 14.348 13.633 12.981 12.362 11.841 11.354 10.859 10.417 10.032 9.671 9.292 8.941 8.638 8.319 7.97 7.68 7.345 6.95 6.652 6.357 6.048 5.724 5.386 5.145 4.892 4.512 4.252 3.98 3.833 3.514 3.192 2.86 2.685 2.362 2.16 1.977 1.766 1.278 1.032 0.781 0.49 0.172 -0.212 -0.702 -2.399 -2 ,17804 ,TETRA ,17585142,Sat Nov 27 11:47:45 CET,Sat Nov 27 13:56:36 CET,0.0 0.957 1.425 1.814 2.171 2.449 2.665 2.852 3.179 3.332 3.495 3.662 3.942 4.081 4.359 4.616 4.846 4.955 5.171 5.382 5.681 5.873 6.069 6.362 6.621 6.856 7.089 7.318 7.612 7.887 8.139 8.446 8.758 9.049 9.377 9.755 10.111 10.49 10.893 11.309 11.745 12.238 12.772 13.251 13.785 14.408 15.095 15.723 16.201 16.429 16.3 15.615 14.764 13.913 13.093 12.344 11.62 10.919 10.331 9.734 9.17 8.66 8.179 7.706 7.261 6.864 6.442 6.054 5.7 5.315 4.899 4.543 4.177 3.812 3.535 3.254 2.959 2.634 2.303 2.069 1.814 1.433 1.182 0.922 0.788 0.507 0.207 -0.098 -0.265 -0.605 -0.86 -1.057 -1.264 -1.698 -1.938 -2.224 -2.546 -2.928 -3.4 -3.988 -5.448 -3 ,21911 ,TETRA ,17585143,Sat Nov 27 11:47:45 CET,Sat Nov 27 13:58:18 CET,0.0 0.977 1.459 1.847 2.167 2.439 2.695 2.944 3.37 3.576 3.767 3.96 4.267 4.423 4.725 5.014 5.289 5.428 5.705 5.952 6.295 6.515 6.734 7.078 7.39 7.673 7.95 8.219 8.565 8.895 9.208 9.579 9.944 10.291 10.682 11.13 11.564 11.996 12.421 12.865 13.316 13.843 14.424 14.945 15.515 16.079 16.672 17.264 17.801 18.25 18.411 17.869 17.188 16.45 15.647 14.879 14.16 13.511 12.952 12.36 11.851 11.384 10.922 10.484 10.065 9.655 9.222 8.851 8.53 8.204 7.878 7.607 7.297 6.957 6.681 6.389 6.096 5.791 5.462 5.235 5.002 4.64 4.378 4.093 3.953 3.669 3.367 3.057 2.895 2.585 2.371 2.174 1.958 1.496 1.264 0.99 0.646 0.26 -0.149 -0.686 -2.489 -4 ,242 ,TETRA ,17585144,Sat Nov 27 11:48:44 CET,Sat Nov 27 13:58:55 CET,0.0 1.096 1.618 2.009 2.33 2.646 2.929 3.194 3.655 3.868 4.07 4.274 4.582 4.738 5.03 5.309 5.58 5.718 5.993 6.252 6.611 6.834 7.055 7.38 7.676 7.951 8.215 8.445 8.724 9.007 9.273 9.577 9.866 10.136 10.448 10.792 11.121 11.513 11.92 12.317 12.749 13.217 13.73 14.221 14.765 15.341 15.965 16.606 17.165 17.606 17.756 17.216 16.3 15.37 14.555 13.735 12.927 12.108 11.349 10.593 9.952 9.373 8.801 8.244 7.716 7.242 6.753 6.323 5.963 5.569 5.169 4.862 4.55 4.219 3.95 3.67 3.395 3.106 2.777 2.535 2.284 1.898 1.638 1.374 1.242 0.961 0.66 0.332 0.161 -0.159 -0.399 -0.612 -0.836 -1.333 -1.601 -1.869 -2.166 -2.503 -2.916 -3.445 -4.788 -5 ,24106 ,TETRA ,17585145,Sat Nov 27 11:48:44 CET,Sat Nov 27 13:46:38 CET,0.0 0.886 1.35 1.746 2.081 2.361 2.599 2.83 3.268 3.465 3.653 3.856 4.175 4.348 4.668 4.971 5.239 5.37 5.647 5.909 6.275 6.496 6.718 7.046 7.346 7.611 7.867 8.122 8.42 8.698 8.977 9.32 9.665 9.985 10.326 10.717 11.083 11.472 11.875 12.329 12.812 13.319 13.908 14.518 15.212 15.846 16.416 16.939 17.47 17.87 17.787 17.108 16.289 15.42 14.56 13.79 13.099 12.405 11.776 11.114 10.547 10.053 9.564 9.098 8.669 8.288 7.896 7.539 7.221 6.875 6.492 6.169 5.837 5.471 5.18 4.892 4.581 4.248 3.928 3.715 3.495 3.134 2.874 2.611 2.472 2.173 1.86 1.541 1.375 1.064 0.861 0.664 0.441 -0.03 -0.263 -0.534 -0.842 -1.177 -1.58 -2.088 -3.717 -6 ,29184 ,TETRA ,17585146,Sat Nov 27 11:49:46 CET,Sat Nov 27 13:57:04 CET,0.0 1.348 1.891 2.296 2.631 2.936 3.218 3.442 3.884 4.115 4.318 4.538 4.871 5.047 5.367 5.661 5.954 6.085 6.33 6.578 6.942 7.174 7.396 7.723 8.05 8.356 8.64 8.912 9.231 9.553 9.896 10.29 10.637 10.94 11.284 11.654 11.997 12.368 12.753 13.151 13.569 14.03 14.533 15.025 15.589 16.165 16.76 17.326 17.819 18.166 18.087 17.35 16.423 15.496 14.626 13.789 13.039 12.372 11.788 11.194 10.669 10.196 9.751 9.323 8.901 8.511 8.094 7.718 7.399 7.068 6.731 6.456 6.164 5.85 5.604 5.345 5.061 4.77 4.483 4.282 4.063 3.688 3.419 3.142 2.998 2.7 2.385 2.056 1.881 1.555 1.319 1.117 0.898 0.432 0.178 -0.099 -0.411 -0.755 -1.175 -1.753 -3.954 -7 ,29778 ,TETRA ,17585147,Sat Nov 27 11:49:46 CET,Sat Nov 27 13:55:59 CET,0.0 1.37 1.917 2.359 2.719 3.026 3.272 3.492 3.938 4.137 4.313 4.519 4.839 4.997 5.304 5.588 5.874 6.014 6.279 6.546 6.926 7.167 7.399 7.745 8.066 8.348 8.609 8.87 9.212 9.547 9.868 10.245 10.594 10.914 11.255 11.607 11.941 12.313 12.704 13.101 13.506 13.971 14.512 15.036 15.618 16.168 16.711 17.272 17.794 18.235 18.34 17.739 16.864 16.055 15.267 14.503 13.816 13.145 12.563 11.984 11.491 11.036 10.581 10.142 9.725 9.333 8.896 8.514 8.202 7.868 7.537 7.26 6.948 6.625 6.352 6.049 5.74 5.422 5.077 4.83 4.588 4.217 3.955 3.684 3.543 3.247 2.924 2.586 2.41 2.08 1.834 1.627 1.411 0.947 0.709 0.448 0.138 -0.215 -0.618 -1.131 -2.767 -8 ,14394 ,TETRA ,17585148,Sat Nov 27 11:49:46 CET,Sat Nov 27 13:58:12 CET,0.0 1.252 1.698 2.055 2.352 2.582 2.802 3.015 3.411 3.601 3.776 3.951 4.225 4.367 4.675 4.959 5.206 5.329 5.556 5.765 6.068 6.252 6.426 6.673 6.902 7.128 7.35 7.574 7.865 8.14 8.404 8.722 9.039 9.348 9.68 10.027 10.372 10.768 11.174 11.604 12.055 12.545 13.101 13.648 14.256 14.87 15.497 16.113 16.725 17.12 17.142 16.674 16.002 15.259 14.458 13.657 12.924 12.241 11.647 11.045 10.514 10.045 9.612 9.217 8.833 8.456 8.064 7.718 7.419 7.059 6.646 6.311 5.962 5.602 5.33 5.051 4.741 4.417 4.084 3.837 3.581 3.202 2.936 2.655 2.517 2.25 1.966 1.659 1.496 1.18 0.996 0.808 0.588 0.149 -0.073 -0.339 -0.652 -1.004 -1.439 -2.033 -3.649 -9 ,27255 ,TETRA ,17585149,Sat Nov 27 11:49:47 CET,Sat Nov 27 13:58:28 CET,0.0 1.408 1.918 2.279 2.581 2.869 3.139 3.372 3.814 4.051 4.273 4.494 4.82 4.99 5.291 5.573 5.859 6.0 6.279 6.54 6.91 7.146 7.374 7.692 7.993 8.284 8.557 8.822 9.172 9.507 9.822 10.196 10.562 10.925 11.336 11.776 12.188 12.651 13.149 13.681 14.229 14.81 15.457 16.093 16.831 17.611 18.408 19.218 20.087 20.806 21.03 20.363 19.339 18.303 17.308 16.309 15.389 14.482 13.733 13.024 12.364 11.757 11.167 10.599 10.064 9.579 9.064 8.594 8.211 7.825 7.412 7.074 6.722 6.357 6.072 5.775 5.47 5.139 4.786 4.543 4.297 3.915 3.651 3.382 3.251 2.987 2.696 2.375 2.197 1.859 1.622 1.437 1.249 0.85 0.613 0.34 0.043 -0.274 -0.664 -1.204 -2.695 -10 ,27001 ,TETRA ,17585150,Sat Nov 27 11:50:43 CET,Sat Nov 27 13:59:32 CET,0.0 1.193 1.656 2.047 2.371 2.662 2.928 3.167 3.601 3.798 3.993 4.23 4.562 4.73 5.041 5.319 5.583 5.712 5.956 6.2 6.543 6.762 6.982 7.289 7.578 7.85 8.117 8.378 8.704 9.05 9.391 9.758 10.103 10.432 10.782 11.152 11.488 11.833 12.204 12.611 13.02 13.454 13.966 14.452 14.969 15.5 16.153 16.903 17.535 18.002 18.229 17.69 16.88 16.076 15.272 14.484 13.764 13.113 12.542 11.882 11.251 10.676 10.12 9.619 9.152 8.688 8.189 7.751 7.383 7.018 6.655 6.341 6.0 5.655 5.378 5.081 4.777 4.453 4.117 3.89 3.659 3.294 3.028 2.742 2.6 2.316 2.027 1.735 1.583 1.271 1.039 0.836 0.626 0.174 -0.097 -0.386 -0.688 -1.054 -1.514 -2.066 -3.841 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt deleted file mode 100644 index 2180e105..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12916 ,TETRA ,17585151,Sat Nov 27 11:50:44 CET,Sat Nov 27 14:04:00 CET,0.0 1.192 1.649 2.002 2.292 2.581 2.849 3.086 3.534 3.744 3.944 4.177 4.505 4.675 5.003 5.313 5.604 5.749 6.028 6.308 6.706 6.945 7.186 7.532 7.863 8.185 8.487 8.786 9.187 9.572 9.934 10.353 10.746 11.121 11.576 12.094 12.582 13.118 13.691 14.33 15.042 15.803 16.611 17.393 18.308 19.288 20.306 21.428 22.741 24.086 25.059 25.247 25.028 24.469 23.765 23.078 22.423 21.779 21.244 20.714 20.229 19.752 19.287 18.859 18.451 18.08 17.703 17.363 17.052 16.714 16.36 16.068 15.765 15.44 15.188 14.945 14.709 14.461 14.171 13.962 13.749 13.405 13.167 12.916 12.779 12.489 12.181 11.857 11.699 11.398 11.184 10.988 10.786 10.381 10.16 9.906 9.619 9.314 8.96 8.499 7.33 -2 ,1843 ,TETRA ,17585152,Sat Nov 27 11:50:43 CET,Sat Nov 27 14:00:20 CET,0.0 0.996 1.432 1.768 2.075 2.346 2.58 2.807 3.23 3.425 3.618 3.817 4.126 4.283 4.59 4.904 5.204 5.342 5.613 5.872 6.245 6.489 6.726 7.071 7.402 7.721 8.039 8.344 8.739 9.133 9.515 9.974 10.394 10.791 11.25 11.747 12.232 12.776 13.362 13.985 14.63 15.343 16.129 16.909 17.82 18.752 19.704 20.668 21.75 22.943 23.888 23.979 23.5 22.755 21.885 21.017 20.322 19.667 19.049 18.437 17.866 17.344 16.861 16.388 15.928 15.496 15.013 14.577 14.214 13.816 13.394 13.059 12.726 12.389 12.118 11.839 11.557 11.257 10.931 10.719 10.511 10.177 9.938 9.674 9.53 9.243 8.971 8.688 8.532 8.224 8.004 7.817 7.626 7.225 7.003 6.774 6.532 6.26 5.893 5.434 4.176 -3 ,749 ,TETRA ,17585153,Sat Nov 27 11:51:44 CET,Sat Nov 27 14:03:04 CET,0.0 1.126 1.645 2.063 2.409 2.697 2.939 3.148 3.523 3.703 3.888 4.111 4.427 4.585 4.883 5.164 5.435 5.566 5.814 6.056 6.401 6.619 6.828 7.134 7.435 7.726 8.02 8.307 8.687 9.058 9.402 9.795 10.186 10.579 11.036 11.529 11.995 12.516 13.077 13.677 14.3 15.0 15.825 16.641 17.58 18.601 19.706 20.806 21.921 23.046 23.804 23.812 23.381 22.777 22.158 21.463 20.716 19.991 19.356 18.74 18.224 17.74 17.255 16.788 16.335 15.919 15.484 15.06 14.71 14.364 13.989 13.669 13.319 12.95 12.656 12.357 12.061 11.74 11.393 11.152 10.91 10.546 10.289 10.012 9.868 9.583 9.266 8.92 8.746 8.42 8.155 7.949 7.754 7.322 7.072 6.808 6.532 6.218 5.832 5.305 4.156 -4 ,23803 ,TETRA ,17585154,Sat Nov 27 11:51:44 CET,Sat Nov 27 14:03:24 CET,0.0 1.095 1.501 1.839 2.147 2.399 2.64 2.872 3.259 3.442 3.625 3.824 4.142 4.299 4.596 4.9 5.173 5.295 5.547 5.79 6.13 6.346 6.559 6.872 7.177 7.481 7.77 8.047 8.408 8.753 9.085 9.483 9.863 10.239 10.67 11.139 11.611 12.145 12.703 13.298 13.935 14.626 15.394 16.151 17.011 17.99 19.013 20.066 21.227 22.313 23.332 23.566 23.29 22.873 22.357 21.776 21.216 20.673 20.176 19.664 19.176 18.721 18.299 17.89 17.493 17.112 16.702 16.335 16.013 15.69 15.358 15.073 14.771 14.444 14.189 13.914 13.632 13.349 13.055 12.854 12.648 12.332 12.098 11.844 11.714 11.45 11.161 10.843 10.674 10.343 10.092 9.899 9.697 9.278 9.037 8.767 8.485 8.157 7.785 7.34 5.851 -5 ,12178 ,TETRA ,17585155,Sat Nov 27 11:51:45 CET,Sat Nov 27 14:03:20 CET,0.0 0.971 1.401 1.742 2.033 2.301 2.551 2.781 3.211 3.406 3.592 3.792 4.101 4.26 4.58 4.893 5.177 5.317 5.584 5.831 6.194 6.43 6.659 6.979 7.277 7.565 7.846 8.127 8.482 8.813 9.151 9.582 9.987 10.362 10.794 11.29 11.772 12.293 12.849 13.416 13.991 14.643 15.397 16.151 16.973 17.802 18.787 19.891 20.973 21.966 22.765 22.819 22.31 21.579 20.878 20.162 19.452 18.79 18.201 17.573 17.018 16.522 16.042 15.566 15.118 14.719 14.292 13.907 13.579 13.238 12.872 12.568 12.261 11.944 11.694 11.425 11.149 10.856 10.541 10.333 10.124 9.771 9.509 9.242 9.102 8.795 8.462 8.107 7.927 7.613 7.393 7.182 6.95 6.445 6.172 5.91 5.624 5.246 4.784 4.24 2.863 -6 ,15469 ,TETRA ,17585156,Sat Nov 27 11:51:44 CET,Sat Nov 27 13:50:06 CET,0.0 1.126 1.593 1.952 2.271 2.584 2.878 3.143 3.614 3.826 4.028 4.255 4.589 4.774 5.115 5.435 5.752 5.903 6.186 6.46 6.85 7.101 7.349 7.707 8.067 8.415 8.738 9.038 9.423 9.796 10.154 10.609 11.063 11.489 11.974 12.513 13.018 13.54 14.072 14.662 15.283 15.972 16.807 17.587 18.409 19.337 20.42 21.647 22.845 23.91 24.704 24.577 24.08 23.369 22.553 21.817 21.162 20.515 19.957 19.385 18.889 18.43 17.964 17.529 17.106 16.696 16.258 15.856 15.516 15.175 14.802 14.497 14.186 13.845 13.572 13.282 12.989 12.693 12.392 12.184 11.954 11.592 11.347 11.096 10.96 10.672 10.371 10.055 9.895 9.598 9.404 9.222 9.027 8.578 8.335 8.064 7.75 7.415 7.055 6.584 5.105 -7 ,28762 ,TETRA ,17585157,Sat Nov 27 11:52:45 CET,Sat Nov 27 14:04:01 CET,0.0 0.972 1.414 1.757 2.075 2.368 2.637 2.879 3.3 3.49 3.663 3.859 4.173 4.328 4.617 4.897 5.173 5.309 5.557 5.788 6.122 6.349 6.577 6.899 7.211 7.522 7.837 8.146 8.536 8.91 9.262 9.673 10.063 10.434 10.871 11.387 11.866 12.381 12.989 13.634 14.268 14.966 15.761 16.536 17.399 18.304 19.292 20.355 21.519 22.69 23.727 23.865 23.276 22.476 21.689 20.968 20.269 19.591 18.986 18.369 17.814 17.32 16.856 16.408 15.956 15.536 15.106 14.7 14.339 13.967 13.59 13.271 12.942 12.601 12.336 12.069 11.785 11.477 11.139 10.905 10.674 10.297 10.019 9.721 9.569 9.261 8.931 8.597 8.422 8.08 7.804 7.595 7.386 6.926 6.664 6.36 6.027 5.681 5.262 4.61 3.002 -8 ,27543 ,TETRA ,17585158,Sat Nov 27 11:52:45 CET,Sat Nov 27 13:54:46 CET,0.0 0.901 1.327 1.706 2.012 2.292 2.558 2.785 3.181 3.366 3.55 3.769 4.103 4.279 4.609 4.912 5.202 5.332 5.58 5.836 6.178 6.388 6.601 6.918 7.242 7.555 7.864 8.173 8.558 8.926 9.28 9.698 10.092 10.486 10.931 11.414 11.873 12.382 12.943 13.522 14.116 14.798 15.629 16.44 17.308 18.245 19.213 20.159 21.197 22.147 22.722 22.547 22.05 21.317 20.511 19.772 19.069 18.429 17.87 17.296 16.781 16.302 15.821 15.336 14.9 14.493 14.062 13.681 13.345 12.984 12.598 12.277 11.952 11.625 11.358 11.067 10.776 10.495 10.207 10.0 9.785 9.464 9.238 8.991 8.866 8.612 8.344 8.045 7.881 7.567 7.341 7.15 6.961 6.549 6.307 6.047 5.764 5.433 5.053 4.589 2.507 -9 ,25808 ,TETRA ,17585159,Sat Nov 27 11:53:45 CET,Sat Nov 27 14:05:39 CET,0.0 1.041 1.449 1.755 2.042 2.318 2.573 2.806 3.198 3.37 3.539 3.77 4.096 4.26 4.569 4.865 5.146 5.285 5.552 5.803 6.155 6.387 6.614 6.949 7.278 7.588 7.884 8.167 8.531 8.893 9.245 9.652 10.043 10.414 10.845 11.335 11.812 12.327 12.858 13.416 14.017 14.746 15.619 16.446 17.296 18.16 19.093 20.066 21.055 21.95 22.643 22.548 21.972 21.298 20.622 19.942 19.285 18.629 18.01 17.406 16.892 16.381 15.873 15.39 14.927 14.507 14.072 13.683 13.339 12.975 12.589 12.268 11.942 11.612 11.357 11.081 10.787 10.477 10.165 9.953 9.721 9.376 9.153 8.909 8.775 8.51 8.242 7.947 7.784 7.47 7.241 7.06 6.883 6.484 6.254 5.993 5.702 5.388 5.028 4.521 3.28 -10 ,31029 ,TETRA ,17585160,Sat Nov 27 11:53:45 CET,Sat Nov 27 13:58:54 CET,0.0 0.965 1.424 1.816 2.132 2.422 2.685 2.918 3.327 3.503 3.674 3.879 4.198 4.362 4.66 4.932 5.217 5.361 5.633 5.886 6.243 6.472 6.708 7.051 7.366 7.658 7.947 8.242 8.614 8.963 9.311 9.735 10.137 10.534 10.987 11.485 11.965 12.481 13.048 13.645 14.24 14.884 15.623 16.363 17.189 18.065 19.056 20.141 21.171 22.038 22.539 22.402 21.89 21.179 20.464 19.712 18.996 18.346 17.724 17.062 16.488 15.937 15.411 14.939 14.483 14.042 13.601 13.214 12.867 12.501 12.111 11.795 11.485 11.146 10.879 10.613 10.329 10.031 9.713 9.494 9.267 8.905 8.671 8.431 8.306 8.031 7.739 7.437 7.284 6.99 6.797 6.611 6.409 5.993 5.762 5.503 5.232 4.955 4.614 4.128 2.743 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index d94ec516..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4973 ,TETRA ,17585161,Sat Nov 27 11:53:45 CET,Sat Nov 27 14:05:49 CET,0.0 1.061 1.439 1.751 2.043 2.305 2.529 2.75 3.137 3.3 3.469 3.653 3.953 4.096 4.354 4.596 4.854 4.98 5.215 5.444 5.771 5.97 6.16 6.428 6.689 6.948 7.21 7.477 7.813 8.121 8.416 8.784 9.152 9.514 9.914 10.348 10.761 11.201 11.703 12.248 12.804 13.427 14.092 14.655 15.25 15.861 16.47 17.081 17.731 18.316 18.568 18.12 17.225 16.172 15.09 14.06 13.088 12.088 11.155 10.256 9.519 8.822 8.126 7.493 6.894 6.349 5.797 5.298 4.852 4.386 3.923 3.534 3.132 2.73 2.417 2.077 1.707 1.326 0.931 0.65 0.346 -0.151 -0.5 -0.853 -1.04 -1.433 -1.835 -2.242 -2.459 -2.837 -3.145 -3.376 -3.633 -4.206 -4.517 -4.831 -5.171 -5.604 -6.119 -6.819 -8.95 -2 ,21399 ,TETRA ,17585162,Sat Nov 27 11:53:45 CET,Sat Nov 27 14:04:28 CET,0.0 0.787 1.188 1.487 1.726 1.968 2.206 2.416 2.818 2.999 3.164 3.353 3.664 3.813 4.095 4.356 4.613 4.742 4.971 5.158 5.414 5.584 5.749 5.987 6.219 6.444 6.665 6.893 7.188 7.463 7.712 8.012 8.302 8.577 8.911 9.283 9.614 9.971 10.358 10.761 11.19 11.664 12.191 12.688 13.249 13.86 14.54 15.237 15.894 16.493 16.59 15.705 14.716 13.72 12.718 11.73 10.787 9.869 9.044 8.226 7.504 6.889 6.337 5.79 5.268 4.781 4.255 3.786 3.375 2.916 2.428 2.042 1.639 1.216 0.864 0.477 0.087 -0.32 -0.756 -1.056 -1.361 -1.832 -2.15 -2.492 -2.677 -3.061 -3.459 -3.863 -4.069 -4.445 -4.797 -5.058 -5.331 -5.956 -6.309 -6.669 -7.084 -7.529 -8.071 -8.824 -11.089 -3 ,1885 ,TETRA ,17585163,Sat Nov 27 11:53:45 CET,Sat Nov 27 13:46:00 CET,0.0 1.187 1.663 2.094 2.43 2.686 2.941 3.185 3.625 3.814 3.995 4.189 4.504 4.655 4.936 5.195 5.451 5.573 5.8 6.023 6.342 6.542 6.735 7.019 7.303 7.582 7.858 8.123 8.443 8.75 9.053 9.412 9.759 10.09 10.47 10.913 11.332 11.758 12.201 12.664 13.151 13.695 14.334 14.956 15.63 16.361 17.101 17.835 18.567 19.103 19.143 18.496 17.593 16.564 15.572 14.654 13.782 12.956 12.222 11.471 10.811 10.205 9.629 9.094 8.561 8.027 7.47 6.973 6.54 6.108 5.656 5.282 4.886 4.472 4.152 3.816 3.476 3.116 2.719 2.453 2.196 1.787 1.495 1.184 1.025 0.704 0.329 -0.076 -0.281 -0.644 -0.941 -1.179 -1.417 -1.907 -2.181 -2.48 -2.825 -3.25 -3.741 -4.378 -6.291 -4 ,12153 ,TETRA ,17585164,Sat Nov 27 11:53:45 CET,Sat Nov 27 14:04:23 CET,0.0 1.186 1.619 1.909 2.128 2.327 2.556 2.798 3.2 3.365 3.53 3.696 3.996 4.144 4.428 4.694 4.953 5.077 5.306 5.511 5.821 6.032 6.231 6.516 6.796 7.068 7.325 7.563 7.862 8.15 8.431 8.773 9.101 9.421 9.795 10.205 10.582 10.992 11.392 11.783 12.214 12.718 13.273 13.785 14.362 14.979 15.687 16.449 17.061 17.284 17.144 16.379 15.245 14.099 12.967 11.877 10.869 9.934 9.154 8.331 7.58 6.885 6.197 5.552 4.991 4.472 3.898 3.387 2.931 2.461 1.961 1.54 1.136 0.716 0.38 0.014 -0.383 -0.782 -1.192 -1.468 -1.743 -2.212 -2.552 -2.887 -3.057 -3.42 -3.804 -4.206 -4.424 -4.813 -5.157 -5.386 -5.632 -6.162 -6.461 -6.806 -7.176 -7.609 -8.167 -8.905 -11.193 -5 ,20886 ,TETRA ,17585165,Sat Nov 27 11:53:47 CET,Sat Nov 27 14:04:22 CET,0.0 1.071 1.555 1.891 2.169 2.429 2.662 2.88 3.279 3.466 3.656 3.85 4.138 4.277 4.552 4.822 5.075 5.198 5.452 5.693 6.026 6.241 6.46 6.773 7.071 7.353 7.616 7.885 8.233 8.564 8.882 9.252 9.606 9.958 10.367 10.809 11.232 11.705 12.219 12.735 13.245 13.8 14.402 14.96 15.609 16.352 17.1 17.776 18.377 18.81 18.911 18.198 17.122 16.084 15.135 14.187 13.309 12.419 11.533 10.664 9.977 9.363 8.748 8.158 7.601 7.078 6.55 6.082 5.68 5.259 4.811 4.414 3.993 3.561 3.208 2.838 2.454 2.072 1.686 1.405 1.118 0.68 0.375 0.038 -0.133 -0.472 -0.852 -1.284 -1.509 -1.875 -2.209 -2.468 -2.737 -3.311 -3.64 -4.005 -4.402 -4.874 -5.422 -6.142 -8.36 -6 ,32567 ,TETRA ,17585166,Sat Nov 27 11:53:44 CET,Sat Nov 27 13:50:47 CET,0.0 1.094 1.505 1.823 2.08 2.316 2.536 2.726 3.059 3.219 3.368 3.49 3.757 3.88 4.125 4.372 4.604 4.71 4.909 5.105 5.392 5.573 5.747 5.998 6.257 6.503 6.733 6.955 7.225 7.49 7.751 8.074 8.388 8.705 9.065 9.462 9.851 10.271 10.737 11.211 11.688 12.233 12.825 13.369 14.001 14.69 15.363 15.99 16.547 16.879 16.761 16.039 14.983 13.785 12.624 11.511 10.49 9.55 8.707 7.837 7.109 6.465 5.828 5.203 4.626 4.086 3.53 3.056 2.635 2.163 1.632 1.196 0.753 0.299 -0.055 -0.448 -0.861 -1.262 -1.662 -1.932 -2.224 -2.701 -3.033 -3.375 -3.552 -3.915 -4.312 -4.747 -4.98 -5.358 -5.69 -5.953 -6.239 -6.83 -7.141 -7.515 -7.918 -8.327 -8.838 -9.554 -12.102 -7 ,25164 ,TETRA ,17585167,Sat Nov 27 11:55:44 CET,Sat Nov 27 14:05:36 CET,0.0 0.954 1.341 1.642 1.922 2.177 2.41 2.617 2.984 3.152 3.318 3.475 3.766 3.896 4.117 4.346 4.592 4.71 4.929 5.157 5.472 5.656 5.835 6.099 6.35 6.575 6.795 7.016 7.293 7.561 7.82 8.137 8.446 8.724 9.036 9.375 9.704 10.098 10.518 10.926 11.354 11.839 12.398 12.936 13.491 14.111 14.766 15.359 15.886 16.26 16.149 15.213 14.033 12.819 11.693 10.621 9.639 8.728 7.903 7.048 6.31 5.646 5.011 4.421 3.879 3.373 2.822 2.322 1.876 1.424 0.982 0.605 0.184 -0.286 -0.656 -1.019 -1.374 -1.752 -2.158 -2.438 -2.759 -3.266 -3.59 -3.915 -4.078 -4.431 -4.784 -5.146 -5.35 -5.714 -6.076 -6.357 -6.645 -7.269 -7.596 -7.927 -8.306 -8.772 -9.37 -10.103 -12.332 -8 ,3793 ,TETRA ,17585168,Sat Nov 27 11:55:45 CET,Sat Nov 27 14:05:56 CET,0.0 1.008 1.374 1.693 1.962 2.205 2.416 2.611 2.961 3.118 3.271 3.43 3.712 3.85 4.113 4.351 4.57 4.677 4.882 5.073 5.345 5.537 5.736 6.014 6.265 6.496 6.727 6.961 7.259 7.542 7.821 8.128 8.417 8.699 9.031 9.399 9.748 10.124 10.52 10.944 11.391 11.889 12.445 13.011 13.659 14.3 14.964 15.606 16.164 16.579 16.614 15.844 14.718 13.57 12.424 11.364 10.46 9.623 8.854 8.073 7.392 6.767 6.165 5.559 5.006 4.518 3.963 3.463 3.021 2.521 2.006 1.591 1.14 0.659 0.305 -0.064 -0.471 -0.873 -1.272 -1.543 -1.824 -2.283 -2.617 -2.967 -3.141 -3.505 -3.889 -4.299 -4.519 -4.909 -5.302 -5.574 -5.843 -6.439 -6.755 -7.092 -7.485 -7.949 -8.477 -9.223 -11.581 -9 ,20661 ,TETRA ,17585169,Sat Nov 27 11:55:45 CET,Sat Nov 27 14:11:19 CET,0.0 1.238 1.7 2.064 2.368 2.663 2.926 3.151 3.583 3.793 3.997 4.243 4.577 4.752 5.079 5.368 5.642 5.779 6.045 6.308 6.69 6.942 7.177 7.503 7.82 8.124 8.422 8.708 9.06 9.373 9.652 9.985 10.306 10.604 10.949 11.357 11.747 12.185 12.635 13.078 13.504 13.955 14.536 15.072 15.613 16.201 16.798 17.391 17.918 18.136 17.735 16.731 15.626 14.517 13.482 12.459 11.487 10.591 9.748 8.834 8.044 7.349 6.709 6.082 5.455 4.875 4.259 3.733 3.299 2.826 2.311 1.89 1.468 1.002 0.634 0.266 -0.113 -0.516 -0.926 -1.2 -1.5 -1.971 -2.292 -2.629 -2.805 -3.175 -3.564 -3.964 -4.176 -4.55 -4.884 -5.137 -5.393 -6.003 -6.384 -6.813 -7.25 -7.699 -8.235 -9.017 -11.439 -10 ,25045 ,TETRA ,17585170,Sat Nov 27 11:56:46 CET,Sat Nov 27 14:07:47 CET,0.0 0.864 1.254 1.585 1.851 2.08 2.287 2.474 2.849 3.023 3.173 3.321 3.613 3.749 3.999 4.221 4.452 4.574 4.806 5.02 5.312 5.507 5.698 5.971 6.241 6.498 6.752 7.0 7.323 7.624 7.9 8.232 8.537 8.826 9.19 9.569 9.888 10.246 10.627 11.015 11.436 11.926 12.504 13.05 13.642 14.229 14.795 15.446 16.062 16.333 16.115 15.221 13.972 12.705 11.535 10.428 9.484 8.623 7.842 7.062 6.383 5.727 5.073 4.466 3.909 3.377 2.828 2.353 1.943 1.513 1.065 0.685 0.273 -0.143 -0.459 -0.798 -1.145 -1.513 -1.919 -2.197 -2.481 -2.916 -3.224 -3.562 -3.731 -4.065 -4.442 -4.86 -5.06 -5.404 -5.695 -5.922 -6.172 -6.747 -7.061 -7.404 -7.787 -8.222 -8.777 -9.48 -11.465 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 542aa155..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4281 ,TETRA ,17585171,Sat Nov 27 11:56:46 CET,Sat Nov 27 14:13:48 CET,0.0 1.132 1.486 1.784 2.03 2.261 2.47 2.668 3.011 3.171 3.312 3.418 3.689 3.817 4.072 4.302 4.499 4.592 4.781 4.963 5.22 5.384 5.535 5.749 5.976 6.199 6.403 6.611 6.885 7.133 7.361 7.623 7.854 8.079 8.353 8.659 8.939 9.229 9.535 9.837 10.134 10.454 10.83 11.197 11.56 11.898 12.236 12.574 12.812 12.844 12.391 11.38 10.359 9.297 8.273 7.339 6.477 5.679 4.99 4.249 3.578 2.985 2.411 1.857 1.372 0.918 0.421 -0.019 -0.417 -0.844 -1.282 -1.652 -2.033 -2.431 -2.74 -3.048 -3.376 -3.717 -4.068 -4.324 -4.597 -5.014 -5.298 -5.605 -5.755 -6.05 -6.375 -6.74 -6.915 -7.229 -7.463 -7.677 -7.907 -8.421 -8.702 -9.014 -9.352 -9.719 -10.2 -10.826 -12.782 -2 ,11063 ,TETRA ,17585172,Sat Nov 27 11:56:46 CET,Sat Nov 27 14:08:46 CET,0.0 1.318 1.782 2.118 2.403 2.665 2.908 3.141 3.565 3.75 3.914 4.039 4.314 4.45 4.723 4.963 5.19 5.306 5.525 5.739 6.036 6.222 6.396 6.628 6.859 7.088 7.291 7.487 7.746 8.0 8.248 8.54 8.816 9.079 9.374 9.7 10.021 10.359 10.714 11.094 11.458 11.83 12.266 12.681 13.108 13.509 13.893 14.239 14.479 14.576 14.298 13.299 12.162 11.077 10.025 8.994 8.03 7.153 6.369 5.524 4.751 4.052 3.394 2.757 2.153 1.61 1.039 0.514 0.058 -0.424 -0.913 -1.303 -1.718 -2.16 -2.495 -2.837 -3.21 -3.597 -3.999 -4.28 -4.587 -5.091 -5.436 -5.781 -5.953 -6.34 -6.759 -7.16 -7.368 -7.722 -8.06 -8.339 -8.627 -9.228 -9.566 -9.947 -10.341 -10.739 -11.23 -11.905 -13.719 -3 ,2875 ,TETRA ,17585173,Sat Nov 27 11:56:46 CET,Sat Nov 27 14:06:09 CET,0.0 1.483 1.93 2.301 2.627 2.884 3.109 3.326 3.709 3.879 4.035 4.178 4.466 4.601 4.834 5.064 5.297 5.404 5.624 5.833 6.116 6.3 6.484 6.737 6.968 7.179 7.378 7.579 7.84 8.098 8.363 8.685 8.966 9.219 9.5 9.82 10.129 10.451 10.791 11.147 11.503 11.879 12.285 12.651 13.043 13.409 13.785 14.18 14.487 14.704 14.489 13.452 12.208 11.004 9.902 8.912 8.018 7.143 6.346 5.562 4.917 4.352 3.813 3.275 2.741 2.255 1.711 1.219 0.812 0.371 -0.08 -0.434 -0.803 -1.181 -1.466 -1.776 -2.109 -2.474 -2.845 -3.085 -3.336 -3.731 -4.005 -4.298 -4.445 -4.744 -5.083 -5.456 -5.653 -6.015 -6.284 -6.486 -6.716 -7.276 -7.578 -7.892 -8.266 -8.727 -9.274 -10.005 -12.26 -4 ,19891 ,TETRA ,17585174,Sat Nov 27 11:56:47 CET,Sat Nov 27 14:06:59 CET,0.0 1.209 1.692 2.043 2.318 2.56 2.785 2.989 3.356 3.533 3.712 3.9 4.191 4.33 4.602 4.858 5.107 5.233 5.471 5.687 6.001 6.222 6.451 6.751 6.999 7.232 7.449 7.646 7.898 8.145 8.382 8.633 8.851 9.068 9.321 9.609 9.881 10.165 10.468 10.787 11.088 11.404 11.78 12.154 12.573 12.996 13.391 13.746 14.035 14.1 13.671 12.707 11.633 10.581 9.61 8.694 7.907 7.16 6.435 5.672 4.999 4.392 3.835 3.299 2.765 2.268 1.757 1.328 0.965 0.584 0.183 -0.171 -0.562 -0.96 -1.26 -1.576 -1.908 -2.247 -2.608 -2.862 -3.118 -3.527 -3.809 -4.101 -4.256 -4.564 -4.879 -5.22 -5.408 -5.764 -6.08 -6.305 -6.527 -7.017 -7.313 -7.651 -8.03 -8.453 -8.889 -9.5 -11.244 -5 ,21909 ,TETRA ,17585175,Sat Nov 27 11:56:47 CET,Sat Nov 27 14:05:25 CET,0.0 1.314 1.746 2.081 2.356 2.603 2.826 3.025 3.378 3.537 3.687 3.83 4.121 4.263 4.52 4.765 5.021 5.147 5.386 5.611 5.936 6.145 6.339 6.61 6.869 7.105 7.318 7.524 7.801 8.063 8.31 8.639 8.985 9.319 9.662 10.018 10.361 10.739 11.115 11.45 11.839 12.341 12.857 13.321 13.814 14.238 14.655 15.036 15.319 15.362 14.945 13.992 12.867 11.733 10.665 9.644 8.763 7.967 7.234 6.467 5.796 5.182 4.568 3.987 3.44 2.949 2.426 1.938 1.53 1.079 0.592 0.201 -0.211 -0.63 -0.961 -1.313 -1.67 -2.031 -2.4 -2.661 -2.936 -3.366 -3.688 -4.024 -4.191 -4.537 -4.932 -5.364 -5.573 -5.928 -6.209 -6.443 -6.703 -7.273 -7.576 -7.914 -8.289 -8.698 -9.195 -9.851 -11.964 -6 ,806 ,TETRA ,17585176,Sat Nov 27 11:56:49 CET,Sat Nov 27 14:06:10 CET,0.0 1.422 1.858 2.209 2.492 2.745 2.95 3.125 3.453 3.612 3.78 3.965 4.26 4.4 4.669 4.906 5.13 5.242 5.459 5.669 5.976 6.175 6.359 6.614 6.863 7.093 7.302 7.508 7.768 8.02 8.267 8.562 8.841 9.092 9.377 9.71 10.04 10.397 10.755 11.106 11.476 11.866 12.283 12.705 13.164 13.591 14.007 14.428 14.762 14.862 14.475 13.496 12.406 11.383 10.44 9.539 8.742 7.954 7.214 6.483 5.86 5.298 4.779 4.276 3.791 3.368 2.909 2.482 2.111 1.727 1.321 0.973 0.598 0.19 -0.119 -0.431 -0.765 -1.121 -1.49 -1.741 -2.002 -2.412 -2.725 -3.057 -3.217 -3.556 -3.941 -4.373 -4.578 -4.917 -5.184 -5.401 -5.619 -6.113 -6.394 -6.702 -7.017 -7.364 -7.824 -8.471 -10.182 -7 ,11021 ,TETRA ,17585177,Sat Nov 27 11:57:43 CET,Sat Nov 27 14:07:33 CET,0.0 1.364 1.823 2.157 2.454 2.741 2.982 3.192 3.561 3.732 3.901 4.058 4.336 4.459 4.709 4.934 5.141 5.242 5.458 5.672 5.961 6.156 6.346 6.612 6.885 7.161 7.418 7.655 7.957 8.253 8.541 8.869 9.188 9.488 9.806 10.139 10.448 10.791 11.145 11.502 11.878 12.269 12.703 13.11 13.544 13.981 14.428 14.83 15.104 15.189 14.864 13.941 12.917 11.927 10.945 9.97 9.074 8.219 7.484 6.757 6.072 5.417 4.805 4.236 3.661 3.108 2.559 2.052 1.59 1.118 0.62 0.192 -0.24 -0.659 -0.978 -1.303 -1.645 -2.031 -2.434 -2.705 -2.99 -3.441 -3.765 -4.094 -4.273 -4.679 -5.081 -5.516 -5.753 -6.133 -6.455 -6.709 -6.96 -7.492 -7.789 -8.103 -8.46 -8.896 -9.433 -10.212 -13.049 -8 ,16896 ,TETRA ,17585178,Sat Nov 27 11:57:46 CET,Sat Nov 27 14:07:32 CET,0.0 1.258 1.636 1.906 2.157 2.377 2.565 2.752 3.106 3.271 3.426 3.58 3.876 4.022 4.284 4.529 4.746 4.846 5.058 5.266 5.562 5.748 5.915 6.146 6.367 6.589 6.81 7.029 7.318 7.612 7.902 8.244 8.564 8.833 9.127 9.461 9.783 10.119 10.476 10.851 11.222 11.615 12.041 12.462 12.908 13.355 13.831 14.277 14.607 14.708 14.263 13.183 12.105 11.066 10.067 9.11 8.254 7.449 6.749 6.059 5.438 4.851 4.28 3.727 3.193 2.713 2.197 1.704 1.255 0.763 0.239 -0.202 -0.665 -1.12 -1.45 -1.79 -2.154 -2.54 -2.937 -3.207 -3.471 -3.883 -4.189 -4.502 -4.66 -4.982 -5.339 -5.744 -5.952 -6.314 -6.601 -6.832 -7.068 -7.635 -7.968 -8.323 -8.717 -9.141 -9.642 -10.353 -12.487 -9 ,9590 ,TETRA ,17585179,Sat Nov 27 11:58:45 CET,Sat Nov 27 14:11:26 CET,0.0 1.647 2.148 2.491 2.767 3.01 3.219 3.426 3.806 3.972 4.122 4.271 4.566 4.706 4.967 5.215 5.473 5.597 5.833 6.053 6.337 6.517 6.713 6.991 7.236 7.467 7.681 7.886 8.155 8.414 8.66 8.951 9.216 9.461 9.752 10.07 10.365 10.705 11.088 11.465 11.844 12.277 12.739 13.167 13.646 14.127 14.61 15.049 15.369 15.48 15.172 14.292 13.304 12.29 11.276 10.32 9.463 8.684 7.963 7.2 6.552 5.97 5.395 4.84 4.3 3.802 3.285 2.806 2.386 1.957 1.49 1.1 0.707 0.29 -0.045 -0.392 -0.755 -1.135 -1.524 -1.811 -2.112 -2.569 -2.89 -3.223 -3.4 -3.797 -4.198 -4.596 -4.807 -5.177 -5.505 -5.779 -6.081 -6.695 -7.026 -7.386 -7.765 -8.205 -8.74 -9.495 -11.958 -10 ,15095 ,TETRA ,17585180,Sat Nov 27 11:58:45 CET,Sat Nov 27 14:09:55 CET,0.0 1.222 1.642 1.997 2.285 2.538 2.762 2.962 3.316 3.477 3.636 3.773 4.058 4.205 4.5 4.753 4.983 5.095 5.302 5.511 5.829 6.025 6.209 6.459 6.694 6.924 7.138 7.341 7.603 7.857 8.114 8.421 8.706 8.974 9.273 9.611 9.954 10.321 10.684 11.045 11.401 11.79 12.24 12.681 13.146 13.596 14.079 14.561 14.872 14.922 14.628 13.76 12.745 11.713 10.642 9.652 8.744 7.83 7.044 6.214 5.454 4.815 4.239 3.615 2.993 2.43 1.866 1.403 0.999 0.55 0.064 -0.336 -0.766 -1.226 -1.585 -1.957 -2.341 -2.752 -3.169 -3.46 -3.794 -4.324 -4.658 -4.981 -5.159 -5.558 -5.972 -6.376 -6.571 -6.923 -7.27 -7.544 -7.811 -8.351 -8.666 -9.012 -9.38 -9.854 -10.449 -11.194 -13.075 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt deleted file mode 100644 index 941dd626..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29128 ,TETRA ,17585181,Sat Nov 27 11:58:45 CET,Sat Nov 27 14:12:30 CET,0.0 1.415 1.85 2.2 2.481 2.734 2.98 3.192 3.572 3.753 3.935 4.137 4.454 4.615 4.94 5.23 5.478 5.606 5.865 6.117 6.47 6.697 6.918 7.238 7.549 7.849 8.144 8.435 8.816 9.181 9.527 9.928 10.281 10.615 10.996 11.435 11.883 12.369 12.894 13.407 13.895 14.439 15.025 15.585 16.223 16.84 17.436 18.027 18.632 19.194 19.442 19.085 18.512 17.83 17.076 16.256 15.48 14.715 14.018 13.357 12.789 12.257 11.729 11.207 10.705 10.231 9.72 9.231 8.784 8.304 7.793 7.375 6.946 6.514 6.194 5.869 5.518 5.149 4.748 4.463 4.176 3.735 3.446 3.118 2.931 2.545 2.128 1.709 1.505 1.124 0.741 0.456 0.157 -0.482 -0.853 -1.267 -1.707 -2.172 -2.734 -3.511 -6.12 -2 ,28680 ,TETRA ,17585182,Sat Nov 27 11:58:44 CET,Sat Nov 27 14:09:28 CET,0.0 1.114 1.569 1.902 2.185 2.461 2.692 2.878 3.237 3.422 3.597 3.762 4.049 4.201 4.475 4.707 4.924 5.032 5.238 5.447 5.765 5.957 6.141 6.412 6.663 6.912 7.154 7.388 7.71 8.014 8.296 8.638 8.98 9.295 9.616 9.989 10.373 10.782 11.212 11.675 12.129 12.598 13.118 13.629 14.198 14.776 15.399 16.054 16.725 17.278 17.499 17.106 16.365 15.574 14.806 14.021 13.161 12.296 11.592 10.891 10.244 9.63 9.074 8.51 7.954 7.479 6.958 6.471 6.056 5.635 5.213 4.848 4.441 4.02 3.682 3.345 2.988 2.567 2.119 1.82 1.518 1.02 0.653 0.267 0.081 -0.261 -0.628 -1.044 -1.258 -1.625 -1.952 -2.199 -2.454 -3.028 -3.374 -3.731 -4.071 -4.48 -4.994 -5.656 -7.816 -3 ,12877 ,TETRA ,17585183,Sat Nov 27 11:58:45 CET,Sat Nov 27 14:10:51 CET,0.0 1.212 1.609 1.945 2.248 2.508 2.729 2.951 3.394 3.573 3.736 3.898 4.201 4.355 4.639 4.908 5.167 5.284 5.523 5.758 6.075 6.267 6.458 6.734 6.999 7.259 7.493 7.719 8.015 8.301 8.582 8.909 9.215 9.516 9.886 10.299 10.666 11.065 11.486 11.902 12.327 12.809 13.372 13.929 14.558 15.229 15.948 16.644 17.338 17.974 18.222 17.846 17.262 16.51 15.716 14.888 14.057 13.277 12.59 11.856 11.193 10.607 10.019 9.444 8.919 8.425 7.908 7.461 7.065 6.659 6.26 5.911 5.542 5.16 4.844 4.515 4.199 3.878 3.503 3.224 2.933 2.476 2.175 1.884 1.742 1.439 1.089 0.704 0.503 0.147 -0.132 -0.365 -0.614 -1.171 -1.503 -1.864 -2.242 -2.656 -3.189 -3.895 -6.03 -4 ,18110 ,TETRA ,17585184,Sat Nov 27 11:58:45 CET,Sat Nov 27 14:09:43 CET,0.0 1.874 2.292 2.631 2.913 3.167 3.412 3.645 4.055 4.232 4.401 4.563 4.863 5.009 5.279 5.55 5.819 5.937 6.179 6.412 6.75 6.974 7.175 7.454 7.722 7.975 8.216 8.44 8.731 9.016 9.298 9.643 9.96 10.266 10.61 10.985 11.356 11.757 12.167 12.602 13.058 13.527 14.063 14.6 15.177 15.768 16.438 17.104 17.744 18.303 18.578 18.21 17.561 16.894 16.175 15.424 14.706 14.035 13.427 12.79 12.209 11.667 11.149 10.637 10.158 9.699 9.196 8.748 8.337 7.91 7.478 7.113 6.737 6.327 6.01 5.695 5.36 4.995 4.599 4.343 4.072 3.648 3.358 3.027 2.86 2.539 2.202 1.808 1.594 1.22 0.83 0.546 0.251 -0.437 -0.822 -1.208 -1.607 -2.088 -2.686 -3.429 -6.609 -5 ,1748 ,TETRA ,17585185,Sat Nov 27 11:58:45 CET,Sat Nov 27 14:10:58 CET,0.0 1.242 1.718 2.091 2.411 2.714 2.994 3.236 3.669 3.863 4.053 4.25 4.561 4.723 5.047 5.344 5.604 5.725 5.955 6.17 6.472 6.652 6.827 7.098 7.361 7.6 7.816 8.029 8.311 8.585 8.857 9.169 9.454 9.735 10.072 10.455 10.803 11.175 11.561 11.972 12.394 12.831 13.309 13.781 14.347 14.965 15.634 16.287 16.923 17.504 17.846 17.65 17.141 16.508 15.814 15.078 14.387 13.754 13.189 12.603 12.057 11.527 10.998 10.506 10.056 9.61 9.116 8.652 8.247 7.864 7.49 7.172 6.796 6.376 6.052 5.717 5.375 5.029 4.666 4.409 4.143 3.715 3.418 3.125 2.974 2.636 2.291 1.916 1.71 1.347 1.004 0.751 0.494 -0.11 -0.451 -0.803 -1.201 -1.637 -2.186 -2.877 -5.573 -6 ,12676 ,TETRA ,17585186,Sat Nov 27 11:59:44 CET,Sat Nov 27 14:13:01 CET,0.0 1.405 1.835 2.166 2.447 2.7 2.928 3.132 3.498 3.671 3.851 4.038 4.336 4.477 4.735 5.004 5.269 5.396 5.642 5.862 6.175 6.38 6.58 6.854 7.106 7.354 7.602 7.843 8.164 8.471 8.742 9.055 9.355 9.653 10.012 10.403 10.777 11.172 11.563 11.98 12.411 12.871 13.391 13.926 14.528 15.146 15.834 16.516 17.166 17.805 18.163 17.882 17.279 16.533 15.781 15.021 14.277 13.553 12.894 12.219 11.635 11.071 10.514 9.987 9.511 9.076 8.57 8.101 7.694 7.264 6.801 6.428 6.032 5.612 5.301 4.966 4.611 4.242 3.859 3.591 3.311 2.863 2.54 2.215 2.05 1.719 1.371 0.985 0.788 0.443 0.165 -0.069 -0.306 -0.82 -1.116 -1.455 -1.858 -2.311 -2.855 -3.543 -5.822 -7 ,20453 ,TETRA ,17585187,Sat Nov 27 11:59:44 CET,Sat Nov 27 14:11:36 CET,0.0 1.35 1.784 2.138 2.462 2.757 3.012 3.24 3.64 3.83 4.011 4.196 4.501 4.662 4.965 5.248 5.534 5.672 5.925 6.166 6.525 6.753 6.973 7.293 7.601 7.902 8.192 8.469 8.818 9.139 9.444 9.829 10.195 10.514 10.87 11.272 11.644 12.036 12.455 12.895 13.353 13.859 14.427 14.961 15.564 16.211 16.884 17.541 18.182 18.748 19.064 18.84 18.196 17.414 16.622 15.815 15.041 14.318 13.625 12.88 12.256 11.676 11.098 10.565 10.087 9.647 9.193 8.79 8.414 7.992 7.546 7.178 6.805 6.418 6.11 5.79 5.461 5.113 4.738 4.492 4.235 3.796 3.488 3.159 2.985 2.641 2.264 1.859 1.647 1.28 0.976 0.721 0.451 -0.142 -0.48 -0.87 -1.318 -1.84 -2.461 -3.249 -6.003 -8 ,23127 ,TETRA ,17585188,Sat Nov 27 11:59:44 CET,Sat Nov 27 14:10:54 CET,0.0 0.768 1.186 1.552 1.908 2.219 2.504 2.776 3.274 3.505 3.726 3.984 4.33 4.527 4.866 5.188 5.506 5.654 5.94 6.225 6.62 6.868 7.106 7.447 7.794 8.128 8.419 8.674 8.963 9.232 9.492 9.787 10.075 10.364 10.687 11.042 11.392 11.764 12.163 12.598 13.034 13.503 14.044 14.568 15.158 15.795 16.435 17.044 17.672 18.279 18.553 18.216 17.652 16.99 16.312 15.667 15.013 14.347 13.752 13.151 12.592 12.042 11.54 11.067 10.594 10.165 9.74 9.363 9.029 8.671 8.286 7.978 7.648 7.292 7.023 6.743 6.453 6.157 5.83 5.598 5.366 4.972 4.682 4.401 4.275 3.992 3.691 3.385 3.209 2.892 2.662 2.486 2.304 1.895 1.654 1.377 1.086 0.765 0.372 -0.176 -1.924 -9 ,17027 ,TETRA ,17585189,Sat Nov 27 11:59:47 CET,Sat Nov 27 14:10:54 CET,0.0 1.399 1.867 2.235 2.542 2.815 3.057 3.275 3.686 3.862 4.028 4.204 4.511 4.659 4.921 5.162 5.395 5.514 5.737 5.952 6.272 6.472 6.659 6.931 7.192 7.438 7.68 7.912 8.213 8.508 8.786 9.12 9.441 9.744 10.09 10.475 10.826 11.202 11.604 12.018 12.442 12.913 13.428 13.954 14.589 15.24 15.918 16.6 17.294 17.916 18.176 17.699 17.055 16.346 15.571 14.844 14.173 13.516 12.9 12.251 11.655 11.113 10.574 10.038 9.54 9.036 8.44 7.886 7.387 6.842 6.287 5.83 5.342 4.849 4.484 4.105 3.704 3.281 2.832 2.525 2.215 1.715 1.368 1.025 0.85 0.482 0.088 -0.326 -0.536 -0.911 -1.255 -1.521 -1.807 -2.416 -2.751 -3.1 -3.47 -3.896 -4.39 -5.116 -7.345 -10 ,24376 ,TETRA ,17585190,Sat Nov 27 12:01:26 CET,Sat Nov 27 14:12:20 CET,0.0 1.071 1.458 1.78 2.065 2.323 2.555 2.766 3.138 3.314 3.492 3.676 3.96 4.102 4.361 4.597 4.838 4.949 5.158 5.358 5.662 5.858 6.052 6.343 6.607 6.853 7.092 7.33 7.65 7.965 8.28 8.651 9.001 9.347 9.696 10.038 10.371 10.739 11.165 11.645 12.111 12.595 13.167 13.699 14.279 14.946 15.631 16.304 16.985 17.532 17.855 17.514 16.791 15.952 15.115 14.331 13.615 12.952 12.359 11.724 11.119 10.571 10.066 9.585 9.118 8.669 8.178 7.715 7.309 6.891 6.446 6.062 5.67 5.271 4.954 4.619 4.267 3.899 3.495 3.235 2.961 2.499 2.19 1.871 1.694 1.315 0.954 0.554 0.332 -0.037 -0.341 -0.588 -0.859 -1.448 -1.781 -2.139 -2.536 -3.004 -3.548 -4.275 -6.686 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt deleted file mode 100644 index c27b8ecd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3147 ,TETRA ,17585191,Sat Nov 27 12:01:26 CET,Sat Nov 27 14:14:21 CET,0.0 1.561 2.118 2.552 2.954 3.313 3.6 3.864 4.394 4.644 4.868 5.113 5.446 5.631 5.976 6.312 6.632 6.779 7.042 7.278 7.649 7.905 8.122 8.415 8.721 9.019 9.289 9.544 9.877 10.197 10.491 10.829 11.155 11.473 11.833 12.22 12.578 12.992 13.492 14.013 14.474 14.923 15.425 15.9 16.417 16.946 17.497 18.04 18.504 18.778 18.647 17.919 16.972 16.005 15.126 14.223 13.314 12.489 11.753 10.956 10.276 9.643 9.04 8.507 8.014 7.522 6.987 6.532 6.141 5.722 5.283 4.937 4.575 4.198 3.904 3.59 3.253 2.899 2.537 2.27 1.971 1.508 1.204 0.9 0.736 0.374 0.005 -0.377 -0.574 -0.928 -1.216 -1.452 -1.7 -2.205 -2.5 -2.847 -3.231 -3.635 -4.105 -4.68 -6.815 -2 ,9062 ,TETRA ,17585192,Sat Nov 27 12:02:46 CET,Sat Nov 27 14:12:59 CET,0.0 1.234 1.807 2.216 2.555 2.864 3.137 3.395 3.848 4.054 4.264 4.499 4.823 4.99 5.317 5.625 5.934 6.09 6.381 6.655 7.031 7.273 7.508 7.831 8.146 8.453 8.754 9.049 9.415 9.743 10.073 10.495 10.906 11.28 11.67 12.105 12.527 12.973 13.419 13.885 14.34 14.771 15.257 15.735 16.356 17.017 17.553 18.078 18.572 18.811 18.496 17.567 16.577 15.54 14.518 13.55 12.651 11.792 11.023 10.24 9.559 8.922 8.274 7.66 7.119 6.639 6.131 5.659 5.24 4.815 4.383 4.022 3.634 3.249 2.949 2.627 2.279 1.892 1.479 1.198 0.915 0.477 0.168 -0.14 -0.292 -0.621 -0.97 -1.324 -1.517 -1.876 -2.13 -2.337 -2.567 -3.036 -3.269 -3.563 -3.889 -4.237 -4.643 -5.172 -7.399 -3 ,15805 ,TETRA ,17585193,Sat Nov 27 12:02:57 CET,Sat Nov 27 14:15:40 CET,0.0 1.283 1.745 2.134 2.47 2.775 3.059 3.309 3.734 3.925 4.133 4.389 4.709 4.866 5.167 5.458 5.732 5.868 6.113 6.339 6.683 6.883 7.073 7.366 7.647 7.914 8.176 8.422 8.715 8.999 9.279 9.612 9.93 10.227 10.576 10.975 11.324 11.685 12.099 12.543 13.006 13.49 14.005 14.47 14.949 15.443 15.974 16.546 17.054 17.254 16.845 15.841 14.785 13.681 12.696 11.809 10.935 10.075 9.315 8.537 7.82 7.143 6.51 5.939 5.423 4.94 4.402 3.914 3.49 3.037 2.557 2.158 1.748 1.328 0.988 0.629 0.262 -0.124 -0.541 -0.831 -1.124 -1.574 -1.877 -2.193 -2.349 -2.664 -3.007 -3.376 -3.572 -3.925 -4.241 -4.487 -4.751 -5.304 -5.582 -5.914 -6.3 -6.712 -7.213 -7.876 -9.654 -4 ,5305 ,TETRA ,17585194,Sat Nov 27 12:02:57 CET,Sat Nov 27 14:12:00 CET,0.0 1.885 2.368 2.716 3.002 3.261 3.509 3.743 4.179 4.382 4.571 4.787 5.115 5.276 5.561 5.836 6.104 6.23 6.457 6.685 7.042 7.271 7.492 7.793 8.081 8.378 8.65 8.892 9.21 9.516 9.799 10.15 10.484 10.783 11.12 11.492 11.837 12.213 12.612 13.033 13.49 13.982 14.518 15.033 15.572 16.106 16.629 17.134 17.564 17.771 17.602 16.902 15.994 15.04 14.088 13.15 12.265 11.42 10.66 9.893 9.252 8.651 8.06 7.506 6.989 6.504 5.992 5.532 5.133 4.693 4.225 3.858 3.485 3.079 2.743 2.404 2.052 1.683 1.307 1.039 0.76 0.333 0.024 -0.309 -0.473 -0.795 -1.129 -1.465 -1.643 -1.993 -2.274 -2.491 -2.725 -3.28 -3.587 -3.882 -4.202 -4.58 -5.052 -5.665 -7.947 -5 ,8004 ,TETRA ,17585195,Sat Nov 27 12:02:57 CET,Sat Nov 27 14:11:57 CET,0.0 1.332 1.771 2.155 2.532 2.833 3.088 3.319 3.746 3.956 4.149 4.355 4.664 4.807 5.105 5.392 5.648 5.778 6.021 6.246 6.57 6.781 6.996 7.298 7.566 7.815 8.057 8.312 8.633 8.92 9.207 9.549 9.872 10.162 10.481 10.846 11.192 11.572 11.971 12.376 12.797 13.254 13.767 14.258 14.785 15.321 15.901 16.438 16.916 17.264 17.119 16.281 15.26 14.219 13.21 12.246 11.386 10.579 9.865 9.125 8.453 7.855 7.255 6.669 6.153 5.677 5.168 4.699 4.295 3.905 3.5 3.165 2.817 2.425 2.112 1.79 1.46 1.112 0.757 0.529 0.285 -0.101 -0.371 -0.671 -0.831 -1.197 -1.568 -1.916 -2.102 -2.45 -2.727 -2.955 -3.192 -3.706 -3.995 -4.28 -4.614 -5.06 -5.561 -6.153 -8.179 -6 ,29248 ,TETRA ,17585196,Sat Nov 27 12:02:57 CET,Sat Nov 27 14:12:25 CET,0.0 1.654 2.181 2.54 2.837 3.104 3.363 3.605 4.024 4.22 4.409 4.63 4.95 5.109 5.411 5.682 5.926 6.051 6.315 6.576 6.917 7.131 7.339 7.627 7.892 8.132 8.365 8.617 8.957 9.26 9.531 9.873 10.209 10.503 10.836 11.217 11.563 11.915 12.279 12.663 13.06 13.497 13.981 14.43 14.918 15.393 15.895 16.431 16.9 17.147 16.947 16.189 15.235 14.229 13.258 12.32 11.451 10.633 9.915 9.214 8.588 7.988 7.418 6.88 6.366 5.892 5.394 4.959 4.574 4.149 3.708 3.341 2.948 2.547 2.243 1.929 1.598 1.257 0.904 0.647 0.383 -0.038 -0.33 -0.607 -0.744 -1.042 -1.387 -1.754 -1.933 -2.271 -2.52 -2.74 -2.969 -3.478 -3.772 -4.104 -4.455 -4.867 -5.388 -6.019 -7.881 -7 ,23668 ,TETRA ,17585197,Sat Nov 27 12:02:57 CET,Sat Nov 27 14:13:50 CET,0.0 1.689 2.203 2.604 2.93 3.245 3.503 3.717 4.139 4.342 4.532 4.709 5.012 5.171 5.456 5.707 5.952 6.07 6.294 6.52 6.844 7.058 7.269 7.573 7.848 8.104 8.369 8.622 8.93 9.214 9.499 9.821 10.116 10.425 10.806 11.205 11.532 11.885 12.284 12.74 13.195 13.648 14.143 14.6 15.093 15.592 16.119 16.64 17.052 17.284 17.146 16.393 15.5 14.577 13.641 12.704 11.826 11.004 10.291 9.576 8.961 8.394 7.819 7.286 6.782 6.312 5.814 5.354 4.952 4.518 4.066 3.687 3.265 2.806 2.46 2.12 1.771 1.411 1.028 0.755 0.483 0.068 -0.232 -0.543 -0.694 -1.002 -1.333 -1.683 -1.872 -2.223 -2.468 -2.691 -2.928 -3.452 -3.749 -4.063 -4.421 -4.817 -5.279 -5.893 -7.291 -8 ,4085 ,TETRA ,17585198,Sat Nov 27 12:03:44 CET,Sat Nov 27 14:16:28 CET,0.0 1.363 1.88 2.321 2.675 2.957 3.196 3.44 3.897 4.101 4.284 4.473 4.784 4.939 5.238 5.535 5.821 5.951 6.192 6.424 6.753 6.962 7.164 7.451 7.731 8.008 8.268 8.521 8.845 9.153 9.443 9.805 10.167 10.492 10.849 11.223 11.561 11.929 12.323 12.724 13.137 13.581 14.055 14.512 15.03 15.57 16.087 16.527 16.93 17.18 16.909 16.025 15.011 13.971 13.004 12.095 11.276 10.491 9.763 8.996 8.316 7.713 7.127 6.575 6.055 5.572 5.082 4.621 4.212 3.796 3.356 2.989 2.615 2.224 1.903 1.573 1.242 0.885 0.514 0.268 0.002 -0.42 -0.697 -1.009 -1.172 -1.482 -1.819 -2.165 -2.344 -2.686 -2.951 -3.183 -3.429 -3.967 -4.253 -4.559 -4.88 -5.208 -5.615 -6.185 -7.99 -9 ,11781 ,TETRA ,17585199,Sat Nov 27 12:03:44 CET,Sat Nov 27 14:14:27 CET,0.0 1.332 1.853 2.266 2.581 2.862 3.142 3.39 3.805 3.998 4.185 4.393 4.704 4.856 5.14 5.425 5.71 5.845 6.1 6.348 6.713 6.951 7.174 7.487 7.783 8.05 8.31 8.575 8.92 9.236 9.543 9.931 10.269 10.567 10.899 11.256 11.617 12.015 12.419 12.844 13.271 13.724 14.215 14.688 15.243 15.778 16.248 16.68 17.125 17.477 17.402 16.764 15.918 14.986 14.073 13.185 12.277 11.41 10.705 9.978 9.327 8.731 8.158 7.595 7.04 6.526 6.012 5.561 5.144 4.703 4.239 3.837 3.423 3.013 2.698 2.381 2.053 1.7 1.339 1.08 0.803 0.379 0.077 -0.243 -0.401 -0.729 -1.068 -1.416 -1.595 -1.931 -2.191 -2.42 -2.665 -3.139 -3.405 -3.721 -4.063 -4.449 -4.926 -5.54 -7.107 -10 ,19868 ,TETRA ,17585200,Sat Nov 27 12:04:44 CET,Sat Nov 27 14:14:18 CET,0.0 1.289 1.807 2.211 2.57 2.887 3.174 3.438 3.905 4.117 4.312 4.516 4.823 4.984 5.279 5.587 5.908 6.067 6.376 6.658 7.041 7.278 7.51 7.835 8.143 8.441 8.725 9.003 9.361 9.705 10.01 10.366 10.7 10.997 11.351 11.765 12.138 12.517 12.922 13.368 13.828 14.303 14.805 15.276 15.796 16.324 16.911 17.448 17.903 18.182 17.97 17.125 16.095 15.085 14.172 13.283 12.45 11.654 10.905 10.106 9.383 8.717 8.057 7.475 6.908 6.331 5.771 5.287 4.854 4.392 3.931 3.552 3.147 2.732 2.423 2.096 1.739 1.376 1.019 0.776 0.518 0.097 -0.214 -0.538 -0.696 -1.008 -1.362 -1.762 -1.966 -2.329 -2.625 -2.853 -3.103 -3.627 -3.903 -4.194 -4.524 -4.923 -5.4 -6.067 -7.656 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt deleted file mode 100644 index 7b92e1a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7962 ,TETRA ,17585201,Sat Nov 27 12:04:44 CET,Sat Nov 27 14:17:50 CET,0.0 4.455 5.221 5.712 6.118 6.49 6.832 7.134 7.683 7.944 8.187 8.481 8.827 9.019 9.397 9.76 10.1 10.261 10.576 10.879 11.312 11.595 11.857 12.22 12.593 12.959 13.291 13.612 14.029 14.416 14.776 15.204 15.631 16.051 16.543 17.095 17.617 18.185 18.816 19.477 20.127 20.836 21.647 22.436 23.329 24.271 25.275 26.285 27.288 28.199 28.71 28.457 27.681 26.718 25.82 24.913 24.07 23.29 22.579 21.84 21.18 20.583 20.008 19.423 18.83 18.299 17.74 17.207 16.733 16.252 15.782 15.402 15.009 14.598 14.278 13.951 13.621 13.287 12.924 12.663 12.393 11.976 11.703 11.408 11.242 10.904 10.553 10.194 10.013 9.665 9.377 9.14 8.89 8.34 8.034 7.718 7.373 6.922 6.392 5.773 3.114 -2 ,29336 ,TETRA ,17585202,Sat Nov 27 12:05:45 CET,Sat Nov 27 14:16:40 CET,0.0 2.849 3.647 4.209 4.683 5.049 5.384 5.708 6.256 6.511 6.772 7.083 7.433 7.633 8.012 8.378 8.725 8.886 9.205 9.516 9.95 10.21 10.472 10.869 11.254 11.626 11.977 12.305 12.726 13.141 13.549 14.041 14.511 14.955 15.473 16.059 16.602 17.202 17.839 18.492 19.161 19.863 20.694 21.558 22.504 23.455 24.471 25.601 26.817 27.964 28.902 28.904 28.092 27.059 26.046 25.058 24.152 23.31 22.55 21.762 21.074 20.462 19.85 19.232 18.653 18.118 17.555 17.038 16.6 16.175 15.733 15.359 14.971 14.555 14.215 13.858 13.5 13.134 12.74 12.462 12.168 11.7 11.368 11.03 10.871 10.565 10.245 9.898 9.707 9.351 9.052 8.827 8.597 8.101 7.822 7.516 7.145 6.716 6.225 5.547 3.031 -3 ,2449 ,TETRA ,17585203,Sat Nov 27 12:05:45 CET,Sat Nov 27 14:16:32 CET,0.0 1.832 2.405 2.809 3.148 3.446 3.712 3.987 4.479 4.704 4.929 5.2 5.515 5.681 6.004 6.31 6.608 6.755 7.026 7.29 7.686 7.95 8.206 8.575 8.94 9.268 9.581 9.879 10.25 10.608 10.957 11.384 11.792 12.19 12.646 13.152 13.669 14.24 14.853 15.509 16.131 16.753 17.425 18.07 18.885 19.841 20.754 21.55 22.33 23.153 23.704 23.36 22.382 21.253 20.194 19.164 18.236 17.394 16.615 15.769 15.054 14.421 13.794 13.191 12.625 12.119 11.596 11.138 10.759 10.357 9.918 9.556 9.19 8.813 8.522 8.207 7.868 7.529 7.172 6.914 6.647 6.24 5.962 5.666 5.52 5.217 4.851 4.449 4.252 3.908 3.645 3.415 3.18 2.706 2.442 2.159 1.833 1.434 0.982 0.45 -1.369 -4 ,15451 ,TETRA ,17585204,Sat Nov 27 12:05:44 CET,Sat Nov 27 14:14:00 CET,0.0 3.344 4.094 4.661 5.089 5.462 5.821 6.147 6.695 6.942 7.178 7.471 7.831 8.038 8.452 8.867 9.26 9.441 9.779 10.086 10.54 10.844 11.137 11.564 11.966 12.333 12.685 13.026 13.447 13.828 14.187 14.612 15.015 15.409 15.858 16.393 16.926 17.472 18.045 18.662 19.317 20.042 20.863 21.628 22.48 23.425 24.434 25.405 26.324 27.071 27.309 26.714 25.736 24.644 23.561 22.495 21.56 20.739 19.978 19.188 18.511 17.898 17.321 16.757 16.215 15.713 15.173 14.698 14.287 13.853 13.394 13.014 12.632 12.253 11.954 11.629 11.282 10.927 10.549 10.292 10.035 9.634 9.357 9.066 8.918 8.616 8.285 7.941 7.777 7.456 7.236 7.052 6.848 6.396 6.17 5.915 5.623 5.316 4.926 4.41 3.064 -5 ,310 ,TETRA ,17585205,Sat Nov 27 12:06:45 CET,Sat Nov 27 14:18:40 CET,0.0 1.361 2.023 2.544 2.981 3.367 3.691 3.993 4.585 4.83 5.048 5.349 5.712 5.918 6.304 6.666 7.014 7.176 7.497 7.814 8.269 8.554 8.825 9.225 9.623 10.005 10.355 10.692 11.14 11.569 11.974 12.448 12.898 13.324 13.799 14.347 14.886 15.476 16.101 16.73 17.376 18.086 18.909 19.661 20.446 21.313 22.188 22.987 23.729 24.275 24.388 23.66 22.619 21.532 20.44 19.402 18.463 17.593 16.831 16.076 15.406 14.797 14.211 13.655 13.14 12.644 12.119 11.653 11.234 10.791 10.332 9.952 9.56 9.145 8.822 8.495 8.166 7.824 7.467 7.208 6.928 6.508 6.212 5.91 5.757 5.425 5.093 4.718 4.51 4.161 3.878 3.669 3.449 2.921 2.628 2.31 1.941 1.501 0.978 0.342 -1.231 -6 ,31821 ,TETRA ,17585206,Sat Nov 27 12:07:44 CET,Sat Nov 27 14:18:33 CET,0.0 2.94 3.616 4.076 4.476 4.853 5.186 5.462 5.98 6.235 6.473 6.766 7.128 7.337 7.717 8.079 8.426 8.591 8.913 9.225 9.661 9.933 10.212 10.621 10.995 11.348 11.687 12.024 12.466 12.894 13.305 13.788 14.258 14.722 15.264 15.847 16.397 16.984 17.583 18.219 18.909 19.671 20.469 21.244 22.162 23.088 24.033 25.069 26.097 27.0 27.604 27.507 26.825 25.73 24.596 23.58 22.648 21.724 20.911 20.14 19.51 18.938 18.348 17.786 17.252 16.764 16.256 15.79 15.387 14.972 14.544 14.188 13.787 13.341 12.994 12.643 12.298 11.928 11.544 11.283 11.015 10.589 10.29 10.002 9.857 9.551 9.214 8.875 8.694 8.346 8.1 7.896 7.68 7.237 6.971 6.66 6.346 5.995 5.559 4.973 3.17 -7 ,26383 ,TETRA ,17585207,Sat Nov 27 12:07:44 CET,Sat Nov 27 14:17:18 CET,0.0 2.593 3.301 3.853 4.267 4.612 4.922 5.192 5.673 5.885 6.073 6.289 6.61 6.785 7.122 7.458 7.767 7.917 8.217 8.514 8.933 9.199 9.461 9.826 10.167 10.522 10.879 11.218 11.639 12.05 12.452 12.917 13.365 13.808 14.306 14.831 15.329 15.862 16.432 17.067 17.735 18.497 19.339 20.108 21.019 22.048 23.101 24.156 25.279 26.258 26.632 25.959 25.017 24.008 22.986 22.065 21.229 20.445 19.714 18.879 18.156 17.548 16.909 16.285 15.737 15.224 14.691 14.226 13.819 13.392 12.932 12.549 12.159 11.766 11.476 11.163 10.832 10.491 10.128 9.882 9.624 9.222 8.947 8.659 8.512 8.199 7.869 7.517 7.32 6.979 6.756 6.569 6.361 5.875 5.603 5.295 4.941 4.575 4.109 3.402 1.691 -8 ,23057 ,TETRA ,17585208,Sat Nov 27 12:09:44 CET,Sat Nov 27 14:20:38 CET,0.0 2.737 3.409 3.874 4.264 4.609 4.933 5.235 5.76 5.996 6.221 6.481 6.828 7.026 7.399 7.745 8.085 8.247 8.539 8.818 9.227 9.486 9.737 10.112 10.475 10.821 11.149 11.465 11.879 12.266 12.638 13.079 13.488 13.893 14.389 14.957 15.49 16.058 16.632 17.215 17.84 18.542 19.356 20.101 20.899 21.818 22.851 23.906 24.86 25.65 26.28 26.013 25.099 24.134 23.187 22.205 21.358 20.576 19.853 19.11 18.414 17.751 17.109 16.49 15.919 15.421 14.903 14.433 14.016 13.585 13.158 12.805 12.417 11.994 11.662 11.324 10.973 10.601 10.23 9.985 9.716 9.27 8.973 8.682 8.53 8.201 7.844 7.469 7.272 6.914 6.633 6.407 6.166 5.657 5.382 5.068 4.7 4.294 3.819 3.204 0.603 -9 ,7750 ,TETRA ,17585209,Sat Nov 27 12:08:48 CET,Sat Nov 27 14:20:02 CET,0.0 2.245 2.9 3.442 3.859 4.199 4.498 4.767 5.306 5.568 5.793 6.047 6.389 6.594 6.999 7.364 7.686 7.838 8.143 8.439 8.875 9.148 9.408 9.772 10.107 10.45 10.793 11.108 11.52 11.932 12.313 12.78 13.251 13.685 14.181 14.746 15.289 15.869 16.484 17.15 17.849 18.563 19.302 19.997 20.707 21.518 22.554 23.568 24.367 25.127 25.548 25.004 23.926 22.713 21.632 20.611 19.689 18.806 17.944 17.042 16.281 15.608 14.957 14.312 13.716 13.134 12.495 11.934 11.467 11.001 10.506 10.083 9.649 9.201 8.844 8.475 8.091 7.681 7.243 6.945 6.662 6.225 5.903 5.571 5.4 5.046 4.668 4.244 4.02 3.644 3.333 3.089 2.835 2.289 1.996 1.701 1.384 1.025 0.547 -0.085 -2.388 -10 ,20282 ,TETRA ,17585210,Sat Nov 27 12:09:50 CET,Sat Nov 27 14:21:08 CET,0.0 2.367 3.04 3.507 3.894 4.245 4.556 4.849 5.371 5.617 5.834 6.092 6.45 6.655 7.055 7.429 7.749 7.894 8.198 8.499 8.913 9.188 9.457 9.834 10.185 10.536 10.905 11.26 11.709 12.134 12.533 13.002 13.45 13.876 14.355 14.908 15.429 15.991 16.588 17.214 17.868 18.574 19.37 20.162 21.078 22.024 22.976 23.956 25.046 25.966 26.583 26.542 26.048 25.299 24.372 23.435 22.592 21.786 21.067 20.335 19.661 19.048 18.476 17.937 17.421 16.905 16.366 15.906 15.496 15.072 14.649 14.302 13.958 13.599 13.306 12.989 12.648 12.307 11.959 11.727 11.49 11.092 10.827 10.575 10.446 10.158 9.839 9.49 9.303 8.971 8.743 8.531 8.319 7.883 7.628 7.355 7.07 6.748 6.318 5.828 4.445 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index 21b65004..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15357 ,KEBNE ,17024142,Wed Dec 22 09:28:16 CET,Wed Dec 22 11:10:01 CET,0.0 0.805 1.159 1.472 1.763 2.018 2.233 2.429 2.806 2.989 3.155 3.334 3.657 3.811 4.111 4.402 4.674 4.805 5.056 5.294 5.648 5.879 6.103 6.428 6.742 7.043 7.326 7.61 7.978 8.332 8.685 9.125 9.566 9.988 10.466 10.995 11.518 12.106 12.741 13.414 14.125 14.966 15.962 16.954 18.077 19.321 20.823 22.512 24.393 26.545 29.045 30.925 31.757 31.995 31.946 31.757 31.493 31.168 30.834 30.449 30.087 29.74 29.347 28.921 28.518 28.127 27.675 27.251 26.881 26.506 26.118 25.805 25.484 25.124 24.828 24.514 24.181 23.859 23.538 23.302 23.05 22.687 22.44 22.144 21.984 21.67 21.347 21.013 20.834 20.516 20.21 19.998 19.771 19.235 18.92 18.538 18.076 17.587 17.025 16.22 13.126 -2 ,31895 ,KEBNE ,17024143,Wed Dec 22 09:28:15 CET,Wed Dec 22 11:11:03 CET,0.0 1.063 1.526 1.881 2.189 2.46 2.684 2.882 3.278 3.471 3.657 3.858 4.168 4.32 4.594 4.856 5.106 5.227 5.47 5.709 6.056 6.264 6.465 6.778 7.086 7.386 7.685 7.969 8.347 8.711 9.06 9.489 9.904 10.318 10.801 11.334 11.849 12.418 13.032 13.695 14.404 15.214 16.156 17.097 18.19 19.409 20.786 22.382 24.358 26.697 29.53 31.468 32.106 32.221 31.945 31.507 31.062 30.649 30.269 29.821 29.407 29.028 28.654 28.296 27.96 27.612 27.216 26.881 26.587 26.252 25.875 25.556 25.246 24.917 24.654 24.403 24.127 23.81 23.47 23.226 22.978 22.598 22.321 22.024 21.88 21.592 21.276 20.946 20.779 20.476 20.185 19.958 19.718 19.193 18.858 18.459 18.064 17.635 17.052 16.273 13.666 -3 ,30052 ,KEBNE ,17024144,Wed Dec 22 09:28:16 CET,Wed Dec 22 11:09:29 CET,0.0 1.178 1.7 2.113 2.444 2.719 2.954 3.167 3.594 3.801 3.986 4.177 4.497 4.662 4.978 5.267 5.538 5.671 5.935 6.21 6.61 6.843 7.074 7.416 7.74 8.056 8.358 8.648 9.026 9.403 9.762 10.185 10.606 11.024 11.495 12.018 12.515 13.043 13.633 14.293 14.96 15.67 16.519 17.407 18.484 19.69 21.042 22.586 24.377 26.559 29.05 30.684 31.428 31.713 31.712 31.502 31.212 30.862 30.47 29.937 29.401 28.913 28.415 27.896 27.421 26.993 26.496 26.057 25.675 25.244 24.796 24.43 24.035 23.656 23.379 23.065 22.714 22.368 22.038 21.8 21.55 21.145 20.855 20.57 20.422 20.098 19.759 19.417 19.232 18.911 18.583 18.336 18.074 17.52 17.211 16.878 16.52 16.077 15.533 14.842 13.154 -4 ,13894 ,KEBNE ,17024145,Wed Dec 22 09:28:16 CET,Wed Dec 22 11:10:18 CET,0.0 1.155 1.607 1.915 2.188 2.432 2.674 2.914 3.342 3.532 3.703 3.883 4.182 4.334 4.646 4.948 5.223 5.356 5.613 5.85 6.205 6.445 6.677 7.02 7.348 7.669 7.976 8.263 8.627 8.98 9.335 9.765 10.179 10.59 11.064 11.594 12.11 12.687 13.324 14.012 14.714 15.493 16.413 17.319 18.364 19.567 20.958 22.478 24.199 26.157 28.29 29.591 30.092 30.209 30.165 29.979 29.683 29.308 28.916 28.501 28.103 27.737 27.384 27.017 26.66 26.326 25.955 25.607 25.303 24.982 24.633 24.335 24.04 23.7 23.411 23.118 22.819 22.522 22.201 21.975 21.724 21.308 21.033 20.76 20.611 20.284 19.95 19.604 19.419 19.105 18.819 18.596 18.359 17.843 17.558 17.245 16.888 16.465 15.947 15.142 12.549 -5 ,14160 ,KEBNE ,17024146,Wed Dec 22 09:28:15 CET,Wed Dec 22 11:10:32 CET,0.0 1.028 1.425 1.738 2.044 2.316 2.554 2.773 3.184 3.361 3.511 3.657 3.939 4.082 4.359 4.617 4.865 4.986 5.232 5.472 5.81 6.028 6.229 6.519 6.816 7.1 7.369 7.633 7.966 8.304 8.651 9.054 9.433 9.805 10.254 10.768 11.252 11.782 12.384 13.045 13.755 14.585 15.55 16.523 17.66 18.97 20.499 22.163 24.124 26.413 29.095 31.037 31.767 31.954 31.943 31.797 31.484 31.107 30.759 30.367 30.005 29.662 29.293 28.909 28.518 28.125 27.731 27.384 27.061 26.731 26.37 26.049 25.718 25.379 25.126 24.868 24.608 24.329 24.013 23.784 23.557 23.197 22.93 22.66 22.514 22.194 21.87 21.534 21.357 21.056 20.77 20.544 20.299 19.754 19.452 19.118 18.733 18.286 17.77 17.058 14.703 -6 ,3573 ,KEBNE ,17024147,Wed Dec 22 09:28:15 CET,Wed Dec 22 11:10:19 CET,0.0 0.855 1.294 1.627 1.905 2.132 2.346 2.578 3.019 3.209 3.389 3.594 3.903 4.062 4.374 4.663 4.943 5.078 5.346 5.593 5.957 6.205 6.441 6.784 7.115 7.425 7.728 8.024 8.395 8.753 9.112 9.574 10.023 10.462 10.973 11.521 12.022 12.553 13.124 13.74 14.373 15.067 15.904 16.804 17.9 19.142 20.54 22.085 23.776 25.529 27.566 28.922 29.348 29.329 29.038 28.652 28.209 27.764 27.351 26.908 26.536 26.186 25.828 25.485 25.126 24.756 24.365 24.021 23.724 23.392 23.04 22.743 22.403 22.033 21.754 21.462 21.159 20.848 20.526 20.295 20.054 19.687 19.432 19.157 18.994 18.654 18.343 18.031 17.849 17.535 17.243 17.011 16.767 16.231 15.94 15.629 15.273 14.868 14.387 13.72 11.413 -7 ,4083 ,KEBNE ,17024148,Wed Dec 22 09:28:15 CET,Wed Dec 22 11:10:14 CET,0.0 1.212 1.629 1.957 2.246 2.484 2.709 2.931 3.325 3.506 3.691 3.885 4.184 4.347 4.654 4.938 5.203 5.332 5.582 5.828 6.2 6.435 6.657 6.992 7.317 7.626 7.929 8.23 8.631 9.009 9.376 9.829 10.256 10.677 11.152 11.683 12.219 12.803 13.43 14.112 14.817 15.605 16.571 17.536 18.654 19.916 21.384 23.036 24.971 27.207 29.659 31.329 31.957 32.05 31.924 31.63 31.26 30.944 30.637 30.238 29.834 29.468 29.099 28.719 28.362 28.031 27.655 27.294 26.993 26.678 26.353 26.064 25.756 25.46 25.203 24.925 24.665 24.39 24.106 23.9 23.678 23.338 23.095 22.824 22.662 22.33 21.992 21.633 21.442 21.111 20.755 20.512 20.263 19.716 19.399 19.033 18.673 18.252 17.709 17.06 14.921 -8 ,15757 ,KEBNE ,17024149,Wed Dec 22 09:28:20 CET,Wed Dec 22 11:08:13 CET,0.0 1.394 1.786 2.068 2.309 2.571 2.825 3.046 3.451 3.631 3.805 3.976 4.267 4.407 4.693 4.987 5.262 5.39 5.635 5.875 6.234 6.465 6.687 7.002 7.301 7.597 7.898 8.198 8.578 8.937 9.28 9.695 10.085 10.454 10.879 11.358 11.819 12.343 12.934 13.557 14.215 14.965 15.854 16.733 17.725 18.862 20.186 21.668 23.4 25.425 27.769 29.366 30.035 30.256 30.119 29.773 29.441 29.13 28.798 28.417 28.062 27.691 27.299 26.917 26.55 26.185 25.801 25.46 25.161 24.833 24.448 24.119 23.796 23.488 23.255 23.011 22.754 22.467 22.171 21.977 21.757 21.398 21.161 20.908 20.768 20.466 20.137 19.752 19.545 19.221 18.936 18.737 18.509 17.955 17.647 17.307 16.911 16.435 15.86 15.095 12.877 -9 ,25649 ,KEBNE ,17024150,Wed Dec 22 09:28:16 CET,Wed Dec 22 11:10:10 CET,0.0 1.0 1.347 1.631 1.912 2.181 2.429 2.653 3.058 3.243 3.424 3.623 3.929 4.078 4.389 4.696 4.974 5.105 5.372 5.632 5.991 6.222 6.452 6.787 7.109 7.414 7.706 7.986 8.353 8.728 9.096 9.536 9.952 10.352 10.827 11.361 11.884 12.478 13.111 13.769 14.458 15.242 16.159 17.074 18.131 19.304 20.629 22.159 23.957 25.953 28.182 29.664 30.126 30.083 29.814 29.534 29.24 28.863 28.495 28.052 27.602 27.205 26.841 26.475 26.114 25.769 25.391 25.059 24.756 24.417 24.056 23.754 23.457 23.15 22.905 22.655 22.382 22.063 21.729 21.519 21.298 20.937 20.67 20.371 20.214 19.868 19.491 19.107 18.906 18.574 18.264 18.04 17.795 17.241 16.947 16.637 16.308 15.928 15.466 14.788 12.308 -10 ,21532 ,KEBNE ,17024151,Wed Dec 22 09:28:16 CET,Wed Dec 22 11:09:39 CET,0.0 0.905 1.322 1.668 1.968 2.253 2.509 2.72 3.095 3.279 3.457 3.651 3.965 4.123 4.446 4.75 5.016 5.146 5.417 5.669 6.019 6.26 6.491 6.814 7.134 7.445 7.743 8.037 8.408 8.759 9.116 9.549 9.96 10.349 10.797 11.306 11.82 12.398 12.99 13.601 14.247 14.99 15.887 16.838 17.965 19.187 20.502 21.952 23.601 25.444 27.5 28.931 29.553 29.697 29.579 29.347 29.054 28.699 28.312 27.879 27.485 27.116 26.758 26.404 26.042 25.716 25.393 25.07 24.749 24.386 24.017 23.728 23.425 23.094 22.817 22.525 22.229 21.908 21.575 21.356 21.113 20.74 20.497 20.214 20.053 19.73 19.388 19.015 18.825 18.513 18.233 17.997 17.74 17.188 16.885 16.533 16.134 15.705 15.196 14.577 12.596 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 21290630..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28535 ,TETRA ,17585211,Sat Nov 27 12:09:51 CET,Sat Nov 27 14:19:54 CET,0.0 0.799 1.164 1.464 1.719 1.958 2.197 2.41 2.779 2.955 3.121 3.301 3.611 3.758 4.051 4.338 4.587 4.704 4.939 5.172 5.515 5.733 5.94 6.248 6.559 6.863 7.163 7.453 7.809 8.143 8.472 8.899 9.324 9.721 10.167 10.67 11.18 11.727 12.283 12.878 13.509 14.247 15.145 16.061 17.111 18.223 19.5 20.934 22.516 24.255 26.089 27.274 27.625 27.479 27.224 26.927 26.526 26.05 25.59 25.136 24.744 24.372 23.973 23.565 23.194 22.833 22.44 22.065 21.711 21.366 21.012 20.713 20.408 20.06 19.78 19.5 19.215 18.907 18.58 18.36 18.131 17.758 17.509 17.254 17.106 16.791 16.477 16.144 15.966 15.66 15.38 15.157 14.93 14.416 14.115 13.811 13.473 13.063 12.573 11.865 9.019 -2 ,21092 ,TETRA ,17585212,Sat Nov 27 12:09:51 CET,Sat Nov 27 14:20:28 CET,0.0 0.945 1.317 1.567 1.788 2.0 2.221 2.446 2.821 2.985 3.161 3.359 3.669 3.821 4.104 4.373 4.645 4.782 5.042 5.296 5.676 5.919 6.145 6.46 6.763 7.058 7.344 7.622 7.982 8.336 8.691 9.118 9.519 9.917 10.376 10.903 11.418 11.991 12.631 13.325 14.039 14.786 15.684 16.552 17.493 18.56 19.754 21.079 22.503 24.147 25.867 26.879 27.264 27.202 26.877 26.383 25.87 25.399 24.973 24.562 24.181 23.764 23.343 22.945 22.56 22.204 21.814 21.461 21.155 20.83 20.486 20.191 19.884 19.545 19.274 19.006 18.719 18.422 18.095 17.861 17.64 17.273 17.0 16.734 16.596 16.306 16.005 15.679 15.518 15.219 14.943 14.727 14.491 13.975 13.699 13.378 13.035 12.647 12.131 11.466 9.3 -3 ,2582 ,TETRA ,17585213,Sat Nov 27 12:10:45 CET,Sat Nov 27 14:20:50 CET,0.0 0.793 1.202 1.487 1.726 1.941 2.145 2.341 2.697 2.862 3.024 3.211 3.51 3.663 3.956 4.235 4.498 4.622 4.867 5.106 5.441 5.661 5.883 6.18 6.463 6.749 7.031 7.314 7.679 8.028 8.376 8.793 9.22 9.651 10.138 10.668 11.155 11.684 12.259 12.9 13.555 14.266 15.123 15.936 16.868 17.991 19.299 20.601 22.015 23.558 24.98 25.59 25.504 25.151 24.585 23.926 23.277 22.658 22.111 21.546 21.031 20.535 20.059 19.616 19.2 18.811 18.401 18.051 17.745 17.395 17.032 16.739 16.423 16.079 15.802 15.522 15.23 14.908 14.567 14.353 14.146 13.796 13.54 13.265 13.108 12.767 12.415 12.04 11.853 11.545 11.26 11.022 10.779 10.283 9.98 9.631 9.26 8.804 8.241 7.489 5.445 -4 ,22018 ,TETRA ,17585214,Sat Nov 27 12:13:45 CET,Sat Nov 27 14:23:50 CET,0.0 0.739 1.093 1.379 1.602 1.814 2.036 2.255 2.644 2.82 2.981 3.145 3.43 3.565 3.833 4.093 4.341 4.465 4.707 4.939 5.267 5.487 5.707 6.029 6.346 6.643 6.92 7.193 7.549 7.882 8.185 8.566 8.958 9.329 9.761 10.262 10.73 11.248 11.81 12.415 13.081 13.812 14.618 15.405 16.352 17.394 18.582 19.896 21.408 23.117 24.802 25.744 26.024 26.031 25.821 25.485 25.077 24.622 24.186 23.678 23.212 22.823 22.443 22.042 21.664 21.326 20.946 20.58 20.266 19.934 19.56 19.253 18.947 18.608 18.329 18.037 17.735 17.43 17.098 16.867 16.653 16.309 16.043 15.779 15.65 15.367 15.05 14.707 14.534 14.229 13.962 13.751 13.531 13.018 12.705 12.369 12.013 11.62 11.121 10.379 7.976 -5 ,406 ,TETRA ,17585215,Sat Nov 27 12:13:48 CET,Sat Nov 27 14:23:52 CET,0.0 1.022 1.431 1.726 1.979 2.215 2.435 2.651 3.057 3.241 3.414 3.602 3.9 4.051 4.357 4.636 4.888 5.014 5.249 5.486 5.854 6.079 6.296 6.606 6.906 7.203 7.487 7.763 8.126 8.472 8.811 9.227 9.636 10.022 10.481 11.02 11.53 12.086 12.684 13.309 13.948 14.675 15.54 16.405 17.387 18.419 19.608 20.998 22.651 24.461 26.165 27.213 27.514 27.439 27.244 26.893 26.49 26.052 25.626 25.201 24.766 24.336 23.94 23.585 23.229 22.868 22.468 22.109 21.791 21.452 21.091 20.755 20.393 20.05 19.779 19.511 19.239 18.943 18.615 18.379 18.144 17.754 17.488 17.228 17.091 16.785 16.466 16.152 15.977 15.661 15.384 15.155 14.911 14.413 14.149 13.833 13.469 13.011 12.437 11.695 9.228 -6 ,12290 ,TETRA ,17585216,Sat Nov 27 12:14:45 CET,Sat Nov 27 14:26:46 CET,0.0 0.558 0.95 1.263 1.527 1.735 1.918 2.106 2.464 2.619 2.768 2.935 3.229 3.375 3.658 3.921 4.158 4.275 4.512 4.74 5.068 5.273 5.477 5.776 6.059 6.318 6.569 6.821 7.156 7.49 7.816 8.195 8.576 8.966 9.402 9.883 10.342 10.846 11.393 11.97 12.598 13.313 14.123 14.94 15.884 16.919 18.069 19.337 20.831 22.498 24.303 25.384 25.514 25.307 24.972 24.533 24.054 23.583 23.174 22.723 22.293 21.866 21.419 20.999 20.6 20.223 19.818 19.439 19.087 18.721 18.355 18.035 17.707 17.371 17.087 16.767 16.452 16.139 15.81 15.588 15.361 15.002 14.73 14.432 14.272 13.947 13.619 13.269 13.084 12.763 12.492 12.278 12.059 11.54 11.223 10.866 10.465 10.075 9.642 8.978 6.516 -7 ,26944 ,TETRA ,17585217,Sat Nov 27 12:14:45 CET,Sat Nov 27 14:24:34 CET,0.0 0.79 1.14 1.458 1.766 2.037 2.269 2.483 2.857 3.025 3.195 3.381 3.671 3.81 4.078 4.334 4.584 4.71 4.952 5.185 5.51 5.72 5.936 6.254 6.558 6.846 7.124 7.402 7.76 8.099 8.438 8.853 9.236 9.616 10.06 10.536 10.983 11.484 12.045 12.651 13.29 14.008 14.844 15.666 16.636 17.747 19.019 20.402 21.935 23.557 25.26 26.321 26.557 26.383 26.019 25.609 25.191 24.72 24.275 23.787 23.331 22.921 22.522 22.147 21.784 21.419 21.042 20.719 20.426 20.124 19.8 19.514 19.227 18.912 18.661 18.413 18.127 17.791 17.449 17.226 16.99 16.617 16.361 16.092 15.951 15.649 15.316 14.956 14.761 14.432 14.126 13.892 13.64 13.119 12.848 12.514 12.143 11.726 11.27 10.653 8.377 -8 ,5406 ,TETRA ,17585218,Sat Nov 27 12:15:45 CET,Sat Nov 27 14:25:45 CET,0.0 0.869 1.302 1.652 1.9 2.126 2.35 2.567 2.945 3.118 3.291 3.478 3.787 3.939 4.235 4.532 4.798 4.931 5.201 5.446 5.792 6.019 6.252 6.594 6.911 7.219 7.538 7.856 8.266 8.678 9.05 9.469 9.888 10.297 10.781 11.329 11.859 12.469 13.125 13.802 14.507 15.302 16.254 17.211 18.281 19.437 20.783 22.353 24.057 25.872 27.885 29.166 29.462 29.292 28.987 28.604 28.182 27.753 27.288 26.783 26.363 25.964 25.553 25.159 24.786 24.425 24.019 23.647 23.316 22.975 22.628 22.315 21.98 21.622 21.343 21.059 20.769 20.462 20.126 19.902 19.677 19.3 19.025 18.747 18.602 18.317 18.018 17.68 17.508 17.205 16.938 16.738 16.538 16.077 15.766 15.394 14.987 14.541 14.003 13.307 11.139 -9 ,19607 ,TETRA ,17585219,Sat Nov 27 12:15:45 CET,Sat Nov 27 14:26:46 CET,0.0 0.951 1.406 1.764 2.036 2.274 2.494 2.708 3.108 3.304 3.489 3.67 3.97 4.116 4.41 4.706 4.987 5.122 5.392 5.648 6.004 6.239 6.469 6.798 7.111 7.415 7.719 8.024 8.423 8.792 9.137 9.558 9.966 10.357 10.817 11.356 11.889 12.462 13.081 13.74 14.406 15.123 15.936 16.777 17.817 19.026 20.437 21.945 23.582 25.234 26.853 27.692 27.698 27.507 27.166 26.695 26.257 25.824 25.377 24.929 24.545 24.169 23.812 23.463 23.106 22.771 22.415 22.067 21.759 21.445 21.105 20.819 20.51 20.192 19.947 19.686 19.421 19.146 18.822 18.576 18.334 17.96 17.708 17.43 17.281 16.989 16.674 16.334 16.15 15.83 15.501 15.27 15.044 14.541 14.256 13.952 13.571 13.128 12.628 11.964 10.181 -10 ,26287 ,TETRA ,17585220,Sat Nov 27 12:15:47 CET,Sat Nov 27 14:26:46 CET,0.0 0.728 1.096 1.378 1.629 1.841 2.047 2.242 2.582 2.744 2.904 3.063 3.338 3.466 3.724 3.98 4.218 4.336 4.555 4.765 5.064 5.262 5.465 5.747 6.018 6.281 6.544 6.796 7.116 7.434 7.75 8.116 8.46 8.804 9.207 9.664 10.12 10.621 11.136 11.68 12.278 12.96 13.744 14.549 15.475 16.502 17.694 18.969 20.401 21.947 23.569 24.642 24.941 24.751 24.422 24.013 23.579 23.13 22.691 22.232 21.767 21.295 20.843 20.424 20.014 19.614 19.165 18.758 18.428 18.076 17.694 17.367 17.033 16.687 16.415 16.123 15.807 15.491 15.165 14.942 14.714 14.349 14.102 13.847 13.709 13.416 13.112 12.793 12.62 12.324 12.076 11.86 11.626 11.151 10.886 10.533 10.113 9.686 9.194 8.452 5.618 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 08d25a94..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25876 ,TETRA ,17585221,Sat Nov 27 12:15:49 CET,Sat Nov 27 14:26:45 CET,0.0 1.074 1.562 1.911 2.185 2.462 2.711 2.931 3.349 3.536 3.712 3.934 4.26 4.416 4.705 4.98 5.25 5.386 5.658 5.93 6.348 6.61 6.86 7.213 7.535 7.865 8.185 8.479 8.855 9.231 9.608 10.073 10.523 10.951 11.434 11.969 12.506 13.077 13.65 14.257 14.89 15.607 16.459 17.333 18.336 19.457 20.785 22.259 23.926 25.867 28.061 29.514 30.093 30.327 30.326 30.177 29.975 29.723 29.448 29.138 28.85 28.564 28.274 28.001 27.729 27.434 27.132 26.867 26.603 26.308 25.98 25.694 25.403 25.096 24.861 24.62 24.343 24.03 23.705 23.492 23.27 22.889 22.618 22.324 22.166 21.864 21.539 21.155 20.95 20.635 20.337 20.119 19.896 19.369 19.057 18.704 18.313 17.878 17.302 16.517 14.22 -2 ,24752 ,TETRA ,17585222,Sat Nov 27 12:15:50 CET,Sat Nov 27 14:27:31 CET,0.0 1.074 1.582 1.994 2.319 2.621 2.892 3.139 3.579 3.793 4.001 4.243 4.577 4.746 5.079 5.404 5.722 5.879 6.156 6.401 6.746 6.963 7.182 7.506 7.83 8.144 8.439 8.725 9.088 9.438 9.769 10.161 10.549 10.924 11.362 11.854 12.32 12.826 13.381 13.997 14.622 15.301 16.09 16.889 17.861 18.934 20.127 21.433 22.979 24.845 26.968 28.447 29.154 29.445 29.479 29.352 29.149 28.935 28.719 28.436 28.141 27.86 27.572 27.29 27.006 26.724 26.402 26.106 25.849 25.572 25.275 25.021 24.759 24.469 24.235 23.996 23.751 23.49 23.191 22.984 22.764 22.387 22.139 21.898 21.761 21.496 21.233 20.935 20.791 20.53 20.322 20.136 19.921 19.466 19.215 18.93 18.601 18.226 17.761 17.113 15.227 -3 ,11453 ,TETRA ,17585223,Sat Nov 27 12:15:45 CET,Sat Nov 27 14:26:04 CET,0.0 1.055 1.499 1.796 2.057 2.3 2.53 2.753 3.172 3.37 3.564 3.781 4.079 4.218 4.493 4.779 5.053 5.186 5.449 5.718 6.128 6.389 6.629 6.973 7.309 7.626 7.94 8.266 8.697 9.099 9.486 9.947 10.377 10.791 11.257 11.761 12.232 12.762 13.382 14.068 14.793 15.637 16.657 17.679 18.89 20.192 21.586 23.114 24.854 26.909 29.201 30.833 31.623 31.9 31.935 31.85 31.638 31.409 31.201 30.931 30.668 30.42 30.133 29.822 29.507 29.206 28.901 28.609 28.329 28.032 27.722 27.452 27.161 26.849 26.593 26.318 26.027 25.727 25.425 25.205 24.976 24.61 24.343 24.069 23.924 23.623 23.324 22.988 22.814 22.521 22.244 22.035 21.785 21.24 20.938 20.64 20.317 19.893 19.349 18.553 16.024 -4 ,17288 ,TETRA ,17585224,Sat Nov 27 12:15:46 CET,Sat Nov 27 14:25:40 CET,0.0 0.838 1.172 1.451 1.696 1.935 2.166 2.385 2.804 2.991 3.168 3.363 3.661 3.802 4.08 4.353 4.616 4.747 5.018 5.281 5.646 5.886 6.121 6.439 6.743 7.051 7.344 7.632 8.025 8.38 8.703 9.1 9.475 9.823 10.237 10.726 11.184 11.7 12.292 12.931 13.569 14.253 15.071 15.924 16.954 18.103 19.391 20.79 22.332 24.021 26.007 27.533 28.229 28.481 28.457 28.278 28.032 27.731 27.412 27.104 26.806 26.462 26.114 25.773 25.432 25.108 24.767 24.464 24.198 23.895 23.563 23.291 22.995 22.668 22.422 22.16 21.856 21.528 21.199 20.991 20.777 20.415 20.16 19.895 19.748 19.429 19.116 18.804 18.638 18.353 18.059 17.837 17.623 17.137 16.848 16.523 16.188 15.793 15.242 14.505 11.372 -5 ,18839 ,TETRA ,17585225,Sat Nov 27 12:15:48 CET,Sat Nov 27 14:26:32 CET,0.0 1.225 1.672 2.03 2.315 2.559 2.792 3.01 3.365 3.529 3.68 3.856 4.17 4.327 4.61 4.881 5.138 5.263 5.513 5.746 6.08 6.298 6.517 6.853 7.171 7.466 7.742 8.016 8.363 8.686 8.998 9.39 9.788 10.171 10.605 11.071 11.518 12.049 12.638 13.262 13.909 14.608 15.445 16.313 17.312 18.433 19.779 21.381 23.235 25.293 27.484 29.036 29.781 30.067 30.11 30.043 29.899 29.654 29.384 29.097 28.823 28.566 28.304 28.035 27.756 27.477 27.176 26.896 26.642 26.38 26.094 25.853 25.604 25.322 25.1 24.857 24.571 24.278 23.977 23.746 23.507 23.154 22.906 22.636 22.501 22.252 21.985 21.677 21.511 21.23 20.979 20.761 20.541 20.072 19.815 19.505 19.126 18.72 18.197 17.606 16.045 -6 ,9995 ,TETRA ,17585226,Sat Nov 27 12:15:50 CET,Sat Nov 27 14:26:19 CET,0.0 1.018 1.38 1.71 2.058 2.324 2.536 2.738 3.097 3.287 3.465 3.622 3.923 4.077 4.362 4.637 4.903 5.024 5.252 5.485 5.86 6.101 6.321 6.622 6.905 7.185 7.472 7.767 8.145 8.49 8.817 9.24 9.659 10.036 10.455 10.926 11.376 11.877 12.422 13.015 13.642 14.324 15.155 16.054 17.116 18.281 19.6 21.06 22.74 24.576 26.596 28.126 28.785 28.975 28.941 28.829 28.667 28.4 28.093 27.783 27.52 27.286 27.037 26.743 26.409 26.084 25.745 25.445 25.193 24.917 24.634 24.381 24.103 23.822 23.581 23.329 23.085 22.816 22.525 22.317 22.1 21.775 21.539 21.295 21.164 20.875 20.57 20.241 20.078 19.803 19.546 19.348 19.159 18.742 18.476 18.146 17.784 17.368 16.868 16.165 13.909 -7 ,22213 ,TETRA ,17585227,Sat Nov 27 12:17:45 CET,Sat Nov 27 14:28:24 CET,0.0 1.237 1.677 2.019 2.31 2.564 2.798 3.004 3.378 3.569 3.755 3.94 4.245 4.407 4.72 5.014 5.295 5.429 5.69 5.934 6.261 6.474 6.698 7.022 7.32 7.599 7.869 8.133 8.48 8.815 9.139 9.545 9.934 10.309 10.746 11.242 11.715 12.217 12.79 13.428 14.075 14.791 15.618 16.444 17.487 18.685 19.999 21.463 23.125 24.942 26.789 28.034 28.659 28.878 28.783 28.571 28.326 27.946 27.507 27.046 26.636 26.264 25.847 25.414 25.023 24.66 24.254 23.858 23.503 23.132 22.75 22.421 22.064 21.71 21.442 21.153 20.845 20.517 20.191 19.977 19.75 19.352 19.045 18.715 18.542 18.191 17.826 17.442 17.245 16.934 16.594 16.328 16.054 15.46 15.134 14.811 14.453 14.014 13.496 12.782 9.955 -8 ,21991 ,TETRA ,17585228,Sat Nov 27 12:18:45 CET,Sat Nov 27 14:29:05 CET,0.0 0.763 1.135 1.398 1.639 1.886 2.128 2.337 2.701 2.868 3.026 3.202 3.484 3.621 3.903 4.169 4.425 4.552 4.79 5.011 5.333 5.549 5.761 6.068 6.364 6.647 6.923 7.188 7.543 7.892 8.219 8.608 8.981 9.339 9.752 10.22 10.667 11.18 11.733 12.317 12.949 13.675 14.531 15.379 16.375 17.497 18.779 20.249 21.936 23.842 26.031 27.546 28.263 28.551 28.518 28.34 28.041 27.706 27.394 27.017 26.663 26.339 26.009 25.669 25.334 25.021 24.699 24.389 24.116 23.824 23.479 23.18 22.889 22.596 22.352 22.076 21.789 21.498 21.191 20.982 20.763 20.395 20.135 19.868 19.729 19.446 19.138 18.784 18.594 18.297 18.017 17.805 17.571 17.05 16.763 16.433 16.053 15.653 15.181 14.508 12.0 -9 ,32323 ,TETRA ,17585229,Sat Nov 27 12:19:44 CET,Sat Nov 27 14:26:31 CET,0.0 0.833 1.258 1.592 1.887 2.161 2.415 2.647 3.063 3.261 3.445 3.609 3.907 4.06 4.339 4.617 4.885 5.013 5.263 5.51 5.872 6.096 6.318 6.647 6.957 7.249 7.518 7.779 8.114 8.424 8.725 9.092 9.451 9.797 10.222 10.691 11.122 11.614 12.164 12.745 13.348 14.02 14.801 15.592 16.513 17.557 18.777 20.103 21.649 23.426 25.375 26.854 27.519 27.702 27.644 27.499 27.324 27.106 26.853 26.534 26.233 25.96 25.688 25.422 25.143 24.879 24.602 24.32 24.059 23.797 23.515 23.265 22.991 22.704 22.501 22.283 22.019 21.749 21.488 21.313 21.113 20.77 20.527 20.262 20.131 19.856 19.533 19.196 19.026 18.724 18.42 18.195 17.972 17.456 17.16 16.862 16.521 16.077 15.54 14.828 12.51 -10 ,19807 ,TETRA ,17585230,Sat Nov 27 12:20:45 CET,Sat Nov 27 14:28:25 CET,0.0 0.791 1.261 1.602 1.892 2.154 2.371 2.583 2.994 3.166 3.317 3.493 3.781 3.916 4.186 4.445 4.693 4.814 5.063 5.306 5.648 5.86 6.054 6.34 6.624 6.902 7.163 7.416 7.76 8.098 8.424 8.816 9.184 9.539 9.974 10.468 10.93 11.435 11.988 12.588 13.244 14.001 14.878 15.746 16.718 17.794 19.025 20.414 22.052 23.886 25.961 27.542 28.326 28.637 28.694 28.632 28.511 28.335 28.124 27.853 27.567 27.261 26.974 26.703 26.426 26.165 25.891 25.65 25.452 25.242 24.966 24.734 24.508 24.252 24.019 23.754 23.501 23.253 22.98 22.784 22.593 22.299 22.098 21.897 21.792 21.563 21.286 20.966 20.812 20.54 20.291 20.112 19.922 19.486 19.243 18.949 18.591 18.154 17.604 16.87 14.299 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index 37bee65d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11029 ,TETRA ,17585231,Sat Nov 27 12:21:47 CET,Sat Nov 27 14:31:39 CET,0.0 0.924 1.374 1.754 2.099 2.376 2.624 2.863 3.314 3.524 3.711 3.94 4.278 4.461 4.789 5.086 5.355 5.485 5.727 5.96 6.291 6.5 6.698 6.982 7.25 7.506 7.754 7.986 8.298 8.598 8.887 9.249 9.588 9.927 10.326 10.745 11.118 11.521 11.977 12.455 12.93 13.49 14.157 14.754 15.407 16.086 16.778 17.479 18.21 18.943 19.391 19.026 18.251 17.305 16.256 15.263 14.453 13.66 12.898 12.082 11.359 10.762 10.21 9.656 9.132 8.659 8.151 7.661 7.24 6.814 6.371 6.006 5.612 5.19 4.843 4.47 4.098 3.73 3.328 3.047 2.76 2.317 2.02 1.715 1.564 1.248 0.909 0.56 0.384 0.064 -0.211 -0.426 -0.656 -1.195 -1.484 -1.779 -2.111 -2.542 -3.085 -3.777 -6.112 -2 ,12760 ,TETRA ,17585232,Sat Nov 27 12:20:45 CET,Sat Nov 27 14:29:18 CET,0.0 1.213 1.611 1.896 2.123 2.323 2.532 2.76 3.194 3.379 3.55 3.755 4.062 4.221 4.526 4.823 5.104 5.231 5.48 5.715 6.029 6.228 6.435 6.735 7.016 7.299 7.584 7.855 8.181 8.495 8.824 9.217 9.575 9.912 10.305 10.745 11.15 11.599 12.091 12.599 13.116 13.686 14.372 15.082 15.835 16.58 17.399 18.287 19.177 19.933 20.389 20.118 19.376 18.359 17.352 16.417 15.565 14.74 13.993 13.276 12.645 12.067 11.474 10.901 10.394 9.925 9.432 8.981 8.568 8.101 7.607 7.223 6.825 6.388 6.045 5.68 5.282 4.856 4.419 4.127 3.819 3.319 2.963 2.589 2.394 1.996 1.587 1.164 0.948 0.579 0.226 -0.05 -0.327 -0.913 -1.246 -1.626 -2.039 -2.466 -2.969 -3.677 -6.042 -3 ,3493 ,TETRA ,17585233,Sat Nov 27 12:20:44 CET,Sat Nov 27 14:29:12 CET,0.0 1.095 1.524 1.874 2.18 2.417 2.636 2.855 3.264 3.446 3.618 3.807 4.124 4.277 4.559 4.808 5.055 5.181 5.428 5.68 6.035 6.247 6.446 6.737 7.017 7.286 7.557 7.828 8.166 8.481 8.779 9.14 9.505 9.856 10.244 10.673 11.086 11.551 12.051 12.576 13.115 13.694 14.354 15.025 15.815 16.671 17.533 18.45 19.398 20.24 20.821 20.615 19.933 19.107 18.267 17.419 16.605 15.868 15.252 14.584 13.984 13.466 12.978 12.493 12.008 11.554 11.069 10.637 10.277 9.89 9.457 9.068 8.643 8.228 7.917 7.572 7.212 6.839 6.433 6.134 5.817 5.322 4.978 4.634 4.458 4.077 3.67 3.269 3.058 2.689 2.358 2.105 1.8 1.046 0.649 0.249 -0.19 -0.633 -1.12 -1.791 -5.396 -4 ,25477 ,TETRA ,17585234,Sat Nov 27 12:21:46 CET,Sat Nov 27 14:31:15 CET,0.0 1.497 2.087 2.475 2.783 3.052 3.297 3.533 3.966 4.16 4.35 4.555 4.856 4.996 5.252 5.51 5.76 5.882 6.129 6.371 6.712 6.93 7.141 7.444 7.736 8.016 8.306 8.588 8.925 9.254 9.579 9.968 10.324 10.668 11.078 11.553 12.019 12.516 13.026 13.526 14.053 14.633 15.244 15.819 16.519 17.27 17.987 18.743 19.506 20.168 20.694 20.314 19.521 18.729 17.898 17.032 16.205 15.407 14.709 14.033 13.44 12.858 12.256 11.732 11.28 10.846 10.383 9.98 9.626 9.221 8.787 8.448 8.079 7.685 7.394 7.093 6.776 6.441 6.084 5.829 5.559 5.161 4.889 4.592 4.435 4.106 3.749 3.381 3.191 2.841 2.535 2.294 2.054 1.502 1.175 0.809 0.387 -0.096 -0.616 -1.277 -3.733 -5 ,3046 ,TETRA ,17585235,Sat Nov 27 12:21:46 CET,Sat Nov 27 14:15:09 CET,0.0 1.65 2.266 2.703 3.044 3.339 3.618 3.87 4.301 4.503 4.704 4.944 5.272 5.436 5.762 6.056 6.344 6.498 6.785 7.056 7.432 7.668 7.895 8.206 8.486 8.738 8.994 9.258 9.603 9.932 10.237 10.605 10.96 11.315 11.733 12.189 12.608 13.051 13.542 14.056 14.597 15.223 15.891 16.491 17.127 17.804 18.551 19.408 20.339 21.127 21.456 20.849 19.886 18.886 17.956 17.068 16.226 15.325 14.501 13.704 12.973 12.303 11.691 11.102 10.526 9.98 9.408 8.915 8.44 7.922 7.407 6.969 6.527 6.065 5.68 5.283 4.867 4.435 4.014 3.715 3.396 2.898 2.522 2.117 1.903 1.472 1.055 0.593 0.335 -0.072 -0.455 -0.743 -1.056 -1.768 -2.181 -2.682 -3.283 -3.93 -4.613 -5.544 -8.727 -6 ,30159 ,TETRA ,17585236,Sat Nov 27 12:23:45 CET,Sat Nov 27 14:30:44 CET,0.0 2.001 2.722 3.195 3.551 3.842 4.111 4.345 4.757 4.948 5.144 5.354 5.67 5.827 6.133 6.441 6.752 6.899 7.187 7.466 7.855 8.095 8.326 8.68 9.024 9.316 9.587 9.868 10.224 10.551 10.863 11.241 11.61 11.951 12.339 12.795 13.221 13.681 14.166 14.648 15.135 15.705 16.398 17.088 17.827 18.591 19.384 20.184 21.07 21.81 22.293 21.978 21.217 20.363 19.428 18.47 17.578 16.714 15.935 15.193 14.56 13.99 13.43 12.905 12.386 11.848 11.293 10.821 10.429 10.012 9.56 9.17 8.733 8.289 7.971 7.635 7.274 6.896 6.508 6.253 5.997 5.579 5.281 4.976 4.812 4.478 4.144 3.777 3.578 3.219 2.895 2.649 2.395 1.781 1.445 1.085 0.602 0.036 -0.557 -1.386 -5.008 -7 ,6214 ,TETRA ,17585237,Sat Nov 27 12:23:45 CET,Sat Nov 27 14:25:09 CET,0.0 1.408 2.02 2.484 2.852 3.178 3.483 3.745 4.228 4.454 4.666 4.91 5.242 5.418 5.764 6.087 6.395 6.551 6.849 7.115 7.484 7.708 7.921 8.213 8.479 8.751 9.016 9.264 9.579 9.892 10.184 10.515 10.838 11.163 11.541 11.936 12.325 12.767 13.213 13.686 14.2 14.76 15.395 16.058 16.825 17.6 18.369 19.136 19.877 20.567 21.05 20.569 19.762 18.972 18.15 17.247 16.348 15.479 14.703 13.913 13.218 12.56 11.914 11.316 10.764 10.27 9.746 9.269 8.85 8.402 7.923 7.537 7.141 6.708 6.362 6.014 5.651 5.264 4.869 4.588 4.287 3.819 3.49 3.139 2.947 2.555 2.143 1.693 1.459 1.073 0.664 0.358 0.032 -0.724 -1.162 -1.618 -2.08 -2.654 -3.344 -4.192 -6.89 -8 ,1104 ,TETRA ,17585238,Sat Nov 27 12:23:45 CET,Sat Nov 27 14:34:06 CET,0.0 1.366 1.815 2.166 2.47 2.72 2.965 3.217 3.69 3.901 4.092 4.295 4.609 4.766 5.062 5.359 5.641 5.773 6.037 6.303 6.666 6.898 7.141 7.49 7.787 8.053 8.315 8.566 8.882 9.204 9.51 9.873 10.242 10.606 11.018 11.463 11.888 12.343 12.799 13.278 13.793 14.372 15.044 15.719 16.504 17.379 18.261 19.118 20.044 20.844 21.294 20.866 20.027 19.059 18.089 17.136 16.226 15.373 14.643 13.897 13.219 12.587 11.994 11.438 10.899 10.398 9.87 9.402 8.993 8.56 8.125 7.764 7.374 6.956 6.621 6.278 5.917 5.56 5.209 4.958 4.698 4.284 3.983 3.665 3.498 3.156 2.805 2.428 2.221 1.856 1.529 1.281 1.024 0.433 0.113 -0.228 -0.61 -1.068 -1.617 -2.352 -5.138 -9 ,10168 ,TETRA ,17585239,Sat Nov 27 12:23:45 CET,Sat Nov 27 14:18:59 CET,0.0 1.257 1.825 2.244 2.584 2.861 3.12 3.373 3.854 4.087 4.295 4.525 4.852 5.02 5.33 5.638 5.918 6.044 6.302 6.56 6.917 7.148 7.367 7.657 7.943 8.217 8.48 8.748 9.082 9.392 9.711 10.087 10.424 10.761 11.15 11.566 11.967 12.417 12.885 13.38 13.916 14.503 15.187 15.861 16.618 17.401 18.164 18.972 19.79 20.364 20.494 19.78 18.796 17.762 16.738 15.743 14.818 13.963 13.188 12.373 11.659 11.016 10.391 9.787 9.23 8.726 8.196 7.723 7.324 6.911 6.483 6.124 5.724 5.297 4.967 4.62 4.258 3.872 3.473 3.199 2.92 2.514 2.224 1.916 1.761 1.423 1.058 0.671 0.471 0.112 -0.232 -0.491 -0.769 -1.4 -1.759 -2.154 -2.579 -3.065 -3.691 -4.601 -7.424 -10 ,21229 ,TETRA ,17585240,Sat Nov 27 12:24:46 CET,Sat Nov 27 14:34:27 CET,0.0 1.36 1.794 2.14 2.436 2.716 2.976 3.183 3.579 3.774 3.951 4.144 4.465 4.629 4.961 5.274 5.578 5.73 6.026 6.3 6.661 6.89 7.113 7.416 7.705 7.99 8.261 8.537 8.905 9.249 9.572 9.973 10.381 10.77 11.213 11.707 12.182 12.683 13.215 13.779 14.371 15.033 15.778 16.513 17.339 18.185 19.126 20.105 21.08 22.079 22.832 22.566 21.934 21.18 20.297 19.433 18.639 17.889 17.221 16.513 15.882 15.312 14.752 14.209 13.672 13.157 12.618 12.121 11.68 11.216 10.746 10.365 9.988 9.623 9.332 9.025 8.71 8.344 7.941 7.672 7.384 6.947 6.645 6.319 6.149 5.79 5.392 4.956 4.721 4.337 3.985 3.728 3.459 2.901 2.577 2.163 1.725 1.266 0.747 0.05 -2.292 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 5de7473f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23980 ,KEBNE ,17024152,Wed Dec 22 09:28:15 CET,Wed Dec 22 11:08:49 CET,0.0 1.321 1.76 2.13 2.444 2.686 2.914 3.139 3.519 3.694 3.868 4.033 4.323 4.463 4.742 4.998 5.237 5.356 5.571 5.762 6.038 6.224 6.408 6.677 6.933 7.177 7.424 7.648 7.921 8.18 8.424 8.724 9.004 9.261 9.564 9.91 10.246 10.608 10.955 11.302 11.667 12.082 12.544 12.959 13.409 13.909 14.421 14.865 15.265 15.542 15.429 14.724 13.798 12.881 12.053 11.252 10.51 9.808 9.197 8.582 8.05 7.564 7.065 6.563 6.094 5.669 5.215 4.831 4.506 4.15 3.779 3.462 3.125 2.769 2.495 2.212 1.912 1.612 1.302 1.083 0.858 0.503 0.264 0.008 -0.134 -0.424 -0.721 -1.046 -1.222 -1.555 -1.786 -1.99 -2.198 -2.643 -2.894 -3.163 -3.476 -3.839 -4.312 -4.956 -7.494 -2 ,30851 ,KEBNE ,17024153,Wed Dec 22 09:28:15 CET,Wed Dec 22 11:08:23 CET,0.0 1.672 2.065 2.376 2.641 2.856 3.067 3.272 3.624 3.791 3.939 4.068 4.365 4.506 4.758 4.993 5.21 5.314 5.522 5.731 6.029 6.21 6.389 6.66 6.918 7.153 7.375 7.585 7.859 8.125 8.359 8.63 8.898 9.149 9.44 9.754 10.04 10.38 10.744 11.088 11.436 11.827 12.275 12.68 13.127 13.642 14.202 14.7 15.138 15.47 15.359 14.767 14.049 13.246 12.432 11.641 10.889 10.185 9.551 8.88 8.305 7.779 7.266 6.78 6.33 5.925 5.516 5.154 4.806 4.422 4.035 3.713 3.355 2.963 2.657 2.341 2.006 1.656 1.306 1.07 0.819 0.415 0.136 -0.152 -0.31 -0.651 -0.992 -1.334 -1.507 -1.847 -2.105 -2.324 -2.569 -3.104 -3.376 -3.665 -4.02 -4.434 -4.924 -5.57 -8.054 -3 ,19954 ,KEBNE ,17024154,Wed Dec 22 09:28:16 CET,Wed Dec 22 11:09:11 CET,0.0 0.997 1.4 1.738 2.018 2.276 2.503 2.686 3.024 3.183 3.335 3.489 3.783 3.924 4.19 4.44 4.672 4.783 4.998 5.214 5.507 5.677 5.847 6.109 6.368 6.606 6.82 7.036 7.311 7.565 7.81 8.103 8.382 8.639 8.946 9.342 9.751 10.211 10.704 11.158 11.574 12.036 12.537 12.953 13.396 13.858 14.318 14.784 15.233 15.476 15.34 14.668 13.779 12.853 11.969 11.141 10.369 9.649 9.008 8.365 7.795 7.261 6.752 6.286 5.865 5.456 5.003 4.592 4.236 3.874 3.486 3.147 2.786 2.423 2.141 1.84 1.524 1.206 0.884 0.651 0.407 0.048 -0.208 -0.485 -0.63 -0.931 -1.256 -1.611 -1.785 -2.099 -2.313 -2.525 -2.756 -3.265 -3.539 -3.829 -4.138 -4.533 -5.025 -5.613 -8.538 -4 ,31671 ,KEBNE ,17024155,Wed Dec 22 09:28:16 CET,Wed Dec 22 11:08:32 CET,0.0 1.142 1.562 1.879 2.156 2.377 2.566 2.752 3.082 3.246 3.409 3.545 3.835 3.973 4.23 4.471 4.693 4.797 5.001 5.204 5.516 5.72 5.902 6.164 6.426 6.677 6.907 7.118 7.401 7.681 7.939 8.255 8.555 8.82 9.119 9.462 9.809 10.176 10.523 10.891 11.285 11.724 12.202 12.605 13.019 13.463 13.95 14.429 14.816 15.045 14.94 14.305 13.504 12.677 11.866 11.065 10.295 9.592 9.0 8.354 7.751 7.2 6.667 6.184 5.744 5.335 4.918 4.534 4.199 3.858 3.477 3.161 2.845 2.519 2.271 1.999 1.707 1.408 1.098 0.877 0.644 0.274 0.015 -0.235 -0.362 -0.637 -0.918 -1.224 -1.395 -1.711 -1.916 -2.107 -2.306 -2.723 -2.963 -3.238 -3.544 -3.935 -4.429 -5.064 -7.15 -5 ,483 ,KEBNE ,17024156,Wed Dec 22 09:28:15 CET,Wed Dec 22 11:08:03 CET,0.0 1.207 1.593 1.911 2.186 2.405 2.598 2.79 3.149 3.318 3.479 3.619 3.903 4.039 4.306 4.539 4.75 4.856 5.059 5.258 5.542 5.715 5.886 6.15 6.399 6.618 6.82 7.012 7.269 7.532 7.79 8.087 8.364 8.634 8.931 9.265 9.588 9.929 10.289 10.631 10.975 11.382 11.853 12.273 12.726 13.216 13.719 14.195 14.609 14.84 14.729 14.127 13.378 12.586 11.783 10.993 10.251 9.552 8.936 8.267 7.659 7.09 6.536 6.026 5.545 5.086 4.58 4.124 3.741 3.342 2.905 2.53 2.157 1.778 1.478 1.163 0.837 0.488 0.118 -0.135 -0.401 -0.828 -1.129 -1.428 -1.576 -1.883 -2.209 -2.555 -2.735 -3.076 -3.315 -3.535 -3.769 -4.258 -4.537 -4.866 -5.258 -5.74 -6.306 -6.992 -10.633 -6 ,10741 ,KEBNE ,17024157,Wed Dec 22 09:28:15 CET,Wed Dec 22 11:08:44 CET,0.0 1.406 1.838 2.143 2.408 2.636 2.877 3.114 3.5 3.671 3.828 3.977 4.275 4.42 4.689 4.928 5.152 5.259 5.463 5.662 5.97 6.162 6.341 6.593 6.825 7.053 7.278 7.492 7.751 7.994 8.233 8.526 8.815 9.086 9.368 9.677 9.979 10.323 10.697 11.072 11.449 11.859 12.335 12.771 13.239 13.753 14.283 14.784 15.246 15.567 15.511 14.869 14.052 13.223 12.409 11.621 10.867 10.165 9.561 8.93 8.356 7.847 7.343 6.853 6.417 6.007 5.562 5.167 4.827 4.463 4.071 3.754 3.412 3.031 2.737 2.442 2.135 1.8 1.452 1.216 0.965 0.572 0.302 0.014 -0.132 -0.425 -0.742 -1.083 -1.255 -1.578 -1.783 -1.981 -2.203 -2.688 -2.975 -3.304 -3.665 -4.075 -4.513 -5.078 -7.333 -7 ,18938 ,KEBNE ,17024158,Wed Dec 22 09:28:15 CET,Wed Dec 22 11:08:50 CET,0.0 1.15 1.565 1.896 2.156 2.372 2.603 2.826 3.197 3.357 3.505 3.623 3.898 4.031 4.304 4.547 4.761 4.862 5.066 5.27 5.566 5.751 5.929 6.166 6.398 6.624 6.833 7.043 7.313 7.569 7.805 8.085 8.357 8.623 8.949 9.307 9.622 9.956 10.328 10.71 11.083 11.498 11.953 12.392 12.868 13.379 13.931 14.432 14.867 15.15 15.113 14.566 13.838 13.083 12.358 11.643 10.982 10.344 9.737 9.122 8.598 8.116 7.657 7.195 6.75 6.35 5.899 5.49 5.139 4.775 4.409 4.087 3.733 3.374 3.103 2.824 2.521 2.193 1.845 1.607 1.372 0.998 0.723 0.436 0.283 -0.038 -0.377 -0.737 -0.92 -1.276 -1.549 -1.764 -1.978 -2.433 -2.704 -3.016 -3.349 -3.729 -4.196 -4.897 -7.491 -8 ,81 ,KEBNE ,17024159,Wed Dec 22 09:28:16 CET,Wed Dec 22 11:08:42 CET,0.0 1.405 1.889 2.228 2.493 2.737 2.952 3.145 3.491 3.658 3.813 3.939 4.226 4.363 4.612 4.851 5.079 5.183 5.383 5.591 5.884 6.063 6.239 6.486 6.719 6.952 7.165 7.37 7.642 7.897 8.152 8.461 8.746 9.015 9.329 9.679 10.009 10.359 10.733 11.115 11.475 11.859 12.306 12.742 13.217 13.692 14.165 14.61 15.0 15.273 15.243 14.665 13.882 13.096 12.318 11.539 10.799 10.09 9.464 8.805 8.237 7.717 7.182 6.678 6.199 5.762 5.313 4.886 4.501 4.113 3.713 3.365 3.007 2.636 2.341 2.048 1.742 1.419 1.082 0.839 0.585 0.183 -0.099 -0.385 -0.53 -0.83 -1.165 -1.519 -1.693 -2.047 -2.327 -2.546 -2.774 -3.292 -3.567 -3.859 -4.176 -4.544 -4.964 -5.534 -7.887 -9 ,21852 ,KEBNE ,17024160,Wed Dec 22 09:29:18 CET,Wed Dec 22 11:09:52 CET,0.0 1.399 1.818 2.123 2.391 2.622 2.824 3.014 3.356 3.526 3.701 3.887 4.189 4.33 4.573 4.806 5.051 5.176 5.395 5.594 5.889 6.064 6.234 6.49 6.728 6.952 7.164 7.362 7.63 7.909 8.178 8.529 8.848 9.109 9.405 9.726 10.023 10.335 10.685 11.083 11.479 11.871 12.332 12.804 13.296 13.794 14.341 14.885 15.354 15.665 15.645 15.052 14.254 13.395 12.551 11.744 11.002 10.314 9.713 9.078 8.516 8.001 7.488 7.007 6.544 6.102 5.637 5.233 4.872 4.479 4.081 3.756 3.417 3.057 2.768 2.462 2.151 1.835 1.502 1.274 1.034 0.655 0.386 0.092 -0.053 -0.333 -0.649 -0.99 -1.171 -1.51 -1.766 -1.976 -2.195 -2.677 -2.948 -3.253 -3.572 -3.919 -4.35 -4.981 -7.288 -10 ,3292 ,KEBNE ,17024161,Wed Dec 22 09:29:18 CET,Wed Dec 22 11:09:48 CET,0.0 0.914 1.307 1.599 1.853 2.109 2.347 2.54 2.902 3.059 3.193 3.316 3.603 3.734 3.971 4.205 4.415 4.516 4.722 4.915 5.2 5.384 5.548 5.787 6.038 6.283 6.501 6.705 6.963 7.212 7.465 7.761 8.037 8.286 8.574 8.905 9.205 9.538 9.919 10.324 10.728 11.164 11.63 12.074 12.546 13.018 13.539 14.042 14.477 14.756 14.714 14.209 13.469 12.712 12.04 11.341 10.653 10.01 9.423 8.825 8.314 7.843 7.362 6.891 6.454 6.057 5.625 5.226 4.893 4.546 4.158 3.83 3.464 3.073 2.769 2.446 2.109 1.765 1.419 1.18 0.938 0.582 0.341 0.086 -0.047 -0.336 -0.665 -1.011 -1.183 -1.505 -1.739 -1.956 -2.171 -2.645 -2.913 -3.218 -3.552 -3.923 -4.356 -4.886 -7.001 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index cb2a80e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21935 ,KEBNE ,17024162,Wed Dec 22 09:29:18 CET,Wed Dec 22 11:11:26 CET,0.0 0.674 1.051 1.364 1.619 1.831 2.038 2.234 2.586 2.751 2.906 3.048 3.321 3.445 3.69 3.929 4.153 4.258 4.462 4.646 4.901 5.073 5.238 5.483 5.723 5.949 6.163 6.37 6.645 6.896 7.126 7.412 7.688 7.956 8.258 8.583 8.901 9.249 9.611 9.983 10.363 10.794 11.285 11.763 12.275 12.766 13.291 13.844 14.362 14.765 14.803 14.188 13.304 12.404 11.535 10.663 9.898 9.23 8.599 7.899 7.291 6.766 6.259 5.771 5.305 4.88 4.425 4.005 3.647 3.287 2.898 2.576 2.237 1.841 1.546 1.253 0.947 0.618 0.258 -0.006 -0.291 -0.731 -1.041 -1.365 -1.523 -1.823 -2.151 -2.531 -2.74 -3.109 -3.431 -3.685 -3.952 -4.51 -4.828 -5.213 -5.659 -6.12 -6.641 -7.407 -11.619 -2 ,9786 ,KEBNE ,17024163,Wed Dec 22 09:29:18 CET,Wed Dec 22 11:10:46 CET,0.0 1.071 1.507 1.881 2.205 2.494 2.75 2.972 3.387 3.582 3.74 3.881 4.158 4.301 4.569 4.818 5.071 5.198 5.437 5.658 5.958 6.153 6.337 6.58 6.817 7.056 7.28 7.485 7.735 7.976 8.218 8.508 8.78 9.043 9.341 9.669 9.974 10.304 10.661 11.047 11.449 11.869 12.329 12.784 13.276 13.747 14.258 14.783 15.245 15.544 15.475 14.827 13.997 13.077 12.213 11.406 10.647 9.889 9.211 8.491 7.811 7.179 6.616 6.097 5.557 5.076 4.557 4.094 3.715 3.325 2.917 2.582 2.236 1.861 1.574 1.285 0.98 0.63 0.233 -0.027 -0.293 -0.741 -1.044 -1.347 -1.5 -1.824 -2.179 -2.567 -2.771 -3.13 -3.416 -3.653 -3.914 -4.474 -4.807 -5.198 -5.638 -6.124 -6.753 -7.601 -10.961 -3 ,25457 ,KEBNE ,17024164,Wed Dec 22 09:29:18 CET,Wed Dec 22 11:11:42 CET,0.0 0.977 1.342 1.602 1.833 2.057 2.263 2.441 2.764 2.916 3.065 3.209 3.487 3.617 3.856 4.101 4.341 4.447 4.663 4.877 5.16 5.335 5.508 5.766 6.016 6.249 6.468 6.68 6.961 7.216 7.453 7.745 8.022 8.284 8.581 8.936 9.283 9.647 10.036 10.444 10.874 11.346 11.858 12.319 12.809 13.335 13.92 14.495 15.041 15.53 15.647 14.827 13.738 12.673 11.668 10.671 9.744 8.948 8.255 7.484 6.794 6.168 5.57 5.015 4.483 4.02 3.538 3.081 2.672 2.241 1.803 1.435 1.055 0.673 0.371 0.062 -0.246 -0.588 -0.957 -1.212 -1.471 -1.862 -2.133 -2.439 -2.602 -2.929 -3.271 -3.617 -3.818 -4.192 -4.507 -4.747 -5.001 -5.587 -5.918 -6.264 -6.628 -7.023 -7.508 -8.193 -10.73 -4 ,22893 ,KEBNE ,17024165,Wed Dec 22 09:29:18 CET,Wed Dec 22 11:11:27 CET,0.0 0.888 1.228 1.521 1.802 2.048 2.242 2.409 2.726 2.875 3.026 3.169 3.445 3.572 3.829 4.08 4.322 4.431 4.646 4.858 5.149 5.336 5.517 5.764 6.001 6.227 6.447 6.678 6.976 7.246 7.502 7.803 8.102 8.388 8.694 9.025 9.332 9.676 10.04 10.421 10.825 11.282 11.81 12.296 12.791 13.267 13.728 14.191 14.659 14.986 14.965 14.309 13.436 12.527 11.61 10.679 9.818 9.021 8.284 7.519 6.817 6.205 5.635 4.994 4.348 3.754 3.094 2.498 2.004 1.494 0.95 0.509 0.058 -0.436 -0.821 -1.217 -1.643 -2.084 -2.531 -2.855 -3.196 -3.712 -4.077 -4.453 -4.648 -5.04 -5.419 -5.832 -6.058 -6.422 -6.741 -7.002 -7.303 -7.989 -8.368 -8.794 -9.24 -9.738 -10.343 -11.167 -14.947 -5 ,2625 ,KEBNE ,17024166,Wed Dec 22 09:29:18 CET,Wed Dec 22 11:10:23 CET,0.0 0.882 1.215 1.517 1.791 2.015 2.226 2.435 2.826 2.986 3.119 3.238 3.519 3.652 3.887 4.101 4.3 4.394 4.574 4.753 5.02 5.192 5.359 5.577 5.773 5.978 6.171 6.349 6.599 6.843 7.081 7.357 7.605 7.838 8.104 8.432 8.758 9.085 9.421 9.774 10.125 10.506 10.942 11.337 11.776 12.271 12.806 13.332 13.796 14.184 14.202 13.679 12.912 11.918 10.896 9.938 9.103 8.366 7.727 7.052 6.428 5.852 5.281 4.734 4.222 3.739 3.228 2.78 2.38 1.932 1.461 1.072 0.652 0.198 -0.145 -0.493 -0.851 -1.207 -1.583 -1.85 -2.134 -2.58 -2.889 -3.226 -3.399 -3.755 -4.13 -4.535 -4.749 -5.125 -5.478 -5.771 -6.085 -6.741 -7.115 -7.52 -7.962 -8.476 -9.078 -9.836 -12.676 -6 ,20881 ,KEBNE ,17024167,Wed Dec 22 09:29:18 CET,Wed Dec 22 11:11:32 CET,0.0 0.861 1.269 1.589 1.829 2.034 2.237 2.431 2.778 2.933 3.068 3.175 3.458 3.593 3.838 4.067 4.288 4.394 4.598 4.796 5.095 5.279 5.444 5.694 5.939 6.18 6.404 6.599 6.85 7.103 7.348 7.658 7.966 8.249 8.576 8.93 9.242 9.584 9.951 10.304 10.644 11.032 11.498 11.952 12.482 13.04 13.534 13.896 14.181 14.368 14.206 13.373 12.323 11.189 10.147 9.169 8.264 7.439 6.615 5.667 4.867 4.219 3.643 3.101 2.576 2.074 1.537 1.035 0.605 0.175 -0.294 -0.711 -1.15 -1.62 -2.005 -2.423 -2.867 -3.33 -3.805 -4.115 -4.443 -4.958 -5.301 -5.663 -5.86 -6.28 -6.694 -7.103 -7.318 -7.707 -8.062 -8.318 -8.588 -9.149 -9.459 -9.851 -10.27 -10.668 -11.187 -11.983 -14.902 -7 ,5337 ,KEBNE ,17024168,Wed Dec 22 09:29:22 CET,Wed Dec 22 11:11:18 CET,0.0 0.766 1.139 1.427 1.678 1.898 2.106 2.314 2.707 2.892 3.069 3.244 3.536 3.675 3.913 4.128 4.359 4.47 4.686 4.885 5.141 5.305 5.468 5.712 5.944 6.173 6.397 6.604 6.872 7.123 7.354 7.631 7.896 8.151 8.452 8.789 9.103 9.451 9.821 10.201 10.574 10.996 11.505 12.004 12.552 13.074 13.62 14.173 14.659 14.86 14.532 13.622 12.515 11.406 10.329 9.289 8.402 7.592 6.864 6.143 5.404 4.635 3.886 3.145 2.461 1.852 1.213 0.676 0.193 -0.336 -0.861 -1.297 -1.748 -2.223 -2.594 -2.971 -3.37 -3.76 -4.147 -4.442 -4.733 -5.169 -5.493 -5.837 -6.013 -6.372 -6.762 -7.201 -7.424 -7.787 -8.13 -8.378 -8.634 -9.215 -9.52 -9.866 -10.297 -10.779 -11.318 -12.1 -16.468 -8 ,12816 ,KEBNE ,17024169,Wed Dec 22 09:29:18 CET,Wed Dec 22 11:11:23 CET,0.0 0.832 1.246 1.58 1.869 2.116 2.353 2.582 2.966 3.135 3.305 3.491 3.791 3.94 4.23 4.497 4.753 4.879 5.119 5.343 5.661 5.857 6.024 6.246 6.464 6.673 6.868 7.066 7.317 7.551 7.784 8.063 8.325 8.585 8.882 9.208 9.52 9.847 10.196 10.568 10.95 11.363 11.806 12.239 12.723 13.202 13.708 14.202 14.558 14.768 14.755 14.037 12.979 11.955 10.968 9.965 9.098 8.254 7.507 6.767 6.08 5.475 4.919 4.394 3.898 3.428 2.894 2.421 2.022 1.564 1.053 0.622 0.148 -0.363 -0.749 -1.141 -1.543 -1.981 -2.435 -2.729 -3.037 -3.515 -3.843 -4.201 -4.394 -4.794 -5.194 -5.617 -5.841 -6.211 -6.535 -6.783 -7.051 -7.667 -7.999 -8.326 -8.691 -9.141 -9.656 -10.34 -13.078 -9 ,10219 ,KEBNE ,17024170,Wed Dec 22 09:29:19 CET,Wed Dec 22 11:10:20 CET,0.0 0.779 1.14 1.412 1.644 1.836 2.015 2.2 2.54 2.701 2.852 2.98 3.255 3.378 3.615 3.848 4.058 4.152 4.34 4.516 4.767 4.936 5.098 5.32 5.542 5.761 5.97 6.173 6.433 6.685 6.938 7.232 7.489 7.736 8.016 8.316 8.61 8.935 9.287 9.655 10.032 10.439 10.873 11.309 11.808 12.323 12.861 13.375 13.899 14.319 14.41 13.734 12.867 12.113 11.253 10.293 9.41 8.584 7.81 7.007 6.35 5.816 5.252 4.67 4.138 3.657 3.115 2.603 2.172 1.731 1.282 0.893 0.484 0.052 -0.276 -0.606 -0.979 -1.401 -1.858 -2.18 -2.508 -3.023 -3.387 -3.754 -3.956 -4.409 -4.865 -5.319 -5.555 -5.957 -6.397 -6.713 -7.039 -7.762 -8.149 -8.542 -8.954 -9.422 -10.031 -10.858 -12.966 -10 ,6026 ,KEBNE ,17024171,Wed Dec 22 09:30:20 CET,Wed Dec 22 11:12:08 CET,0.0 0.827 1.199 1.491 1.72 1.938 2.149 2.346 2.726 2.892 3.045 3.165 3.433 3.573 3.865 4.135 4.371 4.49 4.704 4.881 5.155 5.341 5.513 5.749 5.964 6.166 6.372 6.588 6.864 7.113 7.344 7.625 7.9 8.155 8.444 8.762 9.063 9.382 9.718 10.089 10.479 10.886 11.339 11.77 12.229 12.726 13.251 13.743 14.203 14.557 14.522 13.869 13.02 12.106 11.217 10.331 9.491 8.718 8.042 7.304 6.639 6.053 5.516 4.997 4.502 4.029 3.509 3.053 2.649 2.225 1.792 1.41 0.972 0.535 0.193 -0.191 -0.583 -1.0 -1.442 -1.758 -2.094 -2.596 -2.938 -3.294 -3.485 -3.881 -4.291 -4.748 -4.997 -5.405 -5.807 -6.113 -6.425 -7.061 -7.384 -7.76 -8.194 -8.626 -9.169 -9.934 -13.014 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt deleted file mode 100644 index e4c85c19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14027 ,TETRA ,17585241,Sat Nov 27 12:25:45 CET,Sat Nov 27 14:36:16 CET,0.0 1.04 1.463 1.793 2.065 2.293 2.501 2.701 3.063 3.221 3.368 3.497 3.788 3.935 4.212 4.476 4.727 4.85 5.094 5.32 5.646 5.861 6.075 6.371 6.639 6.904 7.145 7.357 7.612 7.854 8.106 8.419 8.705 8.962 9.269 9.628 9.957 10.315 10.691 11.058 11.426 11.839 12.332 12.779 13.253 13.763 14.315 14.852 15.329 15.717 15.684 14.97 14.124 13.325 12.514 11.671 10.898 10.154 9.525 8.91 8.318 7.774 7.241 6.722 6.236 5.77 5.262 4.809 4.416 3.995 3.559 3.212 2.834 2.423 2.102 1.772 1.443 1.098 0.75 0.518 0.263 -0.169 -0.473 -0.807 -0.983 -1.333 -1.691 -2.064 -2.261 -2.605 -2.895 -3.14 -3.402 -4.005 -4.348 -4.735 -5.155 -5.62 -6.159 -6.891 -10.208 -2 ,32505 ,TETRA ,17585242,Sat Nov 27 12:26:44 CET,Sat Nov 27 14:35:11 CET,0.0 0.856 1.248 1.494 1.7 1.892 2.083 2.247 2.522 2.664 2.808 2.913 3.18 3.293 3.496 3.694 3.899 4.002 4.207 4.404 4.67 4.839 5.004 5.242 5.479 5.713 5.928 6.138 6.415 6.676 6.93 7.24 7.532 7.801 8.115 8.475 8.814 9.19 9.577 9.961 10.359 10.82 11.339 11.809 12.331 12.903 13.489 14.041 14.503 14.832 14.858 14.25 13.372 12.47 11.613 10.681 9.752 8.892 8.139 7.344 6.644 6.021 5.417 4.825 4.25 3.732 3.199 2.688 2.249 1.819 1.361 0.963 0.527 0.079 -0.268 -0.631 -1.02 -1.427 -1.849 -2.148 -2.446 -2.899 -3.221 -3.563 -3.745 -4.137 -4.533 -4.92 -5.124 -5.494 -5.833 -6.083 -6.329 -6.874 -7.187 -7.516 -7.896 -8.3 -8.769 -9.408 -10.87 -3 ,18406 ,TETRA ,17585243,Sat Nov 27 12:26:44 CET,Sat Nov 27 14:37:54 CET,0.0 0.741 1.08 1.34 1.571 1.777 1.965 2.135 2.456 2.602 2.743 2.871 3.153 3.286 3.521 3.747 3.969 4.083 4.303 4.522 4.856 5.07 5.287 5.596 5.879 6.159 6.422 6.673 7.003 7.325 7.634 8.021 8.416 8.794 9.213 9.674 10.097 10.54 11.001 11.489 12.015 12.533 13.037 13.513 14.031 14.584 15.177 15.776 16.329 16.758 16.729 15.995 15.12 14.233 13.397 12.581 11.834 11.12 10.453 9.779 9.188 8.63 8.06 7.496 6.967 6.49 6.01 5.523 5.029 4.55 4.094 3.691 3.271 2.846 2.516 2.177 1.821 1.417 0.952 0.63 0.3 -0.226 -0.581 -0.941 -1.125 -1.517 -1.929 -2.351 -2.583 -2.974 -3.366 -3.646 -3.933 -4.56 -4.896 -5.27 -5.694 -6.16 -6.708 -7.536 -11.268 -4 ,9991 ,TETRA ,17585244,Sat Nov 27 12:27:46 CET,Sat Nov 27 14:19:11 CET,0.0 0.965 1.454 1.828 2.137 2.375 2.586 2.774 3.089 3.23 3.378 3.522 3.799 3.932 4.199 4.443 4.662 4.767 4.973 5.169 5.445 5.621 5.791 6.038 6.286 6.529 6.758 6.972 7.242 7.498 7.742 8.059 8.388 8.691 9.002 9.328 9.653 9.999 10.362 10.752 11.155 11.594 12.093 12.598 13.127 13.611 14.134 14.688 15.165 15.506 15.451 14.759 13.894 12.946 12.015 11.153 10.337 9.554 8.875 8.167 7.524 6.939 6.396 5.879 5.396 4.957 4.479 4.034 3.645 3.258 2.845 2.46 2.045 1.634 1.305 0.938 0.555 0.182 -0.195 -0.455 -0.73 -1.206 -1.531 -1.846 -2.01 -2.348 -2.729 -3.163 -3.394 -3.773 -4.116 -4.379 -4.658 -5.321 -5.666 -6.019 -6.413 -6.849 -7.365 -8.037 -10.878 -5 ,27938 ,TETRA ,17585245,Sat Nov 27 12:28:46 CET,Sat Nov 27 14:39:51 CET,0.0 0.653 0.953 1.21 1.45 1.654 1.829 1.988 2.266 2.406 2.552 2.686 2.949 3.077 3.317 3.535 3.737 3.834 4.02 4.204 4.485 4.66 4.825 5.059 5.277 5.486 5.682 5.874 6.128 6.366 6.595 6.874 7.143 7.412 7.735 8.076 8.393 8.745 9.119 9.508 9.907 10.336 10.815 11.272 11.778 12.283 12.779 13.276 13.788 14.248 14.273 13.641 12.858 12.11 11.331 10.531 9.798 9.038 8.326 7.619 7.009 6.419 5.838 5.291 4.791 4.36 3.911 3.498 3.127 2.732 2.281 1.862 1.429 1.003 0.645 0.265 -0.101 -0.466 -0.836 -1.091 -1.337 -1.688 -1.939 -2.248 -2.417 -2.769 -3.162 -3.596 -3.815 -4.182 -4.528 -4.794 -5.067 -5.663 -6.009 -6.399 -6.806 -7.261 -7.776 -8.385 -11.154 -6 ,29268 ,TETRA ,17585246,Sat Nov 27 12:28:46 CET,Sat Nov 27 14:40:52 CET,0.0 0.796 1.112 1.365 1.605 1.819 2.014 2.215 2.591 2.754 2.9 3.013 3.281 3.409 3.671 3.925 4.165 4.276 4.494 4.701 4.984 5.172 5.364 5.628 5.886 6.126 6.345 6.562 6.844 7.111 7.369 7.682 7.981 8.268 8.582 8.917 9.242 9.619 10.017 10.412 10.812 11.243 11.736 12.205 12.705 13.267 13.902 14.512 15.06 15.52 15.513 14.823 13.938 13.049 12.244 11.46 10.695 9.947 9.307 8.615 7.992 7.432 6.874 6.34 5.83 5.343 4.842 4.386 3.98 3.557 3.093 2.716 2.339 1.932 1.61 1.278 0.924 0.547 0.138 -0.143 -0.425 -0.87 -1.176 -1.506 -1.68 -2.033 -2.395 -2.787 -3.014 -3.395 -3.717 -3.979 -4.274 -4.934 -5.308 -5.685 -6.029 -6.404 -6.907 -7.669 -11.807 -7 ,19952 ,TETRA ,17585247,Sat Nov 27 12:28:46 CET,Sat Nov 27 14:34:41 CET,0.0 0.894 1.246 1.544 1.788 2.009 2.225 2.43 2.804 2.968 3.12 3.274 3.557 3.68 3.914 4.149 4.379 4.487 4.691 4.884 5.165 5.35 5.523 5.797 6.095 6.377 6.622 6.841 7.115 7.368 7.614 7.912 8.2 8.48 8.789 9.13 9.464 9.833 10.223 10.595 10.96 11.385 11.86 12.295 12.787 13.277 13.736 14.179 14.581 14.843 14.687 13.79 12.789 11.872 11.031 10.241 9.47 8.736 8.078 7.346 6.682 6.112 5.559 4.995 4.418 3.861 3.288 2.754 2.265 1.767 1.277 0.861 0.408 -0.067 -0.442 -0.819 -1.198 -1.6 -2.017 -2.318 -2.633 -3.105 -3.439 -3.811 -4.005 -4.369 -4.74 -5.164 -5.398 -5.783 -6.111 -6.363 -6.642 -7.249 -7.586 -7.976 -8.42 -8.907 -9.463 -10.239 -13.88 -8 ,20387 ,TETRA ,17585248,Sat Nov 27 12:28:46 CET,Sat Nov 27 14:38:36 CET,0.0 1.145 1.542 1.854 2.147 2.401 2.638 2.864 3.285 3.471 3.638 3.812 4.116 4.264 4.532 4.787 5.046 5.17 5.413 5.648 5.982 6.198 6.398 6.673 6.917 7.137 7.357 7.577 7.86 8.116 8.354 8.655 8.95 9.224 9.539 9.888 10.217 10.579 10.943 11.297 11.657 12.068 12.534 12.978 13.469 13.947 14.472 15.047 15.608 16.07 16.207 15.794 15.15 14.375 13.571 12.728 11.944 11.192 10.478 9.816 9.277 8.754 8.235 7.741 7.254 6.799 6.343 5.936 5.585 5.23 4.863 4.547 4.198 3.803 3.464 3.094 2.707 2.326 1.917 1.624 1.356 0.942 0.628 0.296 0.131 -0.199 -0.573 -0.994 -1.218 -1.603 -1.963 -2.222 -2.472 -3.036 -3.346 -3.665 -4.024 -4.456 -4.959 -5.758 -8.991 -9 ,24926 ,TETRA ,17585249,Sat Nov 27 12:29:46 CET,Sat Nov 27 14:41:29 CET,0.0 0.865 1.182 1.459 1.701 1.934 2.14 2.324 2.668 2.825 2.962 3.089 3.371 3.506 3.766 4.004 4.23 4.345 4.561 4.753 5.03 5.218 5.401 5.646 5.885 6.127 6.351 6.564 6.85 7.126 7.383 7.68 7.951 8.204 8.504 8.856 9.187 9.536 9.892 10.262 10.66 11.108 11.597 12.059 12.579 13.135 13.747 14.338 14.89 15.344 15.372 14.76 13.953 13.03 12.088 11.153 10.264 9.388 8.61 7.825 7.137 6.521 5.916 5.321 4.767 4.269 3.746 3.252 2.811 2.363 1.884 1.478 1.066 0.638 0.298 -0.05 -0.413 -0.813 -1.244 -1.534 -1.819 -2.263 -2.579 -2.906 -3.078 -3.442 -3.831 -4.243 -4.462 -4.834 -5.147 -5.403 -5.664 -6.247 -6.569 -6.922 -7.335 -7.793 -8.323 -9.048 -10.941 -10 ,24690 ,TETRA ,17585250,Sat Nov 27 12:29:45 CET,Sat Nov 27 14:39:53 CET,0.0 0.984 1.359 1.618 1.832 2.025 2.213 2.395 2.718 2.855 2.993 3.145 3.425 3.54 3.782 4.014 4.221 4.321 4.506 4.679 4.94 5.105 5.266 5.504 5.726 5.944 6.154 6.352 6.618 6.878 7.118 7.405 7.677 7.925 8.214 8.55 8.872 9.221 9.609 10.016 10.42 10.854 11.307 11.731 12.23 12.75 13.324 13.924 14.472 14.848 14.831 14.205 13.444 12.611 11.713 10.814 9.96 9.159 8.447 7.673 6.976 6.372 5.795 5.223 4.69 4.209 3.691 3.207 2.781 2.345 1.889 1.508 1.116 0.705 0.37 0.008 -0.396 -0.835 -1.257 -1.533 -1.828 -2.282 -2.601 -2.947 -3.132 -3.506 -3.883 -4.285 -4.498 -4.87 -5.214 -5.476 -5.738 -6.281 -6.56 -6.869 -7.244 -7.668 -8.178 -8.845 -10.42 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt deleted file mode 100644 index 34a5048a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24204 ,TETRA ,17585251,Sat Nov 27 12:30:45 CET,Sat Nov 27 14:40:28 CET,0.0 1.364 1.819 2.198 2.519 2.799 3.055 3.294 3.724 3.919 4.107 4.32 4.632 4.796 5.115 5.404 5.677 5.815 6.076 6.318 6.66 6.885 7.101 7.389 7.67 7.95 8.205 8.446 8.768 9.086 9.39 9.757 10.091 10.391 10.725 11.114 11.511 11.95 12.386 12.825 13.309 13.839 14.431 14.997 15.612 16.268 16.982 17.672 18.302 18.859 19.172 18.856 18.247 17.508 16.692 15.909 15.221 14.516 13.831 13.131 12.507 11.941 11.401 10.882 10.395 9.923 9.413 8.959 8.573 8.17 7.733 7.36 6.991 6.621 6.311 5.981 5.648 5.305 4.938 4.68 4.415 4.007 3.709 3.388 3.224 2.886 2.527 2.139 1.931 1.582 1.283 1.03 0.772 0.223 -0.083 -0.415 -0.809 -1.271 -1.82 -2.592 -5.438 -2 ,4711 ,TETRA ,17585252,Sat Nov 27 12:30:46 CET,Sat Nov 27 14:41:55 CET,0.0 1.504 1.977 2.315 2.599 2.858 3.099 3.324 3.738 3.933 4.11 4.309 4.615 4.775 5.068 5.333 5.594 5.728 5.973 6.205 6.533 6.743 6.943 7.224 7.515 7.803 8.062 8.311 8.647 8.963 9.249 9.589 9.913 10.231 10.6 11.003 11.402 11.836 12.3 12.782 13.249 13.753 14.351 14.934 15.536 16.153 16.836 17.539 18.222 18.786 19.025 18.575 17.854 17.1 16.309 15.536 14.852 14.201 13.625 13.014 12.474 11.968 11.465 10.981 10.527 10.119 9.684 9.292 8.951 8.584 8.187 7.88 7.581 7.245 6.959 6.661 6.337 5.972 5.583 5.313 5.026 4.58 4.281 3.966 3.798 3.459 3.128 2.783 2.59 2.241 1.951 1.732 1.502 0.989 0.707 0.412 0.091 -0.273 -0.721 -1.306 -8.984 -3 ,1909 ,TETRA ,17585253,Sat Nov 27 12:30:46 CET,Sat Nov 27 14:40:47 CET,0.0 1.461 2.043 2.479 2.865 3.196 3.456 3.692 4.165 4.39 4.58 4.791 5.105 5.263 5.541 5.812 6.076 6.201 6.456 6.692 7.034 7.255 7.457 7.762 8.058 8.339 8.594 8.833 9.145 9.456 9.759 10.125 10.476 10.806 11.184 11.594 11.974 12.384 12.819 13.278 13.747 14.243 14.811 15.392 16.043 16.703 17.378 18.036 18.702 19.317 19.636 19.249 18.563 17.822 17.081 16.338 15.648 15.003 14.406 13.787 13.222 12.673 12.142 11.632 11.152 10.713 10.227 9.784 9.405 9.028 8.645 8.316 7.956 7.559 7.24 6.913 6.566 6.198 5.828 5.58 5.327 4.948 4.683 4.385 4.224 3.903 3.579 3.211 3.004 2.659 2.424 2.23 2.022 1.511 1.216 0.9 0.548 0.12 -0.405 -1.112 -3.437 -4 ,18855 ,TETRA ,17585254,Sat Nov 27 12:32:47 CET,Sat Nov 27 14:41:42 CET,0.0 1.385 1.924 2.379 2.75 3.07 3.359 3.621 4.105 4.311 4.504 4.716 5.021 5.181 5.463 5.726 5.984 6.124 6.428 6.704 7.095 7.354 7.608 7.968 8.283 8.582 8.899 9.23 9.614 9.924 10.212 10.558 10.878 11.172 11.508 11.891 12.272 12.686 13.096 13.513 13.94 14.405 14.958 15.504 16.096 16.711 17.372 18.088 18.794 19.399 19.756 19.468 18.871 18.215 17.52 16.763 16.046 15.397 14.815 14.187 13.635 13.136 12.645 12.177 11.738 11.321 10.872 10.445 10.055 9.639 9.2 8.81 8.41 8.019 7.711 7.386 7.031 6.661 6.263 5.976 5.68 5.201 4.858 4.51 4.339 3.986 3.611 3.21 3.001 2.641 2.315 2.074 1.822 1.273 0.97 0.655 0.341 -0.027 -0.485 -1.102 -4.292 -5 ,5056 ,TETRA ,17585255,Sat Nov 27 12:32:47 CET,Sat Nov 27 14:37:10 CET,0.0 1.503 1.981 2.407 2.801 3.137 3.424 3.684 4.145 4.352 4.561 4.821 5.155 5.342 5.687 6.01 6.312 6.457 6.739 7.011 7.388 7.631 7.871 8.209 8.545 8.868 9.165 9.452 9.827 10.199 10.553 10.963 11.355 11.737 12.182 12.653 13.082 13.568 14.07 14.542 15.045 15.629 16.288 16.896 17.566 18.293 19.025 19.747 20.502 21.166 21.461 21.097 20.381 19.507 18.599 17.671 16.733 15.847 15.106 14.372 13.74 13.199 12.69 12.209 11.764 11.337 10.884 10.473 10.112 9.741 9.357 9.03 8.691 8.345 8.074 7.787 7.479 7.146 6.769 6.506 6.249 5.823 5.531 5.235 5.078 4.76 4.424 4.077 3.897 3.558 3.286 3.055 2.818 2.293 2.007 1.712 1.393 1.014 0.544 -0.032 -2.439 -6 ,6380 ,TETRA ,17585256,Sat Nov 27 12:33:47 CET,Sat Nov 27 14:45:41 CET,0.0 0.898 1.278 1.595 1.865 2.111 2.356 2.597 2.998 3.174 3.333 3.474 3.756 3.898 4.179 4.437 4.691 4.817 5.065 5.29 5.592 5.792 5.992 6.294 6.568 6.832 7.1 7.347 7.64 7.924 8.206 8.548 8.88 9.196 9.571 9.986 10.361 10.771 11.212 11.67 12.116 12.576 13.109 13.638 14.231 14.856 15.524 16.202 16.896 17.466 17.688 17.234 16.537 15.778 14.996 14.277 13.635 12.983 12.376 11.749 11.167 10.64 10.143 9.639 9.16 8.716 8.226 7.801 7.421 7.01 6.585 6.226 5.865 5.494 5.203 4.892 4.557 4.218 3.862 3.601 3.34 2.959 2.68 2.372 2.217 1.888 1.535 1.174 0.997 0.672 0.399 0.177 -0.045 -0.561 -0.868 -1.192 -1.523 -1.893 -2.351 -2.958 -5.747 -7 ,22240 ,TETRA ,17585257,Sat Nov 27 12:32:47 CET,Sat Nov 27 14:41:54 CET,0.0 0.95 1.389 1.738 2.051 2.326 2.583 2.837 3.286 3.48 3.661 3.844 4.156 4.327 4.662 4.961 5.234 5.368 5.616 5.847 6.168 6.364 6.565 6.866 7.156 7.442 7.714 7.975 8.312 8.629 8.924 9.276 9.622 9.944 10.298 10.7 11.078 11.476 11.917 12.395 12.861 13.35 13.922 14.468 15.046 15.651 16.27 16.868 17.48 18.07 18.41 18.082 17.409 16.608 15.83 15.107 14.432 13.799 13.224 12.606 12.066 11.571 11.095 10.621 10.147 9.688 9.199 8.778 8.416 8.019 7.596 7.242 6.86 6.465 6.157 5.837 5.523 5.195 4.826 4.571 4.304 3.885 3.616 3.333 3.182 2.856 2.518 2.17 1.988 1.651 1.383 1.172 0.949 0.427 0.139 -0.169 -0.538 -0.936 -1.439 -2.091 -10.558 -8 ,26754 ,TETRA ,17585258,Sat Nov 27 12:32:47 CET,Sat Nov 27 14:31:02 CET,0.0 1.004 1.45 1.797 2.1 2.353 2.575 2.8 3.224 3.407 3.586 3.807 4.119 4.274 4.578 4.861 5.127 5.261 5.503 5.729 6.049 6.247 6.438 6.714 6.99 7.253 7.498 7.74 8.047 8.333 8.616 8.949 9.251 9.544 9.881 10.257 10.633 11.042 11.465 11.897 12.356 12.871 13.439 13.983 14.586 15.192 15.82 16.455 17.055 17.518 17.631 17.13 16.396 15.622 14.833 14.023 13.285 12.585 11.93 11.233 10.621 10.084 9.547 9.031 8.539 8.065 7.575 7.151 6.774 6.369 5.95 5.603 5.248 4.881 4.582 4.256 3.923 3.591 3.25 3.02 2.775 2.363 2.087 1.812 1.666 1.36 1.025 0.677 0.506 0.186 -0.058 -0.267 -0.493 -1.009 -1.29 -1.609 -1.98 -2.386 -2.842 -3.474 -6.182 -9 ,2753 ,TETRA ,17585259,Sat Nov 27 12:33:47 CET,Sat Nov 27 14:43:18 CET,0.0 1.327 1.961 2.412 2.781 3.101 3.371 3.638 4.121 4.347 4.566 4.803 5.126 5.296 5.589 5.86 6.119 6.253 6.522 6.77 7.136 7.374 7.597 7.917 8.225 8.517 8.785 9.044 9.392 9.706 9.996 10.355 10.696 11.023 11.376 11.753 12.119 12.497 12.898 13.339 13.824 14.367 14.965 15.521 16.119 16.747 17.507 18.335 19.059 19.661 19.923 19.632 19.078 18.355 17.613 16.878 16.149 15.467 14.854 14.213 13.686 13.217 12.76 12.298 11.837 11.435 11.012 10.605 10.244 9.877 9.497 9.169 8.822 8.469 8.19 7.892 7.589 7.276 6.949 6.716 6.473 6.094 5.807 5.496 5.343 5.045 4.733 4.389 4.199 3.855 3.579 3.348 3.077 2.49 2.193 1.902 1.588 1.212 0.694 -0.033 -2.785 -10 ,1945 ,TETRA ,17585260,Sat Nov 27 12:33:47 CET,Sat Nov 27 14:41:00 CET,0.0 1.277 1.685 2.004 2.282 2.563 2.839 3.074 3.492 3.679 3.861 4.034 4.338 4.497 4.796 5.087 5.363 5.492 5.733 5.97 6.324 6.544 6.755 7.066 7.362 7.641 7.907 8.168 8.503 8.813 9.115 9.493 9.856 10.195 10.589 11.031 11.452 11.901 12.357 12.836 13.336 13.879 14.491 15.054 15.656 16.267 16.909 17.616 18.318 18.899 19.214 18.938 18.29 17.598 16.858 16.059 15.295 14.574 13.943 13.286 12.698 12.167 11.65 11.128 10.634 10.165 9.647 9.204 8.833 8.42 7.959 7.563 7.152 6.708 6.353 5.995 5.632 5.244 4.82 4.53 4.231 3.764 3.428 3.069 2.885 2.509 2.12 1.686 1.45 1.074 0.739 0.48 0.201 -0.406 -0.731 -1.063 -1.43 -1.891 -2.458 -3.193 -4.532 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index ef804c16..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5499 ,TETRA ,17585261,Sat Nov 27 12:33:47 CET,Sat Nov 27 14:41:26 CET,0.0 0.868 1.221 1.491 1.731 1.955 2.153 2.342 2.688 2.843 2.99 3.128 3.405 3.538 3.782 4.002 4.212 4.311 4.502 4.684 4.945 5.114 5.281 5.52 5.738 5.955 6.171 6.374 6.636 6.885 7.13 7.42 7.677 7.919 8.194 8.504 8.8 9.111 9.438 9.781 10.149 10.552 10.982 11.384 11.838 12.313 12.825 13.361 13.852 14.203 14.224 13.696 13.003 12.299 11.528 10.651 9.764 8.898 8.142 7.363 6.651 5.992 5.356 4.767 4.199 3.669 3.117 2.624 2.197 1.744 1.283 0.888 0.465 0.037 -0.294 -0.641 -1.019 -1.419 -1.817 -2.098 -2.374 -2.772 -3.084 -3.433 -3.604 -3.947 -4.296 -4.661 -4.867 -5.229 -5.533 -5.772 -6.018 -6.573 -6.891 -7.24 -7.594 -8.009 -8.483 -9.097 -11.141 -2 ,13907 ,TETRA ,17585262,Sat Nov 27 12:33:47 CET,Sat Nov 27 14:39:59 CET,0.0 0.9 1.25 1.509 1.756 1.985 2.183 2.37 2.722 2.889 3.043 3.167 3.432 3.544 3.769 3.988 4.19 4.293 4.493 4.679 4.955 5.131 5.305 5.557 5.783 5.999 6.209 6.408 6.655 6.902 7.137 7.404 7.668 7.925 8.221 8.547 8.836 9.135 9.479 9.851 10.211 10.61 11.08 11.512 11.957 12.403 12.873 13.345 13.764 14.094 14.15 13.674 12.941 12.148 11.385 10.645 9.958 9.319 8.753 8.177 7.667 7.187 6.709 6.242 5.811 5.42 5.001 4.618 4.285 3.925 3.542 3.229 2.904 2.565 2.285 1.985 1.684 1.365 1.015 0.77 0.524 0.132 -0.141 -0.404 -0.536 -0.824 -1.125 -1.449 -1.631 -1.965 -2.219 -2.448 -2.683 -3.173 -3.459 -3.769 -4.142 -4.576 -5.096 -5.786 -8.032 -3 ,17266 ,TETRA ,17585263,Sat Nov 27 12:34:46 CET,Sat Nov 27 14:44:00 CET,0.0 1.003 1.413 1.76 2.035 2.275 2.484 2.663 3.013 3.188 3.341 3.468 3.751 3.882 4.115 4.342 4.578 4.687 4.88 5.07 5.34 5.512 5.672 5.902 6.128 6.342 6.556 6.754 7.014 7.279 7.52 7.803 8.079 8.356 8.684 9.043 9.364 9.722 10.102 10.465 10.836 11.23 11.673 12.095 12.546 13.011 13.492 13.985 14.432 14.763 14.832 14.384 13.715 12.995 12.297 11.591 10.908 10.259 9.686 9.122 8.63 8.18 7.751 7.326 6.922 6.531 6.116 5.738 5.392 5.035 4.679 4.379 4.056 3.712 3.434 3.131 2.837 2.55 2.228 2.0 1.765 1.391 1.139 0.883 0.75 0.472 0.156 -0.173 -0.346 -0.674 -0.921 -1.131 -1.344 -1.806 -2.075 -2.377 -2.722 -3.123 -3.6 -4.317 -6.417 -4 ,8162 ,TETRA ,17585264,Sat Nov 27 12:34:47 CET,Sat Nov 27 14:45:15 CET,0.0 0.926 1.347 1.676 1.954 2.22 2.454 2.671 3.069 3.236 3.391 3.548 3.841 3.995 4.298 4.58 4.849 4.984 5.241 5.498 5.877 6.08 6.253 6.506 6.744 6.97 7.189 7.397 7.662 7.912 8.139 8.396 8.648 8.905 9.203 9.515 9.806 10.124 10.46 10.81 11.172 11.568 11.997 12.41 12.872 13.353 13.896 14.453 15.009 15.479 15.596 15.137 14.412 13.642 12.923 12.223 11.576 10.967 10.413 9.838 9.307 8.843 8.404 7.976 7.582 7.21 6.8 6.423 6.094 5.751 5.373 5.035 4.669 4.3 4.031 3.757 3.46 3.16 2.855 2.633 2.38 1.971 1.695 1.412 1.261 0.944 0.613 0.267 0.088 -0.247 -0.556 -0.805 -1.054 -1.648 -1.972 -2.311 -2.679 -3.103 -3.68 -4.421 -6.5 -5 ,20231 ,TETRA ,17585265,Sat Nov 27 12:35:47 CET,Sat Nov 27 14:42:58 CET,0.0 0.801 1.123 1.396 1.631 1.853 2.062 2.271 2.654 2.814 2.963 3.086 3.359 3.492 3.736 3.963 4.187 4.292 4.496 4.698 4.979 5.147 5.31 5.555 5.8 6.027 6.245 6.45 6.694 6.929 7.158 7.444 7.722 7.98 8.269 8.584 8.876 9.19 9.526 9.869 10.222 10.61 11.063 11.533 12.035 12.562 13.104 13.609 14.08 14.451 14.469 13.899 13.155 12.385 11.602 10.83 10.129 9.49 8.913 8.299 7.764 7.273 6.797 6.342 5.889 5.466 5.031 4.648 4.321 3.98 3.614 3.299 2.951 2.584 2.302 2.019 1.732 1.429 1.115 0.897 0.664 0.283 -0.002 -0.298 -0.449 -0.762 -1.086 -1.426 -1.603 -1.937 -2.204 -2.424 -2.646 -3.131 -3.416 -3.739 -4.088 -4.466 -4.902 -5.523 -7.575 -6 ,13511 ,TETRA ,17585266,Sat Nov 27 12:35:47 CET,Sat Nov 27 14:45:19 CET,0.0 0.995 1.389 1.693 1.949 2.178 2.395 2.588 2.93 3.086 3.229 3.341 3.609 3.737 3.97 4.19 4.408 4.518 4.724 4.92 5.201 5.373 5.533 5.755 5.977 6.203 6.412 6.608 6.874 7.121 7.35 7.633 7.915 8.187 8.48 8.801 9.112 9.441 9.779 10.16 10.552 10.955 11.401 11.824 12.287 12.759 13.266 13.761 14.178 14.445 14.431 13.953 13.269 12.499 11.752 11.059 10.415 9.792 9.225 8.649 8.155 7.706 7.26 6.826 6.429 6.054 5.643 5.26 4.928 4.609 4.277 3.977 3.673 3.364 3.118 2.854 2.578 2.298 1.983 1.75 1.517 1.16 0.905 0.651 0.515 0.204 -0.114 -0.43 -0.594 -0.92 -1.172 -1.373 -1.598 -2.075 -2.312 -2.576 -2.892 -3.284 -3.788 -4.44 -6.318 -7 ,9485 ,TETRA ,17585267,Sat Nov 27 12:35:47 CET,Sat Nov 27 14:44:23 CET,0.0 1.048 1.4 1.715 1.988 2.222 2.443 2.645 2.988 3.15 3.304 3.458 3.746 3.872 4.112 4.345 4.565 4.672 4.883 5.084 5.375 5.554 5.726 5.979 6.214 6.44 6.661 6.868 7.123 7.373 7.615 7.904 8.165 8.418 8.721 9.032 9.314 9.635 10.011 10.397 10.764 11.165 11.632 12.088 12.599 13.125 13.651 14.131 14.575 14.966 15.039 14.498 13.769 13.0 12.255 11.544 10.894 10.263 9.681 9.089 8.554 8.049 7.575 7.133 6.723 6.339 5.93 5.558 5.207 4.826 4.449 4.121 3.769 3.429 3.159 2.846 2.503 2.165 1.836 1.611 1.375 1.009 0.757 0.492 0.345 0.024 -0.315 -0.687 -0.887 -1.241 -1.518 -1.75 -1.987 -2.484 -2.762 -3.081 -3.44 -3.827 -4.326 -4.933 -6.785 -8 ,2055 ,TETRA ,17585268,Sat Nov 27 12:36:46 CET,Sat Nov 27 14:45:09 CET,0.0 0.867 1.219 1.515 1.779 2.016 2.221 2.409 2.739 2.894 3.034 3.172 3.462 3.596 3.852 4.095 4.315 4.423 4.622 4.81 5.1 5.28 5.45 5.706 5.934 6.155 6.366 6.562 6.816 7.066 7.304 7.583 7.849 8.101 8.391 8.722 9.045 9.399 9.762 10.111 10.471 10.88 11.327 11.75 12.235 12.726 13.226 13.757 14.27 14.634 14.672 14.151 13.378 12.555 11.766 10.995 10.256 9.556 8.908 8.232 7.65 7.13 6.662 6.23 5.794 5.358 4.896 4.489 4.12 3.731 3.332 3.009 2.665 2.28 1.985 1.684 1.371 1.044 0.693 0.45 0.202 -0.2 -0.468 -0.727 -0.861 -1.149 -1.463 -1.777 -1.95 -2.292 -2.542 -2.753 -2.968 -3.441 -3.704 -4.01 -4.361 -4.759 -5.221 -5.83 -8.033 -9 ,14108 ,TETRA ,17585269,Sat Nov 27 12:36:47 CET,Sat Nov 27 14:45:33 CET,0.0 0.974 1.391 1.696 1.963 2.211 2.427 2.625 2.974 3.14 3.296 3.424 3.689 3.806 4.046 4.269 4.475 4.573 4.766 4.955 5.221 5.403 5.579 5.827 6.062 6.282 6.494 6.689 6.947 7.209 7.467 7.779 8.072 8.347 8.644 8.962 9.263 9.597 9.953 10.315 10.688 11.104 11.563 12.007 12.508 13.022 13.546 14.048 14.541 14.872 14.816 14.307 13.574 12.796 12.052 11.308 10.639 10.018 9.466 8.888 8.357 7.88 7.412 6.962 6.544 6.141 5.706 5.33 5.013 4.678 4.305 3.977 3.653 3.329 3.073 2.8 2.512 2.212 1.903 1.682 1.452 1.099 0.851 0.596 0.457 0.157 -0.165 -0.502 -0.676 -0.997 -1.23 -1.457 -1.696 -2.164 -2.419 -2.699 -3.008 -3.374 -3.871 -4.559 -6.843 -10 ,17839 ,TETRA ,17585270,Sat Nov 27 12:36:47 CET,Sat Nov 27 14:45:49 CET,0.0 1.317 1.711 1.984 2.229 2.448 2.641 2.813 3.151 3.318 3.47 3.587 3.856 3.982 4.231 4.465 4.687 4.791 4.983 5.167 5.435 5.613 5.786 6.054 6.313 6.53 6.743 6.959 7.222 7.459 7.688 7.958 8.227 8.484 8.769 9.09 9.383 9.699 10.034 10.373 10.725 11.109 11.547 11.958 12.392 12.868 13.406 13.954 14.479 14.905 14.936 14.402 13.649 12.836 12.063 11.356 10.714 10.095 9.52 8.917 8.371 7.885 7.433 6.997 6.571 6.186 5.786 5.41 5.079 4.727 4.36 4.059 3.738 3.395 3.129 2.841 2.542 2.241 1.92 1.694 1.471 1.137 0.902 0.659 0.528 0.229 -0.1 -0.439 -0.615 -0.951 -1.209 -1.426 -1.654 -2.168 -2.457 -2.759 -3.1 -3.497 -3.932 -4.476 -6.143 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt deleted file mode 100644 index ec25eaaf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2837 ,TETRA ,17585271,Sat Nov 27 12:36:47 CET,Sat Nov 27 14:45:03 CET,0.0 2.512 3.108 3.582 4.004 4.377 4.704 4.996 5.518 5.756 5.962 6.189 6.523 6.712 7.036 7.327 7.617 7.753 8.009 8.262 8.614 8.85 9.089 9.434 9.763 10.075 10.363 10.641 11.003 11.349 11.688 12.073 12.435 12.786 13.185 13.641 14.072 14.544 15.054 15.577 16.104 16.688 17.359 18.022 18.744 19.498 20.348 21.09 21.71 22.381 22.684 21.944 20.848 19.744 18.694 17.761 16.958 16.171 15.426 14.649 13.993 13.405 12.803 12.241 11.728 11.249 10.738 10.281 9.906 9.511 9.091 8.766 8.444 8.095 7.814 7.515 7.197 6.864 6.515 6.286 6.067 5.713 5.452 5.163 5.014 4.712 4.388 4.052 3.887 3.574 3.341 3.15 2.946 2.467 2.191 1.883 1.554 1.184 0.765 0.219 -1.592 -2 ,7995 ,TETRA ,17585272,Sat Nov 27 12:37:49 CET,Sat Nov 27 14:41:48 CET,0.0 2.588 3.236 3.71 4.131 4.473 4.768 5.068 5.627 5.86 6.083 6.426 6.802 6.983 7.325 7.66 7.983 8.134 8.416 8.693 9.08 9.318 9.547 9.88 10.212 10.521 10.807 11.088 11.446 11.78 12.089 12.478 12.853 13.211 13.636 14.117 14.561 15.024 15.511 16.019 16.545 17.141 17.808 18.452 19.175 19.895 20.641 21.355 22.065 22.606 22.533 21.644 20.604 19.562 18.518 17.523 16.633 15.786 15.027 14.277 13.62 13.032 12.463 11.915 11.42 10.961 10.473 10.041 9.677 9.302 8.917 8.596 8.26 7.917 7.642 7.344 7.045 6.737 6.401 6.162 5.91 5.502 5.226 4.936 4.784 4.47 4.149 3.827 3.662 3.325 3.072 2.879 2.672 2.183 1.931 1.66 1.324 0.935 0.462 -0.199 -2.363 -3 ,6574 ,TETRA ,17585273,Sat Nov 27 12:37:49 CET,Sat Nov 27 14:46:13 CET,0.0 2.37 3.04 3.523 3.912 4.254 4.569 4.849 5.341 5.565 5.776 6.047 6.385 6.564 6.907 7.233 7.549 7.703 7.996 8.269 8.652 8.896 9.131 9.467 9.793 10.112 10.399 10.672 11.04 11.384 11.722 12.133 12.509 12.868 13.278 13.748 14.196 14.677 15.215 15.777 16.356 16.968 17.62 18.259 18.941 19.629 20.344 21.035 21.694 22.175 22.096 21.115 19.969 18.914 17.874 16.904 15.983 15.099 14.369 13.607 12.935 12.354 11.761 11.182 10.674 10.231 9.748 9.299 8.92 8.519 8.116 7.783 7.434 7.062 6.761 6.447 6.118 5.772 5.418 5.182 4.945 4.592 4.322 4.014 3.859 3.561 3.259 2.929 2.752 2.414 2.134 1.913 1.678 1.147 0.866 0.558 0.209 -0.193 -0.698 -1.367 -3.25 -4 ,11903 ,TETRA ,17585274,Sat Nov 27 12:37:49 CET,Sat Nov 27 14:33:20 CET,0.0 2.059 2.769 3.297 3.752 4.134 4.462 4.753 5.298 5.539 5.761 6.041 6.387 6.578 6.944 7.285 7.591 7.735 8.022 8.294 8.678 8.925 9.171 9.523 9.845 10.141 10.42 10.701 11.061 11.401 11.746 12.189 12.613 12.996 13.426 13.914 14.383 14.896 15.449 16.022 16.625 17.317 18.095 18.843 19.645 20.435 21.283 22.157 22.998 23.63 23.699 23.001 21.912 20.65 19.463 18.355 17.351 16.433 15.65 14.836 14.111 13.464 12.832 12.231 11.651 11.107 10.535 10.026 9.598 9.161 8.706 8.314 7.912 7.504 7.181 6.839 6.471 6.09 5.712 5.447 5.171 4.763 4.481 4.172 4.01 3.682 3.331 2.962 2.77 2.42 2.134 1.888 1.638 1.143 0.857 0.545 0.206 -0.23 -0.729 -1.287 -2.83 -5 ,1136 ,TETRA ,17585275,Sat Nov 27 12:37:49 CET,Sat Nov 27 14:49:58 CET,0.0 2.452 3.057 3.535 3.961 4.334 4.669 4.959 5.441 5.677 5.905 6.19 6.528 6.718 7.079 7.423 7.751 7.901 8.192 8.482 8.897 9.164 9.421 9.802 10.168 10.49 10.777 11.058 11.436 11.797 12.145 12.562 12.953 13.3 13.684 14.117 14.552 15.045 15.568 16.112 16.652 17.252 17.978 18.694 19.468 20.305 21.211 22.146 23.024 23.649 23.816 23.324 22.552 21.68 20.733 19.82 18.949 18.062 17.279 16.491 15.809 15.208 14.655 14.122 13.601 13.106 12.575 12.104 11.694 11.241 10.779 10.408 10.016 9.601 9.27 8.937 8.599 8.238 7.865 7.612 7.349 6.936 6.65 6.354 6.196 5.878 5.567 5.238 5.062 4.726 4.444 4.213 3.99 3.479 3.176 2.869 2.555 2.177 1.709 1.034 -0.906 -6 ,311 ,TETRA ,17585276,Sat Nov 27 12:38:46 CET,Sat Nov 27 14:52:29 CET,0.0 1.915 2.451 2.92 3.354 3.727 4.054 4.34 4.844 5.081 5.309 5.573 5.916 6.105 6.486 6.838 7.162 7.319 7.607 7.872 8.257 8.502 8.75 9.116 9.446 9.766 10.072 10.365 10.744 11.094 11.421 11.822 12.228 12.613 13.046 13.513 13.963 14.464 14.964 15.49 16.04 16.639 17.364 18.064 18.797 19.611 20.529 21.425 22.203 22.754 22.981 22.649 21.901 20.937 19.983 19.022 18.104 17.276 16.552 15.802 15.176 14.595 13.994 13.438 12.927 12.421 11.881 11.418 11.015 10.583 10.148 9.804 9.438 9.067 8.775 8.469 8.158 7.827 7.479 7.237 6.979 6.599 6.355 6.075 5.924 5.621 5.307 4.967 4.8 4.476 4.216 4.003 3.77 3.201 2.86 2.493 2.124 1.739 1.219 0.509 -1.316 -7 ,25798 ,TETRA ,17585277,Sat Nov 27 12:38:46 CET,Sat Nov 27 14:44:29 CET,0.0 2.308 2.976 3.496 3.914 4.25 4.549 4.846 5.376 5.606 5.832 6.085 6.412 6.603 6.964 7.289 7.58 7.717 7.999 8.276 8.659 8.896 9.13 9.479 9.801 10.103 10.396 10.673 11.027 11.375 11.707 12.121 12.521 12.893 13.31 13.765 14.195 14.672 15.178 15.708 16.248 16.857 17.553 18.227 18.995 19.822 20.766 21.669 22.574 23.501 24.136 23.839 23.012 21.976 20.897 19.936 19.093 18.24 17.474 16.711 16.037 15.433 14.863 14.308 13.789 13.31 12.798 12.367 12.003 11.606 11.188 10.836 10.471 10.097 9.797 9.504 9.19 8.832 8.477 8.247 8.006 7.613 7.342 7.069 6.922 6.618 6.309 5.964 5.778 5.436 5.159 4.932 4.698 4.144 3.853 3.53 3.164 2.764 2.304 1.657 -0.309 -8 ,22363 ,TETRA ,17585278,Sat Nov 27 12:38:46 CET,Sat Nov 27 14:35:54 CET,0.0 2.399 3.076 3.555 3.954 4.299 4.598 4.873 5.399 5.628 5.835 6.11 6.46 6.648 7.0 7.322 7.629 7.775 8.05 8.325 8.728 8.977 9.213 9.552 9.874 10.182 10.478 10.769 11.152 11.521 11.868 12.27 12.651 13.01 13.431 13.908 14.352 14.822 15.309 15.831 16.369 16.95 17.632 18.311 19.056 19.84 20.677 21.548 22.424 23.097 23.165 22.471 21.555 20.587 19.672 18.689 17.792 17.037 16.392 15.705 15.074 14.493 13.921 13.357 12.833 12.345 11.838 11.411 11.049 10.664 10.247 9.896 9.51 9.102 8.785 8.472 8.157 7.832 7.507 7.282 7.05 6.673 6.402 6.122 5.981 5.692 5.368 4.994 4.794 4.443 4.16 3.946 3.739 3.239 2.938 2.618 2.263 1.819 1.286 0.671 -1.371 -9 ,21241 ,TETRA ,17585279,Sat Nov 27 12:39:47 CET,Sat Nov 27 14:48:33 CET,0.0 2.139 2.727 3.213 3.615 3.991 4.342 4.653 5.167 5.396 5.622 5.9 6.24 6.433 6.795 7.123 7.447 7.602 7.895 8.18 8.596 8.852 9.086 9.427 9.749 10.053 10.349 10.635 11.006 11.358 11.689 12.091 12.471 12.844 13.261 13.715 14.158 14.633 15.119 15.627 16.154 16.722 17.382 17.993 18.649 19.353 20.111 20.79 21.326 21.758 21.668 20.803 19.719 18.568 17.466 16.438 15.513 14.668 13.906 13.102 12.409 11.785 11.195 10.629 10.12 9.669 9.197 8.786 8.429 8.047 7.641 7.306 6.961 6.595 6.301 6.007 5.716 5.405 5.072 4.834 4.583 4.206 3.95 3.67 3.516 3.186 2.825 2.465 2.281 1.94 1.669 1.443 1.201 0.704 0.43 0.113 -0.226 -0.632 -1.114 -1.776 -4.145 -10 ,2327 ,TETRA ,17585280,Sat Nov 27 12:39:46 CET,Sat Nov 27 14:47:52 CET,0.0 2.807 3.419 3.885 4.256 4.605 4.918 5.202 5.733 5.979 6.204 6.466 6.809 6.989 7.346 7.713 8.055 8.219 8.533 8.821 9.206 9.441 9.675 10.02 10.364 10.7 11.012 11.304 11.688 12.061 12.416 12.826 13.221 13.608 14.056 14.566 15.022 15.509 16.036 16.568 17.102 17.66 18.237 18.799 19.51 20.373 21.379 22.42 23.41 24.126 24.184 23.241 21.962 20.772 19.787 18.873 17.994 17.184 16.467 15.733 15.106 14.55 14.001 13.486 13.003 12.532 12.009 11.54 11.134 10.711 10.293 9.931 9.531 9.106 8.778 8.444 8.087 7.719 7.344 7.09 6.828 6.398 6.093 5.779 5.621 5.311 4.982 4.625 4.44 4.09 3.816 3.609 3.398 2.893 2.6 2.319 1.989 1.571 1.038 0.279 -2.113 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt deleted file mode 100644 index 0299bfc0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18089 ,TETRA ,17585281,Sat Nov 27 12:39:47 CET,Sat Nov 27 14:48:23 CET,0.0 0.985 1.36 1.671 1.913 2.109 2.291 2.467 2.785 2.944 3.098 3.233 3.477 3.608 3.848 4.065 4.264 4.357 4.538 4.71 4.969 5.139 5.299 5.523 5.737 5.952 6.149 6.341 6.583 6.798 6.986 7.215 7.45 7.678 7.943 8.241 8.5 8.762 9.038 9.325 9.628 9.959 10.325 10.68 11.061 11.398 11.694 11.926 12.095 12.009 11.314 9.949 8.591 7.399 6.312 5.279 4.324 3.497 2.786 2.049 1.422 0.875 0.375 -0.113 -0.583 -1.006 -1.452 -1.86 -2.221 -2.586 -2.96 -3.27 -3.591 -3.935 -4.208 -4.478 -4.742 -5.016 -5.326 -5.553 -5.787 -6.166 -6.413 -6.654 -6.784 -7.048 -7.324 -7.619 -7.782 -8.094 -8.28 -8.461 -8.66 -9.105 -9.375 -9.656 -9.923 -10.221 -10.605 -11.094 -12.758 -2 ,12941 ,TETRA ,17585282,Sat Nov 27 12:40:48 CET,Sat Nov 27 14:49:10 CET,0.0 1.102 1.486 1.798 2.058 2.289 2.494 2.67 3.028 3.197 3.347 3.52 3.783 3.924 4.176 4.402 4.605 4.702 4.89 5.055 5.278 5.424 5.568 5.781 5.992 6.186 6.375 6.56 6.787 7.008 7.224 7.477 7.714 7.927 8.155 8.414 8.669 8.943 9.244 9.552 9.842 10.155 10.521 10.872 11.202 11.511 11.876 12.199 12.404 12.342 11.716 10.628 9.541 8.469 7.531 6.717 5.943 5.205 4.584 3.95 3.402 2.928 2.43 1.946 1.516 1.095 0.662 0.295 -0.042 -0.401 -0.775 -1.089 -1.401 -1.703 -1.94 -2.187 -2.439 -2.7 -2.986 -3.203 -3.422 -3.762 -4.006 -4.244 -4.361 -4.638 -4.929 -5.218 -5.379 -5.693 -5.911 -6.1 -6.322 -6.811 -7.075 -7.362 -7.663 -7.972 -8.338 -8.803 -10.047 -3 ,28966 ,TETRA ,17585283,Sat Nov 27 12:40:51 CET,Sat Nov 27 14:49:33 CET,0.0 0.946 1.379 1.691 1.94 2.165 2.36 2.535 2.863 2.998 3.137 3.283 3.532 3.663 3.909 4.133 4.337 4.433 4.61 4.783 5.038 5.196 5.342 5.551 5.754 5.949 6.141 6.327 6.556 6.781 6.99 7.235 7.489 7.731 7.986 8.25 8.495 8.768 9.05 9.339 9.654 9.988 10.353 10.697 11.055 11.397 11.688 11.892 11.991 11.893 11.327 10.306 9.118 7.904 6.827 5.869 5.018 4.21 3.487 2.733 2.086 1.543 1.032 0.552 0.104 -0.321 -0.773 -1.15 -1.477 -1.84 -2.229 -2.556 -2.887 -3.224 -3.487 -3.765 -4.056 -4.357 -4.659 -4.864 -5.073 -5.427 -5.69 -5.94 -6.065 -6.333 -6.622 -6.932 -7.091 -7.393 -7.608 -7.795 -8.012 -8.535 -8.812 -9.087 -9.37 -9.711 -10.161 -10.76 -12.356 -4 ,25556 ,TETRA ,17585284,Sat Nov 27 12:40:53 CET,Sat Nov 27 14:48:31 CET,0.0 0.96 1.309 1.608 1.859 2.075 2.266 2.424 2.683 2.807 2.929 3.039 3.267 3.368 3.561 3.768 3.962 4.049 4.228 4.405 4.654 4.803 4.943 5.16 5.367 5.553 5.738 5.914 6.126 6.333 6.534 6.776 7.016 7.234 7.473 7.736 7.992 8.271 8.555 8.844 9.149 9.486 9.868 10.221 10.56 10.893 11.249 11.554 11.686 11.54 10.983 9.887 8.788 7.698 6.648 5.697 4.836 4.051 3.38 2.698 2.104 1.58 1.061 0.574 0.132 -0.282 -0.71 -1.079 -1.41 -1.782 -2.181 -2.51 -2.83 -3.167 -3.447 -3.755 -4.063 -4.361 -4.664 -4.871 -5.095 -5.456 -5.694 -5.934 -6.061 -6.331 -6.624 -6.944 -7.116 -7.429 -7.669 -7.863 -8.072 -8.555 -8.809 -9.092 -9.424 -9.774 -10.185 -10.674 -12.488 -5 ,11521 ,TETRA ,17585285,Sat Nov 27 12:41:50 CET,Sat Nov 27 14:49:23 CET,0.0 0.841 1.234 1.573 1.84 2.081 2.292 2.47 2.76 2.889 3.017 3.141 3.379 3.505 3.751 3.974 4.182 4.287 4.478 4.643 4.876 5.024 5.18 5.418 5.635 5.851 6.045 6.216 6.458 6.687 6.897 7.141 7.366 7.597 7.869 8.157 8.424 8.69 8.956 9.244 9.534 9.842 10.181 10.514 10.871 11.191 11.448 11.626 11.769 11.703 11.066 9.939 8.805 7.654 6.569 5.565 4.644 3.798 3.044 2.264 1.592 1.021 0.502 0.013 -0.442 -0.859 -1.309 -1.717 -2.077 -2.447 -2.822 -3.127 -3.439 -3.765 -4.029 -4.303 -4.585 -4.876 -5.183 -5.401 -5.63 -6.0 -6.262 -6.535 -6.668 -6.923 -7.194 -7.481 -7.636 -7.934 -8.149 -8.357 -8.575 -9.003 -9.231 -9.483 -9.795 -10.193 -10.613 -11.075 -12.258 -6 ,9696 ,TETRA ,17585286,Sat Nov 27 12:41:48 CET,Sat Nov 27 14:50:47 CET,0.0 0.989 1.359 1.619 1.825 2.024 2.201 2.37 2.684 2.822 2.95 3.069 3.309 3.423 3.667 3.896 4.102 4.201 4.389 4.574 4.848 5.02 5.178 5.403 5.608 5.798 5.974 6.142 6.357 6.561 6.763 7.015 7.245 7.448 7.682 7.942 8.179 8.433 8.717 8.992 9.277 9.601 9.923 10.22 10.564 10.912 11.199 11.39 11.477 11.315 10.621 9.447 8.228 7.105 6.076 5.083 4.204 3.435 2.755 2.019 1.405 0.894 0.39 -0.093 -0.541 -0.962 -1.405 -1.786 -2.129 -2.497 -2.868 -3.184 -3.517 -3.851 -4.106 -4.38 -4.664 -4.948 -5.232 -5.431 -5.639 -5.972 -6.202 -6.435 -6.558 -6.825 -7.116 -7.429 -7.587 -7.872 -8.056 -8.252 -8.472 -8.913 -9.16 -9.428 -9.72 -10.075 -10.533 -11.136 -12.851 -7 ,31125 ,TETRA ,17585287,Sat Nov 27 12:41:50 CET,Sat Nov 27 14:50:08 CET,0.0 0.913 1.334 1.638 1.893 2.109 2.316 2.502 2.826 2.984 3.139 3.298 3.547 3.672 3.907 4.117 4.315 4.415 4.609 4.785 5.029 5.183 5.327 5.538 5.745 5.943 6.13 6.31 6.549 6.772 6.976 7.223 7.461 7.682 7.92 8.197 8.461 8.723 8.992 9.283 9.588 9.905 10.251 10.587 10.96 11.318 11.623 11.877 12.092 12.139 11.757 10.83 9.774 8.726 7.76 6.866 6.009 5.202 4.538 3.872 3.282 2.736 2.2 1.69 1.217 0.802 0.367 -0.033 -0.393 -0.781 -1.195 -1.54 -1.885 -2.221 -2.474 -2.746 -3.02 -3.297 -3.595 -3.806 -4.025 -4.369 -4.613 -4.88 -5.022 -5.289 -5.568 -5.9 -6.075 -6.376 -6.593 -6.772 -6.955 -7.411 -7.655 -7.906 -8.204 -8.554 -8.968 -9.55 -11.31 -8 ,1728 ,TETRA ,17585288,Sat Nov 27 12:41:50 CET,Sat Nov 27 14:53:27 CET,0.0 1.126 1.515 1.797 2.031 2.258 2.488 2.695 3.046 3.214 3.375 3.54 3.794 3.918 4.156 4.39 4.61 4.713 4.899 5.084 5.342 5.49 5.631 5.832 6.023 6.217 6.397 6.562 6.774 6.973 7.161 7.386 7.602 7.801 8.028 8.301 8.55 8.802 9.081 9.367 9.655 9.959 10.285 10.596 10.945 11.288 11.582 11.787 11.882 11.71 11.018 9.797 8.537 7.388 6.282 5.288 4.415 3.601 2.904 2.224 1.631 1.065 0.533 0.025 -0.455 -0.883 -1.341 -1.746 -2.099 -2.462 -2.816 -3.119 -3.455 -3.806 -4.068 -4.335 -4.607 -4.905 -5.211 -5.425 -5.663 -6.019 -6.256 -6.5 -6.622 -6.897 -7.197 -7.5 -7.661 -7.967 -8.18 -8.372 -8.565 -8.949 -9.177 -9.451 -9.758 -10.092 -10.454 -10.956 -12.839 -9 ,29632 ,TETRA ,17585289,Sat Nov 27 12:41:50 CET,Sat Nov 27 14:50:46 CET,0.0 1.227 1.607 1.869 2.106 2.333 2.528 2.701 3.018 3.174 3.323 3.481 3.728 3.845 4.053 4.255 4.457 4.552 4.731 4.902 5.156 5.313 5.453 5.655 5.85 6.039 6.216 6.385 6.598 6.806 7.004 7.235 7.461 7.673 7.904 8.164 8.416 8.689 8.982 9.268 9.536 9.841 10.182 10.474 10.802 11.151 11.474 11.733 11.89 11.824 11.194 9.949 8.793 7.766 6.738 5.77 4.933 4.156 3.476 2.787 2.207 1.69 1.177 0.675 0.194 -0.225 -0.644 -1.018 -1.345 -1.696 -2.056 -2.355 -2.681 -3.01 -3.255 -3.51 -3.778 -4.074 -4.378 -4.578 -4.788 -5.131 -5.372 -5.619 -5.747 -6.023 -6.31 -6.616 -6.773 -7.07 -7.302 -7.491 -7.681 -8.085 -8.294 -8.561 -8.885 -9.218 -9.611 -10.137 -11.489 -10 ,18766 ,TETRA ,17585290,Sat Nov 27 12:41:50 CET,Sat Nov 27 14:50:30 CET,0.0 0.89 1.295 1.624 1.915 2.139 2.331 2.505 2.841 2.998 3.138 3.272 3.519 3.645 3.873 4.088 4.286 4.381 4.557 4.727 4.99 5.155 5.304 5.512 5.717 5.919 6.117 6.296 6.502 6.698 6.891 7.13 7.367 7.579 7.798 8.044 8.292 8.559 8.835 9.123 9.409 9.702 10.024 10.335 10.668 10.979 11.28 11.532 11.634 11.527 10.968 9.793 8.655 7.543 6.47 5.488 4.648 3.878 3.17 2.476 1.895 1.38 0.886 0.418 0.0 -0.377 -0.779 -1.153 -1.499 -1.862 -2.227 -2.526 -2.836 -3.164 -3.418 -3.703 -4.01 -4.332 -4.665 -4.871 -5.085 -5.424 -5.665 -5.933 -6.072 -6.365 -6.671 -6.975 -7.132 -7.431 -7.646 -7.832 -8.033 -8.463 -8.689 -8.926 -9.201 -9.54 -9.885 -10.293 -11.651 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 6cba508e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18677 ,TETRA ,17585291,Sat Nov 27 12:42:47 CET,Sat Nov 27 14:52:00 CET,0.0 1.023 1.441 1.732 2.015 2.288 2.514 2.73 3.1 3.256 3.413 3.593 3.848 3.975 4.199 4.416 4.638 4.745 4.938 5.12 5.388 5.563 5.734 5.972 6.202 6.431 6.651 6.859 7.13 7.387 7.62 7.912 8.189 8.443 8.738 9.066 9.387 9.729 10.082 10.441 10.803 11.197 11.629 12.044 12.491 12.966 13.515 14.089 14.669 15.164 15.434 15.09 14.341 13.56 12.87 12.247 11.657 11.067 10.464 9.804 9.244 8.76 8.326 7.943 7.579 7.23 6.879 6.55 6.263 5.966 5.654 5.386 5.096 4.795 4.559 4.318 4.084 3.841 3.549 3.345 3.143 2.82 2.598 2.374 2.257 2.016 1.774 1.506 1.359 1.088 0.88 0.705 0.528 0.125 -0.112 -0.358 -0.595 -0.865 -1.216 -1.663 -2.635 -2 ,18837 ,TETRA ,17585292,Sat Nov 27 12:42:47 CET,Sat Nov 27 14:51:32 CET,0.0 0.85 1.162 1.416 1.648 1.864 2.055 2.225 2.559 2.716 2.868 3.035 3.292 3.415 3.643 3.87 4.097 4.207 4.404 4.584 4.851 5.016 5.17 5.399 5.627 5.861 6.089 6.298 6.574 6.831 7.072 7.366 7.659 7.936 8.246 8.602 8.923 9.259 9.633 10.024 10.415 10.835 11.291 11.768 12.302 12.855 13.448 13.983 14.468 14.844 15.006 14.66 14.063 13.357 12.638 11.983 11.401 10.815 10.273 9.744 9.284 8.858 8.448 8.05 7.664 7.318 6.963 6.638 6.356 6.055 5.733 5.474 5.207 4.939 4.738 4.521 4.295 4.054 3.796 3.618 3.433 3.148 2.944 2.736 2.63 2.387 2.126 1.853 1.72 1.462 1.272 1.109 0.937 0.583 0.384 0.143 -0.114 -0.386 -0.761 -1.343 -2.979 -3 ,28694 ,TETRA ,17585293,Sat Nov 27 12:43:49 CET,Sat Nov 27 14:36:28 CET,0.0 1.118 1.491 1.746 1.955 2.128 2.304 2.499 2.848 2.987 3.128 3.282 3.53 3.655 3.89 4.112 4.316 4.413 4.596 4.761 5.012 5.188 5.363 5.608 5.829 6.039 6.255 6.464 6.714 6.949 7.177 7.451 7.719 7.977 8.289 8.644 8.959 9.298 9.655 10.025 10.394 10.796 11.268 11.713 12.206 12.741 13.303 13.922 14.524 14.985 15.089 14.612 13.92 13.188 12.512 11.839 11.21 10.6 10.047 9.492 9.005 8.566 8.143 7.745 7.366 7.018 6.654 6.324 6.035 5.757 5.47 5.212 4.945 4.673 4.452 4.218 3.974 3.713 3.448 3.276 3.099 2.81 2.618 2.418 2.307 2.073 1.815 1.525 1.384 1.133 0.976 0.83 0.663 0.263 0.052 -0.162 -0.402 -0.71 -1.092 -1.568 -2.629 -4 ,21440 ,TETRA ,17585294,Sat Nov 27 12:43:49 CET,Sat Nov 27 14:50:55 CET,0.0 0.767 1.149 1.513 1.816 2.045 2.255 2.449 2.802 2.961 3.102 3.254 3.504 3.631 3.89 4.131 4.357 4.469 4.67 4.859 5.125 5.293 5.467 5.721 5.958 6.195 6.423 6.635 6.904 7.157 7.406 7.709 7.994 8.265 8.579 8.941 9.298 9.677 10.054 10.437 10.824 11.255 11.741 12.216 12.765 13.343 13.949 14.539 15.11 15.628 15.891 15.627 15.075 14.36 13.675 13.041 12.455 11.865 11.319 10.769 10.288 9.861 9.444 9.051 8.66 8.285 7.917 7.6 7.306 6.999 6.687 6.416 6.142 5.864 5.637 5.389 5.131 4.866 4.597 4.423 4.242 3.944 3.735 3.516 3.393 3.124 2.86 2.615 2.489 2.222 2.023 1.851 1.676 1.279 1.063 0.815 0.506 0.178 -0.169 -0.605 -2.057 -5 ,11483 ,TETRA ,17585295,Sat Nov 27 12:44:47 CET,Sat Nov 27 14:35:00 CET,0.0 0.927 1.363 1.68 1.951 2.19 2.381 2.561 2.888 3.03 3.17 3.311 3.554 3.686 3.938 4.166 4.367 4.469 4.681 4.868 5.141 5.323 5.486 5.72 5.952 6.169 6.381 6.597 6.872 7.138 7.387 7.677 7.946 8.199 8.503 8.828 9.138 9.482 9.833 10.186 10.55 10.968 11.416 11.81 12.271 12.758 13.286 13.81 14.24 14.456 14.329 13.709 12.943 12.203 11.46 10.726 10.058 9.455 8.926 8.364 7.866 7.406 6.976 6.584 6.21 5.872 5.521 5.202 4.913 4.602 4.284 4.012 3.717 3.418 3.192 2.957 2.705 2.45 2.187 2.0 1.802 1.486 1.266 1.049 0.939 0.695 0.428 0.143 0.01 -0.247 -0.432 -0.589 -0.766 -1.158 -1.378 -1.63 -1.896 -2.201 -2.57 -3.021 -4.056 -6 ,24851 ,TETRA ,17585296,Sat Nov 27 12:44:47 CET,Sat Nov 27 14:33:35 CET,0.0 1.318 1.762 2.095 2.394 2.655 2.879 3.082 3.463 3.626 3.773 3.929 4.172 4.289 4.52 4.76 4.98 5.084 5.279 5.461 5.721 5.878 6.038 6.268 6.486 6.702 6.903 7.101 7.365 7.608 7.835 8.117 8.381 8.628 8.919 9.265 9.59 9.925 10.263 10.61 10.994 11.413 11.881 12.312 12.778 13.275 13.816 14.389 14.904 15.309 15.31 14.746 14.008 13.183 12.45 11.775 11.123 10.554 10.078 9.552 9.083 8.665 8.248 7.837 7.452 7.103 6.742 6.414 6.128 5.837 5.533 5.27 4.996 4.725 4.516 4.276 4.016 3.759 3.491 3.305 3.108 2.793 2.575 2.356 2.236 1.971 1.715 1.441 1.293 1.034 0.878 0.73 0.571 0.181 -0.055 -0.296 -0.555 -0.868 -1.227 -1.683 -3.08 -7 ,15091 ,TETRA ,17585297,Sat Nov 27 12:44:47 CET,Sat Nov 27 14:53:53 CET,0.0 0.978 1.363 1.644 1.899 2.106 2.285 2.456 2.753 2.896 3.036 3.181 3.438 3.568 3.809 4.05 4.28 4.383 4.573 4.77 5.039 5.204 5.37 5.607 5.827 6.041 6.247 6.438 6.679 6.921 7.157 7.43 7.693 7.944 8.235 8.568 8.877 9.213 9.582 9.966 10.35 10.766 11.226 11.655 12.139 12.63 13.112 13.621 14.149 14.6 14.632 14.037 13.337 12.637 11.959 11.3 10.674 10.113 9.621 9.074 8.592 8.173 7.766 7.387 7.032 6.703 6.357 6.047 5.776 5.479 5.165 4.908 4.639 4.347 4.122 3.9 3.663 3.42 3.165 2.972 2.78 2.476 2.271 2.071 1.966 1.741 1.501 1.246 1.106 0.841 0.681 0.53 0.358 -0.008 -0.213 -0.44 -0.711 -1.042 -1.386 -1.875 -3.075 -8 ,30449 ,TETRA ,17585298,Sat Nov 27 12:44:51 CET,Sat Nov 27 14:54:29 CET,0.0 1.07 1.487 1.757 2.003 2.249 2.456 2.628 2.992 3.174 3.333 3.499 3.743 3.857 4.077 4.313 4.532 4.635 4.841 5.027 5.285 5.457 5.631 5.887 6.113 6.313 6.51 6.708 6.962 7.207 7.437 7.703 7.963 8.23 8.553 8.911 9.243 9.594 9.954 10.343 10.762 11.214 11.731 12.226 12.736 13.233 13.775 14.323 14.831 15.168 15.056 14.458 13.701 12.897 12.131 11.44 10.798 10.177 9.63 9.078 8.591 8.146 7.723 7.324 6.938 6.563 6.17 5.83 5.544 5.253 4.93 4.655 4.387 4.115 3.891 3.656 3.415 3.162 2.886 2.689 2.498 2.217 2.017 1.8 1.69 1.473 1.237 0.977 0.83 0.55 0.385 0.227 0.053 -0.354 -0.588 -0.841 -1.104 -1.383 -1.69 -2.076 -3.043 -9 ,2398 ,TETRA ,17585299,Sat Nov 27 12:44:47 CET,Sat Nov 27 14:53:53 CET,0.0 1.063 1.492 1.812 2.055 2.248 2.446 2.64 2.984 3.152 3.318 3.505 3.759 3.88 4.11 4.33 4.528 4.619 4.797 4.973 5.222 5.385 5.548 5.792 6.022 6.24 6.46 6.671 6.942 7.201 7.443 7.74 8.014 8.279 8.588 8.93 9.251 9.598 9.968 10.35 10.749 11.173 11.66 12.145 12.612 13.037 13.466 13.924 14.426 14.819 14.778 14.115 13.339 12.548 11.776 11.062 10.404 9.797 9.256 8.704 8.245 7.842 7.429 7.028 6.658 6.294 5.914 5.578 5.275 4.974 4.672 4.399 4.095 3.769 3.523 3.279 3.021 2.751 2.478 2.291 2.102 1.81 1.607 1.388 1.278 1.042 0.785 0.528 0.388 0.112 -0.068 -0.236 -0.42 -0.843 -1.086 -1.337 -1.616 -1.956 -2.327 -2.747 -4.087 -10 ,22721 ,TETRA ,17585300,Sat Nov 27 12:44:48 CET,Sat Nov 27 14:54:02 CET,0.0 0.877 1.285 1.609 1.887 2.149 2.37 2.558 2.885 3.037 3.196 3.361 3.613 3.74 3.998 4.247 4.47 4.576 4.786 4.983 5.267 5.452 5.625 5.875 6.114 6.334 6.549 6.761 7.025 7.278 7.517 7.8 8.075 8.332 8.634 8.965 9.262 9.584 9.94 10.314 10.706 11.145 11.68 12.242 12.845 13.448 14.098 14.727 15.367 15.958 16.271 16.064 15.652 15.136 14.592 14.054 13.503 12.94 12.443 11.894 11.369 10.898 10.433 9.979 9.547 9.144 8.745 8.406 8.103 7.777 7.43 7.159 6.88 6.579 6.343 6.1 5.863 5.622 5.334 5.125 4.932 4.653 4.456 4.244 4.127 3.885 3.648 3.391 3.252 2.987 2.807 2.636 2.474 2.096 1.872 1.645 1.41 1.123 0.708 0.201 -0.856 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 291eb051..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32212 ,TETRA ,17585301,Sat Nov 27 12:44:47 CET,Sat Nov 27 14:52:22 CET,0.0 0.921 1.32 1.624 1.874 2.097 2.312 2.526 2.908 3.079 3.247 3.431 3.684 3.819 4.078 4.334 4.574 4.689 4.895 5.082 5.357 5.537 5.709 5.955 6.192 6.416 6.642 6.865 7.154 7.431 7.691 7.989 8.26 8.514 8.813 9.15 9.466 9.824 10.21 10.598 11.003 11.446 11.953 12.474 13.077 13.702 14.348 14.976 15.556 16.101 16.467 16.339 15.99 15.541 15.02 14.515 14.04 13.567 13.137 12.681 12.289 11.926 11.568 11.23 10.909 10.625 10.317 10.033 9.799 9.558 9.287 9.053 8.817 8.575 8.39 8.195 7.99 7.782 7.575 7.427 7.259 6.994 6.815 6.628 6.526 6.311 6.089 5.856 5.738 5.5 5.348 5.215 5.076 4.771 4.617 4.443 4.24 3.996 3.679 3.285 2.259 -2 ,12435 ,TETRA ,17585302,Sat Nov 27 12:45:44 CET,Sat Nov 27 14:53:59 CET,0.0 1.163 1.55 1.893 2.181 2.427 2.64 2.828 3.196 3.373 3.542 3.724 3.969 4.087 4.32 4.557 4.793 4.899 5.094 5.274 5.524 5.687 5.845 6.077 6.299 6.51 6.708 6.908 7.177 7.435 7.683 7.982 8.26 8.515 8.801 9.114 9.413 9.74 10.096 10.474 10.867 11.304 11.813 12.309 12.865 13.455 14.094 14.722 15.304 15.897 16.229 16.012 15.607 15.131 14.614 14.071 13.566 13.09 12.665 12.246 11.87 11.519 11.169 10.816 10.496 10.21 9.907 9.646 9.411 9.15 8.877 8.642 8.395 8.145 7.959 7.761 7.547 7.333 7.101 6.943 6.786 6.527 6.335 6.145 6.054 5.863 5.664 5.44 5.319 5.079 4.914 4.769 4.632 4.322 4.159 3.983 3.753 3.479 3.183 2.83 1.877 -3 ,32268 ,TETRA ,17585303,Sat Nov 27 12:46:45 CET,Sat Nov 27 14:56:49 CET,0.0 0.965 1.373 1.676 1.943 2.17 2.363 2.562 2.915 3.077 3.239 3.408 3.655 3.775 4.009 4.237 4.449 4.555 4.775 4.988 5.266 5.436 5.609 5.849 6.071 6.291 6.505 6.714 6.986 7.242 7.476 7.762 8.046 8.314 8.61 8.934 9.253 9.615 9.999 10.383 10.777 11.234 11.77 12.27 12.807 13.364 13.965 14.556 15.139 15.708 16.127 15.95 15.471 14.93 14.396 13.867 13.372 12.929 12.53 12.092 11.714 11.376 11.029 10.698 10.392 10.109 9.819 9.546 9.288 9.028 8.775 8.551 8.313 8.074 7.888 7.695 7.491 7.276 7.055 6.904 6.739 6.476 6.288 6.099 6.005 5.799 5.587 5.37 5.252 5.013 4.86 4.721 4.576 4.253 4.075 3.878 3.672 3.448 3.169 2.798 1.889 -4 ,11996 ,TETRA ,17585304,Sat Nov 27 12:47:45 CET,Sat Nov 27 14:55:12 CET,0.0 1.024 1.396 1.692 1.955 2.206 2.432 2.618 2.944 3.122 3.3 3.489 3.744 3.874 4.121 4.363 4.595 4.703 4.918 5.113 5.375 5.549 5.729 5.988 6.217 6.43 6.642 6.846 7.11 7.36 7.597 7.89 8.167 8.424 8.719 9.066 9.399 9.77 10.176 10.59 11.006 11.437 11.923 12.394 12.926 13.512 14.123 14.686 15.309 15.905 16.228 16.019 15.504 14.916 14.27 13.61 13.027 12.521 12.093 11.661 11.266 10.878 10.499 10.15 9.841 9.555 9.242 8.96 8.716 8.458 8.182 7.959 7.733 7.504 7.313 7.112 6.914 6.693 6.458 6.297 6.122 5.844 5.648 5.446 5.352 5.159 4.938 4.717 4.612 4.385 4.222 4.073 3.928 3.598 3.421 3.217 2.985 2.75 2.492 2.109 0.739 -5 ,31939 ,TETRA ,17585306,Sat Nov 27 12:47:45 CET,Sat Nov 27 14:43:48 CET,0.0 1.185 1.627 1.959 2.219 2.441 2.631 2.813 3.159 3.309 3.454 3.615 3.859 3.985 4.239 4.475 4.698 4.809 5.036 5.251 5.546 5.73 5.898 6.143 6.375 6.613 6.858 7.087 7.371 7.646 7.922 8.249 8.548 8.823 9.155 9.544 9.915 10.327 10.749 11.175 11.61 12.065 12.561 13.036 13.526 14.013 14.567 15.188 15.811 16.341 16.626 16.385 15.843 15.244 14.701 14.185 13.709 13.264 12.862 12.432 12.047 11.701 11.353 11.0 10.662 10.355 10.027 9.737 9.48 9.205 8.935 8.708 8.477 8.247 8.063 7.869 7.663 7.442 7.22 7.073 6.913 6.651 6.469 6.292 6.201 5.997 5.786 5.575 5.455 5.202 5.05 4.918 4.786 4.479 4.321 4.14 3.906 3.641 3.369 3.037 2.19 -6 ,28037 ,TETRA ,17585307,Sat Nov 27 12:47:45 CET,Sat Nov 27 14:56:26 CET,0.0 1.188 1.694 2.071 2.364 2.633 2.88 3.108 3.503 3.68 3.846 4.009 4.282 4.433 4.689 4.919 5.132 5.233 5.437 5.63 5.911 6.091 6.261 6.511 6.74 6.955 7.167 7.376 7.642 7.906 8.157 8.447 8.737 9.021 9.341 9.691 10.016 10.374 10.746 11.135 11.536 11.98 12.457 12.904 13.447 14.025 14.66 15.33 15.978 16.518 16.827 16.602 16.123 15.624 15.159 14.675 14.178 13.696 13.276 12.855 12.481 12.14 11.81 11.494 11.189 10.902 10.588 10.295 10.045 9.787 9.522 9.305 9.083 8.86 8.679 8.48 8.26 8.035 7.812 7.652 7.485 7.23 7.054 6.865 6.765 6.549 6.319 6.08 5.96 5.734 5.584 5.432 5.271 4.939 4.773 4.591 4.396 4.169 3.876 3.494 2.478 -7 ,3555 ,TETRA ,17585308,Sat Nov 27 12:47:45 CET,Sat Nov 27 14:56:19 CET,0.0 1.046 1.465 1.822 2.125 2.365 2.553 2.739 3.118 3.289 3.443 3.608 3.865 3.996 4.248 4.494 4.737 4.848 5.052 5.259 5.549 5.74 5.934 6.202 6.462 6.719 6.974 7.22 7.534 7.838 8.115 8.429 8.743 9.045 9.383 9.76 10.122 10.516 10.918 11.341 11.787 12.292 12.845 13.352 13.952 14.61 15.29 16.022 16.743 17.34 17.715 17.449 16.876 16.289 15.751 15.214 14.697 14.194 13.737 13.273 12.874 12.522 12.165 11.81 11.496 11.203 10.88 10.578 10.315 10.052 9.779 9.549 9.306 9.046 8.833 8.621 8.414 8.189 7.952 7.792 7.621 7.347 7.163 6.97 6.87 6.666 6.44 6.204 6.082 5.844 5.711 5.57 5.423 5.121 4.949 4.748 4.536 4.306 4.029 3.652 2.697 -8 ,11868 ,TETRA ,17585309,Sat Nov 27 12:47:45 CET,Sat Nov 27 14:57:10 CET,0.0 1.062 1.509 1.877 2.183 2.415 2.626 2.811 3.148 3.311 3.469 3.647 3.909 4.046 4.313 4.564 4.793 4.901 5.116 5.316 5.593 5.781 5.961 6.206 6.442 6.668 6.879 7.092 7.378 7.641 7.877 8.173 8.473 8.744 9.049 9.402 9.728 10.087 10.485 10.893 11.311 11.794 12.348 12.876 13.458 14.078 14.751 15.446 16.191 16.834 17.2 17.107 16.824 16.372 15.842 15.328 14.845 14.364 13.929 13.468 13.053 12.681 12.342 12.015 11.69 11.395 11.075 10.785 10.522 10.227 9.932 9.706 9.467 9.204 9.005 8.802 8.592 8.373 8.148 7.992 7.822 7.559 7.364 7.167 7.068 6.848 6.638 6.43 6.317 6.082 5.936 5.795 5.65 5.314 5.136 4.93 4.708 4.482 4.209 3.868 3.209 -9 ,24341 ,TETRA ,17585310,Sat Nov 27 12:47:45 CET,Sat Nov 27 14:43:24 CET,0.0 1.435 1.931 2.317 2.631 2.897 3.154 3.388 3.814 3.99 4.146 4.337 4.613 4.756 5.02 5.278 5.523 5.64 5.855 6.054 6.35 6.544 6.727 6.985 7.227 7.465 7.711 7.944 8.249 8.55 8.826 9.148 9.46 9.757 10.096 10.482 10.848 11.228 11.634 12.073 12.52 13.025 13.605 14.15 14.756 15.391 16.052 16.713 17.379 17.966 18.303 18.065 17.539 17.008 16.479 15.969 15.49 15.003 14.557 14.125 13.743 13.381 13.035 12.691 12.36 12.063 11.752 11.477 11.235 10.97 10.69 10.459 10.223 9.978 9.778 9.572 9.364 9.152 8.934 8.778 8.616 8.367 8.192 7.998 7.898 7.694 7.477 7.25 7.128 6.881 6.739 6.6 6.453 6.153 5.992 5.812 5.606 5.359 5.089 4.718 3.834 -10 ,2442 ,TETRA ,17585311,Sat Nov 27 12:48:46 CET,Sat Nov 27 14:56:46 CET,0.0 1.073 1.491 1.824 2.101 2.348 2.575 2.763 3.132 3.305 3.463 3.65 3.915 4.045 4.29 4.535 4.772 4.882 5.091 5.303 5.606 5.803 5.992 6.253 6.498 6.739 6.978 7.207 7.491 7.758 8.02 8.327 8.611 8.885 9.19 9.524 9.864 10.225 10.585 10.969 11.382 11.843 12.375 12.879 13.416 13.966 14.579 15.237 15.918 16.562 16.926 16.786 16.394 15.82 15.213 14.649 14.136 13.616 13.142 12.661 12.246 11.868 11.49 11.137 10.81 10.514 10.201 9.911 9.661 9.394 9.109 8.884 8.65 8.397 8.2 7.998 7.792 7.58 7.36 7.208 7.053 6.814 6.636 6.445 6.352 6.163 5.955 5.73 5.618 5.388 5.24 5.108 4.971 4.682 4.514 4.317 4.112 3.894 3.652 3.328 2.358 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt deleted file mode 100644 index dd7092f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19854 ,TETRA ,17585312,Sat Nov 27 12:48:46 CET,Sat Nov 27 14:53:26 CET,0.0 1.011 1.383 1.649 1.888 2.117 2.325 2.511 2.853 3.01 3.166 3.34 3.598 3.73 3.995 4.231 4.434 4.534 4.73 4.912 5.186 5.37 5.551 5.81 6.055 6.296 6.533 6.756 7.039 7.307 7.56 7.879 8.177 8.459 8.793 9.161 9.505 9.895 10.319 10.756 11.214 11.725 12.317 12.898 13.57 14.268 15.009 15.844 16.785 17.857 19.014 19.63 19.753 19.658 19.46 19.22 18.931 18.61 18.323 18.016 17.742 17.508 17.251 16.977 16.719 16.48 16.227 15.996 15.799 15.593 15.37 15.173 14.97 14.754 14.582 14.405 14.22 14.024 13.81 13.659 13.516 13.291 13.117 12.937 12.846 12.664 12.456 12.218 12.094 11.861 11.723 11.596 11.459 11.157 10.983 10.783 10.555 10.31 10.072 9.769 8.741 -2 ,24248 ,TETRA ,17585313,Sat Nov 27 12:49:44 CET,Sat Nov 27 14:57:51 CET,0.0 0.77 1.135 1.441 1.699 1.934 2.15 2.35 2.708 2.871 3.03 3.203 3.458 3.599 3.868 4.125 4.356 4.461 4.653 4.837 5.109 5.292 5.471 5.725 5.978 6.225 6.452 6.667 6.947 7.215 7.479 7.789 8.085 8.375 8.718 9.109 9.475 9.875 10.287 10.713 11.156 11.643 12.194 12.748 13.395 14.098 14.872 15.717 16.646 17.677 18.776 19.399 19.531 19.396 19.133 18.805 18.475 18.164 17.846 17.503 17.213 16.957 16.7 16.431 16.184 15.959 15.696 15.463 15.266 15.05 14.816 14.617 14.406 14.196 14.027 13.835 13.631 13.425 13.207 13.049 12.889 12.641 12.457 12.27 12.179 11.987 11.76 11.519 11.395 11.152 11.015 10.869 10.712 10.389 10.216 10.014 9.757 9.443 9.102 8.676 7.778 -3 ,18840 ,TETRA ,17585314,Sat Nov 27 12:48:46 CET,Sat Nov 27 14:57:08 CET,0.0 0.994 1.431 1.728 1.96 2.186 2.41 2.61 2.962 3.11 3.258 3.435 3.681 3.809 4.071 4.315 4.545 4.657 4.862 5.06 5.348 5.534 5.71 5.964 6.22 6.464 6.693 6.915 7.2 7.483 7.758 8.073 8.374 8.67 9.009 9.394 9.768 10.155 10.583 11.043 11.506 12.034 12.654 13.253 13.917 14.629 15.425 16.31 17.285 18.351 19.448 20.094 20.282 20.216 19.998 19.703 19.395 19.078 18.775 18.444 18.151 17.876 17.601 17.34 17.098 16.867 16.609 16.38 16.179 15.966 15.746 15.56 15.376 15.181 15.023 14.859 14.673 14.48 14.279 14.137 14.001 13.788 13.634 13.474 13.394 13.205 12.992 12.779 12.662 12.426 12.267 12.135 12.008 11.719 11.557 11.387 11.204 11.003 10.744 10.363 9.569 -4 ,16204 ,TETRA ,17585315,Sat Nov 27 12:49:44 CET,Sat Nov 27 14:54:24 CET,0.0 1.013 1.432 1.758 2.03 2.275 2.494 2.681 2.99 3.141 3.291 3.446 3.694 3.82 4.072 4.315 4.549 4.668 4.901 5.118 5.401 5.567 5.741 5.992 6.227 6.472 6.704 6.919 7.204 7.484 7.753 8.064 8.343 8.607 8.928 9.297 9.646 10.03 10.425 10.81 11.225 11.711 12.266 12.798 13.407 14.111 14.911 15.775 16.712 17.67 18.664 19.211 19.227 19.055 18.819 18.578 18.289 17.947 17.641 17.321 17.028 16.755 16.491 16.237 16.0 15.774 15.522 15.274 15.05 14.828 14.595 14.398 14.194 13.967 13.794 13.619 13.436 13.25 13.047 12.906 12.764 12.539 12.374 12.2 12.111 11.938 11.752 11.537 11.42 11.186 11.052 10.925 10.783 10.456 10.288 10.099 9.876 9.631 9.34 8.916 7.856 -5 ,8081 ,TETRA ,17585316,Sat Nov 27 12:50:44 CET,Sat Nov 27 14:59:19 CET,0.0 0.835 1.217 1.516 1.788 2.028 2.239 2.438 2.792 2.946 3.088 3.215 3.454 3.578 3.816 4.03 4.233 4.338 4.541 4.728 5.001 5.177 5.349 5.606 5.862 6.114 6.358 6.582 6.858 7.129 7.391 7.714 8.015 8.3 8.627 8.977 9.313 9.69 10.084 10.499 10.949 11.452 12.033 12.595 13.233 13.951 14.77 15.713 16.738 17.77 18.867 19.48 19.609 19.492 19.284 19.037 18.758 18.466 18.197 17.896 17.603 17.329 17.064 16.817 16.566 16.322 16.052 15.798 15.581 15.363 15.129 14.932 14.73 14.508 14.337 14.155 13.967 13.773 13.562 13.417 13.265 13.015 12.844 12.674 12.59 12.418 12.232 12.028 11.916 11.689 11.567 11.439 11.292 10.985 10.827 10.642 10.435 10.217 9.958 9.627 8.794 -6 ,3258 ,TETRA ,17585317,Sat Nov 27 12:51:45 CET,Sat Nov 27 14:55:45 CET,0.0 1.113 1.465 1.729 1.992 2.217 2.419 2.624 2.983 3.138 3.281 3.421 3.662 3.779 4.016 4.248 4.47 4.581 4.8 5.008 5.297 5.47 5.637 5.892 6.15 6.396 6.626 6.847 7.135 7.417 7.682 7.98 8.271 8.555 8.873 9.224 9.565 9.953 10.355 10.765 11.227 11.755 12.33 12.887 13.523 14.219 15.006 15.856 16.818 17.854 18.929 19.524 19.598 19.555 19.437 19.182 18.865 18.576 18.319 18.022 17.756 17.508 17.246 16.989 16.73 16.481 16.224 15.99 15.779 15.558 15.327 15.129 14.918 14.696 14.52 14.337 14.16 13.981 13.781 13.636 13.482 13.244 13.078 12.895 12.792 12.588 12.387 12.168 12.053 11.838 11.728 11.593 11.455 11.148 10.96 10.761 10.543 10.304 10.031 9.694 8.791 -7 ,18065 ,TETRA ,17585318,Sat Nov 27 12:52:48 CET,Sat Nov 27 14:49:35 CET,0.0 0.901 1.271 1.536 1.771 1.993 2.195 2.381 2.719 2.876 3.033 3.208 3.465 3.602 3.854 4.084 4.315 4.421 4.623 4.819 5.093 5.27 5.441 5.688 5.925 6.163 6.397 6.615 6.897 7.17 7.431 7.727 7.995 8.268 8.594 8.976 9.339 9.727 10.139 10.577 11.023 11.517 12.117 12.723 13.428 14.188 15.036 16.004 17.101 18.293 19.53 20.163 20.312 20.283 20.132 19.929 19.689 19.43 19.179 18.892 18.616 18.356 18.103 17.855 17.595 17.363 17.121 16.878 16.669 16.462 16.238 16.041 15.836 15.617 15.443 15.26 15.065 14.866 14.66 14.504 14.343 14.097 13.917 13.723 13.628 13.439 13.232 13.005 12.879 12.643 12.517 12.382 12.23 11.895 11.704 11.502 11.291 11.052 10.767 10.363 9.489 -8 ,7827 ,TETRA ,17585319,Sat Nov 27 12:52:45 CET,Sat Nov 27 15:01:47 CET,0.0 1.046 1.421 1.731 1.991 2.232 2.46 2.649 3.0 3.162 3.319 3.488 3.735 3.856 4.082 4.301 4.516 4.618 4.809 4.999 5.289 5.468 5.63 5.866 6.103 6.326 6.541 6.752 7.018 7.287 7.553 7.863 8.163 8.456 8.808 9.198 9.569 9.977 10.399 10.819 11.26 11.786 12.407 13.019 13.727 14.496 15.334 16.243 17.282 18.44 19.634 20.309 20.457 20.385 20.19 19.904 19.601 19.299 19.03 18.738 18.458 18.186 17.923 17.661 17.413 17.177 16.923 16.699 16.493 16.278 16.05 15.857 15.658 15.444 15.28 15.11 14.922 14.717 14.511 14.378 14.229 13.987 13.816 13.637 13.544 13.351 13.145 12.912 12.787 12.54 12.361 12.211 12.058 11.722 11.529 11.338 11.144 10.911 10.632 10.252 9.529 -9 ,23367 ,TETRA ,17585320,Sat Nov 27 12:52:45 CET,Sat Nov 27 15:01:58 CET,0.0 0.751 1.123 1.442 1.75 1.974 2.169 2.367 2.71 2.868 3.022 3.171 3.422 3.56 3.835 4.082 4.312 4.42 4.619 4.8 5.063 5.234 5.402 5.659 5.915 6.167 6.409 6.627 6.911 7.19 7.443 7.738 8.02 8.303 8.633 9.007 9.371 9.76 10.179 10.615 11.053 11.533 12.105 12.686 13.306 13.948 14.68 15.454 16.334 17.303 18.242 18.675 18.652 18.41 18.129 17.855 17.576 17.274 16.95 16.6 16.286 16.009 15.745 15.479 15.233 15.015 14.782 14.565 14.374 14.171 13.95 13.763 13.558 13.342 13.175 12.992 12.808 12.624 12.426 12.292 12.147 11.921 11.757 11.583 11.502 11.335 11.15 10.949 10.847 10.632 10.517 10.4 10.261 9.943 9.757 9.555 9.348 9.129 8.908 8.595 7.684 -10 ,17738 ,TETRA ,17585321,Sat Nov 27 12:52:45 CET,Sat Nov 27 15:00:50 CET,0.0 0.923 1.331 1.647 1.907 2.126 2.33 2.523 2.841 2.991 3.152 3.34 3.593 3.725 3.966 4.192 4.414 4.519 4.728 4.93 5.216 5.399 5.581 5.841 6.081 6.304 6.521 6.748 7.037 7.312 7.579 7.897 8.207 8.505 8.853 9.234 9.572 9.933 10.321 10.736 11.175 11.677 12.261 12.84 13.498 14.217 15.038 15.887 16.811 17.871 18.986 19.556 19.621 19.518 19.27 18.954 18.636 18.308 18.012 17.697 17.397 17.103 16.817 16.559 16.311 16.081 15.832 15.593 15.395 15.205 14.993 14.808 14.615 14.408 14.247 14.081 13.91 13.728 13.537 13.405 13.266 13.038 12.878 12.711 12.626 12.45 12.251 12.04 11.932 11.711 11.591 11.466 11.33 11.034 10.869 10.678 10.468 10.248 9.966 9.594 8.635 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt deleted file mode 100644 index 6b83dd80..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4224 ,TETRA ,17585322,Sat Nov 27 12:53:44 CET,Sat Nov 27 14:56:26 CET,0.0 0.297 0.495 0.673 0.825 0.956 1.076 1.194 1.411 1.502 1.595 1.665 1.889 1.989 2.158 2.31 2.449 2.515 2.642 2.775 2.979 3.104 3.218 3.38 3.531 3.681 3.833 3.978 4.161 4.341 4.528 4.74 4.932 5.127 5.351 5.595 5.823 6.074 6.332 6.61 6.907 7.211 7.546 7.878 8.256 8.638 9.017 9.328 9.531 9.65 9.504 8.926 8.238 7.505 6.75 6.045 5.403 4.792 4.254 3.698 3.222 2.798 2.398 2.024 1.653 1.272 0.855 0.501 0.202 -0.105 -0.418 -0.682 -0.955 -1.239 -1.467 -1.733 -2.012 -2.285 -2.595 -2.807 -3.008 -3.321 -3.545 -3.78 -3.901 -4.153 -4.445 -4.749 -4.904 -5.19 -5.422 -5.621 -5.835 -6.304 -6.568 -6.856 -7.191 -7.572 -8.015 -8.565 -10.248 -2 ,14038 ,TETRA ,17585323,Sat Nov 27 12:54:46 CET,Sat Nov 27 15:03:05 CET,0.0 0.269 0.524 0.73 0.899 1.051 1.185 1.306 1.524 1.625 1.726 1.798 2.003 2.085 2.254 2.41 2.56 2.636 2.775 2.902 3.098 3.222 3.339 3.516 3.695 3.86 4.004 4.149 4.338 4.511 4.683 4.886 5.067 5.248 5.459 5.694 5.91 6.143 6.389 6.619 6.871 7.143 7.441 7.734 8.044 8.346 8.669 8.993 9.242 9.338 9.134 8.487 7.791 7.139 6.467 5.77 5.134 4.519 3.97 3.423 2.931 2.485 2.041 1.61 1.228 0.888 0.514 0.158 -0.18 -0.517 -0.847 -1.14 -1.438 -1.754 -2.015 -2.299 -2.586 -2.87 -3.17 -3.372 -3.571 -3.865 -4.074 -4.313 -4.438 -4.706 -5.015 -5.343 -5.513 -5.836 -6.128 -6.326 -6.529 -6.952 -7.19 -7.435 -7.701 -8.061 -8.552 -9.229 -11.16 -3 ,11532 ,TETRA ,17585324,Sat Nov 27 12:54:46 CET,Sat Nov 27 15:03:54 CET,0.0 0.395 0.619 0.799 0.952 1.094 1.222 1.339 1.549 1.646 1.745 1.81 2.011 2.099 2.276 2.431 2.569 2.639 2.776 2.914 3.115 3.241 3.361 3.528 3.7 3.866 4.017 4.167 4.356 4.536 4.711 4.905 5.073 5.237 5.439 5.657 5.849 6.061 6.298 6.542 6.78 7.027 7.311 7.603 7.918 8.231 8.572 8.884 9.139 9.276 9.098 8.469 7.726 7.0 6.317 5.683 5.095 4.542 4.047 3.523 3.073 2.674 2.267 1.879 1.521 1.186 0.825 0.506 0.246 -0.047 -0.384 -0.667 -0.951 -1.236 -1.487 -1.786 -2.075 -2.35 -2.613 -2.788 -2.989 -3.308 -3.529 -3.78 -3.921 -4.238 -4.574 -4.889 -5.04 -5.333 -5.602 -5.823 -6.049 -6.511 -6.773 -7.045 -7.368 -7.76 -8.246 -8.947 -11.024 -4 ,2440 ,TETRA ,17585325,Sat Nov 27 12:54:46 CET,Sat Nov 27 15:03:48 CET,0.0 0.34 0.531 0.697 0.86 0.999 1.116 1.236 1.48 1.585 1.677 1.73 1.94 2.032 2.195 2.333 2.464 2.535 2.682 2.824 3.026 3.159 3.282 3.446 3.611 3.766 3.915 4.058 4.229 4.392 4.56 4.758 4.931 5.093 5.283 5.487 5.683 5.886 6.103 6.343 6.592 6.847 7.118 7.408 7.718 8.009 8.31 8.611 8.849 8.91 8.659 7.962 7.201 6.422 5.675 4.991 4.344 3.726 3.176 2.586 2.055 1.593 1.148 0.742 0.369 0.013 -0.362 -0.702 -0.99 -1.286 -1.599 -1.857 -2.131 -2.44 -2.677 -2.914 -3.165 -3.406 -3.641 -3.82 -4.01 -4.327 -4.555 -4.777 -4.888 -5.131 -5.392 -5.653 -5.793 -6.051 -6.23 -6.393 -6.562 -6.925 -7.136 -7.363 -7.629 -7.931 -8.275 -8.884 -11.427 -5 ,26851 ,TETRA ,17585326,Sat Nov 27 12:55:45 CET,Sat Nov 27 15:04:03 CET,0.0 0.327 0.544 0.732 0.916 1.085 1.216 1.34 1.573 1.669 1.76 1.847 2.063 2.152 2.333 2.5 2.656 2.732 2.875 3.013 3.219 3.342 3.462 3.636 3.806 3.969 4.123 4.274 4.468 4.655 4.825 5.026 5.232 5.426 5.641 5.888 6.116 6.349 6.589 6.839 7.1 7.388 7.718 8.012 8.338 8.689 9.0 9.267 9.482 9.572 9.371 8.709 7.938 7.148 6.399 5.735 5.134 4.561 4.069 3.564 3.122 2.736 2.357 1.987 1.618 1.265 0.914 0.59 0.284 -0.035 -0.364 -0.631 -0.902 -1.195 -1.423 -1.658 -1.906 -2.167 -2.434 -2.614 -2.802 -3.109 -3.325 -3.552 -3.67 -3.932 -4.22 -4.506 -4.647 -4.913 -5.111 -5.287 -5.485 -5.893 -6.139 -6.463 -6.857 -7.324 -7.816 -8.408 -10.637 -6 ,20352 ,TETRA ,17585327,Sat Nov 27 12:55:45 CET,Sat Nov 27 15:08:31 CET,0.0 0.365 0.572 0.747 0.902 1.068 1.224 1.345 1.571 1.678 1.779 1.847 2.061 2.156 2.34 2.497 2.641 2.713 2.859 2.996 3.193 3.322 3.444 3.612 3.771 3.929 4.077 4.224 4.418 4.601 4.773 4.974 5.172 5.354 5.553 5.786 6.011 6.245 6.485 6.724 6.968 7.244 7.553 7.84 8.169 8.517 8.848 9.153 9.464 9.647 9.495 8.915 8.197 7.47 6.831 6.228 5.654 5.101 4.606 4.112 3.68 3.276 2.894 2.518 2.148 1.794 1.39 1.046 0.778 0.501 0.182 -0.098 -0.375 -0.68 -0.913 -1.13 -1.384 -1.657 -1.916 -2.093 -2.289 -2.601 -2.816 -3.059 -3.191 -3.458 -3.757 -4.079 -4.234 -4.523 -4.77 -4.969 -5.185 -5.706 -6.017 -6.363 -6.72 -7.115 -7.525 -8.029 -9.702 -7 ,25169 ,TETRA ,17585328,Sat Nov 27 12:56:45 CET,Sat Nov 27 15:04:33 CET,0.0 0.342 0.591 0.787 0.964 1.124 1.247 1.362 1.578 1.684 1.787 1.861 2.068 2.163 2.34 2.494 2.64 2.714 2.848 2.983 3.197 3.323 3.433 3.594 3.746 3.887 4.023 4.15 4.314 4.472 4.629 4.835 5.025 5.198 5.402 5.641 5.878 6.138 6.413 6.681 6.956 7.26 7.598 7.941 8.312 8.685 9.047 9.381 9.675 9.831 9.704 9.18 8.529 7.804 7.1 6.385 5.729 5.189 4.711 4.205 3.773 3.378 2.993 2.613 2.257 1.943 1.614 1.321 1.056 0.755 0.426 0.17 -0.078 -0.359 -0.596 -0.84 -1.082 -1.33 -1.584 -1.758 -1.935 -2.219 -2.412 -2.607 -2.718 -2.966 -3.232 -3.503 -3.653 -3.939 -4.187 -4.364 -4.531 -4.92 -5.138 -5.358 -5.64 -5.985 -6.389 -6.924 -8.777 -8 ,24472 ,TETRA ,17585329,Sat Nov 27 12:57:44 CET,Sat Nov 27 15:07:08 CET,0.0 0.504 0.757 0.964 1.124 1.252 1.356 1.467 1.692 1.806 1.923 2.009 2.221 2.303 2.462 2.621 2.767 2.84 2.984 3.118 3.3 3.404 3.507 3.662 3.817 3.963 4.089 4.212 4.381 4.552 4.72 4.918 5.108 5.3 5.505 5.72 5.931 6.173 6.415 6.649 6.893 7.146 7.431 7.724 8.028 8.312 8.587 8.858 9.08 9.152 8.967 8.383 7.655 6.854 6.115 5.45 4.844 4.269 3.787 3.293 2.844 2.423 2.008 1.617 1.256 0.933 0.584 0.288 0.044 -0.225 -0.524 -0.776 -1.049 -1.334 -1.553 -1.785 -2.018 -2.257 -2.528 -2.73 -2.945 -3.326 -3.612 -3.896 -4.029 -4.292 -4.562 -4.84 -4.983 -5.255 -5.481 -5.67 -5.862 -6.258 -6.462 -6.699 -6.995 -7.346 -7.752 -8.32 -10.15 -9 ,30262 ,TETRA ,17585330,Sat Nov 27 12:57:45 CET,Sat Nov 27 14:55:26 CET,0.0 0.487 0.72 0.888 1.065 1.232 1.374 1.496 1.741 1.854 1.963 2.054 2.28 2.378 2.559 2.73 2.872 2.944 3.088 3.218 3.415 3.553 3.678 3.839 3.994 4.145 4.285 4.431 4.626 4.808 4.981 5.186 5.391 5.59 5.809 6.055 6.283 6.52 6.776 7.043 7.317 7.604 7.914 8.226 8.563 8.878 9.206 9.518 9.802 10.012 9.841 9.173 8.464 7.737 6.999 6.243 5.567 4.958 4.424 3.873 3.387 2.942 2.491 2.072 1.671 1.285 0.887 0.536 0.243 -0.064 -0.396 -0.685 -0.971 -1.236 -1.444 -1.667 -1.917 -2.18 -2.439 -2.623 -2.83 -3.152 -3.372 -3.6 -3.715 -3.965 -4.235 -4.524 -4.671 -4.939 -5.15 -5.327 -5.504 -5.929 -6.19 -6.469 -6.777 -7.165 -7.668 -8.412 -10.856 -10 ,20876 ,TETRA ,17585331,Sat Nov 27 12:57:45 CET,Sat Nov 27 14:59:10 CET,0.0 0.473 0.741 0.951 1.139 1.319 1.468 1.599 1.88 2.007 2.119 2.212 2.434 2.537 2.723 2.897 3.069 3.15 3.305 3.443 3.627 3.752 3.883 4.073 4.245 4.416 4.579 4.73 4.924 5.103 5.28 5.483 5.672 5.858 6.075 6.314 6.546 6.8 7.058 7.325 7.601 7.901 8.223 8.529 8.86 9.214 9.582 9.912 10.233 10.451 10.346 9.799 9.059 8.326 7.619 6.903 6.281 5.722 5.219 4.722 4.256 3.818 3.423 3.053 2.692 2.347 1.978 1.636 1.335 1.024 0.701 0.438 0.163 -0.13 -0.356 -0.586 -0.827 -1.083 -1.34 -1.514 -1.7 -1.999 -2.219 -2.444 -2.55 -2.773 -3.02 -3.294 -3.443 -3.718 -3.951 -4.153 -4.354 -4.737 -4.989 -5.299 -5.609 -5.948 -6.36 -6.928 -8.579 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 7dafeea0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8154 ,TETRA ,17585332,Sat Nov 27 12:58:46 CET,Sat Nov 27 15:07:04 CET,0.0 0.702 1.058 1.33 1.575 1.799 1.997 2.201 2.582 2.734 2.878 3.024 3.299 3.432 3.677 3.905 4.124 4.23 4.44 4.634 4.894 5.066 5.23 5.481 5.728 5.959 6.185 6.403 6.686 6.956 7.218 7.537 7.835 8.117 8.449 8.834 9.206 9.61 10.042 10.491 10.944 11.457 12.087 12.729 13.485 14.298 15.218 16.256 17.424 18.683 20.044 21.008 21.387 21.483 21.448 21.333 21.178 21.026 20.845 20.628 20.425 20.231 20.038 19.836 19.638 19.453 19.267 19.104 18.949 18.771 18.583 18.428 18.265 18.093 17.952 17.804 17.653 17.491 17.323 17.203 17.066 16.853 16.706 16.557 16.483 16.31 16.121 15.931 15.838 15.614 15.513 15.395 15.264 14.978 14.832 14.66 14.452 14.255 14.02 13.674 12.794 -2 ,3416 ,TETRA ,17585333,Sat Nov 27 12:59:46 CET,Sat Nov 27 15:06:05 CET,0.0 0.698 1.074 1.361 1.581 1.796 2.01 2.2 2.541 2.696 2.842 2.986 3.257 3.387 3.646 3.898 4.124 4.227 4.435 4.634 4.923 5.108 5.285 5.543 5.793 6.034 6.267 6.486 6.759 7.025 7.29 7.622 7.942 8.247 8.598 8.979 9.35 9.771 10.224 10.691 11.182 11.738 12.391 13.048 13.775 14.576 15.514 16.55 17.732 19.089 20.603 21.612 22.037 22.144 22.102 22.003 21.856 21.675 21.487 21.265 21.059 20.855 20.618 20.398 20.196 20.006 19.813 19.624 19.452 19.276 19.084 18.915 18.738 18.552 18.401 18.25 18.085 17.895 17.702 17.567 17.427 17.222 17.084 16.938 16.86 16.692 16.525 16.36 16.26 16.024 15.93 15.815 15.682 15.403 15.253 15.07 14.856 14.621 14.368 14.039 13.002 -3 ,2629 ,TETRA ,17585334,Sat Nov 27 12:59:46 CET,Sat Nov 27 15:02:57 CET,0.0 1.01 1.421 1.722 1.972 2.186 2.374 2.577 2.939 3.088 3.23 3.357 3.635 3.769 4.007 4.229 4.446 4.551 4.757 4.961 5.259 5.445 5.625 5.883 6.125 6.37 6.613 6.844 7.136 7.41 7.675 8.003 8.313 8.616 8.984 9.383 9.755 10.167 10.619 11.102 11.598 12.143 12.788 13.449 14.202 15.027 15.974 17.02 18.213 19.553 21.026 22.08 22.517 22.647 22.607 22.494 22.354 22.153 21.945 21.71 21.473 21.257 21.047 20.828 20.635 20.46 20.255 20.06 19.884 19.705 19.529 19.391 19.23 19.037 18.894 18.751 18.592 18.413 18.226 18.101 17.976 17.775 17.629 17.474 17.392 17.224 17.044 16.843 16.736 16.503 16.396 16.275 16.147 15.852 15.697 15.514 15.31 15.103 14.877 14.591 13.973 -4 ,12964 ,TETRA ,17585335,Sat Nov 27 12:59:46 CET,Sat Nov 27 15:08:16 CET,0.0 0.834 1.178 1.444 1.677 1.881 2.068 2.239 2.555 2.715 2.871 3.011 3.296 3.432 3.674 3.908 4.142 4.249 4.456 4.66 4.946 5.133 5.317 5.574 5.829 6.076 6.312 6.552 6.85 7.117 7.376 7.691 7.995 8.289 8.635 9.031 9.404 9.814 10.259 10.725 11.21 11.759 12.392 13.037 13.812 14.668 15.631 16.681 17.872 19.225 20.763 21.867 22.335 22.449 22.438 22.368 22.199 21.964 21.758 21.538 21.321 21.123 20.911 20.678 20.466 20.274 20.048 19.846 19.674 19.485 19.281 19.101 18.901 18.704 18.556 18.391 18.224 18.053 17.876 17.755 17.614 17.386 17.243 17.093 17.0 16.805 16.61 16.404 16.297 16.067 15.974 15.855 15.719 15.412 15.25 15.081 14.908 14.708 14.458 14.119 13.321 -5 ,9467 ,TETRA ,17585336,Sat Nov 27 12:59:45 CET,Sat Nov 27 15:07:13 CET,0.0 0.667 0.974 1.23 1.466 1.673 1.86 2.032 2.35 2.498 2.64 2.771 3.042 3.18 3.44 3.686 3.923 4.039 4.247 4.443 4.729 4.904 5.078 5.351 5.609 5.845 6.073 6.298 6.578 6.852 7.135 7.464 7.765 8.058 8.42 8.826 9.199 9.616 10.063 10.531 11.033 11.591 12.231 12.877 13.627 14.448 15.372 16.39 17.562 18.83 20.242 21.29 21.7 21.823 21.795 21.695 21.537 21.342 21.148 20.914 20.699 20.491 20.277 20.054 19.832 19.621 19.398 19.202 19.018 18.828 18.63 18.455 18.276 18.094 17.94 17.761 17.586 17.413 17.226 17.09 16.955 16.738 16.58 16.425 16.346 16.18 16.007 15.825 15.721 15.483 15.38 15.252 15.117 14.845 14.698 14.527 14.349 14.159 13.905 13.566 12.77 -6 ,25414 ,TETRA ,17585337,Sat Nov 27 13:00:51 CET,Sat Nov 27 15:10:05 CET,0.0 0.952 1.35 1.663 1.905 2.114 2.332 2.512 2.808 2.962 3.111 3.242 3.515 3.64 3.891 4.134 4.362 4.469 4.672 4.87 5.15 5.332 5.511 5.763 6.008 6.244 6.465 6.684 6.973 7.251 7.527 7.858 8.169 8.465 8.816 9.206 9.586 10.007 10.444 10.905 11.381 11.925 12.571 13.23 14.011 14.843 15.77 16.827 18.027 19.322 20.684 21.618 22.036 22.17 22.139 22.027 21.894 21.734 21.535 21.323 21.128 20.929 20.721 20.509 20.303 20.099 19.875 19.672 19.49 19.275 19.056 18.887 18.702 18.5 18.351 18.205 18.049 17.875 17.683 17.539 17.389 17.172 17.021 16.853 16.766 16.597 16.396 16.171 16.058 15.819 15.709 15.585 15.457 15.156 14.977 14.791 14.588 14.379 14.124 13.76 12.86 -7 ,18003 ,TETRA ,17585338,Sat Nov 27 13:01:44 CET,Sat Nov 27 15:09:33 CET,0.0 0.792 1.195 1.507 1.725 1.923 2.123 2.305 2.667 2.83 2.969 3.104 3.377 3.494 3.729 3.966 4.187 4.302 4.525 4.722 5.012 5.203 5.388 5.659 5.914 6.154 6.386 6.613 6.907 7.185 7.462 7.785 8.089 8.388 8.732 9.125 9.507 9.927 10.384 10.869 11.371 11.935 12.594 13.255 14.015 14.835 15.764 16.814 17.985 19.305 20.777 21.772 22.25 22.436 22.445 22.365 22.239 22.08 21.886 21.669 21.463 21.261 21.073 20.885 20.688 20.502 20.304 20.113 19.934 19.745 19.553 19.391 19.219 19.026 18.88 18.728 18.553 18.367 18.179 18.047 17.902 17.68 17.532 17.373 17.289 17.116 16.929 16.739 16.64 16.405 16.3 16.191 16.077 15.822 15.678 15.519 15.327 15.116 14.879 14.602 14.019 -8 ,28276 ,TETRA ,17585339,Sat Nov 27 13:02:46 CET,Sat Nov 27 15:10:21 CET,0.0 0.818 1.135 1.385 1.614 1.822 2.019 2.213 2.547 2.683 2.813 2.943 3.217 3.34 3.573 3.799 4.024 4.13 4.336 4.537 4.807 4.982 5.162 5.418 5.668 5.92 6.161 6.401 6.718 7.009 7.283 7.61 7.922 8.232 8.59 8.966 9.329 9.76 10.218 10.705 11.217 11.762 12.398 13.024 13.741 14.534 15.421 16.422 17.607 18.975 20.452 21.428 21.841 21.97 21.978 21.905 21.746 21.547 21.353 21.149 20.955 20.749 20.546 20.333 20.105 19.902 19.689 19.492 19.314 19.121 18.912 18.742 18.565 18.383 18.241 18.093 17.938 17.757 17.573 17.442 17.3 17.089 16.941 16.79 16.711 16.541 16.368 16.179 16.081 15.853 15.754 15.632 15.499 15.193 15.029 14.851 14.646 14.43 14.22 13.983 13.271 -9 ,3093 ,TETRA ,17585340,Sat Nov 27 13:02:48 CET,Sat Nov 27 15:11:40 CET,0.0 0.856 1.232 1.53 1.761 1.981 2.176 2.362 2.698 2.851 3.002 3.127 3.383 3.509 3.754 3.979 4.198 4.305 4.51 4.698 4.983 5.179 5.367 5.63 5.883 6.126 6.371 6.603 6.882 7.163 7.452 7.795 8.106 8.409 8.765 9.164 9.547 9.968 10.415 10.9 11.403 11.968 12.647 13.313 14.068 14.883 15.806 16.806 17.909 19.168 20.614 21.601 21.973 22.072 22.042 21.934 21.765 21.58 21.404 21.189 20.986 20.793 20.578 20.365 20.173 19.988 19.782 19.588 19.415 19.225 19.024 18.856 18.677 18.496 18.355 18.191 18.017 17.842 17.639 17.503 17.378 17.177 17.033 16.882 16.802 16.636 16.45 16.245 16.133 15.899 15.806 15.692 15.56 15.263 15.105 14.937 14.746 14.527 14.296 14.001 13.428 -10 ,5575 ,TETRA ,17585341,Sat Nov 27 13:02:46 CET,Sat Nov 27 15:09:51 CET,0.0 0.827 1.169 1.427 1.654 1.87 2.071 2.259 2.611 2.77 2.923 3.077 3.348 3.476 3.74 3.998 4.226 4.329 4.532 4.729 5.004 5.192 5.382 5.647 5.896 6.137 6.372 6.599 6.888 7.166 7.423 7.728 8.031 8.325 8.675 9.086 9.476 9.891 10.327 10.78 11.274 11.836 12.489 13.137 13.89 14.721 15.663 16.725 17.945 19.298 20.779 21.754 22.123 22.244 22.242 22.146 21.978 21.792 21.62 21.457 21.301 21.129 20.934 20.72 20.523 20.332 20.128 19.962 19.803 19.628 19.442 19.274 19.092 18.904 18.747 18.585 18.425 18.263 18.094 17.966 17.829 17.608 17.454 17.302 17.226 17.059 16.884 16.709 16.611 16.373 16.254 16.136 16.01 15.718 15.578 15.422 15.239 15.051 14.831 14.52 13.719 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index 6781d16f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10851 ,TETRA ,17585342,Sat Nov 27 13:02:47 CET,Sat Nov 27 15:06:55 CET,0.0 0.811 1.221 1.551 1.792 1.978 2.155 2.326 2.634 2.773 2.917 3.069 3.303 3.416 3.635 3.831 4.013 4.106 4.279 4.446 4.707 4.869 5.015 5.222 5.416 5.602 5.775 5.94 6.148 6.355 6.558 6.795 7.011 7.208 7.442 7.701 7.954 8.247 8.532 8.805 9.106 9.427 9.782 10.147 10.512 10.856 11.183 11.459 11.673 11.754 11.499 10.717 9.924 9.147 8.387 7.69 7.068 6.474 5.929 5.364 4.898 4.501 4.119 3.737 3.357 3.018 2.675 2.357 2.081 1.801 1.505 1.257 1.006 0.748 0.541 0.339 0.124 -0.11 -0.346 -0.517 -0.699 -0.976 -1.167 -1.361 -1.459 -1.668 -1.892 -2.13 -2.248 -2.491 -2.643 -2.772 -2.908 -3.247 -3.447 -3.65 -3.868 -4.131 -4.437 -4.828 -5.846 -2 ,27725 ,TETRA ,17585343,Sat Nov 27 13:02:47 CET,Sat Nov 27 15:14:52 CET,0.0 0.846 1.212 1.492 1.706 1.885 2.065 2.237 2.532 2.665 2.789 2.925 3.157 3.26 3.448 3.643 3.821 3.901 4.058 4.214 4.441 4.587 4.726 4.913 5.088 5.259 5.426 5.581 5.778 5.982 6.173 6.386 6.594 6.803 7.036 7.294 7.557 7.835 8.116 8.391 8.662 8.975 9.317 9.621 9.936 10.232 10.513 10.772 10.973 10.979 10.523 9.684 8.798 7.958 7.177 6.414 5.758 5.164 4.614 4.063 3.603 3.178 2.764 2.371 2.003 1.667 1.312 1.009 0.753 0.476 0.193 -0.041 -0.289 -0.55 -0.755 -0.958 -1.166 -1.395 -1.649 -1.816 -1.986 -2.249 -2.427 -2.618 -2.711 -2.9 -3.111 -3.329 -3.442 -3.682 -3.826 -3.973 -4.135 -4.482 -4.675 -4.87 -5.083 -5.345 -5.64 -6.005 -6.932 -3 ,1235 ,TETRA ,17585344,Sat Nov 27 13:03:45 CET,Sat Nov 27 15:13:09 CET,0.0 0.912 1.269 1.524 1.739 1.957 2.171 2.358 2.679 2.83 2.979 3.128 3.364 3.485 3.713 3.916 4.109 4.205 4.391 4.557 4.785 4.938 5.083 5.288 5.49 5.696 5.898 6.091 6.315 6.529 6.747 6.988 7.211 7.426 7.682 7.958 8.22 8.505 8.792 9.107 9.429 9.746 10.093 10.435 10.812 11.218 11.631 11.957 12.225 12.374 12.149 11.455 10.638 9.79 8.991 8.265 7.644 7.065 6.532 6.0 5.542 5.124 4.709 4.314 3.952 3.613 3.258 2.933 2.657 2.38 2.085 1.832 1.572 1.3 1.077 0.858 0.635 0.397 0.154 -0.022 -0.206 -0.495 -0.691 -0.882 -0.977 -1.207 -1.464 -1.703 -1.825 -2.08 -2.24 -2.385 -2.546 -2.902 -3.09 -3.287 -3.508 -3.769 -4.057 -4.425 -5.352 -4 ,6816 ,TETRA ,17585345,Sat Nov 27 13:04:47 CET,Sat Nov 27 15:12:23 CET,0.0 0.874 1.226 1.512 1.749 1.969 2.177 2.358 2.678 2.82 2.952 3.086 3.311 3.415 3.616 3.811 3.993 4.091 4.287 4.457 4.695 4.845 4.986 5.188 5.387 5.574 5.748 5.917 6.137 6.344 6.546 6.791 7.015 7.22 7.46 7.73 7.967 8.225 8.522 8.821 9.109 9.426 9.77 10.105 10.479 10.827 11.156 11.483 11.74 11.788 11.487 10.722 9.886 9.089 8.336 7.615 6.973 6.387 5.881 5.363 4.907 4.489 4.086 3.711 3.37 3.059 2.73 2.434 2.179 1.911 1.615 1.371 1.124 0.873 0.677 0.476 0.272 0.053 -0.187 -0.35 -0.515 -0.778 -0.961 -1.152 -1.25 -1.462 -1.696 -1.938 -2.058 -2.298 -2.431 -2.572 -2.724 -3.088 -3.293 -3.502 -3.727 -3.957 -4.228 -4.589 -5.449 -5 ,30995 ,TETRA ,17585346,Sat Nov 27 13:04:44 CET,Sat Nov 27 15:13:41 CET,0.0 0.792 1.14 1.4 1.616 1.825 2.029 2.213 2.552 2.707 2.848 2.998 3.23 3.343 3.572 3.785 3.968 4.054 4.231 4.401 4.631 4.785 4.937 5.146 5.338 5.512 5.683 5.866 6.112 6.334 6.522 6.747 6.985 7.216 7.461 7.726 7.977 8.248 8.536 8.818 9.105 9.429 9.775 10.081 10.387 10.675 10.988 11.304 11.54 11.554 11.209 10.414 9.51 8.688 7.927 7.201 6.571 6.005 5.5 4.983 4.519 4.09 3.689 3.311 2.952 2.628 2.293 1.989 1.733 1.477 1.192 0.947 0.698 0.432 0.222 -0.005 -0.238 -0.473 -0.714 -0.88 -1.059 -1.328 -1.509 -1.697 -1.796 -2.018 -2.254 -2.509 -2.655 -2.923 -3.086 -3.223 -3.364 -3.707 -3.894 -4.098 -4.327 -4.611 -4.951 -5.331 -6.318 -6 ,5170 ,TETRA ,17585347,Sat Nov 27 13:04:48 CET,Sat Nov 27 15:13:44 CET,0.0 0.886 1.302 1.577 1.815 2.075 2.298 2.474 2.786 2.933 3.076 3.224 3.474 3.595 3.819 4.028 4.225 4.322 4.511 4.678 4.9 5.054 5.208 5.417 5.621 5.814 5.999 6.187 6.406 6.606 6.795 7.009 7.235 7.457 7.711 7.992 8.246 8.519 8.799 9.099 9.412 9.733 10.115 10.51 10.925 11.341 11.746 12.126 12.423 12.528 12.204 11.331 10.417 9.575 8.779 8.028 7.373 6.779 6.254 5.708 5.227 4.798 4.388 4.01 3.677 3.352 2.993 2.682 2.41 2.125 1.838 1.596 1.336 1.067 0.869 0.673 0.462 0.234 -0.014 -0.197 -0.381 -0.647 -0.84 -1.049 -1.149 -1.35 -1.582 -1.847 -1.981 -2.234 -2.375 -2.518 -2.676 -3.052 -3.256 -3.464 -3.703 -3.964 -4.273 -4.625 -5.528 -7 ,31399 ,TETRA ,17585348,Sat Nov 27 13:05:45 CET,Sat Nov 27 15:13:02 CET,0.0 0.968 1.381 1.711 1.991 2.206 2.399 2.574 2.871 3.015 3.158 3.327 3.574 3.689 3.893 4.084 4.265 4.353 4.53 4.703 4.954 5.103 5.248 5.456 5.651 5.853 6.051 6.239 6.48 6.704 6.91 7.149 7.373 7.601 7.867 8.153 8.416 8.693 8.979 9.261 9.55 9.858 10.205 10.532 10.863 11.21 11.562 11.867 12.106 12.135 11.735 10.887 9.97 9.1 8.336 7.645 7.024 6.448 5.906 5.318 4.817 4.38 3.961 3.566 3.191 2.844 2.467 2.13 1.848 1.552 1.237 0.966 0.69 0.409 0.194 -0.027 -0.254 -0.489 -0.733 -0.898 -1.073 -1.349 -1.541 -1.742 -1.847 -2.059 -2.279 -2.514 -2.63 -2.878 -3.04 -3.188 -3.331 -3.636 -3.82 -4.013 -4.217 -4.461 -4.765 -5.146 -6.119 -8 ,23170 ,TETRA ,17585349,Sat Nov 27 13:05:45 CET,Sat Nov 27 15:13:48 CET,0.0 0.823 1.141 1.378 1.597 1.813 1.991 2.163 2.487 2.625 2.748 2.865 3.097 3.215 3.433 3.627 3.804 3.896 4.092 4.265 4.485 4.635 4.785 4.989 5.176 5.353 5.528 5.701 5.937 6.16 6.37 6.627 6.872 7.094 7.343 7.612 7.863 8.135 8.404 8.677 8.963 9.273 9.646 10.028 10.394 10.705 11.013 11.343 11.645 11.779 11.602 10.977 10.22 9.501 8.795 8.112 7.494 6.925 6.434 5.929 5.494 5.088 4.68 4.308 3.973 3.653 3.306 2.993 2.718 2.445 2.166 1.928 1.686 1.435 1.232 1.012 0.793 0.568 0.327 0.163 -0.003 -0.273 -0.464 -0.648 -0.751 -0.977 -1.22 -1.467 -1.592 -1.84 -1.984 -2.143 -2.32 -2.697 -2.892 -3.101 -3.335 -3.585 -3.861 -4.233 -5.347 -9 ,20918 ,TETRA ,17585350,Sat Nov 27 13:06:45 CET,Sat Nov 27 15:16:30 CET,0.0 0.796 1.163 1.512 1.793 2.009 2.205 2.377 2.698 2.843 2.989 3.164 3.395 3.5 3.712 3.914 4.101 4.19 4.36 4.525 4.753 4.892 5.028 5.226 5.429 5.631 5.818 5.998 6.222 6.422 6.611 6.838 7.056 7.278 7.534 7.772 8.003 8.283 8.573 8.869 9.156 9.465 9.837 10.16 10.494 10.876 11.277 11.613 11.848 11.937 11.602 10.705 9.767 8.934 8.203 7.524 6.88 6.268 5.733 5.199 4.754 4.352 3.966 3.606 3.26 2.939 2.611 2.314 2.049 1.768 1.47 1.22 0.957 0.668 0.434 0.204 -0.022 -0.26 -0.508 -0.678 -0.867 -1.178 -1.398 -1.617 -1.721 -1.941 -2.182 -2.45 -2.595 -2.868 -3.039 -3.184 -3.332 -3.675 -3.873 -4.087 -4.329 -4.598 -4.915 -5.335 -6.348 -10 ,6634 ,TETRA ,17585351,Sat Nov 27 13:06:44 CET,Sat Nov 27 15:16:23 CET,0.0 0.789 1.162 1.459 1.683 1.89 2.071 2.226 2.544 2.698 2.835 2.986 3.216 3.322 3.54 3.746 3.949 4.041 4.208 4.373 4.602 4.749 4.891 5.092 5.284 5.476 5.664 5.84 6.065 6.283 6.478 6.725 6.985 7.221 7.459 7.726 7.991 8.271 8.555 8.83 9.099 9.406 9.789 10.152 10.518 10.881 11.244 11.549 11.771 11.823 11.499 10.721 9.9 9.086 8.324 7.619 6.962 6.367 5.866 5.361 4.913 4.497 4.104 3.744 3.402 3.091 2.766 2.451 2.183 1.908 1.612 1.376 1.139 0.888 0.68 0.464 0.242 0.008 -0.238 -0.403 -0.568 -0.832 -1.014 -1.199 -1.296 -1.492 -1.7 -1.923 -2.042 -2.278 -2.429 -2.568 -2.716 -3.048 -3.215 -3.401 -3.611 -3.849 -4.178 -4.642 -5.641 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 4fcc7721..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18450 ,TETRA ,17585352,Sat Nov 27 13:06:45 CET,Sat Nov 27 15:15:04 CET,0.0 0.856 1.22 1.505 1.752 1.973 2.177 2.357 2.675 2.827 2.968 3.138 3.396 3.534 3.777 4.0 4.2 4.295 4.489 4.665 4.917 5.089 5.254 5.49 5.702 5.897 6.084 6.265 6.494 6.701 6.901 7.145 7.374 7.585 7.816 8.063 8.306 8.566 8.836 9.111 9.382 9.68 10.042 10.402 10.738 11.051 11.371 11.627 11.802 11.817 11.482 10.659 9.737 8.855 8.013 7.237 6.573 5.93 5.367 4.833 4.387 3.975 3.552 3.147 2.796 2.48 2.142 1.843 1.585 1.304 1.001 0.758 0.506 0.236 0.019 -0.209 -0.434 -0.655 -0.881 -1.036 -1.197 -1.456 -1.635 -1.808 -1.899 -2.088 -2.292 -2.535 -2.67 -2.917 -3.087 -3.242 -3.4 -3.727 -3.911 -4.118 -4.339 -4.572 -4.841 -5.207 -6.124 -2 ,19814 ,TETRA ,17585353,Sat Nov 27 13:07:44 CET,Sat Nov 27 15:19:02 CET,0.0 1.212 1.701 2.02 2.256 2.465 2.66 2.853 3.244 3.42 3.573 3.747 3.994 4.119 4.349 4.576 4.791 4.892 5.099 5.29 5.545 5.709 5.867 6.112 6.352 6.569 6.766 6.953 7.209 7.451 7.66 7.906 8.133 8.331 8.555 8.803 9.046 9.337 9.655 9.951 10.212 10.498 10.818 11.111 11.426 11.736 12.035 12.325 12.539 12.514 12.045 11.042 10.012 9.083 8.263 7.512 6.819 6.178 5.64 5.11 4.639 4.218 3.825 3.449 3.081 2.738 2.385 2.069 1.801 1.527 1.236 0.995 0.742 0.476 0.273 0.053 -0.177 -0.411 -0.672 -0.84 -1.009 -1.279 -1.457 -1.654 -1.757 -1.97 -2.199 -2.441 -2.565 -2.804 -2.975 -3.125 -3.281 -3.626 -3.81 -3.997 -4.217 -4.467 -4.746 -5.175 -6.131 -3 ,32672 ,TETRA ,17585354,Sat Nov 27 13:08:46 CET,Sat Nov 27 15:18:23 CET,0.0 0.848 1.29 1.64 1.91 2.129 2.32 2.495 2.821 2.977 3.124 3.289 3.529 3.653 3.899 4.119 4.324 4.424 4.613 4.787 5.031 5.185 5.338 5.574 5.795 5.999 6.192 6.37 6.6 6.818 7.015 7.256 7.48 7.684 7.935 8.209 8.443 8.723 9.04 9.356 9.656 9.992 10.366 10.665 10.99 11.333 11.704 12.045 12.293 12.331 11.893 10.983 10.04 9.13 8.304 7.539 6.874 6.261 5.721 5.201 4.764 4.356 3.941 3.552 3.202 2.873 2.535 2.236 1.972 1.695 1.412 1.171 0.918 0.664 0.455 0.242 0.032 -0.187 -0.418 -0.581 -0.751 -1.001 -1.173 -1.378 -1.49 -1.709 -1.947 -2.192 -2.303 -2.539 -2.67 -2.8 -2.949 -3.25 -3.406 -3.59 -3.798 -4.049 -4.335 -4.697 -5.535 -4 ,30591 ,TETRA ,17585355,Sat Nov 27 13:09:45 CET,Sat Nov 27 15:18:15 CET,0.0 0.797 1.156 1.439 1.694 1.932 2.145 2.32 2.595 2.733 2.878 3.035 3.272 3.385 3.595 3.8 3.999 4.102 4.3 4.473 4.712 4.868 5.017 5.236 5.453 5.651 5.84 6.022 6.251 6.468 6.674 6.924 7.165 7.397 7.66 7.945 8.219 8.519 8.829 9.147 9.464 9.815 10.211 10.559 10.894 11.214 11.526 11.809 11.996 11.969 11.56 10.628 9.634 8.705 7.854 7.106 6.444 5.815 5.27 4.732 4.258 3.826 3.42 3.055 2.71 2.384 2.026 1.704 1.434 1.157 0.876 0.638 0.38 0.099 -0.118 -0.328 -0.533 -0.748 -0.98 -1.144 -1.311 -1.556 -1.735 -1.931 -2.03 -2.25 -2.492 -2.724 -2.833 -3.06 -3.195 -3.33 -3.48 -3.829 -4.013 -4.212 -4.446 -4.697 -4.998 -5.387 -6.065 -5 ,7646 ,TETRA ,17585356,Sat Nov 27 13:09:45 CET,Sat Nov 27 15:17:46 CET,0.0 0.782 1.135 1.407 1.62 1.811 1.995 2.183 2.517 2.667 2.804 2.926 3.136 3.249 3.477 3.68 3.86 3.942 4.107 4.264 4.499 4.647 4.786 4.986 5.168 5.357 5.55 5.735 5.971 6.187 6.387 6.627 6.865 7.071 7.285 7.544 7.799 8.078 8.372 8.68 9.001 9.338 9.693 10.015 10.326 10.641 10.954 11.221 11.407 11.395 11.037 10.177 9.24 8.354 7.525 6.776 6.113 5.504 4.97 4.433 3.967 3.547 3.155 2.782 2.427 2.1 1.749 1.439 1.18 0.909 0.611 0.36 0.107 -0.155 -0.355 -0.564 -0.787 -1.009 -1.233 -1.398 -1.571 -1.834 -2.009 -2.18 -2.274 -2.486 -2.719 -2.959 -3.081 -3.326 -3.487 -3.641 -3.799 -4.115 -4.297 -4.49 -4.711 -4.979 -5.284 -5.675 -6.728 -6 ,8019 ,TETRA ,17585357,Sat Nov 27 13:09:45 CET,Sat Nov 27 15:17:51 CET,0.0 1.017 1.359 1.633 1.872 2.085 2.29 2.495 2.875 3.038 3.18 3.335 3.593 3.729 3.976 4.18 4.354 4.445 4.635 4.821 5.091 5.26 5.427 5.665 5.889 6.098 6.287 6.471 6.702 6.918 7.125 7.373 7.613 7.845 8.107 8.377 8.638 8.922 9.21 9.491 9.749 10.034 10.363 10.67 11.01 11.369 11.723 12.035 12.3 12.406 12.094 11.295 10.391 9.523 8.709 7.948 7.279 6.657 6.116 5.57 5.085 4.651 4.231 3.828 3.472 3.154 2.803 2.467 2.173 1.882 1.592 1.352 1.102 0.843 0.645 0.438 0.218 -0.014 -0.258 -0.419 -0.582 -0.834 -1.009 -1.198 -1.299 -1.517 -1.744 -1.975 -2.098 -2.337 -2.485 -2.623 -2.773 -3.128 -3.313 -3.492 -3.688 -3.928 -4.223 -4.581 -5.422 -7 ,32116 ,TETRA ,17585358,Sat Nov 27 13:09:45 CET,Sat Nov 27 15:11:53 CET,0.0 1.039 1.457 1.742 1.967 2.15 2.329 2.505 2.809 2.95 3.082 3.211 3.432 3.538 3.749 3.946 4.131 4.228 4.425 4.608 4.86 5.025 5.194 5.432 5.65 5.851 6.042 6.219 6.442 6.655 6.847 7.088 7.341 7.562 7.801 8.075 8.32 8.583 8.845 9.109 9.375 9.655 9.985 10.305 10.636 10.984 11.337 11.599 11.77 11.795 11.407 10.555 9.662 8.786 7.983 7.247 6.59 5.981 5.42 4.86 4.393 3.965 3.564 3.198 2.85 2.509 2.15 1.845 1.578 1.29 0.993 0.754 0.507 0.236 0.013 -0.211 -0.429 -0.659 -0.892 -1.049 -1.212 -1.481 -1.674 -1.852 -1.94 -2.135 -2.349 -2.565 -2.681 -2.922 -3.069 -3.208 -3.359 -3.677 -3.848 -4.031 -4.23 -4.456 -4.713 -5.025 -5.626 -8 ,23053 ,TETRA ,17585359,Sat Nov 27 13:09:46 CET,Sat Nov 27 15:18:31 CET,0.0 0.932 1.293 1.6 1.902 2.145 2.352 2.555 2.892 3.044 3.202 3.357 3.571 3.668 3.878 4.082 4.27 4.362 4.547 4.725 4.982 5.146 5.305 5.543 5.76 5.951 6.126 6.294 6.518 6.726 6.926 7.18 7.417 7.636 7.88 8.137 8.383 8.649 8.937 9.242 9.551 9.887 10.237 10.575 10.95 11.289 11.596 11.891 12.114 12.122 11.699 10.783 9.772 8.797 7.953 7.241 6.613 6.013 5.502 4.986 4.532 4.119 3.712 3.324 2.973 2.65 2.31 2.009 1.737 1.45 1.153 0.908 0.657 0.399 0.206 0.004 -0.216 -0.44 -0.669 -0.839 -1.016 -1.278 -1.465 -1.664 -1.766 -1.981 -2.222 -2.456 -2.567 -2.793 -2.948 -3.105 -3.266 -3.595 -3.764 -3.947 -4.149 -4.38 -4.659 -4.992 -5.637 -9 ,23884 ,TETRA ,17585360,Sat Nov 27 13:09:46 CET,Sat Nov 27 15:18:53 CET,0.0 0.836 1.215 1.538 1.783 1.988 2.177 2.339 2.654 2.799 2.932 3.094 3.337 3.463 3.696 3.901 4.097 4.196 4.405 4.593 4.858 5.029 5.186 5.406 5.612 5.819 6.01 6.198 6.447 6.686 6.917 7.19 7.447 7.697 7.965 8.256 8.526 8.798 9.105 9.451 9.79 10.123 10.459 10.768 11.101 11.45 11.781 12.063 12.309 12.346 11.959 11.038 10.075 9.166 8.323 7.541 6.829 6.191 5.64 5.083 4.613 4.196 3.799 3.423 3.066 2.726 2.358 2.021 1.744 1.462 1.168 0.922 0.653 0.39 0.192 -0.016 -0.224 -0.444 -0.668 -0.817 -0.982 -1.268 -1.464 -1.658 -1.763 -1.985 -2.209 -2.438 -2.558 -2.805 -2.962 -3.089 -3.231 -3.557 -3.736 -3.928 -4.132 -4.368 -4.65 -5.041 -5.885 -10 ,14128 ,TETRA ,17585361,Sat Nov 27 13:10:44 CET,Sat Nov 27 15:16:17 CET,0.0 0.879 1.262 1.556 1.816 2.026 2.208 2.394 2.727 2.87 3.015 3.175 3.401 3.513 3.73 3.938 4.136 4.225 4.391 4.557 4.795 4.94 5.079 5.279 5.475 5.676 5.872 6.058 6.29 6.52 6.724 6.958 7.188 7.41 7.667 7.956 8.215 8.479 8.774 9.07 9.361 9.67 9.993 10.324 10.697 11.036 11.341 11.62 11.808 11.809 11.426 10.491 9.515 8.606 7.796 7.059 6.404 5.789 5.245 4.711 4.253 3.842 3.452 3.057 2.674 2.327 1.972 1.667 1.404 1.118 0.813 0.564 0.303 0.029 -0.172 -0.374 -0.584 -0.81 -1.046 -1.208 -1.382 -1.653 -1.833 -2.023 -2.125 -2.335 -2.561 -2.803 -2.927 -3.17 -3.329 -3.467 -3.613 -3.952 -4.138 -4.316 -4.516 -4.751 -5.048 -5.464 -6.237 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index 347a1251..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6645 ,TETRA ,17585362,Sat Nov 27 13:11:45 CET,Sat Nov 27 15:15:40 CET,0.0 0.518 0.775 1.005 1.224 1.426 1.609 1.755 2.014 2.151 2.284 2.409 2.648 2.762 2.971 3.159 3.338 3.427 3.599 3.752 3.976 4.133 4.287 4.51 4.72 4.921 5.119 5.315 5.568 5.811 6.045 6.328 6.59 6.841 7.152 7.505 7.836 8.172 8.513 8.882 9.297 9.767 10.275 10.802 11.41 12.012 12.635 13.28 14.007 14.747 15.368 15.611 15.539 15.281 14.921 14.52 14.131 13.709 13.276 12.818 12.45 12.136 11.823 11.507 11.174 10.846 10.531 10.241 9.98 9.705 9.418 9.178 8.902 8.606 8.376 8.13 7.883 7.634 7.363 7.173 6.978 6.659 6.438 6.222 6.105 5.834 5.548 5.258 5.112 4.846 4.631 4.448 4.257 3.824 3.589 3.333 3.01 2.61 2.102 1.348 -1.092 -2 ,16957 ,TETRA ,17585363,Sat Nov 27 13:13:45 CET,Sat Nov 27 15:24:06 CET,0.0 0.735 1.033 1.266 1.47 1.639 1.789 1.923 2.184 2.317 2.451 2.589 2.824 2.936 3.149 3.336 3.511 3.598 3.772 3.941 4.181 4.335 4.481 4.698 4.911 5.12 5.32 5.504 5.733 5.96 6.185 6.455 6.709 6.952 7.239 7.559 7.858 8.185 8.535 8.89 9.244 9.634 10.086 10.534 11.037 11.58 12.195 12.849 13.526 14.209 14.79 14.98 14.855 14.623 14.311 13.913 13.494 13.081 12.697 12.27 11.9 11.529 11.156 10.821 10.521 10.242 9.917 9.616 9.355 9.075 8.771 8.512 8.232 7.944 7.724 7.5 7.259 6.993 6.706 6.506 6.316 6.027 5.813 5.571 5.439 5.168 4.888 4.588 4.426 4.142 3.917 3.728 3.526 3.1 2.836 2.52 2.189 1.821 1.372 0.757 -1.324 -3 ,2539 ,TETRA ,17585364,Sat Nov 27 13:15:51 CET,Sat Nov 27 15:23:39 CET,0.0 0.629 0.955 1.188 1.38 1.564 1.734 1.875 2.155 2.293 2.416 2.526 2.756 2.862 3.071 3.268 3.459 3.549 3.718 3.878 4.115 4.268 4.419 4.637 4.849 5.053 5.253 5.444 5.69 5.935 6.164 6.43 6.677 6.909 7.186 7.498 7.784 8.105 8.444 8.789 9.163 9.575 10.053 10.538 11.066 11.658 12.316 12.985 13.674 14.405 15.141 15.407 15.288 15.031 14.696 14.292 13.907 13.542 13.18 12.786 12.434 12.103 11.753 11.397 11.055 10.76 10.464 10.184 9.917 9.632 9.334 9.083 8.807 8.496 8.263 8.024 7.773 7.506 7.216 7.006 6.798 6.479 6.243 6.003 5.881 5.62 5.341 5.052 4.907 4.632 4.423 4.249 4.065 3.616 3.351 3.063 2.755 2.393 1.941 1.377 -0.957 -4 ,8971 ,TETRA ,17585365,Sat Nov 27 13:17:49 CET,Sat Nov 27 15:27:15 CET,0.0 0.845 1.18 1.471 1.711 1.936 2.135 2.311 2.621 2.77 2.922 3.081 3.335 3.468 3.703 3.924 4.143 4.245 4.436 4.616 4.87 5.024 5.171 5.385 5.587 5.788 5.984 6.175 6.441 6.7 6.954 7.256 7.52 7.76 8.031 8.336 8.636 8.967 9.305 9.653 10.023 10.421 10.887 11.364 11.91 12.482 13.072 13.728 14.46 15.204 15.905 16.143 15.996 15.676 15.277 14.882 14.517 14.145 13.797 13.438 13.112 12.779 12.427 12.097 11.79 11.509 11.221 10.958 10.717 10.451 10.175 9.944 9.697 9.448 9.25 9.042 8.824 8.579 8.311 8.117 7.914 7.605 7.39 7.181 7.08 6.853 6.61 6.335 6.171 5.893 5.662 5.478 5.291 4.819 4.553 4.257 3.92 3.561 3.08 2.419 -0.128 -5 ,14464 ,TETRA ,17585366,Sat Nov 27 13:17:50 CET,Sat Nov 27 15:23:42 CET,0.0 0.736 1.107 1.412 1.65 1.839 2.002 2.159 2.44 2.567 2.7 2.825 3.053 3.165 3.365 3.55 3.737 3.825 3.993 4.164 4.404 4.564 4.726 4.958 5.18 5.4 5.609 5.802 6.053 6.298 6.522 6.783 7.031 7.268 7.544 7.854 8.149 8.46 8.785 9.132 9.498 9.909 10.393 10.874 11.415 11.997 12.679 13.39 14.138 14.962 15.743 16.04 15.94 15.646 15.303 14.939 14.544 14.123 13.734 13.324 12.921 12.531 12.175 11.876 11.593 11.311 10.979 10.653 10.388 10.135 9.856 9.623 9.392 9.144 8.945 8.732 8.522 8.312 8.088 7.928 7.765 7.495 7.295 7.099 6.992 6.747 6.494 6.233 6.083 5.815 5.616 5.439 5.247 4.819 4.584 4.329 4.051 3.744 3.374 2.819 0.844 -6 ,220 ,TETRA ,17585367,Sat Nov 27 13:17:51 CET,Sat Nov 27 15:24:29 CET,0.0 0.633 0.977 1.224 1.428 1.615 1.784 1.947 2.239 2.38 2.527 2.675 2.905 3.008 3.217 3.426 3.625 3.724 3.918 4.094 4.34 4.511 4.676 4.895 5.116 5.331 5.517 5.694 5.917 6.125 6.335 6.594 6.845 7.087 7.353 7.658 7.963 8.284 8.616 8.975 9.355 9.772 10.263 10.744 11.28 11.862 12.475 13.122 13.84 14.514 14.933 14.897 14.605 14.233 13.838 13.374 12.893 12.457 12.079 11.695 11.342 10.996 10.646 10.308 10.0 9.716 9.399 9.097 8.836 8.554 8.26 8.016 7.743 7.451 7.221 6.979 6.744 6.506 6.245 6.054 5.849 5.511 5.282 5.051 4.928 4.669 4.397 4.099 3.935 3.644 3.406 3.206 3.0 2.575 2.321 2.02 1.702 1.34 0.882 0.198 -2.764 -7 ,3859 ,TETRA ,17585368,Sat Nov 27 13:17:51 CET,Sat Nov 27 15:15:46 CET,0.0 0.461 0.757 1.007 1.219 1.413 1.585 1.747 2.061 2.197 2.31 2.408 2.636 2.746 2.964 3.171 3.359 3.451 3.628 3.805 4.05 4.197 4.344 4.569 4.778 4.968 5.155 5.34 5.576 5.797 6.023 6.3 6.555 6.796 7.078 7.384 7.674 8.001 8.35 8.705 9.057 9.453 9.926 10.396 10.931 11.482 12.117 12.857 13.65 14.436 15.092 15.208 14.946 14.567 14.213 13.868 13.538 13.216 12.886 12.498 12.095 11.683 11.286 10.916 10.554 10.221 9.882 9.579 9.322 9.055 8.761 8.513 8.247 7.948 7.715 7.475 7.212 6.952 6.693 6.5 6.297 5.967 5.743 5.523 5.403 5.145 4.865 4.567 4.402 4.117 3.872 3.655 3.426 2.935 2.666 2.373 2.033 1.616 1.107 0.448 -1.865 -8 ,13957 ,TETRA ,17585369,Sat Nov 27 13:17:51 CET,Sat Nov 27 15:26:43 CET,0.0 0.718 1.0 1.229 1.438 1.626 1.798 1.961 2.245 2.382 2.513 2.637 2.881 3.011 3.233 3.429 3.626 3.721 3.896 4.066 4.306 4.465 4.621 4.836 5.047 5.252 5.451 5.644 5.88 6.105 6.326 6.587 6.832 7.071 7.353 7.663 7.964 8.285 8.613 8.944 9.301 9.702 10.148 10.613 11.164 11.729 12.366 13.071 13.811 14.565 15.249 15.456 15.346 14.999 14.581 14.161 13.741 13.341 12.991 12.624 12.259 11.898 11.543 11.21 10.888 10.577 10.232 9.921 9.65 9.372 9.092 8.865 8.628 8.355 8.142 7.931 7.715 7.482 7.217 7.037 6.858 6.559 6.338 6.096 5.968 5.693 5.412 5.13 4.981 4.704 4.474 4.294 4.102 3.659 3.412 3.142 2.839 2.506 2.081 1.431 -0.657 -9 ,31926 ,TETRA ,17585370,Sat Nov 27 13:19:49 CET,Sat Nov 27 15:29:35 CET,0.0 0.656 0.98 1.225 1.446 1.629 1.792 1.956 2.252 2.386 2.508 2.621 2.851 2.97 3.199 3.39 3.568 3.664 3.841 3.999 4.252 4.413 4.563 4.779 4.992 5.199 5.394 5.592 5.84 6.048 6.25 6.507 6.764 6.997 7.251 7.546 7.835 8.143 8.477 8.828 9.186 9.587 10.064 10.548 11.084 11.642 12.24 12.866 13.555 14.26 14.906 15.118 14.972 14.664 14.214 13.727 13.293 12.843 12.396 11.957 11.598 11.244 10.869 10.537 10.247 9.965 9.665 9.397 9.159 8.925 8.665 8.432 8.208 7.984 7.796 7.592 7.383 7.164 6.925 6.754 6.563 6.272 6.083 5.873 5.756 5.501 5.24 4.967 4.798 4.513 4.308 4.128 3.927 3.497 3.28 3.026 2.729 2.39 1.963 1.317 -0.751 -10 ,18791 ,TETRA ,17585371,Sat Nov 27 13:19:50 CET,Sat Nov 27 15:29:30 CET,0.0 1.067 1.43 1.727 1.973 2.178 2.363 2.54 2.844 2.982 3.118 3.255 3.488 3.602 3.817 4.014 4.203 4.294 4.463 4.626 4.877 5.039 5.188 5.397 5.598 5.797 5.99 6.186 6.433 6.662 6.886 7.158 7.419 7.67 7.943 8.241 8.536 8.849 9.207 9.611 9.999 10.415 10.89 11.341 11.847 12.395 12.996 13.635 14.326 14.963 15.49 15.599 15.385 15.058 14.654 14.264 13.889 13.474 13.072 12.629 12.223 11.86 11.543 11.241 10.933 10.621 10.271 9.964 9.716 9.467 9.208 8.982 8.724 8.459 8.253 8.041 7.828 7.568 7.267 7.068 6.888 6.609 6.385 6.156 6.045 5.796 5.504 5.181 5.013 4.721 4.44 4.222 3.992 3.489 3.234 2.974 2.65 2.271 1.839 1.289 -0.977 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt deleted file mode 100644 index 85463ea6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22570 ,TETRA ,17585372,Sat Nov 27 13:21:51 CET,Sat Nov 27 15:31:29 CET,0.0 0.706 0.994 1.229 1.435 1.64 1.838 2.007 2.306 2.441 2.565 2.705 2.932 3.043 3.26 3.469 3.666 3.764 3.955 4.129 4.373 4.535 4.688 4.903 5.114 5.318 5.512 5.699 5.94 6.176 6.406 6.68 6.944 7.194 7.472 7.796 8.11 8.439 8.788 9.153 9.515 9.899 10.347 10.805 11.316 11.867 12.485 13.162 13.87 14.531 15.032 15.042 14.747 14.348 13.909 13.456 13.023 12.576 12.15 11.738 11.382 11.009 10.635 10.297 9.972 9.666 9.331 9.023 8.777 8.54 8.271 8.021 7.761 7.477 7.255 7.015 6.768 6.531 6.262 6.061 5.852 5.525 5.29 5.048 4.934 4.709 4.445 4.162 4.022 3.752 3.489 3.29 3.072 2.639 2.393 2.097 1.786 1.437 1.05 0.481 -1.464 -2 ,12717 ,TETRA ,17585373,Sat Nov 27 13:22:51 CET,Sat Nov 27 15:31:29 CET,0.0 0.991 1.374 1.669 1.909 2.112 2.296 2.474 2.764 2.893 3.029 3.182 3.41 3.518 3.729 3.934 4.123 4.214 4.404 4.592 4.852 5.015 5.168 5.394 5.614 5.824 6.03 6.221 6.459 6.694 6.924 7.186 7.443 7.687 7.953 8.258 8.557 8.88 9.223 9.586 9.963 10.379 10.839 11.296 11.816 12.373 13.011 13.676 14.395 15.128 15.746 15.842 15.634 15.339 14.976 14.591 14.208 13.815 13.453 13.064 12.685 12.34 12.004 11.676 11.371 11.07 10.736 10.433 10.175 9.91 9.614 9.347 9.079 8.818 8.614 8.384 8.133 7.89 7.626 7.436 7.248 6.943 6.722 6.494 6.382 6.143 5.874 5.591 5.432 5.15 4.889 4.701 4.49 3.998 3.741 3.466 3.17 2.849 2.447 1.84 0.104 -3 ,2547 ,TETRA ,17585374,Sat Nov 27 13:22:51 CET,Sat Nov 27 15:30:18 CET,0.0 0.802 1.121 1.357 1.587 1.799 1.972 2.137 2.479 2.639 2.78 2.935 3.17 3.292 3.514 3.73 3.939 4.033 4.22 4.408 4.67 4.834 4.985 5.209 5.437 5.645 5.838 6.023 6.275 6.523 6.754 7.043 7.313 7.565 7.863 8.185 8.489 8.816 9.157 9.515 9.895 10.333 10.835 11.314 11.84 12.41 13.063 13.742 14.477 15.276 15.944 16.128 15.973 15.656 15.282 14.874 14.484 14.118 13.796 13.47 13.139 12.788 12.462 12.165 11.857 11.555 11.233 10.935 10.692 10.423 10.1 9.828 9.559 9.294 9.077 8.848 8.612 8.348 8.069 7.884 7.705 7.426 7.236 7.064 6.964 6.716 6.446 6.156 6.008 5.748 5.523 5.338 5.138 4.728 4.501 4.22 3.889 3.491 3.065 2.489 0.818 -4 ,21215 ,TETRA ,17585375,Sat Nov 27 13:22:52 CET,Sat Nov 27 15:28:42 CET,0.0 0.826 1.138 1.371 1.62 1.85 2.048 2.218 2.498 2.632 2.76 2.898 3.133 3.252 3.46 3.646 3.825 3.912 4.08 4.244 4.479 4.637 4.793 5.005 5.199 5.394 5.585 5.765 6.005 6.238 6.457 6.71 6.947 7.178 7.453 7.758 8.04 8.348 8.684 9.047 9.418 9.82 10.284 10.748 11.274 11.844 12.479 13.131 13.785 14.425 14.975 15.097 14.899 14.557 14.156 13.73 13.319 12.926 12.532 12.121 11.766 11.405 11.053 10.727 10.424 10.137 9.789 9.452 9.181 8.905 8.604 8.326 8.024 7.724 7.498 7.253 6.986 6.71 6.427 6.247 6.042 5.715 5.526 5.319 5.195 4.932 4.669 4.398 4.254 3.983 3.724 3.529 3.321 2.875 2.628 2.333 1.995 1.64 1.245 0.668 -0.957 -5 ,6020 ,TETRA ,17585376,Sat Nov 27 13:23:49 CET,Sat Nov 27 15:29:04 CET,0.0 0.879 1.25 1.516 1.759 1.979 2.179 2.364 2.688 2.84 2.978 3.12 3.353 3.471 3.699 3.912 4.107 4.195 4.37 4.55 4.821 4.992 5.147 5.361 5.56 5.762 5.96 6.144 6.393 6.633 6.853 7.11 7.353 7.592 7.878 8.195 8.498 8.833 9.201 9.581 9.942 10.333 10.788 11.235 11.748 12.317 12.933 13.583 14.235 14.887 15.469 15.571 15.333 14.969 14.563 14.117 13.681 13.229 12.758 12.276 11.88 11.511 11.167 10.84 10.497 10.185 9.861 9.556 9.285 9.004 8.719 8.47 8.198 7.933 7.73 7.519 7.281 7.017 6.762 6.588 6.406 6.092 5.856 5.618 5.498 5.26 5.011 4.739 4.585 4.307 4.045 3.857 3.658 3.232 3.004 2.715 2.406 2.081 1.65 1.052 -0.356 -6 ,21810 ,TETRA ,17585377,Sat Nov 27 13:25:50 CET,Sat Nov 27 15:21:29 CET,0.0 0.818 1.167 1.425 1.645 1.863 2.066 2.25 2.596 2.759 2.909 3.084 3.326 3.455 3.713 3.933 4.142 4.249 4.445 4.629 4.9 5.074 5.237 5.468 5.681 5.88 6.086 6.28 6.516 6.748 6.969 7.222 7.459 7.689 7.955 8.255 8.533 8.837 9.17 9.514 9.871 10.272 10.714 11.144 11.62 12.112 12.689 13.349 14.028 14.66 15.158 15.183 14.894 14.475 14.05 13.641 13.231 12.818 12.412 11.998 11.657 11.323 11.004 10.684 10.366 10.074 9.75 9.449 9.181 8.911 8.64 8.401 8.126 7.834 7.608 7.371 7.12 6.859 6.584 6.397 6.207 5.911 5.701 5.461 5.341 5.074 4.779 4.516 4.37 4.095 3.873 3.7 3.496 3.043 2.791 2.502 2.148 1.749 1.303 0.626 -1.53 -7 ,5873 ,TETRA ,17585378,Sat Nov 27 13:25:49 CET,Sat Nov 27 15:34:59 CET,0.0 0.742 1.058 1.33 1.543 1.729 1.92 2.096 2.388 2.525 2.661 2.807 3.034 3.141 3.344 3.553 3.75 3.842 4.013 4.174 4.41 4.565 4.718 4.938 5.148 5.352 5.556 5.751 5.991 6.214 6.427 6.689 6.945 7.186 7.454 7.747 8.03 8.343 8.694 9.072 9.444 9.842 10.327 10.819 11.369 11.965 12.619 13.32 14.063 14.78 15.346 15.443 15.232 14.913 14.538 14.115 13.69 13.293 12.945 12.526 12.141 11.811 11.484 11.133 10.78 10.478 10.196 9.935 9.679 9.403 9.113 8.867 8.611 8.317 8.079 7.856 7.623 7.374 7.125 6.939 6.756 6.486 6.263 6.029 5.909 5.636 5.347 5.049 4.894 4.631 4.407 4.233 4.063 3.656 3.405 3.109 2.785 2.451 2.037 1.423 -0.705 -8 ,29759 ,TETRA ,17585379,Sat Nov 27 13:27:50 CET,Sat Nov 27 15:37:34 CET,0.0 0.826 1.222 1.513 1.73 1.923 2.107 2.275 2.588 2.721 2.843 2.981 3.229 3.358 3.584 3.796 3.986 4.077 4.268 4.452 4.716 4.883 5.043 5.269 5.48 5.696 5.915 6.115 6.353 6.585 6.812 7.077 7.334 7.587 7.87 8.173 8.466 8.799 9.151 9.52 9.92 10.358 10.862 11.36 11.902 12.478 13.125 13.824 14.55 15.268 15.888 16.011 15.743 15.341 14.908 14.46 13.993 13.522 13.096 12.668 12.305 11.954 11.606 11.277 10.963 10.663 10.335 10.054 9.805 9.534 9.245 8.983 8.691 8.396 8.18 7.955 7.714 7.441 7.141 6.949 6.769 6.497 6.29 6.05 5.924 5.676 5.406 5.101 4.94 4.668 4.417 4.226 4.047 3.67 3.433 3.154 2.847 2.486 2.021 1.414 -0.218 -9 ,17204 ,TETRA ,17585380,Sat Nov 27 13:26:49 CET,Sat Nov 27 15:36:14 CET,0.0 0.822 1.179 1.472 1.693 1.878 2.065 2.236 2.555 2.705 2.84 2.96 3.189 3.315 3.549 3.784 3.993 4.087 4.262 4.426 4.666 4.822 4.985 5.208 5.412 5.618 5.817 6.005 6.247 6.494 6.728 6.988 7.238 7.491 7.798 8.14 8.452 8.789 9.149 9.525 9.917 10.371 10.895 11.392 11.932 12.464 13.067 13.761 14.485 15.175 15.734 15.782 15.526 15.175 14.804 14.392 13.971 13.537 13.126 12.693 12.305 11.94 11.6 11.269 10.939 10.631 10.275 9.94 9.669 9.403 9.105 8.834 8.539 8.258 8.039 7.798 7.553 7.292 7.004 6.797 6.585 6.245 6.009 5.767 5.634 5.357 5.071 4.805 4.656 4.381 4.142 3.945 3.741 3.303 3.05 2.754 2.442 2.088 1.632 0.998 -0.704 -10 ,28082 ,TETRA ,17585381,Sat Nov 27 13:27:50 CET,Sat Nov 27 15:44:08 CET,0.0 0.886 1.24 1.514 1.74 1.947 2.161 2.346 2.682 2.837 2.971 3.111 3.349 3.47 3.701 3.918 4.119 4.21 4.386 4.569 4.834 4.998 5.154 5.382 5.593 5.795 5.989 6.172 6.412 6.636 6.848 7.101 7.344 7.589 7.878 8.205 8.497 8.801 9.147 9.522 9.91 10.326 10.819 11.318 11.853 12.419 13.067 13.782 14.527 15.24 15.862 16.015 15.835 15.565 15.219 14.812 14.413 13.982 13.565 13.156 12.786 12.453 12.159 11.872 11.569 11.279 10.978 10.695 10.432 10.159 9.876 9.641 9.408 9.153 8.935 8.712 8.484 8.258 8.029 7.855 7.664 7.343 7.114 6.884 6.762 6.503 6.229 5.928 5.765 5.489 5.232 5.015 4.802 4.335 4.078 3.822 3.517 3.166 2.784 2.279 0.003 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt deleted file mode 100644 index 797aa5ef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8448 ,TETRA ,17585382,Sat Nov 27 13:29:49 CET,Sat Nov 27 15:26:59 CET,0.0 1.197 1.766 2.169 2.529 2.859 3.151 3.405 3.869 4.097 4.3 4.529 4.802 4.966 5.29 5.587 5.861 5.994 6.24 6.474 6.801 7.006 7.208 7.496 7.773 8.036 8.268 8.49 8.777 9.042 9.32 9.672 9.995 10.282 10.568 10.853 11.098 11.354 11.639 11.925 12.191 12.495 12.879 13.22 13.536 13.814 14.061 14.255 14.328 14.153 13.413 12.203 11.129 10.153 9.297 8.509 7.772 7.091 6.504 5.911 5.384 4.914 4.458 4.022 3.626 3.259 2.856 2.492 2.185 1.876 1.56 1.285 0.999 0.702 0.463 0.221 -0.024 -0.302 -0.59 -0.777 -0.967 -1.262 -1.47 -1.694 -1.81 -2.039 -2.287 -2.549 -2.691 -2.972 -3.183 -3.348 -3.521 -3.905 -4.117 -4.35 -4.608 -4.887 -5.272 -5.789 -6.734 -2 ,17827 ,TETRA ,17585383,Sat Nov 27 13:29:50 CET,Sat Nov 27 15:41:43 CET,0.0 1.588 2.105 2.473 2.759 3.015 3.252 3.453 3.799 3.943 4.085 4.26 4.502 4.631 4.877 5.093 5.291 5.398 5.601 5.791 6.083 6.271 6.444 6.686 6.909 7.126 7.33 7.518 7.75 7.964 8.169 8.422 8.659 8.881 9.126 9.374 9.619 9.882 10.143 10.406 10.663 10.959 11.279 11.555 11.793 11.979 12.182 12.359 12.423 12.257 11.566 10.392 9.311 8.36 7.503 6.7 5.937 5.24 4.654 4.056 3.537 3.086 2.65 2.225 1.829 1.469 1.089 0.737 0.429 0.119 -0.197 -0.467 -0.758 -1.065 -1.298 -1.537 -1.781 -2.04 -2.315 -2.513 -2.719 -3.035 -3.245 -3.471 -3.591 -3.831 -4.066 -4.323 -4.468 -4.733 -4.929 -5.088 -5.26 -5.65 -5.864 -6.093 -6.364 -6.685 -7.057 -7.542 -8.708 -3 ,16755 ,TETRA ,17585384,Sat Nov 27 13:32:49 CET,Sat Nov 27 15:46:43 CET,0.0 1.786 2.382 2.83 3.161 3.443 3.693 3.889 4.212 4.374 4.534 4.715 4.948 5.064 5.288 5.498 5.698 5.794 5.968 6.136 6.385 6.533 6.675 6.884 7.079 7.244 7.397 7.553 7.76 7.96 8.162 8.415 8.633 8.822 9.032 9.263 9.485 9.729 9.989 10.231 10.462 10.717 10.984 11.209 11.434 11.657 11.852 12.0 12.054 11.937 11.303 10.129 8.991 7.941 7.012 6.166 5.395 4.675 4.053 3.43 2.905 2.447 1.99 1.578 1.209 0.848 0.468 0.13 -0.176 -0.509 -0.852 -1.124 -1.397 -1.683 -1.903 -2.122 -2.346 -2.591 -2.861 -3.056 -3.247 -3.528 -3.74 -3.961 -4.073 -4.312 -4.568 -4.846 -4.989 -5.253 -5.459 -5.642 -5.835 -6.228 -6.455 -6.7 -6.961 -7.265 -7.602 -8.013 -9.516 -4 ,3415 ,TETRA ,17585385,Sat Nov 27 13:31:47 CET,Sat Nov 27 15:40:01 CET,0.0 1.716 2.25 2.634 2.933 3.186 3.415 3.639 4.044 4.228 4.391 4.571 4.816 4.944 5.176 5.39 5.588 5.684 5.893 6.094 6.351 6.522 6.69 6.914 7.122 7.325 7.522 7.711 7.949 8.165 8.363 8.603 8.834 9.052 9.296 9.552 9.795 10.059 10.327 10.597 10.869 11.163 11.468 11.747 12.041 12.309 12.56 12.76 12.836 12.711 12.125 11.11 10.114 9.17 8.322 7.543 6.837 6.166 5.583 4.999 4.481 4.014 3.564 3.136 2.721 2.325 1.913 1.556 1.25 0.94 0.619 0.363 0.088 -0.227 -0.463 -0.702 -0.944 -1.196 -1.48 -1.684 -1.902 -2.241 -2.469 -2.702 -2.824 -3.075 -3.325 -3.588 -3.728 -3.99 -4.182 -4.349 -4.516 -4.861 -5.049 -5.25 -5.46 -5.702 -6.021 -6.426 -7.478 -5 ,678 ,TETRA ,17585386,Sat Nov 27 13:32:49 CET,Sat Nov 27 15:42:01 CET,0.0 1.812 2.307 2.666 2.971 3.24 3.464 3.674 4.06 4.233 4.399 4.583 4.817 4.937 5.178 5.404 5.616 5.721 5.921 6.111 6.379 6.543 6.709 6.952 7.176 7.387 7.569 7.748 7.988 8.223 8.447 8.692 8.914 9.123 9.362 9.627 9.89 10.179 10.461 10.741 11.014 11.319 11.662 11.98 12.308 12.627 12.936 13.11 13.1 12.885 12.151 10.911 9.755 8.692 7.754 6.893 6.107 5.389 4.763 4.112 3.566 3.079 2.605 2.187 1.797 1.426 1.033 0.679 0.38 0.073 -0.252 -0.521 -0.807 -1.109 -1.343 -1.593 -1.855 -2.121 -2.382 -2.56 -2.757 -3.086 -3.314 -3.533 -3.643 -3.878 -4.142 -4.414 -4.554 -4.814 -4.982 -5.132 -5.296 -5.661 -5.864 -6.072 -6.293 -6.539 -6.821 -7.22 -8.109 -6 ,13423 ,TETRA ,17585387,Sat Nov 27 13:33:48 CET,Sat Nov 27 15:40:04 CET,0.0 1.804 2.316 2.68 2.988 3.255 3.486 3.712 4.138 4.317 4.48 4.66 4.909 5.038 5.289 5.545 5.783 5.898 6.12 6.319 6.61 6.806 6.977 7.196 7.401 7.588 7.771 7.951 8.175 8.404 8.628 8.885 9.117 9.328 9.571 9.849 10.109 10.384 10.657 10.926 11.207 11.501 11.816 12.106 12.375 12.627 12.884 13.107 13.229 13.097 12.429 11.24 10.034 8.946 8.022 7.18 6.432 5.767 5.217 4.64 4.116 3.643 3.199 2.788 2.394 2.028 1.646 1.3 1.001 0.678 0.335 0.057 -0.222 -0.491 -0.704 -0.951 -1.198 -1.423 -1.669 -1.844 -2.014 -2.278 -2.481 -2.706 -2.815 -3.04 -3.297 -3.574 -3.713 -3.972 -4.164 -4.329 -4.505 -4.889 -5.107 -5.348 -5.617 -5.912 -6.236 -6.639 -7.592 -7 ,11043 ,TETRA ,17585388,Sat Nov 27 13:33:48 CET,Sat Nov 27 15:27:01 CET,0.0 1.786 2.36 2.767 3.072 3.344 3.587 3.795 4.169 4.345 4.507 4.682 4.928 5.061 5.307 5.539 5.761 5.871 6.079 6.265 6.517 6.675 6.832 7.06 7.278 7.487 7.69 7.883 8.127 8.363 8.58 8.849 9.102 9.319 9.549 9.804 10.05 10.308 10.573 10.864 11.16 11.429 11.72 12.017 12.311 12.612 12.876 13.007 13.049 12.887 12.228 11.083 9.974 9.005 8.152 7.335 6.578 5.871 5.251 4.632 4.115 3.666 3.219 2.774 2.362 1.999 1.621 1.268 0.959 0.634 0.301 0.024 -0.268 -0.564 -0.786 -1.023 -1.271 -1.522 -1.78 -1.964 -2.165 -2.476 -2.688 -2.909 -3.028 -3.276 -3.543 -3.826 -3.962 -4.225 -4.439 -4.616 -4.802 -5.205 -5.417 -5.645 -5.889 -6.19 -6.539 -6.92 -7.895 -8 ,23662 ,TETRA ,17585389,Sat Nov 27 13:34:50 CET,Sat Nov 27 15:44:53 CET,0.0 2.136 2.771 3.197 3.487 3.764 4.031 4.265 4.643 4.808 4.964 5.125 5.361 5.491 5.738 5.973 6.195 6.292 6.471 6.646 6.9 7.072 7.249 7.497 7.709 7.886 8.064 8.242 8.45 8.64 8.825 9.037 9.24 9.434 9.646 9.901 10.145 10.383 10.62 10.855 11.094 11.351 11.647 11.941 12.202 12.433 12.647 12.766 12.743 12.516 11.805 10.579 9.459 8.465 7.539 6.695 5.976 5.293 4.694 4.087 3.553 3.076 2.617 2.18 1.764 1.397 1.005 0.642 0.334 0.017 -0.299 -0.564 -0.859 -1.175 -1.421 -1.675 -1.928 -2.191 -2.486 -2.688 -2.891 -3.216 -3.429 -3.665 -3.796 -4.058 -4.322 -4.593 -4.743 -5.011 -5.196 -5.366 -5.546 -5.934 -6.151 -6.384 -6.658 -6.959 -7.294 -7.727 -8.88 -9 ,31599 ,TETRA ,17585390,Sat Nov 27 13:35:50 CET,Sat Nov 27 15:49:05 CET,0.0 1.741 2.323 2.732 3.083 3.375 3.619 3.835 4.192 4.371 4.532 4.717 4.969 5.103 5.362 5.611 5.858 5.966 6.15 6.324 6.58 6.746 6.913 7.166 7.409 7.647 7.867 8.069 8.32 8.544 8.758 9.016 9.264 9.505 9.772 10.053 10.307 10.564 10.828 11.123 11.422 11.721 12.069 12.411 12.755 13.058 13.3 13.405 13.389 13.149 12.309 11.095 9.989 8.919 7.957 7.111 6.369 5.693 5.092 4.482 3.927 3.435 2.984 2.541 2.123 1.742 1.346 0.996 0.701 0.414 0.122 -0.144 -0.418 -0.694 -0.922 -1.166 -1.412 -1.659 -1.931 -2.118 -2.302 -2.601 -2.821 -3.046 -3.16 -3.398 -3.632 -3.883 -4.024 -4.295 -4.495 -4.649 -4.816 -5.198 -5.397 -5.617 -5.889 -6.178 -6.467 -6.837 -7.613 -10 ,28303 ,TETRA ,17585391,Sat Nov 27 13:36:49 CET,Sat Nov 27 15:23:43 CET,0.0 2.091 2.678 3.081 3.409 3.696 3.949 4.177 4.594 4.783 4.953 5.151 5.398 5.534 5.787 6.016 6.236 6.338 6.535 6.709 6.943 7.101 7.252 7.474 7.69 7.882 8.062 8.247 8.475 8.663 8.841 9.055 9.259 9.448 9.667 9.922 10.142 10.369 10.622 10.893 11.162 11.449 11.75 12.02 12.261 12.439 12.597 12.719 12.683 12.315 11.506 10.316 9.145 8.095 7.145 6.268 5.48 4.77 4.17 3.561 3.035 2.551 2.08 1.646 1.258 0.906 0.517 0.167 -0.132 -0.434 -0.751 -1.026 -1.308 -1.6 -1.827 -2.068 -2.321 -2.587 -2.854 -3.03 -3.218 -3.514 -3.732 -3.967 -4.085 -4.33 -4.581 -4.846 -4.986 -5.248 -5.437 -5.601 -5.772 -6.138 -6.349 -6.598 -6.869 -7.142 -7.446 -7.851 -8.976 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index 47a55468..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11302 ,TETRA ,17585392,Sat Nov 27 13:37:50 CET,Sat Nov 27 15:29:15 CET,0.0 0.758 1.165 1.457 1.697 1.918 2.11 2.269 2.56 2.692 2.823 2.963 3.21 3.335 3.569 3.797 4.006 4.102 4.286 4.467 4.726 4.882 5.044 5.284 5.512 5.732 5.952 6.165 6.418 6.657 6.887 7.162 7.415 7.653 7.929 8.224 8.494 8.785 9.1 9.451 9.831 10.246 10.702 11.131 11.605 12.087 12.598 13.086 13.488 13.771 13.758 13.205 12.423 11.629 10.885 10.189 9.528 8.876 8.304 7.722 7.203 6.744 6.31 5.875 5.459 5.068 4.655 4.294 3.98 3.651 3.304 3.021 2.741 2.437 2.185 1.925 1.666 1.413 1.16 0.984 0.788 0.463 0.233 -0.016 -0.143 -0.384 -0.626 -0.896 -1.04 -1.308 -1.507 -1.67 -1.843 -2.221 -2.435 -2.661 -2.927 -3.27 -3.73 -4.238 -5.267 -2 ,27959 ,TETRA ,17585393,Sat Nov 27 13:38:48 CET,Sat Nov 27 15:34:52 CET,0.0 0.736 1.11 1.392 1.644 1.856 2.035 2.214 2.537 2.678 2.817 2.972 3.22 3.339 3.572 3.792 3.996 4.099 4.298 4.477 4.737 4.91 5.074 5.305 5.516 5.723 5.921 6.105 6.349 6.578 6.789 7.05 7.316 7.567 7.842 8.142 8.439 8.771 9.122 9.482 9.846 10.242 10.694 11.131 11.61 12.082 12.523 12.943 13.303 13.517 13.411 12.645 11.715 10.851 10.015 9.197 8.406 7.693 7.069 6.416 5.847 5.336 4.837 4.369 3.933 3.521 3.102 2.723 2.403 2.079 1.718 1.413 1.105 0.779 0.534 0.295 0.042 -0.222 -0.495 -0.677 -0.862 -1.166 -1.38 -1.603 -1.723 -1.983 -2.242 -2.518 -2.671 -2.945 -3.154 -3.333 -3.525 -3.958 -4.198 -4.438 -4.678 -4.948 -5.288 -5.757 -7.007 -3 ,32600 ,TETRA ,17585394,Sat Nov 27 13:39:50 CET,Sat Nov 27 15:43:32 CET,0.0 0.8 1.142 1.411 1.633 1.823 1.985 2.14 2.45 2.598 2.73 2.85 3.079 3.188 3.401 3.592 3.776 3.866 4.043 4.221 4.469 4.625 4.782 5.006 5.216 5.41 5.601 5.78 6.01 6.238 6.452 6.712 6.962 7.196 7.457 7.731 7.999 8.313 8.638 8.973 9.325 9.689 10.087 10.489 10.921 11.35 11.812 12.249 12.629 12.87 12.742 12.031 11.086 10.172 9.294 8.448 7.704 7.01 6.376 5.701 5.13 4.643 4.169 3.713 3.303 2.927 2.507 2.131 1.817 1.507 1.169 0.879 0.594 0.306 0.074 -0.18 -0.455 -0.747 -1.04 -1.241 -1.46 -1.805 -2.048 -2.303 -2.428 -2.69 -2.975 -3.285 -3.438 -3.711 -3.921 -4.104 -4.301 -4.723 -4.944 -5.164 -5.409 -5.69 -6.045 -6.512 -7.738 -4 ,454 ,TETRA ,17585395,Sat Nov 27 13:39:50 CET,Sat Nov 27 15:48:35 CET,0.0 0.915 1.248 1.516 1.748 1.952 2.133 2.301 2.6 2.728 2.848 2.976 3.225 3.348 3.579 3.789 3.976 4.059 4.223 4.395 4.63 4.785 4.935 5.148 5.357 5.562 5.758 5.944 6.178 6.396 6.609 6.864 7.121 7.357 7.621 7.935 8.236 8.549 8.89 9.272 9.64 10.036 10.509 10.945 11.413 11.903 12.407 12.877 13.315 13.645 13.627 13.033 12.234 11.387 10.599 9.814 9.064 8.386 7.802 7.24 6.748 6.261 5.764 5.276 4.837 4.478 4.104 3.752 3.434 3.107 2.781 2.498 2.202 1.903 1.677 1.443 1.199 0.955 0.714 0.535 0.33 0.019 -0.206 -0.434 -0.544 -0.781 -1.039 -1.32 -1.46 -1.716 -1.906 -2.078 -2.266 -2.678 -2.884 -3.105 -3.361 -3.637 -3.955 -4.372 -5.443 -5 ,10351 ,TETRA ,17585396,Sat Nov 27 13:39:50 CET,Sat Nov 27 15:37:06 CET,0.0 1.074 1.399 1.662 1.921 2.143 2.343 2.527 2.846 2.989 3.128 3.243 3.473 3.589 3.802 3.987 4.172 4.265 4.429 4.587 4.819 4.964 5.115 5.344 5.552 5.745 5.935 6.118 6.349 6.571 6.787 7.043 7.294 7.53 7.791 8.097 8.398 8.723 9.06 9.416 9.784 10.173 10.581 10.959 11.416 11.906 12.446 12.983 13.429 13.716 13.594 12.844 11.942 11.105 10.3 9.508 8.784 8.125 7.568 7.009 6.534 6.111 5.669 5.242 4.862 4.512 4.15 3.828 3.553 3.269 2.97 2.721 2.456 2.177 1.967 1.742 1.494 1.234 0.964 0.765 0.553 0.231 0.013 -0.217 -0.338 -0.572 -0.82 -1.098 -1.251 -1.525 -1.717 -1.885 -2.047 -2.394 -2.581 -2.789 -3.011 -3.281 -3.65 -4.167 -5.067 -6 ,30822 ,TETRA ,17585397,Sat Nov 27 13:39:51 CET,Sat Nov 27 15:48:42 CET,0.0 0.728 1.076 1.351 1.571 1.771 1.943 2.106 2.416 2.564 2.706 2.854 3.098 3.22 3.449 3.654 3.832 3.917 4.087 4.255 4.493 4.652 4.807 5.02 5.231 5.431 5.619 5.808 6.065 6.297 6.503 6.761 7.012 7.253 7.55 7.884 8.194 8.518 8.856 9.196 9.546 9.953 10.403 10.832 11.285 11.75 12.232 12.673 13.07 13.321 13.068 12.201 11.355 10.556 9.769 9.0 8.323 7.712 7.135 6.558 6.055 5.576 5.109 4.65 4.214 3.857 3.495 3.148 2.85 2.543 2.215 1.917 1.612 1.31 1.074 0.828 0.564 0.284 0.004 -0.187 -0.389 -0.698 -0.92 -1.157 -1.277 -1.533 -1.825 -2.125 -2.277 -2.559 -2.781 -2.958 -3.124 -3.481 -3.689 -3.917 -4.155 -4.442 -4.792 -5.214 -6.267 -7 ,16787 ,TETRA ,17585398,Sat Nov 27 13:39:51 CET,Sat Nov 27 15:43:27 CET,0.0 0.726 1.071 1.323 1.528 1.713 1.874 2.036 2.358 2.502 2.632 2.761 2.998 3.109 3.318 3.513 3.702 3.794 3.972 4.155 4.407 4.561 4.712 4.935 5.151 5.356 5.537 5.705 5.927 6.146 6.36 6.618 6.868 7.11 7.395 7.713 8.001 8.303 8.623 8.972 9.342 9.744 10.202 10.651 11.157 11.67 12.196 12.767 13.353 13.759 13.748 13.218 12.499 11.695 10.93 10.21 9.558 8.962 8.445 7.914 7.423 6.985 6.551 6.122 5.715 5.333 4.947 4.59 4.28 3.967 3.623 3.346 3.058 2.752 2.511 2.269 2.033 1.783 1.51 1.322 1.127 0.823 0.606 0.378 0.263 0.031 -0.214 -0.486 -0.627 -0.896 -1.099 -1.272 -1.449 -1.844 -2.057 -2.278 -2.528 -2.8 -3.102 -3.534 -4.849 -8 ,9253 ,TETRA ,17585399,Sat Nov 27 13:40:49 CET,Sat Nov 27 15:49:01 CET,0.0 0.716 1.073 1.33 1.553 1.778 1.98 2.149 2.469 2.623 2.761 2.895 3.135 3.254 3.48 3.685 3.867 3.958 4.142 4.323 4.592 4.751 4.904 5.137 5.363 5.585 5.798 6.004 6.266 6.508 6.741 7.019 7.276 7.511 7.771 8.063 8.353 8.677 9.029 9.394 9.764 10.151 10.602 11.035 11.481 11.956 12.443 12.901 13.277 13.545 13.438 12.623 11.68 10.765 9.896 9.067 8.326 7.659 7.093 6.529 6.028 5.563 5.1 4.661 4.273 3.914 3.52 3.163 2.85 2.528 2.201 1.927 1.64 1.34 1.111 0.884 0.64 0.39 0.126 -0.068 -0.272 -0.597 -0.826 -1.069 -1.189 -1.416 -1.664 -1.936 -2.073 -2.333 -2.512 -2.678 -2.864 -3.275 -3.507 -3.773 -4.036 -4.307 -4.645 -5.101 -6.158 -9 ,11697 ,TETRA ,17585400,Sat Nov 27 13:40:49 CET,Sat Nov 27 15:49:56 CET,0.0 0.792 1.167 1.443 1.665 1.868 2.06 2.215 2.511 2.656 2.795 2.93 3.161 3.274 3.488 3.69 3.881 3.971 4.144 4.308 4.543 4.693 4.829 5.027 5.234 5.434 5.621 5.797 6.025 6.254 6.484 6.759 7.011 7.242 7.509 7.803 8.094 8.423 8.752 9.087 9.424 9.796 10.22 10.611 11.035 11.426 11.827 12.221 12.548 12.675 12.333 11.56 10.661 9.712 8.826 7.992 7.241 6.551 5.941 5.321 4.788 4.307 3.827 3.378 2.975 2.597 2.215 1.867 1.554 1.247 0.925 0.649 0.352 0.043 -0.191 -0.432 -0.677 -0.939 -1.22 -1.41 -1.603 -1.904 -2.111 -2.317 -2.426 -2.676 -2.939 -3.224 -3.374 -3.641 -3.855 -4.031 -4.202 -4.551 -4.754 -4.985 -5.239 -5.577 -5.982 -6.49 -7.987 -10 ,19682 ,TETRA ,17585401,Sat Nov 27 13:40:51 CET,Sat Nov 27 15:48:59 CET,0.0 1.033 1.408 1.668 1.89 2.09 2.264 2.433 2.751 2.887 3.017 3.161 3.408 3.524 3.735 3.933 4.123 4.217 4.408 4.575 4.801 4.948 5.096 5.318 5.527 5.716 5.897 6.078 6.317 6.538 6.761 7.045 7.301 7.539 7.799 8.076 8.334 8.603 8.904 9.222 9.541 9.909 10.333 10.742 11.174 11.59 12.055 12.534 12.969 13.219 13.079 12.501 11.802 10.985 10.118 9.288 8.56 7.908 7.356 6.778 6.247 5.773 5.318 4.894 4.5 4.14 3.773 3.437 3.13 2.807 2.472 2.182 1.895 1.611 1.371 1.125 0.89 0.643 0.373 0.185 -0.006 -0.313 -0.539 -0.779 -0.901 -1.158 -1.429 -1.705 -1.851 -2.119 -2.305 -2.458 -2.621 -2.998 -3.212 -3.472 -3.75 -4.044 -4.386 -4.807 -5.945 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt deleted file mode 100644 index 8b609371..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24746 ,TETRA ,17585402,Sat Nov 27 13:40:49 CET,Sat Nov 27 15:48:54 CET,0.0 1.051 1.436 1.751 2.031 2.258 2.468 2.67 3.028 3.196 3.36 3.523 3.77 3.908 4.163 4.388 4.589 4.686 4.892 5.086 5.358 5.53 5.696 5.946 6.181 6.405 6.632 6.85 7.127 7.394 7.653 7.967 8.26 8.543 8.864 9.229 9.581 9.958 10.376 10.81 11.256 11.72 12.227 12.737 13.302 13.895 14.556 15.298 16.028 16.588 16.839 16.438 15.656 14.798 13.985 13.234 12.543 11.89 11.339 10.752 10.229 9.788 9.344 8.898 8.484 8.113 7.748 7.4 7.096 6.793 6.469 6.195 5.913 5.618 5.392 5.167 4.926 4.665 4.401 4.218 4.02 3.717 3.512 3.303 3.195 2.958 2.717 2.479 2.351 2.094 1.924 1.764 1.59 1.229 1.02 0.804 0.598 0.373 0.098 -0.29 -1.132 -2 ,10920 ,TETRA ,17585403,Sat Nov 27 13:41:50 CET,Sat Nov 27 15:50:05 CET,0.0 0.721 1.128 1.449 1.692 1.922 2.142 2.337 2.687 2.856 3.019 3.233 3.495 3.626 3.897 4.146 4.368 4.48 4.697 4.901 5.206 5.403 5.593 5.848 6.098 6.343 6.571 6.794 7.08 7.368 7.658 7.991 8.281 8.565 8.9 9.271 9.64 10.055 10.495 10.957 11.441 11.977 12.596 13.19 13.832 14.489 15.177 15.848 16.449 16.907 17.177 16.906 16.203 15.353 14.52 13.775 13.111 12.441 11.849 11.281 10.773 10.309 9.865 9.44 9.047 8.677 8.286 7.942 7.659 7.366 7.051 6.785 6.506 6.217 5.992 5.756 5.519 5.278 5.006 4.811 4.614 4.317 4.121 3.919 3.813 3.594 3.347 3.086 2.958 2.705 2.536 2.385 2.229 1.887 1.701 1.502 1.29 1.064 0.816 0.488 -0.236 -3 ,4112 ,TETRA ,17585404,Sat Nov 27 13:41:50 CET,Sat Nov 27 15:47:25 CET,0.0 0.868 1.264 1.584 1.871 2.094 2.284 2.462 2.804 2.968 3.125 3.288 3.535 3.666 3.92 4.134 4.344 4.447 4.634 4.82 5.084 5.249 5.414 5.653 5.892 6.13 6.356 6.56 6.825 7.099 7.355 7.655 7.948 8.232 8.55 8.903 9.253 9.65 10.068 10.497 10.924 11.365 11.869 12.352 12.86 13.416 14.062 14.723 15.316 15.824 15.969 15.325 14.476 13.639 12.802 12.021 11.348 10.72 10.126 9.502 8.992 8.521 8.044 7.599 7.18 6.793 6.402 6.063 5.766 5.456 5.118 4.818 4.52 4.23 4.011 3.782 3.536 3.284 3.012 2.823 2.636 2.334 2.116 1.89 1.778 1.536 1.29 1.042 0.915 0.66 0.475 0.302 0.12 -0.257 -0.469 -0.688 -0.926 -1.193 -1.481 -1.851 -2.678 -4 ,564 ,TETRA ,17585405,Sat Nov 27 13:41:51 CET,Sat Nov 27 15:51:00 CET,0.0 0.815 1.193 1.494 1.744 1.95 2.139 2.327 2.698 2.872 3.031 3.203 3.455 3.587 3.831 4.059 4.256 4.363 4.586 4.791 5.083 5.257 5.419 5.653 5.879 6.104 6.321 6.532 6.818 7.09 7.338 7.641 7.937 8.228 8.547 8.883 9.215 9.587 9.987 10.421 10.871 11.362 11.944 12.544 13.227 13.914 14.589 15.247 15.897 16.392 16.441 16.025 15.361 14.573 13.8 13.041 12.34 11.689 11.107 10.488 9.953 9.477 9.009 8.57 8.165 7.795 7.416 7.072 6.77 6.456 6.135 5.87 5.583 5.273 5.036 4.803 4.559 4.303 4.03 3.834 3.636 3.336 3.122 2.901 2.785 2.547 2.308 2.058 1.924 1.659 1.477 1.325 1.162 0.822 0.632 0.421 0.196 -0.067 -0.415 -0.833 -1.645 -5 ,8839 ,TETRA ,17585406,Sat Nov 27 13:42:50 CET,Sat Nov 27 15:52:19 CET,0.0 0.906 1.286 1.59 1.842 2.082 2.298 2.502 2.891 3.084 3.267 3.467 3.726 3.859 4.117 4.362 4.602 4.721 4.939 5.147 5.465 5.657 5.836 6.1 6.341 6.58 6.82 7.045 7.338 7.618 7.888 8.213 8.535 8.852 9.208 9.593 9.945 10.32 10.721 11.131 11.564 12.046 12.543 13.044 13.618 14.205 14.88 15.554 16.227 16.782 16.838 16.264 15.53 14.744 13.93 13.137 12.429 11.764 11.169 10.563 10.026 9.534 9.078 8.63 8.212 7.852 7.47 7.131 6.838 6.519 6.181 5.899 5.618 5.333 5.106 4.874 4.641 4.401 4.14 3.96 3.783 3.505 3.306 3.088 2.972 2.73 2.482 2.221 2.085 1.838 1.677 1.529 1.369 1.01 0.808 0.589 0.353 0.089 -0.22 -0.624 -1.582 -6 ,14778 ,TETRA ,17585407,Sat Nov 27 13:43:49 CET,Sat Nov 27 15:40:53 CET,0.0 0.964 1.421 1.717 1.968 2.192 2.376 2.537 2.842 2.993 3.149 3.313 3.548 3.672 3.911 4.125 4.341 4.451 4.66 4.855 5.132 5.307 5.479 5.738 5.983 6.219 6.449 6.659 6.915 7.165 7.414 7.716 8.009 8.28 8.582 8.918 9.246 9.613 10.017 10.424 10.802 11.236 11.762 12.305 12.9 13.477 14.094 14.789 15.491 16.019 16.32 16.113 15.439 14.585 13.782 13.032 12.326 11.651 11.067 10.485 9.984 9.531 9.098 8.69 8.297 7.934 7.549 7.193 6.896 6.589 6.274 6.013 5.742 5.457 5.229 4.994 4.758 4.524 4.281 4.106 3.916 3.603 3.385 3.174 3.068 2.847 2.6 2.336 2.206 1.952 1.765 1.607 1.44 1.094 0.905 0.704 0.49 0.219 -0.093 -0.454 -1.446 -7 ,1196 ,TETRA ,17585408,Sat Nov 27 13:44:49 CET,Sat Nov 27 15:54:42 CET,0.0 0.724 1.087 1.369 1.6 1.804 1.986 2.163 2.497 2.655 2.8 2.955 3.208 3.336 3.579 3.813 4.041 4.149 4.356 4.567 4.871 5.055 5.237 5.5 5.747 5.984 6.207 6.422 6.7 6.968 7.226 7.542 7.831 8.101 8.445 8.839 9.185 9.539 9.913 10.322 10.762 11.25 11.805 12.311 12.834 13.382 13.951 14.537 15.135 15.555 15.561 14.965 14.132 13.326 12.549 11.759 11.057 10.402 9.834 9.252 8.721 8.228 7.762 7.34 6.927 6.541 6.142 5.782 5.481 5.159 4.815 4.542 4.257 3.961 3.738 3.509 3.266 2.999 2.731 2.555 2.366 2.079 1.889 1.684 1.566 1.312 1.055 0.8 0.666 0.398 0.242 0.102 -0.048 -0.41 -0.613 -0.838 -1.079 -1.343 -1.645 -2.044 -3.072 -8 ,20514 ,TETRA ,17585409,Sat Nov 27 13:44:49 CET,Sat Nov 27 15:46:22 CET,0.0 0.708 1.014 1.303 1.563 1.782 1.977 2.185 2.579 2.755 2.92 3.092 3.354 3.494 3.746 3.986 4.21 4.315 4.523 4.728 5.022 5.202 5.379 5.653 5.91 6.137 6.353 6.568 6.851 7.129 7.395 7.717 8.023 8.305 8.633 8.989 9.324 9.7 10.106 10.555 11.021 11.523 12.071 12.586 13.157 13.714 14.3 14.935 15.579 16.123 16.24 15.731 14.972 14.081 13.205 12.351 11.561 10.871 10.28 9.677 9.171 8.7 8.235 7.808 7.404 7.038 6.664 6.329 6.035 5.719 5.388 5.12 4.843 4.546 4.305 4.067 3.829 3.576 3.319 3.146 2.963 2.678 2.478 2.265 2.152 1.929 1.699 1.449 1.325 1.082 0.946 0.795 0.621 0.233 0.027 -0.179 -0.398 -0.639 -0.948 -1.342 -2.321 -9 ,11484 ,TETRA ,17585410,Sat Nov 27 13:44:50 CET,Sat Nov 27 15:53:30 CET,0.0 1.169 1.573 1.852 2.102 2.335 2.544 2.741 3.107 3.273 3.435 3.615 3.87 3.997 4.214 4.433 4.647 4.754 4.971 5.16 5.43 5.602 5.774 6.031 6.281 6.522 6.751 6.982 7.289 7.581 7.855 8.183 8.492 8.779 9.111 9.509 9.878 10.259 10.645 11.044 11.485 11.985 12.534 13.07 13.723 14.467 15.254 15.962 16.606 17.223 17.409 16.861 16.167 15.319 14.461 13.698 12.99 12.326 11.726 11.088 10.541 10.072 9.63 9.212 8.826 8.447 8.032 7.682 7.38 7.05 6.704 6.429 6.157 5.871 5.64 5.395 5.147 4.896 4.628 4.432 4.225 3.917 3.711 3.49 3.37 3.129 2.882 2.607 2.464 2.207 2.022 1.846 1.669 1.287 1.076 0.874 0.678 0.453 0.136 -0.281 -1.194 -10 ,155 ,TETRA ,17585411,Sat Nov 27 13:44:52 CET,Sat Nov 27 15:53:58 CET,0.0 0.82 1.156 1.407 1.608 1.797 1.99 2.175 2.507 2.66 2.801 2.952 3.199 3.325 3.57 3.801 4.015 4.125 4.342 4.544 4.815 4.979 5.151 5.415 5.657 5.886 6.11 6.319 6.578 6.822 7.075 7.392 7.69 7.976 8.301 8.653 9.0 9.377 9.747 10.149 10.592 11.084 11.6 12.066 12.606 13.196 13.833 14.472 15.078 15.526 15.53 14.856 14.039 13.183 12.325 11.533 10.835 10.203 9.687 9.165 8.7 8.282 7.85 7.431 7.04 6.672 6.296 5.956 5.669 5.382 5.057 4.785 4.503 4.193 3.96 3.72 3.471 3.219 2.959 2.779 2.585 2.272 2.049 1.823 1.71 1.475 1.23 0.974 0.84 0.577 0.416 0.27 0.106 -0.291 -0.516 -0.741 -0.959 -1.219 -1.531 -1.9 -2.773 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt deleted file mode 100644 index 82896373..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17712 ,TETRA ,17585412,Sat Nov 27 13:44:50 CET,Sat Nov 27 15:43:47 CET,0.0 0.935 1.332 1.621 1.874 2.095 2.274 2.451 2.8 2.961 3.112 3.285 3.553 3.686 3.936 4.201 4.46 4.58 4.801 5.004 5.298 5.496 5.687 5.959 6.226 6.486 6.735 6.979 7.302 7.607 7.906 8.268 8.6 8.926 9.31 9.74 10.16 10.622 11.112 11.621 12.156 12.792 13.545 14.301 15.219 16.258 17.429 18.691 20.103 21.682 23.458 24.684 25.153 25.201 25.124 24.957 24.735 24.497 24.233 23.948 23.705 23.487 23.26 23.027 22.787 22.544 22.295 22.07 21.859 21.627 21.388 21.193 20.975 20.748 20.572 20.391 20.212 20.025 19.821 19.678 19.542 19.337 19.173 19.001 18.919 18.735 18.539 18.347 18.238 18.014 17.868 17.739 17.6 17.307 17.141 16.963 16.752 16.492 16.21 15.86 15.155 -2 ,4864 ,TETRA ,17585413,Sat Nov 27 13:45:50 CET,Sat Nov 27 15:56:12 CET,0.0 0.777 1.121 1.412 1.667 1.882 2.071 2.254 2.588 2.74 2.883 3.033 3.283 3.42 3.684 3.929 4.152 4.26 4.471 4.675 4.977 5.169 5.361 5.657 5.941 6.208 6.461 6.712 7.04 7.347 7.64 7.998 8.34 8.667 9.05 9.478 9.901 10.354 10.842 11.376 11.923 12.548 13.301 14.055 14.912 15.899 17.041 18.296 19.773 21.445 23.258 24.427 24.892 24.997 24.969 24.902 24.757 24.566 24.364 24.115 23.885 23.667 23.446 23.239 23.034 22.836 22.63 22.432 22.242 22.05 21.86 21.693 21.517 21.319 21.154 21.001 20.842 20.666 20.488 20.365 20.229 19.999 19.828 19.661 19.583 19.419 19.241 19.043 18.937 18.715 18.56 18.432 18.296 17.993 17.819 17.649 17.451 17.196 16.912 16.509 15.466 -3 ,11374 ,TETRA ,17585414,Sat Nov 27 13:45:50 CET,Sat Nov 27 15:51:52 CET,0.0 0.793 1.171 1.49 1.745 1.958 2.152 2.335 2.679 2.84 2.99 3.164 3.42 3.556 3.829 4.091 4.324 4.431 4.647 4.866 5.182 5.374 5.564 5.849 6.12 6.37 6.602 6.833 7.148 7.451 7.737 8.093 8.451 8.789 9.181 9.639 10.076 10.543 11.051 11.59 12.145 12.776 13.52 14.277 15.158 16.158 17.285 18.511 19.92 21.509 23.321 24.585 25.116 25.259 25.231 25.113 24.923 24.717 24.507 24.27 24.035 23.778 23.498 23.222 22.987 22.79 22.563 22.34 22.137 21.919 21.695 21.507 21.316 21.103 20.929 20.756 20.571 20.372 20.171 20.034 19.889 19.646 19.485 19.326 19.236 19.045 18.837 18.625 18.512 18.292 18.151 18.015 17.869 17.562 17.391 17.2 16.972 16.735 16.459 16.07 15.215 -4 ,5811 ,TETRA ,17585415,Sat Nov 27 13:45:49 CET,Sat Nov 27 15:54:56 CET,0.0 0.71 1.044 1.318 1.538 1.755 1.973 2.176 2.515 2.674 2.837 3.023 3.273 3.414 3.691 3.937 4.176 4.296 4.528 4.749 5.062 5.261 5.457 5.747 6.017 6.27 6.522 6.763 7.078 7.392 7.686 8.042 8.402 8.75 9.14 9.557 9.958 10.415 10.913 11.44 12.003 12.632 13.333 14.051 14.906 15.866 16.984 18.213 19.602 21.153 22.932 24.137 24.597 24.764 24.73 24.572 24.371 24.161 23.957 23.731 23.528 23.318 23.101 22.902 22.713 22.526 22.316 22.112 21.916 21.721 21.526 21.361 21.173 20.972 20.823 20.667 20.496 20.308 20.114 19.993 19.873 19.668 19.518 19.366 19.285 19.106 18.922 18.724 18.619 18.415 18.289 18.158 18.017 17.737 17.575 17.404 17.23 17.015 16.779 16.43 15.586 -5 ,2961 ,TETRA ,17585416,Sat Nov 27 13:46:49 CET,Sat Nov 27 15:39:08 CET,0.0 0.771 1.134 1.439 1.745 1.993 2.208 2.402 2.755 2.923 3.085 3.271 3.537 3.675 3.938 4.189 4.444 4.565 4.794 5.029 5.366 5.571 5.771 6.055 6.322 6.583 6.843 7.096 7.405 7.703 7.999 8.354 8.701 9.037 9.413 9.842 10.267 10.734 11.229 11.75 12.308 12.949 13.696 14.443 15.325 16.307 17.437 18.691 20.089 21.667 23.468 24.682 25.156 25.313 25.318 25.218 25.034 24.831 24.631 24.395 24.175 23.978 23.792 23.595 23.392 23.198 22.966 22.748 22.566 22.37 22.161 21.98 21.778 21.572 21.414 21.244 21.071 20.9 20.717 20.58 20.436 20.211 20.037 19.858 19.774 19.605 19.427 19.238 19.14 18.937 18.791 18.661 18.532 18.271 18.122 17.933 17.725 17.496 17.198 16.797 16.019 -6 ,22714 ,TETRA ,17585417,Sat Nov 27 13:47:50 CET,Sat Nov 27 15:57:09 CET,0.0 0.981 1.414 1.748 2.003 2.204 2.417 2.619 2.96 3.114 3.261 3.445 3.695 3.824 4.08 4.322 4.552 4.662 4.873 5.073 5.373 5.576 5.771 6.05 6.331 6.595 6.841 7.088 7.39 7.683 7.981 8.342 8.674 9.002 9.39 9.811 10.217 10.665 11.149 11.67 12.227 12.863 13.604 14.352 15.194 16.108 17.162 18.303 19.621 21.147 22.767 23.778 24.195 24.299 24.245 24.136 23.984 23.788 23.591 23.38 23.167 22.945 22.702 22.453 22.205 21.984 21.754 21.528 21.335 21.142 20.924 20.738 20.544 20.334 20.177 20.014 19.826 19.639 19.463 19.338 19.204 18.981 18.815 18.656 18.575 18.394 18.217 18.034 17.932 17.726 17.598 17.474 17.338 17.066 16.932 16.781 16.595 16.37 16.126 15.842 15.137 -7 ,2196 ,TETRA ,17585418,Sat Nov 27 13:47:52 CET,Sat Nov 27 15:57:27 CET,0.0 0.942 1.336 1.626 1.884 2.125 2.335 2.526 2.867 3.027 3.184 3.351 3.616 3.766 4.049 4.314 4.555 4.667 4.887 5.097 5.413 5.624 5.819 6.096 6.364 6.629 6.881 7.118 7.418 7.711 8.002 8.355 8.703 9.04 9.426 9.872 10.299 10.763 11.267 11.801 12.381 13.027 13.757 14.529 15.422 16.416 17.549 18.769 20.149 21.682 23.412 24.564 25.025 25.221 25.241 25.148 24.98 24.79 24.591 24.322 24.076 23.845 23.615 23.376 23.129 22.906 22.662 22.447 22.267 22.071 21.844 21.644 21.422 21.178 20.988 20.814 20.641 20.433 20.23 20.092 19.939 19.696 19.53 19.357 19.263 19.07 18.865 18.665 18.558 18.327 18.153 18.012 17.864 17.537 17.355 17.166 16.967 16.729 16.459 16.088 15.414 -8 ,28147 ,TETRA ,17585419,Sat Nov 27 13:47:52 CET,Sat Nov 27 15:46:22 CET,0.0 1.01 1.416 1.721 1.973 2.2 2.43 2.649 3.045 3.235 3.413 3.618 3.891 4.04 4.319 4.583 4.84 4.955 5.165 5.381 5.698 5.897 6.09 6.39 6.687 6.955 7.212 7.453 7.765 8.077 8.376 8.746 9.104 9.45 9.868 10.323 10.749 11.226 11.751 12.325 12.941 13.604 14.378 15.19 16.097 17.046 18.156 19.402 20.752 22.217 23.914 25.126 25.621 25.735 25.648 25.51 25.348 25.133 24.896 24.634 24.388 24.158 23.932 23.716 23.513 23.304 23.052 22.829 22.647 22.454 22.254 22.086 21.902 21.702 21.54 21.372 21.18 20.978 20.792 20.66 20.523 20.321 20.157 19.966 19.872 19.693 19.495 19.258 19.142 18.931 18.78 18.639 18.499 18.227 18.068 17.873 17.668 17.424 17.117 16.735 15.742 -9 ,16082 ,TETRA ,17585420,Sat Nov 27 13:47:52 CET,Sat Nov 27 15:44:47 CET,0.0 0.577 0.895 1.176 1.41 1.605 1.779 1.942 2.28 2.442 2.6 2.792 3.049 3.195 3.464 3.706 3.946 4.055 4.26 4.462 4.769 4.969 5.158 5.436 5.706 5.968 6.213 6.452 6.767 7.075 7.37 7.718 8.045 8.369 8.738 9.157 9.579 10.037 10.537 11.066 11.61 12.212 12.925 13.647 14.483 15.442 16.535 17.742 19.147 20.722 22.483 23.668 24.15 24.315 24.347 24.284 24.122 23.915 23.681 23.428 23.199 22.965 22.731 22.501 22.278 22.07 21.836 21.61 21.416 21.224 21.019 20.832 20.641 20.446 20.288 20.116 19.933 19.754 19.577 19.441 19.294 19.065 18.902 18.736 18.657 18.494 18.303 18.091 17.978 17.756 17.618 17.489 17.352 17.043 16.882 16.697 16.492 16.246 15.962 15.591 14.573 -10 ,32272 ,TETRA ,17585421,Sat Nov 27 13:48:49 CET,Sat Nov 27 15:56:57 CET,0.0 0.689 1.033 1.333 1.588 1.818 2.027 2.227 2.562 2.713 2.859 3.025 3.287 3.426 3.682 3.942 4.193 4.308 4.535 4.777 5.116 5.325 5.532 5.824 6.102 6.373 6.643 6.911 7.248 7.578 7.904 8.294 8.664 9.017 9.428 9.875 10.301 10.784 11.313 11.869 12.446 13.108 13.863 14.656 15.588 16.55 17.651 18.923 20.372 21.991 23.8 24.972 25.469 25.658 25.637 25.54 25.376 25.16 24.962 24.73 24.508 24.319 24.13 23.928 23.727 23.532 23.319 23.135 22.962 22.768 22.566 22.386 22.19 21.989 21.827 21.661 21.499 21.333 21.152 21.023 20.892 20.676 20.518 20.353 20.265 20.075 19.881 19.67 19.556 19.347 19.208 19.078 18.931 18.627 18.47 18.29 18.071 17.812 17.532 17.192 16.406 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt deleted file mode 100644 index 5d2cd15e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12647 ,TETRA ,17585422,Sat Nov 27 13:48:50 CET,Sat Nov 27 15:59:04 CET,0.0 0.875 1.278 1.585 1.847 2.084 2.317 2.531 2.885 3.047 3.212 3.419 3.686 3.825 4.088 4.345 4.596 4.717 4.948 5.17 5.507 5.728 5.942 6.255 6.549 6.834 7.121 7.395 7.744 8.088 8.417 8.807 9.172 9.529 9.953 10.424 10.884 11.401 11.951 12.535 13.18 13.917 14.736 15.56 16.545 17.608 18.803 20.189 21.831 23.695 25.735 27.053 27.581 27.76 27.687 27.493 27.265 26.998 26.733 26.447 26.159 25.882 25.627 25.362 25.098 24.865 24.612 24.385 24.181 23.95 23.713 23.514 23.301 23.077 22.891 22.683 22.469 22.256 22.044 21.896 21.743 21.508 21.348 21.188 21.102 20.913 20.703 20.481 20.372 20.164 20.028 19.896 19.758 19.436 19.262 19.059 18.822 18.572 18.299 17.945 17.139 -2 ,26042 ,TETRA ,17585423,Sat Nov 27 13:48:49 CET,Sat Nov 27 15:56:45 CET,0.0 0.942 1.323 1.594 1.85 2.095 2.316 2.523 2.867 3.021 3.168 3.333 3.6 3.745 4.008 4.254 4.499 4.621 4.845 5.055 5.377 5.588 5.78 6.056 6.341 6.625 6.887 7.137 7.463 7.78 8.087 8.46 8.823 9.173 9.587 10.058 10.5 11.001 11.557 12.134 12.715 13.375 14.17 14.968 15.869 16.883 18.064 19.296 20.696 22.331 24.148 25.329 25.745 25.914 25.911 25.749 25.528 25.324 25.112 24.866 24.632 24.394 24.153 23.918 23.699 23.493 23.25 23.032 22.853 22.66 22.45 22.268 22.075 21.854 21.66 21.462 21.283 21.092 20.877 20.728 20.577 20.33 20.164 19.994 19.899 19.694 19.471 19.217 19.083 18.843 18.665 18.526 18.375 18.068 17.885 17.675 17.448 17.214 16.943 16.539 15.63 -3 ,11751 ,TETRA ,17585424,Sat Nov 27 13:48:50 CET,Sat Nov 27 15:57:13 CET,0.0 0.879 1.284 1.605 1.889 2.115 2.33 2.526 2.861 3.027 3.197 3.401 3.683 3.841 4.138 4.416 4.677 4.806 5.048 5.281 5.616 5.822 6.026 6.341 6.644 6.926 7.194 7.451 7.781 8.096 8.388 8.757 9.125 9.481 9.895 10.357 10.804 11.308 11.85 12.402 12.987 13.672 14.478 15.26 16.145 17.159 18.36 19.758 21.416 23.132 24.965 26.298 26.931 27.24 27.277 27.184 27.042 26.826 26.591 26.36 26.136 25.907 25.687 25.472 25.268 25.078 24.863 24.656 24.446 24.231 24.007 23.807 23.606 23.393 23.233 23.067 22.887 22.686 22.464 22.31 22.161 21.936 21.778 21.617 21.53 21.344 21.127 20.905 20.8 20.596 20.445 20.307 20.172 19.9 19.733 19.539 19.327 19.103 18.843 18.416 17.584 -4 ,32205 ,TETRA ,17585425,Sat Nov 27 13:48:50 CET,Sat Nov 27 15:58:04 CET,0.0 0.882 1.229 1.509 1.782 2.04 2.258 2.464 2.844 3.014 3.174 3.374 3.652 3.798 4.072 4.327 4.561 4.677 4.913 5.137 5.467 5.681 5.881 6.174 6.461 6.742 7.011 7.263 7.591 7.92 8.245 8.631 9.018 9.391 9.805 10.278 10.757 11.3 11.865 12.469 13.116 13.821 14.638 15.447 16.371 17.399 18.589 19.933 21.452 23.148 25.081 26.478 27.051 27.224 27.179 27.047 26.874 26.675 26.47 26.204 25.926 25.654 25.387 25.111 24.835 24.597 24.346 24.118 23.927 23.713 23.487 23.314 23.124 22.913 22.75 22.573 22.393 22.207 21.998 21.85 21.694 21.449 21.279 21.096 21.005 20.819 20.62 20.408 20.292 20.073 19.909 19.766 19.632 19.316 19.115 18.893 18.661 18.396 18.088 17.709 16.939 -5 ,8170 ,TETRA ,17585426,Sat Nov 27 13:48:50 CET,Sat Nov 27 15:58:36 CET,0.0 0.811 1.188 1.494 1.74 1.959 2.17 2.366 2.726 2.893 3.057 3.237 3.503 3.653 3.95 4.209 4.45 4.582 4.843 5.078 5.387 5.595 5.809 6.111 6.397 6.675 6.948 7.216 7.551 7.885 8.216 8.602 8.974 9.342 9.776 10.265 10.743 11.277 11.847 12.458 13.103 13.814 14.61 15.422 16.381 17.464 18.702 20.029 21.553 23.219 25.026 26.138 26.498 26.591 26.544 26.443 26.279 26.068 25.859 25.612 25.361 25.121 24.896 24.683 24.461 24.241 24.016 23.817 23.629 23.422 23.205 23.017 22.82 22.613 22.438 22.254 22.075 21.892 21.686 21.538 21.391 21.174 21.019 20.825 20.721 20.532 20.321 20.088 19.972 19.753 19.592 19.449 19.309 19.023 18.871 18.707 18.52 18.281 17.982 17.616 16.9 -6 ,3104 ,TETRA ,17585427,Sat Nov 27 13:48:50 CET,Sat Nov 27 15:58:21 CET,0.0 0.756 1.153 1.448 1.709 1.955 2.17 2.361 2.718 2.894 3.065 3.245 3.501 3.639 3.912 4.158 4.408 4.528 4.752 4.985 5.324 5.535 5.744 6.051 6.342 6.614 6.878 7.137 7.483 7.816 8.134 8.541 8.929 9.298 9.717 10.19 10.663 11.169 11.702 12.28 12.888 13.585 14.41 15.23 16.159 17.176 18.387 19.817 21.432 23.15 25.057 26.448 27.131 27.383 27.41 27.341 27.188 26.996 26.801 26.554 26.292 26.037 25.795 25.572 25.35 25.128 24.866 24.636 24.445 24.22 23.975 23.779 23.564 23.344 23.174 22.994 22.804 22.605 22.405 22.254 22.088 21.834 21.668 21.495 21.394 21.182 20.975 20.762 20.641 20.412 20.262 20.122 19.979 19.664 19.484 19.3 19.109 18.887 18.605 18.251 17.555 -7 ,5442 ,TETRA ,17585428,Sat Nov 27 13:49:51 CET,Sat Nov 27 15:57:32 CET,0.0 0.818 1.196 1.523 1.801 2.046 2.276 2.46 2.803 2.969 3.132 3.353 3.641 3.793 4.079 4.35 4.602 4.721 4.956 5.184 5.514 5.724 5.925 6.23 6.524 6.805 7.076 7.334 7.683 8.015 8.325 8.71 9.093 9.46 9.878 10.354 10.812 11.315 11.853 12.426 13.03 13.695 14.463 15.252 16.172 17.179 18.361 19.693 21.254 23.037 24.974 26.306 26.843 27.075 27.101 26.969 26.801 26.599 26.349 26.053 25.785 25.548 25.325 25.095 24.87 24.641 24.378 24.145 23.944 23.727 23.491 23.3 23.107 22.905 22.738 22.551 22.36 22.169 21.963 21.822 21.678 21.447 21.268 21.078 20.987 20.786 20.564 20.319 20.199 19.973 19.816 19.684 19.556 19.286 19.127 18.957 18.773 18.56 18.294 17.95 17.159 -8 ,28215 ,TETRA ,17585429,Sat Nov 27 13:49:51 CET,Sat Nov 27 15:58:29 CET,0.0 0.812 1.176 1.46 1.687 1.878 2.091 2.3 2.659 2.819 2.98 3.183 3.451 3.594 3.876 4.13 4.371 4.492 4.739 4.975 5.31 5.52 5.72 6.018 6.299 6.569 6.83 7.087 7.441 7.788 8.115 8.487 8.85 9.216 9.649 10.131 10.602 11.127 11.682 12.298 12.95 13.679 14.542 15.386 16.37 17.445 18.625 19.951 21.448 23.171 25.176 26.539 27.092 27.251 27.265 27.17 26.958 26.721 26.503 26.258 26.018 25.788 25.543 25.292 25.057 24.825 24.575 24.351 24.157 23.972 23.774 23.585 23.381 23.171 23.006 22.827 22.637 22.431 22.206 22.052 21.889 21.629 21.443 21.25 21.16 20.975 20.765 20.54 20.425 20.206 20.06 19.922 19.775 19.462 19.262 19.055 18.842 18.585 18.296 17.897 16.43 -9 ,22079 ,TETRA ,17585430,Sat Nov 27 13:49:52 CET,Sat Nov 27 15:59:41 CET,0.0 1.213 1.625 1.959 2.235 2.478 2.69 2.89 3.276 3.448 3.611 3.806 4.066 4.2 4.464 4.717 4.959 5.082 5.329 5.565 5.903 6.124 6.338 6.642 6.937 7.226 7.505 7.773 8.116 8.441 8.753 9.138 9.519 9.898 10.346 10.856 11.337 11.854 12.414 13.026 13.665 14.39 15.241 16.086 17.08 18.193 19.491 20.892 22.434 24.266 26.278 27.568 28.094 28.263 28.252 28.123 27.891 27.619 27.384 27.152 26.928 26.689 26.445 26.198 25.96 25.751 25.543 25.35 25.151 24.94 24.731 24.541 24.344 24.15 23.996 23.828 23.656 23.478 23.272 23.125 22.978 22.73 22.538 22.349 22.244 22.023 21.805 21.59 21.479 21.248 21.078 20.946 20.813 20.496 20.318 20.113 19.886 19.662 19.395 19.007 18.13 -10 ,13312 ,TETRA ,17585431,Sat Nov 27 13:49:51 CET,Sat Nov 27 15:59:02 CET,0.0 0.922 1.279 1.572 1.822 2.049 2.263 2.456 2.821 2.985 3.144 3.33 3.588 3.729 3.983 4.214 4.447 4.559 4.78 4.997 5.296 5.499 5.699 5.977 6.242 6.504 6.766 7.018 7.342 7.659 7.972 8.351 8.709 9.055 9.456 9.92 10.377 10.878 11.431 12.04 12.687 13.411 14.242 15.086 16.075 17.147 18.291 19.531 21.048 22.838 24.663 25.742 26.086 26.171 26.111 25.975 25.777 25.527 25.285 25.003 24.757 24.539 24.307 24.084 23.856 23.631 23.388 23.161 22.971 22.774 22.557 22.376 22.19 21.989 21.834 21.672 21.496 21.297 21.084 20.937 20.789 20.563 20.399 20.233 20.144 19.943 19.732 19.515 19.405 19.189 19.047 18.916 18.778 18.485 18.311 18.103 17.878 17.637 17.316 16.892 15.917 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index 3c6d3afc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14429 ,TETRA ,17585433,Sat Nov 27 13:49:51 CET,Sat Nov 27 15:59:21 CET,0.0 0.668 0.96 1.179 1.385 1.585 1.765 1.911 2.157 2.276 2.382 2.478 2.675 2.773 2.967 3.151 3.318 3.398 3.552 3.695 3.893 4.001 4.104 4.27 4.423 4.58 4.724 4.85 5.019 5.18 5.328 5.497 5.648 5.786 5.941 6.103 6.251 6.396 6.543 6.7 6.854 6.996 7.107 7.163 7.193 7.17 7.045 6.811 6.427 5.728 4.289 2.349 0.655 -0.832 -2.105 -3.232 -4.218 -5.101 -5.863 -6.64 -7.31 -7.898 -8.448 -8.968 -9.469 -9.931 -10.402 -10.815 -11.163 -11.516 -11.909 -12.257 -12.604 -12.962 -13.247 -13.534 -13.814 -14.095 -14.387 -14.589 -14.799 -15.126 -15.352 -15.579 -15.693 -15.939 -16.219 -16.508 -16.646 -16.905 -17.105 -17.281 -17.469 -17.858 -18.061 -18.275 -18.502 -18.78 -19.138 -19.554 -20.448 -2 ,11335 ,TETRA ,17585434,Sat Nov 27 13:49:51 CET,Sat Nov 27 15:57:58 CET,0.0 0.816 1.107 1.337 1.539 1.706 1.844 1.965 2.207 2.325 2.431 2.529 2.731 2.831 3.016 3.189 3.357 3.441 3.589 3.723 3.917 4.043 4.158 4.31 4.454 4.584 4.718 4.856 5.01 5.146 5.279 5.449 5.615 5.778 5.972 6.163 6.34 6.515 6.662 6.812 6.952 7.074 7.2 7.301 7.358 7.349 7.251 7.06 6.677 5.876 4.337 2.37 0.657 -0.838 -2.098 -3.203 -4.167 -5.051 -5.815 -6.565 -7.192 -7.738 -8.26 -8.764 -9.249 -9.695 -10.153 -10.552 -10.895 -11.254 -11.624 -11.93 -12.239 -12.574 -12.838 -13.106 -13.38 -13.659 -13.954 -14.156 -14.371 -14.701 -14.918 -15.137 -15.253 -15.507 -15.779 -16.059 -16.203 -16.477 -16.689 -16.86 -17.042 -17.424 -17.614 -17.836 -18.099 -18.374 -18.685 -19.065 -19.894 -3 ,20160 ,TETRA ,17585435,Sat Nov 27 13:49:51 CET,Sat Nov 27 15:57:50 CET,0.0 0.844 1.212 1.511 1.755 1.962 2.139 2.314 2.604 2.724 2.84 2.946 3.135 3.22 3.39 3.565 3.724 3.803 3.95 4.083 4.267 4.381 4.489 4.654 4.827 5.0 5.154 5.283 5.444 5.607 5.761 5.939 6.101 6.261 6.435 6.602 6.757 6.9 7.028 7.166 7.311 7.472 7.648 7.773 7.837 7.839 7.776 7.609 7.303 6.629 5.066 3.011 1.215 -0.382 -1.75 -2.929 -3.956 -4.872 -5.666 -6.455 -7.088 -7.654 -8.22 -8.748 -9.237 -9.679 -10.126 -10.533 -10.883 -11.245 -11.619 -11.941 -12.285 -12.636 -12.907 -13.191 -13.479 -13.765 -14.063 -14.264 -14.472 -14.792 -15.016 -15.241 -15.356 -15.616 -15.89 -16.178 -16.328 -16.607 -16.848 -17.029 -17.223 -17.664 -17.879 -18.118 -18.373 -18.634 -18.979 -19.459 -20.488 -4 ,30702 ,TETRA ,17585436,Sat Nov 27 13:49:52 CET,Sat Nov 27 15:57:49 CET,0.0 0.716 1.05 1.27 1.475 1.666 1.824 1.968 2.233 2.344 2.445 2.542 2.745 2.842 3.019 3.19 3.347 3.415 3.558 3.703 3.889 3.994 4.101 4.259 4.412 4.559 4.692 4.818 4.977 5.128 5.257 5.405 5.555 5.696 5.849 6.021 6.182 6.338 6.484 6.632 6.765 6.893 7.005 7.066 7.107 7.098 7.017 6.813 6.323 5.436 3.816 1.694 -0.12 -1.731 -3.098 -4.285 -5.317 -6.208 -6.979 -7.776 -8.449 -9.045 -9.617 -10.154 -10.639 -11.07 -11.523 -11.916 -12.256 -12.613 -12.988 -13.3 -13.623 -13.972 -14.24 -14.521 -14.813 -15.107 -15.416 -15.625 -15.833 -16.163 -16.399 -16.645 -16.776 -17.043 -17.309 -17.588 -17.738 -18.011 -18.211 -18.388 -18.576 -18.956 -19.17 -19.418 -19.679 -19.968 -20.312 -20.741 -21.719 -5 ,27067 ,TETRA ,17585437,Sat Nov 27 13:49:54 CET,Sat Nov 27 15:58:02 CET,0.0 0.932 1.254 1.496 1.72 1.916 2.083 2.239 2.509 2.633 2.754 2.871 3.072 3.168 3.358 3.533 3.671 3.735 3.865 3.989 4.169 4.289 4.396 4.544 4.688 4.831 4.968 5.09 5.243 5.386 5.53 5.694 5.836 5.97 6.131 6.303 6.443 6.597 6.763 6.904 7.019 7.143 7.256 7.327 7.373 7.367 7.285 7.087 6.647 5.786 4.22 2.165 0.353 -1.186 -2.509 -3.665 -4.683 -5.604 -6.381 -7.166 -7.83 -8.422 -8.997 -9.544 -10.041 -10.471 -10.929 -11.342 -11.691 -12.056 -12.433 -12.75 -13.082 -13.441 -13.728 -14.003 -14.293 -14.606 -14.929 -15.143 -15.357 -15.692 -15.926 -16.168 -16.29 -16.55 -16.83 -17.119 -17.269 -17.543 -17.735 -17.912 -18.112 -18.529 -18.762 -19.015 -19.281 -19.579 -19.91 -20.296 -21.269 -6 ,23005 ,TETRA ,17585438,Sat Nov 27 13:49:54 CET,Sat Nov 27 15:58:34 CET,0.0 0.628 0.895 1.135 1.347 1.514 1.67 1.835 2.151 2.277 2.389 2.48 2.671 2.767 2.937 3.081 3.227 3.299 3.436 3.56 3.724 3.833 3.943 4.096 4.246 4.395 4.528 4.648 4.796 4.922 5.046 5.208 5.352 5.485 5.641 5.8 5.935 6.068 6.201 6.33 6.439 6.547 6.658 6.708 6.729 6.732 6.626 6.346 5.909 5.06 3.33 1.158 -0.678 -2.199 -3.455 -4.628 -5.668 -6.613 -7.453 -8.276 -8.973 -9.58 -10.155 -10.68 -11.159 -11.597 -12.047 -12.451 -12.801 -13.163 -13.542 -13.859 -14.176 -14.5 -14.762 -15.035 -15.318 -15.601 -15.881 -16.077 -16.281 -16.583 -16.796 -17.028 -17.15 -17.411 -17.683 -17.972 -18.131 -18.415 -18.607 -18.779 -18.963 -19.33 -19.537 -19.757 -19.978 -20.236 -20.541 -20.948 -21.84 -7 ,20127 ,TETRA ,17585439,Sat Nov 27 13:49:52 CET,Sat Nov 27 15:59:13 CET,0.0 0.822 1.23 1.536 1.773 1.959 2.139 2.3 2.548 2.666 2.785 2.889 3.082 3.176 3.346 3.503 3.647 3.715 3.838 3.947 4.113 4.223 4.332 4.482 4.628 4.773 4.908 5.036 5.197 5.345 5.473 5.616 5.756 5.9 6.064 6.221 6.352 6.497 6.648 6.793 6.924 7.066 7.206 7.297 7.343 7.308 7.233 7.02 6.53 5.619 3.954 1.865 -0.013 -1.61 -2.937 -4.146 -5.203 -6.151 -6.935 -7.69 -8.359 -8.964 -9.527 -10.045 -10.549 -11.004 -11.459 -11.868 -12.218 -12.573 -12.947 -13.266 -13.605 -13.959 -14.224 -14.487 -14.766 -15.07 -15.38 -15.597 -15.822 -16.174 -16.422 -16.676 -16.807 -17.075 -17.348 -17.621 -17.765 -18.042 -18.236 -18.386 -18.549 -18.901 -19.102 -19.35 -19.609 -19.879 -20.217 -20.674 -21.62 -8 ,30067 ,TETRA ,17585440,Sat Nov 27 13:49:54 CET,Sat Nov 27 15:59:29 CET,0.0 0.869 1.218 1.479 1.693 1.879 2.054 2.214 2.482 2.613 2.745 2.881 3.079 3.17 3.338 3.488 3.623 3.687 3.822 3.95 4.127 4.239 4.34 4.485 4.622 4.75 4.871 4.984 5.125 5.267 5.4 5.543 5.673 5.804 5.942 6.076 6.199 6.333 6.473 6.612 6.755 6.892 7.012 7.108 7.17 7.148 7.002 6.737 6.255 5.365 3.692 1.576 -0.283 -1.923 -3.278 -4.446 -5.413 -6.288 -7.053 -7.822 -8.476 -9.074 -9.656 -10.188 -10.675 -11.099 -11.541 -11.945 -12.301 -12.676 -13.055 -13.364 -13.685 -14.029 -14.295 -14.553 -14.818 -15.101 -15.389 -15.587 -15.798 -16.128 -16.364 -16.602 -16.718 -16.97 -17.243 -17.511 -17.644 -17.904 -18.097 -18.265 -18.434 -18.809 -19.025 -19.246 -19.49 -19.759 -20.062 -20.434 -21.254 -9 ,22290 ,TETRA ,17585441,Sat Nov 27 13:49:52 CET,Sat Nov 27 15:57:54 CET,0.0 0.971 1.321 1.572 1.79 1.982 2.177 2.364 2.663 2.8 2.934 3.051 3.253 3.359 3.557 3.736 3.906 3.984 4.13 4.269 4.467 4.585 4.691 4.852 4.999 5.14 5.277 5.391 5.527 5.66 5.79 5.954 6.107 6.238 6.383 6.535 6.672 6.82 6.969 7.124 7.274 7.42 7.544 7.632 7.714 7.736 7.63 7.346 6.881 6.09 4.672 2.845 1.207 -0.246 -1.51 -2.644 -3.642 -4.545 -5.342 -6.148 -6.81 -7.374 -7.916 -8.438 -8.923 -9.357 -9.805 -10.208 -10.549 -10.883 -11.24 -11.556 -11.892 -12.231 -12.476 -12.722 -12.985 -13.271 -13.572 -13.773 -13.982 -14.328 -14.571 -14.823 -14.951 -15.218 -15.501 -15.797 -15.944 -16.207 -16.409 -16.58 -16.748 -17.107 -17.316 -17.533 -17.767 -18.043 -18.404 -18.869 -19.684 -10 ,2824 ,TETRA ,17585442,Sat Nov 27 13:50:47 CET,Sat Nov 27 15:59:03 CET,0.0 0.847 1.171 1.405 1.634 1.855 2.05 2.222 2.533 2.659 2.766 2.881 3.09 3.189 3.378 3.571 3.76 3.844 3.99 4.131 4.345 4.481 4.608 4.79 4.961 5.12 5.268 5.404 5.571 5.719 5.872 6.069 6.24 6.386 6.545 6.715 6.863 7.034 7.216 7.386 7.552 7.696 7.812 7.91 7.979 7.987 7.941 7.752 7.324 6.566 5.019 2.877 1.137 -0.298 -1.529 -2.643 -3.651 -4.564 -5.354 -6.133 -6.797 -7.384 -7.932 -8.449 -8.94 -9.408 -9.887 -10.306 -10.67 -11.048 -11.438 -11.761 -12.098 -12.443 -12.707 -12.972 -13.251 -13.542 -13.842 -14.053 -14.276 -14.637 -14.884 -15.132 -15.268 -15.554 -15.835 -16.13 -16.284 -16.56 -16.759 -16.928 -17.103 -17.468 -17.67 -17.876 -18.113 -18.407 -18.731 -19.157 -20.291 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 14725457..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5726 ,KEBNE ,17024172,Wed Dec 22 09:30:20 CET,Wed Dec 22 11:10:41 CET,0.0 0.979 1.377 1.651 1.877 2.097 2.303 2.469 2.749 2.869 2.999 3.14 3.346 3.449 3.641 3.817 3.987 4.07 4.226 4.371 4.599 4.742 4.861 5.024 5.181 5.332 5.486 5.637 5.826 6.012 6.194 6.408 6.607 6.792 6.994 7.22 7.425 7.643 7.867 8.083 8.28 8.492 8.745 8.989 9.224 9.418 9.59 9.677 9.62 9.312 8.498 7.159 5.884 4.713 3.632 2.64 1.767 1.024 0.428 -0.184 -0.757 -1.276 -1.76 -2.223 -2.65 -3.055 -3.513 -3.94 -4.29 -4.632 -4.988 -5.28 -5.588 -5.917 -6.169 -6.426 -6.699 -6.987 -7.27 -7.454 -7.654 -7.972 -8.203 -8.455 -8.581 -8.841 -9.121 -9.404 -9.548 -9.807 -9.987 -10.143 -10.319 -10.715 -10.908 -11.106 -11.336 -11.62 -11.964 -12.38 -13.373 -2 ,19765 ,KEBNE ,17024173,Wed Dec 22 09:30:20 CET,Wed Dec 22 11:11:11 CET,0.0 0.823 1.156 1.455 1.702 1.88 2.032 2.186 2.49 2.62 2.735 2.86 3.051 3.136 3.3 3.465 3.625 3.702 3.856 4.003 4.204 4.335 4.458 4.635 4.815 4.984 5.148 5.304 5.496 5.677 5.853 6.057 6.247 6.429 6.632 6.85 7.045 7.238 7.458 7.706 7.941 8.189 8.471 8.719 8.945 9.156 9.316 9.394 9.354 9.062 8.18 6.716 5.406 4.215 3.116 2.11 1.238 0.43 -0.297 -1.002 -1.597 -2.132 -2.649 -3.143 -3.619 -4.051 -4.496 -4.887 -5.218 -5.56 -5.912 -6.212 -6.52 -6.819 -7.054 -7.304 -7.55 -7.809 -8.095 -8.286 -8.466 -8.761 -8.974 -9.203 -9.32 -9.545 -9.786 -10.043 -10.17 -10.407 -10.588 -10.754 -10.923 -11.28 -11.492 -11.714 -11.941 -12.181 -12.453 -12.854 -14.043 -3 ,20648 ,KEBNE ,17024174,Wed Dec 22 09:30:20 CET,Wed Dec 22 11:12:30 CET,0.0 0.782 1.106 1.362 1.556 1.726 1.892 2.039 2.304 2.434 2.552 2.669 2.883 2.984 3.159 3.327 3.491 3.569 3.72 3.875 4.091 4.223 4.347 4.518 4.682 4.846 5.01 5.157 5.337 5.511 5.676 5.867 6.058 6.242 6.439 6.654 6.852 7.06 7.277 7.497 7.7 7.898 8.122 8.328 8.542 8.742 8.866 8.902 8.772 8.356 7.296 5.737 4.313 3.046 1.977 0.991 0.104 -0.711 -1.418 -2.141 -2.766 -3.308 -3.836 -4.335 -4.768 -5.163 -5.59 -5.968 -6.298 -6.637 -7.0 -7.305 -7.624 -7.967 -8.226 -8.49 -8.766 -9.042 -9.332 -9.54 -9.749 -10.074 -10.297 -10.528 -10.646 -10.902 -11.193 -11.488 -11.64 -11.907 -12.106 -12.277 -12.452 -12.828 -13.031 -13.261 -13.506 -13.757 -14.054 -14.429 -15.335 -4 ,2730 ,KEBNE ,17024175,Wed Dec 22 09:30:21 CET,Wed Dec 22 11:12:01 CET,0.0 0.706 1.038 1.299 1.526 1.709 1.871 2.019 2.305 2.442 2.565 2.695 2.912 3.023 3.234 3.434 3.62 3.707 3.864 4.006 4.215 4.351 4.488 4.685 4.866 5.033 5.185 5.338 5.534 5.702 5.853 6.047 6.231 6.401 6.604 6.818 7.015 7.229 7.459 7.702 7.943 8.165 8.389 8.606 8.817 9.002 9.153 9.213 9.109 8.742 7.743 6.168 4.783 3.515 2.385 1.377 0.475 -0.346 -1.069 -1.812 -2.453 -3.0 -3.526 -4.024 -4.474 -4.88 -5.309 -5.704 -6.047 -6.395 -6.76 -7.07 -7.404 -7.743 -8.001 -8.271 -8.536 -8.81 -9.094 -9.287 -9.493 -9.827 -10.061 -10.304 -10.423 -10.669 -10.943 -11.24 -11.393 -11.659 -11.871 -12.05 -12.223 -12.582 -12.775 -12.985 -13.224 -13.486 -13.774 -14.168 -15.4 -5 ,31993 ,KEBNE ,17024176,Wed Dec 22 09:30:21 CET,Wed Dec 22 11:12:09 CET,0.0 0.885 1.287 1.536 1.727 1.912 2.078 2.223 2.493 2.616 2.743 2.86 3.055 3.157 3.335 3.495 3.659 3.74 3.9 4.053 4.258 4.387 4.512 4.693 4.869 5.036 5.191 5.341 5.543 5.721 5.875 6.061 6.243 6.409 6.587 6.774 6.95 7.13 7.326 7.532 7.739 7.978 8.235 8.455 8.665 8.888 9.12 9.277 9.213 8.729 7.63 6.071 4.634 3.365 2.257 1.222 0.293 -0.534 -1.264 -2.021 -2.656 -3.205 -3.75 -4.278 -4.76 -5.205 -5.657 -6.045 -6.383 -6.742 -7.113 -7.399 -7.705 -8.035 -8.287 -8.55 -8.815 -9.084 -9.37 -9.563 -9.764 -10.109 -10.356 -10.595 -10.714 -10.974 -11.245 -11.516 -11.66 -11.924 -12.122 -12.295 -12.489 -12.897 -13.081 -13.283 -13.54 -13.824 -14.142 -14.549 -15.642 -6 ,31297 ,KEBNE ,17024177,Wed Dec 22 09:30:20 CET,Wed Dec 22 11:11:45 CET,0.0 0.776 1.125 1.384 1.595 1.79 1.964 2.135 2.447 2.571 2.69 2.825 3.034 3.137 3.34 3.534 3.716 3.803 3.968 4.126 4.358 4.505 4.634 4.81 4.972 5.13 5.3 5.465 5.66 5.84 6.012 6.205 6.385 6.561 6.752 6.965 7.165 7.369 7.596 7.822 8.032 8.257 8.492 8.692 8.885 9.064 9.205 9.216 9.035 8.589 7.519 6.025 4.657 3.399 2.266 1.207 0.282 -0.55 -1.301 -2.058 -2.687 -3.231 -3.765 -4.271 -4.754 -5.183 -5.615 -6.017 -6.372 -6.736 -7.098 -7.411 -7.739 -8.06 -8.309 -8.574 -8.841 -9.118 -9.413 -9.615 -9.82 -10.137 -10.363 -10.6 -10.725 -10.979 -11.257 -11.54 -11.683 -11.95 -12.157 -12.327 -12.5 -12.881 -13.093 -13.33 -13.6 -13.891 -14.221 -14.654 -15.62 -7 ,11746 ,KEBNE ,17024178,Wed Dec 22 09:30:20 CET,Wed Dec 22 11:12:45 CET,0.0 0.914 1.298 1.563 1.807 2.039 2.235 2.397 2.708 2.845 2.967 3.091 3.29 3.396 3.591 3.781 3.967 4.043 4.187 4.342 4.567 4.702 4.826 5.006 5.178 5.328 5.469 5.612 5.788 5.958 6.124 6.312 6.485 6.653 6.866 7.102 7.299 7.499 7.717 7.923 8.098 8.281 8.498 8.695 8.88 9.032 9.156 9.195 9.058 8.686 7.74 6.258 4.873 3.61 2.466 1.478 0.628 -0.161 -0.826 -1.48 -2.079 -2.639 -3.181 -3.709 -4.197 -4.64 -5.103 -5.531 -5.892 -6.248 -6.637 -6.969 -7.293 -7.602 -7.846 -8.109 -8.381 -8.673 -8.99 -9.203 -9.42 -9.757 -9.986 -10.238 -10.366 -10.636 -10.924 -11.214 -11.364 -11.623 -11.82 -11.981 -12.148 -12.497 -12.695 -12.907 -13.125 -13.388 -13.704 -14.089 -15.343 -8 ,30395 ,KEBNE ,17024179,Wed Dec 22 09:30:20 CET,Wed Dec 22 11:11:05 CET,0.0 0.647 0.961 1.239 1.467 1.663 1.832 1.982 2.25 2.38 2.506 2.622 2.815 2.907 3.087 3.266 3.451 3.535 3.692 3.849 4.067 4.194 4.318 4.494 4.654 4.809 4.969 5.115 5.293 5.474 5.653 5.857 6.057 6.249 6.467 6.697 6.903 7.143 7.39 7.626 7.855 8.077 8.313 8.53 8.752 8.937 9.037 9.08 9.007 8.645 7.636 6.071 4.688 3.488 2.384 1.354 0.463 -0.353 -1.09 -1.847 -2.507 -3.078 -3.606 -4.109 -4.556 -4.96 -5.399 -5.799 -6.14 -6.477 -6.842 -7.15 -7.456 -7.778 -8.045 -8.32 -8.59 -8.87 -9.159 -9.357 -9.566 -9.89 -10.107 -10.333 -10.45 -10.687 -10.944 -11.214 -11.363 -11.634 -11.845 -12.012 -12.174 -12.55 -12.752 -12.967 -13.205 -13.484 -13.809 -14.19 -15.186 -9 ,12292 ,KEBNE ,17024180,Wed Dec 22 09:30:21 CET,Wed Dec 22 11:12:25 CET,0.0 0.658 0.938 1.203 1.423 1.612 1.781 1.93 2.217 2.348 2.468 2.596 2.812 2.922 3.126 3.307 3.48 3.561 3.707 3.855 4.073 4.199 4.319 4.5 4.678 4.85 5.015 5.176 5.38 5.555 5.713 5.906 6.092 6.264 6.451 6.664 6.862 7.066 7.282 7.485 7.663 7.856 8.057 8.247 8.433 8.564 8.651 8.651 8.54 8.166 7.173 5.586 4.09 2.779 1.669 0.666 -0.231 -1.096 -1.872 -2.627 -3.266 -3.811 -4.339 -4.854 -5.323 -5.75 -6.197 -6.592 -6.923 -7.278 -7.658 -7.951 -8.251 -8.574 -8.817 -9.067 -9.332 -9.611 -9.9 -10.098 -10.297 -10.607 -10.837 -11.081 -11.206 -11.449 -11.686 -11.945 -12.092 -12.359 -12.564 -12.741 -12.924 -13.323 -13.562 -13.818 -14.091 -14.412 -14.76 -15.239 -16.349 -10 ,19079 ,KEBNE ,17024181,Wed Dec 22 09:30:21 CET,Wed Dec 22 11:12:11 CET,0.0 0.966 1.315 1.591 1.814 1.986 2.132 2.278 2.561 2.69 2.813 2.93 3.124 3.217 3.413 3.594 3.763 3.844 3.998 4.144 4.351 4.486 4.617 4.8 4.971 5.141 5.296 5.445 5.645 5.833 6.01 6.231 6.428 6.6 6.793 6.985 7.16 7.355 7.564 7.786 8.006 8.22 8.435 8.635 8.81 8.94 9.043 9.039 8.88 8.444 7.402 5.917 4.495 3.133 1.911 0.793 -0.185 -1.041 -1.769 -2.486 -3.095 -3.661 -4.198 -4.699 -5.162 -5.59 -6.066 -6.488 -6.841 -7.206 -7.589 -7.885 -8.181 -8.508 -8.76 -9.024 -9.307 -9.592 -9.884 -10.088 -10.302 -10.643 -10.871 -11.101 -11.227 -11.486 -11.747 -12.037 -12.186 -12.447 -12.626 -12.788 -12.966 -13.344 -13.57 -13.82 -14.078 -14.359 -14.652 -15.023 -15.72 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index 1cfd9c22..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11734 ,TETRA ,17585443,Sat Nov 27 13:50:47 CET,Sat Nov 27 15:56:29 CET,0.0 0.225 0.4 0.538 0.651 0.761 0.868 0.967 1.154 1.246 1.328 1.352 1.534 1.607 1.747 1.876 2.002 2.063 2.182 2.292 2.447 2.553 2.659 2.814 2.96 3.087 3.208 3.326 3.48 3.639 3.8 3.988 4.166 4.331 4.508 4.702 4.892 5.101 5.326 5.562 5.787 6.032 6.316 6.595 6.921 7.273 7.642 8.035 8.403 8.617 8.61 8.276 7.835 7.361 6.89 6.473 6.067 5.649 5.274 4.913 4.584 4.291 3.989 3.668 3.384 3.112 2.823 2.565 2.344 2.117 1.857 1.65 1.441 1.214 1.031 0.823 0.624 0.427 0.198 0.031 -0.133 -0.37 -0.545 -0.739 -0.837 -1.033 -1.234 -1.442 -1.558 -1.803 -1.969 -2.102 -2.253 -2.59 -2.779 -2.983 -3.213 -3.473 -3.809 -4.232 -5.463 -2 ,32304 ,TETRA ,17585444,Sat Nov 27 13:50:49 CET,Sat Nov 27 15:58:20 CET,0.0 0.208 0.34 0.476 0.617 0.75 0.871 0.982 1.17 1.254 1.34 1.389 1.579 1.652 1.796 1.938 2.064 2.123 2.248 2.37 2.545 2.651 2.746 2.884 3.023 3.154 3.271 3.384 3.545 3.7 3.835 4.002 4.162 4.316 4.499 4.716 4.928 5.15 5.382 5.617 5.852 6.106 6.395 6.678 6.99 7.312 7.665 8.048 8.422 8.697 8.768 8.509 8.127 7.68 7.182 6.712 6.292 5.9 5.561 5.179 4.835 4.527 4.223 3.914 3.618 3.354 3.068 2.819 2.6 2.358 2.095 1.861 1.632 1.42 1.254 1.054 0.846 0.64 0.413 0.259 0.087 -0.187 -0.373 -0.571 -0.671 -0.9 -1.16 -1.416 -1.545 -1.792 -1.972 -2.127 -2.297 -2.653 -2.842 -3.05 -3.314 -3.593 -3.887 -4.34 -5.678 -3 ,7869 ,TETRA ,17585445,Sat Nov 27 13:50:47 CET,Sat Nov 27 15:57:11 CET,0.0 0.28 0.49 0.663 0.821 0.961 1.078 1.18 1.383 1.489 1.586 1.636 1.832 1.904 2.038 2.171 2.304 2.37 2.496 2.622 2.802 2.908 3.011 3.162 3.302 3.43 3.559 3.684 3.843 4.0 4.157 4.339 4.502 4.663 4.854 5.056 5.245 5.44 5.649 5.877 6.107 6.375 6.698 6.994 7.296 7.62 7.979 8.355 8.716 9.02 9.113 8.843 8.395 7.844 7.313 6.82 6.36 5.9 5.507 5.14 4.794 4.474 4.166 3.851 3.564 3.31 3.024 2.773 2.557 2.325 2.084 1.88 1.673 1.442 1.25 1.059 0.854 0.642 0.415 0.25 0.086 -0.168 -0.348 -0.549 -0.657 -0.864 -1.069 -1.303 -1.425 -1.661 -1.827 -1.986 -2.157 -2.521 -2.706 -2.91 -3.146 -3.394 -3.684 -3.997 -4.998 -4 ,8478 ,TETRA ,17585446,Sat Nov 27 13:50:47 CET,Sat Nov 27 15:56:56 CET,0.0 0.324 0.483 0.621 0.76 0.892 1.01 1.13 1.34 1.419 1.503 1.559 1.757 1.834 1.976 2.107 2.24 2.303 2.42 2.533 2.7 2.811 2.922 3.083 3.239 3.379 3.508 3.632 3.785 3.937 4.081 4.245 4.399 4.553 4.726 4.924 5.12 5.324 5.537 5.759 5.979 6.219 6.5 6.753 7.05 7.372 7.707 8.067 8.417 8.705 8.789 8.513 8.081 7.613 7.148 6.695 6.286 5.897 5.547 5.161 4.812 4.489 4.16 3.845 3.537 3.262 2.982 2.72 2.501 2.277 2.019 1.8 1.571 1.336 1.151 0.964 0.773 0.563 0.356 0.203 0.03 -0.242 -0.439 -0.638 -0.737 -0.936 -1.148 -1.394 -1.511 -1.744 -1.958 -2.147 -2.338 -2.718 -2.912 -3.103 -3.32 -3.588 -3.92 -4.41 -6.061 -5 ,11090 ,TETRA ,17585447,Sat Nov 27 13:50:48 CET,Sat Nov 27 15:57:13 CET,0.0 0.179 0.335 0.484 0.627 0.751 0.884 1.008 1.2 1.292 1.381 1.437 1.634 1.718 1.875 2.006 2.132 2.195 2.326 2.451 2.626 2.738 2.845 2.999 3.143 3.28 3.401 3.513 3.668 3.823 3.969 4.141 4.312 4.471 4.646 4.854 5.053 5.256 5.457 5.669 5.899 6.146 6.425 6.692 7.009 7.355 7.738 8.148 8.541 8.884 8.966 8.638 8.149 7.683 7.232 6.76 6.32 5.871 5.465 5.046 4.663 4.329 4.011 3.697 3.393 3.1 2.79 2.527 2.296 2.055 1.788 1.563 1.351 1.101 0.889 0.685 0.478 0.262 0.033 -0.143 -0.333 -0.631 -0.844 -1.061 -1.172 -1.377 -1.595 -1.843 -1.975 -2.224 -2.403 -2.55 -2.698 -3.015 -3.2 -3.435 -3.707 -4.012 -4.362 -4.829 -6.512 -6 ,28003 ,TETRA ,17585448,Sat Nov 27 13:50:48 CET,Sat Nov 27 15:57:27 CET,0.0 0.296 0.519 0.657 0.785 0.902 1.013 1.114 1.305 1.39 1.465 1.504 1.696 1.771 1.909 2.039 2.172 2.235 2.349 2.469 2.637 2.746 2.851 3.001 3.14 3.266 3.387 3.511 3.671 3.81 3.942 4.11 4.269 4.416 4.596 4.801 4.983 5.179 5.398 5.614 5.834 6.07 6.346 6.633 6.92 7.21 7.547 7.902 8.223 8.498 8.619 8.384 8.029 7.533 7.005 6.521 6.073 5.655 5.275 4.912 4.607 4.324 4.045 3.75 3.446 3.162 2.865 2.601 2.375 2.134 1.869 1.635 1.4 1.163 0.97 0.756 0.544 0.348 0.134 -0.017 -0.176 -0.442 -0.634 -0.833 -0.929 -1.136 -1.353 -1.57 -1.697 -1.94 -2.089 -2.242 -2.415 -2.788 -3.0 -3.248 -3.497 -3.749 -4.074 -4.539 -6.263 -7 ,21277 ,TETRA ,17585449,Sat Nov 27 13:50:48 CET,Sat Nov 27 15:56:37 CET,0.0 0.205 0.392 0.524 0.649 0.77 0.88 0.987 1.163 1.24 1.323 1.387 1.58 1.655 1.803 1.939 2.056 2.113 2.23 2.346 2.516 2.627 2.728 2.866 3.002 3.135 3.258 3.375 3.534 3.685 3.827 3.995 4.167 4.329 4.509 4.721 4.918 5.123 5.351 5.594 5.848 6.115 6.4 6.695 7.046 7.423 7.793 8.115 8.425 8.704 8.824 8.547 8.079 7.61 7.13 6.617 6.151 5.719 5.333 4.92 4.561 4.245 3.937 3.64 3.349 3.085 2.811 2.572 2.371 2.15 1.903 1.699 1.499 1.285 1.107 0.927 0.737 0.521 0.266 0.095 -0.072 -0.333 -0.51 -0.701 -0.8 -1.01 -1.245 -1.493 -1.618 -1.857 -1.994 -2.134 -2.299 -2.644 -2.841 -3.049 -3.286 -3.583 -3.9 -4.332 -5.727 -8 ,22625 ,TETRA ,17585450,Sat Nov 27 13:50:50 CET,Sat Nov 27 15:56:34 CET,0.0 0.264 0.473 0.65 0.806 0.933 1.043 1.148 1.359 1.453 1.549 1.621 1.826 1.909 2.033 2.152 2.278 2.341 2.462 2.576 2.739 2.852 2.959 3.1 3.244 3.382 3.517 3.644 3.812 3.975 4.119 4.305 4.478 4.648 4.84 5.032 5.211 5.417 5.645 5.872 6.108 6.386 6.688 6.977 7.326 7.681 8.035 8.391 8.74 9.06 9.132 8.795 8.333 7.83 7.372 6.929 6.488 6.058 5.665 5.241 4.867 4.534 4.204 3.862 3.533 3.235 2.935 2.689 2.473 2.246 1.997 1.779 1.548 1.309 1.12 0.921 0.718 0.497 0.264 0.115 -0.031 -0.278 -0.459 -0.642 -0.742 -0.959 -1.169 -1.389 -1.508 -1.736 -1.888 -2.041 -2.194 -2.53 -2.725 -2.938 -3.179 -3.466 -3.813 -4.327 -5.912 -9 ,24696 ,TETRA ,17585451,Sat Nov 27 13:50:48 CET,Sat Nov 27 15:57:37 CET,0.0 0.23 0.406 0.572 0.717 0.838 0.942 1.038 1.215 1.294 1.369 1.409 1.596 1.67 1.82 1.96 2.087 2.146 2.258 2.374 2.543 2.649 2.755 2.911 3.057 3.198 3.343 3.495 3.679 3.841 3.999 4.181 4.352 4.517 4.708 4.926 5.127 5.359 5.588 5.802 6.034 6.306 6.609 6.911 7.254 7.575 7.893 8.223 8.545 8.76 8.75 8.366 7.879 7.367 6.889 6.443 6.033 5.598 5.21 4.81 4.441 4.14 3.807 3.454 3.154 2.884 2.624 2.397 2.171 1.931 1.696 1.5 1.285 1.03 0.826 0.635 0.443 0.221 -0.029 -0.187 -0.346 -0.611 -0.794 -0.974 -1.068 -1.258 -1.492 -1.781 -1.927 -2.183 -2.381 -2.546 -2.703 -3.033 -3.227 -3.433 -3.666 -3.943 -4.251 -4.661 -6.175 -10 ,1278 ,TETRA ,17585452,Sat Nov 27 13:50:48 CET,Sat Nov 27 15:57:07 CET,0.0 0.277 0.459 0.621 0.765 0.905 1.028 1.141 1.373 1.47 1.557 1.605 1.787 1.864 2.021 2.159 2.282 2.343 2.466 2.584 2.749 2.856 2.963 3.108 3.238 3.369 3.504 3.636 3.799 3.954 4.098 4.283 4.467 4.634 4.829 5.048 5.251 5.454 5.662 5.881 6.114 6.377 6.668 6.953 7.243 7.526 7.827 8.175 8.57 8.924 9.019 8.72 8.302 7.834 7.336 6.807 6.334 5.904 5.509 5.101 4.742 4.414 4.086 3.783 3.508 3.247 2.976 2.718 2.484 2.239 1.986 1.772 1.539 1.306 1.125 0.925 0.722 0.511 0.274 0.113 -0.051 -0.321 -0.511 -0.696 -0.794 -1.002 -1.221 -1.466 -1.594 -1.841 -2.016 -2.169 -2.338 -2.733 -2.95 -3.179 -3.449 -3.736 -4.086 -4.496 -5.773 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index ab72cb8a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21986 ,TETRA ,17585453,Sat Nov 27 13:50:49 CET,Sat Nov 27 15:56:08 CET,0.0 0.271 0.458 0.595 0.722 0.863 1.003 1.126 1.344 1.447 1.549 1.619 1.845 1.935 2.096 2.247 2.395 2.469 2.61 2.752 2.956 3.08 3.204 3.387 3.549 3.715 3.892 4.063 4.271 4.465 4.65 4.876 5.093 5.299 5.548 5.818 6.064 6.351 6.67 7.008 7.363 7.751 8.181 8.617 9.161 9.76 10.419 11.128 11.915 12.765 13.7 14.301 14.454 14.421 14.292 14.086 13.858 13.643 13.434 13.177 12.953 12.753 12.545 12.336 12.121 11.898 11.679 11.48 11.289 11.099 10.897 10.716 10.526 10.341 10.194 10.029 9.857 9.682 9.49 9.345 9.198 8.973 8.797 8.618 8.533 8.364 8.181 7.97 7.853 7.619 7.461 7.329 7.19 6.885 6.725 6.543 6.34 6.105 5.81 5.425 4.328 -2 ,17455 ,TETRA ,17585454,Sat Nov 27 13:50:47 CET,Sat Nov 27 15:44:56 CET,0.0 0.363 0.54 0.677 0.804 0.936 1.059 1.171 1.378 1.473 1.567 1.628 1.845 1.929 2.083 2.233 2.382 2.455 2.585 2.712 2.903 3.032 3.158 3.335 3.52 3.697 3.858 4.01 4.194 4.371 4.547 4.766 4.975 5.172 5.407 5.669 5.914 6.19 6.499 6.817 7.123 7.491 7.936 8.372 8.882 9.424 10.021 10.684 11.462 12.319 13.197 13.733 13.879 13.859 13.729 13.49 13.254 13.028 12.797 12.555 12.317 12.075 11.85 11.641 11.434 11.224 11.003 10.815 10.645 10.453 10.247 10.072 9.879 9.682 9.538 9.388 9.228 9.052 8.861 8.72 8.572 8.362 8.202 8.026 7.942 7.753 7.543 7.341 7.239 7.031 6.929 6.794 6.631 6.295 6.132 5.938 5.713 5.45 5.127 4.7 3.593 -3 ,19911 ,TETRA ,17585455,Sat Nov 27 13:50:49 CET,Sat Nov 27 15:55:49 CET,0.0 0.243 0.448 0.61 0.752 0.905 1.042 1.166 1.39 1.485 1.59 1.665 1.878 1.967 2.14 2.298 2.441 2.509 2.642 2.776 2.967 3.092 3.215 3.385 3.554 3.724 3.886 4.038 4.235 4.429 4.613 4.828 5.034 5.234 5.466 5.734 5.99 6.264 6.559 6.873 7.195 7.557 7.994 8.428 8.935 9.488 10.089 10.784 11.594 12.49 13.451 13.916 14.043 14.038 13.872 13.641 13.445 13.209 12.98 12.758 12.569 12.366 12.134 11.916 11.709 11.525 11.314 11.11 10.932 10.751 10.549 10.37 10.17 9.966 9.809 9.641 9.475 9.289 9.083 8.952 8.811 8.574 8.405 8.228 8.143 7.97 7.764 7.544 7.436 7.206 7.047 6.907 6.758 6.445 6.277 6.066 5.845 5.613 5.327 4.933 3.262 -4 ,30915 ,TETRA ,17585456,Sat Nov 27 13:50:48 CET,Sat Nov 27 15:55:26 CET,0.0 0.331 0.516 0.681 0.818 0.96 1.092 1.204 1.404 1.504 1.606 1.669 1.877 1.958 2.12 2.278 2.43 2.498 2.637 2.778 2.971 3.09 3.209 3.383 3.549 3.722 3.88 4.035 4.24 4.424 4.601 4.822 5.042 5.244 5.469 5.726 5.969 6.238 6.547 6.882 7.226 7.594 8.014 8.446 8.96 9.528 10.142 10.818 11.573 12.361 13.19 13.723 13.877 13.847 13.7 13.516 13.319 13.104 12.893 12.644 12.429 12.219 12.006 11.803 11.6 11.391 11.157 10.945 10.754 10.556 10.342 10.153 9.959 9.761 9.603 9.443 9.28 9.092 8.894 8.771 8.641 8.422 8.266 8.11 8.035 7.875 7.688 7.469 7.352 7.119 6.991 6.852 6.704 6.376 6.185 5.988 5.778 5.505 5.184 4.745 3.892 -5 ,22183 ,TETRA ,17585457,Sat Nov 27 13:50:49 CET,Sat Nov 27 15:56:40 CET,0.0 0.244 0.408 0.534 0.663 0.782 0.883 0.984 1.179 1.27 1.371 1.434 1.633 1.716 1.877 2.023 2.165 2.238 2.385 2.52 2.711 2.842 2.975 3.16 3.332 3.495 3.66 3.817 4.011 4.199 4.383 4.599 4.804 5.009 5.253 5.515 5.772 6.056 6.355 6.684 7.051 7.45 7.886 8.337 8.85 9.419 10.128 10.926 11.781 12.713 13.665 14.168 14.285 14.214 14.037 13.842 13.627 13.39 13.169 12.925 12.679 12.43 12.176 11.935 11.706 11.486 11.248 11.044 10.856 10.642 10.428 10.262 10.093 9.901 9.747 9.589 9.407 9.212 9.014 8.884 8.758 8.536 8.381 8.234 8.152 7.976 7.785 7.567 7.46 7.242 7.1 6.974 6.832 6.479 6.287 6.088 5.88 5.603 5.251 4.833 3.403 -6 ,5701 ,TETRA ,17585458,Sat Nov 27 13:50:48 CET,Sat Nov 27 15:56:04 CET,0.0 0.23 0.439 0.627 0.792 0.951 1.077 1.197 1.413 1.515 1.616 1.672 1.888 1.973 2.124 2.264 2.408 2.478 2.618 2.765 2.965 3.088 3.211 3.391 3.562 3.71 3.851 3.994 4.177 4.359 4.535 4.746 4.955 5.156 5.384 5.639 5.876 6.14 6.439 6.75 7.059 7.413 7.865 8.325 8.833 9.378 10.004 10.697 11.518 12.44 13.332 13.839 13.998 13.96 13.794 13.597 13.378 13.146 12.914 12.64 12.394 12.165 11.936 11.715 11.485 11.266 11.028 10.8 10.606 10.41 10.215 10.048 9.851 9.64 9.482 9.309 9.127 8.945 8.76 8.633 8.493 8.287 8.15 7.991 7.91 7.74 7.558 7.376 7.274 7.052 6.939 6.812 6.675 6.39 6.217 6.017 5.793 5.553 5.281 4.939 4.13 -7 ,28506 ,TETRA ,17585459,Sat Nov 27 13:50:49 CET,Sat Nov 27 15:50:22 CET,0.0 0.207 0.411 0.62 0.791 0.925 1.042 1.154 1.39 1.494 1.589 1.645 1.854 1.95 2.139 2.309 2.46 2.533 2.681 2.816 3.006 3.129 3.257 3.446 3.625 3.798 3.958 4.109 4.3 4.49 4.676 4.888 5.097 5.31 5.559 5.83 6.085 6.348 6.645 6.966 7.288 7.65 8.066 8.504 9.026 9.581 10.209 10.913 11.715 12.613 13.542 14.085 14.268 14.253 14.106 13.899 13.678 13.457 13.251 12.981 12.722 12.502 12.271 12.026 11.802 11.603 11.385 11.184 10.999 10.795 10.567 10.387 10.2 10.004 9.837 9.659 9.506 9.333 9.135 8.993 8.851 8.617 8.453 8.272 8.176 8.005 7.826 7.627 7.517 7.301 7.213 7.091 6.954 6.662 6.502 6.328 6.127 5.894 5.606 5.135 3.85 -8 ,1959 ,TETRA ,17585460,Sat Nov 27 13:51:47 CET,Sat Nov 27 15:48:57 CET,0.0 0.374 0.576 0.739 0.876 1.009 1.145 1.276 1.485 1.582 1.681 1.745 1.956 2.054 2.239 2.414 2.592 2.671 2.819 2.97 3.185 3.313 3.433 3.604 3.768 3.937 4.103 4.259 4.462 4.65 4.826 5.035 5.242 5.447 5.681 5.933 6.182 6.453 6.742 7.049 7.372 7.745 8.164 8.578 9.077 9.648 10.286 10.963 11.695 12.498 13.346 13.808 13.885 13.829 13.678 13.488 13.261 13.015 12.771 12.51 12.303 12.097 11.888 11.67 11.448 11.242 11.019 10.809 10.623 10.43 10.234 10.076 9.905 9.706 9.561 9.418 9.25 9.069 8.885 8.761 8.632 8.425 8.259 8.09 8.01 7.833 7.648 7.452 7.346 7.128 6.999 6.867 6.724 6.405 6.24 6.069 5.864 5.644 5.397 5.003 3.609 -9 ,26690 ,TETRA ,17585461,Sat Nov 27 13:51:46 CET,Sat Nov 27 15:56:06 CET,0.0 0.265 0.45 0.613 0.778 0.914 1.024 1.141 1.368 1.473 1.574 1.644 1.86 1.942 2.104 2.255 2.398 2.469 2.606 2.744 2.938 3.053 3.167 3.337 3.506 3.666 3.817 3.961 4.148 4.324 4.49 4.69 4.886 5.077 5.302 5.565 5.818 6.093 6.389 6.706 7.049 7.439 7.89 8.342 8.834 9.375 9.994 10.667 11.445 12.264 13.172 13.704 13.819 13.82 13.698 13.485 13.249 13.033 12.835 12.578 12.324 12.124 11.931 11.721 11.513 11.305 11.055 10.823 10.642 10.447 10.221 10.046 9.863 9.667 9.501 9.318 9.158 8.988 8.805 8.68 8.535 8.306 8.146 7.971 7.884 7.708 7.517 7.298 7.185 6.957 6.821 6.681 6.539 6.255 6.085 5.886 5.675 5.436 5.063 4.578 3.586 -10 ,21282 ,TETRA ,17585462,Sat Nov 27 13:51:46 CET,Sat Nov 27 15:57:36 CET,0.0 0.237 0.414 0.558 0.684 0.811 0.935 1.063 1.298 1.402 1.499 1.547 1.751 1.833 1.999 2.16 2.314 2.387 2.528 2.654 2.831 2.951 3.071 3.237 3.389 3.544 3.703 3.856 4.051 4.23 4.403 4.621 4.83 5.036 5.272 5.537 5.792 6.063 6.358 6.67 7.008 7.394 7.847 8.309 8.831 9.374 9.979 10.67 11.426 12.221 13.093 13.626 13.776 13.754 13.637 13.474 13.284 13.082 12.861 12.605 12.368 12.153 11.938 11.716 11.512 11.313 11.093 10.886 10.711 10.54 10.342 10.169 9.983 9.782 9.637 9.494 9.342 9.171 8.983 8.849 8.712 8.5 8.34 8.169 8.09 7.919 7.734 7.525 7.408 7.179 7.045 6.916 6.778 6.471 6.311 6.126 5.923 5.686 5.372 4.928 3.081 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt deleted file mode 100644 index 7186ba47..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2040 ,TETRA ,17585463,Sat Nov 27 13:51:46 CET,Sat Nov 27 15:57:20 CET,0.0 1.576 1.998 2.318 2.643 2.92 3.156 3.349 3.707 3.875 4.048 4.258 4.508 4.63 4.863 5.079 5.299 5.404 5.606 5.809 6.091 6.282 6.471 6.731 6.979 7.215 7.439 7.652 7.94 8.212 8.45 8.735 9.025 9.295 9.593 9.933 10.271 10.655 11.057 11.466 11.881 12.33 12.847 13.38 14.027 14.749 15.502 16.295 17.183 18.156 19.145 19.747 19.933 19.878 19.68 19.413 19.157 18.908 18.667 18.394 18.111 17.841 17.592 17.356 17.136 16.93 16.693 16.483 16.305 16.115 15.906 15.731 15.547 15.353 15.21 15.059 14.891 14.719 14.543 14.42 14.286 14.065 13.896 13.731 13.655 13.488 13.308 13.12 13.025 12.816 12.727 12.616 12.499 12.244 12.11 11.962 11.781 11.593 11.365 11.032 10.389 -2 ,23467 ,TETRA ,17585464,Sat Nov 27 13:51:46 CET,Sat Nov 27 15:58:11 CET,0.0 1.703 2.191 2.614 3.016 3.356 3.637 3.887 4.356 4.572 4.781 5.043 5.336 5.491 5.761 6.011 6.259 6.372 6.594 6.824 7.152 7.362 7.576 7.87 8.143 8.414 8.67 8.902 9.187 9.461 9.732 10.068 10.396 10.721 11.074 11.448 11.805 12.168 12.546 12.95 13.392 13.882 14.44 14.987 15.644 16.436 17.323 18.243 19.28 20.333 21.361 22.007 22.129 22.054 21.907 21.694 21.406 21.105 20.846 20.569 20.32 20.085 19.857 19.657 19.454 19.255 19.051 18.871 18.706 18.514 18.324 18.156 17.971 17.789 17.639 17.467 17.305 17.15 16.974 16.854 16.728 16.524 16.38 16.223 16.143 15.968 15.771 15.572 15.478 15.271 15.165 15.047 14.93 14.684 14.539 14.385 14.215 14.001 13.773 13.505 12.676 -3 ,24170 ,TETRA ,17585465,Sat Nov 27 13:51:46 CET,Sat Nov 27 15:57:59 CET,0.0 1.607 2.092 2.443 2.764 3.028 3.208 3.366 3.703 3.876 4.038 4.212 4.467 4.586 4.817 5.068 5.319 5.435 5.663 5.878 6.169 6.346 6.502 6.734 6.965 7.185 7.395 7.588 7.847 8.094 8.334 8.623 8.889 9.159 9.472 9.805 10.118 10.466 10.84 11.249 11.689 12.15 12.67 13.208 13.805 14.442 15.184 15.993 16.869 17.781 18.686 19.182 19.351 19.339 19.175 18.952 18.72 18.488 18.266 18.033 17.827 17.62 17.397 17.182 16.969 16.785 16.59 16.391 16.219 16.042 15.862 15.703 15.517 15.331 15.191 15.028 14.857 14.677 14.494 14.372 14.237 14.014 13.854 13.69 13.603 13.429 13.239 13.038 12.939 12.722 12.591 12.453 12.313 12.039 11.873 11.683 11.479 11.233 10.946 10.574 9.88 -4 ,11504 ,TETRA ,17585466,Sat Nov 27 13:51:49 CET,Sat Nov 27 15:57:51 CET,0.0 1.797 2.261 2.63 2.942 3.192 3.399 3.602 4.037 4.233 4.409 4.66 4.952 5.101 5.354 5.565 5.767 5.876 6.087 6.275 6.559 6.739 6.905 7.133 7.352 7.57 7.784 7.99 8.243 8.485 8.717 9.005 9.285 9.555 9.873 10.232 10.597 10.997 11.404 11.809 12.224 12.699 13.253 13.793 14.371 15.015 15.801 16.626 17.509 18.45 19.422 20.064 20.315 20.307 20.197 20.028 19.77 19.498 19.265 19.032 18.801 18.564 18.315 18.073 17.845 17.63 17.406 17.194 16.99 16.776 16.572 16.405 16.217 16.029 15.886 15.724 15.553 15.384 15.22 15.108 14.967 14.734 14.582 14.405 14.31 14.107 13.901 13.706 13.597 13.374 13.266 13.133 12.988 12.684 12.521 12.341 12.144 11.895 11.605 11.23 10.069 -5 ,2633 ,TETRA ,17585467,Sat Nov 27 13:51:46 CET,Sat Nov 27 15:58:06 CET,0.0 1.648 2.177 2.59 2.884 3.139 3.388 3.601 4.017 4.235 4.427 4.633 4.907 5.064 5.393 5.685 5.918 6.031 6.276 6.526 6.857 7.056 7.244 7.506 7.76 8.027 8.274 8.484 8.745 9.008 9.273 9.58 9.874 10.157 10.476 10.839 11.189 11.577 12.019 12.472 12.883 13.328 13.883 14.456 15.075 15.724 16.495 17.328 18.233 19.24 20.24 20.864 21.029 20.991 20.836 20.621 20.409 20.141 19.885 19.624 19.366 19.115 18.89 18.681 18.455 18.234 17.99 17.766 17.569 17.374 17.182 17.025 16.862 16.683 16.546 16.394 16.238 16.078 15.896 15.768 15.639 15.443 15.296 15.131 15.047 14.871 14.683 14.491 14.39 14.162 14.062 13.945 13.812 13.522 13.387 13.259 13.104 12.916 12.707 12.498 11.905 -6 ,27562 ,TETRA ,17585468,Sat Nov 27 13:51:46 CET,Sat Nov 27 16:01:35 CET,0.0 1.3 1.738 2.026 2.268 2.477 2.668 2.834 3.135 3.284 3.424 3.538 3.772 3.886 4.106 4.313 4.512 4.612 4.804 4.987 5.261 5.434 5.59 5.811 6.039 6.258 6.463 6.66 6.917 7.167 7.402 7.694 7.977 8.241 8.543 8.878 9.204 9.567 9.968 10.394 10.834 11.304 11.83 12.36 12.991 13.673 14.428 15.275 16.227 17.256 18.259 18.76 18.84 18.772 18.525 18.243 18.002 17.735 17.465 17.153 16.859 16.573 16.298 16.03 15.786 15.599 15.404 15.208 15.034 14.854 14.659 14.487 14.313 14.124 13.96 13.786 13.609 13.415 13.203 13.06 12.915 12.692 12.536 12.376 12.291 12.106 11.9 11.686 11.578 11.343 11.198 11.052 10.906 10.605 10.426 10.216 10.0 9.751 9.427 9.088 8.122 -7 ,28609 ,TETRA ,17585469,Sat Nov 27 13:51:46 CET,Sat Nov 27 15:56:52 CET,0.0 0.718 1.026 1.277 1.512 1.714 1.886 2.057 2.384 2.529 2.664 2.805 3.056 3.172 3.394 3.614 3.819 3.915 4.116 4.314 4.592 4.762 4.936 5.186 5.413 5.635 5.847 6.051 6.305 6.549 6.793 7.081 7.362 7.638 7.949 8.303 8.643 8.994 9.377 9.788 10.209 10.696 11.276 11.841 12.473 13.185 13.992 14.861 15.833 16.883 17.969 18.563 18.641 18.517 18.328 18.101 17.829 17.546 17.271 16.986 16.744 16.512 16.263 16.02 15.811 15.613 15.398 15.214 15.054 14.857 14.634 14.46 14.27 14.072 13.932 13.773 13.6 13.438 13.265 13.132 12.993 12.793 12.655 12.509 12.432 12.271 12.094 11.908 11.809 11.593 11.503 11.396 11.277 11.023 10.875 10.708 10.542 10.364 10.152 9.876 9.419 -8 ,8873 ,TETRA ,17585470,Sat Nov 27 13:51:46 CET,Sat Nov 27 15:57:58 CET,0.0 1.476 2.031 2.446 2.813 3.134 3.389 3.582 3.944 4.127 4.302 4.513 4.792 4.928 5.192 5.459 5.728 5.859 6.102 6.324 6.654 6.863 7.047 7.297 7.556 7.819 8.064 8.282 8.565 8.858 9.133 9.45 9.748 10.01 10.304 10.636 10.955 11.302 11.652 12.017 12.412 12.846 13.339 13.849 14.458 15.131 15.871 16.641 17.468 18.426 19.438 20.009 20.186 20.14 19.971 19.766 19.571 19.363 19.133 18.892 18.689 18.463 18.229 18.013 17.793 17.591 17.361 17.14 16.954 16.759 16.551 16.379 16.19 15.97 15.787 15.608 15.447 15.278 15.075 14.938 14.804 14.58 14.404 14.215 14.13 13.968 13.804 13.618 13.506 13.262 13.1 12.958 12.813 12.495 12.316 12.132 11.913 11.666 11.371 10.961 9.818 -9 ,22282 ,TETRA ,17585471,Sat Nov 27 13:51:46 CET,Sat Nov 27 15:52:22 CET,0.0 1.802 2.196 2.475 2.701 2.926 3.156 3.371 3.745 3.904 4.065 4.297 4.574 4.708 4.967 5.216 5.425 5.52 5.715 5.91 6.18 6.35 6.514 6.747 6.993 7.239 7.452 7.647 7.915 8.189 8.46 8.793 9.089 9.353 9.655 9.979 10.307 10.688 11.064 11.462 11.892 12.361 12.905 13.46 14.074 14.742 15.525 16.326 17.205 18.183 19.193 19.779 19.965 20.0 19.85 19.614 19.391 19.16 18.924 18.669 18.442 18.232 18.031 17.821 17.618 17.421 17.209 17.022 16.855 16.67 16.467 16.304 16.126 15.94 15.796 15.635 15.473 15.316 15.147 15.023 14.893 14.68 14.526 14.356 14.271 14.1 13.9 13.67 13.553 13.331 13.219 13.093 12.959 12.644 12.46 12.281 12.082 11.869 11.603 11.182 9.942 -10 ,14860 ,TETRA ,17585472,Sat Nov 27 13:52:46 CET,Sat Nov 27 15:59:10 CET,0.0 1.52 2.0 2.355 2.651 2.89 3.123 3.357 3.763 3.936 4.111 4.322 4.579 4.704 4.969 5.235 5.483 5.586 5.782 5.984 6.273 6.459 6.626 6.862 7.114 7.36 7.581 7.798 8.091 8.374 8.636 8.942 9.228 9.489 9.799 10.152 10.473 10.838 11.243 11.65 12.063 12.522 13.065 13.624 14.252 14.922 15.703 16.591 17.565 18.57 19.555 20.105 20.212 20.099 19.913 19.678 19.436 19.196 18.976 18.713 18.446 18.182 17.926 17.697 17.468 17.258 17.041 16.831 16.627 16.403 16.18 15.992 15.792 15.594 15.437 15.263 15.076 14.867 14.635 14.466 14.307 14.077 13.911 13.73 13.619 13.394 13.182 12.955 12.843 12.612 12.464 12.323 12.164 11.82 11.644 11.455 11.243 11.025 10.769 10.427 9.512 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt deleted file mode 100644 index 8574bd8f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18378 ,KEBNE ,17024182,Wed Dec 22 09:30:20 CET,Wed Dec 22 11:09:19 CET,0.0 0.93 1.287 1.588 1.832 2.022 2.158 2.292 2.542 2.634 2.725 2.837 2.982 3.051 3.181 3.308 3.425 3.476 3.58 3.677 3.789 3.862 3.941 4.037 4.116 4.192 4.252 4.298 4.344 4.384 4.408 4.42 4.422 4.425 4.433 4.402 4.354 4.275 4.144 4.002 3.803 3.522 3.142 2.668 2.041 1.244 0.152 -1.405 -3.673 -6.962 -12.106 -17.757 -22.109 -25.694 -28.606 -31.106 -33.203 -35.034 -36.618 -38.156 -39.433 -40.549 -41.589 -42.544 -43.4 -44.132 -44.877 -45.526 -46.057 -46.604 -47.194 -47.688 -48.193 -48.701 -49.098 -49.514 -49.937 -50.377 -50.838 -51.141 -51.447 -51.912 -52.212 -52.526 -52.69 -53.027 -53.404 -53.813 -54.005 -54.334 -54.625 -54.853 -55.069 -55.514 -55.784 -56.067 -56.354 -56.656 -56.997 -57.411 -59.203 -2 ,9636 ,KEBNE ,17024183,Wed Dec 22 09:30:20 CET,Wed Dec 22 11:09:10 CET,0.0 1.13 1.549 1.82 2.027 2.235 2.411 2.542 2.776 2.881 2.995 3.13 3.275 3.348 3.473 3.594 3.724 3.787 3.891 3.984 4.149 4.257 4.352 4.478 4.593 4.688 4.766 4.826 4.878 4.927 4.968 4.99 4.999 4.993 4.981 4.948 4.901 4.822 4.673 4.483 4.248 3.947 3.559 3.087 2.436 1.585 0.442 -1.05 -3.208 -6.527 -11.831 -17.763 -22.407 -26.132 -29.172 -31.787 -33.937 -35.784 -37.32 -38.805 -40.06 -41.151 -42.198 -43.167 -44.014 -44.781 -45.575 -46.259 -46.84 -47.463 -48.138 -48.679 -49.24 -49.795 -50.188 -50.592 -51.005 -51.415 -51.875 -52.206 -52.545 -53.074 -53.41 -53.749 -53.936 -54.306 -54.674 -55.058 -55.263 -55.61 -55.882 -56.1 -56.309 -56.76 -57.023 -57.306 -57.592 -57.876 -58.224 -58.644 -59.947 -3 ,31577 ,KEBNE ,17024184,Wed Dec 22 09:30:20 CET,Wed Dec 22 11:09:18 CET,0.0 1.982 2.449 2.738 2.932 3.078 3.216 3.337 3.546 3.653 3.742 3.816 3.952 4.021 4.148 4.265 4.374 4.415 4.501 4.581 4.677 4.731 4.784 4.88 4.952 4.987 5.021 5.074 5.127 5.155 5.159 5.136 5.118 5.101 5.075 5.029 4.942 4.804 4.654 4.486 4.265 3.989 3.632 3.173 2.523 1.711 0.712 -0.693 -2.836 -6.03 -11.175 -16.904 -21.37 -25.085 -28.164 -30.793 -32.95 -34.872 -36.497 -38.045 -39.312 -40.406 -41.421 -42.342 -43.19 -43.949 -44.726 -45.417 -46.007 -46.595 -47.209 -47.721 -48.234 -48.763 -49.174 -49.589 -50.02 -50.461 -50.907 -51.213 -51.522 -52.002 -52.32 -52.654 -52.827 -53.189 -53.57 -53.951 -54.15 -54.492 -54.778 -55.001 -55.232 -55.735 -56.006 -56.298 -56.623 -56.966 -57.326 -57.73 -59.352 -4 ,3262 ,KEBNE ,17024185,Wed Dec 22 09:30:21 CET,Wed Dec 22 11:09:19 CET,0.0 2.349 2.77 3.082 3.298 3.456 3.588 3.741 4.068 4.212 4.346 4.519 4.678 4.765 4.933 5.07 5.177 5.218 5.311 5.407 5.55 5.63 5.699 5.809 5.897 5.96 6.014 6.051 6.098 6.148 6.179 6.228 6.254 6.242 6.237 6.223 6.213 6.174 6.089 5.986 5.825 5.566 5.193 4.731 4.082 3.246 2.151 0.654 -1.56 -4.73 -9.624 -15.217 -19.62 -23.153 -25.985 -28.408 -30.495 -32.336 -33.876 -35.392 -36.664 -37.765 -38.822 -39.787 -40.656 -41.423 -42.205 -42.924 -43.538 -44.147 -44.779 -45.316 -45.878 -46.439 -46.864 -47.289 -47.709 -48.153 -48.625 -48.934 -49.232 -49.69 -50.0 -50.327 -50.502 -50.866 -51.243 -51.611 -51.794 -52.124 -52.395 -52.61 -52.845 -53.373 -53.654 -53.93 -54.2 -54.504 -54.856 -55.303 -57.148 -5 ,3158 ,KEBNE ,17024186,Wed Dec 22 09:31:23 CET,Wed Dec 22 11:11:11 CET,0.0 0.868 1.132 1.38 1.61 1.813 1.994 2.153 2.419 2.529 2.641 2.778 2.938 3.029 3.198 3.339 3.457 3.525 3.663 3.768 3.884 3.953 4.029 4.128 4.198 4.258 4.315 4.37 4.421 4.469 4.503 4.508 4.505 4.489 4.476 4.46 4.405 4.297 4.148 3.976 3.79 3.542 3.166 2.726 2.13 1.326 0.202 -1.302 -3.393 -6.619 -11.736 -17.35 -21.767 -25.434 -28.445 -30.94 -32.971 -34.682 -36.112 -37.492 -38.672 -39.755 -40.754 -41.663 -42.49 -43.214 -43.953 -44.617 -45.176 -45.765 -46.387 -46.88 -47.376 -47.891 -48.281 -48.673 -49.085 -49.521 -49.96 -50.256 -50.561 -51.01 -51.313 -51.632 -51.797 -52.133 -52.484 -52.849 -53.042 -53.396 -53.727 -53.967 -54.213 -54.732 -54.986 -55.253 -55.578 -55.912 -56.256 -56.755 -58.44 -6 ,19110 ,KEBNE ,17024187,Wed Dec 22 09:31:23 CET,Wed Dec 22 11:10:44 CET,0.0 1.886 2.258 2.539 2.777 2.981 3.154 3.303 3.575 3.691 3.786 3.901 4.06 4.139 4.27 4.409 4.534 4.585 4.682 4.779 4.908 4.985 5.051 5.128 5.196 5.263 5.324 5.373 5.427 5.477 5.523 5.551 5.531 5.491 5.455 5.426 5.386 5.307 5.216 5.098 4.914 4.677 4.346 3.945 3.377 2.576 1.446 -0.064 -2.282 -5.539 -10.544 -16.213 -20.623 -24.193 -27.183 -29.792 -31.933 -33.77 -35.304 -36.806 -38.062 -39.153 -40.22 -41.214 -42.13 -42.94 -43.742 -44.446 -45.041 -45.646 -46.268 -46.783 -47.312 -47.836 -48.227 -48.631 -49.042 -49.46 -49.887 -50.19 -50.511 -50.983 -51.322 -51.681 -51.851 -52.194 -52.562 -52.952 -53.155 -53.495 -53.736 -53.932 -54.142 -54.583 -54.822 -55.097 -55.396 -55.708 -56.041 -56.45 -57.57 -7 ,24158 ,KEBNE ,17024188,Wed Dec 22 09:31:23 CET,Wed Dec 22 11:10:51 CET,0.0 1.903 2.237 2.504 2.719 2.906 3.065 3.215 3.487 3.603 3.707 3.82 3.974 4.052 4.197 4.316 4.429 4.488 4.594 4.697 4.841 4.93 5.007 5.101 5.191 5.256 5.322 5.396 5.479 5.544 5.576 5.609 5.643 5.647 5.624 5.602 5.59 5.552 5.476 5.362 5.193 4.96 4.62 4.175 3.537 2.749 1.611 -0.037 -2.383 -5.806 -11.163 -17.057 -21.528 -25.207 -28.251 -30.85 -33.031 -34.91 -36.475 -37.997 -39.248 -40.324 -41.337 -42.275 -43.133 -43.907 -44.709 -45.416 -46.02 -46.644 -47.281 -47.799 -48.312 -48.83 -49.238 -49.65 -50.06 -50.474 -50.904 -51.201 -51.505 -51.968 -52.273 -52.581 -52.744 -53.091 -53.457 -53.823 -54.013 -54.37 -54.696 -54.915 -55.133 -55.598 -55.847 -56.127 -56.431 -56.762 -57.189 -57.746 -58.889 -8 ,9717 ,KEBNE ,17024189,Wed Dec 22 09:31:23 CET,Wed Dec 22 11:10:03 CET,0.0 1.078 1.418 1.688 1.894 2.065 2.213 2.345 2.578 2.678 2.778 2.892 3.044 3.13 3.289 3.416 3.517 3.568 3.667 3.767 3.914 3.999 4.077 4.161 4.218 4.279 4.332 4.369 4.402 4.422 4.437 4.439 4.44 4.439 4.416 4.364 4.287 4.175 4.014 3.83 3.599 3.278 2.882 2.427 1.774 0.933 -0.172 -1.679 -3.89 -7.138 -12.199 -17.869 -22.345 -25.958 -28.89 -31.447 -33.632 -35.503 -37.068 -38.587 -39.828 -40.913 -41.926 -42.844 -43.663 -44.382 -45.116 -45.753 -46.316 -46.921 -47.552 -48.065 -48.604 -49.143 -49.542 -49.969 -50.408 -50.855 -51.32 -51.63 -51.933 -52.411 -52.759 -53.124 -53.301 -53.656 -54.023 -54.409 -54.602 -54.945 -55.202 -55.415 -55.637 -56.103 -56.357 -56.627 -56.928 -57.263 -57.665 -58.105 -60.031 -9 ,24769 ,KEBNE ,17024190,Wed Dec 22 09:31:23 CET,Wed Dec 22 11:10:33 CET,0.0 2.231 2.663 2.979 3.218 3.433 3.63 3.78 4.036 4.155 4.257 4.357 4.503 4.569 4.695 4.822 4.941 4.992 5.077 5.156 5.272 5.338 5.406 5.524 5.626 5.701 5.758 5.812 5.88 5.915 5.934 5.965 5.988 5.996 6.004 5.98 5.924 5.851 5.764 5.633 5.434 5.179 4.808 4.355 3.76 2.966 1.864 0.361 -1.913 -5.262 -10.457 -16.217 -20.636 -24.17 -27.061 -29.58 -31.701 -33.581 -35.195 -36.742 -38.004 -39.088 -40.094 -41.03 -41.88 -42.636 -43.415 -44.106 -44.692 -45.283 -45.922 -46.437 -46.944 -47.474 -47.866 -48.249 -48.649 -49.074 -49.504 -49.792 -50.082 -50.531 -50.848 -51.183 -51.357 -51.71 -52.071 -52.456 -52.664 -53.017 -53.284 -53.512 -53.756 -54.252 -54.508 -54.797 -55.088 -55.421 -55.875 -56.421 -57.982 -10 ,2981 ,KEBNE ,17024191,Wed Dec 22 09:39:39 CET,Wed Dec 22 11:18:37 CET,0.0 2.378 2.728 2.985 3.19 3.385 3.535 3.656 3.884 3.997 4.1 4.173 4.311 4.381 4.493 4.591 4.695 4.752 4.843 4.921 5.044 5.11 5.163 5.244 5.32 5.376 5.43 5.468 5.522 5.57 5.592 5.611 5.62 5.617 5.595 5.554 5.491 5.419 5.324 5.165 4.965 4.697 4.315 3.864 3.213 2.364 1.236 -0.252 -2.392 -5.671 -10.848 -16.575 -21.012 -24.63 -27.63 -30.145 -32.244 -34.07 -35.585 -37.056 -38.287 -39.34 -40.309 -41.223 -42.051 -42.779 -43.559 -44.283 -44.901 -45.523 -46.159 -46.697 -47.238 -47.768 -48.179 -48.597 -49.028 -49.467 -49.897 -50.183 -50.472 -50.914 -51.234 -51.59 -51.776 -52.168 -52.576 -52.968 -53.161 -53.491 -53.748 -53.961 -54.171 -54.628 -54.873 -55.13 -55.398 -55.733 -56.113 -56.495 -57.817 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt deleted file mode 100644 index 6db0e74b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5167 ,TETRA ,17585473,Sat Nov 27 13:52:46 CET,Sat Nov 27 15:59:50 CET,0.0 0.486 0.832 1.166 1.46 1.717 1.964 2.197 2.607 2.801 3.017 3.289 3.641 3.836 4.199 4.544 4.886 5.062 5.398 5.709 6.183 6.496 6.796 7.216 7.635 8.059 8.47 8.875 9.405 9.941 10.491 11.156 11.79 12.408 13.145 13.993 14.819 15.757 16.773 17.839 18.995 20.345 21.968 23.623 25.65 28.066 30.945 34.347 38.591 43.98 50.952 57.084 60.89 63.56 65.541 67.072 68.225 69.114 69.734 70.239 70.615 70.896 71.136 71.332 71.501 71.627 71.733 71.815 71.875 71.902 71.897 71.881 71.857 71.842 71.817 71.771 71.731 71.683 71.629 71.595 71.55 71.447 71.379 71.311 71.265 71.173 71.075 70.939 70.857 70.701 70.596 70.503 70.395 70.157 70.01 69.841 69.662 69.464 69.234 68.972 68.132 -2 ,27452 ,TETRA ,17585474,Sat Nov 27 13:52:47 CET,Sat Nov 27 16:01:54 CET,0.0 0.488 0.801 1.086 1.342 1.591 1.847 2.088 2.529 2.743 2.957 3.199 3.523 3.696 4.04 4.37 4.69 4.846 5.169 5.5 5.978 6.295 6.61 7.06 7.49 7.926 8.363 8.791 9.344 9.867 10.388 11.045 11.699 12.33 13.048 13.882 14.723 15.651 16.658 17.764 18.941 20.277 21.898 23.619 25.694 28.081 30.946 34.275 38.332 43.403 50.012 55.821 59.474 62.027 63.852 65.261 66.327 67.138 67.749 68.296 68.697 69.017 69.275 69.441 69.557 69.663 69.748 69.783 69.794 69.802 69.806 69.809 69.804 69.771 69.732 69.695 69.649 69.574 69.482 69.419 69.352 69.224 69.129 69.042 68.994 68.878 68.745 68.581 68.49 68.333 68.209 68.098 67.981 67.723 67.576 67.415 67.236 67.038 66.827 66.522 65.62 -3 ,11957 ,TETRA ,17585475,Sat Nov 27 13:52:47 CET,Sat Nov 27 16:01:36 CET,0.0 0.57 0.873 1.14 1.389 1.611 1.825 2.037 2.449 2.636 2.817 3.023 3.342 3.51 3.842 4.164 4.485 4.654 4.991 5.301 5.743 6.034 6.33 6.765 7.176 7.566 7.955 8.347 8.868 9.388 9.903 10.541 11.158 11.755 12.459 13.274 14.067 14.967 15.977 17.089 18.268 19.645 21.307 22.994 24.994 27.237 29.968 33.224 37.296 42.328 48.863 54.825 58.586 61.184 63.061 64.531 65.651 66.528 67.177 67.73 68.145 68.44 68.675 68.878 69.026 69.135 69.227 69.296 69.345 69.376 69.385 69.383 69.351 69.315 69.273 69.217 69.167 69.099 69.019 68.957 68.887 68.758 68.66 68.562 68.509 68.395 68.257 68.113 68.036 67.881 67.765 67.664 67.551 67.301 67.174 67.03 66.852 66.64 66.362 65.972 64.663 -4 ,4675 ,TETRA ,17585476,Sat Nov 27 13:52:46 CET,Sat Nov 27 16:00:48 CET,0.0 0.485 0.806 1.129 1.427 1.668 1.9 2.132 2.555 2.754 2.949 3.182 3.521 3.701 4.056 4.412 4.764 4.936 5.27 5.587 6.044 6.337 6.621 7.048 7.47 7.881 8.282 8.678 9.198 9.707 10.202 10.799 11.393 11.983 12.678 13.466 14.246 15.137 16.104 17.174 18.323 19.624 21.204 22.887 24.9 27.184 29.935 33.148 37.055 42.025 48.694 54.778 58.699 61.383 63.331 64.828 65.933 66.753 67.338 67.838 68.217 68.499 68.7 68.873 69.037 69.151 69.234 69.296 69.344 69.381 69.387 69.372 69.36 69.335 69.302 69.254 69.198 69.135 69.034 68.962 68.885 68.742 68.635 68.512 68.447 68.338 68.223 68.072 67.994 67.842 67.725 67.645 67.534 67.228 67.071 66.91 66.728 66.498 66.21 65.826 65.032 -5 ,22894 ,TETRA ,17585477,Sat Nov 27 13:52:46 CET,Sat Nov 27 16:00:46 CET,0.0 0.505 0.852 1.174 1.449 1.71 1.96 2.199 2.642 2.848 3.052 3.3 3.653 3.862 4.277 4.67 5.035 5.209 5.55 5.889 6.385 6.709 7.022 7.488 7.942 8.373 8.803 9.239 9.8 10.351 10.929 11.631 12.262 12.87 13.596 14.422 15.251 16.182 17.181 18.25 19.398 20.737 22.434 24.202 26.228 28.507 31.216 34.452 38.501 43.594 50.232 56.214 60.052 62.729 64.708 66.198 67.294 68.175 68.84 69.429 69.866 70.193 70.464 70.68 70.843 70.957 71.042 71.102 71.156 71.197 71.214 71.215 71.195 71.152 71.108 71.061 71.013 70.951 70.883 70.831 70.754 70.638 70.55 70.426 70.36 70.223 70.072 69.906 69.806 69.634 69.501 69.391 69.258 68.949 68.787 68.62 68.437 68.227 67.977 67.678 66.721 -6 ,9727 ,TETRA ,17585478,Sat Nov 27 13:52:46 CET,Sat Nov 27 15:59:20 CET,0.0 0.504 0.861 1.204 1.477 1.724 1.96 2.188 2.635 2.846 3.052 3.306 3.655 3.855 4.246 4.608 4.948 5.114 5.44 5.766 6.234 6.527 6.823 7.285 7.716 8.114 8.501 8.881 9.388 9.886 10.386 10.995 11.598 12.204 12.906 13.716 14.522 15.443 16.457 17.536 18.689 19.983 21.528 23.161 25.159 27.494 30.3 33.589 37.676 42.825 49.506 55.613 59.592 62.393 64.345 65.81 66.922 67.788 68.422 68.942 69.331 69.639 69.9 70.105 70.246 70.353 70.436 70.487 70.514 70.518 70.526 70.522 70.504 70.462 70.412 70.359 70.307 70.247 70.167 70.103 70.04 69.945 69.865 69.771 69.721 69.609 69.473 69.331 69.256 69.101 68.967 68.851 68.731 68.485 68.334 68.157 67.98 67.777 67.505 67.142 65.993 -7 ,3485 ,TETRA ,17585479,Sat Nov 27 13:52:46 CET,Sat Nov 27 15:59:56 CET,0.0 0.738 1.09 1.386 1.645 1.877 2.096 2.3 2.707 2.9 3.074 3.275 3.604 3.785 4.137 4.476 4.8 4.955 5.269 5.59 6.074 6.388 6.687 7.123 7.546 7.955 8.361 8.76 9.277 9.785 10.283 10.891 11.48 12.065 12.743 13.521 14.299 15.196 16.184 17.226 18.369 19.71 21.344 23.036 24.99 27.202 29.905 33.1 37.023 42.078 48.873 54.918 58.734 61.415 63.357 64.9 66.033 66.851 67.469 68.013 68.4 68.679 68.903 69.075 69.201 69.299 69.385 69.447 69.488 69.505 69.493 69.48 69.466 69.436 69.397 69.352 69.303 69.236 69.153 69.074 68.979 68.847 68.74 68.61 68.545 68.41 68.27 68.126 68.043 67.876 67.736 67.624 67.5 67.213 67.039 66.849 66.614 66.369 66.112 65.689 63.238 -8 ,10253 ,TETRA ,17585480,Sat Nov 27 13:52:46 CET,Sat Nov 27 16:02:35 CET,0.0 0.423 0.731 1.024 1.284 1.505 1.711 1.921 2.34 2.533 2.711 2.927 3.267 3.44 3.771 4.091 4.421 4.59 4.911 5.225 5.686 5.98 6.279 6.713 7.127 7.551 7.98 8.398 8.954 9.499 10.02 10.647 11.257 11.846 12.542 13.365 14.172 15.066 16.039 17.085 18.232 19.58 21.214 22.902 24.95 27.309 30.058 33.277 37.254 42.247 48.872 54.878 58.775 61.47 63.354 64.824 65.956 66.839 67.501 68.083 68.49 68.793 69.063 69.25 69.376 69.479 69.56 69.599 69.624 69.645 69.654 69.638 69.599 69.576 69.551 69.509 69.454 69.382 69.3 69.241 69.178 69.072 68.981 68.879 68.831 68.716 68.587 68.416 68.317 68.155 68.039 67.949 67.852 67.607 67.468 67.331 67.151 66.922 66.654 66.341 65.549 -9 ,10068 ,TETRA ,17585481,Sat Nov 27 13:52:49 CET,Sat Nov 27 16:02:32 CET,0.0 0.578 0.882 1.159 1.413 1.656 1.877 2.08 2.488 2.686 2.871 3.066 3.389 3.561 3.909 4.253 4.586 4.745 5.052 5.354 5.786 6.08 6.376 6.789 7.187 7.595 7.99 8.371 8.889 9.399 9.901 10.527 11.15 11.766 12.473 13.278 14.085 14.971 15.946 17.026 18.17 19.475 21.033 22.636 24.592 26.874 29.597 32.847 36.859 41.807 48.404 54.613 58.594 61.336 63.281 64.7 65.726 66.547 67.181 67.709 68.104 68.407 68.63 68.797 68.941 69.052 69.142 69.204 69.236 69.261 69.276 69.275 69.25 69.205 69.17 69.114 69.054 69.0 68.941 68.895 68.837 68.737 68.666 68.582 68.527 68.403 68.279 68.161 68.092 67.955 67.857 67.763 67.667 67.393 67.232 67.071 66.906 66.727 66.495 66.187 64.85 -10 ,13397 ,TETRA ,17585482,Sat Nov 27 13:52:50 CET,Sat Nov 27 15:59:41 CET,0.0 0.464 0.793 1.07 1.344 1.62 1.877 2.109 2.542 2.742 2.942 3.175 3.514 3.696 4.047 4.4 4.74 4.907 5.245 5.58 6.073 6.394 6.706 7.156 7.596 8.047 8.476 8.864 9.37 9.883 10.383 11.008 11.642 12.258 12.996 13.855 14.669 15.59 16.636 17.756 18.936 20.265 21.856 23.517 25.532 27.884 30.708 34.002 38.046 43.308 50.215 56.266 60.04 62.766 64.733 66.14 67.198 68.053 68.73 69.323 69.737 70.053 70.293 70.473 70.638 70.763 70.864 70.941 70.981 71.004 71.03 71.038 71.031 71.013 70.987 70.956 70.912 70.855 70.783 70.721 70.662 70.582 70.519 70.424 70.365 70.23 70.081 69.925 69.832 69.669 69.548 69.446 69.333 69.092 68.939 68.755 68.562 68.356 68.125 67.787 66.555 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 23fea912..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29240 ,TETRA ,17585483,Sat Nov 27 13:52:48 CET,Sat Nov 27 16:00:14 CET,0.0 0.335 0.643 0.873 1.049 1.226 1.403 1.572 1.901 2.056 2.194 2.312 2.598 2.729 2.979 3.232 3.47 3.593 3.832 4.042 4.334 4.527 4.72 5.009 5.301 5.585 5.859 6.136 6.494 6.833 7.172 7.574 7.948 8.321 8.764 9.255 9.729 10.242 10.792 11.389 12.011 12.727 13.599 14.483 15.528 16.725 18.115 19.743 21.609 23.758 26.403 28.646 29.916 30.587 30.938 31.141 31.211 31.206 31.165 31.051 30.907 30.778 30.644 30.487 30.342 30.195 30.001 29.818 29.675 29.536 29.372 29.214 29.035 28.833 28.678 28.524 28.35 28.158 27.935 27.768 27.609 27.387 27.223 27.02 26.907 26.692 26.484 26.252 26.118 25.851 25.683 25.51 25.332 24.954 24.734 24.501 24.255 24.006 23.662 23.184 21.917 -2 ,17008 ,TETRA ,17585484,Sat Nov 27 13:52:48 CET,Sat Nov 27 16:02:19 CET,0.0 0.43 0.72 0.966 1.179 1.365 1.539 1.713 2.065 2.231 2.384 2.528 2.811 2.94 3.2 3.443 3.676 3.793 4.019 4.241 4.583 4.809 5.02 5.322 5.626 5.927 6.211 6.485 6.847 7.193 7.518 7.912 8.297 8.67 9.111 9.62 10.117 10.671 11.275 11.927 12.609 13.378 14.273 15.178 16.238 17.417 18.82 20.422 22.277 24.515 27.194 29.221 30.282 30.78 30.985 31.063 31.042 31.003 30.943 30.775 30.604 30.428 30.222 30.042 29.856 29.672 29.476 29.302 29.135 28.927 28.699 28.5 28.296 28.089 27.912 27.726 27.538 27.323 27.078 26.916 26.767 26.516 26.332 26.132 26.025 25.792 25.538 25.288 25.164 24.907 24.729 24.573 24.41 24.036 23.836 23.631 23.369 23.012 22.63 22.202 21.191 -3 ,23275 ,TETRA ,17585485,Sat Nov 27 13:52:49 CET,Sat Nov 27 16:00:18 CET,0.0 0.35 0.606 0.84 1.054 1.265 1.457 1.62 1.939 2.106 2.27 2.434 2.735 2.869 3.131 3.382 3.628 3.75 3.983 4.204 4.517 4.717 4.92 5.227 5.523 5.817 6.107 6.391 6.771 7.13 7.458 7.853 8.231 8.602 9.056 9.577 10.061 10.587 11.171 11.815 12.504 13.272 14.174 15.057 16.103 17.345 18.723 20.253 22.091 24.191 26.709 28.783 29.876 30.486 30.838 31.009 31.033 30.96 30.856 30.722 30.59 30.453 30.279 30.103 29.92 29.739 29.561 29.386 29.207 29.012 28.816 28.644 28.478 28.318 28.173 27.999 27.817 27.643 27.456 27.313 27.166 26.916 26.733 26.553 26.452 26.236 26.015 25.783 25.663 25.41 25.236 25.075 24.906 24.541 24.344 24.124 23.873 23.618 23.329 22.901 21.729 -4 ,6603 ,TETRA ,17585486,Sat Nov 27 13:54:45 CET,Sat Nov 27 16:03:10 CET,0.0 0.435 0.747 0.991 1.202 1.404 1.585 1.748 2.069 2.229 2.384 2.528 2.806 2.941 3.207 3.472 3.73 3.853 4.097 4.337 4.688 4.908 5.122 5.443 5.758 6.061 6.348 6.613 6.953 7.298 7.635 8.037 8.436 8.823 9.263 9.769 10.281 10.847 11.456 12.101 12.763 13.508 14.394 15.289 16.347 17.541 18.942 20.552 22.394 24.531 27.105 29.133 30.196 30.775 31.075 31.222 31.262 31.214 31.108 30.971 30.827 30.655 30.463 30.274 30.089 29.903 29.699 29.507 29.341 29.159 28.956 28.791 28.607 28.405 28.25 28.094 27.92 27.726 27.517 27.371 27.216 26.961 26.784 26.616 26.527 26.316 26.099 25.881 25.758 25.508 25.385 25.246 25.092 24.764 24.593 24.391 24.182 23.967 23.664 23.252 21.895 -5 ,814 ,TETRA ,17585487,Sat Nov 27 13:54:46 CET,Sat Nov 27 16:03:22 CET,0.0 0.305 0.557 0.779 0.989 1.19 1.378 1.556 1.913 2.088 2.246 2.388 2.674 2.813 3.075 3.319 3.559 3.672 3.893 4.119 4.455 4.677 4.895 5.192 5.479 5.761 6.028 6.293 6.65 6.994 7.334 7.753 8.146 8.517 8.951 9.439 9.908 10.422 10.973 11.58 12.241 12.998 13.895 14.794 15.849 17.077 18.477 20.023 21.861 24.031 26.602 28.621 29.714 30.317 30.559 30.632 30.65 30.604 30.53 30.404 30.242 30.091 29.94 29.758 29.573 29.396 29.178 28.975 28.807 28.615 28.405 28.226 28.037 27.852 27.684 27.492 27.302 27.1 26.881 26.733 26.573 26.313 26.135 25.936 25.826 25.617 25.408 25.183 25.055 24.799 24.647 24.496 24.322 23.943 23.736 23.501 23.249 23.009 22.733 22.412 21.718 -6 ,24068 ,TETRA ,17585488,Sat Nov 27 13:53:45 CET,Sat Nov 27 16:00:48 CET,0.0 0.458 0.703 0.927 1.144 1.339 1.515 1.687 2.023 2.19 2.35 2.512 2.809 2.941 3.202 3.457 3.7 3.818 4.053 4.28 4.616 4.828 5.021 5.312 5.594 5.879 6.161 6.43 6.785 7.13 7.459 7.846 8.223 8.598 9.039 9.531 10.011 10.539 11.119 11.759 12.43 13.176 14.067 14.986 16.056 17.248 18.625 20.159 21.94 24.034 26.505 28.461 29.478 30.017 30.333 30.531 30.577 30.501 30.382 30.229 30.116 30.0 29.845 29.677 29.496 29.298 29.066 28.883 28.752 28.605 28.43 28.265 28.077 27.881 27.734 27.581 27.398 27.18 26.95 26.79 26.637 26.377 26.197 26.035 25.943 25.745 25.521 25.279 25.153 24.898 24.748 24.606 24.451 24.096 23.901 23.675 23.414 23.131 22.794 22.332 21.34 -7 ,21696 ,TETRA ,17585489,Sat Nov 27 13:53:45 CET,Sat Nov 27 15:57:37 CET,0.0 0.33 0.577 0.802 1.021 1.231 1.443 1.634 1.967 2.126 2.278 2.416 2.709 2.851 3.114 3.368 3.612 3.727 3.954 4.172 4.488 4.699 4.906 5.209 5.504 5.786 6.062 6.34 6.704 7.053 7.393 7.806 8.191 8.562 9.006 9.508 9.995 10.54 11.134 11.78 12.46 13.228 14.144 15.087 16.192 17.439 18.872 20.43 22.228 24.366 26.953 28.939 30.058 30.723 31.022 31.147 31.141 31.041 30.93 30.781 30.619 30.45 30.27 30.103 29.946 29.789 29.601 29.42 29.25 29.067 28.874 28.711 28.52 28.29 28.108 27.912 27.705 27.497 27.279 27.13 26.979 26.712 26.527 26.355 26.269 26.074 25.85 25.602 25.472 25.224 25.025 24.875 24.741 24.408 24.206 23.999 23.749 23.452 23.151 22.703 21.463 -8 ,27785 ,TETRA ,17585490,Sat Nov 27 13:53:46 CET,Sat Nov 27 16:00:16 CET,0.0 0.506 0.816 1.035 1.229 1.415 1.598 1.778 2.097 2.241 2.377 2.496 2.78 2.911 3.163 3.403 3.627 3.734 3.948 4.167 4.492 4.698 4.897 5.191 5.468 5.731 5.994 6.248 6.577 6.903 7.212 7.6 7.988 8.359 8.774 9.236 9.701 10.22 10.793 11.413 12.063 12.805 13.679 14.569 15.612 16.741 18.044 19.586 21.451 23.692 26.407 28.568 29.766 30.441 30.803 30.961 30.995 31.0 30.986 30.913 30.805 30.686 30.525 30.349 30.188 30.024 29.839 29.663 29.51 29.346 29.174 29.015 28.828 28.646 28.492 28.323 28.14 27.93 27.717 27.582 27.434 27.176 26.999 26.823 26.729 26.522 26.302 26.055 25.916 25.656 25.463 25.293 25.131 24.793 24.603 24.378 24.139 23.902 23.605 23.164 21.978 -9 ,12047 ,TETRA ,17585491,Sat Nov 27 13:53:47 CET,Sat Nov 27 16:00:58 CET,0.0 0.471 0.742 0.952 1.139 1.314 1.495 1.679 2.005 2.143 2.277 2.399 2.672 2.792 3.025 3.249 3.468 3.578 3.792 3.999 4.306 4.515 4.717 4.995 5.26 5.523 5.776 6.018 6.339 6.652 6.961 7.358 7.754 8.134 8.555 9.027 9.507 10.04 10.606 11.22 11.868 12.611 13.494 14.372 15.395 16.541 17.89 19.427 21.315 23.558 26.244 28.427 29.581 30.218 30.552 30.739 30.797 30.756 30.711 30.604 30.484 30.371 30.196 30.009 29.832 29.658 29.473 29.294 29.107 28.902 28.687 28.511 28.347 28.16 27.999 27.835 27.667 27.484 27.285 27.148 27.004 26.758 26.574 26.399 26.312 26.116 25.889 25.648 25.523 25.267 25.12 24.989 24.842 24.469 24.262 24.047 23.801 23.523 23.209 22.759 21.629 -10 ,13912 ,TETRA ,17585492,Sat Nov 27 13:53:46 CET,Sat Nov 27 16:02:01 CET,0.0 0.456 0.782 1.058 1.254 1.454 1.626 1.778 2.077 2.222 2.37 2.487 2.771 2.907 3.165 3.408 3.65 3.767 3.986 4.201 4.514 4.722 4.927 5.213 5.484 5.763 6.038 6.304 6.655 6.986 7.303 7.697 8.086 8.459 8.889 9.372 9.854 10.388 10.954 11.546 12.174 12.902 13.754 14.584 15.575 16.749 18.138 19.691 21.553 23.783 26.422 28.643 29.901 30.615 31.009 31.207 31.31 31.342 31.311 31.227 31.121 31.003 30.829 30.65 30.482 30.292 30.072 29.876 29.717 29.546 29.368 29.223 29.063 28.894 28.752 28.587 28.408 28.218 28.017 27.884 27.749 27.519 27.352 27.173 27.078 26.895 26.705 26.508 26.392 26.147 25.988 25.825 25.656 25.307 25.117 24.908 24.677 24.394 24.082 23.712 22.864 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt deleted file mode 100644 index 49ed7833..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2134 ,TETRA ,17585493,Sat Nov 27 13:53:47 CET,Sat Nov 27 16:01:00 CET,0.0 0.948 1.329 1.653 1.955 2.226 2.459 2.671 3.074 3.279 3.481 3.725 4.019 4.185 4.494 4.808 5.11 5.258 5.541 5.812 6.219 6.479 6.727 7.082 7.443 7.81 8.157 8.494 8.94 9.381 9.807 10.32 10.807 11.263 11.812 12.448 13.07 13.763 14.521 15.371 16.303 17.382 18.638 19.887 21.38 23.112 25.138 27.43 30.208 33.58 37.854 41.551 43.797 45.3 46.314 47.075 47.623 47.992 48.211 48.371 48.477 48.544 48.585 48.575 48.556 48.545 48.502 48.458 48.415 48.365 48.308 48.237 48.158 48.065 47.974 47.88 47.788 47.7 47.608 47.533 47.446 47.292 47.18 47.064 47.003 46.875 46.744 46.599 46.52 46.368 46.275 46.185 46.08 45.865 45.745 45.607 45.429 45.179 44.893 44.534 43.638 -2 ,19608 ,TETRA ,17585494,Sat Nov 27 13:53:47 CET,Sat Nov 27 16:03:31 CET,0.0 2.075 2.548 2.97 3.343 3.657 3.922 4.154 4.582 4.776 4.976 5.241 5.534 5.698 6.013 6.332 6.663 6.817 7.104 7.396 7.827 8.096 8.359 8.741 9.118 9.491 9.863 10.229 10.699 11.161 11.608 12.124 12.639 13.159 13.746 14.408 15.073 15.8 16.568 17.415 18.303 19.288 20.499 21.732 23.16 24.798 26.768 29.045 31.763 35.059 39.255 42.925 45.068 46.434 47.327 47.969 48.415 48.73 48.947 49.101 49.201 49.256 49.269 49.262 49.239 49.203 49.161 49.107 49.053 48.99 48.914 48.839 48.732 48.596 48.483 48.371 48.262 48.161 48.025 47.921 47.808 47.611 47.487 47.371 47.313 47.195 47.069 46.937 46.864 46.717 46.61 46.501 46.392 46.136 45.97 45.793 45.626 45.432 45.183 44.89 44.397 -3 ,11676 ,TETRA ,17585495,Sat Nov 27 13:54:45 CET,Sat Nov 27 16:02:50 CET,0.0 0.983 1.419 1.737 2.033 2.306 2.562 2.791 3.202 3.398 3.586 3.816 4.12 4.297 4.611 4.912 5.222 5.38 5.682 5.965 6.364 6.616 6.857 7.213 7.579 7.955 8.312 8.635 9.06 9.489 9.908 10.433 10.993 11.555 12.159 12.806 13.427 14.133 14.918 15.754 16.661 17.707 18.907 20.15 21.677 23.388 25.399 27.743 30.525 33.934 38.239 41.973 44.286 45.905 47.014 47.754 48.261 48.628 48.873 49.042 49.152 49.227 49.27 49.27 49.248 49.23 49.195 49.158 49.125 49.078 49.008 48.93 48.834 48.736 48.655 48.56 48.452 48.327 48.184 48.091 48.008 47.865 47.747 47.617 47.549 47.4 47.224 47.023 46.926 46.759 46.629 46.523 46.401 46.141 46.0 45.822 45.616 45.409 45.187 44.854 43.679 -4 ,22372 ,TETRA ,17585496,Sat Nov 27 13:53:47 CET,Sat Nov 27 16:02:09 CET,0.0 0.678 1.011 1.297 1.557 1.799 2.022 2.236 2.657 2.858 3.037 3.257 3.559 3.729 4.059 4.374 4.67 4.807 5.065 5.333 5.739 6.002 6.255 6.618 6.977 7.338 7.69 8.026 8.444 8.852 9.277 9.793 10.293 10.799 11.383 12.016 12.615 13.293 14.041 14.841 15.696 16.676 17.836 19.037 20.493 22.131 24.058 26.376 29.155 32.45 36.518 40.021 42.202 43.681 44.681 45.374 45.85 46.164 46.378 46.547 46.656 46.717 46.747 46.781 46.81 46.812 46.796 46.763 46.711 46.645 46.57 46.51 46.44 46.346 46.272 46.191 46.093 45.984 45.868 45.79 45.7 45.553 45.447 45.335 45.275 45.14 44.997 44.845 44.757 44.576 44.417 44.322 44.225 44.006 43.889 43.755 43.608 43.458 43.272 42.957 42.087 -5 ,32242 ,TETRA ,17585497,Sat Nov 27 13:54:46 CET,Sat Nov 27 16:04:20 CET,0.0 0.71 1.098 1.417 1.698 1.944 2.164 2.375 2.78 2.972 3.163 3.399 3.683 3.849 4.18 4.49 4.797 4.943 5.213 5.482 5.873 6.12 6.363 6.739 7.127 7.488 7.827 8.149 8.559 8.984 9.405 9.919 10.413 10.883 11.44 12.069 12.675 13.333 14.065 14.905 15.817 16.86 18.105 19.395 20.937 22.656 24.623 26.924 29.782 33.239 37.632 41.499 43.859 45.409 46.44 47.156 47.672 48.065 48.326 48.504 48.596 48.647 48.665 48.647 48.619 48.581 48.518 48.44 48.364 48.287 48.206 48.128 48.034 47.929 47.84 47.753 47.664 47.554 47.434 47.355 47.267 47.129 47.03 46.925 46.869 46.748 46.629 46.485 46.403 46.242 46.132 46.049 45.949 45.714 45.581 45.416 45.246 45.053 44.804 44.483 43.321 -6 ,11130 ,TETRA ,17585498,Sat Nov 27 13:54:46 CET,Sat Nov 27 16:04:51 CET,0.0 0.825 1.206 1.517 1.794 2.042 2.261 2.474 2.905 3.109 3.287 3.482 3.764 3.93 4.251 4.55 4.85 5.007 5.301 5.577 5.985 6.242 6.495 6.884 7.259 7.617 7.968 8.31 8.752 9.183 9.61 10.138 10.655 11.145 11.694 12.326 12.943 13.606 14.353 15.181 16.073 17.121 18.374 19.638 21.16 22.876 24.889 27.28 30.125 33.48 37.449 40.861 43.043 44.582 45.575 46.261 46.798 47.179 47.425 47.593 47.69 47.744 47.761 47.754 47.74 47.708 47.657 47.6 47.546 47.484 47.388 47.294 47.212 47.136 47.043 46.942 46.852 46.739 46.625 46.546 46.464 46.323 46.212 46.097 46.04 45.924 45.802 45.648 45.547 45.373 45.242 45.142 45.04 44.816 44.687 44.538 44.374 44.193 43.96 43.606 42.559 -7 ,28136 ,TETRA ,17585499,Sat Nov 27 13:54:46 CET,Sat Nov 27 16:05:31 CET,0.0 1.01 1.382 1.694 1.969 2.219 2.453 2.669 3.082 3.274 3.464 3.707 4.007 4.188 4.515 4.812 5.112 5.273 5.607 5.912 6.316 6.583 6.853 7.25 7.643 8.028 8.408 8.787 9.272 9.729 10.155 10.656 11.156 11.643 12.209 12.858 13.482 14.179 14.933 15.753 16.655 17.679 18.896 20.155 21.647 23.333 25.304 27.624 30.439 33.905 38.406 42.339 44.716 46.157 47.031 47.649 48.061 48.379 48.665 48.881 48.996 49.083 49.143 49.155 49.125 49.1 49.073 49.017 48.957 48.895 48.819 48.746 48.669 48.584 48.518 48.444 48.359 48.269 48.167 48.098 48.032 47.913 47.825 47.73 47.675 47.555 47.428 47.286 47.213 47.068 46.941 46.84 46.745 46.524 46.411 46.292 46.134 45.936 45.724 45.403 44.638 -8 ,7897 ,TETRA ,17585500,Sat Nov 27 13:54:46 CET,Sat Nov 27 16:05:34 CET,0.0 0.664 0.996 1.272 1.54 1.804 2.05 2.269 2.669 2.861 3.047 3.273 3.559 3.716 4.042 4.361 4.652 4.789 5.067 5.344 5.716 5.961 6.212 6.571 6.921 7.256 7.587 7.922 8.375 8.822 9.247 9.767 10.282 10.767 11.32 11.976 12.612 13.32 14.125 14.982 15.89 16.961 18.242 19.547 21.101 22.851 24.923 27.355 30.289 33.751 38.011 41.758 44.095 45.632 46.595 47.262 47.724 48.05 48.289 48.494 48.608 48.683 48.734 48.741 48.757 48.763 48.734 48.69 48.639 48.575 48.493 48.422 48.346 48.252 48.168 48.075 47.977 47.862 47.727 47.631 47.518 47.34 47.224 47.102 47.032 46.875 46.713 46.536 46.435 46.265 46.122 45.997 45.871 45.609 45.464 45.306 45.129 44.917 44.665 44.389 43.805 -9 ,6457 ,TETRA ,17585501,Sat Nov 27 13:54:46 CET,Sat Nov 27 16:04:27 CET,0.0 0.691 1.065 1.37 1.645 1.903 2.137 2.354 2.765 2.959 3.147 3.387 3.686 3.858 4.191 4.516 4.829 4.976 5.258 5.546 5.962 6.233 6.499 6.88 7.258 7.625 7.975 8.311 8.761 9.213 9.639 10.152 10.654 11.143 11.729 12.389 13.032 13.721 14.451 15.242 16.102 17.123 18.337 19.556 21.031 22.74 24.734 26.985 29.669 33.002 37.198 40.785 42.987 44.419 45.35 46.0 46.504 46.887 47.116 47.301 47.431 47.508 47.554 47.565 47.556 47.534 47.487 47.425 47.358 47.275 47.176 47.1 47.037 46.973 46.913 46.833 46.746 46.651 46.554 46.486 46.4 46.261 46.162 46.055 45.999 45.87 45.729 45.582 45.505 45.355 45.247 45.153 45.05 44.823 44.709 44.584 44.418 44.215 43.989 43.699 43.169 -10 ,4515 ,TETRA ,17585502,Sat Nov 27 13:54:49 CET,Sat Nov 27 16:05:06 CET,0.0 0.642 0.95 1.245 1.516 1.752 1.97 2.185 2.61 2.807 2.991 3.22 3.515 3.688 4.013 4.321 4.6 4.739 5.033 5.32 5.74 6.012 6.288 6.702 7.091 7.453 7.796 8.133 8.575 8.985 9.411 9.976 10.511 11.028 11.62 12.259 12.892 13.627 14.412 15.252 16.19 17.306 18.614 19.898 21.42 23.132 25.096 27.368 30.169 33.543 37.514 40.777 42.72 44.002 44.919 45.564 45.986 46.275 46.455 46.605 46.714 46.794 46.846 46.862 46.855 46.809 46.739 46.674 46.601 46.518 46.429 46.348 46.28 46.219 46.151 46.05 45.937 45.828 45.711 45.632 45.556 45.417 45.313 45.207 45.15 45.026 44.881 44.726 44.639 44.48 44.38 44.305 44.218 44.023 43.911 43.763 43.593 43.393 43.15 42.811 41.664 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt deleted file mode 100644 index 8f540979..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27313 ,TETRA ,17585503,Sat Nov 27 13:55:45 CET,Sat Nov 27 16:03:14 CET,0.0 0.414 0.674 0.888 1.101 1.307 1.472 1.622 1.896 2.009 2.114 2.197 2.408 2.498 2.678 2.855 3.022 3.099 3.239 3.388 3.595 3.708 3.822 3.98 4.132 4.293 4.446 4.584 4.75 4.898 5.043 5.218 5.365 5.499 5.671 5.866 6.036 6.215 6.418 6.641 6.866 7.084 7.28 7.44 7.595 7.746 7.822 7.786 7.625 7.16 6.074 4.549 3.185 1.969 0.923 -0.029 -0.863 -1.604 -2.266 -2.927 -3.486 -4.004 -4.511 -4.982 -5.414 -5.802 -6.204 -6.562 -6.866 -7.193 -7.551 -7.845 -8.134 -8.428 -8.666 -8.912 -9.154 -9.406 -9.673 -9.854 -10.042 -10.337 -10.534 -10.733 -10.83 -11.026 -11.247 -11.496 -11.626 -11.883 -12.007 -12.146 -12.293 -12.635 -12.827 -13.031 -13.251 -13.489 -13.741 -14.01 -14.551 -2 ,11581 ,TETRA ,17585504,Sat Nov 27 13:55:46 CET,Sat Nov 27 16:07:40 CET,0.0 0.39 0.607 0.791 0.967 1.144 1.286 1.411 1.657 1.779 1.891 1.977 2.191 2.276 2.448 2.619 2.767 2.84 2.994 3.129 3.314 3.432 3.549 3.728 3.891 4.036 4.181 4.319 4.502 4.678 4.838 5.032 5.218 5.394 5.584 5.796 5.998 6.193 6.394 6.609 6.795 6.974 7.174 7.343 7.516 7.671 7.763 7.782 7.675 7.301 6.35 4.859 3.488 2.278 1.207 0.23 -0.645 -1.442 -2.134 -2.8 -3.372 -3.907 -4.41 -4.87 -5.293 -5.673 -6.056 -6.41 -6.722 -7.048 -7.376 -7.633 -7.907 -8.206 -8.438 -8.678 -8.93 -9.187 -9.455 -9.645 -9.846 -10.177 -10.39 -10.596 -10.702 -10.923 -11.164 -11.403 -11.521 -11.778 -11.916 -12.051 -12.196 -12.521 -12.708 -12.897 -13.081 -13.292 -13.511 -13.775 -14.171 -3 ,20204 ,TETRA ,17585505,Sat Nov 27 13:55:48 CET,Sat Nov 27 16:08:29 CET,0.0 0.335 0.595 0.851 1.046 1.209 1.349 1.469 1.694 1.804 1.912 2.005 2.223 2.311 2.476 2.628 2.769 2.839 2.98 3.116 3.319 3.448 3.566 3.733 3.893 4.051 4.202 4.337 4.506 4.674 4.828 4.99 5.139 5.274 5.426 5.625 5.817 5.995 6.163 6.321 6.505 6.709 6.903 7.081 7.245 7.363 7.461 7.481 7.335 6.94 5.978 4.505 3.1 1.911 0.894 -0.068 -0.93 -1.677 -2.345 -3.056 -3.647 -4.147 -4.621 -5.074 -5.488 -5.868 -6.266 -6.616 -6.924 -7.249 -7.585 -7.862 -8.147 -8.439 -8.659 -8.893 -9.138 -9.377 -9.619 -9.788 -9.965 -10.246 -10.45 -10.65 -10.749 -10.964 -11.198 -11.437 -11.553 -11.809 -11.955 -12.097 -12.239 -12.513 -12.652 -12.807 -12.968 -13.139 -13.35 -13.596 -14.116 -4 ,27456 ,TETRA ,17585506,Sat Nov 27 13:55:46 CET,Sat Nov 27 15:55:03 CET,0.0 0.627 0.943 1.157 1.336 1.484 1.613 1.749 2.019 2.146 2.255 2.32 2.527 2.623 2.813 2.972 3.119 3.197 3.342 3.47 3.645 3.759 3.89 4.083 4.25 4.409 4.552 4.69 4.869 5.039 5.205 5.392 5.554 5.701 5.862 6.045 6.23 6.425 6.617 6.827 7.054 7.268 7.508 7.755 8.003 8.215 8.388 8.495 8.464 8.205 7.355 6.013 4.785 3.585 2.472 1.45 0.52 -0.284 -0.957 -1.629 -2.203 -2.711 -3.19 -3.654 -4.083 -4.469 -4.872 -5.23 -5.534 -5.833 -6.145 -6.432 -6.729 -7.015 -7.249 -7.487 -7.708 -7.935 -8.184 -8.36 -8.537 -8.802 -8.992 -9.198 -9.303 -9.504 -9.715 -9.962 -10.097 -10.376 -10.547 -10.694 -10.833 -11.104 -11.256 -11.427 -11.616 -11.832 -12.082 -12.373 -12.833 -5 ,18252 ,TETRA ,17585507,Sat Nov 27 13:55:46 CET,Sat Nov 27 16:05:35 CET,0.0 0.478 0.768 0.987 1.182 1.358 1.52 1.679 1.968 2.097 2.229 2.347 2.582 2.689 2.88 3.056 3.219 3.297 3.446 3.588 3.8 3.927 4.035 4.198 4.343 4.488 4.635 4.767 4.956 5.151 5.332 5.522 5.693 5.862 6.056 6.279 6.494 6.717 6.929 7.125 7.32 7.539 7.835 8.124 8.344 8.517 8.689 8.728 8.515 8.16 7.388 5.953 4.538 3.288 2.226 1.232 0.355 -0.395 -1.032 -1.684 -2.248 -2.763 -3.246 -3.676 -4.084 -4.472 -4.879 -5.247 -5.562 -5.876 -6.191 -6.444 -6.71 -6.992 -7.209 -7.446 -7.697 -7.948 -8.208 -8.386 -8.575 -8.88 -9.088 -9.293 -9.399 -9.618 -9.857 -10.102 -10.224 -10.48 -10.605 -10.742 -10.886 -11.206 -11.387 -11.583 -11.813 -12.044 -12.278 -12.562 -13.009 -6 ,11860 ,TETRA ,17585508,Sat Nov 27 13:55:46 CET,Sat Nov 27 16:05:29 CET,0.0 0.566 0.837 1.085 1.291 1.453 1.601 1.742 1.993 2.111 2.23 2.346 2.58 2.674 2.861 3.044 3.208 3.284 3.428 3.567 3.771 3.898 4.024 4.198 4.35 4.5 4.663 4.817 5.006 5.178 5.31 5.46 5.637 5.814 5.989 6.183 6.375 6.559 6.761 6.984 7.187 7.377 7.582 7.764 7.95 8.135 8.3 8.377 8.192 7.657 6.581 5.135 3.853 2.69 1.665 0.718 -0.133 -0.902 -1.56 -2.21 -2.771 -3.269 -3.741 -4.182 -4.592 -4.966 -5.374 -5.752 -6.07 -6.39 -6.718 -6.982 -7.246 -7.514 -7.721 -7.936 -8.162 -8.405 -8.656 -8.832 -9.013 -9.302 -9.506 -9.715 -9.83 -10.06 -10.285 -10.503 -10.617 -10.869 -11.002 -11.135 -11.273 -11.541 -11.7 -11.891 -12.072 -12.251 -12.469 -12.791 -13.349 -7 ,10684 ,TETRA ,17585509,Sat Nov 27 13:55:46 CET,Sat Nov 27 16:03:15 CET,0.0 0.479 0.771 0.972 1.149 1.331 1.498 1.663 1.946 2.054 2.159 2.253 2.471 2.56 2.72 2.874 3.02 3.091 3.233 3.369 3.555 3.675 3.79 3.964 4.137 4.291 4.434 4.569 4.743 4.913 5.071 5.235 5.393 5.552 5.724 5.904 6.072 6.268 6.473 6.684 6.921 7.156 7.385 7.583 7.741 7.868 7.94 7.925 7.752 7.262 6.26 4.768 3.366 2.127 1.071 0.112 -0.762 -1.552 -2.244 -2.931 -3.529 -4.054 -4.529 -4.975 -5.395 -5.772 -6.17 -6.528 -6.841 -7.177 -7.507 -7.768 -8.037 -8.325 -8.563 -8.802 -9.035 -9.268 -9.504 -9.679 -9.873 -10.152 -10.352 -10.574 -10.682 -10.901 -11.138 -11.389 -11.51 -11.774 -11.947 -12.091 -12.233 -12.545 -12.712 -12.893 -13.108 -13.34 -13.568 -13.822 -14.206 -8 ,9469 ,TETRA ,17585510,Sat Nov 27 13:55:46 CET,Sat Nov 27 16:04:14 CET,0.0 0.355 0.581 0.776 0.939 1.117 1.275 1.398 1.621 1.731 1.845 1.918 2.125 2.216 2.389 2.544 2.688 2.757 2.891 3.026 3.215 3.315 3.414 3.575 3.737 3.886 4.031 4.171 4.334 4.486 4.634 4.811 4.974 5.13 5.308 5.496 5.672 5.861 6.025 6.175 6.338 6.502 6.678 6.831 6.972 7.12 7.214 7.19 6.99 6.513 5.465 3.928 2.56 1.364 0.336 -0.6 -1.426 -2.185 -2.842 -3.494 -4.074 -4.574 -5.054 -5.514 -5.946 -6.344 -6.74 -7.092 -7.399 -7.72 -8.053 -8.332 -8.621 -8.921 -9.157 -9.399 -9.649 -9.901 -10.166 -10.355 -10.547 -10.833 -11.025 -11.232 -11.343 -11.576 -11.798 -12.03 -12.154 -12.404 -12.526 -12.666 -12.812 -13.118 -13.276 -13.455 -13.658 -13.888 -14.205 -14.6 -15.437 -9 ,23825 ,TETRA ,17585511,Sat Nov 27 13:56:45 CET,Sat Nov 27 16:04:54 CET,0.0 0.441 0.749 0.982 1.177 1.342 1.497 1.651 1.924 2.037 2.134 2.203 2.414 2.514 2.705 2.873 3.049 3.134 3.278 3.425 3.637 3.762 3.888 4.065 4.248 4.431 4.597 4.751 4.928 5.078 5.218 5.392 5.569 5.745 5.944 6.15 6.327 6.495 6.661 6.851 7.028 7.202 7.416 7.617 7.786 7.875 7.942 7.969 7.852 7.432 6.443 5.084 3.791 2.589 1.589 0.691 -0.137 -0.889 -1.558 -2.224 -2.79 -3.31 -3.796 -4.243 -4.671 -5.079 -5.506 -5.88 -6.198 -6.528 -6.879 -7.154 -7.435 -7.725 -7.949 -8.181 -8.42 -8.668 -8.916 -9.088 -9.266 -9.547 -9.744 -9.944 -10.045 -10.257 -10.474 -10.708 -10.836 -11.098 -11.244 -11.387 -11.534 -11.859 -12.048 -12.256 -12.475 -12.704 -12.937 -13.229 -13.975 -10 ,4216 ,TETRA ,17585512,Sat Nov 27 13:55:46 CET,Sat Nov 27 16:06:10 CET,0.0 0.634 0.985 1.225 1.398 1.562 1.724 1.883 2.147 2.271 2.387 2.46 2.666 2.751 2.934 3.118 3.284 3.36 3.51 3.656 3.857 3.982 4.1 4.269 4.437 4.589 4.739 4.887 5.069 5.249 5.418 5.626 5.818 6.005 6.224 6.445 6.647 6.858 7.081 7.311 7.516 7.724 7.953 8.168 8.389 8.59 8.719 8.73 8.582 8.16 7.139 5.615 4.194 2.904 1.814 0.841 -0.048 -0.837 -1.51 -2.192 -2.752 -3.242 -3.715 -4.173 -4.595 -4.977 -5.391 -5.745 -6.039 -6.353 -6.678 -6.953 -7.25 -7.56 -7.792 -8.024 -8.258 -8.503 -8.767 -8.942 -9.141 -9.482 -9.702 -9.917 -10.024 -10.25 -10.495 -10.759 -10.892 -11.148 -11.257 -11.381 -11.517 -11.846 -12.025 -12.202 -12.389 -12.594 -12.848 -13.134 -13.742 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt deleted file mode 100644 index 04510ee3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32664 ,TETRA ,17585513,Sat Nov 27 13:56:48 CET,Sat Nov 27 16:06:20 CET,0.0 0.872 1.241 1.549 1.826 2.088 2.339 2.579 3.023 3.24 3.459 3.664 4.075 4.267 4.648 5.029 5.409 5.59 5.916 6.226 6.689 7.004 7.317 7.77 8.222 8.661 9.078 9.491 10.031 10.561 11.073 11.683 12.269 12.854 13.566 14.371 15.156 16.015 16.966 18.026 19.164 20.477 22.031 23.626 25.542 27.716 30.291 33.341 37.003 41.521 47.476 52.955 56.497 58.918 60.633 61.905 62.829 63.564 64.147 64.66 65.029 65.307 65.539 65.733 65.887 65.998 66.081 66.125 66.166 66.208 66.217 66.205 66.189 66.17 66.145 66.104 66.061 66.021 65.967 65.915 65.851 65.749 65.666 65.576 65.531 65.426 65.325 65.218 65.15 64.924 64.898 64.806 64.709 64.478 64.357 64.235 64.078 63.89 63.704 63.497 63.191 -2 ,14216 ,TETRA ,17585514,Sat Nov 27 13:56:48 CET,Sat Nov 27 16:06:21 CET,0.0 0.468 0.864 1.166 1.433 1.711 1.982 2.237 2.684 2.891 3.09 3.251 3.652 3.841 4.229 4.589 4.931 5.103 5.434 5.746 6.224 6.554 6.868 7.316 7.759 8.185 8.601 9.016 9.567 10.084 10.583 11.217 11.844 12.456 13.169 13.972 14.739 15.628 16.616 17.652 18.758 20.032 21.577 23.158 25.035 27.225 29.822 32.857 36.605 41.333 47.544 53.161 56.589 58.869 60.578 61.928 62.877 63.566 64.106 64.582 64.97 65.286 65.52 65.717 65.876 65.986 66.074 66.135 66.175 66.201 66.205 66.2 66.202 66.182 66.161 66.141 66.099 66.048 65.992 65.952 65.899 65.816 65.761 65.685 65.64 65.536 65.434 65.342 65.284 65.068 65.071 64.99 64.91 64.718 64.617 64.518 64.405 64.279 64.109 63.923 63.715 -3 ,9063 ,TETRA ,17585515,Sat Nov 27 13:56:48 CET,Sat Nov 27 16:08:35 CET,0.0 0.53 0.953 1.33 1.652 1.93 2.196 2.465 2.98 3.22 3.455 3.691 4.126 4.337 4.73 5.116 5.487 5.662 5.996 6.317 6.806 7.138 7.45 7.889 8.332 8.773 9.203 9.636 10.205 10.755 11.286 11.931 12.565 13.17 13.883 14.718 15.519 16.399 17.374 18.419 19.541 20.846 22.408 24.021 25.94 28.123 30.677 33.681 37.359 41.851 47.805 53.187 56.567 58.877 60.513 61.76 62.702 63.398 63.892 64.31 64.623 64.862 65.063 65.217 65.331 65.419 65.488 65.535 65.566 65.584 65.597 65.59 65.558 65.52 65.494 65.469 65.434 65.382 65.323 65.272 65.21 65.12 65.048 64.97 64.935 64.858 64.76 64.638 64.575 64.364 64.373 64.296 64.213 64.034 63.932 63.822 63.701 63.545 63.374 63.179 62.891 -4 ,8378 ,TETRA ,17585516,Sat Nov 27 13:56:48 CET,Sat Nov 27 16:05:48 CET,0.0 0.59 0.916 1.211 1.502 1.765 2.031 2.294 2.736 2.938 3.133 3.306 3.712 3.909 4.295 4.664 5.025 5.2 5.542 5.864 6.338 6.654 6.964 7.422 7.863 8.3 8.727 9.144 9.697 10.228 10.738 11.37 12.007 12.63 13.349 14.161 14.947 15.846 16.858 17.938 19.06 20.346 21.915 23.512 25.402 27.595 30.203 33.231 36.919 41.541 47.444 52.684 56.08 58.51 60.224 61.509 62.463 63.156 63.697 64.2 64.565 64.821 65.038 65.219 65.355 65.467 65.552 65.599 65.631 65.65 65.659 65.658 65.648 65.624 65.593 65.554 65.503 65.439 65.361 65.306 65.252 65.172 65.111 65.034 64.997 64.94 64.87 64.775 64.715 64.508 64.529 64.449 64.367 64.219 64.126 64.008 63.871 63.741 63.579 63.337 63.024 -5 ,2340 ,TETRA ,17585517,Sat Nov 27 13:56:48 CET,Sat Nov 27 16:05:56 CET,0.0 1.042 1.4 1.707 2.007 2.287 2.563 2.835 3.301 3.509 3.719 3.915 4.329 4.521 4.908 5.281 5.649 5.834 6.176 6.485 6.93 7.23 7.542 8.019 8.474 8.9 9.317 9.737 10.298 10.841 11.357 11.987 12.603 13.208 13.909 14.701 15.485 16.357 17.29 18.299 19.375 20.635 22.181 23.792 25.695 27.812 30.332 33.303 36.991 41.735 47.917 53.442 56.999 59.402 61.157 62.516 63.506 64.28 64.836 65.287 65.642 65.926 66.141 66.304 66.435 66.542 66.613 66.659 66.702 66.734 66.736 66.711 66.668 66.619 66.58 66.531 66.477 66.415 66.359 66.317 66.26 66.168 66.097 66.009 65.962 65.866 65.74 65.597 65.527 65.315 65.317 65.229 65.133 64.918 64.794 64.654 64.504 64.339 64.15 63.948 63.488 -6 ,31801 ,TETRA ,17585518,Sat Nov 27 13:56:48 CET,Sat Nov 27 16:07:14 CET,0.0 0.376 0.692 0.99 1.278 1.535 1.767 1.998 2.429 2.621 2.821 3.005 3.397 3.587 3.957 4.323 4.68 4.849 5.168 5.488 5.966 6.265 6.555 6.993 7.417 7.835 8.26 8.674 9.209 9.732 10.243 10.877 11.495 12.093 12.792 13.588 14.375 15.256 16.239 17.325 18.473 19.783 21.354 22.995 24.929 27.128 29.775 32.852 36.613 41.269 47.226 52.587 56.002 58.346 59.936 61.125 62.012 62.69 63.225 63.66 63.976 64.23 64.434 64.61 64.748 64.847 64.938 64.996 65.025 65.037 65.027 65.008 64.987 64.95 64.916 64.874 64.826 64.764 64.69 64.636 64.572 64.471 64.386 64.298 64.255 64.161 64.058 63.925 63.85 63.631 63.621 63.532 63.436 63.235 63.129 63.012 62.886 62.711 62.501 62.283 61.972 -7 ,14137 ,TETRA ,17585519,Sat Nov 27 13:57:45 CET,Sat Nov 27 16:07:30 CET,0.0 0.619 0.956 1.245 1.514 1.778 2.041 2.292 2.755 2.976 3.204 3.423 3.838 4.041 4.427 4.774 5.119 5.296 5.639 5.972 6.457 6.769 7.074 7.511 7.932 8.345 8.765 9.191 9.722 10.237 10.76 11.392 12.016 12.645 13.379 14.215 15.028 15.943 16.94 18.003 19.162 20.512 22.123 23.782 25.731 27.931 30.573 33.679 37.508 42.22 48.18 53.586 57.089 59.501 61.171 62.403 63.339 64.074 64.603 65.06 65.407 65.652 65.849 66.013 66.141 66.232 66.309 66.372 66.402 66.404 66.4 66.387 66.356 66.318 66.284 66.236 66.177 66.124 66.062 66.013 65.966 65.863 65.77 65.663 65.612 65.533 65.45 65.357 65.306 65.102 65.092 64.994 64.899 64.712 64.584 64.437 64.29 64.145 63.995 63.811 63.56 -8 ,28617 ,TETRA ,17585520,Sat Nov 27 13:57:45 CET,Sat Nov 27 16:05:24 CET,0.0 0.496 0.881 1.168 1.425 1.663 1.888 2.112 2.537 2.743 2.946 3.127 3.541 3.725 4.076 4.428 4.769 4.929 5.248 5.577 6.049 6.351 6.652 7.101 7.553 7.984 8.397 8.814 9.351 9.86 10.376 11.018 11.634 12.233 12.947 13.769 14.562 15.439 16.415 17.489 18.621 19.909 21.483 23.108 25.027 27.214 29.842 32.936 36.664 41.253 47.257 52.606 55.911 58.281 60.02 61.28 62.213 62.949 63.529 64.022 64.359 64.63 64.854 65.026 65.16 65.273 65.363 65.406 65.415 65.41 65.404 65.395 65.38 65.349 65.318 65.28 65.23 65.175 65.113 65.064 64.999 64.893 64.812 64.71 64.659 64.566 64.459 64.336 64.273 64.056 64.037 63.951 63.869 63.654 63.534 63.414 63.274 63.115 62.912 62.672 62.285 -9 ,29673 ,TETRA ,17585521,Sat Nov 27 13:57:45 CET,Sat Nov 27 16:07:19 CET,0.0 0.5 0.87 1.222 1.558 1.882 2.158 2.424 2.946 3.171 3.38 3.576 3.987 4.172 4.532 4.876 5.225 5.401 5.743 6.071 6.544 6.851 7.171 7.67 8.143 8.584 9.002 9.411 9.967 10.509 11.028 11.659 12.267 12.855 13.563 14.394 15.205 16.098 17.064 18.097 19.202 20.464 21.988 23.603 25.545 27.713 30.236 33.26 37.084 41.812 47.73 53.133 56.659 59.092 60.855 62.184 63.114 63.811 64.346 64.795 65.078 65.282 65.482 65.664 65.819 65.915 65.963 65.984 65.993 66.009 66.013 66.005 65.984 65.951 65.923 65.897 65.868 65.839 65.794 65.748 65.698 65.611 65.545 65.474 65.435 65.35 65.256 65.163 65.107 64.896 64.909 64.837 64.763 64.596 64.503 64.38 64.248 64.1 63.94 63.734 63.34 -10 ,19756 ,TETRA ,17585522,Sat Nov 27 13:57:48 CET,Sat Nov 27 16:07:21 CET,0.0 0.535 0.871 1.175 1.457 1.709 1.949 2.186 2.647 2.855 3.062 3.262 3.669 3.855 4.217 4.574 4.93 5.103 5.439 5.763 6.229 6.536 6.844 7.288 7.722 8.152 8.571 8.997 9.558 10.109 10.658 11.303 11.905 12.485 13.163 13.957 14.74 15.602 16.557 17.605 18.717 20.017 21.588 23.21 25.153 27.36 29.939 32.946 36.678 41.294 47.284 52.632 55.994 58.41 60.145 61.436 62.394 63.083 63.567 63.988 64.291 64.503 64.66 64.79 64.908 64.999 65.069 65.131 65.172 65.186 65.197 65.206 65.2 65.169 65.144 65.111 65.065 65.017 64.964 64.926 64.884 64.792 64.711 64.628 64.587 64.496 64.397 64.296 64.24 64.03 64.037 63.955 63.878 63.714 63.615 63.512 63.386 63.211 63.02 62.784 62.455 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index a3cc5ae9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6513 ,TETRA ,17585523,Sat Nov 27 13:57:47 CET,Sat Nov 27 16:06:26 CET,0.0 0.513 0.833 1.133 1.401 1.663 1.912 2.142 2.595 2.814 3.039 3.29 3.726 3.934 4.316 4.672 5.039 5.218 5.57 5.924 6.454 6.794 7.123 7.612 8.087 8.555 9.019 9.471 10.057 10.634 11.208 11.92 12.622 13.32 14.148 15.094 16.018 17.062 18.211 19.478 20.861 22.461 24.401 26.392 28.788 31.592 34.941 38.912 43.896 50.223 58.612 66.35 71.395 74.943 77.571 79.661 81.317 82.663 83.685 84.582 85.263 85.805 86.262 86.629 86.947 87.227 87.487 87.669 87.807 87.934 88.028 88.096 88.145 88.174 88.195 88.206 88.202 88.188 88.145 88.103 88.061 87.985 87.924 87.851 87.811 87.732 87.655 87.556 87.495 87.309 87.27 87.185 87.099 86.882 86.752 86.618 86.46 86.279 86.036 85.752 85.143 -2 ,30694 ,TETRA ,17585524,Sat Nov 27 13:57:45 CET,Sat Nov 27 16:06:19 CET,0.0 0.478 0.812 1.114 1.396 1.652 1.884 2.14 2.622 2.824 3.024 3.207 3.623 3.814 4.184 4.55 4.916 5.096 5.455 5.811 6.343 6.688 7.011 7.491 7.978 8.454 8.918 9.379 9.976 10.553 11.128 11.842 12.536 13.226 14.06 15.002 15.915 16.945 18.088 19.348 20.721 22.315 24.221 26.206 28.606 31.394 34.758 38.714 43.647 49.895 58.214 66.03 71.205 74.782 77.424 79.484 81.024 82.228 83.121 83.937 84.574 85.076 85.531 85.912 86.216 86.468 86.695 86.858 86.986 87.109 87.212 87.284 87.348 87.391 87.412 87.416 87.406 87.382 87.331 87.302 87.288 87.239 87.182 87.113 87.074 86.974 86.869 86.756 86.696 86.518 86.502 86.431 86.343 86.138 86.01 85.856 85.69 85.513 85.267 84.947 84.352 -3 ,14279 ,TETRA ,17585525,Sat Nov 27 13:57:48 CET,Sat Nov 27 16:07:08 CET,0.0 0.405 0.713 0.995 1.252 1.501 1.743 1.972 2.419 2.642 2.861 3.082 3.505 3.704 4.072 4.435 4.803 4.984 5.35 5.708 6.219 6.555 6.881 7.371 7.848 8.31 8.76 9.197 9.775 10.361 10.941 11.643 12.34 13.022 13.834 14.786 15.728 16.782 17.942 19.221 20.613 22.239 24.18 26.171 28.572 31.364 34.766 38.807 43.791 50.094 58.583 66.511 71.708 75.443 78.245 80.425 82.082 83.391 84.392 85.279 85.963 86.538 87.029 87.44 87.796 88.072 88.309 88.488 88.606 88.708 88.806 88.869 88.924 88.96 88.966 88.969 88.974 88.966 88.939 88.91 88.875 88.817 88.768 88.7 88.661 88.582 88.483 88.357 88.287 88.101 88.07 87.983 87.876 87.646 87.516 87.362 87.19 86.979 86.696 86.3 85.352 -4 ,26709 ,TETRA ,17585526,Sat Nov 27 13:57:50 CET,Sat Nov 27 16:06:19 CET,0.0 0.615 0.982 1.321 1.614 1.876 2.14 2.4 2.851 3.057 3.257 3.431 3.84 4.032 4.423 4.815 5.186 5.366 5.723 6.072 6.584 6.912 7.23 7.695 8.155 8.616 9.061 9.503 10.096 10.674 11.249 11.97 12.672 13.371 14.199 15.141 16.084 17.129 18.279 19.541 20.887 22.462 24.372 26.369 28.776 31.55 34.881 38.863 43.854 50.21 58.679 66.646 72.013 75.806 78.561 80.72 82.374 83.714 84.753 85.648 86.335 86.903 87.397 87.798 88.119 88.359 88.574 88.765 88.906 89.022 89.124 89.199 89.277 89.325 89.345 89.352 89.336 89.321 89.293 89.254 89.197 89.11 89.057 88.989 88.946 88.844 88.741 88.646 88.586 88.389 88.344 88.254 88.143 87.906 87.765 87.6 87.433 87.25 87.033 86.764 86.128 -5 ,26337 ,TETRA ,17585527,Sat Nov 27 13:57:47 CET,Sat Nov 27 15:58:44 CET,0.0 0.369 0.675 1.0 1.317 1.602 1.856 2.094 2.558 2.781 2.996 3.192 3.598 3.789 4.165 4.524 4.874 5.052 5.404 5.754 6.274 6.605 6.932 7.423 7.899 8.369 8.84 9.298 9.886 10.478 11.086 11.839 12.565 13.273 14.101 15.027 15.929 16.978 18.161 19.446 20.813 22.389 24.292 26.253 28.659 31.532 35.006 39.091 44.161 50.578 59.039 66.755 71.76 75.35 77.983 80.02 81.551 82.74 83.651 84.455 85.096 85.597 86.014 86.383 86.686 86.933 87.156 87.313 87.444 87.574 87.666 87.713 87.758 87.811 87.837 87.854 87.871 87.87 87.862 87.848 87.821 87.784 87.748 87.685 87.641 87.543 87.432 87.326 87.274 87.095 87.097 87.027 86.946 86.735 86.617 86.488 86.318 86.096 85.833 85.493 84.587 -6 ,19906 ,TETRA ,17585528,Sat Nov 27 13:57:47 CET,Sat Nov 27 16:04:50 CET,0.0 0.52 0.871 1.158 1.424 1.674 1.912 2.143 2.581 2.8 3.016 3.197 3.608 3.802 4.2 4.588 4.957 5.137 5.493 5.844 6.34 6.665 6.993 7.471 7.939 8.404 8.865 9.323 9.917 10.497 11.071 11.793 12.507 13.203 14.017 14.967 15.91 16.96 18.12 19.377 20.754 22.364 24.279 26.259 28.661 31.46 34.802 38.739 43.623 49.758 57.862 65.411 70.416 73.913 76.478 78.498 80.046 81.293 82.25 83.079 83.725 84.25 84.698 85.058 85.351 85.603 85.827 85.976 86.084 86.2 86.306 86.373 86.412 86.414 86.413 86.404 86.389 86.369 86.338 86.313 86.282 86.214 86.155 86.1 86.064 85.979 85.894 85.78 85.705 85.521 85.501 85.419 85.329 85.108 84.979 84.844 84.672 84.483 84.278 83.98 83.127 -7 ,24292 ,TETRA ,17585529,Sat Nov 27 13:57:47 CET,Sat Nov 27 16:04:06 CET,0.0 0.653 1.024 1.344 1.634 1.893 2.143 2.387 2.828 3.03 3.227 3.408 3.82 4.018 4.413 4.813 5.203 5.39 5.758 6.107 6.619 6.959 7.294 7.788 8.278 8.763 9.234 9.693 10.309 10.908 11.488 12.209 12.914 13.607 14.429 15.378 16.295 17.317 18.456 19.701 21.049 22.625 24.542 26.517 28.863 31.567 34.824 38.761 43.772 50.077 58.386 66.064 71.071 74.634 77.256 79.277 80.818 82.028 82.956 83.791 84.414 84.899 85.305 85.655 85.94 86.174 86.402 86.573 86.695 86.797 86.886 86.96 87.017 87.034 87.037 87.037 87.023 86.99 86.953 86.926 86.895 86.84 86.778 86.697 86.65 86.555 86.457 86.332 86.259 86.053 85.993 85.893 85.775 85.487 85.336 85.183 85.008 84.804 84.531 84.163 83.009 -8 ,2080 ,TETRA ,17585530,Sat Nov 27 13:57:48 CET,Sat Nov 27 16:04:58 CET,0.0 0.459 0.846 1.151 1.429 1.684 1.924 2.149 2.576 2.776 2.972 3.139 3.546 3.736 4.11 4.479 4.835 5.009 5.349 5.686 6.204 6.548 6.883 7.377 7.853 8.305 8.753 9.197 9.777 10.353 10.919 11.623 12.326 13.01 13.81 14.742 15.666 16.694 17.819 19.051 20.394 21.975 23.87 25.831 28.242 31.029 34.359 38.325 43.214 49.38 57.571 65.22 70.315 73.926 76.532 78.484 79.95 81.126 82.051 82.89 83.539 84.05 84.473 84.804 85.079 85.309 85.521 85.695 85.828 85.956 86.08 86.152 86.198 86.238 86.271 86.294 86.301 86.296 86.271 86.251 86.226 86.165 86.112 86.04 85.996 85.911 85.814 85.706 85.644 85.449 85.407 85.312 85.208 84.949 84.797 84.626 84.42 84.215 83.968 83.617 82.498 -9 ,6659 ,TETRA ,17585531,Sat Nov 27 13:57:47 CET,Sat Nov 27 16:05:24 CET,0.0 0.55 0.916 1.221 1.494 1.755 1.998 2.226 2.69 2.917 3.129 3.336 3.753 3.941 4.316 4.675 5.04 5.223 5.575 5.931 6.468 6.813 7.133 7.597 8.061 8.526 8.984 9.443 10.047 10.633 11.211 11.919 12.627 13.344 14.189 15.128 16.043 17.082 18.23 19.483 20.84 22.42 24.329 26.289 28.656 31.429 34.784 38.734 43.629 49.862 58.076 65.695 70.762 74.35 76.963 78.976 80.492 81.71 82.652 83.494 84.145 84.643 85.051 85.396 85.678 85.904 86.126 86.305 86.44 86.566 86.683 86.763 86.825 86.857 86.874 86.897 86.902 86.893 86.888 86.879 86.86 86.815 86.776 86.74 86.719 86.644 86.553 86.462 86.409 86.229 86.208 86.131 86.041 85.817 85.687 85.552 85.395 85.204 84.967 84.666 83.811 -10 ,18791 ,TETRA ,17585532,Sat Nov 27 13:57:47 CET,Sat Nov 27 16:05:06 CET,0.0 0.485 0.782 1.059 1.301 1.538 1.783 2.013 2.432 2.638 2.834 2.998 3.398 3.587 3.964 4.329 4.685 4.86 5.212 5.549 6.063 6.413 6.742 7.218 7.689 8.158 8.621 9.068 9.659 10.246 10.822 11.539 12.24 12.919 13.728 14.656 15.569 16.605 17.758 19.018 20.375 21.967 23.876 25.852 28.259 31.03 34.384 38.412 43.394 49.715 58.168 66.124 71.46 75.238 78.01 80.181 81.815 83.104 84.116 85.018 85.706 86.283 86.768 87.141 87.46 87.73 87.96 88.124 88.251 88.365 88.441 88.489 88.547 88.589 88.592 88.591 88.603 88.597 88.58 88.573 88.555 88.503 88.448 88.368 88.328 88.244 88.124 87.99 87.929 87.737 87.655 87.559 87.465 87.227 87.078 86.909 86.728 86.52 86.259 85.85 84.859 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt deleted file mode 100644 index c1b6188f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28862 ,TETRA ,17585533,Sat Nov 27 13:57:48 CET,Sat Nov 27 16:10:07 CET,0.0 0.939 1.431 1.828 2.139 2.444 2.737 3.011 3.534 3.79 4.054 4.351 4.803 5.026 5.459 5.847 6.214 6.396 6.749 7.107 7.63 7.961 8.283 8.747 9.194 9.642 10.091 10.548 11.153 11.736 12.305 12.997 13.683 14.368 15.174 16.072 16.949 17.969 19.07 20.233 21.507 23.008 24.816 26.646 28.793 31.314 34.406 37.954 42.206 47.504 54.505 60.864 64.924 67.791 69.819 71.377 72.601 73.551 74.251 74.846 75.28 75.61 75.865 76.084 76.285 76.433 76.544 76.638 76.717 76.748 76.752 76.777 76.795 76.793 76.784 76.757 76.726 76.705 76.667 76.634 76.587 76.483 76.412 76.339 76.298 76.202 76.087 75.949 75.885 75.69 75.663 75.577 75.498 75.283 75.162 75.04 74.891 74.703 74.48 74.184 73.609 -2 ,16129 ,TETRA ,17585534,Sat Nov 27 13:57:49 CET,Sat Nov 27 16:11:03 CET,0.0 0.687 1.063 1.391 1.68 1.934 2.186 2.441 2.92 3.145 3.364 3.575 3.996 4.19 4.574 4.949 5.319 5.5 5.865 6.224 6.74 7.075 7.407 7.896 8.364 8.822 9.282 9.742 10.331 10.899 11.449 12.136 12.821 13.483 14.263 15.144 16.003 17.003 18.109 19.306 20.607 22.081 23.822 25.647 27.886 30.468 33.505 37.033 41.327 46.725 53.857 60.316 64.539 67.451 69.532 71.134 72.321 73.248 73.97 74.611 75.093 75.47 75.792 76.084 76.331 76.514 76.659 76.756 76.83 76.894 76.95 76.997 77.031 77.038 77.043 77.046 77.015 76.972 76.92 76.872 76.822 76.744 76.691 76.614 76.56 76.437 76.313 76.19 76.117 75.898 75.846 75.758 75.674 75.453 75.323 75.161 74.96 74.718 74.433 74.148 73.495 -3 ,7204 ,TETRA ,17585535,Sat Nov 27 13:57:48 CET,Sat Nov 27 16:07:40 CET,0.0 1.16 1.609 2.022 2.38 2.69 2.983 3.271 3.794 4.045 4.288 4.516 4.929 5.134 5.551 5.97 6.355 6.531 6.885 7.236 7.758 8.107 8.435 8.897 9.348 9.788 10.239 10.694 11.293 11.882 12.447 13.161 13.877 14.568 15.377 16.312 17.241 18.262 19.377 20.597 21.892 23.351 25.078 26.868 29.006 31.428 34.335 37.803 42.091 47.522 54.627 61.177 65.417 68.324 70.446 72.101 73.35 74.351 75.11 75.742 76.225 76.617 76.92 77.168 77.384 77.568 77.728 77.836 77.92 77.959 77.965 77.968 77.969 77.974 77.969 77.954 77.928 77.893 77.862 77.833 77.796 77.741 77.686 77.624 77.594 77.516 77.431 77.347 77.299 77.105 77.077 77.006 76.92 76.705 76.591 76.472 76.359 76.21 75.996 75.741 75.312 -4 ,28437 ,TETRA ,17585536,Sat Nov 27 13:57:48 CET,Sat Nov 27 16:06:34 CET,0.0 0.452 0.804 1.157 1.501 1.794 2.073 2.348 2.884 3.139 3.382 3.622 4.068 4.292 4.719 5.116 5.498 5.685 6.043 6.411 6.945 7.285 7.62 8.115 8.606 9.083 9.557 10.022 10.612 11.197 11.773 12.455 13.134 13.806 14.594 15.502 16.374 17.359 18.448 19.657 20.967 22.44 24.19 25.976 28.154 30.637 33.603 37.189 41.597 47.097 54.208 60.757 65.061 67.992 70.08 71.702 72.918 73.871 74.576 75.17 75.615 75.984 76.296 76.548 76.767 76.943 77.087 77.192 77.266 77.325 77.38 77.407 77.405 77.394 77.384 77.375 77.357 77.315 77.274 77.244 77.205 77.134 77.069 76.999 76.961 76.881 76.8 76.699 76.632 76.419 76.395 76.312 76.224 76.041 75.93 75.759 75.535 75.299 75.054 74.775 74.204 -5 ,21330 ,TETRA ,17585537,Sat Nov 27 13:57:48 CET,Sat Nov 27 15:55:12 CET,0.0 0.833 1.228 1.544 1.849 2.132 2.409 2.669 3.157 3.387 3.61 3.838 4.279 4.501 4.93 5.346 5.76 5.963 6.354 6.731 7.279 7.636 7.983 8.484 8.97 9.453 9.936 10.396 11.001 11.642 12.266 13.004 13.744 14.48 15.33 16.273 17.192 18.184 19.247 20.407 21.68 23.174 24.924 26.695 28.895 31.415 34.361 37.895 42.277 47.804 54.859 61.311 65.584 68.491 70.547 72.087 73.27 74.235 74.982 75.606 76.071 76.455 76.777 77.049 77.266 77.438 77.577 77.666 77.739 77.806 77.87 77.902 77.902 77.885 77.87 77.851 77.823 77.78 77.733 77.703 77.661 77.565 77.496 77.41 77.361 77.263 77.154 77.047 76.998 76.821 76.827 76.75 76.666 76.471 76.357 76.229 76.065 75.889 75.681 75.402 74.831 -6 ,32239 ,TETRA ,17585538,Sat Nov 27 13:57:48 CET,Sat Nov 27 16:05:42 CET,0.0 0.754 1.186 1.575 1.917 2.215 2.495 2.776 3.31 3.545 3.774 4.005 4.441 4.648 5.063 5.467 5.851 6.036 6.404 6.777 7.306 7.647 7.992 8.51 9.013 9.488 9.943 10.388 10.964 11.529 12.099 12.815 13.509 14.189 14.987 15.885 16.774 17.778 18.877 20.066 21.346 22.818 24.604 26.463 28.635 31.141 34.212 37.838 42.313 47.883 55.053 61.481 65.634 68.548 70.66 72.284 73.536 74.53 75.289 75.915 76.357 76.699 76.985 77.231 77.425 77.581 77.716 77.821 77.888 77.941 77.985 78.025 78.077 78.113 78.128 78.128 78.109 78.086 78.054 78.013 77.954 77.845 77.763 77.677 77.628 77.532 77.434 77.325 77.278 77.095 77.102 77.034 76.963 76.793 76.705 76.611 76.48 76.299 76.083 75.808 75.268 -7 ,9853 ,TETRA ,17585539,Sat Nov 27 13:57:48 CET,Sat Nov 27 16:07:40 CET,0.0 1.182 1.668 2.03 2.322 2.621 2.905 3.181 3.744 4.002 4.25 4.499 4.92 5.132 5.568 5.98 6.373 6.568 6.941 7.301 7.84 8.196 8.559 9.09 9.592 10.086 10.564 11.022 11.638 12.25 12.852 13.58 14.287 14.987 15.824 16.797 17.708 18.697 19.793 20.976 22.247 23.734 25.526 27.399 29.676 32.217 35.188 38.691 43.005 48.396 55.574 62.158 66.318 69.14 71.127 72.642 73.79 74.756 75.451 75.951 76.307 76.611 76.884 77.122 77.329 77.493 77.617 77.711 77.793 77.842 77.865 77.863 77.854 77.832 77.806 77.772 77.732 77.689 77.634 77.605 77.577 77.497 77.424 77.35 77.309 77.212 77.112 76.998 76.937 76.744 76.755 76.695 76.634 76.463 76.342 76.207 76.056 75.878 75.659 75.335 74.767 -8 ,1894 ,TETRA ,17585540,Sat Nov 27 13:57:48 CET,Sat Nov 27 16:06:33 CET,0.0 0.956 1.397 1.756 2.107 2.416 2.717 3.026 3.564 3.803 4.027 4.245 4.678 4.889 5.315 5.723 6.104 6.295 6.672 7.049 7.605 7.959 8.306 8.819 9.318 9.796 10.257 10.706 11.29 11.86 12.409 13.082 13.753 14.417 15.195 16.091 16.983 17.985 19.089 20.296 21.599 23.121 24.937 26.754 28.928 31.476 34.53 38.13 42.527 48.126 55.493 61.978 66.147 69.06 71.176 72.764 73.932 74.855 75.54 76.144 76.622 77.001 77.324 77.583 77.791 77.949 78.083 78.199 78.292 78.359 78.415 78.436 78.441 78.446 78.438 78.422 78.399 78.383 78.362 78.334 78.294 78.213 78.153 78.092 78.058 77.975 77.885 77.799 77.759 77.574 77.591 77.531 77.455 77.275 77.19 77.107 77.003 76.893 76.762 76.552 76.088 -9 ,17944 ,TETRA ,17585541,Sat Nov 27 13:57:48 CET,Sat Nov 27 16:06:05 CET,0.0 0.91 1.451 1.855 2.193 2.502 2.779 3.03 3.516 3.757 3.99 4.233 4.669 4.888 5.307 5.705 6.073 6.249 6.615 6.97 7.494 7.842 8.175 8.668 9.158 9.634 10.096 10.547 11.142 11.708 12.265 12.97 13.654 14.324 15.116 16.024 16.903 17.883 18.988 20.185 21.471 22.93 24.653 26.486 28.746 31.312 34.342 37.93 42.273 47.732 55.011 61.672 65.988 68.936 71.005 72.568 73.737 74.672 75.357 75.938 76.393 76.746 77.038 77.281 77.473 77.616 77.746 77.837 77.906 77.963 77.989 77.998 77.994 77.976 77.964 77.937 77.896 77.852 77.784 77.733 77.681 77.587 77.512 77.439 77.408 77.338 77.249 77.141 77.077 76.876 76.858 76.776 76.684 76.474 76.373 76.253 76.111 75.957 75.761 75.481 74.743 -10 ,11848 ,TETRA ,17585542,Sat Nov 27 13:57:49 CET,Sat Nov 27 16:05:52 CET,0.0 0.558 0.93 1.282 1.586 1.876 2.153 2.401 2.855 3.073 3.291 3.497 3.917 4.114 4.49 4.862 5.241 5.428 5.789 6.143 6.667 7.023 7.382 7.908 8.414 8.905 9.385 9.847 10.447 11.031 11.593 12.279 12.955 13.61 14.37 15.223 16.079 17.067 18.13 19.271 20.522 21.969 23.7 25.5 27.642 30.1 33.052 36.587 40.92 46.212 53.258 59.752 63.855 66.694 68.748 70.295 71.453 72.35 73.019 73.608 74.057 74.411 74.698 74.942 75.143 75.307 75.463 75.553 75.609 75.66 75.704 75.724 75.724 75.714 75.701 75.694 75.687 75.666 75.636 75.612 75.574 75.491 75.419 75.33 75.284 75.186 75.081 74.969 74.905 74.702 74.671 74.58 74.492 74.292 74.173 74.064 73.937 73.791 73.634 73.389 72.821 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index d3a1c330..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30827 ,TETRA ,17585543,Sat Nov 27 13:57:51 CET,Sat Nov 27 16:04:15 CET,0.0 0.29 0.482 0.675 0.853 1.003 1.143 1.278 1.52 1.643 1.762 1.841 2.082 2.177 2.365 2.545 2.72 2.808 2.984 3.153 3.402 3.571 3.739 3.965 4.184 4.4 4.615 4.83 5.095 5.34 5.593 5.916 6.221 6.516 6.859 7.267 7.66 8.088 8.554 9.032 9.549 10.141 10.844 11.544 12.36 13.292 14.376 15.634 16.998 18.568 20.446 21.704 22.283 22.488 22.471 22.374 22.21 22.01 21.765 21.496 21.275 21.015 20.746 20.514 20.286 20.07 19.808 19.563 19.355 19.124 18.887 18.677 18.463 18.229 18.022 17.822 17.614 17.382 17.147 16.989 16.822 16.545 16.337 16.125 16.017 15.789 15.542 15.27 15.13 14.885 14.671 14.479 14.295 13.868 13.613 13.366 13.085 12.636 12.03 11.205 8.023 -2 ,19939 ,TETRA ,17585544,Sat Nov 27 13:57:52 CET,Sat Nov 27 16:04:25 CET,0.0 0.244 0.442 0.619 0.778 0.91 1.039 1.174 1.426 1.538 1.639 1.703 1.946 2.041 2.222 2.408 2.608 2.708 2.892 3.068 3.324 3.479 3.631 3.861 4.091 4.317 4.526 4.726 4.982 5.231 5.477 5.77 6.041 6.319 6.667 7.045 7.398 7.802 8.23 8.666 9.162 9.745 10.421 11.179 12.119 13.077 14.069 15.198 16.609 18.183 19.878 21.118 21.668 21.837 21.768 21.61 21.384 21.124 20.919 20.674 20.437 20.209 19.967 19.722 19.472 19.231 18.965 18.728 18.529 18.311 18.037 17.797 17.565 17.342 17.158 16.956 16.75 16.532 16.266 16.064 15.858 15.565 15.37 15.145 15.022 14.777 14.5 14.192 14.026 13.741 13.51 13.324 13.124 12.67 12.366 12.053 11.771 11.407 10.942 10.387 7.145 -3 ,1411 ,TETRA ,17585545,Sat Nov 27 13:58:47 CET,Sat Nov 27 16:04:03 CET,0.0 0.198 0.402 0.579 0.734 0.867 0.991 1.113 1.336 1.447 1.556 1.628 1.88 1.984 2.178 2.369 2.554 2.645 2.834 3.004 3.24 3.397 3.553 3.782 3.996 4.212 4.431 4.64 4.906 5.17 5.419 5.711 6.005 6.295 6.641 7.042 7.42 7.833 8.303 8.821 9.331 9.876 10.561 11.24 12.038 13.01 14.165 15.411 16.805 18.464 20.48 21.836 22.321 22.524 22.547 22.451 22.291 22.111 21.924 21.683 21.465 21.26 21.035 20.806 20.578 20.366 20.124 19.87 19.649 19.427 19.192 18.987 18.77 18.549 18.381 18.187 17.979 17.767 17.508 17.32 17.131 16.817 16.588 16.363 16.252 16.029 15.78 15.488 15.339 15.069 14.81 14.612 14.381 13.816 13.536 13.248 12.921 12.519 11.988 11.38 7.705 -4 ,8272 ,TETRA ,17585546,Sat Nov 27 13:58:47 CET,Sat Nov 27 16:03:50 CET,0.0 0.276 0.488 0.693 0.876 1.043 1.188 1.308 1.537 1.649 1.758 1.822 2.06 2.162 2.369 2.57 2.751 2.838 3.012 3.189 3.446 3.613 3.781 4.022 4.261 4.497 4.712 4.92 5.19 5.452 5.705 6.005 6.302 6.586 6.918 7.31 7.7 8.128 8.569 9.031 9.532 10.084 10.732 11.435 12.346 13.411 14.549 15.7 16.983 18.45 20.175 21.387 21.849 22.012 21.932 21.761 21.596 21.416 21.23 20.994 20.76 20.533 20.283 20.038 19.805 19.577 19.331 19.094 18.888 18.692 18.481 18.28 18.058 17.808 17.609 17.404 17.196 16.988 16.768 16.618 16.459 16.18 15.981 15.781 15.675 15.45 15.214 14.967 14.825 14.547 14.295 14.107 13.915 13.45 13.168 12.897 12.61 12.255 11.793 11.012 7.819 -5 ,24150 ,TETRA ,17585547,Sat Nov 27 13:58:47 CET,Sat Nov 27 16:04:39 CET,0.0 0.309 0.51 0.713 0.899 1.048 1.186 1.328 1.595 1.715 1.829 1.916 2.173 2.275 2.459 2.639 2.82 2.91 3.088 3.259 3.496 3.653 3.82 4.065 4.285 4.501 4.72 4.929 5.197 5.456 5.7 6.015 6.341 6.647 7.004 7.408 7.786 8.203 8.651 9.141 9.672 10.265 10.975 11.704 12.572 13.534 14.556 15.698 17.051 18.576 20.399 21.666 22.246 22.489 22.525 22.432 22.27 22.097 21.881 21.631 21.396 21.147 20.904 20.667 20.452 20.241 20.017 19.795 19.576 19.363 19.141 18.936 18.715 18.482 18.298 18.099 17.884 17.658 17.418 17.242 17.049 16.767 16.569 16.345 16.234 16.006 15.735 15.457 15.31 15.029 14.801 14.601 14.368 13.917 13.683 13.387 13.064 12.692 12.168 11.382 8.107 -6 ,6330 ,TETRA ,17585548,Sat Nov 27 13:58:47 CET,Sat Nov 27 16:03:54 CET,0.0 0.228 0.446 0.636 0.815 0.971 1.111 1.247 1.479 1.592 1.705 1.769 2.015 2.12 2.323 2.505 2.685 2.778 2.963 3.136 3.38 3.553 3.724 3.962 4.2 4.42 4.632 4.838 5.104 5.376 5.63 5.918 6.206 6.503 6.848 7.238 7.623 8.046 8.492 8.951 9.436 10.009 10.75 11.485 12.319 13.256 14.277 15.464 16.869 18.376 20.059 21.262 21.758 21.907 21.826 21.667 21.497 21.281 21.007 20.725 20.49 20.266 20.042 19.816 19.584 19.359 19.113 18.883 18.674 18.435 18.163 17.934 17.679 17.395 17.187 16.988 16.786 16.573 16.343 16.163 15.967 15.675 15.46 15.229 15.122 14.899 14.626 14.35 14.213 13.934 13.685 13.499 13.31 12.889 12.619 12.292 11.93 11.514 11.012 10.334 8.103 -7 ,16156 ,TETRA ,17585549,Sat Nov 27 13:58:49 CET,Sat Nov 27 16:04:48 CET,0.0 0.213 0.378 0.522 0.669 0.81 0.946 1.087 1.362 1.489 1.604 1.674 1.928 2.031 2.23 2.417 2.591 2.679 2.858 3.035 3.284 3.442 3.596 3.807 4.001 4.193 4.398 4.594 4.852 5.1 5.337 5.648 5.945 6.221 6.544 6.917 7.294 7.701 8.143 8.635 9.132 9.715 10.427 11.152 11.996 12.939 14.014 15.134 16.369 17.838 19.56 20.759 21.328 21.495 21.467 21.384 21.242 21.053 20.84 20.604 20.376 20.137 19.864 19.586 19.356 19.131 18.864 18.615 18.379 18.141 17.92 17.695 17.433 17.175 16.963 16.741 16.522 16.317 16.099 15.936 15.749 15.422 15.199 14.987 14.868 14.62 14.367 14.064 13.908 13.64 13.391 13.206 13.01 12.551 12.308 12.081 11.775 11.395 10.91 10.231 7.286 -8 ,32247 ,TETRA ,17585550,Sat Nov 27 13:58:47 CET,Sat Nov 27 16:03:54 CET,0.0 0.456 0.678 0.905 1.113 1.28 1.426 1.567 1.837 1.965 2.089 2.172 2.421 2.524 2.728 2.921 3.117 3.214 3.392 3.565 3.812 3.973 4.126 4.345 4.574 4.799 5.009 5.211 5.478 5.741 5.999 6.31 6.616 6.914 7.244 7.614 7.991 8.399 8.833 9.332 9.88 10.473 11.148 11.84 12.684 13.637 14.674 15.811 17.15 18.642 20.256 21.314 21.734 21.879 21.828 21.683 21.5 21.263 21.019 20.76 20.508 20.273 20.026 19.744 19.458 19.199 18.934 18.673 18.429 18.172 17.911 17.701 17.493 17.279 17.091 16.879 16.662 16.44 16.206 16.035 15.847 15.564 15.372 15.174 15.074 14.844 14.577 14.282 14.129 13.865 13.679 13.501 13.311 12.856 12.6 12.33 12.015 11.633 11.127 10.317 6.197 -9 ,13182 ,TETRA ,17585551,Sat Nov 27 13:58:49 CET,Sat Nov 27 16:03:57 CET,0.0 0.263 0.48 0.675 0.829 0.972 1.129 1.273 1.526 1.646 1.76 1.848 2.099 2.196 2.389 2.578 2.754 2.843 3.027 3.2 3.444 3.608 3.766 3.993 4.208 4.416 4.624 4.834 5.116 5.377 5.625 5.935 6.238 6.534 6.882 7.272 7.644 8.065 8.534 9.03 9.566 10.19 10.91 11.611 12.44 13.441 14.539 15.697 17.039 18.596 20.403 21.68 22.23 22.41 22.381 22.251 22.075 21.884 21.701 21.471 21.235 20.996 20.753 20.53 20.3 20.088 19.867 19.651 19.446 19.216 18.989 18.804 18.591 18.355 18.185 18.006 17.801 17.58 17.348 17.171 16.974 16.682 16.462 16.219 16.094 15.806 15.515 15.222 15.058 14.777 14.523 14.328 14.125 13.653 13.387 13.1 12.741 12.298 11.75 11.076 6.85 -10 ,9490 ,TETRA ,17585552,Sat Nov 27 13:58:48 CET,Sat Nov 27 16:03:51 CET,0.0 0.343 0.531 0.706 0.866 1.02 1.164 1.289 1.527 1.64 1.745 1.808 2.052 2.154 2.354 2.55 2.735 2.824 2.997 3.169 3.414 3.572 3.732 3.972 4.202 4.422 4.631 4.841 5.109 5.361 5.616 5.926 6.226 6.521 6.866 7.261 7.64 8.067 8.533 9.032 9.574 10.178 10.89 11.604 12.476 13.484 14.635 15.876 17.2 18.857 20.701 21.879 22.544 22.83 22.894 22.834 22.683 22.5 22.291 22.035 21.814 21.6 21.362 21.138 20.9 20.647 20.381 20.16 19.96 19.727 19.473 19.254 19.032 18.804 18.622 18.425 18.213 17.992 17.752 17.569 17.38 17.099 16.893 16.667 16.539 16.271 16.006 15.71 15.565 15.315 15.082 14.888 14.704 14.313 14.063 13.766 13.419 13.054 12.555 11.757 8.844 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt deleted file mode 100644 index 651d1705..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1724 ,TETRA ,17585553,Sat Nov 27 13:58:48 CET,Sat Nov 27 16:08:17 CET,0.0 0.819 1.088 1.309 1.523 1.715 1.876 2.022 2.319 2.456 2.584 2.682 2.948 3.079 3.316 3.528 3.722 3.817 4.021 4.215 4.472 4.638 4.803 5.045 5.273 5.497 5.716 5.932 6.214 6.473 6.722 7.025 7.315 7.592 7.924 8.289 8.623 8.999 9.401 9.814 10.257 10.786 11.381 11.947 12.611 13.363 14.22 15.137 16.259 17.447 18.464 18.964 19.022 18.858 18.548 18.211 17.862 17.522 17.195 16.807 16.455 16.113 15.763 15.429 15.089 14.772 14.45 14.145 13.863 13.575 13.283 13.024 12.739 12.448 12.233 12.021 11.796 11.541 11.268 11.077 10.877 10.558 10.342 10.118 9.988 9.71 9.44 9.162 9.003 8.706 8.473 8.286 8.092 7.648 7.409 7.165 6.895 6.613 6.264 5.779 3.52 -2 ,21844 ,TETRA ,17585554,Sat Nov 27 13:58:48 CET,Sat Nov 27 16:06:31 CET,0.0 0.487 0.729 0.921 1.102 1.28 1.452 1.61 1.891 2.023 2.156 2.28 2.551 2.668 2.885 3.088 3.285 3.375 3.54 3.695 3.926 4.083 4.239 4.462 4.674 4.881 5.095 5.306 5.569 5.819 6.062 6.354 6.621 6.894 7.215 7.57 7.933 8.341 8.787 9.255 9.733 10.281 10.915 11.504 12.22 13.063 13.982 14.973 16.065 17.27 18.384 18.957 19.053 18.881 18.613 18.242 17.847 17.489 17.15 16.8 16.488 16.137 15.764 15.42 15.103 14.84 14.565 14.296 14.068 13.814 13.516 13.273 13.019 12.74 12.526 12.3 12.055 11.808 11.541 11.358 11.183 10.888 10.68 10.472 10.363 10.125 9.866 9.592 9.445 9.178 8.992 8.815 8.621 8.18 7.939 7.692 7.392 7.001 6.57 6.002 3.059 -3 ,16654 ,TETRA ,17585555,Sat Nov 27 13:58:48 CET,Sat Nov 27 16:06:23 CET,0.0 0.462 0.763 1.042 1.267 1.451 1.621 1.791 2.101 2.227 2.345 2.449 2.701 2.806 3.015 3.215 3.399 3.493 3.668 3.844 4.128 4.305 4.468 4.71 4.948 5.181 5.421 5.642 5.909 6.163 6.407 6.707 7.003 7.295 7.607 7.953 8.295 8.677 9.1 9.554 10.026 10.542 11.138 11.752 12.457 13.204 14.054 14.969 15.995 17.15 18.102 18.432 18.447 18.251 17.968 17.647 17.257 16.828 16.448 16.054 15.71 15.404 15.085 14.773 14.458 14.147 13.828 13.562 13.328 13.041 12.727 12.484 12.236 11.98 11.775 11.568 11.374 11.168 10.937 10.764 10.58 10.28 10.066 9.852 9.744 9.486 9.211 8.969 8.844 8.578 8.352 8.176 7.991 7.568 7.358 7.134 6.855 6.503 6.093 5.575 3.522 -4 ,12407 ,TETRA ,17585556,Sat Nov 27 13:58:48 CET,Sat Nov 27 16:04:53 CET,0.0 0.617 0.892 1.112 1.317 1.492 1.655 1.815 2.099 2.234 2.371 2.489 2.748 2.863 3.083 3.286 3.48 3.578 3.758 3.929 4.183 4.345 4.497 4.732 4.973 5.209 5.429 5.631 5.898 6.146 6.391 6.692 6.981 7.283 7.629 8.0 8.346 8.726 9.155 9.593 10.027 10.505 11.086 11.714 12.396 13.113 13.96 14.968 16.126 17.254 18.341 18.892 18.902 18.692 18.437 18.106 17.729 17.377 17.063 16.731 16.402 16.061 15.731 15.436 15.16 14.903 14.627 14.365 14.136 13.896 13.644 13.439 13.227 12.97 12.749 12.528 12.317 12.106 11.867 11.691 11.509 11.217 11.003 10.773 10.654 10.416 10.154 9.863 9.707 9.425 9.212 9.033 8.835 8.415 8.182 7.919 7.66 7.353 6.974 6.47 4.507 -5 ,451 ,TETRA ,17585557,Sat Nov 27 13:58:49 CET,Sat Nov 27 16:04:47 CET,0.0 0.573 0.894 1.158 1.371 1.56 1.726 1.877 2.171 2.312 2.444 2.545 2.79 2.901 3.122 3.334 3.539 3.634 3.816 3.991 4.257 4.429 4.582 4.799 5.007 5.211 5.417 5.616 5.875 6.128 6.372 6.664 6.937 7.202 7.522 7.904 8.272 8.661 9.092 9.529 9.967 10.47 11.068 11.698 12.414 13.172 14.031 14.918 15.889 16.936 18.031 18.57 18.616 18.508 18.28 17.971 17.62 17.264 16.943 16.62 16.319 16.027 15.737 15.465 15.208 14.942 14.649 14.409 14.195 13.947 13.663 13.413 13.169 12.921 12.719 12.508 12.288 12.055 11.815 11.657 11.483 11.2 11.002 10.792 10.681 10.437 10.16 9.853 9.695 9.412 9.203 9.008 8.788 8.349 8.128 7.9 7.641 7.318 6.926 6.455 4.255 -6 ,4243 ,TETRA ,17585558,Sat Nov 27 13:59:47 CET,Sat Nov 27 16:07:33 CET,0.0 0.529 0.836 1.095 1.318 1.506 1.676 1.852 2.227 2.396 2.543 2.661 2.922 3.038 3.248 3.441 3.638 3.743 3.949 4.135 4.411 4.601 4.776 5.013 5.251 5.478 5.693 5.898 6.161 6.411 6.651 6.946 7.23 7.499 7.821 8.194 8.546 8.915 9.312 9.758 10.214 10.721 11.332 11.978 12.732 13.508 14.378 15.323 16.377 17.54 18.608 19.095 19.07 18.777 18.443 18.105 17.779 17.441 17.129 16.806 16.469 16.152 15.856 15.556 15.251 14.959 14.672 14.423 14.185 13.929 13.656 13.422 13.192 12.945 12.721 12.484 12.254 12.019 11.765 11.588 11.414 11.147 10.955 10.74 10.613 10.347 10.078 9.77 9.6 9.317 9.121 8.937 8.726 8.281 8.042 7.793 7.501 7.14 6.726 6.211 3.564 -7 ,18036 ,TETRA ,17585560,Sat Nov 27 13:59:47 CET,Sat Nov 27 16:03:16 CET,0.0 0.567 0.905 1.13 1.319 1.509 1.7 1.859 2.145 2.283 2.412 2.522 2.788 2.904 3.12 3.327 3.524 3.618 3.81 3.998 4.268 4.445 4.628 4.894 5.133 5.356 5.571 5.79 6.067 6.33 6.572 6.86 7.156 7.443 7.768 8.12 8.458 8.842 9.246 9.705 10.188 10.68 11.253 11.83 12.498 13.244 14.104 15.039 16.092 17.196 18.316 18.968 19.03 18.856 18.515 18.121 17.757 17.382 17.036 16.653 16.293 15.973 15.665 15.355 15.059 14.796 14.514 14.242 13.994 13.733 13.466 13.235 12.987 12.742 12.553 12.342 12.118 11.88 11.62 11.444 11.262 10.973 10.75 10.506 10.39 10.153 9.89 9.582 9.422 9.15 8.962 8.8 8.621 8.203 7.95 7.662 7.365 6.982 6.547 5.951 2.056 -8 ,22945 ,TETRA ,17585561,Sat Nov 27 13:59:47 CET,Sat Nov 27 16:01:49 CET,0.0 0.483 0.731 0.948 1.153 1.35 1.536 1.703 1.988 2.122 2.25 2.361 2.615 2.718 2.92 3.117 3.31 3.406 3.594 3.771 4.018 4.179 4.332 4.553 4.769 4.981 5.201 5.418 5.695 5.953 6.199 6.494 6.775 7.056 7.391 7.754 8.091 8.5 8.958 9.41 9.874 10.389 10.981 11.624 12.355 13.055 13.851 14.728 15.717 16.836 17.941 18.531 18.632 18.471 18.197 17.881 17.565 17.235 16.906 16.555 16.244 15.921 15.585 15.274 14.978 14.696 14.392 14.101 13.838 13.576 13.295 13.044 12.785 12.524 12.327 12.119 11.897 11.658 11.393 11.222 11.033 10.724 10.528 10.327 10.218 9.978 9.722 9.452 9.318 9.057 8.885 8.731 8.548 8.116 7.879 7.634 7.354 7.018 6.624 6.012 2.841 -9 ,2637 ,TETRA ,17585562,Sat Nov 27 13:59:47 CET,Sat Nov 27 16:04:45 CET,0.0 0.654 1.02 1.27 1.473 1.662 1.833 1.994 2.284 2.426 2.57 2.684 2.949 3.065 3.298 3.519 3.729 3.833 4.021 4.197 4.457 4.619 4.778 5.025 5.27 5.496 5.71 5.91 6.158 6.405 6.653 6.962 7.269 7.564 7.88 8.231 8.569 8.947 9.375 9.821 10.27 10.781 11.381 11.978 12.675 13.435 14.332 15.284 16.314 17.427 18.568 19.274 19.345 19.113 18.795 18.448 18.062 17.656 17.306 16.921 16.544 16.213 15.888 15.546 15.234 14.958 14.652 14.375 14.137 13.881 13.591 13.328 13.07 12.815 12.609 12.391 12.156 11.91 11.673 11.513 11.34 11.072 10.882 10.66 10.545 10.305 10.031 9.745 9.595 9.313 9.101 8.915 8.727 8.331 8.089 7.816 7.527 7.175 6.768 6.362 3.246 -10 ,918 ,TETRA ,17585563,Sat Nov 27 13:59:47 CET,Sat Nov 27 16:05:23 CET,0.0 0.831 1.145 1.375 1.583 1.774 1.949 2.11 2.4 2.544 2.681 2.802 3.069 3.19 3.426 3.65 3.847 3.941 4.126 4.307 4.568 4.74 4.906 5.131 5.346 5.569 5.787 5.985 6.231 6.471 6.711 7.01 7.309 7.605 7.948 8.334 8.706 9.104 9.541 10.005 10.48 11.005 11.597 12.192 12.882 13.633 14.482 15.434 16.512 17.66 18.83 19.338 19.288 19.055 18.775 18.472 18.154 17.816 17.495 17.176 16.886 16.575 16.263 16.004 15.76 15.492 15.179 14.863 14.58 14.309 14.03 13.789 13.526 13.247 13.033 12.799 12.543 12.288 12.036 11.855 11.665 11.369 11.15 10.924 10.812 10.578 10.339 10.058 9.902 9.638 9.45 9.264 9.067 8.65 8.395 8.134 7.883 7.566 7.164 6.641 4.036 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 4e26431f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9195 ,TETRA ,17585564,Sat Nov 27 13:59:48 CET,Sat Nov 27 16:07:23 CET,0.0 0.675 1.022 1.265 1.465 1.646 1.808 1.978 2.293 2.425 2.556 2.681 2.925 3.043 3.288 3.528 3.747 3.85 4.066 4.268 4.546 4.732 4.912 5.165 5.415 5.67 5.93 6.173 6.477 6.777 7.068 7.419 7.742 8.042 8.401 8.805 9.19 9.614 10.079 10.582 11.118 11.701 12.408 13.133 13.958 14.897 15.941 17.061 18.269 19.619 21.091 22.129 22.535 22.579 22.428 22.195 21.957 21.7 21.411 21.086 20.819 20.571 20.295 20.017 19.761 19.527 19.269 19.02 18.789 18.538 18.278 18.074 17.869 17.645 17.464 17.261 17.051 16.838 16.612 16.456 16.293 16.016 15.819 15.611 15.502 15.291 15.076 14.843 14.713 14.462 14.319 14.17 14.011 13.675 13.483 13.268 13.024 12.761 12.46 12.082 11.272 -2 ,30192 ,TETRA ,17585565,Sat Nov 27 13:59:48 CET,Sat Nov 27 16:07:18 CET,0.0 0.55 0.819 1.051 1.264 1.451 1.61 1.773 2.069 2.193 2.32 2.423 2.665 2.778 2.984 3.176 3.369 3.468 3.673 3.864 4.116 4.279 4.446 4.693 4.93 5.165 5.396 5.628 5.932 6.21 6.48 6.804 7.11 7.425 7.812 8.255 8.659 9.084 9.546 10.061 10.606 11.212 11.923 12.619 13.404 14.282 15.306 16.44 17.671 19.03 20.585 21.607 21.98 22.042 21.97 21.788 21.52 21.212 20.928 20.616 20.347 20.111 19.844 19.586 19.352 19.111 18.849 18.61 18.39 18.154 17.895 17.677 17.47 17.257 17.082 16.895 16.692 16.464 16.222 16.056 15.872 15.586 15.397 15.204 15.104 14.904 14.697 14.456 14.322 14.074 13.913 13.751 13.591 13.276 13.102 12.916 12.702 12.454 12.188 11.87 11.133 -3 ,16426 ,TETRA ,17585566,Sat Nov 27 13:59:50 CET,Sat Nov 27 16:07:15 CET,0.0 0.936 1.307 1.62 1.913 2.152 2.373 2.603 2.962 3.105 3.262 3.436 3.706 3.838 4.105 4.351 4.588 4.707 4.928 5.123 5.395 5.572 5.739 5.982 6.22 6.458 6.694 6.923 7.223 7.523 7.827 8.189 8.524 8.854 9.228 9.622 10.001 10.436 10.898 11.379 11.892 12.448 13.105 13.792 14.55 15.336 16.287 17.368 18.549 19.818 21.178 22.112 22.454 22.532 22.427 22.218 22.018 21.796 21.552 21.297 21.057 20.825 20.568 20.302 20.043 19.788 19.551 19.339 19.135 18.92 18.701 18.513 18.305 18.091 17.922 17.743 17.545 17.328 17.096 16.937 16.778 16.513 16.32 16.113 16.001 15.765 15.516 15.272 15.154 14.907 14.76 14.616 14.466 14.14 13.96 13.772 13.54 13.251 12.935 12.57 11.941 -4 ,7779 ,TETRA ,17585567,Sat Nov 27 13:59:47 CET,Sat Nov 27 16:09:18 CET,0.0 0.716 0.956 1.15 1.338 1.525 1.695 1.85 2.135 2.266 2.398 2.537 2.793 2.918 3.151 3.349 3.555 3.654 3.845 4.046 4.353 4.545 4.731 4.998 5.25 5.49 5.714 5.938 6.231 6.52 6.798 7.139 7.471 7.772 8.114 8.507 8.9 9.338 9.806 10.304 10.822 11.388 12.012 12.625 13.352 14.16 15.099 16.138 17.285 18.635 20.171 21.193 21.59 21.684 21.646 21.491 21.247 20.96 20.68 20.373 20.101 19.848 19.572 19.304 19.055 18.815 18.568 18.338 18.111 17.871 17.627 17.42 17.2 16.956 16.772 16.597 16.402 16.176 15.935 15.774 15.615 15.357 15.17 14.979 14.883 14.68 14.445 14.168 14.021 13.76 13.598 13.45 13.287 12.901 12.687 12.453 12.209 11.938 11.62 11.183 9.189 -5 ,12691 ,TETRA ,17585568,Sat Nov 27 13:59:47 CET,Sat Nov 27 16:08:27 CET,0.0 0.372 0.626 0.864 1.072 1.253 1.415 1.571 1.849 1.981 2.116 2.254 2.512 2.635 2.892 3.135 3.369 3.48 3.675 3.867 4.143 4.323 4.503 4.769 5.024 5.269 5.499 5.719 6.01 6.285 6.546 6.863 7.179 7.493 7.843 8.225 8.585 8.98 9.433 9.913 10.393 10.969 11.66 12.325 13.08 13.899 14.82 15.808 16.96 18.292 19.744 20.684 21.082 21.283 21.318 21.211 21.036 20.82 20.585 20.296 19.998 19.746 19.527 19.307 19.073 18.844 18.619 18.402 18.2 17.989 17.76 17.573 17.357 17.133 16.949 16.741 16.529 16.308 16.083 15.928 15.765 15.498 15.316 15.13 15.031 14.825 14.609 14.385 14.267 14.026 13.862 13.696 13.532 13.182 12.966 12.758 12.535 12.243 11.89 11.424 10.188 -6 ,4052 ,TETRA ,17585569,Sat Nov 27 13:59:48 CET,Sat Nov 27 16:07:11 CET,0.0 0.375 0.654 0.91 1.127 1.328 1.515 1.683 1.99 2.152 2.312 2.458 2.714 2.835 3.066 3.277 3.483 3.588 3.794 3.994 4.287 4.467 4.645 4.904 5.15 5.39 5.613 5.835 6.126 6.399 6.664 6.98 7.284 7.592 7.948 8.352 8.736 9.143 9.584 10.059 10.556 11.112 11.764 12.416 13.186 14.004 14.884 15.849 16.974 18.301 19.692 20.55 20.837 20.856 20.727 20.556 20.349 20.124 19.895 19.614 19.322 19.057 18.812 18.577 18.356 18.135 17.875 17.639 17.415 17.171 16.923 16.713 16.49 16.252 16.077 15.893 15.679 15.457 15.226 15.067 14.906 14.653 14.465 14.259 14.148 13.928 13.706 13.459 13.331 13.076 12.909 12.749 12.582 12.248 12.075 11.885 11.652 11.373 11.048 10.702 10.015 -7 ,7352 ,TETRA ,17585570,Sat Nov 27 14:00:52 CET,Sat Nov 27 16:08:16 CET,0.0 0.482 0.729 0.945 1.14 1.346 1.548 1.72 2.031 2.181 2.319 2.439 2.686 2.8 3.025 3.238 3.439 3.539 3.727 3.906 4.179 4.349 4.515 4.77 5.014 5.252 5.494 5.729 6.021 6.294 6.563 6.89 7.191 7.481 7.829 8.222 8.589 8.984 9.426 9.915 10.433 11.011 11.663 12.324 13.09 13.928 14.898 15.976 17.23 18.646 20.101 20.96 21.278 21.352 21.282 21.094 20.855 20.574 20.306 20.022 19.758 19.499 19.228 18.967 18.699 18.452 18.182 17.928 17.723 17.504 17.253 17.042 16.82 16.589 16.399 16.189 15.974 15.751 15.509 15.338 15.169 14.895 14.698 14.497 14.396 14.194 13.973 13.759 13.641 13.402 13.259 13.105 12.949 12.595 12.398 12.203 11.984 11.738 11.474 11.149 10.528 -8 ,29588 ,TETRA ,17585571,Sat Nov 27 14:00:52 CET,Sat Nov 27 16:08:17 CET,0.0 0.56 0.856 1.102 1.347 1.558 1.721 1.882 2.194 2.332 2.477 2.623 2.888 3.011 3.253 3.477 3.681 3.782 3.979 4.153 4.401 4.562 4.721 4.987 5.258 5.504 5.74 5.972 6.285 6.576 6.851 7.189 7.51 7.824 8.182 8.584 8.974 9.395 9.848 10.337 10.847 11.429 12.115 12.793 13.576 14.437 15.435 16.572 17.819 19.14 20.55 21.418 21.652 21.627 21.522 21.336 21.086 20.812 20.566 20.303 20.044 19.778 19.493 19.192 18.92 18.686 18.415 18.128 17.877 17.618 17.334 17.114 16.892 16.647 16.453 16.255 16.055 15.848 15.619 15.438 15.246 14.964 14.783 14.605 14.511 14.3 14.061 13.81 13.674 13.407 13.233 13.096 12.945 12.594 12.419 12.245 12.041 11.812 11.556 11.171 9.754 -9 ,12224 ,TETRA ,17585572,Sat Nov 27 14:01:49 CET,Sat Nov 27 16:10:24 CET,0.0 0.442 0.671 0.889 1.1 1.287 1.466 1.637 1.975 2.127 2.266 2.394 2.653 2.774 3.012 3.243 3.459 3.562 3.765 3.962 4.247 4.428 4.601 4.857 5.102 5.339 5.566 5.786 6.08 6.358 6.624 6.938 7.24 7.542 7.902 8.306 8.685 9.1 9.562 10.053 10.561 11.134 11.777 12.411 13.154 13.997 14.965 15.978 17.08 18.285 19.607 20.537 20.893 20.966 20.893 20.744 20.553 20.301 20.05 19.788 19.536 19.298 19.053 18.837 18.641 18.442 18.219 17.992 17.783 17.569 17.35 17.172 16.979 16.769 16.609 16.438 16.246 16.047 15.855 15.714 15.567 15.348 15.196 15.035 14.943 14.745 14.538 14.31 14.188 13.95 13.803 13.652 13.493 13.145 12.965 12.786 12.562 12.297 12.019 11.66 10.982 -10 ,23335 ,TETRA ,17585573,Sat Nov 27 14:00:52 CET,Sat Nov 27 16:09:14 CET,0.0 0.412 0.732 0.998 1.238 1.457 1.646 1.808 2.109 2.257 2.389 2.492 2.743 2.857 3.084 3.303 3.517 3.624 3.838 4.042 4.323 4.504 4.685 4.956 5.214 5.47 5.729 5.974 6.278 6.571 6.857 7.194 7.517 7.822 8.181 8.594 8.975 9.379 9.822 10.302 10.824 11.396 12.021 12.684 13.469 14.294 15.227 16.246 17.384 18.711 20.247 21.25 21.614 21.628 21.506 21.379 21.185 20.933 20.659 20.354 20.07 19.771 19.481 19.191 18.892 18.631 18.375 18.14 17.92 17.701 17.482 17.276 17.055 16.824 16.636 16.439 16.231 16.004 15.759 15.589 15.419 15.177 15.014 14.847 14.752 14.531 14.29 14.037 13.899 13.634 13.439 13.275 13.111 12.733 12.512 12.272 12.007 11.725 11.413 11.023 10.201 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt deleted file mode 100644 index a971ce5c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29325 ,TETRA ,17585574,Sat Nov 27 14:00:49 CET,Sat Nov 27 16:11:55 CET,0.0 0.979 1.319 1.576 1.777 1.937 2.101 2.263 2.555 2.687 2.808 2.903 3.163 3.285 3.493 3.69 3.884 3.97 4.131 4.282 4.499 4.644 4.791 5.008 5.212 5.414 5.614 5.799 6.024 6.238 6.448 6.699 6.928 7.139 7.384 7.666 7.935 8.234 8.547 8.867 9.201 9.583 10.026 10.46 10.926 11.393 11.873 12.345 12.793 13.166 13.347 13.062 12.529 11.883 11.252 10.686 10.147 9.584 9.094 8.596 8.158 7.746 7.339 6.972 6.617 6.294 5.96 5.656 5.392 5.115 4.812 4.553 4.29 4.023 3.808 3.576 3.33 3.079 2.823 2.638 2.447 2.146 1.943 1.747 1.634 1.39 1.143 0.88 0.753 0.493 0.319 0.159 0.002 -0.325 -0.504 -0.689 -0.91 -1.185 -1.509 -1.896 -3.083 -2 ,16709 ,TETRA ,17585575,Sat Nov 27 14:01:50 CET,Sat Nov 27 16:08:37 CET,0.0 1.102 1.47 1.737 1.967 2.178 2.365 2.537 2.859 2.994 3.125 3.255 3.508 3.625 3.842 4.038 4.219 4.302 4.479 4.66 4.899 5.047 5.197 5.404 5.607 5.816 6.027 6.235 6.495 6.74 6.964 7.23 7.479 7.707 7.989 8.325 8.625 8.954 9.298 9.634 10.014 10.472 10.985 11.435 11.872 12.304 12.756 13.211 13.702 14.155 14.471 14.232 13.688 13.064 12.451 11.851 11.277 10.746 10.257 9.763 9.315 8.885 8.464 8.047 7.657 7.305 6.933 6.592 6.3 6.003 5.693 5.428 5.136 4.831 4.589 4.325 4.06 3.781 3.488 3.283 3.07 2.745 2.52 2.283 2.165 1.929 1.667 1.372 1.216 0.94 0.749 0.578 0.406 -0.005 -0.246 -0.489 -0.74 -1.032 -1.385 -1.802 -2.983 -3 ,31999 ,TETRA ,17585576,Sat Nov 27 14:01:52 CET,Sat Nov 27 16:09:11 CET,0.0 1.104 1.392 1.645 1.868 2.063 2.264 2.44 2.736 2.882 3.025 3.142 3.401 3.517 3.725 3.919 4.104 4.194 4.366 4.53 4.76 4.918 5.077 5.283 5.469 5.664 5.856 6.034 6.248 6.442 6.637 6.879 7.119 7.362 7.631 7.916 8.179 8.467 8.803 9.159 9.489 9.859 10.311 10.694 11.12 11.583 12.032 12.515 13.077 13.56 13.66 13.356 12.85 12.204 11.52 10.903 10.318 9.76 9.275 8.782 8.36 7.973 7.592 7.222 6.861 6.515 6.152 5.824 5.542 5.262 4.98 4.728 4.468 4.177 3.952 3.74 3.494 3.231 2.974 2.796 2.611 2.324 2.129 1.928 1.814 1.56 1.304 1.03 0.878 0.596 0.415 0.243 0.065 -0.3 -0.497 -0.714 -0.966 -1.246 -1.564 -1.92 -3.087 -4 ,29106 ,TETRA ,17585577,Sat Nov 27 14:01:49 CET,Sat Nov 27 16:10:29 CET,0.0 0.781 1.074 1.301 1.501 1.7 1.884 2.049 2.333 2.468 2.6 2.714 2.965 3.085 3.325 3.533 3.715 3.811 3.995 4.162 4.403 4.563 4.714 4.914 5.114 5.311 5.489 5.654 5.864 6.062 6.253 6.484 6.711 6.945 7.222 7.523 7.807 8.09 8.382 8.691 9.025 9.393 9.758 10.099 10.485 10.906 11.362 11.822 12.278 12.598 12.642 12.26 11.686 11.067 10.425 9.779 9.146 8.525 7.974 7.426 6.956 6.54 6.116 5.709 5.322 4.95 4.57 4.249 3.976 3.687 3.372 3.099 2.811 2.499 2.263 2.036 1.788 1.543 1.298 1.123 0.933 0.632 0.437 0.223 0.106 -0.144 -0.398 -0.657 -0.798 -1.064 -1.213 -1.367 -1.532 -1.907 -2.124 -2.366 -2.642 -2.963 -3.314 -3.706 -4.721 -5 ,18433 ,TETRA ,17585578,Sat Nov 27 14:01:49 CET,Sat Nov 27 16:09:59 CET,0.0 1.194 1.474 1.685 1.888 2.102 2.274 2.423 2.712 2.846 2.97 3.057 3.298 3.399 3.605 3.807 3.983 4.067 4.219 4.363 4.574 4.719 4.861 5.07 5.283 5.477 5.658 5.831 6.061 6.281 6.486 6.732 6.964 7.181 7.435 7.721 7.983 8.274 8.595 8.926 9.28 9.691 10.197 10.694 11.246 11.814 12.296 12.706 13.045 13.29 13.339 12.981 12.424 11.743 11.039 10.389 9.804 9.261 8.784 8.286 7.834 7.41 6.99 6.597 6.218 5.87 5.527 5.212 4.934 4.653 4.361 4.114 3.855 3.584 3.374 3.148 2.911 2.657 2.388 2.204 2.01 1.711 1.513 1.302 1.19 0.96 0.701 0.428 0.289 0.011 -0.169 -0.321 -0.476 -0.846 -1.049 -1.279 -1.569 -1.879 -2.203 -2.627 -4.113 -6 ,24961 ,TETRA ,17585579,Sat Nov 27 14:02:46 CET,Sat Nov 27 16:13:43 CET,0.0 0.768 1.04 1.267 1.475 1.655 1.829 2.004 2.305 2.433 2.558 2.677 2.94 3.052 3.272 3.483 3.666 3.756 3.926 4.075 4.301 4.445 4.588 4.816 5.026 5.225 5.432 5.634 5.886 6.115 6.332 6.597 6.854 7.092 7.352 7.648 7.938 8.25 8.563 8.886 9.23 9.633 10.089 10.497 10.943 11.392 11.847 12.308 12.703 13.005 13.085 12.651 12.04 11.372 10.749 10.148 9.562 8.984 8.471 7.963 7.516 7.118 6.721 6.345 5.993 5.671 5.326 5.006 4.718 4.401 4.067 3.779 3.483 3.165 2.914 2.668 2.394 2.104 1.802 1.579 1.344 0.993 0.758 0.528 0.418 0.17 -0.084 -0.327 -0.449 -0.707 -0.867 -1.03 -1.216 -1.622 -1.835 -2.049 -2.279 -2.565 -2.938 -3.402 -5.209 -7 ,21571 ,TETRA ,17585580,Sat Nov 27 14:02:46 CET,Sat Nov 27 16:11:51 CET,0.0 0.958 1.321 1.565 1.767 1.966 2.144 2.3 2.587 2.724 2.857 2.973 3.225 3.322 3.522 3.707 3.881 3.965 4.143 4.326 4.568 4.731 4.897 5.134 5.356 5.555 5.727 5.888 6.088 6.302 6.52 6.77 7.011 7.237 7.489 7.791 8.108 8.455 8.805 9.164 9.519 9.922 10.371 10.796 11.325 11.919 12.554 13.157 13.767 14.38 14.847 14.545 13.858 13.205 12.576 11.978 11.425 10.904 10.453 9.995 9.593 9.213 8.834 8.467 8.102 7.752 7.401 7.083 6.795 6.5 6.188 5.929 5.664 5.393 5.185 4.96 4.719 4.484 4.248 4.077 3.908 3.644 3.437 3.217 3.108 2.877 2.632 2.377 2.243 1.985 1.827 1.667 1.494 1.121 0.905 0.688 0.478 0.239 -0.083 -0.507 -1.844 -8 ,1034 ,TETRA ,17585581,Sat Nov 27 14:02:47 CET,Sat Nov 27 16:11:40 CET,0.0 0.747 1.086 1.345 1.565 1.753 1.92 2.066 2.333 2.456 2.58 2.7 2.958 3.059 3.252 3.446 3.636 3.73 3.901 4.074 4.337 4.488 4.617 4.816 5.006 5.189 5.381 5.565 5.776 5.979 6.206 6.486 6.737 6.97 7.243 7.55 7.832 8.118 8.407 8.703 9.031 9.438 9.921 10.387 10.873 11.368 11.898 12.359 12.772 13.155 13.281 12.873 12.259 11.661 11.112 10.543 10.027 9.545 9.081 8.588 8.146 7.742 7.355 6.993 6.65 6.325 5.987 5.677 5.397 5.101 4.811 4.567 4.298 4.021 3.812 3.592 3.363 3.135 2.897 2.722 2.541 2.268 2.065 1.848 1.739 1.517 1.278 1.023 0.889 0.624 0.465 0.309 0.153 -0.183 -0.376 -0.578 -0.803 -1.071 -1.401 -1.818 -3.621 -9 ,31128 ,TETRA ,17585582,Sat Nov 27 14:02:47 CET,Sat Nov 27 16:11:30 CET,0.0 0.571 0.868 1.125 1.301 1.471 1.641 1.792 2.084 2.214 2.334 2.431 2.677 2.788 2.981 3.16 3.348 3.438 3.627 3.827 4.108 4.279 4.434 4.654 4.861 5.07 5.283 5.482 5.718 5.956 6.199 6.467 6.709 6.939 7.201 7.487 7.753 8.053 8.375 8.72 9.103 9.506 9.95 10.405 10.897 11.388 11.929 12.514 13.077 13.602 13.909 13.573 12.998 12.377 11.783 11.211 10.66 10.135 9.681 9.183 8.725 8.329 7.948 7.591 7.239 6.902 6.557 6.252 5.997 5.736 5.449 5.202 4.939 4.67 4.466 4.255 4.041 3.809 3.537 3.333 3.121 2.786 2.553 2.311 2.193 1.946 1.661 1.353 1.195 0.903 0.713 0.551 0.371 -0.064 -0.315 -0.547 -0.77 -1.024 -1.342 -1.777 -2.974 -10 ,23468 ,TETRA ,17585583,Sat Nov 27 14:02:48 CET,Sat Nov 27 16:10:21 CET,0.0 0.546 0.8 1.013 1.219 1.399 1.57 1.734 2.049 2.203 2.335 2.436 2.691 2.804 3.014 3.212 3.407 3.506 3.702 3.878 4.119 4.273 4.421 4.625 4.796 4.956 5.149 5.354 5.597 5.829 6.05 6.306 6.546 6.778 7.042 7.332 7.617 7.905 8.181 8.501 8.865 9.262 9.722 10.15 10.563 10.983 11.43 11.882 12.363 12.774 12.974 12.687 12.14 11.53 10.949 10.385 9.859 9.334 8.859 8.372 7.955 7.566 7.179 6.815 6.453 6.12 5.773 5.465 5.196 4.903 4.608 4.366 4.116 3.865 3.662 3.455 3.233 3.001 2.761 2.589 2.419 2.143 1.947 1.741 1.628 1.403 1.154 0.878 0.744 0.479 0.326 0.174 0.002 -0.397 -0.599 -0.827 -1.092 -1.361 -1.681 -2.138 -4.356 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index c1d16139..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22990 ,TETRA ,17585584,Sat Nov 27 14:03:47 CET,Sat Nov 27 16:10:58 CET,0.0 0.888 1.244 1.507 1.72 1.916 2.114 2.286 2.598 2.739 2.86 2.983 3.222 3.342 3.576 3.8 3.984 4.069 4.237 4.391 4.617 4.765 4.898 5.085 5.272 5.452 5.628 5.802 6.016 6.229 6.436 6.674 6.893 7.091 7.319 7.581 7.825 8.082 8.358 8.655 8.985 9.359 9.743 10.082 10.423 10.742 11.087 11.419 11.678 11.795 11.525 10.641 9.573 8.534 7.554 6.599 5.735 4.911 4.185 3.478 2.818 2.188 1.606 1.074 0.564 0.1 -0.397 -0.849 -1.234 -1.656 -2.111 -2.477 -2.849 -3.255 -3.565 -3.879 -4.223 -4.577 -4.943 -5.213 -5.495 -5.92 -6.219 -6.562 -6.739 -7.074 -7.443 -7.862 -8.071 -8.408 -8.763 -9.005 -9.254 -9.809 -10.127 -10.472 -10.89 -11.371 -11.909 -12.582 -14.737 -2 ,9524 ,TETRA ,17585585,Sat Nov 27 14:03:49 CET,Sat Nov 27 16:11:03 CET,0.0 0.831 1.138 1.4 1.635 1.838 2.019 2.187 2.498 2.639 2.778 2.926 3.155 3.268 3.481 3.682 3.87 3.959 4.136 4.316 4.56 4.707 4.859 5.08 5.282 5.477 5.66 5.825 6.039 6.247 6.449 6.695 6.921 7.134 7.375 7.635 7.891 8.186 8.483 8.762 9.059 9.401 9.769 10.117 10.507 10.9 11.286 11.595 11.789 11.801 11.396 10.451 9.443 8.467 7.534 6.663 5.807 4.992 4.309 3.615 2.996 2.439 1.897 1.361 0.853 0.396 -0.074 -0.495 -0.869 -1.274 -1.703 -2.05 -2.414 -2.807 -3.106 -3.416 -3.755 -4.119 -4.489 -4.747 -5.022 -5.446 -5.727 -6.025 -6.19 -6.557 -6.961 -7.373 -7.579 -7.908 -8.236 -8.481 -8.758 -9.34 -9.659 -10.02 -10.407 -10.817 -11.304 -11.979 -13.83 -3 ,19683 ,TETRA ,17585586,Sat Nov 27 14:03:51 CET,Sat Nov 27 16:10:41 CET,0.0 0.77 1.143 1.42 1.643 1.854 2.042 2.2 2.491 2.629 2.765 2.901 3.127 3.23 3.432 3.631 3.81 3.898 4.073 4.235 4.476 4.638 4.788 5.0 5.205 5.394 5.572 5.753 5.985 6.197 6.388 6.618 6.846 7.048 7.295 7.569 7.813 8.084 8.372 8.657 8.925 9.213 9.558 9.885 10.226 10.566 10.879 11.175 11.397 11.416 11.035 10.162 9.23 8.287 7.346 6.456 5.616 4.779 4.041 3.336 2.693 2.1 1.547 1.006 0.506 0.05 -0.43 -0.873 -1.276 -1.701 -2.151 -2.523 -2.898 -3.305 -3.63 -3.974 -4.334 -4.695 -5.078 -5.339 -5.606 -6.051 -6.372 -6.697 -6.868 -7.218 -7.566 -7.965 -8.19 -8.541 -8.902 -9.157 -9.415 -9.986 -10.296 -10.637 -11.027 -11.465 -12.02 -12.745 -14.932 -4 ,18795 ,TETRA ,17585587,Sat Nov 27 14:03:47 CET,Sat Nov 27 16:10:19 CET,0.0 0.919 1.245 1.485 1.692 1.884 2.059 2.221 2.52 2.651 2.781 2.911 3.145 3.251 3.432 3.614 3.795 3.888 4.064 4.222 4.463 4.61 4.744 4.946 5.146 5.345 5.534 5.704 5.91 6.113 6.317 6.555 6.79 7.008 7.254 7.541 7.81 8.08 8.369 8.675 8.97 9.287 9.631 9.977 10.397 10.817 11.185 11.5 11.757 11.888 11.573 10.642 9.714 8.773 7.857 6.906 5.956 5.065 4.314 3.567 2.889 2.259 1.649 1.101 0.571 0.072 -0.439 -0.888 -1.27 -1.682 -2.099 -2.434 -2.799 -3.216 -3.538 -3.864 -4.228 -4.599 -4.98 -5.25 -5.533 -5.972 -6.261 -6.579 -6.737 -7.062 -7.419 -7.804 -8.013 -8.338 -8.636 -8.879 -9.139 -9.666 -9.932 -10.218 -10.559 -10.978 -11.52 -12.24 -15.499 -5 ,27295 ,TETRA ,17585588,Sat Nov 27 14:03:49 CET,Sat Nov 27 16:10:13 CET,0.0 0.775 1.065 1.269 1.469 1.675 1.864 2.032 2.312 2.43 2.558 2.688 2.913 3.015 3.204 3.38 3.548 3.634 3.811 3.976 4.199 4.337 4.479 4.672 4.841 5.014 5.19 5.364 5.592 5.813 6.006 6.218 6.429 6.636 6.866 7.114 7.352 7.614 7.892 8.158 8.418 8.732 9.095 9.441 9.797 10.117 10.409 10.675 10.9 11.004 10.663 9.653 8.583 7.569 6.585 5.665 4.875 4.135 3.448 2.722 2.078 1.495 0.949 0.442 -0.035 -0.476 -0.951 -1.362 -1.712 -2.109 -2.534 -2.882 -3.264 -3.657 -3.96 -4.28 -4.621 -4.982 -5.335 -5.588 -5.857 -6.265 -6.556 -6.875 -7.04 -7.364 -7.689 -8.029 -8.222 -8.555 -8.905 -9.145 -9.396 -9.926 -10.19 -10.484 -10.865 -11.297 -11.814 -12.61 -15.16 -6 ,12697 ,TETRA ,17585589,Sat Nov 27 14:03:47 CET,Sat Nov 27 16:12:18 CET,0.0 0.613 0.887 1.136 1.333 1.497 1.658 1.808 2.068 2.187 2.299 2.41 2.623 2.72 2.912 3.091 3.259 3.342 3.503 3.65 3.845 3.962 4.086 4.291 4.481 4.657 4.843 5.036 5.286 5.508 5.704 5.933 6.154 6.353 6.583 6.85 7.086 7.329 7.587 7.867 8.154 8.457 8.804 9.12 9.444 9.764 10.093 10.376 10.569 10.605 10.24 9.394 8.398 7.392 6.434 5.518 4.685 3.892 3.184 2.483 1.85 1.259 0.671 0.112 -0.405 -0.892 -1.383 -1.804 -2.163 -2.555 -2.982 -3.338 -3.72 -4.13 -4.442 -4.76 -5.112 -5.496 -5.912 -6.192 -6.467 -6.926 -7.248 -7.586 -7.77 -8.151 -8.54 -8.937 -9.142 -9.471 -9.805 -10.045 -10.294 -10.825 -11.136 -11.464 -11.852 -12.33 -12.908 -13.701 -16.024 -7 ,4748 ,TETRA ,17585590,Sat Nov 27 14:03:49 CET,Sat Nov 27 16:15:01 CET,0.0 0.647 0.979 1.25 1.477 1.69 1.881 2.05 2.363 2.508 2.639 2.755 2.98 3.089 3.311 3.53 3.724 3.81 3.976 4.142 4.385 4.534 4.689 4.916 5.118 5.318 5.506 5.676 5.898 6.112 6.312 6.55 6.772 6.978 7.221 7.501 7.767 8.059 8.361 8.662 8.965 9.304 9.697 10.057 10.445 10.838 11.221 11.563 11.835 11.886 11.374 10.249 9.089 7.913 6.847 5.911 5.083 4.305 3.607 2.907 2.325 1.778 1.236 0.732 0.256 -0.177 -0.626 -1.047 -1.434 -1.835 -2.266 -2.651 -3.046 -3.431 -3.737 -4.077 -4.424 -4.768 -5.135 -5.382 -5.627 -6.036 -6.326 -6.642 -6.811 -7.16 -7.512 -7.884 -8.089 -8.424 -8.813 -9.075 -9.347 -9.94 -10.259 -10.604 -10.965 -11.377 -11.896 -12.616 -14.629 -8 ,3128 ,TETRA ,17585591,Sat Nov 27 14:03:47 CET,Sat Nov 27 16:10:21 CET,0.0 1.014 1.403 1.707 1.952 2.168 2.353 2.506 2.802 2.94 3.062 3.187 3.417 3.528 3.757 3.972 4.171 4.265 4.441 4.601 4.827 4.976 5.123 5.33 5.519 5.699 5.874 6.045 6.278 6.499 6.696 6.93 7.156 7.373 7.612 7.874 8.127 8.382 8.646 8.939 9.25 9.577 9.944 10.303 10.675 11.034 11.376 11.678 11.906 11.95 11.522 10.434 9.277 8.26 7.328 6.379 5.506 4.697 3.991 3.317 2.752 2.234 1.685 1.118 0.605 0.135 -0.382 -0.856 -1.27 -1.701 -2.155 -2.531 -2.92 -3.344 -3.675 -4.008 -4.361 -4.751 -5.178 -5.473 -5.788 -6.284 -6.625 -6.982 -7.155 -7.496 -7.891 -8.336 -8.559 -8.901 -9.232 -9.474 -9.736 -10.296 -10.6 -10.953 -11.339 -11.789 -12.437 -13.23 -15.802 -9 ,19100 ,TETRA ,17585592,Sat Nov 27 14:03:47 CET,Sat Nov 27 16:10:49 CET,0.0 0.893 1.252 1.489 1.691 1.871 2.038 2.201 2.506 2.639 2.772 2.927 3.169 3.279 3.474 3.654 3.828 3.917 4.087 4.249 4.489 4.649 4.802 5.018 5.226 5.419 5.596 5.763 5.98 6.186 6.385 6.622 6.848 7.069 7.316 7.579 7.817 8.078 8.352 8.629 8.906 9.217 9.556 9.857 10.194 10.572 10.947 11.239 11.454 11.438 10.888 9.833 8.739 7.662 6.621 5.642 4.787 3.961 3.166 2.39 1.77 1.199 0.648 0.107 -0.437 -0.925 -1.433 -1.906 -2.329 -2.752 -3.21 -3.61 -4.01 -4.41 -4.725 -5.072 -5.416 -5.767 -6.156 -6.438 -6.731 -7.181 -7.505 -7.834 -8.004 -8.382 -8.77 -9.151 -9.362 -9.71 -10.081 -10.35 -10.646 -11.273 -11.589 -11.937 -12.32 -12.774 -13.366 -14.109 -17.405 -10 ,13154 ,TETRA ,17585593,Sat Nov 27 14:03:49 CET,Sat Nov 27 16:10:26 CET,0.0 0.794 1.084 1.324 1.524 1.691 1.835 1.984 2.276 2.403 2.526 2.646 2.88 2.984 3.172 3.357 3.54 3.63 3.805 3.967 4.2 4.355 4.506 4.714 4.909 5.099 5.291 5.484 5.721 5.933 6.138 6.39 6.622 6.839 7.094 7.374 7.636 7.909 8.191 8.492 8.806 9.15 9.539 9.911 10.282 10.673 11.096 11.441 11.733 11.854 11.366 10.285 9.13 8.001 6.95 5.931 4.994 4.122 3.356 2.597 1.987 1.429 0.845 0.288 -0.217 -0.691 -1.222 -1.712 -2.15 -2.612 -3.075 -3.447 -3.824 -4.207 -4.506 -4.827 -5.157 -5.516 -5.916 -6.176 -6.439 -6.876 -7.195 -7.535 -7.707 -8.054 -8.423 -8.807 -9.016 -9.362 -9.707 -9.97 -10.251 -10.832 -11.148 -11.526 -11.93 -12.368 -12.956 -13.649 -15.849 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index fd18182d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31384 ,TETRA ,17585594,Sat Nov 27 14:03:47 CET,Sat Nov 27 16:20:29 CET,0.0 0.337 0.607 0.824 1.0 1.177 1.334 1.484 1.782 1.909 2.032 2.155 2.381 2.486 2.694 2.892 3.063 3.145 3.304 3.44 3.63 3.752 3.879 4.073 4.247 4.411 4.569 4.728 4.934 5.117 5.286 5.492 5.688 5.87 6.077 6.315 6.543 6.782 7.063 7.368 7.663 7.968 8.297 8.617 8.962 9.29 9.575 9.816 10.018 10.024 9.506 8.428 7.293 6.187 5.225 4.331 3.485 2.719 2.055 1.358 0.722 0.139 -0.435 -0.972 -1.473 -1.958 -2.485 -2.946 -3.334 -3.729 -4.122 -4.422 -4.733 -5.083 -5.358 -5.647 -5.962 -6.281 -6.611 -6.879 -7.163 -7.57 -7.88 -8.211 -8.368 -8.689 -9.037 -9.4 -9.581 -9.887 -10.176 -10.389 -10.604 -11.075 -11.329 -11.615 -11.936 -12.277 -12.705 -13.355 -15.034 -2 ,25258 ,TETRA ,17585595,Sat Nov 27 14:03:48 CET,Sat Nov 27 16:13:11 CET,0.0 0.395 0.578 0.758 0.923 1.075 1.205 1.315 1.529 1.63 1.73 1.842 2.063 2.162 2.365 2.541 2.699 2.778 2.922 3.055 3.257 3.381 3.508 3.705 3.89 4.062 4.233 4.4 4.605 4.805 4.989 5.197 5.408 5.613 5.822 6.052 6.289 6.551 6.811 7.067 7.353 7.674 8.002 8.295 8.601 8.897 9.201 9.503 9.723 9.727 9.286 8.272 7.262 6.35 5.476 4.6 3.755 2.946 2.225 1.495 0.912 0.406 -0.094 -0.563 -1.026 -1.494 -1.987 -2.397 -2.754 -3.141 -3.54 -3.874 -4.243 -4.643 -4.941 -5.243 -5.558 -5.873 -6.212 -6.452 -6.708 -7.117 -7.387 -7.654 -7.796 -8.121 -8.493 -8.896 -9.095 -9.408 -9.691 -9.9 -10.123 -10.638 -10.929 -11.238 -11.592 -12.029 -12.563 -13.352 -15.818 -3 ,27418 ,TETRA ,17585596,Sat Nov 27 14:03:47 CET,Sat Nov 27 16:11:29 CET,0.0 0.338 0.548 0.758 0.935 1.092 1.235 1.367 1.599 1.717 1.831 1.935 2.163 2.274 2.475 2.662 2.842 2.928 3.1 3.265 3.495 3.647 3.788 3.993 4.188 4.377 4.556 4.722 4.941 5.16 5.37 5.609 5.829 6.031 6.275 6.55 6.789 7.033 7.282 7.535 7.806 8.115 8.448 8.751 9.076 9.395 9.72 10.005 10.201 10.218 9.839 8.954 7.931 6.938 6.025 5.119 4.279 3.534 2.901 2.22 1.603 1.038 0.513 0.048 -0.38 -0.773 -1.213 -1.627 -2.012 -2.42 -2.831 -3.16 -3.503 -3.862 -4.156 -4.473 -4.807 -5.157 -5.527 -5.794 -6.068 -6.513 -6.814 -7.109 -7.264 -7.569 -7.903 -8.257 -8.448 -8.796 -9.139 -9.378 -9.639 -10.225 -10.541 -10.877 -11.287 -11.791 -12.366 -13.09 -15.318 -4 ,9545 ,TETRA ,17585597,Sat Nov 27 14:03:47 CET,Sat Nov 27 16:12:43 CET,0.0 0.256 0.479 0.712 0.936 1.115 1.258 1.391 1.651 1.775 1.899 2.015 2.248 2.36 2.576 2.777 2.971 3.066 3.247 3.412 3.644 3.793 3.939 4.14 4.318 4.497 4.669 4.832 5.047 5.264 5.473 5.706 5.933 6.158 6.407 6.682 6.951 7.235 7.521 7.796 8.069 8.39 8.727 9.012 9.337 9.679 9.986 10.246 10.431 10.419 10.054 9.211 8.218 7.242 6.347 5.512 4.755 4.045 3.396 2.75 2.186 1.647 1.154 0.677 0.21 -0.223 -0.7 -1.141 -1.517 -1.897 -2.297 -2.635 -2.984 -3.346 -3.632 -3.934 -4.263 -4.607 -4.975 -5.24 -5.508 -5.911 -6.171 -6.438 -6.583 -6.882 -7.189 -7.504 -7.676 -7.979 -8.271 -8.472 -8.662 -9.096 -9.363 -9.683 -10.005 -10.333 -10.74 -11.293 -12.601 -5 ,10469 ,TETRA ,17585598,Sat Nov 27 14:03:49 CET,Sat Nov 27 16:12:25 CET,0.0 0.373 0.59 0.783 0.967 1.139 1.294 1.44 1.712 1.835 1.953 2.057 2.272 2.377 2.564 2.74 2.925 3.016 3.187 3.346 3.57 3.713 3.846 4.034 4.215 4.394 4.559 4.71 4.916 5.117 5.306 5.524 5.726 5.929 6.168 6.438 6.694 6.961 7.233 7.521 7.804 8.128 8.492 8.81 9.171 9.509 9.8 10.08 10.278 10.273 9.887 8.986 7.925 6.884 5.967 5.144 4.419 3.721 3.076 2.4 1.794 1.264 0.737 0.218 -0.26 -0.692 -1.134 -1.54 -1.938 -2.355 -2.753 -3.095 -3.485 -3.906 -4.235 -4.568 -4.906 -5.263 -5.62 -5.864 -6.118 -6.517 -6.798 -7.094 -7.255 -7.563 -7.872 -8.202 -8.37 -8.682 -8.957 -9.161 -9.38 -9.848 -10.081 -10.347 -10.713 -11.152 -11.683 -12.394 -14.933 -6 ,11189 ,TETRA ,17585599,Sat Nov 27 14:03:47 CET,Sat Nov 27 16:11:52 CET,0.0 0.467 0.741 0.914 1.07 1.231 1.382 1.516 1.763 1.889 2.009 2.121 2.341 2.439 2.629 2.802 2.968 3.052 3.222 3.389 3.615 3.755 3.891 4.078 4.251 4.427 4.603 4.777 5.001 5.203 5.403 5.66 5.905 6.126 6.369 6.643 6.903 7.176 7.452 7.739 8.03 8.336 8.664 8.961 9.3 9.652 10.008 10.324 10.527 10.473 9.918 8.838 7.761 6.721 5.802 4.963 4.162 3.434 2.796 2.125 1.51 0.931 0.392 -0.093 -0.551 -0.99 -1.454 -1.873 -2.252 -2.652 -3.062 -3.401 -3.793 -4.228 -4.547 -4.866 -5.199 -5.541 -5.896 -6.132 -6.371 -6.771 -7.048 -7.341 -7.496 -7.822 -8.166 -8.53 -8.728 -9.066 -9.396 -9.616 -9.838 -10.335 -10.627 -10.947 -11.296 -11.669 -12.138 -12.793 -14.689 -7 ,19963 ,TETRA ,17585600,Sat Nov 27 14:03:48 CET,Sat Nov 27 16:12:51 CET,0.0 0.315 0.506 0.682 0.862 1.047 1.222 1.388 1.681 1.814 1.938 2.05 2.269 2.37 2.571 2.761 2.939 3.024 3.197 3.363 3.595 3.744 3.884 4.08 4.267 4.45 4.619 4.782 4.996 5.185 5.363 5.585 5.795 6.011 6.267 6.526 6.757 7.006 7.251 7.508 7.792 8.1 8.433 8.734 9.045 9.366 9.692 9.934 10.071 10.001 9.407 8.356 7.287 6.21 5.22 4.286 3.449 2.722 2.079 1.395 0.776 0.213 -0.332 -0.844 -1.303 -1.727 -2.2 -2.624 -2.992 -3.371 -3.756 -4.086 -4.436 -4.799 -5.097 -5.407 -5.709 -6.043 -6.426 -6.691 -6.962 -7.382 -7.686 -7.995 -8.138 -8.438 -8.769 -9.149 -9.351 -9.672 -9.996 -10.237 -10.487 -11.023 -11.313 -11.647 -12.03 -12.472 -12.973 -13.612 -15.205 -8 ,6988 ,TETRA ,17585601,Sat Nov 27 14:03:51 CET,Sat Nov 27 16:12:45 CET,0.0 0.411 0.694 0.905 1.092 1.274 1.431 1.578 1.832 1.941 2.056 2.165 2.371 2.458 2.64 2.823 2.998 3.085 3.261 3.428 3.651 3.797 3.936 4.13 4.325 4.512 4.689 4.853 5.057 5.249 5.436 5.666 5.874 6.062 6.283 6.536 6.776 7.046 7.328 7.597 7.866 8.159 8.482 8.784 9.081 9.394 9.736 9.997 10.156 10.154 9.691 8.721 7.737 6.729 5.763 4.881 4.096 3.372 2.761 2.116 1.522 0.977 0.476 0.019 -0.423 -0.836 -1.276 -1.674 -2.026 -2.396 -2.824 -3.202 -3.571 -3.928 -4.195 -4.472 -4.747 -5.036 -5.36 -5.589 -5.825 -6.181 -6.43 -6.696 -6.829 -7.134 -7.491 -7.856 -8.05 -8.382 -8.698 -8.933 -9.19 -9.725 -9.991 -10.269 -10.57 -10.923 -11.314 -11.776 -13.042 -9 ,17987 ,TETRA ,17585602,Sat Nov 27 14:03:49 CET,Sat Nov 27 16:12:11 CET,0.0 0.444 0.664 0.862 1.046 1.211 1.371 1.521 1.782 1.898 2.008 2.128 2.35 2.447 2.624 2.797 2.969 3.053 3.209 3.354 3.57 3.717 3.854 4.043 4.231 4.412 4.584 4.747 4.945 5.136 5.325 5.552 5.764 5.96 6.189 6.449 6.691 6.944 7.22 7.495 7.773 8.086 8.429 8.756 9.12 9.488 9.841 10.139 10.348 10.346 9.872 8.878 7.879 6.952 6.035 5.123 4.282 3.508 2.83 2.159 1.586 1.058 0.551 0.081 -0.362 -0.797 -1.249 -1.644 -2.005 -2.372 -2.751 -3.075 -3.418 -3.789 -4.068 -4.333 -4.625 -4.953 -5.303 -5.551 -5.803 -6.202 -6.471 -6.747 -6.893 -7.19 -7.495 -7.831 -8.01 -8.311 -8.597 -8.808 -9.037 -9.54 -9.821 -10.134 -10.493 -10.883 -11.378 -12.115 -14.603 -10 ,6181 ,TETRA ,17585603,Sat Nov 27 14:03:51 CET,Sat Nov 27 16:11:53 CET,0.0 0.362 0.62 0.836 1.022 1.19 1.343 1.481 1.738 1.867 2.002 2.135 2.358 2.463 2.661 2.852 3.038 3.129 3.303 3.469 3.705 3.858 4.003 4.205 4.415 4.62 4.798 4.964 5.173 5.365 5.538 5.747 5.954 6.154 6.376 6.624 6.866 7.112 7.377 7.658 7.927 8.215 8.553 8.86 9.169 9.481 9.787 10.059 10.224 10.189 9.643 8.564 7.516 6.517 5.609 4.735 3.924 3.179 2.505 1.855 1.311 0.817 0.332 -0.144 -0.592 -1.023 -1.481 -1.882 -2.234 -2.614 -3.019 -3.336 -3.666 -4.033 -4.306 -4.584 -4.887 -5.211 -5.543 -5.764 -6.006 -6.391 -6.646 -6.906 -7.043 -7.341 -7.656 -7.981 -8.172 -8.505 -8.841 -9.089 -9.338 -9.935 -10.309 -10.666 -11.024 -11.475 -12.01 -12.667 -14.332 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 84e618bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21165 ,TETRA ,17585604,Sat Nov 27 14:03:50 CET,Sat Nov 27 15:49:06 CET,0.0 2.159 2.77 3.188 3.526 3.84 4.116 4.357 4.782 4.977 5.167 5.397 5.696 5.856 6.138 6.404 6.675 6.806 7.056 7.293 7.609 7.813 8.022 8.317 8.585 8.848 9.106 9.35 9.667 9.975 10.275 10.629 10.959 11.282 11.659 12.067 12.453 12.871 13.306 13.762 14.255 14.811 15.41 16.007 16.693 17.368 18.061 18.762 19.465 19.935 20.006 19.507 18.519 17.533 16.66 15.781 14.966 14.195 13.531 12.861 12.272 11.719 11.186 10.699 10.22 9.772 9.3 8.874 8.525 8.167 7.784 7.446 7.102 6.759 6.488 6.218 5.934 5.632 5.325 5.112 4.885 4.525 4.28 4.017 3.88 3.595 3.297 2.971 2.796 2.49 2.256 2.052 1.843 1.376 1.112 0.826 0.508 0.144 -0.273 -0.832 -2.43 -2 ,7650 ,TETRA ,17585605,Sat Nov 27 14:03:50 CET,Sat Nov 27 15:47:29 CET,0.0 1.968 2.567 2.981 3.319 3.638 3.914 4.161 4.598 4.796 4.997 5.243 5.544 5.704 6.003 6.293 6.56 6.682 6.917 7.148 7.491 7.706 7.902 8.192 8.465 8.719 8.965 9.217 9.557 9.87 10.168 10.519 10.841 11.163 11.543 11.965 12.366 12.787 13.219 13.651 14.116 14.652 15.244 15.833 16.492 17.187 17.957 18.721 19.405 19.981 20.151 19.506 18.57 17.607 16.673 15.751 14.918 14.146 13.474 12.781 12.154 11.606 11.078 10.57 10.085 9.645 9.175 8.754 8.405 8.026 7.634 7.309 6.981 6.647 6.381 6.105 5.815 5.506 5.182 4.954 4.719 4.368 4.125 3.87 3.741 3.473 3.176 2.859 2.687 2.37 2.144 1.962 1.743 1.246 0.974 0.677 0.362 0.014 -0.437 -1.033 -2.451 -3 ,10202 ,TETRA ,17585606,Sat Nov 27 14:03:50 CET,Sat Nov 27 15:47:07 CET,0.0 1.832 2.37 2.78 3.126 3.432 3.696 3.933 4.346 4.539 4.721 4.915 5.194 5.347 5.655 5.932 6.182 6.304 6.535 6.767 7.1 7.304 7.514 7.809 8.089 8.368 8.631 8.879 9.197 9.505 9.796 10.153 10.496 10.817 11.158 11.535 11.926 12.358 12.801 13.266 13.755 14.298 14.903 15.457 16.058 16.691 17.41 18.206 18.943 19.461 19.552 18.905 17.911 16.854 15.876 14.924 14.091 13.308 12.569 11.865 11.249 10.652 10.079 9.555 9.084 8.657 8.224 7.826 7.471 7.084 6.67 6.335 5.982 5.627 5.361 5.065 4.75 4.437 4.112 3.891 3.663 3.301 3.056 2.79 2.649 2.375 2.085 1.746 1.571 1.267 1.043 0.851 0.644 0.191 -0.06 -0.347 -0.656 -0.997 -1.429 -1.997 -3.326 -4 ,20239 ,TETRA ,17585607,Sat Nov 27 14:03:50 CET,Sat Nov 27 15:47:05 CET,0.0 2.064 2.658 3.054 3.419 3.738 4.012 4.268 4.708 4.9 5.087 5.31 5.608 5.769 6.052 6.316 6.585 6.713 6.951 7.188 7.54 7.75 7.949 8.247 8.529 8.788 9.043 9.293 9.605 9.91 10.205 10.546 10.859 11.165 11.533 11.952 12.362 12.791 13.235 13.695 14.179 14.704 15.295 15.897 16.523 17.168 17.889 18.614 19.35 19.922 19.962 19.145 18.159 17.183 16.174 15.251 14.451 13.673 12.971 12.264 11.636 11.057 10.52 10.013 9.529 9.079 8.602 8.174 7.815 7.448 7.068 6.746 6.394 6.025 5.742 5.455 5.154 4.838 4.507 4.273 4.029 3.649 3.389 3.133 2.994 2.701 2.411 2.092 1.928 1.626 1.401 1.209 1.0 0.553 0.294 0.018 -0.278 -0.636 -1.058 -1.624 -3.104 -5 ,20277 ,TETRA ,17585608,Sat Nov 27 14:03:50 CET,Sat Nov 27 15:47:59 CET,0.0 1.597 2.268 2.695 3.049 3.34 3.595 3.844 4.266 4.454 4.638 4.872 5.163 5.316 5.618 5.902 6.181 6.32 6.578 6.82 7.161 7.369 7.564 7.851 8.119 8.379 8.642 8.887 9.2 9.514 9.822 10.181 10.5 10.794 11.144 11.53 11.885 12.283 12.701 13.146 13.623 14.142 14.73 15.284 15.89 16.518 17.164 17.816 18.5 19.057 19.153 18.551 17.699 16.768 15.892 15.052 14.257 13.494 12.824 12.139 11.554 11.052 10.574 10.105 9.648 9.239 8.832 8.456 8.117 7.775 7.42 7.122 6.807 6.477 6.22 5.949 5.672 5.386 5.094 4.887 4.661 4.314 4.081 3.826 3.688 3.417 3.121 2.799 2.626 2.319 2.079 1.87 1.644 1.158 0.901 0.643 0.37 0.052 -0.302 -0.812 -2.459 -6 ,22938 ,TETRA ,17585609,Sat Nov 27 14:03:50 CET,Sat Nov 27 15:50:04 CET,0.0 2.087 2.737 3.181 3.537 3.876 4.185 4.452 4.902 5.106 5.298 5.511 5.809 5.966 6.257 6.52 6.764 6.889 7.131 7.368 7.714 7.932 8.137 8.415 8.677 8.936 9.194 9.44 9.742 10.028 10.316 10.669 10.996 11.317 11.685 12.076 12.454 12.889 13.334 13.814 14.335 14.883 15.494 16.078 16.721 17.413 18.194 18.97 19.634 20.139 20.258 19.574 18.624 17.642 16.668 15.71 14.855 14.033 13.278 12.528 11.901 11.348 10.811 10.303 9.833 9.401 8.936 8.534 8.189 7.811 7.419 7.089 6.743 6.382 6.109 5.832 5.531 5.222 4.912 4.694 4.462 4.104 3.85 3.58 3.438 3.137 2.831 2.524 2.355 2.04 1.795 1.593 1.385 0.927 0.674 0.406 0.096 -0.255 -0.689 -1.3 -2.832 -7 ,2277 ,TETRA ,17585610,Sat Nov 27 14:03:50 CET,Sat Nov 27 15:47:49 CET,0.0 2.177 2.798 3.262 3.63 3.956 4.224 4.468 4.92 5.124 5.314 5.539 5.838 5.994 6.288 6.554 6.811 6.937 7.179 7.413 7.742 7.951 8.154 8.451 8.747 9.031 9.287 9.519 9.807 10.086 10.359 10.681 10.986 11.275 11.64 12.048 12.401 12.804 13.219 13.621 14.04 14.503 15.043 15.569 16.122 16.705 17.367 18.076 18.744 19.312 19.547 19.041 18.202 17.319 16.457 15.62 14.875 14.169 13.515 12.841 12.277 11.779 11.282 10.817 10.381 9.966 9.549 9.164 8.815 8.462 8.095 7.791 7.469 7.132 6.88 6.609 6.318 6.019 5.709 5.493 5.264 4.902 4.651 4.393 4.258 3.96 3.63 3.288 3.112 2.802 2.57 2.371 2.149 1.66 1.391 1.108 0.809 0.461 0.014 -0.55 -2.094 -8 ,22854 ,TETRA ,17585611,Sat Nov 27 14:03:50 CET,Sat Nov 27 15:47:31 CET,0.0 1.713 2.272 2.72 3.079 3.379 3.645 3.884 4.32 4.529 4.714 4.928 5.237 5.401 5.705 5.984 6.246 6.373 6.615 6.85 7.196 7.431 7.655 7.953 8.234 8.504 8.766 9.03 9.369 9.675 9.97 10.327 10.655 10.978 11.35 11.757 12.143 12.563 13.023 13.499 13.992 14.539 15.12 15.675 16.325 17.03 17.79 18.583 19.335 19.857 19.898 19.252 18.343 17.324 16.342 15.422 14.56 13.766 13.063 12.345 11.742 11.21 10.686 10.175 9.693 9.261 8.811 8.398 8.051 7.679 7.278 6.956 6.635 6.297 6.022 5.741 5.447 5.132 4.802 4.58 4.348 3.975 3.718 3.444 3.299 3.007 2.708 2.4 2.238 1.932 1.682 1.482 1.281 0.856 0.615 0.344 0.05 -0.309 -0.737 -1.311 -2.895 -9 ,14467 ,TETRA ,17585612,Sat Nov 27 14:03:52 CET,Sat Nov 27 15:47:06 CET,0.0 2.377 3.03 3.447 3.773 4.065 4.348 4.609 5.068 5.272 5.453 5.663 5.957 6.107 6.372 6.614 6.857 6.978 7.216 7.449 7.787 7.998 8.205 8.507 8.786 9.057 9.324 9.561 9.874 10.198 10.499 10.844 11.185 11.517 11.889 12.302 12.69 13.109 13.564 14.013 14.481 15.009 15.587 16.176 16.821 17.504 18.25 18.926 19.542 19.993 19.977 19.249 18.29 17.287 16.267 15.296 14.441 13.643 12.943 12.242 11.635 11.08 10.527 9.979 9.49 9.074 8.648 8.27 7.938 7.572 7.185 6.863 6.555 6.246 5.994 5.734 5.454 5.161 4.868 4.67 4.462 4.123 3.884 3.63 3.5 3.24 2.957 2.639 2.468 2.147 1.882 1.678 1.464 1.026 0.765 0.471 0.164 -0.175 -0.604 -1.208 -2.621 -10 ,1244 ,TETRA ,17585613,Sat Nov 27 14:03:50 CET,Sat Nov 27 15:48:51 CET,0.0 2.073 2.632 3.026 3.387 3.693 3.983 4.247 4.671 4.866 5.053 5.266 5.554 5.696 5.964 6.234 6.498 6.625 6.865 7.091 7.421 7.643 7.86 8.162 8.441 8.713 8.979 9.228 9.553 9.869 10.174 10.536 10.87 11.201 11.586 12.009 12.415 12.857 13.312 13.794 14.279 14.801 15.389 15.952 16.601 17.302 18.033 18.74 19.458 20.048 20.134 19.457 18.431 17.347 16.375 15.471 14.609 13.829 13.151 12.459 11.861 11.315 10.792 10.274 9.786 9.341 8.881 8.481 8.123 7.75 7.382 7.084 6.766 6.419 6.152 5.875 5.577 5.269 4.94 4.717 4.478 4.089 3.831 3.571 3.438 3.148 2.848 2.533 2.359 2.042 1.78 1.571 1.354 0.88 0.614 0.324 0.004 -0.359 -0.84 -1.408 -2.874 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt deleted file mode 100644 index 6826b600..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6678 ,TETRA ,17585614,Sat Nov 27 14:03:49 CET,Sat Nov 27 15:56:02 CET,0.0 2.617 3.395 3.918 4.399 4.809 5.172 5.536 6.234 6.537 6.802 7.038 7.541 7.767 8.194 8.614 9.0 9.175 9.516 9.84 10.289 10.593 10.894 11.292 11.655 11.996 12.29 12.559 12.948 13.351 13.748 14.232 14.708 15.176 15.682 16.255 16.846 17.446 18.019 18.545 19.034 19.523 20.052 20.586 21.14 21.663 22.172 22.56 22.731 22.683 21.927 20.393 18.931 17.559 16.267 15.003 13.844 12.786 11.839 10.884 10.067 9.309 8.563 7.882 7.249 6.66 6.035 5.444 4.925 4.413 3.898 3.454 2.965 2.444 2.029 1.598 1.149 0.697 0.242 -0.08 -0.409 -0.909 -1.246 -1.606 -1.796 -2.194 -2.635 -3.109 -3.376 -3.92 -4.194 -4.5 -4.818 -5.513 -5.917 -6.352 -6.813 -7.318 -7.885 -8.672 -12.921 -2 ,30227 ,TETRA ,17585615,Sat Nov 27 14:03:49 CET,Sat Nov 27 15:54:57 CET,0.0 2.233 3.014 3.603 4.113 4.54 4.93 5.289 5.841 6.101 6.362 6.552 7.012 7.209 7.595 7.95 8.308 8.483 8.803 9.102 9.512 9.77 10.027 10.403 10.754 11.065 11.347 11.628 12.036 12.458 12.836 13.256 13.642 14.014 14.422 14.868 15.306 15.754 16.209 16.703 17.194 17.699 18.253 18.791 19.407 20.014 20.593 21.106 21.441 21.401 20.704 19.197 17.754 16.443 15.078 13.76 12.627 11.582 10.647 9.668 8.813 8.054 7.306 6.584 5.886 5.252 4.601 4.005 3.497 2.977 2.443 1.986 1.475 0.882 0.405 -0.04 -0.458 -0.898 -1.378 -1.712 -2.066 -2.624 -3.031 -3.454 -3.668 -4.153 -4.665 -5.192 -5.473 -6.038 -6.386 -6.707 -7.044 -7.793 -8.224 -8.693 -9.228 -9.809 -10.445 -11.279 -13.69 -3 ,29286 ,TETRA ,17585616,Sat Nov 27 14:04:17 CET,Sat Nov 27 15:54:45 CET,0.0 2.695 3.49 4.158 4.672 5.1 5.485 5.83 6.483 6.785 7.058 7.287 7.78 8.002 8.452 8.874 9.256 9.438 9.794 10.134 10.578 10.851 11.115 11.494 11.871 12.212 12.535 12.85 13.25 13.632 13.968 14.37 14.76 15.105 15.494 15.948 16.377 16.828 17.288 17.773 18.243 18.74 19.305 19.802 20.319 20.84 21.42 21.953 22.288 22.29 21.579 20.176 18.732 17.304 15.993 14.782 13.678 12.68 11.799 10.868 10.032 9.265 8.506 7.766 7.085 6.458 5.802 5.207 4.68 4.143 3.573 3.079 2.575 2.049 1.628 1.192 0.736 0.256 -0.241 -0.583 -0.942 -1.534 -1.936 -2.329 -2.534 -2.954 -3.39 -3.862 -4.108 -4.635 -4.913 -5.211 -5.533 -6.262 -6.656 -7.076 -7.561 -8.111 -8.787 -9.703 -12.239 -4 ,28499 ,TETRA ,17585617,Sat Nov 27 14:04:17 CET,Sat Nov 27 15:55:53 CET,0.0 3.493 4.386 5.079 5.657 6.174 6.613 6.973 7.589 7.886 8.17 8.442 8.959 9.183 9.581 9.961 10.31 10.472 10.771 11.073 11.515 11.767 12.002 12.346 12.674 12.989 13.283 13.559 13.928 14.298 14.641 15.037 15.407 15.755 16.165 16.612 17.004 17.411 17.855 18.33 18.791 19.298 19.874 20.411 20.985 21.551 22.074 22.519 22.773 22.716 22.017 20.593 19.107 17.617 16.238 14.953 13.777 12.696 11.757 10.838 10.036 9.309 8.587 7.865 7.207 6.622 5.992 5.443 4.984 4.5 3.971 3.531 3.072 2.571 2.184 1.806 1.412 0.974 0.497 0.163 -0.18 -0.703 -1.049 -1.422 -1.636 -2.084 -2.526 -2.984 -3.223 -3.74 -3.996 -4.287 -4.571 -5.184 -5.544 -5.952 -6.44 -6.999 -7.659 -8.57 -11.082 -5 ,18730 ,TETRA ,17585618,Sat Nov 27 14:04:17 CET,Sat Nov 27 15:56:35 CET,0.0 2.339 3.063 3.675 4.182 4.629 5.042 5.404 6.016 6.295 6.551 6.784 7.281 7.523 7.985 8.394 8.772 8.942 9.268 9.593 10.056 10.343 10.604 10.974 11.342 11.68 12.007 12.328 12.726 13.094 13.44 13.864 14.254 14.621 15.072 15.589 16.064 16.553 17.019 17.478 17.944 18.463 19.051 19.582 20.162 20.736 21.297 21.76 22.065 22.082 21.461 19.979 18.397 16.916 15.566 14.313 13.138 12.069 11.207 10.315 9.466 8.688 7.953 7.292 6.667 6.079 5.469 4.904 4.437 3.956 3.427 2.971 2.509 2.048 1.688 1.31 0.889 0.428 -0.065 -0.401 -0.733 -1.263 -1.633 -2.018 -2.224 -2.644 -3.082 -3.566 -3.823 -4.355 -4.657 -4.965 -5.31 -6.088 -6.497 -6.922 -7.394 -7.966 -8.642 -9.522 -12.411 -6 ,11199 ,TETRA ,17585619,Sat Nov 27 14:04:17 CET,Sat Nov 27 15:54:28 CET,0.0 2.586 3.381 4.075 4.622 5.103 5.534 5.921 6.627 6.962 7.28 7.57 8.093 8.322 8.713 9.066 9.386 9.537 9.83 10.117 10.541 10.808 11.057 11.41 11.745 12.069 12.373 12.662 13.039 13.398 13.736 14.129 14.496 14.847 15.241 15.668 16.051 16.469 16.923 17.37 17.847 18.362 18.938 19.524 20.131 20.7 21.246 21.705 22.005 22.001 21.415 20.111 18.666 17.305 16.058 14.896 13.787 12.709 11.777 10.85 10.029 9.327 8.691 8.049 7.426 6.853 6.248 5.703 5.231 4.729 4.206 3.78 3.341 2.875 2.498 2.113 1.7 1.209 0.67 0.295 -0.093 -0.68 -1.088 -1.484 -1.678 -2.077 -2.491 -2.942 -3.191 -3.735 -4.02 -4.3 -4.596 -5.265 -5.643 -6.096 -6.602 -7.127 -7.749 -8.785 -12.688 -7 ,27050 ,TETRA ,17585620,Sat Nov 27 14:04:17 CET,Sat Nov 27 15:54:51 CET,0.0 1.932 2.707 3.266 3.717 4.149 4.539 4.866 5.448 5.741 6.034 6.295 6.798 7.023 7.434 7.792 8.144 8.331 8.672 8.969 9.39 9.681 9.967 10.354 10.71 11.047 11.365 11.673 12.075 12.454 12.815 13.245 13.649 14.011 14.41 14.838 15.242 15.693 16.154 16.625 17.111 17.642 18.2 18.714 19.318 19.85 20.327 20.832 21.246 21.352 20.861 19.6 18.181 16.833 15.537 14.272 13.129 12.091 11.16 10.226 9.41 8.666 7.95 7.286 6.679 6.108 5.497 4.948 4.489 4.012 3.49 3.05 2.59 2.102 1.72 1.32 0.902 0.463 -0.012 -0.345 -0.686 -1.243 -1.628 -2.018 -2.229 -2.667 -3.117 -3.598 -3.844 -4.376 -4.681 -4.997 -5.322 -5.994 -6.38 -6.822 -7.304 -7.848 -8.537 -9.508 -12.438 -8 ,86 ,TETRA ,17585621,Sat Nov 27 14:04:17 CET,Sat Nov 27 15:54:10 CET,0.0 2.715 3.544 4.174 4.684 5.101 5.466 5.8 6.447 6.734 7.013 7.287 7.787 8.012 8.461 8.879 9.27 9.455 9.783 10.109 10.597 10.886 11.168 11.597 12.008 12.408 12.802 13.179 13.634 14.037 14.427 14.899 15.298 15.672 16.09 16.534 16.964 17.403 17.858 18.323 18.811 19.377 19.971 20.528 21.125 21.716 22.27 22.733 23.069 23.084 22.397 20.863 19.186 17.699 16.424 15.186 14.059 13.023 12.141 11.275 10.498 9.752 9.011 8.338 7.706 7.108 6.503 5.959 5.484 4.996 4.462 4.019 3.59 3.143 2.786 2.386 1.935 1.482 0.986 0.629 0.284 -0.248 -0.626 -1.012 -1.216 -1.645 -2.101 -2.61 -2.87 -3.414 -3.717 -4.015 -4.324 -5.022 -5.443 -5.888 -6.348 -6.905 -7.612 -8.487 -10.735 -9 ,13575 ,TETRA ,17585622,Sat Nov 27 14:04:17 CET,Sat Nov 27 15:55:06 CET,0.0 2.938 3.774 4.443 4.968 5.438 5.867 6.229 6.892 7.198 7.475 7.672 8.15 8.368 8.762 9.091 9.389 9.552 9.875 10.158 10.577 10.836 11.077 11.453 11.804 12.108 12.399 12.7 13.131 13.565 13.935 14.331 14.696 15.028 15.416 15.861 16.292 16.757 17.214 17.656 18.101 18.608 19.147 19.651 20.212 20.764 21.318 21.801 22.098 22.105 21.453 20.036 18.506 17.042 15.714 14.459 13.328 12.29 11.373 10.411 9.577 8.86 8.145 7.451 6.8 6.198 5.564 4.999 4.524 4.024 3.478 3.008 2.547 2.062 1.673 1.289 0.901 0.46 -0.024 -0.352 -0.689 -1.22 -1.604 -2.013 -2.216 -2.637 -3.09 -3.539 -3.779 -4.314 -4.631 -4.947 -5.255 -5.9 -6.282 -6.709 -7.153 -7.657 -8.296 -9.17 -12.307 -10 ,17548 ,TETRA ,17585623,Sat Nov 27 14:05:16 CET,Sat Nov 27 15:56:06 CET,0.0 3.27 4.226 4.902 5.447 5.87 6.222 6.584 7.224 7.509 7.785 8.007 8.497 8.716 9.115 9.481 9.817 9.975 10.294 10.601 11.026 11.296 11.554 11.939 12.314 12.666 12.987 13.283 13.686 14.074 14.421 14.833 15.23 15.611 16.042 16.504 16.94 17.377 17.833 18.309 18.771 19.307 19.923 20.472 21.043 21.587 22.106 22.627 22.987 23.031 22.535 21.264 19.799 18.383 17.08 15.87 14.797 13.79 12.899 12.013 11.229 10.525 9.842 9.156 8.523 7.939 7.301 6.748 6.283 5.787 5.26 4.808 4.335 3.847 3.461 3.07 2.646 2.19 1.719 1.377 1.035 0.503 0.101 -0.316 -0.531 -0.982 -1.447 -1.934 -2.192 -2.734 -3.002 -3.288 -3.595 -4.304 -4.701 -5.119 -5.605 -6.173 -6.877 -7.767 -10.396 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt deleted file mode 100644 index c6c07214..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6440 ,TETRA ,17585624,Sat Nov 27 14:05:17 CET,Sat Nov 27 15:55:15 CET,0.0 1.574 2.211 2.757 3.238 3.66 4.056 4.416 5.051 5.346 5.633 5.907 6.421 6.661 7.132 7.564 7.977 8.179 8.57 8.947 9.486 9.836 10.175 10.676 11.165 11.642 12.092 12.523 13.066 13.574 14.093 14.732 15.334 15.894 16.525 17.23 17.915 18.668 19.442 20.248 21.085 21.985 23.005 24.055 25.272 26.507 27.699 28.869 30.045 30.967 31.062 29.915 28.471 27.027 25.497 23.866 22.429 21.097 19.888 18.677 17.622 16.66 15.74 14.869 14.051 13.296 12.505 11.813 11.22 10.611 9.975 9.44 8.89 8.325 7.885 7.426 6.961 6.476 5.959 5.604 5.241 4.692 4.311 3.895 3.672 3.224 2.772 2.303 2.053 1.519 1.23 0.926 0.609 -0.061 -0.411 -0.772 -1.195 -1.685 -2.248 -2.927 -4.751 -2 ,10590 ,TETRA ,17585625,Sat Nov 27 14:05:17 CET,Sat Nov 27 15:54:47 CET,0.0 1.978 2.778 3.361 3.821 4.25 4.652 4.988 5.588 5.876 6.154 6.414 6.926 7.178 7.652 8.096 8.527 8.734 9.124 9.499 10.049 10.401 10.746 11.244 11.706 12.149 12.597 13.035 13.591 14.106 14.603 15.213 15.79 16.327 16.923 17.608 18.285 19.018 19.799 20.641 21.517 22.455 23.49 24.526 25.65 26.791 28.062 29.295 30.342 31.091 31.119 29.919 28.247 26.439 24.739 23.127 21.672 20.387 19.254 18.05 16.97 15.991 15.078 14.22 13.402 12.659 11.897 11.219 10.616 9.969 9.301 8.756 8.184 7.598 7.147 6.687 6.215 5.717 5.195 4.835 4.461 3.874 3.487 3.088 2.873 2.43 1.97 1.487 1.231 0.698 0.432 0.143 -0.158 -0.8 -1.151 -1.534 -1.965 -2.43 -3.01 -3.754 -5.786 -3 ,8066 ,TETRA ,17585626,Sat Nov 27 14:05:17 CET,Sat Nov 27 15:55:32 CET,0.0 1.665 2.404 2.969 3.457 3.885 4.263 4.621 5.242 5.527 5.81 6.085 6.592 6.844 7.351 7.814 8.243 8.454 8.843 9.207 9.744 10.09 10.423 10.922 11.399 11.853 12.285 12.699 13.24 13.77 14.297 14.921 15.513 16.055 16.67 17.375 18.046 18.769 19.53 20.348 21.216 22.159 23.202 24.208 25.334 26.526 27.755 28.914 30.028 30.886 30.928 29.641 27.952 26.194 24.514 22.934 21.474 20.121 18.942 17.754 16.7 15.769 14.864 13.977 13.158 12.42 11.648 10.947 10.363 9.766 9.131 8.574 7.992 7.413 6.973 6.522 6.058 5.579 5.083 4.741 4.386 3.817 3.413 2.992 2.783 2.361 1.91 1.425 1.16 0.613 0.343 0.06 -0.243 -0.912 -1.272 -1.654 -2.089 -2.595 -3.178 -3.9 -5.577 -4 ,85 ,TETRA ,17585627,Sat Nov 27 14:05:17 CET,Sat Nov 27 15:58:01 CET,0.0 2.09 2.735 3.317 3.806 4.219 4.609 4.982 5.646 5.944 6.232 6.521 7.035 7.282 7.756 8.189 8.612 8.817 9.216 9.617 10.163 10.499 10.832 11.311 11.784 12.253 12.698 13.134 13.696 14.225 14.733 15.355 15.959 16.523 17.178 17.874 18.527 19.254 20.005 20.81 21.641 22.552 23.609 24.631 25.744 26.86 27.951 28.946 29.892 30.697 30.684 29.424 27.766 25.959 24.27 22.684 21.222 19.841 18.628 17.41 16.345 15.374 14.458 13.604 12.809 12.089 11.315 10.621 10.031 9.43 8.794 8.236 7.671 7.089 6.625 6.148 5.665 5.175 4.65 4.289 3.916 3.336 2.95 2.552 2.337 1.897 1.459 0.982 0.715 0.17 -0.109 -0.421 -0.743 -1.408 -1.781 -2.175 -2.593 -3.054 -3.599 -4.341 -5.846 -5 ,14289 ,TETRA ,17585628,Sat Nov 27 14:05:17 CET,Sat Nov 27 15:55:06 CET,0.0 2.063 2.698 3.244 3.691 4.043 4.368 4.705 5.327 5.611 5.89 6.181 6.717 6.963 7.423 7.861 8.28 8.484 8.884 9.259 9.794 10.148 10.492 10.979 11.459 11.925 12.366 12.789 13.323 13.839 14.349 14.957 15.546 16.085 16.685 17.385 18.066 18.813 19.592 20.393 21.218 22.111 23.131 24.102 25.151 26.26 27.464 28.736 29.855 30.598 30.767 29.848 28.434 26.768 25.038 23.411 21.977 20.634 19.453 18.226 17.144 16.168 15.262 14.403 13.588 12.861 12.101 11.421 10.819 10.206 9.586 9.064 8.526 7.946 7.475 7.011 6.537 6.04 5.525 5.167 4.806 4.255 3.876 3.486 3.283 2.854 2.407 1.928 1.673 1.147 0.887 0.589 0.267 -0.391 -0.746 -1.132 -1.556 -2.036 -2.588 -3.329 -5.509 -6 ,12447 ,TETRA ,17585629,Sat Nov 27 14:05:18 CET,Sat Nov 27 15:54:26 CET,0.0 1.866 2.538 3.106 3.582 3.976 4.358 4.72 5.381 5.682 5.963 6.241 6.746 6.978 7.456 7.913 8.351 8.569 8.976 9.368 9.925 10.286 10.646 11.145 11.613 12.074 12.513 12.937 13.503 14.034 14.534 15.149 15.745 16.296 16.906 17.602 18.281 19.013 19.8 20.604 21.425 22.344 23.353 24.32 25.474 26.705 28.025 29.364 30.594 31.492 31.588 30.473 28.846 27.163 25.559 24.006 22.58 21.26 20.086 18.854 17.783 16.82 15.893 15.055 14.293 13.593 12.836 12.159 11.579 10.957 10.291 9.746 9.195 8.64 8.219 7.778 7.313 6.816 6.298 5.957 5.61 5.044 4.648 4.24 4.025 3.572 3.109 2.621 2.355 1.812 1.514 1.218 0.932 0.305 -0.052 -0.427 -0.832 -1.287 -1.817 -2.576 -5.078 -7 ,20487 ,TETRA ,17585630,Sat Nov 27 14:05:18 CET,Sat Nov 27 15:54:37 CET,0.0 2.292 2.999 3.563 4.035 4.455 4.842 5.207 5.874 6.183 6.485 6.777 7.301 7.544 8.008 8.459 8.894 9.11 9.528 9.919 10.479 10.836 11.185 11.689 12.161 12.631 13.099 13.545 14.109 14.627 15.13 15.756 16.339 16.889 17.545 18.274 18.936 19.656 20.438 21.263 22.117 23.069 24.166 25.237 26.409 27.596 28.727 29.764 30.857 31.803 31.943 30.797 29.298 27.792 26.296 24.748 23.279 21.851 20.607 19.393 18.339 17.372 16.459 15.615 14.829 14.085 13.298 12.621 12.035 11.41 10.764 10.236 9.687 9.119 8.657 8.172 7.694 7.212 6.708 6.349 5.974 5.387 4.962 4.537 4.329 3.883 3.42 2.93 2.665 2.13 1.857 1.554 1.252 0.589 0.218 -0.15 -0.563 -1.049 -1.581 -2.204 -4.308 -8 ,4981 ,TETRA ,17585631,Sat Nov 27 14:05:20 CET,Sat Nov 27 15:55:18 CET,0.0 2.353 3.104 3.648 4.074 4.485 4.877 5.228 5.897 6.205 6.497 6.78 7.311 7.561 8.03 8.48 8.909 9.114 9.516 9.901 10.456 10.816 11.165 11.664 12.117 12.563 12.995 13.418 13.962 14.49 15.008 15.631 16.233 16.789 17.435 18.134 18.779 19.491 20.248 21.036 21.845 22.773 23.875 24.95 26.075 27.192 28.349 29.487 30.524 31.353 31.513 30.542 29.088 27.558 26.087 24.553 23.103 21.78 20.587 19.355 18.29 17.337 16.452 15.635 14.872 14.145 13.354 12.652 12.047 11.405 10.744 10.202 9.626 9.024 8.56 8.093 7.616 7.112 6.588 6.239 5.878 5.312 4.909 4.503 4.292 3.836 3.381 2.901 2.651 2.129 1.857 1.561 1.269 0.635 0.279 -0.091 -0.504 -0.963 -1.527 -2.278 -3.943 -9 ,28329 ,TETRA ,17585632,Sat Nov 27 14:05:18 CET,Sat Nov 27 15:57:59 CET,0.0 2.41 3.242 3.843 4.301 4.7 5.07 5.416 6.065 6.368 6.656 6.942 7.465 7.713 8.192 8.637 9.063 9.277 9.688 10.06 10.579 10.919 11.26 11.752 12.214 12.663 13.1 13.537 14.124 14.669 15.15 15.738 16.324 16.882 17.492 18.148 18.785 19.522 20.333 21.166 22.026 22.957 24.006 25.019 26.169 27.361 28.575 29.78 30.865 31.594 31.481 30.165 28.49 26.798 25.116 23.402 21.858 20.454 19.224 17.969 16.87 15.89 14.972 14.112 13.304 12.555 11.764 11.079 10.486 9.855 9.2 8.664 8.105 7.523 7.066 6.601 6.137 5.645 5.131 4.772 4.39 3.796 3.402 3.0 2.782 2.336 1.884 1.419 1.167 0.635 0.371 0.082 -0.217 -0.822 -1.171 -1.553 -2.015 -2.565 -3.153 -3.952 -6.066 -10 ,15626 ,TETRA ,17585633,Sat Nov 27 14:06:17 CET,Sat Nov 27 15:54:39 CET,0.0 1.954 2.684 3.245 3.712 4.148 4.549 4.915 5.616 5.922 6.199 6.461 6.976 7.23 7.717 8.161 8.591 8.804 9.207 9.592 10.119 10.452 10.787 11.29 11.795 12.27 12.707 13.128 13.667 14.194 14.715 15.328 15.901 16.463 17.151 17.894 18.568 19.292 20.073 20.905 21.774 22.72 23.759 24.806 25.933 27.073 28.244 29.278 30.292 31.192 31.394 30.394 28.934 27.253 25.639 24.087 22.576 21.161 19.91 18.619 17.524 16.593 15.681 14.798 13.992 13.256 12.471 11.768 11.156 10.518 9.86 9.332 8.793 8.212 7.752 7.285 6.808 6.299 5.768 5.419 5.072 4.538 4.159 3.757 3.546 3.112 2.675 2.211 1.965 1.437 1.159 0.864 0.553 -0.113 -0.465 -0.831 -1.251 -1.723 -2.262 -2.974 -5.616 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt deleted file mode 100644 index 3ece80de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26698 ,TETRA ,17585634,Sat Nov 27 14:06:17 CET,Sat Nov 27 15:59:11 CET,0.0 1.203 1.672 2.021 2.312 2.564 2.787 3.003 3.396 3.556 3.715 3.921 4.192 4.336 4.602 4.858 5.078 5.187 5.401 5.592 5.853 6.022 6.186 6.412 6.625 6.821 7.007 7.186 7.418 7.639 7.843 8.068 8.28 8.477 8.675 8.893 9.116 9.354 9.583 9.808 10.029 10.242 10.451 10.604 10.711 10.739 10.614 10.318 9.73 8.49 5.981 2.682 -0.159 -2.656 -4.807 -6.695 -8.341 -9.797 -11.031 -12.275 -13.34 -14.264 -15.161 -16.009 -16.78 -17.5 -18.27 -18.935 -19.493 -20.081 -20.694 -21.201 -21.733 -22.283 -22.706 -23.132 -23.566 -24.027 -24.509 -24.82 -25.131 -25.639 -25.993 -26.352 -26.538 -26.925 -27.353 -27.824 -28.063 -28.452 -28.787 -29.057 -29.342 -29.978 -30.332 -30.705 -31.088 -31.529 -32.066 -32.743 -34.369 -2 ,18357 ,TETRA ,17585635,Sat Nov 27 14:06:17 CET,Sat Nov 27 15:57:28 CET,0.0 1.233 1.73 2.117 2.438 2.703 2.937 3.143 3.504 3.682 3.851 4.037 4.293 4.434 4.693 4.924 5.146 5.26 5.471 5.668 5.953 6.116 6.26 6.47 6.671 6.852 7.029 7.211 7.441 7.654 7.857 8.097 8.323 8.531 8.742 8.962 9.188 9.434 9.668 9.9 10.102 10.295 10.515 10.678 10.762 10.789 10.705 10.393 9.794 8.57 5.94 2.544 -0.326 -2.828 -4.921 -6.805 -8.479 -9.92 -11.123 -12.272 -13.253 -14.151 -15.009 -15.807 -16.545 -17.204 -17.867 -18.454 -18.968 -19.505 -20.047 -20.496 -20.974 -21.498 -21.916 -22.336 -22.775 -23.229 -23.697 -24.027 -24.359 -24.85 -25.193 -25.552 -25.742 -26.134 -26.546 -27.004 -27.244 -27.638 -27.954 -28.219 -28.506 -29.104 -29.406 -29.763 -30.189 -30.663 -31.247 -31.962 -33.357 -3 ,19423 ,TETRA ,17585636,Sat Nov 27 14:06:17 CET,Sat Nov 27 15:57:12 CET,0.0 1.171 1.641 1.996 2.287 2.569 2.808 3.004 3.364 3.532 3.709 3.905 4.157 4.308 4.595 4.868 5.111 5.211 5.402 5.591 5.846 6.008 6.164 6.383 6.598 6.786 6.968 7.151 7.38 7.597 7.801 8.035 8.257 8.477 8.714 8.945 9.148 9.359 9.586 9.808 10.005 10.207 10.393 10.514 10.589 10.573 10.445 10.105 9.394 8.048 5.494 2.178 -0.712 -3.248 -5.392 -7.252 -8.845 -10.267 -11.542 -12.814 -13.866 -14.785 -15.654 -16.476 -17.243 -17.952 -18.703 -19.369 -19.93 -20.515 -21.127 -21.632 -22.151 -22.672 -23.086 -23.512 -23.962 -24.438 -24.918 -25.236 -25.562 -26.082 -26.431 -26.793 -27.002 -27.477 -27.971 -28.499 -28.765 -29.181 -29.613 -29.929 -30.249 -30.903 -31.286 -31.735 -32.234 -32.797 -33.459 -34.293 -36.65 -4 ,1063 ,TETRA ,17585637,Sat Nov 27 14:06:17 CET,Sat Nov 27 15:56:33 CET,0.0 1.122 1.571 1.901 2.181 2.449 2.685 2.916 3.31 3.47 3.632 3.834 4.096 4.232 4.484 4.724 4.948 5.051 5.246 5.428 5.689 5.863 6.025 6.249 6.47 6.683 6.882 7.067 7.291 7.5 7.704 7.939 8.162 8.377 8.61 8.842 9.053 9.282 9.521 9.776 10.005 10.199 10.394 10.546 10.632 10.625 10.532 10.241 9.55 8.218 5.666 2.358 -0.42 -2.909 -5.1 -7.05 -8.722 -10.208 -11.506 -12.78 -13.862 -14.815 -15.698 -16.513 -17.274 -17.979 -18.709 -19.344 -19.909 -20.499 -21.104 -21.603 -22.11 -22.634 -23.048 -23.481 -23.92 -24.37 -24.83 -25.138 -25.454 -25.948 -26.292 -26.661 -26.848 -27.228 -27.652 -28.095 -28.328 -28.729 -29.048 -29.304 -29.592 -30.227 -30.563 -30.936 -31.342 -31.81 -32.342 -32.976 -34.242 -5 ,30282 ,TETRA ,17585638,Sat Nov 27 14:06:17 CET,Sat Nov 27 16:00:11 CET,0.0 1.082 1.499 1.852 2.18 2.456 2.699 2.924 3.317 3.5 3.677 3.867 4.121 4.258 4.521 4.775 5.023 5.133 5.328 5.524 5.815 5.986 6.137 6.348 6.546 6.727 6.891 7.045 7.242 7.429 7.611 7.831 8.027 8.198 8.381 8.574 8.75 8.927 9.091 9.251 9.406 9.566 9.72 9.79 9.786 9.73 9.53 9.099 8.326 7.023 4.579 1.231 -1.711 -4.166 -6.239 -8.107 -9.736 -11.197 -12.482 -13.733 -14.777 -15.715 -16.592 -17.41 -18.19 -18.91 -19.645 -20.306 -20.893 -21.493 -22.092 -22.601 -23.131 -23.658 -24.051 -24.459 -24.906 -25.379 -25.853 -26.176 -26.51 -27.034 -27.408 -27.812 -28.017 -28.404 -28.795 -29.235 -29.469 -29.866 -30.202 -30.454 -30.72 -31.315 -31.653 -32.009 -32.4 -32.858 -33.381 -34.031 -36.114 -6 ,14823 ,TETRA ,17585639,Sat Nov 27 14:06:18 CET,Sat Nov 27 15:59:23 CET,0.0 1.511 2.007 2.394 2.695 2.956 3.201 3.43 3.84 4.012 4.165 4.342 4.588 4.712 4.969 5.221 5.455 5.556 5.748 5.936 6.192 6.359 6.529 6.771 6.998 7.209 7.401 7.593 7.83 8.035 8.244 8.499 8.742 8.974 9.206 9.434 9.652 9.89 10.135 10.359 10.541 10.717 10.894 11.014 11.093 11.113 10.991 10.67 10.044 8.809 6.342 3.06 0.162 -2.326 -4.413 -6.285 -7.942 -9.364 -10.533 -11.724 -12.757 -13.652 -14.496 -15.299 -16.065 -16.746 -17.411 -18.007 -18.522 -19.054 -19.61 -20.078 -20.568 -21.075 -21.486 -21.916 -22.354 -22.803 -23.263 -23.582 -23.907 -24.419 -24.785 -25.159 -25.348 -25.731 -26.121 -26.552 -26.778 -27.175 -27.539 -27.793 -28.05 -28.608 -28.936 -29.308 -29.686 -30.096 -30.606 -31.294 -33.133 -7 ,16480 ,TETRA ,17585640,Sat Nov 27 14:06:17 CET,Sat Nov 27 15:56:20 CET,0.0 1.515 2.048 2.458 2.802 3.062 3.29 3.509 3.911 4.089 4.251 4.428 4.679 4.812 5.064 5.295 5.504 5.602 5.798 5.978 6.216 6.374 6.53 6.751 6.96 7.141 7.316 7.486 7.684 7.863 8.037 8.242 8.426 8.599 8.78 8.979 9.162 9.341 9.506 9.677 9.836 9.965 10.069 10.135 10.156 10.051 9.791 9.316 8.463 6.959 4.376 1.213 -1.514 -3.839 -5.836 -7.614 -9.149 -10.524 -11.689 -12.849 -13.868 -14.764 -15.595 -16.399 -17.144 -17.796 -18.486 -19.099 -19.604 -20.129 -20.703 -21.184 -21.661 -22.152 -22.554 -22.973 -23.399 -23.831 -24.276 -24.594 -24.923 -25.441 -25.809 -26.192 -26.382 -26.751 -27.132 -27.564 -27.798 -28.189 -28.544 -28.806 -29.077 -29.696 -30.034 -30.378 -30.779 -31.235 -31.793 -32.598 -34.556 -8 ,27037 ,TETRA ,17585641,Sat Nov 27 14:07:19 CET,Sat Nov 27 15:57:53 CET,0.0 0.937 1.411 1.788 2.087 2.352 2.586 2.807 3.189 3.363 3.534 3.753 4.009 4.138 4.372 4.582 4.784 4.882 5.072 5.249 5.502 5.662 5.823 6.045 6.236 6.413 6.587 6.749 6.954 7.152 7.337 7.547 7.726 7.897 8.089 8.282 8.451 8.617 8.779 8.945 9.097 9.246 9.364 9.412 9.416 9.329 9.089 8.642 7.864 6.454 3.874 0.694 -2.021 -4.357 -6.413 -8.262 -9.805 -11.137 -12.302 -13.463 -14.461 -15.346 -16.17 -16.959 -17.693 -18.359 -19.049 -19.667 -20.184 -20.716 -21.279 -21.752 -22.242 -22.754 -23.168 -23.603 -24.042 -24.483 -24.942 -25.267 -25.607 -26.125 -26.486 -26.856 -27.048 -27.445 -27.865 -28.302 -28.523 -28.914 -29.273 -29.535 -29.805 -30.398 -30.724 -31.081 -31.464 -31.904 -32.406 -33.083 -35.035 -9 ,17648 ,TETRA ,17585642,Sat Nov 27 14:07:19 CET,Sat Nov 27 16:02:07 CET,0.0 0.832 1.277 1.635 1.93 2.167 2.389 2.6 2.985 3.157 3.312 3.492 3.749 3.885 4.148 4.391 4.61 4.714 4.905 5.085 5.336 5.49 5.655 5.891 6.108 6.31 6.504 6.689 6.914 7.13 7.34 7.572 7.785 7.986 8.223 8.48 8.686 8.885 9.091 9.31 9.511 9.712 9.929 10.079 10.196 10.224 10.095 9.79 9.127 7.859 5.433 2.172 -0.684 -3.192 -5.385 -7.312 -8.939 -10.394 -11.653 -12.919 -14.005 -14.938 -15.836 -16.689 -17.448 -18.144 -18.868 -19.505 -20.056 -20.618 -21.188 -21.657 -22.135 -22.637 -23.03 -23.424 -23.828 -24.252 -24.701 -25.009 -25.34 -25.868 -26.216 -26.574 -26.765 -27.174 -27.621 -28.093 -28.332 -28.727 -29.069 -29.331 -29.607 -30.192 -30.523 -30.903 -31.299 -31.74 -32.28 -32.905 -34.5 -10 ,10892 ,TETRA ,17585643,Sat Nov 27 14:07:19 CET,Sat Nov 27 15:57:18 CET,0.0 1.175 1.651 2.011 2.309 2.57 2.803 3.014 3.406 3.578 3.736 3.923 4.178 4.312 4.573 4.826 5.058 5.165 5.373 5.567 5.835 6.009 6.178 6.406 6.617 6.811 7.0 7.188 7.426 7.653 7.863 8.099 8.297 8.481 8.708 8.956 9.186 9.43 9.676 9.909 10.112 10.313 10.504 10.632 10.723 10.762 10.672 10.376 9.745 8.421 5.86 2.462 -0.491 -2.973 -5.1 -6.976 -8.613 -10.117 -11.399 -12.661 -13.716 -14.638 -15.523 -16.339 -17.08 -17.747 -18.445 -19.069 -19.597 -20.136 -20.691 -21.16 -21.664 -22.181 -22.578 -23.002 -23.446 -23.883 -24.33 -24.648 -24.976 -25.476 -25.828 -26.202 -26.39 -26.787 -27.206 -27.628 -27.851 -28.249 -28.623 -28.904 -29.189 -29.789 -30.098 -30.424 -30.801 -31.233 -31.742 -32.44 -34.338 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index be088d0e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21616 ,TETRA ,17585644,Sat Nov 27 14:07:19 CET,Sat Nov 27 15:55:23 CET,0.0 0.429 0.74 0.987 1.215 1.414 1.59 1.929 2.093 2.239 2.377 2.614 2.731 2.954 3.179 3.411 3.528 3.749 3.951 4.239 4.421 4.588 4.824 5.039 5.233 5.413 5.588 5.816 6.028 6.216 6.443 6.653 6.851 7.082 7.326 7.551 7.794 8.048 8.312 8.586 8.87 9.171 9.431 9.713 10.014 10.255 10.336 10.238 9.844 8.798 7.118 5.529 4.011 2.663 1.393 0.205 -0.881 -1.813 -2.747 -3.556 -4.273 -4.96 -5.636 -6.283 -6.903 -7.579 -8.176 -8.708 -9.27 -9.859 -10.33 -10.781 -11.238 -11.598 -11.997 -12.421 -12.847 -13.295 -13.617 -13.966 -14.538 -14.945 -15.366 -15.576 -16.027 -16.537 -17.064 -17.347 -17.774 -18.253 -18.593 -18.968 -19.856 -20.361 -20.897 -21.503 -22.231 -23.201 -24.609 -2 ,4956 ,TETRA ,17585645,Sat Nov 27 14:07:19 CET,Sat Nov 27 15:54:08 CET,0.0 0.373 0.679 0.949 1.177 1.381 1.565 1.898 2.04 2.164 2.277 2.506 2.621 2.837 3.034 3.221 3.308 3.481 3.659 3.909 4.057 4.209 4.441 4.644 4.829 5.01 5.187 5.421 5.635 5.836 6.078 6.299 6.498 6.71 6.956 7.203 7.462 7.717 7.968 8.223 8.489 8.772 9.044 9.334 9.589 9.791 9.928 9.868 9.44 8.368 6.654 4.993 3.46 2.1 0.831 -0.322 -1.348 -2.268 -3.219 -4.059 -4.825 -5.526 -6.197 -6.833 -7.418 -8.046 -8.615 -9.091 -9.603 -10.173 -10.642 -11.139 -11.681 -12.088 -12.5 -12.942 -13.413 -13.877 -14.186 -14.529 -15.089 -15.475 -15.871 -16.08 -16.538 -17.031 -17.536 -17.805 -18.207 -18.694 -19.029 -19.369 -20.198 -20.651 -21.159 -21.751 -22.416 -23.283 -24.613 -3 ,21487 ,TETRA ,17585646,Sat Nov 27 14:07:21 CET,Sat Nov 27 15:54:35 CET,0.0 0.424 0.779 1.088 1.349 1.566 1.777 2.182 2.36 2.515 2.674 2.926 3.057 3.312 3.539 3.743 3.846 4.052 4.226 4.447 4.589 4.725 4.917 5.102 5.28 5.451 5.624 5.848 6.054 6.246 6.482 6.699 6.898 7.126 7.381 7.623 7.886 8.15 8.407 8.676 8.978 9.305 9.577 9.849 10.094 10.295 10.433 10.439 10.121 9.101 7.437 5.782 4.274 2.937 1.683 0.582 -0.452 -1.424 -2.422 -3.261 -3.992 -4.69 -5.362 -5.989 -6.55 -7.139 -7.68 -8.167 -8.669 -9.166 -9.577 -10.019 -10.492 -10.857 -11.253 -11.672 -12.089 -12.571 -12.904 -13.217 -13.718 -14.084 -14.475 -14.684 -15.136 -15.597 -16.075 -16.334 -16.751 -17.249 -17.564 -17.909 -18.679 -19.104 -19.592 -20.116 -20.781 -21.684 -22.993 -4 ,7412 ,TETRA ,17585647,Sat Nov 27 14:08:16 CET,Sat Nov 27 15:56:17 CET,0.0 0.512 0.888 1.167 1.401 1.611 1.798 2.156 2.332 2.5 2.694 2.958 3.09 3.33 3.562 3.783 3.887 4.095 4.288 4.562 4.746 4.917 5.164 5.385 5.577 5.777 5.97 6.194 6.41 6.626 6.871 7.08 7.274 7.509 7.78 8.031 8.284 8.549 8.839 9.125 9.416 9.715 10.004 10.313 10.608 10.868 11.012 11.021 10.673 9.572 7.763 6.105 4.599 3.181 1.867 0.722 -0.302 -1.216 -2.14 -2.947 -3.681 -4.379 -5.069 -5.718 -6.303 -6.899 -7.418 -7.88 -8.375 -8.893 -9.343 -9.829 -10.32 -10.678 -11.063 -11.477 -11.902 -12.357 -12.679 -13.017 -13.526 -13.886 -14.272 -14.463 -14.863 -15.294 -15.797 -16.074 -16.451 -16.865 -17.192 -17.542 -18.312 -18.753 -19.229 -19.767 -20.366 -21.196 -22.545 -5 ,27774 ,TETRA ,17585648,Sat Nov 27 14:08:16 CET,Sat Nov 27 15:59:12 CET,0.0 0.365 0.653 0.904 1.137 1.349 1.532 1.861 2.023 2.176 2.334 2.588 2.703 2.909 3.105 3.279 3.365 3.543 3.716 3.959 4.107 4.251 4.462 4.665 4.861 5.042 5.211 5.427 5.647 5.86 6.114 6.352 6.562 6.794 7.045 7.271 7.528 7.789 8.038 8.296 8.57 8.857 9.111 9.388 9.655 9.911 10.105 10.125 9.783 8.637 6.881 5.278 3.779 2.407 1.037 -0.257 -1.492 -2.566 -3.551 -4.35 -5.038 -5.691 -6.325 -6.92 -7.47 -8.057 -8.581 -9.051 -9.547 -10.052 -10.482 -10.981 -11.509 -11.905 -12.321 -12.766 -13.235 -13.743 -14.074 -14.401 -14.935 -15.313 -15.725 -15.955 -16.422 -16.88 -17.401 -17.688 -18.11 -18.607 -18.961 -19.336 -20.129 -20.567 -21.052 -21.631 -22.378 -23.356 -24.708 -6 ,16036 ,TETRA ,17585649,Sat Nov 27 14:08:16 CET,Sat Nov 27 15:55:21 CET,0.0 0.433 0.781 1.07 1.321 1.528 1.711 2.048 2.2 2.347 2.509 2.76 2.887 3.138 3.38 3.61 3.722 3.937 4.146 4.432 4.608 4.778 5.033 5.284 5.503 5.697 5.877 6.096 6.293 6.488 6.727 6.947 7.176 7.434 7.69 7.918 8.16 8.412 8.681 8.961 9.271 9.591 9.839 10.092 10.328 10.53 10.654 10.616 10.189 9.075 7.421 5.761 4.198 2.791 1.532 0.425 -0.604 -1.495 -2.382 -3.186 -3.914 -4.59 -5.293 -5.975 -6.59 -7.259 -7.88 -8.394 -8.91 -9.461 -9.885 -10.319 -10.78 -11.136 -11.516 -11.909 -12.326 -12.782 -13.103 -13.421 -13.928 -14.284 -14.664 -14.881 -15.341 -15.811 -16.271 -16.527 -16.935 -17.384 -17.717 -18.093 -18.892 -19.371 -19.933 -20.575 -21.388 -22.413 -23.912 -7 ,25786 ,TETRA ,17585650,Sat Nov 27 14:08:19 CET,Sat Nov 27 15:55:41 CET,0.0 0.652 1.079 1.438 1.798 2.11 2.371 2.83 3.07 3.291 3.562 3.862 4.022 4.312 4.55 4.754 4.85 5.037 5.209 5.449 5.611 5.771 6.02 6.276 6.517 6.732 6.94 7.207 7.459 7.702 8.014 8.292 8.511 8.766 9.038 9.276 9.516 9.762 10.003 10.254 10.549 10.868 11.153 11.418 11.668 11.91 12.047 12.03 11.661 10.61 8.973 7.359 5.884 4.512 3.272 2.211 1.216 0.332 -0.563 -1.352 -2.058 -2.747 -3.45 -4.134 -4.75 -5.387 -5.982 -6.492 -7.011 -7.573 -8.053 -8.563 -9.082 -9.473 -9.88 -10.303 -10.758 -11.216 -11.531 -11.898 -12.501 -12.902 -13.299 -13.516 -14.009 -14.52 -15.045 -15.322 -15.729 -16.201 -16.53 -16.891 -17.713 -18.171 -18.689 -19.32 -20.064 -20.92 -22.204 -8 ,17159 ,TETRA ,17585651,Sat Nov 27 14:08:17 CET,Sat Nov 27 15:58:30 CET,0.0 0.457 0.82 1.125 1.398 1.645 1.863 2.244 2.416 2.582 2.759 3.016 3.156 3.424 3.672 3.91 4.022 4.221 4.395 4.647 4.808 4.959 5.183 5.393 5.597 5.788 5.966 6.191 6.404 6.606 6.849 7.076 7.288 7.519 7.77 8.014 8.258 8.505 8.767 9.037 9.323 9.624 9.913 10.22 10.493 10.75 10.93 10.938 10.628 9.614 7.865 6.145 4.562 3.179 1.909 0.731 -0.331 -1.25 -2.202 -3.024 -3.752 -4.446 -5.1 -5.724 -6.307 -6.936 -7.516 -7.993 -8.485 -9.032 -9.489 -9.978 -10.514 -10.946 -11.407 -11.885 -12.374 -12.872 -13.2 -13.522 -14.036 -14.411 -14.814 -15.033 -15.478 -15.972 -16.503 -16.768 -17.175 -17.663 -18.013 -18.374 -19.121 -19.536 -20.03 -20.603 -21.234 -21.996 -23.201 -9 ,8725 ,TETRA ,17585652,Sat Nov 27 14:09:17 CET,Sat Nov 27 15:57:35 CET,0.0 0.464 0.767 1.015 1.253 1.482 1.675 2.007 2.161 2.305 2.445 2.695 2.82 3.044 3.249 3.444 3.544 3.74 3.915 4.154 4.312 4.467 4.683 4.88 5.075 5.265 5.434 5.652 5.87 6.067 6.284 6.499 6.718 6.964 7.205 7.434 7.696 7.961 8.233 8.523 8.837 9.182 9.488 9.766 10.056 10.287 10.414 10.41 10.071 9.049 7.363 5.693 4.136 2.707 1.398 0.255 -0.803 -1.717 -2.626 -3.446 -4.198 -4.9 -5.562 -6.175 -6.74 -7.349 -7.881 -8.355 -8.866 -9.399 -9.866 -10.359 -10.835 -11.193 -11.588 -12.002 -12.428 -12.889 -13.207 -13.524 -14.035 -14.391 -14.768 -14.962 -15.361 -15.82 -16.335 -16.599 -16.998 -17.456 -17.774 -18.109 -18.866 -19.314 -19.802 -20.366 -21.069 -22.031 -23.464 -10 ,4611 ,TETRA ,17585653,Sat Nov 27 14:10:17 CET,Sat Nov 27 15:57:22 CET,0.0 0.379 0.645 0.892 1.111 1.314 1.512 1.861 2.015 2.16 2.318 2.571 2.699 2.931 3.152 3.369 3.476 3.686 3.89 4.184 4.37 4.554 4.802 5.039 5.271 5.486 5.7 5.969 6.215 6.461 6.753 7.021 7.26 7.505 7.77 8.023 8.308 8.631 8.958 9.257 9.548 9.85 10.104 10.364 10.641 10.869 10.981 10.888 10.433 9.318 7.628 5.993 4.432 3.011 1.722 0.514 -0.646 -1.602 -2.515 -3.334 -4.079 -4.796 -5.493 -6.111 -6.675 -7.286 -7.835 -8.322 -8.838 -9.386 -9.84 -10.306 -10.806 -11.2 -11.614 -12.055 -12.516 -13.002 -13.338 -13.678 -14.22 -14.595 -14.957 -15.144 -15.566 -16.021 -16.501 -16.75 -17.134 -17.567 -17.891 -18.218 -18.958 -19.424 -19.949 -20.535 -21.205 -22.032 -23.296 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt deleted file mode 100644 index 3f8fca17..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22157 ,TETRA ,17585654,Sat Nov 27 14:10:17 CET,Sat Nov 27 16:00:55 CET,0.0 4.039 5.157 5.946 6.558 7.062 7.511 7.935 8.642 8.952 9.251 9.546 10.085 10.353 10.865 11.339 11.789 12.002 12.415 12.815 13.4 13.782 14.143 14.673 15.178 15.64 16.085 16.509 17.07 17.61 18.11 18.723 19.324 19.867 20.474 21.151 21.813 22.548 23.284 24.08 24.925 25.856 26.94 27.954 29.007 29.925 30.662 31.277 31.788 32.034 31.512 30.164 28.658 27.157 25.754 24.468 23.248 22.039 21.017 19.976 19.058 18.19 17.299 16.424 15.631 14.944 14.206 13.53 12.952 12.34 11.706 11.181 10.615 10.02 9.553 9.073 8.573 8.026 7.45 7.055 6.64 5.99 5.533 5.085 4.851 4.34 3.801 3.21 2.906 2.337 1.973 1.611 1.241 0.437 -0.028 -0.511 -1.057 -1.695 -2.44 -3.439 -7.016 -2 ,22848 ,TETRA ,17585655,Sat Nov 27 14:10:17 CET,Sat Nov 27 16:04:00 CET,0.0 2.918 3.799 4.477 5.079 5.611 6.063 6.476 7.213 7.541 7.863 8.205 8.754 9.015 9.495 9.957 10.393 10.611 11.044 11.45 12.004 12.347 12.683 13.189 13.686 14.146 14.58 15.009 15.56 16.084 16.577 17.148 17.711 18.261 18.871 19.548 20.195 20.909 21.642 22.369 23.103 23.924 24.887 25.736 26.636 27.613 28.552 29.355 30.028 30.298 29.858 28.66 27.226 25.758 24.381 23.104 21.908 20.675 19.524 18.386 17.415 16.544 15.678 14.829 14.052 13.296 12.479 11.784 11.203 10.613 10.02 9.526 9.007 8.456 8.01 7.572 7.138 6.647 6.1 5.74 5.371 4.8 4.403 3.986 3.78 3.345 2.862 2.326 2.03 1.481 1.17 0.833 0.461 -0.369 -0.817 -1.306 -1.861 -2.467 -3.184 -4.124 -9.798 -3 ,20311 ,TETRA ,17585656,Sat Nov 27 14:11:16 CET,Sat Nov 27 16:02:33 CET,0.0 3.287 4.178 4.876 5.462 5.932 6.341 6.738 7.452 7.787 8.126 8.456 8.987 9.245 9.767 10.28 10.738 10.957 11.396 11.796 12.377 12.756 13.111 13.607 14.089 14.525 14.919 15.303 15.803 16.286 16.764 17.355 17.916 18.457 19.058 19.712 20.332 20.982 21.708 22.449 23.178 23.997 24.872 25.711 26.739 27.763 28.6 29.367 30.088 30.465 30.11 28.806 27.32 25.934 24.665 23.393 22.17 21.01 20.027 19.022 18.116 17.293 16.47 15.664 14.908 14.215 13.487 12.859 12.311 11.713 11.087 10.563 10.001 9.409 8.934 8.423 7.902 7.36 6.78 6.376 5.964 5.327 4.868 4.396 4.166 3.679 3.145 2.591 2.302 1.729 1.357 1.034 0.694 -0.063 -0.49 -0.995 -1.568 -2.21 -2.934 -3.837 -6.486 -4 ,19592 ,TETRA ,17585657,Sat Nov 27 14:11:18 CET,Sat Nov 27 16:04:56 CET,0.0 3.136 4.06 4.828 5.426 5.932 6.377 6.778 7.494 7.852 8.188 8.505 9.057 9.341 9.884 10.388 10.846 11.069 11.51 11.93 12.526 12.894 13.244 13.765 14.252 14.688 15.127 15.545 16.062 16.565 17.046 17.627 18.183 18.719 19.34 20.021 20.654 21.333 22.029 22.761 23.538 24.355 25.249 26.156 27.153 28.165 29.232 30.043 30.551 30.714 30.137 28.781 27.379 25.915 24.426 23.065 21.823 20.693 19.674 18.611 17.717 16.887 16.048 15.238 14.481 13.786 13.053 12.382 11.787 11.165 10.531 10.007 9.43 8.793 8.293 7.789 7.281 6.782 6.27 5.899 5.511 4.918 4.517 4.082 3.856 3.382 2.861 2.329 2.059 1.495 1.124 0.761 0.374 -0.437 -0.858 -1.314 -1.889 -2.587 -3.43 -4.508 -7.891 -5 ,22643 ,TETRA ,17585658,Sat Nov 27 14:11:18 CET,Sat Nov 27 16:03:40 CET,0.0 4.044 5.122 5.86 6.4 6.868 7.285 7.659 8.368 8.712 9.031 9.37 9.97 10.277 10.815 11.333 11.808 12.031 12.482 12.914 13.495 13.857 14.225 14.814 15.391 15.884 16.335 16.762 17.289 17.881 18.445 19.017 19.58 20.1 20.681 21.341 21.962 22.616 23.283 23.972 24.723 25.477 26.264 26.995 27.735 28.528 29.311 30.034 30.629 31.165 31.177 29.759 28.04 26.266 24.598 23.053 21.542 20.122 18.934 17.736 16.706 15.778 14.869 14.015 13.175 12.379 11.584 10.891 10.277 9.634 8.999 8.473 7.916 7.347 6.894 6.418 5.927 5.401 4.824 4.425 4.029 3.392 2.96 2.529 2.303 1.825 1.324 0.819 0.55 -0.008 -0.338 -0.667 -1.025 -1.837 -2.258 -2.681 -3.191 -3.774 -4.448 -5.372 -9.229 -6 ,8985 ,TETRA ,17585659,Sat Nov 27 14:12:17 CET,Sat Nov 27 16:03:34 CET,0.0 4.683 5.547 6.213 6.756 7.222 7.659 8.071 8.814 9.154 9.472 9.773 10.308 10.568 11.067 11.579 12.066 12.285 12.692 13.092 13.659 14.011 14.359 14.845 15.317 15.794 16.234 16.642 17.163 17.675 18.158 18.718 19.279 19.827 20.458 21.152 21.777 22.446 23.181 23.96 24.736 25.558 26.45 27.23 28.016 28.813 29.751 30.77 31.762 32.542 32.686 31.598 30.123 28.72 27.395 26.099 24.923 23.834 22.899 21.944 21.068 20.253 19.467 18.717 17.995 17.3 16.567 15.926 15.346 14.754 14.143 13.598 13.032 12.457 12.025 11.582 11.109 10.606 10.08 9.718 9.325 8.713 8.292 7.85 7.617 7.121 6.595 6.064 5.789 5.222 4.853 4.5 4.126 3.349 2.91 2.426 1.898 1.27 0.473 -0.538 -4.92 -7 ,32166 ,TETRA ,17585660,Sat Nov 27 14:12:17 CET,Sat Nov 27 16:01:41 CET,0.0 4.099 5.071 5.718 6.233 6.687 7.116 7.521 8.255 8.59 8.907 9.264 9.834 10.098 10.607 11.095 11.553 11.775 12.183 12.557 13.093 13.441 13.787 14.313 14.804 15.252 15.676 16.08 16.619 17.135 17.624 18.202 18.734 19.246 19.87 20.551 21.16 21.849 22.591 23.349 24.098 24.912 25.875 26.757 27.722 28.734 29.642 30.414 31.201 31.758 31.312 29.794 28.206 26.676 25.288 24.026 22.851 21.705 20.667 19.588 18.663 17.88 17.109 16.261 15.392 14.603 13.801 13.079 12.456 11.832 11.18 10.644 10.086 9.479 8.993 8.51 8.023 7.512 6.979 6.613 6.24 5.653 5.228 4.763 4.526 4.04 3.525 2.993 2.712 2.153 1.812 1.474 1.113 0.373 -0.043 -0.512 -1.027 -1.65 -2.331 -3.266 -6.522 -8 ,15775 ,TETRA ,17585661,Sat Nov 27 14:12:17 CET,Sat Nov 27 16:06:04 CET,0.0 2.83 3.638 4.25 4.784 5.279 5.72 6.121 6.843 7.175 7.475 7.742 8.278 8.547 9.051 9.516 9.944 10.151 10.568 10.974 11.531 11.895 12.256 12.766 13.241 13.68 14.094 14.51 15.061 15.567 16.054 16.646 17.199 17.717 18.305 18.941 19.534 20.174 20.863 21.646 22.449 23.266 24.191 25.1 26.106 27.096 27.934 28.608 29.189 29.46 28.929 27.566 25.977 24.466 23.053 21.725 20.605 19.539 18.52 17.493 16.628 15.826 15.05 14.311 13.625 13.009 12.359 11.755 11.229 10.689 10.099 9.58 9.03 8.469 8.062 7.627 7.12 6.598 6.106 5.769 5.406 4.811 4.391 3.965 3.734 3.24 2.715 2.153 1.844 1.244 0.863 0.528 0.178 -0.546 -0.951 -1.39 -1.908 -2.516 -3.264 -4.25 -8.378 -9 ,3061 ,TETRA ,17585662,Sat Nov 27 14:12:17 CET,Sat Nov 27 16:02:40 CET,0.0 3.689 4.75 5.445 6.002 6.504 6.973 7.394 8.079 8.409 8.726 8.997 9.532 9.799 10.298 10.767 11.217 11.426 11.841 12.241 12.786 13.15 13.494 13.977 14.469 14.951 15.396 15.832 16.411 16.967 17.484 18.066 18.607 19.137 19.759 20.436 21.093 21.867 22.702 23.516 24.317 25.18 26.178 27.124 28.038 28.952 29.856 30.653 31.382 31.837 31.607 30.451 29.082 27.691 26.325 24.998 23.765 22.61 21.677 20.692 19.785 19.0 18.237 17.491 16.8 16.181 15.489 14.862 14.334 13.765 13.167 12.668 12.147 11.608 11.163 10.685 10.189 9.673 9.136 8.764 8.383 7.786 7.367 6.931 6.704 6.228 5.735 5.211 4.93 4.365 3.995 3.655 3.288 2.471 2.012 1.507 0.925 0.243 -0.555 -1.665 -5.087 -10 ,31544 ,TETRA ,17585663,Sat Nov 27 14:13:17 CET,Sat Nov 27 16:04:39 CET,0.0 3.261 4.066 4.717 5.258 5.71 6.137 6.54 7.29 7.637 7.956 8.281 8.812 9.06 9.497 9.901 10.32 10.527 10.936 11.331 11.856 12.199 12.555 13.067 13.552 14.015 14.455 14.87 15.383 15.871 16.359 16.944 17.464 17.936 18.499 19.105 19.653 20.272 20.971 21.664 22.293 23.02 23.894 24.718 25.648 26.641 27.646 28.683 29.72 30.481 30.536 29.408 27.826 26.208 24.6 22.978 21.5 20.128 18.913 17.695 16.598 15.59 14.649 13.762 12.951 12.224 11.45 10.75 10.152 9.528 8.871 8.334 7.762 7.158 6.688 6.168 5.631 5.109 4.577 4.203 3.805 3.189 2.774 2.327 2.087 1.604 1.126 0.63 0.353 -0.21 -0.608 -0.97 -1.337 -2.149 -2.578 -3.037 -3.569 -4.165 -4.885 -5.858 -9.147 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index e279722d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9478 ,TETRA ,17585664,Sat Nov 27 14:13:18 CET,Sat Nov 27 16:03:39 CET,0.0 1.146 1.749 2.222 2.583 2.91 3.214 3.501 4.016 4.266 4.504 4.684 5.156 5.372 5.788 6.164 6.528 6.7 7.037 7.382 7.886 8.202 8.489 8.899 9.301 9.688 10.06 10.396 10.829 11.274 11.71 12.198 12.623 13.026 13.518 14.113 14.7 15.351 16.011 16.612 17.252 17.972 18.709 19.425 20.202 20.996 21.855 22.68 23.488 24.12 24.271 23.672 22.737 21.66 20.64 19.648 18.679 17.8 17.03 16.185 15.385 14.667 13.978 13.299 12.641 11.997 11.32 10.719 10.194 9.684 9.147 8.637 8.089 7.553 7.117 6.647 6.178 5.694 5.183 4.834 4.464 3.889 3.496 3.079 2.86 2.408 1.93 1.415 1.15 0.612 0.283 -0.029 -0.355 -1.081 -1.493 -1.94 -2.407 -2.914 -3.535 -4.353 -6.891 -2 ,19853 ,TETRA ,17585665,Sat Nov 27 14:13:18 CET,Sat Nov 27 16:01:39 CET,0.0 1.197 1.838 2.353 2.804 3.177 3.485 3.793 4.37 4.617 4.845 5.017 5.485 5.69 6.089 6.465 6.828 7.001 7.34 7.672 8.133 8.424 8.714 9.146 9.529 9.879 10.219 10.544 10.983 11.413 11.823 12.302 12.76 13.191 13.666 14.19 14.684 15.235 15.833 16.464 17.126 17.829 18.623 19.417 20.267 21.073 21.862 22.699 23.563 24.225 24.413 23.771 22.827 21.759 20.709 19.66 18.64 17.74 16.946 16.102 15.369 14.697 14.018 13.354 12.726 12.143 11.499 10.898 10.382 9.846 9.258 8.763 8.252 7.694 7.247 6.787 6.33 5.843 5.309 4.948 4.589 4.023 3.604 3.172 2.959 2.506 2.023 1.524 1.268 0.741 0.434 0.134 -0.181 -0.888 -1.286 -1.709 -2.185 -2.764 -3.446 -4.301 -6.71 -3 ,18161 ,TETRA ,17585666,Sat Nov 27 14:13:18 CET,Sat Nov 27 16:03:13 CET,0.0 1.317 1.822 2.247 2.628 2.98 3.308 3.597 4.145 4.392 4.622 4.808 5.291 5.522 5.967 6.36 6.727 6.905 7.253 7.584 8.05 8.35 8.642 9.054 9.461 9.871 10.266 10.633 11.088 11.549 11.997 12.512 13.027 13.52 14.054 14.638 15.165 15.721 16.324 16.976 17.637 18.346 19.14 19.884 20.698 21.524 22.362 23.19 23.964 24.542 24.717 24.128 23.166 22.105 21.151 20.208 19.264 18.385 17.624 16.818 16.046 15.333 14.683 14.065 13.451 12.843 12.148 11.503 10.968 10.405 9.818 9.326 8.787 8.234 7.8 7.346 6.888 6.4 5.884 5.529 5.149 4.558 4.141 3.705 3.485 3.033 2.554 2.031 1.762 1.23 0.922 0.612 0.271 -0.463 -0.852 -1.275 -1.773 -2.347 -2.992 -3.864 -6.539 -4 ,2898 ,TETRA ,17585667,Sat Nov 27 14:14:18 CET,Sat Nov 27 15:55:35 CET,0.0 0.793 1.364 1.822 2.224 2.582 2.902 3.205 3.757 4.015 4.266 4.479 4.963 5.171 5.567 5.959 6.319 6.487 6.821 7.139 7.606 7.907 8.198 8.617 9.02 9.411 9.771 10.112 10.547 10.972 11.382 11.85 12.3 12.731 13.222 13.784 14.311 14.9 15.513 16.146 16.872 17.606 18.356 19.036 19.783 20.603 21.436 22.261 23.029 23.589 23.704 22.957 21.94 20.918 19.913 18.943 18.036 17.15 16.363 15.563 14.796 14.056 13.351 12.662 11.931 11.257 10.585 9.97 9.422 8.845 8.265 7.79 7.283 6.767 6.368 5.935 5.494 5.025 4.513 4.158 3.771 3.17 2.774 2.363 2.138 1.66 1.171 0.668 0.406 -0.146 -0.485 -0.804 -1.144 -1.885 -2.296 -2.732 -3.206 -3.744 -4.367 -5.147 -7.456 -5 ,10731 ,TETRA ,17585668,Sat Nov 27 14:14:18 CET,Sat Nov 27 16:05:34 CET,0.0 1.163 1.72 2.177 2.561 2.914 3.252 3.554 4.081 4.324 4.568 4.767 5.232 5.425 5.809 6.181 6.541 6.712 7.046 7.377 7.843 8.129 8.403 8.805 9.203 9.58 9.929 10.277 10.75 11.195 11.616 12.12 12.599 13.056 13.542 14.089 14.606 15.132 15.716 16.317 16.91 17.555 18.354 19.146 19.946 20.776 21.631 22.469 23.248 23.887 24.139 23.529 22.499 21.385 20.343 19.36 18.42 17.519 16.736 15.893 15.129 14.455 13.775 13.117 12.484 11.884 11.214 10.578 10.047 9.518 8.973 8.488 7.958 7.407 6.957 6.488 6.014 5.508 4.973 4.6 4.222 3.645 3.24 2.817 2.595 2.131 1.642 1.132 0.872 0.337 0.023 -0.292 -0.626 -1.379 -1.786 -2.215 -2.686 -3.224 -3.911 -4.829 -7.324 -6 ,13507 ,TETRA ,17585669,Sat Nov 27 14:14:18 CET,Sat Nov 27 16:10:56 CET,0.0 1.044 1.622 2.077 2.442 2.753 3.057 3.353 3.891 4.141 4.384 4.572 5.05 5.26 5.686 6.136 6.559 6.765 7.169 7.542 8.085 8.446 8.79 9.244 9.643 10.019 10.381 10.747 11.206 11.609 11.991 12.463 12.917 13.348 13.835 14.381 14.934 15.513 16.08 16.675 17.37 18.103 18.828 19.556 20.391 21.253 22.121 22.973 23.751 24.355 24.528 23.89 22.919 21.886 20.879 19.872 18.973 18.162 17.384 16.535 15.787 15.067 14.362 13.712 13.077 12.453 11.789 11.19 10.629 10.044 9.465 8.968 8.479 7.978 7.547 7.071 6.585 6.096 5.562 5.21 4.864 4.247 3.807 3.376 3.15 2.675 2.196 1.686 1.405 0.851 0.507 0.188 -0.145 -0.847 -1.24 -1.68 -2.173 -2.701 -3.309 -4.175 -6.29 -7 ,28532 ,TETRA ,17585670,Sat Nov 27 14:14:18 CET,Sat Nov 27 16:04:24 CET,0.0 1.237 1.783 2.188 2.556 2.911 3.235 3.535 4.074 4.314 4.554 4.778 5.265 5.466 5.841 6.21 6.562 6.735 7.072 7.381 7.821 8.104 8.378 8.77 9.157 9.531 9.881 10.22 10.665 11.112 11.542 12.025 12.499 12.976 13.493 14.046 14.572 15.113 15.69 16.313 16.918 17.584 18.372 19.111 19.894 20.707 21.544 22.379 23.152 23.702 23.669 22.831 21.813 20.786 19.755 18.768 17.893 17.043 16.257 15.446 14.68 13.892 13.141 12.456 11.784 11.146 10.427 9.783 9.251 8.69 8.116 7.613 7.069 6.495 6.042 5.582 5.098 4.623 4.144 3.789 3.41 2.832 2.429 2.023 1.809 1.348 0.85 0.317 0.043 -0.51 -0.826 -1.129 -1.466 -2.187 -2.581 -3.0 -3.461 -4.0 -4.643 -5.51 -7.853 -8 ,29392 ,TETRA ,17585671,Sat Nov 27 14:15:18 CET,Sat Nov 27 16:06:22 CET,0.0 1.018 1.561 2.044 2.461 2.791 3.084 3.346 3.827 4.059 4.289 4.462 4.925 5.129 5.522 5.898 6.26 6.437 6.784 7.111 7.57 7.861 8.141 8.55 8.953 9.338 9.695 10.019 10.453 10.903 11.332 11.817 12.255 12.692 13.201 13.743 14.254 14.823 15.433 16.046 16.639 17.278 18.049 18.791 19.569 20.365 21.156 21.914 22.663 23.292 23.44 22.821 21.829 20.74 19.677 18.579 17.59 16.693 15.898 15.095 14.312 13.514 12.769 12.004 11.276 10.657 9.992 9.38 8.846 8.298 7.73 7.244 6.706 6.136 5.707 5.252 4.788 4.312 3.803 3.455 3.09 2.517 2.106 1.679 1.463 1.014 0.545 0.046 -0.22 -0.759 -1.072 -1.385 -1.721 -2.445 -2.821 -3.243 -3.734 -4.305 -4.977 -5.854 -9.054 -9 ,29259 ,TETRA ,17585672,Sat Nov 27 14:15:20 CET,Sat Nov 27 16:07:05 CET,0.0 1.203 1.801 2.241 2.651 3.01 3.305 3.593 4.183 4.459 4.704 4.916 5.392 5.59 5.971 6.336 6.694 6.863 7.185 7.5 7.957 8.245 8.514 8.918 9.322 9.709 10.079 10.446 10.902 11.312 11.707 12.182 12.64 13.094 13.614 14.184 14.735 15.338 15.97 16.608 17.253 17.937 18.667 19.346 20.075 20.847 21.695 22.53 23.318 23.985 24.152 23.454 22.486 21.495 20.493 19.474 18.526 17.613 16.731 15.864 15.117 14.379 13.646 12.939 12.253 11.617 10.935 10.32 9.798 9.231 8.632 8.142 7.605 7.048 6.612 6.151 5.68 5.189 4.668 4.306 3.947 3.407 3.013 2.578 2.358 1.914 1.437 0.938 0.679 0.146 -0.176 -0.496 -0.831 -1.587 -1.997 -2.401 -2.849 -3.369 -4.019 -4.872 -7.365 -10 ,8996 ,TETRA ,17585673,Sat Nov 27 14:15:18 CET,Sat Nov 27 16:05:29 CET,0.0 0.995 1.494 1.947 2.327 2.657 2.961 3.248 3.783 4.036 4.283 4.501 4.985 5.19 5.59 5.966 6.338 6.52 6.863 7.191 7.656 7.949 8.246 8.657 9.044 9.413 9.754 10.087 10.522 10.943 11.329 11.768 12.193 12.611 13.094 13.661 14.208 14.812 15.428 16.034 16.661 17.363 18.194 18.938 19.726 20.559 21.41 22.239 22.992 23.56 23.686 23.032 22.029 20.952 19.9 18.847 17.824 16.84 16.015 15.143 14.235 13.41 12.692 12.0 11.29 10.63 9.926 9.285 8.755 8.176 7.578 7.078 6.547 6.005 5.587 5.168 4.727 4.24 3.72 3.357 2.994 2.436 2.041 1.614 1.394 0.944 0.46 -0.063 -0.333 -0.869 -1.189 -1.493 -1.817 -2.544 -2.952 -3.403 -3.902 -4.439 -5.085 -5.954 -8.492 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt deleted file mode 100644 index b7f5076e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29181 ,TETRA ,17585674,Sat Nov 27 14:15:18 CET,Sat Nov 27 16:06:19 CET,0.0 1.743 2.409 2.955 3.439 3.864 4.235 4.589 5.258 5.566 5.867 6.165 6.677 6.925 7.405 7.828 8.265 8.492 8.9 9.267 9.805 10.148 10.5 11.035 11.518 11.984 12.429 12.837 13.338 13.843 14.351 14.927 15.491 16.043 16.657 17.332 17.959 18.641 19.397 20.184 20.991 21.882 22.851 23.797 24.806 25.777 26.744 27.642 28.315 28.652 28.168 26.494 24.641 22.771 21.013 19.378 17.887 16.448 15.131 13.777 12.627 11.601 10.607 9.7 8.868 8.076 7.237 6.492 5.854 5.177 4.455 3.861 3.247 2.596 2.095 1.568 0.991 0.414 -0.177 -0.61 -1.047 -1.719 -2.205 -2.723 -2.99 -3.549 -4.129 -4.738 -5.06 -5.674 -6.099 -6.455 -6.842 -7.667 -8.116 -8.577 -9.066 -9.659 -10.398 -11.274 -14.148 -2 ,2064 ,TETRA ,17585675,Sat Nov 27 14:15:20 CET,Sat Nov 27 16:06:23 CET,0.0 2.339 3.127 3.708 4.195 4.643 5.052 5.402 6.009 6.284 6.555 6.82 7.313 7.549 8.046 8.523 8.959 9.174 9.604 9.987 10.52 10.887 11.248 11.765 12.273 12.748 13.171 13.575 14.075 14.557 15.072 15.672 16.235 16.801 17.433 18.119 18.779 19.489 20.242 21.028 21.847 22.724 23.69 24.629 25.698 26.844 28.076 29.231 30.161 30.657 30.206 28.623 26.811 24.991 23.247 21.53 19.986 18.605 17.395 16.112 14.955 13.927 12.945 12.02 11.152 10.341 9.488 8.724 8.048 7.345 6.621 6.028 5.42 4.779 4.285 3.785 3.237 2.639 2.018 1.57 1.134 0.459 -0.019 -0.487 -0.738 -1.283 -1.839 -2.412 -2.724 -3.324 -3.718 -4.083 -4.461 -5.257 -5.721 -6.214 -6.742 -7.321 -8.017 -8.942 -12.05 -3 ,1332 ,TETRA ,17585676,Sat Nov 27 14:16:16 CET,Sat Nov 27 16:07:54 CET,0.0 2.155 2.965 3.63 4.197 4.711 5.172 5.594 6.389 6.727 7.005 7.262 7.775 8.026 8.52 8.974 9.377 9.565 9.918 10.273 10.808 11.158 11.512 12.015 12.474 12.913 13.327 13.72 14.219 14.695 15.156 15.762 16.379 16.93 17.549 18.217 18.845 19.538 20.287 21.063 21.833 22.691 23.676 24.664 25.768 26.858 27.99 29.049 29.805 30.161 29.794 28.198 26.322 24.569 22.876 21.178 19.656 18.231 16.957 15.667 14.541 13.507 12.504 11.543 10.631 9.827 8.982 8.208 7.553 6.888 6.204 5.635 5.012 4.349 3.856 3.345 2.805 2.227 1.58 1.125 0.686 0.032 -0.421 -0.901 -1.143 -1.639 -2.166 -2.744 -3.053 -3.637 -4.055 -4.427 -4.808 -5.627 -6.074 -6.569 -7.136 -7.736 -8.408 -9.291 -11.887 -4 ,25292 ,TETRA ,17585677,Sat Nov 27 14:15:18 CET,Sat Nov 27 16:06:57 CET,0.0 2.373 3.097 3.648 4.118 4.529 4.912 5.255 5.856 6.136 6.416 6.703 7.232 7.488 7.959 8.394 8.823 9.031 9.462 9.876 10.464 10.838 11.16 11.606 12.053 12.482 12.893 13.312 13.891 14.47 14.981 15.622 16.243 16.774 17.371 18.043 18.689 19.402 20.164 20.92 21.686 22.538 23.483 24.331 25.26 26.295 27.441 28.557 29.467 29.994 29.551 27.933 26.131 24.382 22.681 20.978 19.439 18.044 16.821 15.516 14.339 13.33 12.361 11.445 10.579 9.763 8.913 8.147 7.492 6.806 6.099 5.507 4.88 4.236 3.744 3.244 2.73 2.182 1.583 1.182 0.727 -0.034 -0.519 -0.993 -1.247 -1.769 -2.278 -2.828 -3.136 -3.728 -4.148 -4.524 -4.892 -5.659 -6.09 -6.567 -7.098 -7.728 -8.497 -9.537 -12.594 -5 ,30341 ,TETRA ,17585678,Sat Nov 27 14:15:18 CET,Sat Nov 27 16:07:29 CET,0.0 1.983 2.738 3.312 3.793 4.219 4.602 4.955 5.618 5.938 6.242 6.535 7.063 7.327 7.831 8.277 8.671 8.862 9.272 9.686 10.254 10.613 10.966 11.485 11.959 12.414 12.856 13.282 13.851 14.395 14.891 15.458 16.019 16.587 17.208 17.888 18.543 19.251 20.014 20.822 21.66 22.543 23.483 24.41 25.405 26.421 27.545 28.51 29.353 29.996 29.752 28.191 26.368 24.58 22.81 21.204 19.794 18.443 17.213 15.95 14.8 13.771 12.785 11.842 10.984 10.205 9.378 8.604 7.943 7.248 6.497 5.896 5.292 4.655 4.153 3.621 3.068 2.503 1.899 1.457 1.024 0.37 -0.136 -0.686 -0.952 -1.493 -2.051 -2.66 -2.982 -3.567 -3.978 -4.332 -4.697 -5.528 -6.003 -6.496 -7.032 -7.648 -8.358 -9.342 -12.202 -6 ,11208 ,TETRA ,17585679,Sat Nov 27 14:15:18 CET,Sat Nov 27 16:06:35 CET,0.0 1.843 2.525 3.086 3.581 4.043 4.48 4.829 5.43 5.726 6.035 6.364 6.894 7.165 7.668 8.134 8.584 8.793 9.195 9.593 10.157 10.489 10.798 11.288 11.797 12.325 12.819 13.228 13.748 14.284 14.758 15.299 15.834 16.367 16.997 17.678 18.304 19.014 19.796 20.573 21.346 22.168 23.112 24.045 25.069 26.176 27.291 28.222 29.099 29.753 29.391 28.026 26.54 24.827 23.17 21.605 20.113 18.711 17.45 16.142 14.98 13.967 12.981 12.031 11.159 10.362 9.544 8.794 8.129 7.405 6.659 6.082 5.479 4.813 4.263 3.722 3.203 2.633 2.023 1.587 1.127 0.45 -0.002 -0.467 -0.706 -1.204 -1.739 -2.314 -2.618 -3.209 -3.617 -3.962 -4.314 -5.087 -5.538 -6.033 -6.574 -7.239 -8.012 -8.897 -12.622 -7 ,10306 ,TETRA ,17585680,Sat Nov 27 14:16:17 CET,Sat Nov 27 15:52:18 CET,0.0 1.953 2.632 3.171 3.635 4.066 4.468 4.842 5.494 5.78 6.072 6.368 6.89 7.145 7.61 8.047 8.481 8.708 9.165 9.57 10.108 10.45 10.766 11.231 11.725 12.196 12.624 13.048 13.617 14.204 14.729 15.303 15.898 16.476 17.106 17.793 18.443 19.143 19.877 20.636 21.424 22.334 23.39 24.36 25.408 26.39 27.365 28.374 29.187 29.68 29.305 27.794 26.067 24.261 22.489 20.771 19.21 17.715 16.395 15.103 13.948 12.919 11.95 11.038 10.175 9.376 8.552 7.811 7.166 6.491 5.762 5.154 4.549 3.924 3.43 2.928 2.374 1.741 1.094 0.679 0.271 -0.375 -0.863 -1.391 -1.654 -2.213 -2.813 -3.419 -3.733 -4.339 -4.74 -5.069 -5.422 -6.218 -6.649 -7.14 -7.711 -8.353 -9.111 -10.11 -12.994 -8 ,15842 ,TETRA ,17585681,Sat Nov 27 14:17:16 CET,Sat Nov 27 16:08:37 CET,0.0 1.745 2.381 2.916 3.378 3.775 4.148 4.505 5.16 5.469 5.766 6.07 6.608 6.872 7.371 7.844 8.31 8.54 8.946 9.334 9.925 10.311 10.689 11.203 11.67 12.095 12.498 12.905 13.433 13.95 14.467 15.096 15.708 16.279 16.909 17.593 18.247 18.957 19.709 20.522 21.315 22.15 23.111 24.054 25.103 26.169 27.269 28.384 29.28 29.649 29.161 27.595 25.702 23.762 21.985 20.423 18.966 17.583 16.351 15.087 14.004 13.069 12.183 11.331 10.541 9.792 8.921 8.155 7.558 6.944 6.268 5.689 5.088 4.464 3.981 3.47 2.934 2.376 1.778 1.38 0.968 0.241 -0.261 -0.754 -1.016 -1.526 -2.043 -2.574 -2.847 -3.412 -3.792 -4.145 -4.522 -5.372 -5.831 -6.293 -6.799 -7.4 -8.075 -8.95 -11.892 -9 ,4195 ,TETRA ,17585682,Sat Nov 27 14:17:16 CET,Sat Nov 27 16:08:36 CET,0.0 2.052 2.779 3.327 3.766 4.173 4.578 4.966 5.648 5.948 6.24 6.535 7.052 7.29 7.744 8.178 8.582 8.784 9.202 9.612 10.162 10.504 10.854 11.343 11.804 12.252 12.664 13.063 13.586 14.068 14.523 15.094 15.67 16.208 16.798 17.465 18.101 18.788 19.52 20.294 21.094 21.948 22.875 23.775 24.784 25.793 26.807 27.714 28.533 29.11 28.717 27.246 25.42 23.485 21.79 20.24 18.734 17.24 15.912 14.671 13.619 12.619 11.661 10.746 9.859 9.055 8.224 7.442 6.76 6.073 5.324 4.698 4.054 3.394 2.908 2.344 1.716 1.107 0.475 0.047 -0.387 -1.046 -1.491 -1.962 -2.21 -2.764 -3.341 -3.927 -4.232 -4.836 -5.244 -5.59 -5.948 -6.771 -7.234 -7.73 -8.302 -8.947 -9.694 -10.739 -13.837 -10 ,32147 ,TETRA ,17585683,Sat Nov 27 14:17:17 CET,Sat Nov 27 16:03:36 CET,0.0 1.745 2.484 3.062 3.526 3.945 4.332 4.694 5.371 5.688 5.998 6.293 6.8 7.04 7.502 7.95 8.371 8.569 8.946 9.321 9.872 10.209 10.512 10.963 11.417 11.873 12.303 12.716 13.242 13.72 14.179 14.747 15.33 15.879 16.515 17.233 17.883 18.558 19.297 20.049 20.772 21.558 22.479 23.384 24.391 25.552 26.854 27.938 28.741 29.269 29.012 27.599 25.823 24.086 22.422 20.707 19.164 17.75 16.441 15.103 13.974 12.963 11.98 11.044 10.191 9.422 8.601 7.849 7.192 6.521 5.831 5.25 4.607 3.937 3.434 2.934 2.416 1.841 1.245 0.854 0.421 -0.328 -0.803 -1.268 -1.534 -2.083 -2.602 -3.151 -3.451 -4.035 -4.429 -4.778 -5.159 -5.992 -6.431 -6.931 -7.489 -8.103 -8.863 -9.794 -12.297 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 8207d978..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15821 ,TETRA ,17585684,Sat Nov 27 14:17:16 CET,Sat Nov 27 16:05:45 CET,0.0 0.471 0.825 1.101 1.36 1.614 1.857 2.291 2.496 2.686 2.866 3.181 3.335 3.631 3.918 4.197 4.328 4.574 4.825 5.205 5.441 5.672 6.013 6.334 6.652 6.958 7.25 7.629 7.994 8.362 8.81 9.235 9.656 10.145 10.685 11.216 11.819 12.46 13.125 13.799 14.56 15.49 16.418 17.464 18.65 20.048 21.586 23.295 25.197 27.151 28.341 28.715 28.7 28.525 28.215 27.842 27.457 27.083 26.639 26.207 25.791 25.372 24.955 24.547 24.177 23.775 23.396 23.069 22.717 22.335 22.01 21.678 21.329 21.049 20.75 20.427 20.099 19.721 19.45 19.18 18.757 18.439 18.08 17.897 17.529 17.148 16.742 16.531 16.173 15.755 15.442 15.144 14.42 14.0 13.553 13.031 12.417 11.673 10.595 -2 ,24179 ,TETRA ,17585685,Sat Nov 27 14:17:16 CET,Sat Nov 27 16:06:02 CET,0.0 0.429 0.819 1.161 1.454 1.722 1.949 2.355 2.554 2.749 2.976 3.318 3.496 3.834 4.151 4.46 4.608 4.893 5.174 5.587 5.851 6.111 6.491 6.856 7.219 7.568 7.9 8.337 8.753 9.148 9.632 10.094 10.526 11.011 11.549 12.055 12.621 13.241 13.886 14.567 15.328 16.24 17.172 18.3 19.619 21.048 22.54 24.303 26.381 28.569 29.806 30.246 30.239 29.979 29.629 29.221 28.811 28.421 28.009 27.607 27.202 26.813 26.436 26.066 25.707 25.295 24.922 24.599 24.257 23.901 23.58 23.223 22.838 22.548 22.259 21.929 21.589 21.242 20.983 20.707 20.263 19.929 19.575 19.403 19.054 18.684 18.278 18.056 17.689 17.277 16.965 16.647 16.026 15.697 15.29 14.76 14.103 13.301 12.239 -3 ,917 ,TETRA ,17585686,Sat Nov 27 14:18:17 CET,Sat Nov 27 16:07:16 CET,0.0 0.52 0.916 1.24 1.518 1.787 2.045 2.487 2.688 2.887 3.105 3.441 3.614 3.951 4.273 4.577 4.725 5.001 5.251 5.603 5.824 6.038 6.358 6.667 6.978 7.287 7.58 7.966 8.335 8.683 9.113 9.532 9.922 10.38 10.899 11.413 11.99 12.613 13.296 14.017 14.812 15.776 16.748 17.798 18.961 20.345 21.904 23.66 25.573 27.625 28.938 29.305 29.198 28.914 28.56 28.179 27.774 27.383 26.942 26.507 26.123 25.768 25.399 25.009 24.635 24.266 23.933 23.606 23.263 22.921 22.609 22.253 21.901 21.624 21.317 20.992 20.623 20.227 19.966 19.698 19.245 18.914 18.557 18.374 17.999 17.588 17.155 16.927 16.555 16.143 15.837 15.521 14.862 14.475 13.999 13.481 12.875 12.062 10.994 -4 ,21168 ,TETRA ,17585687,Sat Nov 27 14:18:17 CET,Sat Nov 27 16:05:22 CET,0.0 0.451 0.821 1.149 1.453 1.743 2.006 2.48 2.688 2.881 3.094 3.416 3.561 3.851 4.125 4.402 4.547 4.833 5.106 5.501 5.75 5.991 6.337 6.675 7.016 7.357 7.682 8.085 8.469 8.841 9.289 9.722 10.135 10.601 11.119 11.642 12.229 12.876 13.564 14.259 15.031 15.946 16.913 18.039 19.213 20.551 22.086 23.772 25.666 27.751 29.053 29.408 29.313 29.091 28.771 28.358 27.916 27.522 27.116 26.689 26.296 25.954 25.545 25.111 24.727 24.305 23.904 23.561 23.19 22.8 22.488 22.11 21.706 21.419 21.125 20.835 20.519 20.158 19.893 19.605 19.17 18.868 18.548 18.377 17.997 17.592 17.147 16.911 16.543 16.168 15.867 15.526 14.777 14.327 13.812 13.287 12.661 11.88 10.776 -5 ,12891 ,TETRA ,17585688,Sat Nov 27 14:18:17 CET,Sat Nov 27 16:07:43 CET,0.0 0.515 0.895 1.218 1.505 1.771 2.022 2.475 2.691 2.894 3.109 3.442 3.614 3.927 4.218 4.497 4.629 4.892 5.142 5.494 5.738 5.989 6.354 6.705 7.029 7.331 7.623 7.999 8.354 8.705 9.145 9.571 9.985 10.458 10.994 11.527 12.106 12.715 13.345 14.017 14.786 15.682 16.613 17.694 18.846 20.126 21.59 23.345 25.354 27.337 28.345 28.569 28.516 28.242 27.803 27.345 26.918 26.508 26.056 25.615 25.189 24.785 24.383 23.984 23.61 23.22 22.828 22.481 22.137 21.773 21.453 21.113 20.762 20.488 20.203 19.888 19.564 19.212 18.951 18.691 18.294 17.991 17.661 17.49 17.131 16.75 16.349 16.139 15.775 15.404 15.131 14.814 14.162 13.791 13.382 12.885 12.262 11.405 10.175 -6 ,7040 ,TETRA ,17585689,Sat Nov 27 14:19:18 CET,Sat Nov 27 16:08:40 CET,0.0 0.48 0.857 1.145 1.383 1.612 1.846 2.281 2.469 2.643 2.823 3.144 3.297 3.591 3.882 4.177 4.316 4.587 4.849 5.212 5.444 5.67 6.011 6.348 6.663 6.968 7.266 7.647 8.022 8.397 8.887 9.391 9.856 10.345 10.86 11.368 11.934 12.56 13.289 14.062 14.879 15.808 16.699 17.755 19.0 20.397 21.917 23.738 25.788 27.903 29.198 29.54 29.54 29.37 29.089 28.712 28.31 27.924 27.497 27.099 26.702 26.295 25.907 25.531 25.155 24.75 24.376 24.048 23.701 23.286 22.91 22.509 22.075 21.761 21.458 21.108 20.698 20.278 20.003 19.711 19.273 18.987 18.67 18.498 18.144 17.747 17.28 17.046 16.679 16.308 16.019 15.68 14.947 14.525 14.038 13.55 12.9 11.96 10.65 -7 ,32439 ,TETRA ,17585690,Sat Nov 27 14:19:19 CET,Sat Nov 27 16:06:58 CET,0.0 0.508 0.872 1.23 1.537 1.781 2.005 2.391 2.576 2.757 2.941 3.262 3.425 3.749 4.065 4.365 4.503 4.776 5.054 5.456 5.706 5.959 6.355 6.731 7.081 7.42 7.75 8.18 8.604 9.023 9.52 10.003 10.481 11.03 11.608 12.119 12.68 13.294 13.931 14.608 15.415 16.38 17.351 18.463 19.697 21.101 22.571 24.234 26.143 28.191 29.402 29.72 29.685 29.501 29.167 28.647 28.128 27.743 27.329 26.914 26.515 26.115 25.697 25.275 24.908 24.52 24.168 23.85 23.493 23.131 22.819 22.502 22.18 21.907 21.621 21.305 20.955 20.562 20.279 20.009 19.576 19.259 18.929 18.748 18.392 18.01 17.557 17.32 16.951 16.547 16.259 15.952 15.257 14.859 14.383 13.85 13.191 12.382 11.193 -8 ,31791 ,TETRA ,17585691,Sat Nov 27 14:20:18 CET,Sat Nov 27 16:10:16 CET,0.0 0.466 0.856 1.168 1.446 1.711 1.969 2.416 2.615 2.811 3.004 3.326 3.483 3.786 4.088 4.376 4.513 4.773 5.033 5.418 5.661 5.895 6.221 6.541 6.864 7.176 7.48 7.867 8.242 8.611 9.06 9.501 9.933 10.427 10.964 11.48 12.057 12.682 13.327 13.987 14.748 15.688 16.643 17.741 18.943 20.276 21.737 23.437 25.384 27.481 28.733 29.106 29.074 28.834 28.499 28.098 27.682 27.298 26.875 26.457 26.048 25.629 25.205 24.811 24.444 24.048 23.7 23.378 22.982 22.558 22.212 21.837 21.431 21.137 20.853 20.537 20.2 19.84 19.592 19.337 18.881 18.533 18.199 18.02 17.639 17.262 16.864 16.636 16.256 15.875 15.595 15.3 14.696 14.35 13.945 13.476 12.933 12.256 11.009 -9 ,27315 ,TETRA ,17585692,Sat Nov 27 14:19:19 CET,Sat Nov 27 16:07:59 CET,0.0 0.524 0.92 1.242 1.534 1.795 2.035 2.468 2.664 2.854 3.05 3.374 3.54 3.853 4.129 4.396 4.527 4.781 5.027 5.384 5.61 5.821 6.142 6.476 6.796 7.1 7.402 7.79 8.173 8.535 8.972 9.399 9.802 10.277 10.82 11.326 11.876 12.489 13.154 13.851 14.646 15.564 16.473 17.529 18.707 20.077 21.612 23.316 25.197 27.255 28.49 28.868 28.853 28.575 28.194 27.823 27.422 26.997 26.527 26.129 25.734 25.323 24.937 24.58 24.25 23.891 23.528 23.185 22.825 22.429 22.117 21.789 21.414 21.132 20.836 20.526 20.22 19.875 19.586 19.276 18.807 18.472 18.133 17.972 17.646 17.286 16.885 16.653 16.287 15.922 15.613 15.292 14.558 14.12 13.694 13.178 12.506 11.642 10.321 -10 ,20644 ,TETRA ,17585693,Sat Nov 27 14:19:19 CET,Sat Nov 27 16:09:00 CET,0.0 0.482 0.856 1.186 1.479 1.73 1.953 2.338 2.526 2.722 2.92 3.238 3.39 3.674 3.952 4.22 4.348 4.597 4.847 5.203 5.429 5.656 5.995 6.327 6.644 6.951 7.266 7.697 8.117 8.534 9.055 9.544 10.015 10.574 11.166 11.688 12.254 12.864 13.496 14.175 14.964 15.866 16.79 17.892 19.107 20.489 22.003 23.728 25.61 27.627 28.967 29.432 29.417 29.179 28.874 28.481 28.025 27.544 27.035 26.606 26.196 25.794 25.404 25.007 24.615 24.186 23.802 23.443 23.07 22.7 22.399 22.074 21.705 21.428 21.143 20.832 20.509 20.166 19.916 19.651 19.228 18.912 18.577 18.397 18.005 17.603 17.163 16.915 16.531 16.153 15.881 15.582 14.92 14.511 14.038 13.483 12.824 12.047 10.726 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt deleted file mode 100644 index 73421f69..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3408 ,TETRA ,17585694,Sat Nov 27 14:19:19 CET,Sat Nov 27 15:54:20 CET,0.0 0.403 0.741 0.997 1.209 1.417 1.611 1.965 2.131 2.295 2.472 2.79 2.945 3.24 3.533 3.835 3.984 4.272 4.563 4.977 5.236 5.499 5.881 6.247 6.602 6.953 7.296 7.744 8.171 8.592 9.113 9.62 10.119 10.694 11.337 11.972 12.688 13.454 14.279 15.162 16.168 17.353 18.543 19.944 21.552 23.435 25.572 28.094 31.126 34.801 37.62 39.196 40.157 40.689 40.952 41.059 41.078 41.04 40.962 40.826 40.667 40.506 40.308 40.071 39.848 39.619 39.379 39.156 38.935 38.699 38.479 38.222 37.937 37.718 37.504 37.306 37.1 36.857 36.682 36.494 36.189 35.963 35.725 35.6 35.315 34.982 34.641 34.476 34.18 33.892 33.673 33.415 32.841 32.499 32.143 31.749 31.238 30.565 29.602 -2 ,7089 ,TETRA ,17585695,Sat Nov 27 14:20:18 CET,Sat Nov 27 15:53:17 CET,0.0 0.329 0.589 0.808 1.025 1.235 1.422 1.754 1.922 2.091 2.252 2.566 2.734 3.057 3.352 3.655 3.804 4.088 4.367 4.779 5.045 5.305 5.679 6.042 6.409 6.769 7.114 7.557 7.991 8.413 8.929 9.431 9.903 10.462 11.109 11.723 12.423 13.202 14.037 14.939 15.977 17.186 18.39 19.822 21.448 23.326 25.491 28.11 31.181 34.87 37.832 39.469 40.443 41.005 41.326 41.458 41.477 41.432 41.31 41.173 41.019 40.833 40.628 40.414 40.212 39.982 39.771 39.593 39.372 39.119 38.92 38.705 38.471 38.274 38.063 37.849 37.617 37.346 37.145 36.92 36.563 36.316 36.051 35.918 35.624 35.309 34.975 34.797 34.51 34.228 34.013 33.764 33.212 32.882 32.513 32.116 31.603 30.933 30.03 -3 ,19701 ,TETRA ,17585696,Sat Nov 27 14:20:18 CET,Sat Nov 27 16:08:31 CET,0.0 0.366 0.619 0.864 1.099 1.31 1.5 1.853 2.023 2.19 2.343 2.668 2.829 3.141 3.441 3.716 3.849 4.131 4.409 4.776 5.015 5.255 5.606 5.96 6.292 6.614 6.937 7.351 7.75 8.147 8.654 9.165 9.664 10.239 10.895 11.542 12.26 13.043 13.887 14.776 15.807 17.024 18.228 19.662 21.271 23.129 25.279 27.816 30.84 34.524 37.492 39.135 40.06 40.596 40.874 41.003 41.011 40.92 40.796 40.658 40.505 40.327 40.12 39.903 39.692 39.445 39.202 38.978 38.75 38.508 38.292 38.066 37.821 37.606 37.37 37.124 36.872 36.622 36.436 36.222 35.888 35.645 35.372 35.229 34.923 34.579 34.21 34.011 33.707 33.413 33.183 32.947 32.4 32.07 31.66 31.183 30.658 30.017 29.109 -4 ,24088 ,TETRA ,17585697,Sat Nov 27 14:20:17 CET,Sat Nov 27 16:08:02 CET,0.0 0.313 0.583 0.827 1.043 1.237 1.429 1.793 1.953 2.111 2.258 2.563 2.711 3.004 3.277 3.54 3.674 3.935 4.186 4.57 4.819 5.06 5.407 5.74 6.067 6.387 6.698 7.11 7.527 7.93 8.424 8.93 9.427 9.999 10.654 11.301 12.017 12.798 13.636 14.516 15.497 16.672 17.883 19.312 20.931 22.803 24.99 27.622 30.748 34.418 37.264 38.867 39.859 40.408 40.661 40.762 40.765 40.669 40.513 40.343 40.163 39.981 39.792 39.6 39.398 39.171 38.963 38.779 38.575 38.342 38.132 37.912 37.655 37.437 37.223 37.01 36.762 36.492 36.305 36.098 35.773 35.543 35.307 35.181 34.903 34.572 34.195 33.992 33.671 33.361 33.138 32.89 32.305 31.959 31.558 31.108 30.61 29.921 28.985 -5 ,29233 ,TETRA ,17585698,Sat Nov 27 14:21:17 CET,Sat Nov 27 16:09:19 CET,0.0 0.278 0.535 0.79 1.015 1.213 1.408 1.769 1.942 2.119 2.302 2.617 2.763 3.051 3.328 3.603 3.738 4.004 4.259 4.624 4.86 5.089 5.429 5.766 6.105 6.441 6.762 7.171 7.578 7.983 8.483 8.97 9.443 9.986 10.61 11.247 11.969 12.756 13.574 14.462 15.51 16.727 17.958 19.405 21.031 22.915 25.069 27.607 30.611 34.254 37.114 38.696 39.689 40.27 40.574 40.701 40.664 40.579 40.477 40.321 40.138 39.943 39.727 39.505 39.31 39.099 38.884 38.682 38.45 38.188 37.976 37.749 37.49 37.283 37.08 36.851 36.592 36.316 36.114 35.908 35.582 35.342 35.082 34.954 34.692 34.387 34.042 33.866 33.571 33.251 33.007 32.748 32.184 31.883 31.536 31.087 30.565 29.929 28.898 -6 ,30145 ,TETRA ,17585699,Sat Nov 27 14:21:18 CET,Sat Nov 27 16:10:50 CET,0.0 0.333 0.599 0.822 1.023 1.225 1.419 1.783 1.951 2.106 2.251 2.563 2.71 2.99 3.264 3.541 3.675 3.931 4.189 4.56 4.8 5.041 5.391 5.724 6.045 6.364 6.683 7.104 7.508 7.896 8.383 8.856 9.315 9.858 10.478 11.096 11.786 12.53 13.338 14.194 15.186 16.376 17.572 18.995 20.621 22.533 24.732 27.305 30.398 34.149 37.097 38.636 39.547 40.118 40.396 40.479 40.522 40.503 40.397 40.264 40.106 39.903 39.677 39.47 39.268 39.022 38.785 38.569 38.335 38.08 37.856 37.602 37.334 37.113 36.874 36.643 36.402 36.154 35.984 35.798 35.492 35.252 34.971 34.829 34.55 34.241 33.889 33.709 33.408 33.074 32.834 32.578 32.034 31.736 31.379 30.916 30.376 29.702 28.739 -7 ,6441 ,TETRA ,17585700,Sat Nov 27 14:21:17 CET,Sat Nov 27 16:09:35 CET,0.0 0.298 0.566 0.819 1.055 1.274 1.467 1.834 2.011 2.188 2.372 2.698 2.853 3.144 3.428 3.703 3.839 4.113 4.377 4.767 5.022 5.264 5.619 5.965 6.285 6.604 6.928 7.361 7.794 8.212 8.718 9.215 9.7 10.268 10.911 11.524 12.208 12.958 13.786 14.684 15.719 16.939 18.145 19.561 21.183 23.075 25.227 27.75 30.741 34.334 37.276 38.993 40.059 40.633 40.937 41.081 41.097 41.034 40.922 40.805 40.67 40.491 40.295 40.108 39.902 39.647 39.4 39.188 38.982 38.745 38.534 38.318 38.063 37.841 37.601 37.35 37.093 36.822 36.621 36.414 36.089 35.841 35.578 35.442 35.155 34.838 34.496 34.312 34.021 33.764 33.572 33.341 32.771 32.428 32.042 31.588 31.035 30.368 29.435 -8 ,27370 ,TETRA ,17585701,Sat Nov 27 14:21:17 CET,Sat Nov 27 16:09:13 CET,0.0 0.284 0.565 0.817 1.028 1.223 1.414 1.796 1.982 2.146 2.281 2.585 2.733 3.029 3.306 3.574 3.711 3.981 4.236 4.604 4.84 5.069 5.404 5.739 6.076 6.413 6.746 7.183 7.617 8.054 8.589 9.089 9.566 10.121 10.766 11.404 12.113 12.886 13.713 14.602 15.61 16.806 18.033 19.479 21.1 22.98 25.152 27.758 30.828 34.554 37.6 39.267 40.236 40.796 41.101 41.263 41.297 41.244 41.13 40.985 40.828 40.65 40.456 40.263 40.079 39.868 39.666 39.479 39.254 38.994 38.772 38.53 38.278 38.067 37.815 37.548 37.303 37.058 36.872 36.683 36.385 36.154 35.904 35.771 35.504 35.209 34.852 34.663 34.36 34.038 33.832 33.614 33.061 32.769 32.433 32.001 31.474 30.778 29.763 -9 ,506 ,TETRA ,17585702,Sat Nov 27 14:21:17 CET,Sat Nov 27 16:09:00 CET,0.0 0.398 0.684 0.955 1.202 1.397 1.581 1.952 2.133 2.301 2.467 2.778 2.921 3.207 3.483 3.752 3.889 4.161 4.423 4.813 5.067 5.311 5.666 6.012 6.351 6.677 7.004 7.437 7.861 8.273 8.764 9.231 9.686 10.233 10.865 11.478 12.148 12.891 13.702 14.562 15.568 16.761 17.971 19.413 21.05 23.0 25.21 27.828 30.957 34.62 37.525 39.204 40.189 40.76 41.101 41.232 41.232 41.185 41.09 40.969 40.815 40.626 40.417 40.207 40.002 39.767 39.547 39.339 39.104 38.864 38.666 38.445 38.189 37.988 37.784 37.562 37.316 37.042 36.843 36.631 36.298 36.062 35.803 35.672 35.424 35.142 34.816 34.641 34.348 34.05 33.823 33.57 32.96 32.635 32.284 31.859 31.345 30.689 29.771 -10 ,25089 ,TETRA ,17585703,Sat Nov 27 14:23:16 CET,Sat Nov 27 16:13:53 CET,0.0 0.371 0.659 0.912 1.133 1.319 1.502 1.844 2.013 2.189 2.351 2.66 2.814 3.114 3.396 3.665 3.797 4.059 4.312 4.68 4.934 5.18 5.528 5.865 6.195 6.517 6.83 7.243 7.652 8.047 8.53 9.01 9.471 10.006 10.638 11.272 11.986 12.77 13.6 14.478 15.476 16.674 17.915 19.363 21.014 22.904 25.057 27.697 30.843 34.588 37.53 39.153 40.09 40.59 40.853 40.982 41.002 40.944 40.817 40.652 40.489 40.307 40.083 39.863 39.655 39.408 39.178 38.986 38.76 38.503 38.268 37.992 37.723 37.529 37.313 37.08 36.828 36.568 36.378 36.166 35.852 35.627 35.384 35.253 34.951 34.626 34.279 34.095 33.799 33.505 33.284 33.028 32.45 32.119 31.737 31.302 30.807 30.167 29.189 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index 71d3c736..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16657 ,TETRA ,17585704,Sat Nov 27 14:25:17 CET,Sat Nov 27 16:16:56 CET,0.0 0.622 1.114 1.561 1.97 2.339 2.681 3.308 3.615 3.92 4.169 4.763 5.022 5.536 6.018 6.489 6.721 7.182 7.638 8.313 8.756 9.191 9.821 10.419 11.008 11.593 12.177 12.928 13.65 14.382 15.299 16.192 17.083 18.125 19.295 20.449 21.747 23.152 24.651 26.264 28.104 30.297 32.535 35.178 38.245 41.833 45.979 51.017 57.126 64.683 70.951 74.531 76.721 78.092 78.995 79.568 79.875 79.996 80.034 80.011 79.942 79.832 79.654 79.423 79.207 78.938 78.648 78.391 78.105 77.788 77.51 77.203 76.851 76.574 76.286 75.961 75.59 75.207 74.938 74.644 74.195 73.885 73.57 73.403 73.031 72.624 72.185 71.958 71.465 71.196 70.892 70.545 69.769 69.287 68.682 68.007 67.254 66.299 64.941 -2 ,2614 ,TETRA ,17585705,Sat Nov 27 14:25:18 CET,Sat Nov 27 16:19:15 CET,0.0 0.598 1.099 1.527 1.931 2.324 2.69 3.347 3.663 3.971 4.213 4.803 5.063 5.565 6.054 6.539 6.781 7.269 7.735 8.401 8.831 9.254 9.898 10.516 11.119 11.725 12.321 13.094 13.855 14.608 15.524 16.398 17.242 18.243 19.398 20.528 21.795 23.176 24.651 26.244 28.081 30.263 32.5 35.172 38.244 41.908 46.084 50.985 56.997 64.529 70.774 74.28 76.431 77.845 78.707 79.193 79.437 79.517 79.487 79.362 79.183 78.972 78.742 78.503 78.285 78.026 77.759 77.509 77.205 76.845 76.57 76.275 75.927 75.626 75.292 74.955 74.615 74.263 74.002 73.716 73.244 72.904 72.553 72.365 71.968 71.541 71.07 70.818 70.294 69.954 69.633 69.308 68.547 68.112 67.604 66.96 66.19 65.166 63.695 -3 ,14489 ,TETRA ,17585706,Sat Nov 27 14:24:18 CET,Sat Nov 27 16:15:03 CET,0.0 0.625 1.124 1.551 1.921 2.269 2.604 3.261 3.58 3.888 4.141 4.738 5.007 5.524 6.028 6.524 6.765 7.239 7.704 8.378 8.809 9.226 9.851 10.47 11.067 11.648 12.227 13.002 13.751 14.476 15.357 16.218 17.065 18.068 19.219 20.345 21.617 23.002 24.464 26.01 27.811 30.005 32.246 34.893 37.924 41.486 45.605 50.554 56.496 63.872 70.073 73.69 75.886 77.222 78.065 78.618 78.869 78.909 78.913 78.801 78.654 78.494 78.299 78.068 77.816 77.562 77.33 77.097 76.836 76.552 76.303 76.038 75.749 75.509 75.261 74.998 74.696 74.362 74.106 73.817 73.345 73.017 72.678 72.503 72.152 71.769 71.292 71.032 70.513 70.196 69.855 69.477 68.703 68.267 67.776 67.202 66.497 65.558 64.298 -4 ,21746 ,TETRA ,17585707,Sat Nov 27 14:24:19 CET,Sat Nov 27 16:16:00 CET,0.0 0.604 1.108 1.551 1.949 2.32 2.675 3.359 3.676 3.977 4.22 4.826 5.102 5.63 6.134 6.631 6.874 7.34 7.797 8.467 8.896 9.318 9.945 10.553 11.144 11.727 12.306 13.055 13.783 14.509 15.404 16.265 17.119 18.123 19.257 20.374 21.623 22.985 24.484 26.124 27.97 30.131 32.361 34.98 37.975 41.539 45.637 50.63 56.751 64.327 70.355 73.842 76.061 77.389 78.274 78.876 79.253 79.402 79.425 79.353 79.206 79.004 78.798 78.609 78.432 78.204 77.971 77.75 77.498 77.23 76.964 76.638 76.31 76.069 75.791 75.463 75.085 74.626 74.294 73.972 73.465 73.078 72.643 72.409 71.918 71.413 70.852 70.547 69.965 69.449 69.052 68.655 67.762 67.274 66.701 65.947 65.062 64.017 62.414 -5 ,13832 ,TETRA ,17585708,Sat Nov 27 14:25:18 CET,Sat Nov 27 16:17:20 CET,0.0 0.568 1.048 1.495 1.884 2.231 2.559 3.178 3.486 3.788 4.032 4.634 4.895 5.398 5.896 6.378 6.616 7.073 7.511 8.153 8.582 9.008 9.626 10.227 10.823 11.406 11.978 12.734 13.47 14.184 15.078 15.954 16.797 17.788 18.928 20.048 21.284 22.635 24.119 25.729 27.579 29.756 31.996 34.729 37.844 41.473 45.687 50.77 56.877 64.354 70.64 74.337 76.52 77.824 78.692 79.225 79.545 79.673 79.661 79.587 79.5 79.342 79.101 78.846 78.554 78.259 78.003 77.761 77.509 77.201 76.933 76.661 76.321 76.023 75.724 75.409 75.056 74.693 74.419 74.108 73.646 73.341 73.004 72.827 72.453 72.055 71.629 71.369 70.812 70.48 70.172 69.8 69.028 68.606 68.09 67.441 66.697 65.807 64.325 -6 ,7669 ,TETRA ,17585709,Sat Nov 27 14:25:19 CET,Sat Nov 27 16:17:20 CET,0.0 0.622 1.129 1.576 1.976 2.343 2.695 3.361 3.678 3.984 4.238 4.827 5.088 5.621 6.127 6.607 6.843 7.313 7.765 8.412 8.838 9.264 9.897 10.508 11.103 11.682 12.252 13.004 13.736 14.451 15.342 16.225 17.09 18.098 19.232 20.331 21.571 22.933 24.417 26.04 27.898 30.06 32.304 35.017 38.064 41.653 45.838 50.908 57.019 64.539 70.859 74.408 76.552 77.926 78.767 79.256 79.573 79.706 79.706 79.635 79.554 79.4 79.188 78.965 78.738 78.507 78.275 78.014 77.728 77.428 77.144 76.837 76.493 76.226 75.957 75.661 75.338 74.978 74.723 74.451 74.002 73.666 73.319 73.141 72.737 72.307 71.848 71.603 71.095 70.771 70.449 70.124 69.297 68.795 68.243 67.589 66.847 65.875 64.343 -7 ,30931 ,TETRA ,17585710,Sat Nov 27 14:25:19 CET,Sat Nov 27 16:18:07 CET,0.0 0.622 1.139 1.575 1.994 2.392 2.753 3.412 3.723 4.033 4.299 4.897 5.162 5.671 6.169 6.66 6.911 7.407 7.879 8.557 8.987 9.415 10.045 10.653 11.238 11.815 12.393 13.139 13.872 14.595 15.469 16.322 17.165 18.174 19.335 20.471 21.736 23.112 24.569 26.132 27.958 30.137 32.374 35.039 38.08 41.621 45.67 50.575 56.527 63.832 70.103 73.807 76.053 77.487 78.317 78.755 79.034 79.101 79.035 78.964 78.895 78.747 78.511 78.312 78.134 77.851 77.549 77.29 77.003 76.692 76.43 76.141 75.812 75.531 75.245 74.947 74.621 74.274 74.007 73.719 73.282 72.958 72.621 72.439 72.046 71.638 71.188 70.945 70.433 70.148 69.826 69.493 68.803 68.382 67.856 67.254 66.57 65.658 64.279 -8 ,48 ,TETRA ,17585711,Sat Nov 27 14:26:16 CET,Sat Nov 27 16:13:37 CET,0.0 0.6 1.074 1.487 1.865 2.226 2.574 3.227 3.536 3.834 4.078 4.678 4.947 5.473 5.982 6.472 6.713 7.189 7.65 8.326 8.757 9.172 9.8 10.431 11.035 11.618 12.184 12.93 13.655 14.357 15.222 16.073 16.919 17.909 19.049 20.158 21.379 22.741 24.22 25.77 27.603 29.837 32.048 34.667 37.698 41.306 45.493 50.539 56.612 64.076 70.408 74.289 76.604 77.91 78.794 79.434 79.757 79.858 79.863 79.79 79.716 79.574 79.375 79.153 78.92 78.626 78.333 78.074 77.786 77.475 77.19 76.882 76.573 76.296 75.982 75.657 75.331 75.004 74.746 74.45 73.979 73.679 73.367 73.194 72.812 72.406 71.972 71.736 71.214 70.895 70.591 70.258 69.558 69.139 68.616 67.992 67.234 66.217 64.794 -9 ,31779 ,TETRA ,17585712,Sat Nov 27 14:26:17 CET,Sat Nov 27 16:12:50 CET,0.0 0.636 1.151 1.584 1.965 2.325 2.666 3.311 3.615 3.908 4.155 4.752 5.019 5.535 6.037 6.515 6.753 7.227 7.69 8.353 8.786 9.221 9.861 10.473 11.067 11.655 12.232 12.967 13.681 14.393 15.272 16.135 16.986 18.0 19.153 20.271 21.533 22.916 24.388 25.971 27.82 30.049 32.307 34.977 37.992 41.543 45.686 50.619 56.483 63.788 70.009 73.592 75.761 77.102 77.973 78.509 78.778 78.845 78.829 78.771 78.628 78.395 78.156 77.949 77.724 77.448 77.178 76.919 76.625 76.31 76.072 75.807 75.508 75.257 74.958 74.648 74.33 73.982 73.735 73.462 73.011 72.662 72.297 72.117 71.728 71.31 70.866 70.619 70.076 69.714 69.388 69.039 68.198 67.684 67.102 66.426 65.651 64.739 63.551 -10 ,21721 ,TETRA ,17585713,Sat Nov 27 14:26:16 CET,Sat Nov 27 16:19:24 CET,0.0 0.635 1.149 1.601 1.991 2.345 2.686 3.345 3.647 3.937 4.169 4.762 5.028 5.561 6.089 6.587 6.823 7.287 7.726 8.358 8.787 9.215 9.838 10.453 11.06 11.641 12.208 12.963 13.712 14.433 15.309 16.182 17.034 18.036 19.175 20.271 21.504 22.855 24.311 25.897 27.754 29.965 32.187 34.793 37.753 41.325 45.51 50.58 56.75 64.172 70.27 73.796 75.923 77.262 78.197 78.771 79.017 79.104 79.162 79.136 79.008 78.819 78.614 78.395 78.172 77.94 77.721 77.49 77.206 76.889 76.615 76.317 75.993 75.736 75.456 75.151 74.813 74.451 74.197 73.931 73.455 73.095 72.719 72.536 72.149 71.706 71.229 70.983 70.476 70.191 69.876 69.524 68.792 68.401 67.951 67.351 66.582 65.653 64.219 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt deleted file mode 100644 index 8e8aeb11..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11333 ,TETRA ,17664533,Thu Dec 2 13:38:14 CET,Thu Dec 2 15:19:26 CET,0.0 2.125 2.914 3.511 4.035 4.503 4.917 5.318 6.08 6.425 6.758 7.061 7.695 8.003 8.587 9.146 9.692 9.959 10.478 10.992 11.751 12.232 12.698 13.405 14.097 14.759 15.399 16.011 16.811 17.617 18.394 19.35 20.307 21.231 22.325 23.572 24.774 26.105 27.533 29.036 30.637 32.465 34.64 36.917 39.653 42.704 46.173 50.167 54.983 60.795 68.012 74.257 78.084 80.533 82.133 83.266 83.971 84.368 84.545 84.541 84.496 84.407 84.236 84.007 83.757 83.508 83.217 82.922 82.654 82.382 82.096 81.858 81.567 81.24 80.978 80.696 80.422 80.128 79.797 79.567 79.324 78.918 78.614 78.282 78.107 77.743 77.365 76.986 76.775 76.278 76.04 75.773 75.491 74.854 74.484 74.05 73.612 73.099 72.355 71.288 67.584 -2 ,4358 ,TETRA ,17664534,Thu Dec 2 13:38:14 CET,Thu Dec 2 15:21:15 CET,0.0 1.623 2.451 3.089 3.605 4.08 4.532 4.939 5.665 6.024 6.376 6.689 7.323 7.628 8.228 8.789 9.312 9.574 10.097 10.613 11.372 11.852 12.307 12.98 13.636 14.26 14.881 15.497 16.309 17.114 17.889 18.821 19.721 20.598 21.656 22.9 24.108 25.434 26.847 28.34 29.946 31.783 33.98 36.262 38.922 41.903 45.489 49.672 54.703 60.747 68.092 74.245 77.885 80.203 81.688 82.66 83.272 83.643 83.804 83.811 83.726 83.605 83.419 83.194 82.955 82.712 82.426 82.114 81.838 81.554 81.23 80.956 80.665 80.361 80.118 79.857 79.574 79.263 78.935 78.694 78.443 78.056 77.764 77.459 77.299 76.931 76.537 76.125 75.913 75.441 75.219 74.952 74.644 73.946 73.563 73.139 72.668 72.094 71.37 70.313 66.603 -3 ,21826 ,TETRA ,17664535,Thu Dec 2 13:38:14 CET,Thu Dec 2 15:35:40 CET,0.0 1.951 2.707 3.301 3.835 4.32 4.771 5.192 5.928 6.271 6.624 6.981 7.643 7.96 8.565 9.15 9.707 9.962 10.449 10.942 11.669 12.143 12.598 13.259 13.915 14.555 15.182 15.811 16.643 17.451 18.227 19.18 20.121 21.011 22.031 23.219 24.385 25.662 27.072 28.625 30.261 32.111 34.276 36.452 39.032 42.007 45.56 49.635 54.443 60.315 67.795 74.088 77.794 80.076 81.499 82.482 83.119 83.444 83.603 83.654 83.589 83.477 83.327 83.165 82.97 82.726 82.442 82.196 81.963 81.692 81.385 81.119 80.808 80.472 80.2 79.89 79.58 79.268 78.941 78.708 78.463 78.038 77.727 77.411 77.248 76.927 76.581 76.169 75.927 75.416 75.152 74.863 74.558 73.923 73.56 73.135 72.651 72.076 71.381 70.49 65.92 -4 ,5836 ,TETRA ,17664536,Thu Dec 2 13:38:15 CET,Thu Dec 2 15:19:24 CET,0.0 1.814 2.522 3.112 3.603 4.05 4.464 4.879 5.659 6.011 6.352 6.677 7.305 7.616 8.228 8.792 9.344 9.613 10.135 10.655 11.398 11.864 12.323 12.989 13.645 14.286 14.928 15.563 16.36 17.14 17.907 18.836 19.749 20.628 21.648 22.823 23.966 25.225 26.641 28.195 29.82 31.658 33.81 36.017 38.659 41.607 45.143 49.301 54.181 60.11 67.485 73.692 77.327 79.511 80.932 81.918 82.471 82.762 82.916 83.04 83.085 82.976 82.786 82.586 82.377 82.072 81.637 81.259 80.995 80.75 80.471 80.224 79.939 79.627 79.382 79.126 78.848 78.537 78.171 77.905 77.638 77.232 76.93 76.605 76.439 76.085 75.726 75.319 75.096 74.604 74.365 74.118 73.859 73.188 72.772 72.313 71.778 71.216 70.535 69.571 64.645 -5 ,3301 ,TETRA ,17664537,Thu Dec 2 13:38:15 CET,Thu Dec 2 15:36:33 CET,0.0 1.759 2.498 3.106 3.641 4.106 4.543 4.965 5.717 6.069 6.421 6.793 7.445 7.755 8.346 8.937 9.513 9.785 10.317 10.839 11.604 12.083 12.557 13.286 13.988 14.656 15.314 15.96 16.8 17.605 18.37 19.299 20.21 21.112 22.205 23.46 24.65 25.978 27.454 29.042 30.687 32.52 34.682 36.871 39.46 42.423 45.948 50.007 54.9 60.816 68.142 74.419 78.116 80.515 82.144 83.117 83.635 83.994 84.146 84.188 84.159 84.06 83.897 83.685 83.469 83.228 82.94 82.692 82.459 82.206 81.923 81.682 81.412 81.117 80.867 80.595 80.311 80.012 79.701 79.467 79.221 78.824 78.532 78.219 78.059 77.737 77.392 76.98 76.758 76.282 76.053 75.789 75.521 74.859 74.473 74.072 73.641 73.157 72.47 71.431 67.802 -6 ,23819 ,TETRA ,17664538,Thu Dec 2 13:38:15 CET,Thu Dec 2 15:19:17 CET,0.0 1.643 2.467 3.098 3.644 4.125 4.56 4.958 5.683 6.027 6.367 6.694 7.332 7.651 8.276 8.863 9.421 9.695 10.232 10.763 11.555 12.06 12.541 13.224 13.876 14.513 15.149 15.792 16.631 17.43 18.209 19.177 20.127 21.044 22.111 23.328 24.512 25.847 27.31 28.89 30.592 32.553 34.875 37.255 40.106 43.356 47.021 51.162 56.103 61.944 69.269 75.459 79.05 81.282 82.693 83.606 84.228 84.588 84.673 84.683 84.65 84.547 84.414 84.227 84.013 83.816 83.552 83.277 83.011 82.723 82.426 82.161 81.893 81.603 81.358 81.09 80.784 80.463 80.144 79.921 79.673 79.248 78.952 78.643 78.482 78.119 77.703 77.28 77.068 76.581 76.308 76.036 75.744 75.033 74.635 74.239 73.811 73.291 72.706 71.853 67.103 -7 ,18292 ,TETRA ,17664539,Thu Dec 2 13:38:15 CET,Thu Dec 2 15:21:19 CET,0.0 1.759 2.457 3.028 3.524 3.975 4.368 4.758 5.536 5.903 6.253 6.582 7.212 7.504 8.091 8.654 9.186 9.449 9.964 10.476 11.226 11.706 12.179 12.867 13.533 14.167 14.799 15.427 16.233 17.021 17.789 18.725 19.65 20.56 21.618 22.82 23.98 25.284 26.741 28.327 30.027 31.936 34.183 36.511 39.322 42.521 46.235 50.437 55.476 61.504 68.805 75.035 78.678 80.981 82.403 83.303 83.921 84.296 84.449 84.478 84.365 84.224 84.13 83.978 83.773 83.575 83.346 83.105 82.845 82.532 82.224 81.98 81.707 81.398 81.149 80.871 80.584 80.316 80.023 79.809 79.58 79.202 78.898 78.568 78.4 78.047 77.659 77.201 76.964 76.478 76.263 75.98 75.674 75.049 74.707 74.303 73.799 73.235 72.497 71.347 66.701 -8 ,3402 ,TETRA ,17664540,Thu Dec 2 13:38:15 CET,Thu Dec 2 15:30:35 CET,0.0 1.505 2.285 2.909 3.425 3.886 4.315 4.712 5.474 5.832 6.161 6.464 7.089 7.391 7.968 8.524 9.076 9.349 9.879 10.39 11.143 11.62 12.08 12.782 13.48 14.155 14.787 15.41 16.249 17.059 17.857 18.834 19.77 20.685 21.769 23.004 24.216 25.555 27.012 28.575 30.196 32.024 34.173 36.391 39.035 42.005 45.492 49.498 54.343 60.32 67.771 73.99 77.642 79.967 81.5 82.507 83.098 83.462 83.651 83.65 83.56 83.455 83.3 83.119 82.916 82.687 82.441 82.189 81.96 81.713 81.432 81.189 80.91 80.58 80.298 80.009 79.71 79.368 78.97 78.697 78.428 78.011 77.722 77.406 77.231 76.868 76.523 76.162 75.964 75.483 75.226 74.955 74.656 73.915 73.524 73.122 72.641 72.051 71.335 70.261 65.596 -9 ,10900 ,TETRA ,17664541,Thu Dec 2 13:38:15 CET,Thu Dec 2 15:31:32 CET,0.0 2.082 2.889 3.504 4.054 4.55 5.0 5.404 6.153 6.514 6.863 7.196 7.824 8.119 8.669 9.195 9.745 10.023 10.555 11.068 11.817 12.295 12.752 13.436 14.123 14.798 15.447 16.069 16.899 17.71 18.481 19.42 20.34 21.22 22.25 23.407 24.563 25.914 27.353 28.882 30.508 32.357 34.557 36.83 39.535 42.628 46.217 50.283 55.265 61.282 68.699 74.912 78.52 80.787 82.3 83.312 83.922 84.29 84.457 84.443 84.357 84.23 84.019 83.81 83.609 83.38 83.118 82.883 82.652 82.363 82.024 81.741 81.45 81.126 80.867 80.582 80.28 79.972 79.654 79.432 79.201 78.81 78.526 78.195 78.02 77.721 77.356 76.914 76.703 76.23 75.977 75.699 75.365 74.539 74.08 73.572 72.986 72.352 71.532 70.405 66.422 -10 ,14139 ,TETRA ,17664542,Thu Dec 2 13:38:15 CET,Thu Dec 2 15:39:34 CET,0.0 2.068 2.841 3.428 3.967 4.454 4.891 5.304 6.087 6.437 6.783 7.118 7.759 8.07 8.659 9.22 9.767 10.041 10.566 11.065 11.811 12.296 12.772 13.476 14.153 14.807 15.466 16.104 16.916 17.712 18.486 19.428 20.348 21.261 22.333 23.531 24.689 26.005 27.471 29.015 30.607 32.447 34.628 36.882 39.611 42.642 46.158 50.294 55.307 61.313 68.634 74.766 78.357 80.63 82.135 83.104 83.704 84.093 84.241 84.229 84.15 84.011 83.815 83.628 83.428 83.214 82.967 82.708 82.479 82.235 81.93 81.629 81.296 80.981 80.761 80.525 80.23 79.894 79.567 79.339 79.089 78.678 78.386 78.08 77.92 77.58 77.215 76.827 76.617 76.123 75.901 75.647 75.353 74.606 74.183 73.744 73.224 72.618 71.868 70.837 67.645 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt deleted file mode 100644 index 7435b1a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22824 ,KEBNE ,17024192,Wed Dec 22 09:39:38 CET,Wed Dec 22 11:10:00 CET,0.0 1.298 1.919 2.405 2.825 3.236 3.644 4.008 4.686 5.014 5.328 5.602 6.207 6.481 6.995 7.48 7.946 8.177 8.624 9.065 9.716 10.152 10.593 11.213 11.803 12.38 12.945 13.507 14.24 14.944 15.644 16.501 17.323 18.131 19.097 20.192 21.244 22.418 23.718 25.126 26.621 28.34 30.388 32.509 35.035 37.957 41.464 45.509 50.434 56.434 63.865 70.233 74.185 76.823 78.577 79.765 80.625 81.198 81.496 81.731 81.885 81.926 81.911 81.867 81.76 81.635 81.476 81.311 81.163 80.967 80.717 80.487 80.244 80.007 79.812 79.589 79.375 79.134 78.843 78.65 78.432 78.047 77.784 77.502 77.353 77.056 76.729 76.358 76.148 75.687 75.482 75.233 74.968 74.364 74.02 73.621 73.163 72.614 71.967 71.085 68.254 -2 ,14234 ,KEBNE ,17024193,Wed Dec 22 09:39:39 CET,Wed Dec 22 11:09:53 CET,0.0 1.562 2.121 2.596 3.036 3.431 3.791 4.132 4.772 5.076 5.372 5.605 6.194 6.466 7.006 7.516 7.996 8.232 8.698 9.156 9.836 10.273 10.701 11.326 11.941 12.539 13.113 13.675 14.413 15.141 15.859 16.716 17.543 18.35 19.31 20.419 21.496 22.7 24.014 25.438 26.988 28.741 30.798 32.942 35.537 38.533 42.076 46.191 51.227 57.369 65.021 71.657 75.712 78.365 80.202 81.53 82.457 83.144 83.57 83.837 83.953 83.967 83.985 83.977 83.907 83.805 83.656 83.484 83.353 83.192 82.942 82.741 82.547 82.337 82.138 81.895 81.65 81.397 81.11 80.895 80.673 80.342 80.1 79.819 79.672 79.352 78.999 78.618 78.401 77.932 77.692 77.427 77.149 76.499 76.116 75.688 75.23 74.726 74.11 73.203 70.131 -3 ,14566 ,KEBNE ,17024194,Wed Dec 22 09:39:38 CET,Wed Dec 22 11:10:16 CET,0.0 1.201 1.822 2.289 2.699 3.093 3.493 3.874 4.574 4.9 5.208 5.466 6.074 6.351 6.889 7.386 7.87 8.104 8.563 9.017 9.688 10.118 10.529 11.126 11.718 12.314 12.892 13.452 14.189 14.918 15.63 16.511 17.382 18.219 19.189 20.282 21.34 22.537 23.86 25.303 26.865 28.631 30.74 32.905 35.465 38.388 41.85 45.907 50.863 56.911 64.577 71.384 75.48 78.151 80.0 81.336 82.315 82.977 83.398 83.694 83.851 83.907 83.87 83.789 83.7 83.591 83.458 83.308 83.129 82.925 82.697 82.495 82.276 82.026 81.816 81.593 81.356 81.097 80.809 80.604 80.38 80.016 79.761 79.492 79.36 79.082 78.74 78.362 78.162 77.692 77.445 77.183 76.897 76.285 75.952 75.566 75.123 74.589 73.92 73.02 70.18 -4 ,25423 ,KEBNE ,17024195,Wed Dec 22 09:39:38 CET,Wed Dec 22 11:09:52 CET,0.0 1.619 2.255 2.795 3.246 3.637 4.005 4.353 5.029 5.358 5.671 5.943 6.556 6.83 7.358 7.859 8.324 8.556 9.022 9.475 10.129 10.556 10.974 11.584 12.173 12.745 13.311 13.879 14.616 15.313 16.008 16.859 17.688 18.507 19.453 20.519 21.569 22.735 24.03 25.452 26.984 28.74 30.822 32.992 35.564 38.482 41.976 46.042 50.933 56.977 64.748 71.372 75.302 77.835 79.525 80.723 81.553 82.133 82.52 82.832 82.988 83.037 83.001 82.934 82.856 82.739 82.602 82.457 82.298 82.107 81.89 81.685 81.431 81.144 80.923 80.684 80.417 80.124 79.813 79.603 79.376 78.99 78.72 78.438 78.291 77.981 77.643 77.277 77.079 76.633 76.411 76.142 75.869 75.264 74.903 74.498 74.062 73.577 72.948 71.993 69.065 -5 ,26979 ,KEBNE ,17024196,Wed Dec 22 09:39:38 CET,Wed Dec 22 11:09:45 CET,0.0 1.824 2.506 3.026 3.479 3.884 4.271 4.646 5.309 5.612 5.912 6.147 6.733 6.996 7.513 8.015 8.487 8.719 9.186 9.628 10.264 10.68 11.103 11.729 12.33 12.918 13.485 14.029 14.75 15.469 16.169 17.017 17.845 18.67 19.633 20.711 21.765 22.943 24.229 25.624 27.113 28.841 30.917 33.053 35.608 38.528 41.937 45.94 50.894 56.903 64.526 71.297 75.465 78.16 79.907 81.149 82.025 82.635 83.027 83.28 83.419 83.466 83.439 83.362 83.249 83.132 82.979 82.783 82.592 82.408 82.215 82.02 81.786 81.548 81.351 81.122 80.878 80.609 80.291 80.076 79.864 79.494 79.232 78.957 78.804 78.491 78.153 77.769 77.563 77.096 76.863 76.615 76.346 75.736 75.382 74.987 74.55 74.019 73.325 72.402 69.575 -6 ,30056 ,KEBNE ,17024197,Wed Dec 22 09:40:40 CET,Wed Dec 22 11:10:38 CET,0.0 1.345 1.936 2.429 2.878 3.293 3.671 4.025 4.677 4.979 5.275 5.522 6.117 6.386 6.913 7.427 7.922 8.159 8.619 9.052 9.681 10.105 10.528 11.139 11.73 12.33 12.929 13.503 14.232 14.938 15.619 16.445 17.26 18.068 19.03 20.14 21.214 22.383 23.664 25.074 26.593 28.347 30.447 32.601 35.188 38.115 41.564 45.698 50.732 56.855 64.731 71.624 75.767 78.537 80.384 81.63 82.474 83.097 83.486 83.742 83.863 83.864 83.814 83.738 83.62 83.481 83.316 83.123 82.949 82.757 82.512 82.284 82.028 81.759 81.555 81.326 81.079 80.818 80.523 80.309 80.085 79.703 79.424 79.142 78.991 78.665 78.304 77.91 77.703 77.24 76.984 76.709 76.426 75.807 75.446 75.036 74.604 74.119 73.479 72.549 70.091 -7 ,19130 ,KEBNE ,17024198,Wed Dec 22 09:40:40 CET,Wed Dec 22 11:11:30 CET,0.0 1.379 2.057 2.61 3.073 3.504 3.888 4.24 4.897 5.196 5.482 5.711 6.308 6.574 7.098 7.601 8.083 8.313 8.763 9.207 9.867 10.303 10.724 11.323 11.911 12.486 13.055 13.623 14.366 15.074 15.767 16.632 17.473 18.301 19.275 20.357 21.415 22.603 23.918 25.342 26.866 28.646 30.765 32.904 35.446 38.404 41.927 46.009 50.987 57.096 64.684 71.37 75.49 78.13 79.944 81.175 82.043 82.705 83.102 83.382 83.564 83.657 83.666 83.655 83.613 83.483 83.343 83.206 83.052 82.881 82.672 82.468 82.244 82.0 81.796 81.561 81.285 80.998 80.714 80.519 80.305 79.939 79.688 79.421 79.275 78.957 78.594 78.207 78.007 77.545 77.308 77.048 76.771 76.122 75.752 75.343 74.872 74.318 73.662 72.75 69.894 -8 ,16867 ,KEBNE ,17024199,Wed Dec 22 09:40:40 CET,Wed Dec 22 11:10:59 CET,0.0 1.354 1.945 2.422 2.873 3.282 3.665 4.027 4.678 4.986 5.285 5.523 6.122 6.39 6.91 7.417 7.899 8.133 8.603 9.057 9.706 10.141 10.575 11.203 11.804 12.38 12.935 13.48 14.213 14.928 15.613 16.451 17.275 18.096 19.075 20.173 21.247 22.457 23.757 25.144 26.636 28.367 30.422 32.549 35.079 37.954 41.453 45.572 50.431 56.351 63.857 70.377 74.318 76.831 78.58 79.848 80.683 81.24 81.633 81.967 82.161 82.227 82.204 82.139 82.033 81.905 81.782 81.656 81.502 81.3 81.076 80.884 80.654 80.387 80.17 79.922 79.662 79.391 79.093 78.883 78.658 78.304 78.052 77.778 77.635 77.293 76.907 76.514 76.308 75.843 75.596 75.319 75.023 74.402 74.039 73.622 73.156 72.611 71.972 71.053 67.564 -9 ,29773 ,KEBNE ,17024200,Wed Dec 22 09:40:40 CET,Wed Dec 22 11:10:48 CET,0.0 1.369 2.005 2.569 3.039 3.435 3.823 4.189 4.846 5.15 5.44 5.663 6.255 6.521 7.027 7.52 8.016 8.26 8.729 9.177 9.83 10.256 10.665 11.262 11.851 12.427 12.984 13.534 14.26 14.972 15.679 16.536 17.359 18.162 19.115 20.193 21.242 22.416 23.726 25.156 26.661 28.397 30.464 32.592 35.137 38.042 41.456 45.506 50.463 56.514 64.17 70.792 74.849 77.486 79.237 80.418 81.173 81.713 82.065 82.299 82.43 82.475 82.468 82.422 82.332 82.225 82.089 81.915 81.731 81.502 81.229 80.997 80.746 80.478 80.272 80.048 79.793 79.535 79.243 79.014 78.782 78.411 78.146 77.874 77.724 77.408 77.059 76.667 76.459 75.991 75.754 75.508 75.229 74.569 74.218 73.846 73.399 72.86 72.218 71.301 68.678 -10 ,6590 ,KEBNE ,17024201,Wed Dec 22 09:40:40 CET,Wed Dec 22 11:10:44 CET,0.0 1.27 1.853 2.32 2.758 3.154 3.525 3.876 4.536 4.848 5.149 5.39 5.979 6.245 6.77 7.26 7.747 7.989 8.447 8.905 9.58 10.011 10.44 11.067 11.664 12.246 12.815 13.368 14.081 14.774 15.457 16.301 17.136 17.946 18.889 19.986 21.064 22.234 23.517 24.926 26.445 28.216 30.308 32.445 34.999 37.912 41.37 45.427 50.4 56.501 64.064 70.575 74.597 77.272 79.068 80.36 81.299 81.947 82.383 82.725 82.928 83.024 83.071 83.096 83.022 82.917 82.818 82.663 82.488 82.303 82.115 81.947 81.755 81.518 81.292 81.063 80.832 80.573 80.292 80.081 79.854 79.508 79.251 78.963 78.809 78.497 78.142 77.741 77.536 77.094 76.901 76.645 76.366 75.723 75.352 74.937 74.485 73.934 73.253 72.359 69.702 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index f326062f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21534 ,TETRA ,17585724,Sat Nov 27 14:28:16 CET,Sat Nov 27 16:20:41 CET,0.0 1.227 1.747 2.156 2.479 2.766 3.043 3.297 3.769 3.995 4.192 4.289 4.696 4.856 5.173 5.482 5.774 5.912 6.176 6.44 6.826 7.071 7.303 7.632 7.958 8.266 8.536 8.804 9.174 9.522 9.854 10.259 10.641 11.015 11.445 11.899 12.329 12.788 13.284 13.817 14.372 14.991 15.673 16.327 17.056 17.808 18.634 19.421 20.186 20.885 21.235 20.78 19.933 19.016 18.077 17.098 16.182 15.308 14.51 13.683 12.913 12.194 11.511 10.865 10.248 9.673 9.064 8.522 8.054 7.539 7.006 6.555 6.084 5.588 5.175 4.746 4.308 3.855 3.373 3.039 2.705 2.201 1.844 1.442 1.224 0.782 0.335 -0.154 -0.419 -0.963 -1.29 -1.604 -1.932 -2.664 -3.079 -3.535 -4.066 -4.69 -5.412 -6.391 -9.616 -2 ,10715 ,TETRA ,17585725,Sat Nov 27 14:28:16 CET,Sat Nov 27 16:18:49 CET,0.0 1.209 1.724 2.133 2.463 2.763 3.061 3.327 3.787 4.007 4.217 4.347 4.775 4.949 5.284 5.609 5.909 6.05 6.335 6.608 6.984 7.219 7.449 7.787 8.103 8.389 8.675 8.963 9.33 9.674 10.012 10.434 10.82 11.179 11.609 12.09 12.528 12.998 13.507 14.006 14.507 15.069 15.723 16.372 17.09 17.832 18.576 19.287 20.005 20.651 20.94 20.474 19.605 18.634 17.681 16.722 15.815 14.947 14.169 13.342 12.599 11.926 11.256 10.621 10.024 9.444 8.822 8.264 7.773 7.263 6.73 6.268 5.792 5.291 4.872 4.445 4.018 3.562 3.078 2.743 2.4 1.873 1.492 1.085 0.885 0.461 -0.007 -0.502 -0.768 -1.309 -1.651 -1.981 -2.334 -3.091 -3.494 -3.941 -4.455 -5.032 -5.737 -6.706 -9.176 -3 ,11557 ,TETRA ,17585726,Sat Nov 27 14:29:17 CET,Sat Nov 27 16:18:11 CET,0.0 1.335 1.833 2.218 2.561 2.86 3.12 3.381 3.833 4.042 4.243 4.382 4.8 4.96 5.27 5.57 5.874 6.021 6.296 6.549 6.917 7.153 7.373 7.689 7.994 8.291 8.584 8.868 9.218 9.549 9.884 10.284 10.663 11.037 11.459 11.914 12.335 12.775 13.246 13.76 14.313 14.943 15.62 16.236 16.923 17.651 18.442 19.26 20.077 20.787 21.077 20.575 19.727 18.78 17.813 16.809 15.91 15.042 14.214 13.358 12.595 11.894 11.21 10.548 9.914 9.329 8.712 8.17 7.683 7.156 6.605 6.146 5.665 5.174 4.793 4.383 3.945 3.488 3.025 2.699 2.353 1.804 1.411 1.001 0.793 0.37 -0.08 -0.586 -0.858 -1.406 -1.753 -2.067 -2.404 -3.159 -3.578 -4.022 -4.512 -5.101 -5.841 -6.805 -9.606 -4 ,19504 ,TETRA ,17585727,Sat Nov 27 14:29:16 CET,Sat Nov 27 16:19:45 CET,0.0 1.323 1.903 2.32 2.669 2.986 3.262 3.524 4.028 4.259 4.467 4.589 5.014 5.191 5.517 5.826 6.12 6.262 6.536 6.79 7.153 7.387 7.614 7.947 8.265 8.553 8.827 9.101 9.458 9.803 10.127 10.508 10.879 11.23 11.607 12.029 12.45 12.918 13.43 13.98 14.549 15.131 15.792 16.464 17.203 17.991 18.827 19.667 20.525 21.288 21.625 21.206 20.383 19.405 18.381 17.328 16.357 15.439 14.598 13.749 12.973 12.259 11.608 10.994 10.392 9.802 9.202 8.655 8.162 7.656 7.109 6.654 6.197 5.718 5.328 4.914 4.476 4.006 3.517 3.189 2.853 2.316 1.948 1.547 1.335 0.919 0.479 -0.023 -0.288 -0.811 -1.112 -1.418 -1.748 -2.45 -2.839 -3.28 -3.794 -4.376 -5.087 -6.149 -8.855 -5 ,26126 ,TETRA ,17585728,Sat Nov 27 14:29:17 CET,Sat Nov 27 16:16:19 CET,0.0 1.516 2.07 2.522 2.916 3.259 3.591 3.888 4.353 4.546 4.751 4.927 5.376 5.561 5.899 6.208 6.496 6.647 6.937 7.203 7.59 7.825 8.046 8.381 8.702 9.003 9.296 9.573 9.932 10.294 10.631 11.018 11.386 11.741 12.152 12.617 13.048 13.504 14.0 14.509 15.011 15.567 16.216 16.854 17.551 18.297 19.126 19.968 20.77 21.407 21.679 21.201 20.318 19.288 18.304 17.363 16.45 15.563 14.745 13.883 13.145 12.45 11.771 11.124 10.5 9.933 9.334 8.765 8.265 7.769 7.242 6.803 6.348 5.839 5.442 5.047 4.62 4.164 3.684 3.337 2.989 2.44 2.05 1.661 1.462 1.039 0.58 0.1 -0.156 -0.689 -1.003 -1.316 -1.656 -2.385 -2.792 -3.243 -3.754 -4.383 -5.133 -6.149 -8.812 -6 ,31942 ,TETRA ,17585729,Sat Nov 27 14:29:16 CET,Sat Nov 27 16:20:23 CET,0.0 1.359 1.948 2.391 2.737 3.053 3.335 3.604 4.107 4.325 4.519 4.638 5.073 5.247 5.558 5.86 6.147 6.278 6.549 6.81 7.185 7.428 7.649 7.961 8.26 8.544 8.825 9.1 9.455 9.805 10.136 10.531 10.921 11.299 11.723 12.186 12.611 13.072 13.565 14.079 14.618 15.22 15.89 16.517 17.23 17.981 18.801 19.668 20.495 21.166 21.412 20.86 19.964 18.921 17.861 16.814 15.84 14.937 14.122 13.316 12.607 11.921 11.215 10.532 9.892 9.305 8.698 8.148 7.666 7.147 6.602 6.151 5.678 5.18 4.791 4.395 3.976 3.52 3.042 2.711 2.377 1.839 1.453 1.055 0.845 0.415 -0.044 -0.543 -0.806 -1.338 -1.648 -1.959 -2.301 -3.07 -3.494 -3.955 -4.471 -5.091 -5.807 -6.71 -9.71 -7 ,22354 ,TETRA ,17585730,Sat Nov 27 14:30:16 CET,Sat Nov 27 16:16:24 CET,0.0 1.014 1.497 1.87 2.213 2.53 2.815 3.074 3.52 3.73 3.929 4.039 4.453 4.623 4.935 5.23 5.519 5.657 5.923 6.17 6.532 6.773 7.0 7.34 7.659 7.944 8.226 8.511 8.876 9.219 9.547 9.943 10.319 10.671 11.071 11.523 11.959 12.408 12.888 13.401 13.926 14.514 15.18 15.83 16.567 17.328 18.128 18.919 19.71 20.418 20.663 20.158 19.277 18.258 17.253 16.273 15.366 14.507 13.689 12.805 12.04 11.344 10.661 9.998 9.359 8.767 8.141 7.581 7.099 6.6 6.065 5.61 5.146 4.655 4.261 3.846 3.412 2.955 2.466 2.123 1.777 1.24 0.867 0.481 0.27 -0.172 -0.635 -1.134 -1.4 -1.938 -2.268 -2.599 -2.943 -3.733 -4.199 -4.692 -5.223 -5.813 -6.522 -7.521 -10.863 -8 ,9448 ,TETRA ,17585731,Sat Nov 27 14:30:16 CET,Sat Nov 27 16:20:22 CET,0.0 1.292 1.85 2.277 2.633 2.942 3.231 3.505 3.958 4.164 4.367 4.504 4.921 5.101 5.445 5.744 6.028 6.165 6.426 6.675 7.032 7.257 7.475 7.803 8.114 8.405 8.687 8.965 9.313 9.632 9.948 10.341 10.709 11.061 11.466 11.932 12.384 12.859 13.343 13.835 14.347 14.922 15.594 16.213 16.896 17.63 18.408 19.204 19.976 20.605 20.803 20.284 19.424 18.377 17.303 16.249 15.3 14.411 13.609 12.798 12.096 11.433 10.761 10.12 9.504 8.917 8.282 7.716 7.24 6.742 6.209 5.751 5.285 4.812 4.431 4.02 3.588 3.136 2.658 2.323 1.983 1.458 1.082 0.7 0.501 0.069 -0.401 -0.903 -1.167 -1.709 -2.036 -2.36 -2.711 -3.479 -3.903 -4.355 -4.861 -5.423 -6.088 -6.979 -9.822 -9 ,31544 ,TETRA ,17585732,Sat Nov 27 14:31:17 CET,Sat Nov 27 16:20:34 CET,0.0 1.247 1.808 2.259 2.614 2.951 3.264 3.533 4.028 4.255 4.461 4.57 4.981 5.148 5.484 5.796 6.087 6.231 6.515 6.789 7.172 7.415 7.646 7.97 8.284 8.579 8.867 9.146 9.503 9.85 10.173 10.546 10.915 11.284 11.704 12.151 12.567 13.017 13.479 13.991 14.531 15.087 15.7 16.293 16.96 17.666 18.414 19.17 19.926 20.604 20.926 20.448 19.615 18.669 17.641 16.587 15.647 14.777 13.946 13.043 12.263 11.567 10.886 10.231 9.62 9.068 8.465 7.907 7.423 6.921 6.383 5.917 5.434 4.949 4.562 4.129 3.688 3.244 2.761 2.417 2.084 1.567 1.19 0.793 0.587 0.15 -0.297 -0.773 -1.034 -1.575 -1.897 -2.21 -2.554 -3.306 -3.716 -4.161 -4.663 -5.25 -5.952 -6.895 -9.428 -10 ,20671 ,TETRA ,17585733,Sat Nov 27 14:31:17 CET,Sat Nov 27 16:11:02 CET,0.0 1.544 2.095 2.481 2.797 3.109 3.405 3.675 4.122 4.326 4.532 4.669 5.102 5.277 5.598 5.895 6.165 6.301 6.576 6.842 7.222 7.459 7.681 7.996 8.313 8.61 8.883 9.165 9.526 9.863 10.19 10.572 10.936 11.285 11.678 12.115 12.535 12.992 13.48 14.004 14.538 15.107 15.744 16.371 17.071 17.82 18.635 19.485 20.389 21.107 21.32 20.771 19.861 18.876 17.899 16.919 15.995 15.088 14.254 13.372 12.598 11.915 11.234 10.594 9.969 9.357 8.745 8.217 7.74 7.22 6.667 6.196 5.705 5.205 4.811 4.389 3.954 3.493 2.992 2.659 2.325 1.781 1.388 0.984 0.781 0.352 -0.114 -0.614 -0.87 -1.397 -1.73 -2.061 -2.408 -3.137 -3.533 -3.973 -4.456 -5.038 -5.789 -6.798 -9.353 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt deleted file mode 100644 index 166fca1c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25286 ,TETRA ,17585734,Sat Nov 27 14:32:17 CET,Sat Nov 27 16:23:46 CET,0.0 2.09 2.797 3.372 3.882 4.297 4.651 4.982 5.574 5.85 6.13 6.404 6.87 7.084 7.521 7.937 8.33 8.51 8.852 9.188 9.67 9.991 10.296 10.727 11.138 11.518 11.887 12.253 12.721 13.169 13.601 14.125 14.62 15.086 15.611 16.207 16.774 17.382 18.049 18.736 19.434 20.174 20.999 21.823 22.721 23.654 24.689 25.762 26.807 27.661 27.905 27.183 26.09 24.893 23.71 22.533 21.455 20.485 19.648 18.745 17.917 17.162 16.413 15.702 15.05 14.448 13.816 13.262 12.758 12.222 11.654 11.167 10.676 10.179 9.797 9.407 8.997 8.554 8.093 7.779 7.454 6.955 6.606 6.247 6.061 5.656 5.221 4.771 4.547 4.055 3.812 3.551 3.281 2.703 2.363 1.977 1.569 1.13 0.554 -0.267 -2.251 -2 ,19961 ,TETRA ,17585735,Sat Nov 27 14:32:17 CET,Sat Nov 27 16:25:31 CET,0.0 1.648 2.403 3.03 3.555 3.962 4.306 4.644 5.256 5.532 5.807 6.084 6.564 6.788 7.244 7.696 8.092 8.265 8.624 8.986 9.502 9.825 10.131 10.571 10.993 11.392 11.764 12.12 12.576 13.012 13.436 13.959 14.441 14.905 15.452 16.031 16.597 17.241 17.922 18.62 19.33 20.083 20.942 21.809 22.724 23.615 24.573 25.527 26.418 27.193 27.52 26.83 25.775 24.588 23.371 22.224 21.165 20.184 19.333 18.392 17.5 16.703 15.982 15.29 14.625 14.024 13.392 12.835 12.356 11.856 11.326 10.887 10.434 9.942 9.556 9.168 8.77 8.355 7.907 7.598 7.295 6.818 6.461 6.09 5.909 5.523 5.081 4.623 4.394 3.903 3.637 3.347 3.053 2.44 2.101 1.735 1.349 0.915 0.368 -0.406 -2.364 -3 ,30522 ,TETRA ,17585736,Sat Nov 27 14:34:17 CET,Sat Nov 27 16:25:41 CET,0.0 2.478 3.263 3.831 4.274 4.692 5.068 5.408 6.006 6.276 6.556 6.851 7.338 7.558 7.976 8.375 8.745 8.931 9.297 9.636 10.143 10.465 10.767 11.21 11.627 12.023 12.401 12.752 13.205 13.662 14.117 14.659 15.165 15.675 16.246 16.856 17.426 18.021 18.672 19.354 20.08 20.894 21.758 22.599 23.605 24.686 25.812 26.885 27.897 28.818 29.274 28.581 27.45 26.226 24.98 23.775 22.638 21.568 20.658 19.732 18.93 18.182 17.434 16.722 16.06 15.448 14.812 14.229 13.719 13.199 12.657 12.192 11.696 11.202 10.834 10.449 10.043 9.608 9.149 8.837 8.53 8.069 7.731 7.373 7.193 6.826 6.414 5.967 5.739 5.242 5.01 4.744 4.447 3.818 3.474 3.097 2.682 2.23 1.703 0.962 -1.039 -4 ,26456 ,TETRA ,17585737,Sat Nov 27 14:34:17 CET,Sat Nov 27 16:10:28 CET,0.0 1.822 2.535 3.109 3.589 3.991 4.341 4.667 5.261 5.523 5.784 6.032 6.493 6.71 7.141 7.536 7.917 8.106 8.451 8.775 9.271 9.598 9.904 10.337 10.747 11.137 11.52 11.894 12.353 12.803 13.247 13.772 14.277 14.743 15.275 15.888 16.47 17.09 17.751 18.457 19.173 19.937 20.839 21.764 22.763 23.735 24.756 25.718 26.637 27.404 27.538 26.851 25.814 24.603 23.414 22.221 21.106 20.099 19.215 18.295 17.447 16.693 16.002 15.321 14.653 14.041 13.395 12.823 12.345 11.84 11.315 10.88 10.425 9.948 9.562 9.158 8.755 8.343 7.913 7.623 7.328 6.84 6.479 6.105 5.918 5.532 5.123 4.703 4.479 3.981 3.744 3.479 3.195 2.588 2.267 1.92 1.517 1.033 0.46 -0.264 -2.159 -5 ,6537 ,TETRA ,17585738,Sat Nov 27 14:34:17 CET,Sat Nov 27 16:28:22 CET,0.0 2.182 2.894 3.449 3.891 4.267 4.62 4.949 5.549 5.822 6.081 6.321 6.803 7.034 7.445 7.839 8.228 8.417 8.772 9.119 9.612 9.906 10.206 10.648 11.041 11.429 11.824 12.181 12.625 13.061 13.487 14.0 14.474 14.936 15.479 16.101 16.694 17.315 17.951 18.595 19.317 20.144 21.017 21.817 22.692 23.666 24.745 25.788 26.736 27.487 27.721 27.034 25.948 24.733 23.605 22.518 21.449 20.38 19.414 18.431 17.607 16.882 16.16 15.481 14.847 14.249 13.604 13.031 12.547 12.027 11.475 11.018 10.533 10.02 9.623 9.235 8.826 8.367 7.892 7.585 7.279 6.796 6.455 6.094 5.904 5.519 5.115 4.678 4.447 3.947 3.712 3.456 3.167 2.518 2.177 1.831 1.451 1.004 0.436 -0.339 -2.123 -6 ,24217 ,TETRA ,17585739,Sat Nov 27 14:35:16 CET,Sat Nov 27 16:27:23 CET,0.0 2.008 2.764 3.334 3.772 4.163 4.557 4.925 5.568 5.856 6.125 6.362 6.828 7.048 7.468 7.857 8.22 8.402 8.761 9.108 9.618 9.94 10.243 10.674 11.092 11.517 11.924 12.3 12.777 13.227 13.657 14.186 14.691 15.158 15.688 16.296 16.866 17.49 18.153 18.83 19.55 20.304 21.16 21.976 22.857 23.851 24.937 25.987 26.895 27.632 27.901 27.241 26.19 24.949 23.698 22.434 21.246 20.179 19.197 18.14 17.28 16.542 15.814 15.138 14.52 13.93 13.3 12.732 12.234 11.711 11.179 10.731 10.242 9.726 9.322 8.908 8.486 8.055 7.614 7.305 6.986 6.491 6.151 5.802 5.613 5.21 4.797 4.367 4.142 3.647 3.4 3.127 2.834 2.216 1.869 1.493 1.09 0.603 0.051 -0.644 -2.265 -7 ,4554 ,TETRA ,17585740,Sat Nov 27 14:35:16 CET,Sat Nov 27 16:21:29 CET,0.0 1.762 2.526 3.103 3.547 3.944 4.317 4.647 5.244 5.538 5.813 6.064 6.538 6.762 7.193 7.608 7.996 8.182 8.547 8.898 9.414 9.738 10.043 10.485 10.902 11.299 11.673 12.039 12.526 12.996 13.446 13.975 14.46 14.918 15.445 16.034 16.606 17.221 17.856 18.503 19.172 19.944 20.809 21.601 22.521 23.49 24.452 25.46 26.563 27.486 27.807 27.087 25.924 24.662 23.468 22.249 21.089 20.061 19.166 18.218 17.372 16.582 15.83 15.152 14.5 13.896 13.255 12.677 12.179 11.659 11.131 10.692 10.227 9.727 9.327 8.921 8.502 8.059 7.584 7.264 6.952 6.462 6.112 5.748 5.558 5.151 4.729 4.292 4.065 3.574 3.344 3.082 2.817 2.228 1.902 1.554 1.157 0.681 0.12 -0.601 -2.28 -8 ,21122 ,TETRA ,17585741,Sat Nov 27 14:36:17 CET,Sat Nov 27 16:28:01 CET,0.0 2.309 3.113 3.623 4.042 4.417 4.761 5.095 5.706 5.996 6.277 6.553 7.031 7.244 7.648 8.043 8.427 8.617 8.978 9.318 9.803 10.123 10.431 10.863 11.278 11.676 12.059 12.431 12.918 13.375 13.803 14.309 14.792 15.26 15.796 16.386 16.939 17.537 18.169 18.815 19.484 20.233 21.104 21.967 22.943 23.995 25.017 25.983 26.992 27.915 28.298 27.767 26.724 25.477 24.267 23.076 21.989 20.981 20.054 19.124 18.312 17.562 16.841 16.139 15.468 14.831 14.168 13.605 13.106 12.581 12.034 11.57 11.096 10.603 10.226 9.827 9.405 8.968 8.505 8.188 7.866 7.385 7.045 6.683 6.493 6.11 5.722 5.284 5.05 4.563 4.358 4.095 3.804 3.193 2.867 2.504 2.091 1.637 1.115 0.441 -1.033 -9 ,29052 ,TETRA ,17585742,Sat Nov 27 14:36:17 CET,Sat Nov 27 16:18:30 CET,0.0 1.834 2.536 3.061 3.533 3.968 4.339 4.666 5.277 5.564 5.831 6.065 6.542 6.769 7.196 7.599 7.995 8.182 8.531 8.858 9.326 9.635 9.941 10.393 10.819 11.212 11.591 11.971 12.446 12.892 13.316 13.805 14.293 14.777 15.308 15.898 16.468 17.093 17.755 18.441 19.162 19.988 20.918 21.778 22.71 23.668 24.722 25.837 26.88 27.625 27.856 27.114 26.018 24.849 23.67 22.533 21.423 20.362 19.462 18.492 17.64 16.927 16.236 15.547 14.866 14.229 13.588 13.039 12.554 12.024 11.472 11.02 10.555 10.07 9.693 9.305 8.893 8.448 7.989 7.661 7.33 6.836 6.487 6.133 5.946 5.555 5.17 4.754 4.53 4.038 3.79 3.525 3.258 2.665 2.317 1.931 1.5 1.018 0.464 -0.202 -1.895 -10 ,17709 ,TETRA ,17585743,Sat Nov 27 14:38:17 CET,Sat Nov 27 16:26:01 CET,0.0 2.652 3.351 3.877 4.321 4.715 5.06 5.387 6.033 6.327 6.599 6.849 7.328 7.545 7.961 8.348 8.716 8.898 9.247 9.585 10.088 10.403 10.694 11.117 11.52 11.91 12.3 12.659 13.111 13.57 14.019 14.561 15.071 15.547 16.084 16.678 17.227 17.854 18.536 19.216 19.925 20.72 21.641 22.507 23.417 24.347 25.355 26.336 27.293 28.106 28.417 27.8 26.65 25.351 24.15 22.973 21.883 20.856 19.912 18.951 18.109 17.33 16.592 15.869 15.193 14.591 13.946 13.372 12.875 12.347 11.794 11.333 10.855 10.376 10.006 9.614 9.205 8.761 8.29 7.97 7.641 7.138 6.786 6.408 6.218 5.846 5.445 4.991 4.751 4.254 4.014 3.753 3.48 2.868 2.534 2.199 1.8 1.304 0.708 -0.005 -1.665 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index 7280266c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5916 ,TETRA ,17585744,Sat Nov 27 14:37:16 CET,Sat Nov 27 16:16:21 CET,0.0 1.556 2.148 2.567 2.91 3.211 3.477 3.731 4.214 4.432 4.646 4.939 5.272 5.456 5.793 6.109 6.417 6.568 6.845 7.115 7.502 7.746 7.984 8.321 8.652 8.96 9.253 9.542 9.917 10.285 10.632 11.035 11.419 11.793 12.226 12.709 13.172 13.677 14.203 14.759 15.339 15.992 16.761 17.518 18.392 19.312 20.264 21.288 22.403 23.55 24.564 24.938 24.813 24.448 23.968 23.438 22.914 22.399 21.912 21.391 20.932 20.517 20.098 19.697 19.332 18.985 18.613 18.27 17.978 17.672 17.345 17.079 16.797 16.473 16.211 15.939 15.644 15.342 15.031 14.81 14.578 14.185 13.905 13.623 13.481 13.189 12.872 12.542 12.379 12.083 11.807 11.605 11.392 10.913 10.644 10.363 10.055 9.709 9.306 8.821 7.753 -2 ,14922 ,TETRA ,17585745,Sat Nov 27 14:37:17 CET,Sat Nov 27 16:28:49 CET,0.0 1.224 1.781 2.161 2.475 2.751 3.022 3.273 3.726 3.941 4.14 4.372 4.673 4.861 5.2 5.496 5.79 5.931 6.196 6.46 6.854 7.099 7.34 7.705 8.058 8.381 8.685 8.976 9.355 9.729 10.093 10.529 10.934 11.326 11.768 12.259 12.734 13.245 13.777 14.337 14.938 15.582 16.322 17.069 17.907 18.781 19.741 20.817 21.971 23.177 24.327 24.778 24.585 24.145 23.652 23.133 22.617 22.094 21.596 21.098 20.675 20.281 19.874 19.472 19.104 18.758 18.379 18.029 17.723 17.414 17.078 16.794 16.497 16.18 15.937 15.689 15.424 15.147 14.861 14.664 14.462 14.119 13.87 13.623 13.488 13.204 12.91 12.593 12.423 12.129 11.872 11.667 11.459 11.008 10.747 10.457 10.132 9.785 9.385 8.779 7.211 -3 ,1987 ,TETRA ,17585746,Sat Nov 27 14:38:18 CET,Sat Nov 27 16:30:12 CET,0.0 1.634 2.237 2.647 2.986 3.298 3.594 3.845 4.284 4.487 4.689 4.965 5.278 5.45 5.791 6.126 6.444 6.601 6.911 7.206 7.624 7.875 8.109 8.448 8.776 9.089 9.387 9.672 10.054 10.444 10.805 11.243 11.669 12.074 12.531 13.023 13.484 13.99 14.538 15.112 15.722 16.379 17.088 17.822 18.698 19.593 20.561 21.617 22.75 23.913 24.937 25.2 24.943 24.495 23.966 23.428 22.937 22.464 22.02 21.538 21.095 20.682 20.303 19.933 19.551 19.182 18.791 18.44 18.143 17.839 17.507 17.234 16.955 16.655 16.422 16.181 15.914 15.645 15.365 15.165 14.961 14.633 14.395 14.146 14.008 13.72 13.444 13.163 13.015 12.746 12.516 12.326 12.121 11.658 11.387 11.113 10.83 10.48 10.085 9.556 8.09 -4 ,14219 ,TETRA ,17585747,Sat Nov 27 14:39:17 CET,Sat Nov 27 16:31:45 CET,0.0 0.996 1.445 1.792 2.068 2.315 2.56 2.812 3.263 3.467 3.662 3.893 4.198 4.363 4.672 4.978 5.272 5.409 5.675 5.938 6.336 6.593 6.834 7.194 7.533 7.848 8.154 8.448 8.821 9.18 9.524 9.945 10.342 10.715 11.156 11.654 12.121 12.619 13.137 13.677 14.249 14.89 15.65 16.412 17.274 18.18 19.175 20.242 21.358 22.46 23.468 23.816 23.667 23.361 22.94 22.423 21.895 21.371 20.869 20.345 19.878 19.451 19.05 18.676 18.324 17.974 17.6 17.274 16.954 16.586 16.212 15.912 15.604 15.269 15.005 14.729 14.441 14.15 13.855 13.641 13.409 13.033 12.782 12.537 12.404 12.119 11.813 11.487 11.315 11.016 10.716 10.511 10.308 9.874 9.643 9.383 9.088 8.758 8.378 7.897 6.832 -5 ,16928 ,TETRA ,17585748,Sat Nov 27 14:40:16 CET,Sat Nov 27 16:27:43 CET,0.0 1.398 1.996 2.446 2.854 3.192 3.487 3.763 4.238 4.467 4.699 4.992 5.315 5.488 5.819 6.142 6.443 6.589 6.883 7.163 7.549 7.79 8.012 8.348 8.682 9.009 9.347 9.669 10.061 10.424 10.763 11.168 11.559 11.936 12.366 12.843 13.282 13.766 14.304 14.882 15.49 16.166 16.932 17.676 18.513 19.437 20.454 21.554 22.79 24.076 25.206 25.538 25.355 24.998 24.564 24.061 23.585 23.121 22.668 22.173 21.717 21.318 20.933 20.558 20.177 19.816 19.462 19.133 18.829 18.513 18.184 17.913 17.627 17.311 17.066 16.819 16.547 16.261 15.982 15.79 15.589 15.279 15.051 14.805 14.674 14.406 14.127 13.815 13.644 13.352 13.094 12.908 12.715 12.268 12.0 11.709 11.402 11.077 10.711 10.213 8.818 -6 ,10429 ,TETRA ,17585749,Sat Nov 27 14:40:18 CET,Sat Nov 27 16:32:39 CET,0.0 1.88 2.506 2.975 3.36 3.676 3.973 4.249 4.723 4.945 5.154 5.423 5.737 5.911 6.242 6.559 6.872 7.027 7.322 7.599 7.972 8.214 8.451 8.786 9.112 9.436 9.75 10.049 10.431 10.8 11.153 11.588 12.018 12.421 12.869 13.358 13.819 14.324 14.859 15.42 16.012 16.686 17.474 18.239 19.124 20.047 21.022 22.078 23.241 24.496 25.555 25.91 25.786 25.461 25.036 24.518 24.014 23.523 23.062 22.58 22.127 21.693 21.285 20.898 20.523 20.162 19.783 19.455 19.169 18.856 18.527 18.257 17.968 17.659 17.417 17.161 16.889 16.611 16.327 16.127 15.913 15.577 15.342 15.087 14.955 14.685 14.409 14.116 13.943 13.646 13.4 13.207 13.002 12.559 12.303 12.021 11.733 11.423 11.05 10.54 9.397 -7 ,27310 ,TETRA ,17585750,Sat Nov 27 14:40:18 CET,Sat Nov 27 16:32:12 CET,0.0 1.269 1.841 2.269 2.629 2.936 3.227 3.502 3.977 4.199 4.414 4.677 4.99 5.172 5.524 5.847 6.132 6.271 6.544 6.81 7.215 7.475 7.723 8.092 8.445 8.785 9.104 9.407 9.801 10.174 10.534 10.97 11.381 11.77 12.216 12.717 13.207 13.739 14.3 14.884 15.493 16.155 16.883 17.596 18.407 19.279 20.251 21.287 22.409 23.562 24.604 25.013 24.943 24.658 24.227 23.743 23.243 22.746 22.278 21.771 21.315 20.905 20.502 20.099 19.719 19.373 18.999 18.659 18.36 18.059 17.758 17.499 17.204 16.886 16.646 16.396 16.129 15.853 15.568 15.354 15.133 14.815 14.584 14.326 14.196 13.921 13.624 13.325 13.169 12.887 12.635 12.444 12.256 11.867 11.644 11.381 11.082 10.738 10.356 9.873 8.567 -8 ,29399 ,TETRA ,17585751,Sat Nov 27 14:40:20 CET,Sat Nov 27 16:33:29 CET,0.0 1.603 2.147 2.527 2.882 3.221 3.524 3.789 4.293 4.522 4.726 4.986 5.304 5.493 5.845 6.162 6.47 6.619 6.895 7.154 7.526 7.756 7.985 8.341 8.68 8.999 9.313 9.628 10.029 10.394 10.734 11.138 11.53 11.901 12.33 12.834 13.313 13.808 14.334 14.893 15.478 16.133 16.892 17.656 18.54 19.494 20.529 21.625 22.769 23.866 24.865 25.246 25.006 24.51 23.95 23.367 22.744 22.113 21.534 20.932 20.398 19.908 19.428 18.965 18.521 18.111 17.701 17.36 17.06 16.761 16.454 16.189 15.912 15.611 15.381 15.137 14.873 14.6 14.33 14.139 13.928 13.602 13.376 13.129 12.995 12.709 12.416 12.104 11.951 11.681 11.447 11.263 11.072 10.657 10.419 10.158 9.873 9.559 9.183 8.631 7.283 -9 ,22860 ,TETRA ,17585752,Sat Nov 27 14:40:18 CET,Sat Nov 27 16:33:52 CET,0.0 1.008 1.534 1.964 2.312 2.632 2.936 3.22 3.734 3.969 4.179 4.436 4.756 4.937 5.269 5.586 5.894 6.044 6.333 6.6 6.976 7.207 7.431 7.76 8.076 8.389 8.688 8.986 9.379 9.743 10.082 10.498 10.9 11.29 11.742 12.245 12.741 13.27 13.814 14.389 14.98 15.629 16.38 17.139 18.019 18.969 20.011 21.115 22.291 23.447 24.474 24.902 24.752 24.352 23.901 23.399 22.874 22.352 21.868 21.366 20.922 20.51 20.119 19.733 19.361 19.019 18.657 18.332 18.045 17.737 17.415 17.147 16.855 16.546 16.305 16.056 15.802 15.525 15.238 15.048 14.842 14.51 14.279 14.031 13.903 13.65 13.376 13.069 12.901 12.606 12.332 12.13 11.914 11.447 11.191 10.918 10.626 10.262 9.807 9.199 7.525 -10 ,32682 ,TETRA ,17585753,Sat Nov 27 14:41:18 CET,Sat Nov 27 16:33:05 CET,0.0 1.049 1.434 1.786 2.105 2.389 2.684 2.966 3.428 3.637 3.838 4.082 4.395 4.575 4.903 5.199 5.487 5.635 5.907 6.158 6.538 6.786 7.02 7.353 7.677 7.985 8.279 8.566 8.942 9.298 9.645 10.079 10.483 10.86 11.291 11.78 12.247 12.737 13.273 13.843 14.45 15.16 15.97 16.722 17.537 18.376 19.325 20.373 21.446 22.558 23.542 23.803 23.585 23.17 22.698 22.185 21.675 21.166 20.699 20.224 19.78 19.348 18.932 18.544 18.179 17.847 17.488 17.154 16.852 16.528 16.204 15.939 15.658 15.36 15.125 14.884 14.617 14.331 14.035 13.826 13.605 13.25 12.992 12.739 12.614 12.343 12.062 11.738 11.566 11.275 11.021 10.832 10.628 10.175 9.93 9.65 9.326 8.963 8.542 7.999 6.662 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt deleted file mode 100644 index 13608d20..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28250 ,TETRA ,17585754,Sat Nov 27 14:41:18 CET,Sat Nov 27 16:32:57 CET,0.0 1.414 1.944 2.324 2.638 2.92 3.173 3.408 3.81 3.984 4.15 4.339 4.626 4.784 5.087 5.362 5.632 5.762 6.011 6.251 6.596 6.816 7.004 7.236 7.464 7.681 7.89 8.088 8.327 8.559 8.785 9.049 9.277 9.474 9.686 9.923 10.143 10.388 10.656 10.946 11.223 11.439 11.646 11.833 11.999 12.116 12.15 12.071 11.745 10.869 9.028 6.567 4.376 2.487 0.901 -0.599 -1.928 -3.116 -4.149 -5.17 -6.105 -6.974 -7.833 -8.665 -9.4 -10.065 -10.79 -11.463 -12.051 -12.639 -13.246 -13.733 -14.208 -14.712 -15.115 -15.522 -15.934 -16.36 -16.815 -17.138 -17.478 -18.001 -18.359 -18.741 -18.937 -19.326 -19.746 -20.206 -20.437 -20.812 -21.137 -21.405 -21.671 -22.246 -22.597 -22.976 -23.413 -23.923 -24.482 -25.228 -27.53 -2 ,6146 ,TETRA ,17585755,Sat Nov 27 14:41:18 CET,Sat Nov 27 16:31:53 CET,0.0 0.996 1.493 1.852 2.169 2.461 2.733 2.98 3.397 3.584 3.763 3.97 4.263 4.419 4.714 4.994 5.241 5.358 5.577 5.774 6.067 6.246 6.409 6.644 6.86 7.069 7.262 7.452 7.684 7.9 8.105 8.346 8.57 8.777 9.009 9.252 9.497 9.748 9.969 10.176 10.38 10.588 10.798 11.001 11.196 11.279 11.222 11.035 10.636 9.772 7.865 5.291 3.151 1.293 -0.302 -1.712 -2.969 -4.119 -5.151 -6.194 -7.108 -7.938 -8.71 -9.424 -10.094 -10.7 -11.316 -11.872 -12.37 -12.898 -13.433 -13.876 -14.333 -14.83 -15.242 -15.67 -16.111 -16.567 -17.032 -17.35 -17.669 -18.17 -18.542 -18.933 -19.126 -19.514 -19.915 -20.345 -20.571 -20.948 -21.253 -21.503 -21.777 -22.372 -22.713 -23.085 -23.457 -23.895 -24.522 -25.375 -28.712 -3 ,4724 ,TETRA ,17585756,Sat Nov 27 14:41:18 CET,Sat Nov 27 16:32:06 CET,0.0 1.131 1.625 2.024 2.365 2.647 2.92 3.18 3.636 3.843 4.035 4.277 4.585 4.748 5.054 5.341 5.611 5.732 5.94 6.146 6.443 6.62 6.793 7.036 7.261 7.477 7.683 7.904 8.197 8.471 8.742 9.064 9.368 9.647 9.949 10.251 10.506 10.748 10.991 11.241 11.494 11.819 12.22 12.512 12.695 12.833 12.869 12.736 12.377 11.535 9.702 7.16 4.999 3.157 1.564 0.09 -1.242 -2.413 -3.408 -4.434 -5.337 -6.123 -6.852 -7.591 -8.336 -9.025 -9.723 -10.306 -10.788 -11.268 -11.767 -12.2 -12.662 -13.146 -13.509 -13.872 -14.261 -14.688 -15.134 -15.429 -15.735 -16.231 -16.59 -16.966 -17.159 -17.544 -17.955 -18.414 -18.658 -19.066 -19.471 -19.75 -20.025 -20.678 -21.009 -21.355 -21.773 -22.252 -22.823 -23.557 -26.569 -4 ,15957 ,TETRA ,17585757,Sat Nov 27 14:42:16 CET,Sat Nov 27 16:33:10 CET,0.0 1.31 1.792 2.17 2.515 2.82 3.09 3.334 3.773 3.981 4.184 4.423 4.717 4.865 5.161 5.455 5.719 5.838 6.078 6.312 6.622 6.827 7.016 7.247 7.458 7.654 7.845 8.036 8.262 8.468 8.671 8.915 9.152 9.367 9.604 9.854 10.073 10.311 10.564 10.804 11.04 11.268 11.508 11.721 11.893 12.002 12.011 11.913 11.528 10.65 8.849 6.317 4.133 2.265 0.627 -0.909 -2.25 -3.433 -4.444 -5.453 -6.351 -7.161 -7.917 -8.631 -9.298 -9.883 -10.487 -11.048 -11.534 -12.037 -12.571 -13.016 -13.477 -13.95 -14.315 -14.678 -15.08 -15.539 -16.018 -16.331 -16.656 -17.185 -17.551 -17.932 -18.13 -18.527 -18.923 -19.343 -19.563 -19.947 -20.264 -20.51 -20.788 -21.432 -21.78 -22.154 -22.576 -23.051 -23.652 -24.44 -27.125 -5 ,6016 ,TETRA ,17585758,Sat Nov 27 14:42:16 CET,Sat Nov 27 16:34:35 CET,0.0 0.877 1.367 1.762 2.104 2.402 2.668 2.912 3.369 3.567 3.753 3.993 4.295 4.457 4.738 5.0 5.252 5.371 5.605 5.836 6.158 6.359 6.558 6.85 7.119 7.365 7.605 7.853 8.139 8.367 8.579 8.827 9.052 9.266 9.504 9.766 10.009 10.241 10.5 10.77 10.999 11.239 11.496 11.681 11.845 11.978 12.007 11.848 11.433 10.549 8.681 6.194 4.033 2.082 0.399 -1.05 -2.331 -3.523 -4.558 -5.607 -6.491 -7.274 -8.047 -8.772 -9.433 -10.06 -10.717 -11.294 -11.794 -12.308 -12.841 -13.271 -13.717 -14.197 -14.566 -14.969 -15.409 -15.866 -16.339 -16.661 -16.998 -17.528 -17.902 -18.293 -18.489 -18.893 -19.314 -19.76 -20.001 -20.402 -20.773 -21.06 -21.358 -22.016 -22.374 -22.769 -23.2 -23.68 -24.249 -24.936 -27.241 -6 ,18279 ,TETRA ,17585759,Sat Nov 27 14:42:16 CET,Sat Nov 27 16:28:46 CET,0.0 1.052 1.6 1.99 2.322 2.61 2.854 3.077 3.484 3.673 3.853 4.042 4.326 4.476 4.758 5.021 5.283 5.415 5.664 5.897 6.23 6.435 6.627 6.923 7.206 7.454 7.691 7.909 8.149 8.364 8.565 8.802 9.069 9.358 9.671 10.001 10.314 10.638 10.903 11.121 11.366 11.62 11.86 12.061 12.226 12.34 12.364 12.239 11.838 10.964 9.137 6.611 4.404 2.501 0.847 -0.682 -2.042 -3.237 -4.279 -5.312 -6.173 -6.959 -7.706 -8.392 -9.054 -9.654 -10.277 -10.855 -11.343 -11.832 -12.374 -12.828 -13.292 -13.778 -14.136 -14.526 -14.963 -15.422 -15.871 -16.178 -16.512 -17.013 -17.371 -17.762 -17.96 -18.359 -18.772 -19.206 -19.43 -19.815 -20.181 -20.466 -20.743 -21.322 -21.654 -22.027 -22.417 -22.895 -23.49 -24.235 -26.327 -7 ,24951 ,TETRA ,17585760,Sat Nov 27 14:42:16 CET,Sat Nov 27 16:34:20 CET,0.0 1.225 1.716 2.137 2.466 2.748 2.995 3.212 3.607 3.793 3.958 4.147 4.428 4.566 4.834 5.096 5.319 5.423 5.652 5.88 6.21 6.417 6.607 6.856 7.073 7.286 7.492 7.69 7.946 8.187 8.411 8.658 8.897 9.129 9.367 9.61 9.834 10.069 10.32 10.571 10.808 11.037 11.248 11.426 11.588 11.689 11.696 11.546 11.186 10.421 8.66 6.088 3.877 1.965 0.308 -1.225 -2.563 -3.735 -4.753 -5.762 -6.628 -7.409 -8.167 -8.869 -9.501 -10.089 -10.712 -11.25 -11.714 -12.21 -12.721 -13.141 -13.581 -14.038 -14.4 -14.789 -15.175 -15.568 -15.991 -16.288 -16.592 -17.051 -17.377 -17.733 -17.919 -18.289 -18.686 -19.114 -19.327 -19.703 -20.051 -20.329 -20.618 -21.24 -21.588 -21.96 -22.354 -22.808 -23.389 -24.149 -26.24 -8 ,13168 ,TETRA ,17585761,Sat Nov 27 14:42:16 CET,Sat Nov 27 16:28:49 CET,0.0 1.047 1.622 2.065 2.376 2.646 2.906 3.147 3.589 3.793 3.985 4.216 4.51 4.664 4.956 5.242 5.514 5.637 5.87 6.101 6.423 6.623 6.82 7.117 7.401 7.652 7.889 8.128 8.432 8.711 8.98 9.296 9.601 9.902 10.217 10.56 10.869 11.147 11.402 11.645 11.897 12.14 12.363 12.558 12.726 12.831 12.847 12.72 12.317 11.444 9.68 7.313 5.174 3.3 1.661 0.144 -1.171 -2.345 -3.396 -4.477 -5.366 -6.145 -6.91 -7.617 -8.265 -8.864 -9.503 -10.08 -10.572 -11.103 -11.649 -12.085 -12.547 -13.031 -13.395 -13.781 -14.181 -14.585 -15.007 -15.305 -15.621 -16.11 -16.439 -16.778 -16.963 -17.34 -17.738 -18.191 -18.435 -18.84 -19.197 -19.477 -19.77 -20.386 -20.725 -21.092 -21.509 -21.987 -22.538 -23.25 -25.247 -9 ,26167 ,TETRA ,17585762,Sat Nov 27 14:42:17 CET,Sat Nov 27 16:32:51 CET,0.0 1.002 1.483 1.867 2.183 2.488 2.749 2.987 3.424 3.62 3.81 4.026 4.312 4.472 4.778 5.067 5.332 5.455 5.702 5.939 6.273 6.492 6.696 6.98 7.221 7.43 7.627 7.812 8.04 8.251 8.459 8.703 8.924 9.127 9.351 9.588 9.812 10.06 10.305 10.549 10.799 11.022 11.229 11.391 11.542 11.682 11.682 11.5 11.091 10.227 8.392 5.85 3.686 1.808 0.162 -1.329 -2.677 -3.923 -4.964 -5.972 -6.886 -7.72 -8.493 -9.21 -9.879 -10.497 -11.137 -11.714 -12.208 -12.714 -13.236 -13.673 -14.128 -14.615 -15.01 -15.433 -15.881 -16.333 -16.798 -17.118 -17.453 -17.976 -18.336 -18.696 -18.877 -19.249 -19.656 -20.091 -20.32 -20.712 -21.069 -21.365 -21.676 -22.281 -22.597 -22.966 -23.381 -23.866 -24.456 -25.249 -27.359 -10 ,6413 ,TETRA ,17585763,Sat Nov 27 14:43:16 CET,Sat Nov 27 16:33:40 CET,0.0 1.27 1.78 2.173 2.519 2.837 3.091 3.317 3.747 3.952 4.139 4.357 4.651 4.806 5.092 5.361 5.613 5.733 5.961 6.184 6.51 6.73 6.935 7.21 7.475 7.735 7.994 8.224 8.495 8.758 9.017 9.339 9.642 9.921 10.226 10.516 10.763 11.014 11.267 11.522 11.761 11.998 12.255 12.481 12.659 12.789 12.821 12.67 12.289 11.472 9.712 7.285 5.105 3.199 1.558 0.077 -1.232 -2.42 -3.504 -4.643 -5.649 -6.566 -7.444 -8.275 -9.01 -9.671 -10.382 -11.017 -11.57 -12.147 -12.756 -13.243 -13.736 -14.25 -14.648 -15.067 -15.507 -15.961 -16.442 -16.774 -17.103 -17.627 -18.009 -18.41 -18.611 -19.022 -19.441 -19.871 -20.113 -20.542 -20.94 -21.215 -21.503 -22.116 -22.453 -22.841 -23.254 -23.709 -24.289 -25.072 -26.913 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt deleted file mode 100644 index 40e81141..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22526 ,KEBNE ,17024202,Wed Dec 22 09:41:41 CET,Wed Dec 22 11:17:11 CET,0.0 1.001 1.467 1.859 2.205 2.518 2.825 3.099 3.598 3.833 4.043 4.309 4.63 4.8 5.116 5.437 5.747 5.891 6.165 6.438 6.842 7.095 7.339 7.689 8.024 8.338 8.639 8.928 9.3 9.663 10.012 10.418 10.803 11.166 11.582 12.061 12.525 13.045 13.583 14.136 14.718 15.352 16.072 16.808 17.633 18.485 19.423 20.358 21.285 22.089 22.502 22.089 21.312 20.469 19.651 18.854 18.061 17.315 16.663 15.979 15.373 14.829 14.303 13.782 13.293 12.848 12.379 11.953 11.584 11.203 10.783 10.442 10.104 9.743 9.454 9.159 8.866 8.542 8.199 7.984 7.752 7.363 7.093 6.795 6.637 6.327 6.02 5.716 5.552 5.245 4.986 4.777 4.564 4.111 3.848 3.555 3.23 2.844 2.404 1.826 0.321 -2 ,14054 ,KEBNE ,17024203,Wed Dec 22 09:41:41 CET,Wed Dec 22 11:17:13 CET,0.0 1.342 1.872 2.277 2.619 2.943 3.236 3.489 3.961 4.189 4.406 4.663 4.959 5.132 5.495 5.837 6.155 6.312 6.606 6.876 7.284 7.533 7.768 8.122 8.458 8.783 9.107 9.426 9.827 10.195 10.548 10.965 11.371 11.766 12.213 12.712 13.176 13.674 14.199 14.753 15.342 15.988 16.724 17.446 18.247 19.116 20.054 20.99 21.932 22.799 23.322 23.003 22.233 21.382 20.565 19.719 18.91 18.122 17.434 16.741 16.132 15.583 15.061 14.548 14.061 13.628 13.174 12.767 12.411 12.03 11.628 11.294 10.945 10.578 10.292 9.996 9.685 9.362 9.03 8.803 8.563 8.198 7.955 7.685 7.545 7.255 6.936 6.605 6.436 6.138 5.908 5.705 5.489 5.017 4.745 4.443 4.113 3.748 3.296 2.721 1.32 -3 ,32758 ,KEBNE ,17024204,Wed Dec 22 09:41:41 CET,Wed Dec 22 11:16:59 CET,0.0 1.39 1.983 2.413 2.757 3.096 3.406 3.679 4.162 4.382 4.594 4.87 5.193 5.38 5.716 6.016 6.32 6.466 6.75 7.04 7.449 7.695 7.927 8.277 8.616 8.94 9.247 9.553 9.939 10.294 10.652 11.087 11.498 11.89 12.339 12.839 13.31 13.823 14.383 14.982 15.595 16.256 16.976 17.665 18.463 19.324 20.231 21.178 22.129 22.947 23.398 22.997 22.282 21.461 20.565 19.737 19.029 18.323 17.661 16.982 16.386 15.863 15.357 14.872 14.4 13.944 13.462 13.016 12.642 12.276 11.885 11.549 11.205 10.859 10.581 10.273 9.962 9.657 9.33 9.097 8.85 8.462 8.199 7.924 7.784 7.493 7.178 6.853 6.678 6.345 6.073 5.871 5.659 5.192 4.938 4.661 4.351 4.007 3.643 3.138 1.696 -4 ,23884 ,KEBNE ,17024205,Wed Dec 22 09:41:41 CET,Wed Dec 22 11:17:17 CET,0.0 1.293 1.848 2.279 2.645 2.975 3.273 3.525 3.993 4.21 4.409 4.659 4.97 5.15 5.507 5.837 6.139 6.284 6.566 6.844 7.245 7.493 7.731 8.079 8.397 8.69 8.988 9.291 9.685 10.053 10.398 10.807 11.181 11.545 11.993 12.508 12.99 13.51 14.059 14.636 15.242 15.884 16.618 17.364 18.193 19.062 19.96 20.864 21.802 22.692 23.335 23.168 22.524 21.615 20.733 19.919 19.108 18.316 17.589 16.872 16.262 15.683 15.139 14.653 14.196 13.754 13.268 12.834 12.47 12.087 11.691 11.364 11.016 10.647 10.359 10.068 9.765 9.451 9.123 8.902 8.673 8.297 8.037 7.776 7.641 7.366 7.066 6.755 6.597 6.299 6.046 5.834 5.617 5.155 4.898 4.612 4.299 3.952 3.55 2.974 1.415 -5 ,28261 ,KEBNE ,17024206,Wed Dec 22 09:41:41 CET,Wed Dec 22 11:16:41 CET,0.0 1.203 1.724 2.149 2.507 2.833 3.133 3.43 3.975 4.218 4.444 4.726 5.051 5.237 5.576 5.887 6.184 6.328 6.606 6.873 7.272 7.536 7.787 8.156 8.505 8.828 9.153 9.468 9.861 10.238 10.593 11.028 11.446 11.832 12.282 12.795 13.281 13.79 14.321 14.885 15.48 16.15 16.884 17.582 18.368 19.197 20.099 20.994 21.92 22.826 23.365 23.084 22.398 21.542 20.724 19.924 19.151 18.391 17.734 17.086 16.492 15.928 15.372 14.855 14.38 13.943 13.479 13.043 12.649 12.26 11.863 11.524 11.172 10.797 10.504 10.216 9.915 9.58 9.207 8.945 8.695 8.318 8.044 7.75 7.607 7.306 6.985 6.668 6.505 6.199 5.937 5.722 5.493 5.012 4.749 4.468 4.158 3.802 3.389 2.87 1.82 -6 ,9027 ,KEBNE ,17024207,Wed Dec 22 09:41:42 CET,Wed Dec 22 11:16:45 CET,0.0 1.821 2.416 2.813 3.141 3.461 3.768 4.024 4.488 4.717 4.929 5.203 5.532 5.716 6.077 6.422 6.74 6.883 7.156 7.433 7.839 8.091 8.329 8.687 9.026 9.346 9.666 9.97 10.359 10.717 11.058 11.468 11.859 12.247 12.692 13.203 13.676 14.184 14.735 15.308 15.897 16.556 17.289 17.989 18.812 19.682 20.62 21.574 22.522 23.421 23.964 23.785 23.095 22.276 21.525 20.748 19.959 19.199 18.525 17.852 17.275 16.74 16.197 15.673 15.2 14.769 14.292 13.87 13.522 13.159 12.771 12.445 12.097 11.73 11.438 11.125 10.809 10.484 10.131 9.89 9.646 9.271 9.006 8.724 8.584 8.291 7.974 7.637 7.454 7.139 6.888 6.686 6.466 5.992 5.732 5.446 5.145 4.78 4.352 3.859 2.972 -7 ,3048 ,KEBNE ,17024208,Wed Dec 22 09:41:41 CET,Wed Dec 22 11:16:50 CET,0.0 1.016 1.547 1.994 2.39 2.716 3.004 3.269 3.757 3.993 4.222 4.505 4.817 4.994 5.346 5.681 5.976 6.117 6.412 6.692 7.072 7.314 7.556 7.908 8.256 8.594 8.901 9.192 9.572 9.934 10.291 10.72 11.107 11.481 11.911 12.382 12.86 13.387 13.917 14.476 15.071 15.721 16.454 17.172 17.968 18.8 19.701 20.654 21.605 22.436 23.011 22.844 22.204 21.379 20.546 19.778 19.042 18.298 17.623 16.915 16.317 15.808 15.317 14.827 14.362 13.934 13.463 13.034 12.658 12.266 11.877 11.541 11.182 10.824 10.553 10.27 9.966 9.656 9.343 9.118 8.877 8.487 8.214 7.92 7.766 7.464 7.147 6.803 6.629 6.316 6.051 5.843 5.626 5.171 4.929 4.657 4.319 3.914 3.449 2.825 1.542 -8 ,19607 ,KEBNE ,17024209,Wed Dec 22 09:43:48 CET,Wed Dec 22 11:18:56 CET,0.0 0.883 1.426 1.848 2.217 2.555 2.858 3.121 3.59 3.807 4.016 4.287 4.597 4.773 5.104 5.41 5.704 5.846 6.132 6.418 6.817 7.063 7.306 7.651 7.971 8.287 8.599 8.89 9.264 9.632 9.98 10.387 10.766 11.134 11.575 12.076 12.539 13.041 13.608 14.204 14.797 15.451 16.192 16.91 17.698 18.502 19.37 20.267 21.206 22.089 22.614 22.257 21.535 20.718 19.869 19.008 18.22 17.487 16.821 16.15 15.559 15.019 14.472 13.952 13.481 13.044 12.581 12.156 11.782 11.389 10.985 10.653 10.308 9.959 9.681 9.38 9.057 8.716 8.376 8.152 7.92 7.549 7.288 7.013 6.877 6.585 6.278 5.958 5.777 5.451 5.177 4.968 4.743 4.247 3.985 3.706 3.381 3.012 2.576 2.072 0.999 -9 ,18640 ,KEBNE ,17024210,Wed Dec 22 09:43:44 CET,Wed Dec 22 11:20:01 CET,0.0 1.434 1.991 2.413 2.761 3.073 3.374 3.652 4.139 4.35 4.56 4.828 5.138 5.309 5.643 5.96 6.261 6.415 6.719 6.996 7.377 7.619 7.862 8.22 8.563 8.891 9.21 9.52 9.909 10.266 10.617 11.052 11.461 11.841 12.278 12.772 13.255 13.785 14.317 14.872 15.466 16.133 16.904 17.644 18.448 19.292 20.203 21.105 22.04 22.911 23.398 23.114 22.506 21.764 20.945 20.113 19.317 18.543 17.882 17.204 16.582 15.987 15.393 14.872 14.408 13.982 13.514 13.076 12.708 12.329 11.928 11.579 11.22 10.865 10.589 10.285 9.955 9.629 9.295 9.065 8.826 8.453 8.188 7.91 7.765 7.461 7.146 6.81 6.636 6.326 6.067 5.858 5.633 5.161 4.915 4.636 4.312 3.958 3.558 3.028 1.532 -10 ,30095 ,KEBNE ,17024211,Wed Dec 22 09:43:44 CET,Wed Dec 22 11:18:57 CET,0.0 1.527 2.108 2.564 2.95 3.279 3.58 3.848 4.305 4.51 4.715 4.984 5.3 5.487 5.838 6.168 6.499 6.655 6.949 7.235 7.638 7.884 8.11 8.458 8.792 9.108 9.416 9.714 10.098 10.476 10.836 11.262 11.674 12.072 12.527 13.023 13.486 13.987 14.521 15.089 15.698 16.368 17.102 17.819 18.64 19.512 20.399 21.276 22.226 23.111 23.745 23.682 23.048 22.192 21.288 20.419 19.648 18.914 18.265 17.595 16.974 16.41 15.856 15.331 14.858 14.414 13.953 13.538 13.172 12.779 12.364 12.018 11.658 11.295 11.012 10.723 10.434 10.129 9.796 9.564 9.316 8.937 8.69 8.424 8.277 7.973 7.652 7.311 7.14 6.836 6.56 6.35 6.136 5.671 5.4 5.097 4.772 4.416 3.98 3.412 2.148 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt deleted file mode 100644 index b805d691..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14617 ,KEBNE ,17024212,Wed Dec 22 09:43:44 CET,Wed Dec 22 11:18:50 CET,0.0 1.6 2.181 2.621 3.012 3.345 3.651 3.945 4.466 4.689 4.895 5.19 5.523 5.705 6.057 6.394 6.72 6.88 7.185 7.484 7.917 8.186 8.437 8.804 9.154 9.481 9.8 10.101 10.502 10.905 11.268 11.692 12.114 12.512 12.972 13.478 13.951 14.492 15.055 15.622 16.236 16.921 17.71 18.517 19.405 20.337 21.387 22.515 23.722 24.93 25.907 26.038 25.63 25.024 24.354 23.706 23.09 22.466 21.873 21.258 20.701 20.184 19.686 19.202 18.753 18.337 17.89 17.487 17.136 16.771 16.375 16.055 15.732 15.381 15.106 14.828 14.529 14.208 13.885 13.666 13.436 13.057 12.797 12.526 12.381 12.067 11.739 11.408 11.235 10.935 10.677 10.474 10.264 9.786 9.517 9.233 8.91 8.533 8.104 7.518 6.24 -2 ,30961 ,KEBNE ,17024213,Wed Dec 22 09:43:45 CET,Wed Dec 22 11:18:51 CET,0.0 1.471 2.026 2.502 2.911 3.262 3.559 3.833 4.371 4.602 4.817 5.094 5.414 5.604 5.973 6.32 6.649 6.81 7.121 7.417 7.822 8.071 8.314 8.665 8.997 9.333 9.671 9.991 10.39 10.779 11.163 11.626 12.073 12.484 12.962 13.478 13.963 14.523 15.119 15.716 16.325 17.023 17.835 18.633 19.516 20.474 21.531 22.648 23.83 24.929 25.841 26.003 25.652 25.114 24.425 23.724 23.085 22.462 21.883 21.293 20.789 20.314 19.815 19.322 18.865 18.436 17.975 17.569 17.214 16.858 16.5 16.195 15.882 15.55 15.274 14.983 14.679 14.349 13.981 13.736 13.506 13.138 12.878 12.613 12.473 12.177 11.858 11.512 11.329 11.015 10.741 10.521 10.288 9.814 9.553 9.267 8.953 8.575 8.113 7.516 6.173 -3 ,10968 ,KEBNE ,17024214,Wed Dec 22 09:43:44 CET,Wed Dec 22 11:20:37 CET,0.0 1.393 1.975 2.446 2.876 3.28 3.623 3.916 4.425 4.651 4.867 5.145 5.463 5.635 5.994 6.35 6.659 6.806 7.093 7.363 7.759 8.015 8.254 8.599 8.946 9.285 9.608 9.909 10.283 10.644 10.995 11.424 11.846 12.246 12.692 13.185 13.691 14.243 14.807 15.408 16.028 16.709 17.469 18.19 19.02 19.938 20.943 21.996 23.063 24.088 24.975 25.191 24.862 24.322 23.708 23.035 22.33 21.645 21.071 20.482 19.937 19.423 18.918 18.439 17.982 17.571 17.136 16.741 16.4 16.04 15.653 15.33 14.999 14.639 14.363 14.082 13.787 13.49 13.168 12.938 12.7 12.334 12.08 11.81 11.673 11.374 11.047 10.707 10.523 10.2 9.932 9.727 9.499 8.958 8.66 8.352 8.009 7.653 7.245 6.655 5.497 -4 ,14527 ,KEBNE ,17024215,Wed Dec 22 09:43:48 CET,Wed Dec 22 11:14:10 CET,0.0 1.455 2.052 2.501 2.858 3.163 3.461 3.735 4.226 4.462 4.68 4.948 5.267 5.454 5.827 6.185 6.518 6.676 6.989 7.283 7.696 7.969 8.226 8.583 8.928 9.267 9.592 9.912 10.325 10.723 11.099 11.552 12.003 12.414 12.898 13.46 13.987 14.554 15.172 15.807 16.432 17.119 17.885 18.661 19.53 20.459 21.508 22.598 23.781 24.976 25.958 26.156 25.787 25.214 24.567 23.854 23.155 22.519 21.956 21.368 20.833 20.314 19.808 19.334 18.887 18.467 18.031 17.654 17.316 16.948 16.552 16.236 15.906 15.534 15.248 14.956 14.656 14.349 14.026 13.798 13.563 13.19 12.927 12.658 12.521 12.242 11.943 11.607 11.425 11.117 10.846 10.632 10.404 9.924 9.659 9.385 9.084 8.729 8.327 7.825 6.149 -5 ,2759 ,KEBNE ,17024216,Wed Dec 22 09:43:44 CET,Wed Dec 22 11:18:58 CET,0.0 1.889 2.476 2.911 3.27 3.589 3.883 4.152 4.624 4.85 5.067 5.344 5.668 5.864 6.239 6.571 6.894 7.062 7.38 7.683 8.113 8.387 8.649 9.022 9.375 9.714 10.045 10.362 10.764 11.152 11.525 11.964 12.388 12.808 13.292 13.829 14.349 14.907 15.499 16.11 16.738 17.42 18.219 19.029 19.915 20.865 21.876 22.939 24.098 25.31 26.293 26.463 26.144 25.662 25.043 24.358 23.727 23.099 22.506 21.901 21.378 20.907 20.432 19.974 19.539 19.128 18.703 18.321 17.975 17.595 17.202 16.876 16.532 16.181 15.912 15.627 15.329 15.026 14.699 14.469 14.238 13.875 13.621 13.346 13.199 12.889 12.572 12.235 12.061 11.763 11.513 11.298 11.047 10.502 10.21 9.889 9.559 9.214 8.756 8.158 6.722 -6 ,88 ,KEBNE ,17024217,Wed Dec 22 09:43:44 CET,Wed Dec 22 11:18:50 CET,0.0 1.596 2.232 2.701 3.093 3.451 3.744 3.985 4.45 4.683 4.913 5.212 5.536 5.72 6.071 6.414 6.75 6.907 7.207 7.504 7.927 8.186 8.436 8.81 9.179 9.523 9.845 10.162 10.567 10.942 11.315 11.774 12.205 12.605 13.05 13.552 14.037 14.582 15.154 15.733 16.352 17.037 17.796 18.522 19.367 20.34 21.43 22.529 23.694 24.876 25.845 26.125 25.784 25.198 24.56 23.833 23.14 22.482 21.869 21.233 20.691 20.202 19.699 19.214 18.766 18.339 17.886 17.5 17.158 16.798 16.418 16.096 15.75 15.389 15.107 14.803 14.495 14.181 13.845 13.623 13.399 13.014 12.741 12.464 12.32 12.021 11.709 11.373 11.193 10.889 10.626 10.421 10.202 9.723 9.452 9.144 8.817 8.44 7.983 7.428 5.993 -7 ,15783 ,KEBNE ,17024218,Wed Dec 22 09:43:45 CET,Wed Dec 22 11:19:12 CET,0.0 1.566 2.155 2.617 2.994 3.337 3.667 3.951 4.438 4.67 4.885 5.16 5.475 5.652 6.014 6.357 6.675 6.827 7.12 7.403 7.806 8.066 8.324 8.692 9.045 9.372 9.682 9.999 10.391 10.753 11.105 11.532 11.948 12.346 12.798 13.298 13.793 14.345 14.936 15.543 16.18 16.89 17.658 18.417 19.306 20.253 21.297 22.433 23.613 24.731 25.631 25.732 25.266 24.615 23.9 23.131 22.387 21.675 21.031 20.37 19.779 19.241 18.738 18.249 17.772 17.321 16.851 16.449 16.098 15.73 15.349 15.014 14.664 14.309 14.023 13.719 13.41 13.097 12.769 12.548 12.323 11.956 11.697 11.426 11.28 10.976 10.664 10.315 10.13 9.831 9.578 9.371 9.148 8.657 8.38 8.071 7.727 7.352 6.91 6.316 4.692 -8 ,1552 ,KEBNE ,17024219,Wed Dec 22 09:43:45 CET,Wed Dec 22 11:18:59 CET,0.0 1.533 2.085 2.541 2.943 3.285 3.576 3.848 4.354 4.582 4.806 5.102 5.416 5.589 5.947 6.307 6.643 6.8 7.121 7.442 7.878 8.138 8.39 8.751 9.12 9.478 9.798 10.101 10.509 10.92 11.324 11.808 12.272 12.687 13.162 13.724 14.237 14.772 15.368 16.0 16.626 17.299 18.056 18.83 19.735 20.726 21.828 22.963 24.15 25.347 26.324 26.337 25.749 25.026 24.329 23.609 22.903 22.231 21.596 20.933 20.349 19.832 19.344 18.865 18.411 18.009 17.601 17.221 16.866 16.48 16.08 15.753 15.421 15.067 14.795 14.506 14.199 13.873 13.52 13.292 13.065 12.685 12.408 12.12 11.971 11.659 11.328 10.986 10.811 10.501 10.227 10.027 9.813 9.369 9.124 8.83 8.498 8.151 7.773 7.244 5.963 -9 ,17135 ,KEBNE ,17024220,Wed Dec 22 09:43:45 CET,Wed Dec 22 11:19:24 CET,0.0 1.241 1.781 2.203 2.555 2.874 3.171 3.451 3.954 4.185 4.401 4.661 4.979 5.165 5.537 5.872 6.172 6.325 6.625 6.912 7.314 7.573 7.818 8.162 8.504 8.844 9.165 9.482 9.903 10.289 10.654 11.084 11.474 11.845 12.291 12.806 13.305 13.842 14.404 15.001 15.629 16.335 17.134 17.892 18.767 19.742 20.794 21.923 23.088 24.227 25.258 25.509 25.174 24.687 24.102 23.372 22.657 22.025 21.469 20.87 20.326 19.841 19.361 18.869 18.398 17.977 17.541 17.14 16.783 16.416 16.04 15.73 15.397 15.037 14.758 14.465 14.169 13.868 13.55 13.332 13.103 12.737 12.483 12.222 12.083 11.79 11.48 11.146 10.97 10.664 10.398 10.179 9.941 9.439 9.15 8.829 8.501 8.149 7.653 6.98 5.331 -10 ,15861 ,KEBNE ,17024221,Wed Dec 22 09:43:45 CET,Wed Dec 22 11:19:13 CET,0.0 1.345 1.957 2.421 2.855 3.222 3.507 3.775 4.28 4.515 4.736 5.032 5.361 5.545 5.896 6.234 6.551 6.702 6.993 7.272 7.672 7.928 8.187 8.561 8.913 9.229 9.529 9.829 10.213 10.577 10.923 11.347 11.752 12.146 12.606 13.115 13.611 14.156 14.741 15.337 15.95 16.645 17.441 18.224 19.106 20.06 21.119 22.251 23.373 24.492 25.448 25.597 25.293 24.744 24.084 23.402 22.744 22.132 21.554 20.93 20.357 19.82 19.328 18.877 18.431 18.002 17.553 17.138 16.789 16.427 16.048 15.735 15.402 15.051 14.773 14.492 14.193 13.875 13.554 13.329 13.092 12.729 12.48 12.211 12.067 11.774 11.467 11.136 10.97 10.678 10.409 10.198 9.975 9.465 9.192 8.907 8.586 8.225 7.821 7.24 5.818 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index a3d4d988..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1941 ,KEBNE ,17024222,Wed Dec 22 09:43:45 CET,Wed Dec 22 11:15:51 CET,0.0 0.466 0.818 1.108 1.379 1.626 1.858 2.269 2.443 2.613 2.809 3.109 3.263 3.543 3.802 4.056 4.18 4.421 4.647 4.933 5.097 5.257 5.493 5.728 5.967 6.206 6.426 6.698 6.962 7.221 7.53 7.82 8.11 8.458 8.809 9.113 9.467 9.865 10.269 10.681 11.13 11.642 12.148 12.692 13.232 13.763 14.259 14.759 15.089 14.733 13.651 12.416 11.139 9.962 8.862 7.869 6.944 6.106 5.259 4.494 3.793 3.129 2.509 1.913 1.349 0.744 0.201 -0.228 -0.659 -1.159 -1.578 -2.001 -2.454 -2.809 -3.169 -3.529 -3.91 -4.345 -4.673 -5.018 -5.547 -5.911 -6.299 -6.489 -6.915 -7.404 -7.874 -8.123 -8.532 -9.001 -9.325 -9.665 -10.433 -10.899 -11.463 -12.146 -12.909 -13.848 -15.158 -2 ,13121 ,KEBNE ,17024223,Wed Dec 22 09:43:45 CET,Wed Dec 22 11:16:11 CET,0.0 0.472 0.82 1.084 1.305 1.512 1.709 2.078 2.251 2.412 2.577 2.849 2.982 3.243 3.492 3.728 3.835 4.043 4.243 4.525 4.697 4.869 5.132 5.382 5.607 5.811 6.007 6.272 6.535 6.782 7.077 7.369 7.647 7.961 8.33 8.689 9.06 9.436 9.835 10.26 10.712 11.223 11.753 12.341 12.957 13.596 14.183 14.708 14.982 14.709 13.683 12.485 11.295 10.229 9.251 8.296 7.344 6.49 5.628 4.868 4.189 3.539 2.917 2.328 1.799 1.257 0.757 0.308 -0.154 -0.649 -1.064 -1.483 -1.931 -2.291 -2.657 -3.056 -3.487 -3.946 -4.268 -4.597 -5.108 -5.453 -5.804 -5.997 -6.412 -6.846 -7.328 -7.591 -7.992 -8.431 -8.73 -9.039 -9.743 -10.181 -10.681 -11.254 -11.911 -12.693 -13.891 -3 ,8858 ,KEBNE ,17024224,Wed Dec 22 09:43:44 CET,Wed Dec 22 11:16:04 CET,0.0 0.397 0.717 0.998 1.241 1.459 1.659 2.026 2.205 2.386 2.569 2.842 2.975 3.241 3.483 3.697 3.797 4.006 4.217 4.511 4.69 4.863 5.124 5.372 5.596 5.818 6.043 6.324 6.586 6.836 7.137 7.434 7.726 8.047 8.402 8.746 9.108 9.491 9.894 10.301 10.745 11.262 11.762 12.303 12.866 13.437 13.976 14.422 14.608 14.336 13.391 12.193 10.932 9.754 8.675 7.692 6.767 5.943 5.083 4.341 3.689 3.036 2.395 1.824 1.307 0.752 0.238 -0.224 -0.699 -1.173 -1.576 -2.029 -2.557 -2.978 -3.386 -3.802 -4.262 -4.757 -5.097 -5.46 -6.021 -6.407 -6.793 -6.992 -7.428 -7.89 -8.395 -8.672 -9.097 -9.566 -9.894 -10.225 -10.996 -11.48 -12.015 -12.598 -13.271 -14.177 -15.656 -4 ,8540 ,KEBNE ,17024225,Wed Dec 22 09:46:49 CET,Wed Dec 22 11:18:52 CET,0.0 0.428 0.776 1.051 1.282 1.49 1.692 2.064 2.229 2.391 2.564 2.834 2.966 3.232 3.484 3.725 3.836 4.045 4.253 4.541 4.72 4.899 5.154 5.399 5.629 5.847 6.062 6.35 6.642 6.915 7.22 7.512 7.791 8.12 8.473 8.796 9.143 9.514 9.929 10.347 10.785 11.276 11.75 12.272 12.822 13.419 13.988 14.394 14.539 14.176 13.174 12.019 10.809 9.626 8.486 7.417 6.476 5.674 4.833 4.112 3.441 2.788 2.178 1.578 1.0 0.38 -0.186 -0.693 -1.255 -1.826 -2.243 -2.655 -3.12 -3.486 -3.839 -4.221 -4.653 -5.115 -5.429 -5.746 -6.254 -6.626 -7.028 -7.226 -7.658 -8.148 -8.653 -8.921 -9.329 -9.791 -10.098 -10.425 -11.149 -11.557 -12.02 -12.55 -13.189 -14.012 -15.328 -5 ,28492 ,KEBNE ,17024226,Wed Dec 22 09:46:49 CET,Wed Dec 22 11:20:39 CET,0.0 0.419 0.725 0.982 1.213 1.445 1.667 2.063 2.249 2.427 2.61 2.876 3.0 3.25 3.475 3.694 3.801 4.004 4.195 4.453 4.622 4.786 5.043 5.295 5.525 5.756 5.973 6.256 6.538 6.796 7.103 7.392 7.655 7.958 8.296 8.62 8.962 9.314 9.696 10.106 10.546 11.022 11.469 11.976 12.528 13.105 13.659 14.16 14.514 14.278 13.328 12.247 11.115 9.98 8.892 7.922 7.041 6.243 5.376 4.622 3.959 3.329 2.728 2.152 1.612 1.058 0.581 0.147 -0.33 -0.845 -1.273 -1.708 -2.158 -2.521 -2.912 -3.305 -3.715 -4.141 -4.433 -4.748 -5.3 -5.694 -6.079 -6.276 -6.699 -7.155 -7.631 -7.896 -8.308 -8.802 -9.139 -9.482 -10.297 -10.766 -11.286 -11.865 -12.574 -13.568 -14.937 -6 ,10785 ,KEBNE ,17024227,Wed Dec 22 09:46:48 CET,Wed Dec 22 11:18:46 CET,0.0 0.497 0.842 1.138 1.395 1.633 1.853 2.224 2.401 2.573 2.768 3.051 3.201 3.501 3.787 4.066 4.193 4.412 4.615 4.908 5.093 5.268 5.531 5.793 6.036 6.265 6.478 6.75 7.008 7.252 7.567 7.879 8.161 8.507 8.948 9.37 9.789 10.176 10.56 10.945 11.362 11.863 12.364 12.937 13.525 14.082 14.615 15.161 15.432 15.049 13.972 12.79 11.581 10.43 9.349 8.37 7.475 6.657 5.813 5.079 4.414 3.773 3.167 2.575 2.033 1.478 0.958 0.495 0.026 -0.464 -0.877 -1.324 -1.821 -2.21 -2.595 -2.984 -3.408 -3.852 -4.172 -4.501 -4.987 -5.34 -5.708 -5.896 -6.294 -6.722 -7.204 -7.477 -7.882 -8.311 -8.628 -8.969 -9.719 -10.127 -10.57 -11.106 -11.74 -12.636 -13.998 -7 ,12463 ,KEBNE ,17024228,Wed Dec 22 09:46:49 CET,Wed Dec 22 11:19:11 CET,0.0 0.456 0.762 1.01 1.264 1.508 1.737 2.129 2.307 2.479 2.662 2.954 3.104 3.383 3.638 3.873 3.988 4.215 4.425 4.725 4.919 5.105 5.373 5.624 5.88 6.129 6.359 6.645 6.914 7.163 7.445 7.737 8.036 8.375 8.733 9.067 9.416 9.778 10.17 10.594 11.045 11.539 12.062 12.638 13.16 13.692 14.256 14.752 15.027 14.624 13.543 12.367 11.114 9.937 8.868 7.871 6.964 6.15 5.277 4.535 3.899 3.277 2.664 2.07 1.513 0.955 0.458 0.016 -0.446 -0.93 -1.339 -1.776 -2.278 -2.66 -3.02 -3.405 -3.814 -4.272 -4.605 -4.947 -5.497 -5.864 -6.234 -6.439 -6.885 -7.348 -7.831 -8.092 -8.488 -8.923 -9.229 -9.567 -10.36 -10.857 -11.453 -12.089 -12.815 -13.733 -15.037 -8 ,23456 ,KEBNE ,17024229,Wed Dec 22 09:46:49 CET,Wed Dec 22 11:19:04 CET,0.0 0.621 1.105 1.503 1.865 2.191 2.461 2.961 3.221 3.467 3.768 4.092 4.289 4.68 5.028 5.33 5.482 5.779 6.063 6.473 6.726 6.977 7.31 7.576 7.809 8.03 8.246 8.518 8.775 9.028 9.331 9.615 9.895 10.22 10.578 10.935 11.312 11.695 12.087 12.488 12.939 13.472 13.994 14.561 15.113 15.658 16.208 16.734 16.994 16.658 15.693 14.474 13.263 12.129 11.041 10.065 9.155 8.335 7.521 6.82 6.163 5.543 4.935 4.35 3.816 3.218 2.684 2.239 1.745 1.221 0.794 0.341 -0.138 -0.507 -0.897 -1.324 -1.762 -2.218 -2.54 -2.869 -3.411 -3.787 -4.146 -4.334 -4.752 -5.211 -5.685 -5.933 -6.336 -6.75 -7.038 -7.362 -8.158 -8.671 -9.225 -9.803 -10.497 -11.425 -12.874 -9 ,23300 ,KEBNE ,17024230,Wed Dec 22 09:46:49 CET,Wed Dec 22 11:21:28 CET,0.0 0.465 0.794 1.084 1.35 1.581 1.797 2.21 2.396 2.566 2.76 3.049 3.196 3.475 3.732 3.981 4.104 4.335 4.566 4.914 5.13 5.328 5.601 5.864 6.116 6.355 6.581 6.869 7.144 7.411 7.72 7.993 8.268 8.599 8.965 9.313 9.678 10.071 10.484 10.888 11.343 11.862 12.362 12.916 13.462 14.043 14.601 15.083 15.347 15.002 14.037 12.848 11.618 10.502 9.446 8.481 7.546 6.714 5.907 5.181 4.476 3.827 3.224 2.626 2.085 1.534 1.047 0.618 0.152 -0.368 -0.795 -1.215 -1.679 -2.044 -2.407 -2.775 -3.167 -3.592 -3.878 -4.165 -4.633 -4.998 -5.39 -5.576 -5.958 -6.39 -6.9 -7.177 -7.582 -8.04 -8.357 -8.702 -9.503 -9.941 -10.434 -11.022 -11.738 -12.679 -13.922 -10 ,19086 ,KEBNE ,17024231,Wed Dec 22 09:46:49 CET,Wed Dec 22 11:19:04 CET,0.0 0.422 0.756 1.01 1.225 1.429 1.623 1.958 2.116 2.279 2.434 2.699 2.834 3.09 3.32 3.526 3.63 3.843 4.039 4.326 4.517 4.703 4.968 5.225 5.465 5.692 5.91 6.175 6.429 6.68 6.979 7.267 7.548 7.857 8.201 8.534 8.885 9.265 9.656 10.05 10.497 10.995 11.482 12.023 12.595 13.188 13.737 14.182 14.438 14.279 13.235 11.954 10.675 9.511 8.46 7.477 6.552 5.729 4.857 4.093 3.414 2.742 2.094 1.487 0.944 0.352 -0.206 -0.672 -1.135 -1.614 -2.031 -2.494 -2.972 -3.331 -3.702 -4.103 -4.528 -4.973 -5.289 -5.626 -6.172 -6.557 -6.945 -7.151 -7.57 -7.977 -8.412 -8.668 -9.076 -9.551 -9.888 -10.227 -10.978 -11.395 -11.924 -12.49 -13.073 -13.883 -15.072 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index 96d62bf3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21356 ,TETRA ,17585764,Sat Nov 27 14:44:16 CET,Sat Nov 27 16:36:12 CET,0.0 1.292 1.863 2.243 2.551 2.832 3.109 3.378 3.845 4.058 4.269 4.535 4.842 5.013 5.335 5.641 5.94 6.087 6.372 6.647 7.049 7.308 7.549 7.881 8.199 8.514 8.832 9.138 9.519 9.889 10.246 10.678 11.084 11.458 11.9 12.413 12.894 13.416 13.99 14.608 15.249 15.949 16.719 17.458 18.318 19.269 20.337 21.42 22.521 23.667 24.667 24.866 24.537 24.016 23.375 22.735 22.125 21.507 20.95 20.389 19.895 19.437 18.987 18.557 18.143 17.738 17.313 16.938 16.62 16.283 15.911 15.607 15.301 14.966 14.693 14.402 14.106 13.803 13.484 13.263 13.029 12.669 12.425 12.168 12.037 11.762 11.467 11.147 10.975 10.681 10.432 10.233 10.021 9.574 9.332 9.045 8.714 8.319 7.874 7.343 5.925 -2 ,14648 ,TETRA ,17585765,Sat Nov 27 14:44:16 CET,Sat Nov 27 16:36:41 CET,0.0 1.178 1.761 2.202 2.534 2.832 3.119 3.382 3.857 4.083 4.301 4.579 4.897 5.083 5.44 5.768 6.078 6.229 6.531 6.815 7.205 7.455 7.701 8.082 8.445 8.779 9.105 9.415 9.804 10.168 10.517 10.934 11.35 11.752 12.2 12.693 13.168 13.695 14.259 14.864 15.494 16.179 16.959 17.749 18.683 19.654 20.706 21.818 22.92 24.037 25.034 25.191 24.745 24.128 23.479 22.864 22.243 21.624 21.104 20.553 20.048 19.565 19.073 18.623 18.217 17.838 17.432 17.047 16.713 16.374 16.007 15.692 15.372 15.036 14.774 14.513 14.227 13.919 13.596 13.377 13.155 12.79 12.527 12.27 12.141 11.866 11.574 11.254 11.078 10.779 10.524 10.328 10.1 9.588 9.323 9.049 8.75 8.425 8.02 7.472 5.857 -3 ,25826 ,TETRA ,17585766,Sat Nov 27 14:44:16 CET,Sat Nov 27 16:26:36 CET,0.0 1.393 1.986 2.436 2.814 3.155 3.454 3.72 4.207 4.421 4.62 4.865 5.18 5.357 5.694 6.023 6.335 6.481 6.752 7.014 7.394 7.642 7.885 8.23 8.559 8.882 9.192 9.502 9.9 10.262 10.608 11.022 11.424 11.829 12.3 12.807 13.3 13.832 14.396 15.013 15.657 16.415 17.279 18.076 18.997 19.952 20.949 22.07 23.303 24.488 25.455 25.627 25.222 24.633 24.024 23.373 22.74 22.126 21.563 20.97 20.43 19.942 19.468 19.0 18.561 18.179 17.766 17.372 17.038 16.698 16.332 16.023 15.694 15.346 15.083 14.804 14.515 14.225 13.912 13.695 13.476 13.129 12.883 12.624 12.494 12.225 11.933 11.625 11.461 11.176 10.92 10.722 10.513 10.041 9.774 9.49 9.202 8.868 8.428 7.908 6.643 -4 ,10239 ,TETRA ,17585767,Sat Nov 27 14:44:16 CET,Sat Nov 27 16:25:23 CET,0.0 1.189 1.687 2.075 2.402 2.688 2.965 3.239 3.731 3.952 4.15 4.401 4.722 4.91 5.264 5.58 5.87 6.014 6.298 6.573 6.963 7.208 7.449 7.808 8.142 8.452 8.756 9.053 9.446 9.829 10.175 10.58 10.982 11.369 11.808 12.304 12.799 13.354 13.926 14.518 15.138 15.83 16.639 17.398 18.251 19.198 20.268 21.454 22.679 23.882 24.893 25.024 24.664 24.154 23.574 22.921 22.292 21.699 21.153 20.57 20.038 19.577 19.154 18.719 18.287 17.89 17.485 17.125 16.813 16.485 16.122 15.814 15.495 15.157 14.89 14.617 14.328 14.017 13.692 13.467 13.244 12.89 12.642 12.385 12.248 11.96 11.665 11.353 11.183 10.891 10.643 10.447 10.243 9.813 9.577 9.299 8.999 8.649 8.218 7.713 6.461 -5 ,5051 ,TETRA ,17585768,Sat Nov 27 14:45:16 CET,Sat Nov 27 16:37:00 CET,0.0 1.129 1.662 2.092 2.435 2.746 3.057 3.34 3.838 4.061 4.273 4.551 4.864 5.04 5.371 5.699 6.012 6.158 6.431 6.693 7.076 7.321 7.559 7.907 8.234 8.546 8.864 9.167 9.542 9.901 10.25 10.664 11.054 11.441 11.897 12.403 12.905 13.449 14.02 14.613 15.213 15.9 16.687 17.47 18.389 19.339 20.299 21.356 22.531 23.604 24.385 24.578 24.252 23.673 23.078 22.465 21.882 21.307 20.767 20.195 19.682 19.23 18.778 18.334 17.921 17.527 17.098 16.713 16.381 16.034 15.675 15.383 15.088 14.774 14.524 14.267 13.987 13.699 13.404 13.199 12.98 12.62 12.368 12.1 11.959 11.667 11.358 11.043 10.884 10.594 10.323 10.113 9.899 9.451 9.185 8.882 8.554 8.2 7.805 7.297 6.052 -6 ,4850 ,TETRA ,17585769,Sat Nov 27 14:45:17 CET,Sat Nov 27 16:32:17 CET,0.0 1.305 1.826 2.214 2.573 2.907 3.194 3.439 3.881 4.098 4.307 4.564 4.872 5.052 5.404 5.738 6.049 6.199 6.482 6.755 7.14 7.379 7.621 7.971 8.303 8.612 8.902 9.191 9.579 9.947 10.293 10.727 11.16 11.584 12.058 12.545 12.996 13.503 14.054 14.619 15.222 15.915 16.685 17.444 18.345 19.345 20.429 21.535 22.704 23.828 24.713 24.765 24.332 23.757 23.183 22.584 21.95 21.335 20.768 20.156 19.638 19.179 18.74 18.318 17.913 17.543 17.13 16.731 16.38 16.038 15.687 15.383 15.066 14.736 14.484 14.22 13.938 13.644 13.33 13.106 12.87 12.487 12.231 11.965 11.825 11.545 11.251 10.933 10.761 10.469 10.202 9.985 9.764 9.309 9.041 8.747 8.427 8.056 7.637 7.063 5.778 -7 ,10699 ,TETRA ,17585770,Sat Nov 27 14:45:16 CET,Sat Nov 27 16:37:48 CET,0.0 1.368 1.894 2.327 2.733 3.048 3.304 3.553 4.011 4.226 4.436 4.681 4.979 5.15 5.487 5.801 6.105 6.262 6.562 6.857 7.282 7.544 7.795 8.14 8.476 8.818 9.141 9.448 9.836 10.214 10.609 11.086 11.512 11.932 12.438 12.983 13.476 14.001 14.551 15.118 15.729 16.413 17.226 18.042 18.942 19.855 20.808 21.913 23.12 24.242 25.124 25.285 24.95 24.464 23.919 23.321 22.714 22.095 21.524 20.93 20.417 19.959 19.514 19.064 18.613 18.202 17.794 17.436 17.119 16.767 16.385 16.069 15.744 15.404 15.147 14.881 14.605 14.314 13.994 13.772 13.545 13.188 12.943 12.696 12.564 12.286 11.987 11.666 11.493 11.21 10.958 10.751 10.538 10.094 9.849 9.576 9.285 8.964 8.586 8.039 6.535 -8 ,14990 ,TETRA ,17585771,Sat Nov 27 14:45:17 CET,Sat Nov 27 16:36:10 CET,0.0 1.321 1.843 2.241 2.59 2.904 3.206 3.476 3.953 4.178 4.387 4.638 4.943 5.129 5.475 5.786 6.085 6.235 6.529 6.805 7.196 7.444 7.682 8.034 8.377 8.712 9.032 9.342 9.735 10.105 10.47 10.915 11.335 11.736 12.192 12.677 13.14 13.656 14.221 14.831 15.447 16.092 16.85 17.634 18.502 19.46 20.558 21.702 22.882 24.022 24.959 25.128 24.767 24.258 23.699 23.072 22.441 21.806 21.233 20.631 20.092 19.611 19.143 18.68 18.241 17.856 17.454 17.075 16.741 16.399 16.029 15.697 15.365 15.032 14.761 14.48 14.186 13.883 13.567 13.342 13.108 12.749 12.5 12.242 12.105 11.826 11.547 11.241 11.078 10.795 10.552 10.365 10.163 9.709 9.444 9.165 8.867 8.494 8.061 7.538 6.304 -9 ,5429 ,TETRA ,17585772,Sat Nov 27 14:46:17 CET,Sat Nov 27 16:39:23 CET,0.0 1.725 2.318 2.782 3.155 3.48 3.778 4.049 4.53 4.751 4.968 5.251 5.566 5.741 6.097 6.435 6.744 6.893 7.176 7.438 7.828 8.088 8.334 8.674 8.994 9.321 9.655 9.982 10.401 10.774 11.121 11.557 11.961 12.342 12.794 13.305 13.792 14.302 14.847 15.436 16.043 16.716 17.501 18.301 19.178 20.138 21.211 22.282 23.452 24.589 25.454 25.67 25.371 24.846 24.217 23.533 22.879 22.271 21.714 21.121 20.629 20.185 19.715 19.276 18.865 18.468 18.047 17.673 17.346 17.0 16.639 16.339 16.024 15.694 15.431 15.152 14.859 14.554 14.23 14.003 13.771 13.406 13.152 12.894 12.762 12.495 12.211 11.892 11.733 11.462 11.218 11.027 10.83 10.362 10.114 9.859 9.546 9.195 8.793 8.247 7.131 -10 ,25483 ,TETRA ,17585773,Sat Nov 27 14:46:17 CET,Sat Nov 27 16:39:22 CET,0.0 1.751 2.265 2.662 2.995 3.288 3.546 3.789 4.265 4.476 4.675 4.946 5.259 5.433 5.756 6.07 6.383 6.533 6.818 7.085 7.467 7.716 7.961 8.317 8.653 8.982 9.312 9.635 10.037 10.412 10.776 11.227 11.671 12.094 12.567 13.09 13.582 14.114 14.686 15.292 15.916 16.627 17.45 18.218 19.084 20.049 21.132 22.231 23.343 24.481 25.475 25.716 25.413 24.893 24.323 23.689 23.035 22.417 21.858 21.28 20.753 20.263 19.792 19.337 18.905 18.499 18.066 17.678 17.346 17.002 16.64 16.329 16.002 15.67 15.406 15.129 14.844 14.541 14.207 13.978 13.755 13.402 13.16 12.916 12.786 12.511 12.211 11.869 11.693 11.392 11.096 10.891 10.688 10.227 9.965 9.678 9.371 9.034 8.619 8.011 6.635 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3265004.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3265004.txt deleted file mode 100644 index 96066bf8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3265004.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23448 ,KEBNE ,17043811,Thu Dec 23 05:25:59 CET,Thu Dec 23 07:01:26 CET,0.0 1.107 1.651 2.066 2.423 2.735 3.034 3.32 3.807 4.021 4.229 4.494 4.81 4.99 5.324 5.655 5.98 6.14 6.448 6.717 7.093 7.339 7.567 7.89 8.214 8.53 8.843 9.158 9.562 9.953 10.33 10.778 11.215 11.643 12.146 12.711 13.246 13.806 14.401 15.043 15.713 16.44 17.287 18.155 19.12 20.12 21.154 22.207 23.29 24.23 24.831 24.659 24.052 23.287 22.44 21.615 20.837 20.09 19.483 18.913 18.411 17.94 17.496 17.066 16.651 16.25 15.817 15.458 15.145 14.801 14.439 14.141 13.822 13.486 13.225 12.957 12.677 12.379 12.084 11.877 11.646 11.285 11.052 10.803 10.67 10.38 10.075 9.776 9.618 9.335 9.109 8.899 8.676 8.223 7.981 7.708 7.347 6.923 6.453 5.914 4.886 -2 ,22271 ,KEBNE ,17043812,Thu Dec 23 05:27:01 CET,Thu Dec 23 07:02:43 CET,0.0 1.328 1.96 2.426 2.778 3.105 3.412 3.683 4.142 4.363 4.573 4.815 5.122 5.302 5.662 5.997 6.303 6.452 6.734 6.987 7.351 7.59 7.817 8.154 8.478 8.773 9.077 9.399 9.807 10.186 10.55 10.987 11.411 11.811 12.232 12.688 13.125 13.591 14.094 14.609 15.147 15.75 16.449 17.147 17.903 18.698 19.581 20.472 21.379 22.357 23.183 23.026 22.377 21.644 20.796 19.95 19.15 18.347 17.68 17.039 16.465 15.931 15.397 14.861 14.379 13.952 13.501 13.1 12.735 12.352 11.942 11.596 11.25 10.886 10.571 10.224 9.869 9.486 9.069 8.775 8.485 8.052 7.753 7.443 7.273 6.902 6.531 6.13 5.909 5.565 5.214 4.968 4.706 4.104 3.77 3.422 3.039 2.592 2.07 1.37 -0.538 -3 ,8318 ,KEBNE ,17043813,Thu Dec 23 05:25:59 CET,Thu Dec 23 07:01:03 CET,0.0 1.301 1.895 2.355 2.758 3.094 3.395 3.671 4.18 4.408 4.63 4.917 5.237 5.421 5.772 6.12 6.441 6.586 6.873 7.147 7.54 7.797 8.056 8.436 8.795 9.14 9.462 9.777 10.204 10.61 11.01 11.503 11.951 12.375 12.867 13.436 13.976 14.49 14.996 15.549 16.186 16.946 17.779 18.57 19.444 20.4 21.483 22.614 23.843 24.984 25.574 25.358 24.702 23.846 23.043 22.245 21.456 20.707 20.041 19.348 18.754 18.22 17.696 17.196 16.718 16.299 15.855 15.437 15.089 14.701 14.276 13.924 13.567 13.207 12.921 12.625 12.326 12.012 11.672 11.438 11.193 10.799 10.533 10.254 10.113 9.82 9.503 9.174 8.999 8.696 8.442 8.246 8.035 7.563 7.289 6.989 6.659 6.302 5.915 5.291 3.688 -4 ,32641 ,KEBNE ,17043814,Thu Dec 23 05:25:59 CET,Thu Dec 23 07:01:02 CET,0.0 0.98 1.51 1.95 2.296 2.607 2.891 3.142 3.617 3.845 4.065 4.362 4.684 4.867 5.221 5.548 5.858 6.01 6.308 6.593 6.985 7.239 7.495 7.872 8.228 8.566 8.902 9.231 9.637 10.036 10.433 10.891 11.327 11.737 12.172 12.623 13.054 13.533 14.053 14.584 15.122 15.746 16.428 17.06 17.794 18.572 19.385 20.253 21.225 22.18 22.829 22.777 22.394 21.847 21.238 20.628 20.032 19.438 18.879 18.307 17.813 17.353 16.897 16.461 16.027 15.622 15.204 14.811 14.449 14.068 13.672 13.33 12.978 12.61 12.317 12.012 11.701 11.379 11.025 10.786 10.549 10.163 9.901 9.622 9.472 9.184 8.882 8.548 8.368 8.065 7.81 7.602 7.386 6.904 6.629 6.328 5.967 5.583 5.174 4.571 3.179 -5 ,18709 ,KEBNE ,17043815,Thu Dec 23 05:26:03 CET,Thu Dec 23 06:56:18 CET,0.0 1.102 1.631 2.037 2.391 2.732 3.032 3.297 3.76 3.981 4.202 4.466 4.773 4.943 5.276 5.609 5.939 6.097 6.404 6.696 7.103 7.359 7.604 7.968 8.324 8.675 9.023 9.349 9.748 10.13 10.496 10.931 11.36 11.766 12.229 12.763 13.271 13.822 14.4 15.015 15.653 16.357 17.193 17.996 18.899 19.872 20.904 21.978 23.147 24.32 25.053 24.859 24.184 23.341 22.494 21.673 20.906 20.162 19.482 18.801 18.203 17.632 17.079 16.562 16.089 15.65 15.172 14.737 14.363 13.98 13.571 13.224 12.875 12.517 12.238 11.939 11.622 11.295 10.961 10.736 10.498 10.118 9.861 9.605 9.474 9.201 8.899 8.586 8.423 8.122 7.857 7.654 7.444 6.978 6.717 6.43 6.105 5.757 5.343 4.801 3.802 -6 ,25596 ,KEBNE ,17043816,Thu Dec 23 05:25:59 CET,Thu Dec 23 07:01:30 CET,0.0 1.251 1.804 2.287 2.688 3.023 3.318 3.587 4.067 4.283 4.511 4.827 5.16 5.341 5.659 5.963 6.255 6.394 6.667 6.926 7.298 7.545 7.788 8.13 8.442 8.75 9.056 9.345 9.716 10.083 10.433 10.828 11.204 11.565 11.969 12.435 12.889 13.397 13.948 14.507 15.045 15.637 16.355 17.063 17.869 18.731 19.74 20.842 21.961 23.076 23.832 23.721 23.151 22.412 21.643 20.859 20.081 19.293 18.623 17.947 17.35 16.821 16.289 15.786 15.322 14.871 14.388 13.956 13.567 13.173 12.768 12.438 12.093 11.715 11.426 11.129 10.828 10.513 10.179 9.947 9.706 9.323 9.05 8.77 8.624 8.32 7.992 7.656 7.485 7.178 6.9 6.692 6.483 6.028 5.771 5.487 5.17 4.816 4.417 3.921 2.512 -7 ,13719 ,KEBNE ,17043817,Thu Dec 23 05:25:59 CET,Thu Dec 23 07:01:07 CET,0.0 1.642 2.329 2.883 3.36 3.754 4.118 4.468 5.06 5.302 5.524 5.812 6.135 6.319 6.661 7.0 7.324 7.478 7.78 8.054 8.457 8.726 8.984 9.356 9.708 10.029 10.314 10.592 10.994 11.386 11.727 12.135 12.518 12.861 13.263 13.715 14.145 14.631 15.149 15.691 16.259 16.89 17.584 18.252 19.025 19.86 20.784 21.722 22.69 23.651 24.425 24.349 23.651 22.802 22.001 21.235 20.474 19.719 19.027 18.296 17.675 17.142 16.617 16.117 15.647 15.214 14.757 14.327 13.936 13.542 13.143 12.805 12.462 12.104 11.819 11.516 11.202 10.883 10.545 10.301 10.042 9.635 9.357 9.075 8.933 8.653 8.354 8.024 7.85 7.549 7.301 7.1 6.881 6.403 6.149 5.863 5.544 5.168 4.694 4.143 3.042 -8 ,1354 ,KEBNE ,17043818,Thu Dec 23 05:25:59 CET,Thu Dec 23 07:01:00 CET,0.0 1.098 1.747 2.187 2.534 2.849 3.142 3.42 3.919 4.135 4.343 4.609 4.92 5.111 5.478 5.812 6.132 6.28 6.555 6.819 7.182 7.41 7.637 7.973 8.286 8.581 8.882 9.176 9.54 9.877 10.222 10.641 11.024 11.388 11.795 12.258 12.708 13.202 13.722 14.248 14.806 15.442 16.145 16.817 17.659 18.629 19.659 20.717 21.808 22.856 23.53 23.291 22.584 21.743 20.883 20.044 19.224 18.456 17.807 17.122 16.506 15.959 15.433 14.913 14.409 13.937 13.461 13.043 12.669 12.275 11.873 11.527 11.168 10.806 10.506 10.191 9.878 9.567 9.236 8.997 8.754 8.384 8.126 7.847 7.698 7.398 7.08 6.755 6.582 6.271 6.002 5.8 5.585 5.104 4.849 4.571 4.258 3.921 3.528 2.973 1.514 -9 ,29815 ,KEBNE ,17043819,Thu Dec 23 05:27:01 CET,Thu Dec 23 07:04:16 CET,0.0 1.331 1.881 2.301 2.673 2.991 3.283 3.558 4.037 4.257 4.486 4.788 5.094 5.268 5.606 5.917 6.21 6.358 6.656 6.941 7.352 7.617 7.868 8.232 8.593 8.938 9.27 9.59 9.989 10.372 10.747 11.214 11.654 12.073 12.597 13.176 13.696 14.28 14.91 15.545 16.2 16.959 17.805 18.637 19.564 20.542 21.64 22.788 23.984 25.11 25.907 25.765 25.161 24.372 23.55 22.763 22.05 21.343 20.685 19.996 19.383 18.811 18.253 17.736 17.237 16.786 16.319 15.898 15.541 15.157 14.759 14.44 14.102 13.735 13.447 13.157 12.864 12.563 12.245 12.014 11.772 11.387 11.125 10.856 10.713 10.411 10.104 9.78 9.598 9.287 9.021 8.809 8.582 8.053 7.777 7.507 7.189 6.806 6.354 5.82 4.467 -10 ,16105 ,KEBNE ,17043820,Thu Dec 23 05:27:01 CET,Thu Dec 23 07:03:04 CET,0.0 1.261 1.834 2.288 2.721 3.104 3.425 3.712 4.196 4.427 4.652 4.91 5.226 5.412 5.769 6.099 6.404 6.562 6.87 7.159 7.585 7.849 8.095 8.46 8.809 9.15 9.481 9.801 10.23 10.648 11.041 11.472 11.864 12.275 12.754 13.268 13.77 14.322 14.909 15.536 16.185 16.948 17.826 18.621 19.453 20.356 21.466 22.645 23.79 24.806 25.385 25.226 24.62 23.838 23.066 22.302 21.509 20.716 20.065 19.405 18.822 18.276 17.729 17.234 16.759 16.298 15.815 15.397 15.035 14.654 14.26 13.926 13.582 13.222 12.924 12.623 12.326 12.013 11.681 11.439 11.175 10.783 10.519 10.242 10.101 9.804 9.495 9.17 8.996 8.693 8.453 8.255 8.049 7.599 7.35 7.068 6.741 6.382 5.958 5.337 4.106 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index 65acf7cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22974 ,TETRA ,17585774,Sat Nov 27 14:46:17 CET,Sat Nov 27 16:37:47 CET,0.0 1.205 1.779 2.242 2.61 2.904 3.18 3.44 3.874 4.078 4.285 4.568 4.883 5.053 5.38 5.688 5.977 6.118 6.388 6.642 7.012 7.247 7.475 7.811 8.126 8.432 8.731 9.014 9.375 9.722 10.063 10.465 10.846 11.22 11.645 12.098 12.536 13.024 13.548 14.1 14.643 15.257 15.976 16.662 17.413 18.199 19.099 20.043 20.965 21.832 22.43 22.243 21.614 20.856 20.126 19.42 18.744 18.089 17.486 16.867 16.337 15.844 15.343 14.849 14.394 13.996 13.54 13.107 12.738 12.361 11.976 11.64 11.289 10.934 10.653 10.363 10.055 9.729 9.407 9.188 8.958 8.591 8.325 8.052 7.915 7.624 7.312 6.984 6.811 6.513 6.235 6.024 5.804 5.333 5.072 4.794 4.486 4.129 3.694 3.135 1.946 -2 ,30356 ,TETRA ,17585775,Sat Nov 27 14:46:17 CET,Sat Nov 27 16:42:28 CET,0.0 1.549 2.135 2.567 2.936 3.272 3.578 3.841 4.305 4.513 4.707 4.958 5.275 5.457 5.777 6.08 6.37 6.512 6.785 7.033 7.387 7.631 7.872 8.209 8.532 8.845 9.146 9.442 9.828 10.197 10.552 10.97 11.366 11.729 12.145 12.624 13.06 13.535 14.063 14.607 15.153 15.776 16.505 17.197 17.959 18.774 19.685 20.662 21.624 22.488 23.112 22.987 22.471 21.769 21.0 20.248 19.542 18.866 18.254 17.625 17.073 16.564 16.08 15.616 15.161 14.745 14.306 13.911 13.568 13.217 12.851 12.541 12.213 11.868 11.6 11.306 10.997 10.684 10.369 10.156 9.935 9.579 9.324 9.052 8.912 8.634 8.338 8.022 7.853 7.551 7.272 7.064 6.843 6.373 6.107 5.824 5.51 5.15 4.738 4.234 2.865 -3 ,19919 ,TETRA ,17585776,Sat Nov 27 14:46:18 CET,Sat Nov 27 16:42:47 CET,0.0 1.333 1.933 2.378 2.76 3.079 3.356 3.621 4.096 4.313 4.524 4.787 5.082 5.247 5.574 5.867 6.158 6.306 6.583 6.847 7.23 7.471 7.7 8.024 8.333 8.639 8.932 9.217 9.601 9.962 10.31 10.729 11.133 11.523 11.956 12.428 12.877 13.37 13.889 14.436 15.006 15.605 16.287 16.967 17.726 18.556 19.444 20.366 21.293 22.1 22.729 22.614 22.027 21.337 20.604 19.866 19.147 18.438 17.822 17.219 16.684 16.176 15.695 15.241 14.802 14.401 13.977 13.59 13.244 12.887 12.503 12.169 11.842 11.505 11.233 10.954 10.653 10.34 10.02 9.795 9.564 9.197 8.934 8.657 8.52 8.243 7.941 7.617 7.451 7.164 6.905 6.711 6.499 6.027 5.748 5.454 5.133 4.782 4.39 3.85 2.315 -4 ,25655 ,TETRA ,17585777,Sat Nov 27 14:46:18 CET,Sat Nov 27 16:36:42 CET,0.0 1.912 2.501 2.949 3.323 3.636 3.903 4.17 4.656 4.87 5.078 5.354 5.648 5.823 6.158 6.47 6.759 6.897 7.166 7.431 7.813 8.053 8.286 8.62 8.942 9.246 9.537 9.822 10.204 10.569 10.916 11.345 11.766 12.16 12.597 13.091 13.57 14.081 14.625 15.203 15.812 16.5 17.266 18.01 18.835 19.713 20.681 21.643 22.617 23.562 24.105 23.772 23.066 22.246 21.363 20.432 19.59 18.848 18.205 17.55 16.951 16.398 15.87 15.384 14.938 14.524 14.062 13.64 13.287 12.926 12.547 12.206 11.867 11.526 11.244 10.952 10.653 10.342 10.015 9.793 9.568 9.22 8.968 8.701 8.563 8.265 7.965 7.648 7.463 7.158 6.898 6.696 6.492 6.041 5.783 5.504 5.203 4.832 4.41 3.893 2.13 -5 ,32752 ,TETRA ,17585778,Sat Nov 27 14:46:18 CET,Sat Nov 27 16:39:11 CET,0.0 1.422 2.025 2.468 2.839 3.128 3.37 3.63 4.116 4.33 4.541 4.825 5.144 5.324 5.657 5.986 6.306 6.452 6.716 6.972 7.354 7.589 7.817 8.144 8.453 8.765 9.063 9.34 9.696 10.049 10.386 10.789 11.181 11.545 11.97 12.449 12.905 13.401 13.927 14.485 15.056 15.688 16.416 17.165 18.02 18.923 19.887 20.907 21.974 22.883 23.474 23.213 22.478 21.675 20.828 20.013 19.307 18.64 18.034 17.424 16.896 16.422 15.943 15.475 15.03 14.619 14.193 13.813 13.484 13.133 12.767 12.456 12.122 11.766 11.49 11.205 10.901 10.582 10.259 10.037 9.799 9.422 9.162 8.895 8.76 8.471 8.15 7.809 7.635 7.333 7.065 6.869 6.664 6.196 5.94 5.645 5.295 4.885 4.409 3.89 2.808 -6 ,28244 ,TETRA ,17585779,Sat Nov 27 14:47:17 CET,Sat Nov 27 16:38:58 CET,0.0 1.422 1.937 2.32 2.682 3.013 3.297 3.553 4.0 4.201 4.405 4.678 4.985 5.15 5.467 5.772 6.06 6.2 6.47 6.731 7.109 7.355 7.602 7.96 8.29 8.601 8.918 9.216 9.577 9.927 10.267 10.7 11.114 11.503 11.95 12.431 12.885 13.373 13.868 14.371 14.905 15.513 16.205 16.877 17.649 18.498 19.381 20.314 21.314 22.203 22.753 22.586 22.004 21.269 20.516 19.769 19.038 18.304 17.635 16.938 16.347 15.84 15.342 14.845 14.359 13.925 13.487 13.078 12.716 12.347 11.962 11.623 11.267 10.902 10.615 10.324 10.018 9.691 9.353 9.121 8.882 8.511 8.256 7.984 7.839 7.541 7.234 6.895 6.705 6.395 6.108 5.898 5.681 5.182 4.912 4.625 4.318 3.972 3.548 3.021 1.326 -7 ,17181 ,TETRA ,17585780,Sat Nov 27 14:48:16 CET,Sat Nov 27 16:39:47 CET,0.0 1.323 1.897 2.329 2.696 3.006 3.282 3.556 4.069 4.291 4.496 4.746 5.045 5.209 5.535 5.852 6.153 6.302 6.583 6.842 7.21 7.448 7.685 8.015 8.326 8.635 8.933 9.223 9.581 9.931 10.294 10.707 11.086 11.467 11.898 12.372 12.837 13.339 13.857 14.383 14.926 15.537 16.234 16.927 17.719 18.541 19.429 20.352 21.244 22.06 22.562 22.327 21.709 20.948 20.116 19.264 18.469 17.721 17.085 16.455 15.87 15.319 14.796 14.279 13.795 13.375 12.942 12.541 12.174 11.781 11.37 11.029 10.675 10.317 10.036 9.732 9.417 9.087 8.742 8.504 8.261 7.877 7.607 7.328 7.183 6.872 6.551 6.223 6.054 5.758 5.476 5.262 5.042 4.575 4.304 4.014 3.677 3.297 2.887 2.348 1.077 -8 ,7932 ,TETRA ,17585781,Sat Nov 27 14:49:16 CET,Sat Nov 27 16:40:56 CET,0.0 1.359 1.905 2.32 2.661 2.981 3.27 3.525 3.985 4.199 4.399 4.675 4.986 5.163 5.5 5.824 6.133 6.273 6.54 6.802 7.183 7.425 7.665 8.007 8.322 8.619 8.909 9.195 9.555 9.898 10.228 10.633 11.024 11.399 11.832 12.299 12.738 13.23 13.744 14.266 14.819 15.462 16.206 16.901 17.659 18.477 19.367 20.313 21.366 22.276 22.844 22.662 22.033 21.347 20.62 19.865 19.16 18.492 17.903 17.279 16.727 16.227 15.725 15.23 14.755 14.324 13.871 13.463 13.108 12.727 12.324 11.996 11.656 11.304 11.024 10.719 10.399 10.071 9.735 9.506 9.266 8.885 8.629 8.375 8.241 7.95 7.632 7.302 7.137 6.844 6.572 6.359 6.132 5.658 5.403 5.119 4.787 4.41 3.996 3.453 1.836 -9 ,24843 ,TETRA ,17585782,Sat Nov 27 14:49:16 CET,Sat Nov 27 16:40:45 CET,0.0 1.706 2.246 2.665 2.999 3.303 3.586 3.848 4.314 4.522 4.728 4.999 5.301 5.468 5.782 6.078 6.354 6.489 6.763 7.031 7.402 7.632 7.862 8.201 8.522 8.823 9.127 9.433 9.801 10.143 10.483 10.901 11.308 11.72 12.176 12.674 13.182 13.731 14.281 14.85 15.464 16.173 16.948 17.668 18.498 19.365 20.305 21.329 22.361 23.225 23.67 23.325 22.604 21.786 20.972 20.166 19.428 18.707 18.025 17.35 16.767 16.239 15.708 15.184 14.704 14.256 13.805 13.395 13.028 12.663 12.269 11.939 11.607 11.256 10.98 10.699 10.409 10.113 9.801 9.569 9.323 8.945 8.685 8.407 8.269 7.986 7.666 7.328 7.164 6.886 6.65 6.461 6.261 5.813 5.549 5.26 4.965 4.64 4.247 3.735 1.996 -10 ,15123 ,TETRA ,17585783,Sat Nov 27 14:50:17 CET,Sat Nov 27 16:42:37 CET,0.0 1.761 2.346 2.831 3.234 3.565 3.836 4.089 4.562 4.774 4.979 5.248 5.554 5.74 6.086 6.401 6.71 6.854 7.128 7.397 7.767 8.002 8.237 8.57 8.881 9.183 9.474 9.751 10.095 10.425 10.759 11.176 11.568 11.937 12.367 12.838 13.281 13.76 14.256 14.776 15.327 15.941 16.626 17.314 18.113 18.939 19.784 20.665 21.587 22.47 23.14 23.11 22.589 21.893 21.17 20.413 19.689 19.029 18.44 17.811 17.267 16.792 16.315 15.841 15.4 14.999 14.577 14.18 13.819 13.447 13.075 12.763 12.44 12.108 11.84 11.555 11.253 10.946 10.634 10.419 10.189 9.82 9.575 9.309 9.165 8.878 8.581 8.268 8.103 7.805 7.52 7.312 7.11 6.642 6.372 6.112 5.81 5.433 5.01 4.491 2.938 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt deleted file mode 100644 index c90a82ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3110 ,TETRA ,17585784,Sat Nov 27 14:50:17 CET,Sat Nov 27 16:41:36 CET,0.0 1.306 1.822 2.214 2.556 2.848 3.119 3.37 3.815 4.025 4.225 4.476 4.782 4.955 5.289 5.603 5.884 6.025 6.293 6.548 6.95 7.202 7.433 7.769 8.093 8.404 8.707 9.001 9.378 9.743 10.098 10.512 10.892 11.263 11.688 12.152 12.602 13.092 13.605 14.154 14.72 15.33 16.033 16.692 17.403 18.182 19.02 19.749 20.406 21.066 21.296 20.655 19.707 18.681 17.692 16.766 15.94 15.175 14.482 13.773 13.17 12.629 12.094 11.563 11.066 10.611 10.14 9.732 9.366 8.958 8.539 8.215 7.887 7.534 7.241 6.931 6.611 6.26 5.89 5.644 5.381 4.976 4.702 4.422 4.282 3.988 3.673 3.328 3.15 2.837 2.578 2.381 2.16 1.664 1.392 1.11 0.802 0.441 0.02 -0.518 -2.118 -2 ,23298 ,TETRA ,17585785,Sat Nov 27 14:50:17 CET,Sat Nov 27 16:32:23 CET,0.0 1.084 1.684 2.122 2.47 2.758 3.021 3.291 3.79 4.008 4.225 4.497 4.81 4.996 5.35 5.66 5.951 6.093 6.36 6.623 7.001 7.23 7.452 7.783 8.115 8.44 8.74 9.028 9.39 9.74 10.086 10.495 10.88 11.257 11.691 12.159 12.583 13.047 13.555 14.106 14.669 15.276 15.99 16.667 17.415 18.226 19.045 19.815 20.527 21.065 21.18 20.521 19.465 18.298 17.178 16.105 15.132 14.209 13.409 12.571 11.832 11.193 10.558 9.965 9.423 8.91 8.376 7.906 7.481 7.037 6.59 6.217 5.83 5.435 5.128 4.812 4.479 4.126 3.759 3.497 3.231 2.825 2.538 2.24 2.084 1.764 1.442 1.09 0.903 0.589 0.313 0.095 -0.137 -0.649 -0.923 -1.224 -1.554 -1.911 -2.32 -2.832 -4.042 -3 ,25883 ,TETRA ,17585786,Sat Nov 27 14:50:17 CET,Sat Nov 27 16:41:47 CET,0.0 1.324 1.893 2.336 2.716 3.055 3.35 3.611 4.111 4.34 4.556 4.831 5.149 5.337 5.692 6.015 6.306 6.448 6.735 7.007 7.384 7.625 7.851 8.182 8.525 8.851 9.145 9.43 9.806 10.167 10.512 10.935 11.344 11.722 12.143 12.608 13.045 13.516 14.016 14.538 15.095 15.738 16.451 17.104 17.818 18.544 19.344 20.169 20.943 21.559 21.656 20.932 19.932 18.798 17.593 16.474 15.514 14.605 13.778 12.959 12.271 11.633 10.972 10.349 9.79 9.274 8.735 8.285 7.915 7.525 7.116 6.777 6.428 6.054 5.752 5.433 5.094 4.745 4.375 4.113 3.856 3.448 3.155 2.856 2.702 2.369 2.022 1.672 1.484 1.167 0.882 0.648 0.411 -0.099 -0.374 -0.654 -0.971 -1.323 -1.717 -2.232 -3.414 -4 ,25218 ,TETRA ,17585787,Sat Nov 27 14:50:18 CET,Sat Nov 27 16:41:43 CET,0.0 1.161 1.683 2.133 2.494 2.788 3.047 3.303 3.783 3.995 4.21 4.484 4.797 4.989 5.341 5.662 5.97 6.122 6.418 6.687 7.057 7.294 7.526 7.867 8.187 8.484 8.775 9.065 9.425 9.766 10.098 10.489 10.867 11.249 11.686 12.18 12.652 13.136 13.669 14.226 14.777 15.384 16.065 16.733 17.508 18.308 19.115 19.93 20.773 21.388 21.489 20.752 19.612 18.456 17.342 16.251 15.246 14.3 13.502 12.677 11.934 11.266 10.63 10.027 9.463 8.987 8.511 8.091 7.738 7.359 6.954 6.629 6.286 5.912 5.62 5.322 5.015 4.691 4.355 4.126 3.9 3.523 3.235 2.939 2.788 2.471 2.141 1.803 1.626 1.31 1.0 0.781 0.571 0.104 -0.165 -0.47 -0.819 -1.224 -1.667 -2.233 -3.749 -5 ,19438 ,TETRA ,17585788,Sat Nov 27 14:50:20 CET,Sat Nov 27 16:41:37 CET,0.0 1.292 1.899 2.35 2.692 3.0 3.294 3.558 4.029 4.256 4.48 4.766 5.072 5.246 5.58 5.913 6.234 6.384 6.672 6.941 7.322 7.572 7.817 8.17 8.506 8.834 9.145 9.44 9.829 10.207 10.557 10.958 11.344 11.713 12.146 12.629 13.079 13.576 14.11 14.63 15.166 15.786 16.497 17.175 17.93 18.728 19.544 20.355 21.119 21.737 21.836 21.013 19.989 18.849 17.663 16.555 15.628 14.857 14.181 13.457 12.819 12.257 11.72 11.185 10.676 10.227 9.747 9.315 8.948 8.579 8.198 7.868 7.508 7.105 6.783 6.459 6.121 5.761 5.352 5.075 4.819 4.444 4.171 3.853 3.692 3.383 3.059 2.705 2.526 2.209 1.926 1.716 1.493 0.977 0.683 0.388 0.05 -0.357 -0.818 -1.406 -2.595 -6 ,759 ,TETRA ,17585789,Sat Nov 27 14:50:18 CET,Sat Nov 27 16:44:37 CET,0.0 0.966 1.488 1.925 2.273 2.572 2.853 3.116 3.593 3.809 4.008 4.248 4.555 4.747 5.107 5.437 5.727 5.861 6.13 6.387 6.758 6.995 7.24 7.585 7.915 8.23 8.516 8.787 9.145 9.506 9.86 10.273 10.654 11.03 11.465 11.921 12.338 12.801 13.31 13.829 14.35 14.952 15.645 16.31 17.061 17.838 18.67 19.491 20.247 20.83 20.928 20.079 18.923 17.854 16.725 15.616 14.699 13.84 13.046 12.198 11.457 10.821 10.202 9.618 9.079 8.584 8.053 7.581 7.175 6.733 6.265 5.876 5.472 5.061 4.733 4.392 4.063 3.713 3.327 3.066 2.799 2.377 2.089 1.774 1.607 1.265 0.899 0.531 0.349 0.019 -0.294 -0.513 -0.732 -1.219 -1.492 -1.805 -2.165 -2.566 -3.023 -3.599 -5.07 -7 ,23842 ,TETRA ,17585790,Sat Nov 27 14:51:17 CET,Sat Nov 27 16:43:51 CET,0.0 1.422 1.96 2.376 2.725 3.034 3.326 3.59 4.064 4.286 4.484 4.72 5.025 5.199 5.556 5.898 6.205 6.352 6.634 6.902 7.276 7.511 7.738 8.068 8.393 8.71 9.019 9.306 9.673 10.042 10.391 10.807 11.197 11.551 11.963 12.441 12.899 13.396 13.917 14.475 15.065 15.687 16.383 17.043 17.778 18.582 19.431 20.215 20.968 21.63 21.689 20.844 19.731 18.543 17.471 16.505 15.582 14.698 13.925 13.098 12.356 11.692 11.062 10.461 9.898 9.389 8.874 8.403 7.977 7.536 7.076 6.689 6.277 5.846 5.52 5.193 4.852 4.496 4.114 3.851 3.586 3.164 2.872 2.574 2.424 2.111 1.782 1.447 1.261 0.923 0.616 0.395 0.164 -0.364 -0.64 -0.921 -1.23 -1.591 -2.017 -2.507 -3.763 -8 ,11993 ,TETRA ,17585791,Sat Nov 27 14:51:17 CET,Sat Nov 27 16:44:43 CET,0.0 1.359 1.898 2.335 2.685 2.975 3.256 3.531 4.016 4.243 4.455 4.722 5.028 5.208 5.554 5.868 6.163 6.306 6.588 6.85 7.216 7.45 7.683 8.028 8.353 8.668 8.958 9.225 9.589 9.948 10.295 10.716 11.108 11.474 11.889 12.352 12.792 13.265 13.774 14.313 14.873 15.496 16.218 16.937 17.738 18.547 19.376 20.212 20.991 21.59 21.686 20.922 19.821 18.642 17.526 16.502 15.607 14.744 13.949 13.139 12.41 11.762 11.166 10.587 10.024 9.51 8.987 8.509 8.08 7.645 7.213 6.841 6.45 6.058 5.752 5.427 5.086 4.736 4.357 4.097 3.833 3.422 3.136 2.834 2.691 2.405 2.095 1.771 1.598 1.29 1.031 0.819 0.586 0.096 -0.168 -0.466 -0.789 -1.135 -1.545 -2.139 -3.269 -9 ,32065 ,TETRA ,17585792,Sat Nov 27 14:51:17 CET,Sat Nov 27 16:42:21 CET,0.0 1.15 1.696 2.116 2.495 2.83 3.135 3.396 3.887 4.115 4.316 4.567 4.853 5.02 5.359 5.667 5.956 6.1 6.374 6.627 7.006 7.254 7.493 7.817 8.129 8.436 8.723 8.999 9.357 9.708 10.051 10.446 10.823 11.197 11.632 12.118 12.583 13.061 13.58 14.124 14.666 15.26 15.909 16.554 17.283 18.079 18.957 19.788 20.494 21.037 21.216 20.518 19.448 18.35 17.283 16.292 15.438 14.66 13.989 13.279 12.65 12.101 11.588 11.061 10.539 10.091 9.647 9.238 8.865 8.485 8.077 7.725 7.378 7.029 6.75 6.447 6.122 5.777 5.424 5.178 4.92 4.514 4.219 3.918 3.766 3.452 3.121 2.752 2.561 2.249 1.957 1.738 1.511 1.041 0.791 0.51 0.199 -0.167 -0.595 -1.118 -2.34 -10 ,22590 ,TETRA ,17585793,Sat Nov 27 14:51:17 CET,Sat Nov 27 16:42:44 CET,0.0 1.344 1.948 2.403 2.762 3.059 3.335 3.596 4.07 4.277 4.472 4.718 5.017 5.193 5.524 5.826 6.12 6.266 6.559 6.832 7.2 7.44 7.673 8.014 8.34 8.638 8.923 9.203 9.549 9.864 10.176 10.543 10.883 11.211 11.6 12.023 12.409 12.83 13.264 13.703 14.148 14.628 15.171 15.745 16.384 16.989 17.614 18.268 18.982 19.571 19.645 18.802 17.772 16.81 15.889 15.03 14.198 13.368 12.667 11.987 11.382 10.834 10.326 9.847 9.374 8.925 8.455 8.053 7.696 7.299 6.894 6.574 6.238 5.889 5.619 5.331 5.028 4.714 4.392 4.157 3.897 3.473 3.177 2.875 2.719 2.407 2.089 1.732 1.53 1.2 0.922 0.696 0.463 -0.033 -0.291 -0.576 -0.905 -1.27 -1.683 -2.228 -3.449 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index fe828972..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2253 ,TETRA ,17585794,Sat Nov 27 14:52:19 CET,Sat Nov 27 16:38:06 CET,0.0 1.283 1.771 2.076 2.322 2.53 2.701 2.868 3.183 3.321 3.45 3.592 3.823 3.933 4.149 4.362 4.553 4.636 4.793 4.94 5.148 5.28 5.412 5.602 5.766 5.922 6.08 6.225 6.409 6.576 6.724 6.898 7.075 7.255 7.447 7.64 7.823 8.012 8.193 8.376 8.558 8.735 8.9 9.039 9.172 9.267 9.284 9.163 8.848 8.166 6.743 4.823 3.16 1.71 0.442 -0.672 -1.659 -2.551 -3.332 -4.149 -4.84 -5.455 -6.055 -6.614 -7.111 -7.561 -8.041 -8.466 -8.847 -9.244 -9.636 -9.962 -10.312 -10.69 -10.975 -11.268 -11.582 -11.9 -12.229 -12.463 -12.708 -13.085 -13.351 -13.625 -13.775 -14.101 -14.437 -14.822 -15.027 -15.361 -15.649 -15.877 -16.122 -16.646 -16.946 -17.28 -17.646 -18.048 -18.506 -19.151 -21.066 -2 ,10157 ,TETRA ,17585795,Sat Nov 27 14:52:19 CET,Sat Nov 27 16:38:08 CET,0.0 0.977 1.519 1.953 2.324 2.638 2.92 3.165 3.582 3.779 3.959 4.132 4.368 4.492 4.713 4.9 5.077 5.165 5.33 5.481 5.691 5.83 5.96 6.142 6.315 6.479 6.633 6.783 6.974 7.145 7.312 7.507 7.674 7.825 7.996 8.183 8.36 8.556 8.739 8.911 9.078 9.25 9.421 9.561 9.682 9.738 9.732 9.615 9.265 8.57 7.194 5.243 3.565 2.118 0.84 -0.307 -1.305 -2.22 -3.044 -3.853 -4.542 -5.174 -5.792 -6.377 -6.923 -7.399 -7.866 -8.296 -8.668 -9.06 -9.485 -9.841 -10.214 -10.591 -10.885 -11.195 -11.51 -11.839 -12.193 -12.429 -12.675 -13.077 -13.359 -13.636 -13.774 -14.069 -14.373 -14.697 -14.867 -15.178 -15.435 -15.649 -15.879 -16.385 -16.673 -16.994 -17.354 -17.77 -18.284 -18.95 -21.214 -3 ,10068 ,TETRA ,17585796,Sat Nov 27 14:52:19 CET,Sat Nov 27 16:38:01 CET,0.0 1.588 2.043 2.402 2.683 2.912 3.128 3.318 3.65 3.801 3.934 4.083 4.32 4.45 4.715 4.945 5.152 5.241 5.402 5.566 5.79 5.928 6.062 6.261 6.466 6.682 6.883 7.063 7.267 7.43 7.586 7.782 7.965 8.134 8.324 8.542 8.735 8.915 9.101 9.294 9.462 9.619 9.778 9.911 10.053 10.16 10.189 10.087 9.774 9.122 7.726 5.773 3.99 2.471 1.225 0.068 -0.989 -1.952 -2.795 -3.597 -4.277 -4.9 -5.517 -6.109 -6.642 -7.12 -7.633 -8.112 -8.549 -8.999 -9.454 -9.839 -10.238 -10.653 -10.98 -11.32 -11.669 -12.021 -12.384 -12.636 -12.903 -13.325 -13.621 -13.939 -14.109 -14.458 -14.812 -15.183 -15.387 -15.735 -16.052 -16.305 -16.557 -17.058 -17.342 -17.668 -18.012 -18.43 -18.93 -19.537 -21.606 -4 ,2176 ,TETRA ,17585797,Sat Nov 27 14:53:18 CET,Sat Nov 27 16:39:58 CET,0.0 1.276 1.724 2.068 2.356 2.6 2.81 3.002 3.346 3.496 3.625 3.744 3.968 4.086 4.294 4.476 4.667 4.765 4.949 5.131 5.415 5.589 5.728 5.917 6.095 6.259 6.42 6.572 6.746 6.916 7.088 7.277 7.444 7.6 7.786 7.981 8.151 8.334 8.529 8.714 8.874 9.037 9.204 9.361 9.529 9.635 9.637 9.503 9.174 8.515 7.096 5.126 3.423 1.914 0.619 -0.547 -1.595 -2.544 -3.378 -4.272 -5.082 -5.813 -6.46 -7.022 -7.555 -8.034 -8.532 -8.975 -9.353 -9.742 -10.136 -10.474 -10.829 -11.199 -11.497 -11.808 -12.132 -12.473 -12.818 -13.05 -13.291 -13.652 -13.914 -14.193 -14.338 -14.643 -14.958 -15.302 -15.483 -15.8 -16.07 -16.282 -16.502 -16.969 -17.218 -17.495 -17.825 -18.239 -18.72 -19.344 -21.486 -5 ,16094 ,TETRA ,17585798,Sat Nov 27 14:53:18 CET,Sat Nov 27 16:38:22 CET,0.0 1.087 1.588 1.935 2.204 2.444 2.651 2.848 3.19 3.325 3.45 3.581 3.8 3.918 4.153 4.364 4.561 4.651 4.818 4.979 5.204 5.354 5.503 5.729 5.962 6.155 6.314 6.462 6.641 6.818 6.994 7.186 7.364 7.534 7.718 7.913 8.09 8.272 8.454 8.643 8.818 8.97 9.139 9.295 9.395 9.439 9.472 9.434 9.164 8.468 7.015 5.084 3.304 1.765 0.494 -0.664 -1.731 -2.703 -3.602 -4.581 -5.424 -6.083 -6.672 -7.237 -7.755 -8.233 -8.724 -9.176 -9.569 -9.987 -10.428 -10.776 -11.135 -11.51 -11.796 -12.104 -12.415 -12.741 -13.086 -13.316 -13.561 -13.962 -14.253 -14.565 -14.727 -15.058 -15.42 -15.785 -15.953 -16.259 -16.515 -16.73 -16.967 -17.523 -17.809 -18.093 -18.422 -18.825 -19.333 -20.041 -22.24 -6 ,7877 ,TETRA ,17585799,Sat Nov 27 14:53:18 CET,Sat Nov 27 16:39:09 CET,0.0 1.285 1.782 2.129 2.393 2.616 2.8 2.962 3.246 3.39 3.535 3.695 3.926 4.031 4.242 4.441 4.612 4.696 4.862 5.021 5.233 5.358 5.481 5.659 5.837 6.01 6.176 6.323 6.501 6.68 6.86 7.075 7.266 7.442 7.645 7.861 8.045 8.237 8.432 8.625 8.835 9.048 9.218 9.35 9.481 9.562 9.576 9.484 9.192 8.539 7.16 5.228 3.519 2.004 0.705 -0.417 -1.411 -2.326 -3.125 -3.928 -4.59 -5.165 -5.733 -6.267 -6.761 -7.222 -7.738 -8.218 -8.613 -9.006 -9.422 -9.767 -10.111 -10.466 -10.744 -11.044 -11.359 -11.668 -11.994 -12.224 -12.465 -12.856 -13.134 -13.413 -13.559 -13.871 -14.205 -14.548 -14.718 -15.035 -15.323 -15.539 -15.764 -16.293 -16.579 -16.872 -17.221 -17.644 -18.135 -18.755 -20.965 -7 ,7305 ,TETRA ,17585800,Sat Nov 27 14:54:18 CET,Sat Nov 27 16:35:29 CET,0.0 1.441 1.872 2.192 2.463 2.718 2.953 3.15 3.461 3.6 3.747 3.889 4.11 4.218 4.419 4.613 4.798 4.879 5.032 5.179 5.406 5.549 5.685 5.891 6.078 6.242 6.4 6.55 6.727 6.9 7.063 7.255 7.429 7.593 7.794 7.996 8.16 8.338 8.519 8.694 8.87 9.041 9.206 9.351 9.462 9.509 9.485 9.371 9.07 8.369 6.92 4.944 3.216 1.737 0.451 -0.681 -1.672 -2.587 -3.402 -4.202 -4.87 -5.485 -6.083 -6.644 -7.162 -7.638 -8.125 -8.564 -8.943 -9.331 -9.736 -10.075 -10.421 -10.783 -11.083 -11.396 -11.701 -12.01 -12.346 -12.572 -12.8 -13.171 -13.44 -13.718 -13.863 -14.176 -14.499 -14.844 -15.025 -15.34 -15.605 -15.817 -16.047 -16.566 -16.845 -17.155 -17.508 -17.898 -18.349 -19.041 -21.014 -8 ,24837 ,TETRA ,17585801,Sat Nov 27 14:54:18 CET,Sat Nov 27 16:38:31 CET,0.0 1.218 1.732 2.073 2.36 2.591 2.79 2.963 3.28 3.435 3.58 3.739 3.974 4.091 4.304 4.501 4.683 4.767 4.943 5.109 5.346 5.508 5.652 5.843 6.023 6.187 6.332 6.478 6.674 6.851 7.01 7.194 7.361 7.513 7.681 7.868 8.052 8.243 8.429 8.616 8.791 8.958 9.136 9.285 9.4 9.473 9.468 9.353 9.011 8.308 6.879 4.96 3.28 1.812 0.554 -0.586 -1.595 -2.499 -3.295 -4.091 -4.782 -5.416 -6.014 -6.552 -7.035 -7.494 -7.973 -8.404 -8.781 -9.165 -9.604 -9.993 -10.401 -10.827 -11.147 -11.483 -11.836 -12.198 -12.582 -12.838 -13.103 -13.548 -13.858 -14.18 -14.346 -14.669 -15.006 -15.374 -15.572 -15.902 -16.205 -16.436 -16.682 -17.224 -17.508 -17.811 -18.141 -18.537 -19.003 -19.646 -22.064 -9 ,2622 ,TETRA ,17585802,Sat Nov 27 14:54:18 CET,Sat Nov 27 16:38:55 CET,0.0 1.086 1.533 1.828 2.098 2.355 2.574 2.76 3.098 3.26 3.406 3.56 3.784 3.888 4.081 4.265 4.442 4.524 4.682 4.84 5.072 5.211 5.349 5.547 5.73 5.909 6.079 6.229 6.419 6.601 6.757 6.938 7.111 7.274 7.47 7.681 7.869 8.062 8.264 8.453 8.624 8.812 8.98 9.104 9.224 9.312 9.315 9.158 8.788 8.095 6.673 4.668 2.912 1.426 0.158 -1.006 -2.043 -2.989 -3.807 -4.607 -5.303 -5.917 -6.495 -7.039 -7.538 -8.015 -8.531 -8.973 -9.345 -9.746 -10.176 -10.526 -10.888 -11.257 -11.542 -11.852 -12.187 -12.527 -12.865 -13.092 -13.323 -13.698 -13.963 -14.241 -14.384 -14.687 -15.008 -15.335 -15.502 -15.804 -16.046 -16.256 -16.491 -17.001 -17.292 -17.623 -17.99 -18.428 -18.94 -19.604 -21.621 -10 ,9835 ,TETRA ,17585803,Sat Nov 27 14:54:19 CET,Sat Nov 27 16:38:58 CET,0.0 1.115 1.508 1.845 2.144 2.381 2.607 2.81 3.132 3.27 3.405 3.546 3.772 3.891 4.106 4.299 4.48 4.571 4.743 4.902 5.123 5.26 5.4 5.594 5.786 5.995 6.171 6.323 6.525 6.705 6.86 7.042 7.233 7.4 7.578 7.783 7.968 8.161 8.356 8.545 8.745 8.935 9.093 9.214 9.317 9.394 9.412 9.307 9.003 8.362 6.981 5.138 3.474 1.953 0.558 -0.698 -1.734 -2.67 -3.47 -4.267 -4.944 -5.555 -6.177 -6.756 -7.267 -7.728 -8.226 -8.675 -9.058 -9.469 -9.897 -10.268 -10.685 -11.126 -11.463 -11.802 -12.145 -12.507 -12.894 -13.157 -13.42 -13.821 -14.113 -14.426 -14.585 -14.907 -15.239 -15.61 -15.812 -16.155 -16.431 -16.641 -16.868 -17.34 -17.598 -17.899 -18.236 -18.629 -19.117 -19.793 -21.806 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt deleted file mode 100644 index af17a0eb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18411 ,TETRA ,17585804,Sat Nov 27 14:54:21 CET,Sat Nov 27 16:38:06 CET,0.0 1.27 1.807 2.209 2.54 2.815 3.083 3.336 3.768 3.972 4.179 4.441 4.749 4.914 5.22 5.516 5.796 5.931 6.194 6.433 6.76 6.964 7.162 7.448 7.714 7.971 8.228 8.467 8.776 9.078 9.351 9.682 9.997 10.291 10.631 11.011 11.368 11.768 12.2 12.626 13.057 13.523 14.071 14.621 15.22 15.831 16.466 17.123 17.743 18.173 18.252 17.77 17.026 16.224 15.408 14.582 13.767 12.997 12.38 11.735 11.134 10.588 10.073 9.609 9.183 8.8 8.402 8.044 7.735 7.397 7.043 6.746 6.426 6.101 5.845 5.56 5.254 4.939 4.63 4.415 4.198 3.875 3.643 3.396 3.266 2.986 2.674 2.348 2.19 1.895 1.675 1.49 1.289 0.805 0.554 0.3 0.017 -0.317 -0.744 -1.302 -2.773 -2 ,10818 ,TETRA ,17585805,Sat Nov 27 14:54:17 CET,Sat Nov 27 16:40:41 CET,0.0 1.453 1.924 2.309 2.639 2.922 3.185 3.43 3.859 4.058 4.24 4.463 4.759 4.927 5.255 5.536 5.793 5.919 6.168 6.412 6.771 6.999 7.216 7.522 7.809 8.089 8.367 8.64 8.983 9.309 9.622 10.003 10.362 10.702 11.098 11.504 11.872 12.275 12.689 13.107 13.542 14.01 14.579 15.179 15.799 16.433 17.086 17.7 18.305 18.769 18.815 18.284 17.438 16.536 15.694 14.869 14.09 13.374 12.749 12.11 11.546 11.04 10.568 10.126 9.723 9.345 8.938 8.563 8.222 7.877 7.517 7.2 6.867 6.521 6.234 5.929 5.635 5.335 5.007 4.779 4.551 4.188 3.933 3.681 3.552 3.268 2.969 2.639 2.462 2.156 1.915 1.716 1.513 1.077 0.833 0.566 0.24 -0.132 -0.55 -1.115 -2.802 -3 ,15717 ,TETRA ,17585806,Sat Nov 27 14:55:16 CET,Sat Nov 27 16:39:06 CET,0.0 1.544 2.105 2.518 2.862 3.16 3.413 3.64 4.056 4.252 4.431 4.634 4.922 5.086 5.4 5.671 5.933 6.06 6.3 6.546 6.895 7.112 7.32 7.614 7.907 8.179 8.439 8.697 9.008 9.302 9.583 9.912 10.242 10.574 10.959 11.396 11.81 12.239 12.694 13.176 13.661 14.181 14.749 15.294 15.933 16.628 17.314 18.024 18.775 19.298 19.344 18.66 17.747 16.796 15.852 14.938 14.105 13.322 12.63 11.91 11.27 10.714 10.203 9.696 9.209 8.773 8.329 7.935 7.584 7.205 6.818 6.497 6.163 5.811 5.541 5.28 4.997 4.698 4.393 4.178 3.952 3.59 3.335 3.083 2.96 2.71 2.424 2.117 1.963 1.671 1.442 1.242 1.033 0.587 0.335 0.07 -0.237 -0.605 -1.052 -1.574 -3.041 -4 ,18232 ,TETRA ,17585807,Sat Nov 27 14:55:16 CET,Sat Nov 27 16:39:03 CET,0.0 1.409 1.968 2.368 2.704 2.964 3.198 3.432 3.896 4.121 4.325 4.568 4.859 5.015 5.325 5.625 5.9 6.029 6.284 6.522 6.85 7.068 7.275 7.557 7.838 8.126 8.405 8.662 8.986 9.301 9.609 9.966 10.307 10.626 10.985 11.375 11.735 12.125 12.533 12.983 13.468 14.011 14.585 15.109 15.692 16.312 16.946 17.556 18.164 18.643 18.808 18.327 17.555 16.688 15.866 15.057 14.284 13.588 13.002 12.4 11.857 11.363 10.876 10.397 9.93 9.486 9.026 8.637 8.315 7.993 7.661 7.377 7.07 6.742 6.495 6.234 5.958 5.683 5.388 5.175 4.953 4.595 4.34 4.078 3.942 3.661 3.367 3.067 2.914 2.621 2.365 2.166 1.967 1.526 1.254 0.953 0.646 0.318 -0.04 -0.55 -2.313 -5 ,23743 ,TETRA ,17585808,Sat Nov 27 14:56:16 CET,Sat Nov 27 16:40:21 CET,0.0 1.279 1.8 2.212 2.563 2.871 3.146 3.388 3.831 4.043 4.246 4.463 4.746 4.898 5.201 5.493 5.762 5.884 6.118 6.36 6.709 6.929 7.139 7.434 7.719 7.993 8.25 8.507 8.844 9.16 9.458 9.814 10.145 10.447 10.792 11.174 11.543 11.947 12.391 12.881 13.395 13.984 14.603 15.131 15.706 16.306 16.94 17.565 18.165 18.661 18.805 18.185 17.294 16.37 15.491 14.687 13.954 13.248 12.565 11.848 11.235 10.669 10.121 9.626 9.171 8.752 8.312 7.93 7.594 7.23 6.861 6.554 6.22 5.868 5.601 5.316 5.017 4.714 4.406 4.194 3.97 3.626 3.38 3.124 2.994 2.705 2.403 2.102 1.942 1.636 1.385 1.191 0.985 0.548 0.309 0.033 -0.288 -0.669 -1.085 -1.624 -3.383 -6 ,22597 ,TETRA ,17585809,Sat Nov 27 14:56:16 CET,Sat Nov 27 16:31:42 CET,0.0 1.422 1.988 2.402 2.766 3.083 3.365 3.601 4.03 4.243 4.438 4.655 4.942 5.096 5.406 5.721 6.008 6.139 6.379 6.6 6.927 7.15 7.374 7.684 7.98 8.26 8.531 8.796 9.131 9.441 9.719 10.046 10.367 10.675 11.021 11.397 11.74 12.104 12.5 12.92 13.355 13.828 14.354 14.877 15.487 16.122 16.764 17.383 17.973 18.5 18.656 18.024 17.125 16.217 15.358 14.484 13.718 13.06 12.466 11.862 11.351 10.874 10.398 9.93 9.484 9.096 8.697 8.334 8.022 7.707 7.368 7.064 6.741 6.41 6.155 5.888 5.613 5.334 5.025 4.803 4.571 4.202 3.934 3.664 3.536 3.271 2.994 2.681 2.515 2.217 1.965 1.769 1.569 1.138 0.899 0.645 0.366 0.021 -0.425 -1.021 -2.566 -7 ,16158 ,TETRA ,17585810,Sat Nov 27 14:56:16 CET,Sat Nov 27 16:35:40 CET,0.0 1.097 1.649 2.071 2.391 2.685 2.959 3.206 3.657 3.855 4.056 4.272 4.551 4.704 5.009 5.312 5.587 5.715 5.956 6.187 6.52 6.729 6.93 7.238 7.535 7.812 8.072 8.327 8.669 9.001 9.318 9.669 10.007 10.346 10.73 11.154 11.547 11.987 12.465 12.959 13.481 14.043 14.658 15.284 15.959 16.633 17.346 18.063 18.764 19.333 19.392 18.686 17.73 16.739 15.791 14.89 14.03 13.206 12.53 11.82 11.176 10.642 10.13 9.63 9.169 8.75 8.306 7.896 7.546 7.189 6.806 6.487 6.149 5.794 5.507 5.22 4.942 4.644 4.34 4.132 3.914 3.569 3.326 3.071 2.94 2.681 2.403 2.087 1.923 1.628 1.391 1.195 0.991 0.55 0.299 0.022 -0.275 -0.622 -1.039 -1.568 -2.99 -8 ,8131 ,TETRA ,17585811,Sat Nov 27 14:58:18 CET,Sat Nov 27 16:42:47 CET,0.0 1.179 1.659 2.073 2.409 2.69 2.931 3.165 3.598 3.792 3.971 4.166 4.452 4.619 4.926 5.202 5.458 5.582 5.822 6.056 6.382 6.581 6.785 7.087 7.373 7.661 7.946 8.211 8.541 8.848 9.146 9.506 9.845 10.17 10.568 11.02 11.419 11.802 12.191 12.631 13.096 13.621 14.252 14.862 15.555 16.254 16.927 17.585 18.209 18.652 18.664 18.069 17.239 16.34 15.423 14.495 13.614 12.792 12.095 11.449 10.924 10.438 9.966 9.514 9.084 8.684 8.258 7.861 7.511 7.143 6.753 6.436 6.098 5.749 5.484 5.218 4.929 4.607 4.281 4.07 3.849 3.499 3.251 2.995 2.861 2.58 2.286 1.968 1.808 1.499 1.242 1.044 0.837 0.38 0.114 -0.184 -0.502 -0.849 -1.28 -1.859 -3.784 -9 ,19233 ,TETRA ,17585812,Sat Nov 27 14:57:17 CET,Sat Nov 27 16:43:06 CET,0.0 1.348 1.895 2.286 2.59 2.851 3.093 3.317 3.727 3.929 4.116 4.316 4.59 4.741 5.029 5.285 5.532 5.664 5.92 6.144 6.459 6.667 6.87 7.148 7.413 7.664 7.898 8.132 8.435 8.725 9.0 9.334 9.666 9.996 10.376 10.794 11.199 11.627 12.087 12.54 12.979 13.494 14.052 14.576 15.199 15.888 16.652 17.435 18.174 18.708 18.747 17.934 16.963 15.958 15.045 14.255 13.549 12.882 12.275 11.653 11.101 10.608 10.124 9.662 9.239 8.843 8.431 8.068 7.732 7.384 7.023 6.702 6.361 6.017 5.761 5.484 5.195 4.89 4.567 4.343 4.114 3.765 3.528 3.3 3.184 2.932 2.668 2.378 2.218 1.924 1.698 1.511 1.327 0.913 0.676 0.404 0.1 -0.204 -0.598 -1.175 -3.025 -10 ,1650 ,TETRA ,17585813,Sat Nov 27 14:57:17 CET,Sat Nov 27 16:40:59 CET,0.0 1.213 1.768 2.187 2.54 2.846 3.127 3.378 3.826 4.027 4.211 4.435 4.728 4.886 5.179 5.447 5.689 5.809 6.043 6.272 6.616 6.839 7.059 7.381 7.677 7.949 8.203 8.446 8.761 9.06 9.358 9.732 10.077 10.406 10.797 11.24 11.639 12.056 12.515 13.01 13.505 14.018 14.621 15.218 15.904 16.618 17.373 18.163 18.879 19.445 19.553 18.88 17.974 17.018 16.082 15.183 14.393 13.655 12.976 12.293 11.689 11.139 10.634 10.148 9.674 9.245 8.791 8.388 8.033 7.664 7.295 6.987 6.655 6.315 6.053 5.772 5.484 5.18 4.867 4.653 4.429 4.078 3.833 3.591 3.467 3.203 2.924 2.624 2.463 2.179 1.96 1.764 1.569 1.15 0.909 0.649 0.353 0.003 -0.42 -0.983 -2.662 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt deleted file mode 100644 index b0aa9125..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10446 ,TETRA ,17585814,Sat Nov 27 14:57:18 CET,Sat Nov 27 16:43:29 CET,0.0 1.475 2.031 2.432 2.78 3.076 3.326 3.556 3.984 4.183 4.375 4.639 4.953 5.127 5.465 5.777 6.067 6.213 6.494 6.752 7.125 7.362 7.598 7.935 8.244 8.548 8.846 9.132 9.497 9.845 10.188 10.602 10.984 11.346 11.778 12.267 12.721 13.202 13.728 14.281 14.874 15.541 16.278 16.998 17.808 18.68 19.667 20.717 21.797 22.832 23.642 23.646 23.08 22.425 21.722 21.002 20.36 19.706 19.116 18.54 18.018 17.54 17.074 16.628 16.213 15.822 15.389 14.994 14.663 14.321 13.957 13.653 13.338 13.012 12.758 12.498 12.233 11.951 11.661 11.458 11.236 10.888 10.651 10.399 10.268 9.994 9.695 9.382 9.224 8.936 8.721 8.536 8.342 7.923 7.681 7.406 7.098 6.771 6.372 5.827 4.284 -2 ,30399 ,TETRA ,17585815,Sat Nov 27 14:57:18 CET,Sat Nov 27 16:39:22 CET,0.0 1.291 1.93 2.408 2.759 3.048 3.305 3.562 4.038 4.242 4.437 4.664 4.966 5.136 5.462 5.771 6.061 6.204 6.475 6.728 7.07 7.288 7.507 7.829 8.141 8.436 8.723 9.006 9.381 9.733 10.066 10.474 10.858 11.22 11.647 12.133 12.594 13.1 13.633 14.181 14.755 15.392 16.106 16.804 17.604 18.507 19.487 20.446 21.51 22.548 23.225 23.208 22.697 22.021 21.331 20.619 19.939 19.309 18.725 18.091 17.511 16.987 16.503 16.045 15.62 15.221 14.799 14.421 14.083 13.734 13.364 13.061 12.746 12.407 12.152 11.888 11.618 11.338 11.033 10.825 10.609 10.272 10.038 9.79 9.663 9.392 9.118 8.835 8.679 8.388 8.169 7.989 7.798 7.385 7.156 6.899 6.617 6.278 5.866 5.321 3.891 -3 ,22566 ,TETRA ,17585816,Sat Nov 27 14:57:17 CET,Sat Nov 27 16:43:26 CET,0.0 1.262 1.821 2.245 2.581 2.904 3.182 3.421 3.877 4.095 4.299 4.567 4.891 5.073 5.414 5.729 6.027 6.175 6.472 6.759 7.163 7.422 7.675 8.028 8.364 8.701 9.024 9.325 9.705 10.08 10.447 10.875 11.283 11.679 12.13 12.61 13.065 13.575 14.134 14.726 15.356 16.045 16.785 17.5 18.309 19.197 20.19 21.231 22.267 23.189 23.886 23.834 23.31 22.658 21.967 21.259 20.559 19.904 19.328 18.744 18.235 17.744 17.262 16.798 16.367 15.971 15.565 15.202 14.874 14.536 14.181 13.875 13.563 13.239 12.988 12.727 12.457 12.194 11.906 11.689 11.477 11.139 10.896 10.658 10.538 10.277 10.001 9.705 9.545 9.251 9.02 8.834 8.628 8.166 7.908 7.625 7.316 6.977 6.563 5.98 4.243 -4 ,19042 ,TETRA ,17585817,Sat Nov 27 14:57:18 CET,Sat Nov 27 16:42:10 CET,0.0 1.346 1.949 2.384 2.735 3.019 3.287 3.549 3.994 4.178 4.363 4.608 4.919 5.094 5.411 5.706 5.989 6.127 6.391 6.641 7.016 7.254 7.484 7.819 8.125 8.412 8.707 8.994 9.346 9.685 10.006 10.392 10.777 11.154 11.572 12.043 12.491 12.972 13.486 14.032 14.616 15.256 15.981 16.7 17.515 18.397 19.353 20.315 21.325 22.276 22.856 22.615 22.033 21.381 20.664 19.936 19.285 18.66 18.086 17.517 16.991 16.501 16.047 15.599 15.179 14.796 14.377 13.998 13.673 13.311 12.929 12.624 12.309 11.969 11.699 11.432 11.163 10.884 10.591 10.384 10.167 9.821 9.571 9.294 9.15 8.862 8.558 8.225 8.044 7.733 7.472 7.269 7.072 6.633 6.375 6.081 5.764 5.399 4.945 4.311 2.902 -5 ,18025 ,TETRA ,17585818,Sat Nov 27 14:58:18 CET,Sat Nov 27 16:43:55 CET,0.0 1.234 1.811 2.245 2.626 2.958 3.238 3.507 4.0 4.218 4.421 4.69 5.013 5.206 5.567 5.899 6.218 6.369 6.656 6.927 7.322 7.581 7.832 8.185 8.524 8.853 9.162 9.447 9.804 10.155 10.493 10.892 11.283 11.654 12.08 12.565 13.027 13.518 14.056 14.627 15.212 15.882 16.645 17.389 18.229 19.115 20.042 20.944 21.877 22.88 23.728 23.731 23.273 22.649 21.929 21.227 20.558 19.899 19.298 18.693 18.147 17.636 17.125 16.626 16.164 15.732 15.285 14.89 14.539 14.157 13.76 13.421 13.055 12.666 12.378 12.094 11.798 11.495 11.163 10.925 10.686 10.322 10.057 9.778 9.636 9.338 9.039 8.712 8.523 8.198 7.92 7.716 7.504 7.028 6.745 6.423 6.087 5.728 5.298 4.799 3.491 -6 ,14362 ,TETRA ,17585819,Sat Nov 27 14:58:18 CET,Sat Nov 27 16:45:11 CET,0.0 1.112 1.641 2.075 2.454 2.766 3.037 3.298 3.781 3.996 4.198 4.471 4.791 4.961 5.28 5.576 5.867 6.011 6.288 6.549 6.914 7.146 7.366 7.687 7.989 8.276 8.557 8.831 9.192 9.544 9.868 10.247 10.626 10.994 11.413 11.883 12.353 12.879 13.426 13.996 14.587 15.212 15.928 16.669 17.472 18.34 19.334 20.321 21.348 22.304 22.895 22.749 22.187 21.511 20.812 20.101 19.382 18.694 18.105 17.476 16.929 16.45 15.984 15.542 15.115 14.714 14.292 13.918 13.594 13.25 12.901 12.606 12.289 11.957 11.692 11.412 11.127 10.833 10.524 10.313 10.097 9.748 9.495 9.227 9.09 8.814 8.514 8.201 8.047 7.76 7.535 7.343 7.127 6.659 6.407 6.129 5.823 5.477 5.069 4.526 3.174 -7 ,21345 ,TETRA ,17585820,Sat Nov 27 14:58:18 CET,Sat Nov 27 16:43:49 CET,0.0 1.426 2.074 2.533 2.878 3.189 3.482 3.772 4.304 4.524 4.724 4.967 5.278 5.449 5.762 6.05 6.332 6.466 6.727 6.98 7.338 7.568 7.794 8.125 8.44 8.742 9.034 9.316 9.679 10.018 10.346 10.736 11.102 11.48 11.925 12.392 12.843 13.35 13.859 14.377 14.944 15.592 16.351 17.07 17.879 18.738 19.642 20.579 21.586 22.573 23.234 23.136 22.646 21.976 21.277 20.601 19.947 19.305 18.715 18.062 17.468 16.954 16.475 16.028 15.593 15.189 14.743 14.345 14.026 13.695 13.35 13.063 12.757 12.432 12.17 11.902 11.631 11.328 11.003 10.783 10.569 10.226 9.97 9.705 9.58 9.321 9.023 8.732 8.585 8.3 8.088 7.904 7.695 7.25 7.001 6.715 6.406 6.058 5.625 5.134 3.865 -8 ,27970 ,TETRA ,17585821,Sat Nov 27 14:58:20 CET,Sat Nov 27 16:43:58 CET,0.0 1.189 1.711 2.101 2.446 2.765 3.048 3.299 3.75 3.954 4.145 4.381 4.701 4.877 5.203 5.515 5.806 5.941 6.22 6.484 6.851 7.092 7.324 7.651 7.97 8.282 8.584 8.872 9.237 9.587 9.921 10.322 10.706 11.077 11.508 11.991 12.455 12.951 13.484 14.072 14.697 15.345 16.071 16.797 17.65 18.6 19.605 20.642 21.66 22.579 23.312 23.257 22.705 22.024 21.263 20.54 19.894 19.23 18.645 18.02 17.433 16.915 16.423 15.967 15.537 15.132 14.717 14.344 14.0 13.645 13.288 12.986 12.672 12.351 12.098 11.839 11.572 11.281 10.977 10.766 10.545 10.202 9.964 9.712 9.587 9.336 9.061 8.75 8.588 8.307 8.094 7.902 7.692 7.25 7.021 6.762 6.475 6.153 5.786 5.285 4.208 -9 ,12538 ,TETRA ,17585822,Sat Nov 27 14:59:19 CET,Sat Nov 27 16:29:42 CET,0.0 1.015 1.557 2.024 2.409 2.743 3.038 3.293 3.758 3.978 4.178 4.408 4.709 4.871 5.192 5.498 5.779 5.915 6.181 6.428 6.792 7.034 7.269 7.616 7.941 8.242 8.536 8.822 9.177 9.517 9.857 10.269 10.656 11.028 11.481 11.992 12.459 12.955 13.503 14.064 14.627 15.283 16.058 16.834 17.712 18.642 19.658 20.721 21.821 22.837 23.556 23.429 22.809 22.067 21.352 20.663 20.001 19.345 18.708 18.032 17.453 16.917 16.387 15.891 15.423 15.01 14.595 14.212 13.876 13.523 13.158 12.877 12.592 12.271 12.008 11.725 11.431 11.137 10.84 10.646 10.444 10.104 9.856 9.599 9.473 9.218 8.944 8.639 8.473 8.176 7.939 7.754 7.561 7.126 6.869 6.591 6.306 5.981 5.603 5.132 3.791 -10 ,16418 ,TETRA ,17585823,Sat Nov 27 15:00:17 CET,Sat Nov 27 16:46:36 CET,0.0 1.146 1.681 2.101 2.458 2.773 3.053 3.301 3.774 3.989 4.191 4.444 4.755 4.92 5.234 5.544 5.841 5.979 6.25 6.519 6.893 7.124 7.343 7.668 7.991 8.302 8.59 8.862 9.221 9.574 9.91 10.305 10.682 11.044 11.472 11.95 12.396 12.897 13.42 13.952 14.507 15.159 15.919 16.665 17.481 18.323 19.262 20.266 21.349 22.33 23.086 23.181 22.735 22.047 21.294 20.558 19.882 19.213 18.597 17.975 17.423 16.921 16.431 15.954 15.517 15.126 14.72 14.336 13.992 13.641 13.269 12.943 12.604 12.251 11.981 11.712 11.433 11.143 10.835 10.619 10.407 10.078 9.836 9.579 9.439 9.148 8.861 8.545 8.374 8.077 7.86 7.676 7.464 6.967 6.709 6.451 6.165 5.816 5.404 4.934 3.632 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index 1924ba07..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4985 ,TETRA ,17585824,Sat Nov 27 15:00:18 CET,Sat Nov 27 16:40:05 CET,0.0 1.055 1.51 1.891 2.191 2.44 2.666 2.877 3.249 3.418 3.581 3.747 4.019 4.161 4.429 4.69 4.929 5.04 5.269 5.49 5.796 5.995 6.179 6.44 6.683 6.919 7.158 7.39 7.676 7.947 8.214 8.543 8.86 9.161 9.511 9.894 10.249 10.626 11.027 11.464 11.894 12.367 12.921 13.448 14.048 14.672 15.309 15.938 16.547 16.989 16.914 16.037 14.93 13.773 12.673 11.629 10.668 9.786 9.01 8.211 7.527 6.899 6.287 5.713 5.154 4.64 4.102 3.611 3.187 2.752 2.315 1.953 1.559 1.149 0.833 0.506 0.164 -0.2 -0.575 -0.839 -1.115 -1.559 -1.873 -2.187 -2.344 -2.67 -3.015 -3.375 -3.577 -3.924 -4.266 -4.511 -4.763 -5.33 -5.642 -5.971 -6.343 -6.786 -7.293 -7.936 -10.81 -2 ,6430 ,TETRA ,17585825,Sat Nov 27 15:01:34 CET,Sat Nov 27 16:46:34 CET,0.0 1.234 1.725 2.095 2.41 2.689 2.941 3.171 3.575 3.76 3.938 4.159 4.444 4.586 4.859 5.113 5.353 5.469 5.713 5.955 6.274 6.471 6.664 6.936 7.199 7.459 7.703 7.932 8.231 8.52 8.794 9.118 9.437 9.741 10.078 10.458 10.822 11.224 11.66 12.111 12.574 13.088 13.666 14.209 14.833 15.501 16.19 16.853 17.505 18.02 18.022 17.188 16.076 14.904 13.808 12.816 11.894 11.003 10.178 9.333 8.624 8.001 7.409 6.828 6.251 5.728 5.21 4.748 4.332 3.874 3.38 2.979 2.567 2.143 1.807 1.46 1.113 0.753 0.367 0.099 -0.188 -0.632 -0.933 -1.256 -1.417 -1.74 -2.072 -2.43 -2.631 -2.974 -3.318 -3.57 -3.822 -4.36 -4.657 -4.99 -5.372 -5.816 -6.321 -7.045 -9.146 -3 ,2707 ,TETRA ,17585826,Sat Nov 27 15:01:34 CET,Sat Nov 27 16:46:23 CET,0.0 0.998 1.475 1.86 2.192 2.469 2.715 2.93 3.321 3.501 3.676 3.888 4.178 4.333 4.621 4.891 5.141 5.261 5.507 5.751 6.091 6.303 6.507 6.785 7.049 7.308 7.549 7.773 8.058 8.323 8.578 8.893 9.193 9.473 9.795 10.155 10.495 10.871 11.269 11.687 12.113 12.582 13.131 13.672 14.289 14.925 15.602 16.26 16.87 17.274 17.19 16.353 15.228 14.065 12.957 11.902 10.934 10.049 9.256 8.423 7.71 7.067 6.422 5.81 5.258 4.761 4.233 3.759 3.355 2.934 2.495 2.136 1.753 1.348 1.033 0.704 0.354 -0.017 -0.398 -0.658 -0.923 -1.345 -1.647 -1.958 -2.115 -2.423 -2.763 -3.16 -3.366 -3.701 -4.023 -4.261 -4.524 -5.075 -5.358 -5.696 -6.083 -6.517 -7.067 -7.786 -10.24 -4 ,15085 ,TETRA ,17585827,Sat Nov 27 15:01:34 CET,Sat Nov 27 16:46:54 CET,0.0 1.079 1.558 1.956 2.302 2.592 2.822 3.022 3.397 3.578 3.76 3.961 4.232 4.377 4.667 4.943 5.185 5.304 5.541 5.764 6.105 6.324 6.526 6.807 7.072 7.32 7.56 7.796 8.101 8.392 8.663 8.976 9.29 9.608 9.955 10.329 10.682 11.064 11.49 11.947 12.41 12.921 13.5 14.052 14.678 15.342 16.043 16.743 17.441 18.044 18.076 17.174 16.09 14.992 13.884 12.777 11.766 10.86 10.057 9.212 8.489 7.862 7.247 6.647 6.09 5.583 5.044 4.569 4.162 3.724 3.257 2.879 2.494 2.072 1.741 1.394 1.028 0.642 0.229 -0.043 -0.312 -0.735 -1.035 -1.355 -1.525 -1.874 -2.238 -2.649 -2.865 -3.196 -3.514 -3.756 -4.019 -4.594 -4.878 -5.196 -5.57 -5.999 -6.507 -7.153 -8.776 -5 ,4412 ,TETRA ,17585828,Sat Nov 27 15:02:17 CET,Sat Nov 27 16:47:38 CET,0.0 1.247 1.714 2.024 2.297 2.554 2.796 3.02 3.425 3.601 3.77 3.971 4.25 4.388 4.646 4.896 5.152 5.285 5.547 5.796 6.125 6.324 6.518 6.782 7.045 7.3 7.535 7.761 8.051 8.326 8.592 8.915 9.22 9.513 9.845 10.205 10.565 10.946 11.348 11.778 12.214 12.706 13.283 13.822 14.42 15.067 15.761 16.45 17.03 17.387 17.312 16.376 15.244 14.14 13.047 12.013 11.112 10.251 9.479 8.694 8.009 7.379 6.767 6.198 5.669 5.186 4.675 4.217 3.82 3.408 2.976 2.606 2.181 1.712 1.341 0.961 0.562 0.133 -0.315 -0.613 -0.91 -1.4 -1.747 -2.102 -2.292 -2.707 -3.146 -3.587 -3.82 -4.205 -4.614 -4.899 -5.2 -5.839 -6.194 -6.617 -7.097 -7.624 -8.268 -9.145 -11.672 -6 ,19727 ,TETRA ,17585829,Sat Nov 27 15:02:17 CET,Sat Nov 27 16:49:01 CET,0.0 1.009 1.454 1.752 2.014 2.288 2.535 2.736 3.119 3.298 3.474 3.668 3.943 4.081 4.354 4.616 4.85 4.962 5.192 5.414 5.725 5.92 6.104 6.368 6.634 6.891 7.133 7.365 7.657 7.933 8.203 8.527 8.848 9.163 9.505 9.879 10.23 10.594 10.999 11.432 11.87 12.353 12.914 13.492 14.124 14.748 15.363 15.926 16.515 16.941 16.902 16.175 15.12 14.06 13.02 12.015 11.115 10.236 9.444 8.644 7.938 7.287 6.663 6.091 5.57 5.09 4.552 4.067 3.676 3.261 2.81 2.435 2.032 1.624 1.321 1.001 0.649 0.257 -0.145 -0.415 -0.69 -1.116 -1.402 -1.69 -1.839 -2.149 -2.486 -2.848 -3.031 -3.352 -3.636 -3.863 -4.113 -4.654 -4.956 -5.281 -5.631 -6.041 -6.604 -7.376 -9.252 -7 ,2866 ,TETRA ,17585830,Sat Nov 27 15:03:16 CET,Sat Nov 27 16:48:23 CET,0.0 1.018 1.496 1.854 2.147 2.401 2.65 2.876 3.3 3.488 3.656 3.864 4.153 4.307 4.593 4.854 5.106 5.232 5.468 5.688 5.997 6.196 6.394 6.675 6.939 7.189 7.427 7.661 7.966 8.265 8.558 8.924 9.274 9.604 9.96 10.332 10.718 11.153 11.611 12.093 12.567 13.06 13.646 14.217 14.839 15.5 16.174 16.827 17.458 18.059 18.171 17.251 15.975 14.678 13.543 12.459 11.502 10.655 9.894 9.094 8.381 7.725 7.049 6.387 5.811 5.29 4.719 4.218 3.789 3.353 2.919 2.564 2.185 1.777 1.448 1.114 0.762 0.387 0.002 -0.267 -0.534 -0.933 -1.212 -1.51 -1.674 -2.022 -2.385 -2.769 -2.968 -3.306 -3.594 -3.817 -4.068 -4.622 -4.934 -5.281 -5.678 -6.138 -6.709 -7.374 -9.739 -8 ,27002 ,TETRA ,17585831,Sat Nov 27 15:03:17 CET,Sat Nov 27 16:43:44 CET,0.0 1.077 1.489 1.833 2.128 2.388 2.627 2.826 3.209 3.399 3.571 3.751 4.008 4.138 4.397 4.644 4.879 4.992 5.223 5.445 5.744 5.937 6.125 6.389 6.631 6.867 7.103 7.333 7.63 7.913 8.183 8.497 8.792 9.079 9.404 9.77 10.11 10.48 10.896 11.34 11.808 12.32 12.923 13.53 14.177 14.831 15.541 16.265 16.942 17.491 17.575 16.697 15.574 14.421 13.296 12.254 11.309 10.388 9.563 8.752 8.047 7.41 6.796 6.194 5.637 5.145 4.631 4.142 3.704 3.276 2.832 2.451 2.041 1.62 1.3 0.968 0.625 0.264 -0.104 -0.369 -0.651 -1.095 -1.417 -1.765 -1.942 -2.301 -2.656 -3.02 -3.227 -3.577 -3.9 -4.144 -4.412 -4.987 -5.3 -5.653 -6.067 -6.526 -7.043 -7.761 -10.453 -9 ,932 ,TETRA ,17585832,Sat Nov 27 15:04:16 CET,Sat Nov 27 16:51:26 CET,0.0 1.08 1.534 1.892 2.173 2.419 2.645 2.853 3.245 3.419 3.59 3.792 4.059 4.195 4.473 4.731 4.966 5.086 5.324 5.541 5.843 6.038 6.216 6.469 6.727 6.973 7.22 7.461 7.755 8.028 8.295 8.612 8.915 9.223 9.563 9.918 10.261 10.646 11.067 11.511 11.946 12.412 12.93 13.429 14.007 14.605 15.244 15.911 16.467 16.745 16.481 15.552 14.463 13.356 12.287 11.277 10.355 9.482 8.701 7.902 7.213 6.586 5.963 5.387 4.866 4.367 3.841 3.385 3.0 2.599 2.15 1.764 1.36 0.927 0.602 0.275 -0.082 -0.449 -0.826 -1.101 -1.398 -1.867 -2.195 -2.538 -2.716 -3.075 -3.426 -3.796 -4.001 -4.341 -4.644 -4.885 -5.149 -5.699 -5.992 -6.305 -6.697 -7.195 -7.776 -8.529 -10.812 -10 ,8216 ,TETRA ,17585833,Sat Nov 27 15:04:16 CET,Sat Nov 27 16:48:45 CET,0.0 0.983 1.443 1.781 2.062 2.327 2.568 2.779 3.155 3.332 3.501 3.662 3.907 4.035 4.296 4.559 4.818 4.935 5.159 5.374 5.686 5.893 6.101 6.417 6.712 6.994 7.268 7.523 7.828 8.118 8.397 8.717 9.028 9.323 9.665 10.054 10.41 10.801 11.237 11.697 12.173 12.694 13.286 13.839 14.423 15.061 15.756 16.416 17.045 17.584 17.634 16.789 15.66 14.447 13.256 12.158 11.153 10.246 9.469 8.671 7.98 7.338 6.71 6.121 5.584 5.078 4.538 4.058 3.645 3.195 2.719 2.334 1.927 1.502 1.179 0.841 0.486 0.122 -0.251 -0.514 -0.791 -1.224 -1.529 -1.841 -1.998 -2.336 -2.708 -3.112 -3.313 -3.64 -3.929 -4.16 -4.405 -4.971 -5.277 -5.609 -5.98 -6.375 -6.845 -7.509 -9.763 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index df7596e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2719 ,TETRA ,17585834,Sat Nov 27 15:04:17 CET,Sat Nov 27 16:49:01 CET,0.0 1.244 1.758 2.127 2.422 2.677 2.903 3.107 3.484 3.655 3.807 3.965 4.231 4.371 4.635 4.875 5.093 5.195 5.397 5.611 5.925 6.123 6.314 6.58 6.819 7.039 7.245 7.438 7.686 7.939 8.169 8.435 8.692 8.93 9.223 9.594 9.971 10.35 10.698 11.09 11.532 12.012 12.528 12.939 13.305 13.661 14.036 14.349 14.604 14.7 14.308 13.339 12.259 11.171 10.127 9.122 8.233 7.436 6.71 5.981 5.358 4.773 4.193 3.647 3.154 2.708 2.214 1.756 1.364 0.961 0.555 0.187 -0.231 -0.659 -0.996 -1.349 -1.713 -2.101 -2.505 -2.76 -3.015 -3.453 -3.775 -4.095 -4.253 -4.595 -4.996 -5.417 -5.625 -5.98 -6.295 -6.531 -6.796 -7.383 -7.7 -8.037 -8.412 -8.853 -9.386 -10.132 -12.274 -2 ,27988 ,TETRA ,17585835,Sat Nov 27 15:05:17 CET,Sat Nov 27 16:49:59 CET,0.0 1.068 1.525 1.864 2.14 2.363 2.57 2.776 3.154 3.314 3.454 3.586 3.838 3.961 4.195 4.433 4.66 4.764 4.977 5.181 5.458 5.635 5.831 6.14 6.423 6.659 6.865 7.07 7.318 7.542 7.786 8.114 8.43 8.708 9.001 9.322 9.614 9.923 10.257 10.603 10.927 11.276 11.667 12.051 12.541 13.077 13.536 13.85 14.105 14.148 13.667 12.589 11.458 10.326 9.305 8.402 7.564 6.757 6.034 5.265 4.552 3.937 3.366 2.825 2.335 1.88 1.389 0.939 0.556 0.108 -0.43 -0.867 -1.302 -1.763 -2.131 -2.48 -2.81 -3.155 -3.526 -3.777 -4.036 -4.455 -4.745 -5.041 -5.193 -5.523 -5.875 -6.253 -6.461 -6.798 -7.075 -7.305 -7.544 -8.073 -8.39 -8.747 -9.125 -9.567 -10.109 -10.814 -12.758 -3 ,13771 ,TETRA ,17585836,Sat Nov 27 15:05:19 CET,Sat Nov 27 16:49:28 CET,0.0 1.284 1.771 2.146 2.446 2.708 2.954 3.176 3.565 3.744 3.904 4.093 4.389 4.545 4.837 5.116 5.388 5.521 5.752 5.941 6.205 6.375 6.55 6.799 7.023 7.236 7.433 7.62 7.865 8.098 8.329 8.602 8.859 9.116 9.394 9.687 9.97 10.269 10.59 10.946 11.288 11.622 11.984 12.326 12.692 13.052 13.415 13.749 13.999 13.999 13.486 12.474 11.37 10.271 9.291 8.367 7.493 6.698 5.997 5.257 4.607 4.036 3.457 2.898 2.413 1.947 1.443 0.992 0.601 0.211 -0.199 -0.55 -0.921 -1.297 -1.589 -1.899 -2.212 -2.528 -2.853 -3.093 -3.358 -3.775 -4.069 -4.383 -4.54 -4.868 -5.237 -5.63 -5.833 -6.176 -6.499 -6.734 -6.982 -7.551 -7.879 -8.239 -8.669 -9.15 -9.703 -10.439 -12.658 -4 ,7748 ,TETRA ,17585837,Sat Nov 27 15:05:17 CET,Sat Nov 27 16:49:54 CET,0.0 1.532 2.003 2.381 2.694 2.958 3.19 3.404 3.782 3.953 4.109 4.266 4.535 4.677 4.932 5.163 5.376 5.484 5.691 5.881 6.148 6.321 6.496 6.741 6.964 7.179 7.389 7.58 7.811 8.049 8.284 8.552 8.801 9.042 9.327 9.648 9.948 10.264 10.599 10.927 11.246 11.588 11.957 12.309 12.717 13.166 13.599 13.928 14.158 14.175 13.65 12.635 11.532 10.43 9.418 8.439 7.562 6.747 6.005 5.261 4.62 4.034 3.468 2.919 2.394 1.908 1.423 1.004 0.618 0.197 -0.225 -0.573 -0.944 -1.308 -1.592 -1.903 -2.229 -2.553 -2.895 -3.16 -3.421 -3.807 -4.094 -4.384 -4.532 -4.843 -5.173 -5.527 -5.715 -6.056 -6.357 -6.562 -6.781 -7.29 -7.57 -7.876 -8.233 -8.667 -9.227 -10.037 -12.197 -5 ,113 ,TETRA ,17585838,Sat Nov 27 15:06:17 CET,Sat Nov 27 16:50:51 CET,0.0 1.058 1.53 1.9 2.207 2.461 2.691 2.904 3.314 3.494 3.661 3.843 4.109 4.238 4.481 4.722 4.952 5.067 5.293 5.494 5.766 5.929 6.092 6.334 6.559 6.785 6.994 7.189 7.444 7.682 7.916 8.196 8.451 8.696 8.979 9.29 9.585 9.891 10.215 10.548 10.866 11.227 11.637 12.019 12.426 12.812 13.195 13.544 13.761 13.734 13.212 12.107 10.869 9.732 8.735 7.76 6.894 6.094 5.353 4.572 3.877 3.263 2.696 2.169 1.671 1.209 0.725 0.295 -0.094 -0.495 -0.911 -1.276 -1.651 -2.031 -2.314 -2.614 -2.947 -3.296 -3.657 -3.894 -4.143 -4.554 -4.832 -5.11 -5.255 -5.576 -5.931 -6.291 -6.487 -6.831 -7.143 -7.384 -7.636 -8.181 -8.465 -8.79 -9.175 -9.58 -10.047 -10.644 -12.398 -6 ,22588 ,TETRA ,17585839,Sat Nov 27 15:07:16 CET,Sat Nov 27 16:53:02 CET,0.0 1.267 1.747 2.082 2.345 2.603 2.853 3.086 3.492 3.672 3.857 4.083 4.371 4.524 4.82 5.091 5.338 5.454 5.658 5.833 6.092 6.26 6.419 6.645 6.871 7.091 7.296 7.493 7.769 8.021 8.235 8.488 8.717 8.937 9.205 9.498 9.761 10.05 10.379 10.707 11.013 11.347 11.723 12.068 12.447 12.827 13.193 13.528 13.792 13.835 13.38 12.339 11.265 10.186 9.18 8.242 7.373 6.596 5.88 5.123 4.479 3.906 3.349 2.797 2.282 1.824 1.339 0.894 0.511 0.118 -0.298 -0.656 -1.027 -1.4 -1.702 -2.023 -2.357 -2.703 -3.065 -3.315 -3.581 -4.021 -4.332 -4.651 -4.809 -5.15 -5.529 -5.926 -6.13 -6.472 -6.766 -7.0 -7.259 -7.824 -8.137 -8.514 -8.896 -9.279 -9.794 -10.517 -12.366 -7 ,18094 ,TETRA ,17585840,Sat Nov 27 15:07:17 CET,Sat Nov 27 16:50:11 CET,0.0 1.462 1.95 2.272 2.55 2.796 2.995 3.186 3.559 3.73 3.885 4.036 4.296 4.434 4.687 4.923 5.168 5.293 5.529 5.745 6.051 6.266 6.484 6.781 7.068 7.339 7.585 7.827 8.113 8.379 8.647 8.926 9.172 9.41 9.675 9.979 10.261 10.567 10.883 11.2 11.538 11.896 12.281 12.652 13.056 13.439 13.823 14.177 14.451 14.491 13.987 12.919 11.809 10.719 9.687 8.718 7.819 6.989 6.28 5.552 4.905 4.326 3.783 3.265 2.768 2.313 1.822 1.367 0.989 0.592 0.159 -0.21 -0.586 -0.967 -1.263 -1.582 -1.915 -2.249 -2.602 -2.853 -3.117 -3.522 -3.817 -4.133 -4.293 -4.63 -4.99 -5.383 -5.59 -5.932 -6.243 -6.48 -6.721 -7.254 -7.555 -7.873 -8.213 -8.596 -9.059 -9.7 -11.652 -8 ,29391 ,TETRA ,17585841,Sat Nov 27 15:07:16 CET,Sat Nov 27 16:47:02 CET,0.0 1.21 1.675 2.018 2.28 2.512 2.738 2.94 3.302 3.477 3.648 3.812 4.072 4.206 4.46 4.701 4.941 5.051 5.26 5.459 5.727 5.894 6.056 6.283 6.495 6.706 6.922 7.123 7.372 7.609 7.834 8.105 8.351 8.592 8.872 9.179 9.469 9.772 10.081 10.414 10.753 11.136 11.564 11.935 12.322 12.694 13.081 13.44 13.681 13.669 13.173 12.074 10.921 9.794 8.77 7.848 6.986 6.194 5.498 4.787 4.157 3.589 3.048 2.529 2.057 1.616 1.121 0.671 0.287 -0.116 -0.537 -0.889 -1.266 -1.659 -1.959 -2.275 -2.611 -2.94 -3.28 -3.515 -3.763 -4.191 -4.501 -4.843 -5.025 -5.4 -5.779 -6.172 -6.387 -6.731 -7.078 -7.334 -7.592 -8.174 -8.502 -8.863 -9.247 -9.665 -10.179 -10.849 -12.871 -9 ,24761 ,TETRA ,17585842,Sat Nov 27 15:08:18 CET,Sat Nov 27 16:52:31 CET,0.0 1.341 1.973 2.456 2.847 3.16 3.423 3.652 4.05 4.223 4.379 4.531 4.782 4.905 5.139 5.362 5.582 5.689 5.913 6.149 6.467 6.648 6.819 7.059 7.272 7.479 7.715 7.97 8.269 8.515 8.739 9.008 9.251 9.482 9.768 10.065 10.321 10.606 10.924 11.256 11.591 11.959 12.333 12.667 13.024 13.371 13.745 14.094 14.317 14.33 13.917 12.836 11.656 10.54 9.492 8.535 7.672 6.875 6.168 5.443 4.82 4.247 3.668 3.109 2.606 2.145 1.647 1.212 0.842 0.441 0.014 -0.345 -0.721 -1.114 -1.425 -1.751 -2.088 -2.451 -2.837 -3.089 -3.332 -3.749 -4.062 -4.382 -4.542 -4.877 -5.231 -5.597 -5.794 -6.13 -6.431 -6.665 -6.9 -7.382 -7.666 -7.978 -8.338 -8.803 -9.315 -9.938 -12.083 -10 ,8433 ,TETRA ,17585843,Sat Nov 27 15:09:17 CET,Sat Nov 27 16:53:54 CET,0.0 1.15 1.652 1.988 2.248 2.472 2.693 2.918 3.326 3.527 3.721 3.911 4.186 4.319 4.558 4.783 4.999 5.099 5.303 5.516 5.81 5.982 6.142 6.372 6.598 6.822 7.019 7.198 7.436 7.67 7.896 8.143 8.365 8.596 8.873 9.198 9.53 9.918 10.317 10.649 10.959 11.298 11.666 12.023 12.401 12.788 13.162 13.464 13.704 13.729 13.254 12.231 11.156 10.131 9.149 8.175 7.289 6.48 5.753 4.997 4.343 3.777 3.227 2.682 2.168 1.641 1.044 0.526 0.087 -0.352 -0.78 -1.121 -1.484 -1.881 -2.195 -2.517 -2.848 -3.201 -3.572 -3.83 -4.095 -4.5 -4.793 -5.091 -5.244 -5.567 -5.92 -6.3 -6.505 -6.857 -7.167 -7.402 -7.657 -8.185 -8.47 -8.797 -9.186 -9.634 -10.164 -10.887 -12.611 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt deleted file mode 100644 index c3d38019..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21187 ,TETRA ,17585844,Sat Nov 27 15:09:17 CET,Sat Nov 27 16:58:48 CET,0.0 1.116 1.583 1.937 2.229 2.474 2.688 2.898 3.302 3.485 3.667 3.896 4.182 4.334 4.632 4.907 5.162 5.286 5.512 5.717 6.005 6.193 6.386 6.679 6.957 7.207 7.444 7.673 7.961 8.238 8.513 8.849 9.172 9.482 9.825 10.204 10.55 10.936 11.352 11.764 12.195 12.67 13.199 13.705 14.273 14.881 15.506 16.121 16.735 17.275 17.543 17.169 16.534 15.854 15.132 14.404 13.722 13.065 12.467 11.842 11.275 10.729 10.196 9.724 9.317 8.926 8.465 8.052 7.718 7.32 6.85 6.472 6.109 5.771 5.509 5.237 4.96 4.644 4.297 4.066 3.833 3.446 3.175 2.86 2.69 2.355 1.992 1.6 1.392 1.061 0.753 0.52 0.27 -0.272 -0.565 -0.891 -1.249 -1.651 -2.166 -2.882 -5.109 -2 ,5333 ,TETRA ,17585845,Sat Nov 27 15:10:18 CET,Sat Nov 27 16:55:53 CET,0.0 1.26 1.771 2.125 2.421 2.702 2.954 3.184 3.578 3.751 3.917 4.094 4.361 4.494 4.772 5.056 5.324 5.45 5.691 5.915 6.223 6.418 6.614 6.925 7.242 7.529 7.772 7.989 8.274 8.547 8.809 9.122 9.419 9.707 10.022 10.366 10.713 11.134 11.637 12.165 12.642 13.096 13.582 14.078 14.651 15.25 15.897 16.539 17.149 17.655 17.866 17.465 16.792 16.05 15.302 14.548 13.853 13.193 12.594 11.982 11.432 10.926 10.435 9.955 9.498 9.081 8.657 8.27 7.92 7.545 7.139 6.803 6.447 6.069 5.793 5.501 5.197 4.893 4.572 4.344 4.107 3.725 3.451 3.167 3.017 2.707 2.397 2.057 1.867 1.535 1.235 1.011 0.791 0.333 0.065 -0.239 -0.597 -1.021 -1.534 -2.213 -4.306 -3 ,30207 ,TETRA ,17585846,Sat Nov 27 15:10:18 CET,Sat Nov 27 16:56:06 CET,0.0 1.321 1.806 2.172 2.509 2.816 3.102 3.364 3.815 4.012 4.196 4.425 4.717 4.876 5.18 5.44 5.688 5.812 6.05 6.278 6.596 6.801 6.995 7.266 7.531 7.789 8.033 8.266 8.565 8.843 9.094 9.389 9.674 9.955 10.29 10.671 11.041 11.433 11.843 12.247 12.655 13.132 13.676 14.184 14.745 15.341 15.971 16.629 17.254 17.733 17.916 17.545 16.87 16.146 15.486 14.811 14.158 13.526 12.914 12.275 11.732 11.222 10.722 10.249 9.813 9.412 8.982 8.585 8.242 7.892 7.513 7.204 6.88 6.517 6.242 5.964 5.668 5.342 4.989 4.743 4.48 4.073 3.816 3.548 3.41 3.118 2.782 2.4 2.207 1.892 1.616 1.399 1.162 0.641 0.352 0.05 -0.298 -0.703 -1.139 -1.727 -3.438 -4 ,24894 ,TETRA ,17585847,Sat Nov 27 15:10:18 CET,Sat Nov 27 16:54:33 CET,0.0 1.38 1.87 2.206 2.493 2.743 2.982 3.215 3.636 3.829 4.014 4.238 4.531 4.692 4.98 5.229 5.492 5.625 5.862 6.081 6.392 6.585 6.773 7.036 7.275 7.515 7.746 7.974 8.27 8.545 8.794 9.096 9.398 9.699 10.037 10.389 10.732 11.131 11.552 11.982 12.434 12.918 13.411 13.9 14.484 15.063 15.634 16.23 16.886 17.46 17.683 17.317 16.67 15.939 15.209 14.455 13.741 13.061 12.436 11.789 11.241 10.754 10.3 9.874 9.443 9.024 8.594 8.218 7.878 7.516 7.143 6.832 6.512 6.181 5.906 5.604 5.29 4.97 4.645 4.422 4.187 3.806 3.534 3.252 3.106 2.802 2.462 2.094 1.906 1.575 1.252 1.022 0.803 0.314 0.021 -0.29 -0.62 -1.004 -1.51 -2.137 -3.87 -5 ,2221 ,TETRA ,17585848,Sat Nov 27 15:11:17 CET,Sat Nov 27 16:56:05 CET,0.0 1.259 1.778 2.194 2.508 2.779 3.026 3.248 3.649 3.843 4.031 4.242 4.526 4.669 4.932 5.186 5.435 5.55 5.769 5.972 6.26 6.446 6.626 6.882 7.132 7.384 7.631 7.858 8.135 8.4 8.668 8.981 9.258 9.537 9.867 10.221 10.567 10.957 11.353 11.753 12.16 12.617 13.167 13.666 14.192 14.773 15.368 15.931 16.526 17.035 17.23 16.919 16.293 15.549 14.812 14.073 13.403 12.785 12.197 11.595 11.077 10.598 10.104 9.612 9.171 8.775 8.332 7.924 7.578 7.216 6.84 6.517 6.164 5.8 5.525 5.229 4.9 4.551 4.19 3.932 3.657 3.224 2.917 2.596 2.435 2.098 1.74 1.376 1.178 0.844 0.537 0.304 0.065 -0.46 -0.749 -1.102 -1.517 -1.953 -2.479 -3.156 -5.314 -6 ,1660 ,TETRA ,17585849,Sat Nov 27 15:12:16 CET,Sat Nov 27 16:58:23 CET,0.0 1.243 1.752 2.117 2.42 2.685 2.902 3.106 3.474 3.641 3.811 3.991 4.264 4.411 4.701 4.987 5.253 5.382 5.615 5.821 6.12 6.313 6.504 6.787 7.054 7.304 7.546 7.784 8.09 8.374 8.653 8.986 9.285 9.559 9.887 10.264 10.603 10.99 11.459 11.929 12.415 12.947 13.484 14.003 14.561 15.152 15.795 16.424 17.002 17.465 17.648 17.288 16.697 16.003 15.317 14.619 13.933 13.271 12.673 12.04 11.494 11.007 10.522 10.052 9.584 9.149 8.709 8.304 7.954 7.58 7.172 6.831 6.496 6.156 5.883 5.595 5.291 4.973 4.631 4.394 4.151 3.757 3.479 3.187 3.032 2.699 2.356 1.994 1.804 1.503 1.272 1.072 0.843 0.315 0.03 -0.273 -0.599 -0.977 -1.449 -2.151 -4.332 -7 ,8823 ,TETRA ,17585850,Sat Nov 27 15:12:17 CET,Sat Nov 27 16:51:57 CET,0.0 1.367 1.838 2.16 2.456 2.714 2.937 3.151 3.507 3.669 3.843 4.041 4.316 4.456 4.731 4.998 5.267 5.395 5.633 5.858 6.176 6.376 6.564 6.829 7.084 7.348 7.599 7.823 8.101 8.362 8.616 8.931 9.258 9.569 9.922 10.302 10.637 11.007 11.408 11.824 12.248 12.703 13.217 13.715 14.244 14.783 15.377 16.008 16.657 17.216 17.415 17.015 16.344 15.606 14.83 14.078 13.418 12.768 12.174 11.558 10.996 10.484 9.995 9.508 9.05 8.639 8.199 7.803 7.453 7.069 6.654 6.318 5.954 5.573 5.283 4.981 4.666 4.34 4.001 3.759 3.51 3.131 2.87 2.586 2.442 2.141 1.817 1.492 1.323 1.018 0.756 0.54 0.307 -0.211 -0.515 -0.825 -1.166 -1.557 -2.028 -2.656 -4.636 -8 ,26280 ,TETRA ,17585851,Sat Nov 27 15:14:19 CET,Sat Nov 27 16:59:29 CET,0.0 1.065 1.533 1.877 2.157 2.411 2.655 2.895 3.31 3.493 3.667 3.86 4.124 4.256 4.519 4.76 4.987 5.098 5.31 5.516 5.821 6.019 6.205 6.466 6.715 6.987 7.258 7.513 7.835 8.146 8.455 8.79 9.084 9.392 9.781 10.172 10.565 11.035 11.46 11.855 12.264 12.716 13.233 13.724 14.287 14.874 15.492 16.126 16.708 17.198 17.446 17.067 16.432 15.658 14.859 14.143 13.505 12.873 12.262 11.626 11.064 10.567 10.066 9.579 9.14 8.721 8.268 7.854 7.491 7.116 6.726 6.397 6.018 5.615 5.33 5.038 4.726 4.399 4.059 3.826 3.581 3.209 2.957 2.673 2.524 2.24 1.938 1.584 1.385 1.043 0.693 0.44 0.194 -0.329 -0.614 -0.916 -1.263 -1.671 -2.156 -2.784 -4.842 -9 ,1967 ,TETRA ,17585852,Sat Nov 27 15:13:18 CET,Sat Nov 27 16:57:51 CET,0.0 1.229 1.701 2.028 2.315 2.563 2.773 2.975 3.358 3.535 3.694 3.864 4.136 4.273 4.534 4.775 5.01 5.135 5.373 5.582 5.894 6.101 6.289 6.553 6.806 7.063 7.311 7.536 7.827 8.093 8.346 8.675 8.987 9.276 9.607 9.971 10.305 10.676 11.078 11.506 11.96 12.459 13.026 13.545 14.091 14.643 15.284 15.978 16.626 17.176 17.432 17.058 16.426 15.72 14.994 14.268 13.599 12.971 12.405 11.819 11.297 10.809 10.31 9.832 9.402 9.003 8.572 8.168 7.807 7.428 7.034 6.696 6.331 5.967 5.692 5.401 5.095 4.788 4.47 4.229 3.977 3.599 3.328 3.041 2.893 2.58 2.24 1.877 1.682 1.351 1.049 0.82 0.578 0.035 -0.259 -0.588 -0.93 -1.295 -1.774 -2.442 -3.93 -10 ,6698 ,TETRA ,17585853,Sat Nov 27 15:13:16 CET,Sat Nov 27 16:57:07 CET,0.0 1.325 1.804 2.153 2.421 2.664 2.916 3.138 3.534 3.725 3.892 4.056 4.335 4.492 4.795 5.083 5.373 5.509 5.744 5.965 6.286 6.498 6.696 6.985 7.28 7.545 7.799 8.09 8.495 8.857 9.188 9.547 9.85 10.132 10.452 10.837 11.197 11.56 11.947 12.341 12.752 13.216 13.74 14.249 14.814 15.396 16.024 16.658 17.255 17.748 18.023 17.635 16.95 16.194 15.432 14.707 13.994 13.322 12.73 12.044 11.34 10.664 10.114 9.654 9.215 8.814 8.383 7.992 7.649 7.282 6.89 6.578 6.256 5.905 5.634 5.336 4.991 4.612 4.22 3.949 3.672 3.256 2.949 2.632 2.475 2.135 1.772 1.385 1.182 0.847 0.543 0.31 0.05 -0.497 -0.771 -1.076 -1.436 -1.843 -2.337 -3.033 -5.071 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt deleted file mode 100644 index 89751e12..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12740 ,TETRA ,17585854,Sat Nov 27 15:14:16 CET,Sat Nov 27 17:00:05 CET,0.0 1.569 2.089 2.517 2.885 3.184 3.45 3.693 4.138 4.349 4.549 4.812 5.125 5.29 5.577 5.834 6.085 6.21 6.452 6.707 7.064 7.265 7.453 7.728 8.004 8.279 8.547 8.804 9.135 9.429 9.703 10.032 10.338 10.619 10.939 11.304 11.649 12.013 12.393 12.771 13.161 13.614 14.116 14.591 15.08 15.552 16.064 16.565 16.995 17.234 17.075 16.305 15.335 14.357 13.424 12.538 11.685 10.913 10.244 9.548 8.953 8.421 7.905 7.404 6.906 6.453 5.976 5.533 5.147 4.753 4.36 4.006 3.619 3.241 2.951 2.648 2.33 1.987 1.634 1.389 1.124 0.705 0.411 0.099 -0.059 -0.364 -0.685 -1.036 -1.219 -1.554 -1.866 -2.084 -2.304 -2.796 -3.087 -3.409 -3.737 -4.113 -4.591 -5.167 -6.547 -2 ,10432 ,TETRA ,17585855,Sat Nov 27 15:14:19 CET,Sat Nov 27 16:59:04 CET,0.0 1.246 1.772 2.187 2.521 2.821 3.087 3.325 3.764 3.973 4.173 4.428 4.727 4.881 5.172 5.449 5.723 5.857 6.102 6.337 6.672 6.884 7.088 7.367 7.62 7.871 8.13 8.374 8.674 8.963 9.248 9.585 9.905 10.203 10.529 10.889 11.244 11.643 12.055 12.454 12.83 13.246 13.714 14.153 14.631 15.138 15.643 16.092 16.478 16.666 16.442 15.623 14.652 13.709 12.782 11.87 11.03 10.231 9.54 8.803 8.14 7.574 7.03 6.512 6.047 5.62 5.156 4.72 4.316 3.897 3.478 3.128 2.763 2.387 2.093 1.79 1.47 1.134 0.787 0.542 0.289 -0.115 -0.407 -0.706 -0.861 -1.188 -1.535 -1.906 -2.097 -2.425 -2.705 -2.922 -3.158 -3.698 -3.982 -4.289 -4.627 -5.04 -5.57 -6.213 -7.685 -3 ,10001 ,TETRA ,17585856,Sat Nov 27 15:14:16 CET,Sat Nov 27 16:59:34 CET,0.0 1.165 1.697 2.114 2.499 2.855 3.155 3.408 3.89 4.112 4.314 4.574 4.872 5.031 5.361 5.678 5.983 6.136 6.418 6.682 7.023 7.224 7.426 7.718 7.996 8.265 8.53 8.783 9.086 9.375 9.661 9.998 10.335 10.654 11.0 11.379 11.723 12.11 12.505 12.9 13.317 13.766 14.284 14.772 15.283 15.784 16.255 16.701 17.081 17.278 17.065 16.241 15.29 14.329 13.384 12.519 11.727 10.902 10.182 9.505 8.906 8.313 7.755 7.249 6.763 6.319 5.841 5.39 4.988 4.573 4.155 3.811 3.45 3.078 2.789 2.491 2.176 1.84 1.493 1.255 1.005 0.614 0.333 0.04 -0.111 -0.434 -0.762 -1.109 -1.297 -1.629 -1.911 -2.134 -2.368 -2.889 -3.177 -3.475 -3.823 -4.236 -4.705 -5.359 -7.207 -4 ,1603 ,TETRA ,17585857,Sat Nov 27 15:15:18 CET,Sat Nov 27 17:02:14 CET,0.0 1.594 2.131 2.547 2.896 3.213 3.499 3.749 4.19 4.39 4.582 4.811 5.101 5.267 5.595 5.89 6.162 6.296 6.551 6.786 7.136 7.363 7.583 7.911 8.214 8.497 8.764 9.008 9.296 9.572 9.843 10.174 10.502 10.817 11.169 11.537 11.878 12.245 12.626 13.015 13.4 13.811 14.307 14.789 15.288 15.781 16.261 16.735 17.204 17.51 17.316 16.525 15.557 14.557 13.616 12.745 11.93 11.147 10.462 9.773 9.122 8.529 7.97 7.422 6.898 6.415 5.913 5.445 5.036 4.633 4.228 3.872 3.476 3.062 2.747 2.427 2.089 1.738 1.388 1.143 0.881 0.479 0.203 -0.091 -0.245 -0.548 -0.861 -1.2 -1.389 -1.729 -2.015 -2.221 -2.426 -2.903 -3.186 -3.491 -3.83 -4.223 -4.701 -5.34 -6.857 -5 ,31943 ,TETRA ,17585858,Sat Nov 27 15:15:18 CET,Sat Nov 27 17:04:22 CET,0.0 1.678 2.272 2.719 3.12 3.475 3.788 4.058 4.533 4.748 4.94 5.18 5.484 5.639 5.917 6.196 6.466 6.592 6.846 7.077 7.394 7.613 7.821 8.104 8.383 8.66 8.934 9.197 9.506 9.809 10.133 10.519 10.847 11.146 11.521 11.957 12.313 12.663 13.057 13.474 13.869 14.278 14.758 15.233 15.747 16.244 16.731 17.17 17.544 17.776 17.584 16.765 15.805 14.904 14.044 13.184 12.349 11.539 10.817 10.105 9.491 8.924 8.366 7.827 7.291 6.763 6.21 5.743 5.358 4.938 4.486 4.129 3.759 3.362 3.057 2.728 2.378 2.041 1.695 1.45 1.192 0.787 0.505 0.206 0.05 -0.269 -0.6 -0.963 -1.151 -1.463 -1.726 -1.948 -2.183 -2.674 -2.929 -3.223 -3.585 -3.997 -4.436 -4.958 -6.32 -6 ,5614 ,TETRA ,17585859,Sat Nov 27 15:16:16 CET,Sat Nov 27 16:52:39 CET,0.0 1.508 2.09 2.491 2.8 3.109 3.406 3.681 4.202 4.437 4.653 4.95 5.284 5.476 5.83 6.159 6.45 6.585 6.856 7.111 7.454 7.676 7.897 8.212 8.51 8.778 9.02 9.261 9.574 9.866 10.149 10.475 10.784 11.09 11.438 11.822 12.172 12.535 12.914 13.312 13.724 14.142 14.604 15.05 15.553 16.071 16.588 17.079 17.47 17.673 17.436 16.67 15.747 14.754 13.834 12.962 12.153 11.391 10.727 10.048 9.429 8.855 8.312 7.807 7.307 6.833 6.346 5.907 5.511 5.078 4.651 4.305 3.909 3.504 3.211 2.91 2.595 2.275 1.928 1.692 1.464 1.096 0.831 0.551 0.407 0.109 -0.2 -0.545 -0.734 -1.051 -1.328 -1.547 -1.765 -2.23 -2.489 -2.796 -3.142 -3.516 -3.979 -4.627 -5.874 -7 ,17164 ,TETRA ,17585860,Sat Nov 27 15:16:18 CET,Sat Nov 27 17:02:03 CET,0.0 1.714 2.298 2.713 3.052 3.374 3.655 3.895 4.341 4.554 4.74 4.966 5.265 5.419 5.706 5.981 6.25 6.382 6.627 6.856 7.193 7.408 7.609 7.89 8.147 8.394 8.68 8.993 9.378 9.714 10.008 10.341 10.656 10.965 11.309 11.681 12.023 12.404 12.819 13.237 13.655 14.087 14.56 15.01 15.507 16.021 16.546 17.108 17.599 17.811 17.524 16.663 15.74 14.776 13.81 12.928 12.109 11.313 10.63 9.914 9.276 8.668 8.087 7.556 7.033 6.552 6.065 5.634 5.261 4.881 4.491 4.164 3.807 3.423 3.126 2.824 2.514 2.183 1.826 1.582 1.325 0.91 0.614 0.317 0.17 -0.137 -0.462 -0.806 -0.986 -1.311 -1.588 -1.807 -2.047 -2.572 -2.847 -3.145 -3.473 -3.861 -4.335 -4.928 -6.987 -8 ,10001 ,TETRA ,17585861,Sat Nov 27 15:17:17 CET,Sat Nov 27 17:03:25 CET,0.0 1.165 1.697 2.114 2.499 2.855 3.155 3.408 3.89 4.112 4.314 4.574 4.872 5.031 5.361 5.678 5.983 6.136 6.418 6.682 7.023 7.224 7.426 7.718 7.996 8.265 8.53 8.783 9.086 9.375 9.661 9.998 10.335 10.654 11.0 11.379 11.723 12.11 12.505 12.9 13.317 13.766 14.284 14.772 15.283 15.784 16.255 16.701 17.081 17.278 17.065 16.241 15.29 14.329 13.384 12.519 11.727 10.902 10.182 9.505 8.906 8.313 7.755 7.249 6.763 6.319 5.841 5.39 4.988 4.573 4.155 3.811 3.45 3.078 2.789 2.491 2.176 1.84 1.493 1.255 1.005 0.614 0.333 0.04 -0.111 -0.434 -0.762 -1.109 -1.297 -1.629 -1.911 -2.134 -2.368 -2.889 -3.177 -3.475 -3.823 -4.236 -4.705 -5.359 -7.207 -9 ,10674 ,TETRA ,17585862,Sat Nov 27 15:17:17 CET,Sat Nov 27 17:03:24 CET,0.0 1.318 1.849 2.257 2.579 2.85 3.1 3.333 3.751 3.949 4.14 4.369 4.67 4.831 5.126 5.409 5.686 5.816 6.065 6.315 6.683 6.914 7.135 7.46 7.768 8.06 8.336 8.602 8.922 9.236 9.535 9.862 10.17 10.468 10.806 11.156 11.495 11.862 12.269 12.728 13.139 13.53 14.002 14.484 14.984 15.467 15.977 16.462 16.853 17.016 16.781 15.911 14.921 13.936 12.969 12.053 11.23 10.497 9.838 9.113 8.49 7.931 7.368 6.841 6.336 5.865 5.368 4.92 4.54 4.146 3.722 3.362 2.974 2.568 2.262 1.953 1.646 1.329 1.016 0.792 0.541 0.145 -0.127 -0.406 -0.554 -0.857 -1.164 -1.499 -1.683 -1.999 -2.263 -2.473 -2.694 -3.182 -3.442 -3.73 -4.073 -4.451 -4.88 -5.493 -7.088 -10 ,9157 ,TETRA ,17585863,Sat Nov 27 15:17:17 CET,Sat Nov 27 17:04:10 CET,0.0 1.075 1.566 1.953 2.294 2.602 2.875 3.128 3.591 3.805 4.013 4.245 4.539 4.692 4.994 5.282 5.548 5.676 5.928 6.157 6.479 6.683 6.876 7.159 7.442 7.719 7.974 8.208 8.504 8.801 9.107 9.485 9.818 10.11 10.444 10.799 11.139 11.494 11.87 12.286 12.678 13.104 13.607 14.091 14.62 15.146 15.656 16.104 16.519 16.773 16.543 15.697 14.688 13.688 12.736 11.834 11.004 10.209 9.522 8.855 8.261 7.712 7.165 6.619 6.131 5.671 5.173 4.739 4.349 3.914 3.439 3.043 2.651 2.259 1.957 1.642 1.313 0.974 0.616 0.371 0.126 -0.26 -0.534 -0.815 -0.966 -1.297 -1.639 -1.993 -2.192 -2.53 -2.806 -3.019 -3.244 -3.762 -4.069 -4.387 -4.716 -5.085 -5.541 -6.212 -8.102 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt deleted file mode 100644 index 37f3f1d6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4745 ,TETRA ,17585864,Sat Nov 27 15:18:17 CET,Sat Nov 27 17:06:35 CET,0.0 2.728 3.412 3.892 4.276 4.618 4.93 5.19 5.664 5.89 6.098 6.355 6.663 6.846 7.188 7.515 7.828 7.974 8.252 8.527 8.938 9.187 9.417 9.753 10.082 10.393 10.678 10.953 11.301 11.65 12.004 12.417 12.821 13.213 13.638 14.094 14.541 15.064 15.627 16.205 16.792 17.459 18.267 18.97 19.737 20.658 21.657 22.553 23.439 24.316 24.78 24.33 23.477 22.57 21.7 20.823 20.006 19.241 18.551 17.855 17.245 16.68 16.148 15.656 15.179 14.727 14.259 13.845 13.499 13.133 12.736 12.401 12.041 11.678 11.408 11.124 10.826 10.516 10.19 9.965 9.735 9.365 9.092 8.799 8.657 8.378 8.084 7.749 7.567 7.254 6.978 6.77 6.549 6.064 5.803 5.528 5.229 4.881 4.432 3.87 2.283 -2 ,1189 ,TETRA ,17585865,Sat Nov 27 15:18:17 CET,Sat Nov 27 17:03:51 CET,0.0 2.497 3.199 3.731 4.153 4.487 4.796 5.074 5.533 5.756 5.972 6.231 6.553 6.744 7.1 7.42 7.726 7.864 8.123 8.387 8.777 9.036 9.281 9.619 9.942 10.26 10.567 10.869 11.253 11.596 11.924 12.321 12.701 13.071 13.486 13.944 14.411 14.935 15.49 16.07 16.643 17.257 17.947 18.628 19.426 20.256 21.115 22.025 22.911 23.624 23.964 23.609 22.729 21.739 20.829 19.91 19.066 18.275 17.566 16.858 16.248 15.697 15.171 14.676 14.203 13.75 13.285 12.866 12.494 12.115 11.727 11.397 11.053 10.702 10.431 10.146 9.852 9.544 9.208 8.974 8.737 8.38 8.125 7.849 7.7 7.392 7.064 6.703 6.522 6.213 5.929 5.719 5.511 5.051 4.793 4.504 4.173 3.77 3.316 2.794 1.291 -3 ,15673 ,TETRA ,17585866,Sat Nov 27 15:19:17 CET,Sat Nov 27 17:05:45 CET,0.0 2.171 2.837 3.337 3.732 4.089 4.383 4.642 5.136 5.362 5.582 5.864 6.177 6.349 6.678 6.987 7.278 7.419 7.699 7.97 8.323 8.551 8.789 9.124 9.443 9.752 10.051 10.361 10.762 11.137 11.486 11.872 12.244 12.612 13.038 13.504 13.929 14.377 14.867 15.427 16.009 16.642 17.397 18.125 18.902 19.77 20.72 21.638 22.54 23.315 23.674 23.265 22.452 21.533 20.626 19.753 18.954 18.178 17.476 16.748 16.105 15.541 14.996 14.44 13.895 13.405 12.897 12.465 12.097 11.704 11.3 10.968 10.624 10.262 9.969 9.657 9.337 9.008 8.674 8.449 8.214 7.833 7.576 7.317 7.176 6.874 6.549 6.193 5.998 5.675 5.416 5.204 4.988 4.517 4.251 3.968 3.639 3.245 2.779 2.207 1.024 -4 ,21652 ,TETRA ,17585867,Sat Nov 27 15:19:17 CET,Sat Nov 27 17:06:29 CET,0.0 1.763 2.322 2.753 3.133 3.478 3.774 4.042 4.531 4.747 4.951 5.22 5.542 5.741 6.103 6.41 6.696 6.837 7.117 7.392 7.787 8.035 8.276 8.629 8.963 9.275 9.579 9.877 10.267 10.643 10.975 11.363 11.736 12.094 12.521 12.993 13.441 13.926 14.428 14.962 15.54 16.153 16.811 17.479 18.23 19.054 20.024 20.997 21.922 22.752 23.27 22.94 22.158 21.301 20.422 19.519 18.675 17.92 17.249 16.533 15.881 15.307 14.779 14.262 13.769 13.313 12.852 12.442 12.079 11.704 11.315 10.976 10.612 10.219 9.915 9.61 9.289 8.95 8.593 8.35 8.093 7.692 7.415 7.123 6.97 6.66 6.325 5.967 5.79 5.481 5.204 4.995 4.786 4.307 4.031 3.745 3.441 3.073 2.615 2.008 0.205 -5 ,5473 ,TETRA ,17585868,Sat Nov 27 15:19:17 CET,Sat Nov 27 17:05:11 CET,0.0 1.528 2.13 2.571 2.952 3.283 3.581 3.848 4.301 4.505 4.715 4.996 5.308 5.491 5.843 6.163 6.46 6.6 6.879 7.148 7.533 7.791 8.038 8.383 8.713 9.031 9.351 9.653 10.032 10.398 10.754 11.186 11.595 11.989 12.43 12.898 13.326 13.799 14.299 14.841 15.416 16.052 16.785 17.508 18.336 19.185 20.086 21.022 22.017 22.908 23.337 22.966 22.208 21.305 20.388 19.529 18.716 17.932 17.259 16.585 15.96 15.363 14.801 14.267 13.771 13.33 12.864 12.442 12.069 11.69 11.306 10.971 10.62 10.266 9.979 9.673 9.362 9.039 8.695 8.45 8.202 7.819 7.545 7.263 7.115 6.822 6.517 6.178 5.997 5.694 5.424 5.211 4.997 4.534 4.269 3.97 3.649 3.316 2.948 2.439 1.212 -6 ,10592 ,TETRA ,17585869,Sat Nov 27 15:19:18 CET,Sat Nov 27 17:08:04 CET,0.0 2.056 2.676 3.143 3.537 3.874 4.179 4.457 4.968 5.192 5.398 5.684 6.005 6.188 6.528 6.864 7.191 7.341 7.622 7.893 8.287 8.54 8.789 9.156 9.49 9.803 10.107 10.391 10.748 11.105 11.456 11.877 12.29 12.678 13.123 13.603 14.037 14.517 15.031 15.565 16.101 16.708 17.427 18.136 18.912 19.736 20.596 21.433 22.275 23.023 23.388 23.015 22.28 21.404 20.522 19.634 18.806 18.031 17.343 16.627 15.996 15.419 14.866 14.352 13.881 13.445 12.972 12.547 12.173 11.778 11.371 11.029 10.685 10.341 10.065 9.774 9.47 9.151 8.808 8.573 8.346 7.985 7.721 7.455 7.311 6.999 6.677 6.334 6.155 5.843 5.558 5.329 5.083 4.573 4.308 4.013 3.669 3.28 2.854 2.292 0.258 -7 ,6320 ,TETRA ,17585870,Sat Nov 27 15:19:18 CET,Sat Nov 27 17:04:58 CET,0.0 2.304 2.891 3.355 3.743 4.089 4.411 4.687 5.189 5.436 5.666 5.951 6.271 6.466 6.836 7.175 7.487 7.638 7.927 8.203 8.594 8.833 9.063 9.404 9.737 10.051 10.348 10.634 11.008 11.361 11.69 12.092 12.476 12.846 13.277 13.757 14.197 14.69 15.232 15.778 16.349 16.972 17.669 18.369 19.19 20.061 20.949 21.828 22.732 23.562 23.861 23.33 22.548 21.676 20.718 19.733 18.847 18.024 17.303 16.55 15.89 15.294 14.71 14.158 13.659 13.208 12.732 12.311 11.92 11.513 11.096 10.743 10.38 10.002 9.704 9.389 9.061 8.717 8.362 8.128 7.895 7.528 7.268 6.992 6.843 6.543 6.224 5.889 5.716 5.397 5.117 4.904 4.672 4.155 3.868 3.562 3.243 2.874 2.399 1.807 0.054 -8 ,25102 ,TETRA ,17585871,Sat Nov 27 15:22:16 CET,Sat Nov 27 16:56:33 CET,0.0 1.915 2.707 3.294 3.772 4.201 4.591 4.927 5.527 5.803 6.071 6.453 6.818 7.047 7.467 7.854 8.224 8.408 8.76 9.097 9.58 9.88 10.167 10.583 10.981 11.358 11.737 12.102 12.547 12.969 13.343 13.752 14.133 14.499 14.926 15.407 15.861 16.379 16.934 17.473 18.012 18.587 19.253 19.918 20.643 21.45 22.39 23.338 24.223 24.952 25.35 25.04 24.272 23.364 22.457 21.549 20.719 19.962 19.304 18.6 17.99 17.455 16.941 16.443 15.969 15.539 15.089 14.681 14.324 13.959 13.549 13.191 12.842 12.488 12.196 11.893 11.577 11.258 10.936 10.716 10.491 10.106 9.809 9.493 9.344 9.035 8.701 8.363 8.185 7.869 7.625 7.421 7.209 6.766 6.503 6.191 5.836 5.459 5.017 4.477 3.209 -9 ,14609 ,TETRA ,17585872,Sat Nov 27 15:24:17 CET,Sat Nov 27 17:05:15 CET,0.0 2.719 3.398 3.872 4.259 4.613 4.959 5.263 5.776 6.011 6.251 6.572 6.885 7.063 7.406 7.725 8.032 8.18 8.466 8.753 9.167 9.427 9.67 10.015 10.346 10.654 10.958 11.256 11.624 11.963 12.286 12.679 13.068 13.433 13.857 14.333 14.759 15.219 15.722 16.266 16.836 17.479 18.212 18.916 19.696 20.518 21.414 22.317 23.249 24.065 24.404 23.922 23.107 22.267 21.368 20.444 19.645 18.871 18.141 17.371 16.699 16.091 15.518 15.003 14.525 14.066 13.593 13.186 12.824 12.446 12.042 11.71 11.368 11.012 10.73 10.428 10.112 9.797 9.472 9.236 8.989 8.609 8.33 8.033 7.887 7.59 7.278 6.944 6.765 6.449 6.163 5.952 5.738 5.276 5.022 4.726 4.392 4.015 3.567 3.044 1.28 -10 ,2352 ,TETRA ,17585873,Sat Nov 27 15:24:17 CET,Sat Nov 27 16:52:09 CET,0.0 1.55 2.15 2.587 2.944 3.257 3.549 3.822 4.284 4.491 4.689 4.944 5.26 5.439 5.79 6.11 6.407 6.548 6.807 7.063 7.447 7.681 7.901 8.222 8.536 8.844 9.139 9.435 9.791 10.13 10.473 10.886 11.27 11.632 12.067 12.556 13.038 13.559 14.075 14.61 15.188 15.816 16.513 17.208 18.028 18.905 19.829 20.753 21.65 22.452 22.791 22.271 21.413 20.542 19.684 18.784 17.949 17.183 16.497 15.796 15.173 14.606 14.068 13.569 13.103 12.656 12.187 11.757 11.36 10.955 10.523 10.152 9.779 9.407 9.13 8.84 8.518 8.175 7.815 7.573 7.332 6.968 6.719 6.438 6.291 6.0 5.705 5.388 5.208 4.896 4.646 4.438 4.212 3.722 3.448 3.149 2.834 2.482 2.024 1.418 0.095 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index 106b913e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4232 ,KEBNE ,17024232,Wed Dec 22 09:46:49 CET,Wed Dec 22 11:16:11 CET,0.0 1.001 1.439 1.787 2.077 2.338 2.576 2.796 3.221 3.419 3.605 3.826 4.111 4.278 4.606 4.918 5.2 5.335 5.61 5.871 6.234 6.473 6.707 7.027 7.329 7.635 7.937 8.221 8.588 8.941 9.274 9.674 10.062 10.449 10.909 11.426 11.922 12.466 13.057 13.684 14.35 15.102 15.939 16.759 17.753 18.905 20.266 21.757 23.388 25.18 27.05 28.185 28.652 28.762 28.68 28.449 28.147 27.842 27.546 27.196 26.809 26.452 26.102 25.732 25.37 25.031 24.682 24.371 24.089 23.787 23.468 23.208 22.933 22.645 22.41 22.163 21.898 21.593 21.301 21.107 20.885 20.531 20.28 20.011 19.87 19.577 19.266 18.918 18.731 18.445 18.161 17.937 17.698 17.157 16.855 16.536 16.172 15.735 15.217 14.433 11.995 -2 ,19028 ,KEBNE ,17024233,Wed Dec 22 09:46:49 CET,Wed Dec 22 11:16:10 CET,0.0 1.206 1.698 2.073 2.399 2.681 2.94 3.164 3.581 3.78 3.967 4.197 4.491 4.653 4.944 5.212 5.491 5.634 5.91 6.162 6.519 6.745 6.962 7.284 7.591 7.897 8.2 8.491 8.865 9.216 9.546 9.947 10.343 10.738 11.181 11.669 12.164 12.716 13.307 13.937 14.593 15.325 16.157 16.996 18.051 19.266 20.608 22.056 23.721 25.557 27.45 28.658 29.108 29.24 29.16 28.899 28.57 28.237 27.891 27.49 27.132 26.785 26.439 26.096 25.77 25.452 25.114 24.811 24.51 24.187 23.857 23.568 23.277 22.983 22.741 22.475 22.205 21.929 21.611 21.395 21.177 20.827 20.579 20.308 20.167 19.886 19.574 19.217 19.038 18.748 18.431 18.207 17.983 17.5 17.222 16.902 16.538 16.156 15.654 14.899 12.086 -3 ,27944 ,KEBNE ,17024234,Wed Dec 22 09:46:49 CET,Wed Dec 22 11:17:45 CET,0.0 0.959 1.423 1.756 2.054 2.328 2.565 2.787 3.2 3.4 3.59 3.812 4.106 4.267 4.578 4.862 5.123 5.252 5.509 5.76 6.117 6.341 6.56 6.879 7.189 7.501 7.801 8.088 8.457 8.797 9.123 9.533 9.936 10.321 10.77 11.276 11.768 12.307 12.889 13.508 14.148 14.882 15.744 16.595 17.595 18.749 20.089 21.543 23.166 24.985 26.857 28.132 28.556 28.625 28.517 28.269 27.951 27.573 27.223 26.832 26.474 26.156 25.832 25.504 25.178 24.857 24.509 24.199 23.923 23.627 23.306 23.038 22.76 22.445 22.188 21.926 21.664 21.377 21.069 20.86 20.643 20.308 20.07 19.829 19.7 19.415 19.116 18.791 18.613 18.329 18.043 17.829 17.6 17.055 16.741 16.431 16.066 15.561 14.897 14.074 11.665 -4 ,11179 ,KEBNE ,17024235,Wed Dec 22 09:46:49 CET,Wed Dec 22 11:16:11 CET,0.0 1.238 1.756 2.14 2.444 2.716 2.97 3.203 3.608 3.793 3.972 4.181 4.477 4.639 4.925 5.207 5.486 5.618 5.874 6.124 6.49 6.722 6.942 7.269 7.589 7.896 8.189 8.468 8.831 9.185 9.521 9.929 10.314 10.691 11.151 11.672 12.171 12.717 13.334 13.997 14.659 15.404 16.284 17.172 18.201 19.302 20.533 21.904 23.458 25.153 27.061 28.375 28.852 28.929 28.772 28.493 28.187 27.862 27.54 27.181 26.807 26.462 26.143 25.812 25.482 25.184 24.851 24.53 24.249 23.968 23.662 23.384 23.093 22.794 22.552 22.287 22.014 21.756 21.489 21.28 21.056 20.717 20.467 20.185 20.049 19.781 19.474 19.12 18.929 18.639 18.323 18.096 17.867 17.383 17.09 16.745 16.351 15.909 15.334 14.558 12.564 -5 ,19901 ,KEBNE ,17024236,Wed Dec 22 09:47:50 CET,Wed Dec 22 11:18:40 CET,0.0 0.993 1.454 1.822 2.122 2.378 2.613 2.841 3.24 3.433 3.621 3.862 4.167 4.329 4.626 4.894 5.159 5.293 5.558 5.807 6.166 6.399 6.612 6.929 7.247 7.552 7.847 8.138 8.517 8.883 9.232 9.643 10.043 10.439 10.889 11.38 11.864 12.4 12.973 13.592 14.245 14.964 15.798 16.632 17.613 18.729 19.952 21.345 22.989 24.783 26.754 28.089 28.61 28.665 28.52 28.303 28.028 27.676 27.35 27.005 26.656 26.324 25.986 25.635 25.295 24.968 24.607 24.281 23.998 23.695 23.371 23.108 22.84 22.543 22.309 22.063 21.799 21.542 21.28 21.098 20.895 20.541 20.286 20.013 19.871 19.576 19.25 18.887 18.692 18.386 18.046 17.818 17.576 17.02 16.723 16.397 16.021 15.587 15.078 14.352 12.09 -6 ,29166 ,KEBNE ,17024237,Wed Dec 22 09:47:51 CET,Wed Dec 22 11:17:28 CET,0.0 1.124 1.639 2.048 2.39 2.687 2.936 3.156 3.572 3.769 3.96 4.17 4.444 4.599 4.918 5.216 5.487 5.622 5.885 6.125 6.481 6.718 6.947 7.275 7.582 7.877 8.173 8.467 8.84 9.199 9.545 9.974 10.379 10.768 11.231 11.756 12.256 12.794 13.368 13.969 14.603 15.338 16.188 17.045 18.065 19.203 20.506 21.936 23.557 25.358 27.402 28.712 29.043 29.094 28.978 28.714 28.398 28.029 27.69 27.32 26.962 26.61 26.255 25.922 25.582 25.263 24.932 24.621 24.332 24.026 23.703 23.422 23.124 22.819 22.583 22.324 22.053 21.789 21.511 21.297 21.069 20.735 20.501 20.24 20.099 19.811 19.49 19.145 18.967 18.668 18.331 18.102 17.872 17.356 17.047 16.685 16.307 15.879 15.34 14.617 12.327 -7 ,20992 ,KEBNE ,17024238,Wed Dec 22 09:47:51 CET,Wed Dec 22 11:16:51 CET,0.0 1.256 1.759 2.115 2.42 2.708 2.965 3.201 3.623 3.823 4.01 4.225 4.524 4.695 5.005 5.284 5.559 5.696 5.951 6.195 6.545 6.779 7.007 7.319 7.63 7.938 8.235 8.519 8.881 9.237 9.579 9.979 10.361 10.732 11.175 11.687 12.172 12.717 13.318 13.929 14.555 15.287 16.185 17.109 18.17 19.331 20.709 22.234 23.94 25.844 27.879 29.173 29.556 29.561 29.443 29.221 28.909 28.605 28.327 27.97 27.618 27.3 26.954 26.606 26.263 25.926 25.56 25.221 24.931 24.627 24.31 24.06 23.803 23.519 23.281 23.03 22.785 22.535 22.222 21.992 21.768 21.403 21.133 20.847 20.695 20.392 20.081 19.741 19.552 19.242 18.91 18.674 18.426 17.895 17.587 17.244 16.863 16.424 15.868 15.058 12.084 -8 ,17576 ,KEBNE ,17024239,Wed Dec 22 09:47:50 CET,Wed Dec 22 11:16:47 CET,0.0 1.016 1.502 1.877 2.154 2.401 2.643 2.864 3.287 3.496 3.686 3.915 4.214 4.372 4.681 4.974 5.244 5.376 5.636 5.877 6.229 6.459 6.687 7.023 7.348 7.659 7.967 8.259 8.625 8.975 9.309 9.714 10.117 10.513 10.971 11.494 11.991 12.527 13.1 13.7 14.343 15.087 15.924 16.743 17.72 18.794 20.002 21.392 23.054 24.904 26.917 28.275 28.732 28.736 28.494 28.156 27.803 27.432 27.05 26.574 26.146 25.751 25.339 24.942 24.568 24.227 23.861 23.523 23.23 22.911 22.578 22.292 21.956 21.616 21.349 21.062 20.783 20.483 20.146 19.917 19.674 19.269 18.99 18.71 18.564 18.262 17.936 17.584 17.394 17.104 16.804 16.577 16.32 15.723 15.405 15.061 14.689 14.248 13.715 13.003 10.49 -9 ,16273 ,KEBNE ,17024240,Wed Dec 22 09:47:50 CET,Wed Dec 22 11:17:21 CET,0.0 1.129 1.628 2.015 2.334 2.629 2.878 3.117 3.562 3.763 3.943 4.148 4.438 4.592 4.898 5.196 5.471 5.602 5.871 6.125 6.478 6.705 6.923 7.242 7.557 7.875 8.174 8.458 8.822 9.163 9.509 9.932 10.325 10.702 11.143 11.635 12.12 12.672 13.272 13.925 14.601 15.329 16.168 17.002 17.977 19.109 20.378 21.768 23.358 25.137 27.092 28.35 28.841 28.953 28.825 28.602 28.32 27.981 27.674 27.317 26.947 26.612 26.267 25.928 25.606 25.293 24.953 24.642 24.372 24.078 23.765 23.498 23.204 22.882 22.64 22.396 22.115 21.822 21.52 21.298 21.069 20.704 20.44 20.158 20.012 19.712 19.381 19.024 18.836 18.54 18.243 18.02 17.783 17.26 16.952 16.604 16.216 15.755 15.208 14.517 11.74 -10 ,23500 ,KEBNE ,17024241,Wed Dec 22 09:47:50 CET,Wed Dec 22 11:17:06 CET,0.0 1.054 1.512 1.898 2.207 2.489 2.748 2.982 3.403 3.582 3.747 3.938 4.227 4.384 4.69 4.978 5.259 5.397 5.655 5.892 6.246 6.484 6.711 7.039 7.353 7.666 7.969 8.263 8.652 9.019 9.36 9.765 10.158 10.533 10.958 11.438 11.909 12.438 13.018 13.648 14.314 15.025 15.852 16.756 17.807 18.944 20.227 21.66 23.35 25.221 27.174 28.371 28.848 28.997 28.923 28.695 28.408 28.079 27.756 27.419 27.07 26.695 26.333 25.999 25.662 25.346 25.0 24.692 24.424 24.123 23.795 23.508 23.214 22.908 22.656 22.387 22.12 21.831 21.517 21.312 21.1 20.758 20.504 20.216 20.076 19.793 19.478 19.157 18.991 18.696 18.359 18.137 17.909 17.389 17.069 16.73 16.354 15.89 15.348 14.584 12.291 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index fed0b538..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24532 ,TETRA ,17585874,Sat Nov 27 15:24:17 CET,Sat Nov 27 17:08:41 CET,0.0 1.025 1.51 1.876 2.16 2.426 2.683 2.911 3.3 3.494 3.681 3.895 4.18 4.335 4.628 4.904 5.173 5.302 5.547 5.789 6.147 6.371 6.594 6.921 7.24 7.546 7.823 8.094 8.457 8.813 9.151 9.562 9.952 10.329 10.792 11.311 11.79 12.327 12.941 13.582 14.228 14.968 15.835 16.692 17.687 18.827 20.145 21.569 23.164 24.964 26.872 27.928 28.209 28.171 27.925 27.564 27.191 26.815 26.428 25.987 25.597 25.226 24.862 24.493 24.121 23.78 23.425 23.11 22.821 22.498 22.172 21.905 21.615 21.301 21.05 20.8 20.537 20.249 19.956 19.747 19.532 19.2 18.949 18.678 18.54 18.249 17.933 17.606 17.439 17.154 16.863 16.653 16.433 15.939 15.635 15.315 14.982 14.575 14.12 13.518 11.621 -2 ,18054 ,TETRA ,17585875,Sat Nov 27 15:24:17 CET,Sat Nov 27 17:11:04 CET,0.0 0.854 1.313 1.636 1.91 2.167 2.411 2.635 3.047 3.239 3.417 3.633 3.93 4.09 4.401 4.703 4.974 5.11 5.382 5.63 5.967 6.188 6.412 6.732 7.036 7.322 7.609 7.898 8.265 8.62 8.968 9.377 9.763 10.132 10.556 11.029 11.51 12.052 12.624 13.242 13.889 14.624 15.495 16.352 17.355 18.517 19.836 21.274 22.924 24.772 26.781 27.932 28.154 28.071 27.868 27.536 27.151 26.775 26.416 26.032 25.655 25.282 24.902 24.516 24.158 23.839 23.506 23.204 22.933 22.642 22.328 22.07 21.805 21.508 21.278 21.041 20.765 20.473 20.185 19.985 19.759 19.395 19.146 18.881 18.747 18.474 18.199 17.917 17.753 17.461 17.153 16.929 16.692 16.198 15.916 15.612 15.286 14.89 14.378 13.683 11.531 -3 ,13295 ,TETRA ,17585876,Sat Nov 27 15:25:16 CET,Sat Nov 27 17:07:19 CET,0.0 0.917 1.317 1.66 1.955 2.215 2.453 2.676 3.101 3.302 3.484 3.704 3.998 4.146 4.432 4.703 4.955 5.088 5.355 5.599 5.939 6.161 6.378 6.69 7.004 7.313 7.598 7.876 8.25 8.609 8.954 9.362 9.745 10.131 10.579 11.07 11.563 12.122 12.726 13.357 14.021 14.776 15.649 16.519 17.521 18.672 20.027 21.476 23.052 24.792 26.662 27.775 28.047 27.975 27.76 27.436 27.057 26.643 26.234 25.803 25.409 25.044 24.685 24.321 23.972 23.647 23.303 22.973 22.678 22.378 22.067 21.803 21.516 21.215 20.987 20.754 20.507 20.242 19.959 19.758 19.548 19.212 18.97 18.712 18.583 18.308 18.013 17.706 17.533 17.247 16.963 16.757 16.527 16.005 15.703 15.387 15.038 14.61 14.101 13.417 11.178 -4 ,3299 ,TETRA ,17585877,Sat Nov 27 15:26:17 CET,Sat Nov 27 16:54:36 CET,0.0 1.102 1.566 1.908 2.207 2.474 2.705 2.929 3.344 3.524 3.692 3.892 4.178 4.338 4.637 4.905 5.168 5.3 5.555 5.8 6.15 6.368 6.578 6.89 7.2 7.504 7.798 8.079 8.432 8.773 9.106 9.499 9.885 10.271 10.719 11.215 11.693 12.223 12.781 13.394 14.061 14.799 15.676 16.559 17.574 18.682 19.945 21.384 23.049 24.808 26.608 27.7 28.047 28.019 27.771 27.44 27.053 26.652 26.257 25.821 25.428 25.063 24.702 24.342 23.999 23.671 23.304 22.967 22.66 22.337 22.014 21.736 21.45 21.146 20.901 20.653 20.385 20.098 19.792 19.585 19.37 19.015 18.766 18.506 18.371 18.093 17.777 17.431 17.256 16.97 16.678 16.46 16.24 15.763 15.487 15.169 14.793 14.371 13.878 13.158 10.316 -5 ,29202 ,TETRA ,17585878,Sat Nov 27 15:26:17 CET,Sat Nov 27 16:54:37 CET,0.0 0.893 1.352 1.728 2.015 2.255 2.46 2.666 3.072 3.272 3.463 3.677 3.961 4.111 4.403 4.69 4.961 5.092 5.348 5.588 5.927 6.152 6.365 6.667 6.964 7.257 7.548 7.825 8.174 8.511 8.845 9.264 9.683 10.073 10.526 11.053 11.549 12.083 12.671 13.301 13.94 14.667 15.562 16.479 17.506 18.621 19.904 21.304 22.866 24.637 26.499 27.56 27.876 27.882 27.655 27.271 26.87 26.477 26.112 25.694 25.311 24.966 24.594 24.227 23.903 23.596 23.234 22.896 22.605 22.306 21.986 21.704 21.415 21.119 20.887 20.644 20.39 20.13 19.843 19.632 19.413 19.08 18.843 18.585 18.456 18.191 17.881 17.519 17.336 17.058 16.799 16.604 16.39 15.884 15.589 15.26 14.884 14.46 13.936 13.276 11.292 -6 ,11282 ,TETRA ,17585879,Sat Nov 27 15:27:17 CET,Sat Nov 27 17:02:12 CET,0.0 1.079 1.501 1.826 2.111 2.353 2.595 2.831 3.231 3.415 3.595 3.79 4.078 4.234 4.525 4.822 5.106 5.238 5.494 5.738 6.087 6.308 6.519 6.836 7.148 7.448 7.735 8.019 8.4 8.769 9.121 9.527 9.907 10.291 10.74 11.228 11.707 12.242 12.806 13.398 14.036 14.767 15.638 16.497 17.525 18.703 20.059 21.529 23.073 24.74 26.569 27.712 28.123 28.169 27.982 27.674 27.319 26.94 26.579 26.182 25.799 25.424 25.063 24.707 24.351 24.026 23.683 23.358 23.071 22.774 22.451 22.189 21.922 21.633 21.408 21.156 20.89 20.623 20.329 20.12 19.895 19.54 19.298 19.047 18.915 18.621 18.317 17.987 17.81 17.524 17.241 17.042 16.836 16.365 16.079 15.756 15.435 15.078 14.571 13.916 11.466 -7 ,10951 ,TETRA ,17585880,Sat Nov 27 15:27:18 CET,Sat Nov 27 17:14:28 CET,0.0 1.045 1.477 1.867 2.177 2.431 2.662 2.882 3.294 3.495 3.678 3.873 4.166 4.329 4.637 4.919 5.19 5.321 5.578 5.82 6.172 6.399 6.62 6.94 7.246 7.541 7.829 8.111 8.483 8.846 9.185 9.587 9.988 10.38 10.832 11.337 11.823 12.38 12.974 13.603 14.268 15.009 15.894 16.778 17.793 18.937 20.24 21.652 23.219 25.029 26.963 27.993 28.307 28.258 28.009 27.69 27.325 26.912 26.527 26.129 25.755 25.394 25.042 24.71 24.395 24.089 23.743 23.403 23.095 22.78 22.458 22.187 21.894 21.58 21.331 21.06 20.775 20.489 20.185 19.975 19.755 19.397 19.152 18.893 18.76 18.487 18.187 17.866 17.702 17.429 17.151 16.942 16.722 16.232 15.941 15.601 15.236 14.81 14.244 13.431 10.867 -8 ,25133 ,TETRA ,17585881,Sat Nov 27 15:27:20 CET,Sat Nov 27 17:13:10 CET,0.0 1.007 1.474 1.795 2.084 2.355 2.596 2.82 3.25 3.449 3.627 3.837 4.128 4.279 4.582 4.872 5.148 5.277 5.511 5.748 6.106 6.335 6.551 6.861 7.169 7.475 7.777 8.065 8.428 8.766 9.089 9.492 9.89 10.273 10.728 11.243 11.725 12.265 12.856 13.495 14.163 14.915 15.79 16.659 17.657 18.747 20.028 21.481 23.144 25.008 26.998 28.345 28.785 28.788 28.589 28.265 27.914 27.514 27.111 26.706 26.326 25.973 25.642 25.303 24.969 24.66 24.325 24.0 23.714 23.42 23.109 22.841 22.551 22.231 21.984 21.739 21.475 21.191 20.893 20.696 20.499 20.173 19.927 19.664 19.53 19.253 18.969 18.648 18.463 18.17 17.883 17.654 17.412 16.933 16.663 16.372 16.045 15.642 15.15 14.466 12.577 -9 ,21575 ,TETRA ,17585882,Sat Nov 27 15:27:17 CET,Sat Nov 27 17:01:56 CET,0.0 0.843 1.271 1.617 1.902 2.136 2.366 2.591 3.003 3.188 3.364 3.577 3.863 4.014 4.307 4.582 4.853 4.984 5.24 5.482 5.822 6.044 6.26 6.579 6.882 7.173 7.455 7.717 8.061 8.406 8.735 9.131 9.517 9.893 10.322 10.799 11.281 11.84 12.435 13.051 13.702 14.448 15.337 16.228 17.27 18.435 19.72 21.081 22.61 24.352 26.264 27.358 27.631 27.548 27.286 26.975 26.601 26.208 25.842 25.423 25.044 24.68 24.32 23.967 23.638 23.332 22.989 22.666 22.384 22.088 21.782 21.526 21.255 20.963 20.715 20.457 20.197 19.92 19.641 19.445 19.234 18.891 18.648 18.406 18.273 17.977 17.668 17.348 17.18 16.898 16.611 16.417 16.214 15.747 15.476 15.168 14.816 14.384 13.862 13.111 10.458 -10 ,4078 ,TETRA ,17585883,Sat Nov 27 15:27:17 CET,Sat Nov 27 17:11:47 CET,0.0 0.839 1.286 1.631 1.935 2.195 2.453 2.692 3.104 3.307 3.497 3.715 4.006 4.172 4.483 4.767 5.049 5.183 5.435 5.672 6.017 6.241 6.462 6.777 7.068 7.356 7.642 7.926 8.304 8.665 9.008 9.431 9.837 10.217 10.653 11.152 11.647 12.195 12.784 13.411 14.076 14.828 15.695 16.554 17.546 18.653 19.932 21.34 22.922 24.727 26.662 27.693 27.993 28.024 27.778 27.374 26.996 26.608 26.223 25.82 25.443 25.095 24.737 24.375 24.028 23.705 23.379 23.094 22.825 22.516 22.194 21.928 21.641 21.348 21.114 20.863 20.612 20.344 20.058 19.85 19.633 19.318 19.081 18.823 18.695 18.425 18.139 17.832 17.662 17.385 17.128 16.93 16.72 16.262 15.988 15.651 15.259 14.847 14.367 13.745 11.808 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index b32888fc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4864 ,TETRA ,17585884,Sat Nov 27 15:28:17 CET,Sat Nov 27 17:14:10 CET,0.0 1.144 1.656 2.037 2.355 2.63 2.881 3.115 3.541 3.737 3.914 4.124 4.419 4.577 4.877 5.157 5.421 5.556 5.804 6.037 6.39 6.614 6.83 7.152 7.472 7.793 8.106 8.407 8.794 9.172 9.529 9.957 10.383 10.789 11.262 11.778 12.245 12.766 13.354 14.001 14.662 15.39 16.252 17.116 18.142 19.284 20.588 22.091 23.833 25.815 27.848 29.082 29.629 29.783 29.708 29.469 29.138 28.774 28.426 28.052 27.698 27.357 27.02 26.685 26.362 26.047 25.714 25.408 25.13 24.842 24.534 24.256 23.955 23.66 23.435 23.191 22.918 22.635 22.337 22.115 21.895 21.552 21.305 21.049 20.909 20.623 20.338 19.99 19.796 19.519 19.225 19.01 18.779 18.275 18.015 17.698 17.311 16.865 16.369 15.72 13.532 -2 ,13565 ,TETRA ,17585885,Sat Nov 27 15:29:17 CET,Sat Nov 27 17:13:29 CET,0.0 1.156 1.659 2.034 2.355 2.641 2.904 3.132 3.545 3.752 3.936 4.157 4.459 4.624 4.937 5.231 5.518 5.657 5.925 6.193 6.571 6.811 7.036 7.355 7.664 7.956 8.24 8.519 8.876 9.217 9.552 9.962 10.342 10.714 11.167 11.676 12.179 12.728 13.324 13.96 14.621 15.347 16.2 17.081 18.075 19.191 20.524 22.011 23.635 25.447 27.435 28.857 29.476 29.671 29.666 29.521 29.281 29.029 28.775 28.477 28.194 27.904 27.607 27.316 27.024 26.744 26.446 26.161 25.908 25.642 25.359 25.117 24.845 24.554 24.325 24.083 23.831 23.564 23.295 23.102 22.895 22.572 22.336 22.082 21.952 21.668 21.363 21.043 20.874 20.596 20.305 20.095 19.87 19.365 19.073 18.759 18.404 17.986 17.498 16.807 14.747 -3 ,30493 ,TETRA ,17585886,Sat Nov 27 15:29:17 CET,Sat Nov 27 17:11:37 CET,0.0 1.057 1.524 1.891 2.204 2.501 2.759 2.997 3.422 3.622 3.826 4.079 4.377 4.541 4.863 5.147 5.419 5.552 5.811 6.061 6.414 6.64 6.861 7.184 7.498 7.809 8.103 8.383 8.735 9.082 9.429 9.858 10.281 10.673 11.099 11.597 12.08 12.607 13.198 13.822 14.468 15.214 16.089 16.935 17.923 19.044 20.409 21.976 23.686 25.556 27.606 29.089 29.783 30.038 30.025 29.88 29.667 29.412 29.146 28.827 28.535 28.235 27.892 27.581 27.304 27.03 26.712 26.426 26.181 25.913 25.612 25.352 25.084 24.799 24.577 24.345 24.093 23.834 23.559 23.357 23.144 22.798 22.56 22.311 22.18 21.906 21.611 21.293 21.123 20.834 20.513 20.307 20.082 19.572 19.307 18.995 18.631 18.232 17.737 16.958 14.565 -4 ,20313 ,TETRA ,17585887,Sat Nov 27 15:30:16 CET,Sat Nov 27 17:15:17 CET,0.0 1.106 1.612 1.999 2.323 2.613 2.875 3.116 3.528 3.71 3.887 4.102 4.39 4.547 4.848 5.122 5.382 5.511 5.765 6.003 6.334 6.557 6.789 7.123 7.436 7.747 8.043 8.321 8.682 9.029 9.363 9.78 10.195 10.6 11.087 11.609 12.075 12.597 13.187 13.851 14.52 15.237 16.091 16.963 18.01 19.151 20.478 22.02 23.735 25.646 27.819 29.319 29.955 30.16 30.187 30.069 29.855 29.619 29.356 29.03 28.727 28.43 28.133 27.844 27.557 27.277 26.945 26.649 26.401 26.129 25.828 25.574 25.319 25.053 24.838 24.606 24.352 24.069 23.772 23.578 23.379 23.06 22.828 22.575 22.447 22.18 21.91 21.631 21.474 21.216 20.948 20.735 20.502 19.967 19.671 19.344 18.981 18.581 18.09 17.413 15.392 -5 ,2304 ,TETRA ,17585888,Sat Nov 27 15:30:16 CET,Sat Nov 27 17:16:16 CET,0.0 1.134 1.565 1.913 2.221 2.49 2.739 2.967 3.411 3.623 3.816 4.035 4.332 4.51 4.837 5.132 5.425 5.568 5.836 6.086 6.441 6.668 6.893 7.212 7.534 7.858 8.159 8.438 8.804 9.176 9.533 9.956 10.368 10.772 11.244 11.786 12.307 12.851 13.441 14.06 14.706 15.445 16.282 17.14 18.138 19.234 20.497 21.907 23.517 25.367 27.479 28.953 29.619 29.848 29.795 29.607 29.368 29.076 28.748 28.417 28.126 27.836 27.543 27.241 26.938 26.662 26.354 26.042 25.776 25.514 25.213 24.951 24.683 24.401 24.184 23.96 23.723 23.468 23.19 22.992 22.785 22.453 22.222 21.977 21.856 21.612 21.34 21.017 20.852 20.592 20.326 20.127 19.907 19.385 19.093 18.766 18.396 17.992 17.482 16.795 14.336 -6 ,12991 ,TETRA ,17585889,Sat Nov 27 15:30:16 CET,Sat Nov 27 16:59:49 CET,0.0 1.068 1.53 1.888 2.192 2.456 2.7 2.914 3.293 3.481 3.665 3.879 4.163 4.324 4.649 4.96 5.258 5.405 5.687 5.958 6.345 6.59 6.828 7.171 7.5 7.82 8.139 8.441 8.814 9.158 9.482 9.888 10.292 10.689 11.166 11.702 12.223 12.8 13.406 14.061 14.733 15.459 16.292 17.146 18.185 19.351 20.647 22.077 23.761 25.664 27.818 29.38 30.025 30.241 30.259 30.113 29.877 29.609 29.351 29.054 28.734 28.405 28.068 27.745 27.429 27.148 26.859 26.561 26.276 25.977 25.653 25.369 25.065 24.761 24.542 24.298 24.018 23.716 23.404 23.201 22.994 22.653 22.406 22.153 22.022 21.729 21.409 21.082 20.91 20.63 20.34 20.128 19.908 19.36 19.031 18.7 18.353 17.925 17.362 16.585 14.148 -7 ,24915 ,TETRA ,17585890,Sat Nov 27 15:31:17 CET,Sat Nov 27 17:15:26 CET,0.0 1.106 1.569 1.927 2.249 2.557 2.811 3.047 3.479 3.681 3.878 4.101 4.389 4.551 4.856 5.135 5.392 5.515 5.771 6.027 6.378 6.602 6.818 7.126 7.427 7.719 8.006 8.295 8.663 9.009 9.347 9.763 10.174 10.569 11.022 11.547 12.051 12.586 13.143 13.748 14.389 15.098 15.945 16.793 17.798 18.927 20.232 21.709 23.396 25.311 27.392 28.831 29.453 29.679 29.649 29.479 29.253 28.98 28.689 28.365 28.078 27.792 27.482 27.168 26.857 26.573 26.274 25.986 25.729 25.454 25.15 24.889 24.626 24.346 24.117 23.88 23.606 23.307 23.017 22.822 22.626 22.319 22.096 21.862 21.729 21.434 21.149 20.843 20.669 20.391 20.085 19.879 19.661 19.161 18.88 18.571 18.24 17.838 17.336 16.674 14.659 -8 ,28500 ,TETRA ,17585891,Sat Nov 27 15:32:16 CET,Sat Nov 27 17:18:20 CET,0.0 1.126 1.608 1.981 2.29 2.563 2.808 3.047 3.46 3.655 3.851 4.085 4.391 4.555 4.866 5.159 5.432 5.564 5.819 6.077 6.464 6.701 6.914 7.221 7.527 7.821 8.102 8.372 8.707 9.057 9.418 9.842 10.243 10.626 11.065 11.56 12.037 12.574 13.161 13.78 14.44 15.176 16.057 16.947 17.965 19.11 20.388 21.809 23.466 25.376 27.445 28.833 29.424 29.588 29.479 29.178 28.847 28.492 28.133 27.744 27.385 27.044 26.713 26.382 26.033 25.714 25.361 25.025 24.736 24.423 24.081 23.793 23.514 23.221 22.987 22.744 22.492 22.223 21.924 21.72 21.51 21.173 20.931 20.67 20.534 20.249 19.943 19.637 19.472 19.196 18.916 18.698 18.481 18.022 17.761 17.459 17.099 16.679 16.127 15.411 13.501 -9 ,20834 ,TETRA ,17585892,Sat Nov 27 15:32:16 CET,Sat Nov 27 17:17:36 CET,0.0 1.242 1.795 2.218 2.551 2.829 3.075 3.311 3.757 3.946 4.118 4.335 4.64 4.811 5.124 5.42 5.714 5.854 6.125 6.379 6.727 6.945 7.157 7.479 7.807 8.122 8.41 8.682 9.056 9.42 9.752 10.162 10.557 10.935 11.374 11.888 12.406 12.958 13.556 14.187 14.825 15.54 16.409 17.305 18.329 19.488 20.782 22.183 23.812 25.64 27.76 29.362 30.009 30.148 30.089 29.952 29.727 29.437 29.151 28.836 28.54 28.241 27.919 27.627 27.331 27.028 26.72 26.437 26.172 25.9 25.627 25.392 25.124 24.85 24.647 24.418 24.16 23.875 23.578 23.385 23.171 22.817 22.581 22.326 22.188 21.917 21.645 21.343 21.169 20.889 20.59 20.374 20.152 19.644 19.359 19.059 18.728 18.316 17.838 17.105 14.799 -10 ,23122 ,TETRA ,17585893,Sat Nov 27 15:33:20 CET,Sat Nov 27 17:18:08 CET,0.0 1.206 1.738 2.121 2.436 2.704 2.968 3.214 3.65 3.859 4.062 4.311 4.607 4.764 5.066 5.35 5.615 5.745 6.014 6.268 6.635 6.881 7.107 7.423 7.733 8.038 8.342 8.639 9.011 9.356 9.693 10.108 10.517 10.91 11.35 11.846 12.331 12.875 13.452 14.05 14.687 15.423 16.291 17.157 18.125 19.238 20.547 21.988 23.663 25.598 27.702 29.067 29.729 29.965 29.898 29.756 29.548 29.275 29.0 28.688 28.381 28.085 27.789 27.491 27.179 26.865 26.55 26.265 26.008 25.726 25.423 25.167 24.898 24.616 24.396 24.172 23.944 23.695 23.424 23.231 23.012 22.673 22.444 22.193 22.059 21.771 21.46 21.138 20.971 20.697 20.402 20.186 19.948 19.423 19.138 18.84 18.485 18.04 17.54 16.842 14.758 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index 0385f50a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24549 ,TETRA ,17585894,Sat Nov 27 15:33:22 CET,Sat Nov 27 17:17:51 CET,0.0 1.779 2.413 2.834 3.198 3.541 3.839 4.104 4.565 4.783 4.991 5.232 5.54 5.71 6.027 6.333 6.623 6.767 7.052 7.318 7.693 7.928 8.153 8.486 8.802 9.098 9.388 9.675 10.041 10.391 10.722 11.115 11.494 11.868 12.298 12.736 13.138 13.596 14.106 14.641 15.183 15.796 16.501 17.199 17.963 18.757 19.615 20.5 21.395 22.162 22.628 22.299 21.58 20.721 19.839 18.996 18.204 17.437 16.736 16.013 15.368 14.781 14.229 13.688 13.155 12.682 12.217 11.798 11.417 11.027 10.619 10.253 9.872 9.481 9.185 8.882 8.555 8.206 7.851 7.612 7.371 6.979 6.689 6.383 6.223 5.867 5.491 5.113 4.922 4.574 4.216 3.974 3.718 3.141 2.819 2.469 2.037 1.539 0.975 0.137 -3.187 -2 ,6859 ,TETRA ,17585895,Sat Nov 27 15:33:25 CET,Sat Nov 27 17:18:00 CET,0.0 1.697 2.321 2.741 3.113 3.449 3.746 4.003 4.447 4.654 4.859 5.13 5.453 5.623 5.936 6.229 6.528 6.672 6.941 7.199 7.571 7.805 8.032 8.36 8.666 8.968 9.255 9.526 9.88 10.22 10.536 10.911 11.263 11.607 12.022 12.487 12.935 13.426 13.944 14.491 15.018 15.598 16.318 16.998 17.759 18.601 19.529 20.444 21.305 22.084 22.481 22.121 21.347 20.404 19.447 18.566 17.788 17.095 16.484 15.84 15.264 14.743 14.245 13.739 13.269 12.846 12.373 11.941 11.569 11.188 10.814 10.499 10.16 9.798 9.499 9.185 8.874 8.555 8.211 7.969 7.723 7.332 7.049 6.758 6.615 6.304 5.957 5.62 5.428 5.088 4.79 4.562 4.303 3.722 3.384 3.029 2.624 2.132 1.526 0.638 -2.515 -3 ,28246 ,TETRA ,17585897,Sat Nov 27 15:33:26 CET,Sat Nov 27 17:17:52 CET,0.0 1.728 2.377 2.845 3.205 3.507 3.794 4.054 4.499 4.705 4.912 5.176 5.49 5.667 6.013 6.331 6.623 6.764 7.037 7.299 7.671 7.899 8.122 8.445 8.741 9.024 9.297 9.573 9.928 10.269 10.609 11.017 11.398 11.758 12.168 12.633 13.096 13.593 14.123 14.648 15.182 15.803 16.491 17.178 17.975 18.796 19.667 20.555 21.521 22.484 23.024 22.596 21.833 20.968 20.139 19.342 18.546 17.783 17.133 16.435 15.786 15.213 14.67 14.142 13.624 13.134 12.632 12.186 11.802 11.411 11.012 10.693 10.347 9.966 9.677 9.378 9.056 8.706 8.347 8.113 7.887 7.5 7.218 6.912 6.737 6.4 6.064 5.695 5.49 5.138 4.778 4.517 4.236 3.61 3.288 2.957 2.596 2.136 1.549 0.732 -3.379 -4 ,12612 ,TETRA ,17585898,Sat Nov 27 15:33:20 CET,Sat Nov 27 17:17:38 CET,0.0 1.703 2.275 2.705 3.082 3.423 3.738 4.016 4.497 4.703 4.896 5.114 5.415 5.591 5.919 6.22 6.502 6.638 6.903 7.149 7.501 7.728 7.945 8.266 8.579 8.874 9.151 9.421 9.778 10.112 10.431 10.813 11.166 11.507 11.909 12.345 12.768 13.234 13.725 14.246 14.785 15.37 16.052 16.749 17.523 18.323 19.172 20.048 20.907 21.76 22.344 22.015 21.305 20.462 19.611 18.811 18.102 17.376 16.674 15.973 15.342 14.762 14.208 13.659 13.152 12.686 12.187 11.738 11.34 10.913 10.488 10.148 9.779 9.386 9.082 8.768 8.433 8.083 7.714 7.457 7.187 6.77 6.479 6.166 5.998 5.659 5.305 4.908 4.701 4.359 4.03 3.785 3.511 2.883 2.526 2.183 1.813 1.348 0.759 -0.034 -3.698 -5 ,20487 ,TETRA ,17585899,Sat Nov 27 15:33:21 CET,Sat Nov 27 17:17:55 CET,0.0 1.657 2.243 2.694 3.114 3.462 3.754 4.023 4.509 4.745 4.965 5.24 5.557 5.728 6.046 6.352 6.655 6.802 7.069 7.313 7.679 7.913 8.141 8.476 8.79 9.102 9.402 9.68 10.02 10.344 10.667 11.037 11.376 11.716 12.098 12.523 12.931 13.358 13.837 14.353 14.865 15.412 16.043 16.691 17.415 18.168 18.973 19.752 20.568 21.406 21.931 21.655 21.047 20.395 19.64 18.853 18.141 17.452 16.843 16.222 15.654 15.128 14.611 14.1 13.604 13.163 12.742 12.353 12.009 11.647 11.247 10.91 10.567 10.219 9.941 9.643 9.335 9.004 8.64 8.384 8.129 7.738 7.451 7.149 6.999 6.665 6.293 5.907 5.692 5.346 5.045 4.795 4.522 3.964 3.667 3.312 2.901 2.405 1.747 0.808 -2.007 -6 ,26901 ,TETRA ,17585900,Sat Nov 27 15:33:22 CET,Sat Nov 27 17:18:39 CET,0.0 1.48 2.058 2.516 2.912 3.244 3.527 3.796 4.292 4.509 4.702 4.927 5.231 5.394 5.717 6.035 6.332 6.476 6.754 7.019 7.411 7.668 7.91 8.235 8.548 8.858 9.148 9.418 9.759 10.088 10.405 10.778 11.127 11.466 11.851 12.292 12.72 13.195 13.714 14.237 14.765 15.349 16.043 16.745 17.552 18.416 19.296 20.174 21.133 22.008 22.439 22.06 21.28 20.43 19.654 18.903 18.175 17.498 16.885 16.237 15.674 15.145 14.638 14.15 13.668 13.242 12.797 12.372 12.003 11.619 11.207 10.862 10.524 10.168 9.87 9.558 9.23 8.903 8.563 8.323 8.085 7.712 7.44 7.134 6.969 6.632 6.292 5.932 5.732 5.392 5.094 4.848 4.559 3.895 3.519 3.135 2.716 2.186 1.602 0.749 -2.508 -7 ,7868 ,TETRA ,17585901,Sat Nov 27 15:33:25 CET,Sat Nov 27 17:17:54 CET,0.0 1.768 2.404 2.888 3.253 3.561 3.853 4.11 4.554 4.745 4.936 5.185 5.497 5.667 5.965 6.244 6.527 6.666 6.924 7.163 7.502 7.721 7.934 8.231 8.506 8.788 9.065 9.318 9.649 9.978 10.3 10.674 11.034 11.368 11.734 12.156 12.568 13.036 13.544 14.082 14.642 15.236 15.92 16.608 17.373 18.168 19.006 19.872 20.742 21.514 21.894 21.611 20.994 20.185 19.31 18.455 17.616 16.85 16.213 15.533 14.923 14.408 13.898 13.38 12.916 12.493 12.039 11.645 11.287 10.894 10.469 10.098 9.725 9.343 9.035 8.71 8.382 8.045 7.692 7.449 7.193 6.793 6.511 6.212 6.053 5.717 5.344 4.929 4.722 4.39 4.062 3.811 3.535 2.927 2.599 2.251 1.852 1.38 0.797 -0.048 -3.169 -8 ,20865 ,TETRA ,17585902,Sat Nov 27 15:33:21 CET,Sat Nov 27 17:19:05 CET,0.0 1.331 1.867 2.318 2.705 3.046 3.338 3.6 4.084 4.304 4.511 4.783 5.088 5.255 5.58 5.862 6.124 6.248 6.49 6.731 7.093 7.326 7.542 7.869 8.187 8.479 8.752 9.005 9.325 9.639 9.95 10.33 10.686 11.017 11.399 11.827 12.222 12.658 13.147 13.652 14.188 14.803 15.473 16.103 16.788 17.494 18.295 19.171 20.074 20.868 21.344 21.018 20.342 19.654 18.953 18.195 17.437 16.77 16.153 15.482 14.931 14.431 13.932 13.458 12.998 12.544 12.059 11.623 11.231 10.826 10.437 10.112 9.75 9.344 9.026 8.707 8.368 8.024 7.663 7.413 7.164 6.765 6.48 6.171 6.008 5.68 5.331 4.939 4.734 4.402 4.069 3.805 3.535 2.94 2.586 2.216 1.816 1.375 0.857 0.186 -2.915 -9 ,20421 ,TETRA ,17585903,Sat Nov 27 15:33:23 CET,Sat Nov 27 17:19:26 CET,0.0 2.026 2.608 3.024 3.405 3.755 4.048 4.33 4.842 5.066 5.272 5.516 5.82 5.992 6.306 6.612 6.922 7.067 7.332 7.582 7.957 8.185 8.398 8.723 9.046 9.35 9.638 9.914 10.279 10.632 10.959 11.336 11.69 12.041 12.444 12.887 13.308 13.769 14.269 14.789 15.297 15.851 16.529 17.227 18.014 18.868 19.782 20.671 21.624 22.498 22.999 22.803 22.176 21.36 20.491 19.594 18.78 18.008 17.331 16.629 15.976 15.39 14.853 14.354 13.876 13.407 12.918 12.509 12.14 11.744 11.356 11.02 10.637 10.229 9.916 9.598 9.258 8.898 8.51 8.239 7.954 7.507 7.222 6.922 6.755 6.414 6.033 5.622 5.419 5.082 4.752 4.49 4.22 3.637 3.31 2.928 2.476 2.01 1.445 0.615 -2.274 -10 ,24714 ,TETRA ,17585904,Sat Nov 27 15:33:26 CET,Sat Nov 27 17:18:45 CET,0.0 1.582 2.189 2.648 3.03 3.355 3.646 3.904 4.345 4.547 4.746 5.002 5.307 5.474 5.804 6.126 6.424 6.563 6.827 7.071 7.427 7.66 7.889 8.216 8.517 8.802 9.088 9.369 9.724 10.054 10.37 10.773 11.171 11.544 11.944 12.379 12.797 13.248 13.731 14.254 14.816 15.454 16.17 16.83 17.559 18.379 19.342 20.252 21.114 21.909 22.307 21.957 21.279 20.46 19.6 18.755 18.019 17.343 16.72 16.045 15.434 14.877 14.339 13.817 13.306 12.821 12.298 11.859 11.515 11.135 10.689 10.318 9.957 9.576 9.275 8.956 8.608 8.237 7.862 7.616 7.355 6.927 6.625 6.321 6.157 5.806 5.437 5.065 4.881 4.548 4.226 3.988 3.723 3.141 2.836 2.465 2.043 1.609 1.072 0.324 -2.211 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index c64a1ceb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25468 ,KEBNE ,17024242,Wed Dec 22 09:47:51 CET,Wed Dec 22 11:18:41 CET,0.0 1.265 1.769 2.152 2.472 2.739 2.98 3.21 3.589 3.751 3.905 4.086 4.369 4.51 4.781 5.035 5.268 5.374 5.577 5.774 6.079 6.274 6.446 6.688 6.926 7.152 7.366 7.577 7.86 8.138 8.386 8.665 8.943 9.204 9.501 9.836 10.144 10.476 10.818 11.189 11.575 11.988 12.455 12.872 13.324 13.811 14.333 14.841 15.286 15.626 15.704 15.256 14.605 13.906 13.21 12.545 11.903 11.301 10.763 10.216 9.74 9.3 8.869 8.451 8.044 7.675 7.298 6.947 6.626 6.289 5.936 5.631 5.319 4.999 4.733 4.463 4.191 3.897 3.599 3.397 3.187 2.841 2.575 2.313 2.185 1.9 1.592 1.263 1.076 0.742 0.487 0.289 0.079 -0.41 -0.715 -1.054 -1.423 -1.873 -2.415 -3.16 -5.607 -2 ,9805 ,KEBNE ,17024243,Wed Dec 22 09:47:50 CET,Wed Dec 22 11:17:28 CET,0.0 1.431 1.982 2.371 2.68 2.93 3.17 3.396 3.81 3.999 4.162 4.321 4.594 4.74 5.012 5.254 5.495 5.611 5.838 6.056 6.351 6.54 6.718 6.971 7.227 7.469 7.693 7.905 8.193 8.456 8.695 8.988 9.264 9.535 9.843 10.185 10.511 10.854 11.198 11.542 11.889 12.263 12.695 13.134 13.622 14.129 14.658 15.167 15.655 16.053 16.154 15.677 15.002 14.269 13.568 12.892 12.248 11.649 11.109 10.54 10.052 9.601 9.154 8.719 8.301 7.915 7.444 7.002 6.621 6.252 5.899 5.583 5.261 4.902 4.63 4.36 4.047 3.692 3.341 3.122 2.9 2.541 2.265 1.964 1.813 1.483 1.121 0.74 0.541 0.208 -0.093 -0.344 -0.609 -1.15 -1.444 -1.782 -2.166 -2.606 -3.16 -3.895 -5.817 -3 ,32632 ,KEBNE ,17024244,Wed Dec 22 09:47:51 CET,Wed Dec 22 11:18:49 CET,0.0 1.376 1.85 2.214 2.53 2.808 3.06 3.284 3.663 3.83 3.987 4.158 4.436 4.577 4.844 5.094 5.318 5.425 5.629 5.823 6.091 6.262 6.436 6.692 6.94 7.165 7.376 7.577 7.836 8.091 8.327 8.607 8.89 9.155 9.453 9.801 10.142 10.498 10.851 11.216 11.602 11.998 12.418 12.837 13.321 13.857 14.402 14.898 15.371 15.681 15.699 15.203 14.495 13.753 13.043 12.366 11.729 11.132 10.594 10.039 9.546 9.068 8.613 8.203 7.789 7.382 6.972 6.617 6.307 5.985 5.637 5.326 5.002 4.668 4.403 4.128 3.829 3.517 3.216 2.996 2.761 2.402 2.137 1.862 1.72 1.412 1.081 0.719 0.53 0.221 -0.006 -0.215 -0.443 -0.917 -1.175 -1.454 -1.787 -2.207 -2.704 -3.276 -5.057 -4 ,18439 ,KEBNE ,17024245,Wed Dec 22 09:47:51 CET,Wed Dec 22 11:17:01 CET,0.0 1.385 1.858 2.193 2.506 2.783 3.019 3.237 3.634 3.816 3.982 4.163 4.44 4.571 4.83 5.085 5.325 5.441 5.659 5.858 6.137 6.322 6.502 6.747 6.987 7.211 7.425 7.634 7.904 8.168 8.407 8.681 8.939 9.196 9.485 9.792 10.096 10.422 10.763 11.107 11.464 11.879 12.353 12.77 13.224 13.705 14.212 14.755 15.26 15.671 15.757 15.261 14.592 13.86 13.126 12.437 11.82 11.23 10.677 10.109 9.608 9.141 8.669 8.222 7.8 7.411 7.023 6.679 6.372 6.028 5.678 5.401 5.102 4.757 4.486 4.225 3.962 3.688 3.386 3.177 2.966 2.614 2.338 2.058 1.919 1.619 1.315 0.991 0.817 0.492 0.207 0.0 -0.221 -0.723 -1.011 -1.325 -1.657 -2.038 -2.502 -3.163 -5.142 -5 ,14098 ,KEBNE ,17024246,Wed Dec 22 09:47:50 CET,Wed Dec 22 11:18:27 CET,0.0 1.385 1.899 2.259 2.554 2.817 3.056 3.275 3.654 3.826 4.0 4.197 4.479 4.621 4.878 5.117 5.342 5.455 5.679 5.885 6.174 6.36 6.538 6.797 7.047 7.277 7.502 7.719 7.977 8.213 8.458 8.756 9.012 9.254 9.539 9.878 10.211 10.563 10.911 11.26 11.613 11.989 12.438 12.875 13.352 13.851 14.345 14.823 15.317 15.693 15.721 15.249 14.628 13.947 13.232 12.538 11.912 11.337 10.832 10.278 9.778 9.347 8.915 8.479 8.043 7.641 7.232 6.87 6.544 6.15 5.744 5.434 5.134 4.822 4.564 4.286 4.0 3.709 3.391 3.168 2.939 2.59 2.347 2.083 1.949 1.68 1.381 1.056 0.887 0.559 0.275 0.077 -0.138 -0.635 -0.917 -1.244 -1.618 -2.049 -2.564 -3.334 -7.145 -6 ,9552 ,KEBNE ,17024247,Wed Dec 22 09:47:51 CET,Wed Dec 22 11:17:09 CET,0.0 1.224 1.736 2.128 2.443 2.704 2.935 3.174 3.581 3.746 3.91 4.105 4.389 4.526 4.781 5.021 5.238 5.343 5.553 5.759 6.046 6.229 6.413 6.676 6.917 7.14 7.349 7.563 7.842 8.099 8.343 8.645 8.931 9.193 9.486 9.793 10.091 10.416 10.753 11.109 11.479 11.882 12.327 12.755 13.231 13.72 14.211 14.676 15.132 15.468 15.446 14.92 14.242 13.553 12.849 12.134 11.475 10.847 10.283 9.707 9.188 8.711 8.245 7.799 7.393 7.011 6.604 6.228 5.908 5.593 5.236 4.93 4.611 4.271 4.001 3.721 3.439 3.13 2.804 2.591 2.366 1.984 1.721 1.454 1.312 1.011 0.696 0.376 0.193 -0.134 -0.402 -0.634 -0.872 -1.378 -1.654 -1.964 -2.348 -2.772 -3.264 -3.976 -6.114 -7 ,14487 ,KEBNE ,17024248,Wed Dec 22 09:48:57 CET,Wed Dec 22 11:18:00 CET,0.0 1.419 1.902 2.276 2.586 2.885 3.151 3.379 3.767 3.946 4.125 4.342 4.641 4.808 5.113 5.37 5.598 5.711 5.932 6.125 6.396 6.578 6.759 7.018 7.262 7.493 7.704 7.905 8.169 8.426 8.678 8.983 9.274 9.541 9.828 10.146 10.457 10.795 11.149 11.51 11.88 12.292 12.77 13.222 13.716 14.224 14.761 15.298 15.774 16.114 16.127 15.677 15.066 14.422 13.768 13.136 12.525 11.916 11.354 10.747 10.218 9.756 9.305 8.875 8.47 8.093 7.703 7.365 7.06 6.721 6.349 6.036 5.683 5.274 4.953 4.623 4.286 3.935 3.553 3.281 2.998 2.567 2.279 1.973 1.81 1.474 1.133 0.778 0.59 0.257 -0.039 -0.264 -0.507 -1.034 -1.326 -1.638 -2.001 -2.415 -2.901 -3.634 -6.535 -8 ,13502 ,KEBNE ,17024249,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:18:02 CET,0.0 1.684 2.269 2.69 3.011 3.262 3.503 3.726 4.12 4.309 4.49 4.694 4.988 5.136 5.416 5.689 5.943 6.064 6.303 6.532 6.868 7.082 7.289 7.59 7.885 8.167 8.423 8.677 9.013 9.329 9.635 9.997 10.32 10.592 10.903 11.247 11.563 11.898 12.254 12.608 12.962 13.374 13.826 14.249 14.743 15.261 15.782 16.308 16.787 17.173 17.278 16.777 16.137 15.401 14.66 14.008 13.396 12.779 12.226 11.689 11.158 10.656 10.204 9.765 9.356 8.981 8.566 8.195 7.871 7.515 7.142 6.831 6.511 6.194 5.952 5.675 5.385 5.093 4.785 4.572 4.348 3.991 3.741 3.487 3.345 3.029 2.708 2.376 2.192 1.865 1.596 1.388 1.163 0.648 0.349 0.018 -0.358 -0.821 -1.354 -2.021 -4.122 -9 ,4142 ,KEBNE ,17024250,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:19:24 CET,0.0 1.405 1.925 2.328 2.66 2.947 3.219 3.46 3.872 4.07 4.263 4.482 4.775 4.93 5.231 5.525 5.802 5.93 6.161 6.382 6.691 6.899 7.124 7.426 7.674 7.905 8.122 8.32 8.582 8.848 9.099 9.392 9.668 9.93 10.227 10.552 10.862 11.206 11.579 11.973 12.355 12.769 13.244 13.702 14.221 14.759 15.315 15.845 16.295 16.609 16.648 16.173 15.468 14.764 14.089 13.398 12.766 12.147 11.572 10.993 10.475 9.997 9.541 9.089 8.662 8.287 7.889 7.529 7.21 6.857 6.487 6.169 5.834 5.505 5.255 4.988 4.703 4.413 4.103 3.879 3.639 3.266 3.002 2.721 2.584 2.315 2.022 1.677 1.501 1.186 0.881 0.648 0.419 -0.096 -0.375 -0.657 -0.999 -1.456 -2.029 -2.748 -4.949 -10 ,10993 ,KEBNE ,17024251,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:17:54 CET,0.0 1.188 1.674 2.081 2.411 2.691 2.938 3.171 3.625 3.831 4.019 4.243 4.544 4.704 4.983 5.233 5.466 5.579 5.786 5.98 6.285 6.48 6.66 6.914 7.137 7.351 7.57 7.779 8.046 8.314 8.567 8.852 9.125 9.384 9.672 9.981 10.264 10.582 10.927 11.28 11.627 12.004 12.446 12.854 13.316 13.811 14.322 14.814 15.261 15.557 15.545 15.072 14.41 13.698 12.96 12.257 11.617 11.024 10.485 9.925 9.42 8.945 8.491 8.079 7.695 7.324 6.917 6.549 6.236 5.902 5.547 5.252 4.938 4.593 4.332 4.068 3.774 3.455 3.126 2.903 2.679 2.308 2.041 1.784 1.653 1.371 1.069 0.75 0.589 0.278 0.01 -0.213 -0.445 -0.893 -1.148 -1.469 -1.851 -2.318 -2.898 -3.6 -5.783 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index 9e7ee6f1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19422 ,KEBNE ,17024252,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:18:57 CET,0.0 0.81 1.204 1.492 1.743 1.977 2.2 2.413 2.791 2.965 3.133 3.337 3.605 3.736 3.992 4.239 4.484 4.608 4.841 5.044 5.343 5.53 5.698 5.932 6.153 6.375 6.598 6.819 7.094 7.34 7.562 7.832 8.111 8.368 8.658 8.961 9.235 9.547 9.879 10.223 10.595 10.989 11.4 11.795 12.22 12.656 13.084 13.465 13.828 14.044 13.745 12.886 11.981 11.048 10.136 9.265 8.455 7.686 7.022 6.335 5.727 5.191 4.67 4.174 3.694 3.252 2.796 2.37 1.993 1.605 1.201 0.864 0.504 0.128 -0.158 -0.445 -0.747 -1.075 -1.442 -1.709 -1.976 -2.381 -2.662 -2.961 -3.117 -3.442 -3.774 -4.131 -4.339 -4.679 -4.962 -5.184 -5.424 -5.956 -6.246 -6.557 -6.915 -7.34 -7.827 -8.537 -11.395 -2 ,24016 ,KEBNE ,17024253,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:20:10 CET,0.0 0.935 1.342 1.633 1.889 2.11 2.33 2.53 2.864 3.016 3.155 3.294 3.55 3.679 3.943 4.206 4.435 4.537 4.757 4.989 5.332 5.536 5.712 5.988 6.28 6.558 6.828 7.075 7.343 7.603 7.87 8.173 8.443 8.697 8.989 9.299 9.59 9.914 10.256 10.587 10.932 11.31 11.73 12.136 12.563 13.011 13.488 13.936 14.308 14.545 14.373 13.585 12.661 11.749 10.847 9.929 9.106 8.359 7.678 7.001 6.412 5.857 5.331 4.832 4.356 3.919 3.455 3.037 2.687 2.319 1.903 1.549 1.184 0.797 0.499 0.206 -0.087 -0.394 -0.725 -0.969 -1.225 -1.632 -1.911 -2.186 -2.326 -2.63 -2.981 -3.344 -3.531 -3.872 -4.174 -4.394 -4.641 -5.204 -5.512 -5.828 -6.161 -6.509 -6.98 -7.689 -10.172 -3 ,4948 ,KEBNE ,17024254,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:19:37 CET,0.0 0.754 1.129 1.429 1.703 1.951 2.183 2.408 2.832 3.025 3.207 3.389 3.64 3.769 4.026 4.261 4.466 4.564 4.75 4.925 5.185 5.354 5.518 5.753 5.973 6.186 6.395 6.599 6.853 7.082 7.305 7.59 7.865 8.117 8.411 8.729 9.03 9.351 9.663 10.005 10.383 10.791 11.219 11.613 12.04 12.478 12.937 13.367 13.751 13.946 13.678 12.79 11.776 10.812 9.931 9.082 8.256 7.469 6.798 6.125 5.5 4.933 4.405 3.896 3.407 2.966 2.511 2.089 1.711 1.319 0.882 0.48 0.065 -0.345 -0.639 -0.929 -1.243 -1.575 -1.927 -2.169 -2.417 -2.803 -3.073 -3.364 -3.515 -3.828 -4.168 -4.518 -4.696 -5.018 -5.318 -5.536 -5.775 -6.297 -6.573 -6.902 -7.308 -7.771 -8.263 -8.982 -11.662 -4 ,26824 ,KEBNE ,17024255,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:18:50 CET,0.0 1.118 1.527 1.832 2.11 2.346 2.569 2.782 3.145 3.321 3.497 3.664 3.933 4.086 4.388 4.664 4.922 5.048 5.29 5.521 5.82 5.994 6.161 6.401 6.65 6.917 7.168 7.368 7.608 7.854 8.093 8.377 8.678 9.008 9.391 9.772 10.075 10.38 10.707 11.038 11.372 11.759 12.214 12.631 13.077 13.539 14.002 14.419 14.77 15.007 14.892 14.2 13.275 12.311 11.41 10.533 9.712 8.92 8.228 7.517 6.867 6.296 5.772 5.264 4.773 4.305 3.823 3.397 3.024 2.63 2.218 1.882 1.523 1.149 0.86 0.552 0.23 -0.099 -0.439 -0.675 -0.919 -1.324 -1.614 -1.903 -2.051 -2.38 -2.724 -3.078 -3.261 -3.597 -3.904 -4.132 -4.373 -4.924 -5.237 -5.57 -5.948 -6.411 -6.973 -7.714 -11.501 -5 ,3184 ,KEBNE ,17024256,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:20:23 CET,0.0 0.851 1.238 1.536 1.802 2.038 2.264 2.494 2.94 3.141 3.32 3.513 3.779 3.903 4.14 4.397 4.628 4.731 4.943 5.145 5.455 5.669 5.872 6.137 6.372 6.605 6.847 7.074 7.34 7.591 7.832 8.135 8.453 8.743 9.034 9.347 9.634 9.952 10.309 10.67 11.015 11.373 11.784 12.18 12.607 13.031 13.476 13.923 14.306 14.508 14.291 13.487 12.53 11.57 10.643 9.765 8.985 8.237 7.567 6.889 6.282 5.751 5.231 4.708 4.227 3.786 3.319 2.905 2.539 2.151 1.751 1.421 1.087 0.734 0.45 0.153 -0.176 -0.501 -0.84 -1.095 -1.35 -1.733 -2.002 -2.276 -2.418 -2.733 -3.065 -3.412 -3.592 -3.906 -4.174 -4.385 -4.621 -5.18 -5.484 -5.821 -6.228 -6.712 -7.238 -7.927 -10.418 -6 ,31184 ,KEBNE ,17024257,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:18:53 CET,0.0 0.973 1.456 1.84 2.12 2.369 2.63 2.867 3.24 3.407 3.566 3.769 4.05 4.186 4.432 4.666 4.887 4.985 5.186 5.385 5.649 5.82 5.985 6.213 6.442 6.671 6.88 7.087 7.363 7.615 7.849 8.118 8.377 8.638 8.942 9.269 9.575 9.903 10.245 10.601 10.974 11.398 11.87 12.306 12.779 13.233 13.681 14.121 14.536 14.732 14.404 13.511 12.484 11.453 10.47 9.549 8.753 8.004 7.348 6.676 6.051 5.505 4.981 4.464 3.995 3.554 3.073 2.656 2.301 1.933 1.548 1.211 0.861 0.497 0.208 -0.082 -0.388 -0.725 -1.073 -1.3 -1.535 -1.92 -2.202 -2.504 -2.653 -2.956 -3.275 -3.611 -3.788 -4.102 -4.388 -4.61 -4.849 -5.353 -5.621 -5.936 -6.298 -6.704 -7.188 -7.874 -10.106 -7 ,28889 ,KEBNE ,17024258,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:18:25 CET,0.0 0.956 1.463 1.833 2.109 2.338 2.554 2.77 3.154 3.321 3.474 3.649 3.928 4.063 4.309 4.557 4.785 4.883 5.062 5.248 5.53 5.714 5.885 6.125 6.346 6.545 6.741 6.935 7.191 7.447 7.688 7.971 8.247 8.496 8.763 9.061 9.355 9.687 10.035 10.377 10.719 11.086 11.505 11.91 12.339 12.812 13.296 13.719 14.091 14.295 14.087 13.324 12.401 11.435 10.493 9.602 8.781 8.002 7.265 6.441 5.711 5.059 4.429 3.831 3.271 2.758 2.216 1.737 1.36 0.988 0.585 0.247 -0.097 -0.472 -0.774 -1.079 -1.384 -1.706 -2.046 -2.271 -2.511 -2.882 -3.162 -3.485 -3.652 -3.987 -4.338 -4.716 -4.912 -5.235 -5.523 -5.748 -5.977 -6.453 -6.733 -7.072 -7.459 -7.922 -8.485 -9.227 -11.631 -8 ,1730 ,KEBNE ,17024259,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:18:20 CET,0.0 0.889 1.317 1.646 1.931 2.158 2.358 2.552 2.897 3.059 3.224 3.403 3.658 3.795 4.081 4.343 4.566 4.671 4.871 5.054 5.32 5.494 5.662 5.906 6.163 6.443 6.707 6.927 7.178 7.418 7.655 7.941 8.221 8.481 8.779 9.129 9.447 9.768 10.108 10.456 10.811 11.191 11.599 11.993 12.413 12.838 13.286 13.732 14.13 14.346 14.097 13.21 12.202 11.238 10.329 9.432 8.639 7.924 7.269 6.583 5.967 5.412 4.866 4.331 3.842 3.4 2.938 2.53 2.175 1.779 1.358 1.023 0.672 0.289 -0.003 -0.301 -0.62 -0.95 -1.286 -1.506 -1.752 -2.162 -2.449 -2.738 -2.884 -3.196 -3.527 -3.892 -4.082 -4.404 -4.699 -4.931 -5.173 -5.697 -5.986 -6.284 -6.609 -7.016 -7.499 -8.169 -10.174 -9 ,6904 ,KEBNE ,17024260,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:19:33 CET,0.0 1.085 1.585 1.955 2.23 2.477 2.704 2.923 3.311 3.482 3.641 3.811 4.078 4.209 4.462 4.69 4.913 5.021 5.218 5.405 5.671 5.842 6.011 6.261 6.516 6.762 6.975 7.178 7.453 7.711 7.949 8.223 8.478 8.724 9.008 9.316 9.611 9.937 10.272 10.617 10.972 11.375 11.824 12.237 12.692 13.14 13.577 14.025 14.409 14.586 14.335 13.474 12.479 11.503 10.578 9.73 8.97 8.215 7.521 6.834 6.242 5.696 5.165 4.651 4.163 3.714 3.252 2.848 2.487 2.057 1.573 1.171 0.749 0.319 -0.005 -0.342 -0.691 -1.05 -1.432 -1.696 -1.964 -2.383 -2.677 -2.984 -3.138 -3.451 -3.779 -4.111 -4.289 -4.613 -4.898 -5.136 -5.386 -5.899 -6.178 -6.504 -6.873 -7.27 -7.752 -8.494 -11.211 -10 ,9699 ,KEBNE ,17024261,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:19:18 CET,0.0 0.944 1.414 1.749 2.02 2.252 2.473 2.686 3.06 3.226 3.385 3.553 3.819 3.954 4.22 4.464 4.683 4.786 4.999 5.214 5.527 5.736 5.935 6.209 6.477 6.732 6.963 7.169 7.428 7.677 7.908 8.193 8.462 8.707 8.998 9.33 9.636 9.977 10.355 10.734 11.104 11.476 11.886 12.305 12.751 13.199 13.672 14.128 14.52 14.79 14.607 13.754 12.733 11.74 10.808 9.897 9.067 8.311 7.657 6.984 6.368 5.812 5.292 4.792 4.314 3.88 3.433 3.035 2.685 2.31 1.916 1.587 1.233 0.863 0.582 0.28 -0.037 -0.347 -0.673 -0.924 -1.192 -1.622 -1.934 -2.258 -2.428 -2.794 -3.174 -3.572 -3.782 -4.123 -4.445 -4.687 -4.949 -5.532 -5.863 -6.214 -6.582 -7.002 -7.581 -8.318 -11.174 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt deleted file mode 100644 index 4e5cde69..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4772 ,TETRA ,17585905,Sat Nov 27 15:33:27 CET,Sat Nov 27 17:17:47 CET,0.0 1.037 1.51 1.827 2.113 2.357 2.553 2.746 3.119 3.293 3.453 3.634 3.92 4.074 4.349 4.591 4.819 4.931 5.14 5.331 5.605 5.786 5.969 6.239 6.506 6.754 6.999 7.249 7.567 7.878 8.168 8.495 8.785 9.044 9.345 9.696 10.032 10.38 10.735 11.11 11.517 11.963 12.451 12.907 13.424 13.936 14.438 14.999 15.534 15.841 15.73 15.03 14.136 13.201 12.354 11.558 10.766 10.025 9.374 8.7 8.09 7.532 7.007 6.498 6.016 5.56 5.048 4.616 4.255 3.87 3.475 3.147 2.814 2.462 2.192 1.92 1.62 1.299 0.975 0.755 0.526 0.164 -0.088 -0.359 -0.502 -0.802 -1.13 -1.486 -1.678 -2.007 -2.266 -2.477 -2.711 -3.229 -3.513 -3.8 -4.101 -4.491 -4.965 -5.565 -7.603 -2 ,157 ,TETRA ,17585906,Sat Nov 27 15:33:21 CET,Sat Nov 27 17:17:49 CET,0.0 0.952 1.422 1.765 2.055 2.303 2.522 2.732 3.106 3.285 3.455 3.647 3.921 4.061 4.297 4.531 4.786 4.915 5.159 5.387 5.721 5.923 6.096 6.337 6.572 6.796 7.008 7.209 7.5 7.812 8.081 8.372 8.649 8.915 9.223 9.553 9.867 10.204 10.559 10.939 11.311 11.714 12.184 12.639 13.131 13.639 14.155 14.66 15.141 15.476 15.453 14.805 13.994 13.15 12.343 11.57 10.857 10.169 9.541 8.895 8.335 7.847 7.361 6.839 6.295 5.792 5.305 4.908 4.557 4.172 3.774 3.444 3.111 2.761 2.482 2.179 1.839 1.478 1.106 0.85 0.57 0.114 -0.185 -0.513 -0.687 -1.035 -1.404 -1.787 -1.978 -2.313 -2.633 -2.856 -3.096 -3.647 -3.95 -4.281 -4.652 -5.093 -5.585 -6.258 -8.966 -3 ,25067 ,TETRA ,17585907,Sat Nov 27 15:33:22 CET,Sat Nov 27 17:17:33 CET,0.0 0.99 1.4 1.709 1.989 2.252 2.483 2.702 3.105 3.297 3.474 3.668 3.947 4.089 4.354 4.586 4.807 4.921 5.146 5.38 5.725 5.937 6.12 6.365 6.607 6.829 7.049 7.27 7.54 7.788 8.032 8.323 8.599 8.857 9.147 9.46 9.763 10.09 10.428 10.789 11.165 11.583 12.074 12.526 12.982 13.475 13.994 14.467 14.916 15.266 15.256 14.684 13.918 13.102 12.297 11.525 10.786 10.087 9.464 8.805 8.206 7.641 7.108 6.578 6.09 5.668 5.223 4.793 4.371 3.91 3.436 3.052 2.639 2.191 1.857 1.549 1.23 0.9 0.548 0.303 0.064 -0.319 -0.59 -0.882 -1.039 -1.365 -1.712 -2.09 -2.281 -2.606 -2.906 -3.122 -3.345 -3.81 -4.075 -4.375 -4.704 -5.121 -5.618 -6.322 -8.579 -4 ,23422 ,TETRA ,17585908,Sat Nov 27 15:33:24 CET,Sat Nov 27 17:17:45 CET,0.0 1.089 1.543 1.902 2.189 2.438 2.687 2.916 3.306 3.481 3.648 3.833 4.105 4.246 4.527 4.8 5.036 5.144 5.352 5.55 5.849 6.031 6.2 6.451 6.701 6.947 7.182 7.405 7.686 7.94 8.178 8.473 8.801 9.15 9.535 9.899 10.216 10.564 10.915 11.283 11.676 12.105 12.587 13.034 13.516 14.016 14.528 15.053 15.509 15.761 15.602 14.875 14.017 13.137 12.25 11.426 10.697 9.988 9.332 8.656 8.053 7.503 7.002 6.516 6.035 5.593 5.134 4.725 4.367 4.001 3.626 3.311 2.971 2.606 2.326 2.038 1.731 1.405 1.076 0.857 0.632 0.267 -0.009 -0.303 -0.466 -0.826 -1.209 -1.589 -1.779 -2.116 -2.411 -2.633 -2.885 -3.417 -3.694 -4.013 -4.384 -4.769 -5.221 -5.862 -8.663 -5 ,18812 ,TETRA ,17585909,Sat Nov 27 15:33:26 CET,Sat Nov 27 17:17:54 CET,0.0 0.979 1.393 1.718 2.002 2.257 2.49 2.695 3.073 3.252 3.42 3.597 3.866 4.007 4.254 4.479 4.699 4.81 5.045 5.254 5.526 5.726 5.931 6.225 6.486 6.709 6.923 7.137 7.403 7.652 7.889 8.163 8.437 8.71 9.014 9.356 9.695 10.042 10.404 10.795 11.177 11.598 12.086 12.546 13.025 13.519 14.058 14.558 15.009 15.357 15.309 14.61 13.754 12.863 11.99 11.146 10.367 9.633 8.944 8.26 7.667 7.137 6.596 6.074 5.587 5.092 4.569 4.119 3.757 3.398 3.003 2.673 2.299 1.884 1.586 1.288 0.984 0.661 0.325 0.096 -0.15 -0.544 -0.808 -1.068 -1.206 -1.51 -1.85 -2.216 -2.402 -2.725 -3.0 -3.21 -3.44 -3.933 -4.199 -4.499 -4.849 -5.215 -5.668 -6.334 -9.603 -6 ,1201 ,TETRA ,17585910,Sat Nov 27 15:33:22 CET,Sat Nov 27 17:17:55 CET,0.0 0.773 1.239 1.6 1.899 2.158 2.39 2.606 2.992 3.161 3.32 3.499 3.775 3.923 4.203 4.458 4.688 4.796 5.015 5.216 5.483 5.654 5.828 6.088 6.34 6.574 6.791 6.993 7.258 7.524 7.799 8.156 8.513 8.856 9.236 9.676 10.082 10.484 10.893 11.284 11.676 12.104 12.597 13.073 13.571 14.066 14.561 15.011 15.424 15.748 15.638 14.969 14.094 13.142 12.239 11.396 10.632 9.911 9.272 8.595 7.985 7.445 6.921 6.431 5.981 5.545 5.035 4.578 4.201 3.813 3.416 3.081 2.746 2.403 2.119 1.826 1.525 1.2 0.873 0.65 0.41 0.053 -0.199 -0.477 -0.62 -0.916 -1.225 -1.542 -1.709 -2.024 -2.29 -2.511 -2.742 -3.234 -3.525 -3.869 -4.241 -4.618 -5.112 -5.773 -7.721 -7 ,31593 ,TETRA ,17585911,Sat Nov 27 15:33:23 CET,Sat Nov 27 17:17:42 CET,0.0 1.293 1.751 2.1 2.401 2.665 2.893 3.102 3.476 3.645 3.812 3.992 4.251 4.387 4.636 4.865 5.086 5.189 5.386 5.592 5.887 6.071 6.26 6.526 6.761 6.979 7.189 7.396 7.67 7.934 8.183 8.472 8.746 9.012 9.332 9.671 9.975 10.311 10.666 11.031 11.403 11.805 12.273 12.723 13.184 13.68 14.223 14.774 15.263 15.618 15.618 14.962 14.073 13.185 12.344 11.545 10.817 10.112 9.489 8.867 8.294 7.773 7.273 6.786 6.339 5.935 5.494 5.086 4.743 4.349 3.879 3.482 3.078 2.639 2.29 1.944 1.609 1.285 0.955 0.728 0.485 0.09 -0.186 -0.475 -0.625 -0.933 -1.254 -1.585 -1.781 -2.121 -2.401 -2.626 -2.891 -3.455 -3.742 -4.053 -4.458 -4.924 -5.454 -6.114 -7.983 -8 ,8426 ,TETRA ,17585912,Sat Nov 27 15:33:26 CET,Sat Nov 27 17:18:38 CET,0.0 0.968 1.359 1.68 1.967 2.241 2.466 2.666 3.056 3.235 3.393 3.557 3.832 3.973 4.232 4.482 4.711 4.82 5.032 5.229 5.515 5.699 5.873 6.123 6.372 6.627 6.865 7.074 7.331 7.576 7.829 8.133 8.406 8.665 8.952 9.287 9.616 9.977 10.362 10.755 11.157 11.582 12.05 12.508 13.002 13.501 14.03 14.513 14.948 15.267 15.183 14.464 13.561 12.682 11.825 11.012 10.267 9.53 8.855 8.212 7.643 7.094 6.58 6.071 5.596 5.168 4.7 4.28 3.924 3.566 3.181 2.84 2.485 2.135 1.852 1.548 1.237 0.92 0.606 0.392 0.163 -0.209 -0.469 -0.734 -0.874 -1.169 -1.467 -1.809 -2.005 -2.332 -2.609 -2.825 -3.058 -3.564 -3.829 -4.131 -4.482 -4.871 -5.384 -6.084 -8.145 -9 ,18928 ,TETRA ,17585913,Sat Nov 27 15:33:27 CET,Sat Nov 27 17:18:26 CET,0.0 1.057 1.491 1.802 2.081 2.336 2.561 2.784 3.192 3.36 3.526 3.731 4.018 4.177 4.482 4.732 4.947 5.056 5.268 5.466 5.748 5.94 6.146 6.412 6.662 6.935 7.209 7.456 7.737 7.996 8.248 8.556 8.853 9.131 9.442 9.784 10.113 10.456 10.796 11.167 11.558 11.96 12.406 12.85 13.342 13.848 14.366 14.863 15.351 15.709 15.658 15.033 14.257 13.417 12.587 11.789 11.042 10.347 9.734 9.087 8.509 8.002 7.52 7.039 6.581 6.164 5.72 5.301 4.939 4.57 4.185 3.864 3.517 3.167 2.905 2.632 2.346 2.045 1.735 1.509 1.244 0.831 0.575 0.316 0.168 -0.15 -0.485 -0.849 -1.048 -1.391 -1.692 -1.932 -2.193 -2.723 -3.031 -3.371 -3.728 -4.138 -4.628 -5.297 -7.591 -10 ,6379 ,TETRA ,17585914,Sat Nov 27 15:34:17 CET,Sat Nov 27 17:19:00 CET,0.0 0.932 1.373 1.733 2.036 2.302 2.533 2.734 3.102 3.281 3.469 3.7 3.984 4.14 4.456 4.757 5.018 5.134 5.354 5.57 5.879 6.068 6.269 6.577 6.865 7.127 7.38 7.628 7.907 8.149 8.39 8.684 8.961 9.239 9.569 9.922 10.235 10.574 10.954 11.325 11.688 12.102 12.576 13.031 13.542 14.107 14.689 15.23 15.708 16.054 16.025 15.369 14.514 13.641 12.778 11.899 11.11 10.394 9.749 9.097 8.506 7.972 7.481 6.996 6.51 6.072 5.618 5.196 4.842 4.454 4.047 3.733 3.399 3.044 2.751 2.418 2.058 1.671 1.27 1.0 0.73 0.311 0.008 -0.323 -0.492 -0.828 -1.186 -1.582 -1.787 -2.113 -2.425 -2.685 -2.956 -3.541 -3.848 -4.167 -4.541 -4.977 -5.478 -6.124 -7.744 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt deleted file mode 100644 index feddca51..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18235 ,TETRA ,17585915,Sat Nov 27 15:34:20 CET,Sat Nov 27 17:19:45 CET,0.0 1.239 1.792 2.2 2.586 2.932 3.25 3.527 4.019 4.26 4.469 4.71 5.004 5.173 5.551 5.895 6.167 6.284 6.52 6.756 7.086 7.309 7.532 7.843 8.142 8.432 8.713 8.975 9.299 9.602 9.883 10.249 10.616 10.944 11.294 11.674 12.048 12.443 12.839 13.249 13.698 14.221 14.825 15.405 15.988 16.566 17.169 17.741 18.276 18.737 18.85 18.325 17.513 16.53 15.599 14.807 14.091 13.384 12.753 12.101 11.488 10.921 10.357 9.843 9.397 8.975 8.522 8.113 7.748 7.353 6.956 6.622 6.266 5.913 5.621 5.313 4.993 4.627 4.253 4.011 3.762 3.391 3.134 2.86 2.714 2.404 2.09 1.736 1.538 1.209 0.934 0.727 0.512 0.045 -0.221 -0.518 -0.835 -1.18 -1.633 -2.252 -3.874 -2 ,8267 ,TETRA ,17585916,Sat Nov 27 15:34:21 CET,Sat Nov 27 17:19:05 CET,0.0 1.321 1.84 2.266 2.641 2.99 3.294 3.567 4.036 4.237 4.429 4.673 4.971 5.133 5.446 5.762 6.075 6.224 6.501 6.742 7.059 7.268 7.481 7.775 8.045 8.301 8.543 8.785 9.117 9.428 9.71 10.05 10.373 10.695 11.06 11.444 11.807 12.201 12.656 13.122 13.56 14.048 14.595 15.13 15.73 16.329 16.945 17.583 18.181 18.63 18.721 18.145 17.339 16.499 15.679 14.907 14.174 13.436 12.784 12.147 11.594 11.084 10.572 10.075 9.618 9.204 8.751 8.315 7.937 7.568 7.186 6.854 6.478 6.069 5.772 5.49 5.201 4.878 4.523 4.285 4.051 3.692 3.433 3.156 3.016 2.721 2.415 2.086 1.904 1.588 1.341 1.148 0.939 0.468 0.197 -0.111 -0.462 -0.891 -1.388 -1.989 -4.048 -3 ,17473 ,TETRA ,17585917,Sat Nov 27 15:34:23 CET,Sat Nov 27 17:21:12 CET,0.0 1.42 2.042 2.555 2.975 3.321 3.612 3.867 4.344 4.569 4.786 5.055 5.346 5.507 5.816 6.103 6.37 6.502 6.781 7.041 7.384 7.599 7.801 8.085 8.359 8.618 8.876 9.135 9.449 9.742 10.05 10.434 10.787 11.096 11.44 11.825 12.193 12.605 13.024 13.469 13.924 14.402 14.958 15.476 16.035 16.634 17.279 17.881 18.456 18.944 19.089 18.623 17.904 17.077 16.275 15.506 14.764 14.06 13.416 12.762 12.201 11.646 11.11 10.625 10.165 9.74 9.293 8.868 8.498 8.134 7.749 7.429 7.098 6.73 6.444 6.166 5.875 5.573 5.26 5.038 4.802 4.408 4.114 3.825 3.679 3.371 3.056 2.693 2.499 2.182 1.913 1.707 1.481 0.951 0.668 0.367 0.019 -0.388 -0.848 -1.455 -3.879 -4 ,22354 ,TETRA ,17585918,Sat Nov 27 15:34:21 CET,Sat Nov 27 17:20:40 CET,0.0 1.134 1.654 2.018 2.321 2.597 2.848 3.088 3.545 3.742 3.917 4.126 4.424 4.58 4.882 5.177 5.452 5.582 5.829 6.065 6.406 6.626 6.841 7.167 7.463 7.732 7.996 8.247 8.559 8.864 9.162 9.497 9.818 10.143 10.499 10.88 11.241 11.619 12.021 12.455 12.909 13.421 13.991 14.522 15.129 15.779 16.437 17.091 17.69 18.124 18.212 17.69 16.968 16.17 15.356 14.581 13.858 13.173 12.546 11.867 11.262 10.718 10.21 9.725 9.27 8.847 8.379 7.95 7.6 7.24 6.845 6.511 6.145 5.76 5.458 5.138 4.811 4.482 4.133 3.882 3.625 3.226 2.943 2.654 2.505 2.204 1.893 1.566 1.395 1.086 0.821 0.604 0.389 -0.063 -0.331 -0.641 -0.98 -1.348 -1.806 -2.355 -4.208 -5 ,7465 ,TETRA ,17585919,Sat Nov 27 15:34:21 CET,Sat Nov 27 17:19:16 CET,0.0 1.422 1.874 2.236 2.586 2.878 3.155 3.426 3.887 4.094 4.285 4.531 4.831 4.987 5.276 5.547 5.818 5.952 6.205 6.459 6.823 7.044 7.26 7.572 7.864 8.15 8.422 8.674 8.989 9.287 9.579 9.925 10.255 10.575 10.962 11.403 11.789 12.18 12.622 13.094 13.563 14.048 14.562 15.1 15.696 16.299 16.99 17.664 18.269 18.744 18.877 18.422 17.638 16.753 15.929 15.123 14.367 13.67 13.011 12.263 11.62 11.101 10.567 10.012 9.486 9.014 8.53 8.106 7.751 7.346 6.911 6.567 6.237 5.892 5.616 5.332 5.024 4.697 4.34 4.087 3.835 3.425 3.131 2.835 2.689 2.392 2.086 1.749 1.548 1.205 0.911 0.694 0.459 -0.052 -0.312 -0.59 -0.911 -1.276 -1.721 -2.376 -4.548 -6 ,6033 ,TETRA ,17585920,Sat Nov 27 15:34:21 CET,Sat Nov 27 17:19:15 CET,0.0 1.622 2.238 2.668 3.028 3.361 3.66 3.957 4.489 4.713 4.922 5.186 5.5 5.685 6.046 6.377 6.694 6.851 7.146 7.42 7.807 8.049 8.261 8.55 8.825 9.07 9.31 9.564 9.886 10.182 10.47 10.817 11.141 11.444 11.794 12.176 12.547 12.968 13.4 13.831 14.277 14.751 15.292 15.789 16.311 16.916 17.588 18.209 18.79 19.259 19.298 18.751 17.917 17.01 16.188 15.378 14.605 13.843 13.161 12.482 11.865 11.295 10.747 10.232 9.777 9.364 8.933 8.516 8.13 7.74 7.33 7.001 6.666 6.305 6.012 5.708 5.395 5.06 4.718 4.489 4.253 3.865 3.586 3.281 3.125 2.82 2.492 2.152 1.979 1.669 1.398 1.191 0.965 0.458 0.155 -0.169 -0.488 -0.836 -1.274 -1.92 -3.72 -7 ,5632 ,TETRA ,17585921,Sat Nov 27 15:34:23 CET,Sat Nov 27 17:19:51 CET,0.0 1.175 1.74 2.18 2.577 2.93 3.262 3.56 4.077 4.316 4.542 4.833 5.153 5.337 5.686 5.99 6.268 6.395 6.633 6.866 7.216 7.454 7.671 7.956 8.235 8.512 8.773 9.029 9.356 9.7 10.058 10.476 10.866 11.213 11.564 11.936 12.298 12.706 13.124 13.559 14.016 14.497 15.056 15.59 16.14 16.732 17.364 17.961 18.517 18.96 19.016 18.422 17.624 16.702 15.726 14.839 14.085 13.397 12.736 12.041 11.483 10.973 10.467 9.992 9.544 9.126 8.688 8.284 7.911 7.516 7.121 6.79 6.448 6.095 5.8 5.49 5.162 4.811 4.44 4.2 3.965 3.581 3.314 3.019 2.862 2.54 2.215 1.878 1.696 1.383 1.113 0.896 0.666 0.172 -0.087 -0.365 -0.668 -1.037 -1.518 -2.125 -4.362 -8 ,26061 ,TETRA ,17585922,Sat Nov 27 15:34:25 CET,Sat Nov 27 17:19:29 CET,0.0 1.594 2.373 2.936 3.411 3.829 4.205 4.533 5.092 5.346 5.61 5.99 6.333 6.548 6.954 7.313 7.633 7.783 8.081 8.377 8.8 9.068 9.337 9.731 10.11 10.494 10.874 11.254 11.701 12.078 12.435 12.812 13.131 13.446 13.795 14.176 14.546 14.946 15.38 15.823 16.289 16.868 17.478 17.986 18.549 19.157 19.78 20.394 20.972 21.406 21.477 20.967 20.179 19.354 18.534 17.736 17.004 16.3 15.693 15.058 14.483 13.968 13.47 12.993 12.539 12.117 11.682 11.288 10.914 10.5 10.096 9.773 9.419 9.054 8.782 8.487 8.174 7.866 7.545 7.308 7.057 6.666 6.397 6.123 5.981 5.69 5.38 5.054 4.881 4.568 4.304 4.102 3.893 3.432 3.163 2.867 2.542 2.155 1.671 0.993 -1.053 -9 ,24682 ,TETRA ,17585923,Sat Nov 27 15:34:21 CET,Sat Nov 27 17:18:58 CET,0.0 1.115 1.609 2.005 2.33 2.614 2.886 3.142 3.586 3.792 3.996 4.247 4.551 4.71 5.014 5.302 5.573 5.704 5.941 6.168 6.514 6.727 6.924 7.204 7.474 7.747 8.016 8.269 8.578 8.871 9.163 9.512 9.851 10.172 10.541 10.963 11.334 11.727 12.169 12.608 13.033 13.51 14.054 14.617 15.261 15.872 16.485 17.113 17.745 18.262 18.441 17.989 17.246 16.438 15.656 14.893 14.16 13.481 12.878 12.206 11.58 11.039 10.53 10.03 9.572 9.147 8.685 8.261 7.883 7.485 7.092 6.762 6.407 6.037 5.729 5.405 5.066 4.709 4.354 4.117 3.874 3.486 3.211 2.928 2.785 2.495 2.189 1.849 1.656 1.336 1.066 0.85 0.64 0.177 -0.11 -0.419 -0.745 -1.11 -1.571 -2.176 -4.262 -10 ,11731 ,TETRA ,17585924,Sat Nov 27 15:34:21 CET,Sat Nov 27 17:18:49 CET,0.0 1.393 1.99 2.448 2.821 3.156 3.455 3.726 4.191 4.393 4.592 4.874 5.198 5.384 5.728 6.036 6.322 6.464 6.729 6.991 7.382 7.605 7.808 8.118 8.41 8.683 8.938 9.179 9.492 9.783 10.059 10.392 10.721 11.043 11.394 11.778 12.146 12.525 12.926 13.39 13.854 14.321 14.865 15.388 15.947 16.518 17.121 17.741 18.327 18.763 18.833 18.244 17.446 16.62 15.827 15.045 14.289 13.579 12.926 12.255 11.655 11.068 10.511 10.007 9.545 9.14 8.722 8.32 7.969 7.603 7.189 6.832 6.48 6.115 5.817 5.501 5.168 4.829 4.478 4.241 3.986 3.577 3.306 3.037 2.901 2.6 2.277 1.956 1.784 1.478 1.197 0.966 0.733 0.216 -0.074 -0.398 -0.762 -1.127 -1.534 -2.063 -4.229 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index a978c156..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7187 ,TETRA ,17585925,Sat Nov 27 15:34:23 CET,Sat Nov 27 17:18:47 CET,0.0 1.232 1.731 2.134 2.475 2.759 3.017 3.261 3.683 3.865 4.041 4.212 4.473 4.604 4.857 5.116 5.37 5.486 5.707 5.92 6.216 6.396 6.575 6.835 7.075 7.319 7.561 7.785 8.059 8.332 8.596 8.892 9.177 9.449 9.756 10.106 10.436 10.79 11.15 11.518 11.903 12.319 12.779 13.251 13.754 14.244 14.759 15.298 15.817 16.197 16.308 15.88 15.225 14.545 13.887 13.246 12.632 12.013 11.461 10.901 10.375 9.886 9.417 8.971 8.568 8.196 7.801 7.449 7.149 6.811 6.438 6.137 5.803 5.451 5.189 4.907 4.612 4.298 3.954 3.718 3.488 3.124 2.868 2.6 2.465 2.17 1.844 1.516 1.34 1.035 0.796 0.569 0.335 -0.156 -0.442 -0.756 -1.114 -1.521 -1.977 -2.634 -4.542 -2 ,19827 ,TETRA ,17585926,Sat Nov 27 15:34:25 CET,Sat Nov 27 17:18:31 CET,0.0 1.052 1.52 1.891 2.225 2.525 2.808 3.061 3.487 3.688 3.875 4.104 4.404 4.562 4.853 5.126 5.378 5.494 5.721 5.932 6.236 6.438 6.63 6.886 7.124 7.35 7.562 7.774 8.052 8.313 8.567 8.876 9.165 9.438 9.752 10.102 10.432 10.776 11.134 11.503 11.879 12.282 12.744 13.209 13.725 14.256 14.808 15.371 15.933 16.353 16.447 16.091 15.484 14.798 14.106 13.408 12.773 12.16 11.601 11.022 10.5 10.057 9.638 9.204 8.794 8.425 8.026 7.647 7.307 6.958 6.599 6.302 5.975 5.639 5.386 5.115 4.826 4.529 4.207 3.973 3.732 3.357 3.093 2.826 2.685 2.382 2.072 1.747 1.566 1.244 0.958 0.735 0.502 -0.026 -0.317 -0.641 -1.03 -1.476 -2.014 -2.695 -4.63 -3 ,32506 ,TETRA ,17585927,Sat Nov 27 15:34:19 CET,Sat Nov 27 17:19:04 CET,0.0 1.081 1.57 1.983 2.315 2.586 2.859 3.116 3.564 3.766 3.946 4.148 4.44 4.596 4.876 5.137 5.377 5.49 5.715 5.924 6.198 6.38 6.551 6.794 7.044 7.284 7.513 7.731 8.011 8.28 8.539 8.849 9.128 9.39 9.716 10.078 10.404 10.74 11.102 11.497 11.9 12.31 12.744 13.189 13.684 14.188 14.731 15.262 15.74 16.093 16.213 15.804 15.161 14.488 13.803 13.126 12.507 11.898 11.345 10.775 10.273 9.822 9.389 8.96 8.527 8.125 7.714 7.338 7.016 6.693 6.346 6.047 5.722 5.374 5.109 4.837 4.564 4.289 3.971 3.735 3.5 3.154 2.893 2.609 2.47 2.182 1.859 1.515 1.341 1.016 0.71 0.496 0.273 -0.227 -0.507 -0.814 -1.192 -1.65 -2.162 -2.827 -6.163 -4 ,3923 ,TETRA ,17585928,Sat Nov 27 15:34:20 CET,Sat Nov 27 17:18:40 CET,0.0 1.038 1.474 1.823 2.121 2.401 2.663 2.897 3.319 3.518 3.705 3.899 4.178 4.325 4.614 4.873 5.109 5.225 5.448 5.649 5.932 6.113 6.279 6.525 6.763 6.989 7.209 7.417 7.684 7.948 8.202 8.498 8.767 9.024 9.32 9.649 9.963 10.301 10.65 11.013 11.397 11.823 12.304 12.745 13.233 13.762 14.321 14.88 15.397 15.757 15.763 15.31 14.646 13.926 13.249 12.56 11.892 11.252 10.678 10.1 9.583 9.098 8.621 8.167 7.754 7.35 6.936 6.575 6.24 5.9 5.526 5.206 4.872 4.509 4.235 3.965 3.674 3.362 3.047 2.822 2.575 2.158 1.858 1.557 1.401 1.072 0.734 0.385 0.199 -0.131 -0.461 -0.703 -0.936 -1.444 -1.725 -2.048 -2.415 -2.825 -3.359 -4.107 -6.227 -5 ,6024 ,TETRA ,17585929,Sat Nov 27 15:34:23 CET,Sat Nov 27 17:19:40 CET,0.0 1.25 1.767 2.125 2.41 2.659 2.894 3.125 3.524 3.706 3.895 4.107 4.391 4.551 4.85 5.137 5.406 5.533 5.786 6.025 6.357 6.571 6.785 7.096 7.391 7.655 7.913 8.164 8.451 8.703 8.937 9.216 9.498 9.76 10.036 10.348 10.644 10.956 11.295 11.655 12.043 12.468 12.928 13.387 13.893 14.412 14.933 15.422 15.934 16.328 16.371 15.944 15.278 14.561 13.86 13.14 12.513 11.927 11.346 10.742 10.225 9.739 9.267 8.827 8.418 8.052 7.676 7.329 7.012 6.688 6.327 6.009 5.699 5.394 5.156 4.883 4.583 4.281 3.971 3.767 3.557 3.197 2.94 2.683 2.537 2.216 1.882 1.531 1.346 1.02 0.74 0.523 0.301 -0.174 -0.454 -0.781 -1.15 -1.562 -2.094 -2.844 -5.032 -6 ,9410 ,TETRA ,17585930,Sat Nov 27 15:34:25 CET,Sat Nov 27 17:18:41 CET,0.0 0.999 1.502 1.88 2.201 2.482 2.719 2.934 3.329 3.506 3.669 3.838 4.11 4.247 4.505 4.741 4.961 5.073 5.312 5.544 5.861 6.049 6.222 6.479 6.721 6.953 7.188 7.41 7.683 7.942 8.18 8.468 8.757 9.034 9.333 9.672 9.995 10.324 10.68 11.063 11.445 11.848 12.294 12.729 13.222 13.719 14.254 14.83 15.36 15.725 15.752 15.283 14.6 13.865 13.152 12.452 11.796 11.137 10.566 10.025 9.531 9.066 8.61 8.155 7.714 7.298 6.866 6.495 6.163 5.823 5.456 5.145 4.833 4.497 4.234 3.959 3.666 3.354 3.039 2.823 2.597 2.231 1.953 1.651 1.492 1.152 0.788 0.414 0.217 -0.118 -0.409 -0.641 -0.894 -1.432 -1.736 -2.066 -2.439 -2.859 -3.345 -4.062 -7.03 -7 ,30535 ,TETRA ,17585931,Sat Nov 27 15:35:18 CET,Sat Nov 27 17:20:14 CET,0.0 1.17 1.642 1.999 2.299 2.577 2.829 3.05 3.462 3.654 3.838 4.048 4.333 4.489 4.797 5.086 5.366 5.502 5.74 5.936 6.215 6.404 6.59 6.848 7.095 7.329 7.549 7.785 8.106 8.39 8.643 8.941 9.231 9.507 9.811 10.134 10.437 10.758 11.106 11.458 11.803 12.196 12.645 13.09 13.588 14.103 14.642 15.195 15.735 16.144 16.243 15.797 15.146 14.411 13.679 12.986 12.358 11.738 11.177 10.615 10.092 9.629 9.192 8.762 8.347 7.947 7.524 7.148 6.787 6.36 5.918 5.537 5.144 4.749 4.445 4.131 3.797 3.457 3.108 2.855 2.597 2.197 1.897 1.575 1.414 1.08 0.729 0.366 0.174 -0.157 -0.479 -0.723 -0.977 -1.548 -1.868 -2.216 -2.62 -3.056 -3.541 -4.22 -6.145 -8 ,17074 ,TETRA ,17585932,Sat Nov 27 15:35:18 CET,Sat Nov 27 17:09:00 CET,0.0 1.34 1.861 2.245 2.559 2.849 3.1 3.316 3.717 3.898 4.064 4.252 4.526 4.666 4.946 5.209 5.452 5.567 5.782 5.991 6.298 6.491 6.673 6.929 7.163 7.383 7.6 7.814 8.081 8.33 8.581 8.886 9.169 9.425 9.724 10.072 10.399 10.749 11.105 11.467 11.831 12.234 12.684 13.12 13.624 14.159 14.727 15.273 15.795 16.214 16.299 15.807 15.124 14.425 13.69 12.933 12.253 11.642 11.097 10.516 9.99 9.506 9.033 8.605 8.204 7.82 7.418 7.057 6.75 6.422 6.052 5.748 5.442 5.111 4.838 4.564 4.267 3.92 3.549 3.293 3.037 2.634 2.366 2.085 1.937 1.635 1.306 0.969 0.803 0.499 0.214 -0.028 -0.289 -0.884 -1.186 -1.498 -1.889 -2.352 -2.91 -3.674 -5.879 -9 ,10743 ,TETRA ,17585933,Sat Nov 27 15:35:18 CET,Sat Nov 27 17:19:45 CET,0.0 1.134 1.603 1.986 2.309 2.584 2.838 3.062 3.472 3.665 3.843 4.057 4.36 4.535 4.833 5.092 5.344 5.466 5.704 5.951 6.306 6.519 6.711 6.964 7.208 7.445 7.663 7.887 8.176 8.428 8.67 8.96 9.234 9.509 9.82 10.155 10.485 10.836 11.195 11.565 11.94 12.355 12.869 13.381 13.906 14.439 14.984 15.551 16.133 16.54 16.596 16.12 15.406 14.679 13.962 13.254 12.605 12.012 11.518 10.983 10.486 10.052 9.629 9.218 8.818 8.428 8.027 7.673 7.366 7.045 6.696 6.4 6.094 5.765 5.506 5.226 4.919 4.608 4.277 4.048 3.82 3.444 3.164 2.882 2.742 2.433 2.117 1.794 1.61 1.286 1.01 0.777 0.527 0.007 -0.289 -0.632 -1.008 -1.435 -1.963 -2.717 -4.887 -10 ,21948 ,TETRA ,17585934,Sat Nov 27 15:35:21 CET,Sat Nov 27 17:19:42 CET,0.0 1.219 1.726 2.089 2.394 2.672 2.911 3.113 3.486 3.661 3.82 3.982 4.263 4.407 4.691 4.964 5.211 5.325 5.541 5.744 6.037 6.238 6.433 6.688 6.924 7.15 7.374 7.595 7.868 8.128 8.391 8.712 9.0 9.263 9.568 9.901 10.216 10.567 10.93 11.304 11.699 12.139 12.629 13.083 13.584 14.091 14.619 15.158 15.664 15.998 16.022 15.58 14.898 14.166 13.477 12.759 12.095 11.53 11.001 10.412 9.895 9.42 8.958 8.514 8.118 7.754 7.334 6.957 6.638 6.31 5.943 5.625 5.285 4.889 4.604 4.348 4.063 3.757 3.439 3.212 2.985 2.652 2.413 2.132 1.982 1.676 1.341 0.971 0.775 0.443 0.169 -0.051 -0.299 -0.845 -1.144 -1.464 -1.811 -2.239 -2.769 -3.456 -6.443 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt deleted file mode 100644 index 3ac84dce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28338 ,TETRA ,17585935,Sat Nov 27 15:35:23 CET,Sat Nov 27 17:20:36 CET,0.0 2.012 2.754 3.24 3.623 3.969 4.276 4.531 4.988 5.204 5.419 5.676 5.985 6.156 6.467 6.778 7.067 7.194 7.445 7.689 8.024 8.242 8.47 8.797 9.097 9.383 9.668 9.943 10.283 10.61 10.918 11.284 11.632 11.953 12.302 12.695 13.071 13.471 13.906 14.35 14.82 15.353 15.956 16.542 17.161 17.807 18.488 19.158 19.787 20.256 20.396 19.841 19.037 18.252 17.437 16.59 15.785 15.025 14.358 13.693 13.14 12.638 12.125 11.63 11.173 10.753 10.303 9.905 9.57 9.22 8.865 8.578 8.261 7.89 7.602 7.324 7.032 6.727 6.398 6.155 5.895 5.471 5.18 4.89 4.747 4.442 4.11 3.764 3.576 3.254 2.988 2.778 2.561 2.084 1.824 1.54 1.211 0.817 0.316 -0.437 -3.837 -2 ,11542 ,TETRA ,17585936,Sat Nov 27 15:35:18 CET,Sat Nov 27 17:19:36 CET,0.0 2.053 2.711 3.182 3.556 3.849 4.127 4.398 4.861 5.071 5.274 5.536 5.846 6.015 6.346 6.652 6.933 7.069 7.327 7.56 7.909 8.153 8.388 8.696 8.984 9.254 9.509 9.759 10.092 10.404 10.691 11.033 11.372 11.698 12.056 12.443 12.817 13.229 13.657 14.105 14.565 15.049 15.6 16.169 16.826 17.471 18.117 18.803 19.457 19.925 20.107 19.582 18.666 17.707 16.87 16.061 15.294 14.55 13.891 13.238 12.656 12.138 11.635 11.125 10.635 10.195 9.739 9.319 8.957 8.579 8.169 7.834 7.493 7.118 6.808 6.496 6.19 5.886 5.565 5.344 5.123 4.763 4.502 4.223 4.075 3.764 3.442 3.087 2.885 2.547 2.261 2.035 1.792 1.248 0.935 0.605 0.271 -0.124 -0.65 -1.443 -3.742 -3 ,23674 ,TETRA ,17585937,Sat Nov 27 15:37:18 CET,Sat Nov 27 17:12:49 CET,0.0 1.884 2.541 3.061 3.478 3.838 4.169 4.461 4.944 5.157 5.367 5.624 5.927 6.091 6.403 6.691 6.972 7.11 7.374 7.614 7.955 8.174 8.39 8.695 8.982 9.272 9.555 9.832 10.176 10.483 10.785 11.155 11.477 11.777 12.124 12.506 12.878 13.298 13.735 14.19 14.666 15.144 15.669 16.212 16.827 17.506 18.219 18.859 19.518 20.102 20.297 19.765 18.924 18.054 17.205 16.326 15.525 14.848 14.254 13.601 13.015 12.478 11.942 11.441 10.982 10.574 10.14 9.743 9.376 8.966 8.549 8.213 7.869 7.513 7.227 6.926 6.608 6.269 5.921 5.685 5.442 5.055 4.798 4.543 4.406 4.115 3.803 3.447 3.259 2.943 2.665 2.444 2.211 1.672 1.354 1.003 0.615 0.183 -0.316 -0.973 -3.137 -4 ,18472 ,TETRA ,17585938,Sat Nov 27 15:37:18 CET,Sat Nov 27 17:23:21 CET,0.0 2.617 3.292 3.788 4.171 4.506 4.821 5.102 5.593 5.825 6.044 6.296 6.597 6.76 7.09 7.404 7.688 7.82 8.067 8.302 8.641 8.855 9.061 9.359 9.65 9.922 10.176 10.429 10.753 11.049 11.334 11.668 11.993 12.309 12.666 13.045 13.384 13.763 14.176 14.621 15.087 15.631 16.247 16.827 17.511 18.25 19.028 19.789 20.564 21.275 21.611 21.04 20.15 19.221 18.228 17.272 16.414 15.614 14.913 14.177 13.49 12.863 12.297 11.768 11.285 10.847 10.361 9.917 9.55 9.172 8.757 8.404 8.058 7.707 7.422 7.132 6.838 6.523 6.192 5.954 5.703 5.318 5.05 4.772 4.63 4.332 4.0 3.64 3.448 3.115 2.838 2.621 2.39 1.876 1.583 1.273 0.889 0.472 -0.029 -0.691 -2.766 -5 ,30022 ,TETRA ,17585939,Sat Nov 27 15:38:17 CET,Sat Nov 27 17:24:04 CET,0.0 2.904 3.604 4.065 4.408 4.725 5.024 5.301 5.762 5.97 6.167 6.406 6.711 6.878 7.193 7.494 7.788 7.928 8.185 8.423 8.767 8.984 9.193 9.493 9.766 10.025 10.278 10.522 10.833 11.126 11.413 11.759 12.082 12.383 12.732 13.145 13.535 13.944 14.365 14.795 15.237 15.726 16.303 16.875 17.507 18.147 18.809 19.468 20.099 20.605 20.774 20.269 19.408 18.502 17.693 16.899 16.131 15.41 14.751 14.07 13.505 12.995 12.486 12.0 11.537 11.112 10.671 10.272 9.924 9.562 9.19 8.867 8.522 8.157 7.874 7.585 7.302 7.005 6.683 6.46 6.224 5.861 5.62 5.359 5.219 4.929 4.595 4.236 4.057 3.741 3.489 3.277 3.05 2.568 2.286 1.983 1.624 1.202 0.711 0.031 -1.835 -6 ,17340 ,TETRA ,17585940,Sat Nov 27 15:39:19 CET,Sat Nov 27 17:21:40 CET,0.0 3.268 3.968 4.447 4.851 5.204 5.509 5.78 6.252 6.473 6.68 6.91 7.214 7.379 7.694 7.992 8.265 8.391 8.626 8.867 9.22 9.439 9.644 9.935 10.2 10.446 10.693 10.945 11.256 11.557 11.859 12.21 12.554 12.888 13.241 13.621 13.981 14.356 14.764 15.219 15.688 16.201 16.774 17.339 17.977 18.596 19.276 19.976 20.637 21.157 21.267 20.717 19.884 18.972 18.062 17.179 16.4 15.687 15.045 14.39 13.833 13.346 12.877 12.4 11.939 11.524 11.072 10.671 10.331 9.971 9.605 9.309 9.003 8.669 8.388 8.101 7.81 7.497 7.181 6.962 6.733 6.382 6.129 5.843 5.691 5.398 5.084 4.747 4.576 4.25 3.979 3.776 3.561 3.077 2.795 2.471 2.13 1.728 1.215 0.529 -1.327 -7 ,26901 ,TETRA ,17585941,Sat Nov 27 15:39:18 CET,Sat Nov 27 17:10:10 CET,0.0 2.735 3.402 3.86 4.207 4.532 4.836 5.121 5.63 5.846 6.051 6.329 6.649 6.82 7.129 7.421 7.69 7.823 8.089 8.34 8.707 8.939 9.161 9.482 9.785 10.067 10.33 10.571 10.887 11.198 11.494 11.851 12.188 12.51 12.878 13.27 13.627 14.003 14.398 14.811 15.256 15.767 16.32 16.851 17.456 18.116 18.805 19.49 20.168 20.721 20.928 20.411 19.605 18.805 18.023 17.21 16.449 15.738 15.126 14.487 13.899 13.375 12.854 12.359 11.913 11.498 11.037 10.617 10.267 9.903 9.513 9.204 8.882 8.529 8.261 7.984 7.699 7.41 7.098 6.879 6.651 6.288 6.037 5.775 5.638 5.347 5.034 4.694 4.506 4.176 3.899 3.672 3.429 2.9 2.592 2.255 1.88 1.453 0.94 0.23 -1.871 -8 ,1040 ,TETRA ,17585942,Sat Nov 27 15:39:18 CET,Sat Nov 27 17:27:53 CET,0.0 3.353 4.133 4.644 5.033 5.363 5.632 5.882 6.358 6.572 6.771 7.008 7.308 7.48 7.811 8.117 8.402 8.537 8.793 9.032 9.353 9.563 9.777 10.078 10.344 10.594 10.84 11.087 11.425 11.751 12.035 12.36 12.689 13.005 13.352 13.737 14.11 14.509 14.925 15.358 15.81 16.314 16.888 17.436 18.026 18.648 19.299 19.961 20.659 21.238 21.436 20.905 20.037 19.088 18.123 17.143 16.303 15.582 14.921 14.217 13.576 13.001 12.463 11.933 11.423 10.947 10.45 10.024 9.669 9.292 8.919 8.623 8.295 7.929 7.638 7.336 7.02 6.693 6.346 6.108 5.858 5.466 5.204 4.926 4.775 4.483 4.193 3.864 3.68 3.357 3.087 2.875 2.641 2.111 1.824 1.506 1.136 0.709 0.173 -0.606 -3.308 -9 ,26098 ,TETRA ,17585943,Sat Nov 27 15:39:20 CET,Sat Nov 27 17:27:48 CET,0.0 2.808 3.471 3.926 4.295 4.617 4.919 5.194 5.666 5.893 6.1 6.315 6.604 6.759 7.053 7.338 7.633 7.775 8.042 8.3 8.654 8.874 9.08 9.372 9.652 9.925 10.179 10.42 10.738 11.038 11.316 11.654 11.978 12.283 12.653 13.087 13.487 13.902 14.36 14.833 15.281 15.786 16.37 16.934 17.543 18.205 18.907 19.576 20.288 20.852 20.986 20.474 19.645 18.758 17.88 17.057 16.311 15.564 14.872 14.196 13.618 13.053 12.494 11.966 11.464 11.002 10.529 10.105 9.738 9.343 8.926 8.593 8.238 7.856 7.563 7.265 6.955 6.637 6.29 6.041 5.789 5.394 5.116 4.822 4.671 4.356 4.013 3.637 3.45 3.133 2.845 2.617 2.385 1.863 1.56 1.232 0.881 0.467 -0.058 -0.718 -2.692 -10 ,341 ,TETRA ,17585944,Sat Nov 27 15:40:18 CET,Sat Nov 27 17:25:19 CET,0.0 2.384 3.063 3.529 3.89 4.237 4.533 4.779 5.233 5.46 5.667 5.926 6.246 6.432 6.774 7.089 7.385 7.522 7.794 8.062 8.422 8.645 8.861 9.152 9.43 9.708 9.98 10.255 10.606 10.926 11.227 11.595 11.952 12.288 12.656 13.055 13.43 13.841 14.273 14.72 15.193 15.726 16.329 16.891 17.536 18.23 18.961 19.769 20.499 20.955 20.998 20.358 19.429 18.401 17.508 16.7 15.938 15.231 14.588 13.916 13.333 12.795 12.288 11.824 11.373 10.97 10.559 10.173 9.834 9.479 9.093 8.778 8.467 8.137 7.876 7.599 7.313 7.004 6.672 6.444 6.206 5.832 5.567 5.299 5.165 4.877 4.573 4.25 4.075 3.753 3.49 3.283 3.063 2.588 2.312 1.994 1.638 1.254 0.804 0.177 -1.554 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt deleted file mode 100644 index 423edd57..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27982 ,TETRA ,17585945,Sat Nov 27 15:40:18 CET,Sat Nov 27 17:23:38 CET,0.0 1.201 1.743 2.134 2.431 2.674 2.904 3.116 3.501 3.689 3.847 4.012 4.247 4.371 4.612 4.839 5.058 5.16 5.349 5.532 5.799 5.973 6.138 6.366 6.588 6.804 7.011 7.2 7.438 7.664 7.865 8.097 8.331 8.549 8.796 9.079 9.346 9.633 9.922 10.221 10.542 10.89 11.253 11.574 11.898 12.253 12.627 12.99 13.31 13.404 12.936 11.799 10.676 9.663 8.674 7.744 6.918 6.117 5.428 4.75 4.168 3.653 3.155 2.689 2.247 1.834 1.395 1.004 0.677 0.328 -0.044 -0.345 -0.664 -0.994 -1.25 -1.52 -1.794 -2.081 -2.38 -2.595 -2.826 -3.184 -3.424 -3.671 -3.799 -4.072 -4.367 -4.676 -4.84 -5.129 -5.361 -5.549 -5.747 -6.19 -6.435 -6.696 -7.005 -7.393 -7.842 -8.393 -10.072 -2 ,8739 ,TETRA ,17585946,Sat Nov 27 15:41:18 CET,Sat Nov 27 17:16:32 CET,0.0 1.07 1.557 1.931 2.224 2.468 2.682 2.88 3.228 3.378 3.53 3.71 3.941 4.062 4.297 4.515 4.719 4.825 5.028 5.216 5.48 5.653 5.82 6.053 6.273 6.475 6.669 6.848 7.085 7.318 7.517 7.742 7.971 8.196 8.461 8.75 9.022 9.32 9.622 9.928 10.225 10.535 10.876 11.199 11.576 11.964 12.33 12.644 12.869 12.888 12.419 11.391 10.24 9.117 8.06 7.108 6.283 5.545 4.911 4.229 3.616 3.062 2.534 2.043 1.607 1.207 0.779 0.4 0.064 -0.274 -0.614 -0.907 -1.232 -1.569 -1.822 -2.078 -2.35 -2.637 -2.939 -3.15 -3.367 -3.711 -3.955 -4.221 -4.355 -4.619 -4.906 -5.232 -5.4 -5.678 -5.901 -6.08 -6.273 -6.717 -6.969 -7.262 -7.593 -7.966 -8.428 -9.093 -11.34 -3 ,16785 ,TETRA ,17585947,Sat Nov 27 15:41:18 CET,Sat Nov 27 17:25:03 CET,0.0 1.135 1.571 1.944 2.258 2.534 2.766 2.96 3.328 3.508 3.666 3.844 4.088 4.23 4.487 4.727 4.956 5.061 5.246 5.419 5.676 5.838 5.994 6.227 6.452 6.669 6.88 7.081 7.334 7.57 7.782 8.032 8.272 8.503 8.762 9.042 9.299 9.576 9.882 10.188 10.496 10.825 11.188 11.528 11.878 12.235 12.589 12.879 13.046 12.99 12.489 11.414 10.312 9.224 8.202 7.279 6.457 5.712 5.042 4.368 3.807 3.304 2.79 2.289 1.843 1.439 1.024 0.649 0.312 -0.042 -0.413 -0.717 -1.023 -1.343 -1.602 -1.88 -2.158 -2.447 -2.763 -2.978 -3.2 -3.551 -3.795 -4.056 -4.187 -4.45 -4.736 -5.035 -5.188 -5.476 -5.711 -5.903 -6.111 -6.56 -6.814 -7.09 -7.387 -7.724 -8.146 -8.699 -10.349 -4 ,22059 ,TETRA ,17585948,Sat Nov 27 15:41:20 CET,Sat Nov 27 17:25:00 CET,0.0 1.151 1.624 1.968 2.256 2.508 2.737 2.946 3.345 3.526 3.691 3.89 4.137 4.268 4.514 4.754 4.977 5.081 5.277 5.465 5.734 5.903 6.066 6.291 6.5 6.709 6.901 7.071 7.304 7.539 7.748 7.984 8.21 8.433 8.698 8.99 9.261 9.552 9.866 10.175 10.479 10.812 11.188 11.54 11.911 12.271 12.615 12.946 13.154 13.145 12.641 11.559 10.428 9.336 8.318 7.357 6.502 5.694 5.004 4.335 3.762 3.211 2.672 2.183 1.722 1.301 0.869 0.486 0.151 -0.192 -0.557 -0.877 -1.199 -1.522 -1.78 -2.045 -2.316 -2.612 -2.937 -3.154 -3.369 -3.713 -3.951 -4.204 -4.341 -4.617 -4.894 -5.189 -5.354 -5.656 -5.908 -6.102 -6.316 -6.777 -7.026 -7.314 -7.644 -8.049 -8.539 -9.188 -10.841 -5 ,28028 ,TETRA ,17585949,Sat Nov 27 15:41:22 CET,Sat Nov 27 17:25:12 CET,0.0 1.137 1.625 1.97 2.25 2.508 2.749 2.96 3.311 3.483 3.647 3.855 4.1 4.233 4.486 4.717 4.935 5.044 5.247 5.435 5.709 5.877 6.031 6.24 6.437 6.638 6.837 7.035 7.295 7.526 7.74 7.989 8.217 8.433 8.683 8.978 9.251 9.536 9.844 10.157 10.462 10.8 11.168 11.49 11.86 12.275 12.667 12.972 13.205 13.253 12.726 11.588 10.431 9.31 8.318 7.359 6.496 5.733 5.054 4.379 3.786 3.232 2.722 2.258 1.81 1.405 0.976 0.59 0.255 -0.098 -0.464 -0.778 -1.098 -1.428 -1.693 -1.966 -2.25 -2.548 -2.853 -3.06 -3.287 -3.668 -3.935 -4.204 -4.343 -4.629 -4.928 -5.254 -5.425 -5.723 -6.0 -6.207 -6.421 -6.866 -7.093 -7.341 -7.62 -7.963 -8.429 -8.993 -10.487 -6 ,12260 ,TETRA ,17585950,Sat Nov 27 15:41:23 CET,Sat Nov 27 17:25:47 CET,0.0 1.178 1.615 1.966 2.242 2.492 2.737 2.964 3.344 3.506 3.662 3.847 4.089 4.223 4.473 4.694 4.906 5.014 5.212 5.396 5.66 5.831 5.996 6.222 6.439 6.656 6.855 7.04 7.269 7.478 7.69 7.949 8.18 8.397 8.653 8.924 9.164 9.435 9.755 10.086 10.394 10.723 11.115 11.475 11.871 12.284 12.658 12.993 13.283 13.405 13.008 12.001 10.927 9.776 8.68 7.725 6.897 6.148 5.479 4.806 4.235 3.715 3.22 2.741 2.281 1.873 1.449 1.066 0.737 0.393 0.036 -0.267 -0.585 -0.924 -1.193 -1.458 -1.727 -2.001 -2.298 -2.519 -2.743 -3.09 -3.329 -3.567 -3.691 -3.957 -4.247 -4.553 -4.722 -5.022 -5.259 -5.446 -5.649 -6.1 -6.362 -6.646 -6.949 -7.263 -7.64 -8.171 -9.757 -7 ,20877 ,TETRA ,17585951,Sat Nov 27 15:42:19 CET,Sat Nov 27 17:25:56 CET,0.0 1.351 1.816 2.159 2.441 2.688 2.898 3.084 3.43 3.598 3.759 3.953 4.199 4.328 4.57 4.801 5.021 5.126 5.321 5.519 5.799 5.953 6.095 6.323 6.541 6.741 6.938 7.129 7.376 7.609 7.824 8.074 8.317 8.555 8.808 9.083 9.352 9.648 9.963 10.266 10.571 10.927 11.308 11.656 12.037 12.39 12.723 13.033 13.304 13.383 12.918 11.898 10.776 9.686 8.707 7.821 7.007 6.255 5.628 4.969 4.372 3.852 3.354 2.852 2.396 2.007 1.586 1.204 0.83 0.382 -0.081 -0.459 -0.859 -1.285 -1.622 -1.964 -2.323 -2.708 -3.099 -3.368 -3.639 -4.085 -4.394 -4.705 -4.871 -5.213 -5.582 -5.97 -6.174 -6.5 -6.81 -7.053 -7.324 -7.907 -8.244 -8.61 -8.99 -9.434 -9.974 -10.648 -12.738 -8 ,21058 ,TETRA ,17585952,Sat Nov 27 15:42:18 CET,Sat Nov 27 17:29:15 CET,0.0 1.304 1.732 2.071 2.369 2.623 2.863 3.086 3.459 3.636 3.803 3.978 4.216 4.357 4.603 4.829 5.046 5.141 5.323 5.507 5.769 5.927 6.079 6.31 6.53 6.745 6.954 7.139 7.369 7.598 7.802 8.051 8.305 8.537 8.794 9.086 9.348 9.626 9.93 10.249 10.559 10.877 11.254 11.614 12.01 12.411 12.772 13.095 13.322 13.329 12.866 11.724 10.561 9.452 8.413 7.479 6.616 5.807 5.093 4.382 3.792 3.258 2.707 2.121 1.568 1.088 0.57 0.099 -0.304 -0.73 -1.192 -1.577 -1.963 -2.373 -2.713 -3.059 -3.407 -3.775 -4.158 -4.418 -4.696 -5.138 -5.439 -5.757 -5.928 -6.288 -6.655 -7.027 -7.217 -7.538 -7.869 -8.097 -8.334 -8.888 -9.208 -9.551 -9.93 -10.37 -10.903 -11.636 -13.59 -9 ,9253 ,TETRA ,17585953,Sat Nov 27 15:43:18 CET,Sat Nov 27 17:28:16 CET,0.0 1.117 1.619 1.989 2.279 2.515 2.726 2.922 3.27 3.435 3.6 3.784 4.022 4.158 4.414 4.638 4.846 4.946 5.133 5.314 5.567 5.73 5.892 6.124 6.343 6.552 6.751 6.945 7.203 7.435 7.643 7.894 8.127 8.348 8.607 8.915 9.194 9.459 9.763 10.084 10.394 10.726 11.065 11.425 11.835 12.206 12.589 12.94 13.168 13.15 12.693 11.609 10.47 9.41 8.386 7.461 6.665 5.918 5.251 4.584 3.996 3.472 2.972 2.493 2.04 1.614 1.172 0.773 0.429 0.065 -0.319 -0.628 -0.947 -1.271 -1.518 -1.782 -2.052 -2.332 -2.633 -2.848 -3.079 -3.442 -3.687 -3.937 -4.072 -4.356 -4.636 -4.935 -5.111 -5.408 -5.653 -5.858 -6.064 -6.48 -6.736 -7.04 -7.364 -7.7 -8.055 -8.565 -10.161 -10 ,24653 ,TETRA ,17585954,Sat Nov 27 15:44:19 CET,Sat Nov 27 17:23:42 CET,0.0 1.241 1.719 2.088 2.411 2.71 2.954 3.157 3.511 3.678 3.841 4.042 4.289 4.423 4.666 4.891 5.109 5.21 5.411 5.601 5.863 6.039 6.208 6.439 6.657 6.869 7.062 7.247 7.492 7.725 7.942 8.201 8.445 8.664 8.916 9.207 9.489 9.791 10.104 10.43 10.754 11.096 11.445 11.762 12.107 12.427 12.746 13.02 13.231 13.274 12.788 11.64 10.512 9.457 8.45 7.526 6.687 5.909 5.264 4.63 4.045 3.487 2.968 2.503 2.043 1.602 1.157 0.767 0.419 0.064 -0.296 -0.596 -0.904 -1.218 -1.473 -1.753 -2.043 -2.343 -2.652 -2.861 -3.074 -3.41 -3.657 -3.919 -4.054 -4.331 -4.63 -4.954 -5.112 -5.389 -5.611 -5.803 -6.017 -6.505 -6.769 -7.041 -7.344 -7.682 -8.114 -8.69 -10.756 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 37d12df4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31947 ,TETRA ,17585955,Sat Nov 27 15:44:19 CET,Sat Nov 27 17:34:53 CET,0.0 1.158 1.721 2.094 2.382 2.62 2.831 3.043 3.423 3.588 3.754 3.968 4.218 4.359 4.604 4.842 5.075 5.181 5.397 5.605 5.884 6.068 6.245 6.501 6.753 6.989 7.209 7.419 7.687 7.943 8.188 8.488 8.777 9.052 9.374 9.735 10.055 10.4 10.813 11.249 11.67 12.132 12.66 13.176 13.763 14.379 15.013 15.706 16.426 17.051 17.392 17.081 16.491 15.82 15.159 14.507 13.911 13.343 12.847 12.33 11.876 11.472 11.059 10.658 10.288 9.953 9.597 9.279 8.998 8.701 8.389 8.126 7.853 7.576 7.364 7.13 6.88 6.614 6.358 6.189 6.003 5.707 5.5 5.274 5.156 4.919 4.66 4.391 4.252 4.001 3.793 3.623 3.436 2.996 2.766 2.522 2.25 1.954 1.608 1.117 -0.3 -2 ,10715 ,TETRA ,17585956,Sat Nov 27 15:44:19 CET,Sat Nov 27 17:19:09 CET,0.0 1.38 1.933 2.314 2.613 2.868 3.102 3.315 3.66 3.823 3.994 4.203 4.451 4.596 4.87 5.116 5.337 5.447 5.67 5.872 6.157 6.338 6.508 6.761 7.02 7.269 7.506 7.73 8.016 8.283 8.537 8.832 9.111 9.387 9.704 10.045 10.363 10.712 11.09 11.506 11.94 12.385 12.863 13.344 13.888 14.491 15.167 15.845 16.558 17.173 17.445 17.155 16.651 16.12 15.575 15.008 14.464 13.891 13.353 12.83 12.374 11.959 11.556 11.188 10.835 10.494 10.14 9.812 9.526 9.232 8.927 8.675 8.406 8.116 7.89 7.66 7.43 7.183 6.906 6.72 6.536 6.245 6.036 5.809 5.691 5.455 5.215 4.959 4.817 4.56 4.328 4.15 3.966 3.54 3.316 3.072 2.777 2.429 2.001 1.448 0.411 -3 ,9918 ,TETRA ,17585957,Sat Nov 27 15:44:19 CET,Sat Nov 27 17:27:03 CET,0.0 1.31 1.835 2.252 2.566 2.825 3.048 3.271 3.682 3.853 4.012 4.213 4.462 4.591 4.827 5.054 5.281 5.396 5.607 5.809 6.087 6.263 6.438 6.684 6.924 7.164 7.391 7.602 7.877 8.144 8.399 8.694 8.968 9.243 9.579 9.941 10.249 10.582 10.953 11.342 11.756 12.233 12.796 13.309 13.841 14.417 15.022 15.673 16.379 16.974 17.236 16.83 16.199 15.568 14.951 14.317 13.714 13.163 12.678 12.155 11.691 11.274 10.877 10.478 10.095 9.767 9.414 9.091 8.814 8.527 8.235 7.984 7.721 7.433 7.207 6.984 6.746 6.497 6.239 6.056 5.867 5.561 5.346 5.121 5.005 4.761 4.504 4.226 4.075 3.825 3.614 3.444 3.267 2.873 2.655 2.423 2.124 1.774 1.394 0.872 -0.43 -4 ,11178 ,TETRA ,17585958,Sat Nov 27 15:45:21 CET,Sat Nov 27 17:29:12 CET,0.0 1.208 1.706 2.075 2.375 2.633 2.853 3.07 3.478 3.647 3.809 4.036 4.285 4.423 4.69 4.938 5.172 5.279 5.484 5.686 5.982 6.167 6.343 6.61 6.859 7.089 7.314 7.53 7.808 8.085 8.34 8.638 8.932 9.207 9.517 9.878 10.216 10.56 10.938 11.333 11.724 12.152 12.663 13.172 13.749 14.367 15.0 15.659 16.323 16.933 17.287 16.944 16.361 15.735 15.107 14.529 13.955 13.381 12.866 12.333 11.867 11.466 11.082 10.698 10.315 9.95 9.582 9.26 8.982 8.695 8.392 8.133 7.865 7.594 7.383 7.15 6.902 6.655 6.386 6.201 6.01 5.708 5.505 5.297 5.184 4.942 4.69 4.426 4.288 4.047 3.832 3.627 3.397 2.908 2.609 2.278 1.92 1.503 0.998 0.258 -1.888 -5 ,27532 ,TETRA ,17585959,Sat Nov 27 15:45:21 CET,Sat Nov 27 17:43:06 CET,0.0 0.944 1.451 1.871 2.195 2.462 2.706 2.929 3.306 3.473 3.627 3.824 4.076 4.217 4.475 4.714 4.942 5.052 5.265 5.462 5.751 5.938 6.119 6.375 6.608 6.841 7.07 7.284 7.564 7.84 8.089 8.377 8.653 8.926 9.242 9.586 9.923 10.295 10.666 11.051 11.454 11.912 12.437 12.944 13.533 14.133 14.784 15.444 16.088 16.668 17.019 16.834 16.275 15.653 15.03 14.394 13.78 13.198 12.719 12.218 11.756 11.326 10.905 10.5 10.113 9.777 9.427 9.106 8.824 8.529 8.219 7.965 7.697 7.414 7.189 6.949 6.7 6.442 6.174 5.987 5.798 5.521 5.325 5.108 4.991 4.739 4.473 4.194 4.053 3.793 3.548 3.377 3.202 2.801 2.579 2.336 2.057 1.729 1.324 0.751 -0.639 -6 ,11329 ,TETRA ,17585960,Sat Nov 27 15:45:21 CET,Sat Nov 27 17:29:38 CET,0.0 1.179 1.605 1.947 2.246 2.504 2.745 2.968 3.375 3.56 3.722 3.915 4.161 4.298 4.562 4.811 5.036 5.142 5.354 5.562 5.864 6.061 6.25 6.507 6.751 6.988 7.221 7.438 7.706 7.973 8.228 8.539 8.836 9.107 9.408 9.744 10.077 10.447 10.833 11.231 11.633 12.083 12.616 13.105 13.633 14.234 14.894 15.561 16.239 16.802 17.093 16.762 16.159 15.58 15.007 14.394 13.833 13.317 12.833 12.319 11.882 11.487 11.089 10.7 10.327 9.98 9.614 9.298 9.02 8.724 8.424 8.179 7.908 7.623 7.412 7.19 6.955 6.705 6.429 6.237 6.04 5.734 5.523 5.299 5.183 4.95 4.716 4.461 4.316 4.055 3.828 3.648 3.446 3.021 2.801 2.561 2.268 1.947 1.568 1.077 -0.776 -7 ,21568 ,TETRA ,17585961,Sat Nov 27 15:45:21 CET,Sat Nov 27 17:21:51 CET,0.0 1.799 2.452 2.937 3.351 3.697 4.024 4.322 4.803 5.031 5.263 5.594 5.887 6.064 6.419 6.753 7.065 7.216 7.496 7.771 8.158 8.393 8.602 8.853 9.082 9.31 9.531 9.743 10.02 10.293 10.55 10.855 11.144 11.421 11.727 12.073 12.4 12.749 13.144 13.565 13.979 14.434 14.962 15.48 16.065 16.639 17.247 17.912 18.583 19.21 19.592 19.426 18.927 18.295 17.673 17.053 16.428 15.842 15.319 14.782 14.322 13.906 13.484 13.082 12.724 12.393 12.046 11.731 11.455 11.167 10.848 10.566 10.276 9.986 9.758 9.522 9.28 9.023 8.758 8.571 8.379 8.093 7.887 7.668 7.559 7.337 7.101 6.84 6.69 6.431 6.233 6.063 5.879 5.507 5.29 5.046 4.783 4.465 4.074 3.562 2.469 -8 ,12539 ,TETRA ,17585962,Sat Nov 27 15:46:19 CET,Sat Nov 27 17:30:43 CET,0.0 1.249 1.75 2.107 2.388 2.654 2.901 3.117 3.482 3.639 3.79 3.999 4.252 4.393 4.656 4.895 5.118 5.232 5.451 5.654 5.955 6.138 6.308 6.551 6.781 7.012 7.251 7.471 7.729 7.995 8.251 8.555 8.844 9.124 9.439 9.785 10.118 10.482 10.875 11.278 11.673 12.091 12.581 13.075 13.656 14.279 14.964 15.669 16.368 16.994 17.255 16.919 16.345 15.643 14.993 14.37 13.781 13.235 12.723 12.202 11.749 11.323 10.926 10.56 10.201 9.855 9.477 9.144 8.865 8.563 8.258 8.013 7.738 7.436 7.2 6.96 6.708 6.444 6.185 6.005 5.819 5.523 5.305 5.082 4.962 4.709 4.442 4.155 4.003 3.745 3.536 3.366 3.187 2.783 2.566 2.328 2.047 1.694 1.278 0.744 -0.69 -9 ,27014 ,TETRA ,17585963,Sat Nov 27 15:46:21 CET,Sat Nov 27 17:31:59 CET,0.0 1.135 1.618 1.988 2.289 2.537 2.755 2.961 3.328 3.484 3.644 3.857 4.101 4.241 4.501 4.746 4.981 5.092 5.3 5.504 5.797 5.975 6.15 6.407 6.653 6.887 7.11 7.329 7.609 7.87 8.124 8.417 8.693 8.961 9.279 9.626 9.955 10.32 10.693 11.082 11.502 11.964 12.475 12.984 13.55 14.129 14.794 15.512 16.242 16.892 17.239 16.918 16.317 15.68 15.044 14.431 13.873 13.323 12.831 12.322 11.872 11.444 11.023 10.645 10.301 9.978 9.629 9.322 9.05 8.756 8.444 8.187 7.914 7.612 7.38 7.135 6.877 6.618 6.361 6.176 5.971 5.67 5.474 5.265 5.152 4.906 4.656 4.396 4.244 3.977 3.751 3.582 3.393 2.991 2.777 2.539 2.286 1.966 1.566 1.071 -0.069 -10 ,15167 ,TETRA ,17585964,Sat Nov 27 15:46:23 CET,Sat Nov 27 17:22:57 CET,0.0 1.266 1.768 2.136 2.434 2.706 2.936 3.15 3.557 3.743 3.907 4.087 4.341 4.489 4.748 4.975 5.195 5.301 5.502 5.71 6.018 6.199 6.367 6.613 6.841 7.069 7.286 7.486 7.758 8.03 8.282 8.564 8.834 9.101 9.411 9.759 10.085 10.441 10.834 11.237 11.646 12.103 12.619 13.134 13.709 14.296 14.963 15.661 16.362 17.017 17.387 17.198 16.693 16.046 15.391 14.779 14.21 13.686 13.214 12.694 12.232 11.813 11.414 11.031 10.659 10.312 9.944 9.615 9.329 9.041 8.739 8.482 8.215 7.922 7.701 7.477 7.243 7.003 6.747 6.565 6.378 6.074 5.854 5.632 5.516 5.279 5.051 4.786 4.63 4.368 4.131 3.955 3.786 3.401 3.173 2.926 2.641 2.315 1.948 1.424 -0.097 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 59edc5ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9258 ,TETRA ,17585965,Sat Nov 27 15:47:19 CET,Sat Nov 27 17:25:06 CET,0.0 1.05 1.499 1.875 2.184 2.455 2.698 2.908 3.278 3.449 3.618 3.841 4.098 4.245 4.512 4.759 4.999 5.109 5.315 5.531 5.834 6.021 6.204 6.462 6.71 6.952 7.188 7.413 7.688 7.945 8.202 8.516 8.818 9.113 9.437 9.802 10.154 10.518 10.918 11.345 11.784 12.266 12.802 13.33 13.934 14.541 15.188 15.887 16.613 17.248 17.556 17.339 16.872 16.284 15.702 15.135 14.612 14.136 13.706 13.252 12.852 12.485 12.139 11.824 11.503 11.198 10.884 10.599 10.342 10.071 9.799 9.564 9.319 9.066 8.863 8.653 8.44 8.218 7.989 7.829 7.662 7.403 7.216 7.007 6.903 6.696 6.468 6.212 6.084 5.859 5.663 5.492 5.315 4.961 4.763 4.541 4.293 4.001 3.642 3.204 1.946 -2 ,23133 ,TETRA ,17585966,Sat Nov 27 15:47:21 CET,Sat Nov 27 17:34:08 CET,0.0 1.212 1.691 2.076 2.393 2.661 2.915 3.15 3.554 3.728 3.899 4.115 4.364 4.506 4.777 5.024 5.254 5.368 5.588 5.796 6.096 6.282 6.455 6.707 6.955 7.201 7.439 7.667 7.95 8.216 8.472 8.779 9.078 9.375 9.709 10.072 10.408 10.77 11.157 11.559 11.979 12.428 12.941 13.47 14.065 14.667 15.33 16.023 16.741 17.413 17.844 17.713 17.259 16.763 16.225 15.656 15.148 14.659 14.213 13.758 13.365 12.997 12.624 12.278 11.957 11.663 11.363 11.088 10.838 10.574 10.289 10.044 9.792 9.537 9.339 9.134 8.916 8.688 8.465 8.297 8.111 7.84 7.656 7.468 7.369 7.151 6.912 6.645 6.505 6.269 6.087 5.939 5.781 5.454 5.265 5.038 4.771 4.45 4.082 3.637 2.397 -3 ,6785 ,TETRA ,17585967,Sat Nov 27 15:47:21 CET,Sat Nov 27 17:31:12 CET,0.0 1.293 1.77 2.112 2.401 2.664 2.901 3.125 3.521 3.708 3.895 4.118 4.365 4.509 4.78 5.032 5.272 5.386 5.607 5.825 6.129 6.32 6.508 6.781 7.044 7.293 7.528 7.742 8.011 8.281 8.535 8.836 9.133 9.424 9.752 10.104 10.453 10.839 11.237 11.637 12.052 12.5 13.015 13.557 14.189 14.848 15.514 16.173 16.872 17.541 17.999 17.832 17.368 16.829 16.286 15.761 15.265 14.774 14.324 13.867 13.456 13.088 12.74 12.408 12.094 11.795 11.479 11.194 10.943 10.693 10.431 10.209 9.98 9.725 9.514 9.3 9.079 8.841 8.587 8.411 8.229 7.953 7.764 7.549 7.437 7.21 6.977 6.726 6.586 6.343 6.13 5.96 5.783 5.412 5.211 4.985 4.741 4.464 4.105 3.639 2.577 -4 ,13702 ,TETRA ,17585968,Sat Nov 27 15:47:22 CET,Sat Nov 27 17:30:51 CET,0.0 1.132 1.56 1.948 2.302 2.576 2.806 3.009 3.371 3.544 3.722 3.951 4.205 4.345 4.605 4.859 5.099 5.211 5.425 5.619 5.898 6.081 6.27 6.547 6.803 7.045 7.281 7.51 7.809 8.091 8.34 8.653 8.963 9.254 9.585 9.951 10.299 10.663 11.044 11.436 11.854 12.306 12.823 13.375 13.996 14.59 15.167 15.777 16.398 16.982 17.366 17.156 16.69 16.134 15.578 15.021 14.503 14.003 13.56 13.103 12.698 12.336 11.996 11.668 11.365 11.084 10.764 10.466 10.209 9.939 9.657 9.433 9.198 8.941 8.731 8.514 8.306 8.087 7.842 7.665 7.491 7.224 7.033 6.839 6.732 6.507 6.264 6.006 5.869 5.618 5.402 5.229 5.043 4.666 4.468 4.233 3.959 3.653 3.275 2.76 1.522 -5 ,9702 ,TETRA ,17585969,Sat Nov 27 15:47:21 CET,Sat Nov 27 17:43:29 CET,0.0 1.213 1.672 2.013 2.307 2.578 2.815 3.034 3.435 3.612 3.784 4.013 4.263 4.406 4.671 4.908 5.142 5.26 5.481 5.69 5.993 6.183 6.369 6.641 6.904 7.154 7.391 7.605 7.872 8.132 8.388 8.697 8.977 9.252 9.576 9.926 10.263 10.621 11.0 11.406 11.84 12.318 12.845 13.366 13.957 14.597 15.279 15.961 16.653 17.259 17.68 17.602 17.194 16.666 16.145 15.651 15.169 14.688 14.261 13.826 13.44 13.082 12.721 12.377 12.066 11.785 11.479 11.196 10.95 10.692 10.415 10.185 9.945 9.694 9.495 9.279 9.053 8.814 8.566 8.404 8.239 7.979 7.798 7.604 7.499 7.27 7.043 6.815 6.687 6.453 6.264 6.107 5.933 5.56 5.351 5.12 4.863 4.575 4.242 3.774 2.733 -6 ,18742 ,TETRA ,17585970,Sat Nov 27 15:47:21 CET,Sat Nov 27 17:24:34 CET,0.0 1.015 1.436 1.817 2.141 2.401 2.642 2.851 3.206 3.386 3.555 3.749 3.998 4.147 4.4 4.638 4.883 5.0 5.232 5.451 5.751 5.946 6.138 6.407 6.659 6.891 7.109 7.329 7.609 7.872 8.122 8.439 8.75 9.037 9.363 9.737 10.101 10.47 10.867 11.284 11.704 12.165 12.697 13.243 13.863 14.503 15.169 15.853 16.573 17.266 17.698 17.547 17.126 16.625 16.067 15.515 15.0 14.512 14.068 13.597 13.186 12.798 12.428 12.087 11.767 11.467 11.151 10.865 10.609 10.342 10.066 9.841 9.605 9.345 9.143 8.931 8.713 8.49 8.242 8.072 7.905 7.639 7.451 7.255 7.152 6.939 6.715 6.485 6.363 6.127 5.932 5.783 5.621 5.27 5.074 4.844 4.564 4.242 3.868 3.343 1.92 -7 ,5836 ,TETRA ,17585971,Sat Nov 27 15:47:21 CET,Sat Nov 27 17:30:41 CET,0.0 1.246 1.748 2.084 2.386 2.657 2.907 3.129 3.535 3.728 3.901 4.104 4.353 4.495 4.749 4.99 5.225 5.339 5.565 5.778 6.07 6.262 6.453 6.714 6.96 7.199 7.437 7.664 7.944 8.219 8.479 8.788 9.078 9.348 9.668 10.04 10.38 10.732 11.134 11.565 12.006 12.481 13.02 13.545 14.102 14.7 15.346 15.995 16.682 17.369 17.759 17.559 17.164 16.667 16.14 15.624 15.124 14.615 14.165 13.721 13.327 12.975 12.63 12.289 11.971 11.667 11.332 11.044 10.805 10.537 10.234 9.989 9.742 9.489 9.29 9.088 8.869 8.632 8.399 8.235 8.065 7.797 7.612 7.416 7.315 7.102 6.86 6.604 6.474 6.239 6.037 5.876 5.717 5.406 5.23 5.028 4.777 4.441 4.072 3.624 2.511 -8 ,26636 ,TETRA ,17585972,Sat Nov 27 15:48:20 CET,Sat Nov 27 17:31:55 CET,0.0 1.378 1.853 2.227 2.517 2.764 3.009 3.236 3.629 3.81 3.981 4.211 4.465 4.602 4.877 5.142 5.394 5.514 5.744 5.954 6.239 6.425 6.609 6.881 7.141 7.393 7.623 7.84 8.133 8.412 8.676 8.996 9.306 9.589 9.897 10.229 10.549 10.914 11.311 11.725 12.15 12.602 13.115 13.631 14.213 14.85 15.526 16.142 16.775 17.403 17.701 17.455 16.999 16.469 15.904 15.328 14.826 14.353 13.917 13.454 13.041 12.676 12.332 11.996 11.669 11.376 11.081 10.816 10.57 10.301 10.011 9.771 9.531 9.282 9.088 8.879 8.656 8.43 8.198 8.031 7.859 7.587 7.388 7.182 7.075 6.847 6.62 6.378 6.239 5.998 5.823 5.675 5.517 5.156 4.947 4.723 4.479 4.21 3.905 3.435 2.365 -9 ,5114 ,TETRA ,17585973,Sat Nov 27 15:48:19 CET,Sat Nov 27 17:31:46 CET,0.0 1.09 1.566 1.951 2.253 2.518 2.775 3.019 3.437 3.631 3.816 4.03 4.271 4.404 4.661 4.909 5.143 5.252 5.463 5.672 5.978 6.179 6.375 6.641 6.881 7.11 7.345 7.576 7.868 8.145 8.412 8.74 9.036 9.314 9.643 10.005 10.351 10.722 11.122 11.522 11.916 12.376 12.921 13.449 14.02 14.608 15.218 15.844 16.498 17.073 17.421 17.239 16.77 16.15 15.544 15.012 14.523 14.012 13.542 13.085 12.687 12.31 11.947 11.606 11.284 10.992 10.688 10.413 10.163 9.898 9.621 9.384 9.131 8.876 8.693 8.489 8.254 8.023 7.8 7.634 7.452 7.17 6.974 6.778 6.675 6.461 6.238 6.004 5.878 5.643 5.462 5.311 5.135 4.735 4.525 4.295 4.015 3.736 3.426 2.967 1.926 -10 ,516 ,TETRA ,17585974,Sat Nov 27 15:48:20 CET,Sat Nov 27 17:31:49 CET,0.0 1.228 1.73 2.088 2.404 2.676 2.903 3.108 3.482 3.662 3.828 4.032 4.283 4.421 4.678 4.926 5.158 5.27 5.495 5.71 6.004 6.189 6.371 6.633 6.883 7.124 7.354 7.577 7.863 8.125 8.374 8.684 8.98 9.25 9.567 9.941 10.297 10.677 11.083 11.507 11.939 12.414 12.956 13.472 14.029 14.631 15.296 15.951 16.664 17.339 17.716 17.545 17.094 16.578 16.052 15.538 15.027 14.527 14.075 13.604 13.197 12.817 12.438 12.1 11.778 11.462 11.134 10.834 10.572 10.304 10.023 9.793 9.566 9.326 9.122 8.915 8.708 8.488 8.251 8.08 7.913 7.655 7.47 7.286 7.188 6.964 6.721 6.461 6.329 6.099 5.896 5.727 5.56 5.197 4.991 4.765 4.515 4.244 3.917 3.471 2.526 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt deleted file mode 100644 index 84314f29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1307 ,TETRA ,17585975,Sat Nov 27 15:48:19 CET,Sat Nov 27 17:31:29 CET,0.0 1.086 1.594 1.956 2.25 2.515 2.753 2.968 3.346 3.521 3.686 3.892 4.149 4.294 4.561 4.823 5.071 5.193 5.418 5.615 5.905 6.097 6.293 6.584 6.847 7.091 7.32 7.545 7.837 8.122 8.392 8.705 9.019 9.324 9.673 10.061 10.423 10.816 11.236 11.7 12.183 12.702 13.305 13.918 14.583 15.287 16.114 17.035 18.082 19.155 20.114 20.587 20.619 20.458 20.187 19.878 19.558 19.236 18.94 18.626 18.346 18.083 17.814 17.541 17.284 17.055 16.81 16.583 16.375 16.161 15.931 15.736 15.532 15.293 15.107 14.923 14.725 14.525 14.322 14.173 14.016 13.765 13.579 13.38 13.28 13.078 12.868 12.632 12.508 12.291 12.125 11.983 11.819 11.442 11.244 11.032 10.787 10.515 10.204 9.77 8.846 -2 ,369 ,TETRA ,17585976,Sat Nov 27 15:48:20 CET,Sat Nov 27 17:31:39 CET,0.0 1.289 1.74 2.106 2.404 2.646 2.847 3.043 3.426 3.6 3.756 3.968 4.229 4.369 4.638 4.891 5.135 5.255 5.488 5.718 6.029 6.22 6.407 6.676 6.927 7.165 7.402 7.628 7.912 8.199 8.474 8.808 9.14 9.44 9.77 10.143 10.498 10.896 11.322 11.766 12.236 12.776 13.39 13.964 14.625 15.364 16.175 17.055 18.031 19.084 20.136 20.705 20.868 20.768 20.566 20.314 20.007 19.687 19.385 19.065 18.794 18.535 18.268 18.005 17.744 17.502 17.246 17.006 16.788 16.561 16.316 16.121 15.934 15.719 15.538 15.353 15.175 14.981 14.762 14.618 14.465 14.214 14.03 13.835 13.735 13.517 13.278 13.047 12.928 12.705 12.532 12.388 12.237 11.892 11.685 11.459 11.216 10.923 10.542 10.097 8.836 -3 ,25703 ,TETRA ,17585977,Sat Nov 27 15:49:20 CET,Sat Nov 27 17:32:25 CET,0.0 1.442 1.937 2.346 2.652 2.921 3.146 3.359 3.776 3.964 4.131 4.332 4.579 4.718 4.988 5.236 5.465 5.577 5.794 5.997 6.277 6.461 6.649 6.923 7.188 7.441 7.686 7.92 8.222 8.533 8.822 9.143 9.454 9.748 10.092 10.483 10.844 11.237 11.672 12.121 12.576 13.085 13.674 14.313 15.025 15.756 16.605 17.507 18.464 19.489 20.532 21.05 21.117 21.025 20.828 20.563 20.299 19.993 19.69 19.394 19.108 18.833 18.569 18.305 18.056 17.827 17.576 17.349 17.143 16.914 16.674 16.467 16.254 16.044 15.874 15.682 15.487 15.292 15.079 14.927 14.775 14.529 14.351 14.177 14.084 13.899 13.697 13.461 13.336 13.115 12.926 12.763 12.595 12.231 12.022 11.788 11.538 11.253 10.882 10.405 9.341 -4 ,20687 ,TETRA ,17585978,Sat Nov 27 15:49:19 CET,Sat Nov 27 17:35:49 CET,0.0 1.009 1.442 1.785 2.09 2.349 2.579 2.802 3.194 3.36 3.524 3.745 3.993 4.13 4.396 4.641 4.86 4.971 5.194 5.416 5.728 5.918 6.107 6.385 6.645 6.89 7.131 7.359 7.643 7.922 8.19 8.508 8.811 9.104 9.452 9.839 10.205 10.621 11.055 11.509 11.994 12.54 13.18 13.793 14.488 15.233 16.064 16.981 17.959 19.012 20.083 20.635 20.674 20.508 20.262 19.967 19.664 19.336 19.042 18.735 18.432 18.145 17.876 17.611 17.358 17.107 16.861 16.654 16.451 16.229 15.989 15.786 15.582 15.371 15.204 15.023 14.833 14.633 14.423 14.281 14.133 13.886 13.711 13.521 13.419 13.217 13.011 12.8 12.683 12.465 12.306 12.169 12.016 11.67 11.476 11.243 10.973 10.696 10.351 9.855 8.462 -5 ,21086 ,TETRA ,17585979,Sat Nov 27 15:49:20 CET,Sat Nov 27 17:32:43 CET,0.0 1.295 1.789 2.144 2.44 2.701 2.932 3.137 3.516 3.697 3.871 4.084 4.331 4.475 4.746 5.002 5.249 5.367 5.599 5.82 6.129 6.319 6.499 6.759 7.012 7.261 7.505 7.737 8.035 8.327 8.604 8.925 9.216 9.498 9.837 10.207 10.56 10.958 11.387 11.844 12.326 12.861 13.476 14.077 14.766 15.539 16.395 17.319 18.346 19.434 20.528 21.093 21.174 21.006 20.76 20.493 20.197 19.879 19.592 19.297 19.025 18.749 18.462 18.206 17.969 17.736 17.473 17.232 17.018 16.788 16.546 16.339 16.128 15.911 15.736 15.553 15.366 15.164 14.935 14.766 14.596 14.352 14.183 13.999 13.899 13.686 13.457 13.216 13.095 12.881 12.724 12.573 12.409 12.058 11.848 11.634 11.408 11.134 10.781 10.295 9.191 -6 ,2138 ,TETRA ,17585980,Sat Nov 27 15:49:20 CET,Sat Nov 27 17:32:24 CET,0.0 1.815 2.449 2.909 3.301 3.641 3.947 4.235 4.743 4.978 5.198 5.517 5.83 6.017 6.362 6.714 7.059 7.22 7.518 7.793 8.192 8.461 8.713 9.053 9.389 9.719 10.028 10.292 10.585 10.86 11.125 11.442 11.747 12.052 12.393 12.781 13.164 13.566 13.99 14.437 14.907 15.44 16.054 16.646 17.314 18.052 18.894 19.807 20.817 21.892 22.945 23.511 23.594 23.491 23.247 22.921 22.597 22.256 21.941 21.618 21.339 21.074 20.804 20.543 20.295 20.056 19.798 19.579 19.376 19.15 18.907 18.701 18.495 18.263 18.072 17.876 17.672 17.462 17.241 17.089 16.932 16.677 16.495 16.31 16.211 16.003 15.782 15.54 15.415 15.188 15.008 14.862 14.699 14.331 14.132 13.91 13.664 13.378 13.0 12.496 11.181 -7 ,11261 ,TETRA ,17585981,Sat Nov 27 15:49:20 CET,Sat Nov 27 17:31:56 CET,0.0 1.075 1.546 1.903 2.201 2.439 2.654 2.855 3.198 3.365 3.529 3.738 3.979 4.109 4.367 4.61 4.836 4.95 5.181 5.414 5.73 5.916 6.099 6.371 6.627 6.875 7.119 7.359 7.66 7.936 8.204 8.529 8.844 9.148 9.5 9.902 10.277 10.682 11.114 11.555 12.024 12.569 13.22 13.858 14.557 15.314 16.137 17.02 18.053 19.139 20.183 20.768 20.809 20.657 20.448 20.176 19.848 19.518 19.249 18.937 18.633 18.364 18.086 17.807 17.529 17.282 17.044 16.824 16.62 16.388 16.14 15.943 15.741 15.526 15.347 15.158 14.968 14.768 14.546 14.387 14.224 13.965 13.785 13.598 13.5 13.29 13.064 12.83 12.705 12.487 12.328 12.184 12.026 11.667 11.462 11.246 10.986 10.66 10.3 9.857 8.807 -8 ,8598 ,TETRA ,17585982,Sat Nov 27 15:49:20 CET,Sat Nov 27 17:32:54 CET,0.0 1.473 1.999 2.35 2.639 2.907 3.148 3.37 3.785 3.969 4.129 4.326 4.575 4.716 4.995 5.259 5.5 5.618 5.857 6.088 6.419 6.621 6.809 7.073 7.323 7.569 7.8 8.01 8.291 8.563 8.818 9.134 9.444 9.739 10.076 10.459 10.815 11.209 11.64 12.088 12.561 13.077 13.654 14.22 14.88 15.625 16.442 17.332 18.365 19.472 20.563 21.102 21.156 20.995 20.752 20.49 20.204 19.918 19.628 19.295 18.999 18.719 18.46 18.221 17.986 17.763 17.506 17.254 17.043 16.83 16.594 16.404 16.218 15.999 15.815 15.62 15.414 15.208 14.996 14.851 14.691 14.429 14.251 14.049 13.944 13.734 13.509 13.27 13.152 12.934 12.748 12.588 12.41 12.035 11.817 11.579 11.328 11.034 10.685 10.253 9.109 -9 ,32533 ,TETRA ,17585983,Sat Nov 27 15:49:21 CET,Sat Nov 27 17:28:47 CET,0.0 1.111 1.609 1.992 2.301 2.577 2.82 3.039 3.426 3.594 3.753 3.976 4.231 4.372 4.643 4.891 5.129 5.243 5.451 5.654 5.959 6.157 6.342 6.596 6.839 7.079 7.318 7.551 7.848 8.129 8.398 8.721 9.039 9.349 9.71 10.113 10.49 10.908 11.347 11.771 12.226 12.774 13.379 13.974 14.667 15.422 16.242 17.104 18.065 19.082 20.114 20.684 20.761 20.622 20.395 20.132 19.849 19.542 19.228 18.892 18.602 18.329 18.061 17.803 17.546 17.304 17.052 16.829 16.615 16.388 16.151 15.95 15.74 15.521 15.348 15.156 14.957 14.745 14.514 14.36 14.204 13.946 13.761 13.57 13.475 13.282 13.074 12.852 12.734 12.506 12.317 12.184 12.025 11.631 11.424 11.199 10.953 10.683 10.347 9.898 8.831 -10 ,8150 ,TETRA ,17585984,Sat Nov 27 15:49:20 CET,Sat Nov 27 17:33:03 CET,0.0 1.151 1.683 2.062 2.342 2.584 2.82 3.038 3.413 3.6 3.78 3.996 4.256 4.407 4.683 4.938 5.186 5.308 5.525 5.722 6.027 6.229 6.417 6.682 6.935 7.188 7.432 7.661 7.946 8.226 8.506 8.838 9.146 9.441 9.782 10.15 10.503 10.909 11.347 11.788 12.236 12.763 13.374 13.964 14.659 15.427 16.271 17.162 18.11 19.172 20.298 20.819 20.888 20.777 20.572 20.31 20.004 19.699 19.426 19.125 18.854 18.603 18.345 18.08 17.821 17.572 17.309 17.066 16.848 16.614 16.355 16.146 15.932 15.699 15.519 15.332 15.138 14.934 14.701 14.548 14.401 14.151 13.961 13.766 13.668 13.466 13.263 13.022 12.886 12.661 12.476 12.318 12.147 11.778 11.584 11.381 11.144 10.855 10.511 10.068 9.055 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt deleted file mode 100644 index 0174cd5e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24021 ,TETRA ,17585985,Sat Nov 27 15:49:21 CET,Sat Nov 27 17:32:25 CET,0.0 0.94 1.432 1.782 2.022 2.205 2.365 2.516 2.81 2.951 3.071 3.179 3.387 3.488 3.692 3.886 4.06 4.141 4.296 4.45 4.676 4.82 4.956 5.151 5.33 5.49 5.643 5.789 5.984 6.171 6.348 6.562 6.751 6.923 7.124 7.369 7.594 7.822 8.062 8.308 8.569 8.841 9.126 9.395 9.67 9.957 10.276 10.576 10.792 10.891 10.644 9.914 9.135 8.401 7.738 7.091 6.488 5.904 5.376 4.861 4.416 4.008 3.611 3.224 2.829 2.466 2.105 1.771 1.482 1.182 0.858 0.595 0.323 0.028 -0.194 -0.424 -0.675 -0.941 -1.219 -1.415 -1.621 -1.948 -2.173 -2.4 -2.527 -2.807 -3.083 -3.394 -3.568 -3.847 -4.077 -4.261 -4.462 -4.875 -5.106 -5.363 -5.655 -6.04 -6.523 -7.157 -8.997 -2 ,14772 ,TETRA ,17585986,Sat Nov 27 15:50:20 CET,Sat Nov 27 17:32:33 CET,0.0 0.86 1.195 1.49 1.744 1.966 2.165 2.345 2.648 2.781 2.915 3.058 3.265 3.372 3.587 3.787 3.981 4.07 4.237 4.404 4.631 4.777 4.917 5.116 5.308 5.502 5.689 5.842 6.027 6.221 6.425 6.67 6.896 7.104 7.338 7.579 7.791 8.03 8.283 8.553 8.824 9.102 9.419 9.702 9.989 10.273 10.556 10.86 11.091 11.147 10.786 9.896 9.007 8.126 7.274 6.484 5.763 5.113 4.561 3.966 3.428 2.946 2.476 2.03 1.597 1.211 0.806 0.425 0.105 -0.218 -0.562 -0.859 -1.171 -1.51 -1.768 -2.024 -2.304 -2.609 -2.934 -3.152 -3.373 -3.725 -3.976 -4.246 -4.389 -4.695 -5.019 -5.35 -5.526 -5.823 -6.122 -6.337 -6.563 -7.082 -7.371 -7.687 -8.033 -8.431 -8.966 -9.709 -11.665 -3 ,24291 ,TETRA ,17585987,Sat Nov 27 15:50:20 CET,Sat Nov 27 17:32:49 CET,0.0 0.745 1.158 1.482 1.745 1.955 2.123 2.293 2.617 2.758 2.891 3.018 3.222 3.328 3.536 3.738 3.925 4.015 4.197 4.364 4.589 4.729 4.868 5.058 5.224 5.389 5.552 5.701 5.889 6.071 6.246 6.448 6.629 6.8 7.003 7.219 7.424 7.647 7.887 8.129 8.376 8.662 8.987 9.274 9.574 9.911 10.27 10.56 10.742 10.78 10.422 9.574 8.687 7.831 7.032 6.246 5.548 4.916 4.346 3.754 3.212 2.736 2.294 1.849 1.423 1.049 0.653 0.278 -0.054 -0.398 -0.765 -1.057 -1.356 -1.686 -1.947 -2.221 -2.507 -2.803 -3.125 -3.353 -3.587 -3.959 -4.213 -4.485 -4.635 -4.952 -5.274 -5.603 -5.782 -6.094 -6.409 -6.618 -6.834 -7.353 -7.661 -7.973 -8.304 -8.671 -9.129 -9.794 -11.794 -4 ,31829 ,TETRA ,17585988,Sat Nov 27 15:50:20 CET,Sat Nov 27 17:35:29 CET,0.0 1.172 1.689 2.06 2.337 2.537 2.714 2.88 3.197 3.351 3.494 3.641 3.858 3.967 4.165 4.347 4.517 4.604 4.781 4.941 5.159 5.302 5.436 5.619 5.79 5.957 6.116 6.271 6.478 6.672 6.842 7.03 7.206 7.38 7.583 7.801 8.006 8.219 8.441 8.681 8.932 9.197 9.49 9.77 10.066 10.373 10.663 10.915 11.117 11.198 10.941 10.205 9.395 8.6 7.871 7.157 6.492 5.912 5.399 4.866 4.394 3.968 3.564 3.184 2.825 2.489 2.136 1.808 1.511 1.198 0.867 0.598 0.315 0.014 -0.214 -0.444 -0.683 -0.948 -1.225 -1.413 -1.616 -1.942 -2.174 -2.406 -2.52 -2.756 -3.02 -3.314 -3.468 -3.739 -4.001 -4.194 -4.406 -4.898 -5.15 -5.402 -5.682 -6.004 -6.402 -6.928 -8.786 -5 ,21089 ,TETRA ,17585989,Sat Nov 27 15:51:19 CET,Sat Nov 27 17:33:27 CET,0.0 1.252 1.642 1.942 2.189 2.414 2.62 2.792 3.117 3.269 3.403 3.544 3.764 3.875 4.082 4.292 4.491 4.587 4.774 4.94 5.171 5.32 5.464 5.658 5.84 6.012 6.181 6.343 6.542 6.738 6.934 7.18 7.393 7.58 7.798 8.04 8.253 8.482 8.733 8.988 9.247 9.53 9.826 10.099 10.408 10.692 10.975 11.239 11.427 11.454 11.033 10.157 9.3 8.437 7.573 6.74 6.009 5.343 4.767 4.205 3.723 3.298 2.909 2.527 2.145 1.796 1.438 1.125 0.844 0.533 0.213 -0.055 -0.322 -0.606 -0.841 -1.079 -1.329 -1.597 -1.877 -2.076 -2.283 -2.598 -2.813 -3.047 -3.172 -3.438 -3.722 -4.007 -4.143 -4.399 -4.638 -4.825 -5.035 -5.475 -5.723 -5.987 -6.291 -6.689 -7.138 -7.746 -9.78 -6 ,23520 ,TETRA ,17585990,Sat Nov 27 15:51:20 CET,Sat Nov 27 17:33:34 CET,0.0 1.13 1.57 1.879 2.143 2.359 2.547 2.726 3.044 3.175 3.299 3.432 3.637 3.745 3.943 4.134 4.324 4.411 4.575 4.72 4.923 5.061 5.199 5.387 5.555 5.723 5.891 6.039 6.225 6.418 6.6 6.813 7.021 7.211 7.418 7.656 7.896 8.146 8.398 8.654 8.908 9.172 9.451 9.738 10.087 10.423 10.754 11.061 11.288 11.355 11.073 10.421 9.663 8.9 8.175 7.452 6.794 6.189 5.669 5.152 4.688 4.263 3.853 3.471 3.095 2.72 2.312 1.937 1.621 1.325 1.023 0.765 0.494 0.21 -0.016 -0.249 -0.486 -0.738 -1.012 -1.198 -1.384 -1.702 -1.923 -2.147 -2.272 -2.529 -2.799 -3.094 -3.245 -3.516 -3.76 -3.947 -4.154 -4.576 -4.805 -5.064 -5.385 -5.765 -6.197 -6.781 -8.501 -7 ,8467 ,TETRA ,17585991,Sat Nov 27 15:53:20 CET,Sat Nov 27 17:35:36 CET,0.0 0.634 1.011 1.342 1.603 1.825 2.028 2.212 2.531 2.665 2.793 2.94 3.156 3.261 3.451 3.628 3.799 3.884 4.041 4.177 4.372 4.501 4.635 4.828 5.005 5.17 5.325 5.484 5.69 5.875 6.046 6.249 6.443 6.631 6.851 7.085 7.304 7.539 7.778 8.02 8.269 8.541 8.844 9.145 9.458 9.765 10.105 10.396 10.606 10.704 10.463 9.785 9.037 8.272 7.533 6.827 6.179 5.589 5.063 4.514 4.037 3.61 3.189 2.791 2.411 2.063 1.701 1.377 1.099 0.802 0.501 0.247 -0.037 -0.347 -0.579 -0.812 -1.06 -1.33 -1.614 -1.809 -2.014 -2.329 -2.552 -2.777 -2.888 -3.134 -3.416 -3.707 -3.848 -4.107 -4.355 -4.55 -4.74 -5.159 -5.416 -5.707 -6.024 -6.427 -6.941 -7.588 -9.408 -8 ,12367 ,TETRA ,17585992,Sat Nov 27 15:52:20 CET,Sat Nov 27 17:33:04 CET,0.0 0.789 1.145 1.445 1.694 1.899 2.084 2.267 2.577 2.696 2.81 2.933 3.141 3.246 3.445 3.635 3.818 3.898 4.038 4.164 4.378 4.531 4.681 4.884 5.069 5.252 5.415 5.556 5.742 5.927 6.098 6.301 6.504 6.705 6.919 7.149 7.366 7.595 7.843 8.102 8.349 8.598 8.875 9.148 9.432 9.726 10.061 10.374 10.605 10.668 10.342 9.671 8.853 7.997 7.248 6.576 5.957 5.365 4.856 4.345 3.891 3.469 3.044 2.643 2.285 1.956 1.614 1.299 1.018 0.72 0.402 0.137 -0.152 -0.48 -0.75 -1.024 -1.297 -1.575 -1.854 -2.054 -2.272 -2.605 -2.822 -3.041 -3.159 -3.414 -3.668 -3.946 -4.1 -4.362 -4.61 -4.818 -5.033 -5.472 -5.708 -5.974 -6.299 -6.676 -7.107 -7.677 -9.4 -9 ,16306 ,TETRA ,17585993,Sat Nov 27 15:53:21 CET,Sat Nov 27 17:35:36 CET,0.0 0.601 0.978 1.281 1.5 1.685 1.869 2.044 2.36 2.505 2.63 2.756 2.97 3.067 3.252 3.432 3.604 3.685 3.838 3.982 4.187 4.314 4.436 4.624 4.806 4.974 5.131 5.276 5.457 5.64 5.814 6.02 6.214 6.397 6.606 6.837 7.057 7.288 7.532 7.79 8.055 8.339 8.639 8.912 9.191 9.47 9.775 10.071 10.327 10.428 10.166 9.486 8.735 7.982 7.285 6.658 6.068 5.494 4.983 4.456 3.976 3.545 3.141 2.735 2.359 2.029 1.672 1.344 1.059 0.761 0.452 0.191 -0.076 -0.345 -0.554 -0.778 -1.015 -1.27 -1.53 -1.704 -1.9 -2.221 -2.444 -2.683 -2.813 -3.082 -3.375 -3.707 -3.88 -4.164 -4.432 -4.623 -4.815 -5.221 -5.464 -5.73 -6.036 -6.424 -6.889 -7.473 -9.532 -10 ,22462 ,TETRA ,17585994,Sat Nov 27 15:53:24 CET,Sat Nov 27 17:35:33 CET,0.0 0.888 1.236 1.515 1.761 1.969 2.146 2.311 2.609 2.75 2.889 3.041 3.266 3.38 3.586 3.785 3.969 4.056 4.231 4.398 4.616 4.75 4.88 5.079 5.278 5.471 5.657 5.83 6.048 6.25 6.439 6.669 6.889 7.097 7.334 7.573 7.798 8.045 8.281 8.521 8.778 9.08 9.416 9.724 10.067 10.429 10.766 11.051 11.237 11.27 10.936 10.141 9.271 8.464 7.684 6.938 6.337 5.775 5.241 4.709 4.258 3.838 3.423 3.034 2.669 2.336 1.964 1.627 1.332 1.032 0.738 0.482 0.212 -0.068 -0.28 -0.502 -0.756 -1.027 -1.302 -1.498 -1.69 -1.986 -2.205 -2.44 -2.56 -2.811 -3.088 -3.397 -3.547 -3.806 -4.052 -4.236 -4.426 -4.839 -5.083 -5.357 -5.678 -6.033 -6.416 -6.999 -9.06 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 59b3dd78..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17014 ,TETRA ,17585995,Sat Nov 27 15:53:20 CET,Sat Nov 27 17:23:27 CET,0.0 1.198 1.681 2.084 2.434 2.718 2.98 3.219 3.631 3.82 3.994 4.192 4.468 4.612 4.873 5.124 5.374 5.498 5.728 5.944 6.268 6.475 6.671 6.946 7.207 7.458 7.698 7.935 8.243 8.533 8.811 9.139 9.455 9.761 10.104 10.5 10.89 11.329 11.806 12.294 12.776 13.319 13.983 14.637 15.383 16.225 17.171 18.197 19.377 20.698 22.174 23.184 23.616 23.78 23.758 23.662 23.515 23.312 23.081 22.827 22.616 22.415 22.205 22.001 21.802 21.608 21.391 21.192 21.008 20.802 20.579 20.387 20.194 20.005 19.855 19.684 19.505 19.327 19.152 19.031 18.888 18.648 18.483 18.313 18.22 18.023 17.807 17.576 17.454 17.227 17.075 16.922 16.75 16.405 16.207 15.982 15.738 15.467 15.145 14.671 13.507 -2 ,8981 ,TETRA ,17585996,Sat Nov 27 15:53:20 CET,Sat Nov 27 17:38:24 CET,0.0 1.315 1.913 2.304 2.609 2.884 3.131 3.343 3.721 3.898 4.078 4.301 4.576 4.72 4.995 5.252 5.485 5.601 5.832 6.049 6.358 6.554 6.739 7.007 7.275 7.539 7.779 7.993 8.277 8.565 8.846 9.19 9.507 9.807 10.174 10.579 10.954 11.359 11.793 12.277 12.78 13.323 13.941 14.548 15.272 16.104 17.054 18.098 19.253 20.543 22.023 23.026 23.414 23.511 23.472 23.363 23.2 23.007 22.823 22.626 22.424 22.225 22.038 21.85 21.669 21.493 21.295 21.102 20.915 20.725 20.528 20.347 20.161 19.976 19.831 19.677 19.493 19.297 19.104 18.968 18.829 18.61 18.45 18.274 18.186 18.005 17.803 17.569 17.443 17.217 17.073 16.936 16.776 16.446 16.274 16.066 15.824 15.546 15.208 14.753 13.703 -3 ,29069 ,TETRA ,17585997,Sat Nov 27 15:53:20 CET,Sat Nov 27 17:37:33 CET,0.0 1.174 1.715 2.092 2.357 2.594 2.828 3.041 3.425 3.598 3.769 3.973 4.235 4.384 4.675 4.93 5.168 5.285 5.51 5.722 6.033 6.234 6.428 6.709 6.98 7.234 7.482 7.73 8.041 8.329 8.613 8.951 9.272 9.577 9.925 10.321 10.693 11.099 11.546 12.031 12.536 13.087 13.729 14.368 15.124 15.962 16.904 17.975 19.173 20.477 21.923 22.968 23.425 23.562 23.521 23.388 23.213 23.033 22.861 22.656 22.446 22.243 22.032 21.812 21.601 21.415 21.212 21.015 20.844 20.666 20.472 20.306 20.124 19.923 19.779 19.626 19.455 19.277 19.086 18.948 18.803 18.579 18.414 18.231 18.134 17.937 17.721 17.48 17.359 17.122 16.94 16.799 16.643 16.306 16.133 15.927 15.664 15.357 15.0 14.527 13.615 -4 ,17520 ,TETRA ,17585998,Sat Nov 27 15:54:20 CET,Sat Nov 27 17:23:29 CET,0.0 1.236 1.777 2.163 2.469 2.76 3.024 3.242 3.661 3.856 4.029 4.229 4.498 4.645 4.911 5.159 5.408 5.529 5.757 5.966 6.263 6.461 6.661 6.934 7.184 7.437 7.688 7.917 8.215 8.508 8.797 9.137 9.461 9.772 10.127 10.535 10.918 11.333 11.78 12.257 12.765 13.321 13.948 14.587 15.325 16.137 17.072 18.09 19.26 20.604 22.055 23.06 23.545 23.755 23.77 23.671 23.53 23.35 23.151 22.923 22.702 22.494 22.279 22.047 21.819 21.623 21.415 21.221 21.054 20.867 20.678 20.53 20.357 20.158 20.003 19.845 19.682 19.506 19.309 19.168 19.028 18.814 18.658 18.478 18.383 18.199 18.006 17.779 17.645 17.405 17.231 17.083 16.931 16.6 16.407 16.19 15.955 15.703 15.393 14.992 13.95 -5 ,14102 ,TETRA ,17585999,Sat Nov 27 15:54:20 CET,Sat Nov 27 17:37:15 CET,0.0 1.006 1.508 1.892 2.2 2.445 2.675 2.897 3.285 3.452 3.612 3.805 4.074 4.22 4.487 4.736 4.981 5.095 5.319 5.541 5.859 6.058 6.253 6.546 6.826 7.083 7.323 7.551 7.85 8.14 8.419 8.76 9.075 9.363 9.702 10.097 10.478 10.896 11.348 11.812 12.306 12.864 13.5 14.132 14.869 15.689 16.63 17.683 18.876 20.218 21.639 22.641 23.062 23.151 23.132 23.067 22.931 22.726 22.521 22.301 22.085 21.865 21.647 21.441 21.233 21.029 20.816 20.621 20.446 20.262 20.071 19.906 19.715 19.519 19.371 19.218 19.055 18.866 18.675 18.547 18.409 18.179 18.009 17.841 17.751 17.555 17.347 17.117 16.995 16.765 16.609 16.474 16.329 15.982 15.757 15.491 15.217 14.913 14.535 14.013 12.962 -6 ,16157 ,TETRA ,17586000,Sat Nov 27 15:54:21 CET,Sat Nov 27 17:37:29 CET,0.0 1.187 1.677 2.06 2.373 2.648 2.912 3.156 3.584 3.77 3.94 4.13 4.394 4.535 4.812 5.07 5.307 5.421 5.65 5.867 6.165 6.354 6.54 6.815 7.079 7.33 7.564 7.798 8.113 8.41 8.69 9.04 9.375 9.681 10.02 10.41 10.8 11.219 11.665 12.143 12.637 13.171 13.796 14.444 15.208 16.045 17.0 18.061 19.244 20.546 22.059 23.166 23.606 23.703 23.68 23.589 23.449 23.282 23.098 22.873 22.664 22.473 22.28 22.089 21.892 21.696 21.485 21.289 21.116 20.937 20.738 20.569 20.402 20.221 20.061 19.892 19.721 19.549 19.363 19.227 19.087 18.862 18.695 18.513 18.422 18.24 18.036 17.809 17.686 17.453 17.274 17.111 16.946 16.609 16.415 16.199 15.946 15.644 15.253 14.759 13.686 -7 ,3662 ,TETRA ,17586001,Sat Nov 27 15:54:21 CET,Sat Nov 27 17:38:04 CET,0.0 1.03 1.565 2.036 2.396 2.676 2.932 3.163 3.588 3.787 3.979 4.208 4.476 4.623 4.916 5.192 5.442 5.561 5.8 6.018 6.317 6.51 6.698 6.96 7.214 7.463 7.695 7.921 8.22 8.515 8.798 9.134 9.453 9.764 10.122 10.522 10.906 11.315 11.748 12.2 12.687 13.256 13.924 14.59 15.348 16.194 17.189 18.319 19.563 20.87 22.306 23.31 23.739 23.894 23.897 23.794 23.629 23.427 23.236 23.032 22.829 22.625 22.42 22.215 22.012 21.81 21.597 21.404 21.224 21.038 20.841 20.673 20.498 20.311 20.158 19.993 19.824 19.654 19.474 19.347 19.213 18.99 18.833 18.652 18.551 18.358 18.153 17.919 17.792 17.55 17.363 17.227 17.086 16.743 16.539 16.314 16.068 15.775 15.437 14.985 14.033 -8 ,4863 ,TETRA ,17586002,Sat Nov 27 15:54:21 CET,Sat Nov 27 17:37:04 CET,0.0 1.204 1.71 2.097 2.408 2.659 2.883 3.085 3.44 3.617 3.804 4.025 4.298 4.446 4.734 4.998 5.235 5.347 5.566 5.781 6.093 6.294 6.488 6.763 7.022 7.269 7.497 7.722 8.015 8.299 8.578 8.899 9.214 9.53 9.896 10.3 10.685 11.107 11.559 12.036 12.528 13.064 13.699 14.36 15.105 15.911 16.856 17.927 19.136 20.488 21.93 22.865 23.266 23.381 23.352 23.238 23.067 22.888 22.73 22.523 22.312 22.117 21.914 21.701 21.483 21.284 21.079 20.884 20.709 20.519 20.311 20.14 19.951 19.753 19.605 19.447 19.278 19.1 18.91 18.777 18.629 18.396 18.245 18.077 17.978 17.765 17.546 17.318 17.202 16.975 16.813 16.674 16.532 16.218 16.031 15.817 15.569 15.265 14.887 14.43 13.342 -9 ,23972 ,TETRA ,17586003,Sat Nov 27 15:55:19 CET,Sat Nov 27 17:37:50 CET,0.0 1.225 1.654 2.052 2.419 2.701 2.965 3.211 3.654 3.851 4.037 4.242 4.504 4.64 4.9 5.147 5.391 5.502 5.715 5.93 6.238 6.446 6.65 6.924 7.181 7.432 7.679 7.907 8.197 8.48 8.756 9.091 9.403 9.7 10.05 10.447 10.831 11.264 11.725 12.203 12.709 13.271 13.9 14.526 15.25 16.08 17.058 18.107 19.267 20.567 22.014 23.017 23.46 23.607 23.589 23.475 23.306 23.126 22.937 22.687 22.453 22.236 22.029 21.83 21.608 21.402 21.198 21.001 20.832 20.659 20.464 20.293 20.103 19.894 19.736 19.586 19.433 19.264 19.079 18.947 18.802 18.574 18.412 18.239 18.145 17.963 17.765 17.546 17.425 17.192 17.029 16.892 16.741 16.374 16.16 15.942 15.703 15.398 15.033 14.601 13.629 -10 ,3333 ,TETRA ,17586004,Sat Nov 27 15:55:20 CET,Sat Nov 27 17:38:34 CET,0.0 1.0 1.492 1.873 2.188 2.453 2.687 2.913 3.318 3.485 3.657 3.886 4.17 4.32 4.587 4.851 5.107 5.22 5.439 5.655 5.965 6.163 6.35 6.627 6.899 7.158 7.404 7.628 7.925 8.213 8.489 8.828 9.153 9.469 9.826 10.24 10.651 11.059 11.497 11.982 12.485 13.052 13.703 14.361 15.134 15.963 16.885 17.93 19.135 20.496 21.983 22.974 23.367 23.509 23.513 23.427 23.271 23.068 22.866 22.636 22.418 22.225 22.031 21.835 21.64 21.446 21.231 21.039 20.871 20.683 20.478 20.298 20.114 19.919 19.76 19.602 19.432 19.248 19.052 18.912 18.77 18.544 18.371 18.198 18.117 17.93 17.717 17.487 17.368 17.138 16.969 16.823 16.658 16.311 16.133 15.949 15.739 15.475 15.14 14.651 13.594 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index b9385bfc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7108 ,TETRA ,17586005,Sat Nov 27 15:55:20 CET,Sat Nov 27 17:40:28 CET,0.0 1.046 1.477 1.798 2.078 2.326 2.544 2.736 3.083 3.241 3.388 3.569 3.799 3.921 4.159 4.382 4.585 4.68 4.861 5.037 5.294 5.459 5.61 5.82 6.018 6.219 6.412 6.586 6.803 7.006 7.202 7.436 7.666 7.889 8.145 8.432 8.709 9.005 9.302 9.6 9.886 10.197 10.555 10.886 11.246 11.619 11.978 12.324 12.597 12.637 12.314 11.518 10.637 9.811 9.036 8.296 7.618 7.001 6.471 5.927 5.456 5.021 4.6 4.203 3.829 3.478 3.105 2.785 2.515 2.235 1.938 1.687 1.429 1.163 0.952 0.733 0.515 0.292 0.052 -0.123 -0.314 -0.62 -0.824 -1.036 -1.148 -1.378 -1.61 -1.844 -1.973 -2.227 -2.456 -2.623 -2.799 -3.196 -3.394 -3.608 -3.868 -4.165 -4.545 -5.01 -6.006 -2 ,17898 ,TETRA ,17586006,Sat Nov 27 15:55:20 CET,Sat Nov 27 17:39:31 CET,0.0 0.903 1.302 1.64 1.939 2.185 2.4 2.609 2.97 3.128 3.284 3.483 3.72 3.854 4.101 4.315 4.512 4.609 4.8 4.986 5.236 5.389 5.538 5.756 5.96 6.162 6.363 6.54 6.773 7.005 7.218 7.459 7.688 7.901 8.137 8.405 8.65 8.914 9.197 9.5 9.806 10.123 10.468 10.786 11.13 11.479 11.82 12.116 12.352 12.439 12.09 11.254 10.374 9.546 8.758 7.999 7.345 6.742 6.198 5.643 5.174 4.76 4.356 3.946 3.558 3.221 2.866 2.552 2.286 2.009 1.716 1.468 1.203 0.914 0.702 0.495 0.256 -0.008 -0.278 -0.459 -0.643 -0.926 -1.119 -1.324 -1.433 -1.664 -1.916 -2.176 -2.314 -2.562 -2.753 -2.923 -3.105 -3.476 -3.687 -3.925 -4.187 -4.489 -4.842 -5.323 -6.731 -3 ,19803 ,TETRA ,17586007,Sat Nov 27 15:55:21 CET,Sat Nov 27 17:38:11 CET,0.0 1.179 1.66 1.991 2.266 2.504 2.715 2.906 3.247 3.407 3.573 3.79 4.025 4.155 4.387 4.587 4.784 4.883 5.084 5.273 5.516 5.668 5.813 6.027 6.242 6.457 6.663 6.848 7.074 7.282 7.485 7.748 7.986 8.191 8.436 8.722 8.995 9.288 9.596 9.903 10.224 10.571 10.942 11.298 11.67 12.02 12.349 12.692 13.014 13.143 12.88 12.152 11.334 10.525 9.769 9.062 8.408 7.812 7.287 6.735 6.248 5.817 5.407 5.02 4.654 4.326 3.984 3.664 3.385 3.092 2.786 2.521 2.251 1.973 1.753 1.527 1.29 1.038 0.773 0.593 0.415 0.139 -0.066 -0.283 -0.393 -0.632 -0.884 -1.145 -1.282 -1.532 -1.75 -1.922 -2.097 -2.461 -2.658 -2.87 -3.112 -3.42 -3.791 -4.314 -5.695 -4 ,25531 ,TETRA ,17586008,Sat Nov 27 15:55:21 CET,Sat Nov 27 17:32:42 CET,0.0 1.08 1.561 1.939 2.259 2.531 2.763 2.978 3.353 3.514 3.662 3.83 4.059 4.186 4.407 4.618 4.818 4.909 5.093 5.277 5.54 5.707 5.854 6.07 6.29 6.496 6.693 6.875 7.086 7.294 7.493 7.731 7.965 8.183 8.429 8.694 8.95 9.228 9.514 9.807 10.11 10.444 10.8 11.147 11.543 11.924 12.266 12.589 12.868 13.011 12.775 12.033 11.242 10.49 9.771 9.074 8.426 7.826 7.295 6.753 6.298 5.877 5.467 5.072 4.695 4.347 3.981 3.652 3.36 3.059 2.752 2.502 2.236 1.957 1.748 1.53 1.292 1.051 0.81 0.642 0.462 0.17 -0.031 -0.234 -0.347 -0.588 -0.834 -1.101 -1.24 -1.49 -1.69 -1.861 -2.047 -2.44 -2.658 -2.899 -3.171 -3.485 -3.87 -4.409 -5.585 -5 ,4281 ,TETRA ,17586009,Sat Nov 27 15:55:21 CET,Sat Nov 27 17:39:03 CET,0.0 1.11 1.552 1.885 2.179 2.441 2.663 2.855 3.22 3.394 3.548 3.731 3.958 4.077 4.318 4.543 4.744 4.839 5.026 5.21 5.469 5.633 5.793 6.012 6.216 6.414 6.6 6.777 7.011 7.229 7.434 7.681 7.92 8.142 8.384 8.651 8.907 9.175 9.461 9.77 10.072 10.381 10.73 11.082 11.463 11.823 12.18 12.514 12.773 12.832 12.456 11.693 10.851 9.996 9.216 8.492 7.83 7.195 6.632 6.087 5.615 5.177 4.764 4.369 3.993 3.654 3.296 2.981 2.71 2.421 2.121 1.871 1.623 1.365 1.152 0.932 0.7 0.452 0.2 0.028 -0.161 -0.474 -0.684 -0.898 -1.012 -1.246 -1.497 -1.766 -1.905 -2.154 -2.37 -2.536 -2.721 -3.125 -3.337 -3.581 -3.866 -4.19 -4.561 -5.003 -6.098 -6 ,12573 ,TETRA ,17586010,Sat Nov 27 15:55:21 CET,Sat Nov 27 17:40:05 CET,0.0 0.96 1.412 1.739 2.009 2.25 2.485 2.707 3.09 3.248 3.392 3.583 3.817 3.941 4.176 4.394 4.606 4.708 4.9 5.076 5.32 5.476 5.627 5.847 6.063 6.269 6.462 6.644 6.864 7.067 7.265 7.512 7.746 7.965 8.214 8.489 8.749 9.006 9.289 9.597 9.901 10.223 10.564 10.903 11.264 11.624 12.004 12.335 12.616 12.789 12.571 11.798 10.928 10.073 9.304 8.564 7.866 7.245 6.712 6.161 5.683 5.263 4.851 4.458 4.105 3.781 3.425 3.108 2.834 2.538 2.23 1.984 1.726 1.45 1.235 1.01 0.782 0.535 0.268 0.09 -0.095 -0.388 -0.594 -0.803 -0.913 -1.157 -1.412 -1.675 -1.815 -2.061 -2.249 -2.415 -2.596 -2.975 -3.186 -3.444 -3.745 -4.047 -4.391 -4.87 -5.971 -7 ,15925 ,TETRA ,17586011,Sat Nov 27 15:55:22 CET,Sat Nov 27 17:38:42 CET,0.0 1.091 1.636 2.026 2.32 2.557 2.773 2.975 3.338 3.499 3.656 3.863 4.088 4.205 4.443 4.652 4.842 4.938 5.116 5.299 5.575 5.746 5.9 6.121 6.339 6.545 6.737 6.922 7.146 7.362 7.581 7.838 8.069 8.289 8.546 8.815 9.057 9.304 9.571 9.859 10.148 10.452 10.808 11.165 11.518 11.841 12.183 12.537 12.851 12.96 12.621 11.816 10.979 10.166 9.438 8.759 8.13 7.531 6.999 6.471 6.0 5.579 5.171 4.783 4.404 4.044 3.679 3.344 3.051 2.756 2.452 2.194 1.926 1.644 1.43 1.205 0.965 0.727 0.483 0.299 0.095 -0.209 -0.407 -0.626 -0.736 -0.945 -1.169 -1.433 -1.582 -1.829 -2.008 -2.162 -2.326 -2.685 -2.9 -3.139 -3.405 -3.721 -4.09 -4.566 -5.765 -8 ,1789 ,TETRA ,17586012,Sat Nov 27 15:55:21 CET,Sat Nov 27 17:27:18 CET,0.0 1.37 1.891 2.275 2.619 2.918 3.159 3.362 3.719 3.879 4.033 4.217 4.444 4.566 4.792 4.994 5.191 5.284 5.467 5.65 5.909 6.064 6.213 6.43 6.64 6.841 7.026 7.207 7.444 7.658 7.857 8.098 8.322 8.532 8.78 9.062 9.323 9.598 9.886 10.178 10.483 10.816 11.175 11.511 11.882 12.246 12.596 12.924 13.161 13.212 12.906 12.166 11.297 10.455 9.688 8.948 8.292 7.695 7.17 6.635 6.167 5.744 5.336 4.936 4.559 4.221 3.86 3.538 3.254 2.956 2.653 2.398 2.136 1.855 1.632 1.41 1.178 0.937 0.696 0.531 0.354 0.07 -0.125 -0.324 -0.431 -0.664 -0.911 -1.156 -1.277 -1.516 -1.705 -1.856 -2.033 -2.416 -2.606 -2.814 -3.074 -3.388 -3.757 -4.249 -5.486 -9 ,662 ,TETRA ,17586013,Sat Nov 27 15:55:21 CET,Sat Nov 27 17:39:25 CET,0.0 0.796 1.216 1.573 1.874 2.103 2.309 2.511 2.867 3.029 3.182 3.366 3.593 3.718 3.951 4.174 4.386 4.488 4.684 4.858 5.107 5.274 5.434 5.652 5.849 6.04 6.227 6.405 6.633 6.85 7.052 7.293 7.518 7.734 7.984 8.255 8.502 8.764 9.045 9.35 9.662 9.991 10.345 10.68 11.053 11.422 11.776 12.089 12.353 12.48 12.255 11.525 10.724 9.943 9.184 8.47 7.845 7.246 6.711 6.169 5.687 5.252 4.833 4.445 4.085 3.743 3.381 3.064 2.782 2.487 2.184 1.931 1.67 1.399 1.187 0.971 0.742 0.499 0.252 0.068 -0.128 -0.425 -0.632 -0.841 -0.954 -1.193 -1.429 -1.692 -1.83 -2.083 -2.307 -2.472 -2.652 -3.059 -3.262 -3.48 -3.743 -4.042 -4.399 -4.867 -6.16 -10 ,30258 ,TETRA ,17586014,Sat Nov 27 15:55:21 CET,Sat Nov 27 17:38:49 CET,0.0 1.223 1.679 2.029 2.286 2.516 2.744 2.962 3.354 3.519 3.667 3.843 4.073 4.192 4.426 4.66 4.879 4.977 5.145 5.315 5.57 5.726 5.879 6.09 6.288 6.486 6.672 6.837 7.052 7.268 7.469 7.711 7.946 8.164 8.403 8.669 8.922 9.196 9.478 9.768 10.059 10.376 10.735 11.07 11.461 11.825 12.153 12.481 12.742 12.842 12.57 11.842 11.0 10.143 9.365 8.645 7.997 7.397 6.859 6.304 5.833 5.407 4.98 4.577 4.204 3.878 3.54 3.224 2.938 2.638 2.336 2.076 1.802 1.514 1.268 1.022 0.781 0.534 0.283 0.108 -0.078 -0.377 -0.577 -0.778 -0.883 -1.109 -1.335 -1.567 -1.696 -1.933 -2.109 -2.259 -2.433 -2.832 -3.048 -3.285 -3.552 -3.877 -4.278 -4.788 -6.458 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 8afba4f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22844 ,TETRA ,17586015,Sat Nov 27 15:55:21 CET,Sat Nov 27 17:39:04 CET,0.0 1.23 1.761 2.155 2.463 2.715 2.928 3.122 3.471 3.637 3.787 3.961 4.181 4.316 4.575 4.806 5.022 5.123 5.305 5.468 5.721 5.89 6.046 6.258 6.464 6.666 6.855 7.03 7.251 7.459 7.667 7.921 8.154 8.37 8.607 8.873 9.125 9.411 9.716 10.023 10.329 10.654 11.036 11.387 11.751 12.106 12.442 12.737 12.966 12.983 12.561 11.654 10.698 9.792 8.959 8.178 7.469 6.824 6.266 5.715 5.23 4.793 4.377 3.978 3.6 3.244 2.884 2.569 2.286 1.988 1.684 1.427 1.15 0.862 0.646 0.428 0.194 -0.055 -0.323 -0.505 -0.683 -0.954 -1.142 -1.345 -1.453 -1.679 -1.918 -2.184 -2.323 -2.559 -2.752 -2.909 -3.072 -3.427 -3.617 -3.833 -4.092 -4.405 -4.792 -5.262 -6.356 -2 ,12042 ,TETRA ,17586016,Sat Nov 27 15:55:22 CET,Sat Nov 27 17:38:29 CET,0.0 1.011 1.47 1.861 2.164 2.41 2.636 2.837 3.187 3.343 3.488 3.688 3.921 4.047 4.284 4.495 4.703 4.808 4.999 5.177 5.428 5.594 5.755 5.975 6.185 6.39 6.591 6.788 7.021 7.238 7.452 7.702 7.935 8.158 8.418 8.691 8.935 9.206 9.5 9.81 10.126 10.457 10.813 11.13 11.457 11.801 12.135 12.406 12.619 12.67 12.263 11.329 10.373 9.447 8.595 7.848 7.179 6.56 6.001 5.428 4.947 4.511 4.086 3.686 3.308 2.96 2.599 2.27 1.998 1.722 1.414 1.152 0.88 0.599 0.375 0.141 -0.098 -0.337 -0.569 -0.73 -0.902 -1.189 -1.395 -1.601 -1.707 -1.941 -2.188 -2.442 -2.575 -2.808 -2.999 -3.163 -3.339 -3.738 -3.95 -4.171 -4.43 -4.743 -5.119 -5.593 -6.74 -3 ,18416 ,TETRA ,17586017,Sat Nov 27 15:55:22 CET,Sat Nov 27 17:38:39 CET,0.0 1.052 1.517 1.86 2.157 2.421 2.641 2.852 3.242 3.407 3.561 3.758 3.992 4.115 4.337 4.565 4.781 4.878 5.073 5.254 5.503 5.665 5.821 6.055 6.275 6.477 6.671 6.858 7.087 7.302 7.504 7.742 7.973 8.195 8.451 8.723 8.975 9.262 9.561 9.86 10.158 10.474 10.816 11.137 11.498 11.858 12.188 12.468 12.658 12.635 12.16 11.247 10.28 9.347 8.514 7.755 7.075 6.437 5.887 5.344 4.88 4.452 4.038 3.652 3.283 2.943 2.595 2.28 1.996 1.706 1.415 1.164 0.899 0.617 0.392 0.167 -0.061 -0.303 -0.552 -0.721 -0.903 -1.2 -1.402 -1.611 -1.717 -1.932 -2.162 -2.408 -2.536 -2.773 -2.986 -3.152 -3.319 -3.682 -3.882 -4.112 -4.382 -4.668 -4.994 -5.443 -6.568 -4 ,26221 ,TETRA ,17586018,Sat Nov 27 15:55:24 CET,Sat Nov 27 17:38:24 CET,0.0 1.034 1.469 1.803 2.08 2.344 2.59 2.804 3.16 3.313 3.469 3.672 3.893 4.02 4.256 4.473 4.677 4.777 4.976 5.156 5.42 5.596 5.755 5.973 6.192 6.409 6.603 6.777 7.014 7.247 7.461 7.708 7.935 8.146 8.38 8.641 8.899 9.17 9.46 9.778 10.096 10.412 10.742 11.08 11.435 11.771 12.11 12.383 12.595 12.661 12.259 11.312 10.301 9.357 8.525 7.756 7.055 6.408 5.862 5.321 4.853 4.424 3.989 3.581 3.206 2.861 2.497 2.162 1.878 1.591 1.278 1.028 0.772 0.493 0.28 0.053 -0.182 -0.422 -0.674 -0.853 -1.043 -1.34 -1.548 -1.755 -1.864 -2.104 -2.345 -2.6 -2.737 -2.978 -3.177 -3.327 -3.497 -3.892 -4.109 -4.336 -4.579 -4.866 -5.207 -5.697 -6.863 -5 ,23616 ,TETRA ,17586019,Sat Nov 27 15:56:20 CET,Sat Nov 27 17:40:05 CET,0.0 1.606 2.171 2.589 2.9 3.148 3.369 3.579 3.942 4.11 4.28 4.497 4.733 4.876 5.132 5.351 5.553 5.654 5.86 6.059 6.313 6.467 6.614 6.823 7.029 7.236 7.432 7.615 7.842 8.052 8.269 8.533 8.767 8.984 9.234 9.504 9.751 10.019 10.319 10.625 10.919 11.248 11.638 12.014 12.371 12.685 13.015 13.311 13.51 13.52 13.082 12.187 11.231 10.335 9.519 8.745 8.062 7.465 6.936 6.376 5.88 5.447 5.037 4.633 4.254 3.905 3.548 3.237 2.962 2.669 2.36 2.107 1.854 1.578 1.353 1.129 0.891 0.642 0.4 0.229 0.05 -0.225 -0.426 -0.638 -0.747 -0.967 -1.196 -1.447 -1.582 -1.826 -2.014 -2.161 -2.328 -2.716 -2.937 -3.177 -3.425 -3.717 -4.115 -4.667 -5.789 -6 ,19454 ,TETRA ,17586020,Sat Nov 27 15:56:20 CET,Sat Nov 27 17:40:44 CET,0.0 1.235 1.792 2.169 2.472 2.749 2.994 3.223 3.619 3.778 3.934 4.13 4.354 4.479 4.724 4.954 5.164 5.261 5.453 5.637 5.895 6.065 6.226 6.444 6.66 6.878 7.074 7.251 7.484 7.708 7.921 8.174 8.415 8.644 8.891 9.151 9.407 9.685 9.983 10.295 10.587 10.89 11.247 11.583 11.922 12.278 12.651 12.985 13.237 13.295 12.88 11.944 10.969 10.022 9.147 8.357 7.673 7.05 6.495 5.931 5.457 5.018 4.582 4.189 3.824 3.472 3.094 2.769 2.502 2.217 1.905 1.653 1.392 1.106 0.886 0.668 0.441 0.2 -0.053 -0.221 -0.403 -0.71 -0.912 -1.119 -1.231 -1.463 -1.701 -1.963 -2.102 -2.336 -2.538 -2.712 -2.892 -3.293 -3.524 -3.761 -4.044 -4.357 -4.713 -5.2 -6.177 -7 ,11768 ,TETRA ,17586021,Sat Nov 27 15:56:22 CET,Sat Nov 27 17:40:44 CET,0.0 0.84 1.27 1.627 1.923 2.168 2.396 2.618 3.006 3.174 3.33 3.525 3.747 3.866 4.089 4.31 4.518 4.614 4.798 4.979 5.255 5.423 5.573 5.793 6.007 6.201 6.376 6.553 6.784 6.999 7.202 7.444 7.676 7.899 8.141 8.418 8.69 8.973 9.28 9.594 9.903 10.24 10.6 10.943 11.304 11.65 11.991 12.268 12.444 12.46 12.059 11.123 10.14 9.214 8.362 7.578 6.899 6.277 5.722 5.168 4.688 4.242 3.823 3.428 3.046 2.696 2.331 2.014 1.745 1.469 1.177 0.919 0.65 0.372 0.155 -0.07 -0.314 -0.565 -0.824 -1.005 -1.184 -1.453 -1.64 -1.844 -1.951 -2.178 -2.423 -2.682 -2.818 -3.055 -3.238 -3.394 -3.562 -3.9 -4.079 -4.289 -4.547 -4.848 -5.199 -5.677 -6.705 -8 ,17892 ,TETRA ,17586022,Sat Nov 27 15:56:20 CET,Sat Nov 27 17:41:04 CET,0.0 1.403 1.938 2.318 2.591 2.826 3.05 3.261 3.647 3.814 3.961 4.138 4.348 4.47 4.704 4.903 5.108 5.213 5.4 5.581 5.849 6.006 6.172 6.411 6.619 6.816 7.002 7.181 7.412 7.634 7.843 8.086 8.315 8.538 8.785 9.045 9.295 9.571 9.874 10.167 10.447 10.761 11.117 11.452 11.776 12.119 12.517 12.846 13.045 13.024 12.588 11.687 10.691 9.785 8.954 8.164 7.492 6.856 6.282 5.737 5.266 4.821 4.385 3.985 3.621 3.283 2.925 2.596 2.307 1.999 1.682 1.439 1.177 0.893 0.686 0.471 0.235 -0.01 -0.268 -0.445 -0.625 -0.9 -1.088 -1.29 -1.393 -1.615 -1.869 -2.144 -2.285 -2.531 -2.745 -2.909 -3.077 -3.466 -3.677 -3.891 -4.119 -4.369 -4.679 -5.104 -5.997 -9 ,19028 ,TETRA ,17586023,Sat Nov 27 15:56:20 CET,Sat Nov 27 17:37:30 CET,0.0 1.028 1.494 1.828 2.127 2.382 2.608 2.809 3.17 3.334 3.491 3.683 3.906 4.036 4.274 4.5 4.713 4.813 5.013 5.205 5.471 5.639 5.794 6.013 6.23 6.439 6.631 6.816 7.064 7.29 7.5 7.751 7.992 8.219 8.47 8.733 8.98 9.253 9.53 9.826 10.13 10.456 10.813 11.144 11.475 11.799 12.139 12.417 12.604 12.643 12.257 11.336 10.365 9.46 8.63 7.864 7.17 6.527 5.964 5.403 4.915 4.473 4.039 3.635 3.265 2.918 2.554 2.231 1.939 1.627 1.315 1.059 0.789 0.515 0.298 0.061 -0.194 -0.457 -0.713 -0.889 -1.074 -1.37 -1.578 -1.794 -1.909 -2.148 -2.395 -2.652 -2.781 -3.019 -3.249 -3.429 -3.612 -3.976 -4.173 -4.413 -4.69 -5.002 -5.404 -5.924 -7.018 -10 ,32589 ,TETRA ,17586024,Sat Nov 27 15:56:20 CET,Sat Nov 27 17:39:49 CET,0.0 1.201 1.708 2.081 2.366 2.61 2.834 3.044 3.425 3.587 3.733 3.922 4.153 4.284 4.519 4.726 4.934 5.038 5.228 5.411 5.683 5.845 5.996 6.224 6.443 6.655 6.86 7.05 7.277 7.497 7.713 7.96 8.198 8.412 8.624 8.871 9.122 9.397 9.691 9.989 10.302 10.642 10.991 11.32 11.685 12.034 12.364 12.664 12.92 13.023 12.673 11.778 10.801 9.883 9.066 8.3 7.622 6.986 6.426 5.867 5.38 4.948 4.52 4.11 3.734 3.387 3.02 2.693 2.423 2.143 1.835 1.577 1.318 1.045 0.833 0.618 0.396 0.164 -0.088 -0.262 -0.444 -0.728 -0.93 -1.151 -1.268 -1.503 -1.747 -2.014 -2.157 -2.408 -2.63 -2.789 -2.944 -3.306 -3.518 -3.775 -4.071 -4.374 -4.73 -5.191 -6.156 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index fc840d89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9475 ,TETRA ,17586025,Sat Nov 27 15:56:19 CET,Sat Nov 27 17:40:01 CET,0.0 1.041 1.466 1.806 2.096 2.353 2.585 2.787 3.135 3.303 3.465 3.661 3.907 4.039 4.268 4.483 4.695 4.792 4.983 5.173 5.434 5.601 5.763 5.996 6.216 6.413 6.606 6.805 7.044 7.264 7.491 7.768 8.026 8.27 8.55 8.866 9.173 9.5 9.835 10.191 10.567 10.975 11.43 11.889 12.414 12.97 13.586 14.227 14.917 15.633 16.209 16.332 16.142 15.835 15.452 14.993 14.567 14.182 13.841 13.467 13.133 12.82 12.495 12.185 11.891 11.625 11.339 11.076 10.837 10.581 10.289 10.032 9.784 9.523 9.317 9.099 8.867 8.629 8.365 8.174 7.981 7.703 7.519 7.309 7.189 6.922 6.647 6.362 6.202 5.935 5.681 5.502 5.321 4.851 4.563 4.278 3.979 3.627 3.201 2.602 0.361 -2 ,16296 ,TETRA ,17586026,Sat Nov 27 15:56:22 CET,Sat Nov 27 17:41:04 CET,0.0 1.079 1.525 1.878 2.177 2.44 2.673 2.872 3.236 3.409 3.564 3.747 3.977 4.096 4.329 4.558 4.769 4.869 5.065 5.253 5.515 5.678 5.838 6.06 6.278 6.493 6.696 6.892 7.137 7.365 7.587 7.856 8.109 8.353 8.636 8.953 9.252 9.577 9.93 10.305 10.688 11.093 11.557 12.026 12.543 13.118 13.757 14.395 15.106 15.846 16.466 16.664 16.513 16.201 15.847 15.477 15.102 14.72 14.371 13.988 13.634 13.312 13.012 12.724 12.429 12.159 11.871 11.583 11.32 11.039 10.753 10.511 10.257 9.992 9.77 9.541 9.31 9.071 8.816 8.627 8.427 8.119 7.904 7.675 7.565 7.338 7.09 6.825 6.678 6.413 6.166 5.984 5.783 5.334 5.079 4.798 4.465 4.095 3.662 3.097 1.277 -3 ,16434 ,TETRA ,17586027,Sat Nov 27 15:56:21 CET,Sat Nov 27 17:39:38 CET,0.0 1.084 1.611 1.993 2.296 2.549 2.765 2.962 3.327 3.487 3.627 3.779 4.003 4.129 4.359 4.58 4.793 4.893 5.077 5.25 5.508 5.672 5.821 6.034 6.25 6.463 6.672 6.869 7.12 7.357 7.583 7.856 8.113 8.354 8.643 8.983 9.292 9.602 9.928 10.284 10.658 11.064 11.534 12.003 12.536 13.119 13.744 14.388 15.117 15.842 16.457 16.659 16.542 16.272 15.905 15.517 15.136 14.746 14.38 13.998 13.653 13.313 12.962 12.632 12.336 12.071 11.782 11.503 11.252 11.0 10.741 10.512 10.28 10.042 9.844 9.636 9.415 9.168 8.91 8.733 8.548 8.262 8.052 7.836 7.722 7.462 7.191 6.916 6.762 6.497 6.251 6.056 5.845 5.402 5.188 4.933 4.59 4.177 3.716 3.046 0.974 -4 ,12223 ,TETRA ,17586028,Sat Nov 27 15:56:21 CET,Sat Nov 27 17:39:44 CET,0.0 0.92 1.387 1.766 2.047 2.259 2.455 2.646 2.997 3.155 3.306 3.494 3.724 3.854 4.108 4.344 4.562 4.656 4.839 5.024 5.284 5.443 5.596 5.813 6.023 6.228 6.427 6.629 6.878 7.111 7.335 7.598 7.853 8.103 8.386 8.693 8.977 9.288 9.621 9.975 10.353 10.765 11.238 11.706 12.238 12.829 13.486 14.155 14.854 15.549 16.135 16.302 16.153 15.897 15.581 15.2 14.838 14.493 14.136 13.745 13.401 13.102 12.792 12.467 12.153 11.876 11.573 11.273 11.019 10.743 10.454 10.228 9.98 9.696 9.491 9.291 9.064 8.805 8.535 8.355 8.148 7.832 7.634 7.42 7.312 7.085 6.839 6.571 6.422 6.176 5.954 5.769 5.579 5.165 4.946 4.687 4.367 3.99 3.532 2.932 0.44 -5 ,11418 ,TETRA ,17586029,Sat Nov 27 15:56:21 CET,Sat Nov 27 17:38:56 CET,0.0 1.087 1.531 1.896 2.188 2.447 2.684 2.881 3.215 3.368 3.512 3.674 3.897 4.016 4.251 4.48 4.687 4.782 4.965 5.136 5.385 5.542 5.692 5.92 6.139 6.346 6.54 6.732 6.987 7.223 7.445 7.719 7.981 8.228 8.516 8.842 9.154 9.489 9.847 10.215 10.588 11.012 11.488 11.963 12.508 13.082 13.71 14.358 15.065 15.74 16.294 16.511 16.347 16.048 15.719 15.342 14.941 14.55 14.189 13.784 13.406 13.073 12.759 12.437 12.121 11.818 11.5 11.219 10.967 10.713 10.442 10.199 9.951 9.698 9.496 9.276 9.037 8.8 8.558 8.379 8.187 7.891 7.688 7.451 7.326 7.071 6.788 6.504 6.365 6.106 5.849 5.665 5.478 5.034 4.776 4.498 4.194 3.843 3.375 2.737 0.483 -6 ,28473 ,TETRA ,17586030,Sat Nov 27 15:56:21 CET,Sat Nov 27 17:40:05 CET,0.0 0.944 1.337 1.624 1.873 2.112 2.34 2.54 2.897 3.066 3.22 3.412 3.645 3.765 3.985 4.196 4.413 4.519 4.718 4.902 5.166 5.327 5.478 5.703 5.921 6.127 6.331 6.528 6.784 7.028 7.259 7.548 7.813 8.055 8.331 8.625 8.909 9.228 9.568 9.928 10.285 10.686 11.171 11.654 12.199 12.773 13.405 14.07 14.771 15.517 16.188 16.411 16.259 15.947 15.551 15.165 14.824 14.462 14.118 13.739 13.385 13.047 12.701 12.398 12.118 11.845 11.559 11.295 11.058 10.793 10.519 10.293 10.049 9.785 9.576 9.351 9.104 8.847 8.576 8.389 8.201 7.899 7.68 7.448 7.327 7.081 6.83 6.555 6.396 6.125 5.881 5.698 5.511 5.077 4.834 4.568 4.254 3.888 3.425 2.785 0.996 -7 ,19548 ,TETRA ,17586031,Sat Nov 27 15:56:21 CET,Sat Nov 27 17:40:08 CET,0.0 1.039 1.476 1.807 2.128 2.404 2.645 2.845 3.169 3.327 3.479 3.647 3.881 4.011 4.245 4.45 4.647 4.747 4.938 5.112 5.356 5.512 5.668 5.899 6.13 6.35 6.551 6.743 6.98 7.21 7.431 7.697 7.968 8.224 8.509 8.823 9.121 9.446 9.8 10.159 10.522 10.922 11.38 11.844 12.385 12.966 13.585 14.243 14.942 15.644 16.26 16.422 16.271 15.963 15.578 15.175 14.785 14.384 13.992 13.587 13.224 12.907 12.582 12.26 11.961 11.657 11.35 11.092 10.852 10.591 10.314 10.079 9.837 9.576 9.374 9.16 8.923 8.691 8.436 8.252 8.065 7.763 7.544 7.33 7.222 6.977 6.728 6.443 6.291 6.033 5.784 5.6 5.414 5.013 4.78 4.508 4.212 3.853 3.395 2.882 1.211 -8 ,5407 ,TETRA ,17586032,Sat Nov 27 15:56:22 CET,Sat Nov 27 17:39:59 CET,0.0 1.151 1.678 2.03 2.313 2.566 2.788 2.988 3.356 3.52 3.679 3.881 4.117 4.235 4.461 4.683 4.893 4.994 5.194 5.384 5.659 5.833 5.996 6.226 6.444 6.649 6.851 7.043 7.284 7.516 7.737 7.993 8.248 8.497 8.771 9.087 9.378 9.685 10.022 10.363 10.718 11.125 11.583 12.028 12.544 13.123 13.764 14.427 15.165 15.911 16.529 16.673 16.475 16.153 15.783 15.388 14.982 14.553 14.152 13.728 13.371 13.05 12.729 12.396 12.051 11.763 11.472 11.204 10.97 10.709 10.442 10.2 9.947 9.682 9.471 9.252 9.008 8.753 8.503 8.323 8.132 7.847 7.642 7.426 7.313 7.061 6.797 6.503 6.347 6.093 5.871 5.696 5.504 5.081 4.841 4.574 4.272 3.914 3.427 2.762 0.751 -9 ,31182 ,TETRA ,17586033,Sat Nov 27 15:56:21 CET,Sat Nov 27 17:39:55 CET,0.0 0.967 1.41 1.762 2.07 2.328 2.558 2.759 3.114 3.273 3.417 3.577 3.799 3.91 4.124 4.334 4.534 4.633 4.822 5.011 5.287 5.456 5.621 5.854 6.084 6.295 6.483 6.67 6.905 7.124 7.347 7.624 7.89 8.135 8.409 8.721 9.021 9.345 9.685 10.046 10.418 10.819 11.282 11.758 12.295 12.855 13.476 14.123 14.816 15.55 16.183 16.351 16.221 15.897 15.497 15.094 14.699 14.303 13.932 13.54 13.186 12.843 12.495 12.155 11.846 11.579 11.287 11.024 10.794 10.53 10.256 10.025 9.771 9.52 9.337 9.133 8.905 8.655 8.379 8.205 8.04 7.769 7.575 7.36 7.247 7.011 6.754 6.473 6.321 6.057 5.829 5.658 5.469 5.026 4.766 4.478 4.146 3.781 3.335 2.711 0.702 -10 ,15077 ,TETRA ,17586034,Sat Nov 27 15:56:22 CET,Sat Nov 27 17:40:04 CET,0.0 1.05 1.539 1.948 2.221 2.447 2.666 2.881 3.278 3.447 3.599 3.766 3.989 4.111 4.363 4.598 4.797 4.89 5.083 5.26 5.514 5.689 5.859 6.096 6.311 6.514 6.714 6.91 7.167 7.421 7.655 7.921 8.172 8.41 8.68 8.989 9.302 9.642 9.983 10.339 10.706 11.102 11.57 12.047 12.575 13.148 13.772 14.414 15.12 15.846 16.454 16.617 16.49 16.21 15.847 15.5 15.138 14.75 14.381 13.993 13.643 13.315 13.004 12.699 12.415 12.14 11.836 11.545 11.275 11.003 10.72 10.469 10.21 9.956 9.752 9.536 9.31 9.075 8.823 8.649 8.465 8.152 7.944 7.73 7.61 7.345 7.071 6.798 6.648 6.39 6.157 5.976 5.8 5.397 5.141 4.865 4.56 4.203 3.734 3.064 0.762 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt deleted file mode 100644 index cf4d8443..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31680 ,TETRA ,17586035,Sat Nov 27 15:56:25 CET,Sat Nov 27 17:40:10 CET,0.0 1.316 1.819 2.177 2.453 2.71 2.943 3.149 3.527 3.698 3.853 4.062 4.283 4.396 4.615 4.838 5.046 5.147 5.346 5.537 5.805 5.966 6.131 6.37 6.591 6.806 7.014 7.217 7.475 7.72 7.951 8.225 8.48 8.728 9.016 9.33 9.623 9.935 10.286 10.655 11.017 11.412 11.863 12.317 12.848 13.404 13.986 14.6 15.24 15.875 16.385 16.427 16.226 15.894 15.45 14.995 14.57 14.13 13.725 13.301 12.912 12.567 12.228 11.912 11.603 11.295 10.966 10.682 10.43 10.142 9.843 9.605 9.347 9.078 8.858 8.606 8.349 8.093 7.835 7.646 7.445 7.131 6.912 6.672 6.541 6.272 5.989 5.684 5.524 5.282 5.046 4.849 4.628 4.148 3.864 3.557 3.244 2.879 2.404 1.699 -0.232 -2 ,13958 ,TETRA ,17586036,Sat Nov 27 15:56:27 CET,Sat Nov 27 17:40:17 CET,0.0 1.122 1.582 1.924 2.228 2.499 2.74 2.955 3.294 3.437 3.576 3.728 3.932 4.045 4.279 4.517 4.74 4.841 5.019 5.188 5.438 5.603 5.761 5.989 6.2 6.395 6.59 6.78 7.018 7.253 7.476 7.747 8.002 8.242 8.529 8.828 9.106 9.426 9.769 10.119 10.48 10.895 11.377 11.835 12.352 12.906 13.493 14.106 14.759 15.37 15.812 15.782 15.452 15.054 14.607 14.138 13.689 13.248 12.831 12.412 12.056 11.727 11.393 11.049 10.724 10.426 10.104 9.818 9.569 9.292 8.986 8.723 8.461 8.187 7.965 7.746 7.518 7.263 6.983 6.792 6.595 6.276 6.044 5.804 5.674 5.396 5.106 4.793 4.625 4.364 4.11 3.907 3.697 3.212 2.93 2.652 2.348 1.984 1.576 0.969 -0.857 -3 ,31177 ,TETRA ,17586037,Sat Nov 27 15:56:22 CET,Sat Nov 27 17:40:05 CET,0.0 1.438 1.964 2.316 2.59 2.86 3.091 3.278 3.637 3.805 3.954 4.126 4.347 4.475 4.718 4.926 5.111 5.204 5.39 5.569 5.844 6.022 6.2 6.488 6.77 7.028 7.249 7.44 7.687 7.925 8.148 8.412 8.663 8.901 9.176 9.483 9.775 10.087 10.412 10.759 11.113 11.504 11.974 12.418 12.927 13.463 14.01 14.615 15.262 15.877 16.406 16.458 16.178 15.773 15.344 14.92 14.505 14.085 13.715 13.32 12.952 12.607 12.256 11.927 11.614 11.302 10.959 10.643 10.374 10.105 9.816 9.572 9.314 9.04 8.831 8.611 8.372 8.119 7.855 7.664 7.462 7.157 6.944 6.722 6.604 6.346 6.07 5.777 5.624 5.359 5.081 4.903 4.683 4.205 3.948 3.646 3.307 2.922 2.428 1.697 -0.794 -4 ,8894 ,TETRA ,17586038,Sat Nov 27 15:56:22 CET,Sat Nov 27 17:42:14 CET,0.0 1.144 1.727 2.144 2.422 2.684 2.934 3.14 3.531 3.712 3.873 4.095 4.328 4.451 4.67 4.877 5.078 5.181 5.383 5.573 5.844 6.014 6.178 6.411 6.628 6.834 7.03 7.223 7.468 7.701 7.925 8.197 8.453 8.693 8.969 9.276 9.569 9.893 10.241 10.605 10.972 11.379 11.851 12.303 12.812 13.345 13.94 14.581 15.257 15.896 16.392 16.415 16.123 15.717 15.244 14.789 14.368 13.954 13.569 13.163 12.796 12.442 12.096 11.762 11.434 11.128 10.805 10.512 10.255 9.981 9.678 9.439 9.201 8.935 8.716 8.494 8.262 8.002 7.732 7.548 7.346 7.039 6.829 6.595 6.475 6.217 5.925 5.608 5.434 5.172 4.948 4.764 4.555 4.103 3.834 3.539 3.228 2.841 2.382 1.736 -0.618 -5 ,30243 ,TETRA ,17586039,Sat Nov 27 15:58:19 CET,Sat Nov 27 17:42:05 CET,0.0 1.328 1.837 2.206 2.488 2.723 2.947 3.153 3.48 3.633 3.786 3.984 4.219 4.35 4.585 4.808 5.025 5.132 5.332 5.508 5.763 5.925 6.08 6.315 6.548 6.762 6.956 7.141 7.391 7.637 7.865 8.13 8.387 8.627 8.909 9.23 9.526 9.842 10.176 10.529 10.888 11.286 11.749 12.194 12.691 13.242 13.844 14.478 15.111 15.732 16.271 16.325 16.044 15.688 15.32 14.874 14.39 13.938 13.548 13.115 12.735 12.403 12.082 11.759 11.432 11.131 10.824 10.531 10.266 9.997 9.714 9.466 9.208 8.942 8.729 8.498 8.248 7.999 7.73 7.537 7.335 7.026 6.808 6.563 6.44 6.188 5.908 5.618 5.461 5.205 4.953 4.755 4.538 4.064 3.793 3.496 3.161 2.774 2.337 1.678 -0.289 -6 ,11150 ,TETRA ,17586040,Sat Nov 27 15:57:20 CET,Sat Nov 27 17:41:11 CET,0.0 1.056 1.539 1.902 2.194 2.435 2.642 2.834 3.197 3.359 3.51 3.692 3.915 4.044 4.289 4.514 4.712 4.809 5.007 5.194 5.457 5.63 5.799 6.032 6.248 6.452 6.649 6.837 7.078 7.318 7.55 7.818 8.08 8.334 8.613 8.91 9.199 9.525 9.869 10.221 10.578 10.977 11.434 11.878 12.369 12.89 13.468 14.057 14.684 15.345 15.854 15.879 15.63 15.272 14.819 14.344 13.887 13.434 13.032 12.601 12.203 11.83 11.467 11.126 10.824 10.546 10.232 9.948 9.701 9.432 9.133 8.879 8.612 8.327 8.1 7.865 7.634 7.37 7.082 6.899 6.711 6.405 6.193 5.973 5.858 5.598 5.313 5.014 4.858 4.592 4.301 4.108 3.897 3.412 3.133 2.828 2.505 2.142 1.691 1.112 -0.468 -7 ,26948 ,TETRA ,17586041,Sat Nov 27 15:57:22 CET,Sat Nov 27 17:41:06 CET,0.0 0.913 1.366 1.678 1.949 2.205 2.439 2.661 3.029 3.189 3.339 3.531 3.762 3.895 4.139 4.357 4.564 4.661 4.85 5.031 5.275 5.43 5.588 5.815 6.037 6.247 6.445 6.639 6.893 7.136 7.357 7.632 7.899 8.15 8.441 8.759 9.05 9.357 9.707 10.098 10.479 10.875 11.333 11.783 12.305 12.87 13.478 14.11 14.754 15.384 15.863 15.858 15.591 15.209 14.757 14.296 13.848 13.394 13.004 12.602 12.227 11.888 11.558 11.242 10.934 10.653 10.354 10.076 9.828 9.56 9.254 8.993 8.725 8.436 8.205 7.969 7.724 7.475 7.202 7.006 6.815 6.503 6.271 6.028 5.905 5.656 5.4 5.102 4.948 4.7 4.428 4.242 4.05 3.591 3.317 3.048 2.756 2.4 1.947 1.324 -0.218 -8 ,12120 ,TETRA ,17586042,Sat Nov 27 15:57:19 CET,Sat Nov 27 17:40:46 CET,0.0 1.208 1.71 2.069 2.392 2.661 2.894 3.113 3.509 3.674 3.815 3.981 4.205 4.335 4.568 4.788 4.988 5.085 5.278 5.457 5.725 5.904 6.072 6.312 6.525 6.722 6.926 7.122 7.365 7.598 7.822 8.096 8.355 8.596 8.878 9.184 9.464 9.775 10.096 10.441 10.812 11.214 11.672 12.126 12.641 13.198 13.798 14.421 15.088 15.73 16.219 16.159 15.831 15.448 15.062 14.666 14.245 13.802 13.392 12.941 12.533 12.174 11.836 11.516 11.193 10.894 10.59 10.297 10.027 9.756 9.48 9.242 8.98 8.705 8.483 8.25 8.01 7.764 7.512 7.331 7.149 6.839 6.613 6.385 6.257 5.987 5.723 5.457 5.309 5.054 4.758 4.552 4.36 3.919 3.674 3.418 3.105 2.747 2.301 1.678 -0.126 -9 ,12739 ,TETRA ,17586043,Sat Nov 27 15:58:19 CET,Sat Nov 27 17:39:46 CET,0.0 1.181 1.623 1.947 2.203 2.436 2.649 2.852 3.225 3.381 3.528 3.73 3.961 4.088 4.328 4.549 4.746 4.85 5.053 5.239 5.501 5.664 5.83 6.072 6.297 6.512 6.721 6.916 7.158 7.389 7.614 7.893 8.16 8.412 8.697 9.002 9.276 9.576 9.909 10.263 10.625 11.02 11.475 11.934 12.457 12.987 13.557 14.135 14.746 15.396 15.93 16.023 15.781 15.421 15.021 14.599 14.159 13.718 13.326 12.901 12.49 12.108 11.749 11.43 11.131 10.822 10.476 10.184 9.928 9.655 9.367 9.127 8.89 8.629 8.416 8.197 7.959 7.704 7.453 7.276 7.081 6.775 6.554 6.323 6.211 5.982 5.709 5.397 5.232 4.962 4.699 4.524 4.325 3.892 3.669 3.415 3.108 2.724 2.286 1.663 -0.043 -10 ,114 ,TETRA ,17586044,Sat Nov 27 15:57:20 CET,Sat Nov 27 17:41:42 CET,0.0 1.268 1.846 2.245 2.558 2.808 3.048 3.277 3.667 3.843 4.009 4.21 4.436 4.563 4.794 5.013 5.206 5.297 5.483 5.663 5.927 6.097 6.257 6.486 6.712 6.925 7.128 7.329 7.577 7.806 8.035 8.31 8.568 8.817 9.101 9.413 9.708 10.03 10.376 10.728 11.077 11.466 11.919 12.351 12.827 13.348 13.951 14.576 15.227 15.892 16.389 16.443 16.239 15.882 15.446 15.001 14.549 14.097 13.674 13.209 12.809 12.449 12.09 11.757 11.455 11.168 10.858 10.572 10.306 10.029 9.741 9.492 9.228 8.95 8.749 8.549 8.339 8.111 7.849 7.663 7.469 7.166 6.95 6.716 6.596 6.351 6.085 5.786 5.632 5.379 5.103 4.908 4.705 4.276 4.037 3.749 3.412 3.043 2.618 2.04 0.209 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt deleted file mode 100644 index 997c66c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23883 ,TETRA ,17586045,Sat Nov 27 15:57:19 CET,Sat Nov 27 17:42:33 CET,0.0 2.005 2.545 2.905 3.215 3.507 3.76 3.979 4.338 4.504 4.662 4.854 5.072 5.184 5.408 5.623 5.821 5.911 6.081 6.249 6.484 6.629 6.771 6.98 7.183 7.371 7.54 7.703 7.91 8.102 8.277 8.491 8.711 8.91 9.116 9.338 9.545 9.774 10.022 10.276 10.517 10.752 10.999 11.216 11.438 11.646 11.811 11.898 11.864 11.61 10.816 9.581 8.436 7.381 6.441 5.589 4.841 4.149 3.55 2.953 2.42 1.949 1.513 1.093 0.694 0.335 -0.031 -0.37 -0.676 -1.003 -1.344 -1.611 -1.894 -2.206 -2.433 -2.657 -2.894 -3.153 -3.442 -3.643 -3.847 -4.158 -4.37 -4.598 -4.716 -4.956 -5.22 -5.504 -5.643 -5.889 -6.111 -6.288 -6.468 -6.884 -7.126 -7.386 -7.66 -7.984 -8.373 -8.828 -9.994 -2 ,16952 ,TETRA ,17586046,Sat Nov 27 15:57:20 CET,Sat Nov 27 17:42:17 CET,0.0 1.473 1.94 2.29 2.563 2.816 3.052 3.257 3.63 3.794 3.943 4.108 4.316 4.445 4.702 4.928 5.134 5.231 5.409 5.571 5.799 5.951 6.096 6.301 6.493 6.662 6.82 6.974 7.173 7.366 7.545 7.756 7.964 8.161 8.382 8.617 8.827 9.048 9.276 9.505 9.74 10.009 10.298 10.529 10.769 11.033 11.259 11.364 11.375 11.171 10.425 9.246 8.122 7.084 6.148 5.295 4.533 3.837 3.224 2.613 2.094 1.639 1.207 0.798 0.411 0.045 -0.329 -0.667 -0.975 -1.281 -1.592 -1.862 -2.141 -2.431 -2.658 -2.892 -3.136 -3.386 -3.64 -3.822 -4.017 -4.33 -4.551 -4.783 -4.9 -5.134 -5.373 -5.647 -5.797 -6.055 -6.293 -6.465 -6.642 -7.023 -7.243 -7.483 -7.739 -8.052 -8.449 -8.979 -10.268 -3 ,25269 ,TETRA ,17586047,Sat Nov 27 15:57:21 CET,Sat Nov 27 17:42:14 CET,0.0 1.564 2.037 2.395 2.695 2.914 3.122 3.343 3.748 3.919 4.07 4.264 4.49 4.607 4.825 5.04 5.244 5.335 5.512 5.685 5.931 6.087 6.224 6.424 6.617 6.788 6.964 7.129 7.334 7.532 7.718 7.953 8.166 8.357 8.579 8.819 9.047 9.298 9.541 9.76 9.982 10.232 10.506 10.734 10.96 11.181 11.372 11.488 11.469 11.177 10.341 9.116 7.945 6.862 5.928 5.099 4.349 3.664 3.078 2.493 2.007 1.573 1.125 0.693 0.288 -0.083 -0.461 -0.806 -1.106 -1.424 -1.756 -2.028 -2.308 -2.6 -2.834 -3.067 -3.307 -3.571 -3.843 -4.02 -4.205 -4.506 -4.713 -4.94 -5.062 -5.306 -5.544 -5.795 -5.933 -6.184 -6.397 -6.571 -6.764 -7.158 -7.366 -7.601 -7.883 -8.192 -8.561 -9.045 -9.937 -4 ,25372 ,TETRA ,17586048,Sat Nov 27 15:57:19 CET,Sat Nov 27 17:43:30 CET,0.0 1.816 2.279 2.604 2.877 3.114 3.335 3.543 3.904 4.066 4.209 4.384 4.596 4.717 4.95 5.159 5.365 5.462 5.633 5.795 6.033 6.19 6.341 6.543 6.734 6.925 7.103 7.27 7.486 7.684 7.861 8.074 8.276 8.471 8.686 8.913 9.118 9.336 9.557 9.788 10.026 10.257 10.503 10.726 10.939 11.125 11.289 11.377 11.336 11.101 10.353 9.165 8.051 6.997 6.064 5.225 4.487 3.802 3.213 2.634 2.14 1.7 1.267 0.846 0.448 0.084 -0.299 -0.648 -0.941 -1.248 -1.593 -1.878 -2.167 -2.46 -2.684 -2.924 -3.172 -3.423 -3.685 -3.872 -4.075 -4.395 -4.604 -4.806 -4.916 -5.167 -5.441 -5.725 -5.87 -6.115 -6.314 -6.472 -6.63 -7.021 -7.244 -7.49 -7.785 -8.106 -8.482 -8.956 -10.533 -5 ,26549 ,TETRA ,17586049,Sat Nov 27 15:57:21 CET,Sat Nov 27 17:41:25 CET,0.0 1.5 2.009 2.378 2.683 2.941 3.181 3.408 3.769 3.924 4.067 4.224 4.44 4.554 4.76 4.961 5.165 5.267 5.454 5.634 5.884 6.036 6.179 6.377 6.56 6.738 6.914 7.089 7.308 7.514 7.71 7.929 8.13 8.309 8.522 8.765 8.984 9.209 9.434 9.668 9.893 10.126 10.38 10.614 10.839 11.057 11.258 11.378 11.396 11.184 10.427 9.211 8.05 6.991 6.026 5.161 4.415 3.723 3.115 2.515 1.998 1.53 1.07 0.637 0.243 -0.125 -0.513 -0.856 -1.157 -1.47 -1.795 -2.059 -2.33 -2.62 -2.848 -3.073 -3.309 -3.573 -3.848 -4.029 -4.21 -4.51 -4.729 -4.953 -5.068 -5.307 -5.561 -5.833 -5.967 -6.21 -6.427 -6.598 -6.777 -7.171 -7.387 -7.618 -7.872 -8.182 -8.568 -9.069 -10.296 -6 ,14129 ,TETRA ,17586050,Sat Nov 27 15:58:21 CET,Sat Nov 27 17:42:58 CET,0.0 1.532 2.048 2.426 2.722 2.977 3.212 3.41 3.753 3.909 4.062 4.242 4.458 4.573 4.793 4.998 5.193 5.292 5.482 5.655 5.89 6.045 6.195 6.387 6.584 6.78 6.955 7.12 7.33 7.528 7.719 7.944 8.141 8.317 8.516 8.731 8.954 9.189 9.413 9.639 9.856 10.1 10.393 10.656 10.906 11.121 11.304 11.436 11.451 11.215 10.479 9.31 8.236 7.249 6.323 5.454 4.707 4.054 3.458 2.835 2.311 1.867 1.451 1.063 0.698 0.355 -0.005 -0.334 -0.632 -0.942 -1.252 -1.516 -1.807 -2.094 -2.31 -2.55 -2.812 -3.075 -3.35 -3.542 -3.739 -4.047 -4.252 -4.467 -4.584 -4.824 -5.081 -5.376 -5.531 -5.783 -6.001 -6.169 -6.335 -6.71 -6.924 -7.15 -7.394 -7.697 -8.083 -8.574 -9.679 -7 ,22979 ,TETRA ,17586051,Sat Nov 27 15:57:21 CET,Sat Nov 27 17:40:57 CET,0.0 1.6 2.12 2.502 2.793 3.052 3.299 3.513 3.878 4.04 4.186 4.351 4.569 4.688 4.907 5.108 5.286 5.373 5.558 5.731 5.958 6.106 6.256 6.466 6.65 6.821 6.988 7.149 7.359 7.563 7.749 7.947 8.139 8.33 8.55 8.794 9.02 9.265 9.509 9.749 9.988 10.242 10.52 10.765 11.015 11.248 11.444 11.553 11.528 11.296 10.543 9.313 8.187 7.169 6.233 5.353 4.578 3.886 3.273 2.659 2.141 1.664 1.202 0.777 0.392 0.037 -0.34 -0.686 -0.982 -1.286 -1.601 -1.857 -2.13 -2.42 -2.655 -2.898 -3.136 -3.385 -3.655 -3.848 -4.047 -4.363 -4.586 -4.822 -4.941 -5.185 -5.46 -5.752 -5.902 -6.158 -6.387 -6.566 -6.754 -7.179 -7.417 -7.675 -7.967 -8.311 -8.752 -9.275 -10.443 -8 ,31925 ,TETRA ,17586052,Sat Nov 27 15:57:21 CET,Sat Nov 27 17:42:00 CET,0.0 1.257 1.708 2.074 2.372 2.627 2.854 3.054 3.391 3.542 3.677 3.843 4.064 4.186 4.41 4.623 4.819 4.91 5.093 5.264 5.505 5.658 5.805 6.007 6.202 6.398 6.566 6.719 6.938 7.143 7.332 7.561 7.776 7.973 8.187 8.428 8.637 8.856 9.09 9.322 9.555 9.798 10.067 10.296 10.525 10.743 10.929 11.07 11.079 10.857 10.113 8.888 7.731 6.667 5.75 4.917 4.17 3.492 2.897 2.302 1.766 1.279 0.834 0.406 0.008 -0.35 -0.722 -1.056 -1.361 -1.686 -2.023 -2.294 -2.577 -2.88 -3.112 -3.357 -3.613 -3.873 -4.146 -4.333 -4.526 -4.834 -5.044 -5.264 -5.381 -5.621 -5.863 -6.137 -6.283 -6.528 -6.739 -6.902 -7.075 -7.462 -7.696 -7.943 -8.194 -8.487 -8.842 -9.38 -10.707 -9 ,5595 ,TETRA ,17586053,Sat Nov 27 15:57:21 CET,Sat Nov 27 17:41:40 CET,0.0 1.467 1.968 2.367 2.671 2.914 3.135 3.335 3.687 3.836 3.984 4.186 4.408 4.53 4.767 4.981 5.176 5.271 5.453 5.622 5.868 6.023 6.165 6.372 6.57 6.748 6.911 7.069 7.276 7.478 7.669 7.879 8.072 8.253 8.454 8.672 8.88 9.115 9.356 9.583 9.804 10.036 10.281 10.528 10.782 10.991 11.171 11.27 11.27 11.071 10.359 9.195 8.088 7.064 6.136 5.317 4.626 3.952 3.351 2.758 2.226 1.752 1.311 0.887 0.492 0.131 -0.254 -0.606 -0.906 -1.214 -1.542 -1.819 -2.107 -2.401 -2.628 -2.87 -3.134 -3.398 -3.671 -3.867 -4.073 -4.401 -4.625 -4.846 -4.958 -5.206 -5.477 -5.758 -5.907 -6.16 -6.349 -6.504 -6.686 -7.126 -7.366 -7.625 -7.905 -8.227 -8.612 -9.074 -10.226 -10 ,26905 ,TETRA ,17586054,Sat Nov 27 15:57:21 CET,Sat Nov 27 17:41:32 CET,0.0 1.686 2.21 2.548 2.818 3.047 3.251 3.46 3.83 3.982 4.125 4.302 4.523 4.647 4.861 5.075 5.282 5.378 5.557 5.722 5.964 6.116 6.26 6.458 6.65 6.843 7.022 7.186 7.393 7.574 7.748 7.982 8.185 8.365 8.586 8.836 9.067 9.293 9.524 9.755 9.98 10.214 10.468 10.702 10.931 11.141 11.312 11.398 11.366 11.109 10.379 9.183 8.038 7.021 6.116 5.293 4.55 3.85 3.261 2.663 2.128 1.654 1.212 0.794 0.393 0.026 -0.355 -0.697 -0.996 -1.295 -1.609 -1.876 -2.155 -2.455 -2.686 -2.924 -3.174 -3.435 -3.709 -3.896 -4.093 -4.397 -4.603 -4.826 -4.94 -5.182 -5.443 -5.719 -5.863 -6.121 -6.354 -6.528 -6.711 -7.122 -7.345 -7.578 -7.832 -8.139 -8.554 -9.1 -10.253 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index 48f3af61..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19894 ,TETRA ,17586055,Sat Nov 27 15:57:21 CET,Sat Nov 27 17:41:07 CET,0.0 0.935 1.381 1.689 1.955 2.192 2.407 2.604 2.943 3.092 3.233 3.396 3.621 3.735 3.959 4.169 4.372 4.472 4.655 4.839 5.103 5.267 5.425 5.651 5.874 6.089 6.291 6.484 6.734 6.977 7.209 7.49 7.753 8.003 8.285 8.594 8.893 9.217 9.556 9.906 10.265 10.642 11.05 11.455 11.906 12.365 12.866 13.336 13.71 13.997 13.842 13.013 12.087 11.169 10.286 9.462 8.731 8.037 7.439 6.836 6.296 5.799 5.31 4.855 4.453 4.079 3.67 3.298 2.967 2.618 2.253 1.943 1.628 1.321 1.086 0.83 0.548 0.258 -0.029 -0.227 -0.432 -0.752 -0.981 -1.222 -1.348 -1.604 -1.861 -2.133 -2.277 -2.528 -2.747 -2.92 -3.1 -3.475 -3.69 -3.939 -4.231 -4.568 -4.944 -5.425 -6.919 -2 ,19422 ,TETRA ,17586056,Sat Nov 27 15:58:21 CET,Sat Nov 27 17:42:51 CET,0.0 1.018 1.469 1.82 2.093 2.333 2.532 2.709 3.038 3.185 3.331 3.506 3.737 3.855 4.066 4.26 4.451 4.548 4.732 4.905 5.161 5.323 5.478 5.699 5.907 6.103 6.283 6.459 6.686 6.911 7.149 7.419 7.662 7.903 8.185 8.499 8.794 9.116 9.453 9.8 10.164 10.542 10.957 11.379 11.846 12.32 12.813 13.267 13.644 13.908 13.743 12.933 11.955 11.013 10.164 9.361 8.629 7.953 7.354 6.732 6.181 5.686 5.212 4.772 4.358 3.971 3.574 3.228 2.925 2.596 2.25 1.969 1.684 1.384 1.149 0.9 0.632 0.345 0.053 -0.141 -0.343 -0.663 -0.89 -1.125 -1.254 -1.523 -1.798 -2.087 -2.232 -2.488 -2.705 -2.881 -3.075 -3.531 -3.791 -4.041 -4.301 -4.608 -5.005 -5.541 -6.646 -3 ,18743 ,TETRA ,17586057,Sat Nov 27 15:58:21 CET,Sat Nov 27 17:42:50 CET,0.0 0.996 1.481 1.841 2.093 2.308 2.523 2.719 3.07 3.236 3.384 3.556 3.793 3.922 4.153 4.368 4.57 4.668 4.864 5.059 5.318 5.478 5.639 5.866 6.09 6.304 6.499 6.683 6.934 7.192 7.441 7.727 7.994 8.238 8.506 8.808 9.089 9.411 9.766 10.126 10.479 10.85 11.284 11.73 12.226 12.718 13.186 13.636 14.088 14.344 14.189 13.422 12.475 11.558 10.703 9.897 9.155 8.464 7.868 7.254 6.727 6.24 5.759 5.309 4.886 4.495 4.072 3.703 3.395 3.061 2.702 2.405 2.097 1.766 1.512 1.261 0.997 0.719 0.437 0.242 0.042 -0.264 -0.491 -0.748 -0.873 -1.12 -1.391 -1.69 -1.847 -2.107 -2.361 -2.557 -2.748 -3.188 -3.433 -3.673 -3.934 -4.251 -4.634 -5.147 -6.323 -4 ,15243 ,TETRA ,17586058,Sat Nov 27 15:58:21 CET,Sat Nov 27 17:42:31 CET,0.0 1.11 1.575 1.919 2.166 2.4 2.62 2.795 3.099 3.242 3.373 3.519 3.74 3.86 4.093 4.318 4.519 4.613 4.801 4.974 5.216 5.37 5.52 5.743 5.958 6.16 6.355 6.548 6.795 7.03 7.245 7.506 7.758 7.993 8.268 8.577 8.871 9.178 9.509 9.862 10.192 10.541 10.933 11.311 11.728 12.185 12.701 13.162 13.5 13.679 13.489 12.711 11.765 10.814 9.904 9.057 8.307 7.601 6.98 6.346 5.801 5.318 4.838 4.379 3.954 3.566 3.165 2.807 2.499 2.196 1.86 1.562 1.251 0.941 0.701 0.447 0.19 -0.08 -0.363 -0.558 -0.759 -1.076 -1.306 -1.542 -1.662 -1.907 -2.17 -2.458 -2.608 -2.864 -3.092 -3.283 -3.474 -3.85 -4.072 -4.326 -4.595 -4.913 -5.336 -5.899 -7.112 -5 ,28923 ,TETRA ,17586059,Sat Nov 27 15:58:21 CET,Sat Nov 27 17:42:02 CET,0.0 0.943 1.352 1.658 1.921 2.143 2.349 2.544 2.901 3.058 3.208 3.397 3.63 3.751 3.981 4.203 4.408 4.506 4.7 4.888 5.165 5.331 5.488 5.72 5.937 6.145 6.356 6.56 6.804 7.033 7.259 7.525 7.772 8.007 8.273 8.575 8.856 9.171 9.513 9.871 10.246 10.64 11.064 11.483 11.941 12.414 12.932 13.402 13.76 13.995 13.841 13.11 12.251 11.313 10.424 9.606 8.845 8.14 7.518 6.883 6.336 5.86 5.414 4.981 4.572 4.197 3.792 3.421 3.103 2.78 2.448 2.162 1.85 1.521 1.281 1.044 0.794 0.538 0.256 0.053 -0.159 -0.497 -0.728 -0.966 -1.084 -1.328 -1.587 -1.869 -2.015 -2.274 -2.497 -2.677 -2.876 -3.286 -3.52 -3.77 -4.053 -4.4 -4.851 -5.528 -7.016 -6 ,27077 ,TETRA ,17586060,Sat Nov 27 15:58:21 CET,Sat Nov 27 17:42:23 CET,0.0 0.873 1.26 1.543 1.797 2.04 2.245 2.436 2.82 2.988 3.127 3.288 3.509 3.623 3.846 4.057 4.27 4.375 4.569 4.766 5.058 5.233 5.391 5.622 5.843 6.055 6.258 6.449 6.686 6.912 7.133 7.408 7.674 7.92 8.208 8.517 8.785 9.082 9.407 9.74 10.087 10.477 10.917 11.331 11.775 12.228 12.673 13.098 13.497 13.722 13.584 12.862 11.952 11.023 10.162 9.32 8.55 7.853 7.246 6.624 6.065 5.554 5.055 4.595 4.179 3.8 3.402 3.042 2.731 2.408 2.076 1.794 1.493 1.185 0.94 0.681 0.417 0.141 -0.144 -0.34 -0.546 -0.865 -1.084 -1.315 -1.434 -1.689 -1.956 -2.24 -2.394 -2.654 -2.9 -3.081 -3.269 -3.698 -3.938 -4.201 -4.483 -4.808 -5.214 -5.728 -6.998 -7 ,3586 ,TETRA ,17586061,Sat Nov 27 15:58:21 CET,Sat Nov 27 17:42:07 CET,0.0 1.049 1.526 1.878 2.172 2.426 2.629 2.802 3.116 3.267 3.418 3.587 3.812 3.932 4.161 4.37 4.568 4.667 4.863 5.058 5.348 5.53 5.694 5.931 6.151 6.355 6.551 6.739 6.981 7.219 7.452 7.734 8.0 8.247 8.531 8.848 9.139 9.459 9.798 10.14 10.502 10.897 11.314 11.717 12.162 12.614 13.077 13.508 13.909 14.177 14.015 13.192 12.275 11.372 10.499 9.689 8.938 8.246 7.661 7.065 6.523 6.03 5.551 5.094 4.663 4.267 3.867 3.518 3.215 2.889 2.559 2.283 1.979 1.655 1.412 1.162 0.893 0.599 0.291 0.091 -0.116 -0.44 -0.664 -0.903 -1.034 -1.31 -1.599 -1.911 -2.075 -2.342 -2.57 -2.751 -2.941 -3.37 -3.605 -3.854 -4.149 -4.505 -4.904 -5.416 -6.545 -8 ,32490 ,TETRA ,17586062,Sat Nov 27 15:58:21 CET,Sat Nov 27 17:43:26 CET,0.0 0.783 1.204 1.482 1.711 1.947 2.186 2.383 2.718 2.877 3.025 3.194 3.417 3.533 3.761 3.976 4.177 4.273 4.457 4.639 4.896 5.056 5.216 5.455 5.687 5.898 6.094 6.281 6.523 6.763 6.985 7.253 7.509 7.753 8.051 8.369 8.661 8.982 9.326 9.685 10.034 10.407 10.835 11.254 11.717 12.19 12.68 13.145 13.57 13.865 13.733 12.916 11.963 11.019 10.155 9.358 8.651 7.992 7.381 6.782 6.252 5.766 5.309 4.858 4.421 4.009 3.584 3.215 2.891 2.553 2.204 1.931 1.646 1.334 1.092 0.84 0.574 0.299 0.004 -0.203 -0.402 -0.704 -0.922 -1.155 -1.283 -1.563 -1.845 -2.126 -2.273 -2.535 -2.776 -2.957 -3.157 -3.575 -3.819 -4.1 -4.382 -4.715 -5.112 -5.675 -6.941 -9 ,181 ,TETRA ,17586063,Sat Nov 27 15:58:22 CET,Sat Nov 27 17:42:10 CET,0.0 0.876 1.297 1.594 1.83 2.043 2.235 2.408 2.732 2.881 3.022 3.202 3.443 3.57 3.804 4.029 4.238 4.338 4.54 4.733 4.994 5.151 5.304 5.535 5.756 5.969 6.179 6.375 6.622 6.836 7.045 7.32 7.576 7.817 8.095 8.387 8.657 8.959 9.284 9.615 9.962 10.335 10.725 11.108 11.555 12.028 12.48 12.878 13.241 13.436 13.171 12.418 11.548 10.64 9.757 8.894 8.115 7.421 6.832 6.217 5.651 5.142 4.667 4.216 3.786 3.396 2.994 2.623 2.292 1.954 1.604 1.317 1.005 0.68 0.431 0.166 -0.106 -0.391 -0.679 -0.876 -1.092 -1.425 -1.66 -1.909 -2.037 -2.304 -2.562 -2.827 -2.973 -3.236 -3.487 -3.684 -3.881 -4.325 -4.578 -4.854 -5.152 -5.464 -5.827 -6.344 -7.603 -10 ,30307 ,TETRA ,17586064,Sat Nov 27 15:58:22 CET,Sat Nov 27 17:43:06 CET,0.0 0.864 1.278 1.616 1.888 2.103 2.308 2.507 2.853 3.009 3.164 3.337 3.571 3.713 3.974 4.201 4.416 4.512 4.687 4.861 5.122 5.291 5.451 5.674 5.888 6.091 6.28 6.474 6.73 6.965 7.198 7.474 7.73 7.965 8.225 8.532 8.822 9.125 9.455 9.793 10.15 10.556 11.005 11.422 11.858 12.29 12.7 13.124 13.555 13.785 13.577 12.846 11.978 11.053 10.187 9.361 8.618 7.931 7.308 6.679 6.137 5.653 5.177 4.71 4.29 3.916 3.516 3.148 2.83 2.491 2.138 1.845 1.542 1.235 0.992 0.755 0.51 0.236 -0.053 -0.252 -0.456 -0.756 -0.969 -1.208 -1.334 -1.599 -1.881 -2.161 -2.313 -2.582 -2.808 -2.982 -3.169 -3.598 -3.832 -4.064 -4.348 -4.699 -5.105 -5.627 -6.933 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt deleted file mode 100644 index b20d799d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10805 ,TETRA ,17586065,Sat Nov 27 15:58:22 CET,Sat Nov 27 17:42:34 CET,0.0 1.215 1.73 2.077 2.359 2.618 2.852 3.081 3.488 3.668 3.834 4.045 4.298 4.448 4.723 4.996 5.255 5.37 5.593 5.809 6.101 6.285 6.466 6.732 6.991 7.235 7.469 7.699 7.983 8.264 8.541 8.866 9.189 9.504 9.86 10.248 10.613 11.008 11.417 11.84 12.289 12.792 13.355 13.896 14.507 15.191 15.957 16.658 17.297 17.887 18.139 17.632 16.851 16.081 15.292 14.521 13.819 13.172 12.61 12.014 11.481 11.005 10.556 10.128 9.729 9.363 8.965 8.616 8.311 7.98 7.642 7.36 7.072 6.782 6.561 6.326 6.066 5.802 5.539 5.352 5.148 4.83 4.618 4.395 4.269 4.017 3.762 3.477 3.321 3.064 2.847 2.676 2.504 2.122 1.917 1.703 1.439 1.126 0.779 0.316 -0.741 -2 ,23823 ,TETRA ,17586066,Sat Nov 27 15:58:22 CET,Sat Nov 27 17:42:04 CET,0.0 0.891 1.344 1.734 2.062 2.313 2.539 2.747 3.131 3.312 3.483 3.717 3.978 4.118 4.37 4.615 4.852 4.967 5.187 5.398 5.698 5.886 6.077 6.357 6.615 6.863 7.105 7.339 7.632 7.901 8.149 8.456 8.767 9.074 9.429 9.815 10.177 10.575 11.025 11.486 11.936 12.427 12.981 13.552 14.19 14.834 15.514 16.23 16.895 17.414 17.72 17.338 16.669 15.899 15.092 14.33 13.645 12.974 12.362 11.725 11.17 10.683 10.211 9.777 9.38 9.013 8.629 8.28 7.974 7.657 7.328 7.044 6.743 6.437 6.202 5.959 5.714 5.456 5.178 4.988 4.799 4.502 4.293 4.063 3.941 3.693 3.427 3.143 2.996 2.749 2.539 2.369 2.2 1.837 1.624 1.4 1.165 0.883 0.536 0.055 -0.952 -3 ,11118 ,TETRA ,17586067,Sat Nov 27 15:58:24 CET,Sat Nov 27 17:43:08 CET,0.0 0.935 1.357 1.708 2.005 2.248 2.467 2.68 3.057 3.226 3.4 3.63 3.879 4.02 4.277 4.521 4.759 4.872 5.097 5.311 5.61 5.796 5.972 6.233 6.488 6.73 6.967 7.196 7.482 7.76 8.029 8.362 8.677 8.971 9.298 9.661 10.031 10.43 10.836 11.271 11.728 12.219 12.768 13.303 13.909 14.551 15.24 15.938 16.624 17.229 17.444 16.947 16.218 15.42 14.599 13.821 13.118 12.464 11.889 11.288 10.754 10.288 9.845 9.399 8.977 8.593 8.205 7.866 7.565 7.244 6.91 6.644 6.362 6.054 5.812 5.565 5.31 5.044 4.768 4.578 4.383 4.082 3.865 3.631 3.516 3.279 3.024 2.741 2.593 2.343 2.132 1.969 1.796 1.442 1.231 0.99 0.746 0.471 0.147 -0.318 -1.455 -4 ,10037 ,TETRA ,17586068,Sat Nov 27 15:58:22 CET,Sat Nov 27 17:46:07 CET,0.0 1.184 1.664 2.026 2.336 2.597 2.824 3.03 3.402 3.564 3.718 3.935 4.193 4.337 4.611 4.876 5.124 5.235 5.443 5.647 5.936 6.124 6.306 6.564 6.815 7.063 7.306 7.535 7.826 8.109 8.391 8.731 9.043 9.338 9.671 10.047 10.409 10.8 11.222 11.65 12.087 12.589 13.159 13.714 14.354 15.014 15.707 16.464 17.217 17.824 18.034 17.594 16.84 15.998 15.213 14.487 13.786 13.104 12.51 11.913 11.401 10.948 10.52 10.121 9.721 9.339 8.936 8.576 8.27 7.95 7.611 7.327 7.037 6.729 6.486 6.239 5.983 5.717 5.45 5.262 5.058 4.752 4.541 4.317 4.201 3.971 3.725 3.448 3.304 3.053 2.83 2.657 2.477 2.104 1.877 1.627 1.372 1.046 0.631 0.145 -0.885 -5 ,28293 ,TETRA ,17586069,Sat Nov 27 15:58:22 CET,Sat Nov 27 17:44:10 CET,0.0 0.978 1.408 1.715 1.986 2.247 2.489 2.71 3.107 3.282 3.443 3.635 3.875 4.012 4.288 4.545 4.778 4.894 5.119 5.335 5.648 5.836 6.019 6.291 6.547 6.788 7.022 7.257 7.564 7.845 8.109 8.442 8.767 9.069 9.399 9.775 10.155 10.562 10.978 11.409 11.862 12.379 12.947 13.505 14.199 14.891 15.592 16.304 16.972 17.511 17.582 17.08 16.355 15.551 14.759 13.998 13.299 12.651 12.088 11.512 11.005 10.551 10.118 9.69 9.267 8.887 8.486 8.118 7.806 7.49 7.153 6.879 6.594 6.28 6.042 5.804 5.563 5.318 5.045 4.842 4.636 4.329 4.115 3.897 3.782 3.539 3.289 3.031 2.896 2.65 2.458 2.303 2.133 1.741 1.534 1.307 1.054 0.769 0.425 -0.042 -1.076 -6 ,17220 ,TETRA ,17586070,Sat Nov 27 15:58:22 CET,Sat Nov 27 17:44:01 CET,0.0 1.064 1.49 1.809 2.098 2.369 2.608 2.827 3.218 3.391 3.548 3.738 3.985 4.124 4.379 4.619 4.852 4.969 5.198 5.413 5.707 5.9 6.097 6.378 6.642 6.887 7.131 7.368 7.654 7.944 8.239 8.573 8.881 9.172 9.498 9.866 10.227 10.611 11.018 11.453 11.91 12.439 13.043 13.616 14.257 14.913 15.58 16.272 17.033 17.634 17.77 17.342 16.641 15.844 15.114 14.386 13.628 12.947 12.383 11.788 11.245 10.778 10.359 9.936 9.517 9.142 8.757 8.416 8.11 7.782 7.445 7.166 6.878 6.577 6.352 6.125 5.874 5.605 5.325 5.133 4.939 4.629 4.408 4.183 4.072 3.844 3.603 3.336 3.192 2.942 2.714 2.53 2.338 1.932 1.711 1.468 1.209 0.915 0.546 0.051 -1.045 -7 ,16234 ,TETRA ,17586071,Sat Nov 27 15:58:23 CET,Sat Nov 27 17:43:08 CET,0.0 0.931 1.394 1.762 2.046 2.296 2.531 2.745 3.123 3.288 3.454 3.669 3.913 4.047 4.298 4.532 4.761 4.875 5.095 5.303 5.598 5.784 5.966 6.239 6.499 6.746 6.988 7.226 7.533 7.814 8.075 8.397 8.702 8.996 9.332 9.697 10.047 10.441 10.866 11.327 11.801 12.303 12.875 13.423 14.031 14.681 15.393 16.146 16.901 17.576 17.825 17.326 16.573 15.774 14.982 14.191 13.496 12.866 12.304 11.721 11.193 10.708 10.255 9.838 9.453 9.086 8.694 8.343 8.03 7.716 7.4 7.133 6.852 6.563 6.344 6.109 5.848 5.578 5.292 5.095 4.901 4.59 4.372 4.146 4.031 3.791 3.534 3.271 3.129 2.875 2.645 2.466 2.273 1.878 1.662 1.413 1.159 0.874 0.524 0.075 -1.038 -8 ,29607 ,TETRA ,17586072,Sat Nov 27 15:58:23 CET,Sat Nov 27 17:43:59 CET,0.0 0.951 1.406 1.722 2.021 2.295 2.526 2.747 3.125 3.3 3.479 3.693 3.932 4.076 4.356 4.608 4.854 4.974 5.19 5.392 5.679 5.879 6.074 6.324 6.56 6.806 7.049 7.27 7.55 7.841 8.122 8.442 8.746 9.035 9.382 9.756 10.092 10.488 10.917 11.35 11.794 12.276 12.828 13.403 14.054 14.703 15.354 15.968 16.588 17.139 17.364 16.932 16.19 15.435 14.655 13.888 13.224 12.596 12.011 11.412 10.916 10.46 9.999 9.568 9.17 8.8 8.406 8.061 7.76 7.418 7.072 6.807 6.524 6.221 5.984 5.736 5.486 5.231 4.957 4.772 4.577 4.261 4.052 3.834 3.711 3.455 3.199 2.929 2.791 2.546 2.32 2.152 1.982 1.611 1.402 1.157 0.878 0.576 0.225 -0.24 -1.208 -9 ,18068 ,TETRA ,17586073,Sat Nov 27 15:58:23 CET,Sat Nov 27 17:43:58 CET,0.0 1.055 1.474 1.788 2.071 2.326 2.557 2.779 3.163 3.346 3.533 3.779 4.037 4.176 4.446 4.703 4.947 5.063 5.271 5.474 5.787 5.98 6.167 6.439 6.692 6.929 7.159 7.385 7.672 7.96 8.239 8.563 8.878 9.184 9.529 9.892 10.241 10.629 11.036 11.465 11.917 12.437 13.02 13.569 14.175 14.807 15.472 16.145 16.851 17.524 17.854 17.411 16.693 15.906 15.119 14.359 13.664 13.016 12.425 11.831 11.322 10.865 10.406 9.981 9.594 9.216 8.823 8.476 8.182 7.875 7.55 7.279 7.002 6.718 6.496 6.256 6.008 5.75 5.466 5.275 5.082 4.77 4.547 4.314 4.192 3.941 3.687 3.42 3.277 3.024 2.819 2.654 2.481 2.113 1.899 1.662 1.409 1.133 0.783 0.283 -0.863 -10 ,8367 ,TETRA ,17586074,Sat Nov 27 15:58:23 CET,Sat Nov 27 17:43:45 CET,0.0 0.957 1.386 1.707 1.97 2.198 2.409 2.617 2.985 3.158 3.318 3.505 3.745 3.883 4.145 4.403 4.656 4.771 4.987 5.195 5.493 5.688 5.875 6.134 6.385 6.636 6.872 7.088 7.36 7.619 7.884 8.211 8.524 8.837 9.194 9.571 9.93 10.336 10.774 11.218 11.657 12.135 12.682 13.219 13.842 14.482 15.172 15.939 16.685 17.301 17.532 17.137 16.481 15.699 14.922 14.161 13.471 12.829 12.252 11.663 11.126 10.659 10.226 9.802 9.381 9.004 8.626 8.277 7.971 7.651 7.311 7.036 6.758 6.465 6.245 6.018 5.769 5.504 5.225 5.038 4.857 4.571 4.365 4.145 4.033 3.804 3.549 3.279 3.141 2.899 2.697 2.525 2.343 1.968 1.746 1.495 1.248 0.966 0.623 0.191 -0.907 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt deleted file mode 100644 index a9c5eb3e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1559 ,TETRA ,17586075,Sat Nov 27 15:58:22 CET,Sat Nov 27 17:43:36 CET,0.0 1.06 1.477 1.811 2.092 2.327 2.553 2.771 3.197 3.393 3.556 3.746 3.993 4.134 4.399 4.655 4.906 5.025 5.246 5.465 5.787 5.988 6.18 6.463 6.753 7.039 7.312 7.574 7.9 8.219 8.527 8.894 9.265 9.618 10.017 10.463 10.894 11.382 11.897 12.42 12.974 13.619 14.363 15.105 15.978 16.956 18.068 19.284 20.659 22.152 23.829 25.025 25.498 25.591 25.542 25.436 25.235 24.962 24.687 24.424 24.177 23.929 23.688 23.445 23.2 22.973 22.732 22.492 22.281 22.066 21.833 21.635 21.427 21.213 21.051 20.875 20.68 20.477 20.269 20.124 19.972 19.731 19.561 19.382 19.285 19.077 18.848 18.586 18.448 18.235 18.054 17.893 17.73 17.409 17.227 17.003 16.765 16.499 16.163 15.636 14.285 -2 ,26390 ,TETRA ,17586076,Sat Nov 27 15:58:25 CET,Sat Nov 27 17:43:33 CET,0.0 0.881 1.28 1.62 1.892 2.131 2.358 2.573 2.968 3.146 3.317 3.519 3.761 3.904 4.172 4.418 4.656 4.774 4.989 5.211 5.54 5.746 5.949 6.238 6.526 6.792 7.029 7.275 7.614 7.942 8.248 8.613 8.976 9.326 9.729 10.18 10.615 11.103 11.617 12.156 12.73 13.382 14.138 14.897 15.807 16.813 17.914 19.101 20.466 22.061 23.823 24.938 25.311 25.378 25.335 25.198 25.0 24.781 24.547 24.245 23.96 23.708 23.459 23.202 22.96 22.748 22.513 22.298 22.091 21.857 21.627 21.437 21.229 21.011 20.847 20.681 20.501 20.301 20.093 19.949 19.794 19.545 19.366 19.176 19.081 18.884 18.654 18.395 18.268 18.06 17.887 17.745 17.587 17.275 17.11 16.903 16.661 16.399 16.054 15.597 14.504 -3 ,1218 ,TETRA ,17586077,Sat Nov 27 15:58:26 CET,Sat Nov 27 17:43:03 CET,0.0 1.26 1.727 2.082 2.393 2.662 2.908 3.131 3.508 3.682 3.85 4.08 4.34 4.491 4.776 5.042 5.296 5.42 5.654 5.88 6.208 6.416 6.619 6.914 7.187 7.453 7.72 7.98 8.312 8.634 8.94 9.31 9.666 10.01 10.419 10.877 11.309 11.769 12.264 12.804 13.385 14.052 14.815 15.556 16.42 17.38 18.496 19.748 21.175 22.781 24.469 25.601 26.057 26.134 26.052 25.899 25.699 25.466 25.225 24.947 24.685 24.437 24.199 23.97 23.724 23.482 23.232 23.007 22.803 22.593 22.368 22.163 21.947 21.718 21.546 21.377 21.188 20.964 20.732 20.584 20.43 20.14 19.9 19.65 19.524 19.259 18.98 18.687 18.536 18.294 18.032 17.835 17.616 17.146 16.881 16.595 16.26 15.856 15.373 14.728 13.014 -4 ,7104 ,TETRA ,17586078,Sat Nov 27 15:58:22 CET,Sat Nov 27 17:42:59 CET,0.0 1.128 1.589 1.932 2.217 2.477 2.723 2.955 3.352 3.533 3.705 3.927 4.192 4.348 4.627 4.886 5.147 5.268 5.496 5.723 6.052 6.273 6.482 6.772 7.061 7.34 7.595 7.846 8.181 8.506 8.821 9.189 9.541 9.887 10.282 10.715 11.15 11.62 12.104 12.65 13.239 13.881 14.635 15.41 16.321 17.326 18.399 19.581 20.977 22.546 24.26 25.336 25.719 25.854 25.789 25.567 25.312 25.084 24.869 24.576 24.301 24.036 23.765 23.512 23.273 23.054 22.786 22.531 22.324 22.112 21.881 21.678 21.479 21.272 21.101 20.919 20.719 20.51 20.289 20.141 19.989 19.738 19.559 19.372 19.275 19.067 18.846 18.609 18.484 18.258 18.037 17.879 17.715 17.343 17.139 16.899 16.619 16.34 15.961 15.444 14.112 -5 ,26148 ,TETRA ,17586079,Sat Nov 27 15:58:22 CET,Sat Nov 27 17:43:07 CET,0.0 1.22 1.709 2.043 2.337 2.596 2.85 3.093 3.515 3.72 3.9 4.113 4.371 4.526 4.804 5.073 5.32 5.433 5.67 5.907 6.233 6.434 6.624 6.917 7.219 7.499 7.762 8.008 8.319 8.641 8.968 9.363 9.72 10.069 10.485 10.934 11.357 11.828 12.353 12.911 13.494 14.157 14.91 15.652 16.532 17.525 18.685 19.984 21.448 23.066 24.839 25.99 26.369 26.488 26.464 26.344 26.181 25.966 25.73 25.473 25.222 24.984 24.762 24.538 24.305 24.075 23.83 23.594 23.381 23.164 22.923 22.719 22.501 22.267 22.094 21.915 21.726 21.522 21.308 21.162 20.999 20.744 20.568 20.378 20.28 20.085 19.897 19.699 19.588 19.375 19.163 19.004 18.83 18.46 18.258 18.048 17.812 17.541 17.19 16.674 15.427 -6 ,31413 ,TETRA ,17586080,Sat Nov 27 15:58:24 CET,Sat Nov 27 17:42:21 CET,0.0 1.161 1.673 2.042 2.366 2.677 2.943 3.176 3.574 3.755 3.92 4.117 4.367 4.508 4.756 4.993 5.229 5.345 5.578 5.805 6.125 6.324 6.518 6.807 7.088 7.365 7.635 7.887 8.215 8.53 8.826 9.193 9.549 9.892 10.275 10.712 11.149 11.631 12.158 12.713 13.288 13.962 14.748 15.503 16.383 17.384 18.496 19.716 21.133 22.703 24.44 25.653 26.041 26.093 26.027 25.89 25.632 25.331 25.084 24.814 24.571 24.331 24.085 23.841 23.6 23.371 23.121 22.889 22.679 22.471 22.248 22.058 21.862 21.643 21.458 21.269 21.076 20.868 20.664 20.519 20.364 20.115 19.944 19.765 19.669 19.474 19.263 19.016 18.884 18.663 18.462 18.313 18.157 17.8 17.602 17.394 17.164 16.911 16.573 16.058 14.719 -7 ,19052 ,TETRA ,17586081,Sat Nov 27 15:58:24 CET,Sat Nov 27 17:47:01 CET,0.0 0.925 1.331 1.647 1.939 2.19 2.431 2.65 3.019 3.182 3.339 3.543 3.791 3.928 4.202 4.473 4.724 4.846 5.091 5.328 5.654 5.868 6.075 6.364 6.648 6.926 7.183 7.434 7.774 8.11 8.422 8.796 9.154 9.491 9.896 10.34 10.759 11.229 11.75 12.321 12.921 13.585 14.347 15.113 16.002 16.956 18.05 19.308 20.745 22.278 23.894 24.918 25.263 25.306 25.191 25.029 24.85 24.649 24.444 24.165 23.9 23.657 23.406 23.163 22.923 22.692 22.447 22.214 22.006 21.78 21.54 21.346 21.141 20.926 20.764 20.592 20.404 20.202 19.996 19.858 19.701 19.449 19.274 19.09 18.994 18.787 18.568 18.335 18.212 18.001 17.806 17.65 17.482 17.105 16.897 16.67 16.429 16.154 15.799 15.332 14.264 -8 ,4337 ,TETRA ,17586082,Sat Nov 27 15:59:19 CET,Sat Nov 27 17:44:42 CET,0.0 1.15 1.671 2.027 2.33 2.614 2.859 3.086 3.485 3.663 3.832 4.047 4.303 4.454 4.734 5.009 5.266 5.385 5.631 5.859 6.189 6.403 6.595 6.877 7.161 7.431 7.696 7.958 8.285 8.596 8.9 9.274 9.637 9.985 10.387 10.83 11.262 11.733 12.24 12.782 13.347 13.988 14.747 15.525 16.436 17.428 18.525 19.764 21.158 22.668 24.424 25.661 26.141 26.253 26.157 25.968 25.756 25.525 25.271 24.978 24.708 24.445 24.173 23.919 23.684 23.457 23.199 22.961 22.752 22.538 22.331 22.154 21.96 21.744 21.574 21.399 21.216 21.018 20.807 20.673 20.527 20.269 20.081 19.89 19.796 19.596 19.37 19.12 18.991 18.777 18.596 18.441 18.276 17.922 17.726 17.501 17.231 16.922 16.558 16.031 14.452 -9 ,11561 ,TETRA ,17586083,Sat Nov 27 16:00:28 CET,Sat Nov 27 17:45:22 CET,0.0 0.929 1.316 1.64 1.952 2.229 2.463 2.686 3.084 3.269 3.445 3.647 3.894 4.037 4.325 4.602 4.85 4.965 5.197 5.414 5.719 5.931 6.145 6.439 6.709 6.968 7.218 7.458 7.787 8.109 8.416 8.792 9.15 9.504 9.916 10.375 10.815 11.303 11.834 12.395 12.969 13.609 14.382 15.164 16.067 17.034 18.113 19.37 20.827 22.394 24.16 25.376 25.752 25.773 25.673 25.483 25.253 25.016 24.769 24.503 24.227 23.965 23.725 23.487 23.253 23.025 22.771 22.536 22.333 22.114 21.882 21.693 21.487 21.261 21.09 20.902 20.692 20.485 20.273 20.121 19.964 19.706 19.521 19.337 19.245 19.055 18.845 18.64 18.529 18.318 18.125 17.959 17.792 17.44 17.251 17.041 16.793 16.529 16.161 15.626 14.241 -10 ,5768 ,TETRA ,17586084,Sat Nov 27 15:59:19 CET,Sat Nov 27 17:39:00 CET,0.0 1.229 1.808 2.241 2.58 2.864 3.108 3.328 3.722 3.918 4.109 4.337 4.588 4.732 4.994 5.252 5.509 5.639 5.887 6.12 6.459 6.668 6.864 7.165 7.465 7.743 7.998 8.247 8.579 8.903 9.207 9.566 9.916 10.263 10.666 11.118 11.55 12.026 12.536 13.083 13.656 14.284 15.022 15.785 16.677 17.643 18.737 19.961 21.349 22.905 24.658 25.78 26.21 26.348 26.309 26.155 25.943 25.717 25.486 25.214 24.948 24.693 24.432 24.179 23.938 23.719 23.482 23.257 23.059 22.847 22.632 22.449 22.248 22.045 21.884 21.701 21.515 21.325 21.109 20.96 20.799 20.537 20.352 20.161 20.072 19.876 19.658 19.435 19.313 19.1 18.894 18.734 18.575 18.221 18.017 17.77 17.492 17.192 16.866 16.421 15.115 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt deleted file mode 100644 index e30b9657..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11211 ,TETRA ,17586085,Sat Nov 27 15:59:20 CET,Sat Nov 27 17:45:21 CET,0.0 0.913 1.349 1.701 1.987 2.26 2.503 2.711 3.109 3.304 3.493 3.738 4.007 4.162 4.453 4.724 4.974 5.099 5.348 5.587 5.925 6.148 6.358 6.652 6.932 7.21 7.485 7.749 8.089 8.424 8.749 9.132 9.501 9.865 10.277 10.738 11.198 11.697 12.228 12.796 13.402 14.096 14.901 15.691 16.62 17.675 18.864 20.166 21.659 23.345 25.215 26.439 26.929 27.085 26.997 26.8 26.553 26.288 26.047 25.765 25.491 25.213 24.921 24.628 24.366 24.14 23.879 23.63 23.4 23.162 22.919 22.707 22.481 22.244 22.06 21.863 21.667 21.467 21.233 21.065 20.898 20.64 20.465 20.283 20.183 19.968 19.753 19.527 19.404 19.19 18.978 18.817 18.651 18.283 18.083 17.853 17.601 17.338 17.001 16.535 15.555 -2 ,788 ,TETRA ,17586086,Sat Nov 27 15:59:20 CET,Sat Nov 27 17:44:32 CET,0.0 1.037 1.454 1.786 2.078 2.358 2.611 2.828 3.221 3.397 3.576 3.812 4.073 4.223 4.518 4.798 5.063 5.191 5.433 5.661 6.001 6.22 6.432 6.751 7.051 7.327 7.594 7.855 8.19 8.528 8.846 9.219 9.583 9.945 10.383 10.864 11.341 11.868 12.438 13.032 13.623 14.309 15.115 15.904 16.847 17.931 19.137 20.462 21.958 23.584 25.378 26.521 26.926 27.002 26.903 26.711 26.474 26.222 25.941 25.626 25.355 25.107 24.863 24.622 24.375 24.14 23.879 23.63 23.415 23.181 22.924 22.714 22.496 22.26 22.07 21.875 21.657 21.421 21.19 21.035 20.879 20.608 20.406 20.204 20.103 19.907 19.705 19.471 19.338 19.113 18.906 18.754 18.579 18.201 18.011 17.804 17.582 17.289 16.945 16.538 15.394 -3 ,9143 ,TETRA ,17586087,Sat Nov 27 15:59:19 CET,Sat Nov 27 17:45:35 CET,0.0 1.226 1.685 2.019 2.317 2.575 2.814 3.042 3.417 3.587 3.757 3.97 4.228 4.38 4.669 4.939 5.2 5.331 5.588 5.832 6.176 6.39 6.607 6.934 7.238 7.518 7.791 8.061 8.404 8.745 9.075 9.476 9.87 10.234 10.65 11.125 11.573 12.047 12.559 13.132 13.754 14.455 15.276 16.097 17.015 18.036 19.22 20.575 22.137 23.855 25.729 26.93 27.365 27.458 27.418 27.247 26.993 26.7 26.434 26.149 25.876 25.629 25.365 25.095 24.836 24.577 24.297 24.049 23.838 23.623 23.396 23.198 22.991 22.765 22.581 22.39 22.183 21.968 21.734 21.569 21.402 21.139 20.949 20.749 20.65 20.437 20.199 19.964 19.837 19.609 19.41 19.266 19.113 18.769 18.564 18.325 18.044 17.734 17.368 16.906 15.923 -4 ,30610 ,TETRA ,17586088,Sat Nov 27 15:59:19 CET,Sat Nov 27 17:45:21 CET,0.0 1.006 1.438 1.785 2.079 2.339 2.582 2.803 3.206 3.388 3.565 3.819 4.081 4.235 4.52 4.788 5.06 5.185 5.425 5.656 5.973 6.184 6.399 6.709 6.998 7.29 7.57 7.844 8.2 8.523 8.842 9.238 9.622 9.995 10.429 10.93 11.405 11.914 12.474 13.074 13.693 14.392 15.205 15.988 16.899 17.95 19.184 20.581 22.11 23.719 25.563 26.811 27.267 27.366 27.306 27.141 26.896 26.597 26.309 26.024 25.74 25.467 25.207 24.952 24.697 24.442 24.161 23.905 23.668 23.408 23.148 22.941 22.731 22.498 22.311 22.114 21.912 21.708 21.478 21.326 21.18 20.936 20.76 20.576 20.478 20.263 20.021 19.76 19.627 19.411 19.23 19.087 18.92 18.544 18.335 18.093 17.809 17.496 17.121 16.619 15.491 -5 ,4817 ,TETRA ,17586089,Sat Nov 27 15:59:21 CET,Sat Nov 27 17:43:56 CET,0.0 1.238 1.73 2.11 2.431 2.694 2.926 3.145 3.53 3.706 3.879 4.099 4.35 4.5 4.794 5.063 5.324 5.453 5.703 5.944 6.295 6.516 6.717 7.013 7.318 7.618 7.901 8.17 8.52 8.862 9.191 9.601 9.985 10.342 10.77 11.24 11.678 12.162 12.699 13.276 13.889 14.593 15.412 16.223 17.159 18.212 19.436 20.769 22.263 23.902 25.669 26.964 27.515 27.664 27.57 27.36 27.108 26.818 26.556 26.273 25.986 25.711 25.426 25.144 24.889 24.65 24.404 24.178 23.969 23.744 23.512 23.318 23.102 22.878 22.705 22.523 22.329 22.114 21.878 21.723 21.567 21.301 21.119 20.942 20.847 20.644 20.415 20.184 20.064 19.84 19.635 19.488 19.32 18.94 18.74 18.514 18.26 17.961 17.6 17.104 15.914 -6 ,3916 ,TETRA ,17586090,Sat Nov 27 15:59:21 CET,Sat Nov 27 17:45:06 CET,0.0 1.048 1.518 1.897 2.205 2.51 2.786 3.017 3.422 3.611 3.79 4.027 4.292 4.442 4.735 5.019 5.282 5.411 5.659 5.885 6.208 6.426 6.648 6.968 7.269 7.562 7.843 8.109 8.452 8.792 9.118 9.504 9.877 10.251 10.687 11.162 11.627 12.129 12.656 13.226 13.824 14.494 15.273 16.074 17.04 18.094 19.294 20.618 22.096 23.847 25.743 26.924 27.395 27.502 27.444 27.26 27.013 26.732 26.474 26.196 25.921 25.664 25.41 25.147 24.867 24.614 24.358 24.128 23.917 23.693 23.456 23.246 23.032 22.802 22.621 22.428 22.22 22.007 21.791 21.649 21.5 21.264 21.09 20.911 20.818 20.611 20.402 20.176 20.053 19.845 19.665 19.518 19.367 19.008 18.804 18.596 18.367 18.086 17.677 17.157 16.223 -7 ,13137 ,TETRA ,17586091,Sat Nov 27 15:59:21 CET,Sat Nov 27 17:44:57 CET,0.0 1.014 1.506 1.882 2.203 2.467 2.713 2.953 3.388 3.577 3.757 3.987 4.242 4.39 4.673 4.936 5.18 5.299 5.536 5.758 6.077 6.305 6.53 6.839 7.13 7.406 7.675 7.947 8.292 8.608 8.923 9.329 9.71 10.074 10.497 10.967 11.426 11.926 12.448 12.998 13.599 14.298 15.105 15.913 16.853 17.905 19.142 20.482 22.018 23.835 25.764 26.971 27.403 27.489 27.4 27.252 27.046 26.77 26.493 26.188 25.888 25.617 25.333 25.04 24.783 24.545 24.292 24.048 23.825 23.602 23.358 23.143 22.919 22.68 22.48 22.278 22.081 21.871 21.646 21.489 21.326 21.064 20.874 20.669 20.562 20.356 20.134 19.885 19.759 19.545 19.337 19.181 19.013 18.612 18.397 18.174 17.939 17.665 17.312 16.843 15.77 -8 ,20390 ,TETRA ,17586092,Sat Nov 27 15:59:20 CET,Sat Nov 27 17:45:17 CET,0.0 1.132 1.579 1.924 2.218 2.476 2.715 2.941 3.335 3.513 3.7 3.952 4.218 4.377 4.666 4.939 5.192 5.312 5.56 5.801 6.142 6.362 6.571 6.875 7.177 7.481 7.769 8.046 8.406 8.75 9.069 9.449 9.833 10.2 10.618 11.103 11.564 12.057 12.615 13.216 13.829 14.535 15.346 16.126 17.055 18.107 19.303 20.649 22.214 23.907 25.776 27.061 27.447 27.515 27.468 27.345 27.14 26.857 26.553 26.262 26.011 25.754 25.484 25.21 24.957 24.723 24.47 24.244 24.041 23.83 23.599 23.388 23.176 22.955 22.77 22.571 22.363 22.153 21.932 21.774 21.62 21.382 21.196 20.998 20.903 20.706 20.496 20.268 20.144 19.931 19.745 19.594 19.43 19.109 18.922 18.707 18.442 18.128 17.765 17.3 16.2 -9 ,32354 ,TETRA ,17586093,Sat Nov 27 15:59:21 CET,Sat Nov 27 17:44:04 CET,0.0 1.162 1.621 1.988 2.312 2.583 2.817 3.035 3.443 3.634 3.815 4.053 4.316 4.471 4.763 5.045 5.316 5.443 5.686 5.929 6.289 6.514 6.724 7.03 7.332 7.63 7.915 8.176 8.528 8.878 9.209 9.605 9.967 10.312 10.732 11.199 11.635 12.142 12.697 13.281 13.902 14.589 15.399 16.208 17.135 18.172 19.372 20.705 22.238 23.926 25.75 27.02 27.46 27.542 27.424 27.197 26.954 26.689 26.46 26.21 25.935 25.666 25.409 25.17 24.924 24.673 24.394 24.149 23.949 23.739 23.502 23.291 23.063 22.831 22.652 22.468 22.281 22.076 21.847 21.69 21.524 21.255 21.063 20.871 20.771 20.549 20.323 20.099 19.976 19.763 19.586 19.43 19.261 18.894 18.693 18.493 18.282 18.041 17.741 17.351 16.427 -10 ,22869 ,TETRA ,17586094,Sat Nov 27 15:59:21 CET,Sat Nov 27 17:45:31 CET,0.0 0.911 1.331 1.685 1.977 2.216 2.44 2.66 3.041 3.211 3.397 3.645 3.902 4.048 4.313 4.578 4.851 4.982 5.228 5.464 5.802 6.017 6.232 6.55 6.842 7.125 7.404 7.672 8.016 8.347 8.668 9.052 9.425 9.781 10.197 10.674 11.135 11.646 12.179 12.733 13.323 14.001 14.834 15.679 16.621 17.644 18.805 20.162 21.756 23.479 25.294 26.486 27.009 27.157 27.092 26.941 26.719 26.449 26.187 25.883 25.618 25.367 25.097 24.833 24.569 24.322 24.048 23.799 23.58 23.351 23.124 22.931 22.717 22.484 22.301 22.113 21.91 21.694 21.471 21.32 21.159 20.9 20.72 20.53 20.43 20.225 20.019 19.789 19.663 19.445 19.229 19.07 18.91 18.556 18.351 18.095 17.803 17.49 17.115 16.667 15.716 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index 5d2b9103..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,471 ,TETRA ,17586095,Sat Nov 27 16:00:34 CET,Sat Nov 27 17:45:38 CET,0.0 1.0 1.391 1.689 1.961 2.195 2.4 2.585 2.891 3.033 3.175 3.341 3.537 3.644 3.842 4.025 4.195 4.276 4.44 4.588 4.772 4.892 5.007 5.171 5.335 5.493 5.627 5.742 5.9 6.051 6.188 6.352 6.501 6.64 6.802 6.968 7.118 7.268 7.41 7.548 7.672 7.8 7.931 8.057 8.15 8.148 8.08 7.867 7.415 6.534 4.863 2.79 0.971 -0.613 -2.01 -3.245 -4.283 -5.218 -6.051 -6.89 -7.604 -8.23 -8.816 -9.349 -9.844 -10.304 -10.768 -11.17 -11.525 -11.917 -12.313 -12.63 -12.965 -13.326 -13.609 -13.892 -14.181 -14.464 -14.772 -14.993 -15.207 -15.544 -15.789 -16.05 -16.184 -16.473 -16.768 -17.062 -17.217 -17.482 -17.723 -17.905 -18.103 -18.556 -18.801 -19.046 -19.33 -19.683 -20.08 -20.601 -21.978 -2 ,19362 ,TETRA ,17586096,Sat Nov 27 16:00:34 CET,Sat Nov 27 17:49:44 CET,0.0 0.818 1.194 1.496 1.74 1.963 2.162 2.331 2.664 2.822 2.95 3.102 3.315 3.43 3.616 3.794 3.975 4.058 4.2 4.337 4.544 4.674 4.788 4.954 5.115 5.262 5.408 5.551 5.723 5.88 6.026 6.195 6.356 6.502 6.654 6.819 6.97 7.131 7.307 7.46 7.586 7.708 7.838 7.921 7.935 7.904 7.798 7.533 7.063 6.278 4.708 2.585 0.699 -0.927 -2.279 -3.478 -4.532 -5.468 -6.282 -7.101 -7.787 -8.391 -8.96 -9.497 -9.997 -10.458 -10.946 -11.375 -11.738 -12.117 -12.513 -12.84 -13.179 -13.522 -13.788 -14.069 -14.354 -14.645 -14.946 -15.159 -15.382 -15.725 -15.963 -16.222 -16.36 -16.638 -16.931 -17.248 -17.405 -17.667 -17.916 -18.106 -18.322 -18.789 -19.032 -19.317 -19.619 -19.924 -20.325 -20.815 -22.001 -3 ,5440 ,TETRA ,17586097,Sat Nov 27 16:00:32 CET,Sat Nov 27 17:44:45 CET,0.0 1.065 1.508 1.834 2.124 2.372 2.59 2.776 3.078 3.207 3.32 3.462 3.653 3.758 3.949 4.112 4.269 4.343 4.489 4.636 4.847 4.982 5.11 5.29 5.459 5.608 5.745 5.875 6.04 6.188 6.324 6.489 6.641 6.779 6.933 7.127 7.305 7.467 7.619 7.76 7.886 8.0 8.119 8.205 8.239 8.215 8.156 7.977 7.511 6.631 4.974 2.816 0.945 -0.676 -2.037 -3.206 -4.253 -5.213 -6.034 -6.861 -7.571 -8.197 -8.774 -9.327 -9.84 -10.301 -10.786 -11.205 -11.563 -11.952 -12.357 -12.679 -13.011 -13.36 -13.63 -13.909 -14.204 -14.503 -14.812 -15.033 -15.258 -15.608 -15.855 -16.106 -16.239 -16.514 -16.811 -17.122 -17.276 -17.537 -17.778 -17.976 -18.173 -18.605 -18.867 -19.136 -19.419 -19.724 -20.077 -20.551 -21.681 -4 ,19552 ,TETRA ,17586098,Sat Nov 27 16:00:34 CET,Sat Nov 27 17:43:52 CET,0.0 1.03 1.424 1.673 1.886 2.109 2.321 2.499 2.822 2.971 3.11 3.286 3.492 3.605 3.815 3.995 4.155 4.234 4.38 4.524 4.746 4.884 5.002 5.16 5.321 5.486 5.654 5.799 5.956 6.094 6.228 6.4 6.562 6.703 6.863 7.037 7.206 7.381 7.55 7.698 7.817 7.937 8.053 8.155 8.245 8.273 8.239 8.082 7.667 6.831 5.217 3.068 1.243 -0.324 -1.721 -2.955 -4.021 -4.972 -5.773 -6.569 -7.238 -7.833 -8.387 -8.915 -9.418 -9.867 -10.324 -10.74 -11.104 -11.485 -11.886 -12.214 -12.545 -12.885 -13.143 -13.414 -13.701 -13.997 -14.312 -14.531 -14.749 -15.076 -15.318 -15.583 -15.718 -15.993 -16.283 -16.588 -16.742 -17.007 -17.251 -17.443 -17.645 -18.07 -18.305 -18.561 -18.832 -19.125 -19.499 -20.003 -21.104 -5 ,7843 ,TETRA ,17586099,Sat Nov 27 16:01:21 CET,Sat Nov 27 17:45:18 CET,0.0 0.974 1.347 1.658 1.937 2.181 2.397 2.581 2.903 3.039 3.159 3.306 3.494 3.594 3.785 3.968 4.133 4.217 4.376 4.52 4.733 4.86 4.979 5.145 5.306 5.461 5.601 5.727 5.884 6.035 6.184 6.354 6.497 6.633 6.796 6.964 7.099 7.244 7.391 7.528 7.658 7.797 7.942 8.044 8.102 8.09 8.024 7.81 7.347 6.55 4.941 2.797 0.98 -0.605 -1.976 -3.171 -4.231 -5.184 -5.979 -6.787 -7.487 -8.099 -8.678 -9.222 -9.72 -10.158 -10.626 -11.054 -11.414 -11.795 -12.188 -12.514 -12.851 -13.193 -13.465 -13.742 -14.026 -14.323 -14.626 -14.842 -15.067 -15.414 -15.671 -15.947 -16.08 -16.333 -16.598 -16.893 -17.052 -17.321 -17.575 -17.764 -17.96 -18.416 -18.666 -18.913 -19.174 -19.475 -19.825 -20.321 -21.513 -6 ,12226 ,TETRA ,17586100,Sat Nov 27 16:00:34 CET,Sat Nov 27 17:47:56 CET,0.0 1.214 1.723 2.14 2.516 2.829 3.095 3.326 3.742 3.945 4.145 4.413 4.649 4.801 5.08 5.326 5.551 5.669 5.908 6.127 6.434 6.623 6.799 7.045 7.262 7.48 7.702 7.872 8.026 8.178 8.332 8.501 8.665 8.826 8.989 9.159 9.316 9.467 9.612 9.76 9.902 10.03 10.147 10.229 10.274 10.28 10.196 9.967 9.531 8.655 7.012 4.954 3.149 1.562 0.17 -1.052 -2.101 -3.042 -3.872 -4.682 -5.346 -5.954 -6.549 -7.098 -7.6 -8.061 -8.542 -8.972 -9.341 -9.724 -10.121 -10.442 -10.786 -11.146 -11.417 -11.704 -11.997 -12.294 -12.607 -12.816 -13.039 -13.395 -13.643 -13.897 -14.024 -14.299 -14.582 -14.882 -15.043 -15.318 -15.578 -15.769 -15.964 -16.38 -16.609 -16.864 -17.162 -17.475 -17.86 -18.342 -19.36 -7 ,3057 ,TETRA ,17586101,Sat Nov 27 16:00:34 CET,Sat Nov 27 17:46:48 CET,0.0 0.863 1.246 1.566 1.832 2.052 2.246 2.416 2.738 2.89 3.023 3.17 3.357 3.461 3.677 3.86 4.014 4.091 4.248 4.406 4.63 4.763 4.884 5.053 5.205 5.344 5.485 5.625 5.801 5.959 6.1 6.262 6.42 6.56 6.707 6.894 7.057 7.204 7.366 7.512 7.642 7.778 7.921 8.008 8.028 8.005 7.889 7.648 7.202 6.331 4.671 2.553 0.766 -0.78 -2.139 -3.379 -4.482 -5.448 -6.255 -7.035 -7.68 -8.278 -8.867 -9.423 -9.943 -10.406 -10.891 -11.311 -11.681 -12.066 -12.459 -12.794 -13.142 -13.492 -13.757 -14.034 -14.328 -14.639 -14.962 -15.179 -15.4 -15.757 -16.013 -16.268 -16.395 -16.661 -16.948 -17.254 -17.417 -17.687 -17.93 -18.109 -18.29 -18.692 -18.919 -19.169 -19.457 -19.811 -20.225 -20.758 -22.14 -8 ,21420 ,TETRA ,17586102,Sat Nov 27 16:00:34 CET,Sat Nov 27 17:48:23 CET,0.0 1.142 1.615 1.947 2.182 2.39 2.593 2.776 3.077 3.204 3.324 3.484 3.688 3.8 4.018 4.228 4.411 4.492 4.642 4.789 5.001 5.125 5.238 5.403 5.562 5.713 5.861 5.995 6.166 6.325 6.464 6.624 6.772 6.908 7.065 7.24 7.4 7.55 7.695 7.844 7.998 8.142 8.261 8.365 8.431 8.43 8.355 8.126 7.66 6.83 5.217 3.102 1.266 -0.34 -1.708 -2.926 -3.965 -4.887 -5.691 -6.5 -7.187 -7.798 -8.385 -8.929 -9.421 -9.881 -10.364 -10.793 -11.161 -11.535 -11.92 -12.238 -12.571 -12.904 -13.157 -13.428 -13.711 -13.999 -14.307 -14.531 -14.761 -15.107 -15.34 -15.582 -15.713 -15.979 -16.251 -16.544 -16.697 -16.966 -17.204 -17.385 -17.58 -18.007 -18.238 -18.488 -18.786 -19.136 -19.547 -20.116 -21.582 -9 ,2095 ,TETRA ,17586103,Sat Nov 27 16:00:34 CET,Sat Nov 27 17:44:30 CET,0.0 1.315 1.779 2.088 2.338 2.558 2.752 2.922 3.213 3.344 3.475 3.63 3.829 3.941 4.136 4.301 4.473 4.555 4.699 4.839 5.041 5.161 5.274 5.449 5.61 5.742 5.875 6.018 6.193 6.341 6.476 6.636 6.781 6.917 7.071 7.229 7.374 7.522 7.672 7.811 7.934 8.08 8.221 8.305 8.354 8.341 8.25 8.047 7.59 6.7 5.024 2.856 0.994 -0.639 -2.051 -3.284 -4.327 -5.256 -6.071 -6.867 -7.535 -8.126 -8.687 -9.209 -9.701 -10.16 -10.633 -11.039 -11.388 -11.768 -12.172 -12.493 -12.814 -13.151 -13.421 -13.708 -14.006 -14.314 -14.63 -14.846 -15.068 -15.418 -15.669 -15.919 -16.053 -16.34 -16.63 -16.92 -17.071 -17.338 -17.579 -17.766 -17.953 -18.373 -18.612 -18.872 -19.165 -19.518 -19.906 -20.376 -21.48 -10 ,15701 ,TETRA ,17586104,Sat Nov 27 16:00:34 CET,Sat Nov 27 17:44:51 CET,0.0 1.144 1.582 1.889 2.147 2.362 2.551 2.729 3.059 3.211 3.354 3.526 3.724 3.823 4.024 4.222 4.391 4.466 4.613 4.756 4.948 5.068 5.183 5.345 5.507 5.653 5.787 5.92 6.087 6.239 6.382 6.559 6.728 6.879 7.047 7.23 7.385 7.542 7.718 7.897 8.056 8.204 8.324 8.406 8.45 8.449 8.366 8.144 7.723 6.923 5.334 3.263 1.424 -0.224 -1.593 -2.802 -3.858 -4.787 -5.575 -6.376 -7.065 -7.679 -8.279 -8.828 -9.324 -9.782 -10.252 -10.666 -11.021 -11.382 -11.763 -12.091 -12.422 -12.764 -13.031 -13.299 -13.589 -13.891 -14.192 -14.405 -14.63 -14.987 -15.237 -15.503 -15.635 -15.899 -16.186 -16.485 -16.643 -16.912 -17.16 -17.342 -17.532 -17.945 -18.179 -18.45 -18.739 -19.058 -19.429 -19.895 -20.887 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index dae1d6fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12157 ,KEBNE ,17024262,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:19:45 CET,0.0 0.98 1.459 1.811 2.118 2.374 2.587 2.773 3.092 3.244 3.396 3.593 3.802 3.923 4.159 4.365 4.547 4.639 4.813 4.975 5.204 5.354 5.492 5.674 5.864 6.065 6.257 6.428 6.624 6.807 6.983 7.195 7.408 7.602 7.808 8.036 8.255 8.482 8.716 8.954 9.183 9.431 9.71 9.951 10.172 10.352 10.482 10.506 10.36 9.952 8.962 7.452 6.011 4.651 3.445 2.419 1.475 0.574 -0.185 -0.931 -1.567 -2.137 -2.698 -3.217 -3.698 -4.149 -4.604 -5.002 -5.355 -5.728 -6.107 -6.422 -6.751 -7.08 -7.334 -7.605 -7.892 -8.189 -8.489 -8.698 -8.915 -9.265 -9.508 -9.754 -9.879 -10.132 -10.401 -10.689 -10.841 -11.093 -11.333 -11.517 -11.712 -12.135 -12.373 -12.626 -12.89 -13.173 -13.529 -14.023 -15.032 -2 ,9475 ,KEBNE ,17024263,Wed Dec 22 09:48:54 CET,Wed Dec 22 11:18:49 CET,0.0 1.233 1.709 2.03 2.269 2.487 2.688 2.866 3.177 3.314 3.449 3.621 3.824 3.943 4.175 4.38 4.57 4.656 4.825 4.996 5.228 5.372 5.505 5.714 5.922 6.112 6.278 6.435 6.653 6.852 7.024 7.231 7.425 7.602 7.812 8.037 8.228 8.434 8.656 8.89 9.118 9.361 9.612 9.806 9.999 10.159 10.293 10.382 10.329 9.916 8.795 7.124 5.599 4.286 3.117 2.024 1.077 0.238 -0.51 -1.257 -1.882 -2.447 -2.994 -3.511 -3.989 -4.415 -4.855 -5.262 -5.608 -5.955 -6.32 -6.624 -6.941 -7.269 -7.523 -7.789 -8.072 -8.367 -8.662 -8.864 -9.073 -9.412 -9.659 -9.918 -10.048 -10.326 -10.617 -10.91 -11.062 -11.31 -11.55 -11.739 -11.936 -12.356 -12.599 -12.87 -13.158 -13.485 -13.893 -14.486 -16.149 -3 ,16381 ,KEBNE ,17024264,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:18:23 CET,0.0 1.041 1.506 1.807 2.064 2.293 2.491 2.659 2.957 3.1 3.236 3.419 3.633 3.747 3.956 4.144 4.323 4.407 4.572 4.745 4.99 5.139 5.276 5.466 5.649 5.835 6.006 6.164 6.362 6.548 6.73 6.946 7.144 7.324 7.527 7.745 7.965 8.198 8.412 8.629 8.853 9.09 9.34 9.578 9.835 10.022 10.16 10.243 10.108 9.673 8.583 6.937 5.434 4.125 3.0 1.955 1.021 0.174 -0.569 -1.316 -1.948 -2.543 -3.116 -3.638 -4.114 -4.531 -4.98 -5.389 -5.739 -6.099 -6.471 -6.787 -7.117 -7.456 -7.722 -7.998 -8.283 -8.587 -8.894 -9.099 -9.32 -9.665 -9.896 -10.139 -10.265 -10.526 -10.812 -11.126 -11.284 -11.546 -11.812 -12.006 -12.203 -12.642 -12.889 -13.18 -13.475 -13.779 -14.173 -14.725 -16.045 -4 ,9089 ,KEBNE ,17024265,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:18:30 CET,0.0 1.301 1.78 2.144 2.442 2.695 2.926 3.128 3.465 3.622 3.765 3.926 4.128 4.239 4.444 4.633 4.818 4.904 5.075 5.243 5.465 5.607 5.752 5.962 6.153 6.323 6.481 6.644 6.849 7.024 7.189 7.388 7.594 7.8 8.01 8.228 8.434 8.654 8.878 9.096 9.295 9.509 9.759 9.971 10.199 10.388 10.484 10.484 10.32 9.848 8.716 7.121 5.702 4.416 3.221 2.149 1.214 0.359 -0.391 -1.154 -1.789 -2.344 -2.882 -3.379 -3.851 -4.29 -4.741 -5.161 -5.539 -5.905 -6.264 -6.569 -6.892 -7.218 -7.46 -7.719 -7.991 -8.271 -8.568 -8.768 -8.98 -9.325 -9.564 -9.815 -9.943 -10.201 -10.467 -10.753 -10.908 -11.172 -11.419 -11.594 -11.774 -12.183 -12.411 -12.673 -12.95 -13.243 -13.579 -14.012 -14.952 -5 ,370 ,KEBNE ,17024266,Wed Dec 22 09:48:54 CET,Wed Dec 22 11:18:32 CET,0.0 0.965 1.365 1.656 1.923 2.172 2.387 2.579 2.923 3.08 3.233 3.425 3.641 3.776 4.009 4.213 4.403 4.492 4.658 4.815 5.046 5.201 5.344 5.533 5.722 5.901 6.063 6.221 6.42 6.599 6.776 6.995 7.205 7.388 7.578 7.795 8.005 8.231 8.487 8.736 8.961 9.207 9.454 9.669 9.875 10.067 10.219 10.247 10.129 9.724 8.68 7.066 5.537 4.165 2.984 1.933 1.004 0.14 -0.602 -1.328 -1.953 -2.511 -3.048 -3.559 -4.029 -4.46 -4.913 -5.311 -5.658 -6.018 -6.383 -6.687 -7.015 -7.361 -7.623 -7.893 -8.178 -8.463 -8.758 -8.972 -9.193 -9.535 -9.778 -10.015 -10.136 -10.398 -10.668 -10.959 -11.122 -11.384 -11.625 -11.804 -11.987 -12.391 -12.619 -12.85 -13.104 -13.408 -13.813 -14.319 -15.521 -6 ,28390 ,KEBNE ,17024267,Wed Dec 22 09:48:54 CET,Wed Dec 22 11:19:13 CET,0.0 0.766 1.172 1.48 1.728 1.95 2.15 2.336 2.68 2.834 2.972 3.146 3.35 3.461 3.669 3.863 4.055 4.153 4.331 4.493 4.727 4.873 5.007 5.206 5.394 5.562 5.73 5.897 6.104 6.305 6.492 6.698 6.894 7.079 7.278 7.486 7.671 7.893 8.141 8.387 8.623 8.862 9.098 9.298 9.524 9.721 9.871 9.963 9.869 9.391 8.287 6.704 5.248 3.935 2.761 1.707 0.781 -0.061 -0.816 -1.583 -2.225 -2.787 -3.315 -3.83 -4.324 -4.763 -5.203 -5.603 -5.961 -6.324 -6.706 -7.024 -7.342 -7.677 -7.93 -8.171 -8.428 -8.715 -9.016 -9.229 -9.451 -9.789 -10.019 -10.263 -10.395 -10.664 -10.935 -11.228 -11.379 -11.633 -11.889 -12.078 -12.279 -12.737 -12.986 -13.249 -13.555 -13.884 -14.257 -14.74 -15.947 -7 ,9213 ,KEBNE ,17024268,Wed Dec 22 09:48:54 CET,Wed Dec 22 11:18:19 CET,0.0 1.13 1.534 1.848 2.12 2.353 2.585 2.809 3.18 3.351 3.501 3.67 3.865 3.974 4.187 4.379 4.559 4.646 4.813 4.979 5.228 5.381 5.52 5.721 5.919 6.103 6.271 6.428 6.622 6.798 6.976 7.192 7.381 7.557 7.749 7.958 8.151 8.354 8.554 8.77 8.999 9.215 9.466 9.681 9.883 10.103 10.283 10.331 10.203 9.767 8.711 7.136 5.64 4.329 3.139 2.064 1.137 0.276 -0.454 -1.188 -1.857 -2.444 -3.0 -3.541 -4.041 -4.476 -4.915 -5.31 -5.656 -6.023 -6.416 -6.739 -7.053 -7.381 -7.653 -7.931 -8.207 -8.489 -8.789 -8.997 -9.198 -9.531 -9.775 -10.024 -10.153 -10.432 -10.734 -11.035 -11.186 -11.438 -11.657 -11.831 -12.025 -12.448 -12.679 -12.937 -13.235 -13.577 -13.955 -14.491 -15.852 -8 ,16859 ,KEBNE ,17024269,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:18:16 CET,0.0 0.936 1.373 1.716 1.986 2.192 2.376 2.57 2.935 3.094 3.24 3.427 3.634 3.753 3.981 4.189 4.385 4.479 4.661 4.837 5.092 5.249 5.393 5.588 5.775 5.949 6.111 6.268 6.471 6.656 6.832 7.044 7.245 7.444 7.663 7.877 8.076 8.308 8.542 8.789 9.022 9.246 9.499 9.734 9.953 10.124 10.254 10.285 10.155 9.69 8.569 6.976 5.48 4.126 2.945 1.866 0.91 0.058 -0.681 -1.431 -2.051 -2.605 -3.147 -3.652 -4.122 -4.556 -5.026 -5.437 -5.785 -6.164 -6.566 -6.888 -7.209 -7.544 -7.809 -8.086 -8.368 -8.657 -8.966 -9.181 -9.397 -9.722 -9.951 -10.194 -10.321 -10.59 -10.869 -11.161 -11.316 -11.579 -11.832 -12.016 -12.201 -12.601 -12.824 -13.061 -13.332 -13.638 -13.983 -14.505 -15.918 -9 ,3735 ,KEBNE ,17024270,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:19:52 CET,0.0 1.141 1.514 1.803 2.035 2.263 2.468 2.645 2.975 3.125 3.263 3.435 3.646 3.768 3.988 4.184 4.366 4.456 4.631 4.796 5.027 5.168 5.302 5.501 5.693 5.874 6.04 6.195 6.399 6.591 6.769 6.983 7.184 7.362 7.565 7.788 7.986 8.197 8.42 8.631 8.833 9.075 9.346 9.57 9.767 9.925 10.037 10.063 9.956 9.562 8.464 6.823 5.381 4.062 2.903 1.847 0.905 0.056 -0.68 -1.431 -2.062 -2.608 -3.135 -3.627 -4.079 -4.503 -4.97 -5.385 -5.74 -6.118 -6.496 -6.802 -7.129 -7.461 -7.721 -7.99 -8.268 -8.56 -8.867 -9.078 -9.29 -9.634 -9.874 -10.126 -10.254 -10.515 -10.794 -11.103 -11.267 -11.542 -11.813 -12.007 -12.196 -12.581 -12.803 -13.038 -13.313 -13.652 -14.029 -14.544 -15.838 -10 ,16319 ,KEBNE ,17024271,Wed Dec 22 09:48:53 CET,Wed Dec 22 11:19:16 CET,0.0 1.272 1.777 2.107 2.352 2.57 2.775 2.968 3.315 3.478 3.634 3.815 4.016 4.128 4.341 4.541 4.725 4.818 4.997 5.157 5.398 5.553 5.695 5.901 6.086 6.262 6.438 6.61 6.82 7.013 7.202 7.416 7.621 7.818 8.052 8.293 8.482 8.687 8.911 9.154 9.4 9.642 9.879 10.066 10.264 10.477 10.632 10.689 10.553 10.065 8.955 7.251 5.728 4.41 3.205 2.102 1.154 0.309 -0.447 -1.214 -1.861 -2.437 -2.982 -3.483 -3.935 -4.354 -4.801 -5.209 -5.567 -5.939 -6.317 -6.631 -6.955 -7.279 -7.525 -7.788 -8.074 -8.366 -8.662 -8.867 -9.086 -9.436 -9.672 -9.919 -10.051 -10.325 -10.611 -10.912 -11.066 -11.322 -11.565 -11.74 -11.92 -12.33 -12.565 -12.844 -13.155 -13.483 -13.879 -14.41 -15.753 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index 28df11e2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16164 ,TETRA ,17586105,Sat Nov 27 16:00:26 CET,Sat Nov 27 17:41:47 CET,0.0 0.7 1.025 1.264 1.474 1.633 1.757 1.874 2.105 2.213 2.315 2.446 2.644 2.725 2.881 3.031 3.183 3.255 3.385 3.507 3.687 3.798 3.901 4.053 4.197 4.345 4.484 4.61 4.775 4.935 5.086 5.269 5.441 5.602 5.787 5.986 6.167 6.357 6.566 6.8 7.041 7.273 7.522 7.781 8.069 8.358 8.665 8.972 9.244 9.49 9.483 9.083 8.595 8.07 7.601 7.126 6.667 6.248 5.857 5.463 5.139 4.826 4.518 4.233 3.965 3.717 3.444 3.178 2.953 2.725 2.476 2.272 2.056 1.831 1.653 1.465 1.275 1.073 0.863 0.714 0.539 0.279 0.097 -0.097 -0.196 -0.418 -0.647 -0.885 -1.012 -1.247 -1.439 -1.581 -1.74 -2.124 -2.351 -2.594 -2.847 -3.176 -3.584 -4.086 -5.532 -2 ,7645 ,TETRA ,17586106,Sat Nov 27 16:01:21 CET,Sat Nov 27 17:42:18 CET,0.0 0.636 0.978 1.166 1.321 1.484 1.628 1.749 1.981 2.094 2.201 2.294 2.48 2.565 2.731 2.888 3.025 3.091 3.229 3.368 3.565 3.685 3.796 3.95 4.1 4.236 4.367 4.501 4.668 4.817 4.95 5.121 5.299 5.461 5.645 5.849 6.024 6.221 6.437 6.654 6.891 7.166 7.476 7.77 8.088 8.396 8.707 9.011 9.301 9.524 9.51 9.177 8.76 8.292 7.793 7.313 6.879 6.448 6.05 5.652 5.318 5.012 4.699 4.408 4.134 3.867 3.602 3.364 3.148 2.92 2.678 2.475 2.27 2.048 1.871 1.683 1.487 1.288 1.072 0.918 0.747 0.489 0.317 0.137 0.044 -0.148 -0.361 -0.591 -0.71 -0.934 -1.102 -1.255 -1.425 -1.798 -2.003 -2.22 -2.462 -2.727 -3.032 -3.483 -4.91 -3 ,32165 ,TETRA ,17586107,Sat Nov 27 16:01:21 CET,Sat Nov 27 17:42:50 CET,0.0 0.865 1.18 1.409 1.61 1.784 1.937 2.083 2.351 2.473 2.59 2.698 2.883 2.971 3.15 3.32 3.481 3.558 3.701 3.839 4.014 4.117 4.222 4.384 4.539 4.676 4.804 4.931 5.095 5.242 5.38 5.544 5.705 5.866 6.055 6.262 6.456 6.664 6.874 7.098 7.34 7.606 7.896 8.168 8.476 8.769 9.05 9.345 9.666 9.917 9.923 9.556 9.073 8.559 8.044 7.546 7.096 6.67 6.291 5.897 5.553 5.264 4.964 4.658 4.382 4.12 3.83 3.584 3.373 3.136 2.878 2.663 2.454 2.239 2.057 1.861 1.651 1.432 1.209 1.054 0.893 0.636 0.459 0.282 0.184 -0.023 -0.247 -0.488 -0.614 -0.844 -1.077 -1.257 -1.432 -1.829 -2.036 -2.259 -2.512 -2.802 -3.164 -3.642 -5.403 -4 ,12454 ,TETRA ,17586108,Sat Nov 27 16:01:21 CET,Sat Nov 27 17:42:41 CET,0.0 0.614 0.963 1.196 1.364 1.507 1.656 1.8 2.047 2.169 2.285 2.385 2.571 2.663 2.827 2.968 3.105 3.174 3.306 3.428 3.599 3.704 3.811 3.968 4.108 4.238 4.364 4.488 4.644 4.803 4.956 5.129 5.29 5.448 5.631 5.828 6.021 6.219 6.417 6.635 6.866 7.113 7.4 7.666 7.944 8.237 8.57 8.894 9.186 9.421 9.448 9.128 8.639 8.13 7.681 7.247 6.804 6.385 5.998 5.589 5.226 4.888 4.577 4.305 4.052 3.802 3.52 3.266 3.05 2.823 2.582 2.383 2.173 1.946 1.772 1.583 1.381 1.167 0.942 0.79 0.632 0.384 0.215 0.035 -0.059 -0.253 -0.466 -0.715 -0.855 -1.089 -1.275 -1.422 -1.587 -1.95 -2.141 -2.385 -2.669 -2.965 -3.307 -3.799 -5.535 -5 ,31388 ,TETRA ,17586109,Sat Nov 27 16:01:21 CET,Sat Nov 27 17:43:12 CET,0.0 0.621 0.885 1.089 1.283 1.466 1.631 1.767 1.985 2.086 2.184 2.27 2.458 2.554 2.74 2.899 3.038 3.107 3.233 3.342 3.525 3.651 3.769 3.93 4.073 4.214 4.353 4.491 4.659 4.815 4.975 5.157 5.328 5.49 5.665 5.879 6.078 6.27 6.47 6.674 6.887 7.104 7.343 7.601 7.915 8.241 8.563 8.866 9.152 9.377 9.336 8.97 8.47 7.932 7.457 7.011 6.575 6.164 5.776 5.371 5.027 4.707 4.401 4.107 3.835 3.572 3.269 3.011 2.795 2.56 2.309 2.097 1.876 1.649 1.465 1.262 1.054 0.852 0.637 0.478 0.312 0.042 -0.153 -0.356 -0.456 -0.667 -0.9 -1.148 -1.284 -1.52 -1.718 -1.874 -2.052 -2.432 -2.641 -2.883 -3.139 -3.436 -3.85 -4.435 -6.166 -6 ,21434 ,TETRA ,17586110,Sat Nov 27 16:01:21 CET,Sat Nov 27 17:42:52 CET,0.0 0.868 1.215 1.468 1.688 1.857 1.997 2.136 2.38 2.491 2.589 2.681 2.868 2.95 3.109 3.258 3.395 3.462 3.597 3.72 3.896 4.019 4.141 4.301 4.44 4.587 4.729 4.85 5.008 5.157 5.295 5.469 5.638 5.796 5.963 6.156 6.346 6.541 6.759 6.99 7.212 7.463 7.768 8.063 8.364 8.655 8.985 9.346 9.656 9.882 9.93 9.653 9.16 8.593 8.066 7.582 7.107 6.644 6.266 5.886 5.553 5.262 4.982 4.705 4.435 4.174 3.888 3.641 3.43 3.199 2.946 2.731 2.505 2.268 2.078 1.885 1.691 1.473 1.24 1.083 0.916 0.662 0.468 0.261 0.162 -0.059 -0.287 -0.502 -0.625 -0.853 -1.034 -1.197 -1.375 -1.756 -1.962 -2.192 -2.449 -2.742 -3.136 -3.694 -5.426 -7 ,15725 ,TETRA ,17586111,Sat Nov 27 16:01:36 CET,Sat Nov 27 17:42:03 CET,0.0 0.778 1.081 1.324 1.518 1.666 1.8 1.924 2.178 2.292 2.405 2.515 2.697 2.784 2.957 3.118 3.264 3.337 3.482 3.613 3.788 3.902 4.009 4.155 4.297 4.431 4.558 4.681 4.843 5.009 5.165 5.357 5.532 5.687 5.875 6.085 6.281 6.485 6.709 6.941 7.169 7.419 7.695 7.963 8.269 8.601 8.935 9.247 9.545 9.771 9.828 9.518 9.083 8.619 8.158 7.7 7.248 6.802 6.416 6.019 5.671 5.368 5.061 4.749 4.469 4.212 3.935 3.687 3.469 3.229 2.981 2.788 2.582 2.364 2.183 1.988 1.8 1.605 1.379 1.222 1.067 0.808 0.631 0.445 0.347 0.148 -0.079 -0.324 -0.46 -0.691 -0.882 -1.035 -1.196 -1.582 -1.805 -2.063 -2.361 -2.677 -3.036 -3.59 -5.399 -8 ,24023 ,TETRA ,17586112,Sat Nov 27 16:01:36 CET,Sat Nov 27 17:42:49 CET,0.0 0.801 1.13 1.338 1.514 1.68 1.831 1.972 2.23 2.338 2.433 2.522 2.699 2.779 2.938 3.09 3.226 3.292 3.419 3.53 3.681 3.778 3.881 4.036 4.186 4.324 4.456 4.59 4.756 4.908 5.048 5.206 5.362 5.52 5.686 5.871 6.067 6.278 6.495 6.707 6.909 7.13 7.397 7.678 7.999 8.325 8.653 8.99 9.334 9.591 9.636 9.32 8.827 8.306 7.808 7.33 6.889 6.467 6.089 5.688 5.331 5.007 4.679 4.372 4.094 3.82 3.536 3.286 3.067 2.841 2.595 2.384 2.172 1.953 1.778 1.591 1.393 1.185 0.954 0.797 0.638 0.382 0.208 0.032 -0.065 -0.268 -0.48 -0.724 -0.861 -1.097 -1.305 -1.469 -1.63 -2.006 -2.24 -2.468 -2.715 -3.051 -3.445 -3.934 -5.976 -9 ,7132 ,TETRA ,17586113,Sat Nov 27 16:01:36 CET,Sat Nov 27 17:42:52 CET,0.0 0.808 1.161 1.42 1.608 1.775 1.94 2.087 2.319 2.419 2.522 2.622 2.81 2.901 3.065 3.237 3.398 3.466 3.601 3.734 3.906 4.015 4.124 4.273 4.411 4.549 4.681 4.808 4.976 5.132 5.28 5.455 5.624 5.788 5.968 6.162 6.351 6.548 6.76 6.989 7.226 7.473 7.748 8.013 8.321 8.637 8.936 9.245 9.542 9.776 9.781 9.406 8.969 8.478 7.928 7.404 6.954 6.515 6.116 5.731 5.395 5.077 4.753 4.434 4.118 3.839 3.566 3.305 3.063 2.813 2.567 2.365 2.151 1.911 1.722 1.532 1.325 1.11 0.889 0.74 0.575 0.289 0.079 -0.12 -0.218 -0.434 -0.664 -0.923 -1.058 -1.287 -1.5 -1.676 -1.847 -2.212 -2.437 -2.687 -2.933 -3.212 -3.543 -3.964 -5.497 -10 ,15613 ,TETRA ,17586114,Sat Nov 27 16:02:20 CET,Sat Nov 27 17:43:47 CET,0.0 0.57 0.845 1.061 1.253 1.422 1.568 1.696 1.915 2.007 2.1 2.184 2.367 2.454 2.608 2.741 2.878 2.946 3.072 3.196 3.382 3.495 3.607 3.769 3.913 4.048 4.181 4.301 4.449 4.606 4.771 4.956 5.114 5.274 5.452 5.635 5.827 6.042 6.245 6.459 6.697 6.95 7.205 7.44 7.726 8.035 8.339 8.642 8.96 9.211 9.251 8.911 8.441 7.959 7.486 7.003 6.584 6.177 5.787 5.412 5.088 4.769 4.442 4.145 3.873 3.608 3.324 3.068 2.851 2.626 2.378 2.175 1.969 1.751 1.569 1.375 1.178 0.98 0.772 0.616 0.441 0.156 -0.035 -0.224 -0.32 -0.52 -0.735 -0.971 -1.098 -1.335 -1.548 -1.701 -1.855 -2.203 -2.414 -2.649 -2.928 -3.252 -3.615 -4.132 -5.687 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index 49d3f229..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19182 ,TETRA ,17586115,Sat Nov 27 16:02:21 CET,Sat Nov 27 17:39:31 CET,0.0 0.856 1.193 1.422 1.615 1.776 1.932 2.079 2.319 2.435 2.551 2.661 2.869 2.966 3.151 3.328 3.497 3.578 3.73 3.88 4.091 4.23 4.358 4.524 4.691 4.861 5.027 5.182 5.379 5.574 5.764 5.99 6.202 6.405 6.652 6.929 7.18 7.453 7.752 8.069 8.408 8.796 9.235 9.662 10.148 10.699 11.34 12.039 12.8 13.627 14.488 14.913 14.972 14.879 14.677 14.453 14.241 14.018 13.785 13.516 13.246 12.983 12.74 12.524 12.315 12.108 11.875 11.666 11.485 11.294 11.085 10.904 10.712 10.503 10.339 10.173 10.001 9.824 9.637 9.504 9.368 9.157 9.009 8.832 8.742 8.55 8.332 8.113 7.994 7.765 7.584 7.447 7.302 6.956 6.757 6.546 6.324 6.063 5.708 5.236 3.613 -2 ,29308 ,TETRA ,17586116,Sat Nov 27 16:02:21 CET,Sat Nov 27 17:44:23 CET,0.0 0.597 0.913 1.118 1.285 1.452 1.607 1.752 2.011 2.14 2.253 2.346 2.551 2.648 2.835 3.004 3.165 3.244 3.391 3.523 3.727 3.872 4.012 4.204 4.37 4.535 4.696 4.846 5.041 5.231 5.418 5.644 5.859 6.068 6.311 6.59 6.858 7.143 7.443 7.745 8.066 8.438 8.842 9.243 9.717 10.215 10.78 11.431 12.163 12.962 13.763 14.202 14.296 14.205 14.021 13.791 13.548 13.302 13.083 12.829 12.565 12.314 12.071 11.842 11.618 11.401 11.167 10.95 10.756 10.555 10.341 10.167 9.98 9.768 9.602 9.439 9.282 9.109 8.918 8.781 8.631 8.381 8.206 8.018 7.921 7.723 7.498 7.265 7.143 6.92 6.742 6.59 6.426 6.059 5.854 5.632 5.399 5.163 4.855 4.399 3.1 -3 ,2979 ,TETRA ,17586117,Sat Nov 27 16:02:20 CET,Sat Nov 27 17:44:18 CET,0.0 0.777 1.093 1.334 1.547 1.734 1.908 2.079 2.359 2.466 2.566 2.661 2.865 2.966 3.167 3.342 3.499 3.577 3.732 3.876 4.075 4.201 4.329 4.524 4.705 4.868 5.028 5.188 5.383 5.566 5.744 5.952 6.155 6.361 6.598 6.853 7.094 7.359 7.644 7.946 8.266 8.617 9.039 9.465 9.955 10.507 11.08 11.697 12.428 13.189 13.963 14.469 14.582 14.524 14.374 14.161 13.932 13.687 13.464 13.205 12.96 12.723 12.48 12.243 12.028 11.829 11.599 11.38 11.194 11.014 10.812 10.621 10.431 10.232 10.074 9.917 9.739 9.541 9.332 9.184 9.027 8.781 8.619 8.446 8.359 8.174 7.952 7.707 7.574 7.342 7.146 6.993 6.832 6.5 6.315 6.093 5.84 5.553 5.178 4.702 3.476 -4 ,18850 ,TETRA ,17586118,Sat Nov 27 16:02:21 CET,Sat Nov 27 17:42:31 CET,0.0 0.557 0.808 1.034 1.228 1.401 1.567 1.716 1.969 2.088 2.21 2.332 2.539 2.634 2.806 2.976 3.135 3.21 3.353 3.493 3.708 3.847 3.976 4.171 4.36 4.531 4.698 4.859 5.067 5.268 5.453 5.664 5.859 6.059 6.295 6.556 6.81 7.086 7.384 7.707 8.03 8.386 8.813 9.24 9.712 10.216 10.789 11.451 12.207 13.016 13.825 14.291 14.376 14.281 14.115 13.9 13.676 13.457 13.227 12.986 12.77 12.55 12.322 12.108 11.889 11.68 11.459 11.254 11.063 10.858 10.648 10.482 10.308 10.105 9.943 9.774 9.595 9.406 9.216 9.087 8.935 8.702 8.551 8.393 8.307 8.116 7.906 7.676 7.55 7.316 7.134 6.975 6.807 6.458 6.243 6.013 5.779 5.476 5.1 4.64 3.529 -5 ,17226 ,TETRA ,17586119,Sat Nov 27 16:02:21 CET,Sat Nov 27 17:47:43 CET,0.0 0.6 0.912 1.181 1.413 1.592 1.769 1.917 2.166 2.288 2.407 2.517 2.72 2.814 2.991 3.159 3.323 3.403 3.559 3.705 3.914 4.043 4.159 4.338 4.517 4.681 4.839 4.988 5.179 5.379 5.575 5.806 6.026 6.24 6.479 6.74 6.999 7.276 7.571 7.885 8.209 8.573 8.984 9.404 9.904 10.435 11.016 11.684 12.457 13.32 14.203 14.631 14.699 14.627 14.46 14.265 14.036 13.768 13.522 13.249 12.997 12.783 12.57 12.347 12.132 11.934 11.709 11.504 11.325 11.128 10.912 10.726 10.53 10.31 10.144 9.984 9.811 9.639 9.458 9.321 9.178 8.955 8.797 8.625 8.53 8.332 8.129 7.905 7.776 7.542 7.354 7.208 7.058 6.713 6.52 6.307 6.056 5.78 5.426 4.953 3.252 -6 ,30142 ,TETRA ,17586120,Sat Nov 27 16:02:20 CET,Sat Nov 27 17:43:24 CET,0.0 0.801 1.167 1.42 1.615 1.787 1.948 2.093 2.334 2.448 2.557 2.654 2.858 2.959 3.145 3.312 3.471 3.551 3.699 3.831 4.026 4.154 4.279 4.45 4.613 4.776 4.938 5.1 5.303 5.495 5.685 5.916 6.13 6.328 6.553 6.812 7.063 7.335 7.641 7.956 8.286 8.658 9.073 9.496 9.977 10.506 11.11 11.761 12.478 13.272 14.057 14.471 14.536 14.435 14.261 14.062 13.87 13.651 13.419 13.14 12.86 12.603 12.361 12.135 11.918 11.716 11.507 11.305 11.106 10.889 10.666 10.478 10.282 10.079 9.926 9.766 9.594 9.406 9.189 9.038 8.887 8.65 8.482 8.313 8.226 8.02 7.808 7.581 7.445 7.217 7.059 6.904 6.733 6.384 6.183 5.97 5.763 5.507 5.152 4.671 3.266 -7 ,26927 ,TETRA ,17586121,Sat Nov 27 16:02:21 CET,Sat Nov 27 17:46:18 CET,0.0 0.635 1.006 1.287 1.497 1.667 1.81 1.963 2.264 2.398 2.53 2.656 2.859 2.953 3.123 3.289 3.448 3.524 3.674 3.822 4.036 4.172 4.306 4.501 4.679 4.846 5.008 5.165 5.363 5.553 5.746 5.982 6.21 6.419 6.646 6.896 7.147 7.422 7.716 8.028 8.349 8.715 9.139 9.55 10.025 10.56 11.154 11.787 12.48 13.256 14.091 14.603 14.69 14.579 14.432 14.228 13.985 13.737 13.474 13.207 12.982 12.756 12.528 12.304 12.08 11.876 11.656 11.444 11.255 11.058 10.854 10.68 10.481 10.276 10.127 9.969 9.803 9.628 9.44 9.31 9.166 8.934 8.768 8.588 8.486 8.261 8.039 7.82 7.703 7.486 7.315 7.163 7.004 6.658 6.466 6.236 5.981 5.71 5.389 4.961 3.427 -8 ,13199 ,TETRA ,17586122,Sat Nov 27 16:02:21 CET,Sat Nov 27 17:43:13 CET,0.0 0.631 0.942 1.18 1.392 1.567 1.708 1.842 2.085 2.207 2.324 2.429 2.644 2.748 2.942 3.128 3.305 3.389 3.546 3.694 3.899 4.032 4.171 4.369 4.545 4.712 4.87 5.021 5.222 5.425 5.622 5.852 6.075 6.286 6.519 6.78 7.032 7.302 7.576 7.882 8.223 8.596 9.028 9.45 9.935 10.476 11.091 11.79 12.557 13.408 14.265 14.711 14.835 14.773 14.6 14.4 14.187 13.95 13.73 13.502 13.275 13.045 12.827 12.611 12.4 12.194 11.966 11.763 11.568 11.364 11.156 10.978 10.799 10.591 10.416 10.242 10.07 9.894 9.699 9.558 9.416 9.183 9.009 8.831 8.744 8.553 8.336 8.108 7.984 7.76 7.607 7.466 7.299 6.961 6.784 6.574 6.335 6.075 5.737 5.268 3.921 -9 ,27920 ,TETRA ,17586123,Sat Nov 27 16:03:20 CET,Sat Nov 27 17:44:47 CET,0.0 0.548 0.889 1.163 1.399 1.591 1.762 1.921 2.182 2.285 2.387 2.489 2.692 2.794 2.99 3.159 3.325 3.407 3.562 3.715 3.924 4.061 4.191 4.371 4.547 4.719 4.88 5.029 5.229 5.415 5.587 5.807 6.022 6.228 6.475 6.751 7.005 7.28 7.586 7.914 8.255 8.621 9.045 9.488 9.974 10.507 11.121 11.797 12.541 13.348 14.249 14.76 14.829 14.708 14.531 14.329 14.128 13.903 13.665 13.398 13.155 12.906 12.656 12.406 12.188 12.007 11.785 11.574 11.387 11.176 10.959 10.785 10.603 10.409 10.255 10.09 9.91 9.726 9.531 9.386 9.239 9.016 8.858 8.702 8.617 8.425 8.217 7.981 7.854 7.633 7.469 7.328 7.17 6.799 6.59 6.383 6.14 5.818 5.459 5.006 3.589 -10 ,31370 ,TETRA ,17586124,Sat Nov 27 16:03:20 CET,Sat Nov 27 17:43:53 CET,0.0 0.6 0.935 1.205 1.392 1.549 1.707 1.849 2.095 2.215 2.333 2.457 2.671 2.772 2.954 3.12 3.283 3.366 3.522 3.665 3.861 3.986 4.106 4.286 4.461 4.628 4.787 4.944 5.15 5.34 5.527 5.754 5.966 6.168 6.402 6.67 6.925 7.202 7.508 7.832 8.159 8.511 8.923 9.346 9.836 10.383 10.976 11.61 12.315 13.058 13.864 14.387 14.528 14.45 14.255 14.023 13.78 13.554 13.347 13.111 12.894 12.684 12.459 12.225 12.012 11.801 11.569 11.355 11.149 10.947 10.738 10.547 10.346 10.15 10.0 9.833 9.664 9.493 9.294 9.146 9.0 8.784 8.621 8.441 8.349 8.146 7.917 7.692 7.574 7.345 7.181 7.046 6.904 6.549 6.34 6.111 5.849 5.532 5.189 4.75 3.331 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt deleted file mode 100644 index 449ec0e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3853 ,TETRA ,17586125,Sat Nov 27 16:03:20 CET,Sat Nov 27 17:44:46 CET,0.0 1.254 1.675 2.09 2.416 2.703 2.967 3.195 3.589 3.772 3.931 4.092 4.321 4.441 4.673 4.899 5.11 5.209 5.395 5.581 5.856 6.032 6.205 6.454 6.691 6.917 7.138 7.346 7.615 7.877 8.13 8.426 8.707 8.98 9.288 9.634 9.966 10.341 10.751 11.179 11.598 12.058 12.602 13.129 13.756 14.447 15.208 16.046 16.953 17.914 18.885 19.401 19.495 19.422 19.27 19.078 18.863 18.61 18.366 18.1 17.831 17.594 17.364 17.129 16.907 16.699 16.463 16.232 16.035 15.839 15.631 15.46 15.283 15.089 14.938 14.783 14.62 14.449 14.27 14.132 13.992 13.782 13.626 13.461 13.378 13.211 13.027 12.828 12.724 12.52 12.372 12.23 12.093 11.806 11.627 11.441 11.24 10.991 10.695 10.262 9.133 -2 ,9404 ,TETRA ,17586126,Sat Nov 27 16:03:20 CET,Sat Nov 27 17:45:39 CET,0.0 1.63 2.12 2.479 2.77 3.01 3.239 3.471 3.896 4.09 4.274 4.489 4.742 4.886 5.164 5.419 5.644 5.749 5.951 6.148 6.412 6.581 6.747 6.999 7.242 7.475 7.704 7.911 8.172 8.416 8.66 8.955 9.224 9.484 9.788 10.137 10.475 10.833 11.222 11.629 12.04 12.516 13.048 13.557 14.137 14.774 15.525 16.319 17.154 18.087 19.106 19.721 19.895 19.871 19.756 19.584 19.407 19.213 18.987 18.722 18.483 18.261 18.042 17.822 17.61 17.416 17.19 16.984 16.811 16.623 16.406 16.223 16.035 15.825 15.668 15.5 15.317 15.123 14.913 14.768 14.618 14.381 14.214 14.04 13.948 13.765 13.571 13.344 13.226 13.015 12.849 12.7 12.542 12.21 12.02 11.799 11.572 11.298 10.962 10.48 9.112 -3 ,16376 ,TETRA ,17586127,Sat Nov 27 16:03:21 CET,Sat Nov 27 17:45:40 CET,0.0 1.549 2.062 2.433 2.725 2.99 3.223 3.426 3.796 3.965 4.129 4.322 4.56 4.692 4.954 5.214 5.448 5.549 5.747 5.946 6.234 6.413 6.576 6.821 7.063 7.3 7.521 7.731 8.009 8.261 8.502 8.802 9.088 9.369 9.686 10.042 10.381 10.717 11.089 11.497 11.899 12.339 12.854 13.379 13.974 14.614 15.34 16.143 17.055 18.021 18.989 19.571 19.746 19.734 19.576 19.389 19.182 18.958 18.749 18.501 18.274 18.048 17.796 17.555 17.328 17.107 16.867 16.655 16.478 16.277 16.067 15.898 15.707 15.497 15.33 15.17 15.003 14.812 14.606 14.458 14.317 14.105 13.942 13.766 13.67 13.463 13.25 13.021 12.902 12.679 12.512 12.392 12.266 11.941 11.751 11.55 11.335 11.082 10.809 10.477 9.83 -4 ,21166 ,TETRA ,17586128,Sat Nov 27 16:03:21 CET,Sat Nov 27 17:45:33 CET,0.0 1.51 1.983 2.343 2.641 2.901 3.119 3.32 3.694 3.863 4.025 4.236 4.495 4.639 4.897 5.126 5.336 5.438 5.641 5.834 6.12 6.294 6.462 6.709 6.944 7.171 7.389 7.606 7.873 8.119 8.354 8.658 8.948 9.206 9.505 9.845 10.175 10.523 10.888 11.296 11.738 12.22 12.759 13.296 13.918 14.592 15.338 16.143 17.055 18.065 19.138 19.784 19.921 19.851 19.683 19.451 19.203 18.955 18.712 18.453 18.217 17.98 17.748 17.539 17.335 17.141 16.935 16.729 16.549 16.367 16.163 15.996 15.821 15.626 15.458 15.279 15.103 14.907 14.698 14.556 14.411 14.183 14.014 13.845 13.764 13.575 13.373 13.165 13.049 12.844 12.713 12.574 12.421 12.093 11.922 11.741 11.522 11.267 10.955 10.54 9.287 -5 ,32476 ,TETRA ,17586129,Sat Nov 27 16:03:21 CET,Sat Nov 27 17:45:17 CET,0.0 2.099 2.643 3.004 3.304 3.62 3.907 4.122 4.489 4.668 4.832 5.041 5.294 5.423 5.678 5.933 6.177 6.29 6.491 6.681 6.958 7.131 7.297 7.544 7.778 8.006 8.228 8.436 8.704 8.959 9.191 9.456 9.728 10.008 10.324 10.657 10.975 11.335 11.709 12.107 12.534 13.006 13.517 14.02 14.657 15.368 16.103 16.939 17.919 18.932 19.918 20.45 20.597 20.532 20.346 20.105 19.833 19.559 19.32 19.079 18.849 18.624 18.394 18.152 17.919 17.706 17.479 17.268 17.082 16.9 16.712 16.54 16.358 16.174 16.023 15.861 15.678 15.491 15.309 15.177 15.035 14.81 14.65 14.494 14.418 14.246 14.054 13.835 13.715 13.507 13.371 13.249 13.117 12.814 12.631 12.428 12.227 12.0 11.723 11.379 10.633 -6 ,8967 ,TETRA ,17586130,Sat Nov 27 16:04:19 CET,Sat Nov 27 17:44:44 CET,0.0 1.305 1.817 2.192 2.486 2.73 2.959 3.187 3.608 3.788 3.942 4.121 4.358 4.485 4.736 4.966 5.169 5.269 5.475 5.68 5.968 6.144 6.319 6.574 6.803 7.008 7.208 7.414 7.688 7.943 8.178 8.462 8.733 8.999 9.316 9.665 9.997 10.352 10.744 11.157 11.577 12.045 12.566 13.085 13.699 14.376 15.112 15.942 16.851 17.794 18.783 19.316 19.415 19.353 19.206 18.979 18.718 18.468 18.22 17.926 17.663 17.426 17.197 16.968 16.75 16.549 16.321 16.111 15.928 15.732 15.524 15.349 15.17 14.985 14.84 14.682 14.514 14.335 14.145 14.014 13.878 13.654 13.499 13.333 13.246 13.067 12.865 12.651 12.551 12.349 12.197 12.058 11.913 11.571 11.374 11.141 10.884 10.611 10.276 9.836 8.651 -7 ,23540 ,TETRA ,17586131,Sat Nov 27 16:04:22 CET,Sat Nov 27 17:46:17 CET,0.0 1.459 1.948 2.338 2.633 2.869 3.093 3.305 3.705 3.881 4.048 4.267 4.523 4.664 4.934 5.191 5.425 5.537 5.748 5.944 6.232 6.417 6.595 6.86 7.13 7.379 7.603 7.819 8.09 8.343 8.589 8.895 9.196 9.497 9.844 10.215 10.566 10.935 11.318 11.72 12.116 12.556 13.083 13.609 14.213 14.877 15.63 16.473 17.404 18.396 19.386 19.884 19.958 19.877 19.7 19.465 19.233 19.0 18.769 18.517 18.28 18.058 17.833 17.596 17.37 17.167 16.959 16.765 16.574 16.374 16.169 15.995 15.812 15.614 15.454 15.283 15.107 14.939 14.765 14.635 14.505 14.291 14.129 13.959 13.874 13.696 13.508 13.304 13.194 12.976 12.806 12.674 12.54 12.232 12.06 11.877 11.681 11.452 11.134 10.695 9.412 -8 ,27371 ,TETRA ,17586132,Sat Nov 27 16:04:19 CET,Sat Nov 27 17:46:36 CET,0.0 1.165 1.615 1.97 2.255 2.497 2.703 2.901 3.256 3.414 3.57 3.759 3.998 4.119 4.35 4.578 4.801 4.902 5.094 5.288 5.566 5.742 5.917 6.167 6.4 6.626 6.838 7.038 7.3 7.561 7.814 8.104 8.385 8.666 8.981 9.322 9.643 9.987 10.356 10.747 11.154 11.602 12.101 12.617 13.225 13.894 14.648 15.467 16.408 17.426 18.486 19.076 19.217 19.181 19.033 18.843 18.604 18.315 18.061 17.8 17.577 17.358 17.13 16.924 16.725 16.528 16.306 16.096 15.914 15.74 15.543 15.367 15.188 14.997 14.842 14.682 14.502 14.3 14.1 13.968 13.836 13.616 13.456 13.291 13.202 13.025 12.855 12.654 12.545 12.337 12.184 12.05 11.912 11.604 11.42 11.222 10.983 10.7 10.394 9.996 8.902 -9 ,31561 ,TETRA ,17586133,Sat Nov 27 16:04:21 CET,Sat Nov 27 17:46:32 CET,0.0 1.552 2.003 2.379 2.67 2.907 3.141 3.372 3.779 3.942 4.115 4.351 4.607 4.743 4.98 5.202 5.419 5.528 5.732 5.927 6.206 6.383 6.557 6.807 7.047 7.266 7.476 7.684 7.945 8.188 8.418 8.712 9.0 9.264 9.563 9.9 10.234 10.589 10.981 11.388 11.785 12.246 12.782 13.3 13.914 14.614 15.383 16.194 17.12 18.126 19.107 19.645 19.803 19.785 19.636 19.393 19.128 18.856 18.599 18.34 18.1 17.872 17.625 17.385 17.169 16.97 16.749 16.525 16.327 16.125 15.904 15.719 15.533 15.347 15.199 15.033 14.858 14.659 14.434 14.29 14.143 13.899 13.72 13.529 13.436 13.254 13.06 12.846 12.73 12.505 12.338 12.204 12.056 11.7 11.494 11.289 11.064 10.813 10.475 10.013 8.802 -10 ,26677 ,TETRA ,17586134,Sat Nov 27 16:04:20 CET,Sat Nov 27 17:45:59 CET,0.0 1.217 1.615 1.928 2.195 2.426 2.636 2.831 3.159 3.311 3.471 3.654 3.884 4.007 4.243 4.473 4.691 4.792 4.987 5.176 5.449 5.625 5.802 6.059 6.299 6.532 6.755 6.969 7.244 7.5 7.747 8.047 8.327 8.598 8.904 9.246 9.581 9.955 10.348 10.751 11.178 11.66 12.209 12.736 13.339 14.026 14.817 15.64 16.535 17.518 18.566 19.181 19.304 19.253 19.13 18.943 18.749 18.531 18.303 18.035 17.759 17.514 17.27 17.008 16.767 16.551 16.309 16.104 15.943 15.767 15.571 15.396 15.205 15.006 14.856 14.704 14.545 14.38 14.205 14.072 13.935 13.711 13.545 13.376 13.29 13.105 12.906 12.708 12.602 12.394 12.248 12.125 11.998 11.698 11.516 11.305 11.065 10.807 10.516 10.176 9.369 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt deleted file mode 100644 index 94b22ac4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12879 ,KEBNE ,17024272,Wed Dec 22 09:48:54 CET,Wed Dec 22 11:20:36 CET,0.0 1.537 1.945 2.238 2.445 2.631 2.805 2.973 3.305 3.443 3.56 3.722 3.861 3.949 4.096 4.222 4.343 4.401 4.509 4.615 4.752 4.832 4.905 4.999 5.077 5.161 5.24 5.294 5.361 5.424 5.469 5.517 5.531 5.526 5.517 5.484 5.428 5.317 5.203 5.066 4.852 4.575 4.225 3.807 3.193 2.411 1.335 -0.205 -2.419 -5.703 -10.952 -16.729 -21.201 -24.902 -27.989 -30.63 -32.837 -34.767 -36.378 -37.914 -39.19 -40.307 -41.367 -42.363 -43.258 -44.036 -44.83 -45.539 -46.147 -46.764 -47.419 -47.977 -48.532 -49.108 -49.566 -50.033 -50.502 -50.988 -51.498 -51.847 -52.194 -52.726 -53.098 -53.487 -53.687 -54.093 -54.51 -54.945 -55.168 -55.525 -55.877 -56.125 -56.391 -56.973 -57.291 -57.635 -58.038 -58.465 -58.941 -59.531 -61.68 -2 ,15316 ,KEBNE ,17024273,Wed Dec 22 09:48:54 CET,Wed Dec 22 11:18:42 CET,0.0 1.705 2.135 2.444 2.714 2.92 3.094 3.257 3.542 3.668 3.78 3.936 4.067 4.153 4.327 4.472 4.596 4.656 4.77 4.873 5.012 5.089 5.155 5.249 5.328 5.391 5.45 5.505 5.569 5.618 5.644 5.653 5.64 5.612 5.585 5.554 5.505 5.43 5.314 5.157 4.97 4.705 4.376 3.995 3.408 2.64 1.575 0.077 -2.09 -5.274 -10.335 -16.099 -20.634 -24.353 -27.335 -29.869 -32.047 -33.959 -35.585 -37.143 -38.414 -39.531 -40.606 -41.593 -42.49 -43.319 -44.197 -44.963 -45.604 -46.265 -46.944 -47.496 -48.059 -48.639 -49.097 -49.558 -50.019 -50.515 -51.036 -51.38 -51.729 -52.264 -52.62 -52.992 -53.191 -53.601 -54.019 -54.455 -54.682 -55.038 -55.397 -55.651 -55.923 -56.492 -56.805 -57.143 -57.531 -57.954 -58.456 -59.118 -61.857 -3 ,31765 ,KEBNE ,17024274,Wed Dec 22 09:48:54 CET,Wed Dec 22 11:20:28 CET,0.0 1.674 2.126 2.415 2.692 2.947 3.142 3.3 3.562 3.682 3.797 3.96 4.098 4.181 4.329 4.464 4.589 4.648 4.761 4.862 5.005 5.095 5.168 5.266 5.349 5.407 5.461 5.52 5.584 5.627 5.657 5.687 5.703 5.713 5.72 5.703 5.649 5.577 5.484 5.346 5.168 4.917 4.556 4.143 3.564 2.786 1.703 0.222 -1.894 -5.011 -9.982 -15.695 -20.215 -23.859 -26.795 -29.332 -31.52 -33.415 -34.967 -36.487 -37.777 -38.899 -39.946 -40.904 -41.79 -42.58 -43.368 -44.057 -44.658 -45.297 -45.949 -46.475 -47.015 -47.564 -47.975 -48.393 -48.827 -49.283 -49.752 -50.07 -50.389 -50.862 -51.184 -51.51 -51.686 -52.07 -52.465 -52.859 -53.064 -53.392 -53.691 -53.911 -54.125 -54.613 -54.894 -55.19 -55.521 -55.876 -56.28 -56.805 -58.079 -4 ,1295 ,KEBNE ,17024275,Wed Dec 22 09:48:54 CET,Wed Dec 22 11:19:14 CET,0.0 2.249 2.745 3.063 3.299 3.501 3.671 3.829 4.123 4.245 4.354 4.494 4.617 4.695 4.86 5.023 5.164 5.222 5.332 5.431 5.555 5.627 5.692 5.793 5.885 5.958 6.015 6.07 6.14 6.197 6.23 6.258 6.273 6.286 6.281 6.235 6.194 6.141 6.056 5.917 5.74 5.505 5.144 4.713 4.085 3.245 2.142 0.657 -1.386 -4.516 -9.77 -15.66 -20.151 -23.763 -26.776 -29.349 -31.516 -33.406 -34.968 -36.501 -37.797 -38.927 -39.994 -40.973 -41.831 -42.598 -43.407 -44.098 -44.672 -45.292 -45.941 -46.458 -46.985 -47.524 -47.923 -48.331 -48.762 -49.214 -49.674 -49.983 -50.3 -50.788 -51.119 -51.458 -51.638 -52.002 -52.365 -52.75 -52.946 -53.262 -53.541 -53.759 -53.991 -54.491 -54.764 -55.036 -55.336 -55.682 -56.11 -56.694 -58.64 -5 ,20803 ,KEBNE ,17024276,Wed Dec 22 09:48:54 CET,Wed Dec 22 11:19:26 CET,0.0 2.49 2.913 3.249 3.525 3.723 3.897 4.064 4.342 4.465 4.58 4.731 4.861 4.944 5.097 5.231 5.356 5.415 5.522 5.617 5.741 5.815 5.894 6.006 6.095 6.165 6.226 6.282 6.346 6.408 6.45 6.462 6.456 6.458 6.446 6.411 6.355 6.265 6.148 6.012 5.801 5.471 5.038 4.547 3.89 3.035 1.895 0.386 -1.796 -4.97 -9.997 -15.687 -20.109 -23.787 -26.816 -29.387 -31.555 -33.453 -35.055 -36.587 -37.872 -38.995 -40.042 -41.007 -41.871 -42.657 -43.459 -44.154 -44.746 -45.345 -45.958 -46.465 -46.979 -47.486 -47.871 -48.277 -48.712 -49.136 -49.561 -49.87 -50.177 -50.667 -51.033 -51.426 -51.644 -52.081 -52.508 -52.942 -53.17 -53.537 -53.918 -54.178 -54.451 -55.006 -55.299 -55.632 -56.01 -56.428 -56.934 -57.572 -59.85 -6 ,27728 ,KEBNE ,17024277,Wed Dec 22 09:48:54 CET,Wed Dec 22 11:18:40 CET,0.0 2.58 3.009 3.359 3.622 3.823 3.996 4.167 4.466 4.59 4.699 4.839 4.974 5.065 5.238 5.384 5.503 5.558 5.667 5.766 5.905 5.986 6.059 6.175 6.27 6.329 6.386 6.447 6.504 6.546 6.587 6.629 6.657 6.658 6.643 6.622 6.584 6.505 6.396 6.254 6.068 5.831 5.474 5.024 4.409 3.61 2.502 0.919 -1.302 -4.432 -9.423 -15.226 -19.796 -23.501 -26.491 -29.048 -31.195 -33.05 -34.626 -36.149 -37.424 -38.529 -39.555 -40.525 -41.428 -42.236 -43.059 -43.792 -44.428 -45.083 -45.757 -46.315 -46.892 -47.489 -47.942 -48.397 -48.856 -49.339 -49.857 -50.211 -50.566 -51.102 -51.471 -51.859 -52.061 -52.475 -52.902 -53.352 -53.584 -53.941 -54.324 -54.587 -54.872 -55.549 -55.905 -56.26 -56.625 -57.02 -57.511 -58.182 -60.625 -7 ,5338 ,KEBNE ,17024278,Wed Dec 22 09:49:54 CET,Wed Dec 22 11:20:28 CET,0.0 1.694 2.122 2.453 2.692 2.896 3.075 3.252 3.566 3.693 3.809 3.958 4.089 4.173 4.327 4.472 4.615 4.676 4.78 4.886 5.029 5.107 5.172 5.267 5.364 5.437 5.502 5.576 5.657 5.715 5.744 5.771 5.795 5.794 5.776 5.756 5.707 5.626 5.507 5.323 5.117 4.846 4.47 4.038 3.415 2.575 1.441 -0.033 -2.131 -5.289 -10.463 -16.303 -20.849 -24.57 -27.589 -30.181 -32.376 -34.282 -35.878 -37.409 -38.701 -39.809 -40.823 -41.763 -42.606 -43.365 -44.137 -44.8 -45.395 -46.036 -46.692 -47.214 -47.742 -48.294 -48.713 -49.135 -49.578 -50.037 -50.503 -50.843 -51.195 -51.734 -52.113 -52.5 -52.689 -53.075 -53.506 -53.962 -54.191 -54.546 -54.909 -55.168 -55.434 -55.964 -56.22 -56.494 -56.819 -57.163 -57.542 -58.094 -59.607 -8 ,25149 ,KEBNE ,17024279,Wed Dec 22 09:49:55 CET,Wed Dec 22 11:19:37 CET,0.0 1.451 1.764 2.03 2.248 2.435 2.61 2.775 3.068 3.187 3.29 3.439 3.575 3.661 3.82 3.963 4.09 4.152 4.266 4.367 4.515 4.595 4.662 4.765 4.861 4.94 5.01 5.073 5.128 5.163 5.182 5.2 5.226 5.244 5.223 5.169 5.1 5.02 4.932 4.803 4.61 4.334 3.935 3.466 2.808 1.924 0.804 -0.647 -2.792 -6.063 -11.191 -17.025 -21.6 -25.22 -28.215 -30.814 -32.982 -34.877 -36.453 -37.963 -39.242 -40.36 -41.407 -42.37 -43.225 -43.968 -44.744 -45.447 -46.03 -46.626 -47.256 -47.801 -48.365 -48.933 -49.377 -49.833 -50.307 -50.803 -51.305 -51.638 -51.97 -52.447 -52.764 -53.088 -53.253 -53.604 -53.979 -54.374 -54.57 -54.885 -55.206 -55.443 -55.675 -56.185 -56.456 -56.741 -57.058 -57.413 -57.817 -58.27 -59.982 -9 ,29193 ,KEBNE ,17024280,Wed Dec 22 09:49:55 CET,Wed Dec 22 11:21:24 CET,0.0 0.882 1.334 1.622 1.888 2.131 2.32 2.474 2.748 2.87 2.984 3.128 3.259 3.338 3.499 3.642 3.776 3.833 3.933 4.038 4.18 4.262 4.332 4.423 4.503 4.579 4.652 4.707 4.756 4.79 4.816 4.839 4.865 4.879 4.879 4.874 4.847 4.784 4.668 4.519 4.358 4.133 3.777 3.298 2.661 1.905 0.818 -0.743 -2.928 -6.144 -11.26 -17.068 -21.589 -25.211 -28.17 -30.763 -32.939 -34.834 -36.407 -37.905 -39.177 -40.296 -41.331 -42.277 -43.149 -43.935 -44.723 -45.409 -45.996 -46.593 -47.205 -47.708 -48.224 -48.748 -49.162 -49.588 -50.011 -50.464 -50.923 -51.221 -51.534 -52.033 -52.377 -52.708 -52.87 -53.207 -53.576 -53.96 -54.16 -54.484 -54.798 -55.028 -55.276 -55.864 -56.205 -56.558 -56.92 -57.338 -57.824 -58.443 -60.554 -10 ,7741 ,KEBNE ,17024281,Wed Dec 22 09:49:54 CET,Wed Dec 22 11:20:12 CET,0.0 1.621 2.035 2.282 2.482 2.662 2.83 2.995 3.28 3.404 3.516 3.663 3.797 3.885 4.064 4.225 4.355 4.411 4.509 4.593 4.713 4.79 4.865 4.958 5.045 5.125 5.187 5.241 5.295 5.336 5.368 5.41 5.434 5.432 5.435 5.417 5.374 5.3 5.169 4.993 4.762 4.474 4.091 3.643 3.055 2.277 1.187 -0.299 -2.43 -5.665 -10.797 -16.559 -21.061 -24.744 -27.825 -30.383 -32.479 -34.306 -35.838 -37.342 -38.592 -39.677 -40.704 -41.655 -42.524 -43.295 -44.09 -44.796 -45.408 -46.02 -46.631 -47.136 -47.643 -48.171 -48.583 -48.99 -49.403 -49.844 -50.301 -50.607 -50.922 -51.403 -51.729 -52.076 -52.249 -52.599 -52.969 -53.354 -53.549 -53.873 -54.19 -54.422 -54.657 -55.139 -55.4 -55.685 -56.018 -56.385 -56.774 -57.26 -58.695 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt deleted file mode 100644 index 27d49830..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30357 ,TETRA ,17586135,Sat Nov 27 16:04:21 CET,Sat Nov 27 17:50:32 CET,0.0 0.778 1.184 1.514 1.808 2.124 2.424 2.677 3.109 3.318 3.52 3.761 4.074 4.255 4.606 4.955 5.308 5.479 5.825 6.169 6.67 6.998 7.305 7.749 8.179 8.591 8.999 9.406 9.925 10.424 10.935 11.58 12.203 12.818 13.547 14.356 15.143 16.063 17.103 18.235 19.44 20.831 22.511 24.24 26.312 28.72 31.605 34.914 38.942 43.987 50.487 56.372 60.146 62.726 64.595 65.989 67.037 67.871 68.488 68.999 69.345 69.602 69.791 69.939 70.072 70.177 70.254 70.312 70.361 70.383 70.372 70.353 70.323 70.275 70.222 70.163 70.115 70.057 69.97 69.896 69.82 69.704 69.613 69.512 69.455 69.343 69.214 69.061 68.976 68.838 68.674 68.547 68.413 68.093 67.91 67.706 67.486 67.23 66.871 66.429 64.762 -2 ,32533 ,TETRA ,17586136,Sat Nov 27 16:04:21 CET,Sat Nov 27 17:51:19 CET,0.0 0.839 1.248 1.577 1.844 2.112 2.396 2.661 3.146 3.376 3.586 3.855 4.19 4.39 4.761 5.119 5.478 5.654 5.998 6.338 6.816 7.12 7.435 7.903 8.354 8.8 9.234 9.664 10.209 10.727 11.232 11.856 12.48 13.097 13.823 14.633 15.425 16.32 17.306 18.396 19.598 21.003 22.649 24.336 26.362 28.672 31.453 34.736 38.745 43.718 50.173 55.914 59.599 62.27 64.166 65.575 66.645 67.466 68.048 68.535 68.906 69.183 69.374 69.531 69.653 69.73 69.799 69.831 69.842 69.845 69.828 69.813 69.779 69.723 69.691 69.643 69.581 69.514 69.426 69.354 69.268 69.118 69.007 68.889 68.829 68.716 68.575 68.41 68.32 68.182 68.041 67.928 67.789 67.474 67.306 67.139 66.961 66.723 66.393 65.968 64.684 -3 ,20465 ,TETRA ,17586137,Sat Nov 27 16:04:21 CET,Sat Nov 27 17:48:58 CET,0.0 0.724 1.148 1.518 1.852 2.155 2.426 2.67 3.132 3.353 3.561 3.845 4.18 4.372 4.735 5.079 5.415 5.578 5.902 6.21 6.666 6.981 7.297 7.737 8.152 8.58 9.013 9.434 9.981 10.509 11.021 11.66 12.3 12.928 13.658 14.475 15.27 16.172 17.177 18.285 19.482 20.851 22.497 24.175 26.156 28.486 31.259 34.514 38.547 43.571 50.222 56.19 59.932 62.52 64.375 65.785 66.864 67.717 68.336 68.858 69.228 69.494 69.712 69.891 70.012 70.116 70.214 70.273 70.319 70.35 70.357 70.344 70.314 70.258 70.204 70.153 70.085 69.99 69.902 69.841 69.761 69.631 69.537 69.429 69.37 69.245 69.1 68.928 68.837 68.691 68.521 68.41 68.289 67.989 67.813 67.633 67.436 67.193 66.888 66.478 64.34 -4 ,24530 ,TETRA ,17586138,Sat Nov 27 16:04:21 CET,Sat Nov 27 17:52:05 CET,0.0 0.876 1.308 1.698 2.035 2.323 2.592 2.851 3.332 3.551 3.758 4.05 4.381 4.574 4.958 5.336 5.692 5.863 6.2 6.524 7.011 7.334 7.649 8.091 8.511 8.931 9.349 9.75 10.28 10.815 11.331 11.981 12.624 13.238 13.967 14.786 15.569 16.452 17.431 18.501 19.655 20.976 22.593 24.319 26.363 28.667 31.383 34.588 38.576 43.497 49.949 55.865 59.699 62.297 64.125 65.506 66.526 67.306 67.878 68.375 68.746 69.044 69.274 69.451 69.604 69.704 69.775 69.824 69.843 69.849 69.85 69.848 69.831 69.793 69.743 69.681 69.62 69.538 69.435 69.36 69.282 69.145 69.041 68.92 68.853 68.715 68.579 68.417 68.316 68.168 67.993 67.877 67.758 67.486 67.319 67.134 66.909 66.635 66.326 65.86 64.173 -5 ,9407 ,TETRA ,17586139,Sat Nov 27 16:04:21 CET,Sat Nov 27 17:50:26 CET,0.0 1.109 1.608 2.003 2.308 2.559 2.812 3.056 3.516 3.739 3.961 4.247 4.567 4.752 5.122 5.488 5.849 6.028 6.378 6.723 7.206 7.519 7.832 8.278 8.72 9.146 9.551 9.951 10.481 11.011 11.53 12.177 12.826 13.452 14.189 15.053 15.903 16.862 17.922 19.052 20.251 21.607 23.211 24.89 26.901 29.23 32.073 35.376 39.414 44.488 50.966 56.903 60.8 63.478 65.363 66.785 67.823 68.615 69.219 69.754 70.121 70.38 70.593 70.762 70.881 70.967 71.049 71.107 71.131 71.136 71.136 71.117 71.086 71.047 71.013 70.98 70.924 70.849 70.766 70.712 70.642 70.515 70.425 70.315 70.255 70.137 70.003 69.846 69.763 69.623 69.44 69.319 69.195 68.941 68.804 68.641 68.421 68.127 67.776 67.313 65.827 -6 ,8109 ,TETRA ,17586140,Sat Nov 27 16:04:22 CET,Sat Nov 27 17:50:27 CET,0.0 1.29 1.895 2.33 2.683 2.98 3.236 3.502 4.004 4.237 4.455 4.734 5.052 5.237 5.61 5.982 6.337 6.505 6.827 7.157 7.64 7.936 8.222 8.65 9.072 9.479 9.888 10.308 10.862 11.392 11.913 12.559 13.179 13.795 14.543 15.402 16.252 17.215 18.251 19.343 20.512 21.855 23.493 25.208 27.209 29.47 32.219 35.481 39.485 44.528 51.168 57.191 61.055 63.689 65.49 66.848 67.877 68.663 69.243 69.765 70.147 70.427 70.653 70.844 71.003 71.105 71.165 71.204 71.227 71.234 71.227 71.209 71.164 71.115 71.073 71.001 70.912 70.825 70.74 70.674 70.596 70.46 70.362 70.253 70.189 70.058 69.917 69.75 69.659 69.514 69.306 69.165 69.024 68.767 68.629 68.455 68.25 67.985 67.656 67.242 65.131 -7 ,20597 ,TETRA ,17586141,Sat Nov 27 16:04:21 CET,Sat Nov 27 17:51:01 CET,0.0 0.777 1.18 1.504 1.795 2.055 2.319 2.569 3.01 3.237 3.464 3.757 4.095 4.287 4.67 5.051 5.4 5.568 5.89 6.219 6.699 7.009 7.333 7.814 8.276 8.711 9.132 9.552 10.095 10.623 11.14 11.776 12.396 13.023 13.774 14.608 15.405 16.288 17.259 18.328 19.49 20.818 22.434 24.125 26.145 28.482 31.304 34.534 38.508 43.59 50.251 56.166 59.832 62.381 64.169 65.519 66.584 67.414 68.007 68.507 68.902 69.229 69.479 69.662 69.787 69.859 69.921 69.969 69.995 70.002 70.005 70.01 69.99 69.946 69.911 69.867 69.811 69.741 69.655 69.59 69.523 69.399 69.3 69.189 69.127 68.991 68.834 68.658 68.576 68.452 68.291 68.179 68.061 67.791 67.632 67.46 67.25 66.993 66.705 66.282 64.437 -8 ,2742 ,TETRA ,17586142,Sat Nov 27 16:04:22 CET,Sat Nov 27 17:50:26 CET,0.0 0.899 1.353 1.727 2.051 2.339 2.601 2.848 3.304 3.515 3.715 3.976 4.306 4.501 4.89 5.275 5.637 5.816 6.163 6.474 6.935 7.24 7.538 7.99 8.44 8.88 9.314 9.73 10.253 10.764 11.285 11.925 12.534 13.137 13.871 14.716 15.543 16.471 17.501 18.639 19.854 21.234 22.859 24.516 26.505 28.844 31.678 34.958 38.928 43.929 50.405 56.248 60.097 62.772 64.654 66.017 67.014 67.793 68.381 68.889 69.265 69.562 69.789 69.953 70.085 70.188 70.263 70.317 70.353 70.373 70.375 70.356 70.324 70.272 70.219 70.152 70.081 70.006 69.911 69.838 69.764 69.644 69.554 69.444 69.377 69.238 69.106 68.948 68.86 68.728 68.572 68.455 68.321 68.039 67.873 67.676 67.448 67.182 66.866 66.437 65.119 -9 ,305 ,TETRA ,17586143,Sat Nov 27 16:04:22 CET,Sat Nov 27 17:50:37 CET,0.0 0.772 1.27 1.659 1.991 2.283 2.549 2.794 3.242 3.466 3.681 3.961 4.294 4.49 4.87 5.227 5.58 5.767 6.115 6.445 6.937 7.248 7.55 7.99 8.432 8.884 9.331 9.766 10.321 10.85 11.368 12.012 12.649 13.261 13.962 14.779 15.615 16.536 17.531 18.62 19.782 21.136 22.752 24.437 26.483 28.803 31.581 34.868 38.987 44.105 50.693 56.702 60.524 63.103 64.908 66.263 67.279 68.074 68.644 69.145 69.523 69.8 70.033 70.233 70.373 70.455 70.526 70.566 70.579 70.591 70.586 70.559 70.506 70.448 70.406 70.349 70.274 70.181 70.079 70.004 69.928 69.797 69.693 69.578 69.512 69.376 69.237 69.076 68.982 68.844 68.694 68.587 68.475 68.206 68.022 67.823 67.614 67.366 67.071 66.67 65.478 -10 ,23252 ,TETRA ,17586144,Sat Nov 27 16:04:22 CET,Sat Nov 27 17:53:06 CET,0.0 0.737 1.186 1.601 1.946 2.247 2.524 2.782 3.243 3.447 3.658 3.937 4.253 4.435 4.819 5.201 5.55 5.721 6.057 6.391 6.896 7.213 7.519 7.986 8.438 8.869 9.29 9.697 10.217 10.729 11.245 11.874 12.479 13.093 13.824 14.637 15.442 16.354 17.386 18.537 19.732 21.076 22.707 24.414 26.418 28.692 31.495 34.887 39.017 44.048 50.66 56.498 60.19 62.739 64.575 65.995 67.017 67.827 68.445 68.949 69.285 69.544 69.791 69.982 70.104 70.193 70.273 70.309 70.311 70.298 70.276 70.262 70.251 70.211 70.156 70.101 70.027 69.932 69.838 69.777 69.714 69.605 69.518 69.418 69.367 69.252 69.114 68.956 68.856 68.7 68.506 68.37 68.242 67.974 67.809 67.629 67.405 67.136 66.828 66.427 65.434 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 8ef505b7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17182 ,TETRA ,17586145,Sat Nov 27 16:04:22 CET,Sat Nov 27 17:51:14 CET,0.0 0.563 0.877 1.17 1.46 1.705 1.907 2.111 2.497 2.683 2.862 3.047 3.324 3.459 3.721 3.986 4.24 4.37 4.624 4.86 5.203 5.418 5.618 5.904 6.179 6.449 6.719 6.98 7.314 7.648 7.964 8.334 8.693 9.045 9.476 9.988 10.476 11.008 11.593 12.191 12.812 13.551 14.425 15.333 16.425 17.637 19.025 20.585 22.425 24.575 27.152 29.285 30.491 31.192 31.582 31.79 31.874 31.846 31.757 31.631 31.508 31.367 31.202 31.023 30.828 30.643 30.447 30.249 30.065 29.874 29.676 29.504 29.31 29.103 28.935 28.756 28.576 28.38 28.15 27.992 27.832 27.573 27.385 27.181 27.074 26.85 26.618 26.365 26.226 25.989 25.796 25.612 25.43 25.074 24.863 24.639 24.377 24.049 23.651 23.197 21.836 -2 ,25132 ,TETRA ,17586146,Sat Nov 27 16:04:22 CET,Sat Nov 27 17:51:58 CET,0.0 0.43 0.786 1.065 1.308 1.548 1.757 1.945 2.318 2.496 2.662 2.834 3.104 3.247 3.532 3.8 4.05 4.167 4.399 4.628 4.961 5.178 5.377 5.672 5.967 6.242 6.504 6.773 7.137 7.478 7.806 8.208 8.606 8.995 9.434 9.932 10.421 10.964 11.541 12.159 12.832 13.602 14.506 15.416 16.475 17.64 18.959 20.526 22.416 24.582 27.212 29.389 30.59 31.271 31.647 31.833 31.924 31.951 31.898 31.746 31.545 31.327 31.107 30.907 30.72 30.528 30.303 30.086 29.892 29.694 29.474 29.277 29.082 28.885 28.723 28.554 28.371 28.178 27.962 27.8 27.658 27.431 27.247 27.06 26.961 26.752 26.521 26.251 26.109 25.873 25.686 25.514 25.334 24.918 24.69 24.454 24.183 23.876 23.518 22.99 21.847 -3 ,18473 ,TETRA ,17586147,Sat Nov 27 16:04:21 CET,Sat Nov 27 17:50:25 CET,0.0 0.522 0.826 1.113 1.384 1.615 1.837 2.042 2.416 2.591 2.755 2.944 3.23 3.374 3.643 3.888 4.129 4.249 4.488 4.728 5.078 5.292 5.497 5.815 6.129 6.427 6.711 6.988 7.354 7.697 8.009 8.382 8.755 9.135 9.588 10.096 10.591 11.125 11.714 12.36 13.011 13.749 14.626 15.507 16.553 17.695 19.019 20.543 22.344 24.504 27.19 29.365 30.531 31.214 31.6 31.779 31.821 31.768 31.652 31.486 31.322 31.137 30.949 30.792 30.623 30.456 30.307 30.163 30.003 29.811 29.596 29.407 29.212 29.019 28.862 28.68 28.488 28.301 28.095 27.934 27.776 27.53 27.346 27.148 27.038 26.803 26.561 26.315 26.189 25.963 25.787 25.626 25.441 25.044 24.839 24.61 24.34 24.037 23.681 23.251 21.631 -4 ,3231 ,TETRA ,17586148,Sat Nov 27 16:05:18 CET,Sat Nov 27 17:51:31 CET,0.0 0.744 1.091 1.414 1.688 1.915 2.122 2.308 2.653 2.815 2.968 3.134 3.419 3.563 3.818 4.057 4.288 4.407 4.65 4.879 5.22 5.444 5.649 5.946 6.24 6.515 6.782 7.055 7.409 7.752 8.085 8.482 8.887 9.285 9.716 10.191 10.676 11.214 11.798 12.429 13.081 13.833 14.739 15.629 16.646 17.833 19.216 20.742 22.539 24.706 27.431 29.626 30.78 31.402 31.706 31.851 31.917 31.908 31.834 31.729 31.596 31.447 31.298 31.122 30.912 30.706 30.463 30.232 30.02 29.778 29.532 29.347 29.17 28.983 28.833 28.657 28.453 28.241 28.031 27.89 27.724 27.447 27.256 27.054 26.953 26.746 26.525 26.257 26.1 25.852 25.661 25.504 25.31 24.864 24.642 24.408 24.151 23.867 23.522 23.029 21.482 -5 ,9294 ,TETRA ,17586149,Sat Nov 27 16:05:20 CET,Sat Nov 27 17:53:13 CET,0.0 0.591 0.931 1.196 1.441 1.684 1.89 2.092 2.497 2.664 2.821 2.999 3.263 3.39 3.645 3.913 4.174 4.294 4.533 4.765 5.097 5.31 5.521 5.828 6.104 6.372 6.645 6.903 7.245 7.584 7.919 8.338 8.73 9.101 9.551 10.062 10.541 11.058 11.608 12.226 12.902 13.643 14.505 15.392 16.439 17.609 18.954 20.464 22.216 24.316 27.013 29.308 30.47 31.059 31.408 31.613 31.67 31.652 31.588 31.461 31.332 31.184 31.006 30.815 30.622 30.455 30.246 30.029 29.843 29.663 29.467 29.281 29.077 28.863 28.719 28.573 28.405 28.203 27.98 27.82 27.648 27.375 27.178 26.964 26.847 26.608 26.365 26.109 25.979 25.742 25.547 25.379 25.182 24.775 24.561 24.305 23.993 23.628 23.247 22.78 21.494 -6 ,25427 ,TETRA ,17586150,Sat Nov 27 16:05:19 CET,Sat Nov 27 17:53:08 CET,0.0 0.868 1.275 1.573 1.82 2.048 2.266 2.461 2.81 2.98 3.149 3.323 3.593 3.727 3.981 4.225 4.453 4.564 4.797 5.024 5.351 5.577 5.8 6.133 6.445 6.734 7.021 7.302 7.678 8.038 8.366 8.772 9.177 9.55 9.972 10.455 10.931 11.467 12.05 12.67 13.32 14.065 14.921 15.772 16.791 17.947 19.345 20.971 22.827 25.028 27.724 29.913 31.099 31.767 32.131 32.294 32.333 32.277 32.179 32.045 31.916 31.792 31.65 31.471 31.242 31.029 30.825 30.62 30.423 30.205 29.981 29.786 29.577 29.365 29.198 29.002 28.785 28.567 28.337 28.187 28.036 27.794 27.626 27.435 27.336 27.119 26.858 26.594 26.456 26.205 25.995 25.83 25.653 25.265 25.048 24.814 24.524 24.199 23.811 23.3 21.862 -7 ,7654 ,TETRA ,17586151,Sat Nov 27 16:05:19 CET,Sat Nov 27 17:52:08 CET,0.0 0.613 0.945 1.229 1.476 1.724 1.959 2.171 2.531 2.691 2.846 3.003 3.27 3.406 3.66 3.915 4.163 4.285 4.534 4.775 5.109 5.322 5.537 5.841 6.127 6.399 6.671 6.945 7.296 7.643 7.986 8.396 8.785 9.165 9.636 10.168 10.646 11.162 11.726 12.347 13.004 13.772 14.683 15.577 16.632 17.825 19.226 20.816 22.689 24.954 27.684 29.822 30.956 31.543 31.833 31.964 31.936 31.847 31.741 31.579 31.401 31.22 31.016 30.814 30.626 30.44 30.236 30.041 29.848 29.618 29.393 29.201 28.991 28.781 28.609 28.429 28.232 28.022 27.799 27.638 27.475 27.212 27.014 26.797 26.694 26.488 26.264 26.03 25.904 25.664 25.448 25.281 25.127 24.771 24.554 24.298 24.0 23.668 23.275 22.774 21.408 -8 ,31309 ,TETRA ,17586152,Sat Nov 27 16:05:19 CET,Sat Nov 27 17:51:32 CET,0.0 0.491 0.774 1.035 1.296 1.55 1.77 1.97 2.341 2.497 2.65 2.856 3.147 3.292 3.567 3.848 4.121 4.25 4.493 4.733 5.059 5.271 5.49 5.796 6.087 6.38 6.663 6.936 7.289 7.637 7.972 8.354 8.729 9.104 9.529 10.002 10.465 10.98 11.555 12.182 12.843 13.589 14.468 15.354 16.404 17.594 18.985 20.561 22.406 24.576 27.129 29.197 30.377 31.037 31.434 31.681 31.745 31.698 31.611 31.502 31.382 31.235 31.059 30.878 30.706 30.537 30.346 30.164 30.002 29.808 29.605 29.439 29.257 29.054 28.884 28.698 28.487 28.262 28.02 27.855 27.693 27.412 27.199 26.978 26.866 26.632 26.363 26.082 25.937 25.69 25.477 25.294 25.099 24.687 24.471 24.237 23.946 23.618 23.248 22.776 21.543 -9 ,8355 ,TETRA ,17586153,Sat Nov 27 16:05:19 CET,Sat Nov 27 17:51:04 CET,0.0 0.647 1.02 1.295 1.516 1.717 1.903 2.088 2.419 2.574 2.739 2.936 3.217 3.37 3.68 3.97 4.235 4.356 4.596 4.841 5.196 5.415 5.621 5.921 6.215 6.505 6.805 7.093 7.444 7.788 8.132 8.547 8.952 9.34 9.779 10.28 10.76 11.291 11.871 12.504 13.174 13.918 14.796 15.669 16.692 17.866 19.219 20.793 22.684 24.889 27.552 29.716 30.91 31.628 32.018 32.151 32.178 32.173 32.121 32.007 31.851 31.671 31.491 31.316 31.114 30.918 30.692 30.481 30.294 30.088 29.882 29.695 29.471 29.243 29.081 28.903 28.72 28.521 28.305 28.163 28.008 27.755 27.587 27.405 27.302 27.078 26.848 26.596 26.455 26.209 26.01 25.854 25.696 25.342 25.142 24.929 24.658 24.33 23.931 23.435 22.033 -10 ,32001 ,TETRA ,17586154,Sat Nov 27 16:05:20 CET,Sat Nov 27 17:52:52 CET,0.0 0.911 1.322 1.607 1.844 2.056 2.25 2.418 2.744 2.909 3.069 3.243 3.517 3.653 3.914 4.164 4.423 4.557 4.809 5.039 5.364 5.58 5.787 6.091 6.386 6.671 6.947 7.203 7.555 7.892 8.211 8.61 8.982 9.345 9.801 10.326 10.822 11.371 11.958 12.587 13.258 14.007 14.895 15.798 16.865 18.076 19.471 21.09 22.986 25.146 27.702 29.734 30.875 31.581 31.978 32.17 32.232 32.222 32.163 32.035 31.876 31.691 31.472 31.27 31.097 30.923 30.732 30.562 30.401 30.212 30.011 29.844 29.661 29.458 29.287 29.116 28.94 28.75 28.542 28.379 28.203 27.936 27.744 27.534 27.425 27.213 26.99 26.74 26.612 26.383 26.206 26.049 25.87 25.477 25.259 25.009 24.733 24.435 24.103 23.609 22.113 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt deleted file mode 100644 index 7aaddc06..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19821 ,TETRA ,17586155,Sat Nov 27 16:05:19 CET,Sat Nov 27 17:50:14 CET,0.0 0.877 1.314 1.664 1.969 2.255 2.526 2.764 3.207 3.416 3.614 3.894 4.172 4.341 4.677 5.004 5.329 5.486 5.786 6.078 6.507 6.772 7.03 7.396 7.75 8.099 8.441 8.795 9.258 9.704 10.129 10.63 11.115 11.596 12.168 12.835 13.489 14.211 15.011 15.871 16.776 17.8 19.021 20.292 21.781 23.468 25.534 27.884 30.68 34.133 38.378 42.0 44.172 45.556 46.467 47.106 47.559 47.864 48.023 48.127 48.197 48.239 48.23 48.198 48.183 48.168 48.138 48.094 48.041 47.975 47.902 47.824 47.721 47.599 47.496 47.407 47.316 47.195 47.055 46.968 46.886 46.749 46.648 46.52 46.448 46.31 46.161 45.989 45.901 45.773 45.611 45.487 45.355 45.072 44.929 44.753 44.545 44.331 44.075 43.74 43.143 -2 ,15465 ,TETRA ,17586156,Sat Nov 27 16:05:22 CET,Sat Nov 27 17:51:18 CET,0.0 1.316 1.809 2.194 2.496 2.76 2.992 3.221 3.673 3.884 4.077 4.336 4.621 4.799 5.153 5.502 5.826 5.978 6.275 6.568 6.982 7.243 7.513 7.921 8.295 8.657 9.013 9.348 9.781 10.214 10.641 11.157 11.659 12.134 12.707 13.369 14.002 14.739 15.546 16.385 17.3 18.352 19.569 20.804 22.293 24.013 26.036 28.421 31.327 34.762 39.006 42.619 44.809 46.232 47.203 47.905 48.368 48.69 48.898 49.058 49.174 49.225 49.242 49.247 49.215 49.168 49.102 49.04 48.993 48.945 48.883 48.815 48.74 48.651 48.583 48.512 48.421 48.313 48.19 48.096 48.006 47.843 47.721 47.606 47.537 47.406 47.274 47.125 47.042 46.903 46.77 46.675 46.563 46.296 46.14 45.985 45.823 45.627 45.366 44.953 43.56 -3 ,20813 ,TETRA ,17586157,Sat Nov 27 16:05:22 CET,Sat Nov 27 17:51:14 CET,0.0 1.234 1.706 2.117 2.446 2.719 2.981 3.237 3.682 3.883 4.079 4.356 4.639 4.819 5.177 5.515 5.833 5.983 6.265 6.55 6.964 7.23 7.496 7.881 8.245 8.6 8.953 9.311 9.782 10.226 10.665 11.189 11.704 12.219 12.797 13.449 14.107 14.859 15.671 16.53 17.449 18.484 19.693 20.943 22.456 24.203 26.246 28.57 31.348 34.782 39.164 42.843 45.018 46.363 47.273 47.933 48.391 48.711 48.91 49.063 49.165 49.217 49.246 49.247 49.206 49.15 49.097 49.045 48.988 48.922 48.823 48.719 48.622 48.522 48.438 48.342 48.235 48.117 47.985 47.883 47.779 47.627 47.513 47.388 47.321 47.184 47.062 46.936 46.861 46.737 46.603 46.505 46.399 46.126 45.965 45.802 45.635 45.464 45.214 44.808 43.784 -4 ,32504 ,TETRA ,17586158,Sat Nov 27 16:05:22 CET,Sat Nov 27 17:52:20 CET,0.0 1.181 1.624 2.003 2.316 2.584 2.842 3.08 3.492 3.677 3.856 4.108 4.383 4.554 4.878 5.188 5.492 5.645 5.955 6.239 6.643 6.916 7.178 7.551 7.913 8.276 8.632 8.97 9.407 9.837 10.257 10.778 11.287 11.784 12.366 13.021 13.662 14.377 15.169 16.022 16.909 17.928 19.134 20.391 21.888 23.56 25.589 27.942 30.76 34.202 38.474 42.062 44.237 45.657 46.609 47.29 47.735 48.075 48.306 48.462 48.569 48.634 48.664 48.676 48.669 48.629 48.57 48.518 48.467 48.405 48.323 48.251 48.159 48.048 47.964 47.861 47.743 47.629 47.509 47.425 47.333 47.179 47.058 46.921 46.853 46.718 46.564 46.379 46.282 46.133 45.95 45.842 45.715 45.398 45.232 45.06 44.864 44.644 44.392 44.038 43.032 -5 ,22722 ,TETRA ,17586159,Sat Nov 27 16:05:24 CET,Sat Nov 27 17:52:25 CET,0.0 0.899 1.329 1.676 1.987 2.267 2.517 2.75 3.164 3.361 3.577 3.875 4.162 4.346 4.687 5.015 5.333 5.482 5.781 6.063 6.463 6.732 7.0 7.387 7.755 8.122 8.471 8.814 9.265 9.705 10.162 10.709 11.214 11.716 12.301 12.962 13.62 14.339 15.098 15.926 16.817 17.869 19.153 20.466 22.021 23.76 25.813 28.142 30.904 34.297 38.526 42.128 44.352 45.826 46.76 47.405 47.877 48.203 48.414 48.568 48.663 48.68 48.657 48.642 48.607 48.56 48.492 48.413 48.352 48.276 48.182 48.114 48.034 47.937 47.857 47.768 47.666 47.54 47.402 47.314 47.227 47.071 46.967 46.863 46.801 46.653 46.493 46.341 46.253 46.102 45.884 45.74 45.599 45.322 45.169 45.009 44.825 44.605 44.366 44.038 43.055 -6 ,27605 ,TETRA ,17586160,Sat Nov 27 16:05:22 CET,Sat Nov 27 17:54:28 CET,0.0 0.871 1.268 1.597 1.943 2.242 2.501 2.758 3.216 3.427 3.637 3.926 4.21 4.387 4.719 5.039 5.358 5.512 5.815 6.107 6.529 6.801 7.076 7.477 7.844 8.204 8.551 8.887 9.333 9.77 10.197 10.711 11.223 11.73 12.307 12.978 13.662 14.399 15.182 16.037 16.942 17.971 19.175 20.407 21.892 23.595 25.622 27.927 30.598 33.917 38.2 41.924 44.179 45.668 46.629 47.299 47.789 48.12 48.351 48.519 48.589 48.613 48.637 48.629 48.591 48.558 48.529 48.488 48.433 48.356 48.261 48.176 48.079 47.98 47.902 47.816 47.729 47.639 47.536 47.446 47.349 47.197 47.089 46.988 46.931 46.8 46.666 46.516 46.436 46.302 46.138 46.032 45.912 45.651 45.523 45.364 45.176 44.981 44.747 44.391 43.395 -7 ,28450 ,TETRA ,17586161,Sat Nov 27 16:05:22 CET,Sat Nov 27 17:51:59 CET,0.0 1.365 1.805 2.159 2.485 2.78 3.033 3.274 3.718 3.911 4.112 4.401 4.69 4.873 5.209 5.527 5.835 5.986 6.276 6.544 6.928 7.188 7.444 7.838 8.21 8.557 8.904 9.248 9.714 10.161 10.59 11.116 11.623 12.103 12.658 13.287 13.923 14.65 15.448 16.297 17.197 18.245 19.485 20.737 22.219 23.907 25.88 28.232 31.094 34.486 38.757 42.446 44.683 46.11 47.056 47.711 48.136 48.431 48.646 48.794 48.866 48.915 48.947 48.96 48.951 48.927 48.891 48.854 48.815 48.763 48.689 48.618 48.53 48.408 48.311 48.208 48.098 47.996 47.879 47.792 47.69 47.51 47.379 47.245 47.183 47.052 46.908 46.75 46.663 46.525 46.357 46.241 46.128 45.885 45.743 45.582 45.399 45.188 44.933 44.542 43.175 -8 ,17572 ,TETRA ,17586162,Sat Nov 27 16:05:23 CET,Sat Nov 27 17:50:50 CET,0.0 1.014 1.461 1.791 2.08 2.347 2.597 2.836 3.277 3.49 3.697 3.957 4.234 4.403 4.715 5.027 5.339 5.493 5.787 6.076 6.494 6.765 7.023 7.391 7.751 8.1 8.446 8.797 9.27 9.739 10.181 10.687 11.188 11.701 12.292 12.935 13.565 14.281 15.081 15.944 16.855 17.912 19.19 20.492 22.001 23.727 25.762 28.116 31.034 34.578 38.912 42.676 44.941 46.364 47.328 48.018 48.504 48.854 49.063 49.214 49.34 49.412 49.44 49.449 49.434 49.403 49.341 49.27 49.195 49.114 49.045 48.978 48.891 48.798 48.723 48.633 48.533 48.418 48.29 48.209 48.113 47.946 47.84 47.735 47.673 47.53 47.381 47.226 47.143 47.001 46.833 46.72 46.586 46.308 46.166 45.984 45.78 45.56 45.281 44.914 43.954 -9 ,3290 ,TETRA ,17586163,Sat Nov 27 16:05:25 CET,Sat Nov 27 17:51:21 CET,0.0 1.068 1.528 1.889 2.182 2.46 2.719 2.969 3.41 3.611 3.813 4.064 4.339 4.508 4.825 5.143 5.465 5.622 5.921 6.214 6.632 6.898 7.162 7.537 7.902 8.273 8.635 8.989 9.452 9.908 10.338 10.857 11.374 11.881 12.472 13.144 13.808 14.533 15.325 16.171 17.071 18.116 19.36 20.634 22.177 23.93 25.932 28.289 31.118 34.553 38.961 42.707 44.947 46.367 47.355 48.074 48.53 48.872 49.142 49.335 49.422 49.47 49.498 49.484 49.458 49.44 49.398 49.332 49.27 49.205 49.13 49.055 48.974 48.888 48.812 48.729 48.641 48.54 48.429 48.344 48.249 48.101 47.994 47.885 47.825 47.688 47.546 47.396 47.317 47.19 47.051 46.948 46.838 46.601 46.465 46.311 46.121 45.911 45.646 45.289 44.457 -10 ,974 ,TETRA ,17586164,Sat Nov 27 16:05:22 CET,Sat Nov 27 17:49:40 CET,0.0 0.818 1.221 1.566 1.858 2.104 2.368 2.619 3.046 3.244 3.445 3.72 4.006 4.186 4.525 4.859 5.174 5.323 5.614 5.9 6.321 6.595 6.867 7.272 7.663 8.035 8.39 8.735 9.183 9.625 10.061 10.579 11.089 11.595 12.165 12.791 13.416 14.116 14.878 15.726 16.641 17.676 18.935 20.236 21.741 23.438 25.454 27.833 30.696 34.186 38.487 42.14 44.352 45.837 46.85 47.543 48.019 48.339 48.554 48.714 48.788 48.824 48.855 48.857 48.843 48.811 48.745 48.669 48.599 48.516 48.419 48.326 48.208 48.075 47.987 47.908 47.802 47.678 47.55 47.456 47.35 47.176 47.048 46.903 46.834 46.694 46.535 46.349 46.246 46.103 45.953 45.839 45.712 45.454 45.335 45.22 45.065 44.835 44.52 44.13 43.151 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt deleted file mode 100644 index cac0370f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8049 ,TETRA ,17586165,Sat Nov 27 16:05:22 CET,Sat Nov 27 17:51:05 CET,0.0 0.68 1.006 1.262 1.501 1.684 1.853 2.016 2.319 2.458 2.583 2.707 2.909 3.009 3.195 3.365 3.533 3.618 3.776 3.924 4.135 4.262 4.375 4.538 4.7 4.848 4.996 5.141 5.321 5.488 5.642 5.82 5.978 6.144 6.337 6.53 6.701 6.866 7.027 7.196 7.383 7.591 7.796 7.965 8.117 8.245 8.356 8.364 8.198 7.74 6.598 4.936 3.43 2.094 0.968 -0.035 -0.941 -1.739 -2.401 -3.063 -3.629 -4.144 -4.648 -5.117 -5.55 -5.957 -6.396 -6.789 -7.121 -7.445 -7.776 -8.072 -8.375 -8.682 -8.935 -9.185 -9.428 -9.688 -9.961 -10.148 -10.341 -10.647 -10.863 -11.097 -11.22 -11.463 -11.692 -11.926 -12.063 -12.323 -12.518 -12.672 -12.82 -13.159 -13.348 -13.551 -13.787 -14.027 -14.3 -14.67 -15.372 -2 ,12769 ,TETRA ,17586166,Sat Nov 27 16:05:25 CET,Sat Nov 27 17:49:39 CET,0.0 0.784 1.145 1.442 1.697 1.895 2.056 2.216 2.516 2.65 2.779 2.902 3.105 3.21 3.421 3.611 3.786 3.864 4.007 4.167 4.389 4.515 4.641 4.823 4.989 5.146 5.303 5.456 5.643 5.803 5.952 6.135 6.296 6.464 6.661 6.852 7.027 7.226 7.442 7.663 7.873 8.088 8.322 8.523 8.696 8.807 8.9 8.967 8.86 8.396 7.328 5.856 4.438 3.131 2.002 1.018 0.146 -0.658 -1.323 -1.972 -2.537 -3.04 -3.52 -3.971 -4.398 -4.788 -5.184 -5.544 -5.86 -6.185 -6.535 -6.826 -7.126 -7.448 -7.689 -7.935 -8.208 -8.489 -8.769 -8.96 -9.152 -9.445 -9.651 -9.879 -10.004 -10.253 -10.491 -10.742 -10.883 -11.141 -11.34 -11.501 -11.666 -11.998 -12.184 -12.41 -12.653 -12.92 -13.235 -13.614 -14.474 -3 ,5567 ,TETRA ,17586167,Sat Nov 27 16:06:19 CET,Sat Nov 27 17:51:33 CET,0.0 0.958 1.293 1.566 1.797 1.977 2.157 2.32 2.571 2.693 2.815 2.923 3.134 3.24 3.425 3.611 3.79 3.866 4.008 4.151 4.356 4.486 4.602 4.767 4.934 5.099 5.248 5.381 5.564 5.731 5.881 6.081 6.281 6.455 6.646 6.835 7.0 7.188 7.377 7.555 7.72 7.882 8.023 8.148 8.265 8.345 8.379 8.38 8.279 7.884 6.803 5.176 3.744 2.507 1.407 0.411 -0.447 -1.215 -1.894 -2.601 -3.203 -3.721 -4.204 -4.668 -5.107 -5.498 -5.899 -6.264 -6.579 -6.907 -7.241 -7.516 -7.815 -8.149 -8.397 -8.647 -8.916 -9.176 -9.433 -9.628 -9.839 -10.154 -10.363 -10.579 -10.7 -10.945 -11.17 -11.399 -11.53 -11.781 -11.946 -12.092 -12.247 -12.605 -12.795 -12.99 -13.226 -13.478 -13.752 -14.083 -14.82 -4 ,154 ,TETRA ,17586168,Sat Nov 27 16:06:22 CET,Sat Nov 27 17:52:30 CET,0.0 0.968 1.259 1.501 1.758 1.97 2.151 2.307 2.56 2.679 2.798 2.942 3.156 3.251 3.441 3.622 3.787 3.867 4.032 4.185 4.39 4.536 4.674 4.839 4.987 5.142 5.291 5.435 5.62 5.777 5.919 6.106 6.281 6.445 6.647 6.846 7.008 7.175 7.351 7.534 7.734 7.951 8.148 8.285 8.405 8.524 8.572 8.539 8.353 7.863 6.829 5.275 3.893 2.682 1.595 0.61 -0.253 -1.044 -1.738 -2.433 -3.019 -3.529 -4.028 -4.504 -4.929 -5.327 -5.744 -6.109 -6.422 -6.74 -7.084 -7.381 -7.693 -8.008 -8.24 -8.481 -8.747 -9.026 -9.3 -9.482 -9.666 -9.96 -10.181 -10.409 -10.523 -10.758 -10.999 -11.256 -11.394 -11.659 -11.862 -12.016 -12.184 -12.529 -12.71 -12.91 -13.108 -13.311 -13.562 -13.943 -14.668 -5 ,7828 ,TETRA ,17586169,Sat Nov 27 16:06:19 CET,Sat Nov 27 17:52:35 CET,0.0 1.006 1.421 1.715 1.969 2.195 2.36 2.515 2.815 2.939 3.052 3.165 3.369 3.468 3.667 3.851 4.017 4.104 4.261 4.404 4.618 4.752 4.882 5.062 5.234 5.391 5.542 5.675 5.826 5.988 6.163 6.37 6.544 6.701 6.873 7.071 7.271 7.475 7.678 7.874 8.048 8.238 8.48 8.691 8.863 8.996 9.072 9.052 8.85 8.301 7.109 5.486 4.092 2.865 1.77 0.758 -0.117 -0.887 -1.57 -2.226 -2.776 -3.277 -3.755 -4.214 -4.643 -5.048 -5.475 -5.848 -6.173 -6.493 -6.837 -7.138 -7.43 -7.72 -7.949 -8.194 -8.462 -8.736 -9.017 -9.216 -9.414 -9.72 -9.934 -10.157 -10.269 -10.497 -10.735 -10.988 -11.123 -11.377 -11.551 -11.699 -11.868 -12.263 -12.448 -12.634 -12.878 -13.15 -13.447 -13.84 -14.817 -6 ,27751 ,TETRA ,17586170,Sat Nov 27 16:06:19 CET,Sat Nov 27 17:51:56 CET,0.0 0.697 1.029 1.279 1.513 1.719 1.888 2.044 2.324 2.45 2.571 2.687 2.892 2.993 3.196 3.386 3.547 3.626 3.783 3.919 4.111 4.245 4.362 4.517 4.672 4.823 4.967 5.11 5.3 5.484 5.652 5.832 6.004 6.172 6.355 6.546 6.732 6.923 7.099 7.282 7.485 7.707 7.913 8.062 8.189 8.287 8.371 8.393 8.193 7.69 6.59 4.953 3.515 2.264 1.111 0.06 -0.831 -1.634 -2.355 -3.065 -3.644 -4.159 -4.662 -5.133 -5.569 -5.961 -6.367 -6.731 -7.055 -7.374 -7.687 -7.963 -8.256 -8.552 -8.784 -9.029 -9.284 -9.548 -9.83 -10.021 -10.205 -10.501 -10.717 -10.946 -11.066 -11.312 -11.563 -11.811 -11.934 -12.177 -12.323 -12.47 -12.637 -12.993 -13.19 -13.413 -13.662 -13.923 -14.228 -14.618 -15.299 -7 ,15993 ,TETRA ,17586171,Sat Nov 27 16:06:20 CET,Sat Nov 27 17:51:53 CET,0.0 0.6 0.968 1.258 1.488 1.695 1.865 2.011 2.302 2.428 2.542 2.676 2.886 2.989 3.18 3.372 3.56 3.643 3.798 3.939 4.143 4.27 4.388 4.571 4.743 4.89 5.032 5.174 5.35 5.525 5.681 5.851 6.029 6.192 6.36 6.543 6.731 6.944 7.145 7.323 7.491 7.665 7.86 8.026 8.152 8.237 8.297 8.282 8.075 7.62 6.592 5.042 3.638 2.393 1.296 0.311 -0.538 -1.309 -1.996 -2.699 -3.31 -3.841 -4.347 -4.828 -5.279 -5.7 -6.14 -6.519 -6.845 -7.18 -7.509 -7.786 -8.081 -8.393 -8.635 -8.885 -9.14 -9.396 -9.661 -9.853 -10.062 -10.372 -10.573 -10.772 -10.881 -11.125 -11.386 -11.669 -11.811 -12.073 -12.275 -12.425 -12.59 -12.978 -13.192 -13.407 -13.636 -13.886 -14.189 -14.613 -15.402 -8 ,21098 ,TETRA ,17586172,Sat Nov 27 16:06:19 CET,Sat Nov 27 17:52:01 CET,0.0 0.867 1.226 1.533 1.768 1.966 2.147 2.312 2.626 2.774 2.901 3.009 3.216 3.324 3.511 3.685 3.851 3.928 4.081 4.231 4.444 4.58 4.708 4.876 5.028 5.174 5.315 5.455 5.642 5.812 5.962 6.15 6.319 6.464 6.638 6.829 7.005 7.206 7.418 7.614 7.788 7.966 8.155 8.325 8.485 8.619 8.729 8.713 8.459 7.973 6.949 5.406 3.977 2.738 1.688 0.696 -0.188 -0.978 -1.648 -2.324 -2.918 -3.435 -3.926 -4.394 -4.821 -5.2 -5.621 -6.009 -6.341 -6.692 -7.053 -7.353 -7.663 -7.981 -8.22 -8.461 -8.721 -8.981 -9.261 -9.452 -9.641 -9.932 -10.131 -10.348 -10.461 -10.692 -10.925 -11.185 -11.316 -11.555 -11.707 -11.842 -11.988 -12.358 -12.562 -12.766 -12.978 -13.222 -13.47 -13.756 -14.357 -9 ,12157 ,TETRA ,17586173,Sat Nov 27 16:06:21 CET,Sat Nov 27 17:53:43 CET,0.0 0.627 0.93 1.206 1.471 1.686 1.862 2.011 2.275 2.406 2.537 2.677 2.892 3.002 3.202 3.384 3.56 3.635 3.77 3.916 4.132 4.267 4.401 4.592 4.766 4.925 5.078 5.226 5.401 5.578 5.77 5.989 6.165 6.336 6.534 6.724 6.893 7.074 7.27 7.451 7.612 7.797 7.999 8.168 8.322 8.44 8.464 8.373 8.154 7.634 6.558 5.036 3.613 2.366 1.272 0.305 -0.533 -1.3 -1.967 -2.627 -3.194 -3.708 -4.2 -4.677 -5.13 -5.547 -5.974 -6.349 -6.688 -7.048 -7.402 -7.678 -7.955 -8.241 -8.473 -8.728 -8.998 -9.277 -9.574 -9.78 -9.981 -10.286 -10.506 -10.739 -10.857 -11.107 -11.36 -11.621 -11.762 -12.014 -12.192 -12.348 -12.518 -12.885 -13.074 -13.261 -13.47 -13.704 -13.972 -14.303 -15.17 -10 ,1962 ,TETRA ,17586174,Sat Nov 27 16:06:20 CET,Sat Nov 27 17:52:36 CET,0.0 0.753 1.093 1.365 1.602 1.793 1.961 2.115 2.373 2.497 2.619 2.744 2.94 3.038 3.24 3.415 3.568 3.642 3.801 3.957 4.162 4.286 4.411 4.585 4.749 4.907 5.05 5.187 5.361 5.516 5.663 5.854 6.04 6.207 6.383 6.571 6.749 6.929 7.108 7.297 7.501 7.727 7.927 8.07 8.213 8.363 8.474 8.464 8.263 7.788 6.71 5.084 3.671 2.433 1.346 0.371 -0.489 -1.263 -1.933 -2.622 -3.24 -3.768 -4.248 -4.709 -5.139 -5.523 -5.913 -6.26 -6.569 -6.884 -7.225 -7.526 -7.834 -8.149 -8.388 -8.624 -8.86 -9.112 -9.37 -9.555 -9.754 -10.054 -10.273 -10.513 -10.627 -10.866 -11.098 -11.347 -11.488 -11.76 -11.981 -12.148 -12.323 -12.702 -12.911 -13.119 -13.366 -13.62 -13.947 -14.339 -15.111 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt deleted file mode 100644 index bacd3e5a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26422 ,TETRA ,17586175,Sat Nov 27 16:06:20 CET,Sat Nov 27 17:54:31 CET,0.0 0.746 1.25 1.637 1.955 2.245 2.528 2.799 3.321 3.571 3.804 4.043 4.45 4.657 5.059 5.437 5.794 5.973 6.327 6.664 7.153 7.482 7.802 8.271 8.737 9.188 9.622 10.042 10.612 11.18 11.718 12.36 12.995 13.622 14.355 15.19 15.994 16.887 17.875 18.968 20.129 21.445 23.008 24.605 26.522 28.754 31.419 34.539 38.336 43.065 49.168 54.529 57.971 60.396 62.166 63.5 64.489 65.224 65.746 66.195 66.517 66.775 66.965 67.117 67.256 67.325 67.368 67.4 67.408 67.41 67.413 67.398 67.367 67.322 67.268 67.198 67.113 67.01 66.908 66.831 66.74 66.603 66.514 66.423 66.371 66.246 66.101 65.94 65.857 65.632 65.539 65.416 65.3 65.052 64.887 64.694 64.494 64.265 63.982 63.626 63.04 -2 ,26971 ,TETRA ,17586176,Sat Nov 27 16:06:22 CET,Sat Nov 27 17:54:32 CET,0.0 0.681 1.201 1.584 1.927 2.254 2.554 2.835 3.336 3.561 3.776 3.991 4.396 4.602 4.993 5.367 5.74 5.925 6.28 6.629 7.153 7.487 7.809 8.286 8.738 9.18 9.625 10.064 10.626 11.176 11.731 12.401 13.047 13.686 14.441 15.282 16.098 17.006 17.994 19.078 20.255 21.592 23.146 24.742 26.675 28.895 31.511 34.588 38.377 43.095 49.163 54.595 58.065 60.488 62.251 63.569 64.546 65.277 65.816 66.254 66.576 66.852 67.079 67.254 67.39 67.493 67.562 67.584 67.588 67.588 67.575 67.537 67.503 67.478 67.435 67.377 67.311 67.233 67.129 67.051 66.98 66.853 66.75 66.641 66.583 66.46 66.314 66.147 66.07 65.862 65.817 65.729 65.629 65.398 65.277 65.118 64.917 64.702 64.457 64.078 63.15 -3 ,469 ,TETRA ,17586177,Sat Nov 27 16:06:20 CET,Sat Nov 27 17:53:53 CET,0.0 0.761 1.229 1.649 1.984 2.282 2.57 2.836 3.306 3.531 3.767 4.013 4.415 4.624 5.011 5.385 5.772 5.956 6.315 6.666 7.164 7.482 7.806 8.298 8.779 9.238 9.681 10.109 10.676 11.247 11.791 12.449 13.1 13.732 14.462 15.296 16.107 16.992 17.969 19.044 20.213 21.579 23.196 24.833 26.774 29.035 31.737 34.822 38.599 43.29 49.22 54.55 58.058 60.476 62.177 63.507 64.497 65.252 65.819 66.317 66.673 66.933 67.145 67.314 67.442 67.518 67.551 67.568 67.591 67.598 67.581 67.557 67.506 67.456 67.428 67.372 67.306 67.25 67.166 67.098 67.017 66.877 66.778 66.661 66.596 66.464 66.325 66.168 66.077 65.861 65.817 65.706 65.575 65.296 65.138 64.969 64.782 64.566 64.316 63.985 63.394 -4 ,27423 ,TETRA ,17586178,Sat Nov 27 16:06:20 CET,Sat Nov 27 17:53:51 CET,0.0 0.845 1.293 1.628 1.936 2.24 2.543 2.809 3.296 3.535 3.766 4.02 4.434 4.645 5.048 5.447 5.831 6.009 6.356 6.693 7.184 7.503 7.82 8.299 8.756 9.191 9.614 10.037 10.617 11.173 11.701 12.361 13.012 13.647 14.393 15.223 16.026 16.918 17.899 18.967 20.094 21.392 22.932 24.55 26.526 28.748 31.401 34.522 38.285 42.929 48.887 54.257 57.747 60.184 61.948 63.285 64.236 64.923 65.453 65.952 66.299 66.536 66.752 66.942 67.094 67.227 67.316 67.345 67.366 67.37 67.341 67.316 67.293 67.23 67.156 67.087 67.025 66.943 66.853 66.796 66.715 66.579 66.501 66.425 66.38 66.266 66.142 66.001 65.914 65.691 65.642 65.55 65.449 65.228 65.093 64.914 64.713 64.499 64.261 63.979 63.454 -5 ,15143 ,TETRA ,17586179,Sat Nov 27 16:06:20 CET,Sat Nov 27 17:52:09 CET,0.0 0.805 1.319 1.684 2.005 2.315 2.598 2.872 3.395 3.641 3.873 4.127 4.541 4.752 5.159 5.551 5.929 6.109 6.465 6.819 7.317 7.645 7.967 8.439 8.909 9.376 9.826 10.24 10.778 11.324 11.861 12.509 13.145 13.76 14.49 15.314 16.097 16.981 17.983 19.052 20.183 21.491 23.041 24.646 26.586 28.817 31.461 34.519 38.227 42.906 49.032 54.466 57.839 60.089 61.748 63.018 63.942 64.637 65.139 65.557 65.857 66.113 66.332 66.505 66.641 66.733 66.788 66.798 66.793 66.792 66.782 66.76 66.733 66.706 66.677 66.634 66.575 66.507 66.439 66.39 66.325 66.206 66.115 66.008 65.952 65.836 65.706 65.546 65.463 65.248 65.175 65.066 64.959 64.714 64.574 64.416 64.232 64.035 63.815 63.456 62.633 -6 ,6113 ,TETRA ,17586181,Sat Nov 27 16:06:20 CET,Sat Nov 27 17:54:57 CET,0.0 0.803 1.226 1.62 1.956 2.238 2.518 2.794 3.296 3.535 3.768 4.005 4.403 4.602 5.009 5.402 5.779 5.967 6.323 6.68 7.21 7.542 7.866 8.35 8.81 9.251 9.692 10.131 10.705 11.249 11.775 12.417 13.039 13.668 14.423 15.261 16.068 16.989 18.011 19.113 20.292 21.628 23.206 24.814 26.729 28.962 31.666 34.826 38.627 43.329 49.376 54.746 58.195 60.535 62.162 63.338 64.177 64.846 65.398 65.874 66.188 66.409 66.582 66.734 66.856 66.947 67.02 67.062 67.094 67.121 67.113 67.077 67.031 66.968 66.903 66.848 66.795 66.71 66.607 66.544 66.47 66.333 66.24 66.123 66.056 65.925 65.774 65.626 65.558 65.334 65.234 65.126 65.02 64.76 64.607 64.43 64.228 64.02 63.773 63.452 62.744 -7 ,10607 ,TETRA ,17586182,Sat Nov 27 16:06:22 CET,Sat Nov 27 17:52:32 CET,0.0 0.719 1.14 1.518 1.859 2.173 2.476 2.743 3.219 3.449 3.686 3.956 4.36 4.563 4.981 5.395 5.782 5.965 6.34 6.699 7.192 7.524 7.848 8.316 8.768 9.204 9.624 10.033 10.596 11.136 11.647 12.285 12.923 13.548 14.277 15.11 15.935 16.883 17.913 19.001 20.156 21.507 23.128 24.749 26.686 28.92 31.575 34.678 38.463 43.212 49.245 54.626 58.174 60.668 62.434 63.742 64.691 65.4 65.926 66.392 66.717 66.961 67.166 67.307 67.413 67.5 67.57 67.601 67.626 67.662 67.665 67.646 67.61 67.555 67.511 67.462 67.388 67.302 67.217 67.152 67.077 66.962 66.886 66.785 66.725 66.618 66.509 66.369 66.279 66.06 66.032 65.934 65.824 65.55 65.393 65.227 65.041 64.846 64.594 64.222 63.549 -8 ,14794 ,TETRA ,17586183,Sat Nov 27 16:06:22 CET,Sat Nov 27 17:57:11 CET,0.0 1.1 1.583 1.952 2.277 2.588 2.889 3.164 3.677 3.918 4.141 4.359 4.766 4.978 5.376 5.763 6.147 6.336 6.703 7.059 7.56 7.87 8.187 8.66 9.118 9.568 10.007 10.435 10.984 11.527 12.065 12.722 13.368 14.0 14.755 15.613 16.415 17.319 18.341 19.443 20.613 21.949 23.536 25.15 27.06 29.271 31.946 35.058 38.794 43.393 49.491 55.03 58.456 60.838 62.549 63.822 64.742 65.431 65.947 66.398 66.733 67.009 67.241 67.403 67.529 67.6 67.642 67.681 67.694 67.698 67.684 67.648 67.601 67.544 67.48 67.399 67.308 67.224 67.13 67.055 66.979 66.85 66.754 66.653 66.601 66.494 66.374 66.211 66.119 65.892 65.817 65.713 65.603 65.324 65.171 65.012 64.829 64.603 64.33 63.996 63.439 -9 ,24000 ,TETRA ,17586184,Sat Nov 27 16:06:21 CET,Sat Nov 27 17:55:29 CET,0.0 0.692 1.142 1.51 1.844 2.165 2.441 2.698 3.196 3.44 3.662 3.87 4.269 4.467 4.861 5.245 5.624 5.813 6.176 6.523 7.054 7.402 7.724 8.2 8.671 9.126 9.566 9.994 10.545 11.078 11.598 12.241 12.89 13.52 14.245 15.076 15.901 16.812 17.806 18.898 20.062 21.36 22.923 24.572 26.517 28.751 31.427 34.514 38.296 42.968 49.062 54.614 58.112 60.524 62.257 63.554 64.535 65.284 65.794 66.213 66.53 66.774 66.949 67.076 67.198 67.284 67.317 67.337 67.352 67.358 67.344 67.317 67.279 67.225 67.181 67.131 67.064 66.983 66.899 66.843 66.774 66.645 66.558 66.47 66.425 66.327 66.205 66.076 66.012 65.816 65.806 65.72 65.622 65.397 65.263 65.105 64.924 64.746 64.526 64.217 63.577 -10 ,3792 ,TETRA ,17586185,Sat Nov 27 16:06:24 CET,Sat Nov 27 17:55:44 CET,0.0 0.801 1.281 1.68 1.99 2.275 2.562 2.833 3.336 3.57 3.798 4.044 4.454 4.658 5.052 5.439 5.81 5.994 6.357 6.708 7.214 7.538 7.859 8.321 8.782 9.232 9.67 10.105 10.675 11.213 11.75 12.422 13.066 13.705 14.435 15.236 16.034 16.932 17.905 18.994 20.18 21.521 23.109 24.744 26.702 28.929 31.537 34.618 38.482 43.263 49.356 54.878 58.401 60.765 62.423 63.642 64.537 65.233 65.76 66.203 66.515 66.782 66.989 67.124 67.221 67.297 67.349 67.35 67.346 67.35 67.359 67.356 67.324 67.276 67.224 67.161 67.109 67.062 67.005 66.963 66.908 66.785 66.698 66.6 66.539 66.409 66.276 66.126 66.048 65.843 65.808 65.712 65.606 65.348 65.204 65.038 64.855 64.65 64.4 64.121 63.441 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 60d2a036..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11910 ,TETRA ,17586186,Sat Nov 27 16:06:22 CET,Sat Nov 27 17:52:34 CET,0.0 0.508 0.925 1.274 1.579 1.874 2.149 2.407 2.885 3.112 3.337 3.557 3.959 4.164 4.568 4.968 5.35 5.539 5.926 6.303 6.836 7.183 7.516 8.004 8.49 8.965 9.444 9.918 10.527 11.127 11.729 12.481 13.206 13.917 14.764 15.72 16.655 17.715 18.889 20.181 21.565 23.151 25.079 27.08 29.49 32.297 35.657 39.622 44.623 51.028 59.575 67.407 72.496 76.078 78.687 80.76 82.366 83.658 84.626 85.443 86.07 86.562 86.982 87.341 87.628 87.864 88.081 88.244 88.385 88.519 88.607 88.659 88.703 88.729 88.741 88.739 88.725 88.704 88.679 88.645 88.605 88.527 88.454 88.381 88.342 88.259 88.152 88.012 87.928 87.743 87.675 87.583 87.482 87.246 87.097 86.913 86.707 86.452 86.147 85.734 84.369 -2 ,17407 ,TETRA ,17586187,Sat Nov 27 16:07:20 CET,Sat Nov 27 17:53:41 CET,0.0 0.7 1.098 1.44 1.761 2.041 2.312 2.592 3.114 3.355 3.574 3.795 4.2 4.408 4.818 5.221 5.618 5.808 6.188 6.545 7.074 7.431 7.773 8.283 8.778 9.258 9.734 10.204 10.809 11.394 11.974 12.71 13.448 14.178 15.029 15.998 16.934 17.966 19.123 20.391 21.756 23.353 25.302 27.33 29.779 32.586 35.939 39.961 44.959 51.266 59.73 67.64 72.852 76.584 79.323 81.415 83.019 84.25 85.155 85.987 86.625 87.109 87.515 87.868 88.163 88.408 88.638 88.822 88.968 89.074 89.142 89.198 89.253 89.297 89.309 89.308 89.307 89.283 89.237 89.204 89.158 89.074 89.017 88.95 88.904 88.798 88.679 88.533 88.46 88.282 88.2 88.096 87.973 87.683 87.529 87.36 87.169 86.955 86.66 86.225 85.129 -3 ,22417 ,TETRA ,17586188,Sat Nov 27 16:07:22 CET,Sat Nov 27 17:54:26 CET,0.0 0.653 1.056 1.418 1.741 2.029 2.287 2.537 3.018 3.255 3.478 3.717 4.13 4.334 4.727 5.104 5.482 5.67 6.031 6.392 6.916 7.262 7.613 8.125 8.624 9.105 9.578 10.044 10.651 11.259 11.86 12.593 13.324 14.041 14.892 15.875 16.817 17.854 19.002 20.256 21.592 23.161 25.088 27.083 29.505 32.328 35.736 39.751 44.768 51.216 59.754 67.629 72.77 76.423 79.124 81.231 82.873 84.133 85.106 86.012 86.671 87.18 87.62 87.973 88.261 88.505 88.721 88.881 89.012 89.132 89.228 89.285 89.322 89.355 89.372 89.381 89.369 89.336 89.291 89.256 89.214 89.125 89.059 88.99 88.947 88.823 88.688 88.562 88.488 88.304 88.2 88.09 87.976 87.732 87.577 87.394 87.209 86.977 86.675 86.25 85.287 -4 ,3682 ,TETRA ,17586189,Sat Nov 27 16:07:19 CET,Sat Nov 27 17:53:35 CET,0.0 0.666 0.997 1.279 1.551 1.815 2.06 2.304 2.77 2.999 3.228 3.465 3.873 4.081 4.474 4.852 5.231 5.414 5.775 6.138 6.662 7.002 7.342 7.839 8.324 8.803 9.281 9.756 10.365 10.973 11.586 12.326 13.042 13.744 14.576 15.534 16.476 17.53 18.695 19.972 21.362 22.952 24.84 26.8 29.169 31.97 35.366 39.398 44.438 50.843 59.303 67.155 72.342 76.039 78.746 80.82 82.449 83.753 84.717 85.562 86.223 86.753 87.201 87.566 87.849 88.1 88.347 88.521 88.648 88.756 88.826 88.871 88.92 88.948 88.955 88.952 88.929 88.9 88.882 88.86 88.82 88.727 88.643 88.559 88.518 88.422 88.314 88.192 88.12 87.94 87.834 87.722 87.608 87.327 87.165 86.997 86.818 86.582 86.257 85.763 84.59 -5 ,20323 ,TETRA ,17586190,Sat Nov 27 16:07:22 CET,Sat Nov 27 17:52:48 CET,0.0 0.713 1.089 1.448 1.763 2.035 2.3 2.56 3.051 3.289 3.511 3.727 4.12 4.317 4.711 5.102 5.481 5.669 6.041 6.399 6.934 7.287 7.631 8.138 8.635 9.12 9.596 10.071 10.69 11.305 11.918 12.664 13.389 14.1 14.936 15.901 16.842 17.884 19.046 20.303 21.688 23.332 25.306 27.355 29.787 32.58 35.949 39.944 44.867 51.07 59.483 67.411 72.531 76.064 78.675 80.725 82.323 83.619 84.61 85.489 86.168 86.699 87.124 87.474 87.791 88.068 88.296 88.452 88.576 88.679 88.762 88.812 88.853 88.882 88.899 88.907 88.884 88.849 88.804 88.775 88.743 88.675 88.608 88.519 88.474 88.383 88.275 88.137 88.058 87.869 87.753 87.634 87.516 87.257 87.096 86.905 86.684 86.426 86.129 85.768 84.628 -6 ,16404 ,TETRA ,17586191,Sat Nov 27 16:07:19 CET,Sat Nov 27 17:53:41 CET,0.0 0.886 1.305 1.657 1.946 2.207 2.461 2.713 3.202 3.428 3.645 3.891 4.305 4.52 4.93 5.308 5.684 5.869 6.233 6.599 7.145 7.498 7.84 8.342 8.829 9.302 9.773 10.246 10.869 11.468 12.056 12.779 13.492 14.192 15.031 15.994 16.931 17.992 19.175 20.455 21.841 23.472 25.414 27.436 29.893 32.733 36.134 40.163 45.226 51.66 60.075 67.833 73.011 76.756 79.434 81.462 83.031 84.235 85.171 86.03 86.651 87.134 87.555 87.919 88.239 88.494 88.722 88.903 89.02 89.117 89.199 89.245 89.291 89.322 89.33 89.327 89.308 89.283 89.25 89.214 89.178 89.109 89.042 88.959 88.906 88.793 88.678 88.539 88.452 88.258 88.172 88.069 87.953 87.694 87.541 87.357 87.136 86.884 86.593 86.206 85.204 -7 ,7924 ,TETRA ,17586192,Sat Nov 27 16:07:21 CET,Sat Nov 27 17:52:56 CET,0.0 0.611 0.995 1.322 1.627 1.924 2.191 2.446 2.958 3.201 3.421 3.654 4.057 4.257 4.653 5.039 5.411 5.598 5.969 6.333 6.874 7.22 7.558 8.057 8.546 9.034 9.52 10.006 10.635 11.237 11.826 12.566 13.296 14.006 14.839 15.793 16.727 17.779 18.959 20.245 21.618 23.224 25.156 27.169 29.591 32.388 35.803 39.795 44.774 51.173 59.709 67.552 72.634 76.245 78.857 80.902 82.468 83.673 84.633 85.496 86.138 86.645 87.064 87.414 87.71 87.936 88.133 88.287 88.396 88.492 88.577 88.629 88.669 88.696 88.703 88.688 88.679 88.676 88.636 88.596 88.547 88.46 88.395 88.312 88.269 88.18 88.084 87.959 87.885 87.7 87.59 87.463 87.321 87.049 86.902 86.723 86.534 86.302 86.016 85.62 84.724 -8 ,14556 ,TETRA ,17586193,Sat Nov 27 16:07:21 CET,Sat Nov 27 17:53:33 CET,0.0 0.551 0.957 1.295 1.599 1.917 2.209 2.466 2.958 3.187 3.413 3.664 4.071 4.282 4.691 5.075 5.452 5.642 6.016 6.385 6.928 7.283 7.631 8.119 8.595 9.082 9.571 10.054 10.682 11.289 11.878 12.614 13.339 14.037 14.871 15.832 16.766 17.816 18.974 20.245 21.63 23.219 25.129 27.123 29.528 32.313 35.701 39.741 44.723 51.097 59.695 67.542 72.599 76.209 78.819 80.777 82.281 83.504 84.446 85.278 85.9 86.404 86.836 87.187 87.5 87.759 87.976 88.151 88.29 88.391 88.474 88.545 88.598 88.618 88.628 88.633 88.625 88.61 88.573 88.53 88.489 88.41 88.34 88.274 88.237 88.156 88.059 87.929 87.86 87.69 87.617 87.519 87.393 87.093 86.935 86.737 86.504 86.256 85.903 85.419 84.273 -9 ,16803 ,TETRA ,17586194,Sat Nov 27 16:07:23 CET,Sat Nov 27 17:55:47 CET,0.0 0.533 0.964 1.324 1.646 1.948 2.223 2.483 2.976 3.207 3.429 3.65 4.055 4.264 4.656 5.045 5.43 5.618 5.98 6.344 6.892 7.24 7.588 8.116 8.616 9.092 9.562 10.03 10.642 11.24 11.839 12.582 13.312 14.024 14.856 15.821 16.78 17.849 19.032 20.329 21.72 23.327 25.28 27.294 29.687 32.504 35.941 39.978 44.983 51.377 59.878 67.77 72.987 76.682 79.411 81.497 83.077 84.377 85.375 86.249 86.916 87.438 87.883 88.276 88.614 88.883 89.117 89.272 89.38 89.482 89.58 89.639 89.666 89.688 89.7 89.699 89.685 89.647 89.611 89.589 89.563 89.503 89.448 89.39 89.349 89.239 89.133 89.017 88.947 88.756 88.639 88.525 88.408 88.16 88.019 87.847 87.626 87.377 87.086 86.658 85.392 -10 ,29265 ,TETRA ,17586195,Sat Nov 27 16:07:25 CET,Sat Nov 27 17:53:28 CET,0.0 0.58 1.004 1.369 1.703 1.988 2.256 2.511 2.99 3.227 3.465 3.723 4.139 4.354 4.757 5.151 5.528 5.711 6.074 6.445 6.993 7.335 7.673 8.171 8.655 9.147 9.624 10.075 10.684 11.279 11.861 12.576 13.284 14.008 14.862 15.807 16.721 17.758 18.914 20.189 21.558 23.14 25.067 27.064 29.483 32.325 35.737 39.745 44.712 51.019 59.364 67.034 72.109 75.717 78.343 80.359 81.944 83.236 84.207 85.07 85.715 86.223 86.654 87.024 87.327 87.555 87.765 87.92 88.051 88.172 88.261 88.313 88.343 88.358 88.366 88.356 88.345 88.333 88.304 88.268 88.213 88.133 88.081 88.014 87.969 87.864 87.744 87.601 87.521 87.337 87.241 87.135 87.02 86.767 86.631 86.46 86.257 86.036 85.745 85.325 84.383 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt deleted file mode 100644 index 631fda7f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10893 ,TETRA ,17586196,Sat Nov 27 16:07:21 CET,Sat Nov 27 17:54:11 CET,0.0 0.81 1.319 1.735 2.135 2.493 2.802 3.097 3.656 3.918 4.173 4.473 4.895 5.118 5.566 5.993 6.423 6.638 7.051 7.441 7.983 8.326 8.658 9.149 9.639 10.123 10.597 11.065 11.67 12.259 12.836 13.525 14.2 14.875 15.686 16.588 17.452 18.427 19.499 20.679 21.944 23.396 25.181 27.036 29.213 31.717 34.776 38.419 42.835 48.258 55.429 61.931 66.096 69.014 71.048 72.561 73.745 74.714 75.399 75.961 76.405 76.753 77.035 77.27 77.438 77.557 77.668 77.751 77.8 77.839 77.878 77.886 77.882 77.88 77.867 77.834 77.793 77.745 77.692 77.638 77.572 77.464 77.384 77.295 77.245 77.129 77.003 76.864 76.773 76.575 76.52 76.398 76.259 75.978 75.824 75.646 75.441 75.179 74.853 74.407 73.347 -2 ,12845 ,TETRA ,17586197,Sat Nov 27 16:07:22 CET,Sat Nov 27 17:53:37 CET,0.0 1.237 1.78 2.187 2.572 2.913 3.22 3.535 4.112 4.359 4.597 4.854 5.263 5.472 5.882 6.284 6.679 6.873 7.254 7.624 8.177 8.539 8.88 9.371 9.852 10.33 10.79 11.234 11.83 12.408 12.959 13.647 14.339 15.012 15.799 16.711 17.597 18.591 19.675 20.84 22.12 23.609 25.394 27.217 29.379 31.901 34.928 38.507 42.883 48.324 55.56 62.267 66.614 69.648 71.861 73.564 74.827 75.762 76.44 77.05 77.508 77.848 78.13 78.355 78.538 78.668 78.766 78.844 78.896 78.913 78.911 78.912 78.899 78.866 78.824 78.77 78.716 78.647 78.554 78.49 78.416 78.296 78.21 78.114 78.065 77.943 77.789 77.634 77.554 77.35 77.274 77.149 77.008 76.723 76.586 76.427 76.205 75.944 75.632 75.256 74.32 -3 ,25564 ,TETRA ,17586198,Sat Nov 27 16:07:21 CET,Sat Nov 27 17:53:21 CET,0.0 0.997 1.505 1.916 2.305 2.647 2.936 3.213 3.736 3.983 4.234 4.518 4.95 5.18 5.616 6.016 6.399 6.589 6.95 7.304 7.835 8.183 8.526 9.031 9.526 10.013 10.484 10.96 11.574 12.16 12.75 13.473 14.174 14.856 15.649 16.53 17.396 18.385 19.485 20.664 21.915 23.366 25.116 26.935 29.121 31.64 34.633 38.15 42.537 48.08 55.333 62.081 66.308 69.184 71.351 72.981 74.165 75.082 75.787 76.42 76.864 77.213 77.521 77.773 77.971 78.116 78.237 78.326 78.391 78.451 78.501 78.527 78.525 78.495 78.464 78.408 78.339 78.269 78.182 78.115 78.049 77.941 77.853 77.756 77.702 77.585 77.476 77.341 77.26 77.062 76.989 76.874 76.741 76.469 76.318 76.131 75.923 75.686 75.401 75.074 74.123 -4 ,19107 ,TETRA ,17586199,Sat Nov 27 16:07:21 CET,Sat Nov 27 17:55:30 CET,0.0 0.996 1.498 1.9 2.249 2.555 2.843 3.128 3.646 3.873 4.09 4.318 4.724 4.935 5.341 5.725 6.102 6.291 6.664 7.017 7.531 7.875 8.21 8.694 9.172 9.643 10.096 10.558 11.188 11.796 12.396 13.141 13.867 14.581 15.412 16.338 17.241 18.269 19.406 20.601 21.852 23.294 25.037 26.871 29.081 31.634 34.713 38.317 42.716 48.276 55.521 62.052 66.282 69.266 71.401 72.991 74.195 75.147 75.876 76.51 76.986 77.351 77.653 77.899 78.09 78.227 78.344 78.419 78.449 78.479 78.505 78.503 78.48 78.437 78.404 78.373 78.331 78.261 78.159 78.096 78.036 77.914 77.81 77.701 77.644 77.514 77.373 77.2 77.104 76.9 76.815 76.696 76.576 76.337 76.205 76.054 75.888 75.69 75.426 75.013 73.904 -5 ,4140 ,TETRA ,17586200,Sat Nov 27 16:07:21 CET,Sat Nov 27 17:54:18 CET,0.0 0.764 1.201 1.56 1.919 2.297 2.621 2.91 3.477 3.729 3.969 4.235 4.654 4.875 5.314 5.741 6.128 6.313 6.697 7.08 7.62 7.964 8.299 8.806 9.309 9.787 10.237 10.686 11.286 11.867 12.435 13.136 13.825 14.509 15.314 16.224 17.116 18.119 19.227 20.41 21.681 23.172 24.96 26.817 29.051 31.581 34.601 38.184 42.582 48.099 55.302 61.776 65.887 68.822 71.045 72.696 73.918 74.902 75.667 76.313 76.771 77.128 77.415 77.659 77.876 78.039 78.181 78.282 78.336 78.383 78.406 78.401 78.38 78.35 78.317 78.275 78.236 78.187 78.117 78.064 78.012 77.906 77.812 77.72 77.674 77.565 77.444 77.293 77.2 76.996 76.931 76.824 76.711 76.451 76.292 76.128 75.926 75.671 75.332 74.86 73.817 -6 ,28536 ,TETRA ,17586201,Sat Nov 27 16:07:21 CET,Sat Nov 27 17:53:54 CET,0.0 1.171 1.66 2.039 2.372 2.68 2.986 3.281 3.838 4.088 4.328 4.577 4.991 5.219 5.661 6.084 6.487 6.681 7.064 7.448 8.021 8.378 8.731 9.252 9.749 10.248 10.748 11.243 11.893 12.504 13.111 13.88 14.604 15.302 16.135 17.074 17.99 19.019 20.155 21.392 22.73 24.25 26.06 27.983 30.277 32.818 35.821 39.441 43.844 49.252 56.465 63.148 67.451 70.398 72.501 74.119 75.354 76.315 77.049 77.671 78.121 78.485 78.807 79.092 79.289 79.4 79.494 79.572 79.634 79.683 79.709 79.713 79.703 79.687 79.665 79.638 79.596 79.534 79.459 79.397 79.332 79.231 79.155 79.073 79.027 78.922 78.786 78.638 78.549 78.331 78.224 78.111 77.999 77.751 77.609 77.447 77.252 77.01 76.702 76.284 75.165 -7 ,32646 ,TETRA ,17586202,Sat Nov 27 16:07:23 CET,Sat Nov 27 17:54:58 CET,0.0 0.943 1.413 1.849 2.223 2.557 2.865 3.143 3.624 3.869 4.117 4.377 4.799 5.019 5.427 5.814 6.204 6.399 6.771 7.133 7.667 8.017 8.349 8.831 9.309 9.778 10.241 10.696 11.301 11.886 12.453 13.146 13.838 14.523 15.3 16.18 17.061 18.057 19.156 20.343 21.612 23.078 24.837 26.681 28.884 31.418 34.439 37.942 42.327 47.887 55.227 61.844 66.007 68.902 71.009 72.63 73.854 74.816 75.536 76.163 76.625 76.973 77.258 77.491 77.683 77.835 77.974 78.078 78.127 78.158 78.19 78.197 78.199 78.191 78.173 78.144 78.1 78.057 77.998 77.944 77.888 77.798 77.735 77.672 77.626 77.514 77.393 77.243 77.163 76.961 76.867 76.748 76.626 76.364 76.203 76.028 75.826 75.585 75.267 74.824 74.149 -8 ,19763 ,TETRA ,17586203,Sat Nov 27 16:07:21 CET,Sat Nov 27 17:54:02 CET,0.0 1.065 1.612 2.024 2.381 2.691 2.974 3.243 3.767 4.016 4.254 4.522 4.943 5.155 5.578 6.001 6.421 6.621 6.994 7.35 7.882 8.223 8.555 9.043 9.512 9.987 10.447 10.896 11.48 12.061 12.636 13.334 14.04 14.735 15.532 16.446 17.341 18.319 19.396 20.569 21.838 23.335 25.11 26.918 29.093 31.618 34.698 38.327 42.816 48.432 55.674 62.174 66.357 69.263 71.392 73.016 74.189 75.099 75.808 76.446 76.927 77.301 77.591 77.831 78.034 78.193 78.338 78.425 78.477 78.521 78.533 78.531 78.526 78.512 78.493 78.465 78.419 78.354 78.289 78.228 78.145 78.017 77.929 77.824 77.765 77.658 77.538 77.388 77.308 77.11 77.041 76.929 76.801 76.521 76.365 76.187 75.99 75.758 75.485 75.11 74.271 -9 ,1403 ,TETRA ,17586204,Sat Nov 27 16:07:21 CET,Sat Nov 27 17:53:32 CET,0.0 1.287 1.835 2.286 2.671 3.023 3.353 3.651 4.171 4.416 4.661 4.92 5.327 5.542 5.986 6.405 6.785 6.975 7.354 7.725 8.258 8.607 8.947 9.451 9.95 10.43 10.89 11.34 11.931 12.515 13.093 13.792 14.485 15.173 15.978 16.906 17.813 18.813 19.905 21.119 22.426 23.898 25.66 27.504 29.693 32.228 35.287 38.835 43.237 48.811 56.101 62.632 66.866 69.842 71.957 73.549 74.739 75.697 76.42 77.035 77.472 77.812 78.106 78.34 78.529 78.684 78.802 78.872 78.932 78.971 78.989 79.0 78.981 78.949 78.929 78.903 78.856 78.797 78.723 78.657 78.573 78.444 78.369 78.273 78.214 78.085 77.955 77.823 77.755 77.574 77.528 77.419 77.31 77.076 76.925 76.743 76.533 76.291 76.013 75.64 74.689 -10 ,14457 ,TETRA ,17586205,Sat Nov 27 16:08:20 CET,Sat Nov 27 17:55:33 CET,0.0 1.019 1.492 1.862 2.189 2.483 2.771 3.058 3.585 3.819 4.048 4.293 4.7 4.914 5.33 5.744 6.143 6.34 6.72 7.085 7.619 7.965 8.296 8.782 9.284 9.773 10.235 10.702 11.312 11.898 12.477 13.172 13.849 14.527 15.327 16.225 17.107 18.12 19.229 20.421 21.709 23.17 24.907 26.731 28.959 31.541 34.62 38.206 42.59 48.149 55.443 62.088 66.415 69.421 71.569 73.165 74.374 75.329 76.061 76.708 77.163 77.519 77.84 78.09 78.267 78.392 78.513 78.61 78.666 78.7 78.708 78.704 78.691 78.662 78.626 78.577 78.513 78.435 78.36 78.303 78.229 78.108 78.026 77.927 77.872 77.751 77.617 77.473 77.389 77.178 77.075 76.954 76.822 76.523 76.352 76.157 75.93 75.691 75.401 74.97 74.118 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index a67790cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7690 ,TETRA ,17586206,Sat Nov 27 16:08:21 CET,Sat Nov 27 17:52:54 CET,0.0 0.602 0.959 1.215 1.431 1.633 1.818 1.983 2.257 2.391 2.529 2.647 2.877 2.983 3.192 3.391 3.583 3.675 3.86 4.042 4.3 4.467 4.626 4.843 5.06 5.278 5.486 5.688 5.949 6.202 6.455 6.765 7.058 7.345 7.687 8.063 8.421 8.835 9.259 9.692 10.167 10.696 11.328 11.979 12.725 13.556 14.507 15.577 16.825 18.172 19.697 20.811 21.26 21.388 21.306 21.138 20.938 20.698 20.446 20.143 19.87 19.629 19.376 19.126 18.883 18.65 18.4 18.171 17.958 17.721 17.466 17.249 17.022 16.79 16.612 16.41 16.183 15.961 15.732 15.566 15.388 15.089 14.872 14.646 14.524 14.275 14.018 13.746 13.587 13.31 13.013 12.811 12.602 12.116 11.814 11.486 11.145 10.739 10.162 9.362 5.799 -2 ,13072 ,TETRA ,17586207,Sat Nov 27 16:08:23 CET,Sat Nov 27 17:49:54 CET,0.0 0.437 0.683 0.887 1.086 1.264 1.421 1.57 1.854 1.99 2.11 2.227 2.472 2.586 2.802 2.998 3.182 3.273 3.452 3.626 3.884 4.05 4.214 4.455 4.67 4.873 5.069 5.258 5.511 5.763 6.011 6.317 6.615 6.897 7.223 7.592 7.953 8.337 8.736 9.212 9.713 10.262 10.923 11.597 12.365 13.205 14.186 15.253 16.452 17.831 19.422 20.529 20.949 21.049 21.007 20.856 20.667 20.453 20.217 19.935 19.67 19.412 19.136 18.868 18.619 18.376 18.111 17.854 17.615 17.377 17.142 16.923 16.69 16.453 16.251 16.035 15.812 15.583 15.322 15.145 14.968 14.668 14.453 14.221 14.099 13.854 13.579 13.257 13.087 12.819 12.535 12.321 12.094 11.62 11.352 11.025 10.644 10.211 9.693 9.004 5.659 -3 ,19953 ,TETRA ,17586208,Sat Nov 27 16:08:21 CET,Sat Nov 27 17:50:58 CET,0.0 0.486 0.731 0.968 1.176 1.347 1.512 1.674 1.961 2.097 2.225 2.335 2.572 2.681 2.89 3.104 3.314 3.42 3.622 3.806 4.078 4.259 4.426 4.65 4.872 5.09 5.296 5.501 5.767 6.029 6.287 6.607 6.908 7.183 7.51 7.883 8.242 8.636 9.065 9.522 9.994 10.527 11.155 11.781 12.498 13.332 14.346 15.476 16.746 18.288 20.041 21.116 21.512 21.605 21.548 21.371 21.163 20.911 20.662 20.377 20.11 19.879 19.638 19.398 19.166 18.929 18.647 18.348 18.106 17.89 17.649 17.432 17.203 16.959 16.757 16.541 16.31 16.064 15.796 15.602 15.405 15.119 14.917 14.686 14.561 14.316 14.074 13.794 13.639 13.389 13.164 12.985 12.783 12.257 11.959 11.684 11.378 10.976 10.404 9.626 6.771 -4 ,19874 ,TETRA ,17586209,Sat Nov 27 16:08:21 CET,Sat Nov 27 17:52:07 CET,0.0 0.535 0.826 1.057 1.256 1.411 1.575 1.744 2.023 2.148 2.275 2.406 2.654 2.772 2.997 3.204 3.393 3.483 3.661 3.838 4.103 4.27 4.429 4.661 4.89 5.114 5.326 5.53 5.797 6.058 6.316 6.638 6.949 7.235 7.558 7.935 8.304 8.7 9.131 9.583 10.075 10.651 11.304 11.949 12.696 13.538 14.477 15.553 16.786 18.185 19.829 20.856 21.259 21.349 21.265 21.129 20.943 20.698 20.449 20.162 19.912 19.67 19.408 19.127 18.842 18.598 18.351 18.13 17.915 17.683 17.437 17.226 17.018 16.787 16.592 16.378 16.158 15.94 15.701 15.528 15.35 15.079 14.883 14.645 14.516 14.255 13.995 13.73 13.587 13.332 13.058 12.865 12.669 12.233 11.969 11.68 11.324 10.908 10.384 9.667 5.161 -5 ,10184 ,TETRA ,17586210,Sat Nov 27 16:08:21 CET,Sat Nov 27 17:53:00 CET,0.0 0.503 0.772 0.995 1.212 1.402 1.565 1.723 2.008 2.135 2.257 2.363 2.593 2.697 2.905 3.107 3.31 3.407 3.578 3.74 3.98 4.143 4.299 4.512 4.722 4.927 5.123 5.324 5.592 5.842 6.092 6.39 6.669 6.942 7.253 7.609 7.961 8.374 8.828 9.3 9.781 10.333 10.991 11.637 12.409 13.23 14.204 15.342 16.624 18.107 19.844 20.955 21.319 21.401 21.313 21.139 20.934 20.661 20.378 20.09 19.822 19.578 19.337 19.075 18.816 18.569 18.3 18.058 17.853 17.639 17.403 17.195 16.974 16.733 16.542 16.332 16.098 15.863 15.628 15.456 15.271 14.969 14.731 14.491 14.375 14.133 13.848 13.5 13.325 13.062 12.797 12.606 12.402 11.926 11.633 11.314 10.974 10.575 10.034 9.277 5.608 -6 ,16080 ,TETRA ,17586211,Sat Nov 27 16:08:21 CET,Sat Nov 27 17:52:24 CET,0.0 0.588 0.885 1.111 1.297 1.469 1.631 1.774 2.047 2.183 2.309 2.444 2.69 2.807 3.007 3.193 3.385 3.478 3.657 3.829 4.081 4.251 4.412 4.641 4.875 5.096 5.298 5.505 5.781 6.043 6.293 6.584 6.861 7.129 7.444 7.803 8.146 8.541 8.988 9.456 9.942 10.485 11.116 11.753 12.523 13.393 14.389 15.49 16.792 18.299 19.942 21.038 21.395 21.462 21.397 21.231 21.007 20.777 20.544 20.269 20.023 19.784 19.538 19.286 19.017 18.761 18.498 18.254 18.032 17.785 17.522 17.301 17.064 16.818 16.622 16.403 16.184 15.964 15.704 15.513 15.318 15.01 14.799 14.564 14.443 14.193 13.913 13.628 13.476 13.221 12.973 12.776 12.565 12.111 11.858 11.557 11.216 10.8 10.236 9.441 6.296 -7 ,18055 ,TETRA ,17586212,Sat Nov 27 16:08:21 CET,Sat Nov 27 17:52:42 CET,0.0 0.662 1.017 1.271 1.48 1.676 1.854 2.013 2.301 2.424 2.543 2.658 2.893 3.011 3.24 3.445 3.632 3.727 3.92 4.103 4.35 4.504 4.665 4.894 5.11 5.32 5.52 5.72 5.98 6.235 6.487 6.795 7.093 7.379 7.701 8.069 8.448 8.853 9.282 9.755 10.236 10.773 11.428 12.098 12.86 13.725 14.744 15.871 17.105 18.481 20.051 21.119 21.535 21.651 21.591 21.442 21.227 20.99 20.75 20.455 20.182 19.922 19.664 19.386 19.111 18.868 18.611 18.381 18.162 17.913 17.657 17.447 17.219 16.978 16.784 16.579 16.364 16.136 15.89 15.716 15.538 15.244 15.032 14.813 14.693 14.424 14.134 13.841 13.675 13.4 13.156 12.971 12.763 12.281 12.014 11.702 11.332 10.931 10.415 9.745 5.761 -8 ,2169 ,TETRA ,17586213,Sat Nov 27 16:08:21 CET,Sat Nov 27 17:50:48 CET,0.0 0.456 0.746 0.98 1.177 1.347 1.491 1.633 1.9 2.024 2.145 2.251 2.483 2.587 2.789 2.986 3.175 3.271 3.46 3.638 3.9 4.064 4.223 4.461 4.685 4.895 5.094 5.283 5.536 5.792 6.037 6.328 6.629 6.925 7.277 7.669 8.038 8.45 8.881 9.334 9.843 10.421 11.075 11.749 12.507 13.344 14.331 15.406 16.622 18.027 19.488 20.451 20.84 20.888 20.791 20.642 20.45 20.21 19.947 19.665 19.418 19.172 18.89 18.612 18.362 18.108 17.836 17.592 17.361 17.116 16.858 16.64 16.404 16.155 15.963 15.762 15.553 15.312 15.045 14.864 14.689 14.386 14.158 13.929 13.81 13.567 13.31 13.02 12.856 12.598 12.382 12.194 11.964 11.477 11.217 10.942 10.596 10.173 9.581 8.684 5.042 -9 ,28545 ,TETRA ,17586214,Sat Nov 27 16:08:22 CET,Sat Nov 27 17:51:05 CET,0.0 0.478 0.743 0.966 1.176 1.37 1.542 1.709 2.002 2.125 2.247 2.353 2.584 2.688 2.884 3.075 3.259 3.35 3.53 3.701 3.953 4.121 4.289 4.527 4.741 4.942 5.142 5.345 5.61 5.864 6.108 6.401 6.69 6.97 7.291 7.659 8.016 8.418 8.856 9.309 9.794 10.362 11.032 11.694 12.453 13.27 14.223 15.296 16.513 17.948 19.551 20.623 21.037 21.137 21.06 20.908 20.703 20.467 20.237 19.957 19.704 19.463 19.221 18.972 18.744 18.506 18.216 17.973 17.746 17.502 17.258 17.044 16.802 16.547 16.357 16.166 15.966 15.745 15.503 15.319 15.108 14.789 14.584 14.356 14.225 13.944 13.668 13.391 13.241 12.978 12.677 12.472 12.26 11.799 11.525 11.214 10.876 10.471 9.909 9.045 5.106 -10 ,5723 ,TETRA ,17586215,Sat Nov 27 16:08:22 CET,Sat Nov 27 17:50:13 CET,0.0 0.705 1.05 1.292 1.492 1.681 1.847 1.998 2.295 2.438 2.571 2.714 2.95 3.056 3.262 3.461 3.655 3.751 3.934 4.109 4.364 4.527 4.683 4.907 5.126 5.341 5.55 5.753 6.016 6.264 6.498 6.799 7.1 7.382 7.712 8.088 8.444 8.83 9.25 9.711 10.182 10.72 11.35 11.969 12.691 13.492 14.469 15.568 16.789 18.179 19.762 20.791 21.165 21.247 21.167 21.02 20.804 20.562 20.311 20.005 19.733 19.48 19.213 18.945 18.696 18.468 18.212 17.966 17.745 17.506 17.253 17.028 16.788 16.539 16.346 16.149 15.934 15.709 15.475 15.313 15.138 14.829 14.602 14.36 14.238 13.988 13.708 13.4 13.23 12.952 12.667 12.472 12.268 11.814 11.562 11.252 10.894 10.482 9.959 9.108 0.333 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt deleted file mode 100644 index ff0ced1c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9809 ,TETRA ,17586216,Sat Nov 27 16:08:22 CET,Sat Nov 27 17:53:17 CET,0.0 0.708 1.081 1.356 1.567 1.756 1.951 2.137 2.468 2.623 2.78 2.944 3.202 3.333 3.587 3.812 4.03 4.133 4.316 4.493 4.753 4.923 5.092 5.345 5.593 5.826 6.038 6.243 6.527 6.793 7.035 7.332 7.614 7.886 8.207 8.561 8.897 9.261 9.662 10.087 10.542 11.068 11.658 12.265 12.967 13.705 14.502 15.377 16.371 17.427 18.372 18.77 18.762 18.503 18.141 17.736 17.321 16.912 16.54 16.14 15.774 15.446 15.13 14.815 14.507 14.21 13.893 13.601 13.337 13.056 12.764 12.529 12.288 12.028 11.819 11.595 11.356 11.11 10.849 10.667 10.475 10.16 9.948 9.731 9.608 9.35 9.085 8.784 8.621 8.355 8.115 7.923 7.726 7.24 6.949 6.659 6.372 6.029 5.524 4.828 1.431 -2 ,3616 ,TETRA ,17586217,Sat Nov 27 16:08:23 CET,Sat Nov 27 17:51:28 CET,0.0 0.811 1.145 1.388 1.623 1.844 2.045 2.242 2.588 2.733 2.877 3.025 3.269 3.396 3.647 3.883 4.109 4.216 4.416 4.615 4.913 5.105 5.286 5.528 5.756 5.974 6.189 6.405 6.675 6.93 7.18 7.485 7.775 8.058 8.37 8.718 9.06 9.433 9.843 10.284 10.735 11.21 11.772 12.365 13.091 13.923 14.8 15.699 16.664 17.564 18.429 18.87 18.826 18.617 18.35 18.006 17.622 17.226 16.865 16.487 16.148 15.829 15.498 15.192 14.897 14.604 14.296 14.013 13.772 13.528 13.26 13.008 12.74 12.475 12.264 12.037 11.78 11.492 11.204 11.009 10.795 10.471 10.24 9.989 9.86 9.606 9.357 9.07 8.905 8.627 8.381 8.194 7.987 7.537 7.279 7.0 6.7 6.344 5.911 5.284 2.177 -3 ,23154 ,TETRA ,17586218,Sat Nov 27 16:08:22 CET,Sat Nov 27 17:53:02 CET,0.0 0.673 1.067 1.353 1.587 1.785 1.987 2.175 2.531 2.704 2.861 3.018 3.276 3.404 3.634 3.84 4.045 4.149 4.354 4.54 4.825 5.014 5.183 5.428 5.664 5.89 6.113 6.327 6.597 6.857 7.109 7.405 7.679 7.953 8.294 8.693 9.073 9.466 9.877 10.297 10.746 11.273 11.875 12.465 13.153 13.934 14.778 15.645 16.61 17.679 18.671 19.16 19.149 18.86 18.473 18.066 17.659 17.268 16.898 16.503 16.16 15.824 15.46 15.121 14.818 14.531 14.214 13.921 13.654 13.36 13.068 12.833 12.581 12.298 12.084 11.863 11.627 11.386 11.118 10.929 10.725 10.403 10.179 9.927 9.794 9.538 9.278 9.003 8.864 8.587 8.325 8.154 7.966 7.574 7.356 7.109 6.826 6.471 6.029 5.408 1.593 -4 ,31155 ,TETRA ,17586219,Sat Nov 27 16:08:22 CET,Sat Nov 27 17:53:22 CET,0.0 0.594 0.951 1.227 1.47 1.713 1.914 2.081 2.433 2.596 2.738 2.898 3.156 3.276 3.507 3.745 3.993 4.107 4.31 4.499 4.763 4.932 5.103 5.372 5.628 5.845 6.052 6.261 6.525 6.783 7.041 7.348 7.626 7.923 8.273 8.64 8.99 9.365 9.768 10.2 10.665 11.17 11.735 12.305 12.973 13.699 14.484 15.321 16.243 17.236 18.153 18.579 18.558 18.322 17.993 17.584 17.187 16.819 16.462 16.086 15.733 15.389 15.053 14.695 14.364 14.073 13.775 13.494 13.228 12.962 12.677 12.443 12.215 11.959 11.742 11.515 11.272 11.006 10.732 10.539 10.34 10.029 9.799 9.548 9.425 9.185 8.908 8.6 8.446 8.179 7.929 7.737 7.536 7.088 6.825 6.545 6.225 5.855 5.435 4.803 0.864 -5 ,25502 ,TETRA ,17586220,Sat Nov 27 16:08:22 CET,Sat Nov 27 17:52:46 CET,0.0 0.939 1.303 1.594 1.816 2.013 2.21 2.382 2.692 2.846 2.991 3.142 3.397 3.516 3.728 3.935 4.144 4.245 4.442 4.639 4.933 5.107 5.276 5.522 5.75 5.969 6.188 6.403 6.669 6.919 7.158 7.469 7.784 8.085 8.425 8.797 9.156 9.539 9.938 10.381 10.862 11.379 11.946 12.495 13.134 13.868 14.717 15.598 16.526 17.448 18.287 18.663 18.613 18.341 17.925 17.501 17.12 16.745 16.384 15.987 15.588 15.209 14.854 14.507 14.183 13.897 13.608 13.34 13.095 12.838 12.564 12.333 12.093 11.841 11.629 11.397 11.163 10.926 10.671 10.486 10.295 9.982 9.757 9.513 9.386 9.128 8.857 8.571 8.415 8.149 7.903 7.716 7.529 7.102 6.839 6.539 6.186 5.789 5.325 4.767 2.297 -6 ,21151 ,TETRA ,17586221,Sat Nov 27 16:08:22 CET,Sat Nov 27 17:52:15 CET,0.0 0.669 1.058 1.341 1.594 1.818 2.007 2.183 2.501 2.654 2.808 2.967 3.212 3.33 3.557 3.768 3.962 4.061 4.255 4.44 4.707 4.878 5.048 5.299 5.547 5.78 6.001 6.216 6.484 6.749 7.004 7.297 7.588 7.872 8.207 8.584 8.932 9.317 9.738 10.192 10.659 11.172 11.767 12.341 12.997 13.708 14.537 15.446 16.376 17.412 18.487 18.979 18.939 18.64 18.238 17.824 17.432 17.013 16.62 16.221 15.873 15.564 15.252 14.933 14.631 14.348 14.045 13.762 13.515 13.259 12.971 12.719 12.457 12.179 11.967 11.753 11.511 11.238 10.951 10.753 10.539 10.202 9.974 9.738 9.616 9.359 9.08 8.791 8.649 8.39 8.137 7.948 7.747 7.265 6.98 6.679 6.351 6.013 5.603 4.953 3.084 -7 ,4643 ,TETRA ,17586222,Sat Nov 27 16:09:20 CET,Sat Nov 27 17:53:59 CET,0.0 0.732 1.048 1.319 1.593 1.834 2.031 2.209 2.525 2.673 2.82 2.981 3.238 3.371 3.624 3.857 4.08 4.189 4.401 4.603 4.894 5.076 5.243 5.478 5.707 5.93 6.156 6.379 6.654 6.915 7.169 7.472 7.767 8.041 8.354 8.712 9.061 9.441 9.854 10.295 10.754 11.263 11.856 12.457 13.166 14.014 14.985 15.882 16.815 17.811 18.758 19.334 19.335 19.032 18.669 18.291 17.91 17.527 17.171 16.794 16.464 16.141 15.815 15.498 15.193 14.915 14.624 14.364 14.13 13.875 13.602 13.365 13.117 12.859 12.656 12.424 12.172 11.911 11.636 11.442 11.242 10.938 10.729 10.512 10.399 10.165 9.915 9.648 9.495 9.22 8.975 8.792 8.597 8.142 7.895 7.633 7.352 7.02 6.57 5.899 4.038 -8 ,5586 ,TETRA ,17586223,Sat Nov 27 16:09:20 CET,Sat Nov 27 17:53:55 CET,0.0 0.837 1.196 1.462 1.698 1.905 2.104 2.286 2.621 2.782 2.926 3.082 3.34 3.47 3.709 3.923 4.136 4.24 4.425 4.599 4.851 5.016 5.184 5.431 5.671 5.896 6.107 6.307 6.585 6.851 7.088 7.392 7.692 7.971 8.299 8.656 9.001 9.382 9.786 10.229 10.691 11.185 11.752 12.322 12.977 13.679 14.486 15.407 16.392 17.423 18.55 19.135 19.095 18.867 18.566 18.185 17.782 17.402 17.061 16.676 16.318 15.978 15.643 15.325 15.018 14.72 14.42 14.156 13.911 13.647 13.37 13.137 12.872 12.589 12.374 12.148 11.908 11.642 11.358 11.163 10.965 10.651 10.415 10.171 10.051 9.811 9.561 9.262 9.093 8.821 8.576 8.39 8.184 7.745 7.505 7.215 6.916 6.599 6.159 5.521 2.397 -9 ,22382 ,TETRA ,17586224,Sat Nov 27 16:09:20 CET,Sat Nov 27 17:55:01 CET,0.0 0.872 1.254 1.544 1.802 2.023 2.224 2.403 2.731 2.899 3.061 3.232 3.49 3.628 3.886 4.127 4.346 4.445 4.642 4.842 5.128 5.304 5.469 5.712 5.949 6.174 6.392 6.604 6.88 7.14 7.387 7.699 8.021 8.316 8.644 9.021 9.378 9.777 10.207 10.645 11.084 11.557 12.102 12.653 13.3 14.0 14.792 15.677 16.662 17.725 18.766 19.213 19.187 18.995 18.649 18.241 17.848 17.439 17.052 16.623 16.219 15.833 15.467 15.124 14.799 14.51 14.202 13.921 13.657 13.378 13.117 12.91 12.687 12.42 12.191 11.958 11.722 11.471 11.204 11.018 10.82 10.506 10.29 10.054 9.935 9.695 9.42 9.133 8.982 8.705 8.435 8.236 8.039 7.59 7.301 7.005 6.693 6.332 5.872 5.115 2.376 -10 ,32200 ,TETRA ,17586225,Sat Nov 27 16:09:20 CET,Sat Nov 27 17:54:54 CET,0.0 0.572 0.942 1.241 1.47 1.678 1.866 2.041 2.349 2.494 2.634 2.788 3.04 3.165 3.407 3.623 3.837 3.943 4.144 4.338 4.602 4.774 4.951 5.208 5.453 5.691 5.927 6.153 6.43 6.69 6.935 7.236 7.547 7.842 8.162 8.52 8.866 9.24 9.642 10.067 10.511 11.014 11.587 12.15 12.822 13.601 14.472 15.379 16.368 17.519 18.553 18.831 18.725 18.444 18.066 17.632 17.247 16.862 16.465 16.059 15.698 15.35 15.011 14.689 14.388 14.102 13.8 13.53 13.278 13.021 12.739 12.478 12.213 11.943 11.727 11.499 11.263 11.015 10.743 10.554 10.366 10.061 9.831 9.59 9.471 9.221 8.94 8.628 8.468 8.212 7.984 7.814 7.621 7.16 6.894 6.56 6.206 5.823 5.353 4.816 2.078 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 9cfe76a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20129 ,TETRA ,17586226,Sat Nov 27 16:09:20 CET,Sat Nov 27 17:57:00 CET,0.0 0.778 1.142 1.483 1.8 2.033 2.215 2.404 2.768 2.924 3.066 3.197 3.434 3.562 3.804 4.03 4.239 4.341 4.552 4.758 5.063 5.26 5.439 5.691 5.947 6.202 6.453 6.699 7.013 7.311 7.59 7.936 8.255 8.556 8.923 9.338 9.734 10.179 10.65 11.149 11.675 12.247 12.892 13.518 14.239 15.037 16.012 17.101 18.252 19.535 20.923 21.814 22.131 22.171 22.049 21.837 21.602 21.344 21.075 20.771 20.487 20.226 19.966 19.703 19.452 19.206 18.943 18.697 18.463 18.211 17.963 17.748 17.515 17.282 17.098 16.904 16.7 16.478 16.261 16.109 15.939 15.673 15.473 15.267 15.165 14.937 14.694 14.438 14.296 14.046 13.839 13.667 13.477 13.086 12.875 12.66 12.447 12.191 11.837 11.347 10.157 -2 ,11418 ,TETRA ,17586227,Sat Nov 27 16:09:21 CET,Sat Nov 27 17:57:06 CET,0.0 0.744 1.075 1.317 1.536 1.729 1.914 2.086 2.394 2.546 2.697 2.868 3.118 3.247 3.516 3.755 3.961 4.066 4.27 4.471 4.761 4.937 5.106 5.352 5.594 5.835 6.079 6.314 6.606 6.9 7.184 7.505 7.817 8.117 8.466 8.869 9.27 9.697 10.145 10.639 11.165 11.731 12.368 13.028 13.8 14.632 15.566 16.64 17.888 19.26 20.848 21.882 22.214 22.322 22.26 22.105 21.907 21.631 21.342 21.038 20.738 20.424 20.13 19.846 19.552 19.268 18.975 18.701 18.443 18.165 17.887 17.671 17.44 17.201 17.008 16.788 16.555 16.313 16.046 15.862 15.678 15.389 15.2 15.013 14.914 14.701 14.466 14.219 14.086 13.849 13.658 13.498 13.333 12.965 12.752 12.519 12.264 11.967 11.613 11.173 10.039 -3 ,13592 ,TETRA ,17586228,Sat Nov 27 16:09:21 CET,Sat Nov 27 17:54:50 CET,0.0 0.443 0.779 1.059 1.317 1.564 1.777 1.97 2.312 2.469 2.627 2.804 3.059 3.188 3.425 3.664 3.894 4.002 4.205 4.409 4.699 4.885 5.076 5.341 5.59 5.828 6.074 6.319 6.627 6.912 7.179 7.512 7.835 8.153 8.527 8.936 9.343 9.809 10.301 10.801 11.313 11.907 12.595 13.276 14.098 15.002 15.961 16.968 18.114 19.404 20.721 21.566 21.864 21.839 21.735 21.564 21.316 21.045 20.798 20.534 20.279 20.047 19.801 19.543 19.283 19.026 18.765 18.53 18.322 18.101 17.87 17.668 17.434 17.189 16.999 16.801 16.605 16.404 16.179 16.008 15.83 15.557 15.368 15.168 15.069 14.865 14.654 14.432 14.312 14.078 13.88 13.72 13.539 13.134 12.905 12.651 12.382 12.047 11.652 11.134 10.213 -4 ,9351 ,TETRA ,17586229,Sat Nov 27 16:09:21 CET,Sat Nov 27 17:54:49 CET,0.0 0.75 1.075 1.348 1.598 1.807 2.002 2.191 2.525 2.672 2.822 3.008 3.264 3.396 3.66 3.915 4.147 4.253 4.466 4.693 5.015 5.205 5.379 5.634 5.878 6.118 6.355 6.581 6.886 7.165 7.429 7.772 8.105 8.422 8.798 9.218 9.611 10.037 10.485 10.99 11.524 12.108 12.8 13.49 14.254 15.076 16.037 17.138 18.4 19.733 21.139 22.02 22.319 22.347 22.247 22.06 21.815 21.548 21.295 21.026 20.771 20.517 20.269 20.02 19.76 19.496 19.188 18.906 18.667 18.403 18.122 17.888 17.649 17.415 17.232 17.042 16.833 16.604 16.364 16.193 16.012 15.716 15.514 15.306 15.193 14.957 14.7 14.429 14.288 14.04 13.835 13.667 13.488 13.106 12.895 12.65 12.372 12.069 11.72 11.207 10.249 -5 ,12844 ,TETRA ,17586230,Sat Nov 27 16:09:21 CET,Sat Nov 27 17:55:01 CET,0.0 0.592 0.933 1.219 1.458 1.645 1.837 2.032 2.353 2.499 2.644 2.815 3.063 3.189 3.44 3.684 3.916 4.028 4.245 4.45 4.73 4.91 5.087 5.34 5.591 5.836 6.072 6.302 6.595 6.884 7.165 7.502 7.847 8.174 8.526 8.937 9.336 9.784 10.29 10.823 11.369 11.99 12.724 13.448 14.268 15.134 16.076 17.104 18.304 19.671 21.139 22.044 22.348 22.391 22.304 22.085 21.831 21.585 21.311 20.985 20.699 20.443 20.189 19.935 19.683 19.421 19.125 18.873 18.662 18.444 18.204 18.009 17.79 17.542 17.345 17.144 16.945 16.726 16.481 16.304 16.127 15.875 15.688 15.468 15.358 15.135 14.9 14.662 14.536 14.296 14.089 13.911 13.722 13.349 13.15 12.916 12.66 12.382 12.056 11.596 10.604 -6 ,23064 ,TETRA ,17586231,Sat Nov 27 16:09:22 CET,Sat Nov 27 17:55:01 CET,0.0 0.586 0.927 1.231 1.493 1.704 1.901 2.095 2.466 2.637 2.792 2.963 3.214 3.336 3.577 3.812 4.041 4.154 4.372 4.59 4.9 5.093 5.281 5.552 5.815 6.061 6.294 6.532 6.84 7.128 7.407 7.753 8.092 8.411 8.768 9.182 9.588 10.023 10.473 10.945 11.457 12.032 12.7 13.394 14.215 15.121 16.131 17.218 18.467 19.905 21.477 22.486 22.897 22.983 22.888 22.71 22.482 22.224 21.956 21.642 21.322 21.01 20.713 20.419 20.123 19.852 19.565 19.304 19.082 18.828 18.564 18.354 18.113 17.855 17.653 17.444 17.224 16.974 16.697 16.509 16.324 16.058 15.872 15.669 15.561 15.325 15.065 14.807 14.67 14.42 14.204 14.03 13.83 13.414 13.215 12.99 12.743 12.477 12.152 11.704 10.676 -7 ,30482 ,TETRA ,17586232,Sat Nov 27 16:10:18 CET,Sat Nov 27 17:57:05 CET,0.0 0.576 0.928 1.196 1.396 1.603 1.826 2.04 2.418 2.588 2.739 2.91 3.17 3.308 3.56 3.789 4.016 4.131 4.353 4.562 4.872 5.07 5.256 5.529 5.793 6.05 6.297 6.522 6.801 7.092 7.377 7.693 8.015 8.337 8.697 9.118 9.532 9.973 10.431 10.892 11.394 11.988 12.674 13.369 14.137 14.986 15.995 17.087 18.272 19.556 21.005 21.941 22.204 22.217 22.103 21.88 21.625 21.392 21.144 20.832 20.526 20.254 20.002 19.732 19.471 19.245 18.998 18.757 18.542 18.312 18.067 17.856 17.636 17.422 17.227 17.014 16.815 16.613 16.389 16.227 16.067 15.81 15.627 15.439 15.342 15.125 14.853 14.557 14.405 14.157 13.946 13.764 13.551 13.068 12.822 12.578 12.337 12.072 11.755 11.32 10.362 -8 ,10928 ,TETRA ,17586233,Sat Nov 27 16:09:21 CET,Sat Nov 27 17:56:05 CET,0.0 0.745 1.111 1.436 1.728 1.96 2.168 2.359 2.719 2.877 3.022 3.188 3.435 3.56 3.805 4.054 4.295 4.403 4.612 4.813 5.093 5.28 5.464 5.714 5.956 6.21 6.461 6.702 7.015 7.327 7.621 7.978 8.334 8.663 9.029 9.433 9.821 10.243 10.717 11.236 11.752 12.327 13.013 13.688 14.463 15.337 16.311 17.369 18.644 20.108 21.53 22.424 22.787 22.828 22.705 22.52 22.307 22.066 21.83 21.546 21.26 20.991 20.703 20.416 20.178 19.974 19.739 19.504 19.285 19.064 18.834 18.62 18.395 18.163 17.984 17.788 17.575 17.358 17.119 16.949 16.766 16.475 16.262 16.029 15.908 15.659 15.404 15.149 15.019 14.771 14.552 14.391 14.235 13.859 13.634 13.407 13.146 12.833 12.492 12.04 11.04 -9 ,8504 ,TETRA ,17586234,Sat Nov 27 16:09:21 CET,Sat Nov 27 17:58:33 CET,0.0 1.654 2.068 2.38 2.674 2.928 3.133 3.326 3.698 3.875 4.048 4.248 4.504 4.646 4.919 5.182 5.438 5.56 5.792 6.023 6.364 6.581 6.783 7.063 7.336 7.611 7.865 8.099 8.397 8.681 8.968 9.316 9.641 9.958 10.314 10.71 11.102 11.54 12.019 12.519 13.045 13.654 14.347 15.021 15.8 16.662 17.626 18.66 19.816 21.163 22.605 23.464 23.765 23.786 23.688 23.515 23.297 23.049 22.794 22.518 22.263 22.007 21.741 21.476 21.203 20.955 20.693 20.451 20.23 20.002 19.761 19.548 19.34 19.121 18.936 18.744 18.536 18.313 18.083 17.912 17.732 17.451 17.26 17.06 16.955 16.718 16.453 16.187 16.047 15.79 15.596 15.449 15.285 14.892 14.674 14.459 14.226 13.939 13.567 13.098 12.276 -10 ,3153 ,TETRA ,17586235,Sat Nov 27 16:09:21 CET,Sat Nov 27 17:56:02 CET,0.0 0.756 1.162 1.498 1.727 1.916 2.115 2.313 2.664 2.827 2.991 3.173 3.426 3.562 3.835 4.093 4.333 4.444 4.652 4.86 5.165 5.365 5.562 5.837 6.087 6.344 6.59 6.815 7.109 7.393 7.679 8.032 8.368 8.691 9.076 9.494 9.873 10.306 10.776 11.264 11.792 12.387 13.062 13.731 14.511 15.369 16.305 17.357 18.607 19.972 21.335 22.161 22.424 22.5 22.4 22.191 21.98 21.752 21.502 21.164 20.872 20.619 20.353 20.06 19.749 19.477 19.221 18.994 18.782 18.548 18.295 18.072 17.829 17.58 17.394 17.198 16.989 16.779 16.562 16.41 16.255 15.987 15.791 15.587 15.477 15.247 15.008 14.743 14.608 14.371 14.178 14.025 13.871 13.523 13.324 13.094 12.819 12.505 12.132 11.63 10.528 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt deleted file mode 100644 index 83cf80da..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8875 ,TETRA ,17586236,Sat Nov 27 16:09:22 CET,Sat Nov 27 17:55:20 CET,0.0 1.945 2.314 2.637 2.88 3.081 3.283 3.469 3.798 3.949 4.088 4.236 4.484 4.603 4.827 5.037 5.222 5.317 5.505 5.672 5.913 6.063 6.211 6.436 6.653 6.852 7.036 7.216 7.439 7.652 7.857 8.095 8.332 8.565 8.826 9.124 9.402 9.704 10.037 10.352 10.657 11.0 11.403 11.81 12.261 12.74 13.301 13.82 14.231 14.525 14.588 14.196 13.553 12.891 12.255 11.605 10.959 10.356 9.813 9.258 8.795 8.386 7.982 7.597 7.241 6.891 6.521 6.198 5.895 5.575 5.238 4.95 4.655 4.326 4.066 3.797 3.521 3.235 2.93 2.727 2.51 2.154 1.904 1.641 1.505 1.238 0.952 0.632 0.473 0.208 -0.007 -0.182 -0.372 -0.777 -0.985 -1.226 -1.486 -1.783 -2.174 -2.735 -4.363 -2 ,10007 ,TETRA ,17586237,Sat Nov 27 16:10:20 CET,Sat Nov 27 17:56:32 CET,0.0 1.278 1.653 1.94 2.187 2.408 2.624 2.819 3.127 3.26 3.398 3.543 3.781 3.905 4.133 4.333 4.532 4.638 4.841 5.026 5.277 5.425 5.559 5.764 5.973 6.164 6.336 6.509 6.738 6.956 7.156 7.379 7.602 7.835 8.099 8.385 8.645 8.93 9.233 9.564 9.907 10.249 10.625 11.018 11.445 11.844 12.278 12.736 13.164 13.503 13.55 13.136 12.552 11.895 11.252 10.608 10.002 9.455 8.983 8.495 8.044 7.636 7.253 6.872 6.502 6.169 5.826 5.512 5.222 4.905 4.585 4.326 4.05 3.751 3.526 3.284 3.021 2.754 2.465 2.264 2.061 1.735 1.515 1.28 1.146 0.865 0.562 0.239 0.069 -0.219 -0.464 -0.641 -0.833 -1.277 -1.507 -1.751 -2.057 -2.414 -2.785 -3.276 -5.489 -3 ,31729 ,TETRA ,17586238,Sat Nov 27 16:11:20 CET,Sat Nov 27 17:58:46 CET,0.0 1.168 1.541 1.838 2.06 2.254 2.433 2.612 2.945 3.088 3.217 3.35 3.59 3.702 3.913 4.125 4.322 4.419 4.612 4.793 5.028 5.177 5.333 5.55 5.758 5.953 6.131 6.315 6.547 6.76 6.97 7.215 7.452 7.685 7.933 8.202 8.464 8.757 9.084 9.427 9.762 10.104 10.534 10.986 11.46 11.927 12.42 12.949 13.467 13.875 13.922 13.404 12.772 12.13 11.503 10.853 10.261 9.739 9.259 8.738 8.277 7.883 7.49 7.105 6.76 6.428 6.046 5.713 5.438 5.144 4.852 4.603 4.304 3.982 3.747 3.515 3.263 2.982 2.685 2.482 2.262 1.913 1.679 1.439 1.31 1.027 0.722 0.408 0.254 -0.025 -0.28 -0.472 -0.668 -1.141 -1.393 -1.651 -1.956 -2.317 -2.745 -3.235 -4.831 -4 ,19962 ,TETRA ,17586239,Sat Nov 27 16:10:20 CET,Sat Nov 27 17:58:15 CET,0.0 1.806 2.195 2.502 2.744 2.966 3.148 3.314 3.656 3.812 3.955 4.097 4.333 4.444 4.652 4.862 5.063 5.154 5.337 5.512 5.758 5.926 6.081 6.285 6.485 6.668 6.852 7.04 7.266 7.48 7.687 7.928 8.165 8.382 8.621 8.904 9.182 9.483 9.804 10.149 10.522 10.914 11.33 11.732 12.166 12.597 13.034 13.481 13.884 14.156 14.161 13.786 13.203 12.512 11.861 11.271 10.73 10.214 9.73 9.217 8.764 8.346 7.945 7.559 7.2 6.862 6.505 6.181 5.888 5.564 5.237 4.979 4.688 4.377 4.133 3.892 3.653 3.402 3.126 2.936 2.751 2.453 2.236 2.006 1.891 1.664 1.422 1.138 0.994 0.726 0.484 0.303 0.108 -0.321 -0.544 -0.778 -1.025 -1.315 -1.693 -2.21 -4.049 -5 ,25029 ,TETRA ,17586240,Sat Nov 27 16:10:20 CET,Sat Nov 27 17:57:01 CET,0.0 1.254 1.664 1.975 2.212 2.431 2.643 2.823 3.134 3.28 3.413 3.539 3.781 3.902 4.133 4.355 4.554 4.654 4.851 5.042 5.316 5.478 5.621 5.823 6.024 6.217 6.41 6.589 6.819 7.048 7.266 7.515 7.743 7.971 8.233 8.538 8.832 9.15 9.506 9.841 10.146 10.495 10.902 11.277 11.677 12.12 12.63 13.185 13.747 14.139 14.211 13.81 13.196 12.595 12.014 11.378 10.762 10.185 9.701 9.205 8.757 8.336 7.902 7.486 7.103 6.753 6.376 6.035 5.746 5.451 5.125 4.838 4.526 4.21 3.974 3.721 3.452 3.171 2.878 2.682 2.474 2.147 1.937 1.726 1.615 1.377 1.116 0.834 0.685 0.413 0.203 0.033 -0.149 -0.54 -0.761 -1.01 -1.279 -1.577 -1.953 -2.454 -3.662 -6 ,30384 ,TETRA ,17586241,Sat Nov 27 16:10:20 CET,Sat Nov 27 17:56:55 CET,0.0 1.37 1.812 2.122 2.401 2.653 2.867 3.057 3.387 3.529 3.66 3.796 4.038 4.155 4.362 4.563 4.77 4.867 5.052 5.231 5.475 5.625 5.776 6.011 6.23 6.424 6.617 6.802 7.031 7.257 7.466 7.707 7.947 8.182 8.442 8.713 8.978 9.261 9.558 9.872 10.194 10.56 10.943 11.3 11.697 12.106 12.587 13.113 13.61 13.916 13.878 13.475 12.931 12.35 11.787 11.181 10.57 9.992 9.492 8.981 8.511 8.073 7.65 7.259 6.894 6.54 6.135 5.764 5.441 5.085 4.727 4.438 4.128 3.808 3.558 3.305 3.062 2.805 2.528 2.334 2.128 1.798 1.564 1.335 1.219 0.966 0.687 0.404 0.265 0.008 -0.197 -0.367 -0.536 -0.914 -1.129 -1.372 -1.677 -2.045 -2.457 -2.975 -4.246 -7 ,32021 ,TETRA ,17586242,Sat Nov 27 16:10:20 CET,Sat Nov 27 17:55:47 CET,0.0 0.892 1.258 1.548 1.808 2.042 2.231 2.391 2.7 2.85 2.985 3.119 3.358 3.472 3.699 3.913 4.124 4.223 4.399 4.573 4.826 4.979 5.132 5.354 5.568 5.771 5.95 6.124 6.355 6.572 6.785 7.04 7.27 7.497 7.782 8.091 8.38 8.676 8.981 9.311 9.65 10.03 10.471 10.906 11.367 11.862 12.412 12.955 13.483 13.968 14.086 13.657 13.061 12.379 11.725 11.147 10.6 10.045 9.523 8.973 8.503 8.102 7.705 7.308 6.926 6.586 6.235 5.9 5.618 5.327 5.005 4.732 4.458 4.163 3.935 3.715 3.483 3.229 2.951 2.756 2.54 2.188 1.945 1.689 1.556 1.277 0.979 0.664 0.505 0.235 0.016 -0.184 -0.412 -0.901 -1.15 -1.408 -1.695 -2.045 -2.473 -3.025 -4.462 -8 ,20955 ,TETRA ,17586243,Sat Nov 27 16:10:20 CET,Sat Nov 27 17:56:49 CET,0.0 1.145 1.543 1.801 2.018 2.223 2.421 2.609 2.931 3.078 3.222 3.376 3.615 3.733 3.969 4.176 4.364 4.458 4.637 4.798 5.025 5.17 5.312 5.516 5.717 5.916 6.105 6.281 6.498 6.703 6.908 7.159 7.393 7.606 7.861 8.177 8.493 8.812 9.145 9.487 9.811 10.158 10.559 10.95 11.362 11.806 12.273 12.725 13.173 13.619 13.912 13.582 12.866 12.159 11.503 10.85 10.258 9.691 9.196 8.713 8.294 7.891 7.478 7.068 6.674 6.325 5.971 5.651 5.381 5.113 4.82 4.547 4.26 3.966 3.726 3.476 3.221 2.967 2.688 2.489 2.28 1.932 1.712 1.484 1.357 1.09 0.814 0.527 0.367 0.084 -0.127 -0.299 -0.485 -0.882 -1.101 -1.344 -1.622 -1.913 -2.243 -2.715 -4.039 -9 ,5269 ,TETRA ,17586244,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 17:57:34 CET,0.0 1.088 1.451 1.724 1.992 2.232 2.437 2.634 2.98 3.114 3.24 3.375 3.61 3.723 3.95 4.168 4.368 4.461 4.639 4.812 5.05 5.196 5.337 5.545 5.759 5.966 6.152 6.331 6.551 6.771 6.988 7.234 7.467 7.694 7.959 8.258 8.555 8.874 9.192 9.531 9.881 10.244 10.645 11.059 11.512 11.959 12.434 12.908 13.384 13.749 13.826 13.512 13.023 12.409 11.79 11.19 10.582 10.005 9.502 8.987 8.518 8.058 7.63 7.232 6.838 6.492 6.154 5.827 5.531 5.232 4.918 4.664 4.404 4.129 3.904 3.65 3.393 3.144 2.872 2.668 2.464 2.161 1.943 1.704 1.579 1.321 1.053 0.777 0.629 0.357 0.126 -0.055 -0.244 -0.632 -0.842 -1.09 -1.355 -1.635 -1.973 -2.401 -3.91 -10 ,18170 ,TETRA ,17586245,Sat Nov 27 16:11:24 CET,Sat Nov 27 17:57:26 CET,0.0 1.629 2.03 2.359 2.627 2.849 3.049 3.24 3.583 3.734 3.864 3.987 4.227 4.353 4.577 4.772 4.969 5.067 5.252 5.425 5.669 5.819 5.967 6.193 6.392 6.575 6.757 6.934 7.162 7.392 7.612 7.859 8.095 8.313 8.576 8.881 9.16 9.466 9.791 10.132 10.502 10.881 11.272 11.645 12.07 12.525 12.977 13.441 13.912 14.289 14.369 14.028 13.509 12.897 12.239 11.555 10.957 10.42 9.91 9.355 8.866 8.421 7.971 7.547 7.176 6.841 6.463 6.115 5.831 5.509 5.16 4.885 4.604 4.323 4.104 3.872 3.632 3.382 3.122 2.943 2.76 2.472 2.269 2.054 1.938 1.674 1.391 1.106 0.953 0.681 0.447 0.264 0.091 -0.296 -0.52 -0.778 -1.085 -1.411 -1.793 -2.336 -3.945 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index fd04f74f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3735 ,TETRA ,17586246,Sat Nov 27 16:11:20 CET,Sat Nov 27 17:56:48 CET,0.0 1.019 1.422 1.753 2.03 2.266 2.467 2.625 2.932 3.072 3.201 3.356 3.567 3.675 3.881 4.08 4.266 4.36 4.548 4.724 4.952 5.098 5.245 5.456 5.652 5.843 6.029 6.2 6.417 6.618 6.811 7.044 7.261 7.461 7.687 7.932 8.169 8.452 8.756 9.035 9.304 9.595 9.892 10.178 10.496 10.796 11.109 11.399 11.504 11.371 10.712 9.439 8.196 6.972 5.836 4.828 3.926 3.064 2.325 1.615 0.977 0.367 -0.212 -0.754 -1.268 -1.755 -2.25 -2.701 -3.116 -3.555 -4.004 -4.373 -4.771 -5.206 -5.54 -5.879 -6.236 -6.609 -7.001 -7.278 -7.561 -8.005 -8.319 -8.651 -8.823 -9.169 -9.553 -9.97 -10.193 -10.535 -10.96 -11.225 -11.496 -12.13 -12.466 -12.837 -13.274 -13.745 -14.282 -15.0 -16.92 -2 ,10750 ,TETRA ,17586247,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 17:56:55 CET,0.0 0.944 1.371 1.681 1.933 2.163 2.365 2.547 2.866 3.012 3.16 3.342 3.562 3.676 3.907 4.113 4.293 4.389 4.58 4.754 4.993 5.142 5.29 5.494 5.68 5.866 6.04 6.208 6.425 6.614 6.796 7.036 7.267 7.476 7.724 8.009 8.261 8.517 8.786 9.071 9.36 9.66 9.983 10.287 10.629 10.936 11.185 11.372 11.492 11.402 10.759 9.556 8.312 7.106 5.985 4.957 4.051 3.228 2.466 1.689 1.027 0.43 -0.168 -0.753 -1.269 -1.749 -2.273 -2.724 -3.096 -3.489 -3.909 -4.264 -4.644 -5.054 -5.362 -5.689 -6.033 -6.375 -6.751 -7.025 -7.302 -7.712 -7.989 -8.307 -8.483 -8.844 -9.243 -9.671 -9.885 -10.207 -10.574 -10.807 -11.06 -11.631 -11.951 -12.319 -12.701 -13.158 -13.779 -14.594 -17.774 -3 ,23263 ,TETRA ,17586248,Sat Nov 27 16:11:20 CET,Sat Nov 27 17:57:54 CET,0.0 0.883 1.273 1.558 1.781 1.99 2.194 2.379 2.679 2.813 2.946 3.095 3.304 3.412 3.617 3.805 3.999 4.101 4.286 4.45 4.695 4.853 5.0 5.21 5.416 5.614 5.796 5.965 6.184 6.403 6.608 6.836 7.046 7.245 7.481 7.74 7.974 8.229 8.502 8.774 9.029 9.348 9.715 10.032 10.349 10.644 10.931 11.19 11.364 11.294 10.77 9.701 8.589 7.512 6.507 5.57 4.711 3.885 3.14 2.383 1.698 1.072 0.493 -0.054 -0.589 -1.104 -1.646 -2.128 -2.546 -2.967 -3.412 -3.797 -4.197 -4.603 -4.919 -5.258 -5.619 -5.995 -6.391 -6.664 -6.948 -7.391 -7.704 -8.02 -8.175 -8.511 -8.88 -9.288 -9.504 -9.83 -10.207 -10.462 -10.735 -11.362 -11.737 -12.158 -12.6 -13.085 -13.697 -14.477 -17.067 -4 ,22731 ,TETRA ,17586249,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 17:57:05 CET,0.0 0.966 1.399 1.715 1.976 2.199 2.403 2.604 2.972 3.129 3.265 3.42 3.638 3.75 3.981 4.2 4.403 4.499 4.674 4.848 5.093 5.239 5.376 5.57 5.767 5.968 6.156 6.335 6.564 6.784 6.99 7.233 7.489 7.763 8.077 8.417 8.725 9.026 9.328 9.626 9.903 10.218 10.553 10.856 11.193 11.518 11.818 12.05 12.196 12.089 11.502 10.411 9.234 8.097 7.008 5.967 5.033 4.215 3.516 2.79 2.135 1.537 0.981 0.444 -0.072 -0.538 -1.019 -1.456 -1.853 -2.278 -2.725 -3.092 -3.464 -3.867 -4.192 -4.517 -4.862 -5.237 -5.623 -5.889 -6.187 -6.666 -6.987 -7.299 -7.465 -7.824 -8.189 -8.586 -8.809 -9.15 -9.518 -9.755 -10.008 -10.567 -10.889 -11.282 -11.74 -12.251 -12.87 -13.663 -16.374 -5 ,1325 ,TETRA ,17586250,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 17:58:53 CET,0.0 0.943 1.323 1.616 1.871 2.091 2.286 2.47 2.812 2.971 3.116 3.274 3.495 3.62 3.855 4.05 4.235 4.329 4.51 4.681 4.923 5.09 5.255 5.483 5.702 5.904 6.098 6.274 6.499 6.727 6.926 7.166 7.385 7.573 7.796 8.04 8.266 8.51 8.769 9.047 9.328 9.615 9.931 10.217 10.511 10.811 11.118 11.361 11.488 11.345 10.6 9.407 8.16 6.937 5.781 4.757 3.92 3.128 2.417 1.694 1.079 0.513 -0.081 -0.654 -1.207 -1.709 -2.196 -2.646 -3.047 -3.461 -3.899 -4.287 -4.689 -5.113 -5.45 -5.792 -6.155 -6.535 -6.921 -7.189 -7.472 -7.912 -8.216 -8.523 -8.693 -9.062 -9.431 -9.827 -10.034 -10.355 -10.737 -10.978 -11.222 -11.758 -12.068 -12.421 -12.802 -13.227 -13.755 -14.514 -17.481 -6 ,12969 ,TETRA ,17586251,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 17:59:09 CET,0.0 1.044 1.475 1.78 2.022 2.246 2.432 2.594 2.89 3.041 3.205 3.427 3.664 3.797 4.024 4.234 4.442 4.539 4.732 4.903 5.134 5.285 5.433 5.643 5.839 6.023 6.198 6.368 6.575 6.772 6.968 7.191 7.398 7.612 7.854 8.115 8.367 8.636 8.912 9.196 9.498 9.807 10.131 10.437 10.749 11.046 11.332 11.563 11.707 11.655 11.04 9.794 8.563 7.426 6.358 5.388 4.549 3.778 3.1 2.4 1.753 1.153 0.547 -0.025 -0.539 -1.014 -1.533 -2.024 -2.449 -2.894 -3.336 -3.687 -4.068 -4.48 -4.81 -5.136 -5.469 -5.835 -6.224 -6.5 -6.784 -7.215 -7.512 -7.846 -8.023 -8.384 -8.78 -9.204 -9.427 -9.758 -10.15 -10.42 -10.704 -11.325 -11.657 -12.011 -12.402 -12.861 -13.438 -14.151 -16.975 -7 ,17195 ,TETRA ,17586252,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 17:55:52 CET,0.0 1.017 1.432 1.733 1.984 2.215 2.439 2.651 3.013 3.172 3.313 3.471 3.68 3.792 4.011 4.218 4.429 4.535 4.739 4.918 5.153 5.304 5.438 5.619 5.799 5.98 6.156 6.323 6.537 6.751 6.95 7.179 7.394 7.592 7.824 8.071 8.298 8.543 8.797 9.057 9.332 9.632 9.965 10.27 10.567 10.888 11.188 11.409 11.54 11.395 10.649 9.417 8.188 6.991 5.914 4.918 3.995 3.128 2.374 1.629 0.97 0.372 -0.194 -0.738 -1.265 -1.759 -2.274 -2.731 -3.134 -3.557 -3.987 -4.343 -4.736 -5.17 -5.51 -5.848 -6.193 -6.561 -6.954 -7.224 -7.499 -7.945 -8.271 -8.602 -8.768 -9.126 -9.51 -9.922 -10.129 -10.439 -10.798 -11.056 -11.339 -11.97 -12.319 -12.678 -13.073 -13.512 -14.04 -14.806 -17.297 -8 ,17315 ,TETRA ,17586253,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 17:58:04 CET,0.0 0.84 1.242 1.529 1.803 2.057 2.276 2.483 2.819 2.957 3.089 3.242 3.461 3.578 3.786 3.987 4.172 4.262 4.447 4.611 4.832 4.976 5.117 5.311 5.499 5.686 5.871 6.054 6.281 6.494 6.703 6.94 7.147 7.351 7.591 7.865 8.121 8.38 8.644 8.908 9.167 9.453 9.771 10.075 10.4 10.675 10.969 11.275 11.447 11.362 10.718 9.524 8.323 7.12 6.013 5.012 4.101 3.262 2.506 1.74 1.1 0.503 -0.095 -0.675 -1.231 -1.736 -2.268 -2.742 -3.132 -3.53 -3.952 -4.322 -4.721 -5.147 -5.462 -5.78 -6.136 -6.493 -6.852 -7.117 -7.392 -7.8 -8.094 -8.432 -8.612 -8.974 -9.347 -9.754 -9.975 -10.308 -10.687 -10.949 -11.224 -11.807 -12.13 -12.475 -12.863 -13.318 -13.895 -14.684 -17.682 -9 ,785 ,TETRA ,17586254,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 17:57:58 CET,0.0 0.96 1.361 1.657 1.888 2.122 2.333 2.522 2.885 3.034 3.16 3.313 3.535 3.66 3.895 4.115 4.312 4.409 4.611 4.797 5.035 5.178 5.314 5.515 5.706 5.892 6.085 6.266 6.49 6.692 6.88 7.112 7.335 7.548 7.797 8.064 8.302 8.549 8.821 9.098 9.373 9.66 9.946 10.221 10.534 10.841 11.13 11.384 11.585 11.603 11.076 9.86 8.58 7.397 6.349 5.38 4.492 3.658 2.905 2.142 1.482 0.908 0.348 -0.217 -0.75 -1.242 -1.76 -2.212 -2.622 -3.048 -3.478 -3.857 -4.252 -4.664 -4.996 -5.328 -5.682 -6.061 -6.455 -6.731 -7.02 -7.459 -7.76 -8.084 -8.251 -8.604 -8.974 -9.38 -9.603 -9.927 -10.302 -10.555 -10.824 -11.437 -11.792 -12.169 -12.577 -13.044 -13.561 -14.25 -16.5 -10 ,27061 ,TETRA ,17586255,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 18:01:05 CET,0.0 0.836 1.223 1.522 1.788 2.027 2.26 2.461 2.784 2.924 3.066 3.255 3.48 3.599 3.825 4.045 4.25 4.34 4.516 4.691 4.937 5.096 5.24 5.442 5.637 5.82 6.006 6.184 6.402 6.626 6.844 7.082 7.3 7.522 7.776 8.031 8.261 8.524 8.798 9.065 9.335 9.619 9.929 10.234 10.565 10.871 11.143 11.369 11.525 11.477 10.882 9.696 8.463 7.312 6.3 5.351 4.485 3.623 2.863 2.104 1.443 0.851 0.281 -0.271 -0.802 -1.272 -1.774 -2.235 -2.63 -3.037 -3.467 -3.84 -4.237 -4.652 -4.971 -5.288 -5.62 -5.973 -6.347 -6.614 -6.891 -7.356 -7.689 -8.019 -8.185 -8.536 -8.899 -9.284 -9.487 -9.806 -10.187 -10.449 -10.724 -11.302 -11.641 -12.027 -12.464 -12.941 -13.517 -14.317 -17.392 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 48c2adef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,408 ,TETRA ,17586256,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 17:41:28 CET,0.0 0.675 1.037 1.327 1.561 1.777 1.977 2.151 2.427 2.551 2.672 2.812 3.022 3.14 3.36 3.55 3.718 3.806 3.997 4.175 4.427 4.585 4.734 4.952 5.158 5.358 5.546 5.716 5.928 6.129 6.334 6.583 6.81 7.029 7.282 7.563 7.828 8.098 8.392 8.689 8.971 9.288 9.636 9.958 10.308 10.654 10.963 11.176 11.26 11.173 10.667 9.648 8.573 7.557 6.66 5.796 5.026 4.326 3.666 2.997 2.425 1.869 1.335 0.87 0.429 0.013 -0.405 -0.79 -1.161 -1.575 -1.999 -2.352 -2.714 -3.077 -3.356 -3.643 -3.929 -4.228 -4.554 -4.783 -5.034 -5.424 -5.69 -5.967 -6.117 -6.453 -6.805 -7.178 -7.371 -7.676 -7.983 -8.185 -8.418 -8.963 -9.267 -9.603 -9.986 -10.443 -10.976 -11.62 -13.084 -2 ,20068 ,TETRA ,17586257,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 17:48:03 CET,0.0 0.866 1.183 1.431 1.641 1.849 2.05 2.231 2.567 2.729 2.884 3.053 3.259 3.363 3.582 3.797 4.009 4.112 4.309 4.492 4.737 4.885 5.024 5.227 5.431 5.638 5.833 6.023 6.266 6.471 6.656 6.882 7.099 7.304 7.545 7.818 8.077 8.367 8.665 8.968 9.279 9.593 9.93 10.256 10.579 10.876 11.167 11.356 11.441 11.287 10.63 9.519 8.42 7.345 6.303 5.393 4.577 3.825 3.189 2.496 1.898 1.384 0.903 0.455 0.018 -0.39 -0.809 -1.181 -1.53 -1.921 -2.321 -2.66 -3.025 -3.407 -3.708 -4.008 -4.309 -4.634 -4.984 -5.22 -5.475 -5.879 -6.158 -6.451 -6.592 -6.883 -7.19 -7.523 -7.711 -8.0 -8.301 -8.53 -8.765 -9.242 -9.511 -9.818 -10.167 -10.562 -11.039 -11.739 -13.75 -3 ,23446 ,TETRA ,17586258,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 17:59:10 CET,0.0 0.719 1.119 1.429 1.651 1.834 2.013 2.196 2.537 2.689 2.824 2.992 3.21 3.326 3.554 3.763 3.962 4.057 4.23 4.392 4.625 4.785 4.939 5.149 5.358 5.563 5.759 5.944 6.166 6.382 6.605 6.854 7.086 7.315 7.555 7.819 8.088 8.372 8.658 8.948 9.231 9.507 9.777 10.03 10.286 10.547 10.847 11.136 11.349 11.312 10.79 9.8 8.711 7.661 6.702 5.772 4.943 4.192 3.503 2.805 2.206 1.684 1.165 0.638 0.154 -0.306 -0.818 -1.268 -1.641 -2.031 -2.413 -2.741 -3.103 -3.454 -3.74 -4.049 -4.359 -4.676 -5.009 -5.26 -5.53 -5.948 -6.229 -6.516 -6.68 -7.017 -7.358 -7.722 -7.922 -8.234 -8.591 -8.835 -9.077 -9.56 -9.82 -10.154 -10.544 -10.976 -11.464 -12.117 -13.745 -4 ,29550 ,TETRA ,17586259,Sat Nov 27 16:11:22 CET,Sat Nov 27 17:57:50 CET,0.0 0.845 1.29 1.623 1.884 2.098 2.284 2.473 2.793 2.919 3.044 3.191 3.406 3.524 3.745 3.948 4.124 4.207 4.371 4.529 4.766 4.93 5.075 5.264 5.451 5.625 5.795 5.947 6.131 6.321 6.504 6.722 6.94 7.143 7.357 7.626 7.894 8.152 8.404 8.652 8.931 9.252 9.586 9.866 10.144 10.411 10.661 10.907 11.078 11.055 10.572 9.537 8.422 7.345 6.351 5.417 4.594 3.867 3.242 2.551 1.944 1.432 0.942 0.456 -0.023 -0.445 -0.864 -1.263 -1.643 -2.042 -2.425 -2.762 -3.127 -3.488 -3.781 -4.09 -4.41 -4.746 -5.093 -5.344 -5.607 -6.037 -6.348 -6.641 -6.784 -7.094 -7.425 -7.769 -7.946 -8.237 -8.535 -8.766 -9.023 -9.538 -9.829 -10.171 -10.57 -11.017 -11.544 -12.291 -14.237 -5 ,25728 ,TETRA ,17586260,Sat Nov 27 16:12:19 CET,Sat Nov 27 17:57:36 CET,0.0 0.866 1.199 1.464 1.701 1.925 2.123 2.295 2.602 2.749 2.888 3.045 3.26 3.378 3.596 3.778 3.947 4.035 4.203 4.351 4.569 4.72 4.874 5.102 5.311 5.504 5.681 5.848 6.08 6.3 6.506 6.762 7.006 7.239 7.494 7.762 7.998 8.252 8.531 8.816 9.096 9.382 9.689 9.984 10.307 10.646 10.988 11.207 11.302 11.143 10.459 9.337 8.199 7.162 6.209 5.308 4.547 3.848 3.189 2.505 1.92 1.42 0.923 0.382 -0.146 -0.604 -1.053 -1.456 -1.812 -2.171 -2.542 -2.86 -3.191 -3.55 -3.837 -4.14 -4.456 -4.78 -5.104 -5.331 -5.578 -5.962 -6.231 -6.512 -6.658 -6.953 -7.274 -7.63 -7.81 -8.099 -8.391 -8.607 -8.846 -9.357 -9.669 -10.03 -10.387 -10.793 -11.279 -11.898 -14.114 -6 ,26331 ,TETRA ,17586261,Sat Nov 27 16:12:20 CET,Sat Nov 27 17:59:01 CET,0.0 0.522 0.881 1.178 1.384 1.568 1.751 1.931 2.269 2.419 2.556 2.717 2.938 3.06 3.287 3.507 3.697 3.786 3.963 4.124 4.349 4.496 4.639 4.826 5.0 5.182 5.364 5.544 5.779 5.995 6.2 6.446 6.674 6.888 7.134 7.404 7.647 7.917 8.219 8.508 8.767 9.061 9.404 9.698 10.008 10.312 10.585 10.86 11.06 11.031 10.557 9.547 8.47 7.445 6.49 5.601 4.814 4.086 3.434 2.77 2.186 1.646 1.154 0.684 0.205 -0.241 -0.692 -1.095 -1.461 -1.846 -2.249 -2.585 -2.938 -3.304 -3.58 -3.873 -4.201 -4.554 -4.907 -5.138 -5.378 -5.768 -6.043 -6.326 -6.471 -6.781 -7.108 -7.438 -7.618 -7.902 -8.203 -8.425 -8.656 -9.181 -9.463 -9.747 -10.068 -10.465 -10.956 -11.52 -13.259 -7 ,7399 ,TETRA ,17586262,Sat Nov 27 16:12:20 CET,Sat Nov 27 17:58:38 CET,0.0 0.722 1.04 1.279 1.498 1.684 1.853 2.029 2.348 2.488 2.618 2.763 2.967 3.08 3.304 3.525 3.737 3.834 4.021 4.189 4.401 4.552 4.712 4.93 5.116 5.28 5.452 5.631 5.855 6.069 6.279 6.523 6.753 6.962 7.194 7.466 7.729 8.009 8.288 8.57 8.867 9.171 9.486 9.792 10.102 10.418 10.747 10.989 11.122 11.071 10.602 9.579 8.44 7.4 6.501 5.593 4.749 3.984 3.279 2.564 1.981 1.469 0.969 0.504 0.043 -0.409 -0.862 -1.289 -1.666 -2.034 -2.416 -2.731 -3.081 -3.461 -3.772 -4.099 -4.411 -4.747 -5.097 -5.331 -5.58 -5.979 -6.257 -6.541 -6.688 -6.991 -7.321 -7.69 -7.882 -8.177 -8.488 -8.701 -8.931 -9.459 -9.773 -10.126 -10.507 -10.94 -11.494 -12.209 -13.872 -8 ,3622 ,TETRA ,17586263,Sat Nov 27 16:12:23 CET,Sat Nov 27 17:57:18 CET,0.0 0.589 0.918 1.175 1.388 1.585 1.773 1.956 2.288 2.428 2.557 2.714 2.937 3.069 3.319 3.537 3.719 3.801 3.959 4.125 4.381 4.547 4.707 4.937 5.148 5.343 5.539 5.729 5.957 6.164 6.361 6.6 6.822 7.03 7.26 7.487 7.724 8.003 8.292 8.592 8.848 9.101 9.394 9.665 9.943 10.212 10.448 10.633 10.762 10.674 10.062 8.945 7.819 6.789 5.878 5.039 4.268 3.521 2.873 2.204 1.608 1.062 0.524 0.012 -0.487 -0.96 -1.433 -1.844 -2.222 -2.606 -3.009 -3.355 -3.694 -4.04 -4.315 -4.602 -4.914 -5.254 -5.595 -5.83 -6.083 -6.494 -6.79 -7.087 -7.238 -7.565 -7.903 -8.26 -8.451 -8.748 -9.063 -9.279 -9.504 -9.998 -10.253 -10.548 -10.9 -11.275 -11.754 -12.394 -14.059 -9 ,32748 ,TETRA ,17586264,Sat Nov 27 16:12:20 CET,Sat Nov 27 17:59:13 CET,0.0 0.768 1.132 1.407 1.607 1.779 1.933 2.087 2.398 2.533 2.657 2.795 3.005 3.113 3.319 3.533 3.73 3.819 3.995 4.167 4.406 4.555 4.696 4.896 5.098 5.302 5.493 5.663 5.868 6.076 6.285 6.537 6.759 6.958 7.18 7.403 7.61 7.836 8.07 8.305 8.554 8.83 9.115 9.352 9.621 9.897 10.146 10.404 10.582 10.511 10.017 9.015 7.88 6.796 5.754 4.808 4.033 3.31 2.645 2.009 1.457 0.948 0.447 -0.058 -0.536 -0.964 -1.43 -1.863 -2.235 -2.63 -3.049 -3.398 -3.766 -4.14 -4.424 -4.714 -5.015 -5.333 -5.676 -5.925 -6.179 -6.555 -6.819 -7.105 -7.254 -7.571 -7.896 -8.237 -8.419 -8.716 -9.049 -9.269 -9.498 -10.015 -10.299 -10.595 -10.969 -11.413 -11.913 -12.577 -14.458 -10 ,12351 ,TETRA ,17586265,Sat Nov 27 16:12:20 CET,Sat Nov 27 17:57:15 CET,0.0 0.532 0.815 1.033 1.233 1.429 1.606 1.781 2.093 2.237 2.384 2.562 2.775 2.877 3.077 3.263 3.448 3.549 3.736 3.894 4.12 4.267 4.403 4.611 4.822 5.012 5.184 5.352 5.581 5.811 6.026 6.278 6.508 6.729 6.98 7.232 7.462 7.736 8.047 8.351 8.638 8.933 9.264 9.574 9.907 10.258 10.585 10.841 11.011 10.978 10.53 9.63 8.587 7.592 6.7 5.885 5.122 4.396 3.781 3.135 2.548 2.004 1.473 0.992 0.551 0.126 -0.339 -0.774 -1.16 -1.552 -1.951 -2.289 -2.633 -2.979 -3.257 -3.551 -3.85 -4.164 -4.515 -4.758 -4.987 -5.356 -5.644 -5.935 -6.073 -6.369 -6.705 -7.064 -7.25 -7.554 -7.848 -8.068 -8.317 -8.843 -9.146 -9.483 -9.859 -10.264 -10.737 -11.371 -13.237 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt deleted file mode 100644 index c62dc5cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28096 ,KEBNE ,16678549,Thu Nov 25 03:09:04 CET,Thu Nov 25 04:38:36 CET,0.0 0.372 0.448 0.543 0.651 0.742 0.807 0.859 0.956 1.01 1.062 1.095 1.229 1.269 1.353 1.434 1.502 1.542 1.624 1.689 1.781 1.847 1.912 2.011 2.106 2.192 2.273 2.363 2.486 2.593 2.688 2.8 2.922 3.042 3.164 3.304 3.454 3.614 3.791 3.992 4.193 4.406 4.632 4.868 5.185 5.546 5.944 6.379 6.892 7.444 8.094 8.594 8.719 8.691 8.599 8.471 8.33 8.193 8.07 7.921 7.775 7.65 7.542 7.423 7.303 7.178 7.024 6.892 6.787 6.666 6.546 6.43 6.288 6.16 6.067 5.958 5.843 5.737 5.62 5.538 5.45 5.305 5.2 5.098 5.045 4.937 4.825 4.706 4.645 4.49 4.386 4.297 4.192 3.961 3.837 3.71 3.593 3.472 3.31 3.059 2.03 -2 ,19933 ,KEBNE ,16678550,Thu Nov 25 03:09:04 CET,Thu Nov 25 04:39:15 CET,0.0 0.201 0.331 0.434 0.496 0.539 0.592 0.657 0.796 0.859 0.909 0.928 1.058 1.115 1.216 1.292 1.377 1.417 1.489 1.565 1.683 1.756 1.823 1.914 2.0 2.085 2.161 2.234 2.34 2.442 2.539 2.662 2.778 2.88 2.99 3.128 3.271 3.433 3.611 3.794 3.995 4.232 4.507 4.777 5.086 5.441 5.836 6.239 6.736 7.316 7.862 8.215 8.336 8.336 8.255 8.139 8.039 7.926 7.8 7.614 7.44 7.314 7.178 7.041 6.925 6.802 6.676 6.568 6.45 6.318 6.192 6.086 5.976 5.867 5.777 5.68 5.567 5.457 5.348 5.263 5.169 5.019 4.917 4.81 4.754 4.634 4.51 4.393 4.33 4.202 4.158 4.09 4.003 3.799 3.695 3.585 3.46 3.301 3.069 2.792 1.838 -3 ,16761 ,KEBNE ,16678551,Thu Nov 25 03:10:06 CET,Thu Nov 25 04:38:19 CET,0.0 0.231 0.309 0.406 0.505 0.574 0.631 0.693 0.81 0.858 0.912 0.941 1.066 1.11 1.191 1.269 1.345 1.383 1.464 1.539 1.647 1.722 1.79 1.875 1.965 2.053 2.136 2.218 2.316 2.415 2.518 2.64 2.758 2.872 3.018 3.191 3.344 3.502 3.671 3.853 4.05 4.292 4.575 4.85 5.175 5.526 5.923 6.363 6.858 7.416 8.036 8.413 8.523 8.54 8.502 8.392 8.276 8.163 8.034 7.892 7.768 7.639 7.504 7.374 7.247 7.135 7.002 6.864 6.745 6.631 6.498 6.382 6.265 6.117 6.007 5.907 5.793 5.681 5.565 5.481 5.388 5.234 5.13 5.027 4.97 4.849 4.733 4.623 4.565 4.414 4.298 4.208 4.121 3.924 3.813 3.697 3.562 3.432 3.271 2.993 2.081 -4 ,28414 ,KEBNE ,16678552,Thu Nov 25 03:11:08 CET,Thu Nov 25 04:41:02 CET,0.0 0.123 0.222 0.287 0.354 0.426 0.49 0.544 0.65 0.703 0.751 0.761 0.882 0.922 1.0 1.081 1.163 1.206 1.283 1.353 1.457 1.516 1.573 1.668 1.761 1.849 1.936 2.014 2.113 2.213 2.306 2.419 2.533 2.654 2.797 2.952 3.088 3.233 3.395 3.568 3.748 3.96 4.228 4.502 4.828 5.196 5.597 6.048 6.574 7.152 7.829 8.276 8.456 8.561 8.563 8.501 8.426 8.33 8.233 8.117 7.992 7.86 7.735 7.62 7.501 7.401 7.305 7.2 7.099 7.002 6.903 6.806 6.693 6.573 6.483 6.389 6.283 6.183 6.078 5.996 5.91 5.772 5.669 5.566 5.519 5.433 5.334 5.216 5.146 4.992 4.882 4.792 4.716 4.551 4.443 4.288 4.116 3.95 3.71 3.366 2.197 -5 ,5579 ,KEBNE ,16678553,Thu Nov 25 03:12:10 CET,Thu Nov 25 04:40:06 CET,0.0 0.343 0.494 0.605 0.695 0.749 0.801 0.865 0.967 1.008 1.053 1.078 1.203 1.242 1.316 1.395 1.479 1.515 1.589 1.665 1.763 1.822 1.877 1.961 2.047 2.131 2.222 2.312 2.43 2.543 2.645 2.773 2.905 3.026 3.15 3.283 3.415 3.56 3.725 3.905 4.095 4.326 4.594 4.856 5.165 5.506 5.911 6.38 6.91 7.489 8.128 8.526 8.684 8.73 8.695 8.615 8.493 8.356 8.237 8.102 7.977 7.867 7.754 7.64 7.53 7.42 7.279 7.138 7.029 6.918 6.796 6.698 6.601 6.493 6.403 6.307 6.202 6.098 5.99 5.91 5.829 5.688 5.581 5.479 5.427 5.306 5.185 5.053 4.986 4.858 4.797 4.716 4.627 4.408 4.282 4.149 4.0 3.784 3.525 3.275 2.666 -6 ,12513 ,KEBNE ,16678554,Thu Nov 25 03:12:10 CET,Thu Nov 25 04:42:10 CET,0.0 0.183 0.293 0.347 0.408 0.461 0.51 0.562 0.658 0.705 0.75 0.756 0.877 0.922 1.015 1.098 1.173 1.207 1.275 1.344 1.441 1.51 1.584 1.686 1.784 1.878 1.959 2.037 2.154 2.269 2.371 2.491 2.607 2.716 2.848 2.992 3.128 3.285 3.463 3.66 3.87 4.09 4.332 4.588 4.892 5.228 5.626 6.074 6.59 7.232 7.939 8.401 8.595 8.613 8.568 8.488 8.397 8.281 8.131 7.972 7.82 7.683 7.54 7.392 7.239 7.087 6.94 6.819 6.716 6.601 6.481 6.391 6.282 6.165 6.082 5.992 5.884 5.76 5.647 5.567 5.477 5.329 5.223 5.119 5.066 4.957 4.838 4.696 4.622 4.485 4.413 4.329 4.25 4.067 3.957 3.844 3.708 3.518 3.297 3.019 2.203 -7 ,11668 ,KEBNE ,16678555,Thu Nov 25 03:12:10 CET,Thu Nov 25 04:41:46 CET,0.0 0.453 0.569 0.659 0.737 0.814 0.883 0.931 1.019 1.067 1.116 1.128 1.257 1.302 1.384 1.467 1.545 1.58 1.659 1.736 1.847 1.915 1.977 2.072 2.166 2.248 2.322 2.4 2.515 2.623 2.725 2.848 2.958 3.067 3.19 3.332 3.468 3.613 3.776 3.977 4.201 4.436 4.702 4.983 5.3 5.637 6.049 6.558 7.172 7.855 8.571 9.02 9.199 9.241 9.201 9.108 8.994 8.85 8.694 8.543 8.384 8.236 8.107 7.964 7.828 7.702 7.545 7.398 7.268 7.129 6.989 6.877 6.765 6.65 6.553 6.456 6.358 6.236 6.107 6.019 5.923 5.774 5.671 5.556 5.496 5.375 5.237 5.086 5.009 4.859 4.765 4.678 4.586 4.367 4.242 4.089 3.933 3.774 3.568 3.296 2.346 -8 ,28022 ,KEBNE ,16678556,Thu Nov 25 03:12:10 CET,Thu Nov 25 04:41:10 CET,0.0 0.392 0.529 0.64 0.736 0.813 0.873 0.934 1.062 1.116 1.165 1.192 1.329 1.378 1.456 1.53 1.616 1.659 1.734 1.804 1.909 1.975 2.04 2.137 2.221 2.298 2.376 2.452 2.55 2.655 2.766 2.886 2.992 3.102 3.243 3.408 3.565 3.725 3.884 4.071 4.289 4.534 4.805 5.064 5.372 5.702 6.063 6.474 6.963 7.5 8.073 8.509 8.711 8.759 8.707 8.613 8.497 8.379 8.282 8.169 8.075 7.979 7.866 7.757 7.651 7.542 7.408 7.29 7.19 7.084 6.959 6.855 6.758 6.658 6.579 6.488 6.387 6.285 6.167 6.075 5.986 5.87 5.799 5.707 5.662 5.571 5.449 5.301 5.216 5.067 4.989 4.913 4.837 4.672 4.582 4.481 4.32 4.105 3.84 3.558 2.731 -9 ,15113 ,KEBNE ,16678557,Thu Nov 25 03:12:09 CET,Thu Nov 25 04:40:06 CET,0.0 0.097 0.21 0.313 0.369 0.429 0.487 0.54 0.652 0.71 0.756 0.749 0.867 0.908 0.976 1.043 1.123 1.16 1.236 1.317 1.432 1.5 1.558 1.638 1.725 1.814 1.892 1.968 2.075 2.177 2.276 2.398 2.507 2.616 2.754 2.906 3.054 3.217 3.392 3.592 3.802 4.029 4.29 4.541 4.858 5.228 5.647 6.128 6.678 7.256 7.859 8.299 8.51 8.584 8.556 8.456 8.339 8.207 8.081 7.954 7.818 7.687 7.566 7.452 7.316 7.187 7.05 6.906 6.784 6.67 6.547 6.436 6.324 6.207 6.115 6.013 5.899 5.779 5.661 5.588 5.506 5.377 5.294 5.202 5.149 5.037 4.923 4.802 4.739 4.603 4.504 4.412 4.327 4.122 4.002 3.896 3.768 3.592 3.397 3.111 2.192 -10 ,168 ,KEBNE ,16678558,Thu Nov 25 03:12:14 CET,Thu Nov 25 04:38:01 CET,0.0 0.208 0.306 0.412 0.511 0.586 0.654 0.714 0.815 0.859 0.904 0.921 1.053 1.108 1.208 1.294 1.368 1.405 1.483 1.562 1.679 1.746 1.807 1.902 1.992 2.086 2.176 2.252 2.356 2.459 2.557 2.671 2.786 2.904 3.038 3.193 3.351 3.516 3.689 3.881 4.098 4.35 4.624 4.887 5.192 5.552 5.97 6.453 7.016 7.643 8.302 8.717 8.801 8.747 8.69 8.591 8.433 8.267 8.127 7.975 7.829 7.691 7.543 7.397 7.274 7.16 7.039 6.917 6.8 6.674 6.541 6.439 6.344 6.227 6.117 6.009 5.903 5.788 5.668 5.591 5.512 5.383 5.282 5.16 5.087 4.957 4.847 4.723 4.656 4.522 4.461 4.383 4.309 4.143 4.048 3.934 3.789 3.61 3.36 3.056 1.953 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1a.txt deleted file mode 100644 index a9d1ae6a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26736 ,KEBNE ,16678559,Thu Nov 25 03:13:11 CET,Thu Nov 25 04:42:45 CET,0.0 0.1 0.217 0.329 0.397 0.46 0.537 0.608 0.721 0.775 0.827 0.848 0.984 1.033 1.139 1.232 1.319 1.363 1.442 1.524 1.655 1.736 1.813 1.937 2.068 2.192 2.304 2.415 2.558 2.699 2.842 3.017 3.179 3.338 3.523 3.726 3.933 4.169 4.427 4.709 5.002 5.335 5.76 6.21 6.739 7.337 8.046 8.865 9.867 11.126 12.755 14.161 15.007 15.505 15.777 15.955 16.081 16.184 16.26 16.283 16.267 16.236 16.165 16.098 16.036 15.976 15.919 15.841 15.763 15.671 15.571 15.474 15.35 15.225 15.143 15.067 14.991 14.9 14.797 14.73 14.663 14.575 14.497 14.392 14.339 14.228 14.128 14.045 13.987 13.849 13.785 13.709 13.62 13.424 13.306 13.164 13.011 12.814 12.575 12.231 9.336 -2 ,19461 ,KEBNE ,16678560,Thu Nov 25 03:13:11 CET,Thu Nov 25 04:44:31 CET,0.0 0.149 0.257 0.333 0.39 0.446 0.495 0.55 0.686 0.758 0.813 0.813 0.948 0.995 1.078 1.166 1.251 1.289 1.384 1.48 1.601 1.673 1.743 1.858 1.973 2.085 2.195 2.299 2.437 2.572 2.704 2.871 3.035 3.188 3.363 3.57 3.776 4.0 4.257 4.558 4.866 5.193 5.593 6.019 6.536 7.124 7.838 8.658 9.615 10.853 12.47 13.774 14.521 15.009 15.311 15.505 15.638 15.728 15.768 15.787 15.772 15.731 15.682 15.605 15.524 15.466 15.388 15.299 15.229 15.153 15.076 15.014 14.942 14.861 14.801 14.741 14.669 14.577 14.475 14.402 14.325 14.214 14.137 14.056 14.014 13.901 13.767 13.622 13.543 13.374 13.229 13.134 13.044 12.798 12.634 12.473 12.301 12.087 11.817 11.442 9.299 -3 ,30205 ,KEBNE ,16678561,Thu Nov 25 03:13:10 CET,Thu Nov 25 04:42:34 CET,0.0 0.092 0.174 0.285 0.39 0.478 0.562 0.638 0.777 0.845 0.911 0.941 1.086 1.137 1.236 1.346 1.45 1.493 1.58 1.67 1.797 1.878 1.958 2.08 2.188 2.29 2.406 2.519 2.659 2.797 2.933 3.097 3.258 3.423 3.611 3.822 4.038 4.28 4.544 4.821 5.123 5.47 5.878 6.309 6.825 7.433 8.173 9.028 10.023 11.225 12.775 14.136 14.964 15.509 15.838 16.047 16.18 16.228 16.241 16.225 16.184 16.151 16.101 16.024 15.96 15.897 15.803 15.718 15.653 15.567 15.451 15.37 15.28 15.189 15.132 15.055 14.963 14.867 14.746 14.658 14.566 14.428 14.337 14.227 14.172 14.058 13.923 13.793 13.729 13.567 13.446 13.346 13.213 12.903 12.737 12.55 12.307 12.038 11.709 11.179 8.914 -4 ,6679 ,KEBNE ,16678562,Thu Nov 25 03:13:11 CET,Thu Nov 25 04:41:21 CET,0.0 0.225 0.333 0.426 0.535 0.634 0.706 0.781 0.918 0.975 1.044 1.082 1.221 1.277 1.386 1.478 1.569 1.616 1.711 1.799 1.93 2.014 2.094 2.21 2.318 2.419 2.523 2.629 2.764 2.9 3.035 3.206 3.375 3.539 3.739 3.967 4.183 4.419 4.679 4.959 5.266 5.622 6.02 6.429 6.943 7.528 8.211 9.047 10.091 11.356 12.906 14.244 15.062 15.551 15.851 16.053 16.178 16.258 16.3 16.32 16.318 16.29 16.255 16.232 16.203 16.154 16.073 15.987 15.912 15.836 15.748 15.682 15.624 15.544 15.476 15.403 15.33 15.243 15.144 15.069 14.989 14.867 14.77 14.664 14.617 14.514 14.39 14.266 14.199 14.052 13.954 13.859 13.764 13.505 13.367 13.232 13.067 12.82 12.509 12.123 10.218 -5 ,32720 ,KEBNE ,16678563,Thu Nov 25 03:14:13 CET,Thu Nov 25 04:46:52 CET,0.0 0.15 0.238 0.314 0.389 0.469 0.546 0.615 0.748 0.813 0.877 0.907 1.052 1.102 1.186 1.27 1.356 1.398 1.479 1.556 1.668 1.744 1.821 1.942 2.059 2.167 2.28 2.39 2.533 2.667 2.79 2.949 3.113 3.276 3.467 3.675 3.878 4.109 4.364 4.638 4.924 5.258 5.673 6.116 6.631 7.213 7.898 8.69 9.702 10.976 12.493 13.757 14.498 14.914 15.147 15.333 15.48 15.558 15.559 15.524 15.488 15.457 15.438 15.404 15.338 15.255 15.172 15.098 15.035 14.97 14.901 14.831 14.745 14.657 14.583 14.499 14.393 14.273 14.17 14.104 14.004 13.832 13.727 13.605 13.545 13.439 13.308 13.174 13.111 12.962 12.876 12.791 12.682 12.411 12.269 12.116 11.951 11.755 11.474 11.056 9.912 -6 ,15576 ,KEBNE ,16678564,Thu Nov 25 03:15:16 CET,Thu Nov 25 04:48:05 CET,0.0 0.085 0.174 0.258 0.353 0.439 0.506 0.583 0.733 0.784 0.827 0.828 0.965 1.017 1.126 1.233 1.333 1.382 1.48 1.566 1.696 1.789 1.871 1.985 2.092 2.196 2.295 2.401 2.549 2.687 2.825 2.995 3.15 3.302 3.489 3.701 3.91 4.135 4.38 4.666 4.97 5.309 5.722 6.156 6.669 7.263 7.969 8.764 9.758 11.011 12.574 13.88 14.622 15.107 15.425 15.653 15.774 15.793 15.792 15.786 15.769 15.751 15.718 15.663 15.601 15.547 15.493 15.446 15.396 15.294 15.172 15.088 15.013 14.913 14.809 14.699 14.581 14.467 14.358 14.276 14.184 14.062 13.967 13.838 13.778 13.657 13.541 13.441 13.382 13.247 13.173 13.09 12.997 12.742 12.6 12.454 12.31 12.118 11.849 11.372 9.68 -7 ,19825 ,KEBNE ,16678565,Thu Nov 25 03:15:15 CET,Thu Nov 25 04:45:24 CET,0.0 0.186 0.312 0.403 0.504 0.609 0.691 0.759 0.893 0.953 1.011 1.035 1.176 1.236 1.353 1.46 1.563 1.609 1.697 1.785 1.927 2.011 2.094 2.219 2.332 2.443 2.558 2.677 2.825 2.963 3.101 3.269 3.431 3.59 3.786 4.0 4.207 4.445 4.694 4.972 5.272 5.608 6.014 6.434 6.94 7.527 8.212 9.017 10.01 11.224 12.714 13.975 14.767 15.289 15.616 15.823 15.939 15.989 15.997 15.986 15.975 15.956 15.923 15.861 15.76 15.667 15.587 15.521 15.456 15.37 15.276 15.199 15.128 15.045 14.961 14.877 14.791 14.681 14.563 14.484 14.407 14.305 14.222 14.11 14.054 13.956 13.842 13.706 13.631 13.471 13.328 13.2 13.052 12.732 12.551 12.333 12.118 11.9 11.58 11.05 8.388 -8 ,1082 ,KEBNE ,16678566,Thu Nov 25 03:15:16 CET,Thu Nov 25 04:45:08 CET,0.0 0.15 0.235 0.323 0.41 0.491 0.566 0.636 0.76 0.83 0.904 0.933 1.068 1.116 1.224 1.321 1.405 1.446 1.533 1.628 1.766 1.849 1.929 2.052 2.163 2.27 2.388 2.501 2.642 2.78 2.915 3.091 3.265 3.425 3.602 3.808 4.016 4.251 4.51 4.778 5.066 5.402 5.813 6.254 6.77 7.364 8.094 8.972 10.022 11.246 12.761 14.095 14.894 15.376 15.684 15.871 15.991 16.072 16.103 16.108 16.094 16.07 16.018 15.939 15.876 15.819 15.734 15.649 15.583 15.513 15.421 15.353 15.277 15.182 15.111 15.034 14.925 14.804 14.717 14.665 14.602 14.485 14.403 14.317 14.262 14.141 14.01 13.855 13.762 13.604 13.496 13.381 13.234 12.913 12.737 12.548 12.343 12.096 11.734 11.186 8.381 -9 ,16997 ,KEBNE ,16678567,Thu Nov 25 03:15:15 CET,Thu Nov 25 04:44:29 CET,0.0 0.169 0.289 0.392 0.471 0.555 0.63 0.688 0.814 0.872 0.929 0.953 1.087 1.131 1.225 1.312 1.398 1.442 1.524 1.608 1.734 1.81 1.882 1.985 2.087 2.187 2.297 2.419 2.575 2.716 2.843 3.003 3.156 3.302 3.486 3.697 3.895 4.113 4.356 4.626 4.914 5.259 5.663 6.065 6.572 7.165 7.868 8.701 9.704 10.957 12.551 13.873 14.657 15.164 15.508 15.735 15.873 15.953 15.973 15.96 15.929 15.886 15.85 15.817 15.785 15.739 15.659 15.578 15.505 15.427 15.357 15.299 15.217 15.122 15.049 14.967 14.875 14.783 14.685 14.621 14.544 14.412 14.327 14.226 14.168 14.04 13.91 13.765 13.691 13.539 13.432 13.34 13.23 13.01 12.868 12.71 12.546 12.306 11.98 11.48 9.372 -10 ,1995 ,KEBNE ,16678568,Thu Nov 25 03:15:15 CET,Thu Nov 25 04:43:42 CET,0.0 0.153 0.242 0.338 0.418 0.492 0.578 0.641 0.74 0.789 0.846 0.883 1.024 1.069 1.167 1.272 1.369 1.416 1.511 1.598 1.72 1.796 1.873 1.986 2.1 2.207 2.303 2.407 2.542 2.673 2.812 2.98 3.149 3.314 3.497 3.718 3.918 4.13 4.369 4.628 4.911 5.244 5.641 6.053 6.57 7.179 7.918 8.771 9.776 11.039 12.64 14.09 15.019 15.613 15.94 16.156 16.319 16.385 16.405 16.441 16.453 16.447 16.411 16.35 16.312 16.267 16.176 16.093 16.026 15.941 15.845 15.77 15.693 15.611 15.536 15.447 15.34 15.207 15.061 14.968 14.882 14.743 14.641 14.509 14.434 14.291 14.14 13.993 13.909 13.757 13.682 13.601 13.515 13.311 13.175 13.01 12.847 12.664 12.369 11.927 10.235 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1b.txt deleted file mode 100644 index 7265ae55..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11614 ,KEBNE ,16678569,Thu Nov 25 03:15:16 CET,Thu Nov 25 04:44:28 CET,0.0 0.213 0.338 0.471 0.593 0.696 0.786 0.873 1.046 1.125 1.188 1.235 1.394 1.454 1.565 1.67 1.775 1.831 1.94 2.044 2.208 2.316 2.422 2.577 2.719 2.851 2.977 3.091 3.238 3.385 3.527 3.712 3.894 4.059 4.262 4.498 4.708 4.93 5.176 5.442 5.733 6.064 6.455 6.86 7.336 7.861 8.462 9.114 9.861 10.724 11.711 12.447 12.793 12.973 13.046 13.051 13.036 12.981 12.887 12.774 12.674 12.574 12.46 12.338 12.214 12.106 11.991 11.866 11.759 11.632 11.491 11.39 11.277 11.144 11.04 10.939 10.832 10.727 10.615 10.533 10.449 10.313 10.214 10.105 10.05 9.923 9.789 9.658 9.585 9.437 9.365 9.273 9.177 8.963 8.817 8.666 8.519 8.341 8.119 7.8 6.922 -2 ,15549 ,KEBNE ,16678570,Thu Nov 25 03:15:20 CET,Thu Nov 25 04:41:23 CET,0.0 0.385 0.505 0.625 0.749 0.847 0.923 1.006 1.167 1.245 1.324 1.369 1.513 1.574 1.693 1.797 1.904 1.959 2.056 2.154 2.317 2.415 2.503 2.641 2.784 2.917 3.041 3.166 3.327 3.479 3.63 3.821 4.01 4.181 4.365 4.575 4.787 5.022 5.271 5.543 5.833 6.149 6.519 6.901 7.351 7.851 8.463 9.146 9.926 10.852 11.946 12.768 13.185 13.383 13.456 13.475 13.47 13.427 13.339 13.23 13.123 13.038 12.953 12.861 12.779 12.694 12.584 12.471 12.366 12.262 12.145 12.046 11.946 11.834 11.735 11.612 11.482 11.363 11.241 11.141 11.043 10.908 10.794 10.674 10.614 10.493 10.363 10.211 10.136 9.979 9.87 9.789 9.709 9.491 9.353 9.194 9.008 8.802 8.579 8.284 7.025 -3 ,1173 ,KEBNE ,16678571,Thu Nov 25 03:16:18 CET,Thu Nov 25 04:45:34 CET,0.0 0.26 0.478 0.629 0.729 0.835 0.926 0.998 1.132 1.199 1.267 1.323 1.477 1.548 1.696 1.831 1.944 1.998 2.119 2.236 2.392 2.49 2.582 2.714 2.84 2.963 3.091 3.221 3.379 3.525 3.672 3.857 4.035 4.201 4.395 4.62 4.84 5.089 5.357 5.634 5.916 6.228 6.603 6.974 7.421 7.941 8.546 9.22 9.98 10.907 11.969 12.699 13.081 13.263 13.33 13.332 13.308 13.242 13.181 13.108 13.013 12.915 12.802 12.693 12.594 12.494 12.393 12.3 12.199 12.093 11.986 11.893 11.799 11.691 11.597 11.511 11.426 11.335 11.236 11.153 11.064 10.932 10.836 10.735 10.685 10.573 10.449 10.327 10.26 10.105 9.999 9.907 9.826 9.626 9.504 9.379 9.25 9.1 8.919 8.628 7.609 -4 ,31326 ,KEBNE ,16678572,Thu Nov 25 03:16:18 CET,Thu Nov 25 04:48:05 CET,0.0 0.283 0.468 0.59 0.692 0.814 0.933 1.021 1.183 1.261 1.335 1.402 1.565 1.629 1.747 1.857 1.96 2.017 2.127 2.226 2.376 2.477 2.569 2.695 2.828 2.96 3.082 3.204 3.365 3.51 3.653 3.839 4.018 4.185 4.38 4.619 4.857 5.107 5.367 5.646 5.939 6.263 6.642 7.022 7.466 7.967 8.545 9.219 10.022 10.941 12.067 12.987 13.399 13.597 13.686 13.722 13.734 13.694 13.633 13.56 13.484 13.422 13.349 13.264 13.187 13.105 13.003 12.901 12.805 12.707 12.601 12.509 12.414 12.291 12.185 12.099 12.012 11.9 11.78 11.696 11.607 11.478 11.395 11.284 11.216 11.093 10.968 10.831 10.76 10.606 10.534 10.438 10.331 10.094 9.943 9.798 9.667 9.51 9.282 8.977 7.72 -5 ,23502 ,KEBNE ,16678573,Thu Nov 25 03:16:22 CET,Thu Nov 25 04:43:35 CET,0.0 0.287 0.505 0.658 0.798 0.942 1.056 1.14 1.287 1.357 1.417 1.44 1.59 1.655 1.771 1.897 2.028 2.088 2.2 2.301 2.447 2.544 2.643 2.782 2.918 3.044 3.165 3.288 3.443 3.594 3.737 3.901 4.069 4.251 4.463 4.679 4.884 5.123 5.384 5.655 5.928 6.237 6.618 7.0 7.44 7.944 8.531 9.175 9.952 10.857 11.869 12.668 13.053 13.214 13.302 13.341 13.319 13.254 13.175 13.098 13.032 12.944 12.834 12.72 12.609 12.508 12.38 12.253 12.147 12.027 11.892 11.772 11.647 11.527 11.43 11.313 11.191 11.064 10.922 10.828 10.754 10.638 10.531 10.398 10.33 10.207 10.073 9.921 9.836 9.671 9.55 9.435 9.339 9.113 8.961 8.812 8.628 8.38 8.089 7.801 6.896 -6 ,21445 ,KEBNE ,16678574,Thu Nov 25 03:16:20 CET,Thu Nov 25 04:44:35 CET,0.0 0.262 0.397 0.517 0.607 0.692 0.782 0.858 1.008 1.082 1.15 1.208 1.366 1.426 1.54 1.665 1.788 1.85 1.962 2.065 2.219 2.313 2.408 2.543 2.669 2.799 2.933 3.066 3.222 3.366 3.514 3.693 3.863 4.022 4.212 4.44 4.655 4.891 5.162 5.449 5.733 6.037 6.382 6.752 7.199 7.7 8.29 8.939 9.724 10.688 11.748 12.52 12.867 13.035 13.118 13.111 13.048 12.967 12.884 12.771 12.634 12.505 12.389 12.27 12.154 12.035 11.893 11.769 11.665 11.552 11.433 11.338 11.221 11.086 10.966 10.844 10.746 10.654 10.555 10.473 10.381 10.205 10.071 9.962 9.909 9.793 9.688 9.563 9.493 9.351 9.285 9.185 9.066 8.819 8.669 8.51 8.365 8.215 8.015 7.683 6.68 -7 ,18757 ,KEBNE ,16678575,Thu Nov 25 03:17:19 CET,Thu Nov 25 04:46:02 CET,0.0 0.331 0.541 0.684 0.783 0.872 0.967 1.048 1.199 1.268 1.329 1.377 1.533 1.6 1.728 1.854 1.982 2.042 2.154 2.267 2.424 2.518 2.609 2.745 2.877 3.006 3.127 3.248 3.406 3.565 3.719 3.909 4.087 4.25 4.444 4.67 4.884 5.116 5.375 5.666 5.965 6.293 6.678 7.082 7.559 8.071 8.657 9.337 10.143 11.055 12.103 12.9 13.28 13.444 13.516 13.548 13.519 13.453 13.372 13.281 13.195 13.089 12.958 12.815 12.678 12.572 12.465 12.331 12.199 12.073 11.96 11.871 11.777 11.672 11.581 11.487 11.393 11.278 11.165 11.085 10.99 10.853 10.754 10.623 10.55 10.425 10.311 10.173 10.095 9.948 9.863 9.771 9.673 9.436 9.289 9.123 8.964 8.813 8.614 8.245 6.444 -8 ,20836 ,KEBNE ,16678576,Thu Nov 25 03:17:19 CET,Thu Nov 25 04:44:26 CET,0.0 0.213 0.396 0.577 0.71 0.809 0.895 0.975 1.141 1.223 1.31 1.393 1.547 1.606 1.717 1.821 1.929 1.987 2.1 2.2 2.353 2.451 2.535 2.663 2.803 2.944 3.071 3.198 3.366 3.512 3.66 3.849 4.032 4.202 4.398 4.633 4.848 5.086 5.354 5.635 5.921 6.236 6.621 7.023 7.486 7.977 8.539 9.201 9.968 10.843 11.87 12.604 12.957 13.122 13.167 13.148 13.09 13.034 12.988 12.896 12.776 12.66 12.548 12.424 12.292 12.166 12.036 11.921 11.811 11.708 11.609 11.514 11.409 11.296 11.201 11.104 11.0 10.878 10.752 10.676 10.601 10.448 10.326 10.21 10.15 10.005 9.839 9.667 9.581 9.42 9.296 9.176 9.056 8.805 8.693 8.581 8.437 8.228 7.973 7.614 6.25 -9 ,17519 ,KEBNE ,16678577,Thu Nov 25 03:17:19 CET,Thu Nov 25 04:45:41 CET,0.0 0.272 0.447 0.566 0.677 0.782 0.869 0.949 1.1 1.165 1.229 1.274 1.429 1.492 1.607 1.713 1.826 1.889 1.999 2.087 2.226 2.327 2.426 2.566 2.695 2.819 2.946 3.074 3.234 3.387 3.539 3.721 3.894 4.054 4.243 4.456 4.655 4.872 5.12 5.399 5.681 5.995 6.357 6.728 7.182 7.664 8.227 8.901 9.682 10.579 11.624 12.407 12.729 12.809 12.797 12.756 12.704 12.632 12.527 12.407 12.289 12.173 12.051 11.904 11.774 11.651 11.531 11.444 11.364 11.261 11.123 10.996 10.871 10.742 10.632 10.524 10.426 10.338 10.24 10.151 10.048 9.89 9.778 9.66 9.601 9.481 9.345 9.198 9.117 8.94 8.812 8.703 8.586 8.326 8.174 8.012 7.839 7.65 7.411 7.055 5.868 -10 ,5697 ,KEBNE ,16678578,Thu Nov 25 03:17:19 CET,Thu Nov 25 04:49:31 CET,0.0 0.219 0.405 0.573 0.68 0.775 0.869 0.962 1.129 1.195 1.261 1.308 1.457 1.522 1.646 1.774 1.892 1.939 2.033 2.131 2.274 2.372 2.469 2.611 2.752 2.876 2.984 3.092 3.248 3.407 3.552 3.724 3.889 4.049 4.24 4.459 4.676 4.912 5.165 5.443 5.746 6.079 6.471 6.88 7.345 7.861 8.47 9.137 9.893 10.796 11.845 12.637 13.058 13.255 13.301 13.306 13.296 13.251 13.202 13.124 13.026 12.927 12.827 12.738 12.663 12.591 12.503 12.405 12.315 12.227 12.118 12.026 11.932 11.816 11.712 11.616 11.527 11.419 11.293 11.2 11.108 10.966 10.854 10.731 10.67 10.556 10.436 10.303 10.214 10.032 9.904 9.806 9.718 9.518 9.415 9.306 9.167 9.005 8.785 8.483 7.573 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt deleted file mode 100644 index 6578f923..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31590 ,KEBNE ,17024296,Wed Dec 22 09:49:55 CET,Wed Dec 22 11:19:05 CET,0.0 0.357 0.527 0.656 0.747 0.835 0.917 1.004 1.181 1.261 1.328 1.343 1.497 1.553 1.673 1.796 1.918 1.974 2.079 2.182 2.332 2.433 2.537 2.684 2.804 2.925 3.047 3.158 3.302 3.447 3.587 3.765 3.942 4.101 4.303 4.535 4.745 4.971 5.211 5.489 5.794 6.141 6.544 6.925 7.357 7.844 8.423 9.101 9.909 10.811 11.86 12.658 13.083 13.313 13.43 13.466 13.452 13.418 13.373 13.315 13.258 13.207 13.143 13.072 13.0 12.919 12.827 12.742 12.662 12.575 12.5 12.439 12.366 12.285 12.218 12.143 12.064 11.992 11.914 11.856 11.793 11.702 11.641 11.567 11.53 11.457 11.385 11.308 11.263 11.127 11.111 11.062 11.003 10.856 10.773 10.684 10.587 10.474 10.332 10.172 9.812 -2 ,14206 ,KEBNE ,17024297,Wed Dec 22 09:49:55 CET,Wed Dec 22 11:19:04 CET,0.0 0.304 0.435 0.547 0.653 0.754 0.848 0.931 1.069 1.13 1.191 1.218 1.376 1.431 1.539 1.646 1.768 1.826 1.923 2.016 2.163 2.258 2.346 2.473 2.599 2.719 2.836 2.944 3.087 3.24 3.394 3.571 3.741 3.91 4.1 4.305 4.507 4.742 5.001 5.286 5.585 5.93 6.323 6.721 7.207 7.723 8.309 9.005 9.839 10.771 11.847 12.693 13.135 13.385 13.474 13.502 13.526 13.501 13.457 13.389 13.328 13.283 13.225 13.163 13.095 13.023 12.939 12.864 12.791 12.704 12.613 12.538 12.454 12.374 12.314 12.246 12.176 12.093 12.006 11.943 11.87 11.755 11.681 11.618 11.585 11.511 11.424 11.322 11.268 11.135 11.126 11.065 10.998 10.84 10.757 10.684 10.609 10.505 10.363 10.203 9.879 -3 ,5733 ,KEBNE ,17024298,Wed Dec 22 09:49:55 CET,Wed Dec 22 11:19:23 CET,0.0 0.286 0.448 0.576 0.676 0.767 0.856 0.944 1.101 1.174 1.245 1.302 1.464 1.524 1.644 1.766 1.883 1.936 2.039 2.134 2.267 2.355 2.447 2.584 2.717 2.841 2.959 3.078 3.227 3.379 3.535 3.726 3.903 4.075 4.28 4.509 4.736 4.971 5.226 5.5 5.778 6.101 6.488 6.881 7.355 7.882 8.504 9.213 9.969 10.789 11.759 12.5 12.922 13.19 13.296 13.289 13.269 13.249 13.209 13.136 13.042 12.948 12.868 12.799 12.741 12.701 12.655 12.611 12.561 12.486 12.401 12.327 12.248 12.152 12.083 12.022 11.949 11.873 11.792 11.732 11.674 11.58 11.512 11.447 11.414 11.358 11.297 11.214 11.17 11.032 11.021 10.975 10.919 10.798 10.741 10.675 10.595 10.512 10.419 10.299 10.023 -4 ,4734 ,KEBNE ,17024299,Wed Dec 22 09:49:54 CET,Wed Dec 22 11:19:35 CET,0.0 0.304 0.477 0.603 0.721 0.833 0.926 1.004 1.131 1.196 1.268 1.291 1.452 1.517 1.627 1.73 1.827 1.879 1.99 2.09 2.233 2.334 2.438 2.581 2.708 2.841 2.966 3.083 3.241 3.393 3.542 3.723 3.89 4.046 4.243 4.463 4.672 4.911 5.172 5.452 5.747 6.078 6.464 6.861 7.333 7.831 8.4 9.074 9.881 10.826 11.964 12.855 13.285 13.541 13.696 13.785 13.833 13.836 13.812 13.761 13.696 13.622 13.532 13.454 13.387 13.31 13.221 13.141 13.066 12.979 12.885 12.803 12.719 12.632 12.561 12.492 12.422 12.347 12.26 12.198 12.14 12.04 11.968 11.9 11.865 11.781 11.688 11.58 11.529 11.387 11.35 11.296 11.248 11.14 11.071 10.989 10.88 10.764 10.652 10.531 10.303 -5 ,13315 ,KEBNE ,17024300,Wed Dec 22 09:49:55 CET,Wed Dec 22 11:19:34 CET,0.0 0.226 0.376 0.497 0.594 0.705 0.815 0.922 1.106 1.176 1.244 1.281 1.445 1.508 1.614 1.711 1.805 1.848 1.947 2.045 2.173 2.255 2.339 2.461 2.584 2.713 2.839 2.965 3.124 3.274 3.436 3.636 3.81 3.968 4.161 4.386 4.589 4.813 5.073 5.357 5.658 5.984 6.366 6.763 7.219 7.733 8.33 9.011 9.804 10.715 11.746 12.541 13.015 13.265 13.364 13.415 13.434 13.396 13.346 13.311 13.266 13.223 13.174 13.12 13.074 13.02 12.944 12.86 12.78 12.705 12.638 12.581 12.512 12.437 12.386 12.332 12.264 12.195 12.124 12.078 12.028 11.942 11.881 11.814 11.781 11.715 11.64 11.559 11.509 11.372 11.37 11.324 11.268 11.127 11.052 10.981 10.891 10.778 10.666 10.551 10.323 -6 ,19096 ,KEBNE ,17024301,Wed Dec 22 09:49:55 CET,Wed Dec 22 11:19:14 CET,0.0 0.202 0.326 0.42 0.526 0.623 0.715 0.806 0.966 1.043 1.116 1.147 1.303 1.367 1.494 1.608 1.73 1.787 1.888 1.981 2.113 2.2 2.288 2.412 2.536 2.67 2.799 2.918 3.072 3.233 3.387 3.557 3.731 3.919 4.13 4.356 4.572 4.809 5.071 5.352 5.66 6.002 6.391 6.789 7.259 7.8 8.436 9.151 9.978 10.886 12.027 12.986 13.442 13.68 13.797 13.825 13.789 13.744 13.701 13.655 13.604 13.551 13.501 13.443 13.379 13.307 13.226 13.142 13.066 12.988 12.903 12.843 12.777 12.68 12.604 12.538 12.475 12.396 12.308 12.246 12.18 12.074 12.003 11.944 11.913 11.848 11.785 11.707 11.657 11.521 11.509 11.45 11.388 11.26 11.204 11.126 11.013 10.896 10.778 10.665 10.431 -7 ,8103 ,KEBNE ,17024302,Wed Dec 22 09:49:55 CET,Wed Dec 22 11:19:42 CET,0.0 0.302 0.448 0.567 0.673 0.764 0.849 0.932 1.099 1.172 1.243 1.285 1.449 1.507 1.616 1.735 1.865 1.923 2.031 2.145 2.297 2.392 2.483 2.603 2.727 2.857 2.978 3.097 3.249 3.398 3.545 3.725 3.907 4.08 4.263 4.482 4.702 4.941 5.203 5.481 5.761 6.076 6.455 6.834 7.291 7.797 8.375 9.039 9.812 10.697 11.788 12.635 13.034 13.274 13.423 13.477 13.48 13.48 13.477 13.422 13.329 13.232 13.132 13.047 12.968 12.89 12.809 12.732 12.661 12.586 12.5 12.43 12.367 12.292 12.226 12.159 12.091 12.029 11.955 11.899 11.848 11.768 11.712 11.647 11.61 11.536 11.458 11.372 11.332 11.201 11.181 11.128 11.061 10.9 10.817 10.725 10.625 10.515 10.386 10.191 9.839 -8 ,19460 ,KEBNE ,17024303,Wed Dec 22 09:49:55 CET,Wed Dec 22 11:19:09 CET,0.0 0.32 0.504 0.631 0.748 0.855 0.951 1.043 1.199 1.267 1.338 1.376 1.544 1.608 1.728 1.849 1.97 2.024 2.133 2.239 2.396 2.494 2.587 2.727 2.851 2.969 3.085 3.198 3.347 3.484 3.625 3.793 3.95 4.117 4.313 4.539 4.755 4.989 5.249 5.522 5.822 6.168 6.574 6.991 7.482 8.06 8.71 9.409 10.215 11.182 12.347 13.217 13.689 13.991 14.129 14.188 14.191 14.151 14.127 14.086 14.029 13.971 13.9 13.824 13.753 13.68 13.604 13.538 13.471 13.392 13.299 13.207 13.108 13.009 12.941 12.863 12.784 12.717 12.632 12.573 12.515 12.411 12.334 12.256 12.223 12.15 12.069 11.993 11.953 11.82 11.816 11.772 11.713 11.591 11.529 11.456 11.363 11.241 11.132 11.028 10.76 -9 ,21497 ,KEBNE ,17024304,Wed Dec 22 09:49:55 CET,Wed Dec 22 11:20:00 CET,0.0 0.135 0.247 0.35 0.468 0.581 0.665 0.746 0.916 0.997 1.071 1.116 1.291 1.364 1.5 1.616 1.722 1.773 1.882 1.995 2.137 2.231 2.332 2.475 2.616 2.746 2.868 2.998 3.16 3.32 3.478 3.663 3.848 4.024 4.225 4.45 4.656 4.877 5.132 5.412 5.689 6.013 6.425 6.821 7.266 7.773 8.364 9.051 9.869 10.871 12.022 12.879 13.387 13.675 13.821 13.887 13.91 13.864 13.809 13.767 13.698 13.622 13.555 13.484 13.408 13.337 13.255 13.169 13.096 13.024 12.945 12.874 12.797 12.723 12.673 12.62 12.557 12.488 12.423 12.375 12.317 12.232 12.18 12.11 12.065 11.98 11.907 11.828 11.771 11.618 11.602 11.552 11.506 11.389 11.322 11.26 11.168 11.061 10.916 10.734 10.126 -10 ,32737 ,KEBNE ,17024305,Wed Dec 22 09:49:55 CET,Wed Dec 22 11:20:20 CET,0.0 0.258 0.368 0.469 0.585 0.707 0.798 0.877 1.024 1.098 1.179 1.221 1.374 1.424 1.543 1.648 1.749 1.806 1.903 1.998 2.144 2.234 2.327 2.462 2.585 2.702 2.816 2.931 3.086 3.23 3.368 3.525 3.68 3.848 4.044 4.257 4.474 4.72 4.967 5.228 5.522 5.865 6.263 6.656 7.117 7.634 8.242 8.927 9.697 10.603 11.668 12.471 12.909 13.17 13.305 13.348 13.374 13.378 13.337 13.254 13.158 13.064 12.978 12.894 12.815 12.74 12.652 12.568 12.487 12.4 12.325 12.267 12.196 12.114 12.053 11.992 11.93 11.857 11.775 11.726 11.682 11.607 11.54 11.468 11.43 11.35 11.274 11.198 11.155 11.019 11.002 10.947 10.89 10.771 10.7 10.624 10.538 10.414 10.231 9.993 9.428 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_7.txt deleted file mode 100644 index bd258091..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1607 ,KEBNE ,16678579,Thu Nov 25 03:18:21 CET,Thu Nov 25 04:48:48 CET,0.0 0.051 0.078 0.108 0.141 0.16 0.184 0.208 0.235 0.236 0.238 0.167 0.275 0.275 0.253 0.227 0.203 0.194 0.181 0.155 0.106 0.075 0.042 -0.012 -0.071 -0.137 -0.197 -0.253 -0.335 -0.414 -0.499 -0.612 -0.734 -0.858 -1.007 -1.185 -1.367 -1.589 -1.836 -2.112 -2.42 -2.804 -3.322 -3.905 -4.646 -5.533 -6.696 -8.15 -10.01 -12.609 -16.608 -20.961 -24.261 -26.884 -29.026 -30.813 -32.277 -33.55 -34.626 -35.7 -36.611 -37.387 -38.077 -38.7 -39.272 -39.793 -40.331 -40.808 -41.216 -41.614 -42.004 -42.322 -42.657 -43.022 -43.3 -43.572 -43.84 -44.116 -44.409 -44.612 -44.826 -45.14 -45.354 -45.581 -45.694 -45.915 -46.148 -46.404 -46.535 -46.809 -46.905 -47.034 -47.162 -47.467 -47.63 -47.81 -48.009 -48.208 -48.405 -48.648 -48.972 -2 ,16504 ,KEBNE ,16678580,Thu Nov 25 03:18:21 CET,Thu Nov 25 04:51:40 CET,0.0 0.075 0.105 0.132 0.151 0.158 0.179 0.203 0.225 0.229 0.228 0.138 0.247 0.254 0.248 0.23 0.214 0.208 0.199 0.188 0.173 0.158 0.132 0.093 0.049 0.0 -0.047 -0.099 -0.183 -0.267 -0.344 -0.443 -0.554 -0.668 -0.822 -1.012 -1.194 -1.404 -1.647 -1.94 -2.276 -2.681 -3.202 -3.775 -4.504 -5.41 -6.557 -7.976 -9.861 -12.504 -16.552 -20.949 -24.27 -26.839 -28.918 -30.719 -32.228 -33.504 -34.581 -35.682 -36.577 -37.333 -38.001 -38.605 -39.185 -39.699 -40.209 -40.659 -41.054 -41.451 -41.85 -42.176 -42.529 -42.91 -43.201 -43.488 -43.771 -44.065 -44.371 -44.581 -44.79 -45.103 -45.32 -45.534 -45.642 -45.875 -46.125 -46.376 -46.502 -46.785 -46.92 -47.072 -47.225 -47.528 -47.673 -47.831 -48.005 -48.198 -48.411 -48.651 -49.078 -3 ,3674 ,KEBNE ,16678581,Thu Nov 25 03:19:23 CET,Thu Nov 25 04:52:33 CET,0.0 0.121 0.221 0.275 0.321 0.348 0.353 0.364 0.38 0.38 0.379 0.271 0.365 0.363 0.357 0.349 0.331 0.319 0.299 0.283 0.255 0.232 0.209 0.168 0.115 0.055 0.002 -0.056 -0.144 -0.232 -0.32 -0.419 -0.524 -0.641 -0.794 -0.983 -1.165 -1.366 -1.614 -1.907 -2.238 -2.642 -3.168 -3.746 -4.459 -5.346 -6.495 -7.926 -9.847 -12.55 -16.625 -20.988 -24.342 -26.888 -28.821 -30.512 -31.984 -33.277 -34.331 -35.344 -36.206 -36.978 -37.685 -38.334 -38.931 -39.455 -39.986 -40.465 -40.876 -41.269 -41.689 -42.04 -42.39 -42.747 -43.017 -43.299 -43.587 -43.867 -44.153 -44.351 -44.544 -44.844 -45.066 -45.292 -45.404 -45.649 -45.898 -46.152 -46.285 -46.566 -46.703 -46.847 -46.988 -47.277 -47.444 -47.628 -47.799 -47.975 -48.194 -48.462 -48.914 -4 ,6128 ,KEBNE ,16678582,Thu Nov 25 03:20:24 CET,Thu Nov 25 04:52:24 CET,0.0 0.174 0.22 0.288 0.333 0.348 0.372 0.381 0.389 0.401 0.415 0.34 0.447 0.447 0.443 0.438 0.432 0.422 0.385 0.354 0.325 0.304 0.28 0.243 0.197 0.14 0.083 0.032 -0.031 -0.11 -0.19 -0.277 -0.38 -0.488 -0.61 -0.777 -0.965 -1.184 -1.439 -1.728 -2.051 -2.46 -2.974 -3.497 -4.181 -5.048 -6.144 -7.585 -9.537 -12.263 -16.384 -20.77 -24.105 -26.749 -28.837 -30.57 -32.014 -33.289 -34.373 -35.405 -36.237 -36.971 -37.656 -38.298 -38.918 -39.477 -40.01 -40.459 -40.859 -41.263 -41.669 -42.018 -42.371 -42.724 -42.997 -43.277 -43.565 -43.844 -44.131 -44.321 -44.487 -44.753 -44.957 -45.173 -45.278 -45.504 -45.739 -45.973 -46.106 -46.398 -46.564 -46.736 -46.919 -47.335 -47.554 -47.805 -48.076 -48.36 -48.658 -49.06 -49.863 -5 ,31113 ,KEBNE ,16678583,Thu Nov 25 03:20:24 CET,Thu Nov 25 04:50:51 CET,0.0 0.069 0.142 0.178 0.215 0.255 0.264 0.275 0.303 0.299 0.298 0.212 0.317 0.315 0.302 0.292 0.276 0.265 0.241 0.218 0.193 0.169 0.138 0.1 0.062 0.008 -0.047 -0.099 -0.18 -0.263 -0.351 -0.476 -0.607 -0.742 -0.903 -1.093 -1.284 -1.504 -1.763 -2.045 -2.366 -2.758 -3.263 -3.836 -4.561 -5.432 -6.554 -8.01 -9.966 -12.645 -16.66 -21.026 -24.311 -26.833 -28.901 -30.691 -32.171 -33.492 -34.591 -35.628 -36.469 -37.199 -37.901 -38.547 -39.135 -39.684 -40.253 -40.734 -41.146 -41.571 -42.0 -42.35 -42.697 -43.034 -43.289 -43.573 -43.875 -44.171 -44.475 -44.689 -44.913 -45.234 -45.442 -45.664 -45.777 -46.003 -46.244 -46.499 -46.622 -46.894 -47.014 -47.165 -47.316 -47.624 -47.803 -47.979 -48.157 -48.346 -48.564 -48.884 -49.404 -6 ,9528 ,KEBNE ,16678584,Thu Nov 25 03:20:24 CET,Thu Nov 25 04:50:15 CET,0.0 0.04 0.099 0.176 0.24 0.296 0.332 0.344 0.356 0.365 0.371 0.271 0.374 0.375 0.369 0.354 0.338 0.331 0.307 0.28 0.257 0.236 0.208 0.174 0.136 0.082 0.019 -0.05 -0.14 -0.228 -0.324 -0.459 -0.589 -0.718 -0.883 -1.071 -1.244 -1.448 -1.701 -1.996 -2.328 -2.72 -3.209 -3.766 -4.476 -5.338 -6.433 -7.843 -9.779 -12.404 -16.353 -20.704 -23.933 -26.434 -28.482 -30.263 -31.755 -33.026 -34.101 -35.147 -36.015 -36.817 -37.562 -38.216 -38.814 -39.356 -39.907 -40.384 -40.784 -41.194 -41.622 -41.957 -42.281 -42.628 -42.895 -43.159 -43.427 -43.705 -44.018 -44.237 -44.447 -44.764 -44.992 -45.218 -45.327 -45.555 -45.797 -46.032 -46.158 -46.443 -46.568 -46.718 -46.876 -47.199 -47.363 -47.53 -47.732 -47.97 -48.237 -48.511 -48.972 -7 ,27543 ,KEBNE ,16678585,Thu Nov 25 03:20:28 CET,Thu Nov 25 04:48:45 CET,0.0 0.208 0.307 0.37 0.418 0.472 0.517 0.542 0.553 0.557 0.564 0.464 0.553 0.551 0.557 0.545 0.532 0.531 0.529 0.517 0.493 0.48 0.462 0.416 0.357 0.303 0.245 0.179 0.098 0.026 -0.052 -0.167 -0.287 -0.407 -0.563 -0.763 -0.962 -1.183 -1.428 -1.709 -2.044 -2.453 -2.978 -3.565 -4.283 -5.139 -6.274 -7.717 -9.615 -12.282 -16.361 -20.775 -24.166 -26.8 -28.888 -30.673 -32.128 -33.376 -34.412 -35.44 -36.317 -37.085 -37.794 -38.435 -39.045 -39.621 -40.204 -40.707 -41.136 -41.571 -42.012 -42.359 -42.701 -43.061 -43.331 -43.588 -43.856 -44.133 -44.417 -44.615 -44.816 -45.134 -45.351 -45.571 -45.688 -45.925 -46.159 -46.408 -46.543 -46.827 -46.948 -47.092 -47.232 -47.501 -47.655 -47.817 -47.98 -48.155 -48.369 -48.622 -49.019 -8 ,20413 ,KEBNE ,16678586,Thu Nov 25 03:22:31 CET,Thu Nov 25 04:48:57 CET,0.0 0.198 0.27 0.323 0.359 0.378 0.389 0.39 0.406 0.432 0.452 0.386 0.5 0.499 0.482 0.47 0.455 0.447 0.425 0.402 0.367 0.342 0.32 0.276 0.228 0.181 0.132 0.085 0.018 -0.058 -0.134 -0.222 -0.31 -0.414 -0.556 -0.729 -0.926 -1.162 -1.428 -1.735 -2.092 -2.52 -3.056 -3.638 -4.344 -5.222 -6.387 -7.878 -9.792 -12.386 -16.373 -20.608 -23.866 -26.536 -28.629 -30.401 -31.907 -33.214 -34.33 -35.396 -36.295 -37.075 -37.799 -38.493 -39.107 -39.629 -40.168 -40.653 -41.071 -41.494 -41.925 -42.286 -42.65 -43.021 -43.304 -43.573 -43.838 -44.112 -44.389 -44.581 -44.785 -45.087 -45.291 -45.5 -45.602 -45.81 -46.034 -46.288 -46.42 -46.697 -46.815 -46.957 -47.11 -47.432 -47.592 -47.747 -47.922 -48.131 -48.344 -48.602 -49.065 -9 ,18597 ,KEBNE ,16678587,Thu Nov 25 03:23:29 CET,Thu Nov 25 04:54:23 CET,0.0 0.035 0.097 0.134 0.156 0.177 0.191 0.21 0.238 0.246 0.249 0.155 0.257 0.25 0.238 0.227 0.213 0.207 0.194 0.173 0.126 0.092 0.061 0.017 -0.025 -0.069 -0.124 -0.182 -0.255 -0.326 -0.405 -0.503 -0.595 -0.698 -0.839 -1.023 -1.207 -1.426 -1.674 -1.951 -2.272 -2.656 -3.132 -3.695 -4.44 -5.301 -6.422 -7.878 -9.744 -12.259 -16.059 -20.175 -23.322 -25.862 -27.857 -29.493 -30.894 -32.127 -33.164 -34.222 -35.096 -35.81 -36.469 -37.11 -37.706 -38.231 -38.783 -39.257 -39.662 -40.078 -40.495 -40.843 -41.203 -41.557 -41.828 -42.115 -42.406 -42.703 -43.002 -43.202 -43.404 -43.721 -43.941 -44.163 -44.279 -44.521 -44.772 -45.023 -45.152 -45.427 -45.53 -45.67 -45.827 -46.168 -46.335 -46.495 -46.674 -46.883 -47.104 -47.36 -47.847 -10 ,14578 ,KEBNE ,16678588,Thu Nov 25 03:25:32 CET,Thu Nov 25 04:56:56 CET,0.0 0.095 0.185 0.217 0.216 0.226 0.231 0.245 0.287 0.297 0.293 0.186 0.285 0.276 0.258 0.236 0.214 0.199 0.168 0.149 0.118 0.097 0.072 0.028 -0.016 -0.073 -0.136 -0.194 -0.279 -0.372 -0.455 -0.558 -0.676 -0.79 -0.937 -1.125 -1.308 -1.517 -1.758 -2.033 -2.364 -2.78 -3.313 -3.888 -4.59 -5.445 -6.55 -7.96 -9.918 -12.649 -16.658 -20.975 -24.232 -26.822 -28.912 -30.67 -32.173 -33.482 -34.554 -35.607 -36.487 -37.247 -37.97 -38.634 -39.211 -39.724 -40.247 -40.722 -41.129 -41.514 -41.913 -42.247 -42.589 -42.917 -43.16 -43.424 -43.696 -43.975 -44.272 -44.477 -44.676 -44.995 -45.213 -45.425 -45.533 -45.755 -45.979 -46.215 -46.342 -46.614 -46.708 -46.84 -46.973 -47.255 -47.412 -47.581 -47.749 -47.925 -48.128 -48.365 -48.746 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_3a.txt deleted file mode 100644 index 87656dbe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1173 ,KEBNE ,16678589,Thu Nov 25 03:26:34 CET,Thu Nov 25 04:57:12 CET,0.0 0.461 0.722 0.906 1.048 1.199 1.344 1.471 1.706 1.812 1.915 2.003 2.205 2.293 2.444 2.607 2.761 2.828 2.97 3.12 3.324 3.444 3.55 3.707 3.869 4.021 4.175 4.33 4.543 4.746 4.931 5.159 5.393 5.616 5.867 6.151 6.432 6.723 7.028 7.378 7.75 8.166 8.646 9.118 9.64 10.255 10.999 11.835 12.828 13.885 15.052 15.983 16.499 16.721 16.83 16.887 16.877 16.856 16.832 16.798 16.759 16.719 16.684 16.642 16.596 16.553 16.493 16.435 16.386 16.335 16.265 16.208 16.152 16.085 16.035 15.985 15.92 15.842 15.771 15.727 15.683 15.609 15.561 15.515 15.489 15.431 15.37 15.3 15.257 15.129 15.12 15.067 15.008 14.89 14.836 14.778 14.701 14.613 14.513 14.418 14.194 -2 ,11731 ,KEBNE ,16678590,Thu Nov 25 03:26:35 CET,Thu Nov 25 05:02:01 CET,0.0 0.749 0.983 1.148 1.301 1.441 1.574 1.712 1.961 2.073 2.179 2.265 2.46 2.543 2.712 2.875 3.024 3.093 3.223 3.357 3.555 3.681 3.798 3.97 4.154 4.338 4.508 4.67 4.88 5.082 5.275 5.522 5.773 6.006 6.278 6.587 6.887 7.205 7.548 7.897 8.266 8.719 9.24 9.769 10.38 11.042 11.804 12.674 13.592 14.526 15.698 16.655 17.121 17.376 17.523 17.59 17.603 17.594 17.557 17.509 17.477 17.436 17.383 17.314 17.245 17.187 17.124 17.066 17.016 16.968 16.922 16.868 16.808 16.753 16.716 16.669 16.607 16.553 16.502 16.462 16.409 16.327 16.274 16.221 16.197 16.127 16.059 16.008 15.981 15.861 15.874 15.834 15.794 15.711 15.67 15.625 15.573 15.526 15.469 15.316 15.062 -3 ,3634 ,KEBNE ,16678591,Thu Nov 25 03:27:36 CET,Thu Nov 25 04:57:37 CET,0.0 0.546 0.784 1.015 1.192 1.315 1.436 1.544 1.772 1.88 1.975 2.063 2.274 2.374 2.551 2.728 2.892 2.97 3.119 3.268 3.491 3.631 3.758 3.937 4.108 4.274 4.452 4.638 4.876 5.1 5.303 5.527 5.753 5.987 6.255 6.545 6.83 7.136 7.47 7.846 8.225 8.661 9.198 9.718 10.307 10.966 11.751 12.636 13.656 14.794 16.007 16.924 17.4 17.683 17.842 17.885 17.918 17.945 17.928 17.915 17.897 17.862 17.812 17.75 17.706 17.655 17.578 17.525 17.488 17.439 17.371 17.309 17.251 17.192 17.149 17.093 17.026 16.956 16.876 16.821 16.77 16.698 16.649 16.599 16.569 16.513 16.464 16.405 16.372 16.246 16.236 16.187 16.139 16.009 15.929 15.851 15.778 15.697 15.58 15.459 15.268 -4 ,3828 ,KEBNE ,16678592,Thu Nov 25 03:28:38 CET,Thu Nov 25 04:59:24 CET,0.0 0.477 0.666 0.838 0.986 1.107 1.215 1.343 1.593 1.701 1.801 1.858 2.045 2.13 2.302 2.473 2.637 2.713 2.856 3.003 3.221 3.355 3.476 3.656 3.837 4.015 4.183 4.34 4.56 4.786 4.996 5.25 5.483 5.684 5.909 6.163 6.424 6.691 6.972 7.303 7.638 7.997 8.413 8.817 9.313 9.839 10.427 11.124 11.932 12.811 13.83 14.703 15.185 15.442 15.572 15.624 15.62 15.568 15.53 15.498 15.455 15.417 15.358 15.283 15.213 15.169 15.122 15.06 15.003 14.948 14.887 14.829 14.776 14.714 14.657 14.603 14.544 14.473 14.403 14.35 14.283 14.195 14.139 14.076 14.047 13.98 13.902 13.822 13.781 13.657 13.697 13.663 13.617 13.507 13.445 13.385 13.326 13.249 13.124 12.953 12.679 -5 ,9681 ,KEBNE ,16678593,Thu Nov 25 03:29:39 CET,Thu Nov 25 04:59:36 CET,0.0 0.457 0.65 0.794 0.954 1.104 1.241 1.378 1.616 1.725 1.826 1.915 2.11 2.198 2.391 2.571 2.728 2.802 2.957 3.122 3.345 3.481 3.618 3.819 4.007 4.19 4.369 4.532 4.749 4.967 5.175 5.434 5.683 5.916 6.186 6.482 6.766 7.097 7.451 7.835 8.229 8.643 9.133 9.657 10.259 10.905 11.679 12.442 13.225 14.096 15.105 15.958 16.413 16.692 16.837 16.876 16.887 16.879 16.872 16.851 16.803 16.738 16.68 16.629 16.558 16.499 16.439 16.378 16.328 16.269 16.206 16.162 16.118 16.06 16.011 15.963 15.912 15.851 15.783 15.741 15.7 15.645 15.6 15.541 15.509 15.449 15.389 15.319 15.28 15.153 15.154 15.101 15.05 14.941 14.881 14.828 14.759 14.678 14.605 14.521 14.341 -6 ,32754 ,KEBNE ,16678594,Thu Nov 25 03:29:39 CET,Thu Nov 25 05:00:32 CET,0.0 0.567 0.73 0.869 1.017 1.161 1.291 1.404 1.597 1.686 1.774 1.846 2.04 2.129 2.296 2.451 2.607 2.685 2.821 2.932 3.096 3.217 3.342 3.525 3.698 3.853 4.006 4.173 4.394 4.6 4.787 5.012 5.231 5.456 5.743 6.06 6.35 6.681 7.04 7.416 7.801 8.202 8.677 9.167 9.712 10.325 11.058 11.869 12.734 13.707 14.804 15.617 16.081 16.383 16.545 16.624 16.655 16.663 16.63 16.564 16.531 16.497 16.456 16.421 16.382 16.34 16.288 16.253 16.228 16.18 16.127 16.086 16.023 15.962 15.917 15.861 15.813 15.76 15.695 15.645 15.596 15.529 15.477 15.415 15.384 15.325 15.262 15.185 15.145 15.017 15.016 14.965 14.904 14.799 14.75 14.69 14.626 14.543 14.461 14.379 14.241 -7 ,10147 ,KEBNE ,16678595,Thu Nov 25 03:30:42 CET,Thu Nov 25 05:01:12 CET,0.0 0.513 0.761 0.942 1.076 1.213 1.347 1.488 1.74 1.848 1.948 2.027 2.22 2.308 2.485 2.659 2.829 2.909 3.063 3.211 3.424 3.565 3.7 3.881 4.047 4.211 4.373 4.529 4.731 4.938 5.145 5.393 5.632 5.876 6.153 6.45 6.744 7.073 7.431 7.806 8.215 8.659 9.122 9.623 10.259 10.964 11.738 12.516 13.339 14.272 15.317 16.143 16.591 16.833 16.952 16.989 16.991 16.985 16.973 16.925 16.886 16.851 16.801 16.746 16.696 16.646 16.581 16.527 16.479 16.419 16.357 16.314 16.265 16.198 16.14 16.078 16.031 15.98 15.914 15.872 15.819 15.736 15.678 15.614 15.584 15.516 15.443 15.385 15.359 15.239 15.235 15.183 15.134 15.02 14.963 14.888 14.806 14.745 14.663 14.566 14.312 -8 ,13867 ,KEBNE ,16678596,Thu Nov 25 03:30:42 CET,Thu Nov 25 05:01:14 CET,0.0 0.381 0.574 0.76 0.934 1.068 1.189 1.305 1.51 1.617 1.72 1.799 1.997 2.079 2.234 2.391 2.544 2.616 2.754 2.903 3.121 3.259 3.396 3.597 3.788 3.96 4.125 4.287 4.501 4.704 4.902 5.161 5.414 5.639 5.882 6.156 6.432 6.756 7.088 7.431 7.82 8.265 8.748 9.226 9.804 10.386 11.05 11.82 12.67 13.67 14.875 15.759 16.229 16.494 16.622 16.679 16.675 16.629 16.561 16.498 16.457 16.415 16.379 16.332 16.272 16.218 16.157 16.093 16.033 15.97 15.901 15.839 15.777 15.713 15.654 15.591 15.53 15.47 15.416 15.372 15.322 15.246 15.189 15.133 15.102 15.037 14.972 14.902 14.863 14.732 14.743 14.696 14.638 14.527 14.483 14.439 14.378 14.296 14.219 14.145 13.988 -9 ,23654 ,KEBNE ,16678597,Thu Nov 25 03:30:42 CET,Thu Nov 25 05:02:19 CET,0.0 0.331 0.563 0.739 0.883 1.015 1.145 1.269 1.498 1.6 1.695 1.767 1.955 2.037 2.205 2.369 2.522 2.595 2.74 2.883 3.088 3.22 3.348 3.536 3.706 3.868 4.03 4.187 4.386 4.578 4.761 4.982 5.219 5.446 5.71 6.018 6.309 6.615 6.918 7.242 7.582 7.952 8.407 8.893 9.453 10.064 10.74 11.582 12.606 13.64 14.772 15.602 16.031 16.271 16.385 16.437 16.466 16.449 16.405 16.343 16.262 16.2 16.139 16.068 16.021 15.974 15.903 15.845 15.793 15.739 15.679 15.622 15.566 15.511 15.471 15.427 15.383 15.318 15.239 15.198 15.162 15.097 15.044 14.982 14.953 14.889 14.814 14.736 14.694 14.558 14.553 14.507 14.464 14.382 14.322 14.262 14.195 14.117 14.016 13.869 13.646 -10 ,4203 ,KEBNE ,16678598,Thu Nov 25 03:30:46 CET,Thu Nov 25 04:59:19 CET,0.0 0.388 0.654 0.838 0.986 1.113 1.23 1.347 1.572 1.668 1.759 1.818 2.006 2.094 2.253 2.398 2.53 2.595 2.73 2.877 3.088 3.211 3.337 3.52 3.686 3.848 4.017 4.188 4.413 4.637 4.838 5.073 5.306 5.534 5.794 6.074 6.347 6.67 7.023 7.413 7.814 8.238 8.736 9.262 9.914 10.602 11.331 12.063 12.932 14.021 15.181 16.144 16.717 17.032 17.201 17.303 17.332 17.332 17.325 17.292 17.251 17.218 17.187 17.146 17.105 17.069 17.029 16.973 16.911 16.852 16.78 16.718 16.653 16.583 16.527 16.472 16.425 16.381 16.323 16.269 16.225 16.174 16.138 16.085 16.051 15.996 15.941 15.874 15.828 15.697 15.7 15.65 15.602 15.519 15.474 15.4 15.332 15.28 15.214 15.127 14.966 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5a.txt deleted file mode 100644 index 4d68b510..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13497 ,TETRA ,17673036,Fri Dec 3 09:37:50 CET,Fri Dec 3 11:27:24 CET,0.0 0.271 0.403 0.482 0.551 0.617 0.682 0.727 0.799 0.842 0.888 0.881 1.016 1.061 1.156 1.232 1.299 1.33 1.398 1.48 1.592 1.662 1.739 1.841 1.917 1.993 2.068 2.141 2.241 2.323 2.386 2.463 2.544 2.614 2.697 2.817 2.943 3.075 3.199 3.331 3.458 3.571 3.69 3.785 3.878 3.964 4.055 4.129 4.116 3.911 3.332 2.54 1.849 1.184 0.569 0.013 -0.433 -0.831 -1.221 -1.622 -1.955 -2.26 -2.533 -2.761 -2.986 -3.202 -3.435 -3.638 -3.8 -3.96 -4.118 -4.251 -4.396 -4.546 -4.668 -4.8 -4.936 -5.073 -5.225 -5.333 -5.442 -5.614 -5.721 -5.829 -5.888 -6.014 -6.141 -6.273 -6.342 -6.518 -6.559 -6.639 -6.721 -6.879 -6.959 -7.053 -7.158 -7.273 -7.382 -7.476 -7.667 -2 ,10524 ,TETRA ,17673037,Fri Dec 3 09:37:51 CET,Fri Dec 3 11:28:51 CET,0.0 0.17 0.281 0.41 0.515 0.583 0.64 0.702 0.842 0.91 0.977 0.994 1.145 1.204 1.317 1.413 1.508 1.558 1.648 1.734 1.832 1.883 1.935 2.008 2.082 2.163 2.25 2.327 2.417 2.505 2.594 2.726 2.841 2.917 3.014 3.145 3.269 3.386 3.504 3.631 3.747 3.874 4.011 4.098 4.168 4.24 4.32 4.358 4.313 4.145 3.65 2.789 2.023 1.362 0.776 0.247 -0.203 -0.582 -0.933 -1.327 -1.658 -1.938 -2.191 -2.41 -2.611 -2.807 -3.017 -3.204 -3.374 -3.543 -3.724 -3.88 -4.02 -4.169 -4.295 -4.429 -4.577 -4.72 -4.868 -4.97 -5.067 -5.242 -5.36 -5.467 -5.523 -5.635 -5.752 -5.868 -5.923 -6.091 -6.113 -6.189 -6.268 -6.433 -6.556 -6.69 -6.809 -6.924 -7.059 -7.221 -7.381 -3 ,72 ,TETRA ,17673038,Fri Dec 3 09:37:52 CET,Fri Dec 3 11:21:24 CET,0.0 0.079 0.171 0.254 0.343 0.424 0.49 0.555 0.68 0.742 0.801 0.809 0.959 1.008 1.096 1.183 1.262 1.295 1.366 1.434 1.525 1.594 1.667 1.76 1.852 1.934 2.015 2.102 2.19 2.264 2.335 2.427 2.517 2.594 2.687 2.811 2.938 3.055 3.164 3.264 3.341 3.435 3.571 3.678 3.749 3.806 3.825 3.808 3.708 3.412 2.793 1.972 1.261 0.646 0.111 -0.362 -0.783 -1.18 -1.559 -1.954 -2.26 -2.527 -2.792 -3.046 -3.286 -3.495 -3.709 -3.908 -4.069 -4.222 -4.388 -4.533 -4.701 -4.874 -4.989 -5.112 -5.251 -5.394 -5.544 -5.645 -5.744 -5.899 -6.005 -6.114 -6.177 -6.316 -6.443 -6.567 -6.634 -6.802 -6.836 -6.907 -6.98 -7.158 -7.264 -7.369 -7.485 -7.604 -7.707 -7.842 -8.097 -4 ,4225 ,TETRA ,17673039,Fri Dec 3 09:37:51 CET,Fri Dec 3 11:29:12 CET,0.0 0.142 0.247 0.342 0.453 0.563 0.655 0.724 0.836 0.884 0.939 0.951 1.099 1.142 1.216 1.287 1.371 1.414 1.489 1.552 1.64 1.696 1.745 1.833 1.916 1.989 2.079 2.154 2.236 2.32 2.4 2.498 2.594 2.678 2.779 2.881 2.956 3.036 3.106 3.196 3.308 3.416 3.56 3.676 3.78 3.876 3.921 3.921 3.86 3.664 3.111 2.326 1.59 0.912 0.309 -0.221 -0.662 -1.117 -1.539 -1.938 -2.287 -2.593 -2.843 -3.037 -3.238 -3.443 -3.631 -3.8 -3.949 -4.107 -4.3 -4.473 -4.651 -4.821 -4.942 -5.057 -5.176 -5.299 -5.421 -5.511 -5.604 -5.763 -5.873 -5.983 -6.047 -6.169 -6.284 -6.403 -6.462 -6.625 -6.648 -6.714 -6.772 -6.941 -7.047 -7.129 -7.214 -7.327 -7.467 -7.617 -7.786 -5 ,9427 ,TETRA ,17673040,Fri Dec 3 09:37:52 CET,Fri Dec 3 11:16:28 CET,0.0 0.317 0.476 0.597 0.679 0.759 0.843 0.93 1.097 1.173 1.239 1.243 1.396 1.455 1.56 1.656 1.747 1.787 1.862 1.935 2.045 2.115 2.186 2.289 2.369 2.441 2.52 2.601 2.694 2.78 2.861 2.965 3.076 3.177 3.276 3.377 3.48 3.616 3.748 3.866 3.981 4.095 4.224 4.346 4.449 4.525 4.594 4.592 4.514 4.331 3.838 3.02 2.298 1.67 1.097 0.546 0.056 -0.37 -0.749 -1.114 -1.411 -1.682 -1.948 -2.205 -2.447 -2.65 -2.851 -3.036 -3.204 -3.384 -3.567 -3.726 -3.881 -4.021 -4.138 -4.266 -4.409 -4.556 -4.701 -4.797 -4.9 -5.081 -5.194 -5.302 -5.36 -5.477 -5.586 -5.691 -5.76 -5.942 -5.974 -6.062 -6.151 -6.34 -6.429 -6.516 -6.626 -6.73 -6.855 -7.028 -7.337 -6 ,21156 ,TETRA ,17673041,Fri Dec 3 09:39:48 CET,Fri Dec 3 11:16:24 CET,0.0 0.312 0.439 0.549 0.64 0.721 0.783 0.836 0.964 1.029 1.088 1.093 1.235 1.279 1.354 1.421 1.498 1.536 1.604 1.671 1.757 1.821 1.88 1.955 2.033 2.112 2.188 2.255 2.352 2.455 2.571 2.7 2.806 2.918 3.018 3.112 3.193 3.288 3.402 3.506 3.594 3.685 3.806 3.916 4.002 4.078 4.145 4.165 4.129 3.939 3.401 2.595 1.843 1.162 0.56 0.038 -0.426 -0.863 -1.258 -1.631 -1.943 -2.23 -2.491 -2.731 -2.968 -3.19 -3.406 -3.589 -3.763 -3.947 -4.125 -4.273 -4.434 -4.594 -4.713 -4.843 -4.979 -5.123 -5.266 -5.364 -5.461 -5.615 -5.715 -5.822 -5.889 -6.011 -6.125 -6.25 -6.311 -6.487 -6.54 -6.625 -6.717 -6.91 -7.009 -7.102 -7.212 -7.343 -7.478 -7.674 -8.12 -7 ,13232 ,TETRA ,17673042,Fri Dec 3 09:39:48 CET,Fri Dec 3 11:15:25 CET,0.0 0.221 0.353 0.465 0.575 0.647 0.707 0.769 0.881 0.934 0.99 0.998 1.147 1.2 1.288 1.381 1.484 1.528 1.609 1.69 1.8 1.876 1.952 2.051 2.139 2.217 2.292 2.354 2.427 2.489 2.543 2.616 2.691 2.768 2.848 2.924 3.0 3.089 3.189 3.301 3.428 3.553 3.672 3.766 3.85 3.919 3.944 3.934 3.861 3.625 3.014 2.188 1.48 0.85 0.284 -0.214 -0.659 -1.112 -1.511 -1.868 -2.19 -2.505 -2.778 -3.016 -3.244 -3.463 -3.718 -3.95 -4.145 -4.329 -4.523 -4.678 -4.815 -4.963 -5.08 -5.215 -5.358 -5.488 -5.619 -5.716 -5.823 -5.981 -6.087 -6.215 -6.286 -6.428 -6.551 -6.668 -6.736 -6.905 -6.942 -7.023 -7.102 -7.257 -7.336 -7.413 -7.502 -7.608 -7.726 -7.877 -8.103 -8 ,30506 ,TETRA ,17673043,Fri Dec 3 09:39:48 CET,Fri Dec 3 11:15:48 CET,0.0 0.494 0.629 0.71 0.795 0.885 0.974 1.063 1.188 1.245 1.31 1.319 1.46 1.504 1.581 1.672 1.766 1.808 1.89 1.974 2.097 2.17 2.243 2.341 2.436 2.528 2.604 2.671 2.753 2.844 2.933 3.017 3.091 3.169 3.263 3.359 3.449 3.562 3.677 3.791 3.905 4.009 4.095 4.216 4.362 4.461 4.542 4.555 4.513 4.328 3.867 3.18 2.49 1.861 1.283 0.748 0.322 -0.063 -0.416 -0.777 -1.104 -1.39 -1.635 -1.857 -2.094 -2.324 -2.544 -2.749 -2.929 -3.104 -3.285 -3.426 -3.58 -3.751 -3.881 -4.017 -4.153 -4.281 -4.414 -4.51 -4.611 -4.768 -4.872 -4.98 -5.034 -5.153 -5.28 -5.42 -5.495 -5.682 -5.755 -5.843 -5.939 -6.109 -6.183 -6.257 -6.335 -6.418 -6.544 -6.686 -6.938 -9 ,9045 ,TETRA ,17673044,Fri Dec 3 09:40:41 CET,Fri Dec 3 11:18:06 CET,0.0 0.132 0.237 0.327 0.416 0.496 0.572 0.64 0.765 0.823 0.875 0.896 1.048 1.086 1.173 1.267 1.353 1.392 1.467 1.531 1.62 1.687 1.748 1.83 1.918 2.002 2.092 2.184 2.294 2.387 2.46 2.537 2.623 2.729 2.855 2.977 3.08 3.178 3.29 3.413 3.54 3.657 3.769 3.881 3.989 4.083 4.135 4.13 4.038 3.737 3.155 2.335 1.53 0.835 0.244 -0.289 -0.759 -1.187 -1.546 -1.916 -2.228 -2.487 -2.73 -2.966 -3.174 -3.355 -3.554 -3.746 -3.91 -4.063 -4.228 -4.375 -4.523 -4.69 -4.823 -4.947 -5.081 -5.224 -5.362 -5.453 -5.549 -5.699 -5.807 -5.917 -5.967 -6.06 -6.161 -6.296 -6.374 -6.547 -6.565 -6.635 -6.716 -6.89 -6.988 -7.075 -7.152 -7.24 -7.338 -7.446 -7.562 -10 ,22375 ,TETRA ,17673045,Fri Dec 3 09:41:56 CET,Fri Dec 3 11:31:49 CET,0.0 0.246 0.365 0.474 0.564 0.632 0.692 0.749 0.869 0.923 0.977 1.005 1.161 1.206 1.294 1.382 1.472 1.503 1.552 1.604 1.689 1.755 1.819 1.899 1.979 2.064 2.149 2.237 2.362 2.468 2.556 2.676 2.797 2.897 2.98 3.072 3.168 3.278 3.409 3.514 3.6 3.711 3.807 3.889 3.972 4.039 4.102 4.118 4.074 3.964 3.604 2.871 2.111 1.402 0.803 0.271 -0.205 -0.645 -1.046 -1.453 -1.767 -2.022 -2.272 -2.511 -2.744 -2.958 -3.173 -3.376 -3.541 -3.703 -3.871 -4.003 -4.141 -4.278 -4.384 -4.516 -4.651 -4.775 -4.915 -5.021 -5.116 -5.249 -5.347 -5.455 -5.511 -5.634 -5.763 -5.892 -5.957 -6.126 -6.161 -6.234 -6.303 -6.473 -6.563 -6.657 -6.756 -6.877 -7.024 -7.194 -7.431 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5c.txt deleted file mode 100644 index af034222..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24028 ,KEBNE ,16678599,Thu Nov 25 03:32:46 CET,Thu Nov 25 05:02:57 CET,0.0 0.246 0.452 0.593 0.711 0.811 0.897 0.997 1.187 1.271 1.36 1.421 1.589 1.663 1.811 1.943 2.067 2.121 2.224 2.326 2.487 2.592 2.687 2.831 2.963 3.077 3.18 3.285 3.423 3.55 3.672 3.81 3.952 4.124 4.326 4.52 4.703 4.909 5.144 5.388 5.628 5.883 6.18 6.487 6.784 7.065 7.392 7.74 8.082 8.35 8.447 8.242 7.911 7.563 7.193 6.858 6.585 6.315 6.061 5.796 5.554 5.335 5.132 4.946 4.779 4.629 4.471 4.316 4.179 4.05 3.917 3.79 3.632 3.489 3.398 3.296 3.195 3.097 2.997 2.93 2.865 2.761 2.688 2.611 2.566 2.473 2.369 2.265 2.215 2.057 2.036 1.974 1.917 1.8 1.736 1.657 1.555 1.453 1.354 1.205 0.983 -2 ,14804 ,KEBNE ,16678600,Thu Nov 25 03:32:46 CET,Thu Nov 25 05:02:31 CET,0.0 0.386 0.584 0.718 0.832 0.933 1.003 1.099 1.324 1.42 1.516 1.583 1.752 1.818 1.954 2.085 2.208 2.268 2.37 2.461 2.607 2.714 2.822 2.962 3.081 3.198 3.322 3.454 3.612 3.763 3.93 4.131 4.295 4.438 4.604 4.77 4.956 5.193 5.417 5.636 5.875 6.141 6.426 6.68 6.97 7.288 7.613 7.954 8.339 8.715 8.878 8.735 8.517 8.222 7.869 7.552 7.284 7.013 6.77 6.519 6.292 6.088 5.898 5.725 5.55 5.373 5.205 5.074 4.964 4.848 4.719 4.597 4.471 4.363 4.28 4.18 4.059 3.925 3.791 3.713 3.64 3.518 3.425 3.315 3.261 3.16 3.058 2.946 2.888 2.728 2.695 2.621 2.556 2.424 2.351 2.278 2.203 2.113 2.002 1.869 1.703 -3 ,5709 ,KEBNE ,16678601,Thu Nov 25 03:33:48 CET,Thu Nov 25 05:03:53 CET,0.0 0.228 0.41 0.581 0.715 0.826 0.908 0.985 1.163 1.248 1.323 1.366 1.539 1.621 1.78 1.921 2.037 2.093 2.202 2.318 2.49 2.597 2.702 2.864 3.003 3.12 3.247 3.369 3.517 3.668 3.823 3.998 4.159 4.314 4.489 4.687 4.876 5.066 5.262 5.479 5.72 5.986 6.292 6.601 6.933 7.28 7.654 8.028 8.407 8.704 8.813 8.672 8.394 8.096 7.777 7.424 7.103 6.796 6.505 6.239 6.015 5.811 5.623 5.423 5.227 5.046 4.846 4.671 4.547 4.433 4.305 4.192 4.079 3.966 3.879 3.792 3.702 3.606 3.508 3.44 3.369 3.246 3.15 3.057 3.017 2.936 2.843 2.74 2.69 2.534 2.503 2.441 2.383 2.258 2.192 2.133 2.07 1.976 1.877 1.773 1.601 -4 ,8543 ,KEBNE ,16678602,Thu Nov 25 03:33:49 CET,Thu Nov 25 05:06:05 CET,0.0 0.332 0.503 0.656 0.807 0.953 1.077 1.177 1.373 1.473 1.567 1.631 1.804 1.873 2.002 2.12 2.244 2.312 2.434 2.544 2.71 2.81 2.918 3.074 3.211 3.35 3.494 3.627 3.794 3.957 4.109 4.303 4.479 4.637 4.823 5.021 5.19 5.385 5.596 5.81 6.048 6.306 6.595 6.884 7.217 7.572 7.927 8.265 8.65 9.005 9.137 8.926 8.649 8.327 7.974 7.655 7.359 7.054 6.767 6.49 6.288 6.104 5.902 5.711 5.545 5.394 5.236 5.084 4.943 4.811 4.682 4.577 4.476 4.373 4.286 4.189 4.092 3.994 3.863 3.759 3.666 3.541 3.459 3.368 3.32 3.226 3.141 3.058 3.006 2.843 2.812 2.751 2.695 2.592 2.545 2.487 2.419 2.322 2.202 2.077 1.882 -5 ,19777 ,KEBNE ,16678603,Thu Nov 25 03:33:48 CET,Thu Nov 25 05:06:22 CET,0.0 0.21 0.393 0.521 0.652 0.768 0.873 0.991 1.211 1.307 1.401 1.474 1.652 1.725 1.877 2.024 2.138 2.187 2.284 2.384 2.522 2.605 2.683 2.789 2.896 3.021 3.159 3.291 3.432 3.567 3.703 3.857 4.033 4.206 4.373 4.556 4.739 4.933 5.132 5.336 5.568 5.858 6.203 6.506 6.833 7.177 7.521 7.834 8.133 8.437 8.565 8.392 8.083 7.766 7.439 7.104 6.829 6.596 6.396 6.19 5.983 5.75 5.537 5.355 5.19 5.033 4.852 4.708 4.575 4.421 4.277 4.174 4.074 3.958 3.861 3.76 3.661 3.572 3.464 3.382 3.31 3.193 3.105 3.025 2.989 2.911 2.813 2.712 2.663 2.498 2.466 2.398 2.336 2.23 2.165 2.08 1.985 1.889 1.782 1.626 1.414 -6 ,23065 ,KEBNE ,16678604,Thu Nov 25 03:34:50 CET,Thu Nov 25 05:05:35 CET,0.0 0.266 0.408 0.524 0.653 0.788 0.897 0.981 1.128 1.195 1.267 1.316 1.488 1.562 1.701 1.825 1.953 2.017 2.137 2.25 2.417 2.522 2.621 2.765 2.891 3.022 3.17 3.3 3.457 3.612 3.754 3.93 4.091 4.255 4.457 4.683 4.888 5.119 5.391 5.643 5.869 6.158 6.512 6.804 7.097 7.447 7.852 8.237 8.648 8.99 9.156 8.959 8.6 8.243 7.891 7.57 7.293 7.034 6.763 6.448 6.202 5.997 5.777 5.559 5.357 5.188 5.026 4.856 4.71 4.572 4.429 4.299 4.165 4.042 3.938 3.822 3.717 3.618 3.505 3.426 3.342 3.204 3.112 3.026 2.984 2.874 2.753 2.646 2.593 2.437 2.431 2.378 2.32 2.198 2.137 2.071 1.989 1.901 1.803 1.649 1.106 -7 ,25974 ,KEBNE ,16678605,Thu Nov 25 03:34:50 CET,Thu Nov 25 05:03:13 CET,0.0 0.308 0.466 0.604 0.744 0.856 0.949 1.034 1.164 1.235 1.306 1.345 1.516 1.588 1.737 1.873 1.994 2.061 2.194 2.309 2.468 2.566 2.666 2.816 2.956 3.1 3.238 3.353 3.495 3.653 3.791 3.961 4.137 4.289 4.471 4.684 4.872 5.09 5.327 5.562 5.809 6.086 6.417 6.724 7.073 7.451 7.808 8.124 8.45 8.723 8.821 8.64 8.345 8.044 7.741 7.415 7.093 6.8 6.554 6.314 6.048 5.793 5.585 5.387 5.218 5.078 4.928 4.787 4.668 4.533 4.38 4.249 4.108 3.978 3.881 3.789 3.695 3.596 3.484 3.407 3.344 3.237 3.154 3.058 3.005 2.888 2.763 2.647 2.589 2.425 2.393 2.322 2.249 2.112 2.047 1.98 1.897 1.808 1.726 1.619 1.466 -8 ,25530 ,KEBNE ,16678606,Thu Nov 25 03:34:50 CET,Thu Nov 25 05:04:25 CET,0.0 0.255 0.394 0.51 0.611 0.737 0.854 0.948 1.136 1.228 1.31 1.358 1.524 1.586 1.694 1.795 1.892 1.949 2.064 2.169 2.308 2.393 2.487 2.637 2.78 2.919 3.054 3.184 3.341 3.51 3.678 3.857 4.035 4.189 4.362 4.561 4.733 4.903 5.091 5.312 5.546 5.819 6.119 6.403 6.715 7.017 7.353 7.676 8.011 8.299 8.38 8.174 7.854 7.511 7.202 6.884 6.591 6.327 6.085 5.849 5.615 5.368 5.118 4.893 4.696 4.498 4.287 4.13 4.015 3.894 3.755 3.626 3.486 3.345 3.24 3.142 3.034 2.911 2.788 2.703 2.616 2.493 2.407 2.315 2.274 2.164 2.033 1.923 1.867 1.694 1.646 1.568 1.482 1.314 1.243 1.153 1.054 0.966 0.871 0.737 0.449 -9 ,31339 ,KEBNE ,16678607,Thu Nov 25 03:34:50 CET,Thu Nov 25 05:05:03 CET,0.0 0.262 0.455 0.594 0.728 0.88 1.01 1.11 1.27 1.339 1.416 1.468 1.627 1.686 1.805 1.914 2.025 2.076 2.189 2.307 2.486 2.603 2.704 2.842 2.968 3.083 3.194 3.314 3.482 3.635 3.773 3.935 4.087 4.247 4.434 4.624 4.821 5.059 5.298 5.515 5.743 6.012 6.304 6.603 6.939 7.303 7.7 8.056 8.384 8.674 8.813 8.693 8.437 8.088 7.72 7.376 7.068 6.792 6.549 6.312 6.112 5.901 5.691 5.519 5.366 5.193 4.986 4.812 4.667 4.524 4.397 4.285 4.148 4.016 3.924 3.833 3.743 3.641 3.536 3.462 3.386 3.255 3.156 3.061 3.013 2.928 2.821 2.69 2.638 2.491 2.487 2.435 2.374 2.222 2.15 2.072 1.975 1.874 1.77 1.623 1.251 -10 ,664 ,KEBNE ,16678608,Thu Nov 25 03:34:51 CET,Thu Nov 25 05:04:47 CET,0.0 0.394 0.555 0.681 0.783 0.879 0.969 1.054 1.228 1.312 1.406 1.462 1.621 1.693 1.839 1.975 2.098 2.154 2.276 2.402 2.579 2.69 2.796 2.944 3.073 3.189 3.312 3.433 3.578 3.722 3.863 4.018 4.176 4.335 4.519 4.716 4.89 5.086 5.312 5.542 5.766 6.034 6.345 6.628 7.016 7.453 7.857 8.251 8.623 8.871 8.88 8.687 8.425 8.139 7.791 7.434 7.136 6.871 6.602 6.334 6.128 5.945 5.766 5.595 5.42 5.243 5.068 4.919 4.766 4.608 4.476 4.385 4.284 4.162 4.068 3.97 3.867 3.762 3.657 3.581 3.495 3.366 3.282 3.19 3.143 3.049 2.951 2.843 2.789 2.636 2.63 2.578 2.52 2.382 2.302 2.209 2.117 2.039 1.944 1.829 1.662 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_3b.txt deleted file mode 100644 index 8fc0845e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27072 ,KEBNE ,16678609,Thu Nov 25 03:34:50 CET,Thu Nov 25 05:04:30 CET,0.0 0.372 0.556 0.719 0.875 1.016 1.151 1.282 1.506 1.599 1.687 1.742 1.941 2.02 2.17 2.328 2.482 2.56 2.718 2.865 3.085 3.213 3.321 3.493 3.667 3.833 3.997 4.164 4.397 4.619 4.821 5.078 5.322 5.565 5.844 6.146 6.427 6.723 7.066 7.437 7.812 8.239 8.728 9.236 9.829 10.46 11.195 12.019 12.949 13.974 15.21 16.277 16.866 17.182 17.358 17.433 17.444 17.435 17.416 17.383 17.343 17.3 17.249 17.189 17.139 17.093 17.034 16.99 16.954 16.904 16.848 16.802 16.749 16.698 16.662 16.617 16.554 16.486 16.426 16.383 16.34 16.283 16.242 16.187 16.162 16.11 16.055 16.006 15.981 15.859 15.905 15.872 15.833 15.744 15.689 15.629 15.58 15.523 15.462 15.403 15.264 -2 ,12000 ,KEBNE ,16678610,Thu Nov 25 03:36:54 CET,Thu Nov 25 05:08:09 CET,0.0 0.263 0.465 0.642 0.787 0.918 1.024 1.123 1.336 1.434 1.529 1.585 1.764 1.835 1.988 2.138 2.279 2.344 2.474 2.604 2.789 2.913 3.032 3.191 3.349 3.498 3.64 3.773 3.944 4.107 4.269 4.471 4.664 4.859 5.074 5.312 5.551 5.794 6.062 6.364 6.667 7.014 7.432 7.852 8.347 8.899 9.605 10.408 11.213 12.132 13.184 13.98 14.421 14.637 14.724 14.795 14.825 14.792 14.751 14.722 14.694 14.665 14.634 14.605 14.576 14.535 14.482 14.42 14.368 14.323 14.27 14.215 14.16 14.114 14.074 14.025 13.976 13.928 13.877 13.837 13.791 13.717 13.674 13.634 13.615 13.556 13.475 13.407 13.379 13.249 13.27 13.228 13.196 13.121 13.066 13.015 12.969 12.912 12.813 12.707 12.59 -3 ,5290 ,KEBNE ,16678611,Thu Nov 25 03:36:54 CET,Thu Nov 25 05:06:49 CET,0.0 0.434 0.64 0.801 0.943 1.086 1.237 1.369 1.572 1.668 1.761 1.84 2.053 2.133 2.293 2.455 2.613 2.692 2.834 2.972 3.18 3.306 3.431 3.612 3.785 3.968 4.14 4.297 4.507 4.71 4.903 5.135 5.369 5.602 5.858 6.157 6.456 6.77 7.096 7.437 7.797 8.203 8.688 9.194 9.741 10.301 10.936 11.667 12.532 13.488 14.572 15.409 15.867 16.079 16.161 16.227 16.265 16.273 16.263 16.25 16.215 16.167 16.123 16.071 16.012 15.968 15.926 15.879 15.834 15.791 15.739 15.69 15.636 15.582 15.541 15.494 15.446 15.396 15.342 15.304 15.263 15.177 15.115 15.055 15.023 14.962 14.902 14.836 14.798 14.662 14.684 14.649 14.615 14.509 14.454 14.41 14.36 14.273 14.149 13.999 13.807 -4 ,14111 ,KEBNE ,16678612,Thu Nov 25 03:36:54 CET,Thu Nov 25 05:07:56 CET,0.0 0.366 0.554 0.717 0.871 1.003 1.127 1.237 1.411 1.495 1.591 1.657 1.859 1.943 2.103 2.257 2.4 2.467 2.603 2.738 2.925 3.039 3.148 3.311 3.473 3.633 3.785 3.939 4.148 4.35 4.538 4.767 5.002 5.23 5.485 5.757 6.019 6.321 6.651 7.015 7.405 7.819 8.284 8.793 9.417 10.103 10.814 11.529 12.433 13.482 14.667 15.646 16.164 16.465 16.617 16.695 16.74 16.745 16.714 16.661 16.604 16.535 16.471 16.417 16.364 16.307 16.244 16.203 16.167 16.129 16.084 16.028 15.96 15.89 15.843 15.793 15.739 15.689 15.636 15.602 15.571 15.509 15.458 15.411 15.388 15.33 15.264 15.206 15.173 15.038 15.06 15.014 14.976 14.906 14.863 14.817 14.762 14.681 14.59 14.465 14.218 -5 ,21798 ,KEBNE ,16678613,Thu Nov 25 03:37:56 CET,Thu Nov 25 05:08:37 CET,0.0 0.39 0.609 0.763 0.914 1.059 1.183 1.309 1.532 1.635 1.744 1.831 2.044 2.14 2.334 2.508 2.663 2.737 2.881 3.02 3.211 3.337 3.462 3.639 3.8 3.952 4.109 4.271 4.462 4.628 4.791 4.993 5.182 5.371 5.584 5.825 6.091 6.387 6.676 6.968 7.29 7.666 8.133 8.597 9.098 9.624 10.212 10.907 11.732 12.65 13.755 14.645 15.142 15.401 15.482 15.523 15.556 15.543 15.508 15.459 15.407 15.362 15.314 15.267 15.218 15.164 15.109 15.056 15.002 14.939 14.873 14.81 14.75 14.702 14.66 14.608 14.55 14.499 14.435 14.384 14.345 14.278 14.221 14.162 14.134 14.074 14.006 13.936 13.905 13.777 13.804 13.768 13.718 13.61 13.557 13.502 13.437 13.359 13.289 13.193 13.018 -6 ,11935 ,KEBNE ,16678614,Thu Nov 25 03:37:57 CET,Thu Nov 25 05:11:08 CET,0.0 0.343 0.557 0.749 0.929 1.059 1.156 1.262 1.464 1.553 1.646 1.723 1.93 2.017 2.187 2.362 2.527 2.599 2.732 2.854 3.064 3.215 3.35 3.544 3.733 3.899 4.054 4.219 4.442 4.664 4.888 5.136 5.346 5.547 5.783 6.021 6.231 6.474 6.758 7.08 7.428 7.832 8.321 8.789 9.317 9.929 10.632 11.343 12.153 13.17 14.324 15.216 15.695 15.908 16.023 16.119 16.17 16.169 16.153 16.137 16.104 16.063 16.01 15.962 15.913 15.851 15.792 15.73 15.675 15.611 15.541 15.499 15.457 15.408 15.372 15.335 15.285 15.219 15.144 15.1 15.063 15.005 14.963 14.919 14.891 14.831 14.767 14.692 14.657 14.529 14.56 14.513 14.463 14.359 14.315 14.267 14.2 14.145 14.086 13.99 13.827 -7 ,10375 ,KEBNE ,16678615,Thu Nov 25 03:37:56 CET,Thu Nov 25 05:08:35 CET,0.0 0.616 0.811 0.975 1.109 1.212 1.33 1.464 1.686 1.786 1.893 1.972 2.177 2.271 2.461 2.637 2.797 2.876 3.03 3.173 3.384 3.53 3.671 3.852 4.017 4.179 4.332 4.481 4.672 4.871 5.075 5.326 5.575 5.804 6.063 6.365 6.656 6.955 7.272 7.622 8.023 8.458 8.93 9.42 10.0 10.614 11.299 12.073 12.886 13.772 14.826 15.711 16.217 16.479 16.591 16.645 16.675 16.664 16.641 16.603 16.547 16.502 16.462 16.417 16.369 16.325 16.27 16.214 16.152 16.073 16.0 15.942 15.887 15.83 15.787 15.749 15.7 15.639 15.577 15.541 15.498 15.417 15.357 15.297 15.271 15.209 15.149 15.102 15.075 14.942 14.972 14.929 14.889 14.808 14.757 14.698 14.627 14.553 14.481 14.385 14.172 -8 ,10717 ,KEBNE ,16678616,Thu Nov 25 03:38:00 CET,Thu Nov 25 05:03:57 CET,0.0 0.513 0.726 0.898 1.055 1.194 1.316 1.436 1.676 1.771 1.864 1.943 2.151 2.238 2.394 2.552 2.72 2.795 2.935 3.082 3.29 3.421 3.546 3.734 3.911 4.066 4.229 4.391 4.62 4.854 5.081 5.336 5.566 5.784 6.048 6.367 6.658 6.952 7.274 7.64 8.007 8.443 8.972 9.496 10.138 10.865 11.692 12.592 13.619 14.779 16.107 17.054 17.512 17.793 17.924 17.984 18.013 18.011 17.997 17.953 17.906 17.857 17.8 17.75 17.682 17.612 17.552 17.499 17.446 17.389 17.341 17.291 17.224 17.158 17.115 17.073 17.028 16.983 16.927 16.883 16.843 16.772 16.72 16.671 16.643 16.575 16.507 16.445 16.412 16.277 16.306 16.265 16.222 16.133 16.086 16.033 15.979 15.921 15.834 15.707 15.575 -9 ,27964 ,KEBNE ,16678617,Thu Nov 25 03:38:58 CET,Thu Nov 25 05:09:38 CET,0.0 0.398 0.607 0.77 0.919 1.049 1.17 1.287 1.501 1.598 1.698 1.783 1.991 2.079 2.242 2.389 2.524 2.588 2.715 2.848 3.051 3.177 3.299 3.496 3.699 3.882 4.054 4.225 4.454 4.672 4.869 5.104 5.338 5.561 5.83 6.109 6.365 6.672 7.02 7.397 7.778 8.212 8.732 9.206 9.741 10.359 11.082 11.955 12.893 13.851 14.973 15.889 16.373 16.647 16.796 16.842 16.827 16.801 16.745 16.664 16.604 16.544 16.48 16.423 16.376 16.329 16.263 16.204 16.16 16.106 16.044 15.989 15.932 15.884 15.857 15.823 15.788 15.747 15.692 15.643 15.584 15.507 15.457 15.397 15.367 15.307 15.255 15.204 15.17 15.036 15.072 15.028 14.975 14.888 14.849 14.793 14.72 14.632 14.536 14.452 14.39 -10 ,20259 ,KEBNE ,16678618,Thu Nov 25 03:38:59 CET,Thu Nov 25 05:10:53 CET,0.0 0.361 0.557 0.729 0.893 1.036 1.156 1.279 1.486 1.574 1.664 1.74 1.944 2.021 2.183 2.338 2.477 2.548 2.688 2.821 3.011 3.143 3.276 3.464 3.646 3.827 4.0 4.159 4.367 4.572 4.757 4.958 5.17 5.385 5.609 5.829 6.044 6.288 6.561 6.858 7.16 7.539 7.979 8.395 8.893 9.43 10.036 10.748 11.55 12.432 13.444 14.227 14.644 14.88 15.023 15.097 15.108 15.075 15.024 14.972 14.932 14.89 14.836 14.774 14.708 14.645 14.584 14.536 14.495 14.445 14.383 14.333 14.287 14.231 14.177 14.122 14.07 14.013 13.952 13.906 13.865 13.809 13.766 13.719 13.694 13.638 13.582 13.512 13.468 13.319 13.312 13.263 13.211 13.113 13.067 13.014 12.952 12.886 12.807 12.697 12.503 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5a.txt deleted file mode 100644 index 34f09895..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14756 ,KEBNE ,16678619,Thu Nov 25 03:40:01 CET,Thu Nov 25 05:11:19 CET,0.0 0.219 0.442 0.57 0.643 0.73 0.826 0.909 1.075 1.159 1.23 1.243 1.431 1.5 1.642 1.762 1.861 1.918 2.025 2.124 2.277 2.383 2.484 2.624 2.764 2.893 3.021 3.15 3.304 3.452 3.604 3.791 3.983 4.179 4.401 4.654 4.901 5.14 5.387 5.675 5.986 6.346 6.78 7.195 7.719 8.351 9.015 9.685 10.486 11.435 12.624 13.543 13.994 14.25 14.39 14.473 14.486 14.479 14.426 14.347 14.313 14.243 14.133 14.037 13.949 13.864 13.783 13.697 13.603 13.498 13.4 13.323 13.237 13.159 13.098 13.03 12.957 12.876 12.799 12.749 12.689 12.589 12.516 12.431 12.386 12.317 12.244 12.161 12.121 11.971 11.979 11.925 11.859 11.726 11.653 11.562 11.482 11.413 11.322 11.194 10.968 -2 ,11656 ,KEBNE ,16678620,Thu Nov 25 03:40:01 CET,Thu Nov 25 05:09:49 CET,0.0 0.134 0.235 0.346 0.438 0.523 0.603 0.68 0.822 0.884 0.946 0.95 1.133 1.204 1.331 1.465 1.597 1.657 1.766 1.871 2.012 2.097 2.177 2.312 2.45 2.572 2.695 2.818 2.979 3.143 3.305 3.495 3.668 3.826 4.014 4.236 4.448 4.683 4.942 5.222 5.518 5.856 6.246 6.632 7.093 7.603 8.213 8.901 9.683 10.602 11.657 12.517 12.995 13.28 13.438 13.494 13.5 13.463 13.415 13.373 13.289 13.217 13.171 13.11 13.044 12.964 12.874 12.806 12.739 12.669 12.593 12.518 12.443 12.375 12.315 12.245 12.173 12.073 11.969 11.903 11.827 11.717 11.641 11.546 11.496 11.403 11.309 11.213 11.165 11.012 11.018 10.958 10.89 10.736 10.658 10.586 10.508 10.412 10.305 10.161 9.877 -3 ,3052 ,KEBNE ,16678621,Thu Nov 25 03:40:02 CET,Thu Nov 25 05:11:08 CET,0.0 0.497 0.69 0.789 0.883 0.97 1.057 1.14 1.277 1.343 1.41 1.41 1.577 1.634 1.746 1.848 1.963 2.023 2.144 2.268 2.432 2.531 2.632 2.764 2.891 3.026 3.148 3.26 3.418 3.566 3.7 3.872 4.037 4.187 4.387 4.632 4.867 5.118 5.367 5.616 5.879 6.209 6.617 7.041 7.527 8.034 8.628 9.287 10.08 11.012 12.043 12.865 13.289 13.508 13.566 13.526 13.499 13.467 13.403 13.347 13.296 13.197 13.097 13.002 12.88 12.773 12.685 12.605 12.537 12.463 12.371 12.297 12.222 12.144 12.083 12.019 11.958 11.88 11.794 11.744 11.685 11.579 11.511 11.451 11.417 11.338 11.255 11.158 11.113 10.976 11.002 10.951 10.897 10.767 10.697 10.63 10.547 10.458 10.383 10.3 10.086 -4 ,27059 ,KEBNE ,16678622,Thu Nov 25 03:41:04 CET,Thu Nov 25 05:12:31 CET,0.0 0.18 0.369 0.513 0.636 0.755 0.882 0.988 1.147 1.223 1.292 1.288 1.468 1.535 1.653 1.767 1.871 1.92 2.026 2.126 2.262 2.348 2.432 2.573 2.72 2.866 3.006 3.136 3.302 3.46 3.615 3.803 3.975 4.136 4.339 4.59 4.833 5.073 5.327 5.61 5.902 6.221 6.62 7.025 7.506 8.066 8.694 9.414 10.213 11.091 12.171 13.091 13.578 13.832 13.969 14.011 14.015 14.032 14.012 13.971 13.925 13.858 13.78 13.726 13.675 13.593 13.503 13.432 13.38 13.315 13.213 13.129 13.05 12.973 12.91 12.831 12.75 12.671 12.586 12.52 12.449 12.357 12.294 12.229 12.19 12.111 12.024 11.905 11.843 11.677 11.655 11.6 11.543 11.424 11.36 11.292 11.226 11.139 11.036 10.927 10.732 -5 ,3876 ,KEBNE ,16678623,Thu Nov 25 03:41:04 CET,Thu Nov 25 05:13:26 CET,0.0 0.203 0.326 0.399 0.465 0.536 0.63 0.723 0.864 0.923 0.988 0.999 1.17 1.223 1.33 1.44 1.56 1.615 1.72 1.825 1.959 2.044 2.133 2.277 2.419 2.558 2.694 2.814 2.964 3.112 3.253 3.416 3.566 3.714 3.912 4.145 4.366 4.616 4.895 5.183 5.491 5.85 6.25 6.643 7.113 7.623 8.193 8.859 9.667 10.649 11.837 12.775 13.281 13.539 13.658 13.726 13.771 13.786 13.76 13.695 13.623 13.557 13.5 13.439 13.359 13.28 13.192 13.102 13.022 12.948 12.867 12.786 12.708 12.632 12.571 12.51 12.445 12.366 12.273 12.209 12.139 12.038 11.975 11.903 11.863 11.787 11.695 11.597 11.559 11.418 11.427 11.375 11.319 11.183 11.104 11.011 10.9 10.787 10.689 10.578 10.37 -6 ,971 ,KEBNE ,16678624,Thu Nov 25 03:41:04 CET,Thu Nov 25 05:12:02 CET,0.0 0.244 0.378 0.48 0.566 0.664 0.769 0.841 0.965 1.033 1.1 1.119 1.305 1.378 1.523 1.66 1.79 1.848 1.959 2.071 2.231 2.332 2.429 2.566 2.697 2.833 2.967 3.102 3.264 3.405 3.536 3.694 3.857 4.018 4.195 4.402 4.615 4.86 5.119 5.381 5.668 5.99 6.356 6.736 7.174 7.649 8.255 8.986 9.808 10.774 11.925 12.83 13.245 13.446 13.57 13.575 13.557 13.554 13.523 13.438 13.322 13.236 13.155 13.074 12.992 12.921 12.84 12.755 12.696 12.636 12.551 12.457 12.353 12.256 12.181 12.097 12.021 11.952 11.844 11.761 11.693 11.6 11.527 11.448 11.41 11.334 11.257 11.183 11.143 10.984 10.971 10.912 10.844 10.685 10.609 10.533 10.443 10.347 10.25 10.143 9.91 -7 ,20572 ,KEBNE ,16678625,Thu Nov 25 03:41:05 CET,Thu Nov 25 05:08:38 CET,0.0 0.33 0.5 0.616 0.699 0.773 0.852 0.938 1.112 1.199 1.28 1.314 1.498 1.552 1.684 1.814 1.927 1.984 2.093 2.207 2.373 2.483 2.591 2.725 2.84 2.974 3.12 3.268 3.458 3.617 3.778 3.974 4.154 4.335 4.546 4.784 5.023 5.28 5.536 5.811 6.102 6.429 6.819 7.214 7.664 8.149 8.73 9.405 10.201 11.204 12.401 13.223 13.623 13.823 13.949 13.993 13.964 13.884 13.808 13.747 13.652 13.534 13.431 13.349 13.246 13.133 13.035 12.955 12.879 12.788 12.69 12.605 12.518 12.444 12.386 12.314 12.236 12.165 12.088 12.038 11.983 11.895 11.832 11.749 11.702 11.612 11.531 11.428 11.372 11.216 11.224 11.173 11.106 10.941 10.856 10.781 10.697 10.576 10.449 10.294 9.789 -8 ,24016 ,KEBNE ,16678626,Thu Nov 25 03:42:06 CET,Thu Nov 25 05:13:15 CET,0.0 0.158 0.262 0.35 0.426 0.491 0.567 0.657 0.822 0.887 0.962 1.015 1.203 1.272 1.397 1.514 1.636 1.694 1.803 1.897 2.034 2.141 2.248 2.399 2.538 2.673 2.808 2.939 3.097 3.226 3.359 3.548 3.732 3.902 4.112 4.338 4.54 4.761 5.015 5.3 5.597 5.914 6.282 6.715 7.216 7.73 8.319 9.014 9.843 10.767 11.934 12.803 13.224 13.415 13.472 13.506 13.53 13.498 13.41 13.334 13.241 13.153 13.092 13.025 12.954 12.88 12.789 12.695 12.623 12.547 12.467 12.394 12.299 12.202 12.123 12.038 11.965 11.899 11.839 11.8 11.749 11.647 11.576 11.502 11.458 11.365 11.296 11.243 11.209 11.062 11.08 11.026 10.959 10.819 10.741 10.654 10.572 10.496 10.413 10.322 10.013 -9 ,1374 ,KEBNE ,16678627,Thu Nov 25 03:42:07 CET,Thu Nov 25 05:14:42 CET,0.0 0.28 0.465 0.603 0.73 0.84 0.923 0.98 1.107 1.169 1.222 1.213 1.39 1.46 1.595 1.703 1.797 1.847 1.945 2.041 2.186 2.287 2.391 2.527 2.641 2.761 2.885 3.018 3.199 3.358 3.497 3.669 3.838 4.007 4.219 4.446 4.658 4.894 5.149 5.427 5.705 6.011 6.431 6.851 7.283 7.789 8.366 8.993 9.762 10.67 11.763 12.629 13.098 13.362 13.511 13.574 13.548 13.496 13.439 13.377 13.32 13.233 13.138 13.064 12.994 12.924 12.839 12.769 12.71 12.644 12.581 12.521 12.447 12.367 12.306 12.237 12.162 12.079 11.996 11.937 11.868 11.768 11.699 11.627 11.587 11.498 11.399 11.286 11.23 11.076 11.071 11.008 10.955 10.838 10.773 10.704 10.613 10.508 10.377 10.216 9.958 -10 ,29613 ,KEBNE ,16678628,Thu Nov 25 03:42:06 CET,Thu Nov 25 05:14:04 CET,0.0 0.397 0.513 0.599 0.707 0.821 0.915 1.007 1.166 1.241 1.315 1.327 1.495 1.56 1.711 1.843 1.965 2.019 2.123 2.237 2.401 2.503 2.596 2.727 2.855 2.968 3.075 3.185 3.338 3.487 3.636 3.837 4.039 4.22 4.431 4.674 4.894 5.169 5.471 5.781 6.107 6.456 6.865 7.282 7.762 8.315 8.969 9.712 10.52 11.363 12.38 13.181 13.565 13.763 13.83 13.802 13.738 13.656 13.586 13.497 13.404 13.332 13.264 13.194 13.139 13.075 12.982 12.907 12.834 12.753 12.673 12.599 12.516 12.428 12.35 12.273 12.212 12.157 12.081 12.021 11.968 11.878 11.794 11.71 11.67 11.586 11.5 11.409 11.363 11.205 11.21 11.143 11.065 10.907 10.818 10.731 10.65 10.559 10.452 10.344 10.153 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5e.txt deleted file mode 100644 index 8ff7a4fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5169 ,KEBNE ,16678629,Thu Nov 25 03:42:06 CET,Thu Nov 25 05:13:56 CET,0.0 0.304 0.477 0.643 0.795 0.914 1.04 1.16 1.335 1.429 1.528 1.569 1.763 1.844 1.995 2.127 2.239 2.297 2.414 2.513 2.658 2.767 2.862 2.98 3.09 3.203 3.318 3.429 3.568 3.688 3.814 3.984 4.149 4.289 4.446 4.627 4.797 4.986 5.174 5.357 5.547 5.78 6.036 6.287 6.581 6.873 7.194 7.523 7.869 8.203 8.402 8.352 8.164 7.875 7.56 7.275 7.004 6.749 6.542 6.354 6.2 6.035 5.865 5.689 5.515 5.35 5.17 5.014 4.876 4.726 4.58 4.455 4.308 4.166 4.064 3.966 3.875 3.769 3.661 3.583 3.496 3.363 3.272 3.171 3.116 3.027 2.947 2.857 2.81 2.646 2.682 2.629 2.553 2.402 2.32 2.223 2.118 2.006 1.884 1.725 1.548 -2 ,31376 ,KEBNE ,16678630,Thu Nov 25 03:42:06 CET,Thu Nov 25 05:11:14 CET,0.0 0.753 0.955 1.106 1.255 1.391 1.518 1.639 1.854 1.952 2.043 2.095 2.288 2.365 2.504 2.624 2.74 2.794 2.901 3.014 3.194 3.301 3.397 3.531 3.654 3.762 3.864 3.979 4.149 4.316 4.454 4.625 4.789 4.927 5.094 5.277 5.462 5.665 5.896 6.153 6.39 6.627 6.897 7.165 7.473 7.824 8.205 8.566 8.902 9.181 9.372 9.341 9.18 8.948 8.688 8.42 8.172 7.913 7.69 7.484 7.305 7.137 6.958 6.786 6.62 6.479 6.342 6.206 6.081 5.959 5.832 5.727 5.627 5.522 5.428 5.326 5.231 5.137 5.02 4.941 4.874 4.761 4.676 4.581 4.533 4.441 4.336 4.219 4.154 3.973 3.984 3.931 3.869 3.735 3.659 3.561 3.439 3.332 3.225 3.104 2.915 -3 ,23651 ,KEBNE ,16678631,Thu Nov 25 03:42:06 CET,Thu Nov 25 05:13:06 CET,0.0 0.294 0.397 0.486 0.607 0.727 0.828 0.931 1.103 1.177 1.255 1.3 1.5 1.583 1.732 1.86 1.96 2.004 2.107 2.217 2.38 2.486 2.587 2.724 2.846 2.97 3.088 3.201 3.354 3.501 3.648 3.811 3.952 4.088 4.249 4.436 4.611 4.809 5.014 5.213 5.431 5.666 5.921 6.172 6.463 6.761 7.084 7.451 7.817 8.031 8.137 8.025 7.763 7.476 7.206 6.966 6.733 6.503 6.295 6.039 5.815 5.632 5.467 5.311 5.167 5.037 4.889 4.752 4.626 4.501 4.378 4.265 4.156 4.059 3.973 3.895 3.821 3.734 3.65 3.594 3.538 3.445 3.372 3.292 3.25 3.178 3.111 3.038 2.995 2.829 2.84 2.779 2.72 2.612 2.551 2.484 2.407 2.329 2.235 2.067 1.571 -4 ,16512 ,KEBNE ,16678632,Thu Nov 25 03:42:10 CET,Thu Nov 25 05:07:46 CET,0.0 0.455 0.702 0.899 1.061 1.198 1.301 1.398 1.588 1.679 1.777 1.814 1.992 2.066 2.206 2.339 2.47 2.529 2.649 2.76 2.913 3.013 3.111 3.258 3.394 3.518 3.632 3.736 3.869 4.006 4.144 4.311 4.47 4.608 4.762 4.932 5.1 5.286 5.488 5.747 6.001 6.243 6.516 6.8 7.14 7.5 7.882 8.262 8.659 9.047 9.333 9.324 9.148 8.953 8.703 8.426 8.193 7.925 7.681 7.441 7.199 6.98 6.778 6.607 6.468 6.312 6.12 5.955 5.828 5.709 5.585 5.48 5.369 5.244 5.149 5.06 4.974 4.874 4.767 4.698 4.623 4.52 4.442 4.336 4.281 4.184 4.093 3.989 3.921 3.732 3.696 3.632 3.575 3.452 3.396 3.333 3.261 3.185 3.096 2.995 2.777 -5 ,12590 ,KEBNE ,16678633,Thu Nov 25 03:42:06 CET,Thu Nov 25 05:13:40 CET,0.0 0.272 0.45 0.606 0.723 0.841 0.944 1.037 1.197 1.275 1.357 1.378 1.55 1.602 1.729 1.878 2.018 2.081 2.196 2.309 2.467 2.566 2.664 2.811 2.949 3.081 3.224 3.355 3.509 3.665 3.804 3.973 4.142 4.29 4.469 4.657 4.834 5.042 5.238 5.42 5.617 5.844 6.095 6.34 6.622 6.932 7.296 7.632 7.947 8.275 8.459 8.37 8.139 7.877 7.623 7.384 7.132 6.893 6.706 6.513 6.32 6.137 5.959 5.79 5.641 5.496 5.331 5.17 5.038 4.893 4.74 4.63 4.516 4.387 4.275 4.161 4.056 3.955 3.845 3.769 3.696 3.594 3.51 3.425 3.381 3.281 3.171 3.046 2.985 2.804 2.79 2.727 2.666 2.542 2.466 2.394 2.334 2.252 2.164 2.075 1.911 -6 ,9456 ,KEBNE ,16678634,Thu Nov 25 03:42:06 CET,Thu Nov 25 05:14:23 CET,0.0 0.505 0.72 0.877 1.032 1.163 1.28 1.397 1.592 1.668 1.734 1.765 1.95 2.014 2.155 2.29 2.414 2.477 2.592 2.691 2.837 2.934 3.026 3.144 3.273 3.41 3.544 3.68 3.851 4.017 4.162 4.334 4.521 4.708 4.921 5.142 5.337 5.534 5.731 5.938 6.165 6.422 6.721 7.025 7.311 7.566 7.867 8.222 8.589 8.926 9.131 9.034 8.852 8.636 8.369 8.093 7.841 7.616 7.415 7.188 6.975 6.792 6.619 6.454 6.293 6.144 5.983 5.848 5.736 5.615 5.498 5.39 5.268 5.15 5.061 4.977 4.872 4.745 4.626 4.547 4.458 4.327 4.252 4.174 4.133 4.047 3.947 3.853 3.813 3.647 3.646 3.583 3.516 3.366 3.273 3.173 3.076 2.984 2.871 2.736 2.563 -7 ,28231 ,KEBNE ,16678635,Thu Nov 25 03:43:08 CET,Thu Nov 25 05:13:45 CET,0.0 0.578 0.735 0.888 1.025 1.128 1.23 1.332 1.567 1.672 1.747 1.765 1.949 2.017 2.149 2.279 2.393 2.447 2.563 2.667 2.811 2.917 3.018 3.149 3.278 3.411 3.535 3.643 3.791 3.924 4.039 4.177 4.304 4.438 4.609 4.787 4.961 5.158 5.365 5.578 5.789 6.013 6.274 6.55 6.839 7.131 7.489 7.854 8.171 8.46 8.649 8.541 8.333 8.111 7.855 7.62 7.408 7.196 7.005 6.781 6.571 6.393 6.226 6.077 5.945 5.816 5.677 5.545 5.427 5.301 5.143 5.015 4.901 4.77 4.668 4.562 4.45 4.35 4.252 4.169 4.08 3.953 3.851 3.739 3.69 3.582 3.457 3.338 3.281 3.108 3.116 3.054 2.989 2.827 2.747 2.67 2.581 2.465 2.323 2.202 1.859 -8 ,28391 ,KEBNE ,16678636,Thu Nov 25 03:43:08 CET,Thu Nov 25 05:13:25 CET,0.0 0.344 0.567 0.746 0.906 1.03 1.137 1.239 1.432 1.518 1.602 1.648 1.834 1.898 2.024 2.155 2.285 2.342 2.443 2.544 2.694 2.791 2.884 3.016 3.133 3.245 3.355 3.46 3.604 3.759 3.893 4.044 4.188 4.317 4.469 4.64 4.824 5.031 5.253 5.493 5.717 5.944 6.205 6.439 6.697 6.993 7.313 7.616 7.874 8.139 8.339 8.25 8.019 7.767 7.507 7.221 6.955 6.707 6.475 6.225 5.988 5.764 5.564 5.393 5.226 5.055 4.873 4.708 4.562 4.426 4.302 4.204 4.093 3.971 3.869 3.755 3.641 3.522 3.401 3.324 3.249 3.127 3.041 2.951 2.904 2.806 2.704 2.591 2.531 2.363 2.379 2.323 2.259 2.119 2.04 1.95 1.844 1.699 1.56 1.455 1.194 -9 ,13240 ,KEBNE ,16678637,Thu Nov 25 03:43:09 CET,Thu Nov 25 05:14:27 CET,0.0 0.454 0.637 0.797 0.945 1.063 1.165 1.251 1.419 1.51 1.597 1.653 1.853 1.917 2.04 2.182 2.316 2.372 2.476 2.584 2.746 2.84 2.924 3.04 3.168 3.295 3.406 3.518 3.654 3.789 3.928 4.093 4.243 4.383 4.548 4.717 4.882 5.072 5.267 5.458 5.66 5.902 6.186 6.471 6.759 7.024 7.311 7.634 8.022 8.376 8.626 8.599 8.412 8.172 7.922 7.676 7.44 7.207 6.995 6.791 6.587 6.358 6.15 5.977 5.833 5.705 5.552 5.398 5.259 5.12 4.991 4.888 4.774 4.655 4.56 4.464 4.37 4.271 4.163 4.082 3.991 3.849 3.764 3.687 3.646 3.542 3.435 3.317 3.248 3.07 3.07 3.009 2.945 2.814 2.743 2.666 2.583 2.476 2.337 2.185 1.887 -10 ,7460 ,KEBNE ,16678638,Thu Nov 25 03:43:08 CET,Thu Nov 25 05:15:41 CET,0.0 0.376 0.552 0.71 0.84 0.958 1.085 1.195 1.351 1.419 1.488 1.489 1.674 1.749 1.879 1.991 2.101 2.165 2.284 2.385 2.525 2.61 2.706 2.841 2.957 3.063 3.166 3.273 3.431 3.582 3.712 3.864 4.003 4.153 4.335 4.557 4.784 5.009 5.204 5.396 5.636 5.917 6.198 6.444 6.725 7.036 7.381 7.702 7.987 8.252 8.461 8.451 8.239 7.97 7.695 7.391 7.112 6.826 6.536 6.279 6.078 5.883 5.664 5.449 5.278 5.127 4.97 4.843 4.732 4.618 4.499 4.396 4.283 4.166 4.068 3.945 3.815 3.7 3.589 3.505 3.427 3.318 3.227 3.135 3.095 3.005 2.906 2.808 2.753 2.566 2.54 2.47 2.408 2.282 2.218 2.16 2.085 1.983 1.814 1.609 1.443 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_7.txt deleted file mode 100644 index 86e52cbc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3231 ,KEBNE ,16678639,Thu Nov 25 03:43:08 CET,Thu Nov 25 05:15:05 CET,0.0 0.301 0.407 0.496 0.564 0.632 0.688 0.729 0.808 0.838 0.858 0.791 0.936 0.961 1.015 1.066 1.09 1.088 1.091 1.124 1.169 1.182 1.198 1.218 1.215 1.189 1.162 1.144 1.129 1.103 1.075 1.028 0.976 0.935 0.874 0.777 0.657 0.513 0.362 0.199 0.023 -0.203 -0.517 -0.874 -1.37 -1.98 -2.765 -3.802 -5.254 -7.274 -10.254 -13.503 -15.988 -17.99 -19.627 -20.998 -22.146 -23.141 -23.949 -24.736 -25.394 -25.942 -26.444 -26.904 -27.326 -27.71 -28.098 -28.446 -28.745 -29.046 -29.358 -29.612 -29.871 -30.132 -30.331 -30.537 -30.753 -30.98 -31.203 -31.351 -31.511 -31.756 -31.91 -32.058 -32.134 -32.305 -32.484 -32.653 -32.738 -32.973 -33.009 -33.115 -33.231 -33.452 -33.558 -33.683 -33.825 -33.977 -34.178 -34.401 -34.73 -2 ,29473 ,KEBNE ,16678640,Thu Nov 25 03:43:12 CET,Thu Nov 25 05:10:14 CET,0.0 0.146 0.221 0.261 0.293 0.346 0.408 0.47 0.584 0.627 0.661 0.595 0.725 0.745 0.805 0.835 0.844 0.857 0.892 0.911 0.923 0.928 0.933 0.941 0.939 0.938 0.93 0.91 0.873 0.838 0.813 0.78 0.73 0.679 0.63 0.556 0.455 0.325 0.169 -0.019 -0.224 -0.461 -0.761 -1.103 -1.57 -2.175 -2.982 -4.019 -5.39 -7.42 -10.537 -13.744 -16.157 -18.04 -19.627 -20.978 -22.065 -23.02 -23.837 -24.628 -25.278 -25.831 -26.338 -26.801 -27.215 -27.597 -27.999 -28.346 -28.64 -28.941 -29.26 -29.528 -29.782 -30.023 -30.208 -30.413 -30.631 -30.838 -31.057 -31.202 -31.34 -31.556 -31.712 -31.879 -31.96 -32.139 -32.337 -32.529 -32.617 -32.856 -32.896 -32.987 -33.079 -33.277 -33.396 -33.533 -33.663 -33.775 -33.896 -34.071 -34.362 -3 ,1058 ,KEBNE ,16678641,Thu Nov 25 03:43:12 CET,Thu Nov 25 05:10:30 CET,0.0 0.256 0.382 0.437 0.47 0.493 0.538 0.589 0.661 0.684 0.699 0.61 0.746 0.761 0.787 0.835 0.866 0.865 0.871 0.894 0.936 0.962 0.98 0.998 1.011 1.004 0.979 0.954 0.922 0.882 0.856 0.819 0.761 0.695 0.622 0.533 0.424 0.312 0.192 0.037 -0.134 -0.35 -0.648 -0.972 -1.398 -1.99 -2.774 -3.74 -5.091 -7.111 -10.273 -13.597 -16.053 -18.019 -19.58 -20.907 -22.049 -23.03 -23.84 -24.641 -25.313 -25.881 -26.428 -26.947 -27.398 -27.802 -28.212 -28.559 -28.854 -29.158 -29.463 -29.705 -29.952 -30.21 -30.41 -30.602 -30.801 -31.009 -31.216 -31.351 -31.492 -31.718 -31.87 -32.024 -32.099 -32.251 -32.412 -32.594 -32.681 -32.92 -32.968 -33.072 -33.177 -33.393 -33.5 -33.62 -33.756 -33.89 -34.02 -34.173 -34.438 -4 ,3187 ,KEBNE ,16678642,Thu Nov 25 03:44:10 CET,Thu Nov 25 05:14:55 CET,0.0 0.134 0.216 0.267 0.307 0.361 0.42 0.473 0.563 0.594 0.63 0.574 0.703 0.718 0.758 0.799 0.831 0.849 0.878 0.886 0.891 0.886 0.872 0.86 0.865 0.871 0.882 0.894 0.874 0.834 0.788 0.733 0.682 0.621 0.535 0.422 0.308 0.167 0.018 -0.145 -0.348 -0.621 -0.982 -1.321 -1.775 -2.4 -3.21 -4.22 -5.549 -7.516 -10.542 -13.811 -16.345 -18.362 -19.949 -21.269 -22.405 -23.381 -24.166 -24.916 -25.536 -26.098 -26.622 -27.092 -27.532 -27.923 -28.31 -28.651 -28.944 -29.236 -29.535 -29.776 -30.014 -30.265 -30.453 -30.64 -30.833 -31.028 -31.238 -31.381 -31.517 -31.729 -31.88 -32.043 -32.128 -32.291 -32.449 -32.609 -32.694 -32.937 -32.964 -33.051 -33.155 -33.396 -33.51 -33.627 -33.777 -33.914 -34.028 -34.171 -34.377 -5 ,11202 ,KEBNE ,16678643,Thu Nov 25 03:44:11 CET,Thu Nov 25 05:16:04 CET,0.0 0.133 0.189 0.248 0.287 0.34 0.407 0.45 0.514 0.557 0.592 0.516 0.649 0.663 0.695 0.743 0.795 0.809 0.815 0.823 0.83 0.827 0.825 0.826 0.821 0.823 0.823 0.818 0.801 0.775 0.763 0.722 0.663 0.6 0.523 0.431 0.314 0.198 0.074 -0.101 -0.311 -0.581 -0.945 -1.347 -1.839 -2.432 -3.236 -4.326 -5.783 -7.781 -10.814 -14.045 -16.455 -18.406 -19.995 -21.316 -22.415 -23.355 -24.153 -24.953 -25.595 -26.131 -26.629 -27.087 -27.496 -27.86 -28.246 -28.599 -28.893 -29.177 -29.475 -29.725 -29.991 -30.253 -30.442 -30.634 -30.834 -31.034 -31.232 -31.371 -31.519 -31.732 -31.872 -32.029 -32.112 -32.28 -32.444 -32.609 -32.694 -32.931 -32.974 -33.081 -33.191 -33.422 -33.548 -33.671 -33.788 -33.924 -34.085 -34.26 -34.502 -6 ,13463 ,KEBNE ,16678644,Thu Nov 25 03:44:10 CET,Thu Nov 25 05:13:15 CET,0.0 0.203 0.255 0.289 0.324 0.35 0.391 0.438 0.508 0.544 0.576 0.517 0.657 0.673 0.698 0.726 0.76 0.775 0.788 0.805 0.832 0.838 0.847 0.859 0.85 0.829 0.819 0.814 0.791 0.753 0.727 0.696 0.646 0.598 0.534 0.46 0.378 0.256 0.105 -0.065 -0.26 -0.497 -0.826 -1.219 -1.711 -2.302 -3.038 -4.047 -5.492 -7.49 -10.54 -13.883 -16.372 -18.343 -19.93 -21.268 -22.399 -23.384 -24.185 -24.96 -25.625 -26.205 -26.735 -27.215 -27.672 -28.076 -28.461 -28.786 -29.06 -29.366 -29.68 -29.92 -30.169 -30.43 -30.627 -30.829 -31.027 -31.226 -31.446 -31.598 -31.748 -31.98 -32.136 -32.302 -32.386 -32.541 -32.703 -32.869 -32.951 -33.189 -33.212 -33.303 -33.405 -33.613 -33.719 -33.824 -33.96 -34.118 -34.259 -34.42 -34.772 -7 ,5847 ,KEBNE ,16678645,Thu Nov 25 03:44:10 CET,Thu Nov 25 05:16:44 CET,0.0 0.218 0.322 0.387 0.436 0.482 0.524 0.557 0.601 0.626 0.656 0.577 0.705 0.713 0.731 0.745 0.76 0.768 0.784 0.809 0.828 0.833 0.84 0.848 0.847 0.839 0.812 0.784 0.743 0.686 0.634 0.583 0.537 0.488 0.419 0.337 0.25 0.153 0.026 -0.18 -0.406 -0.652 -0.968 -1.325 -1.818 -2.445 -3.239 -4.285 -5.731 -7.782 -10.886 -14.135 -16.533 -18.49 -20.082 -21.421 -22.549 -23.488 -24.254 -24.998 -25.641 -26.2 -26.704 -27.159 -27.564 -27.925 -28.287 -28.617 -28.918 -29.219 -29.516 -29.765 -30.016 -30.276 -30.479 -30.68 -30.886 -31.104 -31.325 -31.464 -31.597 -31.814 -31.968 -32.12 -32.2 -32.358 -32.518 -32.676 -32.749 -32.976 -33.002 -33.102 -33.207 -33.421 -33.532 -33.651 -33.762 -33.878 -34.016 -34.168 -34.369 -8 ,25850 ,KEBNE ,16678646,Thu Nov 25 03:44:11 CET,Thu Nov 25 05:16:46 CET,0.0 0.179 0.266 0.357 0.416 0.458 0.491 0.52 0.564 0.584 0.606 0.528 0.654 0.661 0.68 0.71 0.737 0.753 0.782 0.808 0.848 0.863 0.864 0.862 0.871 0.873 0.873 0.87 0.85 0.82 0.771 0.706 0.666 0.623 0.552 0.454 0.341 0.204 0.038 -0.159 -0.381 -0.682 -1.071 -1.467 -1.961 -2.601 -3.456 -4.556 -6.039 -8.086 -11.179 -14.501 -16.956 -18.893 -20.471 -21.834 -22.988 -23.97 -24.803 -25.596 -26.231 -26.777 -27.275 -27.748 -28.179 -28.559 -28.951 -29.289 -29.587 -29.889 -30.194 -30.447 -30.695 -30.936 -31.127 -31.323 -31.523 -31.725 -31.93 -32.083 -32.239 -32.461 -32.61 -32.754 -32.825 -32.993 -33.155 -33.295 -33.373 -33.612 -33.647 -33.741 -33.837 -34.033 -34.144 -34.272 -34.401 -34.521 -34.647 -34.793 -35.224 -9 ,32653 ,KEBNE ,16678647,Thu Nov 25 03:44:10 CET,Thu Nov 25 05:14:37 CET,0.0 0.152 0.209 0.283 0.349 0.407 0.448 0.483 0.535 0.561 0.604 0.56 0.701 0.717 0.755 0.803 0.829 0.836 0.864 0.886 0.9 0.905 0.911 0.91 0.903 0.9 0.909 0.915 0.893 0.861 0.83 0.788 0.736 0.674 0.588 0.476 0.36 0.234 0.094 -0.072 -0.238 -0.436 -0.746 -1.105 -1.586 -2.222 -3.018 -3.958 -5.22 -7.083 -10.074 -13.384 -15.855 -17.836 -19.464 -20.81 -21.906 -22.882 -23.686 -24.451 -25.09 -25.654 -26.189 -26.673 -27.114 -27.518 -27.936 -28.301 -28.602 -28.9 -29.203 -29.45 -29.695 -29.949 -30.139 -30.315 -30.5 -30.693 -30.892 -31.034 -31.178 -31.401 -31.561 -31.725 -31.805 -31.97 -32.145 -32.313 -32.391 -32.63 -32.693 -32.802 -32.914 -33.136 -33.244 -33.346 -33.441 -33.576 -33.729 -33.879 -34.167 -10 ,31156 ,KEBNE ,16678648,Thu Nov 25 03:45:13 CET,Thu Nov 25 05:15:28 CET,0.0 0.219 0.297 0.362 0.405 0.451 0.502 0.546 0.615 0.653 0.689 0.624 0.766 0.798 0.86 0.9 0.921 0.931 0.945 0.955 0.976 0.978 0.974 0.972 0.968 0.959 0.954 0.942 0.913 0.882 0.845 0.782 0.727 0.682 0.613 0.515 0.413 0.303 0.168 0.017 -0.165 -0.415 -0.732 -1.084 -1.568 -2.209 -3.047 -4.104 -5.497 -7.479 -10.592 -13.986 -16.527 -18.519 -20.159 -21.558 -22.696 -23.687 -24.541 -25.366 -26.036 -26.617 -27.159 -27.639 -28.056 -28.416 -28.794 -29.139 -29.447 -29.774 -30.098 -30.354 -30.616 -30.889 -31.096 -31.309 -31.525 -31.735 -31.938 -32.078 -32.226 -32.453 -32.61 -32.769 -32.855 -33.03 -33.211 -33.392 -33.484 -33.723 -33.734 -33.826 -33.937 -34.17 -34.267 -34.372 -34.5 -34.643 -34.797 -34.952 -35.294 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5e_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5e_5a.txt deleted file mode 100644 index c18a93ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5e_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23167 ,KEBNE ,16678649,Thu Nov 25 03:45:13 CET,Thu Nov 25 05:16:33 CET,0.0 0.348 0.472 0.572 0.673 0.773 0.86 0.942 1.089 1.157 1.238 1.289 1.492 1.561 1.668 1.773 1.885 1.951 2.073 2.185 2.36 2.456 2.548 2.683 2.811 2.943 3.069 3.19 3.353 3.512 3.66 3.835 4.014 4.202 4.425 4.666 4.877 5.132 5.41 5.693 6.008 6.355 6.728 7.103 7.58 8.118 8.724 9.392 10.16 11.048 12.148 13.044 13.507 13.719 13.818 13.858 13.796 13.689 13.583 13.438 13.287 13.159 13.053 12.946 12.84 12.726 12.598 12.488 12.381 12.265 12.138 12.031 11.931 11.819 11.73 11.63 11.532 11.435 11.303 11.202 11.116 10.996 10.905 10.786 10.717 10.592 10.48 10.357 10.288 10.112 10.034 9.932 9.834 9.647 9.539 9.404 9.238 9.049 8.835 8.572 7.911 -2 ,18721 ,KEBNE ,16678650,Thu Nov 25 03:45:13 CET,Thu Nov 25 05:16:28 CET,0.0 0.217 0.343 0.45 0.551 0.622 0.695 0.771 0.903 0.973 1.039 1.058 1.248 1.327 1.457 1.561 1.658 1.709 1.816 1.916 2.06 2.168 2.278 2.419 2.563 2.717 2.847 2.968 3.123 3.27 3.432 3.633 3.816 3.998 4.219 4.469 4.72 5.019 5.324 5.622 5.931 6.266 6.649 7.043 7.519 8.081 8.742 9.446 10.302 11.322 12.448 13.243 13.599 13.736 13.765 13.732 13.662 13.573 13.489 13.363 13.259 13.19 13.067 12.932 12.829 12.735 12.632 12.524 12.422 12.302 12.187 12.09 11.981 11.85 11.744 11.637 11.516 11.401 11.289 11.217 11.141 10.99 10.87 10.763 10.715 10.608 10.473 10.312 10.24 10.062 10.008 9.92 9.829 9.644 9.515 9.373 9.235 9.082 8.876 8.553 7.967 -3 ,25973 ,KEBNE ,16678651,Thu Nov 25 03:45:13 CET,Thu Nov 25 05:16:14 CET,0.0 0.22 0.337 0.441 0.545 0.644 0.723 0.821 1.016 1.089 1.153 1.167 1.35 1.415 1.531 1.641 1.753 1.806 1.906 2.009 2.172 2.274 2.371 2.512 2.655 2.791 2.911 3.024 3.184 3.345 3.492 3.658 3.812 3.976 4.174 4.399 4.627 4.893 5.196 5.504 5.817 6.186 6.638 7.073 7.569 8.134 8.762 9.481 10.296 11.165 12.246 13.137 13.586 13.815 13.899 13.899 13.838 13.716 13.577 13.438 13.284 13.131 13.001 12.858 12.725 12.612 12.48 12.346 12.228 12.091 11.94 11.832 11.715 11.581 11.471 11.37 11.286 11.191 11.081 10.999 10.915 10.786 10.695 10.587 10.527 10.44 10.342 10.206 10.135 9.961 9.925 9.836 9.736 9.497 9.361 9.214 9.06 8.888 8.639 8.35 7.784 -4 ,11864 ,KEBNE ,16678652,Thu Nov 25 03:45:13 CET,Thu Nov 25 05:16:03 CET,0.0 0.189 0.337 0.446 0.541 0.636 0.731 0.814 0.951 1.017 1.093 1.144 1.328 1.396 1.538 1.67 1.78 1.833 1.951 2.066 2.218 2.306 2.4 2.555 2.698 2.82 2.948 3.074 3.242 3.405 3.556 3.755 3.954 4.143 4.365 4.628 4.87 5.135 5.415 5.692 5.991 6.331 6.725 7.124 7.604 8.148 8.802 9.576 10.469 11.453 12.57 13.534 14.066 14.322 14.403 14.398 14.363 14.326 14.27 14.19 14.07 13.95 13.83 13.7 13.571 13.449 13.318 13.199 13.097 12.976 12.854 12.763 12.663 12.527 12.419 12.304 12.165 12.017 11.87 11.784 11.701 11.57 11.458 11.338 11.285 11.164 11.04 10.913 10.836 10.655 10.595 10.489 10.387 10.141 9.987 9.841 9.697 9.532 9.327 9.08 8.308 -5 ,27064 ,KEBNE ,16678653,Thu Nov 25 03:45:13 CET,Thu Nov 25 05:17:59 CET,0.0 0.252 0.411 0.545 0.658 0.757 0.835 0.905 1.042 1.114 1.186 1.22 1.406 1.459 1.575 1.683 1.789 1.846 1.964 2.072 2.214 2.317 2.429 2.573 2.696 2.825 2.943 3.057 3.218 3.379 3.536 3.73 3.914 4.095 4.312 4.555 4.797 5.064 5.348 5.628 5.909 6.251 6.648 7.063 7.558 8.104 8.739 9.464 10.332 11.302 12.389 13.279 13.761 13.95 14.01 14.007 13.984 13.943 13.846 13.709 13.585 13.467 13.368 13.279 13.175 13.065 12.956 12.848 12.739 12.63 12.509 12.408 12.297 12.179 12.087 11.996 11.905 11.808 11.709 11.636 11.55 11.389 11.269 11.154 11.101 11.002 10.883 10.76 10.696 10.513 10.465 10.388 10.29 10.049 9.916 9.774 9.618 9.414 9.186 8.911 8.198 -6 ,28979 ,KEBNE ,16678654,Thu Nov 25 03:45:13 CET,Thu Nov 25 05:16:14 CET,0.0 0.274 0.398 0.522 0.627 0.715 0.783 0.859 1.002 1.061 1.133 1.16 1.347 1.411 1.521 1.629 1.733 1.787 1.891 1.986 2.117 2.199 2.284 2.405 2.517 2.63 2.74 2.861 3.011 3.143 3.278 3.461 3.654 3.823 4.013 4.258 4.505 4.77 5.042 5.335 5.663 6.031 6.452 6.875 7.364 7.931 8.604 9.327 10.173 11.125 12.159 12.966 13.429 13.685 13.799 13.83 13.864 13.855 13.801 13.758 13.655 13.504 13.366 13.239 13.104 12.967 12.812 12.673 12.563 12.446 12.309 12.197 12.079 11.939 11.832 11.733 11.633 11.514 11.382 11.291 11.188 11.019 10.917 10.807 10.743 10.61 10.479 10.366 10.311 10.14 10.113 10.038 9.954 9.745 9.619 9.483 9.33 9.176 8.999 8.744 7.767 -7 ,10772 ,KEBNE ,16678655,Thu Nov 25 03:46:16 CET,Thu Nov 25 05:16:56 CET,0.0 0.348 0.459 0.595 0.734 0.847 0.93 1.01 1.182 1.257 1.33 1.369 1.555 1.615 1.748 1.875 1.985 2.037 2.141 2.264 2.431 2.513 2.589 2.715 2.847 2.981 3.115 3.245 3.409 3.565 3.717 3.899 4.082 4.263 4.47 4.689 4.9 5.147 5.437 5.775 6.111 6.469 6.88 7.289 7.763 8.312 8.974 9.701 10.56 11.575 12.782 13.672 14.121 14.333 14.392 14.385 14.347 14.291 14.224 14.144 14.057 13.984 13.905 13.779 13.64 13.536 13.416 13.271 13.134 13.007 12.89 12.781 12.674 12.577 12.491 12.391 12.274 12.153 12.021 11.924 11.837 11.683 11.567 11.461 11.403 11.268 11.117 10.97 10.896 10.713 10.648 10.556 10.463 10.241 10.117 9.986 9.821 9.654 9.478 9.227 8.429 -8 ,24911 ,KEBNE ,16678656,Thu Nov 25 03:46:16 CET,Thu Nov 25 05:16:53 CET,0.0 0.275 0.393 0.501 0.617 0.725 0.83 0.904 1.025 1.094 1.172 1.19 1.365 1.419 1.542 1.671 1.801 1.86 1.964 2.07 2.234 2.35 2.46 2.594 2.72 2.85 2.967 3.087 3.253 3.425 3.595 3.787 3.974 4.149 4.339 4.559 4.776 5.01 5.267 5.562 5.873 6.22 6.636 7.069 7.546 8.032 8.588 9.233 10.045 10.954 11.96 12.666 12.991 13.114 13.1 13.031 12.985 12.925 12.84 12.744 12.639 12.522 12.381 12.25 12.152 12.061 11.956 11.851 11.757 11.662 11.552 11.446 11.337 11.226 11.131 11.042 10.958 10.87 10.768 10.701 10.63 10.497 10.414 10.342 10.303 10.207 10.089 9.953 9.887 9.717 9.686 9.608 9.515 9.318 9.206 9.067 8.896 8.731 8.584 8.39 7.995 -9 ,30159 ,KEBNE ,16678657,Thu Nov 25 03:46:16 CET,Thu Nov 25 05:18:13 CET,0.0 0.238 0.366 0.462 0.539 0.611 0.687 0.782 0.974 1.052 1.132 1.16 1.336 1.389 1.487 1.601 1.743 1.807 1.917 2.024 2.185 2.285 2.387 2.525 2.653 2.8 2.942 3.076 3.241 3.402 3.572 3.777 3.974 4.155 4.358 4.615 4.864 5.11 5.379 5.657 5.947 6.283 6.671 7.078 7.557 8.097 8.716 9.404 10.205 11.16 12.333 13.224 13.655 13.861 13.921 13.897 13.832 13.766 13.688 13.57 13.451 13.352 13.249 13.132 12.993 12.849 12.709 12.597 12.492 12.374 12.245 12.133 12.006 11.857 11.755 11.663 11.55 11.431 11.317 11.237 11.164 11.052 10.964 10.86 10.801 10.673 10.54 10.395 10.317 10.134 10.049 9.946 9.848 9.622 9.508 9.387 9.251 9.103 8.893 8.482 7.635 -10 ,5236 ,KEBNE ,16678658,Thu Nov 25 03:46:16 CET,Thu Nov 25 05:16:08 CET,0.0 0.165 0.305 0.442 0.563 0.676 0.768 0.844 0.997 1.076 1.145 1.175 1.367 1.435 1.587 1.736 1.867 1.919 2.022 2.13 2.27 2.363 2.455 2.6 2.744 2.894 3.041 3.185 3.369 3.532 3.692 3.891 4.073 4.257 4.495 4.738 4.952 5.213 5.507 5.812 6.108 6.441 6.866 7.27 7.745 8.307 8.944 9.621 10.403 11.314 12.304 13.113 13.561 13.755 13.828 13.857 13.852 13.809 13.74 13.663 13.586 13.492 13.349 13.186 13.051 12.934 12.794 12.678 12.593 12.487 12.364 12.256 12.149 12.05 11.965 11.868 11.773 11.674 11.562 11.485 11.404 11.268 11.175 11.071 11.008 10.875 10.748 10.6 10.513 10.33 10.295 10.21 10.113 9.917 9.8 9.684 9.573 9.438 9.26 9.004 8.239 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5g.txt deleted file mode 100644 index b82e67ad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12393 ,KEBNE ,16678659,Thu Nov 25 03:46:16 CET,Thu Nov 25 05:16:43 CET,0.0 0.222 0.415 0.593 0.727 0.847 0.947 1.028 1.172 1.251 1.331 1.365 1.547 1.621 1.749 1.861 1.969 2.018 2.107 2.215 2.371 2.454 2.537 2.659 2.794 2.93 3.053 3.164 3.319 3.492 3.624 3.748 3.878 4.001 4.146 4.315 4.48 4.669 4.857 5.049 5.242 5.425 5.621 5.81 6.03 6.293 6.562 6.793 7.03 7.268 7.364 7.144 6.812 6.422 6.0 5.663 5.392 5.098 4.856 4.614 4.385 4.187 3.99 3.788 3.592 3.417 3.257 3.109 2.96 2.815 2.671 2.56 2.449 2.323 2.225 2.119 2.01 1.903 1.798 1.709 1.613 1.491 1.409 1.319 1.27 1.175 1.063 0.931 0.862 0.683 0.66 0.593 0.534 0.414 0.341 0.25 0.16 0.055 -0.076 -0.249 -0.778 -2 ,28428 ,KEBNE ,16678660,Thu Nov 25 03:46:20 CET,Thu Nov 25 05:13:45 CET,0.0 0.208 0.373 0.508 0.61 0.725 0.844 0.937 1.074 1.14 1.216 1.252 1.43 1.495 1.627 1.745 1.843 1.889 1.988 2.084 2.226 2.32 2.409 2.537 2.654 2.751 2.843 2.942 3.069 3.2 3.325 3.481 3.627 3.754 3.92 4.094 4.233 4.37 4.508 4.687 4.936 5.167 5.351 5.548 5.791 6.001 6.21 6.414 6.594 6.72 6.69 6.425 6.073 5.719 5.423 5.144 4.864 4.618 4.41 4.181 3.987 3.806 3.624 3.442 3.264 3.086 2.898 2.745 2.607 2.46 2.307 2.177 2.049 1.91 1.797 1.691 1.603 1.523 1.429 1.354 1.259 1.131 1.045 0.951 0.911 0.822 0.719 0.624 0.572 0.403 0.395 0.334 0.269 0.115 0.04 -0.035 -0.114 -0.199 -0.321 -0.463 -0.672 -3 ,28844 ,KEBNE ,16678661,Thu Nov 25 03:46:16 CET,Thu Nov 25 05:15:52 CET,0.0 0.542 0.662 0.766 0.89 1.009 1.1 1.178 1.326 1.402 1.469 1.485 1.673 1.746 1.876 2.001 2.118 2.166 2.257 2.356 2.516 2.616 2.703 2.842 2.974 3.088 3.19 3.301 3.452 3.575 3.672 3.773 3.887 4.011 4.155 4.34 4.514 4.66 4.815 4.99 5.182 5.397 5.615 5.833 6.068 6.289 6.51 6.733 6.966 7.146 7.223 7.102 6.819 6.465 6.14 5.791 5.465 5.217 5.008 4.802 4.609 4.427 4.238 4.043 3.88 3.737 3.582 3.449 3.35 3.239 3.093 2.98 2.887 2.788 2.692 2.597 2.507 2.409 2.308 2.239 2.16 2.031 1.94 1.843 1.799 1.707 1.615 1.526 1.474 1.288 1.249 1.183 1.11 0.95 0.878 0.787 0.688 0.571 0.441 0.306 0.086 -4 ,2896 ,KEBNE ,16678662,Thu Nov 25 03:46:16 CET,Thu Nov 25 05:16:55 CET,0.0 0.368 0.571 0.723 0.823 0.899 0.997 1.104 1.266 1.327 1.389 1.406 1.588 1.655 1.78 1.908 2.023 2.072 2.166 2.264 2.393 2.477 2.56 2.683 2.791 2.89 2.989 3.093 3.224 3.339 3.454 3.591 3.731 3.885 4.05 4.21 4.359 4.552 4.76 4.949 5.121 5.314 5.565 5.781 6.001 6.201 6.405 6.641 6.904 7.09 7.034 6.762 6.405 6.04 5.696 5.37 5.086 4.836 4.613 4.372 4.17 3.974 3.79 3.624 3.459 3.311 3.156 2.998 2.856 2.73 2.599 2.487 2.385 2.269 2.178 2.083 1.969 1.856 1.755 1.685 1.611 1.513 1.436 1.337 1.288 1.198 1.109 1.026 0.98 0.803 0.787 0.723 0.649 0.501 0.437 0.364 0.285 0.215 0.146 0.081 0.009 -5 ,28195 ,KEBNE ,16678663,Thu Nov 25 03:46:16 CET,Thu Nov 25 05:15:44 CET,0.0 0.175 0.327 0.48 0.617 0.743 0.853 0.943 1.094 1.165 1.23 1.248 1.425 1.491 1.634 1.756 1.863 1.918 2.031 2.135 2.287 2.387 2.488 2.65 2.788 2.915 3.04 3.14 3.266 3.407 3.54 3.689 3.837 3.995 4.151 4.294 4.442 4.599 4.738 4.883 5.059 5.25 5.47 5.732 6.018 6.266 6.525 6.762 6.947 7.053 6.99 6.702 6.306 5.928 5.635 5.328 5.02 4.75 4.508 4.255 4.022 3.827 3.663 3.485 3.282 3.112 2.972 2.845 2.727 2.612 2.495 2.403 2.312 2.193 2.088 1.996 1.901 1.793 1.681 1.603 1.535 1.416 1.33 1.232 1.182 1.099 1.005 0.886 0.821 0.652 0.663 0.605 0.549 0.394 0.296 0.205 0.114 0.03 -0.07 -0.215 -0.555 -6 ,23266 ,KEBNE ,16678664,Thu Nov 25 03:46:16 CET,Thu Nov 25 05:17:42 CET,0.0 0.363 0.535 0.661 0.741 0.818 0.912 1.017 1.163 1.217 1.274 1.294 1.47 1.528 1.657 1.787 1.892 1.941 2.042 2.142 2.306 2.432 2.544 2.668 2.789 2.904 3.006 3.105 3.22 3.334 3.458 3.611 3.766 3.908 4.053 4.224 4.394 4.553 4.72 4.905 5.074 5.266 5.526 5.752 5.963 6.19 6.416 6.647 6.874 7.06 7.077 6.821 6.464 6.091 5.766 5.466 5.21 4.95 4.699 4.458 4.267 4.101 3.935 3.767 3.596 3.444 3.285 3.144 3.031 2.9 2.776 2.681 2.57 2.441 2.335 2.243 2.143 2.033 1.932 1.865 1.799 1.679 1.59 1.512 1.463 1.354 1.258 1.141 1.074 0.902 0.912 0.835 0.756 0.629 0.554 0.466 0.382 0.299 0.206 0.109 -0.121 -7 ,17445 ,KEBNE ,16678665,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:18:49 CET,0.0 0.198 0.348 0.503 0.622 0.747 0.861 0.935 1.079 1.149 1.208 1.215 1.382 1.435 1.552 1.682 1.819 1.876 1.989 2.104 2.25 2.332 2.411 2.554 2.715 2.841 2.938 3.041 3.165 3.276 3.388 3.524 3.659 3.786 3.943 4.129 4.283 4.431 4.584 4.798 5.027 5.24 5.497 5.709 5.903 6.133 6.408 6.636 6.832 6.993 6.987 6.71 6.339 5.959 5.63 5.349 5.1 4.852 4.622 4.381 4.149 3.946 3.753 3.581 3.42 3.25 3.086 2.94 2.809 2.7 2.598 2.493 2.378 2.257 2.153 2.061 1.972 1.873 1.777 1.708 1.629 1.51 1.432 1.344 1.295 1.202 1.115 1.012 0.955 0.785 0.788 0.732 0.665 0.493 0.396 0.306 0.197 0.069 -0.047 -0.187 -0.34 -8 ,14339 ,KEBNE ,16678666,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:18:37 CET,0.0 0.548 0.786 1.002 1.14 1.227 1.305 1.397 1.557 1.617 1.684 1.721 1.906 1.979 2.104 2.215 2.324 2.368 2.451 2.53 2.644 2.722 2.804 2.932 3.04 3.141 3.241 3.33 3.44 3.559 3.682 3.831 3.967 4.094 4.252 4.423 4.583 4.745 4.891 5.034 5.204 5.433 5.689 5.909 6.123 6.338 6.578 6.797 6.999 7.147 7.091 6.792 6.428 6.087 5.761 5.43 5.143 4.902 4.668 4.417 4.189 3.978 3.794 3.626 3.461 3.314 3.174 3.039 2.915 2.796 2.681 2.571 2.447 2.333 2.248 2.161 2.063 1.963 1.863 1.787 1.701 1.568 1.483 1.392 1.345 1.244 1.131 0.998 0.937 0.774 0.768 0.698 0.626 0.48 0.404 0.324 0.243 0.149 -0.007 -0.188 -0.488 -9 ,20757 ,KEBNE ,16678667,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:18:49 CET,0.0 0.25 0.498 0.662 0.777 0.873 0.977 1.073 1.251 1.351 1.444 1.477 1.648 1.693 1.794 1.923 2.049 2.105 2.21 2.305 2.44 2.53 2.614 2.74 2.854 2.979 3.107 3.212 3.344 3.496 3.64 3.789 3.931 4.068 4.222 4.386 4.551 4.75 4.971 5.204 5.449 5.684 5.904 6.138 6.433 6.707 6.97 7.241 7.513 7.793 7.909 7.669 7.375 7.068 6.745 6.426 6.135 5.852 5.59 5.296 5.062 4.872 4.698 4.546 4.382 4.217 4.06 3.936 3.813 3.661 3.514 3.407 3.299 3.189 3.112 3.023 2.923 2.828 2.713 2.625 2.536 2.402 2.323 2.244 2.193 2.084 2.001 1.917 1.864 1.697 1.699 1.639 1.579 1.459 1.382 1.292 1.211 1.121 0.999 0.833 0.618 -10 ,11085 ,KEBNE ,16678668,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:18:47 CET,0.0 0.229 0.389 0.499 0.589 0.675 0.77 0.863 1.05 1.137 1.21 1.243 1.424 1.485 1.597 1.726 1.843 1.902 2.013 2.105 2.248 2.343 2.445 2.577 2.679 2.783 2.884 2.987 3.12 3.247 3.354 3.47 3.593 3.735 3.905 4.094 4.273 4.445 4.638 4.821 5.007 5.208 5.431 5.662 5.902 6.144 6.354 6.559 6.773 6.972 7.057 6.796 6.509 6.24 5.966 5.714 5.459 5.216 5.012 4.808 4.634 4.444 4.265 4.116 3.958 3.806 3.659 3.525 3.408 3.298 3.185 3.08 2.964 2.845 2.749 2.657 2.566 2.451 2.33 2.253 2.179 2.069 1.997 1.923 1.878 1.785 1.699 1.608 1.561 1.403 1.405 1.34 1.263 1.085 0.994 0.904 0.805 0.675 0.476 0.251 -0.236 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5i.txt deleted file mode 100644 index 2a7519ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15632 ,KEBNE ,16678669,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:20:01 CET,0.0 0.767 0.926 1.075 1.211 1.325 1.426 1.532 1.727 1.805 1.88 1.929 2.118 2.188 2.329 2.449 2.561 2.62 2.735 2.854 3.024 3.118 3.214 3.364 3.507 3.65 3.786 3.919 4.078 4.219 4.357 4.509 4.661 4.804 4.956 5.11 5.243 5.4 5.568 5.73 5.872 6.037 6.27 6.528 6.803 7.025 7.242 7.479 7.736 7.902 7.823 7.506 7.131 6.707 6.283 5.94 5.656 5.369 5.112 4.863 4.619 4.399 4.204 4.028 3.871 3.722 3.568 3.417 3.291 3.175 3.045 2.925 2.787 2.647 2.545 2.44 2.333 2.233 2.135 2.065 1.991 1.883 1.819 1.756 1.718 1.631 1.545 1.458 1.411 1.252 1.28 1.23 1.17 1.05 0.991 0.921 0.846 0.773 0.665 0.543 0.322 -2 ,7011 ,KEBNE ,16678670,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:22:02 CET,0.0 0.253 0.449 0.594 0.72 0.825 0.934 1.051 1.277 1.374 1.459 1.491 1.673 1.743 1.853 1.965 2.073 2.124 2.232 2.342 2.485 2.568 2.653 2.776 2.911 3.036 3.147 3.27 3.422 3.554 3.674 3.793 3.904 4.045 4.208 4.376 4.536 4.709 4.898 5.087 5.323 5.612 5.893 6.119 6.392 6.691 6.953 7.21 7.438 7.604 7.63 7.406 7.068 6.732 6.395 6.066 5.749 5.436 5.182 4.929 4.701 4.495 4.292 4.118 3.967 3.806 3.627 3.481 3.359 3.235 3.103 2.976 2.836 2.714 2.623 2.52 2.418 2.312 2.191 2.109 2.034 1.923 1.84 1.758 1.715 1.621 1.53 1.431 1.379 1.217 1.221 1.161 1.105 0.993 0.925 0.856 0.772 0.656 0.561 0.475 0.344 -3 ,32090 ,KEBNE ,16678671,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:18:40 CET,0.0 0.269 0.449 0.604 0.779 0.929 1.05 1.163 1.334 1.412 1.5 1.544 1.72 1.779 1.906 2.037 2.137 2.181 2.29 2.408 2.572 2.667 2.749 2.886 3.043 3.185 3.302 3.416 3.543 3.668 3.804 3.979 4.146 4.294 4.477 4.692 4.883 5.087 5.297 5.506 5.725 5.943 6.191 6.431 6.736 7.08 7.414 7.757 8.049 8.219 8.147 7.841 7.501 7.127 6.791 6.5 6.197 5.92 5.66 5.378 5.149 4.943 4.725 4.532 4.383 4.242 4.093 3.962 3.834 3.672 3.481 3.324 3.175 3.039 2.941 2.829 2.702 2.575 2.454 2.368 2.279 2.14 2.043 1.947 1.894 1.776 1.652 1.548 1.497 1.327 1.316 1.252 1.195 1.07 0.968 0.86 0.784 0.712 0.605 0.454 0.126 -4 ,27075 ,KEBNE ,16678672,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:19:49 CET,0.0 0.374 0.548 0.681 0.808 0.916 1.024 1.131 1.344 1.447 1.544 1.607 1.795 1.866 1.984 2.113 2.242 2.296 2.386 2.488 2.66 2.771 2.877 3.026 3.168 3.309 3.436 3.561 3.715 3.852 3.989 4.147 4.263 4.368 4.511 4.673 4.827 4.992 5.169 5.356 5.554 5.766 5.978 6.185 6.422 6.631 6.866 7.121 7.352 7.516 7.446 7.131 6.734 6.3 5.86 5.475 5.139 4.825 4.572 4.309 4.091 3.899 3.706 3.504 3.316 3.164 3.001 2.845 2.708 2.579 2.449 2.346 2.233 2.094 1.997 1.901 1.795 1.693 1.597 1.527 1.454 1.328 1.234 1.126 1.067 0.964 0.872 0.77 0.714 0.541 0.534 0.478 0.402 0.221 0.135 0.055 -0.016 -0.084 -0.176 -0.311 -0.499 -5 ,11324 ,KEBNE ,16678673,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:19:23 CET,0.0 0.718 0.906 1.059 1.191 1.319 1.428 1.52 1.666 1.737 1.808 1.846 2.023 2.088 2.21 2.322 2.435 2.498 2.62 2.73 2.899 3.013 3.105 3.236 3.376 3.493 3.605 3.712 3.84 3.963 4.08 4.209 4.344 4.484 4.65 4.836 4.987 5.158 5.347 5.521 5.701 5.903 6.133 6.369 6.605 6.864 7.163 7.401 7.565 7.657 7.555 7.244 6.944 6.602 6.192 5.807 5.483 5.195 4.929 4.626 4.356 4.111 3.899 3.717 3.528 3.344 3.181 3.033 2.898 2.78 2.647 2.523 2.384 2.25 2.155 2.054 1.946 1.834 1.72 1.64 1.562 1.44 1.351 1.256 1.211 1.12 1.034 0.954 0.915 0.758 0.773 0.718 0.668 0.552 0.467 0.371 0.281 0.185 0.083 -0.04 -0.193 -6 ,22493 ,KEBNE ,16678674,Thu Nov 25 03:48:24 CET,Thu Nov 25 05:16:21 CET,0.0 0.249 0.371 0.495 0.624 0.738 0.832 0.91 1.075 1.175 1.279 1.353 1.545 1.618 1.756 1.897 2.028 2.089 2.199 2.296 2.44 2.535 2.628 2.757 2.888 3.023 3.149 3.266 3.418 3.554 3.671 3.815 3.957 4.105 4.291 4.491 4.68 4.88 5.078 5.277 5.476 5.67 5.872 6.094 6.344 6.619 6.904 7.143 7.367 7.589 7.685 7.427 7.019 6.617 6.246 5.888 5.567 5.268 4.94 4.617 4.401 4.204 4.003 3.841 3.695 3.535 3.36 3.197 3.044 2.91 2.793 2.687 2.573 2.446 2.34 2.232 2.118 2.002 1.895 1.816 1.727 1.601 1.509 1.414 1.368 1.276 1.165 1.04 0.978 0.806 0.801 0.735 0.661 0.516 0.442 0.357 0.26 0.158 0.043 -0.097 -0.281 -7 ,14778 ,KEBNE ,16678675,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:20:08 CET,0.0 0.458 0.679 0.832 0.984 1.1 1.19 1.284 1.466 1.553 1.636 1.665 1.835 1.893 1.998 2.092 2.188 2.238 2.338 2.434 2.583 2.692 2.801 2.94 3.058 3.18 3.284 3.377 3.495 3.617 3.742 3.871 3.989 4.118 4.283 4.48 4.649 4.828 5.033 5.214 5.379 5.591 5.861 6.098 6.366 6.674 6.96 7.249 7.531 7.704 7.696 7.489 7.18 6.843 6.519 6.178 5.876 5.614 5.392 5.15 4.908 4.711 4.517 4.322 4.127 3.954 3.801 3.644 3.51 3.386 3.235 3.101 2.958 2.83 2.752 2.661 2.556 2.449 2.338 2.26 2.183 2.071 1.991 1.92 1.888 1.808 1.723 1.637 1.589 1.421 1.422 1.376 1.322 1.181 1.097 1.012 0.932 0.844 0.758 0.646 0.386 -8 ,17101 ,KEBNE ,16678676,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:19:22 CET,0.0 0.561 0.746 0.885 1.02 1.12 1.219 1.32 1.504 1.593 1.69 1.744 1.926 1.991 2.107 2.222 2.332 2.39 2.5 2.601 2.734 2.816 2.898 3.045 3.187 3.3 3.4 3.499 3.642 3.781 3.914 4.067 4.218 4.364 4.511 4.674 4.851 5.05 5.247 5.451 5.675 5.923 6.181 6.449 6.751 7.007 7.262 7.502 7.663 7.778 7.769 7.465 7.116 6.758 6.414 6.088 5.769 5.461 5.194 4.929 4.701 4.512 4.339 4.167 4.005 3.838 3.649 3.477 3.329 3.184 3.026 2.899 2.786 2.672 2.586 2.495 2.394 2.3 2.206 2.138 2.063 1.934 1.831 1.728 1.68 1.576 1.475 1.375 1.322 1.15 1.127 1.072 1.03 0.929 0.857 0.779 0.69 0.575 0.453 0.308 0.087 -9 ,14838 ,KEBNE ,16678677,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:18:01 CET,0.0 0.414 0.605 0.786 0.944 1.079 1.199 1.303 1.496 1.578 1.654 1.705 1.892 1.954 2.061 2.168 2.275 2.334 2.454 2.556 2.719 2.82 2.905 3.033 3.164 3.311 3.452 3.573 3.723 3.867 4.009 4.187 4.347 4.498 4.681 4.877 5.049 5.234 5.441 5.651 5.856 6.101 6.371 6.607 6.856 7.159 7.46 7.678 7.881 8.041 7.956 7.64 7.281 6.91 6.53 6.17 5.838 5.535 5.283 5.037 4.827 4.639 4.457 4.279 4.121 3.989 3.833 3.687 3.561 3.417 3.264 3.146 3.033 2.912 2.813 2.714 2.613 2.512 2.4 2.32 2.242 2.131 2.067 1.988 1.944 1.85 1.762 1.684 1.632 1.462 1.463 1.392 1.313 1.176 1.104 1.011 0.912 0.818 0.698 0.54 0.381 -10 ,22386 ,KEBNE ,16678678,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:18:46 CET,0.0 0.288 0.482 0.641 0.765 0.882 0.978 1.061 1.213 1.295 1.387 1.43 1.601 1.673 1.822 1.949 2.081 2.149 2.265 2.357 2.474 2.556 2.644 2.773 2.886 2.982 3.081 3.186 3.328 3.461 3.575 3.702 3.821 3.946 4.097 4.261 4.411 4.581 4.763 4.935 5.096 5.292 5.534 5.769 6.005 6.233 6.478 6.684 6.826 6.901 6.861 6.573 6.265 5.913 5.547 5.19 4.872 4.609 4.364 4.125 3.941 3.753 3.574 3.424 3.27 3.116 2.956 2.824 2.723 2.6 2.458 2.358 2.255 2.14 2.044 1.944 1.847 1.747 1.64 1.557 1.468 1.347 1.271 1.178 1.126 1.031 0.929 0.803 0.743 0.579 0.598 0.555 0.487 0.296 0.213 0.136 0.047 -0.033 -0.119 -0.255 -0.531 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5g_5c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5g_5c.txt deleted file mode 100644 index 5ecb8f09..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5g_5c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3967 ,KEBNE ,16678679,Thu Nov 25 03:48:21 CET,Thu Nov 25 05:18:12 CET,0.0 0.479 0.741 0.92 1.067 1.199 1.33 1.463 1.712 1.83 1.94 2.032 2.253 2.353 2.536 2.723 2.893 2.974 3.137 3.299 3.524 3.672 3.822 4.041 4.259 4.476 4.698 4.902 5.152 5.398 5.639 5.921 6.18 6.429 6.72 7.048 7.348 7.691 8.086 8.5 8.922 9.383 9.937 10.53 11.198 11.896 12.702 13.593 14.603 15.78 17.146 18.154 18.661 18.922 19.036 19.031 19.012 18.998 18.969 18.901 18.814 18.751 18.694 18.629 18.554 18.483 18.407 18.304 18.217 18.152 18.071 17.993 17.905 17.808 17.721 17.616 17.505 17.401 17.284 17.197 17.127 17.018 16.93 16.829 16.779 16.691 16.601 16.502 16.45 16.3 16.266 16.193 16.129 16.007 15.943 15.85 15.727 15.585 15.416 15.227 14.922 -2 ,914 ,KEBNE ,16678680,Thu Nov 25 03:48:20 CET,Thu Nov 25 05:18:58 CET,0.0 0.363 0.581 0.809 0.972 1.12 1.26 1.389 1.628 1.748 1.869 1.998 2.225 2.325 2.512 2.693 2.865 2.943 3.085 3.227 3.435 3.573 3.708 3.899 4.092 4.299 4.496 4.657 4.861 5.062 5.265 5.5 5.744 5.994 6.281 6.598 6.892 7.222 7.589 7.992 8.42 8.896 9.464 10.029 10.67 11.357 12.129 13.02 14.054 15.242 16.58 17.626 18.167 18.406 18.546 18.62 18.645 18.64 18.592 18.5 18.382 18.276 18.169 18.071 18.006 17.941 17.854 17.764 17.651 17.514 17.392 17.303 17.226 17.15 17.08 16.999 16.918 16.83 16.73 16.662 16.584 16.439 16.35 16.273 16.233 16.147 16.034 15.904 15.835 15.661 15.608 15.531 15.465 15.326 15.24 15.135 15.038 14.956 14.836 14.635 14.084 -3 ,8612 ,KEBNE ,16678681,Thu Nov 25 03:49:22 CET,Thu Nov 25 05:19:39 CET,0.0 0.542 0.786 0.97 1.11 1.235 1.359 1.483 1.697 1.796 1.9 1.985 2.193 2.285 2.449 2.63 2.8 2.872 3.028 3.193 3.432 3.584 3.728 3.929 4.122 4.317 4.52 4.706 4.931 5.166 5.398 5.678 5.945 6.196 6.51 6.863 7.166 7.49 7.867 8.271 8.698 9.191 9.756 10.337 11.011 11.736 12.507 13.384 14.453 15.675 17.149 18.31 18.944 19.302 19.462 19.515 19.526 19.53 19.496 19.418 19.326 19.238 19.163 19.09 19.013 18.924 18.841 18.77 18.691 18.606 18.508 18.424 18.33 18.227 18.158 18.088 18.01 17.92 17.816 17.731 17.642 17.517 17.435 17.351 17.294 17.163 17.028 16.892 16.827 16.664 16.636 16.567 16.495 16.343 16.258 16.162 16.039 15.913 15.78 15.593 14.826 -4 ,25531 ,KEBNE ,16678682,Thu Nov 25 03:49:23 CET,Thu Nov 25 05:21:01 CET,0.0 0.47 0.802 1.029 1.209 1.373 1.527 1.665 1.9 2.007 2.119 2.22 2.433 2.54 2.734 2.92 3.096 3.182 3.352 3.508 3.742 3.887 4.024 4.224 4.411 4.586 4.76 4.936 5.16 5.368 5.568 5.825 6.078 6.322 6.603 6.922 7.231 7.573 7.951 8.364 8.783 9.224 9.778 10.359 11.014 11.716 12.487 13.358 14.402 15.613 16.989 18.025 18.567 18.883 19.028 19.06 19.067 19.065 19.008 18.894 18.787 18.687 18.6 18.516 18.422 18.347 18.277 18.194 18.093 17.995 17.913 17.836 17.743 17.642 17.563 17.455 17.344 17.255 17.165 17.096 17.018 16.899 16.835 16.764 16.722 16.642 16.529 16.411 16.363 16.213 16.201 16.142 16.081 15.935 15.838 15.721 15.598 15.478 15.36 15.219 14.906 -5 ,13296 ,KEBNE ,16678683,Thu Nov 25 03:49:23 CET,Thu Nov 25 05:23:09 CET,0.0 0.459 0.67 0.84 0.989 1.152 1.297 1.419 1.64 1.744 1.853 1.959 2.171 2.273 2.467 2.643 2.812 2.895 3.064 3.239 3.489 3.636 3.778 3.976 4.173 4.361 4.536 4.717 4.954 5.181 5.397 5.653 5.897 6.132 6.417 6.754 7.092 7.456 7.829 8.213 8.613 9.067 9.588 10.11 10.716 11.393 12.154 12.972 13.908 14.966 16.229 17.293 17.836 18.092 18.186 18.17 18.143 18.136 18.084 17.956 17.8 17.665 17.552 17.432 17.314 17.229 17.14 17.048 16.956 16.853 16.741 16.641 16.526 16.395 16.303 16.214 16.118 16.007 15.91 15.858 15.801 15.696 15.612 15.537 15.501 15.405 15.292 15.183 15.139 14.991 14.972 14.908 14.83 14.634 14.532 14.437 14.353 14.273 14.159 14.003 13.683 -6 ,23762 ,KEBNE ,16678684,Thu Nov 25 03:49:23 CET,Thu Nov 25 05:21:02 CET,0.0 0.414 0.639 0.836 0.99 1.139 1.28 1.422 1.685 1.805 1.918 2.023 2.232 2.333 2.526 2.707 2.89 2.974 3.124 3.255 3.443 3.573 3.707 3.918 4.121 4.305 4.49 4.668 4.884 5.082 5.267 5.518 5.777 6.012 6.274 6.568 6.864 7.188 7.517 7.881 8.295 8.78 9.33 9.859 10.488 11.206 12.059 12.988 13.989 15.2 16.71 17.838 18.419 18.749 18.886 18.913 18.884 18.821 18.78 18.729 18.625 18.525 18.441 18.367 18.289 18.195 18.088 18.002 17.918 17.815 17.727 17.66 17.584 17.497 17.42 17.343 17.278 17.208 17.115 17.053 16.984 16.87 16.786 16.68 16.632 16.545 16.446 16.336 16.276 16.118 16.072 15.997 15.931 15.793 15.718 15.624 15.475 15.307 15.121 14.927 14.613 -7 ,11432 ,KEBNE ,16678685,Thu Nov 25 03:49:27 CET,Thu Nov 25 05:16:20 CET,0.0 0.478 0.74 0.921 1.07 1.189 1.306 1.42 1.63 1.739 1.842 1.907 2.099 2.193 2.383 2.55 2.707 2.785 2.941 3.084 3.303 3.448 3.589 3.799 3.996 4.174 4.351 4.52 4.735 4.948 5.152 5.412 5.66 5.898 6.187 6.516 6.833 7.204 7.603 7.979 8.361 8.835 9.416 10.009 10.695 11.436 12.309 13.296 14.399 15.611 16.97 18.003 18.464 18.655 18.766 18.806 18.8 18.8 18.768 18.699 18.629 18.545 18.455 18.371 18.271 18.185 18.107 18.036 17.977 17.904 17.814 17.731 17.647 17.558 17.481 17.394 17.322 17.258 17.178 17.121 17.061 16.964 16.885 16.8 16.755 16.652 16.537 16.421 16.363 16.208 16.185 16.114 16.033 15.863 15.77 15.685 15.598 15.489 15.332 15.139 14.628 -8 ,2165 ,KEBNE ,16678686,Thu Nov 25 03:49:23 CET,Thu Nov 25 05:21:04 CET,0.0 0.47 0.678 0.869 1.058 1.221 1.361 1.496 1.75 1.867 1.988 2.103 2.31 2.407 2.6 2.78 2.946 3.027 3.19 3.354 3.594 3.746 3.885 4.082 4.274 4.476 4.697 4.904 5.149 5.373 5.591 5.868 6.133 6.391 6.695 7.027 7.327 7.647 7.993 8.368 8.779 9.239 9.769 10.321 10.951 11.615 12.386 13.258 14.275 15.39 16.697 17.762 18.288 18.535 18.607 18.597 18.569 18.498 18.392 18.254 18.127 18.013 17.88 17.756 17.666 17.601 17.528 17.433 17.32 17.206 17.109 17.029 16.926 16.796 16.698 16.617 16.533 16.437 16.341 16.263 16.179 16.074 15.998 15.906 15.856 15.762 15.668 15.554 15.492 15.327 15.283 15.216 15.15 14.975 14.88 14.772 14.653 14.543 14.41 14.2 13.853 -9 ,7706 ,KEBNE ,16678687,Thu Nov 25 03:49:23 CET,Thu Nov 25 05:22:42 CET,0.0 0.486 0.729 0.919 1.069 1.222 1.382 1.523 1.793 1.924 2.051 2.182 2.401 2.501 2.7 2.878 3.044 3.13 3.296 3.451 3.685 3.843 3.978 4.149 4.328 4.508 4.686 4.859 5.089 5.311 5.518 5.775 6.027 6.281 6.575 6.908 7.217 7.551 7.952 8.379 8.776 9.229 9.806 10.354 10.98 11.673 12.472 13.39 14.407 15.607 17.047 18.123 18.636 18.939 19.133 19.213 19.201 19.122 19.052 18.978 18.897 18.805 18.696 18.59 18.509 18.436 18.345 18.263 18.183 18.096 18.011 17.942 17.848 17.741 17.665 17.589 17.505 17.415 17.333 17.282 17.22 17.104 17.026 16.955 16.919 16.821 16.712 16.603 16.549 16.398 16.374 16.307 16.242 16.095 16.015 15.933 15.83 15.709 15.588 15.426 14.971 -10 ,30451 ,KEBNE ,16678688,Thu Nov 25 03:50:28 CET,Thu Nov 25 05:20:27 CET,0.0 0.394 0.656 0.872 1.035 1.172 1.303 1.43 1.671 1.778 1.877 1.974 2.19 2.28 2.458 2.635 2.79 2.871 3.03 3.172 3.393 3.539 3.672 3.873 4.081 4.271 4.446 4.617 4.844 5.068 5.287 5.556 5.824 6.092 6.385 6.697 6.991 7.313 7.671 8.043 8.428 8.875 9.407 9.97 10.655 11.369 12.165 13.079 14.096 15.201 16.483 17.437 17.916 18.119 18.18 18.196 18.192 18.113 18.02 17.962 17.873 17.746 17.641 17.547 17.437 17.33 17.224 17.114 17.019 16.918 16.785 16.658 16.535 16.422 16.344 16.26 16.166 16.075 15.976 15.906 15.83 15.713 15.626 15.537 15.495 15.414 15.336 15.258 15.209 15.057 15.025 14.961 14.901 14.761 14.682 14.584 14.48 14.355 14.221 14.061 13.689 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5f.txt deleted file mode 100644 index 3ca105ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22791 ,KEBNE ,16678689,Thu Nov 25 03:50:27 CET,Thu Nov 25 05:20:04 CET,0.0 0.184 0.312 0.447 0.558 0.636 0.717 0.801 0.937 1.003 1.071 1.068 1.241 1.302 1.397 1.5 1.614 1.668 1.764 1.858 1.996 2.08 2.17 2.303 2.426 2.551 2.672 2.773 2.898 3.023 3.143 3.275 3.407 3.539 3.685 3.865 4.041 4.223 4.408 4.61 4.85 5.124 5.424 5.709 6.001 6.317 6.698 7.149 7.605 8.022 8.394 8.469 8.252 7.873 7.445 7.067 6.722 6.391 6.134 5.865 5.594 5.339 5.079 4.84 4.615 4.372 4.118 3.898 3.691 3.47 3.246 3.076 2.887 2.683 2.537 2.393 2.229 2.046 1.86 1.727 1.588 1.365 1.216 1.072 0.997 0.846 0.681 0.497 0.409 0.215 0.116 -0.008 -0.132 -0.396 -0.541 -0.689 -0.853 -1.04 -1.279 -1.644 -3.018 -2 ,31025 ,KEBNE ,16678690,Thu Nov 25 03:50:27 CET,Thu Nov 25 05:22:15 CET,0.0 0.133 0.243 0.333 0.43 0.532 0.614 0.694 0.853 0.924 0.992 1.006 1.177 1.233 1.337 1.441 1.56 1.61 1.707 1.803 1.932 2.019 2.106 2.223 2.345 2.476 2.597 2.699 2.825 2.942 3.074 3.248 3.399 3.545 3.709 3.891 4.062 4.235 4.424 4.633 4.843 5.078 5.339 5.603 5.929 6.296 6.675 7.075 7.475 7.853 8.135 8.069 7.825 7.444 7.03 6.653 6.319 6.019 5.751 5.48 5.259 5.02 4.742 4.464 4.214 4.003 3.768 3.532 3.309 3.054 2.795 2.607 2.411 2.212 2.059 1.881 1.694 1.52 1.353 1.23 1.109 0.896 0.723 0.564 0.483 0.301 0.129 -0.047 -0.15 -0.373 -0.5 -0.623 -0.753 -1.04 -1.19 -1.364 -1.549 -1.717 -1.89 -2.119 -2.854 -3 ,16362 ,KEBNE ,16678691,Thu Nov 25 03:50:28 CET,Thu Nov 25 05:20:45 CET,0.0 0.208 0.321 0.434 0.514 0.603 0.683 0.75 0.893 0.956 1.013 1.024 1.202 1.262 1.373 1.481 1.579 1.622 1.71 1.806 1.934 2.009 2.087 2.21 2.32 2.431 2.546 2.656 2.797 2.931 3.055 3.202 3.34 3.468 3.637 3.834 4.013 4.214 4.422 4.634 4.855 5.103 5.405 5.717 6.087 6.47 6.834 7.22 7.661 8.102 8.486 8.567 8.326 7.978 7.653 7.32 6.956 6.59 6.26 5.907 5.587 5.291 5.031 4.818 4.623 4.422 4.181 3.951 3.745 3.537 3.329 3.169 3.013 2.838 2.683 2.532 2.389 2.249 2.106 1.991 1.864 1.67 1.529 1.371 1.287 1.121 0.95 0.764 0.665 0.451 0.365 0.253 0.126 -0.157 -0.318 -0.472 -0.639 -0.817 -1.007 -1.299 -1.883 -4 ,9353 ,KEBNE ,16678692,Thu Nov 25 03:50:27 CET,Thu Nov 25 05:20:17 CET,0.0 0.309 0.47 0.6 0.705 0.791 0.879 0.972 1.126 1.187 1.243 1.243 1.417 1.473 1.577 1.678 1.773 1.812 1.887 1.972 2.123 2.225 2.314 2.42 2.522 2.629 2.735 2.848 2.983 3.101 3.213 3.347 3.483 3.618 3.784 3.977 4.166 4.367 4.568 4.789 5.001 5.244 5.54 5.807 6.106 6.444 6.817 7.193 7.596 8.03 8.433 8.503 8.274 7.961 7.66 7.314 6.95 6.607 6.273 5.912 5.595 5.325 5.082 4.842 4.599 4.371 4.12 3.9 3.716 3.517 3.325 3.171 3.006 2.819 2.68 2.542 2.395 2.243 2.094 1.985 1.875 1.683 1.521 1.369 1.298 1.134 0.961 0.788 0.687 0.467 0.344 0.225 0.109 -0.153 -0.32 -0.524 -0.734 -0.938 -1.138 -1.39 -1.907 -5 ,5706 ,KEBNE ,16678693,Thu Nov 25 03:50:27 CET,Thu Nov 25 05:21:26 CET,0.0 0.22 0.405 0.541 0.642 0.734 0.838 0.929 1.076 1.144 1.217 1.262 1.432 1.484 1.602 1.721 1.826 1.876 1.973 2.063 2.188 2.265 2.341 2.456 2.578 2.698 2.801 2.893 3.019 3.141 3.26 3.414 3.566 3.708 3.876 4.069 4.247 4.438 4.646 4.863 5.101 5.353 5.617 5.913 6.243 6.59 6.998 7.423 7.872 8.288 8.645 8.796 8.703 8.38 7.973 7.59 7.24 6.911 6.594 6.28 6.012 5.729 5.453 5.22 4.997 4.775 4.545 4.351 4.181 3.996 3.804 3.64 3.464 3.278 3.137 2.983 2.822 2.651 2.468 2.339 2.21 2.008 1.856 1.691 1.602 1.418 1.232 1.037 0.94 0.732 0.588 0.437 0.295 0.03 -0.122 -0.266 -0.421 -0.632 -0.881 -1.221 -2.242 -6 ,7362 ,KEBNE ,16678694,Thu Nov 25 03:50:27 CET,Thu Nov 25 05:21:45 CET,0.0 0.131 0.259 0.404 0.519 0.62 0.704 0.777 0.926 1.004 1.066 1.079 1.258 1.32 1.428 1.522 1.61 1.654 1.738 1.81 1.936 2.022 2.098 2.205 2.316 2.427 2.536 2.646 2.783 2.918 3.051 3.215 3.349 3.476 3.641 3.823 4.009 4.197 4.399 4.626 4.842 5.081 5.357 5.631 5.958 6.326 6.723 7.134 7.591 8.056 8.465 8.532 8.416 8.176 7.842 7.528 7.218 6.874 6.575 6.291 6.053 5.815 5.572 5.355 5.159 4.951 4.714 4.52 4.36 4.185 3.984 3.828 3.669 3.492 3.346 3.178 3.005 2.837 2.659 2.548 2.439 2.241 2.089 1.919 1.823 1.637 1.476 1.28 1.163 0.933 0.804 0.687 0.573 0.325 0.166 -0.02 -0.227 -0.458 -0.709 -1.015 -1.964 -7 ,12205 ,KEBNE ,16678695,Thu Nov 25 03:50:28 CET,Thu Nov 25 05:21:57 CET,0.0 0.092 0.18 0.284 0.383 0.46 0.521 0.59 0.723 0.779 0.837 0.843 1.021 1.093 1.208 1.311 1.416 1.461 1.54 1.613 1.723 1.805 1.887 2.019 2.151 2.271 2.38 2.478 2.611 2.727 2.827 2.954 3.089 3.222 3.379 3.563 3.731 3.932 4.154 4.361 4.561 4.793 5.06 5.326 5.651 6.007 6.408 6.844 7.319 7.782 8.12 8.173 8.048 7.761 7.421 7.095 6.759 6.428 6.131 5.8 5.507 5.258 5.006 4.766 4.544 4.334 4.111 3.902 3.729 3.549 3.347 3.183 3.007 2.828 2.69 2.541 2.375 2.206 2.026 1.899 1.782 1.602 1.481 1.347 1.276 1.138 0.994 0.825 0.732 0.537 0.476 0.381 0.28 0.043 -0.121 -0.319 -0.516 -0.689 -0.915 -1.285 -2.518 -8 ,7973 ,KEBNE ,16678696,Thu Nov 25 03:50:28 CET,Thu Nov 25 05:21:03 CET,0.0 0.137 0.242 0.348 0.453 0.549 0.623 0.708 0.884 0.963 1.028 1.02 1.187 1.239 1.365 1.497 1.615 1.667 1.758 1.852 1.991 2.072 2.151 2.276 2.398 2.506 2.607 2.716 2.87 3.019 3.141 3.281 3.406 3.524 3.689 3.87 4.011 4.191 4.41 4.637 4.864 5.119 5.413 5.692 6.01 6.326 6.71 7.113 7.501 7.926 8.363 8.532 8.417 8.202 7.941 7.658 7.331 6.987 6.707 6.41 6.16 5.928 5.684 5.466 5.237 5.001 4.762 4.561 4.383 4.206 4.027 3.879 3.709 3.506 3.362 3.226 3.097 2.952 2.764 2.637 2.518 2.315 2.167 2.015 1.945 1.793 1.607 1.415 1.315 1.102 0.978 0.841 0.703 0.441 0.319 0.16 -0.043 -0.269 -0.517 -0.804 -1.787 -9 ,17287 ,KEBNE ,16678697,Thu Nov 25 03:50:28 CET,Thu Nov 25 05:21:22 CET,0.0 0.242 0.345 0.443 0.54 0.636 0.735 0.826 0.965 1.028 1.1 1.116 1.288 1.347 1.462 1.58 1.709 1.763 1.851 1.945 2.08 2.161 2.239 2.356 2.466 2.569 2.679 2.793 2.932 3.05 3.172 3.335 3.496 3.644 3.824 4.033 4.219 4.412 4.608 4.809 5.034 5.311 5.639 5.959 6.3 6.651 7.032 7.456 7.989 8.48 8.832 8.983 8.894 8.731 8.537 8.278 7.992 7.714 7.42 7.113 6.858 6.634 6.441 6.224 6.004 5.82 5.602 5.392 5.222 5.055 4.873 4.706 4.529 4.344 4.205 4.049 3.882 3.715 3.542 3.416 3.286 3.097 2.963 2.816 2.741 2.601 2.446 2.283 2.197 1.984 1.878 1.779 1.656 1.353 1.184 1.015 0.834 0.595 0.288 -0.063 -0.661 -10 ,22364 ,KEBNE ,16678698,Thu Nov 25 03:50:28 CET,Thu Nov 25 05:20:03 CET,0.0 0.393 0.564 0.653 0.717 0.795 0.886 0.971 1.098 1.159 1.231 1.266 1.437 1.484 1.591 1.692 1.791 1.835 1.912 1.991 2.104 2.174 2.241 2.359 2.49 2.606 2.716 2.824 2.964 3.098 3.217 3.369 3.527 3.677 3.84 4.027 4.231 4.453 4.671 4.889 5.125 5.373 5.657 5.941 6.255 6.628 7.082 7.571 8.041 8.508 8.896 8.923 8.763 8.537 8.283 8.0 7.693 7.396 7.112 6.811 6.547 6.31 6.098 5.883 5.652 5.429 5.2 4.999 4.818 4.631 4.436 4.266 4.075 3.879 3.73 3.584 3.444 3.287 3.125 3.006 2.855 2.625 2.479 2.329 2.249 2.096 1.944 1.773 1.682 1.475 1.355 1.235 1.115 0.839 0.669 0.497 0.314 0.105 -0.12 -0.356 -1.158 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5i.txt deleted file mode 100644 index 2a8b61f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17433 ,KEBNE ,16678699,Thu Nov 25 03:50:28 CET,Thu Nov 25 05:21:22 CET,0.0 0.222 0.371 0.511 0.632 0.733 0.842 0.947 1.095 1.153 1.21 1.221 1.396 1.448 1.555 1.669 1.772 1.814 1.901 2.006 2.158 2.25 2.33 2.448 2.568 2.679 2.785 2.888 3.019 3.152 3.299 3.457 3.579 3.699 3.841 3.99 4.137 4.325 4.525 4.711 4.902 5.121 5.39 5.641 5.9 6.212 6.551 6.857 7.185 7.509 7.674 7.516 7.22 6.886 6.484 6.099 5.8 5.502 5.232 4.933 4.673 4.438 4.205 3.982 3.767 3.573 3.36 3.166 2.987 2.808 2.625 2.464 2.311 2.166 2.044 1.907 1.764 1.615 1.445 1.324 1.216 1.047 0.932 0.811 0.75 0.636 0.5 0.344 0.269 0.096 0.037 -0.059 -0.151 -0.331 -0.436 -0.568 -0.718 -0.881 -1.074 -1.312 -1.893 -2 ,19881 ,KEBNE ,16678700,Thu Nov 25 03:52:31 CET,Thu Nov 25 05:24:24 CET,0.0 0.294 0.412 0.513 0.602 0.694 0.786 0.855 0.994 1.076 1.147 1.139 1.31 1.369 1.473 1.578 1.678 1.729 1.826 1.927 2.077 2.153 2.228 2.348 2.46 2.569 2.667 2.765 2.919 3.075 3.228 3.394 3.529 3.656 3.819 4.012 4.189 4.365 4.56 4.793 5.057 5.355 5.664 5.952 6.26 6.568 6.934 7.339 7.774 8.125 8.31 8.183 7.906 7.57 7.226 6.896 6.533 6.178 5.889 5.58 5.291 5.025 4.765 4.516 4.304 4.122 3.902 3.703 3.533 3.338 3.133 2.956 2.771 2.596 2.467 2.324 2.168 2.005 1.831 1.717 1.611 1.455 1.336 1.194 1.12 0.98 0.835 0.675 0.595 0.395 0.324 0.245 0.151 -0.114 -0.249 -0.379 -0.509 -0.678 -0.886 -1.163 -1.676 -3 ,11610 ,KEBNE ,16678701,Thu Nov 25 03:52:31 CET,Thu Nov 25 05:23:33 CET,0.0 0.198 0.325 0.441 0.528 0.612 0.704 0.798 0.983 1.052 1.115 1.133 1.322 1.388 1.505 1.618 1.726 1.782 1.877 1.965 2.093 2.178 2.273 2.411 2.536 2.643 2.748 2.855 2.988 3.101 3.209 3.37 3.536 3.674 3.81 3.956 4.111 4.294 4.504 4.746 4.995 5.248 5.524 5.776 6.055 6.35 6.663 7.004 7.337 7.623 7.681 7.427 7.061 6.716 6.391 6.03 5.69 5.374 5.084 4.765 4.482 4.242 4.02 3.785 3.555 3.343 3.123 2.941 2.769 2.574 2.382 2.233 2.07 1.893 1.766 1.631 1.475 1.289 1.083 0.956 0.836 0.637 0.495 0.341 0.263 0.103 -0.072 -0.251 -0.345 -0.54 -0.596 -0.713 -0.823 -1.018 -1.133 -1.271 -1.431 -1.594 -1.752 -1.988 -2.861 -4 ,29029 ,KEBNE ,16678702,Thu Nov 25 03:52:31 CET,Thu Nov 25 05:22:53 CET,0.0 0.193 0.378 0.512 0.62 0.727 0.834 0.927 1.1 1.189 1.276 1.319 1.505 1.572 1.684 1.787 1.886 1.929 2.021 2.108 2.231 2.313 2.388 2.517 2.652 2.772 2.882 2.992 3.153 3.296 3.422 3.574 3.717 3.853 4.003 4.166 4.327 4.517 4.741 4.98 5.2 5.437 5.71 5.964 6.264 6.625 7.015 7.396 7.773 8.135 8.382 8.233 7.847 7.449 7.115 6.772 6.422 6.052 5.698 5.36 5.073 4.81 4.554 4.301 4.056 3.845 3.637 3.44 3.254 3.039 2.828 2.664 2.509 2.344 2.193 2.035 1.885 1.741 1.585 1.467 1.348 1.158 1.027 0.9 0.835 0.707 0.558 0.397 0.311 0.112 0.042 -0.067 -0.179 -0.403 -0.536 -0.692 -0.858 -1.036 -1.198 -1.411 -2.179 -5 ,8796 ,KEBNE ,16678703,Thu Nov 25 03:52:32 CET,Thu Nov 25 05:23:28 CET,0.0 0.636 0.833 0.953 1.057 1.145 1.216 1.3 1.466 1.533 1.591 1.612 1.797 1.869 2.002 2.114 2.213 2.258 2.361 2.46 2.594 2.682 2.764 2.891 3.011 3.129 3.243 3.345 3.459 3.577 3.717 3.893 4.061 4.2 4.339 4.51 4.673 4.855 5.053 5.266 5.525 5.81 6.092 6.396 6.731 7.04 7.361 7.681 8.044 8.457 8.764 8.688 8.354 7.955 7.587 7.236 6.911 6.56 6.237 5.929 5.675 5.433 5.203 4.974 4.75 4.539 4.315 4.126 3.961 3.793 3.593 3.408 3.23 3.052 2.911 2.768 2.619 2.467 2.303 2.18 2.062 1.888 1.752 1.611 1.54 1.388 1.226 1.054 0.964 0.757 0.679 0.58 0.472 0.23 0.1 -0.031 -0.147 -0.308 -0.562 -0.88 -1.669 -6 ,22471 ,KEBNE ,16678704,Thu Nov 25 03:52:32 CET,Thu Nov 25 05:23:52 CET,0.0 0.226 0.419 0.555 0.633 0.729 0.824 0.912 1.059 1.126 1.186 1.185 1.365 1.423 1.515 1.631 1.755 1.809 1.911 2.01 2.161 2.248 2.332 2.471 2.601 2.72 2.834 2.935 3.05 3.161 3.286 3.445 3.582 3.712 3.885 4.103 4.292 4.472 4.669 4.907 5.16 5.407 5.654 5.906 6.211 6.547 6.906 7.201 7.518 7.848 8.074 7.997 7.682 7.368 7.062 6.741 6.429 6.124 5.862 5.56 5.271 5.011 4.777 4.54 4.313 4.112 3.893 3.703 3.554 3.391 3.203 3.044 2.877 2.7 2.55 2.389 2.225 2.054 1.887 1.774 1.647 1.455 1.325 1.189 1.115 0.944 0.787 0.643 0.561 0.359 0.269 0.155 0.036 -0.216 -0.345 -0.483 -0.647 -0.864 -1.113 -1.358 -1.723 -7 ,1957 ,KEBNE ,16678705,Thu Nov 25 03:52:32 CET,Thu Nov 25 05:27:15 CET,0.0 0.178 0.31 0.414 0.51 0.618 0.727 0.806 0.912 0.97 1.037 1.044 1.211 1.265 1.382 1.493 1.605 1.659 1.749 1.844 1.977 2.063 2.157 2.286 2.411 2.533 2.641 2.737 2.863 2.994 3.12 3.269 3.397 3.516 3.661 3.816 3.985 4.18 4.364 4.561 4.783 5.047 5.33 5.608 5.942 6.27 6.639 7.023 7.401 7.782 8.081 8.102 7.873 7.514 7.193 6.868 6.537 6.214 5.892 5.562 5.281 5.013 4.755 4.522 4.292 4.073 3.843 3.619 3.434 3.247 3.031 2.864 2.705 2.545 2.412 2.251 2.088 1.941 1.791 1.685 1.572 1.389 1.264 1.131 1.062 0.932 0.808 0.673 0.598 0.394 0.299 0.193 0.088 -0.142 -0.261 -0.402 -0.552 -0.685 -0.852 -1.123 -1.459 -8 ,18460 ,KEBNE ,16678706,Thu Nov 25 03:52:31 CET,Thu Nov 25 05:24:43 CET,0.0 0.27 0.384 0.528 0.638 0.732 0.846 0.949 1.136 1.226 1.3 1.3 1.475 1.534 1.65 1.769 1.883 1.929 2.016 2.111 2.233 2.315 2.395 2.494 2.589 2.696 2.805 2.907 3.033 3.157 3.283 3.432 3.577 3.713 3.865 4.046 4.213 4.384 4.563 4.752 4.952 5.189 5.472 5.75 6.058 6.346 6.661 6.983 7.31 7.598 7.7 7.532 7.226 6.858 6.501 6.123 5.775 5.442 5.124 4.823 4.521 4.243 4.011 3.78 3.56 3.369 3.17 2.984 2.811 2.626 2.438 2.283 2.13 1.967 1.841 1.711 1.563 1.416 1.272 1.164 1.041 0.867 0.745 0.617 0.55 0.408 0.26 0.083 0.0 -0.195 -0.269 -0.366 -0.484 -0.735 -0.889 -1.053 -1.193 -1.339 -1.503 -1.709 -2.09 -9 ,9584 ,KEBNE ,16678707,Thu Nov 25 03:52:35 CET,Thu Nov 25 05:22:17 CET,0.0 0.834 1.043 1.188 1.301 1.425 1.525 1.591 1.716 1.785 1.863 1.901 2.082 2.141 2.244 2.345 2.447 2.502 2.605 2.694 2.828 2.913 2.987 3.094 3.204 3.314 3.419 3.522 3.662 3.787 3.905 4.066 4.231 4.37 4.532 4.731 4.905 5.085 5.288 5.487 5.689 5.926 6.197 6.455 6.746 7.08 7.454 7.827 8.181 8.499 8.703 8.598 8.347 8.028 7.675 7.343 7.052 6.743 6.461 6.178 5.915 5.688 5.463 5.224 4.979 4.737 4.5 4.305 4.116 3.903 3.692 3.519 3.345 3.148 3.002 2.842 2.658 2.502 2.358 2.262 2.16 1.974 1.836 1.703 1.637 1.494 1.347 1.196 1.108 0.903 0.835 0.744 0.642 0.429 0.323 0.203 0.082 -0.046 -0.234 -0.481 -1.06 -10 ,11006 ,KEBNE ,16678708,Thu Nov 25 03:52:31 CET,Thu Nov 25 05:24:39 CET,0.0 0.17 0.274 0.375 0.475 0.554 0.63 0.717 0.878 0.941 1.005 1.029 1.197 1.246 1.362 1.479 1.582 1.633 1.732 1.818 1.944 2.03 2.114 2.227 2.339 2.462 2.574 2.68 2.82 2.952 3.088 3.238 3.361 3.5 3.674 3.856 4.033 4.219 4.413 4.61 4.824 5.064 5.354 5.649 5.987 6.361 6.725 7.086 7.456 7.819 8.088 8.029 7.704 7.292 6.896 6.532 6.197 5.868 5.584 5.29 4.994 4.731 4.479 4.232 4.011 3.807 3.581 3.37 3.196 3.013 2.813 2.644 2.482 2.313 2.179 2.055 1.92 1.767 1.615 1.516 1.411 1.238 1.13 1.026 0.962 0.815 0.668 0.508 0.421 0.225 0.169 0.08 -0.013 -0.22 -0.331 -0.454 -0.591 -0.76 -0.959 -1.201 -1.9 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5a.txt deleted file mode 100644 index f03e2f3b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16471 ,KEBNE ,17024306,Wed Dec 22 09:49:55 CET,Wed Dec 22 11:19:43 CET,0.0 0.153 0.279 0.378 0.469 0.553 0.627 0.698 0.837 0.904 0.966 0.972 1.136 1.183 1.289 1.404 1.524 1.585 1.698 1.801 1.95 2.048 2.134 2.25 2.38 2.509 2.62 2.728 2.861 2.99 3.126 3.29 3.438 3.597 3.806 4.041 4.257 4.493 4.747 4.992 5.229 5.504 5.83 6.15 6.531 6.945 7.412 7.927 8.503 9.161 9.908 10.43 10.634 10.714 10.668 10.518 10.321 10.076 9.869 9.709 9.568 9.413 9.252 9.111 8.982 8.867 8.73 8.595 8.48 8.343 8.188 8.077 7.975 7.841 7.718 7.604 7.497 7.382 7.234 7.114 6.983 6.802 6.684 6.577 6.53 6.405 6.261 6.118 6.048 5.869 5.803 5.71 5.61 5.406 5.307 5.207 5.101 4.975 4.791 4.542 3.907 -2 ,32470 ,KEBNE ,17024307,Wed Dec 22 09:50:57 CET,Wed Dec 22 11:20:49 CET,0.0 0.229 0.38 0.522 0.631 0.715 0.795 0.863 1.007 1.077 1.134 1.134 1.305 1.352 1.443 1.546 1.651 1.699 1.79 1.89 2.039 2.136 2.232 2.375 2.507 2.615 2.723 2.831 2.973 3.106 3.241 3.41 3.559 3.703 3.883 4.095 4.281 4.489 4.725 4.968 5.23 5.52 5.835 6.165 6.569 6.991 7.471 8.011 8.607 9.237 9.905 10.343 10.508 10.529 10.488 10.393 10.265 10.148 10.032 9.866 9.716 9.592 9.456 9.33 9.2 9.055 8.904 8.771 8.639 8.514 8.408 8.297 8.177 8.061 7.96 7.869 7.78 7.677 7.557 7.47 7.38 7.218 7.106 7.002 6.946 6.828 6.714 6.595 6.531 6.359 6.324 6.255 6.174 5.98 5.876 5.765 5.631 5.519 5.401 5.157 4.482 -3 ,6881 ,KEBNE ,17024308,Wed Dec 22 09:50:57 CET,Wed Dec 22 11:22:03 CET,0.0 0.207 0.369 0.494 0.582 0.664 0.758 0.846 0.975 1.031 1.093 1.117 1.29 1.343 1.437 1.545 1.654 1.703 1.803 1.908 2.055 2.138 2.216 2.338 2.467 2.589 2.696 2.808 2.956 3.095 3.237 3.407 3.565 3.728 3.93 4.141 4.332 4.553 4.807 5.046 5.274 5.549 5.891 6.227 6.636 7.109 7.621 8.198 8.842 9.579 10.419 10.919 11.051 11.029 10.912 10.776 10.666 10.552 10.441 10.333 10.194 10.025 9.872 9.746 9.631 9.514 9.384 9.258 9.154 9.043 8.928 8.824 8.693 8.553 8.444 8.33 8.204 8.078 7.959 7.887 7.815 7.689 7.608 7.516 7.461 7.353 7.228 7.095 7.04 6.875 6.848 6.775 6.695 6.528 6.433 6.329 6.217 6.076 5.921 5.756 5.499 -4 ,26811 ,KEBNE ,17024309,Wed Dec 22 09:50:58 CET,Wed Dec 22 11:20:35 CET,0.0 0.287 0.422 0.547 0.663 0.757 0.837 0.916 1.062 1.135 1.204 1.21 1.379 1.44 1.56 1.668 1.772 1.818 1.913 2.01 2.149 2.242 2.334 2.466 2.588 2.697 2.794 2.894 3.038 3.169 3.3 3.458 3.608 3.754 3.93 4.13 4.309 4.502 4.707 4.929 5.17 5.451 5.774 6.081 6.442 6.844 7.302 7.829 8.465 9.164 9.911 10.425 10.603 10.622 10.553 10.443 10.305 10.16 10.03 9.888 9.739 9.595 9.457 9.321 9.17 9.031 8.888 8.762 8.658 8.538 8.394 8.287 8.189 8.077 7.992 7.899 7.803 7.707 7.605 7.529 7.457 7.356 7.272 7.173 7.118 7.016 6.932 6.83 6.78 6.627 6.618 6.546 6.465 6.312 6.228 6.131 5.989 5.826 5.667 5.474 5.011 -5 ,3798 ,KEBNE ,17024310,Wed Dec 22 09:50:58 CET,Wed Dec 22 11:20:01 CET,0.0 0.185 0.308 0.414 0.499 0.599 0.69 0.776 0.932 0.992 1.052 1.049 1.21 1.264 1.393 1.517 1.627 1.68 1.795 1.899 2.039 2.127 2.205 2.317 2.425 2.533 2.637 2.744 2.881 3.008 3.148 3.325 3.493 3.643 3.801 3.997 4.19 4.391 4.626 4.866 5.12 5.429 5.772 6.117 6.503 6.887 7.347 7.913 8.519 9.157 9.902 10.368 10.533 10.575 10.534 10.451 10.358 10.241 10.118 10.005 9.883 9.754 9.638 9.513 9.376 9.236 9.081 8.942 8.825 8.71 8.582 8.474 8.367 8.263 8.179 8.083 7.989 7.904 7.818 7.742 7.653 7.527 7.432 7.334 7.286 7.17 7.032 6.908 6.855 6.695 6.677 6.6 6.528 6.356 6.256 6.166 6.05 5.903 5.75 5.562 5.072 -6 ,32229 ,KEBNE ,17024311,Wed Dec 22 09:50:57 CET,Wed Dec 22 11:21:20 CET,0.0 0.181 0.364 0.515 0.6 0.68 0.777 0.862 1.004 1.065 1.124 1.133 1.31 1.372 1.482 1.585 1.674 1.718 1.817 1.916 2.069 2.168 2.258 2.4 2.539 2.665 2.772 2.878 3.028 3.171 3.32 3.506 3.665 3.826 4.011 4.194 4.385 4.619 4.858 5.086 5.321 5.599 5.953 6.302 6.677 7.076 7.534 8.071 8.695 9.381 10.115 10.584 10.777 10.821 10.811 10.765 10.683 10.588 10.491 10.356 10.217 10.088 9.933 9.798 9.69 9.563 9.409 9.282 9.166 9.044 8.918 8.805 8.675 8.531 8.428 8.328 8.222 8.108 8.006 7.934 7.841 7.701 7.628 7.548 7.503 7.41 7.308 7.204 7.146 6.972 6.919 6.842 6.758 6.582 6.493 6.39 6.281 6.157 5.986 5.784 5.158 -7 ,13671 ,KEBNE ,17024312,Wed Dec 22 09:50:57 CET,Wed Dec 22 11:21:28 CET,0.0 0.382 0.548 0.661 0.765 0.861 0.952 1.055 1.22 1.281 1.34 1.337 1.497 1.55 1.658 1.768 1.873 1.921 2.005 2.095 2.241 2.325 2.399 2.518 2.63 2.738 2.851 2.942 3.05 3.193 3.352 3.518 3.665 3.819 3.999 4.189 4.376 4.589 4.8 5.01 5.262 5.558 5.888 6.225 6.599 7.007 7.481 8.021 8.575 9.162 9.835 10.24 10.387 10.447 10.408 10.313 10.193 10.051 9.943 9.815 9.671 9.55 9.424 9.282 9.14 8.994 8.846 8.73 8.627 8.52 8.414 8.317 8.193 8.066 7.98 7.879 7.775 7.673 7.558 7.472 7.375 7.234 7.133 7.021 6.965 6.849 6.737 6.61 6.539 6.359 6.296 6.215 6.131 5.958 5.872 5.785 5.696 5.575 5.445 5.307 4.683 -8 ,28716 ,KEBNE ,17024313,Wed Dec 22 09:50:57 CET,Wed Dec 22 11:21:45 CET,0.0 0.171 0.293 0.448 0.575 0.664 0.74 0.807 0.954 1.028 1.099 1.147 1.332 1.382 1.487 1.601 1.707 1.758 1.848 1.928 2.053 2.142 2.224 2.336 2.452 2.579 2.706 2.82 2.948 3.078 3.209 3.369 3.522 3.668 3.849 4.059 4.264 4.464 4.69 4.939 5.192 5.497 5.851 6.177 6.556 6.989 7.472 7.989 8.579 9.245 9.945 10.455 10.674 10.704 10.674 10.614 10.507 10.382 10.247 10.046 9.894 9.757 9.598 9.457 9.325 9.194 9.037 8.894 8.782 8.672 8.54 8.432 8.336 8.234 8.152 8.065 7.967 7.86 7.742 7.666 7.595 7.491 7.402 7.299 7.25 7.155 7.045 6.927 6.867 6.697 6.663 6.586 6.506 6.343 6.267 6.166 6.029 5.878 5.705 5.511 5.166 -9 ,18119 ,KEBNE ,17024314,Wed Dec 22 09:50:58 CET,Wed Dec 22 11:22:21 CET,0.0 0.214 0.329 0.426 0.543 0.652 0.745 0.827 1.008 1.095 1.16 1.166 1.332 1.38 1.491 1.609 1.731 1.784 1.881 1.984 2.119 2.201 2.292 2.426 2.548 2.672 2.794 2.904 3.041 3.191 3.336 3.496 3.643 3.79 3.967 4.15 4.326 4.525 4.746 4.991 5.257 5.535 5.85 6.176 6.549 6.965 7.444 7.973 8.554 9.224 9.946 10.475 10.757 10.838 10.77 10.644 10.516 10.383 10.252 10.088 9.934 9.801 9.652 9.488 9.35 9.224 9.097 8.969 8.858 8.772 8.679 8.583 8.444 8.297 8.191 8.081 7.974 7.856 7.735 7.65 7.547 7.386 7.284 7.19 7.138 7.03 6.912 6.771 6.698 6.516 6.473 6.394 6.313 6.133 6.026 5.893 5.732 5.578 5.427 5.239 4.84 -10 ,17648 ,KEBNE ,17024315,Wed Dec 22 09:50:58 CET,Wed Dec 22 11:20:33 CET,0.0 0.176 0.277 0.356 0.433 0.517 0.587 0.654 0.791 0.855 0.921 0.943 1.117 1.176 1.289 1.392 1.493 1.545 1.65 1.756 1.907 1.999 2.084 2.19 2.303 2.421 2.531 2.645 2.792 2.93 3.06 3.224 3.384 3.532 3.693 3.868 4.037 4.228 4.43 4.631 4.861 5.15 5.49 5.82 6.19 6.608 7.106 7.624 8.196 8.858 9.584 10.07 10.206 10.225 10.241 10.185 10.077 9.921 9.759 9.611 9.474 9.338 9.21 9.093 8.99 8.882 8.774 8.693 8.616 8.517 8.387 8.279 8.177 8.051 7.966 7.9 7.824 7.74 7.632 7.558 7.487 7.373 7.298 7.197 7.135 7.027 6.927 6.797 6.723 6.551 6.516 6.434 6.357 6.21 6.12 6.023 5.916 5.746 5.552 5.362 4.932 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5g.txt deleted file mode 100644 index 579ec6fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11069 ,KEBNE ,16678709,Thu Nov 25 03:52:31 CET,Thu Nov 25 05:22:08 CET,0.0 0.275 0.385 0.475 0.571 0.666 0.774 0.885 1.06 1.131 1.197 1.208 1.392 1.461 1.578 1.695 1.813 1.867 1.978 2.087 2.24 2.332 2.408 2.519 2.635 2.74 2.828 2.925 3.076 3.218 3.341 3.472 3.591 3.717 3.855 3.983 4.117 4.289 4.465 4.658 4.865 5.068 5.316 5.584 5.879 6.162 6.445 6.772 7.106 7.398 7.576 7.47 7.234 6.97 6.68 6.366 6.074 5.825 5.607 5.371 5.166 4.973 4.799 4.628 4.442 4.271 4.091 3.937 3.814 3.694 3.577 3.478 3.352 3.217 3.124 3.024 2.917 2.808 2.696 2.62 2.544 2.416 2.327 2.24 2.197 2.086 1.959 1.848 1.789 1.617 1.598 1.524 1.447 1.266 1.177 1.089 1.0 0.908 0.786 0.648 0.298 -2 ,15265 ,KEBNE ,16678710,Thu Nov 25 03:52:32 CET,Thu Nov 25 05:23:23 CET,0.0 0.297 0.472 0.591 0.698 0.802 0.903 0.998 1.177 1.251 1.311 1.32 1.5 1.563 1.667 1.757 1.847 1.894 1.975 2.037 2.147 2.22 2.288 2.388 2.485 2.59 2.687 2.776 2.895 3.003 3.103 3.244 3.378 3.495 3.636 3.805 3.967 4.14 4.304 4.491 4.713 4.971 5.25 5.494 5.753 5.995 6.246 6.531 6.846 7.139 7.261 7.08 6.834 6.583 6.322 6.054 5.764 5.466 5.212 4.964 4.747 4.541 4.367 4.212 4.047 3.893 3.711 3.559 3.437 3.297 3.138 3.011 2.883 2.736 2.632 2.536 2.436 2.307 2.165 2.079 1.997 1.865 1.776 1.691 1.646 1.554 1.454 1.36 1.312 1.144 1.146 1.093 1.026 0.89 0.821 0.739 0.661 0.591 0.501 0.366 0.204 -3 ,31634 ,KEBNE ,16678711,Thu Nov 25 03:52:32 CET,Thu Nov 25 05:23:47 CET,0.0 0.169 0.274 0.367 0.463 0.573 0.678 0.759 0.913 0.992 1.066 1.088 1.255 1.295 1.394 1.507 1.611 1.658 1.748 1.839 1.966 2.042 2.113 2.232 2.343 2.437 2.541 2.653 2.789 2.925 3.044 3.168 3.306 3.43 3.574 3.755 3.934 4.122 4.315 4.523 4.716 4.905 5.121 5.363 5.65 5.941 6.223 6.475 6.742 7.031 7.242 7.116 6.825 6.537 6.245 5.897 5.574 5.293 5.067 4.839 4.625 4.415 4.182 3.965 3.759 3.558 3.358 3.198 3.071 2.948 2.818 2.698 2.581 2.461 2.365 2.271 2.175 2.07 1.955 1.881 1.809 1.695 1.612 1.518 1.466 1.365 1.266 1.172 1.128 0.958 0.946 0.874 0.798 0.654 0.579 0.498 0.402 0.302 0.215 0.138 -0.206 -4 ,9266 ,KEBNE ,16678712,Thu Nov 25 03:52:32 CET,Thu Nov 25 05:23:18 CET,0.0 0.2 0.338 0.445 0.545 0.656 0.741 0.815 0.982 1.044 1.095 1.097 1.258 1.307 1.398 1.495 1.592 1.639 1.728 1.803 1.928 2.003 2.068 2.172 2.269 2.349 2.423 2.5 2.599 2.688 2.787 2.928 3.053 3.18 3.336 3.508 3.671 3.844 4.016 4.197 4.391 4.583 4.785 4.972 5.18 5.416 5.678 5.978 6.263 6.533 6.8 6.796 6.638 6.393 6.098 5.771 5.438 5.137 4.898 4.649 4.429 4.24 4.05 3.849 3.684 3.536 3.35 3.184 3.06 2.942 2.802 2.685 2.567 2.424 2.323 2.232 2.126 2.016 1.9 1.821 1.746 1.614 1.518 1.428 1.383 1.284 1.185 1.095 1.05 0.883 0.87 0.81 0.739 0.561 0.468 0.377 0.289 0.197 0.098 -0.03 -0.215 -5 ,4198 ,KEBNE ,16678713,Thu Nov 25 03:52:31 CET,Thu Nov 25 05:23:26 CET,0.0 0.377 0.517 0.629 0.714 0.795 0.888 0.984 1.164 1.243 1.306 1.314 1.482 1.526 1.6 1.686 1.78 1.823 1.904 1.99 2.104 2.166 2.225 2.315 2.418 2.526 2.628 2.73 2.865 2.982 3.085 3.221 3.363 3.488 3.617 3.766 3.92 4.086 4.279 4.477 4.662 4.877 5.147 5.44 5.758 6.07 6.398 6.756 7.127 7.43 7.603 7.523 7.294 7.016 6.734 6.427 6.149 5.921 5.714 5.485 5.28 5.085 4.871 4.675 4.494 4.333 4.187 4.063 3.937 3.785 3.626 3.502 3.382 3.252 3.15 3.047 2.955 2.866 2.764 2.68 2.593 2.451 2.346 2.242 2.194 2.107 2.017 1.912 1.853 1.674 1.659 1.609 1.552 1.404 1.314 1.212 1.115 1.016 0.885 0.667 0.373 -6 ,23508 ,KEBNE ,16678714,Thu Nov 25 03:53:34 CET,Thu Nov 25 05:24:21 CET,0.0 0.213 0.346 0.436 0.528 0.622 0.702 0.777 0.938 1.014 1.082 1.078 1.245 1.304 1.422 1.523 1.611 1.656 1.746 1.836 1.948 2.017 2.095 2.203 2.298 2.39 2.486 2.579 2.69 2.808 2.925 3.054 3.183 3.321 3.473 3.652 3.839 4.016 4.191 4.392 4.61 4.833 5.086 5.322 5.571 5.819 6.057 6.328 6.627 6.911 7.12 7.058 6.833 6.563 6.243 5.918 5.651 5.426 5.226 5.004 4.794 4.603 4.421 4.244 4.081 3.935 3.79 3.653 3.521 3.378 3.223 3.098 2.975 2.84 2.736 2.628 2.517 2.403 2.278 2.192 2.097 1.954 1.872 1.794 1.75 1.656 1.553 1.427 1.364 1.182 1.154 1.09 1.023 0.895 0.82 0.732 0.626 0.511 0.414 0.293 0.084 -7 ,20214 ,KEBNE ,16678715,Thu Nov 25 03:53:34 CET,Thu Nov 25 05:28:04 CET,0.0 0.311 0.458 0.56 0.644 0.732 0.824 0.898 1.03 1.104 1.168 1.162 1.326 1.385 1.504 1.609 1.7 1.742 1.84 1.933 2.053 2.138 2.218 2.317 2.419 2.527 2.633 2.731 2.854 2.974 3.09 3.244 3.393 3.524 3.672 3.827 3.971 4.128 4.285 4.439 4.621 4.836 5.072 5.295 5.558 5.852 6.181 6.497 6.739 6.974 7.216 7.182 6.955 6.649 6.315 5.959 5.645 5.378 5.154 4.924 4.711 4.496 4.271 4.085 3.909 3.73 3.554 3.409 3.299 3.184 3.043 2.93 2.824 2.708 2.603 2.487 2.377 2.28 2.167 2.085 2.004 1.872 1.792 1.695 1.64 1.542 1.434 1.324 1.268 1.092 1.09 1.034 0.97 0.839 0.773 0.708 0.653 0.584 0.501 0.38 0.152 -8 ,25932 ,KEBNE ,16678716,Thu Nov 25 03:53:34 CET,Thu Nov 25 05:24:07 CET,0.0 0.293 0.392 0.471 0.553 0.639 0.718 0.811 0.978 1.045 1.109 1.114 1.29 1.355 1.467 1.568 1.676 1.727 1.816 1.909 2.031 2.102 2.184 2.307 2.427 2.544 2.642 2.728 2.863 2.987 3.105 3.268 3.411 3.542 3.715 3.894 4.051 4.237 4.426 4.614 4.791 5.02 5.292 5.532 5.799 6.097 6.465 6.812 7.135 7.44 7.548 7.388 7.175 6.926 6.644 6.366 6.124 5.912 5.688 5.425 5.21 5.026 4.86 4.681 4.489 4.321 4.146 3.978 3.839 3.704 3.564 3.43 3.297 3.175 3.066 2.967 2.875 2.765 2.639 2.55 2.461 2.327 2.235 2.135 2.088 1.987 1.868 1.747 1.69 1.527 1.53 1.459 1.391 1.238 1.15 1.056 0.955 0.855 0.75 0.622 0.396 -9 ,30452 ,KEBNE ,16678717,Thu Nov 25 03:53:34 CET,Thu Nov 25 05:23:44 CET,0.0 0.151 0.246 0.337 0.436 0.533 0.606 0.678 0.802 0.86 0.922 0.918 1.078 1.125 1.224 1.325 1.427 1.474 1.557 1.632 1.737 1.818 1.903 2.012 2.11 2.217 2.322 2.41 2.528 2.654 2.761 2.875 2.998 3.123 3.267 3.431 3.574 3.725 3.877 4.031 4.209 4.413 4.657 4.887 5.156 5.436 5.693 5.978 6.256 6.522 6.678 6.531 6.28 5.995 5.716 5.426 5.12 4.821 4.574 4.338 4.114 3.894 3.699 3.538 3.374 3.22 3.089 2.953 2.81 2.671 2.533 2.422 2.305 2.177 2.079 1.969 1.865 1.76 1.644 1.564 1.488 1.381 1.304 1.216 1.168 1.075 0.968 0.843 0.782 0.611 0.614 0.558 0.485 0.32 0.233 0.15 0.065 -0.026 -0.144 -0.294 -0.464 -10 ,19298 ,KEBNE ,16678718,Thu Nov 25 03:53:35 CET,Thu Nov 25 05:30:14 CET,0.0 0.207 0.374 0.498 0.622 0.723 0.799 0.873 1.035 1.116 1.194 1.236 1.412 1.463 1.552 1.654 1.762 1.81 1.896 1.984 2.126 2.209 2.286 2.4 2.507 2.604 2.699 2.811 2.942 3.053 3.173 3.303 3.412 3.524 3.668 3.839 3.999 4.18 4.368 4.564 4.798 5.027 5.249 5.459 5.708 6.021 6.355 6.697 7.006 7.257 7.346 7.134 6.84 6.557 6.3 6.045 5.79 5.528 5.292 5.069 4.864 4.677 4.509 4.321 4.135 3.984 3.823 3.667 3.534 3.405 3.249 3.114 2.991 2.86 2.749 2.641 2.541 2.424 2.284 2.189 2.105 1.97 1.886 1.811 1.766 1.653 1.535 1.409 1.344 1.166 1.139 1.067 0.997 0.843 0.765 0.687 0.563 0.438 0.309 0.137 -0.092 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5j_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5j_5b.txt deleted file mode 100644 index 8363fe29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5j_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20884 ,KEBNE ,16678719,Thu Nov 25 03:53:34 CET,Thu Nov 25 05:24:43 CET,0.0 0.149 0.275 0.395 0.477 0.551 0.631 0.699 0.821 0.887 0.955 0.975 1.145 1.212 1.333 1.437 1.522 1.566 1.659 1.746 1.88 1.962 2.033 2.154 2.274 2.383 2.488 2.595 2.734 2.874 3.025 3.204 3.354 3.493 3.654 3.835 4.021 4.21 4.408 4.622 4.858 5.148 5.481 5.808 6.199 6.614 7.066 7.526 8.007 8.572 9.16 9.514 9.635 9.639 9.533 9.373 9.201 9.031 8.882 8.708 8.541 8.393 8.25 8.118 8.012 7.917 7.814 7.736 7.66 7.547 7.425 7.341 7.248 7.14 7.053 6.953 6.845 6.735 6.613 6.533 6.454 6.32 6.238 6.167 6.125 6.022 5.92 5.818 5.765 5.614 5.6 5.537 5.479 5.344 5.276 5.215 5.128 5.02 4.907 4.716 4.413 -2 ,1178 ,KEBNE ,16678720,Thu Nov 25 03:53:34 CET,Thu Nov 25 05:23:42 CET,0.0 0.23 0.351 0.464 0.559 0.639 0.714 0.782 0.912 0.969 1.019 1.013 1.163 1.213 1.322 1.433 1.539 1.592 1.698 1.795 1.923 2.005 2.099 2.248 2.385 2.511 2.626 2.737 2.87 3.006 3.13 3.275 3.421 3.555 3.719 3.899 4.079 4.309 4.553 4.782 5.025 5.311 5.643 5.975 6.343 6.747 7.228 7.742 8.259 8.829 9.447 9.824 9.909 9.888 9.825 9.716 9.555 9.398 9.267 9.136 9.032 8.897 8.768 8.662 8.554 8.446 8.317 8.167 8.04 7.936 7.843 7.768 7.678 7.568 7.49 7.417 7.335 7.256 7.178 7.114 7.037 6.912 6.822 6.732 6.686 6.593 6.487 6.372 6.315 6.164 6.166 6.115 6.064 5.948 5.866 5.778 5.678 5.555 5.43 5.274 4.787 -3 ,1102 ,KEBNE ,16678721,Thu Nov 25 03:53:34 CET,Thu Nov 25 05:23:56 CET,0.0 0.124 0.227 0.331 0.438 0.534 0.617 0.7 0.878 0.958 1.036 1.086 1.257 1.309 1.423 1.551 1.658 1.705 1.805 1.902 2.029 2.118 2.211 2.322 2.427 2.536 2.641 2.748 2.894 3.028 3.158 3.312 3.45 3.588 3.749 3.934 4.122 4.336 4.556 4.783 5.02 5.283 5.593 5.904 6.274 6.677 7.151 7.667 8.212 8.851 9.537 9.967 10.136 10.174 10.131 10.025 9.91 9.773 9.577 9.362 9.215 9.09 8.945 8.784 8.631 8.502 8.374 8.266 8.175 8.067 7.936 7.808 7.668 7.539 7.455 7.36 7.259 7.17 7.073 7.001 6.926 6.817 6.749 6.681 6.644 6.547 6.433 6.318 6.254 6.088 6.056 5.998 5.941 5.813 5.744 5.649 5.544 5.436 5.292 5.07 4.769 -4 ,28794 ,KEBNE ,16678722,Thu Nov 25 03:53:34 CET,Thu Nov 25 05:23:05 CET,0.0 0.226 0.352 0.464 0.576 0.658 0.725 0.791 0.941 1.014 1.069 1.063 1.22 1.279 1.383 1.479 1.576 1.622 1.72 1.816 1.947 2.033 2.127 2.259 2.38 2.507 2.615 2.72 2.865 2.986 3.115 3.287 3.443 3.596 3.769 3.956 4.122 4.312 4.528 4.759 5.034 5.357 5.721 6.078 6.464 6.854 7.306 7.842 8.444 9.073 9.729 10.15 10.316 10.371 10.355 10.26 10.123 9.956 9.783 9.596 9.413 9.257 9.113 8.974 8.854 8.733 8.602 8.477 8.357 8.236 8.096 7.974 7.868 7.759 7.662 7.57 7.473 7.387 7.311 7.243 7.164 7.055 6.977 6.892 6.853 6.761 6.665 6.579 6.534 6.384 6.365 6.307 6.245 6.087 6.003 5.918 5.835 5.74 5.59 5.406 5.123 -5 ,211 ,KEBNE ,16678723,Thu Nov 25 03:54:36 CET,Thu Nov 25 05:26:12 CET,0.0 0.314 0.437 0.551 0.651 0.719 0.795 0.883 1.034 1.09 1.148 1.173 1.336 1.394 1.506 1.608 1.706 1.748 1.831 1.918 2.06 2.143 2.216 2.333 2.46 2.595 2.726 2.851 3.0 3.144 3.285 3.456 3.627 3.787 3.959 4.149 4.345 4.576 4.808 5.022 5.247 5.497 5.783 6.064 6.397 6.785 7.204 7.67 8.239 8.855 9.449 9.752 9.796 9.74 9.648 9.506 9.344 9.185 9.033 8.885 8.751 8.618 8.478 8.343 8.215 8.098 7.979 7.862 7.75 7.618 7.498 7.4 7.271 7.129 7.031 6.947 6.858 6.767 6.688 6.626 6.55 6.427 6.337 6.246 6.199 6.104 6.002 5.89 5.826 5.664 5.636 5.567 5.505 5.357 5.258 5.173 5.094 4.993 4.876 4.712 4.518 -6 ,28196 ,KEBNE ,16678724,Thu Nov 25 03:54:36 CET,Thu Nov 25 05:28:07 CET,0.0 0.146 0.245 0.341 0.436 0.524 0.603 0.674 0.825 0.893 0.953 0.959 1.125 1.189 1.323 1.451 1.563 1.617 1.724 1.84 1.992 2.065 2.142 2.281 2.426 2.548 2.658 2.775 2.919 3.057 3.207 3.386 3.542 3.694 3.895 4.11 4.303 4.503 4.705 4.914 5.128 5.386 5.702 6.028 6.411 6.814 7.236 7.671 8.202 8.853 9.497 9.923 10.056 10.046 10.005 9.916 9.808 9.698 9.564 9.387 9.246 9.101 8.927 8.756 8.603 8.482 8.36 8.231 8.107 7.983 7.866 7.761 7.654 7.562 7.487 7.394 7.285 7.172 7.065 6.997 6.924 6.808 6.73 6.648 6.598 6.484 6.383 6.29 6.242 6.089 6.043 5.956 5.886 5.769 5.701 5.626 5.524 5.416 5.325 5.169 4.822 -7 ,6892 ,KEBNE ,16678725,Thu Nov 25 03:54:36 CET,Thu Nov 25 05:24:30 CET,0.0 0.188 0.331 0.475 0.601 0.683 0.753 0.835 0.981 1.041 1.095 1.089 1.248 1.31 1.421 1.511 1.607 1.65 1.738 1.828 1.967 2.059 2.149 2.283 2.399 2.531 2.657 2.77 2.925 3.062 3.188 3.331 3.466 3.594 3.759 3.969 4.152 4.353 4.58 4.807 5.035 5.299 5.619 5.934 6.294 6.683 7.122 7.608 8.156 8.747 9.333 9.69 9.775 9.723 9.671 9.593 9.46 9.322 9.192 9.064 8.937 8.788 8.617 8.462 8.323 8.2 8.084 7.967 7.86 7.76 7.661 7.575 7.489 7.392 7.294 7.192 7.102 7.014 6.924 6.855 6.792 6.708 6.635 6.553 6.506 6.39 6.281 6.18 6.127 5.969 5.945 5.879 5.807 5.689 5.628 5.566 5.474 5.36 5.257 5.141 4.821 -8 ,31766 ,KEBNE ,16678726,Thu Nov 25 03:54:36 CET,Thu Nov 25 05:27:25 CET,0.0 0.197 0.272 0.345 0.428 0.532 0.629 0.704 0.864 0.933 0.993 1.017 1.19 1.252 1.357 1.456 1.551 1.599 1.692 1.78 1.907 1.984 2.067 2.194 2.307 2.41 2.511 2.614 2.743 2.874 3.01 3.158 3.297 3.439 3.619 3.84 4.045 4.261 4.498 4.74 4.983 5.241 5.56 5.89 6.241 6.64 7.106 7.63 8.245 8.897 9.54 9.912 10.046 10.089 10.059 9.992 9.897 9.761 9.632 9.509 9.416 9.319 9.205 9.109 9.012 8.899 8.762 8.624 8.511 8.416 8.308 8.201 8.097 7.997 7.912 7.828 7.741 7.648 7.557 7.491 7.415 7.279 7.198 7.121 7.072 6.973 6.871 6.769 6.716 6.566 6.563 6.501 6.426 6.28 6.206 6.109 5.996 5.892 5.797 5.678 5.518 -9 ,15793 ,KEBNE ,16678727,Thu Nov 25 03:54:36 CET,Thu Nov 25 05:26:53 CET,0.0 0.205 0.351 0.464 0.579 0.689 0.769 0.837 0.961 1.024 1.094 1.124 1.289 1.353 1.465 1.586 1.713 1.765 1.865 1.975 2.133 2.229 2.315 2.44 2.563 2.669 2.774 2.884 3.012 3.131 3.262 3.434 3.592 3.736 3.91 4.117 4.319 4.528 4.752 5.018 5.29 5.549 5.85 6.172 6.527 6.909 7.335 7.825 8.402 9.005 9.609 9.978 10.058 10.028 9.964 9.885 9.804 9.694 9.582 9.437 9.296 9.175 9.057 8.959 8.869 8.769 8.65 8.545 8.457 8.348 8.23 8.134 8.024 7.924 7.839 7.735 7.619 7.505 7.41 7.343 7.264 7.124 7.023 6.926 6.873 6.768 6.664 6.543 6.483 6.334 6.313 6.243 6.165 6.006 5.939 5.859 5.763 5.651 5.537 5.378 5.123 -10 ,6988 ,KEBNE ,16678728,Thu Nov 25 03:54:40 CET,Thu Nov 25 05:22:42 CET,0.0 0.172 0.26 0.367 0.481 0.574 0.675 0.771 0.92 0.981 1.039 1.055 1.214 1.267 1.393 1.503 1.602 1.653 1.759 1.857 1.99 2.073 2.151 2.272 2.399 2.522 2.642 2.768 2.923 3.074 3.221 3.396 3.575 3.734 3.891 4.085 4.313 4.555 4.778 5.002 5.246 5.53 5.86 6.177 6.518 6.896 7.369 7.911 8.48 9.114 9.738 10.047 10.125 10.089 10.023 9.912 9.776 9.633 9.458 9.281 9.166 9.065 8.953 8.834 8.709 8.587 8.447 8.319 8.208 8.104 7.994 7.895 7.805 7.716 7.646 7.561 7.463 7.364 7.273 7.207 7.135 7.035 6.958 6.871 6.826 6.736 6.64 6.535 6.49 6.346 6.324 6.253 6.182 6.026 5.943 5.855 5.777 5.705 5.622 5.506 5.182 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5d.txt deleted file mode 100644 index 48241c21..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4224 ,KEBNE ,16678729,Thu Nov 25 03:54:36 CET,Thu Nov 25 05:25:13 CET,0.0 0.137 0.272 0.385 0.482 0.58 0.677 0.777 0.954 1.029 1.091 1.073 1.25 1.316 1.456 1.557 1.641 1.681 1.772 1.873 2.014 2.106 2.194 2.328 2.46 2.578 2.703 2.826 2.962 3.098 3.23 3.388 3.555 3.718 3.908 4.119 4.322 4.535 4.74 4.975 5.217 5.471 5.776 6.076 6.442 6.843 7.307 7.86 8.476 9.163 9.986 10.529 10.742 10.836 10.866 10.869 10.802 10.678 10.572 10.46 10.349 10.249 10.148 10.038 9.919 9.819 9.726 9.618 9.503 9.406 9.331 9.248 9.146 9.057 8.998 8.927 8.85 8.775 8.698 8.642 8.572 8.465 8.398 8.316 8.28 8.215 8.121 8.005 7.946 7.782 7.796 7.733 7.672 7.542 7.469 7.388 7.303 7.221 7.137 7.002 6.849 -2 ,2207 ,KEBNE ,16678730,Thu Nov 25 03:54:36 CET,Thu Nov 25 05:25:48 CET,0.0 0.18 0.306 0.43 0.546 0.647 0.737 0.81 0.952 1.025 1.094 1.112 1.307 1.36 1.468 1.598 1.72 1.764 1.846 1.934 2.065 2.152 2.244 2.389 2.521 2.632 2.748 2.876 3.04 3.179 3.297 3.459 3.628 3.797 3.989 4.189 4.384 4.609 4.85 5.096 5.355 5.64 5.979 6.327 6.712 7.11 7.571 8.107 8.752 9.525 10.36 10.932 11.232 11.325 11.303 11.247 11.175 11.104 11.02 10.897 10.799 10.715 10.6 10.488 10.39 10.262 10.1 9.984 9.903 9.808 9.717 9.646 9.546 9.432 9.349 9.266 9.201 9.135 9.039 8.965 8.893 8.784 8.709 8.621 8.575 8.502 8.433 8.362 8.326 8.167 8.181 8.128 8.086 7.979 7.888 7.781 7.689 7.6 7.483 7.356 7.164 -3 ,14259 ,KEBNE ,16678731,Thu Nov 25 03:56:41 CET,Thu Nov 25 05:27:08 CET,0.0 0.143 0.231 0.31 0.392 0.465 0.535 0.598 0.725 0.793 0.854 0.866 1.06 1.121 1.243 1.369 1.488 1.544 1.654 1.759 1.901 1.986 2.074 2.201 2.326 2.447 2.553 2.66 2.817 2.971 3.103 3.266 3.421 3.569 3.755 3.971 4.183 4.406 4.653 4.907 5.156 5.441 5.766 6.098 6.508 6.97 7.481 8.045 8.712 9.477 10.3 10.919 11.193 11.277 11.288 11.229 11.095 10.929 10.802 10.681 10.559 10.455 10.351 10.22 10.084 9.947 9.83 9.747 9.663 9.556 9.433 9.341 9.257 9.174 9.103 9.029 8.946 8.868 8.795 8.737 8.673 8.562 8.478 8.391 8.348 8.252 8.16 8.075 8.032 7.87 7.898 7.854 7.808 7.72 7.651 7.564 7.488 7.395 7.284 7.136 6.808 -4 ,27017 ,KEBNE ,16678732,Thu Nov 25 03:56:41 CET,Thu Nov 25 05:27:11 CET,0.0 0.182 0.364 0.512 0.616 0.719 0.83 0.932 1.118 1.197 1.26 1.273 1.467 1.53 1.667 1.806 1.916 1.967 2.078 2.171 2.302 2.406 2.513 2.66 2.799 2.932 3.072 3.207 3.376 3.558 3.735 3.923 4.092 4.261 4.458 4.673 4.87 5.082 5.324 5.591 5.865 6.138 6.453 6.788 7.173 7.614 8.09 8.616 9.241 9.915 10.698 11.254 11.479 11.616 11.629 11.565 11.509 11.42 11.306 11.197 11.09 10.974 10.88 10.803 10.699 10.583 10.48 10.396 10.321 10.222 10.118 10.034 9.946 9.867 9.808 9.742 9.67 9.605 9.533 9.48 9.427 9.358 9.294 9.206 9.172 9.104 9.015 8.93 8.891 8.739 8.738 8.667 8.602 8.49 8.421 8.341 8.252 8.16 8.06 7.907 7.564 -5 ,13885 ,KEBNE ,16678733,Thu Nov 25 03:56:42 CET,Thu Nov 25 05:28:08 CET,0.0 0.313 0.438 0.552 0.648 0.748 0.832 0.897 1.024 1.094 1.169 1.169 1.349 1.423 1.571 1.69 1.806 1.863 1.966 2.061 2.196 2.279 2.361 2.494 2.639 2.763 2.866 2.965 3.103 3.26 3.419 3.595 3.767 3.937 4.124 4.338 4.553 4.804 5.083 5.362 5.648 5.957 6.296 6.654 7.091 7.554 8.064 8.626 9.277 10.005 10.847 11.466 11.713 11.745 11.69 11.59 11.464 11.349 11.235 11.093 10.998 10.912 10.814 10.723 10.607 10.476 10.331 10.185 10.058 9.946 9.829 9.722 9.618 9.516 9.43 9.346 9.262 9.17 9.061 8.992 8.927 8.823 8.757 8.688 8.65 8.569 8.486 8.379 8.325 8.159 8.182 8.116 8.041 7.906 7.818 7.74 7.669 7.571 7.449 7.286 7.081 -6 ,4013 ,KEBNE ,16678734,Thu Nov 25 03:56:41 CET,Thu Nov 25 05:28:00 CET,0.0 0.258 0.409 0.538 0.645 0.739 0.833 0.915 1.084 1.168 1.244 1.247 1.433 1.489 1.593 1.696 1.801 1.852 1.968 2.09 2.261 2.352 2.431 2.564 2.698 2.838 2.976 3.107 3.278 3.435 3.576 3.73 3.878 4.041 4.253 4.479 4.664 4.874 5.104 5.335 5.587 5.888 6.245 6.597 6.984 7.424 7.947 8.504 9.147 9.901 10.737 11.312 11.542 11.596 11.591 11.535 11.472 11.414 11.315 11.189 11.084 10.994 10.912 10.806 10.698 10.614 10.517 10.432 10.354 10.27 10.163 10.088 10.023 9.934 9.851 9.768 9.697 9.612 9.521 9.463 9.398 9.293 9.228 9.167 9.132 9.062 8.99 8.904 8.861 8.705 8.719 8.666 8.611 8.476 8.403 8.337 8.263 8.143 8.0 7.888 7.481 -7 ,232 ,KEBNE ,16678735,Thu Nov 25 03:56:41 CET,Thu Nov 25 05:28:37 CET,0.0 0.332 0.44 0.549 0.646 0.727 0.808 0.896 1.066 1.139 1.209 1.218 1.403 1.46 1.566 1.673 1.766 1.814 1.925 2.027 2.147 2.227 2.312 2.43 2.548 2.67 2.784 2.898 3.042 3.16 3.278 3.434 3.588 3.757 3.96 4.179 4.381 4.581 4.793 5.017 5.246 5.513 5.833 6.162 6.529 6.916 7.377 7.903 8.531 9.244 10.042 10.577 10.775 10.861 10.873 10.849 10.801 10.723 10.634 10.534 10.424 10.294 10.172 10.071 9.962 9.859 9.752 9.654 9.571 9.484 9.374 9.282 9.187 9.08 8.99 8.912 8.842 8.755 8.671 8.621 8.563 8.457 8.38 8.296 8.251 8.159 8.077 7.991 7.935 7.772 7.797 7.732 7.663 7.55 7.496 7.421 7.334 7.264 7.199 7.096 6.925 -8 ,16681 ,KEBNE ,16678736,Thu Nov 25 03:56:41 CET,Thu Nov 25 05:28:24 CET,0.0 0.147 0.297 0.417 0.504 0.58 0.649 0.722 0.881 0.954 1.021 1.022 1.196 1.246 1.354 1.45 1.548 1.599 1.701 1.798 1.946 2.046 2.139 2.28 2.412 2.535 2.657 2.777 2.924 3.059 3.198 3.36 3.514 3.671 3.846 4.03 4.206 4.407 4.626 4.865 5.128 5.402 5.709 6.029 6.413 6.842 7.355 7.936 8.583 9.33 10.132 10.656 10.827 10.883 10.89 10.85 10.781 10.704 10.631 10.534 10.422 10.321 10.197 10.056 9.94 9.833 9.706 9.594 9.503 9.416 9.328 9.235 9.131 9.034 8.956 8.869 8.779 8.683 8.586 8.532 8.472 8.356 8.286 8.225 8.194 8.134 8.07 8.005 7.963 7.794 7.803 7.748 7.688 7.564 7.498 7.39 7.225 7.079 6.978 6.869 6.734 -9 ,27706 ,KEBNE ,16678737,Thu Nov 25 03:56:41 CET,Thu Nov 25 05:26:46 CET,0.0 0.151 0.239 0.322 0.415 0.52 0.615 0.699 0.851 0.916 0.976 0.963 1.148 1.205 1.315 1.419 1.519 1.567 1.66 1.756 1.892 1.973 2.049 2.185 2.32 2.44 2.554 2.676 2.837 2.972 3.097 3.258 3.428 3.585 3.756 3.951 4.143 4.345 4.566 4.811 5.061 5.326 5.632 5.949 6.299 6.704 7.239 7.832 8.414 9.042 9.701 10.175 10.442 10.539 10.515 10.447 10.375 10.268 10.141 10.045 9.951 9.812 9.678 9.552 9.408 9.285 9.185 9.086 8.967 8.84 8.739 8.657 8.549 8.449 8.375 8.292 8.219 8.146 8.051 7.971 7.891 7.774 7.69 7.603 7.564 7.479 7.389 7.289 7.239 7.077 7.09 7.03 6.968 6.825 6.753 6.682 6.59 6.455 6.334 6.247 5.941 -10 ,31740 ,KEBNE ,16678738,Thu Nov 25 03:56:42 CET,Thu Nov 25 05:27:30 CET,0.0 0.238 0.385 0.514 0.624 0.71 0.797 0.88 1.037 1.121 1.198 1.202 1.383 1.445 1.559 1.661 1.765 1.813 1.908 2.004 2.133 2.225 2.321 2.455 2.572 2.681 2.791 2.9 3.04 3.185 3.332 3.493 3.646 3.796 3.967 4.153 4.331 4.524 4.729 4.979 5.246 5.52 5.874 6.25 6.673 7.145 7.64 8.137 8.717 9.388 10.127 10.633 10.847 10.975 11.009 10.965 10.885 10.778 10.659 10.533 10.433 10.344 10.252 10.142 10.029 9.938 9.849 9.761 9.676 9.584 9.487 9.392 9.291 9.21 9.141 9.054 8.958 8.865 8.776 8.714 8.662 8.582 8.514 8.424 8.377 8.283 8.191 8.119 8.077 7.916 7.931 7.868 7.795 7.638 7.552 7.464 7.4 7.349 7.275 7.181 7.069 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5f.txt deleted file mode 100644 index a74d249a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24632 ,KEBNE ,16678739,Thu Nov 25 03:56:43 CET,Thu Nov 25 05:27:58 CET,0.0 0.151 0.264 0.36 0.456 0.552 0.624 0.693 0.863 0.943 1.012 1.031 1.225 1.289 1.419 1.564 1.7 1.754 1.858 1.968 2.133 2.241 2.344 2.505 2.65 2.778 2.905 3.04 3.231 3.432 3.622 3.82 3.994 4.161 4.361 4.601 4.856 5.126 5.39 5.687 6.006 6.357 6.77 7.192 7.693 8.232 8.892 9.705 10.621 11.635 12.849 13.882 14.523 14.928 15.134 15.221 15.245 15.261 15.268 15.254 15.24 15.217 15.169 15.118 15.058 14.967 14.865 14.777 14.705 14.647 14.583 14.516 14.446 14.375 14.32 14.262 14.192 14.101 14.006 13.947 13.892 13.81 13.745 13.669 13.629 13.544 13.447 13.338 13.287 13.124 13.137 13.094 13.048 12.923 12.856 12.785 12.706 12.624 12.509 12.367 12.178 -2 ,28575 ,KEBNE ,16678740,Thu Nov 25 03:56:41 CET,Thu Nov 25 05:28:35 CET,0.0 0.166 0.27 0.406 0.528 0.632 0.74 0.843 1.034 1.117 1.188 1.213 1.4 1.459 1.584 1.71 1.833 1.892 2.0 2.1 2.255 2.355 2.451 2.603 2.754 2.888 3.014 3.14 3.316 3.483 3.639 3.826 4.009 4.191 4.397 4.627 4.858 5.116 5.385 5.681 6.009 6.391 6.819 7.245 7.77 8.392 9.109 9.863 10.768 11.833 13.027 13.954 14.515 14.847 15.051 15.15 15.188 15.216 15.205 15.181 15.148 15.107 15.064 15.002 14.941 14.878 14.814 14.765 14.72 14.677 14.623 14.563 14.496 14.427 14.375 14.327 14.26 14.178 14.083 14.02 13.965 13.863 13.775 13.695 13.667 13.603 13.521 13.433 13.389 13.236 13.248 13.191 13.132 13.026 12.944 12.836 12.759 12.68 12.554 12.388 12.13 -3 ,26754 ,KEBNE ,16678741,Thu Nov 25 03:56:41 CET,Thu Nov 25 05:27:34 CET,0.0 0.188 0.316 0.413 0.51 0.603 0.678 0.747 0.887 0.953 1.012 1.014 1.204 1.263 1.371 1.485 1.59 1.638 1.745 1.861 2.025 2.127 2.235 2.395 2.537 2.666 2.785 2.915 3.099 3.252 3.391 3.57 3.745 3.93 4.16 4.404 4.624 4.88 5.163 5.441 5.749 6.126 6.562 7.002 7.506 8.045 8.675 9.375 10.184 11.171 12.376 13.303 13.845 14.186 14.386 14.528 14.586 14.615 14.626 14.582 14.507 14.449 14.387 14.319 14.26 14.19 14.106 14.03 13.971 13.908 13.826 13.763 13.704 13.636 13.574 13.507 13.441 13.371 13.298 13.251 13.198 13.113 13.056 12.994 12.959 12.882 12.803 12.735 12.691 12.528 12.545 12.496 12.446 12.325 12.261 12.185 12.092 11.988 11.864 11.752 11.441 -4 ,16289 ,KEBNE ,16678742,Thu Nov 25 03:56:41 CET,Thu Nov 25 05:26:38 CET,0.0 0.171 0.318 0.432 0.515 0.611 0.722 0.825 0.99 1.065 1.136 1.15 1.347 1.413 1.525 1.625 1.72 1.764 1.859 1.962 2.104 2.186 2.269 2.395 2.51 2.627 2.744 2.857 3.011 3.161 3.302 3.469 3.641 3.822 4.036 4.278 4.524 4.786 5.056 5.347 5.648 6.029 6.498 6.939 7.44 8.002 8.687 9.471 10.358 11.415 12.667 13.618 14.11 14.386 14.561 14.673 14.742 14.763 14.755 14.702 14.633 14.583 14.533 14.475 14.413 14.36 14.302 14.238 14.176 14.112 14.029 13.939 13.856 13.801 13.76 13.715 13.663 13.6 13.528 13.475 13.425 13.328 13.25 13.177 13.141 13.069 12.992 12.909 12.866 12.712 12.729 12.675 12.606 12.463 12.381 12.293 12.214 12.132 12.025 11.86 11.534 -5 ,17308 ,KEBNE ,16678743,Thu Nov 25 03:57:43 CET,Thu Nov 25 05:27:45 CET,0.0 0.122 0.264 0.388 0.505 0.632 0.724 0.804 0.966 1.044 1.113 1.103 1.289 1.355 1.488 1.617 1.732 1.79 1.9 1.997 2.144 2.248 2.353 2.503 2.643 2.77 2.891 3.023 3.198 3.371 3.547 3.747 3.937 4.112 4.306 4.547 4.784 5.049 5.349 5.652 5.974 6.365 6.806 7.243 7.752 8.305 8.952 9.688 10.568 11.629 12.937 13.998 14.588 14.913 15.098 15.234 15.292 15.308 15.318 15.277 15.223 15.191 15.162 15.111 15.04 14.967 14.889 14.838 14.804 14.759 14.7 14.64 14.579 14.509 14.446 14.38 14.312 14.248 14.177 14.113 14.036 13.931 13.864 13.791 13.744 13.641 13.55 13.465 13.421 13.266 13.278 13.219 13.161 13.04 12.987 12.933 12.859 12.778 12.693 12.619 12.446 -6 ,8152 ,KEBNE ,16678744,Thu Nov 25 03:57:47 CET,Thu Nov 25 05:24:15 CET,0.0 0.21 0.371 0.511 0.609 0.694 0.791 0.887 1.039 1.108 1.176 1.185 1.388 1.456 1.584 1.706 1.82 1.873 1.972 2.071 2.233 2.336 2.422 2.551 2.696 2.851 2.985 3.094 3.252 3.407 3.562 3.757 3.954 4.155 4.375 4.622 4.882 5.152 5.415 5.705 6.027 6.385 6.801 7.237 7.744 8.298 8.934 9.667 10.561 11.65 12.997 14.11 14.678 15.001 15.197 15.293 15.335 15.369 15.38 15.371 15.333 15.286 15.244 15.203 15.138 15.052 14.983 14.931 14.879 14.812 14.728 14.664 14.587 14.482 14.397 14.31 14.231 14.163 14.101 14.059 13.997 13.887 13.815 13.754 13.728 13.667 13.588 13.494 13.443 13.278 13.265 13.2 13.133 12.996 12.927 12.852 12.75 12.636 12.519 12.355 12.031 -7 ,17661 ,KEBNE ,16678745,Thu Nov 25 03:58:46 CET,Thu Nov 25 05:28:40 CET,0.0 0.145 0.276 0.389 0.512 0.616 0.699 0.78 0.897 0.953 1.017 1.028 1.21 1.262 1.37 1.485 1.589 1.63 1.72 1.815 1.965 2.074 2.177 2.322 2.466 2.604 2.735 2.864 3.02 3.173 3.327 3.502 3.675 3.851 4.067 4.32 4.565 4.831 5.118 5.423 5.745 6.096 6.497 6.923 7.415 7.95 8.584 9.303 10.151 11.186 12.434 13.449 14.033 14.338 14.453 14.5 14.514 14.492 14.476 14.455 14.413 14.365 14.293 14.233 14.205 14.163 14.105 14.053 13.989 13.897 13.805 13.739 13.675 13.605 13.551 13.499 13.439 13.352 13.252 13.191 13.129 13.037 12.973 12.906 12.873 12.81 12.75 12.68 12.645 12.5 12.524 12.473 12.417 12.292 12.234 12.164 12.093 12.017 11.884 11.745 11.497 -8 ,28411 ,KEBNE ,16678746,Thu Nov 25 03:59:49 CET,Thu Nov 25 05:31:41 CET,0.0 0.205 0.331 0.422 0.499 0.584 0.67 0.758 0.932 1.001 1.06 1.038 1.214 1.266 1.354 1.438 1.523 1.568 1.657 1.754 1.918 2.026 2.13 2.271 2.409 2.544 2.682 2.82 2.969 3.102 3.246 3.437 3.639 3.843 4.075 4.316 4.522 4.752 5.02 5.33 5.666 6.028 6.436 6.863 7.374 7.951 8.619 9.365 10.237 11.257 12.568 13.691 14.323 14.71 14.948 15.032 15.071 15.123 15.16 15.153 15.108 15.064 15.013 14.957 14.902 14.813 14.716 14.659 14.592 14.519 14.442 14.364 14.301 14.24 14.185 14.121 14.043 13.965 13.887 13.826 13.765 13.682 13.617 13.549 13.519 13.46 13.396 13.324 13.282 13.117 13.127 13.073 13.021 12.899 12.81 12.72 12.641 12.566 12.473 12.322 12.064 -9 ,30324 ,KEBNE ,16678747,Thu Nov 25 04:00:51 CET,Thu Nov 25 05:33:36 CET,0.0 0.225 0.361 0.458 0.544 0.617 0.694 0.775 0.936 1.015 1.086 1.097 1.294 1.362 1.494 1.619 1.735 1.79 1.9 1.999 2.138 2.229 2.316 2.449 2.571 2.698 2.845 2.978 3.14 3.301 3.451 3.63 3.789 3.952 4.16 4.377 4.59 4.874 5.184 5.498 5.827 6.191 6.63 7.084 7.616 8.213 8.893 9.635 10.518 11.533 12.815 13.895 14.505 14.886 15.106 15.249 15.361 15.437 15.465 15.445 15.402 15.371 15.327 15.258 15.193 15.143 15.082 15.031 14.992 14.939 14.89 14.841 14.759 14.669 14.612 14.549 14.479 14.416 14.348 14.294 14.238 14.146 14.085 14.022 13.989 13.929 13.865 13.787 13.741 13.588 13.621 13.564 13.492 13.344 13.271 13.202 13.137 13.061 12.979 12.858 12.6 -10 ,22131 ,KEBNE ,16678748,Thu Nov 25 04:00:55 CET,Thu Nov 25 05:29:29 CET,0.0 0.29 0.431 0.567 0.698 0.821 0.93 1.022 1.184 1.256 1.324 1.337 1.521 1.579 1.703 1.814 1.919 1.975 2.08 2.181 2.34 2.439 2.524 2.648 2.786 2.925 3.058 3.192 3.368 3.526 3.681 3.878 4.072 4.265 4.476 4.719 4.96 5.211 5.485 5.775 6.082 6.448 6.882 7.347 7.904 8.498 9.186 9.952 10.831 11.855 13.129 14.197 14.79 15.127 15.298 15.361 15.395 15.419 15.41 15.383 15.343 15.304 15.267 15.209 15.152 15.11 15.067 15.016 14.958 14.885 14.805 14.728 14.65 14.589 14.535 14.482 14.43 14.363 14.296 14.244 14.192 14.134 14.091 14.039 14.013 13.948 13.871 13.779 13.728 13.567 13.572 13.509 13.449 13.342 13.274 13.207 13.145 13.058 12.958 12.829 12.65 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5m.txt deleted file mode 100644 index 0b85522b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15499 ,KEBNE ,17043821,Thu Dec 23 05:30:07 CET,Thu Dec 23 07:00:46 CET,0.0 0.612 0.824 0.981 1.115 1.222 1.322 1.42 1.574 1.66 1.758 1.803 2.005 2.088 2.234 2.355 2.468 2.524 2.63 2.738 2.903 3.004 3.103 3.236 3.358 3.496 3.647 3.781 3.953 4.125 4.282 4.474 4.65 4.815 5.004 5.195 5.382 5.6 5.812 6.04 6.283 6.544 6.85 7.125 7.457 7.844 8.259 8.689 9.11 9.513 9.807 9.817 9.699 9.507 9.329 9.135 8.93 8.736 8.548 8.356 8.193 8.045 7.899 7.751 7.623 7.52 7.391 7.258 7.126 6.983 6.869 6.793 6.714 6.62 6.544 6.47 6.377 6.263 6.16 6.098 6.028 5.917 5.84 5.761 5.718 5.614 5.496 5.382 5.334 5.168 5.203 5.16 5.097 4.947 4.882 4.817 4.742 4.65 4.527 4.39 4.192 -2 ,7409 ,KEBNE ,17043822,Thu Dec 23 05:30:07 CET,Thu Dec 23 07:01:11 CET,0.0 0.346 0.521 0.686 0.808 0.908 1.016 1.126 1.312 1.4 1.5 1.558 1.753 1.832 1.997 2.127 2.246 2.301 2.416 2.547 2.715 2.809 2.907 3.039 3.157 3.283 3.413 3.545 3.706 3.853 3.994 4.15 4.291 4.441 4.62 4.824 5.011 5.216 5.458 5.706 5.948 6.239 6.569 6.827 7.121 7.462 7.879 8.325 8.734 9.171 9.618 9.801 9.753 9.604 9.408 9.211 9.011 8.806 8.627 8.446 8.267 8.103 7.963 7.826 7.674 7.54 7.411 7.294 7.202 7.105 7.001 6.908 6.81 6.72 6.645 6.541 6.434 6.323 6.217 6.16 6.099 6.012 5.95 5.873 5.836 5.763 5.686 5.599 5.555 5.385 5.39 5.335 5.277 5.138 5.075 5.022 4.959 4.885 4.817 4.734 4.477 -3 ,28442 ,KEBNE ,17043823,Thu Dec 23 05:32:11 CET,Thu Dec 23 07:02:08 CET,0.0 0.362 0.556 0.711 0.862 0.983 1.077 1.182 1.409 1.512 1.601 1.624 1.822 1.896 2.016 2.128 2.252 2.316 2.431 2.547 2.73 2.837 2.928 3.065 3.209 3.345 3.468 3.584 3.732 3.887 4.041 4.226 4.395 4.545 4.723 4.929 5.121 5.335 5.575 5.826 6.085 6.377 6.702 7.0 7.373 7.798 8.247 8.724 9.25 9.784 10.279 10.522 10.484 10.346 10.183 10.003 9.814 9.643 9.492 9.34 9.186 9.044 8.928 8.814 8.706 8.6 8.5 8.404 8.31 8.207 8.098 8.014 7.934 7.854 7.79 7.717 7.639 7.551 7.456 7.39 7.319 7.203 7.133 7.071 7.037 6.958 6.861 6.765 6.715 6.538 6.536 6.471 6.407 6.285 6.226 6.151 6.064 5.983 5.882 5.746 5.559 -4 ,6910 ,KEBNE ,17043824,Thu Dec 23 05:32:11 CET,Thu Dec 23 07:01:54 CET,0.0 0.335 0.545 0.711 0.841 0.946 1.056 1.164 1.322 1.395 1.475 1.491 1.672 1.732 1.868 2.014 2.163 2.235 2.37 2.493 2.678 2.803 2.928 3.101 3.251 3.397 3.532 3.668 3.855 4.036 4.199 4.39 4.566 4.747 4.97 5.2 5.409 5.632 5.876 6.121 6.382 6.675 6.999 7.332 7.717 8.085 8.464 8.855 9.247 9.655 10.068 10.15 10.027 9.849 9.614 9.397 9.224 9.066 8.9 8.712 8.529 8.364 8.22 8.062 7.896 7.752 7.613 7.487 7.371 7.25 7.129 7.032 6.937 6.83 6.731 6.626 6.534 6.448 6.364 6.301 6.233 6.132 6.059 5.98 5.94 5.869 5.791 5.696 5.648 5.48 5.49 5.434 5.381 5.248 5.176 5.099 5.005 4.912 4.822 4.723 4.544 -5 ,1150 ,KEBNE ,17043825,Thu Dec 23 05:32:11 CET,Thu Dec 23 07:03:03 CET,0.0 0.274 0.427 0.536 0.665 0.803 0.926 1.025 1.216 1.307 1.382 1.385 1.578 1.655 1.789 1.905 2.023 2.078 2.183 2.3 2.475 2.565 2.653 2.775 2.887 3.019 3.152 3.274 3.423 3.567 3.721 3.894 4.042 4.19 4.366 4.558 4.754 4.973 5.191 5.417 5.645 5.908 6.222 6.529 6.884 7.259 7.667 8.104 8.535 8.953 9.418 9.637 9.54 9.395 9.252 9.088 8.913 8.747 8.573 8.343 8.156 8.025 7.903 7.758 7.618 7.501 7.376 7.267 7.177 7.083 6.957 6.852 6.759 6.663 6.58 6.477 6.373 6.272 6.182 6.128 6.068 5.959 5.884 5.816 5.779 5.698 5.614 5.529 5.489 5.322 5.358 5.304 5.24 5.128 5.061 4.987 4.914 4.834 4.735 4.629 4.355 -6 ,7840 ,KEBNE ,17043826,Thu Dec 23 05:32:11 CET,Thu Dec 23 07:02:22 CET,0.0 0.542 0.795 0.957 1.095 1.226 1.354 1.477 1.682 1.776 1.871 1.932 2.146 2.229 2.392 2.543 2.668 2.725 2.856 2.981 3.145 3.243 3.335 3.478 3.612 3.747 3.893 4.03 4.189 4.331 4.476 4.669 4.863 5.065 5.277 5.484 5.678 5.879 6.096 6.344 6.604 6.865 7.154 7.458 7.831 8.217 8.627 9.032 9.412 9.86 10.254 10.312 10.165 9.994 9.837 9.638 9.45 9.277 9.113 8.929 8.771 8.638 8.505 8.361 8.217 8.06 7.909 7.783 7.662 7.554 7.438 7.329 7.232 7.153 7.082 7.006 6.931 6.851 6.757 6.685 6.612 6.497 6.422 6.343 6.3 6.211 6.119 6.029 5.986 5.822 5.854 5.796 5.72 5.561 5.485 5.409 5.33 5.239 5.161 5.085 4.846 -7 ,4895 ,KEBNE ,17043827,Thu Dec 23 05:32:11 CET,Thu Dec 23 07:01:23 CET,0.0 0.55 0.76 0.938 1.079 1.213 1.325 1.42 1.576 1.658 1.747 1.789 1.986 2.052 2.178 2.301 2.413 2.475 2.6 2.72 2.915 3.04 3.141 3.281 3.418 3.528 3.647 3.774 3.923 4.073 4.221 4.421 4.599 4.739 4.932 5.189 5.427 5.652 5.893 6.171 6.467 6.771 7.099 7.426 7.772 8.102 8.485 8.923 9.397 9.867 10.273 10.422 10.317 10.144 9.967 9.798 9.638 9.403 9.174 8.972 8.803 8.662 8.52 8.381 8.243 8.115 7.984 7.863 7.738 7.613 7.487 7.372 7.253 7.127 7.03 6.946 6.874 6.791 6.7 6.635 6.561 6.451 6.367 6.277 6.239 6.159 6.06 5.951 5.895 5.719 5.714 5.646 5.58 5.413 5.323 5.242 5.162 5.072 4.905 4.705 4.426 -8 ,15678 ,KEBNE ,17043828,Thu Dec 23 05:32:12 CET,Thu Dec 23 07:01:58 CET,0.0 0.534 0.699 0.854 1.003 1.131 1.242 1.345 1.521 1.597 1.668 1.679 1.86 1.918 2.053 2.183 2.296 2.355 2.452 2.535 2.666 2.759 2.86 3.012 3.159 3.291 3.411 3.542 3.716 3.878 4.037 4.222 4.405 4.572 4.747 4.946 5.135 5.329 5.525 5.741 5.997 6.292 6.603 6.897 7.249 7.666 8.114 8.592 9.114 9.592 10.01 10.15 10.099 9.926 9.673 9.449 9.233 9.017 8.83 8.61 8.409 8.242 8.104 7.971 7.851 7.741 7.621 7.507 7.385 7.258 7.137 7.036 6.938 6.839 6.758 6.68 6.604 6.514 6.419 6.36 6.296 6.194 6.117 6.039 6.009 5.936 5.851 5.779 5.736 5.572 5.624 5.587 5.533 5.397 5.318 5.247 5.188 5.118 5.008 4.824 4.627 -9 ,7832 ,KEBNE ,17043829,Thu Dec 23 05:32:12 CET,Thu Dec 23 07:02:11 CET,0.0 0.392 0.631 0.8 0.916 1.0 1.095 1.201 1.383 1.468 1.561 1.62 1.823 1.899 2.058 2.198 2.309 2.364 2.469 2.572 2.721 2.809 2.892 3.017 3.147 3.275 3.403 3.524 3.662 3.812 3.963 4.145 4.321 4.481 4.685 4.939 5.178 5.431 5.7 5.971 6.255 6.576 6.951 7.328 7.718 8.048 8.442 8.927 9.377 9.803 10.2 10.353 10.272 10.132 9.947 9.703 9.475 9.299 9.126 8.914 8.733 8.58 8.435 8.282 8.15 8.026 7.888 7.749 7.633 7.527 7.417 7.309 7.198 7.098 7.016 6.928 6.84 6.744 6.64 6.567 6.496 6.401 6.321 6.228 6.182 6.086 5.995 5.911 5.862 5.688 5.712 5.665 5.615 5.496 5.424 5.349 5.288 5.222 5.139 5.053 4.874 -10 ,14610 ,KEBNE ,17043830,Thu Dec 23 05:32:11 CET,Thu Dec 23 07:03:23 CET,0.0 0.422 0.599 0.726 0.833 0.96 1.085 1.195 1.382 1.466 1.552 1.608 1.822 1.908 2.07 2.2 2.325 2.392 2.528 2.652 2.811 2.9 2.985 3.132 3.293 3.437 3.572 3.703 3.872 4.023 4.165 4.373 4.562 4.731 4.932 5.143 5.324 5.519 5.758 6.008 6.256 6.522 6.808 7.109 7.49 7.91 8.353 8.774 9.221 9.741 10.204 10.292 10.168 9.984 9.809 9.629 9.433 9.234 9.053 8.885 8.722 8.559 8.398 8.256 8.123 7.991 7.855 7.737 7.637 7.515 7.393 7.306 7.215 7.115 7.027 6.921 6.824 6.739 6.643 6.576 6.501 6.388 6.311 6.222 6.178 6.083 5.978 5.889 5.851 5.678 5.686 5.628 5.569 5.434 5.359 5.291 5.218 5.132 5.02 4.874 4.581 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5b.txt deleted file mode 100644 index fc2594aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4712 ,KEBNE ,16678749,Thu Nov 25 04:00:55 CET,Thu Nov 25 05:27:30 CET,0.0 0.15 0.297 0.42 0.511 0.601 0.676 0.747 0.897 0.973 1.052 1.101 1.282 1.349 1.487 1.623 1.746 1.809 1.932 2.05 2.214 2.305 2.388 2.505 2.629 2.754 2.867 2.975 3.114 3.257 3.409 3.605 3.783 3.96 4.183 4.418 4.645 4.912 5.205 5.523 5.857 6.206 6.604 7.006 7.455 7.943 8.541 9.298 10.148 11.088 12.134 12.764 13.052 13.235 13.348 13.397 13.404 13.387 13.352 13.284 13.218 13.138 13.02 12.907 12.805 12.708 12.612 12.527 12.449 12.365 12.268 12.196 12.105 12.004 11.933 11.852 11.773 11.693 11.619 11.572 11.513 11.416 11.347 11.275 11.24 11.166 11.094 11.018 10.974 10.833 10.831 10.769 10.709 10.572 10.495 10.419 10.344 10.251 10.121 9.986 9.751 -2 ,28880 ,KEBNE ,16678750,Thu Nov 25 04:01:54 CET,Thu Nov 25 05:32:00 CET,0.0 0.232 0.345 0.466 0.587 0.693 0.794 0.896 1.077 1.161 1.232 1.25 1.426 1.488 1.605 1.718 1.82 1.879 2.003 2.101 2.257 2.362 2.455 2.597 2.743 2.882 3.006 3.127 3.292 3.471 3.653 3.877 4.086 4.268 4.48 4.737 4.978 5.228 5.486 5.766 6.077 6.436 6.842 7.246 7.723 8.231 8.83 9.486 10.213 11.04 11.989 12.704 13.044 13.172 13.211 13.22 13.186 13.148 13.104 13.01 12.891 12.769 12.649 12.544 12.446 12.345 12.231 12.138 12.06 11.974 11.883 11.799 11.695 11.581 11.508 11.425 11.331 11.237 11.138 11.071 10.991 10.874 10.801 10.725 10.685 10.6 10.522 10.447 10.401 10.237 10.217 10.162 10.105 10.001 9.946 9.881 9.804 9.685 9.548 9.401 8.96 -3 ,17565 ,KEBNE ,16678751,Thu Nov 25 04:01:54 CET,Thu Nov 25 05:33:19 CET,0.0 0.179 0.318 0.42 0.499 0.576 0.651 0.711 0.833 0.907 0.981 0.989 1.146 1.2 1.299 1.39 1.49 1.545 1.649 1.755 1.921 2.013 2.099 2.23 2.366 2.507 2.631 2.744 2.916 3.082 3.226 3.386 3.552 3.726 3.931 4.148 4.346 4.564 4.793 5.046 5.315 5.613 5.971 6.334 6.75 7.222 7.751 8.338 9.076 9.934 10.859 11.537 11.885 12.07 12.167 12.192 12.145 12.101 12.068 12.003 11.934 11.852 11.776 11.711 11.634 11.562 11.464 11.353 11.262 11.163 11.07 10.991 10.895 10.8 10.734 10.675 10.615 10.545 10.476 10.43 10.367 10.246 10.162 10.075 10.028 9.934 9.85 9.778 9.739 9.599 9.611 9.561 9.511 9.407 9.342 9.283 9.219 9.127 9.034 8.953 8.804 -4 ,25741 ,KEBNE ,16678752,Thu Nov 25 04:01:54 CET,Thu Nov 25 05:33:57 CET,0.0 0.191 0.334 0.445 0.543 0.661 0.767 0.855 1.022 1.108 1.185 1.188 1.354 1.408 1.509 1.618 1.734 1.787 1.869 1.955 2.098 2.193 2.288 2.452 2.61 2.754 2.898 3.037 3.206 3.358 3.521 3.741 3.945 4.124 4.31 4.529 4.75 4.991 5.245 5.527 5.834 6.157 6.566 7.017 7.498 8.002 8.575 9.189 9.899 10.745 11.717 12.418 12.754 12.886 12.891 12.872 12.855 12.812 12.745 12.637 12.547 12.444 12.321 12.203 12.101 12.006 11.901 11.816 11.738 11.657 11.576 11.509 11.44 11.362 11.297 11.242 11.173 11.083 10.981 10.905 10.837 10.739 10.666 10.581 10.54 10.46 10.373 10.277 10.22 10.058 10.047 9.993 9.926 9.783 9.718 9.643 9.549 9.454 9.347 9.221 9.012 -5 ,31746 ,KEBNE ,16678753,Thu Nov 25 04:05:01 CET,Thu Nov 25 05:36:07 CET,0.0 0.297 0.457 0.585 0.681 0.775 0.869 0.961 1.132 1.2 1.254 1.28 1.457 1.523 1.65 1.769 1.866 1.916 2.025 2.14 2.312 2.416 2.51 2.63 2.744 2.863 2.982 3.1 3.253 3.405 3.544 3.73 3.947 4.158 4.386 4.624 4.842 5.089 5.357 5.63 5.954 6.326 6.743 7.184 7.648 8.112 8.655 9.271 9.978 10.841 11.889 12.674 13.05 13.229 13.327 13.368 13.328 13.255 13.189 13.088 12.996 12.923 12.821 12.693 12.563 12.451 12.315 12.186 12.102 12.026 11.939 11.865 11.784 11.685 11.607 11.517 11.419 11.333 11.246 11.188 11.128 11.015 10.94 10.872 10.84 10.777 10.7 10.611 10.562 10.408 10.404 10.338 10.257 10.111 10.038 9.965 9.9 9.834 9.738 9.631 9.458 -6 ,8074 ,KEBNE ,16678754,Thu Nov 25 04:05:01 CET,Thu Nov 25 05:35:03 CET,0.0 0.182 0.302 0.427 0.518 0.579 0.654 0.74 0.898 0.971 1.037 1.05 1.219 1.269 1.359 1.45 1.557 1.615 1.733 1.846 2.0 2.099 2.2 2.355 2.502 2.64 2.774 2.9 3.066 3.239 3.394 3.565 3.737 3.902 4.1 4.342 4.596 4.878 5.159 5.468 5.784 6.134 6.565 6.973 7.448 7.985 8.583 9.255 10.018 10.854 11.886 12.699 13.068 13.232 13.288 13.24 13.173 13.124 13.07 12.994 12.921 12.816 12.702 12.623 12.527 12.426 12.312 12.22 12.148 12.073 11.989 11.901 11.817 11.743 11.691 11.63 11.561 11.486 11.405 11.35 11.295 11.198 11.119 11.047 11.011 10.931 10.857 10.773 10.728 10.595 10.595 10.541 10.49 10.394 10.332 10.252 10.147 10.044 9.952 9.853 9.585 -7 ,9746 ,KEBNE ,16678755,Thu Nov 25 04:05:01 CET,Thu Nov 25 05:36:58 CET,0.0 0.164 0.284 0.406 0.509 0.599 0.689 0.774 0.917 0.978 1.032 1.029 1.2 1.259 1.369 1.493 1.614 1.668 1.772 1.877 2.029 2.126 2.225 2.387 2.55 2.688 2.819 2.939 3.083 3.241 3.387 3.571 3.781 3.971 4.166 4.384 4.614 4.875 5.14 5.419 5.729 6.074 6.458 6.852 7.357 7.918 8.501 9.152 9.898 10.778 11.828 12.648 13.082 13.332 13.42 13.404 13.346 13.271 13.182 13.071 12.963 12.848 12.738 12.658 12.589 12.521 12.446 12.366 12.297 12.236 12.164 12.091 12.005 11.903 11.824 11.75 11.671 11.598 11.523 11.465 11.393 11.271 11.186 11.09 11.042 10.957 10.866 10.769 10.72 10.569 10.562 10.501 10.439 10.326 10.258 10.183 10.109 10.037 9.933 9.807 9.558 -8 ,19622 ,KEBNE ,16678756,Thu Nov 25 04:06:03 CET,Thu Nov 25 05:36:24 CET,0.0 0.197 0.319 0.455 0.563 0.649 0.749 0.844 1.003 1.077 1.136 1.147 1.315 1.372 1.487 1.592 1.695 1.754 1.865 1.957 2.093 2.186 2.287 2.447 2.601 2.733 2.854 2.975 3.145 3.317 3.487 3.695 3.894 4.092 4.334 4.612 4.852 5.093 5.367 5.656 5.933 6.233 6.605 6.986 7.44 7.967 8.559 9.217 9.986 10.849 11.823 12.578 12.981 13.157 13.204 13.183 13.137 13.112 13.079 13.015 12.944 12.857 12.762 12.656 12.535 12.414 12.28 12.161 12.074 11.984 11.882 11.811 11.748 11.676 11.61 11.541 11.462 11.374 11.289 11.235 11.189 11.117 11.054 10.985 10.944 10.855 10.777 10.68 10.622 10.473 10.469 10.405 10.344 10.207 10.127 10.03 9.932 9.833 9.713 9.573 9.349 -9 ,8227 ,KEBNE ,16678757,Thu Nov 25 04:06:03 CET,Thu Nov 25 05:36:16 CET,0.0 0.216 0.367 0.482 0.561 0.626 0.704 0.782 0.923 0.994 1.063 1.073 1.239 1.301 1.418 1.533 1.661 1.718 1.816 1.912 2.056 2.152 2.255 2.41 2.56 2.703 2.836 2.951 3.092 3.23 3.387 3.592 3.774 3.962 4.177 4.405 4.631 4.879 5.16 5.49 5.833 6.197 6.617 7.044 7.512 8.044 8.653 9.258 9.996 10.937 12.024 12.89 13.322 13.502 13.559 13.561 13.506 13.436 13.368 13.262 13.177 13.105 12.98 12.866 12.791 12.713 12.631 12.555 12.481 12.406 12.332 12.255 12.171 12.086 12.017 11.953 11.886 11.801 11.714 11.662 11.603 11.488 11.408 11.318 11.273 11.191 11.119 11.053 11.007 10.851 10.828 10.77 10.717 10.59 10.505 10.431 10.369 10.29 10.197 10.095 9.968 -10 ,3278 ,KEBNE ,16678758,Thu Nov 25 04:06:03 CET,Thu Nov 25 05:35:41 CET,0.0 0.161 0.29 0.414 0.519 0.604 0.688 0.773 0.915 0.976 1.032 1.027 1.193 1.244 1.342 1.457 1.575 1.63 1.741 1.847 1.983 2.073 2.171 2.307 2.417 2.543 2.686 2.813 2.96 3.099 3.26 3.465 3.63 3.8 4.0 4.203 4.401 4.624 4.877 5.146 5.452 5.793 6.169 6.54 6.956 7.437 7.97 8.563 9.314 10.212 11.224 11.966 12.361 12.557 12.639 12.677 12.683 12.676 12.624 12.524 12.461 12.404 12.319 12.231 12.14 12.051 11.936 11.84 11.761 11.667 11.57 11.484 11.404 11.329 11.266 11.19 11.099 10.973 10.853 10.799 10.744 10.651 10.584 10.522 10.488 10.415 10.337 10.248 10.194 10.033 10.024 9.976 9.923 9.813 9.752 9.682 9.6 9.507 9.4 9.244 8.946 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5f.txt deleted file mode 100644 index 420f8560..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9488 ,KEBNE ,16678759,Thu Nov 25 04:06:03 CET,Thu Nov 25 05:35:57 CET,0.0 0.155 0.237 0.297 0.367 0.442 0.53 0.614 0.712 0.761 0.82 0.828 0.991 1.049 1.154 1.24 1.34 1.391 1.491 1.576 1.7 1.78 1.841 1.923 2.004 2.093 2.189 2.285 2.413 2.534 2.644 2.783 2.911 3.027 3.156 3.287 3.42 3.559 3.698 3.891 4.11 4.313 4.493 4.647 4.838 5.041 5.245 5.458 5.674 5.755 5.578 5.172 4.69 4.258 3.912 3.557 3.224 2.909 2.586 2.253 1.977 1.726 1.495 1.277 1.056 0.861 0.671 0.502 0.343 0.177 0.024 -0.103 -0.248 -0.406 -0.523 -0.642 -0.76 -0.885 -1.009 -1.091 -1.188 -1.339 -1.436 -1.536 -1.584 -1.677 -1.773 -1.898 -1.965 -2.143 -2.167 -2.232 -2.303 -2.465 -2.546 -2.632 -2.716 -2.815 -2.929 -3.068 -3.481 -2 ,2784 ,KEBNE ,16678760,Thu Nov 25 04:06:03 CET,Thu Nov 25 05:36:26 CET,0.0 0.297 0.454 0.563 0.643 0.716 0.807 0.904 1.071 1.151 1.218 1.222 1.383 1.424 1.515 1.618 1.713 1.759 1.841 1.928 2.047 2.104 2.172 2.284 2.376 2.466 2.551 2.622 2.718 2.816 2.916 3.055 3.184 3.304 3.433 3.561 3.678 3.812 3.968 4.133 4.305 4.504 4.718 4.911 5.131 5.346 5.525 5.668 5.842 5.939 5.757 5.333 4.888 4.479 4.071 3.68 3.329 3.003 2.712 2.415 2.177 1.952 1.736 1.541 1.362 1.2 1.035 0.9 0.778 0.616 0.451 0.329 0.197 0.06 -0.061 -0.189 -0.305 -0.415 -0.531 -0.606 -0.675 -0.786 -0.866 -0.95 -0.993 -1.079 -1.188 -1.312 -1.364 -1.523 -1.533 -1.586 -1.641 -1.782 -1.87 -1.963 -2.044 -2.146 -2.279 -2.405 -2.656 -3 ,28892 ,KEBNE ,16678761,Thu Nov 25 04:06:03 CET,Thu Nov 25 05:40:45 CET,0.0 0.168 0.316 0.403 0.474 0.555 0.642 0.719 0.849 0.918 0.982 0.968 1.124 1.177 1.283 1.364 1.43 1.466 1.551 1.628 1.728 1.808 1.887 1.987 2.099 2.212 2.306 2.395 2.506 2.602 2.695 2.809 2.92 3.026 3.154 3.289 3.41 3.535 3.672 3.818 3.959 4.141 4.35 4.525 4.71 4.909 5.127 5.351 5.502 5.504 5.301 4.819 4.32 3.854 3.439 3.018 2.578 2.199 1.922 1.666 1.442 1.218 0.983 0.763 0.564 0.364 0.158 -0.016 -0.171 -0.342 -0.508 -0.639 -0.775 -0.911 -1.027 -1.134 -1.24 -1.363 -1.486 -1.581 -1.694 -1.848 -1.937 -2.035 -2.089 -2.191 -2.291 -2.399 -2.456 -2.632 -2.655 -2.717 -2.791 -2.944 -3.018 -3.098 -3.178 -3.266 -3.354 -3.46 -3.61 -4 ,19598 ,KEBNE ,16678762,Thu Nov 25 04:07:05 CET,Thu Nov 25 05:41:17 CET,0.0 0.297 0.431 0.534 0.617 0.687 0.755 0.827 0.992 1.068 1.124 1.128 1.3 1.363 1.471 1.55 1.622 1.657 1.726 1.803 1.92 1.992 2.063 2.167 2.269 2.365 2.454 2.554 2.685 2.805 2.901 2.989 3.099 3.219 3.34 3.467 3.577 3.7 3.836 3.993 4.176 4.368 4.568 4.778 5.029 5.297 5.544 5.757 5.924 5.993 5.898 5.569 5.164 4.743 4.351 3.975 3.675 3.399 3.132 2.873 2.642 2.442 2.264 2.071 1.891 1.734 1.543 1.339 1.168 1.004 0.84 0.709 0.566 0.411 0.296 0.172 0.04 -0.095 -0.244 -0.34 -0.437 -0.578 -0.68 -0.805 -0.863 -0.992 -1.137 -1.259 -1.315 -1.482 -1.512 -1.604 -1.706 -1.9 -1.986 -2.097 -2.211 -2.327 -2.463 -2.583 -2.916 -5 ,16757 ,KEBNE ,16678763,Thu Nov 25 04:08:06 CET,Thu Nov 25 05:38:27 CET,0.0 0.219 0.32 0.405 0.484 0.558 0.624 0.686 0.812 0.866 0.916 0.908 1.065 1.122 1.228 1.311 1.392 1.432 1.512 1.582 1.682 1.752 1.817 1.91 2.002 2.079 2.164 2.268 2.398 2.507 2.605 2.725 2.841 2.951 3.075 3.198 3.295 3.433 3.585 3.708 3.843 4.012 4.21 4.414 4.643 4.855 5.085 5.28 5.436 5.496 5.343 4.891 4.384 3.908 3.427 3.003 2.648 2.322 2.031 1.72 1.448 1.223 1.031 0.85 0.669 0.508 0.346 0.201 0.068 -0.088 -0.246 -0.377 -0.514 -0.656 -0.777 -0.894 -1.003 -1.124 -1.262 -1.351 -1.434 -1.555 -1.64 -1.742 -1.795 -1.911 -2.03 -2.138 -2.197 -2.366 -2.377 -2.447 -2.52 -2.659 -2.725 -2.792 -2.873 -2.956 -3.043 -3.164 -3.498 -6 ,25713 ,KEBNE ,16678764,Thu Nov 25 04:09:11 CET,Thu Nov 25 05:39:43 CET,0.0 0.223 0.366 0.484 0.589 0.674 0.753 0.826 0.969 1.04 1.11 1.13 1.303 1.361 1.469 1.557 1.648 1.692 1.764 1.827 1.921 1.998 2.081 2.193 2.29 2.371 2.441 2.513 2.604 2.692 2.798 2.928 3.047 3.166 3.307 3.464 3.611 3.758 3.902 4.037 4.158 4.307 4.479 4.649 4.825 5.012 5.253 5.443 5.582 5.655 5.492 5.062 4.56 4.081 3.669 3.296 2.953 2.613 2.324 2.052 1.795 1.554 1.336 1.138 0.959 0.789 0.605 0.435 0.291 0.151 0.0 -0.125 -0.256 -0.396 -0.504 -0.617 -0.726 -0.84 -0.962 -1.047 -1.147 -1.305 -1.41 -1.516 -1.568 -1.672 -1.789 -1.915 -1.968 -2.136 -2.157 -2.23 -2.299 -2.42 -2.493 -2.586 -2.701 -2.814 -2.946 -3.092 -3.276 -7 ,8483 ,KEBNE ,16678765,Thu Nov 25 04:09:08 CET,Thu Nov 25 05:43:37 CET,0.0 0.177 0.324 0.422 0.505 0.59 0.674 0.749 0.89 0.951 1.001 0.982 1.146 1.199 1.297 1.391 1.478 1.514 1.582 1.649 1.761 1.849 1.94 2.06 2.158 2.247 2.334 2.422 2.542 2.655 2.756 2.894 3.019 3.12 3.252 3.4 3.525 3.649 3.78 3.909 4.039 4.195 4.377 4.546 4.733 4.907 5.052 5.209 5.364 5.4 5.246 4.928 4.514 4.07 3.68 3.345 2.976 2.604 2.292 1.982 1.734 1.504 1.276 1.048 0.834 0.658 0.47 0.299 0.159 0.018 -0.139 -0.257 -0.356 -0.482 -0.597 -0.71 -0.813 -0.916 -1.038 -1.122 -1.204 -1.342 -1.43 -1.525 -1.576 -1.672 -1.76 -1.871 -1.939 -2.116 -2.122 -2.181 -2.259 -2.42 -2.493 -2.585 -2.698 -2.815 -2.946 -3.097 -3.352 -8 ,10803 ,KEBNE ,16678766,Thu Nov 25 04:10:10 CET,Thu Nov 25 05:39:06 CET,0.0 0.33 0.49 0.607 0.718 0.812 0.887 0.96 1.1 1.164 1.227 1.244 1.402 1.441 1.525 1.609 1.695 1.734 1.807 1.884 2.0 2.074 2.134 2.217 2.301 2.391 2.485 2.564 2.666 2.76 2.85 2.969 3.1 3.226 3.362 3.526 3.672 3.809 3.947 4.104 4.279 4.445 4.608 4.781 4.968 5.151 5.336 5.501 5.648 5.711 5.543 5.121 4.702 4.287 3.891 3.532 3.207 2.899 2.576 2.247 1.999 1.76 1.54 1.329 1.125 0.934 0.74 0.596 0.474 0.311 0.124 0.002 -0.113 -0.267 -0.401 -0.534 -0.664 -0.796 -0.933 -1.029 -1.133 -1.282 -1.364 -1.454 -1.509 -1.619 -1.723 -1.824 -1.881 -2.057 -2.083 -2.15 -2.219 -2.387 -2.499 -2.612 -2.716 -2.824 -2.928 -3.053 -3.23 -9 ,9943 ,KEBNE ,16678767,Thu Nov 25 04:10:10 CET,Thu Nov 25 05:40:24 CET,0.0 0.207 0.318 0.432 0.55 0.66 0.731 0.781 0.888 0.943 1.004 1.02 1.193 1.252 1.35 1.432 1.5 1.536 1.623 1.704 1.799 1.858 1.927 2.034 2.117 2.178 2.244 2.322 2.437 2.551 2.648 2.76 2.884 3.015 3.153 3.311 3.458 3.599 3.734 3.879 4.05 4.247 4.499 4.718 4.972 5.244 5.46 5.656 5.815 5.905 5.789 5.403 4.948 4.511 4.118 3.758 3.439 3.143 2.888 2.634 2.401 2.198 2.023 1.818 1.595 1.41 1.228 1.058 0.909 0.763 0.61 0.48 0.346 0.197 0.089 -0.016 -0.118 -0.219 -0.324 -0.391 -0.471 -0.618 -0.711 -0.793 -0.832 -0.909 -1.005 -1.127 -1.189 -1.363 -1.381 -1.45 -1.521 -1.676 -1.758 -1.845 -1.938 -2.053 -2.181 -2.321 -2.492 -10 ,11576 ,KEBNE ,16678768,Thu Nov 25 04:11:13 CET,Thu Nov 25 05:42:30 CET,0.0 0.172 0.272 0.37 0.471 0.55 0.62 0.689 0.799 0.844 0.894 0.911 1.075 1.123 1.223 1.317 1.411 1.465 1.559 1.647 1.77 1.837 1.906 2.015 2.12 2.211 2.29 2.377 2.498 2.614 2.712 2.811 2.902 2.998 3.134 3.279 3.4 3.54 3.68 3.81 3.941 4.084 4.246 4.426 4.629 4.844 5.093 5.317 5.5 5.602 5.506 5.115 4.667 4.266 3.886 3.499 3.163 2.847 2.561 2.29 2.044 1.794 1.554 1.36 1.175 0.985 0.775 0.604 0.474 0.332 0.173 0.03 -0.125 -0.28 -0.391 -0.516 -0.641 -0.755 -0.878 -0.957 -1.041 -1.174 -1.267 -1.376 -1.437 -1.546 -1.652 -1.769 -1.831 -2.014 -2.044 -2.11 -2.176 -2.328 -2.419 -2.509 -2.592 -2.673 -2.801 -2.955 -3.256 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5j.txt deleted file mode 100644 index 2bf61c49..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21309 ,KEBNE ,16678769,Thu Nov 25 04:11:13 CET,Thu Nov 25 05:41:32 CET,0.0 0.262 0.442 0.578 0.699 0.801 0.899 0.981 1.106 1.173 1.247 1.274 1.447 1.504 1.602 1.706 1.813 1.867 1.982 2.096 2.264 2.375 2.475 2.616 2.748 2.869 2.995 3.113 3.258 3.398 3.522 3.65 3.779 3.933 4.112 4.296 4.472 4.658 4.868 5.101 5.333 5.578 5.871 6.162 6.511 6.935 7.405 7.889 8.448 9.047 9.505 9.686 9.705 9.607 9.438 9.218 9.021 8.847 8.697 8.539 8.375 8.215 8.049 7.887 7.735 7.603 7.451 7.305 7.198 7.07 6.927 6.834 6.746 6.647 6.557 6.468 6.376 6.27 6.17 6.092 6.005 5.877 5.787 5.698 5.652 5.554 5.466 5.366 5.302 5.136 5.111 5.038 4.966 4.819 4.741 4.645 4.541 4.435 4.314 4.14 3.794 -2 ,3923 ,KEBNE ,16678770,Thu Nov 25 04:13:16 CET,Thu Nov 25 05:43:53 CET,0.0 0.137 0.271 0.393 0.509 0.61 0.701 0.787 0.934 1.012 1.096 1.129 1.307 1.376 1.51 1.624 1.724 1.775 1.883 1.988 2.136 2.234 2.328 2.475 2.624 2.76 2.89 3.011 3.162 3.312 3.461 3.641 3.8 3.949 4.129 4.322 4.506 4.726 4.962 5.185 5.426 5.713 6.036 6.375 6.774 7.155 7.552 7.999 8.495 8.994 9.355 9.542 9.579 9.468 9.327 9.113 8.87 8.685 8.512 8.335 8.178 8.021 7.871 7.729 7.587 7.462 7.338 7.218 7.119 6.993 6.849 6.742 6.633 6.536 6.457 6.367 6.275 6.175 6.07 6.003 5.944 5.849 5.766 5.686 5.649 5.564 5.479 5.378 5.316 5.143 5.12 5.056 4.984 4.838 4.764 4.688 4.606 4.52 4.441 4.346 4.159 -3 ,5354 ,KEBNE ,16678771,Thu Nov 25 04:13:16 CET,Thu Nov 25 05:44:04 CET,0.0 0.269 0.441 0.567 0.656 0.749 0.853 0.948 1.157 1.255 1.326 1.362 1.545 1.622 1.765 1.892 2.015 2.067 2.177 2.287 2.438 2.54 2.632 2.752 2.879 3.019 3.161 3.286 3.433 3.578 3.725 3.911 4.099 4.286 4.487 4.716 4.949 5.206 5.476 5.744 6.0 6.254 6.582 6.914 7.272 7.714 8.222 8.807 9.464 10.054 10.635 10.981 10.989 10.882 10.767 10.592 10.395 10.233 10.096 9.944 9.799 9.631 9.457 9.312 9.178 9.054 8.926 8.817 8.721 8.61 8.49 8.385 8.282 8.17 8.078 7.977 7.871 7.769 7.659 7.591 7.521 7.411 7.333 7.255 7.218 7.147 7.06 6.958 6.904 6.743 6.718 6.662 6.6 6.44 6.361 6.273 6.163 6.061 5.987 5.881 5.564 -4 ,31317 ,KEBNE ,16678772,Thu Nov 25 04:14:19 CET,Thu Nov 25 05:44:43 CET,0.0 0.71 0.878 1.007 1.105 1.188 1.263 1.339 1.482 1.559 1.636 1.679 1.854 1.908 2.023 2.147 2.268 2.322 2.418 2.508 2.646 2.735 2.823 2.951 3.065 3.183 3.306 3.413 3.545 3.678 3.819 3.997 4.169 4.344 4.521 4.698 4.87 5.068 5.295 5.542 5.819 6.149 6.519 6.877 7.275 7.67 8.091 8.527 9.01 9.523 10.043 10.349 10.34 10.201 10.019 9.841 9.682 9.5 9.35 9.212 9.061 8.888 8.718 8.575 8.449 8.325 8.186 8.074 7.976 7.856 7.72 7.619 7.528 7.431 7.347 7.269 7.197 7.11 7.015 6.951 6.886 6.763 6.678 6.589 6.537 6.442 6.364 6.289 6.24 6.078 6.064 6.009 5.958 5.854 5.793 5.706 5.606 5.526 5.425 5.29 5.147 -5 ,10696 ,KEBNE ,16678773,Thu Nov 25 04:14:19 CET,Thu Nov 25 05:45:12 CET,0.0 0.358 0.529 0.646 0.771 0.891 0.98 1.062 1.223 1.3 1.364 1.383 1.573 1.643 1.758 1.886 2.013 2.075 2.184 2.295 2.466 2.559 2.636 2.76 2.904 3.043 3.165 3.271 3.405 3.536 3.647 3.795 3.939 4.097 4.288 4.47 4.655 4.862 5.065 5.289 5.531 5.799 6.086 6.359 6.711 7.146 7.677 8.232 8.901 9.671 10.332 10.61 10.581 10.49 10.359 10.188 10.014 9.84 9.667 9.471 9.287 9.126 8.976 8.831 8.699 8.571 8.44 8.333 8.22 8.101 7.976 7.879 7.791 7.673 7.573 7.483 7.401 7.31 7.207 7.143 7.081 6.991 6.921 6.836 6.791 6.702 6.598 6.489 6.439 6.288 6.298 6.248 6.194 6.045 5.959 5.875 5.798 5.708 5.606 5.481 5.344 -6 ,24562 ,KEBNE ,16678774,Thu Nov 25 04:16:22 CET,Thu Nov 25 05:48:01 CET,0.0 0.317 0.457 0.578 0.684 0.787 0.889 0.978 1.134 1.205 1.27 1.302 1.487 1.558 1.667 1.761 1.861 1.916 2.034 2.15 2.296 2.38 2.464 2.587 2.709 2.827 2.949 3.072 3.223 3.356 3.478 3.643 3.817 3.98 4.157 4.354 4.544 4.733 4.925 5.128 5.344 5.607 5.929 6.227 6.582 6.98 7.409 7.973 8.661 9.308 9.917 10.223 10.275 10.21 10.061 9.899 9.755 9.6 9.437 9.239 9.054 8.893 8.744 8.613 8.497 8.389 8.272 8.143 8.029 7.923 7.815 7.725 7.626 7.515 7.421 7.33 7.248 7.162 7.077 7.025 6.967 6.872 6.81 6.738 6.701 6.613 6.49 6.369 6.313 6.164 6.155 6.092 6.038 5.923 5.851 5.761 5.672 5.589 5.502 5.381 5.13 -7 ,7905 ,KEBNE ,16678775,Thu Nov 25 04:16:22 CET,Thu Nov 25 05:48:27 CET,0.0 0.24 0.398 0.524 0.638 0.735 0.831 0.927 1.103 1.184 1.246 1.263 1.437 1.493 1.591 1.678 1.77 1.826 1.948 2.054 2.19 2.287 2.383 2.521 2.645 2.755 2.87 2.98 3.103 3.229 3.353 3.493 3.636 3.787 3.971 4.162 4.354 4.567 4.773 4.988 5.228 5.522 5.854 6.161 6.509 6.931 7.407 7.89 8.403 8.916 9.352 9.505 9.454 9.309 9.124 8.939 8.736 8.558 8.395 8.194 8.012 7.858 7.717 7.591 7.48 7.373 7.245 7.133 7.033 6.905 6.761 6.641 6.534 6.418 6.327 6.233 6.129 6.01 5.896 5.827 5.743 5.62 5.547 5.469 5.422 5.331 5.258 5.168 5.113 4.956 4.939 4.878 4.808 4.627 4.549 4.485 4.408 4.306 4.183 4.05 3.5 -8 ,16012 ,KEBNE ,16678776,Thu Nov 25 04:19:28 CET,Thu Nov 25 05:51:00 CET,0.0 0.195 0.355 0.505 0.64 0.764 0.861 0.959 1.127 1.188 1.243 1.266 1.437 1.494 1.615 1.736 1.848 1.903 2.017 2.114 2.244 2.332 2.426 2.563 2.7 2.824 2.932 3.06 3.229 3.368 3.505 3.683 3.858 4.01 4.193 4.399 4.591 4.796 5.006 5.233 5.463 5.739 6.07 6.411 6.821 7.244 7.714 8.278 8.893 9.481 10.051 10.311 10.32 10.213 10.058 9.891 9.709 9.505 9.316 9.121 8.945 8.797 8.646 8.49 8.355 8.253 8.141 8.03 7.916 7.789 7.674 7.584 7.5 7.4 7.315 7.219 7.121 7.034 6.947 6.883 6.803 6.675 6.598 6.524 6.48 6.377 6.28 6.193 6.148 5.995 5.968 5.891 5.814 5.67 5.601 5.535 5.468 5.387 5.314 5.191 4.962 -9 ,14067 ,KEBNE ,16678777,Thu Nov 25 04:19:28 CET,Thu Nov 25 05:51:45 CET,0.0 0.236 0.36 0.453 0.528 0.609 0.696 0.773 0.919 0.997 1.069 1.084 1.254 1.322 1.456 1.575 1.686 1.741 1.852 1.961 2.116 2.217 2.312 2.44 2.569 2.683 2.798 2.914 3.054 3.204 3.353 3.518 3.667 3.823 4.006 4.188 4.371 4.571 4.775 4.999 5.237 5.531 5.857 6.133 6.433 6.802 7.214 7.593 8.001 8.489 9.017 9.193 9.144 9.039 8.879 8.715 8.556 8.371 8.162 7.932 7.738 7.567 7.409 7.276 7.155 7.022 6.854 6.708 6.594 6.485 6.378 6.282 6.176 6.079 5.99 5.877 5.779 5.703 5.607 5.533 5.464 5.358 5.288 5.223 5.19 5.107 5.01 4.902 4.846 4.678 4.653 4.594 4.542 4.422 4.339 4.251 4.177 4.096 3.991 3.815 3.604 -10 ,32261 ,KEBNE ,16678778,Thu Nov 25 04:19:28 CET,Thu Nov 25 05:50:25 CET,0.0 0.228 0.341 0.449 0.53 0.601 0.684 0.778 0.933 1.0 1.067 1.09 1.266 1.335 1.465 1.58 1.69 1.743 1.843 1.939 2.08 2.173 2.272 2.425 2.572 2.704 2.825 2.94 3.082 3.235 3.385 3.538 3.69 3.852 4.037 4.239 4.435 4.644 4.857 5.091 5.353 5.654 5.983 6.304 6.683 7.078 7.504 8.009 8.583 9.134 9.607 9.791 9.76 9.617 9.409 9.199 8.968 8.757 8.592 8.417 8.254 8.094 7.946 7.808 7.67 7.544 7.392 7.241 7.121 7.0 6.881 6.784 6.682 6.578 6.499 6.421 6.338 6.247 6.141 6.062 5.978 5.852 5.777 5.696 5.648 5.551 5.455 5.356 5.304 5.149 5.125 5.051 4.981 4.81 4.732 4.665 4.57 4.459 4.347 4.153 3.845 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5d.txt deleted file mode 100644 index fa46f5da..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19311 ,KEBNE ,17069554,Fri Dec 24 07:31:23 CET,Fri Dec 24 09:01:19 CET,0.0 0.155 0.233 0.321 0.425 0.52 0.596 0.661 0.797 0.861 0.915 0.931 1.111 1.153 1.241 1.333 1.427 1.479 1.575 1.667 1.8 1.882 1.967 2.091 2.222 2.349 2.464 2.574 2.707 2.84 2.959 3.088 3.244 3.396 3.545 3.729 3.917 4.123 4.327 4.527 4.755 5.009 5.304 5.595 5.912 6.25 6.624 7.029 7.467 7.957 8.423 8.661 8.662 8.578 8.456 8.241 8.016 7.808 7.619 7.412 7.233 7.071 6.899 6.73 6.564 6.417 6.253 6.096 5.969 5.84 5.712 5.608 5.481 5.337 5.232 5.14 5.034 4.924 4.823 4.735 4.638 4.479 4.374 4.272 4.216 4.094 3.968 3.845 3.779 3.596 3.576 3.499 3.407 3.206 3.097 2.972 2.844 2.709 2.534 2.334 1.987 -2 ,12599 ,KEBNE ,17069555,Fri Dec 24 07:33:31 CET,Fri Dec 24 09:03:27 CET,0.0 0.285 0.422 0.54 0.645 0.727 0.799 0.871 1.007 1.072 1.141 1.149 1.321 1.366 1.465 1.567 1.663 1.706 1.789 1.865 1.979 2.075 2.178 2.302 2.409 2.521 2.633 2.733 2.851 2.992 3.131 3.285 3.434 3.582 3.762 3.958 4.132 4.309 4.514 4.744 4.992 5.29 5.615 5.887 6.211 6.587 7.012 7.486 8.008 8.517 8.974 9.196 9.158 9.08 9.0 8.842 8.648 8.468 8.271 8.045 7.843 7.659 7.494 7.339 7.181 7.03 6.864 6.707 6.568 6.418 6.251 6.111 5.97 5.827 5.723 5.617 5.493 5.363 5.229 5.128 5.027 4.851 4.709 4.571 4.498 4.364 4.247 4.127 4.068 3.879 3.819 3.728 3.643 3.476 3.37 3.252 3.129 3.001 2.836 2.615 2.144 -3 ,19311 ,KEBNE ,17069556,Fri Dec 24 07:38:47 CET,Fri Dec 24 09:08:29 CET,0.0 0.155 0.233 0.321 0.425 0.52 0.596 0.661 0.797 0.861 0.915 0.931 1.111 1.153 1.241 1.333 1.427 1.479 1.575 1.667 1.8 1.882 1.967 2.091 2.222 2.349 2.464 2.574 2.707 2.84 2.959 3.088 3.244 3.396 3.545 3.729 3.917 4.123 4.327 4.527 4.755 5.009 5.304 5.595 5.912 6.25 6.624 7.029 7.467 7.957 8.423 8.661 8.662 8.578 8.456 8.241 8.016 7.808 7.619 7.412 7.233 7.071 6.899 6.73 6.564 6.417 6.253 6.096 5.969 5.84 5.712 5.608 5.481 5.337 5.232 5.14 5.034 4.924 4.823 4.735 4.638 4.479 4.374 4.272 4.216 4.094 3.968 3.845 3.779 3.596 3.576 3.499 3.407 3.206 3.097 2.972 2.844 2.709 2.534 2.334 1.987 -4 ,6897 ,KEBNE ,17069557,Fri Dec 24 07:40:52 CET,Fri Dec 24 09:11:32 CET,0.0 0.181 0.325 0.426 0.518 0.617 0.695 0.757 0.893 0.953 1.008 0.994 1.164 1.212 1.317 1.432 1.537 1.588 1.681 1.767 1.905 1.994 2.087 2.229 2.348 2.453 2.561 2.666 2.798 2.919 3.035 3.187 3.322 3.444 3.61 3.803 3.969 4.156 4.36 4.554 4.751 5.0 5.274 5.525 5.838 6.233 6.664 7.093 7.568 8.108 8.639 8.864 8.884 8.787 8.642 8.442 8.23 8.045 7.88 7.716 7.575 7.433 7.279 7.113 6.949 6.806 6.665 6.551 6.447 6.328 6.185 6.067 5.958 5.845 5.758 5.674 5.569 5.438 5.325 5.263 5.187 5.044 4.949 4.853 4.809 4.716 4.605 4.481 4.417 4.221 4.162 4.084 4.0 3.82 3.735 3.65 3.537 3.38 3.21 2.995 2.211 -5 ,5114 ,KEBNE ,17069558,Fri Dec 24 07:42:57 CET,Fri Dec 24 09:14:01 CET,0.0 0.371 0.505 0.623 0.729 0.813 0.895 0.972 1.103 1.168 1.237 1.239 1.425 1.49 1.605 1.703 1.802 1.851 1.944 2.042 2.192 2.286 2.372 2.49 2.606 2.719 2.833 2.94 3.085 3.228 3.369 3.539 3.698 3.862 4.04 4.212 4.374 4.556 4.749 4.937 5.145 5.379 5.633 5.918 6.249 6.602 7.018 7.467 7.969 8.517 9.089 9.431 9.416 9.288 9.18 9.034 8.841 8.659 8.491 8.273 8.082 7.932 7.776 7.609 7.452 7.306 7.156 7.023 6.916 6.798 6.661 6.549 6.419 6.277 6.169 6.057 5.943 5.816 5.685 5.589 5.487 5.355 5.265 5.163 5.109 4.984 4.847 4.721 4.653 4.464 4.424 4.341 4.257 4.038 3.912 3.794 3.664 3.543 3.397 3.195 2.671 -6 ,24089 ,KEBNE ,17069559,Fri Dec 24 07:42:57 CET,Fri Dec 24 09:12:06 CET,0.0 0.149 0.261 0.369 0.456 0.538 0.615 0.693 0.841 0.901 0.96 0.971 1.151 1.208 1.31 1.406 1.514 1.562 1.659 1.762 1.897 1.994 2.091 2.225 2.359 2.473 2.578 2.681 2.805 2.938 3.069 3.208 3.326 3.444 3.612 3.803 3.971 4.161 4.385 4.61 4.824 5.06 5.344 5.652 5.979 6.313 6.736 7.231 7.757 8.296 8.836 9.056 9.09 9.023 8.854 8.625 8.399 8.214 8.035 7.823 7.628 7.464 7.303 7.134 6.949 6.79 6.651 6.502 6.376 6.269 6.157 6.053 5.939 5.831 5.758 5.676 5.573 5.449 5.319 5.231 5.139 4.998 4.898 4.783 4.718 4.579 4.437 4.303 4.223 4.02 3.967 3.878 3.789 3.58 3.459 3.321 3.162 2.997 2.836 2.629 2.31 -7 ,26187 ,KEBNE ,17069560,Fri Dec 24 07:47:10 CET,Fri Dec 24 09:17:06 CET,0.0 0.305 0.414 0.516 0.617 0.718 0.793 0.858 0.985 1.051 1.12 1.136 1.323 1.382 1.503 1.611 1.712 1.764 1.854 1.936 2.063 2.15 2.228 2.328 2.428 2.537 2.644 2.749 2.892 3.033 3.165 3.317 3.455 3.577 3.728 3.914 4.081 4.272 4.502 4.745 4.961 5.19 5.473 5.745 6.083 6.451 6.805 7.213 7.685 8.196 8.74 8.885 8.779 8.63 8.454 8.295 8.144 7.959 7.764 7.576 7.423 7.272 7.097 6.923 6.754 6.602 6.458 6.335 6.232 6.108 5.968 5.85 5.709 5.555 5.44 5.328 5.201 5.072 4.958 4.883 4.807 4.658 4.555 4.446 4.387 4.274 4.135 3.995 3.934 3.747 3.68 3.587 3.503 3.303 3.185 3.082 2.95 2.793 2.664 2.478 1.821 -8 ,30251 ,KEBNE ,17069561,Fri Dec 24 07:47:10 CET,Fri Dec 24 09:17:00 CET,0.0 0.133 0.232 0.314 0.407 0.497 0.568 0.635 0.772 0.833 0.887 0.872 1.043 1.093 1.199 1.293 1.38 1.426 1.516 1.605 1.743 1.832 1.923 2.057 2.172 2.279 2.372 2.467 2.602 2.73 2.846 2.982 3.113 3.239 3.393 3.581 3.751 3.919 4.123 4.344 4.557 4.784 5.041 5.299 5.608 5.975 6.349 6.731 7.227 7.744 8.253 8.56 8.575 8.446 8.284 8.121 7.972 7.829 7.689 7.514 7.35 7.199 7.055 6.928 6.807 6.682 6.537 6.389 6.268 6.165 6.057 5.957 5.833 5.702 5.607 5.511 5.421 5.322 5.209 5.132 5.047 4.916 4.831 4.742 4.688 4.578 4.474 4.366 4.311 4.13 4.108 4.03 3.947 3.741 3.625 3.517 3.396 3.263 3.122 2.911 2.409 -9 ,19603 ,KEBNE ,17069562,Fri Dec 24 07:48:14 CET,Fri Dec 24 09:18:04 CET,0.0 0.384 0.554 0.663 0.757 0.839 0.908 0.985 1.133 1.195 1.252 1.248 1.433 1.499 1.623 1.72 1.812 1.857 1.946 2.041 2.17 2.239 2.304 2.406 2.519 2.633 2.743 2.854 2.982 3.104 3.233 3.389 3.554 3.708 3.862 4.039 4.212 4.397 4.578 4.771 4.984 5.228 5.538 5.861 6.213 6.588 6.991 7.413 7.91 8.435 8.893 9.123 9.176 9.102 8.941 8.736 8.542 8.342 8.174 7.996 7.835 7.703 7.55 7.374 7.213 7.064 6.888 6.737 6.607 6.461 6.319 6.203 6.081 5.962 5.872 5.761 5.648 5.548 5.433 5.346 5.24 5.065 4.94 4.808 4.744 4.627 4.511 4.395 4.326 4.125 4.073 3.985 3.896 3.725 3.63 3.519 3.398 3.286 3.163 2.965 2.616 -10 ,23836 ,KEBNE ,17069563,Fri Dec 24 07:48:14 CET,Fri Dec 24 09:18:57 CET,0.0 0.231 0.381 0.474 0.536 0.613 0.685 0.754 0.883 0.935 0.99 0.977 1.139 1.187 1.281 1.36 1.456 1.511 1.603 1.698 1.848 1.929 2.0 2.101 2.197 2.287 2.375 2.462 2.572 2.679 2.78 2.906 3.033 3.164 3.325 3.502 3.672 3.865 4.052 4.233 4.429 4.669 4.966 5.291 5.651 5.996 6.383 6.818 7.341 7.909 8.321 8.397 8.349 8.251 8.102 7.937 7.775 7.617 7.439 7.253 7.13 7.0 6.875 6.74 6.607 6.496 6.356 6.229 6.116 5.994 5.867 5.764 5.67 5.563 5.458 5.344 5.239 5.121 4.987 4.91 4.821 4.661 4.561 4.449 4.383 4.259 4.143 4.008 3.936 3.753 3.742 3.667 3.576 3.42 3.352 3.265 3.159 3.055 2.943 2.793 2.513 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5i.txt deleted file mode 100644 index 036528b4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22565 ,KEBNE ,17069564,Fri Dec 24 07:48:14 CET,Fri Dec 24 09:18:29 CET,0.0 0.239 0.361 0.494 0.632 0.738 0.812 0.879 1.012 1.075 1.142 1.154 1.334 1.382 1.486 1.597 1.692 1.742 1.857 1.966 2.112 2.208 2.304 2.442 2.583 2.729 2.855 2.968 3.114 3.248 3.384 3.541 3.699 3.862 4.043 4.253 4.474 4.72 4.965 5.212 5.48 5.803 6.18 6.58 7.046 7.522 8.062 8.674 9.415 10.194 10.995 11.596 11.769 11.771 11.754 11.725 11.687 11.639 11.549 11.419 11.305 11.207 11.105 10.965 10.823 10.715 10.612 10.51 10.417 10.323 10.223 10.14 10.051 9.955 9.889 9.812 9.717 9.636 9.559 9.503 9.441 9.331 9.257 9.185 9.148 9.077 8.988 8.895 8.85 8.687 8.698 8.644 8.584 8.46 8.39 8.317 8.235 8.086 7.883 7.656 7.084 -2 ,6980 ,KEBNE ,17069565,Fri Dec 24 07:49:17 CET,Fri Dec 24 09:20:46 CET,0.0 0.327 0.471 0.56 0.656 0.761 0.856 0.931 1.085 1.159 1.229 1.253 1.44 1.502 1.624 1.757 1.894 1.955 2.074 2.183 2.33 2.432 2.532 2.663 2.785 2.918 3.043 3.162 3.322 3.471 3.608 3.771 3.925 4.089 4.294 4.501 4.696 4.932 5.185 5.434 5.701 6.031 6.421 6.797 7.208 7.648 8.201 8.845 9.547 10.312 11.186 11.802 12.095 12.213 12.222 12.144 12.016 11.89 11.775 11.643 11.533 11.443 11.33 11.222 11.124 11.006 10.876 10.763 10.663 10.56 10.456 10.366 10.261 10.14 10.056 9.98 9.9 9.829 9.756 9.692 9.623 9.52 9.444 9.36 9.322 9.244 9.161 9.076 9.029 8.868 8.862 8.795 8.722 8.578 8.51 8.442 8.36 8.264 8.139 7.946 7.505 -3 ,24499 ,KEBNE ,17069566,Fri Dec 24 07:51:24 CET,Fri Dec 24 09:21:25 CET,0.0 0.294 0.445 0.583 0.704 0.822 0.92 1.003 1.194 1.299 1.392 1.43 1.636 1.715 1.854 1.985 2.102 2.155 2.261 2.363 2.518 2.624 2.728 2.874 3.017 3.154 3.29 3.412 3.548 3.689 3.827 3.984 4.136 4.294 4.493 4.73 4.948 5.161 5.388 5.651 5.934 6.256 6.627 6.994 7.422 7.874 8.412 9.032 9.735 10.518 11.351 11.999 12.238 12.279 12.255 12.213 12.175 12.088 11.982 11.88 11.781 11.7 11.619 11.516 11.415 11.316 11.177 11.037 10.926 10.82 10.727 10.658 10.583 10.49 10.412 10.335 10.26 10.184 10.096 10.037 9.978 9.873 9.802 9.736 9.703 9.623 9.54 9.448 9.398 9.237 9.241 9.188 9.132 9.003 8.928 8.855 8.761 8.645 8.509 8.33 8.072 -4 ,27199 ,KEBNE ,17069567,Fri Dec 24 07:52:30 CET,Fri Dec 24 09:23:59 CET,0.0 0.32 0.488 0.598 0.692 0.806 0.924 1.0 1.13 1.21 1.289 1.3 1.484 1.552 1.672 1.777 1.89 1.943 2.037 2.129 2.276 2.379 2.481 2.625 2.764 2.907 3.044 3.162 3.315 3.479 3.638 3.804 3.974 4.143 4.321 4.512 4.705 4.943 5.202 5.462 5.735 6.035 6.376 6.748 7.159 7.586 8.115 8.723 9.419 10.217 11.091 11.752 12.073 12.18 12.187 12.163 12.101 11.999 11.921 11.867 11.806 11.709 11.594 11.488 11.39 11.274 11.147 11.041 10.945 10.857 10.767 10.687 10.602 10.51 10.435 10.353 10.266 10.17 10.072 9.998 9.918 9.809 9.731 9.642 9.596 9.503 9.398 9.296 9.249 9.09 9.105 9.043 8.969 8.82 8.747 8.658 8.547 8.447 8.349 8.225 8.057 -5 ,566 ,KEBNE ,17069568,Fri Dec 24 07:54:35 CET,Fri Dec 24 09:26:41 CET,0.0 0.255 0.382 0.481 0.589 0.691 0.763 0.848 1.03 1.109 1.186 1.206 1.393 1.458 1.577 1.7 1.817 1.875 1.987 2.091 2.234 2.333 2.433 2.582 2.735 2.873 2.994 3.119 3.276 3.413 3.563 3.754 3.941 4.134 4.356 4.604 4.848 5.1 5.361 5.625 5.902 6.224 6.599 6.967 7.401 7.913 8.447 9.034 9.755 10.537 11.493 12.265 12.642 12.841 12.94 12.924 12.841 12.746 12.673 12.551 12.426 12.331 12.23 12.134 12.039 11.941 11.836 11.749 11.679 11.593 11.49 11.407 11.313 11.225 11.159 11.082 11.005 10.923 10.83 10.77 10.717 10.64 10.584 10.519 10.48 10.408 10.329 10.246 10.205 10.05 10.056 9.992 9.927 9.797 9.72 9.643 9.566 9.474 9.34 9.182 8.858 -6 ,11908 ,KEBNE ,17069569,Fri Dec 24 07:56:45 CET,Fri Dec 24 09:26:59 CET,0.0 0.206 0.301 0.397 0.49 0.569 0.634 0.696 0.835 0.912 0.992 1.014 1.199 1.263 1.382 1.491 1.593 1.644 1.759 1.868 2.006 2.098 2.206 2.365 2.511 2.659 2.804 2.942 3.108 3.249 3.369 3.54 3.719 3.878 4.057 4.275 4.475 4.682 4.909 5.147 5.42 5.742 6.107 6.488 6.93 7.378 7.882 8.488 9.213 10.005 10.833 11.397 11.643 11.737 11.779 11.77 11.697 11.622 11.557 11.459 11.366 11.273 11.161 11.05 10.966 10.89 10.804 10.728 10.654 10.572 10.485 10.415 10.335 10.226 10.143 10.076 10.006 9.929 9.85 9.792 9.713 9.578 9.491 9.403 9.361 9.283 9.21 9.139 9.097 8.942 8.978 8.928 8.87 8.742 8.664 8.58 8.495 8.41 8.293 8.099 7.87 -7 ,15340 ,KEBNE ,17069571,Fri Dec 24 07:56:44 CET,Fri Dec 24 09:27:27 CET,0.0 0.233 0.368 0.501 0.638 0.737 0.824 0.917 1.103 1.17 1.237 1.25 1.431 1.49 1.598 1.711 1.83 1.884 1.983 2.074 2.211 2.293 2.382 2.524 2.641 2.748 2.865 2.985 3.14 3.293 3.465 3.666 3.828 3.992 4.182 4.388 4.582 4.788 5.023 5.281 5.57 5.883 6.225 6.577 6.977 7.436 7.999 8.639 9.4 10.214 11.014 11.571 11.824 11.928 11.912 11.829 11.686 11.554 11.439 11.296 11.164 11.0 10.814 10.662 10.539 10.405 10.273 10.165 10.066 9.968 9.858 9.766 9.685 9.602 9.539 9.482 9.404 9.311 9.224 9.171 9.114 9.025 8.962 8.888 8.85 8.748 8.635 8.537 8.484 8.317 8.302 8.231 8.172 8.038 7.961 7.879 7.786 7.682 7.57 7.438 7.073 -8 ,18484 ,KEBNE ,17069572,Fri Dec 24 07:58:50 CET,Fri Dec 24 09:28:35 CET,0.0 0.376 0.532 0.656 0.755 0.835 0.917 1.014 1.18 1.246 1.302 1.286 1.468 1.527 1.63 1.734 1.844 1.896 2.003 2.115 2.261 2.355 2.449 2.579 2.697 2.819 2.943 3.065 3.222 3.37 3.513 3.694 3.869 4.026 4.23 4.462 4.663 4.89 5.153 5.431 5.703 6.024 6.419 6.802 7.225 7.707 8.282 8.903 9.595 10.361 11.205 11.764 12.016 12.107 12.098 12.082 12.033 11.938 11.828 11.703 11.58 11.468 11.377 11.292 11.203 11.12 11.032 10.93 10.824 10.716 10.618 10.542 10.456 10.372 10.305 10.22 10.117 10.01 9.903 9.835 9.767 9.657 9.583 9.513 9.473 9.378 9.276 9.172 9.115 8.948 8.958 8.899 8.833 8.698 8.621 8.535 8.445 8.35 8.226 8.056 7.754 -9 ,21766 ,KEBNE ,17069573,Fri Dec 24 08:00:55 CET,Fri Dec 24 09:30:12 CET,0.0 0.177 0.323 0.435 0.547 0.674 0.775 0.85 0.992 1.072 1.151 1.168 1.351 1.417 1.539 1.662 1.789 1.841 1.937 2.036 2.182 2.28 2.372 2.496 2.617 2.741 2.852 2.954 3.091 3.253 3.407 3.556 3.697 3.847 4.043 4.27 4.484 4.714 4.976 5.257 5.529 5.829 6.201 6.582 6.998 7.438 7.985 8.612 9.29 10.102 11.007 11.568 11.861 12.001 12.038 11.98 11.872 11.745 11.61 11.487 11.391 11.306 11.2 11.099 11.013 10.913 10.789 10.681 10.587 10.485 10.386 10.307 10.215 10.115 10.034 9.939 9.855 9.78 9.693 9.631 9.575 9.499 9.417 9.313 9.269 9.196 9.122 9.029 8.976 8.805 8.794 8.736 8.674 8.546 8.477 8.403 8.312 8.202 8.1 7.953 7.51 -10 ,28058 ,KEBNE ,17069574,Fri Dec 24 08:00:55 CET,Fri Dec 24 09:32:27 CET,0.0 0.324 0.529 0.64 0.735 0.839 0.938 1.016 1.162 1.243 1.319 1.334 1.521 1.583 1.692 1.803 1.913 1.971 2.084 2.181 2.332 2.436 2.53 2.676 2.827 2.957 3.066 3.171 3.323 3.477 3.616 3.785 3.964 4.135 4.32 4.539 4.765 5.011 5.247 5.474 5.748 6.076 6.438 6.808 7.233 7.727 8.269 8.872 9.605 10.379 11.296 11.955 12.268 12.423 12.461 12.472 12.46 12.403 12.316 12.203 12.117 12.032 11.934 11.837 11.715 11.595 11.494 11.394 11.29 11.19 11.094 11.016 10.93 10.832 10.749 10.657 10.557 10.453 10.353 10.291 10.223 10.094 10.004 9.915 9.873 9.775 9.675 9.595 9.552 9.395 9.388 9.321 9.254 9.113 9.031 8.945 8.867 8.774 8.659 8.493 7.999 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5k.txt deleted file mode 100644 index 31f7bd12..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17198 ,KEBNE ,16678779,Thu Nov 25 04:19:36 CET,Thu Nov 25 05:47:54 CET,0.0 0.218 0.335 0.438 0.531 0.634 0.734 0.815 0.949 1.01 1.073 1.071 1.243 1.28 1.354 1.441 1.531 1.571 1.644 1.721 1.829 1.893 1.956 2.054 2.147 2.233 2.318 2.403 2.512 2.616 2.716 2.835 2.933 3.027 3.14 3.257 3.376 3.505 3.627 3.77 3.922 4.074 4.261 4.436 4.62 4.839 5.088 5.307 5.459 5.512 5.394 4.981 4.471 3.986 3.534 3.131 2.75 2.394 2.114 1.824 1.576 1.37 1.147 0.9 0.667 0.442 0.207 0.001 -0.182 -0.355 -0.528 -0.688 -0.841 -0.988 -1.111 -1.239 -1.364 -1.505 -1.659 -1.759 -1.864 -2.016 -2.117 -2.223 -2.286 -2.428 -2.565 -2.702 -2.776 -2.981 -3.038 -3.129 -3.228 -3.436 -3.543 -3.666 -3.791 -3.932 -4.114 -4.368 -4.767 -2 ,21089 ,KEBNE ,16678780,Thu Nov 25 04:19:36 CET,Thu Nov 25 05:48:10 CET,0.0 0.216 0.335 0.411 0.479 0.557 0.626 0.687 0.805 0.861 0.923 0.924 1.112 1.182 1.288 1.376 1.462 1.506 1.601 1.676 1.767 1.831 1.888 1.963 2.064 2.185 2.276 2.35 2.451 2.539 2.631 2.751 2.867 2.975 3.081 3.195 3.322 3.472 3.624 3.78 3.928 4.076 4.233 4.41 4.62 4.799 4.984 5.147 5.283 5.341 5.167 4.77 4.294 3.796 3.36 2.971 2.644 2.354 2.092 1.79 1.502 1.266 1.045 0.84 0.649 0.468 0.28 0.098 -0.08 -0.246 -0.415 -0.578 -0.729 -0.87 -0.987 -1.111 -1.238 -1.367 -1.509 -1.607 -1.706 -1.857 -1.959 -2.068 -2.126 -2.258 -2.415 -2.566 -2.646 -2.862 -2.9 -2.978 -3.066 -3.246 -3.356 -3.474 -3.602 -3.735 -3.865 -4.029 -4.306 -3 ,26097 ,KEBNE ,16678781,Thu Nov 25 04:19:28 CET,Thu Nov 25 05:50:02 CET,0.0 0.595 0.782 0.921 1.055 1.146 1.217 1.284 1.426 1.496 1.557 1.554 1.735 1.786 1.868 1.938 2.003 2.039 2.12 2.188 2.276 2.341 2.412 2.521 2.629 2.729 2.821 2.901 3.013 3.119 3.23 3.367 3.475 3.562 3.662 3.804 3.931 4.039 4.164 4.324 4.475 4.615 4.783 4.985 5.214 5.437 5.651 5.821 5.999 6.143 6.009 5.487 4.912 4.409 3.986 3.564 3.167 2.794 2.453 2.12 1.846 1.597 1.373 1.16 0.919 0.702 0.504 0.319 0.158 -0.01 -0.211 -0.367 -0.515 -0.671 -0.798 -0.936 -1.069 -1.211 -1.372 -1.487 -1.606 -1.763 -1.86 -1.975 -2.032 -2.152 -2.285 -2.418 -2.487 -2.687 -2.717 -2.781 -2.848 -3.028 -3.13 -3.242 -3.364 -3.473 -3.585 -3.725 -4.073 -4 ,19855 ,KEBNE ,16678782,Thu Nov 25 04:19:28 CET,Thu Nov 25 05:52:02 CET,0.0 0.167 0.282 0.365 0.449 0.522 0.597 0.679 0.808 0.859 0.917 0.911 1.076 1.119 1.207 1.299 1.39 1.435 1.512 1.592 1.701 1.767 1.839 1.938 2.023 2.116 2.205 2.276 2.392 2.513 2.606 2.702 2.815 2.927 3.048 3.181 3.289 3.408 3.541 3.673 3.836 4.024 4.19 4.336 4.499 4.656 4.814 5.007 5.174 5.262 5.211 4.912 4.496 4.006 3.568 3.163 2.732 2.355 2.078 1.787 1.473 1.189 0.918 0.648 0.428 0.226 -0.006 -0.213 -0.389 -0.58 -0.77 -0.904 -1.05 -1.215 -1.339 -1.47 -1.628 -1.796 -1.964 -2.065 -2.165 -2.333 -2.439 -2.557 -2.622 -2.757 -2.918 -3.089 -3.171 -3.372 -3.4 -3.475 -3.55 -3.71 -3.797 -3.907 -4.033 -4.197 -4.383 -4.574 -5.174 -5 ,13800 ,KEBNE ,16678783,Thu Nov 25 04:20:29 CET,Thu Nov 25 05:49:41 CET,0.0 0.213 0.334 0.4 0.467 0.548 0.623 0.697 0.831 0.883 0.942 0.944 1.128 1.184 1.285 1.386 1.479 1.522 1.619 1.71 1.832 1.905 1.976 2.075 2.158 2.235 2.303 2.369 2.47 2.577 2.665 2.763 2.865 2.969 3.105 3.243 3.364 3.507 3.654 3.776 3.896 4.044 4.235 4.427 4.63 4.842 5.035 5.164 5.32 5.444 5.268 4.813 4.394 3.951 3.451 3.011 2.657 2.308 2.004 1.66 1.364 1.112 0.871 0.655 0.437 0.22 -0.009 -0.199 -0.355 -0.519 -0.702 -0.854 -1.018 -1.206 -1.346 -1.469 -1.587 -1.716 -1.855 -1.952 -2.046 -2.189 -2.298 -2.424 -2.488 -2.61 -2.732 -2.861 -2.928 -3.12 -3.15 -3.244 -3.337 -3.521 -3.618 -3.721 -3.835 -3.961 -4.104 -4.264 -4.608 -6 ,20564 ,KEBNE ,16678784,Thu Nov 25 04:20:30 CET,Thu Nov 25 05:50:09 CET,0.0 0.152 0.283 0.381 0.471 0.558 0.622 0.677 0.787 0.853 0.918 0.907 1.078 1.134 1.251 1.373 1.48 1.524 1.62 1.715 1.825 1.885 1.944 2.031 2.115 2.2 2.297 2.39 2.495 2.591 2.69 2.82 2.934 3.031 3.144 3.264 3.373 3.497 3.629 3.763 3.895 4.043 4.196 4.353 4.544 4.712 4.89 5.072 5.206 5.24 5.051 4.546 4.028 3.618 3.23 2.797 2.426 2.095 1.801 1.498 1.205 0.931 0.647 0.383 0.162 -0.047 -0.266 -0.437 -0.589 -0.773 -0.967 -1.105 -1.241 -1.399 -1.528 -1.678 -1.847 -2.004 -2.16 -2.276 -2.398 -2.576 -2.694 -2.815 -2.875 -2.996 -3.135 -3.294 -3.366 -3.557 -3.586 -3.67 -3.75 -3.909 -4.004 -4.117 -4.246 -4.384 -4.526 -4.747 -5.157 -7 ,31872 ,KEBNE ,16678785,Thu Nov 25 04:20:30 CET,Thu Nov 25 05:54:12 CET,0.0 0.142 0.235 0.329 0.421 0.485 0.541 0.603 0.713 0.766 0.825 0.805 0.969 1.011 1.096 1.175 1.26 1.305 1.387 1.457 1.568 1.639 1.701 1.795 1.887 1.975 2.054 2.137 2.246 2.355 2.47 2.592 2.693 2.784 2.88 2.999 3.148 3.317 3.468 3.596 3.739 3.902 4.091 4.251 4.405 4.611 4.809 4.96 5.1 5.12 4.908 4.489 4.003 3.546 3.133 2.713 2.324 2.003 1.733 1.423 1.139 0.888 0.66 0.446 0.244 0.052 -0.159 -0.357 -0.531 -0.703 -0.895 -1.057 -1.216 -1.382 -1.516 -1.648 -1.781 -1.919 -2.054 -2.152 -2.256 -2.42 -2.539 -2.661 -2.721 -2.839 -2.967 -3.118 -3.202 -3.399 -3.42 -3.505 -3.597 -3.811 -3.925 -4.034 -4.132 -4.243 -4.39 -4.588 -4.919 -8 ,15906 ,KEBNE ,16678786,Thu Nov 25 04:20:30 CET,Thu Nov 25 05:50:07 CET,0.0 0.179 0.303 0.415 0.511 0.606 0.694 0.766 0.917 0.985 1.046 1.048 1.219 1.252 1.321 1.407 1.495 1.537 1.616 1.687 1.796 1.864 1.926 2.029 2.133 2.224 2.303 2.381 2.476 2.57 2.655 2.744 2.837 2.924 3.028 3.165 3.286 3.408 3.541 3.663 3.813 4.015 4.216 4.376 4.553 4.737 4.923 5.128 5.28 5.312 5.217 4.827 4.305 3.796 3.33 2.855 2.425 2.061 1.72 1.371 1.09 0.81 0.542 0.324 0.112 -0.094 -0.298 -0.496 -0.667 -0.827 -0.991 -1.138 -1.298 -1.451 -1.576 -1.714 -1.856 -1.987 -2.126 -2.23 -2.323 -2.475 -2.586 -2.701 -2.768 -2.911 -3.053 -3.199 -3.276 -3.485 -3.555 -3.658 -3.758 -3.969 -4.082 -4.221 -4.366 -4.494 -4.657 -4.85 -5.219 -9 ,7595 ,KEBNE ,16678787,Thu Nov 25 04:21:31 CET,Thu Nov 25 05:54:04 CET,0.0 0.113 0.233 0.321 0.408 0.479 0.533 0.592 0.696 0.745 0.8 0.783 0.95 0.987 1.066 1.15 1.223 1.26 1.343 1.42 1.515 1.58 1.646 1.738 1.831 1.919 2.008 2.095 2.194 2.288 2.387 2.498 2.597 2.695 2.808 2.927 3.031 3.162 3.328 3.475 3.612 3.795 4.007 4.191 4.391 4.59 4.784 4.96 5.085 5.18 5.036 4.5 3.998 3.525 3.096 2.668 2.219 1.837 1.529 1.205 0.913 0.639 0.377 0.143 -0.053 -0.24 -0.447 -0.627 -0.788 -0.972 -1.173 -1.329 -1.485 -1.644 -1.765 -1.885 -2.003 -2.144 -2.3 -2.402 -2.515 -2.675 -2.767 -2.869 -2.922 -3.03 -3.157 -3.302 -3.377 -3.569 -3.588 -3.672 -3.761 -3.943 -4.033 -4.129 -4.249 -4.39 -4.544 -4.725 -5.332 -10 ,9918 ,KEBNE ,16678788,Thu Nov 25 04:21:35 CET,Thu Nov 25 05:50:54 CET,0.0 0.142 0.245 0.362 0.455 0.516 0.579 0.638 0.757 0.813 0.875 0.882 1.058 1.111 1.213 1.309 1.4 1.449 1.533 1.606 1.727 1.799 1.862 1.947 2.032 2.124 2.214 2.294 2.388 2.482 2.581 2.685 2.783 2.878 2.985 3.121 3.245 3.379 3.52 3.67 3.847 4.026 4.216 4.396 4.566 4.743 4.945 5.1 5.194 5.258 5.139 4.701 4.197 3.7 3.238 2.83 2.471 2.146 1.869 1.572 1.291 1.054 0.828 0.609 0.396 0.194 -0.012 -0.203 -0.381 -0.579 -0.796 -0.957 -1.086 -1.222 -1.34 -1.469 -1.601 -1.736 -1.887 -1.992 -2.089 -2.237 -2.353 -2.478 -2.543 -2.679 -2.819 -2.958 -3.024 -3.213 -3.253 -3.341 -3.43 -3.62 -3.715 -3.814 -3.943 -4.089 -4.232 -4.472 -4.918 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5n_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5n_5d.txt deleted file mode 100644 index 4743b79c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5n_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10357 ,KEBNE ,17024316,Wed Dec 22 09:50:58 CET,Wed Dec 22 11:19:31 CET,0.0 0.162 0.278 0.376 0.45 0.512 0.573 0.634 0.755 0.817 0.883 0.872 1.038 1.088 1.186 1.277 1.369 1.416 1.508 1.584 1.697 1.766 1.837 1.943 2.032 2.123 2.215 2.311 2.446 2.577 2.703 2.85 2.986 3.116 3.259 3.435 3.618 3.815 4.022 4.226 4.427 4.658 4.966 5.278 5.596 5.914 6.285 6.705 7.163 7.541 7.434 6.719 5.922 5.168 4.599 4.093 3.535 2.953 2.441 1.926 1.437 0.972 0.569 0.209 -0.112 -0.401 -0.738 -1.055 -1.33 -1.614 -1.916 -2.174 -2.433 -2.709 -2.918 -3.125 -3.352 -3.615 -3.893 -4.062 -4.24 -4.543 -4.747 -4.962 -5.073 -5.298 -5.537 -5.817 -5.968 -6.222 -6.41 -6.574 -6.77 -7.22 -7.457 -7.765 -8.109 -8.508 -8.995 -9.653 -12.803 -2 ,30896 ,KEBNE ,17024317,Wed Dec 22 09:51:01 CET,Wed Dec 22 11:18:10 CET,0.0 0.156 0.263 0.343 0.415 0.493 0.561 0.627 0.787 0.866 0.928 0.925 1.102 1.157 1.255 1.34 1.425 1.473 1.553 1.632 1.764 1.855 1.939 2.046 2.149 2.247 2.349 2.451 2.58 2.702 2.816 2.958 3.097 3.221 3.356 3.515 3.673 3.851 4.053 4.28 4.499 4.723 4.996 5.264 5.544 5.848 6.214 6.637 7.104 7.467 7.308 6.805 6.296 5.665 5.032 4.388 3.784 3.27 2.85 2.413 2.008 1.656 1.296 0.914 0.564 0.265 -0.066 -0.389 -0.69 -1.005 -1.338 -1.626 -1.913 -2.198 -2.418 -2.654 -2.9 -3.147 -3.394 -3.551 -3.71 -3.973 -4.183 -4.415 -4.534 -4.771 -5.006 -5.271 -5.417 -5.706 -5.98 -6.173 -6.367 -6.844 -7.154 -7.503 -7.852 -8.223 -8.643 -9.232 -12.092 -3 ,14059 ,KEBNE ,17024318,Wed Dec 22 09:50:58 CET,Wed Dec 22 11:18:29 CET,0.0 0.206 0.338 0.445 0.558 0.659 0.754 0.832 0.953 1.012 1.069 1.058 1.231 1.282 1.37 1.451 1.538 1.578 1.656 1.736 1.846 1.913 1.983 2.092 2.195 2.297 2.403 2.507 2.626 2.752 2.884 3.032 3.175 3.302 3.453 3.626 3.8 4.008 4.241 4.472 4.69 4.952 5.272 5.594 5.9 6.148 6.449 6.772 7.089 7.412 7.486 7.265 6.838 6.254 5.722 5.193 4.629 4.058 3.551 3.014 2.54 2.127 1.742 1.363 0.978 0.622 0.254 -0.06 -0.319 -0.61 -0.95 -1.224 -1.471 -1.73 -1.939 -2.159 -2.393 -2.634 -2.881 -3.047 -3.225 -3.531 -3.727 -3.91 -4.021 -4.271 -4.527 -4.828 -4.994 -5.275 -5.513 -5.701 -5.906 -6.383 -6.63 -6.862 -7.149 -7.528 -7.991 -8.826 -12.497 -4 ,9210 ,KEBNE ,17024319,Wed Dec 22 09:50:58 CET,Wed Dec 22 11:19:48 CET,0.0 0.11 0.198 0.284 0.37 0.449 0.524 0.589 0.702 0.756 0.81 0.792 0.957 1.007 1.104 1.198 1.275 1.314 1.403 1.489 1.607 1.682 1.752 1.862 1.96 2.046 2.139 2.224 2.338 2.45 2.57 2.726 2.861 2.977 3.109 3.261 3.402 3.56 3.732 3.891 4.039 4.237 4.508 4.782 5.086 5.424 5.797 6.171 6.505 6.741 6.495 5.664 4.972 4.167 3.302 2.582 1.935 1.269 0.684 0.126 -0.343 -0.742 -1.131 -1.502 -1.861 -2.216 -2.559 -2.84 -3.062 -3.285 -3.549 -3.801 -4.077 -4.349 -4.579 -4.808 -5.035 -5.3 -5.558 -5.719 -5.887 -6.144 -6.325 -6.538 -6.655 -6.909 -7.179 -7.449 -7.596 -7.849 -8.032 -8.215 -8.387 -8.795 -9.072 -9.404 -9.793 -10.256 -10.733 -11.299 -13.582 -5 ,2343 ,KEBNE ,17024320,Wed Dec 22 09:52:00 CET,Wed Dec 22 11:20:01 CET,0.0 0.155 0.277 0.399 0.504 0.57 0.621 0.682 0.785 0.833 0.892 0.889 1.064 1.117 1.209 1.299 1.384 1.425 1.501 1.587 1.716 1.792 1.863 1.966 2.071 2.19 2.303 2.405 2.542 2.673 2.793 2.919 3.035 3.148 3.286 3.454 3.612 3.77 3.93 4.103 4.278 4.509 4.799 5.048 5.323 5.61 5.938 6.291 6.631 6.905 6.916 6.44 5.819 5.242 4.677 4.069 3.515 2.98 2.494 2.045 1.665 1.281 0.894 0.551 0.24 -0.076 -0.411 -0.698 -0.961 -1.249 -1.56 -1.812 -2.074 -2.353 -2.563 -2.785 -3.018 -3.264 -3.535 -3.74 -3.955 -4.269 -4.487 -4.697 -4.802 -5.03 -5.287 -5.564 -5.695 -5.953 -6.164 -6.348 -6.539 -6.934 -7.18 -7.462 -7.751 -8.107 -8.597 -9.314 -13.863 -6 ,29474 ,KEBNE ,17024321,Wed Dec 22 09:52:00 CET,Wed Dec 22 11:19:49 CET,0.0 0.339 0.474 0.561 0.657 0.739 0.803 0.872 1.002 1.065 1.127 1.125 1.296 1.346 1.437 1.53 1.617 1.661 1.743 1.812 1.923 1.995 2.07 2.189 2.295 2.397 2.493 2.587 2.727 2.861 2.98 3.116 3.24 3.366 3.522 3.707 3.86 4.012 4.181 4.355 4.553 4.779 5.039 5.274 5.551 5.919 6.328 6.685 6.921 7.05 7.02 6.545 5.9 5.43 5.015 4.521 4.003 3.473 2.963 2.464 2.061 1.681 1.273 0.898 0.567 0.255 -0.084 -0.402 -0.672 -0.941 -1.218 -1.46 -1.719 -1.992 -2.218 -2.458 -2.705 -2.971 -3.24 -3.421 -3.616 -3.942 -4.182 -4.427 -4.55 -4.796 -5.045 -5.291 -5.418 -5.68 -5.93 -6.138 -6.339 -6.738 -6.968 -7.253 -7.576 -7.961 -8.419 -8.946 -11.501 -7 ,25759 ,KEBNE ,17024322,Wed Dec 22 09:52:01 CET,Wed Dec 22 11:19:38 CET,0.0 0.233 0.339 0.45 0.572 0.65 0.718 0.781 0.877 0.924 0.984 0.991 1.162 1.217 1.321 1.413 1.496 1.534 1.61 1.696 1.825 1.9 1.973 2.087 2.186 2.282 2.388 2.491 2.61 2.717 2.825 2.967 3.107 3.248 3.4 3.553 3.718 3.913 4.127 4.343 4.552 4.779 5.024 5.255 5.514 5.79 6.097 6.376 6.629 6.799 6.592 5.834 5.213 4.691 4.15 3.551 3.027 2.495 1.926 1.364 0.882 0.456 0.082 -0.257 -0.57 -0.877 -1.22 -1.505 -1.753 -2.028 -2.337 -2.603 -2.864 -3.144 -3.373 -3.611 -3.86 -4.122 -4.376 -4.548 -4.721 -5.009 -5.233 -5.466 -5.589 -5.842 -6.122 -6.453 -6.61 -6.863 -7.1 -7.321 -7.518 -7.903 -8.121 -8.378 -8.689 -9.028 -9.408 -9.954 -12.156 -8 ,30495 ,KEBNE ,17024323,Wed Dec 22 09:52:01 CET,Wed Dec 22 11:20:50 CET,0.0 0.231 0.387 0.52 0.632 0.726 0.793 0.857 0.98 1.033 1.087 1.072 1.242 1.3 1.4 1.492 1.575 1.614 1.694 1.777 1.906 1.987 2.062 2.183 2.305 2.417 2.526 2.631 2.765 2.892 3.015 3.168 3.31 3.44 3.581 3.727 3.872 4.046 4.248 4.443 4.625 4.858 5.166 5.453 5.748 6.09 6.456 6.777 7.155 7.546 7.581 7.132 6.518 5.856 5.241 4.687 4.144 3.639 3.161 2.631 2.206 1.816 1.417 1.012 0.629 0.277 -0.096 -0.393 -0.624 -0.905 -1.209 -1.453 -1.725 -2.03 -2.294 -2.536 -2.753 -2.967 -3.19 -3.367 -3.559 -3.858 -4.09 -4.316 -4.427 -4.69 -4.989 -5.297 -5.436 -5.697 -5.961 -6.165 -6.376 -6.881 -7.157 -7.415 -7.691 -8.003 -8.439 -9.04 -10.524 -9 ,17902 ,KEBNE ,17024324,Wed Dec 22 09:52:01 CET,Wed Dec 22 11:19:42 CET,0.0 0.185 0.321 0.418 0.494 0.566 0.649 0.719 0.841 0.9 0.957 0.95 1.118 1.167 1.263 1.347 1.43 1.471 1.55 1.626 1.724 1.794 1.872 1.987 2.1 2.209 2.306 2.399 2.526 2.645 2.749 2.877 3.02 3.146 3.288 3.462 3.634 3.811 3.984 4.186 4.408 4.626 4.865 5.106 5.348 5.616 5.928 6.263 6.699 7.154 7.195 6.616 5.927 5.335 4.782 4.213 3.732 3.316 2.896 2.41 1.952 1.534 1.143 0.778 0.466 0.186 -0.11 -0.384 -0.636 -0.898 -1.18 -1.414 -1.666 -1.955 -2.194 -2.439 -2.698 -2.982 -3.288 -3.494 -3.68 -3.952 -4.147 -4.341 -4.44 -4.657 -4.888 -5.133 -5.271 -5.541 -5.773 -5.955 -6.143 -6.544 -6.775 -7.043 -7.336 -7.749 -8.243 -8.752 -11.278 -10 ,9304 ,KEBNE ,17024325,Wed Dec 22 09:52:00 CET,Wed Dec 22 11:19:49 CET,0.0 0.372 0.557 0.632 0.704 0.784 0.874 0.96 1.093 1.147 1.191 1.154 1.305 1.348 1.429 1.506 1.589 1.63 1.71 1.787 1.891 1.967 2.04 2.132 2.236 2.346 2.441 2.532 2.66 2.779 2.895 3.032 3.178 3.321 3.47 3.639 3.791 3.966 4.175 4.421 4.668 4.917 5.207 5.498 5.842 6.216 6.614 7.071 7.552 7.98 8.037 7.519 6.931 6.298 5.66 5.107 4.644 4.175 3.745 3.28 2.842 2.426 2.023 1.653 1.306 0.996 0.673 0.371 0.103 -0.193 -0.503 -0.76 -1.04 -1.347 -1.574 -1.8 -2.057 -2.341 -2.606 -2.786 -3.004 -3.357 -3.572 -3.787 -3.914 -4.19 -4.491 -4.801 -4.949 -5.202 -5.402 -5.578 -5.762 -6.184 -6.426 -6.679 -6.972 -7.327 -7.756 -8.403 -11.912 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5m.txt deleted file mode 100644 index 85026646..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7005 ,KEBNE ,16678789,Thu Nov 25 04:22:33 CET,Thu Nov 25 05:52:32 CET,0.0 0.188 0.3 0.38 0.457 0.542 0.629 0.706 0.839 0.895 0.953 0.949 1.127 1.182 1.285 1.389 1.481 1.517 1.59 1.677 1.81 1.896 1.975 2.082 2.187 2.291 2.397 2.499 2.624 2.743 2.859 3.002 3.14 3.271 3.429 3.603 3.767 3.969 4.203 4.466 4.743 5.037 5.342 5.628 5.984 6.384 6.794 7.183 7.535 7.796 7.849 7.458 6.896 6.288 5.684 5.09 4.461 3.849 3.338 2.802 2.313 1.866 1.438 1.013 0.643 0.329 -0.005 -0.323 -0.634 -0.95 -1.25 -1.492 -1.732 -1.988 -2.207 -2.438 -2.657 -2.897 -3.172 -3.352 -3.536 -3.86 -4.1 -4.34 -4.455 -4.697 -4.98 -5.263 -5.4 -5.669 -5.881 -6.056 -6.233 -6.648 -6.924 -7.215 -7.504 -7.858 -8.29 -8.871 -11.257 -2 ,28098 ,KEBNE ,16678790,Thu Nov 25 04:22:33 CET,Thu Nov 25 05:53:21 CET,0.0 0.412 0.52 0.613 0.708 0.79 0.866 0.948 1.096 1.158 1.215 1.205 1.376 1.421 1.509 1.596 1.686 1.729 1.81 1.89 2.006 2.083 2.157 2.264 2.372 2.48 2.588 2.691 2.815 2.934 3.051 3.194 3.329 3.466 3.636 3.8 3.94 4.093 4.247 4.434 4.655 4.89 5.154 5.444 5.752 6.034 6.326 6.606 6.898 7.125 7.084 6.497 5.739 5.051 4.435 3.813 3.213 2.673 2.177 1.613 1.134 0.756 0.404 0.094 -0.217 -0.543 -0.865 -1.135 -1.381 -1.664 -1.959 -2.192 -2.431 -2.684 -2.877 -3.087 -3.32 -3.569 -3.823 -4.019 -4.245 -4.569 -4.77 -4.972 -5.083 -5.33 -5.585 -5.848 -5.985 -6.254 -6.494 -6.698 -6.937 -7.507 -7.804 -8.085 -8.414 -8.805 -9.297 -10.075 -14.038 -3 ,13684 ,KEBNE ,16678791,Thu Nov 25 04:22:33 CET,Thu Nov 25 05:55:01 CET,0.0 0.212 0.31 0.396 0.476 0.553 0.618 0.694 0.823 0.875 0.925 0.91 1.092 1.148 1.265 1.381 1.485 1.529 1.609 1.687 1.795 1.869 1.942 2.049 2.166 2.283 2.399 2.499 2.615 2.738 2.854 2.989 3.115 3.247 3.408 3.573 3.74 3.931 4.134 4.352 4.591 4.866 5.175 5.476 5.824 6.179 6.532 6.87 7.186 7.34 7.249 6.874 6.381 5.843 5.244 4.678 4.218 3.729 3.234 2.732 2.28 1.848 1.462 1.129 0.794 0.481 0.113 -0.223 -0.495 -0.795 -1.108 -1.386 -1.678 -1.962 -2.185 -2.409 -2.647 -2.91 -3.167 -3.344 -3.532 -3.792 -3.979 -4.189 -4.294 -4.528 -4.8 -5.134 -5.324 -5.629 -5.883 -6.071 -6.251 -6.645 -6.884 -7.201 -7.575 -8.021 -8.544 -9.198 -12.816 -4 ,18593 ,KEBNE ,16678792,Thu Nov 25 04:22:38 CET,Thu Nov 25 05:51:04 CET,0.0 0.19 0.306 0.385 0.457 0.543 0.625 0.693 0.825 0.889 0.954 0.962 1.138 1.189 1.29 1.379 1.459 1.504 1.597 1.68 1.798 1.871 1.944 2.064 2.177 2.281 2.382 2.474 2.599 2.72 2.837 2.973 3.114 3.267 3.435 3.616 3.794 3.991 4.202 4.43 4.656 4.916 5.247 5.587 5.934 6.244 6.562 6.936 7.294 7.548 7.591 7.151 6.591 6.07 5.537 4.973 4.428 3.924 3.508 3.082 2.688 2.305 1.929 1.552 1.171 0.826 0.48 0.155 -0.128 -0.411 -0.72 -0.971 -1.218 -1.466 -1.656 -1.867 -2.09 -2.326 -2.569 -2.741 -2.912 -3.173 -3.377 -3.587 -3.697 -3.934 -4.199 -4.518 -4.678 -4.947 -5.128 -5.304 -5.508 -5.933 -6.164 -6.411 -6.671 -6.988 -7.526 -8.424 -12.896 -5 ,5539 ,KEBNE ,16678793,Thu Nov 25 04:22:33 CET,Thu Nov 25 05:52:51 CET,0.0 0.311 0.42 0.518 0.611 0.698 0.791 0.864 0.98 1.032 1.089 1.105 1.3 1.365 1.47 1.557 1.634 1.677 1.759 1.836 1.957 2.03 2.112 2.251 2.371 2.475 2.576 2.67 2.796 2.926 3.054 3.199 3.34 3.486 3.654 3.844 4.023 4.209 4.397 4.596 4.809 5.05 5.364 5.657 5.971 6.316 6.677 7.116 7.661 8.22 8.516 8.205 7.634 7.014 6.401 5.75 5.233 4.788 4.313 3.819 3.357 2.948 2.591 2.218 1.862 1.533 1.189 0.857 0.553 0.275 -0.001 -0.244 -0.488 -0.725 -0.931 -1.152 -1.381 -1.637 -1.925 -2.124 -2.323 -2.63 -2.856 -3.086 -3.189 -3.419 -3.689 -3.99 -4.136 -4.404 -4.637 -4.826 -5.028 -5.507 -5.757 -5.991 -6.26 -6.559 -6.935 -7.631 -10.905 -6 ,9185 ,KEBNE ,16678794,Thu Nov 25 04:22:34 CET,Thu Nov 25 05:53:35 CET,0.0 0.154 0.26 0.331 0.4 0.458 0.514 0.581 0.716 0.77 0.814 0.783 0.951 0.996 1.091 1.177 1.252 1.295 1.385 1.472 1.587 1.652 1.717 1.82 1.927 2.028 2.112 2.197 2.313 2.418 2.531 2.681 2.815 2.943 3.095 3.265 3.445 3.644 3.832 4.019 4.228 4.473 4.776 5.091 5.452 5.817 6.187 6.565 6.973 7.428 7.624 7.295 6.715 6.031 5.34 4.566 3.845 3.282 2.859 2.385 1.961 1.611 1.26 0.919 0.595 0.28 -0.06 -0.374 -0.648 -0.915 -1.2 -1.457 -1.723 -1.987 -2.198 -2.425 -2.662 -2.9 -3.171 -3.37 -3.542 -3.814 -4.036 -4.238 -4.325 -4.53 -4.78 -5.036 -5.17 -5.456 -5.713 -5.896 -6.086 -6.542 -6.803 -7.123 -7.514 -8.003 -8.67 -9.437 -13.194 -7 ,23203 ,KEBNE ,16678795,Thu Nov 25 04:23:40 CET,Thu Nov 25 05:54:41 CET,0.0 0.116 0.232 0.355 0.427 0.496 0.567 0.632 0.756 0.808 0.856 0.826 0.993 1.042 1.142 1.226 1.309 1.356 1.448 1.54 1.68 1.768 1.847 1.957 2.068 2.171 2.274 2.379 2.511 2.639 2.752 2.89 3.014 3.128 3.282 3.457 3.602 3.759 3.928 4.117 4.341 4.609 4.911 5.22 5.584 5.948 6.334 6.71 7.076 7.426 7.352 6.69 6.042 5.431 4.861 4.355 3.896 3.431 3.01 2.578 2.199 1.868 1.534 1.205 0.907 0.59 0.17 -0.209 -0.48 -0.739 -1.001 -1.225 -1.473 -1.727 -1.923 -2.151 -2.42 -2.692 -2.95 -3.14 -3.324 -3.603 -3.819 -4.029 -4.132 -4.34 -4.561 -4.804 -4.923 -5.163 -5.374 -5.558 -5.761 -6.269 -6.55 -6.845 -7.15 -7.517 -8.054 -8.821 -13.169 -8 ,23535 ,KEBNE ,16678796,Thu Nov 25 04:23:36 CET,Thu Nov 25 05:53:39 CET,0.0 0.259 0.397 0.493 0.557 0.618 0.688 0.762 0.906 0.973 1.043 1.047 1.215 1.261 1.363 1.459 1.551 1.6 1.689 1.762 1.87 1.947 2.026 2.128 2.219 2.312 2.408 2.503 2.638 2.773 2.902 3.061 3.21 3.342 3.496 3.699 3.892 4.086 4.284 4.488 4.704 4.946 5.209 5.453 5.719 5.977 6.289 6.661 7.067 7.401 7.478 7.149 6.65 6.029 5.198 4.451 3.933 3.465 2.999 2.475 1.98 1.53 1.089 0.68 0.347 0.056 -0.271 -0.58 -0.858 -1.151 -1.475 -1.739 -1.995 -2.265 -2.476 -2.702 -2.943 -3.205 -3.47 -3.66 -3.871 -4.182 -4.39 -4.599 -4.705 -4.957 -5.226 -5.496 -5.646 -5.948 -6.244 -6.453 -6.701 -7.293 -7.584 -7.91 -8.312 -8.727 -9.222 -9.988 -13.63 -9 ,21406 ,KEBNE ,16678797,Thu Nov 25 04:23:35 CET,Thu Nov 25 05:53:57 CET,0.0 0.263 0.407 0.518 0.622 0.695 0.76 0.823 0.946 1.009 1.072 1.057 1.226 1.273 1.373 1.467 1.546 1.584 1.668 1.758 1.88 1.951 2.023 2.127 2.225 2.327 2.433 2.536 2.674 2.811 2.943 3.103 3.249 3.387 3.541 3.722 3.907 4.122 4.366 4.606 4.842 5.122 5.444 5.745 6.077 6.418 6.735 7.095 7.557 7.903 7.843 7.437 6.852 6.141 5.498 4.931 4.391 3.837 3.329 2.844 2.46 2.12 1.789 1.419 1.043 0.713 0.376 0.075 -0.191 -0.496 -0.831 -1.075 -1.309 -1.576 -1.781 -1.993 -2.225 -2.471 -2.715 -2.877 -3.053 -3.366 -3.601 -3.843 -3.965 -4.213 -4.464 -4.733 -4.88 -5.148 -5.355 -5.526 -5.698 -6.122 -6.371 -6.651 -6.96 -7.281 -7.674 -8.235 -10.822 -10 ,13734 ,KEBNE ,16678798,Thu Nov 25 04:23:35 CET,Thu Nov 25 05:53:13 CET,0.0 0.123 0.229 0.308 0.389 0.479 0.553 0.621 0.755 0.825 0.887 0.868 1.047 1.1 1.186 1.27 1.359 1.403 1.49 1.577 1.697 1.776 1.858 1.968 2.07 2.161 2.248 2.351 2.486 2.606 2.727 2.875 3.021 3.156 3.311 3.497 3.68 3.886 4.11 4.352 4.598 4.853 5.129 5.406 5.705 6.006 6.312 6.684 7.054 7.283 7.39 7.092 6.476 5.68 4.892 4.215 3.644 3.097 2.631 2.186 1.818 1.468 1.101 0.76 0.426 0.122 -0.208 -0.503 -0.784 -1.116 -1.416 -1.638 -1.903 -2.206 -2.463 -2.725 -2.978 -3.231 -3.493 -3.695 -3.914 -4.252 -4.482 -4.703 -4.824 -5.087 -5.35 -5.653 -5.804 -6.054 -6.22 -6.372 -6.57 -7.046 -7.321 -7.589 -7.828 -8.177 -8.722 -9.478 -12.207 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5n.txt deleted file mode 100644 index 7993bd9d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27463 ,KEBNE ,16678799,Thu Nov 25 04:24:36 CET,Thu Nov 25 05:55:47 CET,0.0 0.781 1.063 1.29 1.517 1.715 1.883 2.048 2.329 2.451 2.574 2.686 2.935 3.044 3.239 3.442 3.629 3.717 3.882 4.037 4.279 4.427 4.563 4.751 4.939 5.139 5.332 5.525 5.756 5.964 6.17 6.422 6.662 6.892 7.162 7.465 7.755 8.086 8.434 8.772 9.156 9.61 10.061 10.434 10.891 11.399 11.947 12.57 13.21 13.845 14.52 14.797 14.65 14.366 14.082 13.718 13.256 12.793 12.416 12.051 11.7 11.39 11.13 10.892 10.639 10.38 10.095 9.839 9.633 9.418 9.18 8.986 8.786 8.566 8.406 8.246 8.063 7.865 7.643 7.496 7.368 7.125 6.943 6.768 6.679 6.491 6.29 6.101 5.992 5.75 5.59 5.437 5.275 4.913 4.717 4.522 4.301 4.026 3.665 3.087 0.79 -2 ,16928 ,KEBNE ,16678800,Thu Nov 25 04:24:38 CET,Thu Nov 25 05:56:26 CET,0.0 0.545 0.814 1.065 1.265 1.422 1.582 1.734 1.985 2.097 2.208 2.304 2.532 2.636 2.825 2.999 3.178 3.273 3.459 3.614 3.846 4.008 4.156 4.367 4.574 4.771 4.961 5.149 5.379 5.598 5.825 6.104 6.363 6.608 6.913 7.251 7.542 7.853 8.206 8.595 9.002 9.478 10.039 10.586 11.169 11.734 12.287 12.829 13.459 14.126 14.718 14.969 14.9 14.676 14.439 14.089 13.71 13.401 13.045 12.666 12.373 12.07 11.757 11.484 11.257 11.061 10.835 10.623 10.451 10.275 10.078 9.881 9.647 9.404 9.225 9.025 8.819 8.628 8.424 8.292 8.161 7.92 7.75 7.589 7.506 7.324 7.13 6.94 6.849 6.638 6.522 6.38 6.244 5.956 5.788 5.616 5.425 5.199 4.899 4.52 2.924 -3 ,24543 ,KEBNE ,16678801,Thu Nov 25 04:24:38 CET,Thu Nov 25 05:55:38 CET,0.0 1.678 2.033 2.249 2.45 2.623 2.772 2.915 3.187 3.307 3.43 3.538 3.768 3.871 4.072 4.266 4.451 4.535 4.681 4.826 5.054 5.208 5.352 5.548 5.731 5.899 6.064 6.232 6.445 6.657 6.854 7.074 7.296 7.527 7.818 8.157 8.467 8.811 9.153 9.497 9.883 10.342 10.88 11.387 11.901 12.389 12.9 13.527 14.294 15.003 15.643 15.878 15.739 15.518 15.195 14.756 14.391 14.037 13.681 13.34 13.02 12.689 12.366 12.039 11.759 11.534 11.269 11.017 10.787 10.549 10.313 10.107 9.88 9.663 9.499 9.328 9.147 8.943 8.725 8.579 8.427 8.174 8.0 7.815 7.717 7.527 7.333 7.115 7.003 6.782 6.675 6.566 6.446 6.173 6.027 5.858 5.609 5.319 4.957 4.432 2.324 -4 ,32736 ,KEBNE ,16678802,Thu Nov 25 04:24:37 CET,Thu Nov 25 05:55:20 CET,0.0 1.608 1.849 2.041 2.207 2.36 2.5 2.653 2.937 3.059 3.176 3.263 3.479 3.583 3.784 3.983 4.18 4.273 4.423 4.564 4.792 4.944 5.094 5.303 5.505 5.7 5.884 6.063 6.287 6.499 6.71 6.959 7.199 7.435 7.712 8.031 8.336 8.664 9.028 9.427 9.815 10.216 10.7 11.222 11.838 12.456 13.06 13.774 14.609 15.325 15.936 16.163 16.075 15.839 15.549 15.208 14.867 14.479 14.108 13.748 13.446 13.203 12.952 12.708 12.481 12.255 11.991 11.743 11.52 11.297 11.06 10.848 10.644 10.441 10.275 10.103 9.911 9.704 9.496 9.347 9.179 8.944 8.788 8.612 8.521 8.335 8.136 7.926 7.826 7.596 7.46 7.322 7.161 6.855 6.713 6.511 6.269 6.033 5.727 5.336 4.559 -5 ,19096 ,KEBNE ,16678803,Thu Nov 25 04:25:40 CET,Thu Nov 25 05:57:01 CET,0.0 1.784 2.257 2.547 2.737 2.912 3.067 3.196 3.433 3.553 3.662 3.756 3.975 4.062 4.25 4.434 4.594 4.676 4.82 4.95 5.154 5.306 5.461 5.662 5.839 6.001 6.153 6.316 6.528 6.727 6.921 7.131 7.321 7.524 7.76 7.993 8.24 8.531 8.825 9.164 9.554 9.986 10.471 10.97 11.55 12.155 12.77 13.42 14.106 14.701 15.227 15.462 15.399 15.212 14.926 14.586 14.293 13.963 13.591 13.193 12.82 12.455 12.1 11.777 11.487 11.218 10.929 10.678 10.468 10.232 9.966 9.728 9.48 9.262 9.102 8.906 8.701 8.488 8.252 8.09 7.923 7.661 7.478 7.282 7.182 6.994 6.8 6.576 6.455 6.217 6.049 5.905 5.763 5.465 5.304 5.111 4.896 4.659 4.4 3.981 2.46 -6 ,30190 ,KEBNE ,16678804,Thu Nov 25 04:25:40 CET,Thu Nov 25 05:56:56 CET,0.0 1.616 2.086 2.38 2.644 2.863 3.022 3.172 3.458 3.586 3.695 3.803 4.039 4.146 4.337 4.523 4.702 4.782 4.944 5.117 5.369 5.525 5.684 5.893 6.066 6.228 6.409 6.604 6.873 7.132 7.363 7.631 7.897 8.145 8.428 8.745 9.035 9.361 9.713 10.078 10.464 10.868 11.302 11.712 12.195 12.792 13.488 14.164 14.781 15.413 16.001 16.225 16.2 16.036 15.78 15.514 15.236 14.942 14.675 14.379 14.08 13.788 13.514 13.269 13.024 12.791 12.493 12.204 11.976 11.73 11.465 11.252 11.022 10.768 10.576 10.376 10.159 9.913 9.662 9.5 9.331 9.057 8.87 8.693 8.598 8.406 8.218 7.981 7.857 7.634 7.529 7.385 7.214 6.889 6.722 6.513 6.265 6.029 5.759 5.328 2.782 -7 ,17541 ,KEBNE ,16678805,Thu Nov 25 04:25:40 CET,Thu Nov 25 05:57:05 CET,0.0 1.822 2.172 2.411 2.61 2.793 2.95 3.091 3.335 3.437 3.551 3.656 3.874 3.974 4.177 4.365 4.537 4.621 4.779 4.923 5.14 5.283 5.41 5.613 5.814 5.997 6.175 6.349 6.578 6.797 7.015 7.281 7.535 7.78 8.058 8.35 8.635 8.944 9.271 9.648 10.047 10.472 10.953 11.447 11.988 12.507 13.106 13.813 14.536 15.17 15.718 15.925 15.857 15.696 15.489 15.185 14.796 14.342 13.958 13.631 13.327 13.007 12.681 12.376 12.099 11.844 11.574 11.356 11.19 11.01 10.798 10.613 10.411 10.19 10.034 9.892 9.729 9.545 9.348 9.198 9.055 8.839 8.68 8.526 8.447 8.271 8.083 7.883 7.774 7.542 7.397 7.258 7.13 6.844 6.677 6.499 6.281 6.01 5.71 5.259 2.205 -8 ,21732 ,KEBNE ,16678806,Thu Nov 25 04:26:42 CET,Thu Nov 25 05:57:21 CET,0.0 0.709 1.058 1.278 1.485 1.667 1.811 1.962 2.244 2.366 2.488 2.604 2.827 2.926 3.119 3.303 3.479 3.559 3.71 3.862 4.081 4.222 4.366 4.562 4.755 4.946 5.119 5.299 5.54 5.761 5.984 6.241 6.492 6.751 7.038 7.348 7.649 7.968 8.282 8.624 8.964 9.302 9.705 10.1 10.538 11.039 11.58 12.163 12.931 13.691 14.205 14.404 14.263 13.992 13.67 13.338 13.049 12.724 12.391 12.038 11.767 11.533 11.258 10.96 10.659 10.382 10.101 9.866 9.673 9.464 9.225 9.019 8.798 8.585 8.427 8.256 8.087 7.897 7.702 7.573 7.438 7.246 7.116 6.944 6.846 6.667 6.488 6.303 6.195 5.948 5.806 5.663 5.511 5.168 4.987 4.807 4.585 4.317 4.061 3.677 1.96 -9 ,22824 ,KEBNE ,16678807,Thu Nov 25 04:26:42 CET,Thu Nov 25 05:58:33 CET,0.0 0.856 1.173 1.408 1.586 1.756 1.905 2.036 2.29 2.406 2.52 2.641 2.878 2.981 3.183 3.375 3.557 3.643 3.811 3.969 4.201 4.358 4.509 4.721 4.916 5.093 5.269 5.443 5.662 5.892 6.112 6.371 6.622 6.857 7.129 7.451 7.763 8.099 8.477 8.866 9.271 9.725 10.222 10.722 11.289 11.859 12.45 13.031 13.62 14.19 14.761 14.996 14.9 14.602 14.179 13.713 13.228 12.811 12.506 12.17 11.829 11.516 11.196 10.876 10.622 10.415 10.167 9.93 9.713 9.479 9.24 9.031 8.803 8.558 8.365 8.172 7.969 7.751 7.528 7.377 7.209 6.951 6.785 6.597 6.495 6.291 6.083 5.876 5.773 5.546 5.405 5.266 5.121 4.815 4.644 4.436 4.175 3.925 3.697 3.406 2.501 -10 ,12882 ,KEBNE ,16678808,Thu Nov 25 04:26:43 CET,Thu Nov 25 06:00:14 CET,0.0 1.303 1.783 2.145 2.432 2.654 2.824 2.963 3.188 3.295 3.41 3.513 3.735 3.843 4.053 4.229 4.399 4.484 4.635 4.784 5.004 5.147 5.3 5.509 5.691 5.879 6.067 6.248 6.478 6.703 6.915 7.135 7.326 7.508 7.734 8.003 8.247 8.523 8.86 9.198 9.548 9.969 10.448 10.909 11.374 11.834 12.33 12.883 13.465 14.017 14.498 14.642 14.41 14.095 13.811 13.513 13.202 12.843 12.492 12.161 11.882 11.631 11.388 11.129 10.874 10.639 10.407 10.178 9.974 9.78 9.557 9.375 9.168 8.923 8.74 8.559 8.376 8.18 7.958 7.803 7.647 7.407 7.233 7.048 6.962 6.802 6.631 6.431 6.32 6.074 5.889 5.745 5.616 5.336 5.16 4.934 4.692 4.466 4.16 3.658 1.736 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_3b.txt deleted file mode 100644 index a9cf042b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18162 ,KEBNE ,16678809,Thu Nov 25 04:27:45 CET,Thu Nov 25 05:56:41 CET,0.0 0.415 0.633 0.831 0.938 1.027 1.129 1.219 1.363 1.436 1.509 1.541 1.721 1.791 1.915 2.026 2.142 2.2 2.307 2.405 2.555 2.658 2.758 2.899 3.044 3.189 3.313 3.437 3.615 3.78 3.926 4.094 4.26 4.422 4.604 4.814 5.013 5.233 5.496 5.771 6.044 6.365 6.746 7.145 7.611 8.115 8.696 9.279 9.903 10.668 11.471 11.884 11.961 11.859 11.689 11.472 11.217 10.927 10.66 10.364 10.126 9.928 9.707 9.484 9.271 9.072 8.813 8.54 8.301 8.069 7.84 7.648 7.447 7.234 7.074 6.895 6.71 6.508 6.29 6.145 5.985 5.739 5.561 5.37 5.268 5.055 4.836 4.592 4.458 4.223 3.982 3.785 3.583 3.162 2.93 2.67 2.365 1.962 1.497 0.957 -1.817 -2 ,29849 ,KEBNE ,16678810,Thu Nov 25 04:27:44 CET,Thu Nov 25 05:56:03 CET,0.0 0.314 0.441 0.548 0.662 0.769 0.87 0.956 1.098 1.164 1.235 1.264 1.445 1.513 1.633 1.748 1.865 1.928 2.054 2.174 2.355 2.462 2.559 2.704 2.857 2.998 3.13 3.264 3.432 3.604 3.774 3.97 4.158 4.341 4.56 4.793 5.005 5.24 5.49 5.75 6.025 6.335 6.697 7.062 7.492 7.98 8.5 9.03 9.582 10.188 10.76 10.993 10.952 10.723 10.499 10.274 9.996 9.677 9.374 9.051 8.757 8.458 8.159 7.892 7.649 7.434 7.208 6.974 6.773 6.581 6.358 6.161 5.958 5.758 5.619 5.475 5.29 5.071 4.835 4.657 4.475 4.205 4.035 3.862 3.76 3.555 3.34 3.109 2.979 2.735 2.485 2.305 2.138 1.752 1.481 1.201 0.92 0.571 0.152 -0.514 -4.818 -3 ,20918 ,KEBNE ,16678811,Thu Nov 25 04:27:45 CET,Thu Nov 25 05:56:37 CET,0.0 0.286 0.446 0.562 0.645 0.715 0.78 0.858 1.011 1.079 1.143 1.141 1.294 1.345 1.458 1.563 1.658 1.708 1.818 1.931 2.088 2.181 2.259 2.379 2.515 2.654 2.788 2.918 3.088 3.249 3.401 3.589 3.769 3.939 4.127 4.328 4.518 4.73 4.97 5.255 5.563 5.901 6.315 6.704 7.115 7.573 8.083 8.647 9.333 10.108 10.782 10.965 10.877 10.663 10.341 9.995 9.684 9.401 9.129 8.802 8.485 8.196 7.953 7.726 7.483 7.246 6.978 6.737 6.538 6.3 6.049 5.86 5.641 5.42 5.26 5.096 4.919 4.723 4.511 4.365 4.2 3.937 3.747 3.548 3.443 3.18 2.92 2.668 2.527 2.279 2.047 1.868 1.685 1.279 1.021 0.708 0.389 0.04 -0.38 -0.952 -4.651 -4 ,3888 ,KEBNE ,16678812,Thu Nov 25 04:27:45 CET,Thu Nov 25 05:56:03 CET,0.0 0.338 0.517 0.638 0.75 0.847 0.942 1.037 1.203 1.282 1.367 1.421 1.611 1.682 1.821 1.953 2.093 2.159 2.283 2.422 2.623 2.741 2.847 3.003 3.154 3.306 3.46 3.599 3.775 3.963 4.141 4.352 4.558 4.761 5.011 5.295 5.548 5.814 6.102 6.395 6.681 6.997 7.375 7.798 8.344 8.962 9.689 10.52 11.458 12.524 13.798 14.478 14.476 14.254 13.994 13.69 13.329 12.989 12.683 12.383 12.087 11.772 11.471 11.197 10.927 10.664 10.401 10.177 10.0 9.801 9.565 9.359 9.137 8.909 8.725 8.548 8.36 8.147 7.911 7.745 7.577 7.274 7.055 6.86 6.769 6.578 6.363 6.15 6.031 5.791 5.585 5.412 5.226 4.825 4.595 4.362 4.116 3.802 3.382 2.782 -0.699 -5 ,14705 ,KEBNE ,16678813,Thu Nov 25 04:27:45 CET,Thu Nov 25 05:56:12 CET,0.0 0.316 0.464 0.599 0.728 0.851 0.962 1.055 1.249 1.343 1.422 1.442 1.614 1.68 1.812 1.934 2.048 2.102 2.211 2.325 2.491 2.595 2.699 2.844 2.992 3.131 3.262 3.392 3.548 3.704 3.856 4.043 4.235 4.418 4.614 4.828 5.035 5.253 5.487 5.743 6.031 6.365 6.755 7.111 7.488 7.935 8.461 9.037 9.757 10.539 11.219 11.616 11.729 11.601 11.381 11.1 10.768 10.435 10.169 9.883 9.59 9.324 9.076 8.836 8.606 8.39 8.152 7.951 7.78 7.575 7.343 7.174 7.006 6.813 6.671 6.517 6.343 6.161 5.973 5.847 5.709 5.479 5.321 5.15 5.063 4.883 4.655 4.421 4.308 4.084 3.871 3.716 3.569 3.189 3.001 2.808 2.54 2.19 1.793 1.2 -1.521 -6 ,32655 ,KEBNE ,16678814,Thu Nov 25 04:27:44 CET,Thu Nov 25 05:57:12 CET,0.0 0.267 0.428 0.543 0.648 0.762 0.87 0.963 1.144 1.234 1.319 1.355 1.543 1.618 1.742 1.851 1.965 2.023 2.133 2.245 2.404 2.501 2.593 2.732 2.874 2.999 3.125 3.26 3.44 3.61 3.766 3.968 4.17 4.357 4.577 4.832 5.081 5.359 5.646 5.943 6.274 6.661 7.118 7.556 8.033 8.604 9.259 9.945 10.748 11.668 12.677 13.142 13.084 12.936 12.737 12.486 12.191 11.887 11.601 11.277 10.988 10.738 10.462 10.178 9.943 9.692 9.416 9.185 8.971 8.773 8.541 8.327 8.138 7.938 7.763 7.585 7.399 7.175 6.954 6.82 6.667 6.4 6.225 6.045 5.941 5.707 5.477 5.202 5.062 4.848 4.693 4.529 4.338 3.925 3.701 3.482 3.226 2.912 2.572 2.096 -1.426 -7 ,29982 ,KEBNE ,16678815,Thu Nov 25 04:27:45 CET,Thu Nov 25 05:56:01 CET,0.0 0.336 0.517 0.647 0.756 0.858 0.95 1.032 1.186 1.267 1.345 1.376 1.557 1.622 1.764 1.904 2.037 2.102 2.219 2.339 2.523 2.63 2.731 2.886 3.03 3.158 3.274 3.402 3.588 3.763 3.934 4.128 4.323 4.513 4.73 4.973 5.198 5.444 5.697 5.942 6.2 6.519 6.88 7.226 7.629 8.088 8.645 9.249 9.932 10.628 11.154 11.191 11.028 10.873 10.571 10.198 9.899 9.583 9.288 8.968 8.652 8.386 8.141 7.879 7.63 7.421 7.184 6.951 6.759 6.559 6.354 6.163 5.936 5.689 5.492 5.278 5.056 4.856 4.666 4.506 4.318 4.006 3.798 3.6 3.496 3.299 3.076 2.851 2.733 2.488 2.241 2.042 1.808 1.287 1.009 0.672 0.318 -0.059 -0.565 -1.3 -4.579 -8 ,6994 ,KEBNE ,16678816,Thu Nov 25 04:27:45 CET,Thu Nov 25 05:55:50 CET,0.0 0.135 0.26 0.354 0.457 0.577 0.687 0.79 0.978 1.053 1.118 1.145 1.317 1.371 1.477 1.605 1.733 1.789 1.898 2.004 2.156 2.257 2.347 2.466 2.589 2.719 2.84 2.952 3.11 3.271 3.434 3.624 3.794 3.965 4.184 4.436 4.674 4.926 5.194 5.491 5.824 6.202 6.636 7.061 7.552 8.067 8.598 9.143 9.722 10.414 11.164 11.4 11.215 10.96 10.681 10.376 10.097 9.829 9.577 9.291 9.04 8.815 8.587 8.36 8.141 7.898 7.607 7.369 7.173 6.958 6.736 6.557 6.356 6.127 5.96 5.793 5.604 5.392 5.162 5.008 4.851 4.593 4.398 4.201 4.109 3.909 3.674 3.437 3.317 3.072 2.79 2.606 2.437 2.013 1.773 1.526 1.242 0.913 0.515 -0.018 -3.162 -9 ,13250 ,KEBNE ,16678817,Thu Nov 25 04:27:45 CET,Thu Nov 25 05:58:18 CET,0.0 0.455 0.654 0.797 0.889 0.96 1.05 1.147 1.31 1.394 1.483 1.529 1.718 1.793 1.927 2.054 2.178 2.242 2.361 2.471 2.638 2.744 2.843 2.993 3.145 3.282 3.409 3.536 3.708 3.878 4.033 4.214 4.397 4.574 4.772 4.995 5.214 5.458 5.707 5.987 6.295 6.614 6.998 7.41 7.903 8.435 8.996 9.632 10.423 11.26 12.002 12.36 12.397 12.264 12.059 11.791 11.5 11.2 10.915 10.645 10.396 10.133 9.907 9.703 9.498 9.317 9.117 8.916 8.736 8.508 8.255 8.076 7.88 7.676 7.528 7.356 7.152 6.921 6.663 6.478 6.274 5.946 5.721 5.497 5.396 5.207 4.988 4.741 4.616 4.39 4.199 4.037 3.839 3.317 3.04 2.779 2.47 2.06 1.521 0.844 -3.311 -10 ,16069 ,KEBNE ,16678818,Thu Nov 25 04:28:46 CET,Thu Nov 25 05:56:12 CET,0.0 0.235 0.401 0.557 0.695 0.792 0.89 1.011 1.232 1.315 1.392 1.433 1.611 1.673 1.801 1.918 2.019 2.074 2.192 2.3 2.451 2.55 2.652 2.79 2.916 3.051 3.186 3.314 3.487 3.648 3.793 3.976 4.164 4.345 4.553 4.798 5.04 5.304 5.601 5.898 6.189 6.535 6.953 7.341 7.763 8.241 8.809 9.479 10.221 11.059 11.974 12.417 12.416 12.268 12.057 11.798 11.549 11.293 11.019 10.721 10.47 10.225 9.963 9.728 9.513 9.316 9.105 8.908 8.731 8.515 8.264 8.061 7.86 7.638 7.459 7.262 7.051 6.823 6.581 6.413 6.245 5.997 5.801 5.576 5.477 5.292 5.063 4.801 4.658 4.416 4.245 4.105 3.937 3.494 3.253 3.005 2.73 2.432 1.967 1.347 -2.627 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_5n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_5n.txt deleted file mode 100644 index a3219de8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_5n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29333 ,KEBNE ,16678819,Thu Nov 25 04:29:48 CET,Thu Nov 25 05:59:45 CET,0.0 0.364 0.571 0.753 0.904 1.037 1.159 1.273 1.48 1.589 1.684 1.726 1.915 1.998 2.152 2.311 2.466 2.544 2.706 2.86 3.073 3.201 3.316 3.475 3.625 3.767 3.901 4.031 4.205 4.374 4.54 4.721 4.875 5.023 5.215 5.452 5.673 5.922 6.228 6.577 6.911 7.233 7.577 7.894 8.242 8.618 9.046 9.441 9.769 10.052 10.121 9.733 9.213 8.701 8.204 7.676 7.237 6.84 6.443 6.046 5.696 5.362 5.03 4.723 4.453 4.194 3.92 3.673 3.451 3.224 3.001 2.805 2.592 2.393 2.231 2.037 1.84 1.65 1.449 1.299 1.148 0.92 0.752 0.58 0.492 0.301 0.095 -0.106 -0.218 -0.461 -0.615 -0.756 -0.893 -1.181 -1.351 -1.55 -1.77 -2.017 -2.298 -2.656 -3.826 -2 ,10031 ,KEBNE ,16678820,Thu Nov 25 04:29:48 CET,Thu Nov 25 06:00:10 CET,0.0 0.454 0.656 0.807 0.924 1.049 1.158 1.262 1.458 1.553 1.652 1.739 1.942 2.024 2.186 2.344 2.495 2.571 2.713 2.848 3.034 3.137 3.249 3.414 3.571 3.725 3.87 4.013 4.196 4.374 4.54 4.749 4.957 5.143 5.337 5.553 5.756 5.968 6.201 6.452 6.709 6.995 7.316 7.625 7.962 8.298 8.681 9.027 9.33 9.496 9.398 9.036 8.42 7.717 7.071 6.505 5.937 5.349 4.868 4.402 3.95 3.505 3.117 2.764 2.433 2.145 1.856 1.615 1.398 1.154 0.913 0.711 0.503 0.291 0.115 -0.067 -0.269 -0.488 -0.711 -0.87 -1.05 -1.32 -1.509 -1.714 -1.809 -2.0 -2.225 -2.465 -2.596 -2.857 -3.039 -3.206 -3.381 -3.735 -3.926 -4.118 -4.3 -4.507 -4.788 -5.189 -6.205 -3 ,25961 ,KEBNE ,16678821,Thu Nov 25 04:29:48 CET,Thu Nov 25 05:59:31 CET,0.0 0.446 0.67 0.844 1.012 1.178 1.339 1.478 1.711 1.821 1.925 2.004 2.219 2.317 2.477 2.624 2.749 2.807 2.929 3.048 3.232 3.375 3.514 3.687 3.837 3.972 4.092 4.198 4.344 4.502 4.665 4.862 5.036 5.209 5.428 5.658 5.871 6.113 6.377 6.64 6.888 7.156 7.454 7.71 7.995 8.322 8.728 9.146 9.509 9.792 9.756 9.274 8.688 8.045 7.488 6.925 6.4 5.922 5.467 5.023 4.631 4.268 3.92 3.588 3.292 3.025 2.722 2.431 2.16 1.878 1.589 1.359 1.148 0.912 0.713 0.504 0.277 0.052 -0.173 -0.328 -0.488 -0.767 -0.961 -1.154 -1.255 -1.471 -1.709 -1.958 -2.089 -2.337 -2.481 -2.613 -2.757 -3.069 -3.25 -3.457 -3.678 -3.943 -4.277 -4.647 -5.82 -4 ,24801 ,KEBNE ,16678822,Thu Nov 25 04:29:47 CET,Thu Nov 25 05:59:18 CET,0.0 0.686 0.903 1.073 1.24 1.394 1.527 1.652 1.879 1.98 2.066 2.125 2.322 2.406 2.558 2.694 2.819 2.885 3.04 3.185 3.37 3.484 3.593 3.761 3.898 4.018 4.146 4.283 4.464 4.626 4.788 4.986 5.171 5.35 5.559 5.786 6.009 6.257 6.505 6.753 7.026 7.354 7.722 8.043 8.36 8.712 9.113 9.505 9.924 10.286 10.425 10.129 9.648 9.18 8.689 8.164 7.655 7.154 6.696 6.205 5.76 5.356 4.974 4.638 4.326 4.015 3.692 3.41 3.171 2.924 2.654 2.422 2.188 1.959 1.778 1.588 1.388 1.173 0.944 0.778 0.598 0.318 0.131 -0.072 -0.175 -0.385 -0.605 -0.85 -0.985 -1.236 -1.414 -1.565 -1.707 -2.028 -2.207 -2.405 -2.618 -2.835 -3.117 -3.529 -4.926 -5 ,10077 ,KEBNE ,16678823,Thu Nov 25 04:30:49 CET,Thu Nov 25 06:00:43 CET,0.0 0.374 0.549 0.719 0.898 1.051 1.177 1.291 1.509 1.61 1.7 1.766 1.958 2.038 2.192 2.347 2.494 2.562 2.688 2.805 2.978 3.095 3.21 3.362 3.501 3.62 3.739 3.863 4.027 4.196 4.375 4.593 4.794 4.989 5.207 5.446 5.67 5.902 6.154 6.415 6.685 6.994 7.319 7.637 7.967 8.3 8.663 8.978 9.287 9.544 9.534 9.121 8.598 8.063 7.536 6.982 6.469 5.978 5.516 5.044 4.645 4.292 3.948 3.627 3.297 2.975 2.649 2.344 2.061 1.77 1.463 1.205 0.957 0.688 0.482 0.285 0.081 -0.136 -0.362 -0.537 -0.714 -0.972 -1.177 -1.391 -1.489 -1.683 -1.883 -2.111 -2.23 -2.463 -2.653 -2.816 -2.968 -3.28 -3.443 -3.618 -3.839 -4.101 -4.369 -4.69 -5.48 -6 ,21616 ,KEBNE ,16678824,Thu Nov 25 04:29:48 CET,Thu Nov 25 05:59:31 CET,0.0 0.578 0.782 0.918 1.058 1.181 1.285 1.383 1.567 1.654 1.745 1.807 2.01 2.097 2.236 2.376 2.533 2.614 2.761 2.907 3.102 3.215 3.323 3.488 3.667 3.839 3.995 4.134 4.305 4.458 4.614 4.824 5.029 5.209 5.415 5.644 5.85 6.074 6.33 6.578 6.835 7.154 7.485 7.783 8.146 8.553 9.005 9.427 9.725 9.907 9.914 9.607 9.108 8.502 7.875 7.293 6.777 6.294 5.894 5.468 5.063 4.707 4.365 4.001 3.648 3.361 3.07 2.782 2.541 2.291 1.996 1.759 1.534 1.281 1.072 0.85 0.618 0.36 0.089 -0.081 -0.256 -0.546 -0.75 -0.949 -1.051 -1.268 -1.486 -1.728 -1.853 -2.094 -2.28 -2.438 -2.61 -2.996 -3.185 -3.386 -3.613 -3.876 -4.204 -4.638 -5.715 -7 ,11313 ,KEBNE ,16678825,Thu Nov 25 04:30:49 CET,Thu Nov 25 06:00:31 CET,0.0 0.349 0.628 0.818 0.959 1.099 1.224 1.346 1.578 1.675 1.763 1.811 2.008 2.091 2.241 2.383 2.523 2.595 2.737 2.873 3.07 3.202 3.324 3.503 3.682 3.862 4.035 4.165 4.308 4.463 4.618 4.823 5.028 5.198 5.377 5.578 5.776 5.991 6.21 6.444 6.702 6.978 7.293 7.591 7.936 8.348 8.766 9.127 9.407 9.617 9.636 9.319 8.885 8.367 7.816 7.302 6.755 6.253 5.857 5.44 5.101 4.784 4.447 4.099 3.755 3.435 3.12 2.862 2.657 2.443 2.172 1.93 1.695 1.46 1.269 1.061 0.85 0.605 0.347 0.192 0.038 -0.209 -0.387 -0.56 -0.643 -0.837 -1.06 -1.294 -1.42 -1.667 -1.825 -1.96 -2.1 -2.38 -2.532 -2.733 -2.971 -3.223 -3.539 -3.951 -5.457 -8 ,1180 ,KEBNE ,16678826,Thu Nov 25 04:30:49 CET,Thu Nov 25 06:00:12 CET,0.0 0.472 0.73 0.928 1.089 1.229 1.358 1.465 1.657 1.758 1.849 1.927 2.125 2.204 2.352 2.49 2.622 2.698 2.842 2.963 3.141 3.252 3.359 3.529 3.691 3.833 3.972 4.098 4.282 4.475 4.647 4.854 5.047 5.22 5.433 5.662 5.869 6.119 6.379 6.643 6.917 7.186 7.467 7.754 8.083 8.405 8.736 9.086 9.393 9.634 9.686 9.372 8.892 8.374 7.873 7.319 6.793 6.288 5.773 5.24 4.8 4.418 4.036 3.676 3.358 3.063 2.768 2.505 2.255 2.0 1.739 1.529 1.315 1.054 0.845 0.638 0.423 0.204 -0.027 -0.177 -0.326 -0.571 -0.753 -0.951 -1.051 -1.274 -1.511 -1.744 -1.864 -2.104 -2.269 -2.419 -2.556 -2.849 -3.038 -3.251 -3.468 -3.701 -3.988 -4.384 -5.456 -9 ,28318 ,KEBNE ,16678827,Thu Nov 25 04:31:51 CET,Thu Nov 25 06:02:11 CET,0.0 0.664 0.897 1.116 1.301 1.474 1.625 1.75 1.989 2.102 2.207 2.275 2.463 2.539 2.689 2.828 2.957 3.021 3.143 3.27 3.456 3.568 3.67 3.817 3.976 4.149 4.305 4.443 4.64 4.837 5.021 5.223 5.413 5.594 5.785 6.007 6.214 6.421 6.653 6.913 7.183 7.456 7.771 8.118 8.518 8.902 9.307 9.738 10.087 10.319 10.34 9.933 9.404 8.848 8.33 7.866 7.4 6.93 6.535 6.128 5.747 5.417 5.1 4.786 4.501 4.234 3.941 3.682 3.466 3.241 2.989 2.777 2.568 2.354 2.18 1.985 1.78 1.568 1.341 1.182 1.013 0.759 0.593 0.416 0.325 0.112 -0.12 -0.32 -0.433 -0.687 -0.862 -1.01 -1.162 -1.485 -1.671 -1.868 -2.056 -2.281 -2.578 -2.959 -4.303 -10 ,15013 ,KEBNE ,16678828,Thu Nov 25 04:31:51 CET,Thu Nov 25 06:02:59 CET,0.0 0.499 0.654 0.826 0.993 1.116 1.222 1.332 1.524 1.612 1.693 1.734 1.918 1.993 2.138 2.281 2.429 2.505 2.638 2.755 2.923 3.033 3.147 3.315 3.465 3.608 3.754 3.9 4.079 4.241 4.399 4.596 4.786 4.962 5.16 5.374 5.582 5.813 6.068 6.347 6.619 6.932 7.328 7.709 8.093 8.5 8.949 9.338 9.661 10.029 10.116 9.686 9.239 8.721 8.213 7.731 7.234 6.765 6.377 6.017 5.709 5.398 5.066 4.726 4.404 4.12 3.851 3.621 3.399 3.155 2.897 2.695 2.486 2.258 2.095 1.936 1.77 1.594 1.388 1.233 1.073 0.834 0.681 0.522 0.436 0.238 0.009 -0.233 -0.352 -0.597 -0.78 -0.934 -1.085 -1.429 -1.626 -1.85 -2.095 -2.346 -2.679 -3.099 -3.961 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8b_8a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8b_8a.txt deleted file mode 100644 index a9e2672b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8b_8a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27842 ,KEBNE ,16678829,Thu Nov 25 04:31:51 CET,Thu Nov 25 06:02:05 CET,0.0 0.484 0.714 0.875 1.008 1.119 1.229 1.325 1.496 1.59 1.684 1.768 1.951 2.033 2.167 2.301 2.433 2.497 2.626 2.756 2.935 3.05 3.166 3.338 3.505 3.661 3.803 3.937 4.11 4.293 4.475 4.676 4.868 5.063 5.291 5.537 5.765 6.024 6.315 6.605 6.896 7.234 7.629 8.025 8.495 8.97 9.461 9.999 10.583 11.178 11.686 11.867 11.775 11.538 11.257 10.991 10.735 10.471 10.222 9.959 9.721 9.49 9.254 9.016 8.801 8.608 8.412 8.241 8.084 7.916 7.722 7.542 7.364 7.186 7.038 6.882 6.724 6.564 6.396 6.285 6.176 6.01 5.888 5.758 5.679 5.511 5.355 5.188 5.106 4.932 4.806 4.684 4.561 4.296 4.147 3.992 3.83 3.636 3.407 3.103 2.495 -2 ,882 ,KEBNE ,16678830,Thu Nov 25 04:32:53 CET,Thu Nov 25 06:02:49 CET,0.0 0.371 0.56 0.717 0.832 0.938 1.041 1.15 1.34 1.43 1.515 1.571 1.743 1.829 1.994 2.138 2.267 2.33 2.467 2.608 2.808 2.926 3.035 3.204 3.376 3.53 3.675 3.812 3.981 4.145 4.314 4.519 4.712 4.903 5.114 5.35 5.601 5.856 6.118 6.41 6.72 7.068 7.447 7.822 8.262 8.706 9.183 9.733 10.342 10.951 11.53 11.761 11.687 11.473 11.187 10.849 10.546 10.26 9.975 9.684 9.409 9.145 8.893 8.67 8.461 8.26 8.041 7.828 7.642 7.463 7.278 7.106 6.927 6.75 6.609 6.465 6.309 6.156 6.008 5.895 5.775 5.582 5.445 5.299 5.226 5.089 4.937 4.761 4.667 4.471 4.343 4.247 4.135 3.882 3.754 3.627 3.488 3.311 3.103 2.87 2.37 -3 ,19920 ,KEBNE ,16678831,Thu Nov 25 04:34:57 CET,Thu Nov 25 06:08:09 CET,0.0 0.439 0.618 0.753 0.882 1.001 1.109 1.219 1.435 1.529 1.611 1.689 1.866 1.944 2.093 2.233 2.364 2.43 2.56 2.68 2.834 2.934 3.045 3.217 3.379 3.528 3.67 3.812 3.991 4.168 4.34 4.546 4.75 4.951 5.178 5.418 5.658 5.923 6.194 6.492 6.798 7.113 7.484 7.859 8.276 8.741 9.272 9.841 10.433 11.075 11.697 11.91 11.795 11.54 11.283 11.026 10.764 10.498 10.234 9.944 9.694 9.465 9.214 8.972 8.765 8.572 8.355 8.154 7.978 7.802 7.622 7.46 7.289 7.115 6.978 6.84 6.697 6.538 6.366 6.243 6.112 5.92 5.786 5.64 5.565 5.412 5.249 5.081 4.995 4.818 4.722 4.624 4.523 4.274 4.134 3.985 3.819 3.628 3.382 3.082 2.287 -4 ,6858 ,KEBNE ,16678832,Thu Nov 25 04:36:59 CET,Thu Nov 25 06:06:27 CET,0.0 0.321 0.543 0.695 0.864 1.005 1.115 1.217 1.421 1.522 1.622 1.709 1.887 1.965 2.103 2.242 2.371 2.44 2.587 2.726 2.915 3.042 3.164 3.344 3.519 3.684 3.839 3.985 4.165 4.342 4.521 4.73 4.93 5.118 5.33 5.569 5.801 6.056 6.321 6.596 6.877 7.193 7.568 7.939 8.369 8.831 9.315 9.834 10.449 11.088 11.661 11.872 11.781 11.617 11.441 11.213 10.949 10.649 10.35 10.046 9.792 9.564 9.332 9.106 8.895 8.692 8.475 8.277 8.092 7.888 7.681 7.512 7.327 7.116 6.944 6.775 6.601 6.415 6.235 6.105 5.968 5.764 5.62 5.476 5.402 5.252 5.079 4.892 4.797 4.602 4.46 4.329 4.167 3.817 3.634 3.429 3.197 2.934 2.667 2.29 1.175 -5 ,24511 ,KEBNE ,16678833,Thu Nov 25 04:36:59 CET,Thu Nov 25 06:06:32 CET,0.0 0.272 0.443 0.584 0.713 0.837 0.959 1.075 1.271 1.357 1.444 1.523 1.696 1.78 1.953 2.111 2.253 2.323 2.467 2.595 2.779 2.894 3.002 3.165 3.337 3.508 3.665 3.807 3.992 4.172 4.339 4.548 4.763 4.96 5.182 5.427 5.648 5.897 6.176 6.468 6.778 7.125 7.523 7.903 8.332 8.805 9.334 9.871 10.409 10.964 11.531 11.733 11.592 11.384 11.131 10.849 10.586 10.315 10.04 9.74 9.457 9.185 8.921 8.667 8.431 8.208 7.974 7.764 7.58 7.382 7.16 6.967 6.775 6.577 6.421 6.27 6.114 5.949 5.755 5.614 5.486 5.295 5.151 4.985 4.894 4.708 4.502 4.278 4.171 3.973 3.838 3.718 3.598 3.34 3.198 3.044 2.868 2.682 2.451 2.166 1.53 -6 ,20724 ,KEBNE ,16678834,Thu Nov 25 04:39:03 CET,Thu Nov 25 06:08:30 CET,0.0 0.459 0.701 0.876 1.013 1.139 1.253 1.345 1.517 1.609 1.692 1.753 1.939 2.027 2.18 2.325 2.46 2.529 2.654 2.766 2.942 3.052 3.161 3.323 3.473 3.62 3.767 3.911 4.094 4.26 4.427 4.625 4.805 4.989 5.199 5.442 5.673 5.912 6.163 6.437 6.738 7.067 7.444 7.825 8.252 8.698 9.188 9.712 10.296 10.911 11.517 11.67 11.509 11.319 11.099 10.813 10.508 10.221 9.964 9.697 9.442 9.204 8.985 8.753 8.517 8.303 8.066 7.846 7.657 7.459 7.257 7.089 6.908 6.725 6.583 6.423 6.261 6.099 5.931 5.818 5.704 5.525 5.393 5.254 5.185 5.038 4.889 4.723 4.628 4.456 4.384 4.294 4.192 3.972 3.849 3.709 3.564 3.418 3.228 2.958 2.216 -7 ,26159 ,KEBNE ,16678835,Thu Nov 25 04:39:03 CET,Thu Nov 25 06:10:25 CET,0.0 0.217 0.38 0.528 0.672 0.794 0.909 1.023 1.226 1.313 1.397 1.478 1.65 1.733 1.887 2.023 2.153 2.215 2.345 2.474 2.658 2.781 2.891 3.056 3.22 3.368 3.509 3.649 3.842 4.017 4.182 4.39 4.594 4.787 5.006 5.253 5.489 5.749 6.021 6.306 6.62 6.975 7.375 7.763 8.189 8.657 9.198 9.756 10.334 10.911 11.443 11.661 11.613 11.44 11.174 10.846 10.526 10.224 9.953 9.677 9.427 9.187 8.955 8.733 8.523 8.323 8.103 7.901 7.741 7.578 7.395 7.234 7.065 6.888 6.752 6.617 6.464 6.294 6.112 5.978 5.826 5.593 5.451 5.31 5.233 5.076 4.913 4.741 4.654 4.469 4.368 4.273 4.163 3.885 3.727 3.55 3.375 3.19 2.993 2.785 2.306 -8 ,5284 ,KEBNE ,16678836,Thu Nov 25 04:39:07 CET,Thu Nov 25 06:06:57 CET,0.0 0.486 0.647 0.818 0.972 1.111 1.248 1.381 1.632 1.737 1.83 1.908 2.08 2.157 2.308 2.473 2.626 2.696 2.837 2.974 3.151 3.26 3.374 3.546 3.709 3.852 3.988 4.137 4.324 4.479 4.63 4.821 5.014 5.206 5.413 5.647 5.878 6.13 6.403 6.691 6.998 7.336 7.713 8.09 8.523 8.992 9.476 9.986 10.544 11.105 11.559 11.676 11.581 11.332 11.019 10.696 10.347 10.015 9.735 9.427 9.153 8.881 8.602 8.369 8.155 7.959 7.752 7.558 7.388 7.198 6.99 6.816 6.644 6.468 6.319 6.164 6.014 5.848 5.654 5.53 5.412 5.204 5.054 4.905 4.828 4.659 4.479 4.308 4.23 4.063 3.979 3.89 3.781 3.534 3.388 3.218 3.044 2.87 2.67 2.395 1.487 -9 ,7873 ,KEBNE ,16678837,Thu Nov 25 04:40:04 CET,Thu Nov 25 06:10:55 CET,0.0 0.42 0.651 0.802 0.942 1.087 1.229 1.349 1.557 1.656 1.751 1.823 1.998 2.079 2.228 2.373 2.519 2.594 2.732 2.852 3.022 3.14 3.255 3.413 3.563 3.712 3.864 4.008 4.19 4.361 4.53 4.743 4.944 5.144 5.386 5.649 5.893 6.18 6.502 6.829 7.152 7.491 7.865 8.242 8.699 9.193 9.733 10.31 10.952 11.622 12.212 12.452 12.397 12.189 11.928 11.647 11.364 11.089 10.833 10.549 10.291 10.061 9.815 9.568 9.36 9.164 8.934 8.713 8.519 8.315 8.097 7.929 7.774 7.607 7.463 7.313 7.168 7.022 6.863 6.739 6.615 6.432 6.291 6.151 6.08 5.932 5.781 5.616 5.528 5.347 5.234 5.136 5.03 4.796 4.656 4.496 4.321 4.116 3.867 3.555 2.869 -10 ,28736 ,KEBNE ,16678838,Thu Nov 25 04:41:05 CET,Thu Nov 25 06:10:35 CET,0.0 0.552 0.751 0.937 1.116 1.275 1.411 1.526 1.739 1.842 1.931 2.019 2.193 2.269 2.422 2.568 2.695 2.755 2.879 3.002 3.178 3.29 3.4 3.558 3.715 3.869 4.026 4.185 4.371 4.539 4.692 4.872 5.059 5.248 5.472 5.715 5.938 6.181 6.44 6.721 7.019 7.344 7.732 8.119 8.561 9.054 9.585 10.128 10.703 11.293 11.868 12.138 12.062 11.821 11.551 11.298 11.036 10.738 10.457 10.177 9.911 9.653 9.404 9.161 8.95 8.758 8.535 8.332 8.15 7.96 7.76 7.593 7.41 7.21 7.077 6.93 6.757 6.572 6.393 6.284 6.166 5.99 5.878 5.762 5.702 5.579 5.454 5.305 5.222 5.05 4.942 4.839 4.737 4.501 4.37 4.24 4.094 3.92 3.745 3.51 2.861 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8d_8c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8d_8c.txt deleted file mode 100644 index 49b2265a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8d_8c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22051 ,KEBNE ,16678839,Thu Nov 25 04:41:06 CET,Thu Nov 25 06:10:50 CET,0.0 0.609 0.825 1.025 1.213 1.355 1.469 1.589 1.82 1.905 1.976 2.004 2.193 2.274 2.427 2.561 2.69 2.75 2.858 2.964 3.126 3.225 3.322 3.479 3.625 3.758 3.884 4.0 4.146 4.301 4.44 4.59 4.741 4.895 5.069 5.291 5.512 5.716 5.937 6.178 6.446 6.776 7.137 7.415 7.679 8.013 8.338 8.623 8.929 9.043 8.733 8.059 7.507 6.908 6.317 5.808 5.301 4.808 4.318 3.804 3.419 3.081 2.727 2.387 2.061 1.761 1.451 1.164 0.897 0.62 0.346 0.125 -0.097 -0.339 -0.528 -0.713 -0.899 -1.09 -1.298 -1.443 -1.595 -1.833 -1.979 -2.137 -2.228 -2.418 -2.596 -2.786 -2.887 -3.096 -3.178 -3.285 -3.397 -3.683 -3.844 -4.011 -4.205 -4.438 -4.687 -5.031 -5.958 -2 ,1790 ,KEBNE ,16678840,Thu Nov 25 04:42:08 CET,Thu Nov 25 06:12:41 CET,0.0 0.782 1.09 1.305 1.457 1.589 1.712 1.835 2.046 2.13 2.197 2.227 2.42 2.494 2.615 2.739 2.874 2.94 3.052 3.15 3.304 3.406 3.506 3.642 3.76 3.883 4.018 4.15 4.312 4.456 4.584 4.726 4.857 4.989 5.119 5.292 5.516 5.771 6.051 6.307 6.526 6.788 7.089 7.337 7.628 7.952 8.305 8.74 9.207 9.523 9.457 8.91 8.193 7.531 6.914 6.3 5.776 5.291 4.833 4.377 3.942 3.553 3.199 2.84 2.53 2.268 2.01 1.78 1.575 1.372 1.141 0.944 0.748 0.529 0.359 0.191 0.005 -0.194 -0.399 -0.543 -0.681 -0.896 -1.056 -1.227 -1.315 -1.485 -1.652 -1.832 -1.93 -2.15 -2.229 -2.338 -2.452 -2.688 -2.828 -2.993 -3.195 -3.404 -3.586 -3.875 -4.884 -3 ,6288 ,KEBNE ,16678841,Thu Nov 25 04:42:08 CET,Thu Nov 25 06:13:00 CET,0.0 0.647 0.914 1.127 1.294 1.431 1.551 1.655 1.867 1.974 2.063 2.113 2.3 2.371 2.525 2.665 2.795 2.86 2.994 3.129 3.307 3.415 3.521 3.67 3.805 3.946 4.09 4.215 4.352 4.474 4.599 4.737 4.846 4.952 5.082 5.254 5.421 5.579 5.752 5.923 6.117 6.339 6.551 6.745 7.027 7.462 7.863 8.153 8.494 8.785 8.822 8.33 7.776 7.194 6.571 6.007 5.501 5.04 4.641 4.218 3.844 3.527 3.213 2.894 2.601 2.346 2.089 1.845 1.637 1.436 1.222 1.032 0.816 0.587 0.407 0.216 0.035 -0.144 -0.34 -0.468 -0.593 -0.789 -0.929 -1.083 -1.168 -1.361 -1.562 -1.74 -1.829 -2.043 -2.139 -2.239 -2.334 -2.564 -2.691 -2.818 -2.97 -3.145 -3.391 -3.673 -4.426 -4 ,7011 ,KEBNE ,16678842,Thu Nov 25 04:42:12 CET,Thu Nov 25 06:08:59 CET,0.0 0.781 0.977 1.125 1.251 1.363 1.479 1.593 1.807 1.908 1.989 1.996 2.18 2.249 2.38 2.503 2.618 2.67 2.775 2.887 3.05 3.156 3.263 3.396 3.52 3.652 3.785 3.899 4.037 4.167 4.268 4.387 4.513 4.644 4.797 4.988 5.179 5.374 5.588 5.834 6.091 6.371 6.684 6.961 7.274 7.562 7.839 8.121 8.26 8.113 7.577 6.78 6.015 5.294 4.558 3.861 3.326 2.848 2.368 1.88 1.469 1.108 0.774 0.451 0.136 -0.165 -0.47 -0.726 -0.945 -1.177 -1.408 -1.589 -1.791 -2.011 -2.182 -2.359 -2.539 -2.742 -2.964 -3.107 -3.241 -3.45 -3.61 -3.773 -3.851 -4.009 -4.168 -4.331 -4.423 -4.646 -4.743 -4.853 -4.972 -5.24 -5.386 -5.534 -5.693 -5.874 -6.08 -6.367 -7.453 -5 ,1676 ,KEBNE ,16678843,Thu Nov 25 04:42:08 CET,Thu Nov 25 06:12:35 CET,0.0 1.133 1.388 1.535 1.65 1.785 1.918 2.051 2.314 2.417 2.505 2.554 2.752 2.841 3.011 3.166 3.312 3.379 3.513 3.632 3.794 3.898 3.992 4.12 4.228 4.327 4.426 4.53 4.691 4.853 5.016 5.215 5.402 5.593 5.804 6.036 6.285 6.555 6.816 7.085 7.395 7.75 8.151 8.549 8.998 9.441 9.873 10.253 10.509 10.62 10.514 10.022 9.381 8.728 8.088 7.549 7.082 6.62 6.19 5.715 5.297 4.944 4.623 4.308 3.99 3.696 3.394 3.13 2.893 2.634 2.376 2.177 1.978 1.755 1.553 1.354 1.159 0.951 0.745 0.606 0.455 0.229 0.081 -0.083 -0.167 -0.343 -0.523 -0.697 -0.786 -1.005 -1.114 -1.24 -1.363 -1.608 -1.744 -1.9 -2.063 -2.253 -2.466 -2.731 -3.487 -6 ,6934 ,KEBNE ,16678844,Thu Nov 25 04:42:08 CET,Thu Nov 25 06:13:21 CET,0.0 0.609 0.869 1.061 1.2 1.307 1.409 1.509 1.695 1.785 1.869 1.9 2.084 2.155 2.282 2.372 2.471 2.533 2.643 2.748 2.899 2.986 3.071 3.213 3.358 3.502 3.644 3.769 3.919 4.053 4.177 4.339 4.512 4.667 4.822 5.005 5.178 5.357 5.566 5.794 6.024 6.286 6.586 6.889 7.214 7.56 7.91 8.223 8.567 8.825 8.706 8.203 7.592 6.97 6.386 5.77 5.163 4.615 4.152 3.702 3.297 2.935 2.592 2.267 1.969 1.674 1.359 1.084 0.836 0.59 0.346 0.14 -0.059 -0.251 -0.402 -0.579 -0.777 -0.972 -1.173 -1.317 -1.463 -1.678 -1.835 -2.004 -2.091 -2.258 -2.442 -2.655 -2.757 -2.973 -3.055 -3.165 -3.291 -3.558 -3.7 -3.856 -4.024 -4.219 -4.443 -4.743 -6.146 -7 ,4756 ,KEBNE ,16678845,Thu Nov 25 04:43:09 CET,Thu Nov 25 06:13:03 CET,0.0 0.612 0.815 0.969 1.103 1.221 1.342 1.467 1.668 1.749 1.841 1.911 2.104 2.172 2.301 2.429 2.556 2.619 2.76 2.89 3.063 3.166 3.262 3.415 3.553 3.677 3.817 3.967 4.15 4.296 4.415 4.551 4.69 4.839 5.059 5.319 5.529 5.747 5.991 6.261 6.55 6.853 7.136 7.456 7.873 8.252 8.561 8.84 9.151 9.399 9.341 8.754 7.961 7.229 6.584 5.965 5.405 4.877 4.401 3.954 3.591 3.273 2.983 2.701 2.413 2.147 1.859 1.586 1.343 1.091 0.856 0.674 0.482 0.292 0.137 -0.032 -0.195 -0.359 -0.542 -0.675 -0.811 -1.027 -1.174 -1.318 -1.397 -1.566 -1.731 -1.899 -1.992 -2.21 -2.312 -2.442 -2.568 -2.827 -2.948 -3.077 -3.225 -3.398 -3.625 -3.891 -4.689 -8 ,11139 ,KEBNE ,16678846,Thu Nov 25 04:43:09 CET,Thu Nov 25 06:14:38 CET,0.0 0.682 0.941 1.106 1.278 1.409 1.521 1.63 1.802 1.883 1.972 2.029 2.216 2.29 2.439 2.575 2.695 2.762 2.9 3.018 3.197 3.308 3.423 3.584 3.713 3.843 3.979 4.101 4.266 4.445 4.607 4.796 4.993 5.179 5.364 5.569 5.798 6.059 6.295 6.523 6.792 7.102 7.457 7.823 8.248 8.705 9.247 9.84 10.462 11.07 11.415 11.029 10.486 9.935 9.297 8.703 8.182 7.698 7.291 6.89 6.542 6.219 5.917 5.616 5.296 5.012 4.748 4.524 4.312 4.073 3.83 3.637 3.449 3.251 3.091 2.929 2.756 2.568 2.378 2.248 2.113 1.918 1.781 1.623 1.534 1.362 1.198 1.025 0.94 0.729 0.619 0.487 0.358 0.108 -0.034 -0.177 -0.315 -0.452 -0.643 -0.972 -1.781 -9 ,25372 ,KEBNE ,16678847,Thu Nov 25 04:43:09 CET,Thu Nov 25 06:15:16 CET,0.0 0.718 0.907 1.085 1.255 1.414 1.554 1.688 1.915 2.009 2.096 2.142 2.341 2.423 2.59 2.749 2.87 2.93 3.076 3.215 3.393 3.503 3.611 3.764 3.897 4.013 4.118 4.216 4.344 4.468 4.587 4.733 4.856 4.978 5.128 5.279 5.414 5.563 5.738 5.916 6.081 6.264 6.457 6.624 6.828 7.115 7.466 7.857 8.249 8.395 8.181 7.66 7.045 6.447 5.889 5.33 4.828 4.37 3.945 3.473 3.08 2.744 2.407 2.105 1.805 1.508 1.194 0.896 0.649 0.413 0.158 -0.062 -0.263 -0.471 -0.658 -0.842 -1.016 -1.199 -1.391 -1.516 -1.64 -1.845 -2.001 -2.169 -2.254 -2.402 -2.554 -2.744 -2.842 -3.044 -3.111 -3.223 -3.335 -3.56 -3.691 -3.855 -4.03 -4.202 -4.412 -4.717 -5.536 -10 ,24967 ,KEBNE ,16678848,Thu Nov 25 04:44:10 CET,Thu Nov 25 06:14:03 CET,0.0 0.784 1.009 1.186 1.326 1.461 1.59 1.708 1.932 2.026 2.105 2.154 2.362 2.456 2.609 2.751 2.887 2.958 3.085 3.207 3.394 3.502 3.603 3.741 3.882 4.032 4.186 4.331 4.517 4.688 4.846 5.028 5.185 5.345 5.541 5.75 5.959 6.191 6.424 6.702 7.004 7.299 7.582 7.821 8.15 8.593 8.997 9.308 9.636 9.867 9.828 9.331 8.738 8.155 7.618 7.108 6.653 6.223 5.808 5.376 5.016 4.72 4.403 4.068 3.765 3.519 3.299 3.127 2.977 2.807 2.617 2.439 2.238 2.051 1.901 1.731 1.559 1.4 1.227 1.106 0.993 0.804 0.66 0.507 0.431 0.279 0.12 -0.054 -0.155 -0.387 -0.46 -0.574 -0.7 -0.943 -1.065 -1.199 -1.354 -1.556 -1.803 -2.121 -2.981 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8a.txt deleted file mode 100644 index c5dd44fe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4927 ,KEBNE ,16678849,Thu Nov 25 04:44:15 CET,Thu Nov 25 06:10:54 CET,0.0 0.448 0.689 0.858 1.004 1.127 1.235 1.346 1.537 1.629 1.724 1.805 1.996 2.085 2.249 2.396 2.548 2.627 2.774 2.909 3.115 3.249 3.368 3.534 3.703 3.874 4.039 4.188 4.384 4.588 4.782 5.011 5.241 5.474 5.736 6.017 6.29 6.594 6.932 7.294 7.669 8.087 8.581 9.088 9.663 10.318 11.057 11.808 12.682 13.744 14.972 15.78 16.11 16.256 16.307 16.331 16.313 16.236 16.143 16.025 15.915 15.82 15.738 15.664 15.578 15.482 15.389 15.307 15.215 15.122 15.025 14.938 14.849 14.752 14.682 14.604 14.51 14.421 14.324 14.247 14.168 14.028 13.939 13.86 13.821 13.734 13.643 13.535 13.479 13.327 13.292 13.233 13.17 13.014 12.922 12.808 12.671 12.511 12.339 12.177 11.856 -2 ,4306 ,KEBNE ,16678850,Thu Nov 25 04:45:12 CET,Thu Nov 25 06:13:30 CET,0.0 0.62 0.89 1.094 1.255 1.39 1.504 1.608 1.821 1.928 2.033 2.121 2.313 2.403 2.577 2.758 2.936 3.014 3.16 3.297 3.497 3.624 3.748 3.929 4.098 4.259 4.411 4.571 4.796 5.011 5.218 5.47 5.731 5.982 6.267 6.607 6.935 7.287 7.649 8.012 8.393 8.831 9.35 9.892 10.503 11.164 11.924 12.723 13.601 14.633 15.795 16.609 16.978 17.129 17.215 17.219 17.155 17.07 16.987 16.9 16.8 16.717 16.623 16.513 16.401 16.284 16.165 16.068 15.998 15.906 15.804 15.724 15.63 15.526 15.438 15.34 15.24 15.15 15.044 14.957 14.87 14.732 14.643 14.56 14.518 14.432 14.343 14.255 14.203 14.054 14.04 13.992 13.926 13.776 13.693 13.589 13.482 13.386 13.27 13.096 12.634 -3 ,17819 ,KEBNE ,16678851,Thu Nov 25 04:45:12 CET,Thu Nov 25 06:16:44 CET,0.0 0.184 0.329 0.492 0.644 0.755 0.848 0.958 1.171 1.265 1.352 1.41 1.588 1.669 1.819 1.958 2.094 2.168 2.318 2.455 2.647 2.766 2.881 3.052 3.217 3.377 3.533 3.685 3.892 4.112 4.32 4.56 4.814 5.064 5.327 5.614 5.898 6.221 6.565 6.93 7.321 7.769 8.288 8.823 9.415 10.016 10.735 11.543 12.477 13.531 14.648 15.471 15.855 15.984 15.983 15.95 15.884 15.778 15.666 15.566 15.478 15.382 15.267 15.146 15.05 14.961 14.861 14.776 14.705 14.614 14.516 14.438 14.352 14.248 14.166 14.094 14.013 13.924 13.829 13.753 13.67 13.544 13.461 13.379 13.332 13.223 13.105 12.998 12.942 12.788 12.758 12.7 12.64 12.509 12.416 12.309 12.197 12.064 11.892 11.648 11.212 -4 ,4416 ,KEBNE ,16678852,Thu Nov 25 04:45:12 CET,Thu Nov 25 06:13:54 CET,0.0 0.694 0.916 1.1 1.281 1.442 1.596 1.737 2.011 2.147 2.275 2.413 2.63 2.736 2.918 3.075 3.225 3.3 3.455 3.595 3.798 3.934 4.075 4.29 4.488 4.683 4.866 5.038 5.267 5.498 5.711 5.958 6.199 6.437 6.714 7.014 7.297 7.602 7.92 8.249 8.612 9.026 9.52 10.04 10.617 11.251 11.988 12.799 13.713 14.732 15.878 16.702 17.115 17.295 17.341 17.339 17.312 17.259 17.191 17.112 17.035 16.965 16.89 16.804 16.704 16.617 16.54 16.473 16.407 16.33 16.243 16.173 16.103 16.021 15.951 15.877 15.802 15.716 15.605 15.527 15.44 15.304 15.222 15.132 15.087 14.997 14.891 14.779 14.722 14.567 14.545 14.481 14.407 14.234 14.153 14.052 13.924 13.784 13.599 13.407 13.144 -5 ,23785 ,KEBNE ,16678853,Thu Nov 25 04:45:13 CET,Thu Nov 25 06:15:12 CET,0.0 0.455 0.693 0.849 0.974 1.102 1.231 1.353 1.582 1.684 1.781 1.881 2.065 2.155 2.325 2.486 2.645 2.716 2.85 2.975 3.163 3.284 3.402 3.581 3.752 3.912 4.072 4.234 4.436 4.632 4.834 5.07 5.28 5.488 5.734 6.013 6.291 6.589 6.902 7.258 7.638 8.053 8.525 9.003 9.551 10.156 10.893 11.661 12.416 13.271 14.273 14.955 15.241 15.389 15.445 15.426 15.338 15.234 15.144 15.039 14.953 14.878 14.785 14.688 14.582 14.475 14.352 14.244 14.163 14.073 13.984 13.912 13.829 13.738 13.669 13.589 13.5 13.415 13.323 13.251 13.184 13.071 12.983 12.897 12.855 12.772 12.668 12.564 12.516 12.371 12.334 12.26 12.185 12.027 11.933 11.828 11.715 11.591 11.45 11.265 10.76 -6 ,2735 ,KEBNE ,16678854,Thu Nov 25 04:45:14 CET,Thu Nov 25 06:12:06 CET,0.0 0.319 0.497 0.658 0.806 0.924 1.027 1.127 1.314 1.401 1.485 1.552 1.74 1.818 1.972 2.128 2.262 2.332 2.476 2.605 2.79 2.915 3.035 3.203 3.366 3.528 3.69 3.85 4.052 4.24 4.409 4.621 4.843 5.056 5.305 5.585 5.854 6.153 6.487 6.84 7.198 7.588 8.038 8.486 9.014 9.596 10.24 10.972 11.781 12.674 13.652 14.373 14.729 14.875 14.895 14.835 14.76 14.689 14.614 14.5 14.397 14.309 14.219 14.125 14.017 13.915 13.802 13.704 13.634 13.557 13.468 13.383 13.272 13.15 13.072 12.996 12.909 12.824 12.728 12.66 12.603 12.508 12.429 12.34 12.293 12.196 12.09 11.982 11.935 11.799 11.781 11.721 11.658 11.514 11.433 11.352 11.26 11.174 11.088 10.941 10.374 -7 ,24910 ,KEBNE ,16678855,Thu Nov 25 04:46:13 CET,Thu Nov 25 06:16:37 CET,0.0 0.43 0.601 0.737 0.869 1.01 1.144 1.265 1.475 1.578 1.671 1.749 1.947 2.036 2.205 2.361 2.498 2.565 2.696 2.836 3.04 3.168 3.299 3.487 3.672 3.851 4.01 4.163 4.368 4.574 4.783 5.042 5.267 5.468 5.716 6.001 6.268 6.563 6.893 7.247 7.604 7.982 8.42 8.884 9.472 10.156 10.916 11.727 12.521 13.379 14.324 14.853 15.108 15.233 15.22 15.154 15.069 14.974 14.877 14.765 14.657 14.548 14.441 14.329 14.213 14.084 13.947 13.842 13.753 13.645 13.529 13.442 13.353 13.251 13.171 13.097 13.02 12.939 12.853 12.799 12.745 12.648 12.569 12.485 12.445 12.373 12.293 12.208 12.165 12.027 11.99 11.926 11.873 11.767 11.7 11.613 11.529 11.45 11.348 11.212 11.002 -8 ,18460 ,KEBNE ,16678856,Thu Nov 25 04:46:14 CET,Thu Nov 25 06:17:29 CET,0.0 0.835 1.11 1.348 1.569 1.762 1.922 2.051 2.282 2.402 2.524 2.633 2.826 2.916 3.094 3.266 3.423 3.495 3.634 3.767 3.965 4.088 4.202 4.373 4.551 4.721 4.896 5.067 5.276 5.477 5.666 5.9 6.133 6.363 6.637 6.938 7.232 7.554 7.877 8.219 8.591 9.016 9.526 10.031 10.603 11.234 11.948 12.748 13.68 14.766 16.02 16.971 17.439 17.673 17.766 17.79 17.779 17.714 17.623 17.521 17.436 17.374 17.307 17.23 17.147 17.065 16.989 16.924 16.86 16.776 16.684 16.607 16.517 16.415 16.339 16.274 16.205 16.127 16.042 15.977 15.902 15.782 15.691 15.59 15.538 15.433 15.34 15.251 15.196 15.053 15.019 14.959 14.908 14.765 14.678 14.598 14.52 14.393 14.196 13.97 13.702 -9 ,4135 ,KEBNE ,16678857,Thu Nov 25 04:46:13 CET,Thu Nov 25 06:15:10 CET,0.0 0.225 0.407 0.54 0.668 0.814 0.963 1.079 1.278 1.373 1.465 1.556 1.764 1.851 2.012 2.164 2.322 2.403 2.561 2.708 2.901 3.028 3.152 3.326 3.497 3.66 3.817 3.975 4.191 4.399 4.584 4.816 5.048 5.278 5.544 5.852 6.158 6.478 6.806 7.144 7.518 7.954 8.459 8.951 9.506 10.129 10.841 11.645 12.567 13.629 14.895 15.841 16.275 16.44 16.5 16.483 16.436 16.403 16.34 16.229 16.131 16.034 15.933 15.852 15.773 15.684 15.593 15.501 15.417 15.335 15.245 15.165 15.075 14.98 14.907 14.823 14.726 14.623 14.518 14.448 14.377 14.263 14.185 14.105 14.059 13.963 13.858 13.736 13.675 13.534 13.514 13.443 13.371 13.209 13.118 13.006 12.895 12.799 12.658 12.473 12.107 -10 ,21194 ,KEBNE ,16678858,Thu Nov 25 04:46:13 CET,Thu Nov 25 06:14:33 CET,0.0 0.516 0.708 0.89 1.034 1.171 1.299 1.416 1.637 1.732 1.822 1.907 2.088 2.171 2.34 2.499 2.647 2.726 2.876 3.019 3.231 3.361 3.487 3.675 3.856 4.037 4.215 4.384 4.59 4.78 4.975 5.202 5.425 5.647 5.894 6.179 6.451 6.748 7.073 7.419 7.78 8.208 8.705 9.168 9.714 10.338 11.019 11.719 12.509 13.451 14.549 15.339 15.703 15.788 15.73 15.626 15.52 15.428 15.332 15.217 15.123 15.037 14.922 14.81 14.698 14.589 14.481 14.379 14.293 14.194 14.067 13.969 13.88 13.769 13.685 13.619 13.55 13.473 13.384 13.313 13.241 13.141 13.074 12.987 12.937 12.827 12.709 12.61 12.564 12.424 12.392 12.323 12.257 12.127 12.053 11.974 11.893 11.807 11.728 11.593 11.344 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8c.txt deleted file mode 100644 index b45e2a0f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17230 ,KEBNE ,16678859,Thu Nov 25 04:46:14 CET,Thu Nov 25 06:16:25 CET,0.0 0.693 0.959 1.14 1.304 1.453 1.57 1.656 1.85 1.95 2.031 2.075 2.239 2.303 2.421 2.539 2.653 2.707 2.818 2.921 3.069 3.158 3.251 3.402 3.546 3.679 3.798 3.912 4.071 4.23 4.375 4.538 4.701 4.878 5.042 5.164 5.288 5.414 5.538 5.669 5.805 5.964 6.129 6.283 6.512 6.85 7.24 7.655 8.117 8.379 8.055 7.337 6.53 5.539 4.575 3.786 3.063 2.433 1.874 1.277 0.792 0.345 -0.053 -0.462 -0.875 -1.263 -1.659 -2.002 -2.304 -2.599 -2.94 -3.228 -3.507 -3.815 -4.063 -4.309 -4.549 -4.788 -5.054 -5.246 -5.437 -5.729 -5.929 -6.152 -6.27 -6.51 -6.783 -7.075 -7.209 -7.469 -7.662 -7.814 -7.98 -8.363 -8.576 -8.816 -9.105 -9.457 -9.878 -10.445 -12.999 -2 ,23794 ,KEBNE ,16678860,Thu Nov 25 04:47:15 CET,Thu Nov 25 06:19:42 CET,0.0 0.832 1.047 1.205 1.344 1.459 1.564 1.657 1.815 1.897 1.968 1.991 2.163 2.243 2.385 2.514 2.622 2.674 2.785 2.891 3.042 3.147 3.243 3.364 3.511 3.648 3.753 3.879 4.058 4.195 4.3 4.422 4.534 4.643 4.799 5.01 5.211 5.419 5.631 5.86 6.112 6.38 6.681 6.987 7.335 7.681 8.012 8.335 8.542 8.459 8.051 7.275 6.431 5.603 4.806 4.039 3.322 2.661 2.065 1.444 0.878 0.378 -0.064 -0.49 -0.883 -1.242 -1.617 -1.949 -2.238 -2.556 -2.898 -3.158 -3.427 -3.708 -3.912 -4.13 -4.348 -4.569 -4.811 -4.974 -5.154 -5.452 -5.655 -5.878 -5.995 -6.214 -6.442 -6.711 -6.864 -7.137 -7.34 -7.52 -7.714 -8.088 -8.276 -8.483 -8.762 -9.104 -9.495 -10.004 -11.375 -3 ,5688 ,KEBNE ,16678861,Thu Nov 25 04:48:17 CET,Thu Nov 25 06:19:39 CET,0.0 0.631 0.87 1.098 1.258 1.363 1.463 1.562 1.751 1.836 1.919 1.965 2.13 2.193 2.328 2.466 2.581 2.633 2.74 2.854 3.009 3.105 3.198 3.324 3.461 3.599 3.732 3.864 4.023 4.168 4.306 4.469 4.616 4.771 4.959 5.141 5.315 5.522 5.736 5.962 6.217 6.495 6.814 7.102 7.422 7.789 8.192 8.5 8.684 8.861 8.542 7.619 6.714 5.829 4.917 3.94 3.091 2.348 1.694 1.064 0.52 0.058 -0.363 -0.775 -1.154 -1.509 -1.895 -2.252 -2.58 -2.918 -3.267 -3.553 -3.833 -4.111 -4.332 -4.563 -4.806 -5.065 -5.335 -5.516 -5.697 -5.987 -6.192 -6.398 -6.494 -6.695 -6.904 -7.164 -7.317 -7.579 -7.783 -7.943 -8.112 -8.514 -8.737 -8.965 -9.207 -9.501 -9.854 -10.348 -13.241 -4 ,9849 ,KEBNE ,16678862,Thu Nov 25 04:48:17 CET,Thu Nov 25 06:19:28 CET,0.0 0.665 0.902 1.07 1.198 1.304 1.422 1.526 1.711 1.822 1.919 1.955 2.129 2.193 2.31 2.42 2.531 2.587 2.69 2.794 2.952 3.043 3.128 3.266 3.382 3.476 3.571 3.673 3.808 3.921 4.039 4.202 4.353 4.483 4.638 4.826 5.01 5.234 5.469 5.662 5.822 5.991 6.181 6.372 6.569 6.738 6.91 7.116 7.224 7.16 6.763 5.906 5.008 4.073 3.244 2.524 1.821 1.109 0.472 -0.141 -0.67 -1.155 -1.617 -2.023 -2.395 -2.759 -3.187 -3.589 -3.906 -4.191 -4.491 -4.765 -5.039 -5.327 -5.547 -5.778 -6.042 -6.308 -6.572 -6.743 -6.924 -7.219 -7.42 -7.631 -7.734 -7.956 -8.214 -8.485 -8.62 -8.878 -9.066 -9.219 -9.37 -9.729 -9.954 -10.195 -10.45 -10.737 -11.039 -11.482 -13.226 -5 ,29264 ,KEBNE ,16678863,Thu Nov 25 04:49:18 CET,Thu Nov 25 06:19:04 CET,0.0 0.75 0.972 1.163 1.305 1.438 1.564 1.67 1.863 1.945 2.027 2.097 2.262 2.33 2.475 2.594 2.697 2.754 2.87 2.978 3.166 3.288 3.382 3.513 3.642 3.769 3.897 4.017 4.171 4.32 4.451 4.624 4.795 4.961 5.159 5.361 5.541 5.742 5.972 6.218 6.466 6.7 6.941 7.178 7.421 7.68 7.957 8.208 8.459 8.652 8.4 7.6 6.734 5.892 5.104 4.367 3.664 3.018 2.44 1.843 1.337 0.875 0.425 -0.015 -0.42 -0.792 -1.198 -1.54 -1.832 -2.148 -2.472 -2.75 -3.044 -3.338 -3.557 -3.778 -4.019 -4.277 -4.528 -4.698 -4.869 -5.155 -5.356 -5.553 -5.665 -5.891 -6.124 -6.378 -6.508 -6.772 -6.96 -7.117 -7.28 -7.642 -7.847 -8.081 -8.344 -8.656 -9.047 -9.632 -11.7 -6 ,28151 ,KEBNE ,16678864,Thu Nov 25 04:49:22 CET,Thu Nov 25 06:16:07 CET,0.0 0.7 0.913 1.054 1.195 1.325 1.429 1.519 1.69 1.768 1.853 1.916 2.084 2.144 2.266 2.391 2.518 2.574 2.685 2.8 2.946 3.026 3.101 3.216 3.334 3.447 3.552 3.647 3.766 3.892 4.019 4.155 4.274 4.401 4.545 4.688 4.812 4.95 5.119 5.297 5.48 5.682 5.901 6.124 6.36 6.568 6.771 6.912 6.903 6.686 6.134 5.182 4.121 3.077 2.132 1.205 0.396 -0.321 -0.939 -1.549 -2.074 -2.53 -2.974 -3.411 -3.826 -4.201 -4.573 -4.926 -5.244 -5.555 -5.859 -6.122 -6.41 -6.695 -6.912 -7.133 -7.362 -7.597 -7.841 -8.014 -8.188 -8.456 -8.649 -8.861 -8.969 -9.189 -9.41 -9.645 -9.773 -10.022 -10.186 -10.346 -10.52 -10.906 -11.092 -11.29 -11.54 -11.853 -12.253 -12.803 -15.141 -7 ,20357 ,KEBNE ,16678865,Thu Nov 25 04:49:22 CET,Thu Nov 25 06:16:42 CET,0.0 0.742 0.944 1.106 1.26 1.385 1.501 1.608 1.787 1.863 1.923 1.943 2.113 2.183 2.302 2.423 2.561 2.628 2.741 2.859 3.038 3.151 3.263 3.418 3.548 3.656 3.752 3.843 3.962 4.096 4.224 4.354 4.482 4.604 4.734 4.887 5.041 5.211 5.397 5.568 5.736 5.94 6.171 6.389 6.619 6.843 7.091 7.281 7.393 7.422 7.189 6.458 5.654 4.872 4.025 3.167 2.41 1.741 1.129 0.449 -0.118 -0.587 -1.053 -1.487 -1.877 -2.21 -2.556 -2.89 -3.203 -3.529 -3.871 -4.169 -4.467 -4.782 -5.016 -5.245 -5.478 -5.714 -5.977 -6.174 -6.373 -6.671 -6.89 -7.114 -7.228 -7.462 -7.691 -7.94 -8.079 -8.35 -8.574 -8.75 -8.921 -9.316 -9.531 -9.743 -10.004 -10.334 -10.727 -11.24 -13.076 -8 ,32538 ,KEBNE ,16678866,Thu Nov 25 04:50:19 CET,Thu Nov 25 06:18:05 CET,0.0 0.692 0.968 1.178 1.34 1.457 1.559 1.666 1.877 1.97 2.059 2.135 2.31 2.38 2.505 2.608 2.711 2.77 2.886 2.992 3.142 3.238 3.34 3.489 3.612 3.725 3.844 3.966 4.125 4.272 4.428 4.611 4.765 4.922 5.113 5.318 5.498 5.691 5.897 6.122 6.359 6.614 6.879 7.083 7.29 7.502 7.71 7.991 8.392 8.75 8.848 8.181 7.203 6.25 5.299 4.487 3.795 3.103 2.48 1.848 1.314 0.843 0.401 -0.013 -0.398 -0.745 -1.126 -1.496 -1.817 -2.134 -2.455 -2.716 -2.999 -3.301 -3.534 -3.767 -4.012 -4.265 -4.533 -4.72 -4.899 -5.165 -5.366 -5.601 -5.719 -5.963 -6.21 -6.45 -6.588 -6.87 -7.085 -7.243 -7.399 -7.779 -7.996 -8.236 -8.484 -8.744 -9.091 -9.644 -11.916 -9 ,18053 ,KEBNE ,16678867,Thu Nov 25 04:50:20 CET,Thu Nov 25 06:21:58 CET,0.0 0.898 1.203 1.436 1.579 1.684 1.784 1.864 2.019 2.104 2.186 2.236 2.403 2.472 2.603 2.733 2.847 2.905 3.029 3.138 3.284 3.383 3.474 3.602 3.726 3.848 3.956 4.054 4.177 4.292 4.405 4.531 4.662 4.796 4.942 5.088 5.232 5.403 5.575 5.739 5.909 6.08 6.245 6.435 6.673 6.886 7.107 7.313 7.378 7.273 6.835 5.945 5.018 4.09 3.113 2.154 1.329 0.61 -0.052 -0.736 -1.288 -1.779 -2.254 -2.693 -3.09 -3.456 -3.841 -4.176 -4.483 -4.818 -5.171 -5.459 -5.736 -6.025 -6.267 -6.513 -6.739 -6.963 -7.214 -7.391 -7.576 -7.86 -8.054 -8.263 -8.376 -8.626 -8.884 -9.141 -9.276 -9.534 -9.717 -9.879 -10.06 -10.473 -10.679 -10.886 -11.148 -11.489 -11.917 -12.532 -14.567 -10 ,11121 ,KEBNE ,16678868,Thu Nov 25 04:52:22 CET,Thu Nov 25 06:22:13 CET,0.0 0.655 0.825 0.97 1.138 1.27 1.358 1.454 1.633 1.711 1.787 1.826 2.0 2.075 2.216 2.334 2.437 2.486 2.573 2.663 2.796 2.885 2.97 3.079 3.198 3.33 3.455 3.576 3.728 3.869 4.013 4.185 4.343 4.478 4.604 4.735 4.843 4.963 5.097 5.226 5.348 5.479 5.62 5.753 5.893 6.01 6.123 6.217 6.237 6.086 5.616 4.773 3.877 3.031 2.254 1.583 0.961 0.342 -0.214 -0.756 -1.216 -1.652 -2.075 -2.478 -2.879 -3.279 -3.678 -3.996 -4.267 -4.546 -4.842 -5.092 -5.377 -5.693 -5.924 -6.156 -6.403 -6.662 -6.947 -7.153 -7.349 -7.656 -7.883 -8.116 -8.236 -8.49 -8.761 -9.032 -9.168 -9.44 -9.634 -9.79 -9.974 -10.366 -10.551 -10.759 -11.002 -11.344 -11.814 -12.406 -14.621 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8b.txt deleted file mode 100644 index 265943ff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27515 ,KEBNE ,16678869,Thu Nov 25 04:52:22 CET,Thu Nov 25 06:23:35 CET,0.0 0.534 0.774 0.949 1.101 1.219 1.336 1.439 1.619 1.722 1.819 1.888 2.06 2.138 2.295 2.442 2.575 2.634 2.746 2.862 3.039 3.161 3.284 3.454 3.618 3.773 3.914 4.048 4.236 4.417 4.578 4.772 4.976 5.174 5.401 5.651 5.884 6.149 6.422 6.689 6.974 7.302 7.652 7.997 8.405 8.833 9.292 9.75 10.217 10.704 11.058 11.104 10.973 10.755 10.541 10.339 10.107 9.884 9.682 9.446 9.24 9.054 8.868 8.701 8.554 8.403 8.231 8.075 7.943 7.809 7.673 7.561 7.449 7.326 7.208 7.089 6.988 6.889 6.783 6.712 6.637 6.514 6.437 6.358 6.311 6.207 6.097 5.98 5.922 5.775 5.723 5.65 5.576 5.397 5.298 5.196 5.086 4.955 4.819 4.665 4.424 -2 ,8784 ,KEBNE ,16678870,Thu Nov 25 04:52:23 CET,Thu Nov 25 06:25:57 CET,0.0 0.439 0.68 0.885 1.044 1.172 1.293 1.41 1.604 1.687 1.763 1.84 2.018 2.1 2.254 2.392 2.54 2.613 2.753 2.886 3.072 3.19 3.303 3.455 3.603 3.764 3.925 4.078 4.267 4.448 4.631 4.854 5.06 5.251 5.475 5.72 5.957 6.219 6.503 6.796 7.094 7.435 7.813 8.199 8.653 9.124 9.636 10.188 10.766 11.346 11.873 12.16 12.182 12.008 11.772 11.538 11.296 11.071 10.858 10.622 10.417 10.239 10.083 9.937 9.791 9.643 9.489 9.369 9.261 9.131 8.998 8.887 8.764 8.638 8.549 8.458 8.357 8.25 8.133 8.048 7.967 7.844 7.76 7.675 7.628 7.529 7.424 7.318 7.258 7.1 7.064 6.991 6.913 6.732 6.629 6.511 6.378 6.249 6.102 5.908 5.46 -3 ,3284 ,KEBNE ,16678871,Thu Nov 25 04:53:24 CET,Thu Nov 25 06:27:15 CET,0.0 0.257 0.441 0.602 0.736 0.87 0.994 1.118 1.351 1.459 1.572 1.669 1.845 1.924 2.06 2.198 2.35 2.425 2.561 2.697 2.899 3.025 3.14 3.3 3.455 3.604 3.749 3.892 4.082 4.261 4.439 4.642 4.821 4.998 5.221 5.471 5.696 5.936 6.193 6.471 6.756 7.056 7.408 7.746 8.122 8.541 9.005 9.533 10.113 10.699 11.192 11.255 11.089 10.883 10.664 10.445 10.233 9.982 9.741 9.516 9.326 9.161 9.008 8.845 8.694 8.557 8.403 8.271 8.156 8.033 7.904 7.788 7.67 7.559 7.475 7.383 7.281 7.174 7.063 6.997 6.92 6.789 6.708 6.615 6.563 6.455 6.355 6.262 6.214 6.062 6.035 5.968 5.9 5.77 5.699 5.618 5.521 5.424 5.328 5.204 4.92 -4 ,17739 ,KEBNE ,16678872,Thu Nov 25 04:53:24 CET,Thu Nov 25 06:26:51 CET,0.0 0.604 0.837 1.008 1.167 1.306 1.43 1.564 1.81 1.912 1.996 2.047 2.215 2.291 2.429 2.549 2.665 2.724 2.845 2.97 3.144 3.254 3.367 3.524 3.666 3.812 3.954 4.095 4.284 4.473 4.656 4.868 5.071 5.255 5.468 5.721 5.959 6.215 6.501 6.817 7.145 7.505 7.882 8.232 8.61 9.018 9.505 9.984 10.455 10.974 11.413 11.5 11.366 11.134 10.924 10.709 10.497 10.279 10.068 9.852 9.659 9.47 9.283 9.111 8.936 8.777 8.622 8.489 8.37 8.247 8.122 8.012 7.885 7.753 7.657 7.56 7.468 7.372 7.266 7.191 7.112 6.972 6.878 6.789 6.74 6.629 6.518 6.414 6.361 6.212 6.151 6.066 5.973 5.786 5.689 5.587 5.485 5.381 5.243 5.05 4.626 -5 ,11056 ,KEBNE ,16678873,Thu Nov 25 04:55:27 CET,Thu Nov 25 06:27:48 CET,0.0 0.378 0.557 0.737 0.88 1.014 1.131 1.244 1.444 1.54 1.637 1.707 1.892 1.974 2.139 2.298 2.426 2.489 2.608 2.722 2.911 3.034 3.145 3.296 3.44 3.579 3.718 3.852 4.021 4.2 4.373 4.58 4.787 4.986 5.202 5.436 5.661 5.904 6.166 6.434 6.711 7.029 7.39 7.747 8.146 8.571 9.029 9.522 10.063 10.581 11.113 11.333 11.267 11.144 10.963 10.749 10.536 10.31 10.095 9.885 9.705 9.527 9.337 9.156 8.996 8.849 8.674 8.522 8.402 8.27 8.129 8.012 7.898 7.776 7.68 7.584 7.47 7.35 7.235 7.151 7.062 6.918 6.812 6.71 6.668 6.571 6.469 6.369 6.311 6.157 6.126 6.062 5.99 5.829 5.748 5.661 5.551 5.43 5.275 5.043 4.376 -6 ,9998 ,KEBNE ,16678874,Thu Nov 25 04:55:26 CET,Thu Nov 25 06:25:16 CET,0.0 0.33 0.531 0.692 0.824 0.953 1.077 1.173 1.342 1.421 1.509 1.581 1.761 1.833 1.976 2.135 2.288 2.358 2.48 2.597 2.781 2.899 3.013 3.174 3.315 3.454 3.585 3.726 3.921 4.096 4.254 4.453 4.645 4.825 5.023 5.256 5.497 5.75 6.025 6.307 6.593 6.913 7.273 7.63 8.033 8.473 8.931 9.387 9.847 10.356 10.902 11.135 11.115 10.956 10.726 10.471 10.243 10.035 9.811 9.581 9.388 9.219 9.05 8.862 8.7 8.574 8.44 8.299 8.179 8.071 7.945 7.818 7.691 7.563 7.467 7.38 7.305 7.221 7.119 7.05 6.975 6.853 6.762 6.666 6.617 6.516 6.411 6.303 6.248 6.088 6.055 5.985 5.911 5.755 5.667 5.578 5.475 5.346 5.212 5.075 4.805 -7 ,16540 ,KEBNE ,16678875,Thu Nov 25 04:55:26 CET,Thu Nov 25 06:24:40 CET,0.0 0.31 0.459 0.598 0.722 0.86 1.007 1.127 1.32 1.403 1.477 1.556 1.723 1.793 1.939 2.095 2.23 2.292 2.417 2.522 2.676 2.785 2.906 3.075 3.216 3.361 3.496 3.632 3.817 4.004 4.195 4.408 4.6 4.781 4.992 5.231 5.442 5.67 5.93 6.209 6.497 6.811 7.193 7.574 7.998 8.451 8.925 9.447 10.051 10.679 11.275 11.527 11.527 11.384 11.146 10.914 10.689 10.454 10.25 10.047 9.869 9.711 9.549 9.397 9.258 9.117 8.963 8.828 8.711 8.586 8.458 8.343 8.221 8.115 8.033 7.942 7.841 7.739 7.631 7.558 7.48 7.358 7.274 7.173 7.122 7.024 6.908 6.781 6.727 6.586 6.566 6.493 6.405 6.222 6.13 6.044 5.939 5.83 5.709 5.554 5.19 -8 ,15462 ,KEBNE ,16678876,Thu Nov 25 04:57:30 CET,Thu Nov 25 06:29:30 CET,0.0 0.396 0.598 0.836 1.056 1.21 1.343 1.463 1.677 1.796 1.923 2.051 2.242 2.326 2.501 2.659 2.797 2.868 3.006 3.149 3.363 3.491 3.604 3.767 3.924 4.065 4.203 4.34 4.522 4.715 4.906 5.119 5.319 5.516 5.748 6.008 6.251 6.501 6.768 7.063 7.368 7.698 8.072 8.431 8.841 9.27 9.784 10.33 10.902 11.548 12.088 12.322 12.264 12.077 11.89 11.688 11.475 11.27 11.088 10.882 10.703 10.547 10.376 10.206 10.057 9.915 9.763 9.639 9.532 9.409 9.287 9.184 9.065 8.932 8.826 8.724 8.627 8.526 8.407 8.318 8.224 8.079 7.982 7.885 7.835 7.726 7.613 7.497 7.424 7.251 7.194 7.12 7.038 6.859 6.776 6.686 6.572 6.43 6.277 6.086 5.668 -9 ,3966 ,KEBNE ,16678877,Thu Nov 25 04:57:29 CET,Thu Nov 25 06:27:51 CET,0.0 0.486 0.75 0.945 1.108 1.257 1.398 1.534 1.786 1.904 2.022 2.151 2.34 2.429 2.602 2.766 2.921 2.988 3.14 3.289 3.483 3.606 3.729 3.917 4.089 4.247 4.396 4.541 4.726 4.903 5.065 5.262 5.469 5.667 5.88 6.117 6.348 6.606 6.895 7.193 7.509 7.858 8.237 8.598 9.003 9.45 9.956 10.472 11.047 11.684 12.277 12.542 12.541 12.403 12.199 11.99 11.803 11.587 11.382 11.184 11.015 10.845 10.663 10.499 10.341 10.19 10.03 9.899 9.785 9.661 9.526 9.409 9.29 9.174 9.083 8.978 8.86 8.747 8.637 8.554 8.466 8.324 8.222 8.116 8.062 7.947 7.814 7.685 7.63 7.481 7.459 7.394 7.32 7.15 7.051 6.95 6.846 6.733 6.608 6.446 5.934 -10 ,16450 ,KEBNE ,16678878,Thu Nov 25 04:58:31 CET,Thu Nov 25 06:28:32 CET,0.0 0.355 0.524 0.668 0.786 0.904 1.032 1.138 1.299 1.376 1.456 1.516 1.683 1.757 1.888 2.006 2.133 2.197 2.32 2.44 2.626 2.753 2.878 3.044 3.2 3.35 3.504 3.651 3.829 4.01 4.183 4.377 4.571 4.768 4.989 5.24 5.483 5.736 6.008 6.312 6.65 7.02 7.417 7.802 8.264 8.76 9.243 9.786 10.361 10.883 11.354 11.456 11.338 11.117 10.852 10.582 10.344 10.139 9.967 9.782 9.58 9.402 9.248 9.091 8.926 8.773 8.614 8.477 8.357 8.234 8.11 8.004 7.891 7.774 7.688 7.591 7.482 7.38 7.274 7.192 7.114 7.001 6.924 6.84 6.791 6.694 6.61 6.516 6.458 6.302 6.275 6.227 6.178 6.033 5.933 5.828 5.713 5.585 5.459 5.312 5.012 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8d.txt deleted file mode 100644 index 5f2c0d2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19761 ,KEBNE ,16678879,Thu Nov 25 04:59:33 CET,Thu Nov 25 06:30:35 CET,0.0 0.505 0.67 0.798 0.907 0.999 1.089 1.153 1.25 1.304 1.362 1.365 1.511 1.558 1.645 1.724 1.806 1.846 1.92 1.989 2.083 2.139 2.196 2.286 2.377 2.463 2.548 2.628 2.727 2.815 2.89 2.987 3.08 3.173 3.277 3.395 3.501 3.608 3.735 3.879 4.027 4.187 4.354 4.501 4.656 4.8 4.934 5.004 5.017 4.942 4.469 3.637 2.938 2.279 1.666 1.12 0.57 0.048 -0.375 -0.83 -1.244 -1.639 -2.025 -2.354 -2.665 -2.975 -3.296 -3.575 -3.812 -4.06 -4.331 -4.551 -4.779 -5.02 -5.222 -5.442 -5.662 -5.885 -6.125 -6.291 -6.465 -6.738 -6.937 -7.145 -7.25 -7.484 -7.724 -7.952 -8.082 -8.342 -8.529 -8.681 -8.845 -9.215 -9.398 -9.59 -9.841 -10.166 -10.582 -11.092 -12.782 -2 ,4261 ,KEBNE ,16678880,Thu Nov 25 04:59:37 CET,Thu Nov 25 06:27:07 CET,0.0 0.294 0.394 0.476 0.547 0.63 0.709 0.764 0.856 0.904 0.957 0.986 1.14 1.191 1.289 1.363 1.442 1.487 1.567 1.639 1.726 1.786 1.85 1.942 2.024 2.11 2.191 2.26 2.35 2.433 2.521 2.631 2.74 2.837 2.937 3.047 3.137 3.235 3.35 3.483 3.616 3.736 3.857 3.983 4.12 4.213 4.271 4.318 4.332 4.245 3.845 3.11 2.279 1.52 0.826 0.189 -0.304 -0.787 -1.285 -1.803 -2.23 -2.623 -3.003 -3.366 -3.715 -4.041 -4.401 -4.715 -4.986 -5.287 -5.605 -5.871 -6.128 -6.376 -6.581 -6.79 -7.004 -7.233 -7.466 -7.625 -7.795 -8.073 -8.276 -8.495 -8.603 -8.824 -9.07 -9.339 -9.459 -9.698 -9.894 -10.064 -10.239 -10.612 -10.845 -11.087 -11.353 -11.681 -12.098 -12.605 -14.326 -3 ,20346 ,KEBNE ,16678881,Thu Nov 25 04:59:37 CET,Thu Nov 25 06:26:09 CET,0.0 0.239 0.387 0.486 0.601 0.697 0.756 0.825 0.943 0.987 1.036 1.046 1.198 1.246 1.329 1.409 1.499 1.544 1.631 1.711 1.811 1.876 1.943 2.05 2.144 2.216 2.281 2.341 2.422 2.509 2.598 2.695 2.78 2.866 2.975 3.115 3.242 3.36 3.479 3.597 3.711 3.826 3.949 4.074 4.186 4.285 4.393 4.458 4.432 4.222 3.733 3.016 2.271 1.592 0.927 0.267 -0.32 -0.858 -1.324 -1.789 -2.225 -2.639 -3.057 -3.462 -3.827 -4.161 -4.498 -4.807 -5.077 -5.342 -5.616 -5.842 -6.076 -6.327 -6.528 -6.734 -6.949 -7.178 -7.419 -7.587 -7.766 -8.075 -8.272 -8.467 -8.579 -8.808 -9.041 -9.286 -9.422 -9.693 -9.888 -10.051 -10.228 -10.649 -10.882 -11.125 -11.397 -11.701 -12.082 -12.656 -14.554 -4 ,9052 ,KEBNE ,16678882,Thu Nov 25 05:00:35 CET,Thu Nov 25 06:29:43 CET,0.0 0.172 0.338 0.455 0.547 0.629 0.71 0.775 0.887 0.948 1.007 1.017 1.167 1.214 1.286 1.362 1.448 1.487 1.557 1.637 1.748 1.805 1.852 1.928 2.007 2.084 2.158 2.229 2.32 2.409 2.494 2.583 2.677 2.771 2.872 2.98 3.09 3.204 3.308 3.41 3.523 3.649 3.78 3.915 4.07 4.199 4.277 4.306 4.299 4.184 3.749 2.996 2.296 1.643 1.021 0.393 -0.15 -0.677 -1.146 -1.591 -1.999 -2.39 -2.761 -3.095 -3.394 -3.67 -3.968 -4.245 -4.493 -4.749 -5.042 -5.294 -5.561 -5.849 -6.055 -6.238 -6.439 -6.682 -6.932 -7.103 -7.27 -7.522 -7.696 -7.876 -7.969 -8.174 -8.401 -8.657 -8.797 -9.053 -9.239 -9.401 -9.579 -9.953 -10.17 -10.422 -10.676 -10.973 -11.401 -12.017 -13.995 -5 ,20560 ,KEBNE ,16678883,Thu Nov 25 05:01:37 CET,Thu Nov 25 06:31:43 CET,0.0 0.189 0.316 0.408 0.509 0.591 0.665 0.74 0.862 0.921 0.979 0.976 1.122 1.171 1.262 1.339 1.422 1.463 1.539 1.606 1.701 1.768 1.834 1.928 2.023 2.106 2.18 2.251 2.339 2.416 2.478 2.565 2.654 2.737 2.829 2.932 3.02 3.102 3.206 3.325 3.448 3.58 3.712 3.841 3.99 4.135 4.241 4.315 4.355 4.203 3.742 3.042 2.299 1.582 0.899 0.277 -0.276 -0.85 -1.359 -1.804 -2.191 -2.593 -2.982 -3.335 -3.686 -4.008 -4.343 -4.651 -4.911 -5.189 -5.486 -5.732 -5.973 -6.228 -6.431 -6.643 -6.882 -7.144 -7.395 -7.557 -7.736 -8.017 -8.213 -8.414 -8.516 -8.737 -8.979 -9.224 -9.355 -9.611 -9.796 -9.957 -10.148 -10.586 -10.842 -11.101 -11.347 -11.668 -12.069 -12.6 -14.52 -6 ,28404 ,KEBNE ,16678884,Thu Nov 25 05:01:37 CET,Thu Nov 25 06:31:06 CET,0.0 0.119 0.249 0.353 0.418 0.482 0.547 0.61 0.724 0.775 0.834 0.846 0.992 1.037 1.132 1.234 1.319 1.353 1.421 1.496 1.591 1.649 1.707 1.787 1.855 1.921 2.0 2.084 2.189 2.282 2.364 2.452 2.537 2.618 2.708 2.823 2.93 3.034 3.153 3.263 3.361 3.455 3.574 3.72 3.868 3.965 4.046 4.105 4.083 3.915 3.413 2.586 1.804 1.071 0.382 -0.277 -0.848 -1.339 -1.774 -2.235 -2.649 -3.037 -3.435 -3.805 -4.143 -4.443 -4.729 -5.002 -5.268 -5.57 -5.894 -6.167 -6.448 -6.728 -6.936 -7.16 -7.402 -7.642 -7.881 -8.044 -8.212 -8.483 -8.681 -8.886 -8.99 -9.218 -9.462 -9.697 -9.821 -10.061 -10.249 -10.409 -10.567 -10.934 -11.141 -11.352 -11.602 -11.91 -12.25 -12.757 -14.866 -7 ,27943 ,KEBNE ,16678885,Thu Nov 25 05:01:36 CET,Thu Nov 25 06:30:29 CET,0.0 0.439 0.627 0.738 0.835 0.918 0.996 1.078 1.212 1.276 1.335 1.338 1.487 1.537 1.638 1.724 1.801 1.838 1.917 1.992 2.09 2.154 2.211 2.311 2.415 2.506 2.585 2.667 2.783 2.891 2.983 3.078 3.185 3.299 3.42 3.54 3.65 3.77 3.898 4.027 4.136 4.253 4.399 4.517 4.624 4.735 4.832 4.902 4.939 4.783 4.282 3.518 2.761 2.062 1.362 0.746 0.252 -0.246 -0.717 -1.195 -1.644 -2.073 -2.458 -2.811 -3.122 -3.394 -3.706 -4.011 -4.282 -4.576 -4.905 -5.161 -5.412 -5.677 -5.882 -6.092 -6.31 -6.523 -6.748 -6.923 -7.101 -7.374 -7.573 -7.787 -7.887 -8.094 -8.338 -8.599 -8.743 -8.99 -9.138 -9.29 -9.464 -9.862 -10.067 -10.283 -10.526 -10.821 -11.191 -11.713 -13.805 -8 ,7487 ,KEBNE ,16678886,Thu Nov 25 05:02:39 CET,Thu Nov 25 06:36:06 CET,0.0 0.12 0.261 0.38 0.455 0.537 0.629 0.715 0.849 0.903 0.953 0.954 1.107 1.156 1.235 1.311 1.388 1.421 1.482 1.547 1.637 1.699 1.759 1.841 1.914 1.988 2.077 2.163 2.264 2.364 2.455 2.559 2.662 2.757 2.87 2.984 3.089 3.203 3.322 3.454 3.566 3.674 3.806 3.933 4.061 4.18 4.266 4.309 4.285 4.084 3.543 2.606 1.664 0.806 0.04 -0.642 -1.236 -1.81 -2.322 -2.803 -3.225 -3.602 -3.976 -4.321 -4.649 -4.975 -5.295 -5.591 -5.847 -6.117 -6.431 -6.687 -6.934 -7.184 -7.388 -7.604 -7.82 -8.058 -8.315 -8.49 -8.666 -8.95 -9.152 -9.354 -9.463 -9.681 -9.917 -10.181 -10.319 -10.585 -10.772 -10.922 -11.071 -11.434 -11.632 -11.844 -12.098 -12.417 -12.852 -13.441 -15.265 -9 ,19311 ,KEBNE ,16678887,Thu Nov 25 05:02:39 CET,Thu Nov 25 06:32:45 CET,0.0 0.234 0.341 0.439 0.527 0.598 0.655 0.71 0.834 0.89 0.943 0.966 1.126 1.183 1.294 1.378 1.45 1.49 1.557 1.611 1.701 1.76 1.817 1.907 1.99 2.062 2.141 2.224 2.31 2.388 2.47 2.556 2.647 2.738 2.82 2.921 3.033 3.145 3.242 3.335 3.452 3.595 3.753 3.877 3.984 4.096 4.195 4.257 4.271 4.104 3.634 2.933 2.178 1.453 0.81 0.241 -0.297 -0.824 -1.286 -1.768 -2.172 -2.529 -2.89 -3.246 -3.558 -3.828 -4.146 -4.46 -4.747 -5.036 -5.317 -5.563 -5.826 -6.085 -6.294 -6.531 -6.775 -7.038 -7.317 -7.49 -7.654 -7.912 -8.081 -8.261 -8.363 -8.59 -8.819 -9.057 -9.192 -9.441 -9.584 -9.734 -9.909 -10.294 -10.502 -10.737 -11.036 -11.395 -11.793 -12.329 -14.44 -10 ,16973 ,KEBNE ,16678888,Thu Nov 25 05:02:39 CET,Thu Nov 25 06:32:56 CET,0.0 0.43 0.556 0.633 0.728 0.827 0.908 0.976 1.09 1.15 1.21 1.224 1.365 1.413 1.496 1.568 1.65 1.693 1.767 1.834 1.935 1.998 2.049 2.118 2.187 2.25 2.323 2.398 2.5 2.599 2.674 2.772 2.864 2.945 3.039 3.138 3.239 3.36 3.487 3.6 3.714 3.826 3.944 4.074 4.209 4.32 4.409 4.471 4.461 4.269 3.826 3.144 2.423 1.665 0.91 0.242 -0.316 -0.851 -1.32 -1.809 -2.25 -2.638 -3.008 -3.381 -3.744 -4.045 -4.387 -4.702 -4.955 -5.232 -5.504 -5.732 -5.987 -6.257 -6.472 -6.701 -6.931 -7.175 -7.437 -7.617 -7.797 -8.073 -8.269 -8.474 -8.573 -8.766 -8.996 -9.248 -9.381 -9.627 -9.804 -9.95 -10.11 -10.532 -10.77 -11.03 -11.323 -11.677 -12.088 -12.618 -14.545 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8e.txt deleted file mode 100644 index bae48baa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32397 ,KEBNE ,16678889,Thu Nov 25 05:03:40 CET,Thu Nov 25 06:33:18 CET,0.0 0.257 0.365 0.492 0.596 0.685 0.759 0.834 0.99 1.051 1.108 1.141 1.295 1.349 1.461 1.549 1.629 1.668 1.75 1.831 1.947 2.021 2.098 2.202 2.295 2.393 2.477 2.559 2.665 2.759 2.852 2.968 3.075 3.176 3.304 3.444 3.563 3.698 3.848 4.003 4.155 4.327 4.498 4.636 4.79 4.967 5.16 5.339 5.507 5.554 5.357 4.906 4.39 3.883 3.365 2.879 2.486 2.108 1.754 1.388 1.091 0.826 0.559 0.31 0.08 -0.129 -0.343 -0.533 -0.7 -0.875 -1.063 -1.226 -1.391 -1.558 -1.7 -1.84 -1.979 -2.13 -2.277 -2.383 -2.497 -2.663 -2.765 -2.863 -2.917 -3.031 -3.148 -3.286 -3.355 -3.523 -3.592 -3.682 -3.769 -3.965 -4.083 -4.224 -4.373 -4.516 -4.684 -4.887 -5.258 -2 ,13404 ,KEBNE ,16678890,Thu Nov 25 05:03:40 CET,Thu Nov 25 06:34:15 CET,0.0 0.247 0.41 0.529 0.637 0.751 0.834 0.892 1.019 1.085 1.139 1.153 1.298 1.335 1.417 1.502 1.59 1.63 1.711 1.789 1.881 1.936 2.005 2.108 2.197 2.278 2.353 2.433 2.554 2.667 2.758 2.87 2.982 3.093 3.227 3.363 3.476 3.603 3.742 3.887 4.044 4.218 4.398 4.564 4.743 4.908 5.079 5.217 5.289 5.331 5.16 4.662 4.178 3.727 3.335 2.953 2.585 2.228 1.923 1.63 1.381 1.155 0.922 0.71 0.501 0.294 0.089 -0.077 -0.226 -0.376 -0.528 -0.669 -0.818 -0.969 -1.089 -1.216 -1.347 -1.489 -1.633 -1.732 -1.839 -2.003 -2.11 -2.217 -2.272 -2.384 -2.494 -2.622 -2.697 -2.873 -2.937 -3.024 -3.115 -3.31 -3.419 -3.536 -3.651 -3.786 -3.939 -4.138 -4.587 -3 ,13564 ,KEBNE ,16678891,Thu Nov 25 05:03:40 CET,Thu Nov 25 06:33:11 CET,0.0 0.221 0.34 0.458 0.552 0.608 0.668 0.731 0.848 0.908 0.964 0.977 1.12 1.161 1.25 1.334 1.409 1.444 1.502 1.567 1.674 1.737 1.804 1.914 2.015 2.102 2.178 2.245 2.354 2.464 2.556 2.677 2.794 2.893 3.006 3.138 3.262 3.389 3.525 3.66 3.794 3.961 4.135 4.272 4.43 4.581 4.742 4.932 5.111 5.213 5.117 4.676 4.109 3.552 3.08 2.662 2.27 1.898 1.566 1.239 0.974 0.73 0.499 0.283 0.066 -0.13 -0.337 -0.548 -0.726 -0.895 -1.063 -1.199 -1.348 -1.508 -1.632 -1.742 -1.85 -1.97 -2.093 -2.177 -2.268 -2.422 -2.531 -2.642 -2.699 -2.818 -2.933 -3.054 -3.127 -3.299 -3.349 -3.431 -3.513 -3.691 -3.784 -3.874 -3.983 -4.141 -4.341 -4.559 -5.166 -4 ,11164 ,KEBNE ,16678892,Thu Nov 25 05:03:40 CET,Thu Nov 25 06:32:22 CET,0.0 0.168 0.273 0.39 0.513 0.614 0.691 0.776 0.905 0.958 1.019 1.034 1.174 1.224 1.329 1.417 1.502 1.546 1.629 1.704 1.804 1.871 1.94 2.023 2.105 2.189 2.264 2.334 2.423 2.522 2.624 2.735 2.835 2.939 3.063 3.186 3.307 3.455 3.613 3.77 3.921 4.079 4.235 4.404 4.621 4.837 5.048 5.223 5.371 5.42 5.167 4.561 3.954 3.38 2.911 2.531 2.17 1.83 1.546 1.262 1.017 0.79 0.551 0.316 0.093 -0.104 -0.302 -0.485 -0.64 -0.813 -1.004 -1.146 -1.285 -1.427 -1.533 -1.646 -1.773 -1.904 -2.049 -2.159 -2.275 -2.467 -2.599 -2.732 -2.801 -2.938 -3.079 -3.239 -3.332 -3.529 -3.621 -3.731 -3.843 -4.072 -4.205 -4.342 -4.48 -4.652 -4.847 -5.076 -5.493 -5 ,20403 ,KEBNE ,16678893,Thu Nov 25 05:04:42 CET,Thu Nov 25 06:33:23 CET,0.0 0.305 0.467 0.557 0.636 0.699 0.766 0.839 0.966 1.025 1.08 1.089 1.226 1.275 1.37 1.459 1.538 1.582 1.671 1.743 1.847 1.923 1.992 2.078 2.168 2.251 2.329 2.408 2.513 2.617 2.714 2.833 2.941 3.031 3.136 3.259 3.376 3.516 3.661 3.804 3.95 4.107 4.295 4.477 4.663 4.842 5.032 5.238 5.462 5.595 5.42 4.958 4.456 3.94 3.474 3.042 2.663 2.313 1.988 1.679 1.42 1.174 0.929 0.696 0.481 0.291 0.108 -0.061 -0.219 -0.386 -0.55 -0.683 -0.826 -0.976 -1.105 -1.247 -1.382 -1.529 -1.683 -1.782 -1.888 -2.065 -2.192 -2.321 -2.386 -2.516 -2.651 -2.79 -2.863 -3.041 -3.114 -3.196 -3.282 -3.465 -3.566 -3.682 -3.819 -3.972 -4.149 -4.371 -4.791 -6 ,23620 ,KEBNE ,16678894,Thu Nov 25 05:04:42 CET,Thu Nov 25 06:33:45 CET,0.0 0.401 0.564 0.702 0.803 0.896 0.989 1.086 1.248 1.309 1.369 1.379 1.527 1.579 1.684 1.781 1.872 1.914 2.007 2.105 2.247 2.339 2.417 2.52 2.631 2.737 2.821 2.891 2.981 3.075 3.166 3.273 3.372 3.473 3.588 3.709 3.822 3.94 4.073 4.219 4.37 4.535 4.722 4.892 5.078 5.27 5.443 5.6 5.731 5.722 5.386 4.824 4.312 3.834 3.376 2.952 2.569 2.218 1.897 1.564 1.29 1.041 0.8 0.577 0.368 0.154 -0.074 -0.262 -0.413 -0.57 -0.742 -0.891 -1.062 -1.227 -1.337 -1.452 -1.584 -1.714 -1.837 -1.927 -2.03 -2.192 -2.3 -2.422 -2.488 -2.62 -2.756 -2.91 -2.991 -3.168 -3.219 -3.319 -3.417 -3.62 -3.727 -3.838 -3.979 -4.119 -4.287 -4.484 -4.891 -7 ,9789 ,KEBNE ,16678895,Thu Nov 25 05:04:42 CET,Thu Nov 25 06:33:29 CET,0.0 0.306 0.441 0.569 0.683 0.768 0.864 0.952 1.107 1.18 1.259 1.306 1.456 1.508 1.606 1.697 1.779 1.816 1.885 1.959 2.067 2.135 2.203 2.301 2.393 2.482 2.575 2.66 2.755 2.849 2.951 3.067 3.176 3.275 3.387 3.505 3.617 3.735 3.849 3.982 4.128 4.295 4.47 4.622 4.789 4.968 5.149 5.303 5.435 5.479 5.278 4.876 4.453 3.968 3.49 3.045 2.677 2.363 2.072 1.741 1.451 1.211 0.986 0.749 0.53 0.358 0.172 -0.016 -0.186 -0.354 -0.53 -0.679 -0.834 -1.007 -1.143 -1.273 -1.398 -1.52 -1.648 -1.746 -1.85 -2.011 -2.128 -2.255 -2.314 -2.435 -2.567 -2.699 -2.768 -2.937 -2.973 -3.041 -3.122 -3.299 -3.407 -3.538 -3.655 -3.77 -3.929 -4.137 -4.641 -8 ,1002 ,KEBNE ,16678896,Thu Nov 25 05:04:46 CET,Thu Nov 25 06:32:13 CET,0.0 0.435 0.613 0.75 0.875 0.986 1.083 1.153 1.276 1.35 1.433 1.476 1.637 1.701 1.81 1.905 1.992 2.032 2.105 2.175 2.275 2.342 2.408 2.499 2.588 2.672 2.745 2.815 2.919 3.013 3.103 3.227 3.332 3.425 3.539 3.664 3.788 3.933 4.084 4.227 4.355 4.497 4.665 4.821 4.979 5.137 5.296 5.439 5.535 5.563 5.449 5.074 4.634 4.209 3.788 3.352 2.964 2.627 2.33 2.021 1.752 1.509 1.271 1.041 0.83 0.644 0.435 0.236 0.08 -0.088 -0.269 -0.407 -0.551 -0.714 -0.844 -0.981 -1.109 -1.237 -1.368 -1.459 -1.559 -1.706 -1.803 -1.92 -1.988 -2.124 -2.25 -2.364 -2.427 -2.6 -2.655 -2.74 -2.844 -3.09 -3.226 -3.367 -3.5 -3.649 -3.8 -3.977 -4.414 -9 ,28835 ,KEBNE ,16678897,Thu Nov 25 05:05:43 CET,Thu Nov 25 06:35:42 CET,0.0 0.222 0.357 0.473 0.555 0.633 0.717 0.795 0.948 1.016 1.079 1.085 1.229 1.271 1.358 1.451 1.542 1.579 1.657 1.741 1.854 1.924 1.986 2.067 2.153 2.248 2.343 2.422 2.525 2.633 2.722 2.842 2.958 3.066 3.183 3.294 3.416 3.553 3.678 3.8 3.935 4.1 4.264 4.391 4.54 4.695 4.844 4.996 5.153 5.193 4.915 4.373 3.824 3.31 2.844 2.396 1.975 1.579 1.242 0.888 0.568 0.272 -0.029 -0.287 -0.495 -0.705 -0.946 -1.149 -1.327 -1.517 -1.707 -1.865 -2.039 -2.229 -2.379 -2.535 -2.695 -2.851 -3.003 -3.107 -3.213 -3.37 -3.481 -3.596 -3.652 -3.781 -3.909 -4.039 -4.119 -4.303 -4.375 -4.463 -4.554 -4.771 -4.889 -5.003 -5.13 -5.263 -5.427 -5.683 -6.135 -10 ,4430 ,KEBNE ,16678898,Thu Nov 25 05:05:43 CET,Thu Nov 25 06:35:06 CET,0.0 0.465 0.678 0.805 0.884 0.939 1.019 1.103 1.233 1.289 1.339 1.353 1.507 1.561 1.66 1.758 1.85 1.892 1.969 2.045 2.159 2.227 2.285 2.373 2.468 2.551 2.629 2.705 2.802 2.898 2.995 3.106 3.196 3.285 3.394 3.518 3.641 3.754 3.877 4.028 4.174 4.327 4.5 4.65 4.833 5.04 5.226 5.38 5.5 5.576 5.479 5.132 4.74 4.266 3.8 3.405 3.04 2.705 2.414 2.098 1.841 1.603 1.362 1.137 0.928 0.733 0.528 0.347 0.192 0.042 -0.126 -0.267 -0.404 -0.55 -0.672 -0.809 -0.935 -1.058 -1.2 -1.294 -1.39 -1.555 -1.682 -1.815 -1.882 -2.015 -2.147 -2.284 -2.361 -2.54 -2.583 -2.671 -2.76 -2.939 -3.042 -3.149 -3.269 -3.408 -3.564 -3.718 -3.981 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_1b_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_1b_1a.txt deleted file mode 100644 index 5980c9f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_1b_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10521 ,KEBNE ,16678899,Thu Nov 25 05:05:43 CET,Thu Nov 25 06:29:48 CET,0.0 0.45 0.634 0.771 0.882 0.984 1.087 1.178 1.328 1.392 1.447 1.502 1.619 1.672 1.768 1.858 1.947 1.992 2.072 2.144 2.245 2.319 2.394 2.495 2.59 2.677 2.769 2.857 2.971 3.083 3.184 3.309 3.439 3.568 3.715 3.873 4.023 4.193 4.367 4.54 4.741 4.982 5.237 5.481 5.784 6.155 6.556 6.991 7.478 8.023 8.608 8.929 8.999 8.943 8.835 8.686 8.528 8.364 8.211 8.04 7.881 7.734 7.579 7.425 7.279 7.153 7.018 6.886 6.756 6.61 6.464 6.346 6.234 6.115 6.013 5.917 5.818 5.69 5.548 5.455 5.366 5.222 5.11 4.994 4.934 4.806 4.674 4.533 4.463 4.337 4.197 4.102 4.005 3.765 3.613 3.449 3.274 3.069 2.802 2.461 1.117 -2 ,10022 ,KEBNE ,16678900,Thu Nov 25 05:06:45 CET,Thu Nov 25 06:32:50 CET,0.0 0.572 0.815 0.958 1.069 1.175 1.275 1.365 1.53 1.603 1.671 1.737 1.846 1.897 2.009 2.111 2.199 2.239 2.323 2.415 2.539 2.605 2.669 2.776 2.879 2.973 3.059 3.14 3.251 3.362 3.471 3.604 3.726 3.844 3.982 4.129 4.268 4.418 4.58 4.77 4.973 5.179 5.433 5.698 5.99 6.288 6.641 7.058 7.519 8.024 8.621 8.98 9.039 9.012 8.914 8.774 8.644 8.492 8.336 8.175 8.03 7.883 7.751 7.634 7.504 7.369 7.221 7.078 6.95 6.813 6.662 6.533 6.4 6.266 6.165 6.053 5.942 5.829 5.707 5.618 5.523 5.377 5.264 5.132 5.066 4.934 4.798 4.644 4.562 4.431 4.303 4.213 4.112 3.884 3.767 3.614 3.441 3.241 2.986 2.588 1.141 -3 ,32648 ,KEBNE ,16678901,Thu Nov 25 05:06:44 CET,Thu Nov 25 06:30:57 CET,0.0 0.533 0.784 0.939 1.058 1.17 1.263 1.335 1.486 1.552 1.605 1.656 1.774 1.83 1.921 2.012 2.097 2.141 2.225 2.306 2.434 2.516 2.587 2.683 2.783 2.875 2.958 3.044 3.159 3.276 3.394 3.527 3.649 3.773 3.914 4.072 4.225 4.401 4.585 4.77 4.962 5.187 5.44 5.687 5.992 6.333 6.724 7.169 7.648 8.184 8.784 9.13 9.199 9.164 9.091 8.953 8.813 8.689 8.557 8.404 8.267 8.141 7.995 7.848 7.704 7.571 7.434 7.303 7.192 7.07 6.946 6.849 6.728 6.603 6.51 6.405 6.299 6.182 6.053 5.957 5.853 5.693 5.579 5.463 5.406 5.29 5.158 5.003 4.917 4.785 4.651 4.554 4.452 4.225 4.091 3.922 3.728 3.529 3.257 2.83 1.494 -4 ,29291 ,KEBNE ,16678902,Thu Nov 25 05:07:46 CET,Thu Nov 25 06:30:53 CET,0.0 0.672 0.892 1.036 1.167 1.279 1.362 1.431 1.55 1.618 1.681 1.737 1.852 1.904 2.003 2.095 2.184 2.225 2.308 2.393 2.512 2.581 2.641 2.738 2.841 2.939 3.027 3.112 3.219 3.319 3.419 3.553 3.683 3.794 3.92 4.069 4.21 4.365 4.525 4.713 4.936 5.173 5.432 5.681 5.97 6.284 6.63 7.051 7.541 8.083 8.657 8.946 9.008 8.97 8.841 8.683 8.516 8.35 8.207 8.055 7.904 7.746 7.595 7.425 7.261 7.124 6.98 6.853 6.723 6.582 6.455 6.35 6.236 6.107 5.998 5.891 5.775 5.65 5.515 5.413 5.303 5.124 5.006 4.895 4.842 4.727 4.589 4.436 4.353 4.218 4.095 4.002 3.899 3.672 3.542 3.4 3.25 3.044 2.755 2.298 0.686 -5 ,27461 ,KEBNE ,16678903,Thu Nov 25 05:08:48 CET,Thu Nov 25 06:31:23 CET,0.0 0.677 0.965 1.153 1.303 1.409 1.495 1.58 1.723 1.783 1.84 1.881 1.99 2.045 2.149 2.256 2.357 2.399 2.474 2.542 2.635 2.699 2.767 2.866 2.958 3.051 3.144 3.235 3.352 3.461 3.567 3.706 3.836 3.952 4.081 4.235 4.389 4.548 4.725 4.925 5.132 5.349 5.594 5.846 6.143 6.463 6.81 7.215 7.689 8.238 8.845 9.181 9.25 9.19 9.075 8.945 8.81 8.639 8.48 8.318 8.159 8.01 7.866 7.713 7.565 7.436 7.303 7.175 7.056 6.931 6.802 6.681 6.544 6.417 6.322 6.21 6.087 5.957 5.826 5.738 5.651 5.511 5.395 5.264 5.2 5.065 4.937 4.794 4.709 4.57 4.427 4.315 4.2 3.982 3.852 3.704 3.51 3.266 2.963 2.508 0.669 -6 ,3532 ,KEBNE ,16678904,Thu Nov 25 05:08:48 CET,Thu Nov 25 06:33:23 CET,0.0 0.384 0.57 0.74 0.849 0.929 1.004 1.082 1.213 1.268 1.324 1.376 1.488 1.539 1.625 1.709 1.793 1.837 1.926 2.007 2.115 2.193 2.273 2.372 2.465 2.558 2.649 2.727 2.828 2.934 3.036 3.164 3.291 3.41 3.554 3.712 3.847 3.993 4.164 4.361 4.564 4.777 5.022 5.266 5.55 5.88 6.263 6.7 7.231 7.796 8.32 8.61 8.685 8.679 8.607 8.479 8.337 8.175 8.035 7.889 7.742 7.586 7.418 7.262 7.12 6.993 6.859 6.729 6.601 6.463 6.328 6.214 6.087 5.952 5.847 5.729 5.608 5.492 5.356 5.262 5.172 5.025 4.916 4.791 4.723 4.585 4.443 4.278 4.188 4.049 3.916 3.821 3.702 3.456 3.34 3.206 3.026 2.812 2.571 2.271 1.26 -7 ,4495 ,KEBNE ,16678905,Thu Nov 25 05:08:48 CET,Thu Nov 25 06:32:14 CET,0.0 0.356 0.493 0.612 0.726 0.838 0.941 1.038 1.211 1.289 1.356 1.418 1.53 1.581 1.687 1.798 1.899 1.945 2.03 2.114 2.238 2.315 2.387 2.486 2.579 2.67 2.763 2.852 2.968 3.079 3.183 3.31 3.435 3.554 3.692 3.848 4.0 4.177 4.362 4.55 4.742 4.97 5.238 5.504 5.818 6.16 6.553 6.97 7.424 7.959 8.541 8.859 8.924 8.892 8.804 8.675 8.547 8.4 8.252 8.102 7.935 7.781 7.643 7.499 7.362 7.238 7.105 6.976 6.858 6.728 6.593 6.484 6.366 6.236 6.131 6.019 5.908 5.799 5.675 5.585 5.492 5.34 5.233 5.129 5.069 4.933 4.786 4.623 4.543 4.409 4.284 4.195 4.089 3.844 3.694 3.521 3.366 3.191 2.931 2.581 1.623 -8 ,9466 ,KEBNE ,16678906,Thu Nov 25 05:08:48 CET,Thu Nov 25 06:33:35 CET,0.0 0.634 0.919 1.06 1.177 1.294 1.394 1.482 1.656 1.735 1.802 1.854 1.958 2.008 2.117 2.214 2.304 2.351 2.44 2.521 2.628 2.696 2.769 2.874 2.972 3.063 3.153 3.242 3.353 3.468 3.575 3.706 3.844 3.977 4.123 4.272 4.423 4.604 4.798 4.993 5.198 5.433 5.7 5.966 6.267 6.599 6.994 7.442 7.942 8.515 9.161 9.503 9.573 9.537 9.453 9.342 9.192 9.01 8.849 8.689 8.537 8.401 8.258 8.108 7.959 7.819 7.68 7.534 7.4 7.277 7.146 7.037 6.928 6.809 6.715 6.608 6.49 6.365 6.235 6.151 6.061 5.906 5.787 5.659 5.594 5.457 5.311 5.151 5.069 4.939 4.837 4.752 4.65 4.409 4.278 4.127 3.939 3.743 3.507 3.215 1.785 -9 ,10751 ,KEBNE ,16678907,Thu Nov 25 05:08:50 CET,Thu Nov 25 06:28:52 CET,0.0 0.491 0.678 0.809 0.909 1.002 1.091 1.163 1.294 1.36 1.425 1.491 1.602 1.655 1.756 1.842 1.921 1.963 2.043 2.118 2.231 2.304 2.369 2.457 2.55 2.635 2.716 2.8 2.91 3.029 3.144 3.277 3.401 3.514 3.643 3.807 3.971 4.135 4.305 4.502 4.711 4.933 5.187 5.438 5.745 6.081 6.457 6.894 7.385 7.937 8.525 8.884 8.985 8.916 8.807 8.674 8.506 8.332 8.166 7.986 7.831 7.684 7.534 7.395 7.25 7.108 6.97 6.84 6.72 6.591 6.455 6.343 6.226 6.106 6.002 5.886 5.767 5.644 5.502 5.401 5.299 5.137 5.025 4.908 4.847 4.717 4.575 4.402 4.31 4.179 4.052 3.956 3.851 3.632 3.485 3.314 3.139 2.956 2.723 2.321 0.895 -10 ,8131 ,KEBNE ,16678908,Thu Nov 25 05:08:52 CET,Thu Nov 25 06:27:51 CET,0.0 0.493 0.68 0.836 0.967 1.06 1.145 1.222 1.355 1.416 1.481 1.553 1.664 1.712 1.809 1.913 2.007 2.05 2.136 2.215 2.323 2.397 2.47 2.573 2.676 2.769 2.858 2.955 3.076 3.188 3.298 3.429 3.559 3.689 3.829 3.981 4.131 4.299 4.478 4.662 4.859 5.077 5.323 5.583 5.899 6.253 6.637 7.052 7.549 8.112 8.7 9.052 9.165 9.162 9.076 8.952 8.808 8.644 8.494 8.331 8.181 8.039 7.887 7.738 7.607 7.476 7.331 7.202 7.083 6.963 6.835 6.714 6.585 6.451 6.352 6.246 6.13 6.017 5.89 5.795 5.695 5.546 5.425 5.298 5.242 5.125 4.994 4.841 4.761 4.627 4.477 4.374 4.277 4.053 3.92 3.774 3.611 3.397 3.1 2.714 1.605 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1a.txt deleted file mode 100644 index 5bca5212..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24302 ,KEBNE ,16678909,Thu Nov 25 05:09:49 CET,Thu Nov 25 06:35:30 CET,0.0 0.389 0.568 0.701 0.825 0.942 1.032 1.101 1.234 1.307 1.374 1.427 1.545 1.607 1.717 1.808 1.898 1.945 2.033 2.115 2.247 2.339 2.426 2.549 2.668 2.78 2.885 2.985 3.118 3.247 3.368 3.512 3.656 3.809 3.981 4.169 4.361 4.569 4.804 5.069 5.332 5.619 5.963 6.309 6.727 7.208 7.759 8.384 9.173 10.152 11.311 12.263 12.794 13.095 13.266 13.328 13.332 13.317 13.29 13.261 13.216 13.157 13.084 12.99 12.907 12.824 12.707 12.601 12.513 12.409 12.276 12.157 12.037 11.93 11.844 11.75 11.638 11.508 11.374 11.276 11.182 11.011 10.892 10.776 10.717 10.607 10.473 10.287 10.191 10.053 9.868 9.75 9.634 9.325 9.128 8.917 8.7 8.433 8.061 7.702 5.16 -2 ,20208 ,KEBNE ,16678910,Thu Nov 25 05:10:51 CET,Thu Nov 25 06:36:05 CET,0.0 0.395 0.548 0.673 0.781 0.856 0.913 0.976 1.088 1.144 1.213 1.278 1.392 1.449 1.556 1.655 1.756 1.803 1.884 1.957 2.075 2.156 2.236 2.349 2.451 2.553 2.652 2.748 2.876 3.002 3.129 3.285 3.434 3.575 3.733 3.923 4.12 4.335 4.556 4.802 5.076 5.383 5.738 6.095 6.512 7.007 7.608 8.274 9.049 10.009 11.228 12.186 12.698 12.99 13.147 13.246 13.281 13.255 13.225 13.179 13.119 13.045 12.964 12.886 12.795 12.71 12.632 12.539 12.453 12.372 12.267 12.177 12.081 11.964 11.87 11.77 11.664 11.557 11.441 11.347 11.234 11.046 10.913 10.789 10.726 10.575 10.404 10.208 10.108 9.963 9.824 9.711 9.574 9.28 9.127 8.94 8.716 8.444 8.103 7.542 5.124 -3 ,12625 ,KEBNE ,16678911,Thu Nov 25 05:10:55 CET,Thu Nov 25 06:30:59 CET,0.0 0.334 0.5 0.61 0.73 0.852 0.958 1.044 1.175 1.239 1.309 1.385 1.506 1.565 1.675 1.768 1.862 1.907 1.994 2.091 2.221 2.298 2.377 2.49 2.593 2.697 2.795 2.892 3.028 3.156 3.277 3.422 3.565 3.714 3.896 4.103 4.294 4.494 4.717 4.968 5.234 5.543 5.913 6.269 6.672 7.148 7.728 8.397 9.182 10.139 11.353 12.361 12.924 13.236 13.42 13.534 13.561 13.563 13.539 13.476 13.413 13.326 13.244 13.157 13.056 12.963 12.863 12.767 12.673 12.576 12.47 12.38 12.277 12.15 12.058 11.97 11.871 11.767 11.658 11.576 11.475 11.317 11.212 11.105 11.048 10.925 10.788 10.627 10.539 10.395 10.226 10.11 9.999 9.717 9.528 9.326 9.106 8.834 8.425 7.895 5.129 -4 ,29563 ,KEBNE ,16678912,Thu Nov 25 05:10:55 CET,Thu Nov 25 06:32:04 CET,0.0 0.416 0.63 0.807 0.918 0.994 1.071 1.151 1.299 1.378 1.445 1.491 1.616 1.678 1.786 1.89 1.986 2.033 2.123 2.203 2.324 2.404 2.479 2.59 2.696 2.805 2.919 3.028 3.167 3.299 3.422 3.575 3.725 3.863 4.02 4.205 4.383 4.576 4.8 5.052 5.313 5.613 5.971 6.335 6.757 7.245 7.836 8.488 9.254 10.179 11.343 12.311 12.832 13.138 13.312 13.399 13.424 13.403 13.374 13.338 13.276 13.204 13.107 13.007 12.921 12.833 12.731 12.639 12.551 12.454 12.352 12.265 12.176 12.074 11.997 11.912 11.818 11.699 11.554 11.465 11.379 11.218 11.102 10.983 10.922 10.804 10.674 10.51 10.421 10.29 10.141 10.028 9.914 9.643 9.481 9.298 9.082 8.82 8.494 7.987 5.077 -5 ,19929 ,KEBNE ,16678913,Thu Nov 25 05:11:53 CET,Thu Nov 25 06:35:24 CET,0.0 0.347 0.511 0.647 0.748 0.827 0.912 0.996 1.133 1.191 1.253 1.306 1.416 1.471 1.574 1.674 1.777 1.828 1.921 1.998 2.119 2.195 2.268 2.376 2.482 2.59 2.697 2.807 2.948 3.099 3.24 3.384 3.524 3.665 3.828 4.013 4.189 4.384 4.616 4.878 5.146 5.428 5.766 6.128 6.561 7.062 7.637 8.272 9.056 10.047 11.27 12.269 12.814 13.145 13.339 13.437 13.467 13.451 13.407 13.34 13.267 13.186 13.097 13.014 12.937 12.861 12.757 12.657 12.568 12.469 12.354 12.248 12.146 12.039 11.954 11.856 11.742 11.625 11.508 11.425 11.329 11.184 11.087 10.983 10.925 10.789 10.636 10.47 10.384 10.239 10.082 9.966 9.834 9.539 9.361 9.151 8.917 8.683 8.352 7.802 5.562 -6 ,10486 ,KEBNE ,16678914,Thu Nov 25 05:11:53 CET,Thu Nov 25 06:36:04 CET,0.0 0.356 0.489 0.604 0.701 0.781 0.86 0.925 1.058 1.129 1.196 1.268 1.39 1.45 1.572 1.671 1.762 1.812 1.902 1.977 2.095 2.179 2.264 2.382 2.49 2.592 2.688 2.783 2.915 3.037 3.158 3.318 3.472 3.62 3.79 3.977 4.153 4.348 4.567 4.802 5.053 5.341 5.683 6.036 6.462 6.956 7.529 8.169 8.945 9.902 11.078 12.065 12.561 12.836 13.025 13.138 13.169 13.162 13.146 13.091 13.015 12.932 12.841 12.744 12.643 12.538 12.427 12.325 12.226 12.13 12.037 11.946 11.827 11.693 11.601 11.508 11.406 11.294 11.165 11.074 10.977 10.81 10.682 10.561 10.502 10.367 10.222 10.045 9.948 9.814 9.658 9.557 9.441 9.143 8.967 8.741 8.503 8.242 7.925 7.358 4.434 -7 ,23222 ,KEBNE ,16678915,Thu Nov 25 05:11:53 CET,Thu Nov 25 06:39:18 CET,0.0 0.372 0.596 0.727 0.836 0.941 1.043 1.139 1.283 1.346 1.412 1.483 1.616 1.687 1.813 1.923 2.016 2.058 2.155 2.251 2.373 2.451 2.53 2.644 2.756 2.865 2.964 3.055 3.183 3.313 3.439 3.584 3.723 3.871 4.04 4.218 4.395 4.594 4.804 5.039 5.305 5.601 5.948 6.299 6.702 7.165 7.73 8.387 9.157 10.103 11.301 12.278 12.837 13.164 13.342 13.441 13.491 13.494 13.451 13.387 13.339 13.288 13.206 13.114 13.028 12.942 12.844 12.737 12.624 12.51 12.388 12.284 12.179 12.067 11.984 11.887 11.787 11.677 11.534 11.434 11.339 11.2 11.091 10.958 10.885 10.727 10.568 10.395 10.291 10.137 9.976 9.86 9.723 9.416 9.259 9.073 8.831 8.556 8.213 7.71 4.663 -8 ,126 ,KEBNE ,16678916,Thu Nov 25 05:11:53 CET,Thu Nov 25 06:37:40 CET,0.0 0.523 0.66 0.776 0.888 0.985 1.079 1.172 1.311 1.362 1.42 1.484 1.606 1.658 1.757 1.852 1.939 1.984 2.072 2.16 2.284 2.363 2.443 2.558 2.666 2.772 2.884 2.987 3.121 3.256 3.378 3.53 3.684 3.83 3.999 4.187 4.368 4.58 4.808 5.046 5.307 5.617 5.979 6.343 6.784 7.282 7.862 8.53 9.325 10.249 11.398 12.366 12.879 13.161 13.317 13.401 13.428 13.403 13.355 13.29 13.218 13.138 13.049 12.948 12.846 12.764 12.678 12.597 12.523 12.426 12.318 12.232 12.142 12.038 11.949 11.856 11.756 11.64 11.513 11.425 11.331 11.171 11.054 10.931 10.862 10.735 10.606 10.441 10.349 10.195 10.062 9.968 9.832 9.52 9.35 9.161 8.949 8.712 8.362 7.784 4.911 -9 ,12828 ,KEBNE ,16678917,Thu Nov 25 05:11:52 CET,Thu Nov 25 06:35:27 CET,0.0 0.551 0.775 0.918 1.046 1.145 1.224 1.301 1.445 1.52 1.59 1.653 1.771 1.826 1.925 2.015 2.11 2.158 2.256 2.351 2.485 2.568 2.649 2.767 2.885 2.991 3.089 3.19 3.324 3.453 3.577 3.72 3.852 3.993 4.162 4.347 4.526 4.73 4.958 5.204 5.474 5.773 6.121 6.493 6.938 7.421 8.003 8.689 9.522 10.535 11.727 12.716 13.252 13.542 13.713 13.784 13.817 13.816 13.785 13.721 13.644 13.579 13.512 13.436 13.348 13.258 13.159 13.077 12.999 12.9 12.789 12.685 12.574 12.466 12.377 12.28 12.17 12.051 11.926 11.835 11.738 11.565 11.436 11.302 11.23 11.07 10.904 10.746 10.653 10.505 10.325 10.201 10.086 9.844 9.685 9.491 9.286 9.001 8.606 8.053 5.851 -10 ,17051 ,KEBNE ,16678918,Thu Nov 25 05:12:55 CET,Thu Nov 25 06:39:18 CET,0.0 0.297 0.436 0.55 0.665 0.774 0.868 0.949 1.093 1.164 1.222 1.268 1.387 1.441 1.547 1.647 1.74 1.781 1.862 1.944 2.067 2.15 2.237 2.358 2.466 2.581 2.688 2.788 2.924 3.05 3.172 3.326 3.476 3.619 3.789 3.994 4.191 4.402 4.625 4.866 5.118 5.412 5.776 6.137 6.565 7.049 7.607 8.277 9.091 10.047 11.151 12.078 12.656 12.996 13.13 13.168 13.178 13.158 13.111 13.055 13.005 12.933 12.851 12.757 12.662 12.587 12.496 12.409 12.33 12.234 12.126 12.039 11.948 11.832 11.739 11.65 11.545 11.432 11.316 11.223 11.116 10.958 10.85 10.735 10.679 10.557 10.423 10.269 10.186 10.048 9.893 9.787 9.654 9.36 9.212 9.034 8.806 8.507 8.18 7.667 4.693 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1b.txt deleted file mode 100644 index 9e20a170..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19922 ,KEBNE ,16678919,Thu Nov 25 05:12:55 CET,Thu Nov 25 06:38:16 CET,0.0 0.605 0.828 1.036 1.211 1.346 1.466 1.572 1.733 1.805 1.881 1.968 2.095 2.161 2.293 2.417 2.537 2.596 2.715 2.834 2.994 3.082 3.171 3.31 3.434 3.553 3.671 3.785 3.942 4.094 4.239 4.42 4.587 4.749 4.941 5.156 5.365 5.585 5.815 6.071 6.337 6.628 6.956 7.278 7.686 8.162 8.705 9.263 9.875 10.613 11.402 11.933 12.143 12.197 12.172 12.113 12.025 11.898 11.76 11.616 11.48 11.337 11.195 11.048 10.915 10.795 10.641 10.506 10.39 10.254 10.103 9.96 9.815 9.668 9.557 9.444 9.314 9.185 9.066 8.977 8.87 8.69 8.571 8.443 8.374 8.23 8.093 7.937 7.845 7.694 7.527 7.409 7.3 7.062 6.919 6.747 6.54 6.3 6.005 5.658 4.31 -2 ,1182 ,KEBNE ,16678920,Thu Nov 25 05:13:56 CET,Thu Nov 25 06:39:53 CET,0.0 0.65 0.923 1.128 1.301 1.45 1.567 1.664 1.854 1.949 2.034 2.139 2.282 2.357 2.491 2.61 2.732 2.794 2.911 3.025 3.191 3.29 3.383 3.52 3.645 3.755 3.87 3.986 4.14 4.296 4.443 4.622 4.8 4.97 5.156 5.354 5.546 5.764 6.002 6.251 6.508 6.787 7.13 7.496 7.909 8.35 8.833 9.373 9.996 10.697 11.474 12.056 12.306 12.382 12.357 12.294 12.21 12.079 11.926 11.762 11.622 11.485 11.333 11.19 11.062 10.943 10.801 10.644 10.498 10.358 10.227 10.119 10.006 9.869 9.759 9.652 9.531 9.397 9.257 9.168 9.077 8.908 8.788 8.669 8.602 8.454 8.314 8.179 8.098 7.948 7.802 7.693 7.576 7.306 7.15 6.984 6.793 6.564 6.294 5.923 4.498 -3 ,7853 ,KEBNE ,16678921,Thu Nov 25 05:13:57 CET,Thu Nov 25 06:40:06 CET,0.0 0.529 0.762 0.95 1.117 1.259 1.388 1.509 1.714 1.803 1.892 1.999 2.139 2.21 2.341 2.465 2.585 2.641 2.746 2.856 3.023 3.122 3.22 3.367 3.508 3.648 3.78 3.9 4.048 4.194 4.339 4.521 4.702 4.867 5.055 5.265 5.461 5.675 5.924 6.192 6.458 6.745 7.079 7.43 7.82 8.232 8.711 9.26 9.886 10.577 11.346 11.838 12.008 12.057 12.03 11.964 11.872 11.757 11.636 11.501 11.36 11.207 11.052 10.897 10.762 10.642 10.507 10.371 10.244 10.115 9.96 9.835 9.721 9.596 9.489 9.376 9.267 9.15 9.013 8.911 8.809 8.658 8.543 8.428 8.365 8.227 8.103 7.959 7.872 7.73 7.588 7.47 7.337 7.035 6.887 6.721 6.515 6.293 6.044 5.677 4.294 -4 ,9089 ,KEBNE ,16678922,Thu Nov 25 05:13:57 CET,Thu Nov 25 06:41:47 CET,0.0 0.584 0.853 1.034 1.184 1.304 1.416 1.52 1.719 1.801 1.875 1.961 2.094 2.167 2.304 2.426 2.552 2.616 2.735 2.847 3.01 3.112 3.206 3.34 3.465 3.587 3.705 3.829 3.99 4.13 4.265 4.44 4.615 4.779 4.965 5.174 5.363 5.562 5.784 6.025 6.28 6.589 6.954 7.303 7.694 8.12 8.629 9.211 9.86 10.585 11.394 11.935 12.14 12.178 12.138 12.05 11.935 11.795 11.651 11.522 11.396 11.258 11.12 10.978 10.838 10.705 10.56 10.428 10.315 10.201 10.063 9.942 9.817 9.674 9.563 9.455 9.338 9.21 9.066 8.964 8.863 8.704 8.595 8.474 8.405 8.266 8.117 7.957 7.882 7.741 7.604 7.506 7.388 7.096 6.923 6.738 6.549 6.344 6.079 5.722 4.536 -5 ,22910 ,KEBNE ,16678923,Thu Nov 25 05:13:56 CET,Thu Nov 25 06:37:15 CET,0.0 0.628 0.913 1.113 1.268 1.401 1.521 1.635 1.826 1.914 1.995 2.079 2.209 2.278 2.412 2.545 2.674 2.729 2.833 2.948 3.11 3.209 3.312 3.458 3.596 3.722 3.845 3.967 4.12 4.271 4.421 4.599 4.775 4.945 5.136 5.347 5.548 5.766 5.996 6.247 6.511 6.804 7.15 7.501 7.912 8.364 8.866 9.398 9.992 10.686 11.467 11.973 12.221 12.304 12.281 12.201 12.105 12.001 11.858 11.685 11.536 11.391 11.257 11.127 11.008 10.894 10.765 10.649 10.537 10.403 10.259 10.129 9.995 9.864 9.75 9.639 9.526 9.405 9.278 9.178 9.057 8.873 8.762 8.644 8.582 8.456 8.312 8.145 8.057 7.905 7.754 7.651 7.543 7.289 7.129 6.929 6.721 6.495 6.198 5.786 4.111 -6 ,19591 ,KEBNE ,16678924,Thu Nov 25 05:13:57 CET,Thu Nov 25 06:40:28 CET,0.0 0.586 0.837 1.03 1.188 1.327 1.446 1.543 1.749 1.846 1.936 2.037 2.166 2.233 2.372 2.497 2.612 2.667 2.77 2.874 3.027 3.123 3.215 3.351 3.486 3.614 3.733 3.85 4.003 4.152 4.3 4.472 4.631 4.79 4.977 5.181 5.37 5.58 5.811 6.06 6.323 6.62 6.967 7.303 7.686 8.111 8.6 9.134 9.762 10.475 11.214 11.687 11.893 11.968 11.92 11.808 11.69 11.568 11.453 11.309 11.156 11.024 10.903 10.774 10.647 10.523 10.377 10.244 10.116 9.986 9.858 9.744 9.636 9.517 9.404 9.289 9.177 9.048 8.902 8.801 8.702 8.547 8.422 8.287 8.224 8.106 7.961 7.787 7.702 7.559 7.441 7.354 7.238 6.966 6.822 6.663 6.476 6.24 5.976 5.598 3.781 -7 ,8988 ,KEBNE ,16678925,Thu Nov 25 05:14:00 CET,Thu Nov 25 06:35:32 CET,0.0 0.783 1.002 1.134 1.261 1.381 1.516 1.645 1.834 1.913 1.996 2.101 2.239 2.315 2.454 2.575 2.687 2.741 2.85 2.962 3.124 3.227 3.327 3.461 3.598 3.734 3.861 3.985 4.139 4.29 4.436 4.608 4.771 4.927 5.109 5.313 5.514 5.745 5.982 6.23 6.492 6.78 7.12 7.467 7.867 8.317 8.831 9.404 10.056 10.756 11.564 12.132 12.349 12.416 12.369 12.283 12.175 12.05 11.936 11.784 11.637 11.493 11.339 11.192 11.053 10.928 10.796 10.651 10.529 10.41 10.273 10.142 10.008 9.889 9.789 9.678 9.566 9.45 9.333 9.249 9.151 8.998 8.891 8.766 8.705 8.574 8.422 8.263 8.182 8.039 7.901 7.795 7.682 7.433 7.289 7.142 6.953 6.702 6.416 6.062 4.174 -8 ,21403 ,KEBNE ,16678926,Thu Nov 25 05:13:57 CET,Thu Nov 25 06:38:23 CET,0.0 0.801 1.036 1.193 1.339 1.468 1.591 1.71 1.924 2.011 2.091 2.192 2.331 2.401 2.525 2.651 2.773 2.832 2.944 3.049 3.201 3.3 3.391 3.528 3.663 3.786 3.907 4.027 4.179 4.326 4.473 4.647 4.816 4.984 5.175 5.374 5.57 5.794 6.028 6.278 6.537 6.832 7.177 7.528 7.93 8.368 8.874 9.458 10.132 10.87 11.66 12.16 12.353 12.402 12.368 12.285 12.143 11.98 11.845 11.695 11.561 11.436 11.294 11.145 10.999 10.878 10.729 10.58 10.446 10.304 10.176 10.071 9.954 9.819 9.711 9.592 9.472 9.344 9.209 9.118 9.02 8.87 8.758 8.629 8.56 8.409 8.257 8.099 8.009 7.857 7.716 7.61 7.483 7.198 7.056 6.902 6.721 6.508 6.229 5.845 4.419 -9 ,27916 ,KEBNE ,16678927,Thu Nov 25 05:13:57 CET,Thu Nov 25 06:39:36 CET,0.0 0.686 1.005 1.218 1.37 1.505 1.631 1.746 1.932 2.025 2.114 2.207 2.345 2.42 2.562 2.691 2.816 2.877 2.998 3.12 3.296 3.4 3.494 3.633 3.772 3.902 4.034 4.164 4.323 4.476 4.624 4.796 4.958 5.119 5.3 5.493 5.68 5.885 6.117 6.38 6.657 6.975 7.352 7.705 8.094 8.524 8.997 9.536 10.195 10.952 11.748 12.231 12.442 12.508 12.456 12.362 12.268 12.129 11.973 11.819 11.666 11.512 11.361 11.215 11.068 10.93 10.784 10.643 10.52 10.396 10.261 10.145 10.017 9.883 9.779 9.661 9.538 9.398 9.258 9.152 9.031 8.856 8.73 8.593 8.527 8.384 8.225 8.069 7.988 7.849 7.72 7.62 7.502 7.197 7.044 6.889 6.705 6.456 6.17 5.829 4.659 -10 ,13268 ,KEBNE ,16678928,Thu Nov 25 05:14:58 CET,Thu Nov 25 06:42:25 CET,0.0 0.751 1.081 1.272 1.437 1.575 1.691 1.8 1.993 2.085 2.179 2.283 2.423 2.496 2.627 2.749 2.865 2.92 3.033 3.148 3.303 3.397 3.49 3.623 3.749 3.873 3.991 4.106 4.258 4.407 4.551 4.722 4.881 5.034 5.22 5.429 5.624 5.839 6.077 6.341 6.617 6.917 7.259 7.599 8.008 8.466 8.983 9.547 10.18 10.92 11.739 12.252 12.472 12.566 12.541 12.458 12.339 12.208 12.059 11.885 11.736 11.596 11.463 11.327 11.191 11.048 10.888 10.758 10.647 10.525 10.389 10.264 10.117 9.968 9.853 9.732 9.615 9.493 9.365 9.275 9.173 8.999 8.883 8.762 8.696 8.543 8.371 8.186 8.098 7.959 7.824 7.725 7.607 7.33 7.173 7.011 6.847 6.627 6.359 5.982 4.239 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_3b_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_3b_3a.txt deleted file mode 100644 index 38091154..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_3b_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24322 ,KEBNE ,17024326,Wed Dec 22 09:52:00 CET,Wed Dec 22 11:17:05 CET,0.0 0.399 0.583 0.743 0.875 0.987 1.104 1.215 1.406 1.498 1.583 1.679 1.83 1.905 2.058 2.199 2.335 2.401 2.523 2.638 2.804 2.905 3.005 3.16 3.305 3.44 3.577 3.71 3.879 4.043 4.21 4.411 4.593 4.773 4.988 5.231 5.47 5.736 6.021 6.305 6.617 6.995 7.414 7.82 8.295 8.819 9.442 10.17 11.003 11.948 13.104 14.022 14.463 14.679 14.795 14.87 14.915 14.889 14.831 14.777 14.718 14.648 14.559 14.474 14.41 14.343 14.252 14.164 14.092 14.023 13.946 13.882 13.818 13.743 13.675 13.606 13.532 13.447 13.361 13.3 13.235 13.125 13.049 12.967 12.926 12.846 12.746 12.64 12.586 12.466 12.413 12.355 12.281 12.106 12.017 11.918 11.809 11.691 11.538 11.303 10.624 -2 ,18019 ,KEBNE ,17024327,Wed Dec 22 09:52:01 CET,Wed Dec 22 11:18:45 CET,0.0 0.684 0.936 1.109 1.247 1.357 1.477 1.588 1.782 1.871 1.96 2.055 2.204 2.276 2.411 2.541 2.662 2.722 2.836 2.946 3.106 3.208 3.306 3.448 3.581 3.714 3.849 3.985 4.164 4.336 4.501 4.693 4.883 5.071 5.286 5.516 5.751 6.015 6.289 6.587 6.901 7.26 7.699 8.136 8.616 9.142 9.782 10.535 11.412 12.394 13.525 14.441 14.888 15.118 15.261 15.319 15.321 15.291 15.236 15.176 15.109 15.034 14.966 14.898 14.827 14.754 14.679 14.591 14.509 14.435 14.347 14.269 14.191 14.112 14.055 13.991 13.912 13.831 13.754 13.703 13.645 13.539 13.463 13.384 13.344 13.243 13.132 13.024 12.96 12.834 12.746 12.663 12.583 12.42 12.332 12.228 12.118 11.999 11.864 11.661 11.194 -3 ,7781 ,KEBNE ,17024328,Wed Dec 22 09:52:01 CET,Wed Dec 22 11:19:03 CET,0.0 0.522 0.718 0.893 1.04 1.182 1.317 1.44 1.66 1.756 1.85 1.941 2.093 2.178 2.322 2.453 2.583 2.645 2.759 2.876 3.047 3.153 3.265 3.425 3.57 3.697 3.817 3.941 4.109 4.279 4.44 4.641 4.829 5.005 5.218 5.451 5.666 5.927 6.212 6.504 6.829 7.19 7.612 8.036 8.512 9.058 9.691 10.396 11.238 12.195 13.361 14.309 14.811 15.092 15.217 15.254 15.254 15.228 15.187 15.113 15.042 14.986 14.922 14.841 14.757 14.69 14.612 14.536 14.467 14.393 14.319 14.247 14.163 14.074 14.001 13.926 13.852 13.777 13.693 13.624 13.556 13.444 13.361 13.276 13.23 13.131 13.023 12.918 12.861 12.74 12.688 12.616 12.534 12.37 12.288 12.195 12.078 11.954 11.816 11.567 11.082 -4 ,12711 ,KEBNE ,17024329,Wed Dec 22 09:52:00 CET,Wed Dec 22 11:18:38 CET,0.0 0.865 1.112 1.294 1.449 1.594 1.711 1.812 2.005 2.086 2.161 2.25 2.4 2.474 2.62 2.742 2.859 2.92 3.036 3.146 3.314 3.427 3.535 3.691 3.837 3.972 4.102 4.232 4.4 4.559 4.713 4.904 5.091 5.275 5.494 5.73 5.947 6.199 6.485 6.773 7.086 7.462 7.889 8.319 8.826 9.376 10.01 10.729 11.556 12.525 13.714 14.65 15.079 15.329 15.447 15.483 15.491 15.454 15.406 15.353 15.293 15.227 15.159 15.079 15.002 14.936 14.854 14.765 14.685 14.611 14.532 14.459 14.379 14.291 14.222 14.144 14.063 13.994 13.92 13.86 13.793 13.686 13.605 13.513 13.469 13.382 13.287 13.177 13.122 13.001 12.925 12.853 12.774 12.627 12.541 12.425 12.297 12.16 11.964 11.681 11.046 -5 ,8430 ,KEBNE ,17024330,Wed Dec 22 09:52:00 CET,Wed Dec 22 11:18:21 CET,0.0 0.684 0.92 1.055 1.182 1.309 1.433 1.566 1.825 1.923 2.006 2.103 2.259 2.338 2.48 2.614 2.739 2.798 2.92 3.035 3.201 3.313 3.419 3.569 3.719 3.867 4.013 4.151 4.317 4.48 4.645 4.837 5.016 5.193 5.409 5.661 5.898 6.152 6.429 6.732 7.044 7.378 7.776 8.197 8.686 9.227 9.869 10.592 11.434 12.431 13.61 14.53 15.028 15.302 15.426 15.481 15.487 15.461 15.43 15.367 15.291 15.229 15.166 15.09 15.004 14.918 14.815 14.722 14.658 14.589 14.503 14.417 14.32 14.23 14.165 14.094 14.017 13.939 13.856 13.798 13.74 13.643 13.565 13.492 13.449 13.338 13.234 13.133 13.083 12.967 12.907 12.838 12.761 12.603 12.512 12.408 12.296 12.174 12.012 11.802 11.29 -6 ,26363 ,KEBNE ,17024331,Wed Dec 22 09:52:01 CET,Wed Dec 22 11:20:02 CET,0.0 0.601 0.805 0.969 1.091 1.221 1.344 1.45 1.646 1.733 1.816 1.898 2.041 2.111 2.242 2.367 2.497 2.557 2.674 2.794 2.961 3.071 3.179 3.33 3.473 3.612 3.747 3.882 4.051 4.214 4.368 4.553 4.742 4.926 5.134 5.369 5.6 5.857 6.134 6.426 6.741 7.099 7.514 7.937 8.431 8.984 9.609 10.311 11.155 12.174 13.406 14.352 14.811 15.042 15.155 15.215 15.237 15.229 15.172 15.098 15.041 14.984 14.906 14.817 14.737 14.653 14.554 14.469 14.398 14.324 14.248 14.177 14.091 14.001 13.936 13.865 13.786 13.705 13.62 13.561 13.503 13.406 13.338 13.263 13.22 13.133 13.038 12.939 12.894 12.779 12.716 12.641 12.563 12.401 12.316 12.227 12.129 11.989 11.821 11.635 10.997 -7 ,27490 ,KEBNE ,17024332,Wed Dec 22 09:52:01 CET,Wed Dec 22 11:17:32 CET,0.0 0.525 0.734 0.941 1.119 1.253 1.362 1.461 1.642 1.732 1.825 1.928 2.086 2.162 2.303 2.428 2.543 2.606 2.732 2.84 2.987 3.09 3.205 3.369 3.523 3.672 3.807 3.931 4.098 4.266 4.427 4.632 4.823 5.001 5.217 5.46 5.686 5.92 6.187 6.485 6.788 7.139 7.559 7.975 8.481 9.05 9.71 10.475 11.31 12.275 13.425 14.259 14.685 14.885 14.953 14.966 14.943 14.91 14.861 14.786 14.716 14.653 14.586 14.516 14.437 14.361 14.269 14.173 14.085 13.994 13.904 13.832 13.761 13.688 13.624 13.546 13.469 13.388 13.295 13.228 13.154 13.042 12.97 12.9 12.862 12.773 12.661 12.544 12.493 12.381 12.321 12.254 12.182 12.014 11.923 11.816 11.692 11.552 11.377 11.123 10.558 -8 ,29065 ,KEBNE ,17024333,Wed Dec 22 09:52:05 CET,Wed Dec 22 11:16:07 CET,0.0 0.671 0.939 1.104 1.25 1.376 1.474 1.568 1.75 1.843 1.935 2.017 2.166 2.243 2.39 2.521 2.646 2.715 2.839 2.949 3.114 3.22 3.319 3.471 3.616 3.747 3.878 4.013 4.193 4.367 4.54 4.742 4.918 5.088 5.293 5.514 5.728 5.982 6.258 6.555 6.884 7.252 7.669 8.091 8.575 9.115 9.76 10.473 11.293 12.272 13.431 14.315 14.758 15.033 15.238 15.333 15.341 15.311 15.26 15.193 15.142 15.085 15.017 14.953 14.877 14.791 14.695 14.612 14.534 14.447 14.363 14.291 14.205 14.112 14.042 13.972 13.897 13.815 13.723 13.658 13.589 13.468 13.376 13.279 13.237 13.163 13.069 12.963 12.909 12.788 12.717 12.642 12.572 12.435 12.351 12.256 12.162 12.057 11.908 11.701 11.017 -9 ,5611 ,KEBNE ,17024334,Wed Dec 22 09:52:03 CET,Wed Dec 22 11:16:15 CET,0.0 0.529 0.742 0.922 1.076 1.195 1.3 1.401 1.606 1.71 1.809 1.894 2.04 2.113 2.257 2.396 2.527 2.592 2.717 2.829 2.987 3.092 3.203 3.365 3.509 3.648 3.787 3.915 4.066 4.225 4.393 4.591 4.782 4.964 5.179 5.418 5.648 5.896 6.157 6.443 6.747 7.097 7.516 7.93 8.426 8.987 9.598 10.308 11.184 12.174 13.336 14.221 14.651 14.881 14.983 15.013 15.008 14.987 14.947 14.874 14.793 14.719 14.643 14.568 14.492 14.405 14.305 14.217 14.136 14.057 13.972 13.887 13.798 13.719 13.656 13.59 13.512 13.424 13.336 13.274 13.213 13.112 13.034 12.948 12.904 12.817 12.72 12.617 12.564 12.445 12.376 12.302 12.219 12.037 11.944 11.836 11.727 11.607 11.437 11.182 10.5 -10 ,11971 ,KEBNE ,17024335,Wed Dec 22 09:52:01 CET,Wed Dec 22 11:17:10 CET,0.0 0.359 0.592 0.791 0.941 1.072 1.203 1.331 1.539 1.623 1.702 1.777 1.92 1.99 2.117 2.237 2.362 2.423 2.537 2.652 2.812 2.91 3.009 3.162 3.31 3.447 3.582 3.719 3.897 4.06 4.216 4.405 4.585 4.768 4.982 5.22 5.455 5.706 5.976 6.27 6.583 6.932 7.319 7.718 8.204 8.75 9.389 10.115 10.983 11.988 13.118 13.949 14.398 14.691 14.854 14.877 14.855 14.831 14.807 14.758 14.689 14.631 14.572 14.495 14.413 14.335 14.247 14.168 14.097 14.017 13.927 13.853 13.776 13.69 13.626 13.556 13.485 13.411 13.319 13.256 13.187 13.065 12.984 12.907 12.865 12.783 12.702 12.604 12.55 12.425 12.328 12.248 12.173 12.013 11.923 11.804 11.678 11.558 11.389 11.068 10.363 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_3b_7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_3b_7.txt deleted file mode 100644 index 421ca80b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_3b_7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1314 ,KEBNE ,16678929,Thu Nov 25 05:14:59 CET,Thu Nov 25 06:43:44 CET,0.0 0.481 0.622 0.683 0.729 0.782 0.835 0.882 0.954 0.977 1.001 0.961 1.046 1.061 1.078 1.08 1.068 1.066 1.07 1.063 1.045 1.033 1.01 0.964 0.923 0.885 0.842 0.798 0.729 0.645 0.557 0.442 0.315 0.181 0.029 -0.149 -0.339 -0.56 -0.811 -1.099 -1.44 -1.845 -2.338 -2.903 -3.646 -4.577 -5.785 -7.295 -9.327 -12.212 -16.471 -20.962 -24.455 -27.22 -29.45 -31.372 -32.971 -34.336 -35.488 -36.603 -37.512 -38.302 -39.033 -39.695 -40.295 -40.856 -41.43 -41.913 -42.334 -42.77 -43.219 -43.581 -43.949 -44.323 -44.607 -44.901 -45.195 -45.489 -45.785 -45.992 -46.207 -46.535 -46.764 -46.991 -47.111 -47.361 -47.609 -47.863 -47.997 -48.262 -48.409 -48.56 -48.731 -49.087 -49.273 -49.469 -49.675 -49.906 -50.144 -50.419 -51.037 -2 ,18505 ,KEBNE ,16678930,Thu Nov 25 05:14:58 CET,Thu Nov 25 06:42:28 CET,0.0 0.392 0.599 0.718 0.806 0.861 0.905 0.944 1.004 1.027 1.047 1.007 1.089 1.093 1.094 1.095 1.095 1.091 1.079 1.068 1.066 1.057 1.033 1.001 0.964 0.922 0.881 0.835 0.754 0.664 0.577 0.471 0.365 0.25 0.11 -0.071 -0.271 -0.487 -0.724 -1.007 -1.339 -1.745 -2.254 -2.818 -3.556 -4.471 -5.683 -7.202 -9.207 -12.006 -16.268 -20.893 -24.393 -27.147 -29.329 -31.204 -32.788 -34.159 -35.276 -36.349 -37.276 -38.085 -38.837 -39.519 -40.149 -40.735 -41.32 -41.818 -42.232 -42.656 -43.085 -43.439 -43.809 -44.175 -44.464 -44.764 -45.071 -45.386 -45.698 -45.913 -46.125 -46.443 -46.661 -46.879 -46.998 -47.241 -47.474 -47.709 -47.839 -48.096 -48.231 -48.372 -48.52 -48.867 -49.064 -49.255 -49.446 -49.66 -49.912 -50.222 -51.057 -3 ,32239 ,KEBNE ,16678931,Thu Nov 25 05:14:58 CET,Thu Nov 25 06:40:48 CET,0.0 0.338 0.499 0.593 0.644 0.697 0.745 0.784 0.851 0.875 0.892 0.873 0.96 0.975 1.007 1.02 1.033 1.038 1.033 1.026 1.005 0.984 0.962 0.932 0.899 0.859 0.819 0.769 0.682 0.589 0.497 0.383 0.264 0.142 -0.002 -0.173 -0.352 -0.56 -0.805 -1.1 -1.433 -1.837 -2.358 -2.9 -3.603 -4.516 -5.706 -7.25 -9.291 -12.123 -16.413 -21.031 -24.468 -27.176 -29.431 -31.35 -32.967 -34.381 -35.536 -36.644 -37.573 -38.371 -39.123 -39.828 -40.464 -41.032 -41.598 -42.088 -42.507 -42.943 -43.381 -43.738 -44.115 -44.502 -44.784 -45.067 -45.368 -45.676 -45.998 -46.223 -46.441 -46.774 -47.001 -47.217 -47.328 -47.573 -47.838 -48.116 -48.255 -48.519 -48.684 -48.844 -49.01 -49.348 -49.524 -49.705 -49.912 -50.158 -50.417 -50.693 -51.5 -4 ,20797 ,KEBNE ,16678932,Thu Nov 25 05:14:58 CET,Thu Nov 25 06:41:28 CET,0.0 0.32 0.466 0.541 0.589 0.648 0.702 0.746 0.816 0.835 0.844 0.793 0.875 0.879 0.876 0.869 0.863 0.865 0.866 0.861 0.845 0.828 0.808 0.777 0.736 0.683 0.632 0.584 0.516 0.444 0.368 0.269 0.156 0.022 -0.148 -0.339 -0.529 -0.75 -1.009 -1.298 -1.614 -2.015 -2.541 -3.121 -3.865 -4.783 -5.959 -7.459 -9.456 -12.247 -16.469 -21.032 -24.482 -27.192 -29.432 -31.341 -32.936 -34.291 -35.389 -36.494 -37.417 -38.202 -38.948 -39.632 -40.246 -40.788 -41.337 -41.824 -42.242 -42.673 -43.115 -43.482 -43.85 -44.221 -44.515 -44.809 -45.102 -45.411 -45.732 -45.947 -46.163 -46.485 -46.707 -46.942 -47.06 -47.308 -47.559 -47.815 -47.952 -48.225 -48.405 -48.563 -48.715 -49.032 -49.207 -49.395 -49.611 -49.843 -50.085 -50.378 -51.054 -5 ,14220 ,KEBNE ,16678933,Thu Nov 25 05:14:59 CET,Thu Nov 25 06:43:13 CET,0.0 0.41 0.529 0.613 0.702 0.777 0.832 0.878 0.944 0.963 0.983 0.951 1.033 1.037 1.041 1.04 1.036 1.036 1.036 1.033 1.013 0.992 0.968 0.932 0.895 0.858 0.824 0.776 0.711 0.639 0.552 0.441 0.335 0.216 0.065 -0.112 -0.301 -0.528 -0.791 -1.092 -1.427 -1.843 -2.375 -2.947 -3.675 -4.546 -5.676 -7.189 -9.25 -12.094 -16.304 -20.796 -24.26 -27.032 -29.234 -31.108 -32.707 -34.091 -35.238 -36.336 -37.246 -38.042 -38.78 -39.452 -40.064 -40.619 -41.189 -41.678 -42.093 -42.517 -42.942 -43.289 -43.641 -44.012 -44.305 -44.603 -44.907 -45.21 -45.516 -45.724 -45.936 -46.267 -46.504 -46.741 -46.86 -47.102 -47.352 -47.624 -47.759 -48.022 -48.186 -48.338 -48.49 -48.825 -49.015 -49.211 -49.424 -49.652 -49.933 -50.274 -51.03 -6 ,28233 ,KEBNE ,16678934,Thu Nov 25 05:16:00 CET,Thu Nov 25 06:40:35 CET,0.0 0.617 0.774 0.881 0.942 1.001 1.068 1.122 1.206 1.24 1.26 1.213 1.297 1.299 1.301 1.323 1.335 1.335 1.334 1.327 1.305 1.291 1.271 1.234 1.191 1.148 1.118 1.078 1.015 0.954 0.88 0.762 0.632 0.505 0.353 0.188 0.021 -0.193 -0.442 -0.739 -1.086 -1.502 -2.027 -2.603 -3.347 -4.29 -5.472 -6.927 -8.923 -11.723 -15.962 -20.486 -23.853 -26.589 -28.816 -30.713 -32.325 -33.729 -34.888 -35.989 -36.907 -37.699 -38.441 -39.11 -39.705 -40.244 -40.807 -41.305 -41.718 -42.139 -42.579 -42.941 -43.313 -43.687 -43.97 -44.263 -44.56 -44.853 -45.149 -45.36 -45.576 -45.902 -46.133 -46.368 -46.489 -46.734 -46.986 -47.248 -47.386 -47.648 -47.821 -47.976 -48.121 -48.44 -48.616 -48.806 -49.013 -49.244 -49.534 -49.922 -50.642 -7 ,20098 ,KEBNE ,16678935,Thu Nov 25 05:16:00 CET,Thu Nov 25 06:40:57 CET,0.0 0.462 0.609 0.719 0.791 0.847 0.911 0.962 1.017 1.046 1.064 1.001 1.078 1.079 1.074 1.079 1.087 1.087 1.082 1.07 1.053 1.038 1.013 0.972 0.933 0.891 0.835 0.774 0.703 0.63 0.551 0.446 0.344 0.237 0.096 -0.071 -0.257 -0.484 -0.742 -1.039 -1.376 -1.784 -2.313 -2.898 -3.623 -4.509 -5.676 -7.171 -9.139 -11.914 -16.134 -20.755 -24.238 -26.953 -29.185 -31.082 -32.667 -34.025 -35.16 -36.271 -37.183 -37.972 -38.709 -39.369 -39.971 -40.512 -41.052 -41.539 -41.963 -42.391 -42.823 -43.175 -43.535 -43.911 -44.2 -44.484 -44.774 -45.086 -45.397 -45.604 -45.824 -46.157 -46.384 -46.622 -46.751 -47.012 -47.27 -47.539 -47.678 -47.935 -48.084 -48.232 -48.38 -48.707 -48.892 -49.096 -49.32 -49.547 -49.805 -50.139 -50.787 -8 ,979 ,KEBNE ,16678936,Thu Nov 25 05:16:00 CET,Thu Nov 25 06:43:00 CET,0.0 0.418 0.591 0.699 0.77 0.822 0.863 0.906 0.978 1.017 1.05 1.034 1.132 1.149 1.173 1.195 1.203 1.203 1.204 1.205 1.202 1.191 1.174 1.147 1.108 1.059 1.012 0.964 0.897 0.83 0.757 0.646 0.526 0.408 0.254 0.062 -0.132 -0.357 -0.614 -0.914 -1.252 -1.648 -2.163 -2.74 -3.449 -4.334 -5.508 -6.977 -8.969 -11.762 -15.936 -20.496 -23.947 -26.706 -28.925 -30.797 -32.381 -33.779 -34.948 -36.065 -36.999 -37.797 -38.525 -39.219 -39.849 -40.411 -40.98 -41.468 -41.89 -42.319 -42.762 -43.119 -43.476 -43.851 -44.145 -44.441 -44.744 -45.044 -45.347 -45.555 -45.765 -46.096 -46.325 -46.564 -46.685 -46.927 -47.164 -47.42 -47.553 -47.805 -47.956 -48.102 -48.248 -48.564 -48.747 -48.939 -49.132 -49.335 -49.586 -49.922 -50.614 -9 ,29518 ,KEBNE ,16678937,Thu Nov 25 05:16:00 CET,Thu Nov 25 06:42:45 CET,0.0 0.414 0.578 0.702 0.773 0.828 0.889 0.931 0.983 1.005 1.032 1.015 1.112 1.127 1.136 1.14 1.152 1.155 1.153 1.147 1.128 1.113 1.09 1.048 1.013 0.972 0.925 0.881 0.819 0.749 0.666 0.555 0.441 0.333 0.211 0.046 -0.133 -0.357 -0.629 -0.943 -1.289 -1.706 -2.232 -2.785 -3.495 -4.405 -5.588 -7.059 -9.054 -11.9 -16.186 -20.78 -24.218 -26.936 -29.127 -30.979 -32.543 -33.896 -35.039 -36.15 -37.07 -37.862 -38.603 -39.283 -39.891 -40.433 -40.996 -41.489 -41.895 -42.316 -42.757 -43.113 -43.474 -43.851 -44.141 -44.433 -44.729 -45.033 -45.34 -45.541 -45.742 -46.051 -46.274 -46.51 -46.631 -46.869 -47.106 -47.372 -47.512 -47.78 -47.946 -48.092 -48.236 -48.559 -48.728 -48.908 -49.105 -49.337 -49.608 -49.896 -50.702 -10 ,3684 ,KEBNE ,16678938,Thu Nov 25 05:16:00 CET,Thu Nov 25 06:44:01 CET,0.0 0.416 0.599 0.696 0.761 0.831 0.887 0.923 0.985 1.014 1.035 0.991 1.075 1.081 1.094 1.099 1.1 1.102 1.114 1.114 1.09 1.073 1.057 1.029 0.983 0.932 0.878 0.82 0.741 0.663 0.587 0.483 0.384 0.275 0.126 -0.047 -0.223 -0.433 -0.681 -0.964 -1.291 -1.697 -2.195 -2.756 -3.497 -4.417 -5.624 -7.129 -9.155 -12.061 -16.405 -20.963 -24.427 -27.254 -29.529 -31.424 -33.014 -34.377 -35.491 -36.55 -37.44 -38.237 -38.988 -39.679 -40.305 -40.863 -41.431 -41.924 -42.339 -42.776 -43.221 -43.574 -43.933 -44.308 -44.594 -44.868 -45.149 -45.441 -45.74 -45.947 -46.164 -46.498 -46.714 -46.952 -47.083 -47.337 -47.58 -47.827 -47.948 -48.198 -48.362 -48.513 -48.663 -48.961 -49.111 -49.296 -49.512 -49.727 -49.959 -50.305 -51.08 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5a_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5a_3a.txt deleted file mode 100644 index 1fe8dd8a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5a_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17654 ,KEBNE ,16678939,Thu Nov 25 05:16:00 CET,Thu Nov 25 06:44:32 CET,0.0 0.688 0.989 1.215 1.414 1.598 1.748 1.883 2.132 2.239 2.348 2.487 2.676 2.775 2.96 3.141 3.309 3.387 3.548 3.701 3.918 4.052 4.177 4.365 4.552 4.739 4.921 5.09 5.305 5.519 5.728 5.971 6.204 6.431 6.699 7.002 7.283 7.604 7.961 8.332 8.707 9.14 9.648 10.155 10.781 11.468 12.262 13.115 14.065 15.16 16.427 17.419 17.97 18.292 18.446 18.517 18.531 18.51 18.48 18.427 18.382 18.342 18.283 18.224 18.162 18.1 18.046 18.0 17.948 17.879 17.808 17.755 17.695 17.62 17.559 17.499 17.43 17.361 17.288 17.236 17.185 17.089 17.024 16.965 16.935 16.876 16.818 16.753 16.717 16.613 16.571 16.507 16.436 16.301 16.232 16.132 16.011 15.906 15.787 15.606 15.191 -2 ,9724 ,KEBNE ,16678940,Thu Nov 25 05:17:02 CET,Thu Nov 25 06:42:46 CET,0.0 0.628 0.919 1.154 1.347 1.525 1.689 1.841 2.095 2.209 2.317 2.445 2.626 2.727 2.919 3.1 3.276 3.356 3.504 3.641 3.855 3.995 4.127 4.32 4.505 4.694 4.865 5.022 5.236 5.442 5.649 5.909 6.165 6.42 6.694 6.982 7.267 7.574 7.915 8.292 8.702 9.157 9.668 10.186 10.811 11.484 12.214 13.076 14.095 15.221 16.505 17.475 17.968 18.261 18.436 18.546 18.593 18.604 18.592 18.557 18.503 18.437 18.387 18.346 18.297 18.232 18.161 18.101 18.053 18.005 17.946 17.892 17.833 17.771 17.722 17.67 17.603 17.537 17.468 17.417 17.366 17.28 17.217 17.152 17.117 17.045 16.967 16.889 16.853 16.758 16.728 16.673 16.631 16.525 16.457 16.383 16.285 16.169 16.041 15.871 15.578 -3 ,27760 ,KEBNE ,16678941,Thu Nov 25 05:18:02 CET,Thu Nov 25 06:44:40 CET,0.0 0.712 1.025 1.261 1.441 1.609 1.768 1.91 2.176 2.297 2.412 2.539 2.722 2.817 3.008 3.191 3.356 3.435 3.588 3.74 3.96 4.097 4.23 4.426 4.615 4.8 4.978 5.136 5.339 5.549 5.763 6.011 6.236 6.465 6.738 7.043 7.341 7.672 8.031 8.412 8.814 9.257 9.763 10.265 10.847 11.502 12.258 13.119 14.131 15.309 16.701 17.762 18.323 18.677 18.858 18.96 19.018 19.019 18.987 18.942 18.889 18.826 18.772 18.722 18.663 18.604 18.539 18.479 18.421 18.363 18.306 18.25 18.187 18.113 18.052 17.992 17.929 17.859 17.78 17.725 17.674 17.587 17.518 17.444 17.407 17.338 17.273 17.196 17.149 17.038 16.999 16.94 16.888 16.761 16.684 16.608 16.515 16.402 16.272 16.061 15.317 -4 ,27007 ,KEBNE ,16678942,Thu Nov 25 05:17:02 CET,Thu Nov 25 06:41:51 CET,0.0 0.52 0.813 1.032 1.207 1.365 1.514 1.658 1.908 2.025 2.138 2.25 2.421 2.511 2.692 2.877 3.045 3.123 3.285 3.437 3.641 3.776 3.904 4.1 4.297 4.469 4.629 4.795 5.01 5.218 5.423 5.666 5.904 6.14 6.405 6.698 6.975 7.286 7.63 7.995 8.387 8.812 9.307 9.837 10.448 11.102 11.845 12.681 13.631 14.719 16.008 17.0 17.556 17.876 18.037 18.117 18.147 18.143 18.117 18.08 18.04 17.986 17.922 17.863 17.809 17.754 17.694 17.64 17.576 17.502 17.432 17.378 17.333 17.272 17.211 17.147 17.081 17.017 16.953 16.905 16.845 16.752 16.687 16.621 16.586 16.511 16.434 16.351 16.304 16.19 16.129 16.064 16.007 15.864 15.791 15.736 15.665 15.548 15.425 15.281 14.874 -5 ,14861 ,KEBNE ,16678943,Thu Nov 25 05:17:02 CET,Thu Nov 25 06:45:16 CET,0.0 0.753 1.021 1.24 1.433 1.59 1.737 1.88 2.158 2.286 2.403 2.527 2.702 2.795 2.985 3.175 3.334 3.409 3.564 3.717 3.938 4.067 4.189 4.382 4.575 4.76 4.925 5.085 5.305 5.52 5.72 5.967 6.209 6.432 6.689 6.982 7.26 7.559 7.896 8.258 8.627 9.047 9.532 10.026 10.634 11.317 12.084 12.938 13.951 15.143 16.564 17.652 18.177 18.47 18.641 18.734 18.791 18.81 18.778 18.715 18.659 18.615 18.571 18.515 18.451 18.382 18.296 18.218 18.157 18.097 18.024 17.949 17.876 17.809 17.753 17.699 17.645 17.579 17.497 17.432 17.376 17.302 17.252 17.195 17.16 17.092 17.005 16.916 16.87 16.764 16.735 16.68 16.626 16.474 16.384 16.303 16.199 16.078 15.956 15.794 15.573 -6 ,13403 ,KEBNE ,16678944,Thu Nov 25 05:17:02 CET,Thu Nov 25 06:44:33 CET,0.0 1.134 1.443 1.669 1.84 1.991 2.123 2.248 2.514 2.637 2.751 2.896 3.072 3.164 3.346 3.526 3.695 3.768 3.917 4.071 4.287 4.422 4.56 4.754 4.945 5.137 5.312 5.484 5.705 5.912 6.113 6.367 6.607 6.825 7.072 7.345 7.625 7.935 8.271 8.632 9.016 9.45 9.943 10.429 10.997 11.643 12.37 13.226 14.257 15.435 16.804 17.848 18.351 18.631 18.79 18.865 18.906 18.918 18.893 18.828 18.763 18.703 18.637 18.571 18.503 18.446 18.386 18.324 18.265 18.196 18.119 18.058 17.986 17.903 17.839 17.772 17.706 17.641 17.565 17.508 17.456 17.37 17.303 17.236 17.2 17.117 17.032 16.959 16.923 16.814 16.747 16.674 16.61 16.478 16.385 16.288 16.21 16.124 16.017 15.837 15.402 -7 ,17287 ,KEBNE ,16678945,Thu Nov 25 05:17:06 CET,Thu Nov 25 06:39:16 CET,0.0 0.681 0.927 1.127 1.32 1.483 1.623 1.768 2.061 2.194 2.302 2.416 2.598 2.7 2.896 3.076 3.243 3.322 3.473 3.629 3.847 3.991 4.13 4.32 4.504 4.684 4.851 5.014 5.231 5.44 5.646 5.894 6.127 6.349 6.599 6.88 7.172 7.508 7.871 8.256 8.655 9.104 9.628 10.126 10.707 11.371 12.15 12.984 13.919 15.008 16.315 17.381 17.939 18.259 18.436 18.532 18.565 18.544 18.507 18.454 18.41 18.377 18.343 18.304 18.259 18.209 18.146 18.086 18.027 17.96 17.876 17.799 17.726 17.647 17.585 17.528 17.471 17.404 17.322 17.265 17.217 17.141 17.08 17.015 16.982 16.914 16.843 16.76 16.718 16.609 16.565 16.513 16.46 16.35 16.277 16.177 16.062 15.94 15.803 15.625 15.171 -8 ,5896 ,KEBNE ,16678946,Thu Nov 25 05:17:05 CET,Thu Nov 25 06:39:58 CET,0.0 0.857 1.132 1.345 1.56 1.752 1.906 2.037 2.25 2.352 2.458 2.564 2.735 2.826 3.004 3.176 3.337 3.414 3.568 3.717 3.937 4.086 4.222 4.421 4.614 4.791 4.963 5.137 5.361 5.569 5.775 6.022 6.269 6.522 6.795 7.094 7.411 7.767 8.129 8.494 8.874 9.305 9.803 10.322 10.947 11.628 12.374 13.163 14.105 15.294 16.619 17.561 18.054 18.383 18.583 18.675 18.72 18.724 18.698 18.662 18.617 18.567 18.516 18.458 18.395 18.333 18.269 18.212 18.162 18.106 18.039 17.989 17.937 17.866 17.803 17.742 17.673 17.601 17.53 17.481 17.43 17.338 17.269 17.201 17.163 17.082 16.997 16.912 16.865 16.755 16.702 16.631 16.558 16.416 16.337 16.249 16.16 16.059 15.94 15.809 15.39 -9 ,18331 ,KEBNE ,16678947,Thu Nov 25 05:17:02 CET,Thu Nov 25 06:43:09 CET,0.0 0.77 1.068 1.311 1.52 1.683 1.824 1.955 2.217 2.339 2.443 2.57 2.751 2.85 3.04 3.219 3.388 3.461 3.597 3.741 3.952 4.081 4.206 4.395 4.586 4.767 4.947 5.117 5.335 5.546 5.749 6.003 6.246 6.473 6.725 7.016 7.313 7.647 8.006 8.391 8.787 9.222 9.728 10.234 10.857 11.535 12.271 13.086 14.051 15.192 16.391 17.283 17.796 18.102 18.254 18.321 18.35 18.352 18.333 18.298 18.245 18.194 18.144 18.091 18.038 17.984 17.924 17.863 17.807 17.742 17.67 17.608 17.544 17.483 17.433 17.376 17.31 17.239 17.166 17.117 17.064 16.97 16.906 16.838 16.802 16.731 16.651 16.563 16.515 16.398 16.347 16.29 16.238 16.119 16.049 15.965 15.868 15.748 15.597 15.422 14.972 -10 ,18352 ,KEBNE ,16678948,Thu Nov 25 05:17:02 CET,Thu Nov 25 06:45:26 CET,0.0 0.909 1.292 1.573 1.804 1.995 2.153 2.299 2.566 2.683 2.792 2.921 3.113 3.208 3.376 3.554 3.735 3.82 3.972 4.118 4.333 4.467 4.589 4.774 4.953 5.122 5.283 5.443 5.648 5.845 6.054 6.314 6.549 6.785 7.069 7.374 7.66 7.963 8.294 8.651 9.021 9.458 9.952 10.435 11.002 11.626 12.373 13.215 14.209 15.288 16.478 17.403 17.922 18.195 18.313 18.374 18.38 18.361 18.338 18.299 18.244 18.183 18.129 18.079 18.034 17.982 17.91 17.84 17.786 17.735 17.673 17.623 17.569 17.5 17.441 17.389 17.341 17.283 17.218 17.168 17.109 17.017 16.957 16.893 16.855 16.788 16.722 16.642 16.599 16.491 16.447 16.39 16.326 16.166 16.078 15.988 15.9 15.795 15.676 15.507 15.061 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5a.txt deleted file mode 100644 index 6f9ee5db..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16149 ,TETRA ,17673046,Fri Dec 3 09:41:55 CET,Fri Dec 3 11:18:15 CET,0.0 0.539 0.794 0.959 1.069 1.177 1.285 1.381 1.542 1.619 1.698 1.766 1.903 1.959 2.061 2.179 2.304 2.356 2.449 2.532 2.655 2.741 2.819 2.937 3.043 3.142 3.231 3.317 3.444 3.549 3.65 3.776 3.887 3.995 4.12 4.266 4.391 4.51 4.624 4.707 4.798 4.92 5.065 5.165 5.251 5.364 5.458 5.48 5.425 5.185 4.584 3.678 2.857 2.123 1.446 0.865 0.371 -0.093 -0.51 -0.915 -1.243 -1.528 -1.818 -2.1 -2.354 -2.604 -2.878 -3.115 -3.298 -3.49 -3.697 -3.866 -4.043 -4.224 -4.367 -4.507 -4.643 -4.793 -4.955 -5.062 -5.18 -5.374 -5.503 -5.638 -5.706 -5.844 -6.0 -6.169 -6.253 -6.417 -6.509 -6.605 -6.702 -6.934 -7.066 -7.193 -7.329 -7.479 -7.673 -7.949 -8.746 -2 ,17222 ,TETRA ,17673047,Fri Dec 3 09:46:53 CET,Fri Dec 3 11:32:39 CET,0.0 0.785 1.049 1.207 1.347 1.465 1.566 1.662 1.838 1.918 1.989 2.024 2.151 2.216 2.364 2.487 2.582 2.631 2.718 2.795 2.91 2.987 3.072 3.196 3.309 3.419 3.524 3.626 3.733 3.811 3.885 3.992 4.109 4.208 4.322 4.444 4.542 4.634 4.733 4.859 4.998 5.145 5.282 5.38 5.458 5.519 5.539 5.505 5.411 5.182 4.575 3.606 2.755 2.028 1.395 0.816 0.32 -0.125 -0.528 -0.948 -1.323 -1.632 -1.894 -2.142 -2.391 -2.624 -2.872 -3.09 -3.271 -3.486 -3.707 -3.876 -4.048 -4.212 -4.344 -4.49 -4.653 -4.832 -5.003 -5.118 -5.24 -5.415 -5.542 -5.674 -5.733 -5.865 -6.01 -6.165 -6.252 -6.427 -6.544 -6.637 -6.718 -6.914 -7.037 -7.173 -7.317 -7.482 -7.681 -7.949 -8.512 -3 ,16673 ,TETRA ,17673048,Fri Dec 3 09:46:54 CET,Fri Dec 3 11:40:31 CET,0.0 0.628 0.876 1.025 1.147 1.257 1.365 1.473 1.649 1.72 1.796 1.872 2.022 2.085 2.2 2.313 2.407 2.455 2.54 2.606 2.701 2.772 2.849 2.955 3.065 3.17 3.258 3.342 3.443 3.536 3.616 3.729 3.847 3.943 4.053 4.177 4.282 4.397 4.524 4.636 4.751 4.89 5.007 5.105 5.227 5.313 5.365 5.362 5.234 4.964 4.361 3.436 2.632 1.919 1.25 0.668 0.195 -0.25 -0.64 -1.041 -1.387 -1.681 -1.97 -2.23 -2.463 -2.683 -2.936 -3.159 -3.363 -3.6 -3.819 -3.977 -4.145 -4.323 -4.472 -4.631 -4.786 -4.939 -5.096 -5.203 -5.308 -5.48 -5.604 -5.741 -5.821 -5.969 -6.108 -6.252 -6.325 -6.492 -6.608 -6.708 -6.811 -7.017 -7.127 -7.261 -7.414 -7.595 -7.792 -8.035 -8.726 -4 ,14988 ,TETRA ,17673049,Fri Dec 3 09:46:55 CET,Fri Dec 3 11:19:34 CET,0.0 0.544 0.791 0.973 1.09 1.184 1.278 1.359 1.499 1.579 1.659 1.718 1.864 1.929 2.034 2.132 2.244 2.298 2.388 2.472 2.594 2.672 2.749 2.86 2.958 3.068 3.176 3.265 3.373 3.473 3.575 3.698 3.81 3.902 3.997 4.103 4.198 4.294 4.402 4.528 4.641 4.766 4.913 5.016 5.109 5.196 5.255 5.291 5.235 5.001 4.373 3.483 2.65 1.878 1.251 0.666 0.159 -0.266 -0.66 -1.069 -1.403 -1.679 -1.954 -2.218 -2.461 -2.685 -2.923 -3.152 -3.353 -3.549 -3.742 -3.897 -4.066 -4.251 -4.384 -4.52 -4.657 -4.793 -4.939 -5.043 -5.16 -5.353 -5.489 -5.624 -5.689 -5.836 -5.999 -6.163 -6.246 -6.417 -6.52 -6.612 -6.706 -6.909 -7.023 -7.158 -7.331 -7.53 -7.755 -8.065 -8.981 -5 ,320 ,TETRA ,17673050,Fri Dec 3 10:20:49 CET,Fri Dec 3 11:50:36 CET,0.0 1.032 1.281 1.445 1.583 1.708 1.822 1.915 2.083 2.161 2.237 2.309 2.443 2.497 2.605 2.711 2.81 2.857 2.939 3.027 3.159 3.238 3.32 3.42 3.509 3.599 3.676 3.752 3.856 3.959 4.06 4.172 4.279 4.377 4.482 4.617 4.747 4.869 4.974 5.075 5.193 5.303 5.402 5.501 5.621 5.755 5.847 5.845 5.746 5.497 4.896 3.969 3.14 2.414 1.785 1.234 0.719 0.249 -0.147 -0.548 -0.872 -1.163 -1.458 -1.727 -1.959 -2.169 -2.419 -2.649 -2.838 -3.025 -3.218 -3.382 -3.548 -3.723 -3.861 -3.994 -4.144 -4.296 -4.441 -4.55 -4.664 -4.845 -4.968 -5.092 -5.158 -5.307 -5.466 -5.613 -5.69 -5.859 -5.973 -6.074 -6.184 -6.421 -6.536 -6.66 -6.804 -6.975 -7.155 -7.372 -7.83 -6 ,16947 ,TETRA ,17673051,Fri Dec 3 10:20:49 CET,Fri Dec 3 11:54:48 CET,0.0 0.713 1.003 1.21 1.37 1.501 1.628 1.739 1.888 1.955 2.022 2.057 2.185 2.252 2.371 2.474 2.565 2.613 2.723 2.809 2.928 3.009 3.088 3.206 3.318 3.43 3.539 3.64 3.761 3.874 3.99 4.124 4.24 4.356 4.472 4.578 4.672 4.758 4.856 4.97 5.094 5.214 5.334 5.435 5.548 5.633 5.681 5.706 5.623 5.353 4.742 3.883 3.095 2.326 1.624 1.041 0.54 0.092 -0.309 -0.717 -1.042 -1.352 -1.691 -2.004 -2.291 -2.538 -2.785 -3.01 -3.195 -3.405 -3.632 -3.801 -3.976 -4.16 -4.285 -4.415 -4.556 -4.702 -4.862 -4.978 -5.099 -5.284 -5.408 -5.53 -5.594 -5.739 -5.9 -6.067 -6.151 -6.321 -6.425 -6.522 -6.63 -6.853 -6.958 -7.077 -7.223 -7.376 -7.561 -7.82 -8.424 -7 ,10577 ,TETRA ,17673052,Fri Dec 3 10:20:50 CET,Fri Dec 3 11:51:44 CET,0.0 0.479 0.659 0.851 0.981 1.08 1.192 1.304 1.497 1.581 1.667 1.734 1.867 1.941 2.083 2.196 2.301 2.349 2.436 2.524 2.641 2.72 2.797 2.902 3.005 3.11 3.207 3.289 3.383 3.464 3.546 3.648 3.751 3.858 3.971 4.09 4.221 4.366 4.5 4.627 4.755 4.88 5.035 5.174 5.273 5.336 5.361 5.345 5.237 4.992 4.388 3.497 2.644 1.873 1.207 0.619 0.13 -0.324 -0.72 -1.116 -1.444 -1.722 -1.99 -2.242 -2.474 -2.702 -2.966 -3.186 -3.367 -3.559 -3.753 -3.911 -4.087 -4.282 -4.428 -4.565 -4.701 -4.846 -5.008 -5.127 -5.241 -5.411 -5.534 -5.67 -5.741 -5.879 -6.03 -6.186 -6.266 -6.433 -6.52 -6.606 -6.703 -6.925 -7.048 -7.18 -7.337 -7.522 -7.728 -8.001 -8.846 -8 ,31060 ,TETRA ,17673053,Fri Dec 3 10:20:51 CET,Fri Dec 3 11:57:43 CET,0.0 0.513 0.787 0.989 1.129 1.254 1.381 1.502 1.698 1.779 1.855 1.913 2.046 2.101 2.206 2.318 2.429 2.483 2.578 2.652 2.751 2.822 2.906 3.022 3.119 3.218 3.306 3.391 3.498 3.575 3.667 3.782 3.875 3.972 4.079 4.188 4.295 4.411 4.516 4.602 4.696 4.826 4.963 5.069 5.174 5.243 5.279 5.278 5.178 4.889 4.217 3.307 2.482 1.739 1.116 0.571 0.102 -0.338 -0.752 -1.182 -1.532 -1.83 -2.125 -2.409 -2.664 -2.893 -3.136 -3.349 -3.532 -3.743 -3.968 -4.14 -4.317 -4.502 -4.643 -4.798 -4.949 -5.098 -5.249 -5.35 -5.464 -5.649 -5.783 -5.91 -5.972 -6.108 -6.252 -6.412 -6.494 -6.662 -6.775 -6.879 -6.984 -7.186 -7.306 -7.436 -7.567 -7.732 -7.979 -8.285 -9.01 -9 ,11425 ,TETRA ,17673054,Fri Dec 3 09:46:54 CET,Fri Dec 3 11:23:47 CET,0.0 0.563 0.806 0.999 1.174 1.318 1.426 1.529 1.714 1.799 1.875 1.927 2.067 2.128 2.227 2.321 2.417 2.464 2.556 2.636 2.743 2.826 2.904 3.005 3.094 3.181 3.271 3.356 3.449 3.526 3.616 3.744 3.857 3.954 4.053 4.162 4.261 4.382 4.524 4.667 4.81 4.941 5.055 5.157 5.276 5.347 5.378 5.362 5.249 4.96 4.309 3.417 2.632 1.925 1.267 0.673 0.168 -0.302 -0.719 -1.115 -1.444 -1.745 -2.062 -2.37 -2.632 -2.86 -3.104 -3.331 -3.531 -3.754 -3.965 -4.121 -4.283 -4.464 -4.612 -4.763 -4.925 -5.083 -5.249 -5.366 -5.479 -5.662 -5.799 -5.947 -6.016 -6.163 -6.325 -6.486 -6.567 -6.729 -6.82 -6.914 -7.019 -7.265 -7.393 -7.537 -7.7 -7.848 -8.019 -8.261 -8.935 -10 ,27609 ,TETRA ,17673055,Fri Dec 3 09:46:57 CET,Fri Dec 3 11:22:55 CET,0.0 0.777 1.0 1.148 1.278 1.395 1.497 1.587 1.741 1.819 1.892 1.949 2.089 2.153 2.271 2.37 2.465 2.518 2.611 2.698 2.827 2.905 2.984 3.096 3.21 3.308 3.379 3.449 3.542 3.646 3.759 3.868 3.967 4.066 4.161 4.27 4.387 4.523 4.669 4.825 4.953 5.051 5.173 5.273 5.371 5.446 5.493 5.501 5.395 5.146 4.566 3.672 2.859 2.132 1.534 1.017 0.535 0.092 -0.285 -0.66 -0.977 -1.269 -1.542 -1.811 -2.091 -2.333 -2.565 -2.767 -2.945 -3.14 -3.34 -3.513 -3.685 -3.856 -4.003 -4.154 -4.305 -4.467 -4.627 -4.729 -4.831 -4.995 -5.119 -5.249 -5.318 -5.463 -5.612 -5.777 -5.862 -6.025 -6.129 -6.241 -6.352 -6.572 -6.683 -6.805 -6.957 -7.145 -7.359 -7.619 -8.258 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5c.txt deleted file mode 100644 index ee388c1d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2633 ,KEBNE ,16678949,Thu Nov 25 05:17:02 CET,Thu Nov 25 06:42:03 CET,0.0 0.798 1.081 1.285 1.438 1.563 1.709 1.855 2.087 2.183 2.269 2.374 2.542 2.634 2.803 2.954 3.084 3.15 3.279 3.399 3.591 3.711 3.82 3.978 4.126 4.281 4.428 4.56 4.728 4.896 5.063 5.254 5.434 5.602 5.783 5.978 6.156 6.34 6.544 6.741 6.94 7.165 7.43 7.719 8.036 8.366 8.721 9.037 9.348 9.653 9.774 9.556 9.229 8.873 8.528 8.181 7.867 7.582 7.337 7.08 6.858 6.658 6.448 6.244 6.037 5.859 5.697 5.556 5.422 5.269 5.123 4.987 4.84 4.712 4.618 4.514 4.406 4.275 4.12 4.024 3.932 3.787 3.682 3.571 3.515 3.379 3.237 3.117 3.055 2.91 2.847 2.773 2.694 2.512 2.402 2.277 2.15 2.009 1.852 1.623 1.066 -2 ,16325 ,KEBNE ,16678950,Thu Nov 25 05:17:01 CET,Thu Nov 25 06:43:49 CET,0.0 0.719 0.981 1.184 1.342 1.484 1.623 1.762 2.014 2.123 2.231 2.355 2.514 2.596 2.751 2.908 3.06 3.126 3.254 3.379 3.558 3.669 3.777 3.949 4.103 4.244 4.392 4.533 4.706 4.876 5.042 5.217 5.373 5.535 5.734 5.959 6.166 6.374 6.589 6.839 7.099 7.347 7.627 7.908 8.212 8.53 8.867 9.195 9.539 9.814 9.889 9.737 9.449 9.111 8.788 8.482 8.191 7.877 7.575 7.28 7.051 6.848 6.645 6.447 6.266 6.098 5.92 5.751 5.574 5.399 5.228 5.082 4.932 4.779 4.672 4.566 4.448 4.325 4.214 4.13 4.034 3.904 3.816 3.715 3.663 3.552 3.432 3.315 3.259 3.118 3.035 2.959 2.89 2.72 2.61 2.49 2.355 2.197 2.003 1.735 1.282 -3 ,5436 ,KEBNE ,16678951,Thu Nov 25 05:17:02 CET,Thu Nov 25 06:42:50 CET,0.0 0.701 0.955 1.147 1.278 1.397 1.51 1.624 1.858 1.958 2.047 2.158 2.322 2.403 2.564 2.699 2.819 2.887 3.022 3.144 3.329 3.448 3.557 3.713 3.861 4.002 4.136 4.266 4.442 4.598 4.746 4.93 5.096 5.273 5.476 5.677 5.887 6.127 6.349 6.568 6.801 7.041 7.305 7.573 7.884 8.233 8.587 8.918 9.266 9.551 9.644 9.438 9.09 8.736 8.401 8.068 7.735 7.398 7.115 6.854 6.62 6.389 6.184 6.003 5.82 5.641 5.45 5.277 5.141 5.006 4.855 4.734 4.617 4.482 4.37 4.252 4.127 3.994 3.862 3.77 3.662 3.491 3.373 3.256 3.199 3.069 2.931 2.803 2.737 2.59 2.519 2.442 2.363 2.187 2.086 1.967 1.827 1.681 1.51 1.291 0.675 -4 ,9682 ,KEBNE ,16678952,Thu Nov 25 05:17:02 CET,Thu Nov 25 06:42:53 CET,0.0 1.049 1.356 1.53 1.675 1.833 1.991 2.108 2.292 2.394 2.496 2.592 2.742 2.819 2.969 3.131 3.285 3.348 3.467 3.592 3.774 3.887 3.986 4.119 4.261 4.402 4.528 4.654 4.811 4.949 5.094 5.288 5.461 5.619 5.805 6.02 6.224 6.428 6.648 6.854 7.066 7.325 7.633 7.922 8.213 8.528 8.86 9.17 9.487 9.79 9.969 9.803 9.516 9.181 8.851 8.521 8.202 7.917 7.679 7.427 7.175 6.947 6.74 6.551 6.37 6.188 6.015 5.864 5.719 5.565 5.401 5.265 5.137 5.001 4.889 4.772 4.657 4.524 4.37 4.271 4.178 4.039 3.935 3.821 3.761 3.635 3.51 3.378 3.305 3.162 3.105 3.024 2.939 2.789 2.707 2.598 2.461 2.303 2.147 1.981 1.731 -5 ,31074 ,KEBNE ,16678953,Thu Nov 25 05:17:02 CET,Thu Nov 25 06:41:56 CET,0.0 0.504 0.743 0.951 1.121 1.276 1.423 1.564 1.794 1.888 1.983 2.096 2.255 2.329 2.473 2.61 2.736 2.792 2.911 3.027 3.178 3.28 3.389 3.545 3.684 3.813 3.933 4.059 4.24 4.422 4.587 4.771 4.947 5.119 5.323 5.537 5.724 5.905 6.107 6.329 6.56 6.827 7.1 7.364 7.678 7.993 8.32 8.655 8.993 9.31 9.453 9.231 8.911 8.562 8.203 7.885 7.623 7.371 7.133 6.872 6.644 6.45 6.269 6.067 5.858 5.673 5.474 5.312 5.191 5.064 4.916 4.796 4.67 4.525 4.405 4.272 4.144 4.018 3.893 3.808 3.71 3.549 3.447 3.353 3.301 3.184 3.054 2.914 2.845 2.701 2.623 2.544 2.46 2.283 2.186 2.083 1.955 1.816 1.667 1.439 0.882 -6 ,19621 ,KEBNE ,16678954,Thu Nov 25 05:17:02 CET,Thu Nov 25 06:41:57 CET,0.0 0.531 0.742 0.947 1.12 1.258 1.374 1.476 1.671 1.776 1.874 1.983 2.15 2.239 2.404 2.548 2.683 2.747 2.87 2.985 3.143 3.247 3.365 3.541 3.711 3.873 4.016 4.149 4.316 4.482 4.648 4.844 5.017 5.175 5.367 5.587 5.777 5.995 6.233 6.466 6.716 6.989 7.277 7.551 7.86 8.22 8.598 8.924 9.249 9.542 9.696 9.532 9.223 8.859 8.487 8.166 7.872 7.57 7.29 7.031 6.812 6.603 6.398 6.19 5.972 5.781 5.612 5.446 5.295 5.152 5.006 4.886 4.763 4.636 4.538 4.425 4.303 4.17 4.025 3.924 3.825 3.685 3.576 3.449 3.384 3.264 3.143 3.016 2.952 2.814 2.753 2.672 2.583 2.397 2.31 2.216 2.098 1.95 1.792 1.594 1.169 -7 ,7477 ,KEBNE ,16678955,Thu Nov 25 05:18:03 CET,Thu Nov 25 06:45:16 CET,0.0 0.406 0.64 0.85 1.008 1.15 1.289 1.413 1.644 1.75 1.838 1.931 2.09 2.178 2.342 2.495 2.636 2.698 2.814 2.942 3.129 3.241 3.354 3.524 3.676 3.806 3.936 4.065 4.205 4.341 4.493 4.694 4.886 5.049 5.251 5.483 5.686 5.902 6.132 6.393 6.661 6.924 7.197 7.486 7.823 8.164 8.509 8.825 9.12 9.349 9.467 9.313 9.024 8.69 8.348 8.035 7.748 7.45 7.191 6.934 6.711 6.512 6.305 6.113 5.938 5.784 5.615 5.452 5.315 5.164 4.99 4.846 4.71 4.579 4.468 4.348 4.228 4.099 3.966 3.878 3.795 3.672 3.575 3.465 3.408 3.301 3.189 3.054 2.986 2.845 2.767 2.684 2.596 2.415 2.309 2.202 2.096 1.978 1.844 1.627 0.879 -8 ,30163 ,KEBNE ,16678956,Thu Nov 25 05:19:04 CET,Thu Nov 25 06:44:02 CET,0.0 0.424 0.686 0.886 1.056 1.216 1.361 1.48 1.701 1.81 1.911 2.014 2.182 2.274 2.429 2.574 2.698 2.753 2.885 3.014 3.198 3.323 3.44 3.599 3.753 3.912 4.058 4.189 4.352 4.513 4.665 4.845 4.997 5.13 5.31 5.524 5.715 5.917 6.122 6.33 6.542 6.789 7.079 7.364 7.683 8.005 8.355 8.668 8.947 9.219 9.303 9.099 8.813 8.469 8.123 7.761 7.439 7.161 6.915 6.645 6.393 6.178 5.974 5.762 5.571 5.399 5.204 5.017 4.841 4.666 4.496 4.362 4.244 4.125 4.027 3.919 3.804 3.685 3.546 3.445 3.347 3.205 3.105 2.987 2.921 2.798 2.677 2.542 2.471 2.323 2.255 2.177 2.081 1.851 1.732 1.619 1.509 1.397 1.252 1.035 0.709 -9 ,16740 ,KEBNE ,16678957,Thu Nov 25 05:19:04 CET,Thu Nov 25 06:44:33 CET,0.0 0.733 0.996 1.188 1.327 1.448 1.58 1.701 1.901 2.004 2.101 2.21 2.368 2.457 2.637 2.768 2.896 2.966 3.108 3.239 3.427 3.547 3.665 3.826 3.974 4.113 4.232 4.346 4.503 4.67 4.829 5.008 5.178 5.351 5.538 5.733 5.925 6.128 6.348 6.58 6.818 7.074 7.363 7.652 7.945 8.25 8.607 8.976 9.295 9.528 9.601 9.364 9.023 8.648 8.285 7.901 7.515 7.212 6.987 6.748 6.523 6.306 6.071 5.851 5.66 5.483 5.305 5.139 4.996 4.841 4.651 4.503 4.369 4.239 4.133 4.004 3.866 3.72 3.577 3.492 3.405 3.253 3.144 3.028 2.962 2.825 2.688 2.559 2.496 2.359 2.288 2.201 2.105 1.884 1.778 1.672 1.541 1.407 1.27 1.086 0.65 -10 ,31270 ,KEBNE ,16678958,Thu Nov 25 05:19:05 CET,Thu Nov 25 06:45:09 CET,0.0 0.696 0.941 1.156 1.346 1.504 1.622 1.716 1.904 2.017 2.139 2.262 2.413 2.494 2.656 2.807 2.952 3.018 3.135 3.245 3.414 3.519 3.618 3.777 3.938 4.098 4.246 4.376 4.536 4.694 4.858 5.058 5.23 5.391 5.604 5.823 6.022 6.244 6.474 6.705 6.924 7.162 7.446 7.727 8.038 8.362 8.683 9.018 9.346 9.624 9.801 9.66 9.316 8.933 8.586 8.252 7.921 7.617 7.38 7.141 6.915 6.712 6.534 6.338 6.129 5.962 5.792 5.616 5.452 5.295 5.136 4.994 4.845 4.701 4.599 4.493 4.38 4.263 4.136 4.049 3.953 3.81 3.715 3.605 3.545 3.413 3.276 3.136 3.067 2.916 2.837 2.762 2.671 2.478 2.38 2.263 2.14 2.026 1.878 1.624 1.072 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5d_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5d_3b.txt deleted file mode 100644 index d0d5978b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5d_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1131 ,KEBNE ,16678959,Thu Nov 25 05:19:05 CET,Thu Nov 25 06:46:26 CET,0.0 0.849 1.151 1.399 1.588 1.739 1.887 2.034 2.308 2.436 2.557 2.695 2.891 2.987 3.154 3.318 3.492 3.574 3.733 3.885 4.092 4.228 4.359 4.545 4.725 4.898 5.066 5.227 5.436 5.641 5.844 6.093 6.335 6.553 6.806 7.103 7.392 7.715 8.062 8.445 8.851 9.295 9.788 10.292 10.9 11.566 12.349 13.226 14.185 15.299 16.579 17.569 18.061 18.333 18.521 18.602 18.633 18.633 18.602 18.572 18.543 18.507 18.468 18.406 18.346 18.307 18.259 18.209 18.155 18.093 18.027 17.971 17.912 17.842 17.786 17.731 17.675 17.612 17.539 17.492 17.444 17.364 17.304 17.235 17.196 17.112 17.025 16.939 16.895 16.779 16.758 16.708 16.656 16.539 16.468 16.372 16.251 16.123 15.983 15.778 15.2 -2 ,30126 ,KEBNE ,16678960,Thu Nov 25 05:19:05 CET,Thu Nov 25 06:48:02 CET,0.0 1.053 1.384 1.617 1.813 2.0 2.158 2.295 2.572 2.692 2.798 2.92 3.107 3.189 3.35 3.518 3.675 3.751 3.906 4.053 4.266 4.405 4.538 4.737 4.927 5.106 5.281 5.448 5.657 5.858 6.053 6.293 6.532 6.765 7.025 7.308 7.594 7.917 8.264 8.641 9.033 9.483 10.024 10.563 11.19 11.834 12.515 13.307 14.264 15.392 16.744 17.778 18.282 18.531 18.671 18.746 18.754 18.743 18.732 18.699 18.643 18.573 18.494 18.418 18.354 18.298 18.235 18.181 18.134 18.077 18.006 17.944 17.891 17.83 17.779 17.727 17.67 17.594 17.51 17.46 17.411 17.322 17.257 17.185 17.148 17.077 16.996 16.908 16.867 16.754 16.736 16.685 16.622 16.502 16.427 16.327 16.222 16.104 15.956 15.758 15.215 -3 ,5457 ,KEBNE ,16678961,Thu Nov 25 05:19:05 CET,Thu Nov 25 06:43:33 CET,0.0 0.683 0.95 1.165 1.362 1.534 1.691 1.835 2.066 2.181 2.304 2.436 2.627 2.72 2.898 3.066 3.225 3.303 3.463 3.624 3.844 3.982 4.111 4.305 4.492 4.66 4.826 5.0 5.218 5.422 5.635 5.888 6.117 6.344 6.614 6.919 7.225 7.568 7.918 8.271 8.659 9.127 9.66 10.186 10.791 11.455 12.216 13.079 14.063 15.131 16.384 17.362 17.894 18.182 18.285 18.332 18.368 18.369 18.37 18.347 18.312 18.279 18.236 18.176 18.112 18.057 17.986 17.916 17.847 17.775 17.696 17.623 17.557 17.488 17.429 17.366 17.304 17.24 17.157 17.099 17.043 16.944 16.875 16.811 16.776 16.698 16.613 16.53 16.49 16.369 16.334 16.274 16.204 16.074 16.009 15.931 15.853 15.744 15.585 15.375 14.905 -4 ,4615 ,KEBNE ,16678962,Thu Nov 25 05:19:05 CET,Thu Nov 25 06:48:24 CET,0.0 0.616 0.886 1.137 1.326 1.492 1.648 1.782 2.013 2.124 2.23 2.337 2.519 2.61 2.786 2.95 3.112 3.191 3.344 3.485 3.692 3.821 3.954 4.156 4.353 4.543 4.729 4.91 5.126 5.327 5.527 5.77 6.01 6.237 6.514 6.847 7.152 7.462 7.8 8.169 8.562 9.013 9.533 10.044 10.644 11.308 12.041 12.868 13.849 15.062 16.401 17.354 17.876 18.133 18.293 18.423 18.485 18.491 18.467 18.43 18.392 18.347 18.292 18.237 18.18 18.12 18.045 17.974 17.909 17.834 17.76 17.698 17.633 17.561 17.504 17.449 17.387 17.33 17.277 17.23 17.178 17.084 17.012 16.945 16.91 16.837 16.761 16.672 16.616 16.487 16.446 16.394 16.346 16.209 16.117 16.005 15.889 15.796 15.661 15.471 15.012 -5 ,25882 ,KEBNE ,16678963,Thu Nov 25 05:19:05 CET,Thu Nov 25 06:43:36 CET,0.0 0.864 1.137 1.382 1.562 1.705 1.847 1.98 2.215 2.332 2.44 2.564 2.758 2.848 3.029 3.208 3.376 3.453 3.595 3.733 3.942 4.079 4.217 4.408 4.585 4.755 4.912 5.073 5.295 5.509 5.716 5.952 6.184 6.424 6.698 6.998 7.278 7.579 7.906 8.285 8.688 9.131 9.666 10.2 10.783 11.43 12.19 13.016 14.0 15.182 16.491 17.483 18.015 18.246 18.344 18.399 18.441 18.471 18.477 18.456 18.419 18.383 18.33 18.271 18.211 18.154 18.089 18.027 17.977 17.917 17.858 17.809 17.746 17.673 17.618 17.568 17.506 17.435 17.356 17.311 17.266 17.175 17.113 17.059 17.03 16.958 16.867 16.762 16.715 16.607 16.595 16.538 16.47 16.322 16.254 16.189 16.127 16.061 15.938 15.739 15.356 -6 ,9784 ,KEBNE ,16678964,Thu Nov 25 05:19:05 CET,Thu Nov 25 06:43:51 CET,0.0 0.777 1.061 1.273 1.45 1.6 1.736 1.876 2.133 2.25 2.364 2.479 2.673 2.769 2.939 3.11 3.281 3.364 3.516 3.669 3.882 4.021 4.159 4.344 4.527 4.702 4.864 5.033 5.261 5.468 5.661 5.905 6.133 6.349 6.604 6.89 7.171 7.484 7.821 8.184 8.579 9.019 9.516 10.044 10.655 11.308 12.055 12.897 13.871 14.932 16.123 17.063 17.57 17.868 18.02 18.097 18.148 18.15 18.111 18.065 18.027 17.977 17.913 17.854 17.805 17.755 17.686 17.618 17.566 17.505 17.433 17.372 17.308 17.242 17.191 17.139 17.086 17.026 16.959 16.903 16.843 16.756 16.693 16.631 16.603 16.545 16.471 16.383 16.342 16.228 16.216 16.167 16.102 15.966 15.895 15.815 15.712 15.584 15.409 15.107 14.241 -7 ,21055 ,KEBNE ,16678965,Thu Nov 25 05:19:05 CET,Thu Nov 25 06:43:35 CET,0.0 0.724 1.013 1.227 1.403 1.559 1.711 1.866 2.111 2.205 2.31 2.423 2.614 2.716 2.905 3.084 3.254 3.333 3.497 3.652 3.848 3.983 4.123 4.318 4.493 4.657 4.814 4.974 5.194 5.406 5.613 5.864 6.105 6.333 6.598 6.912 7.198 7.509 7.855 8.213 8.589 9.039 9.559 10.076 10.67 11.327 12.095 12.914 13.844 14.907 16.131 17.072 17.56 17.832 17.974 18.056 18.094 18.09 18.061 18.019 17.972 17.919 17.86 17.786 17.717 17.662 17.601 17.535 17.472 17.415 17.366 17.325 17.269 17.202 17.152 17.09 17.018 16.947 16.877 16.828 16.78 16.689 16.613 16.545 16.508 16.425 16.346 16.27 16.231 16.11 16.065 16.007 15.953 15.821 15.736 15.637 15.519 15.357 15.14 14.852 14.38 -8 ,16339 ,KEBNE ,16678966,Thu Nov 25 05:19:05 CET,Thu Nov 25 06:45:56 CET,0.0 0.74 1.119 1.354 1.545 1.713 1.861 2.015 2.296 2.413 2.525 2.644 2.84 2.939 3.108 3.272 3.437 3.516 3.665 3.813 4.013 4.148 4.285 4.486 4.683 4.86 5.039 5.215 5.426 5.628 5.824 6.071 6.317 6.548 6.803 7.093 7.4 7.732 8.074 8.453 8.86 9.3 9.782 10.275 10.879 11.54 12.272 13.06 14.008 15.166 16.438 17.4 17.894 18.164 18.321 18.4 18.445 18.459 18.445 18.41 18.354 18.303 18.256 18.194 18.127 18.073 18.012 17.958 17.905 17.846 17.789 17.738 17.679 17.607 17.549 17.485 17.424 17.367 17.297 17.251 17.205 17.128 17.078 17.018 16.986 16.92 16.838 16.747 16.702 16.588 16.562 16.501 16.425 16.277 16.209 16.132 16.035 15.923 15.798 15.66 15.357 -9 ,179 ,KEBNE ,16678967,Thu Nov 25 05:20:06 CET,Thu Nov 25 06:46:35 CET,0.0 1.015 1.339 1.549 1.715 1.883 2.04 2.176 2.443 2.566 2.674 2.781 2.965 3.054 3.229 3.387 3.541 3.619 3.767 3.904 4.114 4.252 4.379 4.576 4.77 4.944 5.113 5.287 5.511 5.732 5.944 6.191 6.434 6.666 6.949 7.268 7.553 7.859 8.196 8.552 8.927 9.373 9.866 10.348 10.938 11.611 12.359 13.252 14.318 15.405 16.682 17.67 18.139 18.384 18.546 18.665 18.723 18.735 18.71 18.666 18.63 18.595 18.553 18.502 18.446 18.383 18.312 18.254 18.206 18.154 18.093 18.039 17.984 17.92 17.87 17.81 17.749 17.694 17.631 17.578 17.523 17.45 17.395 17.332 17.298 17.222 17.139 17.063 17.026 16.913 16.906 16.861 16.819 16.722 16.644 16.54 16.45 16.343 16.193 15.99 15.518 -10 ,3711 ,KEBNE ,16678968,Thu Nov 25 05:20:06 CET,Thu Nov 25 06:47:21 CET,0.0 0.764 1.006 1.193 1.361 1.514 1.66 1.796 2.058 2.179 2.293 2.405 2.585 2.678 2.861 3.02 3.177 3.255 3.403 3.54 3.738 3.873 4.002 4.189 4.383 4.572 4.752 4.934 5.17 5.38 5.576 5.824 6.06 6.286 6.553 6.85 7.135 7.447 7.779 8.136 8.513 8.93 9.405 9.912 10.517 11.176 11.947 12.801 13.782 14.905 16.164 17.114 17.618 17.912 18.084 18.165 18.191 18.187 18.165 18.115 18.069 18.027 17.979 17.934 17.875 17.813 17.742 17.671 17.605 17.54 17.481 17.426 17.358 17.279 17.22 17.17 17.121 17.069 17.012 16.969 16.919 16.843 16.783 16.71 16.68 16.629 16.566 16.475 16.421 16.299 16.267 16.205 16.142 15.998 15.902 15.803 15.702 15.576 15.422 15.265 14.915 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5a.txt deleted file mode 100644 index 8cce9059..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19492 ,KEBNE ,16678969,Thu Nov 25 05:20:06 CET,Thu Nov 25 06:45:44 CET,0.0 0.559 0.797 1.011 1.179 1.315 1.435 1.55 1.777 1.883 1.982 2.062 2.229 2.303 2.465 2.624 2.758 2.82 2.955 3.079 3.243 3.35 3.469 3.647 3.813 3.96 4.089 4.223 4.408 4.589 4.783 5.027 5.239 5.436 5.644 5.862 6.114 6.405 6.689 6.991 7.334 7.739 8.174 8.619 9.187 9.8 10.45 11.168 12.014 13.023 14.208 15.095 15.536 15.751 15.865 15.909 15.907 15.851 15.755 15.624 15.495 15.381 15.278 15.164 15.054 14.942 14.806 14.691 14.579 14.482 14.399 14.306 14.199 14.088 14.0 13.905 13.8 13.701 13.594 13.517 13.447 13.318 13.218 13.13 13.082 12.98 12.888 12.788 12.734 12.599 12.549 12.478 12.397 12.224 12.141 12.054 11.945 11.821 11.656 11.419 10.775 -2 ,5446 ,KEBNE ,16678970,Thu Nov 25 05:20:06 CET,Thu Nov 25 06:46:42 CET,0.0 0.522 0.757 0.901 1.06 1.222 1.364 1.483 1.676 1.777 1.878 1.974 2.153 2.233 2.401 2.574 2.721 2.787 2.919 3.046 3.228 3.351 3.465 3.616 3.753 3.9 4.059 4.203 4.387 4.558 4.734 4.954 5.148 5.366 5.612 5.86 6.112 6.386 6.665 6.962 7.282 7.679 8.164 8.608 9.102 9.654 10.289 11.024 11.895 12.878 14.03 14.944 15.409 15.631 15.734 15.74 15.718 15.707 15.663 15.595 15.487 15.399 15.327 15.207 15.076 14.961 14.862 14.765 14.666 14.574 14.478 14.394 14.308 14.22 14.15 14.078 13.997 13.898 13.794 13.717 13.628 13.492 13.404 13.319 13.276 13.18 13.075 12.954 12.881 12.733 12.689 12.623 12.548 12.36 12.268 12.169 12.042 11.902 11.725 11.463 10.854 -3 ,7470 ,KEBNE ,16678971,Thu Nov 25 05:20:06 CET,Thu Nov 25 06:46:21 CET,0.0 0.391 0.607 0.784 0.938 1.079 1.199 1.316 1.541 1.641 1.733 1.815 1.997 2.08 2.238 2.373 2.497 2.563 2.69 2.826 3.019 3.141 3.265 3.445 3.608 3.761 3.914 4.061 4.238 4.404 4.572 4.778 4.978 5.172 5.41 5.665 5.884 6.142 6.457 6.788 7.118 7.492 7.929 8.351 8.823 9.368 10.033 10.781 11.627 12.663 13.872 14.782 15.243 15.464 15.576 15.621 15.62 15.605 15.558 15.487 15.4 15.31 15.23 15.16 15.082 14.995 14.91 14.809 14.714 14.622 14.532 14.441 14.342 14.242 14.161 14.085 13.994 13.885 13.781 13.714 13.631 13.486 13.39 13.286 13.23 13.114 12.993 12.871 12.804 12.658 12.61 12.54 12.468 12.3 12.208 12.115 12.009 11.878 11.718 11.473 10.82 -4 ,2497 ,KEBNE ,16678972,Thu Nov 25 05:21:07 CET,Thu Nov 25 06:46:05 CET,0.0 0.616 0.9 1.132 1.314 1.473 1.596 1.699 1.912 2.022 2.121 2.196 2.371 2.449 2.592 2.73 2.863 2.938 3.085 3.213 3.4 3.514 3.623 3.788 3.962 4.117 4.252 4.401 4.609 4.792 4.96 5.165 5.365 5.556 5.775 6.03 6.275 6.554 6.844 7.154 7.485 7.857 8.283 8.723 9.264 9.857 10.536 11.284 12.171 13.196 14.385 15.318 15.778 16.013 16.116 16.167 16.166 16.108 16.043 15.967 15.903 15.847 15.768 15.678 15.585 15.478 15.375 15.287 15.192 15.091 14.975 14.877 14.776 14.651 14.558 14.472 14.392 14.306 14.207 14.143 14.073 13.959 13.874 13.782 13.732 13.621 13.516 13.407 13.344 13.199 13.148 13.073 13.0 12.83 12.726 12.621 12.486 12.335 12.157 11.869 11.341 -5 ,9934 ,KEBNE ,16678973,Thu Nov 25 05:21:08 CET,Thu Nov 25 06:45:54 CET,0.0 0.843 1.13 1.35 1.537 1.695 1.846 1.96 2.188 2.303 2.399 2.479 2.654 2.733 2.883 3.035 3.177 3.242 3.37 3.494 3.674 3.794 3.915 4.076 4.215 4.365 4.517 4.655 4.823 4.976 5.132 5.333 5.516 5.714 5.961 6.213 6.449 6.716 7.015 7.325 7.654 8.03 8.486 8.945 9.467 10.044 10.701 11.44 12.26 13.249 14.418 15.217 15.662 15.932 16.025 16.061 16.054 16.0 15.936 15.867 15.799 15.725 15.618 15.516 15.442 15.355 15.255 15.161 15.073 14.979 14.881 14.789 14.681 14.568 14.48 14.397 14.312 14.216 14.116 14.043 13.968 13.846 13.757 13.659 13.603 13.508 13.399 13.276 13.22 13.078 13.033 12.953 12.864 12.672 12.568 12.448 12.308 12.149 11.957 11.732 11.035 -6 ,28376 ,KEBNE ,16678974,Thu Nov 25 05:21:07 CET,Thu Nov 25 06:48:13 CET,0.0 0.604 0.857 1.03 1.2 1.358 1.482 1.605 1.852 1.946 2.03 2.11 2.287 2.374 2.525 2.664 2.81 2.888 3.035 3.174 3.387 3.519 3.64 3.828 4.001 4.156 4.299 4.433 4.617 4.804 4.978 5.178 5.361 5.548 5.8 6.069 6.301 6.571 6.869 7.181 7.51 7.889 8.336 8.779 9.279 9.826 10.466 11.218 12.098 13.132 14.347 15.276 15.728 15.969 16.083 16.117 16.121 16.114 16.082 16.014 15.927 15.823 15.723 15.639 15.54 15.433 15.326 15.225 15.12 15.02 14.916 14.822 14.734 14.646 14.567 14.482 14.4 14.308 14.202 14.124 14.042 13.907 13.81 13.71 13.663 13.565 13.455 13.331 13.267 13.125 13.057 12.977 12.895 12.714 12.617 12.521 12.414 12.275 12.096 11.902 11.442 -7 ,10121 ,KEBNE ,16678975,Thu Nov 25 05:22:09 CET,Thu Nov 25 06:47:03 CET,0.0 0.957 1.21 1.409 1.58 1.725 1.846 1.952 2.159 2.253 2.344 2.427 2.598 2.68 2.838 2.984 3.135 3.206 3.33 3.455 3.638 3.751 3.856 4.008 4.163 4.313 4.452 4.59 4.774 4.948 5.103 5.286 5.475 5.661 5.886 6.157 6.424 6.722 7.022 7.313 7.624 8.0 8.439 8.871 9.375 9.929 10.617 11.408 12.25 13.191 14.352 15.221 15.659 15.92 16.053 16.097 16.092 16.065 15.981 15.844 15.753 15.682 15.582 15.478 15.393 15.325 15.232 15.129 15.049 14.972 14.885 14.788 14.666 14.535 14.439 14.352 14.255 14.153 14.057 13.982 13.905 13.798 13.715 13.621 13.573 13.469 13.362 13.249 13.185 13.039 13.001 12.945 12.867 12.68 12.59 12.491 12.371 12.204 12.008 11.715 11.04 -8 ,21643 ,KEBNE ,16678976,Thu Nov 25 05:21:07 CET,Thu Nov 25 06:45:52 CET,0.0 0.614 0.848 1.046 1.197 1.322 1.451 1.582 1.823 1.923 2.014 2.079 2.248 2.335 2.491 2.638 2.785 2.851 2.964 3.076 3.24 3.351 3.464 3.621 3.764 3.92 4.073 4.218 4.416 4.595 4.762 4.977 5.193 5.389 5.616 5.886 6.139 6.42 6.739 7.068 7.393 7.757 8.187 8.608 9.087 9.611 10.229 10.987 11.893 12.902 14.134 15.041 15.421 15.629 15.773 15.832 15.788 15.714 15.646 15.562 15.482 15.383 15.26 15.151 15.051 14.945 14.839 14.742 14.661 14.576 14.462 14.361 14.257 14.138 14.045 13.957 13.865 13.771 13.681 13.614 13.539 13.418 13.34 13.247 13.19 13.078 12.964 12.847 12.792 12.656 12.6 12.519 12.44 12.27 12.155 12.007 11.852 11.686 11.476 11.23 10.598 -9 ,21557 ,KEBNE ,16678977,Thu Nov 25 05:21:07 CET,Thu Nov 25 06:48:15 CET,0.0 0.618 0.847 1.015 1.164 1.311 1.456 1.587 1.814 1.91 2.006 2.098 2.266 2.339 2.489 2.635 2.784 2.852 2.983 3.115 3.301 3.428 3.547 3.72 3.878 4.021 4.157 4.288 4.485 4.684 4.851 5.043 5.239 5.423 5.639 5.904 6.153 6.407 6.686 6.996 7.317 7.71 8.172 8.613 9.138 9.71 10.392 11.146 12.002 13.026 14.217 15.096 15.567 15.796 15.874 15.911 15.908 15.88 15.83 15.748 15.672 15.598 15.501 15.392 15.277 15.17 15.049 14.923 14.83 14.745 14.639 14.543 14.444 14.345 14.271 14.186 14.091 13.993 13.881 13.792 13.709 13.578 13.48 13.386 13.339 13.243 13.137 13.025 12.975 12.84 12.791 12.719 12.631 12.427 12.311 12.202 12.099 11.969 11.812 11.612 11.092 -10 ,9669 ,KEBNE ,16678978,Thu Nov 25 05:21:07 CET,Thu Nov 25 06:45:52 CET,0.0 0.377 0.6 0.792 0.939 1.068 1.182 1.294 1.503 1.606 1.701 1.784 1.953 2.03 2.196 2.344 2.477 2.545 2.68 2.814 3.016 3.141 3.254 3.431 3.605 3.76 3.911 4.054 4.226 4.4 4.573 4.771 4.969 5.187 5.433 5.694 5.947 6.207 6.476 6.78 7.101 7.454 7.89 8.356 8.876 9.417 10.058 10.77 11.636 12.645 13.827 14.75 15.191 15.421 15.531 15.585 15.574 15.513 15.44 15.351 15.276 15.196 15.115 15.034 14.932 14.83 14.733 14.653 14.575 14.485 14.39 14.308 14.21 14.099 14.018 13.948 13.86 13.738 13.618 13.547 13.466 13.326 13.231 13.143 13.099 13.008 12.905 12.795 12.744 12.595 12.504 12.427 12.355 12.171 12.076 11.981 11.873 11.726 11.54 11.368 10.89 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5e.txt deleted file mode 100644 index 6900fa46..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18979 ,KEBNE ,16678979,Thu Nov 25 05:21:07 CET,Thu Nov 25 06:46:54 CET,0.0 0.818 1.061 1.227 1.37 1.516 1.651 1.768 1.953 2.044 2.143 2.219 2.385 2.453 2.593 2.747 2.898 2.964 3.075 3.177 3.335 3.448 3.552 3.685 3.802 3.921 4.047 4.165 4.304 4.435 4.566 4.732 4.908 5.065 5.212 5.384 5.559 5.744 5.929 6.121 6.322 6.555 6.828 7.086 7.362 7.657 7.982 8.278 8.604 8.901 9.048 8.939 8.691 8.414 8.145 7.891 7.635 7.374 7.147 6.928 6.728 6.545 6.374 6.18 5.995 5.836 5.663 5.52 5.392 5.264 5.116 4.995 4.881 4.746 4.638 4.534 4.429 4.318 4.218 4.144 4.059 3.908 3.799 3.694 3.642 3.545 3.44 3.312 3.251 3.102 3.044 2.958 2.867 2.695 2.609 2.504 2.373 2.234 2.076 1.873 1.396 -2 ,31199 ,KEBNE ,16678980,Thu Nov 25 05:21:08 CET,Thu Nov 25 06:45:45 CET,0.0 0.575 0.885 1.106 1.277 1.443 1.589 1.713 1.938 2.039 2.127 2.198 2.373 2.449 2.605 2.767 2.903 2.959 3.073 3.196 3.37 3.472 3.569 3.714 3.844 3.961 4.073 4.192 4.37 4.526 4.656 4.815 4.966 5.123 5.291 5.463 5.632 5.804 5.981 6.189 6.43 6.685 6.95 7.214 7.496 7.787 8.101 8.409 8.702 8.951 9.135 9.052 8.81 8.548 8.29 8.011 7.764 7.531 7.308 7.065 6.849 6.67 6.498 6.329 6.183 6.035 5.863 5.71 5.582 5.437 5.278 5.156 5.026 4.893 4.792 4.699 4.597 4.471 4.354 4.271 4.175 4.021 3.913 3.807 3.751 3.646 3.555 3.45 3.38 3.209 3.153 3.075 2.987 2.8 2.702 2.609 2.499 2.355 2.193 1.999 1.483 -3 ,8248 ,KEBNE ,16678981,Thu Nov 25 05:22:09 CET,Thu Nov 25 06:47:43 CET,0.0 0.515 0.759 0.945 1.123 1.27 1.408 1.53 1.733 1.827 1.923 2.01 2.188 2.265 2.404 2.541 2.674 2.736 2.853 2.967 3.127 3.231 3.334 3.485 3.62 3.752 3.892 4.024 4.181 4.338 4.501 4.69 4.843 4.975 5.15 5.342 5.516 5.71 5.92 6.143 6.365 6.624 6.907 7.144 7.369 7.638 7.959 8.272 8.612 8.928 9.105 9.033 8.848 8.598 8.328 8.07 7.818 7.571 7.355 7.105 6.875 6.691 6.52 6.336 6.147 5.973 5.788 5.628 5.516 5.393 5.24 5.108 4.965 4.82 4.715 4.603 4.474 4.355 4.238 4.143 4.042 3.899 3.789 3.681 3.636 3.527 3.403 3.267 3.2 3.051 3.021 2.952 2.868 2.707 2.618 2.491 2.358 2.217 2.048 1.863 1.453 -4 ,9592 ,KEBNE ,16678982,Thu Nov 25 05:22:10 CET,Thu Nov 25 06:47:07 CET,0.0 0.569 0.898 1.143 1.327 1.471 1.6 1.738 2.005 2.108 2.202 2.298 2.478 2.554 2.691 2.827 2.95 3.009 3.134 3.247 3.405 3.509 3.603 3.73 3.838 3.953 4.077 4.199 4.351 4.494 4.636 4.809 4.969 5.136 5.316 5.483 5.636 5.793 5.959 6.147 6.351 6.582 6.826 7.061 7.343 7.64 7.95 8.265 8.552 8.82 8.994 8.821 8.537 8.254 7.977 7.688 7.429 7.189 6.981 6.757 6.511 6.31 6.134 5.936 5.76 5.606 5.413 5.254 5.126 4.972 4.82 4.698 4.569 4.442 4.342 4.244 4.134 3.997 3.858 3.767 3.673 3.538 3.449 3.355 3.301 3.179 3.058 2.939 2.881 2.725 2.673 2.601 2.528 2.364 2.274 2.174 2.05 1.912 1.78 1.628 1.267 -5 ,23711 ,KEBNE ,16678983,Thu Nov 25 05:22:09 CET,Thu Nov 25 06:46:41 CET,0.0 0.734 0.991 1.198 1.395 1.568 1.688 1.794 2.007 2.098 2.18 2.238 2.409 2.494 2.655 2.784 2.91 2.978 3.108 3.223 3.377 3.478 3.58 3.737 3.877 4.006 4.128 4.242 4.399 4.55 4.696 4.874 5.038 5.192 5.355 5.554 5.744 5.94 6.159 6.357 6.571 6.796 7.021 7.25 7.538 7.837 8.124 8.424 8.754 9.06 9.251 9.178 8.973 8.714 8.392 8.108 7.892 7.63 7.375 7.163 6.979 6.789 6.606 6.425 6.228 6.064 5.91 5.757 5.621 5.484 5.34 5.211 5.074 4.934 4.818 4.703 4.59 4.48 4.378 4.294 4.199 4.071 3.983 3.874 3.82 3.724 3.611 3.476 3.41 3.253 3.186 3.101 3.008 2.816 2.72 2.617 2.517 2.399 2.267 2.084 1.607 -6 ,20880 ,KEBNE ,16678984,Thu Nov 25 05:22:14 CET,Thu Nov 25 06:48:52 CET,0.0 0.617 0.869 1.082 1.261 1.405 1.538 1.673 1.905 2.015 2.119 2.222 2.4 2.48 2.639 2.783 2.906 2.962 3.068 3.172 3.336 3.453 3.561 3.696 3.817 3.941 4.054 4.145 4.275 4.423 4.578 4.749 4.89 5.024 5.202 5.407 5.55 5.695 5.886 6.096 6.308 6.548 6.806 7.039 7.289 7.548 7.843 8.129 8.398 8.674 8.855 8.756 8.549 8.273 8.009 7.738 7.462 7.213 6.992 6.751 6.523 6.331 6.172 6.019 5.875 5.743 5.579 5.427 5.299 5.152 4.998 4.883 4.765 4.629 4.525 4.432 4.329 4.208 4.097 4.013 3.921 3.783 3.674 3.556 3.5 3.398 3.289 3.16 3.096 2.937 2.872 2.793 2.713 2.535 2.445 2.348 2.241 2.135 1.992 1.771 1.278 -7 ,10977 ,KEBNE ,16678985,Thu Nov 25 05:22:10 CET,Thu Nov 25 06:49:42 CET,0.0 0.749 0.969 1.14 1.304 1.456 1.594 1.724 1.958 2.064 2.159 2.244 2.411 2.482 2.629 2.771 2.901 2.971 3.113 3.233 3.407 3.519 3.616 3.754 3.889 4.031 4.17 4.299 4.441 4.562 4.698 4.875 5.037 5.18 5.333 5.508 5.686 5.88 6.078 6.279 6.49 6.724 6.98 7.223 7.504 7.776 8.033 8.322 8.639 8.912 9.036 8.958 8.748 8.458 8.139 7.84 7.581 7.304 7.066 6.824 6.617 6.446 6.267 6.102 5.962 5.831 5.681 5.545 5.426 5.299 5.176 5.067 4.937 4.792 4.674 4.547 4.417 4.279 4.134 4.039 3.955 3.823 3.714 3.609 3.566 3.469 3.337 3.184 3.107 2.94 2.859 2.766 2.68 2.502 2.409 2.294 2.164 2.036 1.899 1.704 1.091 -8 ,30911 ,KEBNE ,16678986,Thu Nov 25 05:22:10 CET,Thu Nov 25 06:51:27 CET,0.0 0.534 0.845 1.046 1.196 1.342 1.466 1.579 1.813 1.922 2.017 2.088 2.254 2.331 2.493 2.62 2.731 2.787 2.909 3.033 3.192 3.295 3.399 3.548 3.69 3.828 3.97 4.104 4.268 4.428 4.568 4.715 4.869 5.027 5.205 5.388 5.542 5.728 5.939 6.154 6.373 6.581 6.823 7.062 7.297 7.549 7.857 8.223 8.563 8.864 9.083 8.985 8.76 8.507 8.248 8.007 7.786 7.56 7.344 7.101 6.901 6.731 6.567 6.403 6.22 6.059 5.899 5.754 5.621 5.473 5.315 5.188 5.071 4.936 4.83 4.721 4.601 4.467 4.326 4.227 4.121 3.971 3.876 3.787 3.738 3.627 3.508 3.393 3.334 3.178 3.13 3.043 2.958 2.792 2.696 2.578 2.449 2.328 2.18 1.961 1.359 -9 ,18965 ,KEBNE ,16678987,Thu Nov 25 05:22:14 CET,Thu Nov 25 06:47:16 CET,0.0 0.441 0.693 0.88 1.041 1.18 1.314 1.439 1.663 1.766 1.857 1.936 2.106 2.184 2.354 2.491 2.607 2.671 2.789 2.904 3.08 3.19 3.295 3.448 3.586 3.72 3.84 3.96 4.105 4.232 4.367 4.523 4.677 4.842 5.04 5.235 5.405 5.588 5.775 5.978 6.188 6.412 6.67 6.926 7.202 7.476 7.743 8.007 8.271 8.557 8.728 8.623 8.44 8.179 7.88 7.604 7.369 7.128 6.914 6.693 6.496 6.33 6.163 6.013 5.866 5.693 5.486 5.323 5.195 5.055 4.915 4.802 4.67 4.527 4.424 4.318 4.199 4.069 3.933 3.844 3.761 3.638 3.547 3.444 3.394 3.284 3.165 3.044 2.978 2.821 2.783 2.701 2.614 2.452 2.359 2.258 2.164 2.056 1.907 1.699 1.373 -10 ,3425 ,KEBNE ,16678988,Thu Nov 25 05:23:11 CET,Thu Nov 25 06:48:16 CET,0.0 0.569 0.808 0.985 1.132 1.278 1.412 1.523 1.7 1.789 1.889 1.974 2.141 2.218 2.373 2.507 2.629 2.692 2.824 2.951 3.116 3.217 3.317 3.451 3.594 3.743 3.86 3.966 4.105 4.239 4.367 4.516 4.659 4.782 4.92 5.1 5.276 5.467 5.669 5.882 6.101 6.32 6.571 6.805 7.07 7.362 7.69 8.015 8.273 8.519 8.673 8.59 8.414 8.166 7.9 7.63 7.373 7.131 6.926 6.699 6.481 6.289 6.097 5.914 5.761 5.624 5.478 5.331 5.178 5.028 4.889 4.776 4.661 4.544 4.451 4.356 4.255 4.129 3.998 3.916 3.828 3.682 3.583 3.488 3.434 3.316 3.198 3.071 3.004 2.841 2.789 2.718 2.635 2.447 2.341 2.234 2.108 1.966 1.817 1.646 1.262 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5d_7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5d_7.txt deleted file mode 100644 index 718523fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5d_7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17426 ,KEBNE ,16678989,Thu Nov 25 05:23:10 CET,Thu Nov 25 06:48:53 CET,0.0 0.336 0.492 0.613 0.756 0.906 1.019 1.086 1.185 1.24 1.295 1.299 1.431 1.467 1.523 1.562 1.598 1.614 1.649 1.689 1.732 1.76 1.798 1.856 1.895 1.909 1.921 1.947 1.977 2.002 2.019 2.015 1.997 1.967 1.926 1.863 1.798 1.731 1.646 1.54 1.405 1.224 0.983 0.696 0.283 -0.299 -1.14 -2.229 -3.677 -5.69 -8.799 -12.247 -14.86 -16.983 -18.701 -20.121 -21.302 -22.327 -23.183 -24.027 -24.717 -25.307 -25.874 -26.402 -26.881 -27.306 -27.72 -28.086 -28.405 -28.725 -29.05 -29.315 -29.585 -29.866 -30.087 -30.312 -30.534 -30.769 -31.02 -31.195 -31.375 -31.627 -31.794 -31.97 -32.052 -32.227 -32.44 -32.658 -32.756 -32.981 -33.078 -33.195 -33.314 -33.573 -33.723 -33.874 -34.038 -34.205 -34.391 -34.67 -35.223 -2 ,16132 ,KEBNE ,16678990,Thu Nov 25 05:23:11 CET,Thu Nov 25 06:52:03 CET,0.0 0.512 0.687 0.781 0.873 0.959 1.044 1.117 1.247 1.302 1.347 1.348 1.475 1.498 1.546 1.605 1.659 1.677 1.709 1.743 1.783 1.804 1.83 1.859 1.868 1.88 1.889 1.882 1.872 1.848 1.816 1.797 1.775 1.755 1.722 1.653 1.584 1.507 1.404 1.264 1.095 0.888 0.612 0.288 -0.173 -0.794 -1.609 -2.622 -4.024 -6.049 -9.205 -12.685 -15.33 -17.424 -19.096 -20.502 -21.704 -22.754 -23.618 -24.46 -25.161 -25.755 -26.311 -26.836 -27.317 -27.731 -28.169 -28.574 -28.898 -29.215 -29.558 -29.837 -30.115 -30.396 -30.612 -30.832 -31.056 -31.294 -31.534 -31.692 -31.853 -32.102 -32.273 -32.453 -32.548 -32.738 -32.933 -33.133 -33.235 -33.466 -33.568 -33.688 -33.804 -34.065 -34.213 -34.361 -34.497 -34.647 -34.854 -35.087 -35.839 -3 ,8001 ,KEBNE ,16678991,Thu Nov 25 05:23:11 CET,Thu Nov 25 06:48:37 CET,0.0 0.549 0.792 0.973 1.1 1.219 1.312 1.392 1.509 1.565 1.618 1.618 1.751 1.786 1.85 1.9 1.937 1.95 1.973 2.008 2.052 2.072 2.094 2.13 2.164 2.181 2.179 2.169 2.168 2.165 2.163 2.159 2.139 2.116 2.076 2.015 1.923 1.802 1.675 1.517 1.309 1.042 0.691 0.289 -0.229 -0.888 -1.688 -2.661 -4.087 -6.113 -9.213 -12.703 -15.357 -17.451 -19.115 -20.546 -21.742 -22.764 -23.607 -24.436 -25.143 -25.759 -26.319 -26.833 -27.306 -27.75 -28.195 -28.566 -28.883 -29.221 -29.583 -29.866 -30.146 -30.435 -30.658 -30.872 -31.08 -31.304 -31.533 -31.687 -31.846 -32.092 -32.258 -32.429 -32.516 -32.692 -32.869 -33.057 -33.162 -33.393 -33.492 -33.602 -33.709 -33.969 -34.113 -34.273 -34.437 -34.592 -34.795 -35.132 -35.92 -4 ,23400 ,KEBNE ,16678992,Thu Nov 25 05:23:11 CET,Thu Nov 25 06:47:50 CET,0.0 0.401 0.616 0.778 0.905 1.01 1.087 1.161 1.285 1.33 1.366 1.337 1.454 1.474 1.516 1.559 1.61 1.63 1.66 1.684 1.711 1.74 1.761 1.77 1.774 1.775 1.781 1.785 1.763 1.717 1.677 1.643 1.607 1.572 1.529 1.46 1.375 1.253 1.105 0.934 0.725 0.48 0.18 -0.187 -0.68 -1.292 -2.109 -3.222 -4.748 -6.839 -10.035 -13.462 -16.075 -18.15 -19.821 -21.26 -22.446 -23.496 -24.381 -25.222 -25.928 -26.537 -27.113 -27.634 -28.093 -28.511 -28.944 -29.319 -29.627 -29.939 -30.264 -30.541 -30.82 -31.095 -31.311 -31.537 -31.763 -31.981 -32.2 -32.359 -32.525 -32.78 -32.953 -33.124 -33.216 -33.406 -33.588 -33.78 -33.89 -34.131 -34.226 -34.339 -34.468 -34.732 -34.863 -35.019 -35.193 -35.38 -35.626 -35.92 -36.674 -5 ,16326 ,KEBNE ,16678993,Thu Nov 25 05:23:15 CET,Thu Nov 25 06:47:32 CET,0.0 0.65 0.913 1.067 1.188 1.298 1.387 1.453 1.558 1.619 1.672 1.653 1.779 1.819 1.886 1.941 1.989 2.007 2.037 2.066 2.098 2.121 2.148 2.17 2.172 2.173 2.164 2.158 2.166 2.161 2.135 2.089 2.051 2.031 1.993 1.911 1.806 1.686 1.545 1.373 1.162 0.895 0.575 0.221 -0.247 -0.863 -1.681 -2.747 -4.248 -6.361 -9.568 -13.026 -15.666 -17.783 -19.456 -20.878 -22.077 -23.091 -23.966 -24.82 -25.509 -26.103 -26.64 -27.139 -27.609 -28.035 -28.488 -28.862 -29.172 -29.491 -29.807 -30.068 -30.332 -30.606 -30.811 -31.03 -31.269 -31.506 -31.746 -31.911 -32.078 -32.326 -32.481 -32.645 -32.734 -32.92 -33.113 -33.324 -33.437 -33.674 -33.764 -33.883 -34.009 -34.285 -34.432 -34.579 -34.742 -34.936 -35.169 -35.412 -35.798 -6 ,30941 ,KEBNE ,16678994,Thu Nov 25 05:23:15 CET,Thu Nov 25 06:46:29 CET,0.0 0.961 1.229 1.382 1.479 1.561 1.627 1.683 1.8 1.849 1.886 1.86 1.987 2.013 2.074 2.137 2.179 2.195 2.216 2.234 2.262 2.289 2.31 2.328 2.344 2.351 2.349 2.343 2.33 2.303 2.276 2.253 2.227 2.195 2.149 2.086 2.016 1.92 1.792 1.632 1.433 1.171 0.844 0.504 0.051 -0.58 -1.473 -2.588 -4.045 -6.077 -9.195 -12.625 -15.179 -17.25 -18.935 -20.345 -21.513 -22.523 -23.374 -24.197 -24.893 -25.489 -26.032 -26.543 -27.006 -27.413 -27.832 -28.215 -28.551 -28.878 -29.205 -29.472 -29.743 -30.016 -30.224 -30.445 -30.672 -30.903 -31.145 -31.308 -31.472 -31.738 -31.926 -32.124 -32.224 -32.425 -32.621 -32.809 -32.915 -33.152 -33.257 -33.379 -33.505 -33.778 -33.931 -34.096 -34.259 -34.448 -34.648 -34.871 -35.598 -7 ,288 ,KEBNE ,16678995,Thu Nov 25 05:24:12 CET,Thu Nov 25 06:50:28 CET,0.0 1.006 1.25 1.382 1.529 1.67 1.762 1.821 1.92 1.967 2.019 2.027 2.157 2.19 2.245 2.281 2.323 2.349 2.39 2.428 2.48 2.5 2.509 2.52 2.524 2.531 2.546 2.556 2.555 2.529 2.517 2.517 2.481 2.427 2.36 2.285 2.2 2.077 1.925 1.761 1.57 1.337 1.005 0.625 0.143 -0.49 -1.327 -2.43 -3.898 -5.928 -9.128 -12.609 -15.195 -17.253 -18.941 -20.395 -21.624 -22.663 -23.497 -24.314 -25.009 -25.611 -26.172 -26.68 -27.143 -27.551 -27.972 -28.365 -28.703 -29.035 -29.366 -29.656 -29.959 -30.24 -30.455 -30.69 -30.92 -31.147 -31.394 -31.565 -31.728 -31.973 -32.148 -32.327 -32.418 -32.609 -32.801 -32.981 -33.082 -33.32 -33.413 -33.516 -33.617 -33.873 -34.024 -34.168 -34.309 -34.467 -34.663 -34.946 -35.422 -8 ,24383 ,KEBNE ,16678996,Thu Nov 25 05:24:12 CET,Thu Nov 25 06:53:33 CET,0.0 0.588 0.867 1.074 1.201 1.28 1.353 1.426 1.574 1.641 1.698 1.689 1.819 1.849 1.899 1.934 1.962 1.98 2.01 2.031 2.059 2.079 2.095 2.131 2.154 2.161 2.169 2.162 2.143 2.123 2.093 2.053 2.023 1.992 1.965 1.906 1.838 1.746 1.63 1.526 1.346 1.089 0.77 0.4 -0.101 -0.706 -1.472 -2.53 -4.007 -6.13 -9.353 -12.844 -15.505 -17.612 -19.318 -20.762 -21.957 -22.979 -23.831 -24.65 -25.348 -25.943 -26.479 -26.985 -27.453 -27.87 -28.289 -28.648 -28.967 -29.294 -29.616 -29.884 -30.167 -30.455 -30.668 -30.881 -31.09 -31.309 -31.546 -31.704 -31.872 -32.141 -32.319 -32.499 -32.592 -32.783 -32.978 -33.19 -33.298 -33.524 -33.619 -33.744 -33.884 -34.19 -34.349 -34.53 -34.723 -34.903 -35.085 -35.315 -35.864 -9 ,11545 ,KEBNE ,16678997,Thu Nov 25 05:24:12 CET,Thu Nov 25 06:49:05 CET,0.0 0.461 0.639 0.757 0.875 0.978 1.061 1.14 1.276 1.324 1.372 1.388 1.522 1.554 1.621 1.692 1.762 1.786 1.813 1.842 1.869 1.89 1.927 1.973 1.99 1.995 1.995 1.997 1.987 1.976 1.987 1.98 1.95 1.923 1.878 1.796 1.703 1.606 1.488 1.323 1.098 0.797 0.43 0.033 -0.499 -1.159 -1.973 -3.027 -4.475 -6.482 -9.689 -13.186 -15.723 -17.734 -19.383 -20.789 -21.957 -23.005 -23.884 -24.711 -25.405 -25.995 -26.536 -27.042 -27.51 -27.926 -28.344 -28.706 -29.011 -29.328 -29.66 -29.939 -30.212 -30.483 -30.707 -30.94 -31.161 -31.39 -31.628 -31.791 -31.959 -32.206 -32.371 -32.536 -32.623 -32.796 -32.981 -33.212 -33.331 -33.562 -33.651 -33.76 -33.878 -34.136 -34.284 -34.434 -34.57 -34.723 -34.915 -35.213 -35.832 -10 ,6090 ,KEBNE ,16678998,Thu Nov 25 05:24:12 CET,Thu Nov 25 06:49:15 CET,0.0 0.498 0.693 0.87 1.013 1.107 1.182 1.247 1.357 1.407 1.452 1.43 1.559 1.592 1.644 1.695 1.733 1.744 1.775 1.811 1.877 1.916 1.93 1.956 1.982 2.003 2.022 2.032 2.047 2.057 2.057 2.056 2.045 2.022 1.974 1.888 1.792 1.667 1.521 1.334 1.112 0.867 0.573 0.226 -0.233 -0.803 -1.578 -2.661 -4.144 -6.229 -9.417 -12.795 -15.394 -17.502 -19.162 -20.546 -21.709 -22.72 -23.601 -24.453 -25.134 -25.723 -26.279 -26.799 -27.262 -27.658 -28.067 -28.437 -28.745 -29.07 -29.414 -29.689 -29.959 -30.227 -30.435 -30.654 -30.885 -31.119 -31.362 -31.529 -31.686 -31.925 -32.098 -32.275 -32.366 -32.554 -32.737 -32.936 -33.044 -33.278 -33.37 -33.489 -33.614 -33.872 -34.014 -34.158 -34.322 -34.514 -34.72 -34.967 -35.555 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5e_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5e_5a.txt deleted file mode 100644 index 64d429e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5e_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13242 ,KEBNE ,16678999,Thu Nov 25 05:24:12 CET,Thu Nov 25 06:48:31 CET,0.0 0.503 0.759 0.941 1.091 1.224 1.324 1.425 1.618 1.704 1.785 1.854 2.028 2.105 2.269 2.428 2.559 2.623 2.741 2.845 3.01 3.129 3.244 3.411 3.569 3.709 3.85 3.989 4.178 4.381 4.569 4.781 4.98 5.172 5.414 5.677 5.931 6.202 6.471 6.788 7.118 7.476 7.916 8.354 8.834 9.385 10.038 10.73 11.558 12.549 13.703 14.583 15.056 15.315 15.429 15.441 15.375 15.285 15.237 15.176 15.078 14.968 14.869 14.775 14.662 14.541 14.421 14.338 14.256 14.15 14.03 13.925 13.815 13.689 13.575 13.444 13.319 13.215 13.11 13.038 12.958 12.811 12.708 12.59 12.528 12.422 12.304 12.168 12.102 11.946 11.838 11.747 11.659 11.411 11.277 11.15 11.012 10.848 10.617 10.316 9.483 -2 ,11748 ,KEBNE ,16679000,Thu Nov 25 05:24:11 CET,Thu Nov 25 06:50:02 CET,0.0 0.384 0.617 0.831 0.992 1.115 1.225 1.333 1.544 1.637 1.718 1.795 1.971 2.049 2.188 2.317 2.451 2.523 2.674 2.813 2.993 3.105 3.222 3.384 3.531 3.679 3.817 3.947 4.125 4.296 4.462 4.676 4.887 5.082 5.32 5.603 5.871 6.152 6.42 6.711 7.027 7.371 7.813 8.262 8.734 9.282 9.958 10.701 11.552 12.526 13.645 14.516 14.956 15.19 15.292 15.298 15.259 15.183 15.133 15.058 14.958 14.861 14.733 14.612 14.51 14.398 14.282 14.162 14.058 13.966 13.856 13.748 13.63 13.517 13.44 13.359 13.266 13.15 13.02 12.944 12.866 12.715 12.605 12.491 12.429 12.308 12.178 12.027 11.953 11.798 11.699 11.608 11.511 11.315 11.211 11.086 10.955 10.807 10.591 10.296 9.47 -3 ,6426 ,KEBNE ,16679001,Thu Nov 25 05:24:12 CET,Thu Nov 25 06:50:22 CET,0.0 0.57 0.806 1.025 1.195 1.343 1.473 1.596 1.823 1.916 2.001 2.097 2.279 2.363 2.527 2.67 2.809 2.873 2.992 3.123 3.306 3.417 3.529 3.69 3.843 3.995 4.148 4.301 4.503 4.687 4.858 5.062 5.254 5.436 5.654 5.9 6.164 6.469 6.754 7.049 7.363 7.717 8.141 8.582 9.079 9.609 10.271 11.026 11.835 12.81 14.006 14.894 15.358 15.594 15.679 15.687 15.668 15.61 15.539 15.448 15.36 15.278 15.186 15.107 15.014 14.898 14.757 14.635 14.545 14.435 14.319 14.231 14.127 14.036 13.963 13.866 13.757 13.619 13.472 13.393 13.315 13.165 13.054 12.937 12.878 12.761 12.645 12.528 12.461 12.301 12.212 12.129 12.044 11.845 11.713 11.573 11.432 11.268 11.061 10.758 9.89 -4 ,23381 ,KEBNE ,16679002,Thu Nov 25 05:24:12 CET,Thu Nov 25 06:49:52 CET,0.0 0.465 0.708 0.881 1.034 1.18 1.31 1.427 1.622 1.706 1.797 1.881 2.049 2.125 2.263 2.386 2.514 2.584 2.725 2.844 3.013 3.127 3.245 3.427 3.589 3.738 3.872 4.015 4.221 4.393 4.542 4.743 4.952 5.155 5.384 5.652 5.91 6.169 6.443 6.762 7.123 7.506 7.912 8.355 8.897 9.455 10.072 10.746 11.575 12.557 13.617 14.445 14.886 15.104 15.208 15.216 15.169 15.08 14.983 14.885 14.797 14.707 14.612 14.52 14.424 14.34 14.218 14.081 13.98 13.872 13.743 13.634 13.518 13.402 13.314 13.209 13.1 12.978 12.852 12.78 12.703 12.551 12.427 12.304 12.249 12.127 12.001 11.866 11.792 11.63 11.538 11.441 11.344 11.134 11.018 10.884 10.714 10.536 10.299 9.999 9.115 -5 ,10406 ,KEBNE ,16679003,Thu Nov 25 05:24:12 CET,Thu Nov 25 06:50:24 CET,0.0 0.415 0.587 0.718 0.86 1.002 1.126 1.244 1.452 1.542 1.625 1.685 1.849 1.92 2.059 2.207 2.352 2.417 2.552 2.682 2.853 2.966 3.083 3.251 3.417 3.578 3.723 3.865 4.053 4.24 4.427 4.64 4.823 4.994 5.2 5.457 5.703 5.965 6.277 6.589 6.9 7.274 7.715 8.139 8.648 9.22 9.859 10.595 11.463 12.44 13.591 14.47 14.89 15.09 15.19 15.235 15.23 15.193 15.122 15.02 14.916 14.826 14.757 14.677 14.567 14.456 14.331 14.209 14.103 13.989 13.874 13.793 13.702 13.592 13.507 13.426 13.343 13.237 13.123 13.047 12.968 12.834 12.734 12.64 12.586 12.47 12.343 12.208 12.144 12.002 11.946 11.872 11.785 11.554 11.423 11.294 11.157 10.993 10.81 10.552 10.095 -6 ,29318 ,KEBNE ,16679004,Thu Nov 25 05:24:12 CET,Thu Nov 25 06:50:53 CET,0.0 0.535 0.746 0.923 1.063 1.188 1.317 1.429 1.619 1.7 1.781 1.847 2.017 2.108 2.279 2.431 2.572 2.631 2.753 2.881 3.061 3.178 3.292 3.452 3.6 3.749 3.904 4.064 4.248 4.416 4.585 4.778 4.96 5.131 5.334 5.567 5.793 6.048 6.335 6.644 6.973 7.35 7.789 8.242 8.771 9.319 9.953 10.694 11.539 12.564 13.79 14.665 15.104 15.33 15.433 15.471 15.468 15.431 15.359 15.236 15.122 15.024 14.928 14.837 14.718 14.598 14.471 14.345 14.215 14.08 13.969 13.876 13.768 13.655 13.565 13.468 13.372 13.267 13.158 13.083 12.992 12.858 12.753 12.625 12.566 12.457 12.338 12.196 12.124 11.972 11.903 11.828 11.746 11.557 11.44 11.294 11.142 10.986 10.816 10.53 9.628 -7 ,9724 ,KEBNE ,16679005,Thu Nov 25 05:24:12 CET,Thu Nov 25 06:48:42 CET,0.0 0.523 0.773 0.926 1.051 1.177 1.298 1.411 1.631 1.741 1.847 1.943 2.112 2.18 2.321 2.462 2.592 2.655 2.794 2.932 3.107 3.208 3.301 3.435 3.568 3.715 3.864 3.999 4.179 4.353 4.514 4.713 4.922 5.113 5.305 5.535 5.774 6.033 6.299 6.584 6.902 7.272 7.702 8.122 8.597 9.124 9.779 10.544 11.387 12.301 13.388 14.218 14.642 14.908 15.014 15.035 15.034 14.991 14.933 14.867 14.777 14.674 14.571 14.462 14.342 14.22 14.076 13.966 13.882 13.774 13.662 13.574 13.466 13.335 13.248 13.158 13.062 12.957 12.851 12.786 12.704 12.563 12.465 12.367 12.315 12.208 12.077 11.93 11.86 11.703 11.615 11.52 11.414 11.168 11.046 10.917 10.737 10.549 10.341 10.006 8.921 -8 ,1620 ,KEBNE ,16679006,Thu Nov 25 05:25:14 CET,Thu Nov 25 06:52:04 CET,0.0 0.619 0.871 1.034 1.164 1.273 1.376 1.484 1.696 1.797 1.899 1.996 2.167 2.246 2.403 2.539 2.67 2.736 2.86 2.974 3.144 3.255 3.358 3.513 3.673 3.828 3.986 4.147 4.348 4.537 4.714 4.937 5.149 5.345 5.57 5.838 6.104 6.388 6.677 6.961 7.268 7.624 8.05 8.476 8.967 9.508 10.13 10.841 11.673 12.675 13.89 14.793 15.267 15.531 15.657 15.707 15.716 15.69 15.619 15.513 15.407 15.308 15.216 15.103 14.979 14.887 14.81 14.716 14.598 14.475 14.372 14.281 14.174 14.064 13.972 13.86 13.747 13.641 13.521 13.439 13.371 13.256 13.155 13.043 12.992 12.893 12.784 12.652 12.579 12.423 12.322 12.226 12.124 11.888 11.753 11.613 11.468 11.297 11.036 10.669 9.931 -9 ,23564 ,KEBNE ,16679007,Thu Nov 25 05:25:13 CET,Thu Nov 25 06:51:33 CET,0.0 0.656 0.969 1.15 1.296 1.429 1.54 1.644 1.849 1.948 2.039 2.101 2.272 2.35 2.499 2.645 2.773 2.836 2.973 3.093 3.243 3.34 3.44 3.605 3.766 3.925 4.075 4.207 4.382 4.547 4.712 4.907 5.09 5.285 5.502 5.737 5.986 6.251 6.522 6.829 7.168 7.545 7.995 8.435 8.924 9.479 10.115 10.851 11.697 12.695 13.886 14.755 15.196 15.438 15.547 15.591 15.591 15.551 15.5 15.408 15.32 15.216 15.081 14.971 14.869 14.775 14.664 14.536 14.422 14.307 14.192 14.107 14.019 13.907 13.823 13.742 13.648 13.541 13.432 13.358 13.275 13.155 13.077 12.979 12.922 12.804 12.674 12.53 12.455 12.299 12.194 12.089 11.986 11.739 11.596 11.448 11.3 11.129 10.914 10.593 9.586 -10 ,7317 ,KEBNE ,16679008,Thu Nov 25 05:25:13 CET,Thu Nov 25 06:51:06 CET,0.0 0.724 0.967 1.177 1.352 1.479 1.606 1.732 1.954 2.06 2.148 2.225 2.408 2.498 2.642 2.774 2.917 2.984 3.101 3.219 3.399 3.523 3.65 3.83 4.005 4.174 4.322 4.45 4.617 4.783 4.958 5.192 5.403 5.594 5.844 6.103 6.336 6.619 6.92 7.226 7.536 7.881 8.294 8.726 9.221 9.776 10.429 11.137 11.974 12.984 14.142 15.029 15.483 15.674 15.782 15.851 15.854 15.82 15.751 15.677 15.618 15.543 15.457 15.341 15.202 15.053 14.897 14.768 14.642 14.518 14.402 14.301 14.19 14.063 13.967 13.882 13.8 13.711 13.59 13.503 13.414 13.269 13.175 13.067 13.004 12.879 12.761 12.635 12.566 12.403 12.309 12.225 12.134 11.931 11.815 11.68 11.521 11.35 11.152 10.85 10.146 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5g.txt deleted file mode 100644 index b766dcbe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25366 ,KEBNE ,16679009,Thu Nov 25 05:25:13 CET,Thu Nov 25 06:50:41 CET,0.0 0.879 1.216 1.436 1.599 1.747 1.886 2.003 2.199 2.298 2.396 2.466 2.628 2.706 2.863 3.028 3.184 3.25 3.371 3.484 3.646 3.753 3.862 4.016 4.154 4.289 4.422 4.546 4.718 4.894 5.045 5.21 5.358 5.491 5.653 5.856 6.042 6.231 6.432 6.618 6.805 7.019 7.29 7.557 7.809 8.062 8.338 8.635 8.948 9.256 9.482 9.42 9.2 8.918 8.641 8.384 8.14 7.884 7.654 7.439 7.257 7.069 6.878 6.708 6.545 6.402 6.234 6.06 5.911 5.755 5.59 5.455 5.327 5.196 5.085 4.987 4.884 4.769 4.66 4.575 4.484 4.344 4.255 4.173 4.121 4.0 3.87 3.731 3.665 3.513 3.454 3.375 3.289 3.104 3.005 2.903 2.793 2.673 2.505 2.288 1.85 -2 ,457 ,KEBNE ,16679010,Thu Nov 25 05:25:14 CET,Thu Nov 25 06:52:25 CET,0.0 0.649 0.919 1.111 1.27 1.42 1.537 1.636 1.843 1.945 2.04 2.121 2.291 2.376 2.529 2.676 2.805 2.865 2.999 3.128 3.302 3.405 3.49 3.63 3.777 3.902 4.015 4.124 4.262 4.391 4.523 4.691 4.847 4.994 5.152 5.334 5.505 5.684 5.884 6.095 6.34 6.599 6.86 7.099 7.349 7.609 7.883 8.172 8.448 8.678 8.816 8.71 8.515 8.253 7.957 7.678 7.433 7.182 6.943 6.714 6.503 6.3 6.108 5.934 5.774 5.614 5.435 5.281 5.145 4.99 4.82 4.682 4.557 4.412 4.288 4.168 4.044 3.923 3.802 3.714 3.612 3.461 3.363 3.257 3.207 3.106 3.0 2.878 2.821 2.665 2.6 2.521 2.422 2.231 2.136 2.032 1.916 1.775 1.589 1.361 0.956 -3 ,6501 ,KEBNE ,16679011,Thu Nov 25 05:25:20 CET,Thu Nov 25 06:47:56 CET,0.0 0.709 0.933 1.11 1.254 1.385 1.512 1.64 1.873 1.972 2.068 2.164 2.328 2.409 2.587 2.745 2.875 2.926 3.032 3.15 3.324 3.438 3.545 3.692 3.838 3.982 4.127 4.262 4.423 4.56 4.682 4.86 5.046 5.211 5.372 5.524 5.691 5.876 6.06 6.254 6.446 6.675 6.932 7.167 7.417 7.718 8.074 8.397 8.702 8.942 9.004 8.806 8.533 8.229 7.952 7.711 7.479 7.222 6.98 6.724 6.498 6.314 6.146 5.995 5.844 5.704 5.549 5.396 5.261 5.109 4.954 4.836 4.738 4.633 4.533 4.423 4.296 4.153 4.02 3.932 3.84 3.7 3.594 3.479 3.421 3.307 3.18 3.049 2.984 2.831 2.758 2.673 2.59 2.398 2.311 2.226 2.101 1.964 1.807 1.568 0.991 -4 ,13236 ,KEBNE ,16679012,Thu Nov 25 05:25:14 CET,Thu Nov 25 06:50:52 CET,0.0 0.422 0.626 0.805 0.978 1.127 1.233 1.335 1.565 1.674 1.773 1.852 2.015 2.089 2.234 2.359 2.463 2.515 2.63 2.746 2.907 3.009 3.112 3.256 3.39 3.516 3.635 3.75 3.9 4.035 4.163 4.336 4.5 4.646 4.81 4.995 5.18 5.384 5.594 5.803 6.021 6.262 6.527 6.795 7.097 7.382 7.655 7.941 8.262 8.563 8.704 8.564 8.304 7.982 7.668 7.398 7.146 6.897 6.679 6.447 6.21 5.978 5.751 5.553 5.405 5.273 5.134 4.992 4.86 4.723 4.558 4.419 4.285 4.148 4.039 3.931 3.824 3.718 3.608 3.529 3.451 3.326 3.235 3.133 3.075 2.948 2.82 2.703 2.647 2.503 2.467 2.394 2.31 2.115 2.025 1.934 1.805 1.665 1.529 1.336 0.943 -5 ,17465 ,KEBNE ,16679013,Thu Nov 25 05:25:14 CET,Thu Nov 25 06:52:41 CET,0.0 0.644 0.874 1.049 1.196 1.329 1.453 1.575 1.819 1.928 2.008 2.08 2.253 2.334 2.478 2.62 2.76 2.831 2.966 3.092 3.262 3.368 3.464 3.601 3.746 3.884 4.001 4.105 4.261 4.412 4.551 4.726 4.886 5.033 5.188 5.354 5.528 5.721 5.922 6.139 6.369 6.601 6.871 7.143 7.413 7.698 8.015 8.307 8.596 8.894 9.063 8.892 8.615 8.321 8.012 7.669 7.357 7.104 6.873 6.613 6.39 6.202 6.033 5.863 5.695 5.537 5.37 5.218 5.071 4.909 4.771 4.679 4.553 4.404 4.298 4.186 4.078 3.978 3.874 3.796 3.703 3.537 3.426 3.322 3.268 3.158 3.032 2.89 2.816 2.657 2.588 2.506 2.423 2.259 2.167 2.054 1.923 1.778 1.618 1.379 0.918 -6 ,25765 ,KEBNE ,16679014,Thu Nov 25 05:26:15 CET,Thu Nov 25 06:52:17 CET,0.0 0.575 0.832 1.006 1.161 1.326 1.481 1.604 1.816 1.916 2.015 2.095 2.265 2.344 2.49 2.633 2.765 2.83 2.958 3.076 3.234 3.329 3.428 3.586 3.722 3.846 3.972 4.094 4.241 4.386 4.524 4.671 4.815 4.971 5.147 5.325 5.531 5.756 5.949 6.147 6.355 6.568 6.812 7.078 7.367 7.653 7.949 8.23 8.503 8.705 8.78 8.606 8.347 8.069 7.797 7.543 7.263 6.979 6.754 6.533 6.34 6.169 5.996 5.825 5.675 5.529 5.357 5.215 5.102 4.978 4.846 4.74 4.631 4.523 4.426 4.313 4.197 4.07 3.939 3.845 3.748 3.61 3.51 3.402 3.348 3.238 3.118 2.991 2.931 2.779 2.717 2.632 2.543 2.369 2.279 2.175 2.061 1.936 1.774 1.57 1.03 -7 ,31336 ,KEBNE ,16679015,Thu Nov 25 05:26:15 CET,Thu Nov 25 06:52:52 CET,0.0 0.839 1.103 1.316 1.504 1.667 1.799 1.905 2.107 2.218 2.326 2.438 2.614 2.698 2.864 3.004 3.141 3.207 3.332 3.45 3.621 3.733 3.842 3.998 4.14 4.264 4.381 4.497 4.647 4.794 4.946 5.129 5.286 5.438 5.62 5.805 5.993 6.206 6.433 6.676 6.908 7.156 7.41 7.64 7.883 8.129 8.409 8.712 9.021 9.323 9.528 9.419 9.157 8.885 8.635 8.369 8.134 7.885 7.628 7.354 7.109 6.901 6.698 6.508 6.328 6.155 5.988 5.845 5.719 5.582 5.43 5.291 5.136 4.99 4.877 4.763 4.647 4.531 4.43 4.354 4.263 4.122 4.027 3.93 3.877 3.765 3.649 3.523 3.46 3.31 3.268 3.202 3.125 2.966 2.881 2.777 2.652 2.514 2.32 2.04 1.602 -8 ,18002 ,KEBNE ,16679016,Thu Nov 25 05:27:15 CET,Thu Nov 25 06:54:06 CET,0.0 0.823 1.075 1.278 1.431 1.566 1.698 1.815 2.023 2.121 2.215 2.301 2.465 2.534 2.668 2.813 2.949 3.013 3.142 3.272 3.468 3.588 3.695 3.846 3.998 4.146 4.279 4.401 4.557 4.703 4.837 4.998 5.159 5.303 5.459 5.64 5.812 5.994 6.182 6.376 6.567 6.802 7.091 7.337 7.603 7.885 8.174 8.475 8.806 9.081 9.216 9.124 8.913 8.668 8.384 8.113 7.863 7.619 7.397 7.148 6.926 6.719 6.534 6.354 6.151 5.96 5.786 5.639 5.516 5.385 5.223 5.078 4.939 4.802 4.69 4.59 4.496 4.376 4.256 4.179 4.099 3.966 3.87 3.766 3.712 3.6 3.473 3.329 3.254 3.097 3.039 2.97 2.899 2.729 2.627 2.527 2.42 2.294 2.129 1.908 1.388 -9 ,3366 ,KEBNE ,16679017,Thu Nov 25 05:27:16 CET,Thu Nov 25 06:53:24 CET,0.0 0.584 0.878 1.108 1.293 1.443 1.585 1.7 1.888 1.982 2.079 2.189 2.355 2.424 2.567 2.707 2.834 2.899 3.032 3.157 3.319 3.426 3.53 3.678 3.83 3.978 4.123 4.25 4.412 4.568 4.707 4.878 5.045 5.186 5.338 5.518 5.686 5.86 6.045 6.253 6.487 6.732 6.99 7.236 7.499 7.786 8.106 8.394 8.641 8.887 9.051 8.977 8.747 8.425 8.093 7.8 7.564 7.339 7.133 6.925 6.736 6.543 6.328 6.116 5.935 5.749 5.55 5.402 5.277 5.126 4.959 4.825 4.681 4.538 4.427 4.302 4.172 4.052 3.939 3.857 3.773 3.641 3.548 3.444 3.383 3.253 3.134 3.007 2.941 2.789 2.72 2.64 2.556 2.377 2.281 2.183 2.069 1.936 1.756 1.52 1.041 -10 ,17199 ,KEBNE ,16679018,Thu Nov 25 05:27:16 CET,Thu Nov 25 06:53:20 CET,0.0 0.528 0.852 1.068 1.224 1.361 1.494 1.623 1.871 1.981 2.073 2.164 2.334 2.407 2.556 2.696 2.819 2.883 3.007 3.134 3.321 3.424 3.511 3.654 3.793 3.923 4.069 4.207 4.351 4.489 4.637 4.825 4.983 5.12 5.302 5.506 5.68 5.875 6.066 6.25 6.448 6.68 6.955 7.209 7.482 7.77 8.108 8.441 8.749 9.035 9.184 9.045 8.808 8.541 8.264 8.01 7.791 7.553 7.322 7.09 6.887 6.702 6.51 6.31 6.132 5.974 5.814 5.678 5.566 5.449 5.315 5.196 5.061 4.919 4.805 4.693 4.593 4.489 4.358 4.271 4.192 4.06 3.963 3.867 3.822 3.721 3.607 3.479 3.41 3.248 3.174 3.1 3.015 2.834 2.738 2.636 2.52 2.367 2.196 1.95 1.443 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5i.txt deleted file mode 100644 index 5b35c6dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15211 ,KEBNE ,16679019,Thu Nov 25 05:27:16 CET,Thu Nov 25 06:55:09 CET,0.0 0.551 0.836 1.057 1.216 1.356 1.493 1.631 1.877 1.982 2.069 2.133 2.294 2.381 2.554 2.708 2.843 2.903 3.022 3.14 3.31 3.416 3.516 3.666 3.822 3.969 4.096 4.217 4.385 4.553 4.703 4.872 5.053 5.231 5.427 5.64 5.829 6.032 6.236 6.431 6.643 6.889 7.148 7.389 7.689 8.017 8.333 8.623 8.913 9.158 9.187 8.897 8.52 8.145 7.77 7.419 7.092 6.775 6.507 6.236 6.003 5.785 5.559 5.347 5.143 4.954 4.759 4.593 4.455 4.291 4.106 3.965 3.84 3.693 3.574 3.452 3.313 3.184 3.039 2.934 2.833 2.687 2.596 2.48 2.416 2.299 2.164 2.003 1.923 1.757 1.696 1.614 1.525 1.359 1.262 1.128 0.993 0.857 0.677 0.423 -0.28 -2 ,18490 ,KEBNE ,16679020,Thu Nov 25 05:27:16 CET,Thu Nov 25 06:54:03 CET,0.0 0.955 1.249 1.458 1.643 1.821 1.983 2.123 2.357 2.471 2.581 2.682 2.854 2.935 3.092 3.229 3.338 3.4 3.528 3.624 3.775 3.873 3.973 4.13 4.281 4.428 4.567 4.709 4.878 5.04 5.204 5.403 5.583 5.737 5.907 6.127 6.341 6.537 6.751 6.977 7.185 7.41 7.678 7.959 8.257 8.573 8.907 9.244 9.587 9.798 9.789 9.523 9.154 8.75 8.393 8.032 7.687 7.373 7.103 6.821 6.578 6.383 6.187 5.982 5.791 5.611 5.426 5.261 5.11 4.949 4.774 4.633 4.5 4.365 4.269 4.17 4.047 3.905 3.755 3.651 3.551 3.393 3.271 3.158 3.106 2.999 2.869 2.723 2.65 2.491 2.432 2.349 2.256 2.047 1.942 1.834 1.707 1.527 1.323 1.078 0.478 -3 ,30491 ,KEBNE ,16679021,Thu Nov 25 05:27:16 CET,Thu Nov 25 06:54:26 CET,0.0 0.799 1.104 1.343 1.539 1.703 1.861 2.006 2.23 2.331 2.431 2.542 2.714 2.796 2.975 3.152 3.298 3.361 3.487 3.611 3.781 3.891 3.998 4.162 4.321 4.471 4.615 4.751 4.914 5.065 5.208 5.377 5.543 5.71 5.896 6.094 6.306 6.54 6.76 6.963 7.171 7.408 7.656 7.88 8.128 8.412 8.734 9.082 9.461 9.729 9.711 9.466 9.133 8.75 8.384 8.02 7.679 7.357 7.068 6.781 6.548 6.346 6.125 5.887 5.682 5.488 5.262 5.065 4.901 4.743 4.59 4.471 4.339 4.182 4.055 3.935 3.825 3.694 3.561 3.477 3.377 3.213 3.109 3.006 2.953 2.835 2.713 2.574 2.497 2.328 2.232 2.143 2.062 1.886 1.789 1.678 1.532 1.368 1.197 0.915 0.163 -4 ,15456 ,KEBNE ,16679022,Thu Nov 25 05:28:17 CET,Thu Nov 25 06:54:57 CET,0.0 0.807 1.106 1.342 1.545 1.721 1.871 1.997 2.236 2.355 2.467 2.585 2.763 2.855 3.02 3.149 3.276 3.343 3.481 3.602 3.768 3.876 3.989 4.17 4.339 4.492 4.632 4.76 4.925 5.079 5.213 5.376 5.54 5.709 5.916 6.145 6.365 6.576 6.793 7.023 7.241 7.489 7.776 8.038 8.315 8.606 8.935 9.296 9.65 9.889 9.955 9.694 9.326 8.987 8.68 8.342 8.0 7.676 7.392 7.102 6.868 6.658 6.442 6.243 6.063 5.896 5.714 5.547 5.391 5.221 5.056 4.925 4.783 4.636 4.527 4.402 4.273 4.154 4.015 3.92 3.822 3.641 3.514 3.412 3.368 3.257 3.141 3.007 2.934 2.778 2.718 2.634 2.544 2.364 2.259 2.14 2.001 1.823 1.615 1.384 0.812 -5 ,17330 ,KEBNE ,16679023,Thu Nov 25 05:28:17 CET,Thu Nov 25 06:54:57 CET,0.0 0.509 0.805 1.014 1.182 1.316 1.454 1.578 1.78 1.885 1.983 2.071 2.241 2.32 2.472 2.628 2.778 2.849 2.987 3.125 3.32 3.428 3.527 3.673 3.799 3.929 4.073 4.209 4.376 4.531 4.684 4.866 5.044 5.224 5.418 5.633 5.82 5.994 6.221 6.462 6.706 6.991 7.276 7.546 7.843 8.123 8.404 8.698 8.988 9.211 9.27 9.115 8.813 8.42 8.054 7.724 7.42 7.127 6.855 6.579 6.343 6.11 5.858 5.634 5.426 5.237 5.041 4.866 4.732 4.603 4.448 4.297 4.151 4.01 3.889 3.758 3.623 3.49 3.365 3.278 3.193 3.04 2.925 2.811 2.754 2.649 2.542 2.423 2.357 2.196 2.128 2.043 1.955 1.754 1.634 1.508 1.377 1.23 1.076 0.85 0.254 -6 ,23695 ,KEBNE ,16679024,Thu Nov 25 05:28:18 CET,Thu Nov 25 06:57:27 CET,0.0 0.603 0.858 1.046 1.194 1.334 1.469 1.599 1.826 1.925 2.022 2.102 2.269 2.349 2.51 2.669 2.814 2.884 3.021 3.144 3.305 3.405 3.515 3.677 3.821 3.968 4.106 4.235 4.405 4.564 4.716 4.909 5.103 5.262 5.434 5.643 5.84 6.039 6.257 6.494 6.715 6.943 7.206 7.479 7.794 8.111 8.454 8.767 9.072 9.337 9.43 9.285 8.999 8.657 8.287 7.941 7.628 7.333 7.048 6.734 6.466 6.242 6.031 5.822 5.627 5.444 5.271 5.111 4.952 4.807 4.659 4.524 4.384 4.226 4.111 3.999 3.879 3.764 3.633 3.527 3.431 3.287 3.176 3.053 2.988 2.856 2.723 2.595 2.532 2.374 2.285 2.182 2.082 1.861 1.755 1.632 1.491 1.352 1.17 0.915 0.303 -7 ,19707 ,KEBNE ,16679025,Thu Nov 25 05:28:17 CET,Thu Nov 25 06:55:36 CET,0.0 0.878 1.214 1.488 1.695 1.848 1.978 2.11 2.348 2.447 2.541 2.636 2.82 2.917 3.078 3.221 3.373 3.45 3.593 3.717 3.881 3.99 4.099 4.251 4.389 4.523 4.663 4.799 4.977 5.128 5.26 5.444 5.637 5.806 5.973 6.157 6.346 6.567 6.801 7.024 7.231 7.462 7.733 8.002 8.272 8.555 8.887 9.183 9.436 9.68 9.763 9.476 9.13 8.786 8.437 8.068 7.696 7.363 7.091 6.808 6.538 6.294 6.045 5.811 5.621 5.448 5.251 5.061 4.899 4.754 4.617 4.49 4.351 4.203 4.075 3.95 3.838 3.702 3.54 3.448 3.353 3.184 3.073 2.959 2.898 2.777 2.646 2.489 2.396 2.221 2.13 2.032 1.931 1.75 1.668 1.575 1.455 1.307 1.141 0.936 0.396 -8 ,10584 ,KEBNE ,16679026,Thu Nov 25 05:28:18 CET,Thu Nov 25 06:55:13 CET,0.0 0.834 1.169 1.39 1.548 1.713 1.881 2.013 2.224 2.322 2.417 2.522 2.706 2.79 2.936 3.08 3.23 3.301 3.446 3.591 3.793 3.913 4.024 4.187 4.328 4.46 4.591 4.704 4.843 4.989 5.129 5.307 5.487 5.655 5.831 6.029 6.225 6.44 6.674 6.897 7.111 7.34 7.591 7.832 8.114 8.417 8.732 9.016 9.295 9.499 9.501 9.253 8.947 8.604 8.259 7.915 7.566 7.25 6.971 6.708 6.5 6.299 6.085 5.89 5.716 5.559 5.391 5.216 5.062 4.909 4.762 4.647 4.506 4.357 4.244 4.136 4.032 3.899 3.755 3.666 3.569 3.396 3.282 3.178 3.12 2.989 2.856 2.723 2.65 2.481 2.4 2.314 2.222 2.044 1.95 1.83 1.695 1.52 1.305 1.006 0.342 -9 ,29018 ,KEBNE ,16679027,Thu Nov 25 05:28:17 CET,Thu Nov 25 06:54:58 CET,0.0 0.722 1.038 1.265 1.441 1.6 1.742 1.859 2.082 2.197 2.293 2.393 2.571 2.655 2.804 2.935 3.066 3.123 3.244 3.373 3.538 3.647 3.754 3.903 4.039 4.162 4.294 4.426 4.602 4.782 4.945 5.122 5.291 5.452 5.643 5.845 6.04 6.277 6.523 6.756 6.98 7.219 7.475 7.758 8.085 8.389 8.692 8.996 9.319 9.653 9.768 9.47 9.066 8.679 8.351 8.043 7.729 7.455 7.2 6.909 6.645 6.414 6.203 6.007 5.833 5.679 5.506 5.334 5.187 5.03 4.864 4.733 4.597 4.451 4.326 4.189 4.059 3.938 3.804 3.714 3.622 3.474 3.373 3.269 3.218 3.104 2.972 2.833 2.759 2.59 2.525 2.449 2.374 2.206 2.107 1.979 1.842 1.706 1.561 1.307 0.827 -10 ,8211 ,KEBNE ,16679028,Thu Nov 25 05:28:21 CET,Thu Nov 25 06:52:47 CET,0.0 0.58 0.861 1.085 1.275 1.456 1.604 1.73 1.958 2.053 2.143 2.229 2.402 2.489 2.657 2.805 2.948 3.021 3.154 3.285 3.466 3.574 3.684 3.841 4.001 4.15 4.273 4.388 4.55 4.714 4.863 5.052 5.254 5.433 5.618 5.82 6.014 6.224 6.424 6.628 6.856 7.116 7.413 7.683 7.967 8.272 8.593 8.909 9.225 9.475 9.549 9.322 8.988 8.641 8.306 7.996 7.711 7.44 7.181 6.92 6.692 6.484 6.277 6.075 5.897 5.721 5.51 5.326 5.178 5.015 4.829 4.67 4.505 4.348 4.246 4.142 4.023 3.894 3.756 3.659 3.564 3.406 3.284 3.169 3.112 2.986 2.853 2.707 2.631 2.474 2.411 2.325 2.24 2.066 1.975 1.861 1.723 1.589 1.427 1.201 0.642 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5g_5c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5g_5c.txt deleted file mode 100644 index 923e884b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5g_5c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,246 ,KEBNE ,16679029,Thu Nov 25 05:28:17 CET,Thu Nov 25 06:55:27 CET,0.0 0.653 0.909 1.11 1.3 1.467 1.615 1.748 1.987 2.092 2.197 2.327 2.52 2.633 2.837 3.014 3.194 3.281 3.445 3.604 3.84 3.991 4.134 4.328 4.503 4.691 4.889 5.088 5.33 5.542 5.745 6.007 6.27 6.518 6.795 7.097 7.403 7.732 8.095 8.497 8.904 9.363 9.882 10.397 11.041 11.719 12.47 13.353 14.381 15.552 16.927 17.984 18.512 18.771 18.902 18.968 18.98 18.935 18.821 18.689 18.604 18.537 18.447 18.341 18.231 18.136 18.033 17.918 17.805 17.681 17.56 17.459 17.354 17.247 17.154 17.058 16.972 16.876 16.764 16.683 16.608 16.486 16.39 16.297 16.246 16.13 16.012 15.885 15.817 15.669 15.585 15.51 15.427 15.214 15.098 14.961 14.808 14.639 14.415 14.107 13.329 -2 ,13539 ,KEBNE ,16679030,Thu Nov 25 05:28:17 CET,Thu Nov 25 06:56:55 CET,0.0 0.787 1.054 1.24 1.414 1.576 1.721 1.85 2.089 2.206 2.318 2.451 2.654 2.76 2.96 3.154 3.332 3.415 3.565 3.714 3.934 4.069 4.201 4.407 4.618 4.819 4.999 5.169 5.407 5.63 5.841 6.108 6.363 6.596 6.859 7.17 7.465 7.78 8.146 8.534 8.937 9.373 9.866 10.409 11.041 11.718 12.505 13.374 14.355 15.502 16.84 17.903 18.472 18.738 18.846 18.875 18.865 18.842 18.776 18.681 18.587 18.483 18.39 18.284 18.159 18.045 17.925 17.826 17.734 17.635 17.529 17.439 17.342 17.214 17.121 17.044 16.958 16.85 16.747 16.678 16.595 16.469 16.385 16.287 16.234 16.126 16.01 15.898 15.833 15.683 15.607 15.513 15.408 15.18 15.045 14.925 14.801 14.638 14.443 14.148 13.516 -3 ,8891 ,KEBNE ,16679031,Thu Nov 25 05:28:17 CET,Thu Nov 25 06:53:06 CET,0.0 0.742 1.012 1.21 1.402 1.567 1.729 1.868 2.118 2.238 2.346 2.473 2.662 2.754 2.931 3.114 3.299 3.381 3.522 3.665 3.885 4.04 4.194 4.412 4.618 4.806 4.992 5.164 5.375 5.575 5.787 6.056 6.304 6.535 6.803 7.123 7.416 7.727 8.062 8.412 8.773 9.2 9.744 10.293 10.913 11.635 12.46 13.365 14.419 15.591 16.938 17.967 18.472 18.716 18.839 18.878 18.853 18.805 18.743 18.66 18.594 18.498 18.372 18.273 18.181 18.082 17.959 17.835 17.724 17.624 17.525 17.421 17.303 17.18 17.089 16.987 16.862 16.737 16.615 16.531 16.442 16.301 16.211 16.119 16.065 15.942 15.823 15.689 15.616 15.476 15.388 15.298 15.203 14.985 14.866 14.738 14.593 14.412 14.211 13.918 13.138 -4 ,24008 ,KEBNE ,16679032,Thu Nov 25 05:28:17 CET,Thu Nov 25 06:58:11 CET,0.0 0.695 0.995 1.238 1.439 1.622 1.786 1.93 2.171 2.288 2.402 2.517 2.705 2.807 2.992 3.161 3.32 3.4 3.563 3.724 3.953 4.099 4.241 4.439 4.622 4.807 4.996 5.183 5.422 5.647 5.852 6.089 6.318 6.539 6.804 7.116 7.423 7.762 8.116 8.492 8.887 9.33 9.834 10.324 10.958 11.669 12.45 13.325 14.318 15.52 16.9 17.915 18.439 18.719 18.859 18.9 18.889 18.855 18.806 18.731 18.658 18.576 18.477 18.372 18.274 18.187 18.093 17.998 17.9 17.779 17.637 17.51 17.393 17.296 17.213 17.12 17.011 16.889 16.764 16.684 16.611 16.472 16.373 16.277 16.219 16.099 15.968 15.819 15.743 15.594 15.515 15.437 15.352 15.149 15.052 14.959 14.828 14.674 14.45 14.148 13.494 -5 ,24592 ,KEBNE ,16679033,Thu Nov 25 05:29:18 CET,Thu Nov 25 06:56:02 CET,0.0 0.507 0.768 0.991 1.178 1.331 1.463 1.597 1.834 1.949 2.078 2.237 2.431 2.539 2.74 2.921 3.092 3.175 3.327 3.464 3.683 3.831 3.977 4.195 4.402 4.593 4.776 4.97 5.223 5.446 5.649 5.886 6.111 6.339 6.612 6.934 7.258 7.588 7.943 8.321 8.713 9.189 9.737 10.261 10.869 11.547 12.354 13.252 14.239 15.359 16.641 17.617 18.158 18.418 18.488 18.507 18.507 18.465 18.388 18.302 18.243 18.175 18.088 17.971 17.838 17.711 17.584 17.488 17.401 17.304 17.196 17.102 16.987 16.864 16.792 16.701 16.577 16.465 16.364 16.287 16.213 16.088 15.991 15.889 15.833 15.711 15.598 15.489 15.425 15.278 15.189 15.107 15.014 14.804 14.688 14.548 14.412 14.254 14.011 13.698 13.037 -6 ,2481 ,KEBNE ,16679034,Thu Nov 25 05:29:19 CET,Thu Nov 25 06:54:58 CET,0.0 0.818 1.08 1.308 1.508 1.654 1.787 1.928 2.204 2.328 2.438 2.553 2.745 2.852 3.052 3.225 3.392 3.483 3.663 3.82 4.015 4.142 4.278 4.481 4.681 4.864 5.033 5.196 5.414 5.635 5.853 6.117 6.371 6.608 6.891 7.211 7.501 7.821 8.162 8.538 8.949 9.408 9.932 10.466 11.089 11.759 12.511 13.375 14.389 15.534 16.853 17.879 18.424 18.719 18.868 18.953 18.968 18.928 18.85 18.762 18.686 18.594 18.486 18.369 18.276 18.183 18.076 17.97 17.85 17.735 17.624 17.517 17.391 17.25 17.141 17.037 16.923 16.806 16.694 16.608 16.515 16.37 16.271 16.156 16.093 15.983 15.875 15.761 15.696 15.545 15.455 15.366 15.272 15.053 14.936 14.825 14.705 14.553 14.361 14.077 13.374 -7 ,21418 ,KEBNE ,16679035,Thu Nov 25 05:29:18 CET,Thu Nov 25 06:55:09 CET,0.0 0.734 1.017 1.205 1.369 1.518 1.659 1.796 2.078 2.222 2.344 2.475 2.66 2.752 2.927 3.105 3.284 3.371 3.539 3.698 3.924 4.077 4.218 4.409 4.606 4.804 4.989 5.167 5.407 5.639 5.859 6.113 6.371 6.635 6.927 7.223 7.504 7.828 8.19 8.567 8.967 9.414 9.939 10.474 11.066 11.758 12.544 13.427 14.475 15.641 16.994 18.076 18.652 18.945 19.069 19.116 19.114 19.083 19.022 18.933 18.847 18.765 18.681 18.574 18.457 18.341 18.19 18.05 17.953 17.866 17.766 17.679 17.597 17.493 17.395 17.298 17.2 17.077 16.956 16.888 16.815 16.683 16.589 16.488 16.429 16.313 16.187 16.041 15.971 15.826 15.734 15.649 15.561 15.365 15.254 15.145 15.007 14.824 14.588 14.304 13.654 -8 ,12386 ,KEBNE ,16679036,Thu Nov 25 05:29:18 CET,Thu Nov 25 06:56:07 CET,0.0 0.51 0.83 1.075 1.293 1.47 1.624 1.777 2.042 2.143 2.24 2.355 2.552 2.655 2.831 3.004 3.176 3.265 3.438 3.592 3.818 3.958 4.094 4.315 4.517 4.695 4.87 5.039 5.243 5.451 5.665 5.912 6.154 6.37 6.637 6.968 7.283 7.613 7.969 8.358 8.77 9.225 9.722 10.233 10.835 11.507 12.307 13.221 14.262 15.411 16.72 17.699 18.209 18.498 18.645 18.708 18.716 18.683 18.625 18.542 18.444 18.336 18.253 18.185 18.079 17.954 17.829 17.723 17.632 17.547 17.453 17.35 17.222 17.102 17.025 16.93 16.816 16.712 16.618 16.54 16.452 16.307 16.199 16.09 16.035 15.915 15.785 15.642 15.575 15.44 15.368 15.292 15.211 15.032 14.924 14.79 14.658 14.524 14.333 14.102 13.55 -9 ,1495 ,KEBNE ,16679037,Thu Nov 25 05:31:21 CET,Thu Nov 25 07:02:34 CET,0.0 0.702 0.987 1.191 1.371 1.546 1.719 1.884 2.17 2.304 2.428 2.556 2.742 2.843 3.03 3.202 3.374 3.453 3.608 3.762 3.979 4.119 4.26 4.469 4.674 4.866 5.045 5.227 5.464 5.698 5.919 6.176 6.431 6.683 6.948 7.255 7.58 7.915 8.257 8.63 9.021 9.469 10.003 10.517 11.119 11.79 12.566 13.461 14.48 15.657 17.039 18.109 18.658 18.913 19.029 19.077 19.082 19.047 18.98 18.888 18.778 18.663 18.565 18.477 18.38 18.293 18.19 18.08 17.978 17.877 17.767 17.667 17.578 17.483 17.408 17.318 17.209 17.09 16.966 16.883 16.799 16.674 16.588 16.483 16.417 16.288 16.175 16.053 15.99 15.834 15.746 15.666 15.57 15.354 15.222 15.084 14.959 14.822 14.668 14.423 13.474 -10 ,2411 ,KEBNE ,16679038,Thu Nov 25 05:30:23 CET,Thu Nov 25 06:55:02 CET,0.0 0.489 0.752 0.989 1.193 1.39 1.562 1.714 1.974 2.083 2.198 2.355 2.557 2.663 2.849 3.017 3.173 3.249 3.395 3.536 3.734 3.879 4.032 4.241 4.421 4.604 4.805 5.0 5.244 5.478 5.709 5.978 6.228 6.461 6.753 7.095 7.393 7.699 8.035 8.403 8.806 9.276 9.804 10.322 10.916 11.568 12.35 13.266 14.305 15.503 16.926 17.979 18.478 18.711 18.844 18.915 18.926 18.884 18.825 18.703 18.562 18.447 18.349 18.261 18.172 18.09 17.986 17.888 17.805 17.698 17.595 17.517 17.434 17.346 17.26 17.173 17.085 16.978 16.876 16.803 16.71 16.579 16.495 16.389 16.328 16.214 16.098 15.963 15.893 15.74 15.652 15.565 15.482 15.281 15.149 15.009 14.863 14.705 14.519 14.281 13.601 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5f.txt deleted file mode 100644 index 154a7393..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4737 ,KEBNE ,16679039,Thu Nov 25 05:32:22 CET,Thu Nov 25 06:57:51 CET,0.0 0.573 0.833 1.016 1.157 1.283 1.419 1.554 1.777 1.867 1.958 2.035 2.196 2.263 2.405 2.54 2.66 2.715 2.834 2.955 3.102 3.193 3.297 3.448 3.582 3.708 3.824 3.949 4.109 4.249 4.396 4.58 4.75 4.905 5.075 5.264 5.456 5.668 5.898 6.157 6.423 6.694 6.996 7.29 7.618 7.984 8.39 8.816 9.269 9.725 10.071 10.179 10.088 9.847 9.56 9.27 8.99 8.738 8.499 8.218 7.951 7.695 7.455 7.232 6.996 6.772 6.566 6.393 6.236 6.063 5.881 5.735 5.572 5.386 5.248 5.099 4.928 4.764 4.613 4.49 4.349 4.122 3.957 3.795 3.714 3.543 3.377 3.189 3.082 2.886 2.737 2.603 2.468 2.178 1.999 1.794 1.594 1.372 1.062 0.598 -0.881 -2 ,11239 ,KEBNE ,16679040,Thu Nov 25 05:32:22 CET,Thu Nov 25 07:00:30 CET,0.0 0.688 0.934 1.125 1.273 1.391 1.508 1.624 1.826 1.921 2.009 2.074 2.242 2.311 2.433 2.548 2.663 2.72 2.844 2.965 3.143 3.252 3.351 3.515 3.683 3.821 3.917 4.015 4.172 4.328 4.473 4.643 4.796 4.943 5.117 5.321 5.524 5.732 5.973 6.238 6.486 6.758 7.072 7.369 7.721 8.104 8.499 8.912 9.368 9.823 10.157 10.2 10.064 9.837 9.608 9.337 9.039 8.758 8.481 8.195 7.943 7.706 7.477 7.265 7.058 6.845 6.615 6.416 6.231 6.017 5.776 5.593 5.438 5.272 5.138 4.992 4.818 4.628 4.446 4.315 4.177 3.975 3.842 3.707 3.63 3.456 3.281 3.089 2.978 2.772 2.612 2.491 2.366 2.065 1.894 1.714 1.505 1.288 1.059 0.71 -0.278 -3 ,32040 ,KEBNE ,16679041,Thu Nov 25 05:34:25 CET,Thu Nov 25 07:02:14 CET,0.0 0.654 0.924 1.115 1.256 1.373 1.49 1.6 1.804 1.914 2.005 2.068 2.234 2.307 2.459 2.607 2.742 2.808 2.935 3.045 3.195 3.293 3.397 3.54 3.671 3.803 3.93 4.056 4.214 4.368 4.516 4.682 4.848 5.018 5.205 5.413 5.609 5.799 5.996 6.211 6.477 6.785 7.12 7.447 7.801 8.201 8.644 9.072 9.535 10.047 10.468 10.576 10.363 10.049 9.778 9.515 9.218 8.946 8.699 8.403 8.142 7.919 7.702 7.486 7.262 7.051 6.844 6.652 6.489 6.326 6.137 5.964 5.788 5.6 5.45 5.288 5.11 4.922 4.729 4.591 4.456 4.268 4.125 3.96 3.866 3.681 3.518 3.344 3.242 3.047 2.917 2.798 2.67 2.395 2.245 2.068 1.858 1.638 1.386 0.988 -0.222 -4 ,5323 ,KEBNE ,16679042,Thu Nov 25 05:34:25 CET,Thu Nov 25 07:01:04 CET,0.0 0.359 0.554 0.687 0.818 0.93 1.038 1.155 1.349 1.442 1.537 1.618 1.784 1.85 1.994 2.133 2.25 2.31 2.43 2.539 2.703 2.813 2.916 3.067 3.214 3.358 3.492 3.627 3.804 3.951 4.093 4.281 4.444 4.589 4.776 4.981 5.156 5.37 5.597 5.825 6.074 6.361 6.671 6.947 7.279 7.659 8.073 8.501 8.964 9.473 9.935 10.1 9.973 9.734 9.511 9.253 8.981 8.712 8.446 8.17 7.926 7.674 7.422 7.187 6.97 6.777 6.562 6.35 6.151 5.941 5.739 5.572 5.395 5.217 5.079 4.93 4.768 4.595 4.433 4.314 4.169 3.952 3.816 3.667 3.586 3.418 3.235 3.041 2.939 2.745 2.603 2.48 2.348 2.058 1.9 1.74 1.571 1.374 1.097 0.703 -0.925 -5 ,4722 ,KEBNE ,16679043,Thu Nov 25 05:34:25 CET,Thu Nov 25 07:02:03 CET,0.0 0.462 0.653 0.8 0.948 1.094 1.21 1.308 1.49 1.575 1.656 1.719 1.894 1.969 2.098 2.223 2.352 2.419 2.534 2.641 2.788 2.885 2.99 3.145 3.291 3.422 3.545 3.67 3.826 3.974 4.109 4.274 4.44 4.598 4.783 4.979 5.146 5.321 5.545 5.779 6.004 6.277 6.581 6.865 7.203 7.615 8.065 8.502 8.972 9.449 9.846 9.951 9.844 9.628 9.378 9.113 8.809 8.485 8.229 7.944 7.664 7.402 7.175 6.96 6.75 6.544 6.298 6.083 5.911 5.717 5.492 5.319 5.151 4.975 4.827 4.677 4.513 4.335 4.161 4.04 3.916 3.717 3.566 3.405 3.323 3.159 2.984 2.806 2.707 2.515 2.373 2.243 2.109 1.826 1.675 1.501 1.3 1.066 0.8 0.406 -0.832 -6 ,29282 ,KEBNE ,16679044,Thu Nov 25 05:35:26 CET,Thu Nov 25 07:00:49 CET,0.0 0.31 0.529 0.738 0.915 1.053 1.174 1.282 1.482 1.565 1.641 1.709 1.876 1.946 2.103 2.263 2.399 2.456 2.558 2.67 2.835 2.94 3.039 3.174 3.299 3.424 3.545 3.653 3.794 3.923 4.06 4.254 4.43 4.582 4.772 4.985 5.177 5.376 5.595 5.848 6.112 6.407 6.725 7.035 7.443 7.87 8.3 8.754 9.257 9.765 10.177 10.226 10.078 9.858 9.557 9.232 8.92 8.655 8.427 8.173 7.916 7.641 7.39 7.186 6.989 6.783 6.551 6.364 6.196 5.997 5.797 5.63 5.436 5.241 5.093 4.926 4.748 4.579 4.412 4.295 4.163 3.951 3.804 3.639 3.554 3.397 3.228 3.02 2.909 2.724 2.595 2.472 2.351 2.078 1.926 1.734 1.516 1.292 1.009 0.633 -0.278 -7 ,16573 ,KEBNE ,16679045,Thu Nov 25 05:36:27 CET,Thu Nov 25 07:02:26 CET,0.0 0.655 0.833 0.959 1.111 1.239 1.335 1.438 1.624 1.711 1.795 1.86 2.029 2.1 2.236 2.36 2.484 2.543 2.649 2.758 2.913 3.006 3.098 3.221 3.341 3.475 3.61 3.743 3.903 4.048 4.192 4.358 4.536 4.702 4.867 5.057 5.255 5.477 5.714 5.963 6.225 6.498 6.795 7.094 7.417 7.764 8.165 8.622 9.11 9.611 10.034 10.135 10.027 9.818 9.543 9.231 8.955 8.687 8.422 8.16 7.927 7.719 7.485 7.251 7.046 6.85 6.631 6.443 6.284 6.08 5.867 5.706 5.519 5.331 5.189 5.036 4.877 4.707 4.524 4.395 4.269 4.063 3.901 3.736 3.648 3.465 3.291 3.096 2.994 2.804 2.675 2.549 2.414 2.142 1.976 1.787 1.607 1.391 1.112 0.696 -0.549 -8 ,25726 ,KEBNE ,16679046,Thu Nov 25 05:36:27 CET,Thu Nov 25 07:01:29 CET,0.0 0.595 0.815 0.963 1.107 1.253 1.405 1.552 1.783 1.881 1.977 2.052 2.211 2.28 2.424 2.566 2.691 2.744 2.856 2.963 3.098 3.188 3.282 3.428 3.575 3.706 3.822 3.945 4.118 4.289 4.45 4.628 4.811 4.99 5.169 5.36 5.553 5.759 5.977 6.21 6.454 6.715 7.01 7.309 7.635 7.998 8.426 8.893 9.399 9.909 10.309 10.292 10.069 9.794 9.525 9.236 8.942 8.667 8.416 8.129 7.852 7.609 7.37 7.155 6.964 6.758 6.523 6.332 6.166 5.972 5.766 5.591 5.384 5.181 5.03 4.856 4.684 4.506 4.302 4.163 4.022 3.813 3.668 3.512 3.434 3.279 3.113 2.927 2.824 2.628 2.496 2.381 2.246 1.957 1.793 1.62 1.445 1.247 0.969 0.57 -0.642 -9 ,8494 ,KEBNE ,16679047,Thu Nov 25 05:36:27 CET,Thu Nov 25 07:02:08 CET,0.0 0.409 0.651 0.89 1.072 1.209 1.315 1.417 1.605 1.686 1.762 1.817 1.989 2.07 2.232 2.382 2.511 2.569 2.675 2.784 2.946 3.045 3.14 3.291 3.45 3.602 3.748 3.889 4.066 4.236 4.385 4.541 4.702 4.869 5.056 5.267 5.456 5.667 5.906 6.137 6.392 6.702 7.071 7.408 7.737 8.092 8.519 9.001 9.513 10.004 10.399 10.468 10.327 10.083 9.804 9.556 9.271 8.959 8.706 8.405 8.144 7.916 7.697 7.496 7.289 7.109 6.922 6.724 6.53 6.337 6.132 5.951 5.768 5.579 5.43 5.27 5.103 4.925 4.723 4.591 4.472 4.285 4.156 4.01 3.92 3.73 3.534 3.344 3.246 3.048 2.888 2.75 2.625 2.379 2.234 2.07 1.867 1.637 1.366 0.96 -0.418 -10 ,27230 ,KEBNE ,16679048,Thu Nov 25 05:37:28 CET,Thu Nov 25 07:02:48 CET,0.0 0.684 0.932 1.122 1.293 1.422 1.539 1.651 1.832 1.921 2.017 2.091 2.256 2.332 2.469 2.59 2.71 2.768 2.881 2.985 3.132 3.235 3.332 3.477 3.62 3.756 3.879 3.991 4.131 4.276 4.437 4.611 4.768 4.936 5.142 5.364 5.568 5.785 6.009 6.246 6.501 6.772 7.072 7.386 7.754 8.129 8.518 8.908 9.342 9.82 10.266 10.4 10.259 10.038 9.751 9.419 9.08 8.764 8.484 8.152 7.875 7.661 7.446 7.215 6.985 6.765 6.527 6.321 6.155 5.969 5.765 5.608 5.437 5.26 5.118 4.959 4.808 4.657 4.46 4.305 4.165 3.961 3.803 3.639 3.563 3.393 3.193 2.989 2.884 2.679 2.518 2.39 2.258 1.949 1.794 1.629 1.434 1.185 0.858 0.479 -0.526 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5i.txt deleted file mode 100644 index 0d3c7026..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10999 ,KEBNE ,16679049,Thu Nov 25 05:37:28 CET,Thu Nov 25 07:05:33 CET,0.0 0.725 1.001 1.197 1.375 1.543 1.667 1.779 1.993 2.083 2.173 2.258 2.441 2.527 2.686 2.838 2.982 3.053 3.186 3.303 3.467 3.567 3.666 3.808 3.946 4.091 4.23 4.364 4.536 4.695 4.831 4.996 5.165 5.319 5.514 5.756 5.98 6.217 6.474 6.73 6.986 7.29 7.638 7.962 8.297 8.655 9.067 9.509 9.965 10.422 10.814 10.847 10.572 10.259 9.955 9.62 9.307 8.995 8.7 8.401 8.131 7.905 7.702 7.462 7.21 6.978 6.751 6.55 6.37 6.183 5.979 5.806 5.626 5.431 5.269 5.105 4.945 4.786 4.614 4.498 4.377 4.144 3.977 3.812 3.733 3.576 3.401 3.228 3.13 2.933 2.804 2.694 2.569 2.315 2.176 2.006 1.801 1.543 1.261 0.914 -0.364 -2 ,4104 ,KEBNE ,16679050,Thu Nov 25 05:37:28 CET,Thu Nov 25 07:03:37 CET,0.0 0.731 1.061 1.263 1.409 1.563 1.707 1.84 2.1 2.208 2.304 2.393 2.578 2.66 2.809 2.958 3.103 3.172 3.303 3.431 3.612 3.722 3.827 3.993 4.158 4.306 4.43 4.54 4.679 4.825 4.983 5.17 5.341 5.508 5.691 5.888 6.11 6.347 6.583 6.843 7.09 7.353 7.649 7.947 8.289 8.641 9.043 9.427 9.815 10.22 10.474 10.475 10.291 9.964 9.646 9.343 9.022 8.698 8.41 8.126 7.852 7.59 7.341 7.092 6.867 6.664 6.441 6.219 6.013 5.809 5.604 5.44 5.265 5.055 4.897 4.739 4.584 4.439 4.282 4.166 4.043 3.846 3.701 3.555 3.478 3.311 3.149 2.972 2.872 2.68 2.557 2.442 2.308 2.058 1.927 1.754 1.555 1.356 1.13 0.783 -0.027 -3 ,26082 ,KEBNE ,16679051,Thu Nov 25 05:39:31 CET,Thu Nov 25 07:05:04 CET,0.0 0.579 0.835 1.011 1.174 1.32 1.45 1.567 1.777 1.873 1.964 2.052 2.23 2.307 2.443 2.57 2.692 2.754 2.873 2.987 3.17 3.29 3.398 3.556 3.702 3.853 4.007 4.141 4.319 4.501 4.666 4.845 5.019 5.189 5.384 5.614 5.821 6.05 6.321 6.617 6.911 7.192 7.5 7.799 8.161 8.603 9.053 9.467 9.897 10.335 10.665 10.683 10.473 10.176 9.867 9.544 9.206 8.892 8.589 8.244 7.955 7.728 7.517 7.291 7.069 6.865 6.65 6.449 6.255 6.044 5.837 5.658 5.464 5.279 5.135 4.986 4.84 4.67 4.491 4.375 4.248 4.046 3.9 3.744 3.67 3.524 3.359 3.181 3.088 2.897 2.778 2.66 2.527 2.247 2.102 1.956 1.773 1.546 1.264 0.904 0.287 -4 ,4899 ,KEBNE ,16679052,Thu Nov 25 05:39:31 CET,Thu Nov 25 07:06:29 CET,0.0 0.516 0.748 0.923 1.1 1.255 1.386 1.506 1.7 1.796 1.903 2.015 2.2 2.285 2.439 2.584 2.726 2.789 2.904 3.016 3.168 3.273 3.383 3.549 3.713 3.855 3.996 4.126 4.29 4.461 4.634 4.836 5.017 5.203 5.436 5.674 5.889 6.128 6.383 6.65 6.896 7.183 7.555 7.886 8.219 8.601 9.038 9.516 9.973 10.365 10.643 10.54 10.264 9.992 9.677 9.348 9.053 8.754 8.495 8.228 7.96 7.713 7.48 7.238 7.006 6.785 6.547 6.326 6.13 5.942 5.768 5.625 5.463 5.307 5.186 5.055 4.901 4.737 4.585 4.479 4.357 4.161 4.021 3.865 3.789 3.628 3.459 3.286 3.187 2.997 2.886 2.767 2.626 2.321 2.159 1.983 1.783 1.574 1.346 0.989 0.021 -5 ,20367 ,KEBNE ,16679053,Thu Nov 25 05:40:36 CET,Thu Nov 25 07:06:08 CET,0.0 0.574 0.811 1.014 1.143 1.263 1.375 1.468 1.644 1.722 1.797 1.836 2.0 2.074 2.203 2.319 2.452 2.516 2.622 2.728 2.887 2.983 3.078 3.206 3.32 3.435 3.559 3.695 3.873 4.037 4.189 4.351 4.512 4.681 4.875 5.089 5.291 5.505 5.72 5.942 6.193 6.484 6.797 7.087 7.45 7.873 8.285 8.684 9.144 9.587 9.86 9.852 9.646 9.336 8.987 8.658 8.347 8.035 7.746 7.457 7.197 6.941 6.694 6.471 6.262 6.071 5.859 5.656 5.485 5.308 5.115 4.948 4.765 4.575 4.43 4.275 4.119 3.964 3.794 3.672 3.546 3.338 3.2 3.053 2.973 2.803 2.621 2.426 2.319 2.126 2.0 1.888 1.767 1.477 1.324 1.168 1.002 0.795 0.534 0.182 -0.611 -6 ,26952 ,KEBNE ,16679054,Thu Nov 25 05:40:32 CET,Thu Nov 25 07:07:16 CET,0.0 0.574 0.812 1.002 1.162 1.315 1.446 1.541 1.721 1.822 1.918 2.0 2.178 2.252 2.389 2.542 2.69 2.75 2.87 3.003 3.207 3.331 3.439 3.578 3.7 3.834 3.972 4.105 4.271 4.43 4.588 4.774 4.949 5.111 5.303 5.532 5.75 5.98 6.209 6.438 6.684 6.963 7.31 7.659 8.019 8.364 8.732 9.136 9.548 9.941 10.233 10.216 9.987 9.689 9.388 9.042 8.677 8.351 8.079 7.79 7.528 7.284 7.062 6.847 6.631 6.424 6.202 5.98 5.772 5.569 5.349 5.169 4.991 4.79 4.633 4.479 4.325 4.168 3.999 3.88 3.759 3.573 3.43 3.265 3.185 3.031 2.862 2.675 2.583 2.399 2.259 2.131 2.003 1.763 1.615 1.453 1.294 1.075 0.774 0.359 -0.46 -7 ,29599 ,KEBNE ,16679055,Thu Nov 25 05:41:34 CET,Thu Nov 25 07:12:49 CET,0.0 0.589 0.902 1.114 1.3 1.466 1.613 1.737 1.961 2.062 2.154 2.214 2.388 2.486 2.654 2.788 2.929 3.004 3.144 3.261 3.436 3.561 3.664 3.81 3.969 4.117 4.258 4.395 4.561 4.719 4.863 5.03 5.196 5.372 5.594 5.824 6.021 6.237 6.472 6.717 6.99 7.326 7.663 7.971 8.326 8.672 9.051 9.466 9.869 10.263 10.575 10.566 10.358 10.022 9.684 9.353 9.006 8.687 8.409 8.114 7.86 7.633 7.422 7.182 6.936 6.739 6.525 6.311 6.12 5.934 5.748 5.569 5.368 5.183 5.046 4.908 4.765 4.612 4.453 4.337 4.209 4.019 3.889 3.744 3.665 3.519 3.369 3.187 3.088 2.895 2.758 2.642 2.525 2.27 2.124 1.968 1.781 1.552 1.3 0.903 -0.064 -8 ,7535 ,KEBNE ,16679056,Thu Nov 25 05:41:34 CET,Thu Nov 25 07:11:48 CET,0.0 0.777 1.035 1.252 1.423 1.549 1.668 1.779 1.988 2.083 2.175 2.272 2.449 2.527 2.678 2.827 2.963 3.03 3.164 3.283 3.453 3.567 3.679 3.841 3.985 4.111 4.246 4.386 4.544 4.687 4.833 5.025 5.217 5.392 5.58 5.808 6.074 6.318 6.542 6.794 7.053 7.348 7.674 7.988 8.342 8.736 9.183 9.602 10.023 10.443 10.764 10.834 10.663 10.385 10.102 9.789 9.437 9.102 8.824 8.531 8.268 8.007 7.758 7.536 7.302 7.079 6.845 6.646 6.483 6.302 6.095 5.914 5.73 5.545 5.399 5.246 5.087 4.913 4.726 4.612 4.5 4.307 4.153 3.988 3.907 3.741 3.567 3.385 3.292 3.099 2.959 2.835 2.716 2.471 2.334 2.159 1.958 1.75 1.472 1.094 0.21 -9 ,24111 ,KEBNE ,16679057,Thu Nov 25 05:43:36 CET,Thu Nov 25 07:10:28 CET,0.0 0.71 0.998 1.182 1.306 1.425 1.549 1.674 1.878 1.963 2.048 2.128 2.308 2.393 2.558 2.711 2.856 2.924 3.045 3.164 3.344 3.451 3.557 3.71 3.861 4.007 4.147 4.279 4.438 4.592 4.741 4.935 5.113 5.274 5.455 5.66 5.86 6.074 6.304 6.532 6.785 7.077 7.37 7.675 8.041 8.42 8.827 9.247 9.731 10.252 10.583 10.553 10.355 10.071 9.745 9.37 8.996 8.663 8.368 8.044 7.754 7.502 7.261 7.018 6.798 6.607 6.394 6.196 6.021 5.854 5.685 5.531 5.358 5.166 5.023 4.868 4.695 4.524 4.347 4.223 4.09 3.879 3.735 3.577 3.492 3.32 3.137 2.954 2.858 2.675 2.569 2.456 2.341 2.077 1.926 1.746 1.549 1.338 1.072 0.763 0.067 -10 ,17750 ,KEBNE ,16679058,Thu Nov 25 05:42:35 CET,Thu Nov 25 07:09:17 CET,0.0 0.749 1.019 1.278 1.481 1.661 1.814 1.932 2.139 2.234 2.319 2.382 2.553 2.633 2.788 2.932 3.076 3.148 3.284 3.42 3.621 3.737 3.844 4.008 4.166 4.309 4.438 4.565 4.73 4.881 5.039 5.233 5.414 5.595 5.811 6.037 6.226 6.448 6.697 6.933 7.152 7.412 7.739 8.048 8.412 8.812 9.249 9.729 10.234 10.679 10.993 10.943 10.757 10.504 10.213 9.911 9.606 9.267 8.959 8.643 8.353 8.097 7.847 7.601 7.373 7.175 6.966 6.757 6.572 6.38 6.166 5.983 5.778 5.568 5.409 5.238 5.078 4.921 4.756 4.638 4.509 4.309 4.175 4.035 3.965 3.812 3.651 3.49 3.397 3.205 3.079 2.965 2.838 2.583 2.446 2.265 2.065 1.845 1.6 1.25 0.437 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5a.txt deleted file mode 100644 index 594121ef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19760 ,KEBNE ,17024345,Wed Dec 22 09:52:01 CET,Wed Dec 22 11:18:54 CET,0.0 0.574 0.755 0.91 1.062 1.189 1.313 1.434 1.661 1.761 1.844 1.917 2.084 2.166 2.32 2.456 2.587 2.649 2.763 2.875 3.057 3.167 3.269 3.429 3.571 3.705 3.828 3.936 4.085 4.235 4.363 4.514 4.685 4.857 5.05 5.265 5.463 5.688 5.949 6.223 6.482 6.747 7.057 7.379 7.74 8.127 8.59 9.109 9.696 10.325 10.984 11.405 11.559 11.575 11.5 11.397 11.244 11.054 10.889 10.738 10.595 10.436 10.269 10.122 9.971 9.829 9.695 9.58 9.481 9.362 9.233 9.121 8.987 8.834 8.718 8.601 8.478 8.359 8.243 8.159 8.06 7.883 7.761 7.647 7.589 7.458 7.309 7.158 7.09 6.936 6.826 6.725 6.633 6.398 6.255 6.116 5.959 5.766 5.524 5.22 4.353 -2 ,26800 ,KEBNE ,17024346,Wed Dec 22 09:52:01 CET,Wed Dec 22 11:18:40 CET,0.0 0.683 0.91 1.096 1.256 1.384 1.502 1.61 1.808 1.893 1.98 2.066 2.236 2.305 2.438 2.586 2.725 2.791 2.914 3.027 3.174 3.265 3.362 3.5 3.627 3.755 3.891 4.024 4.178 4.315 4.445 4.611 4.767 4.919 5.107 5.301 5.485 5.693 5.9 6.112 6.351 6.628 6.943 7.257 7.61 8.008 8.481 8.984 9.55 10.184 10.86 11.294 11.414 11.4 11.33 11.218 11.09 10.952 10.8 10.637 10.459 10.261 10.094 9.95 9.796 9.648 9.51 9.38 9.245 9.12 9.001 8.892 8.775 8.626 8.5 8.376 8.237 8.099 7.973 7.879 7.776 7.619 7.509 7.394 7.334 7.206 7.069 6.929 6.854 6.693 6.608 6.519 6.423 6.21 6.09 5.957 5.813 5.649 5.403 5.095 4.424 -3 ,18422 ,KEBNE ,17024347,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:20:38 CET,0.0 0.575 0.827 1.01 1.152 1.283 1.416 1.526 1.728 1.819 1.904 1.971 2.137 2.213 2.364 2.508 2.638 2.703 2.825 2.942 3.119 3.219 3.313 3.452 3.577 3.702 3.842 3.986 4.162 4.318 4.46 4.64 4.818 4.984 5.179 5.392 5.596 5.832 6.063 6.304 6.574 6.864 7.175 7.526 7.946 8.378 8.854 9.344 9.908 10.561 11.258 11.669 11.74 11.699 11.616 11.498 11.371 11.215 11.06 10.884 10.701 10.54 10.4 10.255 10.108 9.971 9.83 9.711 9.584 9.441 9.314 9.209 9.075 8.931 8.832 8.727 8.613 8.478 8.333 8.245 8.152 8.002 7.896 7.776 7.712 7.587 7.46 7.319 7.248 7.093 7.035 6.961 6.874 6.645 6.514 6.378 6.21 6.004 5.769 5.448 4.345 -4 ,403 ,KEBNE ,17024348,Wed Dec 22 09:53:02 CET,Wed Dec 22 11:20:00 CET,0.0 0.861 1.134 1.329 1.476 1.605 1.731 1.831 2.003 2.086 2.171 2.248 2.41 2.478 2.618 2.772 2.91 2.968 3.075 3.169 3.319 3.424 3.517 3.645 3.777 3.905 4.019 4.136 4.29 4.426 4.578 4.774 4.952 5.114 5.282 5.469 5.658 5.856 6.073 6.338 6.604 6.869 7.195 7.528 7.896 8.296 8.748 9.232 9.801 10.446 11.171 11.67 11.846 11.833 11.757 11.663 11.53 11.388 11.234 11.057 10.922 10.799 10.661 10.526 10.399 10.284 10.135 9.977 9.835 9.681 9.528 9.408 9.283 9.149 9.039 8.931 8.835 8.719 8.584 8.492 8.393 8.225 8.107 7.992 7.937 7.827 7.704 7.57 7.502 7.34 7.249 7.156 7.048 6.83 6.708 6.551 6.383 6.219 6.028 5.736 4.766 -5 ,23566 ,KEBNE ,17024349,Wed Dec 22 09:53:02 CET,Wed Dec 22 11:19:26 CET,0.0 0.957 1.243 1.426 1.59 1.721 1.831 1.952 2.191 2.278 2.353 2.429 2.592 2.659 2.786 2.909 3.018 3.075 3.188 3.295 3.454 3.548 3.64 3.793 3.948 4.09 4.22 4.347 4.509 4.655 4.8 4.98 5.154 5.317 5.492 5.693 5.899 6.131 6.369 6.613 6.857 7.13 7.473 7.813 8.198 8.597 9.033 9.546 10.111 10.743 11.461 11.922 12.044 12.004 11.894 11.739 11.553 11.38 11.228 11.078 10.9 10.718 10.571 10.434 10.306 10.177 10.036 9.908 9.783 9.639 9.491 9.375 9.239 9.091 8.98 8.862 8.758 8.64 8.498 8.405 8.301 8.138 8.039 7.932 7.872 7.756 7.643 7.5 7.426 7.266 7.18 7.089 6.98 6.746 6.611 6.477 6.309 6.109 5.915 5.63 4.735 -6 ,6548 ,KEBNE ,17024350,Wed Dec 22 09:53:03 CET,Wed Dec 22 11:18:54 CET,0.0 0.665 0.88 1.042 1.176 1.325 1.468 1.588 1.775 1.862 1.961 2.052 2.212 2.275 2.414 2.553 2.676 2.737 2.865 2.989 3.164 3.269 3.364 3.508 3.645 3.777 3.898 4.022 4.201 4.37 4.532 4.711 4.873 5.035 5.21 5.415 5.628 5.857 6.098 6.369 6.633 6.918 7.277 7.633 8.023 8.443 8.93 9.447 10.001 10.638 11.344 11.74 11.856 11.859 11.815 11.742 11.648 11.532 11.368 11.204 11.083 10.96 10.841 10.729 10.597 10.455 10.3 10.16 10.04 9.927 9.806 9.697 9.59 9.468 9.366 9.261 9.138 9.007 8.886 8.797 8.692 8.523 8.413 8.305 8.247 8.131 8.006 7.871 7.799 7.635 7.55 7.451 7.339 7.117 6.998 6.869 6.717 6.524 6.275 5.97 4.936 -7 ,25212 ,KEBNE ,17024351,Wed Dec 22 09:53:02 CET,Wed Dec 22 11:18:21 CET,0.0 0.704 1.003 1.222 1.371 1.493 1.63 1.735 1.89 1.97 2.039 2.083 2.243 2.315 2.464 2.613 2.74 2.798 2.909 3.025 3.196 3.304 3.42 3.568 3.691 3.821 3.954 4.078 4.24 4.394 4.539 4.716 4.867 5.015 5.2 5.409 5.607 5.824 6.056 6.293 6.553 6.837 7.147 7.485 7.887 8.3 8.755 9.273 9.868 10.56 11.292 11.729 11.839 11.833 11.72 11.569 11.458 11.301 11.142 11.0 10.827 10.67 10.526 10.385 10.241 10.095 9.943 9.809 9.704 9.593 9.473 9.363 9.244 9.122 9.02 8.905 8.783 8.661 8.536 8.44 8.333 8.183 8.077 7.961 7.897 7.763 7.616 7.447 7.364 7.194 7.116 7.034 6.934 6.72 6.601 6.471 6.323 6.17 5.98 5.731 4.98 -8 ,15592 ,KEBNE ,17024352,Wed Dec 22 09:53:06 CET,Wed Dec 22 11:18:19 CET,0.0 0.669 0.894 1.095 1.265 1.378 1.491 1.615 1.831 1.915 1.992 2.078 2.249 2.322 2.467 2.6 2.721 2.779 2.907 3.036 3.2 3.293 3.379 3.517 3.653 3.771 3.893 4.022 4.181 4.344 4.507 4.699 4.882 5.041 5.216 5.443 5.661 5.879 6.114 6.352 6.601 6.888 7.216 7.528 7.902 8.304 8.756 9.28 9.86 10.519 11.243 11.662 11.76 11.725 11.631 11.51 11.373 11.227 11.097 10.946 10.78 10.619 10.453 10.289 10.135 9.998 9.864 9.712 9.569 9.446 9.305 9.191 9.09 8.973 8.879 8.78 8.666 8.532 8.401 8.321 8.236 8.098 7.981 7.835 7.77 7.649 7.506 7.361 7.283 7.111 7.022 6.932 6.83 6.61 6.492 6.348 6.175 5.975 5.732 5.373 4.544 -9 ,28734 ,KEBNE ,17024353,Wed Dec 22 09:53:03 CET,Wed Dec 22 11:17:58 CET,0.0 0.381 0.588 0.761 0.931 1.073 1.19 1.315 1.532 1.617 1.704 1.806 1.98 2.048 2.18 2.299 2.414 2.478 2.587 2.698 2.869 2.974 3.074 3.219 3.361 3.505 3.64 3.764 3.93 4.103 4.261 4.422 4.566 4.707 4.884 5.095 5.295 5.509 5.752 6.004 6.253 6.524 6.843 7.168 7.541 7.94 8.386 8.883 9.458 10.075 10.744 11.2 11.327 11.302 11.238 11.121 10.961 10.825 10.691 10.504 10.313 10.162 10.032 9.89 9.755 9.637 9.484 9.344 9.231 9.118 8.999 8.883 8.765 8.645 8.553 8.459 8.343 8.216 8.098 8.014 7.925 7.801 7.698 7.55 7.474 7.346 7.211 7.053 6.979 6.826 6.738 6.642 6.543 6.345 6.226 6.093 5.929 5.732 5.492 5.185 4.442 -10 ,17058 ,KEBNE ,17024354,Wed Dec 22 09:53:02 CET,Wed Dec 22 11:17:51 CET,0.0 0.996 1.298 1.488 1.648 1.778 1.893 2.017 2.238 2.331 2.416 2.49 2.661 2.738 2.871 2.988 3.105 3.162 3.278 3.385 3.535 3.636 3.73 3.876 4.009 4.129 4.24 4.351 4.495 4.637 4.785 4.961 5.134 5.291 5.487 5.715 5.914 6.12 6.347 6.602 6.851 7.136 7.471 7.789 8.153 8.568 9.029 9.526 10.112 10.73 11.293 11.6 11.7 11.704 11.64 11.507 11.346 11.19 11.053 10.896 10.74 10.59 10.46 10.327 10.179 10.02 9.833 9.666 9.528 9.399 9.283 9.156 8.998 8.85 8.741 8.631 8.525 8.402 8.259 8.165 8.06 7.9 7.798 7.691 7.626 7.479 7.328 7.181 7.113 6.964 6.871 6.773 6.681 6.468 6.354 6.218 6.055 5.887 5.666 5.358 4.626 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5g.txt deleted file mode 100644 index ce8b037b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7256 ,KEBNE ,16679059,Thu Nov 25 05:44:38 CET,Thu Nov 25 07:14:02 CET,0.0 0.5 0.745 0.928 1.06 1.162 1.278 1.399 1.608 1.699 1.779 1.844 2.008 2.081 2.22 2.354 2.484 2.544 2.661 2.792 2.98 3.082 3.172 3.284 3.404 3.548 3.671 3.786 3.938 4.079 4.221 4.388 4.539 4.679 4.845 5.031 5.199 5.383 5.581 5.787 6.002 6.239 6.505 6.767 7.056 7.348 7.658 7.987 8.35 8.71 8.968 8.959 8.703 8.38 8.081 7.76 7.461 7.206 6.928 6.651 6.426 6.181 5.959 5.739 5.54 5.385 5.217 5.046 4.906 4.778 4.62 4.481 4.338 4.183 4.071 3.96 3.834 3.693 3.554 3.46 3.36 3.197 3.073 2.953 2.898 2.786 2.672 2.547 2.474 2.304 2.223 2.132 2.042 1.847 1.726 1.612 1.473 1.31 1.133 0.871 0.192 -2 ,15424 ,KEBNE ,16679060,Thu Nov 25 05:44:38 CET,Thu Nov 25 07:10:34 CET,0.0 0.676 0.871 1.027 1.191 1.348 1.481 1.595 1.78 1.867 1.952 2.015 2.183 2.253 2.386 2.519 2.642 2.699 2.807 2.913 3.064 3.163 3.255 3.393 3.535 3.669 3.795 3.904 4.046 4.197 4.347 4.506 4.641 4.777 4.944 5.12 5.291 5.483 5.692 5.911 6.114 6.323 6.569 6.838 7.152 7.512 7.894 8.235 8.599 8.958 9.133 8.995 8.742 8.44 8.109 7.779 7.48 7.206 6.961 6.706 6.463 6.227 6.011 5.784 5.565 5.393 5.216 5.051 4.903 4.744 4.593 4.469 4.327 4.193 4.1 4.003 3.899 3.792 3.693 3.623 3.535 3.391 3.304 3.22 3.172 3.072 2.978 2.865 2.792 2.636 2.599 2.532 2.467 2.327 2.237 2.13 2.026 1.923 1.798 1.663 1.489 -3 ,7305 ,KEBNE ,16679061,Thu Nov 25 05:44:38 CET,Thu Nov 25 07:12:33 CET,0.0 0.756 0.994 1.175 1.328 1.464 1.592 1.716 1.943 2.034 2.116 2.174 2.336 2.411 2.554 2.693 2.831 2.891 3.0 3.114 3.28 3.381 3.484 3.628 3.755 3.886 4.012 4.126 4.264 4.385 4.514 4.685 4.84 4.986 5.16 5.35 5.53 5.733 5.941 6.175 6.421 6.663 6.952 7.232 7.511 7.796 8.097 8.442 8.834 9.244 9.483 9.374 9.123 8.807 8.529 8.253 7.997 7.72 7.457 7.217 7.007 6.814 6.623 6.431 6.222 6.019 5.824 5.664 5.533 5.403 5.276 5.156 5.015 4.862 4.741 4.61 4.471 4.33 4.194 4.108 4.008 3.85 3.75 3.639 3.577 3.46 3.35 3.227 3.157 2.997 2.939 2.878 2.818 2.655 2.556 2.46 2.363 2.271 2.15 2.001 1.81 -4 ,21955 ,KEBNE ,16679062,Thu Nov 25 05:45:39 CET,Thu Nov 25 07:12:30 CET,0.0 0.733 1.013 1.201 1.354 1.484 1.596 1.703 1.906 2.005 2.096 2.166 2.319 2.386 2.53 2.661 2.785 2.851 2.977 3.101 3.271 3.373 3.468 3.607 3.745 3.881 4.017 4.141 4.294 4.44 4.576 4.739 4.91 5.082 5.269 5.458 5.613 5.758 5.945 6.195 6.45 6.691 6.942 7.194 7.505 7.86 8.228 8.563 8.913 9.243 9.43 9.336 9.054 8.716 8.421 8.084 7.759 7.481 7.243 7.001 6.792 6.596 6.381 6.189 6.015 5.836 5.653 5.481 5.321 5.163 4.981 4.828 4.698 4.563 4.437 4.303 4.167 4.032 3.893 3.804 3.723 3.587 3.489 3.384 3.323 3.204 3.08 2.937 2.864 2.71 2.666 2.586 2.51 2.374 2.301 2.215 2.12 2.018 1.893 1.734 1.482 -5 ,11657 ,KEBNE ,16679063,Thu Nov 25 05:45:39 CET,Thu Nov 25 07:13:02 CET,0.0 0.827 1.084 1.28 1.424 1.548 1.684 1.813 2.024 2.124 2.219 2.29 2.458 2.536 2.667 2.794 2.933 3.004 3.131 3.241 3.394 3.493 3.585 3.716 3.85 3.977 4.105 4.235 4.398 4.549 4.697 4.895 5.081 5.24 5.418 5.621 5.808 5.984 6.164 6.362 6.584 6.819 7.076 7.318 7.582 7.875 8.22 8.566 8.889 9.212 9.434 9.263 8.968 8.647 8.348 8.08 7.795 7.526 7.297 7.024 6.776 6.561 6.322 6.108 5.927 5.752 5.556 5.381 5.234 5.068 4.894 4.747 4.593 4.433 4.314 4.194 4.068 3.965 3.875 3.809 3.733 3.601 3.503 3.396 3.346 3.242 3.124 3.0 2.937 2.778 2.744 2.685 2.611 2.451 2.384 2.322 2.237 2.119 2.0 1.825 1.494 -6 ,9383 ,KEBNE ,16679064,Thu Nov 25 05:45:39 CET,Thu Nov 25 07:10:45 CET,0.0 0.597 0.824 1.014 1.155 1.289 1.422 1.543 1.762 1.858 1.935 1.984 2.147 2.225 2.359 2.494 2.62 2.684 2.831 2.955 3.113 3.221 3.327 3.479 3.613 3.737 3.856 3.971 4.14 4.305 4.44 4.595 4.756 4.913 5.071 5.229 5.394 5.574 5.772 5.98 6.186 6.419 6.683 6.958 7.299 7.626 7.939 8.291 8.649 8.996 9.23 9.178 8.946 8.659 8.347 8.035 7.754 7.471 7.216 6.948 6.734 6.548 6.327 6.103 5.91 5.752 5.57 5.384 5.241 5.094 4.93 4.793 4.664 4.539 4.451 4.354 4.226 4.094 3.962 3.867 3.775 3.647 3.57 3.481 3.426 3.301 3.168 3.044 2.98 2.824 2.786 2.717 2.641 2.485 2.394 2.309 2.224 2.125 2.006 1.87 1.623 -7 ,16329 ,KEBNE ,16679065,Thu Nov 25 05:48:43 CET,Thu Nov 25 07:16:32 CET,0.0 1.044 1.353 1.539 1.674 1.795 1.903 2.014 2.222 2.318 2.411 2.492 2.657 2.736 2.893 3.023 3.135 3.194 3.309 3.426 3.595 3.689 3.775 3.916 4.053 4.188 4.322 4.453 4.633 4.787 4.927 5.084 5.232 5.373 5.525 5.694 5.859 6.048 6.248 6.467 6.692 6.937 7.232 7.516 7.805 8.093 8.431 8.81 9.187 9.52 9.732 9.694 9.466 9.183 8.888 8.566 8.259 7.958 7.705 7.458 7.232 7.026 6.815 6.617 6.446 6.289 6.108 5.946 5.811 5.658 5.491 5.352 5.214 5.072 4.945 4.814 4.687 4.547 4.419 4.329 4.224 4.057 3.944 3.84 3.789 3.679 3.551 3.384 3.293 3.121 3.033 2.944 2.856 2.692 2.627 2.547 2.454 2.379 2.29 2.154 1.814 -8 ,24511 ,KEBNE ,16679066,Thu Nov 25 05:48:43 CET,Thu Nov 25 07:16:40 CET,0.0 0.783 0.983 1.135 1.28 1.411 1.535 1.648 1.823 1.902 1.991 2.085 2.249 2.312 2.447 2.575 2.699 2.758 2.869 2.981 3.149 3.255 3.353 3.494 3.631 3.754 3.864 3.971 4.114 4.241 4.365 4.52 4.661 4.784 4.925 5.106 5.284 5.484 5.689 5.885 6.088 6.312 6.573 6.815 7.072 7.354 7.675 8.013 8.369 8.715 8.924 8.778 8.512 8.231 7.92 7.612 7.352 7.072 6.775 6.462 6.221 6.028 5.826 5.636 5.455 5.27 5.066 4.876 4.72 4.579 4.433 4.3 4.159 4.016 3.902 3.784 3.67 3.549 3.416 3.322 3.226 3.065 2.959 2.85 2.786 2.654 2.517 2.377 2.31 2.156 2.107 2.038 1.955 1.745 1.625 1.498 1.345 1.187 1.017 0.79 0.423 -9 ,7387 ,KEBNE ,16679067,Thu Nov 25 05:48:51 CET,Thu Nov 25 07:11:00 CET,0.0 0.717 0.984 1.178 1.316 1.444 1.574 1.698 1.905 1.995 2.076 2.141 2.306 2.379 2.525 2.664 2.786 2.847 2.962 3.068 3.232 3.331 3.421 3.559 3.687 3.807 3.931 4.049 4.206 4.362 4.507 4.659 4.793 4.922 5.094 5.295 5.483 5.693 5.894 6.093 6.313 6.554 6.82 7.131 7.504 7.842 8.17 8.505 8.863 9.201 9.373 9.203 8.949 8.683 8.39 8.07 7.782 7.522 7.291 7.05 6.803 6.581 6.372 6.169 5.996 5.837 5.66 5.504 5.37 5.23 5.086 4.96 4.814 4.672 4.575 4.461 4.328 4.196 4.063 3.962 3.861 3.725 3.635 3.549 3.51 3.423 3.327 3.234 3.192 3.055 3.017 2.953 2.89 2.729 2.648 2.573 2.5 2.409 2.274 2.134 1.808 -10 ,6202 ,KEBNE ,16679068,Thu Nov 25 05:48:51 CET,Thu Nov 25 07:13:08 CET,0.0 0.619 0.828 0.998 1.142 1.269 1.397 1.512 1.7 1.787 1.879 1.964 2.131 2.208 2.343 2.461 2.579 2.64 2.765 2.886 3.057 3.158 3.251 3.384 3.518 3.663 3.799 3.919 4.068 4.206 4.352 4.518 4.672 4.839 5.033 5.23 5.399 5.589 5.815 6.041 6.281 6.546 6.792 7.026 7.3 7.632 7.988 8.336 8.717 9.047 9.255 9.218 8.982 8.661 8.328 8.024 7.768 7.522 7.277 7.013 6.779 6.568 6.356 6.171 6.013 5.852 5.669 5.514 5.364 5.194 5.024 4.884 4.742 4.595 4.482 4.363 4.244 4.127 3.988 3.89 3.804 3.66 3.55 3.433 3.371 3.235 3.102 2.97 2.895 2.736 2.654 2.555 2.458 2.245 2.13 2.011 1.877 1.721 1.532 1.305 0.8 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5j_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5j_5b.txt deleted file mode 100644 index b53e1e4e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5j_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16194 ,KEBNE ,16679069,Thu Nov 25 05:50:45 CET,Thu Nov 25 07:15:48 CET,0.0 0.618 0.854 1.02 1.137 1.257 1.371 1.475 1.657 1.747 1.838 1.936 2.102 2.184 2.339 2.468 2.588 2.652 2.772 2.884 3.044 3.146 3.252 3.403 3.54 3.668 3.79 3.906 4.053 4.213 4.388 4.598 4.795 4.97 5.164 5.397 5.63 5.866 6.108 6.37 6.634 6.936 7.301 7.661 8.062 8.504 8.975 9.48 10.115 10.875 11.607 12.024 12.183 12.218 12.146 12.015 11.85 11.675 11.521 11.374 11.267 11.147 11.01 10.872 10.742 10.628 10.496 10.357 10.237 10.125 10.009 9.903 9.793 9.678 9.585 9.49 9.392 9.292 9.188 9.114 9.025 8.88 8.789 8.687 8.638 8.536 8.418 8.295 8.228 8.084 8.021 7.944 7.863 7.698 7.6 7.474 7.353 7.231 7.06 6.828 6.252 -2 ,13619 ,KEBNE ,16679070,Thu Nov 25 05:50:46 CET,Thu Nov 25 07:17:13 CET,0.0 0.527 0.756 0.926 1.059 1.209 1.334 1.448 1.681 1.773 1.86 1.952 2.102 2.169 2.304 2.424 2.547 2.612 2.727 2.841 3.006 3.111 3.209 3.356 3.496 3.629 3.763 3.9 4.08 4.237 4.388 4.556 4.712 4.883 5.101 5.34 5.571 5.811 6.059 6.339 6.612 6.899 7.239 7.571 7.942 8.388 8.923 9.451 10.027 10.698 11.367 11.802 11.947 11.929 11.855 11.725 11.563 11.42 11.272 11.094 10.907 10.744 10.584 10.417 10.289 10.184 10.074 9.968 9.87 9.754 9.609 9.482 9.372 9.251 9.145 9.05 8.946 8.838 8.736 8.663 8.573 8.438 8.35 8.254 8.206 8.093 7.975 7.853 7.777 7.629 7.564 7.491 7.417 7.258 7.165 7.046 6.913 6.76 6.572 6.333 5.865 -3 ,20400 ,KEBNE ,16679071,Thu Nov 25 05:50:46 CET,Thu Nov 25 07:15:40 CET,0.0 0.522 0.808 1.01 1.152 1.283 1.386 1.477 1.658 1.739 1.829 1.931 2.092 2.171 2.325 2.475 2.611 2.671 2.776 2.888 3.062 3.179 3.294 3.445 3.575 3.703 3.837 3.977 4.154 4.322 4.482 4.67 4.86 5.041 5.247 5.47 5.688 5.921 6.173 6.464 6.742 7.039 7.398 7.729 8.14 8.586 9.045 9.546 10.106 10.723 11.373 11.796 11.948 11.915 11.823 11.707 11.527 11.352 11.237 11.083 10.921 10.795 10.659 10.513 10.371 10.218 10.08 9.974 9.859 9.735 9.624 9.532 9.42 9.292 9.186 9.079 8.982 8.89 8.798 8.73 8.649 8.524 8.429 8.324 8.273 8.156 8.032 7.903 7.835 7.698 7.64 7.573 7.494 7.324 7.223 7.113 6.996 6.853 6.692 6.505 5.961 -4 ,9473 ,KEBNE ,16679072,Thu Nov 25 05:50:46 CET,Thu Nov 25 07:15:51 CET,0.0 0.542 0.842 1.054 1.219 1.371 1.505 1.614 1.827 1.917 1.998 2.078 2.237 2.313 2.473 2.62 2.749 2.818 2.947 3.063 3.24 3.361 3.475 3.623 3.753 3.881 4.013 4.139 4.296 4.456 4.613 4.803 4.982 5.142 5.345 5.559 5.748 5.976 6.22 6.476 6.734 7.021 7.348 7.686 8.075 8.471 8.939 9.472 10.092 10.802 11.534 11.939 12.005 11.913 11.815 11.72 11.583 11.419 11.29 11.119 10.941 10.795 10.654 10.511 10.389 10.293 10.177 10.059 9.946 9.821 9.685 9.58 9.482 9.368 9.268 9.167 9.056 8.939 8.807 8.718 8.628 8.481 8.376 8.259 8.201 8.09 7.984 7.868 7.815 7.684 7.608 7.53 7.446 7.238 7.126 7.027 6.911 6.76 6.572 6.289 5.448 -5 ,19810 ,KEBNE ,16679073,Thu Nov 25 05:51:47 CET,Thu Nov 25 07:18:07 CET,0.0 0.781 1.041 1.216 1.368 1.507 1.638 1.761 1.977 2.078 2.171 2.268 2.43 2.507 2.663 2.81 2.949 3.011 3.129 3.251 3.431 3.544 3.647 3.804 3.939 4.054 4.184 4.316 4.496 4.664 4.798 4.956 5.117 5.273 5.467 5.693 5.903 6.126 6.373 6.63 6.886 7.18 7.545 7.909 8.308 8.728 9.211 9.782 10.454 11.156 11.858 12.3 12.436 12.415 12.358 12.27 12.147 11.996 11.823 11.645 11.484 11.34 11.201 11.057 10.913 10.775 10.641 10.523 10.416 10.296 10.157 10.04 9.929 9.827 9.743 9.661 9.578 9.473 9.354 9.274 9.186 9.063 8.974 8.856 8.796 8.69 8.587 8.472 8.403 8.254 8.188 8.113 8.032 7.834 7.713 7.585 7.448 7.308 7.146 6.932 6.368 -6 ,1710 ,KEBNE ,16679074,Thu Nov 25 05:51:55 CET,Thu Nov 25 07:14:09 CET,0.0 0.491 0.721 0.912 1.072 1.206 1.332 1.455 1.646 1.73 1.807 1.871 2.038 2.13 2.28 2.413 2.551 2.612 2.73 2.86 3.029 3.127 3.235 3.384 3.513 3.65 3.778 3.899 4.055 4.201 4.35 4.541 4.721 4.882 5.079 5.308 5.521 5.757 6.018 6.273 6.554 6.852 7.159 7.494 7.907 8.379 8.9 9.416 9.991 10.628 11.265 11.691 11.804 11.771 11.699 11.542 11.373 11.238 11.096 10.94 10.799 10.648 10.504 10.366 10.233 10.112 9.98 9.847 9.716 9.583 9.461 9.349 9.228 9.106 9.007 8.911 8.811 8.704 8.597 8.509 8.416 8.292 8.2 8.091 8.04 7.94 7.829 7.715 7.653 7.508 7.41 7.324 7.25 7.089 7.003 6.901 6.774 6.623 6.428 6.175 5.683 -7 ,23135 ,KEBNE ,16679075,Thu Nov 25 05:51:55 CET,Thu Nov 25 07:16:17 CET,0.0 0.577 0.824 0.988 1.123 1.251 1.371 1.474 1.659 1.75 1.83 1.887 2.033 2.105 2.249 2.404 2.551 2.613 2.735 2.849 2.993 3.094 3.204 3.339 3.464 3.598 3.724 3.838 3.982 4.132 4.279 4.461 4.66 4.845 5.046 5.261 5.449 5.665 5.903 6.161 6.458 6.799 7.158 7.521 7.925 8.342 8.822 9.356 9.962 10.634 11.355 11.801 11.956 11.945 11.864 11.725 11.567 11.414 11.253 11.075 10.932 10.793 10.631 10.485 10.351 10.235 10.114 9.989 9.872 9.732 9.564 9.423 9.298 9.186 9.089 8.978 8.877 8.788 8.684 8.605 8.525 8.397 8.307 8.207 8.16 8.062 7.939 7.81 7.741 7.598 7.529 7.45 7.37 7.161 7.055 6.97 6.845 6.691 6.532 6.334 5.859 -8 ,22832 ,KEBNE ,16679076,Thu Nov 25 05:52:48 CET,Thu Nov 25 07:17:32 CET,0.0 0.476 0.719 0.898 1.059 1.208 1.328 1.417 1.585 1.668 1.744 1.805 1.955 2.018 2.147 2.276 2.391 2.453 2.58 2.696 2.842 2.944 3.038 3.17 3.318 3.473 3.6 3.709 3.874 4.037 4.182 4.354 4.519 4.677 4.853 5.06 5.268 5.498 5.748 6.005 6.277 6.58 6.907 7.222 7.6 8.05 8.554 9.075 9.651 10.272 10.933 11.346 11.452 11.431 11.344 11.216 11.069 10.902 10.754 10.583 10.407 10.247 10.104 9.992 9.886 9.764 9.632 9.515 9.404 9.284 9.154 9.039 8.931 8.829 8.751 8.663 8.553 8.442 8.332 8.26 8.188 8.075 7.991 7.884 7.83 7.726 7.601 7.468 7.409 7.269 7.197 7.126 7.057 6.87 6.759 6.64 6.507 6.365 6.21 5.955 5.328 -9 ,19723 ,KEBNE ,16679077,Thu Nov 25 05:52:48 CET,Thu Nov 25 07:18:38 CET,0.0 0.536 0.758 0.923 1.065 1.187 1.292 1.397 1.592 1.687 1.778 1.871 2.03 2.1 2.232 2.359 2.477 2.53 2.632 2.74 2.917 3.03 3.14 3.293 3.428 3.56 3.684 3.811 3.985 4.139 4.273 4.446 4.621 4.807 5.022 5.23 5.43 5.658 5.916 6.189 6.445 6.746 7.134 7.53 7.927 8.319 8.794 9.312 9.868 10.502 11.16 11.549 11.696 11.697 11.609 11.483 11.359 11.231 11.102 10.943 10.79 10.634 10.493 10.369 10.224 10.096 9.987 9.888 9.789 9.675 9.554 9.441 9.335 9.227 9.122 9.003 8.869 8.739 8.624 8.544 8.463 8.338 8.247 8.149 8.097 7.986 7.866 7.753 7.694 7.553 7.474 7.39 7.319 7.178 7.077 6.955 6.83 6.676 6.461 6.182 5.597 -10 ,32276 ,KEBNE ,16679078,Thu Nov 25 05:52:48 CET,Thu Nov 25 07:17:20 CET,0.0 0.648 0.862 1.032 1.199 1.328 1.44 1.536 1.719 1.811 1.883 1.937 2.086 2.152 2.282 2.408 2.539 2.601 2.7 2.803 2.957 3.051 3.145 3.283 3.417 3.562 3.717 3.853 4.012 4.16 4.303 4.472 4.653 4.826 5.009 5.217 5.415 5.627 5.868 6.135 6.388 6.65 6.963 7.278 7.634 8.036 8.497 9.011 9.618 10.272 10.906 11.299 11.415 11.407 11.329 11.201 11.071 10.933 10.792 10.59 10.395 10.224 10.078 9.955 9.828 9.695 9.55 9.421 9.304 9.187 9.065 8.964 8.86 8.758 8.681 8.593 8.491 8.382 8.28 8.207 8.12 7.968 7.869 7.761 7.706 7.608 7.498 7.376 7.306 7.156 7.078 6.998 6.916 6.744 6.64 6.52 6.385 6.24 6.072 5.853 5.175 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5d.txt deleted file mode 100644 index 999bbfcb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16460 ,KEBNE ,16679079,Thu Nov 25 05:52:48 CET,Thu Nov 25 07:19:28 CET,0.0 0.443 0.727 0.926 1.089 1.248 1.381 1.497 1.711 1.812 1.914 1.994 2.181 2.26 2.409 2.554 2.695 2.765 2.899 3.024 3.2 3.309 3.423 3.595 3.752 3.907 4.045 4.167 4.349 4.537 4.712 4.914 5.096 5.256 5.451 5.695 5.921 6.153 6.408 6.681 6.954 7.275 7.657 8.025 8.447 8.925 9.465 10.057 10.731 11.495 12.358 13.009 13.31 13.406 13.422 13.379 13.3 13.21 13.094 12.951 12.804 12.679 12.542 12.402 12.3 12.203 12.09 11.973 11.851 11.736 11.638 11.56 11.467 11.345 11.25 11.155 11.054 10.947 10.835 10.758 10.685 10.568 10.48 10.378 10.327 10.229 10.115 10.0 9.934 9.764 9.701 9.628 9.556 9.358 9.239 9.112 8.97 8.798 8.6 8.327 7.609 -2 ,7390 ,KEBNE ,16679080,Thu Nov 25 05:52:48 CET,Thu Nov 25 07:22:14 CET,0.0 0.827 1.049 1.22 1.38 1.517 1.644 1.752 1.953 2.049 2.132 2.194 2.38 2.461 2.615 2.774 2.914 2.975 3.097 3.216 3.39 3.499 3.611 3.778 3.936 4.077 4.206 4.326 4.48 4.648 4.822 5.022 5.193 5.355 5.55 5.766 5.97 6.218 6.498 6.769 7.056 7.384 7.751 8.106 8.505 8.97 9.519 10.115 10.799 11.609 12.467 13.009 13.203 13.241 13.225 13.174 13.084 12.972 12.848 12.693 12.549 12.429 12.323 12.214 12.1 11.979 11.866 11.763 11.662 11.551 11.442 11.367 11.274 11.163 11.062 10.954 10.846 10.735 10.618 10.534 10.446 10.314 10.23 10.131 10.072 9.957 9.845 9.727 9.66 9.504 9.462 9.371 9.271 9.059 8.947 8.827 8.68 8.502 8.274 8.0 7.465 -3 ,1287 ,KEBNE ,16679081,Thu Nov 25 05:53:49 CET,Thu Nov 25 07:18:39 CET,0.0 0.656 0.911 1.102 1.269 1.407 1.512 1.609 1.799 1.892 1.986 2.07 2.256 2.329 2.461 2.605 2.758 2.829 2.955 3.066 3.229 3.333 3.425 3.569 3.721 3.866 3.998 4.126 4.315 4.486 4.641 4.838 5.012 5.19 5.406 5.635 5.857 6.102 6.356 6.628 6.912 7.225 7.594 7.977 8.438 8.914 9.439 10.04 10.732 11.553 12.48 13.097 13.355 13.458 13.474 13.421 13.335 13.228 13.119 13.01 12.904 12.768 12.592 12.464 12.377 12.28 12.154 12.033 11.934 11.812 11.681 11.584 11.487 11.384 11.303 11.215 11.11 11.01 10.918 10.844 10.766 10.652 10.565 10.466 10.421 10.334 10.222 10.09 10.027 9.873 9.806 9.722 9.643 9.451 9.346 9.225 9.069 8.9 8.711 8.488 7.847 -4 ,7829 ,KEBNE ,16679082,Thu Nov 25 05:53:49 CET,Thu Nov 25 07:20:22 CET,0.0 0.406 0.634 0.799 0.921 1.031 1.14 1.249 1.455 1.554 1.649 1.696 1.868 1.946 2.09 2.23 2.352 2.415 2.547 2.657 2.817 2.934 3.048 3.21 3.367 3.522 3.664 3.804 3.987 4.143 4.288 4.458 4.624 4.811 5.032 5.263 5.481 5.717 5.984 6.262 6.544 6.881 7.279 7.649 8.07 8.562 9.169 9.813 10.504 11.301 12.135 12.734 13.035 13.137 13.104 12.999 12.882 12.754 12.643 12.514 12.394 12.283 12.145 12.012 11.902 11.787 11.658 11.551 11.465 11.363 11.244 11.142 11.039 10.938 10.858 10.78 10.686 10.586 10.486 10.412 10.331 10.191 10.096 9.986 9.928 9.825 9.714 9.583 9.511 9.35 9.287 9.203 9.124 8.929 8.811 8.694 8.575 8.454 8.284 7.997 6.994 -5 ,5922 ,KEBNE ,16679083,Thu Nov 25 05:53:49 CET,Thu Nov 25 07:20:49 CET,0.0 0.45 0.754 0.99 1.16 1.299 1.42 1.516 1.691 1.781 1.858 1.896 2.066 2.134 2.28 2.426 2.565 2.633 2.77 2.901 3.085 3.198 3.296 3.438 3.58 3.731 3.878 4.007 4.166 4.338 4.503 4.687 4.862 5.017 5.188 5.385 5.593 5.834 6.084 6.38 6.694 7.028 7.409 7.771 8.222 8.711 9.269 9.889 10.59 11.397 12.272 12.889 13.117 13.151 13.135 13.083 13.007 12.911 12.792 12.62 12.464 12.358 12.256 12.12 11.994 11.888 11.739 11.605 11.52 11.423 11.311 11.218 11.119 11.01 10.928 10.823 10.719 10.633 10.526 10.45 10.369 10.238 10.137 10.039 9.989 9.882 9.775 9.646 9.577 9.415 9.36 9.288 9.218 9.062 8.976 8.882 8.763 8.601 8.382 8.092 7.391 -6 ,25093 ,KEBNE ,16679084,Thu Nov 25 05:53:49 CET,Thu Nov 25 07:19:55 CET,0.0 0.411 0.576 0.703 0.802 0.9 1.013 1.125 1.327 1.427 1.515 1.594 1.784 1.866 2.031 2.176 2.302 2.364 2.496 2.613 2.774 2.897 3.016 3.171 3.323 3.462 3.593 3.727 3.899 4.054 4.194 4.37 4.547 4.703 4.905 5.166 5.41 5.66 5.907 6.166 6.459 6.796 7.168 7.541 7.983 8.449 8.97 9.581 10.272 11.043 11.909 12.5 12.732 12.798 12.79 12.734 12.664 12.562 12.423 12.268 12.152 12.054 11.93 11.81 11.709 11.6 11.453 11.323 11.221 11.103 10.967 10.852 10.739 10.627 10.527 10.409 10.291 10.187 10.089 10.013 9.924 9.79 9.699 9.611 9.566 9.442 9.313 9.183 9.112 8.949 8.908 8.843 8.767 8.609 8.521 8.412 8.316 8.198 8.017 7.804 7.233 -7 ,14162 ,KEBNE ,16679085,Thu Nov 25 05:53:50 CET,Thu Nov 25 07:19:36 CET,0.0 0.703 0.977 1.149 1.308 1.456 1.592 1.712 1.934 2.032 2.114 2.178 2.358 2.441 2.603 2.74 2.869 2.935 3.075 3.21 3.387 3.494 3.601 3.755 3.888 4.008 4.131 4.263 4.442 4.603 4.75 4.934 5.118 5.29 5.477 5.688 5.908 6.162 6.434 6.728 7.036 7.357 7.735 8.123 8.548 9.02 9.558 10.164 10.847 11.607 12.431 13.009 13.267 13.363 13.342 13.262 13.18 13.085 12.981 12.849 12.69 12.561 12.478 12.395 12.273 12.153 12.051 11.964 11.866 11.741 11.615 11.508 11.388 11.271 11.177 11.075 10.969 10.857 10.755 10.686 10.61 10.488 10.396 10.3 10.248 10.14 10.037 9.917 9.848 9.691 9.66 9.593 9.522 9.348 9.231 9.107 8.985 8.842 8.639 8.362 7.706 -8 ,25471 ,KEBNE ,16679086,Thu Nov 25 05:54:51 CET,Thu Nov 25 07:21:14 CET,0.0 0.575 0.836 1.003 1.134 1.265 1.385 1.485 1.654 1.746 1.834 1.886 2.062 2.141 2.296 2.432 2.555 2.615 2.727 2.835 3.005 3.126 3.244 3.399 3.549 3.686 3.811 3.937 4.105 4.263 4.411 4.595 4.782 4.958 5.152 5.374 5.605 5.871 6.128 6.399 6.672 6.957 7.298 7.673 8.149 8.647 9.208 9.836 10.506 11.287 12.174 12.706 12.9 12.976 12.94 12.844 12.75 12.648 12.556 12.433 12.301 12.168 12.017 11.891 11.789 11.69 11.546 11.403 11.299 11.18 11.059 10.959 10.836 10.713 10.619 10.528 10.432 10.313 10.19 10.111 10.025 9.878 9.776 9.674 9.625 9.53 9.437 9.33 9.261 9.098 9.036 8.948 8.863 8.682 8.588 8.49 8.374 8.216 7.984 7.727 7.083 -9 ,10439 ,KEBNE ,16679087,Thu Nov 25 05:54:55 CET,Thu Nov 25 07:21:17 CET,0.0 0.538 0.757 0.921 1.063 1.185 1.296 1.396 1.602 1.709 1.802 1.864 2.046 2.121 2.267 2.405 2.536 2.601 2.735 2.854 3.033 3.159 3.277 3.438 3.584 3.723 3.857 3.991 4.157 4.315 4.469 4.634 4.802 4.985 5.219 5.469 5.677 5.92 6.185 6.448 6.722 7.032 7.412 7.806 8.262 8.759 9.314 9.94 10.681 11.493 12.335 12.949 13.246 13.365 13.367 13.326 13.239 13.127 13.009 12.864 12.747 12.649 12.538 12.41 12.273 12.14 12.008 11.892 11.783 11.658 11.543 11.457 11.36 11.262 11.18 11.091 11.001 10.91 10.802 10.717 10.631 10.479 10.382 10.28 10.219 10.105 9.99 9.876 9.815 9.657 9.603 9.524 9.439 9.255 9.167 9.058 8.921 8.762 8.592 8.387 7.923 -10 ,738 ,KEBNE ,16679088,Thu Nov 25 05:54:51 CET,Thu Nov 25 07:24:34 CET,0.0 0.891 1.209 1.432 1.599 1.738 1.857 1.948 2.121 2.217 2.305 2.352 2.526 2.594 2.721 2.851 2.975 3.031 3.153 3.277 3.441 3.547 3.65 3.797 3.925 4.05 4.18 4.301 4.445 4.582 4.741 4.96 5.163 5.36 5.574 5.801 6.027 6.269 6.554 6.85 7.134 7.453 7.83 8.224 8.66 9.14 9.679 10.318 11.083 11.921 12.894 13.48 13.718 13.795 13.755 13.68 13.578 13.472 13.357 13.181 13.045 12.945 12.832 12.711 12.6 12.511 12.416 12.332 12.261 12.174 12.068 11.96 11.83 11.685 11.563 11.442 11.335 11.226 11.116 11.047 10.962 10.816 10.712 10.602 10.55 10.439 10.318 10.187 10.123 9.965 9.912 9.829 9.744 9.558 9.451 9.339 9.194 9.028 8.848 8.64 8.086 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5f.txt deleted file mode 100644 index 09d18849..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29110 ,KEBNE ,16679089,Thu Nov 25 05:54:51 CET,Thu Nov 25 07:24:10 CET,0.0 0.618 0.848 1.022 1.178 1.32 1.449 1.562 1.778 1.867 1.955 2.044 2.229 2.313 2.482 2.646 2.802 2.877 3.021 3.16 3.37 3.499 3.616 3.776 3.938 4.091 4.24 4.394 4.587 4.781 4.972 5.199 5.422 5.646 5.915 6.209 6.472 6.742 7.041 7.367 7.702 8.084 8.532 8.981 9.547 10.216 10.972 11.806 12.783 13.964 15.385 16.553 17.244 17.571 17.735 17.853 17.878 17.875 17.861 17.83 17.796 17.758 17.716 17.65 17.582 17.508 17.423 17.346 17.284 17.227 17.164 17.099 17.025 16.927 16.842 16.772 16.707 16.628 16.514 16.424 16.352 16.27 16.21 16.146 16.108 16.022 15.936 15.846 15.792 15.651 15.623 15.548 15.469 15.291 15.175 15.057 14.937 14.773 14.591 14.367 13.807 -2 ,12828 ,KEBNE ,16679090,Thu Nov 25 05:55:51 CET,Thu Nov 25 07:22:10 CET,0.0 0.474 0.71 0.917 1.072 1.189 1.29 1.399 1.613 1.714 1.809 1.879 2.063 2.156 2.325 2.484 2.644 2.717 2.855 2.99 3.183 3.304 3.416 3.572 3.712 3.862 4.021 4.17 4.354 4.545 4.732 4.949 5.164 5.358 5.577 5.837 6.089 6.36 6.651 6.99 7.349 7.753 8.213 8.658 9.215 9.863 10.586 11.402 12.395 13.574 15.006 16.186 16.805 17.144 17.372 17.524 17.583 17.601 17.617 17.577 17.487 17.408 17.326 17.254 17.182 17.109 17.025 16.928 16.857 16.786 16.708 16.636 16.547 16.455 16.383 16.313 16.245 16.157 16.045 15.964 15.889 15.762 15.665 15.568 15.518 15.414 15.319 15.217 15.163 15.015 14.973 14.899 14.817 14.633 14.527 14.428 14.327 14.204 14.048 13.84 13.235 -3 ,10724 ,KEBNE ,16679091,Thu Nov 25 05:55:52 CET,Thu Nov 25 07:20:58 CET,0.0 0.514 0.741 0.892 1.035 1.201 1.342 1.451 1.662 1.761 1.851 1.933 2.116 2.193 2.359 2.523 2.662 2.724 2.859 2.995 3.194 3.316 3.42 3.576 3.732 3.886 4.037 4.184 4.374 4.556 4.757 5.014 5.244 5.447 5.677 5.937 6.201 6.498 6.823 7.161 7.493 7.875 8.324 8.78 9.367 10.057 10.81 11.64 12.623 13.777 15.158 16.299 16.971 17.356 17.563 17.705 17.78 17.813 17.823 17.8 17.782 17.762 17.709 17.634 17.561 17.481 17.407 17.342 17.287 17.209 17.105 17.025 16.926 16.831 16.766 16.682 16.602 16.52 16.43 16.368 16.294 16.173 16.097 16.027 15.985 15.88 15.778 15.672 15.605 15.45 15.397 15.333 15.265 15.088 14.989 14.884 14.77 14.605 14.422 14.181 13.614 -4 ,31657 ,KEBNE ,16679092,Thu Nov 25 05:55:52 CET,Thu Nov 25 07:20:58 CET,0.0 0.597 0.787 0.941 1.103 1.248 1.369 1.488 1.715 1.814 1.914 2.017 2.213 2.309 2.499 2.658 2.806 2.88 3.018 3.14 3.311 3.434 3.568 3.749 3.9 4.041 4.196 4.363 4.56 4.742 4.92 5.125 5.329 5.555 5.829 6.11 6.368 6.641 6.935 7.273 7.634 8.036 8.518 9.01 9.581 10.195 10.914 11.748 12.738 13.935 15.352 16.479 17.155 17.53 17.742 17.892 17.978 18.022 18.023 17.989 17.927 17.882 17.848 17.772 17.691 17.629 17.554 17.488 17.428 17.372 17.313 17.248 17.175 17.094 17.028 16.948 16.878 16.821 16.734 16.659 16.585 16.466 16.389 16.305 16.25 16.149 16.045 15.924 15.868 15.725 15.679 15.607 15.538 15.386 15.293 15.176 15.041 14.888 14.704 14.488 13.682 -5 ,6755 ,KEBNE ,16679093,Thu Nov 25 05:55:52 CET,Thu Nov 25 07:23:44 CET,0.0 0.645 0.94 1.18 1.36 1.502 1.617 1.714 1.905 2.002 2.094 2.173 2.36 2.439 2.598 2.749 2.88 2.944 3.084 3.217 3.404 3.536 3.668 3.844 4.016 4.186 4.346 4.495 4.682 4.87 5.066 5.312 5.54 5.75 5.997 6.28 6.553 6.851 7.158 7.494 7.848 8.236 8.692 9.165 9.731 10.362 11.064 11.85 12.804 13.967 15.407 16.581 17.21 17.563 17.768 17.859 17.911 17.943 17.926 17.862 17.781 17.724 17.675 17.63 17.576 17.501 17.424 17.338 17.257 17.183 17.098 17.024 16.951 16.853 16.766 16.68 16.601 16.536 16.465 16.411 16.352 16.232 16.14 16.054 16.012 15.92 15.804 15.699 15.644 15.484 15.439 15.367 15.282 15.079 14.968 14.856 14.723 14.564 14.403 14.217 13.648 -6 ,12609 ,KEBNE ,16679094,Thu Nov 25 05:56:53 CET,Thu Nov 25 07:23:26 CET,0.0 0.909 1.211 1.43 1.586 1.712 1.835 1.944 2.15 2.259 2.362 2.439 2.622 2.701 2.852 3.001 3.149 3.223 3.358 3.489 3.672 3.781 3.901 4.09 4.256 4.41 4.571 4.722 4.91 5.092 5.278 5.518 5.75 5.967 6.207 6.465 6.723 7.027 7.344 7.668 8.0 8.376 8.818 9.307 9.892 10.523 11.26 12.069 13.012 14.135 15.538 16.688 17.321 17.697 17.9 18.036 18.116 18.118 18.087 18.056 18.021 17.97 17.924 17.883 17.834 17.785 17.729 17.672 17.605 17.523 17.426 17.34 17.252 17.148 17.062 16.973 16.882 16.794 16.684 16.603 16.525 16.399 16.313 16.223 16.179 16.081 15.966 15.864 15.815 15.67 15.632 15.559 15.475 15.306 15.219 15.097 14.963 14.838 14.643 14.377 13.758 -7 ,4641 ,KEBNE ,16679095,Thu Nov 25 05:56:53 CET,Thu Nov 25 07:24:00 CET,0.0 0.758 0.98 1.153 1.299 1.446 1.604 1.738 1.98 2.099 2.203 2.277 2.45 2.527 2.684 2.839 2.993 3.072 3.228 3.367 3.57 3.703 3.819 3.957 4.092 4.237 4.394 4.564 4.764 4.948 5.142 5.37 5.587 5.805 6.056 6.332 6.589 6.878 7.188 7.503 7.845 8.232 8.686 9.137 9.677 10.312 11.063 11.909 12.887 14.037 15.411 16.514 17.149 17.525 17.727 17.843 17.928 17.981 17.97 17.899 17.828 17.776 17.705 17.63 17.562 17.49 17.422 17.36 17.298 17.218 17.132 17.067 16.988 16.906 16.846 16.774 16.687 16.583 16.492 16.436 16.373 16.263 16.168 16.071 16.022 15.913 15.82 15.721 15.659 15.506 15.459 15.4 15.332 15.167 15.063 14.948 14.845 14.717 14.519 14.243 13.796 -8 ,11794 ,KEBNE ,16679096,Thu Nov 25 05:56:53 CET,Thu Nov 25 07:21:50 CET,0.0 0.485 0.712 0.896 1.067 1.222 1.36 1.494 1.72 1.811 1.902 1.977 2.161 2.238 2.402 2.563 2.704 2.773 2.911 3.05 3.245 3.363 3.48 3.656 3.819 3.978 4.137 4.284 4.479 4.689 4.901 5.15 5.371 5.571 5.821 6.112 6.36 6.624 6.937 7.279 7.636 8.038 8.506 8.974 9.517 10.125 10.818 11.624 12.582 13.714 15.098 16.253 16.93 17.304 17.529 17.677 17.76 17.783 17.761 17.744 17.726 17.68 17.606 17.543 17.485 17.426 17.337 17.235 17.163 17.089 16.999 16.922 16.835 16.751 16.69 16.614 16.539 16.456 16.361 16.295 16.229 16.129 16.053 15.964 15.921 15.836 15.735 15.632 15.58 15.429 15.382 15.316 15.237 15.052 14.955 14.845 14.723 14.599 14.451 14.211 13.664 -9 ,30427 ,KEBNE ,16679097,Thu Nov 25 05:56:53 CET,Thu Nov 25 07:22:14 CET,0.0 0.419 0.639 0.809 0.962 1.087 1.198 1.304 1.493 1.58 1.67 1.744 1.928 2.012 2.17 2.328 2.475 2.546 2.686 2.826 3.029 3.16 3.279 3.448 3.622 3.784 3.947 4.11 4.308 4.477 4.639 4.847 5.054 5.266 5.515 5.77 6.019 6.316 6.647 6.994 7.353 7.778 8.28 8.774 9.313 9.874 10.555 11.384 12.401 13.581 15.012 16.212 16.843 17.174 17.36 17.486 17.56 17.591 17.586 17.549 17.516 17.491 17.447 17.396 17.334 17.268 17.187 17.091 16.988 16.887 16.811 16.748 16.67 16.584 16.503 16.422 16.345 16.255 16.156 16.094 16.027 15.898 15.813 15.725 15.677 15.576 15.467 15.365 15.32 15.179 15.125 15.057 14.985 14.788 14.685 14.574 14.45 14.294 14.109 13.854 13.125 -10 ,9473 ,KEBNE ,16679098,Thu Nov 25 05:56:53 CET,Thu Nov 25 07:22:53 CET,0.0 0.347 0.532 0.701 0.886 1.043 1.177 1.305 1.532 1.634 1.733 1.816 2.002 2.088 2.267 2.416 2.556 2.633 2.782 2.922 3.109 3.223 3.336 3.511 3.682 3.84 4.001 4.154 4.342 4.536 4.726 4.959 5.175 5.378 5.62 5.887 6.147 6.419 6.705 7.017 7.346 7.718 8.177 8.644 9.176 9.791 10.547 11.441 12.475 13.652 15.084 16.28 16.918 17.24 17.415 17.532 17.593 17.624 17.634 17.603 17.567 17.53 17.47 17.405 17.334 17.266 17.175 17.092 17.036 16.972 16.897 16.823 16.748 16.66 16.575 16.494 16.415 16.331 16.236 16.162 16.087 15.987 15.919 15.837 15.794 15.706 15.598 15.485 15.435 15.295 15.256 15.185 15.103 14.912 14.809 14.693 14.563 14.426 14.263 14.004 13.533 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5b.txt deleted file mode 100644 index 35a94f34..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29995 ,KEBNE ,16679099,Thu Nov 25 05:56:53 CET,Thu Nov 25 07:22:43 CET,0.0 0.564 0.788 0.971 1.138 1.278 1.406 1.509 1.695 1.79 1.872 1.949 2.116 2.186 2.321 2.447 2.57 2.635 2.759 2.87 3.039 3.164 3.287 3.458 3.621 3.779 3.929 4.074 4.268 4.452 4.628 4.844 5.068 5.287 5.526 5.781 6.033 6.319 6.615 6.937 7.274 7.639 8.077 8.519 9.018 9.578 10.209 10.902 11.68 12.619 13.705 14.434 14.805 14.977 15.009 15.014 14.999 14.941 14.86 14.752 14.631 14.513 14.403 14.293 14.196 14.097 13.972 13.862 13.768 13.678 13.582 13.473 13.352 13.245 13.165 13.075 12.969 12.857 12.749 12.682 12.617 12.499 12.409 12.315 12.264 12.164 12.062 11.955 11.891 11.748 11.682 11.604 11.529 11.359 11.242 11.111 10.958 10.772 10.555 10.245 9.299 -2 ,14454 ,KEBNE ,16679100,Thu Nov 25 05:56:53 CET,Thu Nov 25 07:22:14 CET,0.0 0.6 0.833 1.006 1.178 1.344 1.476 1.595 1.808 1.899 1.996 2.096 2.267 2.343 2.48 2.615 2.744 2.808 2.947 3.093 3.297 3.408 3.502 3.653 3.809 3.964 4.117 4.257 4.433 4.619 4.813 5.019 5.215 5.424 5.656 5.925 6.199 6.473 6.76 7.096 7.45 7.856 8.319 8.762 9.281 9.85 10.494 11.217 12.067 13.078 14.235 15.086 15.516 15.704 15.749 15.735 15.686 15.622 15.575 15.494 15.395 15.288 15.189 15.095 14.994 14.904 14.782 14.683 14.609 14.525 14.431 14.335 14.233 14.126 14.031 13.943 13.866 13.774 13.651 13.556 13.465 13.324 13.229 13.142 13.099 13.01 12.902 12.78 12.72 12.58 12.525 12.464 12.393 12.213 12.097 11.974 11.857 11.702 11.479 11.173 10.31 -3 ,21266 ,KEBNE ,16679101,Thu Nov 25 05:56:53 CET,Thu Nov 25 07:22:30 CET,0.0 0.421 0.658 0.853 1.0 1.139 1.252 1.36 1.599 1.709 1.794 1.87 2.037 2.112 2.275 2.431 2.571 2.637 2.763 2.902 3.105 3.226 3.342 3.518 3.697 3.873 4.032 4.167 4.336 4.509 4.679 4.893 5.103 5.301 5.519 5.761 6.012 6.305 6.613 6.928 7.269 7.661 8.111 8.563 9.062 9.608 10.274 11.061 11.955 12.964 14.165 15.095 15.51 15.682 15.746 15.747 15.736 15.671 15.555 15.423 15.331 15.265 15.168 15.066 14.971 14.862 14.741 14.636 14.527 14.419 14.318 14.222 14.128 14.029 13.94 13.854 13.779 13.701 13.617 13.55 13.468 13.336 13.244 13.142 13.087 12.975 12.859 12.745 12.681 12.54 12.477 12.402 12.329 12.137 12.018 11.888 11.748 11.602 11.417 11.151 10.538 -4 ,3478 ,KEBNE ,16679102,Thu Nov 25 05:56:53 CET,Thu Nov 25 07:22:00 CET,0.0 0.54 0.784 0.952 1.103 1.251 1.38 1.487 1.696 1.807 1.909 2.016 2.197 2.296 2.48 2.631 2.774 2.847 2.986 3.116 3.296 3.417 3.529 3.684 3.833 3.978 4.121 4.26 4.435 4.598 4.757 4.955 5.161 5.377 5.627 5.895 6.153 6.433 6.721 7.014 7.326 7.697 8.118 8.544 9.055 9.611 10.241 10.967 11.839 12.828 13.918 14.697 15.065 15.234 15.279 15.259 15.231 15.203 15.135 15.046 14.963 14.866 14.768 14.662 14.547 14.445 14.344 14.251 14.163 14.054 13.932 13.838 13.733 13.613 13.524 13.431 13.338 13.241 13.14 13.063 12.971 12.837 12.739 12.649 12.608 12.519 12.417 12.295 12.225 12.083 12.017 11.941 11.862 11.683 11.578 11.473 11.355 11.204 11.029 10.771 10.073 -5 ,18173 ,KEBNE ,16679103,Thu Nov 25 05:57:54 CET,Thu Nov 25 07:22:52 CET,0.0 0.532 0.769 0.972 1.144 1.295 1.432 1.558 1.793 1.892 1.987 2.087 2.272 2.363 2.522 2.681 2.83 2.901 3.032 3.146 3.313 3.426 3.534 3.707 3.874 4.03 4.193 4.342 4.534 4.724 4.891 5.076 5.272 5.491 5.746 6.012 6.264 6.54 6.837 7.169 7.501 7.845 8.275 8.73 9.253 9.801 10.458 11.207 12.072 13.111 14.24 15.041 15.388 15.509 15.575 15.611 15.58 15.512 15.403 15.277 15.161 15.047 14.955 14.863 14.755 14.646 14.544 14.45 14.357 14.27 14.168 14.06 13.952 13.849 13.772 13.683 13.572 13.471 13.382 13.317 13.246 13.127 13.038 12.944 12.891 12.768 12.645 12.52 12.456 12.31 12.219 12.125 12.034 11.838 11.73 11.623 11.488 11.317 11.133 10.924 10.345 -6 ,24519 ,KEBNE ,16679104,Thu Nov 25 05:57:54 CET,Thu Nov 25 07:23:49 CET,0.0 0.654 0.963 1.17 1.329 1.459 1.584 1.713 1.942 2.039 2.139 2.234 2.397 2.473 2.61 2.733 2.853 2.917 3.046 3.179 3.371 3.488 3.602 3.772 3.933 4.079 4.224 4.367 4.533 4.716 4.893 5.09 5.293 5.478 5.687 5.934 6.179 6.455 6.748 7.045 7.367 7.751 8.198 8.619 9.116 9.679 10.3 11.013 11.854 12.778 13.793 14.565 14.933 15.094 15.167 15.185 15.097 14.979 14.873 14.768 14.679 14.576 14.462 14.35 14.24 14.132 14.028 13.921 13.824 13.739 13.648 13.554 13.46 13.357 13.272 13.188 13.092 12.998 12.895 12.811 12.726 12.586 12.478 12.368 12.315 12.223 12.129 12.015 11.946 11.804 11.744 11.671 11.588 11.404 11.307 11.206 11.096 10.961 10.774 10.531 9.938 -7 ,23184 ,KEBNE ,16679105,Thu Nov 25 05:57:54 CET,Thu Nov 25 07:22:51 CET,0.0 0.523 0.747 0.898 1.037 1.18 1.306 1.422 1.634 1.73 1.825 1.941 2.126 2.223 2.378 2.493 2.605 2.67 2.806 2.937 3.134 3.251 3.348 3.485 3.634 3.798 3.956 4.103 4.287 4.449 4.602 4.78 4.952 5.134 5.349 5.585 5.82 6.084 6.364 6.659 6.966 7.326 7.781 8.214 8.696 9.236 9.863 10.593 11.408 12.369 13.513 14.333 14.674 14.8 14.867 14.865 14.834 14.802 14.737 14.626 14.508 14.387 14.275 14.165 14.042 13.944 13.852 13.729 13.609 13.498 13.393 13.31 13.214 13.099 13.01 12.92 12.82 12.716 12.607 12.53 12.451 12.321 12.216 12.109 12.056 11.949 11.836 11.716 11.652 11.512 11.444 11.37 11.297 11.123 11.018 10.912 10.787 10.623 10.394 10.057 9.182 -8 ,21105 ,KEBNE ,16679106,Thu Nov 25 05:57:54 CET,Thu Nov 25 07:24:30 CET,0.0 0.506 0.761 0.952 1.112 1.281 1.439 1.563 1.782 1.872 1.968 2.09 2.262 2.342 2.508 2.667 2.813 2.875 2.993 3.108 3.281 3.407 3.526 3.699 3.854 3.992 4.134 4.272 4.453 4.625 4.784 4.988 5.194 5.381 5.592 5.846 6.096 6.376 6.691 7.016 7.353 7.735 8.141 8.555 9.048 9.578 10.205 10.95 11.8 12.791 13.934 14.764 15.144 15.325 15.406 15.383 15.319 15.278 15.209 15.111 15.017 14.916 14.815 14.711 14.609 14.502 14.384 14.268 14.167 14.059 13.931 13.825 13.723 13.612 13.517 13.417 13.308 13.2 13.084 13.001 12.919 12.786 12.7 12.608 12.554 12.447 12.347 12.231 12.162 12.02 11.963 11.897 11.821 11.629 11.515 11.389 11.253 11.12 10.966 10.737 10.283 -9 ,11573 ,KEBNE ,16679107,Thu Nov 25 05:57:54 CET,Thu Nov 25 07:23:04 CET,0.0 0.548 0.757 0.945 1.139 1.303 1.445 1.585 1.834 1.94 2.038 2.134 2.3 2.376 2.534 2.679 2.831 2.905 3.029 3.153 3.345 3.466 3.59 3.775 3.958 4.121 4.258 4.392 4.575 4.749 4.899 5.082 5.261 5.455 5.703 5.959 6.193 6.483 6.813 7.126 7.454 7.828 8.263 8.716 9.232 9.79 10.423 11.159 12.0 12.967 14.116 14.902 15.233 15.412 15.509 15.523 15.472 15.391 15.281 15.172 15.087 14.985 14.88 14.781 14.69 14.601 14.489 14.383 14.285 14.174 14.063 13.973 13.877 13.775 13.701 13.616 13.521 13.423 13.319 13.238 13.151 13.027 12.939 12.847 12.787 12.667 12.561 12.459 12.407 12.272 12.215 12.152 12.083 11.909 11.802 11.677 11.547 11.427 11.269 11.068 10.484 -10 ,18714 ,KEBNE ,16679108,Thu Nov 25 05:59:56 CET,Thu Nov 25 07:26:07 CET,0.0 0.689 0.963 1.141 1.309 1.467 1.591 1.703 1.895 1.977 2.056 2.141 2.305 2.383 2.531 2.645 2.77 2.838 2.971 3.102 3.287 3.397 3.506 3.668 3.811 3.968 4.134 4.277 4.469 4.661 4.834 5.039 5.239 5.436 5.668 5.92 6.159 6.429 6.713 7.021 7.359 7.728 8.135 8.548 9.044 9.618 10.297 11.045 11.881 12.831 13.917 14.7 15.028 15.191 15.222 15.188 15.153 15.102 15.053 14.963 14.866 14.791 14.711 14.624 14.524 14.423 14.313 14.188 14.078 13.98 13.858 13.735 13.616 13.497 13.406 13.323 13.225 13.11 12.997 12.921 12.84 12.705 12.602 12.505 12.459 12.37 12.279 12.173 12.11 11.958 11.869 11.79 11.705 11.5 11.373 11.251 11.132 10.992 10.844 10.681 9.981 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5f.txt deleted file mode 100644 index 063df226..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19751 ,KEBNE ,16679109,Thu Nov 25 05:59:56 CET,Thu Nov 25 07:25:31 CET,0.0 0.697 0.986 1.175 1.303 1.418 1.535 1.644 1.818 1.903 1.985 2.041 2.194 2.266 2.408 2.531 2.656 2.715 2.817 2.915 3.067 3.161 3.246 3.365 3.47 3.569 3.665 3.763 3.907 4.039 4.168 4.319 4.436 4.545 4.675 4.818 4.975 5.154 5.313 5.479 5.659 5.871 6.155 6.403 6.609 6.791 7.014 7.261 7.427 7.435 7.171 6.643 6.134 5.669 5.239 4.833 4.465 4.109 3.785 3.466 3.208 2.978 2.745 2.507 2.293 2.104 1.908 1.754 1.623 1.477 1.326 1.206 1.059 0.876 0.737 0.598 0.447 0.307 0.179 0.074 -0.046 -0.222 -0.335 -0.452 -0.516 -0.654 -0.794 -0.939 -1.018 -1.181 -1.242 -1.322 -1.402 -1.591 -1.699 -1.819 -1.96 -2.1 -2.277 -2.565 -3.286 -2 ,2468 ,KEBNE ,16679110,Thu Nov 25 05:59:56 CET,Thu Nov 25 07:26:15 CET,0.0 0.405 0.564 0.73 0.885 1.015 1.131 1.233 1.435 1.529 1.617 1.692 1.842 1.904 2.02 2.133 2.235 2.29 2.412 2.516 2.644 2.723 2.808 2.936 3.063 3.193 3.314 3.411 3.521 3.642 3.778 3.946 4.086 4.206 4.35 4.507 4.654 4.808 4.965 5.125 5.28 5.466 5.69 5.888 6.093 6.303 6.516 6.722 6.904 6.988 6.828 6.382 5.887 5.413 4.979 4.566 4.2 3.847 3.54 3.237 2.933 2.626 2.365 2.138 1.917 1.701 1.48 1.301 1.149 0.995 0.827 0.675 0.526 0.389 0.28 0.153 0.012 -0.123 -0.262 -0.367 -0.464 -0.625 -0.748 -0.869 -0.93 -1.054 -1.194 -1.348 -1.428 -1.6 -1.682 -1.767 -1.863 -2.094 -2.22 -2.345 -2.471 -2.611 -2.799 -3.083 -3.954 -3 ,25246 ,KEBNE ,16679111,Thu Nov 25 05:59:57 CET,Thu Nov 25 07:25:46 CET,0.0 0.525 0.723 0.887 1.044 1.165 1.259 1.351 1.541 1.627 1.702 1.778 1.941 2.014 2.158 2.283 2.394 2.446 2.549 2.649 2.81 2.912 2.996 3.11 3.233 3.358 3.467 3.566 3.689 3.817 3.945 4.087 4.21 4.331 4.463 4.606 4.754 4.915 5.097 5.281 5.455 5.649 5.863 6.09 6.333 6.538 6.742 6.942 7.062 7.09 6.915 6.413 5.906 5.406 4.933 4.501 4.112 3.753 3.451 3.14 2.817 2.539 2.31 2.09 1.876 1.671 1.452 1.26 1.105 0.941 0.751 0.597 0.434 0.264 0.135 -0.004 -0.129 -0.261 -0.418 -0.521 -0.619 -0.785 -0.904 -1.02 -1.079 -1.203 -1.35 -1.503 -1.571 -1.733 -1.822 -1.918 -2.002 -2.166 -2.276 -2.407 -2.543 -2.712 -2.899 -3.142 -4.004 -4 ,29286 ,KEBNE ,16679112,Thu Nov 25 05:59:56 CET,Thu Nov 25 07:26:34 CET,0.0 0.601 0.883 1.069 1.228 1.367 1.472 1.579 1.767 1.85 1.937 2.004 2.163 2.231 2.349 2.467 2.589 2.645 2.741 2.821 2.945 3.039 3.13 3.245 3.354 3.455 3.567 3.682 3.818 3.941 4.049 4.163 4.266 4.38 4.516 4.67 4.833 4.994 5.15 5.327 5.511 5.717 5.941 6.139 6.348 6.527 6.699 6.879 7.057 7.129 6.892 6.358 5.836 5.368 4.938 4.541 4.193 3.867 3.574 3.275 3.007 2.774 2.543 2.3 2.067 1.871 1.673 1.483 1.298 1.126 0.971 0.831 0.679 0.506 0.367 0.229 0.081 -0.083 -0.242 -0.347 -0.453 -0.618 -0.731 -0.844 -0.902 -1.035 -1.177 -1.321 -1.404 -1.576 -1.654 -1.752 -1.854 -2.049 -2.16 -2.276 -2.394 -2.531 -2.684 -2.922 -3.625 -5 ,9448 ,KEBNE ,16679113,Thu Nov 25 05:59:56 CET,Thu Nov 25 07:28:31 CET,0.0 0.735 1.014 1.215 1.352 1.451 1.551 1.652 1.842 1.929 2.001 2.045 2.195 2.257 2.379 2.496 2.598 2.653 2.767 2.868 3.004 3.092 3.184 3.303 3.406 3.504 3.607 3.706 3.834 3.956 4.062 4.18 4.29 4.413 4.56 4.711 4.877 5.046 5.2 5.383 5.572 5.801 6.099 6.354 6.564 6.778 7.001 7.178 7.339 7.376 7.188 6.76 6.247 5.758 5.311 4.884 4.513 4.186 3.893 3.563 3.269 3.01 2.757 2.531 2.347 2.194 1.997 1.805 1.656 1.481 1.285 1.132 0.988 0.842 0.727 0.599 0.463 0.343 0.206 0.098 -0.006 -0.158 -0.269 -0.393 -0.454 -0.579 -0.719 -0.881 -0.96 -1.118 -1.191 -1.281 -1.382 -1.627 -1.782 -1.925 -2.041 -2.182 -2.348 -2.59 -3.208 -6 ,6068 ,KEBNE ,16679114,Thu Nov 25 06:00:58 CET,Thu Nov 25 07:27:40 CET,0.0 0.487 0.707 0.88 1.03 1.171 1.289 1.387 1.567 1.652 1.737 1.808 1.965 2.028 2.154 2.286 2.394 2.443 2.543 2.645 2.786 2.865 2.941 3.057 3.183 3.29 3.386 3.489 3.609 3.721 3.834 3.964 4.079 4.196 4.324 4.47 4.621 4.788 4.965 5.159 5.35 5.51 5.694 5.91 6.169 6.384 6.585 6.779 6.919 6.963 6.799 6.368 5.883 5.407 4.963 4.561 4.184 3.829 3.519 3.199 2.907 2.659 2.414 2.17 1.956 1.752 1.528 1.339 1.187 1.036 0.88 0.754 0.621 0.468 0.337 0.19 0.052 -0.086 -0.225 -0.32 -0.426 -0.584 -0.689 -0.807 -0.874 -1.004 -1.141 -1.294 -1.367 -1.526 -1.617 -1.715 -1.813 -2.0 -2.101 -2.232 -2.382 -2.545 -2.777 -3.056 -3.701 -7 ,4630 ,KEBNE ,16679115,Thu Nov 25 06:00:58 CET,Thu Nov 25 07:27:02 CET,0.0 0.375 0.542 0.704 0.844 0.966 1.09 1.191 1.358 1.437 1.515 1.584 1.743 1.815 1.928 2.016 2.103 2.151 2.256 2.351 2.487 2.578 2.671 2.814 2.94 3.061 3.179 3.284 3.408 3.527 3.645 3.778 3.902 4.029 4.166 4.302 4.427 4.563 4.713 4.866 5.017 5.193 5.412 5.61 5.817 6.042 6.292 6.534 6.719 6.808 6.631 6.162 5.652 5.135 4.656 4.229 3.839 3.469 3.15 2.83 2.563 2.343 2.125 1.91 1.72 1.536 1.348 1.173 0.999 0.829 0.652 0.51 0.381 0.235 0.105 -0.023 -0.152 -0.311 -0.473 -0.577 -0.693 -0.875 -0.99 -1.102 -1.16 -1.28 -1.414 -1.561 -1.636 -1.796 -1.864 -1.954 -2.049 -2.259 -2.379 -2.507 -2.629 -2.769 -2.988 -3.308 -4.234 -8 ,5680 ,KEBNE ,16679116,Thu Nov 25 06:00:58 CET,Thu Nov 25 07:28:03 CET,0.0 0.468 0.68 0.839 0.995 1.143 1.262 1.363 1.569 1.657 1.73 1.8 1.954 2.019 2.164 2.303 2.424 2.48 2.594 2.702 2.848 2.938 3.021 3.148 3.258 3.36 3.471 3.576 3.712 3.832 3.945 4.084 4.219 4.351 4.486 4.617 4.749 4.912 5.101 5.288 5.458 5.671 5.908 6.116 6.332 6.539 6.765 6.987 7.159 7.255 7.112 6.604 6.067 5.559 5.079 4.64 4.268 3.921 3.598 3.28 2.999 2.749 2.516 2.259 2.034 1.866 1.682 1.5 1.346 1.175 0.989 0.836 0.661 0.485 0.366 0.253 0.127 -0.011 -0.148 -0.241 -0.336 -0.486 -0.593 -0.707 -0.775 -0.921 -1.065 -1.213 -1.283 -1.441 -1.507 -1.594 -1.694 -1.901 -2.011 -2.133 -2.256 -2.4 -2.577 -2.782 -3.324 -9 ,32239 ,KEBNE ,16679117,Thu Nov 25 06:00:58 CET,Thu Nov 25 07:27:18 CET,0.0 0.476 0.678 0.832 0.976 1.1 1.205 1.312 1.524 1.622 1.707 1.761 1.913 1.994 2.142 2.276 2.4 2.451 2.559 2.673 2.827 2.907 2.981 3.101 3.231 3.359 3.476 3.579 3.694 3.814 3.93 4.047 4.164 4.281 4.42 4.6 4.756 4.923 5.114 5.271 5.424 5.594 5.764 5.937 6.13 6.327 6.549 6.763 6.902 6.921 6.699 6.217 5.694 5.201 4.785 4.391 4.003 3.656 3.333 3.001 2.739 2.503 2.273 2.045 1.831 1.614 1.402 1.239 1.075 0.906 0.742 0.6 0.459 0.305 0.18 0.054 -0.074 -0.199 -0.335 -0.439 -0.549 -0.71 -0.822 -0.943 -1.003 -1.125 -1.267 -1.414 -1.486 -1.654 -1.746 -1.841 -1.94 -2.154 -2.28 -2.416 -2.554 -2.696 -2.847 -3.092 -3.705 -10 ,3845 ,KEBNE ,16679118,Thu Nov 25 06:00:57 CET,Thu Nov 25 07:27:18 CET,0.0 0.465 0.678 0.878 1.031 1.141 1.257 1.372 1.557 1.637 1.719 1.792 1.943 2.001 2.116 2.222 2.331 2.387 2.496 2.604 2.751 2.829 2.909 3.041 3.174 3.309 3.421 3.512 3.632 3.744 3.855 3.998 4.127 4.251 4.397 4.543 4.689 4.861 5.026 5.193 5.406 5.626 5.832 6.059 6.277 6.457 6.646 6.857 7.044 7.137 6.979 6.483 5.957 5.494 5.055 4.642 4.272 3.922 3.615 3.327 3.075 2.836 2.587 2.354 2.157 1.979 1.801 1.652 1.517 1.361 1.191 1.039 0.879 0.72 0.595 0.466 0.331 0.179 0.027 -0.065 -0.169 -0.335 -0.439 -0.555 -0.619 -0.744 -0.867 -1.009 -1.086 -1.248 -1.329 -1.418 -1.524 -1.764 -1.881 -2.009 -2.16 -2.308 -2.485 -2.746 -3.398 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5j.txt deleted file mode 100644 index 681a56e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17271 ,KEBNE ,16679119,Thu Nov 25 06:02:59 CET,Thu Nov 25 07:29:21 CET,0.0 0.322 0.543 0.712 0.879 1.035 1.152 1.26 1.466 1.561 1.649 1.738 1.91 1.987 2.127 2.261 2.399 2.466 2.591 2.714 2.883 2.989 3.091 3.24 3.391 3.535 3.662 3.798 3.993 4.177 4.351 4.55 4.736 4.908 5.102 5.324 5.543 5.758 6.01 6.301 6.584 6.9 7.251 7.585 7.962 8.379 8.86 9.373 9.908 10.456 10.984 11.283 11.308 11.197 10.986 10.728 10.519 10.284 10.063 9.856 9.66 9.479 9.295 9.092 8.898 8.74 8.577 8.441 8.32 8.177 8.034 7.912 7.785 7.66 7.556 7.437 7.31 7.185 7.056 6.97 6.868 6.706 6.608 6.504 6.456 6.353 6.227 6.101 6.037 5.889 5.82 5.745 5.664 5.484 5.39 5.294 5.184 5.044 4.868 4.654 4.139 -2 ,30552 ,KEBNE ,16679120,Thu Nov 25 06:02:59 CET,Thu Nov 25 07:30:10 CET,0.0 0.591 0.81 0.983 1.115 1.241 1.362 1.487 1.726 1.829 1.927 2.02 2.187 2.264 2.413 2.551 2.681 2.743 2.874 3.001 3.178 3.289 3.386 3.53 3.678 3.822 3.95 4.073 4.244 4.414 4.566 4.741 4.911 5.089 5.293 5.514 5.729 5.945 6.207 6.496 6.774 7.086 7.478 7.871 8.263 8.664 9.126 9.649 10.196 10.748 11.312 11.589 11.557 11.416 11.257 11.066 10.858 10.649 10.438 10.213 10.012 9.837 9.661 9.483 9.318 9.139 8.946 8.782 8.641 8.494 8.341 8.204 8.058 7.921 7.814 7.693 7.573 7.458 7.341 7.252 7.161 7.03 6.939 6.843 6.79 6.677 6.544 6.412 6.345 6.191 6.119 6.036 5.943 5.75 5.659 5.553 5.44 5.316 5.176 4.984 4.459 -3 ,21484 ,KEBNE ,16679121,Thu Nov 25 06:03:00 CET,Thu Nov 25 07:29:42 CET,0.0 0.385 0.618 0.781 0.943 1.092 1.212 1.325 1.534 1.634 1.727 1.808 1.975 2.052 2.193 2.323 2.454 2.518 2.639 2.762 2.941 3.054 3.162 3.328 3.483 3.622 3.765 3.902 4.086 4.27 4.444 4.651 4.841 5.014 5.199 5.393 5.595 5.829 6.091 6.372 6.646 6.928 7.245 7.588 7.978 8.377 8.84 9.333 9.909 10.55 11.127 11.391 11.414 11.317 11.156 10.971 10.787 10.574 10.377 10.176 9.993 9.819 9.638 9.461 9.293 9.139 8.975 8.834 8.704 8.559 8.413 8.286 8.156 8.023 7.92 7.81 7.703 7.604 7.503 7.431 7.355 7.22 7.116 7.021 6.975 6.87 6.743 6.619 6.552 6.4 6.345 6.267 6.179 5.984 5.878 5.781 5.667 5.508 5.291 5.015 4.242 -4 ,1247 ,KEBNE ,16679122,Thu Nov 25 06:04:00 CET,Thu Nov 25 07:32:15 CET,0.0 0.667 0.914 1.083 1.246 1.375 1.491 1.609 1.802 1.889 1.98 2.067 2.229 2.303 2.448 2.598 2.748 2.815 2.932 3.035 3.197 3.307 3.417 3.576 3.718 3.859 4.003 4.139 4.307 4.469 4.628 4.807 4.971 5.127 5.327 5.576 5.804 6.024 6.251 6.507 6.778 7.056 7.383 7.717 8.091 8.503 8.982 9.509 10.08 10.655 11.168 11.405 11.415 11.288 11.078 10.845 10.627 10.441 10.277 10.057 9.842 9.67 9.515 9.367 9.233 9.094 8.941 8.811 8.678 8.55 8.423 8.296 8.164 8.034 7.921 7.8 7.694 7.568 7.43 7.338 7.252 7.128 7.03 6.931 6.879 6.76 6.639 6.526 6.466 6.313 6.209 6.111 6.024 5.859 5.765 5.657 5.533 5.388 5.23 5.089 4.813 -5 ,3223 ,KEBNE ,16679123,Thu Nov 25 06:07:04 CET,Thu Nov 25 07:31:31 CET,0.0 0.647 0.86 1.026 1.164 1.3 1.418 1.537 1.797 1.908 1.998 2.084 2.256 2.331 2.475 2.62 2.759 2.829 2.958 3.072 3.244 3.358 3.468 3.624 3.769 3.895 4.022 4.156 4.31 4.465 4.638 4.849 5.053 5.225 5.405 5.617 5.813 6.02 6.252 6.514 6.78 7.078 7.398 7.74 8.158 8.567 9.007 9.483 10.01 10.576 11.105 11.383 11.352 11.126 10.891 10.699 10.502 10.292 10.105 9.92 9.745 9.566 9.399 9.26 9.123 8.962 8.786 8.63 8.488 8.342 8.179 8.036 7.898 7.771 7.678 7.57 7.448 7.319 7.188 7.095 6.996 6.843 6.736 6.63 6.579 6.47 6.337 6.182 6.11 5.974 5.924 5.84 5.748 5.56 5.455 5.34 5.214 5.071 4.918 4.768 4.477 -6 ,16872 ,KEBNE ,16679124,Thu Nov 25 06:07:04 CET,Thu Nov 25 07:33:00 CET,0.0 0.399 0.691 0.903 1.051 1.175 1.291 1.4 1.577 1.668 1.754 1.814 1.986 2.077 2.233 2.371 2.502 2.563 2.678 2.793 2.972 3.084 3.184 3.325 3.469 3.622 3.784 3.935 4.094 4.239 4.39 4.575 4.748 4.902 5.084 5.293 5.492 5.734 6.001 6.266 6.533 6.836 7.17 7.509 7.93 8.363 8.844 9.381 9.949 10.49 10.996 11.208 11.158 10.997 10.779 10.566 10.393 10.22 10.043 9.844 9.669 9.506 9.32 9.151 8.988 8.828 8.686 8.564 8.451 8.31 8.166 8.054 7.939 7.811 7.698 7.595 7.49 7.378 7.262 7.179 7.085 6.937 6.842 6.747 6.698 6.596 6.491 6.362 6.293 6.143 6.076 6.007 5.926 5.718 5.591 5.459 5.312 5.153 4.979 4.727 4.156 -7 ,3193 ,KEBNE ,16679125,Thu Nov 25 06:08:09 CET,Thu Nov 25 07:32:56 CET,0.0 0.662 0.896 1.044 1.169 1.274 1.382 1.504 1.705 1.791 1.877 1.961 2.123 2.196 2.368 2.541 2.686 2.747 2.855 2.968 3.156 3.274 3.387 3.537 3.674 3.805 3.937 4.077 4.255 4.411 4.553 4.722 4.896 5.086 5.3 5.529 5.76 6.01 6.265 6.531 6.796 7.077 7.396 7.737 8.124 8.533 9.023 9.593 10.201 10.827 11.374 11.56 11.525 11.437 11.284 11.049 10.836 10.641 10.445 10.22 10.021 9.871 9.727 9.573 9.416 9.27 9.131 8.995 8.86 8.725 8.579 8.452 8.304 8.137 8.016 7.888 7.757 7.635 7.499 7.407 7.319 7.167 7.057 6.942 6.884 6.767 6.648 6.521 6.455 6.313 6.249 6.168 6.082 5.881 5.767 5.651 5.535 5.386 5.203 4.978 4.582 -8 ,18779 ,KEBNE ,16679126,Thu Nov 25 06:09:06 CET,Thu Nov 25 07:34:13 CET,0.0 0.59 0.845 1.045 1.191 1.298 1.392 1.489 1.686 1.787 1.884 1.978 2.148 2.228 2.374 2.501 2.624 2.69 2.808 2.91 3.072 3.181 3.286 3.438 3.573 3.705 3.84 3.97 4.148 4.324 4.466 4.626 4.796 4.97 5.169 5.384 5.601 5.851 6.108 6.377 6.678 7.034 7.42 7.745 8.143 8.608 9.098 9.652 10.229 10.802 11.42 11.676 11.68 11.604 11.479 11.33 11.148 10.958 10.775 10.55 10.362 10.204 10.002 9.818 9.665 9.517 9.363 9.22 9.094 8.96 8.819 8.703 8.589 8.464 8.362 8.254 8.148 8.04 7.919 7.83 7.737 7.593 7.492 7.379 7.323 7.221 7.11 6.993 6.935 6.785 6.705 6.622 6.549 6.405 6.317 6.225 6.124 6.002 5.874 5.676 5.259 -9 ,28091 ,KEBNE ,16679127,Thu Nov 25 06:09:07 CET,Thu Nov 25 07:38:31 CET,0.0 0.602 0.86 1.055 1.215 1.352 1.491 1.603 1.784 1.872 1.955 2.042 2.22 2.298 2.443 2.584 2.712 2.774 2.889 2.996 3.175 3.296 3.397 3.547 3.692 3.822 3.949 4.073 4.233 4.379 4.533 4.732 4.925 5.128 5.36 5.597 5.81 6.041 6.289 6.558 6.826 7.119 7.443 7.776 8.181 8.608 9.083 9.601 10.141 10.681 11.274 11.589 11.581 11.408 11.173 10.963 10.762 10.516 10.305 10.1 9.924 9.769 9.595 9.419 9.263 9.12 8.964 8.814 8.678 8.535 8.387 8.269 8.161 8.049 7.956 7.855 7.748 7.632 7.51 7.429 7.348 7.216 7.123 7.024 6.97 6.862 6.736 6.592 6.513 6.355 6.298 6.226 6.136 5.929 5.82 5.705 5.584 5.438 5.254 5.024 4.495 -10 ,29048 ,KEBNE ,16679128,Thu Nov 25 06:10:12 CET,Thu Nov 25 07:31:58 CET,0.0 0.376 0.594 0.746 0.883 1.0 1.133 1.242 1.415 1.516 1.609 1.68 1.844 1.92 2.055 2.207 2.34 2.395 2.504 2.609 2.784 2.896 3.003 3.169 3.329 3.484 3.629 3.76 3.938 4.114 4.278 4.464 4.636 4.811 5.028 5.273 5.499 5.749 6.021 6.307 6.581 6.882 7.228 7.562 7.95 8.346 8.761 9.23 9.758 10.28 10.791 11.083 11.057 10.946 10.82 10.639 10.449 10.242 10.042 9.845 9.674 9.519 9.361 9.178 8.983 8.817 8.66 8.512 8.38 8.257 8.134 8.007 7.88 7.758 7.646 7.535 7.434 7.333 7.228 7.147 7.059 6.919 6.82 6.713 6.66 6.557 6.43 6.297 6.23 6.075 6.015 5.954 5.885 5.714 5.611 5.492 5.368 5.205 4.997 4.772 4.368 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5k.txt deleted file mode 100644 index 02953612..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21649 ,KEBNE ,16679129,Thu Nov 25 06:11:09 CET,Thu Nov 25 07:36:34 CET,0.0 0.504 0.721 0.901 1.057 1.186 1.314 1.427 1.605 1.69 1.775 1.835 2.003 2.069 2.196 2.308 2.414 2.47 2.568 2.65 2.769 2.848 2.926 3.041 3.152 3.253 3.361 3.47 3.608 3.725 3.826 3.942 4.047 4.156 4.291 4.445 4.57 4.717 4.879 5.027 5.203 5.403 5.586 5.745 5.917 6.081 6.253 6.412 6.551 6.574 6.354 5.801 5.167 4.604 4.101 3.632 3.207 2.831 2.472 2.086 1.761 1.454 1.155 0.899 0.668 0.421 0.155 -0.077 -0.269 -0.482 -0.721 -0.9 -1.081 -1.275 -1.429 -1.585 -1.742 -1.91 -2.089 -2.213 -2.344 -2.571 -2.72 -2.866 -2.946 -3.107 -3.273 -3.442 -3.538 -3.749 -3.841 -3.942 -4.053 -4.298 -4.443 -4.6 -4.775 -4.968 -5.239 -5.601 -6.457 -2 ,15724 ,KEBNE ,16679130,Thu Nov 25 06:11:09 CET,Thu Nov 25 07:38:53 CET,0.0 0.553 0.784 0.934 1.072 1.209 1.342 1.459 1.632 1.708 1.779 1.818 1.982 2.046 2.171 2.29 2.398 2.45 2.556 2.659 2.793 2.869 2.947 3.077 3.197 3.312 3.416 3.512 3.645 3.758 3.865 3.997 4.11 4.223 4.368 4.531 4.697 4.871 5.024 5.181 5.341 5.513 5.72 5.934 6.134 6.308 6.502 6.651 6.749 6.798 6.537 6.01 5.507 4.955 4.428 3.948 3.503 3.099 2.723 2.335 2.016 1.718 1.436 1.158 0.874 0.64 0.423 0.228 0.051 -0.135 -0.343 -0.533 -0.719 -0.897 -1.044 -1.202 -1.352 -1.506 -1.674 -1.8 -1.929 -2.117 -2.253 -2.399 -2.473 -2.621 -2.766 -2.916 -3.007 -3.212 -3.31 -3.414 -3.523 -3.76 -3.893 -4.044 -4.216 -4.43 -4.676 -4.997 -5.899 -3 ,11359 ,KEBNE ,16679131,Thu Nov 25 06:11:09 CET,Thu Nov 25 07:39:19 CET,0.0 0.307 0.452 0.607 0.737 0.863 0.995 1.105 1.276 1.349 1.414 1.458 1.62 1.687 1.813 1.934 2.037 2.075 2.162 2.261 2.393 2.47 2.537 2.627 2.723 2.818 2.915 3.013 3.123 3.239 3.358 3.495 3.621 3.741 3.87 3.99 4.1 4.219 4.364 4.521 4.671 4.842 5.044 5.226 5.433 5.625 5.783 5.928 6.051 6.038 5.766 5.241 4.648 4.128 3.607 3.105 2.652 2.207 1.811 1.444 1.134 0.821 0.505 0.22 -0.024 -0.241 -0.464 -0.664 -0.842 -1.039 -1.248 -1.416 -1.59 -1.77 -1.909 -2.05 -2.194 -2.341 -2.502 -2.62 -2.741 -2.926 -3.056 -3.194 -3.265 -3.412 -3.584 -3.764 -3.851 -4.044 -4.142 -4.249 -4.356 -4.588 -4.719 -4.856 -4.988 -5.151 -5.39 -5.691 -6.303 -4 ,12453 ,KEBNE ,16679132,Thu Nov 25 06:11:09 CET,Thu Nov 25 07:36:18 CET,0.0 0.704 0.959 1.125 1.259 1.374 1.474 1.573 1.763 1.846 1.921 1.957 2.121 2.187 2.296 2.4 2.514 2.564 2.655 2.75 2.887 2.977 3.062 3.179 3.283 3.382 3.474 3.563 3.682 3.803 3.921 4.052 4.167 4.267 4.385 4.52 4.649 4.779 4.912 5.058 5.222 5.411 5.621 5.793 5.967 6.168 6.357 6.525 6.634 6.626 6.357 5.74 5.148 4.611 4.112 3.641 3.179 2.741 2.372 2.005 1.684 1.376 1.094 0.845 0.614 0.398 0.166 -0.054 -0.25 -0.433 -0.642 -0.838 -1.053 -1.256 -1.389 -1.529 -1.673 -1.823 -1.99 -2.114 -2.229 -2.421 -2.569 -2.719 -2.793 -2.937 -3.081 -3.238 -3.324 -3.512 -3.589 -3.685 -3.786 -4.012 -4.15 -4.315 -4.497 -4.677 -4.885 -5.146 -5.796 -5 ,18944 ,KEBNE ,16679133,Thu Nov 25 06:11:13 CET,Thu Nov 25 07:35:41 CET,0.0 0.627 0.904 1.084 1.242 1.373 1.469 1.558 1.754 1.842 1.922 1.976 2.131 2.188 2.316 2.446 2.574 2.63 2.725 2.818 2.949 3.023 3.093 3.211 3.336 3.453 3.554 3.66 3.798 3.928 4.054 4.193 4.315 4.437 4.59 4.738 4.854 4.985 5.144 5.315 5.49 5.643 5.799 5.977 6.166 6.355 6.545 6.687 6.779 6.764 6.478 5.903 5.355 4.775 4.196 3.671 3.202 2.772 2.404 2.032 1.714 1.434 1.149 0.863 0.587 0.347 0.122 -0.075 -0.251 -0.435 -0.625 -0.783 -0.941 -1.107 -1.245 -1.392 -1.544 -1.711 -1.879 -1.992 -2.111 -2.296 -2.425 -2.565 -2.641 -2.795 -2.959 -3.137 -3.232 -3.427 -3.496 -3.585 -3.692 -3.938 -4.082 -4.24 -4.421 -4.627 -4.886 -5.245 -5.921 -6 ,9477 ,KEBNE ,16679134,Thu Nov 25 06:13:11 CET,Thu Nov 25 07:38:47 CET,0.0 0.729 0.994 1.173 1.308 1.429 1.551 1.652 1.821 1.902 1.983 2.036 2.192 2.246 2.36 2.459 2.553 2.603 2.697 2.789 2.932 3.018 3.09 3.204 3.313 3.42 3.529 3.627 3.749 3.866 3.981 4.11 4.232 4.357 4.5 4.653 4.806 4.973 5.138 5.312 5.472 5.632 5.811 6.0 6.201 6.38 6.542 6.682 6.777 6.732 6.427 5.883 5.289 4.72 4.212 3.726 3.288 2.877 2.502 2.106 1.767 1.489 1.209 0.939 0.695 0.471 0.235 0.023 -0.161 -0.362 -0.579 -0.759 -0.946 -1.149 -1.302 -1.455 -1.615 -1.779 -1.948 -2.066 -2.192 -2.397 -2.533 -2.678 -2.753 -2.91 -3.07 -3.233 -3.321 -3.511 -3.597 -3.713 -3.835 -4.047 -4.16 -4.296 -4.468 -4.661 -4.88 -5.17 -5.811 -7 ,14587 ,KEBNE ,16679135,Thu Nov 25 06:13:12 CET,Thu Nov 25 07:39:01 CET,0.0 0.549 0.787 0.957 1.088 1.193 1.278 1.369 1.546 1.625 1.699 1.741 1.903 1.963 2.069 2.174 2.267 2.311 2.413 2.501 2.629 2.723 2.799 2.908 3.025 3.147 3.267 3.372 3.495 3.613 3.714 3.835 3.958 4.066 4.209 4.375 4.513 4.663 4.814 4.97 5.136 5.315 5.508 5.665 5.83 5.996 6.183 6.422 6.609 6.618 6.417 5.911 5.298 4.741 4.24 3.706 3.197 2.764 2.403 2.041 1.723 1.43 1.151 0.881 0.621 0.375 0.11 -0.128 -0.338 -0.554 -0.766 -0.934 -1.108 -1.303 -1.465 -1.635 -1.808 -1.982 -2.158 -2.268 -2.384 -2.567 -2.692 -2.839 -2.921 -3.087 -3.239 -3.411 -3.514 -3.715 -3.817 -3.932 -4.051 -4.299 -4.441 -4.608 -4.783 -4.972 -5.228 -5.513 -6.364 -8 ,17173 ,KEBNE ,16679136,Thu Nov 25 06:13:12 CET,Thu Nov 25 07:39:41 CET,0.0 0.421 0.623 0.769 0.902 1.038 1.175 1.288 1.47 1.554 1.632 1.687 1.853 1.914 2.042 2.157 2.262 2.319 2.425 2.523 2.672 2.759 2.836 2.95 3.067 3.184 3.287 3.383 3.506 3.607 3.688 3.793 3.906 4.017 4.156 4.332 4.501 4.655 4.809 4.969 5.113 5.265 5.423 5.579 5.756 5.918 6.094 6.249 6.333 6.305 6.07 5.526 4.947 4.406 3.898 3.433 3.006 2.572 2.187 1.838 1.521 1.206 0.906 0.618 0.357 0.117 -0.127 -0.322 -0.513 -0.719 -0.906 -1.069 -1.235 -1.405 -1.566 -1.724 -1.865 -2.029 -2.218 -2.342 -2.459 -2.631 -2.747 -2.874 -2.942 -3.085 -3.236 -3.397 -3.483 -3.675 -3.785 -3.896 -4.013 -4.266 -4.401 -4.543 -4.69 -4.864 -5.049 -5.293 -5.973 -9 ,14222 ,KEBNE ,16679137,Thu Nov 25 06:13:11 CET,Thu Nov 25 07:39:21 CET,0.0 0.559 0.801 0.973 1.089 1.196 1.304 1.404 1.609 1.708 1.798 1.86 2.023 2.089 2.222 2.341 2.448 2.502 2.599 2.684 2.81 2.898 2.981 3.083 3.196 3.327 3.443 3.537 3.647 3.756 3.865 3.998 4.133 4.243 4.364 4.508 4.631 4.755 4.883 5.015 5.137 5.279 5.472 5.664 5.839 5.978 6.152 6.34 6.506 6.572 6.374 5.888 5.326 4.763 4.257 3.773 3.336 2.955 2.6 2.228 1.904 1.621 1.351 1.074 0.829 0.622 0.387 0.167 -0.015 -0.214 -0.422 -0.586 -0.758 -0.941 -1.098 -1.27 -1.433 -1.589 -1.756 -1.869 -1.978 -2.164 -2.305 -2.446 -2.512 -2.641 -2.787 -2.96 -3.056 -3.254 -3.331 -3.426 -3.538 -3.793 -3.937 -4.106 -4.286 -4.469 -4.697 -4.993 -5.841 -10 ,30351 ,KEBNE ,16679138,Thu Nov 25 06:13:14 CET,Thu Nov 25 07:36:27 CET,0.0 0.537 0.749 0.925 1.081 1.19 1.292 1.387 1.541 1.614 1.681 1.713 1.882 1.953 2.087 2.216 2.323 2.372 2.459 2.529 2.649 2.735 2.811 2.911 3.022 3.141 3.253 3.348 3.457 3.567 3.677 3.817 3.936 4.044 4.181 4.329 4.466 4.618 4.778 4.942 5.092 5.239 5.415 5.587 5.765 5.916 6.104 6.29 6.396 6.37 6.183 5.76 5.238 4.727 4.231 3.763 3.299 2.869 2.499 2.137 1.846 1.571 1.261 0.964 0.711 0.472 0.22 -0.02 -0.224 -0.414 -0.624 -0.811 -1.005 -1.215 -1.386 -1.559 -1.72 -1.878 -2.057 -2.195 -2.334 -2.546 -2.685 -2.822 -2.894 -3.044 -3.204 -3.373 -3.465 -3.659 -3.764 -3.876 -3.986 -4.243 -4.371 -4.505 -4.677 -4.875 -5.113 -5.464 -6.381 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5n_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5n_5d.txt deleted file mode 100644 index 154d3c24..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5n_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26849 ,KEBNE ,17024355,Wed Dec 22 09:53:03 CET,Wed Dec 22 11:19:16 CET,0.0 0.281 0.506 0.683 0.817 0.94 1.041 1.121 1.279 1.352 1.416 1.462 1.621 1.686 1.803 1.921 2.046 2.099 2.195 2.298 2.435 2.515 2.604 2.735 2.848 2.956 3.067 3.176 3.311 3.445 3.574 3.728 3.879 4.014 4.166 4.345 4.511 4.685 4.87 5.081 5.316 5.582 5.876 6.141 6.451 6.8 7.114 7.375 7.586 7.666 7.64 7.141 6.392 5.629 4.966 4.383 3.835 3.314 2.861 2.383 1.944 1.577 1.207 0.811 0.441 0.119 -0.194 -0.477 -0.758 -1.068 -1.386 -1.642 -1.903 -2.19 -2.412 -2.637 -2.87 -3.115 -3.374 -3.553 -3.738 -4.046 -4.256 -4.461 -4.574 -4.828 -5.115 -5.418 -5.567 -5.807 -6.016 -6.181 -6.36 -6.732 -6.971 -7.266 -7.578 -7.947 -8.43 -9.034 -11.366 -2 ,3331 ,KEBNE ,17024356,Wed Dec 22 09:53:03 CET,Wed Dec 22 11:18:59 CET,0.0 0.412 0.595 0.731 0.848 0.96 1.095 1.208 1.375 1.447 1.518 1.565 1.728 1.795 1.909 2.021 2.135 2.187 2.291 2.386 2.522 2.611 2.698 2.818 2.918 3.021 3.135 3.247 3.388 3.522 3.646 3.795 3.945 4.087 4.249 4.428 4.596 4.789 5.007 5.247 5.484 5.732 6.022 6.319 6.654 6.987 7.309 7.61 7.933 8.155 8.055 7.501 6.805 6.142 5.51 4.829 4.211 3.692 3.267 2.802 2.373 2.01 1.67 1.337 1.0 0.69 0.36 0.038 -0.223 -0.479 -0.761 -0.999 -1.257 -1.526 -1.741 -1.962 -2.186 -2.433 -2.695 -2.868 -3.039 -3.337 -3.551 -3.777 -3.889 -4.126 -4.397 -4.663 -4.806 -5.059 -5.314 -5.506 -5.715 -6.182 -6.434 -6.704 -7.011 -7.374 -7.81 -8.412 -11.043 -3 ,30681 ,KEBNE ,17024357,Wed Dec 22 09:53:02 CET,Wed Dec 22 11:19:14 CET,0.0 0.535 0.724 0.874 0.998 1.096 1.181 1.271 1.431 1.507 1.577 1.615 1.775 1.836 1.946 2.055 2.173 2.231 2.333 2.441 2.589 2.678 2.763 2.879 2.981 3.076 3.171 3.271 3.411 3.551 3.683 3.827 3.978 4.134 4.295 4.462 4.617 4.795 5.008 5.235 5.435 5.628 5.862 6.101 6.359 6.625 6.93 7.233 7.487 7.651 7.418 6.701 6.044 5.372 4.685 4.0 3.394 2.858 2.357 1.875 1.435 1.028 0.657 0.303 -0.026 -0.35 -0.709 -1.021 -1.287 -1.578 -1.877 -2.139 -2.408 -2.682 -2.901 -3.123 -3.35 -3.579 -3.821 -4.0 -4.188 -4.474 -4.679 -4.88 -4.983 -5.215 -5.45 -5.72 -5.88 -6.126 -6.371 -6.553 -6.743 -7.149 -7.381 -7.671 -8.031 -8.428 -8.877 -9.536 -13.576 -4 ,24719 ,KEBNE ,17024358,Wed Dec 22 09:53:03 CET,Wed Dec 22 11:18:25 CET,0.0 0.419 0.599 0.736 0.861 0.969 1.077 1.17 1.33 1.398 1.461 1.501 1.653 1.703 1.811 1.92 2.021 2.069 2.167 2.272 2.406 2.483 2.568 2.704 2.835 2.956 3.066 3.177 3.319 3.45 3.58 3.746 3.884 3.99 4.127 4.287 4.435 4.608 4.795 4.965 5.152 5.361 5.6 5.865 6.164 6.453 6.723 6.974 7.201 7.364 7.124 6.447 5.761 5.102 4.506 3.904 3.334 2.807 2.346 1.853 1.373 0.959 0.576 0.195 -0.158 -0.501 -0.849 -1.157 -1.444 -1.735 -2.032 -2.28 -2.541 -2.8 -2.999 -3.21 -3.417 -3.644 -3.876 -4.024 -4.209 -4.547 -4.767 -4.985 -5.101 -5.349 -5.597 -5.836 -5.969 -6.219 -6.473 -6.66 -6.868 -7.3 -7.518 -7.779 -8.117 -8.542 -9.026 -9.625 -12.074 -5 ,17402 ,KEBNE ,17024359,Wed Dec 22 09:53:03 CET,Wed Dec 22 11:18:54 CET,0.0 0.42 0.594 0.737 0.868 0.967 1.048 1.119 1.261 1.327 1.39 1.412 1.564 1.628 1.736 1.843 1.951 2.004 2.109 2.206 2.337 2.423 2.516 2.65 2.777 2.911 3.034 3.147 3.292 3.411 3.521 3.662 3.812 3.963 4.133 4.325 4.506 4.699 4.911 5.139 5.368 5.6 5.866 6.138 6.44 6.748 7.06 7.331 7.501 7.562 7.394 6.843 6.184 5.457 4.75 4.134 3.585 3.067 2.622 2.174 1.758 1.375 1.01 0.627 0.251 -0.082 -0.414 -0.709 -0.982 -1.279 -1.57 -1.808 -2.075 -2.349 -2.581 -2.835 -3.068 -3.303 -3.573 -3.76 -3.946 -4.243 -4.456 -4.682 -4.799 -5.044 -5.3 -5.582 -5.736 -5.985 -6.228 -6.408 -6.59 -6.978 -7.229 -7.536 -7.882 -8.231 -8.641 -9.267 -14.091 -6 ,29319 ,KEBNE ,17024360,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:21:52 CET,0.0 0.501 0.707 0.849 0.981 1.096 1.206 1.307 1.46 1.53 1.606 1.651 1.806 1.873 1.995 2.113 2.237 2.293 2.392 2.492 2.636 2.725 2.809 2.924 3.034 3.143 3.25 3.36 3.498 3.627 3.749 3.886 4.027 4.168 4.319 4.503 4.683 4.846 5.022 5.219 5.433 5.689 5.996 6.268 6.556 6.863 7.158 7.465 7.72 7.804 7.617 7.041 6.324 5.583 4.907 4.275 3.711 3.205 2.744 2.293 1.911 1.56 1.222 0.885 0.566 0.262 -0.071 -0.375 -0.644 -0.905 -1.167 -1.422 -1.701 -1.969 -2.163 -2.358 -2.583 -2.838 -3.105 -3.281 -3.455 -3.752 -3.963 -4.16 -4.266 -4.491 -4.725 -5.004 -5.158 -5.399 -5.628 -5.806 -5.995 -6.421 -6.683 -6.974 -7.294 -7.713 -8.233 -8.952 -11.635 -7 ,23426 ,KEBNE ,17024361,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:21:53 CET,0.0 0.375 0.549 0.684 0.775 0.861 0.957 1.056 1.246 1.326 1.391 1.418 1.569 1.636 1.781 1.904 2.006 2.057 2.159 2.261 2.39 2.469 2.554 2.676 2.786 2.893 3.002 3.106 3.239 3.363 3.484 3.631 3.771 3.905 4.051 4.215 4.379 4.56 4.748 4.961 5.178 5.398 5.65 5.911 6.187 6.446 6.719 7.033 7.32 7.475 7.368 6.77 6.063 5.403 4.745 4.079 3.416 2.791 2.285 1.752 1.302 0.895 0.49 0.096 -0.26 -0.576 -0.936 -1.248 -1.507 -1.774 -2.054 -2.29 -2.543 -2.824 -3.04 -3.268 -3.51 -3.759 -4.008 -4.18 -4.374 -4.685 -4.878 -5.066 -5.171 -5.42 -5.704 -5.996 -6.143 -6.377 -6.562 -6.734 -6.937 -7.368 -7.63 -7.962 -8.332 -8.751 -9.296 -10.068 -13.268 -8 ,16041 ,KEBNE ,17024362,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:22:07 CET,0.0 0.709 0.938 1.11 1.254 1.364 1.476 1.585 1.768 1.852 1.931 1.98 2.137 2.205 2.332 2.453 2.581 2.636 2.726 2.81 2.937 3.033 3.127 3.256 3.387 3.513 3.634 3.745 3.871 3.986 4.104 4.259 4.404 4.549 4.72 4.9 5.07 5.248 5.42 5.605 5.805 6.035 6.311 6.586 6.889 7.202 7.51 7.825 8.111 8.335 8.338 7.826 7.098 6.367 5.702 5.065 4.462 3.901 3.423 2.956 2.558 2.18 1.787 1.406 1.058 0.746 0.418 0.101 -0.175 -0.433 -0.714 -0.966 -1.21 -1.464 -1.672 -1.898 -2.148 -2.4 -2.667 -2.841 -3.016 -3.325 -3.532 -3.757 -3.876 -4.126 -4.388 -4.682 -4.832 -5.065 -5.315 -5.503 -5.692 -6.127 -6.376 -6.645 -6.982 -7.402 -7.926 -8.602 -11.058 -9 ,25565 ,KEBNE ,17024363,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:21:04 CET,0.0 0.628 0.818 0.957 1.059 1.158 1.258 1.352 1.52 1.592 1.666 1.713 1.86 1.914 2.043 2.165 2.272 2.326 2.427 2.52 2.66 2.745 2.821 2.936 3.058 3.17 3.276 3.389 3.525 3.66 3.799 3.95 4.088 4.22 4.38 4.571 4.755 4.949 5.145 5.355 5.574 5.818 6.116 6.417 6.758 7.08 7.403 7.761 8.049 8.155 7.93 7.387 6.782 6.159 5.517 4.891 4.313 3.779 3.311 2.819 2.408 2.021 1.638 1.256 0.893 0.587 0.248 -0.065 -0.327 -0.603 -0.907 -1.147 -1.404 -1.687 -1.895 -2.119 -2.364 -2.613 -2.869 -3.044 -3.225 -3.513 -3.728 -3.963 -4.074 -4.333 -4.632 -4.946 -5.105 -5.359 -5.645 -5.826 -6.018 -6.482 -6.744 -7.053 -7.387 -7.772 -8.281 -8.97 -12.318 -10 ,9544 ,KEBNE ,17024364,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:21:34 CET,0.0 0.356 0.573 0.738 0.84 0.927 1.014 1.114 1.322 1.402 1.465 1.499 1.647 1.712 1.857 1.988 2.096 2.148 2.248 2.332 2.463 2.556 2.647 2.782 2.902 3.011 3.124 3.234 3.37 3.498 3.615 3.766 3.907 4.034 4.183 4.363 4.544 4.741 4.935 5.14 5.346 5.569 5.823 6.059 6.364 6.693 7.013 7.353 7.719 8.0 7.908 7.245 6.454 5.707 5.07 4.424 3.819 3.271 2.773 2.283 1.875 1.51 1.144 0.778 0.438 0.122 -0.25 -0.601 -0.884 -1.166 -1.47 -1.726 -1.973 -2.217 -2.419 -2.63 -2.862 -3.119 -3.367 -3.531 -3.718 -4.012 -4.199 -4.388 -4.493 -4.715 -4.954 -5.244 -5.391 -5.627 -5.833 -5.982 -6.163 -6.599 -6.834 -7.108 -7.439 -7.853 -8.352 -8.912 -11.856 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5m.txt deleted file mode 100644 index 4db97236..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11583 ,KEBNE ,16679139,Thu Nov 25 06:14:12 CET,Thu Nov 25 07:40:50 CET,0.0 0.179 0.284 0.372 0.451 0.523 0.595 0.666 0.792 0.852 0.908 0.925 1.077 1.118 1.205 1.301 1.408 1.459 1.56 1.666 1.815 1.91 2.0 2.128 2.247 2.354 2.468 2.588 2.735 2.881 3.016 3.154 3.285 3.418 3.588 3.774 3.936 4.113 4.309 4.512 4.715 4.953 5.252 5.546 5.85 6.198 6.573 6.922 7.145 7.109 6.885 6.202 5.379 4.665 3.999 3.374 2.819 2.285 1.8 1.308 0.891 0.513 0.139 -0.211 -0.531 -0.817 -1.122 -1.409 -1.66 -1.926 -2.226 -2.476 -2.727 -2.993 -3.218 -3.442 -3.665 -3.906 -4.136 -4.281 -4.445 -4.716 -4.909 -5.119 -5.228 -5.443 -5.671 -5.931 -6.073 -6.317 -6.511 -6.665 -6.831 -7.254 -7.508 -7.763 -8.051 -8.406 -8.87 -9.46 -11.771 -2 ,20426 ,KEBNE ,16679140,Thu Nov 25 06:14:12 CET,Thu Nov 25 07:43:42 CET,0.0 0.205 0.32 0.425 0.491 0.554 0.617 0.676 0.795 0.852 0.916 0.939 1.089 1.143 1.251 1.351 1.439 1.479 1.569 1.66 1.779 1.849 1.916 2.018 2.116 2.212 2.306 2.407 2.551 2.688 2.821 2.984 3.133 3.27 3.434 3.621 3.794 3.978 4.189 4.418 4.647 4.907 5.208 5.491 5.825 6.189 6.526 6.801 7.037 7.19 7.114 6.562 5.785 5.022 4.365 3.736 3.097 2.486 1.978 1.449 1.002 0.624 0.25 -0.104 -0.451 -0.791 -1.159 -1.492 -1.788 -2.096 -2.402 -2.65 -2.904 -3.166 -3.36 -3.582 -3.82 -4.045 -4.285 -4.472 -4.658 -4.952 -5.157 -5.341 -5.44 -5.648 -5.891 -6.166 -6.296 -6.52 -6.707 -6.874 -7.065 -7.504 -7.759 -8.032 -8.305 -8.675 -9.176 -9.702 -11.673 -3 ,31094 ,KEBNE ,16679141,Thu Nov 25 06:14:12 CET,Thu Nov 25 07:41:20 CET,0.0 0.231 0.335 0.421 0.508 0.598 0.672 0.741 0.882 0.94 0.993 0.995 1.144 1.199 1.302 1.389 1.466 1.503 1.571 1.635 1.733 1.803 1.876 1.987 2.088 2.174 2.255 2.341 2.464 2.606 2.735 2.883 3.034 3.175 3.344 3.541 3.718 3.91 4.132 4.364 4.602 4.866 5.163 5.447 5.765 6.081 6.408 6.759 7.076 7.246 7.128 6.506 5.737 4.999 4.29 3.616 2.952 2.304 1.777 1.303 0.897 0.509 0.109 -0.278 -0.644 -0.966 -1.305 -1.635 -1.904 -2.165 -2.462 -2.724 -2.993 -3.264 -3.467 -3.667 -3.878 -4.101 -4.326 -4.477 -4.638 -4.902 -5.086 -5.281 -5.383 -5.606 -5.836 -6.093 -6.253 -6.499 -6.684 -6.846 -7.01 -7.367 -7.561 -7.785 -8.035 -8.332 -8.702 -9.16 -12.082 -4 ,19428 ,KEBNE ,16679142,Thu Nov 25 06:14:12 CET,Thu Nov 25 07:41:39 CET,0.0 0.187 0.272 0.369 0.465 0.533 0.593 0.653 0.784 0.854 0.915 0.928 1.071 1.122 1.232 1.331 1.419 1.462 1.549 1.633 1.745 1.817 1.903 2.039 2.167 2.288 2.4 2.507 2.639 2.776 2.91 3.056 3.198 3.346 3.512 3.714 3.921 4.119 4.319 4.523 4.737 4.991 5.269 5.53 5.813 6.074 6.346 6.709 6.996 7.014 6.714 5.958 5.066 4.3 3.626 2.972 2.407 1.878 1.413 0.948 0.54 0.188 -0.161 -0.517 -0.87 -1.206 -1.538 -1.839 -2.108 -2.363 -2.612 -2.832 -3.073 -3.335 -3.534 -3.719 -3.906 -4.117 -4.377 -4.56 -4.746 -5.081 -5.31 -5.517 -5.62 -5.832 -6.043 -6.27 -6.395 -6.618 -6.793 -6.957 -7.124 -7.507 -7.735 -7.943 -8.192 -8.503 -8.89 -9.441 -12.631 -5 ,14552 ,KEBNE ,16679143,Thu Nov 25 06:15:14 CET,Thu Nov 25 07:44:16 CET,0.0 0.15 0.244 0.331 0.413 0.485 0.546 0.614 0.732 0.784 0.839 0.842 0.979 1.015 1.105 1.207 1.293 1.334 1.422 1.506 1.627 1.703 1.781 1.897 2.009 2.128 2.236 2.332 2.451 2.564 2.68 2.828 2.98 3.148 3.337 3.527 3.712 3.906 4.115 4.363 4.6 4.828 5.1 5.363 5.658 5.992 6.349 6.654 6.897 7.112 7.068 6.461 5.705 4.954 4.252 3.594 3.01 2.444 1.933 1.458 1.071 0.699 0.309 -0.06 -0.389 -0.706 -1.047 -1.351 -1.613 -1.881 -2.176 -2.415 -2.642 -2.872 -3.052 -3.25 -3.465 -3.694 -3.94 -4.11 -4.285 -4.569 -4.771 -4.979 -5.086 -5.312 -5.565 -5.835 -5.962 -6.183 -6.369 -6.537 -6.721 -7.128 -7.338 -7.535 -7.763 -8.087 -8.538 -9.263 -12.428 -6 ,26638 ,KEBNE ,16679144,Thu Nov 25 06:15:13 CET,Thu Nov 25 07:42:07 CET,0.0 0.155 0.286 0.389 0.476 0.56 0.631 0.692 0.812 0.865 0.914 0.921 1.072 1.122 1.22 1.316 1.41 1.455 1.541 1.624 1.748 1.829 1.901 2.0 2.088 2.184 2.28 2.367 2.471 2.564 2.661 2.797 2.929 3.05 3.207 3.395 3.577 3.776 3.986 4.199 4.422 4.681 4.957 5.208 5.498 5.8 6.159 6.531 6.833 6.988 6.849 6.281 5.625 4.91 4.248 3.64 3.052 2.535 2.076 1.595 1.176 0.794 0.424 0.071 -0.26 -0.558 -0.89 -1.212 -1.473 -1.73 -2.001 -2.228 -2.455 -2.681 -2.878 -3.081 -3.273 -3.486 -3.715 -3.872 -4.03 -4.276 -4.46 -4.663 -4.764 -4.968 -5.183 -5.399 -5.516 -5.733 -5.915 -6.086 -6.251 -6.588 -6.778 -6.993 -7.251 -7.557 -8.017 -8.537 -10.204 -7 ,14646 ,KEBNE ,16679145,Thu Nov 25 06:16:14 CET,Thu Nov 25 07:44:10 CET,0.0 0.172 0.266 0.342 0.414 0.477 0.54 0.608 0.746 0.804 0.857 0.858 1.006 1.048 1.124 1.203 1.284 1.321 1.401 1.487 1.599 1.673 1.749 1.862 1.986 2.093 2.178 2.277 2.409 2.526 2.641 2.777 2.91 3.043 3.195 3.384 3.583 3.807 4.047 4.274 4.488 4.712 4.994 5.284 5.573 5.864 6.152 6.419 6.725 6.998 6.861 6.136 5.402 4.759 4.103 3.389 2.753 2.226 1.773 1.273 0.817 0.393 -0.003 -0.351 -0.681 -0.997 -1.322 -1.605 -1.857 -2.133 -2.416 -2.663 -2.951 -3.244 -3.471 -3.702 -3.93 -4.172 -4.427 -4.605 -4.795 -5.105 -5.336 -5.559 -5.665 -5.893 -6.118 -6.379 -6.531 -6.786 -7.043 -7.218 -7.404 -7.835 -8.09 -8.358 -8.623 -8.945 -9.433 -10.126 -12.45 -8 ,31919 ,KEBNE ,16679146,Thu Nov 25 06:16:15 CET,Thu Nov 25 07:46:01 CET,0.0 0.131 0.237 0.321 0.397 0.471 0.537 0.598 0.739 0.799 0.844 0.844 0.996 1.051 1.154 1.245 1.335 1.381 1.475 1.568 1.695 1.768 1.847 1.979 2.096 2.201 2.303 2.398 2.508 2.606 2.701 2.835 2.978 3.106 3.26 3.424 3.583 3.762 3.964 4.204 4.451 4.7 4.99 5.266 5.555 5.848 6.14 6.463 6.811 7.039 6.818 6.054 5.27 4.529 3.835 3.15 2.536 1.963 1.444 0.936 0.493 0.094 -0.285 -0.658 -1.017 -1.357 -1.722 -2.039 -2.29 -2.536 -2.819 -3.061 -3.283 -3.505 -3.702 -3.925 -4.164 -4.409 -4.646 -4.801 -4.965 -5.249 -5.448 -5.652 -5.762 -5.994 -6.259 -6.534 -6.674 -6.911 -7.11 -7.269 -7.422 -7.774 -7.999 -8.275 -8.562 -8.909 -9.385 -10.032 -12.679 -9 ,8240 ,KEBNE ,16679147,Thu Nov 25 06:16:15 CET,Thu Nov 25 07:44:09 CET,0.0 0.189 0.324 0.437 0.52 0.594 0.667 0.732 0.854 0.909 0.961 0.964 1.113 1.163 1.264 1.359 1.452 1.499 1.59 1.682 1.807 1.885 1.967 2.086 2.175 2.255 2.336 2.411 2.513 2.636 2.766 2.922 3.076 3.211 3.371 3.548 3.724 3.923 4.128 4.333 4.545 4.784 5.048 5.291 5.56 5.871 6.231 6.609 6.948 7.166 6.962 6.231 5.47 4.765 4.113 3.46 2.878 2.376 1.931 1.434 0.992 0.602 0.227 -0.116 -0.46 -0.776 -1.067 -1.344 -1.617 -1.906 -2.2 -2.433 -2.662 -2.917 -3.131 -3.349 -3.588 -3.841 -4.093 -4.256 -4.426 -4.704 -4.905 -5.116 -5.221 -5.438 -5.688 -5.962 -6.093 -6.328 -6.527 -6.681 -6.857 -7.289 -7.531 -7.773 -8.052 -8.408 -8.827 -9.334 -11.552 -10 ,25506 ,KEBNE ,16679148,Thu Nov 25 06:17:16 CET,Thu Nov 25 07:46:43 CET,0.0 0.196 0.328 0.422 0.499 0.577 0.649 0.716 0.836 0.885 0.931 0.929 1.075 1.124 1.224 1.315 1.397 1.443 1.526 1.597 1.707 1.773 1.837 1.942 2.05 2.153 2.25 2.345 2.469 2.589 2.707 2.843 2.967 3.103 3.273 3.454 3.631 3.823 4.023 4.229 4.444 4.673 4.924 5.18 5.465 5.75 6.064 6.381 6.715 7.015 7.03 6.55 5.78 5.029 4.337 3.659 3.066 2.504 2.008 1.512 1.075 0.683 0.291 -0.064 -0.38 -0.702 -1.055 -1.37 -1.632 -1.892 -2.173 -2.408 -2.63 -2.862 -3.052 -3.252 -3.482 -3.706 -3.934 -4.109 -4.307 -4.641 -4.864 -5.057 -5.149 -5.368 -5.607 -5.864 -5.999 -6.23 -6.417 -6.569 -6.743 -7.154 -7.377 -7.632 -7.899 -8.19 -8.582 -9.225 -12.802 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5n.txt deleted file mode 100644 index 9402ba35..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,611 ,KEBNE ,16679149,Thu Nov 25 06:17:16 CET,Thu Nov 25 07:48:25 CET,0.0 1.551 2.086 2.439 2.669 2.851 3.001 3.137 3.417 3.55 3.677 3.834 4.047 4.153 4.37 4.585 4.785 4.879 5.05 5.199 5.422 5.576 5.721 5.932 6.132 6.336 6.533 6.711 6.937 7.175 7.411 7.674 7.945 8.217 8.518 8.85 9.176 9.553 9.936 10.297 10.655 11.022 11.479 11.953 12.46 12.972 13.471 13.975 14.516 15.096 15.657 15.714 15.466 15.117 14.732 14.326 13.95 13.588 13.179 12.717 12.328 11.969 11.653 11.373 11.1 10.859 10.61 10.365 10.129 9.878 9.627 9.424 9.192 8.948 8.774 8.581 8.375 8.158 7.929 7.775 7.612 7.37 7.185 6.984 6.884 6.67 6.437 6.201 6.077 5.861 5.683 5.523 5.344 4.945 4.722 4.466 4.206 3.949 3.647 3.178 1.0 -2 ,20590 ,KEBNE ,16679150,Thu Nov 25 06:17:16 CET,Thu Nov 25 07:47:16 CET,0.0 2.203 2.703 2.978 3.19 3.4 3.588 3.738 3.994 4.128 4.285 4.468 4.673 4.771 4.966 5.155 5.324 5.406 5.585 5.775 6.041 6.192 6.325 6.522 6.73 6.92 7.093 7.262 7.481 7.701 7.935 8.213 8.477 8.732 9.009 9.309 9.592 9.938 10.322 10.674 11.006 11.359 11.76 12.172 12.667 13.227 13.764 14.268 14.852 15.477 15.96 16.081 15.92 15.661 15.328 14.913 14.555 14.268 13.95 13.495 13.097 12.774 12.457 12.15 11.864 11.598 11.318 11.077 10.853 10.62 10.403 10.205 9.999 9.799 9.635 9.457 9.259 9.046 8.831 8.678 8.514 8.268 8.091 7.905 7.811 7.586 7.342 7.099 6.969 6.747 6.571 6.435 6.296 5.956 5.754 5.549 5.305 4.99 4.606 4.02 2.099 -3 ,29011 ,KEBNE ,16679151,Thu Nov 25 06:17:20 CET,Thu Nov 25 07:42:34 CET,0.0 1.679 2.076 2.438 2.766 3.019 3.214 3.386 3.698 3.833 3.957 4.116 4.34 4.459 4.663 4.855 5.043 5.134 5.312 5.481 5.724 5.878 6.02 6.226 6.424 6.608 6.809 7.023 7.289 7.529 7.763 8.028 8.265 8.504 8.789 9.098 9.399 9.717 10.033 10.363 10.723 11.149 11.632 12.121 12.63 13.091 13.606 14.183 14.777 15.384 16.018 16.197 15.929 15.504 15.033 14.563 14.14 13.747 13.344 12.895 12.505 12.15 11.832 11.547 11.281 11.037 10.75 10.471 10.217 9.963 9.713 9.502 9.287 9.051 8.86 8.681 8.497 8.299 8.094 7.948 7.787 7.543 7.367 7.159 7.053 6.836 6.61 6.385 6.27 6.065 5.917 5.77 5.601 5.225 5.011 4.773 4.49 4.184 3.786 3.238 1.227 -4 ,10346 ,KEBNE ,16679152,Thu Nov 25 06:17:20 CET,Thu Nov 25 07:45:44 CET,0.0 2.676 3.098 3.449 3.722 3.917 4.113 4.301 4.623 4.774 4.909 5.074 5.301 5.43 5.653 5.851 6.043 6.132 6.313 6.491 6.728 6.873 7.012 7.211 7.404 7.608 7.815 8.014 8.249 8.459 8.67 8.938 9.194 9.433 9.712 10.041 10.326 10.601 10.888 11.22 11.584 11.943 12.329 12.715 13.228 13.823 14.419 15.05 15.8 16.519 17.061 17.164 16.984 16.711 16.417 16.093 15.763 15.418 15.056 14.676 14.367 14.085 13.771 13.484 13.219 12.954 12.679 12.427 12.193 11.93 11.658 11.43 11.181 10.933 10.747 10.556 10.352 10.139 9.905 9.742 9.592 9.34 9.159 8.973 8.873 8.66 8.43 8.188 8.059 7.84 7.681 7.536 7.369 7.035 6.835 6.577 6.302 6.017 5.674 5.142 3.024 -5 ,16277 ,KEBNE ,16679153,Thu Nov 25 06:18:17 CET,Thu Nov 25 07:49:24 CET,0.0 2.189 2.617 2.887 3.125 3.357 3.568 3.761 4.043 4.176 4.321 4.474 4.677 4.781 4.964 5.147 5.348 5.447 5.643 5.835 6.089 6.24 6.389 6.614 6.842 7.056 7.248 7.422 7.652 7.873 8.083 8.348 8.592 8.816 9.07 9.359 9.631 9.929 10.266 10.65 11.08 11.568 12.125 12.643 13.222 13.827 14.427 15.01 15.602 16.188 16.781 16.971 16.805 16.482 16.112 15.764 15.44 15.121 14.817 14.422 14.05 13.714 13.359 13.019 12.696 12.401 12.116 11.876 11.654 11.411 11.142 10.911 10.67 10.403 10.199 9.999 9.792 9.565 9.312 9.133 8.94 8.667 8.489 8.303 8.208 8.01 7.814 7.592 7.474 7.26 7.06 6.91 6.769 6.446 6.227 5.993 5.734 5.38 5.002 4.513 2.597 -6 ,32206 ,KEBNE ,16679154,Thu Nov 25 06:18:16 CET,Thu Nov 25 07:45:33 CET,0.0 2.128 2.575 2.855 3.114 3.335 3.526 3.706 3.992 4.132 4.264 4.401 4.604 4.715 4.928 5.126 5.306 5.388 5.545 5.706 5.937 6.103 6.273 6.499 6.71 6.909 7.098 7.273 7.499 7.716 7.927 8.168 8.383 8.6 8.852 9.144 9.431 9.751 10.088 10.429 10.792 11.175 11.565 11.952 12.412 12.902 13.475 14.087 14.668 15.207 15.684 15.8 15.565 15.097 14.593 14.202 13.874 13.523 13.201 12.838 12.509 12.196 11.897 11.596 11.262 10.955 10.652 10.398 10.162 9.89 9.608 9.37 9.131 8.885 8.696 8.513 8.326 8.128 7.92 7.778 7.629 7.361 7.156 6.964 6.865 6.651 6.435 6.204 6.089 5.888 5.74 5.593 5.424 5.076 4.902 4.697 4.424 4.108 3.734 3.223 1.189 -7 ,3680 ,KEBNE ,16679155,Thu Nov 25 06:19:18 CET,Thu Nov 25 07:48:23 CET,0.0 2.099 2.461 2.767 3.019 3.231 3.406 3.586 3.927 4.063 4.195 4.389 4.614 4.738 4.98 5.192 5.383 5.475 5.655 5.831 6.065 6.219 6.383 6.608 6.812 7.016 7.219 7.408 7.64 7.851 8.072 8.359 8.606 8.82 9.068 9.361 9.637 9.927 10.241 10.562 10.927 11.345 11.77 12.186 12.664 13.247 13.839 14.365 15.043 15.802 16.37 16.422 16.168 15.847 15.526 15.107 14.641 14.206 13.841 13.502 13.179 12.848 12.527 12.24 11.975 11.737 11.473 11.222 11.006 10.771 10.522 10.321 10.114 9.895 9.703 9.491 9.282 9.05 8.798 8.621 8.447 8.19 8.008 7.811 7.71 7.517 7.291 7.039 6.913 6.689 6.494 6.336 6.175 5.821 5.584 5.344 5.082 4.748 4.346 3.824 2.116 -8 ,29630 ,KEBNE ,16679156,Thu Nov 25 06:20:19 CET,Thu Nov 25 07:52:30 CET,0.0 2.014 2.477 2.766 3.038 3.274 3.482 3.651 3.946 4.11 4.257 4.423 4.632 4.734 4.936 5.12 5.302 5.395 5.574 5.745 5.978 6.113 6.243 6.439 6.656 6.873 7.059 7.224 7.429 7.629 7.815 8.035 8.261 8.497 8.791 9.113 9.397 9.719 10.084 10.443 10.795 11.171 11.594 12.019 12.551 13.126 13.77 14.486 15.138 15.716 16.237 16.33 16.12 15.863 15.558 15.203 14.834 14.499 14.205 13.871 13.55 13.258 12.97 12.663 12.34 12.058 11.768 11.498 11.266 11.024 10.776 10.571 10.357 10.132 9.943 9.739 9.525 9.309 9.094 8.929 8.769 8.555 8.395 8.217 8.123 7.925 7.715 7.463 7.329 7.112 6.938 6.783 6.604 6.234 6.046 5.84 5.598 5.249 4.773 4.185 1.967 -9 ,12765 ,KEBNE ,16679157,Thu Nov 25 06:20:19 CET,Thu Nov 25 07:52:21 CET,0.0 1.266 1.732 2.094 2.37 2.576 2.761 2.931 3.236 3.4 3.557 3.704 3.908 4.019 4.227 4.413 4.596 4.692 4.871 5.042 5.278 5.425 5.587 5.819 6.033 6.244 6.446 6.634 6.881 7.116 7.331 7.601 7.838 8.055 8.325 8.64 8.946 9.279 9.618 9.953 10.321 10.747 11.211 11.641 12.173 12.795 13.441 14.099 14.85 15.543 16.036 16.116 15.797 15.418 15.076 14.681 14.297 13.867 13.438 13.036 12.656 12.286 11.944 11.636 11.363 11.117 10.841 10.582 10.349 10.107 9.874 9.681 9.468 9.237 9.059 8.868 8.653 8.432 8.206 8.05 7.889 7.626 7.439 7.251 7.153 6.938 6.695 6.444 6.326 6.12 5.961 5.811 5.651 5.323 5.128 4.909 4.67 4.349 3.977 3.497 1.828 -10 ,20468 ,KEBNE ,16679158,Thu Nov 25 06:20:19 CET,Thu Nov 25 07:51:29 CET,0.0 1.317 1.814 2.155 2.404 2.6 2.796 2.974 3.265 3.399 3.528 3.693 3.905 4.008 4.202 4.395 4.59 4.676 4.835 4.996 5.256 5.435 5.596 5.811 6.016 6.227 6.418 6.602 6.836 7.036 7.234 7.491 7.762 8.027 8.311 8.633 8.949 9.273 9.585 9.903 10.257 10.647 11.075 11.558 12.149 12.8 13.461 14.056 14.647 15.199 15.738 15.947 15.835 15.565 15.253 14.903 14.517 14.116 13.726 13.338 13.004 12.701 12.421 12.159 11.901 11.658 11.404 11.175 10.977 10.771 10.547 10.332 10.104 9.881 9.699 9.505 9.296 9.082 8.866 8.717 8.568 8.325 8.144 7.954 7.855 7.656 7.454 7.225 7.09 6.872 6.737 6.614 6.456 6.09 5.917 5.692 5.381 5.048 4.705 4.235 1.96 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5p_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5p_3b.txt deleted file mode 100644 index e42a07c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5p_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14533 ,KEBNE ,16679159,Thu Nov 25 06:23:23 CET,Thu Nov 25 07:54:01 CET,0.0 0.518 0.71 0.869 0.994 1.102 1.204 1.303 1.506 1.613 1.713 1.794 1.952 2.026 2.174 2.313 2.445 2.508 2.632 2.753 2.919 3.019 3.116 3.266 3.414 3.554 3.69 3.821 3.993 4.157 4.317 4.517 4.711 4.902 5.124 5.37 5.597 5.861 6.16 6.461 6.778 7.137 7.531 7.922 8.387 8.873 9.437 10.11 10.784 11.464 12.209 12.49 12.388 12.171 11.935 11.681 11.391 11.099 10.83 10.53 10.263 10.017 9.773 9.527 9.298 9.09 8.852 8.63 8.417 8.183 7.951 7.756 7.568 7.37 7.208 7.04 6.861 6.664 6.454 6.304 6.141 5.901 5.726 5.54 5.448 5.258 5.058 4.813 4.669 4.446 4.195 4.018 3.83 3.41 3.175 2.935 2.68 2.367 1.922 1.225 -3.235 -2 ,11893 ,KEBNE ,16679160,Thu Nov 25 06:23:23 CET,Thu Nov 25 07:52:02 CET,0.0 0.373 0.541 0.667 0.803 0.945 1.072 1.176 1.365 1.455 1.544 1.627 1.787 1.869 2.014 2.152 2.294 2.355 2.473 2.582 2.741 2.854 2.961 3.125 3.29 3.439 3.583 3.721 3.898 4.067 4.226 4.427 4.631 4.818 5.013 5.25 5.487 5.747 6.028 6.308 6.611 6.976 7.375 7.781 8.275 8.828 9.457 10.056 10.688 11.365 11.968 12.215 12.202 12.056 11.824 11.536 11.245 10.931 10.613 10.276 9.972 9.717 9.485 9.253 9.036 8.818 8.582 8.38 8.195 7.995 7.794 7.589 7.363 7.157 7.0 6.837 6.642 6.407 6.181 6.029 5.867 5.631 5.462 5.272 5.17 4.951 4.709 4.465 4.333 4.116 3.892 3.738 3.558 3.145 2.916 2.642 2.339 2.028 1.625 0.933 -2.104 -3 ,7874 ,KEBNE ,16679161,Thu Nov 25 06:24:24 CET,Thu Nov 25 07:53:56 CET,0.0 0.416 0.631 0.776 0.881 0.996 1.112 1.206 1.389 1.483 1.575 1.643 1.785 1.851 1.99 2.124 2.253 2.312 2.436 2.555 2.719 2.818 2.917 3.063 3.203 3.349 3.487 3.618 3.794 3.97 4.132 4.319 4.502 4.687 4.907 5.145 5.376 5.635 5.913 6.207 6.524 6.874 7.253 7.664 8.15 8.638 9.221 9.81 10.361 10.925 11.41 11.624 11.554 11.338 11.02 10.657 10.293 9.969 9.694 9.394 9.121 8.856 8.609 8.369 8.132 7.903 7.651 7.419 7.217 7.004 6.774 6.579 6.37 6.175 6.013 5.826 5.649 5.467 5.249 5.101 4.96 4.727 4.562 4.386 4.294 4.092 3.85 3.574 3.433 3.221 3.004 2.844 2.674 2.283 2.038 1.775 1.472 1.138 0.742 0.117 -3.187 -4 ,22431 ,KEBNE ,16679162,Thu Nov 25 06:25:25 CET,Thu Nov 25 07:53:33 CET,0.0 0.319 0.537 0.703 0.839 0.989 1.137 1.255 1.448 1.539 1.633 1.721 1.88 1.948 2.082 2.214 2.342 2.403 2.525 2.645 2.816 2.931 3.042 3.197 3.354 3.506 3.646 3.778 3.958 4.135 4.296 4.484 4.678 4.874 5.08 5.3 5.53 5.799 6.079 6.357 6.658 6.998 7.389 7.795 8.262 8.764 9.321 9.931 10.634 11.333 12.033 12.35 12.234 12.008 11.747 11.476 11.23 10.956 10.688 10.42 10.165 9.917 9.653 9.382 9.133 8.902 8.656 8.433 8.226 8.007 7.796 7.607 7.407 7.203 7.047 6.883 6.69 6.474 6.249 6.091 5.927 5.672 5.5 5.327 5.226 5.005 4.786 4.547 4.409 4.196 3.973 3.803 3.61 3.19 2.973 2.733 2.456 2.133 1.684 0.996 -2.231 -5 ,32134 ,KEBNE ,16679163,Thu Nov 25 06:25:25 CET,Thu Nov 25 07:52:06 CET,0.0 0.547 0.772 0.934 1.068 1.181 1.281 1.385 1.58 1.67 1.759 1.84 2.004 2.089 2.244 2.368 2.499 2.569 2.704 2.82 2.976 3.075 3.181 3.346 3.496 3.632 3.772 3.911 4.084 4.259 4.426 4.621 4.817 5.006 5.218 5.459 5.702 5.969 6.256 6.566 6.89 7.232 7.624 8.039 8.538 9.098 9.673 10.227 10.829 11.495 12.148 12.429 12.328 12.05 11.801 11.562 11.314 11.048 10.747 10.427 10.157 9.906 9.657 9.406 9.169 8.945 8.709 8.488 8.28 8.056 7.828 7.647 7.467 7.272 7.106 6.931 6.742 6.547 6.333 6.174 6.012 5.75 5.562 5.354 5.243 5.03 4.824 4.61 4.49 4.281 4.043 3.867 3.655 3.195 2.947 2.659 2.38 2.043 1.582 0.894 -2.268 -6 ,10459 ,KEBNE ,16679164,Thu Nov 25 06:26:27 CET,Thu Nov 25 07:57:41 CET,0.0 0.593 0.812 0.974 1.119 1.263 1.391 1.515 1.738 1.827 1.918 2.01 2.178 2.254 2.392 2.524 2.651 2.718 2.846 2.965 3.135 3.25 3.359 3.517 3.673 3.816 3.95 4.081 4.254 4.433 4.603 4.805 5.007 5.205 5.427 5.665 5.89 6.128 6.376 6.652 6.957 7.288 7.687 8.138 8.638 9.119 9.642 10.212 10.89 11.647 12.391 12.8 12.832 12.674 12.431 12.194 11.943 11.639 11.338 11.046 10.786 10.522 10.285 10.058 9.826 9.625 9.39 9.155 8.956 8.748 8.526 8.321 8.111 7.894 7.721 7.525 7.296 7.076 6.865 6.718 6.549 6.266 6.096 5.916 5.813 5.592 5.372 5.124 4.982 4.768 4.551 4.403 4.241 3.855 3.636 3.385 3.086 2.673 2.158 1.598 -2.381 -7 ,28435 ,KEBNE ,16679165,Thu Nov 25 06:26:31 CET,Thu Nov 25 07:50:02 CET,0.0 0.536 0.783 0.969 1.119 1.246 1.351 1.444 1.624 1.706 1.78 1.839 1.994 2.065 2.213 2.346 2.462 2.519 2.63 2.742 2.923 3.039 3.15 3.307 3.455 3.596 3.731 3.866 4.04 4.204 4.363 4.552 4.743 4.944 5.187 5.454 5.697 5.953 6.228 6.534 6.855 7.207 7.57 7.893 8.267 8.712 9.262 9.852 10.528 11.367 12.154 12.413 12.35 12.143 11.868 11.587 11.281 10.956 10.662 10.346 10.075 9.832 9.577 9.325 9.08 8.859 8.635 8.42 8.225 8.03 7.793 7.576 7.368 7.155 6.985 6.798 6.597 6.364 6.132 5.973 5.808 5.551 5.361 5.156 5.054 4.851 4.643 4.427 4.296 4.071 3.843 3.69 3.514 3.097 2.837 2.52 2.193 1.846 1.377 0.599 -2.416 -8 ,4778 ,KEBNE ,16679166,Thu Nov 25 06:27:28 CET,Thu Nov 25 07:59:04 CET,0.0 0.395 0.595 0.77 0.935 1.061 1.171 1.299 1.523 1.616 1.708 1.776 1.936 2.015 2.164 2.294 2.415 2.48 2.611 2.73 2.91 3.028 3.136 3.292 3.448 3.61 3.762 3.896 4.074 4.244 4.409 4.606 4.798 4.991 5.201 5.425 5.639 5.875 6.144 6.455 6.788 7.123 7.498 7.89 8.298 8.751 9.304 9.863 10.436 10.991 11.536 11.752 11.653 11.509 11.31 11.012 10.696 10.359 10.03 9.732 9.468 9.202 8.933 8.664 8.427 8.217 7.996 7.788 7.588 7.38 7.179 6.999 6.783 6.561 6.387 6.213 6.043 5.855 5.648 5.502 5.349 5.101 4.946 4.78 4.683 4.487 4.253 3.986 3.842 3.633 3.419 3.234 3.025 2.541 2.269 1.977 1.621 1.195 0.684 -0.015 -2.791 -9 ,28997 ,KEBNE ,16679167,Thu Nov 25 06:27:28 CET,Thu Nov 25 07:59:11 CET,0.0 0.384 0.609 0.792 0.944 1.081 1.184 1.266 1.434 1.526 1.613 1.688 1.847 1.912 2.042 2.166 2.287 2.35 2.471 2.585 2.757 2.872 2.979 3.132 3.287 3.441 3.582 3.715 3.881 4.04 4.197 4.384 4.573 4.746 4.941 5.183 5.412 5.66 5.932 6.243 6.579 6.951 7.364 7.762 8.212 8.656 9.166 9.714 10.265 10.957 11.856 12.381 12.446 12.22 11.908 11.591 11.271 10.93 10.633 10.328 10.037 9.758 9.502 9.261 9.024 8.798 8.54 8.31 8.115 7.907 7.671 7.479 7.278 7.063 6.908 6.742 6.56 6.374 6.174 6.024 5.859 5.61 5.429 5.219 5.117 4.922 4.692 4.429 4.283 4.07 3.843 3.673 3.494 3.108 2.876 2.623 2.376 2.046 1.491 0.814 -2.278 -10 ,5674 ,KEBNE ,16679168,Thu Nov 25 06:27:31 CET,Thu Nov 25 07:53:12 CET,0.0 0.392 0.646 0.807 0.945 1.073 1.184 1.292 1.494 1.583 1.675 1.774 1.946 2.033 2.181 2.305 2.429 2.485 2.591 2.701 2.856 2.963 3.073 3.221 3.357 3.487 3.622 3.757 3.936 4.109 4.271 4.474 4.672 4.864 5.082 5.304 5.533 5.801 6.071 6.361 6.676 7.029 7.448 7.853 8.314 8.809 9.358 9.957 10.588 11.269 11.998 12.385 12.356 12.116 11.831 11.565 11.294 11.019 10.728 10.416 10.142 9.878 9.616 9.36 9.103 8.861 8.627 8.411 8.221 8.011 7.788 7.614 7.419 7.207 7.046 6.876 6.7 6.511 6.29 6.136 5.98 5.713 5.512 5.31 5.219 5.021 4.8 4.537 4.381 4.156 3.92 3.759 3.567 3.061 2.795 2.547 2.229 1.834 1.429 0.827 -2.916 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5p_5n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5p_5n.txt deleted file mode 100644 index 16099dbd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_5p_5n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17597 ,KEBNE ,16679169,Thu Nov 25 06:28:29 CET,Thu Nov 25 08:00:03 CET,0.0 1.61 2.083 2.387 2.626 2.815 2.969 3.101 3.328 3.445 3.561 3.71 3.891 3.974 4.145 4.318 4.47 4.538 4.683 4.828 5.025 5.137 5.245 5.406 5.555 5.689 5.815 5.952 6.148 6.323 6.489 6.689 6.881 7.061 7.268 7.506 7.724 7.968 8.249 8.531 8.8 9.105 9.432 9.753 10.134 10.489 10.819 11.139 11.435 11.595 11.568 11.162 10.639 10.059 9.422 8.833 8.316 7.856 7.441 6.97 6.566 6.227 5.907 5.601 5.292 4.995 4.67 4.372 4.114 3.854 3.56 3.305 3.062 2.827 2.638 2.423 2.206 2.004 1.792 1.633 1.464 1.213 1.036 0.842 0.74 0.52 0.283 0.039 -0.088 -0.32 -0.55 -0.719 -0.87 -1.204 -1.389 -1.604 -1.878 -2.166 -2.506 -2.925 -4.157 -2 ,29620 ,KEBNE ,16679170,Thu Nov 25 06:28:29 CET,Thu Nov 25 07:55:49 CET,0.0 0.799 1.045 1.246 1.457 1.641 1.796 1.939 2.2 2.313 2.43 2.569 2.749 2.847 3.03 3.192 3.357 3.438 3.588 3.715 3.891 4.004 4.114 4.275 4.432 4.595 4.764 4.938 5.135 5.292 5.453 5.66 5.865 6.054 6.252 6.516 6.766 7.005 7.266 7.522 7.783 8.066 8.397 8.755 9.12 9.453 9.806 10.148 10.472 10.723 10.749 10.46 9.962 9.346 8.74 8.147 7.625 7.126 6.661 6.193 5.776 5.401 5.053 4.718 4.406 4.117 3.793 3.504 3.277 3.023 2.764 2.562 2.33 2.095 1.919 1.725 1.511 1.281 1.028 0.864 0.712 0.456 0.266 0.061 -0.039 -0.214 -0.414 -0.648 -0.777 -1.0 -1.165 -1.304 -1.468 -1.844 -2.048 -2.271 -2.496 -2.745 -3.1 -3.599 -5.142 -3 ,3059 ,KEBNE ,16679171,Thu Nov 25 06:28:33 CET,Thu Nov 25 07:53:07 CET,0.0 1.114 1.506 1.765 1.952 2.102 2.259 2.401 2.666 2.797 2.906 3.007 3.186 3.277 3.439 3.591 3.748 3.818 3.952 4.1 4.308 4.437 4.555 4.719 4.876 5.039 5.186 5.323 5.513 5.691 5.866 6.062 6.241 6.422 6.627 6.855 7.059 7.296 7.599 7.89 8.141 8.414 8.733 9.024 9.333 9.695 10.111 10.477 10.775 11.015 11.053 10.725 10.217 9.633 8.981 8.338 7.837 7.38 6.936 6.477 6.089 5.737 5.379 5.047 4.741 4.469 4.187 3.914 3.691 3.472 3.206 2.969 2.726 2.472 2.276 2.069 1.861 1.65 1.434 1.276 1.103 0.836 0.653 0.467 0.375 0.177 -0.037 -0.264 -0.397 -0.639 -0.838 -0.965 -1.129 -1.533 -1.733 -1.946 -2.197 -2.471 -2.8 -3.242 -4.793 -4 ,2133 ,KEBNE ,16679172,Thu Nov 25 06:29:30 CET,Thu Nov 25 07:57:55 CET,0.0 0.94 1.26 1.491 1.687 1.864 2.03 2.182 2.471 2.594 2.701 2.807 2.981 3.073 3.236 3.393 3.549 3.623 3.761 3.896 4.094 4.231 4.364 4.544 4.707 4.857 5.007 5.148 5.324 5.498 5.652 5.826 5.999 6.157 6.34 6.571 6.803 7.034 7.26 7.519 7.797 8.101 8.441 8.771 9.136 9.533 9.94 10.299 10.64 10.841 10.786 10.286 9.658 9.047 8.438 7.871 7.352 6.871 6.408 5.943 5.554 5.189 4.831 4.466 4.113 3.803 3.481 3.191 2.968 2.717 2.428 2.19 1.941 1.685 1.493 1.307 1.115 0.91 0.686 0.53 0.377 0.135 -0.068 -0.296 -0.404 -0.603 -0.805 -1.029 -1.152 -1.374 -1.556 -1.703 -1.867 -2.202 -2.38 -2.618 -2.891 -3.182 -3.539 -4.002 -5.728 -5 ,15770 ,KEBNE ,16679173,Thu Nov 25 06:29:32 CET,Thu Nov 25 07:54:53 CET,0.0 0.871 1.241 1.524 1.737 1.913 2.08 2.229 2.473 2.581 2.683 2.787 2.966 3.068 3.255 3.416 3.567 3.637 3.774 3.904 4.088 4.21 4.324 4.484 4.64 4.787 4.931 5.08 5.27 5.448 5.624 5.842 6.05 6.25 6.479 6.734 6.951 7.154 7.379 7.632 7.897 8.171 8.473 8.791 9.135 9.479 9.9 10.335 10.659 10.87 10.848 10.369 9.789 9.192 8.613 8.035 7.501 7.038 6.608 6.157 5.795 5.456 5.117 4.796 4.47 4.179 3.886 3.592 3.336 3.085 2.818 2.602 2.383 2.142 1.961 1.771 1.56 1.328 1.082 0.926 0.766 0.516 0.336 0.133 0.028 -0.176 -0.395 -0.654 -0.782 -0.995 -1.148 -1.293 -1.48 -1.918 -2.127 -2.343 -2.59 -2.881 -3.257 -3.709 -5.088 -6 ,14859 ,KEBNE ,16679174,Thu Nov 25 06:30:31 CET,Thu Nov 25 07:58:15 CET,0.0 0.779 1.078 1.304 1.52 1.712 1.847 1.987 2.276 2.408 2.533 2.66 2.842 2.935 3.111 3.294 3.462 3.536 3.684 3.824 4.017 4.14 4.265 4.44 4.602 4.759 4.905 5.042 5.216 5.382 5.559 5.778 5.969 6.147 6.355 6.581 6.816 7.088 7.349 7.605 7.866 8.164 8.516 8.86 9.205 9.557 9.994 10.385 10.652 10.815 10.79 10.401 9.856 9.277 8.703 8.149 7.613 7.123 6.7 6.261 5.876 5.527 5.193 4.877 4.553 4.251 3.943 3.655 3.412 3.159 2.873 2.624 2.381 2.141 1.954 1.751 1.543 1.327 1.109 0.947 0.768 0.511 0.331 0.125 0.016 -0.186 -0.399 -0.66 -0.79 -1.005 -1.193 -1.353 -1.523 -1.866 -2.063 -2.292 -2.541 -2.823 -3.148 -3.566 -5.395 -7 ,17594 ,KEBNE ,16679175,Thu Nov 25 06:30:31 CET,Thu Nov 25 08:00:50 CET,0.0 0.873 1.167 1.421 1.622 1.78 1.927 2.075 2.316 2.425 2.529 2.63 2.808 2.9 3.077 3.244 3.388 3.46 3.598 3.734 3.94 4.065 4.179 4.332 4.479 4.626 4.776 4.926 5.105 5.269 5.423 5.625 5.82 6.018 6.259 6.501 6.701 6.907 7.141 7.383 7.644 7.932 8.238 8.535 8.848 9.165 9.529 9.902 10.213 10.431 10.308 9.705 9.057 8.396 7.775 7.213 6.702 6.199 5.743 5.279 4.872 4.522 4.176 3.853 3.56 3.296 3.026 2.768 2.534 2.294 2.047 1.829 1.593 1.342 1.15 0.959 0.765 0.545 0.304 0.147 -0.018 -0.304 -0.52 -0.741 -0.847 -1.047 -1.255 -1.494 -1.623 -1.849 -2.061 -2.222 -2.378 -2.696 -2.879 -3.104 -3.353 -3.605 -3.93 -4.288 -5.844 -8 ,5736 ,KEBNE ,16679176,Thu Nov 25 06:30:31 CET,Thu Nov 25 08:00:20 CET,0.0 1.236 1.474 1.694 1.928 2.146 2.328 2.488 2.769 2.891 3.017 3.179 3.369 3.466 3.631 3.802 3.991 4.069 4.191 4.322 4.536 4.671 4.785 4.956 5.126 5.282 5.431 5.569 5.752 5.924 6.096 6.294 6.479 6.669 6.884 7.121 7.343 7.584 7.824 8.069 8.329 8.597 8.905 9.22 9.547 9.891 10.28 10.648 10.961 11.24 11.341 10.912 10.321 9.743 9.16 8.6 8.054 7.538 7.115 6.683 6.309 5.977 5.666 5.376 5.095 4.824 4.53 4.254 4.007 3.76 3.515 3.312 3.092 2.845 2.642 2.434 2.23 2.023 1.8 1.639 1.484 1.238 1.06 0.881 0.781 0.568 0.366 0.131 -0.008 -0.246 -0.467 -0.627 -0.786 -1.104 -1.291 -1.49 -1.715 -2.0 -2.354 -2.78 -3.98 -9 ,24458 ,KEBNE ,16679177,Thu Nov 25 06:31:32 CET,Thu Nov 25 08:00:44 CET,0.0 1.205 1.54 1.784 2.0 2.17 2.31 2.45 2.693 2.801 2.902 3.012 3.19 3.286 3.475 3.64 3.788 3.864 4.013 4.155 4.367 4.516 4.667 4.894 5.105 5.281 5.433 5.571 5.744 5.912 6.074 6.264 6.446 6.621 6.826 7.064 7.295 7.53 7.765 8.005 8.258 8.546 8.844 9.119 9.412 9.757 10.186 10.612 10.987 11.304 11.468 11.178 10.718 10.164 9.54 8.968 8.472 7.972 7.551 7.151 6.774 6.428 6.074 5.69 5.322 5.0 4.674 4.403 4.163 3.88 3.592 3.372 3.141 2.894 2.694 2.473 2.265 2.061 1.83 1.679 1.52 1.266 1.096 0.908 0.805 0.59 0.354 0.111 -0.017 -0.255 -0.45 -0.596 -0.76 -1.098 -1.273 -1.477 -1.695 -1.957 -2.323 -2.837 -4.798 -10 ,27918 ,KEBNE ,16679178,Thu Nov 25 06:31:32 CET,Thu Nov 25 07:59:24 CET,0.0 1.127 1.502 1.733 1.876 2.028 2.186 2.335 2.614 2.736 2.842 2.968 3.15 3.231 3.401 3.573 3.716 3.785 3.925 4.075 4.299 4.435 4.56 4.722 4.881 5.037 5.176 5.31 5.491 5.667 5.84 6.033 6.212 6.394 6.598 6.821 7.044 7.276 7.519 7.78 8.051 8.335 8.638 8.972 9.377 9.771 10.144 10.505 10.904 11.227 11.187 10.819 10.326 9.688 9.058 8.494 7.986 7.522 7.136 6.76 6.389 6.012 5.657 5.348 5.04 4.736 4.42 4.14 3.879 3.596 3.318 3.085 2.84 2.603 2.429 2.236 2.02 1.792 1.56 1.406 1.243 0.979 0.816 0.644 0.545 0.351 0.147 -0.086 -0.225 -0.468 -0.665 -0.813 -0.963 -1.278 -1.46 -1.678 -1.91 -2.185 -2.562 -3.072 -4.962 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8b_8a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8b_8a.txt deleted file mode 100644 index 9f6fd79d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8b_8a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31623 ,KEBNE ,16679179,Thu Nov 25 06:31:32 CET,Thu Nov 25 08:01:30 CET,0.0 0.515 0.777 0.98 1.153 1.315 1.443 1.554 1.787 1.887 1.983 2.032 2.276 2.369 2.538 2.701 2.856 2.925 3.059 3.181 3.366 3.483 3.592 3.76 3.926 4.09 4.251 4.396 4.572 4.752 4.928 5.132 5.323 5.505 5.732 5.994 6.226 6.469 6.747 7.049 7.349 7.69 8.076 8.436 8.862 9.329 9.845 10.382 10.929 11.478 11.951 12.079 11.908 11.648 11.368 11.058 10.767 10.472 10.188 9.904 9.634 9.391 9.158 8.927 8.702 8.488 8.273 8.07 7.881 7.695 7.5 7.338 7.173 6.987 6.837 6.681 6.512 6.342 6.176 6.051 5.91 5.693 5.558 5.42 5.345 5.19 5.012 4.816 4.716 4.47 4.396 4.267 4.132 3.839 3.66 3.469 3.275 3.05 2.743 2.357 1.356 -2 ,3821 ,KEBNE ,16679180,Thu Nov 25 06:31:32 CET,Thu Nov 25 07:59:26 CET,0.0 0.629 0.902 1.078 1.23 1.391 1.543 1.674 1.907 2.014 2.117 2.162 2.399 2.488 2.655 2.807 2.95 3.021 3.159 3.289 3.49 3.615 3.732 3.892 4.046 4.211 4.377 4.539 4.739 4.924 5.1 5.296 5.479 5.666 5.88 6.126 6.374 6.638 6.915 7.198 7.497 7.833 8.201 8.56 8.959 9.439 9.969 10.446 10.957 11.483 11.932 12.072 11.942 11.681 11.389 11.074 10.78 10.48 10.181 9.881 9.622 9.394 9.172 8.941 8.713 8.497 8.264 8.049 7.869 7.677 7.473 7.304 7.114 6.917 6.776 6.621 6.455 6.289 6.111 5.987 5.857 5.656 5.513 5.363 5.291 5.129 4.953 4.791 4.71 4.476 4.421 4.288 4.143 3.826 3.658 3.483 3.28 3.014 2.693 2.317 1.444 -3 ,30697 ,KEBNE ,16679181,Thu Nov 25 06:31:36 CET,Thu Nov 25 07:55:42 CET,0.0 0.734 1.038 1.272 1.46 1.615 1.746 1.867 2.114 2.228 2.33 2.379 2.631 2.718 2.882 3.056 3.222 3.3 3.448 3.595 3.814 3.946 4.059 4.217 4.373 4.525 4.681 4.831 5.028 5.213 5.388 5.603 5.806 6.013 6.251 6.511 6.758 7.019 7.305 7.601 7.883 8.189 8.54 8.892 9.308 9.754 10.225 10.735 11.301 11.892 12.387 12.518 12.398 12.167 11.903 11.617 11.336 11.036 10.756 10.454 10.188 9.946 9.687 9.444 9.226 9.024 8.803 8.605 8.435 8.259 8.075 7.896 7.695 7.502 7.35 7.192 7.026 6.846 6.657 6.531 6.399 6.176 6.028 5.876 5.793 5.607 5.425 5.25 5.161 4.919 4.85 4.731 4.585 4.285 4.157 4.011 3.821 3.603 3.349 3.029 2.32 -4 ,8167 ,KEBNE ,16679182,Thu Nov 25 06:31:32 CET,Thu Nov 25 08:00:26 CET,0.0 0.823 1.038 1.233 1.401 1.548 1.677 1.802 2.047 2.151 2.249 2.299 2.552 2.639 2.792 2.945 3.088 3.16 3.306 3.443 3.632 3.76 3.88 4.037 4.198 4.356 4.502 4.64 4.816 5.003 5.189 5.401 5.607 5.797 6.003 6.247 6.487 6.738 6.993 7.275 7.589 7.929 8.311 8.691 9.118 9.583 10.111 10.682 11.253 11.828 12.369 12.55 12.406 12.125 11.836 11.524 11.219 10.947 10.682 10.387 10.118 9.857 9.606 9.373 9.158 8.959 8.741 8.531 8.345 8.137 7.894 7.71 7.533 7.336 7.179 7.008 6.823 6.639 6.45 6.307 6.156 5.924 5.768 5.617 5.536 5.371 5.2 5.002 4.896 4.647 4.573 4.449 4.318 4.039 3.897 3.726 3.518 3.313 3.059 2.717 1.458 -5 ,7442 ,KEBNE ,16679183,Thu Nov 25 06:31:32 CET,Thu Nov 25 08:00:05 CET,0.0 0.667 0.94 1.157 1.324 1.459 1.586 1.712 1.94 2.049 2.164 2.217 2.452 2.538 2.695 2.849 2.994 3.069 3.23 3.373 3.563 3.683 3.797 3.973 4.143 4.292 4.434 4.582 4.77 4.942 5.113 5.32 5.511 5.693 5.901 6.136 6.368 6.626 6.896 7.174 7.491 7.841 8.215 8.585 9.002 9.446 9.956 10.504 11.056 11.59 12.068 12.228 12.112 11.906 11.65 11.348 11.064 10.774 10.47 10.161 9.888 9.636 9.394 9.172 8.972 8.778 8.569 8.363 8.168 7.97 7.773 7.612 7.421 7.218 7.08 6.938 6.783 6.61 6.427 6.302 6.172 5.972 5.831 5.684 5.611 5.455 5.275 5.082 4.982 4.732 4.689 4.579 4.452 4.191 4.044 3.868 3.676 3.461 3.167 2.81 1.922 -6 ,17645 ,KEBNE ,16679184,Thu Nov 25 06:32:33 CET,Thu Nov 25 08:01:14 CET,0.0 0.435 0.646 0.795 0.944 1.091 1.228 1.345 1.543 1.653 1.76 1.796 2.034 2.123 2.295 2.445 2.598 2.675 2.817 2.964 3.179 3.309 3.433 3.618 3.786 3.941 4.095 4.242 4.428 4.614 4.797 5.013 5.224 5.42 5.645 5.907 6.155 6.422 6.694 6.99 7.317 7.656 8.022 8.382 8.796 9.272 9.809 10.322 10.849 11.41 11.852 12.013 11.967 11.789 11.502 11.157 10.849 10.538 10.236 9.942 9.685 9.453 9.205 8.957 8.739 8.533 8.311 8.113 7.94 7.751 7.556 7.397 7.208 6.994 6.84 6.694 6.534 6.353 6.168 6.042 5.915 5.726 5.598 5.457 5.381 5.232 5.077 4.894 4.793 4.55 4.474 4.355 4.228 3.929 3.776 3.605 3.424 3.216 2.918 2.513 1.606 -7 ,22924 ,KEBNE ,16679185,Thu Nov 25 06:32:33 CET,Thu Nov 25 08:00:42 CET,0.0 0.706 0.94 1.118 1.284 1.445 1.592 1.743 2.012 2.129 2.236 2.288 2.535 2.622 2.79 2.954 3.116 3.192 3.342 3.493 3.708 3.834 3.954 4.14 4.314 4.481 4.649 4.799 4.982 5.161 5.329 5.531 5.726 5.927 6.158 6.407 6.644 6.894 7.16 7.43 7.709 8.016 8.383 8.765 9.2 9.658 10.149 10.653 11.169 11.695 12.179 12.327 12.208 11.943 11.644 11.339 11.047 10.783 10.52 10.222 9.961 9.717 9.483 9.254 9.02 8.803 8.585 8.393 8.214 8.024 7.819 7.647 7.474 7.29 7.144 6.984 6.822 6.662 6.494 6.373 6.245 6.051 5.911 5.746 5.66 5.492 5.319 5.14 5.037 4.777 4.705 4.59 4.466 4.186 4.035 3.885 3.71 3.505 3.259 2.865 1.836 -8 ,22781 ,KEBNE ,16679186,Thu Nov 25 06:32:33 CET,Thu Nov 25 08:02:09 CET,0.0 0.757 1.016 1.232 1.42 1.596 1.738 1.857 2.082 2.186 2.287 2.322 2.552 2.634 2.808 2.964 3.102 3.166 3.298 3.425 3.603 3.717 3.82 3.974 4.127 4.286 4.438 4.581 4.775 4.954 5.128 5.341 5.533 5.716 5.936 6.185 6.416 6.66 6.927 7.219 7.512 7.831 8.226 8.607 9.018 9.462 9.987 10.547 11.113 11.668 12.15 12.326 12.184 11.939 11.655 11.339 11.038 10.738 10.462 10.162 9.892 9.655 9.425 9.202 8.986 8.775 8.553 8.362 8.183 8.0 7.818 7.649 7.473 7.301 7.162 7.01 6.839 6.661 6.48 6.354 6.24 6.059 5.914 5.754 5.67 5.506 5.336 5.129 5.013 4.763 4.701 4.585 4.45 4.116 3.937 3.755 3.55 3.292 3.011 2.712 1.954 -9 ,20690 ,KEBNE ,16679187,Thu Nov 25 06:32:37 CET,Thu Nov 25 07:58:33 CET,0.0 0.949 1.239 1.46 1.676 1.858 2.009 2.152 2.394 2.499 2.598 2.629 2.863 2.946 3.103 3.257 3.407 3.481 3.629 3.768 3.966 4.086 4.195 4.354 4.511 4.674 4.832 4.976 5.156 5.347 5.532 5.726 5.921 6.12 6.344 6.579 6.797 7.055 7.331 7.619 7.924 8.24 8.588 8.951 9.372 9.803 10.284 10.791 11.299 11.825 12.304 12.377 12.228 12.016 11.749 11.435 11.116 10.81 10.529 10.234 9.963 9.707 9.45 9.199 8.964 8.748 8.518 8.311 8.128 7.924 7.71 7.543 7.364 7.169 7.014 6.852 6.684 6.508 6.304 6.169 6.04 5.837 5.692 5.536 5.457 5.304 5.147 4.976 4.885 4.651 4.591 4.473 4.356 4.092 3.939 3.766 3.59 3.397 3.172 2.884 2.186 -10 ,1644 ,KEBNE ,16679188,Thu Nov 25 06:32:37 CET,Thu Nov 25 07:58:45 CET,0.0 0.594 0.818 1.01 1.182 1.333 1.475 1.615 1.883 2.008 2.116 2.161 2.403 2.492 2.667 2.831 2.976 3.047 3.183 3.306 3.499 3.634 3.756 3.924 4.087 4.235 4.376 4.521 4.712 4.897 5.074 5.281 5.485 5.682 5.903 6.141 6.376 6.642 6.925 7.212 7.51 7.849 8.221 8.587 8.993 9.433 9.936 10.461 11.026 11.595 12.056 12.186 12.057 11.78 11.486 11.163 10.858 10.594 10.341 10.061 9.804 9.56 9.329 9.106 8.869 8.642 8.409 8.212 8.047 7.86 7.659 7.486 7.298 7.11 6.96 6.805 6.648 6.482 6.301 6.177 6.052 5.849 5.713 5.582 5.515 5.348 5.156 4.96 4.861 4.615 4.546 4.438 4.325 4.066 3.911 3.741 3.564 3.352 3.078 2.744 1.949 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8d_8c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8d_8c.txt deleted file mode 100644 index 59cc4f27..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8d_8c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27198 ,KEBNE ,16679189,Thu Nov 25 06:33:34 CET,Thu Nov 25 08:05:00 CET,0.0 0.546 0.794 1.023 1.211 1.368 1.507 1.63 1.84 1.941 2.046 2.074 2.333 2.409 2.556 2.698 2.842 2.909 3.032 3.16 3.342 3.453 3.574 3.744 3.9 4.049 4.175 4.299 4.456 4.6 4.751 4.94 5.131 5.313 5.497 5.705 5.908 6.124 6.353 6.606 6.889 7.201 7.553 7.871 8.202 8.537 8.908 9.278 9.548 9.631 9.331 8.746 8.089 7.337 6.611 5.948 5.386 4.86 4.376 3.879 3.439 3.061 2.712 2.368 2.037 1.738 1.44 1.177 0.938 0.693 0.441 0.22 -0.013 -0.241 -0.416 -0.609 -0.802 -0.997 -1.211 -1.35 -1.494 -1.728 -1.883 -2.043 -2.13 -2.3 -2.471 -2.651 -2.755 -3.049 -3.097 -3.229 -3.364 -3.644 -3.8 -3.969 -4.157 -4.38 -4.688 -5.067 -5.978 -2 ,12559 ,KEBNE ,16679190,Thu Nov 25 06:33:34 CET,Thu Nov 25 08:03:19 CET,0.0 0.678 0.967 1.205 1.382 1.546 1.697 1.821 2.058 2.165 2.271 2.307 2.564 2.639 2.787 2.939 3.083 3.149 3.272 3.397 3.6 3.725 3.833 3.981 4.13 4.279 4.418 4.55 4.717 4.869 5.006 5.186 5.364 5.539 5.743 5.947 6.131 6.333 6.554 6.786 7.033 7.3 7.591 7.891 8.243 8.597 8.932 9.252 9.553 9.717 9.501 8.887 8.218 7.565 6.879 6.204 5.591 5.027 4.554 4.06 3.609 3.216 2.861 2.513 2.182 1.897 1.606 1.331 1.093 0.859 0.601 0.394 0.197 -0.019 -0.19 -0.367 -0.561 -0.765 -0.967 -1.113 -1.276 -1.528 -1.703 -1.888 -1.981 -2.174 -2.371 -2.569 -2.675 -2.961 -3.022 -3.149 -3.28 -3.556 -3.718 -3.91 -4.117 -4.366 -4.68 -5.093 -6.52 -3 ,10446 ,KEBNE ,16679191,Thu Nov 25 06:33:34 CET,Thu Nov 25 08:00:48 CET,0.0 1.152 1.449 1.681 1.882 2.026 2.157 2.294 2.542 2.641 2.731 2.73 2.987 3.07 3.234 3.387 3.53 3.598 3.725 3.842 4.007 4.108 4.209 4.36 4.506 4.648 4.784 4.914 5.091 5.263 5.43 5.634 5.831 6.013 6.178 6.345 6.517 6.743 6.99 7.212 7.453 7.717 8.009 8.321 8.673 8.989 9.291 9.618 9.907 10.05 9.829 9.07 8.284 7.54 6.836 6.169 5.6 5.08 4.614 4.159 3.725 3.326 2.96 2.616 2.303 2.003 1.666 1.381 1.166 0.948 0.716 0.516 0.307 0.108 -0.043 -0.207 -0.377 -0.573 -0.791 -0.942 -1.093 -1.328 -1.499 -1.679 -1.769 -1.957 -2.159 -2.373 -2.487 -2.782 -2.844 -2.977 -3.116 -3.415 -3.58 -3.779 -4.004 -4.256 -4.528 -4.86 -5.848 -4 ,13869 ,KEBNE ,16679192,Thu Nov 25 06:33:34 CET,Thu Nov 25 08:01:59 CET,0.0 0.82 1.112 1.341 1.515 1.677 1.823 1.951 2.188 2.297 2.39 2.378 2.636 2.72 2.868 3.009 3.146 3.217 3.357 3.491 3.661 3.756 3.852 4.004 4.157 4.289 4.411 4.533 4.674 4.805 4.931 5.079 5.214 5.367 5.563 5.779 6.001 6.238 6.466 6.697 6.955 7.231 7.546 7.857 8.189 8.544 8.909 9.27 9.569 9.775 9.661 9.016 8.349 7.641 6.935 6.3 5.714 5.109 4.602 4.17 3.82 3.499 3.175 2.875 2.607 2.349 2.088 1.856 1.634 1.39 1.119 0.896 0.695 0.508 0.353 0.174 -0.024 -0.231 -0.438 -0.576 -0.722 -0.966 -1.149 -1.329 -1.416 -1.596 -1.784 -2.002 -2.121 -2.42 -2.487 -2.62 -2.761 -3.065 -3.227 -3.39 -3.578 -3.825 -4.134 -4.539 -5.461 -5 ,10810 ,KEBNE ,16679193,Thu Nov 25 06:33:34 CET,Thu Nov 25 08:00:59 CET,0.0 1.192 1.559 1.789 1.965 2.131 2.279 2.401 2.612 2.71 2.798 2.809 3.067 3.146 3.3 3.449 3.588 3.654 3.789 3.92 4.11 4.236 4.347 4.496 4.641 4.784 4.92 5.053 5.234 5.398 5.545 5.728 5.891 6.028 6.199 6.411 6.63 6.86 7.086 7.335 7.586 7.849 8.151 8.439 8.788 9.15 9.494 9.839 10.206 10.4 10.183 9.556 8.773 7.995 7.4 6.916 6.431 5.956 5.508 5.04 4.635 4.255 3.903 3.594 3.295 3.029 2.751 2.471 2.231 1.99 1.737 1.519 1.29 1.054 0.871 0.687 0.507 0.319 0.099 -0.057 -0.205 -0.434 -0.59 -0.74 -0.826 -1.018 -1.209 -1.42 -1.524 -1.8 -1.854 -1.988 -2.121 -2.408 -2.564 -2.727 -2.947 -3.203 -3.496 -3.864 -4.785 -6 ,15298 ,KEBNE ,16679194,Thu Nov 25 06:33:35 CET,Thu Nov 25 08:01:33 CET,0.0 0.863 1.204 1.464 1.636 1.767 1.907 2.041 2.258 2.362 2.469 2.482 2.744 2.833 3.0 3.148 3.283 3.35 3.479 3.596 3.758 3.858 3.961 4.127 4.271 4.398 4.531 4.662 4.827 4.978 5.143 5.34 5.514 5.693 5.891 6.086 6.295 6.534 6.771 7.01 7.267 7.564 7.878 8.182 8.522 8.864 9.19 9.467 9.754 9.954 9.855 9.309 8.569 7.789 7.061 6.415 5.847 5.333 4.864 4.396 4.019 3.702 3.41 3.104 2.81 2.557 2.263 1.981 1.742 1.496 1.242 1.026 0.801 0.562 0.396 0.228 0.037 -0.159 -0.367 -0.514 -0.66 -0.883 -1.041 -1.211 -1.297 -1.465 -1.647 -1.857 -1.968 -2.253 -2.343 -2.492 -2.625 -2.908 -3.058 -3.22 -3.422 -3.649 -3.898 -4.182 -5.171 -7 ,28982 ,KEBNE ,16679195,Thu Nov 25 06:33:34 CET,Thu Nov 25 08:01:12 CET,0.0 0.909 1.238 1.502 1.708 1.854 1.983 2.099 2.321 2.434 2.543 2.567 2.827 2.913 3.084 3.236 3.374 3.444 3.577 3.695 3.849 3.967 4.088 4.245 4.397 4.538 4.669 4.805 4.976 5.132 5.282 5.449 5.625 5.79 5.941 6.105 6.278 6.479 6.699 6.925 7.165 7.446 7.753 8.038 8.359 8.712 9.063 9.362 9.666 9.867 9.654 8.901 8.152 7.408 6.672 6.019 5.438 4.905 4.447 4.009 3.607 3.222 2.862 2.5 2.161 1.862 1.565 1.325 1.1 0.859 0.612 0.409 0.198 -0.028 -0.201 -0.385 -0.576 -0.764 -0.965 -1.119 -1.274 -1.498 -1.655 -1.829 -1.918 -2.098 -2.299 -2.506 -2.607 -2.9 -2.962 -3.086 -3.221 -3.498 -3.662 -3.865 -4.086 -4.322 -4.607 -5.005 -6.224 -8 ,9449 ,KEBNE ,16679196,Thu Nov 25 06:33:34 CET,Thu Nov 25 08:00:38 CET,0.0 0.606 0.842 1.03 1.188 1.336 1.485 1.618 1.836 1.942 2.051 2.076 2.342 2.437 2.614 2.759 2.887 2.949 3.083 3.225 3.412 3.528 3.64 3.788 3.933 4.081 4.237 4.381 4.549 4.716 4.872 5.066 5.263 5.435 5.626 5.846 6.051 6.261 6.482 6.724 6.978 7.254 7.556 7.849 8.16 8.494 8.882 9.237 9.54 9.781 9.697 9.107 8.364 7.61 6.895 6.226 5.658 5.143 4.689 4.236 3.83 3.433 3.058 2.705 2.371 2.085 1.783 1.495 1.245 0.992 0.737 0.533 0.312 0.053 -0.151 -0.35 -0.552 -0.744 -0.938 -1.082 -1.231 -1.452 -1.61 -1.783 -1.875 -2.051 -2.232 -2.434 -2.538 -2.82 -2.882 -3.015 -3.151 -3.471 -3.648 -3.827 -4.021 -4.243 -4.507 -4.87 -6.002 -9 ,16342 ,KEBNE ,16679197,Thu Nov 25 06:34:35 CET,Thu Nov 25 08:01:40 CET,0.0 0.885 1.197 1.442 1.619 1.774 1.922 2.052 2.278 2.379 2.48 2.484 2.737 2.824 2.986 3.139 3.271 3.333 3.446 3.559 3.748 3.867 3.978 4.136 4.285 4.432 4.565 4.697 4.864 5.027 5.185 5.363 5.535 5.709 5.915 6.123 6.325 6.539 6.777 7.038 7.288 7.585 7.932 8.261 8.636 8.977 9.318 9.678 9.941 10.019 9.775 9.114 8.392 7.677 6.959 6.272 5.666 5.132 4.651 4.165 3.75 3.361 2.995 2.656 2.324 2.021 1.726 1.465 1.237 1.001 0.739 0.515 0.292 0.047 -0.139 -0.311 -0.491 -0.696 -0.903 -1.045 -1.205 -1.455 -1.62 -1.774 -1.854 -2.034 -2.218 -2.415 -2.521 -2.8 -2.851 -2.98 -3.114 -3.403 -3.57 -3.772 -3.984 -4.222 -4.525 -4.915 -6.221 -10 ,27092 ,KEBNE ,16679198,Thu Nov 25 06:34:35 CET,Thu Nov 25 08:04:03 CET,0.0 0.852 1.172 1.395 1.549 1.689 1.841 1.964 2.159 2.245 2.32 2.314 2.578 2.657 2.808 2.944 3.077 3.144 3.268 3.393 3.577 3.687 3.79 3.95 4.105 4.256 4.401 4.533 4.717 4.886 5.023 5.189 5.36 5.525 5.72 5.951 6.168 6.398 6.651 6.91 7.157 7.437 7.753 8.038 8.382 8.749 9.116 9.47 9.736 9.895 9.723 9.016 8.26 7.551 6.887 6.244 5.643 5.097 4.615 4.095 3.663 3.3 2.941 2.606 2.296 1.999 1.69 1.412 1.167 0.912 0.644 0.414 0.172 -0.062 -0.24 -0.423 -0.61 -0.802 -0.999 -1.136 -1.28 -1.505 -1.675 -1.842 -1.92 -2.106 -2.31 -2.519 -2.627 -2.911 -2.961 -3.087 -3.225 -3.534 -3.697 -3.886 -4.109 -4.363 -4.651 -5.006 -6.029 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8a.txt deleted file mode 100644 index 3366ecea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1559 ,KEBNE ,16679199,Thu Nov 25 06:34:35 CET,Thu Nov 25 08:03:58 CET,0.0 0.74 1.037 1.268 1.456 1.614 1.757 1.893 2.164 2.302 2.422 2.478 2.743 2.84 3.034 3.221 3.395 3.475 3.633 3.796 4.02 4.163 4.307 4.517 4.717 4.907 5.087 5.255 5.476 5.688 5.9 6.168 6.428 6.68 6.961 7.27 7.564 7.898 8.263 8.628 9.028 9.51 10.041 10.555 11.158 11.817 12.574 13.403 14.309 15.367 16.555 17.338 17.732 17.912 17.942 17.911 17.858 17.799 17.712 17.608 17.522 17.42 17.31 17.198 17.075 16.962 16.852 16.751 16.65 16.543 16.436 16.347 16.257 16.159 16.079 15.985 15.875 15.773 15.659 15.576 15.49 15.354 15.269 15.171 15.111 14.992 14.873 14.729 14.648 14.42 14.379 14.285 14.204 14.016 13.906 13.776 13.63 13.48 13.305 13.06 12.425 -2 ,1308 ,KEBNE ,16679200,Thu Nov 25 06:35:36 CET,Thu Nov 25 08:03:52 CET,0.0 0.739 1.063 1.28 1.45 1.6 1.741 1.893 2.179 2.297 2.409 2.463 2.725 2.82 2.996 3.172 3.353 3.443 3.609 3.766 3.983 4.128 4.276 4.489 4.697 4.879 5.053 5.233 5.463 5.683 5.899 6.16 6.41 6.658 6.935 7.235 7.523 7.84 8.194 8.572 8.969 9.412 9.937 10.446 10.993 11.606 12.342 13.192 14.156 15.202 16.395 17.254 17.573 17.69 17.712 17.682 17.616 17.52 17.429 17.308 17.182 17.072 16.952 16.828 16.7 16.567 16.427 16.306 16.208 16.104 15.987 15.881 15.765 15.649 15.553 15.452 15.359 15.269 15.159 15.078 14.991 14.842 14.743 14.634 14.581 14.481 14.357 14.237 14.178 13.964 13.966 13.882 13.795 13.607 13.498 13.367 13.207 13.058 12.866 12.636 11.984 -3 ,23471 ,KEBNE ,16679201,Thu Nov 25 06:35:36 CET,Thu Nov 25 08:05:21 CET,0.0 0.676 0.945 1.125 1.311 1.475 1.624 1.779 2.046 2.164 2.278 2.323 2.583 2.679 2.857 3.042 3.22 3.305 3.471 3.622 3.839 3.998 4.158 4.367 4.553 4.734 4.91 5.085 5.314 5.527 5.726 5.982 6.241 6.484 6.77 7.113 7.43 7.757 8.106 8.476 8.877 9.331 9.846 10.349 10.922 11.59 12.369 13.249 14.245 15.283 16.475 17.332 17.653 17.761 17.798 17.776 17.688 17.569 17.47 17.358 17.254 17.163 17.048 16.924 16.801 16.69 16.567 16.45 16.351 16.238 16.115 16.008 15.902 15.805 15.728 15.64 15.533 15.411 15.292 15.22 15.145 15.012 14.906 14.79 14.729 14.614 14.502 14.368 14.295 14.08 14.087 14.009 13.924 13.729 13.608 13.475 13.32 13.128 12.934 12.719 12.044 -4 ,24000 ,KEBNE ,16679202,Thu Nov 25 06:35:36 CET,Thu Nov 25 08:03:18 CET,0.0 1.122 1.534 1.791 1.966 2.114 2.267 2.409 2.672 2.79 2.901 2.958 3.222 3.318 3.493 3.665 3.843 3.936 4.103 4.252 4.456 4.595 4.732 4.931 5.134 5.325 5.51 5.69 5.921 6.156 6.383 6.643 6.883 7.119 7.403 7.727 8.042 8.389 8.756 9.116 9.496 9.951 10.48 11.002 11.608 12.275 13.025 13.84 14.76 15.865 17.105 17.902 18.278 18.429 18.481 18.46 18.397 18.32 18.227 18.121 18.029 17.93 17.803 17.685 17.585 17.484 17.363 17.252 17.16 17.05 16.93 16.83 16.721 16.606 16.513 16.417 16.312 16.209 16.101 16.02 15.929 15.787 15.696 15.59 15.532 15.407 15.277 15.15 15.087 14.87 14.863 14.785 14.697 14.498 14.387 14.262 14.119 13.959 13.752 13.423 12.908 -5 ,23580 ,KEBNE ,16679203,Thu Nov 25 06:35:36 CET,Thu Nov 25 08:03:44 CET,0.0 1.029 1.378 1.604 1.81 1.969 2.102 2.247 2.515 2.636 2.755 2.825 3.092 3.194 3.39 3.585 3.765 3.853 4.029 4.188 4.402 4.544 4.69 4.891 5.079 5.268 5.456 5.637 5.868 6.084 6.296 6.567 6.83 7.08 7.371 7.693 7.996 8.332 8.688 9.071 9.492 9.961 10.488 10.999 11.585 12.237 12.985 13.815 14.787 15.871 17.033 17.829 18.171 18.336 18.386 18.34 18.264 18.179 18.092 17.988 17.869 17.76 17.666 17.557 17.442 17.333 17.212 17.105 17.001 16.886 16.781 16.695 16.586 16.466 16.377 16.281 16.178 16.067 15.947 15.862 15.769 15.625 15.529 15.429 15.38 15.272 15.152 15.027 14.961 14.747 14.733 14.642 14.552 14.355 14.243 14.112 13.969 13.844 13.681 13.428 12.851 -6 ,12568 ,KEBNE ,16679204,Thu Nov 25 06:36:37 CET,Thu Nov 25 08:05:12 CET,0.0 0.47 0.745 0.968 1.168 1.333 1.484 1.617 1.871 1.989 2.091 2.143 2.397 2.484 2.663 2.849 3.024 3.108 3.284 3.435 3.647 3.799 3.937 4.135 4.34 4.537 4.719 4.896 5.117 5.333 5.545 5.807 6.064 6.301 6.575 6.889 7.187 7.516 7.864 8.238 8.637 9.071 9.593 10.127 10.722 11.364 12.111 12.964 13.895 14.931 16.155 17.026 17.41 17.544 17.586 17.569 17.49 17.393 17.284 17.143 17.031 16.916 16.795 16.676 16.551 16.436 16.31 16.209 16.117 15.996 15.868 15.773 15.67 15.548 15.452 15.362 15.265 15.161 15.052 14.974 14.894 14.782 14.697 14.596 14.548 14.439 14.305 14.182 14.126 13.919 13.949 13.878 13.795 13.595 13.478 13.344 13.187 13.015 12.817 12.591 12.023 -7 ,5943 ,KEBNE ,16679205,Thu Nov 25 06:36:37 CET,Thu Nov 25 08:06:03 CET,0.0 0.678 0.994 1.24 1.437 1.606 1.757 1.882 2.112 2.237 2.36 2.415 2.682 2.79 2.986 3.162 3.317 3.401 3.576 3.736 3.96 4.103 4.244 4.45 4.65 4.836 5.004 5.175 5.414 5.646 5.863 6.123 6.375 6.625 6.903 7.216 7.527 7.867 8.234 8.628 9.033 9.486 10.014 10.536 11.15 11.824 12.597 13.481 14.508 15.635 16.831 17.681 18.059 18.21 18.276 18.254 18.155 18.038 17.953 17.849 17.732 17.621 17.508 17.386 17.265 17.142 17.006 16.883 16.78 16.674 16.562 16.473 16.373 16.262 16.179 16.085 15.979 15.869 15.75 15.672 15.6 15.469 15.372 15.27 15.214 15.109 14.996 14.856 14.792 14.581 14.574 14.493 14.407 14.214 14.094 13.949 13.804 13.657 13.418 13.11 12.116 -8 ,26729 ,KEBNE ,16679206,Thu Nov 25 06:36:38 CET,Thu Nov 25 08:06:04 CET,0.0 0.849 1.152 1.334 1.505 1.671 1.835 1.986 2.254 2.384 2.501 2.549 2.806 2.908 3.105 3.287 3.469 3.557 3.722 3.877 4.116 4.264 4.401 4.599 4.783 4.977 5.168 5.341 5.562 5.78 5.992 6.249 6.5 6.746 7.036 7.355 7.642 7.969 8.339 8.715 9.113 9.578 10.093 10.588 11.189 11.869 12.635 13.519 14.534 15.609 16.757 17.568 17.929 18.066 18.116 18.096 18.013 17.909 17.804 17.696 17.601 17.501 17.38 17.278 17.178 17.073 16.964 16.862 16.771 16.677 16.562 16.46 16.357 16.248 16.16 16.056 15.958 15.856 15.73 15.642 15.555 15.419 15.329 15.237 15.19 15.083 14.965 14.842 14.769 14.539 14.528 14.463 14.383 14.187 14.073 13.949 13.823 13.688 13.499 13.196 12.355 -9 ,29627 ,KEBNE ,16679207,Thu Nov 25 06:36:38 CET,Thu Nov 25 08:10:29 CET,0.0 0.535 0.836 1.05 1.218 1.374 1.526 1.664 1.908 2.028 2.136 2.183 2.444 2.543 2.725 2.894 3.065 3.154 3.323 3.477 3.696 3.84 3.979 4.17 4.355 4.536 4.718 4.896 5.117 5.335 5.551 5.822 6.063 6.281 6.551 6.862 7.16 7.491 7.851 8.227 8.624 9.07 9.555 10.059 10.691 11.391 12.185 13.063 14.01 15.04 16.197 16.985 17.33 17.478 17.54 17.532 17.449 17.347 17.255 17.149 17.031 16.912 16.802 16.681 16.545 16.43 16.311 16.176 16.065 15.956 15.842 15.751 15.654 15.549 15.46 15.37 15.278 15.184 15.082 15.004 14.916 14.779 14.68 14.574 14.526 14.413 14.279 14.146 14.083 13.88 13.898 13.822 13.737 13.524 13.41 13.291 13.139 12.94 12.742 12.534 11.956 -10 ,6515 ,KEBNE ,16679208,Thu Nov 25 06:36:41 CET,Thu Nov 25 08:01:18 CET,0.0 0.748 0.994 1.201 1.381 1.536 1.675 1.798 2.034 2.147 2.252 2.3 2.563 2.66 2.848 3.035 3.217 3.304 3.464 3.618 3.852 4.007 4.153 4.362 4.554 4.732 4.916 5.094 5.336 5.57 5.798 6.076 6.331 6.583 6.872 7.186 7.503 7.848 8.208 8.58 8.959 9.398 9.914 10.442 11.054 11.728 12.514 13.353 14.252 15.246 16.443 17.332 17.779 17.988 18.033 18.01 17.958 17.866 17.749 17.628 17.503 17.374 17.253 17.138 17.019 16.909 16.793 16.684 16.581 16.468 16.355 16.263 16.168 16.066 15.983 15.898 15.801 15.693 15.568 15.484 15.402 15.27 15.187 15.099 15.044 14.939 14.842 14.736 14.673 14.445 14.419 14.335 14.236 14.011 13.895 13.778 13.633 13.449 13.244 13.004 12.294 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8c.txt deleted file mode 100644 index 610da186..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13468 ,KEBNE ,16679209,Thu Nov 25 06:37:39 CET,Thu Nov 25 08:04:43 CET,0.0 0.876 1.18 1.402 1.561 1.704 1.825 1.927 2.132 2.23 2.325 2.34 2.566 2.632 2.752 2.862 2.974 3.029 3.127 3.217 3.355 3.452 3.545 3.674 3.787 3.882 3.966 4.048 4.168 4.299 4.425 4.583 4.739 4.88 5.023 5.152 5.29 5.462 5.654 5.851 6.047 6.258 6.474 6.69 6.926 7.156 7.395 7.554 7.596 7.454 7.02 6.099 5.097 4.178 3.27 2.428 1.688 1.021 0.439 -0.166 -0.704 -1.198 -1.663 -2.087 -2.473 -2.818 -3.185 -3.508 -3.788 -4.112 -4.444 -4.719 -5.003 -5.273 -5.485 -5.712 -5.945 -6.197 -6.47 -6.654 -6.837 -7.132 -7.338 -7.548 -7.654 -7.856 -8.066 -8.323 -8.468 -8.789 -8.888 -9.046 -9.225 -9.637 -9.857 -10.063 -10.301 -10.62 -10.986 -11.498 -13.409 -2 ,32517 ,KEBNE ,16679210,Thu Nov 25 06:38:41 CET,Thu Nov 25 08:06:36 CET,0.0 0.715 0.938 1.122 1.312 1.483 1.596 1.708 1.917 2.005 2.098 2.117 2.346 2.412 2.55 2.674 2.792 2.855 2.967 3.076 3.232 3.327 3.421 3.558 3.693 3.823 3.939 4.055 4.209 4.348 4.47 4.603 4.728 4.855 5.006 5.179 5.343 5.507 5.689 5.868 6.065 6.297 6.509 6.721 6.944 7.147 7.391 7.576 7.681 7.619 7.13 6.207 5.246 4.261 3.366 2.556 1.804 1.116 0.526 -0.077 -0.597 -1.074 -1.547 -1.974 -2.359 -2.722 -3.095 -3.42 -3.699 -3.995 -4.324 -4.599 -4.868 -5.14 -5.358 -5.586 -5.836 -6.106 -6.378 -6.552 -6.738 -7.033 -7.222 -7.439 -7.558 -7.804 -8.053 -8.319 -8.465 -8.778 -8.886 -9.052 -9.245 -9.686 -9.897 -10.107 -10.369 -10.662 -11.035 -11.561 -13.66 -3 ,3883 ,KEBNE ,16679211,Thu Nov 25 06:38:41 CET,Thu Nov 25 08:09:36 CET,0.0 0.786 1.061 1.246 1.411 1.572 1.686 1.793 2.003 2.102 2.199 2.201 2.427 2.499 2.642 2.773 2.892 2.943 3.039 3.14 3.288 3.374 3.457 3.586 3.717 3.829 3.935 4.044 4.177 4.322 4.451 4.588 4.722 4.85 5.006 5.173 5.317 5.471 5.651 5.835 6.006 6.192 6.416 6.634 6.865 7.077 7.283 7.474 7.546 7.426 6.933 5.965 4.955 3.92 2.977 2.148 1.379 0.628 -0.025 -0.652 -1.224 -1.748 -2.214 -2.638 -3.044 -3.417 -3.798 -4.133 -4.419 -4.715 -5.043 -5.317 -5.583 -5.86 -6.081 -6.302 -6.525 -6.778 -7.041 -7.215 -7.391 -7.661 -7.858 -8.06 -8.167 -8.391 -8.627 -8.894 -9.037 -9.362 -9.52 -9.696 -9.86 -10.22 -10.443 -10.676 -10.922 -11.228 -11.592 -12.119 -14.105 -4 ,24471 ,KEBNE ,16679212,Thu Nov 25 06:38:41 CET,Thu Nov 25 08:07:39 CET,0.0 1.004 1.276 1.495 1.676 1.825 1.972 2.106 2.331 2.427 2.516 2.502 2.726 2.797 2.927 3.048 3.158 3.212 3.317 3.414 3.564 3.67 3.766 3.896 4.025 4.151 4.278 4.398 4.54 4.68 4.81 4.958 5.104 5.242 5.41 5.597 5.765 5.94 6.111 6.304 6.51 6.709 6.915 7.125 7.373 7.64 7.898 8.082 8.185 8.095 7.636 6.651 5.612 4.649 3.734 2.86 2.093 1.401 0.779 0.159 -0.361 -0.81 -1.232 -1.638 -2.02 -2.387 -2.787 -3.127 -3.419 -3.74 -4.073 -4.338 -4.61 -4.908 -5.142 -5.381 -5.625 -5.868 -6.127 -6.303 -6.487 -6.778 -6.981 -7.191 -7.298 -7.517 -7.758 -8.033 -8.177 -8.494 -8.61 -8.773 -8.947 -9.303 -9.512 -9.767 -10.053 -10.371 -10.706 -11.199 -13.445 -5 ,4723 ,KEBNE ,16679213,Thu Nov 25 06:39:42 CET,Thu Nov 25 08:08:59 CET,0.0 0.862 1.152 1.361 1.522 1.652 1.753 1.859 2.077 2.178 2.28 2.291 2.528 2.603 2.726 2.843 2.96 3.014 3.135 3.254 3.402 3.497 3.593 3.724 3.851 3.979 4.097 4.211 4.348 4.474 4.614 4.771 4.898 5.033 5.205 5.386 5.554 5.719 5.85 5.985 6.124 6.268 6.44 6.612 6.826 7.032 7.232 7.406 7.464 7.236 6.53 5.389 4.272 3.285 2.436 1.621 0.799 0.052 -0.574 -1.183 -1.696 -2.158 -2.611 -3.048 -3.464 -3.838 -4.222 -4.582 -4.886 -5.188 -5.507 -5.773 -6.04 -6.318 -6.536 -6.758 -6.994 -7.231 -7.482 -7.667 -7.855 -8.144 -8.353 -8.561 -8.671 -8.903 -9.13 -9.377 -9.509 -9.818 -9.932 -10.087 -10.264 -10.644 -10.834 -11.052 -11.313 -11.6 -11.952 -12.512 -14.84 -6 ,12903 ,KEBNE ,16679214,Thu Nov 25 06:39:42 CET,Thu Nov 25 08:10:30 CET,0.0 0.73 0.99 1.188 1.356 1.514 1.652 1.757 1.933 2.027 2.119 2.118 2.351 2.426 2.569 2.697 2.816 2.875 2.982 3.084 3.242 3.335 3.423 3.575 3.712 3.829 3.947 4.065 4.21 4.337 4.468 4.632 4.772 4.9 5.07 5.273 5.441 5.607 5.787 5.968 6.153 6.371 6.628 6.851 7.033 7.242 7.472 7.63 7.692 7.581 6.913 5.807 4.711 3.669 2.762 1.936 1.192 0.468 -0.17 -0.773 -1.274 -1.735 -2.193 -2.636 -3.042 -3.414 -3.792 -4.141 -4.464 -4.78 -5.089 -5.348 -5.625 -5.922 -6.158 -6.398 -6.635 -6.869 -7.106 -7.271 -7.449 -7.735 -7.94 -8.15 -8.253 -8.469 -8.689 -8.93 -9.064 -9.393 -9.546 -9.701 -9.862 -10.266 -10.51 -10.77 -11.05 -11.353 -11.707 -12.27 -14.237 -7 ,26269 ,KEBNE ,16679215,Thu Nov 25 06:39:42 CET,Thu Nov 25 08:11:10 CET,0.0 0.79 1.109 1.333 1.505 1.646 1.79 1.931 2.167 2.262 2.353 2.365 2.605 2.683 2.812 2.944 3.073 3.132 3.251 3.37 3.529 3.625 3.712 3.844 3.972 4.083 4.19 4.291 4.428 4.561 4.688 4.838 4.978 5.116 5.27 5.437 5.609 5.799 5.984 6.187 6.412 6.625 6.86 7.073 7.273 7.48 7.694 7.873 7.948 7.804 7.203 6.141 5.112 4.203 3.338 2.499 1.768 1.069 0.459 -0.148 -0.696 -1.2 -1.696 -2.147 -2.555 -2.926 -3.304 -3.633 -3.911 -4.208 -4.542 -4.816 -5.092 -5.389 -5.612 -5.848 -6.099 -6.363 -6.639 -6.828 -7.029 -7.338 -7.533 -7.731 -7.84 -8.067 -8.297 -8.541 -8.674 -8.998 -9.136 -9.298 -9.469 -9.879 -10.107 -10.35 -10.619 -10.924 -11.316 -11.9 -14.242 -8 ,27601 ,KEBNE ,16679216,Thu Nov 25 06:39:46 CET,Thu Nov 25 08:04:55 CET,0.0 0.702 0.954 1.144 1.313 1.442 1.568 1.673 1.85 1.937 2.022 2.024 2.248 2.316 2.46 2.585 2.707 2.764 2.873 2.977 3.124 3.222 3.318 3.462 3.583 3.68 3.784 3.892 4.038 4.173 4.293 4.445 4.586 4.716 4.87 5.046 5.216 5.402 5.606 5.821 6.023 6.23 6.464 6.683 6.929 7.149 7.33 7.528 7.672 7.564 7.052 6.149 5.2 4.253 3.363 2.504 1.75 1.06 0.433 -0.179 -0.723 -1.232 -1.697 -2.135 -2.541 -2.914 -3.305 -3.641 -3.93 -4.241 -4.571 -4.843 -5.137 -5.439 -5.656 -5.879 -6.117 -6.363 -6.627 -6.821 -7.024 -7.325 -7.528 -7.741 -7.851 -8.069 -8.304 -8.59 -8.733 -9.048 -9.163 -9.313 -9.492 -9.904 -10.11 -10.347 -10.623 -10.927 -11.328 -11.897 -13.865 -9 ,32557 ,KEBNE ,16679217,Thu Nov 25 06:40:43 CET,Thu Nov 25 08:08:36 CET,0.0 0.675 0.96 1.171 1.331 1.483 1.626 1.753 1.961 2.054 2.144 2.133 2.364 2.441 2.572 2.706 2.844 2.901 3.011 3.126 3.29 3.394 3.485 3.618 3.745 3.854 3.956 4.056 4.182 4.315 4.445 4.605 4.751 4.886 5.053 5.23 5.396 5.579 5.775 5.971 6.152 6.338 6.563 6.769 6.986 7.217 7.452 7.663 7.765 7.669 7.129 6.15 5.069 3.976 3.054 2.197 1.403 0.692 0.032 -0.636 -1.171 -1.653 -2.114 -2.529 -2.905 -3.27 -3.663 -4.015 -4.324 -4.631 -4.963 -5.232 -5.487 -5.772 -6.005 -6.237 -6.46 -6.687 -6.944 -7.123 -7.305 -7.582 -7.783 -7.998 -8.109 -8.341 -8.595 -8.873 -9.014 -9.334 -9.479 -9.652 -9.826 -10.201 -10.414 -10.655 -10.902 -11.2 -11.592 -12.167 -13.962 -10 ,32432 ,KEBNE ,16679218,Thu Nov 25 06:40:42 CET,Thu Nov 25 08:10:24 CET,0.0 0.767 0.996 1.181 1.371 1.529 1.658 1.781 2.005 2.101 2.181 2.18 2.42 2.494 2.631 2.76 2.883 2.945 3.058 3.164 3.312 3.404 3.489 3.608 3.728 3.853 3.973 4.089 4.244 4.386 4.51 4.654 4.802 4.932 5.065 5.234 5.401 5.571 5.766 5.972 6.178 6.403 6.633 6.856 7.076 7.275 7.521 7.695 7.767 7.696 7.18 6.189 5.244 4.249 3.261 2.403 1.658 0.973 0.354 -0.291 -0.857 -1.337 -1.788 -2.227 -2.646 -3.024 -3.399 -3.738 -4.047 -4.366 -4.671 -4.935 -5.22 -5.505 -5.721 -5.949 -6.184 -6.434 -6.705 -6.895 -7.094 -7.379 -7.572 -7.797 -7.915 -8.166 -8.422 -8.67 -8.799 -9.11 -9.234 -9.408 -9.591 -9.982 -10.205 -10.456 -10.739 -11.053 -11.486 -12.059 -14.028 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8b.txt deleted file mode 100644 index 40bdaf78..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1556 ,KEBNE ,16679219,Thu Nov 25 06:40:43 CET,Thu Nov 25 08:12:42 CET,0.0 0.426 0.625 0.785 0.915 1.062 1.208 1.325 1.526 1.625 1.716 1.712 1.937 2.008 2.148 2.28 2.411 2.476 2.6 2.72 2.903 3.019 3.131 3.302 3.468 3.625 3.782 3.947 4.151 4.332 4.507 4.721 4.932 5.142 5.375 5.633 5.885 6.15 6.432 6.741 7.048 7.373 7.738 8.086 8.486 8.919 9.39 9.899 10.473 11.017 11.501 11.662 11.533 11.332 11.097 10.841 10.603 10.363 10.15 9.937 9.733 9.538 9.348 9.179 9.043 8.923 8.78 8.655 8.553 8.441 8.321 8.222 8.115 7.999 7.905 7.813 7.721 7.623 7.518 7.44 7.358 7.223 7.131 7.038 6.99 6.892 6.79 6.689 6.624 6.402 6.438 6.374 6.313 6.174 6.084 5.998 5.906 5.794 5.659 5.463 5.155 -2 ,4638 ,KEBNE ,16679220,Thu Nov 25 06:40:43 CET,Thu Nov 25 08:11:35 CET,0.0 0.27 0.435 0.605 0.745 0.867 0.979 1.074 1.25 1.336 1.427 1.441 1.669 1.739 1.899 2.049 2.184 2.251 2.38 2.508 2.688 2.802 2.92 3.092 3.253 3.411 3.566 3.707 3.886 4.053 4.206 4.398 4.592 4.79 5.025 5.278 5.518 5.791 6.08 6.385 6.702 7.051 7.413 7.767 8.187 8.642 9.156 9.692 10.235 10.756 11.268 11.417 11.326 11.15 10.947 10.715 10.469 10.241 10.056 9.838 9.616 9.424 9.243 9.063 8.895 8.727 8.54 8.372 8.246 8.129 7.996 7.873 7.755 7.629 7.528 7.421 7.304 7.191 7.061 6.965 6.873 6.736 6.635 6.523 6.474 6.392 6.289 6.174 6.113 5.892 5.897 5.83 5.762 5.597 5.495 5.389 5.289 5.18 5.047 4.869 4.435 -3 ,15784 ,KEBNE ,16679221,Thu Nov 25 06:40:47 CET,Thu Nov 25 08:07:18 CET,0.0 0.317 0.532 0.708 0.858 0.964 1.073 1.179 1.364 1.449 1.532 1.532 1.767 1.846 1.993 2.13 2.265 2.331 2.468 2.606 2.81 2.942 3.068 3.263 3.453 3.617 3.762 3.909 4.108 4.297 4.473 4.684 4.878 5.063 5.29 5.55 5.803 6.077 6.361 6.648 6.933 7.244 7.629 8.022 8.469 8.944 9.418 9.898 10.389 10.911 11.394 11.523 11.397 11.193 10.964 10.724 10.473 10.229 10.028 9.798 9.578 9.389 9.208 9.015 8.837 8.676 8.512 8.373 8.25 8.12 7.976 7.846 7.712 7.572 7.47 7.373 7.268 7.165 7.062 6.981 6.896 6.765 6.663 6.554 6.502 6.404 6.295 6.169 6.103 5.882 5.898 5.822 5.751 5.598 5.504 5.399 5.287 5.163 5.017 4.852 4.565 -4 ,10140 ,KEBNE ,16679222,Thu Nov 25 06:41:43 CET,Thu Nov 25 08:10:27 CET,0.0 0.441 0.606 0.732 0.868 1.009 1.132 1.238 1.428 1.519 1.608 1.62 1.852 1.931 2.096 2.245 2.378 2.439 2.556 2.675 2.848 2.957 3.07 3.238 3.39 3.528 3.669 3.808 3.981 4.147 4.308 4.518 4.727 4.919 5.152 5.412 5.641 5.887 6.164 6.466 6.763 7.094 7.484 7.877 8.33 8.799 9.295 9.81 10.415 11.018 11.526 11.704 11.617 11.434 11.211 10.98 10.752 10.518 10.303 10.085 9.893 9.708 9.515 9.328 9.147 8.978 8.807 8.668 8.549 8.417 8.285 8.173 8.05 7.929 7.84 7.749 7.649 7.536 7.421 7.348 7.275 7.159 7.073 6.977 6.925 6.808 6.685 6.576 6.525 6.312 6.324 6.239 6.155 5.974 5.873 5.77 5.666 5.548 5.403 5.201 4.761 -5 ,29088 ,KEBNE ,16679223,Thu Nov 25 06:41:43 CET,Thu Nov 25 08:12:24 CET,0.0 0.401 0.562 0.714 0.854 0.971 1.095 1.216 1.409 1.5 1.586 1.588 1.822 1.899 2.045 2.188 2.331 2.401 2.533 2.649 2.807 2.908 3.009 3.166 3.319 3.458 3.591 3.719 3.887 4.051 4.217 4.428 4.62 4.8 5.013 5.254 5.489 5.742 6.025 6.332 6.634 6.965 7.354 7.714 8.15 8.658 9.196 9.785 10.398 10.975 11.448 11.569 11.439 11.245 11.029 10.784 10.529 10.288 10.064 9.81 9.595 9.415 9.252 9.079 8.915 8.764 8.595 8.448 8.322 8.181 8.016 7.881 7.746 7.606 7.502 7.387 7.27 7.159 7.034 6.945 6.856 6.694 6.584 6.482 6.427 6.313 6.186 6.064 6.009 5.794 5.808 5.733 5.658 5.501 5.419 5.331 5.236 5.124 5.004 4.82 4.557 -6 ,32763 ,KEBNE ,16679224,Thu Nov 25 06:41:44 CET,Thu Nov 25 08:11:43 CET,0.0 0.485 0.724 0.891 1.037 1.157 1.278 1.4 1.601 1.7 1.799 1.825 2.068 2.148 2.289 2.425 2.565 2.631 2.749 2.871 3.046 3.152 3.257 3.405 3.55 3.691 3.838 3.993 4.183 4.352 4.52 4.73 4.933 5.125 5.332 5.587 5.837 6.107 6.411 6.711 7.013 7.35 7.726 8.09 8.521 8.952 9.413 9.955 10.501 11.057 11.529 11.63 11.508 11.277 11.012 10.752 10.529 10.318 10.12 9.908 9.699 9.496 9.307 9.142 8.992 8.844 8.676 8.531 8.406 8.266 8.113 7.982 7.847 7.724 7.642 7.553 7.456 7.353 7.239 7.159 7.081 6.949 6.862 6.78 6.733 6.626 6.515 6.391 6.331 6.12 6.134 6.058 5.984 5.832 5.749 5.65 5.55 5.449 5.294 5.054 4.581 -7 ,3272 ,KEBNE ,16679225,Thu Nov 25 06:42:44 CET,Thu Nov 25 08:11:40 CET,0.0 0.361 0.525 0.683 0.826 0.958 1.089 1.192 1.344 1.423 1.507 1.503 1.729 1.794 1.947 2.088 2.222 2.293 2.429 2.552 2.731 2.854 2.98 3.156 3.313 3.468 3.612 3.751 3.95 4.146 4.336 4.564 4.768 4.954 5.171 5.419 5.667 5.936 6.222 6.522 6.813 7.152 7.55 7.921 8.327 8.747 9.237 9.798 10.423 11.058 11.484 11.548 11.379 11.102 10.842 10.595 10.357 10.108 9.876 9.652 9.439 9.235 9.047 8.869 8.699 8.532 8.352 8.208 8.08 7.93 7.796 7.701 7.585 7.461 7.376 7.293 7.193 7.089 6.988 6.913 6.839 6.729 6.652 6.575 6.533 6.433 6.322 6.211 6.152 5.938 5.973 5.905 5.835 5.689 5.609 5.529 5.431 5.296 5.144 4.959 4.57 -8 ,19788 ,KEBNE ,16679226,Thu Nov 25 06:42:45 CET,Thu Nov 25 08:13:36 CET,0.0 0.51 0.725 0.903 1.027 1.134 1.241 1.353 1.546 1.631 1.72 1.733 1.967 2.048 2.2 2.343 2.489 2.555 2.678 2.804 2.992 3.11 3.216 3.367 3.518 3.667 3.8 3.93 4.105 4.276 4.437 4.622 4.815 5.02 5.243 5.479 5.718 5.983 6.269 6.568 6.873 7.223 7.59 7.934 8.361 8.802 9.303 9.88 10.433 10.9 11.243 11.335 11.212 10.985 10.767 10.526 10.265 10.035 9.844 9.643 9.451 9.276 9.089 8.897 8.731 8.588 8.438 8.293 8.164 8.031 7.881 7.751 7.627 7.509 7.415 7.321 7.219 7.093 6.968 6.885 6.795 6.655 6.551 6.454 6.413 6.333 6.249 6.139 6.073 5.851 5.869 5.806 5.739 5.59 5.504 5.418 5.32 5.198 5.067 4.893 4.536 -9 ,483 ,KEBNE ,16679227,Thu Nov 25 06:42:45 CET,Thu Nov 25 08:15:53 CET,0.0 0.302 0.497 0.651 0.79 0.918 1.041 1.153 1.343 1.44 1.531 1.543 1.79 1.868 2.007 2.157 2.299 2.365 2.501 2.626 2.805 2.92 3.03 3.186 3.342 3.494 3.64 3.776 3.943 4.104 4.258 4.449 4.643 4.841 5.073 5.337 5.586 5.84 6.122 6.435 6.763 7.12 7.5 7.884 8.34 8.793 9.284 9.832 10.406 10.932 11.429 11.569 11.438 11.202 10.953 10.72 10.463 10.21 9.997 9.773 9.595 9.42 9.235 9.062 8.894 8.74 8.578 8.447 8.325 8.193 8.067 7.943 7.815 7.696 7.602 7.498 7.394 7.297 7.189 7.111 7.029 6.886 6.791 6.702 6.653 6.543 6.43 6.319 6.269 6.059 6.09 6.024 5.957 5.808 5.719 5.632 5.521 5.372 5.198 5.022 4.653 -10 ,29543 ,KEBNE ,16679228,Thu Nov 25 06:42:45 CET,Thu Nov 25 08:14:47 CET,0.0 0.377 0.567 0.705 0.82 0.939 1.061 1.166 1.362 1.454 1.539 1.547 1.781 1.865 2.021 2.173 2.316 2.379 2.506 2.624 2.799 2.912 3.03 3.2 3.362 3.526 3.689 3.851 4.052 4.24 4.421 4.649 4.87 5.076 5.307 5.549 5.78 6.04 6.324 6.614 6.915 7.251 7.634 7.999 8.413 8.877 9.381 9.869 10.39 10.92 11.257 11.286 11.119 10.892 10.666 10.43 10.204 9.962 9.745 9.52 9.317 9.127 8.928 8.749 8.595 8.45 8.286 8.135 8.006 7.868 7.728 7.62 7.499 7.368 7.276 7.192 7.103 7.003 6.897 6.821 6.738 6.61 6.522 6.441 6.403 6.316 6.216 6.102 6.038 5.817 5.836 5.769 5.691 5.512 5.413 5.311 5.2 5.077 4.939 4.734 4.353 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8d.txt deleted file mode 100644 index 9a6c1424..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1262 ,KEBNE ,16679229,Thu Nov 25 06:42:45 CET,Thu Nov 25 08:11:09 CET,0.0 0.157 0.261 0.334 0.396 0.449 0.506 0.561 0.672 0.728 0.771 0.705 0.911 0.962 1.061 1.141 1.225 1.267 1.332 1.39 1.489 1.554 1.611 1.684 1.758 1.836 1.909 1.972 2.056 2.144 2.216 2.287 2.358 2.445 2.543 2.646 2.749 2.857 2.972 3.096 3.227 3.353 3.478 3.586 3.694 3.808 3.929 4.004 3.969 3.781 3.271 2.482 1.747 1.06 0.429 -0.183 -0.778 -1.341 -1.81 -2.311 -2.765 -3.151 -3.496 -3.831 -4.163 -4.469 -4.797 -5.083 -5.33 -5.593 -5.866 -6.085 -6.313 -6.573 -6.772 -6.969 -7.173 -7.386 -7.62 -7.785 -7.944 -8.186 -8.356 -8.535 -8.63 -8.839 -9.067 -9.313 -9.438 -9.746 -9.856 -10.001 -10.153 -10.511 -10.714 -10.923 -11.161 -11.46 -11.861 -12.361 -14.185 -2 ,30336 ,KEBNE ,16679230,Thu Nov 25 06:42:44 CET,Thu Nov 25 08:12:00 CET,0.0 0.336 0.457 0.55 0.613 0.681 0.749 0.798 0.895 0.949 1.009 0.958 1.153 1.188 1.256 1.32 1.386 1.418 1.482 1.542 1.63 1.692 1.766 1.882 1.983 2.074 2.151 2.22 2.326 2.427 2.516 2.625 2.722 2.819 2.929 3.04 3.156 3.291 3.425 3.538 3.644 3.754 3.886 4.02 4.133 4.245 4.35 4.382 4.326 4.142 3.613 2.743 1.985 1.291 0.621 -0.019 -0.578 -1.096 -1.567 -2.036 -2.428 -2.801 -3.208 -3.586 -3.923 -4.246 -4.597 -4.906 -5.162 -5.433 -5.73 -5.967 -6.21 -6.451 -6.626 -6.816 -7.018 -7.225 -7.446 -7.61 -7.781 -8.053 -8.249 -8.443 -8.541 -8.749 -8.979 -9.217 -9.331 -9.629 -9.743 -9.893 -10.046 -10.378 -10.568 -10.788 -11.041 -11.315 -11.682 -12.229 -14.486 -3 ,22792 ,KEBNE ,16679231,Thu Nov 25 06:42:45 CET,Thu Nov 25 08:12:04 CET,0.0 0.251 0.345 0.423 0.499 0.572 0.624 0.672 0.775 0.831 0.89 0.853 1.067 1.115 1.212 1.303 1.379 1.415 1.483 1.544 1.634 1.688 1.735 1.82 1.9 1.968 2.041 2.109 2.182 2.263 2.353 2.452 2.555 2.66 2.771 2.87 2.964 3.091 3.225 3.334 3.437 3.566 3.718 3.86 3.994 4.106 4.224 4.309 4.296 4.148 3.707 2.946 2.171 1.382 0.672 0.073 -0.475 -1.003 -1.485 -1.963 -2.353 -2.713 -3.078 -3.415 -3.731 -4.019 -4.307 -4.584 -4.85 -5.132 -5.397 -5.618 -5.86 -6.112 -6.319 -6.535 -6.747 -6.983 -7.227 -7.394 -7.569 -7.827 -8.01 -8.202 -8.297 -8.495 -8.717 -8.961 -9.085 -9.393 -9.521 -9.678 -9.841 -10.193 -10.401 -10.634 -10.888 -11.175 -11.518 -11.989 -13.626 -4 ,10483 ,KEBNE ,16679232,Thu Nov 25 06:43:46 CET,Thu Nov 25 08:13:35 CET,0.0 0.181 0.33 0.43 0.505 0.569 0.624 0.691 0.842 0.907 0.958 0.891 1.097 1.142 1.224 1.305 1.381 1.414 1.477 1.539 1.622 1.669 1.723 1.799 1.87 1.946 2.017 2.083 2.167 2.243 2.308 2.388 2.481 2.568 2.652 2.748 2.836 2.937 3.041 3.151 3.27 3.4 3.552 3.685 3.815 3.933 4.011 4.051 4.039 3.889 3.426 2.624 1.835 1.11 0.466 -0.141 -0.714 -1.267 -1.725 -2.164 -2.561 -2.954 -3.335 -3.689 -4.013 -4.306 -4.63 -4.912 -5.154 -5.41 -5.695 -5.945 -6.183 -6.43 -6.627 -6.838 -7.065 -7.301 -7.56 -7.737 -7.91 -8.178 -8.377 -8.579 -8.677 -8.878 -9.1 -9.341 -9.464 -9.769 -9.897 -10.054 -10.209 -10.549 -10.736 -10.958 -11.232 -11.539 -11.912 -12.416 -14.043 -5 ,31043 ,KEBNE ,16679233,Thu Nov 25 06:43:46 CET,Thu Nov 25 08:14:04 CET,0.0 0.262 0.36 0.446 0.527 0.603 0.674 0.729 0.819 0.868 0.917 0.858 1.057 1.098 1.185 1.263 1.333 1.367 1.437 1.501 1.59 1.654 1.715 1.797 1.875 1.958 2.035 2.113 2.228 2.331 2.427 2.533 2.63 2.717 2.819 2.952 3.071 3.175 3.273 3.388 3.524 3.664 3.792 3.914 4.052 4.165 4.25 4.298 4.259 4.089 3.696 2.863 2.003 1.296 0.627 -0.021 -0.596 -1.138 -1.594 -2.047 -2.451 -2.822 -3.199 -3.581 -3.939 -4.256 -4.565 -4.851 -5.105 -5.359 -5.625 -5.855 -6.102 -6.362 -6.564 -6.785 -7.025 -7.261 -7.5 -7.662 -7.824 -8.095 -8.283 -8.473 -8.581 -8.796 -9.006 -9.231 -9.349 -9.645 -9.752 -9.907 -10.068 -10.439 -10.654 -10.887 -11.168 -11.501 -11.874 -12.351 -14.178 -6 ,29494 ,KEBNE ,16679234,Thu Nov 25 06:43:48 CET,Thu Nov 25 08:15:01 CET,0.0 0.339 0.454 0.543 0.635 0.724 0.791 0.85 0.971 1.031 1.089 1.026 1.23 1.274 1.345 1.427 1.517 1.555 1.615 1.671 1.767 1.825 1.884 1.981 2.069 2.156 2.242 2.324 2.42 2.502 2.586 2.699 2.803 2.904 3.018 3.131 3.224 3.319 3.436 3.566 3.68 3.795 3.926 4.037 4.144 4.268 4.394 4.469 4.494 4.377 3.924 3.194 2.441 1.71 1.083 0.516 -0.014 -0.517 -0.98 -1.483 -1.924 -2.305 -2.667 -3.022 -3.354 -3.659 -3.969 -4.244 -4.493 -4.753 -5.037 -5.275 -5.503 -5.734 -5.926 -6.125 -6.327 -6.533 -6.746 -6.903 -7.081 -7.36 -7.551 -7.753 -7.862 -8.084 -8.298 -8.52 -8.648 -8.957 -9.049 -9.196 -9.35 -9.676 -9.868 -10.075 -10.292 -10.581 -10.96 -11.457 -13.533 -7 ,10312 ,KEBNE ,16679235,Thu Nov 25 06:43:49 CET,Thu Nov 25 08:12:32 CET,0.0 0.197 0.318 0.383 0.449 0.517 0.583 0.654 0.776 0.833 0.883 0.814 1.012 1.054 1.138 1.202 1.272 1.31 1.378 1.447 1.553 1.617 1.677 1.768 1.85 1.917 1.982 2.044 2.112 2.179 2.25 2.343 2.435 2.52 2.624 2.747 2.856 2.967 3.085 3.213 3.343 3.468 3.596 3.72 3.851 3.972 4.077 4.129 4.095 3.923 3.384 2.568 1.833 1.126 0.468 -0.177 -0.746 -1.296 -1.782 -2.277 -2.718 -3.097 -3.48 -3.83 -4.149 -4.447 -4.76 -5.053 -5.315 -5.597 -5.897 -6.15 -6.408 -6.654 -6.839 -7.045 -7.254 -7.462 -7.691 -7.853 -8.023 -8.28 -8.455 -8.66 -8.767 -8.97 -9.198 -9.459 -9.593 -9.898 -9.983 -10.12 -10.269 -10.6 -10.789 -11.007 -11.238 -11.497 -11.819 -12.304 -13.923 -8 ,18949 ,KEBNE ,16679236,Thu Nov 25 06:43:49 CET,Thu Nov 25 08:12:01 CET,0.0 0.184 0.287 0.367 0.427 0.497 0.578 0.642 0.735 0.778 0.831 0.784 0.985 1.027 1.115 1.205 1.286 1.324 1.393 1.455 1.542 1.594 1.645 1.716 1.789 1.855 1.93 2.008 2.102 2.207 2.3 2.402 2.51 2.603 2.699 2.812 2.923 3.033 3.151 3.268 3.375 3.482 3.609 3.73 3.833 3.926 3.996 4.023 4.007 3.829 3.235 2.395 1.606 0.868 0.194 -0.417 -0.984 -1.542 -2.02 -2.51 -2.921 -3.297 -3.668 -4.006 -4.329 -4.627 -4.938 -5.221 -5.482 -5.75 -6.026 -6.266 -6.507 -6.754 -6.947 -7.155 -7.384 -7.609 -7.843 -8.001 -8.162 -8.435 -8.627 -8.825 -8.923 -9.128 -9.353 -9.59 -9.712 -10.009 -10.132 -10.289 -10.448 -10.828 -11.023 -11.226 -11.464 -11.762 -12.147 -12.654 -14.531 -9 ,1848 ,KEBNE ,16679237,Thu Nov 25 06:43:48 CET,Thu Nov 25 08:15:14 CET,0.0 0.348 0.479 0.566 0.635 0.697 0.751 0.817 0.95 1.003 1.057 1.008 1.218 1.26 1.341 1.415 1.484 1.519 1.583 1.642 1.737 1.799 1.851 1.922 1.995 2.071 2.145 2.212 2.297 2.378 2.453 2.545 2.636 2.729 2.837 2.937 3.032 3.151 3.267 3.374 3.479 3.606 3.747 3.884 4.02 4.109 4.198 4.235 4.171 4.005 3.509 2.676 1.927 1.199 0.509 -0.111 -0.681 -1.202 -1.656 -2.125 -2.526 -2.866 -3.194 -3.539 -3.886 -4.201 -4.519 -4.814 -5.076 -5.348 -5.638 -5.869 -6.098 -6.337 -6.541 -6.757 -6.969 -7.192 -7.434 -7.596 -7.768 -8.035 -8.22 -8.414 -8.512 -8.728 -8.958 -9.19 -9.315 -9.622 -9.737 -9.879 -10.016 -10.357 -10.563 -10.781 -11.025 -11.315 -11.664 -12.216 -14.146 -10 ,18315 ,KEBNE ,16679238,Thu Nov 25 06:43:48 CET,Thu Nov 25 08:14:36 CET,0.0 0.296 0.432 0.537 0.632 0.724 0.808 0.873 1.002 1.059 1.107 1.035 1.243 1.297 1.383 1.467 1.555 1.594 1.654 1.717 1.815 1.876 1.929 2.019 2.122 2.208 2.281 2.35 2.434 2.525 2.622 2.743 2.849 2.941 3.044 3.136 3.235 3.343 3.444 3.564 3.687 3.82 3.95 4.056 4.169 4.274 4.334 4.331 4.298 4.176 3.735 2.981 2.222 1.498 0.853 0.217 -0.361 -0.884 -1.35 -1.827 -2.228 -2.594 -3.008 -3.41 -3.751 -4.047 -4.37 -4.688 -4.962 -5.234 -5.522 -5.759 -6.003 -6.267 -6.481 -6.689 -6.893 -7.113 -7.367 -7.538 -7.698 -7.974 -8.172 -8.366 -8.462 -8.667 -8.906 -9.154 -9.282 -9.589 -9.71 -9.867 -10.025 -10.383 -10.586 -10.818 -11.081 -11.387 -11.748 -12.199 -13.766 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8e.txt deleted file mode 100644 index 0b9ac950..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/OPLS2015/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1435 ,KEBNE ,16679239,Thu Nov 25 06:43:49 CET,Thu Nov 25 08:11:55 CET,0.0 0.521 0.716 0.896 1.054 1.172 1.268 1.353 1.498 1.569 1.636 1.605 1.823 1.877 1.98 2.09 2.186 2.232 2.325 2.416 2.541 2.623 2.702 2.808 2.913 3.019 3.119 3.211 3.329 3.447 3.562 3.691 3.8 3.904 4.027 4.154 4.275 4.41 4.543 4.684 4.838 4.997 5.16 5.312 5.493 5.661 5.823 5.987 6.116 6.154 5.928 5.413 4.852 4.32 3.835 3.37 2.948 2.568 2.219 1.873 1.572 1.288 1.01 0.75 0.538 0.332 0.113 -0.083 -0.253 -0.422 -0.618 -0.778 -0.942 -1.122 -1.267 -1.416 -1.559 -1.721 -1.898 -2.012 -2.119 -2.293 -2.42 -2.544 -2.609 -2.745 -2.888 -3.06 -3.15 -3.406 -3.467 -3.574 -3.684 -3.957 -4.11 -4.276 -4.451 -4.644 -4.891 -5.179 -6.042 -2 ,6423 ,KEBNE ,16679240,Thu Nov 25 06:43:49 CET,Thu Nov 25 08:13:34 CET,0.0 0.235 0.395 0.525 0.656 0.767 0.86 0.957 1.132 1.207 1.272 1.243 1.463 1.527 1.639 1.741 1.833 1.876 1.973 2.07 2.197 2.275 2.354 2.48 2.588 2.672 2.758 2.843 2.953 3.066 3.176 3.307 3.429 3.547 3.684 3.823 3.944 4.082 4.235 4.396 4.54 4.696 4.873 5.041 5.231 5.404 5.585 5.769 5.879 5.86 5.518 4.833 4.198 3.655 3.153 2.679 2.277 1.899 1.556 1.216 0.919 0.64 0.374 0.123 -0.119 -0.355 -0.612 -0.839 -1.023 -1.209 -1.406 -1.566 -1.73 -1.899 -2.038 -2.184 -2.337 -2.492 -2.658 -2.774 -2.893 -3.076 -3.189 -3.311 -3.381 -3.524 -3.679 -3.856 -3.941 -4.184 -4.203 -4.301 -4.4 -4.616 -4.753 -4.903 -5.075 -5.274 -5.52 -5.804 -6.512 -3 ,22914 ,KEBNE ,16679241,Thu Nov 25 06:43:46 CET,Thu Nov 25 08:13:59 CET,0.0 0.43 0.643 0.81 0.948 1.072 1.185 1.272 1.417 1.495 1.567 1.556 1.78 1.838 1.933 2.031 2.136 2.186 2.274 2.358 2.465 2.535 2.615 2.727 2.822 2.916 3.006 3.092 3.211 3.316 3.41 3.524 3.624 3.72 3.835 3.971 4.101 4.237 4.394 4.568 4.725 4.867 5.01 5.137 5.301 5.494 5.674 5.81 5.888 5.902 5.704 5.142 4.541 3.964 3.443 2.993 2.576 2.173 1.818 1.446 1.12 0.854 0.599 0.337 0.086 -0.144 -0.376 -0.579 -0.762 -0.956 -1.152 -1.331 -1.516 -1.694 -1.831 -1.972 -2.115 -2.264 -2.424 -2.532 -2.639 -2.816 -2.948 -3.094 -3.174 -3.324 -3.486 -3.663 -3.744 -4.007 -4.089 -4.192 -4.292 -4.532 -4.662 -4.81 -4.971 -5.141 -5.323 -5.596 -6.526 -4 ,8974 ,KEBNE ,16679242,Thu Nov 25 06:44:47 CET,Thu Nov 25 08:13:55 CET,0.0 0.546 0.743 0.908 1.06 1.191 1.301 1.394 1.537 1.608 1.683 1.679 1.899 1.963 2.077 2.177 2.28 2.33 2.423 2.512 2.642 2.724 2.801 2.906 2.997 3.084 3.17 3.257 3.374 3.481 3.583 3.715 3.839 3.947 4.062 4.188 4.314 4.447 4.582 4.7 4.83 4.99 5.16 5.338 5.532 5.708 5.872 5.981 6.054 6.074 5.847 5.303 4.679 4.07 3.527 3.03 2.602 2.224 1.886 1.547 1.249 0.957 0.683 0.44 0.204 0.001 -0.215 -0.427 -0.605 -0.794 -0.99 -1.152 -1.316 -1.491 -1.639 -1.792 -1.958 -2.131 -2.286 -2.399 -2.516 -2.691 -2.837 -2.997 -3.073 -3.223 -3.382 -3.55 -3.635 -3.887 -3.936 -4.039 -4.136 -4.357 -4.48 -4.623 -4.788 -4.959 -5.172 -5.442 -6.467 -5 ,13430 ,KEBNE ,16679243,Thu Nov 25 06:44:47 CET,Thu Nov 25 08:14:07 CET,0.0 0.491 0.731 0.955 1.103 1.213 1.319 1.423 1.586 1.659 1.739 1.723 1.936 2.0 2.131 2.244 2.341 2.387 2.479 2.565 2.677 2.755 2.832 2.939 3.047 3.141 3.227 3.309 3.408 3.514 3.611 3.714 3.829 3.94 4.05 4.178 4.298 4.415 4.54 4.672 4.813 4.97 5.142 5.304 5.467 5.63 5.8 5.96 6.079 6.069 5.766 5.151 4.537 3.982 3.479 2.994 2.571 2.182 1.818 1.46 1.158 0.89 0.612 0.35 0.104 -0.129 -0.365 -0.574 -0.753 -0.954 -1.17 -1.336 -1.505 -1.678 -1.81 -1.95 -2.105 -2.274 -2.438 -2.552 -2.679 -2.865 -3.001 -3.151 -3.226 -3.38 -3.535 -3.698 -3.783 -4.031 -4.074 -4.182 -4.289 -4.519 -4.654 -4.788 -4.928 -5.094 -5.319 -5.681 -6.534 -6 ,14297 ,KEBNE ,16679244,Thu Nov 25 06:44:47 CET,Thu Nov 25 08:15:19 CET,0.0 0.659 0.916 1.107 1.261 1.396 1.511 1.601 1.771 1.853 1.925 1.901 2.115 2.172 2.276 2.376 2.483 2.538 2.644 2.737 2.857 2.931 3.005 3.117 3.214 3.31 3.412 3.51 3.624 3.73 3.824 3.925 4.036 4.148 4.264 4.392 4.522 4.663 4.807 4.95 5.085 5.238 5.402 5.557 5.746 5.904 6.048 6.2 6.309 6.289 5.98 5.402 4.842 4.264 3.719 3.254 2.837 2.412 2.052 1.705 1.395 1.108 0.837 0.593 0.368 0.163 -0.054 -0.245 -0.409 -0.592 -0.787 -0.943 -1.122 -1.319 -1.466 -1.614 -1.763 -1.923 -2.1 -2.209 -2.32 -2.517 -2.647 -2.781 -2.851 -2.988 -3.141 -3.313 -3.405 -3.654 -3.691 -3.809 -3.934 -4.193 -4.32 -4.454 -4.619 -4.81 -5.084 -5.491 -6.747 -7 ,19983 ,KEBNE ,16679245,Thu Nov 25 06:44:48 CET,Thu Nov 25 08:17:18 CET,0.0 0.491 0.704 0.852 0.977 1.109 1.228 1.336 1.495 1.569 1.654 1.663 1.879 1.934 2.057 2.18 2.287 2.334 2.427 2.521 2.66 2.745 2.826 2.939 3.032 3.116 3.215 3.304 3.417 3.533 3.63 3.736 3.864 3.988 4.102 4.233 4.368 4.512 4.655 4.809 4.958 5.102 5.294 5.474 5.635 5.78 5.924 6.055 6.113 6.034 5.732 5.183 4.565 3.979 3.486 3.03 2.616 2.218 1.874 1.531 1.222 0.95 0.69 0.437 0.193 -0.022 -0.25 -0.455 -0.628 -0.807 -1.001 -1.165 -1.329 -1.5 -1.639 -1.787 -1.934 -2.092 -2.257 -2.357 -2.465 -2.638 -2.758 -2.892 -2.963 -3.109 -3.265 -3.433 -3.519 -3.771 -3.824 -3.925 -4.023 -4.234 -4.351 -4.482 -4.623 -4.797 -5.038 -5.326 -6.059 -8 ,10762 ,KEBNE ,16679246,Thu Nov 25 06:44:48 CET,Thu Nov 25 08:17:05 CET,0.0 0.548 0.755 0.927 1.09 1.204 1.317 1.442 1.637 1.712 1.778 1.746 1.96 2.02 2.137 2.259 2.377 2.428 2.522 2.614 2.747 2.823 2.894 3.005 3.117 3.22 3.317 3.41 3.534 3.65 3.758 3.884 3.998 4.102 4.209 4.342 4.476 4.621 4.778 4.93 5.08 5.234 5.396 5.548 5.717 5.91 6.099 6.254 6.351 6.347 6.105 5.62 5.105 4.564 4.051 3.566 3.114 2.715 2.368 2.018 1.69 1.374 1.094 0.831 0.594 0.383 0.148 -0.057 -0.224 -0.412 -0.633 -0.801 -0.957 -1.133 -1.268 -1.417 -1.57 -1.707 -1.865 -1.973 -2.079 -2.261 -2.384 -2.524 -2.601 -2.748 -2.9 -3.063 -3.154 -3.411 -3.455 -3.55 -3.66 -3.899 -4.022 -4.169 -4.348 -4.563 -4.785 -5.066 -5.956 -9 ,16798 ,KEBNE ,16679247,Thu Nov 25 06:44:48 CET,Thu Nov 25 08:16:42 CET,0.0 0.426 0.63 0.807 0.97 1.095 1.206 1.313 1.523 1.609 1.679 1.665 1.882 1.94 2.046 2.152 2.255 2.303 2.385 2.465 2.59 2.666 2.745 2.858 2.963 3.069 3.158 3.24 3.343 3.44 3.548 3.68 3.804 3.924 4.062 4.203 4.327 4.461 4.597 4.751 4.92 5.088 5.25 5.395 5.575 5.762 5.932 6.103 6.27 6.332 6.092 5.554 5.011 4.447 3.925 3.438 2.982 2.559 2.192 1.856 1.562 1.281 1.02 0.779 0.541 0.318 0.096 -0.108 -0.288 -0.466 -0.65 -0.812 -0.975 -1.144 -1.276 -1.412 -1.552 -1.7 -1.863 -1.966 -2.074 -2.254 -2.383 -2.517 -2.585 -2.74 -2.903 -3.052 -3.135 -3.388 -3.429 -3.531 -3.638 -3.862 -3.987 -4.14 -4.312 -4.5 -4.742 -5.042 -5.875 -10 ,16607 ,KEBNE ,16679248,Thu Nov 25 06:44:47 CET,Thu Nov 25 08:17:42 CET,0.0 1.043 1.308 1.474 1.601 1.713 1.808 1.891 2.034 2.105 2.184 2.18 2.4 2.459 2.57 2.682 2.792 2.842 2.943 3.046 3.174 3.244 3.312 3.42 3.528 3.634 3.731 3.812 3.921 4.032 4.135 4.259 4.369 4.469 4.598 4.739 4.866 5.001 5.13 5.264 5.405 5.562 5.729 5.871 6.026 6.206 6.394 6.558 6.685 6.702 6.454 5.872 5.256 4.685 4.152 3.694 3.285 2.86 2.496 2.137 1.827 1.548 1.277 1.023 0.79 0.581 0.347 0.13 -0.047 -0.231 -0.42 -0.583 -0.756 -0.936 -1.079 -1.224 -1.375 -1.529 -1.684 -1.796 -1.909 -2.087 -2.221 -2.359 -2.423 -2.555 -2.702 -2.858 -2.944 -3.194 -3.222 -3.326 -3.433 -3.656 -3.785 -3.931 -4.101 -4.301 -4.542 -4.911 -6.196 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 6184ebdf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22 ,KEBNE ,17026555,Wed Dec 22 14:35:00 CET,Wed Dec 22 16:28:32 CET,0.0 0.34 0.543 0.709 0.85 0.986 1.113 1.228 1.424 1.507 1.594 1.542 1.828 1.907 2.053 2.188 2.326 2.393 2.512 2.628 2.815 2.936 3.047 3.204 3.352 3.494 3.634 3.768 3.939 4.103 4.267 4.46 4.653 4.848 5.055 5.288 5.516 5.743 5.979 6.242 6.534 6.842 7.172 7.492 7.844 8.222 8.636 9.1 9.602 10.131 10.587 10.653 10.482 10.203 9.867 9.497 9.121 8.776 8.475 8.156 7.873 7.603 7.334 7.079 6.826 6.573 6.281 6.008 5.767 5.513 5.228 4.986 4.746 4.477 4.267 4.066 3.851 3.61 3.349 3.158 2.959 2.675 2.477 2.27 2.173 1.974 1.762 1.538 1.407 1.075 1.039 0.907 0.761 0.399 0.208 0.03 -0.168 -0.41 -0.728 -1.184 -2.303 -2 ,24834 ,KEBNE ,17026556,Wed Dec 22 14:35:00 CET,Wed Dec 22 16:27:28 CET,0.0 0.416 0.618 0.798 0.966 1.12 1.246 1.36 1.587 1.698 1.802 1.79 2.092 2.178 2.348 2.498 2.647 2.721 2.851 2.984 3.179 3.303 3.427 3.604 3.777 3.939 4.09 4.246 4.445 4.615 4.77 4.977 5.19 5.371 5.573 5.814 6.045 6.283 6.521 6.764 7.013 7.281 7.587 7.908 8.287 8.713 9.172 9.65 10.15 10.614 10.98 11.049 10.868 10.568 10.25 9.886 9.456 9.052 8.739 8.415 8.112 7.84 7.604 7.384 7.149 6.919 6.66 6.413 6.196 5.96 5.718 5.511 5.292 5.067 4.882 4.689 4.511 4.336 4.133 3.985 3.838 3.595 3.419 3.226 3.121 2.909 2.702 2.489 2.365 2.028 1.972 1.82 1.663 1.332 1.153 0.952 0.751 0.544 0.273 -0.058 -0.73 -3 ,14875 ,KEBNE ,17026557,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:27:22 CET,0.0 0.463 0.647 0.787 0.941 1.084 1.217 1.33 1.534 1.637 1.731 1.698 1.982 2.065 2.237 2.412 2.572 2.64 2.768 2.902 3.111 3.238 3.346 3.504 3.664 3.813 3.956 4.093 4.267 4.434 4.606 4.834 5.034 5.206 5.394 5.602 5.813 6.048 6.299 6.558 6.825 7.113 7.435 7.766 8.13 8.503 8.922 9.352 9.81 10.246 10.543 10.481 10.221 9.895 9.547 9.14 8.715 8.311 7.969 7.646 7.362 7.076 6.787 6.524 6.265 6.014 5.741 5.49 5.269 5.036 4.8 4.606 4.396 4.181 4.022 3.857 3.678 3.489 3.298 3.158 3.009 2.777 2.59 2.382 2.281 2.064 1.827 1.603 1.497 1.173 1.072 0.904 0.751 0.464 0.317 0.135 -0.094 -0.372 -0.713 -1.092 -2.093 -4 ,2630 ,KEBNE ,17026558,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:27:51 CET,0.0 0.601 0.852 1.028 1.182 1.319 1.448 1.57 1.812 1.932 2.044 2.029 2.34 2.436 2.633 2.817 2.967 3.045 3.208 3.357 3.569 3.702 3.822 4.0 4.171 4.335 4.5 4.657 4.86 5.051 5.23 5.449 5.648 5.843 6.059 6.284 6.498 6.731 6.975 7.231 7.516 7.837 8.178 8.5 8.869 9.28 9.709 10.152 10.639 11.094 11.433 11.48 11.3 11.027 10.728 10.394 10.044 9.716 9.431 9.109 8.805 8.511 8.221 7.944 7.689 7.455 7.198 6.979 6.789 6.576 6.353 6.168 5.966 5.751 5.581 5.418 5.251 5.064 4.88 4.754 4.619 4.398 4.245 4.077 3.985 3.795 3.594 3.369 3.241 2.913 2.89 2.755 2.607 2.295 2.115 1.928 1.735 1.514 1.284 0.931 -0.195 -5 ,3019 ,KEBNE ,17026559,Wed Dec 22 14:35:00 CET,Wed Dec 22 16:27:33 CET,0.0 0.454 0.708 0.92 1.096 1.235 1.368 1.491 1.729 1.845 1.951 1.934 2.233 2.328 2.505 2.671 2.84 2.917 3.054 3.191 3.396 3.518 3.637 3.814 3.964 4.108 4.256 4.407 4.606 4.801 4.98 5.18 5.359 5.535 5.742 5.974 6.191 6.426 6.673 6.927 7.203 7.506 7.843 8.177 8.554 8.934 9.335 9.767 10.202 10.618 10.997 11.002 10.756 10.462 10.152 9.794 9.427 9.084 8.738 8.35 8.026 7.749 7.475 7.176 6.89 6.641 6.381 6.151 5.942 5.727 5.492 5.276 5.053 4.82 4.632 4.434 4.242 4.055 3.841 3.672 3.498 3.251 3.097 2.933 2.846 2.656 2.428 2.178 2.054 1.733 1.67 1.5 1.332 0.973 0.769 0.536 0.27 0.011 -0.263 -0.641 -1.769 -6 ,14149 ,KEBNE ,17026560,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:28:28 CET,0.0 0.457 0.7 0.857 1.009 1.155 1.296 1.427 1.653 1.753 1.845 1.832 2.13 2.218 2.389 2.544 2.686 2.756 2.894 3.024 3.204 3.318 3.432 3.6 3.761 3.911 4.057 4.205 4.387 4.556 4.726 4.924 5.117 5.303 5.513 5.742 5.951 6.192 6.459 6.735 7.003 7.301 7.644 7.973 8.367 8.785 9.214 9.663 10.121 10.569 10.933 10.909 10.65 10.291 9.887 9.477 9.099 8.746 8.403 8.024 7.687 7.394 7.124 6.847 6.565 6.302 6.028 5.78 5.558 5.304 5.016 4.763 4.506 4.255 4.053 3.841 3.633 3.404 3.159 2.994 2.81 2.519 2.322 2.128 2.018 1.777 1.556 1.313 1.184 0.864 0.799 0.644 0.484 0.132 -0.078 -0.297 -0.536 -0.813 -1.142 -1.57 -2.938 -7 ,14796 ,KEBNE ,17026561,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:27:27 CET,0.0 0.609 0.867 1.069 1.233 1.383 1.524 1.656 1.895 2.026 2.155 2.161 2.458 2.541 2.692 2.85 3.005 3.08 3.237 3.386 3.598 3.732 3.854 4.017 4.18 4.343 4.507 4.652 4.816 4.981 5.144 5.343 5.545 5.733 5.939 6.194 6.442 6.693 6.962 7.258 7.576 7.93 8.323 8.694 9.095 9.522 9.998 10.488 11.014 11.476 11.746 11.758 11.578 11.27 10.916 10.542 10.157 9.808 9.502 9.173 8.892 8.611 8.324 8.068 7.828 7.601 7.371 7.167 6.974 6.768 6.552 6.367 6.161 5.941 5.777 5.603 5.415 5.213 5.007 4.869 4.728 4.497 4.331 4.156 4.069 3.899 3.709 3.483 3.367 3.057 3.039 2.921 2.804 2.54 2.391 2.222 2.043 1.835 1.574 1.279 0.784 -8 ,7525 ,KEBNE ,17026562,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:27:39 CET,0.0 0.396 0.629 0.818 0.967 1.12 1.277 1.392 1.591 1.691 1.785 1.761 2.049 2.133 2.293 2.445 2.592 2.662 2.795 2.919 3.1 3.224 3.342 3.507 3.669 3.833 3.98 4.125 4.333 4.521 4.69 4.903 5.111 5.298 5.508 5.746 5.966 6.213 6.479 6.75 7.034 7.348 7.69 8.011 8.377 8.785 9.232 9.712 10.228 10.739 11.07 11.03 10.798 10.48 10.187 9.885 9.546 9.197 8.887 8.527 8.183 7.865 7.575 7.298 7.027 6.793 6.539 6.28 6.045 5.809 5.552 5.32 5.076 4.806 4.591 4.396 4.204 4.002 3.785 3.63 3.475 3.201 2.986 2.771 2.669 2.466 2.228 1.971 1.848 1.517 1.427 1.257 1.084 0.724 0.542 0.364 0.155 -0.055 -0.31 -0.64 -1.743 -9 ,9690 ,KEBNE ,17026563,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:27:50 CET,0.0 0.458 0.655 0.819 0.985 1.135 1.261 1.368 1.574 1.686 1.796 1.786 2.09 2.174 2.334 2.489 2.622 2.689 2.824 2.947 3.117 3.226 3.336 3.492 3.639 3.787 3.931 4.07 4.247 4.404 4.544 4.726 4.921 5.113 5.326 5.551 5.771 6.019 6.274 6.539 6.811 7.114 7.453 7.761 8.111 8.507 8.951 9.43 9.913 10.37 10.747 10.77 10.591 10.332 10.016 9.676 9.346 9.004 8.701 8.392 8.105 7.847 7.576 7.322 7.095 6.878 6.652 6.443 6.258 6.057 5.837 5.651 5.46 5.264 5.099 4.921 4.73 4.531 4.336 4.21 4.078 3.865 3.717 3.563 3.483 3.317 3.136 2.941 2.842 2.53 2.473 2.331 2.184 1.864 1.677 1.455 1.226 0.996 0.723 0.345 -0.819 -10 ,20311 ,KEBNE ,17026564,Wed Dec 22 14:35:00 CET,Wed Dec 22 16:28:02 CET,0.0 0.524 0.695 0.838 0.988 1.123 1.249 1.364 1.572 1.667 1.753 1.711 1.993 2.07 2.232 2.391 2.541 2.613 2.751 2.881 3.073 3.193 3.301 3.462 3.63 3.786 3.931 4.066 4.236 4.402 4.566 4.772 4.96 5.148 5.37 5.602 5.82 6.047 6.308 6.581 6.851 7.148 7.463 7.782 8.161 8.552 8.965 9.396 9.87 10.339 10.697 10.673 10.434 10.159 9.843 9.497 9.187 8.862 8.539 8.21 7.901 7.617 7.349 7.093 6.85 6.612 6.358 6.124 5.908 5.692 5.468 5.271 5.062 4.833 4.651 4.473 4.297 4.098 3.871 3.706 3.537 3.289 3.104 2.891 2.785 2.594 2.389 2.158 2.039 1.7 1.653 1.525 1.392 1.092 0.913 0.713 0.508 0.307 0.051 -0.299 -1.138 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index d82a162a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32199 ,TETRA ,17589242,Sat Nov 27 17:00:02 CET,Sat Nov 27 19:17:58 CET,0.0 0.447 0.674 0.864 1.017 1.146 1.257 1.363 1.552 1.632 1.715 1.686 1.974 2.051 2.196 2.329 2.459 2.531 2.674 2.806 2.99 3.099 3.206 3.364 3.52 3.673 3.81 3.947 4.119 4.274 4.419 4.588 4.755 4.904 5.068 5.272 5.477 5.692 5.913 6.138 6.352 6.562 6.829 7.114 7.441 7.772 8.106 8.471 8.783 8.964 8.918 8.479 7.895 7.3 6.705 6.088 5.507 4.945 4.458 3.986 3.573 3.192 2.797 2.412 2.094 1.821 1.505 1.218 0.969 0.689 0.392 0.159 -0.074 -0.325 -0.522 -0.722 -0.934 -1.164 -1.41 -1.572 -1.736 -2.013 -2.213 -2.416 -2.524 -2.76 -2.993 -3.237 -3.377 -3.729 -3.847 -4.042 -4.251 -4.679 -4.907 -5.155 -5.391 -5.616 -5.921 -6.309 -7.258 -2 ,1456 ,TETRA ,17589243,Sat Nov 27 17:00:04 CET,Sat Nov 27 19:18:32 CET,0.0 0.32 0.508 0.637 0.786 0.92 1.033 1.159 1.395 1.496 1.589 1.547 1.82 1.891 2.029 2.158 2.283 2.342 2.448 2.558 2.739 2.85 2.957 3.115 3.268 3.418 3.558 3.69 3.864 4.033 4.188 4.368 4.55 4.739 4.931 5.132 5.346 5.563 5.774 5.988 6.23 6.495 6.764 7.018 7.299 7.587 7.888 8.186 8.482 8.655 8.488 7.935 7.292 6.674 6.074 5.472 4.904 4.366 3.887 3.422 3.012 2.601 2.213 1.832 1.46 1.146 0.826 0.533 0.28 0.023 -0.258 -0.501 -0.749 -1.02 -1.229 -1.45 -1.709 -1.984 -2.283 -2.501 -2.71 -3.022 -3.236 -3.462 -3.571 -3.772 -4.001 -4.254 -4.383 -4.724 -4.817 -4.984 -5.157 -5.543 -5.754 -5.978 -6.226 -6.51 -6.826 -7.254 -8.535 -3 ,32747 ,TETRA ,17589244,Sat Nov 27 17:00:06 CET,Sat Nov 27 19:17:06 CET,0.0 0.414 0.634 0.803 0.94 1.078 1.214 1.342 1.577 1.69 1.807 1.802 2.096 2.184 2.351 2.504 2.65 2.724 2.875 3.011 3.189 3.302 3.412 3.58 3.74 3.894 4.054 4.194 4.357 4.525 4.686 4.88 5.068 5.245 5.44 5.656 5.865 6.08 6.304 6.547 6.801 7.08 7.386 7.667 7.939 8.226 8.566 8.923 9.22 9.356 9.257 8.809 8.267 7.703 7.099 6.475 5.884 5.341 4.846 4.3 3.818 3.386 2.988 2.604 2.224 1.881 1.519 1.181 0.884 0.58 0.25 -0.035 -0.345 -0.675 -0.928 -1.199 -1.485 -1.773 -2.054 -2.238 -2.437 -2.768 -2.993 -3.213 -3.331 -3.586 -3.866 -4.204 -4.384 -4.764 -4.884 -5.067 -5.271 -5.76 -6.03 -6.3 -6.589 -6.886 -7.219 -7.632 -8.74 -4 ,13760 ,TETRA ,17589245,Sat Nov 27 17:00:01 CET,Sat Nov 27 19:15:57 CET,0.0 0.489 0.769 0.996 1.181 1.351 1.513 1.67 1.949 2.066 2.17 2.163 2.456 2.548 2.718 2.867 3.002 3.069 3.189 3.298 3.457 3.554 3.647 3.784 3.928 4.072 4.199 4.317 4.493 4.669 4.84 5.061 5.256 5.407 5.58 5.777 5.953 6.136 6.33 6.535 6.744 6.987 7.274 7.528 7.781 8.071 8.404 8.717 9.006 9.264 9.281 8.825 8.207 7.565 6.967 6.413 5.875 5.337 4.833 4.328 3.86 3.396 2.974 2.58 2.198 1.852 1.496 1.153 0.823 0.466 0.104 -0.189 -0.486 -0.778 -1.005 -1.259 -1.52 -1.786 -2.081 -2.284 -2.484 -2.8 -3.026 -3.262 -3.378 -3.602 -3.829 -4.077 -4.221 -4.58 -4.691 -4.849 -5.004 -5.348 -5.563 -5.823 -6.121 -6.463 -6.874 -7.404 -9.082 -5 ,21991 ,TETRA ,17589246,Sat Nov 27 17:00:02 CET,Sat Nov 27 19:17:17 CET,0.0 0.638 0.896 1.103 1.267 1.413 1.558 1.679 1.904 2.011 2.104 2.072 2.354 2.426 2.573 2.711 2.83 2.891 3.02 3.145 3.301 3.392 3.482 3.619 3.758 3.893 4.028 4.161 4.327 4.486 4.655 4.856 5.028 5.189 5.368 5.559 5.747 5.953 6.155 6.359 6.582 6.818 7.077 7.337 7.618 7.91 8.192 8.414 8.564 8.618 8.38 7.718 6.987 6.204 5.497 4.863 4.247 3.669 3.156 2.634 2.188 1.771 1.341 0.945 0.588 0.234 -0.139 -0.467 -0.75 -1.039 -1.331 -1.584 -1.871 -2.157 -2.359 -2.576 -2.807 -3.042 -3.301 -3.485 -3.684 -4.004 -4.214 -4.433 -4.556 -4.809 -5.076 -5.364 -5.51 -5.876 -6.016 -6.204 -6.392 -6.788 -7.002 -7.237 -7.5 -7.818 -8.188 -8.691 -10.432 -6 ,13149 ,TETRA ,17589247,Sat Nov 27 17:00:05 CET,Sat Nov 27 19:16:52 CET,0.0 0.561 0.784 0.976 1.152 1.301 1.422 1.535 1.74 1.846 1.949 1.919 2.207 2.291 2.45 2.586 2.719 2.79 2.926 3.053 3.221 3.336 3.45 3.617 3.78 3.927 4.062 4.198 4.377 4.54 4.699 4.891 5.063 5.226 5.403 5.592 5.78 5.989 6.214 6.435 6.646 6.885 7.162 7.427 7.722 8.022 8.338 8.676 9.026 9.281 9.208 8.674 8.096 7.515 6.954 6.428 5.958 5.499 5.068 4.609 4.151 3.736 3.36 2.97 2.622 2.339 2.034 1.724 1.452 1.184 0.893 0.664 0.438 0.2 0.007 -0.207 -0.44 -0.675 -0.907 -1.07 -1.254 -1.562 -1.784 -2.018 -2.133 -2.354 -2.578 -2.828 -2.959 -3.293 -3.36 -3.509 -3.676 -4.014 -4.207 -4.445 -4.71 -4.993 -5.321 -5.722 -6.88 -7 ,22235 ,TETRA ,17589248,Sat Nov 27 17:00:01 CET,Sat Nov 27 19:18:05 CET,0.0 0.471 0.73 0.904 1.035 1.138 1.237 1.354 1.579 1.669 1.752 1.719 2.004 2.088 2.23 2.362 2.494 2.558 2.686 2.805 2.971 3.084 3.19 3.341 3.491 3.628 3.757 3.882 4.052 4.218 4.365 4.551 4.743 4.912 5.091 5.287 5.471 5.658 5.855 6.07 6.289 6.538 6.82 7.084 7.384 7.696 7.991 8.256 8.486 8.629 8.514 8.011 7.402 6.817 6.295 5.754 5.212 4.692 4.247 3.788 3.344 2.946 2.581 2.186 1.8 1.461 1.135 0.848 0.584 0.309 0.005 -0.26 -0.523 -0.784 -1.003 -1.242 -1.486 -1.763 -2.047 -2.224 -2.417 -2.714 -2.916 -3.131 -3.249 -3.503 -3.761 -4.048 -4.208 -4.567 -4.691 -4.884 -5.076 -5.505 -5.777 -6.064 -6.357 -6.673 -7.039 -7.489 -8.989 -8 ,7859 ,TETRA ,17589249,Sat Nov 27 17:00:02 CET,Sat Nov 27 19:08:52 CET,0.0 0.521 0.793 1.002 1.181 1.328 1.467 1.597 1.813 1.922 2.032 2.032 2.323 2.416 2.593 2.749 2.894 2.965 3.111 3.246 3.424 3.544 3.655 3.8 3.943 4.089 4.229 4.357 4.522 4.689 4.833 5.017 5.206 5.373 5.563 5.765 5.955 6.162 6.366 6.568 6.787 7.03 7.305 7.58 7.877 8.172 8.475 8.771 9.02 9.15 8.951 8.342 7.649 7.016 6.384 5.755 5.219 4.667 4.137 3.602 3.134 2.713 2.326 1.955 1.603 1.283 0.938 0.631 0.357 0.049 -0.267 -0.526 -0.806 -1.09 -1.316 -1.565 -1.815 -2.054 -2.307 -2.494 -2.695 -3.016 -3.239 -3.455 -3.564 -3.806 -4.078 -4.367 -4.518 -4.882 -5.011 -5.183 -5.372 -5.785 -6.007 -6.233 -6.464 -6.732 -7.062 -7.513 -8.781 -9 ,30439 ,TETRA ,17589250,Sat Nov 27 17:00:58 CET,Sat Nov 27 19:18:35 CET,0.0 0.468 0.638 0.782 0.92 1.06 1.189 1.308 1.545 1.652 1.747 1.721 2.012 2.105 2.271 2.424 2.585 2.665 2.813 2.949 3.129 3.246 3.357 3.519 3.679 3.833 3.992 4.136 4.292 4.438 4.578 4.749 4.925 5.093 5.28 5.492 5.69 5.908 6.134 6.371 6.625 6.89 7.178 7.432 7.711 8.018 8.353 8.653 8.865 9.006 8.939 8.468 7.903 7.273 6.659 6.084 5.543 5.025 4.549 4.072 3.644 3.243 2.855 2.506 2.183 1.875 1.551 1.256 0.985 0.683 0.374 0.134 -0.12 -0.392 -0.601 -0.82 -1.059 -1.303 -1.543 -1.717 -1.897 -2.183 -2.397 -2.625 -2.74 -2.98 -3.242 -3.526 -3.67 -4.026 -4.127 -4.285 -4.447 -4.808 -5.012 -5.236 -5.485 -5.762 -6.11 -6.576 -8.021 -10 ,18199 ,TETRA ,17589251,Sat Nov 27 17:01:56 CET,Sat Nov 27 19:16:55 CET,0.0 0.612 0.843 1.003 1.134 1.268 1.404 1.521 1.739 1.839 1.941 1.933 2.222 2.302 2.454 2.608 2.757 2.829 2.963 3.097 3.294 3.406 3.512 3.674 3.835 3.979 4.126 4.274 4.467 4.656 4.824 5.023 5.214 5.395 5.608 5.849 6.074 6.301 6.532 6.776 7.037 7.319 7.636 7.912 8.181 8.483 8.825 9.167 9.496 9.671 9.554 9.097 8.484 7.864 7.273 6.671 6.111 5.6 5.132 4.601 4.161 3.786 3.41 3.038 2.671 2.344 2.016 1.734 1.487 1.213 0.919 0.667 0.394 0.12 -0.102 -0.351 -0.598 -0.844 -1.101 -1.274 -1.46 -1.775 -1.992 -2.218 -2.344 -2.601 -2.852 -3.114 -3.249 -3.583 -3.692 -3.87 -4.046 -4.399 -4.582 -4.8 -5.036 -5.306 -5.642 -6.07 -7.207 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt deleted file mode 100644 index 1436601f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1734 ,TETRA ,17589252,Sat Nov 27 17:00:58 CET,Sat Nov 27 19:20:06 CET,0.0 0.628 0.867 1.109 1.346 1.558 1.732 1.898 2.195 2.317 2.432 2.454 2.754 2.85 3.036 3.228 3.423 3.511 3.674 3.824 4.05 4.201 4.333 4.521 4.714 4.894 5.062 5.23 5.431 5.614 5.795 6.016 6.221 6.409 6.621 6.853 7.068 7.294 7.537 7.791 8.048 8.296 8.549 8.803 9.09 9.396 9.708 9.992 10.232 10.359 10.147 9.502 8.755 8.042 7.385 6.766 6.221 5.704 5.223 4.72 4.291 3.897 3.516 3.158 2.822 2.499 2.139 1.836 1.571 1.283 0.997 0.745 0.474 0.204 0.002 -0.202 -0.414 -0.655 -0.91 -1.08 -1.246 -1.496 -1.692 -1.912 -2.026 -2.268 -2.537 -2.814 -2.961 -3.316 -3.412 -3.565 -3.726 -4.121 -4.331 -4.553 -4.818 -5.129 -5.465 -5.869 -6.84 -2 ,2262 ,TETRA ,17589253,Sat Nov 27 17:00:58 CET,Sat Nov 27 19:15:59 CET,0.0 0.97 1.332 1.564 1.775 1.964 2.123 2.27 2.53 2.644 2.758 2.761 3.064 3.164 3.368 3.552 3.72 3.8 3.947 4.089 4.285 4.409 4.527 4.703 4.871 5.023 5.171 5.313 5.497 5.676 5.84 6.037 6.231 6.411 6.613 6.827 7.04 7.268 7.489 7.726 7.971 8.219 8.466 8.699 8.948 9.203 9.452 9.688 9.88 9.889 9.531 8.789 8.006 7.251 6.565 5.899 5.291 4.748 4.275 3.79 3.363 2.994 2.622 2.246 1.907 1.597 1.264 0.962 0.685 0.388 0.097 -0.146 -0.408 -0.673 -0.875 -1.089 -1.32 -1.574 -1.835 -2.008 -2.2 -2.511 -2.723 -2.934 -3.039 -3.269 -3.529 -3.795 -3.916 -4.241 -4.301 -4.452 -4.612 -4.953 -5.136 -5.338 -5.563 -5.821 -6.117 -6.525 -7.509 -3 ,14864 ,TETRA ,17589254,Sat Nov 27 17:00:59 CET,Sat Nov 27 19:10:49 CET,0.0 0.669 0.967 1.205 1.434 1.657 1.845 2.006 2.282 2.409 2.544 2.598 2.897 2.996 3.18 3.344 3.508 3.592 3.762 3.918 4.125 4.256 4.389 4.576 4.74 4.896 5.053 5.207 5.39 5.569 5.75 5.956 6.138 6.305 6.494 6.711 6.913 7.125 7.369 7.626 7.873 8.146 8.452 8.728 9.006 9.291 9.586 9.836 10.04 10.084 9.79 9.108 8.298 7.542 6.864 6.205 5.586 5.007 4.518 4.036 3.594 3.167 2.746 2.362 1.992 1.622 1.229 0.895 0.614 0.312 -0.007 -0.271 -0.537 -0.816 -1.036 -1.276 -1.542 -1.814 -2.066 -2.219 -2.383 -2.662 -2.869 -3.085 -3.194 -3.432 -3.672 -3.919 -4.052 -4.399 -4.515 -4.679 -4.837 -5.146 -5.336 -5.555 -5.791 -6.068 -6.383 -6.761 -7.995 -4 ,9562 ,TETRA ,17589255,Sat Nov 27 17:00:59 CET,Sat Nov 27 19:22:32 CET,0.0 0.723 1.073 1.34 1.544 1.73 1.895 2.028 2.265 2.371 2.477 2.475 2.781 2.897 3.099 3.273 3.437 3.514 3.667 3.817 4.026 4.158 4.288 4.466 4.641 4.814 4.967 5.108 5.301 5.492 5.659 5.858 6.056 6.251 6.469 6.697 6.914 7.144 7.385 7.619 7.848 8.106 8.391 8.669 8.964 9.242 9.521 9.782 10.003 10.077 9.808 9.095 8.318 7.599 6.905 6.255 5.667 5.112 4.632 4.146 3.702 3.298 2.899 2.516 2.166 1.847 1.507 1.214 0.971 0.703 0.407 0.158 -0.107 -0.39 -0.62 -0.858 -1.09 -1.33 -1.577 -1.752 -1.932 -2.2 -2.389 -2.59 -2.69 -2.9 -3.129 -3.366 -3.489 -3.822 -3.877 -4.02 -4.173 -4.487 -4.664 -4.853 -5.06 -5.291 -5.528 -5.827 -6.876 -5 ,28184 ,TETRA ,17589256,Sat Nov 27 17:01:01 CET,Sat Nov 27 19:23:11 CET,0.0 0.52 0.782 0.994 1.155 1.306 1.471 1.608 1.853 1.974 2.09 2.112 2.416 2.513 2.703 2.877 3.047 3.128 3.275 3.418 3.616 3.742 3.865 4.049 4.228 4.392 4.552 4.711 4.914 5.097 5.266 5.46 5.646 5.83 6.047 6.294 6.513 6.716 6.936 7.174 7.414 7.678 7.948 8.204 8.469 8.739 9.017 9.254 9.423 9.445 9.174 8.414 7.596 6.823 6.102 5.432 4.809 4.244 3.748 3.222 2.748 2.314 1.903 1.519 1.145 0.81 0.474 0.163 -0.097 -0.355 -0.65 -0.911 -1.187 -1.492 -1.722 -1.956 -2.202 -2.444 -2.697 -2.867 -3.048 -3.362 -3.57 -3.78 -3.881 -4.077 -4.31 -4.572 -4.709 -5.056 -5.118 -5.264 -5.424 -5.758 -5.945 -6.155 -6.359 -6.578 -6.835 -7.213 -8.283 -6 ,13485 ,TETRA ,17589257,Sat Nov 27 17:00:59 CET,Sat Nov 27 19:21:15 CET,0.0 0.69 0.896 1.087 1.276 1.446 1.592 1.723 2.038 2.193 2.31 2.318 2.617 2.709 2.886 3.063 3.238 3.318 3.472 3.62 3.832 3.962 4.092 4.282 4.459 4.63 4.789 4.939 5.129 5.305 5.478 5.689 5.879 6.051 6.242 6.463 6.669 6.885 7.112 7.336 7.57 7.813 8.078 8.324 8.584 8.88 9.171 9.405 9.587 9.628 9.297 8.585 7.85 7.139 6.417 5.712 5.124 4.589 4.098 3.578 3.131 2.732 2.335 1.967 1.619 1.286 0.945 0.641 0.359 0.056 -0.254 -0.494 -0.73 -0.976 -1.163 -1.368 -1.596 -1.848 -2.113 -2.288 -2.466 -2.755 -2.973 -3.193 -3.304 -3.54 -3.787 -4.046 -4.183 -4.537 -4.628 -4.798 -4.991 -5.378 -5.574 -5.778 -5.993 -6.239 -6.549 -6.928 -7.838 -7 ,8516 ,TETRA ,17589258,Sat Nov 27 17:01:01 CET,Sat Nov 27 19:20:36 CET,0.0 0.573 0.838 1.078 1.286 1.472 1.633 1.784 2.065 2.191 2.311 2.33 2.631 2.733 2.936 3.127 3.291 3.366 3.519 3.672 3.885 4.02 4.152 4.329 4.493 4.659 4.813 4.968 5.167 5.352 5.523 5.71 5.887 6.062 6.27 6.508 6.732 6.958 7.2 7.471 7.719 7.949 8.235 8.514 8.806 9.081 9.343 9.574 9.718 9.758 9.489 8.789 7.978 7.167 6.459 5.849 5.293 4.754 4.263 3.763 3.309 2.88 2.496 2.147 1.813 1.504 1.188 0.902 0.637 0.358 0.083 -0.151 -0.41 -0.665 -0.864 -1.084 -1.316 -1.539 -1.772 -1.937 -2.097 -2.352 -2.524 -2.699 -2.798 -3.01 -3.231 -3.476 -3.597 -3.928 -3.994 -4.135 -4.289 -4.643 -4.82 -4.996 -5.194 -5.422 -5.699 -6.036 -6.819 -8 ,357 ,TETRA ,17589259,Sat Nov 27 17:00:59 CET,Sat Nov 27 19:18:21 CET,0.0 0.701 0.996 1.242 1.436 1.608 1.78 1.934 2.198 2.317 2.43 2.454 2.766 2.877 3.08 3.259 3.428 3.507 3.654 3.797 3.995 4.115 4.236 4.42 4.59 4.745 4.899 5.047 5.225 5.385 5.539 5.715 5.888 6.069 6.272 6.492 6.69 6.896 7.128 7.364 7.593 7.84 8.116 8.383 8.662 8.921 9.182 9.411 9.552 9.547 9.225 8.501 7.739 6.997 6.3 5.649 5.048 4.499 4.016 3.519 3.087 2.691 2.307 1.939 1.574 1.247 0.912 0.6 0.332 0.051 -0.257 -0.518 -0.791 -1.073 -1.29 -1.523 -1.764 -2.009 -2.259 -2.434 -2.617 -2.899 -3.092 -3.309 -3.419 -3.645 -3.921 -4.219 -4.375 -4.757 -4.915 -5.109 -5.309 -5.712 -5.901 -6.094 -6.323 -6.576 -6.873 -7.31 -8.597 -9 ,3641 ,TETRA ,17589260,Sat Nov 27 17:00:58 CET,Sat Nov 27 19:18:51 CET,0.0 0.458 0.7 0.883 1.05 1.202 1.363 1.513 1.77 1.895 2.012 2.04 2.336 2.425 2.596 2.767 2.939 3.02 3.177 3.319 3.509 3.631 3.752 3.932 4.099 4.245 4.39 4.536 4.718 4.885 5.05 5.256 5.449 5.629 5.83 6.039 6.236 6.458 6.679 6.916 7.177 7.467 7.761 8.025 8.291 8.559 8.844 9.076 9.242 9.291 8.988 8.265 7.556 6.834 6.114 5.472 4.886 4.326 3.822 3.284 2.829 2.443 2.08 1.745 1.428 1.103 0.742 0.424 0.157 -0.123 -0.437 -0.703 -0.954 -1.195 -1.399 -1.63 -1.866 -2.103 -2.356 -2.532 -2.718 -3.015 -3.215 -3.429 -3.542 -3.77 -4.004 -4.244 -4.376 -4.731 -4.811 -4.966 -5.139 -5.467 -5.637 -5.822 -6.007 -6.225 -6.533 -6.958 -7.835 -10 ,21907 ,TETRA ,17589261,Sat Nov 27 17:01:01 CET,Sat Nov 27 19:18:40 CET,0.0 0.472 0.793 1.017 1.214 1.399 1.551 1.691 1.972 2.101 2.221 2.245 2.55 2.656 2.864 3.068 3.256 3.34 3.492 3.631 3.833 3.959 4.079 4.263 4.439 4.607 4.765 4.912 5.104 5.297 5.478 5.686 5.865 6.027 6.221 6.429 6.632 6.866 7.102 7.321 7.531 7.781 8.056 8.303 8.588 8.866 9.11 9.331 9.514 9.548 9.201 8.477 7.734 6.998 6.289 5.612 5.054 4.57 4.112 3.629 3.206 2.819 2.46 2.108 1.754 1.416 1.062 0.754 0.486 0.214 -0.078 -0.328 -0.593 -0.859 -1.059 -1.28 -1.519 -1.757 -2.0 -2.176 -2.354 -2.635 -2.839 -3.056 -3.162 -3.376 -3.626 -3.894 -4.026 -4.365 -4.478 -4.651 -4.82 -5.134 -5.307 -5.509 -5.76 -6.077 -6.442 -6.959 -8.225 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 8dbd4060..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10429 ,TETRA ,17589262,Sat Nov 27 17:01:02 CET,Sat Nov 27 19:17:23 CET,0.0 0.453 0.619 0.757 0.915 1.056 1.172 1.287 1.481 1.563 1.637 1.602 1.883 1.951 2.072 2.192 2.319 2.38 2.498 2.613 2.766 2.863 2.954 3.079 3.205 3.33 3.447 3.558 3.707 3.848 3.976 4.133 4.279 4.407 4.555 4.719 4.863 5.014 5.182 5.361 5.522 5.671 5.847 6.011 6.183 6.344 6.495 6.626 6.664 6.502 5.883 4.952 4.131 3.413 2.77 2.152 1.58 1.005 0.492 0.01 -0.394 -0.778 -1.16 -1.518 -1.847 -2.147 -2.468 -2.763 -3.008 -3.263 -3.535 -3.746 -3.977 -4.235 -4.445 -4.667 -4.89 -5.112 -5.334 -5.485 -5.644 -5.897 -6.07 -6.244 -6.33 -6.511 -6.716 -6.948 -7.074 -7.4 -7.478 -7.631 -7.774 -8.117 -8.307 -8.474 -8.668 -8.891 -9.138 -9.41 -11.037 -2 ,9699 ,TETRA ,17589263,Sat Nov 27 17:01:04 CET,Sat Nov 27 19:16:42 CET,0.0 0.514 0.703 0.857 0.997 1.105 1.221 1.34 1.531 1.612 1.681 1.618 1.884 1.953 2.098 2.228 2.337 2.389 2.489 2.59 2.742 2.841 2.931 3.053 3.177 3.293 3.39 3.479 3.599 3.711 3.819 3.95 4.082 4.204 4.326 4.462 4.597 4.738 4.876 5.018 5.153 5.279 5.407 5.524 5.616 5.661 5.672 5.612 5.426 5.036 4.143 2.825 1.589 0.47 -0.466 -1.316 -2.116 -2.856 -3.495 -4.124 -4.65 -5.154 -5.678 -6.108 -6.439 -6.744 -7.058 -7.339 -7.601 -7.867 -8.157 -8.421 -8.697 -8.982 -9.201 -9.44 -9.702 -9.966 -10.206 -10.358 -10.521 -10.781 -10.964 -11.171 -11.269 -11.451 -11.656 -11.895 -12.029 -12.369 -12.444 -12.574 -12.716 -13.083 -13.288 -13.496 -13.695 -13.9 -14.136 -14.481 -15.53 -3 ,31529 ,TETRA ,17589264,Sat Nov 27 17:00:59 CET,Sat Nov 27 19:20:07 CET,0.0 0.295 0.564 0.759 0.907 1.054 1.183 1.291 1.485 1.585 1.674 1.638 1.915 1.988 2.116 2.237 2.354 2.411 2.526 2.629 2.772 2.863 2.945 3.063 3.196 3.33 3.449 3.554 3.678 3.801 3.922 4.067 4.197 4.305 4.437 4.596 4.739 4.892 5.06 5.216 5.36 5.502 5.661 5.787 5.892 5.99 6.049 6.036 5.867 5.471 4.617 3.333 2.104 1.033 0.081 -0.818 -1.605 -2.318 -2.925 -3.561 -4.159 -4.726 -5.268 -5.728 -6.09 -6.383 -6.682 -6.962 -7.208 -7.456 -7.721 -7.963 -8.211 -8.463 -8.669 -8.885 -9.112 -9.356 -9.598 -9.756 -9.912 -10.142 -10.313 -10.503 -10.6 -10.811 -11.04 -11.264 -11.377 -11.708 -11.782 -11.941 -12.1 -12.432 -12.615 -12.821 -13.07 -13.354 -13.65 -14.061 -15.338 -4 ,7443 ,TETRA ,17589265,Sat Nov 27 17:01:02 CET,Sat Nov 27 19:19:55 CET,0.0 0.562 0.779 0.93 1.097 1.26 1.403 1.526 1.742 1.844 1.936 1.909 2.187 2.265 2.414 2.54 2.658 2.72 2.85 2.962 3.106 3.21 3.315 3.456 3.586 3.703 3.818 3.929 4.066 4.203 4.337 4.493 4.641 4.775 4.92 5.065 5.204 5.364 5.53 5.697 5.879 6.059 6.252 6.451 6.629 6.784 6.93 7.02 6.947 6.581 5.736 4.461 3.245 2.194 1.231 0.335 -0.421 -1.156 -1.807 -2.46 -3.003 -3.478 -3.961 -4.423 -4.856 -5.264 -5.707 -6.11 -6.458 -6.768 -7.046 -7.262 -7.493 -7.742 -7.921 -8.094 -8.288 -8.501 -8.715 -8.869 -9.017 -9.253 -9.41 -9.565 -9.66 -9.871 -10.083 -10.323 -10.448 -10.767 -10.819 -10.966 -11.114 -11.431 -11.588 -11.764 -11.96 -12.176 -12.454 -12.853 -14.006 -5 ,20619 ,TETRA ,17589266,Sat Nov 27 17:01:58 CET,Sat Nov 27 19:18:14 CET,0.0 0.268 0.455 0.613 0.758 0.902 1.017 1.109 1.273 1.351 1.422 1.359 1.615 1.674 1.791 1.896 2.004 2.062 2.17 2.261 2.376 2.453 2.535 2.662 2.796 2.919 3.019 3.116 3.243 3.367 3.477 3.604 3.723 3.829 3.95 4.083 4.196 4.307 4.423 4.549 4.683 4.811 4.935 5.058 5.171 5.249 5.314 5.309 5.184 4.882 4.071 2.792 1.683 0.726 -0.164 -0.995 -1.79 -2.531 -3.164 -3.858 -4.451 -4.956 -5.447 -5.91 -6.35 -6.745 -7.082 -7.36 -7.614 -7.874 -8.143 -8.369 -8.601 -8.846 -9.038 -9.237 -9.452 -9.683 -9.918 -10.072 -10.224 -10.456 -10.625 -10.814 -10.919 -11.13 -11.33 -11.551 -11.673 -11.997 -12.04 -12.181 -12.341 -12.67 -12.837 -12.997 -13.182 -13.414 -13.679 -14.038 -15.061 -6 ,29771 ,TETRA ,17589267,Sat Nov 27 17:01:59 CET,Sat Nov 27 19:09:35 CET,0.0 0.447 0.654 0.826 0.958 1.075 1.191 1.307 1.503 1.584 1.665 1.614 1.883 1.955 2.098 2.227 2.34 2.394 2.502 2.603 2.758 2.862 2.963 3.107 3.228 3.343 3.46 3.576 3.728 3.879 4.014 4.165 4.304 4.425 4.555 4.707 4.853 5.007 5.175 5.34 5.492 5.652 5.821 5.981 6.134 6.276 6.426 6.54 6.581 6.407 5.914 5.078 4.183 3.329 2.567 1.908 1.332 0.774 0.251 -0.264 -0.694 -1.097 -1.516 -1.89 -2.217 -2.543 -2.894 -3.211 -3.504 -3.817 -4.127 -4.365 -4.591 -4.821 -5.007 -5.215 -5.436 -5.661 -5.899 -6.07 -6.25 -6.536 -6.741 -6.944 -7.04 -7.229 -7.428 -7.652 -7.78 -8.11 -8.189 -8.348 -8.516 -8.878 -9.064 -9.27 -9.478 -9.675 -9.916 -10.258 -10.974 -7 ,25243 ,TETRA ,17589268,Sat Nov 27 17:01:58 CET,Sat Nov 27 19:14:18 CET,0.0 0.369 0.595 0.781 0.928 1.048 1.158 1.26 1.432 1.514 1.592 1.538 1.801 1.873 2.01 2.15 2.274 2.329 2.433 2.536 2.691 2.78 2.857 2.971 3.082 3.188 3.286 3.38 3.508 3.634 3.765 3.912 4.033 4.147 4.285 4.446 4.586 4.723 4.874 5.025 5.165 5.3 5.45 5.573 5.665 5.72 5.72 5.672 5.527 5.133 4.159 2.842 1.641 0.485 -0.551 -1.492 -2.26 -2.857 -3.308 -3.763 -4.174 -4.555 -4.957 -5.339 -5.675 -5.981 -6.308 -6.597 -6.85 -7.125 -7.397 -7.608 -7.838 -8.08 -8.275 -8.484 -8.697 -8.916 -9.152 -9.33 -9.508 -9.78 -9.969 -10.168 -10.268 -10.464 -10.667 -10.888 -11.015 -11.355 -11.463 -11.619 -11.759 -12.049 -12.241 -12.465 -12.683 -12.944 -13.267 -13.707 -14.794 -8 ,8978 ,TETRA ,17589269,Sat Nov 27 17:01:58 CET,Sat Nov 27 19:04:25 CET,0.0 0.276 0.414 0.538 0.665 0.802 0.934 1.059 1.278 1.374 1.469 1.445 1.707 1.777 1.922 2.041 2.153 2.216 2.326 2.426 2.569 2.659 2.747 2.868 2.975 3.082 3.19 3.299 3.444 3.589 3.728 3.876 4.004 4.133 4.28 4.421 4.571 4.73 4.878 5.027 5.157 5.294 5.449 5.568 5.678 5.779 5.832 5.809 5.687 5.372 4.559 3.401 2.375 1.385 0.471 -0.377 -1.174 -1.9 -2.501 -3.095 -3.631 -4.125 -4.608 -5.084 -5.537 -5.947 -6.385 -6.792 -7.144 -7.518 -7.918 -8.253 -8.616 -8.971 -9.195 -9.401 -9.618 -9.85 -10.096 -10.274 -10.467 -10.763 -10.98 -11.203 -11.317 -11.553 -11.807 -12.077 -12.218 -12.579 -12.694 -12.884 -13.082 -13.47 -13.676 -13.889 -14.136 -14.435 -14.75 -15.127 -15.977 -9 ,16865 ,TETRA ,17589271,Sat Nov 27 17:01:58 CET,Sat Nov 27 19:20:46 CET,0.0 0.432 0.596 0.736 0.849 0.962 1.085 1.206 1.41 1.5 1.589 1.541 1.811 1.889 2.029 2.151 2.261 2.31 2.413 2.514 2.652 2.744 2.834 2.969 3.1 3.226 3.34 3.446 3.587 3.716 3.84 3.975 4.101 4.237 4.392 4.547 4.679 4.816 4.992 5.185 5.351 5.486 5.614 5.741 5.858 5.949 5.97 5.909 5.76 5.414 4.526 3.15 1.933 0.889 -0.036 -0.876 -1.636 -2.371 -3.042 -3.716 -4.309 -4.833 -5.308 -5.782 -6.257 -6.701 -7.169 -7.62 -8.015 -8.381 -8.723 -8.999 -9.287 -9.562 -9.777 -10.013 -10.248 -10.476 -10.715 -10.88 -11.054 -11.333 -11.528 -11.732 -11.836 -12.059 -12.293 -12.565 -12.721 -13.065 -13.145 -13.286 -13.447 -13.815 -14.005 -14.188 -14.405 -14.68 -14.97 -15.347 -16.433 -10 ,15198 ,TETRA ,17589272,Sat Nov 27 17:01:58 CET,Sat Nov 27 19:20:27 CET,0.0 0.313 0.504 0.624 0.749 0.858 0.966 1.078 1.28 1.365 1.451 1.415 1.683 1.756 1.89 2.016 2.135 2.192 2.31 2.425 2.58 2.667 2.749 2.867 2.972 3.083 3.205 3.317 3.458 3.591 3.71 3.852 3.973 4.092 4.228 4.361 4.488 4.625 4.775 4.919 5.045 5.178 5.323 5.435 5.536 5.642 5.718 5.699 5.53 5.146 4.28 2.944 1.682 0.545 -0.44 -1.321 -2.109 -2.896 -3.603 -4.293 -4.905 -5.393 -5.797 -6.184 -6.545 -6.861 -7.188 -7.484 -7.735 -7.992 -8.267 -8.513 -8.772 -9.046 -9.256 -9.454 -9.653 -9.862 -10.069 -10.217 -10.392 -10.671 -10.877 -11.097 -11.196 -11.391 -11.602 -11.826 -11.941 -12.263 -12.285 -12.41 -12.552 -12.863 -13.034 -13.241 -13.482 -13.753 -14.048 -14.361 -15.125 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 3030f8cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24165 ,KEBNE ,17026565,Wed Dec 22 14:36:02 CET,Wed Dec 22 16:30:36 CET,0.0 0.714 0.927 1.125 1.301 1.449 1.559 1.658 1.855 1.955 2.05 2.002 2.277 2.361 2.509 2.641 2.768 2.83 2.963 3.092 3.26 3.372 3.485 3.649 3.805 3.943 4.083 4.224 4.387 4.536 4.689 4.887 5.08 5.246 5.425 5.618 5.791 5.987 6.2 6.4 6.595 6.815 7.054 7.254 7.442 7.632 7.792 7.849 7.79 7.512 6.645 5.265 3.953 2.672 1.515 0.486 -0.432 -1.27 -2.003 -2.758 -3.421 -4.056 -4.664 -5.224 -5.707 -6.091 -6.493 -6.845 -7.135 -7.435 -7.755 -8.027 -8.299 -8.57 -8.786 -9.008 -9.235 -9.48 -9.731 -9.893 -10.054 -10.32 -10.523 -10.734 -10.833 -11.027 -11.242 -11.481 -11.601 -11.928 -12.007 -12.158 -12.309 -12.641 -12.821 -13.004 -13.209 -13.443 -13.7 -14.013 -14.993 -2 ,25046 ,KEBNE ,17026566,Wed Dec 22 14:36:02 CET,Wed Dec 22 16:30:15 CET,0.0 0.756 1.051 1.295 1.466 1.624 1.766 1.9 2.166 2.282 2.388 2.389 2.686 2.783 2.95 3.103 3.257 3.332 3.471 3.596 3.782 3.896 4.01 4.176 4.322 4.473 4.64 4.804 5.001 5.179 5.349 5.538 5.706 5.877 6.075 6.314 6.552 6.805 7.053 7.27 7.478 7.702 7.952 8.172 8.388 8.603 8.775 8.878 8.91 8.793 8.156 7.041 5.995 4.979 4.084 3.228 2.471 1.827 1.247 0.673 0.196 -0.256 -0.723 -1.161 -1.555 -1.913 -2.287 -2.609 -2.863 -3.142 -3.448 -3.704 -3.976 -4.266 -4.499 -4.73 -4.966 -5.21 -5.456 -5.635 -5.812 -6.071 -6.258 -6.448 -6.541 -6.743 -6.984 -7.252 -7.391 -7.732 -7.768 -7.91 -8.066 -8.383 -8.536 -8.705 -8.897 -9.1 -9.313 -9.639 -10.32 -3 ,26158 ,KEBNE ,17026567,Wed Dec 22 14:36:02 CET,Wed Dec 22 16:29:40 CET,0.0 0.27 0.451 0.623 0.794 0.92 1.033 1.168 1.442 1.563 1.661 1.638 1.929 2.014 2.185 2.347 2.501 2.575 2.713 2.854 3.072 3.203 3.313 3.461 3.609 3.764 3.92 4.069 4.249 4.396 4.531 4.694 4.848 4.998 5.164 5.34 5.51 5.686 5.849 6.038 6.27 6.518 6.764 6.991 7.254 7.528 7.777 7.948 7.968 7.769 7.083 5.848 4.639 3.609 2.746 1.917 1.154 0.464 -0.127 -0.734 -1.275 -1.786 -2.264 -2.691 -3.125 -3.546 -3.947 -4.274 -4.564 -4.871 -5.206 -5.492 -5.771 -6.051 -6.278 -6.517 -6.75 -7.003 -7.285 -7.474 -7.654 -7.914 -8.11 -8.324 -8.43 -8.661 -8.91 -9.172 -9.312 -9.661 -9.73 -9.88 -10.033 -10.358 -10.529 -10.705 -10.895 -11.119 -11.41 -11.77 -12.552 -4 ,3980 ,KEBNE ,17026568,Wed Dec 22 14:36:02 CET,Wed Dec 22 16:30:29 CET,0.0 1.137 1.429 1.594 1.735 1.872 2.005 2.133 2.365 2.464 2.575 2.608 2.896 2.982 3.149 3.343 3.528 3.6 3.745 3.883 4.065 4.188 4.309 4.485 4.644 4.794 4.954 5.092 5.27 5.449 5.607 5.8 5.984 6.154 6.341 6.544 6.729 6.919 7.111 7.312 7.514 7.728 7.962 8.159 8.358 8.548 8.648 8.638 8.532 8.124 7.002 5.395 4.043 2.818 1.73 0.654 -0.288 -1.089 -1.822 -2.557 -3.224 -3.783 -4.257 -4.69 -5.096 -5.473 -5.869 -6.225 -6.522 -6.833 -7.154 -7.424 -7.712 -8.008 -8.237 -8.483 -8.73 -8.965 -9.208 -9.38 -9.557 -9.846 -10.044 -10.243 -10.347 -10.579 -10.825 -11.055 -11.189 -11.536 -11.604 -11.739 -11.888 -12.25 -12.434 -12.629 -12.849 -13.104 -13.395 -13.711 -14.307 -5 ,17344 ,KEBNE ,17026569,Wed Dec 22 14:36:02 CET,Wed Dec 22 16:30:00 CET,0.0 0.343 0.605 0.834 1.015 1.146 1.254 1.373 1.588 1.692 1.801 1.813 2.101 2.185 2.358 2.511 2.641 2.713 2.854 2.977 3.144 3.252 3.355 3.511 3.666 3.808 3.939 4.065 4.244 4.413 4.567 4.731 4.875 5.018 5.178 5.349 5.517 5.701 5.878 6.088 6.319 6.543 6.778 6.978 7.151 7.324 7.467 7.537 7.481 7.103 6.124 4.577 3.11 1.802 0.68 -0.376 -1.347 -2.218 -2.988 -3.77 -4.421 -5.028 -5.632 -6.206 -6.737 -7.194 -7.674 -8.099 -8.408 -8.694 -8.988 -9.24 -9.505 -9.772 -9.982 -10.201 -10.423 -10.654 -10.899 -11.06 -11.227 -11.501 -11.681 -11.873 -11.969 -12.161 -12.365 -12.595 -12.714 -13.042 -13.105 -13.246 -13.391 -13.705 -13.879 -14.072 -14.287 -14.517 -14.796 -15.126 -15.659 -6 ,27266 ,KEBNE ,17026570,Wed Dec 22 14:36:02 CET,Wed Dec 22 16:29:49 CET,0.0 0.989 1.24 1.406 1.536 1.668 1.794 1.909 2.145 2.252 2.349 2.337 2.613 2.696 2.862 3.025 3.168 3.237 3.374 3.507 3.697 3.816 3.927 4.101 4.261 4.393 4.525 4.664 4.845 5.0 5.154 5.34 5.509 5.678 5.855 6.043 6.222 6.424 6.655 6.876 7.079 7.3 7.527 7.72 7.921 8.093 8.236 8.307 8.233 7.875 6.931 5.439 4.043 2.771 1.602 0.514 -0.378 -1.1 -1.695 -2.316 -2.861 -3.353 -3.807 -4.224 -4.614 -4.969 -5.336 -5.641 -5.908 -6.204 -6.534 -6.823 -7.111 -7.381 -7.585 -7.805 -8.039 -8.272 -8.495 -8.651 -8.82 -9.083 -9.258 -9.427 -9.517 -9.722 -9.937 -10.166 -10.301 -10.634 -10.666 -10.812 -10.96 -11.246 -11.392 -11.554 -11.731 -11.933 -12.162 -12.481 -13.263 -7 ,12266 ,KEBNE ,17026571,Wed Dec 22 14:36:02 CET,Wed Dec 22 16:30:28 CET,0.0 0.654 1.03 1.303 1.504 1.672 1.804 1.911 2.107 2.202 2.302 2.316 2.613 2.709 2.887 3.036 3.175 3.243 3.378 3.507 3.684 3.809 3.928 4.082 4.233 4.376 4.506 4.625 4.772 4.923 5.073 5.249 5.407 5.552 5.723 5.921 6.105 6.289 6.481 6.67 6.849 7.048 7.284 7.498 7.703 7.885 8.024 8.131 8.163 7.911 7.185 6.242 5.293 4.35 3.441 2.511 1.669 0.992 0.45 -0.089 -0.535 -0.962 -1.383 -1.77 -2.132 -2.452 -2.77 -3.066 -3.318 -3.57 -3.853 -4.093 -4.344 -4.63 -4.871 -5.108 -5.342 -5.599 -5.875 -6.059 -6.236 -6.525 -6.739 -6.956 -7.065 -7.287 -7.526 -7.788 -7.927 -8.284 -8.378 -8.537 -8.708 -9.056 -9.232 -9.419 -9.615 -9.828 -10.099 -10.405 -10.881 -8 ,4381 ,KEBNE ,17026572,Wed Dec 22 14:36:02 CET,Wed Dec 22 16:29:47 CET,0.0 1.094 1.372 1.564 1.754 1.927 2.075 2.198 2.396 2.494 2.588 2.577 2.87 2.961 3.137 3.291 3.427 3.497 3.64 3.773 3.963 4.079 4.185 4.336 4.469 4.592 4.71 4.825 4.985 5.134 5.271 5.445 5.624 5.796 5.969 6.157 6.347 6.55 6.752 6.951 7.15 7.365 7.606 7.862 8.131 8.371 8.6 8.759 8.789 8.627 8.064 7.017 5.963 5.009 4.11 3.242 2.523 1.907 1.34 0.717 0.14 -0.384 -0.872 -1.318 -1.725 -2.108 -2.497 -2.828 -3.117 -3.423 -3.741 -3.992 -4.238 -4.502 -4.715 -4.932 -5.15 -5.378 -5.622 -5.787 -5.961 -6.232 -6.425 -6.647 -6.761 -6.983 -7.212 -7.44 -7.557 -7.887 -7.947 -8.101 -8.274 -8.669 -8.873 -9.073 -9.267 -9.487 -9.761 -10.118 -10.703 -9 ,21214 ,KEBNE ,17026573,Wed Dec 22 14:36:01 CET,Wed Dec 22 16:30:29 CET,0.0 0.325 0.533 0.724 0.894 1.044 1.186 1.319 1.58 1.698 1.805 1.807 2.09 2.179 2.358 2.533 2.687 2.764 2.901 3.012 3.186 3.305 3.417 3.575 3.73 3.89 4.045 4.179 4.351 4.53 4.679 4.824 4.967 5.102 5.262 5.451 5.625 5.819 6.021 6.198 6.38 6.586 6.814 7.013 7.184 7.332 7.46 7.493 7.355 6.919 5.944 4.56 3.163 1.943 0.858 -0.234 -1.208 -2.087 -2.816 -3.467 -4.0 -4.492 -4.967 -5.45 -5.896 -6.274 -6.661 -7.003 -7.313 -7.653 -7.998 -8.273 -8.553 -8.844 -9.07 -9.31 -9.569 -9.827 -10.074 -10.244 -10.428 -10.715 -10.915 -11.11 -11.203 -11.4 -11.606 -11.819 -11.937 -12.271 -12.359 -12.515 -12.689 -13.063 -13.267 -13.512 -13.783 -14.047 -14.306 -14.792 -16.586 -10 ,26923 ,KEBNE ,17026574,Wed Dec 22 14:37:03 CET,Wed Dec 22 16:31:54 CET,0.0 0.54 0.764 0.93 1.077 1.214 1.333 1.454 1.666 1.762 1.86 1.848 2.126 2.206 2.359 2.505 2.655 2.723 2.84 2.952 3.127 3.25 3.372 3.553 3.716 3.871 4.023 4.156 4.319 4.471 4.623 4.802 4.971 5.122 5.282 5.467 5.632 5.81 6.022 6.233 6.423 6.623 6.825 6.998 7.174 7.335 7.454 7.46 7.298 6.882 6.007 4.639 3.222 1.973 0.887 -0.168 -1.155 -2.008 -2.661 -3.282 -3.829 -4.297 -4.717 -5.124 -5.504 -5.864 -6.259 -6.59 -6.881 -7.189 -7.5 -7.759 -8.031 -8.332 -8.577 -8.824 -9.067 -9.311 -9.568 -9.749 -9.926 -10.193 -10.385 -10.594 -10.701 -10.927 -11.158 -11.411 -11.536 -11.863 -11.906 -12.041 -12.187 -12.544 -12.733 -12.922 -13.127 -13.338 -13.585 -13.927 -14.6 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt deleted file mode 100644 index 060721dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27479 ,TETRA ,17589273,Sat Nov 27 17:01:58 CET,Sat Nov 27 19:19:37 CET,0.0 1.025 1.268 1.434 1.613 1.769 1.893 2.007 2.207 2.302 2.389 2.37 2.646 2.731 2.903 3.074 3.238 3.321 3.474 3.608 3.801 3.934 4.053 4.224 4.408 4.587 4.763 4.915 5.089 5.267 5.43 5.614 5.783 5.933 6.117 6.326 6.521 6.755 7.007 7.254 7.514 7.809 8.14 8.445 8.804 9.207 9.576 9.857 10.092 10.205 9.963 9.279 8.522 7.685 6.775 5.89 5.117 4.403 3.77 3.158 2.629 2.143 1.659 1.203 0.772 0.349 -0.102 -0.48 -0.761 -1.029 -1.297 -1.499 -1.713 -1.945 -2.123 -2.303 -2.496 -2.704 -2.919 -3.064 -3.211 -3.427 -3.572 -3.725 -3.804 -4.003 -4.286 -4.623 -4.798 -5.168 -5.226 -5.354 -5.494 -5.77 -5.902 -6.017 -6.135 -6.295 -6.491 -6.726 -7.271 -2 ,20796 ,TETRA ,17589274,Sat Nov 27 17:02:01 CET,Sat Nov 27 19:19:25 CET,0.0 0.55 0.82 1.026 1.193 1.348 1.497 1.639 1.904 2.03 2.151 2.177 2.462 2.551 2.725 2.894 3.044 3.117 3.266 3.406 3.615 3.754 3.883 4.05 4.21 4.379 4.534 4.686 4.877 5.049 5.225 5.436 5.633 5.799 5.985 6.24 6.494 6.749 7.027 7.328 7.615 7.901 8.231 8.526 8.843 9.191 9.541 9.871 10.12 10.223 9.96 9.235 8.444 7.637 6.847 6.143 5.513 4.877 4.323 3.784 3.271 2.779 2.311 1.852 1.412 1.005 0.568 0.168 -0.183 -0.545 -0.922 -1.225 -1.537 -1.877 -2.141 -2.413 -2.713 -3.047 -3.378 -3.557 -3.706 -3.959 -4.139 -4.324 -4.427 -4.634 -4.833 -5.043 -5.156 -5.474 -5.521 -5.643 -5.763 -6.036 -6.187 -6.347 -6.508 -6.677 -6.889 -7.12 -7.814 -3 ,25524 ,TETRA ,17589275,Sat Nov 27 17:01:58 CET,Sat Nov 27 19:16:50 CET,0.0 0.624 0.893 1.114 1.313 1.476 1.642 1.802 2.045 2.145 2.25 2.263 2.542 2.638 2.822 2.981 3.149 3.24 3.412 3.57 3.793 3.931 4.066 4.251 4.426 4.6 4.764 4.911 5.095 5.28 5.445 5.634 5.825 6.006 6.215 6.437 6.64 6.884 7.155 7.424 7.698 7.99 8.326 8.665 9.039 9.409 9.782 10.147 10.508 10.834 10.789 10.339 9.714 9.043 8.443 7.829 7.272 6.774 6.344 5.91 5.523 5.167 4.815 4.455 4.115 3.817 3.509 3.22 2.976 2.741 2.487 2.273 2.048 1.812 1.627 1.438 1.247 1.043 0.837 0.696 0.547 0.32 0.168 0.004 -0.086 -0.264 -0.467 -0.698 -0.808 -1.111 -1.134 -1.253 -1.391 -1.747 -1.927 -2.077 -2.232 -2.395 -2.639 -2.997 -4.773 -4 ,30007 ,TETRA ,17589276,Sat Nov 27 17:01:58 CET,Sat Nov 27 19:19:14 CET,0.0 0.614 0.865 1.063 1.225 1.382 1.519 1.65 1.917 2.032 2.148 2.189 2.491 2.585 2.779 2.964 3.114 3.195 3.359 3.503 3.707 3.831 3.949 4.121 4.286 4.439 4.588 4.744 4.939 5.13 5.317 5.533 5.745 5.964 6.208 6.459 6.711 6.982 7.267 7.578 7.879 8.212 8.585 8.952 9.33 9.709 10.18 10.607 10.949 11.234 11.367 11.119 10.595 9.995 9.458 8.986 8.509 8.012 7.601 7.175 6.773 6.419 6.074 5.733 5.403 5.101 4.793 4.517 4.272 4.022 3.77 3.557 3.334 3.11 2.939 2.745 2.539 2.308 2.062 1.907 1.748 1.508 1.346 1.175 1.086 0.896 0.706 0.514 0.405 0.089 0.04 -0.092 -0.225 -0.51 -0.667 -0.831 -1.011 -1.254 -1.524 -1.823 -2.795 -5 ,30413 ,TETRA ,17589277,Sat Nov 27 17:02:59 CET,Sat Nov 27 19:20:06 CET,0.0 0.436 0.672 0.873 1.035 1.201 1.355 1.483 1.713 1.815 1.909 1.915 2.2 2.289 2.462 2.625 2.792 2.871 3.018 3.158 3.356 3.489 3.62 3.792 3.955 4.113 4.256 4.397 4.574 4.738 4.911 5.123 5.324 5.517 5.715 5.924 6.125 6.337 6.548 6.782 7.027 7.274 7.552 7.847 8.178 8.503 8.867 9.231 9.528 9.606 9.307 8.624 7.824 6.978 6.154 5.381 4.796 4.355 3.948 3.502 3.116 2.783 2.42 2.059 1.748 1.473 1.182 0.912 0.671 0.421 0.163 -0.057 -0.299 -0.542 -0.722 -0.913 -1.11 -1.314 -1.533 -1.695 -1.857 -2.11 -2.283 -2.453 -2.536 -2.7 -2.883 -3.069 -3.174 -3.49 -3.526 -3.643 -3.772 -4.074 -4.253 -4.429 -4.595 -4.784 -4.998 -5.3 -6.111 -6 ,17510 ,TETRA ,17589278,Sat Nov 27 17:02:59 CET,Sat Nov 27 19:07:21 CET,0.0 0.435 0.671 0.857 1.038 1.199 1.345 1.489 1.731 1.832 1.931 1.946 2.234 2.322 2.491 2.642 2.782 2.857 3.005 3.151 3.368 3.503 3.637 3.825 3.995 4.159 4.333 4.508 4.719 4.915 5.108 5.33 5.526 5.724 5.959 6.219 6.47 6.733 6.997 7.284 7.572 7.884 8.246 8.562 8.893 9.226 9.569 9.869 10.099 10.242 10.042 9.335 8.475 7.557 6.74 5.967 5.264 4.59 3.979 3.34 2.746 2.228 1.778 1.416 1.107 0.808 0.493 0.216 -0.03 -0.3 -0.58 -0.809 -1.054 -1.301 -1.488 -1.684 -1.886 -2.111 -2.344 -2.501 -2.677 -2.967 -3.151 -3.318 -3.41 -3.619 -3.831 -4.045 -4.159 -4.479 -4.53 -4.674 -4.829 -5.139 -5.299 -5.476 -5.664 -5.864 -6.109 -6.429 -7.22 -7 ,17917 ,TETRA ,17589279,Sat Nov 27 17:02:59 CET,Sat Nov 27 19:25:28 CET,0.0 0.434 0.72 0.919 1.102 1.28 1.432 1.558 1.787 1.907 2.028 2.065 2.359 2.446 2.613 2.784 2.947 3.021 3.16 3.307 3.523 3.659 3.787 3.968 4.138 4.293 4.445 4.584 4.759 4.938 5.115 5.33 5.532 5.719 5.937 6.182 6.405 6.642 6.919 7.194 7.449 7.736 8.085 8.438 8.802 9.161 9.511 9.818 10.065 10.151 9.801 8.939 8.151 7.487 6.884 6.283 5.751 5.256 4.829 4.397 3.974 3.578 3.206 2.848 2.519 2.227 1.92 1.639 1.386 1.14 0.885 0.667 0.456 0.237 0.07 -0.109 -0.302 -0.506 -0.732 -0.873 -1.014 -1.242 -1.4 -1.575 -1.667 -1.861 -2.065 -2.258 -2.359 -2.678 -2.73 -2.844 -2.957 -3.213 -3.357 -3.517 -3.689 -3.876 -4.099 -4.382 -5.211 -8 ,11404 ,TETRA ,17589280,Sat Nov 27 17:02:59 CET,Sat Nov 27 19:17:31 CET,0.0 0.546 0.796 1.001 1.203 1.379 1.528 1.676 1.94 2.048 2.138 2.13 2.412 2.5 2.688 2.868 3.035 3.123 3.298 3.452 3.656 3.781 3.914 4.118 4.312 4.495 4.666 4.82 5.016 5.198 5.362 5.565 5.777 5.981 6.199 6.442 6.683 6.931 7.178 7.432 7.711 8.014 8.333 8.666 9.036 9.409 9.807 10.192 10.493 10.714 10.853 10.551 9.992 9.375 8.784 8.183 7.588 7.041 6.576 6.108 5.685 5.306 4.976 4.659 4.357 4.082 3.778 3.493 3.242 3.005 2.764 2.544 2.324 2.11 1.94 1.752 1.554 1.356 1.154 1.016 0.867 0.646 0.505 0.368 0.301 0.152 -0.003 -0.183 -0.277 -0.555 -0.554 -0.647 -0.743 -0.974 -1.102 -1.225 -1.378 -1.564 -1.74 -1.911 -2.623 -9 ,25088 ,TETRA ,17589281,Sat Nov 27 17:03:00 CET,Sat Nov 27 19:09:33 CET,0.0 0.422 0.646 0.902 1.11 1.269 1.412 1.533 1.741 1.842 1.93 1.897 2.181 2.261 2.422 2.562 2.7 2.773 2.919 3.058 3.256 3.377 3.491 3.655 3.801 3.932 4.06 4.187 4.35 4.502 4.649 4.849 5.059 5.265 5.502 5.767 6.017 6.281 6.573 6.88 7.174 7.494 7.874 8.243 8.61 8.973 9.435 9.904 10.279 10.598 10.717 10.375 9.816 9.238 8.712 8.16 7.626 7.13 6.711 6.262 5.824 5.443 5.111 4.788 4.487 4.218 3.904 3.627 3.396 3.159 2.914 2.708 2.49 2.267 2.101 1.932 1.75 1.548 1.334 1.196 1.05 0.804 0.632 0.455 0.37 0.194 0.001 -0.193 -0.287 -0.585 -0.568 -0.671 -0.775 -1.011 -1.159 -1.322 -1.485 -1.663 -1.88 -2.117 -3.068 -10 ,29072 ,TETRA ,17589282,Sat Nov 27 17:03:00 CET,Sat Nov 27 19:18:12 CET,0.0 0.376 0.6 0.767 0.912 1.058 1.199 1.321 1.557 1.674 1.781 1.772 2.064 2.156 2.319 2.477 2.632 2.712 2.874 3.024 3.229 3.359 3.491 3.673 3.839 4.014 4.184 4.333 4.515 4.695 4.874 5.102 5.311 5.493 5.687 5.899 6.118 6.371 6.647 6.934 7.205 7.473 7.787 8.101 8.443 8.771 9.122 9.518 9.889 10.172 10.074 9.486 8.814 8.137 7.506 6.935 6.436 5.931 5.486 5.05 4.667 4.327 3.998 3.707 3.425 3.129 2.819 2.565 2.338 2.096 1.856 1.664 1.475 1.27 1.097 0.909 0.704 0.501 0.311 0.177 0.029 -0.21 -0.368 -0.523 -0.609 -0.78 -0.954 -1.134 -1.228 -1.533 -1.561 -1.681 -1.815 -2.096 -2.232 -2.365 -2.557 -2.777 -3.011 -3.292 -3.933 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index b31bbeae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19796 ,TETRA ,17589283,Sat Nov 27 17:03:00 CET,Sat Nov 27 19:20:06 CET,0.0 0.757 1.01 1.169 1.334 1.511 1.673 1.81 2.057 2.187 2.311 2.298 2.586 2.679 2.868 3.049 3.204 3.27 3.397 3.53 3.736 3.865 3.989 4.178 4.355 4.518 4.669 4.814 5.012 5.211 5.403 5.614 5.813 6.028 6.267 6.521 6.764 7.027 7.303 7.59 7.916 8.284 8.773 9.348 9.982 10.643 11.374 12.139 12.968 13.824 14.542 14.792 14.73 14.515 14.257 13.946 13.606 13.315 13.066 12.762 12.469 12.195 11.923 11.65 11.386 11.142 10.874 10.649 10.462 10.258 10.041 9.866 9.676 9.453 9.282 9.113 8.93 8.737 8.535 8.391 8.254 8.048 7.896 7.74 7.651 7.449 7.248 7.051 6.952 6.646 6.62 6.507 6.391 6.15 6.017 5.84 5.64 5.458 5.237 4.949 4.393 -2 ,20512 ,TETRA ,17589284,Sat Nov 27 17:03:00 CET,Sat Nov 27 19:17:14 CET,0.0 0.552 0.815 1.016 1.166 1.29 1.408 1.51 1.708 1.817 1.913 1.93 2.242 2.34 2.524 2.692 2.858 2.938 3.094 3.235 3.424 3.552 3.676 3.839 3.996 4.158 4.318 4.488 4.715 4.919 5.103 5.315 5.534 5.747 5.989 6.247 6.486 6.769 7.071 7.363 7.674 8.023 8.388 8.748 9.184 9.641 10.125 10.663 11.222 11.726 12.136 12.201 12.023 11.782 11.525 11.204 10.841 10.515 10.228 9.927 9.66 9.398 9.156 8.919 8.672 8.428 8.163 7.94 7.756 7.565 7.369 7.185 6.976 6.766 6.589 6.399 6.215 6.042 5.856 5.724 5.608 5.438 5.315 5.181 5.108 4.938 4.775 4.634 4.542 4.244 4.266 4.163 4.048 3.782 3.647 3.53 3.397 3.233 3.033 2.806 2.485 -3 ,22355 ,TETRA ,17589285,Sat Nov 27 17:03:00 CET,Sat Nov 27 19:15:10 CET,0.0 0.617 0.87 1.064 1.245 1.407 1.566 1.704 1.934 2.037 2.146 2.189 2.499 2.592 2.775 2.949 3.123 3.205 3.355 3.49 3.7 3.843 3.972 4.168 4.366 4.56 4.745 4.912 5.122 5.327 5.512 5.747 5.982 6.198 6.441 6.703 6.954 7.23 7.514 7.801 8.095 8.423 8.8 9.167 9.583 10.065 10.691 11.46 12.285 13.139 14.029 14.54 14.618 14.451 14.188 13.891 13.56 13.219 12.906 12.564 12.26 11.989 11.725 11.473 11.23 11.016 10.783 10.547 10.341 10.133 9.905 9.716 9.524 9.317 9.145 8.966 8.791 8.601 8.394 8.257 8.123 7.895 7.737 7.575 7.483 7.295 7.11 6.912 6.791 6.466 6.431 6.301 6.17 5.854 5.659 5.46 5.257 5.056 4.835 4.489 3.697 -4 ,19182 ,TETRA ,17589286,Sat Nov 27 17:03:02 CET,Sat Nov 27 19:03:50 CET,0.0 1.35 2.006 2.417 2.646 2.829 2.995 3.157 3.466 3.606 3.731 3.761 4.064 4.16 4.35 4.555 4.752 4.849 5.026 5.181 5.468 5.69 5.908 6.223 6.524 6.813 7.094 7.356 7.673 7.968 8.254 8.609 8.941 9.246 9.595 9.987 10.352 10.74 11.157 11.592 12.043 12.534 13.087 13.617 14.232 14.916 15.656 16.442 17.33 18.257 19.092 19.446 19.418 19.266 19.068 18.828 18.559 18.279 18.03 17.767 17.52 17.261 17.006 16.772 16.551 16.353 16.138 15.937 15.763 15.562 15.344 15.173 14.988 14.781 14.623 14.465 14.303 14.135 13.942 13.814 13.687 13.498 13.365 13.209 13.126 12.947 12.745 12.529 12.42 12.12 12.103 11.99 11.863 11.531 11.354 11.179 10.967 10.724 10.455 10.15 9.505 -5 ,8623 ,TETRA ,17589287,Sat Nov 27 17:03:01 CET,Sat Nov 27 19:16:48 CET,0.0 0.783 1.036 1.248 1.401 1.532 1.662 1.785 2.002 2.123 2.243 2.241 2.531 2.621 2.806 2.989 3.149 3.225 3.382 3.531 3.74 3.878 4.027 4.286 4.567 4.831 5.083 5.326 5.632 5.919 6.203 6.553 6.878 7.178 7.518 7.89 8.247 8.629 9.033 9.47 9.917 10.409 10.985 11.528 12.134 12.775 13.468 14.245 15.081 15.96 16.84 17.3 17.39 17.359 17.25 17.088 16.9 16.676 16.458 16.24 16.027 15.815 15.597 15.37 15.147 14.935 14.705 14.496 14.313 14.118 13.915 13.736 13.539 13.342 13.186 13.008 12.819 12.617 12.412 12.267 12.111 11.863 11.701 11.542 11.448 11.245 11.038 10.831 10.72 10.399 10.349 10.224 10.078 9.746 9.573 9.397 9.195 8.969 8.744 8.473 7.775 -6 ,17160 ,TETRA ,17589288,Sat Nov 27 17:03:02 CET,Sat Nov 27 19:16:38 CET,0.0 1.079 1.356 1.548 1.713 1.858 1.985 2.108 2.358 2.485 2.617 2.643 2.94 3.027 3.184 3.343 3.502 3.576 3.708 3.842 4.024 4.142 4.257 4.411 4.573 4.744 4.904 5.047 5.231 5.418 5.597 5.813 6.047 6.278 6.515 6.76 7.001 7.278 7.563 7.855 8.146 8.483 8.864 9.218 9.641 10.108 10.622 11.153 11.676 12.165 12.657 12.83 12.75 12.541 12.254 11.981 11.69 11.384 11.099 10.773 10.487 10.214 9.946 9.701 9.457 9.232 8.983 8.741 8.54 8.335 8.112 7.922 7.738 7.541 7.377 7.218 7.048 6.866 6.681 6.548 6.406 6.189 6.036 5.881 5.802 5.634 5.445 5.229 5.119 4.795 4.705 4.568 4.45 4.208 4.066 3.871 3.646 3.409 3.16 2.869 2.348 -7 ,19889 ,TETRA ,17589289,Sat Nov 27 17:03:01 CET,Sat Nov 27 19:25:35 CET,0.0 0.836 1.149 1.39 1.632 1.844 2.013 2.161 2.396 2.519 2.639 2.621 2.906 3.008 3.209 3.399 3.574 3.653 3.799 3.951 4.191 4.342 4.486 4.686 4.867 5.036 5.204 5.37 5.58 5.785 5.969 6.183 6.397 6.595 6.817 7.054 7.292 7.561 7.831 8.105 8.387 8.704 9.056 9.419 9.838 10.287 10.8 11.408 12.119 12.849 13.48 13.71 13.655 13.481 13.218 12.907 12.628 12.343 12.032 11.666 11.349 11.065 10.794 10.535 10.278 10.051 9.81 9.576 9.371 9.155 8.926 8.747 8.562 8.369 8.206 8.024 7.83 7.638 7.461 7.326 7.174 6.938 6.781 6.606 6.518 6.348 6.141 5.91 5.798 5.487 5.461 5.337 5.21 4.93 4.777 4.595 4.401 4.225 3.981 3.668 3.086 -8 ,10129 ,TETRA ,17589290,Sat Nov 27 17:03:03 CET,Sat Nov 27 19:25:39 CET,0.0 0.512 0.823 1.06 1.249 1.404 1.542 1.658 1.868 1.974 2.074 2.091 2.39 2.483 2.674 2.856 3.021 3.101 3.252 3.39 3.601 3.734 3.851 4.008 4.164 4.321 4.471 4.618 4.812 4.988 5.157 5.365 5.574 5.771 5.989 6.248 6.498 6.753 7.037 7.349 7.653 7.997 8.494 9.075 9.706 10.368 11.113 11.899 12.749 13.634 14.544 15.091 15.169 15.101 14.936 14.678 14.416 14.142 13.878 13.627 13.404 13.174 12.905 12.642 12.414 12.204 11.973 11.781 11.62 11.439 11.241 11.076 10.897 10.701 10.548 10.383 10.215 10.049 9.872 9.747 9.616 9.402 9.241 9.084 9.005 8.833 8.658 8.466 8.367 8.066 8.043 7.925 7.802 7.528 7.368 7.2 7.026 6.814 6.581 6.321 5.783 -9 ,30255 ,TETRA ,17589291,Sat Nov 27 17:03:04 CET,Sat Nov 27 19:21:19 CET,0.0 0.434 0.706 0.937 1.154 1.352 1.507 1.642 1.883 1.987 2.082 2.064 2.346 2.435 2.637 2.826 2.999 3.077 3.216 3.353 3.545 3.669 3.799 3.989 4.169 4.337 4.497 4.657 4.864 5.06 5.246 5.465 5.668 5.873 6.123 6.391 6.647 6.94 7.246 7.54 7.826 8.15 8.51 8.862 9.269 9.691 10.144 10.642 11.174 11.696 12.117 12.228 12.053 11.762 11.465 11.162 10.874 10.584 10.303 9.997 9.736 9.502 9.26 9.022 8.805 8.604 8.39 8.207 8.047 7.865 7.661 7.484 7.301 7.104 6.952 6.793 6.622 6.444 6.256 6.12 5.978 5.755 5.603 5.441 5.353 5.174 4.983 4.761 4.639 4.325 4.281 4.153 4.028 3.777 3.641 3.491 3.322 3.132 2.913 2.577 2.03 -10 ,25591 ,TETRA ,17589292,Sat Nov 27 17:03:02 CET,Sat Nov 27 19:21:57 CET,0.0 0.56 0.758 0.945 1.118 1.262 1.407 1.535 1.795 1.928 2.044 2.054 2.354 2.456 2.634 2.798 2.973 3.06 3.228 3.395 3.644 3.789 3.922 4.102 4.257 4.411 4.572 4.729 4.931 5.18 5.467 5.811 6.145 6.471 6.838 7.233 7.603 8.008 8.441 8.873 9.322 9.833 10.405 10.954 11.569 12.233 12.991 13.768 14.562 15.398 16.253 16.713 16.79 16.69 16.531 16.343 16.125 15.936 15.736 15.48 15.226 14.984 14.765 14.546 14.343 14.151 13.94 13.742 13.565 13.401 13.231 13.086 12.926 12.746 12.608 12.467 12.31 12.132 11.94 11.819 11.701 11.509 11.372 11.218 11.14 10.982 10.809 10.625 10.529 10.242 10.236 10.119 10.005 9.79 9.651 9.496 9.327 9.116 8.864 8.511 7.619 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt deleted file mode 100644 index 7ea13e2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13483 ,TETRA ,17589293,Sat Nov 27 17:03:06 CET,Sat Nov 27 19:21:02 CET,0.0 1.113 1.605 2.087 2.542 2.925 3.235 3.502 3.988 4.217 4.44 4.658 5.049 5.223 5.563 5.888 6.191 6.336 6.605 6.849 7.192 7.415 7.621 7.906 8.188 8.457 8.713 8.954 9.272 9.568 9.82 10.115 10.395 10.671 10.983 11.327 11.638 11.965 12.345 12.732 13.108 13.501 13.927 14.333 14.761 15.213 15.673 16.106 16.537 16.873 16.911 16.476 15.883 15.249 14.655 14.105 13.613 13.133 12.69 12.226 11.821 11.463 11.091 10.721 10.398 10.117 9.825 9.561 9.325 9.078 8.819 8.605 8.388 8.153 7.963 7.765 7.561 7.358 7.15 7.001 6.849 6.607 6.429 6.241 6.141 5.929 5.726 5.524 5.41 5.086 5.045 4.918 4.792 4.52 4.354 4.184 4.017 3.815 3.578 3.291 2.471 -2 ,26685 ,TETRA ,17589294,Sat Nov 27 17:03:09 CET,Sat Nov 27 19:20:43 CET,0.0 0.714 1.044 1.347 1.592 1.792 1.97 2.142 2.479 2.635 2.77 2.795 3.115 3.215 3.4 3.561 3.718 3.796 3.975 4.164 4.402 4.536 4.658 4.828 4.978 5.142 5.323 5.494 5.699 5.876 6.034 6.24 6.46 6.71 7.034 7.385 7.721 8.084 8.439 8.781 9.149 9.55 9.987 10.42 10.876 11.298 11.746 12.184 12.652 13.07 13.185 12.878 12.372 11.804 11.239 10.679 10.137 9.633 9.211 8.762 8.363 8.005 7.666 7.361 7.048 6.748 6.443 6.178 5.956 5.719 5.467 5.265 5.066 4.862 4.694 4.513 4.311 4.096 3.884 3.738 3.59 3.366 3.205 3.031 2.943 2.764 2.569 2.361 2.246 1.922 1.906 1.786 1.658 1.405 1.263 1.101 0.925 0.734 0.491 0.153 -0.667 -3 ,3923 ,TETRA ,17589295,Sat Nov 27 17:03:02 CET,Sat Nov 27 19:22:06 CET,0.0 0.73 1.128 1.455 1.836 2.17 2.414 2.587 2.855 2.994 3.126 3.158 3.468 3.575 3.771 3.96 4.148 4.229 4.395 4.563 4.793 4.938 5.078 5.272 5.435 5.581 5.731 5.882 6.074 6.258 6.442 6.653 6.85 7.039 7.246 7.473 7.738 8.055 8.373 8.728 9.125 9.581 10.058 10.477 10.917 11.342 11.81 12.276 12.698 13.037 13.029 12.619 12.135 11.565 10.973 10.408 9.895 9.404 8.977 8.547 8.158 7.8 7.459 7.133 6.817 6.502 6.185 5.931 5.714 5.484 5.246 5.053 4.837 4.606 4.429 4.243 4.056 3.864 3.653 3.504 3.358 3.143 2.989 2.829 2.747 2.571 2.381 2.173 2.062 1.742 1.694 1.561 1.427 1.142 0.965 0.78 0.614 0.421 0.181 -0.103 -0.601 -4 ,26568 ,TETRA ,17589296,Sat Nov 27 17:03:03 CET,Sat Nov 27 19:23:35 CET,0.0 1.422 1.901 2.231 2.47 2.69 2.903 3.078 3.356 3.486 3.613 3.661 3.977 4.088 4.288 4.472 4.652 4.742 4.923 5.087 5.321 5.477 5.619 5.828 6.028 6.211 6.39 6.555 6.77 6.971 7.162 7.401 7.625 7.837 8.071 8.314 8.565 8.87 9.196 9.552 9.936 10.358 10.82 11.248 11.724 12.204 12.671 13.058 13.385 13.594 13.455 12.992 12.387 11.712 11.016 10.335 9.787 9.311 8.875 8.428 8.038 7.679 7.355 7.026 6.683 6.384 6.082 5.785 5.506 5.244 4.99 4.764 4.527 4.287 4.118 3.947 3.758 3.568 3.383 3.247 3.095 2.859 2.699 2.538 2.454 2.284 2.106 1.897 1.791 1.481 1.454 1.331 1.207 0.967 0.841 0.712 0.565 0.376 0.176 -0.039 -0.672 -5 ,30176 ,TETRA ,17589297,Sat Nov 27 17:03:58 CET,Sat Nov 27 19:10:34 CET,0.0 1.299 1.588 1.835 2.058 2.237 2.393 2.542 2.856 3.007 3.144 3.215 3.537 3.66 3.872 4.058 4.245 4.335 4.488 4.641 4.885 5.028 5.164 5.374 5.569 5.748 5.925 6.102 6.324 6.518 6.688 6.892 7.091 7.339 7.704 8.119 8.498 8.896 9.311 9.697 10.096 10.525 10.987 11.459 11.978 12.477 12.995 13.54 14.107 14.525 14.624 14.286 13.719 13.0 12.298 11.655 11.071 10.554 10.092 9.627 9.206 8.805 8.428 8.06 7.722 7.423 7.097 6.797 6.53 6.253 5.986 5.767 5.528 5.29 5.094 4.885 4.67 4.459 4.254 4.095 3.928 3.685 3.509 3.317 3.217 3.019 2.813 2.585 2.471 2.154 2.101 1.965 1.84 1.558 1.4 1.217 1.016 0.815 0.581 0.306 -0.371 -6 ,12097 ,TETRA ,17589298,Sat Nov 27 17:03:58 CET,Sat Nov 27 19:21:03 CET,0.0 1.547 1.915 2.19 2.468 2.681 2.851 2.991 3.259 3.379 3.506 3.565 3.875 3.982 4.169 4.34 4.512 4.598 4.753 4.907 5.139 5.266 5.388 5.567 5.721 5.883 6.057 6.216 6.404 6.576 6.743 6.939 7.122 7.313 7.551 7.802 8.014 8.25 8.498 8.744 9.001 9.289 9.596 9.874 10.202 10.525 10.813 11.026 11.125 11.129 10.828 10.009 9.157 8.374 7.701 7.079 6.495 5.952 5.49 5.031 4.606 4.204 3.83 3.492 3.185 2.91 2.629 2.382 2.166 1.929 1.67 1.456 1.23 0.994 0.815 0.641 0.466 0.283 0.086 -0.057 -0.2 -0.419 -0.569 -0.742 -0.834 -1.029 -1.252 -1.481 -1.6 -1.934 -1.993 -2.139 -2.289 -2.62 -2.816 -3.039 -3.292 -3.57 -3.871 -4.281 -5.283 -7 ,19444 ,TETRA ,17589299,Sat Nov 27 17:03:58 CET,Sat Nov 27 19:19:38 CET,0.0 1.235 1.732 2.116 2.399 2.634 2.857 3.042 3.338 3.482 3.622 3.676 4.008 4.127 4.334 4.526 4.715 4.812 4.999 5.159 5.381 5.53 5.671 5.861 6.043 6.228 6.391 6.523 6.69 6.867 7.035 7.232 7.44 7.628 7.822 8.033 8.247 8.496 8.755 8.984 9.207 9.469 9.837 10.271 10.723 11.151 11.581 11.987 12.346 12.608 12.53 12.044 11.485 10.868 10.271 9.672 9.056 8.458 7.947 7.455 7.048 6.678 6.327 6.014 5.725 5.429 5.09 4.792 4.541 4.277 4.0 3.772 3.531 3.274 3.072 2.864 2.643 2.408 2.176 2.014 1.851 1.603 1.422 1.229 1.131 0.949 0.763 0.545 0.424 0.097 0.021 -0.128 -0.269 -0.594 -0.78 -0.979 -1.175 -1.402 -1.675 -1.977 -2.596 -8 ,28289 ,TETRA ,17589300,Sat Nov 27 17:03:58 CET,Sat Nov 27 19:23:22 CET,0.0 1.213 1.744 2.123 2.387 2.61 2.798 2.954 3.253 3.401 3.553 3.619 3.936 4.048 4.267 4.459 4.628 4.713 4.885 5.05 5.291 5.443 5.588 5.79 5.969 6.132 6.285 6.428 6.607 6.795 6.977 7.18 7.382 7.572 7.794 8.037 8.259 8.525 8.815 9.072 9.308 9.558 9.799 10.015 10.279 10.574 10.838 11.023 11.195 11.306 11.076 10.35 9.552 8.78 8.043 7.363 6.739 6.169 5.68 5.181 4.754 4.381 4.029 3.691 3.384 3.098 2.778 2.465 2.192 1.921 1.649 1.435 1.21 0.982 0.807 0.618 0.413 0.191 -0.033 -0.186 -0.354 -0.62 -0.795 -0.984 -1.094 -1.314 -1.534 -1.759 -1.879 -2.219 -2.269 -2.416 -2.571 -2.873 -3.044 -3.233 -3.419 -3.605 -3.832 -4.119 -4.634 -9 ,15092 ,TETRA ,17589301,Sat Nov 27 17:03:58 CET,Sat Nov 27 19:21:06 CET,0.0 1.82 2.177 2.434 2.651 2.848 3.02 3.173 3.445 3.575 3.708 3.741 4.048 4.157 4.35 4.528 4.704 4.789 4.945 5.093 5.326 5.481 5.63 5.821 5.99 6.171 6.34 6.483 6.662 6.829 6.976 7.146 7.319 7.495 7.691 7.9 8.1 8.324 8.555 8.801 9.042 9.269 9.529 9.765 9.996 10.216 10.446 10.653 10.805 10.82 10.446 9.627 8.707 7.909 7.209 6.536 5.921 5.36 4.882 4.391 3.958 3.582 3.209 2.853 2.529 2.235 1.93 1.643 1.383 1.116 0.849 0.619 0.372 0.117 -0.076 -0.279 -0.496 -0.725 -0.964 -1.117 -1.264 -1.514 -1.694 -1.882 -1.977 -2.166 -2.37 -2.59 -2.716 -3.045 -3.072 -3.197 -3.332 -3.635 -3.807 -3.988 -4.152 -4.327 -4.536 -4.767 -5.457 -10 ,17 ,TETRA ,17589302,Sat Nov 27 17:04:01 CET,Sat Nov 27 19:18:52 CET,0.0 0.91 1.297 1.584 1.844 2.05 2.211 2.382 2.698 2.826 2.95 2.985 3.302 3.412 3.612 3.793 3.961 4.049 4.23 4.401 4.644 4.797 4.939 5.126 5.295 5.458 5.619 5.784 5.999 6.2 6.407 6.637 6.828 7.008 7.223 7.472 7.685 7.895 8.128 8.364 8.595 8.846 9.116 9.384 9.658 9.943 10.224 10.416 10.534 10.502 10.185 9.466 8.681 7.918 7.233 6.629 6.065 5.54 5.081 4.601 4.193 3.841 3.487 3.126 2.785 2.479 2.164 1.885 1.65 1.412 1.168 0.968 0.755 0.531 0.351 0.155 -0.041 -0.242 -0.459 -0.612 -0.776 -1.01 -1.168 -1.337 -1.427 -1.615 -1.804 -2.006 -2.108 -2.421 -2.426 -2.544 -2.682 -2.969 -3.122 -3.27 -3.425 -3.633 -3.867 -4.217 -5.137 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt deleted file mode 100644 index 4b258d67..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3959 ,TETRA ,17589303,Sat Nov 27 17:04:00 CET,Sat Nov 27 19:13:38 CET,0.0 0.426 0.663 0.864 1.033 1.196 1.347 1.464 1.689 1.804 1.908 1.901 2.202 2.296 2.485 2.682 2.871 2.958 3.118 3.265 3.458 3.58 3.703 3.889 4.081 4.259 4.432 4.589 4.767 4.958 5.148 5.378 5.6 5.796 6.028 6.292 6.542 6.816 7.105 7.421 7.742 8.081 8.468 8.834 9.253 9.715 10.216 10.743 11.269 11.736 12.116 12.17 11.967 11.66 11.277 10.891 10.497 10.073 9.682 9.288 8.959 8.648 8.349 8.079 7.834 7.584 7.318 7.104 6.912 6.713 6.503 6.311 6.098 5.882 5.718 5.55 5.374 5.183 4.986 4.851 4.703 4.456 4.292 4.129 4.038 3.856 3.663 3.448 3.33 3.0 2.941 2.823 2.688 2.374 2.211 2.045 1.863 1.641 1.362 1.015 0.477 -2 ,20263 ,TETRA ,17589304,Sat Nov 27 17:03:59 CET,Sat Nov 27 19:22:48 CET,0.0 0.563 0.754 0.901 1.046 1.18 1.304 1.432 1.687 1.802 1.913 1.928 2.235 2.328 2.502 2.663 2.819 2.898 3.046 3.191 3.407 3.541 3.669 3.844 4.023 4.2 4.361 4.516 4.703 4.892 5.09 5.314 5.527 5.732 5.967 6.233 6.489 6.777 7.077 7.384 7.69 8.021 8.41 8.8 9.231 9.658 10.101 10.569 11.082 11.537 11.816 11.713 11.458 11.116 10.694 10.26 9.832 9.44 9.102 8.74 8.429 8.157 7.867 7.558 7.269 6.997 6.694 6.438 6.218 5.986 5.755 5.541 5.304 5.067 4.877 4.684 4.477 4.267 4.062 3.908 3.745 3.485 3.306 3.123 3.027 2.829 2.608 2.377 2.263 1.943 1.901 1.786 1.669 1.386 1.227 1.063 0.875 0.656 0.411 0.138 -0.425 -3 ,25961 ,TETRA ,17589305,Sat Nov 27 17:04:00 CET,Sat Nov 27 19:23:16 CET,0.0 0.363 0.633 0.837 0.986 1.131 1.259 1.388 1.64 1.753 1.858 1.873 2.179 2.276 2.467 2.643 2.823 2.915 3.079 3.224 3.439 3.585 3.723 3.928 4.118 4.289 4.45 4.609 4.828 5.033 5.213 5.424 5.642 5.847 6.076 6.353 6.624 6.893 7.178 7.472 7.774 8.125 8.516 8.907 9.331 9.771 10.285 10.813 11.368 11.912 12.301 12.38 12.188 11.85 11.479 11.068 10.659 10.259 9.91 9.555 9.213 8.906 8.604 8.326 8.074 7.837 7.59 7.349 7.137 6.926 6.685 6.476 6.273 6.07 5.904 5.726 5.541 5.353 5.149 5.005 4.863 4.632 4.464 4.294 4.203 3.998 3.802 3.603 3.501 3.197 3.157 3.033 2.915 2.659 2.504 2.326 2.134 1.906 1.667 1.374 0.68 -4 ,30952 ,TETRA ,17589306,Sat Nov 27 17:04:02 CET,Sat Nov 27 19:22:28 CET,0.0 0.479 0.727 0.928 1.104 1.254 1.401 1.528 1.751 1.845 1.933 1.914 2.204 2.295 2.465 2.635 2.795 2.868 3.012 3.157 3.362 3.492 3.628 3.818 3.987 4.152 4.308 4.452 4.649 4.844 5.039 5.272 5.494 5.713 5.953 6.21 6.456 6.729 7.02 7.319 7.624 7.979 8.384 8.747 9.187 9.69 10.214 10.775 11.36 11.896 12.371 12.516 12.322 11.987 11.611 11.228 10.872 10.496 10.12 9.732 9.405 9.117 8.827 8.524 8.214 7.937 7.666 7.433 7.217 6.977 6.749 6.562 6.357 6.137 5.955 5.763 5.567 5.353 5.128 4.983 4.828 4.575 4.409 4.236 4.14 3.943 3.73 3.504 3.393 3.088 3.051 2.929 2.793 2.49 2.327 2.145 1.952 1.756 1.529 1.251 0.806 -5 ,28600 ,TETRA ,17589307,Sat Nov 27 17:03:59 CET,Sat Nov 27 19:23:51 CET,0.0 0.345 0.581 0.767 0.936 1.104 1.269 1.414 1.677 1.8 1.925 1.964 2.273 2.369 2.553 2.747 2.924 3.008 3.183 3.351 3.59 3.738 3.871 4.061 4.244 4.42 4.587 4.74 4.928 5.122 5.319 5.554 5.771 5.966 6.194 6.465 6.722 7.001 7.292 7.593 7.907 8.255 8.644 9.027 9.501 10.003 10.534 11.09 11.659 12.196 12.6 12.624 12.412 12.074 11.697 11.294 10.919 10.547 10.16 9.743 9.405 9.105 8.798 8.503 8.241 7.999 7.735 7.497 7.29 7.08 6.855 6.66 6.458 6.266 6.123 5.958 5.771 5.572 5.362 5.217 5.073 4.847 4.68 4.503 4.413 4.229 4.028 3.816 3.701 3.381 3.341 3.204 3.062 2.785 2.636 2.464 2.259 2.015 1.712 1.35 0.69 -6 ,21415 ,TETRA ,17589308,Sat Nov 27 17:04:01 CET,Sat Nov 27 19:23:13 CET,0.0 0.406 0.649 0.832 0.988 1.128 1.272 1.406 1.654 1.772 1.88 1.881 2.175 2.269 2.457 2.651 2.837 2.921 3.077 3.225 3.448 3.589 3.72 3.909 4.085 4.248 4.408 4.568 4.786 4.988 5.165 5.382 5.579 5.775 6.009 6.264 6.516 6.779 7.041 7.328 7.638 7.967 8.332 8.69 9.088 9.522 10.006 10.512 11.05 11.517 11.803 11.713 11.429 11.023 10.542 10.055 9.627 9.261 8.934 8.589 8.269 7.947 7.63 7.342 7.07 6.828 6.537 6.249 6.007 5.764 5.526 5.332 5.128 4.919 4.755 4.588 4.409 4.207 4.002 3.861 3.711 3.47 3.313 3.155 3.066 2.879 2.689 2.478 2.367 2.06 2.04 1.926 1.811 1.574 1.443 1.289 1.111 0.905 0.656 0.368 -0.116 -7 ,31805 ,TETRA ,17589309,Sat Nov 27 17:04:02 CET,Sat Nov 27 19:14:03 CET,0.0 0.335 0.541 0.689 0.85 1.027 1.177 1.307 1.53 1.639 1.747 1.745 2.038 2.126 2.309 2.488 2.646 2.73 2.901 3.046 3.26 3.401 3.536 3.735 3.919 4.089 4.25 4.396 4.595 4.806 4.998 5.219 5.447 5.659 5.881 6.144 6.402 6.673 6.959 7.268 7.589 7.924 8.304 8.68 9.105 9.575 10.07 10.544 11.057 11.556 11.913 11.904 11.691 11.364 10.979 10.591 10.174 9.797 9.474 9.089 8.738 8.436 8.165 7.884 7.591 7.324 7.055 6.817 6.617 6.416 6.197 6.003 5.799 5.585 5.418 5.246 5.044 4.837 4.647 4.515 4.374 4.136 3.966 3.794 3.705 3.522 3.332 3.127 3.022 2.722 2.704 2.584 2.451 2.145 1.974 1.791 1.599 1.404 1.172 0.862 0.188 -8 ,27020 ,TETRA ,17589310,Sat Nov 27 17:04:58 CET,Sat Nov 27 19:32:00 CET,0.0 0.326 0.554 0.743 0.893 1.043 1.193 1.318 1.55 1.655 1.755 1.766 2.065 2.161 2.336 2.508 2.683 2.772 2.931 3.077 3.299 3.444 3.577 3.762 3.95 4.142 4.321 4.483 4.697 4.902 5.107 5.34 5.541 5.735 5.968 6.244 6.506 6.773 7.04 7.328 7.632 7.959 8.339 8.715 9.141 9.622 10.151 10.7 11.297 11.922 12.397 12.411 12.161 11.796 11.441 11.1 10.762 10.428 10.114 9.785 9.484 9.195 8.922 8.673 8.426 8.197 7.967 7.752 7.553 7.346 7.134 6.953 6.764 6.553 6.379 6.207 6.035 5.851 5.643 5.502 5.347 5.093 4.925 4.745 4.658 4.489 4.311 4.115 4.014 3.716 3.708 3.579 3.432 3.141 2.981 2.807 2.631 2.441 2.222 1.913 1.416 -9 ,32530 ,TETRA ,17589311,Sat Nov 27 17:04:00 CET,Sat Nov 27 19:22:22 CET,0.0 0.555 0.772 0.925 1.047 1.175 1.303 1.427 1.652 1.751 1.849 1.831 2.132 2.234 2.403 2.565 2.723 2.794 2.929 3.057 3.248 3.372 3.486 3.658 3.834 4.0 4.16 4.317 4.512 4.692 4.86 5.064 5.267 5.465 5.69 5.938 6.177 6.445 6.716 6.99 7.292 7.626 8.009 8.394 8.831 9.308 9.845 10.423 10.974 11.463 11.919 11.996 11.702 11.277 10.843 10.395 9.964 9.543 9.139 8.742 8.438 8.158 7.876 7.614 7.365 7.125 6.857 6.61 6.377 6.138 5.906 5.71 5.5 5.278 5.107 4.924 4.719 4.502 4.278 4.131 3.981 3.747 3.586 3.421 3.339 3.161 2.96 2.751 2.646 2.328 2.257 2.127 1.999 1.713 1.551 1.37 1.188 0.99 0.748 0.426 -0.246 -10 ,28713 ,TETRA ,17589312,Sat Nov 27 17:04:00 CET,Sat Nov 27 19:22:20 CET,0.0 0.397 0.59 0.769 0.905 1.039 1.189 1.338 1.603 1.723 1.83 1.817 2.117 2.208 2.385 2.554 2.717 2.796 2.952 3.102 3.31 3.437 3.565 3.742 3.909 4.089 4.262 4.418 4.613 4.803 4.983 5.203 5.41 5.602 5.836 6.114 6.369 6.634 6.929 7.249 7.581 7.933 8.328 8.724 9.21 9.747 10.281 10.823 11.427 12.046 12.568 12.626 12.327 11.964 11.606 11.192 10.792 10.451 10.148 9.795 9.458 9.152 8.857 8.578 8.318 8.076 7.835 7.622 7.433 7.224 7.008 6.835 6.647 6.446 6.28 6.105 5.928 5.749 5.557 5.428 5.298 5.084 4.925 4.764 4.681 4.497 4.301 4.089 3.991 3.691 3.64 3.506 3.363 3.082 2.945 2.785 2.593 2.388 2.16 1.863 1.316 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt deleted file mode 100644 index fb20fdd2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7769 ,TETRA ,17589313,Sat Nov 27 17:04:00 CET,Sat Nov 27 19:14:49 CET,0.0 0.35 0.609 0.834 1.027 1.191 1.336 1.49 1.76 1.861 1.959 1.945 2.241 2.331 2.492 2.65 2.805 2.878 3.024 3.165 3.369 3.497 3.611 3.778 3.946 4.111 4.273 4.415 4.592 4.758 4.914 5.112 5.305 5.487 5.714 5.977 6.205 6.444 6.704 6.974 7.261 7.576 7.924 8.267 8.623 8.974 9.373 9.818 10.25 10.606 10.752 10.419 9.941 9.398 8.855 8.338 7.839 7.347 6.911 6.458 6.054 5.699 5.386 5.077 4.75 4.443 4.125 3.838 3.6 3.357 3.099 2.882 2.657 2.416 2.219 2.027 1.826 1.611 1.38 1.217 1.048 0.765 0.572 0.384 0.284 0.052 -0.18 -0.396 -0.51 -0.841 -0.906 -1.041 -1.201 -1.552 -1.725 -1.901 -2.094 -2.317 -2.635 -3.02 -3.696 -2 ,11306 ,TETRA ,17589314,Sat Nov 27 17:04:01 CET,Sat Nov 27 19:25:18 CET,0.0 0.379 0.584 0.775 0.949 1.099 1.255 1.392 1.636 1.754 1.861 1.861 2.149 2.241 2.415 2.565 2.708 2.78 2.922 3.058 3.255 3.382 3.509 3.692 3.866 4.033 4.189 4.331 4.511 4.696 4.876 5.08 5.269 5.461 5.701 5.956 6.186 6.438 6.703 6.974 7.254 7.592 8.012 8.406 8.812 9.258 9.747 10.212 10.659 11.1 11.475 11.457 11.053 10.539 10.039 9.579 9.15 8.675 8.224 7.752 7.341 6.989 6.658 6.319 5.995 5.729 5.444 5.176 4.956 4.737 4.501 4.293 4.08 3.857 3.673 3.495 3.313 3.1 2.877 2.721 2.571 2.323 2.139 1.968 1.881 1.692 1.47 1.225 1.089 0.743 0.647 0.51 0.366 0.012 -0.165 -0.339 -0.549 -0.778 -1.015 -1.312 -2.007 -3 ,17221 ,TETRA ,17589315,Sat Nov 27 17:04:04 CET,Sat Nov 27 19:25:04 CET,0.0 0.511 0.813 1.074 1.279 1.449 1.603 1.75 2.023 2.142 2.251 2.256 2.561 2.669 2.86 3.043 3.215 3.291 3.443 3.595 3.811 3.941 4.068 4.249 4.414 4.577 4.738 4.891 5.09 5.281 5.464 5.687 5.895 6.099 6.327 6.576 6.826 7.097 7.389 7.695 8.001 8.346 8.727 9.079 9.469 9.866 10.319 10.808 11.266 11.654 11.892 11.773 11.425 10.999 10.566 10.098 9.625 9.154 8.706 8.242 7.841 7.494 7.164 6.814 6.476 6.202 5.936 5.686 5.46 5.201 4.913 4.678 4.441 4.196 4.005 3.81 3.6 3.381 3.158 3.01 2.855 2.587 2.39 2.189 2.086 1.879 1.675 1.464 1.354 1.036 0.979 0.831 0.671 0.345 0.139 -0.081 -0.291 -0.546 -0.867 -1.229 -2.171 -4 ,14445 ,TETRA ,17589316,Sat Nov 27 17:04:06 CET,Sat Nov 27 19:24:42 CET,0.0 0.411 0.621 0.807 0.966 1.098 1.221 1.333 1.555 1.664 1.768 1.763 2.05 2.128 2.271 2.432 2.59 2.659 2.798 2.957 3.197 3.337 3.462 3.633 3.815 3.986 4.141 4.298 4.498 4.696 4.894 5.135 5.359 5.565 5.797 6.055 6.299 6.555 6.829 7.121 7.419 7.758 8.163 8.539 8.969 9.405 9.838 10.247 10.613 10.973 11.189 10.898 10.427 9.951 9.426 8.879 8.431 8.043 7.669 7.272 6.91 6.572 6.25 5.9 5.542 5.245 4.944 4.661 4.409 4.151 3.874 3.626 3.376 3.123 2.916 2.702 2.494 2.266 2.015 1.85 1.683 1.43 1.26 1.081 0.987 0.804 0.619 0.395 0.271 -0.043 -0.097 -0.237 -0.384 -0.703 -0.854 -1.021 -1.221 -1.447 -1.695 -1.987 -2.612 -5 ,25017 ,TETRA ,17589317,Sat Nov 27 17:04:02 CET,Sat Nov 27 19:24:32 CET,0.0 0.378 0.651 0.889 1.08 1.238 1.384 1.522 1.77 1.889 2.005 2.034 2.317 2.411 2.602 2.792 2.963 3.043 3.188 3.33 3.549 3.692 3.83 4.026 4.212 4.378 4.537 4.686 4.867 5.048 5.227 5.442 5.647 5.835 6.048 6.287 6.495 6.715 6.96 7.216 7.478 7.766 8.084 8.387 8.725 9.063 9.432 9.794 10.095 10.354 10.441 10.172 9.766 9.335 8.85 8.315 7.824 7.366 6.91 6.428 6.009 5.617 5.249 4.9 4.575 4.286 3.984 3.685 3.413 3.148 2.885 2.67 2.438 2.189 1.994 1.803 1.607 1.37 1.123 0.963 0.798 0.542 0.371 0.181 0.083 -0.104 -0.308 -0.53 -0.654 -0.981 -1.046 -1.187 -1.343 -1.648 -1.823 -2.023 -2.229 -2.465 -2.737 -3.09 -4.01 -6 ,15586 ,TETRA ,17589318,Sat Nov 27 17:04:01 CET,Sat Nov 27 19:23:31 CET,0.0 0.232 0.422 0.583 0.736 0.898 1.034 1.144 1.359 1.476 1.595 1.608 1.904 1.991 2.177 2.361 2.52 2.593 2.732 2.886 3.107 3.243 3.385 3.576 3.758 3.938 4.103 4.269 4.473 4.66 4.848 5.057 5.249 5.436 5.667 5.94 6.181 6.443 6.723 7.017 7.319 7.651 8.057 8.431 8.796 9.184 9.634 10.122 10.626 11.089 11.391 11.133 10.657 10.168 9.665 9.142 8.661 8.259 7.91 7.517 7.145 6.797 6.43 6.091 5.806 5.549 5.264 4.988 4.74 4.486 4.224 3.998 3.771 3.56 3.38 3.182 2.986 2.778 2.561 2.407 2.246 1.989 1.807 1.608 1.502 1.298 1.099 0.891 0.774 0.448 0.356 0.2 0.05 -0.297 -0.504 -0.693 -0.923 -1.205 -1.493 -1.885 -2.837 -7 ,3323 ,TETRA ,17589319,Sat Nov 27 17:04:03 CET,Sat Nov 27 19:23:20 CET,0.0 0.395 0.597 0.786 0.957 1.098 1.235 1.366 1.612 1.723 1.826 1.819 2.106 2.199 2.377 2.548 2.707 2.779 2.928 3.079 3.293 3.425 3.548 3.731 3.904 4.07 4.232 4.377 4.569 4.759 4.953 5.18 5.374 5.563 5.789 6.046 6.296 6.551 6.819 7.114 7.404 7.718 8.086 8.444 8.814 9.195 9.626 10.084 10.586 11.077 11.386 11.253 10.775 10.224 9.706 9.199 8.703 8.218 7.799 7.36 6.964 6.593 6.239 5.908 5.602 5.337 5.024 4.725 4.484 4.236 3.97 3.746 3.517 3.275 3.09 2.894 2.681 2.466 2.245 2.084 1.916 1.658 1.479 1.293 1.197 0.988 0.773 0.561 0.441 0.117 0.078 -0.057 -0.226 -0.6 -0.763 -0.919 -1.105 -1.334 -1.605 -1.959 -2.923 -8 ,5459 ,TETRA ,17589320,Sat Nov 27 17:04:04 CET,Sat Nov 27 19:24:31 CET,0.0 0.557 0.785 0.947 1.088 1.22 1.34 1.468 1.711 1.816 1.92 1.936 2.232 2.322 2.497 2.655 2.801 2.865 2.994 3.128 3.327 3.448 3.574 3.771 3.94 4.096 4.256 4.413 4.62 4.82 5.0 5.216 5.434 5.639 5.858 6.107 6.331 6.57 6.837 7.118 7.39 7.686 8.026 8.358 8.755 9.167 9.604 10.071 10.543 10.943 11.102 10.802 10.323 9.846 9.347 8.82 8.328 7.865 7.425 6.957 6.574 6.231 5.875 5.508 5.152 4.833 4.49 4.18 3.906 3.609 3.312 3.066 2.807 2.546 2.338 2.121 1.899 1.659 1.401 1.223 1.044 0.752 0.54 0.331 0.223 -0.021 -0.292 -0.58 -0.731 -1.077 -1.159 -1.317 -1.481 -1.823 -2.015 -2.224 -2.451 -2.704 -3.053 -3.481 -4.546 -9 ,14015 ,TETRA ,17589321,Sat Nov 27 17:04:07 CET,Sat Nov 27 19:24:57 CET,0.0 0.655 0.938 1.124 1.278 1.436 1.592 1.738 2.013 2.133 2.238 2.258 2.568 2.667 2.854 3.031 3.206 3.285 3.437 3.586 3.8 3.931 4.047 4.232 4.412 4.584 4.755 4.927 5.137 5.327 5.514 5.745 5.979 6.211 6.453 6.702 6.958 7.22 7.475 7.749 8.037 8.353 8.736 9.133 9.566 10.01 10.49 10.97 11.417 11.844 12.162 12.02 11.626 11.213 10.766 10.259 9.771 9.305 8.908 8.522 8.146 7.795 7.473 7.159 6.838 6.533 6.221 5.925 5.662 5.403 5.136 4.907 4.66 4.4 4.205 4.01 3.804 3.582 3.363 3.216 3.059 2.797 2.613 2.406 2.301 2.096 1.881 1.662 1.549 1.231 1.152 0.991 0.828 0.48 0.307 0.136 -0.064 -0.322 -0.652 -1.071 -2.034 -10 ,27846 ,TETRA ,17589322,Sat Nov 27 17:05:00 CET,Sat Nov 27 19:32:00 CET,0.0 0.631 0.849 1.027 1.201 1.357 1.474 1.597 1.833 1.94 2.046 2.039 2.325 2.416 2.605 2.785 2.956 3.039 3.194 3.336 3.531 3.653 3.77 3.949 4.139 4.327 4.5 4.656 4.85 5.045 5.231 5.449 5.657 5.852 6.076 6.332 6.579 6.83 7.092 7.378 7.68 8.016 8.382 8.732 9.121 9.523 9.96 10.416 10.872 11.282 11.496 11.23 10.765 10.294 9.812 9.333 8.888 8.446 8.037 7.642 7.306 7.002 6.717 6.445 6.19 5.953 5.693 5.447 5.228 4.997 4.739 4.507 4.264 4.013 3.82 3.618 3.41 3.189 2.955 2.793 2.611 2.32 2.135 1.946 1.843 1.638 1.422 1.194 1.086 0.779 0.739 0.602 0.443 0.094 -0.086 -0.267 -0.482 -0.716 -0.97 -1.357 -2.416 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt deleted file mode 100644 index abc26307..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26105 ,TETRA ,17589323,Sat Nov 27 17:05:58 CET,Sat Nov 27 19:27:25 CET,0.0 0.314 0.53 0.706 0.879 1.041 1.186 1.312 1.571 1.694 1.796 1.791 2.093 2.173 2.33 2.501 2.666 2.747 2.906 3.055 3.259 3.385 3.514 3.701 3.868 4.024 4.182 4.338 4.526 4.714 4.9 5.122 5.327 5.514 5.738 5.995 6.228 6.465 6.724 7.014 7.301 7.607 7.964 8.296 8.676 9.074 9.493 9.939 10.321 10.604 10.706 10.388 9.905 9.353 8.777 8.242 7.745 7.264 6.817 6.336 5.923 5.581 5.256 4.944 4.645 4.334 3.979 3.675 3.425 3.165 2.907 2.678 2.433 2.191 1.994 1.787 1.578 1.376 1.164 1.012 0.841 0.57 0.402 0.22 0.127 -0.06 -0.254 -0.467 -0.582 -0.901 -0.949 -1.085 -1.222 -1.481 -1.615 -1.769 -1.951 -2.154 -2.354 -2.597 -3.153 -2 ,6308 ,TETRA ,17589324,Sat Nov 27 17:04:58 CET,Sat Nov 27 19:25:30 CET,0.0 0.6 0.86 1.042 1.207 1.365 1.52 1.671 1.94 2.058 2.166 2.167 2.461 2.556 2.749 2.928 3.096 3.181 3.344 3.503 3.74 3.877 4.004 4.192 4.375 4.548 4.705 4.854 5.054 5.243 5.419 5.652 5.882 6.085 6.311 6.558 6.786 7.023 7.281 7.556 7.824 8.117 8.478 8.81 9.147 9.477 9.815 10.173 10.511 10.745 10.745 10.303 9.706 9.1 8.522 7.947 7.406 6.863 6.401 5.962 5.568 5.218 4.894 4.577 4.255 3.966 3.658 3.378 3.136 2.9 2.662 2.454 2.233 2.004 1.817 1.608 1.396 1.183 0.956 0.803 0.648 0.4 0.227 0.049 -0.04 -0.22 -0.405 -0.59 -0.692 -1.005 -1.057 -1.192 -1.339 -1.65 -1.815 -2.018 -2.236 -2.452 -2.714 -3.037 -3.875 -3 ,4610 ,TETRA ,17589325,Sat Nov 27 17:04:59 CET,Sat Nov 27 19:15:26 CET,0.0 0.385 0.573 0.768 0.968 1.138 1.302 1.433 1.664 1.788 1.909 1.923 2.23 2.321 2.481 2.638 2.785 2.853 2.993 3.132 3.328 3.462 3.592 3.779 3.965 4.142 4.316 4.483 4.683 4.869 5.063 5.292 5.497 5.681 5.892 6.147 6.4 6.663 6.932 7.206 7.475 7.779 8.132 8.442 8.769 9.115 9.479 9.9 10.331 10.628 10.578 10.139 9.602 9.031 8.475 7.897 7.355 6.82 6.328 5.83 5.402 5.025 4.681 4.371 4.082 3.809 3.523 3.258 3.016 2.759 2.492 2.283 2.057 1.82 1.636 1.44 1.229 0.999 0.766 0.606 0.443 0.189 0.007 -0.164 -0.261 -0.468 -0.678 -0.893 -0.998 -1.331 -1.404 -1.546 -1.688 -1.99 -2.168 -2.359 -2.585 -2.833 -3.076 -3.362 -4.043 -4 ,28285 ,TETRA ,17589326,Sat Nov 27 17:04:58 CET,Sat Nov 27 19:23:33 CET,0.0 0.42 0.714 0.92 1.127 1.339 1.509 1.639 1.857 1.965 2.077 2.106 2.406 2.497 2.671 2.835 3.004 3.086 3.237 3.383 3.597 3.742 3.874 4.058 4.23 4.39 4.555 4.725 4.936 5.125 5.302 5.508 5.718 5.933 6.161 6.392 6.628 6.891 7.145 7.392 7.651 7.942 8.276 8.595 8.949 9.336 9.715 10.069 10.4 10.611 10.617 10.276 9.738 9.12 8.572 8.075 7.562 7.044 6.559 6.078 5.662 5.292 4.955 4.626 4.32 4.027 3.712 3.442 3.222 2.988 2.721 2.504 2.286 2.056 1.87 1.664 1.464 1.259 1.036 0.892 0.747 0.52 0.361 0.198 0.12 -0.047 -0.228 -0.423 -0.522 -0.825 -0.843 -0.958 -1.084 -1.37 -1.512 -1.659 -1.835 -2.026 -2.246 -2.549 -3.183 -5 ,1197 ,TETRA ,17589327,Sat Nov 27 17:04:59 CET,Sat Nov 27 19:28:47 CET,0.0 0.657 0.996 1.239 1.396 1.544 1.669 1.799 2.056 2.18 2.293 2.297 2.605 2.705 2.885 3.074 3.253 3.334 3.499 3.65 3.872 4.02 4.158 4.352 4.534 4.717 4.891 5.06 5.28 5.466 5.638 5.858 6.077 6.281 6.501 6.738 6.953 7.188 7.448 7.736 8.032 8.354 8.713 9.05 9.452 9.861 10.274 10.712 11.115 11.377 11.349 10.788 10.058 9.392 8.753 8.106 7.544 7.065 6.65 6.199 5.766 5.376 4.987 4.609 4.266 3.954 3.63 3.344 3.098 2.832 2.55 2.323 2.095 1.861 1.675 1.478 1.275 1.059 0.842 0.697 0.53 0.274 0.102 -0.076 -0.16 -0.347 -0.56 -0.769 -0.877 -1.198 -1.239 -1.375 -1.517 -1.8 -1.945 -2.099 -2.313 -2.562 -2.822 -3.133 -3.846 -6 ,12438 ,TETRA ,17589328,Sat Nov 27 17:04:59 CET,Sat Nov 27 19:24:31 CET,0.0 0.487 0.734 0.924 1.089 1.246 1.4 1.546 1.816 1.938 2.061 2.1 2.401 2.487 2.664 2.842 3.001 3.072 3.205 3.337 3.527 3.653 3.781 3.986 4.183 4.348 4.505 4.659 4.854 5.044 5.237 5.473 5.688 5.889 6.123 6.393 6.637 6.883 7.153 7.442 7.735 8.045 8.395 8.724 9.116 9.548 9.977 10.387 10.745 11.018 10.931 10.416 9.821 9.218 8.684 8.191 7.744 7.319 6.941 6.544 6.195 5.866 5.538 5.235 4.938 4.645 4.345 4.08 3.843 3.603 3.348 3.132 2.914 2.681 2.5 2.318 2.119 1.915 1.711 1.559 1.403 1.184 1.016 0.83 0.737 0.55 0.365 0.172 0.067 -0.258 -0.298 -0.42 -0.554 -0.862 -1.049 -1.243 -1.431 -1.635 -1.861 -2.145 -2.786 -7 ,8495 ,TETRA ,17589329,Sat Nov 27 17:05:00 CET,Sat Nov 27 19:26:57 CET,0.0 0.65 0.891 1.067 1.233 1.4 1.551 1.69 1.947 2.069 2.178 2.174 2.462 2.549 2.731 2.921 3.088 3.163 3.311 3.453 3.67 3.813 3.932 4.112 4.295 4.458 4.612 4.765 4.961 5.15 5.325 5.542 5.749 5.938 6.162 6.41 6.635 6.875 7.118 7.389 7.689 8.002 8.35 8.691 9.05 9.416 9.819 10.192 10.487 10.714 10.701 10.214 9.615 9.029 8.441 7.865 7.327 6.809 6.34 5.867 5.45 5.064 4.691 4.339 4.006 3.697 3.401 3.149 2.916 2.676 2.411 2.174 1.938 1.693 1.502 1.305 1.089 0.864 0.634 0.478 0.324 0.073 -0.101 -0.284 -0.385 -0.582 -0.772 -0.974 -1.086 -1.401 -1.472 -1.612 -1.742 -2.015 -2.184 -2.381 -2.585 -2.806 -3.066 -3.375 -4.079 -8 ,21244 ,TETRA ,17589330,Sat Nov 27 17:04:59 CET,Sat Nov 27 19:30:18 CET,0.0 0.391 0.655 0.875 1.051 1.205 1.35 1.494 1.764 1.879 1.982 1.969 2.257 2.347 2.533 2.701 2.859 2.938 3.086 3.224 3.444 3.587 3.71 3.887 4.061 4.211 4.357 4.521 4.739 4.931 5.113 5.325 5.524 5.721 5.944 6.18 6.411 6.66 6.901 7.159 7.441 7.745 8.091 8.409 8.735 9.097 9.513 9.922 10.289 10.561 10.534 10.095 9.517 8.904 8.298 7.656 7.023 6.425 5.918 5.418 5.006 4.648 4.307 3.989 3.691 3.399 3.084 2.808 2.569 2.318 2.028 1.772 1.52 1.27 1.084 0.895 0.685 0.454 0.219 0.052 -0.122 -0.381 -0.567 -0.774 -0.877 -1.093 -1.347 -1.608 -1.734 -2.071 -2.159 -2.295 -2.438 -2.775 -2.969 -3.177 -3.396 -3.634 -3.876 -4.211 -5.099 -9 ,26268 ,TETRA ,17589331,Sat Nov 27 17:05:02 CET,Sat Nov 27 19:30:21 CET,0.0 0.557 0.827 1.017 1.193 1.348 1.473 1.589 1.822 1.942 2.049 2.045 2.33 2.419 2.585 2.73 2.87 2.945 3.094 3.232 3.428 3.557 3.686 3.866 4.032 4.206 4.374 4.524 4.719 4.91 5.079 5.267 5.459 5.665 5.899 6.149 6.388 6.638 6.898 7.152 7.407 7.711 8.046 8.376 8.756 9.132 9.531 9.899 10.25 10.582 10.667 10.257 9.746 9.253 8.748 8.24 7.769 7.308 6.899 6.466 6.075 5.734 5.401 5.096 4.818 4.55 4.256 3.981 3.741 3.494 3.251 3.053 2.826 2.578 2.391 2.205 2.019 1.821 1.603 1.45 1.285 1.018 0.831 0.637 0.537 0.334 0.118 -0.108 -0.23 -0.552 -0.582 -0.702 -0.83 -1.179 -1.37 -1.538 -1.727 -1.953 -2.216 -2.532 -3.024 -10 ,28665 ,TETRA ,17589332,Sat Nov 27 17:04:59 CET,Sat Nov 27 19:32:30 CET,0.0 0.502 0.755 0.945 1.114 1.255 1.388 1.532 1.812 1.923 2.021 2.026 2.325 2.411 2.581 2.754 2.917 2.993 3.139 3.283 3.488 3.612 3.739 3.929 4.111 4.287 4.447 4.604 4.81 5.0 5.176 5.394 5.61 5.819 6.051 6.305 6.545 6.804 7.069 7.323 7.59 7.892 8.24 8.567 8.937 9.319 9.715 10.157 10.573 10.896 10.96 10.517 9.908 9.287 8.686 8.085 7.521 6.999 6.561 6.122 5.733 5.358 4.99 4.646 4.301 3.986 3.684 3.403 3.131 2.839 2.549 2.316 2.058 1.783 1.579 1.366 1.147 0.924 0.691 0.535 0.372 0.114 -0.065 -0.261 -0.361 -0.576 -0.827 -1.091 -1.218 -1.536 -1.579 -1.712 -1.85 -2.146 -2.317 -2.499 -2.684 -2.898 -3.184 -3.533 -4.189 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 8be926fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20752 ,TETRA ,17589334,Sat Nov 27 17:05:00 CET,Sat Nov 27 19:18:14 CET,0.0 0.462 0.647 0.821 0.984 1.113 1.239 1.354 1.553 1.652 1.742 1.694 1.972 2.063 2.233 2.378 2.501 2.563 2.69 2.805 2.96 3.06 3.152 3.288 3.44 3.581 3.71 3.829 3.971 4.111 4.244 4.398 4.536 4.662 4.799 4.958 5.121 5.279 5.436 5.606 5.75 5.9 6.082 6.222 6.341 6.442 6.504 6.497 6.386 6.061 5.272 3.998 2.727 1.524 0.502 -0.407 -1.232 -1.981 -2.643 -3.345 -3.89 -4.304 -4.709 -5.091 -5.449 -5.804 -6.209 -6.576 -6.886 -7.219 -7.554 -7.821 -8.093 -8.379 -8.609 -8.842 -9.09 -9.364 -9.652 -9.842 -10.027 -10.327 -10.555 -10.798 -10.93 -11.204 -11.482 -11.773 -11.922 -12.293 -12.466 -12.674 -12.875 -13.286 -13.517 -13.783 -14.08 -14.399 -14.757 -15.183 -16.324 -2 ,5562 ,TETRA ,17589335,Sat Nov 27 17:05:01 CET,Sat Nov 27 19:22:25 CET,0.0 0.336 0.552 0.735 0.873 1.002 1.127 1.232 1.402 1.487 1.574 1.539 1.807 1.876 2.006 2.125 2.239 2.296 2.419 2.534 2.673 2.763 2.86 2.997 3.11 3.211 3.319 3.427 3.569 3.705 3.822 3.971 4.115 4.235 4.375 4.519 4.658 4.816 4.982 5.14 5.289 5.457 5.636 5.792 5.941 6.063 6.138 6.166 6.109 5.847 5.023 3.714 2.443 1.215 0.143 -0.848 -1.792 -2.648 -3.364 -4.111 -4.75 -5.333 -5.9 -6.423 -6.903 -7.35 -7.842 -8.29 -8.691 -9.14 -9.621 -10.021 -10.422 -10.817 -11.115 -11.434 -11.784 -12.162 -12.574 -12.849 -13.121 -13.548 -13.831 -14.127 -14.297 -14.674 -15.059 -15.456 -15.671 -16.113 -16.439 -16.718 -16.994 -17.546 -17.849 -18.185 -18.557 -18.998 -19.588 -20.125 -21.37 -3 ,7875 ,TETRA ,17589336,Sat Nov 27 17:05:00 CET,Sat Nov 27 19:19:31 CET,0.0 0.327 0.498 0.65 0.802 0.935 1.04 1.147 1.357 1.452 1.536 1.495 1.757 1.825 1.955 2.071 2.178 2.234 2.34 2.432 2.57 2.659 2.745 2.876 3.004 3.121 3.227 3.319 3.455 3.6 3.714 3.842 3.974 4.11 4.252 4.403 4.548 4.688 4.827 4.974 5.123 5.277 5.434 5.562 5.663 5.735 5.75 5.677 5.539 5.207 4.367 3.103 1.938 0.894 -0.011 -0.882 -1.758 -2.565 -3.263 -4.003 -4.655 -5.225 -5.768 -6.277 -6.744 -7.182 -7.65 -8.097 -8.512 -8.917 -9.264 -9.524 -9.804 -10.099 -10.312 -10.534 -10.788 -11.065 -11.352 -11.557 -11.775 -12.142 -12.413 -12.676 -12.807 -13.093 -13.402 -13.714 -13.872 -14.253 -14.423 -14.607 -14.789 -15.164 -15.359 -15.564 -15.812 -16.097 -16.411 -16.838 -18.191 -4 ,8352 ,TETRA ,17589337,Sat Nov 27 17:05:00 CET,Sat Nov 27 19:21:54 CET,0.0 0.704 0.909 1.073 1.22 1.368 1.507 1.625 1.832 1.931 2.023 2.007 2.286 2.361 2.515 2.667 2.8 2.863 2.981 3.096 3.253 3.348 3.438 3.575 3.707 3.837 3.965 4.082 4.227 4.353 4.478 4.635 4.777 4.907 5.047 5.189 5.322 5.475 5.633 5.776 5.922 6.089 6.263 6.411 6.531 6.607 6.683 6.703 6.537 6.101 5.126 3.666 2.239 0.981 -0.096 -1.11 -2.019 -2.858 -3.64 -4.433 -5.105 -5.706 -6.306 -6.914 -7.497 -8.005 -8.541 -9.057 -9.512 -9.969 -10.437 -10.828 -11.233 -11.668 -12.017 -12.378 -12.749 -13.129 -13.532 -13.822 -14.14 -14.648 -15.001 -15.378 -15.571 -15.956 -16.38 -16.876 -17.136 -17.604 -17.975 -18.274 -18.579 -19.257 -19.642 -20.045 -20.496 -21.071 -21.77 -22.576 -24.213 -5 ,9335 ,TETRA ,17589338,Sat Nov 27 17:05:02 CET,Sat Nov 27 19:23:37 CET,0.0 0.306 0.472 0.597 0.716 0.846 0.963 1.066 1.26 1.356 1.448 1.419 1.696 1.766 1.893 2.003 2.112 2.171 2.278 2.374 2.521 2.618 2.702 2.822 2.947 3.071 3.184 3.282 3.409 3.529 3.634 3.752 3.866 3.97 4.084 4.215 4.346 4.487 4.612 4.729 4.855 5.007 5.176 5.319 5.46 5.574 5.617 5.613 5.526 5.152 4.147 2.61 1.317 0.17 -0.9 -1.85 -2.734 -3.582 -4.293 -5.013 -5.646 -6.197 -6.748 -7.276 -7.766 -8.242 -8.738 -9.195 -9.599 -9.991 -10.381 -10.711 -11.08 -11.464 -11.773 -12.099 -12.452 -12.839 -13.22 -13.481 -13.763 -14.209 -14.527 -14.856 -14.999 -15.25 -15.518 -15.783 -15.914 -16.281 -16.418 -16.577 -16.758 -17.15 -17.366 -17.641 -17.949 -18.279 -18.72 -19.392 -21.427 -6 ,351 ,TETRA ,17589339,Sat Nov 27 17:05:04 CET,Sat Nov 27 19:22:25 CET,0.0 0.381 0.569 0.709 0.86 1.006 1.12 1.218 1.429 1.517 1.589 1.546 1.818 1.89 2.031 2.158 2.275 2.328 2.434 2.543 2.7 2.803 2.897 3.018 3.127 3.228 3.332 3.443 3.577 3.698 3.82 3.961 4.095 4.224 4.367 4.524 4.663 4.797 4.928 5.071 5.22 5.387 5.562 5.664 5.748 5.852 5.941 5.956 5.856 5.492 4.594 3.351 2.203 1.093 0.089 -0.843 -1.748 -2.597 -3.344 -4.109 -4.764 -5.324 -5.853 -6.364 -6.846 -7.318 -7.828 -8.298 -8.715 -9.15 -9.64 -10.056 -10.463 -10.868 -11.177 -11.509 -11.849 -12.2 -12.577 -12.841 -13.13 -13.6 -13.925 -14.256 -14.424 -14.788 -15.183 -15.603 -15.831 -16.274 -16.556 -16.83 -17.125 -17.754 -18.096 -18.487 -18.95 -19.511 -20.155 -20.979 -22.888 -7 ,12530 ,TETRA ,17589340,Sat Nov 27 17:05:00 CET,Sat Nov 27 19:20:02 CET,0.0 0.423 0.608 0.766 0.922 1.041 1.156 1.265 1.435 1.517 1.594 1.526 1.795 1.869 2.01 2.138 2.272 2.339 2.459 2.571 2.721 2.814 2.908 3.024 3.137 3.253 3.351 3.447 3.575 3.7 3.817 3.946 4.063 4.176 4.317 4.474 4.613 4.752 4.895 5.059 5.235 5.417 5.595 5.747 5.87 5.943 5.983 5.955 5.762 5.324 4.44 3.083 1.728 0.645 -0.14 -0.854 -1.512 -2.115 -2.634 -3.176 -3.679 -4.13 -4.559 -4.953 -5.311 -5.644 -6.003 -6.337 -6.657 -6.992 -7.32 -7.601 -7.908 -8.222 -8.466 -8.734 -9.029 -9.326 -9.62 -9.838 -10.073 -10.435 -10.695 -10.965 -11.094 -11.354 -11.629 -11.894 -12.039 -12.407 -12.556 -12.738 -12.939 -13.377 -13.596 -13.875 -14.219 -14.562 -14.975 -15.494 -17.04 -8 ,19222 ,TETRA ,17589341,Sat Nov 27 17:05:00 CET,Sat Nov 27 19:16:55 CET,0.0 0.475 0.742 0.902 1.028 1.148 1.244 1.328 1.503 1.588 1.672 1.65 1.93 2.008 2.133 2.24 2.339 2.388 2.5 2.615 2.772 2.872 2.969 3.102 3.226 3.349 3.465 3.573 3.71 3.84 3.972 4.139 4.289 4.425 4.586 4.749 4.897 5.042 5.177 5.322 5.472 5.643 5.824 5.979 6.111 6.194 6.227 6.171 5.993 5.587 4.615 3.23 2.014 0.913 -0.097 -1.038 -1.929 -2.764 -3.514 -4.287 -4.942 -5.534 -6.093 -6.577 -7.0 -7.363 -7.748 -8.127 -8.444 -8.758 -9.081 -9.331 -9.584 -9.861 -10.072 -10.282 -10.502 -10.726 -10.963 -11.14 -11.326 -11.615 -11.82 -12.042 -12.164 -12.419 -12.679 -12.946 -13.08 -13.431 -13.526 -13.68 -13.838 -14.233 -14.454 -14.662 -14.924 -15.22 -15.563 -16.017 -17.14 -9 ,15012 ,TETRA ,17589342,Sat Nov 27 17:05:00 CET,Sat Nov 27 19:24:10 CET,0.0 0.506 0.754 0.93 1.097 1.253 1.376 1.486 1.67 1.751 1.832 1.805 2.088 2.171 2.321 2.462 2.589 2.649 2.763 2.858 3.008 3.111 3.21 3.362 3.495 3.615 3.731 3.835 3.965 4.098 4.227 4.365 4.492 4.63 4.786 4.94 5.072 5.212 5.359 5.518 5.68 5.818 5.961 6.106 6.247 6.366 6.459 6.489 6.379 6.01 5.0 3.552 2.261 1.073 -0.009 -1.038 -1.959 -2.825 -3.573 -4.284 -4.918 -5.495 -6.028 -6.545 -7.065 -7.547 -8.04 -8.488 -8.88 -9.284 -9.703 -10.049 -10.411 -10.811 -11.135 -11.468 -11.808 -12.164 -12.48 -12.666 -12.86 -13.151 -13.35 -13.563 -13.68 -13.934 -14.192 -14.468 -14.628 -15.005 -15.135 -15.311 -15.51 -15.942 -16.184 -16.457 -16.762 -17.098 -17.536 -18.206 -19.942 -10 ,20722 ,TETRA ,17589343,Sat Nov 27 17:05:00 CET,Sat Nov 27 19:29:42 CET,0.0 0.312 0.53 0.727 0.917 1.074 1.208 1.326 1.539 1.641 1.728 1.676 1.938 2.01 2.155 2.297 2.43 2.492 2.611 2.728 2.903 3.01 3.105 3.243 3.374 3.493 3.612 3.728 3.874 4.009 4.13 4.263 4.389 4.521 4.668 4.834 4.989 5.122 5.257 5.405 5.557 5.72 5.88 6.03 6.165 6.282 6.352 6.352 6.255 5.915 5.082 3.797 2.586 1.473 0.46 -0.514 -1.388 -2.163 -2.859 -3.592 -4.231 -4.807 -5.361 -5.87 -6.335 -6.769 -7.252 -7.705 -8.101 -8.538 -8.962 -9.251 -9.548 -9.879 -10.14 -10.398 -10.659 -10.949 -11.245 -11.458 -11.689 -12.027 -12.262 -12.499 -12.617 -12.862 -13.148 -13.492 -13.685 -14.085 -14.334 -14.597 -14.853 -15.346 -15.63 -15.957 -16.312 -16.703 -17.168 -17.753 -19.816 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 23b62f55..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4676 ,TETRA ,17589344,Sat Nov 27 17:05:02 CET,Sat Nov 27 19:30:02 CET,0.0 0.616 0.861 1.052 1.211 1.352 1.484 1.611 1.837 1.941 2.055 2.065 2.356 2.442 2.625 2.812 2.968 3.041 3.187 3.333 3.558 3.698 3.831 4.009 4.176 4.329 4.477 4.631 4.825 5.011 5.178 5.362 5.56 5.769 6.009 6.257 6.49 6.741 6.986 7.266 7.571 7.906 8.281 8.625 9.025 9.449 9.894 10.392 10.973 11.563 12.051 12.165 11.996 11.703 11.357 10.98 10.644 10.345 10.059 9.777 9.525 9.28 9.047 8.823 8.612 8.4 8.168 7.958 7.772 7.573 7.364 7.191 6.995 6.781 6.633 6.492 6.337 6.153 5.93 5.754 5.566 5.281 5.095 4.902 4.797 4.566 4.324 4.082 3.955 3.626 3.527 3.352 3.176 2.792 2.583 2.384 2.182 1.963 1.708 1.328 0.096 -2 ,22655 ,TETRA ,17589345,Sat Nov 27 17:05:05 CET,Sat Nov 27 19:22:26 CET,0.0 0.917 1.18 1.388 1.59 1.776 1.942 2.082 2.31 2.418 2.524 2.524 2.814 2.897 3.061 3.225 3.387 3.463 3.609 3.751 3.968 4.113 4.252 4.441 4.609 4.787 4.957 5.1 5.269 5.432 5.592 5.785 5.958 6.122 6.307 6.514 6.718 6.912 7.111 7.339 7.646 8.046 8.484 8.891 9.339 9.808 10.32 10.856 11.341 11.712 11.764 11.355 10.816 10.148 9.588 9.168 8.774 8.42 8.077 7.704 7.369 7.066 6.78 6.49 6.217 5.969 5.695 5.442 5.227 5.0 4.749 4.536 4.321 4.103 3.922 3.724 3.533 3.334 3.109 2.956 2.807 2.571 2.399 2.218 2.123 1.92 1.705 1.471 1.349 1.035 0.995 0.87 0.725 0.384 0.211 0.049 -0.145 -0.372 -0.641 -0.941 -1.954 -3 ,23813 ,TETRA ,17589346,Sat Nov 27 17:05:06 CET,Sat Nov 27 19:23:04 CET,0.0 0.534 0.764 0.952 1.145 1.306 1.452 1.592 1.804 1.896 2.005 2.03 2.318 2.405 2.573 2.735 2.894 2.977 3.158 3.336 3.562 3.703 3.845 4.035 4.199 4.35 4.502 4.65 4.823 4.985 5.141 5.344 5.551 5.736 5.925 6.13 6.326 6.553 6.852 7.214 7.578 7.962 8.407 8.829 9.269 9.758 10.252 10.725 11.201 11.62 11.83 11.599 11.174 10.805 10.502 10.15 9.785 9.435 9.122 8.788 8.479 8.186 7.909 7.642 7.367 7.117 6.86 6.618 6.41 6.177 5.911 5.69 5.451 5.19 4.994 4.794 4.606 4.406 4.169 4.001 3.836 3.58 3.385 3.183 3.079 2.868 2.643 2.397 2.279 1.958 1.887 1.744 1.603 1.252 1.06 0.857 0.618 0.38 0.132 -0.213 -1.11 -4 ,29761 ,TETRA ,17589347,Sat Nov 27 17:05:59 CET,Sat Nov 27 19:27:14 CET,0.0 0.724 0.962 1.142 1.317 1.459 1.586 1.707 1.929 2.03 2.13 2.124 2.426 2.524 2.693 2.848 3.007 3.089 3.25 3.395 3.595 3.735 3.902 4.182 4.459 4.725 4.988 5.233 5.528 5.802 6.05 6.344 6.628 6.899 7.205 7.543 7.874 8.241 8.633 9.043 9.46 9.906 10.404 10.903 11.451 11.973 12.486 12.997 13.465 13.815 13.917 13.644 13.163 12.627 12.051 11.469 10.932 10.353 9.801 9.266 8.79 8.357 7.957 7.566 7.188 6.842 6.462 6.106 5.791 5.46 5.113 4.826 4.524 4.201 3.944 3.672 3.393 3.104 2.795 2.579 2.349 1.981 1.716 1.437 1.299 1.01 0.704 0.366 0.184 -0.19 -0.351 -0.527 -0.686 -1.004 -1.161 -1.323 -1.5 -1.707 -1.979 -2.373 -3.944 -5 ,17062 ,TETRA ,17589348,Sat Nov 27 17:05:59 CET,Sat Nov 27 19:10:53 CET,0.0 1.479 1.764 2.01 2.231 2.436 2.622 2.778 3.088 3.24 3.381 3.432 3.739 3.836 4.023 4.214 4.403 4.49 4.646 4.796 5.009 5.152 5.297 5.509 5.72 5.903 6.064 6.226 6.445 6.655 6.856 7.087 7.3 7.548 7.856 8.19 8.515 8.857 9.221 9.592 9.967 10.379 10.851 11.287 11.745 12.245 12.782 13.291 13.778 14.211 14.398 14.132 13.65 13.034 12.418 11.787 11.195 10.639 10.142 9.653 9.19 8.752 8.339 7.945 7.611 7.347 7.077 6.826 6.615 6.395 6.161 5.969 5.765 5.532 5.36 5.194 5.005 4.808 4.601 4.45 4.296 4.028 3.831 3.634 3.533 3.323 3.117 2.901 2.782 2.468 2.405 2.241 2.075 1.757 1.588 1.39 1.132 0.846 0.547 0.129 -0.948 -6 ,12480 ,TETRA ,17589349,Sat Nov 27 17:05:59 CET,Sat Nov 27 19:11:30 CET,0.0 0.688 0.895 1.067 1.224 1.368 1.511 1.647 1.894 1.996 2.086 2.068 2.362 2.451 2.606 2.764 2.937 3.017 3.158 3.307 3.531 3.665 3.787 3.957 4.125 4.294 4.461 4.615 4.805 4.999 5.198 5.428 5.641 5.84 6.053 6.296 6.561 6.902 7.266 7.63 8.003 8.408 8.861 9.283 9.738 10.195 10.698 11.228 11.731 12.133 12.271 12.006 11.444 10.768 10.206 9.722 9.303 8.93 8.576 8.188 7.845 7.534 7.228 6.931 6.654 6.395 6.117 5.858 5.633 5.401 5.147 4.932 4.698 4.457 4.271 4.069 3.867 3.662 3.436 3.278 3.115 2.865 2.699 2.539 2.454 2.255 2.053 1.851 1.742 1.43 1.373 1.237 1.099 0.814 0.645 0.464 0.267 0.027 -0.245 -0.551 -1.186 -7 ,13896 ,TETRA ,17589350,Sat Nov 27 17:05:59 CET,Sat Nov 27 19:17:18 CET,0.0 0.379 0.625 0.809 0.949 1.078 1.208 1.336 1.574 1.679 1.777 1.771 2.071 2.164 2.326 2.502 2.667 2.748 2.917 3.065 3.263 3.388 3.51 3.688 3.859 4.02 4.174 4.341 4.555 4.746 4.927 5.14 5.349 5.543 5.761 5.993 6.23 6.494 6.766 7.07 7.387 7.738 8.14 8.534 8.974 9.419 9.937 10.492 11.021 11.557 12.018 12.131 11.953 11.649 11.316 10.968 10.64 10.314 9.983 9.634 9.333 9.053 8.792 8.554 8.315 8.083 7.833 7.592 7.383 7.169 6.941 6.751 6.555 6.355 6.195 6.018 5.842 5.641 5.402 5.241 5.074 4.822 4.637 4.441 4.344 4.144 3.923 3.658 3.523 3.19 3.107 2.944 2.775 2.412 2.202 1.99 1.778 1.528 1.185 0.744 -0.431 -8 ,4234 ,TETRA ,17589351,Sat Nov 27 17:05:59 CET,Sat Nov 27 19:19:14 CET,0.0 0.565 0.834 1.04 1.242 1.426 1.578 1.712 1.961 2.089 2.214 2.232 2.527 2.616 2.781 2.938 3.09 3.166 3.297 3.417 3.606 3.736 3.861 4.038 4.202 4.359 4.507 4.654 4.836 5.002 5.184 5.457 5.753 6.028 6.333 6.66 6.979 7.327 7.681 8.054 8.428 8.814 9.242 9.672 10.162 10.657 11.173 11.671 12.19 12.624 12.796 12.587 12.144 11.573 10.961 10.372 9.808 9.281 8.805 8.324 7.915 7.527 7.111 6.704 6.33 5.96 5.57 5.232 4.938 4.629 4.299 4.01 3.69 3.352 3.088 2.813 2.532 2.229 1.951 1.793 1.645 1.429 1.267 1.112 1.036 0.861 0.661 0.449 0.345 0.036 -0.001 -0.127 -0.273 -0.607 -0.772 -0.922 -1.096 -1.296 -1.529 -1.779 -2.647 -9 ,24381 ,TETRA ,17589352,Sat Nov 27 17:09:34 CET,Sat Nov 27 19:27:27 CET,0.0 0.427 0.624 0.805 0.965 1.107 1.268 1.42 1.656 1.758 1.866 1.898 2.187 2.277 2.46 2.635 2.793 2.876 3.044 3.194 3.4 3.532 3.671 3.876 4.064 4.231 4.394 4.558 4.761 4.945 5.127 5.367 5.597 5.809 6.048 6.296 6.517 6.775 7.054 7.333 7.645 8.004 8.382 8.729 9.129 9.557 10.033 10.526 11.031 11.563 11.914 11.833 11.548 11.198 10.825 10.449 10.063 9.68 9.36 9.015 8.694 8.412 8.124 7.845 7.584 7.34 7.085 6.843 6.629 6.414 6.192 6.003 5.801 5.576 5.394 5.213 5.026 4.828 4.627 4.482 4.331 4.102 3.945 3.789 3.708 3.527 3.335 3.138 3.034 2.739 2.689 2.566 2.44 2.148 1.994 1.83 1.656 1.459 1.216 0.841 -0.691 -10 ,30341 ,TETRA ,17589353,Sat Nov 27 17:05:59 CET,Sat Nov 27 19:19:31 CET,0.0 0.299 0.56 0.787 0.973 1.141 1.29 1.428 1.68 1.787 1.893 1.893 2.18 2.271 2.447 2.614 2.774 2.848 3.003 3.153 3.37 3.51 3.642 3.83 3.998 4.163 4.309 4.446 4.683 4.959 5.224 5.542 5.839 6.123 6.448 6.783 7.085 7.402 7.743 8.12 8.499 8.901 9.355 9.799 10.261 10.738 11.269 11.78 12.248 12.622 12.805 12.499 11.978 11.437 10.851 10.239 9.674 9.125 8.618 8.125 7.696 7.3 6.919 6.546 6.174 5.798 5.398 5.039 4.722 4.4 4.047 3.748 3.446 3.133 2.882 2.611 2.337 2.055 1.762 1.553 1.331 0.98 0.717 0.451 0.316 0.023 -0.3 -0.66 -0.842 -1.22 -1.416 -1.631 -1.858 -2.338 -2.616 -2.946 -3.309 -3.741 -4.239 -4.907 -6.784 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt deleted file mode 100644 index 89463aec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9497 ,TETRA ,17589354,Sat Nov 27 17:05:59 CET,Sat Nov 27 19:25:33 CET,0.0 0.762 1.073 1.314 1.51 1.694 1.856 2.01 2.279 2.402 2.523 2.541 2.838 2.939 3.135 3.319 3.496 3.582 3.735 3.877 4.076 4.196 4.32 4.501 4.671 4.826 4.975 5.13 5.323 5.503 5.675 5.867 6.044 6.218 6.408 6.624 6.84 7.074 7.313 7.536 7.754 7.989 8.261 8.526 8.797 9.062 9.312 9.532 9.673 9.649 9.393 8.753 8.017 7.3 6.597 5.951 5.396 4.88 4.413 3.932 3.505 3.11 2.722 2.347 2.019 1.73 1.401 1.104 0.843 0.572 0.283 0.024 -0.255 -0.529 -0.74 -0.968 -1.194 -1.424 -1.664 -1.828 -1.988 -2.24 -2.425 -2.625 -2.734 -2.971 -3.226 -3.499 -3.645 -4.0 -4.118 -4.279 -4.446 -4.828 -5.049 -5.301 -5.577 -5.866 -6.23 -6.747 -8.228 -2 ,23078 ,TETRA ,17589355,Sat Nov 27 17:06:00 CET,Sat Nov 27 19:25:08 CET,0.0 0.864 1.14 1.358 1.55 1.725 1.889 2.049 2.324 2.429 2.541 2.561 2.861 2.97 3.171 3.354 3.51 3.593 3.753 3.894 4.092 4.226 4.35 4.527 4.696 4.841 4.985 5.129 5.312 5.483 5.643 5.827 6.01 6.191 6.381 6.587 6.781 6.992 7.227 7.468 7.696 7.945 8.217 8.468 8.744 9.019 9.279 9.509 9.679 9.715 9.443 8.716 7.988 7.324 6.709 6.134 5.599 5.083 4.644 4.187 3.749 3.352 2.997 2.674 2.378 2.092 1.775 1.487 1.235 0.973 0.676 0.413 0.157 -0.102 -0.323 -0.563 -0.824 -1.098 -1.378 -1.572 -1.771 -2.094 -2.328 -2.554 -2.663 -2.922 -3.202 -3.484 -3.627 -3.97 -4.065 -4.223 -4.379 -4.777 -5.012 -5.238 -5.485 -5.789 -6.127 -6.594 -8.092 -3 ,4311 ,TETRA ,17589356,Sat Nov 27 17:06:01 CET,Sat Nov 27 19:24:54 CET,0.0 0.69 0.988 1.257 1.52 1.75 1.931 2.087 2.354 2.476 2.597 2.638 2.937 3.04 3.241 3.419 3.588 3.667 3.814 3.957 4.165 4.289 4.404 4.587 4.764 4.925 5.083 5.229 5.408 5.583 5.753 5.96 6.146 6.318 6.509 6.71 6.911 7.134 7.359 7.577 7.799 8.044 8.323 8.586 8.843 9.095 9.379 9.621 9.776 9.789 9.478 8.793 8.052 7.355 6.749 6.153 5.613 5.107 4.638 4.174 3.772 3.424 3.089 2.744 2.403 2.091 1.755 1.453 1.188 0.917 0.651 0.423 0.185 -0.061 -0.259 -0.469 -0.683 -0.918 -1.201 -1.393 -1.584 -1.873 -2.062 -2.261 -2.374 -2.623 -2.888 -3.187 -3.339 -3.712 -3.837 -4.012 -4.215 -4.673 -4.919 -5.171 -5.46 -5.792 -6.168 -6.681 -8.544 -4 ,6032 ,TETRA ,17589357,Sat Nov 27 17:06:02 CET,Sat Nov 27 19:24:49 CET,0.0 0.611 0.901 1.126 1.305 1.473 1.639 1.8 2.07 2.198 2.325 2.361 2.66 2.749 2.919 3.089 3.245 3.319 3.469 3.611 3.81 3.937 4.057 4.224 4.384 4.532 4.667 4.804 4.979 5.141 5.302 5.51 5.705 5.865 6.042 6.245 6.444 6.652 6.854 7.076 7.307 7.539 7.79 8.015 8.24 8.474 8.716 8.913 9.049 9.037 8.72 7.981 7.2 6.481 5.785 5.141 4.583 4.065 3.607 3.125 2.73 2.386 2.034 1.699 1.363 1.051 0.734 0.432 0.175 -0.07 -0.331 -0.555 -0.796 -1.07 -1.292 -1.515 -1.738 -1.979 -2.239 -2.408 -2.573 -2.829 -2.993 -3.176 -3.28 -3.503 -3.76 -4.041 -4.185 -4.537 -4.688 -4.879 -5.097 -5.551 -5.766 -5.97 -6.209 -6.479 -6.765 -7.241 -8.9 -5 ,27970 ,TETRA ,17589358,Sat Nov 27 17:06:00 CET,Sat Nov 27 19:23:37 CET,0.0 0.805 1.187 1.461 1.679 1.865 2.027 2.169 2.426 2.545 2.655 2.666 2.958 3.052 3.23 3.398 3.553 3.625 3.773 3.916 4.117 4.241 4.361 4.54 4.712 4.884 5.042 5.189 5.381 5.56 5.725 5.922 6.113 6.293 6.499 6.718 6.927 7.144 7.379 7.624 7.857 8.107 8.395 8.656 8.906 9.145 9.408 9.674 9.833 9.873 9.598 8.805 8.032 7.321 6.63 5.956 5.33 4.746 4.218 3.663 3.184 2.761 2.36 2.0 1.676 1.361 1.01 0.701 0.452 0.179 -0.113 -0.363 -0.634 -0.888 -1.085 -1.295 -1.526 -1.79 -2.043 -2.202 -2.376 -2.643 -2.83 -3.054 -3.177 -3.423 -3.694 -4.002 -4.157 -4.523 -4.648 -4.817 -5.017 -5.44 -5.657 -5.934 -6.276 -6.628 -6.982 -7.44 -9.487 -6 ,27178 ,TETRA ,17589359,Sat Nov 27 17:06:00 CET,Sat Nov 27 19:22:00 CET,0.0 0.472 0.783 1.02 1.184 1.335 1.488 1.637 1.887 2.004 2.117 2.129 2.43 2.53 2.717 2.891 3.055 3.132 3.288 3.435 3.629 3.761 3.892 4.077 4.255 4.417 4.573 4.724 4.917 5.102 5.276 5.473 5.667 5.856 6.059 6.27 6.472 6.675 6.883 7.115 7.352 7.61 7.895 8.147 8.406 8.651 8.868 9.06 9.214 9.247 8.951 8.272 7.516 6.845 6.216 5.552 4.942 4.378 3.866 3.363 2.946 2.56 2.184 1.831 1.5 1.168 0.797 0.477 0.211 -0.074 -0.371 -0.617 -0.888 -1.174 -1.399 -1.643 -1.909 -2.183 -2.443 -2.614 -2.805 -3.113 -3.331 -3.571 -3.699 -3.95 -4.204 -4.465 -4.604 -4.966 -5.092 -5.262 -5.439 -5.836 -6.064 -6.311 -6.592 -6.878 -7.203 -7.638 -9.216 -7 ,7822 ,TETRA ,17589360,Sat Nov 27 17:06:00 CET,Sat Nov 27 19:24:20 CET,0.0 0.647 0.871 1.061 1.23 1.389 1.52 1.634 1.857 1.97 2.077 2.081 2.39 2.5 2.701 2.883 3.046 3.123 3.286 3.441 3.657 3.792 3.926 4.112 4.275 4.43 4.574 4.714 4.892 5.059 5.223 5.411 5.599 5.787 6.003 6.223 6.431 6.656 6.87 7.086 7.307 7.556 7.817 8.043 8.277 8.515 8.772 8.996 9.134 9.137 8.826 8.186 7.523 6.813 6.144 5.535 4.952 4.412 3.963 3.479 3.021 2.622 2.247 1.889 1.538 1.212 0.854 0.516 0.244 -0.036 -0.34 -0.603 -0.885 -1.186 -1.436 -1.7 -1.954 -2.21 -2.488 -2.674 -2.868 -3.187 -3.395 -3.599 -3.706 -3.931 -4.199 -4.508 -4.664 -5.027 -5.166 -5.344 -5.52 -5.869 -6.065 -6.277 -6.513 -6.783 -7.091 -7.512 -9.039 -8 ,19954 ,TETRA ,17589361,Sat Nov 27 17:06:01 CET,Sat Nov 27 19:22:22 CET,0.0 0.794 1.093 1.289 1.48 1.672 1.834 1.979 2.229 2.34 2.445 2.461 2.756 2.84 3.009 3.168 3.315 3.388 3.523 3.656 3.853 3.971 4.088 4.253 4.396 4.539 4.684 4.823 4.99 5.161 5.338 5.534 5.707 5.872 6.058 6.26 6.455 6.67 6.904 7.155 7.399 7.654 7.936 8.215 8.512 8.788 9.079 9.303 9.431 9.46 9.136 8.387 7.558 6.768 6.102 5.487 4.913 4.354 3.874 3.354 2.852 2.413 1.984 1.565 1.179 0.845 0.506 0.188 -0.105 -0.427 -0.755 -1.007 -1.262 -1.529 -1.74 -1.965 -2.189 -2.415 -2.648 -2.82 -3.011 -3.293 -3.485 -3.683 -3.786 -4.015 -4.28 -4.575 -4.722 -5.078 -5.189 -5.372 -5.578 -6.037 -6.288 -6.568 -6.887 -7.285 -7.729 -8.289 -10.157 -9 ,29379 ,TETRA ,17589362,Sat Nov 27 17:06:00 CET,Sat Nov 27 19:26:40 CET,0.0 0.868 1.181 1.411 1.607 1.777 1.926 2.07 2.333 2.464 2.591 2.61 2.908 3.008 3.193 3.371 3.54 3.617 3.763 3.9 4.103 4.232 4.355 4.544 4.723 4.887 5.044 5.193 5.385 5.573 5.739 5.931 6.121 6.292 6.474 6.688 6.903 7.126 7.351 7.594 7.851 8.112 8.381 8.63 8.909 9.192 9.454 9.648 9.777 9.741 9.311 8.482 7.571 6.686 5.937 5.267 4.661 4.088 3.578 3.104 2.693 2.265 1.834 1.437 1.064 0.719 0.357 0.044 -0.214 -0.492 -0.793 -1.037 -1.286 -1.537 -1.744 -1.984 -2.232 -2.472 -2.734 -2.929 -3.154 -3.511 -3.735 -3.963 -4.082 -4.33 -4.595 -4.883 -5.03 -5.387 -5.515 -5.694 -5.88 -6.27 -6.48 -6.713 -6.967 -7.262 -7.605 -8.071 -9.944 -10 ,30680 ,TETRA ,17589363,Sat Nov 27 17:06:05 CET,Sat Nov 27 19:26:19 CET,0.0 0.867 1.129 1.333 1.532 1.714 1.88 2.032 2.303 2.423 2.527 2.54 2.852 2.957 3.152 3.328 3.49 3.569 3.723 3.878 4.093 4.22 4.351 4.537 4.71 4.875 5.028 5.176 5.357 5.526 5.691 5.885 6.06 6.233 6.424 6.631 6.823 7.031 7.256 7.472 7.706 7.973 8.249 8.495 8.754 9.006 9.213 9.367 9.484 9.468 9.094 8.272 7.415 6.622 5.9 5.239 4.624 4.043 3.569 3.106 2.691 2.324 1.98 1.645 1.328 1.027 0.688 0.36 0.08 -0.189 -0.474 -0.714 -0.965 -1.242 -1.472 -1.716 -1.965 -2.23 -2.484 -2.65 -2.836 -3.127 -3.323 -3.537 -3.652 -3.906 -4.199 -4.497 -4.639 -5.001 -5.12 -5.272 -5.428 -5.793 -6.025 -6.274 -6.507 -6.787 -7.132 -7.545 -9.239 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index f0c4be55..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14093 ,TETRA ,17589364,Sat Nov 27 17:06:01 CET,Sat Nov 27 19:25:40 CET,0.0 0.558 0.802 1.025 1.232 1.407 1.558 1.706 1.982 2.109 2.227 2.247 2.542 2.641 2.845 3.047 3.238 3.324 3.485 3.639 3.863 4.0 4.135 4.342 4.528 4.709 4.897 5.077 5.293 5.504 5.713 5.966 6.214 6.448 6.716 7.015 7.294 7.596 7.933 8.289 8.645 9.028 9.465 9.918 10.453 11.033 11.653 12.292 12.968 13.659 14.328 14.632 14.614 14.455 14.223 13.974 13.705 13.385 13.091 12.781 12.485 12.184 11.874 11.59 11.334 11.106 10.858 10.619 10.396 10.166 9.938 9.748 9.545 9.331 9.174 9.003 8.812 8.613 8.401 8.243 8.071 7.8 7.619 7.435 7.338 7.128 6.897 6.639 6.51 6.185 6.096 5.951 5.8 5.464 5.264 5.051 4.838 4.601 4.317 3.858 1.08 -2 ,2288 ,TETRA ,17589365,Sat Nov 27 17:06:02 CET,Sat Nov 27 19:25:15 CET,0.0 1.38 1.631 1.828 1.975 2.124 2.264 2.412 2.672 2.781 2.893 2.928 3.222 3.31 3.482 3.653 3.818 3.901 4.068 4.221 4.436 4.575 4.72 4.926 5.101 5.267 5.444 5.622 5.854 6.081 6.288 6.528 6.761 6.989 7.249 7.53 7.784 8.065 8.379 8.705 9.034 9.406 9.844 10.266 10.738 11.251 11.849 12.544 13.294 14.107 14.972 15.217 15.044 14.73 14.352 13.98 13.645 13.341 13.032 12.688 12.388 12.106 11.835 11.576 11.332 11.124 10.891 10.652 10.445 10.232 10.012 9.822 9.632 9.445 9.28 9.087 8.875 8.634 8.367 8.197 8.038 7.795 7.623 7.405 7.277 7.032 6.788 6.547 6.427 6.105 6.022 5.872 5.711 5.372 5.203 5.015 4.816 4.595 4.3 3.869 2.692 -3 ,9463 ,TETRA ,17589366,Sat Nov 27 17:06:02 CET,Sat Nov 27 19:29:17 CET,0.0 1.482 2.067 2.506 2.884 3.204 3.485 3.733 4.162 4.366 4.57 4.74 5.104 5.262 5.566 5.853 6.124 6.253 6.501 6.735 7.049 7.25 7.452 7.746 8.017 8.269 8.522 8.769 9.079 9.365 9.64 9.974 10.297 10.605 10.957 11.345 11.694 12.065 12.471 12.904 13.338 13.805 14.325 14.836 15.436 16.087 16.81 17.586 18.432 19.348 20.274 20.775 20.885 20.823 20.674 20.482 20.279 20.033 19.781 19.519 19.277 19.032 18.782 18.564 18.342 18.107 17.871 17.667 17.473 17.253 17.023 16.841 16.66 16.447 16.27 16.091 15.897 15.695 15.497 15.358 15.209 14.981 14.806 14.607 14.505 14.299 14.067 13.822 13.709 13.385 13.277 13.104 12.931 12.576 12.379 12.169 11.919 11.619 11.266 10.845 9.898 -4 ,1745 ,TETRA ,17589367,Sat Nov 27 17:06:04 CET,Sat Nov 27 19:28:44 CET,0.0 0.549 0.799 0.997 1.168 1.328 1.481 1.623 1.901 2.025 2.136 2.157 2.463 2.569 2.763 2.941 3.104 3.187 3.361 3.536 3.778 3.921 4.062 4.277 4.486 4.674 4.845 5.012 5.218 5.406 5.591 5.83 6.054 6.262 6.5 6.775 7.036 7.304 7.613 7.937 8.26 8.625 9.059 9.497 10.006 10.535 11.062 11.638 12.303 12.965 13.564 13.872 13.859 13.687 13.427 13.112 12.813 12.52 12.249 11.959 11.672 11.394 11.115 10.853 10.616 10.377 10.107 9.881 9.699 9.502 9.26 9.029 8.774 8.503 8.29 8.06 7.812 7.557 7.316 7.157 6.987 6.712 6.503 6.273 6.156 5.905 5.66 5.422 5.289 4.95 4.86 4.699 4.51 4.027 3.745 3.445 3.123 2.761 2.319 1.75 -0.011 -5 ,27565 ,TETRA ,17589368,Sat Nov 27 17:06:05 CET,Sat Nov 27 19:25:16 CET,0.0 1.165 1.455 1.668 1.868 2.063 2.258 2.459 2.798 2.94 3.082 3.162 3.494 3.64 3.933 4.186 4.403 4.506 4.702 4.882 5.141 5.303 5.466 5.72 5.96 6.176 6.37 6.539 6.762 6.992 7.213 7.458 7.709 7.97 8.246 8.534 8.815 9.136 9.472 9.799 10.135 10.532 11.008 11.458 11.982 12.54 13.123 13.754 14.453 15.122 15.749 16.022 15.995 15.851 15.573 15.254 14.939 14.641 14.376 14.07 13.783 13.504 13.232 12.981 12.726 12.481 12.226 11.999 11.803 11.589 11.347 11.153 10.959 10.742 10.574 10.409 10.232 10.04 9.843 9.698 9.535 9.278 9.105 8.91 8.811 8.62 8.435 8.251 8.149 7.846 7.804 7.668 7.52 7.187 7.001 6.764 6.46 6.126 5.755 5.302 4.177 -6 ,29666 ,TETRA ,17589369,Sat Nov 27 17:06:02 CET,Sat Nov 27 19:24:51 CET,0.0 1.29 1.639 1.872 2.046 2.192 2.345 2.492 2.726 2.831 2.936 2.959 3.265 3.368 3.559 3.729 3.902 3.991 4.165 4.331 4.565 4.714 4.848 5.035 5.226 5.413 5.591 5.775 6.013 6.238 6.454 6.707 6.934 7.146 7.396 7.678 7.962 8.275 8.606 8.955 9.31 9.687 10.123 10.561 11.041 11.561 12.139 12.762 13.413 14.078 14.828 15.153 15.031 14.798 14.556 14.294 14.02 13.755 13.515 13.21 12.927 12.691 12.447 12.192 11.949 11.719 11.464 11.241 11.055 10.851 10.622 10.443 10.266 10.065 9.895 9.719 9.535 9.345 9.165 9.044 8.909 8.69 8.546 8.375 8.28 8.1 7.9 7.667 7.545 7.227 7.161 7.015 6.874 6.571 6.389 6.16 5.896 5.653 5.359 4.948 3.984 -7 ,2194 ,TETRA ,17589370,Sat Nov 27 17:06:02 CET,Sat Nov 27 19:24:41 CET,0.0 0.787 1.141 1.417 1.669 1.889 2.069 2.21 2.468 2.609 2.754 2.823 3.137 3.241 3.439 3.632 3.805 3.887 4.043 4.193 4.416 4.56 4.701 4.9 5.081 5.261 5.432 5.591 5.798 6.01 6.211 6.457 6.707 6.934 7.193 7.482 7.741 8.017 8.313 8.632 8.973 9.354 9.77 10.148 10.583 11.086 11.691 12.35 13.005 13.645 14.238 14.463 14.375 14.191 13.965 13.693 13.413 13.118 12.835 12.542 12.249 11.955 11.674 11.413 11.138 10.869 10.601 10.374 10.186 9.975 9.73 9.521 9.301 9.07 8.897 8.721 8.544 8.355 8.143 7.992 7.829 7.572 7.384 7.182 7.079 6.864 6.652 6.439 6.318 5.993 5.926 5.79 5.648 5.311 5.103 4.849 4.578 4.297 3.993 3.553 2.307 -8 ,15916 ,TETRA ,17589371,Sat Nov 27 17:06:03 CET,Sat Nov 27 19:24:55 CET,0.0 0.461 0.791 1.037 1.232 1.42 1.599 1.752 2.01 2.13 2.243 2.264 2.564 2.662 2.86 3.053 3.238 3.324 3.495 3.658 3.876 4.021 4.164 4.367 4.564 4.753 4.932 5.106 5.326 5.537 5.745 5.989 6.219 6.437 6.703 6.995 7.265 7.552 7.86 8.201 8.552 8.931 9.37 9.824 10.32 10.822 11.396 12.017 12.694 13.441 14.121 14.429 14.473 14.299 14.006 13.704 13.41 13.084 12.802 12.53 12.273 12.034 11.772 11.488 11.226 10.995 10.737 10.496 10.293 10.075 9.839 9.645 9.441 9.216 9.04 8.854 8.656 8.462 8.273 8.14 7.992 7.757 7.602 7.438 7.347 7.16 6.948 6.684 6.544 6.208 6.1 5.934 5.759 5.403 5.197 4.947 4.664 4.383 4.052 3.592 2.358 -9 ,20088 ,TETRA ,17589372,Sat Nov 27 17:06:05 CET,Sat Nov 27 19:24:17 CET,0.0 0.454 0.696 0.859 1.024 1.18 1.33 1.49 1.781 1.913 2.032 2.068 2.381 2.483 2.678 2.855 3.017 3.103 3.281 3.437 3.655 3.804 3.949 4.134 4.308 4.494 4.677 4.846 5.062 5.27 5.471 5.728 5.96 6.167 6.41 6.69 6.967 7.265 7.569 7.89 8.233 8.629 9.106 9.569 10.086 10.641 11.229 11.843 12.524 13.199 13.738 13.881 13.774 13.585 13.31 13.0 12.688 12.349 12.03 11.699 11.397 11.137 10.868 10.577 10.317 10.09 9.839 9.598 9.373 9.141 8.914 8.722 8.514 8.29 8.115 7.928 7.731 7.528 7.317 7.168 7.01 6.764 6.6 6.419 6.305 6.042 5.763 5.465 5.314 4.96 4.808 4.618 4.43 4.048 3.844 3.633 3.396 3.112 2.747 2.231 0.959 -10 ,22082 ,TETRA ,17589373,Sat Nov 27 17:06:07 CET,Sat Nov 27 19:24:19 CET,0.0 0.635 0.973 1.215 1.442 1.639 1.82 1.989 2.275 2.408 2.545 2.596 2.892 2.99 3.184 3.371 3.562 3.658 3.846 4.018 4.256 4.413 4.563 4.775 4.982 5.198 5.404 5.577 5.804 6.034 6.24 6.482 6.718 6.94 7.205 7.516 7.804 8.121 8.457 8.813 9.179 9.583 10.059 10.521 11.036 11.585 12.174 12.822 13.558 14.304 15.148 15.584 15.519 15.27 14.991 14.745 14.486 14.153 13.834 13.518 13.23 12.972 12.714 12.459 12.22 11.999 11.758 11.533 11.341 11.134 10.917 10.731 10.513 10.282 10.102 9.92 9.734 9.544 9.344 9.189 9.03 8.767 8.575 8.377 8.285 8.101 7.886 7.681 7.586 7.278 7.213 7.076 6.933 6.63 6.464 6.276 6.059 5.802 5.452 4.964 3.845 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt deleted file mode 100644 index 7148291b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17826 ,TETRA ,17589374,Sat Nov 27 17:06:02 CET,Sat Nov 27 19:27:51 CET,0.0 0.717 1.087 1.352 1.562 1.742 1.897 2.045 2.323 2.45 2.562 2.557 2.89 2.991 3.181 3.358 3.54 3.638 3.809 3.961 4.195 4.34 4.477 4.664 4.834 5.002 5.169 5.349 5.576 5.782 5.959 6.17 6.395 6.603 6.837 7.097 7.32 7.534 7.76 8.003 8.261 8.529 8.82 9.102 9.394 9.692 9.989 10.235 10.416 10.506 10.248 9.547 8.836 8.11 7.452 6.815 6.175 5.557 5.019 4.485 4.013 3.599 3.218 2.848 2.506 2.19 1.836 1.517 1.238 0.947 0.655 0.416 0.165 -0.096 -0.302 -0.52 -0.745 -0.977 -1.203 -1.355 -1.519 -1.779 -1.967 -2.147 -2.234 -2.429 -2.63 -2.853 -2.974 -3.315 -3.33 -3.466 -3.606 -3.887 -4.05 -4.24 -4.463 -4.716 -5.0 -5.316 -5.927 -2 ,2962 ,TETRA ,17589375,Sat Nov 27 17:06:04 CET,Sat Nov 27 19:27:39 CET,0.0 0.816 1.157 1.471 1.713 1.887 2.061 2.224 2.503 2.619 2.73 2.729 3.053 3.151 3.342 3.532 3.708 3.79 3.933 4.057 4.243 4.362 4.477 4.641 4.787 4.927 5.075 5.222 5.419 5.615 5.798 6.02 6.229 6.418 6.63 6.868 7.087 7.315 7.555 7.778 8.0 8.248 8.504 8.738 9.02 9.302 9.569 9.809 9.927 9.874 9.352 8.347 7.406 6.537 5.769 5.044 4.388 3.792 3.249 2.674 2.179 1.743 1.322 0.933 0.565 0.217 -0.137 -0.417 -0.653 -0.906 -1.158 -1.377 -1.619 -1.886 -2.092 -2.303 -2.534 -2.773 -3.022 -3.194 -3.366 -3.641 -3.838 -4.045 -4.152 -4.389 -4.644 -4.896 -5.025 -5.39 -5.439 -5.588 -5.733 -6.056 -6.239 -6.414 -6.622 -6.853 -7.12 -7.477 -8.297 -3 ,2941 ,TETRA ,17589376,Sat Nov 27 17:06:06 CET,Sat Nov 27 19:25:05 CET,0.0 1.281 1.618 1.865 2.094 2.291 2.498 2.696 3.015 3.162 3.304 3.32 3.652 3.761 3.964 4.169 4.369 4.468 4.643 4.803 5.051 5.202 5.336 5.543 5.753 5.955 6.145 6.32 6.529 6.711 6.893 7.133 7.346 7.553 7.806 8.059 8.282 8.546 8.837 9.157 9.48 9.793 10.16 10.467 10.746 11.012 11.285 11.577 11.807 11.886 11.51 10.642 9.732 8.838 8.114 7.455 6.836 6.252 5.741 5.257 4.844 4.487 4.099 3.688 3.319 3.0 2.668 2.363 2.093 1.816 1.54 1.288 1.013 0.743 0.531 0.304 0.072 -0.147 -0.365 -0.533 -0.711 -0.978 -1.159 -1.341 -1.435 -1.635 -1.846 -2.073 -2.194 -2.555 -2.585 -2.725 -2.867 -3.153 -3.313 -3.491 -3.678 -3.902 -4.161 -4.509 -5.518 -4 ,23580 ,TETRA ,17589377,Sat Nov 27 17:06:03 CET,Sat Nov 27 19:26:14 CET,0.0 0.998 1.311 1.589 1.842 2.053 2.244 2.422 2.703 2.825 2.959 3.008 3.348 3.453 3.665 3.866 4.05 4.138 4.296 4.455 4.69 4.836 4.969 5.164 5.354 5.532 5.695 5.845 6.041 6.222 6.396 6.604 6.793 6.972 7.185 7.44 7.667 7.926 8.209 8.464 8.707 8.984 9.288 9.572 9.886 10.185 10.471 10.754 11.055 11.222 10.93 10.037 9.112 8.308 7.539 6.765 6.089 5.53 5.073 4.602 4.163 3.75 3.359 3.0 2.649 2.318 1.976 1.68 1.426 1.163 0.889 0.657 0.407 0.142 -0.058 -0.255 -0.474 -0.721 -0.978 -1.153 -1.326 -1.594 -1.791 -2.006 -2.116 -2.332 -2.555 -2.789 -2.92 -3.304 -3.391 -3.557 -3.719 -4.041 -4.237 -4.446 -4.666 -4.953 -5.263 -5.59 -6.446 -5 ,12705 ,TETRA ,17589379,Sat Nov 27 17:06:02 CET,Sat Nov 27 19:26:51 CET,0.0 1.373 1.656 1.881 2.09 2.282 2.452 2.614 2.897 3.009 3.122 3.093 3.4 3.491 3.67 3.834 3.995 4.071 4.226 4.377 4.572 4.686 4.797 4.965 5.126 5.285 5.44 5.585 5.767 5.927 6.09 6.29 6.469 6.66 6.894 7.134 7.364 7.609 7.844 8.083 8.319 8.568 8.859 9.145 9.467 9.761 9.99 10.202 10.344 10.274 9.777 8.932 8.03 7.185 6.449 5.742 5.089 4.502 4.009 3.492 3.043 2.655 2.281 1.937 1.618 1.318 1.01 0.734 0.493 0.231 -0.052 -0.294 -0.526 -0.751 -0.94 -1.138 -1.347 -1.567 -1.787 -1.935 -2.094 -2.344 -2.513 -2.69 -2.777 -2.953 -3.153 -3.376 -3.494 -3.849 -3.842 -3.961 -4.096 -4.378 -4.53 -4.698 -4.869 -5.064 -5.279 -5.543 -6.26 -6 ,18087 ,TETRA ,17589380,Sat Nov 27 17:06:32 CET,Sat Nov 27 19:25:24 CET,0.0 0.629 0.908 1.119 1.308 1.481 1.627 1.757 2.01 2.142 2.255 2.248 2.579 2.672 2.843 3.015 3.182 3.265 3.421 3.57 3.794 3.936 4.078 4.269 4.446 4.617 4.77 4.921 5.113 5.303 5.487 5.705 5.902 6.076 6.267 6.487 6.707 6.934 7.168 7.425 7.704 7.976 8.26 8.579 8.976 9.376 9.698 9.936 10.111 10.153 9.853 8.977 7.97 7.033 6.144 5.309 4.595 3.949 3.395 2.813 2.285 1.853 1.48 1.12 0.766 0.439 0.098 -0.199 -0.466 -0.761 -1.062 -1.319 -1.58 -1.84 -2.035 -2.237 -2.446 -2.657 -2.885 -3.044 -3.206 -3.453 -3.616 -3.789 -3.882 -4.072 -4.267 -4.451 -4.55 -4.894 -4.887 -4.998 -5.123 -5.434 -5.613 -5.792 -5.963 -6.135 -6.342 -6.606 -7.416 -7 ,14186 ,TETRA ,17589381,Sat Nov 27 17:06:32 CET,Sat Nov 27 19:26:40 CET,0.0 0.743 1.016 1.248 1.45 1.624 1.791 1.965 2.271 2.41 2.576 2.684 3.035 3.142 3.359 3.565 3.754 3.841 4.003 4.153 4.388 4.546 4.695 4.895 5.086 5.277 5.443 5.595 5.797 5.992 6.176 6.394 6.606 6.806 7.02 7.257 7.482 7.729 8.011 8.281 8.558 8.881 9.221 9.534 9.88 10.209 10.552 10.89 11.166 11.334 11.2 10.482 9.435 8.422 7.615 6.883 6.181 5.549 5.006 4.432 3.94 3.508 3.092 2.711 2.353 2.029 1.705 1.433 1.194 0.931 0.648 0.425 0.193 -0.064 -0.258 -0.465 -0.667 -0.861 -1.074 -1.221 -1.375 -1.618 -1.781 -1.952 -2.041 -2.224 -2.418 -2.612 -2.71 -3.051 -3.055 -3.187 -3.318 -3.575 -3.697 -3.845 -4.055 -4.314 -4.598 -4.948 -5.853 -8 ,7895 ,TETRA ,17589382,Sat Nov 27 17:07:32 CET,Sat Nov 27 19:27:37 CET,0.0 1.289 1.698 2.003 2.224 2.415 2.578 2.732 3.027 3.168 3.3 3.292 3.627 3.741 3.963 4.169 4.375 4.486 4.688 4.86 5.103 5.256 5.406 5.617 5.807 5.988 6.157 6.313 6.526 6.731 6.921 7.146 7.373 7.598 7.845 8.109 8.354 8.632 8.919 9.196 9.47 9.713 9.948 10.223 10.555 10.858 11.131 11.326 11.497 11.597 11.231 10.334 9.445 8.646 7.87 7.123 6.469 5.859 5.334 4.799 4.336 3.924 3.545 3.187 2.834 2.5 2.151 1.853 1.599 1.328 1.051 0.805 0.517 0.233 0.043 -0.16 -0.392 -0.647 -0.893 -1.05 -1.207 -1.436 -1.611 -1.803 -1.896 -2.093 -2.312 -2.529 -2.646 -3.006 -3.025 -3.167 -3.308 -3.588 -3.753 -3.952 -4.173 -4.419 -4.719 -5.065 -6.211 -9 ,30177 ,TETRA ,17589383,Sat Nov 27 17:06:33 CET,Sat Nov 27 19:17:20 CET,0.0 0.886 1.239 1.499 1.694 1.873 2.05 2.206 2.478 2.612 2.745 2.767 3.114 3.229 3.433 3.629 3.826 3.93 4.132 4.313 4.551 4.695 4.829 5.014 5.193 5.364 5.524 5.683 5.905 6.122 6.335 6.561 6.767 6.985 7.231 7.488 7.715 7.984 8.263 8.519 8.766 9.035 9.339 9.608 9.911 10.204 10.45 10.659 10.804 10.701 10.224 9.442 8.652 7.849 7.057 6.306 5.64 5.016 4.455 3.876 3.39 3.002 2.627 2.235 1.846 1.481 1.103 0.784 0.513 0.232 -0.064 -0.311 -0.565 -0.835 -1.034 -1.25 -1.493 -1.75 -2.017 -2.186 -2.361 -2.659 -2.865 -3.071 -3.175 -3.391 -3.626 -3.878 -4.006 -4.377 -4.408 -4.539 -4.683 -4.97 -5.137 -5.334 -5.534 -5.786 -6.103 -6.525 -7.568 -10 ,27103 ,TETRA ,17589384,Sat Nov 27 17:06:32 CET,Sat Nov 27 19:27:46 CET,0.0 0.791 1.099 1.353 1.55 1.718 1.876 2.028 2.33 2.469 2.597 2.61 2.929 3.024 3.217 3.388 3.55 3.631 3.772 3.904 4.107 4.239 4.367 4.561 4.745 4.9 5.061 5.226 5.437 5.637 5.827 6.041 6.242 6.435 6.642 6.878 7.086 7.299 7.521 7.764 8.044 8.337 8.63 8.879 9.156 9.463 9.781 10.011 10.136 10.16 9.801 8.927 8.111 7.358 6.667 6.01 5.382 4.789 4.273 3.726 3.221 2.772 2.36 1.992 1.637 1.324 1.002 0.694 0.436 0.175 -0.095 -0.314 -0.559 -0.826 -1.022 -1.214 -1.417 -1.629 -1.855 -2.014 -2.168 -2.401 -2.561 -2.724 -2.813 -3.012 -3.226 -3.456 -3.577 -3.925 -3.936 -4.084 -4.246 -4.56 -4.71 -4.87 -5.06 -5.25 -5.451 -5.743 -6.834 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt deleted file mode 100644 index 5482c12d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16819 ,TETRA ,17589385,Sat Nov 27 17:06:35 CET,Sat Nov 27 19:27:03 CET,0.0 0.487 0.651 0.761 0.832 0.906 0.968 1.018 1.085 1.104 1.118 0.939 1.18 1.193 1.225 1.248 1.251 1.248 1.226 1.218 1.22 1.209 1.191 1.15 1.119 1.084 1.034 0.975 0.875 0.779 0.681 0.549 0.43 0.306 0.122 -0.127 -0.385 -0.681 -1.025 -1.431 -1.903 -2.48 -3.194 -3.975 -4.99 -6.288 -7.974 -10.148 -13.12 -17.233 -23.298 -29.696 -34.522 -38.35 -41.442 -44.07 -46.277 -48.182 -49.728 -51.206 -52.454 -53.527 -54.532 -55.461 -56.304 -57.056 -57.814 -58.5 -59.084 -59.657 -60.251 -60.738 -61.231 -61.741 -62.136 -62.539 -62.937 -63.338 -63.755 -64.034 -64.321 -64.768 -65.062 -65.364 -65.512 -65.812 -66.137 -66.482 -66.653 -67.114 -67.196 -67.384 -67.567 -67.945 -68.146 -68.357 -68.589 -68.821 -69.055 -69.395 -70.264 -2 ,26613 ,TETRA ,17589386,Sat Nov 27 17:06:36 CET,Sat Nov 27 19:26:34 CET,0.0 0.256 0.377 0.485 0.555 0.619 0.691 0.745 0.847 0.892 0.924 0.741 0.984 1.004 1.027 1.041 1.057 1.061 1.057 1.041 1.01 0.996 0.985 0.952 0.901 0.844 0.784 0.725 0.65 0.565 0.467 0.323 0.162 0.009 -0.181 -0.436 -0.7 -1.029 -1.416 -1.845 -2.327 -2.916 -3.657 -4.497 -5.614 -7.003 -8.788 -11.067 -14.159 -18.446 -24.852 -31.594 -36.582 -40.517 -43.683 -46.324 -48.5 -50.383 -51.97 -53.507 -54.759 -55.832 -56.841 -57.772 -58.617 -59.365 -60.122 -60.779 -61.334 -61.901 -62.486 -62.965 -63.455 -63.962 -64.346 -64.73 -65.121 -65.523 -65.934 -66.208 -66.479 -66.88 -67.163 -67.469 -67.627 -67.958 -68.298 -68.645 -68.817 -69.288 -69.341 -69.522 -69.712 -70.151 -70.375 -70.584 -70.825 -71.123 -71.437 -71.798 -72.498 -3 ,7615 ,TETRA ,17589387,Sat Nov 27 17:06:32 CET,Sat Nov 27 19:27:49 CET,0.0 0.904 1.136 1.285 1.371 1.455 1.554 1.642 1.772 1.818 1.874 1.743 2.01 2.041 2.101 2.146 2.184 2.196 2.199 2.206 2.213 2.208 2.196 2.155 2.108 2.068 2.02 1.961 1.875 1.778 1.679 1.562 1.434 1.287 1.095 0.858 0.621 0.342 -0.008 -0.435 -0.914 -1.504 -2.263 -3.095 -4.17 -5.493 -7.198 -9.429 -12.43 -16.584 -22.809 -29.357 -34.207 -37.966 -41.004 -43.641 -45.868 -47.797 -49.366 -50.861 -52.114 -53.183 -54.15 -55.051 -55.876 -56.61 -57.371 -58.045 -58.622 -59.197 -59.769 -60.236 -60.717 -61.209 -61.582 -61.961 -62.362 -62.778 -63.193 -63.478 -63.771 -64.221 -64.51 -64.809 -64.973 -65.302 -65.637 -65.965 -66.118 -66.581 -66.647 -66.853 -67.065 -67.504 -67.737 -67.984 -68.244 -68.499 -68.799 -69.122 -69.993 -4 ,24325 ,TETRA ,17589388,Sat Nov 27 17:07:32 CET,Sat Nov 27 19:16:37 CET,0.0 0.226 0.406 0.596 0.753 0.858 0.96 1.067 1.242 1.297 1.345 1.198 1.461 1.494 1.554 1.628 1.682 1.69 1.706 1.711 1.704 1.701 1.696 1.677 1.64 1.606 1.57 1.525 1.453 1.357 1.247 1.118 0.986 0.84 0.648 0.396 0.137 -0.165 -0.531 -0.946 -1.419 -2.017 -2.781 -3.651 -4.77 -6.125 -7.863 -10.094 -13.091 -17.221 -23.378 -29.928 -34.828 -38.677 -41.781 -44.384 -46.53 -48.374 -49.911 -51.412 -52.649 -53.695 -54.684 -55.6 -56.416 -57.141 -57.879 -58.529 -59.084 -59.65 -60.236 -60.721 -61.207 -61.697 -62.079 -62.468 -62.864 -63.255 -63.64 -63.906 -64.184 -64.615 -64.906 -65.208 -65.37 -65.706 -66.05 -66.399 -66.571 -67.041 -67.125 -67.315 -67.518 -67.947 -68.146 -68.371 -68.633 -68.895 -69.195 -69.574 -70.393 -5 ,29488 ,TETRA ,17589389,Sat Nov 27 17:07:32 CET,Sat Nov 27 19:20:32 CET,0.0 0.713 0.985 1.175 1.297 1.388 1.467 1.531 1.632 1.675 1.708 1.565 1.834 1.875 1.934 1.969 1.993 2.007 2.025 2.02 2.005 2.0 1.985 1.94 1.892 1.86 1.823 1.777 1.704 1.61 1.501 1.35 1.199 1.035 0.821 0.581 0.358 0.089 -0.236 -0.609 -1.028 -1.574 -2.316 -3.139 -4.213 -5.507 -7.177 -9.341 -12.215 -16.279 -22.491 -29.122 -34.04 -37.886 -40.98 -43.588 -45.777 -47.722 -49.322 -50.8 -52.002 -53.067 -54.066 -54.961 -55.773 -56.499 -57.225 -57.881 -58.453 -59.038 -59.624 -60.101 -60.594 -61.066 -61.414 -61.79 -62.182 -62.564 -62.956 -63.226 -63.496 -63.907 -64.188 -64.466 -64.609 -64.926 -65.255 -65.583 -65.767 -66.25 -66.323 -66.514 -66.705 -67.114 -67.35 -67.598 -67.848 -68.104 -68.369 -68.759 -69.693 -6 ,10321 ,TETRA ,17589390,Sat Nov 27 17:07:31 CET,Sat Nov 27 19:26:16 CET,0.0 0.542 0.729 0.865 0.96 1.054 1.154 1.218 1.286 1.323 1.344 1.15 1.386 1.395 1.435 1.463 1.462 1.465 1.472 1.473 1.465 1.453 1.443 1.421 1.381 1.328 1.265 1.203 1.117 1.018 0.922 0.8 0.661 0.499 0.284 0.032 -0.228 -0.564 -0.962 -1.41 -1.929 -2.568 -3.377 -4.273 -5.408 -6.778 -8.557 -10.87 -13.989 -18.296 -24.844 -31.752 -36.821 -40.818 -44.042 -46.797 -49.034 -50.921 -52.491 -53.987 -55.217 -56.279 -57.268 -58.176 -59.001 -59.756 -60.53 -61.197 -61.765 -62.335 -62.928 -63.41 -63.893 -64.401 -64.794 -65.181 -65.56 -65.963 -66.377 -66.654 -66.937 -67.366 -67.66 -67.952 -68.096 -68.391 -68.714 -69.063 -69.242 -69.717 -69.799 -69.993 -70.202 -70.644 -70.882 -71.125 -71.377 -71.641 -71.931 -72.342 -73.258 -7 ,14523 ,TETRA ,17589391,Sat Nov 27 17:07:32 CET,Sat Nov 27 19:25:35 CET,0.0 0.493 0.701 0.873 1.02 1.152 1.245 1.313 1.448 1.51 1.562 1.414 1.66 1.678 1.713 1.753 1.783 1.791 1.802 1.806 1.807 1.797 1.782 1.743 1.699 1.642 1.566 1.493 1.397 1.293 1.176 1.024 0.883 0.737 0.562 0.33 0.054 -0.272 -0.643 -1.078 -1.584 -2.203 -2.99 -3.847 -4.942 -6.318 -8.086 -10.333 -13.399 -17.654 -24.074 -30.96 -36.033 -40.009 -43.199 -45.852 -48.053 -49.978 -51.578 -53.096 -54.353 -55.445 -56.473 -57.424 -58.282 -59.054 -59.839 -60.513 -61.075 -61.635 -62.2 -62.663 -63.136 -63.62 -64.001 -64.397 -64.792 -65.194 -65.603 -65.877 -66.165 -66.607 -66.912 -67.227 -67.385 -67.705 -68.041 -68.387 -68.569 -69.054 -69.155 -69.367 -69.575 -69.991 -70.223 -70.474 -70.723 -70.991 -71.31 -71.68 -72.54 -8 ,29676 ,TETRA ,17589392,Sat Nov 27 17:07:32 CET,Sat Nov 27 19:28:06 CET,0.0 0.689 0.83 0.925 1.01 1.095 1.182 1.248 1.332 1.364 1.385 1.213 1.468 1.498 1.536 1.552 1.571 1.583 1.598 1.595 1.562 1.535 1.516 1.486 1.453 1.415 1.358 1.295 1.219 1.131 1.018 0.872 0.732 0.592 0.405 0.176 -0.06 -0.349 -0.703 -1.123 -1.62 -2.251 -3.062 -3.94 -5.068 -6.458 -8.19 -10.368 -13.253 -17.349 -23.606 -30.283 -35.182 -39.016 -42.157 -44.753 -46.874 -48.737 -50.297 -51.825 -53.089 -54.162 -55.171 -56.094 -56.931 -57.685 -58.455 -59.127 -59.696 -60.268 -60.85 -61.326 -61.81 -62.298 -62.669 -63.056 -63.457 -63.863 -64.282 -64.571 -64.857 -65.301 -65.605 -65.903 -66.054 -66.365 -66.688 -67.015 -67.179 -67.651 -67.738 -67.922 -68.102 -68.5 -68.72 -68.932 -69.156 -69.421 -69.731 -70.115 -70.973 -9 ,5502 ,TETRA ,17589393,Sat Nov 27 17:07:35 CET,Sat Nov 27 19:26:00 CET,0.0 0.511 0.732 0.879 0.965 1.052 1.135 1.221 1.374 1.435 1.486 1.336 1.585 1.608 1.634 1.64 1.646 1.659 1.681 1.685 1.668 1.653 1.632 1.589 1.548 1.506 1.473 1.436 1.364 1.277 1.182 1.058 0.921 0.764 0.561 0.306 0.07 -0.203 -0.55 -0.948 -1.42 -2.004 -2.753 -3.588 -4.649 -5.979 -7.727 -9.93 -12.945 -17.178 -23.505 -30.235 -35.21 -39.096 -42.184 -44.809 -47.012 -48.902 -50.473 -51.971 -53.207 -54.309 -55.323 -56.215 -57.038 -57.776 -58.543 -59.219 -59.779 -60.362 -60.96 -61.439 -61.949 -62.474 -62.861 -63.246 -63.639 -64.053 -64.475 -64.764 -65.065 -65.53 -65.847 -66.17 -66.329 -66.654 -67.009 -67.39 -67.582 -68.068 -68.188 -68.397 -68.614 -69.092 -69.348 -69.619 -69.891 -70.177 -70.507 -70.858 -71.772 -10 ,15723 ,TETRA ,17589394,Sat Nov 27 17:07:32 CET,Sat Nov 27 19:02:49 CET,0.0 0.576 0.764 0.916 1.037 1.112 1.178 1.254 1.387 1.454 1.51 1.341 1.598 1.637 1.704 1.751 1.782 1.798 1.824 1.834 1.82 1.801 1.776 1.735 1.69 1.637 1.572 1.5 1.403 1.292 1.168 1.02 0.87 0.714 0.513 0.259 -0.015 -0.345 -0.736 -1.188 -1.7 -2.338 -3.158 -4.065 -5.221 -6.616 -8.42 -10.736 -13.793 -18.037 -24.342 -31.007 -35.96 -39.815 -42.91 -45.485 -47.608 -49.449 -50.962 -52.414 -53.613 -54.652 -55.632 -56.523 -57.325 -58.041 -58.762 -59.399 -59.935 -60.468 -61.038 -61.503 -61.966 -62.459 -62.837 -63.207 -63.575 -63.969 -64.388 -64.665 -64.954 -65.399 -65.685 -65.975 -66.131 -66.443 -66.747 -67.069 -67.24 -67.71 -67.79 -67.986 -68.18 -68.559 -68.766 -68.979 -69.208 -69.486 -69.779 -70.08 -70.921 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt deleted file mode 100644 index 24f90864..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27461 ,TETRA ,17589395,Sat Nov 27 17:07:32 CET,Sat Nov 27 19:14:24 CET,0.0 0.721 0.937 1.1 1.197 1.311 1.413 1.48 1.575 1.617 1.667 1.515 1.765 1.793 1.84 1.869 1.885 1.893 1.901 1.898 1.895 1.879 1.857 1.826 1.782 1.739 1.677 1.595 1.474 1.351 1.23 1.061 0.886 0.703 0.464 0.171 -0.132 -0.494 -0.913 -1.401 -1.973 -2.685 -3.597 -4.593 -5.851 -7.391 -9.336 -11.827 -15.25 -20.09 -27.342 -34.926 -40.605 -45.094 -48.727 -51.82 -54.372 -56.535 -58.309 -60.015 -61.418 -62.61 -63.719 -64.778 -65.748 -66.588 -67.452 -68.192 -68.815 -69.469 -70.158 -70.724 -71.285 -71.852 -72.276 -72.706 -73.164 -73.638 -74.103 -74.42 -74.751 -75.257 -75.6 -75.932 -76.101 -76.467 -76.836 -77.21 -77.408 -77.913 -78.026 -78.237 -78.461 -78.976 -79.26 -79.557 -79.886 -80.259 -80.634 -81.033 -81.913 -2 ,24977 ,TETRA ,17589396,Sat Nov 27 17:07:34 CET,Sat Nov 27 19:29:06 CET,0.0 0.715 0.976 1.11 1.239 1.32 1.395 1.478 1.585 1.628 1.676 1.518 1.772 1.802 1.857 1.899 1.931 1.945 1.954 1.945 1.906 1.871 1.838 1.786 1.715 1.643 1.568 1.495 1.394 1.264 1.127 0.963 0.784 0.598 0.368 0.049 -0.286 -0.672 -1.121 -1.629 -2.212 -2.919 -3.79 -4.762 -6.027 -7.587 -9.598 -12.137 -15.573 -20.371 -27.583 -35.276 -40.923 -45.29 -48.772 -51.676 -54.092 -56.164 -57.871 -59.556 -60.941 -62.118 -63.211 -64.206 -65.117 -65.95 -66.791 -67.509 -68.114 -68.74 -69.388 -69.914 -70.439 -70.965 -71.366 -71.769 -72.177 -72.589 -73.031 -73.34 -73.649 -74.117 -74.438 -74.754 -74.909 -75.234 -75.562 -75.892 -76.066 -76.56 -76.634 -76.834 -77.042 -77.478 -77.71 -77.943 -78.186 -78.449 -78.76 -79.183 -80.112 -3 ,13328 ,TETRA ,17589397,Sat Nov 27 17:07:32 CET,Sat Nov 27 19:28:22 CET,0.0 0.673 0.955 1.153 1.323 1.48 1.615 1.697 1.826 1.899 1.948 1.773 2.021 2.055 2.116 2.171 2.198 2.203 2.2 2.196 2.215 2.214 2.186 2.144 2.095 2.039 1.975 1.903 1.808 1.714 1.612 1.446 1.278 1.146 0.981 0.733 0.454 0.102 -0.316 -0.774 -1.318 -2.002 -2.877 -3.864 -5.138 -6.704 -8.727 -11.295 -14.751 -19.709 -27.123 -34.818 -40.658 -45.325 -48.972 -51.985 -54.474 -56.606 -58.385 -60.118 -61.546 -62.769 -63.931 -65.035 -66.011 -66.844 -67.681 -68.413 -69.032 -69.647 -70.276 -70.783 -71.299 -71.839 -72.248 -72.68 -73.153 -73.642 -74.133 -74.469 -74.821 -75.353 -75.704 -76.061 -76.234 -76.584 -76.974 -77.377 -77.576 -78.085 -78.19 -78.408 -78.632 -79.086 -79.341 -79.619 -79.924 -80.225 -80.558 -81.013 -82.254 -4 ,23192 ,TETRA ,17589398,Sat Nov 27 17:07:34 CET,Sat Nov 27 19:26:49 CET,0.0 0.672 0.937 1.153 1.311 1.441 1.552 1.634 1.748 1.8 1.832 1.656 1.919 1.967 2.023 2.046 2.066 2.082 2.118 2.152 2.171 2.168 2.165 2.149 2.125 2.09 2.051 1.995 1.916 1.828 1.712 1.548 1.378 1.197 0.973 0.709 0.417 0.057 -0.377 -0.872 -1.411 -2.065 -2.879 -3.772 -4.96 -6.438 -8.353 -10.863 -14.305 -19.116 -26.264 -33.838 -39.529 -44.005 -47.57 -50.568 -53.042 -55.135 -56.855 -58.526 -59.934 -61.166 -62.31 -63.37 -64.342 -65.197 -66.043 -66.78 -67.42 -68.068 -68.706 -69.22 -69.745 -70.277 -70.692 -71.119 -71.557 -72.016 -72.484 -72.808 -73.138 -73.645 -73.998 -74.361 -74.544 -74.915 -75.299 -75.689 -75.885 -76.389 -76.495 -76.715 -76.926 -77.345 -77.576 -77.821 -78.094 -78.407 -78.766 -79.275 -80.62 -5 ,5986 ,TETRA ,17589399,Sat Nov 27 17:07:34 CET,Sat Nov 27 19:23:32 CET,0.0 0.739 1.045 1.228 1.367 1.483 1.588 1.688 1.853 1.913 1.963 1.812 2.062 2.09 2.141 2.182 2.209 2.215 2.217 2.219 2.21 2.193 2.171 2.132 2.088 2.025 1.961 1.898 1.797 1.684 1.572 1.418 1.259 1.098 0.88 0.606 0.321 -0.014 -0.436 -0.925 -1.457 -2.13 -3.019 -4.016 -5.313 -6.884 -8.886 -11.496 -14.967 -19.72 -26.823 -34.398 -40.056 -44.456 -47.997 -50.972 -53.437 -55.553 -57.303 -58.998 -60.437 -61.703 -62.849 -63.879 -64.836 -65.715 -66.639 -67.457 -68.156 -68.87 -69.591 -70.177 -70.777 -71.404 -71.885 -72.372 -72.863 -73.355 -73.86 -74.211 -74.575 -75.131 -75.514 -75.909 -76.113 -76.531 -76.945 -77.369 -77.586 -78.115 -78.276 -78.515 -78.77 -79.317 -79.598 -79.885 -80.213 -80.592 -81.036 -81.568 -82.596 -6 ,21244 ,TETRA ,17589400,Sat Nov 27 17:07:34 CET,Sat Nov 27 19:27:13 CET,0.0 0.455 0.767 0.969 1.089 1.199 1.272 1.329 1.424 1.466 1.503 1.323 1.563 1.578 1.595 1.616 1.632 1.626 1.609 1.607 1.594 1.577 1.558 1.518 1.465 1.396 1.315 1.232 1.131 1.026 0.92 0.771 0.6 0.412 0.173 -0.098 -0.386 -0.752 -1.19 -1.678 -2.21 -2.857 -3.708 -4.704 -5.967 -7.487 -9.474 -11.996 -15.373 -20.103 -27.09 -34.497 -40.044 -44.369 -47.855 -50.78 -53.172 -55.228 -56.952 -58.605 -59.989 -61.196 -62.289 -63.273 -64.176 -64.993 -65.829 -66.563 -67.187 -67.822 -68.475 -69.008 -69.539 -70.094 -70.519 -70.938 -71.365 -71.811 -72.271 -72.57 -72.889 -73.403 -73.73 -74.059 -74.228 -74.574 -74.918 -75.272 -75.465 -75.961 -76.02 -76.208 -76.412 -76.852 -77.078 -77.313 -77.588 -77.892 -78.197 -78.486 -79.277 -7 ,27181 ,TETRA ,17589401,Sat Nov 27 17:07:36 CET,Sat Nov 27 19:26:11 CET,0.0 0.907 1.157 1.312 1.403 1.487 1.572 1.641 1.772 1.821 1.872 1.745 2.005 2.04 2.087 2.111 2.132 2.143 2.152 2.165 2.171 2.16 2.142 2.118 2.08 2.03 1.978 1.916 1.828 1.729 1.631 1.503 1.358 1.194 0.967 0.696 0.418 0.074 -0.333 -0.799 -1.359 -2.06 -2.947 -3.961 -5.273 -6.884 -8.931 -11.602 -15.201 -20.09 -27.45 -35.299 -41.122 -45.661 -49.256 -52.244 -54.69 -56.839 -58.638 -60.34 -61.762 -62.979 -64.086 -65.122 -66.083 -66.937 -67.796 -68.548 -69.187 -69.83 -70.473 -71.003 -71.536 -72.074 -72.484 -72.901 -73.334 -73.774 -74.22 -74.523 -74.836 -75.328 -75.68 -76.035 -76.215 -76.585 -76.97 -77.364 -77.557 -78.061 -78.166 -78.378 -78.597 -79.081 -79.339 -79.599 -79.872 -80.167 -80.508 -80.904 -81.591 -8 ,16034 ,TETRA ,17589402,Sat Nov 27 17:07:34 CET,Sat Nov 27 19:20:49 CET,0.0 0.695 0.957 1.148 1.294 1.444 1.562 1.664 1.854 1.934 1.993 1.848 2.108 2.149 2.21 2.277 2.335 2.348 2.367 2.384 2.384 2.378 2.38 2.367 2.328 2.291 2.249 2.192 2.101 1.996 1.884 1.745 1.599 1.437 1.222 0.948 0.661 0.335 -0.049 -0.533 -1.094 -1.748 -2.6 -3.556 -4.776 -6.291 -8.24 -10.694 -13.938 -18.512 -25.517 -32.987 -38.579 -42.934 -46.415 -49.381 -51.846 -53.966 -55.711 -57.391 -58.8 -59.992 -61.084 -62.08 -62.985 -63.794 -64.606 -65.322 -65.942 -66.574 -67.218 -67.744 -68.281 -68.826 -69.229 -69.638 -70.068 -70.495 -70.937 -71.238 -71.535 -72.003 -72.317 -72.636 -72.803 -73.134 -73.471 -73.827 -74.006 -74.498 -74.582 -74.782 -74.986 -75.432 -75.706 -75.979 -76.227 -76.515 -76.839 -77.281 -78.473 -9 ,9909 ,TETRA ,17589403,Sat Nov 27 17:07:34 CET,Sat Nov 27 19:25:41 CET,0.0 0.463 0.708 0.845 0.992 1.104 1.203 1.293 1.438 1.49 1.519 1.346 1.6 1.622 1.641 1.679 1.704 1.706 1.709 1.699 1.687 1.683 1.675 1.644 1.587 1.514 1.427 1.338 1.226 1.103 0.969 0.793 0.607 0.412 0.158 -0.142 -0.451 -0.818 -1.251 -1.77 -2.361 -3.088 -3.987 -4.959 -6.191 -7.7 -9.668 -12.194 -15.702 -20.607 -27.847 -35.571 -41.203 -45.566 -49.118 -52.168 -54.697 -56.83 -58.584 -60.304 -61.741 -62.963 -64.089 -65.106 -66.041 -66.884 -67.737 -68.482 -69.107 -69.75 -70.401 -70.927 -71.459 -72.014 -72.455 -72.902 -73.348 -73.794 -74.252 -74.568 -74.889 -75.38 -75.714 -76.056 -76.232 -76.581 -76.945 -77.354 -77.562 -78.077 -78.179 -78.396 -78.621 -79.092 -79.351 -79.643 -79.933 -80.244 -80.62 -81.07 -82.079 -10 ,17096 ,TETRA ,17589404,Sat Nov 27 17:08:33 CET,Sat Nov 27 19:31:00 CET,0.0 0.597 0.774 0.913 1.024 1.079 1.138 1.182 1.267 1.309 1.343 1.183 1.45 1.492 1.545 1.574 1.591 1.6 1.614 1.627 1.632 1.619 1.6 1.562 1.511 1.448 1.398 1.355 1.274 1.181 1.073 0.926 0.776 0.59 0.359 0.108 -0.169 -0.51 -0.917 -1.386 -1.922 -2.608 -3.5 -4.483 -5.771 -7.367 -9.338 -11.904 -15.423 -20.272 -27.604 -35.365 -41.051 -45.446 -48.998 -52.008 -54.495 -56.614 -58.366 -60.073 -61.495 -62.729 -63.869 -64.92 -65.881 -66.734 -67.593 -68.339 -68.981 -69.651 -70.324 -70.858 -71.397 -71.95 -72.378 -72.813 -73.264 -73.741 -74.217 -74.534 -74.87 -75.391 -75.744 -76.106 -76.287 -76.648 -77.01 -77.386 -77.589 -78.082 -78.183 -78.395 -78.598 -78.999 -79.204 -79.441 -79.724 -80.015 -80.315 -80.667 -81.331 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt deleted file mode 100644 index 725f119d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7025 ,TETRA ,17589405,Sat Nov 27 17:08:33 CET,Sat Nov 27 19:22:27 CET,0.0 0.729 0.987 1.19 1.36 1.501 1.644 1.792 2.051 2.163 2.268 2.236 2.551 2.646 2.835 3.025 3.198 3.275 3.426 3.569 3.78 3.922 4.056 4.239 4.436 4.631 4.802 4.968 5.176 5.379 5.586 5.82 6.034 6.239 6.48 6.76 7.037 7.32 7.588 7.871 8.183 8.538 8.967 9.415 9.908 10.402 10.937 11.473 12.002 12.538 13.001 13.085 12.846 12.497 12.053 11.592 11.106 10.564 10.084 9.607 9.175 8.789 8.443 8.111 7.793 7.496 7.168 6.867 6.61 6.35 6.071 5.835 5.609 5.384 5.219 5.049 4.851 4.647 4.416 4.249 4.093 3.841 3.668 3.492 3.397 3.2 2.998 2.79 2.672 2.31 2.27 2.136 1.996 1.703 1.547 1.355 1.121 0.865 0.585 0.207 -0.755 -2 ,966 ,TETRA ,17589406,Sat Nov 27 17:08:33 CET,Sat Nov 27 19:28:11 CET,0.0 0.53 0.828 1.082 1.283 1.463 1.629 1.772 2.03 2.154 2.277 2.286 2.623 2.726 2.935 3.145 3.339 3.428 3.597 3.743 3.963 4.117 4.263 4.467 4.659 4.846 5.025 5.192 5.42 5.648 5.855 6.098 6.329 6.54 6.791 7.071 7.323 7.584 7.857 8.161 8.455 8.739 9.076 9.419 9.813 10.214 10.589 11.009 11.46 11.812 11.971 11.771 11.323 10.72 10.132 9.541 8.984 8.472 8.013 7.516 7.055 6.621 6.214 5.873 5.558 5.236 4.883 4.574 4.306 4.036 3.752 3.503 3.247 2.995 2.793 2.574 2.353 2.117 1.873 1.71 1.544 1.283 1.094 0.897 0.792 0.57 0.335 0.081 -0.05 -0.413 -0.445 -0.591 -0.736 -1.042 -1.228 -1.432 -1.646 -1.891 -2.211 -2.599 -3.324 -3 ,27195 ,TETRA ,17589407,Sat Nov 27 17:09:34 CET,Sat Nov 27 19:15:21 CET,0.0 0.456 0.724 0.924 1.093 1.265 1.409 1.511 1.706 1.813 1.909 1.856 2.163 2.262 2.453 2.609 2.756 2.833 2.994 3.152 3.384 3.533 3.669 3.859 4.036 4.199 4.367 4.527 4.732 4.925 5.097 5.302 5.501 5.687 5.9 6.142 6.371 6.618 6.869 7.13 7.396 7.684 8.021 8.373 8.754 9.11 9.516 9.96 10.4 10.753 10.773 10.369 9.803 9.172 8.575 7.95 7.398 6.924 6.497 6.066 5.664 5.299 4.955 4.66 4.401 4.151 3.882 3.636 3.421 3.187 2.947 2.751 2.532 2.286 2.079 1.863 1.648 1.433 1.225 1.074 0.912 0.656 0.476 0.316 0.234 0.038 -0.169 -0.402 -0.526 -0.882 -0.929 -1.074 -1.217 -1.547 -1.722 -1.91 -2.122 -2.358 -2.636 -2.998 -4.043 -4 ,32308 ,TETRA ,17589408,Sat Nov 27 17:09:33 CET,Sat Nov 27 19:25:06 CET,0.0 0.426 0.643 0.816 0.96 1.068 1.175 1.3 1.562 1.683 1.798 1.783 2.115 2.22 2.402 2.552 2.693 2.77 2.932 3.089 3.292 3.421 3.542 3.716 3.897 4.084 4.255 4.405 4.609 4.812 5.005 5.229 5.435 5.646 5.89 6.151 6.391 6.641 6.932 7.253 7.583 7.936 8.326 8.701 9.087 9.503 9.971 10.376 10.759 11.093 11.269 11.091 10.631 10.021 9.388 8.821 8.356 7.979 7.611 7.174 6.78 6.439 6.111 5.78 5.479 5.213 4.91 4.621 4.389 4.155 3.914 3.703 3.464 3.213 3.024 2.829 2.616 2.397 2.179 2.032 1.873 1.631 1.46 1.287 1.201 1.016 0.819 0.621 0.521 0.184 0.172 0.042 -0.087 -0.389 -0.551 -0.699 -0.863 -1.05 -1.268 -1.569 -2.657 -5 ,30995 ,TETRA ,17589409,Sat Nov 27 17:09:34 CET,Sat Nov 27 19:19:39 CET,0.0 0.515 0.755 0.975 1.161 1.333 1.497 1.637 1.867 1.988 2.1 2.072 2.399 2.494 2.669 2.822 2.984 3.066 3.209 3.343 3.548 3.673 3.79 3.971 4.144 4.311 4.46 4.605 4.801 4.979 5.138 5.316 5.51 5.704 5.906 6.131 6.349 6.567 6.803 7.065 7.331 7.643 8.003 8.357 8.758 9.194 9.65 10.069 10.482 10.828 10.979 10.685 10.15 9.498 8.947 8.459 7.949 7.433 6.951 6.441 5.994 5.625 5.282 4.955 4.673 4.39 4.044 3.74 3.483 3.228 2.975 2.765 2.545 2.302 2.109 1.903 1.689 1.471 1.245 1.09 0.926 0.671 0.495 0.312 0.21 0.012 -0.174 -0.377 -0.489 -0.839 -0.852 -0.974 -1.088 -1.341 -1.51 -1.688 -1.874 -2.104 -2.348 -2.669 -3.544 -6 ,30021 ,TETRA ,17589410,Sat Nov 27 17:09:34 CET,Sat Nov 27 19:27:17 CET,0.0 0.54 0.854 1.083 1.301 1.497 1.64 1.78 2.045 2.155 2.252 2.221 2.541 2.639 2.829 3.007 3.167 3.242 3.396 3.533 3.739 3.878 4.014 4.219 4.412 4.603 4.782 4.94 5.15 5.362 5.561 5.793 6.025 6.254 6.527 6.824 7.099 7.402 7.717 8.049 8.397 8.786 9.198 9.583 10.035 10.556 11.084 11.559 11.988 12.248 12.378 12.0 11.397 10.771 10.127 9.505 8.933 8.409 7.945 7.466 7.048 6.67 6.29 5.922 5.583 5.268 4.95 4.676 4.444 4.21 3.96 3.751 3.536 3.319 3.146 2.956 2.76 2.559 2.33 2.175 2.029 1.794 1.617 1.428 1.338 1.154 0.963 0.748 0.627 0.278 0.258 0.122 -0.021 -0.321 -0.477 -0.659 -0.869 -1.08 -1.321 -1.719 -2.828 -7 ,9273 ,TETRA ,17589411,Sat Nov 27 17:09:33 CET,Sat Nov 27 19:24:24 CET,0.0 0.312 0.508 0.672 0.845 0.998 1.135 1.267 1.508 1.622 1.741 1.757 2.089 2.19 2.398 2.616 2.799 2.878 3.033 3.178 3.388 3.531 3.662 3.836 4.021 4.209 4.384 4.548 4.749 4.948 5.152 5.407 5.65 5.876 6.128 6.417 6.707 6.997 7.272 7.54 7.815 8.132 8.505 8.909 9.355 9.802 10.312 10.808 11.273 11.673 11.906 11.69 11.275 10.804 10.324 9.875 9.456 9.005 8.578 8.163 7.792 7.444 7.087 6.723 6.396 6.131 5.863 5.604 5.367 5.127 4.858 4.616 4.366 4.114 3.921 3.724 3.526 3.317 3.085 2.917 2.748 2.486 2.304 2.117 2.019 1.832 1.644 1.452 1.34 0.986 0.996 0.895 0.784 0.52 0.364 0.206 0.026 -0.223 -0.482 -0.81 -1.952 -8 ,15613 ,TETRA ,17589412,Sat Nov 27 17:10:33 CET,Sat Nov 27 19:19:53 CET,0.0 0.426 0.711 0.913 1.084 1.242 1.409 1.587 1.872 1.993 2.104 2.078 2.408 2.505 2.675 2.839 3.004 3.083 3.246 3.401 3.614 3.75 3.879 4.062 4.248 4.419 4.571 4.728 4.928 5.121 5.308 5.527 5.755 5.976 6.206 6.469 6.71 6.973 7.292 7.647 8.015 8.409 8.866 9.289 9.72 10.156 10.634 11.114 11.534 11.816 11.922 11.639 11.044 10.414 9.76 9.113 8.538 7.991 7.521 7.055 6.629 6.254 5.89 5.503 5.152 4.822 4.44 4.129 3.891 3.618 3.303 3.041 2.77 2.48 2.26 2.043 1.808 1.567 1.333 1.171 0.988 0.715 0.536 0.336 0.221 -0.013 -0.244 -0.488 -0.607 -0.96 -1.003 -1.145 -1.287 -1.593 -1.758 -1.944 -2.14 -2.342 -2.595 -2.945 -3.658 -9 ,30518 ,TETRA ,17589413,Sat Nov 27 17:10:33 CET,Sat Nov 27 19:15:52 CET,0.0 0.988 1.353 1.622 1.821 2.015 2.194 2.343 2.589 2.703 2.811 2.792 3.118 3.222 3.404 3.568 3.75 3.829 3.961 4.113 4.331 4.46 4.597 4.802 4.997 5.188 5.363 5.528 5.764 5.99 6.198 6.456 6.696 6.909 7.12 7.348 7.583 7.839 8.174 8.554 8.869 9.188 9.581 9.987 10.427 10.835 11.278 11.76 12.236 12.69 12.895 12.511 11.827 11.138 10.465 9.756 9.103 8.499 7.974 7.454 7.019 6.632 6.268 5.927 5.601 5.283 4.955 4.676 4.442 4.211 3.977 3.762 3.514 3.26 3.063 2.849 2.627 2.408 2.179 2.014 1.835 1.545 1.358 1.172 1.072 0.877 0.684 0.484 0.376 0.037 0.033 -0.099 -0.244 -0.536 -0.707 -0.903 -1.095 -1.287 -1.533 -1.851 -2.606 -10 ,21914 ,TETRA ,17589414,Sat Nov 27 17:10:33 CET,Sat Nov 27 19:14:18 CET,0.0 0.484 0.82 1.038 1.186 1.342 1.498 1.622 1.89 2.027 2.143 2.136 2.463 2.565 2.75 2.93 3.108 3.194 3.35 3.505 3.73 3.866 4.007 4.224 4.426 4.62 4.81 4.99 5.226 5.436 5.626 5.88 6.14 6.374 6.628 6.89 7.138 7.404 7.689 8.019 8.357 8.721 9.134 9.495 9.857 10.242 10.658 11.129 11.708 12.244 12.603 12.426 11.847 11.166 10.457 9.848 9.35 8.886 8.492 8.064 7.68 7.337 7.003 6.679 6.371 6.094 5.813 5.571 5.36 5.128 4.87 4.652 4.427 4.194 4.018 3.828 3.618 3.415 3.216 3.072 2.911 2.658 2.475 2.281 2.192 2.014 1.814 1.586 1.474 1.132 1.125 0.997 0.875 0.583 0.418 0.257 0.089 -0.101 -0.327 -0.575 -1.212 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index 351e7a35..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8650 ,TETRA ,17589415,Sat Nov 27 17:10:34 CET,Sat Nov 27 19:28:47 CET,0.0 0.554 0.777 0.973 1.133 1.271 1.393 1.507 1.75 1.862 1.971 1.97 2.273 2.377 2.581 2.774 2.964 3.048 3.205 3.361 3.593 3.75 3.905 4.117 4.32 4.52 4.727 4.94 5.213 5.476 5.738 6.045 6.332 6.62 6.951 7.318 7.674 8.066 8.495 8.953 9.439 9.984 10.603 11.214 11.906 12.66 13.528 14.523 15.68 17.027 18.414 19.288 19.599 19.528 19.308 19.068 18.849 18.622 18.388 18.1 17.822 17.578 17.342 17.1 16.866 16.657 16.434 16.229 16.039 15.841 15.625 15.447 15.246 15.027 14.849 14.658 14.479 14.282 14.087 13.948 13.794 13.571 13.408 13.234 13.148 12.965 12.764 12.549 12.437 12.111 12.083 11.949 11.801 11.486 11.311 11.131 10.932 10.671 10.34 9.91 8.811 -2 ,2952 ,TETRA ,17589416,Sat Nov 27 17:10:34 CET,Sat Nov 27 19:28:14 CET,0.0 0.42 0.694 0.913 1.128 1.312 1.487 1.671 2.058 2.225 2.365 2.401 2.75 2.878 3.139 3.378 3.594 3.707 3.939 4.144 4.423 4.605 4.786 5.041 5.275 5.509 5.742 5.967 6.265 6.544 6.811 7.142 7.456 7.762 8.11 8.511 8.908 9.334 9.796 10.294 10.824 11.404 12.082 12.784 13.592 14.468 15.46 16.559 17.779 19.131 20.58 21.508 21.818 21.929 21.932 21.801 21.643 21.484 21.312 21.101 20.845 20.575 20.312 20.046 19.781 19.533 19.276 19.054 18.873 18.69 18.474 18.277 18.079 17.883 17.728 17.568 17.402 17.217 17.029 16.9 16.757 16.514 16.349 16.178 16.088 15.906 15.703 15.47 15.348 15.019 15.015 14.91 14.779 14.457 14.281 14.099 13.88 13.618 13.334 12.929 12.024 -3 ,13504 ,TETRA ,17589417,Sat Nov 27 17:10:33 CET,Sat Nov 27 19:27:24 CET,0.0 0.708 1.017 1.244 1.473 1.695 1.881 2.049 2.346 2.487 2.624 2.641 2.992 3.109 3.325 3.529 3.74 3.846 4.055 4.248 4.513 4.689 4.865 5.117 5.357 5.581 5.786 5.994 6.276 6.549 6.817 7.142 7.44 7.738 8.105 8.505 8.892 9.306 9.739 10.208 10.69 11.238 11.89 12.542 13.313 14.184 15.177 16.305 17.61 19.101 20.851 22.202 22.862 23.18 23.25 23.197 23.084 22.945 22.8 22.613 22.449 22.277 22.074 21.905 21.763 21.6 21.413 21.236 21.063 20.884 20.717 20.576 20.416 20.23 20.072 19.904 19.737 19.58 19.432 19.326 19.208 19.01 18.864 18.714 18.643 18.506 18.34 18.155 18.066 17.766 17.776 17.674 17.563 17.315 17.185 17.043 16.906 16.768 16.586 16.278 15.596 -4 ,17717 ,TETRA ,17589418,Sat Nov 27 17:10:34 CET,Sat Nov 27 19:25:01 CET,0.0 0.878 1.2 1.456 1.696 1.916 2.098 2.258 2.554 2.708 2.862 2.921 3.28 3.414 3.663 3.886 4.096 4.197 4.388 4.573 4.858 5.05 5.237 5.501 5.753 5.996 6.219 6.432 6.719 7.013 7.304 7.65 7.985 8.32 8.713 9.144 9.535 9.933 10.37 10.859 11.367 11.931 12.559 13.173 13.894 14.686 15.577 16.56 17.693 18.991 20.507 21.544 22.031 22.238 22.239 22.139 21.984 21.781 21.536 21.215 20.977 20.81 20.604 20.387 20.186 19.982 19.759 19.555 19.399 19.238 19.044 18.876 18.706 18.518 18.363 18.207 18.033 17.841 17.651 17.532 17.422 17.243 17.101 16.947 16.875 16.719 16.544 16.363 16.267 15.962 15.94 15.81 15.668 15.362 15.216 15.067 14.901 14.712 14.496 14.189 13.212 -5 ,28439 ,TETRA ,17589419,Sat Nov 27 17:10:34 CET,Sat Nov 27 19:29:12 CET,0.0 0.497 0.791 1.039 1.231 1.407 1.594 1.775 2.125 2.283 2.419 2.436 2.77 2.878 3.092 3.301 3.5 3.608 3.816 3.999 4.266 4.451 4.635 4.899 5.157 5.404 5.633 5.846 6.128 6.415 6.69 7.002 7.298 7.604 7.968 8.359 8.739 9.159 9.59 10.044 10.575 11.208 11.922 12.617 13.407 14.308 15.305 16.358 17.548 18.974 20.66 21.82 22.33 22.51 22.472 22.314 22.089 21.836 21.614 21.372 21.15 20.954 20.78 20.583 20.365 20.16 19.954 19.774 19.61 19.432 19.227 19.042 18.836 18.63 18.457 18.265 18.078 17.891 17.7 17.565 17.433 17.232 17.097 16.951 16.871 16.713 16.533 16.333 16.225 15.894 15.857 15.716 15.581 15.287 15.122 14.926 14.711 14.515 14.26 13.833 12.842 -6 ,21258 ,TETRA ,17589420,Sat Nov 27 17:10:34 CET,Sat Nov 27 19:27:30 CET,0.0 0.53 0.853 1.118 1.346 1.521 1.677 1.844 2.163 2.307 2.438 2.449 2.797 2.926 3.173 3.408 3.634 3.74 3.951 4.153 4.421 4.595 4.765 5.031 5.298 5.54 5.778 6.014 6.329 6.624 6.881 7.206 7.525 7.832 8.201 8.604 8.975 9.378 9.816 10.281 10.766 11.326 11.992 12.605 13.323 14.158 15.071 16.1 17.307 18.648 20.098 21.085 21.423 21.491 21.472 21.366 21.193 20.964 20.716 20.456 20.218 19.983 19.723 19.467 19.228 18.996 18.752 18.543 18.372 18.198 18.014 17.849 17.661 17.466 17.317 17.15 16.972 16.776 16.566 16.426 16.288 16.078 15.929 15.771 15.691 15.508 15.306 15.103 14.997 14.678 14.677 14.565 14.455 14.208 14.032 13.839 13.646 13.441 13.228 12.944 12.349 -7 ,25288 ,TETRA ,17589421,Sat Nov 27 17:10:34 CET,Sat Nov 27 19:11:06 CET,0.0 0.825 1.137 1.398 1.618 1.809 1.998 2.172 2.47 2.607 2.741 2.792 3.149 3.27 3.498 3.725 3.933 4.035 4.25 4.457 4.727 4.9 5.078 5.333 5.574 5.805 6.026 6.246 6.532 6.805 7.072 7.389 7.696 7.985 8.308 8.672 9.023 9.41 9.821 10.261 10.725 11.268 11.948 12.617 13.363 14.171 15.105 16.194 17.435 18.822 20.344 21.402 21.854 22.016 22.006 21.914 21.748 21.515 21.307 21.061 20.793 20.551 20.341 20.147 19.962 19.782 19.581 19.386 19.223 19.058 18.867 18.695 18.509 18.323 18.174 18.021 17.866 17.681 17.468 17.326 17.196 16.977 16.815 16.652 16.571 16.415 16.254 16.082 15.987 15.661 15.619 15.499 15.38 15.119 14.966 14.795 14.611 14.376 14.109 13.811 12.655 -8 ,18420 ,TETRA ,17589422,Sat Nov 27 17:10:34 CET,Sat Nov 27 19:30:07 CET,0.0 0.637 0.938 1.186 1.361 1.514 1.679 1.832 2.111 2.239 2.376 2.438 2.794 2.928 3.183 3.419 3.643 3.751 3.966 4.175 4.456 4.629 4.796 5.043 5.294 5.542 5.769 5.972 6.223 6.497 6.799 7.164 7.503 7.842 8.259 8.71 9.101 9.516 9.964 10.436 10.931 11.471 12.066 12.687 13.413 14.169 15.073 16.086 17.172 18.406 19.838 20.847 21.239 21.297 21.314 21.255 21.062 20.839 20.604 20.352 20.144 19.912 19.677 19.471 19.276 19.073 18.851 18.666 18.502 18.325 18.133 17.97 17.786 17.591 17.436 17.268 17.097 16.93 16.744 16.609 16.469 16.252 16.11 15.935 15.834 15.643 15.464 15.289 15.185 14.859 14.849 14.728 14.597 14.305 14.147 13.979 13.801 13.586 13.336 13.048 12.31 -9 ,19447 ,TETRA ,17589423,Sat Nov 27 17:10:34 CET,Sat Nov 27 19:17:26 CET,0.0 0.708 1.124 1.449 1.666 1.844 2.025 2.209 2.556 2.716 2.859 2.913 3.28 3.409 3.657 3.915 4.152 4.265 4.505 4.734 5.059 5.258 5.437 5.699 5.959 6.2 6.447 6.706 7.022 7.324 7.611 7.959 8.311 8.647 9.034 9.46 9.851 10.275 10.73 11.231 11.754 12.314 12.964 13.608 14.336 15.162 16.122 17.189 18.453 19.815 21.284 22.401 22.955 23.162 23.149 23.078 22.94 22.734 22.497 22.212 21.952 21.704 21.468 21.26 21.067 20.882 20.688 20.502 20.331 20.144 19.952 19.793 19.624 19.42 19.253 19.094 18.939 18.766 18.574 18.463 18.346 18.139 17.992 17.843 17.766 17.601 17.424 17.217 17.107 16.788 16.776 16.66 16.544 16.253 16.082 15.914 15.698 15.474 15.251 14.918 14.206 -10 ,21723 ,TETRA ,17589424,Sat Nov 27 17:10:34 CET,Sat Nov 27 19:29:19 CET,0.0 1.021 1.318 1.561 1.767 1.969 2.161 2.324 2.644 2.8 2.955 3.01 3.357 3.47 3.683 3.892 4.09 4.179 4.345 4.515 4.765 4.922 5.093 5.349 5.585 5.803 6.016 6.227 6.495 6.749 7.002 7.329 7.634 7.916 8.241 8.594 8.947 9.346 9.753 10.188 10.66 11.173 11.75 12.326 13.027 13.829 14.741 15.744 16.907 18.242 19.687 20.73 21.172 21.272 21.251 21.124 20.952 20.825 20.661 20.394 20.132 19.914 19.69 19.465 19.249 19.047 18.84 18.656 18.495 18.319 18.131 17.97 17.803 17.641 17.507 17.352 17.182 17.007 16.829 16.699 16.56 16.345 16.182 16.004 15.916 15.741 15.575 15.406 15.305 14.989 14.991 14.867 14.727 14.444 14.293 14.12 13.932 13.706 13.439 13.121 12.333 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt deleted file mode 100644 index f0210d94..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18474 ,TETRA ,17589425,Sat Nov 27 17:11:34 CET,Sat Nov 27 19:23:17 CET,0.0 1.044 1.388 1.682 1.936 2.162 2.372 2.551 2.845 2.963 3.073 2.98 3.37 3.473 3.669 3.84 4.005 4.083 4.227 4.377 4.607 4.742 4.868 5.057 5.23 5.388 5.538 5.683 5.878 6.067 6.229 6.419 6.599 6.768 6.958 7.166 7.366 7.576 7.784 7.992 8.215 8.464 8.727 8.973 9.212 9.427 9.629 9.71 9.651 9.363 8.491 7.122 5.991 5.025 4.123 3.24 2.457 1.817 1.304 0.792 0.309 -0.146 -0.539 -0.926 -1.324 -1.678 -2.055 -2.39 -2.656 -2.919 -3.208 -3.46 -3.735 -4.03 -4.264 -4.497 -4.722 -4.961 -5.216 -5.406 -5.606 -5.905 -6.126 -6.363 -6.481 -6.736 -6.995 -7.265 -7.404 -7.844 -7.827 -7.979 -8.139 -8.49 -8.684 -8.885 -9.101 -9.326 -9.57 -9.894 -10.693 -2 ,29308 ,TETRA ,17589426,Sat Nov 27 17:11:34 CET,Sat Nov 27 19:28:57 CET,0.0 0.802 1.052 1.22 1.394 1.546 1.685 1.815 2.064 2.181 2.287 2.203 2.609 2.712 2.903 3.068 3.194 3.256 3.394 3.534 3.74 3.869 3.981 4.142 4.296 4.455 4.603 4.742 4.93 5.11 5.291 5.491 5.655 5.825 6.019 6.22 6.416 6.634 6.841 7.066 7.32 7.555 7.801 7.99 8.136 8.243 8.325 8.348 8.258 7.946 7.096 5.868 4.723 3.698 2.793 1.988 1.244 0.555 -0.036 -0.625 -1.135 -1.592 -2.017 -2.438 -2.831 -3.151 -3.464 -3.781 -4.093 -4.424 -4.76 -5.026 -5.29 -5.566 -5.79 -6.028 -6.272 -6.535 -6.812 -6.999 -7.196 -7.501 -7.702 -7.916 -8.035 -8.264 -8.495 -8.733 -8.847 -9.271 -9.224 -9.361 -9.491 -9.793 -9.957 -10.121 -10.305 -10.528 -10.777 -11.172 -12.204 -3 ,3155 ,TETRA ,17589427,Sat Nov 27 17:11:36 CET,Sat Nov 27 19:29:40 CET,0.0 0.875 1.18 1.39 1.54 1.672 1.845 2.007 2.253 2.385 2.517 2.427 2.823 2.915 3.093 3.269 3.431 3.511 3.666 3.815 4.027 4.16 4.291 4.473 4.645 4.802 4.933 5.07 5.255 5.422 5.583 5.79 5.994 6.204 6.44 6.673 6.877 7.09 7.313 7.543 7.785 8.011 8.238 8.47 8.739 8.998 9.209 9.327 9.259 8.896 8.112 6.883 5.662 4.535 3.528 2.657 1.864 1.158 0.58 0.006 -0.469 -0.891 -1.307 -1.703 -2.067 -2.42 -2.8 -3.124 -3.414 -3.719 -4.033 -4.298 -4.565 -4.845 -5.056 -5.274 -5.519 -5.775 -6.027 -6.201 -6.379 -6.676 -6.886 -7.094 -7.196 -7.39 -7.605 -7.844 -7.963 -8.399 -8.38 -8.522 -8.674 -8.998 -9.172 -9.358 -9.579 -9.845 -10.157 -10.52 -11.764 -4 ,29698 ,TETRA ,17589428,Sat Nov 27 17:11:36 CET,Sat Nov 27 19:28:27 CET,0.0 0.646 0.969 1.231 1.43 1.613 1.774 1.919 2.204 2.343 2.458 2.361 2.745 2.849 3.04 3.21 3.38 3.463 3.627 3.784 3.997 4.125 4.256 4.45 4.62 4.775 4.928 5.08 5.276 5.468 5.641 5.824 6.009 6.19 6.385 6.608 6.823 7.062 7.308 7.54 7.769 8.029 8.333 8.634 8.936 9.216 9.467 9.617 9.664 9.542 9.05 8.121 7.197 6.215 5.289 4.44 3.662 2.976 2.362 1.739 1.216 0.73 0.266 -0.176 -0.591 -0.945 -1.314 -1.634 -1.89 -2.162 -2.456 -2.701 -2.963 -3.24 -3.458 -3.682 -3.912 -4.157 -4.409 -4.588 -4.776 -5.07 -5.284 -5.52 -5.642 -5.877 -6.134 -6.428 -6.583 -7.04 -7.041 -7.196 -7.362 -7.729 -7.926 -8.152 -8.395 -8.648 -8.936 -9.268 -9.989 -5 ,30541 ,TETRA ,17589429,Sat Nov 27 17:11:37 CET,Sat Nov 27 19:29:11 CET,0.0 0.692 1.055 1.332 1.579 1.817 2.007 2.175 2.516 2.671 2.814 2.766 3.172 3.278 3.504 3.706 3.882 3.963 4.119 4.278 4.508 4.664 4.807 4.991 5.165 5.333 5.501 5.637 5.789 5.947 6.119 6.335 6.509 6.661 6.853 7.059 7.232 7.404 7.584 7.774 7.978 8.221 8.494 8.755 9.004 9.211 9.383 9.477 9.405 9.046 8.206 7.037 5.982 4.962 3.981 3.071 2.302 1.609 1.005 0.415 -0.083 -0.522 -0.938 -1.324 -1.693 -2.034 -2.382 -2.685 -2.949 -3.239 -3.546 -3.803 -4.054 -4.308 -4.51 -4.721 -4.933 -5.148 -5.374 -5.531 -5.701 -5.974 -6.161 -6.35 -6.447 -6.644 -6.845 -7.061 -7.179 -7.601 -7.529 -7.646 -7.784 -8.118 -8.294 -8.457 -8.624 -8.865 -9.2 -9.579 -10.517 -6 ,6866 ,TETRA ,17589430,Sat Nov 27 17:11:37 CET,Sat Nov 27 19:30:13 CET,0.0 0.667 0.972 1.21 1.427 1.607 1.785 1.938 2.202 2.323 2.444 2.391 2.804 2.91 3.119 3.311 3.481 3.562 3.722 3.874 4.088 4.214 4.336 4.529 4.72 4.895 5.061 5.232 5.442 5.63 5.813 6.034 6.243 6.431 6.66 6.937 7.178 7.428 7.696 7.974 8.238 8.513 8.832 9.113 9.417 9.775 10.095 10.297 10.386 10.293 9.769 8.717 7.639 6.567 5.563 4.638 3.829 3.135 2.562 1.984 1.475 1.02 0.594 0.204 -0.183 -0.538 -0.891 -1.213 -1.474 -1.748 -2.062 -2.319 -2.582 -2.862 -3.078 -3.304 -3.532 -3.783 -4.059 -4.246 -4.438 -4.73 -4.94 -5.158 -5.264 -5.469 -5.673 -5.909 -6.034 -6.456 -6.413 -6.561 -6.725 -7.105 -7.289 -7.458 -7.662 -7.922 -8.191 -8.579 -9.627 -7 ,19760 ,TETRA ,17589431,Sat Nov 27 17:11:36 CET,Sat Nov 27 19:30:16 CET,0.0 0.659 0.994 1.268 1.484 1.67 1.829 1.97 2.226 2.333 2.438 2.357 2.751 2.848 3.042 3.224 3.39 3.469 3.623 3.77 3.963 4.08 4.202 4.385 4.546 4.705 4.85 4.983 5.167 5.345 5.509 5.702 5.89 6.078 6.29 6.492 6.687 6.921 7.148 7.384 7.642 7.921 8.208 8.432 8.682 8.934 9.126 9.21 9.095 8.731 8.019 6.948 5.797 4.739 3.866 3.071 2.348 1.688 1.105 0.529 0.052 -0.357 -0.762 -1.172 -1.578 -1.944 -2.294 -2.613 -2.905 -3.208 -3.508 -3.748 -4.003 -4.257 -4.449 -4.654 -4.869 -5.094 -5.339 -5.501 -5.655 -5.901 -6.093 -6.295 -6.387 -6.571 -6.755 -6.938 -7.042 -7.458 -7.389 -7.506 -7.615 -7.856 -7.996 -8.156 -8.361 -8.59 -8.805 -9.054 -9.618 -8 ,1222 ,TETRA ,17589432,Sat Nov 27 17:11:38 CET,Sat Nov 27 19:29:48 CET,0.0 0.57 0.842 1.026 1.205 1.371 1.517 1.642 1.862 1.975 2.087 2.018 2.423 2.524 2.698 2.864 3.027 3.105 3.261 3.406 3.594 3.706 3.823 4.003 4.181 4.348 4.502 4.641 4.825 4.998 5.146 5.335 5.529 5.709 5.905 6.117 6.321 6.544 6.745 6.957 7.2 7.428 7.643 7.873 8.143 8.346 8.437 8.423 8.332 8.092 7.416 6.23 5.081 4.068 3.182 2.372 1.653 1.002 0.429 -0.132 -0.613 -1.049 -1.471 -1.876 -2.241 -2.574 -2.957 -3.323 -3.633 -3.943 -4.268 -4.525 -4.776 -5.042 -5.255 -5.474 -5.698 -5.935 -6.192 -6.365 -6.529 -6.784 -6.96 -7.154 -7.257 -7.466 -7.678 -7.895 -8.005 -8.422 -8.378 -8.523 -8.675 -9.016 -9.2 -9.396 -9.61 -9.854 -10.166 -10.539 -11.272 -9 ,22221 ,TETRA ,17589433,Sat Nov 27 17:11:36 CET,Sat Nov 27 19:23:08 CET,0.0 0.843 1.208 1.505 1.739 1.917 2.08 2.23 2.538 2.686 2.822 2.776 3.189 3.305 3.522 3.717 3.907 3.994 4.16 4.32 4.54 4.682 4.829 5.032 5.208 5.387 5.556 5.698 5.877 6.062 6.235 6.446 6.638 6.802 6.986 7.171 7.371 7.602 7.829 8.05 8.251 8.455 8.685 8.919 9.169 9.398 9.596 9.757 9.767 9.461 8.684 7.513 6.316 5.211 4.273 3.436 2.709 2.057 1.441 0.758 0.151 -0.364 -0.84 -1.312 -1.763 -2.149 -2.553 -2.924 -3.227 -3.54 -3.863 -4.143 -4.449 -4.755 -4.991 -5.226 -5.455 -5.712 -5.974 -6.141 -6.31 -6.587 -6.799 -7.003 -7.107 -7.327 -7.564 -7.803 -7.924 -8.358 -8.314 -8.454 -8.601 -8.913 -9.082 -9.267 -9.475 -9.738 -10.019 -10.267 -11.041 -10 ,22764 ,TETRA ,17589434,Sat Nov 27 17:11:36 CET,Sat Nov 27 19:26:04 CET,0.0 0.718 1.011 1.29 1.547 1.765 1.94 2.085 2.36 2.485 2.609 2.538 2.949 3.054 3.234 3.426 3.612 3.693 3.843 3.984 4.173 4.309 4.451 4.632 4.792 4.93 5.054 5.193 5.372 5.551 5.727 5.92 6.097 6.25 6.422 6.63 6.831 7.033 7.226 7.439 7.649 7.837 8.032 8.196 8.343 8.541 8.741 8.819 8.821 8.589 7.872 6.769 5.63 4.556 3.57 2.658 1.882 1.202 0.621 0.068 -0.402 -0.839 -1.256 -1.652 -2.014 -2.339 -2.685 -3.008 -3.285 -3.56 -3.846 -4.092 -4.345 -4.591 -4.765 -4.956 -5.176 -5.408 -5.659 -5.823 -5.988 -6.244 -6.422 -6.614 -6.714 -6.909 -7.116 -7.328 -7.437 -7.859 -7.807 -7.952 -8.091 -8.381 -8.554 -8.741 -8.923 -9.132 -9.378 -9.724 -10.742 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt deleted file mode 100644 index 297867da..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16834 ,TETRA ,17589435,Sat Nov 27 17:11:37 CET,Sat Nov 27 19:23:31 CET,0.0 0.57 0.903 1.179 1.423 1.661 1.889 2.103 2.54 2.741 2.918 2.972 3.458 3.627 3.941 4.254 4.564 4.717 5.021 5.307 5.751 6.06 6.358 6.781 7.184 7.578 7.966 8.358 8.88 9.39 9.884 10.493 11.086 11.658 12.339 13.125 13.89 14.757 15.743 16.817 17.945 19.278 20.898 22.542 24.476 26.715 29.401 32.59 36.624 41.759 48.642 55.13 59.463 62.627 64.967 66.76 68.154 69.277 70.154 70.97 71.591 72.095 72.539 72.93 73.268 73.525 73.756 73.956 74.116 74.27 74.41 74.509 74.603 74.691 74.753 74.796 74.822 74.856 74.888 74.9 74.897 74.889 74.888 74.883 74.879 74.871 74.84 74.794 74.774 74.511 74.671 74.634 74.601 74.507 74.447 74.392 74.314 74.182 73.989 73.712 72.871 -2 ,17246 ,TETRA ,17589436,Sat Nov 27 17:11:36 CET,Sat Nov 27 19:24:57 CET,0.0 0.681 1.096 1.422 1.712 1.966 2.212 2.461 2.917 3.122 3.32 3.404 3.909 4.1 4.451 4.789 5.12 5.279 5.587 5.896 6.352 6.643 6.935 7.377 7.803 8.213 8.618 9.016 9.534 10.031 10.498 11.081 11.667 12.243 12.949 13.778 14.579 15.47 16.449 17.488 18.582 19.876 21.418 22.995 24.927 27.199 29.968 33.25 37.298 42.432 49.367 55.988 60.41 63.574 65.928 67.775 69.223 70.381 71.271 72.067 72.688 73.185 73.609 73.974 74.283 74.553 74.829 75.052 75.223 75.374 75.515 75.634 75.751 75.85 75.921 75.989 76.048 76.094 76.133 76.154 76.175 76.207 76.206 76.183 76.172 76.158 76.134 76.09 76.062 75.799 75.979 75.938 75.894 75.8 75.737 75.65 75.532 75.4 75.27 75.097 74.629 -3 ,24806 ,TETRA ,17589437,Sat Nov 27 17:11:37 CET,Sat Nov 27 19:25:09 CET,0.0 0.603 0.925 1.2 1.443 1.679 1.915 2.139 2.545 2.734 2.923 3.0 3.476 3.64 3.992 4.352 4.701 4.871 5.202 5.524 5.963 6.247 6.537 6.976 7.409 7.826 8.233 8.634 9.156 9.669 10.169 10.762 11.338 11.913 12.6 13.384 14.143 15.002 15.953 16.964 18.043 19.321 20.9 22.532 24.49 26.775 29.509 32.714 36.689 41.79 48.722 55.264 59.62 62.724 65.031 66.881 68.337 69.511 70.403 71.202 71.841 72.365 72.82 73.201 73.52 73.793 74.052 74.264 74.435 74.591 74.738 74.84 74.932 75.033 75.102 75.167 75.231 75.283 75.328 75.351 75.37 75.396 75.407 75.419 75.421 75.403 75.378 75.356 75.349 75.101 75.306 75.282 75.247 75.16 75.109 75.046 74.96 74.853 74.726 74.519 74.212 -4 ,29637 ,TETRA ,17589438,Sat Nov 27 17:12:33 CET,Sat Nov 27 19:30:39 CET,0.0 0.505 0.889 1.198 1.48 1.754 2.031 2.278 2.715 2.928 3.13 3.237 3.745 3.95 4.342 4.699 5.045 5.21 5.524 5.837 6.286 6.571 6.861 7.295 7.709 8.112 8.504 8.883 9.394 9.899 10.399 11.021 11.628 12.225 12.941 13.758 14.545 15.426 16.383 17.396 18.496 19.787 21.353 22.976 24.929 27.207 29.924 33.168 37.255 42.506 49.58 56.194 60.514 63.652 66.038 67.861 69.25 70.378 71.257 72.055 72.688 73.203 73.662 74.041 74.332 74.582 74.83 75.039 75.2 75.342 75.485 75.6 75.71 75.806 75.873 75.936 75.994 76.038 76.066 76.083 76.106 76.127 76.121 76.117 76.116 76.109 76.086 76.056 76.043 75.789 75.973 75.946 75.914 75.797 75.723 75.634 75.528 75.42 75.266 75.05 74.585 -5 ,17763 ,TETRA ,17589439,Sat Nov 27 17:12:33 CET,Sat Nov 27 19:32:55 CET,0.0 0.838 1.261 1.597 1.895 2.173 2.444 2.706 3.209 3.453 3.69 3.819 4.326 4.525 4.937 5.317 5.665 5.835 6.164 6.504 7.007 7.332 7.673 8.158 8.615 9.079 9.535 9.982 10.588 11.186 11.74 12.396 13.055 13.71 14.464 15.307 16.119 17.023 18.019 19.106 20.276 21.614 23.174 24.768 26.734 29.045 31.82 35.126 39.276 44.577 51.696 58.38 62.838 66.009 68.323 70.099 71.456 72.564 73.434 74.207 74.81 75.317 75.773 76.162 76.475 76.74 76.992 77.198 77.366 77.523 77.667 77.77 77.861 77.935 77.98 78.018 78.054 78.079 78.103 78.115 78.122 78.129 78.122 78.102 78.088 78.053 78.019 77.98 77.955 77.701 77.871 77.83 77.788 77.679 77.607 77.533 77.433 77.302 77.172 77.005 76.627 -6 ,31114 ,TETRA ,17589440,Sat Nov 27 17:12:36 CET,Sat Nov 27 19:32:08 CET,0.0 0.741 1.141 1.453 1.738 2.024 2.284 2.523 2.983 3.206 3.426 3.547 4.042 4.235 4.605 4.948 5.283 5.451 5.795 6.135 6.612 6.904 7.189 7.619 8.034 8.43 8.83 9.242 9.79 10.329 10.835 11.425 12.007 12.596 13.274 14.036 14.792 15.635 16.562 17.572 18.656 19.911 21.438 23.026 24.942 27.19 29.914 33.156 37.196 42.298 49.194 55.766 60.135 63.3 65.682 67.524 68.945 70.106 71.004 71.795 72.405 72.905 73.342 73.742 74.083 74.357 74.628 74.831 74.986 75.14 75.275 75.373 75.465 75.554 75.627 75.688 75.738 75.787 75.829 75.851 75.859 75.866 75.861 75.841 75.833 75.822 75.805 75.786 75.776 75.527 75.702 75.672 75.639 75.554 75.486 75.418 75.346 75.248 75.123 74.941 74.436 -7 ,12363 ,TETRA ,17589441,Sat Nov 27 17:12:33 CET,Sat Nov 27 19:33:28 CET,0.0 1.483 1.937 2.276 2.567 2.838 3.113 3.368 3.859 4.09 4.301 4.394 4.89 5.076 5.444 5.807 6.157 6.329 6.654 6.951 7.387 7.684 7.977 8.406 8.845 9.298 9.737 10.151 10.698 11.242 11.762 12.4 13.026 13.639 14.351 15.155 15.927 16.794 17.756 18.803 19.933 21.243 22.812 24.417 26.362 28.646 31.412 34.676 38.716 43.883 50.863 57.334 61.647 64.791 67.117 68.899 70.252 71.374 72.265 73.062 73.682 74.174 74.597 74.961 75.273 75.53 75.781 75.997 76.166 76.333 76.49 76.611 76.73 76.835 76.886 76.92 76.956 76.984 77.004 77.01 77.01 77.009 76.998 76.974 76.961 76.925 76.875 76.845 76.829 76.56 76.692 76.639 76.589 76.45 76.38 76.287 76.152 76.007 75.849 75.668 75.146 -8 ,7724 ,TETRA ,17589442,Sat Nov 27 17:12:33 CET,Sat Nov 27 19:33:01 CET,0.0 0.827 1.222 1.527 1.789 2.047 2.28 2.515 2.97 3.163 3.346 3.395 3.873 4.034 4.343 4.66 4.978 5.134 5.44 5.741 6.186 6.478 6.767 7.182 7.597 8.004 8.378 8.744 9.232 9.723 10.206 10.789 11.365 11.936 12.596 13.353 14.14 15.031 15.986 17.019 18.132 19.424 21.003 22.665 24.686 26.992 29.707 32.953 37.08 42.321 49.221 55.69 60.083 63.241 65.585 67.445 68.9 70.099 71.039 71.864 72.498 73.014 73.465 73.861 74.178 74.449 74.722 74.935 75.093 75.229 75.346 75.441 75.531 75.604 75.662 75.721 75.772 75.809 75.84 75.854 75.865 75.878 75.873 75.855 75.84 75.816 75.796 75.74 75.707 75.445 75.612 75.577 75.539 75.426 75.35 75.251 75.16 75.077 74.932 74.751 74.345 -9 ,32040 ,TETRA ,17589443,Sat Nov 27 17:12:34 CET,Sat Nov 27 19:32:56 CET,0.0 0.636 1.083 1.446 1.739 1.995 2.232 2.46 2.876 3.068 3.261 3.354 3.848 4.049 4.431 4.8 5.157 5.318 5.639 5.972 6.473 6.796 7.118 7.588 8.03 8.45 8.85 9.231 9.746 10.274 10.778 11.37 11.939 12.517 13.217 14.01 14.775 15.625 16.556 17.579 18.697 19.988 21.549 23.165 25.112 27.387 30.122 33.35 37.396 42.577 49.525 56.146 60.617 63.816 66.181 67.997 69.385 70.495 71.374 72.185 72.824 73.355 73.829 74.244 74.583 74.849 75.101 75.318 75.486 75.635 75.785 75.896 75.986 76.069 76.129 76.18 76.226 76.281 76.324 76.337 76.349 76.366 76.372 76.365 76.359 76.347 76.327 76.305 76.289 76.021 76.202 76.165 76.121 76.002 75.907 75.821 75.727 75.588 75.418 75.236 74.885 -10 ,15072 ,TETRA ,17589444,Sat Nov 27 17:12:35 CET,Sat Nov 27 19:33:22 CET,0.0 0.589 0.938 1.231 1.479 1.72 1.972 2.203 2.612 2.801 2.983 3.024 3.511 3.684 4.004 4.329 4.654 4.814 5.13 5.434 5.876 6.161 6.448 6.88 7.317 7.745 8.138 8.511 9.007 9.498 9.989 10.587 11.16 11.729 12.398 13.162 13.925 14.798 15.767 16.807 17.921 19.194 20.745 22.395 24.372 26.657 29.421 32.679 36.712 41.825 48.778 55.419 59.859 63.084 65.442 67.228 68.644 69.798 70.698 71.527 72.159 72.677 73.151 73.558 73.872 74.13 74.4 74.617 74.786 74.952 75.105 75.201 75.277 75.345 75.39 75.442 75.49 75.54 75.577 75.594 75.612 75.632 75.646 75.654 75.649 75.634 75.624 75.594 75.567 75.304 75.488 75.455 75.424 75.336 75.265 75.186 75.103 75.021 74.932 74.814 74.558 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt deleted file mode 100644 index d8f78269..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14729 ,TETRA ,17589445,Sat Nov 27 17:12:37 CET,Sat Nov 27 19:22:39 CET,0.0 0.582 0.921 1.161 1.421 1.664 1.894 2.135 2.563 2.757 2.943 2.982 3.455 3.622 3.954 4.278 4.588 4.743 5.059 5.373 5.822 6.108 6.395 6.823 7.245 7.669 8.085 8.489 9.012 9.531 10.036 10.66 11.277 11.877 12.585 13.392 14.171 15.045 16.035 17.115 18.287 19.628 21.228 22.911 24.929 27.301 30.201 33.653 37.963 43.432 50.839 57.834 62.474 65.903 68.485 70.506 72.094 73.388 74.375 75.271 75.992 76.579 77.094 77.531 77.906 78.219 78.514 78.764 78.965 79.166 79.351 79.483 79.608 79.712 79.78 79.84 79.898 79.949 79.988 80.011 80.037 80.073 80.081 80.073 80.064 80.04 80.001 79.94 79.909 79.646 79.801 79.747 79.684 79.524 79.427 79.32 79.186 78.998 78.77 78.511 77.897 -2 ,12035 ,TETRA ,17589446,Sat Nov 27 17:12:35 CET,Sat Nov 27 19:31:39 CET,0.0 0.49 0.813 1.109 1.361 1.587 1.813 2.034 2.468 2.668 2.857 2.92 3.401 3.582 3.922 4.26 4.601 4.765 5.09 5.398 5.834 6.116 6.394 6.806 7.222 7.621 8.023 8.427 8.937 9.447 9.948 10.558 11.164 11.77 12.492 13.312 14.111 15.019 16.03 17.131 18.336 19.716 21.361 23.056 25.078 27.426 30.29 33.753 38.069 43.543 50.896 57.831 62.567 66.014 68.537 70.52 72.063 73.326 74.322 75.224 75.919 76.466 76.942 77.367 77.735 78.032 78.312 78.553 78.748 78.92 79.076 79.192 79.301 79.385 79.435 79.484 79.527 79.57 79.604 79.621 79.627 79.615 79.603 79.594 79.581 79.555 79.54 79.51 79.485 79.225 79.403 79.354 79.301 79.147 79.047 78.95 78.84 78.715 78.563 78.354 78.065 -3 ,6466 ,TETRA ,17589447,Sat Nov 27 17:12:35 CET,Sat Nov 27 19:21:06 CET,0.0 0.9 1.262 1.558 1.787 2.014 2.229 2.423 2.822 3.02 3.211 3.278 3.757 3.931 4.275 4.617 4.936 5.086 5.378 5.668 6.107 6.395 6.68 7.102 7.511 7.908 8.307 8.702 9.216 9.713 10.207 10.817 11.411 11.997 12.693 13.507 14.333 15.269 16.284 17.369 18.562 19.961 21.646 23.389 25.474 27.863 30.71 34.146 38.516 44.126 51.696 58.81 63.43 66.758 69.26 71.208 72.753 74.008 74.986 75.843 76.509 77.072 77.568 78.01 78.382 78.674 78.944 79.16 79.326 79.491 79.645 79.76 79.858 79.938 79.981 80.024 80.084 80.123 80.133 80.139 80.142 80.115 80.087 80.064 80.049 80.016 79.963 79.906 79.883 79.613 79.732 79.662 79.594 79.446 79.368 79.278 79.166 79.041 78.898 78.727 78.143 -4 ,31522 ,TETRA ,17589448,Sat Nov 27 17:12:35 CET,Sat Nov 27 19:33:57 CET,0.0 0.677 0.976 1.235 1.481 1.689 1.902 2.106 2.494 2.695 2.892 2.942 3.411 3.571 3.895 4.207 4.525 4.687 4.99 5.279 5.71 5.992 6.267 6.669 7.068 7.474 7.871 8.257 8.765 9.264 9.763 10.401 11.038 11.647 12.367 13.18 13.971 14.883 15.88 16.97 18.154 19.519 21.161 22.893 24.995 27.388 30.252 33.654 37.892 43.343 50.771 57.786 62.462 65.889 68.44 70.403 71.921 73.172 74.169 75.071 75.792 76.375 76.875 77.326 77.709 78.025 78.328 78.568 78.765 78.954 79.141 79.293 79.438 79.571 79.657 79.734 79.807 79.869 79.917 79.948 79.97 79.99 79.995 79.988 79.982 79.966 79.946 79.904 79.871 79.617 79.769 79.716 79.666 79.543 79.459 79.361 79.255 79.139 78.994 78.747 77.907 -5 ,19582 ,TETRA ,17589449,Sat Nov 27 17:12:35 CET,Sat Nov 27 19:30:22 CET,0.0 0.598 0.96 1.296 1.589 1.867 2.118 2.339 2.763 2.963 3.17 3.266 3.754 3.929 4.274 4.62 4.961 5.122 5.433 5.741 6.211 6.517 6.812 7.264 7.723 8.15 8.556 8.958 9.48 10.0 10.517 11.148 11.757 12.364 13.086 13.907 14.701 15.601 16.605 17.684 18.849 20.219 21.88 23.583 25.628 28.018 30.955 34.5 38.871 44.397 51.83 58.823 63.512 66.919 69.454 71.423 72.951 74.211 75.165 76.029 76.703 77.228 77.702 78.104 78.426 78.706 78.972 79.188 79.36 79.517 79.668 79.767 79.861 79.957 80.023 80.065 80.101 80.141 80.173 80.183 80.181 80.175 80.17 80.154 80.143 80.131 80.098 80.021 79.981 79.714 79.845 79.789 79.734 79.544 79.42 79.29 79.151 78.974 78.779 78.503 77.89 -6 ,12469 ,TETRA ,17589450,Sat Nov 27 17:12:35 CET,Sat Nov 27 19:29:17 CET,0.0 0.643 0.904 1.17 1.458 1.72 1.947 2.171 2.586 2.771 2.956 3.013 3.49 3.665 4.028 4.37 4.69 4.85 5.184 5.52 5.984 6.279 6.575 6.996 7.403 7.808 8.218 8.623 9.147 9.663 10.164 10.77 11.362 11.953 12.676 13.522 14.334 15.227 16.213 17.301 18.466 19.812 21.479 23.238 25.324 27.717 30.572 33.974 38.304 43.854 51.358 58.427 63.185 66.627 69.156 71.123 72.645 73.892 74.861 75.73 76.417 76.968 77.447 77.868 78.236 78.542 78.811 79.033 79.224 79.412 79.594 79.732 79.866 79.991 80.077 80.149 80.21 80.261 80.308 80.33 80.336 80.338 80.334 80.316 80.304 80.288 80.27 80.245 80.223 79.958 80.094 80.045 79.993 79.898 79.849 79.789 79.707 79.579 79.397 79.147 78.385 -7 ,11340 ,TETRA ,17589451,Sat Nov 27 17:12:34 CET,Sat Nov 27 19:20:25 CET,0.0 0.464 0.857 1.131 1.393 1.645 1.857 2.066 2.481 2.68 2.876 2.937 3.422 3.598 3.949 4.277 4.598 4.758 5.067 5.374 5.832 6.135 6.434 6.867 7.275 7.682 8.085 8.482 9.028 9.55 10.052 10.678 11.298 11.922 12.651 13.458 14.234 15.104 16.076 17.126 18.272 19.624 21.233 22.894 24.936 27.383 30.37 33.89 38.262 43.845 51.273 58.3 63.025 66.418 68.944 70.913 72.434 73.657 74.639 75.519 76.204 76.782 77.282 77.713 78.091 78.404 78.693 78.938 79.126 79.303 79.466 79.579 79.687 79.796 79.861 79.925 80.003 80.058 80.097 80.122 80.149 80.169 80.163 80.164 80.164 80.148 80.124 80.103 80.082 79.819 80.015 79.995 79.965 79.838 79.76 79.692 79.626 79.535 79.414 79.248 78.859 -8 ,2535 ,TETRA ,17589452,Sat Nov 27 17:12:35 CET,Sat Nov 27 19:28:58 CET,0.0 0.671 1.008 1.305 1.577 1.818 2.042 2.265 2.692 2.877 3.045 3.087 3.56 3.72 4.041 4.374 4.704 4.868 5.184 5.498 5.944 6.222 6.497 6.908 7.316 7.714 8.106 8.508 9.037 9.545 10.047 10.647 11.233 11.814 12.501 13.294 14.071 14.951 15.943 17.016 18.184 19.553 21.209 22.913 24.982 27.451 30.419 33.931 38.3 43.854 51.425 58.62 63.45 66.929 69.478 71.458 73.001 74.259 75.234 76.134 76.868 77.45 77.944 78.374 78.748 79.064 79.363 79.61 79.799 79.973 80.133 80.254 80.375 80.475 80.529 80.581 80.624 80.659 80.703 80.725 80.737 80.74 80.737 80.737 80.731 80.693 80.641 80.57 80.539 80.287 80.473 80.437 80.406 80.31 80.239 80.179 80.094 79.974 79.851 79.668 79.101 -9 ,2638 ,TETRA ,17589453,Sat Nov 27 17:12:36 CET,Sat Nov 27 19:31:30 CET,0.0 0.646 1.002 1.256 1.466 1.68 1.922 2.153 2.574 2.78 2.969 3.02 3.503 3.694 4.073 4.419 4.738 4.894 5.211 5.519 5.973 6.273 6.559 6.983 7.388 7.778 8.178 8.578 9.094 9.598 10.092 10.707 11.318 11.917 12.629 13.443 14.241 15.15 16.171 17.282 18.45 19.818 21.451 23.133 25.182 27.578 30.504 33.987 38.326 43.876 51.384 58.44 63.131 66.5 69.024 71.015 72.558 73.805 74.763 75.618 76.302 76.882 77.391 77.839 78.224 78.535 78.829 79.079 79.27 79.425 79.569 79.685 79.794 79.885 79.948 80.011 80.072 80.122 80.155 80.174 80.183 80.187 80.183 80.174 80.168 80.135 80.082 80.039 80.021 79.766 79.95 79.914 79.865 79.739 79.635 79.51 79.406 79.295 79.135 78.937 78.574 -10 ,4228 ,TETRA ,17589454,Sat Nov 27 17:12:35 CET,Sat Nov 27 19:28:05 CET,0.0 0.548 0.877 1.166 1.422 1.65 1.882 2.124 2.577 2.782 2.992 3.114 3.616 3.79 4.121 4.44 4.744 4.893 5.194 5.488 5.929 6.224 6.516 6.974 7.428 7.849 8.259 8.661 9.194 9.718 10.212 10.812 11.408 11.994 12.71 13.545 14.348 15.268 16.296 17.421 18.633 20.011 21.68 23.42 25.499 27.923 30.846 34.31 38.61 44.084 51.476 58.446 63.124 66.456 68.949 70.905 72.426 73.683 74.655 75.506 76.172 76.721 77.198 77.611 77.969 78.263 78.541 78.779 78.964 79.137 79.299 79.414 79.516 79.611 79.681 79.739 79.797 79.851 79.878 79.879 79.875 79.873 79.87 79.868 79.867 79.861 79.847 79.812 79.785 79.534 79.699 79.66 79.611 79.481 79.418 79.344 79.228 79.119 79.008 78.818 78.251 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 97df30b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30456 ,TETRA ,17589455,Sat Nov 27 17:13:35 CET,Sat Nov 27 19:32:06 CET,0.0 0.419 0.682 0.913 1.115 1.304 1.453 1.584 1.834 1.955 2.083 2.109 2.427 2.54 2.747 2.936 3.102 3.183 3.334 3.479 3.706 3.856 4.008 4.228 4.439 4.639 4.81 4.975 5.206 5.425 5.629 5.879 6.131 6.369 6.642 6.953 7.227 7.523 7.891 8.288 8.679 9.122 9.627 10.115 10.669 11.302 12.033 12.802 13.657 14.632 15.754 16.527 16.795 16.845 16.827 16.738 16.594 16.433 16.25 16.022 15.833 15.651 15.457 15.273 15.08 14.903 14.731 14.567 14.42 14.26 14.093 13.947 13.788 13.625 13.496 13.347 13.174 13.003 12.821 12.681 12.536 12.323 12.177 12.024 11.942 11.771 11.571 11.379 11.302 11.012 10.979 10.86 10.733 10.435 10.275 10.091 9.897 9.661 9.388 9.093 8.572 -2 ,15890 ,TETRA ,17589456,Sat Nov 27 17:13:32 CET,Sat Nov 27 19:24:56 CET,0.0 0.435 0.735 0.964 1.146 1.318 1.477 1.622 1.909 2.038 2.152 2.16 2.478 2.588 2.779 2.947 3.122 3.214 3.386 3.541 3.769 3.922 4.064 4.264 4.462 4.653 4.826 4.997 5.227 5.455 5.666 5.885 6.105 6.331 6.601 6.906 7.2 7.518 7.861 8.236 8.625 9.054 9.572 10.103 10.71 11.409 12.215 13.087 14.045 15.126 16.355 17.16 17.448 17.514 17.455 17.306 17.137 16.964 16.766 16.561 16.377 16.196 16.036 15.876 15.688 15.477 15.256 15.059 14.886 14.715 14.529 14.372 14.191 13.978 13.819 13.656 13.481 13.304 13.126 12.981 12.825 12.618 12.468 12.308 12.226 12.04 11.84 11.651 11.558 11.265 11.249 11.135 11.003 10.685 10.533 10.384 10.191 9.964 9.737 9.422 8.575 -3 ,10632 ,TETRA ,17589457,Sat Nov 27 17:13:34 CET,Sat Nov 27 19:17:24 CET,0.0 0.756 0.998 1.172 1.326 1.501 1.663 1.792 2.075 2.221 2.357 2.391 2.713 2.827 3.044 3.247 3.44 3.531 3.708 3.871 4.093 4.249 4.407 4.627 4.833 5.068 5.337 5.597 5.921 6.225 6.516 6.858 7.188 7.517 7.889 8.274 8.643 9.054 9.478 9.934 10.418 10.937 11.528 12.119 12.803 13.533 14.329 15.227 16.232 17.312 18.447 19.111 19.338 19.363 19.231 18.969 18.645 18.295 17.981 17.671 17.398 17.143 16.89 16.636 16.392 16.164 15.896 15.625 15.386 15.149 14.895 14.669 14.418 14.163 13.964 13.741 13.507 13.26 12.999 12.851 12.724 12.523 12.376 12.226 12.155 12.013 11.849 11.67 11.577 11.268 11.209 11.076 10.931 10.623 10.476 10.315 10.108 9.872 9.593 9.269 7.966 -4 ,6674 ,TETRA ,17589458,Sat Nov 27 17:13:34 CET,Sat Nov 27 19:30:59 CET,0.0 0.364 0.591 0.787 0.951 1.097 1.234 1.372 1.647 1.765 1.877 1.891 2.199 2.298 2.468 2.631 2.797 2.875 3.041 3.201 3.402 3.539 3.68 3.88 4.068 4.255 4.438 4.612 4.843 5.076 5.294 5.553 5.8 6.042 6.328 6.647 6.949 7.274 7.619 7.975 8.353 8.781 9.282 9.777 10.351 10.995 11.703 12.471 13.373 14.393 15.467 16.116 16.321 16.316 16.182 16.025 15.853 15.606 15.366 15.094 14.832 14.595 14.357 14.119 13.874 13.646 13.399 13.178 12.992 12.781 12.568 12.391 12.207 12.011 11.839 11.655 11.47 11.288 11.08 10.926 10.779 10.561 10.404 10.226 10.129 9.923 9.714 9.509 9.387 9.067 9.023 8.891 8.744 8.434 8.277 8.1 7.902 7.672 7.425 7.123 6.085 -5 ,32665 ,TETRA ,17589459,Sat Nov 27 17:13:34 CET,Sat Nov 27 19:15:56 CET,0.0 0.238 0.398 0.556 0.71 0.857 0.993 1.126 1.347 1.443 1.551 1.561 1.848 1.932 2.099 2.265 2.418 2.49 2.629 2.767 2.978 3.117 3.25 3.441 3.63 3.814 3.993 4.158 4.365 4.573 4.769 4.997 5.216 5.44 5.707 6.011 6.31 6.628 6.958 7.308 7.678 8.097 8.568 9.025 9.574 10.166 10.815 11.528 12.341 13.289 14.321 14.977 15.281 15.376 15.301 15.145 14.971 14.757 14.506 14.252 14.052 13.855 13.644 13.456 13.278 13.101 12.919 12.755 12.61 12.452 12.264 12.095 11.926 11.749 11.619 11.489 11.346 11.194 11.032 10.916 10.793 10.585 10.43 10.271 10.192 10.04 9.882 9.707 9.615 9.334 9.328 9.221 9.11 8.868 8.732 8.566 8.352 8.099 7.841 7.529 6.635 -6 ,3450 ,TETRA ,17589460,Sat Nov 27 17:13:34 CET,Sat Nov 27 19:36:09 CET,0.0 0.569 0.827 1.047 1.227 1.386 1.532 1.682 1.965 2.091 2.206 2.205 2.512 2.617 2.823 3.008 3.189 3.276 3.432 3.579 3.792 3.93 4.065 4.249 4.43 4.613 4.791 4.96 5.182 5.397 5.606 5.861 6.102 6.343 6.646 6.977 7.271 7.599 7.984 8.423 8.896 9.403 9.974 10.569 11.248 11.958 12.799 13.72 14.71 15.777 16.862 17.512 17.686 17.595 17.384 17.122 16.846 16.562 16.346 16.158 15.951 15.759 15.591 15.404 15.201 15.023 14.849 14.681 14.536 14.379 14.187 14.027 13.878 13.714 13.582 13.442 13.286 13.126 12.93 12.793 12.67 12.462 12.314 12.167 12.089 11.932 11.767 11.557 11.439 11.136 11.111 10.999 10.886 10.625 10.459 10.265 10.082 9.889 9.653 9.36 8.451 -7 ,18540 ,TETRA ,17589461,Sat Nov 27 17:13:36 CET,Sat Nov 27 19:35:24 CET,0.0 0.537 0.776 0.963 1.134 1.289 1.441 1.583 1.796 1.908 2.017 2.015 2.319 2.407 2.583 2.751 2.918 2.997 3.156 3.319 3.525 3.658 3.795 3.979 4.154 4.33 4.492 4.655 4.873 5.078 5.287 5.593 5.923 6.237 6.593 6.99 7.366 7.768 8.19 8.636 9.113 9.65 10.26 10.88 11.598 12.318 13.1 13.966 14.904 15.906 16.903 17.417 17.533 17.475 17.338 17.119 16.857 16.593 16.334 16.012 15.692 15.404 15.126 14.83 14.553 14.281 13.983 13.716 13.464 13.192 12.905 12.673 12.425 12.156 11.958 11.749 11.516 11.265 10.999 10.81 10.615 10.293 10.05 9.796 9.662 9.37 9.065 8.757 8.601 8.242 8.065 7.862 7.641 7.145 6.854 6.566 6.318 6.085 5.784 5.317 4.181 -8 ,29384 ,TETRA ,17589462,Sat Nov 27 17:13:38 CET,Sat Nov 27 19:30:44 CET,0.0 0.385 0.616 0.811 0.98 1.129 1.269 1.405 1.625 1.72 1.83 1.838 2.132 2.217 2.388 2.553 2.714 2.794 2.94 3.081 3.301 3.44 3.578 3.776 3.97 4.157 4.335 4.499 4.709 4.924 5.125 5.365 5.599 5.81 6.067 6.368 6.653 6.964 7.305 7.697 8.093 8.52 9.021 9.525 10.1 10.705 11.376 12.131 13.012 13.986 14.963 15.605 15.858 15.887 15.813 15.674 15.488 15.268 15.068 14.866 14.693 14.524 14.355 14.179 14.0 13.836 13.642 13.452 13.284 13.114 12.931 12.78 12.632 12.476 12.353 12.224 12.083 11.934 11.774 11.659 11.536 11.348 11.224 11.086 11.013 10.835 10.629 10.444 10.352 10.047 9.992 9.859 9.72 9.409 9.254 9.072 8.836 8.598 8.331 7.955 7.083 -9 ,12698 ,TETRA ,17589463,Sat Nov 27 17:13:39 CET,Sat Nov 27 19:30:26 CET,0.0 0.48 0.739 0.97 1.169 1.327 1.478 1.625 1.882 1.996 2.105 2.099 2.403 2.505 2.697 2.875 3.041 3.126 3.3 3.457 3.691 3.844 3.985 4.192 4.397 4.587 4.761 4.933 5.163 5.394 5.612 5.864 6.106 6.34 6.618 6.95 7.277 7.617 7.982 8.364 8.753 9.187 9.69 10.213 10.823 11.478 12.215 13.037 13.999 15.083 16.151 16.816 17.064 17.043 16.877 16.697 16.545 16.363 16.162 15.937 15.727 15.519 15.313 15.101 14.891 14.693 14.477 14.285 14.123 13.945 13.75 13.579 13.405 13.229 13.084 12.924 12.772 12.626 12.456 12.335 12.212 12.013 11.869 11.709 11.627 11.457 11.266 11.076 10.977 10.689 10.688 10.595 10.495 10.272 10.141 9.978 9.801 9.556 9.227 8.775 7.667 -10 ,3958 ,TETRA ,17589464,Sat Nov 27 17:13:34 CET,Sat Nov 27 19:29:09 CET,0.0 0.347 0.551 0.721 0.885 1.043 1.174 1.312 1.589 1.71 1.83 1.846 2.153 2.256 2.462 2.653 2.831 2.92 3.1 3.262 3.495 3.654 3.802 3.999 4.192 4.384 4.57 4.749 4.981 5.203 5.422 5.702 5.964 6.207 6.486 6.79 7.086 7.42 7.772 8.15 8.552 8.984 9.49 9.997 10.576 11.208 11.918 12.687 13.57 14.626 15.799 16.52 16.765 16.807 16.755 16.64 16.469 16.263 16.053 15.826 15.624 15.439 15.249 15.055 14.859 14.669 14.475 14.297 14.137 13.968 13.788 13.619 13.427 13.243 13.113 12.975 12.825 12.657 12.478 12.354 12.218 12.01 11.863 11.706 11.624 11.453 11.262 11.061 10.965 10.661 10.635 10.504 10.35 10.018 9.846 9.654 9.434 9.179 8.852 8.437 7.707 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index d6bd9227..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4616 ,TETRA ,17589465,Sat Nov 27 17:13:34 CET,Sat Nov 27 19:35:07 CET,0.0 0.629 1.001 1.272 1.483 1.645 1.818 2.03 2.393 2.536 2.676 2.732 3.066 3.187 3.427 3.671 3.889 3.991 4.181 4.354 4.613 4.788 4.948 5.178 5.412 5.636 5.847 6.04 6.295 6.552 6.792 7.086 7.366 7.623 7.917 8.24 8.547 8.889 9.26 9.706 10.229 10.808 11.464 12.113 12.855 13.643 14.508 15.46 16.529 17.709 18.992 19.762 19.906 19.746 19.475 19.17 18.846 18.51 18.178 17.793 17.447 17.138 16.811 16.487 16.183 15.902 15.598 15.3 15.03 14.734 14.421 14.166 13.891 13.596 13.369 13.131 12.881 12.609 12.306 12.09 11.875 11.567 11.339 11.072 10.933 10.649 10.333 9.989 9.807 9.435 9.28 9.128 8.963 8.602 8.439 8.263 8.059 7.827 7.522 7.129 6.218 -2 ,29160 ,TETRA ,17589466,Sat Nov 27 17:13:35 CET,Sat Nov 27 19:32:51 CET,0.0 0.618 0.946 1.181 1.375 1.578 1.77 1.929 2.224 2.363 2.487 2.504 2.825 2.945 3.163 3.361 3.564 3.668 3.849 4.017 4.26 4.414 4.566 4.793 5.01 5.21 5.404 5.605 5.884 6.166 6.422 6.697 6.955 7.224 7.543 7.886 8.216 8.586 8.996 9.419 9.859 10.358 10.928 11.483 12.149 12.878 13.681 14.597 15.655 16.83 18.089 18.892 19.162 19.169 19.038 18.826 18.606 18.373 18.128 17.865 17.611 17.359 17.119 16.886 16.655 16.423 16.168 15.942 15.733 15.509 15.282 15.085 14.889 14.693 14.519 14.32 14.124 13.928 13.725 13.589 13.443 13.2 13.03 12.851 12.76 12.58 12.378 12.159 12.04 11.714 11.646 11.495 11.342 11.03 10.849 10.637 10.406 10.152 9.868 9.483 8.419 -3 ,19235 ,TETRA ,17589467,Sat Nov 27 17:13:37 CET,Sat Nov 27 19:32:29 CET,0.0 0.425 0.66 0.909 1.133 1.324 1.498 1.66 1.939 2.069 2.205 2.255 2.578 2.69 2.894 3.099 3.316 3.417 3.601 3.785 4.056 4.23 4.389 4.614 4.826 5.047 5.276 5.494 5.77 6.026 6.258 6.523 6.796 7.064 7.369 7.702 8.019 8.386 8.776 9.171 9.581 10.031 10.562 11.121 11.77 12.463 13.27 14.223 15.335 16.59 17.985 18.65 18.561 18.398 18.298 18.15 17.975 17.757 17.527 17.271 17.039 16.817 16.563 16.319 16.093 15.867 15.631 15.422 15.233 15.038 14.826 14.627 14.388 14.133 13.948 13.75 13.524 13.275 13.034 12.874 12.709 12.467 12.3 12.135 12.049 11.85 11.631 11.398 11.272 10.948 10.896 10.771 10.623 10.29 10.113 9.911 9.677 9.416 9.127 8.73 7.583 -4 ,3581 ,TETRA ,17589468,Sat Nov 27 17:13:34 CET,Sat Nov 27 19:31:59 CET,0.0 0.713 1.112 1.362 1.584 1.777 1.922 2.052 2.32 2.459 2.59 2.632 2.961 3.081 3.306 3.515 3.711 3.801 3.976 4.136 4.368 4.527 4.682 4.906 5.136 5.353 5.545 5.735 6.003 6.27 6.509 6.781 7.043 7.302 7.597 7.93 8.278 8.665 9.063 9.481 9.913 10.391 10.947 11.512 12.18 12.931 13.782 14.721 15.778 16.912 18.168 19.014 19.297 19.333 19.258 19.068 18.848 18.602 18.324 18.014 17.737 17.496 17.26 17.014 16.772 16.545 16.305 16.088 15.882 15.66 15.441 15.256 15.05 14.837 14.666 14.483 14.308 14.122 13.925 13.799 13.662 13.435 13.269 13.097 13.003 12.803 12.599 12.392 12.287 11.981 11.918 11.776 11.639 11.337 11.175 10.996 10.8 10.569 10.24 9.8 8.903 -5 ,10737 ,TETRA ,17589469,Sat Nov 27 17:13:35 CET,Sat Nov 27 19:33:06 CET,0.0 0.495 0.787 1.029 1.225 1.406 1.585 1.749 2.022 2.157 2.291 2.321 2.633 2.73 2.918 3.112 3.3 3.398 3.609 3.79 4.021 4.164 4.304 4.514 4.718 4.922 5.139 5.357 5.618 5.868 6.105 6.385 6.667 6.926 7.218 7.558 7.875 8.212 8.589 9.008 9.463 9.988 10.583 11.158 11.799 12.464 13.201 14.044 15.061 16.199 17.393 18.19 18.482 18.539 18.467 18.287 18.066 17.84 17.623 17.378 17.142 16.935 16.718 16.473 16.232 16.016 15.783 15.568 15.392 15.197 14.977 14.793 14.601 14.407 14.248 14.078 13.913 13.741 13.555 13.419 13.279 13.075 12.94 12.786 12.696 12.521 12.344 12.135 12.018 11.697 11.627 11.495 11.36 11.045 10.866 10.655 10.409 10.147 9.851 9.456 8.407 -6 ,21531 ,TETRA ,17589470,Sat Nov 27 17:13:37 CET,Sat Nov 27 19:35:35 CET,0.0 0.914 1.282 1.538 1.754 1.936 2.115 2.273 2.549 2.675 2.813 2.881 3.207 3.332 3.565 3.77 3.973 4.078 4.285 4.478 4.748 4.909 5.062 5.28 5.489 5.698 5.907 6.107 6.352 6.588 6.84 7.147 7.427 7.688 7.991 8.328 8.654 9.001 9.371 9.761 10.16 10.623 11.177 11.726 12.379 13.234 14.267 15.381 16.679 18.187 19.824 20.858 21.3 21.467 21.457 21.35 21.21 21.053 20.864 20.644 20.434 20.226 20.023 19.824 19.619 19.416 19.202 19.011 18.825 18.598 18.334 18.106 17.876 17.663 17.477 17.258 17.035 16.802 16.572 16.416 16.265 16.036 15.879 15.719 15.635 15.462 15.276 15.082 14.977 14.66 14.596 14.45 14.295 13.937 13.742 13.535 13.279 12.983 12.624 12.057 10.172 -7 ,1051 ,TETRA ,17589471,Sat Nov 27 17:13:34 CET,Sat Nov 27 19:36:33 CET,0.0 0.801 1.147 1.461 1.723 1.953 2.143 2.312 2.647 2.788 2.928 2.992 3.313 3.428 3.654 3.863 4.057 4.15 4.337 4.515 4.759 4.922 5.082 5.308 5.518 5.718 5.915 6.104 6.35 6.598 6.844 7.137 7.426 7.714 8.037 8.394 8.737 9.114 9.516 9.932 10.372 10.88 11.473 12.065 12.724 13.446 14.277 15.183 16.265 17.439 18.607 19.356 19.63 19.686 19.611 19.447 19.22 18.953 18.699 18.442 18.204 17.953 17.68 17.409 17.15 16.918 16.682 16.467 16.275 16.076 15.869 15.681 15.477 15.28 15.123 14.946 14.747 14.533 14.311 14.161 14.013 13.757 13.581 13.423 13.338 13.145 12.942 12.723 12.602 12.29 12.218 12.069 11.928 11.612 11.432 11.24 11.021 10.781 10.487 10.073 9.082 -8 ,30029 ,TETRA ,17589472,Sat Nov 27 17:13:34 CET,Sat Nov 27 19:32:57 CET,0.0 0.623 0.933 1.181 1.394 1.585 1.755 1.912 2.192 2.315 2.43 2.466 2.789 2.896 3.109 3.313 3.516 3.613 3.786 3.942 4.177 4.34 4.499 4.725 4.927 5.121 5.32 5.526 5.806 6.061 6.291 6.577 6.847 7.093 7.371 7.684 7.989 8.327 8.702 9.116 9.543 10.023 10.59 11.156 11.823 12.553 13.35 14.227 15.2 16.268 17.471 18.221 18.478 18.518 18.428 18.226 17.991 17.756 17.524 17.244 16.992 16.782 16.568 16.341 16.1 15.875 15.635 15.42 15.222 14.979 14.723 14.515 14.279 14.01 13.815 13.638 13.451 13.238 13.007 12.848 12.69 12.455 12.299 12.14 12.061 11.883 11.682 11.467 11.348 11.016 10.933 10.787 10.628 10.287 10.109 9.908 9.685 9.426 9.108 8.684 7.464 -9 ,28656 ,TETRA ,17589473,Sat Nov 27 17:13:36 CET,Sat Nov 27 19:32:57 CET,0.0 0.808 1.135 1.405 1.637 1.828 2.0 2.153 2.431 2.572 2.717 2.784 3.114 3.232 3.475 3.677 3.856 3.948 4.123 4.289 4.525 4.685 4.851 5.089 5.315 5.525 5.724 5.92 6.175 6.427 6.668 6.949 7.207 7.451 7.734 8.051 8.354 8.693 9.055 9.433 9.836 10.28 10.799 11.361 12.007 12.67 13.454 14.378 15.383 16.468 17.598 18.306 18.539 18.55 18.455 18.3 18.089 17.839 17.613 17.372 17.137 16.911 16.671 16.453 16.256 16.061 15.838 15.635 15.468 15.293 15.095 14.908 14.715 14.527 14.374 14.204 14.024 13.84 13.652 13.523 13.379 13.128 12.945 12.757 12.667 12.499 12.311 12.092 11.984 11.669 11.597 11.463 11.324 11.02 10.842 10.656 10.464 10.254 9.993 9.643 8.64 -10 ,746 ,TETRA ,17589474,Sat Nov 27 17:13:38 CET,Sat Nov 27 19:32:49 CET,0.0 0.854 1.171 1.414 1.613 1.796 1.976 2.129 2.381 2.506 2.626 2.662 2.969 3.073 3.287 3.483 3.672 3.766 3.945 4.119 4.373 4.534 4.691 4.932 5.168 5.385 5.59 5.787 6.037 6.275 6.494 6.752 7.008 7.257 7.549 7.882 8.203 8.557 8.942 9.344 9.753 10.207 10.742 11.301 11.922 12.588 13.356 14.213 15.24 16.364 17.573 18.433 18.792 18.877 18.827 18.71 18.526 18.311 18.086 17.822 17.589 17.358 17.122 16.899 16.659 16.429 16.206 16.001 15.811 15.612 15.39 15.196 14.982 14.744 14.566 14.377 14.187 13.991 13.777 13.62 13.46 13.213 13.033 12.843 12.747 12.544 12.318 12.07 11.939 11.618 11.529 11.381 11.242 10.928 10.75 10.553 10.326 10.069 9.727 9.258 8.091 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 4ad45dca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31061 ,TETRA ,17589475,Sat Nov 27 17:13:40 CET,Sat Nov 27 19:31:01 CET,0.0 1.135 1.482 1.708 1.929 2.118 2.283 2.439 2.694 2.802 2.907 2.915 3.228 3.33 3.516 3.697 3.874 3.958 4.117 4.278 4.519 4.673 4.819 5.014 5.193 5.364 5.525 5.682 5.88 6.06 6.242 6.465 6.68 6.883 7.119 7.379 7.61 7.857 8.126 8.417 8.711 9.016 9.352 9.675 10.043 10.433 10.902 11.452 12.027 12.566 12.932 12.884 12.647 12.334 11.949 11.507 11.072 10.682 10.378 10.045 9.718 9.42 9.138 8.86 8.605 8.382 8.138 7.917 7.731 7.523 7.3 7.133 6.948 6.747 6.586 6.409 6.233 6.049 5.858 5.724 5.581 5.344 5.182 5.017 4.937 4.794 4.627 4.448 4.351 4.042 3.997 3.871 3.752 3.483 3.323 3.146 2.96 2.759 2.535 2.261 1.412 -2 ,18905 ,TETRA ,17589476,Sat Nov 27 17:14:33 CET,Sat Nov 27 19:29:26 CET,0.0 0.402 0.712 0.942 1.125 1.31 1.47 1.617 1.901 2.018 2.126 2.126 2.434 2.544 2.733 2.906 3.064 3.142 3.3 3.446 3.645 3.775 3.92 4.175 4.444 4.703 4.96 5.209 5.5 5.786 6.062 6.374 6.677 6.973 7.305 7.664 7.993 8.332 8.688 9.064 9.454 9.87 10.358 10.844 11.384 11.95 12.515 13.059 13.645 14.207 14.576 14.505 14.117 13.657 13.192 12.744 12.315 11.911 11.559 11.218 10.919 10.637 10.382 10.146 9.924 9.714 9.481 9.264 9.066 8.833 8.589 8.391 8.169 7.949 7.79 7.627 7.457 7.286 7.09 6.946 6.811 6.611 6.478 6.325 6.235 6.039 5.848 5.666 5.56 5.247 5.203 5.078 4.952 4.681 4.536 4.377 4.21 4.032 3.826 3.551 2.842 -3 ,25706 ,TETRA ,17589477,Sat Nov 27 17:14:33 CET,Sat Nov 27 19:34:04 CET,0.0 0.682 0.996 1.229 1.4 1.539 1.686 1.837 2.099 2.226 2.353 2.379 2.685 2.788 2.991 3.187 3.368 3.455 3.623 3.78 3.996 4.12 4.25 4.46 4.648 4.824 4.998 5.156 5.363 5.574 5.777 6.022 6.246 6.465 6.717 6.985 7.23 7.553 7.971 8.397 8.808 9.248 9.742 10.237 10.799 11.368 11.963 12.606 13.265 13.782 14.023 13.874 13.549 13.16 12.733 12.298 11.856 11.436 11.07 10.684 10.351 10.006 9.666 9.374 9.098 8.853 8.606 8.388 8.195 7.982 7.759 7.577 7.381 7.177 7.022 6.862 6.678 6.475 6.259 6.113 5.961 5.72 5.547 5.365 5.279 5.109 4.941 4.755 4.655 4.351 4.339 4.223 4.089 3.788 3.635 3.479 3.296 3.09 2.857 2.514 1.52 -4 ,26593 ,TETRA ,17589478,Sat Nov 27 17:14:35 CET,Sat Nov 27 19:36:16 CET,0.0 0.865 1.145 1.373 1.594 1.786 1.933 2.066 2.341 2.472 2.592 2.615 2.918 3.018 3.211 3.443 3.709 3.844 4.107 4.348 4.704 4.925 5.145 5.455 5.735 5.997 6.235 6.466 6.766 7.052 7.313 7.621 7.928 8.223 8.548 8.915 9.268 9.64 10.018 10.413 10.835 11.279 11.769 12.247 12.792 13.372 13.992 14.58 15.176 15.794 16.209 16.161 15.878 15.497 15.101 14.704 14.316 13.92 13.557 13.198 12.848 12.529 12.238 11.935 11.659 11.435 11.199 10.983 10.797 10.597 10.377 10.189 9.99 9.773 9.608 9.446 9.276 9.107 8.921 8.787 8.654 8.453 8.31 8.154 8.073 7.898 7.704 7.484 7.37 7.061 7.037 6.921 6.796 6.545 6.411 6.262 6.078 5.853 5.593 5.262 4.11 -5 ,15589 ,TETRA ,17589479,Sat Nov 27 17:14:34 CET,Sat Nov 27 19:31:48 CET,0.0 0.966 1.323 1.543 1.758 1.933 2.078 2.219 2.484 2.603 2.716 2.752 3.063 3.171 3.379 3.563 3.742 3.833 3.984 4.111 4.3 4.433 4.564 4.746 4.911 5.069 5.228 5.383 5.593 5.793 5.981 6.207 6.429 6.643 6.87 7.11 7.341 7.583 7.83 8.122 8.503 8.975 9.509 10.001 10.541 11.117 11.729 12.361 12.997 13.587 13.998 13.937 13.558 13.109 12.68 12.23 11.811 11.42 11.055 10.673 10.327 10.017 9.722 9.439 9.183 8.966 8.744 8.524 8.329 8.121 7.902 7.725 7.536 7.332 7.175 7.019 6.857 6.689 6.507 6.373 6.227 5.974 5.805 5.652 5.572 5.395 5.219 5.026 4.914 4.607 4.539 4.388 4.239 3.912 3.743 3.568 3.354 3.114 2.848 2.491 0.632 -6 ,30212 ,TETRA ,17589480,Sat Nov 27 17:15:33 CET,Sat Nov 27 19:32:09 CET,0.0 1.291 1.537 1.758 1.972 2.154 2.308 2.46 2.722 2.837 2.96 2.991 3.278 3.372 3.556 3.725 3.89 3.97 4.126 4.271 4.486 4.624 4.756 4.954 5.143 5.322 5.496 5.66 5.856 6.029 6.183 6.381 6.586 6.78 6.996 7.217 7.415 7.632 7.872 8.112 8.354 8.633 8.955 9.272 9.633 10.035 10.474 10.891 11.255 11.557 11.721 11.514 11.071 10.567 10.056 9.563 9.101 8.686 8.319 7.922 7.562 7.219 6.894 6.589 6.296 6.028 5.748 5.5 5.293 5.08 4.85 4.644 4.435 4.234 4.076 3.909 3.736 3.548 3.348 3.21 3.057 2.805 2.626 2.438 2.341 2.149 1.956 1.747 1.634 1.317 1.243 1.105 0.97 0.663 0.501 0.327 0.108 -0.138 -0.403 -0.747 -2.67 -7 ,1751 ,TETRA ,17589481,Sat Nov 27 17:14:35 CET,Sat Nov 27 19:29:10 CET,0.0 0.508 0.783 0.962 1.133 1.303 1.465 1.605 1.861 1.987 2.115 2.19 2.498 2.607 2.807 2.988 3.162 3.247 3.408 3.554 3.781 3.976 4.193 4.491 4.767 5.026 5.275 5.51 5.814 6.114 6.408 6.754 7.078 7.394 7.743 8.114 8.468 8.849 9.235 9.645 10.069 10.513 11.003 11.45 11.943 12.457 13.032 13.661 14.331 15.05 15.561 15.534 15.236 14.881 14.545 14.159 13.781 13.417 13.081 12.688 12.323 12.026 11.732 11.445 11.188 10.929 10.636 10.379 10.153 9.917 9.66 9.453 9.245 9.02 8.84 8.655 8.478 8.301 8.096 7.951 7.819 7.599 7.435 7.28 7.201 7.03 6.852 6.64 6.529 6.231 6.211 6.073 5.913 5.587 5.417 5.239 5.016 4.665 4.177 3.687 1.877 -8 ,25333 ,TETRA ,17589482,Sat Nov 27 17:14:34 CET,Sat Nov 27 19:30:27 CET,0.0 0.595 0.799 0.951 1.119 1.286 1.434 1.605 2.007 2.218 2.418 2.585 2.961 3.13 3.441 3.731 4.0 4.13 4.381 4.617 4.936 5.142 5.343 5.631 5.91 6.162 6.4 6.631 6.919 7.198 7.464 7.772 8.051 8.317 8.63 8.97 9.289 9.628 9.988 10.381 10.783 11.198 11.653 12.095 12.602 13.151 13.718 14.263 14.769 15.218 15.454 15.277 14.981 14.592 14.153 13.746 13.375 13.009 12.653 12.274 11.959 11.66 11.358 11.071 10.804 10.55 10.294 10.08 9.884 9.684 9.487 9.327 9.161 8.967 8.813 8.655 8.489 8.314 8.133 8.016 7.89 7.674 7.519 7.353 7.268 7.102 6.925 6.728 6.613 6.303 6.271 6.129 5.987 5.718 5.574 5.402 5.216 5.022 4.775 4.429 3.887 -9 ,27234 ,TETRA ,17589483,Sat Nov 27 17:14:34 CET,Sat Nov 27 19:19:03 CET,0.0 0.938 1.269 1.529 1.754 1.946 2.133 2.303 2.605 2.747 2.866 2.87 3.167 3.265 3.452 3.64 3.812 3.894 4.06 4.224 4.434 4.564 4.7 4.892 5.068 5.25 5.421 5.573 5.769 5.962 6.152 6.385 6.594 6.789 7.018 7.273 7.535 7.807 8.059 8.321 8.605 8.991 9.522 10.028 10.57 11.111 11.699 12.317 12.939 13.545 13.981 14.017 13.76 13.346 12.902 12.446 12.025 11.643 11.293 10.928 10.634 10.375 10.122 9.877 9.618 9.368 9.1 8.844 8.621 8.399 8.159 7.939 7.71 7.491 7.331 7.155 6.962 6.759 6.544 6.396 6.249 5.998 5.816 5.636 5.543 5.341 5.127 4.904 4.79 4.493 4.45 4.324 4.176 3.834 3.679 3.53 3.348 3.145 2.881 2.535 1.739 -10 ,716 ,TETRA ,17589484,Sat Nov 27 17:14:33 CET,Sat Nov 27 19:30:32 CET,0.0 1.624 2.254 2.764 3.223 3.573 3.869 4.136 4.611 4.83 5.036 5.215 5.588 5.762 6.091 6.397 6.682 6.817 7.073 7.318 7.661 7.874 8.08 8.386 8.687 8.959 9.209 9.445 9.73 10.011 10.285 10.608 10.909 11.195 11.524 11.885 12.224 12.581 12.96 13.36 13.772 14.23 14.74 15.22 15.752 16.288 16.865 17.467 18.084 18.644 18.985 18.872 18.519 18.096 17.648 17.22 16.806 16.385 15.993 15.581 15.217 14.9 14.611 14.33 14.071 13.833 13.57 13.331 13.106 12.861 12.608 12.41 12.21 11.996 11.82 11.639 11.462 11.276 11.065 10.91 10.757 10.528 10.369 10.21 10.123 9.943 9.753 9.531 9.416 9.112 9.105 8.994 8.865 8.582 8.412 8.221 8.033 7.81 7.526 7.179 5.369 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt deleted file mode 100644 index d2abaa2c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24568 ,TETRA ,17589485,Sat Nov 27 17:14:33 CET,Sat Nov 27 19:23:50 CET,0.0 0.606 0.937 1.168 1.372 1.587 1.773 1.937 2.286 2.443 2.573 2.603 2.908 3.019 3.242 3.439 3.613 3.703 3.876 4.045 4.275 4.408 4.544 4.75 4.928 5.1 5.284 5.456 5.675 5.879 6.066 6.264 6.452 6.628 6.801 6.986 7.182 7.415 7.655 7.886 8.111 8.332 8.528 8.678 8.826 8.942 8.93 8.689 8.27 7.577 6.06 3.993 2.249 0.766 -0.529 -1.698 -2.726 -3.659 -4.467 -5.244 -5.874 -6.431 -6.967 -7.47 -7.943 -8.382 -8.833 -9.228 -9.573 -9.917 -10.273 -10.582 -10.899 -11.219 -11.46 -11.704 -11.955 -12.232 -12.532 -12.735 -12.939 -13.233 -13.443 -13.666 -13.776 -14.005 -14.249 -14.512 -14.651 -15.006 -15.111 -15.278 -15.442 -15.798 -15.999 -16.209 -16.413 -16.651 -16.928 -17.229 -18.015 -2 ,31458 ,TETRA ,17589486,Sat Nov 27 17:14:33 CET,Sat Nov 27 19:39:34 CET,0.0 0.639 0.965 1.226 1.434 1.625 1.784 1.926 2.22 2.35 2.473 2.506 2.8 2.909 3.121 3.307 3.476 3.558 3.713 3.865 4.079 4.23 4.375 4.558 4.721 4.868 5.023 5.161 5.33 5.508 5.673 5.867 6.052 6.228 6.418 6.621 6.809 6.994 7.186 7.371 7.543 7.728 7.911 8.052 8.184 8.251 8.247 8.155 7.864 7.23 5.804 3.678 1.815 0.226 -1.076 -2.196 -3.18 -4.063 -4.845 -5.62 -6.26 -6.822 -7.377 -7.898 -8.378 -8.816 -9.267 -9.669 -10.01 -10.361 -10.725 -11.028 -11.336 -11.658 -11.914 -12.182 -12.47 -12.773 -13.071 -13.267 -13.469 -13.795 -14.02 -14.245 -14.359 -14.604 -14.872 -15.132 -15.259 -15.604 -15.695 -15.842 -16.002 -16.342 -16.514 -16.694 -16.887 -17.121 -17.417 -17.777 -18.313 -3 ,502 ,TETRA ,17589487,Sat Nov 27 17:14:34 CET,Sat Nov 27 19:39:46 CET,0.0 0.671 1.053 1.296 1.51 1.69 1.855 2.017 2.303 2.43 2.555 2.595 2.902 2.993 3.17 3.372 3.562 3.639 3.781 3.922 4.134 4.271 4.41 4.591 4.757 4.932 5.097 5.252 5.448 5.632 5.804 5.984 6.154 6.332 6.527 6.721 6.905 7.104 7.3 7.507 7.713 7.903 8.071 8.201 8.319 8.426 8.507 8.446 8.048 7.173 5.525 3.402 1.594 0.031 -1.319 -2.481 -3.462 -4.325 -5.082 -5.833 -6.444 -6.997 -7.535 -8.037 -8.502 -8.928 -9.363 -9.773 -10.145 -10.514 -10.881 -11.167 -11.47 -11.784 -12.032 -12.304 -12.582 -12.865 -13.145 -13.349 -13.562 -13.872 -14.073 -14.293 -14.413 -14.653 -14.918 -15.192 -15.333 -15.682 -15.765 -15.935 -16.115 -16.493 -16.671 -16.851 -17.075 -17.318 -17.609 -18.008 -18.703 -4 ,17721 ,TETRA ,17589488,Sat Nov 27 17:14:34 CET,Sat Nov 27 19:35:20 CET,0.0 0.573 0.86 1.085 1.316 1.513 1.671 1.821 2.117 2.238 2.339 2.357 2.659 2.773 2.982 3.154 3.311 3.387 3.534 3.672 3.874 4.001 4.137 4.337 4.522 4.687 4.839 4.997 5.177 5.342 5.527 5.72 5.887 6.042 6.214 6.434 6.644 6.842 7.024 7.187 7.355 7.544 7.688 7.781 7.855 7.883 7.861 7.716 7.362 6.638 5.173 3.2 1.494 0.021 -1.223 -2.325 -3.266 -4.115 -4.893 -5.674 -6.322 -6.896 -7.453 -7.97 -8.435 -8.844 -9.282 -9.682 -10.009 -10.343 -10.701 -11.003 -11.312 -11.644 -11.897 -12.157 -12.44 -12.738 -13.034 -13.229 -13.433 -13.748 -13.965 -14.184 -14.295 -14.527 -14.772 -15.045 -15.189 -15.541 -15.684 -15.875 -16.065 -16.446 -16.633 -16.826 -17.061 -17.361 -17.719 -18.15 -18.771 -5 ,5998 ,TETRA ,17589489,Sat Nov 27 17:14:37 CET,Sat Nov 27 19:34:49 CET,0.0 0.941 1.223 1.455 1.654 1.8 1.944 2.089 2.351 2.47 2.592 2.619 2.917 3.021 3.213 3.387 3.56 3.641 3.79 3.943 4.166 4.305 4.44 4.646 4.839 5.002 5.158 5.314 5.51 5.685 5.851 6.076 6.276 6.443 6.635 6.826 6.992 7.176 7.366 7.56 7.742 7.91 8.12 8.294 8.397 8.438 8.404 8.24 7.864 7.091 5.515 3.477 1.682 0.042 -1.379 -2.582 -3.564 -4.442 -5.22 -5.978 -6.622 -7.198 -7.734 -8.251 -8.751 -9.203 -9.653 -10.045 -10.382 -10.732 -11.105 -11.409 -11.726 -12.058 -12.305 -12.573 -12.851 -13.114 -13.384 -13.577 -13.779 -14.086 -14.292 -14.503 -14.607 -14.826 -15.067 -15.314 -15.444 -15.783 -15.846 -15.995 -16.165 -16.553 -16.762 -16.966 -17.171 -17.399 -17.69 -18.014 -18.577 -6 ,1637 ,TETRA ,17589490,Sat Nov 27 17:14:38 CET,Sat Nov 27 19:36:00 CET,0.0 0.469 0.731 0.948 1.162 1.356 1.55 1.73 2.0 2.119 2.26 2.346 2.661 2.779 3.01 3.208 3.386 3.47 3.63 3.783 3.997 4.122 4.237 4.408 4.572 4.734 4.9 5.05 5.246 5.443 5.617 5.83 6.033 6.223 6.449 6.699 6.915 7.115 7.292 7.474 7.664 7.856 8.057 8.225 8.34 8.442 8.514 8.417 8.055 7.351 5.922 3.886 2.15 0.636 -0.682 -1.834 -2.824 -3.72 -4.488 -5.244 -5.885 -6.457 -7.009 -7.523 -8.002 -8.432 -8.87 -9.265 -9.608 -9.988 -10.391 -10.708 -11.026 -11.357 -11.612 -11.866 -12.123 -12.393 -12.686 -12.889 -13.092 -13.397 -13.62 -13.838 -13.94 -14.156 -14.399 -14.663 -14.796 -15.147 -15.236 -15.392 -15.55 -15.864 -16.034 -16.214 -16.407 -16.625 -16.871 -17.174 -17.666 -7 ,6620 ,TETRA ,17589491,Sat Nov 27 17:14:40 CET,Sat Nov 27 19:36:09 CET,0.0 0.536 0.863 1.152 1.386 1.603 1.811 1.995 2.31 2.446 2.566 2.605 2.912 3.02 3.23 3.421 3.597 3.686 3.86 4.019 4.234 4.366 4.489 4.67 4.859 5.049 5.223 5.384 5.583 5.757 5.931 6.132 6.317 6.494 6.679 6.874 7.054 7.247 7.459 7.658 7.832 8.037 8.26 8.412 8.539 8.631 8.614 8.498 8.127 7.35 5.915 3.898 2.159 0.675 -0.585 -1.689 -2.662 -3.546 -4.301 -5.063 -5.725 -6.305 -6.855 -7.365 -7.831 -8.256 -8.698 -9.093 -9.429 -9.775 -10.134 -10.438 -10.756 -11.075 -11.305 -11.551 -11.837 -12.125 -12.416 -12.628 -12.845 -13.176 -13.406 -13.632 -13.747 -13.987 -14.231 -14.483 -14.618 -14.977 -15.077 -15.23 -15.383 -15.691 -15.869 -16.067 -16.282 -16.534 -16.834 -17.265 -18.271 -8 ,23264 ,TETRA ,17589492,Sat Nov 27 17:14:34 CET,Sat Nov 27 19:36:34 CET,0.0 1.433 1.96 2.3 2.547 2.752 2.928 3.081 3.344 3.466 3.598 3.639 3.948 4.059 4.244 4.421 4.591 4.671 4.84 5.008 5.233 5.374 5.513 5.704 5.876 6.05 6.212 6.361 6.561 6.745 6.908 7.089 7.263 7.428 7.63 7.865 8.055 8.238 8.427 8.631 8.836 9.01 9.178 9.295 9.369 9.455 9.504 9.298 8.758 7.943 6.517 4.537 2.791 1.275 -0.05 -1.17 -2.127 -3.024 -3.83 -4.644 -5.323 -5.896 -6.44 -6.968 -7.449 -7.876 -8.32 -8.708 -9.025 -9.369 -9.742 -10.05 -10.382 -10.721 -10.97 -11.228 -11.49 -11.751 -12.031 -12.222 -12.413 -12.715 -12.925 -13.137 -13.244 -13.471 -13.713 -13.964 -14.093 -14.428 -14.502 -14.654 -14.809 -15.158 -15.356 -15.564 -15.783 -16.021 -16.288 -16.635 -17.604 -9 ,8015 ,TETRA ,17589493,Sat Nov 27 17:15:34 CET,Sat Nov 27 19:39:05 CET,0.0 0.465 0.729 0.946 1.167 1.362 1.537 1.701 1.988 2.129 2.266 2.325 2.625 2.735 2.947 3.122 3.307 3.407 3.583 3.744 3.989 4.14 4.28 4.474 4.658 4.835 5.003 5.166 5.36 5.528 5.699 5.914 6.107 6.286 6.492 6.721 6.921 7.138 7.354 7.546 7.76 7.98 8.227 8.465 8.668 8.825 8.937 8.906 8.597 7.956 6.532 4.418 2.58 0.997 -0.358 -1.535 -2.595 -3.569 -4.396 -5.206 -5.889 -6.485 -7.041 -7.594 -8.122 -8.582 -9.033 -9.437 -9.789 -10.157 -10.548 -10.859 -11.176 -11.525 -11.803 -12.077 -12.353 -12.635 -12.938 -13.145 -13.35 -13.685 -13.917 -14.158 -14.281 -14.533 -14.796 -15.076 -15.233 -15.596 -15.726 -15.909 -16.095 -16.486 -16.695 -16.923 -17.182 -17.494 -17.844 -18.27 -19.264 -10 ,16108 ,TETRA ,17589494,Sat Nov 27 17:14:37 CET,Sat Nov 27 19:37:38 CET,0.0 0.489 0.839 1.128 1.354 1.55 1.723 1.874 2.149 2.281 2.408 2.475 2.805 2.928 3.157 3.367 3.545 3.626 3.779 3.93 4.161 4.31 4.456 4.661 4.841 5.009 5.179 5.34 5.528 5.727 5.915 6.115 6.297 6.463 6.662 6.885 7.127 7.436 7.753 8.071 8.391 8.703 8.993 9.22 9.467 9.719 9.909 9.888 9.579 8.924 7.478 5.446 3.575 1.911 0.484 -0.805 -1.946 -3.004 -3.918 -4.815 -5.584 -6.277 -6.886 -7.4 -7.875 -8.304 -8.747 -9.139 -9.466 -9.817 -10.199 -10.504 -10.808 -11.115 -11.356 -11.617 -11.881 -12.148 -12.429 -12.62 -12.817 -13.14 -13.371 -13.61 -13.729 -13.97 -14.225 -14.479 -14.606 -14.956 -15.052 -15.227 -15.41 -15.81 -16.028 -16.243 -16.444 -16.661 -16.938 -17.276 -17.868 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 36c8a6dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2621 ,TETRA ,17589495,Sat Nov 27 17:14:39 CET,Sat Nov 27 19:37:16 CET,0.0 0.305 0.483 0.636 0.786 0.935 1.077 1.191 1.396 1.502 1.602 1.596 1.865 1.95 2.109 2.238 2.371 2.44 2.572 2.695 2.86 2.967 3.074 3.221 3.359 3.498 3.628 3.746 3.903 4.043 4.16 4.308 4.465 4.61 4.746 4.878 5.005 5.136 5.288 5.451 5.602 5.738 5.876 6.0 6.103 6.156 6.148 6.085 5.869 5.298 4.08 2.365 0.74 -0.677 -1.916 -3.061 -4.063 -4.976 -5.813 -6.658 -7.371 -8.019 -8.628 -9.182 -9.705 -10.194 -10.704 -11.163 -11.557 -11.967 -12.394 -12.748 -13.125 -13.505 -13.802 -14.116 -14.444 -14.79 -15.152 -15.41 -15.678 -16.034 -16.239 -16.448 -16.561 -16.808 -17.067 -17.323 -17.45 -17.787 -17.867 -18.015 -18.174 -18.54 -18.742 -18.966 -19.212 -19.461 -19.756 -20.162 -21.394 -2 ,12174 ,TETRA ,17589496,Sat Nov 27 17:14:36 CET,Sat Nov 27 19:33:29 CET,0.0 0.558 0.841 1.063 1.223 1.38 1.536 1.674 1.901 2.003 2.1 2.084 2.367 2.464 2.629 2.774 2.916 2.986 3.122 3.254 3.447 3.556 3.667 3.828 3.951 4.063 4.192 4.32 4.473 4.617 4.754 4.915 5.062 5.19 5.333 5.501 5.659 5.819 5.982 6.145 6.303 6.458 6.608 6.742 6.868 6.961 7.012 6.934 6.68 6.138 4.93 3.26 1.817 0.535 -0.616 -1.621 -2.501 -3.3 -3.966 -4.642 -5.25 -5.788 -6.297 -6.78 -7.228 -7.637 -8.068 -8.455 -8.78 -9.127 -9.489 -9.775 -10.077 -10.39 -10.644 -10.914 -11.176 -11.445 -11.729 -11.918 -12.107 -12.392 -12.602 -12.827 -12.937 -13.164 -13.404 -13.672 -13.82 -14.177 -14.265 -14.425 -14.582 -14.882 -15.039 -15.229 -15.457 -15.719 -15.99 -16.271 -16.802 -3 ,25291 ,TETRA ,17589497,Sat Nov 27 17:14:39 CET,Sat Nov 27 19:33:19 CET,0.0 0.317 0.525 0.692 0.838 0.958 1.08 1.206 1.401 1.492 1.578 1.529 1.798 1.875 2.022 2.163 2.308 2.374 2.494 2.615 2.776 2.868 2.959 3.094 3.235 3.371 3.5 3.636 3.812 3.957 4.073 4.209 4.324 4.434 4.569 4.71 4.846 4.98 5.102 5.216 5.325 5.44 5.553 5.637 5.687 5.708 5.7 5.615 5.315 4.649 3.431 1.833 0.41 -0.871 -2.016 -3.059 -3.973 -4.792 -5.496 -6.195 -6.787 -7.324 -7.829 -8.284 -8.717 -9.111 -9.501 -9.855 -10.167 -10.48 -10.806 -11.093 -11.396 -11.698 -11.929 -12.174 -12.433 -12.707 -12.977 -13.153 -13.332 -13.614 -13.809 -14.008 -14.112 -14.32 -14.534 -14.766 -14.898 -15.246 -15.298 -15.441 -15.573 -15.849 -16.008 -16.169 -16.344 -16.553 -16.803 -17.166 -17.747 -4 ,7261 ,TETRA ,17589498,Sat Nov 27 17:14:37 CET,Sat Nov 27 19:31:44 CET,0.0 0.362 0.602 0.77 0.908 1.062 1.211 1.344 1.562 1.658 1.75 1.725 1.995 2.071 2.213 2.35 2.487 2.557 2.685 2.796 2.94 3.038 3.126 3.257 3.394 3.521 3.629 3.732 3.863 3.978 4.091 4.234 4.368 4.5 4.644 4.777 4.906 5.044 5.18 5.312 5.442 5.586 5.732 5.837 5.902 5.913 5.889 5.768 5.452 4.802 3.457 1.704 0.21 -1.125 -2.3 -3.348 -4.213 -4.982 -5.659 -6.325 -6.895 -7.417 -7.937 -8.412 -8.853 -9.261 -9.667 -10.023 -10.341 -10.677 -11.021 -11.314 -11.634 -11.958 -12.196 -12.443 -12.695 -12.964 -13.245 -13.429 -13.617 -13.895 -14.09 -14.293 -14.393 -14.603 -14.826 -15.061 -15.188 -15.519 -15.579 -15.73 -15.882 -16.175 -16.331 -16.522 -16.729 -16.942 -17.205 -17.506 -18.202 -5 ,10390 ,TETRA ,17589499,Sat Nov 27 17:14:37 CET,Sat Nov 27 19:24:25 CET,0.0 0.311 0.515 0.711 0.879 1.028 1.173 1.311 1.561 1.676 1.79 1.788 2.063 2.149 2.294 2.426 2.551 2.614 2.741 2.856 3.011 3.101 3.194 3.34 3.473 3.601 3.732 3.864 4.018 4.145 4.268 4.407 4.534 4.646 4.77 4.911 5.049 5.206 5.358 5.512 5.663 5.803 5.939 6.044 6.11 6.125 6.059 5.885 5.583 5.003 3.708 1.952 0.479 -0.873 -2.076 -3.122 -4.026 -4.853 -5.585 -6.309 -6.911 -7.433 -7.938 -8.425 -8.873 -9.281 -9.718 -10.14 -10.529 -10.915 -11.284 -11.578 -11.868 -12.175 -12.421 -12.68 -12.937 -13.186 -13.445 -13.622 -13.806 -14.116 -14.331 -14.544 -14.654 -14.873 -15.082 -15.318 -15.443 -15.767 -15.855 -16.025 -16.197 -16.515 -16.697 -16.907 -17.146 -17.407 -17.668 -17.966 -18.597 -6 ,5885 ,TETRA ,17589500,Sat Nov 27 17:15:35 CET,Sat Nov 27 19:34:12 CET,0.0 0.314 0.555 0.713 0.833 0.946 1.06 1.174 1.385 1.481 1.578 1.55 1.815 1.884 2.003 2.121 2.25 2.309 2.409 2.516 2.689 2.8 2.895 3.03 3.189 3.342 3.482 3.616 3.775 3.913 4.023 4.142 4.253 4.372 4.507 4.63 4.742 4.847 4.946 5.041 5.128 5.23 5.331 5.396 5.444 5.455 5.379 5.216 4.874 4.211 2.999 1.412 -0.046 -1.335 -2.453 -3.447 -4.286 -5.035 -5.691 -6.343 -6.89 -7.375 -7.853 -8.311 -8.744 -9.143 -9.553 -9.914 -10.226 -10.556 -10.909 -11.202 -11.497 -11.8 -12.036 -12.278 -12.534 -12.805 -13.08 -13.27 -13.475 -13.793 -14.006 -14.217 -14.326 -14.55 -14.788 -15.046 -15.179 -15.525 -15.611 -15.764 -15.918 -16.24 -16.4 -16.574 -16.774 -17.01 -17.295 -17.693 -18.329 -7 ,20448 ,TETRA ,17589501,Sat Nov 27 17:15:35 CET,Sat Nov 27 19:32:35 CET,0.0 0.438 0.633 0.842 1.042 1.201 1.324 1.428 1.624 1.727 1.833 1.833 2.118 2.206 2.366 2.517 2.645 2.706 2.831 2.931 3.067 3.159 3.247 3.376 3.498 3.611 3.715 3.822 3.955 4.074 4.194 4.332 4.458 4.572 4.69 4.819 4.949 5.074 5.197 5.323 5.452 5.59 5.772 5.967 6.139 6.256 6.291 6.258 6.063 5.546 4.389 2.694 1.163 -0.25 -1.478 -2.568 -3.554 -4.434 -5.204 -5.997 -6.632 -7.159 -7.666 -8.128 -8.539 -8.906 -9.295 -9.664 -9.984 -10.307 -10.649 -10.943 -11.252 -11.579 -11.852 -12.127 -12.382 -12.638 -12.921 -13.11 -13.297 -13.589 -13.788 -13.996 -14.104 -14.337 -14.578 -14.838 -14.976 -15.324 -15.406 -15.555 -15.704 -16.013 -16.196 -16.391 -16.598 -16.821 -17.088 -17.578 -19.24 -8 ,5771 ,TETRA ,17589502,Sat Nov 27 17:15:35 CET,Sat Nov 27 19:35:17 CET,0.0 0.534 0.775 0.974 1.139 1.284 1.413 1.535 1.753 1.85 1.945 1.943 2.219 2.292 2.418 2.539 2.661 2.719 2.836 2.944 3.093 3.188 3.278 3.414 3.538 3.646 3.744 3.847 3.983 4.106 4.225 4.358 4.486 4.607 4.743 4.872 4.966 5.077 5.206 5.335 5.458 5.582 5.679 5.723 5.734 5.684 5.608 5.465 5.106 4.425 3.125 1.38 -0.114 -1.359 -2.443 -3.464 -4.369 -5.166 -5.863 -6.556 -7.148 -7.687 -8.203 -8.673 -9.1 -9.492 -9.898 -10.249 -10.559 -10.894 -11.227 -11.494 -11.774 -12.075 -12.308 -12.554 -12.807 -13.063 -13.338 -13.524 -13.718 -14.031 -14.247 -14.459 -14.56 -14.788 -15.053 -15.374 -15.543 -15.9 -16.0 -16.166 -16.332 -16.726 -16.939 -17.16 -17.398 -17.614 -17.87 -18.258 -19.015 -9 ,21760 ,TETRA ,17589503,Sat Nov 27 17:15:35 CET,Sat Nov 27 19:35:36 CET,0.0 0.493 0.762 0.898 1.05 1.197 1.301 1.398 1.602 1.701 1.794 1.773 2.048 2.132 2.274 2.406 2.538 2.607 2.733 2.85 3.031 3.134 3.24 3.396 3.517 3.635 3.757 3.876 4.023 4.15 4.265 4.394 4.515 4.634 4.762 4.886 5.013 5.156 5.277 5.38 5.492 5.595 5.668 5.731 5.8 5.831 5.789 5.644 5.277 4.527 3.125 1.33 -0.209 -1.566 -2.737 -3.768 -4.69 -5.555 -6.293 -7.03 -7.664 -8.21 -8.727 -9.215 -9.667 -10.075 -10.488 -10.853 -11.161 -11.483 -11.828 -12.105 -12.401 -12.732 -12.979 -13.226 -13.487 -13.76 -14.049 -14.243 -14.435 -14.733 -14.948 -15.166 -15.277 -15.504 -15.731 -15.963 -16.084 -16.42 -16.464 -16.606 -16.764 -17.101 -17.298 -17.502 -17.701 -17.946 -18.248 -18.611 -19.273 -10 ,6894 ,TETRA ,17589504,Sat Nov 27 17:15:34 CET,Sat Nov 27 19:35:25 CET,0.0 0.461 0.7 0.908 1.062 1.202 1.333 1.433 1.61 1.705 1.788 1.754 2.025 2.114 2.281 2.403 2.515 2.572 2.679 2.786 2.941 3.031 3.112 3.24 3.373 3.496 3.611 3.721 3.861 3.994 4.118 4.258 4.395 4.535 4.687 4.829 4.961 5.114 5.269 5.43 5.581 5.725 5.859 5.947 6.004 6.026 6.005 5.875 5.568 4.948 3.644 1.851 0.341 -0.909 -1.997 -3.033 -3.962 -4.76 -5.444 -6.14 -6.727 -7.25 -7.756 -8.245 -8.679 -9.069 -9.473 -9.826 -10.149 -10.481 -10.819 -11.1 -11.397 -11.705 -11.94 -12.189 -12.458 -12.721 -13.006 -13.213 -13.417 -13.722 -13.934 -14.153 -14.264 -14.491 -14.714 -14.973 -15.114 -15.457 -15.546 -15.724 -15.895 -16.24 -16.417 -16.601 -16.811 -17.028 -17.293 -17.64 -18.353 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 49af2942..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6414 ,TETRA ,17589505,Sat Nov 27 17:15:35 CET,Sat Nov 27 19:16:20 CET,0.0 0.79 1.134 1.414 1.628 1.806 1.978 2.15 2.457 2.608 2.753 2.788 3.123 3.255 3.498 3.731 3.96 4.066 4.27 4.473 4.761 4.943 5.12 5.377 5.627 5.875 6.155 6.464 6.853 7.212 7.575 8.029 8.458 8.869 9.337 9.857 10.349 10.882 11.447 12.05 12.699 13.425 14.273 15.095 16.014 17.06 18.267 19.565 21.033 22.762 24.701 26.107 26.827 27.131 27.226 27.249 27.219 27.127 27.012 26.894 26.766 26.646 26.527 26.374 26.221 26.074 25.901 25.759 25.638 25.498 25.345 25.219 25.095 24.969 24.866 24.755 24.629 24.49 24.353 24.26 24.156 23.989 23.868 23.741 23.675 23.54 23.404 23.245 23.158 22.871 22.871 22.767 22.656 22.402 22.258 22.08 21.891 21.705 21.491 21.198 20.238 -2 ,14583 ,TETRA ,17589506,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:38:04 CET,0.0 0.687 0.969 1.226 1.462 1.685 1.881 2.052 2.387 2.541 2.676 2.708 3.046 3.165 3.394 3.606 3.816 3.916 4.103 4.292 4.568 4.751 4.943 5.229 5.504 5.757 5.994 6.229 6.515 6.787 7.07 7.41 7.734 8.056 8.435 8.838 9.206 9.61 10.069 10.553 11.046 11.641 12.365 13.034 13.794 14.66 15.628 16.737 18.035 19.527 21.251 22.448 22.983 23.169 23.231 23.251 23.172 22.995 22.811 22.604 22.416 22.263 22.125 21.996 21.869 21.738 21.593 21.464 21.337 21.194 21.051 20.918 20.761 20.605 20.492 20.377 20.247 20.077 19.876 19.745 19.613 19.42 19.295 19.166 19.099 18.951 18.797 18.659 18.575 18.276 18.284 18.189 18.073 17.841 17.701 17.532 17.362 17.158 16.911 16.639 15.606 -3 ,11642 ,TETRA ,17589507,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:36:55 CET,0.0 0.793 1.11 1.354 1.558 1.764 1.978 2.174 2.478 2.624 2.77 2.83 3.178 3.306 3.575 3.822 4.039 4.143 4.348 4.542 4.809 4.989 5.214 5.598 5.952 6.279 6.6 6.909 7.301 7.679 8.036 8.462 8.865 9.254 9.711 10.221 10.699 11.213 11.764 12.35 12.958 13.639 14.448 15.223 16.112 17.149 18.345 19.64 21.057 22.623 24.466 25.917 26.616 26.93 27.033 27.004 26.917 26.807 26.688 26.516 26.328 26.151 25.993 25.856 25.714 25.576 25.431 25.288 25.156 25.01 24.851 24.73 24.605 24.463 24.35 24.231 24.103 23.965 23.815 23.714 23.61 23.447 23.315 23.173 23.106 22.965 22.81 22.628 22.533 22.247 22.259 22.159 22.05 21.812 21.677 21.536 21.369 21.21 21.005 20.672 20.04 -4 ,16071 ,TETRA ,17589508,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:33:19 CET,0.0 1.175 1.494 1.756 2.014 2.217 2.401 2.568 2.867 3.007 3.144 3.207 3.555 3.685 3.945 4.199 4.424 4.53 4.743 4.945 5.221 5.4 5.589 5.874 6.143 6.39 6.624 6.846 7.127 7.402 7.667 7.992 8.304 8.606 8.969 9.379 9.78 10.234 10.699 11.183 11.706 12.3 12.978 13.646 14.448 15.428 16.628 17.952 19.415 21.096 23.093 24.587 25.357 25.769 25.981 26.056 26.076 26.057 25.992 25.908 25.799 25.689 25.564 25.426 25.298 25.157 24.997 24.852 24.706 24.544 24.38 24.24 24.107 23.97 23.85 23.713 23.564 23.422 23.262 23.158 23.058 22.88 22.757 22.619 22.55 22.416 22.273 22.128 22.055 21.786 21.817 21.712 21.608 21.408 21.28 21.15 21.02 20.848 20.607 20.317 19.898 -5 ,17463 ,TETRA ,17589509,Sat Nov 27 17:16:31 CET,Sat Nov 27 19:32:40 CET,0.0 0.785 1.167 1.47 1.674 1.851 2.045 2.245 2.566 2.7 2.839 2.893 3.245 3.371 3.595 3.808 4.038 4.153 4.36 4.548 4.826 5.002 5.172 5.428 5.691 5.946 6.183 6.407 6.686 6.96 7.233 7.557 7.875 8.187 8.527 8.911 9.288 9.695 10.152 10.652 11.173 11.745 12.39 13.055 13.85 14.704 15.694 16.777 18.009 19.456 21.12 22.325 22.826 23.049 23.137 23.149 23.074 22.951 22.831 22.693 22.56 22.41 22.253 22.121 21.981 21.813 21.628 21.474 21.335 21.176 20.995 20.844 20.697 20.536 20.396 20.26 20.139 20.009 19.871 19.766 19.651 19.475 19.352 19.218 19.151 19.007 18.851 18.697 18.617 18.334 18.334 18.231 18.123 17.874 17.743 17.58 17.377 17.177 16.953 16.668 15.711 -6 ,6205 ,TETRA ,17589510,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:29:17 CET,0.0 1.106 1.409 1.669 1.891 2.093 2.271 2.441 2.78 2.928 3.064 3.096 3.434 3.555 3.798 4.027 4.25 4.357 4.551 4.74 5.043 5.242 5.427 5.696 5.946 6.19 6.438 6.679 6.977 7.278 7.565 7.896 8.218 8.52 8.874 9.26 9.623 10.026 10.492 11.0 11.491 12.053 12.71 13.356 14.109 14.918 15.845 16.881 18.087 19.492 21.035 22.169 22.71 22.918 22.988 23.002 22.959 22.803 22.577 22.36 22.192 22.032 21.861 21.691 21.539 21.406 21.271 21.133 21.003 20.873 20.716 20.575 20.438 20.284 20.15 20.018 19.897 19.767 19.617 19.507 19.384 19.194 19.074 18.947 18.87 18.699 18.528 18.346 18.253 17.96 17.931 17.8 17.672 17.413 17.261 17.095 16.901 16.68 16.415 16.076 15.136 -7 ,11889 ,TETRA ,17589511,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:33:54 CET,0.0 1.23 1.614 1.931 2.194 2.427 2.607 2.775 3.104 3.256 3.395 3.428 3.769 3.897 4.131 4.367 4.597 4.703 4.915 5.118 5.427 5.623 5.795 6.055 6.308 6.548 6.785 7.009 7.306 7.592 7.863 8.178 8.479 8.792 9.16 9.555 9.918 10.321 10.738 11.187 11.707 12.287 12.96 13.608 14.356 15.226 16.206 17.33 18.662 20.072 21.561 22.701 23.238 23.447 23.49 23.454 23.382 23.273 23.149 22.966 22.754 22.529 22.328 22.167 22.009 21.879 21.726 21.579 21.453 21.318 21.18 21.038 20.88 20.736 20.627 20.511 20.378 20.225 20.076 19.972 19.872 19.713 19.594 19.463 19.385 19.231 19.07 18.889 18.781 18.475 18.463 18.347 18.222 17.954 17.818 17.671 17.505 17.329 17.143 16.932 16.033 -8 ,3804 ,TETRA ,17589512,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:29:48 CET,0.0 0.861 1.179 1.431 1.657 1.856 2.029 2.19 2.502 2.644 2.788 2.86 3.194 3.312 3.564 3.807 4.028 4.139 4.364 4.578 4.863 5.045 5.23 5.489 5.747 6.003 6.249 6.491 6.807 7.117 7.407 7.765 8.107 8.43 8.813 9.241 9.654 10.092 10.561 11.062 11.641 12.372 13.212 14.044 15.004 16.02 17.221 18.613 20.102 21.724 23.573 24.891 25.604 26.025 26.193 26.261 26.226 26.115 25.998 25.845 25.704 25.557 25.38 25.221 25.045 24.855 24.656 24.447 24.266 24.098 23.943 23.82 23.655 23.47 23.34 23.202 23.04 22.861 22.677 22.559 22.436 22.212 22.063 21.938 21.87 21.7 21.511 21.298 21.188 20.887 20.866 20.756 20.64 20.413 20.283 20.101 19.903 19.7 19.467 19.202 17.964 -9 ,23170 ,TETRA ,17589513,Sat Nov 27 17:16:33 CET,Sat Nov 27 19:32:35 CET,0.0 0.462 0.73 0.943 1.148 1.357 1.541 1.708 2.018 2.154 2.306 2.375 2.715 2.835 3.059 3.274 3.495 3.603 3.811 4.011 4.281 4.448 4.624 4.897 5.151 5.391 5.625 5.851 6.132 6.404 6.675 6.999 7.309 7.61 7.962 8.352 8.721 9.158 9.72 10.369 11.011 11.717 12.542 13.34 14.267 15.327 16.587 17.942 19.457 21.198 23.145 24.533 25.191 25.55 25.697 25.67 25.62 25.563 25.462 25.346 25.233 25.12 24.986 24.823 24.662 24.51 24.337 24.183 24.061 23.933 23.777 23.615 23.441 23.271 23.14 23.006 22.864 22.718 22.564 22.456 22.342 22.156 22.022 21.88 21.814 21.686 21.542 21.372 21.275 20.979 20.98 20.877 20.759 20.492 20.351 20.211 20.075 19.91 19.664 19.347 18.694 -10 ,7441 ,TETRA ,17589514,Sat Nov 27 17:16:33 CET,Sat Nov 27 19:33:50 CET,0.0 0.603 0.865 1.091 1.313 1.522 1.702 1.866 2.167 2.304 2.449 2.5 2.84 2.963 3.188 3.402 3.6 3.705 3.92 4.114 4.382 4.563 4.757 5.06 5.392 5.737 6.072 6.408 6.83 7.208 7.555 7.97 8.372 8.757 9.203 9.701 10.189 10.739 11.321 11.936 12.576 13.308 14.128 14.913 15.867 16.933 18.13 19.398 20.867 22.596 24.545 26.042 26.792 27.231 27.46 27.545 27.531 27.441 27.352 27.2 27.025 26.868 26.72 26.596 26.472 26.337 26.187 26.056 25.932 25.797 25.646 25.505 25.368 25.233 25.121 25.011 24.882 24.735 24.587 24.483 24.372 24.199 24.092 23.98 23.909 23.76 23.612 23.444 23.356 23.068 23.058 22.951 22.853 22.629 22.492 22.365 22.252 22.114 21.954 21.739 21.146 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt deleted file mode 100644 index 71ad8488..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4615 ,TETRA ,17589515,Sat Nov 27 17:16:35 CET,Sat Nov 27 19:34:21 CET,0.0 0.486 0.757 1.014 1.215 1.402 1.575 1.726 1.986 2.111 2.246 2.278 2.605 2.722 2.956 3.167 3.375 3.482 3.686 3.876 4.16 4.347 4.523 4.762 4.992 5.217 5.438 5.66 5.962 6.255 6.525 6.852 7.161 7.458 7.803 8.187 8.562 8.971 9.412 9.892 10.395 10.95 11.588 12.215 12.946 13.829 14.88 16.028 17.368 18.895 20.724 22.128 22.759 23.043 23.184 23.242 23.227 23.148 23.037 22.914 22.794 22.693 22.588 22.465 22.332 22.197 22.053 21.922 21.809 21.684 21.536 21.406 21.277 21.148 21.054 20.947 20.82 20.688 20.549 20.461 20.375 20.236 20.136 20.022 19.959 19.822 19.68 19.539 19.468 19.197 19.223 19.129 19.031 18.818 18.693 18.565 18.449 18.298 18.112 17.917 17.474 -2 ,32031 ,TETRA ,17589516,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:33:05 CET,0.0 0.552 0.76 0.951 1.16 1.364 1.54 1.692 1.971 2.107 2.251 2.304 2.649 2.776 3.009 3.218 3.402 3.493 3.682 3.862 4.114 4.28 4.445 4.679 4.909 5.143 5.364 5.573 5.844 6.105 6.357 6.654 6.961 7.28 7.645 8.036 8.418 8.84 9.303 9.815 10.336 10.913 11.556 12.185 12.949 13.822 14.814 15.892 17.127 18.62 20.315 21.539 22.162 22.455 22.584 22.606 22.544 22.442 22.338 22.234 22.142 22.04 21.91 21.785 21.676 21.556 21.421 21.289 21.161 21.025 20.883 20.778 20.677 20.556 20.453 20.345 20.225 20.088 19.946 19.847 19.736 19.565 19.447 19.325 19.267 19.125 18.978 18.825 18.743 18.468 18.482 18.391 18.308 18.099 17.966 17.834 17.688 17.525 17.301 17.033 16.587 -3 ,27532 ,TETRA ,17589517,Sat Nov 27 17:16:32 CET,Sat Nov 27 19:33:38 CET,0.0 0.467 0.746 0.987 1.191 1.389 1.558 1.704 1.979 2.114 2.248 2.297 2.647 2.767 2.997 3.221 3.439 3.543 3.731 3.926 4.205 4.37 4.538 4.775 5.005 5.24 5.474 5.692 5.955 6.209 6.463 6.788 7.112 7.417 7.768 8.171 8.541 8.946 9.412 9.896 10.372 10.902 11.549 12.233 13.007 13.847 14.831 15.947 17.237 18.691 20.364 21.601 22.183 22.511 22.7 22.784 22.766 22.694 22.6 22.471 22.363 22.248 22.125 22.003 21.873 21.737 21.591 21.467 21.351 21.226 21.085 20.961 20.834 20.7 20.596 20.479 20.349 20.224 20.093 19.992 19.89 19.728 19.61 19.501 19.444 19.309 19.18 19.055 18.986 18.713 18.75 18.669 18.574 18.353 18.238 18.134 18.006 17.854 17.708 17.524 17.203 -4 ,8835 ,TETRA ,17589518,Sat Nov 27 17:16:33 CET,Sat Nov 27 19:34:37 CET,0.0 0.499 0.814 1.036 1.225 1.421 1.6 1.753 2.027 2.171 2.318 2.363 2.694 2.8 3.024 3.233 3.421 3.524 3.728 3.913 4.182 4.358 4.53 4.779 5.02 5.247 5.465 5.674 5.932 6.182 6.422 6.715 7.015 7.307 7.646 8.034 8.403 8.818 9.264 9.73 10.215 10.747 11.384 12.057 12.859 13.721 14.693 15.8 17.069 18.555 20.361 21.693 22.337 22.675 22.827 22.895 22.888 22.824 22.744 22.635 22.52 22.413 22.297 22.178 22.054 21.932 21.806 21.684 21.582 21.471 21.349 21.254 21.15 21.034 20.942 20.842 20.725 20.6 20.474 20.39 20.304 20.162 20.059 19.96 19.904 19.782 19.667 19.539 19.464 19.19 19.227 19.141 19.051 18.87 18.767 18.632 18.504 18.389 18.246 18.084 17.816 -5 ,10547 ,TETRA ,17589519,Sat Nov 27 17:17:32 CET,Sat Nov 27 19:34:28 CET,0.0 0.732 1.0 1.2 1.376 1.54 1.707 1.868 2.158 2.291 2.429 2.506 2.857 2.967 3.17 3.383 3.59 3.689 3.889 4.083 4.368 4.555 4.729 4.97 5.197 5.416 5.644 5.877 6.166 6.451 6.731 7.032 7.314 7.616 7.98 8.372 8.733 9.13 9.558 10.02 10.519 11.082 11.738 12.409 13.164 13.978 14.956 16.073 17.386 18.884 20.545 21.873 22.593 22.97 23.156 23.218 23.239 23.198 23.118 23.027 22.921 22.824 22.724 22.61 22.48 22.347 22.204 22.077 21.972 21.853 21.719 21.6 21.479 21.356 21.266 21.171 21.062 20.934 20.792 20.701 20.607 20.458 20.352 20.246 20.193 20.074 19.937 19.786 19.713 19.454 19.515 19.437 19.36 19.192 19.085 18.965 18.848 18.701 18.529 18.348 18.063 -6 ,15355 ,TETRA ,17589520,Sat Nov 27 17:16:34 CET,Sat Nov 27 19:34:18 CET,0.0 0.667 0.943 1.163 1.363 1.544 1.701 1.851 2.134 2.262 2.384 2.388 2.723 2.836 3.046 3.265 3.47 3.564 3.752 3.941 4.218 4.391 4.558 4.815 5.065 5.31 5.541 5.759 6.044 6.309 6.562 6.889 7.198 7.479 7.809 8.176 8.533 8.945 9.411 9.903 10.392 10.954 11.612 12.227 12.935 13.75 14.715 15.781 17.04 18.612 20.415 21.803 22.477 22.822 23.011 23.072 23.07 23.037 22.973 22.87 22.768 22.673 22.561 22.428 22.3 22.183 22.044 21.907 21.783 21.653 21.503 21.372 21.23 21.084 20.985 20.879 20.757 20.615 20.473 20.384 20.286 20.127 20.024 19.911 19.849 19.712 19.57 19.426 19.346 19.058 19.074 18.986 18.89 18.665 18.544 18.43 18.285 18.109 17.927 17.713 17.349 -7 ,13747 ,TETRA ,17589521,Sat Nov 27 17:16:37 CET,Sat Nov 27 19:34:30 CET,0.0 0.69 0.961 1.213 1.444 1.652 1.835 1.989 2.282 2.421 2.552 2.588 2.92 3.036 3.263 3.494 3.712 3.815 4.019 4.216 4.486 4.664 4.844 5.104 5.36 5.601 5.837 6.057 6.337 6.611 6.873 7.186 7.472 7.77 8.124 8.516 8.894 9.306 9.758 10.226 10.714 11.282 11.957 12.624 13.373 14.217 15.194 16.264 17.545 18.969 20.629 21.979 22.664 23.03 23.227 23.292 23.269 23.21 23.124 23.019 22.898 22.757 22.608 22.479 22.361 22.246 22.125 22.007 21.895 21.767 21.63 21.519 21.402 21.281 21.178 21.062 20.937 20.809 20.674 20.584 20.487 20.323 20.205 20.075 20.002 19.849 19.696 19.534 19.453 19.167 19.166 19.079 18.999 18.801 18.674 18.538 18.406 18.262 18.09 17.886 17.508 -8 ,7149 ,TETRA ,17589522,Sat Nov 27 17:16:38 CET,Sat Nov 27 19:33:39 CET,0.0 0.536 0.825 1.06 1.277 1.482 1.659 1.833 2.147 2.286 2.423 2.461 2.782 2.89 3.109 3.325 3.532 3.629 3.818 4.005 4.28 4.454 4.632 4.89 5.122 5.354 5.582 5.794 6.076 6.359 6.628 6.973 7.301 7.606 7.962 8.351 8.735 9.149 9.591 10.086 10.594 11.138 11.766 12.422 13.242 14.146 15.142 16.223 17.461 18.894 20.624 22.014 22.727 23.061 23.215 23.26 23.254 23.238 23.177 23.073 22.979 22.891 22.773 22.651 22.547 22.446 22.306 22.168 22.053 21.913 21.767 21.662 21.557 21.437 21.33 21.204 21.075 20.959 20.829 20.74 20.651 20.503 20.401 20.29 20.229 20.106 19.989 19.86 19.788 19.515 19.533 19.441 19.353 19.155 19.05 18.941 18.814 18.658 18.451 18.19 17.886 -9 ,4629 ,TETRA ,17589523,Sat Nov 27 17:17:31 CET,Sat Nov 27 19:33:47 CET,0.0 0.954 1.242 1.457 1.681 1.893 2.06 2.22 2.55 2.697 2.823 2.84 3.173 3.283 3.51 3.738 3.955 4.056 4.258 4.461 4.75 4.926 5.102 5.367 5.624 5.863 6.089 6.321 6.615 6.899 7.179 7.501 7.806 8.117 8.489 8.901 9.314 9.771 10.242 10.742 11.275 11.869 12.533 13.193 13.962 14.838 15.863 16.992 18.317 19.875 21.676 23.007 23.675 24.007 24.11 24.128 24.105 24.063 24.013 23.913 23.806 23.691 23.543 23.401 23.251 23.108 22.963 22.823 22.698 22.557 22.403 22.286 22.168 22.023 21.902 21.778 21.652 21.513 21.352 21.248 21.156 20.998 20.881 20.757 20.69 20.552 20.411 20.265 20.187 19.901 19.92 19.823 19.718 19.508 19.396 19.28 19.144 18.98 18.75 18.479 18.121 -10 ,17658 ,TETRA ,17589524,Sat Nov 27 17:16:34 CET,Sat Nov 27 19:36:19 CET,0.0 0.553 0.833 1.091 1.281 1.447 1.613 1.765 2.023 2.142 2.268 2.309 2.65 2.769 2.995 3.207 3.404 3.505 3.714 3.907 4.184 4.359 4.517 4.754 4.993 5.232 5.464 5.684 5.96 6.228 6.491 6.794 7.093 7.404 7.761 8.154 8.532 8.945 9.397 9.881 10.383 10.944 11.578 12.218 13.002 13.851 14.843 15.994 17.306 18.861 20.728 22.083 22.774 23.172 23.403 23.529 23.577 23.566 23.54 23.482 23.389 23.281 23.163 23.042 22.903 22.777 22.648 22.519 22.408 22.285 22.148 22.029 21.898 21.756 21.648 21.544 21.425 21.294 21.155 21.059 20.957 20.791 20.677 20.573 20.518 20.389 20.254 20.108 20.036 19.764 19.789 19.69 19.593 19.401 19.289 19.161 19.034 18.9 18.749 18.528 18.18 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 9099290d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8542 ,TETRA ,17589525,Sat Nov 27 17:16:36 CET,Sat Nov 27 19:35:47 CET,0.0 0.625 0.931 1.201 1.414 1.587 1.763 1.937 2.228 2.366 2.502 2.525 2.85 2.96 3.174 3.383 3.579 3.662 3.83 4.003 4.25 4.409 4.564 4.796 5.012 5.23 5.441 5.625 5.866 6.103 6.342 6.627 6.893 7.15 7.434 7.746 8.048 8.359 8.672 9.033 9.423 9.901 10.521 11.161 11.903 12.718 13.626 14.578 15.63 16.789 18.086 18.921 19.137 19.102 18.928 18.679 18.46 18.24 17.992 17.758 17.553 17.314 17.056 16.801 16.569 16.357 16.129 15.902 15.702 15.505 15.302 15.144 14.994 14.845 14.714 14.581 14.459 14.316 14.145 14.036 13.931 13.75 13.619 13.476 13.405 13.27 13.146 13.01 12.922 12.626 12.636 12.523 12.412 12.184 12.056 11.902 11.736 11.554 11.339 11.126 10.615 -2 ,18687 ,TETRA ,17589526,Sat Nov 27 17:17:31 CET,Sat Nov 27 19:31:59 CET,0.0 0.739 1.024 1.247 1.462 1.669 1.851 1.993 2.254 2.376 2.494 2.496 2.81 2.902 3.094 3.278 3.459 3.56 3.804 4.074 4.443 4.678 4.912 5.245 5.57 5.884 6.184 6.473 6.831 7.155 7.467 7.848 8.205 8.533 8.908 9.336 9.751 10.197 10.668 11.165 11.665 12.226 12.894 13.542 14.265 15.075 15.982 16.951 18.078 19.249 20.404 21.2 21.498 21.505 21.435 21.344 21.195 20.991 20.775 20.55 20.334 20.093 19.838 19.606 19.374 19.153 18.924 18.734 18.579 18.409 18.237 18.098 17.941 17.76 17.619 17.478 17.323 17.148 16.968 16.849 16.723 16.525 16.392 16.263 16.193 16.042 15.88 15.714 15.634 15.343 15.35 15.244 15.132 14.895 14.772 14.645 14.492 14.286 14.08 13.824 13.288 -3 ,14753 ,TETRA ,17589527,Sat Nov 27 17:17:31 CET,Sat Nov 27 19:37:21 CET,0.0 0.81 1.082 1.328 1.507 1.671 1.811 1.936 2.196 2.325 2.445 2.443 2.759 2.855 3.047 3.248 3.428 3.512 3.686 3.86 4.11 4.266 4.415 4.619 4.816 5.009 5.186 5.361 5.597 5.826 6.037 6.284 6.539 6.797 7.082 7.381 7.68 8.024 8.398 8.772 9.161 9.6 10.11 10.657 11.289 11.957 12.702 13.519 14.416 15.351 16.305 16.848 16.969 16.956 16.837 16.649 16.43 16.205 16.004 15.79 15.586 15.372 15.146 14.928 14.735 14.559 14.359 14.175 14.01 13.83 13.635 13.476 13.308 13.136 13.002 12.853 12.694 12.54 12.386 12.265 12.137 11.955 11.833 11.698 11.626 11.481 11.333 11.167 11.08 10.775 10.77 10.658 10.544 10.301 10.169 10.023 9.861 9.676 9.465 9.2 8.775 -4 ,5441 ,TETRA ,17589528,Sat Nov 27 17:17:32 CET,Sat Nov 27 19:28:49 CET,0.0 0.702 0.951 1.129 1.304 1.472 1.618 1.758 2.023 2.14 2.251 2.252 2.575 2.682 2.869 3.035 3.212 3.299 3.462 3.612 3.836 3.98 4.122 4.342 4.557 4.764 4.956 5.146 5.385 5.617 5.847 6.106 6.346 6.572 6.825 7.125 7.434 7.775 8.132 8.501 8.881 9.295 9.795 10.302 10.865 11.457 12.089 12.779 13.556 14.392 15.291 15.807 15.901 15.882 15.772 15.589 15.354 15.093 14.86 14.603 14.363 14.151 13.955 13.743 13.54 13.348 13.123 12.925 12.755 12.581 12.399 12.233 12.06 11.876 11.736 11.592 11.438 11.267 11.09 10.973 10.847 10.646 10.5 10.342 10.258 10.078 9.887 9.688 9.588 9.282 9.274 9.165 9.055 8.805 8.663 8.503 8.34 8.178 7.964 7.674 7.225 -5 ,28028 ,TETRA ,17589529,Sat Nov 27 17:17:32 CET,Sat Nov 27 19:34:42 CET,0.0 0.649 0.986 1.184 1.382 1.556 1.715 1.852 2.118 2.256 2.382 2.385 2.71 2.812 3.004 3.187 3.362 3.448 3.63 3.799 4.036 4.193 4.338 4.535 4.727 4.93 5.121 5.301 5.54 5.754 5.962 6.237 6.508 6.76 7.046 7.373 7.689 8.019 8.371 8.741 9.125 9.553 10.066 10.611 11.202 11.802 12.486 13.278 14.11 14.884 15.692 16.09 16.063 15.934 15.74 15.49 15.225 14.933 14.648 14.343 14.065 13.82 13.59 13.368 13.152 12.939 12.726 12.529 12.354 12.187 12.01 11.854 11.688 11.501 11.343 11.187 11.036 10.871 10.692 10.571 10.456 10.265 10.121 9.982 9.914 9.767 9.603 9.429 9.342 9.046 9.088 8.99 8.881 8.648 8.506 8.349 8.19 8.006 7.77 7.501 5.948 -6 ,31744 ,TETRA ,17589530,Sat Nov 27 17:17:32 CET,Sat Nov 27 19:25:54 CET,0.0 0.8 1.13 1.32 1.494 1.643 1.776 1.913 2.178 2.315 2.45 2.468 2.794 2.899 3.094 3.296 3.482 3.563 3.73 3.888 4.105 4.251 4.398 4.615 4.837 5.047 5.268 5.523 5.877 6.215 6.528 6.883 7.228 7.568 7.961 8.399 8.797 9.23 9.685 10.161 10.66 11.193 11.826 12.471 13.171 13.926 14.769 15.679 16.72 17.849 18.982 19.711 19.905 19.818 19.704 19.532 19.333 19.128 18.912 18.658 18.438 18.239 18.016 17.791 17.594 17.41 17.206 17.016 16.856 16.681 16.484 16.323 16.163 15.997 15.857 15.714 15.569 15.42 15.266 15.147 15.026 14.847 14.718 14.586 14.516 14.366 14.204 14.03 13.938 13.645 13.662 13.552 13.432 13.176 13.044 12.887 12.703 12.506 12.262 11.964 11.356 -7 ,30461 ,TETRA ,17589531,Sat Nov 27 17:17:32 CET,Sat Nov 27 19:34:50 CET,0.0 0.486 0.817 1.067 1.266 1.461 1.655 1.832 2.129 2.269 2.403 2.42 2.754 2.865 3.081 3.282 3.473 3.56 3.724 3.886 4.126 4.28 4.441 4.691 4.915 5.126 5.333 5.529 5.784 6.026 6.242 6.514 6.778 7.025 7.311 7.628 7.943 8.289 8.652 9.03 9.436 9.888 10.429 10.963 11.545 12.158 12.812 13.542 14.361 15.266 16.131 16.539 16.557 16.396 16.176 15.891 15.57 15.238 14.911 14.584 14.285 13.988 13.73 13.509 13.295 13.093 12.895 12.718 12.543 12.36 12.166 11.981 11.789 11.604 11.461 11.32 11.186 11.046 10.893 10.778 10.65 10.47 10.348 10.215 10.148 10.016 9.869 9.695 9.605 9.306 9.318 9.195 9.064 8.803 8.656 8.483 8.305 8.102 7.863 7.609 6.926 -8 ,19891 ,TETRA ,17589532,Sat Nov 27 17:17:32 CET,Sat Nov 27 19:35:21 CET,0.0 0.91 1.186 1.37 1.528 1.667 1.798 1.94 2.224 2.343 2.455 2.471 2.776 2.87 3.053 3.213 3.368 3.453 3.621 3.773 3.993 4.14 4.285 4.496 4.701 4.917 5.165 5.428 5.764 6.073 6.378 6.765 7.129 7.485 7.887 8.31 8.704 9.128 9.578 10.061 10.59 11.196 11.877 12.522 13.224 14.013 14.918 15.895 17.006 18.236 19.483 20.203 20.427 20.385 20.223 19.992 19.754 19.541 19.352 19.132 18.908 18.683 18.439 18.208 17.988 17.766 17.53 17.318 17.139 16.963 16.767 16.596 16.421 16.228 16.077 15.927 15.767 15.611 15.462 15.354 15.244 15.067 14.94 14.812 14.742 14.586 14.42 14.25 14.156 13.848 13.84 13.722 13.602 13.349 13.221 13.089 12.934 12.746 12.5 12.214 11.796 -9 ,16958 ,TETRA ,17589533,Sat Nov 27 17:18:31 CET,Sat Nov 27 19:38:52 CET,0.0 0.758 0.954 1.106 1.284 1.459 1.598 1.732 1.989 2.118 2.236 2.217 2.543 2.658 2.871 3.062 3.239 3.327 3.495 3.66 3.889 4.038 4.188 4.398 4.59 4.783 4.975 5.168 5.415 5.652 5.884 6.153 6.435 6.759 7.178 7.642 8.053 8.487 8.958 9.451 9.965 10.526 11.176 11.838 12.582 13.383 14.276 15.244 16.304 17.518 18.838 19.647 19.947 19.963 19.858 19.693 19.497 19.293 19.095 18.859 18.626 18.394 18.163 17.936 17.705 17.5 17.294 17.104 16.937 16.765 16.577 16.407 16.218 16.008 15.854 15.708 15.55 15.378 15.197 15.082 14.971 14.788 14.645 14.484 14.399 14.241 14.087 13.914 13.813 13.49 13.458 13.345 13.231 12.978 12.832 12.688 12.554 12.38 12.153 11.851 10.956 -10 ,15681 ,TETRA ,17589534,Sat Nov 27 17:17:32 CET,Sat Nov 27 19:35:27 CET,0.0 1.026 1.288 1.5 1.676 1.844 2.009 2.169 2.458 2.59 2.719 2.752 3.086 3.193 3.404 3.608 3.796 3.887 4.061 4.218 4.433 4.574 4.721 4.949 5.158 5.358 5.56 5.754 5.994 6.218 6.45 6.782 7.134 7.473 7.863 8.319 8.75 9.187 9.663 10.193 10.738 11.304 11.932 12.545 13.234 13.986 14.827 15.734 16.746 17.876 19.077 19.807 20.034 20.043 19.922 19.761 19.583 19.374 19.204 19.017 18.797 18.573 18.353 18.147 17.961 17.783 17.59 17.422 17.26 17.082 16.893 16.724 16.546 16.368 16.238 16.089 15.921 15.754 15.596 15.482 15.352 15.163 15.042 14.899 14.824 14.682 14.521 14.336 14.242 13.935 13.933 13.819 13.708 13.475 13.339 13.184 13.033 12.86 12.651 12.373 11.945 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index d31d29c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30853 ,TETRA ,17589535,Sat Nov 27 17:17:34 CET,Sat Nov 27 19:33:41 CET,0.0 0.605 0.868 1.062 1.229 1.362 1.493 1.601 1.792 1.89 1.976 1.947 2.227 2.301 2.436 2.575 2.716 2.785 2.919 3.04 3.198 3.293 3.387 3.523 3.647 3.773 3.89 4.006 4.166 4.314 4.462 4.647 4.813 4.957 5.112 5.274 5.418 5.6 5.805 5.983 6.142 6.318 6.52 6.702 6.893 7.061 7.211 7.304 7.282 7.068 6.362 5.25 4.251 3.331 2.519 1.783 1.125 0.533 0.007 -0.497 -0.914 -1.311 -1.685 -2.03 -2.367 -2.684 -2.999 -3.283 -3.545 -3.807 -4.058 -4.279 -4.53 -4.762 -4.934 -5.131 -5.339 -5.555 -5.78 -5.93 -6.082 -6.328 -6.507 -6.675 -6.753 -6.929 -7.122 -7.328 -7.436 -7.753 -7.776 -7.901 -8.026 -8.275 -8.412 -8.552 -8.718 -8.908 -9.096 -9.295 -10.009 -2 ,16025 ,TETRA ,17589536,Sat Nov 27 17:17:33 CET,Sat Nov 27 19:36:22 CET,0.0 0.32 0.507 0.681 0.837 0.95 1.066 1.188 1.416 1.518 1.614 1.591 1.873 1.943 2.081 2.225 2.372 2.439 2.554 2.663 2.834 2.948 3.065 3.233 3.386 3.528 3.676 3.824 3.982 4.124 4.277 4.463 4.627 4.774 4.946 5.145 5.317 5.505 5.724 5.923 6.117 6.332 6.566 6.797 7.035 7.273 7.492 7.625 7.646 7.524 6.98 5.996 5.072 4.264 3.537 2.839 2.2 1.611 1.111 0.595 0.122 -0.289 -0.653 -0.991 -1.31 -1.607 -1.923 -2.19 -2.409 -2.65 -2.905 -3.118 -3.344 -3.582 -3.782 -3.985 -4.186 -4.399 -4.616 -4.767 -4.92 -5.159 -5.332 -5.524 -5.621 -5.807 -6.009 -6.212 -6.316 -6.646 -6.671 -6.794 -6.922 -7.208 -7.369 -7.528 -7.681 -7.853 -8.057 -8.312 -8.917 -3 ,16147 ,TETRA ,17589537,Sat Nov 27 17:17:34 CET,Sat Nov 27 19:35:36 CET,0.0 0.311 0.546 0.723 0.883 1.038 1.183 1.313 1.561 1.67 1.779 1.792 2.097 2.186 2.367 2.54 2.689 2.76 2.893 3.037 3.25 3.369 3.484 3.655 3.816 3.975 4.132 4.283 4.463 4.625 4.792 4.977 5.137 5.293 5.465 5.654 5.845 6.054 6.26 6.454 6.646 6.853 7.075 7.292 7.522 7.718 7.87 7.98 8.009 7.812 7.209 6.191 5.195 4.334 3.577 2.903 2.274 1.669 1.144 0.599 0.131 -0.275 -0.661 -1.023 -1.355 -1.654 -1.966 -2.256 -2.509 -2.779 -3.061 -3.291 -3.518 -3.744 -3.921 -4.111 -4.314 -4.52 -4.724 -4.862 -5.007 -5.255 -5.418 -5.585 -5.678 -5.865 -6.059 -6.272 -6.38 -6.698 -6.719 -6.834 -6.952 -7.184 -7.311 -7.484 -7.677 -7.846 -8.043 -8.292 -8.789 -4 ,29585 ,TETRA ,17589538,Sat Nov 27 17:17:35 CET,Sat Nov 27 19:36:10 CET,0.0 0.328 0.556 0.735 0.894 1.035 1.164 1.285 1.49 1.582 1.676 1.652 1.946 2.041 2.217 2.369 2.513 2.576 2.695 2.812 3.0 3.121 3.233 3.399 3.557 3.707 3.846 3.971 4.125 4.278 4.429 4.597 4.75 4.909 5.096 5.286 5.459 5.651 5.848 6.045 6.255 6.502 6.748 6.954 7.222 7.512 7.722 7.879 7.927 7.731 7.154 6.238 5.391 4.599 3.866 3.212 2.64 2.074 1.572 1.084 0.649 0.259 -0.12 -0.474 -0.801 -1.099 -1.404 -1.697 -1.958 -2.215 -2.488 -2.724 -2.96 -3.182 -3.353 -3.545 -3.752 -3.963 -4.165 -4.31 -4.468 -4.704 -4.86 -5.016 -5.103 -5.291 -5.494 -5.717 -5.826 -6.14 -6.155 -6.28 -6.41 -6.697 -6.846 -6.997 -7.183 -7.397 -7.606 -7.834 -8.432 -5 ,3355 ,TETRA ,17589539,Sat Nov 27 17:17:34 CET,Sat Nov 27 19:34:05 CET,0.0 0.274 0.463 0.627 0.778 0.918 1.037 1.139 1.329 1.424 1.519 1.504 1.795 1.887 2.06 2.22 2.356 2.418 2.537 2.644 2.8 2.906 3.013 3.171 3.318 3.454 3.575 3.694 3.864 4.026 4.177 4.362 4.537 4.692 4.862 5.047 5.248 5.461 5.663 5.878 6.102 6.344 6.58 6.793 7.016 7.216 7.402 7.535 7.599 7.513 7.03 6.143 5.31 4.556 3.866 3.205 2.589 2.011 1.525 1.054 0.62 0.205 -0.202 -0.568 -0.881 -1.158 -1.468 -1.758 -2.009 -2.258 -2.504 -2.718 -2.932 -3.152 -3.331 -3.52 -3.727 -3.953 -4.208 -4.391 -4.563 -4.819 -5.008 -5.209 -5.318 -5.548 -5.791 -6.051 -6.172 -6.504 -6.563 -6.721 -6.876 -7.177 -7.358 -7.561 -7.776 -8.013 -8.279 -8.624 -9.356 -6 ,2704 ,TETRA ,17589540,Sat Nov 27 17:17:34 CET,Sat Nov 27 19:33:39 CET,0.0 0.469 0.759 0.968 1.131 1.279 1.422 1.543 1.753 1.848 1.943 1.94 2.244 2.323 2.458 2.595 2.732 2.796 2.925 3.055 3.244 3.364 3.468 3.621 3.765 3.904 4.042 4.167 4.338 4.505 4.657 4.828 4.981 5.125 5.299 5.492 5.672 5.876 6.092 6.296 6.488 6.697 6.913 7.114 7.332 7.533 7.696 7.793 7.774 7.601 7.055 6.122 5.269 4.491 3.808 3.184 2.597 2.073 1.645 1.19 0.782 0.422 0.07 -0.267 -0.578 -0.87 -1.175 -1.437 -1.67 -1.921 -2.175 -2.384 -2.604 -2.831 -3.005 -3.183 -3.372 -3.559 -3.758 -3.906 -4.046 -4.249 -4.403 -4.568 -4.648 -4.815 -4.993 -5.203 -5.32 -5.642 -5.679 -5.81 -5.94 -6.199 -6.331 -6.47 -6.619 -6.793 -6.987 -7.24 -7.77 -7 ,16652 ,TETRA ,17589541,Sat Nov 27 17:17:34 CET,Sat Nov 27 19:38:24 CET,0.0 0.387 0.572 0.746 0.916 1.057 1.181 1.3 1.514 1.608 1.69 1.637 1.916 1.999 2.166 2.319 2.448 2.51 2.645 2.78 2.974 3.094 3.204 3.37 3.53 3.671 3.81 3.946 4.113 4.279 4.444 4.626 4.801 4.966 5.143 5.34 5.542 5.756 5.976 6.205 6.397 6.601 6.847 7.078 7.329 7.579 7.796 7.948 8.042 7.976 7.496 6.601 5.702 4.838 4.077 3.428 2.849 2.307 1.852 1.376 0.948 0.569 0.214 -0.109 -0.413 -0.706 -1.02 -1.292 -1.527 -1.798 -2.083 -2.314 -2.541 -2.762 -2.952 -3.154 -3.374 -3.604 -3.829 -3.98 -4.128 -4.346 -4.502 -4.671 -4.759 -4.934 -5.11 -5.305 -5.406 -5.722 -5.751 -5.887 -6.026 -6.283 -6.421 -6.578 -6.757 -6.988 -7.265 -7.566 -8.33 -8 ,11916 ,TETRA ,17589542,Sat Nov 27 17:17:35 CET,Sat Nov 27 19:38:52 CET,0.0 0.237 0.397 0.567 0.722 0.863 0.986 1.103 1.33 1.425 1.512 1.473 1.758 1.838 1.986 2.126 2.256 2.316 2.433 2.559 2.753 2.871 2.983 3.139 3.286 3.429 3.563 3.692 3.866 4.034 4.189 4.367 4.528 4.688 4.872 5.071 5.254 5.448 5.648 5.837 6.03 6.247 6.498 6.731 6.956 7.162 7.363 7.506 7.529 7.359 6.76 5.819 4.934 4.08 3.318 2.626 1.994 1.445 0.988 0.525 0.134 -0.24 -0.62 -0.974 -1.286 -1.56 -1.848 -2.119 -2.369 -2.628 -2.887 -3.095 -3.323 -3.563 -3.744 -3.933 -4.125 -4.328 -4.538 -4.676 -4.824 -5.066 -5.235 -5.403 -5.492 -5.68 -5.862 -6.06 -6.163 -6.47 -6.452 -6.565 -6.68 -6.92 -7.051 -7.193 -7.354 -7.535 -7.708 -7.92 -8.332 -9 ,1996 ,TETRA ,17589543,Sat Nov 27 17:17:35 CET,Sat Nov 27 19:35:16 CET,0.0 0.468 0.67 0.838 0.98 1.093 1.205 1.314 1.496 1.587 1.681 1.641 1.933 2.016 2.176 2.326 2.458 2.523 2.654 2.777 2.94 3.048 3.162 3.327 3.482 3.639 3.785 3.915 4.082 4.24 4.392 4.572 4.738 4.91 5.115 5.318 5.491 5.69 5.921 6.142 6.353 6.557 6.773 7.006 7.244 7.455 7.664 7.805 7.792 7.563 6.963 5.965 5.012 4.173 3.436 2.745 2.119 1.553 1.076 0.617 0.221 -0.138 -0.484 -0.815 -1.121 -1.415 -1.745 -2.043 -2.298 -2.588 -2.897 -3.128 -3.363 -3.623 -3.842 -4.075 -4.312 -4.548 -4.821 -5.009 -5.181 -5.461 -5.652 -5.832 -5.928 -6.144 -6.342 -6.549 -6.675 -7.017 -7.118 -7.259 -7.4 -7.739 -7.92 -8.102 -8.308 -8.541 -8.839 -9.266 -10.319 -10 ,13953 ,TETRA ,17589544,Sat Nov 27 17:17:34 CET,Sat Nov 27 19:35:04 CET,0.0 0.377 0.585 0.757 0.905 1.021 1.128 1.227 1.417 1.522 1.621 1.601 1.89 1.964 2.103 2.245 2.388 2.457 2.593 2.73 2.924 3.033 3.13 3.265 3.407 3.547 3.673 3.789 3.928 4.064 4.206 4.383 4.56 4.727 4.902 5.09 5.279 5.466 5.66 5.865 6.045 6.23 6.435 6.622 6.835 7.038 7.216 7.341 7.355 7.192 6.628 5.671 4.701 3.792 2.989 2.268 1.632 1.027 0.495 -0.026 -0.465 -0.845 -1.201 -1.547 -1.882 -2.171 -2.459 -2.73 -2.96 -3.213 -3.492 -3.717 -3.948 -4.188 -4.378 -4.577 -4.785 -4.997 -5.225 -5.382 -5.534 -5.765 -5.93 -6.101 -6.193 -6.386 -6.57 -6.781 -6.896 -7.219 -7.253 -7.393 -7.544 -7.831 -7.978 -8.145 -8.331 -8.526 -8.765 -9.093 -9.873 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt deleted file mode 100644 index 8639389a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15273 ,TETRA ,17589545,Sat Nov 27 17:17:34 CET,Sat Nov 27 19:33:32 CET,0.0 0.389 0.649 0.846 1.02 1.174 1.313 1.451 1.724 1.85 1.971 2.01 2.325 2.433 2.645 2.851 3.037 3.126 3.299 3.472 3.719 3.87 4.014 4.219 4.423 4.636 4.839 5.037 5.292 5.528 5.754 6.033 6.294 6.538 6.814 7.126 7.43 7.766 8.129 8.525 8.947 9.396 9.939 10.496 11.118 11.824 12.667 13.628 14.728 15.963 17.346 18.309 18.75 18.945 18.97 18.946 18.917 18.846 18.743 18.625 18.523 18.41 18.27 18.128 17.992 17.855 17.716 17.597 17.492 17.377 17.246 17.119 16.972 16.826 16.72 16.602 16.469 16.335 16.212 16.126 16.032 15.881 15.774 15.662 15.6 15.474 15.351 15.225 15.155 14.898 14.934 14.845 14.745 14.549 14.453 14.354 14.242 14.105 13.954 13.75 13.477 -2 ,31055 ,TETRA ,17589546,Sat Nov 27 17:18:31 CET,Sat Nov 27 19:32:11 CET,0.0 0.676 0.959 1.177 1.346 1.501 1.66 1.811 2.076 2.201 2.321 2.342 2.663 2.775 2.998 3.207 3.384 3.468 3.642 3.812 4.049 4.198 4.348 4.562 4.778 5.004 5.209 5.401 5.656 5.895 6.133 6.427 6.707 6.977 7.292 7.663 8.012 8.38 8.772 9.179 9.606 10.109 10.716 11.315 11.997 12.741 13.594 14.584 15.716 16.99 18.484 19.578 20.123 20.373 20.446 20.417 20.347 20.254 20.143 20.014 19.896 19.767 19.603 19.44 19.285 19.146 19.001 18.844 18.708 18.575 18.436 18.322 18.204 18.072 17.959 17.84 17.712 17.574 17.426 17.325 17.216 17.029 16.903 16.77 16.706 16.589 16.464 16.316 16.225 15.94 15.958 15.865 15.768 15.551 15.424 15.294 15.17 15.037 14.887 14.66 13.954 -3 ,22091 ,TETRA ,17589547,Sat Nov 27 17:18:32 CET,Sat Nov 27 19:36:53 CET,0.0 0.282 0.499 0.676 0.831 0.983 1.143 1.301 1.553 1.658 1.763 1.769 2.072 2.183 2.404 2.596 2.766 2.853 3.025 3.185 3.418 3.575 3.731 3.953 4.174 4.399 4.613 4.809 5.053 5.288 5.515 5.794 6.069 6.328 6.62 6.952 7.286 7.67 8.068 8.461 8.893 9.388 9.969 10.571 11.256 12.016 12.882 13.818 14.888 16.157 17.598 18.639 19.118 19.323 19.392 19.385 19.32 19.226 19.116 18.979 18.871 18.741 18.603 18.48 18.347 18.222 18.082 17.939 17.81 17.676 17.53 17.401 17.265 17.129 17.031 16.916 16.787 16.655 16.511 16.419 16.324 16.163 16.059 15.957 15.897 15.76 15.623 15.482 15.405 15.142 15.157 15.066 14.957 14.723 14.602 14.471 14.342 14.196 13.982 13.672 12.639 -4 ,18763 ,TETRA ,17589548,Sat Nov 27 17:18:34 CET,Sat Nov 27 19:36:17 CET,0.0 0.43 0.698 0.859 1.017 1.161 1.292 1.413 1.657 1.772 1.887 1.915 2.228 2.344 2.567 2.772 2.958 3.045 3.21 3.369 3.612 3.778 3.937 4.163 4.386 4.594 4.783 4.97 5.227 5.462 5.683 5.969 6.25 6.529 6.838 7.18 7.518 7.88 8.267 8.69 9.153 9.652 10.207 10.774 11.438 12.186 13.05 13.999 15.056 16.276 17.663 18.635 19.118 19.338 19.415 19.407 19.347 19.254 19.143 19.005 18.848 18.708 18.575 18.429 18.299 18.177 18.025 17.874 17.742 17.623 17.5 17.379 17.258 17.133 17.025 16.911 16.776 16.634 16.498 16.402 16.308 16.162 16.053 15.932 15.866 15.74 15.605 15.449 15.373 15.099 15.109 15.015 14.916 14.717 14.607 14.487 14.344 14.194 14.046 13.832 13.395 -5 ,14283 ,TETRA ,17589549,Sat Nov 27 17:18:35 CET,Sat Nov 27 19:35:38 CET,0.0 0.329 0.534 0.71 0.889 1.061 1.203 1.329 1.583 1.71 1.831 1.839 2.151 2.251 2.435 2.614 2.789 2.882 3.068 3.246 3.499 3.661 3.815 4.033 4.255 4.473 4.683 4.879 5.121 5.365 5.606 5.89 6.156 6.425 6.763 7.127 7.448 7.791 8.184 8.608 9.04 9.538 10.136 10.723 11.378 12.081 12.903 13.864 14.932 16.141 17.632 18.762 19.274 19.523 19.638 19.652 19.617 19.546 19.454 19.332 19.183 19.039 18.895 18.742 18.603 18.477 18.334 18.176 18.034 17.899 17.756 17.627 17.487 17.351 17.244 17.127 17.013 16.893 16.757 16.657 16.543 16.348 16.209 16.077 16.016 15.884 15.732 15.566 15.484 15.21 15.207 15.113 15.028 14.832 14.704 14.555 14.406 14.249 14.061 13.831 13.12 -6 ,10760 ,TETRA ,17589550,Sat Nov 27 17:18:32 CET,Sat Nov 27 19:35:43 CET,0.0 0.457 0.696 0.896 1.065 1.242 1.431 1.604 1.907 2.033 2.158 2.2 2.512 2.623 2.832 3.041 3.248 3.34 3.509 3.687 3.951 4.106 4.258 4.49 4.713 4.918 5.105 5.295 5.562 5.821 6.07 6.362 6.653 6.935 7.252 7.607 7.938 8.295 8.686 9.115 9.58 10.091 10.671 11.239 11.882 12.613 13.463 14.405 15.493 16.774 18.163 19.104 19.599 19.824 19.882 19.872 19.811 19.696 19.568 19.411 19.251 19.106 18.963 18.816 18.666 18.52 18.361 18.216 18.083 17.938 17.773 17.632 17.488 17.325 17.185 17.049 16.922 16.785 16.623 16.509 16.398 16.222 16.082 15.921 15.845 15.707 15.576 15.439 15.362 15.093 15.088 14.985 14.874 14.617 14.483 14.358 14.225 14.067 13.871 13.648 13.273 -7 ,16264 ,TETRA ,17589551,Sat Nov 27 17:18:33 CET,Sat Nov 27 19:36:30 CET,0.0 0.384 0.649 0.874 1.069 1.241 1.402 1.547 1.799 1.925 2.051 2.081 2.389 2.49 2.703 2.899 3.076 3.165 3.346 3.523 3.777 3.937 4.087 4.311 4.527 4.735 4.944 5.151 5.414 5.649 5.867 6.142 6.416 6.683 7.002 7.356 7.706 8.084 8.474 8.9 9.354 9.863 10.446 11.043 11.752 12.518 13.368 14.333 15.434 16.653 17.987 18.942 19.412 19.657 19.732 19.683 19.578 19.444 19.312 19.172 19.026 18.877 18.725 18.551 18.378 18.228 18.068 17.919 17.783 17.635 17.473 17.344 17.209 17.054 16.934 16.819 16.697 16.555 16.412 16.314 16.206 16.032 15.907 15.771 15.697 15.553 15.416 15.265 15.18 14.908 14.934 14.843 14.735 14.478 14.341 14.18 13.993 13.773 13.532 13.293 12.841 -8 ,4742 ,TETRA ,17589552,Sat Nov 27 17:18:35 CET,Sat Nov 27 19:35:49 CET,0.0 0.421 0.662 0.864 1.015 1.159 1.313 1.456 1.712 1.834 1.955 1.986 2.308 2.418 2.632 2.828 3.008 3.092 3.245 3.394 3.625 3.785 3.939 4.156 4.373 4.579 4.772 4.964 5.216 5.468 5.71 5.989 6.256 6.514 6.811 7.161 7.516 7.906 8.325 8.754 9.202 9.705 10.295 10.908 11.604 12.367 13.251 14.208 15.316 16.61 18.05 19.054 19.512 19.721 19.78 19.763 19.669 19.545 19.426 19.264 19.083 18.915 18.773 18.615 18.454 18.303 18.136 17.991 17.871 17.733 17.577 17.455 17.323 17.172 17.054 16.921 16.769 16.626 16.485 16.384 16.286 16.14 16.031 15.9 15.834 15.709 15.583 15.448 15.365 15.074 15.063 14.953 14.843 14.613 14.496 14.376 14.212 14.011 13.748 13.467 12.955 -9 ,25572 ,TETRA ,17589553,Sat Nov 27 17:18:37 CET,Sat Nov 27 19:36:20 CET,0.0 0.407 0.636 0.818 0.982 1.129 1.283 1.444 1.729 1.849 1.967 1.982 2.284 2.378 2.566 2.742 2.908 2.993 3.155 3.324 3.593 3.753 3.907 4.124 4.328 4.53 4.731 4.927 5.179 5.425 5.679 5.995 6.276 6.532 6.831 7.17 7.501 7.884 8.287 8.726 9.189 9.681 10.234 10.799 11.467 12.212 13.064 13.998 15.109 16.409 17.845 18.868 19.358 19.6 19.676 19.648 19.591 19.487 19.363 19.236 19.096 18.947 18.779 18.614 18.469 18.32 18.146 17.992 17.852 17.705 17.567 17.44 17.295 17.15 17.045 16.94 16.818 16.681 16.544 16.445 16.326 16.14 16.027 15.916 15.854 15.71 15.568 15.43 15.351 15.071 15.058 14.962 14.863 14.656 14.537 14.4 14.261 14.096 13.911 13.678 13.233 -10 ,21701 ,TETRA ,17589554,Sat Nov 27 17:18:32 CET,Sat Nov 27 19:34:45 CET,0.0 0.295 0.515 0.694 0.862 1.012 1.171 1.325 1.593 1.709 1.819 1.842 2.156 2.261 2.471 2.674 2.864 2.952 3.114 3.272 3.501 3.662 3.831 4.07 4.3 4.523 4.73 4.927 5.184 5.433 5.676 5.978 6.263 6.541 6.879 7.246 7.573 7.933 8.35 8.791 9.225 9.713 10.286 10.855 11.528 12.276 13.109 14.03 15.102 16.343 17.721 18.718 19.207 19.491 19.654 19.692 19.667 19.599 19.495 19.339 19.178 19.023 18.869 18.726 18.581 18.43 18.253 18.097 17.968 17.819 17.667 17.545 17.396 17.226 17.105 16.984 16.855 16.723 16.575 16.474 16.38 16.22 16.093 15.965 15.895 15.743 15.578 15.412 15.328 15.05 15.06 14.959 14.858 14.638 14.52 14.402 14.273 14.11 13.898 13.651 13.253 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index da15fcaf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3071 ,TETRA ,17589555,Sat Nov 27 17:18:34 CET,Sat Nov 27 19:35:39 CET,0.0 1.529 1.814 2.037 2.238 2.416 2.581 2.745 3.029 3.155 3.277 3.273 3.583 3.699 3.896 4.073 4.249 4.335 4.492 4.638 4.869 5.011 5.14 5.326 5.493 5.647 5.797 5.946 6.133 6.31 6.488 6.704 6.892 7.07 7.291 7.532 7.757 7.993 8.216 8.435 8.686 8.948 9.221 9.501 9.798 10.082 10.352 10.711 11.194 11.547 11.596 11.194 10.637 10.044 9.478 8.925 8.388 7.887 7.455 7.022 6.644 6.308 5.981 5.661 5.368 5.09 4.796 4.538 4.307 4.072 3.827 3.617 3.397 3.169 3.001 2.824 2.636 2.434 2.207 2.065 1.93 1.719 1.57 1.405 1.32 1.139 0.952 0.745 0.631 0.318 0.305 0.2 0.097 -0.14 -0.276 -0.427 -0.596 -0.802 -1.019 -1.276 -1.899 -2 ,19186 ,TETRA ,17589556,Sat Nov 27 17:18:33 CET,Sat Nov 27 19:36:47 CET,0.0 0.536 0.787 0.981 1.14 1.286 1.435 1.57 1.786 1.89 1.996 1.979 2.258 2.345 2.502 2.649 2.794 2.87 3.035 3.187 3.389 3.507 3.618 3.787 3.953 4.104 4.24 4.381 4.575 4.759 4.921 5.125 5.319 5.494 5.702 5.912 6.099 6.309 6.581 6.905 7.254 7.652 8.081 8.488 8.931 9.374 9.829 10.273 10.673 10.967 10.946 10.465 9.858 9.236 8.66 8.097 7.573 7.084 6.652 6.222 5.85 5.506 5.168 4.837 4.515 4.233 3.948 3.689 3.463 3.233 2.997 2.798 2.589 2.362 2.198 2.042 1.863 1.675 1.49 1.348 1.192 0.966 0.808 0.638 0.553 0.37 0.188 -0.003 -0.11 -0.431 -0.443 -0.557 -0.673 -0.93 -1.095 -1.266 -1.441 -1.645 -1.851 -2.095 -2.604 -3 ,24418 ,TETRA ,17589557,Sat Nov 27 17:18:35 CET,Sat Nov 27 19:36:25 CET,0.0 0.616 0.872 1.059 1.245 1.407 1.561 1.702 1.948 2.063 2.171 2.164 2.466 2.564 2.744 2.918 3.077 3.162 3.33 3.475 3.687 3.82 3.946 4.128 4.304 4.475 4.631 4.789 4.987 5.154 5.311 5.51 5.704 5.872 6.079 6.319 6.543 6.783 7.018 7.234 7.462 7.727 8.022 8.297 8.573 8.827 9.071 9.299 9.521 9.582 9.182 8.352 7.54 6.823 6.207 5.643 5.131 4.632 4.199 3.793 3.413 3.039 2.711 2.402 2.101 1.821 1.541 1.302 1.075 0.838 0.6 0.389 0.161 -0.067 -0.246 -0.425 -0.604 -0.808 -1.02 -1.151 -1.286 -1.507 -1.659 -1.826 -1.913 -2.09 -2.26 -2.436 -2.535 -2.835 -2.83 -2.939 -3.055 -3.327 -3.478 -3.645 -3.834 -4.062 -4.312 -4.618 -6.299 -4 ,22998 ,TETRA ,17589558,Sat Nov 27 17:18:36 CET,Sat Nov 27 19:38:54 CET,0.0 0.993 1.277 1.487 1.714 1.889 2.02 2.157 2.408 2.53 2.662 2.671 2.97 3.072 3.269 3.449 3.608 3.686 3.84 3.973 4.149 4.263 4.384 4.546 4.702 4.863 5.006 5.141 5.331 5.511 5.672 5.877 6.134 6.403 6.707 7.048 7.362 7.684 8.015 8.375 8.745 9.148 9.576 9.974 10.433 10.893 11.343 11.763 12.104 12.385 12.41 11.942 11.307 10.641 10.008 9.394 8.84 8.329 7.872 7.402 6.996 6.661 6.337 6.01 5.712 5.439 5.143 4.87 4.629 4.377 4.128 3.928 3.728 3.514 3.34 3.167 2.988 2.781 2.56 2.412 2.266 2.048 1.895 1.728 1.64 1.462 1.274 1.072 0.962 0.647 0.621 0.508 0.394 0.129 -0.023 -0.18 -0.346 -0.544 -0.739 -0.941 -1.498 -5 ,9080 ,TETRA ,17589559,Sat Nov 27 17:18:33 CET,Sat Nov 27 19:35:05 CET,0.0 0.651 0.93 1.155 1.359 1.551 1.718 1.856 2.137 2.267 2.378 2.39 2.682 2.774 2.94 3.098 3.27 3.354 3.52 3.676 3.869 4.003 4.138 4.322 4.497 4.662 4.82 4.968 5.148 5.318 5.485 5.691 5.885 6.062 6.245 6.434 6.622 6.829 7.058 7.297 7.542 7.869 8.319 8.738 9.187 9.658 10.11 10.499 10.827 11.045 10.978 10.467 9.782 9.145 8.601 8.057 7.515 7.0 6.559 6.12 5.729 5.358 5.011 4.696 4.384 4.09 3.79 3.523 3.279 3.032 2.782 2.574 2.363 2.141 1.962 1.78 1.586 1.379 1.177 1.044 0.896 0.654 0.504 0.346 0.266 0.111 -0.074 -0.266 -0.359 -0.655 -0.634 -0.731 -0.832 -1.048 -1.177 -1.316 -1.464 -1.633 -1.823 -2.049 -2.52 -6 ,32182 ,TETRA ,17589560,Sat Nov 27 17:18:34 CET,Sat Nov 27 19:37:14 CET,0.0 0.461 0.733 0.971 1.166 1.329 1.458 1.584 1.849 1.977 2.103 2.144 2.462 2.569 2.766 2.942 3.108 3.185 3.328 3.458 3.648 3.786 3.921 4.114 4.305 4.477 4.631 4.774 4.952 5.131 5.309 5.512 5.686 5.854 6.053 6.268 6.476 6.751 7.111 7.48 7.835 8.219 8.64 9.037 9.465 9.911 10.379 10.799 11.164 11.42 11.372 10.912 10.372 9.807 9.229 8.685 8.19 7.683 7.22 6.782 6.385 5.995 5.644 5.333 5.026 4.738 4.436 4.181 3.965 3.718 3.457 3.26 3.059 2.845 2.676 2.496 2.311 2.127 1.931 1.797 1.664 1.439 1.277 1.12 1.034 0.848 0.672 0.484 0.383 0.072 0.095 -0.006 -0.12 -0.376 -0.506 -0.643 -0.804 -0.982 -1.211 -1.491 -2.275 -7 ,26600 ,TETRA ,17589561,Sat Nov 27 17:18:34 CET,Sat Nov 27 19:37:35 CET,0.0 0.88 1.182 1.398 1.593 1.765 1.92 2.059 2.299 2.412 2.515 2.517 2.804 2.905 3.088 3.256 3.409 3.481 3.621 3.752 3.953 4.09 4.222 4.407 4.575 4.729 4.873 5.01 5.187 5.366 5.551 5.765 5.955 6.127 6.311 6.505 6.694 6.918 7.162 7.413 7.667 7.938 8.227 8.518 8.844 9.175 9.484 9.699 9.848 9.869 9.53 8.777 7.97 7.165 6.436 5.771 5.148 4.572 4.097 3.632 3.233 2.879 2.526 2.196 1.894 1.598 1.282 1.002 0.742 0.491 0.242 0.029 -0.179 -0.42 -0.613 -0.801 -1.004 -1.213 -1.442 -1.603 -1.773 -2.014 -2.168 -2.332 -2.411 -2.573 -2.75 -2.944 -3.051 -3.359 -3.392 -3.514 -3.652 -3.923 -4.072 -4.241 -4.403 -4.59 -4.839 -5.172 -5.759 -8 ,32523 ,TETRA ,17589562,Sat Nov 27 17:18:35 CET,Sat Nov 27 19:36:26 CET,0.0 1.027 1.294 1.489 1.667 1.852 2.008 2.159 2.444 2.568 2.696 2.715 3.014 3.111 3.308 3.493 3.655 3.728 3.878 4.019 4.206 4.326 4.443 4.623 4.798 4.956 5.11 5.258 5.442 5.622 5.798 5.989 6.163 6.339 6.521 6.716 6.921 7.145 7.374 7.615 7.856 8.104 8.343 8.578 8.857 9.149 9.44 9.755 10.186 10.62 10.725 10.282 9.609 8.908 8.275 7.672 7.093 6.54 6.044 5.524 5.104 4.76 4.428 4.103 3.802 3.511 3.212 2.95 2.717 2.474 2.21 1.997 1.776 1.556 1.4 1.235 1.06 0.873 0.67 0.537 0.4 0.157 -0.004 -0.15 -0.232 -0.406 -0.585 -0.778 -0.877 -1.18 -1.212 -1.344 -1.486 -1.826 -1.994 -2.152 -2.326 -2.489 -2.658 -2.894 -3.513 -9 ,21188 ,TETRA ,17589563,Sat Nov 27 17:18:38 CET,Sat Nov 27 19:37:48 CET,0.0 0.742 1.048 1.252 1.436 1.606 1.76 1.895 2.124 2.232 2.34 2.345 2.659 2.759 2.946 3.109 3.245 3.316 3.476 3.631 3.833 3.954 4.078 4.263 4.437 4.615 4.782 4.925 5.107 5.31 5.545 5.855 6.156 6.444 6.757 7.088 7.398 7.738 8.102 8.455 8.819 9.226 9.66 10.066 10.516 10.988 11.466 11.898 12.324 12.664 12.709 12.279 11.721 11.11 10.507 9.933 9.391 8.854 8.38 7.917 7.513 7.162 6.819 6.484 6.174 5.88 5.577 5.318 5.087 4.855 4.631 4.444 4.246 4.029 3.852 3.665 3.479 3.293 3.076 2.921 2.773 2.535 2.364 2.187 2.093 1.888 1.697 1.511 1.404 1.087 1.063 0.948 0.824 0.54 0.37 0.186 -0.005 -0.216 -0.453 -0.719 -1.192 -10 ,32353 ,TETRA ,17589564,Sat Nov 27 17:18:40 CET,Sat Nov 27 19:36:32 CET,0.0 1.15 1.37 1.572 1.75 1.907 2.061 2.204 2.442 2.547 2.657 2.659 2.959 3.051 3.228 3.373 3.51 3.58 3.714 3.843 4.032 4.154 4.27 4.439 4.613 4.779 4.922 5.06 5.241 5.411 5.576 5.778 5.961 6.133 6.336 6.552 6.749 6.956 7.183 7.435 7.695 7.945 8.209 8.479 8.815 9.244 9.746 10.257 10.695 10.99 11.091 10.791 10.302 9.734 9.157 8.56 7.966 7.419 6.941 6.428 5.953 5.559 5.201 4.854 4.551 4.279 3.992 3.727 3.49 3.245 2.992 2.788 2.573 2.343 2.154 1.974 1.8 1.62 1.425 1.286 1.147 0.931 0.774 0.614 0.538 0.381 0.203 0.006 -0.093 -0.401 -0.4 -0.522 -0.655 -0.913 -1.062 -1.228 -1.403 -1.6 -1.814 -2.082 -2.635 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 3336c36f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12799 ,TETRA ,17589565,Sat Nov 27 17:18:34 CET,Sat Nov 27 19:36:33 CET,0.0 0.435 0.615 0.779 0.94 1.084 1.224 1.374 1.652 1.759 1.853 1.851 2.174 2.277 2.471 2.647 2.823 2.916 3.066 3.198 3.404 3.542 3.669 3.857 4.06 4.266 4.453 4.612 4.796 4.976 5.164 5.389 5.623 5.859 6.106 6.377 6.645 6.927 7.186 7.428 7.672 7.953 8.297 8.609 8.938 9.276 9.606 9.915 10.155 10.224 9.908 9.098 8.258 7.415 6.619 5.87 5.186 4.548 3.972 3.386 2.866 2.386 1.924 1.472 1.064 0.76 0.475 0.196 -0.056 -0.314 -0.576 -0.784 -0.999 -1.226 -1.406 -1.59 -1.778 -1.988 -2.214 -2.362 -2.511 -2.758 -2.935 -3.111 -3.205 -3.393 -3.576 -3.779 -3.892 -4.228 -4.278 -4.416 -4.563 -4.855 -5.006 -5.175 -5.354 -5.574 -5.831 -6.123 -7.018 -2 ,16828 ,TETRA ,17589566,Sat Nov 27 17:18:35 CET,Sat Nov 27 19:36:44 CET,0.0 0.513 0.806 1.088 1.297 1.454 1.621 1.785 2.066 2.179 2.289 2.314 2.622 2.718 2.911 3.086 3.267 3.355 3.502 3.641 3.854 3.982 4.099 4.284 4.467 4.636 4.798 4.945 5.142 5.347 5.533 5.742 5.944 6.131 6.347 6.593 6.817 7.059 7.332 7.63 7.934 8.252 8.612 8.95 9.321 9.705 10.071 10.44 10.793 11.041 11.065 10.685 10.15 9.569 9.015 8.474 7.965 7.493 7.049 6.595 6.181 5.791 5.451 5.128 4.82 4.548 4.255 3.982 3.745 3.503 3.258 3.061 2.855 2.632 2.463 2.29 2.102 1.908 1.705 1.561 1.416 1.181 1.014 0.836 0.744 0.56 0.374 0.184 0.084 -0.231 -0.246 -0.374 -0.514 -0.822 -0.99 -1.155 -1.317 -1.532 -1.794 -2.12 -2.986 -3 ,8379 ,TETRA ,17589567,Sat Nov 27 17:18:35 CET,Sat Nov 27 19:36:58 CET,0.0 1.236 1.525 1.763 1.943 2.099 2.236 2.368 2.614 2.74 2.871 2.886 3.186 3.271 3.437 3.591 3.756 3.844 4.001 4.141 4.353 4.499 4.644 4.821 4.97 5.116 5.264 5.422 5.623 5.803 5.964 6.169 6.382 6.563 6.767 6.999 7.198 7.411 7.645 7.891 8.139 8.417 8.739 9.007 9.264 9.536 9.833 10.126 10.327 10.313 9.933 9.176 8.361 7.501 6.684 5.942 5.246 4.571 3.987 3.424 2.916 2.483 2.111 1.763 1.452 1.171 0.871 0.597 0.343 0.084 -0.162 -0.368 -0.599 -0.846 -1.036 -1.233 -1.435 -1.637 -1.853 -1.997 -2.147 -2.403 -2.589 -2.784 -2.874 -3.051 -3.255 -3.47 -3.584 -3.912 -3.938 -4.062 -4.191 -4.465 -4.626 -4.81 -4.996 -5.245 -5.594 -6.015 -6.593 -4 ,28059 ,TETRA ,17589568,Sat Nov 27 17:18:38 CET,Sat Nov 27 19:36:22 CET,0.0 0.548 0.797 1.01 1.225 1.393 1.512 1.638 1.914 2.052 2.171 2.182 2.489 2.577 2.764 2.939 3.121 3.214 3.376 3.525 3.751 3.883 4.009 4.202 4.375 4.533 4.684 4.841 5.047 5.242 5.41 5.607 5.792 5.971 6.185 6.411 6.622 6.862 7.141 7.439 7.709 7.989 8.323 8.652 9.051 9.484 9.885 10.244 10.603 10.87 10.827 10.32 9.684 9.065 8.526 8.021 7.528 7.035 6.591 6.13 5.742 5.414 5.094 4.781 4.49 4.213 3.911 3.661 3.457 3.249 3.018 2.813 2.6 2.378 2.2 2.021 1.841 1.649 1.45 1.313 1.169 0.947 0.78 0.608 0.522 0.338 0.145 -0.054 -0.159 -0.475 -0.487 -0.601 -0.721 -0.97 -1.107 -1.256 -1.438 -1.656 -1.906 -2.203 -2.854 -5 ,24457 ,TETRA ,17589569,Sat Nov 27 17:18:34 CET,Sat Nov 27 19:37:09 CET,0.0 0.518 0.76 0.974 1.149 1.305 1.463 1.599 1.826 1.942 2.056 2.048 2.359 2.449 2.613 2.767 2.913 2.992 3.142 3.283 3.503 3.643 3.772 3.95 4.119 4.283 4.452 4.613 4.817 5.016 5.208 5.429 5.637 5.846 6.074 6.316 6.557 6.814 7.07 7.339 7.6 7.862 8.143 8.422 8.757 9.102 9.429 9.715 9.995 10.181 9.907 9.073 8.188 7.346 6.495 5.699 5.019 4.383 3.835 3.246 2.682 2.133 1.614 1.137 0.735 0.408 0.081 -0.199 -0.444 -0.7 -0.97 -1.197 -1.438 -1.686 -1.887 -2.102 -2.325 -2.552 -2.774 -2.937 -3.104 -3.361 -3.532 -3.709 -3.806 -4.011 -4.243 -4.484 -4.604 -4.94 -5.01 -5.165 -5.309 -5.623 -5.821 -6.042 -6.264 -6.503 -6.803 -7.197 -8.118 -6 ,28760 ,TETRA ,17589570,Sat Nov 27 17:18:37 CET,Sat Nov 27 19:37:31 CET,0.0 0.706 1.013 1.248 1.443 1.62 1.778 1.936 2.208 2.332 2.459 2.481 2.78 2.879 3.081 3.259 3.413 3.491 3.655 3.808 4.02 4.154 4.281 4.488 4.7 4.892 5.082 5.263 5.48 5.673 5.85 6.055 6.242 6.446 6.697 6.966 7.211 7.463 7.735 8.022 8.308 8.602 8.923 9.264 9.656 10.051 10.433 10.791 11.071 11.246 11.074 10.38 9.621 8.817 8.066 7.369 6.721 6.113 5.57 5.014 4.535 4.072 3.633 3.228 2.825 2.443 2.018 1.624 1.276 0.919 0.55 0.239 -0.069 -0.396 -0.643 -0.857 -1.059 -1.282 -1.506 -1.658 -1.818 -2.063 -2.238 -2.418 -2.509 -2.704 -2.912 -3.128 -3.248 -3.581 -3.617 -3.736 -3.866 -4.14 -4.297 -4.481 -4.669 -4.88 -5.165 -5.504 -6.117 -7 ,19514 ,TETRA ,17589571,Sat Nov 27 17:19:33 CET,Sat Nov 27 19:30:40 CET,0.0 0.453 0.716 0.922 1.097 1.253 1.381 1.504 1.759 1.869 1.977 1.991 2.303 2.401 2.582 2.748 2.904 2.982 3.136 3.283 3.476 3.602 3.737 3.923 4.087 4.255 4.422 4.598 4.813 5.002 5.181 5.396 5.599 5.793 6.017 6.263 6.49 6.75 7.044 7.34 7.622 7.899 8.204 8.509 8.869 9.241 9.613 9.957 10.267 10.507 10.496 10.04 9.461 8.862 8.25 7.624 7.029 6.475 5.989 5.481 5.035 4.665 4.327 3.987 3.652 3.329 2.981 2.686 2.444 2.201 1.946 1.724 1.495 1.246 1.028 0.8 0.572 0.333 0.077 -0.104 -0.285 -0.547 -0.731 -0.911 -1.004 -1.217 -1.451 -1.693 -1.811 -2.135 -2.178 -2.316 -2.467 -2.786 -2.957 -3.148 -3.356 -3.604 -3.893 -4.201 -4.938 -8 ,10375 ,TETRA ,17589572,Sat Nov 27 17:19:33 CET,Sat Nov 27 19:34:14 CET,0.0 0.698 1.017 1.245 1.46 1.651 1.809 1.948 2.187 2.311 2.44 2.436 2.744 2.843 3.038 3.241 3.426 3.502 3.644 3.785 3.995 4.132 4.262 4.442 4.608 4.775 4.949 5.12 5.314 5.492 5.673 5.895 6.099 6.274 6.482 6.732 6.959 7.193 7.451 7.725 7.986 8.279 8.6 8.891 9.225 9.594 9.987 10.323 10.631 10.948 11.045 10.741 10.26 9.648 9.051 8.502 7.994 7.518 7.081 6.625 6.236 5.881 5.539 5.209 4.901 4.625 4.341 4.087 3.857 3.613 3.362 3.168 2.962 2.722 2.537 2.354 2.154 1.947 1.725 1.565 1.394 1.127 0.954 0.773 0.679 0.491 0.281 0.038 -0.076 -0.4 -0.427 -0.557 -0.7 -0.974 -1.122 -1.295 -1.482 -1.689 -1.962 -2.301 -3.157 -9 ,15375 ,TETRA ,17589573,Sat Nov 27 17:19:33 CET,Sat Nov 27 19:28:57 CET,0.0 0.368 0.573 0.773 0.987 1.192 1.354 1.506 1.794 1.91 2.029 2.049 2.347 2.442 2.629 2.776 2.906 2.977 3.127 3.262 3.454 3.583 3.705 3.9 4.091 4.264 4.429 4.595 4.804 4.995 5.177 5.376 5.56 5.739 5.944 6.15 6.339 6.569 6.84 7.143 7.426 7.695 8.024 8.339 8.643 8.948 9.264 9.586 9.814 9.861 9.661 8.953 8.103 7.251 6.445 5.697 5.007 4.351 3.805 3.322 2.942 2.62 2.319 2.03 1.762 1.508 1.239 1.018 0.825 0.617 0.386 0.191 -0.006 -0.226 -0.391 -0.561 -0.74 -0.934 -1.149 -1.291 -1.438 -1.673 -1.825 -1.979 -2.055 -2.231 -2.435 -2.622 -2.721 -3.052 -3.074 -3.185 -3.304 -3.587 -3.755 -3.931 -4.118 -4.322 -4.549 -4.833 -5.335 -10 ,26057 ,TETRA ,17589574,Sat Nov 27 17:19:33 CET,Sat Nov 27 19:37:36 CET,0.0 0.365 0.623 0.821 0.989 1.132 1.252 1.367 1.583 1.689 1.792 1.784 2.085 2.18 2.37 2.556 2.716 2.792 2.948 3.093 3.307 3.439 3.55 3.723 3.9 4.071 4.241 4.402 4.61 4.812 5.018 5.24 5.429 5.63 5.878 6.156 6.402 6.652 6.901 7.156 7.424 7.709 8.029 8.36 8.719 9.043 9.351 9.635 9.855 9.948 9.816 9.216 8.405 7.566 6.799 6.083 5.442 4.855 4.333 3.781 3.282 2.847 2.445 2.077 1.769 1.508 1.216 0.916 0.644 0.375 0.106 -0.102 -0.31 -0.535 -0.724 -0.918 -1.109 -1.314 -1.528 -1.675 -1.83 -2.086 -2.26 -2.429 -2.518 -2.705 -2.907 -3.134 -3.254 -3.593 -3.622 -3.749 -3.88 -4.164 -4.328 -4.512 -4.727 -4.951 -5.203 -5.522 -5.992 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt deleted file mode 100644 index 0797c476..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22958 ,TETRA ,17589575,Sat Nov 27 17:19:33 CET,Sat Nov 27 19:37:45 CET,0.0 0.549 0.847 1.069 1.276 1.479 1.654 1.817 2.099 2.222 2.358 2.431 2.776 2.908 3.145 3.362 3.567 3.668 3.862 4.051 4.334 4.518 4.69 4.923 5.149 5.366 5.582 5.814 6.114 6.395 6.659 6.971 7.275 7.571 7.925 8.331 8.728 9.164 9.629 10.125 10.633 11.204 11.879 12.538 13.288 14.153 15.162 16.307 17.612 19.052 20.695 21.95 22.594 22.855 22.92 22.864 22.719 22.555 22.384 22.247 22.15 22.063 21.989 21.895 21.782 21.666 21.541 21.408 21.277 21.128 20.966 20.846 20.722 20.582 20.462 20.336 20.203 20.06 19.922 19.832 19.739 19.584 19.471 19.35 19.283 19.141 19.001 18.839 18.754 18.469 18.459 18.344 18.224 17.997 17.864 17.714 17.572 17.429 17.255 17.007 16.478 -2 ,4954 ,TETRA ,17589576,Sat Nov 27 17:19:36 CET,Sat Nov 27 19:37:18 CET,0.0 0.753 1.078 1.31 1.524 1.723 1.898 2.046 2.343 2.495 2.641 2.696 3.032 3.158 3.405 3.637 3.849 3.949 4.148 4.347 4.642 4.833 5.006 5.263 5.503 5.738 5.986 6.232 6.539 6.81 7.079 7.436 7.78 8.11 8.483 8.885 9.278 9.713 10.195 10.721 11.274 11.874 12.542 13.222 14.024 14.934 15.996 17.154 18.574 20.308 22.354 23.961 24.831 25.348 25.637 25.785 25.856 25.875 25.876 25.852 25.764 25.655 25.561 25.448 25.337 25.253 25.158 25.056 24.962 24.864 24.732 24.616 24.508 24.394 24.299 24.193 24.075 23.955 23.828 23.737 23.638 23.471 23.357 23.235 23.17 23.032 22.868 22.685 22.594 22.315 22.329 22.228 22.122 21.898 21.761 21.611 21.441 21.239 20.984 20.727 19.953 -3 ,6233 ,TETRA ,17589577,Sat Nov 27 17:19:37 CET,Sat Nov 27 19:37:47 CET,0.0 0.579 0.829 1.044 1.22 1.365 1.505 1.634 1.872 1.993 2.122 2.148 2.473 2.587 2.806 2.998 3.186 3.277 3.451 3.622 3.873 4.029 4.185 4.419 4.651 4.871 5.08 5.282 5.539 5.795 6.046 6.337 6.627 6.922 7.269 7.673 8.079 8.518 8.978 9.466 9.976 10.575 11.288 11.989 12.842 13.793 14.845 16.037 17.396 18.917 20.592 21.839 22.424 22.651 22.714 22.66 22.525 22.353 22.181 21.981 21.759 21.549 21.392 21.27 21.148 21.021 20.881 20.746 20.621 20.494 20.349 20.224 20.097 19.963 19.859 19.736 19.604 19.465 19.321 19.224 19.109 18.908 18.775 18.646 18.576 18.443 18.309 18.145 18.061 17.785 17.767 17.657 17.544 17.309 17.169 17.023 16.851 16.646 16.437 16.207 15.534 -4 ,28685 ,TETRA ,17589578,Sat Nov 27 17:19:33 CET,Sat Nov 27 19:40:58 CET,0.0 0.422 0.68 0.883 1.066 1.242 1.412 1.567 1.843 1.984 2.127 2.174 2.498 2.612 2.85 3.072 3.278 3.38 3.584 3.78 4.05 4.23 4.396 4.63 4.872 5.106 5.32 5.538 5.839 6.129 6.389 6.696 7.007 7.307 7.659 8.07 8.457 8.855 9.29 9.776 10.299 10.899 11.581 12.241 13.004 13.851 14.838 15.931 17.204 18.668 20.354 21.623 22.176 22.44 22.526 22.476 22.378 22.229 22.02 21.779 21.559 21.323 21.075 20.847 20.604 20.359 20.123 19.957 19.836 19.685 19.53 19.412 19.277 19.135 19.027 18.915 18.794 18.676 18.544 18.438 18.333 18.189 18.088 17.955 17.881 17.735 17.582 17.427 17.344 17.065 17.083 16.991 16.884 16.634 16.494 16.346 16.178 15.975 15.771 15.516 14.872 -5 ,9657 ,TETRA ,17589579,Sat Nov 27 17:19:34 CET,Sat Nov 27 19:37:58 CET,0.0 0.594 0.901 1.133 1.346 1.514 1.655 1.796 2.084 2.216 2.341 2.37 2.683 2.784 2.99 3.187 3.377 3.471 3.656 3.842 4.126 4.3 4.462 4.704 4.933 5.156 5.381 5.615 5.902 6.164 6.424 6.734 7.026 7.312 7.656 8.061 8.455 8.881 9.34 9.813 10.321 10.903 11.575 12.241 13.028 13.903 14.889 15.993 17.305 18.906 20.752 22.053 22.605 22.815 22.895 22.856 22.714 22.533 22.354 22.126 21.899 21.695 21.482 21.265 21.06 20.862 20.631 20.473 20.377 20.276 20.16 20.054 19.945 19.82 19.715 19.594 19.471 19.347 19.205 19.107 19.006 18.855 18.754 18.659 18.606 18.481 18.342 18.179 18.09 17.829 17.857 17.766 17.676 17.49 17.388 17.256 17.107 16.952 16.765 16.533 15.998 -6 ,6187 ,TETRA ,17589580,Sat Nov 27 17:19:34 CET,Sat Nov 27 19:36:07 CET,0.0 0.495 0.827 1.096 1.301 1.468 1.629 1.795 2.092 2.231 2.354 2.361 2.673 2.781 3.002 3.206 3.388 3.477 3.677 3.896 4.205 4.392 4.557 4.78 5.01 5.249 5.487 5.718 6.02 6.31 6.583 6.908 7.223 7.545 7.924 8.331 8.71 9.13 9.582 10.08 10.591 11.158 11.843 12.526 13.324 14.215 15.223 16.353 17.66 19.131 20.826 22.137 22.801 23.134 23.228 23.211 23.099 22.898 22.699 22.481 22.243 22.003 21.768 21.597 21.473 21.344 21.212 21.092 20.979 20.861 20.749 20.643 20.516 20.371 20.254 20.126 19.995 19.873 19.74 19.65 19.554 19.395 19.277 19.148 19.083 18.955 18.819 18.657 18.576 18.314 18.351 18.26 18.161 17.948 17.833 17.715 17.581 17.435 17.271 17.047 16.157 -7 ,13021 ,TETRA ,17589581,Sat Nov 27 17:20:33 CET,Sat Nov 27 19:40:40 CET,0.0 0.568 0.853 1.08 1.3 1.507 1.684 1.842 2.129 2.258 2.388 2.416 2.741 2.856 3.089 3.306 3.499 3.595 3.788 3.969 4.237 4.417 4.58 4.799 5.02 5.239 5.452 5.661 5.945 6.203 6.445 6.741 7.033 7.322 7.633 7.994 8.362 8.772 9.208 9.701 10.234 10.795 11.435 12.095 12.888 13.729 14.665 15.747 17.047 18.543 20.235 21.519 22.124 22.38 22.424 22.325 22.192 22.038 21.842 21.598 21.383 21.226 21.117 21.02 20.91 20.799 20.682 20.564 20.454 20.325 20.185 20.071 19.958 19.846 19.75 19.638 19.525 19.402 19.269 19.17 19.058 18.898 18.785 18.661 18.597 18.456 18.315 18.17 18.089 17.806 17.796 17.69 17.58 17.352 17.226 17.086 16.913 16.726 16.539 16.259 15.807 -8 ,4589 ,TETRA ,17589582,Sat Nov 27 17:19:34 CET,Sat Nov 27 19:38:16 CET,0.0 0.535 0.803 0.996 1.155 1.306 1.454 1.598 1.841 1.957 2.078 2.091 2.404 2.52 2.743 2.944 3.138 3.23 3.413 3.6 3.888 4.069 4.237 4.478 4.7 4.915 5.129 5.344 5.619 5.884 6.155 6.482 6.776 7.055 7.386 7.758 8.105 8.489 8.921 9.386 9.878 10.448 11.119 11.786 12.573 13.451 14.431 15.511 16.78 18.235 19.953 21.183 21.707 21.909 21.931 21.921 21.921 21.898 21.864 21.797 21.718 21.648 21.544 21.402 21.277 21.159 21.03 20.922 20.82 20.707 20.58 20.469 20.346 20.201 20.09 19.974 19.843 19.698 19.537 19.426 19.314 19.136 19.013 18.891 18.824 18.676 18.511 18.341 18.251 17.965 17.936 17.819 17.701 17.44 17.295 17.145 16.975 16.762 16.477 16.142 15.293 -9 ,20827 ,TETRA ,17589583,Sat Nov 27 17:19:36 CET,Sat Nov 27 19:38:38 CET,0.0 0.799 1.034 1.263 1.474 1.659 1.815 1.958 2.245 2.379 2.501 2.524 2.839 2.941 3.147 3.345 3.534 3.628 3.81 3.984 4.256 4.443 4.628 4.875 5.103 5.335 5.555 5.771 6.073 6.357 6.608 6.92 7.23 7.527 7.88 8.285 8.661 9.051 9.479 9.94 10.431 10.998 11.653 12.277 13.004 13.832 14.782 15.883 17.225 18.757 20.398 21.58 22.098 22.334 22.415 22.36 22.255 22.085 21.89 21.662 21.485 21.374 21.289 21.196 21.1 21.007 20.887 20.746 20.608 20.474 20.334 20.197 20.039 19.88 19.756 19.621 19.484 19.351 19.206 19.099 19.002 18.839 18.708 18.569 18.499 18.357 18.211 18.061 17.977 17.698 17.671 17.557 17.433 17.158 17.006 16.835 16.639 16.427 16.19 15.853 14.013 -10 ,27329 ,TETRA ,17589584,Sat Nov 27 17:19:37 CET,Sat Nov 27 19:38:44 CET,0.0 0.364 0.631 0.838 1.009 1.189 1.358 1.51 1.777 1.895 2.009 2.011 2.33 2.442 2.659 2.87 3.064 3.157 3.353 3.55 3.812 3.974 4.142 4.382 4.601 4.813 5.018 5.227 5.507 5.783 6.043 6.362 6.679 6.972 7.302 7.68 8.057 8.478 8.923 9.397 9.903 10.476 11.135 11.806 12.616 13.514 14.55 15.72 17.089 18.743 20.736 22.27 23.143 23.687 24.015 24.206 24.3 24.309 24.261 24.197 24.135 24.069 23.968 23.828 23.683 23.559 23.43 23.313 23.199 23.068 22.933 22.82 22.702 22.559 22.435 22.311 22.188 22.06 21.933 21.85 21.759 21.604 21.493 21.373 21.308 21.188 21.065 20.932 20.856 20.586 20.596 20.503 20.406 20.196 20.071 19.92 19.735 19.504 19.229 18.918 17.975 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt deleted file mode 100644 index 0d1a394c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25993 ,TETRA ,17589585,Sat Nov 27 17:19:40 CET,Sat Nov 27 19:40:02 CET,0.0 0.451 0.687 0.89 1.059 1.202 1.346 1.468 1.663 1.766 1.875 1.84 2.134 2.219 2.39 2.551 2.694 2.766 2.901 3.027 3.214 3.333 3.456 3.635 3.807 3.973 4.127 4.27 4.458 4.632 4.8 5.011 5.205 5.382 5.575 5.79 5.982 6.189 6.425 6.678 6.944 7.222 7.53 7.848 8.18 8.509 8.841 9.13 9.389 9.568 9.43 8.882 8.279 7.687 7.167 6.635 6.117 5.629 5.19 4.775 4.415 4.088 3.78 3.469 3.175 2.899 2.586 2.309 2.079 1.842 1.594 1.386 1.16 0.924 0.74 0.546 0.347 0.137 -0.068 -0.2 -0.344 -0.579 -0.74 -0.909 -1.003 -1.19 -1.378 -1.594 -1.707 -2.043 -2.081 -2.225 -2.38 -2.728 -2.914 -3.099 -3.318 -3.579 -3.861 -4.276 -5.804 -2 ,13146 ,TETRA ,17589586,Sat Nov 27 17:19:35 CET,Sat Nov 27 19:39:36 CET,0.0 0.485 0.748 0.971 1.153 1.274 1.404 1.539 1.767 1.873 1.986 1.998 2.318 2.415 2.584 2.746 2.904 2.981 3.112 3.232 3.415 3.552 3.689 3.871 4.043 4.208 4.361 4.5 4.679 4.851 5.017 5.221 5.405 5.57 5.765 5.971 6.172 6.399 6.626 6.851 7.068 7.312 7.6 7.849 8.127 8.442 8.768 9.053 9.271 9.397 9.152 8.464 7.685 6.889 6.172 5.5 4.858 4.208 3.634 3.063 2.536 2.064 1.633 1.213 0.818 0.444 0.048 -0.301 -0.615 -0.945 -1.3 -1.607 -1.941 -2.284 -2.54 -2.8 -3.067 -3.355 -3.676 -3.9 -4.136 -4.523 -4.794 -5.078 -5.23 -5.56 -5.897 -6.251 -6.444 -6.863 -7.053 -7.282 -7.537 -8.084 -8.375 -8.677 -9.022 -9.441 -9.942 -10.594 -12.747 -3 ,26224 ,TETRA ,17589587,Sat Nov 27 17:19:37 CET,Sat Nov 27 19:40:27 CET,0.0 0.36 0.555 0.729 0.869 0.985 1.113 1.241 1.5 1.616 1.715 1.683 1.964 2.039 2.185 2.334 2.486 2.56 2.708 2.858 3.073 3.204 3.33 3.518 3.712 3.903 4.073 4.237 4.453 4.657 4.836 5.035 5.231 5.418 5.627 5.849 6.051 6.263 6.491 6.736 6.976 7.233 7.529 7.816 8.142 8.466 8.807 9.181 9.558 9.858 9.795 9.281 8.672 8.051 7.484 6.943 6.464 6.02 5.611 5.18 4.81 4.488 4.173 3.861 3.559 3.276 2.989 2.739 2.519 2.294 2.05 1.847 1.629 1.384 1.2 1.021 0.841 0.644 0.434 0.283 0.122 -0.112 -0.273 -0.459 -0.554 -0.746 -0.945 -1.15 -1.266 -1.596 -1.635 -1.781 -1.926 -2.204 -2.362 -2.552 -2.766 -3.004 -3.315 -3.69 -5.362 -4 ,18270 ,TETRA ,17589588,Sat Nov 27 17:19:40 CET,Sat Nov 27 19:40:35 CET,0.0 0.631 0.907 1.109 1.285 1.46 1.625 1.779 2.052 2.158 2.264 2.263 2.576 2.671 2.844 3.011 3.166 3.239 3.383 3.523 3.723 3.85 3.971 4.153 4.332 4.497 4.648 4.79 4.979 5.165 5.339 5.543 5.722 5.884 6.086 6.308 6.518 6.751 6.994 7.231 7.443 7.722 8.077 8.387 8.711 9.005 9.276 9.501 9.665 9.728 9.426 8.692 7.915 7.126 6.404 5.741 5.119 4.525 3.988 3.436 2.961 2.529 2.112 1.696 1.299 0.918 0.483 0.094 -0.24 -0.585 -0.874 -1.077 -1.301 -1.534 -1.702 -1.873 -2.065 -2.261 -2.46 -2.606 -2.76 -2.986 -3.144 -3.312 -3.393 -3.567 -3.759 -3.954 -4.053 -4.377 -4.421 -4.549 -4.681 -4.997 -5.187 -5.375 -5.552 -5.764 -6.033 -6.388 -8.531 -5 ,22165 ,TETRA ,17589589,Sat Nov 27 17:19:36 CET,Sat Nov 27 19:39:57 CET,0.0 0.556 0.807 1.019 1.179 1.313 1.447 1.579 1.815 1.92 2.034 2.055 2.353 2.431 2.593 2.749 2.897 2.968 3.107 3.247 3.441 3.56 3.673 3.845 4.012 4.173 4.328 4.472 4.654 4.831 5.015 5.233 5.428 5.603 5.804 6.028 6.239 6.465 6.703 6.951 7.195 7.455 7.753 8.05 8.368 8.673 8.929 9.117 9.281 9.267 8.848 8.076 7.26 6.487 5.774 5.079 4.418 3.797 3.255 2.704 2.205 1.734 1.291 0.871 0.466 0.093 -0.298 -0.656 -0.971 -1.302 -1.657 -1.954 -2.265 -2.594 -2.854 -3.133 -3.418 -3.706 -4.026 -4.266 -4.514 -4.899 -5.163 -5.436 -5.574 -5.85 -6.158 -6.501 -6.691 -7.054 -7.069 -7.185 -7.31 -7.57 -7.714 -7.885 -8.069 -8.282 -8.53 -8.836 -10.422 -6 ,2908 ,TETRA ,17589590,Sat Nov 27 17:19:34 CET,Sat Nov 27 19:43:10 CET,0.0 0.733 0.988 1.206 1.402 1.56 1.707 1.854 2.119 2.247 2.354 2.334 2.642 2.74 2.951 3.14 3.286 3.352 3.484 3.628 3.839 3.958 4.071 4.238 4.41 4.59 4.758 4.905 5.093 5.292 5.478 5.697 5.907 6.094 6.297 6.513 6.737 6.978 7.219 7.472 7.719 7.995 8.299 8.58 8.874 9.162 9.435 9.626 9.782 9.869 9.562 8.763 7.917 7.082 6.255 5.452 4.76 4.13 3.578 3.015 2.487 1.99 1.502 1.03 0.574 0.126 -0.365 -0.719 -0.968 -1.231 -1.496 -1.717 -1.945 -2.187 -2.375 -2.566 -2.777 -3.01 -3.244 -3.407 -3.57 -3.822 -3.988 -4.15 -4.232 -4.419 -4.635 -4.862 -4.972 -5.305 -5.364 -5.497 -5.622 -5.894 -6.065 -6.244 -6.427 -6.643 -6.915 -7.26 -8.675 -7 ,8155 ,TETRA ,17589591,Sat Nov 27 17:19:37 CET,Sat Nov 27 19:42:46 CET,0.0 0.621 0.92 1.169 1.356 1.511 1.686 1.867 2.143 2.257 2.363 2.343 2.644 2.733 2.912 3.072 3.198 3.268 3.421 3.569 3.779 3.899 4.02 4.201 4.375 4.535 4.675 4.803 4.972 5.15 5.324 5.535 5.72 5.892 6.095 6.295 6.48 6.69 6.904 7.128 7.362 7.615 7.901 8.165 8.445 8.725 8.982 9.185 9.336 9.371 9.071 8.422 7.696 6.887 6.125 5.419 4.767 4.167 3.627 3.051 2.52 2.103 1.774 1.449 1.134 0.847 0.558 0.289 0.019 -0.252 -0.516 -0.743 -0.978 -1.221 -1.413 -1.609 -1.798 -1.984 -2.173 -2.313 -2.461 -2.684 -2.854 -3.036 -3.127 -3.316 -3.517 -3.747 -3.866 -4.19 -4.207 -4.337 -4.475 -4.788 -4.97 -5.163 -5.378 -5.632 -5.946 -6.373 -7.976 -8 ,21828 ,TETRA ,17589592,Sat Nov 27 17:20:33 CET,Sat Nov 27 19:42:35 CET,0.0 0.697 0.967 1.168 1.337 1.49 1.615 1.752 2.025 2.143 2.262 2.272 2.578 2.668 2.833 2.991 3.143 3.216 3.357 3.489 3.675 3.789 3.906 4.067 4.219 4.374 4.517 4.655 4.832 5.011 5.186 5.39 5.582 5.749 5.947 6.179 6.393 6.613 6.821 7.024 7.234 7.465 7.749 8.017 8.282 8.566 8.82 9.064 9.295 9.343 8.996 8.145 7.189 6.244 5.38 4.565 3.836 3.161 2.542 1.913 1.338 0.795 0.286 -0.186 -0.607 -0.996 -1.425 -1.812 -2.158 -2.503 -2.85 -3.16 -3.509 -3.818 -4.017 -4.223 -4.44 -4.656 -4.867 -5.025 -5.202 -5.472 -5.66 -5.855 -5.954 -6.156 -6.347 -6.574 -6.696 -7.019 -7.041 -7.167 -7.301 -7.616 -7.791 -7.975 -8.17 -8.39 -8.667 -9.029 -10.744 -9 ,2505 ,TETRA ,17589593,Sat Nov 27 17:20:35 CET,Sat Nov 27 19:42:08 CET,0.0 0.703 0.945 1.11 1.252 1.38 1.504 1.643 1.871 1.968 2.07 2.035 2.33 2.412 2.559 2.704 2.853 2.926 3.071 3.219 3.418 3.528 3.643 3.821 3.981 4.136 4.28 4.417 4.6 4.768 4.938 5.146 5.331 5.511 5.714 5.93 6.147 6.393 6.65 6.903 7.139 7.387 7.674 7.939 8.21 8.511 8.9 9.254 9.503 9.647 9.513 9.008 8.405 7.819 7.275 6.718 6.184 5.69 5.263 4.851 4.491 4.141 3.797 3.487 3.206 2.938 2.649 2.396 2.175 1.93 1.667 1.463 1.253 1.024 0.847 0.656 0.461 0.27 0.069 -0.073 -0.215 -0.445 -0.611 -0.777 -0.865 -1.054 -1.247 -1.45 -1.561 -1.893 -1.949 -2.084 -2.217 -2.51 -2.68 -2.857 -3.042 -3.259 -3.531 -3.953 -5.735 -10 ,28355 ,TETRA ,17589594,Sat Nov 27 17:20:33 CET,Sat Nov 27 19:40:51 CET,0.0 0.443 0.734 0.919 1.06 1.191 1.314 1.422 1.622 1.714 1.806 1.774 2.063 2.131 2.26 2.391 2.513 2.566 2.682 2.801 2.977 3.084 3.2 3.399 3.586 3.76 3.932 4.09 4.277 4.447 4.609 4.811 5.001 5.185 5.389 5.601 5.8 6.004 6.223 6.452 6.676 6.914 7.186 7.448 7.737 8.019 8.263 8.45 8.566 8.549 8.129 7.199 6.29 5.458 4.698 3.977 3.304 2.66 2.089 1.486 0.929 0.421 -0.075 -0.564 -0.952 -1.235 -1.526 -1.791 -2.025 -2.267 -2.522 -2.734 -2.97 -3.223 -3.41 -3.589 -3.779 -3.992 -4.207 -4.35 -4.499 -4.73 -4.891 -5.059 -5.147 -5.323 -5.504 -5.699 -5.809 -6.142 -6.166 -6.297 -6.443 -6.757 -6.919 -7.085 -7.271 -7.487 -7.746 -8.121 -9.535 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 93bc92dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23160 ,TETRA ,17589595,Sat Nov 27 17:20:33 CET,Sat Nov 27 19:47:13 CET,0.0 0.802 1.022 1.198 1.37 1.528 1.672 1.813 2.105 2.236 2.352 2.373 2.68 2.77 2.949 3.119 3.268 3.336 3.473 3.633 3.861 3.996 4.121 4.297 4.471 4.634 4.79 4.943 5.143 5.335 5.523 5.742 5.956 6.158 6.373 6.613 6.845 7.103 7.397 7.708 8.019 8.363 8.766 9.15 9.547 9.967 10.525 11.225 11.983 12.808 13.558 13.82 13.729 13.438 13.023 12.593 12.174 11.749 11.357 10.919 10.608 10.387 10.157 9.93 9.71 9.496 9.256 9.04 8.845 8.634 8.424 8.251 8.038 7.79 7.604 7.412 7.205 6.994 6.78 6.634 6.494 6.255 6.073 5.891 5.805 5.639 5.46 5.266 5.158 4.835 4.813 4.679 4.534 4.236 4.07 3.893 3.692 3.461 3.192 2.833 1.119 -2 ,21582 ,TETRA ,17589596,Sat Nov 27 17:20:36 CET,Sat Nov 27 19:45:38 CET,0.0 0.446 0.696 0.877 1.01 1.145 1.28 1.411 1.643 1.746 1.848 1.849 2.16 2.261 2.463 2.645 2.822 2.908 3.068 3.219 3.443 3.582 3.716 3.905 4.081 4.26 4.437 4.606 4.805 4.999 5.199 5.438 5.669 5.886 6.138 6.416 6.682 6.99 7.324 7.672 8.039 8.435 8.866 9.308 9.799 10.317 10.908 11.565 12.274 12.939 13.415 13.487 13.295 12.966 12.62 12.27 11.937 11.611 11.273 10.923 10.617 10.335 10.043 9.764 9.511 9.257 9.003 8.776 8.557 8.333 8.119 7.944 7.752 7.547 7.374 7.194 7.017 6.818 6.615 6.476 6.327 6.099 5.927 5.747 5.663 5.48 5.287 5.089 4.982 4.663 4.632 4.5 4.35 4.011 3.845 3.681 3.465 3.201 2.906 2.514 1.274 -3 ,26473 ,TETRA ,17589597,Sat Nov 27 17:20:34 CET,Sat Nov 27 19:41:34 CET,0.0 1.557 2.037 2.418 2.751 3.042 3.293 3.517 3.933 4.124 4.299 4.429 4.801 4.946 5.224 5.491 5.741 5.857 6.08 6.294 6.601 6.799 6.987 7.259 7.519 7.766 8.0 8.226 8.512 8.785 9.038 9.35 9.653 9.935 10.252 10.601 10.939 11.323 11.733 12.143 12.574 13.049 13.578 14.096 14.674 15.296 15.995 16.718 17.441 18.188 18.782 18.783 18.472 18.111 17.738 17.318 16.874 16.436 16.051 15.651 15.268 14.886 14.537 14.244 13.983 13.749 13.5 13.273 13.076 12.866 12.642 12.462 12.276 12.072 11.906 11.723 11.522 11.323 11.135 11.009 10.874 10.652 10.5 10.343 10.252 10.068 9.894 9.698 9.586 9.275 9.246 9.106 8.951 8.617 8.433 8.222 7.966 7.697 7.399 6.962 5.267 -4 ,30139 ,TETRA ,17589598,Sat Nov 27 17:20:34 CET,Sat Nov 27 19:41:20 CET,0.0 0.247 0.423 0.616 0.792 0.927 1.054 1.185 1.416 1.524 1.642 1.642 1.951 2.038 2.213 2.393 2.571 2.658 2.825 2.983 3.196 3.33 3.467 3.652 3.816 3.983 4.152 4.323 4.54 4.743 4.93 5.148 5.376 5.6 5.846 6.116 6.39 6.687 6.992 7.315 7.635 7.984 8.388 8.806 9.299 9.809 10.369 10.954 11.589 12.317 12.98 13.194 13.095 12.849 12.56 12.236 11.873 11.521 11.209 10.868 10.536 10.226 9.949 9.679 9.408 9.146 8.861 8.611 8.384 8.154 7.92 7.716 7.5 7.263 7.081 6.903 6.717 6.52 6.308 6.152 6.0 5.772 5.604 5.433 5.346 5.161 4.956 4.731 4.617 4.293 4.259 4.138 4.001 3.69 3.536 3.378 3.203 3.014 2.755 2.412 1.181 -5 ,17250 ,TETRA ,17589599,Sat Nov 27 17:20:34 CET,Sat Nov 27 19:41:22 CET,0.0 0.561 0.764 0.925 1.089 1.248 1.386 1.509 1.725 1.826 1.927 1.92 2.218 2.307 2.491 2.663 2.833 2.918 3.07 3.203 3.395 3.524 3.661 3.86 4.054 4.251 4.436 4.607 4.824 5.034 5.238 5.475 5.706 5.942 6.207 6.501 6.78 7.07 7.387 7.718 8.04 8.401 8.854 9.311 9.826 10.397 11.011 11.659 12.381 13.113 13.777 14.029 13.863 13.491 13.123 12.752 12.336 11.929 11.566 11.17 10.832 10.545 10.244 9.946 9.663 9.381 9.096 8.856 8.646 8.427 8.19 7.985 7.781 7.555 7.371 7.187 6.988 6.771 6.557 6.417 6.26 6.018 5.845 5.664 5.575 5.384 5.18 4.957 4.849 4.53 4.486 4.356 4.228 3.949 3.788 3.615 3.424 3.187 2.891 2.489 1.337 -6 ,10550 ,TETRA ,17589600,Sat Nov 27 17:20:36 CET,Sat Nov 27 19:42:06 CET,0.0 0.28 0.496 0.704 0.9 1.083 1.224 1.349 1.575 1.68 1.802 1.833 2.149 2.239 2.415 2.594 2.761 2.844 3.003 3.15 3.374 3.522 3.65 3.837 4.023 4.198 4.371 4.543 4.753 4.958 5.162 5.389 5.604 5.827 6.081 6.346 6.6 6.878 7.181 7.514 7.841 8.201 8.615 9.018 9.47 9.945 10.494 11.065 11.67 12.393 13.096 13.35 13.3 13.112 12.851 12.573 12.293 11.992 11.702 11.391 11.096 10.816 10.541 10.26 9.995 9.768 9.526 9.29 9.081 8.867 8.64 8.456 8.265 8.054 7.883 7.717 7.556 7.369 7.154 7.012 6.866 6.628 6.474 6.325 6.245 6.083 5.909 5.716 5.617 5.304 5.29 5.161 5.025 4.75 4.597 4.433 4.241 4.01 3.725 3.384 2.45 -7 ,933 ,TETRA ,17589601,Sat Nov 27 17:20:38 CET,Sat Nov 27 19:41:16 CET,0.0 1.702 2.251 2.65 2.983 3.282 3.556 3.809 4.237 4.42 4.603 4.748 5.113 5.261 5.547 5.826 6.087 6.211 6.444 6.664 6.987 7.193 7.388 7.663 7.93 8.189 8.439 8.685 8.988 9.25 9.5 9.813 10.118 10.404 10.724 11.099 11.455 11.825 12.236 12.663 13.068 13.51 14.027 14.504 15.019 15.598 16.237 16.92 17.632 18.316 18.921 19.072 18.905 18.598 18.198 17.758 17.321 16.896 16.517 16.129 15.765 15.408 15.049 14.691 14.354 14.047 13.678 13.322 13.033 12.737 12.406 12.13 11.847 11.55 11.305 11.038 10.763 10.483 10.191 9.978 9.754 9.406 9.156 8.891 8.751 8.455 8.142 7.811 7.636 7.245 7.043 6.825 6.59 6.179 5.998 5.805 5.58 5.314 5.039 4.657 3.144 -8 ,21451 ,TETRA ,17589602,Sat Nov 27 17:21:31 CET,Sat Nov 27 19:49:32 CET,0.0 0.399 0.62 0.848 1.041 1.19 1.332 1.469 1.711 1.812 1.918 1.913 2.22 2.326 2.578 2.85 3.104 3.222 3.447 3.664 3.974 4.172 4.366 4.638 4.89 5.131 5.36 5.584 5.876 6.153 6.42 6.742 7.051 7.338 7.663 8.025 8.374 8.762 9.157 9.561 9.977 10.429 10.939 11.434 11.983 12.553 13.194 13.864 14.557 15.244 15.923 16.238 16.086 15.749 15.402 15.041 14.668 14.3 13.961 13.581 13.207 12.849 12.501 12.142 11.79 11.471 11.13 10.815 10.538 10.258 9.959 9.703 9.432 9.148 8.935 8.708 8.466 8.217 7.947 7.746 7.54 7.209 6.964 6.704 6.567 6.296 6.075 5.9 5.81 5.499 5.459 5.342 5.235 4.999 4.841 4.637 4.4 4.16 3.893 3.571 2.284 -9 ,19983 ,TETRA ,17589603,Sat Nov 27 17:21:34 CET,Sat Nov 27 19:49:14 CET,0.0 1.755 2.285 2.694 3.05 3.362 3.677 3.974 4.423 4.616 4.805 4.941 5.317 5.475 5.764 6.035 6.303 6.431 6.672 6.898 7.217 7.425 7.626 7.912 8.181 8.436 8.685 8.923 9.22 9.498 9.762 10.086 10.402 10.711 11.061 11.444 11.806 12.182 12.58 12.987 13.39 13.848 14.39 14.896 15.457 16.069 16.725 17.416 18.135 18.889 19.583 19.796 19.691 19.442 19.083 18.688 18.319 17.924 17.547 17.172 16.817 16.463 16.122 15.794 15.459 15.128 14.764 14.445 14.16 13.839 13.495 13.218 12.943 12.645 12.408 12.163 11.928 11.701 11.46 11.302 11.153 10.926 10.756 10.522 10.38 10.078 9.759 9.436 9.269 8.889 8.726 8.572 8.435 8.101 7.927 7.754 7.55 7.313 7.042 6.681 5.066 -10 ,7642 ,TETRA ,17589604,Sat Nov 27 17:21:36 CET,Sat Nov 27 19:43:38 CET,0.0 0.322 0.53 0.699 0.869 1.027 1.163 1.294 1.549 1.67 1.781 1.792 2.109 2.212 2.403 2.57 2.744 2.832 2.993 3.153 3.376 3.519 3.695 3.992 4.271 4.539 4.8 5.036 5.33 5.623 5.905 6.237 6.551 6.838 7.178 7.567 7.917 8.287 8.693 9.125 9.564 10.052 10.602 11.12 11.697 12.311 12.965 13.616 14.293 14.963 15.523 15.716 15.608 15.336 15.025 14.696 14.38 14.069 13.791 13.477 13.196 12.935 12.632 12.326 12.043 11.784 11.517 11.273 11.061 10.837 10.597 10.401 10.198 9.979 9.803 9.62 9.425 9.224 9.022 8.876 8.728 8.487 8.309 8.122 8.028 7.85 7.669 7.47 7.356 7.018 7.001 6.875 6.729 6.433 6.277 6.088 5.87 5.587 5.275 4.901 3.962 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt deleted file mode 100644 index ab5ac2d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10625 ,TETRA ,17589605,Sat Nov 27 17:21:35 CET,Sat Nov 27 19:40:55 CET,0.0 0.51 0.756 0.957 1.104 1.226 1.358 1.487 1.716 1.817 1.9 1.861 2.129 2.196 2.338 2.476 2.579 2.623 2.711 2.811 2.972 3.065 3.157 3.297 3.429 3.544 3.652 3.752 3.863 3.978 4.096 4.239 4.361 4.465 4.592 4.724 4.847 4.974 5.089 5.203 5.315 5.436 5.522 5.559 5.591 5.572 5.48 5.278 4.907 4.217 2.87 1.113 -0.458 -1.789 -2.908 -3.879 -4.727 -5.532 -6.228 -6.898 -7.475 -7.988 -8.472 -8.915 -9.322 -9.704 -10.1 -10.458 -10.764 -11.075 -11.4 -11.66 -11.925 -12.205 -12.422 -12.639 -12.872 -13.113 -13.349 -13.508 -13.665 -13.901 -14.067 -14.252 -14.349 -14.542 -14.72 -14.903 -15.006 -15.311 -15.31 -15.425 -15.549 -15.798 -15.934 -16.086 -16.252 -16.42 -16.605 -16.817 -17.214 -2 ,26994 ,TETRA ,17589606,Sat Nov 27 17:21:33 CET,Sat Nov 27 19:40:37 CET,0.0 0.498 0.711 0.891 1.047 1.177 1.291 1.4 1.602 1.702 1.794 1.743 1.996 2.063 2.205 2.33 2.451 2.513 2.62 2.717 2.874 2.968 3.058 3.194 3.316 3.426 3.535 3.644 3.782 3.908 4.027 4.156 4.258 4.347 4.458 4.577 4.682 4.791 4.897 4.991 5.071 5.166 5.266 5.331 5.35 5.326 5.254 5.067 4.71 4.073 2.859 1.33 -0.121 -1.49 -2.666 -3.676 -4.549 -5.323 -5.979 -6.639 -7.219 -7.758 -8.264 -8.722 -9.121 -9.47 -9.843 -10.174 -10.457 -10.751 -11.058 -11.318 -11.593 -11.888 -12.112 -12.336 -12.569 -12.823 -13.077 -13.236 -13.397 -13.635 -13.806 -13.998 -14.106 -14.324 -14.544 -14.785 -14.914 -15.259 -15.299 -15.423 -15.553 -15.868 -16.053 -16.221 -16.388 -16.577 -16.808 -17.115 -17.77 -3 ,22883 ,TETRA ,17589607,Sat Nov 27 17:21:33 CET,Sat Nov 27 19:40:20 CET,0.0 0.884 1.255 1.518 1.718 1.887 2.035 2.172 2.427 2.54 2.641 2.647 2.923 3.01 3.182 3.34 3.486 3.551 3.672 3.789 3.953 4.058 4.168 4.322 4.451 4.577 4.691 4.789 4.9 4.994 5.079 5.183 5.299 5.41 5.53 5.653 5.764 5.877 5.975 6.05 6.12 6.206 6.281 6.315 6.331 6.324 6.221 6.02 5.691 5.036 3.742 2.104 0.704 -0.593 -1.727 -2.7 -3.543 -4.295 -4.941 -5.579 -6.108 -6.584 -7.038 -7.47 -7.891 -8.298 -8.723 -9.075 -9.363 -9.666 -9.993 -10.249 -10.522 -10.819 -11.043 -11.277 -11.513 -11.762 -12.023 -12.203 -12.389 -12.668 -12.868 -13.084 -13.186 -13.381 -13.582 -13.783 -13.898 -14.234 -14.266 -14.396 -14.522 -14.803 -14.962 -15.141 -15.356 -15.561 -15.771 -16.052 -16.988 -4 ,11089 ,TETRA ,17589608,Sat Nov 27 17:21:34 CET,Sat Nov 27 19:40:02 CET,0.0 0.958 1.206 1.402 1.556 1.7 1.839 1.973 2.173 2.269 2.374 2.378 2.669 2.75 2.882 3.022 3.163 3.226 3.348 3.471 3.64 3.73 3.826 3.984 4.134 4.268 4.386 4.504 4.643 4.766 4.879 4.998 5.11 5.228 5.351 5.469 5.592 5.72 5.855 5.986 6.118 6.259 6.37 6.44 6.491 6.532 6.499 6.377 6.069 5.388 4.105 2.451 0.972 -0.325 -1.402 -2.346 -3.182 -3.944 -4.592 -5.254 -5.846 -6.36 -6.828 -7.275 -7.697 -8.091 -8.495 -8.847 -9.17 -9.509 -9.846 -10.109 -10.376 -10.671 -10.907 -11.148 -11.392 -11.634 -11.889 -12.069 -12.254 -12.517 -12.697 -12.89 -12.992 -13.206 -13.427 -13.663 -13.785 -14.119 -14.166 -14.303 -14.443 -14.762 -14.927 -15.091 -15.26 -15.443 -15.683 -16.02 -17.185 -5 ,10048 ,TETRA ,17589609,Sat Nov 27 17:21:37 CET,Sat Nov 27 19:39:12 CET,0.0 1.07 1.392 1.637 1.838 2.01 2.148 2.277 2.523 2.641 2.753 2.757 3.035 3.118 3.267 3.415 3.557 3.622 3.745 3.862 4.022 4.116 4.208 4.364 4.514 4.65 4.784 4.901 5.052 5.201 5.33 5.475 5.604 5.724 5.871 6.02 6.157 6.304 6.441 6.572 6.7 6.822 6.931 7.008 7.065 7.108 7.081 6.935 6.659 6.061 4.807 3.17 1.71 0.365 -0.791 -1.784 -2.629 -3.373 -4.041 -4.715 -5.267 -5.731 -6.169 -6.596 -6.98 -7.33 -7.715 -8.058 -8.356 -8.665 -8.994 -9.279 -9.579 -9.894 -10.119 -10.356 -10.603 -10.845 -11.099 -11.268 -11.453 -11.755 -11.96 -12.167 -12.273 -12.495 -12.729 -12.978 -13.105 -13.442 -13.514 -13.661 -13.795 -14.08 -14.251 -14.462 -14.692 -14.94 -15.208 -15.511 -16.874 -6 ,21906 ,TETRA ,17589610,Sat Nov 27 17:21:32 CET,Sat Nov 27 19:44:40 CET,0.0 0.39 0.588 0.745 0.883 0.999 1.095 1.194 1.383 1.468 1.552 1.539 1.793 1.859 1.989 2.118 2.243 2.3 2.412 2.521 2.663 2.742 2.816 2.925 3.024 3.127 3.232 3.336 3.456 3.545 3.621 3.711 3.811 3.923 4.049 4.166 4.266 4.377 4.483 4.58 4.692 4.807 4.914 4.999 5.043 5.025 4.94 4.804 4.525 3.874 2.528 0.741 -0.811 -2.135 -3.244 -4.26 -5.202 -6.02 -6.682 -7.34 -7.906 -8.438 -8.94 -9.361 -9.736 -10.091 -10.481 -10.843 -11.142 -11.429 -11.725 -11.98 -12.227 -12.481 -12.691 -12.904 -13.125 -13.348 -13.579 -13.743 -13.914 -14.175 -14.362 -14.554 -14.646 -14.83 -15.038 -15.263 -15.38 -15.712 -15.746 -15.877 -16.007 -16.311 -16.489 -16.661 -16.85 -17.089 -17.36 -17.662 -18.757 -7 ,1760 ,TETRA ,17589611,Sat Nov 27 17:21:35 CET,Sat Nov 27 19:44:22 CET,0.0 0.631 0.842 1.018 1.165 1.304 1.445 1.574 1.781 1.878 1.989 1.992 2.278 2.366 2.518 2.65 2.776 2.837 2.957 3.071 3.236 3.35 3.457 3.589 3.705 3.812 3.921 4.029 4.154 4.269 4.385 4.515 4.644 4.774 4.911 5.062 5.197 5.345 5.501 5.642 5.765 5.889 6.026 6.129 6.209 6.272 6.249 6.064 5.664 4.959 3.63 1.824 0.263 -1.083 -2.266 -3.351 -4.306 -5.162 -5.881 -6.571 -7.143 -7.657 -8.124 -8.539 -8.933 -9.287 -9.639 -9.952 -10.233 -10.532 -10.853 -11.136 -11.425 -11.732 -11.972 -12.204 -12.454 -12.713 -12.987 -13.185 -13.376 -13.659 -13.855 -14.062 -14.168 -14.393 -14.627 -14.859 -14.978 -15.328 -15.414 -15.569 -15.723 -16.059 -16.234 -16.407 -16.617 -16.864 -17.125 -17.455 -18.137 -8 ,9936 ,TETRA ,17589612,Sat Nov 27 17:21:33 CET,Sat Nov 27 19:40:08 CET,0.0 1.325 1.67 1.896 2.071 2.233 2.371 2.494 2.714 2.809 2.902 2.891 3.167 3.243 3.383 3.514 3.651 3.716 3.834 3.943 4.107 4.215 4.316 4.45 4.579 4.708 4.821 4.92 5.047 5.168 5.288 5.423 5.559 5.701 5.831 5.958 6.102 6.253 6.39 6.52 6.641 6.776 6.917 7.029 7.093 7.094 7.048 6.901 6.558 5.901 4.562 2.738 1.202 -0.1 -1.236 -2.286 -3.211 -3.976 -4.624 -5.283 -5.818 -6.303 -6.774 -7.208 -7.622 -8.012 -8.415 -8.76 -9.056 -9.362 -9.678 -9.952 -10.232 -10.497 -10.713 -10.963 -11.22 -11.462 -11.704 -11.878 -12.06 -12.34 -12.54 -12.756 -12.871 -13.104 -13.324 -13.534 -13.638 -13.962 -13.999 -14.131 -14.276 -14.587 -14.745 -14.905 -15.076 -15.284 -15.544 -15.89 -16.444 -9 ,17410 ,TETRA ,17589613,Sat Nov 27 17:22:31 CET,Sat Nov 27 19:36:16 CET,0.0 0.861 1.062 1.213 1.332 1.437 1.537 1.631 1.817 1.906 1.996 1.998 2.28 2.353 2.5 2.633 2.756 2.823 2.934 3.029 3.17 3.275 3.377 3.501 3.621 3.729 3.826 3.924 4.048 4.161 4.26 4.37 4.479 4.584 4.701 4.827 4.924 5.016 5.128 5.231 5.322 5.43 5.526 5.595 5.652 5.668 5.625 5.462 5.061 4.291 2.892 1.185 -0.303 -1.612 -2.722 -3.674 -4.465 -5.182 -5.811 -6.463 -7.003 -7.469 -7.905 -8.322 -8.717 -9.067 -9.438 -9.762 -10.033 -10.307 -10.583 -10.813 -11.058 -11.308 -11.494 -11.686 -11.889 -12.104 -12.322 -12.468 -12.622 -12.879 -13.068 -13.248 -13.335 -13.506 -13.691 -13.891 -13.99 -14.3 -14.327 -14.443 -14.57 -14.867 -15.038 -15.205 -15.354 -15.513 -15.707 -15.998 -16.61 -10 ,6791 ,TETRA ,17589614,Sat Nov 27 17:22:33 CET,Sat Nov 27 19:41:41 CET,0.0 0.496 0.782 0.992 1.179 1.364 1.505 1.622 1.906 2.047 2.16 2.158 2.429 2.511 2.656 2.785 2.905 2.958 3.066 3.181 3.343 3.443 3.539 3.679 3.808 3.93 4.044 4.17 4.336 4.47 4.597 4.741 4.876 5.004 5.144 5.294 5.437 5.591 5.733 5.874 6.01 6.146 6.308 6.437 6.515 6.55 6.53 6.372 5.981 5.278 3.981 2.324 0.896 -0.451 -1.659 -2.653 -3.505 -4.301 -4.963 -5.607 -6.177 -6.667 -7.137 -7.608 -8.041 -8.437 -8.846 -9.202 -9.507 -9.82 -10.142 -10.423 -10.71 -10.994 -11.224 -11.468 -11.711 -11.959 -12.207 -12.37 -12.544 -12.816 -12.993 -13.175 -13.271 -13.466 -13.674 -13.903 -14.019 -14.35 -14.399 -14.528 -14.653 -14.924 -15.076 -15.24 -15.424 -15.637 -15.906 -16.208 -17.317 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index ae92e24b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24649 ,TETRA ,17589615,Sat Nov 27 17:23:31 CET,Sat Nov 27 19:45:20 CET,0.0 0.602 0.894 1.121 1.326 1.541 1.738 1.912 2.219 2.358 2.503 2.588 2.944 3.062 3.276 3.489 3.698 3.799 4.003 4.189 4.432 4.589 4.754 5.01 5.244 5.45 5.657 5.862 6.121 6.38 6.642 6.963 7.278 7.571 7.907 8.293 8.66 9.06 9.486 9.94 10.425 10.99 11.629 12.25 13.009 13.876 14.863 15.963 17.226 18.697 20.454 21.812 22.515 22.908 23.08 23.134 23.119 23.058 22.969 22.823 22.637 22.46 22.303 22.132 21.95 21.785 21.619 21.457 21.294 21.108 20.921 20.76 20.571 20.381 20.24 20.092 19.93 19.754 19.564 19.422 19.28 19.059 18.898 18.741 18.669 18.512 18.332 18.131 18.032 17.743 17.695 17.571 17.442 17.128 16.953 16.754 16.513 16.235 15.949 15.577 14.569 -2 ,6837 ,TETRA ,17589616,Sat Nov 27 17:23:31 CET,Sat Nov 27 19:45:29 CET,0.0 0.454 0.73 0.969 1.187 1.39 1.569 1.717 2.005 2.145 2.278 2.318 2.659 2.788 3.026 3.252 3.462 3.559 3.743 3.926 4.199 4.368 4.525 4.765 5.009 5.245 5.467 5.683 5.972 6.247 6.514 6.822 7.133 7.443 7.777 8.157 8.528 8.944 9.401 9.882 10.386 10.935 11.573 12.246 13.061 13.978 15.001 16.132 17.522 19.194 21.092 22.508 23.206 23.527 23.619 23.624 23.565 23.437 23.296 23.141 22.998 22.854 22.693 22.532 22.384 22.225 22.032 21.855 21.708 21.545 21.351 21.169 20.97 20.772 20.61 20.446 20.291 20.114 19.924 19.79 19.648 19.446 19.29 19.122 19.036 18.853 18.663 18.467 18.367 18.067 18.025 17.905 17.771 17.461 17.293 17.103 16.883 16.624 16.327 15.899 15.113 -3 ,19318 ,TETRA ,17589617,Sat Nov 27 17:23:33 CET,Sat Nov 27 19:52:45 CET,0.0 0.577 0.831 1.043 1.204 1.354 1.506 1.646 1.892 2.018 2.138 2.149 2.478 2.591 2.791 2.969 3.15 3.24 3.416 3.588 3.836 4.006 4.176 4.406 4.629 4.864 5.084 5.291 5.557 5.812 6.054 6.359 6.656 6.933 7.259 7.624 7.971 8.373 8.812 9.249 9.699 10.22 10.828 11.449 12.184 12.986 13.91 14.991 16.289 17.809 19.602 20.946 21.617 21.962 22.087 22.092 22.027 21.887 21.719 21.517 21.325 21.157 20.982 20.79 20.593 20.398 20.198 20.02 19.86 19.686 19.496 19.316 19.131 18.963 18.835 18.689 18.524 18.355 18.169 18.036 17.897 17.685 17.537 17.363 17.269 17.07 16.862 16.649 16.536 16.233 16.196 16.062 15.915 15.615 15.446 15.239 15.008 14.764 14.479 14.143 13.316 -4 ,15080 ,TETRA ,17589618,Sat Nov 27 17:23:35 CET,Sat Nov 27 19:52:04 CET,0.0 0.608 0.872 1.11 1.317 1.515 1.701 1.88 2.166 2.287 2.401 2.407 2.725 2.831 3.029 3.214 3.403 3.498 3.692 3.872 4.12 4.285 4.451 4.68 4.896 5.109 5.326 5.544 5.819 6.087 6.345 6.651 6.945 7.231 7.56 7.945 8.31 8.683 9.087 9.535 10.014 10.564 11.218 11.86 12.607 13.459 14.458 15.57 16.849 18.341 20.144 21.509 22.221 22.576 22.704 22.732 22.687 22.617 22.51 22.327 22.121 21.953 21.807 21.651 21.493 21.329 21.141 20.96 20.8 20.629 20.448 20.297 20.138 19.957 19.793 19.609 19.418 19.235 19.034 18.88 18.73 18.509 18.349 18.161 18.062 17.858 17.63 17.395 17.269 16.935 16.855 16.717 16.568 16.264 16.105 15.926 15.677 15.371 15.04 14.618 13.884 -5 ,29462 ,TETRA ,17589619,Sat Nov 27 17:23:37 CET,Sat Nov 27 19:47:21 CET,0.0 0.452 0.719 0.926 1.144 1.336 1.488 1.632 1.928 2.055 2.163 2.161 2.488 2.601 2.814 3.013 3.222 3.325 3.533 3.735 4.003 4.166 4.322 4.54 4.76 4.985 5.203 5.426 5.721 6.003 6.272 6.592 6.896 7.181 7.505 7.867 8.221 8.615 9.028 9.474 9.955 10.484 11.104 11.746 12.499 13.352 14.334 15.414 16.692 18.201 20.008 21.407 22.104 22.469 22.627 22.65 22.601 22.498 22.381 22.217 22.038 21.862 21.669 21.475 21.273 21.087 20.889 20.691 20.512 20.32 20.113 19.935 19.745 19.541 19.389 19.228 19.046 18.845 18.644 18.508 18.357 18.105 17.933 17.763 17.673 17.484 17.292 17.078 16.953 16.629 16.536 16.381 16.223 15.892 15.721 15.535 15.317 15.054 14.689 14.237 13.085 -6 ,19060 ,TETRA ,17589620,Sat Nov 27 17:23:38 CET,Sat Nov 27 19:46:30 CET,0.0 0.636 0.911 1.094 1.273 1.456 1.622 1.768 2.068 2.215 2.358 2.432 2.769 2.877 3.098 3.313 3.526 3.632 3.826 3.996 4.247 4.427 4.605 4.857 5.101 5.334 5.551 5.765 6.043 6.311 6.579 6.907 7.223 7.521 7.869 8.264 8.647 9.072 9.531 10.021 10.542 11.14 11.847 12.568 13.386 14.301 15.372 16.559 17.896 19.41 21.301 22.815 23.538 23.941 24.132 24.164 24.16 24.121 24.059 23.96 23.81 23.648 23.48 23.299 23.108 22.911 22.685 22.495 22.334 22.13 21.909 21.732 21.547 21.332 21.157 20.997 20.819 20.624 20.426 20.287 20.142 19.913 19.744 19.561 19.469 19.268 19.066 18.852 18.73 18.427 18.392 18.266 18.124 17.795 17.606 17.417 17.202 16.972 16.702 16.274 15.412 -7 ,19505 ,TETRA ,17589621,Sat Nov 27 17:24:32 CET,Sat Nov 27 19:40:46 CET,0.0 0.373 0.668 0.924 1.151 1.356 1.53 1.687 1.985 2.127 2.255 2.29 2.64 2.781 3.036 3.278 3.523 3.638 3.85 4.062 4.372 4.559 4.736 5.001 5.261 5.497 5.72 5.952 6.281 6.597 6.902 7.27 7.62 7.936 8.282 8.698 9.12 9.573 10.062 10.572 11.102 11.699 12.391 13.081 13.852 14.718 15.704 16.791 18.07 19.578 21.359 22.74 23.456 23.829 24.014 24.076 24.025 23.906 23.774 23.607 23.445 23.303 23.146 22.965 22.781 22.592 22.381 22.19 22.017 21.831 21.641 21.486 21.314 21.134 20.998 20.838 20.646 20.447 20.235 20.086 19.937 19.686 19.509 19.33 19.242 19.056 18.856 18.649 18.53 18.204 18.135 18.005 17.87 17.548 17.365 17.185 16.987 16.763 16.441 15.973 14.905 -8 ,15265 ,TETRA ,17589622,Sat Nov 27 17:24:32 CET,Sat Nov 27 19:48:12 CET,0.0 0.701 1.13 1.374 1.598 1.806 1.994 2.17 2.501 2.653 2.787 2.813 3.152 3.276 3.498 3.71 3.914 4.007 4.197 4.382 4.639 4.809 4.983 5.248 5.494 5.731 5.967 6.182 6.448 6.721 6.983 7.296 7.592 7.88 8.22 8.586 8.941 9.33 9.738 10.175 10.646 11.177 11.802 12.446 13.203 14.06 15.035 16.122 17.422 18.919 20.694 22.002 22.556 22.817 22.911 22.906 22.831 22.69 22.543 22.384 22.223 22.053 21.885 21.722 21.549 21.373 21.174 20.994 20.826 20.643 20.454 20.29 20.111 19.91 19.751 19.577 19.399 19.235 19.063 18.938 18.806 18.601 18.443 18.273 18.189 18.007 17.815 17.603 17.482 17.16 17.098 16.971 16.844 16.516 16.324 16.102 15.853 15.611 15.312 14.885 13.598 -9 ,1005 ,TETRA ,17589623,Sat Nov 27 17:24:32 CET,Sat Nov 27 19:27:42 CET,0.0 0.399 0.651 0.827 0.988 1.141 1.275 1.394 1.625 1.739 1.855 1.888 2.217 2.322 2.515 2.702 2.889 2.977 3.153 3.326 3.568 3.731 3.893 4.13 4.354 4.566 4.775 4.974 5.238 5.499 5.742 6.026 6.311 6.595 6.922 7.28 7.622 8.003 8.424 8.883 9.379 9.937 10.581 11.242 12.007 12.867 13.87 14.988 16.285 17.782 19.552 20.894 21.529 21.808 21.926 21.944 21.897 21.811 21.677 21.513 21.353 21.198 21.031 20.866 20.713 20.551 20.37 20.196 20.035 19.865 19.685 19.542 19.378 19.197 19.062 18.914 18.749 18.576 18.399 18.276 18.132 17.895 17.736 17.574 17.491 17.326 17.163 16.978 16.876 16.574 16.529 16.403 16.27 15.977 15.785 15.553 15.335 15.066 14.745 14.39 13.622 -10 ,30008 ,TETRA ,17589624,Sat Nov 27 17:24:32 CET,Sat Nov 27 19:32:00 CET,0.0 0.403 0.671 0.879 1.081 1.285 1.477 1.631 1.886 2.017 2.148 2.187 2.52 2.627 2.841 3.054 3.267 3.371 3.565 3.744 3.983 4.139 4.305 4.543 4.778 5.005 5.226 5.437 5.699 5.954 6.197 6.492 6.787 7.074 7.404 7.782 8.157 8.585 9.049 9.552 10.096 10.688 11.349 12.01 12.782 13.659 14.658 15.787 17.152 18.701 20.436 21.811 22.496 22.83 22.984 23.025 23.017 22.942 22.818 22.66 22.5 22.325 22.134 21.951 21.771 21.594 21.396 21.205 21.033 20.841 20.627 20.454 20.28 20.102 19.96 19.795 19.623 19.451 19.251 19.123 19.003 18.802 18.658 18.506 18.424 18.254 18.078 17.863 17.752 17.446 17.378 17.246 17.1 16.782 16.629 16.458 16.259 16.036 15.74 15.338 14.616 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 10c766d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16135 ,TETRA ,17589625,Sat Nov 27 17:24:32 CET,Sat Nov 27 19:44:30 CET,0.0 0.674 0.969 1.242 1.46 1.63 1.781 1.93 2.178 2.297 2.423 2.453 2.768 2.875 3.081 3.28 3.474 3.563 3.734 3.9 4.14 4.298 4.451 4.666 4.876 5.088 5.291 5.492 5.752 5.999 6.253 6.555 6.839 7.104 7.409 7.77 8.123 8.51 8.927 9.391 9.869 10.378 10.993 11.62 12.346 13.14 14.032 15.011 16.185 17.602 19.156 20.277 20.776 20.913 20.926 20.801 20.594 20.387 20.16 19.913 19.687 19.468 19.237 18.998 18.771 18.539 18.279 18.048 17.833 17.608 17.362 17.145 16.944 16.717 16.532 16.36 16.171 15.962 15.755 15.608 15.439 15.166 14.975 14.775 14.664 14.434 14.199 13.968 13.862 13.56 13.496 13.34 13.161 12.795 12.593 12.358 12.089 11.806 11.483 11.048 9.501 -2 ,9525 ,TETRA ,17589626,Sat Nov 27 17:24:32 CET,Sat Nov 27 19:45:15 CET,0.0 0.558 0.841 1.097 1.303 1.474 1.63 1.782 2.064 2.209 2.346 2.38 2.725 2.846 3.087 3.321 3.55 3.662 3.882 4.102 4.41 4.605 4.796 5.056 5.295 5.537 5.777 6.004 6.278 6.53 6.773 7.058 7.347 7.639 7.973 8.36 8.738 9.137 9.561 10.018 10.495 11.031 11.671 12.305 13.037 13.861 14.818 15.929 17.22 18.717 20.389 21.516 22.049 22.297 22.351 22.268 22.059 21.738 21.423 21.125 20.864 20.606 20.327 20.039 19.73 19.433 19.132 18.854 18.593 18.342 18.107 17.9 17.693 17.473 17.293 17.111 16.926 16.739 16.52 16.367 16.209 15.951 15.766 15.567 15.467 15.276 15.075 14.839 14.709 14.385 14.286 14.134 13.973 13.578 13.361 13.143 12.884 12.583 12.233 11.687 9.337 -3 ,6481 ,TETRA ,17589627,Sat Nov 27 17:24:34 CET,Sat Nov 27 19:45:47 CET,0.0 0.896 1.158 1.351 1.533 1.704 1.856 2.0 2.278 2.404 2.512 2.51 2.825 2.932 3.151 3.356 3.547 3.635 3.806 3.966 4.205 4.373 4.542 4.798 5.065 5.327 5.561 5.776 6.064 6.34 6.6 6.908 7.203 7.491 7.835 8.225 8.604 9.024 9.476 9.95 10.443 11.008 11.669 12.295 13.047 13.91 14.882 15.958 17.227 18.753 20.458 21.698 22.273 22.572 22.652 22.577 22.42 22.207 21.993 21.78 21.574 21.367 21.131 20.869 20.646 20.451 20.236 20.049 19.871 19.664 19.422 19.191 18.931 18.669 18.492 18.3 18.07 17.829 17.587 17.422 17.25 16.968 16.764 16.559 16.451 16.205 15.953 15.692 15.553 15.222 15.092 14.915 14.737 14.309 14.068 13.822 13.553 13.249 12.886 12.386 10.656 -4 ,16801 ,TETRA ,17589628,Sat Nov 27 17:24:37 CET,Sat Nov 27 19:45:35 CET,0.0 1.143 1.489 1.712 1.896 2.068 2.233 2.381 2.656 2.792 2.928 2.978 3.31 3.428 3.658 3.896 4.113 4.212 4.419 4.611 4.85 5.006 5.162 5.383 5.608 5.827 6.042 6.243 6.486 6.731 6.977 7.257 7.519 7.779 8.079 8.434 8.78 9.154 9.576 10.027 10.493 11.033 11.646 12.265 13.024 13.841 14.756 15.789 16.961 18.364 20.005 21.28 21.937 22.194 22.245 22.189 22.048 21.877 21.683 21.452 21.27 21.084 20.882 20.702 20.512 20.322 20.127 19.96 19.8 19.607 19.418 19.261 19.085 18.898 18.744 18.561 18.361 18.167 17.97 17.832 17.701 17.461 17.279 17.108 17.016 16.805 16.579 16.332 16.194 15.85 15.729 15.582 15.418 15.017 14.795 14.522 14.22 13.886 13.433 12.744 10.244 -5 ,25813 ,TETRA ,17589629,Sat Nov 27 17:24:38 CET,Sat Nov 27 19:45:29 CET,0.0 0.34 0.577 0.818 1.056 1.255 1.426 1.588 1.888 2.024 2.151 2.191 2.515 2.635 2.863 3.077 3.284 3.378 3.564 3.75 4.008 4.176 4.331 4.556 4.797 5.042 5.273 5.484 5.753 6.016 6.269 6.57 6.855 7.133 7.462 7.842 8.214 8.63 9.079 9.54 10.018 10.556 11.16 11.764 12.491 13.3 14.239 15.382 16.821 18.44 20.274 21.67 22.333 22.628 22.724 22.735 22.684 22.573 22.449 22.304 22.156 22.006 21.808 21.582 21.385 21.2 20.973 20.753 20.577 20.395 20.178 19.994 19.802 19.594 19.439 19.275 19.093 18.89 18.673 18.535 18.398 18.183 18.019 17.845 17.761 17.593 17.417 17.214 17.103 16.795 16.739 16.603 16.449 16.094 15.899 15.712 15.519 15.237 14.883 14.444 12.884 -6 ,6310 ,TETRA ,17589630,Sat Nov 27 17:24:33 CET,Sat Nov 27 19:53:42 CET,0.0 0.703 1.077 1.328 1.536 1.724 1.896 2.053 2.342 2.488 2.635 2.7 3.028 3.154 3.404 3.638 3.856 3.961 4.169 4.378 4.656 4.828 5.011 5.261 5.499 5.733 5.95 6.162 6.435 6.699 6.966 7.28 7.574 7.853 8.178 8.574 8.978 9.403 9.84 10.303 10.794 11.357 12.011 12.64 13.381 14.217 15.181 16.285 17.548 19.007 20.737 22.018 22.639 22.945 23.027 22.947 22.798 22.629 22.456 22.246 22.031 21.801 21.557 21.326 21.109 20.885 20.62 20.376 20.172 19.955 19.713 19.496 19.256 19.02 18.838 18.654 18.483 18.291 18.079 17.933 17.785 17.534 17.356 17.165 17.062 16.847 16.611 16.358 16.217 15.877 15.771 15.608 15.429 15.041 14.839 14.612 14.382 14.123 13.731 13.189 11.347 -7 ,1592 ,TETRA ,17589631,Sat Nov 27 17:24:37 CET,Sat Nov 27 19:54:00 CET,0.0 1.068 1.44 1.662 1.842 2.01 2.169 2.314 2.568 2.704 2.846 2.9 3.23 3.341 3.553 3.757 3.944 4.037 4.219 4.383 4.61 4.762 4.921 5.158 5.378 5.576 5.772 5.969 6.237 6.489 6.724 7.018 7.3 7.566 7.873 8.239 8.595 8.98 9.398 9.87 10.378 10.919 11.554 12.204 12.958 13.8 14.752 15.794 17.027 18.493 20.129 21.295 21.846 22.053 22.099 22.064 21.955 21.811 21.634 21.411 21.231 21.071 20.891 20.701 20.511 20.306 20.086 19.88 19.672 19.467 19.254 19.071 18.89 18.682 18.506 18.324 18.113 17.884 17.658 17.493 17.31 17.025 16.821 16.617 16.528 16.345 16.137 15.897 15.775 15.461 15.347 15.192 15.016 14.649 14.439 14.215 13.99 13.725 13.335 12.77 10.22 -8 ,2181 ,TETRA ,17589632,Sat Nov 27 17:24:33 CET,Sat Nov 27 19:46:21 CET,0.0 0.587 0.839 1.059 1.236 1.381 1.504 1.635 1.875 1.981 2.084 2.066 2.362 2.459 2.643 2.831 3.014 3.104 3.277 3.44 3.676 3.826 3.97 4.191 4.396 4.578 4.771 4.966 5.205 5.435 5.673 5.957 6.232 6.5 6.807 7.156 7.498 7.891 8.304 8.741 9.197 9.704 10.315 10.922 11.612 12.409 13.346 14.342 15.515 16.969 18.691 19.983 20.572 20.814 20.92 20.92 20.863 20.773 20.63 20.425 20.225 20.019 19.809 19.598 19.39 19.185 18.96 18.773 18.592 18.405 18.205 18.024 17.834 17.636 17.486 17.337 17.187 17.019 16.835 16.703 16.564 16.336 16.173 16.01 15.924 15.749 15.569 15.357 15.243 14.948 14.911 14.781 14.61 14.195 13.996 13.823 13.628 13.405 13.129 12.734 11.384 -9 ,3738 ,TETRA ,17589633,Sat Nov 27 17:24:35 CET,Sat Nov 27 19:45:30 CET,0.0 0.526 0.821 1.081 1.305 1.481 1.657 1.827 2.131 2.266 2.405 2.457 2.788 2.92 3.164 3.386 3.585 3.676 3.859 4.048 4.329 4.505 4.671 4.908 5.145 5.385 5.61 5.815 6.078 6.344 6.6 6.9 7.18 7.459 7.799 8.174 8.531 8.927 9.355 9.794 10.26 10.808 11.431 12.047 12.762 13.538 14.434 15.452 16.639 18.054 19.628 20.768 21.367 21.688 21.811 21.776 21.64 21.465 21.258 21.007 20.747 20.456 20.162 19.881 19.635 19.424 19.182 18.935 18.726 18.509 18.272 18.064 17.82 17.558 17.348 17.112 16.854 16.594 16.32 16.144 15.976 15.693 15.485 15.264 15.148 14.926 14.689 14.413 14.26 13.913 13.772 13.585 13.393 12.957 12.715 12.432 12.101 11.755 11.37 10.741 8.773 -10 ,12062 ,TETRA ,17589634,Sat Nov 27 17:25:32 CET,Sat Nov 27 19:32:36 CET,0.0 0.525 0.775 1.0 1.191 1.35 1.493 1.63 1.877 2.014 2.146 2.167 2.478 2.581 2.788 2.969 3.143 3.236 3.427 3.607 3.864 4.035 4.201 4.438 4.664 4.881 5.103 5.323 5.582 5.827 6.071 6.373 6.659 6.938 7.265 7.624 7.965 8.344 8.771 9.246 9.742 10.278 10.914 11.572 12.308 13.101 14.047 15.087 16.294 17.774 19.525 20.782 21.326 21.559 21.618 21.489 21.281 21.08 20.818 20.494 20.19 19.911 19.648 19.392 19.145 18.908 18.677 18.459 18.251 18.01 17.735 17.503 17.275 17.037 16.841 16.646 16.406 16.111 15.852 15.699 15.534 15.27 15.084 14.886 14.787 14.591 14.385 14.166 14.048 13.729 13.643 13.504 13.35 12.993 12.788 12.556 12.308 12.022 11.666 11.213 10.078 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt deleted file mode 100644 index eb5c37af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24891 ,TETRA ,17589635,Sat Nov 27 17:25:33 CET,Sat Nov 27 19:39:43 CET,0.0 1.033 1.458 1.781 2.055 2.316 2.55 2.748 3.097 3.265 3.426 3.532 3.898 4.034 4.296 4.545 4.797 4.919 5.134 5.337 5.632 5.814 5.982 6.23 6.483 6.726 6.963 7.193 7.469 7.726 7.977 8.29 8.572 8.823 9.111 9.428 9.728 10.074 10.426 10.785 11.153 11.539 11.984 12.408 12.874 13.362 13.854 14.355 14.869 15.291 15.435 14.967 14.29 13.652 12.981 12.342 11.821 11.314 10.828 10.334 9.939 9.604 9.263 8.916 8.585 8.265 7.907 7.563 7.245 6.921 6.597 6.315 6.023 5.725 5.488 5.231 4.935 4.628 4.33 4.128 3.917 3.593 3.357 3.107 2.985 2.73 2.456 2.156 1.999 1.621 1.488 1.31 1.119 0.688 0.455 0.202 -0.057 -0.354 -0.736 -1.224 -2.376 -2 ,28861 ,TETRA ,17589636,Sat Nov 27 17:25:33 CET,Sat Nov 27 19:48:48 CET,0.0 0.943 1.334 1.656 1.938 2.202 2.438 2.643 3.001 3.172 3.335 3.402 3.743 3.872 4.105 4.331 4.548 4.646 4.848 5.044 5.32 5.504 5.673 5.909 6.141 6.372 6.596 6.798 7.049 7.295 7.53 7.821 8.108 8.377 8.684 9.034 9.36 9.697 10.06 10.445 10.846 11.297 11.821 12.321 12.854 13.431 14.038 14.589 15.085 15.463 15.486 15.021 14.377 13.672 12.947 12.24 11.573 10.937 10.39 9.829 9.308 8.839 8.424 8.036 7.672 7.333 6.964 6.601 6.262 5.91 5.559 5.278 4.976 4.652 4.397 4.133 3.859 3.584 3.28 3.052 2.797 2.392 2.109 1.818 1.671 1.366 1.031 0.676 0.486 0.065 -0.115 -0.323 -0.55 -1.041 -1.303 -1.622 -2.018 -2.423 -2.912 -3.618 -6.364 -3 ,17569 ,TETRA ,17589637,Sat Nov 27 17:25:33 CET,Sat Nov 27 19:49:14 CET,0.0 0.762 1.117 1.41 1.694 1.982 2.239 2.454 2.857 3.057 3.234 3.314 3.647 3.77 4.021 4.243 4.443 4.541 4.724 4.907 5.171 5.34 5.499 5.727 5.94 6.141 6.326 6.502 6.736 6.977 7.213 7.47 7.695 7.928 8.188 8.461 8.748 9.091 9.452 9.798 10.129 10.497 10.923 11.323 11.774 12.261 12.772 13.303 13.825 14.187 14.117 13.696 13.098 12.449 11.846 11.257 10.686 10.072 9.52 8.998 8.543 8.127 7.71 7.3 6.919 6.581 6.238 5.929 5.654 5.347 5.026 4.765 4.465 4.135 3.886 3.648 3.398 3.124 2.843 2.652 2.458 2.156 1.945 1.735 1.626 1.398 1.172 0.927 0.797 0.439 0.319 0.133 -0.061 -0.476 -0.696 -0.929 -1.177 -1.468 -1.813 -2.266 -3.647 -4 ,8056 ,TETRA ,17589638,Sat Nov 27 17:25:35 CET,Sat Nov 27 19:48:28 CET,0.0 0.691 1.046 1.326 1.59 1.819 2.014 2.189 2.452 2.585 2.739 2.804 3.136 3.25 3.472 3.677 3.882 3.984 4.173 4.358 4.642 4.825 4.991 5.229 5.46 5.663 5.861 6.073 6.336 6.577 6.812 7.081 7.341 7.596 7.881 8.201 8.501 8.818 9.162 9.518 9.858 10.223 10.644 11.044 11.518 12.006 12.478 12.992 13.528 13.891 13.959 13.656 13.069 12.333 11.594 10.876 10.207 9.576 9.01 8.469 8.014 7.589 7.184 6.801 6.427 6.078 5.736 5.437 5.169 4.884 4.572 4.307 4.028 3.749 3.547 3.327 3.089 2.84 2.574 2.385 2.19 1.896 1.696 1.487 1.371 1.13 0.876 0.612 0.483 0.14 0.059 -0.104 -0.284 -0.663 -0.863 -1.103 -1.356 -1.627 -1.979 -2.455 -3.401 -5 ,1753 ,TETRA ,17589639,Sat Nov 27 17:25:37 CET,Sat Nov 27 19:49:03 CET,0.0 1.383 1.832 2.164 2.432 2.661 2.864 3.046 3.378 3.534 3.68 3.75 4.095 4.228 4.487 4.729 4.942 5.045 5.249 5.436 5.694 5.866 6.037 6.271 6.492 6.703 6.903 7.1 7.357 7.606 7.837 8.117 8.416 8.695 8.994 9.316 9.602 9.925 10.268 10.597 10.944 11.338 11.761 12.176 12.645 13.102 13.568 14.032 14.495 14.862 14.946 14.478 13.814 13.154 12.546 11.977 11.47 10.983 10.5 9.997 9.549 9.137 8.732 8.315 7.913 7.556 7.174 6.83 6.527 6.202 5.854 5.572 5.29 4.999 4.768 4.526 4.279 4.012 3.729 3.541 3.346 3.036 2.818 2.586 2.458 2.204 1.951 1.682 1.543 1.184 1.081 0.904 0.711 0.304 0.074 -0.181 -0.451 -0.759 -1.13 -1.598 -2.895 -6 ,15508 ,TETRA ,17589640,Sat Nov 27 17:26:32 CET,Sat Nov 27 19:46:28 CET,0.0 0.74 1.201 1.513 1.752 1.953 2.154 2.363 2.716 2.878 3.042 3.129 3.472 3.594 3.813 4.023 4.237 4.347 4.561 4.77 5.048 5.232 5.429 5.692 5.922 6.146 6.352 6.552 6.815 7.053 7.276 7.555 7.819 8.069 8.362 8.674 8.962 9.296 9.652 9.986 10.326 10.719 11.166 11.61 12.096 12.605 13.163 13.695 14.193 14.616 14.811 14.484 13.866 13.206 12.556 11.891 11.249 10.678 10.215 9.773 9.379 9.024 8.679 8.308 7.934 7.589 7.228 6.904 6.64 6.378 6.098 5.85 5.583 5.287 5.046 4.812 4.589 4.359 4.128 3.968 3.798 3.508 3.299 3.081 2.959 2.707 2.45 2.199 2.076 1.728 1.631 1.465 1.303 0.947 0.736 0.501 0.242 -0.04 -0.387 -0.894 -2.455 -7 ,29627 ,TETRA ,17589641,Sat Nov 27 17:26:32 CET,Sat Nov 27 19:49:59 CET,0.0 0.908 1.316 1.638 1.871 2.078 2.307 2.531 2.871 3.03 3.176 3.218 3.538 3.658 3.892 4.097 4.298 4.399 4.6 4.799 5.081 5.26 5.433 5.666 5.898 6.124 6.323 6.507 6.753 6.983 7.203 7.47 7.715 7.953 8.216 8.503 8.779 9.097 9.448 9.797 10.134 10.49 10.911 11.331 11.775 12.229 12.729 13.196 13.599 13.92 13.907 13.347 12.627 11.923 11.302 10.658 9.996 9.405 8.896 8.361 7.908 7.501 7.089 6.696 6.318 5.96 5.586 5.235 4.931 4.615 4.287 4.025 3.733 3.419 3.194 2.957 2.706 2.447 2.164 1.96 1.748 1.434 1.214 0.995 0.886 0.655 0.404 0.133 -0.005 -0.367 -0.502 -0.681 -0.861 -1.283 -1.513 -1.759 -2.036 -2.365 -2.776 -3.329 -4.735 -8 ,26695 ,TETRA ,17589642,Sat Nov 27 17:27:33 CET,Sat Nov 27 19:34:32 CET,0.0 0.724 1.097 1.377 1.606 1.801 1.974 2.15 2.48 2.631 2.776 2.852 3.186 3.314 3.566 3.807 4.028 4.126 4.311 4.498 4.775 4.953 5.123 5.356 5.57 5.783 5.996 6.199 6.469 6.722 6.951 7.227 7.492 7.755 8.062 8.392 8.701 9.041 9.396 9.757 10.125 10.548 11.036 11.482 12.011 12.558 13.12 13.746 14.34 14.913 15.463 15.455 15.082 14.595 14.08 13.563 13.095 12.657 12.256 11.818 11.429 11.089 10.762 10.434 10.116 9.82 9.481 9.177 8.95 8.697 8.405 8.185 7.965 7.725 7.547 7.367 7.167 6.953 6.739 6.594 6.435 6.169 5.981 5.798 5.703 5.496 5.286 5.067 4.944 4.613 4.533 4.368 4.203 3.891 3.721 3.536 3.321 3.069 2.758 2.39 1.66 -9 ,14316 ,TETRA ,17589643,Sat Nov 27 17:27:32 CET,Sat Nov 27 19:49:26 CET,0.0 1.22 1.644 1.961 2.236 2.469 2.664 2.85 3.205 3.352 3.496 3.587 3.936 4.065 4.319 4.564 4.778 4.876 5.088 5.298 5.579 5.753 5.92 6.169 6.392 6.606 6.817 7.011 7.263 7.515 7.758 8.05 8.344 8.625 8.923 9.238 9.542 9.871 10.228 10.597 10.985 11.403 11.83 12.289 12.833 13.386 13.966 14.511 15.007 15.414 15.561 15.216 14.567 13.829 13.177 12.544 11.925 11.338 10.826 10.332 9.914 9.546 9.19 8.829 8.471 8.12 7.751 7.417 7.13 6.844 6.532 6.264 5.98 5.694 5.481 5.256 5.012 4.768 4.507 4.317 4.114 3.793 3.572 3.334 3.22 2.99 2.704 2.392 2.241 1.871 1.712 1.527 1.343 0.908 0.658 0.398 0.099 -0.274 -0.711 -1.308 -4.165 -10 ,5487 ,TETRA ,17589644,Sat Nov 27 17:28:31 CET,Sat Nov 27 19:59:29 CET,0.0 1.034 1.348 1.623 1.879 2.119 2.337 2.52 2.868 3.037 3.184 3.224 3.561 3.683 3.935 4.173 4.387 4.489 4.693 4.888 5.166 5.338 5.497 5.745 5.993 6.225 6.439 6.645 6.912 7.169 7.402 7.65 7.905 8.154 8.421 8.735 9.044 9.372 9.712 10.052 10.405 10.782 11.216 11.638 12.102 12.561 13.039 13.557 14.045 14.445 14.561 14.137 13.573 12.993 12.416 11.866 11.336 10.803 10.303 9.774 9.31 8.878 8.45 8.048 7.675 7.326 6.956 6.631 6.359 6.076 5.778 5.532 5.269 4.998 4.796 4.583 4.347 4.079 3.793 3.603 3.405 3.075 2.834 2.598 2.481 2.233 1.967 1.688 1.547 1.195 1.093 0.926 0.754 0.416 0.226 -0.005 -0.286 -0.63 -0.992 -1.489 -2.507 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 5539b20d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31962 ,TETRA ,17589645,Sat Nov 27 17:28:34 CET,Sat Nov 27 20:03:25 CET,0.0 0.713 1.02 1.269 1.51 1.708 1.879 2.038 2.313 2.454 2.604 2.669 3.025 3.168 3.42 3.647 3.871 3.976 4.177 4.381 4.68 4.868 5.048 5.303 5.545 5.784 6.03 6.284 6.595 6.877 7.16 7.506 7.842 8.175 8.557 8.978 9.4 9.883 10.405 10.962 11.553 12.223 13.0 13.784 14.706 15.755 17.013 18.45 20.118 22.069 24.482 26.509 27.608 28.2 28.517 28.704 28.763 28.732 28.673 28.576 28.452 28.304 28.132 27.976 27.821 27.666 27.462 27.235 27.023 26.813 26.625 26.443 26.234 26.017 25.85 25.669 25.458 25.239 25.0 24.828 24.655 24.398 24.226 24.047 23.942 23.694 23.429 23.16 23.009 22.661 22.542 22.365 22.176 21.726 21.486 21.254 20.984 20.583 20.077 19.531 17.412 -2 ,10041 ,TETRA ,17589646,Sat Nov 27 17:28:31 CET,Sat Nov 27 19:56:06 CET,0.0 0.5 0.763 0.986 1.199 1.409 1.597 1.759 2.051 2.197 2.337 2.367 2.711 2.827 3.038 3.254 3.459 3.557 3.744 3.927 4.192 4.362 4.547 4.817 5.071 5.31 5.54 5.762 6.047 6.332 6.6 6.922 7.246 7.569 7.955 8.385 8.781 9.228 9.739 10.302 10.886 11.526 12.274 13.031 13.921 14.93 16.115 17.501 19.134 21.12 23.623 25.702 26.916 27.617 28.019 28.262 28.369 28.407 28.374 28.25 28.096 27.927 27.759 27.577 27.391 27.232 27.065 26.902 26.747 26.573 26.389 26.236 26.062 25.878 25.729 25.569 25.396 25.198 24.978 24.833 24.69 24.461 24.277 24.075 23.971 23.749 23.525 23.298 23.161 22.836 22.759 22.612 22.465 22.105 21.916 21.688 21.407 21.123 20.787 20.267 18.516 -3 ,11787 ,TETRA ,17589647,Sat Nov 27 17:29:33 CET,Sat Nov 27 19:58:44 CET,0.0 0.62 0.937 1.197 1.428 1.628 1.816 2.008 2.328 2.465 2.608 2.667 3.009 3.126 3.353 3.57 3.79 3.9 4.111 4.314 4.609 4.802 4.989 5.252 5.496 5.737 5.976 6.201 6.499 6.792 7.07 7.405 7.729 8.042 8.407 8.83 9.246 9.701 10.191 10.716 11.292 11.954 12.71 13.477 14.384 15.416 16.644 18.073 19.797 21.855 24.356 26.377 27.533 28.197 28.537 28.698 28.779 28.808 28.767 28.687 28.582 28.45 28.315 28.181 28.042 27.901 27.738 27.594 27.457 27.291 27.084 26.88 26.665 26.44 26.255 26.068 25.881 25.678 25.45 25.293 25.14 24.893 24.706 24.507 24.414 24.201 23.959 23.7 23.562 23.217 23.06 22.902 22.737 22.377 22.152 21.862 21.554 21.208 20.822 20.313 17.872 -4 ,13821 ,TETRA ,17589648,Sat Nov 27 17:29:33 CET,Sat Nov 27 19:43:24 CET,0.0 0.456 0.727 0.945 1.147 1.339 1.517 1.675 1.966 2.109 2.249 2.302 2.646 2.769 3.017 3.242 3.449 3.549 3.737 3.924 4.207 4.389 4.562 4.822 5.076 5.314 5.547 5.787 6.097 6.394 6.68 7.017 7.357 7.693 8.088 8.53 8.946 9.386 9.876 10.416 10.976 11.615 12.365 13.158 14.105 15.153 16.4 17.81 19.458 21.423 23.857 25.829 26.916 27.589 27.92 28.033 28.114 28.131 28.102 28.065 27.995 27.884 27.713 27.536 27.386 27.229 27.036 26.867 26.714 26.527 26.326 26.161 25.978 25.789 25.656 25.519 25.346 25.143 24.934 24.78 24.621 24.359 24.164 23.964 23.863 23.644 23.409 23.155 23.028 22.697 22.557 22.39 22.218 21.855 21.642 21.382 21.077 20.719 20.304 19.822 17.74 -5 ,20861 ,TETRA ,17589649,Sat Nov 27 17:29:33 CET,Sat Nov 27 19:59:04 CET,0.0 0.728 1.085 1.375 1.617 1.794 1.975 2.143 2.437 2.587 2.73 2.793 3.146 3.26 3.459 3.655 3.864 3.974 4.178 4.363 4.632 4.814 4.995 5.249 5.489 5.725 5.958 6.191 6.496 6.783 7.059 7.403 7.741 8.059 8.42 8.841 9.239 9.666 10.146 10.659 11.195 11.804 12.537 13.292 14.189 15.226 16.431 17.843 19.496 21.457 23.859 25.795 26.835 27.403 27.805 28.019 28.048 27.96 27.863 27.795 27.703 27.594 27.48 27.344 27.2 27.026 26.816 26.619 26.449 26.296 26.114 25.937 25.739 25.549 25.42 25.279 25.125 24.967 24.804 24.675 24.528 24.279 24.109 23.94 23.847 23.66 23.47 23.238 23.101 22.781 22.699 22.559 22.416 22.083 21.877 21.64 21.358 21.036 20.642 20.111 18.415 -6 ,27630 ,TETRA ,17589650,Sat Nov 27 17:30:32 CET,Sat Nov 27 19:58:01 CET,0.0 0.478 0.724 0.905 1.083 1.246 1.393 1.538 1.824 1.959 2.096 2.14 2.489 2.613 2.841 3.061 3.272 3.374 3.572 3.762 4.036 4.218 4.401 4.665 4.921 5.158 5.384 5.61 5.909 6.209 6.501 6.853 7.184 7.507 7.897 8.324 8.727 9.183 9.678 10.216 10.773 11.397 12.167 12.933 13.82 14.85 16.073 17.494 19.169 21.155 23.563 25.519 26.591 27.194 27.574 27.789 27.868 27.877 27.829 27.742 27.64 27.515 27.358 27.198 27.05 26.907 26.738 26.576 26.434 26.276 26.108 25.974 25.822 25.624 25.462 25.298 25.111 24.916 24.715 24.576 24.424 24.182 24.021 23.835 23.736 23.54 23.325 23.048 22.902 22.572 22.464 22.317 22.169 21.794 21.538 21.275 21.025 20.746 20.351 19.864 18.22 -7 ,25132 ,TETRA ,17589651,Sat Nov 27 17:31:32 CET,Sat Nov 27 19:56:17 CET,0.0 0.75 1.128 1.349 1.527 1.694 1.863 2.022 2.31 2.441 2.569 2.594 2.922 3.031 3.255 3.472 3.674 3.773 3.961 4.139 4.403 4.581 4.754 4.996 5.233 5.471 5.702 5.93 6.219 6.495 6.756 7.081 7.401 7.7 8.06 8.479 8.89 9.346 9.835 10.345 10.881 11.496 12.247 13.013 13.877 14.846 16.024 17.418 19.027 20.948 23.433 25.413 26.438 27.024 27.356 27.473 27.48 27.472 27.428 27.337 27.202 27.054 26.899 26.716 26.515 26.303 26.073 25.873 25.697 25.506 25.326 25.182 25.007 24.825 24.667 24.499 24.336 24.145 23.935 23.786 23.624 23.382 23.204 23.002 22.899 22.685 22.462 22.219 22.079 21.748 21.634 21.449 21.273 20.901 20.679 20.428 20.122 19.787 19.398 18.878 16.785 -8 ,17456 ,TETRA ,17589652,Sat Nov 27 17:31:33 CET,Sat Nov 27 19:43:33 CET,0.0 0.686 0.994 1.201 1.379 1.566 1.728 1.881 2.2 2.345 2.482 2.53 2.875 2.988 3.204 3.432 3.665 3.77 3.967 4.16 4.439 4.626 4.802 5.055 5.309 5.547 5.775 5.989 6.272 6.569 6.862 7.202 7.528 7.839 8.198 8.613 9.025 9.479 9.979 10.509 11.064 11.705 12.451 13.217 14.123 15.151 16.365 17.799 19.462 21.444 24.039 26.126 27.256 27.986 28.375 28.574 28.698 28.727 28.656 28.555 28.453 28.326 28.183 28.027 27.873 27.717 27.539 27.357 27.181 26.979 26.779 26.616 26.404 26.164 25.999 25.849 25.694 25.523 25.313 25.146 24.971 24.693 24.495 24.289 24.185 23.955 23.684 23.395 23.249 22.913 22.818 22.665 22.478 22.087 21.89 21.65 21.376 21.071 20.716 20.246 18.2 -9 ,20911 ,TETRA ,17589653,Sat Nov 27 17:31:32 CET,Sat Nov 27 19:54:39 CET,0.0 0.326 0.562 0.744 0.924 1.114 1.295 1.443 1.716 1.841 1.971 2.0 2.346 2.461 2.682 2.896 3.096 3.197 3.394 3.584 3.86 4.033 4.201 4.452 4.696 4.925 5.152 5.379 5.679 5.976 6.263 6.605 6.933 7.248 7.615 8.01 8.376 8.785 9.243 9.758 10.288 10.886 11.623 12.349 13.203 14.207 15.368 16.683 18.293 20.209 22.514 24.395 25.446 26.016 26.301 26.498 26.61 26.598 26.535 26.446 26.334 26.206 26.074 25.92 25.735 25.56 25.376 25.2 25.05 24.882 24.663 24.479 24.291 24.1 23.969 23.836 23.687 23.501 23.287 23.14 22.986 22.74 22.572 22.394 22.302 22.095 21.873 21.635 21.502 21.167 21.046 20.886 20.723 20.337 20.075 19.779 19.457 19.094 18.623 17.983 14.467 -10 ,23330 ,TETRA ,17589654,Sat Nov 27 17:31:32 CET,Sat Nov 27 19:56:19 CET,0.0 0.532 0.809 1.033 1.274 1.467 1.624 1.792 2.135 2.298 2.446 2.5 2.853 2.975 3.187 3.399 3.602 3.699 3.894 4.083 4.346 4.521 4.697 4.949 5.182 5.414 5.652 5.872 6.157 6.437 6.704 7.037 7.362 7.676 8.059 8.49 8.894 9.334 9.818 10.342 10.9 11.521 12.249 13.048 14.003 15.088 16.356 17.77 19.478 21.535 24.059 26.134 27.346 28.046 28.416 28.619 28.693 28.661 28.596 28.524 28.399 28.255 28.102 27.924 27.745 27.581 27.388 27.192 27.024 26.846 26.651 26.467 26.256 26.028 25.856 25.687 25.507 25.313 25.098 24.949 24.784 24.521 24.345 24.127 24.01 23.791 23.566 23.311 23.169 22.831 22.697 22.515 22.337 21.967 21.781 21.564 21.305 20.998 20.631 20.192 17.726 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt deleted file mode 100644 index 4b978ba8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14458 ,TETRA ,17589655,Sat Nov 27 19:04:40 CET,Sat Nov 27 21:13:20 CET,0.0 0.866 1.27 1.546 1.782 1.98 2.16 2.339 2.679 2.828 2.977 3.047 3.391 3.519 3.751 3.958 4.153 4.253 4.447 4.624 4.901 5.082 5.253 5.503 5.734 5.946 6.151 6.352 6.611 6.87 7.114 7.399 7.672 7.928 8.234 8.577 8.888 9.229 9.604 9.993 10.385 10.837 11.372 11.892 12.481 13.133 13.892 14.711 15.576 16.456 17.291 17.661 17.58 17.368 17.05 16.682 16.365 16.047 15.737 15.383 15.052 14.746 14.442 14.16 13.87 13.568 13.259 12.982 12.751 12.518 12.267 12.046 11.816 11.585 11.392 11.194 10.985 10.756 10.499 10.311 10.113 9.8 9.584 9.364 9.25 9.021 8.788 8.521 8.365 7.977 7.837 7.659 7.487 7.117 6.914 6.696 6.446 6.159 5.783 5.265 3.055 -2 ,1356 ,TETRA ,17589656,Sat Nov 27 19:04:41 CET,Sat Nov 27 21:19:17 CET,0.0 0.683 1.032 1.318 1.559 1.764 1.957 2.126 2.422 2.581 2.747 2.81 3.164 3.289 3.525 3.756 3.981 4.091 4.309 4.519 4.817 4.996 5.173 5.434 5.677 5.904 6.122 6.341 6.62 6.867 7.113 7.422 7.712 7.997 8.324 8.681 9.018 9.39 9.785 10.203 10.63 11.11 11.684 12.246 12.87 13.518 14.226 14.992 15.849 16.753 17.561 17.877 17.815 17.57 17.185 16.755 16.326 15.922 15.561 15.157 14.793 14.461 14.141 13.835 13.541 13.276 13.011 12.764 12.533 12.284 11.991 11.735 11.49 11.247 11.056 10.817 10.564 10.307 10.033 9.849 9.65 9.352 9.159 8.965 8.861 8.616 8.341 8.046 7.888 7.521 7.407 7.243 7.075 6.66 6.43 6.193 5.905 5.577 5.171 4.64 2.517 -3 ,18249 ,TETRA ,17589657,Sat Nov 27 19:04:43 CET,Sat Nov 27 21:20:26 CET,0.0 0.96 1.317 1.615 1.862 2.082 2.285 2.464 2.788 2.938 3.086 3.164 3.523 3.66 3.916 4.153 4.379 4.48 4.668 4.856 5.129 5.3 5.46 5.69 5.911 6.134 6.352 6.544 6.797 7.044 7.301 7.625 7.924 8.201 8.501 8.828 9.138 9.489 9.86 10.241 10.646 11.111 11.661 12.198 12.806 13.47 14.208 15.049 15.963 16.884 17.749 18.075 18.053 17.901 17.644 17.312 16.966 16.62 16.276 15.901 15.571 15.264 14.955 14.661 14.356 14.057 13.754 13.474 13.222 12.964 12.692 12.455 12.204 11.925 11.712 11.509 11.276 11.01 10.751 10.559 10.349 10.027 9.786 9.548 9.434 9.195 8.943 8.667 8.514 8.144 8.036 7.871 7.681 7.289 7.09 6.88 6.631 6.317 5.956 5.489 4.029 -4 ,14655 ,TETRA ,17589658,Sat Nov 27 19:04:42 CET,Sat Nov 27 21:27:33 CET,0.0 0.674 0.971 1.205 1.41 1.611 1.795 1.968 2.29 2.437 2.599 2.684 3.033 3.167 3.422 3.658 3.875 3.984 4.179 4.367 4.645 4.82 4.986 5.224 5.462 5.691 5.913 6.128 6.404 6.669 6.92 7.21 7.5 7.775 8.073 8.412 8.741 9.094 9.466 9.862 10.277 10.739 11.269 11.792 12.397 13.066 13.802 14.571 15.4 16.226 17.006 17.387 17.334 17.099 16.744 16.342 15.952 15.55 15.165 14.761 14.413 14.082 13.736 13.401 13.079 12.782 12.468 12.169 11.907 11.654 11.399 11.181 10.934 10.668 10.457 10.225 9.972 9.709 9.454 9.281 9.101 8.825 8.611 8.388 8.283 8.071 7.853 7.621 7.496 7.14 7.035 6.879 6.719 6.392 6.192 5.958 5.671 5.337 4.988 4.498 1.831 -5 ,29153 ,TETRA ,17589659,Sat Nov 27 19:05:39 CET,Sat Nov 27 21:33:12 CET,0.0 0.564 0.807 1.018 1.209 1.361 1.52 1.683 1.965 2.093 2.222 2.257 2.597 2.718 2.953 3.163 3.364 3.466 3.665 3.861 4.134 4.306 4.467 4.693 4.901 5.099 5.302 5.501 5.749 6.0 6.232 6.502 6.778 7.042 7.339 7.682 8.028 8.408 8.799 9.213 9.654 10.155 10.719 11.253 11.844 12.482 13.184 13.938 14.794 15.725 16.611 17.009 16.978 16.792 16.527 16.178 15.816 15.463 15.141 14.776 14.437 14.132 13.825 13.531 13.246 12.986 12.705 12.439 12.196 11.93 11.657 11.428 11.198 10.967 10.779 10.566 10.344 10.13 9.911 9.755 9.585 9.302 9.087 8.875 8.767 8.525 8.272 8.026 7.893 7.542 7.458 7.292 7.1 6.652 6.396 6.144 5.903 5.641 5.279 4.686 1.625 -6 ,27551 ,TETRA ,17589660,Sat Nov 27 19:05:41 CET,Sat Nov 27 21:33:18 CET,0.0 0.728 1.06 1.31 1.543 1.756 1.943 2.119 2.44 2.591 2.741 2.811 3.155 3.282 3.532 3.744 3.935 4.036 4.234 4.416 4.673 4.835 4.999 5.23 5.458 5.683 5.89 6.087 6.347 6.6 6.846 7.138 7.41 7.671 7.968 8.313 8.668 9.04 9.405 9.795 10.213 10.669 11.2 11.733 12.333 12.962 13.664 14.416 15.21 16.018 16.819 17.295 17.315 17.078 16.749 16.354 15.939 15.54 15.206 14.858 14.521 14.192 13.849 13.543 13.247 12.948 12.635 12.369 12.146 11.885 11.614 11.395 11.167 10.928 10.725 10.499 10.252 9.997 9.755 9.604 9.447 9.155 8.928 8.695 8.588 8.378 8.148 7.896 7.756 7.399 7.289 7.113 6.925 6.504 6.28 6.046 5.777 5.495 5.139 4.607 2.422 -7 ,6664 ,TETRA ,17589661,Sat Nov 27 19:05:41 CET,Sat Nov 27 21:25:39 CET,0.0 0.505 0.799 1.052 1.277 1.466 1.647 1.817 2.114 2.243 2.375 2.402 2.731 2.855 3.091 3.314 3.523 3.62 3.818 4.017 4.277 4.435 4.591 4.824 5.05 5.267 5.479 5.689 5.966 6.209 6.429 6.705 6.98 7.243 7.551 7.906 8.254 8.629 9.012 9.421 9.842 10.301 10.849 11.431 12.102 12.801 13.562 14.395 15.322 16.269 17.156 17.534 17.449 17.166 16.825 16.436 16.077 15.768 15.498 15.171 14.832 14.506 14.18 13.872 13.589 13.332 13.06 12.793 12.546 12.3 12.04 11.804 11.559 11.309 11.109 10.897 10.676 10.46 10.223 10.048 9.868 9.572 9.376 9.181 9.069 8.821 8.564 8.305 8.154 7.776 7.658 7.473 7.288 6.874 6.665 6.456 6.197 5.893 5.552 5.06 3.298 -8 ,21867 ,TETRA ,17589662,Sat Nov 27 19:05:41 CET,Sat Nov 27 21:29:35 CET,0.0 0.549 0.865 1.141 1.374 1.571 1.756 1.931 2.261 2.413 2.563 2.62 2.959 3.079 3.325 3.562 3.779 3.878 4.067 4.251 4.531 4.717 4.888 5.129 5.349 5.559 5.771 5.977 6.233 6.491 6.742 7.028 7.313 7.601 7.916 8.256 8.59 8.972 9.381 9.788 10.223 10.698 11.228 11.765 12.366 12.983 13.655 14.417 15.26 16.118 16.989 17.396 17.342 17.088 16.756 16.399 16.053 15.682 15.323 14.929 14.546 14.197 13.876 13.551 13.226 12.922 12.606 12.334 12.081 11.815 11.53 11.279 11.027 10.77 10.552 10.312 10.084 9.837 9.564 9.374 9.191 8.913 8.683 8.434 8.319 8.076 7.839 7.605 7.478 7.116 6.97 6.795 6.606 6.145 5.908 5.674 5.41 5.112 4.754 4.252 2.453 -9 ,576 ,TETRA ,17589663,Sat Nov 27 19:05:41 CET,Sat Nov 27 21:38:45 CET,0.0 0.379 0.617 0.87 1.109 1.307 1.501 1.681 1.984 2.119 2.241 2.271 2.605 2.724 2.97 3.182 3.382 3.48 3.665 3.846 4.096 4.256 4.427 4.677 4.916 5.137 5.336 5.54 5.803 6.047 6.287 6.575 6.857 7.124 7.422 7.756 8.075 8.424 8.791 9.179 9.597 10.056 10.59 11.141 11.765 12.444 13.206 14.028 14.895 15.734 16.457 16.727 16.685 16.503 16.206 15.863 15.525 15.195 14.869 14.514 14.177 13.819 13.458 13.139 12.837 12.552 12.256 11.999 11.746 11.472 11.208 10.987 10.764 10.511 10.312 10.108 9.898 9.684 9.441 9.275 9.112 8.844 8.649 8.436 8.318 8.063 7.817 7.569 7.434 7.098 7.038 6.88 6.712 6.366 6.153 5.906 5.617 5.29 4.93 4.415 2.185 -10 ,15137 ,TETRA ,17589664,Sat Nov 27 19:06:41 CET,Sat Nov 27 21:34:18 CET,0.0 0.948 1.293 1.554 1.773 1.971 2.146 2.302 2.583 2.713 2.846 2.91 3.257 3.38 3.611 3.817 4.012 4.112 4.298 4.486 4.767 4.94 5.105 5.354 5.598 5.836 6.067 6.286 6.553 6.805 7.049 7.328 7.595 7.866 8.17 8.521 8.858 9.206 9.572 9.96 10.379 10.852 11.388 11.913 12.526 13.191 13.905 14.644 15.474 16.343 17.232 17.677 17.61 17.428 17.166 16.826 16.489 16.136 15.811 15.479 15.175 14.88 14.582 14.293 14.011 13.74 13.462 13.205 12.95 12.688 12.418 12.197 11.957 11.688 11.482 11.273 11.059 10.82 10.587 10.431 10.263 9.994 9.808 9.612 9.499 9.249 9.001 8.776 8.654 8.303 8.203 8.045 7.871 7.486 7.293 7.058 6.767 6.46 6.106 5.654 4.29 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 2bc66a16..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19617 ,KEBNE ,17026575,Wed Dec 22 14:38:05 CET,Wed Dec 22 16:32:08 CET,0.0 0.702 1.078 1.362 1.567 1.721 1.852 1.984 2.244 2.363 2.468 2.464 2.787 2.888 3.073 3.251 3.414 3.488 3.626 3.774 3.992 4.134 4.278 4.486 4.686 4.874 5.056 5.236 5.454 5.657 5.862 6.103 6.341 6.572 6.835 7.146 7.448 7.763 8.099 8.449 8.805 9.185 9.611 10.043 10.532 11.065 11.648 12.232 12.811 13.369 13.805 13.872 13.705 13.477 13.167 12.789 12.435 12.099 11.789 11.452 11.134 10.824 10.508 10.188 9.881 9.6 9.311 9.048 8.813 8.571 8.308 8.074 7.835 7.613 7.455 7.289 7.093 6.874 6.659 6.497 6.323 6.072 5.887 5.705 5.618 5.416 5.183 4.96 4.854 4.51 4.41 4.249 4.086 3.729 3.519 3.286 3.046 2.728 2.344 1.842 0.088 -2 ,21105 ,KEBNE ,17026576,Wed Dec 22 14:46:21 CET,Wed Dec 22 16:39:39 CET,0.0 0.397 0.641 0.848 1.041 1.207 1.344 1.477 1.722 1.836 1.949 1.97 2.285 2.385 2.571 2.734 2.915 3.001 3.145 3.288 3.507 3.656 3.796 3.989 4.181 4.368 4.547 4.699 4.886 5.067 5.235 5.462 5.694 5.898 6.12 6.373 6.621 6.888 7.173 7.485 7.804 8.148 8.555 8.947 9.411 9.97 10.587 11.197 11.798 12.419 12.952 13.037 12.856 12.58 12.263 11.921 11.579 11.231 10.908 10.558 10.224 9.92 9.629 9.33 9.049 8.796 8.516 8.277 8.079 7.855 7.626 7.442 7.227 6.998 6.825 6.65 6.465 6.258 6.032 5.873 5.705 5.451 5.287 5.129 5.045 4.863 4.658 4.451 4.336 3.998 3.957 3.838 3.704 3.339 3.114 2.89 2.657 2.379 2.054 1.565 0.16 -3 ,1710 ,KEBNE ,17026577,Wed Dec 22 14:46:21 CET,Wed Dec 22 16:41:18 CET,0.0 0.543 0.804 1.031 1.221 1.378 1.529 1.664 1.94 2.078 2.204 2.219 2.527 2.626 2.816 3.003 3.176 3.254 3.4 3.549 3.771 3.907 4.038 4.241 4.432 4.611 4.793 4.974 5.204 5.399 5.58 5.813 6.038 6.258 6.509 6.783 7.032 7.308 7.631 7.966 8.304 8.709 9.151 9.529 9.973 10.454 10.972 11.567 12.219 12.802 13.278 13.35 13.134 12.86 12.571 12.225 11.818 11.37 10.968 10.595 10.284 9.99 9.688 9.404 9.143 8.89 8.628 8.399 8.196 7.975 7.744 7.545 7.335 7.128 6.969 6.804 6.629 6.445 6.251 6.111 5.964 5.703 5.493 5.28 5.173 4.946 4.709 4.441 4.301 3.953 3.854 3.726 3.603 3.333 3.18 2.999 2.777 2.554 2.362 2.093 0.488 -4 ,24318 ,KEBNE ,17026578,Wed Dec 22 14:47:22 CET,Wed Dec 22 16:41:28 CET,0.0 0.517 0.744 0.935 1.112 1.266 1.385 1.509 1.764 1.864 1.968 1.974 2.274 2.38 2.612 2.814 2.985 3.07 3.224 3.37 3.596 3.757 3.907 4.107 4.304 4.484 4.648 4.808 5.021 5.223 5.417 5.659 5.883 6.094 6.34 6.62 6.903 7.228 7.578 7.918 8.278 8.68 9.124 9.557 10.019 10.512 11.045 11.603 12.248 12.88 13.418 13.601 13.398 13.014 12.62 12.268 11.903 11.546 11.21 10.818 10.499 10.215 9.936 9.673 9.417 9.175 8.907 8.651 8.424 8.188 7.945 7.745 7.526 7.307 7.131 6.925 6.699 6.481 6.275 6.132 5.976 5.713 5.541 5.371 5.279 5.097 4.909 4.704 4.588 4.263 4.263 4.142 3.982 3.632 3.438 3.224 2.991 2.725 2.433 2.043 0.832 -5 ,9247 ,KEBNE ,17026579,Wed Dec 22 14:47:22 CET,Wed Dec 22 16:41:22 CET,0.0 1.066 1.392 1.612 1.795 1.975 2.144 2.303 2.579 2.703 2.822 2.844 3.164 3.272 3.473 3.656 3.851 3.947 4.124 4.278 4.497 4.641 4.783 4.975 5.165 5.355 5.53 5.693 5.907 6.131 6.351 6.604 6.843 7.064 7.327 7.638 7.915 8.206 8.532 8.89 9.269 9.71 10.232 10.712 11.217 11.791 12.45 13.14 13.826 14.449 14.946 14.949 14.649 14.254 13.864 13.456 13.045 12.625 12.215 11.789 11.424 11.105 10.767 10.408 10.065 9.757 9.405 9.098 8.862 8.586 8.27 8.02 7.772 7.509 7.298 7.074 6.829 6.581 6.321 6.137 5.955 5.659 5.444 5.219 5.105 4.883 4.656 4.419 4.3 3.969 3.881 3.692 3.502 3.153 2.932 2.681 2.466 2.244 1.917 1.453 0.1 -6 ,8054 ,KEBNE ,17026580,Wed Dec 22 14:48:24 CET,Wed Dec 22 16:42:40 CET,0.0 0.529 0.793 1.018 1.218 1.403 1.573 1.732 2.02 2.146 2.26 2.282 2.595 2.688 2.868 3.046 3.195 3.272 3.439 3.593 3.799 3.928 4.054 4.241 4.455 4.668 4.875 5.079 5.316 5.551 5.779 6.029 6.281 6.527 6.792 7.085 7.372 7.693 8.038 8.404 8.793 9.248 9.772 10.235 10.727 11.239 11.767 12.329 12.923 13.496 13.996 14.099 13.836 13.476 13.083 12.665 12.26 11.879 11.517 11.104 10.728 10.422 10.121 9.797 9.496 9.242 8.979 8.752 8.545 8.322 8.094 7.896 7.693 7.476 7.305 7.135 6.963 6.776 6.58 6.431 6.276 6.042 5.873 5.686 5.592 5.397 5.18 4.945 4.823 4.498 4.446 4.298 4.146 3.773 3.583 3.399 3.166 2.911 2.64 2.317 1.452 -7 ,18435 ,KEBNE ,17026581,Wed Dec 22 14:48:24 CET,Wed Dec 22 16:42:08 CET,0.0 0.715 1.104 1.387 1.595 1.787 1.966 2.128 2.422 2.56 2.685 2.7 3.025 3.144 3.364 3.576 3.762 3.842 4.024 4.201 4.434 4.576 4.72 4.94 5.151 5.356 5.549 5.743 6.019 6.273 6.497 6.743 6.965 7.178 7.443 7.731 8.016 8.368 8.727 9.098 9.496 9.929 10.395 10.847 11.406 12.042 12.696 13.323 13.924 14.509 14.948 15.012 14.868 14.567 14.174 13.775 13.451 13.158 12.857 12.521 12.231 11.965 11.687 11.403 11.129 10.876 10.592 10.323 10.085 9.822 9.531 9.288 9.032 8.755 8.545 8.33 8.099 7.867 7.625 7.457 7.266 6.959 6.771 6.574 6.471 6.258 6.019 5.738 5.588 5.225 5.102 4.936 4.768 4.429 4.222 3.977 3.671 3.305 2.91 2.385 0.414 -8 ,15507 ,KEBNE ,17026582,Wed Dec 22 14:48:24 CET,Wed Dec 22 16:42:39 CET,0.0 0.774 1.078 1.326 1.544 1.736 1.909 2.069 2.378 2.546 2.699 2.737 3.07 3.191 3.405 3.593 3.783 3.881 4.065 4.226 4.458 4.62 4.781 5.008 5.226 5.435 5.629 5.811 6.046 6.281 6.513 6.789 7.059 7.306 7.59 7.903 8.189 8.492 8.813 9.16 9.52 9.937 10.438 10.914 11.443 12.004 12.627 13.26 13.905 14.573 15.193 15.337 15.049 14.647 14.255 13.841 13.429 13.051 12.709 12.361 12.048 11.743 11.41 11.074 10.776 10.509 10.223 9.948 9.701 9.441 9.17 8.949 8.7 8.443 8.258 8.062 7.848 7.637 7.41 7.23 7.042 6.752 6.553 6.349 6.241 6.017 5.782 5.524 5.395 5.055 4.956 4.788 4.611 4.221 4.015 3.78 3.486 3.169 2.841 2.39 0.7 -9 ,14051 ,KEBNE ,17026583,Wed Dec 22 14:49:25 CET,Wed Dec 22 16:43:03 CET,0.0 0.464 0.698 0.895 1.063 1.196 1.337 1.476 1.711 1.809 1.9 1.892 2.202 2.303 2.49 2.681 2.873 2.973 3.17 3.34 3.565 3.706 3.841 4.04 4.228 4.421 4.621 4.804 5.042 5.268 5.497 5.782 6.032 6.26 6.538 6.856 7.148 7.463 7.805 8.158 8.513 8.932 9.409 9.861 10.379 10.956 11.559 12.11 12.648 13.215 13.672 13.643 13.364 12.987 12.596 12.212 11.829 11.428 11.025 10.57 10.185 9.85 9.532 9.211 8.899 8.605 8.289 8.012 7.753 7.49 7.196 6.938 6.682 6.431 6.235 6.028 5.832 5.621 5.386 5.227 5.069 4.805 4.614 4.425 4.334 4.135 3.917 3.699 3.582 3.241 3.153 3.005 2.842 2.455 2.243 2.03 1.811 1.522 1.202 0.78 -0.878 -10 ,29885 ,KEBNE ,17026584,Wed Dec 22 14:49:26 CET,Wed Dec 22 16:43:58 CET,0.0 0.372 0.661 0.911 1.1 1.278 1.438 1.577 1.835 1.958 2.077 2.095 2.41 2.511 2.719 2.917 3.097 3.183 3.352 3.515 3.745 3.897 4.045 4.261 4.471 4.671 4.863 5.046 5.282 5.493 5.679 5.911 6.137 6.368 6.636 6.938 7.229 7.531 7.858 8.201 8.545 8.927 9.38 9.826 10.326 10.836 11.374 11.951 12.536 13.078 13.553 13.664 13.505 13.227 12.85 12.449 12.064 11.691 11.363 11.01 10.713 10.47 10.226 9.972 9.717 9.47 9.209 8.976 8.764 8.556 8.346 8.17 7.992 7.793 7.633 7.476 7.315 7.142 6.946 6.801 6.665 6.438 6.259 6.061 5.955 5.731 5.492 5.259 5.134 4.792 4.725 4.566 4.405 4.074 3.886 3.66 3.396 3.126 2.866 2.604 1.418 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 835611d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21879 ,TETRA ,17589665,Sat Nov 27 19:06:41 CET,Sat Nov 27 21:20:06 CET,0.0 0.334 0.554 0.74 0.914 1.072 1.225 1.38 1.633 1.755 1.883 1.919 2.243 2.349 2.557 2.758 2.957 3.045 3.211 3.391 3.649 3.806 3.96 4.197 4.45 4.703 4.939 5.155 5.433 5.71 5.98 6.31 6.624 6.934 7.295 7.677 8.038 8.465 8.93 9.407 9.914 10.463 11.073 11.698 12.445 13.307 14.288 15.326 16.515 17.863 19.364 20.527 21.116 21.346 21.395 21.346 21.234 21.123 21.013 20.855 20.682 20.531 20.382 20.213 20.051 19.911 19.749 19.594 19.459 19.3 19.122 18.976 18.823 18.671 18.554 18.431 18.298 18.152 18.008 17.912 17.808 17.649 17.543 17.435 17.375 17.24 17.087 16.946 16.877 16.606 16.621 16.53 16.436 16.226 16.112 15.992 15.853 15.676 15.464 15.213 14.854 -2 ,32444 ,TETRA ,17589666,Sat Nov 27 19:06:41 CET,Sat Nov 27 21:25:20 CET,0.0 0.795 1.152 1.421 1.615 1.796 1.986 2.153 2.438 2.572 2.706 2.759 3.099 3.227 3.464 3.686 3.894 4.004 4.216 4.411 4.72 4.92 5.088 5.33 5.588 5.843 6.088 6.325 6.624 6.899 7.165 7.504 7.822 8.128 8.482 8.868 9.246 9.668 10.122 10.586 11.049 11.57 12.218 12.889 13.666 14.48 15.391 16.416 17.526 18.775 20.278 21.352 21.87 22.093 22.126 22.083 21.994 21.86 21.72 21.563 21.413 21.273 21.112 20.936 20.775 20.633 20.467 20.298 20.141 19.986 19.835 19.694 19.535 19.366 19.228 19.09 18.942 18.777 18.618 18.515 18.413 18.248 18.121 17.978 17.903 17.771 17.626 17.455 17.372 17.091 17.085 16.969 16.846 16.585 16.455 16.318 16.175 16.003 15.779 15.513 14.755 -3 ,11222 ,TETRA ,17589667,Sat Nov 27 19:07:40 CET,Sat Nov 27 21:25:59 CET,0.0 0.471 0.761 1.003 1.211 1.402 1.582 1.743 2.035 2.174 2.312 2.346 2.677 2.793 3.01 3.218 3.423 3.522 3.695 3.861 4.124 4.303 4.477 4.718 4.945 5.17 5.392 5.596 5.847 6.101 6.356 6.652 6.955 7.261 7.604 7.974 8.33 8.753 9.214 9.682 10.156 10.71 11.37 12.012 12.766 13.589 14.556 15.684 16.898 18.217 19.682 20.772 21.272 21.462 21.474 21.428 21.342 21.21 21.052 20.871 20.688 20.491 20.301 20.117 19.934 19.765 19.585 19.415 19.263 19.098 18.927 18.794 18.657 18.514 18.39 18.264 18.136 18.003 17.859 17.76 17.655 17.469 17.345 17.228 17.161 17.009 16.858 16.687 16.59 16.306 16.336 16.241 16.13 15.913 15.791 15.636 15.481 15.322 15.135 14.886 14.478 -4 ,19335 ,TETRA ,17589668,Sat Nov 27 19:07:40 CET,Sat Nov 27 21:26:32 CET,0.0 0.516 0.772 1.028 1.304 1.536 1.711 1.866 2.172 2.326 2.463 2.513 2.85 2.965 3.19 3.416 3.637 3.747 3.96 4.16 4.461 4.655 4.824 5.047 5.274 5.5 5.709 5.92 6.197 6.455 6.711 7.038 7.351 7.645 7.987 8.355 8.696 9.069 9.481 9.954 10.451 10.974 11.569 12.166 12.887 13.693 14.63 15.726 17.003 18.448 20.033 21.131 21.6 21.811 21.892 21.855 21.735 21.576 21.396 21.191 20.994 20.826 20.687 20.54 20.381 20.226 20.057 19.891 19.754 19.617 19.461 19.341 19.213 19.061 18.944 18.817 18.682 18.549 18.419 18.326 18.23 18.078 17.954 17.824 17.758 17.619 17.48 17.325 17.233 16.957 16.971 16.881 16.799 16.589 16.453 16.336 16.206 16.037 15.863 15.64 15.289 -5 ,21955 ,TETRA ,17589669,Sat Nov 27 19:07:40 CET,Sat Nov 27 21:27:17 CET,0.0 0.584 0.893 1.12 1.315 1.471 1.625 1.793 2.088 2.222 2.354 2.385 2.706 2.815 3.016 3.226 3.442 3.538 3.717 3.907 4.186 4.354 4.509 4.744 4.973 5.2 5.435 5.661 5.948 6.229 6.487 6.792 7.056 7.319 7.652 8.017 8.381 8.789 9.226 9.697 10.186 10.721 11.347 11.936 12.625 13.425 14.333 15.371 16.558 17.864 19.412 20.596 21.238 21.593 21.72 21.749 21.732 21.666 21.59 21.484 21.352 21.232 21.105 20.955 20.802 20.663 20.517 20.376 20.254 20.123 19.979 19.856 19.72 19.569 19.45 19.339 19.228 19.084 18.93 18.829 18.719 18.538 18.411 18.285 18.227 18.108 17.972 17.824 17.747 17.472 17.501 17.418 17.326 17.114 16.993 16.867 16.743 16.597 16.436 16.214 15.641 -6 ,31571 ,TETRA ,17589670,Sat Nov 27 19:07:40 CET,Sat Nov 27 21:30:29 CET,0.0 0.615 0.954 1.192 1.406 1.6 1.772 1.945 2.269 2.415 2.551 2.599 2.927 3.042 3.262 3.473 3.677 3.78 3.965 4.132 4.379 4.546 4.712 4.948 5.169 5.387 5.593 5.786 6.053 6.325 6.576 6.856 7.134 7.402 7.723 8.111 8.494 8.908 9.345 9.829 10.338 10.914 11.63 12.355 13.168 14.063 15.064 16.119 17.3 18.611 20.027 21.18 21.746 21.975 22.089 22.087 21.982 21.83 21.679 21.483 21.306 21.151 20.972 20.792 20.624 20.472 20.305 20.133 19.98 19.819 19.647 19.5 19.355 19.219 19.122 19.017 18.901 18.776 18.637 18.541 18.436 18.255 18.133 18.011 17.946 17.812 17.661 17.515 17.445 17.16 17.136 17.025 16.914 16.651 16.511 16.352 16.174 15.973 15.746 15.491 15.038 -7 ,27377 ,TETRA ,17589671,Sat Nov 27 19:07:40 CET,Sat Nov 27 21:26:29 CET,0.0 0.549 0.772 0.969 1.179 1.383 1.562 1.756 2.085 2.223 2.354 2.395 2.721 2.835 3.055 3.277 3.494 3.591 3.782 3.971 4.229 4.383 4.539 4.772 4.999 5.206 5.396 5.597 5.857 6.101 6.362 6.671 6.954 7.23 7.554 7.931 8.298 8.719 9.155 9.577 10.06 10.639 11.252 11.862 12.621 13.486 14.467 15.49 16.627 17.926 19.425 20.505 21.0 21.173 21.176 21.116 21.022 20.916 20.793 20.648 20.523 20.401 20.25 20.087 19.952 19.835 19.686 19.535 19.401 19.255 19.112 18.999 18.866 18.72 18.61 18.5 18.372 18.226 18.082 17.978 17.869 17.701 17.585 17.451 17.386 17.273 17.14 16.984 16.908 16.648 16.685 16.588 16.484 16.285 16.176 16.03 15.866 15.697 15.519 15.307 14.65 -8 ,6936 ,TETRA ,17589672,Sat Nov 27 19:07:40 CET,Sat Nov 27 21:13:12 CET,0.0 0.546 0.856 1.095 1.302 1.51 1.701 1.879 2.177 2.319 2.459 2.501 2.828 2.946 3.171 3.368 3.549 3.64 3.828 4.014 4.275 4.444 4.613 4.86 5.096 5.32 5.539 5.754 6.026 6.284 6.541 6.853 7.151 7.44 7.75 8.098 8.454 8.846 9.271 9.71 10.142 10.628 11.249 11.893 12.637 13.463 14.357 15.391 16.602 17.963 19.479 20.54 21.067 21.321 21.398 21.365 21.264 21.156 21.033 20.892 20.781 20.663 20.517 20.365 20.22 20.089 19.962 19.835 19.709 19.563 19.41 19.289 19.149 18.997 18.885 18.762 18.63 18.492 18.346 18.241 18.133 17.975 17.856 17.724 17.657 17.52 17.377 17.22 17.142 16.873 16.913 16.823 16.732 16.501 16.356 16.212 16.078 15.924 15.732 15.501 14.952 -9 ,5335 ,TETRA ,17589673,Sat Nov 27 19:07:41 CET,Sat Nov 27 21:26:44 CET,0.0 1.148 1.544 1.785 1.989 2.212 2.442 2.64 2.949 3.091 3.232 3.296 3.641 3.767 3.99 4.204 4.422 4.528 4.726 4.926 5.218 5.397 5.556 5.786 6.013 6.231 6.444 6.656 6.938 7.218 7.476 7.781 8.095 8.39 8.722 9.121 9.507 9.927 10.381 10.847 11.346 11.922 12.598 13.304 14.082 14.924 15.909 16.959 18.195 19.652 21.248 22.31 22.741 22.896 22.937 22.895 22.784 22.649 22.514 22.351 22.158 21.955 21.766 21.579 21.38 21.195 21.015 20.855 20.717 20.565 20.389 20.234 20.068 19.887 19.739 19.585 19.429 19.277 19.105 18.972 18.845 18.664 18.538 18.408 18.344 18.208 18.055 17.89 17.804 17.524 17.524 17.413 17.305 17.08 16.943 16.798 16.63 16.445 16.25 15.988 15.408 -10 ,26061 ,TETRA ,17589674,Sat Nov 27 19:07:42 CET,Sat Nov 27 21:23:56 CET,0.0 0.718 1.043 1.317 1.551 1.745 1.925 2.085 2.381 2.527 2.66 2.699 3.045 3.181 3.428 3.66 3.879 3.982 4.18 4.376 4.664 4.851 5.037 5.304 5.548 5.776 5.996 6.208 6.482 6.749 7.01 7.323 7.624 7.93 8.302 8.703 9.076 9.482 9.925 10.4 10.924 11.562 12.267 12.891 13.623 14.476 15.427 16.563 17.891 19.245 20.733 21.794 22.265 22.505 22.602 22.542 22.445 22.348 22.2 22.032 21.865 21.706 21.544 21.371 21.206 21.033 20.851 20.693 20.549 20.403 20.247 20.11 19.976 19.835 19.72 19.604 19.483 19.353 19.202 19.093 18.979 18.805 18.686 18.559 18.489 18.343 18.189 18.033 17.954 17.67 17.678 17.574 17.467 17.258 17.125 16.984 16.826 16.646 16.435 16.162 15.572 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt deleted file mode 100644 index b8c5348f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19015 ,TETRA ,17589675,Sat Nov 27 19:07:42 CET,Sat Nov 27 21:21:08 CET,0.0 0.552 0.785 0.989 1.182 1.327 1.466 1.593 1.799 1.904 2.012 1.984 2.262 2.343 2.508 2.656 2.783 2.842 2.955 3.068 3.24 3.352 3.459 3.593 3.705 3.826 3.946 4.054 4.19 4.313 4.423 4.556 4.692 4.82 4.978 5.155 5.31 5.481 5.658 5.837 6.004 6.155 6.313 6.468 6.662 6.916 7.165 7.257 7.122 6.669 5.678 4.287 2.972 1.848 0.876 -0.087 -0.923 -1.636 -2.23 -2.818 -3.345 -3.796 -4.208 -4.606 -4.972 -5.304 -5.656 -5.971 -6.251 -6.536 -6.819 -7.053 -7.295 -7.556 -7.768 -7.986 -8.216 -8.447 -8.668 -8.822 -8.981 -9.221 -9.39 -9.557 -9.659 -9.907 -10.142 -10.376 -10.501 -10.852 -10.868 -10.984 -11.11 -11.395 -11.549 -11.707 -11.876 -12.059 -12.268 -12.523 -12.872 -2 ,20073 ,TETRA ,17589676,Sat Nov 27 19:07:42 CET,Sat Nov 27 21:25:59 CET,0.0 0.957 1.209 1.413 1.58 1.714 1.819 1.93 2.141 2.236 2.333 2.301 2.596 2.672 2.807 2.936 3.065 3.13 3.253 3.359 3.523 3.632 3.722 3.865 4.016 4.156 4.288 4.417 4.569 4.71 4.86 5.048 5.224 5.378 5.529 5.702 5.89 6.094 6.283 6.464 6.666 6.866 7.079 7.291 7.493 7.664 7.759 7.75 7.636 7.286 6.358 4.891 3.546 2.394 1.409 0.468 -0.395 -1.171 -1.829 -2.477 -3.028 -3.517 -3.993 -4.442 -4.85 -5.211 -5.568 -5.894 -6.185 -6.499 -6.84 -7.113 -7.384 -7.652 -7.859 -8.081 -8.307 -8.542 -8.787 -8.947 -9.108 -9.379 -9.58 -9.787 -9.886 -10.086 -10.306 -10.544 -10.676 -11.035 -11.097 -11.256 -11.42 -11.741 -11.926 -12.135 -12.36 -12.638 -12.948 -13.358 -14.452 -3 ,5292 ,TETRA ,17589677,Sat Nov 27 19:08:46 CET,Sat Nov 27 21:27:01 CET,0.0 1.006 1.333 1.514 1.66 1.792 1.926 2.054 2.284 2.381 2.479 2.448 2.738 2.829 3.009 3.161 3.301 3.37 3.491 3.606 3.793 3.909 4.018 4.176 4.328 4.48 4.621 4.746 4.904 5.071 5.231 5.41 5.595 5.769 5.945 6.142 6.325 6.496 6.661 6.827 7.0 7.188 7.401 7.584 7.746 7.91 8.069 8.115 7.964 7.527 6.622 5.333 4.093 2.966 2.005 1.142 0.36 -0.375 -1.006 -1.592 -2.074 -2.501 -2.92 -3.325 -3.69 -4.01 -4.354 -4.661 -4.918 -5.193 -5.501 -5.749 -5.999 -6.265 -6.457 -6.654 -6.86 -7.076 -7.304 -7.447 -7.586 -7.809 -7.966 -8.135 -8.224 -8.41 -8.602 -8.808 -8.918 -9.245 -9.255 -9.376 -9.491 -9.737 -9.879 -10.021 -10.169 -10.318 -10.487 -10.727 -11.243 -4 ,17442 ,TETRA ,17589678,Sat Nov 27 19:08:43 CET,Sat Nov 27 21:18:20 CET,0.0 0.411 0.674 0.895 1.066 1.203 1.332 1.45 1.67 1.766 1.855 1.815 2.092 2.16 2.297 2.434 2.568 2.635 2.752 2.861 3.024 3.125 3.22 3.354 3.474 3.614 3.763 3.892 4.058 4.207 4.331 4.486 4.629 4.755 4.911 5.084 5.248 5.432 5.636 5.857 6.085 6.302 6.504 6.698 6.931 7.113 7.211 7.193 6.957 6.443 5.38 3.822 2.455 1.301 0.312 -0.63 -1.474 -2.199 -2.836 -3.467 -3.964 -4.402 -4.843 -5.253 -5.638 -6.005 -6.37 -6.675 -6.943 -7.231 -7.522 -7.748 -7.985 -8.253 -8.466 -8.676 -8.889 -9.104 -9.344 -9.517 -9.687 -9.948 -10.119 -10.286 -10.367 -10.538 -10.737 -10.962 -11.075 -11.416 -11.422 -11.531 -11.655 -11.934 -12.073 -12.2 -12.341 -12.526 -12.777 -13.104 -13.49 -5 ,7495 ,TETRA ,17589679,Sat Nov 27 19:08:41 CET,Sat Nov 27 21:23:47 CET,0.0 0.586 0.847 1.089 1.298 1.467 1.611 1.734 1.971 2.08 2.173 2.148 2.451 2.529 2.685 2.861 3.033 3.111 3.264 3.415 3.613 3.724 3.842 4.027 4.209 4.37 4.514 4.658 4.843 5.019 5.181 5.371 5.556 5.725 5.895 6.068 6.238 6.424 6.601 6.773 6.949 7.146 7.349 7.506 7.66 7.809 7.928 7.933 7.707 7.249 6.245 4.722 3.334 2.091 1.061 0.188 -0.601 -1.31 -1.931 -2.57 -3.109 -3.596 -4.045 -4.448 -4.825 -5.176 -5.557 -5.896 -6.169 -6.453 -6.763 -7.011 -7.256 -7.518 -7.717 -7.932 -8.17 -8.404 -8.638 -8.804 -8.969 -9.212 -9.385 -9.565 -9.657 -9.85 -10.046 -10.247 -10.356 -10.698 -10.703 -10.814 -10.931 -11.189 -11.332 -11.486 -11.653 -11.852 -12.065 -12.299 -12.906 -6 ,28444 ,TETRA ,17589680,Sat Nov 27 19:08:42 CET,Sat Nov 27 21:20:41 CET,0.0 0.633 0.937 1.146 1.317 1.485 1.617 1.745 1.985 2.111 2.231 2.204 2.491 2.563 2.711 2.859 2.996 3.072 3.226 3.355 3.541 3.671 3.796 3.958 4.107 4.267 4.425 4.564 4.73 4.879 5.017 5.193 5.36 5.511 5.675 5.863 6.051 6.26 6.448 6.619 6.796 6.973 7.179 7.397 7.625 7.837 7.993 8.044 7.996 7.753 6.95 5.663 4.521 3.478 2.536 1.711 0.988 0.289 -0.34 -0.934 -1.447 -1.905 -2.342 -2.772 -3.164 -3.51 -3.868 -4.187 -4.467 -4.76 -5.059 -5.307 -5.569 -5.838 -6.043 -6.272 -6.505 -6.72 -6.934 -7.085 -7.243 -7.499 -7.675 -7.849 -7.942 -8.127 -8.314 -8.523 -8.632 -8.967 -8.98 -9.102 -9.234 -9.516 -9.675 -9.844 -10.016 -10.223 -10.456 -10.746 -11.438 -7 ,29652 ,TETRA ,17589681,Sat Nov 27 19:08:42 CET,Sat Nov 27 21:26:15 CET,0.0 0.835 1.127 1.319 1.5 1.68 1.826 1.964 2.235 2.352 2.454 2.445 2.761 2.845 2.994 3.158 3.317 3.392 3.536 3.668 3.839 3.945 4.056 4.231 4.386 4.527 4.673 4.81 4.976 5.143 5.305 5.478 5.624 5.752 5.921 6.133 6.325 6.51 6.689 6.889 7.096 7.315 7.556 7.743 7.917 8.069 8.183 8.246 8.177 7.843 7.025 5.759 4.507 3.385 2.413 1.543 0.783 0.105 -0.481 -1.058 -1.535 -1.975 -2.413 -2.834 -3.226 -3.554 -3.892 -4.2 -4.454 -4.726 -5.011 -5.237 -5.482 -5.748 -5.947 -6.15 -6.361 -6.601 -6.847 -7.008 -7.174 -7.425 -7.595 -7.775 -7.864 -8.034 -8.238 -8.475 -8.594 -8.916 -8.91 -9.031 -9.162 -9.433 -9.574 -9.722 -9.901 -10.102 -10.335 -10.608 -11.27 -8 ,26264 ,TETRA ,17589682,Sat Nov 27 19:08:41 CET,Sat Nov 27 21:26:10 CET,0.0 0.411 0.623 0.77 0.908 1.05 1.174 1.294 1.534 1.648 1.76 1.771 2.089 2.189 2.382 2.552 2.707 2.792 2.957 3.09 3.262 3.381 3.504 3.689 3.862 4.023 4.177 4.306 4.462 4.639 4.816 5.007 5.186 5.357 5.529 5.7 5.865 6.042 6.215 6.399 6.592 6.787 6.988 7.169 7.326 7.444 7.537 7.551 7.36 6.876 5.895 4.533 3.38 2.368 1.484 0.689 -0.027 -0.719 -1.317 -1.893 -2.412 -2.878 -3.324 -3.758 -4.16 -4.527 -4.916 -5.258 -5.552 -5.853 -6.175 -6.454 -6.728 -7.008 -7.234 -7.464 -7.685 -7.895 -8.119 -8.285 -8.463 -8.735 -8.919 -9.105 -9.197 -9.401 -9.617 -9.821 -9.931 -10.261 -10.271 -10.386 -10.516 -10.797 -10.945 -11.108 -11.29 -11.505 -11.787 -12.112 -12.739 -9 ,16586 ,TETRA ,17589683,Sat Nov 27 19:08:43 CET,Sat Nov 27 21:26:07 CET,0.0 0.597 0.883 1.095 1.268 1.419 1.55 1.653 1.84 1.95 2.061 2.053 2.358 2.439 2.57 2.694 2.815 2.875 2.995 3.117 3.265 3.356 3.453 3.582 3.699 3.807 3.909 4.005 4.137 4.27 4.4 4.564 4.73 4.89 5.059 5.229 5.39 5.561 5.759 5.974 6.173 6.367 6.558 6.718 6.835 6.936 7.003 6.993 6.872 6.478 5.516 4.218 3.096 2.02 0.979 0.014 -0.815 -1.545 -2.168 -2.799 -3.363 -3.85 -4.279 -4.675 -5.044 -5.375 -5.723 -6.037 -6.308 -6.604 -6.899 -7.121 -7.37 -7.627 -7.821 -8.024 -8.227 -8.449 -8.68 -8.832 -8.991 -9.228 -9.393 -9.566 -9.65 -9.846 -10.072 -10.295 -10.403 -10.738 -10.747 -10.868 -10.983 -11.256 -11.416 -11.571 -11.738 -11.923 -12.116 -12.357 -12.974 -10 ,5167 ,TETRA ,17589684,Sat Nov 27 19:08:43 CET,Sat Nov 27 21:27:26 CET,0.0 0.475 0.667 0.838 0.966 1.088 1.202 1.308 1.519 1.621 1.722 1.698 1.973 2.045 2.204 2.352 2.474 2.531 2.642 2.76 2.946 3.047 3.147 3.289 3.425 3.565 3.695 3.822 3.982 4.125 4.269 4.456 4.631 4.788 4.961 5.173 5.382 5.59 5.8 6.016 6.235 6.443 6.641 6.805 6.959 7.157 7.354 7.458 7.459 7.133 6.143 4.591 3.29 2.19 1.155 0.186 -0.664 -1.391 -2.015 -2.679 -3.248 -3.756 -4.219 -4.662 -5.103 -5.485 -5.878 -6.235 -6.537 -6.844 -7.151 -7.384 -7.625 -7.875 -8.068 -8.283 -8.503 -8.735 -8.976 -9.13 -9.284 -9.534 -9.698 -9.85 -9.932 -10.112 -10.297 -10.5 -10.617 -10.95 -10.963 -11.082 -11.21 -11.543 -11.737 -11.915 -12.111 -12.324 -12.571 -12.831 -13.322 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt deleted file mode 100644 index 9b432a29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29257 ,TETRA ,17589685,Sat Nov 27 19:08:42 CET,Sat Nov 27 21:23:28 CET,0.0 0.795 1.185 1.489 1.745 2.002 2.235 2.436 2.841 3.042 3.252 3.435 3.82 3.994 4.342 4.688 5.028 5.188 5.509 5.828 6.278 6.58 6.878 7.307 7.732 8.153 8.572 8.982 9.511 10.033 10.547 11.17 11.776 12.377 13.088 13.928 14.758 15.645 16.606 17.671 18.819 20.169 21.82 23.517 25.564 27.975 30.904 34.359 38.621 44.019 51.21 57.88 62.244 65.314 67.621 69.397 70.762 71.868 72.71 73.444 73.989 74.42 74.786 75.096 75.361 75.588 75.813 75.965 76.063 76.153 76.229 76.286 76.339 76.354 76.353 76.369 76.386 76.396 76.386 76.384 76.386 76.361 76.335 76.316 76.312 76.314 76.312 76.267 76.238 76.091 76.156 76.117 76.073 75.982 75.932 75.859 75.758 75.627 75.468 75.256 74.657 -2 ,16668 ,TETRA ,17589686,Sat Nov 27 19:08:43 CET,Sat Nov 27 21:29:49 CET,0.0 1.054 1.417 1.696 1.954 2.207 2.44 2.669 3.109 3.319 3.519 3.686 4.077 4.266 4.642 4.988 5.316 5.477 5.794 6.105 6.565 6.864 7.166 7.6 8.022 8.454 8.875 9.286 9.841 10.382 10.906 11.569 12.206 12.835 13.586 14.435 15.273 16.214 17.249 18.396 19.614 21.014 22.726 24.496 26.643 29.122 32.047 35.567 39.953 45.44 52.726 59.497 63.892 66.975 69.209 70.911 72.249 73.303 74.115 74.844 75.402 75.863 76.259 76.58 76.837 77.079 77.316 77.494 77.635 77.77 77.9 77.994 78.063 78.122 78.158 78.191 78.228 78.253 78.257 78.25 78.26 78.279 78.281 78.268 78.258 78.241 78.21 78.168 78.137 77.965 77.998 77.956 77.927 77.856 77.808 77.719 77.621 77.527 77.367 77.171 76.789 -3 ,31509 ,TETRA ,17589687,Sat Nov 27 19:08:44 CET,Sat Nov 27 21:30:51 CET,0.0 0.712 0.99 1.269 1.53 1.76 1.971 2.172 2.554 2.74 2.921 3.067 3.45 3.621 3.953 4.284 4.592 4.748 5.058 5.356 5.804 6.1 6.395 6.816 7.221 7.623 8.021 8.413 8.922 9.425 9.924 10.523 11.112 11.691 12.381 13.195 13.999 14.906 15.895 16.958 18.129 19.506 21.163 22.887 24.942 27.324 30.197 33.614 37.86 43.176 50.238 56.943 61.388 64.448 66.717 68.517 69.898 71.013 71.809 72.463 73.016 73.5 73.921 74.285 74.602 74.864 75.072 75.219 75.343 75.454 75.563 75.64 75.71 75.785 75.817 75.832 75.852 75.876 75.878 75.87 75.864 75.853 75.835 75.81 75.79 75.737 75.693 75.631 75.598 75.426 75.46 75.409 75.349 75.199 75.104 75.0 74.869 74.716 74.541 74.305 73.699 -4 ,2942 ,TETRA ,17589688,Sat Nov 27 19:08:47 CET,Sat Nov 27 21:28:08 CET,0.0 1.453 1.923 2.276 2.554 2.793 3.021 3.234 3.628 3.834 4.036 4.201 4.585 4.766 5.11 5.439 5.77 5.936 6.252 6.573 7.042 7.33 7.615 8.043 8.456 8.859 9.261 9.656 10.179 10.706 11.227 11.853 12.454 13.055 13.784 14.61 15.4 16.286 17.261 18.31 19.468 20.815 22.416 24.066 26.084 28.462 31.312 34.709 39.019 44.406 51.41 57.951 62.374 65.518 67.741 69.468 70.87 72.019 72.897 73.704 74.305 74.77 75.181 75.532 75.83 76.071 76.31 76.508 76.661 76.798 76.917 77.009 77.088 77.156 77.205 77.242 77.27 77.295 77.301 77.301 77.3 77.274 77.256 77.241 77.224 77.18 77.136 77.09 77.058 76.876 76.911 76.853 76.792 76.654 76.586 76.523 76.419 76.289 76.151 75.942 75.519 -5 ,5795 ,TETRA ,17589689,Sat Nov 27 19:08:43 CET,Sat Nov 27 21:17:40 CET,0.0 0.676 1.044 1.324 1.577 1.849 2.113 2.347 2.8 3.017 3.223 3.401 3.792 3.962 4.298 4.615 4.926 5.084 5.404 5.715 6.15 6.435 6.722 7.142 7.545 7.937 8.323 8.702 9.221 9.727 10.213 10.822 11.423 12.017 12.712 13.5 14.304 15.2 16.175 17.225 18.339 19.665 21.322 23.066 25.119 27.512 30.47 33.963 38.289 43.732 50.945 57.716 62.222 65.377 67.627 69.379 70.747 71.847 72.676 73.413 73.997 74.441 74.793 75.11 75.376 75.605 75.836 76.018 76.16 76.289 76.407 76.494 76.571 76.633 76.67 76.702 76.736 76.758 76.762 76.765 76.755 76.735 76.724 76.71 76.705 76.678 76.623 76.542 76.491 76.305 76.339 76.287 76.236 76.073 75.957 75.838 75.732 75.616 75.458 75.259 74.492 -6 ,30472 ,TETRA ,17589690,Sat Nov 27 19:08:43 CET,Sat Nov 27 21:25:16 CET,0.0 0.881 1.283 1.61 1.927 2.209 2.468 2.708 3.137 3.348 3.56 3.754 4.158 4.339 4.707 5.065 5.398 5.559 5.865 6.156 6.587 6.869 7.141 7.555 7.968 8.372 8.776 9.177 9.705 10.211 10.698 11.307 11.909 12.491 13.185 13.98 14.756 15.63 16.592 17.651 18.821 20.173 21.767 23.438 25.481 27.841 30.661 34.02 38.261 43.723 51.085 57.892 62.375 65.585 67.949 69.796 71.197 72.302 73.161 73.92 74.534 75.061 75.499 75.865 76.175 76.42 76.653 76.861 77.032 77.196 77.357 77.472 77.569 77.653 77.7 77.728 77.75 77.779 77.795 77.794 77.791 77.791 77.782 77.764 77.753 77.713 77.653 77.592 77.563 77.398 77.457 77.406 77.352 77.218 77.125 77.0 76.879 76.769 76.581 76.327 75.747 -7 ,20664 ,TETRA ,17589691,Sat Nov 27 19:09:40 CET,Sat Nov 27 21:18:52 CET,0.0 0.578 0.921 1.193 1.419 1.645 1.858 2.063 2.446 2.622 2.794 2.925 3.295 3.476 3.806 4.108 4.407 4.557 4.857 5.156 5.599 5.894 6.188 6.609 7.029 7.434 7.816 8.204 8.733 9.243 9.732 10.343 10.955 11.557 12.253 13.04 13.823 14.734 15.739 16.814 17.979 19.336 20.972 22.669 24.731 27.133 30.009 33.425 37.696 43.074 50.251 56.945 61.353 64.486 66.796 68.538 69.825 70.839 71.609 72.325 72.887 73.32 73.679 73.988 74.258 74.492 74.728 74.914 75.053 75.166 75.265 75.341 75.396 75.436 75.463 75.487 75.517 75.549 75.555 75.543 75.538 75.545 75.557 75.546 75.533 75.503 75.468 75.44 75.425 75.277 75.379 75.351 75.318 75.256 75.203 75.132 75.05 74.952 74.867 74.77 74.211 -8 ,31619 ,TETRA ,17589692,Sat Nov 27 19:10:40 CET,Sat Nov 27 21:28:06 CET,0.0 0.918 1.283 1.608 1.905 2.177 2.401 2.606 3.047 3.277 3.492 3.669 4.075 4.271 4.645 4.997 5.336 5.506 5.829 6.143 6.607 6.903 7.183 7.58 7.961 8.337 8.706 9.071 9.557 10.034 10.516 11.106 11.671 12.23 12.905 13.705 14.487 15.348 16.305 17.353 18.456 19.741 21.304 22.944 24.951 27.25 30.063 33.518 37.894 43.405 50.715 57.435 61.757 64.836 67.155 68.912 70.206 71.234 72.032 72.764 73.338 73.754 74.089 74.389 74.631 74.828 75.031 75.21 75.343 75.471 75.61 75.698 75.753 75.813 75.862 75.894 75.904 75.909 75.915 75.914 75.907 75.889 75.865 75.834 75.818 75.779 75.742 75.712 75.685 75.508 75.532 75.477 75.425 75.295 75.215 75.107 74.986 74.878 74.737 74.514 73.907 -9 ,20149 ,TETRA ,17589693,Sat Nov 27 19:09:40 CET,Sat Nov 27 21:27:48 CET,0.0 0.449 0.748 1.001 1.217 1.418 1.599 1.765 2.093 2.257 2.42 2.544 2.912 3.066 3.362 3.661 3.953 4.097 4.374 4.644 5.044 5.311 5.578 5.968 6.353 6.728 7.1 7.473 7.959 8.43 8.897 9.472 10.027 10.58 11.246 12.018 12.783 13.656 14.616 15.646 16.79 18.135 19.764 21.46 23.483 25.836 28.725 32.234 36.548 42.003 49.318 56.137 60.672 63.89 66.199 68.004 69.442 70.588 71.472 72.288 72.946 73.466 73.89 74.258 74.571 74.849 75.116 75.31 75.468 75.637 75.79 75.895 76.01 76.126 76.204 76.271 76.329 76.387 76.45 76.484 76.509 76.541 76.563 76.586 76.593 76.597 76.597 76.58 76.565 76.433 76.515 76.493 76.471 76.413 76.366 76.326 76.276 76.208 76.116 75.974 75.424 -10 ,31952 ,TETRA ,17589694,Sat Nov 27 19:09:41 CET,Sat Nov 27 21:29:59 CET,0.0 1.027 1.372 1.662 1.95 2.2 2.425 2.641 3.054 3.255 3.454 3.634 4.031 4.217 4.585 4.944 5.298 5.482 5.837 6.154 6.602 6.901 7.201 7.631 8.061 8.507 8.928 9.339 9.874 10.395 10.93 11.583 12.215 12.83 13.521 14.29 15.069 15.972 16.965 18.044 19.209 20.553 22.144 23.786 25.83 28.243 31.139 34.594 38.845 44.26 51.519 58.268 62.715 65.848 68.205 70.057 71.456 72.567 73.42 74.162 74.747 75.261 75.712 76.048 76.316 76.573 76.829 77.023 77.162 77.299 77.417 77.485 77.561 77.645 77.689 77.717 77.733 77.743 77.755 77.759 77.769 77.777 77.772 77.772 77.769 77.762 77.759 77.731 77.706 77.545 77.613 77.568 77.53 77.472 77.43 77.366 77.241 77.101 76.959 76.783 76.487 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 175a7d4c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30198 ,TETRA ,17589695,Sat Nov 27 19:09:40 CET,Sat Nov 27 21:31:41 CET,0.0 0.551 0.856 1.098 1.328 1.516 1.69 1.851 2.156 2.314 2.471 2.538 2.904 3.044 3.301 3.538 3.769 3.878 4.088 4.294 4.594 4.79 4.982 5.256 5.517 5.767 6.011 6.254 6.572 6.884 7.184 7.531 7.87 8.216 8.616 9.051 9.477 9.964 10.501 11.074 11.658 12.328 13.159 14.003 14.988 16.133 17.472 18.985 20.822 23.019 25.764 28.133 29.56 30.45 31.072 31.509 31.79 31.984 32.111 32.211 32.262 32.287 32.298 32.283 32.257 32.221 32.159 32.077 31.99 31.898 31.805 31.724 31.635 31.547 31.485 31.42 31.338 31.248 31.134 31.05 30.971 30.852 30.776 30.688 30.641 30.557 30.461 30.345 30.282 30.017 30.057 29.974 29.888 29.713 29.604 29.483 29.347 29.204 29.069 28.883 28.601 -2 ,13991 ,TETRA ,17589696,Sat Nov 27 19:09:40 CET,Sat Nov 27 21:18:25 CET,0.0 0.438 0.685 0.909 1.093 1.27 1.428 1.561 1.821 1.948 2.076 2.103 2.445 2.571 2.81 3.045 3.272 3.385 3.614 3.812 4.083 4.259 4.434 4.71 4.965 5.206 5.452 5.701 6.017 6.316 6.619 6.991 7.349 7.685 8.085 8.551 8.98 9.427 9.914 10.452 11.023 11.663 12.459 13.302 14.309 15.459 16.791 18.339 20.165 22.357 25.142 27.512 28.888 29.748 30.312 30.697 30.953 31.108 31.209 31.295 31.326 31.331 31.329 31.329 31.322 31.288 31.226 31.143 31.064 30.992 30.914 30.841 30.75 30.622 30.532 30.454 30.371 30.282 30.176 30.093 30.01 29.894 29.804 29.712 29.669 29.572 29.473 29.365 29.294 29.025 29.076 29.009 28.932 28.71 28.57 28.438 28.317 28.178 28.013 27.813 27.455 -3 ,12279 ,TETRA ,17589697,Sat Nov 27 19:09:41 CET,Sat Nov 27 21:22:49 CET,0.0 0.43 0.729 0.959 1.186 1.391 1.576 1.749 2.052 2.199 2.334 2.37 2.711 2.821 3.054 3.276 3.489 3.595 3.805 4.01 4.298 4.49 4.68 4.945 5.2 5.462 5.715 5.963 6.278 6.577 6.872 7.239 7.602 7.941 8.352 8.826 9.295 9.798 10.317 10.896 11.513 12.213 13.006 13.812 14.783 15.872 17.159 18.622 20.372 22.527 25.272 27.714 29.193 30.162 30.839 31.306 31.622 31.833 31.947 32.038 32.091 32.105 32.108 32.095 32.055 32.009 31.955 31.912 31.873 31.815 31.744 31.672 31.583 31.498 31.435 31.369 31.289 31.189 31.093 31.028 30.958 30.845 30.763 30.676 30.626 30.523 30.406 30.255 30.183 29.927 29.963 29.866 29.76 29.558 29.444 29.301 29.15 28.991 28.816 28.561 27.648 -4 ,29403 ,TETRA ,17589698,Sat Nov 27 19:09:40 CET,Sat Nov 27 21:32:41 CET,0.0 0.94 1.29 1.591 1.835 2.045 2.229 2.404 2.746 2.908 3.059 3.09 3.439 3.558 3.788 4.02 4.249 4.358 4.575 4.794 5.097 5.288 5.48 5.757 6.036 6.31 6.57 6.82 7.132 7.441 7.753 8.13 8.489 8.845 9.253 9.708 10.17 10.679 11.227 11.816 12.441 13.172 14.03 14.894 15.928 17.12 18.536 20.1 21.926 24.119 26.854 29.229 30.68 31.673 32.325 32.807 33.155 33.349 33.456 33.536 33.578 33.602 33.607 33.584 33.545 33.513 33.459 33.405 33.349 33.279 33.196 33.117 33.039 32.938 32.845 32.753 32.666 32.574 32.457 32.371 32.282 32.137 32.03 31.909 31.849 31.727 31.586 31.421 31.336 31.066 31.073 30.966 30.856 30.635 30.526 30.398 30.234 30.041 29.828 29.555 28.966 -5 ,26373 ,TETRA ,17589699,Sat Nov 27 19:09:41 CET,Sat Nov 27 21:19:59 CET,0.0 0.628 0.872 1.095 1.3 1.483 1.666 1.827 2.142 2.305 2.458 2.521 2.877 3.009 3.254 3.484 3.703 3.809 4.014 4.212 4.508 4.698 4.881 5.163 5.435 5.693 5.946 6.186 6.493 6.793 7.077 7.435 7.789 8.128 8.538 9.02 9.491 9.987 10.499 11.04 11.631 12.339 13.16 13.975 14.916 16.005 17.352 18.879 20.74 23.038 25.843 28.262 29.77 30.741 31.356 31.784 32.095 32.295 32.396 32.473 32.506 32.501 32.485 32.444 32.384 32.322 32.257 32.196 32.134 32.067 31.993 31.922 31.843 31.758 31.683 31.609 31.53 31.445 31.359 31.296 31.221 31.09 31.005 30.923 30.884 30.806 30.709 30.602 30.55 30.295 30.346 30.27 30.185 29.996 29.891 29.772 29.641 29.488 29.296 29.045 28.454 -6 ,9077 ,TETRA ,17589700,Sat Nov 27 19:09:40 CET,Sat Nov 27 21:22:11 CET,0.0 0.693 0.973 1.167 1.36 1.546 1.725 1.898 2.199 2.333 2.475 2.533 2.879 2.995 3.254 3.509 3.74 3.852 4.065 4.276 4.593 4.795 4.986 5.264 5.543 5.803 6.052 6.297 6.597 6.879 7.168 7.525 7.864 8.202 8.608 9.056 9.469 9.934 10.445 10.992 11.575 12.241 13.035 13.829 14.762 15.812 17.075 18.582 20.332 22.377 24.969 27.241 28.581 29.451 30.069 30.484 30.742 30.921 31.04 31.13 31.176 31.194 31.186 31.163 31.137 31.093 31.023 30.954 30.894 30.83 30.749 30.684 30.615 30.532 30.472 30.402 30.316 30.239 30.154 30.081 30.007 29.896 29.821 29.747 29.707 29.619 29.52 29.414 29.354 29.091 29.141 29.055 28.96 28.775 28.67 28.537 28.394 28.256 28.08 27.83 27.281 -7 ,350 ,TETRA ,17589701,Sat Nov 27 19:10:40 CET,Sat Nov 27 21:24:26 CET,0.0 0.709 1.005 1.289 1.52 1.724 1.907 2.089 2.42 2.567 2.718 2.78 3.124 3.249 3.515 3.766 3.989 4.094 4.3 4.502 4.784 4.973 5.155 5.42 5.692 5.95 6.194 6.434 6.737 7.031 7.32 7.678 8.043 8.394 8.797 9.256 9.703 10.187 10.706 11.257 11.839 12.52 13.327 14.153 15.121 16.223 17.557 19.105 20.914 23.071 25.761 27.929 29.127 29.898 30.374 30.69 30.921 31.081 31.178 31.231 31.247 31.232 31.191 31.15 31.103 31.046 30.983 30.92 30.847 30.763 30.666 30.564 30.471 30.374 30.286 30.211 30.13 30.033 29.941 29.884 29.811 29.681 29.592 29.495 29.442 29.328 29.209 29.101 29.038 28.777 28.828 28.737 28.635 28.407 28.282 28.152 28.014 27.866 27.684 27.418 26.999 -8 ,29856 ,TETRA ,17589702,Sat Nov 27 19:10:40 CET,Sat Nov 27 21:28:28 CET,0.0 0.5 0.768 1.02 1.238 1.446 1.63 1.795 2.095 2.238 2.38 2.441 2.81 2.944 3.193 3.419 3.647 3.768 4.002 4.227 4.539 4.742 4.949 5.235 5.511 5.78 6.039 6.285 6.61 6.939 7.249 7.619 7.977 8.325 8.732 9.189 9.63 10.12 10.659 11.253 11.889 12.597 13.46 14.366 15.415 16.587 17.961 19.514 21.328 23.548 26.343 28.716 30.129 31.011 31.567 31.948 32.214 32.396 32.506 32.565 32.573 32.547 32.502 32.473 32.454 32.416 32.36 32.303 32.245 32.174 32.09 32.012 31.924 31.816 31.73 31.649 31.562 31.459 31.343 31.26 31.176 31.04 30.94 30.837 30.784 30.681 30.57 30.453 30.391 30.131 30.176 30.095 30.017 29.826 29.713 29.595 29.5 29.377 29.19 28.976 28.334 -9 ,19308 ,TETRA ,17589703,Sat Nov 27 19:10:40 CET,Sat Nov 27 21:33:32 CET,0.0 0.811 1.143 1.427 1.622 1.8 1.974 2.139 2.447 2.597 2.745 2.787 3.127 3.25 3.493 3.717 3.939 4.052 4.273 4.482 4.776 4.966 5.153 5.441 5.72 5.98 6.233 6.488 6.82 7.13 7.438 7.818 8.202 8.581 9.015 9.493 9.946 10.462 11.03 11.631 12.265 12.974 13.818 14.692 15.735 16.888 18.235 19.767 21.566 23.787 26.463 28.668 30.012 30.943 31.58 32.0 32.282 32.491 32.625 32.724 32.781 32.801 32.806 32.793 32.769 32.739 32.705 32.668 32.623 32.564 32.477 32.407 32.333 32.255 32.198 32.125 32.044 31.949 31.82 31.727 31.627 31.443 31.314 31.196 31.141 31.029 30.902 30.773 30.707 30.44 30.473 30.381 30.278 30.075 29.976 29.841 29.697 29.554 29.389 29.174 28.409 -10 ,19897 ,TETRA ,17589704,Sat Nov 27 19:10:40 CET,Sat Nov 27 21:24:50 CET,0.0 0.906 1.233 1.483 1.682 1.87 2.044 2.211 2.541 2.688 2.829 2.864 3.205 3.329 3.574 3.81 4.036 4.15 4.371 4.563 4.85 5.054 5.25 5.517 5.777 6.039 6.296 6.543 6.865 7.16 7.441 7.795 8.136 8.464 8.839 9.265 9.689 10.162 10.682 11.245 11.838 12.525 13.322 14.108 15.05 16.142 17.411 18.853 20.588 22.712 25.334 27.607 28.925 29.735 30.287 30.674 30.954 31.158 31.274 31.353 31.414 31.428 31.412 31.383 31.343 31.306 31.256 31.212 31.165 31.107 31.051 30.995 30.92 30.823 30.748 30.662 30.574 30.489 30.389 30.328 30.265 30.153 30.07 29.983 29.943 29.863 29.764 29.643 29.588 29.345 29.427 29.359 29.279 29.092 28.998 28.895 28.76 28.617 28.421 28.164 27.709 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt deleted file mode 100644 index 33af4505..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18640 ,TETRA ,17589705,Sat Nov 27 19:10:40 CET,Sat Nov 27 21:29:15 CET,0.0 0.856 1.041 1.217 1.403 1.554 1.66 1.745 1.902 1.971 2.034 2.016 2.193 2.217 2.249 2.273 2.28 2.28 2.292 2.308 2.325 2.33 2.324 2.293 2.246 2.195 2.144 2.09 2.008 1.897 1.764 1.61 1.466 1.317 1.121 0.883 0.606 0.248 -0.14 -0.553 -1.043 -1.718 -2.613 -3.578 -4.803 -6.297 -8.221 -10.621 -13.821 -18.427 -25.352 -32.669 -38.059 -42.219 -45.529 -48.34 -50.67 -52.67 -54.334 -55.94 -57.281 -58.444 -59.517 -60.494 -61.396 -62.2 -62.992 -63.686 -64.274 -64.859 -65.449 -65.925 -66.425 -66.948 -67.341 -67.739 -68.14 -68.557 -68.988 -69.267 -69.557 -70.023 -70.329 -70.635 -70.789 -71.105 -71.43 -71.775 -71.957 -72.353 -72.512 -72.711 -72.917 -73.327 -73.544 -73.773 -74.002 -74.255 -74.559 -74.941 -75.774 -2 ,12728 ,TETRA ,17589706,Sat Nov 27 19:10:40 CET,Sat Nov 27 21:27:38 CET,0.0 0.866 1.132 1.289 1.414 1.512 1.596 1.662 1.771 1.821 1.861 1.773 1.932 1.959 2.004 2.039 2.066 2.08 2.108 2.115 2.088 2.069 2.063 2.027 1.956 1.887 1.821 1.736 1.61 1.493 1.379 1.222 1.051 0.868 0.63 0.341 0.04 -0.321 -0.74 -1.226 -1.781 -2.457 -3.31 -4.261 -5.507 -7.043 -8.976 -11.441 -14.763 -19.358 -26.192 -33.504 -38.967 -43.164 -46.505 -49.319 -51.636 -53.618 -55.253 -56.807 -58.106 -59.238 -60.286 -61.263 -62.151 -62.923 -63.711 -64.405 -64.986 -65.58 -66.193 -66.696 -67.204 -67.712 -68.104 -68.505 -68.901 -69.309 -69.727 -70.011 -70.299 -70.736 -71.039 -71.346 -71.494 -71.807 -72.14 -72.471 -72.638 -73.023 -73.182 -73.37 -73.561 -74.002 -74.231 -74.461 -74.717 -74.978 -75.26 -75.574 -76.205 -3 ,17947 ,TETRA ,17589707,Sat Nov 27 19:10:40 CET,Sat Nov 27 21:27:42 CET,0.0 0.419 0.663 0.87 1.027 1.143 1.239 1.308 1.424 1.465 1.505 1.444 1.598 1.626 1.678 1.705 1.713 1.717 1.726 1.718 1.692 1.674 1.656 1.61 1.55 1.498 1.435 1.355 1.242 1.115 0.979 0.796 0.603 0.41 0.187 -0.088 -0.384 -0.726 -1.13 -1.61 -2.164 -2.839 -3.712 -4.666 -5.876 -7.378 -9.316 -11.807 -15.177 -19.859 -26.799 -34.194 -39.69 -43.953 -47.33 -50.122 -52.471 -54.493 -56.144 -57.76 -59.107 -60.256 -61.319 -62.282 -63.134 -63.886 -64.666 -65.359 -65.948 -66.541 -67.159 -67.675 -68.18 -68.693 -69.09 -69.49 -69.889 -70.291 -70.7 -70.978 -71.266 -71.702 -71.999 -72.321 -72.488 -72.815 -73.15 -73.492 -73.675 -74.065 -74.224 -74.415 -74.618 -75.045 -75.257 -75.479 -75.736 -76.018 -76.326 -76.719 -77.909 -4 ,18012 ,TETRA ,17589708,Sat Nov 27 19:10:43 CET,Sat Nov 27 21:30:47 CET,0.0 0.839 1.045 1.167 1.281 1.381 1.474 1.569 1.75 1.818 1.863 1.788 1.946 1.972 2.007 2.03 2.047 2.052 2.056 2.039 2.003 1.989 1.981 1.952 1.896 1.834 1.765 1.694 1.598 1.495 1.385 1.215 1.036 0.871 0.652 0.366 0.068 -0.293 -0.701 -1.186 -1.751 -2.444 -3.339 -4.313 -5.549 -7.074 -9.046 -11.573 -14.966 -19.64 -26.592 -33.963 -39.338 -43.517 -46.931 -49.79 -52.123 -54.13 -55.802 -57.421 -58.765 -59.923 -60.965 -61.91 -62.78 -63.548 -64.323 -65.01 -65.602 -66.194 -66.786 -67.277 -67.777 -68.292 -68.687 -69.074 -69.459 -69.856 -70.261 -70.528 -70.798 -71.217 -71.511 -71.811 -71.961 -72.257 -72.567 -72.896 -73.061 -73.443 -73.571 -73.743 -73.923 -74.309 -74.505 -74.716 -74.946 -75.214 -75.518 -75.839 -76.916 -5 ,30218 ,TETRA ,17589709,Sat Nov 27 19:10:40 CET,Sat Nov 27 21:24:40 CET,0.0 0.85 1.055 1.189 1.274 1.351 1.421 1.497 1.63 1.663 1.69 1.629 1.793 1.823 1.888 1.928 1.949 1.952 1.958 1.963 1.958 1.953 1.933 1.889 1.864 1.831 1.782 1.724 1.638 1.525 1.393 1.221 1.037 0.867 0.661 0.385 0.095 -0.253 -0.654 -1.114 -1.657 -2.339 -3.222 -4.184 -5.424 -6.966 -8.905 -11.38 -14.748 -19.352 -26.249 -33.574 -38.963 -43.148 -46.505 -49.304 -51.609 -53.604 -55.226 -56.779 -58.087 -59.213 -60.244 -61.186 -62.045 -62.808 -63.585 -64.269 -64.839 -65.418 -66.013 -66.498 -66.989 -67.474 -67.846 -68.228 -68.629 -69.038 -69.434 -69.7 -69.979 -70.404 -70.693 -70.996 -71.148 -71.437 -71.734 -72.048 -72.207 -72.583 -72.723 -72.907 -73.091 -73.456 -73.649 -73.847 -74.049 -74.306 -74.647 -74.976 -75.596 -6 ,16499 ,TETRA ,17589710,Sat Nov 27 19:11:40 CET,Sat Nov 27 21:30:54 CET,0.0 0.901 1.097 1.229 1.327 1.427 1.529 1.618 1.743 1.781 1.807 1.738 1.905 1.94 1.989 2.009 2.014 2.012 2.011 2.0 1.962 1.933 1.899 1.845 1.788 1.727 1.657 1.572 1.456 1.343 1.232 1.076 0.899 0.717 0.486 0.223 -0.056 -0.421 -0.852 -1.337 -1.888 -2.568 -3.424 -4.358 -5.541 -7.02 -8.95 -11.396 -14.735 -19.409 -26.32 -33.663 -39.135 -43.394 -46.788 -49.635 -51.984 -53.995 -55.64 -57.199 -58.504 -59.646 -60.694 -61.654 -62.537 -63.321 -64.123 -64.819 -65.405 -66.009 -66.629 -67.124 -67.622 -68.127 -68.509 -68.898 -69.296 -69.704 -70.124 -70.413 -70.694 -71.123 -71.425 -71.72 -71.873 -72.196 -72.518 -72.847 -73.019 -73.421 -73.579 -73.76 -73.958 -74.356 -74.562 -74.789 -75.029 -75.275 -75.54 -75.905 -76.857 -7 ,19419 ,TETRA ,17589711,Sat Nov 27 19:11:40 CET,Sat Nov 27 21:13:46 CET,0.0 0.389 0.559 0.688 0.796 0.884 0.952 1.017 1.132 1.187 1.243 1.182 1.378 1.427 1.471 1.506 1.524 1.53 1.526 1.515 1.495 1.478 1.464 1.43 1.369 1.309 1.263 1.202 1.111 1.01 0.899 0.761 0.602 0.433 0.218 -0.049 -0.33 -0.689 -1.108 -1.586 -2.14 -2.823 -3.716 -4.699 -5.925 -7.423 -9.344 -11.816 -15.143 -19.696 -26.538 -33.794 -39.076 -43.228 -46.598 -49.445 -51.794 -53.795 -55.469 -57.095 -58.421 -59.561 -60.643 -61.627 -62.499 -63.262 -64.03 -64.727 -65.33 -65.94 -66.566 -67.059 -67.554 -68.062 -68.447 -68.843 -69.248 -69.661 -70.084 -70.369 -70.652 -71.089 -71.394 -71.707 -71.861 -72.151 -72.445 -72.763 -72.933 -73.316 -73.456 -73.642 -73.827 -74.205 -74.41 -74.656 -74.898 -75.132 -75.407 -75.769 -76.529 -8 ,4464 ,TETRA ,17589712,Sat Nov 27 19:11:40 CET,Sat Nov 27 21:26:27 CET,0.0 0.673 0.883 1.018 1.109 1.18 1.241 1.301 1.43 1.48 1.523 1.462 1.622 1.641 1.674 1.704 1.725 1.731 1.755 1.776 1.774 1.76 1.744 1.714 1.674 1.636 1.597 1.543 1.447 1.347 1.243 1.104 0.955 0.797 0.592 0.325 0.059 -0.244 -0.601 -1.022 -1.526 -2.139 -2.923 -3.813 -4.987 -6.426 -8.232 -10.592 -13.799 -18.27 -25.016 -32.266 -37.625 -41.782 -45.091 -47.886 -50.269 -52.32 -53.978 -55.595 -56.937 -58.077 -59.117 -60.059 -60.92 -61.692 -62.481 -63.165 -63.75 -64.335 -64.905 -65.379 -65.873 -66.369 -66.748 -67.134 -67.515 -67.897 -68.295 -68.566 -68.84 -69.263 -69.56 -69.87 -70.026 -70.334 -70.659 -70.988 -71.157 -71.548 -71.734 -71.932 -72.122 -72.531 -72.75 -72.983 -73.23 -73.477 -73.773 -74.183 -75.068 -9 ,18522 ,TETRA ,17589713,Sat Nov 27 19:11:40 CET,Sat Nov 27 21:25:10 CET,0.0 0.989 1.197 1.28 1.36 1.437 1.494 1.543 1.608 1.622 1.639 1.551 1.682 1.681 1.675 1.656 1.65 1.647 1.626 1.597 1.536 1.488 1.438 1.356 1.28 1.206 1.117 1.034 0.924 0.782 0.628 0.433 0.223 0.018 -0.23 -0.548 -0.87 -1.262 -1.716 -2.222 -2.805 -3.517 -4.414 -5.374 -6.615 -8.183 -10.195 -12.735 -16.146 -20.849 -27.75 -35.011 -40.402 -44.634 -48.027 -50.878 -53.249 -55.273 -56.922 -58.485 -59.796 -60.929 -61.957 -62.89 -63.731 -64.48 -65.236 -65.884 -66.441 -67.002 -67.572 -68.043 -68.513 -68.983 -69.345 -69.705 -70.059 -70.418 -70.792 -71.051 -71.315 -71.71 -71.978 -72.264 -72.409 -72.7 -72.992 -73.283 -73.435 -73.803 -73.924 -74.081 -74.251 -74.595 -74.773 -74.97 -75.175 -75.391 -75.615 -75.911 -76.707 -10 ,16343 ,TETRA ,17589714,Sat Nov 27 19:11:40 CET,Sat Nov 27 21:28:25 CET,0.0 0.831 1.024 1.131 1.252 1.363 1.435 1.488 1.589 1.636 1.682 1.626 1.789 1.81 1.832 1.844 1.838 1.833 1.828 1.82 1.796 1.778 1.755 1.701 1.655 1.616 1.557 1.485 1.39 1.275 1.144 0.978 0.802 0.615 0.376 0.085 -0.209 -0.567 -0.992 -1.477 -2.039 -2.723 -3.594 -4.536 -5.712 -7.16 -9.055 -11.474 -14.775 -19.419 -26.342 -33.691 -39.066 -43.25 -46.611 -49.45 -51.845 -53.904 -55.574 -57.16 -58.495 -59.663 -60.745 -61.728 -62.602 -63.367 -64.142 -64.826 -65.402 -65.971 -66.537 -67.002 -67.477 -67.974 -68.354 -68.734 -69.125 -69.52 -69.928 -70.207 -70.477 -70.898 -71.193 -71.495 -71.649 -71.957 -72.266 -72.587 -72.765 -73.156 -73.277 -73.454 -73.642 -74.025 -74.227 -74.439 -74.671 -74.937 -75.241 -75.676 -76.611 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index a18778d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17187 ,TETRA ,17589715,Sat Nov 27 19:11:40 CET,Sat Nov 27 21:32:19 CET,0.0 0.621 0.89 1.065 1.228 1.372 1.495 1.62 1.859 1.965 2.06 2.037 2.335 2.422 2.58 2.733 2.904 2.986 3.135 3.271 3.471 3.607 3.731 3.914 4.093 4.253 4.403 4.549 4.738 4.915 5.084 5.286 5.487 5.677 5.894 6.134 6.358 6.592 6.821 7.058 7.315 7.61 7.954 8.262 8.567 8.894 9.244 9.617 9.971 10.181 10.137 9.72 9.183 8.641 8.12 7.605 7.127 6.678 6.278 5.879 5.535 5.214 4.878 4.556 4.258 3.985 3.698 3.428 3.194 2.965 2.72 2.495 2.269 2.038 1.843 1.636 1.414 1.197 1.004 0.859 0.691 0.442 0.277 0.112 0.032 -0.135 -0.34 -0.582 -0.706 -1.046 -1.1 -1.226 -1.366 -1.663 -1.815 -1.959 -2.17 -2.422 -2.659 -2.972 -4.103 -2 ,3556 ,TETRA ,17589716,Sat Nov 27 19:11:41 CET,Sat Nov 27 21:27:03 CET,0.0 0.374 0.613 0.769 0.91 1.046 1.196 1.32 1.519 1.615 1.706 1.664 1.942 2.027 2.203 2.346 2.484 2.561 2.705 2.823 2.991 3.111 3.232 3.406 3.56 3.698 3.839 3.985 4.173 4.34 4.507 4.71 4.899 5.093 5.302 5.529 5.746 6.0 6.28 6.562 6.851 7.155 7.482 7.791 8.166 8.552 8.919 9.303 9.677 9.888 9.855 9.481 8.927 8.358 7.836 7.307 6.802 6.359 5.971 5.571 5.219 4.873 4.542 4.24 3.969 3.726 3.466 3.223 3.004 2.775 2.538 2.352 2.165 1.958 1.784 1.593 1.399 1.205 0.999 0.857 0.719 0.511 0.37 0.216 0.135 -0.026 -0.213 -0.417 -0.511 -0.815 -0.833 -0.953 -1.073 -1.346 -1.504 -1.67 -1.846 -2.046 -2.302 -2.651 -3.278 -3 ,9596 ,TETRA ,17589717,Sat Nov 27 19:11:40 CET,Sat Nov 27 21:32:04 CET,0.0 0.691 0.965 1.128 1.267 1.405 1.543 1.67 1.906 2.003 2.09 2.044 2.343 2.435 2.609 2.769 2.904 2.972 3.117 3.263 3.465 3.583 3.704 3.89 4.055 4.201 4.345 4.488 4.68 4.875 5.061 5.296 5.512 5.697 5.904 6.12 6.322 6.554 6.798 7.034 7.304 7.602 7.901 8.202 8.546 8.897 9.262 9.602 9.897 10.08 10.078 9.794 9.331 8.804 8.32 7.854 7.41 6.974 6.573 6.163 5.791 5.46 5.147 4.841 4.552 4.289 4.009 3.762 3.546 3.331 3.103 2.908 2.713 2.496 2.321 2.145 1.971 1.77 1.545 1.39 1.23 0.984 0.804 0.619 0.528 0.326 0.107 -0.114 -0.215 -0.535 -0.556 -0.676 -0.821 -1.168 -1.343 -1.508 -1.685 -1.896 -2.169 -2.54 -3.179 -4 ,9652 ,TETRA ,17589718,Sat Nov 27 19:11:41 CET,Sat Nov 27 21:14:25 CET,0.0 0.562 0.839 1.043 1.171 1.283 1.402 1.521 1.74 1.848 1.95 1.909 2.199 2.293 2.473 2.641 2.803 2.882 3.041 3.178 3.38 3.519 3.644 3.811 3.978 4.14 4.296 4.444 4.631 4.811 4.976 5.168 5.344 5.522 5.738 5.969 6.19 6.433 6.679 6.951 7.245 7.546 7.866 8.174 8.519 8.875 9.232 9.527 9.805 10.068 10.058 9.645 9.134 8.615 8.137 7.673 7.24 6.809 6.435 6.059 5.714 5.411 5.116 4.828 4.566 4.314 4.037 3.778 3.551 3.323 3.082 2.882 2.675 2.466 2.307 2.145 1.959 1.746 1.535 1.391 1.224 0.952 0.757 0.552 0.451 0.244 0.043 -0.155 -0.275 -0.626 -0.674 -0.819 -0.969 -1.237 -1.406 -1.612 -1.799 -1.966 -2.179 -2.484 -3.151 -5 ,7640 ,TETRA ,17589719,Sat Nov 27 19:11:41 CET,Sat Nov 27 21:36:28 CET,0.0 0.458 0.7 0.922 1.108 1.259 1.395 1.522 1.785 1.912 2.02 2.003 2.317 2.408 2.589 2.757 2.892 2.964 3.105 3.244 3.44 3.559 3.678 3.853 4.021 4.171 4.309 4.449 4.638 4.814 4.983 5.188 5.375 5.544 5.746 5.971 6.184 6.432 6.688 6.933 7.177 7.453 7.773 8.087 8.435 8.812 9.197 9.538 9.801 9.973 9.951 9.555 9.036 8.471 7.949 7.47 7.002 6.546 6.129 5.681 5.294 4.962 4.66 4.374 4.095 3.817 3.517 3.264 3.044 2.801 2.561 2.366 2.16 1.942 1.757 1.564 1.367 1.171 0.976 0.833 0.676 0.404 0.217 0.047 -0.04 -0.217 -0.411 -0.631 -0.741 -1.056 -1.066 -1.191 -1.315 -1.583 -1.737 -1.902 -2.103 -2.356 -2.684 -3.067 -4.444 -6 ,17665 ,TETRA ,17589720,Sat Nov 27 19:11:40 CET,Sat Nov 27 21:32:18 CET,0.0 0.344 0.548 0.719 0.868 1.008 1.139 1.272 1.554 1.693 1.806 1.788 2.088 2.19 2.383 2.545 2.692 2.765 2.904 3.039 3.238 3.361 3.483 3.667 3.858 4.028 4.182 4.341 4.547 4.737 4.921 5.138 5.346 5.556 5.794 6.062 6.299 6.547 6.808 7.057 7.317 7.609 7.947 8.288 8.644 8.997 9.335 9.669 10.005 10.215 10.129 9.655 9.059 8.402 7.802 7.218 6.668 6.175 5.752 5.323 4.937 4.581 4.222 3.877 3.558 3.263 2.951 2.672 2.427 2.177 1.926 1.714 1.484 1.245 1.071 0.907 0.727 0.524 0.324 0.184 0.03 -0.216 -0.389 -0.568 -0.658 -0.848 -1.048 -1.248 -1.351 -1.672 -1.686 -1.808 -1.962 -2.307 -2.486 -2.666 -2.839 -3.022 -3.248 -3.58 -4.266 -7 ,1068 ,TETRA ,17589721,Sat Nov 27 19:12:40 CET,Sat Nov 27 21:35:30 CET,0.0 0.398 0.62 0.798 0.954 1.102 1.237 1.35 1.57 1.671 1.777 1.776 2.098 2.199 2.375 2.546 2.709 2.782 2.921 3.064 3.273 3.404 3.523 3.692 3.861 4.022 4.173 4.323 4.515 4.692 4.852 5.041 5.235 5.414 5.613 5.819 6.012 6.231 6.479 6.74 6.989 7.277 7.593 7.89 8.239 8.594 8.951 9.267 9.54 9.753 9.754 9.323 8.766 8.205 7.674 7.154 6.681 6.253 5.866 5.443 5.072 4.755 4.432 4.117 3.843 3.604 3.345 3.092 2.865 2.635 2.404 2.212 2.009 1.792 1.622 1.439 1.249 1.048 0.825 0.671 0.521 0.314 0.183 0.033 -0.054 -0.229 -0.4 -0.585 -0.681 -1.0 -1.028 -1.153 -1.276 -1.558 -1.72 -1.887 -2.078 -2.285 -2.53 -2.844 -3.704 -8 ,19213 ,TETRA ,17589722,Sat Nov 27 19:12:40 CET,Sat Nov 27 21:34:05 CET,0.0 0.454 0.698 0.871 1.035 1.194 1.335 1.467 1.699 1.793 1.891 1.884 2.182 2.26 2.421 2.574 2.708 2.779 2.923 3.06 3.271 3.409 3.536 3.711 3.872 4.033 4.184 4.32 4.498 4.671 4.846 5.064 5.266 5.461 5.684 5.933 6.173 6.445 6.731 7.015 7.307 7.622 7.978 8.304 8.65 9.006 9.348 9.669 9.965 10.165 10.126 9.742 9.25 8.74 8.222 7.694 7.204 6.749 6.343 5.923 5.555 5.22 4.896 4.582 4.298 4.038 3.733 3.444 3.207 2.977 2.742 2.529 2.304 2.087 1.926 1.755 1.55 1.324 1.094 0.939 0.792 0.56 0.386 0.193 0.099 -0.084 -0.27 -0.474 -0.585 -0.9 -0.922 -1.043 -1.16 -1.43 -1.593 -1.775 -1.954 -2.156 -2.409 -2.72 -3.453 -9 ,22655 ,TETRA ,17589723,Sat Nov 27 19:12:40 CET,Sat Nov 27 21:37:15 CET,0.0 0.341 0.565 0.777 0.946 1.074 1.189 1.296 1.512 1.613 1.71 1.69 1.982 2.066 2.226 2.381 2.525 2.597 2.739 2.873 3.07 3.195 3.316 3.493 3.674 3.847 4.008 4.165 4.371 4.568 4.741 4.941 5.136 5.315 5.529 5.768 5.993 6.234 6.49 6.763 7.025 7.3 7.596 7.875 8.191 8.499 8.834 9.178 9.506 9.75 9.757 9.384 8.879 8.38 7.901 7.41 6.948 6.535 6.176 5.801 5.455 5.149 4.855 4.568 4.305 4.062 3.811 3.591 3.388 3.17 2.942 2.742 2.53 2.31 2.152 1.987 1.81 1.642 1.475 1.355 1.227 1.033 0.885 0.707 0.617 0.451 0.291 0.128 0.032 -0.29 -0.305 -0.416 -0.529 -0.758 -0.883 -1.015 -1.165 -1.349 -1.567 -1.898 -2.522 -10 ,2317 ,TETRA ,17589724,Sat Nov 27 19:12:40 CET,Sat Nov 27 21:34:52 CET,0.0 0.54 0.83 1.076 1.27 1.403 1.518 1.64 1.889 2.006 2.117 2.107 2.41 2.5 2.663 2.82 2.978 3.055 3.198 3.334 3.543 3.685 3.814 3.986 4.157 4.319 4.476 4.627 4.831 5.029 5.211 5.434 5.649 5.848 6.083 6.351 6.601 6.85 7.105 7.362 7.62 7.923 8.246 8.543 8.888 9.26 9.608 9.936 10.246 10.465 10.519 10.167 9.639 9.055 8.497 7.97 7.467 6.991 6.556 6.103 5.722 5.399 5.099 4.809 4.522 4.261 3.988 3.735 3.517 3.28 3.015 2.802 2.585 2.357 2.17 1.982 1.79 1.574 1.365 1.223 1.066 0.814 0.633 0.459 0.376 0.199 0.005 -0.202 -0.313 -0.635 -0.641 -0.759 -0.879 -1.13 -1.267 -1.411 -1.589 -1.803 -2.038 -2.319 -2.904 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt deleted file mode 100644 index e864191d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,511 ,TETRA ,17589725,Sat Nov 27 19:12:40 CET,Sat Nov 27 21:35:29 CET,0.0 0.361 0.541 0.728 0.903 1.047 1.173 1.321 1.6 1.725 1.845 1.838 2.155 2.256 2.448 2.631 2.81 2.904 3.101 3.283 3.524 3.67 3.811 4.027 4.24 4.444 4.645 4.842 5.094 5.344 5.596 5.885 6.149 6.419 6.749 7.104 7.438 7.836 8.277 8.722 9.196 9.744 10.379 11.021 11.772 12.61 13.59 14.703 15.992 17.459 19.214 20.68 21.45 21.898 22.168 22.302 22.346 22.344 22.31 22.259 22.201 22.112 21.985 21.865 21.772 21.673 21.56 21.457 21.356 21.247 21.116 20.99 20.861 20.735 20.631 20.513 20.384 20.257 20.126 20.03 19.929 19.772 19.674 19.564 19.509 19.395 19.26 19.119 19.045 18.775 18.786 18.678 18.576 18.372 18.255 18.122 17.999 17.864 17.691 17.473 16.719 -2 ,9928 ,TETRA ,17589726,Sat Nov 27 19:12:41 CET,Sat Nov 27 21:35:56 CET,0.0 0.394 0.653 0.879 1.084 1.242 1.391 1.538 1.808 1.936 2.065 2.115 2.453 2.58 2.804 2.999 3.188 3.283 3.459 3.628 3.888 4.066 4.232 4.461 4.694 4.916 5.122 5.321 5.576 5.837 6.113 6.442 6.743 7.047 7.418 7.815 8.158 8.536 8.963 9.424 9.895 10.408 11.021 11.648 12.374 13.197 14.162 15.231 16.472 17.965 19.753 21.174 21.904 22.282 22.512 22.639 22.661 22.608 22.548 22.465 22.357 22.26 22.164 22.04 21.904 21.775 21.641 21.522 21.404 21.274 21.147 21.039 20.913 20.768 20.654 20.535 20.412 20.286 20.146 20.048 19.948 19.784 19.672 19.555 19.497 19.367 19.216 19.056 18.971 18.685 18.666 18.565 18.459 18.222 18.091 17.944 17.792 17.611 17.378 17.083 16.508 -3 ,14621 ,TETRA ,17589727,Sat Nov 27 19:12:43 CET,Sat Nov 27 21:35:19 CET,0.0 0.534 0.865 1.09 1.249 1.409 1.548 1.672 1.923 2.057 2.196 2.217 2.524 2.616 2.825 3.038 3.221 3.311 3.497 3.675 3.924 4.082 4.242 4.476 4.708 4.935 5.144 5.341 5.608 5.873 6.141 6.468 6.758 7.037 7.367 7.741 8.117 8.557 9.022 9.489 9.98 10.535 11.199 11.866 12.634 13.474 14.452 15.576 16.869 18.378 20.178 21.607 22.432 22.916 23.159 23.278 23.327 23.314 23.248 23.149 23.035 22.919 22.795 22.65 22.518 22.404 22.275 22.156 22.053 21.948 21.835 21.734 21.624 21.508 21.421 21.336 21.243 21.125 21.009 20.93 20.829 20.663 20.552 20.435 20.373 20.257 20.133 19.992 19.911 19.639 19.656 19.565 19.477 19.314 19.203 19.066 18.91 18.737 18.563 18.279 17.609 -4 ,5355 ,TETRA ,17589728,Sat Nov 27 19:12:46 CET,Sat Nov 27 21:35:03 CET,0.0 0.42 0.66 0.841 0.977 1.1 1.25 1.411 1.666 1.785 1.9 1.905 2.21 2.317 2.517 2.698 2.877 2.963 3.132 3.294 3.501 3.643 3.804 4.033 4.24 4.443 4.65 4.849 5.099 5.338 5.568 5.854 6.149 6.436 6.757 7.111 7.453 7.811 8.196 8.625 9.047 9.503 10.103 10.733 11.45 12.277 13.269 14.392 15.702 17.322 19.217 20.61 21.353 21.78 22.006 22.099 22.124 22.125 22.096 22.027 21.942 21.852 21.737 21.618 21.506 21.398 21.268 21.144 21.037 20.907 20.761 20.637 20.508 20.374 20.268 20.148 20.026 19.902 19.759 19.664 19.566 19.393 19.257 19.11 19.036 18.906 18.779 18.63 18.541 18.258 18.266 18.16 18.052 17.825 17.694 17.542 17.39 17.234 17.074 16.89 16.395 -5 ,12007 ,TETRA ,17589729,Sat Nov 27 19:12:40 CET,Sat Nov 27 21:31:51 CET,0.0 0.753 0.989 1.185 1.363 1.524 1.682 1.835 2.12 2.232 2.34 2.357 2.676 2.776 2.97 3.15 3.322 3.415 3.597 3.767 4.014 4.173 4.334 4.563 4.776 4.989 5.204 5.409 5.665 5.916 6.163 6.47 6.758 7.049 7.394 7.772 8.142 8.539 8.954 9.403 9.887 10.418 11.032 11.665 12.396 13.207 14.15 15.252 16.551 18.07 19.849 21.254 22.021 22.452 22.702 22.816 22.858 22.882 22.872 22.814 22.711 22.604 22.508 22.395 22.27 22.157 22.035 21.903 21.78 21.658 21.507 21.373 21.238 21.095 20.994 20.879 20.745 20.61 20.474 20.374 20.26 20.066 19.929 19.796 19.73 19.597 19.459 19.286 19.178 18.873 18.824 18.696 18.569 18.264 18.095 17.935 17.775 17.587 17.348 17.08 16.532 -6 ,20819 ,TETRA ,17589730,Sat Nov 27 19:12:41 CET,Sat Nov 27 21:35:45 CET,0.0 0.507 0.714 0.894 1.065 1.244 1.391 1.512 1.745 1.864 1.983 1.993 2.306 2.404 2.601 2.788 2.972 3.059 3.219 3.38 3.621 3.783 3.946 4.18 4.394 4.604 4.822 5.03 5.299 5.56 5.801 6.092 6.381 6.648 6.951 7.296 7.62 7.98 8.394 8.847 9.314 9.839 10.449 11.062 11.792 12.631 13.595 14.685 15.986 17.501 19.293 20.744 21.493 21.854 22.05 22.16 22.179 22.117 22.041 21.944 21.85 21.754 21.636 21.491 21.341 21.213 21.073 20.916 20.775 20.632 20.493 20.375 20.233 20.096 20.004 19.898 19.773 19.632 19.491 19.402 19.306 19.15 19.033 18.915 18.854 18.729 18.588 18.42 18.337 18.078 18.104 17.998 17.896 17.686 17.564 17.433 17.276 17.082 16.871 16.643 15.941 -7 ,11673 ,TETRA ,17589731,Sat Nov 27 19:12:41 CET,Sat Nov 27 21:34:54 CET,0.0 0.476 0.723 0.915 1.108 1.31 1.491 1.637 1.886 2.005 2.117 2.143 2.462 2.571 2.787 2.999 3.206 3.301 3.473 3.649 3.918 4.095 4.268 4.502 4.728 4.956 5.168 5.369 5.624 5.877 6.129 6.428 6.722 7.013 7.348 7.724 8.089 8.501 8.956 9.434 9.941 10.509 11.175 11.84 12.583 13.426 14.41 15.516 16.807 18.345 20.203 21.653 22.416 22.828 23.048 23.159 23.19 23.173 23.141 23.079 22.984 22.873 22.766 22.655 22.537 22.408 22.256 22.125 22.012 21.893 21.775 21.675 21.558 21.407 21.277 21.143 21.0 20.851 20.685 20.562 20.439 20.251 20.123 19.992 19.921 19.763 19.588 19.425 19.355 19.092 19.11 19.018 18.933 18.724 18.601 18.465 18.324 18.179 17.956 17.539 16.444 -8 ,17212 ,TETRA ,17589732,Sat Nov 27 19:12:40 CET,Sat Nov 27 21:30:26 CET,0.0 0.684 0.984 1.226 1.415 1.584 1.745 1.902 2.189 2.331 2.474 2.53 2.855 2.976 3.201 3.404 3.597 3.693 3.89 4.09 4.374 4.548 4.716 4.972 5.21 5.417 5.625 5.843 6.125 6.398 6.656 6.974 7.289 7.59 7.926 8.296 8.667 9.069 9.492 9.949 10.449 11.016 11.68 12.334 13.073 13.903 14.85 15.925 17.234 18.792 20.621 22.012 22.751 23.138 23.316 23.393 23.429 23.423 23.371 23.294 23.194 23.082 22.971 22.855 22.737 22.619 22.475 22.33 22.192 22.062 21.92 21.789 21.66 21.504 21.379 21.263 21.15 21.035 20.902 20.801 20.701 20.538 20.414 20.291 20.23 20.105 19.974 19.82 19.726 19.445 19.454 19.347 19.222 18.967 18.836 18.699 18.537 18.346 18.146 17.88 17.166 -9 ,1161 ,TETRA ,17589733,Sat Nov 27 19:12:41 CET,Sat Nov 27 21:38:57 CET,0.0 0.462 0.705 0.947 1.147 1.321 1.491 1.643 1.941 2.085 2.214 2.233 2.559 2.674 2.887 3.092 3.295 3.388 3.571 3.753 4.02 4.188 4.353 4.588 4.807 5.022 5.243 5.458 5.73 5.988 6.239 6.541 6.823 7.102 7.431 7.794 8.141 8.527 8.942 9.386 9.864 10.419 11.08 11.748 12.496 13.321 14.283 15.384 16.695 18.163 19.876 21.166 21.858 22.218 22.328 22.319 22.289 22.213 22.14 22.059 21.948 21.834 21.699 21.56 21.428 21.301 21.155 21.02 20.898 20.757 20.595 20.459 20.329 20.201 20.097 19.975 19.843 19.711 19.57 19.471 19.375 19.215 19.088 18.953 18.883 18.743 18.612 18.46 18.374 18.097 18.115 18.014 17.894 17.656 17.543 17.406 17.259 17.098 16.87 16.593 15.908 -10 ,15730 ,TETRA ,17589734,Sat Nov 27 19:12:41 CET,Sat Nov 27 21:34:58 CET,0.0 0.442 0.746 0.991 1.212 1.392 1.551 1.704 1.957 2.079 2.214 2.267 2.589 2.7 2.913 3.113 3.319 3.424 3.622 3.805 4.077 4.258 4.426 4.667 4.895 5.116 5.332 5.55 5.846 6.121 6.363 6.652 6.931 7.202 7.527 7.879 8.211 8.583 8.995 9.442 9.91 10.449 11.079 11.704 12.438 13.286 14.286 15.415 16.727 18.259 20.073 21.448 22.149 22.563 22.804 22.904 22.916 22.874 22.805 22.699 22.591 22.499 22.373 22.243 22.122 21.987 21.804 21.642 21.52 21.379 21.225 21.107 20.98 20.844 20.729 20.604 20.477 20.331 20.186 20.091 19.985 19.82 19.689 19.543 19.469 19.329 19.194 19.036 18.956 18.673 18.653 18.529 18.426 18.229 18.111 17.98 17.82 17.649 17.427 17.137 16.633 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt deleted file mode 100644 index 9ac0da46..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23985 ,TETRA ,17589735,Sat Nov 27 19:13:41 CET,Sat Nov 27 21:39:46 CET,0.0 1.185 1.557 1.817 2.02 2.219 2.411 2.56 2.848 2.994 3.134 3.164 3.493 3.611 3.819 4.01 4.206 4.305 4.492 4.669 4.907 5.047 5.188 5.413 5.618 5.804 5.988 6.169 6.403 6.621 6.821 7.075 7.325 7.561 7.826 8.096 8.356 8.652 8.984 9.328 9.669 10.064 10.518 10.957 11.441 11.95 12.528 13.129 13.778 14.412 15.004 15.307 15.282 15.13 14.86 14.58 14.333 14.061 13.799 13.531 13.298 13.074 12.844 12.599 12.362 12.147 11.908 11.703 11.525 11.328 11.108 10.925 10.744 10.549 10.39 10.227 10.054 9.872 9.669 9.517 9.366 9.144 8.993 8.834 8.749 8.565 8.348 8.12 8.004 7.685 7.626 7.48 7.347 7.032 6.847 6.661 6.488 6.292 6.02 5.675 4.694 -2 ,4289 ,TETRA ,17589736,Sat Nov 27 19:13:41 CET,Sat Nov 27 21:41:25 CET,0.0 0.915 1.254 1.474 1.633 1.779 1.933 2.079 2.328 2.441 2.551 2.552 2.868 2.967 3.177 3.378 3.555 3.642 3.808 3.967 4.219 4.378 4.527 4.737 4.939 5.127 5.294 5.462 5.678 5.896 6.115 6.361 6.584 6.793 7.035 7.315 7.573 7.865 8.198 8.52 8.836 9.185 9.601 10.034 10.514 11.033 11.646 12.328 13.016 13.713 14.376 14.633 14.566 14.359 14.104 13.823 13.521 13.204 12.893 12.578 12.325 12.088 11.857 11.633 11.418 11.22 11.011 10.811 10.635 10.454 10.257 10.1 9.939 9.746 9.6 9.454 9.285 9.099 8.913 8.792 8.667 8.469 8.32 8.153 8.065 7.878 7.703 7.513 7.407 7.092 7.053 6.925 6.782 6.489 6.347 6.204 6.059 5.905 5.698 5.442 4.715 -3 ,16131 ,TETRA ,17589737,Sat Nov 27 19:13:41 CET,Sat Nov 27 21:34:18 CET,0.0 0.877 1.214 1.502 1.725 1.917 2.084 2.234 2.485 2.605 2.724 2.761 3.084 3.187 3.401 3.615 3.809 3.894 4.055 4.218 4.456 4.598 4.727 4.911 5.093 5.274 5.447 5.622 5.848 6.061 6.267 6.518 6.751 6.971 7.221 7.5 7.78 8.096 8.437 8.762 9.095 9.461 9.879 10.328 10.83 11.33 11.89 12.516 13.169 13.899 14.657 14.978 14.921 14.696 14.412 14.114 13.831 13.523 13.242 12.954 12.683 12.446 12.215 11.97 11.735 11.497 11.24 11.029 10.845 10.646 10.427 10.244 10.062 9.872 9.733 9.591 9.414 9.229 9.056 8.938 8.812 8.613 8.478 8.328 8.249 8.093 7.913 7.708 7.609 7.3 7.274 7.144 7.028 6.796 6.649 6.473 6.3 6.1 5.844 5.502 4.462 -4 ,7764 ,TETRA ,17589738,Sat Nov 27 19:14:40 CET,Sat Nov 27 21:37:47 CET,0.0 0.923 1.221 1.476 1.677 1.873 2.057 2.201 2.441 2.571 2.708 2.761 3.091 3.204 3.412 3.594 3.785 3.88 4.047 4.21 4.448 4.592 4.735 4.942 5.131 5.307 5.481 5.661 5.901 6.121 6.328 6.574 6.798 7.016 7.287 7.592 7.876 8.197 8.531 8.897 9.28 9.689 10.176 10.645 11.179 11.733 12.336 12.985 13.684 14.367 14.959 15.218 15.205 15.05 14.785 14.503 14.196 13.883 13.633 13.349 13.073 12.827 12.584 12.348 12.115 11.893 11.67 11.469 11.293 11.106 10.904 10.731 10.541 10.342 10.188 10.023 9.859 9.7 9.53 9.405 9.273 9.067 8.929 8.783 8.711 8.575 8.422 8.243 8.152 7.857 7.864 7.756 7.638 7.382 7.238 7.078 6.897 6.686 6.396 6.079 5.206 -5 ,16102 ,TETRA ,17589739,Sat Nov 27 19:13:41 CET,Sat Nov 27 21:33:34 CET,0.0 0.81 1.078 1.307 1.483 1.643 1.8 1.953 2.249 2.382 2.508 2.539 2.859 2.966 3.169 3.367 3.535 3.621 3.796 3.959 4.197 4.336 4.471 4.685 4.881 5.06 5.24 5.42 5.642 5.844 6.04 6.29 6.526 6.736 6.979 7.279 7.574 7.888 8.217 8.544 8.885 9.27 9.718 10.168 10.654 11.187 11.78 12.388 13.054 13.782 14.536 14.844 14.783 14.615 14.381 14.115 13.851 13.555 13.273 13.006 12.758 12.52 12.284 12.047 11.822 11.6 11.368 11.165 10.99 10.805 10.597 10.411 10.196 9.978 9.822 9.656 9.48 9.301 9.116 8.988 8.86 8.66 8.519 8.364 8.28 8.106 7.929 7.75 7.654 7.353 7.35 7.249 7.131 6.832 6.68 6.503 6.297 6.081 5.854 5.608 4.739 -6 ,22667 ,TETRA ,17589740,Sat Nov 27 19:13:41 CET,Sat Nov 27 21:37:40 CET,0.0 1.032 1.286 1.508 1.706 1.876 2.064 2.238 2.506 2.626 2.763 2.807 3.13 3.232 3.433 3.624 3.8 3.887 4.046 4.207 4.457 4.613 4.768 4.995 5.196 5.388 5.576 5.748 5.955 6.159 6.364 6.616 6.877 7.137 7.41 7.698 7.996 8.342 8.691 9.017 9.359 9.755 10.208 10.653 11.155 11.689 12.282 12.949 13.684 14.445 15.114 15.363 15.339 15.168 14.926 14.664 14.385 14.086 13.81 13.528 13.27 13.03 12.79 12.561 12.351 12.136 11.889 11.668 11.478 11.283 11.08 10.904 10.707 10.495 10.328 10.147 9.966 9.792 9.609 9.479 9.348 9.131 8.973 8.811 8.724 8.547 8.348 8.139 8.037 7.722 7.679 7.547 7.412 7.097 6.905 6.677 6.436 6.165 5.806 5.346 4.351 -7 ,2304 ,TETRA ,17589741,Sat Nov 27 19:13:41 CET,Sat Nov 27 21:37:27 CET,0.0 0.795 1.123 1.403 1.634 1.844 2.017 2.154 2.44 2.585 2.716 2.765 3.097 3.204 3.405 3.603 3.79 3.878 4.06 4.235 4.471 4.624 4.772 4.991 5.197 5.394 5.592 5.77 6.0 6.222 6.431 6.686 6.936 7.169 7.445 7.783 8.089 8.408 8.762 9.135 9.513 9.939 10.397 10.836 11.344 11.875 12.459 13.075 13.755 14.466 15.148 15.444 15.385 15.177 14.923 14.63 14.332 14.048 13.789 13.493 13.216 12.959 12.707 12.467 12.234 12.007 11.758 11.528 11.327 11.125 10.916 10.734 10.548 10.36 10.196 10.022 9.857 9.688 9.51 9.38 9.238 9.022 8.883 8.731 8.642 8.454 8.274 8.077 7.973 7.66 7.609 7.471 7.317 7.005 6.858 6.681 6.485 6.259 5.928 5.504 4.388 -8 ,12495 ,TETRA ,17589742,Sat Nov 27 19:13:41 CET,Sat Nov 27 21:31:28 CET,0.0 0.776 1.087 1.308 1.508 1.69 1.861 2.027 2.296 2.424 2.547 2.575 2.898 3.004 3.2 3.378 3.55 3.637 3.794 3.954 4.202 4.352 4.493 4.705 4.922 5.122 5.304 5.479 5.695 5.889 6.097 6.354 6.586 6.82 7.071 7.357 7.636 7.911 8.221 8.546 8.884 9.287 9.742 10.191 10.722 11.293 11.906 12.586 13.276 13.901 14.537 14.815 14.757 14.614 14.406 14.118 13.829 13.58 13.34 13.039 12.746 12.483 12.247 12.016 11.806 11.607 11.373 11.164 10.981 10.774 10.551 10.369 10.182 9.995 9.852 9.711 9.569 9.412 9.251 9.137 9.004 8.782 8.64 8.492 8.413 8.263 8.097 7.905 7.801 7.493 7.468 7.34 7.206 6.901 6.733 6.569 6.402 6.203 5.947 5.588 4.586 -9 ,20213 ,TETRA ,17589743,Sat Nov 27 19:13:41 CET,Sat Nov 27 21:40:17 CET,0.0 1.018 1.397 1.732 1.983 2.18 2.35 2.515 2.806 2.929 3.06 3.137 3.474 3.591 3.822 4.036 4.233 4.328 4.509 4.678 4.898 5.036 5.172 5.385 5.601 5.801 5.993 6.179 6.406 6.626 6.851 7.111 7.354 7.586 7.855 8.161 8.443 8.742 9.072 9.419 9.772 10.178 10.636 11.048 11.529 12.094 12.731 13.408 14.096 14.779 15.471 15.76 15.715 15.537 15.267 14.992 14.708 14.414 14.161 13.881 13.608 13.35 13.102 12.877 12.665 12.475 12.278 12.081 11.909 11.731 11.533 11.369 11.192 11.002 10.862 10.711 10.546 10.375 10.192 10.059 9.922 9.714 9.574 9.435 9.364 9.208 9.042 8.862 8.766 8.472 8.49 8.383 8.279 8.067 7.941 7.793 7.64 7.467 7.273 7.024 6.256 -10 ,23136 ,TETRA ,17589744,Sat Nov 27 19:13:41 CET,Sat Nov 27 21:36:08 CET,0.0 0.688 0.98 1.192 1.387 1.56 1.708 1.85 2.128 2.261 2.389 2.415 2.722 2.822 3.022 3.204 3.382 3.468 3.628 3.769 3.984 4.129 4.267 4.468 4.655 4.844 5.04 5.22 5.449 5.664 5.865 6.124 6.366 6.586 6.84 7.119 7.386 7.684 8.001 8.322 8.676 9.101 9.578 10.036 10.548 11.09 11.691 12.345 13.047 13.74 14.455 14.827 14.82 14.64 14.363 14.064 13.806 13.558 13.325 13.071 12.824 12.585 12.329 12.057 11.797 11.569 11.331 11.135 10.97 10.79 10.599 10.431 10.265 10.086 9.943 9.796 9.625 9.438 9.244 9.112 8.972 8.758 8.603 8.44 8.359 8.176 7.972 7.761 7.655 7.344 7.324 7.204 7.08 6.812 6.645 6.458 6.283 6.113 5.922 5.611 4.855 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt deleted file mode 100644 index bae9af77..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21131 ,TETRA ,17589745,Sat Nov 27 19:13:41 CET,Sat Nov 27 21:33:32 CET,0.0 1.75 2.128 2.339 2.533 2.699 2.845 2.987 3.248 3.364 3.481 3.502 3.825 3.926 4.126 4.32 4.506 4.588 4.736 4.884 5.11 5.249 5.377 5.564 5.739 5.917 6.096 6.255 6.465 6.68 6.895 7.16 7.399 7.628 7.893 8.187 8.485 8.786 9.084 9.398 9.716 10.077 10.478 10.885 11.349 11.839 12.407 13.02 13.673 14.304 14.77 14.863 14.64 14.294 13.924 13.567 13.183 12.761 12.411 12.08 11.771 11.476 11.2 10.942 10.692 10.45 10.176 9.926 9.709 9.466 9.184 8.944 8.721 8.495 8.301 8.091 7.903 7.737 7.538 7.383 7.226 6.964 6.768 6.574 6.472 6.245 6.01 5.764 5.629 5.282 5.221 5.074 4.923 4.573 4.366 4.151 3.909 3.607 3.277 2.828 1.162 -2 ,11172 ,TETRA ,17589746,Sat Nov 27 19:13:43 CET,Sat Nov 27 21:29:51 CET,0.0 1.481 1.729 1.971 2.147 2.291 2.439 2.581 2.84 2.968 3.094 3.096 3.414 3.512 3.701 3.893 4.086 4.181 4.375 4.554 4.782 4.925 5.058 5.249 5.435 5.615 5.778 5.937 6.168 6.396 6.598 6.816 7.028 7.245 7.497 7.766 8.04 8.365 8.693 9.029 9.384 9.784 10.24 10.678 11.193 11.742 12.32 12.945 13.591 14.232 14.915 15.181 15.101 14.878 14.551 14.199 13.849 13.507 13.222 12.942 12.664 12.421 12.198 11.959 11.732 11.526 11.311 11.122 10.949 10.743 10.506 10.313 10.125 9.924 9.758 9.585 9.391 9.188 8.964 8.796 8.631 8.386 8.206 8.001 7.884 7.652 7.445 7.224 7.115 6.779 6.688 6.516 6.349 5.998 5.798 5.56 5.287 4.991 4.606 4.133 2.814 -3 ,30935 ,TETRA ,17589747,Sat Nov 27 19:13:43 CET,Sat Nov 27 21:37:45 CET,0.0 0.788 1.074 1.285 1.436 1.579 1.733 1.872 2.121 2.245 2.363 2.359 2.688 2.787 2.969 3.147 3.312 3.392 3.544 3.692 3.921 4.056 4.184 4.374 4.557 4.737 4.907 5.081 5.309 5.525 5.737 5.976 6.196 6.416 6.684 6.978 7.252 7.537 7.829 8.165 8.512 8.898 9.353 9.771 10.271 10.787 11.339 11.968 12.655 13.405 14.163 14.49 14.478 14.288 13.991 13.673 13.354 13.038 12.74 12.425 12.154 11.893 11.628 11.377 11.139 10.912 10.662 10.453 10.286 10.093 9.888 9.723 9.498 9.235 9.048 8.829 8.586 8.372 8.169 8.024 7.876 7.639 7.466 7.3 7.219 7.046 6.869 6.666 6.554 6.234 6.236 6.118 6.006 5.76 5.633 5.488 5.29 5.038 4.744 4.38 2.765 -4 ,24425 ,TETRA ,17589749,Sat Nov 27 19:14:40 CET,Sat Nov 27 21:37:43 CET,0.0 0.817 1.161 1.341 1.538 1.73 1.89 2.035 2.291 2.417 2.54 2.563 2.898 3.006 3.189 3.358 3.517 3.591 3.744 3.892 4.108 4.26 4.403 4.594 4.782 4.959 5.133 5.299 5.512 5.72 5.924 6.177 6.399 6.594 6.825 7.093 7.356 7.654 7.965 8.299 8.663 9.079 9.544 9.975 10.468 11.003 11.594 12.202 12.803 13.429 13.999 14.159 14.006 13.711 13.356 12.961 12.575 12.194 11.848 11.498 11.194 10.922 10.637 10.354 10.101 9.863 9.602 9.365 9.167 8.967 8.756 8.583 8.402 8.207 8.053 7.889 7.723 7.556 7.371 7.236 7.08 6.807 6.625 6.448 6.356 6.158 5.941 5.706 5.592 5.257 5.236 5.117 4.994 4.727 4.567 4.373 4.141 3.889 3.59 3.158 1.58 -5 ,19333 ,TETRA ,17589750,Sat Nov 27 19:14:42 CET,Sat Nov 27 21:38:00 CET,0.0 0.862 1.107 1.316 1.508 1.695 1.859 2.017 2.29 2.422 2.555 2.563 2.889 3.007 3.233 3.45 3.639 3.727 3.901 4.047 4.243 4.378 4.51 4.694 4.887 5.086 5.262 5.429 5.644 5.846 6.035 6.284 6.513 6.713 6.967 7.276 7.547 7.819 8.129 8.473 8.81 9.172 9.613 10.039 10.534 11.051 11.624 12.285 13.009 13.776 14.517 14.755 14.575 14.268 13.895 13.49 13.113 12.736 12.392 12.042 11.723 11.42 11.107 10.808 10.549 10.32 10.068 9.833 9.631 9.42 9.187 8.989 8.775 8.524 8.335 8.152 7.956 7.739 7.515 7.361 7.196 6.929 6.746 6.563 6.468 6.285 6.079 5.835 5.716 5.37 5.297 5.17 5.032 4.719 4.539 4.313 4.036 3.71 3.342 2.931 1.463 -6 ,30200 ,TETRA ,17589751,Sat Nov 27 19:14:45 CET,Sat Nov 27 21:35:32 CET,0.0 0.726 1.016 1.206 1.378 1.537 1.685 1.819 2.059 2.174 2.289 2.306 2.655 2.771 2.986 3.181 3.362 3.448 3.608 3.761 3.994 4.15 4.305 4.517 4.71 4.901 5.086 5.268 5.5 5.719 5.941 6.196 6.434 6.68 6.963 7.262 7.551 7.86 8.192 8.524 8.858 9.274 9.755 10.202 10.707 11.262 11.851 12.498 13.246 13.997 14.607 14.813 14.678 14.388 14.035 13.687 13.395 13.09 12.768 12.413 12.09 11.79 11.503 11.235 10.99 10.752 10.437 10.16 9.941 9.699 9.448 9.237 9.024 8.806 8.631 8.435 8.215 8.003 7.79 7.617 7.434 7.134 6.93 6.748 6.653 6.449 6.225 5.966 5.822 5.459 5.367 5.216 5.062 4.694 4.501 4.299 4.094 3.873 3.571 3.132 1.677 -7 ,30264 ,TETRA ,17589752,Sat Nov 27 19:14:40 CET,Sat Nov 27 21:35:44 CET,0.0 0.406 0.641 0.849 1.027 1.199 1.342 1.48 1.757 1.883 1.984 1.962 2.285 2.388 2.577 2.736 2.871 2.939 3.083 3.22 3.432 3.571 3.708 3.907 4.09 4.249 4.396 4.545 4.747 4.945 5.119 5.333 5.541 5.732 5.963 6.231 6.494 6.769 7.061 7.376 7.706 8.101 8.575 9.031 9.546 10.1 10.669 11.272 11.943 12.643 13.316 13.577 13.435 13.134 12.79 12.433 12.034 11.643 11.326 10.997 10.692 10.407 10.115 9.822 9.552 9.306 9.017 8.732 8.503 8.272 8.031 7.826 7.597 7.362 7.18 6.99 6.789 6.559 6.297 6.115 5.923 5.622 5.423 5.212 5.096 4.847 4.589 4.351 4.219 3.866 3.78 3.614 3.457 3.102 2.888 2.628 2.342 2.028 1.647 1.216 -0.466 -8 ,26709 ,TETRA ,17589753,Sat Nov 27 19:14:40 CET,Sat Nov 27 21:35:54 CET,0.0 0.747 1.038 1.296 1.507 1.685 1.835 1.964 2.203 2.323 2.445 2.447 2.777 2.885 3.076 3.271 3.46 3.548 3.713 3.876 4.112 4.253 4.38 4.588 4.81 5.008 5.187 5.357 5.583 5.812 6.025 6.278 6.513 6.744 7.016 7.309 7.607 7.938 8.266 8.595 8.947 9.335 9.743 10.15 10.653 11.197 11.773 12.368 13.055 13.766 14.349 14.545 14.432 14.165 13.816 13.439 13.095 12.768 12.44 12.087 11.796 11.529 11.279 11.024 10.771 10.545 10.285 10.023 9.806 9.587 9.341 9.137 8.924 8.702 8.533 8.348 8.151 7.948 7.728 7.575 7.423 7.168 6.999 6.834 6.749 6.559 6.325 6.069 5.938 5.593 5.53 5.371 5.201 4.868 4.707 4.505 4.285 4.056 3.775 3.404 1.869 -9 ,20183 ,TETRA ,17589754,Sat Nov 27 19:14:42 CET,Sat Nov 27 21:36:52 CET,0.0 0.473 0.717 0.912 1.101 1.269 1.421 1.575 1.862 1.991 2.117 2.135 2.475 2.592 2.806 2.989 3.167 3.262 3.439 3.617 3.872 4.026 4.169 4.363 4.554 4.742 4.933 5.118 5.346 5.567 5.764 5.987 6.221 6.457 6.719 7.0 7.273 7.588 7.924 8.27 8.629 9.027 9.498 9.973 10.498 11.038 11.634 12.278 12.967 13.616 14.115 14.281 14.083 13.788 13.481 13.17 12.885 12.578 12.276 11.914 11.58 11.269 10.911 10.576 10.283 10.009 9.721 9.483 9.299 9.068 8.779 8.549 8.338 8.123 7.947 7.773 7.601 7.406 7.2 7.042 6.855 6.551 6.338 6.135 6.034 5.827 5.624 5.422 5.306 4.948 4.876 4.727 4.572 4.251 4.078 3.884 3.664 3.411 3.128 2.818 1.232 -10 ,16212 ,TETRA ,17589755,Sat Nov 27 19:14:42 CET,Sat Nov 27 21:34:28 CET,0.0 1.453 1.726 1.961 2.148 2.306 2.46 2.636 2.957 3.096 3.242 3.279 3.617 3.73 3.958 4.154 4.321 4.406 4.568 4.726 4.947 5.087 5.224 5.421 5.615 5.8 5.975 6.153 6.397 6.613 6.804 7.037 7.262 7.469 7.707 7.993 8.278 8.588 8.924 9.276 9.636 10.021 10.459 10.88 11.35 11.856 12.421 13.027 13.639 14.282 14.878 15.01 14.833 14.521 14.168 13.802 13.466 13.146 12.823 12.502 12.239 12.007 11.786 11.558 11.327 11.113 10.871 10.63 10.422 10.196 9.924 9.682 9.427 9.165 8.965 8.76 8.533 8.278 8.027 7.863 7.7 7.445 7.254 7.051 6.946 6.721 6.511 6.308 6.184 5.842 5.778 5.623 5.465 5.124 4.936 4.724 4.472 4.179 3.824 3.347 2.001 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index fbc25883..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8168 ,TETRA ,17589756,Sat Nov 27 19:14:42 CET,Sat Nov 27 21:38:28 CET,0.0 1.052 1.449 1.762 2.017 2.239 2.442 2.63 2.979 3.123 3.237 3.245 3.573 3.674 3.868 4.058 4.239 4.328 4.494 4.658 4.911 5.066 5.215 5.444 5.672 5.887 6.082 6.266 6.507 6.733 6.944 7.217 7.474 7.698 7.962 8.257 8.542 8.872 9.223 9.583 9.959 10.387 10.883 11.376 11.944 12.53 13.145 13.817 14.615 15.509 16.323 16.801 16.896 16.746 16.547 16.287 16.021 15.776 15.517 15.216 14.93 14.661 14.383 14.125 13.894 13.685 13.473 13.271 13.074 12.856 12.629 12.45 12.272 12.091 11.937 11.77 11.611 11.448 11.277 11.146 11.011 10.821 10.674 10.522 10.453 10.306 10.131 9.943 9.85 9.543 9.525 9.401 9.277 9.018 8.854 8.674 8.493 8.292 8.044 7.696 6.827 -2 ,3550 ,TETRA ,17589757,Sat Nov 27 19:14:42 CET,Sat Nov 27 21:29:21 CET,0.0 1.183 1.487 1.68 1.866 2.032 2.193 2.352 2.642 2.761 2.876 2.906 3.24 3.353 3.581 3.784 3.97 4.055 4.219 4.398 4.668 4.833 4.987 5.212 5.424 5.624 5.82 5.997 6.217 6.431 6.64 6.902 7.149 7.393 7.676 7.981 8.285 8.615 8.984 9.391 9.784 10.211 10.699 11.173 11.736 12.368 13.061 13.782 14.547 15.362 16.254 16.764 16.812 16.705 16.521 16.264 15.981 15.728 15.472 15.17 14.919 14.673 14.414 14.159 13.908 13.676 13.437 13.234 13.059 12.864 12.649 12.482 12.32 12.157 12.021 11.856 11.687 11.519 11.34 11.21 11.067 10.829 10.673 10.507 10.406 10.174 9.927 9.691 9.575 9.246 9.217 9.072 8.907 8.572 8.375 8.146 7.905 7.641 7.334 6.949 5.834 -3 ,647 ,TETRA ,17589758,Sat Nov 27 19:14:42 CET,Sat Nov 27 21:23:27 CET,0.0 0.878 1.139 1.369 1.569 1.731 1.868 1.999 2.252 2.369 2.484 2.495 2.825 2.924 3.128 3.332 3.524 3.618 3.798 3.973 4.24 4.418 4.578 4.795 5.0 5.201 5.401 5.593 5.837 6.069 6.282 6.542 6.81 7.072 7.397 7.763 8.086 8.43 8.815 9.238 9.671 10.135 10.644 11.181 11.776 12.377 13.025 13.727 14.541 15.332 16.119 16.523 16.548 16.458 16.309 16.099 15.864 15.612 15.347 15.071 14.827 14.599 14.381 14.17 13.971 13.785 13.571 13.362 13.171 12.969 12.75 12.566 12.398 12.233 12.091 11.936 11.784 11.628 11.461 11.337 11.208 11.01 10.849 10.675 10.592 10.423 10.242 10.065 9.968 9.649 9.614 9.481 9.349 9.071 8.922 8.761 8.607 8.452 8.258 7.941 7.089 -4 ,4923 ,TETRA ,17589759,Sat Nov 27 19:14:42 CET,Sat Nov 27 21:37:09 CET,0.0 0.667 0.948 1.151 1.333 1.496 1.651 1.781 2.026 2.156 2.285 2.297 2.628 2.739 2.932 3.098 3.255 3.334 3.501 3.659 3.864 4.004 4.146 4.357 4.565 4.75 4.93 5.12 5.367 5.594 5.81 6.083 6.339 6.566 6.825 7.139 7.464 7.818 8.175 8.55 8.956 9.406 9.912 10.416 10.964 11.539 12.174 12.862 13.662 14.581 15.462 15.892 15.976 15.869 15.71 15.52 15.306 15.088 14.866 14.61 14.374 14.153 13.922 13.692 13.471 13.248 13.002 12.789 12.61 12.425 12.237 12.072 11.89 11.691 11.537 11.379 11.227 11.075 10.894 10.771 10.655 10.489 10.36 10.213 10.142 9.991 9.836 9.677 9.585 9.267 9.273 9.171 9.068 8.845 8.692 8.524 8.364 8.173 7.927 7.578 6.637 -5 ,27094 ,TETRA ,17589760,Sat Nov 27 19:14:42 CET,Sat Nov 27 21:39:38 CET,0.0 0.54 0.829 1.077 1.295 1.489 1.677 1.874 2.22 2.356 2.47 2.45 2.771 2.875 3.068 3.256 3.439 3.536 3.724 3.9 4.149 4.297 4.443 4.662 4.867 5.061 5.247 5.43 5.681 5.925 6.147 6.421 6.684 6.932 7.23 7.561 7.88 8.235 8.625 9.04 9.465 9.921 10.43 10.917 11.489 12.128 12.802 13.516 14.301 15.145 15.959 16.387 16.488 16.409 16.231 15.992 15.683 15.37 15.091 14.784 14.531 14.334 14.13 13.922 13.728 13.534 13.326 13.125 12.946 12.752 12.53 12.356 12.191 12.01 11.859 11.709 11.561 11.405 11.247 11.129 10.997 10.786 10.643 10.503 10.43 10.263 10.083 9.894 9.792 9.476 9.46 9.344 9.206 8.882 8.716 8.551 8.364 8.154 7.916 7.615 6.447 -6 ,6512 ,TETRA ,17589761,Sat Nov 27 19:14:45 CET,Sat Nov 27 21:38:13 CET,0.0 0.923 1.191 1.39 1.571 1.754 1.947 2.11 2.339 2.465 2.595 2.598 2.932 3.046 3.27 3.494 3.686 3.774 3.939 4.096 4.32 4.47 4.617 4.824 5.017 5.206 5.402 5.602 5.863 6.103 6.311 6.549 6.787 7.019 7.28 7.57 7.844 8.118 8.429 8.796 9.182 9.584 10.043 10.525 11.059 11.627 12.286 12.977 13.783 14.699 15.587 16.023 16.022 15.751 15.365 14.985 14.642 14.28 13.916 13.513 13.133 12.787 12.482 12.172 11.857 11.579 11.29 11.028 10.804 10.582 10.351 10.156 9.939 9.709 9.548 9.393 9.225 9.019 8.802 8.661 8.504 8.262 8.086 7.922 7.841 7.635 7.41 7.171 7.043 6.708 6.635 6.481 6.323 6.033 5.873 5.689 5.496 5.313 5.049 4.62 2.809 -7 ,25726 ,TETRA ,17589762,Sat Nov 27 19:14:42 CET,Sat Nov 27 21:40:12 CET,0.0 0.845 1.107 1.341 1.561 1.751 1.915 2.075 2.355 2.469 2.577 2.583 2.912 3.02 3.232 3.413 3.563 3.64 3.807 3.969 4.218 4.381 4.524 4.738 4.955 5.165 5.353 5.53 5.772 6.009 6.228 6.502 6.774 7.025 7.31 7.641 7.956 8.277 8.622 9.004 9.391 9.811 10.293 10.761 11.293 11.903 12.588 13.33 14.128 14.97 15.895 16.385 16.475 16.393 16.216 16.0 15.779 15.514 15.245 14.983 14.756 14.525 14.28 14.052 13.83 13.613 13.391 13.189 13.004 12.8 12.578 12.394 12.199 11.991 11.818 11.639 11.463 11.273 11.084 10.955 10.807 10.564 10.397 10.231 10.145 9.942 9.738 9.539 9.433 9.112 9.082 8.943 8.795 8.456 8.273 8.08 7.834 7.569 7.302 6.972 6.428 -8 ,21393 ,TETRA ,17589763,Sat Nov 27 19:14:42 CET,Sat Nov 27 21:35:41 CET,0.0 0.863 1.124 1.34 1.541 1.713 1.863 1.992 2.224 2.341 2.451 2.425 2.748 2.856 3.054 3.245 3.436 3.529 3.702 3.861 4.098 4.264 4.418 4.624 4.812 5.0 5.186 5.359 5.601 5.839 6.05 6.305 6.561 6.798 7.082 7.399 7.682 7.981 8.308 8.671 9.062 9.509 10.004 10.469 11.013 11.587 12.216 12.864 13.606 14.449 15.235 15.745 15.911 15.802 15.585 15.353 15.087 14.813 14.561 14.265 14.009 13.773 13.521 13.276 13.044 12.839 12.613 12.413 12.241 12.048 11.844 11.671 11.475 11.264 11.114 10.956 10.776 10.59 10.409 10.285 10.162 9.972 9.816 9.648 9.561 9.38 9.203 9.031 8.934 8.603 8.552 8.415 8.282 7.997 7.832 7.644 7.458 7.278 7.04 6.707 5.534 -9 ,10191 ,TETRA ,17589764,Sat Nov 27 19:14:44 CET,Sat Nov 27 21:33:12 CET,0.0 0.489 0.761 0.981 1.146 1.291 1.437 1.599 1.869 1.983 2.101 2.104 2.43 2.53 2.723 2.911 3.101 3.204 3.413 3.614 3.901 4.068 4.224 4.453 4.667 4.883 5.103 5.318 5.602 5.859 6.088 6.353 6.616 6.879 7.182 7.518 7.836 8.182 8.54 8.926 9.331 9.76 10.243 10.724 11.269 11.856 12.555 13.315 14.147 15.088 15.957 16.406 16.429 16.283 16.114 15.91 15.635 15.342 15.103 14.846 14.6 14.383 14.176 13.963 13.749 13.547 13.321 13.105 12.909 12.689 12.465 12.294 12.115 11.919 11.765 11.603 11.436 11.259 11.072 10.946 10.815 10.607 10.462 10.314 10.239 10.071 9.885 9.692 9.573 9.233 9.182 9.038 8.887 8.57 8.404 8.226 8.041 7.832 7.603 7.278 6.317 -10 ,23689 ,TETRA ,17589765,Sat Nov 27 19:14:43 CET,Sat Nov 27 21:20:23 CET,0.0 1.033 1.277 1.525 1.737 1.898 2.067 2.22 2.472 2.6 2.717 2.7 3.015 3.119 3.314 3.482 3.664 3.761 3.935 4.098 4.33 4.479 4.628 4.846 5.051 5.246 5.43 5.609 5.843 6.064 6.282 6.558 6.827 7.081 7.359 7.666 7.973 8.297 8.635 9.0 9.383 9.806 10.288 10.768 11.3 11.875 12.523 13.215 14.005 14.875 15.687 16.063 16.116 16.02 15.856 15.666 15.42 15.145 14.889 14.605 14.344 14.096 13.861 13.643 13.42 13.21 12.994 12.778 12.591 12.393 12.174 12.002 11.836 11.652 11.494 11.334 11.16 10.966 10.77 10.636 10.496 10.27 10.113 9.944 9.857 9.684 9.499 9.31 9.204 8.87 8.802 8.657 8.526 8.223 8.036 7.824 7.62 7.376 7.064 6.699 5.728 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt deleted file mode 100644 index 5d36bf3b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15851 ,TETRA ,17589766,Sat Nov 27 19:14:42 CET,Sat Nov 27 21:31:11 CET,0.0 1.412 1.937 2.265 2.519 2.731 2.935 3.118 3.421 3.561 3.69 3.7 4.03 4.14 4.357 4.569 4.762 4.854 5.037 5.214 5.448 5.597 5.749 5.974 6.197 6.413 6.616 6.81 7.058 7.295 7.526 7.81 8.08 8.33 8.62 8.949 9.248 9.566 9.919 10.312 10.734 11.192 11.7 12.201 12.762 13.353 14.051 14.859 15.773 16.829 17.993 18.731 18.992 19.013 18.926 18.769 18.573 18.365 18.158 17.907 17.683 17.485 17.255 17.029 16.831 16.644 16.434 16.244 16.084 15.924 15.752 15.6 15.432 15.261 15.14 15.007 14.864 14.722 14.557 14.441 14.32 14.116 13.988 13.871 13.8 13.641 13.49 13.33 13.24 12.937 12.95 12.844 12.733 12.492 12.357 12.19 12.0 11.805 11.573 11.288 10.552 -2 ,25006 ,TETRA ,17589767,Sat Nov 27 19:14:43 CET,Sat Nov 27 21:39:55 CET,0.0 0.919 1.223 1.454 1.663 1.868 2.075 2.245 2.561 2.704 2.838 2.888 3.231 3.353 3.584 3.808 4.0 4.088 4.26 4.429 4.688 4.857 5.034 5.281 5.506 5.732 5.932 6.126 6.381 6.622 6.855 7.126 7.375 7.609 7.883 8.186 8.475 8.79 9.125 9.469 9.848 10.29 10.797 11.317 11.92 12.555 13.24 14.035 14.94 15.903 16.973 17.656 17.862 17.853 17.778 17.645 17.428 17.211 17.027 16.819 16.619 16.43 16.261 16.081 15.889 15.712 15.525 15.355 15.201 15.042 14.868 14.712 14.551 14.387 14.256 14.116 13.977 13.832 13.681 13.578 13.463 13.275 13.155 13.024 12.951 12.812 12.656 12.489 12.399 12.101 12.139 12.037 11.926 11.698 11.574 11.433 11.27 11.096 10.864 10.588 9.426 -3 ,17425 ,TETRA ,17589768,Sat Nov 27 19:14:43 CET,Sat Nov 27 21:37:35 CET,0.0 0.805 1.156 1.416 1.647 1.832 2.014 2.17 2.433 2.564 2.68 2.672 3.002 3.108 3.291 3.47 3.648 3.737 3.914 4.101 4.363 4.513 4.666 4.895 5.109 5.306 5.495 5.675 5.909 6.145 6.368 6.634 6.879 7.116 7.387 7.682 8.005 8.368 8.724 9.104 9.491 9.919 10.43 10.932 11.495 12.117 12.828 13.585 14.449 15.404 16.382 16.94 17.105 17.093 16.991 16.841 16.657 16.458 16.269 16.051 15.835 15.618 15.402 15.213 15.043 14.875 14.68 14.506 14.354 14.188 14.006 13.846 13.68 13.502 13.355 13.209 13.05 12.874 12.703 12.587 12.462 12.261 12.118 11.982 11.913 11.769 11.606 11.421 11.326 11.016 11.011 10.903 10.799 10.525 10.363 10.211 10.049 9.88 9.674 9.43 8.737 -4 ,5798 ,TETRA ,17589769,Sat Nov 27 19:14:43 CET,Sat Nov 27 21:40:04 CET,0.0 0.71 1.006 1.275 1.497 1.683 1.862 2.024 2.317 2.456 2.587 2.598 2.911 3.011 3.22 3.41 3.579 3.663 3.836 4.012 4.273 4.444 4.605 4.823 5.036 5.247 5.446 5.638 5.877 6.102 6.326 6.6 6.866 7.126 7.418 7.741 8.067 8.443 8.835 9.216 9.606 10.07 10.639 11.208 11.85 12.564 13.409 14.313 15.3 16.397 17.541 18.199 18.356 18.359 18.278 18.138 17.943 17.736 17.558 17.343 17.142 16.946 16.743 16.543 16.348 16.162 15.964 15.786 15.635 15.469 15.28 15.13 14.983 14.822 14.69 14.557 14.418 14.25 14.072 13.961 13.854 13.68 13.558 13.437 13.367 13.222 13.08 12.905 12.812 12.51 12.517 12.405 12.295 12.084 11.961 11.828 11.661 11.474 11.264 10.995 10.292 -5 ,20161 ,TETRA ,17589770,Sat Nov 27 19:14:43 CET,Sat Nov 27 21:24:51 CET,0.0 1.109 1.43 1.677 1.909 2.084 2.222 2.374 2.668 2.794 2.922 2.944 3.283 3.386 3.583 3.781 3.982 4.075 4.25 4.413 4.65 4.807 4.961 5.187 5.392 5.582 5.764 5.934 6.172 6.409 6.63 6.909 7.192 7.446 7.726 8.037 8.33 8.666 9.046 9.444 9.85 10.309 10.845 11.363 11.946 12.596 13.306 14.081 14.955 15.885 16.802 17.316 17.454 17.407 17.281 17.088 16.874 16.643 16.411 16.157 15.901 15.657 15.426 15.212 15.005 14.814 14.613 14.434 14.284 14.119 13.916 13.739 13.567 13.393 13.263 13.12 12.965 12.811 12.643 12.521 12.397 12.2 12.05 11.899 11.823 11.656 11.49 11.32 11.228 10.913 10.912 10.796 10.671 10.395 10.242 10.083 9.926 9.737 9.515 9.177 7.876 -6 ,30899 ,TETRA ,17589771,Sat Nov 27 19:14:43 CET,Sat Nov 27 21:36:28 CET,0.0 0.8 1.117 1.357 1.584 1.82 2.022 2.192 2.498 2.622 2.733 2.73 3.053 3.158 3.372 3.582 3.774 3.863 4.042 4.218 4.475 4.634 4.778 4.975 5.164 5.35 5.545 5.734 5.966 6.184 6.38 6.629 6.883 7.133 7.426 7.743 8.048 8.379 8.714 9.067 9.445 9.883 10.399 10.891 11.442 12.061 12.802 13.627 14.515 15.49 16.464 17.081 17.278 17.271 17.2 17.051 16.881 16.711 16.514 16.289 16.081 15.893 15.703 15.507 15.331 15.153 14.96 14.8 14.651 14.49 14.323 14.183 14.029 13.852 13.719 13.585 13.43 13.267 13.1 12.987 12.868 12.681 12.547 12.393 12.316 12.158 11.986 11.789 11.685 11.388 11.4 11.27 11.121 10.851 10.723 10.584 10.418 10.226 9.988 9.684 8.561 -7 ,8570 ,TETRA ,17589772,Sat Nov 27 19:14:46 CET,Sat Nov 27 21:36:45 CET,0.0 0.915 1.216 1.489 1.739 1.948 2.117 2.285 2.63 2.774 2.898 2.9 3.225 3.338 3.565 3.787 3.99 4.083 4.263 4.436 4.671 4.822 4.973 5.2 5.421 5.621 5.831 6.037 6.282 6.514 6.738 7.018 7.288 7.539 7.827 8.16 8.488 8.847 9.21 9.586 9.992 10.466 11.017 11.554 12.182 12.852 13.607 14.446 15.326 16.264 17.282 17.798 17.899 17.856 17.691 17.496 17.26 17.031 16.815 16.54 16.32 16.119 15.908 15.683 15.468 15.266 15.044 14.851 14.679 14.499 14.321 14.176 14.032 13.885 13.754 13.617 13.483 13.341 13.188 13.088 12.976 12.78 12.634 12.48 12.406 12.258 12.103 11.941 11.861 11.558 11.57 11.478 11.363 11.1 10.981 10.856 10.721 10.573 10.37 10.087 9.138 -8 ,8336 ,TETRA ,17589773,Sat Nov 27 19:14:43 CET,Sat Nov 27 21:36:42 CET,0.0 0.9 1.099 1.259 1.41 1.591 1.781 1.935 2.22 2.354 2.479 2.478 2.802 2.906 3.097 3.283 3.467 3.561 3.745 3.915 4.143 4.295 4.451 4.67 4.889 5.095 5.299 5.488 5.709 5.927 6.136 6.395 6.655 6.909 7.196 7.549 7.882 8.201 8.535 8.909 9.318 9.759 10.28 10.82 11.424 12.061 12.761 13.516 14.422 15.461 16.533 17.244 17.493 17.537 17.466 17.323 17.143 16.943 16.763 16.559 16.347 16.123 15.91 15.693 15.494 15.321 15.129 14.954 14.792 14.626 14.453 14.295 14.132 13.963 13.824 13.688 13.541 13.384 13.234 13.13 12.998 12.776 12.635 12.474 12.385 12.188 11.971 11.749 11.64 11.314 11.299 11.161 11.004 10.682 10.516 10.31 10.087 9.858 9.604 9.279 7.95 -9 ,19883 ,TETRA ,17589774,Sat Nov 27 19:15:40 CET,Sat Nov 27 21:37:57 CET,0.0 0.814 1.147 1.426 1.644 1.828 1.995 2.141 2.412 2.552 2.685 2.712 3.06 3.181 3.402 3.62 3.809 3.898 4.076 4.257 4.527 4.691 4.849 5.091 5.32 5.528 5.727 5.921 6.176 6.42 6.653 6.939 7.217 7.474 7.756 8.079 8.399 8.756 9.115 9.492 9.91 10.368 10.885 11.398 11.994 12.648 13.36 14.108 15.001 15.997 16.966 17.499 17.66 17.58 17.42 17.24 17.041 16.827 16.605 16.363 16.129 15.898 15.656 15.427 15.221 15.015 14.799 14.624 14.463 14.286 14.107 13.946 13.779 13.615 13.492 13.361 13.204 13.024 12.848 12.732 12.607 12.413 12.28 12.131 12.048 11.868 11.687 11.502 11.405 11.101 11.11 11.0 10.888 10.656 10.533 10.403 10.231 10.014 9.795 9.51 8.596 -10 ,15525 ,TETRA ,17589775,Sat Nov 27 19:15:42 CET,Sat Nov 27 21:25:21 CET,0.0 1.085 1.366 1.591 1.799 2.001 2.176 2.334 2.607 2.732 2.856 2.88 3.213 3.323 3.534 3.74 3.939 4.034 4.213 4.388 4.653 4.814 4.966 5.188 5.386 5.576 5.775 5.971 6.204 6.432 6.652 6.904 7.151 7.393 7.674 8.002 8.321 8.675 9.045 9.433 9.84 10.29 10.784 11.269 11.849 12.494 13.243 14.059 15.014 16.087 17.218 17.924 18.184 18.245 18.158 18.018 17.851 17.665 17.476 17.235 17.017 16.831 16.635 16.436 16.248 16.066 15.871 15.696 15.532 15.349 15.147 14.987 14.819 14.647 14.531 14.403 14.261 14.109 13.949 13.83 13.694 13.479 13.331 13.183 13.111 12.959 12.795 12.624 12.524 12.206 12.163 12.037 11.917 11.634 11.487 11.32 11.129 10.927 10.657 10.31 9.057 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt deleted file mode 100644 index fd041d16..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4319 ,KEBNE ,17026585,Wed Dec 22 14:49:26 CET,Wed Dec 22 16:45:45 CET,0.0 0.339 0.515 0.628 0.716 0.8 0.873 0.925 1.005 1.025 1.034 0.86 1.081 1.098 1.103 1.088 1.074 1.079 1.094 1.1 1.093 1.074 1.053 1.021 0.982 0.921 0.838 0.743 0.61 0.477 0.328 0.118 -0.107 -0.339 -0.613 -0.957 -1.339 -1.794 -2.318 -2.898 -3.557 -4.378 -5.409 -6.536 -7.976 -9.764 -12.081 -15.029 -18.961 -24.417 -32.638 -41.326 -47.762 -52.779 -56.734 -60.023 -62.739 -65.081 -67.005 -68.827 -70.357 -71.689 -72.939 -74.099 -75.141 -76.074 -77.017 -77.829 -78.532 -79.244 -79.956 -80.533 -81.125 -81.725 -82.164 -82.617 -83.088 -83.571 -84.056 -84.376 -84.701 -85.203 -85.55 -85.916 -86.104 -86.468 -86.842 -87.22 -87.422 -87.926 -88.042 -88.276 -88.509 -88.956 -89.196 -89.443 -89.697 -89.984 -90.32 -90.672 -91.259 -2 ,16963 ,KEBNE ,17026586,Wed Dec 22 14:56:38 CET,Wed Dec 22 16:52:10 CET,0.0 0.412 0.555 0.686 0.812 0.902 0.965 1.027 1.109 1.141 1.16 0.978 1.197 1.213 1.234 1.245 1.243 1.236 1.211 1.178 1.11 1.076 1.046 0.979 0.908 0.825 0.715 0.602 0.449 0.278 0.118 -0.08 -0.304 -0.555 -0.855 -1.203 -1.576 -1.997 -2.491 -3.096 -3.788 -4.65 -5.746 -6.926 -8.435 -10.273 -12.611 -15.573 -19.514 -24.976 -33.126 -41.84 -48.272 -53.205 -57.141 -60.469 -63.215 -65.517 -67.402 -69.239 -70.763 -72.078 -73.304 -74.44 -75.472 -76.383 -77.304 -78.12 -78.812 -79.49 -80.179 -80.747 -81.311 -81.881 -82.329 -82.8 -83.284 -83.763 -84.245 -84.58 -84.92 -85.438 -85.787 -86.132 -86.308 -86.665 -87.038 -87.421 -87.616 -88.118 -88.225 -88.43 -88.642 -89.107 -89.349 -89.583 -89.84 -90.167 -90.502 -90.841 -91.583 -3 ,4263 ,KEBNE ,17026587,Wed Dec 22 14:58:40 CET,Wed Dec 22 16:54:10 CET,0.0 0.723 0.931 1.052 1.148 1.199 1.239 1.28 1.34 1.368 1.385 1.187 1.399 1.409 1.43 1.442 1.442 1.443 1.433 1.407 1.354 1.308 1.261 1.184 1.101 1.01 0.913 0.811 0.666 0.502 0.32 0.102 -0.118 -0.346 -0.632 -0.997 -1.368 -1.79 -2.293 -2.866 -3.484 -4.294 -5.362 -6.53 -8.04 -9.877 -12.177 -15.11 -19.112 -24.559 -32.733 -41.355 -47.591 -52.569 -56.595 -59.941 -62.761 -65.204 -67.225 -69.175 -70.785 -72.138 -73.382 -74.536 -75.576 -76.503 -77.443 -78.263 -78.968 -79.675 -80.403 -81.013 -81.632 -82.25 -82.716 -83.183 -83.657 -84.131 -84.602 -84.931 -85.26 -85.755 -86.092 -86.451 -86.639 -87.023 -87.422 -87.819 -88.015 -88.517 -88.658 -88.887 -89.133 -89.63 -89.859 -90.097 -90.35 -90.615 -90.911 -91.305 -91.888 -4 ,16920 ,KEBNE ,17026588,Wed Dec 22 14:58:41 CET,Wed Dec 22 16:54:08 CET,0.0 0.858 1.149 1.333 1.456 1.558 1.648 1.705 1.779 1.813 1.839 1.675 1.893 1.908 1.938 1.942 1.925 1.916 1.899 1.871 1.804 1.75 1.697 1.632 1.56 1.488 1.404 1.294 1.147 1.004 0.853 0.635 0.407 0.173 -0.108 -0.439 -0.797 -1.244 -1.76 -2.34 -2.994 -3.803 -4.849 -5.991 -7.453 -9.248 -11.585 -14.557 -18.564 -24.109 -32.377 -41.121 -47.522 -52.451 -56.374 -59.683 -62.414 -64.732 -66.665 -68.547 -70.109 -71.458 -72.693 -73.835 -74.864 -75.754 -76.653 -77.436 -78.11 -78.805 -79.511 -80.092 -80.693 -81.303 -81.756 -82.235 -82.731 -83.22 -83.707 -84.02 -84.337 -84.839 -85.18 -85.532 -85.717 -86.099 -86.479 -86.868 -87.063 -87.557 -87.682 -87.9 -88.126 -88.585 -88.818 -89.065 -89.304 -89.565 -89.869 -90.21 -90.953 -5 ,16485 ,KEBNE ,17026589,Wed Dec 22 14:58:41 CET,Wed Dec 22 16:54:21 CET,0.0 0.497 0.701 0.82 0.897 0.952 1.017 1.064 1.138 1.182 1.205 1.048 1.274 1.285 1.29 1.291 1.288 1.282 1.255 1.232 1.199 1.161 1.118 1.041 0.952 0.863 0.772 0.675 0.521 0.355 0.191 -0.04 -0.279 -0.518 -0.83 -1.21 -1.603 -2.058 -2.572 -3.161 -3.836 -4.637 -5.63 -6.747 -8.189 -9.971 -12.263 -15.194 -19.188 -24.707 -32.889 -41.424 -47.698 -52.606 -56.542 -59.859 -62.586 -64.906 -66.821 -68.708 -70.27 -71.588 -72.811 -73.92 -74.96 -75.889 -76.794 -77.584 -78.246 -78.916 -79.627 -80.195 -80.763 -81.375 -81.841 -82.302 -82.77 -83.251 -83.736 -84.057 -84.389 -84.901 -85.245 -85.591 -85.767 -86.138 -86.531 -86.946 -87.156 -87.659 -87.8 -88.036 -88.278 -88.802 -89.065 -89.316 -89.592 -89.892 -90.2 -90.593 -91.329 -6 ,11688 ,KEBNE ,17026590,Wed Dec 22 14:59:43 CET,Wed Dec 22 16:55:40 CET,0.0 0.409 0.546 0.707 0.822 0.875 0.94 0.989 1.037 1.068 1.088 0.899 1.109 1.119 1.129 1.122 1.107 1.096 1.077 1.053 0.989 0.939 0.895 0.826 0.736 0.639 0.541 0.431 0.275 0.125 -0.037 -0.251 -0.476 -0.729 -1.044 -1.427 -1.818 -2.266 -2.8 -3.404 -4.076 -4.907 -5.974 -7.166 -8.668 -10.49 -12.861 -15.895 -19.951 -25.541 -33.829 -42.48 -48.854 -53.889 -57.896 -61.206 -63.938 -66.28 -68.211 -70.06 -71.603 -72.936 -74.17 -75.315 -76.336 -77.225 -78.126 -78.922 -79.6 -80.293 -81.023 -81.615 -82.195 -82.783 -83.233 -83.699 -84.177 -84.652 -85.133 -85.457 -85.788 -86.302 -86.648 -86.99 -87.166 -87.525 -87.898 -88.274 -88.473 -88.975 -89.107 -89.33 -89.552 -90.014 -90.266 -90.536 -90.814 -91.1 -91.434 -91.85 -92.509 -7 ,11436 ,KEBNE ,17026591,Wed Dec 22 14:59:44 CET,Wed Dec 22 16:54:56 CET,0.0 0.527 0.724 0.875 0.995 1.085 1.148 1.207 1.326 1.372 1.402 1.249 1.475 1.481 1.479 1.472 1.453 1.447 1.444 1.426 1.375 1.342 1.311 1.247 1.181 1.109 1.029 0.932 0.778 0.628 0.47 0.255 0.035 -0.202 -0.495 -0.848 -1.217 -1.646 -2.157 -2.752 -3.422 -4.245 -5.279 -6.356 -7.77 -9.595 -11.885 -14.774 -18.691 -24.18 -32.383 -41.053 -47.447 -52.534 -56.589 -59.942 -62.693 -65.032 -66.967 -68.833 -70.357 -71.689 -72.947 -74.103 -75.171 -76.103 -77.02 -77.807 -78.469 -79.158 -79.876 -80.466 -81.068 -81.663 -82.111 -82.559 -83.023 -83.516 -84.014 -84.348 -84.695 -85.218 -85.572 -85.946 -86.128 -86.494 -86.879 -87.271 -87.47 -87.969 -88.088 -88.311 -88.537 -88.985 -89.212 -89.446 -89.705 -89.988 -90.315 -90.752 -91.777 -8 ,2454 ,KEBNE ,17026592,Wed Dec 22 14:59:43 CET,Wed Dec 22 16:55:26 CET,0.0 0.637 0.939 1.152 1.27 1.364 1.447 1.535 1.693 1.763 1.82 1.7 1.942 1.971 2.026 2.062 2.06 2.054 2.041 2.019 1.976 1.938 1.904 1.846 1.762 1.676 1.573 1.459 1.325 1.18 1.02 0.814 0.605 0.392 0.101 -0.263 -0.641 -1.102 -1.602 -2.173 -2.849 -3.653 -4.679 -5.837 -7.296 -9.108 -11.509 -14.483 -18.409 -23.887 -32.016 -40.684 -47.149 -52.194 -56.228 -59.639 -62.47 -64.851 -66.816 -68.732 -70.297 -71.648 -72.901 -74.03 -75.052 -75.969 -76.911 -77.724 -78.396 -79.072 -79.768 -80.336 -80.922 -81.531 -81.984 -82.443 -82.917 -83.396 -83.872 -84.193 -84.531 -85.059 -85.417 -85.77 -85.95 -86.325 -86.715 -87.126 -87.335 -87.838 -87.967 -88.184 -88.402 -88.864 -89.127 -89.4 -89.654 -89.951 -90.301 -90.751 -92.155 -9 ,17256 ,KEBNE ,17026593,Wed Dec 22 14:59:43 CET,Wed Dec 22 16:55:37 CET,0.0 0.285 0.48 0.612 0.672 0.716 0.773 0.831 0.914 0.95 0.983 0.824 1.038 1.048 1.068 1.089 1.099 1.094 1.073 1.045 0.978 0.921 0.863 0.786 0.695 0.602 0.517 0.422 0.263 0.093 -0.075 -0.29 -0.519 -0.763 -1.073 -1.457 -1.853 -2.314 -2.819 -3.396 -4.061 -4.847 -5.873 -7.014 -8.466 -10.265 -12.566 -15.551 -19.584 -25.206 -33.458 -42.042 -48.381 -53.309 -57.296 -60.636 -63.366 -65.729 -67.678 -69.546 -71.094 -72.416 -73.628 -74.722 -75.705 -76.588 -77.495 -78.297 -78.971 -79.635 -80.313 -80.885 -81.451 -82.025 -82.469 -82.911 -83.353 -83.807 -84.265 -84.571 -84.891 -85.378 -85.705 -86.035 -86.208 -86.557 -86.916 -87.292 -87.482 -87.975 -88.072 -88.273 -88.48 -88.898 -89.134 -89.398 -89.697 -90.022 -90.336 -90.65 -91.436 -10 ,9134 ,KEBNE ,17026594,Wed Dec 22 14:59:43 CET,Wed Dec 22 16:55:48 CET,0.0 0.703 0.923 1.069 1.194 1.302 1.402 1.471 1.543 1.578 1.623 1.508 1.736 1.751 1.783 1.803 1.804 1.799 1.787 1.766 1.711 1.668 1.626 1.559 1.464 1.347 1.242 1.148 1.016 0.882 0.742 0.531 0.307 0.081 -0.212 -0.561 -0.931 -1.388 -1.908 -2.498 -3.159 -3.942 -4.955 -6.115 -7.633 -9.51 -11.844 -14.78 -18.783 -24.334 -32.63 -41.354 -47.821 -52.896 -56.907 -60.235 -62.986 -65.371 -67.351 -69.265 -70.846 -72.195 -73.429 -74.536 -75.54 -76.451 -77.38 -78.186 -78.86 -79.545 -80.249 -80.826 -81.41 -82.003 -82.459 -82.908 -83.37 -83.855 -84.358 -84.696 -85.024 -85.535 -85.877 -86.217 -86.393 -86.745 -87.104 -87.476 -87.668 -88.157 -88.269 -88.476 -88.699 -89.169 -89.412 -89.671 -89.937 -90.209 -90.496 -90.82 -91.543 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt deleted file mode 100644 index 5cdc6778..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17443 ,TETRA ,17589776,Sat Nov 27 19:15:40 CET,Sat Nov 27 21:38:37 CET,0.0 0.892 1.156 1.391 1.619 1.818 1.979 2.124 2.397 2.525 2.648 2.666 2.982 3.091 3.279 3.472 3.648 3.726 3.884 4.032 4.251 4.393 4.521 4.727 4.938 5.143 5.338 5.51 5.741 5.976 6.196 6.456 6.717 6.979 7.28 7.616 7.939 8.292 8.674 9.072 9.469 9.921 10.464 11.036 11.715 12.441 13.263 14.142 15.102 16.198 17.439 18.346 18.786 18.958 18.991 18.976 18.916 18.815 18.689 18.519 18.346 18.176 18.008 17.839 17.676 17.516 17.336 17.167 17.02 16.878 16.725 16.585 16.438 16.298 16.178 16.042 15.906 15.754 15.597 15.496 15.382 15.183 15.041 14.887 14.803 14.662 14.538 14.381 14.298 14.01 14.016 13.923 13.81 13.552 13.42 13.291 13.139 12.944 12.723 12.459 11.547 -2 ,1309 ,TETRA ,17589777,Sat Nov 27 19:15:40 CET,Sat Nov 27 21:39:04 CET,0.0 0.921 1.298 1.559 1.802 2.007 2.183 2.36 2.697 2.829 2.971 3.068 3.409 3.551 3.814 4.058 4.302 4.414 4.621 4.828 5.097 5.259 5.425 5.667 5.899 6.123 6.344 6.565 6.835 7.096 7.364 7.67 7.956 8.228 8.521 8.844 9.162 9.512 9.899 10.308 10.717 11.17 11.716 12.288 12.928 13.593 14.349 15.203 16.173 17.256 18.494 19.337 19.737 19.916 19.945 19.894 19.794 19.688 19.566 19.408 19.261 19.116 18.932 18.733 18.549 18.368 18.175 18.011 17.875 17.723 17.561 17.426 17.271 17.109 16.987 16.862 16.739 16.607 16.434 16.303 16.175 15.985 15.861 15.727 15.655 15.509 15.349 15.192 15.105 14.813 14.791 14.665 14.544 14.306 14.172 14.019 13.825 13.609 13.368 13.065 12.147 -3 ,2119 ,TETRA ,17589778,Sat Nov 27 19:15:41 CET,Sat Nov 27 21:52:45 CET,0.0 1.182 1.479 1.682 1.906 2.088 2.255 2.434 2.755 2.883 3.007 3.028 3.331 3.448 3.687 3.907 4.109 4.199 4.371 4.559 4.83 4.987 5.141 5.365 5.57 5.777 5.977 6.18 6.461 6.722 6.964 7.236 7.514 7.797 8.108 8.435 8.737 9.081 9.469 9.895 10.312 10.766 11.307 11.834 12.444 13.095 13.834 14.695 15.705 16.821 17.977 18.792 19.202 19.361 19.351 19.264 19.16 19.014 18.839 18.657 18.473 18.293 18.117 17.932 17.766 17.622 17.448 17.277 17.13 16.976 16.817 16.686 16.551 16.409 16.29 16.159 16.017 15.874 15.715 15.587 15.461 15.293 15.179 15.062 14.997 14.856 14.701 14.526 14.443 14.172 14.177 14.082 13.967 13.682 13.538 13.397 13.244 13.048 12.764 12.349 10.992 -4 ,5314 ,TETRA ,17589779,Sat Nov 27 19:15:41 CET,Sat Nov 27 21:27:24 CET,0.0 0.712 1.041 1.286 1.5 1.678 1.836 1.989 2.27 2.401 2.527 2.555 2.863 2.967 3.177 3.383 3.568 3.655 3.841 4.013 4.238 4.392 4.542 4.755 4.968 5.163 5.341 5.511 5.744 5.983 6.203 6.471 6.742 6.999 7.275 7.583 7.885 8.215 8.57 8.962 9.385 9.86 10.41 10.948 11.582 12.29 13.063 13.92 14.862 15.947 17.236 18.188 18.648 18.868 18.932 18.884 18.81 18.72 18.62 18.493 18.345 18.181 18.009 17.83 17.653 17.472 17.265 17.091 16.952 16.811 16.662 16.533 16.391 16.233 16.113 15.986 15.847 15.693 15.521 15.402 15.293 15.126 15.005 14.871 14.795 14.631 14.472 14.313 14.224 13.926 13.893 13.781 13.658 13.371 13.228 13.092 12.944 12.759 12.484 12.124 11.117 -5 ,24588 ,TETRA ,17589780,Sat Nov 27 19:15:41 CET,Sat Nov 27 21:38:43 CET,0.0 1.172 1.557 1.8 2.011 2.183 2.336 2.482 2.771 2.909 3.041 3.083 3.396 3.505 3.723 3.932 4.129 4.22 4.395 4.559 4.806 4.972 5.139 5.38 5.6 5.808 6.004 6.2 6.454 6.695 6.927 7.199 7.461 7.729 8.041 8.388 8.717 9.066 9.437 9.82 10.22 10.69 11.25 11.805 12.442 13.157 13.985 14.893 15.909 17.057 18.314 19.233 19.687 19.858 19.891 19.85 19.738 19.592 19.471 19.331 19.161 19.001 18.84 18.667 18.512 18.373 18.197 18.032 17.892 17.74 17.561 17.412 17.261 17.097 16.968 16.813 16.645 16.483 16.311 16.192 16.061 15.845 15.701 15.566 15.492 15.332 15.166 14.979 14.883 14.593 14.576 14.461 14.339 14.071 13.917 13.754 13.594 13.394 13.153 12.871 12.153 -6 ,10472 ,TETRA ,17589781,Sat Nov 27 19:15:41 CET,Sat Nov 27 21:40:26 CET,0.0 0.658 0.939 1.182 1.41 1.586 1.728 1.876 2.16 2.297 2.434 2.483 2.8 2.915 3.133 3.335 3.532 3.621 3.786 3.958 4.209 4.362 4.503 4.706 4.931 5.159 5.373 5.579 5.829 6.055 6.275 6.534 6.78 7.028 7.311 7.635 7.954 8.298 8.662 9.052 9.47 9.935 10.462 10.985 11.584 12.277 13.081 13.932 14.904 16.058 17.385 18.332 18.818 19.056 19.107 19.074 18.992 18.852 18.682 18.504 18.335 18.182 18.027 17.858 17.709 17.566 17.397 17.239 17.103 16.946 16.78 16.658 16.538 16.41 16.315 16.217 16.092 15.953 15.819 15.721 15.608 15.421 15.289 15.154 15.089 14.957 14.808 14.637 14.544 14.264 14.272 14.161 14.037 13.784 13.656 13.521 13.378 13.17 12.905 12.63 11.914 -7 ,3449 ,TETRA ,17589782,Sat Nov 27 19:15:41 CET,Sat Nov 27 21:40:28 CET,0.0 1.011 1.343 1.612 1.811 1.988 2.166 2.323 2.621 2.755 2.871 2.895 3.203 3.304 3.502 3.699 3.896 3.994 4.174 4.336 4.579 4.738 4.898 5.131 5.352 5.565 5.772 5.967 6.216 6.447 6.675 6.964 7.234 7.492 7.799 8.156 8.497 8.857 9.247 9.66 10.061 10.501 11.034 11.583 12.236 12.94 13.737 14.635 15.623 16.728 18.012 18.945 19.333 19.485 19.512 19.463 19.372 19.23 19.06 18.88 18.709 18.526 18.356 18.21 18.046 17.864 17.669 17.49 17.319 17.152 16.998 16.854 16.688 16.521 16.401 16.276 16.132 15.978 15.809 15.686 15.563 15.376 15.251 15.119 15.041 14.879 14.72 14.55 14.457 14.167 14.144 14.036 13.94 13.724 13.58 13.434 13.262 13.04 12.806 12.531 11.836 -8 ,8075 ,TETRA ,17589783,Sat Nov 27 19:16:43 CET,Sat Nov 27 21:35:45 CET,0.0 0.585 0.886 1.131 1.336 1.523 1.674 1.799 2.049 2.167 2.283 2.33 2.641 2.747 2.95 3.135 3.311 3.397 3.558 3.709 3.928 4.085 4.242 4.466 4.677 4.878 5.083 5.293 5.547 5.783 6.008 6.281 6.556 6.823 7.136 7.463 7.756 8.072 8.429 8.823 9.238 9.696 10.232 10.797 11.432 12.11 12.882 13.732 14.735 15.889 17.204 18.13 18.552 18.77 18.85 18.797 18.681 18.544 18.406 18.267 18.111 17.946 17.765 17.577 17.395 17.218 17.038 16.874 16.726 16.574 16.413 16.27 16.131 15.998 15.884 15.766 15.63 15.48 15.329 15.215 15.097 14.922 14.795 14.662 14.593 14.445 14.283 14.104 14.008 13.729 13.729 13.637 13.538 13.305 13.175 13.027 12.88 12.702 12.506 12.25 11.303 -9 ,8350 ,TETRA ,17589784,Sat Nov 27 19:15:42 CET,Sat Nov 27 21:34:50 CET,0.0 0.713 1.031 1.281 1.483 1.655 1.81 1.955 2.2 2.322 2.433 2.436 2.735 2.83 3.041 3.249 3.424 3.514 3.696 3.866 4.126 4.293 4.449 4.661 4.86 5.061 5.268 5.474 5.736 5.98 6.219 6.496 6.748 7.001 7.305 7.648 7.971 8.317 8.708 9.14 9.588 10.075 10.627 11.175 11.821 12.579 13.424 14.303 15.313 16.498 17.786 18.602 18.984 19.144 19.186 19.131 19.02 18.881 18.713 18.536 18.385 18.226 18.058 17.881 17.702 17.531 17.344 17.187 17.05 16.887 16.711 16.57 16.43 16.259 16.123 15.995 15.869 15.746 15.605 15.505 15.41 15.26 15.141 15.021 14.959 14.812 14.657 14.508 14.425 14.154 14.148 14.048 13.92 13.615 13.469 13.318 13.145 12.953 12.732 12.418 11.585 -10 ,16111 ,TETRA ,17589785,Sat Nov 27 19:15:42 CET,Sat Nov 27 21:50:01 CET,0.0 1.025 1.351 1.577 1.81 2.025 2.218 2.386 2.681 2.824 2.959 3.007 3.324 3.431 3.634 3.836 4.019 4.113 4.298 4.474 4.727 4.893 5.049 5.262 5.482 5.699 5.9 6.09 6.339 6.587 6.831 7.118 7.401 7.669 7.966 8.305 8.636 8.992 9.358 9.761 10.2 10.683 11.203 11.714 12.321 12.994 13.775 14.663 15.678 16.821 18.075 19.002 19.449 19.605 19.658 19.661 19.592 19.495 19.406 19.285 19.138 18.984 18.829 18.677 18.509 18.344 18.183 18.039 17.9 17.757 17.615 17.5 17.379 17.24 17.124 17.009 16.894 16.758 16.61 16.506 16.384 16.191 16.066 15.938 15.875 15.74 15.573 15.397 15.308 15.017 15.011 14.92 14.824 14.605 14.482 14.365 14.226 14.046 13.84 13.59 12.835 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index a85e72e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1114 ,KEBNE ,17026595,Wed Dec 22 14:59:43 CET,Wed Dec 22 16:32:44 CET,0.0 0.427 0.583 0.723 0.83 0.903 0.971 1.045 1.187 1.253 1.324 1.325 1.516 1.573 1.678 1.781 1.883 1.931 2.028 2.134 2.294 2.386 2.473 2.603 2.727 2.844 2.965 3.086 3.228 3.382 3.546 3.729 3.891 4.044 4.224 4.43 4.627 4.842 5.065 5.288 5.528 5.795 6.102 6.392 6.733 7.094 7.469 7.905 8.35 8.78 9.041 8.844 8.443 8.029 7.634 7.251 6.903 6.554 6.226 5.882 5.588 5.335 5.083 4.835 4.598 4.361 4.106 3.883 3.685 3.469 3.248 3.062 2.861 2.655 2.506 2.347 2.176 2.002 1.816 1.689 1.557 1.347 1.199 1.038 0.955 0.786 0.59 0.375 0.272 0.034 -0.061 -0.183 -0.321 -0.6 -0.761 -0.947 -1.143 -1.358 -1.61 -1.919 -2.593 -2 ,27459 ,KEBNE ,17026596,Wed Dec 22 14:59:43 CET,Wed Dec 22 16:32:51 CET,0.0 0.19 0.313 0.427 0.538 0.637 0.717 0.794 0.956 1.026 1.082 1.063 1.252 1.313 1.424 1.526 1.63 1.68 1.776 1.862 1.982 2.068 2.155 2.281 2.402 2.518 2.635 2.75 2.897 3.03 3.148 3.29 3.421 3.559 3.725 3.904 4.089 4.298 4.504 4.732 4.983 5.256 5.567 5.866 6.188 6.525 6.901 7.291 7.694 8.075 8.341 8.29 7.998 7.619 7.246 6.882 6.52 6.159 5.827 5.48 5.187 4.919 4.645 4.384 4.135 3.901 3.657 3.433 3.243 3.043 2.826 2.645 2.455 2.246 2.086 1.932 1.773 1.593 1.408 1.291 1.172 0.99 0.871 0.746 0.674 0.529 0.387 0.231 0.157 -0.052 -0.129 -0.235 -0.338 -0.578 -0.703 -0.826 -0.949 -1.086 -1.251 -1.463 -1.902 -3 ,21030 ,KEBNE ,17026597,Wed Dec 22 14:59:43 CET,Wed Dec 22 16:32:58 CET,0.0 0.283 0.422 0.526 0.628 0.734 0.831 0.924 1.071 1.133 1.198 1.187 1.366 1.423 1.535 1.634 1.738 1.789 1.884 1.975 2.118 2.217 2.309 2.432 2.563 2.692 2.817 2.941 3.099 3.25 3.391 3.555 3.715 3.872 4.049 4.251 4.45 4.672 4.92 5.166 5.399 5.665 5.978 6.272 6.598 6.96 7.353 7.747 8.148 8.492 8.73 8.723 8.439 8.021 7.594 7.193 6.834 6.481 6.166 5.854 5.599 5.358 5.1 4.85 4.634 4.451 4.242 4.045 3.887 3.728 3.549 3.388 3.235 3.069 2.913 2.762 2.616 2.458 2.298 2.185 2.078 1.92 1.792 1.649 1.58 1.439 1.289 1.134 1.053 0.834 0.787 0.7 0.595 0.352 0.234 0.112 -0.021 -0.153 -0.315 -0.564 -1.101 -4 ,20605 ,KEBNE ,17026598,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:36:42 CET,0.0 0.205 0.351 0.456 0.542 0.626 0.718 0.803 0.957 1.027 1.095 1.087 1.273 1.329 1.45 1.574 1.69 1.739 1.837 1.936 2.081 2.185 2.288 2.441 2.591 2.729 2.868 2.995 3.154 3.304 3.445 3.63 3.8 3.96 4.152 4.359 4.563 4.798 5.035 5.265 5.495 5.755 6.064 6.372 6.707 7.065 7.451 7.826 8.239 8.645 8.87 8.788 8.543 8.224 7.873 7.509 7.143 6.79 6.484 6.175 5.895 5.631 5.371 5.125 4.899 4.687 4.463 4.244 4.046 3.846 3.64 3.461 3.277 3.099 2.963 2.805 2.636 2.478 2.319 2.211 2.103 1.93 1.8 1.665 1.6 1.459 1.31 1.151 1.069 0.866 0.815 0.719 0.615 0.382 0.256 0.125 -0.017 -0.17 -0.336 -0.569 -1.175 -5 ,18711 ,KEBNE ,17026599,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:37:11 CET,0.0 0.148 0.281 0.401 0.5 0.586 0.669 0.749 0.898 0.971 1.04 1.038 1.231 1.292 1.401 1.504 1.609 1.662 1.759 1.849 1.981 2.067 2.154 2.282 2.403 2.52 2.634 2.746 2.885 3.018 3.156 3.322 3.488 3.649 3.823 4.021 4.224 4.445 4.663 4.888 5.127 5.38 5.686 5.986 6.304 6.657 7.023 7.434 7.856 8.184 8.381 8.244 7.951 7.598 7.204 6.816 6.488 6.171 5.844 5.503 5.194 4.907 4.644 4.399 4.173 3.958 3.727 3.509 3.317 3.127 2.936 2.772 2.597 2.39 2.223 2.061 1.885 1.695 1.496 1.36 1.217 0.992 0.831 0.657 0.568 0.393 0.215 0.029 -0.061 -0.273 -0.356 -0.474 -0.58 -0.807 -0.939 -1.076 -1.233 -1.392 -1.541 -1.753 -2.185 -6 ,13168 ,KEBNE ,17026600,Wed Dec 22 15:01:48 CET,Wed Dec 22 16:34:52 CET,0.0 0.456 0.699 0.874 1.022 1.153 1.27 1.388 1.615 1.715 1.803 1.84 2.051 2.132 2.279 2.42 2.554 2.616 2.734 2.852 3.027 3.144 3.252 3.398 3.531 3.661 3.787 3.905 4.053 4.206 4.359 4.546 4.73 4.896 5.08 5.282 5.476 5.69 5.904 6.125 6.358 6.622 6.932 7.232 7.562 7.915 8.293 8.663 9.07 9.469 9.68 9.575 9.284 8.923 8.537 8.147 7.77 7.395 7.069 6.74 6.441 6.179 5.92 5.67 5.434 5.211 4.971 4.747 4.554 4.352 4.142 3.959 3.774 3.577 3.411 3.234 3.044 2.861 2.678 2.552 2.415 2.205 2.068 1.918 1.841 1.695 1.55 1.393 1.307 1.091 1.033 0.927 0.816 0.57 0.437 0.3 0.145 -0.02 -0.177 -0.375 -0.768 -7 ,16878 ,KEBNE ,17026601,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:36:32 CET,0.0 0.231 0.402 0.526 0.618 0.706 0.798 0.889 1.054 1.121 1.182 1.172 1.359 1.417 1.536 1.648 1.759 1.811 1.907 2.002 2.135 2.218 2.298 2.416 2.537 2.65 2.763 2.871 3.005 3.139 3.267 3.43 3.587 3.746 3.941 4.147 4.337 4.542 4.761 5.0 5.249 5.517 5.815 6.093 6.4 6.751 7.141 7.525 7.897 8.27 8.516 8.384 8.087 7.741 7.362 6.959 6.601 6.274 5.96 5.602 5.279 5.005 4.743 4.483 4.228 3.986 3.74 3.529 3.346 3.154 2.953 2.791 2.636 2.479 2.341 2.19 2.042 1.877 1.699 1.585 1.472 1.299 1.172 1.035 0.967 0.83 0.686 0.529 0.444 0.227 0.186 0.089 -0.018 -0.232 -0.344 -0.477 -0.635 -0.801 -0.995 -1.257 -2.105 -8 ,10023 ,KEBNE ,17026602,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:36:59 CET,0.0 0.35 0.54 0.663 0.771 0.874 0.967 1.049 1.197 1.273 1.345 1.349 1.536 1.593 1.711 1.826 1.933 1.985 2.087 2.181 2.327 2.42 2.509 2.632 2.745 2.857 2.963 3.064 3.206 3.346 3.478 3.636 3.793 3.956 4.14 4.345 4.547 4.767 4.996 5.23 5.481 5.747 6.05 6.341 6.64 6.973 7.349 7.717 8.096 8.504 8.83 8.765 8.488 8.132 7.769 7.41 7.054 6.712 6.398 6.076 5.773 5.5 5.253 5.012 4.774 4.546 4.3 4.072 3.884 3.685 3.468 3.279 3.083 2.904 2.769 2.618 2.47 2.322 2.161 2.047 1.928 1.757 1.643 1.517 1.447 1.309 1.17 1.02 0.94 0.722 0.665 0.566 0.465 0.245 0.128 0.003 -0.142 -0.301 -0.515 -0.744 -1.222 -9 ,16223 ,KEBNE ,17026603,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:35:53 CET,0.0 0.25 0.401 0.529 0.627 0.712 0.792 0.865 0.99 1.055 1.118 1.098 1.286 1.352 1.475 1.58 1.686 1.738 1.839 1.937 2.062 2.138 2.221 2.344 2.464 2.583 2.689 2.788 2.915 3.034 3.151 3.292 3.428 3.557 3.706 3.887 4.068 4.257 4.458 4.68 4.918 5.19 5.483 5.758 6.082 6.444 6.844 7.262 7.703 8.076 8.312 8.295 8.06 7.734 7.353 6.986 6.634 6.277 5.969 5.639 5.335 5.079 4.843 4.619 4.4 4.18 3.925 3.704 3.531 3.344 3.146 2.974 2.791 2.606 2.459 2.301 2.132 1.957 1.783 1.668 1.546 1.341 1.198 1.056 0.991 0.872 0.738 0.603 0.53 0.314 0.273 0.187 0.09 -0.133 -0.251 -0.357 -0.477 -0.635 -0.805 -1.015 -1.606 -10 ,1575 ,KEBNE ,17026604,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:37:07 CET,0.0 0.229 0.389 0.512 0.622 0.712 0.798 0.889 1.05 1.114 1.184 1.219 1.422 1.499 1.65 1.785 1.921 1.986 2.1 2.214 2.375 2.483 2.588 2.737 2.885 3.021 3.148 3.271 3.42 3.564 3.709 3.891 4.063 4.229 4.429 4.644 4.833 5.039 5.269 5.515 5.759 6.022 6.323 6.607 6.938 7.321 7.709 8.075 8.469 8.825 9.016 8.903 8.599 8.249 7.879 7.494 7.134 6.785 6.475 6.164 5.877 5.599 5.331 5.063 4.811 4.601 4.38 4.167 3.974 3.755 3.52 3.34 3.161 2.961 2.801 2.632 2.455 2.269 2.073 1.94 1.802 1.601 1.455 1.291 1.208 1.035 0.843 0.635 0.527 0.289 0.198 0.066 -0.087 -0.386 -0.549 -0.716 -0.901 -1.152 -1.444 -1.753 -2.69 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index ff10afeb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14109 ,TETRA ,17589786,Sat Nov 27 19:15:42 CET,Sat Nov 27 21:04:58 CET,0.0 0.222 0.329 0.442 0.555 0.656 0.747 0.827 0.97 1.042 1.109 1.122 1.318 1.394 1.531 1.648 1.762 1.823 1.952 2.067 2.219 2.318 2.417 2.56 2.694 2.817 2.94 3.066 3.227 3.369 3.507 3.677 3.829 3.98 4.149 4.327 4.49 4.675 4.873 5.067 5.255 5.47 5.726 5.972 6.239 6.498 6.759 6.992 7.219 7.398 7.29 6.822 6.235 5.64 5.058 4.476 3.932 3.413 2.963 2.527 2.158 1.819 1.475 1.158 0.876 0.61 0.332 0.094 -0.11 -0.347 -0.604 -0.81 -1.027 -1.249 -1.414 -1.584 -1.777 -1.977 -2.171 -2.307 -2.457 -2.697 -2.865 -3.041 -3.135 -3.335 -3.541 -3.749 -3.853 -4.093 -4.222 -4.354 -4.493 -4.818 -4.989 -5.146 -5.317 -5.533 -5.797 -6.164 -7.329 -2 ,15498 ,TETRA ,17589787,Sat Nov 27 19:15:42 CET,Sat Nov 27 21:04:45 CET,0.0 0.204 0.321 0.429 0.538 0.623 0.696 0.765 0.899 0.965 1.03 1.027 1.211 1.271 1.378 1.477 1.579 1.635 1.743 1.848 2.006 2.1 2.192 2.33 2.47 2.604 2.724 2.835 2.98 3.123 3.259 3.43 3.589 3.73 3.901 4.094 4.278 4.478 4.672 4.859 5.06 5.301 5.556 5.804 6.08 6.348 6.64 6.912 7.158 7.334 7.214 6.669 6.021 5.414 4.825 4.265 3.779 3.301 2.864 2.42 2.047 1.704 1.358 1.032 0.74 0.49 0.221 -0.041 -0.281 -0.537 -0.8 -1.015 -1.235 -1.453 -1.613 -1.78 -1.958 -2.153 -2.364 -2.521 -2.694 -2.951 -3.125 -3.316 -3.413 -3.588 -3.756 -3.948 -4.05 -4.279 -4.393 -4.516 -4.63 -4.881 -5.023 -5.185 -5.368 -5.587 -5.839 -6.165 -7.662 -3 ,19894 ,TETRA ,17589788,Sat Nov 27 19:15:42 CET,Sat Nov 27 21:05:35 CET,0.0 0.257 0.378 0.474 0.564 0.65 0.737 0.824 0.981 1.052 1.12 1.12 1.31 1.37 1.473 1.565 1.657 1.701 1.788 1.886 2.024 2.103 2.182 2.303 2.414 2.527 2.637 2.73 2.849 2.966 3.08 3.212 3.335 3.457 3.6 3.758 3.91 4.099 4.308 4.514 4.729 4.965 5.216 5.451 5.708 5.96 6.223 6.483 6.693 6.769 6.535 5.985 5.332 4.68 4.1 3.519 2.982 2.494 2.068 1.634 1.244 0.898 0.561 0.234 -0.088 -0.381 -0.687 -0.945 -1.155 -1.384 -1.611 -1.801 -2.009 -2.231 -2.403 -2.58 -2.771 -2.967 -3.175 -3.323 -3.469 -3.691 -3.853 -4.031 -4.125 -4.314 -4.51 -4.725 -4.835 -5.077 -5.19 -5.329 -5.47 -5.743 -5.905 -6.085 -6.286 -6.511 -6.748 -7.117 -8.421 -4 ,27646 ,TETRA ,17589789,Sat Nov 27 19:15:42 CET,Sat Nov 27 21:06:14 CET,0.0 0.406 0.586 0.709 0.806 0.903 0.986 1.057 1.186 1.253 1.322 1.323 1.503 1.558 1.669 1.77 1.865 1.911 2.003 2.096 2.232 2.321 2.402 2.508 2.615 2.726 2.833 2.933 3.072 3.215 3.348 3.502 3.65 3.792 3.952 4.129 4.318 4.509 4.685 4.886 5.092 5.304 5.535 5.755 6.011 6.282 6.555 6.815 7.059 7.18 7.026 6.48 5.837 5.247 4.66 4.086 3.567 3.064 2.609 2.164 1.786 1.432 1.081 0.744 0.424 0.118 -0.2 -0.49 -0.733 -0.961 -1.208 -1.419 -1.635 -1.863 -2.04 -2.224 -2.408 -2.606 -2.816 -2.957 -3.105 -3.344 -3.509 -3.683 -3.771 -3.949 -4.139 -4.345 -4.46 -4.708 -4.818 -4.951 -5.1 -5.41 -5.561 -5.728 -5.928 -6.139 -6.375 -6.742 -7.798 -5 ,23025 ,TETRA ,17589790,Sat Nov 27 19:15:42 CET,Sat Nov 27 20:59:13 CET,0.0 0.396 0.557 0.682 0.773 0.852 0.928 0.992 1.103 1.156 1.217 1.214 1.398 1.453 1.545 1.637 1.727 1.774 1.877 1.984 2.146 2.248 2.344 2.479 2.604 2.726 2.84 2.952 3.1 3.239 3.382 3.546 3.696 3.83 3.982 4.155 4.314 4.492 4.693 4.89 5.088 5.308 5.553 5.799 6.068 6.325 6.589 6.844 7.057 7.19 7.108 6.632 6.02 5.391 4.814 4.271 3.769 3.272 2.835 2.409 2.022 1.667 1.31 0.963 0.651 0.355 0.022 -0.268 -0.51 -0.772 -1.057 -1.301 -1.542 -1.79 -1.996 -2.208 -2.42 -2.645 -2.89 -3.057 -3.231 -3.503 -3.681 -3.882 -3.997 -4.22 -4.436 -4.679 -4.807 -5.05 -5.205 -5.364 -5.533 -5.911 -6.114 -6.341 -6.582 -6.849 -7.12 -7.479 -8.744 -6 ,1242 ,TETRA ,17589791,Sat Nov 27 19:15:43 CET,Sat Nov 27 21:06:33 CET,0.0 0.23 0.357 0.469 0.571 0.655 0.736 0.815 0.953 1.017 1.079 1.073 1.252 1.305 1.417 1.522 1.635 1.692 1.792 1.89 2.02 2.1 2.176 2.294 2.409 2.516 2.625 2.727 2.853 2.976 3.093 3.225 3.353 3.483 3.626 3.778 3.925 4.1 4.285 4.461 4.656 4.871 5.093 5.316 5.578 5.869 6.171 6.451 6.704 6.816 6.692 6.174 5.541 4.919 4.328 3.768 3.249 2.777 2.374 1.947 1.538 1.151 0.787 0.458 0.167 -0.119 -0.44 -0.714 -0.949 -1.218 -1.508 -1.731 -1.956 -2.188 -2.364 -2.558 -2.754 -2.948 -3.149 -3.289 -3.444 -3.697 -3.877 -4.061 -4.155 -4.354 -4.562 -4.78 -4.889 -5.133 -5.26 -5.39 -5.526 -5.809 -5.963 -6.146 -6.374 -6.614 -6.863 -7.209 -7.93 -7 ,28261 ,TETRA ,17589792,Sat Nov 27 19:15:43 CET,Sat Nov 27 21:04:57 CET,0.0 0.258 0.377 0.488 0.585 0.669 0.749 0.827 0.966 1.03 1.089 1.076 1.254 1.309 1.42 1.523 1.614 1.658 1.742 1.818 1.945 2.038 2.121 2.225 2.324 2.423 2.524 2.628 2.761 2.882 3.008 3.167 3.32 3.466 3.628 3.81 3.973 4.143 4.336 4.539 4.753 4.97 5.207 5.432 5.692 5.975 6.24 6.5 6.689 6.751 6.59 6.124 5.483 4.84 4.282 3.711 3.165 2.66 2.2 1.715 1.304 0.973 0.639 0.273 -0.06 -0.363 -0.674 -0.954 -1.211 -1.464 -1.728 -1.948 -2.173 -2.417 -2.611 -2.819 -3.034 -3.246 -3.464 -3.621 -3.789 -4.036 -4.211 -4.398 -4.493 -4.696 -4.916 -5.152 -5.272 -5.522 -5.688 -5.839 -5.992 -6.383 -6.599 -6.802 -7.033 -7.284 -7.552 -7.879 -8.814 -8 ,13398 ,TETRA ,17589793,Sat Nov 27 19:15:45 CET,Sat Nov 27 21:04:51 CET,0.0 0.208 0.318 0.411 0.507 0.586 0.659 0.733 0.876 0.947 1.018 1.028 1.213 1.268 1.371 1.467 1.556 1.602 1.693 1.771 1.89 1.973 2.053 2.169 2.284 2.395 2.503 2.604 2.723 2.843 2.964 3.107 3.242 3.361 3.496 3.658 3.817 3.992 4.165 4.347 4.531 4.737 4.981 5.193 5.42 5.675 5.942 6.195 6.458 6.595 6.389 5.858 5.268 4.63 4.012 3.468 2.968 2.5 2.073 1.63 1.244 0.896 0.581 0.268 -0.053 -0.332 -0.63 -0.92 -1.166 -1.419 -1.687 -1.907 -2.132 -2.39 -2.587 -2.783 -3.014 -3.246 -3.467 -3.622 -3.786 -4.068 -4.278 -4.483 -4.578 -4.762 -4.961 -5.176 -5.284 -5.514 -5.619 -5.752 -5.883 -6.174 -6.349 -6.532 -6.719 -6.927 -7.202 -7.577 -8.311 -9 ,12725 ,TETRA ,17589794,Sat Nov 27 19:16:40 CET,Sat Nov 27 21:06:13 CET,0.0 0.194 0.342 0.453 0.55 0.638 0.718 0.802 0.951 1.01 1.066 1.054 1.237 1.293 1.393 1.497 1.599 1.643 1.729 1.815 1.949 2.045 2.139 2.265 2.392 2.527 2.654 2.762 2.9 3.041 3.177 3.337 3.489 3.632 3.792 3.97 4.137 4.322 4.512 4.703 4.904 5.132 5.398 5.656 5.93 6.201 6.477 6.718 6.882 6.972 6.858 6.339 5.735 5.124 4.539 3.986 3.475 2.986 2.564 2.113 1.693 1.318 0.959 0.639 0.338 0.055 -0.251 -0.545 -0.792 -1.046 -1.321 -1.542 -1.778 -2.033 -2.24 -2.479 -2.711 -2.942 -3.181 -3.342 -3.521 -3.78 -3.949 -4.144 -4.25 -4.474 -4.693 -4.929 -5.065 -5.332 -5.493 -5.633 -5.774 -6.133 -6.349 -6.536 -6.709 -6.908 -7.203 -7.558 -8.125 -10 ,25416 ,TETRA ,17589795,Sat Nov 27 19:16:40 CET,Sat Nov 27 21:07:36 CET,0.0 0.265 0.383 0.472 0.565 0.658 0.742 0.822 0.959 1.017 1.076 1.069 1.245 1.302 1.411 1.521 1.646 1.708 1.819 1.933 2.11 2.216 2.307 2.437 2.566 2.697 2.824 2.94 3.084 3.228 3.367 3.529 3.676 3.814 3.983 4.175 4.348 4.524 4.718 4.925 5.121 5.335 5.583 5.822 6.094 6.361 6.636 6.896 7.105 7.225 7.045 6.534 5.929 5.284 4.706 4.158 3.629 3.121 2.685 2.233 1.835 1.458 1.084 0.746 0.434 0.139 -0.166 -0.455 -0.727 -1.0 -1.271 -1.487 -1.722 -1.997 -2.201 -2.396 -2.605 -2.824 -3.064 -3.251 -3.432 -3.685 -3.874 -4.077 -4.173 -4.375 -4.616 -4.867 -4.997 -5.257 -5.412 -5.565 -5.721 -6.104 -6.328 -6.563 -6.783 -7.002 -7.243 -7.566 -8.595 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt deleted file mode 100644 index 6a5c90f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15095 ,TETRA ,17589796,Sat Nov 27 19:16:40 CET,Sat Nov 27 21:07:10 CET,0.0 0.221 0.362 0.493 0.595 0.674 0.755 0.843 1.02 1.093 1.167 1.183 1.374 1.442 1.574 1.693 1.798 1.847 1.944 2.041 2.175 2.264 2.347 2.46 2.575 2.69 2.801 2.918 3.068 3.196 3.316 3.469 3.619 3.755 3.901 4.066 4.229 4.407 4.606 4.822 5.031 5.252 5.523 5.782 6.049 6.298 6.544 6.8 7.01 7.074 6.865 6.303 5.614 4.976 4.4 3.844 3.318 2.825 2.418 1.98 1.579 1.223 0.892 0.585 0.296 0.025 -0.274 -0.542 -0.768 -1.001 -1.262 -1.474 -1.687 -1.915 -2.101 -2.294 -2.491 -2.698 -2.907 -3.056 -3.216 -3.462 -3.622 -3.786 -3.876 -4.062 -4.251 -4.451 -4.557 -4.797 -4.922 -5.043 -5.169 -5.462 -5.622 -5.814 -6.031 -6.275 -6.55 -6.867 -7.621 -2 ,15683 ,TETRA ,17589797,Sat Nov 27 19:16:40 CET,Sat Nov 27 21:07:32 CET,0.0 0.331 0.512 0.723 0.933 1.086 1.207 1.327 1.541 1.635 1.735 1.806 2.026 2.117 2.265 2.398 2.527 2.591 2.721 2.841 3.003 3.103 3.205 3.364 3.516 3.658 3.781 3.897 4.049 4.191 4.324 4.49 4.644 4.787 4.95 5.139 5.33 5.536 5.743 5.952 6.178 6.423 6.689 6.944 7.218 7.48 7.744 7.992 8.176 8.253 8.039 7.44 6.788 6.175 5.596 5.012 4.478 3.992 3.576 3.136 2.726 2.381 2.065 1.742 1.424 1.138 0.843 0.569 0.319 0.068 -0.189 -0.413 -0.652 -0.891 -1.065 -1.245 -1.44 -1.648 -1.872 -2.028 -2.178 -2.412 -2.581 -2.754 -2.84 -3.028 -3.227 -3.43 -3.534 -3.768 -3.861 -3.981 -4.119 -4.406 -4.554 -4.722 -4.896 -5.115 -5.43 -5.817 -6.435 -3 ,22701 ,TETRA ,17589798,Sat Nov 27 19:16:40 CET,Sat Nov 27 20:58:00 CET,0.0 0.284 0.46 0.58 0.673 0.769 0.865 0.959 1.126 1.203 1.282 1.311 1.514 1.597 1.743 1.884 2.023 2.088 2.21 2.328 2.501 2.612 2.718 2.864 3.011 3.158 3.294 3.424 3.591 3.749 3.904 4.091 4.256 4.404 4.576 4.759 4.937 5.129 5.325 5.538 5.764 6.015 6.286 6.547 6.823 7.109 7.421 7.696 7.92 8.013 7.822 7.278 6.65 6.037 5.419 4.829 4.314 3.829 3.394 2.936 2.548 2.209 1.877 1.549 1.231 0.946 0.663 0.411 0.193 -0.04 -0.289 -0.503 -0.732 -0.961 -1.134 -1.328 -1.529 -1.726 -1.93 -2.065 -2.204 -2.422 -2.57 -2.719 -2.79 -2.937 -3.105 -3.286 -3.376 -3.598 -3.667 -3.767 -3.876 -4.106 -4.229 -4.368 -4.513 -4.665 -4.855 -5.08 -5.592 -4 ,3102 ,TETRA ,17589799,Sat Nov 27 19:16:42 CET,Sat Nov 27 21:07:41 CET,0.0 0.239 0.37 0.499 0.606 0.702 0.792 0.872 1.034 1.109 1.183 1.188 1.367 1.421 1.534 1.643 1.738 1.79 1.892 1.983 2.123 2.217 2.307 2.433 2.562 2.677 2.78 2.88 3.014 3.145 3.27 3.43 3.586 3.734 3.905 4.096 4.28 4.48 4.687 4.891 5.115 5.369 5.633 5.868 6.114 6.366 6.644 6.885 7.02 7.065 6.864 6.281 5.669 5.037 4.41 3.816 3.287 2.815 2.387 1.943 1.587 1.282 0.984 0.699 0.438 0.199 -0.046 -0.252 -0.442 -0.659 -0.893 -1.071 -1.255 -1.465 -1.621 -1.773 -1.954 -2.162 -2.358 -2.481 -2.603 -2.787 -2.929 -3.089 -3.168 -3.321 -3.495 -3.677 -3.765 -3.982 -4.033 -4.146 -4.262 -4.483 -4.611 -4.751 -4.913 -5.102 -5.322 -5.583 -6.075 -5 ,26427 ,TETRA ,17589800,Sat Nov 27 19:16:42 CET,Sat Nov 27 21:08:58 CET,0.0 0.326 0.451 0.574 0.684 0.784 0.864 0.945 1.104 1.179 1.247 1.27 1.463 1.525 1.633 1.74 1.844 1.891 1.98 2.066 2.186 2.262 2.346 2.471 2.593 2.708 2.819 2.926 3.071 3.219 3.358 3.526 3.685 3.833 4.014 4.222 4.406 4.588 4.786 4.997 5.215 5.465 5.732 5.959 6.219 6.493 6.761 6.997 7.168 7.245 7.027 6.427 5.781 5.126 4.513 3.937 3.415 2.932 2.496 2.044 1.645 1.296 0.963 0.628 0.325 0.067 -0.206 -0.476 -0.706 -0.921 -1.153 -1.358 -1.565 -1.771 -1.931 -2.095 -2.264 -2.438 -2.632 -2.764 -2.895 -3.1 -3.237 -3.379 -3.455 -3.613 -3.784 -3.975 -4.066 -4.278 -4.329 -4.425 -4.538 -4.806 -4.944 -5.082 -5.24 -5.418 -5.628 -5.841 -6.256 -6 ,31198 ,TETRA ,17589801,Sat Nov 27 19:16:42 CET,Sat Nov 27 20:59:10 CET,0.0 0.303 0.466 0.592 0.687 0.769 0.847 0.93 1.109 1.194 1.277 1.297 1.482 1.542 1.661 1.765 1.868 1.919 2.015 2.112 2.263 2.362 2.462 2.602 2.741 2.877 3.004 3.128 3.284 3.425 3.561 3.739 3.907 4.058 4.238 4.443 4.626 4.811 5.019 5.243 5.472 5.727 6.003 6.249 6.514 6.783 7.054 7.312 7.522 7.584 7.375 6.821 6.2 5.569 4.984 4.45 3.956 3.496 3.073 2.628 2.25 1.903 1.545 1.208 0.906 0.63 0.335 0.068 -0.156 -0.376 -0.596 -0.78 -0.971 -1.173 -1.334 -1.494 -1.66 -1.836 -2.01 -2.136 -2.264 -2.46 -2.602 -2.745 -2.817 -2.965 -3.13 -3.296 -3.381 -3.601 -3.661 -3.759 -3.865 -4.109 -4.25 -4.395 -4.532 -4.692 -4.893 -5.105 -5.498 -7 ,23876 ,TETRA ,17589802,Sat Nov 27 19:16:42 CET,Sat Nov 27 21:11:27 CET,0.0 0.274 0.424 0.547 0.659 0.751 0.845 0.931 1.078 1.153 1.23 1.252 1.434 1.492 1.619 1.739 1.848 1.901 1.997 2.086 2.22 2.312 2.402 2.539 2.666 2.779 2.897 3.013 3.16 3.303 3.442 3.614 3.774 3.923 4.104 4.307 4.495 4.693 4.905 5.119 5.323 5.547 5.804 6.044 6.307 6.594 6.872 7.092 7.265 7.339 7.135 6.545 5.867 5.251 4.675 4.085 3.538 3.018 2.566 2.126 1.748 1.392 1.033 0.701 0.407 0.13 -0.173 -0.435 -0.661 -0.906 -1.165 -1.374 -1.589 -1.823 -2.007 -2.194 -2.377 -2.552 -2.729 -2.857 -2.986 -3.177 -3.31 -3.448 -3.524 -3.675 -3.834 -4.013 -4.11 -4.329 -4.384 -4.493 -4.606 -4.85 -4.981 -5.118 -5.255 -5.42 -5.63 -5.869 -6.385 -8 ,13664 ,TETRA ,17589803,Sat Nov 27 19:16:42 CET,Sat Nov 27 20:53:26 CET,0.0 0.29 0.459 0.587 0.703 0.799 0.888 0.984 1.142 1.201 1.257 1.259 1.452 1.512 1.628 1.742 1.848 1.899 2.006 2.114 2.264 2.362 2.462 2.61 2.748 2.886 3.029 3.16 3.318 3.474 3.632 3.819 3.986 4.144 4.328 4.524 4.701 4.885 5.093 5.32 5.535 5.76 6.025 6.266 6.515 6.781 7.022 7.234 7.444 7.528 7.27 6.635 5.949 5.338 4.778 4.209 3.68 3.203 2.791 2.356 1.964 1.628 1.33 1.053 0.789 0.539 0.272 0.024 -0.191 -0.394 -0.619 -0.811 -1.001 -1.201 -1.36 -1.528 -1.705 -1.88 -2.058 -2.185 -2.307 -2.493 -2.626 -2.766 -2.845 -3.007 -3.165 -3.331 -3.418 -3.641 -3.704 -3.801 -3.903 -4.125 -4.245 -4.384 -4.532 -4.708 -4.934 -5.212 -5.782 -9 ,7033 ,TETRA ,17589804,Sat Nov 27 19:16:42 CET,Sat Nov 27 21:06:21 CET,0.0 0.22 0.383 0.516 0.642 0.781 0.917 1.038 1.262 1.36 1.459 1.539 1.749 1.835 2.004 2.159 2.31 2.385 2.517 2.636 2.811 2.924 3.031 3.182 3.322 3.455 3.578 3.697 3.851 3.996 4.141 4.318 4.487 4.649 4.831 5.03 5.222 5.422 5.62 5.824 6.043 6.29 6.557 6.812 7.091 7.367 7.644 7.907 8.118 8.177 7.929 7.3 6.592 5.925 5.351 4.808 4.294 3.813 3.392 2.957 2.568 2.226 1.893 1.558 1.247 0.958 0.659 0.394 0.149 -0.098 -0.345 -0.548 -0.761 -0.994 -1.185 -1.387 -1.584 -1.786 -1.987 -2.121 -2.272 -2.51 -2.67 -2.824 -2.902 -3.064 -3.252 -3.462 -3.563 -3.791 -3.861 -3.961 -4.074 -4.321 -4.455 -4.603 -4.749 -4.919 -5.137 -5.429 -5.973 -10 ,4894 ,TETRA ,17589805,Sat Nov 27 19:16:42 CET,Sat Nov 27 21:06:09 CET,0.0 0.244 0.384 0.498 0.608 0.712 0.803 0.885 1.048 1.132 1.212 1.22 1.405 1.467 1.583 1.683 1.774 1.823 1.923 2.023 2.167 2.255 2.341 2.469 2.593 2.711 2.823 2.931 3.073 3.203 3.337 3.496 3.643 3.787 3.958 4.151 4.328 4.532 4.755 4.979 5.202 5.43 5.691 5.946 6.223 6.501 6.784 7.039 7.227 7.312 7.051 6.383 5.697 5.036 4.413 3.839 3.317 2.815 2.373 1.927 1.552 1.217 0.874 0.54 0.246 -0.028 -0.321 -0.595 -0.832 -1.059 -1.304 -1.512 -1.714 -1.918 -2.076 -2.23 -2.387 -2.545 -2.71 -2.825 -2.95 -3.163 -3.303 -3.436 -3.505 -3.661 -3.835 -4.01 -4.1 -4.322 -4.388 -4.485 -4.577 -4.789 -4.914 -5.043 -5.208 -5.422 -5.678 -5.973 -6.488 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index a61f28bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,656 ,TETRA ,17589806,Sat Nov 27 19:16:43 CET,Sat Nov 27 21:06:43 CET,0.0 0.152 0.282 0.383 0.486 0.575 0.647 0.722 0.857 0.912 0.972 0.961 1.13 1.183 1.279 1.354 1.423 1.46 1.534 1.598 1.696 1.768 1.836 1.931 2.016 2.09 2.173 2.252 2.342 2.427 2.515 2.614 2.711 2.813 2.924 3.049 3.179 3.306 3.422 3.554 3.698 3.852 4.011 4.147 4.267 4.372 4.448 4.461 4.364 4.072 3.373 2.334 1.416 0.571 -0.213 -0.936 -1.569 -2.139 -2.642 -3.141 -3.57 -3.975 -4.357 -4.7 -5.017 -5.3 -5.597 -5.856 -6.074 -6.315 -6.582 -6.8 -7.018 -7.24 -7.429 -7.634 -7.832 -8.035 -8.251 -8.406 -8.567 -8.811 -8.981 -9.16 -9.253 -9.44 -9.623 -9.816 -9.919 -10.142 -10.214 -10.331 -10.453 -10.713 -10.857 -11.022 -11.216 -11.437 -11.677 -11.972 -12.756 -2 ,29740 ,TETRA ,17589807,Sat Nov 27 19:16:42 CET,Sat Nov 27 21:06:47 CET,0.0 0.292 0.411 0.497 0.567 0.641 0.722 0.798 0.931 0.982 1.043 1.035 1.199 1.248 1.33 1.401 1.468 1.505 1.582 1.65 1.75 1.811 1.865 1.953 2.047 2.135 2.211 2.285 2.382 2.462 2.542 2.644 2.738 2.829 2.936 3.053 3.161 3.274 3.393 3.515 3.63 3.757 3.889 4.001 4.136 4.254 4.321 4.348 4.284 4.024 3.288 2.249 1.308 0.449 -0.325 -1.04 -1.665 -2.256 -2.759 -3.281 -3.737 -4.126 -4.515 -4.9 -5.256 -5.566 -5.878 -6.161 -6.411 -6.671 -6.941 -7.171 -7.417 -7.681 -7.886 -8.099 -8.316 -8.536 -8.768 -8.932 -9.105 -9.368 -9.545 -9.741 -9.843 -10.042 -10.258 -10.483 -10.598 -10.838 -10.938 -11.058 -11.186 -11.487 -11.647 -11.823 -11.994 -12.17 -12.422 -12.807 -13.646 -3 ,27756 ,TETRA ,17589808,Sat Nov 27 19:16:42 CET,Sat Nov 27 21:05:10 CET,0.0 0.252 0.382 0.496 0.595 0.684 0.776 0.874 1.039 1.099 1.158 1.151 1.319 1.369 1.474 1.568 1.648 1.691 1.769 1.838 1.935 1.997 2.063 2.154 2.241 2.333 2.413 2.48 2.565 2.65 2.734 2.833 2.929 3.018 3.128 3.251 3.363 3.479 3.609 3.749 3.881 4.017 4.157 4.273 4.389 4.502 4.583 4.588 4.471 4.185 3.459 2.378 1.418 0.57 -0.201 -0.91 -1.554 -2.131 -2.607 -3.108 -3.548 -3.936 -4.325 -4.688 -5.009 -5.313 -5.653 -5.944 -6.177 -6.439 -6.715 -6.927 -7.161 -7.407 -7.592 -7.79 -7.987 -8.184 -8.39 -8.536 -8.694 -8.937 -9.093 -9.256 -9.346 -9.54 -9.733 -9.929 -10.035 -10.273 -10.368 -10.482 -10.601 -10.845 -10.987 -11.16 -11.34 -11.562 -11.827 -12.134 -12.848 -4 ,30558 ,TETRA ,17589809,Sat Nov 27 19:16:43 CET,Sat Nov 27 21:05:24 CET,0.0 0.203 0.321 0.423 0.51 0.59 0.673 0.75 0.881 0.938 0.988 0.968 1.14 1.196 1.302 1.394 1.482 1.521 1.586 1.646 1.73 1.794 1.861 1.957 2.053 2.143 2.226 2.307 2.428 2.54 2.644 2.765 2.874 2.985 3.117 3.248 3.355 3.475 3.601 3.724 3.859 3.996 4.141 4.276 4.386 4.479 4.522 4.511 4.437 4.195 3.565 2.532 1.604 0.791 0.025 -0.706 -1.357 -1.943 -2.439 -2.944 -3.39 -3.799 -4.201 -4.567 -4.881 -5.156 -5.469 -5.756 -5.989 -6.233 -6.5 -6.713 -6.918 -7.14 -7.315 -7.493 -7.673 -7.871 -8.076 -8.209 -8.349 -8.571 -8.726 -8.901 -9.0 -9.187 -9.366 -9.565 -9.678 -9.927 -10.028 -10.155 -10.293 -10.594 -10.758 -10.929 -11.126 -11.336 -11.573 -11.905 -12.676 -5 ,29150 ,TETRA ,17589810,Sat Nov 27 19:16:42 CET,Sat Nov 27 21:09:12 CET,0.0 0.323 0.463 0.556 0.65 0.744 0.817 0.89 1.019 1.067 1.114 1.089 1.256 1.303 1.393 1.473 1.552 1.591 1.661 1.735 1.839 1.908 1.978 2.063 2.142 2.222 2.305 2.389 2.481 2.566 2.649 2.748 2.845 2.939 3.054 3.18 3.295 3.421 3.558 3.697 3.833 3.968 4.108 4.227 4.342 4.467 4.573 4.609 4.521 4.257 3.652 2.679 1.683 0.793 0.029 -0.721 -1.402 -1.991 -2.489 -2.982 -3.415 -3.805 -4.174 -4.54 -4.905 -5.237 -5.567 -5.872 -6.145 -6.418 -6.689 -6.914 -7.151 -7.409 -7.604 -7.795 -7.999 -8.21 -8.417 -8.559 -8.714 -8.947 -9.108 -9.282 -9.369 -9.548 -9.728 -9.915 -10.02 -10.258 -10.368 -10.503 -10.642 -10.916 -11.068 -11.241 -11.423 -11.632 -11.893 -12.171 -12.759 -6 ,22385 ,TETRA ,17589811,Sat Nov 27 19:16:42 CET,Sat Nov 27 21:07:28 CET,0.0 0.209 0.313 0.405 0.483 0.555 0.634 0.705 0.837 0.904 0.96 0.946 1.122 1.174 1.27 1.366 1.45 1.493 1.58 1.66 1.758 1.814 1.871 1.97 2.067 2.154 2.249 2.341 2.458 2.576 2.678 2.799 2.917 3.034 3.178 3.32 3.437 3.568 3.706 3.828 3.945 4.082 4.229 4.347 4.442 4.504 4.517 4.511 4.427 4.126 3.408 2.356 1.376 0.462 -0.345 -1.092 -1.73 -2.282 -2.778 -3.278 -3.706 -4.088 -4.451 -4.809 -5.155 -5.473 -5.799 -6.09 -6.348 -6.612 -6.882 -7.116 -7.36 -7.603 -7.792 -7.996 -8.207 -8.41 -8.618 -8.768 -8.927 -9.173 -9.342 -9.516 -9.611 -9.826 -10.041 -10.263 -10.39 -10.645 -10.781 -10.932 -11.081 -11.409 -11.602 -11.784 -11.975 -12.19 -12.438 -12.706 -13.486 -7 ,5363 ,TETRA ,17589812,Sat Nov 27 19:16:42 CET,Sat Nov 27 21:07:05 CET,0.0 0.299 0.451 0.565 0.655 0.738 0.825 0.895 1.01 1.067 1.126 1.123 1.298 1.346 1.432 1.519 1.612 1.653 1.725 1.797 1.892 1.951 2.014 2.11 2.198 2.278 2.359 2.435 2.527 2.62 2.707 2.802 2.891 2.98 3.083 3.186 3.277 3.396 3.54 3.7 3.85 3.993 4.142 4.276 4.439 4.582 4.654 4.659 4.583 4.278 3.519 2.441 1.452 0.522 -0.271 -0.958 -1.588 -2.154 -2.649 -3.156 -3.59 -3.985 -4.348 -4.705 -5.052 -5.365 -5.702 -5.995 -6.246 -6.511 -6.784 -7.008 -7.239 -7.48 -7.675 -7.876 -8.085 -8.308 -8.544 -8.706 -8.871 -9.115 -9.287 -9.474 -9.568 -9.76 -9.958 -10.181 -10.302 -10.554 -10.681 -10.814 -10.954 -11.242 -11.399 -11.57 -11.75 -11.966 -12.262 -12.635 -13.438 -8 ,2836 ,TETRA ,17589813,Sat Nov 27 19:16:44 CET,Sat Nov 27 21:05:10 CET,0.0 0.274 0.426 0.516 0.589 0.659 0.738 0.807 0.916 0.978 1.043 1.03 1.196 1.244 1.335 1.425 1.502 1.539 1.608 1.667 1.761 1.827 1.89 1.982 2.073 2.159 2.234 2.308 2.403 2.485 2.561 2.651 2.738 2.823 2.927 3.032 3.126 3.242 3.37 3.487 3.601 3.729 3.87 4.011 4.136 4.22 4.282 4.289 4.202 3.919 3.195 2.14 1.201 0.343 -0.441 -1.162 -1.81 -2.403 -2.9 -3.41 -3.86 -4.265 -4.651 -5.013 -5.361 -5.666 -5.972 -6.252 -6.508 -6.787 -7.088 -7.334 -7.589 -7.852 -8.043 -8.24 -8.454 -8.677 -8.895 -9.041 -9.199 -9.452 -9.636 -9.822 -9.912 -10.089 -10.259 -10.447 -10.553 -10.788 -10.893 -11.023 -11.149 -11.391 -11.526 -11.668 -11.829 -12.043 -12.287 -12.635 -13.474 -9 ,19880 ,TETRA ,17589814,Sat Nov 27 19:16:43 CET,Sat Nov 27 21:05:16 CET,0.0 0.147 0.266 0.368 0.445 0.518 0.584 0.648 0.774 0.832 0.891 0.891 1.064 1.112 1.202 1.284 1.36 1.396 1.471 1.541 1.632 1.694 1.756 1.844 1.927 2.011 2.094 2.164 2.253 2.345 2.439 2.541 2.631 2.711 2.802 2.906 3.004 3.099 3.203 3.322 3.448 3.584 3.721 3.845 3.985 4.132 4.228 4.231 4.109 3.793 3.06 1.985 1.026 0.15 -0.636 -1.376 -2.069 -2.696 -3.211 -3.7 -4.129 -4.54 -4.939 -5.317 -5.66 -5.978 -6.303 -6.584 -6.832 -7.091 -7.353 -7.561 -7.779 -8.008 -8.181 -8.36 -8.549 -8.753 -8.972 -9.125 -9.28 -9.517 -9.68 -9.852 -9.94 -10.118 -10.313 -10.499 -10.595 -10.831 -10.93 -11.048 -11.172 -11.43 -11.571 -11.743 -11.94 -12.144 -12.384 -12.71 -13.474 -10 ,23989 ,TETRA ,17589815,Sat Nov 27 19:17:39 CET,Sat Nov 27 21:06:26 CET,0.0 0.306 0.451 0.546 0.63 0.701 0.769 0.843 0.973 1.027 1.083 1.069 1.241 1.293 1.402 1.512 1.596 1.632 1.705 1.778 1.875 1.941 2.01 2.11 2.206 2.298 2.393 2.486 2.599 2.7 2.799 2.923 3.026 3.126 3.254 3.397 3.527 3.667 3.798 3.912 4.044 4.186 4.313 4.44 4.593 4.711 4.789 4.828 4.748 4.446 3.752 2.735 1.739 0.859 0.106 -0.566 -1.137 -1.679 -2.177 -2.684 -3.131 -3.533 -3.921 -4.286 -4.642 -4.954 -5.268 -5.568 -5.827 -6.091 -6.355 -6.568 -6.8 -7.049 -7.227 -7.405 -7.589 -7.779 -7.985 -8.128 -8.281 -8.515 -8.678 -8.851 -8.94 -9.117 -9.306 -9.522 -9.631 -9.873 -9.985 -10.105 -10.221 -10.503 -10.665 -10.838 -11.042 -11.261 -11.514 -11.867 -12.812 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index f8bd25b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5528 ,KEBNE ,17026605,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:36:05 CET,0.0 0.305 0.52 0.653 0.747 0.847 0.955 1.066 1.261 1.334 1.412 1.456 1.654 1.738 1.894 2.027 2.151 2.213 2.325 2.436 2.612 2.721 2.826 2.969 3.112 3.254 3.38 3.495 3.64 3.767 3.899 4.074 4.232 4.379 4.546 4.734 4.899 5.06 5.238 5.406 5.561 5.734 5.909 6.064 6.222 6.345 6.428 6.484 6.408 6.04 5.194 3.891 2.648 1.584 0.624 -0.326 -1.17 -1.88 -2.515 -3.165 -3.7 -4.176 -4.63 -5.072 -5.506 -5.905 -6.3 -6.652 -6.948 -7.242 -7.544 -7.778 -8.027 -8.287 -8.483 -8.698 -8.925 -9.155 -9.404 -9.569 -9.743 -10.012 -10.187 -10.376 -10.474 -10.675 -10.89 -11.094 -11.202 -11.469 -11.605 -11.747 -11.892 -12.185 -12.341 -12.519 -12.718 -12.921 -13.143 -13.432 -14.212 -2 ,6184 ,KEBNE ,17026606,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:36:38 CET,0.0 0.479 0.671 0.797 0.892 0.983 1.071 1.145 1.283 1.352 1.417 1.424 1.604 1.664 1.785 1.899 2.007 2.054 2.132 2.209 2.323 2.401 2.479 2.574 2.681 2.783 2.865 2.948 3.058 3.162 3.265 3.387 3.504 3.626 3.774 3.948 4.113 4.26 4.413 4.579 4.736 4.906 5.088 5.233 5.393 5.551 5.671 5.713 5.592 5.233 4.373 3.043 1.836 0.765 -0.204 -1.1 -1.881 -2.576 -3.186 -3.835 -4.399 -4.877 -5.342 -5.778 -6.176 -6.553 -6.943 -7.28 -7.573 -7.885 -8.207 -8.474 -8.738 -8.997 -9.201 -9.41 -9.625 -9.861 -10.113 -10.285 -10.46 -10.741 -10.941 -11.138 -11.238 -11.444 -11.657 -11.865 -11.963 -12.201 -12.301 -12.424 -12.564 -12.849 -12.996 -13.173 -13.357 -13.545 -13.777 -14.111 -14.777 -3 ,16131 ,KEBNE ,17026607,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:35:36 CET,0.0 0.269 0.435 0.557 0.65 0.744 0.844 0.929 1.083 1.153 1.215 1.241 1.429 1.492 1.595 1.686 1.795 1.858 1.983 2.103 2.273 2.369 2.457 2.586 2.721 2.863 2.989 3.105 3.262 3.41 3.544 3.7 3.851 3.989 4.139 4.295 4.448 4.612 4.765 4.927 5.085 5.241 5.427 5.599 5.766 5.923 6.082 6.188 6.192 5.951 5.144 3.84 2.684 1.578 0.551 -0.373 -1.154 -1.844 -2.488 -3.114 -3.64 -4.138 -4.627 -5.074 -5.482 -5.878 -6.283 -6.62 -6.91 -7.224 -7.55 -7.815 -8.091 -8.368 -8.594 -8.83 -9.075 -9.324 -9.585 -9.769 -9.943 -10.217 -10.423 -10.639 -10.75 -10.986 -11.221 -11.458 -11.583 -11.847 -12.01 -12.171 -12.345 -12.718 -12.908 -13.131 -13.385 -13.676 -14.029 -14.468 -15.538 -4 ,32752 ,KEBNE ,17026608,Wed Dec 22 15:01:48 CET,Wed Dec 22 16:35:25 CET,0.0 0.239 0.423 0.553 0.658 0.764 0.856 0.945 1.129 1.219 1.297 1.31 1.487 1.533 1.626 1.741 1.852 1.905 2.002 2.091 2.219 2.306 2.388 2.497 2.604 2.713 2.825 2.932 3.075 3.23 3.377 3.541 3.692 3.83 3.984 4.155 4.315 4.492 4.68 4.865 5.031 5.178 5.332 5.479 5.654 5.819 5.923 5.943 5.824 5.47 4.545 3.202 1.999 0.88 -0.122 -1.013 -1.813 -2.546 -3.183 -3.81 -4.354 -4.833 -5.284 -5.722 -6.112 -6.458 -6.841 -7.194 -7.503 -7.832 -8.177 -8.451 -8.712 -8.98 -9.189 -9.407 -9.641 -9.878 -10.113 -10.281 -10.462 -10.748 -10.943 -11.145 -11.255 -11.48 -11.71 -11.97 -12.116 -12.386 -12.528 -12.678 -12.824 -13.132 -13.295 -13.463 -13.658 -13.869 -14.092 -14.382 -15.088 -5 ,9013 ,KEBNE ,17026609,Wed Dec 22 15:01:48 CET,Wed Dec 22 16:35:51 CET,0.0 0.242 0.399 0.522 0.617 0.712 0.799 0.866 1.011 1.097 1.189 1.249 1.444 1.529 1.675 1.819 1.968 2.027 2.135 2.245 2.397 2.489 2.581 2.717 2.845 2.97 3.093 3.203 3.345 3.481 3.607 3.767 3.928 4.076 4.241 4.418 4.577 4.75 4.933 5.098 5.243 5.392 5.573 5.742 5.907 6.043 6.161 6.22 6.136 5.839 5.045 3.76 2.56 1.502 0.562 -0.325 -1.117 -1.83 -2.498 -3.184 -3.728 -4.194 -4.648 -5.098 -5.542 -5.945 -6.338 -6.673 -6.965 -7.286 -7.634 -7.912 -8.2 -8.499 -8.71 -8.923 -9.163 -9.404 -9.657 -9.836 -10.028 -10.329 -10.532 -10.747 -10.854 -11.065 -11.28 -11.504 -11.616 -11.862 -11.994 -12.154 -12.309 -12.604 -12.763 -12.93 -13.117 -13.329 -13.557 -13.85 -14.805 -6 ,29325 ,KEBNE ,17026610,Wed Dec 22 15:01:48 CET,Wed Dec 22 16:35:33 CET,0.0 0.227 0.365 0.49 0.602 0.696 0.78 0.866 1.052 1.142 1.235 1.293 1.485 1.563 1.711 1.852 1.99 2.056 2.18 2.286 2.425 2.527 2.639 2.794 2.938 3.086 3.223 3.343 3.486 3.614 3.737 3.893 4.052 4.202 4.362 4.529 4.694 4.867 5.04 5.212 5.374 5.538 5.725 5.912 6.086 6.214 6.292 6.307 6.22 5.874 4.948 3.666 2.498 1.363 0.344 -0.549 -1.317 -2.029 -2.649 -3.292 -3.853 -4.343 -4.825 -5.283 -5.691 -6.071 -6.473 -6.826 -7.122 -7.433 -7.766 -8.044 -8.33 -8.621 -8.841 -9.066 -9.302 -9.549 -9.81 -9.98 -10.139 -10.381 -10.548 -10.722 -10.814 -11.016 -11.234 -11.478 -11.598 -11.847 -11.947 -12.074 -12.212 -12.493 -12.651 -12.856 -13.08 -13.323 -13.609 -13.958 -14.669 -7 ,6941 ,KEBNE ,17026611,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:37:20 CET,0.0 0.25 0.429 0.58 0.713 0.829 0.926 1.014 1.194 1.283 1.374 1.408 1.588 1.653 1.778 1.903 2.026 2.086 2.202 2.316 2.486 2.594 2.699 2.85 3.002 3.135 3.244 3.357 3.5 3.638 3.771 3.925 4.069 4.199 4.344 4.508 4.673 4.849 5.023 5.202 5.392 5.582 5.774 5.957 6.125 6.263 6.381 6.437 6.408 6.157 5.388 4.135 2.915 1.818 0.817 -0.101 -0.895 -1.618 -2.297 -2.991 -3.554 -4.051 -4.519 -4.935 -5.319 -5.696 -6.1 -6.465 -6.773 -7.077 -7.409 -7.689 -7.984 -8.277 -8.482 -8.7 -8.936 -9.181 -9.449 -9.638 -9.818 -10.089 -10.292 -10.499 -10.598 -10.824 -11.066 -11.305 -11.439 -11.717 -11.884 -12.038 -12.189 -12.498 -12.667 -12.84 -13.014 -13.206 -13.414 -13.724 -14.549 -8 ,22358 ,KEBNE ,17026612,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:36:09 CET,0.0 0.191 0.351 0.478 0.595 0.709 0.79 0.87 1.052 1.129 1.187 1.191 1.372 1.428 1.54 1.665 1.807 1.868 1.953 2.03 2.151 2.232 2.313 2.427 2.525 2.614 2.709 2.815 2.941 3.06 3.179 3.3 3.415 3.523 3.642 3.77 3.884 4.019 4.18 4.361 4.542 4.728 4.923 5.087 5.259 5.415 5.545 5.63 5.596 5.275 4.321 2.988 1.794 0.674 -0.333 -1.235 -2.055 -2.821 -3.455 -4.078 -4.633 -5.125 -5.582 -6.022 -6.443 -6.824 -7.223 -7.585 -7.894 -8.209 -8.542 -8.822 -9.107 -9.404 -9.634 -9.867 -10.111 -10.367 -10.634 -10.817 -11.007 -11.294 -11.485 -11.691 -11.797 -12.022 -12.262 -12.503 -12.625 -12.892 -13.033 -13.167 -13.306 -13.606 -13.761 -13.946 -14.147 -14.374 -14.644 -14.993 -15.72 -9 ,21696 ,KEBNE ,17026613,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:35:49 CET,0.0 0.416 0.571 0.679 0.781 0.87 0.956 1.042 1.221 1.304 1.37 1.382 1.567 1.626 1.738 1.84 1.935 1.979 2.067 2.164 2.306 2.384 2.462 2.581 2.688 2.783 2.878 2.977 3.112 3.248 3.377 3.516 3.634 3.757 3.9 4.04 4.164 4.303 4.459 4.621 4.791 4.965 5.125 5.267 5.432 5.602 5.748 5.812 5.747 5.41 4.544 3.272 2.016 0.831 -0.214 -1.141 -1.95 -2.696 -3.35 -4.005 -4.567 -5.063 -5.514 -5.935 -6.333 -6.713 -7.114 -7.459 -7.753 -8.052 -8.36 -8.603 -8.845 -9.102 -9.301 -9.511 -9.725 -9.953 -10.193 -10.347 -10.501 -10.742 -10.916 -11.095 -11.184 -11.359 -11.552 -11.762 -11.881 -12.138 -12.256 -12.396 -12.534 -12.827 -12.993 -13.18 -13.368 -13.548 -13.78 -14.175 -14.989 -10 ,11599 ,KEBNE ,17026614,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:35:46 CET,0.0 0.46 0.595 0.683 0.773 0.881 0.991 1.073 1.205 1.274 1.344 1.346 1.528 1.586 1.694 1.803 1.907 1.953 2.033 2.115 2.235 2.309 2.38 2.482 2.588 2.687 2.781 2.886 3.014 3.131 3.246 3.39 3.535 3.667 3.818 3.996 4.167 4.338 4.509 4.691 4.876 5.054 5.235 5.39 5.554 5.716 5.87 5.958 5.895 5.581 4.767 3.459 2.182 1.045 0.016 -0.921 -1.737 -2.493 -3.146 -3.766 -4.27 -4.739 -5.202 -5.631 -6.022 -6.369 -6.722 -7.048 -7.325 -7.61 -7.905 -8.142 -8.4 -8.654 -8.844 -9.052 -9.263 -9.473 -9.701 -9.865 -10.028 -10.286 -10.467 -10.64 -10.727 -10.914 -11.118 -11.317 -11.419 -11.668 -11.793 -11.914 -12.049 -12.387 -12.569 -12.749 -12.94 -13.158 -13.404 -13.718 -14.6 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt deleted file mode 100644 index eb91245f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7812 ,TETRA ,17589816,Sat Nov 27 19:17:39 CET,Sat Nov 27 21:09:08 CET,0.0 0.497 0.735 0.87 0.97 1.085 1.201 1.294 1.478 1.568 1.638 1.649 1.843 1.912 2.032 2.148 2.262 2.318 2.424 2.521 2.648 2.732 2.818 2.947 3.074 3.2 3.324 3.44 3.601 3.761 3.907 4.112 4.332 4.52 4.712 4.936 5.153 5.378 5.612 5.863 6.143 6.454 6.781 7.083 7.424 7.775 8.163 8.596 9.013 9.282 9.234 8.861 8.388 7.852 7.292 6.754 6.275 5.821 5.412 4.978 4.614 4.321 4.041 3.777 3.527 3.295 3.047 2.813 2.618 2.411 2.201 2.029 1.823 1.605 1.435 1.26 1.091 0.91 0.712 0.577 0.446 0.238 0.095 -0.059 -0.142 -0.303 -0.46 -0.619 -0.71 -0.929 -1.0 -1.097 -1.183 -1.372 -1.492 -1.638 -1.786 -1.921 -2.068 -2.261 -2.66 -2 ,13760 ,TETRA ,17589817,Sat Nov 27 19:17:39 CET,Sat Nov 27 21:08:19 CET,0.0 0.36 0.507 0.628 0.741 0.852 0.942 1.024 1.182 1.26 1.335 1.372 1.569 1.645 1.8 1.931 2.044 2.1 2.215 2.328 2.488 2.581 2.668 2.812 2.95 3.085 3.24 3.401 3.594 3.765 3.934 4.143 4.333 4.517 4.734 4.978 5.207 5.465 5.741 6.011 6.302 6.613 6.939 7.263 7.647 8.067 8.503 8.911 9.282 9.526 9.511 9.079 8.542 8.023 7.5 6.959 6.459 5.981 5.56 5.14 4.752 4.418 4.079 3.734 3.424 3.147 2.848 2.579 2.354 2.13 1.907 1.723 1.526 1.311 1.154 0.986 0.801 0.608 0.411 0.283 0.152 -0.077 -0.241 -0.404 -0.495 -0.678 -0.867 -1.069 -1.172 -1.405 -1.516 -1.64 -1.787 -2.103 -2.248 -2.385 -2.544 -2.702 -2.854 -3.01 -3.46 -3 ,18867 ,TETRA ,17589818,Sat Nov 27 19:17:39 CET,Sat Nov 27 20:57:30 CET,0.0 0.312 0.491 0.653 0.786 0.901 1.005 1.102 1.271 1.349 1.431 1.464 1.649 1.714 1.847 1.973 2.094 2.152 2.272 2.389 2.558 2.665 2.766 2.913 3.048 3.176 3.301 3.427 3.597 3.75 3.891 4.063 4.235 4.403 4.597 4.815 5.026 5.27 5.547 5.835 6.102 6.396 6.755 7.075 7.425 7.816 8.212 8.603 8.983 9.246 9.271 8.879 8.357 7.771 7.171 6.623 6.124 5.631 5.154 4.684 4.277 3.917 3.588 3.267 2.97 2.701 2.419 2.171 1.962 1.737 1.508 1.316 1.105 0.869 0.684 0.51 0.342 0.163 -0.026 -0.157 -0.287 -0.477 -0.617 -0.77 -0.842 -0.982 -1.131 -1.3 -1.384 -1.598 -1.657 -1.753 -1.865 -2.102 -2.239 -2.386 -2.524 -2.665 -2.81 -2.976 -3.405 -4 ,27258 ,TETRA ,17589819,Sat Nov 27 19:17:40 CET,Sat Nov 27 21:09:23 CET,0.0 0.361 0.594 0.767 0.884 1.001 1.126 1.224 1.378 1.477 1.568 1.586 1.771 1.843 1.981 2.109 2.242 2.311 2.44 2.558 2.733 2.846 2.942 3.083 3.232 3.381 3.524 3.666 3.845 4.011 4.165 4.352 4.534 4.704 4.905 5.137 5.352 5.582 5.827 6.08 6.343 6.637 6.976 7.314 7.659 8.022 8.428 8.827 9.22 9.495 9.497 9.19 8.66 8.02 7.414 6.856 6.344 5.876 5.436 5.006 4.659 4.316 3.957 3.634 3.366 3.115 2.842 2.591 2.368 2.133 1.882 1.673 1.463 1.26 1.1 0.92 0.739 0.57 0.412 0.307 0.198 0.029 -0.093 -0.24 -0.316 -0.459 -0.61 -0.774 -0.866 -1.092 -1.172 -1.266 -1.365 -1.581 -1.704 -1.835 -1.967 -2.109 -2.3 -2.538 -2.985 -5 ,25958 ,TETRA ,17589820,Sat Nov 27 19:17:40 CET,Sat Nov 27 21:10:12 CET,0.0 0.35 0.525 0.677 0.806 0.929 1.053 1.168 1.392 1.506 1.622 1.733 1.94 2.026 2.194 2.354 2.51 2.578 2.711 2.858 3.069 3.188 3.299 3.463 3.63 3.793 3.939 4.086 4.284 4.466 4.63 4.823 5.018 5.199 5.403 5.636 5.865 6.126 6.412 6.707 6.992 7.29 7.636 7.985 8.372 8.762 9.189 9.654 10.087 10.388 10.501 10.222 9.687 9.118 8.542 7.976 7.455 6.914 6.448 6.007 5.616 5.264 4.932 4.608 4.302 4.022 3.724 3.434 3.189 2.954 2.703 2.498 2.286 2.065 1.891 1.716 1.529 1.332 1.141 1.0 0.844 0.601 0.448 0.307 0.235 0.084 -0.072 -0.244 -0.33 -0.539 -0.599 -0.696 -0.797 -1.007 -1.118 -1.241 -1.386 -1.529 -1.687 -1.889 -2.23 -6 ,23674 ,TETRA ,17589821,Sat Nov 27 19:17:40 CET,Sat Nov 27 21:07:16 CET,0.0 0.314 0.475 0.621 0.756 0.868 0.957 1.038 1.215 1.304 1.376 1.397 1.594 1.667 1.791 1.917 2.053 2.123 2.244 2.354 2.524 2.626 2.728 2.877 3.007 3.127 3.243 3.354 3.494 3.628 3.763 3.922 4.08 4.233 4.399 4.596 4.791 4.998 5.225 5.465 5.716 5.999 6.318 6.642 7.008 7.377 7.771 8.167 8.493 8.742 8.783 8.419 7.894 7.335 6.797 6.288 5.792 5.285 4.849 4.425 4.066 3.742 3.422 3.108 2.804 2.541 2.275 2.033 1.822 1.595 1.352 1.158 0.963 0.751 0.584 0.412 0.215 -0.003 -0.209 -0.341 -0.493 -0.74 -0.9 -1.071 -1.159 -1.347 -1.553 -1.78 -1.898 -2.132 -2.234 -2.349 -2.462 -2.693 -2.809 -2.923 -3.071 -3.244 -3.4 -3.54 -3.942 -7 ,9203 ,TETRA ,17589822,Sat Nov 27 19:17:40 CET,Sat Nov 27 21:03:10 CET,0.0 0.391 0.571 0.748 0.901 1.028 1.148 1.26 1.455 1.549 1.639 1.687 1.879 1.952 2.088 2.213 2.327 2.387 2.507 2.627 2.805 2.912 3.012 3.15 3.277 3.402 3.518 3.631 3.788 3.934 4.087 4.281 4.463 4.653 4.865 5.09 5.302 5.531 5.784 6.039 6.292 6.565 6.853 7.141 7.499 7.914 8.33 8.686 9.035 9.362 9.417 9.003 8.426 7.872 7.365 6.765 6.217 5.779 5.38 4.937 4.558 4.236 3.92 3.625 3.338 3.07 2.79 2.531 2.317 2.096 1.847 1.646 1.45 1.252 1.1 0.932 0.755 0.564 0.359 0.212 0.064 -0.157 -0.311 -0.47 -0.561 -0.756 -0.958 -1.168 -1.273 -1.509 -1.617 -1.733 -1.861 -2.143 -2.303 -2.471 -2.654 -2.879 -3.153 -3.482 -4.328 -8 ,17913 ,TETRA ,17589823,Sat Nov 27 19:17:40 CET,Sat Nov 27 21:07:57 CET,0.0 0.521 0.775 0.975 1.128 1.254 1.371 1.479 1.657 1.733 1.81 1.843 2.035 2.104 2.245 2.395 2.539 2.603 2.714 2.811 2.949 3.042 3.137 3.282 3.422 3.553 3.685 3.816 3.993 4.159 4.309 4.487 4.655 4.812 4.992 5.185 5.368 5.585 5.813 6.046 6.28 6.551 6.872 7.164 7.472 7.786 8.174 8.582 8.937 9.21 9.241 8.835 8.29 7.741 7.217 6.714 6.242 5.809 5.416 4.999 4.653 4.337 4.012 3.709 3.433 3.178 2.914 2.666 2.447 2.233 2.031 1.868 1.694 1.502 1.355 1.219 1.07 0.89 0.705 0.582 0.459 0.266 0.126 -0.017 -0.094 -0.242 -0.377 -0.539 -0.633 -0.845 -0.873 -0.961 -1.06 -1.266 -1.388 -1.53 -1.67 -1.836 -2.043 -2.264 -2.708 -9 ,13578 ,TETRA ,17589824,Sat Nov 27 19:17:40 CET,Sat Nov 27 21:02:26 CET,0.0 0.429 0.614 0.79 0.929 1.043 1.154 1.248 1.397 1.467 1.543 1.578 1.769 1.835 1.962 2.108 2.253 2.317 2.435 2.552 2.715 2.814 2.914 3.056 3.182 3.308 3.432 3.551 3.723 3.894 4.049 4.244 4.445 4.642 4.867 5.121 5.349 5.591 5.856 6.124 6.397 6.69 7.022 7.339 7.658 8.026 8.451 8.811 9.158 9.492 9.571 9.187 8.642 8.085 7.511 6.976 6.519 6.071 5.664 5.253 4.882 4.555 4.239 3.935 3.655 3.379 3.08 2.806 2.573 2.344 2.101 1.91 1.711 1.495 1.329 1.149 0.963 0.767 0.554 0.4 0.238 0.009 -0.147 -0.31 -0.395 -0.572 -0.75 -0.945 -1.053 -1.287 -1.404 -1.524 -1.65 -1.927 -2.059 -2.177 -2.308 -2.499 -2.698 -2.89 -3.44 -10 ,15849 ,TETRA ,17589825,Sat Nov 27 19:17:40 CET,Sat Nov 27 21:08:34 CET,0.0 0.651 0.95 1.178 1.385 1.583 1.735 1.852 2.083 2.203 2.309 2.374 2.582 2.669 2.84 3.019 3.19 3.268 3.418 3.557 3.745 3.869 3.992 4.159 4.315 4.469 4.625 4.783 4.975 5.141 5.304 5.499 5.691 5.878 6.075 6.31 6.547 6.791 7.041 7.308 7.57 7.844 8.178 8.515 8.86 9.218 9.627 10.038 10.425 10.67 10.656 10.255 9.684 9.065 8.454 7.914 7.43 6.958 6.535 6.073 5.667 5.317 4.978 4.676 4.41 4.166 3.907 3.674 3.474 3.269 3.054 2.873 2.668 2.454 2.313 2.167 2.006 1.844 1.674 1.555 1.436 1.257 1.124 0.972 0.897 0.749 0.603 0.454 0.375 0.166 0.103 0.008 -0.096 -0.329 -0.455 -0.595 -0.731 -0.864 -1.025 -1.233 -1.747 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index cc90ecb4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24240 ,TETRA ,17589826,Sat Nov 27 19:17:41 CET,Sat Nov 27 21:07:56 CET,0.0 0.351 0.57 0.74 0.871 0.982 1.087 1.189 1.382 1.474 1.559 1.604 1.806 1.891 2.073 2.245 2.396 2.472 2.631 2.783 2.985 3.105 3.216 3.388 3.566 3.739 3.894 4.037 4.224 4.408 4.593 4.821 5.029 5.225 5.461 5.712 5.948 6.214 6.489 6.789 7.106 7.443 7.831 8.209 8.649 9.138 9.665 10.225 10.849 11.488 12.092 12.38 12.35 12.145 11.906 11.663 11.432 11.205 10.95 10.657 10.422 10.206 9.985 9.769 9.563 9.382 9.199 9.023 8.86 8.693 8.528 8.387 8.223 8.054 7.931 7.801 7.659 7.51 7.352 7.243 7.141 6.986 6.874 6.748 6.682 6.546 6.406 6.274 6.201 6.0 5.947 5.859 5.768 5.543 5.418 5.296 5.168 5.02 4.858 4.638 4.094 -2 ,8366 ,TETRA ,17589827,Sat Nov 27 19:17:43 CET,Sat Nov 27 21:07:41 CET,0.0 0.473 0.77 0.959 1.125 1.265 1.417 1.579 1.851 1.963 2.069 2.153 2.364 2.456 2.651 2.83 2.994 3.069 3.202 3.332 3.533 3.661 3.786 3.964 4.142 4.31 4.465 4.619 4.807 4.982 5.151 5.364 5.584 5.782 5.994 6.241 6.486 6.768 7.056 7.34 7.652 7.995 8.385 8.777 9.213 9.692 10.243 10.835 11.444 12.081 12.685 12.947 12.942 12.812 12.623 12.378 12.116 11.854 11.617 11.39 11.177 10.955 10.725 10.509 10.313 10.127 9.943 9.778 9.629 9.463 9.27 9.103 8.925 8.729 8.577 8.432 8.29 8.153 8.008 7.909 7.816 7.66 7.545 7.438 7.382 7.254 7.128 7.005 6.936 6.739 6.695 6.616 6.53 6.344 6.244 6.118 5.982 5.819 5.619 5.419 5.006 -3 ,14213 ,TETRA ,17589828,Sat Nov 27 19:17:42 CET,Sat Nov 27 21:00:32 CET,0.0 0.748 0.939 1.091 1.235 1.36 1.468 1.569 1.754 1.846 1.935 1.98 2.181 2.257 2.403 2.54 2.667 2.724 2.836 2.965 3.15 3.252 3.36 3.529 3.687 3.835 3.962 4.087 4.269 4.454 4.645 4.89 5.123 5.338 5.569 5.821 6.057 6.309 6.572 6.871 7.184 7.514 7.915 8.319 8.76 9.267 9.836 10.431 11.056 11.702 12.295 12.521 12.457 12.286 12.091 11.822 11.542 11.292 11.073 10.84 10.628 10.409 10.17 9.962 9.782 9.601 9.4 9.219 9.061 8.899 8.731 8.597 8.446 8.275 8.141 8.002 7.862 7.728 7.6 7.507 7.411 7.255 7.135 7.001 6.934 6.811 6.678 6.519 6.447 6.264 6.218 6.127 6.027 5.795 5.665 5.518 5.356 5.208 5.046 4.841 4.363 -4 ,24619 ,TETRA ,17589829,Sat Nov 27 19:17:42 CET,Sat Nov 27 21:12:42 CET,0.0 0.51 0.705 0.838 0.944 1.039 1.139 1.239 1.457 1.567 1.663 1.746 1.975 2.077 2.264 2.438 2.603 2.679 2.828 2.971 3.17 3.305 3.443 3.626 3.803 3.969 4.118 4.27 4.476 4.675 4.854 5.075 5.285 5.479 5.705 5.961 6.209 6.481 6.768 7.067 7.38 7.735 8.146 8.528 8.983 9.495 10.042 10.633 11.279 11.935 12.525 12.792 12.784 12.619 12.398 12.173 11.948 11.7 11.464 11.214 10.972 10.739 10.531 10.341 10.143 9.942 9.733 9.545 9.379 9.218 9.054 8.9 8.73 8.562 8.431 8.299 8.166 8.034 7.905 7.811 7.703 7.533 7.431 7.325 7.265 7.131 6.986 6.848 6.777 6.577 6.543 6.469 6.385 6.199 6.095 5.992 5.871 5.721 5.551 5.321 4.814 -5 ,20115 ,TETRA ,17589830,Sat Nov 27 19:17:42 CET,Sat Nov 27 21:07:23 CET,0.0 0.441 0.601 0.796 0.935 1.05 1.166 1.269 1.464 1.557 1.637 1.655 1.86 1.946 2.087 2.222 2.363 2.429 2.547 2.661 2.826 2.934 3.041 3.189 3.315 3.431 3.557 3.696 3.886 4.061 4.232 4.462 4.683 4.885 5.126 5.403 5.654 5.903 6.177 6.47 6.772 7.103 7.485 7.886 8.338 8.843 9.406 9.973 10.606 11.289 11.961 12.23 12.131 11.935 11.726 11.509 11.261 10.988 10.739 10.488 10.255 10.029 9.803 9.594 9.411 9.242 9.073 8.923 8.788 8.642 8.497 8.378 8.238 8.098 7.993 7.876 7.755 7.622 7.49 7.404 7.316 7.156 7.035 6.911 6.849 6.739 6.614 6.468 6.391 6.194 6.144 6.046 5.953 5.764 5.66 5.561 5.434 5.28 5.142 4.97 4.51 -6 ,4542 ,TETRA ,17589831,Sat Nov 27 19:17:42 CET,Sat Nov 27 21:01:49 CET,0.0 0.261 0.431 0.601 0.752 0.873 0.982 1.073 1.25 1.346 1.429 1.442 1.639 1.715 1.864 2.001 2.126 2.188 2.312 2.432 2.613 2.742 2.861 3.029 3.21 3.381 3.534 3.681 3.878 4.071 4.261 4.474 4.685 4.902 5.15 5.434 5.692 5.972 6.265 6.562 6.87 7.196 7.571 7.965 8.433 8.921 9.465 10.076 10.724 11.364 11.92 12.177 12.173 12.024 11.781 11.501 11.239 10.958 10.678 10.392 10.137 9.913 9.7 9.494 9.31 9.148 8.971 8.8 8.642 8.466 8.281 8.123 7.954 7.78 7.637 7.488 7.336 7.187 7.036 6.92 6.809 6.647 6.535 6.414 6.353 6.24 6.119 5.981 5.914 5.728 5.708 5.631 5.534 5.327 5.227 5.111 4.98 4.859 4.716 4.525 3.995 -7 ,32323 ,TETRA ,17589832,Sat Nov 27 19:17:42 CET,Sat Nov 27 21:08:13 CET,0.0 0.51 0.799 1.037 1.243 1.425 1.58 1.703 1.915 2.037 2.159 2.252 2.473 2.561 2.731 2.914 3.082 3.156 3.294 3.434 3.642 3.766 3.892 4.081 4.252 4.416 4.569 4.721 4.931 5.13 5.317 5.539 5.739 5.948 6.189 6.429 6.663 6.933 7.227 7.546 7.873 8.224 8.619 8.997 9.42 9.891 10.446 11.027 11.638 12.308 13.003 13.283 13.238 13.113 12.918 12.689 12.459 12.222 11.996 11.755 11.521 11.292 11.068 10.86 10.663 10.46 10.249 10.068 9.903 9.746 9.582 9.433 9.28 9.125 8.996 8.864 8.726 8.561 8.378 8.254 8.137 7.955 7.826 7.696 7.628 7.48 7.315 7.139 7.05 6.843 6.756 6.646 6.531 6.263 6.106 5.922 5.726 5.525 5.245 4.87 4.044 -8 ,31977 ,TETRA ,17589833,Sat Nov 27 19:17:42 CET,Sat Nov 27 21:07:51 CET,0.0 0.368 0.558 0.72 0.857 0.979 1.09 1.19 1.353 1.441 1.53 1.57 1.773 1.857 2.03 2.214 2.385 2.465 2.613 2.748 2.948 3.074 3.2 3.379 3.553 3.731 3.905 4.054 4.237 4.413 4.59 4.802 5.002 5.212 5.454 5.721 5.963 6.227 6.535 6.865 7.201 7.558 7.947 8.335 8.793 9.283 9.828 10.402 11.024 11.687 12.323 12.615 12.614 12.491 12.301 12.049 11.781 11.524 11.3 11.06 10.829 10.622 10.425 10.233 10.049 9.874 9.673 9.493 9.342 9.18 9.011 8.857 8.692 8.532 8.405 8.269 8.131 7.984 7.827 7.716 7.588 7.369 7.22 7.073 7.0 6.869 6.726 6.554 6.463 6.255 6.189 6.088 5.979 5.738 5.608 5.478 5.33 5.151 4.943 4.689 3.89 -9 ,6109 ,TETRA ,17589834,Sat Nov 27 19:18:40 CET,Sat Nov 27 21:10:17 CET,0.0 0.521 0.744 0.908 1.055 1.18 1.28 1.371 1.567 1.666 1.762 1.826 2.022 2.091 2.248 2.389 2.501 2.552 2.664 2.771 2.928 3.035 3.133 3.271 3.41 3.552 3.69 3.828 4.013 4.196 4.373 4.582 4.801 5.025 5.267 5.518 5.758 6.037 6.315 6.586 6.882 7.227 7.638 8.028 8.473 8.949 9.46 10.021 10.627 11.259 11.85 12.12 12.048 11.833 11.574 11.299 11.011 10.713 10.456 10.206 9.977 9.757 9.532 9.309 9.098 8.9 8.673 8.46 8.282 8.105 7.929 7.776 7.61 7.444 7.305 7.141 6.983 6.825 6.644 6.525 6.406 6.219 6.112 6.013 5.953 5.829 5.698 5.562 5.488 5.28 5.213 5.124 5.034 4.836 4.722 4.6 4.475 4.327 4.153 3.966 3.547 -10 ,19772 ,TETRA ,17589835,Sat Nov 27 19:18:40 CET,Sat Nov 27 21:10:03 CET,0.0 0.833 1.029 1.201 1.339 1.452 1.557 1.671 1.873 1.973 2.077 2.127 2.324 2.388 2.521 2.661 2.8 2.866 2.998 3.129 3.292 3.393 3.503 3.667 3.809 3.938 4.073 4.208 4.384 4.554 4.725 4.941 5.134 5.31 5.525 5.773 6.008 6.259 6.547 6.862 7.17 7.53 7.945 8.324 8.767 9.257 9.781 10.358 11.009 11.661 12.213 12.352 12.245 12.019 11.735 11.464 11.198 10.908 10.628 10.339 10.09 9.866 9.654 9.468 9.29 9.104 8.899 8.714 8.549 8.382 8.2 8.036 7.859 7.67 7.517 7.365 7.226 7.078 6.918 6.805 6.685 6.497 6.352 6.203 6.13 5.974 5.81 5.642 5.555 5.338 5.241 5.129 5.02 4.819 4.707 4.575 4.439 4.314 4.172 3.981 3.622 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt deleted file mode 100644 index 53e8cada..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14387 ,TETRA ,17589836,Sat Nov 27 19:18:40 CET,Sat Nov 27 21:08:35 CET,0.0 0.919 1.152 1.351 1.524 1.674 1.826 1.991 2.288 2.416 2.54 2.655 2.884 2.978 3.146 3.323 3.495 3.574 3.718 3.853 4.047 4.17 4.296 4.499 4.685 4.852 5.008 5.144 5.337 5.531 5.702 5.892 6.07 6.252 6.475 6.71 6.908 7.138 7.394 7.663 7.929 8.209 8.518 8.789 9.096 9.429 9.773 10.113 10.422 10.647 10.569 10.034 9.431 8.863 8.339 7.824 7.319 6.851 6.458 6.055 5.694 5.373 5.07 4.804 4.549 4.311 4.071 3.86 3.661 3.447 3.238 3.056 2.871 2.678 2.525 2.381 2.237 2.084 1.924 1.82 1.711 1.544 1.428 1.3 1.237 1.106 0.963 0.801 0.717 0.51 0.48 0.401 0.316 0.123 0.009 -0.107 -0.227 -0.369 -0.528 -0.723 -1.075 -2 ,32113 ,TETRA ,17589837,Sat Nov 27 19:18:40 CET,Sat Nov 27 21:08:10 CET,0.0 0.752 1.113 1.374 1.585 1.787 1.969 2.113 2.35 2.475 2.596 2.692 2.923 3.032 3.228 3.401 3.561 3.635 3.783 3.925 4.115 4.246 4.37 4.556 4.741 4.919 5.082 5.222 5.404 5.58 5.74 5.929 6.118 6.296 6.495 6.725 6.944 7.163 7.39 7.652 7.932 8.228 8.539 8.837 9.165 9.473 9.788 10.067 10.316 10.506 10.345 9.831 9.247 8.643 8.102 7.617 7.175 6.728 6.338 5.932 5.559 5.238 4.925 4.618 4.337 4.087 3.827 3.598 3.402 3.185 2.964 2.775 2.562 2.347 2.191 2.017 1.836 1.664 1.477 1.336 1.196 0.981 0.823 0.665 0.587 0.424 0.237 0.049 -0.041 -0.266 -0.356 -0.468 -0.593 -0.861 -1.007 -1.166 -1.336 -1.495 -1.645 -1.873 -2.405 -3 ,28947 ,TETRA ,17589838,Sat Nov 27 19:18:40 CET,Sat Nov 27 21:09:36 CET,0.0 0.509 0.718 0.917 1.075 1.2 1.349 1.498 1.754 1.871 1.978 2.054 2.268 2.364 2.549 2.723 2.882 2.964 3.128 3.268 3.467 3.593 3.715 3.885 4.038 4.193 4.355 4.51 4.704 4.881 5.034 5.227 5.432 5.627 5.842 6.066 6.28 6.506 6.73 6.956 7.193 7.468 7.784 8.078 8.364 8.661 9.01 9.317 9.577 9.764 9.688 9.209 8.647 8.052 7.458 6.908 6.427 6.006 5.611 5.187 4.825 4.52 4.246 3.964 3.675 3.406 3.121 2.856 2.618 2.379 2.153 1.974 1.783 1.579 1.422 1.256 1.075 0.89 0.718 0.603 0.475 0.267 0.121 -0.04 -0.125 -0.283 -0.436 -0.592 -0.678 -0.9 -0.961 -1.051 -1.152 -1.372 -1.487 -1.612 -1.745 -1.877 -2.023 -2.24 -2.741 -4 ,23927 ,TETRA ,17589839,Sat Nov 27 19:18:42 CET,Sat Nov 27 21:10:14 CET,0.0 0.958 1.297 1.542 1.724 1.893 2.064 2.226 2.514 2.638 2.747 2.86 3.087 3.175 3.355 3.542 3.719 3.797 3.942 4.086 4.277 4.396 4.518 4.697 4.868 5.031 5.196 5.35 5.542 5.735 5.912 6.126 6.324 6.506 6.709 6.938 7.171 7.41 7.648 7.894 8.146 8.423 8.708 8.988 9.305 9.623 9.977 10.328 10.633 10.771 10.624 10.172 9.571 8.939 8.368 7.848 7.393 6.972 6.595 6.201 5.836 5.498 5.185 4.898 4.639 4.397 4.128 3.89 3.689 3.485 3.271 3.086 2.892 2.69 2.528 2.36 2.177 1.976 1.785 1.668 1.548 1.357 1.227 1.09 1.021 0.894 0.761 0.608 0.533 0.326 0.283 0.201 0.119 -0.073 -0.178 -0.291 -0.428 -0.584 -0.747 -0.945 -1.416 -5 ,18190 ,TETRA ,17589840,Sat Nov 27 19:18:42 CET,Sat Nov 27 21:10:04 CET,0.0 0.524 0.779 1.0 1.171 1.311 1.444 1.567 1.788 1.876 1.958 2.006 2.228 2.331 2.526 2.705 2.871 2.948 3.101 3.256 3.454 3.576 3.705 3.893 4.059 4.227 4.389 4.528 4.725 4.913 5.069 5.259 5.453 5.644 5.856 6.073 6.283 6.505 6.72 6.974 7.235 7.492 7.795 8.089 8.398 8.728 9.068 9.363 9.641 9.821 9.683 9.173 8.588 8.046 7.528 7.0 6.507 6.053 5.662 5.278 4.938 4.626 4.322 4.037 3.768 3.51 3.239 3.007 2.793 2.567 2.346 2.163 1.963 1.749 1.585 1.418 1.248 1.07 0.894 0.769 0.641 0.433 0.277 0.126 0.046 -0.121 -0.306 -0.503 -0.606 -0.83 -0.893 -0.993 -1.103 -1.314 -1.412 -1.541 -1.68 -1.824 -2.005 -2.209 -2.47 -6 ,5039 ,TETRA ,17589841,Sat Nov 27 19:18:42 CET,Sat Nov 27 21:08:45 CET,0.0 0.854 1.221 1.515 1.737 1.909 2.063 2.214 2.488 2.616 2.745 2.864 3.08 3.171 3.355 3.539 3.711 3.79 3.945 4.085 4.265 4.388 4.507 4.678 4.842 4.995 5.138 5.293 5.501 5.69 5.861 6.056 6.25 6.424 6.61 6.816 7.027 7.258 7.498 7.763 8.05 8.353 8.677 9.009 9.348 9.655 9.97 10.271 10.548 10.747 10.642 10.126 9.512 8.915 8.392 7.923 7.498 7.082 6.705 6.323 5.987 5.672 5.364 5.068 4.796 4.566 4.307 4.065 3.871 3.663 3.45 3.284 3.114 2.924 2.784 2.65 2.505 2.344 2.178 2.069 1.958 1.79 1.664 1.522 1.456 1.327 1.178 1.023 0.941 0.729 0.692 0.598 0.499 0.297 0.189 0.078 -0.05 -0.227 -0.439 -0.703 -1.228 -7 ,18394 ,TETRA ,17589842,Sat Nov 27 19:18:43 CET,Sat Nov 27 21:09:41 CET,0.0 0.701 0.979 1.208 1.378 1.505 1.616 1.735 1.999 2.128 2.248 2.348 2.566 2.661 2.84 3.021 3.185 3.267 3.434 3.585 3.797 3.927 4.046 4.224 4.388 4.536 4.684 4.836 5.028 5.214 5.395 5.594 5.779 5.953 6.152 6.369 6.577 6.802 7.038 7.295 7.574 7.86 8.16 8.431 8.708 9.009 9.361 9.722 10.059 10.292 10.223 9.822 9.319 8.806 8.327 7.839 7.377 6.958 6.583 6.188 5.817 5.466 5.146 4.84 4.549 4.294 4.031 3.789 3.573 3.355 3.139 2.958 2.766 2.556 2.395 2.246 2.084 1.902 1.721 1.603 1.478 1.264 1.123 0.981 0.906 0.747 0.57 0.401 0.309 0.079 -0.017 -0.124 -0.23 -0.495 -0.643 -0.791 -0.949 -1.099 -1.251 -1.436 -1.835 -8 ,23431 ,TETRA ,17589843,Sat Nov 27 19:18:42 CET,Sat Nov 27 21:11:00 CET,0.0 0.63 0.885 1.067 1.225 1.372 1.509 1.633 1.89 2.019 2.132 2.202 2.414 2.493 2.649 2.806 2.96 3.03 3.168 3.296 3.462 3.574 3.682 3.833 3.983 4.133 4.276 4.401 4.572 4.741 4.886 5.058 5.224 5.371 5.549 5.763 5.959 6.165 6.382 6.609 6.837 7.074 7.383 7.672 7.954 8.267 8.626 8.993 9.297 9.457 9.364 8.96 8.478 7.95 7.397 6.902 6.454 6.018 5.642 5.252 4.885 4.548 4.238 3.933 3.642 3.379 3.098 2.849 2.633 2.417 2.187 1.983 1.781 1.575 1.414 1.239 1.055 0.865 0.669 0.541 0.408 0.189 0.044 -0.104 -0.183 -0.344 -0.511 -0.688 -0.774 -0.99 -1.082 -1.191 -1.3 -1.53 -1.676 -1.839 -2.006 -2.217 -2.442 -2.715 -3.238 -9 ,972 ,TETRA ,17589844,Sat Nov 27 19:18:44 CET,Sat Nov 27 21:12:19 CET,0.0 0.655 0.903 1.096 1.254 1.394 1.521 1.637 1.833 1.93 2.036 2.113 2.324 2.406 2.554 2.712 2.864 2.935 3.078 3.213 3.404 3.511 3.613 3.777 3.935 4.079 4.228 4.392 4.589 4.771 4.95 5.157 5.354 5.55 5.751 5.957 6.171 6.418 6.665 6.906 7.143 7.398 7.696 7.976 8.279 8.602 8.928 9.245 9.544 9.713 9.645 9.147 8.508 7.928 7.392 6.873 6.414 5.979 5.588 5.173 4.81 4.482 4.166 3.88 3.602 3.364 3.117 2.885 2.693 2.491 2.282 2.113 1.95 1.773 1.625 1.479 1.333 1.178 1.014 0.905 0.796 0.619 0.502 0.385 0.324 0.187 0.028 -0.144 -0.238 -0.456 -0.495 -0.586 -0.68 -0.876 -0.985 -1.109 -1.24 -1.361 -1.51 -1.707 -2.044 -10 ,5473 ,TETRA ,17589845,Sat Nov 27 19:18:42 CET,Sat Nov 27 21:11:33 CET,0.0 0.47 0.736 0.955 1.12 1.27 1.41 1.531 1.766 1.876 1.979 2.045 2.256 2.336 2.487 2.619 2.747 2.812 2.936 3.055 3.218 3.327 3.438 3.597 3.739 3.86 3.969 4.085 4.259 4.432 4.592 4.775 4.951 5.117 5.288 5.48 5.663 5.846 6.037 6.248 6.474 6.734 7.055 7.355 7.666 8.017 8.343 8.605 8.876 9.068 8.998 8.595 8.075 7.514 6.971 6.453 6.0 5.564 5.171 4.779 4.432 4.128 3.829 3.521 3.225 2.966 2.711 2.484 2.265 2.038 1.814 1.625 1.437 1.257 1.11 0.953 0.789 0.611 0.418 0.288 0.161 -0.017 -0.13 -0.252 -0.32 -0.458 -0.606 -0.77 -0.842 -1.046 -1.09 -1.181 -1.281 -1.494 -1.61 -1.721 -1.842 -1.981 -2.143 -2.348 -2.917 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt deleted file mode 100644 index e1576a57..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8086 ,TETRA ,17589846,Sat Nov 27 19:18:42 CET,Sat Nov 27 21:13:57 CET,0.0 0.37 0.53 0.639 0.747 0.845 0.936 1.018 1.166 1.241 1.306 1.295 1.479 1.541 1.665 1.782 1.889 1.944 2.042 2.132 2.274 2.359 2.439 2.563 2.679 2.792 2.908 3.014 3.138 3.26 3.385 3.546 3.705 3.856 4.036 4.237 4.439 4.669 4.907 5.154 5.419 5.716 6.058 6.389 6.733 7.097 7.506 7.934 8.407 8.842 9.116 9.058 8.817 8.511 8.173 7.806 7.458 7.119 6.808 6.462 6.167 5.917 5.65 5.382 5.134 4.903 4.671 4.468 4.289 4.093 3.872 3.687 3.508 3.329 3.19 3.046 2.884 2.708 2.529 2.408 2.285 2.09 1.94 1.784 1.714 1.575 1.411 1.231 1.141 0.936 0.901 0.822 0.734 0.538 0.431 0.314 0.183 0.05 -0.098 -0.302 -0.67 -2 ,9059 ,TETRA ,17589847,Sat Nov 27 19:18:43 CET,Sat Nov 27 21:10:10 CET,0.0 0.323 0.51 0.641 0.759 0.848 0.918 0.992 1.145 1.214 1.288 1.308 1.497 1.557 1.664 1.771 1.874 1.922 2.017 2.115 2.254 2.347 2.444 2.594 2.737 2.875 3.008 3.132 3.292 3.445 3.603 3.796 3.973 4.147 4.351 4.577 4.793 5.028 5.284 5.545 5.797 6.089 6.426 6.737 7.085 7.461 7.863 8.287 8.775 9.25 9.516 9.419 9.148 8.813 8.468 8.124 7.78 7.417 7.082 6.748 6.459 6.192 5.935 5.683 5.439 5.218 4.985 4.778 4.605 4.426 4.233 4.066 3.883 3.689 3.538 3.374 3.195 3.018 2.847 2.729 2.606 2.407 2.266 2.116 2.035 1.875 1.71 1.523 1.425 1.203 1.105 0.998 0.888 0.651 0.515 0.375 0.239 0.061 -0.164 -0.477 -1.234 -3 ,9262 ,TETRA ,17589848,Sat Nov 27 19:18:43 CET,Sat Nov 27 21:12:13 CET,0.0 0.23 0.349 0.43 0.511 0.596 0.674 0.751 0.899 0.967 1.032 1.04 1.237 1.311 1.449 1.58 1.723 1.792 1.918 2.038 2.209 2.322 2.434 2.6 2.749 2.886 3.013 3.128 3.285 3.448 3.602 3.778 3.944 4.112 4.306 4.516 4.712 4.926 5.163 5.429 5.708 6.011 6.346 6.672 7.069 7.495 7.894 8.31 8.774 9.187 9.468 9.425 9.171 8.859 8.546 8.189 7.828 7.479 7.165 6.853 6.576 6.331 6.09 5.84 5.599 5.37 5.124 4.922 4.747 4.561 4.374 4.194 3.999 3.812 3.673 3.528 3.375 3.219 3.048 2.926 2.797 2.597 2.453 2.303 2.226 2.061 1.888 1.704 1.608 1.385 1.289 1.177 1.055 0.794 0.662 0.499 0.315 0.124 -0.113 -0.485 -1.374 -4 ,15241 ,TETRA ,17589849,Sat Nov 27 19:18:45 CET,Sat Nov 27 21:11:46 CET,0.0 0.283 0.402 0.526 0.654 0.764 0.858 0.94 1.089 1.156 1.22 1.226 1.413 1.472 1.579 1.685 1.786 1.837 1.941 2.04 2.186 2.284 2.375 2.498 2.616 2.737 2.851 2.954 3.093 3.234 3.38 3.571 3.754 3.916 4.106 4.322 4.529 4.753 4.987 5.25 5.521 5.806 6.133 6.475 6.853 7.226 7.627 8.063 8.509 8.921 9.195 9.149 8.938 8.618 8.269 7.903 7.534 7.2 6.883 6.548 6.262 5.993 5.728 5.466 5.228 5.02 4.803 4.594 4.404 4.207 3.999 3.829 3.655 3.475 3.341 3.2 3.044 2.877 2.705 2.589 2.466 2.275 2.137 1.987 1.921 1.786 1.648 1.519 1.438 1.226 1.175 1.088 1.001 0.816 0.709 0.591 0.472 0.349 0.19 -0.02 -0.428 -5 ,5736 ,TETRA ,17589850,Sat Nov 27 19:18:43 CET,Sat Nov 27 21:11:06 CET,0.0 0.951 1.243 1.429 1.594 1.748 1.887 2.0 2.176 2.273 2.376 2.439 2.644 2.724 2.872 3.021 3.176 3.248 3.382 3.511 3.684 3.794 3.907 4.065 4.211 4.351 4.486 4.617 4.777 4.933 5.094 5.294 5.479 5.653 5.852 6.073 6.281 6.5 6.738 6.984 7.248 7.538 7.854 8.191 8.58 8.968 9.383 9.81 10.232 10.623 10.897 10.859 10.633 10.325 9.99 9.617 9.226 8.849 8.52 8.196 7.905 7.634 7.387 7.152 6.915 6.699 6.468 6.261 6.086 5.897 5.694 5.531 5.354 5.166 5.022 4.882 4.745 4.603 4.463 4.365 4.265 4.109 3.988 3.854 3.787 3.654 3.512 3.371 3.302 3.111 3.081 2.993 2.895 2.696 2.596 2.49 2.373 2.243 2.092 1.912 1.577 -6 ,32559 ,TETRA ,17589851,Sat Nov 27 19:18:43 CET,Sat Nov 27 21:10:35 CET,0.0 0.194 0.327 0.443 0.534 0.626 0.723 0.807 0.952 1.029 1.114 1.178 1.387 1.465 1.624 1.776 1.924 1.994 2.123 2.246 2.42 2.534 2.642 2.793 2.939 3.087 3.233 3.369 3.538 3.702 3.851 4.034 4.212 4.378 4.576 4.787 4.982 5.204 5.449 5.707 5.969 6.259 6.574 6.88 7.233 7.632 8.09 8.559 9.048 9.476 9.729 9.611 9.301 8.96 8.582 8.18 7.822 7.487 7.192 6.893 6.608 6.339 6.068 5.801 5.561 5.343 5.09 4.871 4.703 4.517 4.313 4.151 3.985 3.816 3.683 3.536 3.377 3.211 3.041 2.919 2.794 2.599 2.456 2.3 2.222 2.066 1.914 1.756 1.674 1.474 1.427 1.334 1.243 1.055 0.946 0.811 0.66 0.513 0.355 0.158 -0.169 -7 ,1628 ,TETRA ,17589852,Sat Nov 27 19:18:45 CET,Sat Nov 27 21:10:37 CET,0.0 0.191 0.322 0.43 0.527 0.623 0.719 0.803 0.957 1.027 1.092 1.086 1.27 1.33 1.446 1.551 1.652 1.705 1.81 1.914 2.065 2.163 2.268 2.418 2.557 2.691 2.826 2.961 3.135 3.303 3.461 3.638 3.812 3.987 4.181 4.395 4.613 4.856 5.11 5.393 5.673 5.965 6.304 6.633 7.0 7.389 7.798 8.225 8.692 9.128 9.421 9.385 9.105 8.74 8.39 8.027 7.646 7.285 6.98 6.677 6.41 6.147 5.886 5.649 5.42 5.192 4.956 4.745 4.552 4.363 4.155 3.975 3.787 3.588 3.44 3.292 3.131 2.959 2.802 2.694 2.57 2.357 2.209 2.067 1.994 1.819 1.64 1.474 1.383 1.178 1.111 1.015 0.918 0.696 0.578 0.462 0.347 0.24 0.106 -0.078 -0.333 -8 ,25882 ,TETRA ,17589853,Sat Nov 27 19:18:43 CET,Sat Nov 27 21:13:20 CET,0.0 0.262 0.391 0.512 0.608 0.695 0.781 0.858 1.006 1.078 1.148 1.157 1.347 1.41 1.537 1.661 1.775 1.831 1.935 2.028 2.156 2.239 2.324 2.442 2.553 2.665 2.783 2.891 3.025 3.17 3.324 3.499 3.653 3.795 3.958 4.153 4.361 4.585 4.799 5.027 5.273 5.566 5.912 6.239 6.612 7.003 7.414 7.846 8.303 8.811 9.189 9.135 8.836 8.44 8.022 7.624 7.272 6.926 6.602 6.244 5.945 5.703 5.45 5.202 4.964 4.742 4.509 4.286 4.101 3.92 3.739 3.582 3.403 3.223 3.082 2.939 2.787 2.619 2.442 2.326 2.202 1.988 1.846 1.697 1.618 1.465 1.306 1.121 1.02 0.805 0.74 0.624 0.495 0.236 0.099 -0.074 -0.274 -0.475 -0.7 -0.989 -1.561 -9 ,18761 ,TETRA ,17589854,Sat Nov 27 19:18:43 CET,Sat Nov 27 21:10:36 CET,0.0 0.285 0.445 0.548 0.641 0.724 0.792 0.874 1.052 1.138 1.222 1.237 1.427 1.5 1.653 1.802 1.93 1.99 2.109 2.218 2.391 2.502 2.603 2.754 2.899 3.041 3.184 3.323 3.487 3.642 3.796 3.976 4.152 4.326 4.541 4.775 4.98 5.201 5.442 5.693 5.948 6.249 6.589 6.901 7.259 7.661 8.094 8.536 8.985 9.42 9.752 9.676 9.402 9.103 8.782 8.409 8.009 7.637 7.323 7.003 6.707 6.427 6.158 5.907 5.676 5.463 5.248 5.037 4.839 4.636 4.429 4.26 4.075 3.878 3.721 3.559 3.396 3.231 3.056 2.934 2.808 2.61 2.464 2.311 2.228 2.051 1.882 1.698 1.607 1.393 1.321 1.226 1.121 0.875 0.746 0.634 0.521 0.384 0.228 0.044 -0.322 -10 ,20020 ,TETRA ,17589855,Sat Nov 27 19:19:41 CET,Sat Nov 27 21:12:03 CET,0.0 0.222 0.362 0.497 0.599 0.69 0.777 0.85 0.987 1.058 1.129 1.142 1.333 1.392 1.513 1.626 1.735 1.788 1.884 1.972 2.115 2.215 2.303 2.426 2.541 2.655 2.779 2.904 3.062 3.213 3.353 3.512 3.648 3.785 3.957 4.147 4.323 4.518 4.731 4.953 5.211 5.507 5.839 6.178 6.526 6.892 7.322 7.767 8.211 8.594 8.846 8.844 8.564 8.195 7.852 7.476 7.147 6.832 6.52 6.204 5.925 5.671 5.424 5.171 4.932 4.722 4.499 4.291 4.103 3.893 3.668 3.488 3.3 3.107 2.966 2.827 2.678 2.513 2.333 2.205 2.067 1.853 1.712 1.566 1.491 1.346 1.186 1.022 0.942 0.727 0.651 0.545 0.429 0.204 0.069 -0.093 -0.278 -0.497 -0.718 -0.942 -1.402 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt deleted file mode 100644 index 0974eb41..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30631 ,TETRA ,17589856,Sat Nov 27 19:19:41 CET,Sat Nov 27 21:14:22 CET,0.0 0.23 0.37 0.498 0.584 0.668 0.756 0.837 0.99 1.061 1.133 1.16 1.359 1.431 1.561 1.692 1.819 1.877 1.984 2.091 2.246 2.355 2.469 2.616 2.759 2.902 3.034 3.157 3.312 3.467 3.62 3.797 3.964 4.128 4.311 4.506 4.696 4.91 5.135 5.384 5.659 5.951 6.269 6.574 6.92 7.297 7.715 8.13 8.502 8.824 9.018 8.886 8.571 8.132 7.677 7.217 6.777 6.373 6.002 5.606 5.261 4.955 4.653 4.368 4.101 3.849 3.593 3.373 3.178 2.955 2.723 2.533 2.328 2.113 1.949 1.783 1.601 1.402 1.211 1.085 0.95 0.739 0.6 0.437 0.352 0.193 0.04 -0.124 -0.212 -0.421 -0.493 -0.599 -0.708 -0.946 -1.079 -1.233 -1.402 -1.586 -1.808 -2.089 -2.684 -2 ,32358 ,TETRA ,17589857,Sat Nov 27 19:19:41 CET,Sat Nov 27 21:15:13 CET,0.0 0.252 0.422 0.534 0.619 0.708 0.803 0.894 1.049 1.113 1.177 1.179 1.357 1.406 1.505 1.604 1.703 1.755 1.858 1.95 2.078 2.156 2.234 2.356 2.473 2.592 2.721 2.837 2.979 3.138 3.292 3.46 3.629 3.8 3.994 4.21 4.424 4.651 4.878 5.112 5.367 5.673 6.014 6.329 6.675 7.052 7.477 7.888 8.281 8.628 8.784 8.613 8.249 7.816 7.362 6.908 6.474 6.076 5.729 5.369 5.047 4.745 4.447 4.162 3.885 3.621 3.351 3.095 2.855 2.618 2.386 2.19 1.988 1.771 1.605 1.435 1.257 1.073 0.868 0.717 0.567 0.343 0.18 0.012 -0.075 -0.258 -0.442 -0.631 -0.728 -0.948 -1.065 -1.193 -1.327 -1.614 -1.77 -1.945 -2.111 -2.28 -2.485 -2.717 -3.561 -3 ,8498 ,TETRA ,17589858,Sat Nov 27 19:19:41 CET,Sat Nov 27 21:13:14 CET,0.0 0.432 0.588 0.709 0.806 0.894 0.982 1.061 1.222 1.307 1.381 1.376 1.553 1.616 1.737 1.847 1.96 2.008 2.109 2.214 2.35 2.434 2.523 2.655 2.771 2.89 3.009 3.118 3.265 3.413 3.566 3.753 3.92 4.083 4.271 4.469 4.663 4.881 5.106 5.343 5.599 5.881 6.223 6.562 6.91 7.303 7.714 8.087 8.477 8.85 9.06 8.84 8.407 7.948 7.479 7.019 6.618 6.23 5.857 5.472 5.146 4.844 4.534 4.232 3.965 3.739 3.492 3.257 3.06 2.841 2.593 2.404 2.227 2.038 1.886 1.742 1.597 1.432 1.248 1.126 1.002 0.81 0.674 0.528 0.46 0.323 0.154 -0.024 -0.106 -0.317 -0.39 -0.499 -0.611 -0.859 -1.004 -1.144 -1.301 -1.497 -1.706 -1.975 -2.662 -4 ,16985 ,TETRA ,17589859,Sat Nov 27 19:19:41 CET,Sat Nov 27 21:08:11 CET,0.0 0.201 0.328 0.442 0.559 0.668 0.773 0.871 1.029 1.099 1.164 1.168 1.35 1.407 1.531 1.659 1.784 1.847 1.969 2.083 2.248 2.348 2.442 2.581 2.725 2.862 2.993 3.118 3.283 3.446 3.6 3.79 3.974 4.133 4.308 4.513 4.71 4.928 5.173 5.424 5.678 5.956 6.261 6.576 6.945 7.323 7.718 8.11 8.507 8.922 9.208 9.047 8.684 8.273 7.824 7.332 6.879 6.496 6.155 5.794 5.465 5.165 4.889 4.639 4.387 4.135 3.885 3.661 3.468 3.252 3.012 2.823 2.622 2.406 2.245 2.077 1.882 1.694 1.516 1.388 1.257 1.041 0.886 0.724 0.645 0.477 0.283 0.091 -0.007 -0.231 -0.326 -0.449 -0.588 -0.886 -1.041 -1.216 -1.396 -1.596 -1.859 -2.199 -3.06 -5 ,22667 ,TETRA ,17589860,Sat Nov 27 19:19:42 CET,Sat Nov 27 21:12:06 CET,0.0 0.197 0.359 0.464 0.539 0.613 0.695 0.776 0.942 1.021 1.092 1.097 1.277 1.34 1.48 1.619 1.739 1.798 1.92 2.033 2.199 2.307 2.41 2.565 2.718 2.856 2.981 3.103 3.257 3.412 3.569 3.752 3.926 4.098 4.296 4.516 4.715 4.934 5.171 5.415 5.674 5.96 6.283 6.584 6.915 7.278 7.672 8.069 8.477 8.847 9.098 8.959 8.641 8.243 7.791 7.367 6.982 6.61 6.255 5.881 5.53 5.214 4.932 4.664 4.414 4.183 3.939 3.708 3.5 3.283 3.058 2.878 2.69 2.481 2.311 2.144 1.973 1.798 1.607 1.468 1.322 1.089 0.934 0.775 0.686 0.49 0.309 0.141 0.046 -0.182 -0.313 -0.45 -0.6 -0.907 -1.073 -1.268 -1.492 -1.734 -2.003 -2.331 -3.213 -6 ,17929 ,TETRA ,17589861,Sat Nov 27 19:19:41 CET,Sat Nov 27 21:13:09 CET,0.0 0.214 0.336 0.433 0.518 0.61 0.696 0.766 0.901 0.963 1.032 1.041 1.225 1.288 1.405 1.527 1.639 1.689 1.778 1.869 2.004 2.087 2.172 2.299 2.432 2.57 2.71 2.845 3.01 3.163 3.31 3.492 3.67 3.84 4.035 4.248 4.437 4.647 4.883 5.126 5.397 5.689 5.998 6.325 6.698 7.062 7.452 7.842 8.257 8.678 8.893 8.709 8.378 8.001 7.585 7.159 6.738 6.326 5.958 5.576 5.251 4.979 4.703 4.406 4.134 3.903 3.632 3.381 3.174 2.954 2.721 2.53 2.334 2.127 1.96 1.778 1.588 1.394 1.198 1.066 0.94 0.717 0.562 0.409 0.321 0.136 -0.055 -0.272 -0.392 -0.624 -0.737 -0.864 -1.012 -1.321 -1.487 -1.674 -1.882 -2.125 -2.389 -2.684 -3.388 -7 ,17366 ,TETRA ,17589862,Sat Nov 27 19:19:41 CET,Sat Nov 27 21:12:56 CET,0.0 0.271 0.432 0.564 0.657 0.733 0.814 0.896 1.035 1.103 1.168 1.17 1.352 1.412 1.546 1.69 1.823 1.886 2.007 2.119 2.282 2.385 2.48 2.622 2.769 2.908 3.041 3.169 3.326 3.485 3.645 3.83 4.004 4.175 4.37 4.586 4.789 5.017 5.259 5.511 5.781 6.075 6.406 6.728 7.077 7.449 7.851 8.251 8.657 9.031 9.236 9.099 8.759 8.325 7.854 7.391 6.983 6.599 6.234 5.866 5.546 5.233 4.92 4.65 4.416 4.186 3.935 3.699 3.498 3.287 3.045 2.857 2.669 2.464 2.301 2.132 1.941 1.737 1.55 1.419 1.269 1.027 0.866 0.708 0.631 0.474 0.308 0.122 0.027 -0.194 -0.274 -0.377 -0.487 -0.721 -0.862 -1.013 -1.163 -1.348 -1.56 -1.785 -2.29 -8 ,3073 ,TETRA ,17589863,Sat Nov 27 19:19:42 CET,Sat Nov 27 21:02:56 CET,0.0 0.285 0.429 0.558 0.652 0.742 0.828 0.907 1.05 1.113 1.172 1.17 1.352 1.411 1.534 1.658 1.773 1.821 1.911 2.009 2.144 2.227 2.309 2.433 2.551 2.664 2.776 2.882 3.013 3.139 3.266 3.432 3.592 3.752 3.946 4.17 4.388 4.619 4.861 5.103 5.354 5.634 5.938 6.243 6.606 6.977 7.328 7.716 8.15 8.527 8.696 8.488 8.108 7.698 7.29 6.874 6.442 6.041 5.707 5.352 5.053 4.791 4.528 4.27 4.038 3.829 3.61 3.415 3.238 3.052 2.863 2.711 2.544 2.364 2.221 2.068 1.908 1.742 1.57 1.453 1.339 1.142 0.996 0.842 0.754 0.587 0.414 0.236 0.145 -0.072 -0.148 -0.259 -0.368 -0.58 -0.705 -0.849 -1.005 -1.213 -1.46 -1.745 -2.414 -9 ,1533 ,TETRA ,17589864,Sat Nov 27 19:19:42 CET,Sat Nov 27 21:14:45 CET,0.0 0.305 0.421 0.521 0.613 0.687 0.763 0.848 0.999 1.063 1.125 1.12 1.305 1.363 1.462 1.554 1.653 1.708 1.807 1.896 2.048 2.149 2.251 2.409 2.554 2.68 2.796 2.924 3.104 3.268 3.422 3.606 3.783 3.948 4.132 4.343 4.535 4.738 4.961 5.206 5.462 5.728 6.046 6.366 6.719 7.1 7.503 7.89 8.262 8.611 8.812 8.615 8.222 7.783 7.357 6.917 6.454 6.015 5.649 5.279 4.949 4.665 4.383 4.1 3.831 3.579 3.325 3.093 2.887 2.676 2.45 2.25 2.042 1.816 1.636 1.465 1.288 1.103 0.898 0.756 0.615 0.394 0.242 0.085 0.001 -0.183 -0.369 -0.556 -0.66 -0.893 -0.988 -1.101 -1.232 -1.517 -1.659 -1.799 -1.975 -2.202 -2.429 -2.725 -3.459 -10 ,11061 ,TETRA ,17589865,Sat Nov 27 19:19:41 CET,Sat Nov 27 21:17:32 CET,0.0 0.199 0.336 0.475 0.573 0.659 0.752 0.838 0.988 1.055 1.119 1.126 1.311 1.37 1.481 1.585 1.688 1.741 1.839 1.925 2.06 2.153 2.237 2.357 2.48 2.597 2.696 2.79 2.917 3.045 3.182 3.354 3.514 3.663 3.835 4.038 4.247 4.476 4.7 4.94 5.206 5.49 5.786 6.099 6.45 6.825 7.255 7.677 8.08 8.448 8.666 8.454 8.059 7.629 7.224 6.836 6.455 6.067 5.711 5.325 4.975 4.663 4.363 4.079 3.816 3.572 3.302 3.058 2.83 2.589 2.351 2.158 1.966 1.749 1.577 1.404 1.225 1.049 0.863 0.736 0.613 0.413 0.272 0.123 0.041 -0.129 -0.313 -0.501 -0.589 -0.798 -0.881 -0.989 -1.092 -1.334 -1.485 -1.651 -1.838 -2.034 -2.227 -2.482 -3.12 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt deleted file mode 100644 index 364cf932..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22980 ,TETRA ,17589866,Sat Nov 27 19:19:42 CET,Sat Nov 27 21:12:41 CET,0.0 0.351 0.473 0.581 0.681 0.764 0.837 0.906 1.056 1.135 1.204 1.212 1.398 1.462 1.582 1.685 1.782 1.83 1.927 2.016 2.144 2.23 2.315 2.443 2.559 2.679 2.81 2.943 3.102 3.249 3.403 3.587 3.759 3.921 4.098 4.29 4.468 4.677 4.913 5.152 5.396 5.653 5.941 6.224 6.52 6.821 7.134 7.427 7.731 7.975 7.992 7.608 7.076 6.523 6.024 5.554 5.1 4.691 4.327 3.944 3.614 3.317 3.024 2.755 2.509 2.276 2.021 1.773 1.567 1.378 1.177 1.005 0.826 0.648 0.513 0.373 0.236 0.091 -0.06 -0.164 -0.27 -0.431 -0.545 -0.667 -0.732 -0.861 -0.989 -1.132 -1.205 -1.409 -1.467 -1.563 -1.65 -1.835 -1.941 -2.043 -2.144 -2.282 -2.443 -2.595 -2.828 -2 ,22517 ,TETRA ,17589867,Sat Nov 27 19:19:45 CET,Sat Nov 27 21:12:48 CET,0.0 0.24 0.361 0.462 0.552 0.64 0.723 0.796 0.931 0.999 1.06 1.066 1.26 1.332 1.46 1.579 1.714 1.782 1.903 2.022 2.184 2.278 2.376 2.534 2.685 2.828 2.959 3.078 3.24 3.411 3.571 3.749 3.925 4.095 4.268 4.462 4.652 4.852 5.069 5.297 5.539 5.808 6.093 6.392 6.741 7.1 7.447 7.758 8.079 8.329 8.349 8.011 7.46 6.915 6.433 5.952 5.495 5.059 4.672 4.289 3.957 3.655 3.368 3.095 2.825 2.577 2.323 2.084 1.876 1.669 1.461 1.289 1.104 0.906 0.753 0.6 0.447 0.28 0.093 -0.038 -0.171 -0.374 -0.512 -0.657 -0.736 -0.905 -1.076 -1.256 -1.347 -1.556 -1.637 -1.745 -1.856 -2.094 -2.234 -2.394 -2.574 -2.786 -3.031 -3.394 -4.026 -3 ,20300 ,TETRA ,17589868,Sat Nov 27 19:19:42 CET,Sat Nov 27 21:12:02 CET,0.0 0.299 0.445 0.545 0.633 0.717 0.802 0.887 1.061 1.141 1.213 1.239 1.43 1.496 1.619 1.725 1.825 1.877 1.973 2.069 2.215 2.312 2.413 2.562 2.704 2.852 2.998 3.126 3.291 3.446 3.588 3.766 3.939 4.098 4.278 4.472 4.668 4.895 5.115 5.334 5.566 5.822 6.106 6.385 6.702 7.039 7.383 7.696 7.98 8.177 8.112 7.693 7.196 6.693 6.209 5.726 5.285 4.876 4.515 4.148 3.833 3.551 3.268 2.994 2.735 2.505 2.271 2.06 1.864 1.653 1.44 1.265 1.085 0.899 0.748 0.59 0.425 0.239 0.044 -0.084 -0.212 -0.406 -0.549 -0.697 -0.77 -0.921 -1.087 -1.266 -1.358 -1.575 -1.663 -1.773 -1.884 -2.109 -2.213 -2.327 -2.447 -2.576 -2.72 -2.866 -3.092 -4 ,14158 ,TETRA ,17589869,Sat Nov 27 19:19:43 CET,Sat Nov 27 21:14:24 CET,0.0 0.254 0.407 0.536 0.647 0.757 0.848 0.934 1.092 1.159 1.223 1.237 1.431 1.503 1.642 1.773 1.893 1.952 2.075 2.197 2.375 2.488 2.589 2.729 2.855 2.983 3.119 3.248 3.415 3.581 3.738 3.919 4.089 4.253 4.447 4.657 4.846 5.053 5.283 5.509 5.733 5.995 6.297 6.571 6.882 7.236 7.605 7.949 8.25 8.495 8.467 8.05 7.556 7.062 6.565 6.075 5.639 5.246 4.892 4.51 4.191 3.92 3.643 3.381 3.135 2.903 2.659 2.432 2.229 2.021 1.799 1.609 1.413 1.22 1.068 0.899 0.737 0.578 0.405 0.284 0.159 -0.037 -0.17 -0.307 -0.386 -0.559 -0.732 -0.918 -1.021 -1.24 -1.315 -1.418 -1.524 -1.74 -1.87 -2.023 -2.19 -2.389 -2.655 -2.987 -3.921 -5 ,182 ,TETRA ,17589870,Sat Nov 27 19:19:43 CET,Sat Nov 27 21:13:15 CET,0.0 0.192 0.357 0.536 0.685 0.824 0.973 1.103 1.313 1.407 1.496 1.526 1.723 1.798 1.94 2.085 2.221 2.28 2.386 2.495 2.665 2.772 2.873 3.018 3.17 3.322 3.45 3.58 3.763 3.93 4.077 4.243 4.407 4.572 4.761 4.966 5.17 5.384 5.591 5.813 6.048 6.308 6.603 6.889 7.219 7.558 7.882 8.19 8.454 8.647 8.653 8.302 7.835 7.329 6.839 6.344 5.914 5.517 5.141 4.769 4.437 4.122 3.833 3.554 3.281 3.036 2.781 2.557 2.356 2.136 1.912 1.739 1.569 1.395 1.262 1.121 0.976 0.823 0.658 0.549 0.443 0.279 0.159 0.037 -0.028 -0.167 -0.298 -0.428 -0.496 -0.689 -0.732 -0.824 -0.898 -1.057 -1.155 -1.27 -1.406 -1.541 -1.686 -1.837 -2.096 -6 ,27834 ,TETRA ,17589871,Sat Nov 27 19:20:40 CET,Sat Nov 27 21:14:43 CET,0.0 0.219 0.371 0.491 0.593 0.696 0.785 0.858 0.991 1.054 1.122 1.135 1.32 1.381 1.506 1.619 1.717 1.763 1.859 1.953 2.076 2.157 2.24 2.367 2.49 2.611 2.727 2.833 2.971 3.105 3.229 3.379 3.523 3.666 3.835 4.022 4.202 4.393 4.582 4.776 4.987 5.224 5.493 5.752 6.043 6.355 6.699 7.048 7.395 7.648 7.638 7.293 6.795 6.274 5.767 5.271 4.823 4.411 4.048 3.677 3.354 3.076 2.805 2.528 2.268 2.029 1.779 1.56 1.373 1.172 0.956 0.793 0.634 0.456 0.321 0.186 0.055 -0.074 -0.211 -0.311 -0.421 -0.582 -0.701 -0.833 -0.905 -1.052 -1.184 -1.32 -1.395 -1.594 -1.65 -1.741 -1.825 -2.0 -2.117 -2.233 -2.336 -2.47 -2.625 -2.808 -3.138 -7 ,22464 ,TETRA ,17589872,Sat Nov 27 19:20:40 CET,Sat Nov 27 21:16:26 CET,0.0 0.219 0.337 0.439 0.533 0.622 0.699 0.766 0.892 0.951 1.011 1.003 1.181 1.242 1.356 1.469 1.573 1.623 1.735 1.852 2.021 2.131 2.236 2.388 2.541 2.689 2.819 2.947 3.115 3.271 3.42 3.597 3.779 3.947 4.133 4.351 4.556 4.784 5.012 5.233 5.464 5.726 6.028 6.305 6.621 6.968 7.337 7.68 7.972 8.231 8.303 7.991 7.47 6.908 6.377 5.907 5.488 5.071 4.711 4.345 4.022 3.731 3.455 3.193 2.936 2.698 2.448 2.222 2.029 1.829 1.61 1.418 1.214 1.02 0.877 0.722 0.555 0.378 0.201 0.078 -0.054 -0.262 -0.405 -0.555 -0.632 -0.786 -0.944 -1.096 -1.176 -1.384 -1.431 -1.518 -1.61 -1.799 -1.916 -2.041 -2.152 -2.273 -2.419 -2.612 -2.992 -8 ,16780 ,TETRA ,17589873,Sat Nov 27 19:20:40 CET,Sat Nov 27 21:13:37 CET,0.0 0.213 0.361 0.487 0.599 0.687 0.779 0.872 1.041 1.115 1.176 1.167 1.343 1.396 1.506 1.616 1.729 1.785 1.884 1.969 2.101 2.187 2.271 2.393 2.508 2.629 2.763 2.892 3.048 3.204 3.362 3.562 3.738 3.891 4.073 4.283 4.473 4.676 4.901 5.141 5.381 5.639 5.941 6.231 6.545 6.877 7.21 7.538 7.855 8.099 8.114 7.792 7.319 6.755 6.24 5.772 5.324 4.899 4.533 4.143 3.804 3.518 3.242 2.971 2.703 2.46 2.209 1.978 1.789 1.599 1.393 1.207 1.012 0.822 0.669 0.511 0.354 0.187 0.013 -0.104 -0.222 -0.429 -0.584 -0.736 -0.813 -0.971 -1.136 -1.307 -1.398 -1.61 -1.663 -1.743 -1.821 -1.999 -2.093 -2.201 -2.314 -2.436 -2.588 -2.77 -3.055 -9 ,4251 ,TETRA ,17589874,Sat Nov 27 19:20:43 CET,Sat Nov 27 21:13:06 CET,0.0 0.198 0.319 0.432 0.521 0.604 0.688 0.768 0.912 0.978 1.042 1.045 1.23 1.298 1.422 1.525 1.626 1.685 1.807 1.927 2.099 2.205 2.31 2.46 2.597 2.736 2.88 3.011 3.176 3.337 3.494 3.686 3.869 4.04 4.238 4.454 4.645 4.848 5.069 5.302 5.556 5.837 6.138 6.429 6.764 7.095 7.412 7.738 8.064 8.315 8.304 7.917 7.423 6.92 6.45 5.99 5.557 5.159 4.795 4.433 4.119 3.826 3.543 3.27 3.013 2.767 2.51 2.291 2.093 1.884 1.668 1.486 1.3 1.094 0.939 0.787 0.609 0.43 0.261 0.144 0.033 -0.135 -0.246 -0.361 -0.422 -0.546 -0.673 -0.81 -0.881 -1.076 -1.106 -1.181 -1.257 -1.416 -1.52 -1.627 -1.739 -1.867 -2.006 -2.193 -2.463 -10 ,15729 ,TETRA ,17589875,Sat Nov 27 19:20:41 CET,Sat Nov 27 21:13:58 CET,0.0 0.311 0.483 0.604 0.686 0.76 0.832 0.901 1.039 1.108 1.173 1.197 1.387 1.447 1.574 1.692 1.792 1.84 1.931 2.013 2.139 2.226 2.309 2.43 2.542 2.644 2.75 2.854 2.992 3.118 3.241 3.398 3.544 3.694 3.87 4.065 4.253 4.452 4.669 4.908 5.158 5.419 5.693 5.949 6.232 6.567 6.95 7.301 7.612 7.837 7.825 7.426 6.909 6.393 5.903 5.419 4.967 4.542 4.158 3.779 3.454 3.163 2.886 2.607 2.336 2.096 1.853 1.636 1.44 1.23 1.008 0.833 0.653 0.462 0.32 0.165 -0.004 -0.17 -0.343 -0.463 -0.572 -0.736 -0.853 -0.973 -1.034 -1.165 -1.304 -1.436 -1.503 -1.698 -1.733 -1.82 -1.906 -2.098 -2.198 -2.311 -2.43 -2.553 -2.69 -2.843 -3.046 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index b1a197ad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26929 ,TETRA ,17589876,Sat Nov 27 19:20:41 CET,Sat Nov 27 21:05:36 CET,0.0 0.514 0.752 0.937 1.056 1.164 1.264 1.364 1.573 1.664 1.747 1.782 1.964 2.032 2.16 2.273 2.392 2.445 2.544 2.643 2.783 2.874 2.958 3.077 3.189 3.287 3.383 3.472 3.58 3.696 3.806 3.937 4.059 4.159 4.28 4.414 4.544 4.676 4.805 4.945 5.099 5.26 5.427 5.586 5.759 5.912 6.036 6.086 6.01 5.76 5.148 4.142 3.199 2.332 1.559 0.873 0.254 -0.32 -0.853 -1.402 -1.879 -2.292 -2.683 -3.059 -3.4 -3.734 -4.1 -4.42 -4.696 -4.986 -5.275 -5.5 -5.73 -5.969 -6.162 -6.373 -6.584 -6.811 -7.063 -7.228 -7.401 -7.676 -7.866 -8.066 -8.169 -8.374 -8.596 -8.834 -8.957 -9.21 -9.35 -9.497 -9.664 -10.025 -10.223 -10.429 -10.656 -10.914 -11.238 -11.666 -12.724 -2 ,25823 ,TETRA ,17589877,Sat Nov 27 19:20:42 CET,Sat Nov 27 21:09:48 CET,0.0 0.236 0.382 0.476 0.568 0.642 0.715 0.784 0.907 0.978 1.041 1.033 1.213 1.264 1.352 1.434 1.525 1.568 1.643 1.714 1.815 1.88 1.946 2.034 2.121 2.213 2.306 2.404 2.533 2.656 2.78 2.922 3.058 3.19 3.32 3.452 3.582 3.721 3.858 4.0 4.153 4.317 4.489 4.655 4.815 4.94 5.058 5.141 5.138 4.942 4.266 3.22 2.27 1.419 0.649 -0.099 -0.766 -1.347 -1.842 -2.343 -2.802 -3.219 -3.607 -3.971 -4.311 -4.651 -5.016 -5.331 -5.62 -5.921 -6.226 -6.481 -6.746 -7.031 -7.262 -7.496 -7.728 -7.959 -8.218 -8.414 -8.61 -8.906 -9.122 -9.353 -9.472 -9.718 -9.97 -10.228 -10.367 -10.65 -10.864 -11.054 -11.247 -11.646 -11.878 -12.14 -12.422 -12.709 -13.075 -13.619 -14.898 -3 ,10003 ,TETRA ,17589878,Sat Nov 27 19:20:42 CET,Sat Nov 27 21:12:51 CET,0.0 0.194 0.338 0.454 0.549 0.646 0.737 0.815 0.944 1.005 1.066 1.056 1.224 1.27 1.366 1.46 1.562 1.611 1.705 1.792 1.906 1.983 2.053 2.155 2.252 2.343 2.436 2.523 2.634 2.737 2.839 2.976 3.098 3.198 3.312 3.438 3.559 3.678 3.794 3.923 4.054 4.2 4.349 4.488 4.636 4.775 4.901 4.964 4.944 4.78 4.234 3.355 2.475 1.623 0.814 0.07 -0.597 -1.236 -1.774 -2.306 -2.757 -3.174 -3.6 -3.992 -4.338 -4.651 -4.985 -5.289 -5.558 -5.849 -6.153 -6.396 -6.644 -6.909 -7.122 -7.348 -7.588 -7.836 -8.09 -8.26 -8.432 -8.693 -8.863 -9.05 -9.15 -9.351 -9.58 -9.826 -9.951 -10.213 -10.366 -10.509 -10.668 -11.013 -11.217 -11.431 -11.671 -11.991 -12.333 -12.702 -13.919 -4 ,24190 ,TETRA ,17589879,Sat Nov 27 19:20:42 CET,Sat Nov 27 21:12:47 CET,0.0 0.322 0.471 0.602 0.698 0.801 0.904 0.983 1.123 1.183 1.242 1.238 1.412 1.465 1.569 1.672 1.772 1.818 1.901 1.989 2.121 2.202 2.277 2.372 2.462 2.56 2.663 2.757 2.879 3.008 3.122 3.244 3.366 3.482 3.609 3.764 3.926 4.095 4.271 4.441 4.61 4.79 4.995 5.188 5.374 5.55 5.707 5.794 5.79 5.661 5.209 4.37 3.431 2.516 1.723 1.019 0.383 -0.223 -0.741 -1.267 -1.738 -2.15 -2.543 -2.937 -3.308 -3.645 -4.005 -4.333 -4.614 -4.898 -5.184 -5.437 -5.711 -5.984 -6.198 -6.428 -6.668 -6.909 -7.177 -7.37 -7.565 -7.873 -8.088 -8.321 -8.439 -8.68 -8.938 -9.199 -9.344 -9.618 -9.801 -9.988 -10.188 -10.588 -10.795 -11.005 -11.236 -11.512 -11.845 -12.293 -13.626 -5 ,5575 ,TETRA ,17589880,Sat Nov 27 19:20:42 CET,Sat Nov 27 21:11:27 CET,0.0 0.191 0.316 0.419 0.512 0.601 0.679 0.753 0.906 0.97 1.028 1.015 1.178 1.224 1.319 1.419 1.51 1.552 1.643 1.73 1.845 1.915 1.985 2.091 2.195 2.291 2.382 2.472 2.581 2.687 2.796 2.921 3.04 3.165 3.303 3.449 3.593 3.741 3.893 4.055 4.209 4.369 4.562 4.727 4.914 5.131 5.309 5.397 5.405 5.253 4.774 3.932 3.023 2.165 1.392 0.683 0.048 -0.56 -1.128 -1.673 -2.126 -2.549 -2.928 -3.28 -3.638 -3.969 -4.323 -4.642 -4.908 -5.184 -5.478 -5.707 -5.936 -6.177 -6.373 -6.58 -6.783 -6.998 -7.215 -7.366 -7.518 -7.76 -7.942 -8.131 -8.226 -8.448 -8.708 -8.985 -9.122 -9.376 -9.513 -9.663 -9.824 -10.191 -10.398 -10.599 -10.817 -11.084 -11.389 -11.777 -12.895 -6 ,3593 ,TETRA ,17589881,Sat Nov 27 19:20:42 CET,Sat Nov 27 21:11:15 CET,0.0 0.328 0.466 0.589 0.699 0.796 0.885 0.959 1.104 1.173 1.256 1.329 1.523 1.586 1.704 1.805 1.903 1.954 2.055 2.164 2.316 2.406 2.493 2.62 2.736 2.834 2.935 3.044 3.18 3.31 3.425 3.557 3.693 3.818 3.953 4.111 4.258 4.405 4.558 4.716 4.882 5.063 5.258 5.425 5.582 5.713 5.838 5.937 5.938 5.821 5.394 4.567 3.687 2.836 2.022 1.301 0.686 0.104 -0.397 -0.919 -1.375 -1.785 -2.2 -2.588 -2.929 -3.241 -3.59 -3.917 -4.201 -4.492 -4.786 -5.038 -5.298 -5.563 -5.779 -5.995 -6.209 -6.432 -6.657 -6.814 -6.992 -7.278 -7.473 -7.669 -7.771 -7.998 -8.242 -8.486 -8.598 -8.852 -9.014 -9.166 -9.31 -9.603 -9.767 -9.946 -10.148 -10.413 -10.741 -11.162 -12.31 -7 ,5401 ,TETRA ,17589882,Sat Nov 27 19:20:43 CET,Sat Nov 27 21:05:03 CET,0.0 0.23 0.366 0.46 0.552 0.64 0.707 0.774 0.914 0.978 1.039 1.05 1.235 1.303 1.434 1.554 1.67 1.723 1.827 1.932 2.075 2.167 2.261 2.385 2.495 2.603 2.702 2.796 2.93 3.063 3.185 3.315 3.441 3.572 3.712 3.857 4.0 4.14 4.285 4.464 4.647 4.83 5.035 5.218 5.381 5.513 5.641 5.72 5.682 5.44 4.781 3.902 3.052 2.248 1.496 0.82 0.223 -0.347 -0.851 -1.402 -1.913 -2.363 -2.779 -3.167 -3.508 -3.84 -4.219 -4.553 -4.821 -5.097 -5.381 -5.61 -5.872 -6.128 -6.312 -6.521 -6.739 -6.982 -7.226 -7.376 -7.541 -7.817 -8.01 -8.206 -8.308 -8.518 -8.741 -8.991 -9.115 -9.365 -9.541 -9.71 -9.865 -10.191 -10.382 -10.575 -10.809 -11.094 -11.385 -11.782 -12.978 -8 ,4734 ,TETRA ,17589883,Sat Nov 27 19:20:42 CET,Sat Nov 27 21:10:10 CET,0.0 0.156 0.27 0.379 0.49 0.594 0.696 0.8 1.014 1.119 1.203 1.232 1.421 1.482 1.606 1.742 1.866 1.923 2.032 2.122 2.243 2.329 2.415 2.532 2.646 2.758 2.866 2.964 3.089 3.223 3.344 3.479 3.603 3.721 3.867 4.034 4.185 4.338 4.491 4.655 4.823 4.991 5.167 5.335 5.501 5.652 5.83 5.978 6.08 6.025 5.568 4.717 3.838 3.036 2.302 1.619 1.011 0.403 -0.147 -0.704 -1.205 -1.62 -2.008 -2.393 -2.747 -3.088 -3.462 -3.79 -4.068 -4.35 -4.638 -4.883 -5.143 -5.419 -5.633 -5.866 -6.121 -6.382 -6.643 -6.827 -7.005 -7.299 -7.523 -7.746 -7.867 -8.119 -8.367 -8.609 -8.735 -8.995 -9.145 -9.292 -9.454 -9.835 -10.042 -10.259 -10.521 -10.825 -11.136 -11.569 -12.613 -9 ,17277 ,TETRA ,17589884,Sat Nov 27 19:20:42 CET,Sat Nov 27 21:11:03 CET,0.0 0.114 0.201 0.298 0.397 0.493 0.586 0.659 0.78 0.835 0.893 0.895 1.074 1.135 1.25 1.358 1.473 1.528 1.637 1.731 1.855 1.945 2.041 2.17 2.287 2.406 2.52 2.622 2.746 2.862 2.984 3.133 3.269 3.393 3.52 3.663 3.799 3.953 4.121 4.28 4.433 4.602 4.803 5.002 5.204 5.362 5.513 5.665 5.714 5.555 5.039 4.218 3.31 2.384 1.577 0.887 0.266 -0.316 -0.851 -1.423 -1.928 -2.374 -2.781 -3.156 -3.498 -3.814 -4.162 -4.482 -4.757 -5.051 -5.353 -5.588 -5.817 -6.049 -6.244 -6.456 -6.67 -6.89 -7.131 -7.305 -7.474 -7.74 -7.94 -8.146 -8.246 -8.444 -8.68 -8.939 -9.065 -9.322 -9.469 -9.628 -9.801 -10.154 -10.335 -10.554 -10.81 -11.073 -11.423 -11.855 -13.172 -10 ,6890 ,TETRA ,17589885,Sat Nov 27 19:20:42 CET,Sat Nov 27 21:07:35 CET,0.0 0.248 0.373 0.482 0.559 0.623 0.692 0.774 0.939 1.0 1.056 1.061 1.238 1.3 1.429 1.551 1.661 1.717 1.821 1.919 2.061 2.154 2.243 2.367 2.477 2.58 2.69 2.789 2.915 3.048 3.172 3.313 3.44 3.56 3.69 3.838 3.985 4.145 4.314 4.479 4.646 4.811 4.988 5.16 5.336 5.502 5.657 5.768 5.833 5.781 5.293 4.293 3.27 2.371 1.577 0.806 0.127 -0.478 -1.029 -1.546 -1.979 -2.389 -2.783 -3.165 -3.507 -3.829 -4.181 -4.474 -4.743 -5.042 -5.357 -5.623 -5.895 -6.192 -6.422 -6.631 -6.861 -7.133 -7.405 -7.588 -7.776 -8.075 -8.286 -8.508 -8.627 -8.871 -9.125 -9.374 -9.506 -9.779 -9.94 -10.099 -10.295 -10.708 -10.917 -11.148 -11.398 -11.685 -12.047 -12.544 -14.016 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 9bf36140..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13543 ,TETRA ,17589886,Sat Nov 27 19:20:42 CET,Sat Nov 27 21:11:30 CET,0.0 0.215 0.369 0.515 0.678 0.836 0.979 1.108 1.344 1.449 1.55 1.639 1.852 1.948 2.127 2.292 2.459 2.536 2.681 2.812 3.0 3.126 3.238 3.393 3.553 3.715 3.868 4.009 4.19 4.362 4.525 4.722 4.911 5.087 5.288 5.517 5.734 5.978 6.259 6.547 6.822 7.11 7.447 7.803 8.218 8.643 9.113 9.581 10.049 10.519 10.831 10.8 10.491 10.119 9.775 9.414 9.05 8.689 8.336 7.977 7.693 7.41 7.102 6.813 6.554 6.312 6.045 5.818 5.629 5.429 5.217 5.036 4.848 4.655 4.518 4.38 4.222 4.053 3.874 3.738 3.593 3.391 3.266 3.132 3.059 2.908 2.762 2.616 2.54 2.334 2.241 2.139 2.029 1.789 1.664 1.526 1.372 1.207 1.022 0.789 0.174 -2 ,20475 ,TETRA ,17589887,Sat Nov 27 19:20:44 CET,Sat Nov 27 21:11:36 CET,0.0 0.166 0.301 0.424 0.537 0.642 0.737 0.826 0.991 1.079 1.169 1.22 1.437 1.536 1.7 1.843 1.978 2.05 2.199 2.336 2.525 2.654 2.78 2.96 3.142 3.31 3.462 3.605 3.784 3.956 4.116 4.307 4.489 4.67 4.881 5.123 5.365 5.619 5.905 6.213 6.497 6.805 7.169 7.498 7.853 8.238 8.676 9.137 9.634 10.128 10.441 10.382 10.137 9.744 9.283 8.828 8.426 8.066 7.749 7.43 7.128 6.839 6.558 6.286 6.04 5.82 5.578 5.348 5.146 4.928 4.701 4.52 4.321 4.103 3.935 3.776 3.613 3.424 3.22 3.073 2.921 2.709 2.576 2.433 2.358 2.209 2.06 1.906 1.823 1.61 1.525 1.427 1.324 1.081 0.966 0.835 0.67 0.496 0.312 0.051 -0.722 -3 ,13653 ,TETRA ,17589888,Sat Nov 27 19:20:42 CET,Sat Nov 27 21:12:01 CET,0.0 0.352 0.529 0.654 0.773 0.883 0.967 1.043 1.213 1.296 1.374 1.405 1.593 1.656 1.794 1.92 2.034 2.092 2.204 2.314 2.473 2.576 2.679 2.834 2.977 3.107 3.245 3.386 3.554 3.707 3.87 4.061 4.249 4.441 4.646 4.89 5.135 5.4 5.673 5.96 6.258 6.569 6.891 7.184 7.54 7.967 8.456 8.991 9.546 10.042 10.353 10.29 10.019 9.633 9.218 8.791 8.402 8.067 7.752 7.43 7.148 6.875 6.618 6.365 6.122 5.905 5.684 5.496 5.325 5.147 4.965 4.819 4.66 4.477 4.338 4.203 4.071 3.932 3.766 3.653 3.536 3.343 3.218 3.078 3.0 2.846 2.683 2.529 2.456 2.248 2.166 2.066 1.968 1.728 1.597 1.465 1.319 1.169 0.999 0.76 0.252 -4 ,4877 ,TETRA ,17589889,Sat Nov 27 19:20:44 CET,Sat Nov 27 21:11:51 CET,0.0 0.439 0.595 0.738 0.877 1.025 1.159 1.276 1.51 1.628 1.735 1.795 2.004 2.087 2.234 2.398 2.564 2.637 2.778 2.91 3.098 3.217 3.333 3.507 3.664 3.81 3.962 4.112 4.297 4.483 4.669 4.89 5.088 5.269 5.486 5.731 5.95 6.177 6.428 6.708 6.982 7.282 7.632 7.954 8.341 8.781 9.196 9.616 10.095 10.537 10.848 10.848 10.604 10.273 9.903 9.504 9.148 8.811 8.491 8.154 7.866 7.597 7.335 7.092 6.848 6.595 6.333 6.113 5.904 5.683 5.469 5.292 5.105 4.903 4.743 4.583 4.426 4.262 4.087 3.969 3.854 3.68 3.561 3.44 3.373 3.24 3.102 2.941 2.863 2.668 2.607 2.508 2.406 2.185 2.068 1.919 1.743 1.57 1.38 1.107 0.51 -5 ,19965 ,TETRA ,17589890,Sat Nov 27 19:20:46 CET,Sat Nov 27 21:11:02 CET,0.0 0.286 0.448 0.569 0.697 0.814 0.91 0.997 1.181 1.264 1.342 1.389 1.592 1.673 1.835 1.992 2.142 2.213 2.351 2.483 2.676 2.805 2.925 3.103 3.274 3.423 3.564 3.702 3.893 4.084 4.266 4.493 4.7 4.885 5.1 5.339 5.575 5.836 6.109 6.399 6.687 7.012 7.402 7.779 8.194 8.626 9.114 9.636 10.153 10.636 10.949 10.903 10.651 10.288 9.931 9.594 9.233 8.854 8.52 8.177 7.884 7.614 7.343 7.073 6.817 6.583 6.336 6.106 5.907 5.718 5.489 5.277 5.075 4.878 4.736 4.6 4.452 4.291 4.132 4.023 3.903 3.708 3.569 3.431 3.361 3.213 3.06 2.893 2.809 2.611 2.549 2.454 2.361 2.17 2.061 1.941 1.795 1.613 1.413 1.182 0.577 -6 ,2745 ,TETRA ,17589891,Sat Nov 27 19:20:44 CET,Sat Nov 27 21:12:33 CET,0.0 0.878 1.222 1.452 1.619 1.759 1.9 2.026 2.241 2.336 2.428 2.495 2.704 2.794 2.953 3.118 3.28 3.356 3.501 3.635 3.842 3.973 4.089 4.256 4.412 4.559 4.708 4.856 5.039 5.216 5.379 5.568 5.759 5.943 6.156 6.407 6.63 6.862 7.131 7.393 7.661 7.974 8.318 8.663 9.035 9.437 9.877 10.308 10.78 11.216 11.539 11.518 11.235 10.904 10.551 10.188 9.826 9.471 9.162 8.813 8.487 8.206 7.938 7.683 7.463 7.272 7.069 6.874 6.697 6.52 6.332 6.171 6.008 5.838 5.696 5.554 5.412 5.243 5.061 4.937 4.821 4.65 4.532 4.417 4.356 4.221 4.076 3.919 3.834 3.622 3.549 3.448 3.346 3.123 2.997 2.864 2.717 2.542 2.328 2.103 1.64 -7 ,32657 ,TETRA ,17589892,Sat Nov 27 19:21:41 CET,Sat Nov 27 21:13:46 CET,0.0 0.371 0.51 0.643 0.763 0.862 0.951 1.051 1.259 1.358 1.464 1.557 1.767 1.857 2.033 2.197 2.365 2.439 2.565 2.698 2.891 3.011 3.125 3.291 3.459 3.621 3.773 3.915 4.086 4.248 4.415 4.625 4.818 5.009 5.239 5.477 5.707 5.973 6.247 6.544 6.842 7.147 7.495 7.836 8.212 8.629 9.092 9.611 10.161 10.605 10.882 10.8 10.53 10.191 9.819 9.441 9.061 8.702 8.392 8.068 7.778 7.527 7.287 7.04 6.785 6.547 6.302 6.073 5.878 5.674 5.456 5.278 5.086 4.89 4.736 4.571 4.404 4.219 4.017 3.883 3.737 3.495 3.339 3.184 3.096 2.908 2.724 2.545 2.463 2.261 2.184 2.068 1.949 1.71 1.581 1.439 1.282 1.116 0.935 0.673 0.292 -8 ,17444 ,TETRA ,17589893,Sat Nov 27 19:21:41 CET,Sat Nov 27 21:12:58 CET,0.0 0.262 0.412 0.533 0.647 0.766 0.881 1.011 1.258 1.36 1.459 1.532 1.742 1.834 2.005 2.163 2.319 2.402 2.559 2.692 2.885 3.016 3.136 3.29 3.45 3.61 3.755 3.901 4.092 4.272 4.45 4.66 4.865 5.067 5.286 5.516 5.741 5.985 6.242 6.508 6.777 7.084 7.448 7.813 8.215 8.625 9.044 9.477 9.985 10.463 10.763 10.737 10.49 10.164 9.836 9.474 9.154 8.859 8.573 8.261 7.995 7.756 7.514 7.293 7.1 6.917 6.713 6.515 6.339 6.176 6.01 5.86 5.703 5.527 5.387 5.249 5.103 4.954 4.791 4.672 4.549 4.361 4.232 4.096 4.022 3.865 3.709 3.556 3.474 3.266 3.216 3.13 3.027 2.77 2.633 2.51 2.37 2.193 2.008 1.795 1.32 -9 ,8673 ,TETRA ,17589894,Sat Nov 27 19:21:41 CET,Sat Nov 27 21:12:23 CET,0.0 0.188 0.326 0.443 0.552 0.658 0.76 0.86 1.049 1.137 1.208 1.233 1.426 1.489 1.603 1.715 1.831 1.892 2.014 2.146 2.335 2.45 2.558 2.72 2.888 3.041 3.187 3.331 3.513 3.693 3.871 4.083 4.286 4.48 4.7 4.933 5.145 5.382 5.645 5.923 6.205 6.504 6.83 7.16 7.556 7.961 8.373 8.786 9.231 9.682 9.954 9.851 9.59 9.279 8.934 8.54 8.139 7.781 7.46 7.112 6.803 6.517 6.236 5.96 5.7 5.461 5.203 4.98 4.79 4.578 4.352 4.166 3.971 3.767 3.609 3.453 3.304 3.147 2.98 2.873 2.754 2.567 2.43 2.278 2.209 2.069 1.915 1.759 1.667 1.453 1.408 1.32 1.211 0.986 0.869 0.73 0.59 0.447 0.267 -0.005 -0.578 -10 ,9957 ,TETRA ,17589895,Sat Nov 27 19:21:41 CET,Sat Nov 27 21:14:57 CET,0.0 0.224 0.374 0.503 0.631 0.744 0.849 0.953 1.115 1.184 1.257 1.287 1.483 1.567 1.737 1.902 2.061 2.128 2.256 2.382 2.578 2.717 2.834 2.989 3.165 3.337 3.491 3.639 3.824 3.995 4.159 4.362 4.564 4.766 4.981 5.211 5.447 5.694 5.957 6.232 6.508 6.816 7.155 7.483 7.872 8.273 8.677 9.101 9.556 9.971 10.17 9.979 9.656 9.235 8.813 8.432 8.043 7.655 7.311 6.955 6.622 6.323 6.047 5.778 5.522 5.281 5.04 4.822 4.623 4.414 4.184 3.988 3.801 3.603 3.44 3.281 3.115 2.937 2.741 2.605 2.472 2.255 2.1 1.939 1.857 1.691 1.517 1.342 1.249 1.036 0.98 0.885 0.777 0.558 0.449 0.334 0.202 0.039 -0.139 -0.376 -0.871 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt deleted file mode 100644 index c37c6c89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10024 ,TETRA ,17589896,Sat Nov 27 19:21:41 CET,Sat Nov 27 21:11:50 CET,0.0 0.723 1.004 1.201 1.375 1.545 1.689 1.82 2.073 2.175 2.264 2.322 2.529 2.61 2.768 2.904 3.026 3.09 3.21 3.325 3.49 3.593 3.689 3.836 3.978 4.102 4.216 4.325 4.456 4.59 4.73 4.889 5.031 5.161 5.321 5.517 5.697 5.865 6.036 6.218 6.396 6.608 6.861 7.078 7.264 7.434 7.603 7.72 7.78 7.702 7.265 6.479 5.699 4.959 4.3 3.711 3.147 2.602 2.11 1.609 1.192 0.831 0.482 0.138 -0.191 -0.515 -0.856 -1.146 -1.394 -1.645 -1.908 -2.13 -2.374 -2.621 -2.802 -3.0 -3.222 -3.447 -3.677 -3.838 -3.996 -4.243 -4.412 -4.588 -4.682 -4.883 -5.098 -5.309 -5.425 -5.677 -5.799 -5.938 -6.082 -6.417 -6.619 -6.824 -7.024 -7.218 -7.436 -7.751 -8.608 -2 ,879 ,TETRA ,17589897,Sat Nov 27 19:21:44 CET,Sat Nov 27 21:13:23 CET,0.0 0.184 0.329 0.476 0.596 0.688 0.776 0.861 1.007 1.076 1.146 1.144 1.321 1.376 1.485 1.589 1.69 1.744 1.837 1.918 2.037 2.108 2.18 2.289 2.398 2.507 2.607 2.703 2.838 2.973 3.106 3.27 3.431 3.583 3.752 3.929 4.093 4.276 4.473 4.664 4.839 5.029 5.251 5.457 5.662 5.87 6.057 6.161 6.205 6.148 5.787 5.007 4.207 3.463 2.775 2.143 1.575 1.053 0.584 0.115 -0.29 -0.668 -1.022 -1.359 -1.684 -1.98 -2.289 -2.569 -2.812 -3.053 -3.319 -3.556 -3.787 -4.031 -4.23 -4.416 -4.607 -4.816 -5.033 -5.19 -5.361 -5.622 -5.794 -5.967 -6.058 -6.267 -6.475 -6.689 -6.806 -7.053 -7.169 -7.287 -7.408 -7.692 -7.845 -8.025 -8.232 -8.432 -8.631 -8.92 -9.826 -3 ,21893 ,TETRA ,17589898,Sat Nov 27 19:21:43 CET,Sat Nov 27 21:11:31 CET,0.0 0.201 0.324 0.442 0.561 0.654 0.734 0.815 0.978 1.049 1.111 1.11 1.293 1.349 1.456 1.561 1.666 1.718 1.808 1.89 2.008 2.087 2.17 2.29 2.409 2.535 2.664 2.795 2.936 3.071 3.217 3.378 3.519 3.648 3.811 4.007 4.181 4.362 4.552 4.738 4.922 5.108 5.311 5.505 5.694 5.865 6.024 6.17 6.261 6.202 5.814 5.032 4.24 3.496 2.826 2.198 1.624 1.084 0.607 0.152 -0.246 -0.608 -0.958 -1.314 -1.653 -1.936 -2.221 -2.483 -2.712 -2.942 -3.183 -3.384 -3.589 -3.803 -3.961 -4.125 -4.298 -4.469 -4.649 -4.782 -4.915 -5.113 -5.258 -5.422 -5.505 -5.677 -5.869 -6.068 -6.172 -6.406 -6.506 -6.638 -6.775 -7.041 -7.185 -7.351 -7.522 -7.706 -7.946 -8.372 -9.746 -4 ,29168 ,TETRA ,17589899,Sat Nov 27 19:21:43 CET,Sat Nov 27 21:11:05 CET,0.0 0.162 0.301 0.413 0.494 0.569 0.639 0.708 0.847 0.918 0.984 0.975 1.153 1.205 1.303 1.407 1.511 1.568 1.695 1.816 1.981 2.089 2.19 2.339 2.482 2.61 2.729 2.843 2.987 3.121 3.258 3.418 3.558 3.698 3.86 4.041 4.196 4.358 4.544 4.733 4.912 5.09 5.286 5.484 5.7 5.895 6.109 6.284 6.337 6.254 5.837 5.045 4.224 3.461 2.803 2.181 1.61 1.085 0.62 0.141 -0.275 -0.648 -1.002 -1.344 -1.655 -1.923 -2.219 -2.502 -2.737 -2.987 -3.255 -3.473 -3.7 -3.937 -4.135 -4.346 -4.551 -4.758 -4.973 -5.111 -5.246 -5.475 -5.629 -5.787 -5.872 -6.052 -6.24 -6.43 -6.529 -6.766 -6.889 -7.011 -7.131 -7.41 -7.563 -7.718 -7.885 -8.066 -8.271 -8.537 -9.136 -5 ,10968 ,TETRA ,17589900,Sat Nov 27 19:21:43 CET,Sat Nov 27 21:12:41 CET,0.0 0.275 0.421 0.547 0.654 0.735 0.814 0.901 1.046 1.109 1.175 1.17 1.347 1.407 1.517 1.616 1.714 1.762 1.858 1.956 2.088 2.162 2.237 2.349 2.447 2.541 2.639 2.731 2.839 2.941 3.038 3.154 3.274 3.395 3.529 3.681 3.821 3.976 4.14 4.294 4.445 4.614 4.799 4.965 5.168 5.382 5.576 5.734 5.802 5.69 5.227 4.466 3.735 3.035 2.352 1.698 1.138 0.634 0.181 -0.298 -0.717 -1.084 -1.411 -1.722 -2.024 -2.3 -2.599 -2.874 -3.12 -3.37 -3.63 -3.861 -4.077 -4.28 -4.445 -4.614 -4.794 -4.971 -5.166 -5.311 -5.459 -5.699 -5.864 -6.022 -6.1 -6.277 -6.48 -6.678 -6.776 -7.011 -7.088 -7.206 -7.335 -7.599 -7.751 -7.906 -8.074 -8.27 -8.507 -8.813 -9.666 -6 ,31770 ,TETRA ,17589901,Sat Nov 27 19:21:43 CET,Sat Nov 27 21:13:26 CET,0.0 0.735 1.045 1.282 1.47 1.635 1.781 1.887 2.071 2.167 2.255 2.292 2.493 2.576 2.733 2.876 3.015 3.079 3.202 3.321 3.483 3.584 3.679 3.798 3.913 4.041 4.17 4.293 4.447 4.585 4.716 4.876 5.024 5.17 5.337 5.515 5.681 5.854 6.03 6.211 6.398 6.6 6.813 7.003 7.213 7.404 7.576 7.73 7.812 7.777 7.423 6.618 5.782 5.046 4.389 3.797 3.252 2.742 2.299 1.834 1.413 1.044 0.704 0.372 0.05 -0.255 -0.569 -0.852 -1.102 -1.362 -1.632 -1.85 -2.094 -2.354 -2.547 -2.749 -2.962 -3.176 -3.387 -3.54 -3.703 -3.946 -4.124 -4.321 -4.419 -4.623 -4.838 -5.046 -5.158 -5.409 -5.533 -5.667 -5.81 -6.142 -6.345 -6.554 -6.751 -6.978 -7.267 -7.775 -9.472 -7 ,446 ,TETRA ,17589902,Sat Nov 27 19:21:44 CET,Sat Nov 27 21:12:58 CET,0.0 0.173 0.287 0.391 0.485 0.566 0.642 0.711 0.847 0.912 0.977 0.984 1.168 1.225 1.336 1.444 1.553 1.607 1.711 1.811 1.962 2.058 2.15 2.281 2.403 2.537 2.676 2.796 2.939 3.077 3.217 3.378 3.514 3.638 3.794 3.986 4.17 4.359 4.559 4.753 4.953 5.178 5.404 5.611 5.823 6.005 6.179 6.336 6.416 6.31 5.814 4.955 4.144 3.402 2.701 2.048 1.463 0.929 0.474 0.002 -0.432 -0.812 -1.162 -1.505 -1.849 -2.16 -2.472 -2.751 -2.983 -3.228 -3.493 -3.729 -3.978 -4.206 -4.39 -4.59 -4.788 -4.993 -5.203 -5.354 -5.521 -5.772 -5.935 -6.102 -6.188 -6.362 -6.53 -6.727 -6.839 -7.081 -7.186 -7.307 -7.431 -7.698 -7.835 -7.983 -8.17 -8.369 -8.588 -8.89 -9.692 -8 ,19158 ,TETRA ,17589903,Sat Nov 27 19:21:43 CET,Sat Nov 27 21:12:12 CET,0.0 0.171 0.308 0.401 0.485 0.569 0.651 0.74 0.921 0.994 1.055 1.06 1.243 1.298 1.399 1.496 1.596 1.645 1.743 1.838 1.975 2.064 2.151 2.27 2.373 2.469 2.568 2.664 2.788 2.911 3.026 3.165 3.296 3.42 3.561 3.713 3.857 4.015 4.17 4.322 4.483 4.67 4.874 5.069 5.268 5.46 5.64 5.772 5.819 5.725 5.276 4.485 3.652 2.867 2.209 1.589 1.016 0.483 0.015 -0.435 -0.82 -1.192 -1.547 -1.877 -2.2 -2.488 -2.778 -3.043 -3.274 -3.519 -3.769 -3.962 -4.163 -4.373 -4.535 -4.71 -4.895 -5.086 -5.286 -5.426 -5.573 -5.792 -5.946 -6.113 -6.198 -6.379 -6.584 -6.786 -6.882 -7.112 -7.2 -7.312 -7.43 -7.693 -7.852 -8.036 -8.232 -8.449 -8.715 -9.033 -9.71 -9 ,26666 ,TETRA ,17589904,Sat Nov 27 19:21:43 CET,Sat Nov 27 21:11:52 CET,0.0 0.192 0.354 0.478 0.576 0.663 0.747 0.832 0.988 1.064 1.148 1.196 1.393 1.478 1.636 1.781 1.924 1.989 2.113 2.23 2.4 2.506 2.605 2.736 2.857 2.98 3.103 3.218 3.363 3.5 3.622 3.772 3.92 4.058 4.204 4.368 4.531 4.707 4.886 5.05 5.21 5.411 5.637 5.844 6.055 6.262 6.451 6.56 6.585 6.443 5.947 5.138 4.337 3.58 2.89 2.245 1.671 1.149 0.686 0.217 -0.205 -0.586 -0.932 -1.257 -1.569 -1.869 -2.188 -2.48 -2.735 -2.992 -3.253 -3.478 -3.717 -3.969 -4.155 -4.346 -4.554 -4.764 -4.982 -5.142 -5.306 -5.565 -5.755 -5.962 -6.067 -6.268 -6.492 -6.732 -6.856 -7.106 -7.244 -7.399 -7.565 -7.895 -8.069 -8.249 -8.497 -8.843 -9.196 -9.614 -10.845 -10 ,20887 ,TETRA ,17589905,Sat Nov 27 19:21:44 CET,Sat Nov 27 21:11:56 CET,0.0 0.357 0.487 0.602 0.699 0.782 0.856 0.926 1.043 1.104 1.166 1.158 1.339 1.404 1.529 1.633 1.752 1.814 1.933 2.048 2.202 2.303 2.401 2.537 2.666 2.797 2.924 3.039 3.186 3.334 3.476 3.643 3.793 3.928 4.088 4.26 4.414 4.571 4.734 4.901 5.077 5.28 5.508 5.733 5.946 6.146 6.337 6.468 6.528 6.457 5.99 5.193 4.404 3.67 3.012 2.391 1.827 1.313 0.873 0.407 -0.007 -0.371 -0.725 -1.054 -1.337 -1.587 -1.858 -2.105 -2.335 -2.577 -2.811 -3.009 -3.222 -3.449 -3.623 -3.791 -3.963 -4.149 -4.353 -4.496 -4.638 -4.847 -4.988 -5.138 -5.216 -5.383 -5.572 -5.766 -5.858 -6.089 -6.188 -6.299 -6.423 -6.702 -6.855 -7.009 -7.155 -7.336 -7.595 -7.917 -8.596 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 5ae54ff8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18738 ,TETRA ,17589906,Sat Nov 27 19:21:44 CET,Sat Nov 27 21:11:10 CET,0.0 0.501 0.682 0.829 0.972 1.1 1.212 1.316 1.498 1.586 1.687 1.769 1.974 2.055 2.21 2.355 2.49 2.554 2.673 2.782 2.943 3.048 3.153 3.31 3.459 3.595 3.729 3.87 4.064 4.249 4.42 4.636 4.852 5.064 5.304 5.558 5.804 6.075 6.362 6.659 6.961 7.31 7.717 8.114 8.593 9.11 9.641 10.238 10.883 11.544 12.181 12.34 12.231 12.032 11.785 11.516 11.217 10.905 10.604 10.298 10.04 9.8 9.555 9.316 9.093 8.878 8.65 8.443 8.269 8.083 7.884 7.719 7.523 7.308 7.148 6.991 6.819 6.633 6.454 6.341 6.237 6.061 5.921 5.798 5.742 5.591 5.422 5.267 5.188 4.992 4.948 4.845 4.734 4.521 4.401 4.253 4.092 3.916 3.705 3.406 2.493 -2 ,27833 ,TETRA ,17589907,Sat Nov 27 19:21:44 CET,Sat Nov 27 21:15:55 CET,0.0 0.367 0.52 0.663 0.796 0.915 1.03 1.14 1.348 1.436 1.528 1.613 1.825 1.917 2.105 2.289 2.467 2.557 2.721 2.86 3.048 3.167 3.288 3.475 3.66 3.836 3.998 4.161 4.372 4.576 4.78 5.019 5.239 5.445 5.667 5.919 6.175 6.456 6.752 7.065 7.373 7.725 8.152 8.561 9.016 9.498 10.043 10.646 11.301 11.934 12.5 12.738 12.631 12.387 12.128 11.849 11.536 11.215 10.93 10.611 10.327 10.087 9.836 9.584 9.358 9.153 8.94 8.743 8.558 8.373 8.201 8.061 7.9 7.714 7.565 7.422 7.266 7.102 6.955 6.854 6.746 6.579 6.456 6.321 6.246 6.083 5.931 5.795 5.719 5.506 5.412 5.297 5.164 4.882 4.729 4.545 4.335 4.125 3.889 3.594 2.656 -3 ,24592 ,TETRA ,17589908,Sat Nov 27 19:21:44 CET,Sat Nov 27 21:12:08 CET,0.0 0.822 1.134 1.388 1.601 1.784 1.941 2.082 2.329 2.438 2.555 2.65 2.859 2.942 3.102 3.27 3.434 3.51 3.665 3.816 4.018 4.154 4.286 4.473 4.659 4.844 5.026 5.199 5.412 5.6 5.776 5.991 6.209 6.428 6.677 6.948 7.193 7.455 7.748 8.072 8.415 8.783 9.19 9.574 10.013 10.519 11.079 11.69 12.363 13.044 13.658 13.805 13.71 13.51 13.224 12.897 12.592 12.292 12.015 11.742 11.492 11.232 10.971 10.752 10.563 10.385 10.197 10.029 9.872 9.701 9.512 9.348 9.179 9.009 8.877 8.734 8.58 8.42 8.252 8.137 8.019 7.819 7.676 7.549 7.483 7.331 7.178 7.021 6.932 6.727 6.661 6.563 6.456 6.215 6.096 5.972 5.81 5.63 5.46 5.178 4.408 -4 ,15529 ,TETRA ,17589909,Sat Nov 27 19:21:47 CET,Sat Nov 27 21:12:07 CET,0.0 0.353 0.509 0.642 0.768 0.888 0.982 1.076 1.291 1.4 1.508 1.597 1.81 1.9 2.078 2.246 2.413 2.493 2.65 2.812 3.026 3.166 3.308 3.505 3.69 3.854 4.019 4.187 4.404 4.605 4.792 5.013 5.219 5.422 5.669 5.944 6.197 6.468 6.755 7.074 7.407 7.765 8.179 8.585 9.038 9.54 10.103 10.73 11.384 11.978 12.508 12.72 12.572 12.285 11.972 11.666 11.369 11.068 10.818 10.552 10.314 10.113 9.905 9.69 9.498 9.338 9.162 8.974 8.803 8.629 8.45 8.312 8.166 7.995 7.862 7.721 7.574 7.42 7.261 7.151 7.033 6.844 6.715 6.583 6.51 6.354 6.188 6.024 5.943 5.739 5.681 5.567 5.441 5.198 5.053 4.897 4.715 4.511 4.298 3.958 2.842 -5 ,32205 ,TETRA ,17589910,Sat Nov 27 19:21:44 CET,Sat Nov 27 21:11:50 CET,0.0 0.404 0.592 0.749 0.869 0.982 1.097 1.207 1.407 1.502 1.591 1.622 1.821 1.896 2.043 2.186 2.334 2.407 2.534 2.644 2.809 2.917 3.026 3.189 3.338 3.482 3.628 3.776 3.985 4.184 4.361 4.582 4.799 4.997 5.239 5.509 5.75 6.011 6.293 6.61 6.95 7.314 7.718 8.091 8.515 8.996 9.514 10.042 10.62 11.284 11.979 12.195 12.116 11.89 11.566 11.264 10.982 10.698 10.426 10.126 9.873 9.638 9.384 9.13 8.9 8.698 8.487 8.29 8.109 7.932 7.737 7.553 7.369 7.168 7.004 6.841 6.666 6.478 6.28 6.142 6.001 5.783 5.629 5.473 5.395 5.219 5.037 4.832 4.726 4.501 4.377 4.252 4.104 3.788 3.624 3.444 3.267 3.08 2.875 2.65 1.915 -6 ,16211 ,TETRA ,17589911,Sat Nov 27 19:21:44 CET,Sat Nov 27 21:13:24 CET,0.0 0.455 0.665 0.848 0.99 1.122 1.238 1.348 1.544 1.634 1.718 1.747 1.947 2.023 2.173 2.321 2.454 2.519 2.646 2.765 2.935 3.045 3.153 3.31 3.461 3.607 3.746 3.875 4.049 4.22 4.385 4.579 4.772 4.969 5.209 5.483 5.728 5.995 6.28 6.582 6.909 7.283 7.699 8.089 8.527 9.01 9.555 10.146 10.78 11.447 12.089 12.37 12.313 12.107 11.856 11.585 11.296 10.986 10.692 10.398 10.136 9.892 9.654 9.414 9.176 8.967 8.761 8.564 8.377 8.174 7.965 7.794 7.621 7.435 7.28 7.119 6.948 6.762 6.575 6.455 6.324 6.112 5.975 5.842 5.77 5.608 5.417 5.221 5.129 4.91 4.785 4.668 4.554 4.318 4.202 4.065 3.906 3.732 3.508 3.231 2.315 -7 ,12844 ,TETRA ,17589912,Sat Nov 27 19:21:44 CET,Sat Nov 27 21:12:49 CET,0.0 0.836 1.107 1.318 1.514 1.689 1.845 1.992 2.271 2.4 2.524 2.621 2.837 2.938 3.132 3.316 3.491 3.569 3.714 3.854 4.066 4.202 4.331 4.524 4.701 4.864 5.029 5.189 5.39 5.587 5.778 6.005 6.217 6.425 6.675 6.95 7.195 7.458 7.752 8.057 8.371 8.734 9.133 9.53 10.002 10.498 11.026 11.573 12.171 12.769 13.372 13.61 13.495 13.255 12.985 12.705 12.411 12.121 11.855 11.56 11.269 11.012 10.772 10.541 10.319 10.107 9.88 9.663 9.471 9.273 9.071 8.903 8.719 8.528 8.375 8.21 8.044 7.878 7.691 7.561 7.426 7.221 7.086 6.932 6.853 6.689 6.504 6.301 6.196 5.969 5.852 5.724 5.574 5.24 5.043 4.834 4.603 4.322 4.01 3.55 1.607 -8 ,31592 ,TETRA ,17589913,Sat Nov 27 19:21:44 CET,Sat Nov 27 21:11:48 CET,0.0 0.424 0.632 0.77 0.887 0.993 1.103 1.208 1.396 1.486 1.577 1.642 1.862 1.966 2.151 2.321 2.487 2.569 2.728 2.87 3.066 3.196 3.327 3.515 3.688 3.853 4.007 4.168 4.384 4.586 4.787 5.025 5.249 5.455 5.693 5.974 6.229 6.507 6.827 7.145 7.466 7.832 8.233 8.622 9.079 9.601 10.172 10.757 11.39 12.033 12.597 12.791 12.756 12.584 12.281 11.938 11.61 11.304 11.037 10.726 10.421 10.143 9.886 9.66 9.437 9.213 8.984 8.777 8.6 8.414 8.213 8.041 7.867 7.683 7.526 7.359 7.182 7.0 6.813 6.68 6.547 6.34 6.192 6.026 5.935 5.76 5.588 5.41 5.317 5.094 4.997 4.893 4.789 4.565 4.437 4.282 4.09 3.879 3.646 3.298 2.296 -9 ,19502 ,TETRA ,17589914,Sat Nov 27 19:22:42 CET,Sat Nov 27 21:12:56 CET,0.0 0.395 0.578 0.713 0.842 0.954 1.055 1.16 1.347 1.428 1.511 1.538 1.732 1.807 1.945 2.079 2.209 2.275 2.398 2.509 2.676 2.783 2.893 3.057 3.217 3.371 3.529 3.694 3.901 4.091 4.272 4.499 4.715 4.918 5.154 5.422 5.683 5.96 6.247 6.558 6.886 7.234 7.624 8.015 8.475 8.984 9.557 10.161 10.767 11.339 11.867 12.034 11.896 11.656 11.384 11.074 10.748 10.466 10.232 9.993 9.771 9.557 9.328 9.103 8.892 8.695 8.507 8.35 8.204 8.029 7.845 7.687 7.509 7.327 7.19 7.045 6.89 6.722 6.542 6.407 6.258 6.03 5.888 5.745 5.666 5.505 5.348 5.184 5.099 4.901 4.844 4.745 4.628 4.342 4.193 4.041 3.874 3.669 3.437 3.211 2.737 -10 ,18672 ,TETRA ,17589915,Sat Nov 27 19:22:42 CET,Sat Nov 27 21:14:24 CET,0.0 0.474 0.669 0.815 0.943 1.065 1.19 1.315 1.554 1.678 1.797 1.879 2.095 2.203 2.406 2.582 2.752 2.835 2.989 3.132 3.328 3.448 3.566 3.746 3.93 4.112 4.279 4.433 4.633 4.831 5.019 5.239 5.441 5.639 5.88 6.139 6.38 6.651 6.948 7.255 7.581 7.952 8.376 8.814 9.285 9.749 10.259 10.799 11.41 12.075 12.63 12.808 12.709 12.486 12.204 11.913 11.632 11.348 11.093 10.812 10.541 10.285 10.041 9.804 9.563 9.327 9.082 8.863 8.677 8.496 8.322 8.177 8.008 7.83 7.69 7.543 7.393 7.238 7.076 6.969 6.864 6.679 6.539 6.411 6.342 6.188 6.037 5.878 5.791 5.58 5.464 5.347 5.242 5.006 4.869 4.735 4.598 4.399 4.186 3.93 3.034 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt deleted file mode 100644 index 6dcfdcac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26810 ,TETRA ,17589916,Sat Nov 27 19:22:42 CET,Sat Nov 27 21:14:01 CET,0.0 0.53 0.709 0.879 1.029 1.153 1.266 1.387 1.593 1.68 1.771 1.799 2.027 2.111 2.266 2.389 2.514 2.583 2.705 2.828 3.004 3.113 3.228 3.387 3.539 3.681 3.81 3.929 4.079 4.229 4.365 4.529 4.689 4.841 5.02 5.225 5.438 5.691 5.977 6.258 6.534 6.851 7.198 7.511 7.867 8.235 8.562 8.842 9.023 8.998 8.524 7.637 6.752 5.9 5.081 4.33 3.716 3.148 2.649 2.166 1.719 1.279 0.87 0.495 0.142 -0.174 -0.505 -0.81 -1.087 -1.365 -1.648 -1.891 -2.133 -2.375 -2.566 -2.768 -2.966 -3.165 -3.378 -3.518 -3.655 -3.869 -4.019 -4.173 -4.249 -4.406 -4.561 -4.732 -4.821 -5.066 -5.107 -5.207 -5.319 -5.578 -5.717 -5.859 -6.013 -6.161 -6.345 -6.628 -7.237 -2 ,1260 ,TETRA ,17589917,Sat Nov 27 19:22:42 CET,Sat Nov 27 21:16:33 CET,0.0 0.496 0.74 0.913 1.052 1.192 1.323 1.435 1.652 1.748 1.831 1.836 2.066 2.147 2.3 2.433 2.556 2.622 2.752 2.882 3.085 3.214 3.338 3.517 3.707 3.891 4.054 4.198 4.388 4.582 4.77 4.986 5.186 5.376 5.601 5.867 6.108 6.351 6.602 6.858 7.139 7.459 7.786 8.064 8.348 8.682 9.043 9.309 9.501 9.552 9.154 8.26 7.352 6.479 5.642 4.887 4.221 3.62 3.116 2.601 2.126 1.696 1.3 0.925 0.577 0.264 -0.057 -0.338 -0.592 -0.876 -1.165 -1.393 -1.637 -1.886 -2.087 -2.298 -2.502 -2.716 -2.937 -3.088 -3.25 -3.497 -3.659 -3.828 -3.921 -4.126 -4.329 -4.553 -4.676 -4.941 -5.034 -5.167 -5.301 -5.58 -5.745 -5.911 -6.105 -6.356 -6.654 -6.985 -7.689 -3 ,12522 ,TETRA ,17589918,Sat Nov 27 19:22:42 CET,Sat Nov 27 21:12:52 CET,0.0 0.554 0.831 1.069 1.258 1.427 1.591 1.722 1.981 2.109 2.223 2.287 2.529 2.624 2.797 2.961 3.145 3.227 3.356 3.468 3.627 3.731 3.836 3.992 4.116 4.234 4.364 4.491 4.656 4.807 4.95 5.127 5.299 5.461 5.643 5.848 6.024 6.224 6.448 6.682 6.921 7.173 7.437 7.663 7.939 8.258 8.567 8.865 9.075 9.012 8.507 7.613 6.718 5.849 5.044 4.299 3.614 2.99 2.458 1.925 1.466 1.062 0.674 0.314 -0.031 -0.368 -0.715 -1.01 -1.262 -1.521 -1.799 -2.038 -2.274 -2.513 -2.706 -2.92 -3.152 -3.377 -3.609 -3.77 -3.929 -4.17 -4.348 -4.529 -4.619 -4.816 -5.018 -5.235 -5.343 -5.601 -5.695 -5.816 -5.933 -6.18 -6.337 -6.523 -6.713 -6.891 -7.11 -7.378 -7.727 -4 ,6979 ,TETRA ,17589919,Sat Nov 27 19:22:44 CET,Sat Nov 27 21:13:02 CET,0.0 0.517 0.728 0.915 1.073 1.209 1.334 1.449 1.654 1.748 1.838 1.852 2.082 2.16 2.306 2.455 2.598 2.67 2.811 2.93 3.08 3.192 3.305 3.456 3.606 3.751 3.886 4.011 4.162 4.306 4.445 4.61 4.785 4.968 5.173 5.395 5.604 5.825 6.057 6.287 6.512 6.748 7.043 7.379 7.755 8.108 8.441 8.717 8.894 8.941 8.626 7.698 6.693 5.774 4.975 4.241 3.603 3.029 2.511 1.98 1.512 1.091 0.684 0.302 -0.053 -0.383 -0.718 -1.029 -1.317 -1.601 -1.892 -2.134 -2.373 -2.634 -2.834 -3.037 -3.248 -3.465 -3.699 -3.862 -4.017 -4.25 -4.438 -4.628 -4.713 -4.9 -5.099 -5.311 -5.426 -5.689 -5.776 -5.9 -6.034 -6.341 -6.531 -6.743 -6.957 -7.199 -7.469 -7.832 -8.412 -5 ,14988 ,TETRA ,17589920,Sat Nov 27 19:22:43 CET,Sat Nov 27 21:13:46 CET,0.0 0.607 0.847 1.072 1.253 1.376 1.479 1.582 1.791 1.885 1.969 1.968 2.2 2.287 2.444 2.578 2.72 2.791 2.928 3.079 3.291 3.418 3.54 3.713 3.874 4.034 4.178 4.309 4.482 4.649 4.813 5.018 5.218 5.412 5.643 5.889 6.122 6.387 6.658 6.92 7.169 7.427 7.738 8.04 8.341 8.665 8.988 9.243 9.449 9.432 9.03 8.238 7.353 6.453 5.656 4.941 4.295 3.692 3.157 2.628 2.187 1.798 1.402 1.012 0.66 0.356 0.048 -0.224 -0.457 -0.701 -0.965 -1.186 -1.407 -1.626 -1.788 -1.959 -2.148 -2.345 -2.548 -2.691 -2.838 -3.067 -3.235 -3.406 -3.487 -3.653 -3.826 -4.009 -4.102 -4.35 -4.406 -4.523 -4.642 -4.902 -5.05 -5.194 -5.327 -5.469 -5.649 -5.885 -6.439 -6 ,1699 ,TETRA ,17589921,Sat Nov 27 19:22:42 CET,Sat Nov 27 21:12:56 CET,0.0 0.581 0.795 0.977 1.126 1.249 1.376 1.494 1.711 1.829 1.94 1.977 2.218 2.331 2.533 2.694 2.855 2.938 3.107 3.253 3.435 3.566 3.689 3.867 4.047 4.215 4.38 4.532 4.715 4.891 5.058 5.263 5.462 5.648 5.849 6.069 6.279 6.514 6.757 6.997 7.242 7.501 7.808 8.116 8.435 8.731 8.991 9.168 9.27 9.19 8.633 7.608 6.617 5.755 5.001 4.319 3.706 3.148 2.651 2.121 1.665 1.264 0.87 0.525 0.237 -0.027 -0.318 -0.599 -0.846 -1.105 -1.369 -1.584 -1.821 -2.049 -2.218 -2.403 -2.598 -2.793 -2.987 -3.127 -3.274 -3.505 -3.666 -3.824 -3.896 -4.046 -4.227 -4.418 -4.516 -4.77 -4.809 -4.912 -5.025 -5.266 -5.396 -5.538 -5.703 -5.86 -6.027 -6.22 -6.782 -7 ,11479 ,TETRA ,17589922,Sat Nov 27 19:22:42 CET,Sat Nov 27 21:14:41 CET,0.0 0.622 0.849 1.017 1.168 1.3 1.422 1.536 1.746 1.84 1.923 1.937 2.167 2.246 2.386 2.516 2.652 2.718 2.835 2.956 3.133 3.242 3.347 3.498 3.65 3.79 3.919 4.048 4.23 4.397 4.555 4.747 4.922 5.109 5.36 5.631 5.876 6.149 6.43 6.703 6.963 7.233 7.529 7.822 8.128 8.427 8.73 8.979 9.181 9.209 8.801 7.879 6.917 6.041 5.211 4.427 3.756 3.146 2.63 2.105 1.633 1.195 0.778 0.395 0.02 -0.322 -0.676 -1.0 -1.277 -1.571 -1.868 -2.107 -2.355 -2.613 -2.808 -3.005 -3.224 -3.453 -3.673 -3.824 -3.985 -4.244 -4.428 -4.62 -4.72 -4.935 -5.148 -5.369 -5.483 -5.748 -5.858 -6.005 -6.146 -6.429 -6.593 -6.75 -6.905 -7.086 -7.301 -7.505 -8.027 -8 ,25882 ,TETRA ,17589923,Sat Nov 27 19:22:42 CET,Sat Nov 27 21:14:58 CET,0.0 0.584 0.793 0.952 1.098 1.233 1.365 1.476 1.662 1.746 1.831 1.851 2.078 2.152 2.319 2.488 2.654 2.741 2.902 3.041 3.257 3.397 3.527 3.722 3.893 4.043 4.188 4.333 4.51 4.68 4.845 5.04 5.246 5.439 5.653 5.9 6.141 6.376 6.604 6.844 7.107 7.405 7.699 7.949 8.239 8.55 8.862 9.133 9.317 9.346 8.868 7.882 6.945 6.087 5.283 4.53 3.87 3.267 2.742 2.197 1.699 1.262 0.861 0.482 0.116 -0.211 -0.556 -0.87 -1.123 -1.373 -1.639 -1.861 -2.087 -2.308 -2.472 -2.651 -2.844 -3.047 -3.245 -3.371 -3.508 -3.723 -3.878 -4.047 -4.126 -4.278 -4.446 -4.632 -4.733 -4.989 -5.05 -5.155 -5.265 -5.489 -5.611 -5.761 -5.94 -6.116 -6.284 -6.537 -7.139 -9 ,22974 ,TETRA ,17589924,Sat Nov 27 19:22:42 CET,Sat Nov 27 21:12:54 CET,0.0 0.505 0.752 0.969 1.146 1.272 1.373 1.483 1.688 1.766 1.835 1.831 2.061 2.141 2.286 2.43 2.563 2.628 2.754 2.873 3.052 3.166 3.275 3.431 3.581 3.719 3.846 3.973 4.136 4.29 4.43 4.611 4.799 4.984 5.206 5.464 5.708 5.955 6.205 6.451 6.694 6.942 7.2 7.437 7.694 7.962 8.233 8.466 8.648 8.715 8.302 7.392 6.379 5.413 4.569 3.808 3.157 2.548 2.043 1.561 1.111 0.69 0.305 -0.064 -0.42 -0.745 -1.091 -1.401 -1.654 -1.915 -2.186 -2.42 -2.672 -2.913 -3.087 -3.267 -3.452 -3.642 -3.837 -3.973 -4.122 -4.351 -4.493 -4.638 -4.716 -4.876 -5.034 -5.197 -5.289 -5.534 -5.573 -5.678 -5.795 -6.028 -6.137 -6.269 -6.422 -6.582 -6.752 -6.951 -7.425 -10 ,16859 ,TETRA ,17589925,Sat Nov 27 19:22:43 CET,Sat Nov 27 21:13:19 CET,0.0 0.569 0.848 1.023 1.194 1.338 1.469 1.588 1.773 1.861 1.958 1.996 2.233 2.32 2.477 2.634 2.785 2.85 2.965 3.076 3.235 3.333 3.431 3.582 3.728 3.867 4.003 4.142 4.329 4.502 4.671 4.875 5.067 5.265 5.508 5.751 5.954 6.18 6.447 6.739 7.022 7.323 7.649 7.947 8.265 8.592 8.913 9.201 9.401 9.328 8.834 7.898 6.872 5.958 5.144 4.379 3.723 3.155 2.63 2.071 1.584 1.147 0.757 0.389 0.047 -0.277 -0.625 -0.923 -1.177 -1.439 -1.701 -1.923 -2.173 -2.434 -2.635 -2.839 -3.049 -3.26 -3.475 -3.629 -3.783 -4.023 -4.193 -4.36 -4.44 -4.616 -4.782 -4.944 -5.032 -5.279 -5.325 -5.428 -5.544 -5.78 -5.903 -6.044 -6.207 -6.386 -6.552 -6.74 -7.425 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt deleted file mode 100644 index 949e4615..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13203 ,TETRA ,17589926,Sat Nov 27 19:22:43 CET,Sat Nov 27 21:15:29 CET,0.0 0.384 0.546 0.652 0.73 0.79 0.843 0.89 0.984 1.025 1.05 0.923 1.074 1.076 1.065 1.044 1.02 1.01 0.992 0.969 0.927 0.893 0.855 0.796 0.745 0.687 0.622 0.557 0.466 0.363 0.263 0.14 0.005 -0.146 -0.349 -0.592 -0.847 -1.161 -1.523 -1.926 -2.4 -2.999 -3.751 -4.581 -5.648 -6.965 -8.665 -10.821 -13.726 -17.815 -23.99 -30.53 -35.402 -39.195 -42.236 -44.802 -46.92 -48.738 -50.261 -51.755 -52.989 -54.033 -54.991 -55.875 -56.699 -57.426 -58.171 -58.83 -59.38 -59.954 -60.534 -60.991 -61.46 -61.946 -62.312 -62.687 -63.069 -63.46 -63.849 -64.107 -64.383 -64.818 -65.116 -65.409 -65.559 -65.877 -66.21 -66.57 -66.755 -67.152 -67.291 -67.479 -67.678 -68.106 -68.342 -68.586 -68.833 -69.123 -69.446 -69.751 -70.666 -2 ,16861 ,TETRA ,17589927,Sat Nov 27 19:22:43 CET,Sat Nov 27 21:15:19 CET,0.0 0.443 0.618 0.731 0.809 0.868 0.916 0.948 0.973 0.983 1.004 0.869 1.018 1.016 1.006 0.999 0.991 0.981 0.953 0.926 0.878 0.843 0.813 0.773 0.724 0.677 0.633 0.577 0.498 0.414 0.312 0.186 0.063 -0.087 -0.282 -0.518 -0.778 -1.08 -1.4 -1.802 -2.293 -2.887 -3.622 -4.429 -5.477 -6.75 -8.422 -10.575 -13.502 -17.586 -23.681 -30.266 -35.202 -39.059 -42.18 -44.818 -46.964 -48.818 -50.38 -51.898 -53.146 -54.216 -55.198 -56.082 -56.888 -57.606 -58.339 -58.99 -59.545 -60.104 -60.666 -61.125 -61.581 -62.039 -62.393 -62.753 -63.123 -63.5 -63.867 -64.124 -64.388 -64.78 -65.051 -65.326 -65.466 -65.745 -66.029 -66.337 -66.5 -66.878 -66.965 -67.129 -67.305 -67.667 -67.838 -68.016 -68.215 -68.414 -68.633 -68.903 -69.499 -3 ,542 ,TETRA ,17589928,Sat Nov 27 19:22:43 CET,Sat Nov 27 21:15:07 CET,0.0 0.274 0.461 0.597 0.704 0.788 0.83 0.857 0.925 0.951 0.961 0.817 0.965 0.969 0.975 0.975 0.973 0.971 0.968 0.954 0.906 0.865 0.826 0.762 0.693 0.629 0.573 0.513 0.421 0.326 0.24 0.119 -0.017 -0.164 -0.365 -0.619 -0.885 -1.193 -1.53 -1.916 -2.375 -2.947 -3.697 -4.538 -5.601 -6.892 -8.555 -10.7 -13.61 -17.684 -23.785 -30.248 -35.11 -38.931 -42.011 -44.601 -46.738 -48.589 -50.103 -51.57 -52.796 -53.855 -54.851 -55.757 -56.566 -57.274 -57.986 -58.6 -59.118 -59.639 -60.176 -60.625 -61.075 -61.534 -61.904 -62.283 -62.652 -63.012 -63.369 -63.609 -63.854 -64.245 -64.516 -64.787 -64.919 -65.187 -65.471 -65.758 -65.912 -66.294 -66.387 -66.542 -66.708 -67.045 -67.222 -67.425 -67.647 -67.868 -68.111 -68.373 -68.875 -4 ,2565 ,TETRA ,17589929,Sat Nov 27 19:23:42 CET,Sat Nov 27 21:14:03 CET,0.0 0.579 0.752 0.833 0.888 0.935 0.978 1.007 1.036 1.054 1.068 0.93 1.08 1.083 1.096 1.095 1.085 1.079 1.068 1.051 1.024 1.003 0.975 0.945 0.913 0.862 0.812 0.763 0.696 0.606 0.499 0.365 0.228 0.094 -0.083 -0.322 -0.583 -0.887 -1.247 -1.655 -2.119 -2.702 -3.443 -4.288 -5.381 -6.686 -8.356 -10.525 -13.496 -17.651 -23.873 -30.457 -35.35 -39.191 -42.278 -44.886 -47.069 -48.95 -50.504 -52.011 -53.24 -54.29 -55.289 -56.2 -57.019 -57.755 -58.497 -59.151 -59.702 -60.244 -60.803 -61.261 -61.723 -62.2 -62.572 -62.943 -63.325 -63.716 -64.1 -64.365 -64.64 -65.059 -65.345 -65.643 -65.793 -66.077 -66.364 -66.665 -66.822 -67.201 -67.301 -67.461 -67.62 -67.966 -68.161 -68.352 -68.549 -68.766 -69.001 -69.277 -69.78 -5 ,6512 ,TETRA ,17589930,Sat Nov 27 19:23:42 CET,Sat Nov 27 21:14:28 CET,0.0 0.603 0.788 0.925 1.068 1.196 1.298 1.38 1.474 1.507 1.552 1.488 1.668 1.697 1.743 1.779 1.795 1.796 1.795 1.799 1.801 1.795 1.779 1.75 1.712 1.667 1.618 1.561 1.469 1.367 1.256 1.11 0.963 0.804 0.605 0.368 0.117 -0.192 -0.556 -0.978 -1.467 -2.056 -2.81 -3.668 -4.75 -6.066 -7.787 -9.996 -12.994 -17.169 -23.37 -30.012 -34.971 -38.869 -41.998 -44.595 -46.76 -48.649 -50.201 -51.7 -52.942 -53.999 -54.992 -55.906 -56.736 -57.465 -58.177 -58.796 -59.325 -59.857 -60.392 -60.831 -61.275 -61.712 -62.055 -62.411 -62.778 -63.152 -63.522 -63.769 -64.018 -64.403 -64.669 -64.944 -65.08 -65.364 -65.662 -65.958 -66.108 -66.479 -66.573 -66.743 -66.901 -67.217 -67.391 -67.565 -67.757 -67.989 -68.255 -68.529 -69.116 -6 ,908 ,TETRA ,17589931,Sat Nov 27 19:23:42 CET,Sat Nov 27 21:11:00 CET,0.0 0.427 0.556 0.632 0.703 0.784 0.835 0.874 0.931 0.95 0.966 0.846 1.003 1.002 0.996 0.982 0.97 0.962 0.953 0.938 0.909 0.884 0.853 0.807 0.739 0.666 0.592 0.511 0.395 0.266 0.133 -0.045 -0.221 -0.392 -0.609 -0.883 -1.161 -1.484 -1.862 -2.295 -2.795 -3.396 -4.145 -4.972 -6.039 -7.342 -9.013 -11.176 -14.07 -18.103 -24.165 -30.656 -35.516 -39.389 -42.501 -45.084 -47.262 -49.146 -50.671 -52.145 -53.362 -54.408 -55.377 -56.271 -57.095 -57.824 -58.545 -59.163 -59.694 -60.242 -60.787 -61.212 -61.65 -62.1 -62.44 -62.789 -63.141 -63.487 -63.837 -64.085 -64.346 -64.739 -65.001 -65.279 -65.42 -65.696 -65.986 -66.299 -66.451 -66.822 -66.926 -67.087 -67.246 -67.587 -67.787 -68.001 -68.231 -68.486 -68.747 -69.088 -69.643 -7 ,27246 ,TETRA ,17589932,Sat Nov 27 19:23:42 CET,Sat Nov 27 21:09:12 CET,0.0 0.435 0.602 0.704 0.765 0.815 0.85 0.882 0.938 0.961 0.974 0.844 0.996 0.992 0.976 0.958 0.942 0.931 0.909 0.886 0.848 0.828 0.82 0.801 0.768 0.728 0.678 0.63 0.555 0.472 0.374 0.226 0.073 -0.09 -0.288 -0.525 -0.78 -1.082 -1.446 -1.869 -2.34 -2.906 -3.639 -4.468 -5.539 -6.856 -8.551 -10.731 -13.669 -17.733 -23.838 -30.37 -35.253 -39.053 -42.082 -44.649 -46.806 -48.672 -50.19 -51.659 -52.918 -53.998 -54.972 -55.867 -56.695 -57.424 -58.153 -58.787 -59.326 -59.881 -60.449 -60.913 -61.385 -61.86 -62.217 -62.58 -62.951 -63.323 -63.698 -63.962 -64.221 -64.593 -64.85 -65.131 -65.273 -65.549 -65.829 -66.108 -66.255 -66.63 -66.733 -66.912 -67.086 -67.43 -67.612 -67.812 -68.013 -68.216 -68.462 -68.765 -69.286 -8 ,15214 ,TETRA ,17589933,Sat Nov 27 19:23:43 CET,Sat Nov 27 21:14:27 CET,0.0 0.475 0.577 0.665 0.745 0.809 0.848 0.882 0.932 0.956 0.978 0.853 1.012 1.016 1.014 1.007 1.0 0.994 0.975 0.948 0.897 0.861 0.828 0.774 0.712 0.64 0.565 0.483 0.368 0.256 0.144 -0.011 -0.164 -0.311 -0.492 -0.718 -0.953 -1.249 -1.617 -2.03 -2.496 -3.061 -3.782 -4.602 -5.661 -6.958 -8.656 -10.855 -13.807 -17.887 -24.042 -30.573 -35.385 -39.205 -42.292 -44.847 -46.973 -48.82 -50.343 -51.834 -53.073 -54.12 -55.092 -56.002 -56.815 -57.54 -58.289 -58.949 -59.51 -60.066 -60.638 -61.106 -61.571 -62.049 -62.42 -62.803 -63.192 -63.594 -64.004 -64.27 -64.54 -64.952 -65.241 -65.541 -65.694 -66.0 -66.308 -66.632 -66.793 -67.17 -67.281 -67.458 -67.638 -67.982 -68.16 -68.348 -68.558 -68.804 -69.047 -69.348 -69.881 -9 ,14756 ,TETRA ,17589934,Sat Nov 27 19:23:42 CET,Sat Nov 27 21:16:41 CET,0.0 0.749 1.029 1.218 1.357 1.471 1.553 1.616 1.739 1.791 1.844 1.777 1.947 1.978 2.031 2.052 2.064 2.072 2.089 2.094 2.094 2.096 2.086 2.062 2.039 1.997 1.94 1.882 1.802 1.708 1.595 1.452 1.32 1.164 0.945 0.683 0.418 0.109 -0.247 -0.669 -1.141 -1.73 -2.503 -3.344 -4.421 -5.74 -7.433 -9.606 -12.542 -16.659 -22.832 -29.46 -34.406 -38.298 -41.412 -44.048 -46.236 -48.12 -49.693 -51.205 -52.466 -53.536 -54.509 -55.4 -56.224 -56.961 -57.698 -58.341 -58.872 -59.402 -59.944 -60.375 -60.815 -61.275 -61.632 -61.997 -62.364 -62.737 -63.114 -63.366 -63.617 -64.005 -64.274 -64.55 -64.691 -64.975 -65.276 -65.593 -65.748 -66.119 -66.223 -66.388 -66.561 -66.93 -67.118 -67.31 -67.514 -67.744 -68.005 -68.349 -68.875 -10 ,19727 ,TETRA ,17589935,Sat Nov 27 19:23:42 CET,Sat Nov 27 21:14:53 CET,0.0 0.446 0.535 0.628 0.715 0.781 0.832 0.872 0.916 0.93 0.951 0.817 0.961 0.959 0.953 0.946 0.941 0.937 0.928 0.904 0.85 0.816 0.781 0.725 0.657 0.592 0.521 0.432 0.31 0.182 0.056 -0.092 -0.248 -0.423 -0.65 -0.925 -1.179 -1.459 -1.796 -2.202 -2.676 -3.273 -4.048 -4.883 -5.946 -7.268 -8.986 -11.184 -14.134 -18.264 -24.503 -31.101 -35.994 -39.844 -42.93 -45.546 -47.715 -49.545 -51.064 -52.526 -53.734 -54.797 -55.809 -56.731 -57.544 -58.261 -58.994 -59.645 -60.195 -60.747 -61.318 -61.773 -62.237 -62.728 -63.1 -63.467 -63.841 -64.227 -64.618 -64.889 -65.162 -65.551 -65.805 -66.071 -66.212 -66.503 -66.773 -67.041 -67.184 -67.548 -67.64 -67.806 -67.969 -68.328 -68.517 -68.699 -68.894 -69.123 -69.37 -69.653 -70.24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt deleted file mode 100644 index 6e488ef7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,620 ,TETRA ,17589936,Sat Nov 27 19:23:42 CET,Sat Nov 27 21:13:29 CET,0.0 0.445 0.582 0.688 0.758 0.801 0.844 0.883 0.912 0.915 0.913 0.775 0.93 0.931 0.916 0.883 0.847 0.828 0.806 0.785 0.727 0.688 0.648 0.579 0.508 0.431 0.357 0.276 0.15 0.02 -0.123 -0.319 -0.518 -0.717 -0.964 -1.28 -1.615 -1.992 -2.424 -2.94 -3.52 -4.215 -5.117 -6.103 -7.376 -8.958 -10.97 -13.534 -17.008 -21.871 -29.105 -36.831 -42.606 -47.145 -50.82 -53.892 -56.423 -58.626 -60.446 -62.172 -63.625 -64.892 -66.065 -67.15 -68.125 -68.98 -69.861 -70.642 -71.293 -71.95 -72.624 -73.159 -73.703 -74.271 -74.705 -75.136 -75.568 -76.008 -76.451 -76.747 -77.049 -77.521 -77.851 -78.191 -78.367 -78.734 -79.118 -79.509 -79.703 -80.123 -80.306 -80.532 -80.765 -81.237 -81.497 -81.779 -82.075 -82.386 -82.733 -83.132 -83.996 -2 ,16553 ,TETRA ,17589937,Sat Nov 27 19:23:43 CET,Sat Nov 27 21:13:37 CET,0.0 0.252 0.366 0.458 0.535 0.582 0.62 0.65 0.684 0.693 0.705 0.576 0.725 0.723 0.722 0.712 0.698 0.69 0.661 0.625 0.572 0.537 0.492 0.413 0.339 0.251 0.151 0.062 -0.067 -0.213 -0.353 -0.527 -0.708 -0.902 -1.138 -1.414 -1.713 -2.092 -2.544 -3.077 -3.683 -4.395 -5.294 -6.293 -7.538 -9.06 -11.065 -13.624 -17.107 -21.977 -29.245 -37.026 -42.8 -47.28 -50.872 -53.91 -56.442 -58.621 -60.433 -62.174 -63.611 -64.838 -65.984 -67.058 -68.03 -68.886 -69.757 -70.512 -71.145 -71.787 -72.426 -72.943 -73.477 -74.021 -74.432 -74.851 -75.273 -75.701 -76.133 -76.42 -76.71 -77.154 -77.462 -77.776 -77.939 -78.266 -78.586 -78.93 -79.107 -79.512 -79.633 -79.809 -80.012 -80.43 -80.648 -80.88 -81.112 -81.388 -81.687 -81.982 -82.605 -3 ,31929 ,TETRA ,17589938,Sat Nov 27 19:23:43 CET,Sat Nov 27 21:13:49 CET,0.0 0.536 0.67 0.772 0.835 0.88 0.923 0.953 0.987 1.007 1.026 0.9 1.057 1.067 1.073 1.061 1.044 1.033 1.004 0.972 0.916 0.875 0.83 0.768 0.711 0.657 0.597 0.521 0.407 0.287 0.156 -0.022 -0.209 -0.402 -0.65 -0.94 -1.232 -1.599 -2.026 -2.51 -3.073 -3.787 -4.702 -5.697 -6.968 -8.512 -10.497 -13.031 -16.478 -21.311 -28.546 -36.213 -42.019 -46.654 -50.322 -53.411 -55.991 -58.186 -60.008 -61.738 -63.134 -64.344 -65.494 -66.542 -67.487 -68.343 -69.197 -69.939 -70.569 -71.208 -71.859 -72.399 -72.955 -73.502 -73.92 -74.342 -74.77 -75.221 -75.682 -75.987 -76.292 -76.775 -77.106 -77.443 -77.612 -77.939 -78.26 -78.594 -78.766 -79.161 -79.278 -79.465 -79.665 -80.08 -80.303 -80.539 -80.762 -80.993 -81.239 -81.52 -82.16 -4 ,9482 ,TETRA ,17589939,Sat Nov 27 19:23:43 CET,Sat Nov 27 21:12:48 CET,0.0 0.372 0.487 0.584 0.644 0.697 0.739 0.79 0.9 0.926 0.935 0.791 0.943 0.951 0.952 0.939 0.925 0.914 0.891 0.863 0.811 0.777 0.73 0.656 0.579 0.501 0.419 0.325 0.19 0.051 -0.091 -0.279 -0.468 -0.661 -0.904 -1.197 -1.505 -1.872 -2.286 -2.759 -3.326 -4.025 -4.901 -5.88 -7.096 -8.603 -10.623 -13.18 -16.596 -21.408 -28.581 -36.168 -41.872 -46.358 -49.983 -53.038 -55.553 -57.699 -59.467 -61.179 -62.622 -63.88 -65.03 -66.078 -67.027 -67.886 -68.762 -69.504 -70.129 -70.772 -71.424 -71.948 -72.484 -73.041 -73.473 -73.909 -74.34 -74.775 -75.21 -75.515 -75.835 -76.318 -76.649 -76.994 -77.167 -77.514 -77.865 -78.222 -78.407 -78.829 -79.001 -79.208 -79.426 -79.878 -80.127 -80.379 -80.65 -80.949 -81.279 -81.647 -82.237 -5 ,5195 ,TETRA ,17589940,Sat Nov 27 19:23:43 CET,Sat Nov 27 21:15:55 CET,0.0 0.327 0.439 0.505 0.555 0.596 0.622 0.645 0.704 0.731 0.765 0.673 0.838 0.859 0.886 0.905 0.922 0.922 0.906 0.888 0.859 0.836 0.809 0.764 0.708 0.645 0.577 0.501 0.395 0.279 0.144 -0.024 -0.201 -0.397 -0.632 -0.922 -1.226 -1.598 -2.042 -2.524 -3.09 -3.794 -4.668 -5.627 -6.865 -8.42 -10.426 -12.991 -16.428 -21.207 -28.388 -36.026 -41.728 -46.21 -49.809 -52.827 -55.321 -57.48 -59.278 -60.999 -62.434 -63.666 -64.796 -65.825 -66.765 -67.595 -68.434 -69.175 -69.807 -70.46 -71.116 -71.642 -72.186 -72.743 -73.166 -73.592 -74.016 -74.436 -74.854 -75.142 -75.429 -75.847 -76.134 -76.44 -76.598 -76.938 -77.295 -77.64 -77.813 -78.213 -78.328 -78.51 -78.706 -79.11 -79.325 -79.574 -79.833 -80.082 -80.359 -80.712 -81.553 -6 ,28700 ,TETRA ,17589941,Sat Nov 27 19:23:43 CET,Sat Nov 27 21:14:43 CET,0.0 0.508 0.742 0.914 1.029 1.132 1.232 1.312 1.425 1.46 1.485 1.391 1.557 1.579 1.615 1.621 1.62 1.618 1.606 1.589 1.566 1.546 1.517 1.457 1.39 1.317 1.232 1.15 1.042 0.919 0.789 0.606 0.406 0.198 -0.049 -0.349 -0.672 -1.066 -1.524 -2.036 -2.62 -3.332 -4.203 -5.172 -6.466 -8.047 -10.075 -12.71 -16.225 -21.1 -28.444 -36.181 -41.873 -46.347 -49.931 -52.916 -55.394 -57.558 -59.339 -61.008 -62.397 -63.614 -64.724 -65.753 -66.675 -67.477 -68.313 -69.047 -69.663 -70.278 -70.897 -71.401 -71.921 -72.458 -72.863 -73.264 -73.679 -74.114 -74.548 -74.833 -75.129 -75.593 -75.904 -76.216 -76.377 -76.699 -77.023 -77.365 -77.543 -77.954 -78.087 -78.268 -78.457 -78.86 -79.076 -79.293 -79.508 -79.746 -80.033 -80.401 -81.096 -7 ,22100 ,TETRA ,17589942,Sat Nov 27 19:23:43 CET,Sat Nov 27 21:13:34 CET,0.0 0.559 0.718 0.807 0.867 0.934 0.988 1.023 1.068 1.081 1.085 0.952 1.108 1.115 1.109 1.096 1.094 1.083 1.05 1.014 0.95 0.905 0.856 0.777 0.703 0.627 0.541 0.445 0.302 0.156 0.012 -0.176 -0.383 -0.609 -0.895 -1.228 -1.558 -1.944 -2.404 -2.926 -3.503 -4.205 -5.099 -6.098 -7.388 -8.988 -11.042 -13.662 -17.182 -21.999 -29.239 -37.02 -42.742 -47.189 -50.754 -53.741 -56.23 -58.392 -60.192 -61.986 -63.463 -64.725 -65.905 -66.958 -67.893 -68.728 -69.596 -70.35 -70.987 -71.639 -72.299 -72.816 -73.326 -73.865 -74.273 -74.677 -75.095 -75.523 -75.944 -76.226 -76.523 -76.965 -77.248 -77.556 -77.716 -78.025 -78.325 -78.632 -78.799 -79.201 -79.331 -79.512 -79.689 -80.065 -80.267 -80.477 -80.692 -80.927 -81.242 -81.629 -82.18 -8 ,24310 ,TETRA ,17589943,Sat Nov 27 19:23:43 CET,Sat Nov 27 21:13:36 CET,0.0 0.401 0.489 0.585 0.668 0.715 0.758 0.794 0.844 0.861 0.875 0.746 0.895 0.888 0.874 0.856 0.835 0.826 0.797 0.756 0.695 0.65 0.6 0.517 0.422 0.317 0.218 0.117 -0.031 -0.185 -0.331 -0.511 -0.7 -0.897 -1.133 -1.413 -1.71 -2.071 -2.484 -2.956 -3.504 -4.185 -5.067 -6.049 -7.318 -8.893 -10.936 -13.555 -17.012 -21.769 -29.039 -36.783 -42.511 -47.006 -50.634 -53.745 -56.293 -58.469 -60.27 -61.973 -63.391 -64.614 -65.733 -66.76 -67.7 -68.53 -69.384 -70.147 -70.789 -71.431 -72.07 -72.589 -73.122 -73.67 -74.087 -74.503 -74.936 -75.376 -75.813 -76.105 -76.401 -76.867 -77.177 -77.484 -77.642 -77.965 -78.286 -78.61 -78.783 -79.192 -79.34 -79.527 -79.699 -80.08 -80.299 -80.512 -80.725 -80.958 -81.214 -81.546 -82.101 -9 ,18097 ,TETRA ,17589944,Sat Nov 27 19:23:45 CET,Sat Nov 27 21:13:48 CET,0.0 0.576 0.785 0.935 1.065 1.164 1.242 1.308 1.412 1.454 1.495 1.414 1.586 1.616 1.664 1.686 1.698 1.696 1.679 1.665 1.633 1.604 1.578 1.521 1.457 1.398 1.333 1.264 1.155 1.028 0.9 0.73 0.537 0.326 0.08 -0.208 -0.506 -0.854 -1.26 -1.736 -2.276 -2.942 -3.825 -4.806 -6.043 -7.591 -9.588 -12.136 -15.585 -20.412 -27.658 -35.342 -41.058 -45.545 -49.141 -52.161 -54.669 -56.821 -58.6 -60.34 -61.789 -63.023 -64.161 -65.187 -66.103 -66.911 -67.738 -68.474 -69.09 -69.712 -70.347 -70.851 -71.365 -71.908 -72.319 -72.727 -73.137 -73.557 -73.988 -74.271 -74.557 -75.009 -75.319 -75.631 -75.785 -76.098 -76.427 -76.765 -76.935 -77.331 -77.432 -77.602 -77.791 -78.192 -78.399 -78.609 -78.851 -79.13 -79.404 -79.733 -80.336 -10 ,28940 ,TETRA ,17589945,Sat Nov 27 19:24:43 CET,Sat Nov 27 21:14:20 CET,0.0 0.528 0.742 0.917 1.041 1.147 1.232 1.302 1.409 1.444 1.473 1.374 1.543 1.56 1.587 1.607 1.609 1.61 1.605 1.59 1.572 1.548 1.512 1.46 1.411 1.347 1.266 1.176 1.062 0.943 0.805 0.632 0.46 0.271 0.026 -0.271 -0.58 -0.943 -1.362 -1.864 -2.435 -3.129 -4.017 -5.003 -6.266 -7.808 -9.836 -12.456 -15.935 -20.708 -27.913 -35.643 -41.399 -45.877 -49.465 -52.514 -55.044 -57.236 -59.059 -60.794 -62.235 -63.477 -64.621 -65.683 -66.661 -67.519 -68.382 -69.136 -69.764 -70.396 -71.048 -71.586 -72.132 -72.677 -73.088 -73.519 -73.961 -74.408 -74.866 -75.174 -75.48 -75.965 -76.307 -76.651 -76.829 -77.198 -77.581 -77.976 -78.175 -78.601 -78.767 -78.974 -79.188 -79.624 -79.843 -80.051 -80.278 -80.533 -80.814 -81.106 -81.505 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt deleted file mode 100644 index 1f2ec232..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11105 ,TETRA ,17589946,Sat Nov 27 19:24:44 CET,Sat Nov 27 21:15:40 CET,0.0 0.395 0.541 0.663 0.783 0.903 1.02 1.114 1.283 1.362 1.441 1.442 1.667 1.754 1.931 2.104 2.284 2.365 2.513 2.664 2.871 3.005 3.141 3.341 3.539 3.72 3.882 4.036 4.244 4.467 4.661 4.865 5.062 5.254 5.493 5.756 5.988 6.26 6.554 6.857 7.177 7.528 7.908 8.268 8.674 9.144 9.681 10.179 10.652 11.11 11.333 11.091 10.642 10.13 9.581 8.998 8.466 7.948 7.485 7.042 6.632 6.257 5.905 5.557 5.224 4.919 4.598 4.319 4.097 3.859 3.578 3.345 3.123 2.902 2.725 2.527 2.309 2.089 1.868 1.71 1.547 1.315 1.157 0.983 0.9 0.755 0.6 0.427 0.339 0.102 0.071 -0.031 -0.152 -0.395 -0.526 -0.668 -0.821 -0.971 -1.139 -1.369 -1.801 -2 ,14368 ,TETRA ,17589947,Sat Nov 27 19:24:43 CET,Sat Nov 27 21:15:45 CET,0.0 0.404 0.587 0.718 0.841 0.961 1.07 1.173 1.358 1.448 1.533 1.548 1.777 1.849 2.0 2.152 2.294 2.36 2.483 2.605 2.784 2.904 3.019 3.176 3.321 3.466 3.617 3.762 3.935 4.099 4.265 4.473 4.681 4.879 5.102 5.358 5.595 5.846 6.131 6.449 6.769 7.107 7.487 7.854 8.28 8.739 9.194 9.641 10.093 10.493 10.741 10.545 10.061 9.536 9.056 8.572 8.096 7.626 7.156 6.648 6.227 5.853 5.491 5.142 4.819 4.526 4.212 3.917 3.663 3.411 3.146 2.915 2.675 2.432 2.244 2.055 1.857 1.642 1.419 1.268 1.118 0.87 0.692 0.524 0.439 0.24 0.043 -0.143 -0.249 -0.515 -0.613 -0.744 -0.87 -1.117 -1.265 -1.416 -1.569 -1.72 -1.878 -2.117 -2.512 -3 ,18560 ,TETRA ,17589948,Sat Nov 27 19:24:43 CET,Sat Nov 27 21:16:03 CET,0.0 0.383 0.576 0.739 0.889 1.04 1.179 1.306 1.549 1.666 1.78 1.857 2.102 2.197 2.388 2.563 2.73 2.811 2.964 3.11 3.315 3.444 3.57 3.739 3.908 4.084 4.245 4.4 4.597 4.781 4.953 5.161 5.371 5.591 5.84 6.093 6.346 6.622 6.903 7.19 7.478 7.796 8.155 8.523 8.957 9.397 9.864 10.391 10.994 11.457 11.669 11.437 10.954 10.351 9.726 9.137 8.633 8.149 7.677 7.182 6.753 6.409 6.088 5.755 5.428 5.136 4.839 4.558 4.312 4.07 3.81 3.587 3.356 3.113 2.919 2.72 2.528 2.333 2.121 1.963 1.804 1.583 1.428 1.276 1.2 1.022 0.855 0.684 0.586 0.347 0.31 0.202 0.084 -0.158 -0.281 -0.421 -0.576 -0.742 -0.931 -1.196 -1.839 -4 ,25631 ,TETRA ,17589949,Sat Nov 27 19:24:43 CET,Sat Nov 27 21:15:19 CET,0.0 0.375 0.565 0.712 0.834 0.955 1.071 1.162 1.342 1.436 1.527 1.535 1.753 1.827 1.976 2.125 2.27 2.332 2.455 2.572 2.743 2.858 2.969 3.121 3.268 3.408 3.535 3.665 3.842 4.027 4.206 4.407 4.609 4.814 5.043 5.296 5.539 5.814 6.104 6.414 6.717 6.993 7.293 7.622 8.019 8.411 8.816 9.216 9.691 10.169 10.37 10.165 9.752 9.209 8.679 8.191 7.686 7.189 6.759 6.308 5.914 5.535 5.163 4.823 4.502 4.22 3.919 3.653 3.433 3.191 2.927 2.708 2.475 2.233 2.044 1.838 1.626 1.418 1.192 1.041 0.903 0.676 0.507 0.329 0.234 0.042 -0.151 -0.347 -0.455 -0.727 -0.826 -0.94 -1.071 -1.364 -1.514 -1.679 -1.882 -2.151 -2.469 -2.83 -3.406 -5 ,21454 ,TETRA ,17589950,Sat Nov 27 19:24:43 CET,Sat Nov 27 21:15:53 CET,0.0 0.643 0.843 0.998 1.127 1.239 1.348 1.453 1.655 1.755 1.845 1.856 2.078 2.158 2.333 2.486 2.619 2.684 2.81 2.928 3.106 3.221 3.322 3.464 3.612 3.761 3.906 4.045 4.229 4.422 4.605 4.816 5.038 5.259 5.497 5.739 5.981 6.26 6.559 6.868 7.16 7.487 7.893 8.255 8.669 9.157 9.656 10.117 10.6 10.963 10.977 10.594 10.104 9.486 8.85 8.231 7.685 7.218 6.815 6.383 5.975 5.611 5.273 4.945 4.629 4.334 4.025 3.739 3.489 3.242 2.989 2.792 2.579 2.347 2.17 1.972 1.777 1.583 1.372 1.217 1.059 0.821 0.645 0.455 0.359 0.162 -0.048 -0.258 -0.363 -0.612 -0.675 -0.78 -0.885 -1.098 -1.209 -1.345 -1.494 -1.668 -1.879 -2.084 -2.508 -6 ,2858 ,TETRA ,17589951,Sat Nov 27 19:24:43 CET,Sat Nov 27 21:09:31 CET,0.0 0.409 0.62 0.786 0.899 1.015 1.144 1.257 1.467 1.584 1.705 1.771 2.024 2.129 2.314 2.484 2.661 2.741 2.894 3.045 3.244 3.375 3.502 3.689 3.866 4.027 4.181 4.33 4.525 4.719 4.911 5.147 5.373 5.595 5.847 6.117 6.376 6.671 6.98 7.276 7.58 7.937 8.334 8.697 9.117 9.574 10.067 10.572 11.02 11.374 11.472 11.024 10.342 9.654 9.091 8.547 8.035 7.549 7.098 6.646 6.245 5.861 5.504 5.172 4.844 4.559 4.275 4.015 3.786 3.555 3.32 3.119 2.906 2.692 2.542 2.392 2.233 2.061 1.866 1.737 1.61 1.409 1.264 1.111 1.03 0.853 0.682 0.508 0.418 0.186 0.133 0.026 -0.083 -0.308 -0.428 -0.568 -0.736 -0.923 -1.133 -1.391 -1.844 -7 ,16043 ,TETRA ,17589952,Sat Nov 27 19:24:43 CET,Sat Nov 27 21:14:07 CET,0.0 0.726 0.995 1.186 1.367 1.539 1.684 1.818 2.08 2.203 2.312 2.374 2.622 2.718 2.902 3.081 3.239 3.311 3.46 3.603 3.813 3.952 4.086 4.28 4.46 4.627 4.79 4.944 5.135 5.328 5.504 5.717 5.929 6.116 6.35 6.623 6.868 7.12 7.388 7.683 7.988 8.33 8.733 9.121 9.548 9.955 10.373 10.858 11.376 11.836 12.075 11.744 11.219 10.667 10.076 9.492 8.976 8.494 8.032 7.541 7.119 6.735 6.356 6.007 5.692 5.406 5.116 4.852 4.62 4.38 4.118 3.899 3.678 3.45 3.269 3.07 2.872 2.681 2.464 2.307 2.156 1.92 1.753 1.584 1.493 1.292 1.085 0.888 0.784 0.525 0.42 0.285 0.153 -0.132 -0.295 -0.48 -0.685 -0.892 -1.132 -1.443 -1.97 -8 ,16227 ,TETRA ,17589953,Sat Nov 27 19:24:44 CET,Sat Nov 27 21:14:15 CET,0.0 0.311 0.458 0.607 0.747 0.865 0.978 1.089 1.309 1.405 1.498 1.536 1.773 1.849 1.998 2.14 2.268 2.332 2.46 2.585 2.767 2.873 2.974 3.129 3.273 3.414 3.559 3.7 3.876 4.045 4.227 4.464 4.685 4.894 5.139 5.409 5.641 5.893 6.174 6.456 6.753 7.081 7.441 7.822 8.264 8.73 9.191 9.54 9.873 10.204 10.307 9.999 9.455 8.825 8.181 7.537 6.975 6.475 6.039 5.607 5.214 4.839 4.464 4.116 3.801 3.513 3.211 2.943 2.719 2.482 2.224 2.021 1.824 1.59 1.396 1.207 1.019 0.819 0.6 0.45 0.292 0.056 -0.096 -0.261 -0.341 -0.49 -0.649 -0.819 -0.906 -1.15 -1.227 -1.355 -1.478 -1.699 -1.829 -1.966 -2.133 -2.339 -2.541 -2.755 -3.242 -9 ,32276 ,TETRA ,17589954,Sat Nov 27 19:24:44 CET,Sat Nov 27 21:14:42 CET,0.0 0.474 0.645 0.804 0.946 1.069 1.173 1.273 1.467 1.561 1.648 1.652 1.876 1.953 2.106 2.256 2.401 2.469 2.607 2.739 2.908 3.018 3.127 3.295 3.464 3.618 3.769 3.907 4.071 4.228 4.388 4.586 4.779 4.972 5.181 5.398 5.605 5.836 6.101 6.393 6.678 6.979 7.341 7.698 8.093 8.554 9.064 9.628 10.222 10.633 10.811 10.561 10.028 9.454 8.895 8.402 7.937 7.432 6.978 6.519 6.098 5.725 5.381 5.05 4.749 4.455 4.123 3.83 3.589 3.34 3.075 2.863 2.642 2.409 2.232 2.04 1.83 1.613 1.386 1.234 1.083 0.85 0.687 0.502 0.41 0.224 0.012 -0.204 -0.311 -0.564 -0.666 -0.817 -0.962 -1.234 -1.384 -1.55 -1.741 -1.977 -2.257 -2.589 -3.134 -10 ,24717 ,TETRA ,17589955,Sat Nov 27 19:24:44 CET,Sat Nov 27 21:18:20 CET,0.0 0.341 0.548 0.72 0.855 0.978 1.088 1.191 1.404 1.504 1.588 1.588 1.806 1.875 2.011 2.144 2.274 2.34 2.471 2.595 2.767 2.873 2.975 3.133 3.296 3.449 3.589 3.722 3.893 4.063 4.219 4.404 4.597 4.805 5.059 5.337 5.606 5.882 6.16 6.445 6.748 7.081 7.446 7.823 8.251 8.684 9.147 9.629 10.139 10.63 10.849 10.526 9.988 9.345 8.704 8.086 7.507 6.985 6.538 6.068 5.67 5.323 4.966 4.629 4.329 4.064 3.783 3.52 3.299 3.075 2.85 2.666 2.478 2.286 2.13 1.972 1.813 1.64 1.459 1.334 1.198 0.993 0.853 0.708 0.632 0.467 0.291 0.115 0.035 -0.205 -0.246 -0.349 -0.468 -0.703 -0.827 -0.964 -1.128 -1.31 -1.476 -1.657 -2.297 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index a1c60f57..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,37 ,TETRA ,17589956,Sat Nov 27 19:24:44 CET,Sat Nov 27 21:14:58 CET,0.0 0.356 0.554 0.714 0.874 1.01 1.139 1.258 1.47 1.578 1.682 1.728 1.976 2.078 2.273 2.442 2.597 2.677 2.837 2.989 3.213 3.362 3.507 3.71 3.904 4.108 4.311 4.507 4.763 5.016 5.271 5.581 5.879 6.166 6.487 6.847 7.2 7.593 8.027 8.493 8.971 9.5 10.115 10.742 11.462 12.226 13.097 14.079 15.213 16.583 18.167 19.189 19.532 19.606 19.544 19.38 19.172 18.95 18.714 18.45 18.222 17.985 17.724 17.484 17.26 17.049 16.844 16.65 16.469 16.285 16.097 15.943 15.797 15.649 15.515 15.364 15.214 15.05 14.869 14.751 14.632 14.432 14.284 14.142 14.07 13.91 13.751 13.58 13.488 13.255 13.189 13.077 12.96 12.716 12.584 12.442 12.271 12.068 11.844 11.551 10.385 -2 ,4074 ,TETRA ,17589957,Sat Nov 27 19:24:46 CET,Sat Nov 27 21:14:53 CET,0.0 0.354 0.529 0.699 0.861 1.0 1.12 1.238 1.455 1.559 1.661 1.704 1.948 2.036 2.212 2.387 2.545 2.622 2.775 2.925 3.144 3.291 3.437 3.648 3.848 4.048 4.24 4.415 4.638 4.859 5.079 5.358 5.631 5.886 6.194 6.551 6.885 7.237 7.631 8.06 8.529 9.092 9.717 10.334 11.057 11.834 12.725 13.751 14.918 16.234 17.686 18.6 18.87 18.956 18.883 18.713 18.54 18.324 18.109 17.87 17.633 17.414 17.195 16.979 16.768 16.57 16.372 16.188 16.004 15.813 15.598 15.407 15.222 15.032 14.885 14.727 14.554 14.373 14.194 14.074 13.943 13.723 13.57 13.419 13.334 13.138 12.939 12.745 12.634 12.384 12.276 12.15 12.017 11.703 11.525 11.331 11.139 10.913 10.64 10.243 9.183 -3 ,28543 ,TETRA ,17589958,Sat Nov 27 19:24:44 CET,Sat Nov 27 21:15:13 CET,0.0 0.861 1.139 1.4 1.621 1.79 1.937 2.082 2.343 2.462 2.585 2.685 2.942 3.042 3.228 3.428 3.623 3.713 3.885 4.054 4.296 4.452 4.605 4.821 5.039 5.249 5.451 5.653 5.923 6.191 6.44 6.735 7.031 7.314 7.63 7.981 8.322 8.73 9.184 9.637 10.094 10.62 11.248 11.878 12.621 13.428 14.345 15.369 16.486 17.733 19.13 20.103 20.391 20.368 20.224 20.008 19.758 19.494 19.241 18.978 18.739 18.495 18.245 18.004 17.771 17.563 17.333 17.114 16.919 16.724 16.533 16.353 16.171 15.991 15.832 15.669 15.506 15.339 15.162 15.036 14.907 14.684 14.515 14.344 14.26 14.079 13.878 13.683 13.584 13.334 13.235 13.102 12.961 12.693 12.527 12.342 12.135 11.9 11.615 11.169 10.122 -4 ,9366 ,TETRA ,17589959,Sat Nov 27 19:24:44 CET,Sat Nov 27 21:15:11 CET,0.0 0.344 0.517 0.655 0.821 1.008 1.178 1.332 1.616 1.747 1.87 1.96 2.215 2.325 2.547 2.749 2.931 3.021 3.196 3.363 3.608 3.777 3.93 4.14 4.359 4.579 4.8 5.015 5.28 5.526 5.769 6.066 6.359 6.645 6.974 7.345 7.704 8.109 8.555 9.027 9.5 10.026 10.666 11.3 12.028 12.873 13.834 14.888 16.102 17.465 18.973 19.974 20.345 20.405 20.327 20.203 20.034 19.811 19.579 19.3 19.028 18.789 18.558 18.329 18.12 17.916 17.694 17.5 17.313 17.108 16.907 16.742 16.56 16.37 16.233 16.083 15.921 15.752 15.568 15.434 15.295 15.103 14.967 14.815 14.735 14.58 14.436 14.295 14.218 13.995 13.933 13.832 13.73 13.492 13.346 13.19 13.026 12.84 12.602 12.217 11.239 -5 ,25696 ,TETRA ,17589960,Sat Nov 27 19:24:44 CET,Sat Nov 27 21:15:16 CET,0.0 0.315 0.485 0.639 0.769 0.894 1.015 1.119 1.329 1.435 1.528 1.569 1.82 1.924 2.132 2.33 2.52 2.613 2.782 2.947 3.204 3.373 3.535 3.77 3.992 4.202 4.42 4.632 4.895 5.151 5.398 5.702 5.992 6.262 6.575 6.938 7.279 7.659 8.086 8.529 9.007 9.54 10.151 10.783 11.539 12.404 13.419 14.537 15.751 17.096 18.626 19.646 19.969 20.001 19.945 19.831 19.637 19.396 19.151 18.89 18.66 18.441 18.226 18.013 17.793 17.592 17.384 17.191 17.011 16.821 16.627 16.459 16.282 16.095 15.945 15.796 15.644 15.481 15.31 15.185 15.048 14.852 14.72 14.588 14.526 14.393 14.241 14.08 13.989 13.759 13.697 13.589 13.491 13.271 13.128 12.974 12.818 12.637 12.389 12.09 11.145 -6 ,23805 ,TETRA ,17589961,Sat Nov 27 19:24:44 CET,Sat Nov 27 21:14:55 CET,0.0 0.918 1.229 1.452 1.648 1.83 1.987 2.135 2.411 2.53 2.651 2.741 2.992 3.094 3.308 3.515 3.709 3.804 3.98 4.146 4.392 4.556 4.718 4.953 5.173 5.385 5.59 5.796 6.071 6.331 6.581 6.867 7.14 7.409 7.73 8.099 8.454 8.848 9.274 9.714 10.175 10.72 11.361 12.014 12.779 13.646 14.624 15.706 16.983 18.325 19.651 20.461 20.761 20.851 20.742 20.537 20.309 20.081 19.868 19.607 19.349 19.091 18.839 18.603 18.387 18.197 18.009 17.839 17.682 17.51 17.323 17.168 16.996 16.815 16.685 16.553 16.408 16.252 16.077 15.955 15.83 15.651 15.534 15.407 15.335 15.173 15.018 14.859 14.769 14.539 14.478 14.373 14.269 14.037 13.911 13.767 13.599 13.414 13.206 12.942 12.318 -7 ,24755 ,TETRA ,17589962,Sat Nov 27 19:25:42 CET,Sat Nov 27 21:16:02 CET,0.0 0.21 0.416 0.611 0.754 0.88 1.01 1.141 1.391 1.494 1.587 1.625 1.869 1.966 2.138 2.298 2.458 2.537 2.692 2.839 3.057 3.207 3.352 3.552 3.754 3.957 4.162 4.371 4.657 4.925 5.168 5.461 5.754 6.035 6.353 6.712 7.063 7.456 7.875 8.316 8.796 9.355 9.993 10.635 11.394 12.223 13.154 14.188 15.395 16.749 18.121 18.926 19.249 19.288 19.149 18.935 18.695 18.458 18.22 17.92 17.647 17.402 17.163 16.94 16.723 16.508 16.286 16.094 15.921 15.73 15.533 15.379 15.208 15.013 14.863 14.714 14.558 14.401 14.249 14.15 14.042 13.855 13.723 13.585 13.513 13.373 13.209 13.047 12.966 12.743 12.707 12.614 12.513 12.286 12.155 12.014 11.849 11.653 11.457 11.182 10.558 -8 ,20639 ,TETRA ,17589963,Sat Nov 27 19:25:41 CET,Sat Nov 27 21:16:41 CET,0.0 0.305 0.544 0.737 0.877 1.011 1.138 1.262 1.496 1.605 1.705 1.733 1.976 2.074 2.261 2.431 2.591 2.67 2.827 2.98 3.205 3.351 3.496 3.701 3.901 4.094 4.274 4.451 4.689 4.917 5.135 5.41 5.677 5.939 6.26 6.627 6.986 7.381 7.799 8.251 8.73 9.271 9.921 10.563 11.301 12.136 13.08 14.092 15.203 16.44 17.789 18.726 19.14 19.249 19.128 18.939 18.692 18.415 18.173 17.904 17.655 17.409 17.168 16.945 16.729 16.52 16.295 16.094 15.921 15.742 15.555 15.396 15.227 15.035 14.883 14.727 14.56 14.388 14.21 14.086 13.962 13.777 13.639 13.486 13.412 13.264 13.105 12.939 12.852 12.625 12.577 12.472 12.363 12.151 12.03 11.894 11.737 11.563 11.391 11.12 10.165 -9 ,3124 ,TETRA ,17589964,Sat Nov 27 19:25:41 CET,Sat Nov 27 21:17:20 CET,0.0 0.272 0.491 0.665 0.834 0.984 1.123 1.247 1.488 1.595 1.689 1.722 1.956 2.048 2.234 2.405 2.565 2.648 2.812 2.96 3.178 3.326 3.466 3.674 3.888 4.103 4.313 4.504 4.753 5.007 5.242 5.516 5.792 6.08 6.407 6.758 7.108 7.512 7.952 8.403 8.877 9.423 10.06 10.706 11.469 12.305 13.238 14.272 15.458 16.837 18.392 19.334 19.659 19.734 19.685 19.566 19.387 19.173 18.939 18.664 18.427 18.228 18.022 17.799 17.579 17.372 17.158 16.973 16.804 16.615 16.434 16.282 16.113 15.943 15.815 15.676 15.53 15.384 15.236 15.132 15.016 14.841 14.724 14.592 14.523 14.377 14.221 14.061 13.974 13.748 13.707 13.609 13.495 13.25 13.119 12.982 12.841 12.671 12.423 12.098 11.343 -10 ,23151 ,TETRA ,17589965,Sat Nov 27 19:26:42 CET,Sat Nov 27 21:21:44 CET,0.0 0.464 0.7 0.865 0.988 1.108 1.231 1.352 1.566 1.676 1.794 1.848 2.09 2.187 2.371 2.548 2.746 2.846 3.035 3.215 3.482 3.655 3.819 4.057 4.271 4.479 4.705 4.927 5.189 5.432 5.682 5.989 6.279 6.56 6.888 7.259 7.62 8.027 8.475 8.93 9.405 9.95 10.596 11.259 12.028 12.888 13.836 14.838 16.046 17.455 18.88 19.858 20.309 20.415 20.359 20.228 20.044 19.827 19.605 19.345 19.103 18.876 18.643 18.431 18.224 18.005 17.77 17.571 17.394 17.204 17.009 16.848 16.676 16.496 16.363 16.225 16.091 15.957 15.803 15.687 15.568 15.377 15.246 15.104 15.029 14.883 14.728 14.562 14.48 14.25 14.189 14.093 13.978 13.721 13.579 13.436 13.285 13.105 12.886 12.591 12.016 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt deleted file mode 100644 index f1d2b03b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29873 ,TETRA ,17589966,Sat Nov 27 19:25:41 CET,Sat Nov 27 21:15:44 CET,0.0 0.321 0.579 0.805 0.941 1.056 1.176 1.299 1.521 1.613 1.694 1.627 1.928 2.0 2.134 2.275 2.408 2.469 2.578 2.69 2.856 2.962 3.07 3.231 3.38 3.526 3.666 3.798 3.971 4.135 4.289 4.476 4.655 4.819 5.018 5.238 5.432 5.634 5.851 6.067 6.289 6.531 6.788 7.025 7.245 7.46 7.662 7.782 7.795 7.61 6.853 5.45 4.209 3.123 2.095 1.141 0.279 -0.495 -1.158 -1.838 -2.426 -2.912 -3.359 -3.78 -4.159 -4.506 -4.872 -5.215 -5.508 -5.802 -6.121 -6.389 -6.659 -6.944 -7.158 -7.371 -7.608 -7.846 -8.071 -8.229 -8.404 -8.678 -8.864 -9.058 -9.161 -9.352 -9.534 -9.741 -9.846 -10.182 -10.174 -10.278 -10.386 -10.614 -10.75 -10.892 -11.05 -11.238 -11.428 -11.641 -12.201 -2 ,7890 ,TETRA ,17589967,Sat Nov 27 19:25:41 CET,Sat Nov 27 21:15:54 CET,0.0 0.497 0.723 0.906 1.06 1.203 1.341 1.459 1.664 1.768 1.86 1.807 2.112 2.191 2.337 2.477 2.607 2.67 2.797 2.913 3.103 3.224 3.337 3.514 3.678 3.827 3.968 4.103 4.29 4.466 4.622 4.799 4.966 5.134 5.32 5.535 5.728 5.927 6.148 6.341 6.522 6.743 6.986 7.217 7.469 7.664 7.814 7.875 7.795 7.488 6.569 5.151 3.843 2.707 1.684 0.733 -0.108 -0.882 -1.518 -2.123 -2.673 -3.177 -3.65 -4.104 -4.54 -4.924 -5.309 -5.654 -5.95 -6.254 -6.574 -6.851 -7.132 -7.415 -7.636 -7.863 -8.099 -8.344 -8.61 -8.79 -8.963 -9.216 -9.389 -9.573 -9.66 -9.836 -10.019 -10.208 -10.305 -10.636 -10.626 -10.745 -10.883 -11.157 -11.298 -11.468 -11.641 -11.843 -12.063 -12.276 -12.68 -3 ,24374 ,TETRA ,17589968,Sat Nov 27 19:25:43 CET,Sat Nov 27 21:15:26 CET,0.0 0.584 0.804 0.965 1.099 1.233 1.351 1.455 1.636 1.719 1.807 1.753 2.046 2.121 2.268 2.401 2.531 2.6 2.732 2.847 3.0 3.102 3.205 3.352 3.487 3.614 3.74 3.873 4.044 4.206 4.37 4.547 4.697 4.859 5.053 5.247 5.415 5.61 5.827 6.025 6.233 6.466 6.713 6.939 7.156 7.344 7.513 7.619 7.587 7.307 6.435 5.081 3.856 2.756 1.799 0.935 0.193 -0.474 -1.065 -1.638 -2.121 -2.572 -3.012 -3.419 -3.806 -4.174 -4.55 -4.886 -5.178 -5.48 -5.802 -6.064 -6.337 -6.635 -6.856 -7.087 -7.321 -7.553 -7.789 -7.939 -8.095 -8.323 -8.482 -8.654 -8.738 -8.909 -9.079 -9.257 -9.362 -9.7 -9.686 -9.799 -9.91 -10.127 -10.267 -10.435 -10.605 -10.763 -10.927 -11.159 -11.662 -4 ,23584 ,TETRA ,17589969,Sat Nov 27 19:25:43 CET,Sat Nov 27 21:19:48 CET,0.0 0.525 0.796 1.011 1.205 1.396 1.568 1.71 1.935 2.041 2.174 2.2 2.517 2.609 2.78 2.945 3.101 3.173 3.312 3.441 3.641 3.766 3.878 4.042 4.199 4.348 4.49 4.628 4.793 4.944 5.107 5.311 5.5 5.667 5.853 6.067 6.255 6.456 6.68 6.905 7.11 7.342 7.629 7.871 8.074 8.243 8.398 8.5 8.455 8.124 7.202 5.789 4.499 3.32 2.239 1.301 0.501 -0.255 -0.903 -1.557 -2.107 -2.591 -3.055 -3.476 -3.872 -4.235 -4.616 -4.959 -5.238 -5.538 -5.862 -6.12 -6.374 -6.638 -6.853 -7.072 -7.282 -7.5 -7.736 -7.889 -8.043 -8.286 -8.455 -8.636 -8.73 -8.912 -9.096 -9.289 -9.387 -9.716 -9.69 -9.806 -9.933 -10.182 -10.311 -10.446 -10.597 -10.753 -10.922 -11.144 -11.527 -5 ,4351 ,TETRA ,17589970,Sat Nov 27 19:25:43 CET,Sat Nov 27 21:17:37 CET,0.0 0.511 0.718 0.901 1.057 1.201 1.333 1.457 1.674 1.764 1.857 1.809 2.107 2.182 2.311 2.429 2.55 2.607 2.718 2.833 2.992 3.091 3.192 3.342 3.48 3.605 3.737 3.875 4.054 4.232 4.403 4.605 4.795 4.972 5.156 5.342 5.531 5.754 5.982 6.201 6.411 6.642 6.889 7.13 7.376 7.583 7.744 7.804 7.828 7.635 6.827 5.454 4.181 3.059 2.091 1.249 0.474 -0.251 -0.878 -1.52 -2.079 -2.564 -3.004 -3.425 -3.837 -4.211 -4.6 -4.944 -5.233 -5.525 -5.831 -6.097 -6.374 -6.658 -6.885 -7.108 -7.335 -7.558 -7.772 -7.923 -8.081 -8.325 -8.502 -8.689 -8.779 -8.962 -9.16 -9.358 -9.46 -9.796 -9.771 -9.884 -10.007 -10.241 -10.357 -10.494 -10.659 -10.841 -11.054 -11.266 -11.716 -6 ,14338 ,TETRA ,17589971,Sat Nov 27 19:25:43 CET,Sat Nov 27 21:20:34 CET,0.0 0.389 0.619 0.807 0.958 1.074 1.185 1.29 1.494 1.591 1.684 1.643 1.947 2.028 2.185 2.335 2.468 2.531 2.653 2.773 2.949 3.057 3.16 3.319 3.478 3.627 3.778 3.928 4.119 4.304 4.475 4.665 4.845 5.012 5.193 5.399 5.594 5.795 6.005 6.233 6.451 6.641 6.834 7.028 7.23 7.433 7.602 7.694 7.633 7.28 6.362 4.93 3.659 2.504 1.462 0.533 -0.245 -0.919 -1.522 -2.178 -2.749 -3.237 -3.688 -4.123 -4.545 -4.913 -5.293 -5.639 -5.936 -6.255 -6.58 -6.845 -7.125 -7.409 -7.628 -7.852 -8.091 -8.359 -8.626 -8.793 -8.969 -9.262 -9.471 -9.678 -9.782 -9.99 -10.207 -10.438 -10.552 -10.89 -10.884 -10.992 -11.106 -11.363 -11.496 -11.643 -11.808 -11.983 -12.171 -12.397 -12.861 -7 ,5185 ,TETRA ,17589972,Sat Nov 27 19:25:43 CET,Sat Nov 27 21:15:04 CET,0.0 0.508 0.778 0.967 1.102 1.222 1.331 1.43 1.619 1.7 1.781 1.717 2.011 2.084 2.22 2.354 2.486 2.548 2.667 2.782 2.943 3.037 3.127 3.268 3.404 3.536 3.667 3.79 3.944 4.099 4.244 4.407 4.562 4.708 4.874 5.045 5.2 5.387 5.582 5.77 5.969 6.165 6.348 6.548 6.775 6.958 7.096 7.21 7.185 6.817 5.885 4.538 3.305 2.199 1.173 0.205 -0.624 -1.352 -1.975 -2.602 -3.141 -3.617 -4.059 -4.481 -4.89 -5.256 -5.643 -5.989 -6.281 -6.587 -6.903 -7.166 -7.437 -7.709 -7.932 -8.175 -8.411 -8.644 -8.885 -9.048 -9.216 -9.494 -9.694 -9.892 -9.996 -10.227 -10.456 -10.683 -10.797 -11.132 -11.118 -11.23 -11.348 -11.612 -11.759 -11.913 -12.079 -12.265 -12.452 -12.678 -13.401 -8 ,15709 ,TETRA ,17589973,Sat Nov 27 19:25:43 CET,Sat Nov 27 21:16:51 CET,0.0 0.685 0.908 1.088 1.245 1.372 1.486 1.609 1.824 1.913 1.996 1.926 2.215 2.288 2.437 2.589 2.728 2.79 2.912 3.032 3.198 3.298 3.4 3.554 3.703 3.847 3.993 4.136 4.304 4.459 4.613 4.798 4.966 5.117 5.305 5.532 5.731 5.936 6.153 6.367 6.577 6.814 7.074 7.278 7.462 7.65 7.844 7.947 7.896 7.643 6.837 5.497 4.284 3.191 2.194 1.268 0.421 -0.349 -0.981 -1.607 -2.152 -2.628 -3.069 -3.481 -3.878 -4.239 -4.608 -4.947 -5.244 -5.554 -5.865 -6.129 -6.402 -6.667 -6.881 -7.099 -7.327 -7.575 -7.817 -7.977 -8.145 -8.404 -8.586 -8.772 -8.871 -9.087 -9.31 -9.532 -9.643 -9.987 -10.013 -10.144 -10.286 -10.598 -10.773 -10.961 -11.157 -11.373 -11.631 -11.902 -12.293 -9 ,9571 ,TETRA ,17589974,Sat Nov 27 19:26:42 CET,Sat Nov 27 21:17:34 CET,0.0 0.474 0.667 0.857 1.019 1.124 1.222 1.323 1.517 1.61 1.697 1.636 1.932 2.014 2.157 2.279 2.398 2.454 2.555 2.657 2.812 2.905 2.999 3.142 3.277 3.402 3.517 3.634 3.791 3.929 4.062 4.221 4.383 4.551 4.741 4.945 5.127 5.321 5.542 5.772 5.985 6.204 6.436 6.633 6.858 7.077 7.246 7.346 7.32 6.995 6.018 4.595 3.281 2.122 1.11 0.165 -0.694 -1.465 -2.145 -2.823 -3.39 -3.889 -4.348 -4.763 -5.148 -5.517 -5.902 -6.252 -6.556 -6.871 -7.197 -7.461 -7.738 -8.021 -8.232 -8.446 -8.676 -8.918 -9.164 -9.33 -9.509 -9.805 -10.0 -10.196 -10.301 -10.519 -10.752 -11.001 -11.12 -11.455 -11.47 -11.618 -11.776 -12.086 -12.259 -12.449 -12.654 -12.869 -13.119 -13.437 -14.207 -10 ,15774 ,TETRA ,17589975,Sat Nov 27 19:25:43 CET,Sat Nov 27 21:15:38 CET,0.0 0.77 0.968 1.131 1.27 1.38 1.48 1.582 1.783 1.882 1.983 1.948 2.248 2.323 2.472 2.616 2.749 2.81 2.929 3.049 3.215 3.317 3.413 3.554 3.7 3.831 3.951 4.064 4.204 4.358 4.522 4.718 4.909 5.102 5.319 5.523 5.702 5.901 6.113 6.332 6.546 6.762 7.01 7.241 7.465 7.669 7.86 8.006 7.995 7.724 6.906 5.653 4.472 3.369 2.386 1.447 0.635 -0.106 -0.741 -1.371 -1.928 -2.412 -2.883 -3.329 -3.747 -4.121 -4.502 -4.845 -5.148 -5.461 -5.782 -6.046 -6.31 -6.588 -6.803 -7.023 -7.264 -7.506 -7.739 -7.911 -8.095 -8.374 -8.56 -8.749 -8.852 -9.071 -9.303 -9.552 -9.679 -10.037 -10.067 -10.199 -10.338 -10.629 -10.79 -10.961 -11.137 -11.316 -11.525 -11.795 -12.376 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt deleted file mode 100644 index b23fab05..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14672 ,TETRA ,17589976,Sat Nov 27 19:25:43 CET,Sat Nov 27 21:15:44 CET,0.0 0.619 0.981 1.297 1.595 1.847 2.066 2.271 2.658 2.854 3.05 3.195 3.606 3.787 4.129 4.451 4.771 4.928 5.23 5.526 5.975 6.273 6.561 6.976 7.376 7.765 8.148 8.532 9.038 9.534 10.016 10.603 11.19 11.78 12.478 13.267 14.028 14.878 15.818 16.855 17.969 19.246 20.806 22.444 24.414 26.707 29.489 32.814 36.886 42.017 48.992 55.601 60.04 63.182 65.462 67.254 68.652 69.791 70.673 71.474 72.143 72.716 73.217 73.645 73.999 74.303 74.606 74.857 75.059 75.251 75.437 75.578 75.716 75.854 75.949 76.037 76.126 76.215 76.293 76.34 76.383 76.442 76.475 76.496 76.506 76.522 76.533 76.547 76.552 76.405 76.553 76.539 76.522 76.483 76.458 76.425 76.4 76.372 76.333 76.283 76.106 -2 ,2764 ,TETRA ,17589977,Sat Nov 27 19:25:44 CET,Sat Nov 27 21:15:44 CET,0.0 0.338 0.596 0.832 1.06 1.264 1.447 1.628 1.996 2.178 2.348 2.455 2.855 3.021 3.343 3.657 3.961 4.117 4.426 4.713 5.153 5.443 5.724 6.126 6.519 6.911 7.294 7.675 8.182 8.685 9.172 9.761 10.337 10.905 11.582 12.348 13.102 13.957 14.908 15.951 17.067 18.386 19.991 21.638 23.645 25.992 28.849 32.275 36.542 41.993 49.171 55.893 60.491 63.785 66.247 68.197 69.699 70.91 71.835 72.649 73.297 73.829 74.286 74.676 75.023 75.329 75.62 75.846 76.02 76.189 76.344 76.458 76.573 76.682 76.754 76.827 76.892 76.962 77.032 77.077 77.119 77.165 77.198 77.232 77.246 77.279 77.315 77.343 77.349 77.2 77.35 77.344 77.333 77.277 77.217 77.138 77.06 76.964 76.825 76.659 76.188 -3 ,19020 ,TETRA ,17589978,Sat Nov 27 19:25:44 CET,Sat Nov 27 21:16:06 CET,0.0 0.34 0.607 0.832 1.061 1.265 1.45 1.635 1.984 2.151 2.319 2.4 2.774 2.924 3.234 3.54 3.835 3.975 4.247 4.525 4.934 5.2 5.462 5.854 6.255 6.646 7.016 7.37 7.83 8.283 8.735 9.303 9.871 10.448 11.122 11.875 12.622 13.489 14.464 15.526 16.672 17.993 19.577 21.201 23.15 25.434 28.186 31.452 35.544 40.729 47.742 54.335 58.753 61.941 64.255 66.081 67.513 68.657 69.548 70.369 71.01 71.527 71.985 72.38 72.713 73.001 73.273 73.5 73.686 73.864 74.051 74.199 74.345 74.479 74.571 74.659 74.745 74.833 74.907 74.952 74.996 75.044 75.072 75.089 75.099 75.126 75.138 75.142 75.138 74.981 75.104 75.086 75.069 75.04 75.018 74.964 74.912 74.87 74.812 74.751 74.498 -4 ,19598 ,TETRA ,17589979,Sat Nov 27 19:25:45 CET,Sat Nov 27 21:15:39 CET,0.0 0.415 0.704 0.954 1.163 1.367 1.563 1.754 2.107 2.272 2.439 2.539 2.928 3.082 3.38 3.673 3.956 4.097 4.366 4.618 5.0 5.27 5.54 5.931 6.316 6.698 7.07 7.441 7.932 8.414 8.901 9.517 10.117 10.705 11.407 12.205 12.984 13.862 14.837 15.897 17.051 18.4 20.002 21.674 23.696 25.999 28.797 32.18 36.405 41.828 49.125 55.985 60.537 63.778 66.185 68.045 69.466 70.62 71.512 72.326 72.971 73.5 73.974 74.39 74.75 75.052 75.325 75.545 75.744 75.937 76.104 76.233 76.344 76.444 76.515 76.579 76.649 76.72 76.781 76.812 76.839 76.87 76.886 76.888 76.882 76.866 76.84 76.812 76.799 76.632 76.738 76.707 76.667 76.589 76.545 76.477 76.375 76.258 76.139 75.932 75.31 -5 ,16628 ,TETRA ,17589980,Sat Nov 27 19:25:44 CET,Sat Nov 27 21:17:15 CET,0.0 0.477 0.755 0.993 1.224 1.431 1.629 1.816 2.165 2.335 2.51 2.61 2.994 3.155 3.468 3.764 4.063 4.211 4.491 4.772 5.201 5.488 5.771 6.177 6.573 6.968 7.372 7.77 8.281 8.795 9.29 9.888 10.471 11.036 11.708 12.469 13.21 14.054 14.98 15.989 17.104 18.411 19.962 21.554 23.518 25.809 28.554 31.86 35.972 41.149 48.111 54.676 59.044 62.2 64.603 66.51 67.968 69.138 70.071 70.917 71.581 72.124 72.604 73.024 73.374 73.651 73.905 74.129 74.305 74.463 74.618 74.729 74.844 74.967 75.043 75.1 75.153 75.208 75.263 75.295 75.32 75.357 75.381 75.403 75.416 75.44 75.458 75.468 75.474 75.328 75.461 75.441 75.424 75.374 75.332 75.286 75.238 75.169 75.077 74.974 74.61 -6 ,8770 ,TETRA ,17589981,Sat Nov 27 19:25:43 CET,Sat Nov 27 21:15:53 CET,0.0 0.361 0.596 0.837 1.087 1.351 1.607 1.832 2.237 2.431 2.61 2.727 3.123 3.294 3.642 3.972 4.293 4.455 4.774 5.076 5.514 5.805 6.089 6.506 6.908 7.297 7.68 8.062 8.575 9.081 9.582 10.189 10.778 11.362 12.055 12.852 13.637 14.513 15.466 16.51 17.644 18.979 20.619 22.309 24.289 26.551 29.288 32.54 36.558 41.749 48.724 55.283 59.735 62.947 65.316 67.134 68.533 69.657 70.512 71.302 71.937 72.451 72.903 73.302 73.657 73.942 74.197 74.408 74.578 74.737 74.885 74.995 75.091 75.195 75.272 75.333 75.393 75.449 75.498 75.523 75.54 75.561 75.569 75.565 75.564 75.576 75.563 75.513 75.491 75.322 75.42 75.394 75.362 75.249 75.18 75.1 75.01 74.906 74.796 74.679 74.279 -7 ,32018 ,TETRA ,17589982,Sat Nov 27 19:25:46 CET,Sat Nov 27 21:16:18 CET,0.0 0.502 0.762 1.018 1.252 1.459 1.67 1.875 2.235 2.405 2.579 2.681 3.066 3.222 3.528 3.817 4.108 4.257 4.542 4.818 5.227 5.49 5.75 6.127 6.494 6.869 7.234 7.584 8.044 8.494 8.936 9.484 10.059 10.639 11.299 12.062 12.827 13.688 14.646 15.697 16.818 18.115 19.665 21.262 23.207 25.469 28.212 31.519 35.611 40.769 47.827 54.455 58.811 61.932 64.229 66.033 67.462 68.611 69.503 70.327 70.985 71.519 71.978 72.37 72.708 73.006 73.287 73.515 73.696 73.859 74.014 74.133 74.252 74.356 74.424 74.486 74.546 74.598 74.637 74.663 74.692 74.736 74.766 74.798 74.818 74.848 74.863 74.871 74.877 74.735 74.907 74.903 74.885 74.858 74.837 74.808 74.79 74.752 74.699 74.62 74.501 -8 ,29739 ,TETRA ,17589983,Sat Nov 27 19:25:48 CET,Sat Nov 27 21:16:10 CET,0.0 0.563 0.85 1.113 1.345 1.552 1.744 1.92 2.258 2.424 2.589 2.702 3.095 3.25 3.574 3.911 4.224 4.375 4.692 4.998 5.435 5.719 5.995 6.422 6.835 7.221 7.601 7.978 8.478 8.969 9.448 10.049 10.656 11.24 11.904 12.673 13.437 14.281 15.206 16.219 17.331 18.63 20.188 21.817 23.785 26.041 28.745 32.023 36.138 41.328 48.295 54.905 59.314 62.469 64.806 66.609 68.018 69.179 70.079 70.897 71.571 72.131 72.597 72.987 73.318 73.593 73.854 74.061 74.216 74.369 74.513 74.622 74.735 74.85 74.932 75.005 75.082 75.156 75.212 75.241 75.265 75.301 75.32 75.321 75.323 75.321 75.302 75.275 75.253 75.08 75.145 75.085 75.033 74.941 74.888 74.813 74.723 74.633 74.509 74.269 73.487 -9 ,15426 ,TETRA ,17589984,Sat Nov 27 19:25:43 CET,Sat Nov 27 21:15:39 CET,0.0 0.498 0.792 1.04 1.242 1.425 1.611 1.808 2.191 2.364 2.528 2.632 3.033 3.205 3.533 3.85 4.154 4.309 4.62 4.916 5.349 5.628 5.909 6.325 6.723 7.115 7.49 7.866 8.372 8.861 9.341 9.925 10.508 11.093 11.768 12.54 13.295 14.134 15.054 16.067 17.173 18.453 20.021 21.665 23.627 25.893 28.679 31.997 36.118 41.353 48.312 54.893 59.395 62.68 65.108 67.028 68.544 69.79 70.755 71.635 72.338 72.891 73.356 73.76 74.107 74.401 74.674 74.898 75.092 75.291 75.483 75.63 75.772 75.908 76.007 76.093 76.181 76.267 76.341 76.394 76.437 76.488 76.526 76.563 76.583 76.616 76.64 76.657 76.664 76.519 76.683 76.683 76.663 76.611 76.586 76.557 76.527 76.488 76.415 76.297 76.105 -10 ,16967 ,TETRA ,17589985,Sat Nov 27 19:26:42 CET,Sat Nov 27 21:16:00 CET,0.0 0.392 0.663 0.91 1.117 1.305 1.489 1.668 2.003 2.161 2.316 2.39 2.763 2.913 3.211 3.502 3.789 3.93 4.204 4.471 4.882 5.148 5.402 5.783 6.161 6.532 6.908 7.289 7.799 8.3 8.786 9.375 9.955 10.527 11.19 11.959 12.738 13.61 14.567 15.587 16.681 17.958 19.493 21.115 23.088 25.349 28.045 31.254 35.288 40.525 47.582 54.149 58.535 61.716 64.081 65.952 67.42 68.614 69.557 70.421 71.087 71.639 72.134 72.55 72.912 73.213 73.491 73.718 73.892 74.052 74.206 74.324 74.43 74.532 74.608 74.681 74.747 74.812 74.873 74.899 74.92 74.941 74.958 74.983 74.99 74.991 74.982 74.956 74.936 74.767 74.896 74.887 74.865 74.819 74.801 74.776 74.735 74.676 74.588 74.485 74.219 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt deleted file mode 100644 index a23c53d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6413 ,TETRA ,17589986,Sat Nov 27 19:27:43 CET,Sat Nov 27 21:19:18 CET,0.0 0.775 1.245 1.583 1.872 2.131 2.358 2.579 3.016 3.21 3.392 3.52 3.925 4.101 4.45 4.792 5.115 5.276 5.599 5.901 6.33 6.619 6.91 7.348 7.771 8.18 8.602 9.016 9.543 10.069 10.578 11.187 11.796 12.407 13.136 13.969 14.774 15.685 16.712 17.835 19.033 20.422 22.106 23.865 25.975 28.422 31.417 34.963 39.367 45.022 52.72 59.92 64.785 68.352 70.986 73.046 74.64 75.958 76.977 77.914 78.651 79.232 79.738 80.179 80.569 80.9 81.205 81.455 81.661 81.862 82.046 82.182 82.308 82.422 82.503 82.578 82.649 82.705 82.751 82.783 82.808 82.824 82.829 82.829 82.823 82.812 82.822 82.825 82.817 82.666 82.801 82.797 82.786 82.743 82.716 82.694 82.662 82.604 82.521 82.415 82.158 -2 ,28974 ,TETRA ,17589987,Sat Nov 27 19:26:42 CET,Sat Nov 27 21:17:46 CET,0.0 0.596 0.886 1.165 1.423 1.692 1.947 2.192 2.669 2.884 3.095 3.268 3.67 3.843 4.21 4.564 4.884 5.043 5.361 5.666 6.112 6.4 6.689 7.105 7.503 7.914 8.329 8.734 9.255 9.765 10.285 10.923 11.531 12.122 12.828 13.648 14.46 15.389 16.43 17.559 18.75 20.131 21.805 23.571 25.716 28.199 31.215 34.765 39.236 45.036 52.822 60.134 65.016 68.523 71.141 73.194 74.783 76.062 77.044 77.931 78.624 79.175 79.68 80.143 80.526 80.845 81.155 81.408 81.605 81.788 81.963 82.096 82.213 82.316 82.39 82.468 82.546 82.62 82.686 82.713 82.734 82.76 82.766 82.78 82.785 82.785 82.786 82.797 82.807 82.656 82.796 82.797 82.789 82.759 82.742 82.709 82.657 82.601 82.522 82.413 82.093 -3 ,4337 ,TETRA ,17589988,Sat Nov 27 19:26:42 CET,Sat Nov 27 21:12:09 CET,0.0 0.381 0.629 0.859 1.082 1.278 1.471 1.653 1.996 2.156 2.31 2.406 2.798 2.956 3.256 3.551 3.845 3.992 4.272 4.554 4.985 5.26 5.518 5.903 6.3 6.684 7.057 7.456 7.993 8.506 9.019 9.651 10.258 10.853 11.558 12.371 13.167 14.047 15.022 16.108 17.29 18.641 20.269 21.973 24.054 26.482 29.371 32.803 37.102 42.649 50.182 57.238 62.011 65.494 68.071 70.1 71.692 72.992 74.015 74.934 75.638 76.208 76.718 77.175 77.57 77.897 78.21 78.468 78.692 78.906 79.084 79.216 79.344 79.459 79.541 79.622 79.696 79.778 79.864 79.917 79.971 80.038 80.069 80.105 80.128 80.163 80.176 80.166 80.162 80.014 80.129 80.114 80.103 80.072 80.049 80.023 79.979 79.921 79.841 79.696 79.113 -4 ,17683 ,TETRA ,17589989,Sat Nov 27 19:26:42 CET,Sat Nov 27 21:16:24 CET,0.0 0.386 0.632 0.893 1.123 1.317 1.508 1.684 1.994 2.149 2.316 2.407 2.789 2.942 3.236 3.528 3.817 3.965 4.26 4.541 4.966 5.241 5.51 5.912 6.307 6.695 7.081 7.464 7.975 8.487 8.996 9.626 10.245 10.842 11.551 12.362 13.156 14.073 15.094 16.217 17.42 18.78 20.397 22.09 24.154 26.548 29.421 32.914 37.326 42.875 50.435 57.592 62.364 65.861 68.486 70.541 72.152 73.424 74.407 75.309 76.014 76.614 77.139 77.584 77.956 78.261 78.561 78.804 79.0 79.194 79.383 79.544 79.713 79.872 79.979 80.074 80.166 80.256 80.337 80.382 80.418 80.465 80.504 80.544 80.558 80.576 80.601 80.62 80.616 80.474 80.629 80.62 80.597 80.548 80.519 80.478 80.434 80.383 80.302 80.197 79.924 -5 ,5651 ,TETRA ,17589990,Sat Nov 27 19:26:45 CET,Sat Nov 27 21:16:12 CET,0.0 0.405 0.645 0.856 1.068 1.269 1.456 1.639 1.986 2.152 2.314 2.405 2.782 2.927 3.222 3.518 3.808 3.954 4.247 4.533 4.945 5.225 5.507 5.928 6.341 6.741 7.144 7.538 8.038 8.523 9.008 9.621 10.227 10.819 11.529 12.34 13.131 14.011 14.984 16.067 17.243 18.606 20.242 21.948 24.023 26.417 29.29 32.683 36.938 42.486 50.073 57.205 61.987 65.434 67.996 70.043 71.618 72.861 73.853 74.777 75.495 76.084 76.602 77.051 77.438 77.762 78.056 78.302 78.511 78.707 78.894 79.029 79.152 79.273 79.365 79.444 79.512 79.578 79.641 79.681 79.706 79.714 79.717 79.726 79.726 79.724 79.73 79.735 79.733 79.584 79.721 79.707 79.701 79.697 79.665 79.608 79.577 79.541 79.457 79.34 79.046 -6 ,131 ,TETRA ,17589991,Sat Nov 27 19:26:43 CET,Sat Nov 27 21:16:18 CET,0.0 0.323 0.561 0.778 0.985 1.194 1.395 1.574 1.908 2.063 2.218 2.301 2.681 2.833 3.138 3.443 3.745 3.903 4.209 4.506 4.944 5.229 5.516 5.936 6.36 6.772 7.17 7.564 8.073 8.57 9.062 9.68 10.295 10.891 11.59 12.392 13.187 14.076 15.061 16.133 17.28 18.649 20.317 22.044 24.136 26.572 29.499 32.99 37.33 42.885 50.578 57.941 62.79 66.252 68.84 70.911 72.543 73.875 74.916 75.846 76.579 77.192 77.73 78.181 78.557 78.87 79.184 79.433 79.629 79.826 80.004 80.136 80.272 80.397 80.483 80.566 80.628 80.683 80.731 80.753 80.779 80.828 80.863 80.898 80.915 80.938 80.945 80.95 80.951 80.794 80.914 80.901 80.883 80.836 80.809 80.773 80.732 80.667 80.57 80.462 80.229 -7 ,32593 ,TETRA ,17589992,Sat Nov 27 19:26:43 CET,Sat Nov 27 21:16:09 CET,0.0 0.653 0.925 1.15 1.358 1.544 1.721 1.904 2.26 2.427 2.584 2.669 3.051 3.202 3.497 3.792 4.079 4.235 4.555 4.859 5.303 5.598 5.896 6.342 6.781 7.192 7.591 7.993 8.52 9.051 9.591 10.236 10.856 11.467 12.182 13.012 13.815 14.697 15.673 16.744 17.912 19.301 20.986 22.71 24.797 27.204 30.137 33.633 37.964 43.531 51.057 58.241 63.12 66.646 69.272 71.328 72.907 74.204 75.219 76.102 76.776 77.343 77.856 78.298 78.691 79.031 79.337 79.587 79.794 79.974 80.137 80.271 80.394 80.501 80.58 80.655 80.723 80.779 80.824 80.85 80.877 80.91 80.934 80.967 80.983 81.018 81.048 81.052 81.043 80.892 81.019 81.004 80.994 80.965 80.933 80.876 80.807 80.747 80.665 80.518 80.189 -8 ,11175 ,TETRA ,17589993,Sat Nov 27 19:27:43 CET,Sat Nov 27 21:18:31 CET,0.0 0.634 0.9 1.132 1.355 1.575 1.8 2.028 2.458 2.658 2.86 3.024 3.432 3.615 3.964 4.289 4.616 4.777 5.089 5.385 5.809 6.098 6.397 6.831 7.241 7.65 8.063 8.458 8.966 9.471 9.974 10.605 11.228 11.834 12.525 13.314 14.092 14.953 15.925 16.999 18.173 19.549 21.194 22.913 24.989 27.362 30.229 33.714 38.083 43.684 51.294 58.428 63.164 66.657 69.313 71.393 73.038 74.338 75.33 76.238 76.952 77.546 78.068 78.522 78.919 79.263 79.588 79.853 80.066 80.267 80.466 80.624 80.784 80.95 81.058 81.155 81.263 81.368 81.463 81.51 81.547 81.607 81.642 81.683 81.705 81.746 81.778 81.784 81.787 81.638 81.774 81.766 81.743 81.681 81.65 81.611 81.572 81.514 81.424 81.311 80.908 -9 ,12310 ,TETRA ,17589994,Sat Nov 27 19:26:43 CET,Sat Nov 27 21:14:20 CET,0.0 0.406 0.665 0.919 1.141 1.342 1.53 1.712 2.088 2.283 2.473 2.604 3.012 3.192 3.516 3.829 4.148 4.302 4.619 4.938 5.387 5.678 5.964 6.392 6.813 7.232 7.638 8.03 8.553 9.074 9.587 10.226 10.853 11.456 12.165 12.989 13.795 14.713 15.726 16.833 18.021 19.37 20.984 22.671 24.787 27.276 30.261 33.787 38.184 43.806 51.451 58.727 63.549 67.008 69.59 71.643 73.256 74.563 75.579 76.513 77.261 77.866 78.383 78.843 79.247 79.59 79.928 80.178 80.371 80.562 80.743 80.891 81.033 81.176 81.278 81.377 81.474 81.574 81.661 81.7 81.74 81.79 81.819 81.857 81.872 81.885 81.898 81.915 81.922 81.78 81.926 81.924 81.925 81.907 81.877 81.821 81.744 81.661 81.539 81.405 80.901 -10 ,22222 ,TETRA ,17589995,Sat Nov 27 19:26:45 CET,Sat Nov 27 21:13:07 CET,0.0 0.394 0.635 0.858 1.062 1.253 1.452 1.654 2.056 2.257 2.451 2.601 3.015 3.193 3.537 3.884 4.223 4.38 4.686 4.987 5.424 5.714 5.993 6.415 6.835 7.239 7.635 8.036 8.573 9.11 9.625 10.236 10.846 11.45 12.176 12.993 13.773 14.672 15.679 16.755 17.925 19.315 21.009 22.761 24.832 27.239 30.169 33.724 38.171 43.767 51.341 58.575 63.46 66.954 69.554 71.635 73.253 74.527 75.51 76.379 77.06 77.638 78.132 78.55 78.922 79.248 79.559 79.796 79.985 80.17 80.357 80.508 80.636 80.751 80.837 80.913 80.978 81.043 81.098 81.126 81.156 81.188 81.199 81.209 81.208 81.209 81.209 81.185 81.173 81.007 81.08 81.055 81.031 80.964 80.934 80.897 80.854 80.806 80.734 80.582 80.111 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 7c409e0f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27357 ,TETRA ,17589996,Sat Nov 27 19:26:43 CET,Sat Nov 27 21:22:00 CET,0.0 0.534 0.751 0.929 1.091 1.234 1.359 1.479 1.695 1.796 1.901 1.984 2.214 2.319 2.508 2.687 2.846 2.923 3.074 3.214 3.419 3.55 3.682 3.876 4.058 4.228 4.39 4.546 4.745 4.939 5.119 5.352 5.58 5.787 6.026 6.308 6.58 6.886 7.207 7.526 7.86 8.244 8.695 9.122 9.603 10.158 10.837 11.557 12.33 13.197 14.114 14.724 14.921 14.898 14.836 14.716 14.53 14.342 14.138 13.897 13.697 13.507 13.31 13.123 12.942 12.765 12.569 12.398 12.248 12.093 11.915 11.763 11.613 11.45 11.319 11.191 11.056 10.91 10.765 10.673 10.579 10.419 10.311 10.206 10.15 10.022 9.879 9.728 9.652 9.456 9.415 9.328 9.234 9.006 8.874 8.744 8.608 8.432 8.231 7.975 7.448 -2 ,1389 ,TETRA ,17589997,Sat Nov 27 19:27:43 CET,Sat Nov 27 21:16:44 CET,0.0 0.297 0.462 0.599 0.719 0.812 0.9 1.0 1.19 1.274 1.357 1.393 1.594 1.669 1.812 1.949 2.078 2.138 2.258 2.377 2.548 2.656 2.758 2.917 3.084 3.235 3.373 3.508 3.69 3.871 4.044 4.263 4.479 4.675 4.9 5.168 5.445 5.753 6.089 6.461 6.833 7.232 7.693 8.148 8.661 9.234 9.886 10.597 11.366 12.155 12.991 13.478 13.609 13.602 13.486 13.273 13.024 12.787 12.576 12.348 12.144 11.959 11.778 11.589 11.41 11.238 11.051 10.888 10.727 10.553 10.367 10.211 10.058 9.896 9.769 9.639 9.503 9.357 9.196 9.081 8.956 8.758 8.621 8.474 8.398 8.234 8.054 7.87 7.775 7.566 7.478 7.366 7.245 6.974 6.828 6.646 6.453 6.275 6.112 5.937 5.459 -3 ,16829 ,TETRA ,17589998,Sat Nov 27 19:27:43 CET,Sat Nov 27 21:16:36 CET,0.0 0.398 0.569 0.714 0.841 0.951 1.046 1.133 1.297 1.391 1.483 1.512 1.71 1.776 1.9 2.019 2.142 2.199 2.313 2.42 2.576 2.681 2.776 2.922 3.065 3.201 3.338 3.468 3.636 3.796 3.94 4.124 4.33 4.541 4.794 5.068 5.316 5.601 5.906 6.218 6.553 6.916 7.342 7.8 8.341 8.927 9.582 10.326 11.139 11.977 12.808 13.314 13.498 13.469 13.318 13.14 12.963 12.766 12.555 12.327 12.134 11.956 11.753 11.517 11.301 11.128 10.936 10.75 10.582 10.413 10.231 10.068 9.904 9.742 9.606 9.457 9.303 9.149 8.988 8.878 8.769 8.592 8.467 8.336 8.27 8.145 8.016 7.879 7.807 7.615 7.57 7.465 7.349 7.128 7.028 6.936 6.838 6.729 6.585 6.348 5.795 -4 ,170 ,TETRA ,17589999,Sat Nov 27 19:27:45 CET,Sat Nov 27 21:18:30 CET,0.0 0.242 0.389 0.51 0.619 0.718 0.824 0.927 1.107 1.195 1.275 1.295 1.5 1.576 1.72 1.859 1.994 2.056 2.165 2.284 2.473 2.595 2.71 2.877 3.055 3.233 3.413 3.59 3.808 4.01 4.206 4.46 4.707 4.926 5.18 5.47 5.743 6.036 6.342 6.676 7.02 7.412 7.888 8.357 8.89 9.463 10.113 10.838 11.645 12.528 13.473 14.098 14.318 14.325 14.201 14.001 13.811 13.612 13.401 13.184 12.981 12.771 12.576 12.403 12.219 12.026 11.812 11.63 11.488 11.331 11.168 11.033 10.888 10.739 10.611 10.474 10.334 10.192 10.036 9.92 9.8 9.613 9.497 9.381 9.319 9.198 9.075 8.937 8.857 8.657 8.61 8.526 8.448 8.288 8.185 8.063 7.952 7.829 7.645 7.393 6.884 -5 ,9509 ,TETRA ,17590000,Sat Nov 27 19:27:43 CET,Sat Nov 27 21:22:34 CET,0.0 0.224 0.373 0.504 0.617 0.723 0.825 0.917 1.083 1.165 1.242 1.259 1.456 1.528 1.677 1.819 1.949 2.014 2.152 2.277 2.447 2.565 2.694 2.885 3.067 3.249 3.417 3.576 3.79 3.988 4.174 4.403 4.627 4.846 5.094 5.36 5.622 5.92 6.24 6.575 6.915 7.314 7.775 8.215 8.726 9.281 9.908 10.636 11.472 12.364 13.314 13.859 14.032 14.048 13.955 13.803 13.628 13.431 13.238 13.036 12.847 12.672 12.503 12.336 12.165 11.986 11.792 11.635 11.503 11.361 11.202 11.054 10.912 10.765 10.637 10.494 10.34 10.192 10.035 9.915 9.795 9.604 9.467 9.346 9.289 9.183 9.066 8.93 8.862 8.671 8.619 8.533 8.449 8.273 8.182 8.062 7.924 7.78 7.595 7.346 6.772 -6 ,8323 ,TETRA ,17590001,Sat Nov 27 19:27:43 CET,Sat Nov 27 21:18:40 CET,0.0 0.189 0.342 0.456 0.546 0.65 0.742 0.818 0.972 1.055 1.141 1.166 1.362 1.431 1.573 1.715 1.846 1.909 2.03 2.153 2.323 2.422 2.517 2.667 2.824 2.968 3.109 3.249 3.439 3.637 3.824 4.045 4.259 4.469 4.708 4.972 5.232 5.521 5.831 6.146 6.482 6.869 7.327 7.789 8.334 8.922 9.592 10.358 11.182 12.059 12.998 13.594 13.766 13.727 13.591 13.396 13.2 13.006 12.824 12.619 12.408 12.198 11.977 11.766 11.587 11.423 11.229 11.06 10.915 10.76 10.595 10.453 10.306 10.154 10.036 9.893 9.742 9.603 9.45 9.344 9.244 9.093 8.981 8.866 8.811 8.692 8.568 8.44 8.37 8.178 8.136 8.053 7.961 7.756 7.644 7.531 7.417 7.27 7.102 6.882 6.314 -7 ,7464 ,TETRA ,17590002,Sat Nov 27 19:27:43 CET,Sat Nov 27 21:16:45 CET,0.0 0.332 0.525 0.674 0.786 0.888 0.984 1.076 1.241 1.313 1.386 1.402 1.597 1.663 1.802 1.938 2.058 2.117 2.23 2.342 2.522 2.642 2.755 2.915 3.07 3.21 3.34 3.482 3.672 3.847 4.018 4.217 4.416 4.625 4.87 5.136 5.401 5.706 6.018 6.338 6.683 7.087 7.552 8.001 8.506 9.057 9.698 10.429 11.257 12.152 13.083 13.644 13.768 13.74 13.653 13.492 13.303 13.083 12.885 12.68 12.468 12.273 12.08 11.885 11.705 11.54 11.359 11.189 11.045 10.884 10.704 10.559 10.411 10.256 10.135 10.008 9.865 9.711 9.544 9.423 9.298 9.102 8.954 8.801 8.73 8.564 8.399 8.255 8.183 7.994 7.962 7.871 7.769 7.562 7.455 7.333 7.197 7.031 6.864 6.667 6.152 -8 ,28158 ,TETRA ,17590003,Sat Nov 27 19:27:43 CET,Sat Nov 27 21:17:21 CET,0.0 0.267 0.442 0.579 0.71 0.833 0.941 1.028 1.192 1.277 1.362 1.396 1.598 1.667 1.8 1.926 2.042 2.104 2.23 2.354 2.535 2.65 2.764 2.937 3.108 3.268 3.42 3.573 3.77 3.97 4.158 4.384 4.608 4.826 5.079 5.363 5.648 5.97 6.302 6.636 6.989 7.374 7.809 8.244 8.731 9.265 9.881 10.566 11.331 12.183 13.107 13.668 13.817 13.829 13.754 13.604 13.421 13.211 13.005 12.805 12.627 12.435 12.24 12.039 11.835 11.641 11.427 11.235 11.068 10.901 10.728 10.576 10.419 10.254 10.116 9.99 9.881 9.751 9.619 9.539 9.45 9.285 9.175 9.063 9.0 8.863 8.723 8.572 8.497 8.305 8.272 8.188 8.097 7.88 7.727 7.572 7.417 7.255 7.061 6.798 6.251 -9 ,17688 ,TETRA ,17590004,Sat Nov 27 19:27:43 CET,Sat Nov 27 21:12:16 CET,0.0 0.192 0.344 0.476 0.578 0.683 0.791 0.895 1.084 1.165 1.252 1.294 1.491 1.559 1.693 1.82 1.941 2.003 2.127 2.245 2.418 2.529 2.633 2.77 2.905 3.044 3.182 3.319 3.487 3.658 3.834 4.052 4.271 4.469 4.711 4.995 5.261 5.556 5.87 6.193 6.535 6.928 7.381 7.824 8.339 8.899 9.526 10.233 11.066 11.98 12.9 13.406 13.534 13.511 13.435 13.293 13.104 12.878 12.665 12.464 12.244 12.017 11.809 11.626 11.464 11.307 11.149 11.006 10.866 10.73 10.596 10.463 10.321 10.183 10.069 9.961 9.855 9.724 9.587 9.489 9.388 9.243 9.144 9.046 8.992 8.853 8.696 8.551 8.473 8.272 8.218 8.124 8.04 7.851 7.749 7.646 7.503 7.318 7.106 6.86 6.446 -10 ,20262 ,TETRA ,17590005,Sat Nov 27 19:27:43 CET,Sat Nov 27 21:21:27 CET,0.0 0.256 0.422 0.559 0.686 0.797 0.899 1.0 1.181 1.252 1.319 1.334 1.527 1.591 1.734 1.879 2.007 2.069 2.19 2.297 2.465 2.577 2.682 2.843 2.992 3.127 3.249 3.373 3.548 3.716 3.873 4.067 4.257 4.441 4.661 4.907 5.143 5.418 5.72 6.028 6.363 6.754 7.219 7.674 8.171 8.73 9.375 10.092 10.908 11.777 12.664 13.22 13.403 13.432 13.347 13.187 13.028 12.839 12.629 12.426 12.245 12.062 11.871 11.661 11.454 11.273 11.086 10.909 10.76 10.612 10.439 10.279 10.117 9.954 9.809 9.653 9.506 9.365 9.224 9.117 9.005 8.847 8.748 8.641 8.584 8.457 8.305 8.15 8.071 7.875 7.815 7.723 7.639 7.437 7.326 7.22 7.085 6.918 6.727 6.443 5.91 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 73bcebca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25766 ,TETRA ,17590006,Sat Nov 27 19:27:43 CET,Sat Nov 27 21:19:49 CET,0.0 0.62 0.809 0.975 1.125 1.268 1.401 1.517 1.715 1.808 1.899 1.951 2.173 2.265 2.445 2.612 2.778 2.856 3.005 3.157 3.368 3.49 3.612 3.786 3.957 4.127 4.298 4.476 4.715 4.941 5.152 5.409 5.657 5.902 6.197 6.519 6.83 7.195 7.58 7.968 8.36 8.797 9.331 9.862 10.458 11.143 11.917 12.754 13.724 14.839 16.03 16.733 16.97 17.017 16.914 16.758 16.593 16.387 16.178 15.929 15.684 15.446 15.205 14.984 14.767 14.553 14.32 14.108 13.932 13.751 13.566 13.4 13.213 13.023 12.868 12.693 12.512 12.336 12.148 12.012 11.867 11.63 11.471 11.313 11.234 11.075 10.929 10.783 10.708 10.503 10.404 10.291 10.179 9.933 9.804 9.661 9.496 9.3 9.067 8.731 8.045 -2 ,18443 ,TETRA ,17590007,Sat Nov 27 19:27:43 CET,Sat Nov 27 21:17:32 CET,0.0 0.409 0.634 0.797 0.962 1.111 1.246 1.367 1.58 1.697 1.822 1.948 2.196 2.302 2.512 2.711 2.9 2.991 3.163 3.327 3.556 3.704 3.855 4.078 4.287 4.491 4.693 4.89 5.147 5.386 5.607 5.885 6.157 6.404 6.685 7.005 7.308 7.64 7.992 8.374 8.775 9.211 9.715 10.235 10.875 11.558 12.311 13.129 14.061 15.13 16.263 17.024 17.257 17.229 17.124 16.951 16.728 16.502 16.287 16.043 15.801 15.561 15.328 15.102 14.877 14.668 14.45 14.25 14.07 13.889 13.706 13.554 13.386 13.211 13.085 12.952 12.801 12.638 12.479 12.372 12.251 12.048 11.905 11.763 11.691 11.535 11.366 11.2 11.119 10.916 10.865 10.777 10.665 10.415 10.291 10.151 9.993 9.814 9.588 9.28 8.627 -3 ,18894 ,TETRA ,17590008,Sat Nov 27 19:28:42 CET,Sat Nov 27 21:18:46 CET,0.0 0.389 0.557 0.689 0.815 0.943 1.068 1.186 1.397 1.51 1.615 1.661 1.871 1.945 2.101 2.264 2.413 2.486 2.625 2.757 2.962 3.088 3.207 3.38 3.55 3.739 3.921 4.104 4.355 4.581 4.795 5.062 5.329 5.58 5.847 6.143 6.441 6.784 7.155 7.531 7.926 8.381 8.889 9.422 10.071 10.762 11.526 12.343 13.263 14.366 15.585 16.328 16.528 16.485 16.33 16.122 15.903 15.645 15.353 15.053 14.808 14.579 14.366 14.155 13.944 13.748 13.536 13.325 13.14 12.958 12.764 12.6 12.427 12.251 12.114 11.953 11.784 11.627 11.461 11.339 11.217 11.025 10.885 10.75 10.681 10.519 10.361 10.209 10.128 9.925 9.863 9.758 9.634 9.368 9.217 9.068 8.905 8.691 8.459 8.18 7.321 -4 ,22035 ,TETRA ,17590009,Sat Nov 27 19:27:45 CET,Sat Nov 27 21:17:51 CET,0.0 0.25 0.428 0.57 0.697 0.812 0.921 1.053 1.304 1.411 1.52 1.594 1.821 1.914 2.1 2.268 2.42 2.497 2.651 2.804 3.008 3.13 3.251 3.436 3.627 3.811 3.982 4.143 4.359 4.564 4.754 5.004 5.252 5.477 5.741 6.035 6.313 6.624 6.959 7.323 7.721 8.164 8.657 9.166 9.765 10.427 11.225 12.114 13.084 14.149 15.268 15.926 16.132 16.139 16.02 15.829 15.593 15.349 15.118 14.842 14.58 14.353 14.135 13.907 13.684 13.479 13.251 13.047 12.868 12.678 12.487 12.327 12.161 11.994 11.859 11.705 11.531 11.347 11.157 11.033 10.899 10.7 10.575 10.432 10.355 10.19 10.023 9.855 9.759 9.543 9.45 9.341 9.229 8.988 8.86 8.725 8.563 8.383 8.165 7.854 7.095 -5 ,13113 ,TETRA ,17590010,Sat Nov 27 19:27:45 CET,Sat Nov 27 21:18:31 CET,0.0 0.361 0.591 0.775 0.946 1.087 1.199 1.32 1.576 1.684 1.778 1.859 2.101 2.2 2.394 2.604 2.79 2.88 3.062 3.233 3.485 3.641 3.788 4.0 4.203 4.394 4.583 4.774 5.019 5.247 5.466 5.722 5.979 6.226 6.493 6.815 7.131 7.471 7.825 8.199 8.597 9.053 9.589 10.125 10.75 11.422 12.163 12.979 13.93 15.013 16.237 17.06 17.308 17.303 17.187 16.991 16.75 16.483 16.231 15.964 15.706 15.469 15.23 14.994 14.775 14.571 14.344 14.129 13.952 13.778 13.588 13.412 13.224 13.031 12.868 12.699 12.535 12.354 12.163 12.029 11.89 11.673 11.509 11.342 11.254 11.056 10.857 10.654 10.542 10.31 10.205 10.091 9.977 9.73 9.581 9.407 9.193 8.959 8.74 8.49 7.41 -6 ,8125 ,TETRA ,17590011,Sat Nov 27 19:27:47 CET,Sat Nov 27 21:18:18 CET,0.0 0.38 0.551 0.698 0.839 0.992 1.124 1.236 1.439 1.533 1.632 1.683 1.89 1.968 2.127 2.269 2.41 2.485 2.624 2.754 2.951 3.083 3.227 3.45 3.662 3.864 4.052 4.231 4.458 4.681 4.903 5.17 5.415 5.65 5.933 6.263 6.565 6.871 7.217 7.622 8.036 8.477 9.011 9.53 10.109 10.797 11.619 12.507 13.466 14.513 15.653 16.303 16.493 16.48 16.344 16.174 15.976 15.733 15.497 15.244 14.995 14.758 14.538 14.316 14.086 13.864 13.637 13.435 13.244 13.049 12.849 12.682 12.499 12.31 12.159 11.989 11.816 11.641 11.441 11.293 11.151 10.938 10.788 10.636 10.562 10.406 10.244 10.087 10.009 9.801 9.706 9.585 9.465 9.225 9.097 8.944 8.771 8.596 8.406 8.168 7.456 -7 ,3931 ,TETRA ,17590012,Sat Nov 27 19:27:49 CET,Sat Nov 27 21:17:55 CET,0.0 0.56 0.777 0.939 1.057 1.186 1.297 1.409 1.629 1.73 1.828 1.883 2.103 2.189 2.362 2.516 2.661 2.73 2.861 3.001 3.204 3.342 3.482 3.699 3.927 4.134 4.33 4.512 4.748 4.988 5.215 5.479 5.728 5.965 6.244 6.563 6.86 7.185 7.537 7.903 8.296 8.752 9.29 9.839 10.459 11.167 12.002 12.88 13.814 14.869 16.048 16.788 16.994 16.969 16.899 16.765 16.569 16.336 16.108 15.879 15.665 15.431 15.192 14.977 14.781 14.596 14.379 14.166 13.982 13.801 13.609 13.444 13.261 13.064 12.91 12.732 12.542 12.357 12.17 12.043 11.908 11.694 11.544 11.377 11.281 11.082 10.878 10.679 10.582 10.367 10.289 10.182 10.058 9.791 9.646 9.489 9.327 9.144 8.9 8.575 7.615 -8 ,30374 ,TETRA ,17590013,Sat Nov 27 19:28:42 CET,Sat Nov 27 21:18:28 CET,0.0 0.619 0.851 1.038 1.193 1.331 1.451 1.56 1.759 1.856 1.95 1.989 2.208 2.298 2.465 2.628 2.801 2.89 3.054 3.207 3.429 3.576 3.727 3.94 4.147 4.35 4.54 4.726 4.965 5.194 5.419 5.685 5.938 6.187 6.476 6.799 7.103 7.418 7.772 8.17 8.569 9.004 9.528 10.065 10.676 11.337 12.068 12.867 13.781 14.789 15.878 16.537 16.707 16.68 16.557 16.412 16.252 16.053 15.856 15.629 15.404 15.184 14.96 14.735 14.522 14.335 14.137 13.952 13.782 13.585 13.378 13.207 13.04 12.885 12.755 12.623 12.49 12.341 12.181 12.069 11.958 11.79 11.656 11.52 11.45 11.291 11.133 10.969 10.885 10.683 10.612 10.503 10.393 10.169 10.036 9.886 9.733 9.568 9.355 9.053 8.301 -9 ,8776 ,TETRA ,17590014,Sat Nov 27 19:28:42 CET,Sat Nov 27 21:19:52 CET,0.0 0.27 0.478 0.674 0.83 0.974 1.104 1.234 1.478 1.58 1.665 1.694 1.909 1.991 2.162 2.327 2.484 2.565 2.724 2.884 3.126 3.281 3.427 3.633 3.841 4.048 4.249 4.436 4.673 4.901 5.112 5.366 5.615 5.866 6.143 6.456 6.78 7.137 7.509 7.888 8.296 8.746 9.254 9.761 10.367 11.048 11.817 12.652 13.557 14.598 15.712 16.355 16.548 16.547 16.434 16.274 16.085 15.847 15.6 15.346 15.115 14.893 14.67 14.453 14.259 14.073 13.855 13.642 13.443 13.228 13.013 12.837 12.642 12.435 12.273 12.101 11.921 11.737 11.534 11.39 11.24 10.994 10.828 10.661 10.576 10.394 10.192 9.983 9.878 9.653 9.537 9.416 9.283 8.977 8.81 8.632 8.449 8.247 8.01 7.722 7.006 -10 ,28644 ,TETRA ,17590015,Sat Nov 27 19:28:42 CET,Sat Nov 27 21:09:45 CET,0.0 0.303 0.489 0.639 0.784 0.928 1.069 1.192 1.416 1.528 1.635 1.695 1.925 2.01 2.148 2.299 2.446 2.513 2.657 2.81 3.03 3.161 3.283 3.464 3.635 3.796 3.95 4.11 4.338 4.546 4.728 4.951 5.175 5.394 5.65 5.934 6.208 6.518 6.843 7.206 7.61 8.077 8.63 9.155 9.792 10.51 11.247 12.046 12.983 14.073 15.277 16.056 16.328 16.352 16.261 16.098 15.855 15.616 15.4 15.128 14.876 14.642 14.408 14.183 13.965 13.765 13.534 13.328 13.165 12.987 12.782 12.604 12.413 12.208 12.052 11.893 11.717 11.536 11.352 11.223 11.081 10.854 10.709 10.559 10.474 10.308 10.143 9.938 9.824 9.594 9.476 9.349 9.205 8.85 8.654 8.471 8.284 8.058 7.803 7.469 6.597 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 28635b4c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32731 ,TETRA ,17590016,Sat Nov 27 19:28:42 CET,Sat Nov 27 21:19:27 CET,0.0 0.4 0.581 0.733 0.887 1.02 1.123 1.218 1.387 1.471 1.556 1.599 1.803 1.877 2.019 2.174 2.317 2.379 2.498 2.606 2.756 2.856 2.958 3.112 3.248 3.374 3.496 3.614 3.771 3.919 4.066 4.247 4.422 4.586 4.77 4.996 5.213 5.442 5.693 5.964 6.247 6.569 6.932 7.264 7.646 8.031 8.393 8.769 9.146 9.481 9.671 9.436 9.032 8.58 8.121 7.673 7.241 6.845 6.508 6.155 5.844 5.565 5.283 5.016 4.78 4.568 4.35 4.149 3.972 3.783 3.584 3.424 3.258 3.09 2.957 2.819 2.672 2.529 2.382 2.276 2.159 1.976 1.856 1.725 1.657 1.523 1.392 1.248 1.164 0.954 0.885 0.789 0.686 0.478 0.374 0.268 0.152 0.009 -0.158 -0.375 -1.017 -2 ,12057 ,TETRA ,17590017,Sat Nov 27 19:28:42 CET,Sat Nov 27 21:18:12 CET,0.0 1.038 1.345 1.579 1.792 1.984 2.155 2.31 2.581 2.696 2.803 2.909 3.132 3.231 3.446 3.643 3.8 3.875 4.022 4.161 4.369 4.494 4.611 4.802 4.99 5.164 5.331 5.493 5.685 5.866 6.045 6.256 6.439 6.63 6.864 7.116 7.348 7.585 7.84 8.118 8.404 8.691 9.015 9.341 9.682 10.037 10.429 10.797 11.13 11.409 11.467 11.15 10.692 10.245 9.797 9.319 8.837 8.387 8.034 7.693 7.373 7.071 6.782 6.508 6.261 6.042 5.818 5.63 5.452 5.269 5.078 4.913 4.756 4.606 4.487 4.345 4.186 4.03 3.882 3.773 3.656 3.491 3.375 3.254 3.198 3.073 2.931 2.79 2.719 2.516 2.469 2.39 2.306 2.129 2.035 1.933 1.812 1.657 1.482 1.318 0.835 -3 ,22757 ,TETRA ,17590018,Sat Nov 27 19:28:43 CET,Sat Nov 27 21:21:17 CET,0.0 0.515 0.719 0.899 1.049 1.198 1.332 1.447 1.645 1.736 1.81 1.823 2.014 2.087 2.224 2.348 2.473 2.536 2.665 2.797 2.977 3.076 3.169 3.307 3.432 3.562 3.696 3.814 3.958 4.101 4.243 4.408 4.575 4.746 4.948 5.176 5.378 5.594 5.836 6.084 6.322 6.591 6.905 7.211 7.573 7.954 8.351 8.759 9.154 9.463 9.569 9.27 8.838 8.386 7.945 7.516 7.085 6.693 6.37 6.026 5.729 5.468 5.2 4.947 4.699 4.461 4.233 4.038 3.859 3.662 3.469 3.319 3.155 2.987 2.861 2.731 2.599 2.445 2.275 2.16 2.038 1.841 1.718 1.597 1.534 1.407 1.273 1.124 1.044 0.843 0.789 0.696 0.597 0.404 0.298 0.185 0.061 -0.087 -0.262 -0.544 -2.127 -4 ,6393 ,TETRA ,17590019,Sat Nov 27 19:28:43 CET,Sat Nov 27 21:20:54 CET,0.0 1.021 1.321 1.564 1.767 1.955 2.121 2.266 2.554 2.677 2.79 2.88 3.102 3.202 3.392 3.583 3.772 3.859 4.006 4.149 4.367 4.505 4.632 4.794 4.949 5.114 5.269 5.41 5.576 5.736 5.906 6.115 6.317 6.508 6.726 6.974 7.203 7.453 7.721 7.995 8.286 8.612 8.979 9.329 9.706 10.104 10.533 10.946 11.351 11.649 11.729 11.502 11.063 10.542 10.014 9.5 9.053 8.65 8.293 7.904 7.564 7.261 6.957 6.688 6.437 6.185 5.922 5.697 5.51 5.326 5.135 4.979 4.807 4.633 4.511 4.369 4.214 4.064 3.92 3.825 3.719 3.542 3.422 3.304 3.237 3.089 2.928 2.759 2.68 2.482 2.454 2.378 2.292 2.098 1.983 1.85 1.723 1.588 1.411 1.181 0.561 -5 ,11076 ,TETRA ,17590020,Sat Nov 27 19:28:43 CET,Sat Nov 27 21:18:28 CET,0.0 0.431 0.619 0.77 0.919 1.054 1.178 1.286 1.488 1.582 1.665 1.721 1.929 2.005 2.147 2.294 2.423 2.481 2.596 2.71 2.868 2.971 3.073 3.21 3.335 3.465 3.608 3.75 3.915 4.07 4.231 4.433 4.627 4.808 5.014 5.242 5.447 5.675 5.917 6.171 6.439 6.728 7.055 7.374 7.733 8.123 8.539 8.929 9.276 9.575 9.718 9.478 9.003 8.483 8.05 7.622 7.227 6.878 6.547 6.16 5.819 5.517 5.227 4.96 4.723 4.502 4.248 4.012 3.801 3.572 3.33 3.138 2.952 2.76 2.605 2.442 2.276 2.096 1.905 1.774 1.634 1.419 1.263 1.1 1.016 0.841 0.667 0.484 0.384 0.165 0.07 -0.044 -0.167 -0.424 -0.561 -0.718 -0.911 -1.135 -1.38 -1.68 -2.847 -6 ,27209 ,TETRA ,17590021,Sat Nov 27 19:28:45 CET,Sat Nov 27 21:18:35 CET,0.0 0.62 0.83 0.971 1.108 1.244 1.36 1.466 1.659 1.755 1.831 1.836 2.021 2.095 2.234 2.373 2.515 2.579 2.704 2.827 3.004 3.119 3.232 3.397 3.547 3.689 3.837 3.99 4.182 4.346 4.517 4.736 4.924 5.105 5.328 5.563 5.788 6.054 6.318 6.566 6.826 7.118 7.464 7.796 8.162 8.551 8.969 9.358 9.68 9.969 10.101 9.877 9.489 9.045 8.604 8.178 7.759 7.341 6.976 6.597 6.272 5.983 5.711 5.461 5.209 4.968 4.71 4.471 4.267 4.055 3.839 3.649 3.452 3.248 3.076 2.902 2.731 2.551 2.361 2.231 2.1 1.886 1.727 1.565 1.484 1.308 1.126 0.948 0.85 0.64 0.552 0.429 0.306 0.023 -0.131 -0.287 -0.45 -0.627 -0.792 -0.993 -1.569 -7 ,5738 ,TETRA ,17590022,Sat Nov 27 19:28:43 CET,Sat Nov 27 21:18:49 CET,0.0 0.363 0.578 0.77 0.924 1.051 1.166 1.284 1.48 1.576 1.67 1.72 1.924 2.005 2.154 2.295 2.435 2.508 2.662 2.802 2.994 3.13 3.266 3.457 3.627 3.784 3.94 4.094 4.279 4.45 4.621 4.827 5.038 5.239 5.461 5.695 5.913 6.16 6.424 6.693 6.953 7.235 7.584 7.937 8.3 8.67 9.089 9.525 9.892 10.172 10.294 10.022 9.593 9.085 8.567 8.095 7.695 7.333 6.976 6.579 6.253 5.983 5.734 5.497 5.266 5.05 4.817 4.607 4.424 4.233 4.031 3.868 3.713 3.544 3.405 3.258 3.109 2.954 2.787 2.68 2.573 2.402 2.281 2.148 2.08 1.938 1.791 1.652 1.575 1.371 1.317 1.22 1.114 0.902 0.783 0.65 0.511 0.355 0.156 -0.092 -0.678 -8 ,12966 ,TETRA ,17590023,Sat Nov 27 19:28:43 CET,Sat Nov 27 21:18:08 CET,0.0 0.838 1.18 1.424 1.638 1.841 2.015 2.147 2.382 2.489 2.592 2.701 2.923 3.013 3.206 3.396 3.568 3.644 3.782 3.915 4.119 4.255 4.38 4.547 4.714 4.882 5.035 5.18 5.379 5.57 5.73 5.912 6.087 6.269 6.492 6.734 6.954 7.19 7.444 7.709 7.999 8.31 8.635 8.964 9.343 9.745 10.174 10.586 10.957 11.22 11.303 11.086 10.701 10.308 9.896 9.425 8.985 8.594 8.243 7.879 7.557 7.241 6.926 6.656 6.396 6.142 5.896 5.683 5.488 5.281 5.064 4.879 4.688 4.495 4.344 4.177 4.011 3.841 3.655 3.528 3.4 3.209 3.074 2.93 2.851 2.696 2.572 2.451 2.375 2.174 2.111 2.018 1.938 1.744 1.622 1.493 1.349 1.189 1.027 0.822 0.357 -9 ,28335 ,TETRA ,17590024,Sat Nov 27 19:28:43 CET,Sat Nov 27 21:13:36 CET,0.0 0.434 0.657 0.827 0.955 1.073 1.188 1.293 1.48 1.573 1.658 1.696 1.895 1.973 2.117 2.256 2.396 2.458 2.569 2.68 2.846 2.951 3.055 3.206 3.35 3.498 3.643 3.787 3.973 4.146 4.31 4.495 4.673 4.871 5.105 5.336 5.543 5.762 5.984 6.217 6.454 6.736 7.079 7.412 7.778 8.162 8.555 8.928 9.269 9.514 9.593 9.323 8.91 8.411 7.941 7.496 7.072 6.672 6.307 5.921 5.579 5.281 4.998 4.728 4.475 4.251 4.014 3.811 3.64 3.453 3.256 3.086 2.923 2.772 2.652 2.516 2.375 2.241 2.099 1.995 1.88 1.696 1.576 1.448 1.384 1.252 1.112 0.963 0.88 0.682 0.641 0.539 0.422 0.192 0.085 -0.036 -0.186 -0.365 -0.537 -0.715 -1.147 -10 ,6234 ,TETRA ,17590025,Sat Nov 27 19:29:42 CET,Sat Nov 27 21:18:49 CET,0.0 0.436 0.668 0.854 1.008 1.13 1.235 1.338 1.531 1.621 1.711 1.76 1.951 2.022 2.163 2.295 2.413 2.471 2.586 2.693 2.849 2.943 3.032 3.18 3.319 3.444 3.568 3.682 3.831 3.992 4.149 4.326 4.485 4.638 4.845 5.095 5.329 5.578 5.842 6.126 6.413 6.699 7.013 7.343 7.713 8.102 8.514 8.911 9.321 9.66 9.73 9.369 8.851 8.38 7.924 7.43 6.97 6.56 6.213 5.859 5.541 5.253 4.983 4.726 4.468 4.22 3.967 3.736 3.538 3.343 3.149 2.973 2.775 2.578 2.434 2.285 2.137 1.984 1.823 1.719 1.615 1.439 1.313 1.188 1.126 0.993 0.842 0.683 0.603 0.41 0.37 0.287 0.209 0.026 -0.096 -0.232 -0.365 -0.488 -0.642 -0.873 -1.245 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt deleted file mode 100644 index d55191df..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17969 ,TETRA ,17590026,Sat Nov 27 19:29:42 CET,Sat Nov 27 21:22:01 CET,0.0 0.631 0.849 1.023 1.161 1.288 1.408 1.517 1.728 1.827 1.908 1.954 2.147 2.222 2.36 2.482 2.605 2.663 2.769 2.873 3.027 3.13 3.233 3.376 3.513 3.641 3.766 3.883 4.027 4.159 4.281 4.425 4.556 4.686 4.843 5.017 5.166 5.309 5.469 5.65 5.827 5.992 6.158 6.271 6.342 6.384 6.356 6.217 5.824 5.015 3.516 1.508 -0.244 -1.775 -3.081 -4.234 -5.216 -6.105 -6.868 -7.609 -8.252 -8.812 -9.324 -9.808 -10.265 -10.686 -11.126 -11.516 -11.848 -12.19 -12.539 -12.825 -13.13 -13.444 -13.67 -13.894 -14.128 -14.36 -14.605 -14.776 -14.945 -15.225 -15.409 -15.589 -15.688 -15.887 -16.091 -16.304 -16.405 -16.64 -16.735 -16.852 -16.985 -17.25 -17.383 -17.524 -17.668 -17.856 -18.123 -18.443 -18.902 -2 ,2772 ,TETRA ,17590027,Sat Nov 27 19:29:42 CET,Sat Nov 27 21:21:09 CET,0.0 0.583 0.868 1.063 1.214 1.365 1.501 1.613 1.81 1.9 1.986 2.035 2.235 2.318 2.455 2.585 2.728 2.803 2.955 3.1 3.299 3.426 3.55 3.729 3.896 4.051 4.198 4.338 4.508 4.668 4.82 4.994 5.15 5.313 5.484 5.658 5.831 5.991 6.145 6.298 6.449 6.618 6.766 6.88 6.967 6.978 6.915 6.759 6.384 5.579 3.978 1.894 0.117 -1.4 -2.714 -3.87 -4.844 -5.721 -6.493 -7.266 -7.939 -8.53 -9.07 -9.574 -10.044 -10.463 -10.9 -11.287 -11.62 -11.967 -12.314 -12.594 -12.877 -13.159 -13.381 -13.608 -13.837 -14.069 -14.309 -14.47 -14.633 -14.89 -15.057 -15.221 -15.309 -15.494 -15.689 -15.898 -16.003 -16.241 -16.343 -16.458 -16.581 -16.852 -16.99 -17.142 -17.304 -17.472 -17.65 -17.885 -18.432 -3 ,25068 ,TETRA ,17590028,Sat Nov 27 19:29:42 CET,Sat Nov 27 21:23:26 CET,0.0 0.385 0.61 0.818 0.993 1.127 1.241 1.339 1.542 1.649 1.751 1.816 2.01 2.095 2.248 2.364 2.48 2.539 2.651 2.755 2.916 3.025 3.129 3.287 3.427 3.55 3.672 3.789 3.923 4.039 4.151 4.283 4.409 4.539 4.682 4.833 4.983 5.134 5.27 5.412 5.561 5.718 5.874 5.995 6.083 6.108 6.044 5.877 5.524 4.719 3.079 0.941 -0.87 -2.404 -3.698 -4.855 -5.874 -6.811 -7.62 -8.428 -9.107 -9.691 -10.24 -10.739 -11.195 -11.615 -12.07 -12.465 -12.781 -13.099 -13.433 -13.706 -13.973 -14.25 -14.465 -14.693 -14.919 -15.138 -15.378 -15.55 -15.722 -15.977 -16.15 -16.334 -16.426 -16.607 -16.803 -16.991 -17.085 -17.321 -17.411 -17.536 -17.672 -17.943 -18.084 -18.241 -18.415 -18.607 -18.819 -19.102 -19.746 -4 ,2357 ,TETRA ,17590029,Sat Nov 27 19:29:42 CET,Sat Nov 27 21:21:18 CET,0.0 0.683 0.95 1.116 1.251 1.376 1.505 1.624 1.843 1.952 2.049 2.112 2.315 2.388 2.523 2.663 2.806 2.874 2.993 3.098 3.248 3.343 3.435 3.565 3.688 3.806 3.928 4.055 4.207 4.35 4.483 4.633 4.774 4.891 5.019 5.152 5.282 5.427 5.577 5.731 5.886 6.065 6.234 6.345 6.407 6.433 6.392 6.21 5.841 5.013 3.406 1.351 -0.473 -2.078 -3.452 -4.646 -5.701 -6.671 -7.506 -8.293 -8.951 -9.541 -10.097 -10.623 -11.114 -11.559 -12.006 -12.391 -12.718 -13.072 -13.452 -13.758 -14.061 -14.366 -14.601 -14.846 -15.113 -15.394 -15.671 -15.856 -16.04 -16.3 -16.477 -16.661 -16.754 -16.947 -17.141 -17.35 -17.463 -17.71 -17.801 -17.908 -18.026 -18.293 -18.445 -18.608 -18.779 -18.971 -19.186 -19.47 -20.329 -5 ,18263 ,TETRA ,17590030,Sat Nov 27 19:29:42 CET,Sat Nov 27 21:20:30 CET,0.0 0.439 0.69 0.905 1.082 1.223 1.346 1.477 1.722 1.821 1.913 1.981 2.183 2.277 2.471 2.655 2.83 2.912 3.074 3.237 3.453 3.577 3.69 3.845 4.006 4.169 4.309 4.431 4.589 4.745 4.9 5.086 5.258 5.406 5.572 5.738 5.884 6.048 6.214 6.38 6.53 6.659 6.8 6.937 7.037 7.074 7.023 6.809 6.377 5.59 4.045 2.039 0.268 -1.251 -2.556 -3.713 -4.711 -5.614 -6.377 -7.119 -7.758 -8.332 -8.883 -9.383 -9.848 -10.278 -10.693 -11.069 -11.4 -11.738 -12.091 -12.376 -12.675 -12.979 -13.199 -13.411 -13.636 -13.877 -14.122 -14.287 -14.456 -14.716 -14.893 -15.08 -15.174 -15.366 -15.57 -15.776 -15.881 -16.121 -16.221 -16.338 -16.457 -16.729 -16.88 -17.031 -17.187 -17.385 -17.621 -17.85 -18.314 -6 ,18670 ,TETRA ,17590031,Sat Nov 27 19:29:42 CET,Sat Nov 27 21:21:52 CET,0.0 0.772 1.012 1.207 1.375 1.511 1.622 1.738 1.952 2.047 2.144 2.208 2.4 2.475 2.61 2.736 2.858 2.918 3.033 3.139 3.296 3.403 3.506 3.638 3.756 3.87 3.98 4.092 4.234 4.364 4.504 4.695 4.875 5.032 5.193 5.371 5.543 5.706 5.871 6.038 6.194 6.373 6.551 6.666 6.778 6.829 6.76 6.601 6.215 5.387 3.757 1.615 -0.199 -1.742 -3.021 -4.163 -5.174 -6.086 -6.854 -7.616 -8.282 -8.85 -9.388 -9.877 -10.318 -10.727 -11.149 -11.534 -11.878 -12.239 -12.6 -12.903 -13.218 -13.539 -13.786 -14.033 -14.287 -14.546 -14.815 -15.001 -15.184 -15.464 -15.65 -15.828 -15.92 -16.107 -16.309 -16.528 -16.633 -16.867 -16.975 -17.1 -17.228 -17.518 -17.665 -17.806 -17.963 -18.143 -18.336 -18.563 -18.978 -7 ,32257 ,TETRA ,17590032,Sat Nov 27 19:29:42 CET,Sat Nov 27 21:20:17 CET,0.0 0.368 0.623 0.792 0.953 1.107 1.225 1.344 1.584 1.7 1.805 1.895 2.106 2.186 2.335 2.467 2.595 2.658 2.778 2.898 3.067 3.168 3.261 3.392 3.517 3.638 3.751 3.866 4.018 4.153 4.294 4.475 4.635 4.778 4.957 5.146 5.321 5.522 5.707 5.87 6.035 6.208 6.361 6.468 6.548 6.549 6.495 6.334 5.892 5.062 3.496 1.441 -0.33 -1.872 -3.23 -4.423 -5.42 -6.329 -7.112 -7.881 -8.543 -9.125 -9.675 -10.199 -10.695 -11.148 -11.602 -11.997 -12.342 -12.691 -13.039 -13.346 -13.669 -13.987 -14.244 -14.514 -14.779 -15.032 -15.295 -15.479 -15.675 -15.983 -16.188 -16.411 -16.528 -16.764 -17.016 -17.282 -17.419 -17.686 -17.844 -17.999 -18.161 -18.522 -18.729 -18.962 -19.199 -19.456 -19.817 -20.25 -21.514 -8 ,24706 ,TETRA ,17590033,Sat Nov 27 19:29:42 CET,Sat Nov 27 21:22:32 CET,0.0 0.842 1.135 1.351 1.55 1.717 1.864 2.003 2.277 2.4 2.518 2.637 2.865 2.969 3.153 3.331 3.511 3.598 3.766 3.907 4.098 4.221 4.346 4.533 4.702 4.872 5.034 5.17 5.344 5.511 5.664 5.838 5.999 6.156 6.333 6.51 6.678 6.855 7.005 7.154 7.302 7.432 7.551 7.632 7.712 7.775 7.696 7.433 6.982 6.089 4.444 2.386 0.569 -0.957 -2.255 -3.418 -4.429 -5.322 -6.078 -6.822 -7.455 -8.018 -8.547 -9.057 -9.532 -9.963 -10.404 -10.785 -11.119 -11.464 -11.811 -12.093 -12.391 -12.697 -12.935 -13.19 -13.448 -13.705 -13.967 -14.148 -14.33 -14.623 -14.836 -15.052 -15.16 -15.39 -15.64 -15.888 -16.015 -16.274 -16.432 -16.58 -16.741 -17.107 -17.297 -17.505 -17.741 -18.001 -18.305 -18.686 -19.332 -9 ,32338 ,TETRA ,17590034,Sat Nov 27 19:29:42 CET,Sat Nov 27 21:21:03 CET,0.0 0.664 0.903 1.115 1.268 1.382 1.499 1.622 1.841 1.94 2.032 2.08 2.272 2.353 2.505 2.648 2.782 2.846 2.973 3.089 3.241 3.338 3.434 3.556 3.667 3.779 3.894 4.008 4.158 4.317 4.462 4.623 4.79 4.938 5.098 5.271 5.415 5.578 5.74 5.892 6.042 6.181 6.327 6.44 6.5 6.499 6.454 6.328 5.961 5.165 3.602 1.525 -0.256 -1.754 -3.047 -4.187 -5.173 -6.047 -6.806 -7.575 -8.219 -8.799 -9.351 -9.86 -10.335 -10.753 -11.175 -11.559 -11.895 -12.235 -12.58 -12.865 -13.164 -13.478 -13.72 -13.959 -14.193 -14.431 -14.69 -14.884 -15.074 -15.353 -15.558 -15.774 -15.887 -16.109 -16.308 -16.52 -16.633 -16.88 -16.992 -17.127 -17.26 -17.528 -17.662 -17.81 -17.977 -18.168 -18.393 -18.67 -19.143 -10 ,29867 ,TETRA ,17590035,Sat Nov 27 19:29:44 CET,Sat Nov 27 21:24:48 CET,0.0 0.442 0.647 0.814 0.966 1.101 1.226 1.352 1.602 1.721 1.845 1.974 2.187 2.283 2.457 2.612 2.776 2.856 3.001 3.149 3.358 3.479 3.596 3.78 3.951 4.097 4.235 4.364 4.524 4.676 4.814 4.985 5.146 5.292 5.463 5.644 5.813 5.999 6.172 6.336 6.487 6.637 6.789 6.911 7.004 7.021 6.96 6.726 6.283 5.558 4.04 1.987 0.21 -1.364 -2.66 -3.804 -4.824 -5.717 -6.493 -7.251 -7.89 -8.465 -9.026 -9.55 -10.016 -10.426 -10.857 -11.251 -11.591 -11.942 -12.298 -12.592 -12.913 -13.239 -13.486 -13.742 -14.009 -14.285 -14.571 -14.772 -14.973 -15.28 -15.496 -15.715 -15.82 -16.045 -16.288 -16.532 -16.656 -16.928 -17.102 -17.256 -17.423 -17.77 -17.952 -18.147 -18.346 -18.574 -18.884 -19.313 -20.363 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index fb09349a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24131 ,TETRA ,17590036,Sat Nov 27 19:29:44 CET,Sat Nov 27 21:18:53 CET,0.0 0.442 0.647 0.825 0.976 1.095 1.208 1.317 1.542 1.652 1.74 1.78 1.971 2.05 2.199 2.326 2.433 2.489 2.597 2.69 2.817 2.895 2.974 3.088 3.179 3.266 3.366 3.465 3.583 3.699 3.802 3.91 4.017 4.128 4.258 4.391 4.512 4.644 4.785 4.912 5.006 5.096 5.16 5.196 5.214 5.188 5.096 4.894 4.502 3.747 2.294 0.428 -1.117 -2.475 -3.651 -4.673 -5.54 -6.314 -6.994 -7.665 -8.227 -8.729 -9.222 -9.673 -10.096 -10.481 -10.876 -11.238 -11.547 -11.86 -12.179 -12.426 -12.672 -12.946 -13.156 -13.362 -13.574 -13.792 -14.013 -14.171 -14.339 -14.59 -14.759 -14.94 -15.032 -15.224 -15.429 -15.63 -15.738 -15.975 -16.054 -16.178 -16.314 -16.585 -16.742 -16.913 -17.075 -17.248 -17.446 -17.708 -18.121 -2 ,159 ,TETRA ,17590037,Sat Nov 27 19:29:44 CET,Sat Nov 27 21:21:00 CET,0.0 0.206 0.345 0.481 0.584 0.675 0.767 0.844 0.976 1.044 1.116 1.135 1.303 1.354 1.443 1.526 1.609 1.646 1.724 1.805 1.918 1.989 2.059 2.157 2.239 2.323 2.405 2.479 2.571 2.659 2.75 2.864 2.974 3.07 3.175 3.281 3.392 3.527 3.666 3.788 3.884 3.982 4.057 4.102 4.128 4.098 4.005 3.847 3.537 2.876 1.479 -0.361 -1.951 -3.316 -4.49 -5.545 -6.451 -7.261 -7.953 -8.659 -9.275 -9.818 -10.336 -10.816 -11.248 -11.648 -12.065 -12.429 -12.744 -13.074 -13.421 -13.701 -13.98 -14.261 -14.49 -14.733 -14.988 -15.251 -15.518 -15.702 -15.887 -16.168 -16.365 -16.577 -16.684 -16.907 -17.139 -17.372 -17.493 -17.749 -17.903 -18.049 -18.197 -18.529 -18.715 -18.921 -19.162 -19.436 -19.762 -20.224 -21.408 -3 ,9304 ,TETRA ,17590038,Sat Nov 27 19:29:44 CET,Sat Nov 27 21:21:10 CET,0.0 0.212 0.337 0.43 0.512 0.599 0.685 0.767 0.912 0.974 1.03 1.016 1.18 1.227 1.316 1.401 1.487 1.532 1.616 1.695 1.808 1.878 1.944 2.035 2.117 2.193 2.269 2.339 2.44 2.549 2.649 2.771 2.898 3.013 3.105 3.196 3.298 3.406 3.505 3.608 3.704 3.772 3.83 3.867 3.885 3.865 3.761 3.511 3.033 2.242 0.787 -1.117 -2.722 -4.047 -5.2 -6.263 -7.155 -7.946 -8.633 -9.331 -9.92 -10.424 -10.908 -11.37 -11.789 -12.174 -12.593 -12.966 -13.281 -13.601 -13.931 -14.201 -14.476 -14.751 -14.969 -15.203 -15.451 -15.705 -15.957 -16.131 -16.313 -16.607 -16.806 -17.007 -17.112 -17.33 -17.561 -17.802 -17.934 -18.196 -18.338 -18.488 -18.644 -18.967 -19.144 -19.327 -19.518 -19.728 -19.938 -20.2 -20.628 -4 ,20793 ,TETRA ,17590039,Sat Nov 27 19:29:44 CET,Sat Nov 27 21:20:24 CET,0.0 0.283 0.431 0.544 0.649 0.749 0.826 0.893 1.034 1.101 1.165 1.161 1.319 1.363 1.451 1.541 1.621 1.658 1.737 1.823 1.954 2.031 2.106 2.218 2.322 2.422 2.514 2.601 2.711 2.815 2.913 3.031 3.145 3.251 3.348 3.443 3.543 3.637 3.73 3.824 3.917 4.017 4.103 4.156 4.189 4.179 4.087 3.871 3.434 2.654 1.233 -0.55 -2.06 -3.344 -4.48 -5.521 -6.398 -7.214 -7.903 -8.566 -9.157 -9.685 -10.19 -10.653 -11.07 -11.452 -11.84 -12.194 -12.514 -12.832 -13.153 -13.432 -13.726 -14.006 -14.206 -14.417 -14.639 -14.861 -15.09 -15.242 -15.394 -15.622 -15.78 -15.949 -16.041 -16.231 -16.419 -16.616 -16.721 -16.959 -17.06 -17.18 -17.295 -17.557 -17.704 -17.846 -18.004 -18.198 -18.43 -18.684 -19.104 -5 ,22930 ,TETRA ,17590040,Sat Nov 27 19:29:44 CET,Sat Nov 27 21:21:29 CET,0.0 0.29 0.431 0.553 0.643 0.717 0.792 0.858 0.979 1.033 1.086 1.099 1.28 1.337 1.419 1.505 1.578 1.614 1.691 1.769 1.874 1.933 1.992 2.078 2.155 2.225 2.303 2.381 2.485 2.59 2.678 2.776 2.869 2.96 3.066 3.174 3.273 3.377 3.482 3.579 3.653 3.72 3.79 3.831 3.816 3.746 3.617 3.398 2.999 2.243 0.773 -1.067 -2.599 -3.928 -5.065 -6.089 -6.989 -7.8 -8.5 -9.189 -9.769 -10.278 -10.767 -11.217 -11.636 -12.01 -12.408 -12.777 -13.085 -13.404 -13.725 -13.978 -14.236 -14.486 -14.68 -14.89 -15.108 -15.326 -15.543 -15.703 -15.872 -16.131 -16.311 -16.505 -16.602 -16.793 -16.996 -17.203 -17.309 -17.557 -17.661 -17.778 -17.892 -18.129 -18.264 -18.425 -18.608 -18.806 -19.033 -19.312 -19.816 -6 ,23040 ,TETRA ,17590041,Sat Nov 27 19:29:44 CET,Sat Nov 27 21:21:38 CET,0.0 0.277 0.389 0.507 0.605 0.678 0.74 0.807 0.952 1.017 1.081 1.086 1.253 1.299 1.385 1.474 1.558 1.596 1.67 1.748 1.864 1.938 2.004 2.105 2.202 2.286 2.368 2.443 2.547 2.655 2.75 2.861 2.959 3.043 3.133 3.23 3.346 3.488 3.603 3.703 3.797 3.881 3.943 3.975 3.997 3.982 3.917 3.74 3.321 2.563 1.123 -0.718 -2.241 -3.569 -4.728 -5.742 -6.615 -7.419 -8.108 -8.793 -9.367 -9.876 -10.371 -10.826 -11.24 -11.619 -12.014 -12.359 -12.668 -12.999 -13.34 -13.616 -13.891 -14.175 -14.394 -14.631 -14.892 -15.163 -15.422 -15.592 -15.766 -16.041 -16.235 -16.431 -16.534 -16.745 -16.953 -17.181 -17.293 -17.534 -17.651 -17.777 -17.905 -18.167 -18.306 -18.463 -18.644 -18.84 -19.052 -19.301 -19.894 -7 ,11228 ,TETRA ,17590042,Sat Nov 27 19:30:42 CET,Sat Nov 27 21:22:32 CET,0.0 0.217 0.334 0.442 0.534 0.611 0.683 0.756 0.891 0.958 1.02 1.02 1.18 1.224 1.335 1.44 1.523 1.563 1.649 1.728 1.819 1.869 1.923 1.999 2.077 2.158 2.221 2.277 2.349 2.434 2.522 2.606 2.681 2.75 2.835 2.95 3.068 3.186 3.303 3.417 3.505 3.588 3.66 3.698 3.705 3.677 3.618 3.456 3.09 2.341 0.932 -0.868 -2.45 -3.81 -4.945 -5.958 -6.871 -7.69 -8.38 -9.06 -9.63 -10.136 -10.643 -11.111 -11.535 -11.927 -12.327 -12.686 -13.014 -13.353 -13.673 -13.943 -14.24 -14.548 -14.773 -15.003 -15.238 -15.47 -15.712 -15.875 -16.03 -16.267 -16.437 -16.611 -16.702 -16.895 -17.097 -17.309 -17.417 -17.646 -17.736 -17.858 -17.987 -18.27 -18.422 -18.591 -18.772 -18.968 -19.19 -19.465 -20.027 -8 ,32070 ,TETRA ,17590043,Sat Nov 27 19:30:42 CET,Sat Nov 27 21:21:19 CET,0.0 0.222 0.349 0.452 0.538 0.618 0.7 0.782 0.912 0.969 1.026 1.012 1.172 1.221 1.302 1.375 1.463 1.508 1.578 1.64 1.75 1.831 1.897 1.988 2.078 2.153 2.228 2.293 2.375 2.461 2.542 2.632 2.709 2.769 2.835 2.913 2.988 3.065 3.143 3.223 3.29 3.342 3.38 3.391 3.362 3.288 3.139 2.874 2.437 1.672 0.241 -1.603 -3.204 -4.543 -5.717 -6.81 -7.768 -8.61 -9.304 -9.988 -10.575 -11.089 -11.582 -12.043 -12.461 -12.842 -13.232 -13.566 -13.85 -14.146 -14.446 -14.695 -14.961 -15.23 -15.435 -15.649 -15.868 -16.092 -16.335 -16.507 -16.681 -16.95 -17.13 -17.311 -17.408 -17.605 -17.792 -17.996 -18.105 -18.353 -18.456 -18.583 -18.722 -18.989 -19.135 -19.3 -19.48 -19.673 -19.897 -20.184 -20.862 -9 ,29933 ,TETRA ,17590044,Sat Nov 27 19:30:42 CET,Sat Nov 27 21:23:40 CET,0.0 0.732 1.012 1.201 1.348 1.487 1.622 1.755 1.988 2.074 2.152 2.209 2.398 2.463 2.577 2.683 2.788 2.842 2.943 3.038 3.178 3.264 3.338 3.448 3.56 3.663 3.757 3.857 3.989 4.098 4.18 4.28 4.396 4.501 4.595 4.702 4.801 4.897 4.996 5.081 5.152 5.218 5.307 5.388 5.413 5.377 5.302 5.119 4.728 4.033 2.634 0.806 -0.766 -2.129 -3.286 -4.298 -5.166 -5.94 -6.61 -7.265 -7.836 -8.379 -8.878 -9.335 -9.776 -10.175 -10.591 -10.95 -11.252 -11.56 -11.874 -12.144 -12.435 -12.741 -12.975 -13.218 -13.462 -13.705 -13.973 -14.16 -14.34 -14.612 -14.806 -14.997 -15.089 -15.28 -15.472 -15.67 -15.778 -16.029 -16.151 -16.268 -16.39 -16.676 -16.825 -16.982 -17.157 -17.349 -17.562 -17.804 -18.187 -10 ,6872 ,TETRA ,17590045,Sat Nov 27 19:30:43 CET,Sat Nov 27 21:21:54 CET,0.0 0.22 0.326 0.417 0.513 0.602 0.676 0.744 0.871 0.931 0.999 1.028 1.2 1.244 1.323 1.407 1.484 1.521 1.594 1.663 1.758 1.813 1.87 1.958 2.044 2.124 2.192 2.254 2.344 2.444 2.545 2.663 2.774 2.875 2.986 3.094 3.183 3.297 3.419 3.512 3.606 3.717 3.823 3.883 3.874 3.82 3.697 3.46 3.044 2.289 0.863 -1.018 -2.59 -3.917 -5.053 -6.081 -6.99 -7.799 -8.474 -9.143 -9.71 -10.228 -10.726 -11.195 -11.639 -12.031 -12.434 -12.794 -13.115 -13.446 -13.797 -14.095 -14.388 -14.684 -14.916 -15.158 -15.409 -15.676 -15.94 -16.115 -16.303 -16.606 -16.813 -17.012 -17.109 -17.314 -17.522 -17.726 -17.828 -18.067 -18.148 -18.27 -18.402 -18.691 -18.854 -19.022 -19.198 -19.379 -19.571 -19.795 -20.118 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 6a0499dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22893 ,TETRA ,17590046,Sat Nov 27 19:30:45 CET,Sat Nov 27 21:20:39 CET,0.0 0.571 0.794 1.008 1.203 1.361 1.504 1.651 1.923 2.053 2.18 2.263 2.502 2.602 2.799 2.985 3.17 3.263 3.442 3.606 3.825 3.972 4.121 4.341 4.555 4.764 4.972 5.175 5.433 5.672 5.907 6.191 6.471 6.756 7.075 7.435 7.793 8.184 8.603 9.071 9.584 10.162 10.829 11.48 12.239 13.094 14.077 15.16 16.427 17.863 19.508 20.706 21.267 21.562 21.648 21.642 21.602 21.506 21.391 21.257 21.107 20.946 20.793 20.649 20.505 20.372 20.217 20.069 19.941 19.801 19.644 19.511 19.375 19.237 19.132 19.012 18.883 18.753 18.601 18.499 18.398 18.209 18.071 17.924 17.843 17.685 17.517 17.342 17.25 17.037 16.956 16.854 16.745 16.507 16.375 16.231 16.082 15.917 15.699 15.365 14.424 -2 ,13618 ,TETRA ,17590047,Sat Nov 27 19:30:42 CET,Sat Nov 27 21:20:00 CET,0.0 0.561 0.801 1.011 1.2 1.36 1.527 1.687 1.957 2.076 2.184 2.262 2.52 2.633 2.832 3.008 3.185 3.275 3.446 3.624 3.896 4.061 4.211 4.421 4.63 4.833 5.041 5.252 5.506 5.751 5.998 6.281 6.56 6.831 7.139 7.509 7.874 8.264 8.686 9.125 9.572 10.094 10.745 11.434 12.246 13.116 14.068 15.15 16.406 17.762 19.312 20.45 21.032 21.356 21.462 21.41 21.326 21.25 21.149 21.008 20.856 20.698 20.54 20.391 20.243 20.1 19.946 19.794 19.651 19.498 19.33 19.2 19.076 18.942 18.837 18.733 18.628 18.511 18.389 18.31 18.225 18.09 17.999 17.905 17.859 17.757 17.64 17.517 17.445 17.25 17.227 17.158 17.084 16.921 16.834 16.742 16.616 16.461 16.314 16.113 15.742 -3 ,32580 ,TETRA ,17590048,Sat Nov 27 19:30:44 CET,Sat Nov 27 21:20:17 CET,0.0 0.583 0.794 0.98 1.148 1.304 1.465 1.619 1.906 2.034 2.148 2.214 2.442 2.539 2.756 2.971 3.162 3.246 3.404 3.556 3.78 3.936 4.094 4.32 4.533 4.736 4.945 5.153 5.4 5.643 5.887 6.171 6.432 6.688 7.004 7.37 7.739 8.154 8.592 9.062 9.558 10.106 10.762 11.449 12.254 13.171 14.23 15.391 16.691 18.166 19.819 20.913 21.41 21.6 21.616 21.599 21.54 21.427 21.314 21.186 21.06 20.944 20.816 20.667 20.529 20.408 20.275 20.151 20.03 19.903 19.776 19.674 19.578 19.468 19.366 19.263 19.164 19.062 18.958 18.882 18.801 18.677 18.591 18.494 18.441 18.336 18.224 18.086 18.013 17.82 17.782 17.704 17.614 17.412 17.325 17.229 17.119 16.966 16.758 16.536 15.964 -4 ,31904 ,TETRA ,17590049,Sat Nov 27 19:30:44 CET,Sat Nov 27 21:20:01 CET,0.0 1.004 1.273 1.475 1.675 1.848 2.001 2.135 2.377 2.491 2.604 2.685 2.929 3.038 3.246 3.434 3.612 3.707 3.894 4.064 4.321 4.495 4.668 4.916 5.153 5.379 5.603 5.819 6.086 6.34 6.596 6.913 7.232 7.542 7.887 8.269 8.636 9.03 9.457 9.926 10.422 10.985 11.652 12.323 13.119 14.004 14.959 15.991 17.215 18.651 20.287 21.481 22.032 22.301 22.382 22.334 22.276 22.192 22.048 21.867 21.705 21.545 21.403 21.273 21.142 21.023 20.874 20.728 20.615 20.495 20.365 20.244 20.106 19.96 19.857 19.747 19.63 19.502 19.329 19.21 19.106 18.948 18.84 18.726 18.664 18.539 18.42 18.29 18.22 18.032 17.988 17.908 17.823 17.626 17.532 17.434 17.326 17.208 17.049 16.842 16.462 -5 ,14537 ,TETRA ,17590050,Sat Nov 27 19:30:44 CET,Sat Nov 27 21:20:02 CET,0.0 1.07 1.493 1.795 2.046 2.282 2.497 2.678 3.024 3.173 3.302 3.419 3.678 3.807 4.053 4.271 4.476 4.582 4.792 4.984 5.259 5.439 5.612 5.858 6.11 6.349 6.57 6.792 7.077 7.342 7.589 7.901 8.214 8.521 8.878 9.268 9.63 10.027 10.482 10.968 11.463 12.04 12.699 13.355 14.118 14.934 15.878 16.956 18.249 19.718 21.302 22.44 23.063 23.326 23.375 23.384 23.342 23.259 23.14 22.981 22.84 22.718 22.575 22.407 22.259 22.116 21.956 21.814 21.686 21.544 21.379 21.258 21.146 21.015 20.92 20.811 20.693 20.592 20.472 20.39 20.318 20.188 20.094 19.998 19.953 19.86 19.755 19.636 19.56 19.365 19.346 19.276 19.202 19.015 18.912 18.791 18.661 18.534 18.403 18.231 17.511 -6 ,3831 ,TETRA ,17590051,Sat Nov 27 19:30:43 CET,Sat Nov 27 21:24:14 CET,0.0 0.576 0.839 1.058 1.243 1.398 1.544 1.682 1.955 2.089 2.21 2.288 2.529 2.63 2.816 3.001 3.193 3.287 3.468 3.637 3.873 4.03 4.194 4.429 4.645 4.853 5.045 5.23 5.485 5.733 5.977 6.283 6.59 6.876 7.206 7.599 7.978 8.388 8.833 9.304 9.8 10.377 11.055 11.76 12.56 13.384 14.366 15.469 16.709 18.167 19.784 20.906 21.451 21.731 21.845 21.815 21.701 21.568 21.412 21.261 21.138 21.003 20.866 20.742 20.61 20.47 20.33 20.213 20.116 20.01 19.897 19.798 19.685 19.573 19.492 19.4 19.294 19.182 19.054 18.958 18.862 18.724 18.629 18.535 18.484 18.378 18.28 18.173 18.109 17.917 17.877 17.803 17.728 17.566 17.482 17.357 17.214 17.083 16.923 16.725 16.333 -7 ,18254 ,TETRA ,17590052,Sat Nov 27 19:30:44 CET,Sat Nov 27 21:20:09 CET,0.0 0.782 1.16 1.453 1.718 1.957 2.171 2.364 2.698 2.853 2.996 3.126 3.395 3.517 3.753 3.986 4.22 4.332 4.53 4.717 4.979 5.145 5.306 5.546 5.78 6.008 6.238 6.456 6.732 6.999 7.26 7.58 7.878 8.151 8.471 8.856 9.228 9.62 10.06 10.525 10.992 11.532 12.183 12.845 13.661 14.561 15.538 16.617 17.846 19.259 20.843 21.97 22.503 22.733 22.803 22.802 22.72 22.605 22.506 22.373 22.235 22.095 21.94 21.784 21.618 21.46 21.323 21.206 21.1 21.002 20.891 20.785 20.672 20.541 20.441 20.348 20.253 20.155 20.046 19.972 19.91 19.803 19.716 19.623 19.575 19.471 19.366 19.271 19.215 19.031 19.0 18.913 18.833 18.652 18.548 18.442 18.319 18.185 18.038 17.85 17.276 -8 ,1041 ,TETRA ,17590053,Sat Nov 27 19:30:44 CET,Sat Nov 27 21:22:33 CET,0.0 0.55 0.763 0.945 1.099 1.238 1.358 1.477 1.718 1.838 1.959 2.033 2.28 2.386 2.583 2.781 2.973 3.064 3.237 3.409 3.663 3.822 3.981 4.215 4.435 4.665 4.9 5.125 5.409 5.68 5.953 6.277 6.577 6.867 7.213 7.596 7.953 8.357 8.802 9.281 9.785 10.354 11.012 11.666 12.429 13.305 14.323 15.432 16.677 18.069 19.66 20.826 21.4 21.69 21.797 21.804 21.731 21.624 21.504 21.361 21.235 21.109 20.963 20.811 20.66 20.513 20.352 20.192 20.049 19.899 19.748 19.637 19.519 19.4 19.316 19.231 19.136 19.02 18.885 18.79 18.701 18.576 18.483 18.382 18.331 18.233 18.127 18.007 17.948 17.762 17.747 17.677 17.593 17.406 17.305 17.199 17.082 16.96 16.83 16.652 16.081 -9 ,20335 ,TETRA ,17590054,Sat Nov 27 19:30:44 CET,Sat Nov 27 21:23:39 CET,0.0 0.512 0.753 0.958 1.155 1.344 1.514 1.657 1.917 2.041 2.161 2.246 2.484 2.582 2.781 2.961 3.145 3.231 3.386 3.541 3.778 3.925 4.066 4.293 4.511 4.719 4.934 5.132 5.377 5.628 5.878 6.17 6.446 6.72 7.054 7.429 7.795 8.208 8.658 9.135 9.637 10.198 10.846 11.525 12.318 13.179 14.207 15.369 16.662 18.056 19.617 20.762 21.272 21.47 21.54 21.527 21.461 21.357 21.244 21.098 20.939 20.814 20.677 20.523 20.377 20.217 20.046 19.91 19.795 19.663 19.519 19.392 19.248 19.109 19.015 18.907 18.781 18.653 18.5 18.402 18.308 18.141 18.026 17.903 17.84 17.707 17.543 17.363 17.274 17.064 16.981 16.864 16.751 16.548 16.427 16.289 16.157 15.993 15.778 15.546 15.076 -10 ,11902 ,TETRA ,17590055,Sat Nov 27 19:30:45 CET,Sat Nov 27 21:23:29 CET,0.0 0.803 1.111 1.328 1.494 1.666 1.814 1.944 2.208 2.332 2.448 2.542 2.792 2.902 3.107 3.3 3.493 3.591 3.778 3.969 4.256 4.43 4.604 4.872 5.13 5.367 5.599 5.823 6.107 6.383 6.641 6.955 7.269 7.567 7.914 8.308 8.677 9.088 9.548 10.034 10.54 11.111 11.753 12.432 13.264 14.142 15.117 16.236 17.551 19.047 20.701 21.888 22.458 22.69 22.775 22.772 22.736 22.658 22.55 22.422 22.288 22.146 22.0 21.852 21.705 21.567 21.411 21.27 21.142 21.003 20.835 20.682 20.542 20.414 20.305 20.177 20.045 19.913 19.773 19.68 19.591 19.431 19.312 19.189 19.124 18.989 18.836 18.663 18.574 18.373 18.332 18.234 18.127 17.919 17.782 17.635 17.466 17.26 17.037 16.698 15.655 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt deleted file mode 100644 index 361be3a4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11361 ,TETRA ,17590056,Sat Nov 27 19:31:42 CET,Sat Nov 27 21:22:34 CET,0.0 0.318 0.505 0.677 0.832 0.971 1.103 1.231 1.469 1.578 1.676 1.736 1.973 2.064 2.244 2.429 2.614 2.711 2.904 3.09 3.349 3.509 3.666 3.895 4.117 4.325 4.525 4.728 4.997 5.254 5.505 5.812 6.101 6.375 6.702 7.097 7.471 7.87 8.302 8.763 9.237 9.764 10.417 11.087 11.85 12.698 13.648 14.715 15.997 17.444 19.068 20.342 20.99 21.331 21.499 21.552 21.544 21.465 21.373 21.285 21.181 21.059 20.921 20.799 20.685 20.564 20.425 20.303 20.194 20.07 19.96 19.887 19.813 19.723 19.651 19.577 19.495 19.412 19.334 19.282 19.224 19.132 19.07 19.003 18.966 18.887 18.808 18.715 18.657 18.479 18.481 18.423 18.36 18.218 18.147 18.066 17.975 17.881 17.785 17.651 17.353 -2 ,10478 ,TETRA ,17590057,Sat Nov 27 19:31:42 CET,Sat Nov 27 21:23:40 CET,0.0 0.342 0.554 0.746 0.911 1.06 1.197 1.33 1.582 1.697 1.804 1.862 2.096 2.194 2.375 2.539 2.702 2.781 2.927 3.072 3.299 3.459 3.616 3.832 4.039 4.241 4.42 4.592 4.837 5.093 5.346 5.651 5.951 6.227 6.541 6.902 7.25 7.643 8.078 8.553 9.044 9.577 10.187 10.795 11.52 12.367 13.329 14.366 15.604 17.045 18.688 19.983 20.629 20.98 21.171 21.25 21.275 21.243 21.168 21.077 20.989 20.901 20.815 20.715 20.607 20.5 20.385 20.278 20.176 20.072 19.958 19.849 19.733 19.612 19.515 19.411 19.305 19.196 19.071 18.98 18.883 18.74 18.644 18.534 18.477 18.347 18.209 18.068 17.989 17.783 17.72 17.634 17.549 17.349 17.218 17.079 16.913 16.728 16.538 16.23 15.61 -3 ,4563 ,TETRA ,17590058,Sat Nov 27 19:31:42 CET,Sat Nov 27 21:22:16 CET,0.0 0.311 0.515 0.684 0.807 0.933 1.069 1.191 1.403 1.518 1.628 1.666 1.893 1.99 2.193 2.394 2.582 2.674 2.859 3.024 3.257 3.416 3.57 3.804 4.046 4.285 4.511 4.725 5.0 5.263 5.508 5.794 6.073 6.351 6.673 7.039 7.4 7.783 8.182 8.62 9.106 9.656 10.296 10.926 11.617 12.404 13.343 14.419 15.645 17.049 18.722 19.911 20.505 20.848 21.026 21.101 21.096 21.075 21.052 20.99 20.887 20.774 20.661 20.542 20.428 20.324 20.207 20.092 19.992 19.878 19.755 19.666 19.564 19.447 19.355 19.265 19.186 19.113 19.028 18.97 18.908 18.808 18.745 18.68 18.642 18.561 18.47 18.374 18.331 18.166 18.17 18.102 18.025 17.89 17.826 17.744 17.651 17.55 17.421 17.266 16.964 -4 ,19021 ,TETRA ,17590059,Sat Nov 27 19:31:42 CET,Sat Nov 27 21:22:25 CET,0.0 0.456 0.641 0.788 0.932 1.077 1.203 1.318 1.528 1.62 1.711 1.78 2.026 2.12 2.294 2.463 2.629 2.709 2.859 3.004 3.217 3.363 3.512 3.728 3.957 4.185 4.387 4.583 4.842 5.086 5.329 5.623 5.913 6.21 6.539 6.904 7.264 7.658 8.086 8.547 9.029 9.559 10.214 10.888 11.627 12.454 13.39 14.459 15.725 17.185 18.864 20.156 20.816 21.123 21.267 21.296 21.26 21.199 21.133 21.054 20.962 20.85 20.744 20.646 20.523 20.407 20.291 20.164 20.053 19.954 19.846 19.735 19.623 19.513 19.422 19.322 19.212 19.107 19.003 18.934 18.869 18.768 18.695 18.612 18.569 18.49 18.403 18.302 18.255 18.081 18.093 18.045 17.984 17.836 17.767 17.697 17.62 17.55 17.473 17.361 16.989 -5 ,4506 ,TETRA ,17590060,Sat Nov 27 19:31:42 CET,Sat Nov 27 21:21:53 CET,0.0 0.483 0.723 0.895 1.035 1.158 1.29 1.425 1.653 1.765 1.877 1.94 2.17 2.259 2.446 2.627 2.797 2.877 3.037 3.203 3.454 3.61 3.764 3.984 4.189 4.388 4.58 4.764 4.995 5.226 5.447 5.714 5.99 6.254 6.548 6.876 7.202 7.565 7.983 8.428 8.89 9.427 10.052 10.664 11.392 12.24 13.218 14.297 15.516 16.936 18.603 19.892 20.538 20.86 21.028 21.085 21.085 21.056 20.988 20.892 20.801 20.689 20.558 20.446 20.34 20.23 20.113 19.995 19.887 19.767 19.637 19.529 19.414 19.292 19.19 19.079 18.968 18.87 18.777 18.713 18.648 18.54 18.454 18.361 18.318 18.233 18.13 18.02 17.965 17.794 17.793 17.725 17.667 17.528 17.442 17.354 17.259 17.158 17.05 16.915 16.648 -6 ,2256 ,TETRA ,17590061,Sat Nov 27 19:31:42 CET,Sat Nov 27 21:23:15 CET,0.0 0.94 1.321 1.577 1.76 1.949 2.153 2.319 2.593 2.727 2.848 2.949 3.21 3.323 3.536 3.743 3.937 4.029 4.207 4.372 4.619 4.776 4.926 5.157 5.386 5.601 5.813 6.039 6.319 6.573 6.831 7.146 7.448 7.742 8.089 8.475 8.842 9.244 9.677 10.137 10.61 11.141 11.763 12.378 13.132 13.997 14.975 16.061 17.299 18.733 20.386 21.717 22.396 22.73 22.907 22.957 22.945 22.897 22.812 22.717 22.61 22.486 22.371 22.255 22.136 22.019 21.882 21.755 21.64 21.519 21.393 21.284 21.174 21.063 20.959 20.841 20.725 20.602 20.467 20.375 20.287 20.139 20.024 19.907 19.854 19.756 19.657 19.567 19.517 19.339 19.338 19.277 19.206 19.043 18.955 18.859 18.756 18.643 18.521 18.397 18.128 -7 ,16637 ,TETRA ,17590062,Sat Nov 27 19:31:42 CET,Sat Nov 27 21:21:15 CET,0.0 0.894 1.212 1.463 1.677 1.875 2.055 2.222 2.507 2.632 2.757 2.847 3.096 3.209 3.421 3.633 3.845 3.942 4.133 4.319 4.574 4.742 4.91 5.151 5.381 5.604 5.823 6.032 6.288 6.538 6.782 7.086 7.382 7.66 7.986 8.363 8.713 9.088 9.542 10.058 10.553 11.101 11.751 12.381 13.114 13.935 14.915 16.025 17.228 18.607 20.303 21.647 22.321 22.667 22.827 22.879 22.87 22.798 22.711 22.616 22.522 22.452 22.386 22.306 22.232 22.159 22.067 21.984 21.919 21.845 21.757 21.684 21.601 21.51 21.436 21.361 21.285 21.203 21.11 21.045 20.979 20.87 20.803 20.737 20.704 20.631 20.544 20.449 20.399 20.233 20.258 20.204 20.153 20.052 19.987 19.91 19.829 19.737 19.634 19.519 19.265 -8 ,4510 ,TETRA ,17590063,Sat Nov 27 19:31:42 CET,Sat Nov 27 21:23:52 CET,0.0 0.98 1.299 1.535 1.73 1.915 2.076 2.215 2.466 2.583 2.705 2.818 3.068 3.161 3.351 3.542 3.737 3.839 4.033 4.212 4.46 4.618 4.774 5.005 5.231 5.447 5.668 5.885 6.16 6.425 6.683 6.997 7.276 7.544 7.869 8.23 8.57 8.955 9.395 9.844 10.316 10.858 11.481 12.115 12.858 13.68 14.628 15.675 16.869 18.27 19.922 21.175 21.786 22.105 22.282 22.359 22.371 22.325 22.236 22.13 22.012 21.887 21.765 21.651 21.542 21.434 21.31 21.191 21.076 20.942 20.802 20.692 20.578 20.46 20.358 20.241 20.127 20.011 19.881 19.79 19.698 19.552 19.453 19.348 19.289 19.165 19.031 18.888 18.816 18.632 18.641 18.581 18.518 18.393 18.317 18.232 18.141 18.048 17.933 17.772 17.511 -9 ,10263 ,TETRA ,17590064,Sat Nov 27 19:32:42 CET,Sat Nov 27 21:24:17 CET,0.0 0.349 0.502 0.628 0.748 0.868 0.997 1.117 1.329 1.433 1.532 1.562 1.781 1.873 2.062 2.242 2.41 2.481 2.622 2.765 2.979 3.114 3.243 3.447 3.645 3.837 4.027 4.218 4.464 4.703 4.94 5.227 5.518 5.798 6.114 6.478 6.837 7.234 7.663 8.127 8.6 9.11 9.738 10.421 11.194 12.022 12.988 14.083 15.354 16.802 18.467 19.747 20.361 20.658 20.804 20.849 20.816 20.745 20.669 20.563 20.451 20.339 20.229 20.121 20.003 19.892 19.763 19.629 19.508 19.378 19.25 19.134 19.008 18.889 18.796 18.693 18.599 18.505 18.39 18.32 18.257 18.151 18.075 18.0 17.961 17.875 17.785 17.686 17.635 17.466 17.489 17.425 17.35 17.212 17.133 17.044 16.959 16.857 16.712 16.54 16.161 -10 ,21516 ,TETRA ,17590065,Sat Nov 27 19:32:42 CET,Sat Nov 27 21:22:21 CET,0.0 0.301 0.499 0.676 0.837 0.985 1.112 1.256 1.521 1.623 1.723 1.768 1.997 2.091 2.281 2.455 2.619 2.697 2.862 3.03 3.258 3.403 3.547 3.755 3.965 4.192 4.413 4.617 4.887 5.133 5.36 5.649 5.934 6.219 6.548 6.921 7.288 7.68 8.094 8.548 9.014 9.522 10.149 10.808 11.587 12.452 13.463 14.605 15.89 17.366 19.035 20.264 20.882 21.212 21.357 21.404 21.414 21.375 21.304 21.212 21.114 21.004 20.882 20.758 20.632 20.526 20.424 20.32 20.21 20.095 19.981 19.885 19.772 19.635 19.542 19.447 19.343 19.229 19.106 19.03 18.956 18.834 18.736 18.633 18.58 18.473 18.357 18.227 18.163 17.982 17.947 17.862 17.791 17.654 17.579 17.495 17.399 17.292 17.178 17.005 16.675 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 6eda43b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4073 ,TETRA ,17590066,Sat Nov 27 19:32:42 CET,Sat Nov 27 21:26:50 CET,0.0 0.367 0.566 0.699 0.8 0.915 1.023 1.131 1.357 1.455 1.548 1.585 1.814 1.9 2.06 2.21 2.362 2.439 2.59 2.738 2.947 3.081 3.209 3.38 3.542 3.709 3.876 4.039 4.244 4.441 4.634 4.878 5.127 5.369 5.646 5.965 6.272 6.587 6.929 7.3 7.7 8.146 8.638 9.112 9.65 10.267 10.989 11.787 12.648 13.541 14.403 14.885 14.953 14.821 14.66 14.442 14.185 13.922 13.683 13.435 13.19 12.973 12.758 12.537 12.327 12.138 11.926 11.727 11.561 11.385 11.2 11.042 10.876 10.698 10.55 10.394 10.241 10.081 9.903 9.783 9.661 9.47 9.334 9.198 9.131 8.981 8.821 8.66 8.575 8.349 8.25 8.128 8.011 7.767 7.632 7.473 7.301 7.144 6.988 6.826 6.483 -2 ,12562 ,TETRA ,17590067,Sat Nov 27 19:32:42 CET,Sat Nov 27 21:27:23 CET,0.0 0.768 1.126 1.382 1.614 1.816 1.982 2.125 2.407 2.532 2.648 2.739 2.983 3.083 3.278 3.466 3.64 3.719 3.865 4.023 4.269 4.419 4.558 4.761 4.968 5.172 5.355 5.532 5.765 5.985 6.196 6.455 6.696 6.933 7.22 7.549 7.849 8.175 8.531 8.9 9.293 9.726 10.241 10.768 11.338 11.992 12.737 13.482 14.316 15.199 16.02 16.443 16.53 16.467 16.298 16.061 15.809 15.53 15.289 15.042 14.789 14.571 14.361 14.139 13.932 13.744 13.551 13.369 13.199 13.015 12.807 12.638 12.471 12.298 12.163 12.02 11.871 11.728 11.586 11.495 11.408 11.269 11.168 11.052 10.995 10.877 10.749 10.619 10.546 10.335 10.29 10.204 10.123 9.934 9.828 9.704 9.578 9.462 9.337 9.181 8.744 -3 ,3751 ,TETRA ,17590068,Sat Nov 27 19:33:42 CET,Sat Nov 27 21:25:14 CET,0.0 0.492 0.71 0.879 1.024 1.154 1.267 1.375 1.596 1.707 1.803 1.831 2.057 2.146 2.315 2.469 2.614 2.686 2.812 2.926 3.098 3.217 3.34 3.529 3.719 3.904 4.074 4.231 4.429 4.641 4.866 5.112 5.336 5.57 5.835 6.121 6.405 6.724 7.08 7.458 7.846 8.289 8.775 9.263 9.851 10.502 11.246 12.058 12.869 13.751 14.778 15.302 15.395 15.329 15.166 14.942 14.683 14.434 14.188 13.901 13.659 13.444 13.207 12.986 12.806 12.639 12.462 12.293 12.134 11.981 11.817 11.681 11.552 11.41 11.3 11.177 11.042 10.904 10.763 10.668 10.575 10.436 10.335 10.238 10.186 10.062 9.936 9.801 9.723 9.508 9.464 9.385 9.312 9.125 9.009 8.882 8.739 8.611 8.47 8.277 7.792 -4 ,18644 ,TETRA ,17590069,Sat Nov 27 19:32:43 CET,Sat Nov 27 21:30:46 CET,0.0 0.373 0.67 0.914 1.118 1.314 1.49 1.649 1.929 2.052 2.173 2.248 2.482 2.59 2.79 2.977 3.159 3.248 3.411 3.558 3.776 3.921 4.057 4.261 4.468 4.667 4.861 5.059 5.317 5.556 5.772 6.041 6.299 6.543 6.836 7.157 7.461 7.781 8.13 8.494 8.867 9.31 9.828 10.349 10.948 11.581 12.285 13.102 14.004 14.931 15.828 16.261 16.289 16.133 15.904 15.653 15.408 15.138 14.867 14.579 14.34 14.121 13.89 13.67 13.462 13.258 13.035 12.842 12.679 12.493 12.289 12.127 11.956 11.782 11.658 11.528 11.39 11.241 11.072 10.957 10.842 10.649 10.51 10.372 10.304 10.165 10.01 9.848 9.768 9.542 9.448 9.343 9.231 8.952 8.785 8.59 8.399 8.244 8.027 7.662 6.662 -5 ,5179 ,TETRA ,17590070,Sat Nov 27 19:32:43 CET,Sat Nov 27 21:23:47 CET,0.0 0.676 0.856 1.001 1.114 1.248 1.403 1.539 1.8 1.923 2.038 2.129 2.374 2.475 2.654 2.828 2.992 3.075 3.245 3.404 3.639 3.786 3.921 4.11 4.298 4.486 4.662 4.831 5.048 5.259 5.476 5.741 5.984 6.221 6.504 6.823 7.137 7.478 7.829 8.185 8.568 8.977 9.453 9.966 10.53 11.115 11.792 12.562 13.426 14.385 15.356 15.891 16.032 15.945 15.763 15.537 15.301 15.058 14.816 14.565 14.335 14.101 13.874 13.666 13.46 13.284 13.106 12.932 12.779 12.613 12.439 12.304 12.166 12.02 11.906 11.787 11.66 11.529 11.39 11.298 11.206 11.062 10.959 10.848 10.793 10.682 10.561 10.431 10.362 10.156 10.143 10.066 9.978 9.766 9.643 9.515 9.378 9.246 9.107 8.907 8.592 -6 ,21296 ,TETRA ,17590071,Sat Nov 27 19:32:42 CET,Sat Nov 27 21:23:55 CET,0.0 0.836 1.166 1.378 1.597 1.798 1.979 2.139 2.418 2.543 2.657 2.736 2.977 3.08 3.294 3.493 3.669 3.753 3.91 4.057 4.284 4.435 4.576 4.776 4.982 5.177 5.354 5.531 5.775 6.001 6.207 6.462 6.701 6.925 7.188 7.493 7.787 8.1 8.451 8.838 9.225 9.66 10.177 10.681 11.262 11.905 12.637 13.417 14.294 15.3 16.328 16.792 16.831 16.697 16.488 16.239 16.0 15.782 15.546 15.272 15.026 14.804 14.6 14.406 14.212 14.027 13.844 13.667 13.486 13.309 13.131 12.969 12.805 12.647 12.519 12.383 12.239 12.08 11.916 11.802 11.69 11.527 11.425 11.321 11.262 11.143 11.022 10.884 10.816 10.619 10.606 10.538 10.461 10.291 10.201 10.088 9.97 9.868 9.738 9.508 8.945 -7 ,24686 ,TETRA ,17590072,Sat Nov 27 19:32:44 CET,Sat Nov 27 21:22:24 CET,0.0 0.448 0.676 0.846 1.0 1.14 1.284 1.411 1.611 1.702 1.789 1.821 2.043 2.125 2.287 2.43 2.566 2.632 2.763 2.901 3.108 3.235 3.364 3.573 3.775 3.981 4.176 4.347 4.561 4.766 4.973 5.235 5.488 5.727 5.989 6.274 6.557 6.886 7.235 7.599 8.008 8.46 8.973 9.46 10.019 10.638 11.302 12.019 12.826 13.669 14.514 15.019 15.166 15.117 14.949 14.712 14.449 14.209 13.985 13.728 13.504 13.298 13.095 12.895 12.686 12.497 12.295 12.092 11.915 11.735 11.538 11.383 11.219 11.034 10.886 10.74 10.605 10.46 10.293 10.183 10.075 9.898 9.769 9.625 9.55 9.387 9.217 9.042 8.95 8.729 8.669 8.568 8.464 8.248 8.127 7.997 7.859 7.713 7.556 7.356 6.965 -8 ,27369 ,TETRA ,17590073,Sat Nov 27 19:33:42 CET,Sat Nov 27 21:17:37 CET,0.0 0.259 0.483 0.645 0.774 0.891 0.999 1.108 1.311 1.405 1.498 1.535 1.758 1.842 2.003 2.152 2.288 2.351 2.493 2.633 2.809 2.932 3.065 3.253 3.426 3.593 3.76 3.923 4.128 4.316 4.496 4.71 4.916 5.129 5.382 5.668 5.947 6.264 6.605 6.965 7.355 7.786 8.283 8.769 9.33 9.956 10.653 11.408 12.274 13.195 14.026 14.418 14.458 14.334 14.149 13.898 13.623 13.36 13.096 12.823 12.574 12.326 12.098 11.889 11.683 11.494 11.294 11.118 10.972 10.84 10.698 10.566 10.437 10.3 10.194 10.079 9.952 9.826 9.7 9.613 9.515 9.359 9.255 9.14 9.076 8.938 8.793 8.651 8.58 8.38 8.348 8.254 8.165 7.983 7.879 7.758 7.632 7.494 7.315 7.055 6.646 -9 ,20180 ,TETRA ,17590074,Sat Nov 27 19:32:42 CET,Sat Nov 27 21:22:15 CET,0.0 0.675 1.075 1.33 1.527 1.74 1.931 2.087 2.393 2.534 2.649 2.731 2.973 3.075 3.285 3.478 3.647 3.73 3.898 4.057 4.279 4.417 4.554 4.749 4.948 5.138 5.316 5.494 5.704 5.907 6.107 6.338 6.578 6.821 7.093 7.393 7.696 8.031 8.387 8.76 9.143 9.554 10.042 10.561 11.167 11.799 12.479 13.233 14.074 15.049 16.081 16.618 16.685 16.542 16.345 16.119 15.897 15.674 15.477 15.272 15.066 14.861 14.678 14.507 14.336 14.177 14.003 13.842 13.706 13.568 13.416 13.288 13.155 13.015 12.904 12.79 12.668 12.528 12.391 12.294 12.188 12.035 11.939 11.842 11.79 11.684 11.559 11.41 11.336 11.139 11.139 11.062 10.977 10.785 10.68 10.572 10.454 10.303 10.122 9.907 9.455 -10 ,30672 ,TETRA ,17590075,Sat Nov 27 19:32:42 CET,Sat Nov 27 21:24:15 CET,0.0 0.476 0.668 0.843 1.001 1.157 1.295 1.398 1.598 1.69 1.789 1.855 2.085 2.173 2.332 2.489 2.652 2.731 2.885 3.021 3.204 3.318 3.434 3.619 3.789 3.957 4.125 4.284 4.485 4.679 4.875 5.128 5.374 5.599 5.851 6.145 6.439 6.759 7.121 7.512 7.913 8.342 8.818 9.29 9.851 10.497 11.206 11.971 12.799 13.633 14.505 14.994 15.094 15.029 14.873 14.673 14.435 14.173 13.941 13.668 13.408 13.19 12.973 12.769 12.573 12.379 12.179 12.013 11.87 11.715 11.568 11.446 11.311 11.173 11.059 10.949 10.85 10.741 10.619 10.529 10.421 10.247 10.14 10.032 9.978 9.87 9.757 9.629 9.553 9.351 9.32 9.224 9.125 8.944 8.846 8.735 8.622 8.508 8.402 8.237 7.693 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 938c379b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16169 ,TETRA ,17590076,Sat Nov 27 19:32:42 CET,Sat Nov 27 21:21:11 CET,0.0 0.363 0.596 0.802 0.985 1.119 1.236 1.337 1.548 1.659 1.76 1.809 2.016 2.097 2.236 2.371 2.501 2.563 2.676 2.777 2.914 3.006 3.095 3.225 3.351 3.47 3.587 3.7 3.84 3.971 4.099 4.248 4.38 4.511 4.668 4.84 4.986 5.143 5.336 5.515 5.661 5.819 5.984 6.121 6.26 6.418 6.577 6.667 6.619 6.349 5.627 4.568 3.524 2.555 1.742 0.97 0.273 -0.341 -0.879 -1.403 -1.835 -2.236 -2.634 -3.006 -3.346 -3.654 -3.975 -4.245 -4.475 -4.707 -4.948 -5.151 -5.348 -5.553 -5.714 -5.885 -6.053 -6.225 -6.439 -6.592 -6.726 -6.934 -7.091 -7.242 -7.317 -7.475 -7.639 -7.809 -7.897 -8.12 -8.169 -8.267 -8.373 -8.606 -8.734 -8.868 -9.001 -9.161 -9.344 -9.599 -10.328 -2 ,29736 ,TETRA ,17590077,Sat Nov 27 19:32:44 CET,Sat Nov 27 21:08:49 CET,0.0 0.125 0.236 0.326 0.411 0.485 0.558 0.635 0.767 0.832 0.89 0.862 1.039 1.09 1.193 1.288 1.373 1.418 1.504 1.582 1.7 1.783 1.867 1.999 2.133 2.267 2.402 2.527 2.661 2.785 2.929 3.101 3.242 3.368 3.533 3.716 3.869 4.034 4.2 4.363 4.536 4.726 4.929 5.113 5.294 5.46 5.591 5.644 5.577 5.299 4.557 3.405 2.328 1.372 0.555 -0.187 -0.857 -1.445 -1.972 -2.518 -2.971 -3.36 -3.711 -4.033 -4.341 -4.622 -4.903 -5.145 -5.369 -5.598 -5.826 -6.028 -6.24 -6.452 -6.621 -6.796 -6.969 -7.153 -7.354 -7.491 -7.637 -7.868 -8.016 -8.162 -8.23 -8.369 -8.524 -8.691 -8.784 -9.008 -9.056 -9.155 -9.263 -9.469 -9.588 -9.725 -9.861 -10.012 -10.217 -10.515 -11.293 -3 ,3273 ,TETRA ,17590078,Sat Nov 27 19:32:43 CET,Sat Nov 27 21:25:44 CET,0.0 0.22 0.357 0.467 0.56 0.643 0.721 0.807 0.97 1.033 1.09 1.089 1.273 1.323 1.415 1.504 1.603 1.656 1.746 1.837 1.977 2.063 2.141 2.254 2.367 2.474 2.573 2.663 2.781 2.892 2.996 3.119 3.229 3.332 3.449 3.569 3.678 3.806 3.951 4.099 4.26 4.435 4.623 4.796 4.959 5.102 5.208 5.28 5.285 5.01 4.208 2.977 1.896 0.944 0.096 -0.673 -1.342 -1.914 -2.405 -2.912 -3.363 -3.783 -4.184 -4.56 -4.926 -5.258 -5.584 -5.867 -6.106 -6.336 -6.573 -6.765 -6.964 -7.185 -7.347 -7.516 -7.696 -7.874 -8.055 -8.192 -8.335 -8.547 -8.692 -8.84 -8.92 -9.089 -9.255 -9.418 -9.508 -9.739 -9.797 -9.894 -10.0 -10.26 -10.402 -10.55 -10.712 -10.888 -11.11 -11.381 -12.085 -4 ,8892 ,TETRA ,17590079,Sat Nov 27 19:32:43 CET,Sat Nov 27 21:22:52 CET,0.0 0.236 0.408 0.565 0.729 0.88 1.024 1.15 1.363 1.455 1.536 1.56 1.751 1.82 1.948 2.078 2.197 2.248 2.337 2.434 2.588 2.686 2.776 2.91 3.043 3.166 3.285 3.401 3.54 3.675 3.814 3.976 4.108 4.22 4.356 4.518 4.664 4.81 4.972 5.138 5.296 5.472 5.651 5.816 5.992 6.148 6.277 6.344 6.324 6.085 5.412 4.385 3.315 2.297 1.423 0.676 0.003 -0.608 -1.131 -1.659 -2.116 -2.535 -2.94 -3.304 -3.628 -3.929 -4.241 -4.518 -4.754 -4.996 -5.251 -5.462 -5.676 -5.892 -6.059 -6.227 -6.394 -6.577 -6.774 -6.907 -7.035 -7.248 -7.411 -7.568 -7.64 -7.797 -7.972 -8.154 -8.246 -8.475 -8.552 -8.659 -8.766 -8.996 -9.128 -9.276 -9.431 -9.586 -9.777 -10.026 -10.45 -5 ,13974 ,TETRA ,17590080,Sat Nov 27 19:33:42 CET,Sat Nov 27 21:23:09 CET,0.0 0.163 0.291 0.411 0.499 0.571 0.646 0.716 0.848 0.913 0.984 1.007 1.191 1.241 1.346 1.465 1.594 1.658 1.782 1.905 2.073 2.169 2.263 2.403 2.54 2.664 2.778 2.889 3.017 3.141 3.27 3.428 3.571 3.692 3.844 4.026 4.18 4.339 4.517 4.684 4.841 5.001 5.173 5.339 5.5 5.648 5.791 5.87 5.828 5.565 4.852 3.689 2.562 1.587 0.745 0.007 -0.622 -1.197 -1.7 -2.197 -2.634 -3.049 -3.455 -3.847 -4.205 -4.518 -4.853 -5.15 -5.392 -5.652 -5.931 -6.152 -6.385 -6.628 -6.812 -6.998 -7.198 -7.411 -7.627 -7.775 -7.924 -8.167 -8.337 -8.496 -8.572 -8.732 -8.9 -9.065 -9.159 -9.398 -9.472 -9.571 -9.67 -9.917 -10.065 -10.211 -10.355 -10.517 -10.702 -10.919 -11.455 -6 ,29777 ,TETRA ,17590081,Sat Nov 27 19:33:42 CET,Sat Nov 27 21:22:51 CET,0.0 0.283 0.495 0.685 0.835 0.955 1.076 1.19 1.392 1.49 1.583 1.619 1.813 1.889 2.031 2.155 2.273 2.33 2.43 2.537 2.69 2.781 2.882 3.026 3.167 3.303 3.428 3.543 3.685 3.821 3.949 4.099 4.238 4.381 4.547 4.728 4.89 5.052 5.225 5.381 5.518 5.663 5.821 5.973 6.098 6.202 6.313 6.328 6.253 5.963 5.169 4.073 3.008 2.039 1.18 0.418 -0.225 -0.801 -1.305 -1.823 -2.261 -2.661 -3.054 -3.417 -3.736 -4.022 -4.337 -4.619 -4.873 -5.143 -5.408 -5.624 -5.844 -6.068 -6.251 -6.446 -6.635 -6.826 -7.025 -7.157 -7.292 -7.497 -7.642 -7.795 -7.867 -8.009 -8.174 -8.343 -8.426 -8.652 -8.713 -8.808 -8.905 -9.109 -9.224 -9.356 -9.502 -9.68 -9.871 -10.093 -10.57 -7 ,8826 ,TETRA ,17590082,Sat Nov 27 19:33:42 CET,Sat Nov 27 21:24:20 CET,0.0 0.237 0.395 0.509 0.614 0.706 0.778 0.847 0.961 1.011 1.072 1.065 1.238 1.29 1.401 1.501 1.587 1.63 1.717 1.793 1.907 1.994 2.084 2.205 2.322 2.449 2.568 2.677 2.817 2.941 3.06 3.213 3.364 3.503 3.652 3.821 3.986 4.151 4.313 4.479 4.632 4.79 4.981 5.173 5.371 5.52 5.638 5.688 5.612 5.311 4.629 3.468 2.343 1.402 0.591 -0.132 -0.768 -1.365 -1.886 -2.403 -2.855 -3.253 -3.635 -3.997 -4.315 -4.601 -4.922 -5.219 -5.467 -5.714 -5.968 -6.186 -6.42 -6.657 -6.836 -7.032 -7.231 -7.422 -7.627 -7.779 -7.929 -8.143 -8.282 -8.426 -8.507 -8.672 -8.841 -9.018 -9.108 -9.336 -9.41 -9.516 -9.623 -9.855 -9.977 -10.109 -10.252 -10.426 -10.632 -10.868 -11.457 -8 ,20220 ,TETRA ,17590083,Sat Nov 27 19:33:42 CET,Sat Nov 27 21:23:34 CET,0.0 0.173 0.268 0.346 0.431 0.51 0.578 0.644 0.776 0.837 0.899 0.883 1.06 1.122 1.255 1.378 1.491 1.544 1.643 1.744 1.885 1.968 2.051 2.162 2.272 2.396 2.522 2.634 2.777 2.918 3.052 3.205 3.341 3.474 3.626 3.784 3.93 4.078 4.221 4.37 4.529 4.696 4.873 5.025 5.174 5.281 5.355 5.406 5.339 5.02 4.245 3.184 2.177 1.259 0.474 -0.294 -0.981 -1.588 -2.098 -2.601 -3.073 -3.502 -3.884 -4.236 -4.566 -4.874 -5.19 -5.459 -5.687 -5.914 -6.152 -6.355 -6.56 -6.778 -6.949 -7.114 -7.27 -7.432 -7.619 -7.752 -7.887 -8.109 -8.262 -8.42 -8.507 -8.675 -8.827 -8.984 -9.08 -9.324 -9.398 -9.5 -9.613 -9.871 -10.008 -10.145 -10.294 -10.475 -10.707 -10.976 -11.539 -9 ,28726 ,TETRA ,17590084,Sat Nov 27 19:33:43 CET,Sat Nov 27 21:22:16 CET,0.0 0.232 0.342 0.454 0.545 0.618 0.692 0.758 0.88 0.946 1.005 0.992 1.169 1.222 1.325 1.417 1.505 1.548 1.63 1.702 1.812 1.885 1.949 2.033 2.123 2.218 2.301 2.384 2.49 2.591 2.692 2.826 2.965 3.087 3.231 3.406 3.556 3.703 3.879 4.058 4.215 4.371 4.543 4.702 4.836 4.956 5.056 5.074 4.98 4.723 3.987 2.86 1.83 0.911 0.106 -0.625 -1.289 -1.921 -2.462 -3.011 -3.471 -3.86 -4.242 -4.604 -4.93 -5.219 -5.505 -5.775 -6.026 -6.257 -6.492 -6.695 -6.898 -7.105 -7.271 -7.443 -7.621 -7.809 -8.0 -8.132 -8.267 -8.478 -8.622 -8.764 -8.835 -8.979 -9.139 -9.313 -9.407 -9.636 -9.691 -9.799 -9.919 -10.175 -10.304 -10.445 -10.609 -10.791 -11.007 -11.299 -12.127 -10 ,17911 ,TETRA ,17590085,Sat Nov 27 19:33:43 CET,Sat Nov 27 21:23:07 CET,0.0 0.217 0.328 0.439 0.534 0.626 0.71 0.796 0.946 1.014 1.079 1.077 1.266 1.33 1.437 1.54 1.634 1.674 1.751 1.833 1.947 2.014 2.084 2.178 2.272 2.377 2.491 2.602 2.742 2.873 2.993 3.14 3.287 3.421 3.552 3.694 3.839 4.008 4.171 4.318 4.466 4.634 4.812 4.941 5.066 5.21 5.307 5.345 5.271 4.963 4.226 3.077 2.011 1.059 0.211 -0.556 -1.238 -1.817 -2.308 -2.822 -3.268 -3.673 -4.044 -4.389 -4.73 -5.034 -5.341 -5.624 -5.887 -6.166 -6.441 -6.662 -6.875 -7.099 -7.278 -7.461 -7.648 -7.832 -8.022 -8.158 -8.298 -8.518 -8.67 -8.829 -8.912 -9.069 -9.228 -9.405 -9.504 -9.735 -9.79 -9.902 -10.015 -10.213 -10.336 -10.481 -10.644 -10.816 -11.007 -11.25 -11.688 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt deleted file mode 100644 index bb92365c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8123 ,TETRA ,17590086,Sat Nov 27 19:33:46 CET,Sat Nov 27 21:22:49 CET,0.0 0.381 0.52 0.647 0.785 0.898 0.997 1.086 1.239 1.317 1.393 1.422 1.619 1.695 1.84 1.979 2.113 2.179 2.32 2.453 2.634 2.745 2.852 3.015 3.187 3.369 3.545 3.712 3.934 4.158 4.37 4.618 4.859 5.082 5.335 5.634 5.921 6.222 6.566 6.967 7.369 7.794 8.31 8.831 9.426 10.103 10.906 11.773 12.727 13.836 15.099 16.015 16.462 16.628 16.671 16.664 16.603 16.496 16.378 16.241 16.077 15.912 15.748 15.601 15.458 15.309 15.141 14.993 14.863 14.714 14.558 14.43 14.304 14.174 14.062 13.947 13.837 13.71 13.56 13.457 13.345 13.18 13.067 12.948 12.889 12.765 12.633 12.51 12.461 12.29 12.256 12.182 12.112 11.954 11.859 11.757 11.648 11.526 11.395 11.223 10.835 -2 ,27014 ,TETRA ,17590087,Sat Nov 27 19:33:43 CET,Sat Nov 27 21:22:53 CET,0.0 0.319 0.442 0.529 0.629 0.738 0.834 0.923 1.098 1.189 1.273 1.301 1.503 1.575 1.716 1.856 2.003 2.075 2.21 2.336 2.519 2.637 2.762 2.96 3.143 3.319 3.493 3.659 3.875 4.08 4.278 4.523 4.755 4.988 5.265 5.567 5.843 6.158 6.5 6.857 7.239 7.698 8.246 8.78 9.397 10.066 10.823 11.69 12.673 13.816 15.201 16.177 16.588 16.739 16.78 16.744 16.658 16.542 16.412 16.264 16.116 15.97 15.824 15.667 15.521 15.39 15.237 15.094 14.967 14.84 14.717 14.615 14.499 14.365 14.258 14.165 14.068 13.956 13.845 13.761 13.677 13.559 13.472 13.377 13.332 13.243 13.14 13.029 12.981 12.826 12.825 12.761 12.688 12.531 12.442 12.351 12.255 12.12 11.96 11.801 11.408 -3 ,13221 ,TETRA ,17590088,Sat Nov 27 19:33:43 CET,Sat Nov 27 21:22:50 CET,0.0 0.246 0.409 0.536 0.673 0.819 0.968 1.113 1.384 1.5 1.606 1.686 1.906 2.001 2.18 2.362 2.531 2.607 2.759 2.916 3.141 3.28 3.41 3.604 3.798 3.982 4.155 4.314 4.532 4.757 4.975 5.225 5.465 5.705 5.97 6.263 6.56 6.893 7.244 7.621 8.017 8.454 8.967 9.492 10.089 10.744 11.512 12.363 13.337 14.479 15.757 16.649 17.053 17.223 17.273 17.234 17.133 17.013 16.911 16.782 16.63 16.485 16.344 16.198 16.064 15.937 15.783 15.638 15.511 15.38 15.239 15.129 15.019 14.885 14.782 14.679 14.575 14.469 14.343 14.256 14.163 14.0 13.879 13.746 13.676 13.533 13.395 13.255 13.18 12.989 12.919 12.828 12.71 12.466 12.354 12.228 12.098 11.958 11.759 11.483 10.859 -4 ,31899 ,TETRA ,17590089,Sat Nov 27 19:33:43 CET,Sat Nov 27 21:22:39 CET,0.0 0.228 0.372 0.522 0.65 0.759 0.86 0.945 1.118 1.208 1.297 1.337 1.538 1.613 1.752 1.882 2.011 2.073 2.192 2.312 2.486 2.594 2.704 2.869 3.035 3.198 3.354 3.497 3.688 3.88 4.066 4.289 4.491 4.69 4.93 5.216 5.5 5.811 6.162 6.552 6.946 7.388 7.916 8.432 9.036 9.713 10.49 11.376 12.414 13.594 14.88 15.791 16.215 16.393 16.439 16.387 16.307 16.21 16.107 15.963 15.816 15.675 15.515 15.364 15.225 15.08 14.913 14.765 14.633 14.504 14.363 14.243 14.125 14.004 13.911 13.797 13.676 13.561 13.441 13.361 13.281 13.151 13.044 12.931 12.875 12.75 12.617 12.473 12.402 12.215 12.136 12.024 11.91 11.695 11.591 11.471 11.32 11.117 10.854 10.51 9.621 -5 ,5752 ,TETRA ,17590090,Sat Nov 27 19:33:44 CET,Sat Nov 27 21:22:54 CET,0.0 0.22 0.393 0.52 0.635 0.74 0.839 0.935 1.122 1.209 1.284 1.311 1.509 1.59 1.746 1.88 2.014 2.085 2.217 2.335 2.506 2.623 2.736 2.897 3.063 3.224 3.379 3.531 3.722 3.906 4.09 4.322 4.548 4.768 5.035 5.347 5.659 6.006 6.362 6.734 7.147 7.612 8.145 8.687 9.314 10.025 10.816 11.67 12.678 13.827 15.127 16.045 16.471 16.655 16.709 16.698 16.632 16.519 16.398 16.275 16.156 16.011 15.852 15.711 15.576 15.421 15.243 15.082 14.938 14.794 14.646 14.531 14.417 14.294 14.195 14.096 13.994 13.877 13.748 13.649 13.54 13.371 13.247 13.123 13.061 12.932 12.798 12.655 12.586 12.395 12.3 12.193 12.083 11.835 11.693 11.527 11.348 11.141 10.928 10.719 10.303 -6 ,14591 ,TETRA ,17590091,Sat Nov 27 19:33:44 CET,Sat Nov 27 21:24:06 CET,0.0 0.183 0.315 0.428 0.533 0.633 0.72 0.799 0.966 1.058 1.155 1.205 1.403 1.481 1.634 1.786 1.94 2.012 2.147 2.277 2.463 2.586 2.706 2.873 3.033 3.188 3.344 3.496 3.692 3.885 4.078 4.327 4.568 4.794 5.073 5.396 5.699 6.038 6.407 6.784 7.172 7.624 8.158 8.686 9.305 10.042 10.871 11.748 12.742 13.848 15.106 16.062 16.501 16.665 16.716 16.692 16.607 16.491 16.379 16.258 16.135 15.995 15.837 15.684 15.549 15.412 15.252 15.122 15.007 14.88 14.738 14.614 14.502 14.377 14.266 14.145 14.031 13.906 13.755 13.656 13.56 13.416 13.315 13.212 13.166 13.083 12.996 12.902 12.849 12.681 12.684 12.623 12.545 12.377 12.285 12.179 12.068 11.961 11.818 11.608 11.06 -7 ,28572 ,TETRA ,17590092,Sat Nov 27 19:33:44 CET,Sat Nov 27 21:22:41 CET,0.0 0.281 0.446 0.569 0.681 0.791 0.893 0.991 1.176 1.257 1.343 1.38 1.574 1.641 1.77 1.898 2.017 2.081 2.22 2.345 2.523 2.64 2.753 2.922 3.084 3.243 3.4 3.561 3.779 3.998 4.217 4.478 4.727 4.965 5.238 5.541 5.836 6.151 6.486 6.852 7.246 7.692 8.228 8.776 9.393 10.078 10.845 11.696 12.655 13.782 15.109 16.066 16.512 16.688 16.715 16.665 16.59 16.488 16.377 16.249 16.106 15.966 15.823 15.682 15.55 15.42 15.271 15.143 15.049 14.932 14.784 14.661 14.523 14.39 14.293 14.182 14.069 13.961 13.831 13.733 13.645 13.525 13.434 13.335 13.289 13.185 13.069 12.963 12.907 12.732 12.693 12.619 12.545 12.389 12.305 12.209 12.108 12.006 11.892 11.743 11.247 -8 ,9104 ,TETRA ,17590093,Sat Nov 27 19:33:44 CET,Sat Nov 27 21:23:08 CET,0.0 0.234 0.411 0.547 0.677 0.796 0.903 1.004 1.171 1.258 1.347 1.38 1.579 1.659 1.805 1.941 2.078 2.149 2.29 2.423 2.613 2.729 2.839 3.0 3.152 3.308 3.462 3.613 3.825 4.042 4.238 4.471 4.712 4.94 5.212 5.532 5.843 6.187 6.551 6.924 7.339 7.83 8.39 8.934 9.565 10.264 11.044 11.912 12.942 14.108 15.359 16.188 16.568 16.755 16.813 16.758 16.65 16.535 16.41 16.255 16.128 16.005 15.879 15.753 15.601 15.467 15.321 15.157 15.023 14.901 14.772 14.663 14.558 14.454 14.37 14.285 14.204 14.111 14.002 13.931 13.856 13.735 13.65 13.567 13.525 13.433 13.335 13.23 13.169 12.991 12.967 12.896 12.832 12.692 12.597 12.5 12.39 12.246 12.112 11.938 11.47 -9 ,29810 ,TETRA ,17590094,Sat Nov 27 19:33:46 CET,Sat Nov 27 21:22:57 CET,0.0 0.205 0.349 0.476 0.575 0.685 0.802 0.903 1.086 1.169 1.25 1.304 1.512 1.593 1.749 1.894 2.03 2.097 2.232 2.371 2.573 2.698 2.817 3.011 3.194 3.343 3.489 3.648 3.862 4.053 4.234 4.464 4.688 4.903 5.156 5.432 5.704 6.015 6.366 6.745 7.132 7.575 8.108 8.638 9.24 9.933 10.729 11.586 12.558 13.692 14.981 15.879 16.319 16.545 16.591 16.538 16.445 16.33 16.213 16.076 15.946 15.811 15.669 15.522 15.371 15.227 15.062 14.917 14.787 14.643 14.491 14.36 14.223 14.079 13.967 13.848 13.718 13.587 13.448 13.345 13.244 13.089 12.982 12.867 12.812 12.7 12.56 12.411 12.335 12.138 12.051 11.951 11.853 11.622 11.491 11.342 11.138 10.91 10.673 10.386 9.476 -10 ,26527 ,TETRA ,17590095,Sat Nov 27 19:33:49 CET,Sat Nov 27 21:23:09 CET,0.0 0.297 0.433 0.561 0.669 0.761 0.848 0.935 1.104 1.184 1.271 1.312 1.508 1.583 1.738 1.887 2.017 2.083 2.214 2.337 2.514 2.631 2.747 2.93 3.126 3.307 3.472 3.648 3.875 4.083 4.285 4.521 4.757 4.997 5.261 5.547 5.818 6.123 6.467 6.844 7.259 7.719 8.234 8.765 9.356 9.986 10.72 11.535 12.483 13.618 14.981 15.96 16.383 16.548 16.59 16.545 16.465 16.375 16.268 16.131 15.982 15.848 15.72 15.566 15.418 15.286 15.133 14.991 14.862 14.731 14.588 14.467 14.357 14.235 14.129 14.015 13.895 13.762 13.624 13.53 13.428 13.28 13.175 13.047 12.979 12.852 12.725 12.587 12.505 12.309 12.248 12.154 12.061 11.889 11.799 11.71 11.607 11.495 11.375 11.178 10.789 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 7b0dfc7f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6434 ,TETRA ,17590096,Sat Nov 27 19:33:44 CET,Sat Nov 27 21:23:23 CET,0.0 0.484 0.742 0.909 1.026 1.145 1.27 1.373 1.53 1.611 1.692 1.726 1.928 2.003 2.137 2.258 2.384 2.448 2.554 2.661 2.833 2.94 3.047 3.194 3.337 3.475 3.588 3.707 3.873 4.022 4.157 4.336 4.531 4.704 4.881 5.077 5.267 5.474 5.683 5.907 6.158 6.421 6.701 6.962 7.209 7.441 7.683 7.907 8.083 8.071 7.677 6.915 6.18 5.53 4.907 4.307 3.757 3.229 2.756 2.293 1.904 1.558 1.225 0.922 0.645 0.39 0.124 -0.109 -0.32 -0.549 -0.783 -0.972 -1.164 -1.376 -1.542 -1.702 -1.876 -2.071 -2.274 -2.413 -2.552 -2.742 -2.866 -3.001 -3.073 -3.207 -3.334 -3.473 -3.55 -3.761 -3.801 -3.892 -3.983 -4.169 -4.278 -4.393 -4.506 -4.648 -4.835 -5.064 -5.418 -2 ,20874 ,TETRA ,17590097,Sat Nov 27 19:34:42 CET,Sat Nov 27 21:20:22 CET,0.0 0.523 0.722 0.864 0.98 1.089 1.203 1.314 1.516 1.604 1.677 1.689 1.885 1.958 2.09 2.214 2.337 2.403 2.534 2.648 2.806 2.9 2.987 3.122 3.251 3.376 3.495 3.606 3.738 3.86 3.979 4.132 4.291 4.453 4.632 4.826 5.016 5.216 5.427 5.636 5.846 6.071 6.318 6.576 6.855 7.128 7.448 7.713 7.89 7.943 7.628 6.921 6.191 5.485 4.832 4.252 3.75 3.288 2.864 2.413 2.025 1.693 1.378 1.073 0.787 0.526 0.26 0.033 -0.159 -0.357 -0.567 -0.748 -0.917 -1.083 -1.23 -1.375 -1.535 -1.704 -1.864 -1.977 -2.099 -2.279 -2.405 -2.546 -2.613 -2.742 -2.88 -3.03 -3.114 -3.33 -3.387 -3.481 -3.566 -3.754 -3.863 -3.987 -4.121 -4.265 -4.45 -4.692 -5.674 -3 ,19136 ,TETRA ,17590098,Sat Nov 27 19:34:42 CET,Sat Nov 27 21:12:33 CET,0.0 0.462 0.636 0.79 0.92 1.034 1.133 1.226 1.4 1.469 1.54 1.553 1.736 1.794 1.917 2.04 2.155 2.212 2.331 2.456 2.613 2.704 2.791 2.915 3.036 3.151 3.268 3.395 3.558 3.707 3.844 4.003 4.151 4.283 4.428 4.602 4.783 4.97 5.169 5.384 5.616 5.859 6.107 6.351 6.613 6.872 7.12 7.335 7.495 7.539 7.295 6.669 5.942 5.265 4.598 3.959 3.415 2.909 2.468 2.0 1.583 1.229 0.896 0.572 0.271 0.015 -0.255 -0.518 -0.728 -0.942 -1.173 -1.369 -1.576 -1.772 -1.921 -2.079 -2.246 -2.426 -2.614 -2.741 -2.871 -3.063 -3.195 -3.326 -3.386 -3.513 -3.667 -3.836 -3.916 -4.122 -4.155 -4.253 -4.353 -4.563 -4.679 -4.782 -4.894 -5.047 -5.255 -5.482 -5.88 -4 ,17580 ,TETRA ,17590099,Sat Nov 27 19:34:42 CET,Sat Nov 27 21:24:44 CET,0.0 0.41 0.595 0.757 0.869 0.974 1.088 1.193 1.375 1.463 1.548 1.604 1.811 1.875 1.991 2.097 2.204 2.259 2.371 2.479 2.625 2.729 2.838 2.994 3.14 3.265 3.388 3.502 3.643 3.764 3.869 4.026 4.186 4.331 4.51 4.699 4.871 5.061 5.254 5.451 5.663 5.885 6.148 6.428 6.725 7.026 7.307 7.525 7.658 7.642 7.265 6.517 5.738 4.963 4.314 3.728 3.197 2.709 2.278 1.834 1.454 1.12 0.804 0.504 0.216 -0.059 -0.346 -0.596 -0.807 -1.028 -1.268 -1.467 -1.659 -1.855 -2.018 -2.186 -2.363 -2.549 -2.753 -2.896 -3.035 -3.26 -3.418 -3.579 -3.667 -3.854 -4.037 -4.227 -4.324 -4.548 -4.633 -4.748 -4.864 -5.093 -5.2 -5.304 -5.415 -5.54 -5.692 -5.839 -6.169 -5 ,2358 ,TETRA ,17590100,Sat Nov 27 19:34:42 CET,Sat Nov 27 21:25:25 CET,0.0 0.607 0.816 0.978 1.118 1.248 1.357 1.451 1.642 1.731 1.811 1.835 2.026 2.094 2.232 2.365 2.49 2.548 2.644 2.742 2.895 2.989 3.076 3.196 3.309 3.412 3.513 3.618 3.755 3.885 4.003 4.155 4.321 4.466 4.622 4.799 4.956 5.128 5.321 5.543 5.761 5.998 6.266 6.487 6.731 6.964 7.173 7.374 7.526 7.525 7.234 6.596 5.888 5.182 4.554 3.968 3.443 2.986 2.565 2.111 1.721 1.388 1.069 0.762 0.479 0.204 -0.088 -0.329 -0.535 -0.759 -0.989 -1.186 -1.4 -1.611 -1.768 -1.938 -2.115 -2.289 -2.46 -2.58 -2.7 -2.876 -3.002 -3.133 -3.195 -3.317 -3.453 -3.609 -3.684 -3.892 -3.931 -4.024 -4.118 -4.316 -4.415 -4.51 -4.604 -4.708 -4.885 -5.122 -5.518 -6 ,20045 ,TETRA ,17590101,Sat Nov 27 19:34:42 CET,Sat Nov 27 21:26:15 CET,0.0 0.366 0.54 0.669 0.774 0.885 0.982 1.078 1.257 1.34 1.417 1.45 1.652 1.728 1.885 2.038 2.173 2.234 2.339 2.446 2.618 2.72 2.807 2.93 3.044 3.162 3.291 3.422 3.589 3.749 3.904 4.087 4.265 4.439 4.623 4.825 5.017 5.223 5.448 5.677 5.899 6.139 6.399 6.63 6.881 7.12 7.35 7.542 7.72 7.791 7.495 6.8 6.04 5.298 4.62 4.02 3.497 2.987 2.535 2.105 1.72 1.371 1.056 0.747 0.442 0.164 -0.129 -0.389 -0.605 -0.824 -1.06 -1.266 -1.48 -1.71 -1.892 -2.062 -2.234 -2.416 -2.602 -2.728 -2.861 -3.065 -3.208 -3.366 -3.452 -3.637 -3.815 -4.011 -4.119 -4.347 -4.452 -4.582 -4.703 -4.948 -5.102 -5.286 -5.476 -5.701 -5.966 -6.28 -7.067 -7 ,18589 ,TETRA ,17590102,Sat Nov 27 19:34:42 CET,Sat Nov 27 21:26:14 CET,0.0 0.72 0.897 1.049 1.214 1.367 1.493 1.595 1.761 1.839 1.916 1.939 2.136 2.21 2.338 2.452 2.559 2.617 2.744 2.865 3.046 3.168 3.278 3.421 3.565 3.721 3.874 4.018 4.2 4.36 4.514 4.696 4.866 5.027 5.211 5.425 5.614 5.813 6.032 6.262 6.498 6.732 6.988 7.22 7.443 7.711 7.97 8.175 8.339 8.347 8.031 7.323 6.589 5.913 5.275 4.662 4.128 3.655 3.23 2.786 2.409 2.09 1.792 1.488 1.185 0.903 0.6 0.337 0.118 -0.1 -0.339 -0.54 -0.737 -0.95 -1.123 -1.301 -1.476 -1.645 -1.813 -1.923 -2.041 -2.219 -2.341 -2.476 -2.549 -2.696 -2.834 -2.97 -3.043 -3.258 -3.294 -3.384 -3.483 -3.7 -3.827 -3.946 -4.044 -4.155 -4.295 -4.477 -5.162 -8 ,30236 ,TETRA ,17590103,Sat Nov 27 19:34:42 CET,Sat Nov 27 21:23:55 CET,0.0 0.85 1.138 1.309 1.445 1.562 1.666 1.777 1.978 2.056 2.13 2.151 2.349 2.414 2.538 2.675 2.807 2.867 2.988 3.106 3.258 3.354 3.457 3.616 3.774 3.925 4.058 4.189 4.36 4.521 4.674 4.861 5.041 5.202 5.385 5.581 5.771 5.994 6.221 6.441 6.654 6.897 7.15 7.384 7.664 7.943 8.202 8.419 8.571 8.545 8.212 7.538 6.8 6.095 5.457 4.864 4.295 3.771 3.338 2.913 2.558 2.252 1.948 1.648 1.359 1.085 0.801 0.55 0.333 0.131 -0.077 -0.268 -0.458 -0.638 -0.778 -0.933 -1.089 -1.244 -1.404 -1.508 -1.623 -1.821 -1.942 -2.048 -2.106 -2.239 -2.376 -2.506 -2.575 -2.779 -2.801 -2.893 -2.986 -3.206 -3.322 -3.433 -3.579 -3.74 -3.883 -4.084 -4.872 -9 ,28560 ,TETRA ,17590104,Sat Nov 27 19:34:42 CET,Sat Nov 27 21:24:10 CET,0.0 0.984 1.158 1.324 1.46 1.574 1.675 1.783 1.999 2.087 2.167 2.203 2.397 2.459 2.587 2.705 2.814 2.867 2.961 3.048 3.179 3.262 3.343 3.465 3.598 3.744 3.893 4.031 4.196 4.352 4.498 4.665 4.828 4.987 5.147 5.333 5.522 5.707 5.913 6.13 6.343 6.588 6.867 7.117 7.372 7.608 7.802 7.981 8.156 8.245 8.063 7.437 6.716 6.043 5.413 4.826 4.317 3.816 3.36 2.917 2.53 2.176 1.857 1.56 1.272 1.017 0.739 0.469 0.233 0.001 -0.232 -0.423 -0.624 -0.835 -1.001 -1.172 -1.346 -1.529 -1.71 -1.834 -1.959 -2.137 -2.263 -2.405 -2.478 -2.624 -2.777 -2.931 -3.008 -3.212 -3.243 -3.33 -3.429 -3.643 -3.751 -3.864 -3.989 -4.14 -4.29 -4.482 -4.997 -10 ,574 ,TETRA ,17590105,Sat Nov 27 19:34:43 CET,Sat Nov 27 21:24:10 CET,0.0 0.945 1.176 1.317 1.438 1.562 1.67 1.772 1.975 2.06 2.143 2.158 2.345 2.411 2.54 2.666 2.776 2.831 2.933 3.023 3.173 3.276 3.37 3.49 3.601 3.713 3.823 3.942 4.1 4.25 4.388 4.548 4.699 4.846 5.032 5.245 5.434 5.612 5.798 6.017 6.241 6.479 6.737 6.964 7.231 7.494 7.729 7.941 8.083 8.096 7.796 7.116 6.37 5.636 4.966 4.349 3.789 3.269 2.845 2.453 2.103 1.776 1.47 1.184 0.91 0.652 0.375 0.13 -0.093 -0.339 -0.572 -0.76 -0.959 -1.165 -1.327 -1.498 -1.676 -1.867 -2.066 -2.195 -2.329 -2.538 -2.674 -2.821 -2.898 -3.056 -3.235 -3.436 -3.543 -3.777 -3.881 -4.006 -4.126 -4.38 -4.522 -4.649 -4.779 -4.936 -5.095 -5.28 -5.782 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 54be725b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10853 ,TETRA ,17590106,Sat Nov 27 19:34:44 CET,Sat Nov 27 21:23:44 CET,0.0 0.21 0.377 0.517 0.631 0.748 0.85 0.934 1.091 1.163 1.24 1.266 1.47 1.536 1.657 1.777 1.893 1.953 2.072 2.184 2.344 2.444 2.538 2.676 2.818 2.939 3.043 3.14 3.266 3.386 3.497 3.635 3.798 3.948 4.094 4.266 4.437 4.63 4.845 5.057 5.271 5.52 5.79 6.057 6.357 6.656 6.956 7.227 7.451 7.568 7.338 6.666 5.945 5.285 4.693 4.124 3.579 3.092 2.657 2.198 1.832 1.515 1.208 0.885 0.568 0.287 0.001 -0.268 -0.496 -0.721 -0.976 -1.185 -1.386 -1.614 -1.796 -1.983 -2.188 -2.401 -2.612 -2.758 -2.903 -3.122 -3.282 -3.462 -3.552 -3.731 -3.935 -4.153 -4.267 -4.513 -4.597 -4.7 -4.813 -5.063 -5.209 -5.374 -5.547 -5.725 -5.923 -6.224 -7.335 -2 ,27716 ,TETRA ,17590107,Sat Nov 27 19:34:43 CET,Sat Nov 27 21:25:00 CET,0.0 0.368 0.521 0.621 0.715 0.805 0.883 0.962 1.126 1.211 1.285 1.295 1.502 1.575 1.709 1.86 1.988 2.036 2.13 2.227 2.37 2.466 2.564 2.707 2.861 3.003 3.136 3.275 3.466 3.643 3.809 3.997 4.154 4.303 4.472 4.674 4.874 5.087 5.308 5.536 5.776 6.01 6.268 6.546 6.84 7.101 7.37 7.611 7.782 7.82 7.539 6.908 6.235 5.571 4.933 4.336 3.813 3.331 2.918 2.502 2.125 1.787 1.447 1.122 0.816 0.534 0.252 -0.008 -0.237 -0.469 -0.7 -0.902 -1.127 -1.363 -1.549 -1.739 -1.932 -2.139 -2.361 -2.521 -2.679 -2.911 -3.08 -3.269 -3.366 -3.548 -3.736 -3.939 -4.038 -4.27 -4.346 -4.457 -4.578 -4.862 -5.026 -5.2 -5.363 -5.521 -5.719 -6.007 -6.872 -3 ,15274 ,TETRA ,17590108,Sat Nov 27 19:34:44 CET,Sat Nov 27 21:24:10 CET,0.0 0.378 0.582 0.702 0.817 0.937 1.042 1.13 1.297 1.373 1.445 1.452 1.646 1.707 1.839 1.989 2.13 2.196 2.334 2.463 2.636 2.748 2.857 3.004 3.142 3.277 3.408 3.541 3.708 3.86 4.012 4.193 4.359 4.52 4.714 4.937 5.139 5.36 5.579 5.789 6.019 6.259 6.501 6.733 7.01 7.284 7.514 7.721 7.869 7.896 7.66 7.055 6.366 5.709 5.099 4.551 4.07 3.593 3.166 2.739 2.369 2.032 1.683 1.358 1.061 0.763 0.45 0.187 -0.027 -0.256 -0.517 -0.74 -0.951 -1.162 -1.336 -1.525 -1.728 -1.949 -2.174 -2.328 -2.483 -2.716 -2.882 -3.047 -3.14 -3.328 -3.508 -3.697 -3.789 -4.013 -4.08 -4.204 -4.336 -4.578 -4.708 -4.85 -4.999 -5.195 -5.442 -5.731 -6.88 -4 ,1083 ,TETRA ,17590109,Sat Nov 27 19:34:44 CET,Sat Nov 27 21:24:09 CET,0.0 0.664 0.856 0.986 1.121 1.254 1.363 1.45 1.619 1.705 1.782 1.781 1.979 2.045 2.173 2.3 2.421 2.477 2.582 2.682 2.828 2.928 3.028 3.173 3.316 3.465 3.611 3.742 3.907 4.072 4.238 4.454 4.648 4.815 4.996 5.206 5.411 5.618 5.841 6.059 6.273 6.505 6.77 7.009 7.267 7.557 7.832 8.061 8.24 8.299 8.033 7.402 6.768 6.131 5.51 4.942 4.444 3.952 3.516 3.096 2.721 2.394 2.082 1.759 1.453 1.185 0.908 0.632 0.376 0.135 -0.093 -0.273 -0.456 -0.651 -0.817 -0.993 -1.168 -1.342 -1.527 -1.656 -1.784 -1.989 -2.133 -2.286 -2.367 -2.52 -2.683 -2.882 -2.979 -3.212 -3.296 -3.407 -3.522 -3.756 -3.885 -4.032 -4.19 -4.366 -4.585 -4.87 -5.572 -5 ,6447 ,TETRA ,17590110,Sat Nov 27 19:34:44 CET,Sat Nov 27 21:24:18 CET,0.0 0.448 0.645 0.79 0.902 0.986 1.068 1.159 1.343 1.423 1.499 1.526 1.727 1.788 1.897 2.003 2.107 2.166 2.278 2.375 2.527 2.619 2.717 2.874 3.024 3.174 3.311 3.434 3.598 3.753 3.899 4.082 4.253 4.406 4.586 4.789 4.98 5.18 5.397 5.635 5.882 6.148 6.429 6.69 6.97 7.245 7.517 7.769 7.971 8.031 7.744 7.129 6.478 5.848 5.2 4.542 3.985 3.481 3.05 2.628 2.229 1.836 1.494 1.189 0.892 0.649 0.41 0.169 -0.05 -0.274 -0.519 -0.729 -0.93 -1.132 -1.288 -1.455 -1.63 -1.81 -1.998 -2.119 -2.249 -2.451 -2.585 -2.731 -2.811 -2.986 -3.166 -3.344 -3.434 -3.664 -3.76 -3.871 -3.99 -4.27 -4.406 -4.551 -4.747 -4.946 -5.143 -5.427 -6.554 -6 ,16837 ,TETRA ,17590111,Sat Nov 27 19:34:44 CET,Sat Nov 27 21:24:34 CET,0.0 0.31 0.458 0.588 0.693 0.795 0.884 0.98 1.16 1.231 1.303 1.321 1.521 1.584 1.698 1.817 1.937 1.994 2.108 2.213 2.348 2.437 2.529 2.669 2.806 2.937 3.059 3.184 3.348 3.492 3.63 3.804 3.976 4.147 4.345 4.559 4.758 4.97 5.191 5.41 5.652 5.911 6.187 6.462 6.769 7.092 7.391 7.605 7.829 7.978 7.742 7.077 6.449 5.847 5.253 4.709 4.216 3.726 3.27 2.804 2.404 2.068 1.747 1.42 1.11 0.816 0.512 0.249 0.012 -0.23 -0.484 -0.693 -0.906 -1.125 -1.291 -1.468 -1.654 -1.847 -2.047 -2.183 -2.324 -2.568 -2.737 -2.916 -3.02 -3.218 -3.397 -3.594 -3.692 -3.92 -4.002 -4.116 -4.224 -4.448 -4.575 -4.721 -4.895 -5.08 -5.306 -5.591 -6.804 -7 ,5993 ,TETRA ,17590112,Sat Nov 27 19:34:45 CET,Sat Nov 27 21:24:20 CET,0.0 0.328 0.483 0.628 0.741 0.847 0.963 1.058 1.207 1.275 1.339 1.334 1.536 1.598 1.712 1.821 1.923 1.977 2.093 2.209 2.369 2.461 2.554 2.689 2.816 2.945 3.072 3.203 3.369 3.532 3.698 3.888 4.057 4.218 4.412 4.624 4.806 4.996 5.197 5.413 5.644 5.887 6.144 6.371 6.636 6.923 7.195 7.454 7.655 7.721 7.49 6.882 6.219 5.584 5.02 4.478 3.978 3.498 3.061 2.626 2.25 1.909 1.581 1.265 0.963 0.678 0.374 0.107 -0.114 -0.332 -0.56 -0.766 -0.992 -1.217 -1.394 -1.58 -1.77 -1.97 -2.193 -2.346 -2.494 -2.749 -2.933 -3.127 -3.224 -3.408 -3.602 -3.819 -3.939 -4.187 -4.312 -4.448 -4.57 -4.826 -4.962 -5.097 -5.26 -5.473 -5.692 -5.977 -7.732 -8 ,6503 ,TETRA ,17590113,Sat Nov 27 19:34:47 CET,Sat Nov 27 21:24:16 CET,0.0 0.346 0.551 0.691 0.812 0.928 1.021 1.096 1.268 1.361 1.439 1.446 1.658 1.73 1.859 1.991 2.116 2.172 2.283 2.403 2.578 2.683 2.784 2.938 3.083 3.216 3.346 3.474 3.64 3.799 3.953 4.137 4.31 4.469 4.658 4.862 5.056 5.269 5.481 5.7 5.951 6.221 6.497 6.772 7.056 7.325 7.611 7.861 8.052 8.163 7.938 7.427 6.771 6.048 5.422 4.84 4.292 3.763 3.301 2.844 2.45 2.089 1.748 1.427 1.125 0.855 0.581 0.334 0.106 -0.114 -0.319 -0.491 -0.667 -0.852 -0.997 -1.155 -1.318 -1.474 -1.654 -1.788 -1.926 -2.126 -2.261 -2.421 -2.509 -2.669 -2.82 -3.008 -3.115 -3.35 -3.429 -3.542 -3.658 -3.917 -4.059 -4.204 -4.357 -4.568 -4.842 -5.146 -5.606 -9 ,21965 ,TETRA ,17590114,Sat Nov 27 19:36:42 CET,Sat Nov 27 21:25:58 CET,0.0 0.899 1.197 1.364 1.502 1.636 1.764 1.891 2.084 2.168 2.269 2.352 2.573 2.657 2.824 2.982 3.127 3.2 3.332 3.457 3.653 3.766 3.865 4.011 4.166 4.317 4.463 4.605 4.764 4.918 5.088 5.304 5.497 5.669 5.856 6.063 6.261 6.483 6.708 6.937 7.181 7.444 7.728 7.961 8.223 8.501 8.777 9.035 9.225 9.341 9.205 8.625 7.949 7.273 6.655 6.061 5.486 4.957 4.515 4.076 3.692 3.345 3.007 2.684 2.368 2.074 1.771 1.528 1.301 1.039 0.774 0.561 0.346 0.123 -0.052 -0.236 -0.428 -0.627 -0.82 -0.955 -1.098 -1.329 -1.496 -1.672 -1.767 -1.957 -2.145 -2.341 -2.436 -2.656 -2.698 -2.796 -2.92 -3.231 -3.406 -3.59 -3.789 -4.003 -4.251 -4.594 -5.449 -10 ,8681 ,TETRA ,17590115,Sat Nov 27 19:35:42 CET,Sat Nov 27 21:25:14 CET,0.0 0.324 0.519 0.667 0.791 0.906 1.019 1.164 1.422 1.497 1.569 1.574 1.765 1.821 1.941 2.072 2.196 2.256 2.38 2.492 2.644 2.747 2.85 3.019 3.185 3.327 3.476 3.621 3.788 3.951 4.107 4.288 4.444 4.61 4.804 5.017 5.226 5.429 5.641 5.865 6.091 6.346 6.623 6.87 7.144 7.429 7.701 7.964 8.178 8.271 8.11 7.572 6.92 6.269 5.624 5.003 4.439 3.896 3.438 2.97 2.564 2.214 1.88 1.563 1.271 0.996 0.697 0.431 0.195 -0.053 -0.301 -0.515 -0.749 -0.987 -1.173 -1.362 -1.553 -1.746 -1.937 -2.074 -2.213 -2.415 -2.551 -2.697 -2.773 -2.915 -3.073 -3.266 -3.366 -3.598 -3.662 -3.766 -3.887 -4.16 -4.307 -4.445 -4.608 -4.815 -5.04 -5.352 -6.292 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt deleted file mode 100644 index f6718cc7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21834 ,TETRA ,17590116,Sat Nov 27 19:35:42 CET,Sat Nov 27 21:28:08 CET,0.0 0.343 0.537 0.722 0.856 0.978 1.093 1.209 1.427 1.519 1.619 1.695 1.917 2.0 2.175 2.344 2.501 2.577 2.728 2.877 3.084 3.213 3.346 3.548 3.744 3.928 4.11 4.288 4.504 4.714 4.928 5.184 5.438 5.709 6.03 6.382 6.715 7.078 7.475 7.908 8.391 8.939 9.565 10.196 10.938 11.744 12.652 13.717 14.997 16.525 18.344 19.763 20.563 21.026 21.294 21.45 21.469 21.449 21.421 21.348 21.247 21.152 21.053 20.949 20.848 20.731 20.59 20.465 20.363 20.264 20.153 20.044 19.92 19.786 19.679 19.559 19.433 19.309 19.175 19.078 18.974 18.809 18.696 18.569 18.503 18.371 18.237 18.077 17.99 17.799 17.779 17.721 17.645 17.472 17.372 17.269 17.168 17.045 16.898 16.69 16.073 -2 ,3079 ,TETRA ,17590117,Sat Nov 27 19:35:42 CET,Sat Nov 27 21:30:15 CET,0.0 0.641 0.951 1.201 1.404 1.604 1.787 1.95 2.24 2.367 2.486 2.598 2.845 2.957 3.174 3.384 3.579 3.67 3.845 4.02 4.273 4.431 4.593 4.834 5.072 5.291 5.483 5.675 5.931 6.182 6.431 6.716 6.984 7.258 7.565 7.914 8.27 8.645 9.038 9.477 9.949 10.479 11.103 11.734 12.473 13.301 14.282 15.422 16.744 18.278 20.108 21.558 22.355 22.855 23.173 23.344 23.418 23.419 23.351 23.242 23.136 23.025 22.912 22.793 22.672 22.557 22.422 22.303 22.191 22.063 21.927 21.816 21.697 21.571 21.479 21.366 21.243 21.118 20.979 20.881 20.777 20.616 20.513 20.421 20.361 20.22 20.08 19.922 19.84 19.648 19.587 19.492 19.415 19.292 19.202 19.089 18.963 18.817 18.655 18.449 17.926 -3 ,9680 ,TETRA ,17590118,Sat Nov 27 19:35:42 CET,Sat Nov 27 21:26:41 CET,0.0 0.351 0.564 0.715 0.837 0.945 1.051 1.155 1.348 1.444 1.539 1.582 1.789 1.873 2.054 2.218 2.374 2.448 2.601 2.765 2.984 3.115 3.242 3.43 3.609 3.786 3.971 4.151 4.386 4.619 4.846 5.124 5.401 5.683 6.005 6.364 6.701 7.077 7.52 7.988 8.45 8.985 9.623 10.246 10.97 11.785 12.745 13.864 15.185 16.648 18.405 19.904 20.682 21.104 21.389 21.559 21.626 21.617 21.551 21.481 21.419 21.336 21.224 21.092 20.958 20.834 20.73 20.645 20.571 20.493 20.403 20.327 20.252 20.165 20.09 20.011 19.925 19.822 19.705 19.63 19.542 19.386 19.274 19.174 19.127 19.021 18.903 18.774 18.716 18.546 18.518 18.439 18.357 18.191 18.102 17.997 17.887 17.772 17.641 17.476 17.145 -4 ,23700 ,TETRA ,17590119,Sat Nov 27 19:35:42 CET,Sat Nov 27 21:25:44 CET,0.0 0.234 0.447 0.627 0.77 0.896 1.027 1.161 1.382 1.484 1.591 1.654 1.871 1.952 2.113 2.28 2.458 2.542 2.691 2.84 3.063 3.212 3.368 3.597 3.802 3.999 4.202 4.4 4.664 4.932 5.18 5.481 5.781 6.077 6.419 6.793 7.152 7.54 7.954 8.419 8.917 9.454 10.068 10.693 11.444 12.315 13.332 14.474 15.78 17.28 19.119 20.614 21.386 21.782 21.966 22.048 22.044 21.998 21.936 21.867 21.781 21.67 21.576 21.482 21.372 21.284 21.192 21.091 21.001 20.891 20.777 20.699 20.622 20.527 20.445 20.364 20.286 20.192 20.065 19.978 19.886 19.733 19.643 19.553 19.503 19.404 19.298 19.186 19.128 18.954 18.935 18.866 18.793 18.62 18.521 18.42 18.314 18.165 17.977 17.768 17.247 -5 ,19628 ,TETRA ,17590120,Sat Nov 27 19:35:44 CET,Sat Nov 27 21:25:42 CET,0.0 1.076 1.426 1.649 1.867 2.055 2.216 2.371 2.648 2.779 2.895 2.984 3.225 3.338 3.565 3.797 4.014 4.113 4.293 4.457 4.697 4.855 5.009 5.238 5.455 5.658 5.866 6.063 6.311 6.558 6.801 7.093 7.371 7.643 7.954 8.298 8.645 9.043 9.454 9.893 10.366 10.897 11.536 12.179 12.931 13.781 14.763 15.842 17.076 18.51 20.301 21.776 22.591 23.021 23.245 23.369 23.425 23.431 23.374 23.27 23.185 23.081 22.964 22.863 22.752 22.635 22.5 22.371 22.245 22.111 21.989 21.884 21.767 21.652 21.563 21.474 21.387 21.289 21.185 21.121 21.045 20.902 20.8 20.695 20.642 20.538 20.425 20.308 20.246 20.067 20.027 19.95 19.864 19.696 19.615 19.507 19.383 19.257 19.115 18.951 18.098 -6 ,11587 ,TETRA ,17590121,Sat Nov 27 19:35:42 CET,Sat Nov 27 21:25:06 CET,0.0 0.527 0.684 0.818 0.964 1.095 1.23 1.351 1.546 1.641 1.737 1.8 2.028 2.117 2.291 2.46 2.621 2.697 2.844 2.998 3.219 3.357 3.492 3.682 3.867 4.056 4.243 4.423 4.652 4.882 5.114 5.391 5.653 5.914 6.213 6.54 6.875 7.256 7.659 8.101 8.587 9.115 9.727 10.365 11.104 11.934 12.926 14.04 15.315 16.806 18.683 20.244 21.038 21.455 21.658 21.719 21.728 21.705 21.666 21.597 21.489 21.377 21.275 21.165 21.042 20.929 20.815 20.696 20.58 20.453 20.322 20.216 20.096 19.96 19.852 19.745 19.637 19.512 19.374 19.275 19.171 19.011 18.914 18.821 18.775 18.68 18.58 18.474 18.411 18.229 18.2 18.13 18.044 17.863 17.774 17.672 17.556 17.43 17.26 17.069 16.59 -7 ,23576 ,TETRA ,17590122,Sat Nov 27 19:35:42 CET,Sat Nov 27 21:25:07 CET,0.0 0.341 0.529 0.713 0.866 0.993 1.131 1.264 1.477 1.577 1.68 1.736 1.946 2.022 2.179 2.325 2.471 2.551 2.727 2.901 3.147 3.31 3.465 3.692 3.912 4.11 4.297 4.49 4.747 4.991 5.225 5.504 5.778 6.047 6.357 6.699 7.044 7.433 7.851 8.292 8.74 9.254 9.88 10.512 11.221 12.008 12.948 14.034 15.29 16.777 18.548 19.903 20.676 21.106 21.326 21.458 21.526 21.533 21.5 21.424 21.327 21.22 21.107 20.99 20.865 20.744 20.622 20.506 20.393 20.266 20.14 20.026 19.902 19.789 19.673 19.547 19.434 19.317 19.187 19.092 19.0 18.868 18.776 18.672 18.614 18.489 18.342 18.176 18.089 17.892 17.822 17.726 17.634 17.487 17.408 17.293 17.165 17.045 16.876 16.634 16.023 -8 ,20779 ,TETRA ,17590123,Sat Nov 27 19:35:42 CET,Sat Nov 27 21:26:58 CET,0.0 0.288 0.466 0.647 0.796 0.916 1.046 1.167 1.371 1.469 1.562 1.624 1.843 1.925 2.08 2.232 2.376 2.442 2.582 2.736 2.958 3.103 3.263 3.503 3.728 3.945 4.15 4.342 4.602 4.861 5.101 5.375 5.644 5.908 6.22 6.583 6.93 7.313 7.72 8.143 8.614 9.166 9.82 10.49 11.259 12.087 13.05 14.163 15.476 17.027 18.899 20.369 21.125 21.559 21.763 21.833 21.859 21.846 21.809 21.754 21.668 21.572 21.485 21.397 21.283 21.157 21.034 20.925 20.825 20.703 20.563 20.444 20.328 20.212 20.108 19.994 19.879 19.764 19.656 19.577 19.498 19.392 19.319 19.242 19.198 19.094 18.964 18.83 18.767 18.586 18.563 18.495 18.421 18.257 18.158 18.049 17.926 17.781 17.619 17.414 16.93 -9 ,4920 ,TETRA ,17590124,Sat Nov 27 19:36:42 CET,Sat Nov 27 21:27:39 CET,0.0 0.261 0.417 0.574 0.702 0.817 0.921 1.031 1.267 1.372 1.471 1.545 1.769 1.85 2.011 2.156 2.286 2.352 2.505 2.664 2.891 3.038 3.188 3.409 3.625 3.841 4.049 4.243 4.502 4.763 5.006 5.295 5.57 5.842 6.165 6.534 6.889 7.275 7.701 8.148 8.606 9.145 9.818 10.518 11.319 12.183 13.144 14.234 15.542 17.08 18.92 20.379 21.134 21.572 21.864 22.018 22.052 22.019 21.97 21.9 21.81 21.719 21.624 21.521 21.401 21.286 21.156 21.024 20.911 20.79 20.672 20.576 20.463 20.335 20.221 20.097 19.982 19.871 19.748 19.651 19.556 19.426 19.339 19.241 19.191 19.095 18.987 18.873 18.803 18.621 18.612 18.544 18.465 18.307 18.216 18.105 17.98 17.854 17.719 17.546 16.905 -10 ,20961 ,TETRA ,17590125,Sat Nov 27 19:35:42 CET,Sat Nov 27 21:25:20 CET,0.0 0.399 0.592 0.747 0.894 1.029 1.149 1.261 1.46 1.565 1.674 1.73 1.951 2.036 2.2 2.36 2.525 2.605 2.747 2.883 3.108 3.256 3.394 3.596 3.792 3.978 4.161 4.337 4.568 4.8 5.038 5.32 5.573 5.816 6.111 6.448 6.781 7.166 7.592 8.038 8.509 9.049 9.687 10.342 11.11 11.958 12.949 14.06 15.29 16.773 18.591 20.025 20.83 21.309 21.589 21.756 21.784 21.726 21.666 21.589 21.502 21.416 21.305 21.172 21.049 20.933 20.781 20.618 20.487 20.362 20.245 20.148 20.031 19.906 19.803 19.699 19.587 19.471 19.354 19.266 19.165 18.991 18.885 18.774 18.71 18.577 18.455 18.345 18.281 18.099 18.041 17.963 17.892 17.704 17.604 17.518 17.416 17.274 17.114 16.909 16.199 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt deleted file mode 100644 index 93cbd589..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8153 ,TETRA ,17590126,Sat Nov 27 19:35:44 CET,Sat Nov 27 21:25:58 CET,0.0 0.341 0.527 0.674 0.786 0.887 0.982 1.075 1.251 1.342 1.421 1.432 1.632 1.695 1.816 1.965 2.121 2.187 2.294 2.391 2.536 2.623 2.712 2.85 2.978 3.115 3.259 3.393 3.55 3.709 3.871 4.059 4.232 4.401 4.581 4.773 4.971 5.187 5.399 5.619 5.861 6.131 6.412 6.676 6.973 7.271 7.584 7.859 8.074 8.176 7.978 7.303 6.446 5.621 4.914 4.27 3.68 3.122 2.621 2.111 1.683 1.294 0.911 0.561 0.212 -0.106 -0.422 -0.718 -0.981 -1.247 -1.518 -1.751 -1.988 -2.231 -2.421 -2.623 -2.84 -3.062 -3.281 -3.43 -3.587 -3.846 -4.033 -4.236 -4.339 -4.534 -4.746 -4.986 -5.117 -5.388 -5.514 -5.662 -5.83 -6.175 -6.373 -6.598 -6.855 -7.154 -7.524 -8.006 -9.505 -2 ,1904 ,TETRA ,17590127,Sat Nov 27 19:35:44 CET,Sat Nov 27 21:26:03 CET,0.0 0.571 0.741 0.874 0.967 1.073 1.181 1.266 1.429 1.513 1.593 1.632 1.843 1.911 2.034 2.147 2.245 2.296 2.407 2.514 2.676 2.783 2.886 3.04 3.201 3.35 3.487 3.627 3.82 3.99 4.138 4.311 4.475 4.636 4.825 5.037 5.238 5.46 5.69 5.921 6.17 6.443 6.748 7.026 7.314 7.603 7.88 8.146 8.359 8.409 8.147 7.427 6.621 5.852 5.18 4.559 3.971 3.439 2.971 2.485 2.07 1.712 1.353 0.999 0.679 0.384 0.06 -0.233 -0.482 -0.739 -1.002 -1.242 -1.5 -1.751 -1.939 -2.145 -2.364 -2.59 -2.831 -2.998 -3.172 -3.423 -3.597 -3.781 -3.884 -4.118 -4.339 -4.572 -4.692 -4.955 -5.109 -5.266 -5.42 -5.757 -5.947 -6.151 -6.369 -6.603 -6.873 -7.246 -8.394 -3 ,28919 ,TETRA ,17590128,Sat Nov 27 19:35:44 CET,Sat Nov 27 21:22:20 CET,0.0 0.371 0.527 0.674 0.816 0.94 1.056 1.164 1.385 1.493 1.586 1.624 1.839 1.925 2.085 2.244 2.395 2.469 2.613 2.747 2.932 3.052 3.16 3.304 3.454 3.596 3.732 3.87 4.04 4.197 4.347 4.532 4.698 4.858 5.046 5.252 5.446 5.657 5.868 6.09 6.332 6.572 6.831 7.073 7.322 7.581 7.826 8.03 8.188 8.227 7.954 7.222 6.417 5.669 5.006 4.382 3.801 3.264 2.765 2.246 1.822 1.444 1.069 0.719 0.392 0.088 -0.231 -0.51 -0.743 -0.988 -1.258 -1.494 -1.738 -1.983 -2.164 -2.366 -2.592 -2.823 -3.086 -3.261 -3.433 -3.709 -3.907 -4.124 -4.241 -4.475 -4.707 -4.933 -5.051 -5.314 -5.459 -5.618 -5.783 -6.154 -6.341 -6.538 -6.755 -7.002 -7.268 -7.615 -9.182 -4 ,4336 ,TETRA ,17590129,Sat Nov 27 19:35:44 CET,Sat Nov 27 21:26:42 CET,0.0 0.368 0.538 0.688 0.802 0.898 0.996 1.091 1.255 1.335 1.419 1.444 1.647 1.719 1.854 1.97 2.076 2.123 2.225 2.333 2.482 2.575 2.668 2.79 2.896 3.004 3.109 3.217 3.358 3.483 3.615 3.784 3.933 4.073 4.238 4.429 4.622 4.829 5.039 5.266 5.5 5.754 6.051 6.338 6.623 6.891 7.16 7.381 7.534 7.534 7.221 6.479 5.65 4.92 4.269 3.584 2.96 2.42 1.93 1.436 1.019 0.644 0.274 -0.083 -0.4 -0.687 -1.018 -1.311 -1.561 -1.837 -2.128 -2.364 -2.603 -2.853 -3.055 -3.268 -3.478 -3.689 -3.92 -4.076 -4.228 -4.474 -4.644 -4.815 -4.902 -5.084 -5.281 -5.479 -5.586 -5.849 -5.957 -6.079 -6.21 -6.527 -6.723 -6.939 -7.146 -7.356 -7.627 -7.968 -9.454 -5 ,12782 ,TETRA ,17590130,Sat Nov 27 19:35:44 CET,Sat Nov 27 21:26:02 CET,0.0 0.212 0.393 0.554 0.697 0.825 0.923 1.025 1.229 1.313 1.388 1.405 1.611 1.679 1.816 1.969 2.111 2.182 2.321 2.445 2.619 2.731 2.844 3.01 3.165 3.309 3.449 3.58 3.732 3.884 4.034 4.202 4.367 4.529 4.719 4.939 5.143 5.36 5.583 5.804 6.017 6.239 6.499 6.757 7.039 7.323 7.575 7.779 7.938 7.965 7.661 6.973 6.215 5.437 4.695 4.005 3.438 2.921 2.469 2.009 1.592 1.217 0.858 0.523 0.197 -0.103 -0.421 -0.721 -0.972 -1.242 -1.527 -1.748 -1.964 -2.178 -2.341 -2.523 -2.728 -2.945 -3.164 -3.312 -3.46 -3.682 -3.842 -4.014 -4.098 -4.282 -4.484 -4.689 -4.796 -5.041 -5.152 -5.289 -5.42 -5.73 -5.887 -6.027 -6.207 -6.444 -6.726 -7.091 -8.518 -6 ,4417 ,TETRA ,17590131,Sat Nov 27 19:36:42 CET,Sat Nov 27 21:29:14 CET,0.0 0.295 0.47 0.617 0.751 0.863 0.973 1.065 1.223 1.31 1.41 1.498 1.726 1.821 2.001 2.166 2.305 2.364 2.485 2.613 2.797 2.917 3.031 3.196 3.362 3.517 3.66 3.799 3.973 4.133 4.287 4.463 4.628 4.793 5.004 5.229 5.421 5.634 5.868 6.106 6.324 6.539 6.775 7.017 7.288 7.562 7.839 8.104 8.287 8.307 8.007 7.343 6.589 5.857 5.149 4.485 3.907 3.354 2.876 2.403 1.995 1.625 1.262 0.913 0.588 0.283 -0.044 -0.325 -0.578 -0.847 -1.115 -1.327 -1.556 -1.799 -1.996 -2.203 -2.411 -2.625 -2.845 -3.007 -3.177 -3.427 -3.6 -3.793 -3.893 -4.082 -4.281 -4.472 -4.568 -4.813 -4.902 -5.04 -5.185 -5.463 -5.626 -5.805 -5.988 -6.205 -6.485 -6.799 -8.554 -7 ,22292 ,TETRA ,17590132,Sat Nov 27 19:36:42 CET,Sat Nov 27 21:22:42 CET,0.0 0.592 0.881 1.137 1.352 1.523 1.659 1.776 2.0 2.102 2.206 2.269 2.485 2.572 2.753 2.931 3.102 3.182 3.325 3.464 3.662 3.78 3.881 4.033 4.196 4.351 4.495 4.627 4.786 4.938 5.078 5.242 5.409 5.583 5.779 5.988 6.187 6.398 6.626 6.848 7.087 7.368 7.66 7.923 8.186 8.436 8.705 8.941 9.103 9.135 8.813 8.06 7.198 6.355 5.605 4.922 4.289 3.704 3.205 2.702 2.25 1.837 1.457 1.125 0.826 0.539 0.229 -0.038 -0.252 -0.471 -0.707 -0.921 -1.161 -1.395 -1.555 -1.721 -1.901 -2.089 -2.296 -2.452 -2.618 -2.855 -3.013 -3.184 -3.271 -3.446 -3.632 -3.86 -3.985 -4.245 -4.35 -4.473 -4.601 -4.889 -5.052 -5.229 -5.427 -5.653 -5.931 -6.265 -7.588 -8 ,30316 ,TETRA ,17590133,Sat Nov 27 19:36:42 CET,Sat Nov 27 21:27:31 CET,0.0 0.596 0.776 0.95 1.082 1.194 1.316 1.423 1.598 1.683 1.761 1.756 1.95 2.022 2.17 2.305 2.436 2.505 2.64 2.771 2.965 3.082 3.183 3.333 3.495 3.652 3.787 3.905 4.059 4.213 4.357 4.528 4.704 4.881 5.072 5.28 5.469 5.653 5.869 6.1 6.31 6.55 6.829 7.084 7.363 7.656 7.951 8.204 8.429 8.49 8.158 7.437 6.667 5.934 5.241 4.568 3.955 3.38 2.889 2.404 1.959 1.555 1.178 0.842 0.553 0.268 -0.071 -0.371 -0.617 -0.882 -1.169 -1.418 -1.681 -1.945 -2.14 -2.336 -2.543 -2.758 -2.972 -3.121 -3.282 -3.551 -3.737 -3.938 -4.041 -4.258 -4.485 -4.699 -4.806 -5.069 -5.234 -5.395 -5.553 -5.872 -6.047 -6.261 -6.515 -6.81 -7.17 -7.596 -9.524 -9 ,16041 ,TETRA ,17590134,Sat Nov 27 19:36:44 CET,Sat Nov 27 21:27:10 CET,0.0 0.5 0.635 0.736 0.828 0.927 1.02 1.114 1.283 1.364 1.451 1.489 1.696 1.766 1.899 2.017 2.144 2.208 2.315 2.424 2.588 2.693 2.794 2.934 3.075 3.207 3.336 3.462 3.623 3.781 3.938 4.133 4.332 4.517 4.718 4.941 5.142 5.343 5.552 5.784 6.026 6.274 6.543 6.81 7.083 7.355 7.649 7.911 8.122 8.179 7.846 7.1 6.244 5.446 4.709 4.022 3.427 2.858 2.361 1.882 1.451 1.065 0.707 0.34 0.015 -0.281 -0.609 -0.888 -1.13 -1.39 -1.662 -1.894 -2.147 -2.406 -2.606 -2.815 -3.029 -3.251 -3.485 -3.641 -3.793 -4.043 -4.222 -4.408 -4.509 -4.718 -4.935 -5.185 -5.308 -5.575 -5.722 -5.875 -6.025 -6.349 -6.557 -6.78 -7.022 -7.313 -7.653 -8.07 -9.523 -10 ,1145 ,TETRA ,17590135,Sat Nov 27 19:36:43 CET,Sat Nov 27 21:28:12 CET,0.0 0.633 0.834 1.012 1.136 1.248 1.361 1.473 1.663 1.751 1.833 1.863 2.069 2.145 2.28 2.412 2.536 2.597 2.733 2.856 2.997 3.077 3.157 3.279 3.391 3.5 3.611 3.717 3.855 4.013 4.175 4.362 4.534 4.713 4.919 5.131 5.318 5.526 5.773 6.011 6.239 6.475 6.729 6.984 7.251 7.485 7.712 7.958 8.141 8.138 7.834 7.078 6.231 5.495 4.83 4.166 3.579 3.066 2.593 2.089 1.669 1.269 0.889 0.561 0.249 -0.06 -0.39 -0.683 -0.947 -1.204 -1.447 -1.664 -1.906 -2.166 -2.367 -2.561 -2.749 -2.938 -3.138 -3.288 -3.45 -3.703 -3.859 -4.011 -4.104 -4.305 -4.501 -4.71 -4.83 -5.087 -5.164 -5.285 -5.414 -5.689 -5.854 -6.055 -6.293 -6.536 -6.812 -7.175 -8.736 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 04c62de3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1946 ,TETRA ,17590136,Sat Nov 27 19:36:44 CET,Sat Nov 27 21:28:07 CET,0.0 0.239 0.421 0.567 0.684 0.798 0.908 0.992 1.151 1.223 1.295 1.306 1.505 1.579 1.732 1.882 2.022 2.092 2.23 2.358 2.54 2.651 2.763 2.939 3.112 3.265 3.402 3.545 3.726 3.892 4.046 4.227 4.416 4.604 4.808 5.027 5.241 5.488 5.744 6.01 6.288 6.614 7.001 7.343 7.735 8.182 8.631 9.051 9.514 9.988 10.327 10.253 9.966 9.641 9.236 8.826 8.481 8.164 7.865 7.516 7.201 6.935 6.671 6.413 6.175 5.955 5.73 5.534 5.354 5.143 4.9 4.707 4.514 4.309 4.149 3.982 3.816 3.635 3.433 3.29 3.146 2.928 2.768 2.605 2.524 2.339 2.134 1.911 1.802 1.571 1.481 1.358 1.225 0.971 0.825 0.614 0.357 0.078 -0.258 -0.677 -2.045 -2 ,11836 ,TETRA ,17590137,Sat Nov 27 19:36:44 CET,Sat Nov 27 21:30:25 CET,0.0 0.281 0.412 0.531 0.643 0.748 0.848 0.946 1.165 1.279 1.388 1.449 1.664 1.743 1.909 2.072 2.208 2.277 2.416 2.553 2.746 2.859 2.972 3.138 3.286 3.427 3.566 3.702 3.875 4.038 4.207 4.418 4.624 4.825 5.065 5.333 5.567 5.819 6.098 6.399 6.718 7.054 7.418 7.77 8.165 8.587 9.015 9.438 9.912 10.403 10.718 10.62 10.365 10.031 9.663 9.286 8.932 8.606 8.307 7.99 7.716 7.457 7.208 6.967 6.73 6.521 6.285 6.044 5.849 5.646 5.416 5.228 5.03 4.823 4.668 4.514 4.359 4.199 4.04 3.93 3.806 3.613 3.479 3.333 3.263 3.132 2.974 2.808 2.731 2.517 2.445 2.33 2.226 2.006 1.886 1.756 1.584 1.367 1.159 0.869 -0.387 -3 ,11960 ,TETRA ,17590138,Sat Nov 27 19:36:44 CET,Sat Nov 27 21:28:12 CET,0.0 0.326 0.481 0.626 0.751 0.844 0.932 1.016 1.177 1.254 1.324 1.327 1.533 1.62 1.786 1.934 2.065 2.128 2.25 2.364 2.527 2.637 2.745 2.91 3.073 3.223 3.361 3.497 3.681 3.855 4.01 4.22 4.433 4.606 4.8 5.024 5.239 5.472 5.737 6.036 6.348 6.678 7.039 7.39 7.768 8.174 8.625 9.096 9.592 10.06 10.415 10.384 10.062 9.663 9.286 8.95 8.631 8.292 7.961 7.623 7.339 7.079 6.817 6.564 6.326 6.106 5.856 5.629 5.44 5.24 5.033 4.865 4.685 4.475 4.316 4.158 3.983 3.796 3.592 3.455 3.322 3.125 3.001 2.883 2.817 2.653 2.487 2.332 2.25 2.03 1.961 1.855 1.739 1.517 1.398 1.254 1.079 0.86 0.58 0.225 -1.189 -4 ,27974 ,TETRA ,17590139,Sat Nov 27 19:36:46 CET,Sat Nov 27 21:28:00 CET,0.0 0.229 0.356 0.458 0.562 0.662 0.758 0.853 1.028 1.104 1.187 1.241 1.455 1.527 1.657 1.771 1.877 1.928 2.044 2.168 2.34 2.447 2.544 2.682 2.813 2.938 3.072 3.201 3.35 3.5 3.644 3.814 4.005 4.188 4.395 4.638 4.854 5.087 5.357 5.646 5.926 6.222 6.551 6.886 7.262 7.672 8.149 8.611 9.076 9.544 9.909 9.919 9.701 9.356 8.989 8.623 8.257 7.876 7.527 7.18 6.886 6.63 6.366 6.113 5.875 5.656 5.432 5.227 5.044 4.853 4.656 4.484 4.295 4.114 3.989 3.852 3.703 3.547 3.375 3.256 3.135 2.948 2.821 2.678 2.609 2.465 2.31 2.145 2.056 1.835 1.779 1.677 1.565 1.346 1.203 1.036 0.889 0.746 0.543 0.253 -1.297 -5 ,13049 ,TETRA ,17590140,Sat Nov 27 19:36:44 CET,Sat Nov 27 21:27:18 CET,0.0 0.354 0.491 0.603 0.717 0.821 0.915 1.002 1.17 1.249 1.33 1.341 1.525 1.582 1.704 1.825 1.945 2.002 2.108 2.207 2.345 2.435 2.527 2.663 2.799 2.936 3.065 3.187 3.335 3.473 3.611 3.787 3.97 4.157 4.381 4.618 4.829 5.055 5.301 5.558 5.833 6.148 6.512 6.882 7.286 7.698 8.142 8.586 9.07 9.568 9.869 9.75 9.42 9.037 8.624 8.225 7.851 7.484 7.153 6.814 6.517 6.223 5.942 5.682 5.435 5.213 4.981 4.757 4.561 4.37 4.163 3.983 3.791 3.585 3.43 3.281 3.12 2.937 2.738 2.604 2.455 2.211 2.042 1.861 1.774 1.6 1.391 1.177 1.066 0.82 0.716 0.586 0.437 0.086 -0.093 -0.273 -0.486 -0.728 -1.052 -1.442 -3.05 -6 ,14099 ,TETRA ,17590141,Sat Nov 27 19:36:44 CET,Sat Nov 27 21:27:16 CET,0.0 0.203 0.34 0.472 0.58 0.674 0.758 0.835 0.999 1.077 1.153 1.169 1.37 1.443 1.583 1.721 1.865 1.933 2.059 2.185 2.367 2.493 2.615 2.773 2.928 3.09 3.24 3.386 3.593 3.777 3.943 4.135 4.311 4.496 4.712 4.931 5.142 5.381 5.627 5.879 6.144 6.449 6.812 7.174 7.584 8.01 8.454 8.94 9.442 9.909 10.227 10.134 9.86 9.472 9.059 8.657 8.256 7.882 7.547 7.207 6.922 6.662 6.406 6.141 5.882 5.659 5.43 5.209 5.021 4.834 4.628 4.448 4.273 4.089 3.937 3.772 3.6 3.411 3.208 3.07 2.93 2.733 2.587 2.434 2.366 2.218 2.056 1.892 1.798 1.566 1.497 1.396 1.285 1.041 0.901 0.739 0.584 0.382 0.104 -0.203 -1.705 -7 ,1082 ,TETRA ,17590142,Sat Nov 27 19:36:44 CET,Sat Nov 27 21:27:13 CET,0.0 0.256 0.379 0.482 0.575 0.667 0.757 0.838 0.998 1.08 1.155 1.172 1.372 1.435 1.568 1.707 1.839 1.902 2.019 2.133 2.302 2.414 2.532 2.704 2.871 3.033 3.185 3.335 3.522 3.682 3.835 4.022 4.202 4.377 4.598 4.87 5.106 5.34 5.588 5.845 6.119 6.427 6.772 7.117 7.506 7.923 8.409 8.914 9.388 9.826 10.122 10.054 9.808 9.472 9.092 8.741 8.423 8.096 7.774 7.43 7.133 6.862 6.59 6.339 6.104 5.878 5.64 5.418 5.226 5.013 4.788 4.614 4.418 4.214 4.057 3.897 3.723 3.535 3.345 3.218 3.09 2.886 2.736 2.579 2.504 2.354 2.201 2.05 1.965 1.741 1.691 1.593 1.47 1.192 1.041 0.886 0.705 0.505 0.288 0.015 -1.707 -8 ,9046 ,TETRA ,17590143,Sat Nov 27 19:36:46 CET,Sat Nov 27 21:28:09 CET,0.0 0.282 0.448 0.578 0.688 0.793 0.886 0.974 1.141 1.212 1.291 1.326 1.529 1.6 1.74 1.86 1.975 2.034 2.144 2.241 2.37 2.461 2.561 2.695 2.814 2.935 3.062 3.191 3.349 3.497 3.642 3.825 4.001 4.161 4.347 4.56 4.753 4.955 5.188 5.445 5.716 6.006 6.332 6.657 7.035 7.453 7.916 8.389 8.88 9.366 9.682 9.627 9.366 9.021 8.607 8.214 7.87 7.539 7.242 6.933 6.632 6.332 6.058 5.798 5.549 5.324 5.07 4.844 4.657 4.456 4.249 4.079 3.895 3.698 3.546 3.393 3.229 3.044 2.855 2.733 2.603 2.386 2.233 2.069 1.98 1.805 1.63 1.44 1.348 1.117 0.991 0.857 0.722 0.397 0.2 0.0 -0.186 -0.414 -0.729 -1.117 -2.414 -9 ,31477 ,TETRA ,17590144,Sat Nov 27 19:36:49 CET,Sat Nov 27 21:27:49 CET,0.0 0.243 0.399 0.523 0.628 0.717 0.8 0.885 1.034 1.106 1.193 1.232 1.434 1.501 1.629 1.74 1.861 1.929 2.048 2.161 2.337 2.45 2.561 2.728 2.893 3.044 3.183 3.321 3.491 3.657 3.817 4.025 4.247 4.449 4.671 4.916 5.153 5.402 5.659 5.937 6.222 6.541 6.909 7.249 7.623 8.027 8.444 8.88 9.352 9.826 10.152 10.051 9.73 9.333 8.944 8.573 8.223 7.882 7.543 7.185 6.888 6.627 6.368 6.113 5.859 5.622 5.384 5.172 4.987 4.777 4.552 4.369 4.172 3.967 3.809 3.651 3.491 3.318 3.135 3.01 2.882 2.697 2.565 2.4 2.308 2.136 1.952 1.745 1.644 1.42 1.302 1.163 1.028 0.732 0.574 0.422 0.266 0.079 -0.146 -0.406 -1.654 -10 ,31734 ,TETRA ,17590145,Sat Nov 27 19:36:44 CET,Sat Nov 27 21:27:11 CET,0.0 0.198 0.356 0.486 0.591 0.692 0.792 0.892 1.085 1.172 1.249 1.254 1.457 1.526 1.655 1.785 1.906 1.964 2.083 2.193 2.356 2.457 2.541 2.663 2.793 2.928 3.06 3.186 3.35 3.515 3.671 3.86 4.036 4.195 4.37 4.574 4.784 5.003 5.232 5.484 5.756 6.048 6.38 6.742 7.156 7.589 8.08 8.581 9.048 9.481 9.786 9.663 9.334 8.975 8.598 8.206 7.846 7.518 7.188 6.846 6.56 6.292 6.034 5.785 5.552 5.345 5.128 4.939 4.779 4.607 4.422 4.263 4.086 3.914 3.786 3.651 3.495 3.313 3.138 3.021 2.894 2.703 2.569 2.42 2.344 2.196 2.05 1.894 1.815 1.604 1.544 1.43 1.313 1.05 0.901 0.729 0.556 0.346 0.074 -0.264 -1.837 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt deleted file mode 100644 index fd1a43c6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14932 ,TETRA ,17590146,Sat Nov 27 19:36:46 CET,Sat Nov 27 21:27:20 CET,0.0 0.388 0.553 0.663 0.78 0.894 0.986 1.07 1.251 1.326 1.387 1.385 1.566 1.624 1.721 1.818 1.923 1.975 2.076 2.18 2.329 2.413 2.492 2.615 2.726 2.828 2.927 3.019 3.142 3.247 3.346 3.47 3.574 3.675 3.78 3.89 3.985 4.08 4.189 4.29 4.375 4.456 4.532 4.581 4.598 4.568 4.47 4.26 3.865 3.155 1.795 0.133 -1.302 -2.593 -3.679 -4.629 -5.471 -6.235 -6.88 -7.519 -8.082 -8.576 -9.023 -9.439 -9.84 -10.19 -10.538 -10.837 -11.091 -11.363 -11.637 -11.861 -12.086 -12.314 -12.494 -12.679 -12.882 -13.088 -13.29 -13.434 -13.574 -13.777 -13.92 -14.075 -14.16 -14.335 -14.51 -14.683 -14.772 -15.004 -15.069 -15.168 -15.277 -15.536 -15.668 -15.792 -15.923 -16.097 -16.309 -16.557 -17.091 -2 ,9690 ,TETRA ,17590147,Sat Nov 27 19:36:45 CET,Sat Nov 27 21:27:27 CET,0.0 0.49 0.718 0.9 1.071 1.202 1.329 1.451 1.645 1.735 1.812 1.842 2.038 2.116 2.248 2.375 2.495 2.552 2.657 2.747 2.881 2.959 3.03 3.149 3.263 3.361 3.445 3.521 3.62 3.714 3.808 3.92 4.024 4.127 4.241 4.358 4.469 4.582 4.694 4.788 4.854 4.922 4.999 5.066 5.094 5.062 4.942 4.726 4.32 3.606 2.292 0.55 -0.912 -2.211 -3.342 -4.312 -5.185 -5.968 -6.63 -7.275 -7.811 -8.302 -8.764 -9.186 -9.584 -9.948 -10.321 -10.649 -10.931 -11.221 -11.506 -11.733 -11.965 -12.198 -12.378 -12.57 -12.767 -12.963 -13.165 -13.305 -13.45 -13.672 -13.819 -13.976 -14.064 -14.24 -14.404 -14.581 -14.68 -14.915 -14.969 -15.065 -15.165 -15.388 -15.511 -15.649 -15.807 -15.969 -16.138 -16.369 -16.995 -3 ,12992 ,TETRA ,17590148,Sat Nov 27 19:36:46 CET,Sat Nov 27 21:27:24 CET,0.0 0.669 0.931 1.152 1.329 1.48 1.622 1.74 1.933 2.019 2.106 2.146 2.331 2.404 2.539 2.657 2.771 2.826 2.928 3.025 3.175 3.267 3.347 3.458 3.568 3.682 3.784 3.877 3.992 4.096 4.188 4.296 4.397 4.489 4.595 4.702 4.801 4.904 4.994 5.086 5.198 5.304 5.376 5.421 5.46 5.475 5.421 5.242 4.87 4.233 3.034 1.357 -0.108 -1.404 -2.533 -3.459 -4.256 -5.012 -5.661 -6.294 -6.835 -7.333 -7.803 -8.241 -8.638 -8.974 -9.315 -9.618 -9.888 -10.156 -10.419 -10.641 -10.88 -11.128 -11.315 -11.509 -11.705 -11.901 -12.106 -12.253 -12.406 -12.639 -12.793 -12.936 -13.012 -13.188 -13.372 -13.543 -13.628 -13.853 -13.905 -14.011 -14.12 -14.345 -14.463 -14.588 -14.745 -14.932 -15.151 -15.391 -15.91 -4 ,22917 ,TETRA ,17590149,Sat Nov 27 19:36:46 CET,Sat Nov 27 21:27:22 CET,0.0 0.782 1.063 1.257 1.42 1.57 1.698 1.803 2.002 2.09 2.18 2.242 2.434 2.499 2.638 2.78 2.897 2.949 3.047 3.142 3.282 3.371 3.461 3.58 3.691 3.794 3.884 3.98 4.1 4.206 4.304 4.416 4.516 4.61 4.719 4.834 4.946 5.055 5.162 5.267 5.349 5.417 5.474 5.506 5.516 5.5 5.405 5.198 4.839 4.156 2.832 1.142 -0.332 -1.617 -2.717 -3.72 -4.607 -5.381 -6.027 -6.679 -7.221 -7.705 -8.165 -8.593 -8.988 -9.34 -9.706 -10.041 -10.329 -10.613 -10.899 -11.14 -11.395 -11.648 -11.851 -12.06 -12.266 -12.486 -12.714 -12.871 -13.036 -13.293 -13.469 -13.647 -13.742 -13.935 -14.132 -14.338 -14.444 -14.685 -14.799 -14.937 -15.076 -15.366 -15.523 -15.689 -15.861 -16.033 -16.208 -16.404 -16.827 -5 ,4908 ,TETRA ,17590150,Sat Nov 27 19:36:46 CET,Sat Nov 27 21:27:12 CET,0.0 0.286 0.454 0.603 0.724 0.823 0.912 0.997 1.152 1.221 1.289 1.306 1.482 1.532 1.629 1.717 1.81 1.86 1.954 2.045 2.193 2.276 2.35 2.464 2.585 2.692 2.792 2.884 2.985 3.083 3.183 3.303 3.409 3.504 3.606 3.712 3.793 3.864 3.957 4.054 4.136 4.236 4.349 4.425 4.467 4.464 4.377 4.168 3.769 3.037 1.763 0.106 -1.389 -2.66 -3.768 -4.753 -5.588 -6.33 -6.944 -7.538 -8.06 -8.542 -9.0 -9.432 -9.82 -10.17 -10.537 -10.855 -11.141 -11.44 -11.735 -11.978 -12.237 -12.511 -12.722 -12.94 -13.17 -13.409 -13.644 -13.799 -13.957 -14.206 -14.385 -14.552 -14.63 -14.79 -14.956 -15.129 -15.217 -15.449 -15.525 -15.642 -15.772 -16.017 -16.126 -16.247 -16.378 -16.543 -16.75 -16.98 -17.635 -6 ,23740 ,TETRA ,17590151,Sat Nov 27 19:36:48 CET,Sat Nov 27 21:27:43 CET,0.0 0.277 0.448 0.587 0.703 0.789 0.882 0.972 1.104 1.177 1.248 1.253 1.423 1.469 1.56 1.652 1.745 1.785 1.864 1.941 2.037 2.102 2.166 2.256 2.341 2.426 2.505 2.581 2.693 2.806 2.909 3.024 3.131 3.225 3.33 3.431 3.515 3.619 3.732 3.834 3.914 3.989 4.048 4.081 4.093 4.066 3.986 3.787 3.389 2.687 1.406 -0.301 -1.779 -3.015 -4.112 -5.092 -5.903 -6.631 -7.256 -7.865 -8.388 -8.843 -9.281 -9.716 -10.118 -10.471 -10.829 -11.153 -11.446 -11.746 -12.043 -12.283 -12.541 -12.813 -13.015 -13.231 -13.462 -13.673 -13.885 -14.041 -14.199 -14.433 -14.589 -14.734 -14.807 -14.967 -15.126 -15.297 -15.386 -15.612 -15.656 -15.751 -15.849 -16.061 -16.193 -16.327 -16.461 -16.608 -16.771 -16.966 -17.553 -7 ,29073 ,TETRA ,17590152,Sat Nov 27 19:37:42 CET,Sat Nov 27 21:30:15 CET,0.0 0.287 0.43 0.571 0.68 0.784 0.884 0.968 1.125 1.192 1.258 1.298 1.492 1.563 1.698 1.826 1.953 2.014 2.121 2.226 2.37 2.463 2.551 2.659 2.758 2.851 2.938 3.019 3.12 3.217 3.312 3.412 3.498 3.586 3.688 3.797 3.89 3.983 4.082 4.174 4.279 4.364 4.427 4.472 4.466 4.427 4.328 4.143 3.8 3.145 1.791 0.033 -1.411 -2.652 -3.712 -4.67 -5.514 -6.286 -6.946 -7.58 -8.112 -8.589 -9.056 -9.47 -9.836 -10.192 -10.557 -10.88 -11.169 -11.47 -11.774 -12.017 -12.279 -12.545 -12.74 -12.949 -13.175 -13.411 -13.646 -13.801 -13.963 -14.212 -14.377 -14.55 -14.639 -14.818 -15.003 -15.184 -15.277 -15.511 -15.575 -15.675 -15.771 -15.974 -16.092 -16.227 -16.382 -16.556 -16.74 -16.976 -17.59 -8 ,14784 ,TETRA ,17590153,Sat Nov 27 19:37:42 CET,Sat Nov 27 21:29:14 CET,0.0 0.255 0.399 0.546 0.677 0.768 0.846 0.918 1.049 1.116 1.18 1.19 1.371 1.438 1.571 1.69 1.792 1.842 1.943 2.04 2.179 2.268 2.346 2.448 2.554 2.671 2.775 2.866 2.987 3.092 3.189 3.295 3.394 3.498 3.612 3.729 3.832 3.923 4.027 4.129 4.215 4.312 4.39 4.429 4.445 4.452 4.41 4.247 3.922 3.296 2.021 0.253 -1.213 -2.411 -3.471 -4.442 -5.286 -6.045 -6.671 -7.294 -7.845 -8.328 -8.78 -9.204 -9.615 -10.0 -10.375 -10.697 -10.973 -11.251 -11.54 -11.778 -12.014 -12.253 -12.444 -12.644 -12.854 -13.066 -13.28 -13.419 -13.551 -13.75 -13.9 -14.06 -14.14 -14.302 -14.483 -14.67 -14.76 -14.993 -15.061 -15.165 -15.277 -15.535 -15.673 -15.816 -15.993 -16.221 -16.452 -16.678 -17.34 -9 ,23932 ,TETRA ,17590154,Sat Nov 27 19:37:43 CET,Sat Nov 27 21:32:10 CET,0.0 0.767 0.985 1.13 1.241 1.341 1.442 1.527 1.68 1.761 1.836 1.866 2.062 2.146 2.286 2.4 2.502 2.552 2.659 2.753 2.879 2.962 3.039 3.152 3.266 3.373 3.468 3.556 3.662 3.763 3.862 3.968 4.054 4.134 4.247 4.365 4.461 4.561 4.663 4.781 4.883 4.971 5.067 5.158 5.218 5.21 5.123 4.921 4.514 3.86 2.684 1.161 -0.199 -1.445 -2.525 -3.476 -4.304 -5.063 -5.71 -6.342 -6.883 -7.36 -7.817 -8.236 -8.611 -8.952 -9.315 -9.629 -9.9 -10.197 -10.5 -10.744 -10.992 -11.241 -11.436 -11.646 -11.869 -12.104 -12.339 -12.494 -12.659 -12.916 -13.093 -13.268 -13.358 -13.56 -13.777 -14.003 -14.117 -14.366 -14.467 -14.589 -14.711 -15.026 -15.209 -15.378 -15.588 -15.818 -16.024 -16.25 -16.635 -10 ,28596 ,TETRA ,17590155,Sat Nov 27 19:38:42 CET,Sat Nov 27 21:30:23 CET,0.0 0.325 0.444 0.562 0.656 0.749 0.839 0.926 1.073 1.141 1.206 1.2 1.37 1.42 1.516 1.601 1.686 1.724 1.799 1.885 2.013 2.088 2.15 2.228 2.303 2.375 2.449 2.521 2.614 2.708 2.8 2.921 3.028 3.114 3.2 3.297 3.392 3.492 3.585 3.67 3.752 3.836 3.914 3.954 3.966 3.961 3.902 3.737 3.351 2.597 1.217 -0.469 -1.908 -3.158 -4.227 -5.213 -6.08 -6.832 -7.441 -8.064 -8.616 -9.097 -9.554 -9.976 -10.343 -10.688 -11.065 -11.396 -11.683 -11.965 -12.256 -12.507 -12.764 -13.022 -13.211 -13.413 -13.636 -13.855 -14.091 -14.257 -14.432 -14.714 -14.898 -15.078 -15.167 -15.358 -15.574 -15.797 -15.901 -16.143 -16.255 -16.382 -16.508 -16.781 -16.914 -17.034 -17.175 -17.344 -17.541 -17.767 -18.23 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index aec3b4bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27737 ,TETRA ,17590156,Sat Nov 27 19:37:42 CET,Sat Nov 27 21:29:08 CET,0.0 0.291 0.48 0.61 0.734 0.849 0.951 1.057 1.266 1.365 1.462 1.506 1.726 1.817 1.98 2.133 2.286 2.364 2.523 2.669 2.878 3.014 3.142 3.327 3.511 3.698 3.873 4.031 4.245 4.457 4.663 4.922 5.177 5.42 5.706 6.037 6.346 6.677 7.046 7.441 7.854 8.337 8.934 9.54 10.232 10.998 11.875 12.884 14.023 15.32 16.804 17.844 18.263 18.361 18.358 18.297 18.164 18.001 17.861 17.679 17.484 17.292 17.093 16.896 16.688 16.491 16.28 16.078 15.913 15.75 15.561 15.401 15.242 15.08 14.943 14.784 14.624 14.458 14.282 14.166 14.05 13.872 13.741 13.608 13.542 13.378 13.193 13.005 12.904 12.689 12.584 12.459 12.339 12.067 11.902 11.704 11.491 11.283 11.032 10.62 9.442 -2 ,30210 ,TETRA ,17590157,Sat Nov 27 19:37:42 CET,Sat Nov 27 21:30:01 CET,0.0 0.229 0.406 0.567 0.715 0.837 0.947 1.085 1.361 1.476 1.583 1.659 1.896 1.999 2.197 2.389 2.575 2.664 2.834 2.992 3.22 3.362 3.5 3.713 3.906 4.096 4.291 4.481 4.732 4.975 5.207 5.488 5.761 6.027 6.322 6.649 6.979 7.351 7.75 8.165 8.598 9.102 9.699 10.301 11.004 11.765 12.643 13.651 14.793 16.109 17.657 18.782 19.233 19.402 19.449 19.381 19.252 19.073 18.883 18.679 18.482 18.283 18.096 17.915 17.729 17.557 17.38 17.22 17.077 16.922 16.751 16.601 16.446 16.283 16.147 15.999 15.844 15.685 15.532 15.421 15.297 15.102 14.97 14.83 14.755 14.605 14.44 14.264 14.178 13.972 13.894 13.776 13.652 13.357 13.193 13.038 12.884 12.701 12.467 12.127 11.106 -3 ,24572 ,TETRA ,17590158,Sat Nov 27 19:37:42 CET,Sat Nov 27 21:29:00 CET,0.0 0.314 0.5 0.65 0.762 0.867 0.987 1.096 1.295 1.396 1.49 1.538 1.768 1.866 2.048 2.215 2.389 2.481 2.641 2.786 3.016 3.176 3.325 3.525 3.726 3.931 4.128 4.319 4.567 4.795 5.015 5.297 5.574 5.842 6.154 6.497 6.817 7.178 7.59 8.027 8.482 8.977 9.549 10.131 10.812 11.598 12.504 13.485 14.588 15.847 17.386 18.52 18.998 19.178 19.196 19.159 19.064 18.918 18.736 18.513 18.313 18.109 17.891 17.695 17.515 17.337 17.132 16.926 16.747 16.57 16.378 16.214 16.034 15.837 15.688 15.525 15.355 15.178 14.994 14.874 14.75 14.555 14.422 14.281 14.206 14.049 13.886 13.703 13.597 13.369 13.267 13.155 13.04 12.794 12.635 12.431 12.205 11.974 11.7 11.364 10.132 -4 ,3599 ,TETRA ,17590159,Sat Nov 27 19:37:42 CET,Sat Nov 27 21:29:59 CET,0.0 0.259 0.416 0.552 0.671 0.792 0.915 1.02 1.219 1.329 1.433 1.48 1.697 1.78 1.951 2.126 2.293 2.371 2.526 2.675 2.899 3.051 3.199 3.414 3.624 3.816 3.994 4.174 4.42 4.658 4.891 5.166 5.419 5.67 5.966 6.295 6.626 7.003 7.399 7.822 8.261 8.765 9.346 9.911 10.599 11.392 12.285 13.277 14.425 15.75 17.277 18.383 18.888 19.119 19.173 19.096 18.974 18.832 18.669 18.457 18.244 18.036 17.833 17.642 17.45 17.259 17.056 16.868 16.698 16.523 16.328 16.165 16.003 15.832 15.693 15.546 15.391 15.23 15.049 14.915 14.779 14.554 14.388 14.219 14.132 13.95 13.76 13.533 13.416 13.187 13.044 12.907 12.763 12.417 12.218 12.023 11.801 11.482 11.088 10.678 9.4 -5 ,6138 ,TETRA ,17590160,Sat Nov 27 19:38:42 CET,Sat Nov 27 21:33:39 CET,0.0 0.199 0.361 0.505 0.637 0.746 0.864 0.976 1.163 1.25 1.326 1.359 1.58 1.661 1.819 1.985 2.147 2.221 2.375 2.533 2.751 2.893 3.04 3.25 3.451 3.644 3.832 4.015 4.237 4.465 4.697 4.974 5.239 5.494 5.796 6.135 6.468 6.849 7.257 7.68 8.113 8.614 9.213 9.818 10.511 11.272 12.172 13.175 14.311 15.613 17.12 18.253 18.777 18.98 19.023 18.952 18.824 18.688 18.55 18.364 18.172 17.996 17.801 17.609 17.416 17.218 17.028 16.857 16.7 16.526 16.325 16.154 15.976 15.79 15.652 15.508 15.357 15.176 14.983 14.858 14.721 14.507 14.35 14.175 14.085 13.907 13.704 13.468 13.351 13.121 12.971 12.831 12.682 12.351 12.193 12.026 11.847 11.628 11.383 11.062 9.897 -6 ,3473 ,TETRA ,17590161,Sat Nov 27 19:37:43 CET,Sat Nov 27 21:29:15 CET,0.0 0.954 1.239 1.464 1.64 1.772 1.897 2.034 2.276 2.375 2.483 2.556 2.792 2.897 3.096 3.283 3.457 3.545 3.725 3.889 4.12 4.272 4.417 4.634 4.845 5.04 5.228 5.413 5.643 5.863 6.081 6.352 6.632 6.906 7.216 7.561 7.902 8.267 8.64 9.056 9.51 10.021 10.597 11.177 11.887 12.675 13.586 14.632 15.836 17.222 18.735 19.748 20.227 20.465 20.512 20.424 20.265 20.083 19.911 19.73 19.545 19.361 19.175 18.979 18.784 18.595 18.383 18.184 18.016 17.83 17.627 17.451 17.262 17.073 16.915 16.756 16.596 16.42 16.235 16.098 15.96 15.747 15.604 15.451 15.363 15.177 14.994 14.789 14.672 14.433 14.267 14.127 13.988 13.698 13.513 13.308 13.113 12.894 12.617 12.242 11.134 -7 ,16340 ,TETRA ,17590162,Sat Nov 27 19:37:45 CET,Sat Nov 27 21:29:14 CET,0.0 0.253 0.455 0.608 0.733 0.844 0.96 1.074 1.27 1.36 1.457 1.52 1.748 1.834 1.997 2.16 2.321 2.394 2.534 2.669 2.861 2.992 3.117 3.294 3.467 3.642 3.81 3.977 4.202 4.428 4.647 4.91 5.179 5.427 5.712 6.053 6.381 6.744 7.139 7.564 8.012 8.518 9.124 9.728 10.424 11.203 12.091 13.117 14.286 15.614 17.159 18.251 18.785 19.007 19.029 18.95 18.814 18.647 18.483 18.297 18.101 17.905 17.705 17.501 17.305 17.118 16.899 16.694 16.515 16.32 16.114 15.941 15.773 15.608 15.457 15.289 15.131 14.958 14.757 14.619 14.47 14.238 14.087 13.938 13.864 13.697 13.51 13.308 13.212 13.005 12.901 12.779 12.665 12.407 12.24 12.032 11.818 11.63 11.386 11.016 9.587 -8 ,28387 ,TETRA ,17590163,Sat Nov 27 19:37:43 CET,Sat Nov 27 21:29:14 CET,0.0 0.269 0.431 0.594 0.741 0.88 1.008 1.112 1.313 1.408 1.5 1.562 1.8 1.904 2.092 2.281 2.465 2.55 2.705 2.852 3.077 3.227 3.371 3.57 3.765 3.961 4.164 4.358 4.595 4.822 5.037 5.308 5.569 5.824 6.123 6.456 6.786 7.164 7.568 7.993 8.429 8.906 9.49 10.085 10.784 11.564 12.421 13.396 14.532 15.801 17.227 18.269 18.749 18.927 18.977 18.948 18.838 18.718 18.605 18.422 18.223 18.023 17.813 17.624 17.433 17.23 17.015 16.826 16.652 16.461 16.257 16.079 15.899 15.719 15.575 15.419 15.259 15.099 14.925 14.797 14.658 14.437 14.284 14.123 14.044 13.888 13.707 13.491 13.377 13.147 13.013 12.884 12.74 12.409 12.245 12.048 11.814 11.569 11.234 10.677 9.214 -9 ,18232 ,TETRA ,17590164,Sat Nov 27 19:37:45 CET,Sat Nov 27 21:29:21 CET,0.0 0.466 0.605 0.743 0.859 0.968 1.075 1.185 1.412 1.508 1.6 1.645 1.864 1.939 2.084 2.237 2.387 2.459 2.609 2.757 2.964 3.096 3.222 3.405 3.591 3.766 3.933 4.102 4.32 4.536 4.744 5.001 5.258 5.508 5.807 6.149 6.483 6.852 7.238 7.653 8.093 8.587 9.168 9.745 10.423 11.183 12.081 13.12 14.331 15.68 17.214 18.363 18.86 19.062 19.145 19.107 18.982 18.828 18.656 18.466 18.298 18.116 17.897 17.681 17.476 17.285 17.091 16.901 16.719 16.526 16.33 16.171 16.014 15.855 15.723 15.582 15.435 15.277 15.112 15.003 14.886 14.692 14.554 14.417 14.347 14.184 14.009 13.827 13.731 13.521 13.44 13.323 13.199 12.917 12.751 12.567 12.372 12.147 11.858 11.452 10.099 -10 ,22175 ,TETRA ,17590165,Sat Nov 27 19:38:42 CET,Sat Nov 27 21:29:57 CET,0.0 0.303 0.506 0.672 0.816 0.936 1.043 1.145 1.343 1.439 1.53 1.57 1.79 1.879 2.047 2.205 2.356 2.426 2.563 2.705 2.9 3.025 3.149 3.332 3.519 3.711 3.905 4.082 4.3 4.51 4.71 4.943 5.182 5.422 5.692 5.996 6.287 6.607 6.953 7.33 7.75 8.245 8.836 9.422 10.119 10.909 11.784 12.761 13.898 15.19 16.663 17.754 18.233 18.409 18.428 18.338 18.219 18.076 17.909 17.718 17.537 17.359 17.164 16.965 16.759 16.56 16.36 16.181 16.018 15.839 15.661 15.506 15.335 15.154 15.009 14.861 14.702 14.536 14.375 14.254 14.11 13.887 13.732 13.569 13.484 13.317 13.16 12.995 12.896 12.675 12.592 12.481 12.351 12.052 11.888 11.712 11.506 11.298 11.046 10.681 9.67 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index bdb029b5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29985 ,TETRA ,17590166,Sat Nov 27 19:38:43 CET,Sat Nov 27 21:30:11 CET,0.0 0.404 0.665 0.896 1.093 1.24 1.386 1.531 1.783 1.902 2.023 2.128 2.366 2.462 2.659 2.84 3.005 3.089 3.261 3.433 3.667 3.811 3.961 4.186 4.395 4.587 4.779 4.976 5.226 5.465 5.702 5.984 6.255 6.524 6.842 7.205 7.554 7.936 8.331 8.748 9.201 9.723 10.319 10.917 11.618 12.388 13.275 14.312 15.546 16.904 18.434 19.499 19.957 20.175 20.223 20.144 19.998 19.826 19.655 19.476 19.298 19.117 18.928 18.727 18.517 18.307 18.099 17.914 17.741 17.55 17.347 17.178 17.003 16.808 16.651 16.497 16.329 16.159 16.0 15.881 15.755 15.563 15.425 15.282 15.21 15.041 14.861 14.675 14.572 14.343 14.215 14.088 13.966 13.716 13.558 13.352 13.126 12.895 12.641 12.307 11.153 -2 ,26971 ,TETRA ,17590167,Sat Nov 27 19:38:42 CET,Sat Nov 27 21:26:52 CET,0.0 0.476 0.622 0.753 0.889 1.025 1.159 1.274 1.471 1.571 1.671 1.724 1.956 2.06 2.243 2.422 2.602 2.689 2.852 3.01 3.256 3.417 3.569 3.781 3.985 4.176 4.362 4.546 4.781 5.016 5.25 5.519 5.785 6.058 6.379 6.732 7.075 7.447 7.838 8.275 8.735 9.24 9.83 10.419 11.117 11.941 12.897 13.913 15.074 16.45 18.023 19.097 19.533 19.675 19.679 19.6 19.448 19.259 19.071 18.849 18.625 18.427 18.232 18.037 17.849 17.658 17.446 17.248 17.075 16.895 16.719 16.582 16.425 16.26 16.133 15.992 15.836 15.677 15.495 15.368 15.25 15.057 14.924 14.785 14.709 14.548 14.372 14.189 14.094 13.874 13.771 13.654 13.531 13.253 13.091 12.908 12.701 12.448 12.149 11.784 10.528 -3 ,4902 ,TETRA ,17590168,Sat Nov 27 19:38:43 CET,Sat Nov 27 21:30:34 CET,0.0 0.346 0.548 0.717 0.856 0.973 1.082 1.188 1.403 1.511 1.606 1.638 1.859 1.949 2.118 2.273 2.427 2.507 2.654 2.792 2.992 3.124 3.26 3.455 3.628 3.8 3.979 4.155 4.387 4.606 4.819 5.086 5.351 5.611 5.918 6.269 6.589 6.95 7.356 7.784 8.241 8.754 9.341 9.938 10.641 11.427 12.355 13.378 14.538 15.86 17.428 18.58 19.077 19.262 19.28 19.221 19.089 18.914 18.741 18.527 18.326 18.133 17.939 17.734 17.532 17.355 17.168 16.979 16.792 16.602 16.407 16.24 16.059 15.866 15.717 15.562 15.403 15.233 15.045 14.912 14.778 14.572 14.434 14.294 14.212 14.041 13.865 13.67 13.57 13.356 13.278 13.155 13.023 12.754 12.594 12.421 12.22 11.976 11.693 11.285 10.072 -4 ,3440 ,TETRA ,17590169,Sat Nov 27 19:38:43 CET,Sat Nov 27 21:32:10 CET,0.0 0.43 0.612 0.757 0.892 1.023 1.15 1.266 1.488 1.59 1.682 1.744 1.974 2.064 2.243 2.434 2.618 2.7 2.865 3.026 3.259 3.412 3.56 3.771 3.981 4.192 4.395 4.585 4.835 5.082 5.314 5.589 5.869 6.142 6.451 6.8 7.132 7.498 7.904 8.336 8.78 9.278 9.855 10.446 11.136 11.933 12.861 13.844 14.997 16.317 17.754 18.773 19.268 19.478 19.5 19.408 19.285 19.145 18.987 18.792 18.596 18.394 18.193 17.999 17.799 17.607 17.384 17.179 17.012 16.837 16.657 16.514 16.369 16.202 16.059 15.919 15.776 15.619 15.452 15.331 15.213 15.033 14.894 14.739 14.657 14.497 14.328 14.148 14.055 13.834 13.74 13.621 13.492 13.221 13.069 12.904 12.705 12.46 12.178 11.822 10.468 -5 ,2519 ,TETRA ,17590170,Sat Nov 27 19:38:43 CET,Sat Nov 27 21:30:09 CET,0.0 0.308 0.482 0.642 0.796 0.937 1.061 1.176 1.389 1.495 1.607 1.697 1.938 2.043 2.231 2.409 2.584 2.675 2.849 3.021 3.272 3.429 3.597 3.83 4.044 4.255 4.447 4.633 4.88 5.123 5.357 5.637 5.91 6.165 6.459 6.813 7.158 7.517 7.9 8.308 8.748 9.278 9.91 10.525 11.215 11.979 12.87 13.894 15.055 16.358 17.925 19.058 19.572 19.775 19.797 19.71 19.544 19.336 19.153 18.96 18.758 18.563 18.381 18.188 17.993 17.829 17.659 17.492 17.347 17.2 17.03 16.875 16.714 16.542 16.403 16.256 16.102 15.937 15.765 15.639 15.513 15.324 15.192 15.062 14.975 14.792 14.624 14.431 14.332 14.116 14.051 13.948 13.819 13.542 13.39 13.226 13.038 12.783 12.497 12.173 10.9 -6 ,31088 ,TETRA ,17590171,Sat Nov 27 19:38:43 CET,Sat Nov 27 21:29:54 CET,0.0 0.37 0.588 0.757 0.895 1.007 1.121 1.235 1.443 1.558 1.681 1.761 1.995 2.097 2.296 2.483 2.666 2.758 2.936 3.102 3.336 3.492 3.638 3.846 4.053 4.261 4.458 4.643 4.891 5.137 5.372 5.659 5.95 6.237 6.558 6.907 7.247 7.604 7.984 8.406 8.858 9.367 9.975 10.608 11.354 12.151 13.045 14.059 15.251 16.614 18.119 19.144 19.585 19.754 19.768 19.695 19.544 19.362 19.185 18.976 18.745 18.534 18.341 18.134 17.934 17.75 17.547 17.358 17.192 16.998 16.796 16.629 16.442 16.251 16.103 15.949 15.782 15.592 15.391 15.249 15.102 14.869 14.704 14.52 14.424 14.235 14.035 13.808 13.687 13.452 13.313 13.184 13.052 12.707 12.497 12.281 12.034 11.725 11.356 10.842 9.715 -7 ,30889 ,TETRA ,17590172,Sat Nov 27 19:38:45 CET,Sat Nov 27 21:26:42 CET,0.0 0.408 0.575 0.728 0.87 0.996 1.112 1.225 1.472 1.589 1.696 1.763 1.994 2.079 2.239 2.403 2.565 2.642 2.791 2.937 3.14 3.273 3.406 3.605 3.816 4.027 4.217 4.401 4.65 4.9 5.141 5.429 5.71 5.969 6.256 6.584 6.907 7.271 7.674 8.108 8.55 9.037 9.632 10.251 10.976 11.769 12.67 13.665 14.8 16.116 17.685 18.842 19.322 19.506 19.514 19.43 19.291 19.107 18.94 18.722 18.513 18.315 18.112 17.913 17.705 17.511 17.298 17.098 16.925 16.746 16.554 16.389 16.206 16.004 15.853 15.7 15.548 15.384 15.189 15.042 14.894 14.672 14.513 14.335 14.239 14.049 13.862 13.658 13.557 13.335 13.213 13.099 12.978 12.694 12.535 12.354 12.161 11.952 11.663 11.229 9.555 -8 ,17634 ,TETRA ,17590173,Sat Nov 27 19:39:41 CET,Sat Nov 27 21:33:14 CET,0.0 0.739 0.962 1.173 1.382 1.571 1.738 1.878 2.125 2.247 2.369 2.443 2.671 2.782 2.991 3.175 3.347 3.429 3.576 3.726 3.958 4.112 4.266 4.495 4.711 4.918 5.116 5.301 5.547 5.797 6.033 6.309 6.577 6.844 7.153 7.495 7.828 8.198 8.598 9.035 9.502 10.028 10.636 11.239 11.951 12.738 13.615 14.615 15.835 17.214 18.694 19.782 20.256 20.443 20.476 20.402 20.279 20.128 19.964 19.769 19.567 19.366 19.162 18.961 18.756 18.563 18.354 18.144 17.957 17.764 17.566 17.406 17.23 17.035 16.885 16.732 16.56 16.368 16.185 16.059 15.917 15.688 15.526 15.349 15.251 15.05 14.838 14.6 14.48 14.25 14.113 13.978 13.833 13.504 13.312 13.096 12.845 12.576 12.28 11.838 9.978 -9 ,1689 ,TETRA ,17590174,Sat Nov 27 19:39:41 CET,Sat Nov 27 21:31:15 CET,0.0 0.423 0.616 0.763 0.895 1.023 1.135 1.239 1.431 1.525 1.626 1.678 1.905 1.992 2.152 2.307 2.46 2.537 2.681 2.822 3.029 3.168 3.306 3.491 3.682 3.867 4.044 4.223 4.449 4.661 4.868 5.123 5.373 5.616 5.898 6.224 6.539 6.875 7.23 7.623 8.035 8.502 9.089 9.689 10.383 11.15 12.043 13.078 14.23 15.545 17.102 18.233 18.782 19.022 19.057 18.996 18.89 18.728 18.549 18.364 18.176 17.974 17.774 17.579 17.384 17.199 16.994 16.8 16.623 16.428 16.225 16.059 15.872 15.663 15.504 15.339 15.165 14.988 14.818 14.709 14.583 14.368 14.223 14.081 14.003 13.832 13.661 13.466 13.362 13.144 13.052 12.929 12.799 12.522 12.372 12.204 12.01 11.766 11.481 11.111 9.669 -10 ,25166 ,TETRA ,17590175,Sat Nov 27 19:39:41 CET,Sat Nov 27 21:33:14 CET,0.0 0.634 0.822 0.983 1.14 1.267 1.386 1.507 1.733 1.844 1.949 2.005 2.224 2.307 2.479 2.644 2.802 2.88 3.04 3.193 3.418 3.566 3.707 3.92 4.126 4.317 4.509 4.706 4.959 5.199 5.43 5.709 5.988 6.245 6.536 6.869 7.185 7.544 7.943 8.366 8.813 9.335 9.934 10.521 11.24 12.043 12.935 13.925 15.072 16.419 17.98 19.07 19.529 19.698 19.735 19.709 19.61 19.459 19.289 19.086 18.886 18.69 18.483 18.282 18.083 17.873 17.64 17.435 17.269 17.097 16.896 16.723 16.543 16.352 16.196 16.032 15.869 15.706 15.522 15.385 15.241 14.996 14.83 14.665 14.576 14.396 14.189 13.962 13.853 13.614 13.463 13.334 13.19 12.854 12.699 12.522 12.313 12.088 11.819 11.502 10.338 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt deleted file mode 100644 index bb2abe58..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9062 ,TETRA ,17590176,Sat Nov 27 19:39:41 CET,Sat Nov 27 21:33:54 CET,0.0 1.26 1.687 2.033 2.278 2.514 2.719 2.9 3.246 3.399 3.542 3.676 3.93 4.054 4.296 4.529 4.757 4.868 5.086 5.277 5.539 5.71 5.876 6.118 6.364 6.601 6.807 7.008 7.273 7.524 7.758 8.051 8.33 8.58 8.875 9.203 9.499 9.808 10.137 10.482 10.852 11.265 11.724 12.155 12.638 13.189 13.76 14.304 14.874 15.404 15.635 15.314 14.776 14.199 13.623 13.075 12.577 12.096 11.663 11.205 10.781 10.394 10.006 9.641 9.315 9.013 8.705 8.43 8.174 7.9 7.605 7.366 7.133 6.885 6.696 6.503 6.307 6.105 5.902 5.761 5.618 5.38 5.201 5.034 4.954 4.786 4.609 4.393 4.272 4.025 3.943 3.816 3.685 3.418 3.257 3.077 2.896 2.692 2.435 2.101 1.347 -2 ,13217 ,TETRA ,17590177,Sat Nov 27 19:39:41 CET,Sat Nov 27 21:31:58 CET,0.0 0.801 1.164 1.444 1.663 1.849 2.03 2.188 2.483 2.622 2.751 2.848 3.093 3.201 3.399 3.584 3.76 3.846 4.017 4.186 4.423 4.577 4.731 4.962 5.177 5.386 5.6 5.795 6.049 6.295 6.515 6.779 7.039 7.291 7.579 7.901 8.21 8.55 8.893 9.238 9.599 9.991 10.442 10.907 11.447 11.994 12.568 13.152 13.718 14.249 14.562 14.326 13.86 13.293 12.679 12.063 11.52 11.031 10.584 10.114 9.686 9.3 8.944 8.604 8.268 7.963 7.651 7.347 7.077 6.819 6.549 6.318 6.077 5.834 5.644 5.445 5.244 5.033 4.808 4.649 4.482 4.231 4.057 3.868 3.774 3.572 3.356 3.132 3.016 2.769 2.675 2.55 2.421 2.156 2.008 1.837 1.634 1.405 1.14 0.812 -0.001 -3 ,2608 ,TETRA ,17590178,Sat Nov 27 19:39:43 CET,Sat Nov 27 21:32:11 CET,0.0 1.315 1.611 1.884 2.134 2.321 2.488 2.646 2.955 3.109 3.256 3.398 3.657 3.781 4.008 4.212 4.417 4.52 4.717 4.913 5.192 5.355 5.507 5.748 5.987 6.203 6.405 6.597 6.828 7.049 7.269 7.537 7.804 8.06 8.344 8.653 8.94 9.254 9.596 9.96 10.329 10.728 11.208 11.673 12.172 12.705 13.271 13.832 14.355 14.803 15.075 14.888 14.466 13.961 13.405 12.82 12.294 11.811 11.359 10.892 10.5 10.146 9.796 9.46 9.129 8.815 8.484 8.194 7.947 7.686 7.399 7.154 6.917 6.679 6.489 6.279 6.058 5.838 5.605 5.445 5.279 5.007 4.816 4.612 4.508 4.299 4.075 3.851 3.731 3.474 3.337 3.19 3.04 2.717 2.549 2.377 2.201 2.016 1.794 1.454 0.542 -4 ,10577 ,TETRA ,17590179,Sat Nov 27 19:39:43 CET,Sat Nov 27 21:29:14 CET,0.0 1.812 2.255 2.604 2.922 3.183 3.397 3.594 3.944 4.108 4.259 4.414 4.68 4.809 5.049 5.283 5.508 5.611 5.814 6.006 6.27 6.432 6.592 6.828 7.053 7.265 7.473 7.677 7.921 8.159 8.388 8.657 8.918 9.165 9.448 9.766 10.074 10.417 10.773 11.129 11.498 11.926 12.415 12.87 13.372 13.898 14.411 14.93 15.491 15.976 16.23 15.956 15.45 14.853 14.26 13.686 13.147 12.668 12.226 11.767 11.348 10.941 10.576 10.234 9.906 9.613 9.299 9.013 8.761 8.48 8.192 7.952 7.699 7.433 7.239 7.032 6.8 6.564 6.311 6.137 5.963 5.696 5.498 5.29 5.186 4.984 4.78 4.545 4.428 4.18 4.057 3.909 3.761 3.433 3.242 3.029 2.803 2.545 2.232 1.801 0.433 -5 ,5441 ,TETRA ,17590180,Sat Nov 27 19:39:43 CET,Sat Nov 27 21:31:43 CET,0.0 1.483 1.837 2.129 2.368 2.553 2.75 2.933 3.237 3.378 3.519 3.628 3.874 3.995 4.229 4.449 4.644 4.737 4.906 5.077 5.338 5.499 5.65 5.86 6.063 6.259 6.448 6.632 6.88 7.122 7.342 7.609 7.847 8.061 8.322 8.609 8.886 9.215 9.565 9.926 10.297 10.69 11.135 11.57 12.084 12.639 13.204 13.784 14.348 14.853 15.133 14.858 14.364 13.831 13.28 12.72 12.154 11.638 11.195 10.72 10.301 9.933 9.592 9.272 8.947 8.645 8.348 8.065 7.811 7.554 7.282 7.054 6.818 6.584 6.412 6.225 6.018 5.794 5.568 5.416 5.246 4.978 4.805 4.632 4.533 4.314 4.08 3.845 3.718 3.457 3.353 3.231 3.094 2.79 2.639 2.487 2.302 2.098 1.874 1.531 0.784 -6 ,12103 ,TETRA ,17590181,Sat Nov 27 19:40:41 CET,Sat Nov 27 21:34:16 CET,0.0 0.85 1.21 1.456 1.67 1.873 2.058 2.231 2.519 2.643 2.762 2.856 3.096 3.202 3.437 3.66 3.84 3.919 4.08 4.248 4.501 4.658 4.814 5.041 5.248 5.456 5.659 5.861 6.119 6.359 6.601 6.879 7.143 7.403 7.697 8.019 8.318 8.641 8.996 9.379 9.773 10.188 10.671 11.147 11.65 12.184 12.782 13.372 13.967 14.537 14.781 14.496 13.994 13.387 12.787 12.22 11.7 11.196 10.724 10.263 9.874 9.512 9.15 8.809 8.473 8.148 7.838 7.565 7.317 7.06 6.79 6.566 6.326 6.06 5.856 5.655 5.435 5.195 4.946 4.771 4.592 4.313 4.121 3.924 3.818 3.596 3.372 3.129 2.999 2.74 2.597 2.453 2.308 1.985 1.793 1.585 1.379 1.107 0.776 0.366 -0.57 -7 ,8669 ,TETRA ,17590182,Sat Nov 27 19:40:41 CET,Sat Nov 27 21:33:14 CET,0.0 1.26 1.655 1.928 2.131 2.313 2.504 2.675 2.949 3.073 3.196 3.297 3.539 3.643 3.851 4.043 4.208 4.286 4.457 4.622 4.838 4.975 5.102 5.294 5.499 5.7 5.884 6.057 6.284 6.502 6.704 6.946 7.179 7.423 7.723 8.05 8.364 8.707 9.064 9.426 9.804 10.227 10.713 11.188 11.703 12.232 12.818 13.446 14.078 14.559 14.706 14.43 13.963 13.395 12.838 12.298 11.776 11.249 10.79 10.323 9.891 9.507 9.152 8.812 8.476 8.149 7.806 7.507 7.25 6.99 6.721 6.477 6.214 5.948 5.737 5.528 5.314 5.08 4.826 4.667 4.526 4.289 4.122 3.961 3.88 3.71 3.527 3.315 3.206 2.976 2.902 2.783 2.644 2.361 2.204 2.009 1.807 1.584 1.31 1.011 0.009 -8 ,5700 ,TETRA ,17590183,Sat Nov 27 19:40:42 CET,Sat Nov 27 21:33:14 CET,0.0 0.731 1.05 1.304 1.518 1.7 1.865 2.029 2.341 2.481 2.607 2.709 2.957 3.06 3.248 3.434 3.612 3.699 3.871 4.046 4.306 4.47 4.622 4.848 5.071 5.282 5.483 5.69 5.953 6.186 6.412 6.687 6.952 7.197 7.483 7.809 8.116 8.455 8.813 9.199 9.584 9.991 10.46 10.913 11.416 11.953 12.546 13.144 13.727 14.234 14.551 14.395 13.922 13.35 12.748 12.176 11.672 11.179 10.736 10.276 9.874 9.502 9.122 8.758 8.437 8.151 7.833 7.532 7.263 6.993 6.711 6.474 6.237 5.99 5.796 5.582 5.357 5.133 4.889 4.72 4.551 4.282 4.09 3.878 3.774 3.577 3.375 3.158 3.039 2.786 2.678 2.55 2.41 2.12 1.944 1.759 1.572 1.355 1.083 0.69 -0.419 -9 ,10532 ,TETRA ,17590184,Sat Nov 27 19:40:42 CET,Sat Nov 27 21:33:04 CET,0.0 0.892 1.238 1.481 1.698 1.909 2.104 2.266 2.531 2.659 2.774 2.851 3.094 3.2 3.415 3.625 3.815 3.904 4.083 4.256 4.499 4.652 4.802 5.015 5.231 5.444 5.636 5.814 6.056 6.298 6.529 6.806 7.071 7.34 7.656 8.001 8.317 8.66 9.031 9.406 9.807 10.23 10.697 11.16 11.646 12.148 12.693 13.243 13.779 14.298 14.608 14.429 13.992 13.438 12.859 12.281 11.749 11.228 10.772 10.314 9.917 9.551 9.189 8.842 8.528 8.253 7.95 7.656 7.4 7.15 6.901 6.702 6.487 6.253 6.063 5.873 5.686 5.484 5.274 5.131 4.982 4.748 4.595 4.436 4.349 4.175 3.998 3.816 3.716 3.469 3.384 3.276 3.162 2.882 2.724 2.556 2.338 2.088 1.82 1.517 0.813 -10 ,10899 ,TETRA ,17590185,Sat Nov 27 19:40:42 CET,Sat Nov 27 21:33:14 CET,0.0 0.945 1.247 1.502 1.728 1.935 2.123 2.289 2.573 2.701 2.828 2.955 3.209 3.315 3.521 3.731 3.93 4.033 4.231 4.409 4.686 4.864 5.024 5.258 5.479 5.689 5.897 6.101 6.354 6.592 6.829 7.108 7.364 7.615 7.907 8.212 8.506 8.849 9.204 9.562 9.943 10.353 10.806 11.263 11.803 12.387 12.98 13.579 14.176 14.657 14.94 14.717 14.22 13.71 13.161 12.566 12.008 11.51 11.063 10.594 10.192 9.821 9.448 9.083 8.742 8.427 8.097 7.806 7.563 7.302 7.032 6.803 6.558 6.309 6.12 5.918 5.694 5.458 5.213 5.041 4.868 4.608 4.432 4.251 4.157 3.949 3.73 3.509 3.397 3.156 3.061 2.929 2.792 2.506 2.355 2.184 1.965 1.671 1.344 0.913 -0.635 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 26c34b4b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25956 ,TETRA ,17590186,Sat Nov 27 19:41:44 CET,Sat Nov 27 21:33:33 CET,0.0 0.236 0.39 0.53 0.684 0.833 0.962 1.083 1.325 1.437 1.539 1.59 1.823 1.911 2.079 2.243 2.407 2.491 2.658 2.818 3.045 3.191 3.335 3.536 3.73 3.925 4.117 4.31 4.557 4.793 5.029 5.329 5.616 5.878 6.193 6.57 6.924 7.307 7.742 8.218 8.707 9.27 9.948 10.635 11.433 12.35 13.427 14.667 16.224 18.049 20.137 21.758 22.63 23.118 23.342 23.446 23.47 23.41 23.303 23.183 23.073 22.94 22.788 22.647 22.511 22.382 22.235 22.08 21.932 21.778 21.606 21.456 21.299 21.125 20.974 20.823 20.675 20.5 20.307 20.183 20.06 19.872 19.74 19.583 19.494 19.312 19.114 18.897 18.776 18.53 18.39 18.25 18.1 17.762 17.568 17.359 17.133 16.86 16.511 16.018 13.343 -2 ,591 ,TETRA ,17590187,Sat Nov 27 19:41:44 CET,Sat Nov 27 21:35:14 CET,0.0 0.217 0.41 0.576 0.721 0.856 0.988 1.12 1.361 1.461 1.56 1.614 1.843 1.929 2.106 2.282 2.446 2.528 2.678 2.822 3.036 3.179 3.326 3.531 3.724 3.917 4.112 4.308 4.567 4.826 5.084 5.384 5.668 5.956 6.302 6.703 7.091 7.511 7.955 8.434 8.953 9.539 10.235 10.946 11.773 12.685 13.768 15.006 16.481 18.239 20.329 21.972 22.839 23.313 23.551 23.677 23.713 23.685 23.624 23.527 23.414 23.286 23.132 22.95 22.765 22.584 22.386 22.209 22.056 21.887 21.693 21.533 21.368 21.185 21.039 20.905 20.77 20.625 20.458 20.324 20.184 19.967 19.813 19.66 19.582 19.404 19.205 18.991 18.881 18.653 18.52 18.385 18.242 17.921 17.735 17.523 17.262 16.986 16.674 16.18 13.355 -3 ,14441 ,TETRA ,17590188,Sat Nov 27 19:41:44 CET,Sat Nov 27 21:34:04 CET,0.0 0.236 0.395 0.543 0.701 0.846 0.963 1.087 1.335 1.441 1.541 1.592 1.824 1.918 2.121 2.306 2.476 2.561 2.728 2.895 3.151 3.314 3.468 3.708 3.944 4.156 4.368 4.578 4.85 5.11 5.356 5.656 5.947 6.234 6.562 6.939 7.314 7.714 8.144 8.611 9.113 9.683 10.361 11.06 11.871 12.777 13.879 15.176 16.712 18.485 20.542 22.18 23.06 23.502 23.706 23.78 23.733 23.648 23.577 23.487 23.357 23.209 23.065 22.916 22.767 22.607 22.412 22.228 22.06 21.872 21.67 21.504 21.326 21.14 20.993 20.83 20.66 20.473 20.268 20.125 19.965 19.734 19.571 19.382 19.284 19.077 18.823 18.556 18.425 18.163 17.97 17.817 17.654 17.264 17.042 16.802 16.534 16.196 15.793 15.247 13.036 -4 ,17615 ,TETRA ,17590189,Sat Nov 27 19:41:44 CET,Sat Nov 27 21:33:58 CET,0.0 0.261 0.426 0.579 0.724 0.851 0.967 1.087 1.31 1.404 1.491 1.517 1.746 1.837 2.015 2.183 2.347 2.428 2.581 2.733 2.947 3.082 3.221 3.434 3.645 3.844 4.035 4.217 4.459 4.701 4.94 5.233 5.517 5.786 6.098 6.459 6.807 7.203 7.634 8.094 8.591 9.165 9.863 10.578 11.399 12.305 13.389 14.664 16.189 17.992 20.097 21.748 22.629 23.126 23.389 23.487 23.474 23.408 23.321 23.238 23.142 22.995 22.815 22.624 22.436 22.247 22.045 21.864 21.715 21.545 21.333 21.166 21.0 20.813 20.667 20.501 20.309 20.114 19.917 19.765 19.606 19.393 19.225 19.049 18.969 18.781 18.574 18.364 18.263 18.039 17.879 17.731 17.59 17.271 17.093 16.884 16.615 16.319 16.007 15.499 12.703 -5 ,4826 ,TETRA ,17590190,Sat Nov 27 19:41:44 CET,Sat Nov 27 21:34:13 CET,0.0 0.324 0.483 0.627 0.762 0.902 1.033 1.143 1.361 1.465 1.559 1.598 1.833 1.929 2.117 2.308 2.49 2.579 2.765 2.944 3.19 3.352 3.508 3.738 3.97 4.186 4.385 4.583 4.84 5.096 5.35 5.656 5.952 6.23 6.572 6.968 7.339 7.759 8.226 8.715 9.232 9.826 10.5 11.19 12.033 12.971 14.072 15.339 16.801 18.491 20.545 22.242 23.133 23.608 23.86 23.964 23.975 23.919 23.817 23.685 23.556 23.421 23.262 23.109 22.935 22.753 22.557 22.377 22.207 22.027 21.855 21.701 21.525 21.329 21.17 20.992 20.815 20.643 20.453 20.307 20.152 19.93 19.778 19.61 19.519 19.326 19.104 18.876 18.768 18.541 18.399 18.266 18.137 17.836 17.667 17.486 17.277 17.053 16.794 16.393 14.377 -6 ,26834 ,TETRA ,17590191,Sat Nov 27 19:41:44 CET,Sat Nov 27 21:34:04 CET,0.0 0.38 0.565 0.713 0.855 0.982 1.109 1.225 1.446 1.556 1.656 1.706 1.95 2.049 2.239 2.442 2.631 2.72 2.906 3.08 3.327 3.489 3.651 3.891 4.119 4.337 4.541 4.741 5.011 5.275 5.538 5.86 6.168 6.459 6.796 7.185 7.563 7.975 8.427 8.924 9.462 10.064 10.746 11.434 12.259 13.192 14.278 15.518 17.002 18.796 20.924 22.561 23.469 23.937 24.149 24.275 24.317 24.27 24.182 24.087 23.988 23.848 23.675 23.501 23.322 23.153 22.971 22.794 22.628 22.448 22.26 22.094 21.902 21.7 21.541 21.373 21.2 21.012 20.811 20.671 20.522 20.274 20.096 19.911 19.82 19.62 19.39 19.138 18.995 18.734 18.575 18.432 18.261 17.879 17.667 17.438 17.183 16.843 16.368 15.768 13.403 -7 ,16299 ,TETRA ,17590192,Sat Nov 27 19:42:42 CET,Sat Nov 27 21:35:05 CET,0.0 0.322 0.514 0.674 0.795 0.91 1.028 1.141 1.34 1.438 1.534 1.585 1.827 1.923 2.12 2.311 2.493 2.582 2.756 2.925 3.169 3.326 3.473 3.701 3.925 4.139 4.347 4.55 4.82 5.083 5.334 5.626 5.905 6.192 6.541 6.939 7.317 7.729 8.171 8.641 9.153 9.738 10.427 11.128 11.927 12.833 13.917 15.165 16.654 18.455 20.536 22.088 22.876 23.293 23.526 23.61 23.594 23.53 23.441 23.312 23.165 23.007 22.837 22.662 22.487 22.321 22.127 21.928 21.779 21.633 21.45 21.29 21.122 20.966 20.844 20.706 20.546 20.372 20.216 20.101 19.957 19.726 19.57 19.412 19.332 19.141 18.93 18.724 18.624 18.401 18.303 18.187 18.03 17.641 17.449 17.237 16.953 16.619 16.238 15.714 13.655 -8 ,6280 ,TETRA ,17590193,Sat Nov 27 19:43:42 CET,Sat Nov 27 21:34:22 CET,0.0 0.331 0.489 0.619 0.745 0.882 1.037 1.185 1.447 1.566 1.678 1.764 2.017 2.13 2.354 2.557 2.75 2.84 3.018 3.197 3.458 3.624 3.779 4.007 4.23 4.443 4.641 4.834 5.097 5.364 5.619 5.915 6.21 6.502 6.851 7.25 7.637 8.064 8.519 9.005 9.517 10.104 10.788 11.492 12.338 13.281 14.393 15.68 17.249 19.072 21.169 22.86 23.741 24.142 24.336 24.442 24.429 24.355 24.274 24.129 23.967 23.786 23.605 23.454 23.281 23.091 22.876 22.693 22.555 22.403 22.208 22.032 21.839 21.628 21.465 21.3 21.128 20.954 20.765 20.622 20.463 20.219 20.049 19.864 19.769 19.559 19.327 19.089 18.97 18.721 18.55 18.383 18.203 17.835 17.623 17.413 17.143 16.796 16.388 15.829 13.003 -9 ,20349 ,TETRA ,17590194,Sat Nov 27 19:44:41 CET,Sat Nov 27 21:36:19 CET,0.0 0.279 0.457 0.62 0.766 0.911 1.058 1.188 1.404 1.501 1.593 1.624 1.854 1.958 2.165 2.362 2.563 2.662 2.846 3.016 3.269 3.433 3.59 3.822 4.053 4.28 4.49 4.691 4.957 5.217 5.472 5.786 6.089 6.372 6.705 7.075 7.433 7.847 8.284 8.744 9.257 9.856 10.558 11.263 12.065 12.976 14.059 15.289 16.729 18.453 20.551 22.135 22.963 23.423 23.648 23.772 23.802 23.755 23.678 23.559 23.411 23.266 23.09 22.897 22.723 22.554 22.363 22.185 22.018 21.816 21.603 21.434 21.251 21.047 20.897 20.737 20.556 20.356 20.137 19.979 19.822 19.593 19.422 19.225 19.118 18.896 18.68 18.436 18.3 18.046 17.876 17.726 17.56 17.17 16.943 16.682 16.373 16.035 15.601 15.015 12.666 -10 ,28207 ,TETRA ,17590195,Sat Nov 27 19:44:43 CET,Sat Nov 27 21:37:16 CET,0.0 0.346 0.502 0.645 0.782 0.912 1.033 1.147 1.341 1.435 1.531 1.57 1.8 1.887 2.062 2.241 2.407 2.485 2.644 2.801 3.028 3.175 3.319 3.538 3.754 3.956 4.144 4.339 4.6 4.845 5.08 5.36 5.631 5.903 6.218 6.584 6.956 7.37 7.813 8.279 8.781 9.377 10.067 10.764 11.614 12.566 13.67 14.957 16.5 18.284 20.33 21.843 22.635 23.077 23.255 23.3 23.297 23.256 23.189 23.101 22.993 22.851 22.715 22.582 22.434 22.292 22.122 21.963 21.831 21.686 21.534 21.393 21.249 21.108 20.982 20.828 20.657 20.475 20.284 20.158 20.026 19.837 19.702 19.556 19.476 19.29 19.099 18.914 18.815 18.589 18.462 18.318 18.159 17.813 17.63 17.43 17.21 16.953 16.596 16.112 13.803 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt deleted file mode 100644 index 86fc7d64..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28182 ,TETRA ,17590196,Sat Nov 27 19:45:42 CET,Sat Nov 27 21:40:10 CET,0.0 0.596 0.842 1.044 1.215 1.353 1.481 1.607 1.842 1.953 2.065 2.137 2.379 2.472 2.655 2.835 2.994 3.069 3.209 3.357 3.605 3.761 3.9 4.091 4.269 4.446 4.62 4.789 5.001 5.207 5.416 5.663 5.9 6.127 6.391 6.688 6.966 7.263 7.59 7.952 8.322 8.711 9.184 9.687 10.279 10.936 11.65 12.368 13.178 14.061 14.868 15.23 15.163 14.932 14.644 14.304 13.991 13.671 13.348 13.023 12.74 12.47 12.191 11.914 11.641 11.384 11.117 10.882 10.671 10.449 10.221 10.022 9.811 9.578 9.387 9.206 9.01 8.794 8.576 8.421 8.268 8.031 7.879 7.736 7.655 7.47 7.271 7.063 6.956 6.714 6.613 6.487 6.365 6.08 5.914 5.746 5.564 5.352 5.135 4.862 3.548 -2 ,4266 ,TETRA ,17590197,Sat Nov 27 19:46:42 CET,Sat Nov 27 21:39:55 CET,0.0 0.318 0.536 0.71 0.858 1.007 1.164 1.297 1.566 1.706 1.827 1.93 2.191 2.312 2.534 2.729 2.919 3.008 3.182 3.351 3.605 3.77 3.919 4.131 4.345 4.553 4.747 4.928 5.167 5.405 5.634 5.902 6.16 6.414 6.705 7.01 7.304 7.634 7.971 8.331 8.717 9.157 9.689 10.227 10.807 11.408 12.089 12.787 13.548 14.344 15.102 15.474 15.427 15.204 14.886 14.518 14.151 13.798 13.493 13.159 12.832 12.521 12.226 11.934 11.652 11.404 11.121 10.852 10.626 10.407 10.175 9.971 9.745 9.506 9.335 9.162 8.975 8.773 8.559 8.402 8.233 7.984 7.803 7.622 7.534 7.335 7.116 6.874 6.753 6.493 6.34 6.177 6.004 5.654 5.455 5.237 5.015 4.785 4.517 4.18 2.914 -3 ,21100 ,TETRA ,17590198,Sat Nov 27 19:47:41 CET,Sat Nov 27 21:40:26 CET,0.0 0.751 0.999 1.161 1.308 1.454 1.591 1.72 1.938 2.035 2.132 2.191 2.434 2.538 2.734 2.921 3.116 3.216 3.399 3.564 3.792 3.95 4.106 4.32 4.518 4.719 4.915 5.098 5.355 5.597 5.816 6.082 6.342 6.59 6.876 7.196 7.507 7.85 8.221 8.625 9.04 9.502 10.015 10.489 11.021 11.596 12.282 13.053 13.859 14.707 15.529 15.916 15.877 15.64 15.372 15.058 14.715 14.367 14.032 13.666 13.347 13.058 12.761 12.488 12.222 11.976 11.736 11.507 11.279 11.031 10.782 10.579 10.361 10.136 9.951 9.745 9.545 9.335 9.102 8.946 8.782 8.5 8.307 8.122 8.026 7.832 7.625 7.398 7.282 7.032 6.912 6.783 6.658 6.407 6.267 6.105 5.929 5.743 5.524 5.221 4.086 -4 ,12208 ,TETRA ,17590199,Sat Nov 27 19:47:41 CET,Sat Nov 27 21:41:05 CET,0.0 0.386 0.642 0.817 0.955 1.088 1.217 1.342 1.588 1.716 1.855 1.995 2.253 2.362 2.584 2.793 2.983 3.078 3.265 3.442 3.696 3.859 4.022 4.249 4.454 4.65 4.835 5.021 5.285 5.535 5.769 6.051 6.314 6.563 6.857 7.187 7.501 7.839 8.196 8.552 8.922 9.339 9.818 10.319 10.909 11.519 12.157 12.848 13.633 14.454 15.22 15.624 15.639 15.442 15.135 14.822 14.519 14.192 13.879 13.542 13.234 12.94 12.668 12.406 12.143 11.903 11.65 11.414 11.191 10.95 10.711 10.51 10.297 10.091 9.934 9.746 9.532 9.313 9.095 8.942 8.778 8.518 8.338 8.144 8.054 7.875 7.677 7.484 7.38 7.138 7.03 6.898 6.769 6.485 6.326 6.14 5.936 5.712 5.462 5.169 2.772 -5 ,22448 ,TETRA ,17590200,Sat Nov 27 19:48:44 CET,Sat Nov 27 21:42:01 CET,0.0 0.465 0.721 0.923 1.09 1.229 1.348 1.462 1.697 1.81 1.908 1.939 2.168 2.261 2.428 2.578 2.726 2.8 2.949 3.101 3.316 3.445 3.574 3.765 3.945 4.126 4.313 4.492 4.737 4.984 5.216 5.494 5.751 6.004 6.297 6.62 6.922 7.243 7.59 7.971 8.391 8.87 9.388 9.867 10.424 11.026 11.686 12.423 13.212 13.982 14.731 15.059 14.97 14.692 14.359 14.023 13.701 13.371 13.053 12.706 12.382 12.079 11.79 11.512 11.243 10.992 10.717 10.479 10.27 10.043 9.808 9.602 9.366 9.125 8.955 8.779 8.592 8.395 8.178 8.019 7.852 7.595 7.418 7.228 7.13 6.928 6.709 6.462 6.326 6.055 5.907 5.758 5.601 5.266 5.068 4.85 4.616 4.344 4.034 3.652 2.007 -6 ,31046 ,TETRA ,17590201,Sat Nov 27 19:49:42 CET,Sat Nov 27 21:42:38 CET,0.0 0.406 0.67 0.863 1.017 1.155 1.283 1.403 1.608 1.708 1.811 1.869 2.103 2.198 2.404 2.608 2.793 2.88 3.054 3.23 3.471 3.625 3.776 3.988 4.206 4.412 4.599 4.774 5.016 5.269 5.502 5.793 6.06 6.298 6.574 6.889 7.199 7.546 7.908 8.282 8.678 9.127 9.637 10.124 10.689 11.297 11.993 12.741 13.514 14.314 15.083 15.433 15.382 15.153 14.842 14.462 14.097 13.745 13.412 13.072 12.758 12.479 12.204 11.927 11.657 11.407 11.167 10.947 10.729 10.485 10.228 10.017 9.797 9.565 9.382 9.195 8.999 8.783 8.568 8.423 8.27 8.028 7.853 7.666 7.567 7.366 7.151 6.928 6.813 6.559 6.434 6.293 6.136 5.806 5.638 5.455 5.263 5.033 4.781 4.502 3.426 -7 ,28824 ,TETRA ,17590202,Sat Nov 27 19:49:42 CET,Sat Nov 27 21:45:36 CET,0.0 0.502 0.69 0.867 1.015 1.145 1.276 1.408 1.666 1.788 1.905 1.973 2.207 2.301 2.481 2.664 2.837 2.917 3.071 3.221 3.454 3.605 3.761 3.986 4.19 4.378 4.559 4.766 5.043 5.289 5.514 5.775 6.033 6.28 6.568 6.897 7.21 7.542 7.897 8.268 8.635 9.042 9.536 10.047 10.621 11.196 11.818 12.528 13.316 14.154 14.952 15.288 15.275 15.064 14.787 14.472 14.147 13.83 13.527 13.202 12.913 12.624 12.313 12.005 11.712 11.448 11.185 10.944 10.731 10.507 10.265 10.051 9.823 9.584 9.395 9.21 9.016 8.801 8.577 8.422 8.261 8.01 7.83 7.637 7.542 7.343 7.126 6.899 6.772 6.503 6.366 6.225 6.073 5.778 5.634 5.473 5.266 5.021 4.727 4.349 2.45 -8 ,23517 ,TETRA ,17590203,Sat Nov 27 19:49:42 CET,Sat Nov 27 21:45:36 CET,0.0 0.967 1.345 1.641 1.87 2.071 2.245 2.406 2.703 2.838 2.966 3.051 3.297 3.41 3.635 3.849 4.04 4.134 4.311 4.482 4.736 4.888 5.035 5.262 5.476 5.683 5.884 6.081 6.331 6.556 6.776 7.045 7.302 7.549 7.821 8.117 8.412 8.741 9.098 9.479 9.872 10.293 10.769 11.245 11.802 12.413 13.08 13.8 14.585 15.411 16.193 16.5 16.457 16.244 15.927 15.564 15.224 14.907 14.596 14.277 13.996 13.741 13.491 13.243 13.001 12.772 12.537 12.304 12.077 11.846 11.627 11.451 11.262 11.06 10.905 10.744 10.581 10.418 10.24 10.104 9.966 9.764 9.617 9.451 9.366 9.2 9.019 8.829 8.729 8.489 8.401 8.279 8.154 7.878 7.732 7.571 7.369 7.101 6.82 6.505 5.212 -9 ,14751 ,TETRA ,17590204,Sat Nov 27 19:49:41 CET,Sat Nov 27 21:43:03 CET,0.0 1.016 1.369 1.645 1.88 2.081 2.241 2.397 2.695 2.836 2.968 3.074 3.323 3.436 3.655 3.849 4.035 4.131 4.315 4.488 4.736 4.898 5.055 5.281 5.492 5.692 5.897 6.101 6.361 6.597 6.817 7.082 7.336 7.586 7.866 8.181 8.488 8.829 9.195 9.565 9.943 10.392 10.94 11.458 12.034 12.652 13.31 14.014 14.792 15.629 16.436 16.817 16.8 16.603 16.311 15.938 15.556 15.19 14.871 14.53 14.22 13.938 13.658 13.376 13.108 12.868 12.599 12.332 12.111 11.901 11.665 11.463 11.25 11.018 10.823 10.612 10.399 10.181 9.966 9.821 9.672 9.452 9.289 9.096 8.993 8.792 8.593 8.378 8.254 7.986 7.84 7.694 7.534 7.165 6.961 6.747 6.517 6.234 5.875 5.423 3.829 -10 ,29992 ,TETRA ,17590205,Sat Nov 27 19:49:44 CET,Sat Nov 27 21:42:41 CET,0.0 0.482 0.732 0.934 1.095 1.244 1.382 1.511 1.745 1.853 1.958 2.02 2.257 2.357 2.536 2.705 2.879 2.956 3.098 3.246 3.473 3.614 3.741 3.925 4.107 4.283 4.45 4.611 4.827 5.043 5.249 5.489 5.716 5.938 6.203 6.499 6.786 7.105 7.464 7.843 8.232 8.673 9.171 9.662 10.219 10.822 11.494 12.225 12.98 13.753 14.501 14.817 14.748 14.506 14.214 13.885 13.542 13.193 12.86 12.515 12.192 11.887 11.591 11.282 10.978 10.705 10.417 10.16 9.931 9.69 9.438 9.233 9.016 8.786 8.619 8.448 8.275 8.088 7.893 7.768 7.637 7.426 7.271 7.11 7.034 6.866 6.679 6.498 6.405 6.162 6.078 5.968 5.842 5.559 5.412 5.246 5.047 4.844 4.564 4.169 2.769 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 1f00ef76..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2238 ,KEBNE ,17026615,Wed Dec 22 15:01:48 CET,Wed Dec 22 16:36:13 CET,0.0 0.531 0.795 0.969 1.108 1.239 1.361 1.476 1.673 1.773 1.872 1.889 2.104 2.187 2.335 2.484 2.623 2.687 2.806 2.922 3.098 3.214 3.324 3.477 3.621 3.768 3.912 4.041 4.205 4.364 4.514 4.71 4.917 5.108 5.332 5.578 5.813 6.09 6.39 6.697 7.014 7.355 7.731 8.117 8.55 8.997 9.499 10.009 10.516 11.043 11.401 11.199 10.777 10.348 9.905 9.468 9.039 8.609 8.248 7.902 7.564 7.242 6.933 6.63 6.361 6.135 5.887 5.645 5.433 5.201 4.95 4.744 4.516 4.279 4.102 3.91 3.725 3.543 3.341 3.197 3.041 2.797 2.632 2.452 2.353 2.145 1.937 1.703 1.578 1.33 1.194 1.048 0.896 0.546 0.357 0.17 -0.014 -0.229 -0.542 -0.975 -2.673 -2 ,27654 ,KEBNE ,17026616,Wed Dec 22 15:01:48 CET,Wed Dec 22 16:37:02 CET,0.0 0.471 0.693 0.865 1.007 1.123 1.256 1.403 1.655 1.759 1.874 1.963 2.199 2.305 2.487 2.648 2.816 2.9 3.057 3.199 3.407 3.553 3.693 3.889 4.065 4.219 4.371 4.53 4.742 4.945 5.141 5.372 5.584 5.796 6.035 6.293 6.542 6.809 7.082 7.377 7.704 8.058 8.446 8.832 9.266 9.717 10.221 10.728 11.255 11.781 12.145 11.964 11.531 11.091 10.645 10.193 9.768 9.357 8.995 8.645 8.347 8.047 7.739 7.446 7.163 6.91 6.654 6.419 6.204 5.975 5.74 5.545 5.332 5.107 4.935 4.765 4.589 4.397 4.19 4.036 3.882 3.662 3.507 3.347 3.262 3.072 2.867 2.657 2.551 2.315 2.225 2.091 1.935 1.591 1.409 1.213 1.007 0.811 0.542 0.162 -1.179 -3 ,7469 ,KEBNE ,17026617,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:36:00 CET,0.0 0.507 0.719 0.878 1.027 1.162 1.29 1.403 1.601 1.696 1.789 1.832 2.049 2.135 2.281 2.416 2.55 2.616 2.748 2.886 3.101 3.233 3.349 3.521 3.689 3.85 4.007 4.159 4.364 4.561 4.754 4.988 5.195 5.399 5.638 5.885 6.129 6.415 6.718 7.007 7.307 7.677 8.097 8.465 8.879 9.339 9.823 10.3 10.864 11.442 11.731 11.606 11.326 10.902 10.423 10.015 9.609 9.188 8.823 8.443 8.098 7.791 7.493 7.199 6.92 6.664 6.402 6.153 5.935 5.72 5.488 5.284 5.072 4.854 4.688 4.534 4.383 4.201 3.992 3.856 3.712 3.494 3.344 3.187 3.105 2.932 2.753 2.552 2.446 2.201 2.083 1.952 1.822 1.552 1.389 1.222 1.054 0.868 0.639 0.278 -1.06 -4 ,25270 ,KEBNE ,17026618,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:37:22 CET,0.0 0.48 0.712 0.886 1.028 1.163 1.278 1.386 1.605 1.694 1.775 1.8 2.016 2.093 2.227 2.368 2.502 2.563 2.68 2.79 2.953 3.065 3.174 3.326 3.47 3.611 3.756 3.894 4.074 4.245 4.407 4.607 4.811 5.014 5.239 5.496 5.745 6.026 6.33 6.641 6.957 7.296 7.674 8.052 8.486 8.921 9.404 9.934 10.446 10.899 11.211 11.073 10.733 10.306 9.878 9.452 9.051 8.681 8.322 7.95 7.632 7.339 7.047 6.753 6.487 6.256 5.978 5.724 5.493 5.244 4.996 4.799 4.606 4.398 4.229 4.053 3.866 3.672 3.475 3.339 3.195 2.959 2.797 2.642 2.56 2.383 2.212 2.021 1.918 1.682 1.614 1.51 1.391 1.099 0.953 0.823 0.658 0.454 0.228 -0.11 -1.14 -5 ,25797 ,KEBNE ,17026619,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:37:35 CET,0.0 0.464 0.674 0.819 0.955 1.068 1.167 1.257 1.441 1.538 1.622 1.631 1.844 1.925 2.076 2.218 2.346 2.408 2.535 2.661 2.827 2.931 3.041 3.216 3.381 3.541 3.713 3.878 4.076 4.271 4.473 4.697 4.906 5.112 5.343 5.607 5.859 6.132 6.419 6.727 7.046 7.38 7.758 8.144 8.587 9.013 9.502 10.099 10.65 11.043 11.258 11.118 10.773 10.363 9.936 9.494 9.075 8.656 8.261 7.874 7.538 7.213 6.89 6.593 6.329 6.082 5.803 5.559 5.348 5.121 4.886 4.692 4.49 4.267 4.09 3.916 3.737 3.538 3.327 3.175 3.014 2.783 2.614 2.443 2.358 2.176 1.989 1.773 1.658 1.409 1.278 1.142 1.003 0.7 0.535 0.356 0.115 -0.185 -0.524 -0.961 -2.341 -6 ,19330 ,KEBNE ,17026620,Wed Dec 22 15:01:48 CET,Wed Dec 22 16:36:04 CET,0.0 0.559 0.746 0.908 1.067 1.218 1.355 1.477 1.68 1.767 1.848 1.874 2.091 2.174 2.324 2.454 2.574 2.637 2.77 2.892 3.072 3.201 3.329 3.518 3.704 3.871 4.036 4.192 4.378 4.569 4.763 4.989 5.19 5.394 5.627 5.87 6.109 6.383 6.675 6.969 7.267 7.596 7.971 8.35 8.788 9.253 9.744 10.223 10.732 11.201 11.527 11.44 11.073 10.653 10.238 9.806 9.378 8.978 8.632 8.269 7.913 7.57 7.253 6.953 6.654 6.378 6.105 5.868 5.645 5.419 5.196 5.004 4.79 4.551 4.362 4.173 3.983 3.781 3.57 3.424 3.271 3.02 2.845 2.669 2.573 2.381 2.177 1.967 1.859 1.607 1.474 1.332 1.196 0.905 0.735 0.52 0.284 0.05 -0.262 -0.677 -2.081 -7 ,5858 ,KEBNE ,17026621,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:36:21 CET,0.0 0.79 1.031 1.21 1.347 1.485 1.611 1.718 1.935 2.031 2.117 2.155 2.37 2.449 2.609 2.765 2.917 2.986 3.109 3.232 3.418 3.535 3.644 3.798 3.955 4.114 4.281 4.444 4.651 4.846 5.033 5.273 5.491 5.683 5.912 6.173 6.422 6.687 6.98 7.282 7.586 7.935 8.329 8.704 9.11 9.546 10.018 10.507 11.001 11.473 11.796 11.651 11.278 10.894 10.52 10.121 9.726 9.341 8.968 8.57 8.235 7.93 7.638 7.36 7.068 6.781 6.483 6.223 6.001 5.753 5.494 5.289 5.082 4.868 4.697 4.523 4.345 4.141 3.914 3.767 3.62 3.386 3.224 3.051 2.952 2.742 2.529 2.309 2.195 1.945 1.828 1.686 1.541 1.238 1.053 0.869 0.697 0.502 0.256 -0.078 -1.404 -8 ,17773 ,KEBNE ,17026622,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:37:32 CET,0.0 0.346 0.561 0.702 0.824 0.938 1.046 1.144 1.325 1.413 1.499 1.525 1.737 1.821 1.993 2.172 2.348 2.428 2.581 2.729 2.946 3.081 3.215 3.409 3.582 3.747 3.915 4.09 4.306 4.497 4.679 4.906 5.127 5.326 5.561 5.836 6.097 6.372 6.674 6.987 7.297 7.648 8.04 8.428 8.848 9.294 9.789 10.294 10.875 11.455 11.844 11.813 11.492 11.078 10.659 10.22 9.807 9.404 9.072 8.708 8.354 8.037 7.735 7.456 7.194 6.946 6.675 6.429 6.22 5.998 5.761 5.551 5.319 5.092 4.913 4.729 4.54 4.33 4.111 3.956 3.801 3.555 3.385 3.215 3.132 2.966 2.794 2.617 2.517 2.27 2.168 2.049 1.917 1.623 1.469 1.286 1.083 0.854 0.592 0.297 -0.967 -9 ,10037 ,KEBNE ,17026623,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:36:04 CET,0.0 0.429 0.601 0.774 0.937 1.066 1.19 1.314 1.525 1.614 1.699 1.716 1.934 2.008 2.146 2.294 2.439 2.507 2.637 2.77 2.95 3.065 3.181 3.339 3.487 3.633 3.779 3.917 4.088 4.244 4.405 4.609 4.814 5.009 5.215 5.44 5.667 5.926 6.21 6.517 6.836 7.168 7.55 7.944 8.404 8.874 9.372 9.901 10.397 10.847 11.195 11.197 10.89 10.439 9.98 9.555 9.177 8.796 8.437 8.067 7.759 7.475 7.188 6.901 6.628 6.382 6.12 5.877 5.657 5.422 5.174 4.975 4.774 4.56 4.406 4.257 4.091 3.906 3.722 3.597 3.466 3.264 3.109 2.947 2.866 2.698 2.535 2.367 2.27 2.037 1.943 1.82 1.7 1.444 1.299 1.135 0.945 0.75 0.502 0.135 -0.895 -10 ,18692 ,KEBNE ,17026624,Wed Dec 22 15:01:48 CET,Wed Dec 22 16:38:19 CET,0.0 0.537 0.715 0.866 1.0 1.118 1.24 1.351 1.557 1.656 1.746 1.799 2.028 2.11 2.262 2.408 2.539 2.604 2.729 2.836 2.994 3.112 3.233 3.401 3.575 3.754 3.915 4.071 4.275 4.461 4.641 4.852 5.046 5.247 5.497 5.765 6.008 6.267 6.545 6.841 7.145 7.476 7.856 8.227 8.641 9.072 9.54 10.023 10.521 10.971 11.192 11.105 10.773 10.324 9.878 9.446 9.02 8.604 8.226 7.827 7.472 7.154 6.862 6.595 6.326 6.078 5.826 5.584 5.369 5.152 4.914 4.709 4.496 4.275 4.09 3.905 3.726 3.526 3.32 3.174 3.027 2.792 2.616 2.444 2.365 2.194 2.007 1.814 1.712 1.471 1.394 1.289 1.167 0.871 0.708 0.548 0.372 0.149 -0.135 -0.513 -1.603 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 3989aaab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9566 ,TETRA ,17590206,Sat Nov 27 19:50:42 CET,Sat Nov 27 21:41:22 CET,0.0 0.571 0.926 1.205 1.457 1.66 1.827 1.979 2.225 2.34 2.452 2.532 2.777 2.888 3.099 3.289 3.469 3.561 3.74 3.904 4.133 4.292 4.454 4.681 4.897 5.111 5.315 5.506 5.756 5.996 6.237 6.538 6.822 7.097 7.414 7.772 8.133 8.515 8.922 9.363 9.824 10.353 10.983 11.628 12.354 13.131 14.025 15.048 16.219 17.519 19.013 20.147 20.711 20.965 21.031 20.988 20.892 20.779 20.682 20.571 20.451 20.325 20.202 20.094 19.983 19.878 19.769 19.675 19.586 19.483 19.375 19.285 19.191 19.088 19.005 18.912 18.809 18.703 18.604 18.535 18.461 18.335 18.247 18.172 18.128 18.025 17.934 17.826 17.768 17.592 17.575 17.501 17.427 17.265 17.176 17.1 17.028 16.924 16.814 16.677 16.313 -2 ,24050 ,TETRA ,17590207,Sat Nov 27 19:52:41 CET,Sat Nov 27 21:45:03 CET,0.0 0.607 0.953 1.222 1.437 1.613 1.779 1.939 2.197 2.323 2.448 2.548 2.796 2.903 3.121 3.336 3.535 3.632 3.821 4.001 4.257 4.419 4.579 4.814 5.038 5.253 5.455 5.656 5.926 6.181 6.419 6.701 6.97 7.242 7.567 7.932 8.284 8.667 9.093 9.545 10.015 10.558 11.188 11.804 12.518 13.333 14.251 15.212 16.379 17.813 19.448 20.548 21.065 21.324 21.395 21.36 21.291 21.189 21.054 20.916 20.797 20.655 20.504 20.357 20.226 20.105 19.944 19.798 19.688 19.581 19.464 19.362 19.258 19.132 19.03 18.932 18.82 18.704 18.589 18.508 18.417 18.282 18.189 18.081 18.025 17.912 17.797 17.676 17.61 17.423 17.379 17.287 17.195 17.011 16.899 16.767 16.637 16.488 16.272 15.99 15.372 -3 ,13781 ,TETRA ,17590208,Sat Nov 27 19:53:42 CET,Sat Nov 27 21:46:37 CET,0.0 0.403 0.597 0.748 0.888 1.014 1.132 1.247 1.454 1.56 1.675 1.742 1.969 2.072 2.284 2.486 2.676 2.769 2.953 3.127 3.37 3.519 3.673 3.908 4.127 4.335 4.544 4.756 5.02 5.272 5.515 5.802 6.089 6.367 6.688 7.052 7.397 7.784 8.216 8.68 9.168 9.693 10.299 10.937 11.69 12.483 13.386 14.419 15.577 16.861 18.369 19.497 19.99 20.216 20.287 20.277 20.23 20.14 20.036 19.903 19.779 19.663 19.544 19.41 19.26 19.119 18.973 18.843 18.727 18.601 18.468 18.352 18.221 18.066 17.948 17.833 17.712 17.59 17.457 17.364 17.272 17.117 17.008 16.892 16.83 16.699 16.561 16.417 16.339 16.147 16.079 15.981 15.883 15.675 15.562 15.428 15.253 15.052 14.855 14.6 14.111 -4 ,31562 ,TETRA ,17590209,Sat Nov 27 19:58:41 CET,Sat Nov 27 21:49:27 CET,0.0 0.574 0.759 0.907 1.046 1.171 1.28 1.387 1.618 1.731 1.833 1.878 2.104 2.194 2.368 2.538 2.7 2.776 2.929 3.082 3.297 3.439 3.581 3.789 3.99 4.181 4.369 4.559 4.807 5.045 5.282 5.575 5.866 6.158 6.49 6.869 7.228 7.61 8.037 8.486 8.963 9.515 10.146 10.769 11.5 12.297 13.218 14.285 15.479 16.84 18.394 19.47 19.944 20.148 20.207 20.155 20.049 19.95 19.865 19.751 19.628 19.519 19.402 19.27 19.134 18.996 18.852 18.722 18.606 18.48 18.341 18.224 18.101 17.965 17.862 17.761 17.649 17.523 17.388 17.297 17.205 17.06 16.945 16.823 16.763 16.647 16.523 16.384 16.321 16.14 16.131 16.063 15.994 15.849 15.77 15.679 15.58 15.489 15.364 15.227 15.07 -5 ,1090 ,TETRA ,17590210,Sat Nov 27 19:59:41 CET,Sat Nov 27 21:53:57 CET,0.0 0.274 0.476 0.63 0.765 0.9 1.031 1.148 1.355 1.468 1.583 1.656 1.888 1.983 2.173 2.359 2.518 2.595 2.752 2.902 3.129 3.272 3.424 3.661 3.883 4.108 4.317 4.504 4.747 5.001 5.264 5.566 5.846 6.122 6.449 6.818 7.161 7.524 7.914 8.346 8.815 9.341 9.952 10.578 11.323 12.138 13.046 14.068 15.272 16.624 18.093 19.114 19.591 19.828 19.917 19.913 19.868 19.775 19.665 19.551 19.425 19.282 19.145 19.018 18.876 18.74 18.604 18.467 18.344 18.225 18.1 17.989 17.875 17.754 17.663 17.566 17.451 17.335 17.212 17.125 17.037 16.897 16.801 16.708 16.662 16.561 16.453 16.335 16.274 16.093 16.079 16.016 15.942 15.756 15.674 15.587 15.491 15.399 15.3 15.164 14.813 -6 ,21710 ,TETRA ,17590211,Sat Nov 27 19:59:42 CET,Sat Nov 27 21:54:48 CET,0.0 0.283 0.464 0.62 0.782 0.925 1.059 1.181 1.406 1.518 1.628 1.7 1.934 2.021 2.182 2.351 2.516 2.598 2.757 2.898 3.121 3.279 3.437 3.666 3.891 4.115 4.331 4.539 4.802 5.061 5.324 5.638 5.924 6.203 6.534 6.898 7.253 7.645 8.057 8.505 8.98 9.525 10.147 10.769 11.498 12.296 13.193 14.183 15.351 16.732 18.268 19.303 19.783 20.022 20.107 20.092 20.025 19.941 19.832 19.697 19.573 19.44 19.304 19.158 19.027 18.922 18.802 18.683 18.558 18.425 18.289 18.17 18.051 17.937 17.845 17.749 17.661 17.57 17.467 17.396 17.328 17.216 17.135 17.052 17.008 16.917 16.827 16.737 16.683 16.507 16.514 16.456 16.388 16.239 16.165 16.075 15.97 15.877 15.786 15.645 15.415 -7 ,4115 ,TETRA ,17590212,Sat Nov 27 19:59:41 CET,Sat Nov 27 21:49:51 CET,0.0 1.136 1.522 1.805 2.013 2.192 2.372 2.532 2.823 2.968 3.105 3.216 3.461 3.565 3.773 3.99 4.192 4.276 4.448 4.628 4.879 5.033 5.179 5.388 5.606 5.824 6.031 6.231 6.485 6.731 6.973 7.277 7.571 7.851 8.18 8.538 8.888 9.274 9.688 10.146 10.635 11.191 11.825 12.474 13.245 14.082 15.045 16.105 17.3 18.671 20.198 21.221 21.662 21.879 21.965 21.951 21.864 21.762 21.676 21.541 21.4 21.271 21.143 21.018 20.887 20.762 20.624 20.496 20.388 20.264 20.121 20.0 19.875 19.738 19.622 19.497 19.38 19.258 19.128 19.045 18.95 18.798 18.702 18.603 18.547 18.419 18.272 18.113 18.032 17.832 17.789 17.705 17.611 17.434 17.348 17.267 17.184 17.071 16.901 16.728 16.309 -8 ,8903 ,TETRA ,17590213,Sat Nov 27 19:59:43 CET,Sat Nov 27 21:50:19 CET,0.0 0.329 0.549 0.737 0.893 1.031 1.156 1.272 1.468 1.579 1.692 1.749 1.981 2.078 2.26 2.419 2.569 2.644 2.797 2.954 3.186 3.336 3.476 3.67 3.871 4.08 4.282 4.48 4.746 5.005 5.25 5.545 5.842 6.12 6.419 6.771 7.125 7.512 7.932 8.37 8.84 9.384 10.016 10.663 11.416 12.213 13.094 14.094 15.223 16.471 17.963 19.043 19.548 19.807 19.916 19.915 19.837 19.719 19.594 19.457 19.327 19.197 19.068 18.94 18.805 18.681 18.548 18.417 18.296 18.172 18.041 17.931 17.817 17.695 17.599 17.495 17.376 17.246 17.112 17.022 16.928 16.792 16.695 16.59 16.536 16.415 16.279 16.126 16.048 15.852 15.811 15.74 15.672 15.525 15.445 15.359 15.256 15.139 15.015 14.849 14.656 -9 ,16282 ,TETRA ,17590214,Sat Nov 27 19:59:41 CET,Sat Nov 27 21:53:35 CET,0.0 0.356 0.588 0.741 0.892 1.049 1.17 1.283 1.522 1.629 1.728 1.777 2.005 2.105 2.289 2.46 2.626 2.704 2.863 3.014 3.239 3.389 3.526 3.729 3.932 4.12 4.302 4.488 4.741 4.992 5.228 5.524 5.816 6.086 6.409 6.774 7.123 7.516 7.939 8.386 8.862 9.413 10.038 10.639 11.344 12.127 13.006 13.981 15.147 16.577 18.15 19.192 19.709 19.94 20.024 20.041 19.979 19.889 19.798 19.672 19.536 19.407 19.287 19.161 19.044 18.919 18.781 18.664 18.554 18.433 18.308 18.195 18.063 17.933 17.842 17.749 17.663 17.572 17.467 17.392 17.314 17.195 17.117 17.036 16.994 16.904 16.808 16.714 16.666 16.495 16.504 16.446 16.377 16.221 16.13 16.034 15.939 15.84 15.732 15.596 15.288 -10 ,18919 ,TETRA ,17590215,Sat Nov 27 19:59:42 CET,Sat Nov 27 21:49:24 CET,0.0 0.799 1.145 1.37 1.561 1.723 1.878 2.034 2.305 2.428 2.553 2.651 2.893 2.998 3.198 3.383 3.559 3.65 3.817 3.98 4.221 4.386 4.553 4.779 4.998 5.205 5.407 5.61 5.865 6.112 6.359 6.659 6.95 7.227 7.545 7.91 8.269 8.667 9.081 9.511 9.966 10.488 11.076 11.677 12.411 13.218 14.137 15.117 16.279 17.712 19.298 20.358 20.853 21.117 21.221 21.21 21.114 20.989 20.885 20.764 20.661 20.556 20.416 20.265 20.115 19.987 19.851 19.709 19.585 19.461 19.326 19.21 19.083 18.951 18.851 18.74 18.625 18.511 18.388 18.306 18.231 18.111 18.026 17.94 17.899 17.809 17.703 17.61 17.565 17.395 17.403 17.346 17.29 17.157 17.08 16.996 16.901 16.807 16.7 16.565 16.102 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt deleted file mode 100644 index ddd7ff0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2173 ,TETRA ,17590216,Sat Nov 27 19:59:41 CET,Sat Nov 27 21:51:28 CET,0.0 0.491 0.663 0.785 0.906 1.026 1.132 1.227 1.407 1.483 1.555 1.551 1.749 1.811 1.92 2.034 2.167 2.235 2.371 2.499 2.66 2.763 2.873 3.024 3.16 3.289 3.405 3.507 3.632 3.764 3.902 4.061 4.198 4.324 4.48 4.662 4.835 5.027 5.229 5.425 5.602 5.787 5.98 6.154 6.321 6.461 6.546 6.566 6.507 6.169 5.159 3.63 2.278 1.077 0.051 -0.847 -1.666 -2.432 -3.06 -3.676 -4.231 -4.734 -5.187 -5.594 -5.977 -6.325 -6.693 -7.02 -7.3 -7.584 -7.888 -8.144 -8.398 -8.665 -8.87 -9.078 -9.294 -9.51 -9.732 -9.884 -10.045 -10.305 -10.48 -10.65 -10.732 -10.886 -11.051 -11.238 -11.331 -11.574 -11.622 -11.721 -11.828 -12.077 -12.203 -12.318 -12.432 -12.565 -12.719 -12.905 -13.143 -2 ,24866 ,TETRA ,17590217,Sat Nov 27 19:59:42 CET,Sat Nov 27 21:51:44 CET,0.0 0.483 0.656 0.786 0.924 1.051 1.144 1.233 1.398 1.473 1.547 1.553 1.755 1.812 1.935 2.054 2.159 2.214 2.33 2.431 2.573 2.67 2.765 2.909 3.046 3.175 3.291 3.401 3.555 3.703 3.84 3.998 4.14 4.289 4.458 4.626 4.784 4.962 5.144 5.312 5.472 5.642 5.842 6.017 6.192 6.357 6.496 6.557 6.449 6.057 5.188 3.78 2.424 1.221 0.2 -0.711 -1.523 -2.26 -2.901 -3.521 -4.059 -4.543 -4.99 -5.409 -5.805 -6.173 -6.537 -6.845 -7.117 -7.397 -7.666 -7.898 -8.155 -8.415 -8.611 -8.816 -9.027 -9.247 -9.486 -9.649 -9.81 -10.048 -10.217 -10.399 -10.491 -10.681 -10.875 -11.078 -11.179 -11.433 -11.52 -11.647 -11.776 -12.067 -12.229 -12.397 -12.577 -12.795 -13.052 -13.338 -14.005 -3 ,16920 ,TETRA ,17590218,Sat Nov 27 19:59:42 CET,Sat Nov 27 21:54:10 CET,0.0 0.327 0.471 0.614 0.747 0.857 0.954 1.032 1.191 1.266 1.33 1.322 1.519 1.578 1.698 1.817 1.925 1.976 2.079 2.171 2.305 2.39 2.471 2.595 2.708 2.807 2.909 3.01 3.126 3.246 3.377 3.538 3.692 3.831 3.992 4.159 4.309 4.481 4.659 4.831 5.012 5.224 5.438 5.623 5.794 5.906 6.0 6.009 5.857 5.463 4.481 2.938 1.531 0.293 -0.79 -1.729 -2.575 -3.341 -3.988 -4.648 -5.223 -5.739 -6.206 -6.643 -7.045 -7.407 -7.782 -8.111 -8.396 -8.682 -8.966 -9.205 -9.463 -9.719 -9.907 -10.104 -10.301 -10.494 -10.701 -10.847 -10.992 -11.209 -11.37 -11.534 -11.61 -11.769 -11.944 -12.119 -12.209 -12.451 -12.492 -12.59 -12.686 -12.881 -12.98 -13.095 -13.237 -13.408 -13.589 -13.796 -14.267 -4 ,10982 ,TETRA ,17590219,Sat Nov 27 19:59:42 CET,Sat Nov 27 21:50:37 CET,0.0 0.309 0.491 0.654 0.797 0.915 1.013 1.1 1.25 1.322 1.41 1.456 1.679 1.762 1.91 2.057 2.206 2.271 2.39 2.506 2.664 2.77 2.88 3.033 3.167 3.293 3.416 3.526 3.661 3.792 3.919 4.071 4.23 4.397 4.575 4.748 4.909 5.082 5.263 5.432 5.604 5.797 6.004 6.19 6.347 6.442 6.507 6.522 6.394 5.965 4.984 3.56 2.223 1.025 -0.038 -0.985 -1.815 -2.567 -3.234 -3.913 -4.464 -4.933 -5.383 -5.821 -6.232 -6.598 -6.967 -7.296 -7.587 -7.876 -8.166 -8.406 -8.657 -8.917 -9.122 -9.328 -9.539 -9.77 -10.012 -10.169 -10.334 -10.588 -10.762 -10.944 -11.037 -11.23 -11.438 -11.66 -11.767 -12.018 -12.063 -12.164 -12.271 -12.478 -12.584 -12.712 -12.853 -12.994 -13.165 -13.417 -13.912 -5 ,11773 ,TETRA ,17590220,Sat Nov 27 19:59:45 CET,Sat Nov 27 21:47:46 CET,0.0 0.393 0.577 0.707 0.821 0.919 1.006 1.086 1.23 1.294 1.362 1.371 1.578 1.651 1.783 1.894 1.997 2.049 2.15 2.24 2.372 2.46 2.543 2.662 2.777 2.885 2.98 3.074 3.202 3.318 3.45 3.618 3.762 3.901 4.068 4.243 4.39 4.552 4.738 4.927 5.105 5.302 5.51 5.67 5.808 5.948 6.055 6.057 5.944 5.527 4.504 2.963 1.572 0.374 -0.666 -1.622 -2.482 -3.249 -3.9 -4.538 -5.081 -5.541 -5.961 -6.369 -6.755 -7.099 -7.445 -7.746 -8.015 -8.278 -8.53 -8.747 -8.986 -9.23 -9.411 -9.598 -9.789 -9.98 -10.18 -10.325 -10.471 -10.693 -10.853 -11.013 -11.095 -11.282 -11.466 -11.642 -11.733 -11.971 -12.003 -12.108 -12.215 -12.422 -12.53 -12.641 -12.765 -12.902 -13.045 -13.211 -13.742 -6 ,6649 ,TETRA ,17590221,Sat Nov 27 19:59:42 CET,Sat Nov 27 21:50:07 CET,0.0 0.602 0.785 0.938 1.053 1.157 1.267 1.361 1.516 1.591 1.66 1.659 1.86 1.922 2.035 2.15 2.265 2.326 2.443 2.538 2.674 2.768 2.85 2.954 3.065 3.182 3.284 3.384 3.52 3.66 3.792 3.946 4.094 4.234 4.406 4.585 4.745 4.925 5.112 5.294 5.487 5.688 5.896 6.069 6.23 6.387 6.504 6.509 6.378 5.994 5.003 3.531 2.171 0.982 -0.07 -1.014 -1.837 -2.578 -3.23 -3.901 -4.468 -4.962 -5.421 -5.85 -6.251 -6.604 -6.966 -7.294 -7.576 -7.87 -8.177 -8.426 -8.675 -8.931 -9.138 -9.347 -9.562 -9.787 -10.012 -10.166 -10.322 -10.557 -10.731 -10.917 -11.006 -11.188 -11.385 -11.575 -11.661 -11.9 -11.953 -12.057 -12.161 -12.377 -12.506 -12.639 -12.783 -12.937 -13.092 -13.264 -13.545 -7 ,20858 ,TETRA ,17590222,Sat Nov 27 19:59:45 CET,Sat Nov 27 21:50:20 CET,0.0 0.399 0.563 0.718 0.852 0.964 1.061 1.162 1.383 1.484 1.578 1.625 1.849 1.942 2.102 2.233 2.363 2.428 2.556 2.679 2.841 2.939 3.044 3.195 3.331 3.465 3.581 3.694 3.85 3.994 4.132 4.307 4.46 4.589 4.746 4.921 5.079 5.259 5.448 5.636 5.823 6.009 6.197 6.366 6.524 6.642 6.729 6.75 6.642 6.25 5.208 3.73 2.422 1.202 0.139 -0.781 -1.604 -2.372 -3.008 -3.623 -4.167 -4.648 -5.1 -5.519 -5.915 -6.283 -6.658 -6.996 -7.295 -7.597 -7.89 -8.133 -8.389 -8.644 -8.84 -9.049 -9.275 -9.496 -9.698 -9.836 -9.982 -10.192 -10.333 -10.497 -10.582 -10.751 -10.92 -11.099 -11.196 -11.44 -11.488 -11.589 -11.696 -11.925 -12.046 -12.167 -12.292 -12.415 -12.564 -12.794 -13.292 -8 ,11371 ,TETRA ,17590223,Sat Nov 27 19:59:42 CET,Sat Nov 27 21:50:01 CET,0.0 0.327 0.48 0.619 0.742 0.844 0.929 1.018 1.21 1.297 1.372 1.367 1.564 1.625 1.735 1.842 1.946 1.996 2.097 2.205 2.365 2.471 2.58 2.743 2.896 3.028 3.139 3.251 3.404 3.551 3.682 3.824 3.962 4.1 4.249 4.412 4.567 4.74 4.906 5.066 5.246 5.434 5.626 5.797 5.941 6.056 6.162 6.182 6.015 5.556 4.586 3.149 1.761 0.543 -0.492 -1.434 -2.252 -2.964 -3.598 -4.27 -4.845 -5.331 -5.772 -6.194 -6.591 -6.954 -7.322 -7.637 -7.913 -8.221 -8.531 -8.767 -9.027 -9.295 -9.492 -9.695 -9.911 -10.148 -10.386 -10.542 -10.703 -10.947 -11.114 -11.299 -11.391 -11.578 -11.78 -12.001 -12.121 -12.376 -12.454 -12.573 -12.686 -12.931 -13.073 -13.21 -13.349 -13.5 -13.662 -13.859 -14.324 -9 ,5629 ,TETRA ,17590224,Sat Nov 27 19:59:45 CET,Sat Nov 27 21:50:17 CET,0.0 0.433 0.602 0.736 0.853 0.959 1.058 1.147 1.317 1.406 1.48 1.472 1.675 1.738 1.86 1.971 2.087 2.15 2.278 2.39 2.537 2.646 2.75 2.885 3.016 3.15 3.277 3.39 3.531 3.67 3.806 3.965 4.121 4.265 4.433 4.607 4.763 4.936 5.117 5.306 5.478 5.667 5.871 6.043 6.234 6.427 6.557 6.573 6.463 6.06 5.066 3.581 2.21 0.994 -0.047 -0.962 -1.782 -2.516 -3.131 -3.764 -4.308 -4.786 -5.239 -5.662 -6.054 -6.412 -6.788 -7.114 -7.387 -7.671 -7.973 -8.236 -8.505 -8.763 -8.965 -9.173 -9.393 -9.625 -9.859 -10.017 -10.173 -10.417 -10.585 -10.75 -10.836 -11.022 -11.217 -11.421 -11.528 -11.789 -11.879 -11.994 -12.109 -12.348 -12.483 -12.637 -12.808 -13.013 -13.263 -13.533 -13.92 -10 ,7077 ,TETRA ,17590225,Sat Nov 27 19:59:42 CET,Sat Nov 27 21:49:45 CET,0.0 0.174 0.318 0.45 0.554 0.64 0.715 0.798 0.955 1.024 1.092 1.096 1.293 1.349 1.455 1.552 1.657 1.71 1.808 1.903 2.038 2.126 2.201 2.308 2.418 2.517 2.615 2.707 2.823 2.939 3.058 3.209 3.338 3.448 3.587 3.752 3.914 4.075 4.247 4.43 4.596 4.785 4.973 5.122 5.283 5.406 5.501 5.526 5.348 4.876 3.884 2.465 1.157 -0.094 -1.21 -2.169 -2.994 -3.741 -4.39 -5.047 -5.596 -6.065 -6.511 -6.926 -7.294 -7.62 -7.958 -8.26 -8.527 -8.805 -9.094 -9.326 -9.556 -9.792 -9.98 -10.182 -10.376 -10.559 -10.754 -10.884 -11.022 -11.25 -11.401 -11.557 -11.637 -11.801 -11.973 -12.143 -12.232 -12.473 -12.523 -12.634 -12.739 -12.946 -13.055 -13.171 -13.306 -13.461 -13.635 -13.829 -14.178 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt deleted file mode 100644 index 829dd4a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18962 ,TETRA ,17590226,Sat Nov 27 19:59:43 CET,Sat Nov 27 21:49:34 CET,0.0 0.353 0.605 0.82 1.012 1.184 1.347 1.515 1.828 1.98 2.132 2.301 2.594 2.751 3.051 3.344 3.631 3.769 4.044 4.324 4.725 4.98 5.24 5.632 6.015 6.392 6.763 7.13 7.622 8.097 8.565 9.155 9.734 10.299 10.962 11.734 12.511 13.396 14.368 15.431 16.579 17.909 19.5 21.158 23.199 25.588 28.423 31.765 35.929 41.256 48.392 54.95 59.196 62.145 64.341 66.058 67.388 68.47 69.278 69.969 70.497 70.956 71.35 71.664 71.951 72.189 72.399 72.572 72.702 72.822 72.937 73.019 73.098 73.17 73.213 73.251 73.297 73.346 73.385 73.402 73.419 73.437 73.44 73.45 73.453 73.445 73.428 73.414 73.409 73.336 73.38 73.367 73.347 73.291 73.244 73.171 73.106 73.046 72.948 72.8 72.304 -2 ,2846 ,TETRA ,17590227,Sat Nov 27 19:59:44 CET,Sat Nov 27 21:49:59 CET,0.0 0.43 0.674 0.901 1.124 1.332 1.526 1.707 2.061 2.237 2.405 2.595 2.892 3.041 3.331 3.618 3.901 4.045 4.33 4.602 5.006 5.26 5.51 5.893 6.274 6.643 7.007 7.377 7.871 8.347 8.804 9.37 9.935 10.491 11.158 11.941 12.698 13.551 14.508 15.557 16.706 18.051 19.675 21.355 23.365 25.717 28.586 31.989 36.218 41.515 48.541 55.145 59.475 62.537 64.784 66.501 67.772 68.777 69.592 70.333 70.893 71.35 71.736 72.061 72.355 72.597 72.809 72.979 73.122 73.266 73.397 73.489 73.562 73.628 73.659 73.684 73.72 73.746 73.772 73.795 73.807 73.799 73.791 73.795 73.799 73.803 73.8 73.79 73.772 73.687 73.708 73.684 73.651 73.563 73.52 73.472 73.408 73.321 73.232 73.137 72.74 -3 ,27647 ,TETRA ,17590228,Sat Nov 27 19:59:46 CET,Sat Nov 27 21:51:32 CET,0.0 0.446 0.704 0.918 1.113 1.298 1.477 1.648 1.981 2.143 2.306 2.487 2.775 2.93 3.249 3.548 3.84 3.987 4.276 4.569 5.007 5.286 5.562 5.958 6.341 6.738 7.13 7.512 8.015 8.506 8.993 9.584 10.167 10.76 11.455 12.26 13.056 13.932 14.899 15.965 17.113 18.446 20.073 21.773 23.848 26.242 29.093 32.499 36.734 42.07 49.164 55.683 59.953 62.962 65.135 66.767 68.005 69.048 69.88 70.607 71.136 71.571 71.959 72.293 72.577 72.818 73.058 73.241 73.389 73.533 73.667 73.769 73.873 73.969 74.024 74.077 74.12 74.155 74.19 74.217 74.24 74.252 74.255 74.257 74.257 74.259 74.261 74.257 74.247 74.169 74.19 74.161 74.136 74.079 74.043 74.014 73.969 73.891 73.785 73.668 73.401 -4 ,9029 ,TETRA ,17590229,Sat Nov 27 19:59:47 CET,Sat Nov 27 21:51:25 CET,0.0 0.541 0.801 1.017 1.221 1.411 1.59 1.766 2.11 2.271 2.44 2.648 2.94 3.085 3.365 3.651 3.929 4.06 4.326 4.589 4.993 5.266 5.528 5.898 6.264 6.629 6.985 7.346 7.836 8.316 8.791 9.374 9.936 10.489 11.151 11.918 12.675 13.54 14.502 15.538 16.668 17.996 19.598 21.271 23.285 25.654 28.501 31.845 36.075 41.403 48.404 54.919 59.264 62.356 64.603 66.321 67.598 68.625 69.439 70.153 70.701 71.15 71.533 71.866 72.153 72.389 72.611 72.79 72.937 73.089 73.222 73.301 73.379 73.459 73.506 73.551 73.593 73.619 73.638 73.652 73.656 73.636 73.616 73.592 73.577 73.558 73.533 73.495 73.477 73.394 73.372 73.323 73.27 73.143 73.085 73.009 72.894 72.739 72.537 72.26 71.548 -5 ,12064 ,TETRA ,17590230,Sat Nov 27 19:59:44 CET,Sat Nov 27 21:50:10 CET,0.0 0.394 0.655 0.882 1.103 1.307 1.491 1.683 2.078 2.263 2.448 2.688 2.996 3.164 3.482 3.781 4.073 4.216 4.507 4.785 5.2 5.48 5.749 6.133 6.499 6.877 7.251 7.621 8.112 8.584 9.065 9.678 10.282 10.864 11.534 12.31 13.099 13.995 14.971 16.021 17.168 18.508 20.112 21.79 23.835 26.2 29.055 32.445 36.635 41.956 49.053 55.572 59.826 62.854 65.067 66.787 68.099 69.133 69.923 70.638 71.17 71.598 71.969 72.277 72.542 72.767 72.983 73.157 73.304 73.448 73.587 73.692 73.786 73.865 73.923 73.982 74.038 74.094 74.137 74.157 74.176 74.208 74.214 74.218 74.222 74.205 74.192 74.174 74.149 74.068 74.079 74.041 74.006 73.923 73.881 73.833 73.785 73.724 73.625 73.51 73.092 -6 ,31890 ,TETRA ,17590231,Sat Nov 27 19:59:44 CET,Sat Nov 27 21:53:24 CET,0.0 0.617 0.913 1.139 1.339 1.531 1.705 1.87 2.181 2.334 2.488 2.67 2.966 3.123 3.425 3.722 4.022 4.161 4.426 4.703 5.135 5.414 5.678 6.065 6.448 6.821 7.208 7.593 8.093 8.586 9.063 9.658 10.256 10.842 11.529 12.319 13.106 13.997 14.966 16.021 17.168 18.503 20.112 21.761 23.778 26.139 28.966 32.346 36.535 41.879 48.988 55.469 59.727 62.748 64.924 66.625 67.928 68.966 69.78 70.486 71.029 71.482 71.873 72.19 72.45 72.667 72.879 73.058 73.189 73.313 73.443 73.532 73.609 73.688 73.743 73.791 73.841 73.889 73.932 73.952 73.96 73.97 73.973 73.954 73.945 73.947 73.936 73.915 73.903 73.832 73.875 73.858 73.832 73.765 73.729 73.686 73.619 73.536 73.431 73.246 72.677 -7 ,29718 ,TETRA ,17590232,Sat Nov 27 19:59:44 CET,Sat Nov 27 21:50:41 CET,0.0 0.399 0.67 0.899 1.106 1.32 1.525 1.718 2.087 2.258 2.431 2.616 2.901 3.058 3.353 3.644 3.936 4.074 4.349 4.623 5.033 5.301 5.566 5.979 6.384 6.777 7.173 7.564 8.074 8.569 9.055 9.653 10.244 10.829 11.522 12.319 13.101 13.98 14.956 16.021 17.167 18.506 20.138 21.83 23.88 26.263 29.122 32.505 36.707 42.062 49.176 55.802 60.177 63.18 65.29 66.936 68.237 69.263 70.058 70.774 71.325 71.772 72.17 72.505 72.77 72.999 73.217 73.391 73.531 73.666 73.782 73.872 73.955 74.024 74.061 74.091 74.119 74.145 74.178 74.192 74.197 74.196 74.197 74.187 74.18 74.163 74.136 74.114 74.102 74.021 74.052 74.032 74.003 73.93 73.888 73.848 73.796 73.729 73.655 73.522 73.138 -8 ,17876 ,TETRA ,17590233,Sat Nov 27 19:59:43 CET,Sat Nov 27 21:50:00 CET,0.0 0.444 0.685 0.919 1.113 1.304 1.496 1.682 2.078 2.259 2.43 2.627 2.919 3.087 3.423 3.745 4.056 4.207 4.5 4.789 5.234 5.525 5.805 6.211 6.601 6.992 7.381 7.758 8.253 8.733 9.216 9.825 10.406 10.979 11.677 12.461 13.211 14.081 15.062 16.129 17.272 18.62 20.249 21.891 23.912 26.279 29.114 32.47 36.613 41.944 49.024 55.529 59.787 62.797 65.005 66.69 67.993 69.037 69.845 70.577 71.119 71.561 71.969 72.332 72.638 72.885 73.106 73.29 73.448 73.604 73.741 73.844 73.944 74.029 74.089 74.144 74.187 74.231 74.287 74.314 74.332 74.343 74.353 74.369 74.373 74.381 74.372 74.355 74.35 74.274 74.283 74.255 74.228 74.155 74.102 74.049 73.998 73.923 73.812 73.686 73.242 -9 ,30959 ,TETRA ,17590234,Sat Nov 27 19:59:44 CET,Sat Nov 27 21:50:42 CET,0.0 0.338 0.605 0.847 1.049 1.237 1.42 1.594 1.934 2.103 2.263 2.426 2.709 2.862 3.166 3.449 3.71 3.84 4.097 4.355 4.737 4.99 5.245 5.63 6.013 6.391 6.763 7.124 7.603 8.085 8.561 9.142 9.724 10.311 11.013 11.821 12.603 13.478 14.45 15.516 16.685 18.023 19.62 21.305 23.345 25.687 28.481 31.815 36.013 41.364 48.526 55.094 59.296 62.253 64.46 66.186 67.5 68.52 69.301 70.01 70.552 71.002 71.393 71.712 71.973 72.196 72.415 72.583 72.716 72.849 72.968 73.051 73.125 73.2 73.252 73.3 73.343 73.371 73.397 73.412 73.42 73.424 73.42 73.403 73.393 73.369 73.327 73.287 73.266 73.17 73.144 73.103 73.07 72.98 72.902 72.808 72.694 72.555 72.398 72.199 71.715 -10 ,6292 ,TETRA ,17590235,Sat Nov 27 19:59:46 CET,Sat Nov 27 21:50:21 CET,0.0 0.468 0.746 0.981 1.183 1.37 1.549 1.74 2.109 2.276 2.437 2.621 2.918 3.072 3.383 3.682 3.965 4.1 4.37 4.645 5.046 5.308 5.567 5.953 6.348 6.733 7.105 7.479 7.983 8.469 8.957 9.569 10.167 10.757 11.453 12.253 13.046 13.947 14.942 16.033 17.195 18.537 20.177 21.869 23.877 26.21 29.043 32.447 36.679 41.997 48.997 55.439 59.746 62.885 65.257 67.088 68.48 69.624 70.503 71.295 71.911 72.396 72.828 73.206 73.52 73.779 74.029 74.231 74.388 74.542 74.671 74.768 74.867 74.963 75.037 75.091 75.133 75.179 75.227 75.256 75.272 75.291 75.286 75.269 75.259 75.239 75.209 75.176 75.157 75.065 75.067 75.035 74.99 74.838 74.75 74.657 74.546 74.432 74.328 74.19 73.754 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 3988ef85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6101 ,TETRA ,17590236,Sat Nov 27 19:59:44 CET,Sat Nov 27 21:51:12 CET,0.0 0.333 0.542 0.717 0.874 1.009 1.148 1.303 1.603 1.732 1.858 1.964 2.227 2.347 2.589 2.805 3.013 3.119 3.327 3.522 3.796 3.975 4.147 4.413 4.676 4.926 5.171 5.411 5.727 6.033 6.331 6.69 7.049 7.403 7.812 8.285 8.729 9.202 9.735 10.31 10.939 11.649 12.46 13.3 14.322 15.488 16.833 18.363 20.191 22.423 25.194 27.543 28.931 29.81 30.426 30.856 31.137 31.354 31.503 31.601 31.65 31.688 31.698 31.682 31.659 31.611 31.562 31.532 31.499 31.454 31.409 31.363 31.319 31.292 31.25 31.194 31.143 31.094 31.036 30.987 30.94 30.872 30.819 30.76 30.733 30.683 30.622 30.565 30.536 30.375 30.399 30.352 30.312 30.226 30.166 30.092 30.009 29.921 29.804 29.661 29.435 -2 ,12873 ,TETRA ,17590237,Sat Nov 27 19:59:45 CET,Sat Nov 27 21:52:25 CET,0.0 0.247 0.454 0.633 0.792 0.939 1.074 1.206 1.459 1.582 1.703 1.78 2.037 2.138 2.339 2.539 2.737 2.83 3.012 3.185 3.433 3.596 3.764 4.026 4.296 4.55 4.783 5.02 5.353 5.674 5.969 6.327 6.683 7.042 7.446 7.884 8.323 8.834 9.381 9.956 10.568 11.279 12.124 12.974 13.958 15.059 16.376 17.883 19.68 21.865 24.566 26.882 28.297 29.197 29.763 30.157 30.425 30.61 30.725 30.811 30.866 30.897 30.912 30.899 30.89 30.878 30.843 30.812 30.769 30.705 30.646 30.595 30.529 30.46 30.405 30.336 30.255 30.183 30.106 30.054 29.994 29.889 29.817 29.744 29.706 29.632 29.573 29.502 29.462 29.31 29.34 29.287 29.236 29.122 29.068 29.012 28.926 28.798 28.648 28.499 28.242 -3 ,27139 ,TETRA ,17590238,Sat Nov 27 19:59:47 CET,Sat Nov 27 21:52:21 CET,0.0 0.453 0.719 0.931 1.092 1.244 1.393 1.535 1.802 1.918 2.025 2.102 2.367 2.475 2.68 2.876 3.067 3.162 3.359 3.555 3.838 4.022 4.204 4.469 4.724 4.979 5.228 5.474 5.788 6.09 6.393 6.765 7.114 7.451 7.847 8.319 8.776 9.263 9.789 10.364 10.987 11.695 12.551 13.426 14.426 15.558 16.899 18.419 20.224 22.38 25.109 27.47 28.88 29.79 30.373 30.767 31.071 31.304 31.452 31.535 31.571 31.604 31.62 31.596 31.565 31.549 31.518 31.475 31.438 31.403 31.363 31.329 31.297 31.266 31.237 31.199 31.158 31.111 31.055 31.016 30.973 30.899 30.841 30.783 30.752 30.685 30.614 30.536 30.501 30.345 30.375 30.325 30.275 30.176 30.115 30.051 29.982 29.903 29.802 29.677 29.219 -4 ,2026 ,TETRA ,17590239,Sat Nov 27 19:59:48 CET,Sat Nov 27 21:50:47 CET,0.0 0.446 0.646 0.824 0.979 1.124 1.264 1.391 1.656 1.797 1.927 2.039 2.319 2.443 2.683 2.914 3.135 3.243 3.449 3.643 3.924 4.11 4.296 4.575 4.851 5.103 5.338 5.575 5.89 6.204 6.503 6.863 7.222 7.574 7.978 8.436 8.893 9.405 9.952 10.506 11.111 11.828 12.669 13.522 14.518 15.61 16.915 18.472 20.307 22.51 25.299 27.609 28.958 29.819 30.405 30.841 31.138 31.35 31.48 31.559 31.606 31.632 31.639 31.628 31.605 31.577 31.538 31.496 31.47 31.445 31.417 31.393 31.364 31.329 31.294 31.251 31.205 31.149 31.089 31.041 30.99 30.916 30.859 30.798 30.766 30.694 30.618 30.544 30.504 30.346 30.373 30.322 30.264 30.163 30.105 30.022 29.932 29.842 29.743 29.605 29.309 -5 ,24180 ,TETRA ,17590240,Sat Nov 27 19:59:45 CET,Sat Nov 27 21:51:17 CET,0.0 0.387 0.567 0.731 0.897 1.045 1.196 1.336 1.571 1.688 1.801 1.859 2.115 2.224 2.43 2.625 2.815 2.908 3.088 3.262 3.516 3.685 3.848 4.088 4.334 4.577 4.816 5.043 5.325 5.603 5.884 6.242 6.599 6.944 7.33 7.765 8.204 8.705 9.241 9.819 10.435 11.128 11.951 12.785 13.78 14.906 16.204 17.747 19.6 21.786 24.535 26.895 28.314 29.23 29.851 30.282 30.562 30.766 30.897 30.997 31.062 31.1 31.111 31.092 31.06 31.034 31.0 30.956 30.917 30.871 30.807 30.749 30.682 30.602 30.545 30.482 30.404 30.319 30.238 30.185 30.131 30.059 30.0 29.934 29.908 29.859 29.795 29.726 29.689 29.531 29.556 29.511 29.472 29.37 29.313 29.244 29.149 29.064 28.943 28.79 28.593 -6 ,23565 ,TETRA ,17590241,Sat Nov 27 19:59:45 CET,Sat Nov 27 21:50:59 CET,0.0 0.651 0.938 1.163 1.385 1.598 1.781 1.953 2.272 2.409 2.541 2.65 2.922 3.046 3.288 3.506 3.704 3.806 4.005 4.206 4.495 4.677 4.859 5.115 5.367 5.626 5.864 6.104 6.428 6.73 7.022 7.378 7.733 8.074 8.475 8.929 9.355 9.845 10.393 10.982 11.604 12.31 13.166 14.022 15.045 16.223 17.584 19.144 20.939 23.053 25.753 28.08 29.453 30.32 30.917 31.347 31.648 31.858 31.996 32.1 32.153 32.179 32.183 32.177 32.17 32.148 32.137 32.128 32.1 32.066 32.029 32.003 31.97 31.92 31.876 31.83 31.774 31.717 31.651 31.603 31.557 31.488 31.432 31.368 31.342 31.286 31.212 31.129 31.088 30.927 30.95 30.9 30.846 30.737 30.683 30.615 30.539 30.47 30.376 30.227 29.941 -7 ,21135 ,TETRA ,17590242,Sat Nov 27 20:00:12 CET,Sat Nov 27 21:51:10 CET,0.0 0.673 1.017 1.287 1.5 1.673 1.831 1.985 2.284 2.435 2.583 2.708 2.984 3.109 3.338 3.553 3.756 3.858 4.06 4.256 4.551 4.745 4.929 5.2 5.463 5.714 5.958 6.194 6.5 6.803 7.091 7.443 7.798 8.143 8.551 9.012 9.469 9.974 10.507 11.081 11.71 12.42 13.24 14.06 15.05 16.22 17.55 19.012 20.789 23.008 25.745 28.053 29.441 30.342 30.934 31.35 31.66 31.89 32.043 32.162 32.232 32.258 32.262 32.257 32.244 32.217 32.176 32.138 32.099 32.059 32.003 31.944 31.88 31.817 31.777 31.731 31.679 31.628 31.567 31.525 31.485 31.413 31.362 31.311 31.279 31.207 31.132 31.045 31.0 30.838 30.848 30.794 30.741 30.623 30.556 30.488 30.411 30.32 30.206 30.064 29.852 -8 ,1849 ,TETRA ,17590243,Sat Nov 27 20:00:12 CET,Sat Nov 27 21:52:14 CET,0.0 0.413 0.678 0.881 1.061 1.209 1.341 1.466 1.698 1.816 1.936 2.011 2.266 2.371 2.578 2.779 2.965 3.053 3.222 3.4 3.678 3.863 4.035 4.278 4.524 4.765 5.006 5.253 5.575 5.887 6.193 6.547 6.893 7.249 7.661 8.124 8.576 9.057 9.576 10.155 10.778 11.475 12.296 13.157 14.188 15.334 16.693 18.264 20.074 22.262 24.96 27.214 28.574 29.465 30.08 30.503 30.796 30.989 31.107 31.198 31.258 31.302 31.322 31.314 31.286 31.25 31.202 31.146 31.098 31.047 30.986 30.936 30.875 30.806 30.751 30.688 30.62 30.546 30.471 30.413 30.356 30.267 30.202 30.132 30.093 30.01 29.931 29.85 29.809 29.651 29.701 29.663 29.626 29.529 29.458 29.376 29.284 29.186 29.074 28.95 28.662 -9 ,32605 ,TETRA ,17590244,Sat Nov 27 20:00:14 CET,Sat Nov 27 21:52:06 CET,0.0 1.02 1.313 1.546 1.765 1.969 2.162 2.338 2.652 2.792 2.927 3.041 3.313 3.437 3.658 3.869 4.087 4.194 4.397 4.589 4.873 5.061 5.25 5.525 5.783 6.041 6.295 6.543 6.867 7.173 7.472 7.847 8.205 8.546 8.951 9.416 9.858 10.339 10.885 11.475 12.091 12.793 13.617 14.449 15.419 16.57 17.92 19.443 21.323 23.564 26.265 28.59 29.938 30.773 31.34 31.759 32.087 32.324 32.468 32.557 32.587 32.593 32.595 32.603 32.608 32.592 32.552 32.517 32.482 32.431 32.379 32.336 32.278 32.202 32.155 32.109 32.048 31.985 31.909 31.856 31.807 31.744 31.693 31.631 31.599 31.532 31.464 31.394 31.355 31.195 31.216 31.16 31.108 31.001 30.932 30.846 30.75 30.654 30.535 30.392 30.228 -10 ,1954 ,TETRA ,17590245,Sat Nov 27 20:04:12 CET,Sat Nov 27 21:59:35 CET,0.0 0.321 0.493 0.663 0.831 0.991 1.141 1.281 1.539 1.655 1.77 1.847 2.11 2.217 2.427 2.626 2.816 2.907 3.085 3.268 3.54 3.717 3.888 4.131 4.366 4.597 4.816 5.037 5.332 5.617 5.892 6.238 6.583 6.914 7.311 7.756 8.172 8.647 9.198 9.785 10.394 11.102 11.941 12.802 13.818 14.945 16.254 17.747 19.535 21.739 24.512 26.885 28.284 29.166 29.744 30.135 30.423 30.634 30.737 30.8 30.862 30.892 30.885 30.867 30.849 30.831 30.791 30.737 30.691 30.645 30.59 30.541 30.478 30.407 30.352 30.283 30.215 30.142 30.064 30.011 29.946 29.846 29.792 29.745 29.718 29.658 29.593 29.521 29.481 29.322 29.354 29.311 29.265 29.138 29.073 29.013 28.942 28.856 28.754 28.643 28.475 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt deleted file mode 100644 index 354fee33..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23071 ,TETRA ,17590246,Sat Nov 27 20:04:12 CET,Sat Nov 27 21:58:51 CET,0.0 1.268 1.54 1.714 1.864 1.977 2.068 2.14 2.26 2.316 2.363 2.374 2.464 2.484 2.523 2.562 2.602 2.608 2.598 2.591 2.557 2.524 2.498 2.458 2.408 2.351 2.293 2.232 2.133 2.009 1.869 1.705 1.555 1.389 1.171 0.904 0.63 0.298 -0.114 -0.588 -1.137 -1.809 -2.639 -3.558 -4.744 -6.219 -8.119 -10.559 -13.868 -18.44 -25.303 -32.581 -37.964 -42.198 -45.573 -48.365 -50.679 -52.668 -54.297 -55.836 -57.104 -58.186 -59.185 -60.109 -60.95 -61.709 -62.472 -63.141 -63.712 -64.277 -64.846 -65.31 -65.785 -66.274 -66.646 -67.015 -67.386 -67.761 -68.149 -68.415 -68.679 -69.081 -69.356 -69.624 -69.759 -70.044 -70.328 -70.609 -70.755 -71.038 -71.209 -71.365 -71.525 -71.85 -72.013 -72.196 -72.407 -72.602 -72.803 -73.063 -73.685 -2 ,3163 ,TETRA ,17590247,Sat Nov 27 20:05:11 CET,Sat Nov 27 21:44:10 CET,0.0 0.577 0.707 0.802 0.899 0.972 1.028 1.069 1.113 1.125 1.131 1.081 1.157 1.166 1.184 1.187 1.172 1.166 1.16 1.16 1.147 1.124 1.095 1.042 0.988 0.938 0.877 0.811 0.722 0.618 0.499 0.341 0.181 -0.002 -0.24 -0.506 -0.792 -1.147 -1.559 -2.031 -2.564 -3.211 -4.029 -4.926 -6.078 -7.519 -9.389 -11.791 -15.057 -19.579 -26.325 -33.508 -38.893 -43.101 -46.43 -49.231 -51.545 -53.518 -55.145 -56.726 -58.015 -59.129 -60.175 -61.111 -61.956 -62.707 -63.464 -64.137 -64.716 -65.291 -65.858 -66.314 -66.784 -67.265 -67.627 -67.998 -68.373 -68.755 -69.139 -69.396 -69.651 -70.032 -70.296 -70.563 -70.696 -70.968 -71.237 -71.51 -71.653 -71.933 -72.097 -72.261 -72.438 -72.796 -72.976 -73.167 -73.373 -73.6 -73.819 -74.049 -74.479 -3 ,1389 ,TETRA ,17590248,Sat Nov 27 20:10:12 CET,Sat Nov 27 21:59:48 CET,0.0 0.576 0.724 0.815 0.901 0.968 1.014 1.054 1.122 1.145 1.165 1.139 1.215 1.214 1.211 1.209 1.197 1.193 1.18 1.165 1.136 1.109 1.078 1.019 0.96 0.908 0.846 0.774 0.664 0.551 0.439 0.28 0.098 -0.099 -0.335 -0.608 -0.893 -1.248 -1.642 -2.091 -2.619 -3.25 -4.077 -5.012 -6.216 -7.676 -9.529 -11.943 -15.24 -19.871 -26.768 -33.978 -39.292 -43.444 -46.799 -49.607 -51.906 -53.892 -55.533 -57.081 -58.352 -59.456 -60.491 -61.429 -62.274 -63.027 -63.772 -64.422 -64.979 -65.544 -66.125 -66.598 -67.08 -67.575 -67.942 -68.301 -68.674 -69.071 -69.471 -69.738 -70.004 -70.391 -70.649 -70.912 -71.047 -71.33 -71.603 -71.886 -72.037 -72.319 -72.462 -72.604 -72.757 -73.068 -73.233 -73.401 -73.573 -73.764 -74.024 -74.33 -74.687 -4 ,27807 ,TETRA ,17590249,Sat Nov 27 20:10:12 CET,Sat Nov 27 22:00:06 CET,0.0 0.539 0.715 0.811 0.878 0.93 0.997 1.035 1.066 1.095 1.12 1.089 1.16 1.155 1.142 1.144 1.134 1.122 1.095 1.072 1.057 1.039 1.005 0.942 0.883 0.812 0.732 0.662 0.545 0.41 0.283 0.124 -0.046 -0.22 -0.439 -0.717 -0.999 -1.328 -1.713 -2.176 -2.722 -3.384 -4.237 -5.17 -6.348 -7.805 -9.697 -12.09 -15.293 -19.803 -26.538 -33.684 -39.02 -43.223 -46.59 -49.398 -51.709 -53.682 -55.297 -56.877 -58.191 -59.298 -60.322 -61.249 -62.089 -62.84 -63.59 -64.239 -64.784 -65.346 -65.928 -66.392 -66.861 -67.35 -67.722 -68.099 -68.488 -68.887 -69.281 -69.548 -69.827 -70.242 -70.512 -70.779 -70.917 -71.196 -71.461 -71.716 -71.849 -72.132 -72.283 -72.432 -72.584 -72.898 -73.072 -73.261 -73.467 -73.674 -73.898 -74.191 -74.748 -5 ,8438 ,TETRA ,17590250,Sat Nov 27 20:10:12 CET,Sat Nov 27 21:48:34 CET,0.0 0.335 0.456 0.557 0.65 0.715 0.773 0.826 0.946 1.001 1.037 1.05 1.144 1.171 1.205 1.216 1.221 1.219 1.211 1.201 1.174 1.151 1.126 1.084 1.033 0.976 0.909 0.84 0.746 0.644 0.535 0.376 0.215 0.03 -0.214 -0.5 -0.792 -1.121 -1.523 -2.004 -2.539 -3.179 -4.005 -4.923 -6.11 -7.586 -9.491 -11.936 -15.256 -19.788 -26.524 -33.728 -39.076 -43.247 -46.588 -49.402 -51.706 -53.668 -55.3 -56.867 -58.163 -59.274 -60.301 -61.243 -62.097 -62.861 -63.628 -64.286 -64.843 -65.419 -65.996 -66.462 -66.939 -67.427 -67.811 -68.192 -68.572 -68.97 -69.379 -69.66 -69.942 -70.355 -70.632 -70.921 -71.069 -71.368 -71.673 -71.976 -72.128 -72.42 -72.615 -72.776 -72.92 -73.223 -73.387 -73.565 -73.776 -74.018 -74.284 -74.57 -75.182 -6 ,29890 ,TETRA ,17590251,Sat Nov 27 20:11:11 CET,Sat Nov 27 22:01:35 CET,0.0 0.823 1.06 1.245 1.373 1.492 1.602 1.684 1.819 1.856 1.886 1.879 1.961 1.981 2.005 2.023 2.047 2.06 2.074 2.079 2.068 2.05 2.031 1.992 1.943 1.88 1.805 1.725 1.601 1.475 1.351 1.191 1.027 0.85 0.621 0.345 0.058 -0.292 -0.69 -1.141 -1.665 -2.341 -3.205 -4.14 -5.337 -6.818 -8.713 -11.12 -14.425 -19.038 -25.895 -33.138 -38.479 -42.634 -45.965 -48.794 -51.112 -53.058 -54.707 -56.295 -57.579 -58.695 -59.729 -60.669 -61.523 -62.269 -63.03 -63.695 -64.256 -64.825 -65.406 -65.874 -66.338 -66.812 -67.189 -67.578 -67.962 -68.343 -68.729 -68.988 -69.255 -69.692 -69.979 -70.257 -70.397 -70.664 -70.937 -71.216 -71.359 -71.635 -71.793 -71.947 -72.101 -72.418 -72.588 -72.765 -72.937 -73.128 -73.365 -73.638 -74.322 -7 ,25999 ,TETRA ,17590252,Sat Nov 27 20:12:11 CET,Sat Nov 27 22:02:06 CET,0.0 0.294 0.445 0.562 0.65 0.727 0.793 0.852 0.962 1.014 1.058 1.074 1.166 1.186 1.232 1.259 1.248 1.25 1.258 1.245 1.225 1.198 1.159 1.106 1.055 1.003 0.943 0.866 0.751 0.623 0.494 0.333 0.162 -0.017 -0.242 -0.513 -0.799 -1.144 -1.547 -2.001 -2.51 -3.149 -4.0 -4.951 -6.142 -7.593 -9.494 -11.943 -15.231 -19.819 -26.711 -33.969 -39.32 -43.513 -46.862 -49.65 -51.953 -53.941 -55.594 -57.186 -58.497 -59.616 -60.648 -61.593 -62.42 -63.15 -63.901 -64.547 -65.102 -65.678 -66.276 -66.76 -67.23 -67.706 -68.076 -68.457 -68.851 -69.246 -69.64 -69.904 -70.172 -70.58 -70.856 -71.141 -71.285 -71.584 -71.898 -72.216 -72.373 -72.669 -72.879 -73.068 -73.263 -73.644 -73.852 -74.085 -74.357 -74.643 -74.946 -75.388 -76.52 -8 ,16443 ,TETRA ,17590253,Sat Nov 27 20:12:14 CET,Sat Nov 27 22:02:51 CET,0.0 0.469 0.626 0.729 0.804 0.859 0.909 0.961 1.027 1.056 1.069 1.016 1.084 1.087 1.079 1.063 1.058 1.053 1.016 0.977 0.927 0.887 0.84 0.777 0.71 0.626 0.534 0.437 0.308 0.177 0.027 -0.172 -0.365 -0.561 -0.792 -1.07 -1.363 -1.689 -2.071 -2.527 -3.066 -3.723 -4.541 -5.451 -6.647 -8.123 -10.001 -12.439 -15.792 -20.421 -27.256 -34.497 -39.883 -44.036 -47.345 -50.135 -52.442 -54.425 -56.049 -57.607 -58.905 -60.015 -61.023 -61.949 -62.799 -63.559 -64.314 -64.966 -65.517 -66.068 -66.633 -67.088 -67.539 -67.991 -68.328 -68.675 -69.032 -69.39 -69.751 -69.997 -70.248 -70.622 -70.868 -71.114 -71.243 -71.519 -71.801 -72.091 -72.239 -72.523 -72.686 -72.843 -72.998 -73.312 -73.486 -73.661 -73.834 -74.018 -74.244 -74.55 -75.159 -9 ,5871 ,TETRA ,17590254,Sat Nov 27 20:12:11 CET,Sat Nov 27 21:58:37 CET,0.0 0.464 0.609 0.734 0.809 0.859 0.904 0.937 0.97 0.983 1.0 0.971 1.046 1.056 1.063 1.061 1.058 1.055 1.053 1.05 1.034 1.012 0.991 0.965 0.931 0.879 0.804 0.719 0.601 0.481 0.361 0.21 0.05 -0.118 -0.347 -0.639 -0.928 -1.277 -1.698 -2.195 -2.753 -3.426 -4.297 -5.245 -6.432 -7.891 -9.77 -12.177 -15.439 -19.957 -26.737 -33.967 -39.368 -43.585 -46.928 -49.732 -52.064 -54.068 -55.7 -57.243 -58.521 -59.629 -60.655 -61.595 -62.439 -63.181 -63.946 -64.618 -65.197 -65.785 -66.362 -66.828 -67.304 -67.786 -68.151 -68.523 -68.901 -69.284 -69.687 -69.962 -70.241 -70.674 -70.968 -71.256 -71.396 -71.689 -71.995 -72.299 -72.465 -72.783 -73.008 -73.192 -73.386 -73.781 -73.983 -74.191 -74.413 -74.665 -74.916 -75.174 -75.773 -10 ,3324 ,TETRA ,17590255,Sat Nov 27 20:12:11 CET,Sat Nov 27 21:50:42 CET,0.0 0.306 0.423 0.536 0.646 0.708 0.761 0.804 0.851 0.87 0.89 0.861 0.93 0.933 0.936 0.928 0.922 0.916 0.894 0.877 0.839 0.802 0.76 0.679 0.596 0.512 0.425 0.34 0.213 0.08 -0.042 -0.206 -0.395 -0.58 -0.797 -1.077 -1.369 -1.7 -2.095 -2.558 -3.081 -3.738 -4.593 -5.518 -6.674 -8.11 -10.002 -12.429 -15.662 -20.212 -27.087 -34.328 -39.647 -43.799 -47.153 -49.964 -52.272 -54.252 -55.871 -57.421 -58.71 -59.803 -60.803 -61.732 -62.574 -63.318 -64.09 -64.768 -65.324 -65.88 -66.451 -66.918 -67.399 -67.888 -68.265 -68.656 -69.044 -69.423 -69.806 -70.073 -70.355 -70.786 -71.08 -71.38 -71.533 -71.846 -72.146 -72.45 -72.615 -72.917 -73.107 -73.278 -73.478 -73.902 -74.112 -74.338 -74.563 -74.782 -75.019 -75.346 -76.15 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index 75d33d33..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29641 ,TETRA ,17590256,Sat Nov 27 20:12:11 CET,Sat Nov 27 22:05:08 CET,0.0 0.231 0.344 0.459 0.563 0.654 0.738 0.816 0.955 1.022 1.091 1.081 1.268 1.33 1.445 1.552 1.655 1.706 1.812 1.914 2.049 2.137 2.219 2.339 2.453 2.559 2.662 2.766 2.911 3.046 3.176 3.328 3.473 3.615 3.777 3.961 4.137 4.338 4.546 4.749 4.949 5.173 5.456 5.703 5.938 6.192 6.465 6.702 6.856 6.865 6.585 5.909 5.211 4.545 3.937 3.374 2.877 2.389 1.908 1.446 1.075 0.738 0.416 0.116 -0.165 -0.435 -0.718 -0.967 -1.188 -1.418 -1.667 -1.874 -2.084 -2.302 -2.47 -2.644 -2.81 -2.968 -3.132 -3.25 -3.385 -3.592 -3.723 -3.863 -3.94 -4.098 -4.252 -4.414 -4.506 -4.73 -4.779 -4.884 -5.003 -5.263 -5.389 -5.526 -5.667 -5.805 -5.987 -6.264 -6.954 -2 ,11410 ,TETRA ,17590258,Sat Nov 27 20:14:11 CET,Sat Nov 27 22:08:36 CET,0.0 0.347 0.463 0.568 0.674 0.761 0.844 0.922 1.088 1.172 1.24 1.241 1.429 1.48 1.583 1.682 1.79 1.846 1.94 2.033 2.175 2.261 2.339 2.46 2.571 2.67 2.767 2.866 2.999 3.133 3.27 3.438 3.591 3.728 3.876 4.045 4.212 4.383 4.581 4.79 4.989 5.208 5.457 5.691 5.932 6.183 6.438 6.654 6.811 6.895 6.714 6.112 5.387 4.669 4.067 3.497 2.945 2.448 2.029 1.606 1.245 0.891 0.537 0.217 -0.066 -0.327 -0.616 -0.887 -1.118 -1.35 -1.6 -1.805 -2.013 -2.241 -2.416 -2.601 -2.798 -2.994 -3.183 -3.305 -3.444 -3.67 -3.818 -3.976 -4.064 -4.242 -4.428 -4.631 -4.729 -4.956 -5.052 -5.17 -5.267 -5.472 -5.59 -5.736 -5.892 -6.061 -6.26 -6.491 -7.123 -3 ,2301 ,TETRA ,17590259,Sat Nov 27 20:15:11 CET,Sat Nov 27 22:09:00 CET,0.0 0.36 0.541 0.679 0.783 0.883 0.975 1.058 1.199 1.268 1.337 1.339 1.532 1.591 1.701 1.814 1.926 1.982 2.088 2.186 2.322 2.408 2.495 2.615 2.722 2.821 2.932 3.05 3.2 3.343 3.472 3.625 3.77 3.908 4.069 4.247 4.426 4.631 4.847 5.066 5.285 5.523 5.775 6.019 6.3 6.557 6.79 7.0 7.157 7.203 6.944 6.286 5.576 4.91 4.325 3.786 3.301 2.837 2.435 2.039 1.676 1.338 1.019 0.715 0.428 0.176 -0.09 -0.344 -0.564 -0.786 -1.023 -1.225 -1.429 -1.64 -1.802 -1.974 -2.155 -2.347 -2.547 -2.688 -2.829 -3.039 -3.174 -3.31 -3.382 -3.527 -3.683 -3.84 -3.931 -4.169 -4.236 -4.347 -4.463 -4.7 -4.832 -4.984 -5.161 -5.357 -5.588 -5.841 -6.553 -4 ,21409 ,TETRA ,17590260,Sat Nov 27 20:15:11 CET,Sat Nov 27 22:06:15 CET,0.0 0.538 0.787 0.979 1.15 1.294 1.414 1.516 1.703 1.792 1.873 1.92 2.131 2.204 2.342 2.462 2.578 2.639 2.759 2.871 3.031 3.132 3.231 3.378 3.523 3.662 3.796 3.915 4.05 4.195 4.347 4.508 4.647 4.79 4.961 5.149 5.323 5.505 5.686 5.883 6.096 6.333 6.606 6.851 7.106 7.37 7.627 7.873 8.095 8.169 7.922 7.296 6.623 5.991 5.405 4.851 4.322 3.823 3.397 2.97 2.59 2.236 1.905 1.596 1.313 1.055 0.794 0.568 0.377 0.17 -0.055 -0.227 -0.404 -0.592 -0.738 -0.898 -1.065 -1.241 -1.412 -1.52 -1.641 -1.84 -1.97 -2.104 -2.176 -2.32 -2.477 -2.649 -2.736 -2.959 -3.019 -3.121 -3.214 -3.426 -3.542 -3.667 -3.806 -3.943 -4.13 -4.397 -5.024 -5 ,31873 ,TETRA ,17590261,Sat Nov 27 20:15:13 CET,Sat Nov 27 22:06:27 CET,0.0 0.341 0.525 0.67 0.791 0.891 0.986 1.074 1.244 1.325 1.402 1.442 1.648 1.719 1.866 2.003 2.141 2.213 2.347 2.472 2.646 2.75 2.851 3.001 3.138 3.262 3.384 3.498 3.635 3.767 3.9 4.056 4.206 4.356 4.534 4.727 4.896 5.092 5.291 5.488 5.693 5.911 6.151 6.395 6.676 6.955 7.224 7.466 7.648 7.657 7.342 6.704 6.036 5.405 4.829 4.261 3.728 3.238 2.824 2.436 2.078 1.751 1.442 1.13 0.838 0.573 0.306 0.071 -0.139 -0.364 -0.603 -0.807 -1.021 -1.243 -1.416 -1.596 -1.774 -1.947 -2.142 -2.287 -2.432 -2.649 -2.796 -2.956 -3.046 -3.23 -3.421 -3.629 -3.736 -3.976 -4.069 -4.196 -4.324 -4.601 -4.747 -4.914 -5.119 -5.322 -5.55 -5.908 -6.912 -6 ,15222 ,TETRA ,17590262,Sat Nov 27 20:15:11 CET,Sat Nov 27 22:08:18 CET,0.0 0.324 0.475 0.6 0.703 0.777 0.849 0.928 1.08 1.172 1.269 1.314 1.524 1.602 1.751 1.903 2.05 2.121 2.247 2.362 2.517 2.617 2.726 2.868 2.995 3.124 3.245 3.362 3.514 3.66 3.793 3.952 4.118 4.268 4.433 4.623 4.794 4.972 5.16 5.349 5.545 5.764 6.021 6.27 6.532 6.804 7.092 7.347 7.551 7.632 7.361 6.712 6.036 5.352 4.733 4.162 3.638 3.181 2.784 2.365 1.992 1.656 1.332 1.005 0.706 0.454 0.182 -0.074 -0.298 -0.528 -0.761 -0.953 -1.152 -1.362 -1.526 -1.693 -1.875 -2.077 -2.274 -2.405 -2.544 -2.769 -2.934 -3.099 -3.185 -3.374 -3.566 -3.752 -3.855 -4.098 -4.203 -4.333 -4.467 -4.745 -4.892 -5.044 -5.223 -5.437 -5.689 -5.955 -6.666 -7 ,13526 ,TETRA ,17590263,Sat Nov 27 20:15:11 CET,Sat Nov 27 22:06:01 CET,0.0 0.419 0.678 0.952 1.177 1.348 1.494 1.614 1.839 1.951 2.054 2.111 2.32 2.39 2.522 2.656 2.79 2.857 2.978 3.084 3.241 3.342 3.442 3.581 3.717 3.847 3.967 4.09 4.254 4.413 4.561 4.732 4.892 5.041 5.208 5.399 5.59 5.782 5.973 6.186 6.414 6.661 6.905 7.136 7.387 7.637 7.913 8.124 8.26 8.282 8.033 7.415 6.685 6.024 5.425 4.851 4.353 3.892 3.472 3.053 2.705 2.384 2.06 1.746 1.439 1.169 0.896 0.645 0.419 0.182 -0.049 -0.24 -0.443 -0.66 -0.827 -0.997 -1.172 -1.335 -1.494 -1.609 -1.74 -1.927 -2.045 -2.183 -2.255 -2.402 -2.564 -2.729 -2.811 -3.027 -3.071 -3.169 -3.27 -3.498 -3.627 -3.763 -3.902 -4.058 -4.284 -4.62 -5.761 -8 ,17222 ,TETRA ,17590264,Sat Nov 27 20:15:11 CET,Sat Nov 27 22:01:16 CET,0.0 0.428 0.649 0.844 1.003 1.157 1.299 1.419 1.633 1.736 1.833 1.897 2.112 2.197 2.352 2.492 2.636 2.703 2.826 2.94 3.087 3.177 3.267 3.403 3.536 3.657 3.775 3.894 4.046 4.194 4.342 4.504 4.65 4.801 4.981 5.185 5.371 5.558 5.747 5.952 6.166 6.391 6.636 6.863 7.112 7.38 7.649 7.894 8.099 8.175 7.964 7.371 6.695 6.019 5.392 4.817 4.295 3.815 3.385 2.938 2.553 2.217 1.897 1.563 1.252 0.995 0.712 0.458 0.246 0.021 -0.221 -0.421 -0.631 -0.843 -1.005 -1.183 -1.372 -1.564 -1.763 -1.894 -2.029 -2.251 -2.406 -2.572 -2.654 -2.823 -3.018 -3.209 -3.307 -3.557 -3.661 -3.785 -3.915 -4.225 -4.403 -4.578 -4.748 -4.965 -5.277 -5.695 -6.57 -9 ,20607 ,TETRA ,17590265,Sat Nov 27 20:15:11 CET,Sat Nov 27 22:09:14 CET,0.0 0.167 0.296 0.413 0.508 0.591 0.666 0.741 0.879 0.953 1.024 1.014 1.211 1.27 1.373 1.478 1.584 1.633 1.725 1.81 1.947 2.032 2.108 2.226 2.346 2.453 2.55 2.651 2.785 2.915 3.042 3.19 3.329 3.457 3.606 3.77 3.928 4.106 4.296 4.5 4.718 4.952 5.205 5.444 5.687 5.95 6.208 6.431 6.629 6.672 6.416 5.822 5.104 4.407 3.786 3.195 2.668 2.175 1.728 1.295 0.918 0.571 0.254 -0.032 -0.309 -0.574 -0.847 -1.088 -1.293 -1.512 -1.751 -1.957 -2.17 -2.392 -2.56 -2.719 -2.895 -3.11 -3.32 -3.454 -3.601 -3.827 -3.977 -4.147 -4.234 -4.41 -4.579 -4.742 -4.824 -5.038 -5.095 -5.197 -5.301 -5.529 -5.656 -5.792 -5.935 -6.092 -6.273 -6.524 -7.238 -10 ,1704 ,TETRA ,17590266,Sat Nov 27 20:16:11 CET,Sat Nov 27 22:09:14 CET,0.0 0.295 0.442 0.558 0.657 0.747 0.826 0.902 1.045 1.112 1.179 1.187 1.388 1.45 1.571 1.698 1.827 1.891 2.004 2.112 2.268 2.364 2.457 2.595 2.728 2.855 2.982 3.107 3.263 3.412 3.546 3.709 3.87 4.017 4.174 4.343 4.515 4.708 4.914 5.122 5.342 5.583 5.83 6.053 6.307 6.569 6.799 7.01 7.216 7.298 7.085 6.479 5.855 5.248 4.637 4.076 3.558 3.083 2.686 2.261 1.89 1.569 1.248 0.932 0.634 0.362 0.073 -0.199 -0.43 -0.654 -0.887 -1.096 -1.308 -1.513 -1.673 -1.844 -2.016 -2.193 -2.382 -2.503 -2.627 -2.816 -2.946 -3.084 -3.157 -3.318 -3.473 -3.638 -3.724 -3.949 -3.991 -4.091 -4.198 -4.405 -4.512 -4.624 -4.768 -4.933 -5.123 -5.416 -6.309 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt deleted file mode 100644 index 3db8a4c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21623 ,TETRA ,17590267,Sat Nov 27 20:16:11 CET,Sat Nov 27 22:07:30 CET,0.0 0.195 0.36 0.519 0.663 0.782 0.896 0.989 1.156 1.239 1.323 1.353 1.563 1.643 1.794 1.939 2.089 2.163 2.3 2.442 2.642 2.766 2.891 3.075 3.251 3.423 3.601 3.784 4.022 4.26 4.489 4.757 5.024 5.287 5.59 5.934 6.276 6.647 7.039 7.461 7.92 8.43 9.013 9.589 10.256 11.024 11.916 12.913 14.112 15.531 17.203 18.497 19.193 19.607 19.814 19.894 19.883 19.835 19.757 19.65 19.528 19.405 19.289 19.175 19.056 18.922 18.785 18.664 18.545 18.418 18.29 18.19 18.087 17.953 17.851 17.75 17.64 17.525 17.4 17.31 17.213 17.068 16.969 16.859 16.8 16.672 16.521 16.373 16.314 16.132 16.105 16.037 15.962 15.81 15.734 15.644 15.524 15.392 15.252 15.047 14.474 -2 ,32050 ,TETRA ,17590268,Sat Nov 27 20:16:12 CET,Sat Nov 27 22:07:10 CET,0.0 0.673 0.862 0.994 1.12 1.243 1.36 1.463 1.637 1.729 1.82 1.865 2.086 2.178 2.363 2.534 2.692 2.774 2.939 3.103 3.339 3.482 3.627 3.84 4.044 4.241 4.432 4.624 4.866 5.101 5.328 5.599 5.866 6.12 6.419 6.758 7.073 7.425 7.815 8.229 8.682 9.201 9.797 10.391 11.084 11.859 12.764 13.791 15.004 16.443 18.108 19.346 19.977 20.348 20.527 20.575 20.579 20.55 20.496 20.404 20.294 20.18 20.068 19.939 19.814 19.706 19.591 19.482 19.372 19.252 19.124 19.012 18.893 18.761 18.653 18.545 18.432 18.306 18.175 18.088 18.005 17.861 17.743 17.624 17.563 17.444 17.327 17.193 17.124 16.945 16.888 16.792 16.691 16.476 16.358 16.222 16.057 15.868 15.666 15.406 14.579 -3 ,14539 ,TETRA ,17590269,Sat Nov 27 20:16:14 CET,Sat Nov 27 22:08:22 CET,0.0 0.265 0.407 0.535 0.658 0.777 0.902 1.013 1.201 1.289 1.374 1.4 1.615 1.699 1.859 2.006 2.16 2.244 2.413 2.581 2.811 2.946 3.084 3.295 3.494 3.699 3.894 4.07 4.299 4.515 4.729 5.007 5.277 5.541 5.852 6.185 6.515 6.88 7.276 7.695 8.12 8.616 9.227 9.848 10.539 11.304 12.221 13.253 14.431 15.798 17.435 18.747 19.415 19.79 19.961 20.003 20.008 19.995 19.953 19.859 19.76 19.658 19.542 19.414 19.289 19.174 19.05 18.935 18.831 18.73 18.624 18.527 18.421 18.316 18.238 18.157 18.065 17.956 17.843 17.77 17.692 17.577 17.496 17.417 17.38 17.295 17.189 17.082 17.027 16.848 16.845 16.782 16.703 16.519 16.417 16.318 16.214 16.097 15.944 15.739 15.416 -4 ,28682 ,TETRA ,17590270,Sat Nov 27 20:16:11 CET,Sat Nov 27 22:06:33 CET,0.0 0.387 0.585 0.723 0.849 0.966 1.071 1.175 1.372 1.465 1.559 1.618 1.852 1.967 2.181 2.376 2.554 2.635 2.797 2.967 3.214 3.37 3.521 3.743 3.952 4.143 4.337 4.519 4.746 4.967 5.188 5.467 5.73 5.99 6.301 6.658 6.999 7.366 7.766 8.193 8.64 9.152 9.742 10.33 11.016 11.782 12.688 13.72 14.906 16.274 17.849 19.088 19.778 20.138 20.312 20.378 20.394 20.382 20.323 20.22 20.121 20.029 19.93 19.835 19.724 19.599 19.467 19.351 19.244 19.136 19.031 18.943 18.85 18.745 18.665 18.581 18.497 18.409 18.313 18.246 18.171 18.043 17.959 17.861 17.814 17.718 17.604 17.488 17.428 17.252 17.227 17.145 17.07 16.938 16.856 16.749 16.62 16.49 16.325 16.132 15.483 -5 ,16566 ,TETRA ,17590271,Sat Nov 27 20:16:11 CET,Sat Nov 27 22:07:13 CET,0.0 0.226 0.426 0.555 0.668 0.777 0.883 0.98 1.162 1.255 1.344 1.398 1.619 1.699 1.862 2.02 2.176 2.248 2.378 2.514 2.718 2.847 2.972 3.152 3.326 3.503 3.669 3.827 4.045 4.254 4.461 4.713 4.956 5.196 5.474 5.786 6.098 6.464 6.873 7.302 7.744 8.242 8.813 9.4 10.101 10.893 11.809 12.819 14.0 15.38 17.048 18.349 19.037 19.39 19.544 19.606 19.598 19.521 19.425 19.329 19.226 19.12 19.016 18.911 18.788 18.663 18.537 18.413 18.312 18.223 18.133 18.04 17.942 17.841 17.755 17.669 17.582 17.484 17.385 17.321 17.245 17.125 17.045 16.965 16.924 16.827 16.721 16.609 16.552 16.378 16.358 16.28 16.207 16.048 15.958 15.858 15.757 15.65 15.51 15.355 14.886 -6 ,25058 ,TETRA ,17590272,Sat Nov 27 20:16:12 CET,Sat Nov 27 22:07:07 CET,0.0 0.303 0.455 0.589 0.709 0.836 0.962 1.069 1.256 1.342 1.427 1.478 1.701 1.796 1.982 2.175 2.359 2.444 2.614 2.772 2.999 3.151 3.297 3.5 3.692 3.886 4.078 4.257 4.484 4.716 4.944 5.213 5.474 5.732 6.03 6.369 6.707 7.082 7.476 7.895 8.335 8.838 9.435 10.034 10.748 11.54 12.414 13.438 14.687 16.121 17.797 19.164 19.857 20.179 20.33 20.398 20.395 20.354 20.298 20.208 20.114 20.001 19.882 19.773 19.66 19.554 19.432 19.314 19.209 19.09 18.957 18.832 18.699 18.579 18.488 18.383 18.268 18.149 18.026 17.941 17.849 17.697 17.591 17.483 17.424 17.292 17.158 17.016 16.936 16.746 16.701 16.609 16.518 16.325 16.214 16.102 15.978 15.839 15.694 15.486 14.747 -7 ,13570 ,TETRA ,17590273,Sat Nov 27 20:17:12 CET,Sat Nov 27 21:50:15 CET,0.0 0.289 0.448 0.597 0.727 0.846 0.959 1.084 1.343 1.459 1.57 1.66 1.897 2.006 2.215 2.413 2.615 2.708 2.886 3.052 3.277 3.422 3.565 3.792 4.014 4.214 4.403 4.594 4.837 5.071 5.297 5.573 5.843 6.099 6.399 6.733 7.064 7.445 7.852 8.283 8.744 9.259 9.862 10.473 11.17 11.972 12.907 13.945 15.193 16.624 18.218 19.447 20.098 20.437 20.6 20.672 20.67 20.616 20.557 20.484 20.402 20.318 20.216 20.097 19.975 19.872 19.766 19.655 19.551 19.444 19.333 19.232 19.137 19.046 18.965 18.879 18.789 18.699 18.598 18.523 18.451 18.349 18.278 18.195 18.152 18.052 17.943 17.838 17.782 17.605 17.582 17.503 17.417 17.25 17.158 17.057 16.948 16.823 16.681 16.511 15.962 -8 ,17675 ,TETRA ,17590274,Sat Nov 27 20:17:12 CET,Sat Nov 27 22:08:55 CET,0.0 0.319 0.496 0.64 0.76 0.871 0.972 1.069 1.265 1.355 1.441 1.477 1.686 1.763 1.92 2.069 2.207 2.276 2.413 2.548 2.75 2.882 3.01 3.194 3.372 3.555 3.728 3.883 4.093 4.318 4.545 4.815 5.079 5.339 5.645 5.988 6.316 6.683 7.086 7.518 7.964 8.453 9.027 9.618 10.335 11.129 12.031 13.106 14.34 15.756 17.415 18.748 19.464 19.816 19.985 20.065 20.078 20.045 19.979 19.886 19.782 19.671 19.546 19.425 19.312 19.208 19.091 18.969 18.864 18.749 18.621 18.516 18.413 18.305 18.221 18.136 18.042 17.948 17.846 17.769 17.694 17.578 17.496 17.415 17.375 17.294 17.197 17.099 17.05 16.872 16.851 16.785 16.718 16.553 16.458 16.343 16.209 16.072 15.938 15.746 14.759 -9 ,15012 ,TETRA ,17590275,Sat Nov 27 20:17:12 CET,Sat Nov 27 22:08:24 CET,0.0 0.367 0.537 0.677 0.797 0.91 1.026 1.145 1.331 1.412 1.504 1.546 1.754 1.828 1.978 2.127 2.275 2.35 2.504 2.668 2.918 3.074 3.213 3.42 3.631 3.831 4.021 4.205 4.439 4.655 4.875 5.14 5.391 5.638 5.924 6.252 6.578 6.942 7.351 7.798 8.263 8.783 9.395 10.018 10.745 11.546 12.486 13.534 14.715 16.104 17.742 19.033 19.714 20.093 20.258 20.303 20.288 20.25 20.195 20.114 20.012 19.9 19.797 19.694 19.584 19.462 19.323 19.19 19.067 18.933 18.802 18.698 18.596 18.487 18.393 18.299 18.208 18.118 18.028 17.964 17.891 17.779 17.702 17.612 17.563 17.464 17.353 17.232 17.172 17.0 16.984 16.908 16.83 16.665 16.579 16.48 16.364 16.213 16.016 15.803 15.446 -10 ,2570 ,TETRA ,17590276,Sat Nov 27 20:18:11 CET,Sat Nov 27 22:09:41 CET,0.0 0.473 0.751 1.003 1.231 1.427 1.588 1.731 2.006 2.142 2.27 2.343 2.568 2.665 2.873 3.066 3.237 3.326 3.501 3.671 3.913 4.058 4.198 4.412 4.611 4.803 4.997 5.179 5.416 5.65 5.865 6.124 6.388 6.656 6.977 7.322 7.641 7.991 8.371 8.775 9.211 9.715 10.304 10.914 11.625 12.408 13.309 14.327 15.499 16.901 18.57 19.831 20.5 20.846 21.035 21.127 21.103 21.036 20.946 20.841 20.753 20.653 20.546 20.437 20.321 20.208 20.095 19.997 19.913 19.831 19.741 19.662 19.574 19.481 19.407 19.323 19.236 19.147 19.055 18.981 18.9 18.779 18.694 18.609 18.565 18.473 18.385 18.294 18.243 18.078 18.068 17.989 17.908 17.749 17.67 17.587 17.478 17.335 17.171 16.962 16.317 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt deleted file mode 100644 index 60600f77..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31235 ,TETRA ,17590277,Sat Nov 27 20:18:12 CET,Sat Nov 27 22:09:34 CET,0.0 0.552 0.78 0.969 1.133 1.275 1.417 1.564 1.869 2.01 2.133 2.23 2.458 2.554 2.748 2.938 3.126 3.214 3.374 3.53 3.748 3.887 4.013 4.183 4.36 4.531 4.691 4.854 5.075 5.276 5.455 5.692 5.928 6.139 6.38 6.673 6.951 7.238 7.548 7.862 8.185 8.558 8.984 9.4 9.901 10.449 11.014 11.627 12.329 13.105 13.809 14.126 14.149 14.014 13.794 13.522 13.27 13.039 12.81 12.561 12.335 12.114 11.896 11.691 11.491 11.3 11.099 10.926 10.776 10.618 10.451 10.306 10.151 9.984 9.855 9.727 9.588 9.432 9.281 9.188 9.085 8.923 8.821 8.714 8.653 8.525 8.373 8.212 8.136 7.935 7.904 7.824 7.734 7.516 7.409 7.3 7.178 7.002 6.77 6.509 5.987 -2 ,14495 ,TETRA ,17590278,Sat Nov 27 20:18:13 CET,Sat Nov 27 22:05:10 CET,0.0 0.626 0.835 1.053 1.226 1.355 1.489 1.634 1.887 1.997 2.09 2.123 2.336 2.408 2.539 2.676 2.816 2.881 3.012 3.152 3.343 3.455 3.576 3.751 3.918 4.078 4.237 4.402 4.612 4.817 5.018 5.24 5.445 5.657 5.919 6.205 6.469 6.754 7.058 7.378 7.706 8.074 8.503 8.925 9.399 9.921 10.495 11.124 11.827 12.573 13.285 13.606 13.631 13.492 13.28 13.068 12.834 12.571 12.321 12.058 11.828 11.618 11.405 11.202 11.008 10.83 10.642 10.465 10.316 10.165 10.001 9.856 9.697 9.538 9.417 9.293 9.17 9.042 8.9 8.805 8.713 8.562 8.462 8.364 8.311 8.19 8.054 7.919 7.851 7.653 7.623 7.541 7.46 7.273 7.159 7.043 6.913 6.763 6.583 6.365 5.664 -3 ,16943 ,TETRA ,17590279,Sat Nov 27 20:18:13 CET,Sat Nov 27 22:11:05 CET,0.0 0.625 0.85 1.052 1.249 1.426 1.589 1.756 2.065 2.19 2.31 2.398 2.627 2.722 2.915 3.097 3.259 3.334 3.487 3.65 3.866 3.995 4.128 4.316 4.489 4.663 4.835 5.008 5.227 5.43 5.621 5.835 6.068 6.302 6.547 6.82 7.08 7.379 7.714 8.048 8.388 8.754 9.168 9.606 10.113 10.641 11.236 11.894 12.589 13.316 14.04 14.394 14.37 14.213 13.969 13.681 13.414 13.142 12.899 12.648 12.417 12.214 12.021 11.823 11.622 11.434 11.237 11.065 10.912 10.738 10.535 10.362 10.198 10.041 9.92 9.78 9.618 9.447 9.277 9.161 9.044 8.881 8.766 8.624 8.546 8.393 8.238 8.063 7.971 7.758 7.697 7.594 7.478 7.232 7.092 6.93 6.742 6.55 6.345 6.064 5.026 -4 ,2555 ,TETRA ,17590280,Sat Nov 27 20:18:13 CET,Sat Nov 27 22:09:56 CET,0.0 0.47 0.697 0.878 1.037 1.154 1.276 1.394 1.608 1.716 1.818 1.86 2.074 2.153 2.329 2.493 2.642 2.708 2.841 2.975 3.163 3.283 3.391 3.55 3.706 3.865 4.041 4.216 4.431 4.634 4.836 5.093 5.347 5.572 5.821 6.117 6.395 6.681 6.994 7.322 7.667 8.043 8.461 8.89 9.389 9.931 10.535 11.201 11.912 12.639 13.378 13.725 13.736 13.571 13.334 13.117 12.897 12.657 12.425 12.175 11.953 11.748 11.539 11.343 11.145 10.941 10.745 10.577 10.404 10.226 10.064 9.926 9.769 9.595 9.461 9.33 9.19 9.042 8.886 8.77 8.651 8.473 8.351 8.213 8.141 7.994 7.843 7.69 7.606 7.389 7.314 7.211 7.096 6.852 6.723 6.588 6.436 6.285 6.127 5.863 5.081 -5 ,19746 ,TETRA ,17590281,Sat Nov 27 20:19:11 CET,Sat Nov 27 22:10:05 CET,0.0 0.572 0.794 0.962 1.128 1.274 1.405 1.524 1.721 1.816 1.909 1.953 2.163 2.244 2.401 2.547 2.709 2.793 2.954 3.109 3.332 3.465 3.597 3.791 3.975 4.155 4.325 4.497 4.713 4.908 5.103 5.331 5.545 5.759 6.025 6.317 6.598 6.909 7.227 7.566 7.915 8.299 8.739 9.168 9.651 10.174 10.783 11.434 12.134 12.868 13.568 13.892 13.905 13.775 13.571 13.339 13.106 12.877 12.64 12.398 12.173 11.943 11.727 11.522 11.311 11.107 10.895 10.722 10.572 10.407 10.238 10.092 9.944 9.788 9.661 9.534 9.404 9.275 9.14 9.042 8.946 8.793 8.685 8.565 8.502 8.386 8.266 8.125 8.052 7.859 7.831 7.743 7.648 7.45 7.347 7.222 7.072 6.908 6.722 6.443 5.672 -6 ,24916 ,TETRA ,17590282,Sat Nov 27 20:19:12 CET,Sat Nov 27 22:06:09 CET,0.0 0.495 0.718 0.884 1.048 1.169 1.272 1.381 1.611 1.717 1.807 1.859 2.078 2.153 2.297 2.459 2.619 2.687 2.81 2.929 3.123 3.252 3.372 3.545 3.713 3.877 4.042 4.204 4.416 4.622 4.809 5.04 5.268 5.486 5.743 6.024 6.285 6.572 6.878 7.208 7.549 7.928 8.383 8.831 9.315 9.826 10.401 11.037 11.732 12.46 13.176 13.483 13.471 13.355 13.186 12.953 12.689 12.441 12.215 11.978 11.791 11.621 11.449 11.283 11.117 10.951 10.77 10.608 10.473 10.327 10.16 10.018 9.87 9.719 9.613 9.507 9.391 9.275 9.155 9.069 8.986 8.85 8.747 8.645 8.596 8.489 8.381 8.263 8.2 8.012 7.999 7.919 7.831 7.645 7.537 7.399 7.256 7.119 6.942 6.681 5.782 -7 ,560 ,TETRA ,17590283,Sat Nov 27 20:19:12 CET,Sat Nov 27 22:11:53 CET,0.0 1.076 1.266 1.433 1.609 1.771 1.901 2.021 2.255 2.353 2.437 2.472 2.687 2.767 2.925 3.078 3.213 3.275 3.409 3.541 3.715 3.828 3.937 4.102 4.272 4.447 4.621 4.775 4.968 5.168 5.373 5.619 5.848 6.062 6.303 6.57 6.823 7.119 7.445 7.78 8.123 8.486 8.905 9.342 9.839 10.368 10.965 11.62 12.34 13.08 13.77 14.088 14.057 13.852 13.631 13.388 13.128 12.877 12.649 12.389 12.138 11.917 11.698 11.483 11.281 11.093 10.906 10.736 10.578 10.417 10.258 10.132 9.996 9.846 9.722 9.583 9.434 9.284 9.123 9.01 8.894 8.709 8.592 8.476 8.416 8.29 8.145 7.996 7.925 7.724 7.667 7.579 7.491 7.278 7.158 7.034 6.907 6.783 6.602 6.355 5.511 -8 ,15762 ,TETRA ,17590284,Sat Nov 27 20:20:11 CET,Sat Nov 27 22:06:53 CET,0.0 0.746 1.023 1.215 1.378 1.512 1.636 1.76 1.971 2.069 2.169 2.221 2.432 2.509 2.668 2.808 2.937 3.004 3.133 3.255 3.427 3.542 3.658 3.827 3.99 4.135 4.265 4.41 4.612 4.794 4.965 5.179 5.406 5.642 5.897 6.158 6.416 6.705 7.014 7.349 7.704 8.091 8.52 8.957 9.458 9.997 10.605 11.218 11.875 12.577 13.242 13.599 13.589 13.389 13.14 12.888 12.611 12.307 12.069 11.839 11.623 11.419 11.199 10.988 10.8 10.625 10.438 10.281 10.154 10.016 9.87 9.748 9.62 9.482 9.379 9.271 9.154 9.037 8.918 8.837 8.746 8.589 8.484 8.38 8.325 8.204 8.079 7.948 7.88 7.682 7.646 7.575 7.499 7.326 7.217 7.089 6.961 6.805 6.627 6.413 5.799 -9 ,19764 ,TETRA ,17590285,Sat Nov 27 20:20:11 CET,Sat Nov 27 22:11:47 CET,0.0 0.444 0.664 0.838 0.974 1.113 1.239 1.358 1.561 1.653 1.747 1.795 2.013 2.099 2.279 2.472 2.657 2.743 2.897 3.045 3.264 3.404 3.534 3.726 3.914 4.082 4.247 4.411 4.612 4.8 4.983 5.211 5.43 5.632 5.864 6.137 6.408 6.708 7.032 7.363 7.697 8.074 8.522 8.957 9.44 9.984 10.581 11.198 11.87 12.576 13.259 13.619 13.61 13.45 13.247 13.036 12.82 12.571 12.349 12.107 11.843 11.608 11.389 11.183 11.003 10.822 10.624 10.442 10.27 10.091 9.911 9.765 9.617 9.445 9.308 9.182 9.043 8.882 8.726 8.625 8.525 8.38 8.274 8.153 8.095 7.986 7.86 7.715 7.637 7.443 7.416 7.332 7.251 7.069 6.976 6.87 6.746 6.6 6.423 6.214 5.638 -10 ,6990 ,TETRA ,17590286,Sat Nov 27 20:20:12 CET,Sat Nov 27 22:11:18 CET,0.0 0.695 0.945 1.139 1.293 1.429 1.538 1.648 1.874 1.979 2.075 2.122 2.337 2.415 2.567 2.716 2.852 2.92 3.05 3.17 3.349 3.464 3.586 3.765 3.925 4.072 4.215 4.346 4.513 4.686 4.856 5.066 5.269 5.459 5.68 5.929 6.171 6.443 6.746 7.071 7.409 7.779 8.208 8.64 9.141 9.682 10.27 10.886 11.551 12.294 13.007 13.356 13.379 13.252 13.018 12.736 12.475 12.207 11.955 11.69 11.429 11.191 10.951 10.721 10.524 10.345 10.161 9.984 9.826 9.666 9.485 9.333 9.184 9.024 8.891 8.743 8.606 8.47 8.319 8.206 8.08 7.897 7.775 7.64 7.57 7.43 7.295 7.179 7.113 6.909 6.883 6.806 6.721 6.538 6.439 6.322 6.187 6.037 5.842 5.631 4.833 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt deleted file mode 100644 index 87701eaa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13104 ,TETRA ,17590287,Sat Nov 27 20:20:12 CET,Sat Nov 27 22:11:53 CET,0.0 0.475 0.722 0.916 1.096 1.258 1.419 1.565 1.805 1.917 2.025 2.103 2.35 2.45 2.646 2.829 2.992 3.068 3.225 3.378 3.588 3.723 3.854 4.043 4.23 4.414 4.59 4.761 4.98 5.189 5.39 5.63 5.854 6.068 6.312 6.585 6.842 7.117 7.438 7.772 8.087 8.426 8.832 9.235 9.687 10.199 10.75 11.275 11.824 12.375 12.739 12.76 12.558 12.244 11.891 11.504 11.131 10.764 10.387 9.998 9.701 9.419 9.144 8.896 8.643 8.406 8.162 7.913 7.69 7.462 7.213 7.008 6.804 6.592 6.426 6.254 6.07 5.873 5.67 5.533 5.38 5.144 5.002 4.844 4.75 4.554 4.358 4.14 4.029 3.782 3.689 3.561 3.43 3.174 3.024 2.852 2.669 2.453 2.131 1.719 0.572 -2 ,10916 ,TETRA ,17590288,Sat Nov 27 20:21:12 CET,Sat Nov 27 22:11:36 CET,0.0 0.469 0.706 0.921 1.084 1.212 1.333 1.438 1.638 1.735 1.825 1.86 2.082 2.161 2.325 2.463 2.582 2.644 2.771 2.894 3.065 3.176 3.29 3.465 3.637 3.81 3.969 4.11 4.296 4.474 4.642 4.837 5.019 5.209 5.452 5.731 5.992 6.277 6.568 6.865 7.183 7.525 7.906 8.261 8.681 9.171 9.714 10.256 10.755 11.249 11.69 11.755 11.534 11.18 10.803 10.428 10.055 9.698 9.328 8.931 8.618 8.326 8.039 7.764 7.493 7.253 7.013 6.769 6.55 6.344 6.123 5.935 5.739 5.534 5.374 5.199 5.016 4.826 4.621 4.48 4.329 4.081 3.925 3.768 3.678 3.482 3.27 3.056 2.948 2.693 2.597 2.474 2.348 2.079 1.932 1.779 1.605 1.402 1.171 0.82 -0.393 -3 ,21355 ,TETRA ,17590289,Sat Nov 27 20:21:12 CET,Sat Nov 27 22:14:33 CET,0.0 0.422 0.692 0.868 1.007 1.143 1.263 1.382 1.602 1.699 1.789 1.81 2.029 2.107 2.267 2.424 2.566 2.638 2.784 2.922 3.136 3.277 3.409 3.589 3.766 3.948 4.122 4.285 4.496 4.704 4.895 5.123 5.349 5.57 5.816 6.095 6.361 6.632 6.927 7.227 7.531 7.877 8.288 8.723 9.188 9.644 10.145 10.656 11.204 11.713 12.108 12.131 11.907 11.565 11.172 10.783 10.451 10.111 9.79 9.48 9.182 8.911 8.652 8.384 8.115 7.878 7.627 7.399 7.206 6.991 6.744 6.533 6.327 6.127 5.97 5.79 5.594 5.4 5.208 5.06 4.9 4.677 4.522 4.355 4.266 4.07 3.858 3.636 3.527 3.27 3.149 3.012 2.861 2.512 2.328 2.134 1.891 1.62 1.313 0.87 -0.352 -4 ,8390 ,TETRA ,17590290,Sat Nov 27 20:22:12 CET,Sat Nov 27 22:14:37 CET,0.0 0.389 0.623 0.812 0.951 1.088 1.215 1.329 1.536 1.632 1.736 1.796 2.031 2.112 2.262 2.402 2.529 2.586 2.699 2.825 3.018 3.142 3.258 3.43 3.603 3.77 3.927 4.071 4.256 4.44 4.603 4.79 4.983 5.181 5.416 5.683 5.939 6.219 6.516 6.824 7.154 7.513 7.931 8.361 8.822 9.323 9.863 10.412 10.991 11.597 12.133 12.229 12.012 11.67 11.278 10.88 10.519 10.172 9.847 9.485 9.153 8.865 8.588 8.317 8.052 7.811 7.571 7.344 7.137 6.927 6.701 6.51 6.297 6.063 5.901 5.735 5.574 5.416 5.223 5.08 4.944 4.733 4.592 4.461 4.39 4.227 4.05 3.86 3.756 3.505 3.396 3.274 3.146 2.851 2.697 2.536 2.348 2.131 1.881 1.514 0.637 -5 ,6058 ,TETRA ,17590291,Sat Nov 27 20:22:14 CET,Sat Nov 27 22:15:36 CET,0.0 0.445 0.655 0.787 0.921 1.046 1.169 1.293 1.508 1.601 1.687 1.714 1.94 2.019 2.181 2.336 2.472 2.538 2.675 2.8 2.972 3.092 3.209 3.382 3.558 3.736 3.919 4.09 4.287 4.481 4.684 4.916 5.128 5.336 5.573 5.836 6.094 6.387 6.689 6.999 7.324 7.672 8.075 8.472 8.91 9.385 9.911 10.447 10.999 11.532 11.935 11.977 11.739 11.388 10.986 10.59 10.233 9.84 9.457 9.083 8.777 8.49 8.206 7.934 7.671 7.426 7.157 6.925 6.73 6.503 6.252 6.05 5.854 5.649 5.485 5.304 5.11 4.908 4.707 4.576 4.437 4.213 4.053 3.89 3.805 3.621 3.423 3.214 3.103 2.856 2.744 2.61 2.487 2.223 2.08 1.919 1.734 1.531 1.268 0.972 -0.02 -6 ,31341 ,TETRA ,17590292,Sat Nov 27 20:22:12 CET,Sat Nov 27 22:12:16 CET,0.0 0.558 0.722 0.853 0.997 1.132 1.248 1.36 1.579 1.682 1.779 1.816 2.036 2.116 2.277 2.426 2.567 2.636 2.772 2.906 3.105 3.233 3.358 3.541 3.707 3.862 4.007 4.144 4.319 4.485 4.647 4.842 5.042 5.241 5.461 5.697 5.939 6.222 6.52 6.835 7.145 7.491 7.896 8.285 8.756 9.254 9.78 10.355 10.933 11.42 11.736 11.648 11.355 11.051 10.712 10.331 9.94 9.569 9.246 8.879 8.545 8.242 7.961 7.712 7.449 7.191 6.927 6.683 6.468 6.25 6.033 5.847 5.652 5.439 5.269 5.104 4.929 4.747 4.547 4.399 4.25 4.025 3.87 3.701 3.607 3.406 3.202 2.983 2.864 2.606 2.496 2.364 2.222 1.907 1.742 1.55 1.349 1.127 0.86 0.533 -0.824 -7 ,27578 ,TETRA ,17590293,Sat Nov 27 20:22:13 CET,Sat Nov 27 22:13:33 CET,0.0 0.463 0.644 0.804 0.941 1.072 1.201 1.318 1.537 1.633 1.717 1.737 1.955 2.038 2.195 2.341 2.487 2.561 2.711 2.845 3.032 3.15 3.262 3.429 3.586 3.75 3.917 4.066 4.256 4.453 4.648 4.872 5.092 5.309 5.548 5.82 6.095 6.392 6.698 7.025 7.365 7.742 8.169 8.583 9.031 9.49 9.997 10.554 11.158 11.732 12.204 12.22 11.963 11.664 11.33 10.973 10.598 10.229 9.9 9.537 9.218 8.919 8.611 8.32 8.052 7.806 7.55 7.329 7.13 6.913 6.679 6.49 6.297 6.084 5.913 5.726 5.535 5.362 5.205 5.095 4.963 4.744 4.595 4.445 4.366 4.213 4.037 3.845 3.752 3.515 3.452 3.34 3.225 2.969 2.797 2.598 2.379 2.121 1.843 1.49 0.345 -8 ,7135 ,TETRA ,17590294,Sat Nov 27 20:22:15 CET,Sat Nov 27 22:12:21 CET,0.0 0.475 0.696 0.847 0.993 1.132 1.255 1.364 1.549 1.639 1.736 1.779 2.012 2.093 2.226 2.351 2.481 2.551 2.691 2.827 3.007 3.13 3.259 3.428 3.577 3.724 3.872 4.019 4.206 4.392 4.572 4.785 4.99 5.178 5.386 5.632 5.87 6.116 6.379 6.677 6.992 7.339 7.75 8.161 8.626 9.137 9.727 10.333 10.958 11.606 12.125 12.231 12.048 11.747 11.394 11.018 10.647 10.28 9.937 9.593 9.276 8.99 8.722 8.453 8.184 7.91 7.637 7.415 7.211 6.99 6.756 6.56 6.365 6.15 5.977 5.81 5.631 5.446 5.256 5.114 4.965 4.736 4.573 4.398 4.308 4.126 3.941 3.725 3.601 3.336 3.204 3.061 2.911 2.588 2.401 2.185 1.952 1.698 1.353 0.855 -0.575 -9 ,8846 ,TETRA ,17590295,Sat Nov 27 20:22:13 CET,Sat Nov 27 22:12:07 CET,0.0 0.33 0.53 0.703 0.869 1.011 1.123 1.223 1.396 1.483 1.573 1.593 1.82 1.9 2.038 2.179 2.333 2.406 2.534 2.653 2.82 2.929 3.031 3.18 3.334 3.485 3.632 3.773 3.959 4.161 4.372 4.616 4.827 5.029 5.278 5.558 5.832 6.14 6.472 6.789 7.125 7.511 7.904 8.285 8.733 9.208 9.717 10.255 10.826 11.391 11.799 11.844 11.624 11.282 10.909 10.542 10.141 9.724 9.389 9.053 8.741 8.444 8.147 7.868 7.596 7.342 7.089 6.852 6.645 6.44 6.211 6.013 5.81 5.599 5.44 5.269 5.085 4.9 4.695 4.547 4.404 4.193 4.04 3.875 3.792 3.623 3.447 3.251 3.145 2.896 2.818 2.695 2.557 2.275 2.136 1.99 1.819 1.605 1.315 0.936 -0.321 -10 ,31650 ,TETRA ,17590296,Sat Nov 27 20:22:13 CET,Sat Nov 27 22:15:19 CET,0.0 0.667 0.883 1.026 1.163 1.292 1.411 1.534 1.749 1.835 1.92 1.944 2.171 2.254 2.403 2.561 2.719 2.79 2.923 3.054 3.233 3.348 3.469 3.651 3.837 4.02 4.189 4.358 4.577 4.79 4.998 5.257 5.486 5.698 5.946 6.211 6.464 6.732 7.021 7.342 7.668 8.007 8.401 8.8 9.235 9.693 10.188 10.747 11.378 11.918 12.293 12.278 11.94 11.558 11.134 10.683 10.256 9.864 9.548 9.211 8.885 8.581 8.297 8.031 7.763 7.51 7.253 7.008 6.788 6.569 6.35 6.153 5.945 5.733 5.559 5.38 5.2 5.012 4.809 4.665 4.507 4.254 4.089 3.921 3.845 3.681 3.48 3.269 3.17 2.941 2.883 2.776 2.657 2.379 2.223 2.058 1.862 1.626 1.346 0.942 -0.275 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index 173c85ed..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4038 ,TETRA ,17590297,Sat Nov 27 20:22:13 CET,Sat Nov 27 22:13:07 CET,0.0 0.503 0.683 0.826 0.983 1.131 1.257 1.367 1.556 1.64 1.73 1.772 1.999 2.078 2.235 2.388 2.528 2.593 2.718 2.84 3.021 3.145 3.268 3.446 3.613 3.766 3.911 4.054 4.245 4.442 4.638 4.881 5.126 5.36 5.627 5.903 6.173 6.479 6.796 7.141 7.504 7.911 8.377 8.842 9.386 9.96 10.58 11.234 11.943 12.689 13.353 13.627 13.535 13.284 13.017 12.739 12.436 12.113 11.82 11.494 11.197 10.919 10.651 10.38 10.11 9.874 9.627 9.41 9.215 8.998 8.776 8.588 8.377 8.17 8.013 7.833 7.65 7.474 7.277 7.134 6.99 6.772 6.612 6.437 6.354 6.204 6.05 5.878 5.785 5.55 5.476 5.355 5.229 4.947 4.795 4.626 4.427 4.209 3.968 3.667 2.458 -2 ,13724 ,TETRA ,17590298,Sat Nov 27 20:22:13 CET,Sat Nov 27 22:13:41 CET,0.0 0.838 1.115 1.278 1.406 1.517 1.619 1.712 1.901 2.003 2.102 2.164 2.408 2.506 2.704 2.885 3.046 3.127 3.283 3.432 3.649 3.787 3.923 4.118 4.307 4.496 4.676 4.841 5.055 5.267 5.461 5.684 5.904 6.121 6.376 6.679 6.973 7.266 7.583 7.932 8.296 8.695 9.152 9.593 10.109 10.71 11.356 12.017 12.716 13.427 14.094 14.258 14.084 13.801 13.46 13.094 12.713 12.357 12.047 11.722 11.446 11.191 10.942 10.689 10.428 10.192 9.972 9.757 9.55 9.332 9.105 8.916 8.711 8.502 8.336 8.161 7.984 7.803 7.62 7.491 7.358 7.145 6.989 6.809 6.709 6.519 6.322 6.109 6.0 5.752 5.639 5.517 5.387 5.074 4.916 4.778 4.614 4.409 4.171 3.843 2.334 -3 ,8088 ,TETRA ,17590299,Sat Nov 27 20:22:13 CET,Sat Nov 27 22:12:41 CET,0.0 0.487 0.697 0.86 0.993 1.1 1.216 1.334 1.521 1.608 1.702 1.736 1.959 2.034 2.176 2.328 2.477 2.543 2.675 2.808 2.998 3.122 3.243 3.42 3.579 3.743 3.902 4.048 4.236 4.421 4.618 4.85 5.085 5.322 5.585 5.886 6.176 6.49 6.825 7.167 7.529 7.925 8.378 8.844 9.361 9.91 10.551 11.244 11.958 12.695 13.375 13.645 13.584 13.36 13.069 12.719 12.365 12.031 11.731 11.385 11.066 10.796 10.518 10.241 9.993 9.782 9.55 9.334 9.158 8.975 8.779 8.607 8.422 8.241 8.104 7.961 7.811 7.657 7.496 7.379 7.262 7.073 6.932 6.795 6.713 6.525 6.342 6.157 6.062 5.829 5.767 5.654 5.535 5.307 5.182 5.019 4.856 4.682 4.428 4.07 2.711 -4 ,7076 ,TETRA ,17590300,Sat Nov 27 20:22:15 CET,Sat Nov 27 22:14:25 CET,0.0 0.675 0.921 1.106 1.255 1.378 1.481 1.584 1.789 1.889 1.981 1.997 2.214 2.289 2.437 2.571 2.694 2.757 2.892 3.034 3.246 3.375 3.492 3.664 3.845 4.033 4.205 4.372 4.583 4.783 4.983 5.221 5.447 5.667 5.927 6.228 6.511 6.807 7.124 7.469 7.831 8.228 8.678 9.109 9.639 10.228 10.822 11.471 12.221 12.937 13.598 13.827 13.65 13.355 13.017 12.674 12.36 12.047 11.744 11.422 11.131 10.871 10.62 10.372 10.125 9.896 9.646 9.409 9.205 8.993 8.772 8.583 8.384 8.178 8.02 7.852 7.678 7.5 7.315 7.192 7.059 6.821 6.654 6.497 6.416 6.24 6.045 5.818 5.7 5.453 5.343 5.2 5.052 4.743 4.57 4.388 4.177 3.95 3.705 3.328 2.223 -5 ,10693 ,TETRA ,17590301,Sat Nov 27 20:22:13 CET,Sat Nov 27 22:14:00 CET,0.0 0.576 0.826 1.011 1.163 1.332 1.507 1.66 1.923 2.051 2.173 2.268 2.521 2.624 2.813 2.986 3.151 3.229 3.378 3.532 3.753 3.89 4.021 4.209 4.394 4.574 4.739 4.904 5.118 5.322 5.517 5.757 5.989 6.213 6.474 6.759 7.03 7.318 7.638 7.987 8.344 8.746 9.199 9.64 10.165 10.737 11.392 12.085 12.796 13.474 14.143 14.452 14.412 14.185 13.858 13.502 13.137 12.794 12.487 12.183 11.915 11.65 11.396 11.165 10.945 10.741 10.527 10.331 10.15 9.955 9.739 9.561 9.383 9.194 9.046 8.892 8.734 8.565 8.39 8.272 8.139 7.935 7.808 7.673 7.6 7.44 7.278 7.101 7.009 6.783 6.717 6.617 6.509 6.276 6.145 5.995 5.81 5.594 5.342 4.999 3.918 -6 ,31019 ,TETRA ,17590302,Sat Nov 27 20:22:14 CET,Sat Nov 27 22:12:16 CET,0.0 0.588 0.808 0.971 1.105 1.23 1.357 1.468 1.665 1.774 1.874 1.905 2.134 2.219 2.366 2.502 2.64 2.713 2.854 2.98 3.153 3.267 3.38 3.545 3.711 3.873 4.023 4.168 4.369 4.58 4.785 5.034 5.272 5.485 5.731 6.029 6.317 6.623 6.953 7.285 7.643 8.051 8.525 8.995 9.481 10.003 10.581 11.213 11.925 12.646 13.256 13.388 13.227 12.977 12.676 12.343 11.998 11.657 11.343 11.033 10.756 10.483 10.212 9.932 9.661 9.432 9.185 8.937 8.728 8.501 8.252 8.058 7.87 7.659 7.494 7.325 7.139 6.954 6.761 6.624 6.485 6.271 6.112 5.936 5.849 5.68 5.494 5.288 5.182 4.94 4.842 4.714 4.583 4.297 4.123 3.921 3.704 3.458 3.177 2.789 1.369 -7 ,15054 ,TETRA ,17590303,Sat Nov 27 20:22:16 CET,Sat Nov 27 22:14:08 CET,0.0 0.584 0.784 0.97 1.102 1.212 1.316 1.409 1.586 1.672 1.754 1.785 2.008 2.091 2.258 2.415 2.563 2.634 2.773 2.903 3.082 3.2 3.312 3.477 3.642 3.811 3.974 4.144 4.378 4.587 4.78 5.011 5.229 5.44 5.692 5.982 6.254 6.542 6.846 7.19 7.558 7.971 8.442 8.888 9.412 9.971 10.589 11.277 12.003 12.732 13.378 13.577 13.445 13.145 12.822 12.457 12.078 11.75 11.442 11.12 10.837 10.56 10.283 10.016 9.764 9.549 9.335 9.147 8.973 8.784 8.596 8.43 8.24 8.044 7.901 7.753 7.582 7.406 7.219 7.086 6.96 6.778 6.647 6.497 6.418 6.251 6.07 5.873 5.773 5.536 5.447 5.328 5.219 4.976 4.821 4.637 4.438 4.233 4.019 3.704 2.818 -8 ,23182 ,TETRA ,17590304,Sat Nov 27 20:22:18 CET,Sat Nov 27 22:12:45 CET,0.0 0.416 0.642 0.797 0.937 1.054 1.178 1.302 1.512 1.617 1.709 1.712 1.923 1.994 2.137 2.28 2.409 2.474 2.6 2.72 2.897 3.016 3.135 3.315 3.491 3.654 3.813 3.977 4.187 4.397 4.62 4.873 5.09 5.299 5.556 5.844 6.132 6.443 6.747 7.081 7.442 7.844 8.309 8.736 9.216 9.77 10.386 11.055 11.787 12.505 13.124 13.348 13.26 13.01 12.676 12.321 11.941 11.579 11.25 10.91 10.623 10.35 10.071 9.791 9.537 9.295 9.022 8.77 8.567 8.354 8.12 7.924 7.712 7.486 7.314 7.137 6.952 6.764 6.572 6.446 6.316 6.103 5.96 5.813 5.732 5.549 5.362 5.167 5.055 4.811 4.739 4.633 4.515 4.228 4.068 3.899 3.725 3.534 3.278 2.915 1.707 -9 ,18651 ,TETRA ,17590305,Sat Nov 27 20:22:14 CET,Sat Nov 27 22:13:15 CET,0.0 0.552 0.791 0.946 1.08 1.222 1.362 1.506 1.759 1.873 1.999 2.077 2.318 2.415 2.605 2.793 2.97 3.056 3.216 3.372 3.602 3.734 3.865 4.061 4.238 4.407 4.582 4.752 4.96 5.158 5.348 5.592 5.835 6.068 6.341 6.644 6.923 7.229 7.574 7.928 8.278 8.655 9.108 9.587 10.12 10.713 11.359 12.013 12.711 13.363 13.93 14.142 14.043 13.833 13.509 13.118 12.75 12.4 12.073 11.745 11.457 11.168 10.888 10.636 10.404 10.189 9.965 9.763 9.582 9.383 9.168 8.999 8.835 8.662 8.521 8.379 8.234 8.068 7.89 7.769 7.649 7.465 7.337 7.194 7.119 6.964 6.792 6.618 6.531 6.306 6.234 6.118 5.989 5.704 5.543 5.367 5.184 4.972 4.734 4.386 3.122 -10 ,5432 ,TETRA ,17590306,Sat Nov 27 20:23:12 CET,Sat Nov 27 22:15:07 CET,0.0 0.686 1.039 1.315 1.543 1.737 1.912 2.074 2.303 2.415 2.551 2.655 2.899 2.997 3.189 3.37 3.536 3.624 3.788 3.927 4.145 4.295 4.442 4.647 4.829 5.006 5.185 5.347 5.545 5.749 5.955 6.203 6.431 6.654 6.913 7.197 7.471 7.763 8.076 8.418 8.789 9.185 9.614 10.042 10.554 11.128 11.725 12.341 13.007 13.691 14.307 14.475 14.339 14.067 13.749 13.418 13.081 12.726 12.411 12.083 11.792 11.522 11.275 11.034 10.774 10.541 10.292 10.069 9.881 9.668 9.428 9.222 9.013 8.802 8.639 8.466 8.294 8.118 7.924 7.79 7.663 7.49 7.355 7.189 7.103 6.93 6.747 6.565 6.479 6.242 6.157 6.028 5.892 5.624 5.482 5.333 5.167 4.982 4.774 4.489 3.168 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt deleted file mode 100644 index 05bee4a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31162 ,TETRA ,17590307,Sat Nov 27 20:23:12 CET,Sat Nov 27 22:16:10 CET,0.0 0.848 1.13 1.392 1.6 1.772 1.916 2.053 2.342 2.475 2.612 2.736 2.99 3.1 3.31 3.513 3.706 3.794 3.946 4.097 4.323 4.46 4.594 4.809 5.014 5.208 5.403 5.586 5.821 6.052 6.278 6.535 6.78 7.023 7.3 7.613 7.906 8.226 8.579 8.961 9.361 9.795 10.3 10.803 11.414 12.085 12.864 13.708 14.598 15.583 16.633 17.3 17.504 17.537 17.436 17.266 17.064 16.845 16.637 16.409 16.202 15.995 15.794 15.614 15.441 15.264 15.072 14.902 14.76 14.619 14.464 14.331 14.195 14.036 13.911 13.794 13.669 13.541 13.415 13.329 13.243 13.116 13.008 12.886 12.825 12.692 12.551 12.402 12.32 12.108 12.064 11.979 11.895 11.703 11.595 11.476 11.337 11.195 11.036 10.824 10.243 -2 ,22597 ,TETRA ,17590308,Sat Nov 27 20:23:14 CET,Sat Nov 27 22:15:14 CET,0.0 0.497 0.737 0.909 1.062 1.204 1.328 1.44 1.649 1.748 1.841 1.876 2.112 2.198 2.355 2.507 2.66 2.733 2.889 3.043 3.244 3.389 3.54 3.754 3.952 4.139 4.332 4.52 4.754 4.972 5.18 5.428 5.666 5.901 6.186 6.511 6.805 7.128 7.485 7.861 8.248 8.676 9.173 9.686 10.305 10.968 11.715 12.568 13.482 14.494 15.597 16.313 16.532 16.486 16.331 16.167 15.997 15.799 15.564 15.311 15.104 14.901 14.711 14.532 14.338 14.155 13.967 13.792 13.638 13.481 13.31 13.159 13.001 12.834 12.699 12.551 12.403 12.254 12.085 11.973 11.869 11.693 11.57 11.428 11.356 11.209 11.045 10.877 10.791 10.576 10.52 10.418 10.304 10.057 9.94 9.824 9.698 9.556 9.408 9.178 8.653 -3 ,8778 ,TETRA ,17590309,Sat Nov 27 20:23:12 CET,Sat Nov 27 22:14:58 CET,0.0 0.745 1.036 1.271 1.448 1.588 1.715 1.844 2.092 2.201 2.294 2.326 2.557 2.651 2.828 2.986 3.134 3.204 3.347 3.482 3.678 3.806 3.928 4.105 4.282 4.455 4.615 4.772 4.976 5.176 5.385 5.629 5.841 6.059 6.331 6.64 6.945 7.272 7.612 7.981 8.383 8.837 9.361 9.89 10.495 11.164 11.93 12.739 13.641 14.6 15.642 16.357 16.541 16.488 16.351 16.165 15.96 15.775 15.594 15.383 15.209 15.044 14.867 14.703 14.546 14.389 14.222 14.078 13.958 13.815 13.652 13.53 13.412 13.281 13.169 13.047 12.921 12.788 12.657 12.564 12.465 12.319 12.217 12.111 12.059 11.948 11.819 11.692 11.633 11.431 11.377 11.286 11.201 11.022 10.921 10.812 10.703 10.566 10.404 10.218 9.596 -4 ,8170 ,TETRA ,17590310,Sat Nov 27 20:23:12 CET,Sat Nov 27 22:14:58 CET,0.0 0.77 0.991 1.166 1.333 1.484 1.619 1.734 1.944 2.051 2.168 2.267 2.521 2.633 2.846 3.03 3.205 3.29 3.455 3.62 3.865 4.021 4.168 4.373 4.561 4.751 4.943 5.131 5.376 5.602 5.817 6.082 6.342 6.59 6.867 7.174 7.468 7.785 8.12 8.483 8.883 9.34 9.861 10.375 10.981 11.668 12.431 13.245 14.184 15.236 16.335 17.036 17.247 17.229 17.114 16.969 16.79 16.553 16.335 16.116 15.901 15.711 15.514 15.297 15.109 14.942 14.747 14.558 14.387 14.199 14.013 13.863 13.706 13.545 13.405 13.261 13.114 12.952 12.79 12.684 12.581 12.431 12.327 12.218 12.162 12.041 11.911 11.778 11.716 11.517 11.491 11.403 11.316 11.134 11.037 10.935 10.809 10.676 10.54 10.367 9.897 -5 ,26599 ,TETRA ,17590311,Sat Nov 27 20:23:14 CET,Sat Nov 27 22:15:53 CET,0.0 0.832 1.137 1.391 1.583 1.793 1.977 2.116 2.392 2.523 2.639 2.731 2.977 3.075 3.267 3.442 3.619 3.709 3.88 4.041 4.277 4.434 4.587 4.813 5.022 5.22 5.414 5.605 5.855 6.088 6.314 6.599 6.864 7.111 7.39 7.702 8.0 8.326 8.686 9.069 9.462 9.916 10.449 10.952 11.531 12.195 12.934 13.745 14.71 15.758 16.785 17.377 17.525 17.498 17.375 17.178 16.964 16.741 16.528 16.313 16.119 15.913 15.701 15.509 15.32 15.136 14.941 14.763 14.61 14.449 14.27 14.119 13.973 13.814 13.682 13.55 13.417 13.267 13.099 12.993 12.891 12.735 12.631 12.513 12.452 12.332 12.209 12.069 11.988 11.777 11.736 11.642 11.551 11.352 11.238 11.123 10.991 10.844 10.664 10.404 9.907 -6 ,30796 ,TETRA ,17590312,Sat Nov 27 20:23:12 CET,Sat Nov 27 22:14:21 CET,0.0 0.625 0.891 1.072 1.235 1.384 1.51 1.625 1.826 1.92 2.011 2.038 2.266 2.358 2.532 2.679 2.817 2.889 3.035 3.168 3.365 3.503 3.639 3.839 4.044 4.238 4.421 4.592 4.82 5.056 5.287 5.561 5.815 6.06 6.34 6.654 6.967 7.31 7.661 8.023 8.407 8.846 9.37 9.899 10.508 11.171 11.894 12.693 13.631 14.61 15.563 16.113 16.295 16.264 16.09 15.891 15.715 15.503 15.276 15.045 14.83 14.619 14.419 14.225 14.029 13.846 13.658 13.483 13.324 13.165 13.0 12.86 12.703 12.535 12.4 12.257 12.117 11.969 11.811 11.691 11.565 11.38 11.258 11.124 11.05 10.9 10.737 10.557 10.459 10.235 10.174 10.072 9.957 9.662 9.499 9.338 9.159 8.974 8.74 8.427 7.585 -7 ,10017 ,TETRA ,17590313,Sat Nov 27 20:23:14 CET,Sat Nov 27 22:15:43 CET,0.0 0.645 0.831 0.993 1.157 1.311 1.442 1.562 1.768 1.86 1.961 2.013 2.25 2.338 2.51 2.67 2.813 2.884 3.019 3.142 3.333 3.471 3.617 3.834 4.039 4.234 4.419 4.602 4.84 5.069 5.289 5.555 5.818 6.063 6.355 6.688 6.995 7.333 7.706 8.091 8.48 8.924 9.44 9.957 10.558 11.241 12.011 12.858 13.804 14.777 15.768 16.353 16.518 16.499 16.385 16.221 16.029 15.807 15.579 15.322 15.089 14.881 14.665 14.453 14.246 14.057 13.853 13.665 13.51 13.344 13.178 13.035 12.877 12.703 12.561 12.412 12.261 12.115 11.976 11.88 11.777 11.626 11.527 11.415 11.355 11.237 11.119 10.982 10.913 10.704 10.663 10.578 10.488 10.307 10.202 10.082 9.946 9.783 9.589 9.354 8.757 -8 ,29446 ,TETRA ,17590314,Sat Nov 27 20:23:16 CET,Sat Nov 27 22:14:32 CET,0.0 0.792 1.04 1.201 1.341 1.479 1.612 1.73 1.929 2.027 2.118 2.145 2.376 2.464 2.632 2.793 2.942 3.007 3.133 3.269 3.474 3.603 3.731 3.924 4.107 4.285 4.459 4.616 4.832 5.054 5.26 5.497 5.726 5.957 6.228 6.528 6.827 7.162 7.52 7.902 8.306 8.754 9.26 9.773 10.385 11.076 11.858 12.701 13.617 14.64 15.711 16.302 16.449 16.417 16.292 16.098 15.869 15.645 15.439 15.203 14.989 14.78 14.562 14.356 14.165 13.979 13.777 13.603 13.456 13.291 13.11 12.967 12.821 12.67 12.542 12.404 12.27 12.128 11.987 11.884 11.758 11.541 11.41 11.292 11.226 11.078 10.914 10.747 10.659 10.444 10.39 10.287 10.171 9.92 9.779 9.625 9.448 9.249 9.025 8.776 8.044 -9 ,7336 ,TETRA ,17590315,Sat Nov 27 20:23:13 CET,Sat Nov 27 22:15:34 CET,0.0 0.81 1.141 1.382 1.575 1.743 1.914 2.075 2.316 2.439 2.574 2.675 2.933 3.051 3.259 3.436 3.597 3.678 3.847 4.005 4.224 4.371 4.52 4.745 4.957 5.141 5.323 5.511 5.748 5.983 6.212 6.48 6.733 6.981 7.272 7.583 7.879 8.209 8.572 8.968 9.391 9.858 10.415 10.969 11.589 12.272 13.046 13.873 14.772 15.749 16.773 17.398 17.57 17.535 17.426 17.263 17.058 16.851 16.671 16.481 16.277 16.062 15.86 15.673 15.485 15.298 15.095 14.928 14.777 14.604 14.428 14.278 14.122 13.959 13.831 13.702 13.568 13.408 13.237 13.123 13.006 12.82 12.684 12.54 12.472 12.336 12.184 12.011 11.925 11.717 11.665 11.559 11.442 11.202 11.062 10.895 10.715 10.515 10.273 9.92 9.136 -10 ,25711 ,TETRA ,17590316,Sat Nov 27 20:24:12 CET,Sat Nov 27 22:16:27 CET,0.0 0.828 1.08 1.251 1.39 1.513 1.638 1.755 1.958 2.058 2.152 2.189 2.418 2.505 2.673 2.836 2.991 3.066 3.219 3.369 3.566 3.691 3.812 3.994 4.18 4.355 4.528 4.706 4.943 5.166 5.378 5.651 5.908 6.147 6.439 6.763 7.061 7.397 7.748 8.115 8.517 8.976 9.502 10.049 10.677 11.337 12.079 12.894 13.812 14.796 15.774 16.327 16.499 16.458 16.283 16.083 15.866 15.638 15.41 15.167 14.953 14.748 14.551 14.361 14.174 13.988 13.795 13.635 13.486 13.317 13.139 12.992 12.84 12.668 12.526 12.38 12.232 12.092 11.933 11.819 11.711 11.538 11.42 11.298 11.228 11.073 10.909 10.752 10.665 10.44 10.384 10.279 10.163 9.911 9.78 9.625 9.445 9.265 9.014 8.722 8.107 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt deleted file mode 100644 index 9c2a21e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18539 ,KEBNE ,17026625,Wed Dec 22 15:01:48 CET,Wed Dec 22 16:36:41 CET,0.0 0.682 0.932 1.076 1.165 1.242 1.299 1.351 1.442 1.476 1.504 1.431 1.571 1.579 1.59 1.58 1.573 1.573 1.567 1.555 1.496 1.448 1.4 1.319 1.227 1.12 1.007 0.887 0.721 0.556 0.387 0.168 -0.057 -0.29 -0.58 -0.949 -1.332 -1.779 -2.305 -2.894 -3.556 -4.388 -5.455 -6.604 -8.058 -9.85 -12.178 -15.163 -19.164 -24.651 -32.931 -41.749 -48.199 -53.287 -57.386 -60.796 -63.603 -66.027 -68.01 -69.898 -71.477 -72.827 -74.087 -75.235 -76.26 -77.177 -78.108 -78.922 -79.612 -80.302 -81.006 -81.583 -82.151 -82.719 -83.147 -83.582 -84.034 -84.48 -84.923 -85.234 -85.549 -86.027 -86.355 -86.691 -86.86 -87.191 -87.527 -87.887 -88.07 -88.467 -88.624 -88.816 -89.014 -89.431 -89.662 -89.895 -90.137 -90.392 -90.642 -90.954 -91.58 -2 ,12958 ,KEBNE ,17026626,Wed Dec 22 15:01:47 CET,Wed Dec 22 16:38:32 CET,0.0 0.318 0.443 0.531 0.591 0.624 0.648 0.678 0.742 0.751 0.754 0.647 0.772 0.78 0.791 0.794 0.795 0.79 0.766 0.735 0.683 0.643 0.598 0.524 0.443 0.344 0.245 0.138 -0.013 -0.165 -0.328 -0.571 -0.818 -1.054 -1.354 -1.724 -2.107 -2.557 -3.092 -3.708 -4.367 -5.176 -6.231 -7.381 -8.867 -10.718 -13.091 -16.048 -20.016 -25.558 -33.869 -42.668 -49.179 -54.241 -58.272 -61.653 -64.456 -66.893 -68.899 -70.817 -72.41 -73.782 -75.036 -76.185 -77.222 -78.147 -79.095 -79.923 -80.621 -81.318 -82.033 -82.617 -83.202 -83.79 -84.233 -84.684 -85.149 -85.625 -86.121 -86.451 -86.784 -87.298 -87.639 -87.974 -88.142 -88.498 -88.851 -89.202 -89.38 -89.776 -89.928 -90.122 -90.312 -90.704 -90.919 -91.157 -91.399 -91.664 -91.953 -92.272 -92.719 -3 ,17646 ,KEBNE ,17026627,Wed Dec 22 15:03:49 CET,Wed Dec 22 16:38:38 CET,0.0 0.338 0.423 0.496 0.59 0.664 0.723 0.795 0.886 0.902 0.92 0.82 0.948 0.955 0.963 0.962 0.955 0.951 0.939 0.906 0.829 0.779 0.73 0.649 0.55 0.452 0.362 0.255 0.09 -0.073 -0.242 -0.461 -0.692 -0.925 -1.212 -1.574 -1.948 -2.39 -2.911 -3.504 -4.161 -4.973 -6.036 -7.21 -8.698 -10.537 -12.877 -15.837 -19.82 -25.363 -33.625 -42.373 -48.887 -53.973 -58.011 -61.382 -64.183 -66.593 -68.582 -70.481 -72.033 -73.363 -74.608 -75.769 -76.813 -77.726 -78.641 -79.445 -80.136 -80.831 -81.529 -82.103 -82.694 -83.285 -83.718 -84.154 -84.602 -85.07 -85.542 -85.848 -86.156 -86.633 -86.963 -87.297 -87.465 -87.814 -88.163 -88.516 -88.698 -89.102 -89.26 -89.452 -89.646 -90.046 -90.26 -90.49 -90.727 -90.972 -91.264 -91.616 -92.232 -4 ,27891 ,KEBNE ,17026628,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 16:38:24 CET,0.0 0.39 0.536 0.677 0.799 0.887 0.948 1.003 1.091 1.125 1.149 1.066 1.203 1.21 1.218 1.209 1.187 1.177 1.147 1.112 1.047 0.996 0.95 0.888 0.81 0.712 0.618 0.514 0.347 0.171 -0.006 -0.237 -0.48 -0.725 -1.017 -1.376 -1.758 -2.2 -2.728 -3.341 -4.032 -4.875 -5.91 -7.045 -8.535 -10.368 -12.712 -15.709 -19.725 -25.299 -33.639 -42.341 -48.754 -53.824 -57.851 -61.229 -64.066 -66.486 -68.466 -70.363 -71.938 -73.304 -74.567 -75.704 -76.735 -77.657 -78.578 -79.384 -80.078 -80.781 -81.494 -82.079 -82.663 -83.266 -83.729 -84.178 -84.641 -85.122 -85.601 -85.93 -86.266 -86.776 -87.119 -87.471 -87.652 -88.016 -88.385 -88.758 -88.941 -89.343 -89.512 -89.712 -89.911 -90.311 -90.514 -90.75 -91.006 -91.262 -91.542 -91.855 -92.386 -5 ,4574 ,KEBNE ,17026629,Wed Dec 22 15:03:49 CET,Wed Dec 22 16:39:06 CET,0.0 0.335 0.446 0.526 0.598 0.656 0.697 0.714 0.712 0.711 0.71 0.567 0.678 0.668 0.653 0.631 0.586 0.561 0.508 0.446 0.358 0.293 0.232 0.139 0.036 -0.066 -0.17 -0.274 -0.427 -0.59 -0.757 -0.979 -1.211 -1.449 -1.761 -2.143 -2.535 -2.992 -3.499 -4.093 -4.784 -5.623 -6.678 -7.823 -9.292 -11.115 -13.426 -16.359 -20.362 -25.943 -34.282 -43.085 -49.566 -54.618 -58.671 -62.062 -64.895 -67.342 -69.35 -71.268 -72.863 -74.246 -75.51 -76.671 -77.719 -78.631 -79.561 -80.375 -81.056 -81.759 -82.471 -83.038 -83.62 -84.215 -84.659 -85.112 -85.58 -86.048 -86.517 -86.841 -87.178 -87.686 -88.025 -88.37 -88.55 -88.927 -89.304 -89.681 -89.875 -90.292 -90.491 -90.716 -90.935 -91.387 -91.636 -91.885 -92.152 -92.446 -92.81 -93.278 -94.374 -6 ,5902 ,KEBNE ,17026630,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 16:38:16 CET,0.0 0.187 0.263 0.318 0.373 0.413 0.445 0.496 0.557 0.563 0.568 0.443 0.568 0.563 0.534 0.516 0.502 0.487 0.438 0.374 0.272 0.209 0.143 0.039 -0.054 -0.15 -0.262 -0.378 -0.542 -0.704 -0.87 -1.096 -1.329 -1.572 -1.868 -2.234 -2.617 -3.07 -3.592 -4.191 -4.878 -5.716 -6.772 -7.912 -9.401 -11.265 -13.601 -16.546 -20.551 -26.139 -34.404 -43.146 -49.618 -54.695 -58.763 -62.172 -64.98 -67.403 -69.414 -71.319 -72.902 -74.242 -75.463 -76.586 -77.587 -78.475 -79.387 -80.179 -80.849 -81.523 -82.2 -82.748 -83.308 -83.875 -84.295 -84.721 -85.158 -85.602 -86.049 -86.354 -86.67 -87.145 -87.461 -87.779 -87.948 -88.295 -88.643 -88.995 -89.176 -89.574 -89.715 -89.9 -90.092 -90.503 -90.716 -90.933 -91.165 -91.411 -91.682 -92.025 -92.705 -7 ,28115 ,KEBNE ,17026631,Wed Dec 22 15:03:49 CET,Wed Dec 22 16:38:44 CET,0.0 0.238 0.32 0.376 0.44 0.484 0.502 0.514 0.513 0.511 0.509 0.369 0.474 0.454 0.431 0.4 0.341 0.309 0.257 0.205 0.12 0.055 -0.013 -0.132 -0.265 -0.388 -0.504 -0.625 -0.797 -0.972 -1.148 -1.376 -1.616 -1.861 -2.162 -2.53 -2.923 -3.398 -3.923 -4.498 -5.163 -5.997 -7.05 -8.201 -9.676 -11.497 -13.835 -16.791 -20.73 -26.297 -34.675 -43.503 -50.057 -55.157 -59.213 -62.641 -65.483 -67.903 -69.901 -71.821 -73.385 -74.724 -75.971 -77.104 -78.11 -79.006 -79.923 -80.73 -81.423 -82.124 -82.839 -83.417 -83.98 -84.547 -84.983 -85.416 -85.853 -86.305 -86.776 -87.089 -87.392 -87.866 -88.201 -88.535 -88.701 -89.039 -89.375 -89.713 -89.891 -90.296 -90.461 -90.658 -90.864 -91.298 -91.51 -91.726 -91.956 -92.194 -92.437 -92.737 -93.37 -8 ,30231 ,KEBNE ,17026632,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 16:38:33 CET,0.0 0.53 0.706 0.848 0.959 1.059 1.133 1.179 1.245 1.263 1.283 1.205 1.334 1.338 1.358 1.371 1.367 1.358 1.328 1.304 1.257 1.201 1.138 1.054 0.966 0.867 0.761 0.651 0.501 0.347 0.181 -0.033 -0.253 -0.485 -0.778 -1.136 -1.515 -1.98 -2.518 -3.126 -3.814 -4.649 -5.715 -6.878 -8.349 -10.189 -12.54 -15.536 -19.55 -25.034 -33.238 -42.006 -48.513 -53.595 -57.682 -61.101 -63.937 -66.367 -68.366 -70.308 -71.897 -73.264 -74.535 -75.684 -76.725 -77.658 -78.615 -79.436 -80.121 -80.827 -81.546 -82.121 -82.695 -83.273 -83.719 -84.167 -84.615 -85.068 -85.522 -85.824 -86.133 -86.604 -86.929 -87.259 -87.427 -87.784 -88.147 -88.511 -88.698 -89.107 -89.284 -89.483 -89.683 -90.095 -90.305 -90.521 -90.743 -90.976 -91.214 -91.497 -92.08 -9 ,4941 ,KEBNE ,17026633,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 16:38:15 CET,0.0 0.236 0.363 0.466 0.53 0.568 0.601 0.629 0.663 0.674 0.674 0.525 0.633 0.626 0.607 0.573 0.545 0.526 0.476 0.417 0.32 0.261 0.209 0.124 0.038 -0.049 -0.143 -0.24 -0.397 -0.567 -0.733 -0.956 -1.186 -1.424 -1.724 -2.101 -2.491 -2.942 -3.479 -4.09 -4.79 -5.639 -6.709 -7.86 -9.294 -11.119 -13.48 -16.49 -20.519 -26.055 -34.309 -43.06 -49.571 -54.687 -58.757 -62.127 -64.92 -67.372 -69.387 -71.286 -72.873 -74.257 -75.541 -76.704 -77.746 -78.687 -79.629 -80.438 -81.125 -81.819 -82.525 -83.088 -83.663 -84.247 -84.686 -85.146 -85.619 -86.095 -86.579 -86.908 -87.24 -87.741 -88.075 -88.406 -88.572 -88.909 -89.247 -89.591 -89.77 -90.173 -90.334 -90.53 -90.726 -91.144 -91.367 -91.593 -91.834 -92.081 -92.348 -92.643 -93.097 -10 ,663 ,KEBNE ,17026634,Wed Dec 22 15:03:49 CET,Wed Dec 22 16:39:06 CET,0.0 0.156 0.222 0.27 0.302 0.354 0.41 0.425 0.423 0.423 0.421 0.291 0.401 0.384 0.348 0.306 0.256 0.23 0.175 0.122 0.029 -0.046 -0.117 -0.214 -0.326 -0.455 -0.583 -0.696 -0.841 -0.99 -1.144 -1.354 -1.583 -1.826 -2.128 -2.491 -2.874 -3.321 -3.818 -4.408 -5.092 -5.933 -7.019 -8.207 -9.735 -11.6 -13.963 -16.939 -20.888 -26.331 -34.563 -43.303 -49.749 -54.776 -58.79 -62.161 -64.992 -67.425 -69.414 -71.337 -72.927 -74.273 -75.509 -76.658 -77.675 -78.572 -79.495 -80.298 -80.98 -81.682 -82.405 -82.989 -83.565 -84.147 -84.593 -85.043 -85.485 -85.938 -86.401 -86.707 -87.024 -87.496 -87.815 -88.148 -88.316 -88.654 -88.999 -89.34 -89.516 -89.92 -90.075 -90.269 -90.471 -90.898 -91.124 -91.353 -91.608 -91.871 -92.15 -92.498 -93.192 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt deleted file mode 100644 index 5e0e79e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25435 ,TETRA ,17590317,Sat Nov 27 20:23:13 CET,Sat Nov 27 22:16:40 CET,0.0 0.6 0.892 1.15 1.352 1.529 1.688 1.852 2.161 2.291 2.417 2.516 2.743 2.848 3.044 3.234 3.412 3.493 3.652 3.81 4.029 4.167 4.302 4.491 4.684 4.874 5.065 5.242 5.452 5.667 5.873 6.12 6.364 6.6 6.876 7.178 7.469 7.795 8.155 8.552 8.955 9.393 9.883 10.367 10.944 11.591 12.323 13.096 13.986 15.044 16.2 16.957 17.269 17.341 17.28 17.188 17.078 16.944 16.799 16.607 16.429 16.261 16.083 15.916 15.759 15.596 15.423 15.279 15.146 14.997 14.835 14.703 14.564 14.417 14.298 14.173 14.041 13.897 13.75 13.646 13.536 13.369 13.254 13.124 13.053 12.91 12.767 12.619 12.536 12.335 12.269 12.184 12.11 11.94 11.838 11.712 11.562 11.383 11.165 10.936 10.44 -2 ,19360 ,TETRA ,17590318,Sat Nov 27 20:24:13 CET,Sat Nov 27 22:14:39 CET,0.0 0.419 0.666 0.806 0.948 1.096 1.215 1.322 1.529 1.623 1.718 1.774 1.978 2.054 2.197 2.337 2.498 2.581 2.744 2.915 3.142 3.276 3.418 3.634 3.834 4.029 4.224 4.41 4.636 4.859 5.075 5.33 5.584 5.828 6.105 6.414 6.699 6.994 7.325 7.697 8.085 8.518 9.022 9.509 10.086 10.746 11.499 12.322 13.26 14.312 15.439 16.207 16.513 16.622 16.595 16.503 16.394 16.249 16.125 16.001 15.867 15.716 15.56 15.412 15.282 15.172 15.046 14.925 14.802 14.671 14.54 14.423 14.3 14.174 14.074 13.964 13.85 13.738 13.625 13.548 13.463 13.314 13.205 13.103 13.052 12.938 12.813 12.674 12.603 12.417 12.377 12.299 12.212 12.028 11.934 11.826 11.701 11.568 11.406 11.154 10.287 -3 ,4586 ,TETRA ,17590319,Sat Nov 27 20:24:14 CET,Sat Nov 27 22:16:18 CET,0.0 0.873 1.246 1.516 1.739 1.924 2.09 2.242 2.497 2.619 2.74 2.842 3.074 3.184 3.377 3.557 3.734 3.822 3.993 4.154 4.375 4.515 4.653 4.846 5.037 5.229 5.413 5.581 5.808 6.02 6.227 6.488 6.729 6.963 7.231 7.524 7.806 8.128 8.464 8.831 9.213 9.625 10.108 10.567 11.109 11.726 12.429 13.216 14.102 15.1 16.199 16.919 17.195 17.256 17.211 17.104 16.98 16.819 16.642 16.46 16.275 16.106 15.943 15.783 15.624 15.469 15.309 15.158 15.014 14.863 14.701 14.563 14.427 14.285 14.174 14.057 13.923 13.789 13.661 13.566 13.46 13.292 13.175 13.046 12.977 12.836 12.687 12.531 12.457 12.276 12.252 12.169 12.077 11.89 11.784 11.658 11.506 11.326 11.134 10.901 10.125 -4 ,28350 ,TETRA ,17590320,Sat Nov 27 20:24:13 CET,Sat Nov 27 22:16:14 CET,0.0 0.527 0.764 0.963 1.12 1.257 1.392 1.524 1.725 1.811 1.896 1.942 2.148 2.222 2.368 2.516 2.653 2.715 2.842 2.968 3.155 3.285 3.411 3.591 3.762 3.914 4.058 4.211 4.43 4.64 4.84 5.087 5.322 5.549 5.832 6.144 6.416 6.725 7.075 7.446 7.832 8.261 8.745 9.233 9.793 10.405 11.121 11.913 12.839 13.883 14.988 15.756 16.073 16.175 16.171 16.092 15.989 15.872 15.727 15.539 15.35 15.18 15.014 14.856 14.702 14.552 14.398 14.252 14.113 13.961 13.8 13.668 13.534 13.389 13.279 13.145 12.987 12.829 12.666 12.561 12.455 12.288 12.173 12.032 11.958 11.816 11.651 11.485 11.399 11.193 11.119 11.018 10.909 10.683 10.559 10.415 10.261 10.096 9.897 9.657 9.156 -5 ,4079 ,TETRA ,17590321,Sat Nov 27 20:24:13 CET,Sat Nov 27 22:14:27 CET,0.0 0.594 0.829 1.014 1.178 1.304 1.428 1.557 1.769 1.864 1.96 2.032 2.252 2.348 2.542 2.718 2.873 2.951 3.108 3.266 3.5 3.652 3.799 4.008 4.206 4.395 4.585 4.761 4.971 5.178 5.377 5.629 5.882 6.123 6.403 6.7 6.975 7.283 7.638 8.015 8.397 8.827 9.307 9.799 10.385 11.009 11.746 12.57 13.454 14.44 15.582 16.402 16.728 16.793 16.738 16.628 16.484 16.319 16.157 15.989 15.822 15.657 15.475 15.292 15.126 14.963 14.794 14.646 14.518 14.384 14.234 14.102 13.958 13.81 13.706 13.583 13.453 13.325 13.193 13.107 13.009 12.86 12.765 12.665 12.609 12.489 12.367 12.245 12.179 11.997 11.967 11.874 11.779 11.595 11.488 11.373 11.245 11.074 10.881 10.659 10.034 -6 ,27205 ,TETRA ,17590322,Sat Nov 27 20:24:14 CET,Sat Nov 27 22:15:33 CET,0.0 0.466 0.674 0.86 1.014 1.161 1.294 1.403 1.596 1.69 1.785 1.84 2.041 2.12 2.287 2.453 2.613 2.682 2.817 2.957 3.154 3.283 3.411 3.613 3.814 4.008 4.191 4.356 4.571 4.783 4.981 5.228 5.471 5.698 5.958 6.24 6.518 6.832 7.177 7.549 7.931 8.36 8.879 9.396 10.002 10.674 11.425 12.248 13.178 14.23 15.356 16.101 16.407 16.484 16.477 16.405 16.27 16.094 15.927 15.736 15.539 15.372 15.219 15.062 14.91 14.758 14.58 14.413 14.275 14.135 13.984 13.851 13.697 13.531 13.413 13.293 13.166 13.037 12.889 12.781 12.667 12.486 12.362 12.231 12.164 12.021 11.863 11.688 11.603 11.408 11.331 11.222 11.108 10.888 10.762 10.621 10.488 10.35 10.183 9.939 9.057 -7 ,5855 ,TETRA ,17590323,Sat Nov 27 20:24:13 CET,Sat Nov 27 22:15:59 CET,0.0 0.763 0.972 1.178 1.326 1.465 1.606 1.734 1.953 2.061 2.169 2.218 2.422 2.51 2.684 2.826 2.951 3.012 3.139 3.265 3.462 3.591 3.706 3.877 4.061 4.234 4.403 4.575 4.799 5.012 5.216 5.477 5.735 5.964 6.215 6.515 6.812 7.13 7.475 7.843 8.22 8.653 9.154 9.649 10.242 10.888 11.594 12.365 13.255 14.292 15.442 16.163 16.457 16.596 16.593 16.492 16.358 16.201 16.055 15.876 15.691 15.506 15.321 15.156 14.983 14.814 14.637 14.474 14.332 14.186 14.027 13.889 13.754 13.604 13.484 13.364 13.239 13.112 12.98 12.884 12.789 12.655 12.562 12.457 12.403 12.287 12.167 12.049 11.985 11.811 11.772 11.68 11.589 11.378 11.264 11.156 11.03 10.888 10.718 10.449 9.685 -8 ,10410 ,TETRA ,17590324,Sat Nov 27 20:24:13 CET,Sat Nov 27 22:14:19 CET,0.0 0.46 0.697 0.85 0.977 1.113 1.249 1.367 1.568 1.665 1.783 1.907 2.14 2.235 2.396 2.564 2.744 2.833 2.998 3.145 3.355 3.494 3.631 3.842 4.045 4.243 4.428 4.604 4.838 5.05 5.248 5.498 5.744 5.975 6.245 6.549 6.837 7.152 7.488 7.87 8.267 8.705 9.212 9.718 10.315 10.953 11.675 12.465 13.341 14.32 15.427 16.186 16.506 16.62 16.621 16.539 16.41 16.28 16.158 15.995 15.818 15.648 15.474 15.296 15.122 14.958 14.781 14.626 14.488 14.332 14.178 14.036 13.878 13.727 13.601 13.475 13.347 13.205 13.057 12.954 12.851 12.682 12.553 12.417 12.349 12.21 12.063 11.884 11.785 11.579 11.502 11.395 11.279 11.005 10.848 10.683 10.491 10.302 10.115 9.828 9.24 -9 ,22918 ,TETRA ,17590325,Sat Nov 27 20:24:14 CET,Sat Nov 27 22:16:08 CET,0.0 0.801 1.025 1.211 1.395 1.544 1.655 1.76 1.949 2.034 2.119 2.171 2.383 2.466 2.624 2.775 2.93 3.004 3.15 3.299 3.519 3.662 3.799 3.994 4.182 4.361 4.533 4.704 4.927 5.142 5.352 5.609 5.852 6.074 6.333 6.628 6.913 7.231 7.57 7.927 8.305 8.733 9.238 9.737 10.298 10.918 11.642 12.447 13.343 14.366 15.479 16.169 16.401 16.462 16.423 16.296 16.136 15.966 15.794 15.607 15.436 15.257 15.062 14.885 14.719 14.553 14.385 14.225 14.085 13.944 13.768 13.612 13.453 13.287 13.17 13.06 12.94 12.813 12.695 12.617 12.532 12.405 12.319 12.218 12.16 12.04 11.928 11.8 11.721 11.535 11.497 11.406 11.307 11.104 10.992 10.862 10.735 10.599 10.434 10.203 9.321 -10 ,2087 ,TETRA ,17590326,Sat Nov 27 20:24:17 CET,Sat Nov 27 22:14:22 CET,0.0 1.073 1.344 1.579 1.782 1.96 2.126 2.284 2.535 2.642 2.745 2.839 3.068 3.175 3.373 3.555 3.731 3.813 3.976 4.132 4.353 4.5 4.648 4.861 5.059 5.242 5.41 5.579 5.804 6.024 6.242 6.492 6.736 6.974 7.233 7.521 7.805 8.12 8.458 8.813 9.187 9.612 10.105 10.609 11.198 11.837 12.542 13.344 14.272 15.273 16.385 17.143 17.467 17.56 17.545 17.481 17.382 17.253 17.115 16.964 16.798 16.631 16.466 16.303 16.144 15.981 15.808 15.648 15.501 15.348 15.18 15.049 14.917 14.76 14.636 14.513 14.372 14.219 14.073 13.973 13.854 13.669 13.555 13.433 13.364 13.218 13.062 12.881 12.789 12.578 12.483 12.383 12.274 12.01 11.855 11.688 11.511 11.332 11.111 10.776 10.017 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_17_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_17_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 14fb5ced..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_17_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4563 ,TETRA ,17590364,Sat Nov 27 20:25:13 CET,Sat Nov 27 23:28:28 CET,0.0 0.401 0.693 0.958 1.151 1.319 1.485 1.64 1.926 2.062 2.189 2.102 2.526 2.624 2.801 2.965 3.128 3.206 3.357 3.51 3.719 3.845 3.968 4.149 4.329 4.509 4.687 4.852 5.055 5.252 5.437 5.667 5.894 6.103 6.35 6.633 6.894 7.174 7.481 7.81 8.13 8.473 8.884 9.314 9.822 10.337 10.883 11.457 12.068 12.749 13.394 13.528 13.306 12.899 12.428 11.901 11.348 10.843 10.379 9.888 9.448 9.068 8.725 8.365 8.001 7.675 7.338 7.035 6.789 6.518 6.199 5.934 5.678 5.41 5.199 4.988 4.75 4.493 4.223 4.015 3.805 3.503 3.291 3.09 2.98 2.713 2.435 2.13 1.965 1.484 1.418 1.237 1.061 0.661 0.418 0.134 -0.177 -0.529 -0.921 -1.449 -2.366 -2 ,16912 ,TETRA ,17590365,Sat Nov 27 20:25:13 CET,Sat Nov 27 23:33:57 CET,0.0 0.347 0.628 0.847 1.036 1.225 1.395 1.56 1.86 1.993 2.126 2.04 2.461 2.562 2.747 2.933 3.113 3.196 3.345 3.487 3.699 3.833 3.971 4.181 4.365 4.541 4.718 4.888 5.103 5.308 5.497 5.718 5.942 6.153 6.392 6.668 6.927 7.213 7.525 7.846 8.171 8.539 8.984 9.416 9.887 10.401 10.983 11.597 12.252 12.937 13.558 13.76 13.688 13.474 13.172 12.846 12.502 12.128 11.792 11.439 11.12 10.85 10.582 10.292 10.01 9.76 9.495 9.254 9.043 8.818 8.571 8.373 8.176 7.975 7.805 7.62 7.436 7.224 6.998 6.845 6.682 6.443 6.28 6.102 6.01 5.806 5.582 5.344 5.23 4.802 4.858 4.714 4.554 4.16 3.926 3.703 3.465 3.194 2.898 2.488 1.392 -3 ,3165 ,TETRA ,17590366,Sat Nov 27 20:25:13 CET,Sat Nov 27 23:28:54 CET,0.0 0.617 0.952 1.198 1.408 1.592 1.747 1.9 2.191 2.327 2.457 2.376 2.816 2.93 3.127 3.307 3.481 3.56 3.707 3.864 4.086 4.224 4.368 4.572 4.751 4.914 5.079 5.241 5.446 5.641 5.82 6.03 6.245 6.465 6.709 6.979 7.237 7.513 7.806 8.109 8.439 8.798 9.175 9.561 10.015 10.492 11.021 11.582 12.177 12.787 13.34 13.459 13.203 12.898 12.546 12.144 11.75 11.347 10.978 10.628 10.314 10.038 9.745 9.424 9.134 8.848 8.551 8.27 8.007 7.746 7.474 7.25 7.017 6.776 6.573 6.338 6.096 5.85 5.585 5.402 5.21 4.901 4.688 4.48 4.372 4.157 3.94 3.682 3.54 3.081 3.084 2.917 2.722 2.303 2.092 1.844 1.576 1.284 0.906 0.384 -0.925 -4 ,28915 ,TETRA ,17590367,Sat Nov 27 20:25:13 CET,Sat Nov 27 23:29:51 CET,0.0 0.586 0.921 1.215 1.469 1.676 1.837 1.969 2.229 2.355 2.47 2.374 2.794 2.887 3.072 3.257 3.422 3.497 3.646 3.792 4.002 4.133 4.262 4.445 4.615 4.778 4.928 5.078 5.277 5.464 5.642 5.859 6.062 6.262 6.503 6.761 7.014 7.298 7.602 7.928 8.262 8.62 9.03 9.435 9.887 10.395 10.975 11.524 12.026 12.52 12.905 12.973 12.733 12.296 11.837 11.363 10.906 10.447 10.035 9.667 9.352 9.014 8.642 8.314 8.033 7.75 7.444 7.163 6.913 6.63 6.328 6.093 5.84 5.57 5.355 5.125 4.888 4.66 4.434 4.265 4.09 3.813 3.62 3.409 3.29 3.043 2.778 2.486 2.336 1.866 1.863 1.711 1.546 1.185 0.998 0.779 0.542 0.277 -0.046 -0.507 -1.301 -5 ,30745 ,TETRA ,17590368,Sat Nov 27 20:25:14 CET,Sat Nov 27 23:27:53 CET,0.0 0.422 0.727 0.945 1.125 1.294 1.463 1.614 1.874 1.987 2.094 1.983 2.403 2.497 2.687 2.856 3.014 3.094 3.255 3.416 3.644 3.785 3.93 4.134 4.31 4.481 4.645 4.796 4.994 5.195 5.392 5.616 5.825 6.03 6.271 6.54 6.774 7.035 7.328 7.621 7.937 8.309 8.734 9.151 9.64 10.202 10.811 11.388 11.996 12.674 13.318 13.498 13.367 13.133 12.825 12.499 12.18 11.85 11.545 11.222 10.936 10.662 10.381 10.133 9.886 9.639 9.386 9.145 8.931 8.673 8.358 8.094 7.827 7.537 7.298 7.063 6.819 6.552 6.272 6.09 5.92 5.644 5.416 5.177 5.053 4.764 4.468 4.161 3.998 3.513 3.444 3.239 3.056 2.676 2.461 2.225 1.938 1.57 1.136 0.527 -0.946 -6 ,14204 ,TETRA ,17590369,Sat Nov 27 20:26:11 CET,Sat Nov 27 23:30:24 CET,0.0 0.415 0.652 0.853 1.043 1.21 1.349 1.48 1.737 1.859 1.972 1.863 2.276 2.373 2.574 2.759 2.922 2.997 3.14 3.28 3.493 3.635 3.77 3.958 4.13 4.298 4.472 4.629 4.819 5.006 5.194 5.434 5.668 5.878 6.122 6.4 6.65 6.928 7.23 7.553 7.891 8.248 8.659 9.059 9.493 9.966 10.479 11.031 11.664 12.293 12.862 13.115 13.009 12.716 12.395 12.037 11.631 11.236 10.906 10.584 10.28 9.989 9.739 9.505 9.257 9.017 8.774 8.56 8.359 8.143 7.923 7.74 7.557 7.355 7.2 7.043 6.872 6.696 6.508 6.378 6.238 6.021 5.871 5.713 5.63 5.444 5.251 5.057 4.957 4.538 4.594 4.446 4.298 3.983 3.814 3.627 3.401 3.14 2.838 2.404 1.676 -7 ,16710 ,TETRA ,17590370,Sat Nov 27 20:26:13 CET,Sat Nov 27 23:29:05 CET,0.0 0.578 0.898 1.164 1.39 1.567 1.72 1.869 2.163 2.293 2.406 2.29 2.714 2.811 2.994 3.175 3.343 3.421 3.575 3.726 3.944 4.079 4.214 4.413 4.603 4.79 4.962 5.118 5.327 5.533 5.725 5.949 6.162 6.38 6.63 6.894 7.144 7.425 7.738 8.056 8.372 8.747 9.201 9.639 10.124 10.652 11.234 11.829 12.486 13.195 13.813 13.975 13.831 13.529 13.149 12.738 12.341 11.93 11.544 11.113 10.706 10.324 9.944 9.597 9.273 9.014 8.777 8.56 8.346 8.105 7.845 7.629 7.43 7.222 7.045 6.863 6.679 6.481 6.274 6.131 5.97 5.706 5.525 5.333 5.234 5.028 4.779 4.494 4.349 3.881 3.875 3.705 3.513 3.095 2.887 2.635 2.343 2.071 1.734 1.267 -0.297 -8 ,3323 ,TETRA ,17590371,Sat Nov 27 20:26:14 CET,Sat Nov 27 23:28:46 CET,0.0 0.686 0.954 1.152 1.332 1.501 1.658 1.807 2.067 2.18 2.293 2.187 2.606 2.7 2.884 3.069 3.236 3.314 3.463 3.596 3.802 3.944 4.08 4.271 4.453 4.632 4.799 4.957 5.16 5.344 5.526 5.763 5.992 6.208 6.447 6.699 6.945 7.212 7.483 7.775 8.086 8.427 8.822 9.224 9.714 10.242 10.816 11.456 12.16 12.896 13.542 13.822 13.77 13.482 13.081 12.656 12.207 11.784 11.412 11.015 10.652 10.302 9.988 9.714 9.421 9.11 8.799 8.543 8.317 8.067 7.789 7.546 7.29 7.024 6.851 6.687 6.484 6.277 6.053 5.886 5.725 5.483 5.296 5.111 5.017 4.787 4.538 4.29 4.168 3.722 3.749 3.604 3.436 3.0 2.772 2.568 2.327 2.047 1.771 1.363 0.471 -9 ,11783 ,TETRA ,17590372,Sat Nov 27 20:26:13 CET,Sat Nov 27 23:30:09 CET,0.0 0.669 0.998 1.224 1.432 1.61 1.782 1.943 2.219 2.342 2.464 2.37 2.795 2.896 3.086 3.264 3.426 3.5 3.646 3.789 3.999 4.131 4.256 4.444 4.624 4.798 4.966 5.124 5.329 5.535 5.72 5.937 6.161 6.374 6.602 6.856 7.113 7.397 7.695 8.023 8.376 8.758 9.194 9.616 10.083 10.573 11.137 11.777 12.466 13.171 13.874 14.182 14.1 13.82 13.449 13.028 12.644 12.275 11.925 11.57 11.264 11.0 10.748 10.5 10.242 10.007 9.765 9.547 9.35 9.116 8.861 8.644 8.392 8.135 7.924 7.692 7.459 7.198 6.922 6.741 6.554 6.238 6.005 5.763 5.64 5.384 5.099 4.77 4.604 4.128 4.085 3.889 3.698 3.3 3.07 2.819 2.547 2.236 1.873 1.413 0.44 -10 ,28568 ,TETRA ,17590373,Sat Nov 27 20:26:13 CET,Sat Nov 27 23:29:57 CET,0.0 0.502 0.861 1.084 1.269 1.447 1.609 1.754 2.016 2.137 2.256 2.156 2.571 2.667 2.853 3.026 3.193 3.269 3.418 3.555 3.754 3.883 4.019 4.228 4.416 4.59 4.753 4.915 5.124 5.326 5.515 5.732 5.955 6.176 6.416 6.687 6.944 7.21 7.502 7.831 8.17 8.527 8.941 9.359 9.825 10.34 10.923 11.543 12.188 12.872 13.59 13.838 13.684 13.463 13.186 12.892 12.591 12.277 11.98 11.648 11.343 11.062 10.787 10.501 10.248 10.034 9.8 9.588 9.41 9.216 8.998 8.82 8.641 8.439 8.264 8.086 7.916 7.729 7.521 7.382 7.247 7.026 6.868 6.72 6.637 6.435 6.236 6.029 5.916 5.491 5.55 5.409 5.271 4.978 4.795 4.588 4.382 4.133 3.833 3.496 2.921 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_17.txt deleted file mode 100644 index cd06aa90..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7033 ,TETRA ,17590374,Sat Nov 27 20:26:13 CET,Sat Nov 27 23:31:31 CET,0.0 0.601 0.996 1.31 1.561 1.747 1.927 2.097 2.382 2.522 2.654 2.585 3.034 3.155 3.372 3.58 3.768 3.855 4.028 4.195 4.436 4.588 4.731 4.938 5.125 5.306 5.482 5.648 5.86 6.068 6.262 6.498 6.722 6.932 7.193 7.488 7.742 8.011 8.293 8.59 8.91 9.275 9.699 10.083 10.519 11.006 11.528 12.052 12.587 13.115 13.643 13.871 13.8 13.61 13.376 13.148 12.915 12.673 12.431 12.157 11.911 11.686 11.467 11.245 11.031 10.833 10.634 10.443 10.264 10.092 9.91 9.75 9.581 9.415 9.289 9.15 9.004 8.849 8.677 8.549 8.426 8.256 8.135 8.012 7.943 7.785 7.607 7.43 7.347 6.939 7.062 6.945 6.821 6.565 6.422 6.254 6.074 5.868 5.605 5.282 4.693 -2 ,19357 ,TETRA ,17590375,Sat Nov 27 20:26:13 CET,Sat Nov 27 23:30:36 CET,0.0 0.914 1.295 1.538 1.758 1.945 2.091 2.237 2.509 2.636 2.759 2.669 3.094 3.199 3.395 3.57 3.74 3.826 3.996 4.168 4.418 4.569 4.71 4.916 5.109 5.281 5.453 5.628 5.85 6.058 6.259 6.503 6.734 6.943 7.178 7.44 7.702 7.98 8.262 8.567 8.894 9.247 9.677 10.11 10.556 11.026 11.548 12.107 12.749 13.431 14.029 14.266 14.219 14.055 13.831 13.568 13.292 12.997 12.744 12.493 12.256 12.044 11.829 11.617 11.418 11.243 11.067 10.894 10.732 10.571 10.415 10.271 10.113 9.96 9.83 9.69 9.557 9.413 9.259 9.155 9.037 8.841 8.715 8.583 8.508 8.353 8.206 8.045 7.95 7.536 7.645 7.518 7.394 7.128 6.962 6.792 6.621 6.419 6.202 5.94 5.465 -3 ,10688 ,TETRA ,17590376,Sat Nov 27 20:26:13 CET,Sat Nov 27 23:30:58 CET,0.0 1.129 1.527 1.847 2.096 2.298 2.468 2.627 2.944 3.08 3.209 3.146 3.589 3.696 3.91 4.122 4.31 4.395 4.565 4.734 4.98 5.133 5.281 5.484 5.669 5.85 6.026 6.198 6.414 6.613 6.807 7.059 7.291 7.5 7.739 8.003 8.249 8.521 8.837 9.153 9.469 9.841 10.282 10.684 11.128 11.621 12.177 12.763 13.332 13.938 14.494 14.616 14.427 14.155 13.871 13.602 13.351 13.085 12.802 12.508 12.271 12.058 11.864 11.656 11.447 11.263 11.073 10.91 10.751 10.576 10.403 10.254 10.079 9.9 9.773 9.629 9.472 9.315 9.149 9.034 8.916 8.731 8.606 8.473 8.405 8.265 8.111 7.939 7.851 7.436 7.548 7.439 7.314 7.035 6.885 6.705 6.496 6.282 6.01 5.683 5.128 -4 ,14238 ,TETRA ,17590377,Sat Nov 27 20:26:13 CET,Sat Nov 27 23:29:05 CET,0.0 0.613 0.875 1.11 1.338 1.543 1.724 1.882 2.177 2.309 2.421 2.319 2.745 2.85 3.062 3.254 3.422 3.502 3.66 3.81 4.035 4.182 4.321 4.521 4.718 4.914 5.107 5.285 5.499 5.705 5.902 6.132 6.339 6.55 6.807 7.065 7.305 7.593 7.884 8.187 8.53 8.92 9.349 9.751 10.189 10.655 11.188 11.754 12.366 12.988 13.512 13.705 13.705 13.575 13.326 13.057 12.805 12.562 12.323 12.07 11.848 11.626 11.429 11.25 11.064 10.902 10.74 10.574 10.428 10.279 10.112 9.967 9.815 9.653 9.51 9.352 9.198 9.036 8.867 8.754 8.633 8.438 8.311 8.184 8.116 7.98 7.818 7.64 7.551 7.13 7.253 7.15 7.04 6.796 6.655 6.508 6.336 6.129 5.899 5.622 4.932 -5 ,11107 ,TETRA ,17590378,Sat Nov 27 20:26:15 CET,Sat Nov 27 23:30:51 CET,0.0 0.634 1.021 1.329 1.588 1.806 1.966 2.121 2.438 2.578 2.717 2.666 3.102 3.207 3.425 3.641 3.837 3.933 4.112 4.274 4.509 4.655 4.8 5.014 5.225 5.434 5.628 5.809 6.037 6.244 6.434 6.657 6.876 7.081 7.326 7.615 7.879 8.151 8.451 8.78 9.099 9.442 9.831 10.208 10.639 11.107 11.648 12.212 12.786 13.39 13.9 14.043 13.919 13.711 13.475 13.216 12.961 12.713 12.489 12.253 12.015 11.796 11.595 11.389 11.199 11.012 10.813 10.635 10.477 10.321 10.153 10.003 9.842 9.679 9.546 9.409 9.277 9.145 8.996 8.884 8.777 8.609 8.484 8.347 8.274 8.134 7.99 7.825 7.735 7.32 7.444 7.34 7.228 6.973 6.842 6.704 6.544 6.373 6.181 5.931 5.475 -6 ,13445 ,TETRA ,17590379,Sat Nov 27 20:26:14 CET,Sat Nov 27 23:29:05 CET,0.0 0.682 0.976 1.217 1.433 1.641 1.831 1.992 2.273 2.42 2.572 2.511 2.947 3.056 3.248 3.422 3.596 3.675 3.835 4.006 4.256 4.412 4.555 4.751 4.928 5.104 5.276 5.432 5.638 5.848 6.038 6.25 6.468 6.666 6.891 7.156 7.398 7.664 7.962 8.267 8.567 8.904 9.277 9.65 10.109 10.616 11.165 11.729 12.3 12.84 13.346 13.571 13.516 13.318 13.087 12.85 12.6 12.368 12.167 11.93 11.707 11.506 11.26 10.998 10.785 10.589 10.378 10.192 10.036 9.876 9.697 9.54 9.372 9.208 9.087 8.936 8.781 8.638 8.483 8.372 8.259 8.084 7.954 7.814 7.747 7.611 7.46 7.287 7.194 6.78 6.901 6.786 6.659 6.371 6.211 6.05 5.852 5.627 5.374 5.08 4.562 -7 ,11883 ,TETRA ,17590380,Sat Nov 27 20:26:16 CET,Sat Nov 27 23:30:26 CET,0.0 0.568 0.863 1.116 1.346 1.567 1.76 1.92 2.195 2.317 2.444 2.391 2.835 2.949 3.164 3.362 3.542 3.629 3.792 3.942 4.16 4.309 4.456 4.658 4.844 5.009 5.176 5.354 5.578 5.778 5.968 6.202 6.424 6.624 6.858 7.13 7.382 7.642 7.924 8.211 8.491 8.821 9.208 9.582 10.018 10.503 11.042 11.633 12.307 12.998 13.586 13.806 13.778 13.653 13.432 13.144 12.869 12.598 12.341 12.075 11.849 11.639 11.43 11.234 11.05 10.87 10.675 10.503 10.356 10.19 10.003 9.852 9.697 9.53 9.391 9.24 9.086 8.928 8.765 8.651 8.525 8.33 8.199 8.066 8.0 7.851 7.689 7.503 7.4 6.987 7.099 6.991 6.873 6.614 6.474 6.311 6.125 5.937 5.727 5.44 4.814 -8 ,944 ,TETRA ,17590381,Sat Nov 27 20:26:14 CET,Sat Nov 27 23:28:42 CET,0.0 0.702 1.052 1.326 1.559 1.762 1.928 2.1 2.447 2.594 2.727 2.628 3.05 3.152 3.341 3.507 3.672 3.756 3.916 4.075 4.314 4.476 4.629 4.824 5.001 5.18 5.357 5.535 5.765 5.968 6.156 6.385 6.607 6.821 7.065 7.34 7.608 7.896 8.182 8.484 8.817 9.18 9.595 10.028 10.502 10.973 11.509 12.054 12.644 13.296 13.939 14.232 14.176 14.01 13.772 13.489 13.201 12.912 12.671 12.433 12.212 12.004 11.796 11.598 11.418 11.231 11.024 10.838 10.672 10.509 10.338 10.195 10.038 9.86 9.729 9.602 9.472 9.337 9.186 9.079 8.966 8.778 8.649 8.51 8.441 8.309 8.159 7.995 7.909 7.502 7.615 7.497 7.374 7.123 6.983 6.839 6.677 6.473 6.247 5.957 5.347 -9 ,16268 ,TETRA ,17590382,Sat Nov 27 20:26:16 CET,Sat Nov 27 23:30:09 CET,0.0 0.484 0.78 1.089 1.358 1.561 1.744 1.919 2.225 2.37 2.496 2.384 2.815 2.927 3.114 3.294 3.482 3.574 3.74 3.904 4.147 4.288 4.423 4.637 4.85 5.042 5.227 5.403 5.605 5.803 5.994 6.206 6.418 6.637 6.881 7.139 7.387 7.654 7.93 8.233 8.548 8.882 9.275 9.677 10.124 10.609 11.153 11.727 12.342 12.976 13.605 13.869 13.809 13.617 13.367 13.066 12.786 12.513 12.222 11.943 11.717 11.496 11.276 11.065 10.877 10.7 10.503 10.325 10.163 9.985 9.795 9.645 9.488 9.32 9.192 9.063 8.915 8.762 8.614 8.5 8.38 8.208 8.085 7.949 7.881 7.753 7.615 7.462 7.388 6.991 7.108 6.998 6.888 6.655 6.52 6.369 6.197 6.004 5.796 5.537 5.056 -10 ,4 ,TETRA ,17590383,Sat Nov 27 20:27:13 CET,Sat Nov 27 23:31:20 CET,0.0 0.754 1.136 1.449 1.692 1.908 2.092 2.238 2.494 2.619 2.738 2.64 3.074 3.178 3.375 3.572 3.76 3.851 4.039 4.229 4.479 4.633 4.78 4.982 5.18 5.369 5.541 5.711 5.927 6.128 6.322 6.562 6.794 7.009 7.246 7.508 7.748 8.031 8.349 8.665 8.987 9.335 9.734 10.138 10.587 11.073 11.607 12.171 12.803 13.448 14.059 14.321 14.269 14.105 13.88 13.606 13.346 13.098 12.873 12.624 12.397 12.199 11.992 11.765 11.556 11.371 11.157 10.96 10.801 10.634 10.459 10.313 10.151 9.974 9.836 9.697 9.565 9.426 9.275 9.164 9.042 8.865 8.738 8.592 8.518 8.367 8.21 8.035 7.93 7.487 7.549 7.422 7.283 6.979 6.815 6.633 6.442 6.217 5.943 5.622 4.863 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt deleted file mode 100644 index e64b5de5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,422 ,TETRA ,17590384,Sat Nov 27 20:27:13 CET,Sat Nov 27 23:29:00 CET,0.0 0.439 0.722 0.969 1.17 1.364 1.538 1.687 1.979 2.107 2.22 2.122 2.558 2.663 2.856 3.038 3.219 3.304 3.467 3.624 3.837 3.975 4.116 4.321 4.517 4.695 4.871 5.046 5.263 5.462 5.657 5.897 6.119 6.341 6.594 6.869 7.138 7.432 7.756 8.111 8.463 8.855 9.325 9.777 10.268 10.824 11.492 12.218 12.992 13.837 14.666 15.074 15.101 14.918 14.693 14.42 14.115 13.829 13.568 13.29 13.024 12.79 12.57 12.328 12.081 11.868 11.656 11.462 11.277 11.078 10.872 10.693 10.514 10.331 10.191 10.042 9.887 9.724 9.549 9.436 9.314 9.113 8.965 8.804 8.722 8.531 8.333 8.132 8.027 7.6 7.663 7.544 7.418 7.145 7.002 6.841 6.639 6.382 6.09 5.733 5.16 -2 ,8802 ,TETRA ,17590385,Sat Nov 27 20:27:13 CET,Sat Nov 27 23:31:59 CET,0.0 0.559 0.828 1.036 1.222 1.393 1.542 1.691 1.974 2.099 2.227 2.136 2.568 2.679 2.888 3.081 3.255 3.341 3.508 3.666 3.888 4.019 4.149 4.345 4.53 4.701 4.869 5.039 5.252 5.459 5.664 5.915 6.151 6.371 6.622 6.914 7.196 7.492 7.814 8.155 8.517 8.931 9.382 9.815 10.347 10.964 11.649 12.37 13.145 13.972 14.837 15.283 15.374 15.322 15.174 14.961 14.736 14.474 14.231 13.96 13.705 13.486 13.269 13.05 12.844 12.656 12.463 12.298 12.14 11.956 11.76 11.601 11.432 11.261 11.134 10.998 10.857 10.711 10.546 10.43 10.315 10.13 9.996 9.852 9.778 9.615 9.44 9.262 9.164 8.745 8.831 8.703 8.576 8.319 8.176 7.999 7.771 7.507 7.178 6.758 5.993 -3 ,16265 ,TETRA ,17590386,Sat Nov 27 20:27:13 CET,Sat Nov 27 23:30:45 CET,0.0 0.536 0.811 1.042 1.231 1.403 1.57 1.717 2.001 2.128 2.249 2.167 2.602 2.705 2.887 3.064 3.237 3.318 3.476 3.633 3.856 3.999 4.139 4.343 4.534 4.719 4.904 5.072 5.281 5.484 5.685 5.926 6.155 6.38 6.63 6.904 7.165 7.458 7.787 8.137 8.49 8.886 9.342 9.783 10.3 10.896 11.587 12.31 13.076 13.881 14.688 15.152 15.307 15.325 15.168 14.913 14.667 14.419 14.153 13.889 13.682 13.481 13.242 12.991 12.768 12.561 12.33 12.119 11.938 11.769 11.599 11.415 11.196 10.985 10.836 10.675 10.495 10.301 10.093 9.941 9.78 9.548 9.386 9.209 9.113 8.905 8.682 8.439 8.313 7.881 7.946 7.798 7.641 7.326 7.139 6.939 6.725 6.489 6.213 5.873 5.258 -4 ,20820 ,TETRA ,17590387,Sat Nov 27 20:27:13 CET,Sat Nov 27 23:36:05 CET,0.0 0.471 0.785 1.037 1.246 1.447 1.626 1.79 2.069 2.183 2.293 2.173 2.585 2.683 2.872 3.032 3.186 3.262 3.416 3.579 3.832 3.993 4.135 4.329 4.515 4.694 4.867 5.036 5.245 5.44 5.634 5.878 6.115 6.33 6.57 6.854 7.13 7.427 7.739 8.067 8.414 8.799 9.247 9.699 10.208 10.758 11.378 12.063 12.862 13.759 14.593 15.031 15.102 14.954 14.728 14.48 14.187 13.856 13.557 13.293 13.074 12.843 12.597 12.355 12.11 11.864 11.617 11.424 11.262 11.058 10.821 10.653 10.477 10.261 10.087 9.903 9.707 9.507 9.305 9.162 9.015 8.799 8.641 8.471 8.38 8.19 7.996 7.77 7.64 7.189 7.213 7.079 6.941 6.595 6.411 6.228 6.034 5.813 5.558 5.248 4.691 -5 ,24054 ,TETRA ,17590388,Sat Nov 27 20:27:15 CET,Sat Nov 27 23:29:37 CET,0.0 0.443 0.752 0.999 1.203 1.366 1.515 1.667 1.963 2.093 2.213 2.166 2.621 2.729 2.925 3.101 3.273 3.359 3.522 3.677 3.893 4.025 4.169 4.392 4.58 4.75 4.917 5.079 5.288 5.489 5.684 5.922 6.142 6.347 6.592 6.876 7.15 7.463 7.797 8.134 8.492 8.896 9.34 9.779 10.319 10.911 11.572 12.307 13.095 13.954 14.782 15.114 15.071 14.905 14.645 14.345 14.044 13.724 13.416 13.1 12.82 12.546 12.268 12.028 11.82 11.604 11.365 11.147 10.955 10.752 10.518 10.324 10.136 9.934 9.773 9.614 9.465 9.31 9.13 9.004 8.869 8.653 8.507 8.341 8.247 8.049 7.835 7.579 7.451 7.013 7.065 6.932 6.775 6.438 6.276 6.083 5.844 5.558 5.205 4.777 3.924 -6 ,13059 ,TETRA ,17590389,Sat Nov 27 20:27:13 CET,Sat Nov 27 23:32:32 CET,0.0 0.524 0.841 1.07 1.249 1.408 1.574 1.734 2.004 2.133 2.248 2.121 2.539 2.632 2.818 2.994 3.157 3.234 3.385 3.539 3.756 3.891 4.024 4.218 4.402 4.582 4.754 4.919 5.145 5.35 5.546 5.786 6.014 6.234 6.486 6.78 7.056 7.356 7.682 8.01 8.349 8.739 9.192 9.642 10.158 10.739 11.406 12.12 12.921 13.831 14.774 15.247 15.268 15.116 14.921 14.687 14.435 14.188 13.939 13.663 13.395 13.147 12.913 12.674 12.443 12.214 11.947 11.708 11.506 11.295 11.064 10.865 10.673 10.484 10.332 10.161 9.98 9.789 9.578 9.439 9.297 9.071 8.913 8.744 8.659 8.472 8.273 8.051 7.929 7.501 7.58 7.453 7.313 6.992 6.821 6.637 6.432 6.204 5.943 5.594 5.019 -7 ,18276 ,TETRA ,17590390,Sat Nov 27 20:27:13 CET,Sat Nov 27 23:31:28 CET,0.0 0.452 0.767 1.019 1.213 1.383 1.532 1.679 1.977 2.113 2.234 2.154 2.588 2.697 2.901 3.087 3.257 3.342 3.513 3.677 3.908 4.049 4.183 4.381 4.563 4.74 4.923 5.1 5.322 5.527 5.722 5.962 6.19 6.406 6.662 6.953 7.226 7.521 7.837 8.189 8.555 8.96 9.424 9.88 10.423 11.029 11.714 12.479 13.336 14.267 15.256 15.848 16.062 16.097 15.979 15.767 15.548 15.336 15.131 14.904 14.686 14.467 14.25 14.046 13.854 13.669 13.451 13.244 13.061 12.852 12.637 12.481 12.3 12.09 11.933 11.761 11.575 11.381 11.17 11.03 10.888 10.659 10.494 10.313 10.218 10.031 9.848 9.657 9.549 9.12 9.169 9.021 8.87 8.561 8.408 8.227 7.995 7.748 7.494 7.172 6.4 -8 ,25815 ,TETRA ,17590391,Sat Nov 27 20:28:13 CET,Sat Nov 27 23:34:12 CET,0.0 0.712 1.07 1.341 1.582 1.792 1.959 2.116 2.417 2.549 2.664 2.567 2.996 3.099 3.286 3.457 3.626 3.708 3.867 4.022 4.248 4.391 4.527 4.726 4.916 5.121 5.338 5.54 5.791 6.025 6.258 6.553 6.815 7.036 7.283 7.569 7.841 8.146 8.476 8.817 9.191 9.615 10.088 10.565 11.099 11.677 12.34 13.102 13.929 14.765 15.611 16.122 16.24 16.2 16.037 15.808 15.575 15.357 15.169 14.934 14.66 14.391 14.132 13.87 13.624 13.397 13.145 12.915 12.697 12.442 12.182 11.971 11.74 11.509 11.332 11.145 10.946 10.714 10.455 10.286 10.106 9.822 9.641 9.45 9.345 9.126 8.899 8.642 8.503 8.045 8.063 7.904 7.74 7.37 7.149 6.907 6.663 6.39 6.042 5.569 4.461 -9 ,32269 ,TETRA ,17590392,Sat Nov 27 20:28:15 CET,Sat Nov 27 23:30:06 CET,0.0 0.47 0.774 1.019 1.222 1.393 1.535 1.672 1.954 2.08 2.197 2.102 2.53 2.631 2.838 3.032 3.21 3.296 3.462 3.62 3.849 3.99 4.129 4.331 4.519 4.706 4.891 5.065 5.279 5.489 5.704 5.951 6.177 6.407 6.672 6.953 7.224 7.524 7.851 8.189 8.548 8.977 9.473 9.952 10.474 11.033 11.682 12.421 13.211 14.038 14.884 15.329 15.377 15.208 15.01 14.811 14.582 14.308 14.039 13.761 13.486 13.233 12.998 12.737 12.476 12.227 11.957 11.739 11.554 11.344 11.113 10.919 10.722 10.513 10.33 10.143 9.951 9.75 9.542 9.39 9.234 8.984 8.811 8.627 8.526 8.311 8.092 7.864 7.736 7.289 7.318 7.158 7.002 6.665 6.464 6.236 5.994 5.745 5.47 5.075 3.823 -10 ,24530 ,TETRA ,17590393,Sat Nov 27 20:28:13 CET,Sat Nov 27 23:33:19 CET,0.0 0.461 0.741 0.983 1.189 1.372 1.535 1.68 1.935 2.066 2.207 2.146 2.581 2.684 2.885 3.081 3.257 3.343 3.506 3.656 3.877 4.018 4.148 4.334 4.522 4.715 4.901 5.069 5.279 5.487 5.686 5.924 6.16 6.389 6.656 6.972 7.276 7.597 7.955 8.332 8.703 9.11 9.585 10.057 10.576 11.122 11.755 12.499 13.354 14.263 15.2 15.855 16.092 16.076 15.946 15.782 15.596 15.392 15.178 14.934 14.724 14.532 14.36 14.187 14.006 13.839 13.646 13.472 13.323 13.169 13.001 12.86 12.717 12.547 12.4 12.248 12.088 11.908 11.735 11.613 11.475 11.277 11.141 10.995 10.916 10.739 10.546 10.338 10.221 9.794 9.867 9.728 9.596 9.29 9.108 8.931 8.744 8.524 8.267 7.903 7.258 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt deleted file mode 100644 index eec2b082..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17252 ,TETRA ,17590394,Sat Nov 27 20:28:13 CET,Sat Nov 27 23:30:41 CET,0.0 2.056 2.717 3.222 3.654 4.045 4.393 4.716 5.291 5.546 5.801 5.774 6.541 6.763 7.182 7.596 8.0 8.203 8.579 8.937 9.488 9.851 10.192 10.683 11.151 11.597 12.066 12.512 13.067 13.616 14.141 14.803 15.46 16.084 16.789 17.595 18.385 19.28 20.255 21.287 22.406 23.677 25.172 26.682 28.394 30.353 32.736 35.495 38.875 42.814 47.625 51.876 54.212 55.545 56.327 56.793 56.948 56.927 56.874 56.788 56.686 56.537 56.305 56.039 55.819 55.639 55.401 55.163 54.963 54.737 54.47 54.223 53.896 53.48 53.147 52.817 52.452 52.039 51.615 51.33 51.026 50.539 50.201 49.844 49.669 49.322 48.936 48.489 48.257 47.493 47.547 47.283 47.013 46.45 46.144 45.793 45.338 44.819 44.178 43.253 40.723 -2 ,6623 ,TETRA ,17590395,Sat Nov 27 20:28:14 CET,Sat Nov 27 23:33:28 CET,0.0 2.312 3.075 3.667 4.136 4.527 4.878 5.204 5.802 6.092 6.368 6.362 7.146 7.391 7.891 8.367 8.782 8.983 9.355 9.704 10.219 10.544 10.867 11.355 11.824 12.266 12.718 13.165 13.717 14.252 14.774 15.429 16.081 16.729 17.505 18.376 19.205 20.114 21.086 22.111 23.181 24.43 25.941 27.455 29.252 31.248 33.575 36.378 39.723 43.35 47.381 50.49 52.128 53.072 53.507 53.618 53.577 53.456 53.329 53.187 53.031 52.857 52.625 52.366 52.131 51.946 51.73 51.506 51.314 51.122 50.927 50.744 50.506 50.229 50.028 49.82 49.606 49.373 49.113 48.939 48.763 48.468 48.268 48.057 47.936 47.689 47.431 47.174 47.035 46.397 46.579 46.414 46.242 45.805 45.546 45.286 44.992 44.641 44.209 43.677 41.935 -3 ,84 ,TETRA ,17590396,Sat Nov 27 20:28:13 CET,Sat Nov 27 23:29:57 CET,0.0 1.873 2.479 2.95 3.346 3.709 4.052 4.377 4.946 5.214 5.49 5.452 6.204 6.425 6.838 7.238 7.625 7.817 8.217 8.601 9.146 9.49 9.812 10.29 10.755 11.203 11.65 12.082 12.658 13.247 13.822 14.525 15.206 15.859 16.632 17.518 18.343 19.202 20.15 21.209 22.304 23.547 25.089 26.632 28.441 30.463 32.714 35.283 38.308 41.792 45.933 49.271 50.973 51.822 52.274 52.485 52.531 52.497 52.435 52.302 52.096 51.924 51.766 51.562 51.354 51.146 50.903 50.659 50.411 50.105 49.792 49.564 49.313 49.027 48.814 48.594 48.317 48.016 47.729 47.526 47.305 46.957 46.71 46.443 46.31 46.019 45.703 45.394 45.231 44.557 44.67 44.468 44.23 43.711 43.45 43.159 42.846 42.488 42.001 41.347 38.473 -4 ,32456 ,TETRA ,17590397,Sat Nov 27 20:28:13 CET,Sat Nov 27 23:31:49 CET,0.0 1.874 2.477 2.974 3.393 3.755 4.07 4.346 4.885 5.145 5.384 5.318 6.073 6.288 6.711 7.129 7.536 7.728 8.112 8.47 8.998 9.344 9.679 10.167 10.636 11.105 11.562 12.011 12.603 13.168 13.719 14.407 15.099 15.776 16.538 17.375 18.182 19.118 20.172 21.311 22.523 23.905 25.582 27.283 29.301 31.568 34.084 37.002 40.397 44.2 48.875 52.856 54.992 56.113 56.634 56.871 56.97 56.983 56.922 56.741 56.571 56.407 56.215 56.022 55.818 55.623 55.411 55.198 55.02 54.843 54.653 54.477 54.243 53.98 53.804 53.643 53.449 53.24 53.046 52.912 52.75 52.484 52.31 52.115 52.008 51.78 51.525 51.24 51.082 50.442 50.6 50.422 50.239 49.83 49.592 49.325 49.025 48.716 48.324 47.675 45.489 -5 ,25212 ,TETRA ,17590398,Sat Nov 27 20:28:15 CET,Sat Nov 27 23:33:48 CET,0.0 1.716 2.454 3.003 3.46 3.912 4.33 4.716 5.48 5.797 6.056 6.038 6.814 7.042 7.492 7.921 8.339 8.54 8.904 9.271 9.818 10.165 10.511 11.006 11.484 11.956 12.399 12.846 13.455 14.042 14.602 15.269 15.95 16.635 17.4 18.261 19.142 20.1 21.102 22.175 23.318 24.618 26.102 27.602 29.335 31.267 33.681 36.406 39.479 43.056 47.028 50.163 51.794 52.627 53.048 53.27 53.336 53.283 53.204 53.088 52.961 52.826 52.622 52.352 52.035 51.721 51.41 51.128 50.842 50.531 50.23 49.99 49.743 49.48 49.28 49.077 48.823 48.54 48.268 48.065 47.825 47.403 47.107 46.792 46.615 46.227 45.833 45.438 45.217 44.453 44.519 44.264 44.023 43.462 43.122 42.777 42.41 41.97 41.382 40.605 37.895 -6 ,13979 ,TETRA ,17590399,Sat Nov 27 20:28:15 CET,Sat Nov 27 23:32:41 CET,0.0 1.732 2.348 2.847 3.274 3.663 4.016 4.33 4.927 5.215 5.481 5.429 6.198 6.427 6.874 7.286 7.697 7.903 8.291 8.668 9.201 9.541 9.878 10.351 10.797 11.248 11.71 12.164 12.73 13.261 13.783 14.426 15.04 15.664 16.432 17.306 18.151 19.087 20.079 21.099 22.212 23.531 25.043 26.553 28.327 30.384 32.867 35.618 38.755 42.549 47.392 51.051 52.765 53.677 54.07 54.169 54.173 54.068 53.906 53.731 53.508 53.301 53.138 52.934 52.693 52.459 52.217 52.02 51.837 51.612 51.374 51.184 50.978 50.759 50.565 50.344 50.137 49.906 49.646 49.474 49.285 48.993 48.799 48.569 48.438 48.132 47.755 47.349 47.139 46.395 46.495 46.267 46.049 45.55 45.25 44.931 44.58 44.168 43.657 42.941 40.151 -7 ,19489 ,TETRA ,17590400,Sat Nov 27 20:28:15 CET,Sat Nov 27 23:31:34 CET,0.0 2.278 3.088 3.673 4.122 4.498 4.839 5.19 5.849 6.137 6.42 6.404 7.156 7.386 7.848 8.276 8.673 8.858 9.234 9.618 10.171 10.528 10.867 11.324 11.779 12.234 12.677 13.12 13.684 14.233 14.798 15.492 16.129 16.726 17.427 18.227 18.99 19.848 20.815 21.899 23.112 24.46 26.031 27.671 29.6 31.752 34.284 37.116 40.34 44.035 48.459 51.949 53.706 54.62 55.108 55.386 55.434 55.363 55.232 55.031 54.851 54.701 54.526 54.294 54.013 53.715 53.376 53.085 52.863 52.603 52.319 52.079 51.823 51.573 51.355 51.115 50.892 50.649 50.391 50.222 50.041 49.727 49.482 49.239 49.113 48.853 48.584 48.269 48.105 47.447 47.59 47.398 47.179 46.682 46.402 46.092 45.747 45.391 44.923 44.243 42.206 -8 ,2535 ,TETRA ,17590401,Sat Nov 27 20:28:15 CET,Sat Nov 27 23:36:43 CET,0.0 1.816 2.481 2.964 3.393 3.763 4.093 4.42 5.027 5.305 5.582 5.56 6.338 6.573 7.004 7.416 7.81 7.998 8.373 8.739 9.271 9.613 9.939 10.403 10.867 11.315 11.743 12.168 12.719 13.265 13.795 14.448 15.113 15.765 16.509 17.334 18.134 19.017 19.967 20.999 22.126 23.452 25.096 26.739 28.558 30.648 33.132 35.929 39.225 42.865 46.751 49.672 51.257 52.212 52.721 52.845 52.831 52.714 52.515 52.236 51.975 51.717 51.434 51.193 50.975 50.762 50.516 50.286 50.079 49.841 49.568 49.339 49.091 48.821 48.628 48.44 48.22 47.965 47.688 47.486 47.292 46.968 46.721 46.467 46.333 46.084 45.822 45.508 45.339 44.672 44.781 44.577 44.362 43.905 43.635 43.323 42.995 42.616 42.175 41.588 39.435 -9 ,19767 ,TETRA ,17590402,Sat Nov 27 20:29:13 CET,Sat Nov 27 23:35:30 CET,0.0 1.611 2.276 2.799 3.232 3.612 3.935 4.262 4.87 5.15 5.413 5.317 6.047 6.253 6.675 7.089 7.49 7.684 8.068 8.451 9.005 9.359 9.693 10.16 10.617 11.084 11.56 12.005 12.582 13.157 13.701 14.348 14.951 15.526 16.211 16.995 17.777 18.69 19.688 20.77 21.953 23.311 24.866 26.415 28.281 30.397 32.93 35.781 39.087 42.855 46.767 49.532 50.87 51.495 51.871 51.977 51.828 51.698 51.596 51.395 51.161 50.962 50.721 50.464 50.21 49.952 49.652 49.373 49.13 48.868 48.597 48.366 48.14 47.903 47.713 47.501 47.261 47.011 46.735 46.536 46.328 46.014 45.794 45.55 45.416 45.145 44.88 44.603 44.46 43.806 43.932 43.758 43.568 43.162 42.93 42.64 42.314 41.945 41.448 40.755 37.569 -10 ,10846 ,TETRA ,17590403,Sat Nov 27 20:29:13 CET,Sat Nov 27 23:42:21 CET,0.0 1.816 2.534 3.104 3.568 3.967 4.361 4.725 5.339 5.615 5.886 5.874 6.658 6.922 7.401 7.837 8.268 8.467 8.847 9.217 9.74 10.073 10.412 10.903 11.364 11.817 12.254 12.696 13.268 13.825 14.354 14.95 15.518 16.081 16.773 17.575 18.358 19.252 20.258 21.33 22.449 23.722 25.242 26.794 28.617 30.674 33.089 35.829 38.935 42.558 47.02 50.607 52.597 53.651 54.166 54.446 54.532 54.498 54.436 54.34 54.231 54.081 53.876 53.662 53.453 53.246 52.983 52.74 52.555 52.361 52.143 51.953 51.735 51.463 51.243 51.025 50.798 50.576 50.356 50.201 50.03 49.738 49.524 49.286 49.154 48.878 48.591 48.289 48.126 47.463 47.557 47.357 47.161 46.673 46.38 46.094 45.779 45.381 44.866 44.139 41.447 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt deleted file mode 100644 index 7d764289..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2037 ,TETRA ,17590404,Sat Nov 27 20:29:13 CET,Sat Nov 27 23:33:56 CET,0.0 0.723 1.16 1.548 1.899 2.228 2.552 2.87 3.477 3.773 4.067 4.089 4.884 5.141 5.661 6.168 6.641 6.874 7.342 7.791 8.45 8.889 9.322 9.964 10.607 11.231 11.837 12.435 13.221 14.015 14.804 15.75 16.681 17.61 18.706 19.972 21.215 22.634 24.248 26.017 27.929 30.157 32.845 35.628 39.008 42.988 47.845 53.674 60.856 70.014 82.561 94.313 102.029 107.611 111.763 114.971 117.529 119.68 121.337 122.796 123.949 124.89 125.689 126.381 126.99 127.528 128.051 128.478 128.816 129.139 129.458 129.696 129.931 130.148 130.299 130.452 130.596 130.724 130.812 130.866 130.925 130.996 131.037 131.077 131.094 131.113 131.13 131.129 131.107 130.687 131.006 130.965 130.92 130.796 130.687 130.549 130.416 130.275 130.095 129.821 128.786 -2 ,12079 ,TETRA ,17590405,Sat Nov 27 20:29:13 CET,Sat Nov 27 23:31:43 CET,0.0 0.871 1.386 1.822 2.192 2.525 2.833 3.147 3.767 4.05 4.321 4.309 5.097 5.358 5.86 6.341 6.809 7.043 7.506 7.962 8.644 9.077 9.497 10.125 10.751 11.372 11.982 12.577 13.356 14.137 14.927 15.868 16.785 17.718 18.831 20.116 21.377 22.797 24.368 26.087 27.941 30.104 32.755 35.555 38.957 42.87 47.645 53.308 60.262 69.202 81.228 92.655 100.36 105.837 109.924 113.238 115.857 117.973 119.618 121.107 122.264 123.207 124.091 124.857 125.487 126.039 126.551 126.976 127.324 127.658 127.98 128.212 128.438 128.662 128.815 128.963 129.1 129.228 129.338 129.406 129.468 129.541 129.564 129.564 129.567 129.571 129.573 129.567 129.556 129.147 129.477 129.442 129.378 129.183 129.068 128.936 128.785 128.587 128.309 127.966 127.01 -3 ,21782 ,TETRA ,17590406,Sat Nov 27 20:29:13 CET,Sat Nov 27 23:40:56 CET,0.0 0.69 1.162 1.592 1.983 2.341 2.686 2.994 3.563 3.829 4.09 4.079 4.857 5.103 5.599 6.091 6.568 6.803 7.261 7.71 8.378 8.809 9.225 9.838 10.448 11.05 11.645 12.236 13.007 13.762 14.514 15.451 16.366 17.265 18.32 19.531 20.749 22.133 23.643 25.295 27.113 29.245 31.819 34.52 37.811 41.633 46.268 51.849 58.869 67.911 80.12 91.478 99.135 104.679 108.842 112.105 114.541 116.544 118.166 119.656 120.844 121.818 122.674 123.43 124.076 124.609 125.117 125.539 125.876 126.198 126.522 126.779 127.004 127.209 127.364 127.502 127.617 127.712 127.792 127.848 127.905 127.978 128.021 128.059 128.071 128.082 128.078 128.047 128.026 127.62 127.957 127.92 127.86 127.684 127.597 127.5 127.357 127.154 126.936 126.661 125.581 -4 ,11573 ,TETRA ,17590407,Sat Nov 27 20:30:13 CET,Sat Nov 27 23:31:22 CET,0.0 1.097 1.547 1.967 2.362 2.707 3.009 3.303 3.873 4.149 4.431 4.447 5.237 5.504 6.021 6.51 6.97 7.202 7.662 8.111 8.787 9.228 9.664 10.329 11.004 11.652 12.276 12.895 13.71 14.514 15.301 16.289 17.279 18.234 19.361 20.688 21.995 23.461 25.087 26.87 28.8 31.008 33.646 36.401 39.773 43.747 48.455 53.987 60.904 69.756 81.764 93.128 100.761 106.235 110.318 113.575 116.128 118.162 119.766 121.235 122.376 123.324 124.157 124.873 125.493 126.033 126.555 126.996 127.344 127.667 127.98 128.216 128.448 128.675 128.82 128.966 129.117 129.231 129.323 129.388 129.445 129.491 129.518 129.544 129.548 129.561 129.572 129.568 129.559 129.151 129.495 129.464 129.428 129.308 129.222 129.122 129.01 128.892 128.716 128.412 127.643 -5 ,984 ,TETRA ,17590408,Sat Nov 27 20:30:13 CET,Sat Nov 27 23:32:34 CET,0.0 1.067 1.559 1.984 2.358 2.716 3.065 3.395 4.005 4.3 4.589 4.594 5.387 5.644 6.142 6.633 7.101 7.328 7.778 8.221 8.875 9.306 9.73 10.352 10.976 11.604 12.225 12.844 13.67 14.469 15.253 16.214 17.152 18.064 19.146 20.426 21.693 23.102 24.664 26.418 28.327 30.517 33.145 35.858 39.098 42.848 47.429 52.965 59.915 68.812 81.007 92.654 100.432 105.969 110.104 113.391 115.969 118.064 119.702 121.193 122.36 123.322 124.159 124.892 125.52 126.031 126.526 126.959 127.307 127.636 127.944 128.165 128.39 128.59 128.712 128.832 128.951 129.066 129.172 129.232 129.284 129.339 129.357 129.35 129.345 129.338 129.326 129.316 129.298 128.88 129.166 129.114 129.066 128.907 128.796 128.675 128.513 128.305 128.093 127.773 126.972 -6 ,23350 ,TETRA ,17590409,Sat Nov 27 20:30:16 CET,Sat Nov 27 23:31:21 CET,0.0 0.839 1.341 1.759 2.101 2.438 2.768 3.072 3.666 3.95 4.226 4.237 5.029 5.278 5.765 6.242 6.708 6.943 7.413 7.868 8.521 8.943 9.367 9.986 10.589 11.18 11.774 12.377 13.16 13.936 14.708 15.647 16.612 17.574 18.671 19.937 21.193 22.614 24.213 25.993 27.915 30.095 32.711 35.469 38.827 42.751 47.469 53.071 60.179 69.34 81.641 93.292 101.047 106.492 110.594 113.909 116.49 118.571 120.2 121.692 122.84 123.76 124.604 125.341 125.938 126.449 126.982 127.408 127.738 128.059 128.36 128.584 128.788 128.986 129.136 129.281 129.411 129.533 129.634 129.696 129.764 129.842 129.885 129.924 129.941 129.96 129.961 129.94 129.92 129.508 129.82 129.775 129.717 129.554 129.463 129.368 129.246 129.09 128.88 128.617 127.678 -7 ,28280 ,TETRA ,17590410,Sat Nov 27 20:30:17 CET,Sat Nov 27 23:31:42 CET,0.0 0.894 1.382 1.756 2.078 2.401 2.702 2.995 3.574 3.853 4.124 4.113 4.902 5.153 5.632 6.102 6.562 6.79 7.239 7.674 8.316 8.744 9.171 9.783 10.377 10.963 11.548 12.139 12.925 13.705 14.48 15.434 16.364 17.269 18.346 19.608 20.859 22.275 23.834 25.536 27.388 29.576 32.248 35.013 38.357 42.251 46.966 52.605 59.606 68.485 80.556 91.92 99.521 104.979 109.09 112.377 114.927 116.991 118.588 120.069 121.272 122.263 123.145 123.909 124.55 125.104 125.655 126.071 126.378 126.683 126.967 127.177 127.395 127.601 127.741 127.873 127.989 128.088 128.181 128.242 128.302 128.38 128.429 128.463 128.465 128.464 128.458 128.441 128.417 127.995 128.285 128.226 128.153 127.967 127.868 127.761 127.634 127.476 127.268 126.993 126.307 -8 ,21372 ,TETRA ,17590411,Sat Nov 27 20:30:11 CET,Sat Nov 27 23:33:03 CET,0.0 0.956 1.469 1.923 2.333 2.692 3.013 3.335 3.976 4.266 4.546 4.566 5.374 5.631 6.136 6.638 7.131 7.381 7.887 8.373 9.076 9.539 9.989 10.651 11.311 11.955 12.577 13.182 13.975 14.785 15.586 16.547 17.512 18.474 19.586 20.86 22.128 23.566 25.155 26.88 28.742 30.909 33.59 36.421 39.805 43.685 48.349 53.938 61.048 70.201 82.438 94.098 101.995 107.694 111.888 115.112 117.588 119.655 121.332 122.827 123.97 124.923 125.768 126.481 127.091 127.619 128.141 128.564 128.899 129.238 129.575 129.822 130.046 130.247 130.378 130.525 130.672 130.795 130.9 130.95 130.977 131.013 131.039 131.063 131.07 131.074 131.066 131.038 131.021 130.606 130.93 130.877 130.799 130.613 130.513 130.417 130.296 130.106 129.882 129.577 128.918 -9 ,20669 ,TETRA ,17590412,Sat Nov 27 20:30:13 CET,Sat Nov 27 23:34:35 CET,0.0 0.997 1.508 1.913 2.278 2.607 2.923 3.234 3.806 4.083 4.354 4.347 5.135 5.382 5.863 6.334 6.798 7.024 7.47 7.921 8.583 9.012 9.433 10.059 10.682 11.309 11.93 12.532 13.32 14.094 14.849 15.79 16.718 17.628 18.721 20.004 21.277 22.692 24.243 25.956 27.843 30.031 32.669 35.442 38.802 42.725 47.528 53.301 60.446 69.428 81.515 92.971 100.531 105.963 110.098 113.389 115.934 117.982 119.61 121.122 122.295 123.242 124.079 124.795 125.411 125.934 126.439 126.869 127.206 127.519 127.828 128.067 128.293 128.512 128.672 128.816 128.943 129.062 129.173 129.242 129.304 129.386 129.422 129.421 129.421 129.434 129.434 129.421 129.392 128.954 129.212 129.142 129.069 128.856 128.714 128.564 128.388 128.198 127.925 127.502 126.504 -10 ,9219 ,TETRA ,17590413,Sat Nov 27 20:30:13 CET,Sat Nov 27 23:35:39 CET,0.0 0.733 1.198 1.635 2.02 2.383 2.72 3.02 3.594 3.886 4.182 4.217 5.019 5.271 5.763 6.249 6.735 6.979 7.444 7.888 8.544 8.976 9.409 10.041 10.656 11.27 11.874 12.47 13.265 14.05 14.822 15.782 16.73 17.669 18.791 20.045 21.26 22.627 24.137 25.838 27.669 29.752 32.283 34.946 38.204 42.045 46.776 52.441 59.475 68.509 80.696 92.242 100.118 105.818 110.066 113.379 115.907 117.948 119.555 121.042 122.219 123.187 124.053 124.797 125.428 125.975 126.489 126.91 127.26 127.589 127.903 128.145 128.371 128.576 128.717 128.844 128.967 129.099 129.22 129.277 129.319 129.369 129.394 129.4 129.399 129.399 129.386 129.356 129.335 128.919 129.23 129.189 129.142 129.025 128.934 128.794 128.594 128.376 128.127 127.81 127.212 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 27b4d6c2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11906 ,TETRA ,17590414,Sat Nov 27 20:30:14 CET,Sat Nov 27 23:33:34 CET,0.0 0.457 0.726 0.972 1.18 1.381 1.564 1.725 2.016 2.156 2.286 2.187 2.642 2.762 2.983 3.185 3.382 3.485 3.681 3.865 4.132 4.294 4.449 4.672 4.896 5.121 5.337 5.542 5.812 6.075 6.318 6.618 6.909 7.191 7.53 7.914 8.285 8.706 9.153 9.624 10.118 10.686 11.353 12.015 12.805 13.706 14.741 15.871 17.173 18.719 20.476 21.745 22.318 22.585 22.768 22.877 22.884 22.838 22.743 22.609 22.473 22.326 22.171 22.033 21.89 21.752 21.611 21.472 21.34 21.2 21.066 20.946 20.819 20.679 20.559 20.433 20.299 20.158 20.005 19.9 19.794 19.623 19.5 19.37 19.302 19.159 18.995 18.807 18.713 18.296 18.38 18.262 18.138 17.86 17.717 17.566 17.394 17.206 16.969 16.65 16.052 -2 ,30689 ,TETRA ,17590415,Sat Nov 27 20:30:16 CET,Sat Nov 27 23:33:11 CET,0.0 0.489 0.788 1.047 1.267 1.462 1.652 1.817 2.097 2.25 2.394 2.293 2.741 2.86 3.107 3.328 3.537 3.639 3.834 4.014 4.279 4.45 4.621 4.876 5.121 5.347 5.553 5.749 6.015 6.293 6.568 6.892 7.19 7.476 7.8 8.174 8.55 8.954 9.394 9.869 10.385 10.99 11.694 12.403 13.253 14.206 15.276 16.468 17.917 19.66 21.578 22.943 23.681 24.077 24.273 24.403 24.446 24.436 24.41 24.345 24.25 24.13 23.995 23.866 23.743 23.615 23.45 23.29 23.167 23.058 22.927 22.801 22.658 22.511 22.402 22.276 22.144 22.008 21.855 21.748 21.643 21.48 21.369 21.255 21.19 21.054 20.917 20.746 20.651 20.246 20.346 20.23 20.117 19.862 19.722 19.565 19.388 19.175 18.897 18.594 18.093 -3 ,15990 ,TETRA ,17590416,Sat Nov 27 20:30:13 CET,Sat Nov 27 23:39:09 CET,0.0 0.595 0.906 1.161 1.37 1.56 1.75 1.921 2.228 2.374 2.521 2.475 2.952 3.078 3.303 3.522 3.734 3.834 4.031 4.232 4.51 4.686 4.85 5.088 5.321 5.548 5.768 5.98 6.258 6.532 6.797 7.12 7.434 7.735 8.081 8.469 8.85 9.267 9.701 10.176 10.697 11.266 11.944 12.664 13.489 14.39 15.496 16.76 18.182 19.79 21.64 23.091 23.774 24.075 24.216 24.253 24.22 24.122 23.999 23.873 23.763 23.661 23.548 23.436 23.316 23.19 23.054 22.941 22.843 22.715 22.567 22.427 22.284 22.14 22.021 21.893 21.745 21.592 21.452 21.35 21.233 21.062 20.939 20.808 20.743 20.59 20.419 20.244 20.152 19.743 19.826 19.7 19.589 19.376 19.261 19.141 19.0 18.808 18.545 18.234 17.651 -4 ,3538 ,TETRA ,17590417,Sat Nov 27 20:30:13 CET,Sat Nov 27 23:35:32 CET,0.0 0.48 0.821 1.107 1.334 1.522 1.695 1.851 2.14 2.294 2.449 2.396 2.86 2.981 3.198 3.404 3.621 3.727 3.922 4.109 4.398 4.576 4.735 4.978 5.204 5.432 5.655 5.865 6.158 6.44 6.686 6.985 7.272 7.582 8.009 8.518 8.976 9.396 9.804 10.263 10.771 11.349 12.008 12.662 13.485 14.423 15.491 16.682 18.066 19.7 21.619 23.01 23.69 23.966 24.041 24.068 24.044 23.976 23.896 23.782 23.646 23.501 23.346 23.175 23.009 22.856 22.689 22.546 22.423 22.282 22.136 22.023 21.896 21.749 21.635 21.518 21.395 21.257 21.097 20.986 20.88 20.707 20.577 20.451 20.392 20.26 20.111 19.953 19.871 19.465 19.582 19.476 19.357 19.092 18.959 18.812 18.631 18.4 18.138 17.89 17.338 -5 ,25324 ,TETRA ,17590418,Sat Nov 27 20:30:14 CET,Sat Nov 27 23:33:37 CET,0.0 0.676 1.047 1.301 1.516 1.7 1.864 2.032 2.368 2.526 2.675 2.598 3.054 3.172 3.39 3.586 3.774 3.87 4.071 4.264 4.541 4.719 4.893 5.152 5.4 5.63 5.85 6.067 6.334 6.594 6.845 7.145 7.439 7.723 8.054 8.437 8.818 9.239 9.711 10.221 10.737 11.295 11.956 12.606 13.36 14.213 15.192 16.337 17.703 19.282 21.029 22.406 23.133 23.47 23.618 23.658 23.629 23.532 23.407 23.237 23.091 22.979 22.875 22.756 22.617 22.478 22.322 22.171 22.039 21.904 21.754 21.627 21.481 21.316 21.186 21.056 20.924 20.777 20.614 20.499 20.388 20.218 20.102 19.974 19.906 19.77 19.607 19.418 19.318 18.899 19.0 18.884 18.766 18.496 18.329 18.163 17.985 17.778 17.539 17.252 16.708 -6 ,12875 ,TETRA ,17590419,Sat Nov 27 20:30:16 CET,Sat Nov 27 23:33:09 CET,0.0 0.441 0.717 0.933 1.14 1.339 1.518 1.69 2.025 2.17 2.309 2.26 2.734 2.855 3.083 3.298 3.499 3.598 3.794 3.982 4.247 4.409 4.572 4.817 5.044 5.263 5.479 5.693 5.962 6.219 6.476 6.79 7.1 7.409 7.763 8.151 8.54 8.973 9.433 9.905 10.402 11.008 11.713 12.403 13.229 14.132 15.163 16.367 17.795 19.386 21.269 22.831 23.588 23.913 24.065 24.136 24.136 24.089 24.013 23.908 23.822 23.736 23.642 23.526 23.385 23.264 23.14 23.006 22.875 22.74 22.596 22.48 22.344 22.191 22.074 21.946 21.81 21.663 21.514 21.411 21.295 21.099 20.959 20.819 20.746 20.58 20.407 20.238 20.153 19.737 19.833 19.717 19.59 19.32 19.169 19.006 18.829 18.629 18.352 17.986 17.287 -7 ,18559 ,TETRA ,17590420,Sat Nov 27 20:30:14 CET,Sat Nov 27 23:32:37 CET,0.0 0.576 0.89 1.151 1.383 1.572 1.739 1.902 2.207 2.341 2.471 2.395 2.853 2.978 3.216 3.434 3.644 3.743 3.938 4.136 4.424 4.605 4.782 5.027 5.259 5.482 5.699 5.913 6.2 6.473 6.72 7.023 7.335 7.634 7.98 8.384 8.76 9.188 9.67 10.167 10.688 11.262 11.932 12.627 13.437 14.331 15.338 16.519 17.955 19.566 21.371 22.744 23.453 23.891 24.126 24.201 24.207 24.175 24.109 24.015 23.913 23.789 23.653 23.51 23.373 23.246 23.107 22.993 22.887 22.769 22.646 22.539 22.421 22.291 22.185 22.074 21.947 21.807 21.656 21.55 21.453 21.309 21.195 21.067 20.998 20.853 20.687 20.49 20.391 19.984 20.098 19.981 19.861 19.604 19.448 19.277 19.097 18.896 18.648 18.339 17.793 -8 ,29131 ,TETRA ,17590421,Sat Nov 27 20:30:14 CET,Sat Nov 27 23:33:18 CET,0.0 0.516 0.796 1.045 1.283 1.486 1.679 1.864 2.159 2.294 2.426 2.352 2.812 2.926 3.145 3.351 3.56 3.664 3.863 4.056 4.334 4.51 4.677 4.916 5.148 5.38 5.609 5.818 6.092 6.365 6.609 6.909 7.203 7.482 7.807 8.181 8.542 8.94 9.366 9.802 10.271 10.817 11.456 12.094 12.848 13.73 14.789 15.99 17.394 19.041 20.939 22.392 23.191 23.625 23.806 23.833 23.755 23.647 23.559 23.469 23.371 23.263 23.14 22.984 22.817 22.664 22.502 22.354 22.222 22.075 21.925 21.797 21.653 21.514 21.41 21.292 21.161 21.012 20.858 20.758 20.648 20.472 20.344 20.201 20.13 19.986 19.827 19.646 19.556 19.158 19.271 19.165 19.055 18.816 18.681 18.512 18.303 18.067 17.817 17.476 16.71 -9 ,29760 ,TETRA ,17590422,Sat Nov 27 20:30:14 CET,Sat Nov 27 23:33:54 CET,0.0 0.545 0.855 1.116 1.353 1.563 1.744 1.919 2.235 2.376 2.521 2.467 2.93 3.058 3.297 3.496 3.691 3.795 3.994 4.174 4.435 4.602 4.765 5.019 5.264 5.487 5.694 5.894 6.16 6.407 6.647 6.945 7.23 7.505 7.838 8.226 8.602 9.026 9.489 9.969 10.473 11.051 11.699 12.317 13.049 13.9 14.915 16.049 17.333 18.811 20.526 21.83 22.453 22.731 22.862 22.84 22.726 22.624 22.539 22.444 22.36 22.253 22.109 21.958 21.804 21.654 21.492 21.346 21.235 21.118 20.972 20.85 20.714 20.562 20.449 20.332 20.208 20.074 19.929 19.825 19.718 19.544 19.409 19.275 19.206 19.049 18.885 18.721 18.638 18.233 18.357 18.249 18.141 17.891 17.742 17.584 17.403 17.175 16.863 16.505 16.057 -10 ,16358 ,TETRA ,17590423,Sat Nov 27 20:30:16 CET,Sat Nov 27 23:34:08 CET,0.0 0.53 0.84 1.097 1.312 1.503 1.692 1.854 2.151 2.292 2.425 2.342 2.805 2.931 3.153 3.362 3.559 3.651 3.832 4.013 4.271 4.435 4.602 4.846 5.075 5.301 5.521 5.723 5.975 6.235 6.493 6.795 7.088 7.384 7.735 8.123 8.498 8.913 9.375 9.859 10.361 10.957 11.662 12.349 13.114 13.994 14.965 16.015 17.267 18.724 20.424 21.646 22.274 22.592 22.716 22.747 22.684 22.546 22.426 22.284 22.146 22.022 21.887 21.751 21.619 21.476 21.303 21.157 21.034 20.901 20.748 20.625 20.495 20.342 20.23 20.11 19.988 19.857 19.716 19.619 19.519 19.36 19.243 19.118 19.053 18.919 18.768 18.605 18.52 18.111 18.202 18.075 17.94 17.663 17.515 17.35 17.162 16.952 16.699 16.385 15.823 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 0bfe29b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8648 ,TETRA ,17590424,Sat Nov 27 20:30:17 CET,Sat Nov 27 23:31:05 CET,0.0 0.809 1.395 1.931 2.455 2.933 3.379 3.78 4.555 4.937 5.319 5.52 6.427 6.795 7.51 8.185 8.839 9.143 9.69 10.211 10.976 11.475 11.965 12.691 13.413 14.126 14.837 15.531 16.437 17.328 18.202 19.294 20.36 21.401 22.647 24.092 25.522 27.132 28.915 30.884 33.042 35.571 38.632 41.834 45.709 50.262 55.8 62.318 70.404 80.673 94.612 107.58 116.09 122.257 126.844 130.383 133.158 135.473 137.247 138.806 140.016 141.039 141.944 142.73 143.421 144.005 144.588 145.09 145.504 145.892 146.26 146.546 146.805 147.057 147.239 147.394 147.528 147.647 147.742 147.799 147.846 147.892 147.918 147.931 147.939 147.951 147.913 147.859 147.836 147.473 147.699 147.636 147.55 147.36 147.211 147.033 146.846 146.601 146.273 145.726 143.59 -2 ,24113 ,TETRA ,17590425,Sat Nov 27 20:30:19 CET,Sat Nov 27 23:30:41 CET,0.0 1.461 2.068 2.566 3.026 3.477 3.911 4.32 5.086 5.45 5.807 5.981 6.874 7.224 7.91 8.575 9.225 9.556 10.22 10.862 11.736 12.253 12.743 13.467 14.195 14.919 15.625 16.314 17.216 18.126 19.024 20.132 21.229 22.308 23.585 25.043 26.476 28.1 29.904 31.881 34.081 36.654 39.754 43.017 46.976 51.569 57.098 63.746 72.091 82.673 96.848 110.131 118.964 125.267 129.888 133.51 136.366 138.701 140.494 142.11 143.336 144.303 145.181 145.973 146.677 147.276 147.821 148.28 148.67 149.018 149.318 149.556 149.8 150.016 150.163 150.314 150.462 150.605 150.722 150.779 150.813 150.86 150.882 150.889 150.897 150.896 150.868 150.825 150.797 150.435 150.619 150.506 150.392 150.153 150.008 149.835 149.613 149.341 148.991 148.516 147.125 -3 ,1486 ,TETRA ,17590426,Sat Nov 27 20:30:14 CET,Sat Nov 27 23:30:22 CET,0.0 0.803 1.366 1.814 2.259 2.686 3.079 3.466 4.205 4.564 4.914 5.061 5.928 6.262 6.905 7.521 8.135 8.443 9.049 9.642 10.512 11.081 11.647 12.491 13.328 14.16 14.98 15.777 16.822 17.877 18.942 20.247 21.531 22.785 24.153 25.623 27.062 28.67 30.441 32.373 34.47 36.96 40.015 43.146 46.92 51.373 56.761 63.197 71.314 81.666 95.705 108.882 117.433 123.422 127.844 131.388 134.179 136.449 138.266 139.934 141.219 142.246 143.153 143.91 144.547 145.115 145.651 146.082 146.408 146.74 147.078 147.326 147.579 147.794 147.93 148.064 148.193 148.321 148.428 148.48 148.523 148.561 148.577 148.6 148.613 148.632 148.63 148.602 148.581 148.232 148.432 148.331 148.22 147.974 147.809 147.649 147.475 147.178 146.753 146.168 144.116 -4 ,16567 ,TETRA ,17590427,Sat Nov 27 20:30:17 CET,Sat Nov 27 23:32:11 CET,0.0 1.486 2.14 2.632 3.056 3.459 3.839 4.198 4.881 5.225 5.565 5.704 6.495 6.78 7.33 7.873 8.418 8.687 9.197 9.689 10.409 10.88 11.361 12.08 12.782 13.482 14.174 14.863 15.757 16.638 17.533 18.645 19.736 20.796 22.045 23.464 24.861 26.447 28.217 30.165 32.321 34.877 37.939 41.082 44.886 49.34 54.685 61.111 69.148 79.43 93.305 106.366 115.167 121.449 126.071 129.736 132.525 134.741 136.501 138.075 139.312 140.353 141.287 142.107 142.818 143.426 144.002 144.48 144.863 145.24 145.603 145.854 146.073 146.276 146.424 146.579 146.731 146.876 147.001 147.076 147.155 147.213 147.21 147.214 147.222 147.226 147.188 147.137 147.115 146.76 146.991 146.935 146.854 146.672 146.551 146.374 146.128 145.809 145.391 144.744 141.77 -5 ,11186 ,TETRA ,17590428,Sat Nov 27 20:30:15 CET,Sat Nov 27 23:31:07 CET,0.0 0.928 1.577 2.144 2.685 3.159 3.565 3.946 4.673 5.033 5.389 5.544 6.419 6.744 7.388 8.048 8.69 9.004 9.631 10.204 10.964 11.459 11.964 12.719 13.456 14.185 14.883 15.559 16.455 17.348 18.24 19.344 20.431 21.508 22.771 24.204 25.64 27.301 29.142 31.138 33.335 35.905 38.997 42.212 46.076 50.635 56.274 62.97 71.211 81.686 95.707 108.749 117.242 123.284 127.823 131.367 134.044 136.224 138.014 139.699 140.998 142.068 143.05 143.889 144.595 145.19 145.74 146.178 146.541 146.905 147.249 147.506 147.743 147.958 148.127 148.294 148.431 148.532 148.595 148.638 148.693 148.74 148.756 148.772 148.769 148.758 148.74 148.708 148.689 148.342 148.586 148.506 148.397 148.196 148.077 147.861 147.588 147.304 146.973 146.471 144.569 -6 ,5427 ,TETRA ,17590429,Sat Nov 27 20:30:16 CET,Sat Nov 27 23:30:46 CET,0.0 0.865 1.45 1.947 2.395 2.819 3.24 3.662 4.446 4.822 5.18 5.318 6.117 6.435 7.042 7.625 8.176 8.443 8.976 9.509 10.292 10.802 11.304 12.035 12.756 13.481 14.196 14.894 15.827 16.767 17.692 18.8 19.914 21.024 22.321 23.819 25.257 26.841 28.62 30.612 32.772 35.296 38.396 41.602 45.453 49.984 55.499 61.98 70.001 80.474 94.659 107.877 116.599 122.909 127.703 131.48 134.325 136.542 138.225 139.81 141.126 142.213 143.16 143.969 144.676 145.271 145.8 146.214 146.557 146.899 147.244 147.51 147.747 147.958 148.11 148.271 148.41 148.521 148.614 148.672 148.722 148.757 148.762 148.753 148.763 148.76 148.708 148.652 148.611 148.244 148.464 148.373 148.261 148.003 147.836 147.627 147.392 147.072 146.666 146.081 144.54 -7 ,16867 ,TETRA ,17590430,Sat Nov 27 20:30:16 CET,Sat Nov 27 23:39:33 CET,0.0 0.746 1.263 1.684 2.112 2.545 2.943 3.304 3.97 4.295 4.606 4.716 5.515 5.809 6.371 6.927 7.484 7.758 8.302 8.825 9.574 10.071 10.564 11.305 12.044 12.763 13.462 14.147 15.053 15.959 16.862 18.004 19.137 20.209 21.451 22.908 24.379 26.014 27.845 29.877 32.091 34.665 37.754 41.007 44.91 49.472 55.035 61.604 69.729 79.983 93.582 106.353 114.972 121.152 125.595 129.056 131.844 134.109 135.857 137.427 138.66 139.677 140.58 141.374 142.057 142.622 143.17 143.624 143.985 144.33 144.651 144.91 145.172 145.433 145.61 145.755 145.904 146.059 146.184 146.256 146.314 146.378 146.415 146.434 146.435 146.441 146.421 146.373 146.351 146.0 146.234 146.189 146.121 145.87 145.72 145.538 145.316 145.018 144.621 144.06 142.299 -8 ,17378 ,TETRA ,17590431,Sat Nov 27 20:30:17 CET,Sat Nov 27 23:38:38 CET,0.0 1.262 1.932 2.476 2.954 3.421 3.882 4.336 5.179 5.562 5.933 6.131 7.033 7.374 8.065 8.722 9.348 9.669 10.295 10.906 11.818 12.412 13.005 13.889 14.764 15.617 16.451 17.214 18.134 19.056 19.955 21.041 22.113 23.179 24.442 25.901 27.348 28.97 30.749 32.683 34.805 37.299 40.322 43.509 47.406 51.87 57.204 63.699 71.774 81.991 96.026 109.147 117.762 123.927 128.427 131.96 134.733 136.984 138.771 140.379 141.654 142.692 143.587 144.381 145.069 145.646 146.174 146.603 146.978 147.353 147.712 147.962 148.175 148.398 148.552 148.672 148.809 148.924 148.984 149.041 149.105 149.186 149.235 149.265 149.279 149.266 149.254 149.268 149.248 148.888 149.099 149.048 148.988 148.79 148.642 148.464 148.252 147.968 147.623 147.128 145.559 -9 ,21923 ,TETRA ,17590432,Sat Nov 27 20:30:18 CET,Sat Nov 27 23:32:39 CET,0.0 0.775 1.258 1.698 2.112 2.497 2.866 3.197 3.819 4.119 4.423 4.533 5.308 5.589 6.136 6.687 7.22 7.478 7.999 8.51 9.254 9.752 10.256 10.989 11.704 12.416 13.111 13.805 14.732 15.638 16.526 17.616 18.707 19.789 21.044 22.504 23.935 25.536 27.353 29.342 31.462 33.925 36.924 40.036 43.857 48.362 53.772 60.258 68.328 78.442 92.359 105.711 114.353 120.5 125.164 128.89 131.82 134.145 135.921 137.53 138.785 139.803 140.69 141.473 142.154 142.732 143.302 143.765 144.133 144.506 144.85 145.095 145.344 145.585 145.751 145.911 146.05 146.153 146.255 146.318 146.366 146.43 146.439 146.447 146.455 146.455 146.436 146.391 146.375 146.037 146.293 146.248 146.191 146.008 145.884 145.715 145.492 145.222 144.829 144.265 142.023 -10 ,7310 ,TETRA ,17590433,Sat Nov 27 20:30:21 CET,Sat Nov 27 23:31:49 CET,0.0 0.937 1.525 2.01 2.455 2.899 3.327 3.729 4.497 4.863 5.224 5.396 6.279 6.614 7.272 7.906 8.523 8.84 9.47 10.086 10.996 11.58 12.163 13.029 13.891 14.749 15.595 16.44 17.547 18.63 19.711 21.056 22.365 23.577 24.89 26.368 27.837 29.487 31.3 33.281 35.401 37.893 40.993 44.161 47.861 52.152 57.398 63.751 71.734 81.904 95.504 108.093 116.467 122.494 126.989 130.557 133.315 135.587 137.409 139.037 140.295 141.339 142.265 143.062 143.74 144.265 144.752 145.169 145.505 145.837 146.16 146.409 146.639 146.857 147.013 147.158 147.282 147.395 147.501 147.563 147.624 147.689 147.727 147.766 147.779 147.791 147.765 147.675 147.625 147.277 147.54 147.484 147.403 147.211 147.087 146.941 146.739 146.458 146.086 145.52 143.265 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt deleted file mode 100644 index 23a67b69..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1362 ,TETRA ,17590434,Sat Nov 27 20:30:15 CET,Sat Nov 27 23:33:48 CET,0.0 0.825 1.214 1.509 1.768 2.004 2.238 2.449 2.827 3.02 3.21 3.159 3.696 3.847 4.132 4.419 4.714 4.851 5.122 5.383 5.76 6.003 6.231 6.563 6.886 7.204 7.517 7.825 8.236 8.638 9.028 9.519 9.997 10.454 10.996 11.612 12.204 12.853 13.568 14.357 15.214 16.197 17.368 18.59 20.029 21.673 23.674 26.093 29.038 32.566 37.196 41.355 43.797 45.389 46.483 47.263 47.751 48.099 48.357 48.545 48.655 48.724 48.79 48.814 48.799 48.775 48.733 48.681 48.615 48.517 48.401 48.281 48.168 48.062 47.963 47.857 47.733 47.588 47.438 47.335 47.207 46.998 46.858 46.709 46.626 46.442 46.248 46.047 45.923 45.436 45.486 45.352 45.2 44.813 44.603 44.357 44.046 43.719 43.381 42.959 41.26 -2 ,29604 ,TETRA ,17590435,Sat Nov 27 20:30:15 CET,Sat Nov 27 23:35:23 CET,0.0 0.615 0.963 1.248 1.485 1.711 1.927 2.133 2.519 2.704 2.878 2.811 3.355 3.506 3.797 4.083 4.36 4.488 4.737 4.988 5.353 5.589 5.811 6.148 6.486 6.808 7.129 7.442 7.842 8.253 8.654 9.119 9.574 10.021 10.553 11.161 11.768 12.471 13.244 14.079 14.967 15.966 17.139 18.349 19.83 21.516 23.548 25.976 28.988 32.79 37.678 42.033 44.762 46.599 47.764 48.558 49.179 49.713 50.066 50.29 50.454 50.562 50.658 50.768 50.817 50.797 50.742 50.671 50.595 50.515 50.43 50.358 50.271 50.166 50.071 49.965 49.863 49.736 49.583 49.49 49.394 49.221 49.093 48.954 48.885 48.743 48.576 48.375 48.254 47.79 47.849 47.705 47.559 47.231 47.058 46.841 46.584 46.302 45.915 45.344 43.204 -3 ,25872 ,TETRA ,17590436,Sat Nov 27 20:30:17 CET,Sat Nov 27 23:35:02 CET,0.0 0.647 1.046 1.351 1.637 1.897 2.107 2.291 2.654 2.826 2.986 2.904 3.441 3.59 3.864 4.134 4.4 4.525 4.769 5.008 5.351 5.576 5.805 6.138 6.456 6.766 7.082 7.401 7.799 8.176 8.565 9.05 9.517 9.968 10.494 11.098 11.677 12.322 13.031 13.814 14.673 15.65 16.823 18.041 19.482 21.162 23.204 25.57 28.433 32.012 36.726 40.848 43.326 44.962 46.076 46.836 47.328 47.681 47.888 48.034 48.156 48.24 48.305 48.331 48.311 48.277 48.226 48.172 48.127 48.062 47.974 47.889 47.784 47.675 47.586 47.473 47.343 47.207 47.057 46.954 46.847 46.674 46.518 46.348 46.261 46.069 45.867 45.621 45.476 44.997 45.021 44.853 44.677 44.276 44.046 43.786 43.499 43.145 42.721 42.189 40.915 -4 ,22058 ,TETRA ,17590437,Sat Nov 27 20:30:18 CET,Sat Nov 27 23:31:44 CET,0.0 0.641 1.014 1.349 1.649 1.913 2.123 2.314 2.68 2.854 3.023 2.966 3.514 3.669 3.954 4.221 4.476 4.602 4.858 5.107 5.461 5.687 5.916 6.251 6.574 6.901 7.22 7.531 7.936 8.338 8.737 9.22 9.688 10.143 10.679 11.283 11.878 12.544 13.265 14.07 14.934 15.898 17.078 18.284 19.692 21.351 23.342 25.695 28.62 32.278 36.809 40.816 43.514 45.317 46.571 47.478 48.157 48.704 49.069 49.294 49.393 49.475 49.56 49.632 49.662 49.622 49.556 49.487 49.404 49.32 49.24 49.153 49.04 48.921 48.827 48.717 48.594 48.458 48.302 48.203 48.09 47.89 47.75 47.576 47.487 47.318 47.102 46.835 46.71 46.252 46.31 46.152 45.987 45.636 45.443 45.217 44.927 44.586 44.176 43.685 42.035 -5 ,14504 ,TETRA ,17590438,Sat Nov 27 20:30:42 CET,Sat Nov 27 23:34:16 CET,0.0 0.55 0.919 1.209 1.482 1.71 1.921 2.117 2.455 2.629 2.806 2.739 3.272 3.415 3.701 3.974 4.234 4.362 4.61 4.856 5.215 5.444 5.67 6.008 6.342 6.659 6.964 7.267 7.677 8.078 8.459 8.93 9.399 9.863 10.409 11.009 11.595 12.253 12.962 13.746 14.602 15.582 16.751 17.977 19.452 21.132 23.164 25.551 28.44 31.976 36.523 40.366 42.581 44.044 45.067 45.792 46.225 46.49 46.646 46.753 46.804 46.832 46.878 46.902 46.9 46.866 46.797 46.717 46.619 46.517 46.427 46.346 46.239 46.118 46.025 45.917 45.782 45.638 45.502 45.403 45.285 45.093 44.928 44.728 44.624 44.406 44.178 43.937 43.814 43.345 43.353 43.163 42.964 42.553 42.331 42.106 41.872 41.575 41.201 40.746 38.767 -6 ,18566 ,TETRA ,17590439,Sat Nov 27 20:30:44 CET,Sat Nov 27 23:35:23 CET,0.0 0.598 0.925 1.21 1.456 1.697 1.924 2.122 2.491 2.664 2.828 2.759 3.305 3.456 3.749 4.026 4.29 4.423 4.681 4.93 5.315 5.566 5.797 6.125 6.448 6.766 7.077 7.38 7.775 8.165 8.555 9.025 9.483 9.933 10.461 11.061 11.647 12.309 13.041 13.847 14.704 15.698 16.893 18.127 19.608 21.314 23.372 25.733 28.57 32.019 36.45 40.404 42.792 44.371 45.428 46.172 46.686 47.025 47.244 47.401 47.482 47.538 47.585 47.597 47.568 47.542 47.502 47.449 47.391 47.307 47.211 47.126 47.018 46.889 46.781 46.649 46.504 46.342 46.17 46.058 45.948 45.764 45.615 45.454 45.365 45.164 44.968 44.756 44.637 44.186 44.246 44.1 43.949 43.588 43.385 43.151 42.87 42.577 42.21 41.708 40.336 -7 ,330 ,TETRA ,17590440,Sat Nov 27 20:30:45 CET,Sat Nov 27 23:32:13 CET,0.0 0.709 1.081 1.384 1.635 1.863 2.081 2.281 2.653 2.827 2.99 2.913 3.453 3.596 3.871 4.141 4.402 4.533 4.795 5.051 5.414 5.654 5.885 6.231 6.579 6.913 7.239 7.556 7.962 8.358 8.749 9.23 9.7 10.167 10.72 11.325 11.918 12.58 13.315 14.131 15.004 16.012 17.204 18.438 19.944 21.663 23.68 26.027 28.92 32.567 37.211 41.142 43.612 45.299 46.423 47.185 47.719 48.123 48.42 48.613 48.681 48.703 48.7 48.705 48.714 48.677 48.612 48.577 48.532 48.453 48.347 48.247 48.129 47.992 47.883 47.757 47.611 47.446 47.269 47.145 47.019 46.813 46.654 46.48 46.388 46.192 45.991 45.789 45.68 45.225 45.239 45.047 44.851 44.436 44.208 43.958 43.664 43.329 42.93 42.329 40.476 -8 ,920 ,TETRA ,17590441,Sat Nov 27 20:30:49 CET,Sat Nov 27 23:31:27 CET,0.0 0.59 0.964 1.302 1.597 1.863 2.119 2.352 2.782 2.973 3.152 3.122 3.687 3.867 4.199 4.51 4.817 4.961 5.236 5.509 5.911 6.184 6.452 6.819 7.164 7.489 7.799 8.11 8.522 8.915 9.306 9.799 10.271 10.72 11.231 11.827 12.428 13.113 13.844 14.614 15.456 16.432 17.604 18.817 20.275 21.98 24.061 26.491 29.329 32.818 37.404 41.471 43.981 45.667 46.86 47.693 48.25 48.636 48.907 49.121 49.254 49.335 49.399 49.4 49.377 49.371 49.338 49.308 49.263 49.193 49.115 49.039 48.956 48.855 48.765 48.678 48.57 48.41 48.232 48.129 48.023 47.816 47.664 47.515 47.435 47.243 47.037 46.833 46.719 46.243 46.292 46.145 45.991 45.64 45.422 45.201 44.946 44.604 44.216 43.738 42.68 -9 ,16318 ,TETRA ,17590442,Sat Nov 27 20:30:42 CET,Sat Nov 27 23:37:40 CET,0.0 0.606 0.964 1.254 1.502 1.725 1.935 2.126 2.489 2.665 2.838 2.784 3.329 3.484 3.773 4.048 4.324 4.458 4.716 4.976 5.349 5.59 5.823 6.152 6.471 6.789 7.112 7.427 7.84 8.239 8.619 9.112 9.594 10.044 10.58 11.201 11.809 12.488 13.228 14.027 14.912 15.926 17.109 18.37 19.921 21.705 23.82 26.261 29.142 32.653 37.149 41.077 43.559 45.176 46.293 47.108 47.651 48.019 48.261 48.456 48.605 48.694 48.718 48.717 48.714 48.682 48.611 48.545 48.476 48.395 48.293 48.198 48.102 47.994 47.897 47.767 47.609 47.435 47.267 47.149 47.004 46.749 46.575 46.401 46.307 46.111 45.895 45.673 45.558 45.092 45.164 45.029 44.873 44.507 44.308 44.092 43.832 43.501 43.049 42.421 41.243 -10 ,21863 ,TETRA ,17590443,Sat Nov 27 20:30:43 CET,Sat Nov 27 23:37:36 CET,0.0 0.426 0.773 1.074 1.333 1.581 1.821 2.027 2.389 2.571 2.752 2.712 3.264 3.423 3.745 4.061 4.374 4.514 4.77 5.028 5.413 5.656 5.887 6.22 6.54 6.853 7.163 7.466 7.864 8.265 8.65 9.114 9.576 10.036 10.572 11.176 11.759 12.406 13.133 13.932 14.767 15.735 16.911 18.113 19.521 21.126 23.117 25.49 28.361 31.927 36.395 40.344 42.85 44.487 45.571 46.344 46.858 47.24 47.48 47.63 47.725 47.756 47.741 47.719 47.689 47.646 47.599 47.551 47.486 47.385 47.271 47.16 47.031 46.877 46.759 46.645 46.507 46.363 46.214 46.108 45.995 45.814 45.675 45.512 45.432 45.268 45.1 44.917 44.808 44.354 44.414 44.261 44.113 43.753 43.544 43.33 43.061 42.757 42.407 41.915 40.144 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_20_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_20_17.txt deleted file mode 100644 index 20494c22..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_20_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10454 ,TETRA ,17590444,Sat Nov 27 20:30:45 CET,Sat Nov 27 23:34:04 CET,0.0 1.927 2.642 3.148 3.528 3.834 4.124 4.391 4.895 5.136 5.35 5.425 5.957 6.158 6.509 6.822 7.137 7.281 7.55 7.8 8.164 8.403 8.633 8.974 9.274 9.55 9.825 10.111 10.481 10.802 11.088 11.438 11.79 12.102 12.448 12.838 13.228 13.656 14.077 14.516 15.002 15.552 16.169 16.783 17.475 18.218 19.048 19.94 20.872 21.732 22.518 22.77 22.567 22.236 21.801 21.351 20.949 20.561 20.215 19.858 19.544 19.263 18.967 18.675 18.421 18.168 17.899 17.644 17.407 17.179 16.945 16.746 16.529 16.304 16.128 15.944 15.746 15.542 15.336 15.187 15.035 14.794 14.623 14.45 14.359 14.159 13.948 13.725 13.606 13.169 13.214 13.066 12.912 12.561 12.353 12.138 11.903 11.625 11.286 10.828 9.96 -2 ,10123 ,TETRA ,17590445,Sat Nov 27 20:30:48 CET,Sat Nov 27 23:32:32 CET,0.0 1.195 1.74 2.137 2.472 2.771 3.028 3.277 3.736 3.941 4.151 4.222 4.725 4.882 5.198 5.51 5.804 5.943 6.179 6.389 6.711 6.923 7.13 7.434 7.714 7.975 8.237 8.484 8.803 9.11 9.4 9.755 10.075 10.374 10.737 11.138 11.505 11.886 12.316 12.771 13.201 13.685 14.251 14.836 15.483 16.131 16.881 17.643 18.438 19.316 20.062 20.208 19.979 19.591 19.169 18.714 18.239 17.792 17.427 17.062 16.734 16.435 16.146 15.859 15.581 15.333 15.061 14.82 14.605 14.367 14.122 13.91 13.685 13.446 13.258 13.073 12.883 12.678 12.448 12.291 12.135 11.882 11.707 11.519 11.418 11.221 11.014 10.783 10.66 10.218 10.271 10.129 9.967 9.598 9.39 9.154 8.893 8.596 8.243 7.8 6.646 -3 ,21825 ,TETRA ,17590446,Sat Nov 27 20:30:44 CET,Sat Nov 27 23:33:24 CET,0.0 0.754 1.241 1.561 1.827 2.077 2.33 2.591 3.034 3.231 3.43 3.47 3.955 4.104 4.396 4.674 4.93 5.054 5.298 5.529 5.842 6.035 6.233 6.523 6.784 7.02 7.263 7.511 7.828 8.131 8.426 8.783 9.12 9.459 9.864 10.289 10.674 11.097 11.549 12.002 12.455 12.983 13.589 14.156 14.796 15.542 16.467 17.498 18.592 19.691 20.759 21.142 21.143 20.98 20.643 20.31 19.902 19.465 19.096 18.735 18.431 18.143 17.866 17.591 17.312 17.044 16.756 16.498 16.28 16.063 15.835 15.642 15.429 15.188 15.004 14.814 14.609 14.406 14.185 14.022 13.86 13.62 13.445 13.255 13.16 12.953 12.712 12.446 12.314 11.869 11.913 11.774 11.625 11.279 11.101 10.893 10.638 10.364 10.047 9.623 8.723 -4 ,11149 ,TETRA ,17590447,Sat Nov 27 20:30:44 CET,Sat Nov 27 23:32:25 CET,0.0 0.852 1.332 1.763 2.143 2.459 2.737 2.995 3.459 3.666 3.852 3.883 4.392 4.554 4.835 5.112 5.41 5.557 5.86 6.15 6.541 6.794 7.031 7.361 7.695 8.021 8.306 8.571 8.918 9.25 9.575 9.96 10.35 10.742 11.186 11.659 12.086 12.54 13.007 13.506 14.01 14.553 15.225 15.881 16.554 17.283 18.144 19.019 19.877 20.721 21.439 21.741 21.648 21.332 20.941 20.543 20.165 19.812 19.493 19.15 18.838 18.563 18.311 18.068 17.834 17.594 17.336 17.116 16.916 16.701 16.467 16.282 16.083 15.851 15.675 15.501 15.329 15.146 14.952 14.817 14.66 14.395 14.224 14.051 13.955 13.757 13.545 13.3 13.173 12.728 12.779 12.633 12.472 12.09 11.887 11.676 11.444 11.179 10.825 10.38 9.406 -5 ,31699 ,TETRA ,17590448,Sat Nov 27 20:30:44 CET,Sat Nov 27 23:32:02 CET,0.0 1.709 2.16 2.54 2.911 3.242 3.51 3.772 4.221 4.418 4.613 4.649 5.14 5.291 5.563 5.815 6.057 6.177 6.404 6.62 6.955 7.187 7.42 7.75 8.049 8.323 8.569 8.803 9.122 9.454 9.795 10.207 10.593 10.918 11.268 11.672 12.078 12.53 13.023 13.565 14.148 14.782 15.478 16.203 17.027 17.849 18.742 19.718 20.682 21.434 22.083 22.199 21.973 21.65 21.288 20.914 20.536 20.168 19.819 19.417 19.033 18.736 18.484 18.224 17.974 17.725 17.44 17.178 16.959 16.743 16.496 16.283 16.075 15.859 15.689 15.504 15.307 15.096 14.867 14.719 14.575 14.345 14.168 13.975 13.882 13.69 13.473 13.241 13.118 12.673 12.732 12.586 12.436 12.103 11.892 11.667 11.435 11.18 10.836 10.365 9.405 -6 ,10522 ,TETRA ,17590449,Sat Nov 27 20:30:46 CET,Sat Nov 27 23:31:40 CET,0.0 1.062 1.486 1.849 2.155 2.416 2.641 2.866 3.308 3.524 3.729 3.753 4.262 4.442 4.77 5.058 5.326 5.451 5.705 5.959 6.325 6.561 6.787 7.112 7.423 7.704 7.966 8.225 8.551 8.88 9.203 9.562 9.873 10.169 10.507 10.872 11.232 11.614 12.007 12.443 12.895 13.373 13.958 14.527 15.15 15.844 16.597 17.381 18.278 19.262 20.187 20.619 20.59 20.352 19.986 19.519 19.086 18.686 18.311 17.947 17.626 17.331 17.047 16.758 16.483 16.229 15.953 15.707 15.491 15.274 15.039 14.834 14.625 14.399 14.219 14.02 13.805 13.588 13.364 13.201 13.043 12.811 12.641 12.45 12.35 12.158 11.96 11.749 11.638 11.199 11.23 11.067 10.908 10.572 10.387 10.174 9.92 9.659 9.365 8.934 7.648 -7 ,11001 ,TETRA ,17590450,Sat Nov 27 20:30:49 CET,Sat Nov 27 23:33:01 CET,0.0 1.086 1.591 1.998 2.36 2.634 2.878 3.129 3.595 3.799 3.988 4.032 4.545 4.713 5.039 5.329 5.568 5.682 5.91 6.117 6.434 6.647 6.839 7.123 7.402 7.668 7.915 8.141 8.444 8.719 8.982 9.323 9.651 9.97 10.327 10.705 11.06 11.469 11.902 12.327 12.799 13.318 13.851 14.366 14.995 15.749 16.608 17.521 18.544 19.641 20.672 21.152 21.137 20.911 20.59 20.18 19.772 19.367 18.99 18.605 18.245 17.894 17.545 17.242 16.975 16.715 16.434 16.183 15.946 15.699 15.447 15.224 15.007 14.796 14.63 14.46 14.282 14.092 13.892 13.747 13.595 13.351 13.162 12.967 12.87 12.659 12.446 12.229 12.101 11.651 11.687 11.534 11.375 11.029 10.833 10.609 10.348 10.064 9.71 9.27 8.241 -8 ,17769 ,TETRA ,17590451,Sat Nov 27 20:30:44 CET,Sat Nov 27 23:32:03 CET,0.0 1.502 2.081 2.522 2.887 3.223 3.544 3.821 4.26 4.471 4.678 4.77 5.296 5.469 5.778 6.079 6.378 6.514 6.795 7.064 7.427 7.661 7.881 8.199 8.494 8.768 9.027 9.276 9.597 9.909 10.229 10.609 10.988 11.379 11.824 12.298 12.731 13.186 13.65 14.157 14.72 15.254 15.777 16.319 16.967 17.698 18.439 19.16 19.983 20.873 21.754 22.236 22.086 21.727 21.33 20.905 20.526 20.141 19.768 19.39 19.066 18.76 18.451 18.179 17.924 17.676 17.41 17.153 16.92 16.689 16.441 16.239 16.025 15.787 15.604 15.416 15.22 15.023 14.816 14.664 14.502 14.253 14.085 13.899 13.799 13.606 13.392 13.149 13.023 12.577 12.634 12.495 12.341 11.968 11.755 11.532 11.306 11.036 10.683 10.206 8.642 -9 ,8800 ,TETRA ,17590452,Sat Nov 27 20:30:44 CET,Sat Nov 27 23:34:30 CET,0.0 0.985 1.435 1.774 2.059 2.338 2.604 2.839 3.267 3.461 3.641 3.656 4.158 4.323 4.633 4.916 5.194 5.333 5.583 5.832 6.185 6.402 6.618 6.936 7.231 7.513 7.791 8.058 8.413 8.757 9.085 9.476 9.865 10.226 10.634 11.106 11.521 11.961 12.461 12.979 13.507 14.073 14.706 15.307 15.945 16.656 17.443 18.319 19.357 20.364 21.187 21.479 21.447 21.207 20.889 20.537 20.165 19.778 19.41 19.022 18.654 18.314 17.99 17.697 17.422 17.18 16.935 16.689 16.454 16.196 15.936 15.734 15.521 15.293 15.117 14.918 14.717 14.521 14.323 14.182 14.024 13.789 13.635 13.471 13.385 13.209 12.999 12.765 12.649 12.201 12.215 12.056 11.897 11.554 11.359 11.133 10.886 10.589 10.188 9.548 7.941 -10 ,16292 ,TETRA ,17590453,Sat Nov 27 20:30:44 CET,Sat Nov 27 23:31:57 CET,0.0 1.532 2.243 2.812 3.215 3.585 3.93 4.2 4.68 4.905 5.104 5.105 5.585 5.726 5.992 6.245 6.513 6.636 6.853 7.065 7.371 7.569 7.76 8.03 8.292 8.563 8.811 9.04 9.357 9.651 9.924 10.251 10.566 10.879 11.231 11.612 11.991 12.402 12.831 13.291 13.757 14.257 14.871 15.526 16.246 16.953 17.685 18.537 19.443 20.298 21.093 21.211 20.926 20.573 20.151 19.729 19.395 19.024 18.655 18.299 18.004 17.727 17.456 17.205 16.93 16.668 16.41 16.176 15.961 15.73 15.475 15.251 15.027 14.817 14.655 14.47 14.259 14.037 13.815 13.663 13.507 13.249 13.068 12.881 12.781 12.59 12.396 12.142 12.012 11.572 11.634 11.496 11.353 11.005 10.811 10.583 10.325 10.043 9.674 9.211 8.123 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_20_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_20_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 52e75a26..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_20_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24503 ,TETRA ,17590454,Sat Nov 27 20:31:41 CET,Sat Nov 27 23:36:15 CET,0.0 1.319 1.808 2.155 2.445 2.68 2.896 3.095 3.44 3.603 3.773 3.767 4.237 4.374 4.656 4.915 5.156 5.273 5.499 5.698 5.987 6.18 6.352 6.606 6.867 7.12 7.358 7.578 7.852 8.112 8.372 8.701 8.999 9.267 9.579 9.928 10.265 10.621 11.006 11.447 11.935 12.43 12.968 13.529 14.131 14.747 15.469 16.282 17.145 17.996 18.707 18.911 18.799 18.404 17.961 17.491 17.013 16.55 16.145 15.753 15.392 15.078 14.765 14.45 14.184 13.952 13.67 13.408 13.198 12.966 12.718 12.519 12.307 12.073 11.894 11.711 11.525 11.332 11.106 10.945 10.79 10.545 10.363 10.167 10.059 9.835 9.615 9.392 9.275 8.83 8.875 8.724 8.56 8.209 8.021 7.81 7.563 7.283 6.951 6.467 5.108 -2 ,18695 ,TETRA ,17590455,Sat Nov 27 20:31:40 CET,Sat Nov 27 23:34:19 CET,0.0 0.941 1.412 1.723 1.964 2.188 2.382 2.574 2.937 3.1 3.247 3.18 3.635 3.759 4.002 4.238 4.445 4.539 4.733 4.926 5.19 5.344 5.49 5.693 5.895 6.088 6.274 6.459 6.695 6.939 7.173 7.443 7.699 7.948 8.225 8.523 8.811 9.117 9.447 9.795 10.149 10.539 11.008 11.477 12.022 12.608 13.206 13.837 14.532 15.221 15.682 15.613 15.293 14.894 14.426 13.934 13.498 13.068 12.62 12.146 11.738 11.346 11.005 10.698 10.389 10.111 9.827 9.566 9.329 9.08 8.828 8.604 8.359 8.1 7.905 7.706 7.499 7.295 7.076 6.921 6.757 6.487 6.298 6.091 5.985 5.793 5.591 5.372 5.259 4.814 4.86 4.71 4.545 4.149 3.916 3.689 3.431 3.119 2.78 2.343 1.213 -3 ,15005 ,TETRA ,17590456,Sat Nov 27 20:32:41 CET,Sat Nov 27 23:34:34 CET,0.0 0.933 1.302 1.644 1.944 2.195 2.429 2.63 2.98 3.133 3.284 3.251 3.713 3.836 4.075 4.315 4.535 4.642 4.855 5.065 5.366 5.549 5.729 5.991 6.238 6.475 6.707 6.938 7.233 7.503 7.754 8.044 8.341 8.625 8.926 9.236 9.556 9.927 10.302 10.688 11.094 11.554 12.077 12.589 13.183 13.876 14.688 15.5 16.184 16.714 17.039 16.896 16.522 16.02 15.511 15.065 14.641 14.249 13.881 13.47 13.114 12.8 12.491 12.193 11.913 11.661 11.401 11.15 10.923 10.686 10.451 10.254 10.03 9.799 9.629 9.449 9.256 9.042 8.814 8.654 8.48 8.211 8.026 7.84 7.745 7.529 7.3 7.063 6.944 6.497 6.54 6.388 6.232 5.926 5.753 5.549 5.314 5.058 4.732 4.297 3.297 -4 ,15127 ,TETRA ,17590457,Sat Nov 27 20:32:42 CET,Sat Nov 27 23:33:16 CET,0.0 0.768 1.174 1.497 1.787 2.046 2.246 2.437 2.792 2.944 3.086 3.011 3.467 3.6 3.87 4.128 4.372 4.484 4.686 4.882 5.156 5.339 5.527 5.793 6.053 6.313 6.56 6.798 7.082 7.321 7.553 7.85 8.134 8.407 8.728 9.07 9.405 9.776 10.15 10.511 10.886 11.328 11.829 12.336 12.91 13.519 14.227 14.991 15.835 16.707 17.449 17.586 17.456 17.219 16.829 16.379 15.916 15.452 15.047 14.629 14.255 13.92 13.592 13.264 12.932 12.627 12.32 12.033 11.78 11.524 11.264 11.046 10.812 10.581 10.394 10.191 9.995 9.808 9.597 9.436 9.277 9.007 8.805 8.6 8.497 8.28 8.058 7.821 7.689 7.235 7.296 7.155 7.002 6.667 6.472 6.252 6.004 5.657 5.174 4.564 2.935 -5 ,27994 ,TETRA ,17590458,Sat Nov 27 20:32:44 CET,Sat Nov 27 23:34:33 CET,0.0 1.059 1.451 1.816 2.117 2.369 2.604 2.826 3.225 3.402 3.582 3.594 4.068 4.218 4.514 4.772 5.017 5.133 5.349 5.558 5.867 6.075 6.267 6.544 6.817 7.07 7.299 7.507 7.779 8.056 8.325 8.625 8.913 9.195 9.523 9.897 10.255 10.65 11.081 11.522 11.988 12.495 13.054 13.634 14.279 14.954 15.656 16.292 16.922 17.575 17.989 17.883 17.567 17.18 16.721 16.247 15.85 15.461 15.068 14.63 14.227 13.86 13.527 13.227 12.943 12.66 12.341 12.052 11.815 11.568 11.288 11.057 10.824 10.584 10.394 10.2 9.991 9.76 9.529 9.367 9.197 8.928 8.746 8.558 8.463 8.278 8.065 7.828 7.694 7.236 7.295 7.153 7.003 6.669 6.498 6.317 6.103 5.839 5.51 5.066 4.097 -6 ,18121 ,TETRA ,17590459,Sat Nov 27 20:32:47 CET,Sat Nov 27 23:35:07 CET,0.0 0.613 0.999 1.369 1.642 1.888 2.129 2.345 2.736 2.917 3.089 3.069 3.533 3.665 3.931 4.184 4.403 4.513 4.733 4.936 5.228 5.416 5.603 5.871 6.121 6.357 6.601 6.831 7.09 7.333 7.567 7.841 8.092 8.346 8.66 9.001 9.315 9.663 10.019 10.391 10.802 11.254 11.811 12.367 12.945 13.508 14.18 14.975 15.759 16.529 17.163 17.414 17.273 16.865 16.393 15.953 15.551 15.137 14.758 14.36 13.97 13.639 13.353 13.073 12.784 12.505 12.22 11.962 11.727 11.468 11.206 10.992 10.767 10.527 10.342 10.151 9.936 9.719 9.5 9.343 9.18 8.932 8.758 8.571 8.475 8.274 8.044 7.792 7.657 7.19 7.212 7.059 6.905 6.56 6.367 6.168 5.918 5.629 5.285 4.821 3.835 -7 ,21007 ,TETRA ,17590460,Sat Nov 27 20:32:43 CET,Sat Nov 27 23:34:02 CET,0.0 0.599 0.952 1.268 1.525 1.727 1.937 2.127 2.463 2.627 2.805 2.825 3.301 3.421 3.651 3.874 4.092 4.201 4.408 4.593 4.874 5.064 5.237 5.491 5.748 6.007 6.249 6.469 6.749 7.007 7.253 7.561 7.855 8.134 8.469 8.856 9.239 9.653 10.107 10.605 11.127 11.711 12.319 12.858 13.469 14.127 14.817 15.444 16.163 17.038 17.682 17.597 17.266 16.904 16.398 15.885 15.445 15.031 14.653 14.253 13.877 13.525 13.217 12.908 12.6 12.321 12.037 11.789 11.575 11.353 11.112 10.899 10.675 10.452 10.276 10.074 9.873 9.686 9.469 9.31 9.161 8.924 8.749 8.575 8.483 8.286 8.072 7.824 7.7 7.255 7.288 7.124 6.945 6.593 6.41 6.194 5.944 5.654 5.34 4.904 3.705 -8 ,22914 ,TETRA ,17590461,Sat Nov 27 20:32:41 CET,Sat Nov 27 23:33:09 CET,0.0 0.741 1.081 1.334 1.554 1.775 1.992 2.177 2.52 2.673 2.826 2.774 3.225 3.343 3.573 3.802 4.011 4.11 4.31 4.503 4.763 4.936 5.118 5.367 5.6 5.839 6.084 6.329 6.633 6.92 7.19 7.49 7.775 8.058 8.387 8.735 9.067 9.436 9.84 10.263 10.655 11.067 11.53 11.98 12.5 13.079 13.74 14.426 15.059 15.56 15.865 15.742 15.406 14.989 14.514 14.025 13.592 13.194 12.826 12.443 12.103 11.768 11.443 11.133 10.825 10.547 10.258 9.992 9.753 9.508 9.251 9.003 8.737 8.488 8.306 8.122 7.91 7.662 7.379 7.175 6.98 6.724 6.547 6.362 6.268 6.06 5.835 5.587 5.462 5.015 5.052 4.904 4.75 4.397 4.208 4.003 3.774 3.482 3.135 2.714 1.646 -9 ,4683 ,TETRA ,17590462,Sat Nov 27 20:32:42 CET,Sat Nov 27 23:33:58 CET,0.0 0.747 1.145 1.493 1.806 2.066 2.298 2.517 2.909 3.089 3.251 3.213 3.699 3.852 4.125 4.389 4.652 4.776 5.017 5.244 5.54 5.736 5.934 6.21 6.474 6.725 6.958 7.192 7.493 7.775 8.046 8.372 8.664 8.933 9.237 9.564 9.894 10.279 10.701 11.124 11.53 12.0 12.582 13.128 13.729 14.44 15.2 15.869 16.489 17.086 17.513 17.413 17.021 16.566 16.073 15.595 15.171 14.749 14.379 13.99 13.647 13.343 13.023 12.711 12.414 12.126 11.822 11.552 11.299 11.015 10.716 10.472 10.217 9.948 9.736 9.528 9.318 9.086 8.842 8.674 8.502 8.232 8.046 7.843 7.737 7.527 7.304 7.062 6.932 6.484 6.544 6.388 6.216 5.84 5.64 5.433 5.201 4.89 4.492 4.03 2.825 -10 ,10913 ,TETRA ,17590463,Sat Nov 27 20:32:44 CET,Sat Nov 27 23:34:17 CET,0.0 0.619 0.994 1.312 1.569 1.779 1.968 2.153 2.518 2.693 2.853 2.821 3.294 3.443 3.712 3.943 4.167 4.28 4.499 4.707 4.99 5.165 5.339 5.596 5.837 6.061 6.272 6.483 6.769 7.038 7.3 7.625 7.924 8.201 8.538 8.931 9.291 9.667 10.055 10.459 10.859 11.282 11.8 12.346 12.958 13.591 14.287 15.032 15.777 16.471 17.059 17.182 16.955 16.537 16.056 15.619 15.202 14.769 14.384 14.014 13.664 13.336 13.015 12.696 12.417 12.164 11.884 11.628 11.406 11.174 10.92 10.693 10.451 10.2 10.006 9.813 9.623 9.434 9.218 9.068 8.91 8.654 8.474 8.274 8.168 7.941 7.704 7.464 7.341 6.875 6.877 6.716 6.546 6.164 5.956 5.718 5.449 5.155 4.795 4.353 3.425 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_21_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_21_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 8d8bdb58..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_21_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32034 ,TETRA ,17667729,Fri Dec 3 06:00:45 CET,Fri Dec 3 08:56:05 CET,0.0 0.722 1.044 1.28 1.481 1.668 1.849 2.006 2.279 2.403 2.524 2.42 2.878 2.998 3.225 3.42 3.614 3.715 3.902 4.069 4.31 4.471 4.623 4.84 5.042 5.248 5.458 5.653 5.904 6.155 6.401 6.704 6.982 7.239 7.533 7.882 8.245 8.64 9.049 9.49 9.955 10.467 11.071 11.697 12.428 13.235 14.174 15.208 16.405 17.844 19.543 20.864 21.504 21.773 21.872 21.878 21.823 21.712 21.574 21.397 21.242 21.106 20.96 20.81 20.656 20.498 20.333 20.165 20.005 19.836 19.642 19.476 19.297 19.095 18.934 18.77 18.605 18.435 18.26 18.145 18.023 17.822 17.679 17.526 17.448 17.267 17.052 16.822 16.703 16.261 16.3 16.126 15.927 15.472 15.23 14.96 14.656 14.313 13.917 13.428 12.006 -2 ,3445 ,TETRA ,17667730,Fri Dec 3 06:00:43 CET,Fri Dec 3 09:03:16 CET,0.0 0.656 1.032 1.284 1.5 1.712 1.903 2.064 2.374 2.524 2.662 2.588 3.049 3.16 3.368 3.571 3.777 3.876 4.061 4.235 4.478 4.639 4.799 5.027 5.234 5.428 5.631 5.829 6.074 6.317 6.55 6.833 7.111 7.382 7.697 8.05 8.39 8.78 9.197 9.631 10.092 10.615 11.222 11.849 12.597 13.402 14.339 15.393 16.601 18.104 19.86 21.127 21.73 21.965 22.054 22.046 21.975 21.849 21.712 21.554 21.38 21.192 21.005 20.835 20.659 20.479 20.287 20.127 19.985 19.827 19.662 19.52 19.363 19.189 19.051 18.91 18.745 18.553 18.334 18.179 18.013 17.755 17.585 17.391 17.287 17.083 16.858 16.607 16.474 16.013 16.021 15.85 15.675 15.307 15.093 14.88 14.661 14.398 14.079 13.666 12.869 -3 ,157 ,TETRA ,17667731,Fri Dec 3 06:00:46 CET,Fri Dec 3 09:03:19 CET,0.0 0.674 1.04 1.281 1.478 1.667 1.848 2.006 2.298 2.432 2.56 2.464 2.916 3.022 3.232 3.444 3.642 3.736 3.925 4.106 4.346 4.503 4.656 4.879 5.104 5.326 5.547 5.761 6.025 6.285 6.53 6.839 7.149 7.428 7.751 8.121 8.493 8.904 9.353 9.848 10.355 10.931 11.625 12.312 13.094 13.997 15.045 16.157 17.451 19.009 20.755 22.08 22.701 22.98 23.17 23.279 23.268 23.197 23.11 22.983 22.855 22.722 22.578 22.438 22.303 22.16 21.99 21.834 21.703 21.557 21.377 21.216 21.048 20.865 20.724 20.58 20.426 20.269 20.101 19.966 19.827 19.624 19.481 19.328 19.248 19.083 18.904 18.712 18.605 18.175 18.286 18.167 18.028 17.678 17.482 17.276 17.052 16.794 16.454 15.978 14.514 -4 ,23411 ,TETRA ,17667732,Fri Dec 3 06:00:43 CET,Fri Dec 3 09:02:20 CET,0.0 0.388 0.664 0.897 1.092 1.283 1.464 1.615 1.883 2.017 2.143 2.054 2.52 2.647 2.887 3.079 3.261 3.354 3.54 3.732 4.002 4.167 4.324 4.557 4.784 4.989 5.195 5.409 5.689 5.952 6.192 6.481 6.768 7.053 7.381 7.739 8.091 8.475 8.877 9.321 9.788 10.32 10.947 11.585 12.338 13.187 14.199 15.318 16.589 18.06 19.726 20.84 21.381 21.655 21.732 21.678 21.55 21.366 21.193 21.018 20.837 20.658 20.472 20.296 20.131 19.979 19.82 19.663 19.515 19.339 19.145 18.987 18.807 18.612 18.466 18.322 18.167 17.987 17.794 17.665 17.534 17.331 17.181 17.025 16.947 16.757 16.545 16.335 16.212 15.756 15.799 15.656 15.497 15.138 14.936 14.717 14.485 14.202 13.876 13.455 11.816 -5 ,15442 ,TETRA ,17667733,Fri Dec 3 06:00:43 CET,Fri Dec 3 09:06:25 CET,0.0 0.581 0.897 1.153 1.352 1.524 1.678 1.836 2.173 2.327 2.483 2.419 2.883 3.004 3.227 3.439 3.652 3.755 3.943 4.121 4.382 4.55 4.713 4.947 5.178 5.403 5.614 5.827 6.111 6.373 6.631 6.936 7.228 7.523 7.86 8.242 8.611 9.003 9.43 9.916 10.433 10.996 11.646 12.309 13.096 13.968 14.999 16.152 17.465 19.044 20.974 22.424 23.174 23.605 23.757 23.778 23.741 23.632 23.513 23.357 23.199 23.072 22.935 22.772 22.59 22.408 22.226 22.057 21.901 21.754 21.598 21.448 21.29 21.133 21.012 20.89 20.754 20.586 20.409 20.298 20.185 19.992 19.838 19.668 19.578 19.393 19.212 19.012 18.905 18.469 18.516 18.363 18.198 17.848 17.662 17.46 17.253 17.008 16.699 16.259 14.333 -6 ,6678 ,TETRA ,17667734,Fri Dec 3 06:00:43 CET,Fri Dec 3 09:01:20 CET,0.0 0.665 1.065 1.369 1.592 1.779 1.947 2.125 2.491 2.647 2.772 2.666 3.12 3.231 3.444 3.637 3.828 3.926 4.117 4.307 4.57 4.73 4.893 5.139 5.365 5.579 5.793 5.992 6.254 6.502 6.73 7.028 7.316 7.593 7.916 8.275 8.614 8.986 9.384 9.821 10.306 10.851 11.482 12.101 12.843 13.675 14.637 15.763 16.989 18.368 19.977 21.079 21.659 21.949 21.997 21.995 21.934 21.811 21.674 21.505 21.32 21.139 20.972 20.804 20.637 20.473 20.283 20.121 19.984 19.822 19.643 19.492 19.335 19.16 19.017 18.871 18.715 18.535 18.344 18.213 18.082 17.864 17.693 17.516 17.424 17.227 17.014 16.774 16.656 16.218 16.283 16.151 16.01 15.668 15.473 15.24 14.99 14.697 14.316 13.859 11.864 -7 ,11509 ,TETRA ,17667735,Fri Dec 3 06:00:45 CET,Fri Dec 3 08:55:00 CET,0.0 0.628 0.946 1.232 1.492 1.73 1.95 2.15 2.506 2.676 2.835 2.774 3.253 3.383 3.64 3.893 4.134 4.249 4.473 4.695 5.026 5.233 5.422 5.679 5.926 6.165 6.39 6.621 6.918 7.205 7.486 7.807 8.118 8.418 8.753 9.134 9.503 9.916 10.367 10.847 11.342 11.887 12.525 13.162 13.906 14.719 15.66 16.707 17.904 19.327 21.009 22.292 22.924 23.189 23.277 23.276 23.21 23.099 22.964 22.79 22.619 22.453 22.292 22.106 21.897 21.705 21.5 21.32 21.174 21.005 20.807 20.628 20.434 20.228 20.068 19.9 19.708 19.508 19.309 19.164 19.01 18.758 18.578 18.399 18.31 18.116 17.9 17.667 17.546 17.109 17.194 17.058 16.897 16.553 16.372 16.161 15.927 15.693 15.4 14.935 14.04 -8 ,4333 ,TETRA ,17667736,Fri Dec 3 06:00:43 CET,Fri Dec 3 09:01:20 CET,0.0 0.573 0.893 1.133 1.332 1.514 1.688 1.856 2.165 2.302 2.438 2.355 2.811 2.92 3.129 3.333 3.525 3.625 3.824 4.009 4.259 4.411 4.559 4.77 4.982 5.194 5.389 5.582 5.845 6.105 6.352 6.644 6.928 7.199 7.524 7.894 8.236 8.62 9.036 9.473 9.937 10.471 11.076 11.658 12.343 13.114 13.99 14.963 16.127 17.496 19.037 20.135 20.612 20.799 20.838 20.797 20.722 20.625 20.497 20.333 20.186 20.04 19.868 19.684 19.506 19.332 19.139 18.952 18.793 18.629 18.44 18.283 18.111 17.929 17.778 17.616 17.462 17.289 17.093 16.96 16.829 16.623 16.479 16.325 16.242 16.061 15.866 15.657 15.55 15.11 15.156 15.016 14.868 14.527 14.337 14.132 13.907 13.636 13.3 12.867 12.157 -9 ,9542 ,TETRA ,17667737,Fri Dec 3 06:00:43 CET,Fri Dec 3 08:59:49 CET,0.0 0.413 0.694 0.938 1.159 1.347 1.513 1.679 1.986 2.121 2.259 2.179 2.631 2.745 2.957 3.15 3.34 3.441 3.642 3.837 4.115 4.287 4.446 4.665 4.874 5.069 5.27 5.478 5.742 5.998 6.25 6.554 6.846 7.123 7.442 7.811 8.167 8.552 8.96 9.404 9.875 10.407 11.047 11.714 12.47 13.28 14.274 15.396 16.684 18.161 19.766 20.978 21.49 21.704 21.825 21.81 21.713 21.578 21.436 21.271 21.107 20.983 20.853 20.696 20.52 20.344 20.135 19.917 19.713 19.502 19.289 19.097 18.889 18.663 18.49 18.324 18.149 17.967 17.776 17.638 17.491 17.254 17.081 16.893 16.794 16.599 16.39 16.168 16.044 15.594 15.631 15.468 15.307 14.987 14.811 14.613 14.375 14.101 13.771 13.35 12.455 -10 ,12841 ,TETRA ,17667738,Fri Dec 3 06:00:46 CET,Fri Dec 3 08:54:46 CET,0.0 0.677 1.013 1.281 1.497 1.694 1.871 2.034 2.337 2.485 2.638 2.568 3.023 3.129 3.34 3.539 3.729 3.824 4.003 4.186 4.459 4.624 4.779 5.011 5.233 5.443 5.647 5.86 6.141 6.391 6.622 6.894 7.167 7.436 7.761 8.143 8.506 8.892 9.294 9.718 10.166 10.687 11.288 11.894 12.606 13.377 14.265 15.322 16.613 18.078 19.726 20.892 21.414 21.677 21.737 21.685 21.607 21.489 21.344 21.17 20.994 20.814 20.634 20.447 20.253 20.066 19.831 19.604 19.437 19.264 19.073 18.916 18.752 18.577 18.423 18.245 18.075 17.903 17.717 17.59 17.45 17.221 17.059 16.886 16.795 16.607 16.39 16.159 16.043 15.595 15.66 15.518 15.357 15.021 14.829 14.627 14.416 14.144 13.804 13.398 12.652 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_21_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_21_22.txt deleted file mode 100644 index e65d48ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_21_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7183 ,TETRA ,17590464,Sat Nov 27 20:34:41 CET,Sat Nov 27 23:38:36 CET,0.0 0.9 1.35 1.705 2.007 2.281 2.527 2.724 3.085 3.263 3.427 3.391 3.875 4.006 4.256 4.502 4.713 4.806 4.993 5.173 5.425 5.599 5.772 6.017 6.258 6.489 6.708 6.915 7.168 7.406 7.634 7.919 8.208 8.483 8.781 9.112 9.437 9.794 10.186 10.598 11.04 11.547 12.12 12.69 13.325 14.002 14.766 15.571 16.394 17.329 18.377 19.022 19.187 19.14 19.012 18.806 18.564 18.313 18.065 17.793 17.563 17.337 17.089 16.854 16.65 16.464 16.25 16.047 15.854 15.645 15.439 15.269 15.086 14.895 14.75 14.595 14.429 14.262 14.096 13.983 13.856 13.645 13.494 13.333 13.251 13.083 12.906 12.72 12.614 12.165 12.231 12.094 11.948 11.605 11.419 11.22 11.007 10.778 10.473 9.985 8.826 -2 ,32083 ,TETRA ,17590465,Sat Nov 27 20:34:43 CET,Sat Nov 27 23:38:18 CET,0.0 0.756 1.201 1.586 1.93 2.22 2.476 2.702 3.082 3.253 3.415 3.38 3.86 3.992 4.26 4.523 4.759 4.87 5.094 5.303 5.594 5.782 5.968 6.239 6.496 6.739 6.972 7.192 7.465 7.73 7.994 8.298 8.578 8.864 9.2 9.563 9.9 10.279 10.689 11.116 11.553 12.051 12.622 13.159 13.782 14.488 15.288 16.145 17.12 18.196 19.299 19.965 20.116 20.039 19.891 19.693 19.467 19.221 18.962 18.678 18.423 18.178 17.943 17.706 17.468 17.243 16.997 16.771 16.567 16.351 16.138 15.966 15.782 15.591 15.436 15.275 15.103 14.922 14.739 14.606 14.465 14.234 14.07 13.914 13.831 13.642 13.457 13.277 13.175 12.733 12.804 12.666 12.534 12.253 12.097 11.932 11.746 11.513 11.218 10.841 10.136 -3 ,7291 ,TETRA ,17590466,Sat Nov 27 20:36:41 CET,Sat Nov 27 23:39:23 CET,0.0 1.21 1.735 2.127 2.425 2.693 2.97 3.199 3.575 3.775 3.963 3.921 4.403 4.561 4.871 5.152 5.4 5.508 5.713 5.906 6.172 6.338 6.511 6.775 7.017 7.236 7.454 7.665 7.931 8.189 8.433 8.738 9.033 9.291 9.602 9.984 10.335 10.709 11.128 11.554 11.987 12.473 13.027 13.586 14.21 14.879 15.65 16.49 17.448 18.513 19.6 20.312 20.494 20.438 20.347 20.182 19.982 19.747 19.473 19.192 18.943 18.691 18.441 18.206 17.99 17.793 17.581 17.356 17.164 16.979 16.781 16.626 16.461 16.284 16.139 15.981 15.813 15.639 15.46 15.328 15.192 14.985 14.832 14.665 14.574 14.382 14.175 13.948 13.831 13.386 13.48 13.345 13.201 12.851 12.65 12.43 12.188 11.94 11.635 11.215 10.204 -4 ,20539 ,TETRA ,17590467,Sat Nov 27 20:36:42 CET,Sat Nov 27 23:42:30 CET,0.0 1.482 1.898 2.236 2.55 2.803 3.014 3.215 3.567 3.722 3.881 3.835 4.305 4.456 4.736 4.977 5.203 5.312 5.528 5.73 6.028 6.216 6.4 6.666 6.923 7.175 7.406 7.622 7.912 8.181 8.429 8.73 9.014 9.293 9.609 9.963 10.312 10.698 11.109 11.533 11.97 12.451 13.022 13.582 14.239 14.947 15.721 16.581 17.514 18.536 19.506 20.076 20.262 20.18 20.007 19.851 19.645 19.376 19.088 18.794 18.553 18.308 18.068 17.842 17.61 17.399 17.178 16.958 16.762 16.554 16.337 16.16 15.977 15.779 15.618 15.451 15.281 15.091 14.878 14.732 14.577 14.348 14.189 14.013 13.926 13.742 13.537 13.324 13.211 12.758 12.832 12.693 12.55 12.219 12.015 11.793 11.557 11.311 11.024 10.627 9.991 -5 ,12317 ,TETRA ,17590468,Sat Nov 27 20:38:41 CET,Sat Nov 27 23:42:27 CET,0.0 0.665 1.079 1.378 1.649 1.876 2.09 2.286 2.601 2.748 2.899 2.853 3.334 3.465 3.713 3.946 4.166 4.272 4.474 4.666 4.955 5.139 5.312 5.569 5.802 6.032 6.281 6.511 6.776 7.022 7.259 7.576 7.887 8.151 8.458 8.814 9.152 9.536 9.943 10.381 10.847 11.334 11.88 12.458 13.167 13.928 14.74 15.59 16.541 17.595 18.642 19.229 19.455 19.484 19.364 19.16 18.926 18.711 18.498 18.257 18.044 17.831 17.604 17.383 17.175 16.981 16.787 16.617 16.455 16.267 16.068 15.907 15.741 15.561 15.416 15.259 15.083 14.894 14.703 14.57 14.424 14.179 14.015 13.853 13.765 13.588 13.405 13.21 13.104 12.666 12.771 12.647 12.508 12.194 12.024 11.839 11.637 11.425 11.169 10.796 10.098 -6 ,32019 ,TETRA ,17590469,Sat Nov 27 20:38:43 CET,Sat Nov 27 23:41:13 CET,0.0 0.865 1.214 1.478 1.713 1.921 2.118 2.309 2.669 2.825 2.985 2.94 3.404 3.524 3.773 4.008 4.221 4.323 4.531 4.73 4.99 5.167 5.341 5.586 5.835 6.069 6.288 6.498 6.765 7.027 7.285 7.591 7.887 8.173 8.495 8.864 9.207 9.57 9.971 10.383 10.796 11.263 11.816 12.372 13.016 13.726 14.524 15.397 16.367 17.478 18.73 19.5 19.739 19.762 19.64 19.416 19.206 19.004 18.795 18.55 18.322 18.104 17.883 17.666 17.447 17.234 17.01 16.818 16.654 16.476 16.297 16.142 15.956 15.775 15.638 15.483 15.31 15.134 14.963 14.832 14.693 14.498 14.36 14.204 14.122 13.952 13.765 13.544 13.427 12.992 13.099 12.971 12.824 12.505 12.345 12.17 11.966 11.75 11.522 11.207 10.426 -7 ,11607 ,TETRA ,17590470,Sat Nov 27 20:57:43 CET,Sun Nov 28 00:07:53 CET,0.0 0.894 1.336 1.639 1.906 2.15 2.372 2.581 2.965 3.153 3.333 3.329 3.819 3.956 4.221 4.473 4.705 4.815 5.024 5.228 5.537 5.724 5.892 6.136 6.375 6.602 6.82 7.045 7.336 7.601 7.86 8.199 8.525 8.815 9.135 9.492 9.837 10.211 10.614 11.035 11.459 11.934 12.48 12.994 13.611 14.307 15.08 15.938 16.894 17.951 19.037 19.689 19.931 19.947 19.799 19.583 19.36 19.146 18.934 18.683 18.446 18.221 17.98 17.731 17.485 17.26 17.024 16.818 16.64 16.446 16.25 16.083 15.888 15.666 15.502 15.342 15.185 15.013 14.827 14.699 14.564 14.353 14.199 14.027 13.938 13.757 13.549 13.334 13.228 12.793 12.889 12.757 12.618 12.305 12.141 11.965 11.742 11.486 11.209 10.849 10.201 -8 ,32365 ,TETRA ,17590471,Sat Nov 27 20:57:44 CET,Sat Nov 27 23:34:29 CET,0.0 1.437 1.907 2.249 2.535 2.807 3.051 3.284 3.724 3.916 4.096 4.086 4.579 4.732 4.998 5.22 5.429 5.536 5.757 5.97 6.269 6.471 6.667 6.928 7.175 7.429 7.668 7.893 8.185 8.455 8.719 9.036 9.333 9.608 9.937 10.328 10.688 11.072 11.467 11.869 12.296 12.775 13.303 13.829 14.426 15.07 15.827 16.638 17.578 18.631 19.736 20.453 20.71 20.709 20.56 20.377 20.169 19.926 19.679 19.41 19.174 18.96 18.734 18.476 18.211 17.977 17.754 17.568 17.391 17.187 16.98 16.814 16.623 16.393 16.219 16.048 15.861 15.678 15.503 15.374 15.235 15.004 14.837 14.665 14.573 14.388 14.203 13.992 13.867 13.392 13.44 13.301 13.157 12.84 12.666 12.48 12.257 11.978 11.651 11.255 10.381 -9 ,20899 ,TETRA ,17590472,Sat Nov 27 20:58:42 CET,Sun Nov 28 00:01:35 CET,0.0 0.695 1.117 1.421 1.665 1.91 2.151 2.365 2.737 2.909 3.08 3.063 3.562 3.707 3.978 4.234 4.479 4.598 4.812 5.004 5.285 5.465 5.651 5.925 6.173 6.412 6.657 6.9 7.201 7.497 7.774 8.098 8.399 8.678 8.993 9.335 9.677 10.068 10.481 10.908 11.343 11.8 12.338 12.893 13.545 14.262 15.06 15.915 16.826 17.821 18.844 19.437 19.61 19.576 19.435 19.211 18.967 18.715 18.469 18.194 17.931 17.695 17.454 17.228 17.02 16.811 16.567 16.358 16.182 15.984 15.785 15.625 15.447 15.264 15.127 14.959 14.764 14.559 14.351 14.205 14.054 13.828 13.675 13.508 13.415 13.232 13.059 12.875 12.772 12.319 12.375 12.238 12.096 11.77 11.585 11.396 11.185 10.951 10.68 10.317 9.565 -10 ,27817 ,TETRA ,17590473,Sat Nov 27 20:59:42 CET,Sun Nov 28 00:03:01 CET,0.0 0.809 1.234 1.583 1.852 2.095 2.315 2.513 2.84 2.981 3.129 3.081 3.562 3.7 3.956 4.205 4.45 4.561 4.76 4.955 5.239 5.419 5.594 5.857 6.107 6.349 6.59 6.821 7.115 7.383 7.636 7.964 8.286 8.588 8.924 9.297 9.652 10.017 10.399 10.81 11.251 11.744 12.29 12.845 13.482 14.157 14.948 15.821 16.824 17.917 19.03 19.712 19.858 19.794 19.646 19.44 19.179 18.91 18.675 18.432 18.234 18.04 17.839 17.637 17.431 17.241 17.039 16.849 16.684 16.509 16.322 16.159 15.986 15.802 15.656 15.503 15.335 15.161 14.983 14.855 14.716 14.504 14.349 14.181 14.094 13.911 13.715 13.525 13.429 12.987 13.087 12.961 12.826 12.497 12.307 12.096 11.856 11.618 11.335 10.933 9.902 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_22_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_22_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 81fbc57c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_22_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27249 ,TETRA ,17590474,Sat Nov 27 20:59:44 CET,Sun Nov 28 00:04:17 CET,0.0 0.441 0.745 0.955 1.132 1.306 1.477 1.632 1.923 2.055 2.174 2.07 2.5 2.593 2.779 2.959 3.128 3.209 3.373 3.544 3.776 3.914 4.047 4.241 4.423 4.594 4.77 4.941 5.145 5.335 5.523 5.756 5.984 6.209 6.468 6.745 7.001 7.294 7.608 7.927 8.272 8.667 9.126 9.566 10.045 10.565 11.139 11.754 12.42 13.102 13.715 13.97 13.911 13.692 13.413 13.055 12.667 12.315 12.006 11.693 11.394 11.073 10.745 10.458 10.214 9.98 9.735 9.513 9.304 9.088 8.855 8.668 8.481 8.272 8.105 7.925 7.722 7.512 7.303 7.149 6.991 6.75 6.577 6.404 6.316 6.125 5.928 5.69 5.544 5.067 5.037 4.856 4.69 4.319 4.117 3.884 3.611 3.308 2.949 2.516 1.593 -2 ,3247 ,TETRA ,17590475,Sat Nov 27 20:59:42 CET,Sat Nov 27 23:48:38 CET,0.0 0.531 0.794 1.008 1.195 1.352 1.498 1.638 1.9 2.021 2.142 2.046 2.486 2.589 2.778 2.953 3.126 3.214 3.388 3.546 3.757 3.893 4.027 4.229 4.418 4.599 4.782 4.963 5.189 5.388 5.578 5.811 6.039 6.252 6.493 6.768 7.019 7.289 7.581 7.906 8.248 8.603 8.996 9.406 9.88 10.366 10.927 11.521 12.158 12.837 13.502 13.824 13.777 13.558 13.236 12.904 12.593 12.273 11.963 11.624 11.345 11.077 10.773 10.495 10.244 9.998 9.74 9.5 9.278 9.044 8.796 8.585 8.362 8.131 7.95 7.754 7.541 7.323 7.101 6.933 6.76 6.491 6.304 6.1 5.987 5.763 5.526 5.275 5.135 4.663 4.663 4.485 4.3 3.894 3.667 3.4 3.095 2.736 2.295 1.75 -0.021 -3 ,1486 ,TETRA ,17590476,Sat Nov 27 20:59:42 CET,Sat Nov 27 23:58:18 CET,0.0 0.437 0.697 0.899 1.068 1.23 1.396 1.547 1.812 1.932 2.046 1.944 2.376 2.476 2.662 2.839 3.021 3.105 3.251 3.392 3.591 3.718 3.854 4.053 4.237 4.42 4.6 4.775 4.998 5.205 5.403 5.637 5.854 6.063 6.309 6.589 6.861 7.159 7.477 7.804 8.134 8.483 8.89 9.308 9.781 10.31 10.907 11.554 12.279 13.02 13.707 13.982 13.871 13.589 13.322 13.086 12.858 12.633 12.415 12.137 11.847 11.569 11.307 11.049 10.809 10.587 10.335 10.102 9.889 9.661 9.416 9.21 9.001 8.776 8.595 8.383 8.163 7.943 7.701 7.542 7.375 7.108 6.9 6.684 6.583 6.36 6.128 5.889 5.756 5.288 5.279 5.107 4.922 4.527 4.322 4.104 3.859 3.55 3.179 2.765 1.657 -4 ,19990 ,TETRA ,17590477,Sat Nov 27 21:00:43 CET,Sun Nov 28 00:03:10 CET,0.0 0.539 0.805 1.005 1.193 1.364 1.51 1.642 1.864 1.969 2.07 1.942 2.362 2.449 2.617 2.773 2.925 3.001 3.15 3.288 3.488 3.623 3.75 3.932 4.107 4.285 4.454 4.611 4.828 5.034 5.223 5.447 5.663 5.878 6.12 6.388 6.644 6.912 7.182 7.472 7.796 8.179 8.617 9.034 9.49 9.972 10.494 11.016 11.614 12.293 12.817 12.929 12.816 12.578 12.28 11.935 11.589 11.26 10.927 10.552 10.24 9.976 9.73 9.492 9.25 9.003 8.737 8.515 8.32 8.12 7.901 7.713 7.511 7.281 7.105 6.909 6.696 6.478 6.246 6.091 5.927 5.664 5.475 5.275 5.173 4.946 4.693 4.419 4.272 3.792 3.813 3.662 3.495 3.14 2.934 2.691 2.421 2.133 1.771 1.217 -0.359 -5 ,22132 ,TETRA ,17590478,Sat Nov 27 21:00:42 CET,Sat Nov 27 23:54:07 CET,0.0 0.595 0.907 1.1 1.292 1.481 1.643 1.787 2.065 2.199 2.322 2.221 2.666 2.78 2.965 3.14 3.304 3.381 3.533 3.672 3.881 4.022 4.151 4.339 4.526 4.698 4.858 5.031 5.277 5.487 5.675 5.912 6.14 6.354 6.581 6.825 7.069 7.345 7.631 7.956 8.323 8.704 9.133 9.556 10.032 10.551 11.129 11.742 12.407 13.145 13.89 14.184 14.154 14.01 13.791 13.499 13.165 12.82 12.506 12.191 11.877 11.559 11.269 11.014 10.765 10.512 10.258 10.055 9.867 9.654 9.408 9.202 9.004 8.784 8.594 8.394 8.208 7.993 7.745 7.589 7.429 7.186 7.016 6.831 6.733 6.539 6.35 6.131 6.007 5.554 5.614 5.472 5.318 4.98 4.776 4.533 4.263 3.938 3.582 3.166 1.917 -6 ,30492 ,TETRA ,17590479,Sat Nov 27 21:02:41 CET,Sun Nov 28 00:05:18 CET,0.0 0.653 0.939 1.177 1.397 1.584 1.752 1.901 2.172 2.302 2.426 2.319 2.752 2.856 3.053 3.227 3.391 3.473 3.634 3.794 4.022 4.164 4.303 4.498 4.687 4.874 5.055 5.219 5.415 5.612 5.816 6.046 6.251 6.458 6.704 6.987 7.263 7.556 7.858 8.178 8.51 8.883 9.336 9.77 10.279 10.862 11.498 12.171 12.949 13.835 14.699 15.073 14.992 14.74 14.495 14.251 13.958 13.646 13.354 13.037 12.741 12.474 12.211 11.942 11.675 11.407 11.106 10.835 10.627 10.427 10.195 9.989 9.759 9.492 9.275 9.049 8.819 8.569 8.307 8.138 7.942 7.623 7.398 7.139 7.013 6.78 6.533 6.286 6.155 5.675 5.676 5.519 5.34 4.94 4.72 4.489 4.213 3.855 3.473 2.995 1.885 -7 ,11537 ,TETRA ,17590480,Sat Nov 27 21:02:41 CET,Sun Nov 28 00:01:25 CET,0.0 0.54 0.846 1.087 1.278 1.438 1.593 1.737 1.999 2.116 2.22 2.09 2.516 2.61 2.797 2.981 3.152 3.234 3.39 3.537 3.743 3.871 3.996 4.191 4.383 4.567 4.745 4.913 5.12 5.321 5.511 5.73 5.946 6.168 6.418 6.681 6.953 7.264 7.578 7.902 8.235 8.599 9.048 9.475 9.946 10.456 10.997 11.591 12.216 12.824 13.365 13.509 13.39 13.178 12.881 12.521 12.161 11.847 11.576 11.261 10.976 10.706 10.412 10.12 9.863 9.636 9.384 9.129 8.912 8.69 8.44 8.226 7.994 7.744 7.557 7.365 7.152 6.927 6.697 6.534 6.368 6.096 5.898 5.687 5.576 5.352 5.114 4.879 4.756 4.3 4.325 4.153 3.958 3.549 3.313 3.059 2.797 2.486 2.116 1.669 -0.507 -8 ,28952 ,TETRA ,17590481,Sat Nov 27 21:03:44 CET,Sat Nov 27 23:50:32 CET,0.0 0.767 1.079 1.295 1.477 1.648 1.817 1.971 2.256 2.383 2.496 2.387 2.819 2.929 3.128 3.302 3.467 3.551 3.724 3.877 4.105 4.262 4.406 4.612 4.803 4.99 5.168 5.329 5.53 5.714 5.904 6.135 6.349 6.554 6.791 7.065 7.32 7.591 7.887 8.206 8.548 8.937 9.389 9.847 10.352 10.875 11.445 12.079 12.784 13.43 13.925 13.992 13.816 13.57 13.279 12.938 12.599 12.282 12.02 11.743 11.471 11.205 10.944 10.686 10.415 10.176 9.917 9.658 9.426 9.187 8.954 8.75 8.529 8.291 8.101 7.916 7.733 7.534 7.313 7.163 7.012 6.757 6.575 6.383 6.276 6.043 5.785 5.514 5.37 4.901 4.929 4.784 4.618 4.185 3.944 3.686 3.389 3.085 2.732 2.312 1.486 -9 ,18360 ,TETRA ,17590482,Sat Nov 27 21:03:44 CET,Sun Nov 28 00:05:26 CET,0.0 0.404 0.646 0.842 1.022 1.195 1.367 1.524 1.831 1.98 2.106 2.014 2.463 2.562 2.746 2.919 3.084 3.163 3.319 3.472 3.684 3.823 3.96 4.151 4.336 4.526 4.713 4.88 5.088 5.294 5.493 5.708 5.922 6.138 6.381 6.65 6.899 7.179 7.489 7.801 8.113 8.472 8.912 9.342 9.831 10.391 11.016 11.663 12.332 13.049 13.75 14.103 14.109 13.921 13.634 13.299 12.985 12.695 12.425 12.111 11.812 11.543 11.261 10.982 10.71 10.422 10.137 9.921 9.725 9.514 9.288 9.083 8.868 8.657 8.496 8.328 8.142 7.944 7.73 7.566 7.4 7.164 6.992 6.792 6.693 6.491 6.261 6.005 5.875 5.415 5.44 5.277 5.081 4.664 4.448 4.208 3.941 3.641 3.258 2.765 1.848 -10 ,30318 ,TETRA ,17590483,Sat Nov 27 21:05:43 CET,Sat Nov 27 23:58:37 CET,0.0 0.507 0.773 0.994 1.17 1.323 1.492 1.674 1.96 2.079 2.194 2.078 2.513 2.626 2.823 2.997 3.175 3.258 3.411 3.565 3.785 3.919 4.055 4.256 4.459 4.65 4.828 4.994 5.208 5.428 5.632 5.867 6.103 6.334 6.588 6.871 7.151 7.449 7.75 8.058 8.403 8.807 9.239 9.672 10.199 10.742 11.342 12.018 12.733 13.433 14.141 14.57 14.638 14.489 14.287 14.066 13.798 13.514 13.225 12.885 12.595 12.345 12.086 11.816 11.565 11.333 11.077 10.846 10.639 10.415 10.186 9.983 9.742 9.5 9.312 9.121 8.927 8.709 8.476 8.316 8.159 7.895 7.689 7.502 7.407 7.204 6.986 6.727 6.603 6.152 6.13 5.934 5.747 5.375 5.182 4.963 4.708 4.387 3.928 3.329 2.104 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 653fc62e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16528 ,KEBNE ,17070586,Fri Dec 24 19:42:52 CET,Fri Dec 24 21:54:37 CET,0.0 0.791 1.104 1.321 1.509 1.691 1.849 1.991 2.278 2.41 2.528 2.422 2.849 2.956 3.166 3.374 3.56 3.64 3.802 3.96 4.175 4.314 4.458 4.667 4.862 5.036 5.201 5.379 5.603 5.806 6.001 6.237 6.472 6.7 6.954 7.24 7.528 7.826 8.122 8.461 8.823 9.222 9.691 10.177 10.732 11.314 11.963 12.625 13.335 14.103 14.843 15.137 15.073 14.859 14.575 14.269 13.951 13.612 13.285 12.921 12.605 12.287 11.963 11.687 11.426 11.153 10.841 10.57 10.338 10.092 9.835 9.621 9.391 9.146 8.956 8.763 8.563 8.345 8.107 7.947 7.787 7.531 7.344 7.135 7.024 6.795 6.544 6.293 6.159 5.687 5.684 5.529 5.357 4.953 4.72 4.449 4.157 3.854 3.494 3.006 1.693 -2 ,207 ,KEBNE ,17070587,Fri Dec 24 19:44:58 CET,Fri Dec 24 21:55:17 CET,0.0 0.735 1.05 1.322 1.548 1.745 1.932 2.106 2.404 2.535 2.654 2.554 2.986 3.09 3.292 3.497 3.69 3.781 3.954 4.115 4.354 4.503 4.641 4.847 5.042 5.231 5.407 5.572 5.789 5.997 6.203 6.452 6.679 6.892 7.142 7.425 7.701 7.998 8.308 8.629 8.96 9.352 9.821 10.283 10.812 11.36 11.96 12.657 13.443 14.247 14.928 15.237 15.239 15.028 14.72 14.371 14.007 13.674 13.381 13.05 12.74 12.439 12.114 11.759 11.432 11.172 10.873 10.586 10.36 10.114 9.867 9.663 9.444 9.231 9.058 8.864 8.66 8.438 8.192 8.013 7.831 7.547 7.342 7.124 7.013 6.796 6.555 6.284 6.149 5.693 5.68 5.5 5.32 4.866 4.582 4.297 4.008 3.68 3.289 2.789 1.581 -3 ,28291 ,KEBNE ,17070588,Fri Dec 24 19:44:58 CET,Fri Dec 24 21:55:23 CET,0.0 0.539 0.851 1.069 1.265 1.454 1.628 1.785 2.089 2.228 2.347 2.238 2.665 2.766 2.961 3.157 3.347 3.439 3.611 3.771 3.988 4.128 4.27 4.466 4.653 4.837 5.013 5.186 5.415 5.634 5.843 6.097 6.34 6.575 6.839 7.129 7.411 7.729 8.062 8.4 8.754 9.167 9.646 10.099 10.629 11.2 11.841 12.533 13.276 14.111 14.949 15.311 15.229 15.027 14.718 14.29 13.889 13.52 13.161 12.792 12.473 12.147 11.818 11.522 11.257 10.993 10.686 10.408 10.146 9.859 9.575 9.339 9.073 8.773 8.537 8.298 8.057 7.803 7.558 7.396 7.206 6.889 6.673 6.465 6.357 6.13 5.873 5.576 5.431 4.968 4.957 4.78 4.587 4.154 3.91 3.63 3.285 2.906 2.467 1.833 -0.854 -4 ,18548 ,KEBNE ,17070589,Fri Dec 24 19:46:00 CET,Fri Dec 24 21:57:11 CET,0.0 0.486 0.792 1.0 1.195 1.388 1.561 1.721 2.013 2.144 2.279 2.215 2.657 2.759 2.956 3.159 3.353 3.447 3.63 3.801 4.029 4.178 4.329 4.542 4.747 4.953 5.146 5.327 5.559 5.795 6.025 6.288 6.532 6.767 7.036 7.339 7.63 7.938 8.276 8.639 9.004 9.399 9.855 10.329 10.875 11.449 12.118 12.83 13.568 14.36 15.218 15.722 15.741 15.529 15.197 14.834 14.509 14.185 13.859 13.513 13.2 12.916 12.638 12.345 12.046 11.765 11.467 11.193 10.967 10.736 10.495 10.282 10.036 9.773 9.568 9.351 9.118 8.885 8.644 8.462 8.264 7.954 7.731 7.499 7.382 7.127 6.828 6.497 6.328 5.844 5.811 5.625 5.425 4.963 4.699 4.414 4.123 3.751 3.263 2.64 0.911 -5 ,20746 ,KEBNE ,17070590,Fri Dec 24 19:47:03 CET,Fri Dec 24 21:57:04 CET,0.0 0.568 0.849 1.082 1.269 1.439 1.608 1.764 2.039 2.166 2.307 2.236 2.659 2.757 2.95 3.138 3.321 3.407 3.566 3.727 3.961 4.106 4.248 4.439 4.619 4.804 4.982 5.148 5.37 5.588 5.798 6.046 6.281 6.515 6.788 7.078 7.332 7.608 7.906 8.225 8.579 8.974 9.428 9.855 10.323 10.859 11.43 12.066 12.818 13.576 14.275 14.482 14.374 14.22 13.931 13.541 13.176 12.837 12.529 12.197 11.837 11.492 11.193 10.924 10.667 10.43 10.182 9.943 9.741 9.515 9.27 9.058 8.83 8.6 8.415 8.221 8.006 7.779 7.547 7.389 7.227 6.961 6.771 6.557 6.444 6.214 5.971 5.721 5.581 5.115 5.097 4.896 4.693 4.307 4.087 3.823 3.507 3.153 2.744 2.172 0.851 -6 ,6747 ,KEBNE ,17070591,Fri Dec 24 19:47:03 CET,Fri Dec 24 21:56:55 CET,0.0 0.737 1.13 1.415 1.645 1.853 2.034 2.211 2.549 2.687 2.807 2.703 3.13 3.228 3.428 3.627 3.804 3.889 4.056 4.214 4.437 4.579 4.722 4.933 5.124 5.307 5.495 5.677 5.904 6.121 6.325 6.562 6.802 7.029 7.282 7.575 7.849 8.151 8.466 8.79 9.133 9.51 9.937 10.368 10.897 11.463 12.089 12.775 13.525 14.331 15.104 15.485 15.438 15.229 14.978 14.643 14.29 13.958 13.638 13.286 12.965 12.654 12.345 12.058 11.785 11.528 11.256 11.001 10.769 10.514 10.256 10.051 9.829 9.587 9.404 9.218 9.016 8.802 8.571 8.419 8.257 7.986 7.799 7.604 7.507 7.305 7.082 6.842 6.71 6.251 6.23 6.059 5.881 5.471 5.243 4.986 4.72 4.434 4.046 3.481 2.43 -7 ,8190 ,KEBNE ,17070592,Fri Dec 24 19:49:08 CET,Fri Dec 24 22:02:04 CET,0.0 0.551 0.836 1.054 1.252 1.438 1.6 1.748 2.039 2.178 2.305 2.214 2.644 2.738 2.924 3.108 3.276 3.353 3.505 3.668 3.913 4.066 4.211 4.416 4.604 4.781 4.956 5.125 5.34 5.55 5.75 5.987 6.215 6.43 6.675 6.948 7.218 7.514 7.831 8.174 8.525 8.898 9.321 9.751 10.268 10.844 11.484 12.155 12.863 13.601 14.324 14.684 14.675 14.487 14.19 13.884 13.566 13.23 12.914 12.568 12.255 11.973 11.694 11.411 11.138 10.889 10.604 10.336 10.121 9.896 9.643 9.44 9.239 9.002 8.801 8.602 8.397 8.175 7.927 7.744 7.568 7.277 7.064 6.851 6.738 6.51 6.251 5.967 5.827 5.365 5.362 5.189 5.007 4.607 4.384 4.134 3.853 3.525 3.131 2.55 1.086 -8 ,6819 ,KEBNE ,17070593,Fri Dec 24 19:49:08 CET,Fri Dec 24 22:01:08 CET,0.0 0.498 0.798 1.029 1.217 1.405 1.579 1.721 1.977 2.1 2.223 2.132 2.563 2.669 2.869 3.052 3.225 3.306 3.457 3.607 3.824 3.961 4.095 4.297 4.494 4.688 4.87 5.04 5.269 5.496 5.708 5.953 6.176 6.392 6.639 6.916 7.184 7.475 7.789 8.13 8.495 8.893 9.351 9.822 10.347 10.883 11.503 12.225 13.061 13.977 14.782 15.086 14.99 14.675 14.328 14.022 13.703 13.344 13.02 12.643 12.314 12.033 11.719 11.393 11.09 10.812 10.497 10.208 9.967 9.727 9.49 9.291 9.064 8.79 8.568 8.339 8.092 7.852 7.595 7.411 7.232 6.957 6.76 6.542 6.424 6.183 5.946 5.693 5.558 5.101 5.097 4.921 4.743 4.374 4.15 3.889 3.582 3.233 2.832 2.294 0.962 -9 ,7548 ,KEBNE ,17070594,Fri Dec 24 20:15:39 CET,Fri Dec 24 22:25:50 CET,0.0 0.411 0.681 0.92 1.126 1.314 1.48 1.626 1.881 2.008 2.13 2.037 2.465 2.567 2.78 2.99 3.172 3.25 3.405 3.553 3.772 3.912 4.05 4.259 4.451 4.624 4.785 4.951 5.165 5.365 5.569 5.818 6.047 6.263 6.506 6.77 7.035 7.327 7.632 7.961 8.319 8.723 9.19 9.647 10.186 10.79 11.482 12.197 12.908 13.659 14.411 14.748 14.676 14.461 14.145 13.766 13.416 13.102 12.808 12.471 12.164 11.885 11.609 11.338 11.073 10.812 10.525 10.273 10.038 9.774 9.516 9.32 9.122 8.902 8.732 8.551 8.353 8.148 7.911 7.733 7.545 7.261 7.058 6.842 6.738 6.514 6.272 6.002 5.855 5.396 5.406 5.245 5.073 4.679 4.452 4.203 3.94 3.63 3.243 2.747 1.617 -10 ,24644 ,KEBNE ,17070595,Fri Dec 24 20:20:56 CET,Fri Dec 24 22:31:02 CET,0.0 0.513 0.839 1.109 1.341 1.54 1.72 1.865 2.138 2.269 2.398 2.339 2.805 2.932 3.14 3.337 3.525 3.61 3.772 3.922 4.147 4.291 4.432 4.635 4.824 5.005 5.178 5.346 5.574 5.796 6.004 6.252 6.49 6.716 6.957 7.211 7.464 7.75 8.051 8.396 8.77 9.146 9.571 10.023 10.572 11.128 11.715 12.427 13.245 14.085 14.837 15.13 15.11 14.947 14.716 14.43 14.108 13.775 13.471 13.135 12.807 12.509 12.239 11.985 11.73 11.493 11.234 10.973 10.74 10.501 10.254 10.055 9.832 9.583 9.395 9.19 8.98 8.766 8.522 8.353 8.166 7.866 7.677 7.474 7.363 7.137 6.9 6.609 6.442 5.968 5.957 5.765 5.563 5.133 4.888 4.636 4.371 4.035 3.603 3.031 1.635 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1oi9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1oi9.txt deleted file mode 100644 index 738a421a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1oi9.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18944 ,TETRA ,17590484,Sat Nov 27 21:05:43 CET,Sun Nov 28 00:07:50 CET,0.0 0.588 1.091 1.449 1.747 1.981 2.142 2.284 2.556 2.683 2.794 2.683 3.107 3.197 3.364 3.518 3.657 3.726 3.854 3.972 4.151 4.266 4.374 4.539 4.697 4.843 4.984 5.111 5.264 5.411 5.564 5.745 5.907 6.051 6.215 6.403 6.591 6.791 6.982 7.174 7.387 7.629 7.862 8.047 8.231 8.417 8.604 8.74 8.807 8.694 7.912 6.449 5.224 4.233 3.193 2.164 1.298 0.515 -0.235 -1.005 -1.659 -2.26 -2.817 -3.33 -3.798 -4.221 -4.668 -5.081 -5.456 -5.857 -6.27 -6.622 -6.987 -7.356 -7.642 -7.947 -8.264 -8.581 -8.908 -9.13 -9.365 -9.747 -10.011 -10.293 -10.444 -10.755 -11.078 -11.43 -11.618 -12.163 -12.276 -12.494 -12.729 -13.261 -13.551 -13.863 -14.2 -14.558 -14.998 -15.522 -16.598 -2 ,32271 ,TETRA ,17590485,Sat Nov 27 21:05:43 CET,Sun Nov 28 00:08:46 CET,0.0 0.51 0.848 1.142 1.393 1.601 1.791 1.966 2.271 2.41 2.538 2.454 2.892 3.0 3.189 3.349 3.504 3.583 3.744 3.898 4.103 4.237 4.368 4.551 4.726 4.888 5.037 5.173 5.327 5.465 5.595 5.751 5.897 6.029 6.179 6.353 6.52 6.693 6.863 7.049 7.251 7.457 7.68 7.877 8.062 8.253 8.438 8.558 8.563 8.362 7.551 6.25 4.975 3.716 2.589 1.525 0.594 -0.242 -0.986 -1.73 -2.342 -2.862 -3.371 -3.894 -4.383 -4.839 -5.311 -5.704 -6.028 -6.365 -6.729 -7.062 -7.412 -7.75 -8.011 -8.274 -8.545 -8.825 -9.117 -9.318 -9.528 -9.888 -10.158 -10.447 -10.591 -10.878 -11.188 -11.52 -11.688 -12.208 -12.255 -12.446 -12.662 -13.124 -13.383 -13.655 -13.968 -14.349 -14.8 -15.422 -17.071 -3 ,24501 ,TETRA ,17590486,Sat Nov 27 21:05:43 CET,Sun Nov 28 00:06:37 CET,0.0 0.528 0.812 1.054 1.229 1.377 1.534 1.678 1.93 2.051 2.165 2.047 2.448 2.524 2.698 2.867 3.011 3.079 3.214 3.344 3.526 3.639 3.746 3.902 4.049 4.196 4.354 4.51 4.691 4.856 5.015 5.202 5.364 5.511 5.68 5.858 6.025 6.209 6.39 6.566 6.751 6.965 7.202 7.418 7.628 7.814 7.997 8.137 8.188 8.069 7.547 6.565 5.651 4.771 3.926 3.074 2.285 1.594 1.027 0.484 -0.014 -0.468 -0.913 -1.349 -1.753 -2.145 -2.563 -2.942 -3.278 -3.606 -3.953 -4.255 -4.576 -4.919 -5.189 -5.48 -5.785 -6.085 -6.393 -6.612 -6.847 -7.242 -7.526 -7.806 -7.947 -8.267 -8.617 -8.971 -9.151 -9.673 -9.72 -9.917 -10.136 -10.645 -10.915 -11.241 -11.59 -11.933 -12.38 -12.974 -14.08 -4 ,587 ,TETRA ,17590487,Sat Nov 27 21:05:43 CET,Sun Nov 28 00:01:14 CET,0.0 0.508 0.819 1.064 1.272 1.455 1.613 1.764 2.027 2.147 2.27 2.178 2.606 2.705 2.869 3.007 3.151 3.223 3.354 3.481 3.663 3.781 3.896 4.049 4.189 4.317 4.442 4.565 4.723 4.874 5.018 5.185 5.345 5.493 5.657 5.848 6.058 6.324 6.564 6.772 7.017 7.296 7.559 7.76 7.975 8.181 8.356 8.47 8.5 8.349 7.763 6.577 5.417 4.369 3.382 2.448 1.592 0.779 0.066 -0.662 -1.254 -1.749 -2.256 -2.777 -3.25 -3.664 -4.09 -4.477 -4.812 -5.151 -5.509 -5.818 -6.147 -6.486 -6.742 -7.015 -7.315 -7.624 -7.93 -8.151 -8.397 -8.772 -9.025 -9.286 -9.421 -9.7 -9.978 -10.278 -10.446 -10.957 -11.009 -11.214 -11.43 -11.938 -12.22 -12.501 -12.822 -13.199 -13.631 -14.202 -15.957 -5 ,6567 ,TETRA ,17590488,Sat Nov 27 21:05:45 CET,Sun Nov 28 00:08:01 CET,0.0 0.539 0.844 1.054 1.238 1.405 1.558 1.699 1.956 2.073 2.18 2.057 2.485 2.595 2.771 2.916 3.062 3.134 3.271 3.403 3.596 3.726 3.853 4.031 4.193 4.337 4.467 4.59 4.742 4.889 5.037 5.21 5.368 5.512 5.676 5.862 6.031 6.22 6.412 6.605 6.799 6.996 7.221 7.448 7.771 8.145 8.465 8.686 8.751 8.546 7.574 6.086 4.83 3.656 2.654 1.774 0.987 0.224 -0.45 -1.127 -1.714 -2.242 -2.747 -3.226 -3.687 -4.118 -4.573 -4.98 -5.338 -5.73 -6.144 -6.482 -6.833 -7.204 -7.504 -7.827 -8.166 -8.506 -8.845 -9.082 -9.317 -9.671 -9.945 -10.238 -10.379 -10.67 -10.998 -11.353 -11.531 -12.055 -12.156 -12.382 -12.591 -13.011 -13.26 -13.57 -13.912 -14.277 -14.743 -15.329 -16.992 -6 ,18586 ,TETRA ,17590489,Sat Nov 27 21:05:43 CET,Sun Nov 28 00:07:54 CET,0.0 0.552 0.848 1.079 1.275 1.445 1.598 1.737 2.005 2.125 2.23 2.092 2.496 2.575 2.731 2.878 3.032 3.106 3.236 3.362 3.536 3.647 3.763 3.93 4.071 4.194 4.314 4.436 4.598 4.755 4.903 5.071 5.226 5.373 5.544 5.745 5.94 6.142 6.354 6.562 6.775 7.013 7.315 7.609 7.884 8.162 8.403 8.549 8.636 8.566 8.017 6.938 5.788 4.637 3.601 2.601 1.612 0.686 -0.117 -0.917 -1.558 -2.089 -2.6 -3.111 -3.601 -4.025 -4.463 -4.852 -5.185 -5.548 -5.931 -6.262 -6.639 -7.024 -7.324 -7.624 -7.906 -8.196 -8.512 -8.749 -9.001 -9.379 -9.629 -9.905 -10.062 -10.371 -10.67 -10.996 -11.171 -11.699 -11.779 -12.0 -12.214 -12.704 -13.001 -13.317 -13.637 -14.0 -14.502 -15.142 -16.861 -7 ,2507 ,TETRA ,17590490,Sat Nov 27 21:06:42 CET,Sun Nov 28 00:07:20 CET,0.0 0.579 0.921 1.171 1.361 1.524 1.688 1.853 2.119 2.24 2.359 2.256 2.687 2.786 2.957 3.117 3.273 3.344 3.475 3.596 3.765 3.871 3.981 4.144 4.288 4.419 4.556 4.698 4.861 4.997 5.126 5.289 5.451 5.61 5.782 5.955 6.116 6.284 6.463 6.653 6.832 7.025 7.236 7.418 7.614 7.817 8.0 8.132 8.14 7.946 7.135 5.799 4.666 3.652 2.7 1.744 0.872 0.1 -0.584 -1.321 -1.989 -2.585 -3.146 -3.646 -4.102 -4.531 -4.975 -5.399 -5.773 -6.154 -6.543 -6.869 -7.209 -7.562 -7.841 -8.12 -8.423 -8.747 -9.09 -9.327 -9.57 -9.955 -10.224 -10.497 -10.634 -10.925 -11.25 -11.613 -11.803 -12.339 -12.439 -12.66 -12.872 -13.379 -13.669 -13.987 -14.363 -14.78 -15.218 -15.861 -17.636 -8 ,13409 ,TETRA ,17590491,Sat Nov 27 21:05:43 CET,Sun Nov 28 00:07:01 CET,0.0 0.603 0.897 1.109 1.31 1.49 1.643 1.78 2.05 2.186 2.307 2.2 2.626 2.726 2.913 3.089 3.264 3.35 3.508 3.666 3.895 4.035 4.169 4.353 4.518 4.678 4.831 4.973 5.153 5.317 5.481 5.671 5.839 6.009 6.21 6.435 6.628 6.829 7.058 7.284 7.518 7.788 8.064 8.28 8.503 8.728 8.881 8.957 9.01 8.942 8.587 7.781 6.815 5.927 5.14 4.281 3.422 2.618 1.914 1.211 0.568 -0.015 -0.584 -1.144 -1.635 -2.069 -2.538 -2.954 -3.315 -3.705 -4.095 -4.418 -4.778 -5.153 -5.429 -5.709 -6.012 -6.334 -6.649 -6.87 -7.114 -7.473 -7.711 -7.966 -8.096 -8.367 -8.687 -9.049 -9.238 -9.776 -9.846 -10.051 -10.263 -10.768 -11.059 -11.348 -11.659 -12.014 -12.466 -13.074 -14.326 -9 ,8496 ,TETRA ,17590492,Sat Nov 27 21:05:43 CET,Sun Nov 28 00:03:12 CET,0.0 0.522 0.809 1.039 1.216 1.355 1.483 1.629 1.907 2.021 2.122 1.983 2.402 2.493 2.655 2.803 2.946 3.018 3.165 3.305 3.495 3.6 3.703 3.857 4.003 4.138 4.264 4.385 4.534 4.668 4.8 4.966 5.121 5.274 5.438 5.616 5.804 6.02 6.225 6.436 6.633 6.813 7.03 7.262 7.516 7.737 7.948 8.131 8.2 8.043 7.255 5.918 4.712 3.556 2.55 1.611 0.757 0.003 -0.651 -1.325 -1.912 -2.477 -3.015 -3.492 -3.932 -4.339 -4.796 -5.231 -5.599 -5.975 -6.399 -6.75 -7.111 -7.51 -7.812 -8.102 -8.385 -8.682 -9.005 -9.236 -9.455 -9.774 -9.997 -10.23 -10.36 -10.638 -10.948 -11.275 -11.435 -11.931 -11.965 -12.169 -12.374 -12.845 -13.116 -13.407 -13.724 -14.065 -14.488 -15.053 -16.124 -10 ,14403 ,TETRA ,17590493,Sat Nov 27 21:06:42 CET,Sun Nov 28 00:08:02 CET,0.0 0.422 0.693 0.913 1.128 1.324 1.492 1.641 1.89 2.001 2.11 1.991 2.412 2.501 2.654 2.8 2.947 3.017 3.146 3.268 3.435 3.541 3.648 3.8 3.945 4.075 4.201 4.32 4.47 4.618 4.758 4.931 5.094 5.242 5.407 5.577 5.745 5.93 6.11 6.291 6.462 6.647 6.848 7.035 7.242 7.456 7.642 7.773 7.83 7.657 7.118 6.219 5.275 4.398 3.587 2.814 2.126 1.502 0.934 0.349 -0.162 -0.639 -1.084 -1.499 -1.88 -2.239 -2.632 -2.977 -3.307 -3.661 -3.999 -4.285 -4.601 -4.958 -5.219 -5.462 -5.73 -6.018 -6.306 -6.51 -6.742 -7.108 -7.362 -7.634 -7.778 -8.1 -8.43 -8.771 -8.955 -9.475 -9.519 -9.724 -9.953 -10.476 -10.756 -11.039 -11.369 -11.807 -12.319 -12.946 -14.56 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_26_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_26_21.txt deleted file mode 100644 index b8246424..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_26_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10765 ,TETRA ,17590494,Sat Nov 27 21:06:43 CET,Sun Nov 28 00:07:41 CET,0.0 0.978 1.392 1.719 1.999 2.229 2.44 2.648 2.982 3.13 3.283 3.246 3.697 3.813 4.035 4.241 4.429 4.525 4.7 4.85 5.065 5.203 5.335 5.521 5.709 5.887 6.044 6.187 6.365 6.538 6.706 6.913 7.109 7.287 7.472 7.671 7.861 8.06 8.254 8.43 8.6 8.778 8.958 9.102 9.205 9.278 9.283 9.141 8.799 8.121 6.767 4.899 3.258 1.853 0.632 -0.438 -1.396 -2.269 -3.004 -3.735 -4.366 -4.932 -5.475 -6.003 -6.476 -6.889 -7.323 -7.719 -8.061 -8.422 -8.8 -9.098 -9.393 -9.703 -9.943 -10.194 -10.448 -10.711 -11.003 -11.213 -11.43 -11.747 -11.968 -12.207 -12.323 -12.566 -12.844 -13.126 -13.265 -13.749 -13.73 -13.914 -14.103 -14.483 -14.7 -14.933 -15.173 -15.456 -15.791 -16.172 -16.843 -2 ,17731 ,TETRA ,17590495,Sat Nov 27 21:06:43 CET,Sun Nov 28 00:07:32 CET,0.0 0.803 1.301 1.682 1.961 2.201 2.427 2.638 3.073 3.274 3.448 3.45 3.911 4.035 4.272 4.523 4.761 4.86 5.046 5.224 5.473 5.63 5.769 5.966 6.16 6.354 6.545 6.739 6.985 7.198 7.397 7.616 7.804 8.0 8.239 8.468 8.659 8.859 9.059 9.254 9.429 9.611 9.821 9.997 10.144 10.217 10.188 10.057 9.74 9.076 7.728 5.841 4.226 2.863 1.664 0.575 -0.401 -1.305 -2.053 -2.756 -3.367 -3.926 -4.434 -4.893 -5.346 -5.764 -6.171 -6.539 -6.883 -7.224 -7.561 -7.852 -8.152 -8.458 -8.698 -8.95 -9.205 -9.457 -9.729 -9.929 -10.138 -10.477 -10.714 -10.951 -11.078 -11.342 -11.61 -11.886 -12.029 -12.52 -12.478 -12.637 -12.814 -13.232 -13.464 -13.718 -13.987 -14.277 -14.611 -15.016 -15.982 -3 ,21511 ,TETRA ,17590496,Sat Nov 27 21:06:42 CET,Sun Nov 28 00:07:10 CET,0.0 1.24 1.738 2.155 2.544 2.885 3.109 3.286 3.604 3.75 3.889 3.831 4.268 4.382 4.61 4.82 5.015 5.104 5.276 5.454 5.705 5.847 5.987 6.187 6.362 6.542 6.706 6.845 7.031 7.217 7.389 7.587 7.766 7.924 8.097 8.291 8.494 8.714 8.938 9.15 9.338 9.524 9.69 9.806 9.923 10.002 10.049 9.96 9.623 8.93 7.417 5.41 3.678 2.203 0.94 -0.143 -1.108 -2.067 -2.903 -3.68 -4.308 -4.849 -5.365 -5.864 -6.34 -6.77 -7.214 -7.619 -7.971 -8.336 -8.703 -9.021 -9.355 -9.68 -9.926 -10.185 -10.458 -10.737 -11.025 -11.227 -11.428 -11.739 -11.967 -12.214 -12.338 -12.581 -12.852 -13.181 -13.346 -13.844 -13.821 -13.981 -14.156 -14.567 -14.793 -15.023 -15.28 -15.553 -15.869 -16.335 -17.228 -4 ,6668 ,TETRA ,17590497,Sat Nov 27 21:06:43 CET,Sun Nov 28 00:01:21 CET,0.0 1.553 2.172 2.653 3.013 3.29 3.586 3.864 4.281 4.447 4.608 4.575 5.028 5.153 5.414 5.663 5.878 5.976 6.174 6.382 6.65 6.799 6.958 7.182 7.38 7.588 7.794 7.989 8.224 8.428 8.629 8.85 9.048 9.249 9.491 9.752 9.985 10.211 10.431 10.657 10.892 11.139 11.367 11.543 11.7 11.809 11.898 11.903 11.67 11.042 9.701 7.896 6.385 5.013 3.74 2.626 1.647 0.756 0.04 -0.676 -1.337 -1.943 -2.519 -3.036 -3.514 -3.969 -4.453 -4.887 -5.246 -5.607 -5.975 -6.27 -6.589 -6.931 -7.202 -7.493 -7.791 -8.094 -8.405 -8.621 -8.843 -9.166 -9.404 -9.664 -9.788 -10.043 -10.332 -10.642 -10.8 -11.305 -11.319 -11.512 -11.708 -12.127 -12.341 -12.56 -12.819 -13.156 -13.626 -14.149 -15.192 -5 ,2049 ,TETRA ,17590498,Sat Nov 27 21:06:43 CET,Sun Nov 28 00:15:39 CET,0.0 2.08 2.67 3.06 3.378 3.683 3.942 4.167 4.552 4.72 4.876 4.833 5.293 5.424 5.669 5.912 6.116 6.205 6.392 6.583 6.85 7.018 7.174 7.385 7.583 7.771 7.951 8.116 8.317 8.506 8.686 8.898 9.089 9.268 9.454 9.664 9.875 10.098 10.321 10.526 10.724 10.918 11.099 11.278 11.491 11.684 11.766 11.717 11.519 10.982 9.693 7.853 6.252 4.922 3.728 2.651 1.744 0.917 0.169 -0.577 -1.198 -1.753 -2.267 -2.747 -3.188 -3.586 -4.017 -4.409 -4.738 -5.076 -5.421 -5.699 -5.994 -6.303 -6.552 -6.814 -7.081 -7.363 -7.668 -7.871 -8.072 -8.384 -8.601 -8.835 -8.957 -9.216 -9.489 -9.777 -9.933 -10.429 -10.412 -10.591 -10.778 -11.165 -11.377 -11.606 -11.858 -12.148 -12.497 -12.964 -13.824 -6 ,2420 ,TETRA ,17590499,Sat Nov 27 21:06:43 CET,Sun Nov 28 00:04:55 CET,0.0 2.128 2.634 2.988 3.274 3.552 3.848 4.114 4.611 4.847 5.038 5.054 5.54 5.683 5.92 6.153 6.372 6.477 6.684 6.875 7.137 7.296 7.442 7.64 7.839 8.032 8.198 8.341 8.541 8.735 8.913 9.133 9.345 9.55 9.777 10.003 10.209 10.465 10.706 10.919 11.123 11.315 11.515 11.674 11.833 11.942 11.938 11.798 11.447 10.669 9.107 7.108 5.464 4.039 2.819 1.697 0.705 -0.153 -0.888 -1.618 -2.262 -2.829 -3.366 -3.873 -4.329 -4.753 -5.197 -5.593 -5.922 -6.254 -6.613 -6.909 -7.235 -7.592 -7.871 -8.142 -8.402 -8.663 -8.94 -9.136 -9.321 -9.611 -9.833 -10.07 -10.192 -10.451 -10.723 -11.01 -11.163 -11.66 -11.655 -11.845 -12.035 -12.431 -12.654 -12.901 -13.188 -13.48 -13.803 -14.253 -15.315 -7 ,22842 ,TETRA ,17590500,Sat Nov 27 21:07:42 CET,Sun Nov 28 00:10:48 CET,0.0 1.538 2.044 2.42 2.772 3.062 3.283 3.505 3.901 4.082 4.272 4.316 4.792 4.935 5.218 5.475 5.698 5.801 5.998 6.186 6.455 6.624 6.781 7.006 7.219 7.43 7.617 7.795 8.02 8.205 8.389 8.608 8.799 8.989 9.208 9.444 9.661 9.896 10.134 10.383 10.639 10.883 11.152 11.395 11.595 11.754 11.829 11.716 11.34 10.544 9.036 7.147 5.518 4.158 2.997 1.965 1.003 0.101 -0.65 -1.394 -2.025 -2.575 -3.095 -3.584 -4.028 -4.444 -4.89 -5.299 -5.645 -6.002 -6.376 -6.681 -6.987 -7.298 -7.548 -7.801 -8.052 -8.311 -8.577 -8.771 -8.983 -9.305 -9.524 -9.744 -9.859 -10.104 -10.361 -10.633 -10.768 -11.249 -11.2 -11.358 -11.538 -11.927 -12.136 -12.367 -12.628 -12.926 -13.277 -13.723 -14.668 -8 ,27036 ,TETRA ,17590501,Sat Nov 27 21:07:42 CET,Sun Nov 28 00:10:15 CET,0.0 2.13 2.658 3.031 3.344 3.625 3.875 4.109 4.527 4.721 4.918 4.94 5.425 5.582 5.862 6.14 6.416 6.538 6.751 6.944 7.209 7.373 7.529 7.761 7.974 8.154 8.327 8.496 8.713 8.918 9.107 9.337 9.557 9.761 9.988 10.225 10.422 10.637 10.883 11.123 11.361 11.589 11.808 12.016 12.228 12.344 12.305 12.166 11.85 11.15 9.659 7.665 5.957 4.503 3.257 2.165 1.148 0.181 -0.579 -1.302 -1.969 -2.558 -3.098 -3.596 -4.051 -4.472 -4.908 -5.288 -5.617 -5.988 -6.372 -6.671 -6.983 -7.316 -7.569 -7.837 -8.121 -8.39 -8.66 -8.862 -9.08 -9.404 -9.632 -9.875 -9.994 -10.23 -10.481 -10.754 -10.908 -11.414 -11.412 -11.592 -11.78 -12.221 -12.475 -12.745 -13.015 -13.336 -13.736 -14.283 -15.295 -9 ,18850 ,TETRA ,17590502,Sat Nov 27 21:07:42 CET,Sun Nov 28 00:07:41 CET,0.0 1.975 2.557 2.972 3.309 3.592 3.832 4.042 4.39 4.563 4.748 4.784 5.263 5.397 5.639 5.877 6.102 6.196 6.373 6.557 6.827 6.994 7.156 7.372 7.568 7.749 7.921 8.082 8.272 8.456 8.634 8.847 9.046 9.223 9.428 9.654 9.855 10.071 10.314 10.55 10.779 11.025 11.271 11.46 11.617 11.743 11.821 11.783 11.544 11.02 9.913 8.094 6.396 4.926 3.631 2.481 1.492 0.605 -0.163 -0.909 -1.535 -2.098 -2.634 -3.134 -3.581 -3.988 -4.417 -4.806 -5.137 -5.478 -5.841 -6.14 -6.439 -6.749 -7.006 -7.277 -7.539 -7.799 -8.057 -8.242 -8.445 -8.759 -8.977 -9.199 -9.318 -9.572 -9.845 -10.137 -10.284 -10.773 -10.769 -10.951 -11.14 -11.548 -11.782 -12.04 -12.314 -12.598 -12.951 -13.405 -14.13 -10 ,21439 ,TETRA ,17590503,Sat Nov 27 21:07:42 CET,Sun Nov 28 00:09:59 CET,0.0 1.586 2.11 2.484 2.805 3.064 3.303 3.524 3.905 4.081 4.24 4.201 4.665 4.799 5.063 5.298 5.508 5.627 5.858 6.049 6.304 6.462 6.596 6.769 6.929 7.093 7.27 7.44 7.647 7.834 8.011 8.24 8.469 8.674 8.909 9.152 9.35 9.56 9.772 9.99 10.224 10.469 10.719 10.914 11.092 11.218 11.235 11.08 10.673 9.929 8.468 6.489 4.804 3.366 2.084 0.91 -0.072 -0.921 -1.679 -2.452 -3.114 -3.706 -4.266 -4.785 -5.26 -5.698 -6.139 -6.527 -6.869 -7.224 -7.602 -7.919 -8.239 -8.565 -8.813 -9.068 -9.341 -9.626 -9.928 -10.136 -10.35 -10.691 -10.924 -11.171 -11.304 -11.571 -11.843 -12.138 -12.291 -12.791 -12.811 -13.012 -13.214 -13.616 -13.846 -14.101 -14.361 -14.645 -14.98 -15.35 -16.316 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_28_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_28_1h1s.txt deleted file mode 100644 index 1d23c72b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_28_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18276 ,TETRA ,17590504,Sat Nov 27 21:07:43 CET,Sun Nov 28 00:10:50 CET,0.0 0.595 0.908 1.137 1.314 1.492 1.649 1.769 1.993 2.09 2.175 1.849 2.41 2.493 2.636 2.76 2.881 2.939 3.036 3.129 3.257 3.325 3.38 3.447 3.513 3.585 3.664 3.739 3.825 3.891 3.942 3.981 3.997 4.008 4.018 4.01 3.967 3.918 3.868 3.802 3.709 3.588 3.374 3.079 2.687 2.144 1.383 0.346 -1.152 -3.404 -7.01 -11.136 -14.428 -17.147 -19.384 -21.279 -22.909 -24.334 -25.529 -26.737 -27.771 -28.694 -29.563 -30.343 -31.055 -31.702 -32.354 -32.934 -33.445 -33.974 -34.529 -34.968 -35.443 -35.971 -36.368 -36.764 -37.17 -37.608 -38.053 -38.366 -38.702 -39.194 -39.552 -39.933 -40.127 -40.507 -40.86 -41.24 -41.449 -42.187 -42.112 -42.359 -42.617 -43.172 -43.469 -43.778 -44.111 -44.519 -45.012 -45.583 -47.1 -2 ,28702 ,TETRA ,17590505,Sat Nov 27 21:08:42 CET,Sun Nov 28 00:11:33 CET,0.0 0.42 0.707 0.961 1.165 1.327 1.467 1.584 1.778 1.874 1.964 1.643 2.198 2.269 2.409 2.524 2.635 2.695 2.804 2.898 3.041 3.12 3.185 3.288 3.381 3.455 3.508 3.557 3.639 3.719 3.786 3.841 3.866 3.882 3.893 3.887 3.875 3.849 3.791 3.71 3.639 3.535 3.306 3.028 2.64 2.115 1.366 0.333 -1.123 -3.332 -6.911 -10.991 -14.15 -16.722 -18.911 -20.79 -22.33 -23.667 -24.842 -26.064 -27.111 -28.013 -28.857 -29.651 -30.358 -30.982 -31.649 -32.248 -32.77 -33.315 -33.875 -34.34 -34.814 -35.293 -35.669 -36.074 -36.481 -36.893 -37.335 -37.629 -37.927 -38.402 -38.74 -39.106 -39.29 -39.668 -40.066 -40.479 -40.693 -41.444 -41.389 -41.639 -41.891 -42.432 -42.729 -43.047 -43.387 -43.746 -44.203 -44.83 -46.355 -3 ,1908 ,TETRA ,17590506,Sat Nov 27 21:07:43 CET,Sun Nov 28 00:08:18 CET,0.0 1.059 1.507 1.831 2.035 2.191 2.315 2.425 2.633 2.74 2.844 2.542 3.095 3.163 3.295 3.419 3.538 3.595 3.696 3.786 3.895 3.954 4.016 4.119 4.207 4.282 4.358 4.428 4.512 4.569 4.608 4.651 4.685 4.715 4.744 4.754 4.757 4.752 4.716 4.637 4.53 4.39 4.172 3.882 3.488 2.943 2.169 1.152 -0.326 -2.536 -6.049 -10.089 -13.359 -16.039 -18.215 -20.071 -21.664 -23.075 -24.278 -25.457 -26.468 -27.402 -28.307 -29.147 -29.929 -30.629 -31.337 -31.983 -32.528 -33.066 -33.648 -34.137 -34.625 -35.128 -35.496 -35.865 -36.247 -36.67 -37.128 -37.427 -37.723 -38.188 -38.513 -38.843 -39.016 -39.361 -39.718 -40.093 -40.284 -41.007 -40.9 -41.11 -41.334 -41.893 -42.192 -42.481 -42.77 -43.095 -43.507 -44.08 -45.798 -4 ,14021 ,TETRA ,17590507,Sat Nov 27 21:07:43 CET,Sun Nov 28 00:13:00 CET,0.0 0.481 0.807 1.031 1.196 1.345 1.484 1.612 1.854 1.958 2.049 1.743 2.291 2.349 2.474 2.589 2.694 2.743 2.836 2.932 3.065 3.132 3.183 3.245 3.304 3.372 3.436 3.505 3.606 3.689 3.765 3.833 3.866 3.899 3.932 3.953 3.952 3.92 3.883 3.819 3.712 3.572 3.366 3.089 2.683 2.133 1.375 0.342 -1.195 -3.456 -7.015 -11.016 -14.157 -16.734 -18.907 -20.808 -22.392 -23.76 -24.892 -26.048 -27.04 -27.896 -28.737 -29.541 -30.27 -30.936 -31.618 -32.215 -32.718 -33.222 -33.763 -34.203 -34.669 -35.19 -35.585 -35.998 -36.415 -36.819 -37.235 -37.524 -37.835 -38.31 -38.638 -38.977 -39.141 -39.477 -39.844 -40.24 -40.452 -41.207 -41.135 -41.377 -41.626 -42.195 -42.511 -42.833 -43.186 -43.589 -44.072 -44.713 -46.372 -5 ,19875 ,TETRA ,17590508,Sat Nov 27 21:07:43 CET,Sun Nov 28 00:14:55 CET,0.0 0.475 0.748 0.952 1.133 1.278 1.413 1.545 1.773 1.864 1.959 1.647 2.207 2.283 2.415 2.537 2.633 2.677 2.769 2.854 2.979 3.051 3.118 3.212 3.295 3.363 3.42 3.475 3.543 3.609 3.665 3.727 3.778 3.809 3.829 3.837 3.832 3.807 3.758 3.683 3.576 3.419 3.194 2.918 2.512 1.97 1.231 0.193 -1.33 -3.563 -7.119 -11.134 -14.266 -16.839 -19.075 -21.128 -22.787 -24.137 -25.379 -26.652 -27.71 -28.648 -29.519 -30.342 -31.105 -31.783 -32.477 -33.072 -33.591 -34.137 -34.699 -35.164 -35.64 -36.128 -36.504 -36.874 -37.238 -37.631 -38.039 -38.312 -38.598 -39.023 -39.32 -39.65 -39.821 -40.188 -40.598 -41.013 -41.218 -41.968 -41.891 -42.124 -42.381 -42.894 -43.171 -43.493 -43.838 -44.237 -44.708 -45.32 -47.758 -6 ,29603 ,TETRA ,17590509,Sat Nov 27 21:09:42 CET,Sun Nov 28 00:14:30 CET,0.0 0.349 0.576 0.775 0.937 1.08 1.226 1.367 1.589 1.687 1.769 1.424 1.976 2.05 2.192 2.313 2.421 2.468 2.547 2.635 2.774 2.855 2.914 2.994 3.083 3.173 3.256 3.324 3.414 3.505 3.574 3.626 3.665 3.686 3.688 3.688 3.687 3.649 3.578 3.487 3.373 3.219 2.985 2.682 2.273 1.736 0.97 -0.071 -1.543 -3.731 -7.328 -11.457 -14.619 -17.188 -19.314 -21.146 -22.714 -24.115 -25.356 -26.603 -27.667 -28.547 -29.366 -30.128 -30.8 -31.447 -32.133 -32.733 -33.255 -33.808 -34.37 -34.827 -35.292 -35.763 -36.125 -36.49 -36.842 -37.205 -37.635 -37.951 -38.269 -38.75 -39.095 -39.45 -39.617 -39.937 -40.258 -40.606 -40.82 -41.578 -41.522 -41.782 -42.041 -42.653 -42.989 -43.315 -43.661 -44.039 -44.471 -44.995 -46.268 -7 ,30369 ,TETRA ,17590510,Sat Nov 27 21:08:42 CET,Sun Nov 28 00:09:15 CET,0.0 0.571 0.844 1.041 1.214 1.352 1.494 1.64 1.858 1.96 2.053 1.739 2.306 2.381 2.523 2.657 2.767 2.821 2.928 3.02 3.131 3.194 3.25 3.339 3.425 3.509 3.587 3.646 3.721 3.786 3.837 3.894 3.946 3.989 4.017 4.026 4.041 4.041 3.995 3.934 3.854 3.721 3.507 3.229 2.811 2.266 1.543 0.517 -0.982 -3.176 -6.753 -10.732 -13.781 -16.366 -18.525 -20.338 -21.879 -23.276 -24.492 -25.697 -26.704 -27.579 -28.416 -29.216 -29.952 -30.626 -31.31 -31.861 -32.32 -32.826 -33.38 -33.824 -34.291 -34.799 -35.169 -35.528 -35.895 -36.283 -36.701 -36.99 -37.277 -37.695 -37.996 -38.33 -38.496 -38.835 -39.2 -39.584 -39.791 -40.54 -40.463 -40.691 -40.921 -41.475 -41.776 -42.069 -42.403 -42.806 -43.267 -43.792 -45.532 -8 ,32162 ,TETRA ,17590511,Sat Nov 27 21:08:43 CET,Sun Nov 28 00:04:15 CET,0.0 0.526 0.744 0.915 1.074 1.21 1.338 1.481 1.743 1.864 1.968 1.651 2.211 2.282 2.41 2.537 2.659 2.714 2.809 2.892 3.002 3.074 3.145 3.246 3.344 3.438 3.532 3.603 3.686 3.759 3.802 3.866 3.922 3.95 3.988 4.02 4.014 4.001 3.965 3.884 3.782 3.62 3.38 3.099 2.703 2.136 1.357 0.319 -1.186 -3.404 -6.889 -10.865 -14.268 -16.988 -19.096 -20.957 -22.545 -23.915 -25.035 -26.106 -27.065 -27.941 -28.763 -29.551 -30.272 -30.897 -31.527 -32.153 -32.708 -33.23 -33.772 -34.213 -34.656 -35.13 -35.511 -35.927 -36.367 -36.825 -37.284 -37.598 -37.936 -38.441 -38.786 -39.133 -39.309 -39.699 -40.108 -40.527 -40.734 -41.479 -41.415 -41.671 -41.945 -42.526 -42.846 -43.187 -43.555 -43.956 -44.405 -45.008 -46.833 -9 ,17078 ,TETRA ,17590512,Sat Nov 27 21:08:43 CET,Sun Nov 28 00:13:47 CET,0.0 0.492 0.798 1.015 1.198 1.369 1.51 1.627 1.846 1.942 2.03 1.746 2.307 2.374 2.509 2.636 2.756 2.803 2.889 2.975 3.095 3.174 3.239 3.329 3.414 3.483 3.55 3.614 3.674 3.725 3.784 3.84 3.871 3.887 3.905 3.906 3.877 3.845 3.797 3.728 3.636 3.47 3.214 2.935 2.556 2.037 1.322 0.343 -1.089 -3.218 -6.665 -10.675 -13.837 -16.461 -18.667 -20.582 -22.23 -23.668 -24.87 -26.077 -27.108 -28.038 -28.926 -29.739 -30.475 -31.15 -31.847 -32.416 -32.909 -33.459 -34.035 -34.527 -35.037 -35.547 -35.939 -36.345 -36.778 -37.209 -37.613 -37.899 -38.214 -38.723 -39.059 -39.4 -39.577 -39.921 -40.265 -40.639 -40.847 -41.599 -41.522 -41.753 -41.999 -42.522 -42.813 -43.142 -43.5 -43.889 -44.402 -45.112 -46.935 -10 ,18358 ,TETRA ,17590513,Sat Nov 27 21:08:43 CET,Sun Nov 28 00:07:38 CET,0.0 0.59 0.865 1.079 1.256 1.394 1.535 1.667 1.906 2.017 2.118 1.825 2.385 2.464 2.621 2.742 2.854 2.915 3.013 3.077 3.167 3.233 3.306 3.417 3.517 3.597 3.665 3.721 3.778 3.826 3.873 3.93 3.972 4.007 4.026 4.036 4.047 4.02 3.959 3.873 3.78 3.647 3.428 3.16 2.784 2.278 1.561 0.585 -0.847 -3.104 -6.754 -10.87 -14.134 -16.803 -18.978 -20.829 -22.42 -23.818 -24.966 -26.151 -27.208 -28.104 -28.93 -29.686 -30.388 -31.053 -31.72 -32.294 -32.76 -33.284 -33.898 -34.406 -34.913 -35.411 -35.803 -36.218 -36.607 -36.973 -37.376 -37.653 -37.933 -38.383 -38.71 -39.062 -39.223 -39.53 -39.858 -40.208 -40.412 -41.152 -41.028 -41.239 -41.477 -41.998 -42.258 -42.53 -42.856 -43.238 -43.674 -44.181 -45.774 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_28_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_28_30.txt deleted file mode 100644 index f9fc3337..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_28_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29026 ,TETRA ,17590514,Sat Nov 27 21:08:43 CET,Sun Nov 28 00:10:42 CET,0.0 0.765 1.176 1.525 1.837 2.112 2.363 2.605 3.049 3.243 3.425 3.287 3.942 4.124 4.468 4.773 5.075 5.222 5.505 5.788 6.199 6.471 6.733 7.115 7.504 7.886 8.259 8.621 9.08 9.521 9.964 10.53 11.068 11.572 12.171 12.862 13.537 14.299 15.125 16.007 16.966 18.064 19.404 20.817 22.469 24.303 26.533 29.17 32.351 36.286 41.391 46.002 48.932 50.996 52.498 53.59 54.348 54.91 55.319 55.655 55.924 56.136 56.285 56.41 56.511 56.575 56.619 56.656 56.684 56.686 56.66 56.635 56.601 56.564 56.538 56.505 56.428 56.301 56.149 56.037 55.907 55.7 55.553 55.389 55.294 55.084 54.88 54.657 54.53 53.974 54.104 53.951 53.776 53.357 53.125 52.863 52.565 52.208 51.75 51.196 49.789 -2 ,21115 ,TETRA ,17590515,Sat Nov 27 21:08:43 CET,Sun Nov 28 00:11:46 CET,0.0 0.751 1.134 1.462 1.761 2.043 2.292 2.527 2.952 3.148 3.345 3.229 3.878 4.058 4.403 4.716 5.022 5.174 5.465 5.745 6.153 6.423 6.703 7.111 7.495 7.864 8.207 8.546 8.989 9.426 9.861 10.374 10.874 11.367 11.959 12.638 13.282 14.025 14.853 15.733 16.684 17.782 19.091 20.395 21.959 23.796 25.925 28.386 31.427 35.203 40.075 44.54 47.392 49.297 50.609 51.61 52.378 52.935 53.328 53.709 54.008 54.213 54.371 54.493 54.588 54.658 54.714 54.744 54.756 54.768 54.776 54.762 54.742 54.721 54.7 54.668 54.625 54.578 54.518 54.466 54.406 54.312 54.237 54.151 54.1 53.99 53.887 53.765 53.691 53.193 53.458 53.379 53.284 53.068 52.931 52.767 52.601 52.417 52.185 51.903 50.854 -3 ,7971 ,TETRA ,17590516,Sat Nov 27 21:08:43 CET,Sun Nov 28 00:13:34 CET,0.0 0.567 0.913 1.234 1.508 1.751 1.991 2.216 2.616 2.796 2.995 2.904 3.558 3.723 4.057 4.376 4.671 4.818 5.113 5.395 5.8 6.062 6.326 6.73 7.124 7.512 7.887 8.24 8.699 9.156 9.599 10.117 10.621 11.138 11.743 12.419 13.09 13.841 14.664 15.547 16.481 17.575 18.926 20.298 21.901 23.754 25.969 28.562 31.633 35.398 40.508 45.194 48.126 50.168 51.642 52.734 53.54 54.187 54.67 55.077 55.37 55.579 55.777 55.944 56.046 56.125 56.198 56.233 56.238 56.242 56.251 56.25 56.24 56.232 56.204 56.15 56.095 56.043 55.977 55.918 55.835 55.711 55.636 55.533 55.477 55.372 55.261 55.13 55.055 54.563 54.806 54.704 54.595 54.342 54.206 54.063 53.897 53.716 53.475 53.14 52.061 -4 ,3083 ,TETRA ,17590517,Sat Nov 27 21:08:42 CET,Sun Nov 28 00:08:59 CET,0.0 0.776 1.18 1.497 1.771 2.016 2.235 2.439 2.84 3.036 3.227 3.085 3.728 3.893 4.214 4.521 4.813 4.957 5.255 5.54 5.935 6.195 6.459 6.848 7.231 7.599 7.965 8.324 8.77 9.207 9.636 10.156 10.671 11.184 11.802 12.499 13.174 13.942 14.765 15.651 16.62 17.715 19.026 20.379 21.992 23.839 26.02 28.59 31.727 35.532 40.546 45.172 48.065 50.045 51.499 52.594 53.402 54.014 54.475 54.916 55.232 55.438 55.617 55.764 55.875 55.95 55.993 56.014 56.02 56.026 56.026 56.016 55.999 55.966 55.942 55.894 55.826 55.758 55.666 55.596 55.528 55.414 55.334 55.244 55.189 55.079 54.947 54.789 54.71 54.201 54.416 54.3 54.187 53.973 53.84 53.684 53.523 53.333 53.068 52.723 51.571 -5 ,28634 ,TETRA ,17590518,Sat Nov 27 21:08:44 CET,Sun Nov 28 00:08:51 CET,0.0 0.746 1.135 1.477 1.768 2.018 2.259 2.476 2.875 3.07 3.26 3.145 3.798 3.958 4.269 4.575 4.867 5.006 5.28 5.559 5.968 6.228 6.475 6.839 7.194 7.542 7.891 8.227 8.669 9.107 9.528 10.031 10.54 11.05 11.638 12.303 12.947 13.675 14.491 15.372 16.333 17.457 18.784 20.125 21.73 23.584 25.766 28.357 31.525 35.422 40.519 45.064 47.943 49.919 51.37 52.451 53.216 53.808 54.238 54.626 54.897 55.086 55.262 55.398 55.484 55.543 55.602 55.632 55.644 55.641 55.637 55.632 55.593 55.553 55.529 55.482 55.421 55.347 55.261 55.195 55.114 54.991 54.901 54.81 54.761 54.653 54.537 54.394 54.314 53.819 54.062 53.97 53.878 53.65 53.508 53.355 53.177 52.969 52.717 52.384 51.504 -6 ,14584 ,TETRA ,17590519,Sat Nov 27 21:08:43 CET,Sun Nov 28 00:11:01 CET,0.0 0.702 1.092 1.426 1.732 2.018 2.29 2.529 2.977 3.203 3.409 3.295 3.957 4.138 4.486 4.787 5.072 5.222 5.525 5.816 6.228 6.5 6.764 7.149 7.527 7.888 8.238 8.578 9.036 9.488 9.925 10.466 10.99 11.497 12.102 12.771 13.412 14.151 14.949 15.812 16.737 17.786 19.064 20.421 22.043 23.886 26.079 28.674 31.876 35.865 41.1 45.71 48.659 50.745 52.209 53.279 54.093 54.739 55.211 55.61 55.907 56.135 56.315 56.462 56.564 56.634 56.715 56.764 56.79 56.803 56.79 56.775 56.758 56.735 56.706 56.669 56.619 56.566 56.501 56.44 56.381 56.289 56.223 56.153 56.109 56.007 55.889 55.775 55.716 55.229 55.485 55.382 55.266 54.995 54.845 54.702 54.544 54.347 54.092 53.777 52.706 -7 ,3141 ,TETRA ,17590520,Sat Nov 27 21:08:46 CET,Sun Nov 28 00:11:00 CET,0.0 0.786 1.162 1.484 1.739 1.982 2.218 2.429 2.824 3.019 3.211 3.091 3.741 3.898 4.201 4.494 4.788 4.933 5.219 5.495 5.896 6.163 6.424 6.833 7.245 7.633 8.006 8.35 8.79 9.241 9.686 10.219 10.737 11.253 11.867 12.552 13.22 13.972 14.759 15.589 16.516 17.616 18.947 20.312 21.963 23.862 26.102 28.747 32.008 36.073 41.24 45.826 48.783 50.818 52.275 53.399 54.254 54.932 55.426 55.822 56.113 56.328 56.518 56.688 56.807 56.891 56.948 56.971 56.982 56.991 56.994 56.98 56.955 56.925 56.897 56.863 56.812 56.755 56.694 56.63 56.555 56.45 56.376 56.285 56.237 56.141 56.027 55.895 55.825 55.329 55.564 55.459 55.344 55.079 54.939 54.794 54.624 54.42 54.139 53.738 52.64 -8 ,1914 ,TETRA ,17590521,Sat Nov 27 21:09:43 CET,Sun Nov 28 00:24:00 CET,0.0 1.365 2.07 2.586 3.044 3.407 3.68 3.931 4.391 4.601 4.809 4.723 5.396 5.582 5.926 6.27 6.631 6.813 7.17 7.516 7.993 8.276 8.55 8.973 9.392 9.789 10.174 10.549 11.031 11.502 11.973 12.557 13.114 13.651 14.256 14.933 15.606 16.357 17.174 18.059 19.017 20.129 21.45 22.805 24.404 26.189 28.337 30.897 34.05 37.996 43.229 47.871 50.723 52.637 54.006 55.044 55.793 56.364 56.787 57.153 57.423 57.632 57.785 57.904 57.995 58.042 58.079 58.078 58.065 58.042 57.993 57.942 57.879 57.8 57.726 57.639 57.538 57.436 57.326 57.241 57.142 56.984 56.882 56.759 56.685 56.506 56.33 56.167 56.077 55.537 55.648 55.501 55.345 54.971 54.792 54.605 54.383 54.107 53.835 53.509 52.215 -9 ,3641 ,TETRA ,17590522,Sat Nov 27 21:09:44 CET,Sun Nov 28 00:09:23 CET,0.0 0.556 0.936 1.261 1.55 1.805 2.048 2.286 2.725 2.916 3.097 2.966 3.61 3.777 4.104 4.408 4.701 4.852 5.161 5.452 5.859 6.128 6.399 6.808 7.217 7.601 7.976 8.342 8.801 9.243 9.667 10.193 10.719 11.251 11.874 12.56 13.233 14.005 14.851 15.756 16.735 17.877 19.248 20.629 22.256 24.092 26.216 28.741 31.877 35.809 40.983 45.642 48.575 50.601 52.106 53.245 54.05 54.649 55.073 55.436 55.727 55.931 56.09 56.239 56.35 56.418 56.477 56.525 56.55 56.552 56.54 56.521 56.498 56.468 56.426 56.364 56.313 56.268 56.186 56.125 56.064 55.937 55.843 55.745 55.684 55.559 55.446 55.314 55.231 54.731 54.962 54.839 54.694 54.321 54.087 53.839 53.573 53.27 52.891 52.316 50.878 -10 ,23457 ,TETRA ,17590523,Sat Nov 27 21:09:42 CET,Sun Nov 28 00:11:37 CET,0.0 0.743 1.144 1.456 1.748 2.008 2.255 2.486 2.91 3.113 3.309 3.217 3.881 4.059 4.417 4.763 5.1 5.262 5.574 5.873 6.286 6.547 6.812 7.196 7.578 7.953 8.313 8.654 9.085 9.528 9.972 10.522 11.05 11.555 12.155 12.835 13.51 14.27 15.109 16.021 16.971 18.089 19.482 20.92 22.615 24.547 26.836 29.4 32.459 36.372 41.531 46.202 49.244 51.309 52.754 53.831 54.619 55.226 55.713 56.155 56.483 56.735 56.916 57.054 57.175 57.273 57.365 57.418 57.437 57.441 57.421 57.4 57.372 57.303 57.239 57.178 57.097 57.004 56.91 56.841 56.776 56.674 56.592 56.512 56.469 56.366 56.238 56.092 56.016 55.518 55.75 55.653 55.555 55.333 55.205 55.038 54.848 54.603 54.293 53.91 52.831 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_29_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_29_28.txt deleted file mode 100644 index 4e1859ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_29_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12321 ,TETRA ,17590524,Sat Nov 27 21:09:42 CET,Sun Nov 28 00:07:33 CET,0.0 0.511 0.762 0.936 1.086 1.218 1.345 1.459 1.655 1.732 1.796 1.472 1.953 2.009 2.138 2.247 2.334 2.381 2.463 2.524 2.615 2.674 2.722 2.787 2.855 2.907 2.945 2.986 3.031 3.072 3.102 3.121 3.15 3.172 3.184 3.173 3.131 3.075 3.001 2.896 2.748 2.578 2.364 2.066 1.629 1.088 0.368 -0.638 -2.091 -4.266 -7.77 -11.747 -14.82 -17.285 -19.408 -21.35 -22.939 -24.296 -25.484 -26.659 -27.648 -28.523 -29.331 -30.092 -30.818 -31.454 -32.102 -32.687 -33.186 -33.676 -34.19 -34.613 -35.04 -35.512 -35.865 -36.205 -36.573 -36.983 -37.401 -37.676 -37.974 -38.429 -38.73 -39.047 -39.21 -39.549 -39.912 -40.314 -40.53 -41.222 -41.156 -41.38 -41.614 -42.113 -42.405 -42.746 -43.089 -43.435 -43.843 -44.386 -45.682 -2 ,19849 ,TETRA ,17590525,Sat Nov 27 21:10:42 CET,Sun Nov 28 00:17:16 CET,0.0 0.627 0.874 1.061 1.218 1.357 1.491 1.615 1.815 1.903 1.983 1.702 2.202 2.261 2.383 2.489 2.576 2.618 2.702 2.773 2.876 2.934 2.979 3.047 3.12 3.187 3.242 3.286 3.343 3.388 3.412 3.429 3.424 3.415 3.407 3.402 3.388 3.342 3.272 3.178 3.068 2.926 2.727 2.463 2.098 1.617 0.869 -0.188 -1.677 -3.857 -7.346 -11.328 -14.396 -16.88 -18.924 -20.663 -22.146 -23.441 -24.553 -25.684 -26.638 -27.501 -28.308 -29.052 -29.718 -30.315 -30.96 -31.533 -32.022 -32.515 -33.031 -33.454 -33.905 -34.407 -34.785 -35.155 -35.536 -35.925 -36.326 -36.611 -36.92 -37.395 -37.709 -38.041 -38.213 -38.556 -38.925 -39.319 -39.518 -40.198 -40.144 -40.359 -40.58 -41.111 -41.42 -41.746 -42.095 -42.489 -42.954 -43.582 -45.273 -3 ,17846 ,TETRA ,17590526,Sat Nov 27 21:09:43 CET,Sun Nov 28 00:11:12 CET,0.0 0.905 1.249 1.538 1.768 1.957 2.13 2.285 2.54 2.65 2.749 2.49 3.01 3.086 3.223 3.36 3.495 3.563 3.693 3.806 3.948 4.034 4.114 4.224 4.334 4.437 4.518 4.592 4.68 4.75 4.797 4.835 4.854 4.864 4.864 4.859 4.837 4.788 4.718 4.625 4.528 4.379 4.121 3.804 3.362 2.786 2.021 1.004 -0.446 -2.655 -6.219 -10.26 -13.474 -16.087 -18.276 -20.201 -21.846 -23.287 -24.462 -25.581 -26.558 -27.425 -28.221 -28.967 -29.69 -30.377 -31.092 -31.736 -32.299 -32.831 -33.336 -33.765 -34.218 -34.687 -35.061 -35.458 -35.876 -36.291 -36.706 -36.996 -37.295 -37.759 -38.093 -38.445 -38.618 -38.953 -39.306 -39.681 -39.885 -40.581 -40.552 -40.79 -41.028 -41.528 -41.815 -42.135 -42.464 -42.856 -43.348 -43.956 -45.202 -4 ,14796 ,TETRA ,17590527,Sat Nov 27 21:09:44 CET,Sun Nov 28 00:13:25 CET,0.0 0.443 0.719 0.976 1.177 1.333 1.5 1.671 1.942 2.06 2.175 1.942 2.475 2.566 2.724 2.877 3.028 3.101 3.231 3.344 3.49 3.579 3.67 3.801 3.922 4.037 4.154 4.259 4.361 4.438 4.501 4.566 4.626 4.68 4.743 4.812 4.843 4.842 4.825 4.768 4.664 4.502 4.249 3.938 3.502 2.961 2.229 1.158 -0.372 -2.594 -6.216 -10.289 -13.407 -15.932 -18.067 -19.904 -21.428 -22.788 -23.96 -25.161 -26.216 -27.124 -27.986 -28.771 -29.459 -30.077 -30.731 -31.343 -31.869 -32.382 -32.914 -33.36 -33.827 -34.313 -34.679 -35.041 -35.411 -35.807 -36.209 -36.476 -36.774 -37.265 -37.597 -37.931 -38.096 -38.421 -38.78 -39.173 -39.373 -40.046 -39.962 -40.185 -40.432 -40.94 -41.231 -41.559 -41.912 -42.342 -42.833 -43.411 -44.719 -5 ,3585 ,TETRA ,17590528,Sat Nov 27 21:09:44 CET,Sun Nov 28 00:08:10 CET,0.0 0.363 0.597 0.779 0.945 1.103 1.238 1.355 1.539 1.613 1.688 1.4 1.899 1.965 2.086 2.199 2.313 2.359 2.427 2.492 2.582 2.642 2.706 2.785 2.856 2.919 2.968 3.009 3.06 3.105 3.14 3.172 3.187 3.196 3.2 3.183 3.144 3.11 3.061 2.981 2.863 2.682 2.412 2.077 1.62 1.033 0.27 -0.775 -2.279 -4.559 -8.205 -12.216 -15.298 -17.907 -20.15 -22.017 -23.536 -24.897 -26.07 -27.212 -28.195 -29.074 -29.908 -30.697 -31.412 -32.024 -32.652 -33.236 -33.745 -34.256 -34.78 -35.206 -35.641 -36.1 -36.465 -36.855 -37.248 -37.648 -38.061 -38.335 -38.621 -39.06 -39.364 -39.689 -39.861 -40.216 -40.572 -40.965 -41.171 -41.86 -41.825 -42.057 -42.32 -42.907 -43.219 -43.554 -43.916 -44.306 -44.772 -45.382 -46.665 -6 ,28407 ,TETRA ,17590529,Sat Nov 27 21:09:44 CET,Sat Nov 27 23:45:46 CET,0.0 0.444 0.701 0.89 1.031 1.16 1.272 1.385 1.59 1.684 1.778 1.508 2.012 2.079 2.209 2.332 2.431 2.47 2.54 2.619 2.733 2.792 2.845 2.929 2.997 3.046 3.088 3.13 3.186 3.232 3.274 3.319 3.348 3.365 3.365 3.349 3.32 3.276 3.2 3.077 2.932 2.753 2.491 2.179 1.767 1.212 0.433 -0.61 -2.066 -4.198 -7.632 -11.526 -14.593 -17.09 -19.146 -20.942 -22.492 -23.928 -25.129 -26.268 -27.213 -28.05 -28.859 -29.627 -30.348 -31.016 -31.72 -32.333 -32.826 -33.336 -33.88 -34.331 -34.824 -35.354 -35.779 -36.215 -36.633 -37.051 -37.497 -37.794 -38.09 -38.558 -38.871 -39.202 -39.377 -39.736 -40.113 -40.507 -40.717 -41.409 -41.36 -41.6 -41.854 -42.419 -42.718 -43.032 -43.389 -43.786 -44.235 -44.792 -46.495 -7 ,16620 ,TETRA ,17590530,Sat Nov 27 21:09:44 CET,Sun Nov 28 00:08:44 CET,0.0 0.634 0.972 1.222 1.412 1.566 1.699 1.84 2.125 2.229 2.308 2.012 2.511 2.582 2.714 2.821 2.918 2.962 3.046 3.124 3.241 3.311 3.372 3.46 3.538 3.603 3.655 3.693 3.73 3.767 3.804 3.828 3.836 3.839 3.843 3.847 3.824 3.768 3.688 3.58 3.446 3.244 2.96 2.657 2.235 1.664 0.909 -0.091 -1.552 -3.702 -7.13 -11.115 -14.327 -17.009 -19.223 -21.109 -22.711 -24.124 -25.297 -26.472 -27.492 -28.413 -29.292 -30.086 -30.819 -31.488 -32.168 -32.742 -33.221 -33.721 -34.248 -34.696 -35.158 -35.626 -35.985 -36.354 -36.738 -37.134 -37.524 -37.791 -38.081 -38.557 -38.872 -39.186 -39.349 -39.686 -40.049 -40.422 -40.61 -41.293 -41.244 -41.46 -41.684 -42.171 -42.436 -42.702 -43.007 -43.399 -43.83 -44.336 -45.577 -8 ,20279 ,TETRA ,17590531,Sat Nov 27 21:09:44 CET,Sun Nov 28 00:13:19 CET,0.0 0.379 0.61 0.81 0.974 1.114 1.26 1.391 1.57 1.645 1.728 1.444 1.933 1.986 2.093 2.203 2.319 2.373 2.461 2.529 2.617 2.669 2.717 2.782 2.849 2.918 2.972 3.002 3.032 3.066 3.091 3.109 3.112 3.118 3.139 3.136 3.104 3.061 3.0 2.91 2.773 2.594 2.344 2.043 1.626 1.03 0.24 -0.803 -2.292 -4.462 -7.984 -11.893 -14.93 -17.474 -19.591 -21.386 -22.911 -24.27 -25.413 -26.542 -27.494 -28.317 -29.115 -29.903 -30.645 -31.301 -31.96 -32.528 -33.0 -33.519 -34.091 -34.53 -34.966 -35.425 -35.781 -36.163 -36.563 -36.958 -37.355 -37.621 -37.893 -38.323 -38.626 -38.935 -39.094 -39.453 -39.848 -40.241 -40.445 -41.141 -41.145 -41.429 -41.732 -42.33 -42.672 -43.073 -43.515 -43.999 -44.542 -45.228 -47.043 -9 ,12348 ,TETRA ,17590532,Sat Nov 27 21:10:45 CET,Sun Nov 28 00:18:33 CET,0.0 0.54 0.844 1.098 1.304 1.499 1.655 1.779 1.981 2.064 2.14 1.847 2.347 2.412 2.54 2.652 2.752 2.804 2.899 2.977 3.074 3.127 3.184 3.264 3.335 3.398 3.454 3.504 3.56 3.606 3.649 3.7 3.726 3.742 3.745 3.727 3.695 3.633 3.564 3.472 3.339 3.167 2.912 2.601 2.185 1.625 0.878 -0.086 -1.51 -3.639 -7.01 -10.926 -14.045 -16.575 -18.708 -20.609 -22.234 -23.638 -24.81 -25.97 -26.95 -27.795 -28.597 -29.342 -30.033 -30.644 -31.286 -31.893 -32.394 -32.903 -33.451 -33.893 -34.365 -34.863 -35.227 -35.606 -36.005 -36.402 -36.815 -37.114 -37.422 -37.904 -38.249 -38.595 -38.766 -39.119 -39.513 -39.954 -40.166 -40.841 -40.791 -41.029 -41.28 -41.835 -42.137 -42.442 -42.771 -43.137 -43.57 -44.118 -45.537 -10 ,7534 ,TETRA ,17590533,Sat Nov 27 21:10:42 CET,Sun Nov 28 00:10:44 CET,0.0 0.622 0.93 1.157 1.34 1.499 1.641 1.754 1.966 2.062 2.149 1.89 2.399 2.469 2.619 2.765 2.892 2.941 3.03 3.112 3.202 3.258 3.313 3.385 3.462 3.535 3.594 3.652 3.723 3.774 3.803 3.819 3.835 3.851 3.847 3.824 3.792 3.743 3.672 3.58 3.471 3.31 3.05 2.719 2.303 1.751 0.975 -0.063 -1.549 -3.773 -7.301 -11.16 -14.276 -16.829 -18.919 -20.799 -22.455 -23.837 -25.001 -26.225 -27.246 -28.152 -28.988 -29.736 -30.446 -31.089 -31.738 -32.311 -32.809 -33.311 -33.819 -34.246 -34.681 -35.132 -35.489 -35.857 -36.226 -36.604 -37.015 -37.308 -37.616 -38.078 -38.388 -38.72 -38.893 -39.242 -39.605 -39.973 -40.16 -40.834 -40.768 -41.0 -41.242 -41.789 -42.089 -42.382 -42.69 -43.055 -43.5 -44.074 -45.469 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_29_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_29_30.txt deleted file mode 100644 index 6d1f68ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_29_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23237 ,TETRA ,17590535,Sat Nov 27 21:10:42 CET,Sun Nov 28 00:10:39 CET,0.0 0.611 0.97 1.219 1.411 1.595 1.77 1.929 2.188 2.317 2.452 2.269 2.829 2.944 3.177 3.398 3.594 3.692 3.876 4.051 4.312 4.485 4.653 4.878 5.093 5.307 5.503 5.693 5.958 6.216 6.459 6.755 7.044 7.312 7.612 7.957 8.277 8.637 9.039 9.467 9.932 10.437 11.011 11.568 12.196 12.957 13.817 14.678 15.72 16.974 18.203 18.954 19.277 19.386 19.31 19.114 18.874 18.596 18.323 18.041 17.805 17.577 17.336 17.091 16.83 16.591 16.338 16.081 15.853 15.628 15.394 15.19 14.98 14.749 14.565 14.382 14.184 13.965 13.743 13.583 13.407 13.13 12.942 12.744 12.637 12.415 12.17 11.908 11.776 11.218 11.332 11.167 10.99 10.573 10.33 10.105 9.869 9.585 9.271 8.852 7.502 -2 ,25429 ,TETRA ,17590536,Sat Nov 27 21:10:42 CET,Sun Nov 28 00:11:28 CET,0.0 0.513 0.806 1.061 1.284 1.48 1.658 1.827 2.125 2.27 2.41 2.253 2.812 2.932 3.162 3.383 3.579 3.667 3.848 4.039 4.314 4.483 4.658 4.912 5.127 5.331 5.535 5.729 5.987 6.242 6.483 6.769 7.041 7.301 7.603 7.948 8.267 8.622 9.02 9.437 9.869 10.368 10.968 11.542 12.179 12.873 13.643 14.514 15.553 16.651 17.762 18.42 18.497 18.403 18.234 17.988 17.726 17.446 17.193 16.903 16.607 16.339 16.073 15.797 15.538 15.3 15.029 14.78 14.564 14.319 14.065 13.853 13.621 13.385 13.2 13.014 12.813 12.576 12.347 12.19 12.001 11.706 11.515 11.309 11.201 10.975 10.708 10.42 10.282 9.713 9.791 9.608 9.403 8.943 8.729 8.508 8.228 7.89 7.544 7.038 4.864 -3 ,31374 ,TETRA ,17590537,Sat Nov 27 21:10:42 CET,Sun Nov 28 00:09:15 CET,0.0 0.658 0.972 1.229 1.419 1.599 1.782 1.947 2.231 2.365 2.503 2.338 2.888 3.004 3.222 3.438 3.658 3.76 3.942 4.113 4.364 4.53 4.687 4.916 5.14 5.356 5.564 5.767 6.034 6.291 6.535 6.82 7.088 7.358 7.685 8.034 8.352 8.689 9.073 9.483 9.906 10.406 10.985 11.538 12.176 12.85 13.56 14.361 15.28 16.313 17.431 18.111 18.291 18.237 18.101 17.9 17.68 17.456 17.208 16.923 16.623 16.309 16.034 15.806 15.554 15.286 14.996 14.74 14.535 14.317 14.031 13.756 13.454 13.123 12.87 12.613 12.365 12.121 11.843 11.641 11.436 11.11 10.877 10.633 10.504 10.238 9.948 9.635 9.469 8.878 8.919 8.717 8.516 8.061 7.807 7.532 7.198 6.802 6.346 5.68 3.963 -4 ,14908 ,TETRA ,17590538,Sat Nov 27 21:10:44 CET,Sun Nov 28 00:10:31 CET,0.0 0.745 1.085 1.354 1.584 1.789 1.988 2.161 2.453 2.587 2.724 2.572 3.136 3.261 3.489 3.714 3.925 4.019 4.198 4.383 4.662 4.84 5.013 5.26 5.483 5.695 5.9 6.097 6.346 6.595 6.842 7.125 7.402 7.678 7.998 8.329 8.628 8.992 9.396 9.801 10.216 10.708 11.312 11.897 12.549 13.215 13.944 14.769 15.697 16.791 18.077 18.987 19.421 19.496 19.352 19.133 18.869 18.589 18.314 18.017 17.744 17.482 17.251 17.013 16.735 16.459 16.187 15.943 15.71 15.473 15.236 15.039 14.831 14.597 14.422 14.243 14.04 13.831 13.613 13.455 13.287 13.01 12.803 12.607 12.501 12.27 12.036 11.774 11.64 11.078 11.171 10.999 10.822 10.425 10.183 9.938 9.669 9.307 8.889 8.362 6.277 -5 ,12981 ,TETRA ,17590539,Sat Nov 27 21:10:44 CET,Sun Nov 28 00:08:52 CET,0.0 0.527 0.901 1.159 1.378 1.56 1.719 1.889 2.199 2.332 2.462 2.285 2.838 2.951 3.168 3.377 3.583 3.678 3.857 4.034 4.288 4.452 4.607 4.819 5.037 5.257 5.463 5.662 5.926 6.19 6.446 6.751 7.041 7.321 7.639 7.996 8.329 8.695 9.1 9.516 9.948 10.433 11.01 11.581 12.215 12.92 13.685 14.512 15.46 16.553 17.737 18.43 18.62 18.54 18.344 18.129 17.892 17.639 17.385 17.072 16.794 16.55 16.315 16.076 15.823 15.595 15.35 15.123 14.932 14.738 14.526 14.34 14.138 13.913 13.733 13.541 13.338 13.134 12.926 12.774 12.609 12.353 12.161 11.963 11.863 11.638 11.409 11.193 11.066 10.487 10.598 10.437 10.27 9.924 9.715 9.477 9.211 8.892 8.518 8.069 6.687 -6 ,6115 ,TETRA ,17590540,Sat Nov 27 21:10:44 CET,Sun Nov 28 00:12:47 CET,0.0 0.363 0.643 0.87 1.058 1.227 1.392 1.545 1.826 1.963 2.092 1.905 2.458 2.564 2.767 2.969 3.156 3.245 3.425 3.607 3.881 4.057 4.225 4.48 4.719 4.936 5.143 5.349 5.611 5.856 6.109 6.404 6.688 6.978 7.29 7.639 7.976 8.344 8.759 9.192 9.626 10.133 10.731 11.321 12.007 12.735 13.537 14.404 15.372 16.401 17.522 18.164 18.29 18.237 18.107 17.909 17.648 17.39 17.149 16.877 16.628 16.388 16.14 15.886 15.637 15.419 15.182 14.946 14.748 14.554 14.341 14.149 13.945 13.731 13.553 13.369 13.196 13.006 12.791 12.646 12.492 12.232 12.058 11.866 11.757 11.541 11.324 11.095 10.966 10.414 10.524 10.356 10.199 9.844 9.627 9.409 9.17 8.879 8.528 8.091 6.455 -7 ,18100 ,TETRA ,17590541,Sat Nov 27 21:10:44 CET,Sun Nov 28 00:12:38 CET,0.0 0.482 0.818 1.076 1.293 1.501 1.683 1.846 2.131 2.261 2.391 2.201 2.756 2.871 3.106 3.329 3.527 3.626 3.823 4.015 4.284 4.455 4.627 4.864 5.084 5.289 5.487 5.689 5.945 6.18 6.411 6.699 6.973 7.236 7.535 7.871 8.207 8.584 8.967 9.379 9.827 10.332 10.9 11.468 12.14 12.853 13.65 14.511 15.475 16.567 17.622 18.186 18.341 18.3 18.14 17.915 17.69 17.465 17.21 16.899 16.63 16.388 16.142 15.916 15.686 15.439 15.177 14.93 14.693 14.453 14.205 13.991 13.773 13.538 13.359 13.177 12.984 12.767 12.541 12.387 12.222 11.966 11.772 11.573 11.471 11.252 11.015 10.746 10.608 10.056 10.2 10.037 9.863 9.526 9.332 9.105 8.845 8.549 8.146 7.624 6.435 -8 ,28348 ,TETRA ,17590542,Sat Nov 27 21:10:48 CET,Sun Nov 28 00:12:35 CET,0.0 0.495 0.765 1.005 1.225 1.426 1.606 1.774 2.07 2.203 2.331 2.151 2.714 2.841 3.086 3.318 3.526 3.624 3.816 4.002 4.274 4.444 4.609 4.846 5.073 5.291 5.495 5.709 5.992 6.249 6.497 6.808 7.097 7.361 7.688 8.059 8.4 8.774 9.176 9.596 10.046 10.55 11.131 11.701 12.327 13.009 13.785 14.641 15.627 16.789 18.157 18.987 19.175 19.152 19.06 18.919 18.756 18.55 18.306 18.035 17.803 17.581 17.328 17.055 16.781 16.499 16.203 15.954 15.731 15.49 15.228 15.007 14.772 14.529 14.352 14.184 13.989 13.746 13.497 13.337 13.177 12.92 12.723 12.504 12.389 12.163 11.936 11.687 11.561 11.014 11.167 11.025 10.865 10.491 10.269 10.006 9.723 9.412 9.055 8.595 7.307 -9 ,28854 ,TETRA ,17590543,Sat Nov 27 21:10:45 CET,Sun Nov 28 00:19:17 CET,0.0 0.521 0.859 1.118 1.347 1.551 1.73 1.892 2.188 2.326 2.454 2.279 2.828 2.945 3.174 3.398 3.611 3.714 3.92 4.112 4.396 4.573 4.739 4.977 5.195 5.401 5.613 5.823 6.091 6.359 6.623 6.92 7.183 7.435 7.741 8.087 8.427 8.798 9.158 9.525 9.931 10.41 10.964 11.527 12.19 12.894 13.638 14.484 15.506 16.565 17.567 18.156 18.298 18.195 18.011 17.778 17.446 17.099 16.789 16.466 16.174 15.883 15.578 15.277 15.015 14.778 14.526 14.297 14.061 13.787 13.503 13.261 13.003 12.74 12.541 12.336 12.109 11.855 11.577 11.394 11.207 10.919 10.709 10.47 10.351 10.101 9.841 9.576 9.439 8.879 8.991 8.813 8.613 8.207 7.981 7.72 7.426 7.107 6.749 6.276 4.854 -10 ,7402 ,TETRA ,17590544,Sat Nov 27 21:10:45 CET,Sun Nov 28 00:19:13 CET,0.0 0.618 0.947 1.218 1.46 1.676 1.885 2.077 2.413 2.556 2.691 2.519 3.074 3.19 3.419 3.628 3.823 3.921 4.115 4.293 4.537 4.692 4.854 5.101 5.332 5.564 5.782 5.984 6.255 6.516 6.752 7.027 7.301 7.562 7.861 8.205 8.545 8.915 9.288 9.685 10.124 10.635 11.232 11.784 12.403 13.139 13.981 14.869 15.843 16.938 18.073 18.655 18.798 18.767 18.618 18.421 18.215 18.009 17.8 17.542 17.278 17.032 16.801 16.576 16.352 16.14 15.921 15.679 15.446 15.227 15.009 14.812 14.594 14.373 14.201 14.02 13.825 13.594 13.335 13.163 13.001 12.741 12.547 12.353 12.245 12.029 11.805 11.545 11.403 10.841 10.962 10.79 10.609 10.224 9.996 9.765 9.524 9.226 8.888 8.414 6.634 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_30_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_30_1h1s.txt deleted file mode 100644 index f0c971d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_30_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29356 ,TETRA ,17590545,Sat Nov 27 21:10:44 CET,Sun Nov 28 00:12:36 CET,0.0 0.424 0.7 0.887 1.023 1.129 1.222 1.292 1.414 1.478 1.528 1.152 1.588 1.602 1.636 1.67 1.688 1.69 1.681 1.658 1.611 1.575 1.531 1.458 1.381 1.294 1.196 1.091 0.929 0.757 0.587 0.368 0.128 -0.137 -0.45 -0.819 -1.205 -1.657 -2.183 -2.777 -3.445 -4.267 -5.319 -6.473 -7.93 -9.732 -12.082 -15.094 -19.141 -24.851 -33.474 -42.534 -49.307 -54.632 -58.929 -62.561 -65.587 -68.211 -70.353 -72.419 -74.157 -75.642 -77.014 -78.274 -79.419 -80.431 -81.442 -82.333 -83.104 -83.885 -84.665 -85.304 -85.965 -86.642 -87.158 -87.678 -88.206 -88.751 -89.309 -89.694 -90.086 -90.687 -91.11 -91.575 -91.828 -92.349 -92.877 -93.415 -93.693 -94.5 -94.557 -94.873 -95.198 -95.885 -96.253 -96.629 -97.046 -97.521 -98.049 -98.711 -100.161 -2 ,19742 ,TETRA ,17590546,Sat Nov 27 21:10:44 CET,Sun Nov 28 00:06:28 CET,0.0 0.47 0.73 0.922 1.074 1.2 1.303 1.384 1.58 1.658 1.717 1.406 1.854 1.87 1.903 1.926 1.925 1.924 1.919 1.902 1.853 1.807 1.763 1.693 1.631 1.555 1.462 1.358 1.19 1.011 0.821 0.587 0.357 0.105 -0.214 -0.576 -0.946 -1.401 -1.93 -2.54 -3.201 -4.018 -5.105 -6.322 -7.862 -9.698 -12.036 -15.095 -19.199 -24.86 -33.345 -42.403 -49.205 -54.561 -58.804 -62.389 -65.365 -67.885 -69.994 -72.068 -73.805 -75.293 -76.656 -77.906 -79.06 -80.116 -81.203 -82.146 -82.95 -83.77 -84.61 -85.303 -85.998 -86.689 -87.207 -87.735 -88.285 -88.846 -89.413 -89.8 -90.193 -90.81 -91.243 -91.685 -91.915 -92.377 -92.826 -93.293 -93.541 -94.326 -94.307 -94.567 -94.846 -95.41 -95.711 -96.032 -96.406 -96.802 -97.214 -97.745 -98.664 -3 ,7116 ,TETRA ,17590547,Sat Nov 27 21:11:41 CET,Sun Nov 28 00:12:30 CET,0.0 0.466 0.686 0.868 1.015 1.108 1.206 1.283 1.374 1.421 1.474 1.133 1.577 1.606 1.646 1.667 1.665 1.654 1.641 1.633 1.599 1.561 1.514 1.441 1.365 1.283 1.183 1.088 0.955 0.779 0.607 0.393 0.157 -0.084 -0.39 -0.759 -1.127 -1.552 -2.052 -2.619 -3.268 -4.096 -5.179 -6.397 -7.923 -9.748 -12.114 -15.159 -19.276 -25.015 -33.516 -42.409 -49.013 -54.304 -58.584 -62.141 -65.141 -67.774 -69.911 -71.995 -73.748 -75.268 -76.68 -77.926 -79.044 -80.076 -81.129 -82.037 -82.816 -83.599 -84.398 -85.069 -85.749 -86.43 -86.945 -87.456 -87.984 -88.537 -89.109 -89.502 -89.895 -90.491 -90.912 -91.351 -91.577 -92.025 -92.472 -92.943 -93.189 -93.967 -93.947 -94.221 -94.505 -95.121 -95.439 -95.764 -96.137 -96.517 -96.923 -97.479 -98.466 -4 ,4742 ,TETRA ,17590548,Sat Nov 27 21:11:41 CET,Sun Nov 28 00:14:42 CET,0.0 0.642 0.902 1.1 1.245 1.369 1.48 1.572 1.726 1.782 1.822 1.48 1.935 1.973 2.05 2.107 2.147 2.162 2.187 2.205 2.211 2.198 2.174 2.114 2.036 1.963 1.881 1.777 1.615 1.445 1.277 1.061 0.83 0.584 0.279 -0.082 -0.468 -0.942 -1.495 -2.125 -2.818 -3.653 -4.743 -5.927 -7.416 -9.246 -11.628 -14.696 -18.776 -24.448 -32.917 -41.974 -48.674 -53.963 -58.33 -62.041 -65.081 -67.678 -69.812 -71.86 -73.603 -75.117 -76.517 -77.794 -78.944 -79.981 -81.047 -81.968 -82.727 -83.518 -84.343 -85.015 -85.712 -86.419 -86.962 -87.521 -88.101 -88.709 -89.354 -89.801 -90.221 -90.819 -91.237 -91.672 -91.888 -92.317 -92.755 -93.226 -93.471 -94.246 -94.244 -94.516 -94.789 -95.366 -95.672 -95.991 -96.344 -96.738 -97.168 -97.706 -99.159 -5 ,7262 ,TETRA ,17590549,Sat Nov 27 21:11:41 CET,Sun Nov 28 00:09:47 CET,0.0 0.51 0.71 0.864 0.995 1.101 1.195 1.269 1.386 1.422 1.455 1.085 1.521 1.541 1.573 1.585 1.574 1.565 1.542 1.503 1.438 1.398 1.354 1.278 1.182 1.073 0.97 0.87 0.729 0.578 0.418 0.188 -0.059 -0.317 -0.627 -0.992 -1.387 -1.86 -2.405 -3.023 -3.711 -4.563 -5.679 -6.896 -8.424 -10.287 -12.673 -15.723 -19.85 -25.614 -34.09 -43.157 -49.989 -55.302 -59.612 -63.222 -66.267 -68.929 -71.1 -73.18 -74.936 -76.452 -77.841 -79.152 -80.332 -81.366 -82.444 -83.377 -84.161 -84.963 -85.788 -86.454 -87.118 -87.797 -88.323 -88.874 -89.442 -90.016 -90.605 -91.002 -91.406 -92.009 -92.413 -92.828 -93.033 -93.457 -93.923 -94.418 -94.659 -95.434 -95.4 -95.664 -95.934 -96.507 -96.816 -97.129 -97.465 -97.845 -98.281 -98.818 -99.608 -6 ,16269 ,TETRA ,17590550,Sat Nov 27 21:11:43 CET,Sun Nov 28 00:11:09 CET,0.0 0.425 0.631 0.776 0.893 0.984 1.061 1.133 1.225 1.259 1.297 0.937 1.385 1.414 1.452 1.478 1.481 1.478 1.47 1.456 1.415 1.387 1.351 1.27 1.187 1.109 1.012 0.896 0.749 0.605 0.437 0.202 -0.037 -0.287 -0.611 -0.999 -1.387 -1.833 -2.369 -3.005 -3.711 -4.573 -5.667 -6.876 -8.433 -10.311 -12.677 -15.687 -19.701 -25.304 -33.83 -42.865 -49.528 -54.738 -58.916 -62.559 -65.715 -68.419 -70.622 -72.779 -74.598 -76.176 -77.617 -78.929 -80.107 -81.151 -82.262 -83.222 -84.008 -84.819 -85.66 -86.346 -87.035 -87.731 -88.254 -88.78 -89.339 -89.929 -90.511 -90.895 -91.275 -91.855 -92.264 -92.692 -92.915 -93.374 -93.829 -94.298 -94.537 -95.308 -95.276 -95.54 -95.832 -96.451 -96.768 -97.115 -97.491 -97.884 -98.331 -98.822 -100.103 -7 ,23062 ,TETRA ,17590551,Sat Nov 27 21:11:43 CET,Sun Nov 28 00:15:12 CET,0.0 0.727 1.03 1.232 1.4 1.561 1.683 1.773 1.906 1.976 2.049 1.719 2.177 2.212 2.26 2.299 2.325 2.337 2.353 2.357 2.363 2.366 2.353 2.308 2.258 2.21 2.15 2.083 1.994 1.878 1.736 1.555 1.369 1.164 0.903 0.579 0.221 -0.203 -0.687 -1.282 -1.999 -2.874 -3.98 -5.208 -6.779 -8.68 -11.076 -14.072 -18.112 -23.734 -32.118 -41.053 -47.786 -53.116 -57.408 -61.029 -64.121 -66.86 -69.142 -71.373 -73.289 -74.927 -76.399 -77.746 -78.977 -80.055 -81.106 -82.015 -82.792 -83.587 -84.398 -85.069 -85.748 -86.426 -86.947 -87.478 -88.008 -88.546 -89.105 -89.481 -89.861 -90.469 -90.881 -91.286 -91.493 -91.923 -92.388 -92.878 -93.123 -93.901 -93.9 -94.18 -94.458 -95.073 -95.426 -95.78 -96.152 -96.592 -97.088 -97.722 -99.256 -8 ,922 ,TETRA ,17590552,Sat Nov 27 21:11:43 CET,Sun Nov 28 00:18:44 CET,0.0 0.608 0.92 1.147 1.33 1.49 1.628 1.753 1.941 2.02 2.089 1.782 2.26 2.316 2.396 2.445 2.466 2.478 2.495 2.514 2.53 2.521 2.51 2.487 2.452 2.398 2.319 2.23 2.12 2.006 1.881 1.71 1.524 1.319 1.059 0.741 0.405 0.016 -0.445 -1.008 -1.685 -2.518 -3.59 -4.784 -6.287 -8.157 -10.587 -13.729 -17.987 -23.778 -32.281 -41.206 -47.791 -53.077 -57.398 -61.003 -64.062 -66.695 -68.855 -70.906 -72.6 -74.122 -75.515 -76.786 -77.97 -79.047 -80.154 -81.088 -81.873 -82.666 -83.46 -84.114 -84.795 -85.479 -85.996 -86.537 -87.098 -87.655 -88.207 -88.599 -88.99 -89.56 -89.955 -90.367 -90.582 -91.019 -91.482 -91.962 -92.202 -92.98 -92.982 -93.244 -93.507 -94.068 -94.368 -94.706 -95.049 -95.419 -95.859 -96.407 -97.404 -9 ,6177 ,TETRA ,17590553,Sat Nov 27 21:11:43 CET,Sun Nov 28 00:17:01 CET,0.0 0.606 0.879 1.052 1.15 1.242 1.333 1.414 1.539 1.591 1.635 1.277 1.717 1.735 1.757 1.776 1.776 1.771 1.772 1.779 1.771 1.771 1.785 1.809 1.817 1.806 1.786 1.761 1.68 1.543 1.386 1.169 0.953 0.735 0.447 0.087 -0.299 -0.761 -1.291 -1.891 -2.581 -3.436 -4.516 -5.69 -7.178 -9.033 -11.414 -14.463 -18.597 -24.313 -32.756 -41.767 -48.521 -53.855 -58.19 -61.842 -64.868 -67.474 -69.613 -71.684 -73.436 -74.954 -76.381 -77.668 -78.815 -79.843 -80.903 -81.826 -82.589 -83.365 -84.155 -84.795 -85.453 -86.123 -86.634 -87.158 -87.698 -88.247 -88.821 -89.225 -89.616 -90.213 -90.625 -91.128 -91.423 -92.012 -92.614 -93.229 -93.545 -94.436 -94.51 -94.852 -95.186 -95.887 -96.269 -96.652 -97.055 -97.522 -98.019 -98.634 -100.108 -10 ,24023 ,TETRA ,17590554,Sat Nov 27 21:11:43 CET,Sun Nov 28 00:25:35 CET,0.0 0.697 0.969 1.164 1.323 1.461 1.571 1.677 1.821 1.866 1.915 1.586 2.031 2.055 2.092 2.152 2.233 2.268 2.303 2.314 2.321 2.314 2.3 2.259 2.196 2.121 2.043 1.967 1.861 1.753 1.634 1.46 1.266 1.052 0.777 0.417 0.041 -0.401 -0.923 -1.531 -2.212 -3.023 -4.078 -5.253 -6.751 -8.613 -10.993 -14.017 -18.056 -23.639 -32.031 -40.996 -47.862 -53.286 -57.596 -61.261 -64.306 -66.914 -69.085 -71.187 -72.928 -74.423 -75.809 -77.076 -78.244 -79.301 -80.351 -81.253 -82.025 -82.804 -83.599 -84.256 -84.923 -85.606 -86.123 -86.652 -87.198 -87.745 -88.299 -88.682 -89.076 -89.686 -90.116 -90.567 -90.801 -91.285 -91.78 -92.3 -92.569 -93.368 -93.408 -93.707 -94.014 -94.683 -95.03 -95.392 -95.798 -96.25 -96.763 -97.368 -98.581 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_30_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_30_26.txt deleted file mode 100644 index 049827c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_30_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19105 ,KEBNE ,17070596,Fri Dec 24 20:25:13 CET,Fri Dec 24 22:36:23 CET,0.0 0.915 1.449 1.896 2.322 2.704 3.033 3.333 3.907 4.181 4.433 4.494 5.163 5.41 5.887 6.352 6.789 7.0 7.413 7.804 8.387 8.773 9.16 9.724 10.257 10.773 11.281 11.792 12.459 13.114 13.758 14.517 15.254 15.987 16.852 17.842 18.808 19.897 21.097 22.387 23.778 25.384 27.297 29.289 31.736 34.598 38.006 42.067 47.108 53.429 61.901 69.877 75.177 78.877 81.548 83.632 85.258 86.54 87.523 88.425 89.103 89.592 89.978 90.318 90.623 90.864 91.076 91.236 91.374 91.499 91.601 91.693 91.774 91.838 91.879 91.919 91.937 91.925 91.888 91.858 91.818 91.732 91.66 91.564 91.517 91.431 91.331 91.221 91.15 90.741 90.87 90.773 90.652 90.358 90.204 90.008 89.745 89.407 89.011 88.507 86.434 -2 ,16340 ,KEBNE ,17070597,Fri Dec 24 20:29:36 CET,Fri Dec 24 22:38:37 CET,0.0 0.929 1.48 1.91 2.282 2.601 2.902 3.198 3.731 3.976 4.216 4.265 4.907 5.13 5.57 5.985 6.377 6.564 6.931 7.299 7.858 8.223 8.57 9.078 9.587 10.1 10.598 11.079 11.716 12.339 12.945 13.689 14.418 15.145 16.019 17.017 17.996 19.078 20.242 21.524 22.92 24.522 26.449 28.457 30.899 33.734 37.165 41.258 46.265 52.532 60.702 68.259 73.304 76.867 79.466 81.482 83.021 84.281 85.275 86.123 86.773 87.296 87.749 88.124 88.433 88.705 88.97 89.186 89.343 89.467 89.568 89.623 89.664 89.686 89.694 89.711 89.726 89.729 89.718 89.697 89.67 89.617 89.555 89.469 89.424 89.346 89.252 89.137 89.072 88.679 88.816 88.701 88.588 88.331 88.179 88.005 87.774 87.484 87.067 86.473 84.839 -3 ,12995 ,KEBNE ,17070598,Fri Dec 24 20:31:45 CET,Fri Dec 24 22:40:30 CET,0.0 0.86 1.315 1.718 2.095 2.415 2.721 3.014 3.531 3.774 4.002 4.025 4.666 4.882 5.294 5.691 6.087 6.288 6.675 7.054 7.627 7.998 8.353 8.882 9.399 9.893 10.386 10.869 11.496 12.12 12.739 13.487 14.216 14.943 15.807 16.772 17.704 18.756 19.931 21.24 22.678 24.326 26.271 28.281 30.711 33.543 36.995 41.062 46.053 52.383 60.655 68.254 73.344 76.984 79.653 81.687 83.173 84.342 85.231 86.001 86.58 87.032 87.469 87.864 88.171 88.421 88.653 88.845 88.998 89.127 89.251 89.353 89.428 89.48 89.508 89.516 89.526 89.521 89.497 89.471 89.449 89.43 89.398 89.352 89.316 89.216 89.112 88.999 88.925 88.513 88.631 88.511 88.388 88.114 87.955 87.759 87.504 87.231 86.926 86.5 84.985 -4 ,7251 ,KEBNE ,17070599,Fri Dec 24 20:32:51 CET,Fri Dec 24 22:43:50 CET,0.0 0.902 1.391 1.794 2.152 2.485 2.776 3.055 3.617 3.876 4.116 4.166 4.816 5.033 5.445 5.841 6.236 6.432 6.807 7.163 7.673 8.018 8.366 8.874 9.377 9.865 10.333 10.798 11.412 12.009 12.598 13.326 14.037 14.75 15.6 16.559 17.493 18.55 19.697 20.932 22.296 23.896 25.842 27.883 30.333 33.188 36.628 40.673 45.751 52.216 60.741 68.637 73.844 77.597 80.393 82.504 84.086 85.319 86.261 87.15 87.856 88.412 88.882 89.268 89.562 89.779 89.983 90.15 90.281 90.394 90.484 90.54 90.583 90.628 90.652 90.665 90.68 90.662 90.605 90.56 90.518 90.464 90.398 90.311 90.274 90.19 90.074 89.946 89.882 89.494 89.646 89.544 89.429 89.181 89.034 88.849 88.639 88.394 88.077 87.629 85.939 -5 ,11989 ,KEBNE ,17070600,Fri Dec 24 20:38:05 CET,Fri Dec 24 22:46:19 CET,0.0 1.097 1.581 1.957 2.322 2.656 2.948 3.225 3.733 3.979 4.223 4.267 4.915 5.141 5.579 6.006 6.416 6.613 6.991 7.36 7.9 8.254 8.601 9.109 9.608 10.097 10.581 11.063 11.711 12.34 12.944 13.684 14.419 15.136 15.987 16.987 17.97 19.058 20.252 21.544 22.951 24.586 26.537 28.576 31.062 33.925 37.334 41.382 46.428 52.828 61.226 68.849 73.957 77.68 80.4 82.506 84.11 85.386 86.337 87.185 87.865 88.401 88.874 89.267 89.594 89.899 90.165 90.365 90.526 90.656 90.754 90.831 90.912 90.964 90.99 91.012 91.023 91.001 90.953 90.914 90.875 90.8 90.739 90.671 90.62 90.502 90.394 90.278 90.208 89.803 89.962 89.875 89.77 89.531 89.385 89.178 88.941 88.671 88.326 87.915 86.267 -6 ,426 ,KEBNE ,17070601,Fri Dec 24 20:49:41 CET,Fri Dec 24 23:00:19 CET,0.0 1.248 1.903 2.402 2.826 3.202 3.539 3.863 4.461 4.744 5.011 5.084 5.729 5.938 6.35 6.764 7.18 7.387 7.779 8.14 8.671 9.025 9.374 9.886 10.378 10.864 11.341 11.815 12.44 13.04 13.631 14.366 15.085 15.802 16.646 17.611 18.572 19.659 20.84 22.117 23.485 25.086 27.032 29.053 31.516 34.362 37.806 41.902 46.902 53.134 61.479 69.233 74.316 77.969 80.658 82.729 84.337 85.648 86.657 87.556 88.245 88.785 89.239 89.644 90.011 90.315 90.579 90.788 90.959 91.117 91.266 91.367 91.44 91.503 91.537 91.568 91.591 91.577 91.544 91.526 91.519 91.492 91.463 91.416 91.382 91.308 91.204 91.089 91.012 90.595 90.718 90.599 90.464 90.141 89.987 89.833 89.635 89.347 88.93 88.325 86.465 -7 ,28742 ,KEBNE ,17070602,Fri Dec 24 20:49:41 CET,Fri Dec 24 23:00:53 CET,0.0 0.867 1.405 1.856 2.233 2.591 2.931 3.243 3.821 4.093 4.346 4.398 5.053 5.287 5.754 6.205 6.641 6.853 7.25 7.632 8.218 8.61 8.982 9.508 10.024 10.542 11.051 11.55 12.216 12.873 13.516 14.309 15.076 15.838 16.75 17.769 18.747 19.841 21.06 22.405 23.846 25.513 27.533 29.647 32.2 35.137 38.631 42.658 47.707 54.27 62.965 71.035 76.269 79.914 82.66 84.747 86.281 87.493 88.436 89.295 89.971 90.493 90.93 91.29 91.593 91.864 92.132 92.356 92.529 92.676 92.805 92.91 93.004 93.086 93.138 93.17 93.181 93.178 93.159 93.139 93.114 93.063 93.034 93.005 92.988 92.937 92.867 92.782 92.722 92.336 92.53 92.425 92.302 92.048 91.905 91.737 91.505 91.223 90.909 90.455 88.661 -8 ,194 ,KEBNE ,17070603,Fri Dec 24 20:49:41 CET,Fri Dec 24 22:58:07 CET,0.0 1.04 1.562 1.966 2.319 2.657 2.976 3.275 3.83 4.086 4.331 4.362 4.997 5.216 5.647 6.056 6.443 6.631 7.0 7.366 7.91 8.269 8.618 9.129 9.629 10.142 10.659 11.148 11.763 12.363 12.964 13.712 14.45 15.183 16.047 17.049 18.033 19.127 20.327 21.6 22.969 24.589 26.573 28.606 31.02 33.832 37.221 41.316 46.428 52.793 61.295 69.233 74.471 78.199 80.849 82.832 84.404 85.712 86.694 87.534 88.203 88.763 89.233 89.627 89.96 90.228 90.486 90.692 90.841 90.983 91.119 91.219 91.297 91.359 91.395 91.421 91.439 91.442 91.421 91.405 91.396 91.368 91.331 91.284 91.251 91.157 91.035 90.889 90.811 90.407 90.554 90.464 90.364 90.093 89.939 89.767 89.559 89.322 89.038 88.61 86.744 -9 ,23970 ,KEBNE ,17070604,Fri Dec 24 20:49:41 CET,Fri Dec 24 23:00:05 CET,0.0 1.035 1.509 1.903 2.246 2.549 2.848 3.143 3.693 3.948 4.2 4.274 4.93 5.155 5.602 6.032 6.455 6.662 7.059 7.436 7.975 8.328 8.672 9.203 9.748 10.27 10.78 11.28 11.928 12.564 13.196 13.981 14.713 15.411 16.25 17.229 18.198 19.28 20.477 21.8 23.239 24.887 26.832 28.863 31.332 34.157 37.496 41.436 46.339 52.596 60.961 68.816 73.909 77.516 80.188 82.16 83.654 84.846 85.796 86.689 87.357 87.877 88.315 88.686 88.999 89.264 89.507 89.707 89.853 89.976 90.079 90.139 90.204 90.256 90.283 90.322 90.339 90.319 90.283 90.262 90.241 90.223 90.204 90.147 90.109 90.027 89.913 89.77 89.703 89.31 89.452 89.344 89.223 88.96 88.795 88.601 88.368 88.098 87.773 87.304 84.473 -10 ,30693 ,KEBNE ,17070605,Fri Dec 24 20:50:44 CET,Fri Dec 24 23:01:34 CET,0.0 1.001 1.515 1.922 2.288 2.622 2.93 3.211 3.733 3.989 4.25 4.33 4.983 5.204 5.636 6.067 6.474 6.672 7.06 7.435 7.981 8.344 8.713 9.251 9.768 10.268 10.759 11.244 11.88 12.498 13.109 13.869 14.597 15.303 16.149 17.113 18.051 19.11 20.294 21.605 22.991 24.588 26.577 28.631 31.071 33.908 37.344 41.438 46.501 52.817 61.192 68.895 73.932 77.475 80.085 82.083 83.562 84.725 85.641 86.498 87.199 87.745 88.198 88.605 88.936 89.195 89.444 89.651 89.822 89.962 90.034 90.062 90.098 90.137 90.152 90.159 90.173 90.197 90.199 90.19 90.178 90.123 90.072 89.99 89.947 89.882 89.786 89.657 89.574 89.165 89.322 89.228 89.109 88.818 88.661 88.478 88.263 88.015 87.732 87.342 85.944 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_30_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_30_31.txt deleted file mode 100644 index e729d860..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_30_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27196 ,TETRA ,17590555,Sat Nov 27 21:11:42 CET,Sun Nov 28 00:12:45 CET,0.0 0.573 0.939 1.241 1.492 1.74 1.98 2.2 2.608 2.8 2.981 2.903 3.491 3.661 3.987 4.29 4.577 4.717 4.991 5.262 5.661 5.917 6.165 6.532 6.893 7.238 7.563 7.876 8.29 8.693 9.089 9.565 10.021 10.482 11.019 11.633 12.249 12.946 13.699 14.503 15.383 16.403 17.6 18.853 20.362 22.106 24.197 26.603 29.577 33.267 38.065 42.416 45.149 47.037 48.39 49.38 50.145 50.745 51.158 51.502 51.743 51.919 52.055 52.156 52.237 52.32 52.398 52.425 52.414 52.367 52.3 52.241 52.18 52.109 52.041 51.967 51.887 51.797 51.685 51.603 51.528 51.406 51.318 51.228 51.174 51.058 50.936 50.791 50.713 50.276 50.479 50.386 50.297 50.091 49.955 49.79 49.61 49.417 49.173 48.799 48.062 -2 ,19200 ,TETRA ,17590556,Sat Nov 27 21:11:43 CET,Sun Nov 28 00:11:22 CET,0.0 0.512 0.834 1.098 1.366 1.622 1.868 2.101 2.525 2.726 2.909 2.854 3.443 3.606 3.927 4.216 4.498 4.64 4.906 5.169 5.558 5.813 6.066 6.426 6.781 7.126 7.456 7.795 8.257 8.697 9.123 9.641 10.151 10.658 11.242 11.912 12.572 13.317 14.141 15.04 15.984 17.022 18.225 19.486 21.055 22.795 24.824 27.197 30.08 33.785 38.653 43.088 45.924 47.865 49.249 50.261 50.975 51.544 51.989 52.369 52.638 52.842 53.02 53.15 53.244 53.304 53.326 53.34 53.335 53.301 53.264 53.24 53.213 53.179 53.137 53.084 53.022 52.941 52.854 52.791 52.731 52.631 52.539 52.441 52.391 52.285 52.171 52.038 51.967 51.505 51.637 51.533 51.428 51.157 50.985 50.785 50.58 50.37 50.099 49.72 48.368 -3 ,12680 ,TETRA ,17590557,Sat Nov 27 21:11:43 CET,Sun Nov 28 00:12:59 CET,0.0 0.527 0.896 1.186 1.437 1.665 1.884 2.099 2.519 2.713 2.892 2.819 3.404 3.568 3.879 4.167 4.458 4.606 4.882 5.136 5.51 5.764 6.017 6.386 6.743 7.09 7.432 7.762 8.193 8.63 9.062 9.579 10.07 10.547 11.122 11.779 12.425 13.168 13.978 14.824 15.713 16.767 18.017 19.284 20.796 22.53 24.75 27.437 30.45 34.07 38.927 43.234 45.999 47.91 49.273 50.278 51.003 51.515 51.845 52.151 52.38 52.552 52.681 52.769 52.814 52.843 52.875 52.874 52.868 52.858 52.83 52.798 52.758 52.713 52.675 52.633 52.581 52.501 52.391 52.303 52.211 52.077 51.978 51.864 51.804 51.675 51.546 51.434 51.358 50.894 51.053 50.938 50.822 50.552 50.397 50.227 50.046 49.854 49.594 49.202 48.505 -4 ,25857 ,TETRA ,17590558,Sat Nov 27 21:11:44 CET,Sun Nov 28 00:14:52 CET,0.0 0.672 1.02 1.306 1.579 1.831 2.065 2.304 2.767 2.983 3.186 3.136 3.733 3.907 4.24 4.564 4.88 5.027 5.317 5.605 6.016 6.292 6.565 6.954 7.327 7.689 8.048 8.399 8.861 9.314 9.754 10.306 10.822 11.287 11.835 12.474 13.113 13.832 14.613 15.479 16.414 17.473 18.719 19.983 21.473 23.226 25.423 27.992 31.098 34.979 40.041 44.408 47.099 48.936 50.263 51.279 52.013 52.573 52.979 53.323 53.569 53.755 53.917 54.026 54.104 54.171 54.224 54.243 54.227 54.204 54.185 54.164 54.136 54.098 54.058 54.008 53.953 53.897 53.835 53.791 53.738 53.638 53.559 53.47 53.419 53.318 53.193 53.029 52.952 52.505 52.663 52.558 52.452 52.213 52.07 51.91 51.724 51.507 51.219 50.737 49.766 -5 ,24204 ,TETRA ,17590559,Sat Nov 27 21:11:44 CET,Sun Nov 28 00:13:27 CET,0.0 0.642 1.076 1.432 1.697 1.952 2.186 2.39 2.794 2.997 3.189 3.105 3.681 3.831 4.134 4.421 4.687 4.825 5.099 5.361 5.75 6.009 6.256 6.612 6.961 7.31 7.65 7.978 8.396 8.822 9.253 9.748 10.227 10.721 11.292 11.936 12.577 13.287 14.071 14.936 15.845 16.865 18.082 19.361 20.927 22.746 24.978 27.552 30.605 34.442 39.421 43.947 46.817 48.684 49.981 50.937 51.619 52.144 52.545 52.891 53.121 53.29 53.437 53.544 53.609 53.628 53.63 53.635 53.627 53.621 53.61 53.573 53.532 53.483 53.427 53.359 53.279 53.187 53.083 53.005 52.926 52.787 52.688 52.582 52.524 52.395 52.246 52.079 51.996 51.546 51.695 51.578 51.453 51.168 51.017 50.853 50.659 50.388 50.068 49.675 48.533 -6 ,29697 ,TETRA ,17590560,Sat Nov 27 21:11:44 CET,Sun Nov 28 00:09:24 CET,0.0 0.605 1.009 1.353 1.644 1.897 2.153 2.411 2.881 3.087 3.284 3.252 3.854 4.03 4.377 4.714 5.028 5.174 5.455 5.722 6.103 6.353 6.601 6.967 7.326 7.672 8.009 8.35 8.793 9.215 9.614 10.102 10.586 11.056 11.616 12.261 12.874 13.538 14.272 15.096 16.007 17.076 18.344 19.631 21.128 22.83 24.898 27.348 30.351 33.98 38.655 42.844 45.496 47.312 48.588 49.557 50.295 50.862 51.28 51.637 51.883 52.079 52.247 52.382 52.488 52.579 52.663 52.705 52.725 52.735 52.719 52.687 52.637 52.592 52.558 52.503 52.44 52.364 52.27 52.209 52.156 52.062 51.982 51.896 51.85 51.74 51.605 51.472 51.409 50.978 51.186 51.078 50.959 50.723 50.59 50.443 50.277 50.073 49.84 49.51 48.444 -7 ,4681 ,TETRA ,17590561,Sat Nov 27 21:11:46 CET,Sun Nov 28 00:12:48 CET,0.0 0.836 1.182 1.44 1.677 1.919 2.144 2.363 2.784 2.975 3.153 3.07 3.655 3.816 4.129 4.442 4.739 4.879 5.155 5.422 5.803 6.06 6.31 6.672 7.03 7.37 7.698 8.024 8.453 8.864 9.269 9.79 10.286 10.758 11.321 11.975 12.608 13.3 14.06 14.882 15.78 16.845 18.107 19.358 20.936 22.783 24.903 27.379 30.467 34.299 39.139 43.448 46.159 48.061 49.442 50.46 51.2 51.773 52.165 52.461 52.675 52.848 52.992 53.105 53.195 53.257 53.29 53.29 53.284 53.267 53.219 53.169 53.103 53.016 52.95 52.882 52.806 52.727 52.652 52.595 52.513 52.368 52.27 52.174 52.123 52.011 51.883 51.735 51.657 51.208 51.376 51.272 51.166 50.914 50.774 50.612 50.426 50.19 49.891 49.55 48.613 -8 ,27901 ,TETRA ,17590562,Sat Nov 27 21:11:44 CET,Sun Nov 28 00:15:17 CET,0.0 1.244 1.774 2.172 2.505 2.775 3.018 3.252 3.68 3.865 4.047 3.978 4.556 4.716 5.045 5.349 5.628 5.768 6.05 6.33 6.74 7.003 7.251 7.611 7.969 8.321 8.668 9.005 9.441 9.88 10.3 10.797 11.298 11.793 12.358 12.99 13.613 14.295 15.076 15.961 16.877 17.916 19.184 20.529 22.119 23.917 26.073 28.607 31.765 35.673 40.57 44.845 47.547 49.375 50.605 51.56 52.323 52.931 53.365 53.702 53.935 54.099 54.22 54.316 54.382 54.43 54.489 54.523 54.53 54.538 54.53 54.507 54.471 54.41 54.354 54.302 54.252 54.193 54.119 54.066 54.007 53.895 53.796 53.69 53.638 53.52 53.374 53.211 53.127 52.673 52.863 52.762 52.648 52.394 52.252 52.088 51.897 51.685 51.463 51.125 50.431 -9 ,14727 ,TETRA ,17590563,Sat Nov 27 21:12:42 CET,Sat Nov 27 23:53:06 CET,0.0 0.472 0.819 1.131 1.395 1.626 1.852 2.064 2.459 2.642 2.82 2.761 3.358 3.53 3.843 4.137 4.428 4.573 4.857 5.123 5.499 5.742 5.986 6.354 6.727 7.094 7.431 7.76 8.195 8.623 9.045 9.55 10.033 10.506 11.06 11.705 12.335 13.032 13.781 14.569 15.418 16.424 17.616 18.817 20.283 21.985 23.993 26.406 29.392 33.068 37.915 42.306 44.982 46.786 48.119 49.104 49.834 50.398 50.812 51.156 51.379 51.552 51.685 51.806 51.909 51.974 52.029 52.062 52.079 52.067 52.038 52.021 52.005 51.979 51.95 51.903 51.832 51.757 51.686 51.634 51.572 51.454 51.358 51.252 51.199 51.076 50.948 50.817 50.74 50.296 50.496 50.409 50.323 50.109 49.979 49.835 49.649 49.42 49.119 48.717 47.45 -10 ,24738 ,TETRA ,17590564,Sat Nov 27 21:12:42 CET,Sun Nov 28 00:13:59 CET,0.0 0.676 1.078 1.426 1.727 2.014 2.291 2.533 2.969 3.168 3.354 3.304 3.896 4.058 4.368 4.681 4.979 5.123 5.424 5.714 6.128 6.4 6.663 7.044 7.406 7.758 8.11 8.447 8.883 9.31 9.743 10.292 10.82 11.331 11.929 12.613 13.299 14.052 14.858 15.737 16.683 17.765 19.057 20.385 21.964 23.784 25.937 28.366 31.272 34.868 39.446 43.745 46.568 48.399 49.689 50.673 51.388 51.924 52.291 52.599 52.821 52.978 53.121 53.23 53.291 53.343 53.396 53.417 53.421 53.425 53.412 53.399 53.382 53.348 53.314 53.266 53.217 53.165 53.099 53.05 52.993 52.879 52.798 52.726 52.688 52.602 52.496 52.37 52.303 51.872 52.077 51.969 51.861 51.632 51.501 51.363 51.172 50.941 50.69 50.351 49.506 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_31_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_31_26.txt deleted file mode 100644 index 31a3960e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_31_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4863 ,TETRA ,17590565,Sat Nov 27 21:12:42 CET,Sun Nov 28 00:14:51 CET,0.0 0.968 1.378 1.718 2.014 2.276 2.521 2.756 3.192 3.388 3.568 3.557 4.099 4.265 4.593 4.9 5.185 5.326 5.605 5.879 6.274 6.524 6.766 7.133 7.496 7.847 8.183 8.499 8.919 9.337 9.739 10.217 10.681 11.14 11.672 12.277 12.861 13.516 14.245 15.031 15.865 16.806 17.914 19.044 20.36 21.818 23.51 25.443 27.778 30.666 34.216 37.32 39.25 40.461 41.265 41.861 42.277 42.51 42.635 42.746 42.838 42.862 42.82 42.76 42.703 42.656 42.605 42.557 42.484 42.396 42.313 42.238 42.153 42.042 41.957 41.865 41.76 41.661 41.536 41.437 41.339 41.172 41.042 40.889 40.807 40.645 40.451 40.23 40.12 39.68 39.744 39.608 39.475 39.12 38.904 38.691 38.444 38.176 37.857 37.424 36.133 -2 ,27073 ,TETRA ,17590566,Sat Nov 27 21:12:42 CET,Sun Nov 28 00:13:14 CET,0.0 0.834 1.26 1.603 1.888 2.145 2.394 2.63 3.059 3.253 3.437 3.407 3.936 4.11 4.459 4.791 5.104 5.247 5.524 5.796 6.184 6.443 6.704 7.076 7.434 7.784 8.114 8.426 8.829 9.227 9.616 10.087 10.567 11.034 11.571 12.159 12.711 13.323 13.99 14.715 15.483 16.334 17.34 18.388 19.629 21.053 22.734 24.689 27.041 29.885 33.4 36.352 38.06 39.171 39.952 40.498 40.893 41.197 41.398 41.525 41.603 41.637 41.658 41.661 41.635 41.596 41.533 41.446 41.358 41.257 41.13 41.018 40.891 40.745 40.645 40.547 40.428 40.301 40.168 40.066 39.959 39.796 39.678 39.548 39.479 39.337 39.18 39.002 38.908 38.482 38.573 38.457 38.337 38.084 37.937 37.754 37.53 37.277 36.93 36.439 35.358 -3 ,15786 ,TETRA ,17590567,Sat Nov 27 21:12:44 CET,Sun Nov 28 00:12:39 CET,0.0 0.682 1.163 1.485 1.778 2.065 2.315 2.539 2.97 3.185 3.392 3.392 3.926 4.097 4.429 4.738 5.041 5.184 5.462 5.743 6.16 6.422 6.668 7.031 7.392 7.731 8.061 8.382 8.801 9.214 9.603 10.085 10.541 10.992 11.537 12.166 12.784 13.461 14.22 15.039 15.882 16.77 17.781 18.858 20.206 21.761 23.555 25.523 27.918 30.9 34.543 37.787 39.736 40.98 41.82 42.347 42.717 43.038 43.254 43.364 43.401 43.407 43.384 43.338 43.262 43.179 43.104 43.051 43.018 42.975 42.913 42.842 42.765 42.686 42.621 42.54 42.453 42.357 42.248 42.168 42.072 41.914 41.802 41.685 41.626 41.498 41.361 41.193 41.099 40.677 40.777 40.673 40.565 40.295 40.14 39.947 39.719 39.476 39.207 38.857 38.004 -4 ,592 ,TETRA ,17590568,Sat Nov 27 21:12:42 CET,Sun Nov 28 00:21:57 CET,0.0 0.849 1.256 1.583 1.886 2.183 2.45 2.689 3.131 3.335 3.538 3.561 4.104 4.279 4.618 4.926 5.208 5.352 5.644 5.922 6.319 6.582 6.834 7.206 7.565 7.897 8.227 8.554 8.993 9.43 9.839 10.32 10.79 11.257 11.803 12.403 12.996 13.654 14.355 15.1 15.884 16.816 17.934 19.035 20.3 21.725 23.376 25.342 27.771 30.632 34.108 36.96 38.67 39.816 40.613 41.196 41.573 41.838 42.0 42.099 42.17 42.199 42.189 42.166 42.133 42.08 42.008 41.916 41.818 41.703 41.568 41.455 41.345 41.216 41.103 40.996 40.878 40.735 40.578 40.479 40.386 40.222 40.097 39.964 39.889 39.717 39.545 39.385 39.298 38.867 38.946 38.794 38.629 38.315 38.144 37.95 37.725 37.47 37.188 36.825 35.781 -5 ,13975 ,TETRA ,17590569,Sat Nov 27 21:12:42 CET,Sun Nov 28 00:11:15 CET,0.0 0.763 1.168 1.488 1.782 2.049 2.291 2.505 2.897 3.086 3.268 3.256 3.796 3.973 4.3 4.609 4.907 5.052 5.34 5.622 6.038 6.297 6.544 6.914 7.268 7.608 7.946 8.286 8.714 9.119 9.526 10.02 10.494 10.963 11.504 12.115 12.702 13.34 14.055 14.814 15.62 16.588 17.74 18.914 20.267 21.735 23.433 25.392 27.732 30.607 34.241 37.319 39.167 40.419 41.269 41.798 42.123 42.349 42.478 42.574 42.65 42.685 42.675 42.633 42.583 42.521 42.433 42.346 42.271 42.193 42.09 41.989 41.876 41.772 41.689 41.574 41.444 41.301 41.164 41.069 40.966 40.811 40.694 40.558 40.484 40.333 40.191 40.026 39.926 39.498 39.588 39.46 39.321 39.01 38.833 38.652 38.447 38.189 37.839 37.466 36.817 -6 ,23402 ,TETRA ,17590570,Sat Nov 27 21:12:42 CET,Sun Nov 28 00:15:56 CET,0.0 0.883 1.343 1.741 2.072 2.37 2.63 2.865 3.287 3.485 3.687 3.707 4.251 4.425 4.759 5.071 5.373 5.515 5.777 6.044 6.43 6.67 6.908 7.243 7.563 7.883 8.196 8.489 8.873 9.284 9.699 10.19 10.66 11.109 11.626 12.202 12.777 13.416 14.089 14.822 15.629 16.535 17.608 18.729 20.015 21.466 23.211 25.238 27.628 30.512 34.198 37.353 39.245 40.546 41.443 42.024 42.403 42.727 42.963 43.129 43.234 43.299 43.34 43.35 43.312 43.261 43.214 43.149 43.083 43.021 42.96 42.904 42.827 42.714 42.62 42.54 42.466 42.371 42.255 42.167 42.062 41.885 41.754 41.609 41.542 41.395 41.193 40.969 40.865 40.427 40.468 40.316 40.171 39.924 39.785 39.618 39.411 39.123 38.766 38.372 37.617 -7 ,29607 ,TETRA ,17590571,Sat Nov 27 21:12:42 CET,Sun Nov 28 00:15:25 CET,0.0 0.786 1.254 1.635 1.95 2.218 2.476 2.727 3.181 3.39 3.589 3.592 4.132 4.307 4.643 4.956 5.264 5.416 5.709 5.992 6.401 6.651 6.886 7.235 7.588 7.938 8.261 8.562 8.959 9.369 9.778 10.278 10.773 11.238 11.756 12.363 12.963 13.589 14.266 14.993 15.754 16.638 17.691 18.777 20.113 21.618 23.314 25.342 27.778 30.633 34.315 37.524 39.41 40.679 41.581 42.227 42.675 42.966 43.143 43.278 43.318 43.306 43.311 43.313 43.276 43.224 43.183 43.13 43.053 42.966 42.886 42.807 42.703 42.59 42.496 42.384 42.263 42.127 41.971 41.872 41.77 41.597 41.473 41.337 41.271 41.141 40.989 40.812 40.716 40.294 40.413 40.311 40.203 39.924 39.748 39.552 39.345 39.1 38.82 38.458 37.27 -8 ,8518 ,TETRA ,17590572,Sat Nov 27 21:12:44 CET,Sun Nov 28 00:15:40 CET,0.0 0.794 1.265 1.648 1.985 2.273 2.539 2.787 3.231 3.431 3.619 3.618 4.156 4.326 4.643 4.939 5.23 5.367 5.635 5.907 6.3 6.55 6.792 7.137 7.476 7.807 8.122 8.428 8.83 9.231 9.615 10.07 10.513 10.937 11.425 11.984 12.535 13.154 13.831 14.564 15.343 16.224 17.262 18.312 19.578 21.061 22.825 24.856 27.245 30.116 33.752 36.807 38.542 39.646 40.385 40.933 41.339 41.626 41.796 41.942 42.029 42.059 42.035 41.981 41.938 41.893 41.842 41.789 41.725 41.643 41.562 41.49 41.404 41.296 41.18 41.053 40.937 40.808 40.668 40.573 40.473 40.316 40.194 40.07 40.008 39.868 39.713 39.502 39.367 38.928 39.023 38.886 38.749 38.445 38.256 38.059 37.865 37.645 37.379 36.994 35.998 -9 ,18689 ,TETRA ,17590573,Sat Nov 27 21:12:44 CET,Sun Nov 28 00:14:39 CET,0.0 0.833 1.279 1.667 1.99 2.261 2.519 2.771 3.214 3.422 3.626 3.646 4.19 4.357 4.677 4.994 5.297 5.445 5.737 6.01 6.409 6.67 6.925 7.3 7.673 8.038 8.389 8.722 9.144 9.568 9.99 10.499 10.982 11.45 12.003 12.638 13.244 13.884 14.569 15.306 16.08 16.95 17.971 18.995 20.245 21.68 23.352 25.306 27.672 30.518 34.085 37.128 39.037 40.34 41.175 41.814 42.259 42.558 42.767 42.924 43.027 43.087 43.111 43.116 43.112 43.08 43.036 42.992 42.934 42.854 42.755 42.683 42.598 42.499 42.424 42.339 42.243 42.123 41.983 41.887 41.788 41.618 41.496 41.369 41.305 41.164 41.006 40.838 40.755 40.344 40.447 40.311 40.162 39.898 39.769 39.614 39.436 39.231 38.948 38.544 37.724 -10 ,20615 ,TETRA ,17590574,Sat Nov 27 21:12:44 CET,Sun Nov 28 00:16:16 CET,0.0 0.811 1.274 1.642 1.958 2.223 2.464 2.701 3.126 3.319 3.51 3.509 4.048 4.221 4.547 4.849 5.148 5.296 5.589 5.864 6.251 6.5 6.738 7.09 7.436 7.778 8.104 8.41 8.808 9.202 9.581 10.043 10.495 10.943 11.457 12.036 12.599 13.224 13.899 14.62 15.392 16.247 17.297 18.409 19.708 21.189 22.905 24.866 27.287 30.255 33.985 37.163 39.125 40.399 41.23 41.867 42.301 42.578 42.773 42.949 43.054 43.114 43.122 43.096 43.077 43.036 42.969 42.907 42.858 42.784 42.663 42.553 42.449 42.345 42.253 42.15 42.047 41.917 41.775 41.687 41.588 41.41 41.277 41.145 41.081 40.947 40.794 40.617 40.527 40.105 40.197 40.077 39.945 39.655 39.497 39.329 39.136 38.917 38.602 38.202 37.493 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1h1s.txt deleted file mode 100644 index 793f13ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5973 ,TETRA ,17590575,Sat Nov 27 21:12:46 CET,Sun Nov 28 00:18:02 CET,0.0 0.73 1.178 1.508 1.802 2.088 2.349 2.58 2.989 3.19 3.393 3.179 3.943 4.111 4.434 4.76 5.079 5.232 5.53 5.818 6.241 6.506 6.771 7.185 7.587 7.966 8.332 8.697 9.166 9.633 10.096 10.644 11.185 11.719 12.349 13.079 13.789 14.586 15.458 16.39 17.416 18.61 20.042 21.553 23.363 25.347 27.639 30.334 33.581 37.627 42.712 47.04 49.696 51.429 52.614 53.479 54.082 54.483 54.731 54.921 55.003 54.993 54.974 54.93 54.858 54.801 54.713 54.606 54.494 54.357 54.217 54.096 53.945 53.772 53.629 53.464 53.3 53.134 52.938 52.792 52.627 52.386 52.246 52.103 52.023 51.845 51.646 51.393 51.262 50.591 50.82 50.667 50.517 50.183 49.959 49.694 49.397 49.028 48.617 48.142 46.697 -2 ,32437 ,TETRA ,17590576,Sat Nov 27 21:12:43 CET,Sun Nov 28 00:13:57 CET,0.0 0.635 1.01 1.315 1.589 1.845 2.107 2.371 2.822 3.024 3.219 3.004 3.775 3.951 4.284 4.607 4.92 5.071 5.366 5.658 6.082 6.354 6.627 7.028 7.42 7.807 8.195 8.566 9.037 9.499 9.939 10.473 11.025 11.579 12.22 12.957 13.669 14.457 15.325 16.279 17.287 18.437 19.844 21.25 22.89 24.825 27.197 29.995 33.31 37.353 42.551 47.177 50.081 51.947 53.12 53.962 54.53 54.908 55.148 55.329 55.447 55.5 55.496 55.45 55.374 55.284 55.17 55.057 54.937 54.814 54.677 54.53 54.383 54.246 54.126 54.004 53.886 53.715 53.524 53.401 53.268 53.053 52.891 52.701 52.596 52.39 52.177 51.948 51.833 51.159 51.343 51.165 50.991 50.605 50.376 50.118 49.821 49.482 49.092 48.572 46.752 -3 ,5586 ,TETRA ,17590577,Sat Nov 27 21:12:43 CET,Sun Nov 28 00:13:57 CET,0.0 0.549 0.958 1.269 1.529 1.777 2.007 2.216 2.576 2.756 2.95 2.731 3.501 3.673 4.004 4.322 4.625 4.775 5.068 5.352 5.766 6.038 6.302 6.686 7.077 7.467 7.839 8.199 8.67 9.14 9.592 10.127 10.67 11.202 11.808 12.499 13.173 13.942 14.809 15.746 16.738 17.875 19.257 20.706 22.464 24.484 26.864 29.627 32.957 37.111 42.494 47.213 50.094 51.985 53.295 54.221 54.796 55.178 55.439 55.642 55.726 55.755 55.763 55.744 55.718 55.663 55.569 55.477 55.393 55.294 55.191 55.096 54.993 54.878 54.783 54.681 54.562 54.43 54.256 54.119 53.991 53.796 53.617 53.358 53.216 52.909 52.577 52.244 52.069 51.304 51.431 51.186 50.946 50.433 50.139 49.807 49.46 49.074 48.604 47.965 46.055 -4 ,31161 ,TETRA ,17590578,Sat Nov 27 21:12:43 CET,Sun Nov 28 00:14:22 CET,0.0 0.716 1.069 1.391 1.678 1.93 2.148 2.358 2.759 2.96 3.16 2.929 3.687 3.856 4.172 4.471 4.761 4.91 5.205 5.485 5.897 6.185 6.468 6.858 7.244 7.625 7.987 8.338 8.801 9.264 9.737 10.303 10.838 11.379 12.02 12.729 13.423 14.212 15.077 16.021 17.036 18.205 19.602 21.028 22.744 24.735 27.093 29.837 33.148 37.225 42.472 47.079 49.961 51.87 53.103 53.937 54.485 54.914 55.249 55.483 55.614 55.676 55.678 55.653 55.618 55.571 55.498 55.411 55.33 55.227 55.076 54.947 54.84 54.72 54.6 54.474 54.351 54.201 54.032 53.911 53.773 53.567 53.424 53.264 53.186 53.029 52.815 52.581 52.464 51.8 52.069 51.914 51.733 51.301 51.061 50.812 50.53 50.155 49.655 49.005 47.541 -5 ,1235 ,TETRA ,17590579,Sat Nov 27 21:12:45 CET,Sun Nov 28 00:13:51 CET,0.0 0.654 1.024 1.334 1.612 1.867 2.121 2.366 2.811 3.027 3.237 3.027 3.802 3.984 4.334 4.667 4.992 5.144 5.44 5.747 6.197 6.48 6.758 7.156 7.545 7.947 8.334 8.709 9.204 9.679 10.145 10.715 11.261 11.787 12.406 13.12 13.818 14.577 15.402 16.316 17.304 18.439 19.8 21.195 22.861 24.77 27.059 29.716 32.902 36.88 42.001 46.595 49.432 51.264 52.496 53.377 54.023 54.482 54.801 55.057 55.234 55.338 55.374 55.362 55.32 55.282 55.236 55.186 55.121 55.004 54.89 54.801 54.685 54.547 54.425 54.299 54.162 54.021 53.858 53.736 53.62 53.397 53.213 53.021 52.924 52.735 52.548 52.339 52.214 51.533 51.74 51.568 51.394 51.021 50.807 50.563 50.282 49.934 49.515 48.998 47.2 -6 ,22632 ,TETRA ,17590580,Sat Nov 27 21:12:47 CET,Sun Nov 28 00:13:33 CET,0.0 0.843 1.243 1.618 1.985 2.285 2.568 2.834 3.292 3.502 3.707 3.516 4.295 4.484 4.832 5.149 5.464 5.618 5.91 6.193 6.604 6.883 7.16 7.552 7.931 8.306 8.688 9.048 9.515 9.987 10.441 11.001 11.545 12.083 12.72 13.423 14.115 14.904 15.794 16.764 17.789 18.954 20.374 21.835 23.553 25.518 27.86 30.615 33.898 37.957 43.123 47.539 50.297 52.139 53.35 54.141 54.649 55.033 55.309 55.499 55.57 55.599 55.603 55.589 55.594 55.586 55.523 55.423 55.323 55.219 55.097 54.981 54.837 54.675 54.551 54.418 54.285 54.148 53.993 53.867 53.726 53.497 53.33 53.148 53.052 52.861 52.663 52.448 52.337 51.67 51.884 51.723 51.548 51.178 50.974 50.74 50.469 50.146 49.737 49.163 47.268 -7 ,21736 ,TETRA ,17590581,Sat Nov 27 21:12:44 CET,Sun Nov 28 00:16:02 CET,0.0 0.69 1.021 1.323 1.573 1.799 2.018 2.221 2.611 2.804 2.988 2.771 3.538 3.707 4.047 4.37 4.681 4.828 5.115 5.406 5.84 6.116 6.381 6.764 7.136 7.499 7.859 8.225 8.701 9.163 9.62 10.161 10.69 11.224 11.858 12.572 13.254 14.029 14.884 15.821 16.832 17.966 19.301 20.685 22.333 24.255 26.583 29.288 32.578 36.703 41.984 46.586 49.375 51.169 52.426 53.333 53.898 54.202 54.408 54.588 54.68 54.71 54.706 54.694 54.634 54.538 54.425 54.309 54.198 54.079 53.956 53.827 53.675 53.526 53.401 53.251 53.096 52.935 52.739 52.593 52.45 52.245 52.092 51.908 51.809 51.604 51.397 51.187 51.075 50.417 50.658 50.513 50.366 50.044 49.835 49.572 49.28 48.97 48.605 48.104 46.453 -8 ,17359 ,TETRA ,17590582,Sat Nov 27 21:12:44 CET,Sun Nov 28 00:15:44 CET,0.0 0.639 0.995 1.309 1.593 1.849 2.086 2.322 2.762 2.955 3.164 2.994 3.767 3.937 4.26 4.581 4.887 5.036 5.331 5.624 6.059 6.337 6.606 6.996 7.372 7.748 8.12 8.486 8.964 9.43 9.889 10.441 10.989 11.527 12.155 12.863 13.552 14.335 15.199 16.121 17.114 18.262 19.639 21.111 22.89 24.882 27.224 30.016 33.413 37.526 42.785 47.428 50.367 52.327 53.651 54.614 55.272 55.724 56.036 56.289 56.419 56.484 56.503 56.5 56.467 56.389 56.311 56.249 56.191 56.116 55.999 55.895 55.796 55.677 55.565 55.445 55.338 55.224 55.076 54.956 54.837 54.665 54.536 54.385 54.301 54.133 53.944 53.722 53.604 52.953 53.219 53.08 52.933 52.56 52.351 52.096 51.797 51.498 51.099 50.541 48.961 -9 ,24251 ,TETRA ,17590583,Sat Nov 27 21:12:47 CET,Sun Nov 28 00:12:54 CET,0.0 0.569 0.882 1.181 1.463 1.713 1.926 2.138 2.541 2.73 2.923 2.7 3.448 3.613 3.955 4.286 4.591 4.738 5.042 5.339 5.754 6.012 6.267 6.649 7.044 7.441 7.815 8.174 8.644 9.101 9.555 10.104 10.633 11.152 11.755 12.448 13.135 13.912 14.759 15.669 16.634 17.744 19.12 20.538 22.212 24.153 26.474 29.195 32.491 36.484 41.593 45.93 48.438 50.052 51.118 51.854 52.316 52.611 52.841 53.021 53.078 53.069 53.029 52.97 52.901 52.813 52.709 52.601 52.509 52.398 52.277 52.168 52.024 51.873 51.765 51.643 51.492 51.325 51.151 51.018 50.866 50.644 50.49 50.317 50.233 50.071 49.874 49.646 49.53 48.859 49.098 48.94 48.766 48.398 48.19 47.966 47.697 47.367 46.967 46.45 45.254 -10 ,5011 ,TETRA ,17590584,Sat Nov 27 21:12:44 CET,Sun Nov 28 00:14:47 CET,0.0 0.716 1.066 1.395 1.7 1.951 2.187 2.427 2.859 3.061 3.258 3.068 3.841 4.025 4.403 4.761 5.108 5.272 5.601 5.932 6.42 6.732 7.039 7.477 7.885 8.288 8.692 9.091 9.613 10.11 10.577 11.169 11.769 12.339 12.988 13.746 14.493 15.31 16.193 17.141 18.161 19.338 20.742 22.179 23.922 25.964 28.369 31.128 34.475 38.544 43.832 48.626 51.564 53.517 54.873 55.882 56.595 57.141 57.491 57.707 57.822 57.87 57.872 57.867 57.86 57.82 57.735 57.644 57.568 57.476 57.365 57.241 57.086 56.918 56.777 56.629 56.486 56.332 56.154 56.035 55.909 55.688 55.531 55.362 55.268 55.071 54.868 54.633 54.507 53.861 54.13 53.976 53.824 53.478 53.278 53.042 52.769 52.42 51.951 51.277 49.549 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1oiu.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1oiu.txt deleted file mode 100644 index 8e42a4a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1oiu.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19740 ,TETRA ,17590585,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:01:28 CET,0.0 1.464 2.157 2.761 3.306 3.786 4.221 4.641 5.426 5.798 6.173 6.25 7.208 7.533 8.132 8.648 9.131 9.376 9.863 10.35 11.074 11.534 11.972 12.618 13.247 13.856 14.462 15.08 15.916 16.717 17.469 18.391 19.301 20.202 21.276 22.487 23.697 25.053 26.506 28.129 29.871 31.852 34.212 36.64 39.607 43.05 47.17 52.052 57.988 65.392 75.003 83.606 89.026 92.579 95.021 96.629 97.681 98.547 99.218 99.784 100.204 100.525 100.721 100.839 100.97 101.068 101.139 101.191 101.197 101.172 101.146 101.111 101.04 100.952 100.874 100.77 100.633 100.459 100.268 100.12 99.968 99.728 99.553 99.346 99.222 98.963 98.683 98.356 98.187 97.526 97.658 97.472 97.276 96.878 96.599 96.245 95.822 95.331 94.746 93.894 89.803 -2 ,630 ,TETRA ,17590586,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:18:35 CET,0.0 1.343 1.957 2.483 2.964 3.373 3.751 4.13 4.846 5.211 5.582 5.651 6.548 6.824 7.353 7.894 8.428 8.685 9.189 9.691 10.413 10.87 11.321 11.978 12.624 13.262 13.87 14.465 15.303 16.101 16.833 17.768 18.69 19.579 20.611 21.784 22.933 24.227 25.684 27.331 29.071 30.983 33.267 35.671 38.548 41.858 45.819 50.458 56.247 63.7 73.24 81.591 86.926 90.463 92.978 94.843 96.17 97.185 97.91 98.474 98.86 99.122 99.321 99.5 99.64 99.737 99.82 99.833 99.801 99.776 99.761 99.747 99.706 99.631 99.569 99.497 99.377 99.205 99.03 98.946 98.851 98.67 98.543 98.401 98.327 98.126 97.896 97.681 97.538 96.897 97.085 96.908 96.699 96.144 95.785 95.384 94.958 94.508 93.886 92.925 88.283 -3 ,16995 ,TETRA ,17590587,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:13:28 CET,0.0 1.169 1.817 2.313 2.74 3.136 3.502 3.854 4.523 4.819 5.104 5.083 5.954 6.239 6.777 7.286 7.778 8.019 8.512 9.008 9.709 10.149 10.577 11.216 11.856 12.486 13.104 13.712 14.514 15.305 16.061 16.977 17.9 18.807 19.855 21.059 22.243 23.587 25.092 26.716 28.484 30.551 33.02 35.545 38.549 42.037 46.175 51.047 57.194 64.514 73.242 80.766 85.531 88.669 90.82 92.394 93.525 94.375 94.97 95.505 95.882 96.139 96.293 96.354 96.33 96.307 96.314 96.308 96.269 96.163 96.048 95.983 95.894 95.771 95.668 95.524 95.357 95.182 94.998 94.868 94.731 94.507 94.321 94.112 94.014 93.818 93.568 93.256 93.095 92.433 92.556 92.364 92.157 91.669 91.406 91.127 90.773 90.323 89.71 88.829 86.125 -4 ,16346 ,TETRA ,17590588,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:15:57 CET,0.0 1.891 2.528 3.076 3.544 3.974 4.363 4.715 5.391 5.714 6.009 5.971 6.83 7.101 7.646 8.169 8.667 8.928 9.438 9.91 10.621 11.088 11.543 12.197 12.81 13.402 14.002 14.619 15.436 16.205 16.938 17.84 18.71 19.566 20.604 21.797 22.984 24.36 25.884 27.569 29.364 31.373 33.801 36.252 39.074 42.343 46.268 50.926 56.868 64.263 73.679 82.018 87.187 90.826 93.372 95.268 96.702 97.75 98.499 99.149 99.626 99.978 100.248 100.478 100.659 100.768 100.885 100.969 100.994 101.005 101.0 100.968 100.923 100.867 100.791 100.685 100.586 100.473 100.357 100.286 100.2 100.032 99.888 99.727 99.634 99.435 99.231 98.979 98.846 98.241 98.454 98.29 98.119 97.686 97.416 97.123 96.82 96.471 95.96 95.114 91.908 -5 ,8679 ,TETRA ,17590589,Sat Nov 27 21:13:43 CET,Sun Nov 28 00:17:34 CET,0.0 1.77 2.418 2.907 3.368 3.786 4.168 4.526 5.189 5.499 5.803 5.812 6.687 6.963 7.464 7.939 8.42 8.669 9.17 9.643 10.306 10.737 11.176 11.826 12.46 13.078 13.681 14.284 15.079 15.855 16.61 17.527 18.405 19.265 20.292 21.521 22.745 24.065 25.526 27.142 28.863 30.895 33.309 35.664 38.527 41.915 45.933 50.591 56.245 63.349 72.544 80.665 85.804 89.244 91.592 93.298 94.544 95.513 96.251 96.864 97.298 97.596 97.833 98.016 98.142 98.256 98.358 98.42 98.437 98.42 98.371 98.292 98.173 98.039 97.93 97.807 97.665 97.527 97.388 97.272 97.126 96.878 96.706 96.535 96.441 96.233 96.02 95.769 95.637 95.022 95.226 95.063 94.883 94.438 94.166 93.885 93.554 93.127 92.569 91.731 87.652 -6 ,5720 ,TETRA ,17590590,Sat Nov 27 21:13:45 CET,Sun Nov 28 00:16:03 CET,0.0 1.465 2.037 2.511 2.972 3.385 3.751 4.092 4.79 5.126 5.445 5.461 6.337 6.634 7.199 7.723 8.226 8.475 8.966 9.441 10.136 10.582 11.014 11.652 12.284 12.911 13.528 14.134 14.927 15.704 16.477 17.444 18.389 19.304 20.366 21.607 22.834 24.208 25.736 27.366 29.097 31.065 33.424 35.932 38.923 42.302 46.354 51.111 56.9 64.205 73.898 82.595 87.879 91.515 94.122 96.061 97.491 98.523 99.29 99.934 100.363 100.688 100.936 101.089 101.205 101.284 101.355 101.409 101.382 101.306 101.242 101.183 101.107 101.013 100.914 100.817 100.733 100.609 100.453 100.342 100.212 99.997 99.85 99.674 99.574 99.378 99.162 98.878 98.712 98.056 98.213 98.033 97.834 97.396 97.13 96.819 96.461 96.021 95.486 94.741 91.558 -7 ,19604 ,TETRA ,17590592,Sat Nov 27 21:13:43 CET,Sun Nov 28 00:15:44 CET,0.0 1.739 2.369 2.902 3.372 3.785 4.19 4.575 5.25 5.568 5.898 5.937 6.834 7.132 7.685 8.22 8.735 8.98 9.478 9.966 10.684 11.178 11.658 12.333 12.964 13.574 14.179 14.767 15.53 16.279 17.017 17.917 18.824 19.731 20.781 21.951 23.095 24.39 25.819 27.405 29.146 31.12 33.498 36.031 39.058 42.467 46.516 51.218 56.948 64.194 73.66 81.976 87.061 90.531 93.076 94.964 96.274 97.244 97.961 98.613 99.086 99.422 99.663 99.831 99.963 100.043 100.1 100.083 100.064 100.071 100.026 99.934 99.804 99.677 99.57 99.432 99.276 99.1 98.918 98.791 98.644 98.381 98.178 97.966 97.86 97.654 97.383 97.014 96.821 96.142 96.236 96.049 95.852 95.409 95.139 94.809 94.437 94.004 93.427 92.569 89.422 -8 ,5716 ,TETRA ,17590593,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:15:49 CET,0.0 1.022 1.589 2.05 2.457 2.813 3.157 3.489 4.133 4.451 4.761 4.75 5.62 5.886 6.4 6.897 7.374 7.615 8.099 8.565 9.246 9.697 10.135 10.774 11.401 12.019 12.619 13.218 14.029 14.813 15.56 16.493 17.409 18.308 19.351 20.521 21.691 22.984 24.442 26.082 27.87 29.924 32.403 35.003 38.083 41.603 45.819 50.807 56.79 63.809 72.824 81.087 86.296 89.76 92.127 93.969 95.366 96.41 97.18 97.817 98.254 98.61 98.873 99.031 99.173 99.278 99.36 99.429 99.472 99.481 99.425 99.342 99.265 99.207 99.153 99.07 98.969 98.83 98.649 98.534 98.437 98.253 98.1 97.916 97.814 97.623 97.416 97.18 97.047 96.425 96.602 96.413 96.219 95.746 95.473 95.177 94.835 94.443 93.909 93.033 89.653 -9 ,1966 ,TETRA ,17590594,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:23:27 CET,0.0 1.016 1.61 2.116 2.545 2.939 3.287 3.636 4.298 4.596 4.892 4.883 5.749 6.017 6.535 7.042 7.54 7.791 8.295 8.79 9.496 9.946 10.398 11.069 11.711 12.324 12.932 13.552 14.359 15.143 15.919 16.868 17.817 18.761 19.848 21.104 22.317 23.648 25.185 26.884 28.713 30.789 33.184 35.648 38.641 42.048 46.019 50.641 56.133 62.925 71.576 78.837 83.287 86.267 88.341 89.884 90.988 91.845 92.446 92.935 93.3 93.552 93.746 93.859 93.876 93.855 93.825 93.796 93.757 93.703 93.639 93.561 93.445 93.282 93.156 93.038 92.925 92.795 92.549 92.339 92.121 91.75 91.493 91.221 91.071 90.758 90.446 90.1 89.893 89.14 89.256 89.024 88.756 88.172 87.83 87.424 87.0 86.505 85.845 84.897 81.802 -10 ,7160 ,TETRA ,17590595,Sat Nov 27 21:13:42 CET,Sun Nov 28 00:13:57 CET,0.0 1.939 2.556 3.062 3.509 3.927 4.297 4.659 5.35 5.656 5.951 5.943 6.806 7.074 7.618 8.143 8.647 8.89 9.366 9.837 10.533 10.984 11.425 12.11 12.793 13.439 14.053 14.645 15.443 16.245 17.027 18.001 18.973 19.942 21.087 22.357 23.588 24.979 26.497 28.163 29.967 32.043 34.581 37.155 40.145 43.558 47.63 52.409 58.346 65.707 74.751 82.666 87.653 91.008 93.297 94.977 96.242 97.173 97.832 98.36 98.69 98.934 99.125 99.24 99.279 99.281 99.246 99.181 99.122 99.03 98.889 98.788 98.68 98.504 98.373 98.266 98.11 97.931 97.747 97.601 97.467 97.245 97.06 96.857 96.74 96.451 96.141 95.856 95.706 95.05 95.138 94.906 94.674 94.094 93.718 93.31 92.886 92.389 91.776 90.917 85.376 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_32_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_32_30.txt deleted file mode 100644 index 806010b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/protein/Summary_FEP_32_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6255 ,KEBNE ,17026645,Wed Dec 22 15:03:49 CET,Wed Dec 22 17:14:17 CET,0.0 1.083 1.621 2.066 2.474 2.857 3.205 3.53 4.147 4.448 4.749 4.744 5.612 5.903 6.474 7.019 7.55 7.821 8.37 8.92 9.717 10.208 10.687 11.396 12.085 12.77 13.459 14.134 15.005 15.879 16.768 17.845 18.891 19.933 21.166 22.593 24.072 25.743 27.522 29.469 31.576 34.017 36.966 40.041 43.789 48.205 53.563 59.986 68.13 78.556 92.554 105.913 115.016 121.68 126.71 130.721 133.872 136.418 138.411 140.266 141.725 142.929 144.008 144.936 145.736 146.413 147.072 147.619 148.062 148.51 148.948 149.278 149.599 149.897 150.102 150.304 150.505 150.699 150.87 150.973 151.061 151.174 151.25 151.311 151.325 151.331 151.338 151.315 151.291 150.851 151.216 151.184 151.137 151.007 150.919 150.79 150.623 150.418 150.144 149.655 147.528 -2 ,673 ,KEBNE ,17026646,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 17:14:20 CET,0.0 1.293 1.946 2.481 2.97 3.424 3.849 4.3 5.223 5.645 6.04 6.171 7.169 7.54 8.281 8.917 9.45 9.71 10.224 10.735 11.493 11.989 12.489 13.213 13.922 14.629 15.325 16.015 16.92 17.813 18.7 19.818 20.909 21.967 23.231 24.686 26.121 27.737 29.54 31.481 33.558 35.995 38.959 42.029 45.774 50.19 55.547 61.98 70.095 80.517 94.575 108.059 117.217 123.793 128.691 132.597 135.683 138.228 140.239 142.062 143.496 144.673 145.72 146.66 147.476 148.156 148.782 149.308 149.743 150.17 150.591 150.903 151.21 151.515 151.738 151.951 152.164 152.362 152.531 152.632 152.721 152.861 152.95 153.025 153.062 153.104 153.101 153.092 153.099 152.678 153.06 153.039 152.993 152.86 152.769 152.671 152.55 152.362 152.113 151.724 150.309 -3 ,22782 ,KEBNE ,17026647,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 17:15:11 CET,0.0 1.017 1.593 2.096 2.543 2.945 3.327 3.677 4.338 4.66 4.966 4.967 5.834 6.12 6.679 7.249 7.809 8.072 8.592 9.107 9.857 10.343 10.822 11.529 12.213 12.899 13.589 14.269 15.163 16.027 16.878 17.939 18.977 20.015 21.271 22.687 24.071 25.654 27.433 29.394 31.504 33.932 36.878 39.963 43.699 48.086 53.493 60.066 68.221 78.477 92.398 105.662 114.657 121.253 126.205 130.038 133.029 135.513 137.48 139.251 140.604 141.706 142.707 143.607 144.393 145.046 145.663 146.164 146.579 146.969 147.336 147.643 147.929 148.192 148.39 148.57 148.729 148.888 149.038 149.107 149.161 149.267 149.335 149.386 149.409 149.466 149.516 149.536 149.525 149.077 149.415 149.356 149.274 149.079 148.965 148.829 148.661 148.458 148.203 147.76 145.865 -4 ,21686 ,KEBNE ,17026648,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 17:13:28 CET,0.0 0.884 1.484 2.022 2.494 2.92 3.339 3.758 4.558 4.947 5.322 5.417 6.331 6.616 7.167 7.714 8.246 8.503 9.015 9.526 10.271 10.748 11.217 11.916 12.62 13.322 14.007 14.666 15.535 16.42 17.287 18.332 19.377 20.417 21.645 23.045 24.433 26.004 27.741 29.656 31.753 34.231 37.221 40.285 43.979 48.315 53.589 59.868 67.837 78.076 91.923 105.19 114.179 120.755 125.681 129.549 132.545 134.998 136.948 138.716 140.11 141.279 142.356 143.293 144.083 144.764 145.419 145.956 146.396 146.837 147.263 147.585 147.903 148.196 148.403 148.606 148.79 148.961 149.11 149.195 149.277 149.373 149.436 149.514 149.552 149.624 149.666 149.673 149.672 149.225 149.541 149.465 149.385 149.221 149.121 149.005 148.813 148.512 148.15 147.736 146.269 -5 ,23246 ,KEBNE ,17026649,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 17:13:34 CET,0.0 1.209 1.889 2.468 2.994 3.497 3.975 4.428 5.259 5.646 6.046 6.182 7.191 7.566 8.202 8.756 9.3 9.565 10.095 10.631 11.398 11.891 12.39 13.14 13.888 14.611 15.299 15.971 16.863 17.747 18.616 19.679 20.754 21.83 23.109 24.595 26.041 27.637 29.422 31.395 33.497 35.953 38.912 42.001 45.752 50.168 55.584 62.058 70.192 80.627 94.948 108.673 117.949 124.678 129.735 133.76 136.89 139.397 141.354 143.158 144.606 145.8 146.82 147.7 148.478 149.151 149.8 150.329 150.757 151.175 151.583 151.9 152.2 152.473 152.662 152.84 153.024 153.203 153.349 153.434 153.526 153.66 153.73 153.78 153.804 153.851 153.878 153.879 153.865 153.419 153.767 153.726 153.673 153.528 153.43 153.3 153.161 152.997 152.746 152.338 150.573 -6 ,5870 ,KEBNE ,17026650,Wed Dec 22 15:03:49 CET,Wed Dec 22 17:12:49 CET,0.0 1.019 1.585 2.07 2.498 2.896 3.279 3.648 4.345 4.679 5.003 5.054 6.011 6.346 6.929 7.514 8.087 8.37 8.928 9.476 10.288 10.823 11.353 12.124 12.88 13.629 14.372 15.088 16.015 16.916 17.788 18.882 19.949 20.997 22.254 23.706 25.14 26.76 28.569 30.554 32.68 35.128 38.073 41.176 44.97 49.38 54.787 61.278 69.437 79.895 94.074 107.676 116.741 123.274 128.239 132.23 135.332 137.88 139.898 141.715 143.152 144.34 145.408 146.36 147.154 147.794 148.42 148.972 149.421 149.842 150.231 150.53 150.831 151.121 151.319 151.499 151.679 151.857 152.009 152.096 152.183 152.287 152.349 152.414 152.443 152.489 152.514 152.53 152.523 152.087 152.457 152.417 152.373 152.234 152.121 151.971 151.779 151.54 151.263 150.78 149.046 -7 ,26513 ,KEBNE ,17026651,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 17:14:01 CET,0.0 1.159 1.674 2.136 2.544 2.923 3.287 3.627 4.264 4.577 4.885 4.908 5.786 6.064 6.611 7.174 7.726 8.006 8.558 9.066 9.816 10.306 10.785 11.513 12.232 12.935 13.629 14.315 15.218 16.097 16.956 18.035 19.109 20.147 21.377 22.809 24.215 25.801 27.57 29.511 31.624 34.071 36.986 40.045 43.807 48.22 53.591 60.041 68.147 78.51 92.625 106.014 114.868 121.322 126.228 130.147 133.221 135.712 137.682 139.462 140.848 142.014 143.03 143.921 144.734 145.422 146.054 146.572 147.001 147.422 147.843 148.143 148.4 148.64 148.821 148.996 149.154 149.306 149.46 149.563 149.654 149.759 149.822 149.881 149.91 149.981 150.028 150.016 149.995 149.549 149.87 149.814 149.77 149.693 149.641 149.566 149.447 149.26 148.963 148.476 146.668 -8 ,31520 ,KEBNE ,17026652,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 17:13:10 CET,0.0 1.208 1.839 2.373 2.861 3.31 3.746 4.193 5.034 5.387 5.703 5.741 6.63 6.923 7.505 8.073 8.63 8.905 9.45 9.979 10.73 11.22 11.707 12.417 13.103 13.765 14.434 15.124 16.033 16.925 17.796 18.866 19.95 21.031 22.287 23.704 25.088 26.637 28.396 30.339 32.399 34.788 37.706 40.783 44.495 48.857 54.196 60.596 68.6 78.821 92.634 105.713 114.616 121.096 125.943 129.751 132.769 135.274 137.233 139.014 140.431 141.625 142.675 143.582 144.368 145.035 145.692 146.24 146.689 147.132 147.553 147.875 148.181 148.464 148.68 148.895 149.096 149.274 149.44 149.545 149.646 149.793 149.877 149.954 149.989 150.046 150.077 150.087 150.084 149.661 150.042 150.002 149.958 149.825 149.731 149.624 149.483 149.314 149.083 148.662 147.133 -9 ,1271 ,KEBNE ,17026653,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 17:13:23 CET,0.0 1.12 1.741 2.267 2.719 3.126 3.501 3.851 4.523 4.857 5.182 5.224 6.115 6.41 6.967 7.508 8.049 8.318 8.849 9.366 10.115 10.609 11.097 11.807 12.515 13.209 13.888 14.573 15.481 16.387 17.279 18.392 19.487 20.547 21.8 23.258 24.701 26.313 28.114 30.098 32.266 34.735 37.669 40.768 44.56 48.948 54.255 60.649 68.611 78.828 92.668 105.753 114.611 121.083 125.944 129.794 132.8 135.273 137.227 138.963 140.314 141.445 142.456 143.358 144.143 144.781 145.389 145.858 146.236 146.641 147.036 147.336 147.629 147.906 148.101 148.285 148.46 148.629 148.784 148.874 148.95 149.053 149.114 149.143 149.144 149.164 149.199 149.213 149.213 148.778 149.151 149.119 149.051 148.87 148.795 148.709 148.561 148.38 148.137 147.759 146.42 -10 ,26492 ,KEBNE ,17026654,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 17:12:54 CET,0.0 1.213 1.762 2.268 2.78 3.268 3.691 4.056 4.742 5.058 5.365 5.367 6.233 6.517 7.087 7.636 8.167 8.429 8.942 9.439 10.167 10.66 11.159 11.908 12.644 13.346 14.026 14.697 15.588 16.486 17.372 18.451 19.518 20.562 21.794 23.216 24.606 26.177 27.941 29.865 31.921 34.303 37.237 40.372 44.132 48.468 53.763 60.142 68.076 78.246 92.208 105.417 114.393 120.942 125.88 129.744 132.755 135.246 137.201 138.97 140.38 141.559 142.584 143.471 144.234 144.862 145.462 145.958 146.365 146.762 147.127 147.397 147.678 147.977 148.178 148.367 148.546 148.707 148.859 148.942 149.024 149.159 149.224 149.267 149.288 149.317 149.321 149.291 149.265 148.821 149.173 149.13 149.075 148.938 148.847 148.714 148.532 148.286 148.014 147.585 146.265 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_17_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_17_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 85e6f422..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_17_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32584 ,TETRA ,17590596,Sat Nov 27 21:13:43 CET,Sat Nov 27 23:04:00 CET,0.0 0.559 0.94 1.245 1.49 1.712 1.915 2.088 2.389 2.528 2.657 2.574 2.986 3.095 3.31 3.505 3.713 3.816 3.985 4.137 4.352 4.493 4.628 4.815 5.001 5.173 5.337 5.493 5.695 5.897 6.092 6.325 6.549 6.763 7.009 7.28 7.543 7.831 8.125 8.435 8.772 9.161 9.594 10.003 10.455 10.951 11.5 12.086 12.747 13.452 14.119 14.386 14.316 14.066 13.774 13.491 13.204 12.901 12.614 12.312 12.033 11.768 11.496 11.229 10.985 10.758 10.537 10.326 10.138 9.955 9.747 9.556 9.358 9.167 9.008 8.835 8.655 8.464 8.264 8.13 7.988 7.76 7.595 7.409 7.315 7.125 6.926 6.696 6.574 6.15 6.184 6.03 5.854 5.473 5.255 5.013 4.75 4.436 4.026 3.388 1.987 -2 ,28076 ,TETRA ,17590597,Sat Nov 27 21:13:44 CET,Sat Nov 27 23:05:12 CET,0.0 0.495 0.794 1.047 1.272 1.473 1.657 1.831 2.112 2.236 2.36 2.286 2.713 2.83 3.026 3.205 3.379 3.462 3.619 3.773 3.997 4.136 4.273 4.481 4.689 4.877 5.042 5.199 5.408 5.615 5.821 6.072 6.307 6.537 6.796 7.078 7.354 7.652 7.954 8.275 8.625 9.014 9.448 9.871 10.355 10.877 11.442 12.044 12.741 13.458 14.079 14.311 14.248 14.057 13.777 13.478 13.191 12.886 12.593 12.3 12.043 11.779 11.527 11.299 11.049 10.816 10.605 10.405 10.212 10.005 9.781 9.585 9.38 9.16 8.983 8.791 8.584 8.371 8.143 7.989 7.838 7.597 7.414 7.226 7.142 6.948 6.72 6.478 6.353 5.928 5.967 5.822 5.665 5.292 5.095 4.864 4.602 4.31 3.936 3.3 1.83 -3 ,12643 ,TETRA ,17590598,Sat Nov 27 21:13:44 CET,Sat Nov 27 23:05:37 CET,0.0 0.478 0.818 1.09 1.296 1.473 1.625 1.775 2.061 2.197 2.328 2.278 2.711 2.821 3.009 3.184 3.347 3.436 3.63 3.815 4.079 4.237 4.372 4.566 4.758 4.941 5.114 5.28 5.494 5.712 5.936 6.203 6.449 6.683 6.955 7.255 7.529 7.828 8.162 8.527 8.881 9.258 9.701 10.125 10.602 11.086 11.635 12.277 12.993 13.713 14.383 14.658 14.613 14.414 14.123 13.807 13.512 13.21 12.936 12.659 12.398 12.149 11.917 11.685 11.454 11.245 11.003 10.769 10.57 10.368 10.154 9.964 9.76 9.56 9.406 9.236 9.058 8.884 8.692 8.554 8.397 8.152 7.986 7.805 7.706 7.488 7.266 7.043 6.921 6.489 6.526 6.366 6.191 5.794 5.585 5.367 5.11 4.809 4.44 3.89 2.764 -4 ,8311 ,TETRA ,17590599,Sat Nov 27 21:13:45 CET,Sat Nov 27 23:03:19 CET,0.0 0.699 1.051 1.307 1.529 1.725 1.907 2.079 2.389 2.525 2.645 2.554 2.973 3.078 3.277 3.472 3.657 3.743 3.917 4.086 4.325 4.479 4.626 4.834 5.032 5.223 5.399 5.561 5.769 5.979 6.189 6.44 6.683 6.91 7.155 7.432 7.695 7.971 8.27 8.582 8.916 9.289 9.706 10.126 10.599 11.098 11.65 12.248 12.901 13.592 14.271 14.518 14.397 14.149 13.891 13.617 13.328 13.052 12.791 12.482 12.197 11.944 11.696 11.457 11.233 11.023 10.8 10.603 10.422 10.229 10.021 9.833 9.643 9.443 9.272 9.093 8.915 8.725 8.528 8.392 8.241 7.98 7.8 7.61 7.512 7.323 7.107 6.852 6.724 6.298 6.329 6.176 6.014 5.667 5.476 5.25 4.984 4.69 4.367 3.932 2.54 -5 ,3039 ,TETRA ,17590600,Sat Nov 27 21:13:44 CET,Sat Nov 27 23:03:38 CET,0.0 0.71 1.088 1.364 1.594 1.792 1.976 2.139 2.431 2.559 2.671 2.585 3.01 3.115 3.302 3.482 3.649 3.735 3.913 4.077 4.3 4.439 4.576 4.773 4.959 5.139 5.315 5.483 5.704 5.919 6.113 6.343 6.573 6.794 7.043 7.317 7.573 7.854 8.171 8.512 8.838 9.204 9.635 10.076 10.583 11.097 11.687 12.344 13.069 13.804 14.463 14.731 14.688 14.501 14.236 13.935 13.625 13.325 13.062 12.772 12.491 12.235 11.983 11.748 11.528 11.31 11.081 10.864 10.665 10.457 10.242 10.074 9.882 9.656 9.477 9.301 9.117 8.916 8.72 8.592 8.457 8.234 8.071 7.88 7.767 7.548 7.347 7.122 6.994 6.542 6.528 6.354 6.175 5.8 5.585 5.337 5.061 4.754 4.328 3.699 1.734 -6 ,30672 ,TETRA ,17590601,Sat Nov 27 21:13:45 CET,Sat Nov 27 23:03:49 CET,0.0 0.624 0.949 1.209 1.418 1.597 1.769 1.935 2.229 2.363 2.485 2.427 2.858 2.97 3.171 3.354 3.534 3.621 3.786 3.942 4.17 4.322 4.475 4.689 4.885 5.071 5.248 5.412 5.619 5.817 6.002 6.236 6.477 6.703 6.954 7.229 7.501 7.816 8.143 8.472 8.817 9.195 9.621 10.035 10.511 11.031 11.614 12.232 12.897 13.601 14.272 14.548 14.487 14.294 14.009 13.701 13.423 13.138 12.853 12.545 12.265 11.996 11.709 11.441 11.217 11.004 10.775 10.557 10.369 10.175 9.95 9.757 9.571 9.366 9.205 9.034 8.851 8.678 8.486 8.337 8.178 7.92 7.742 7.542 7.439 7.244 7.046 6.837 6.714 6.278 6.295 6.138 5.977 5.634 5.417 5.166 4.905 4.621 4.247 3.684 2.058 -7 ,22781 ,TETRA ,17590602,Sat Nov 27 21:13:44 CET,Sat Nov 27 23:03:17 CET,0.0 0.787 1.316 1.727 2.049 2.282 2.451 2.614 2.929 3.071 3.193 3.113 3.528 3.628 3.814 3.993 4.177 4.264 4.436 4.605 4.845 5.0 5.151 5.366 5.562 5.733 5.901 6.072 6.282 6.48 6.676 6.921 7.16 7.379 7.623 7.898 8.164 8.447 8.755 9.099 9.447 9.82 10.251 10.667 11.15 11.691 12.26 12.849 13.511 14.191 14.82 15.151 15.183 15.015 14.786 14.512 14.212 13.915 13.628 13.326 13.029 12.748 12.498 12.262 12.032 11.798 11.557 11.347 11.155 10.953 10.74 10.562 10.369 10.157 9.98 9.8 9.625 9.442 9.249 9.115 8.969 8.733 8.571 8.386 8.285 8.083 7.874 7.636 7.513 7.087 7.113 6.963 6.796 6.44 6.254 6.034 5.769 5.461 5.072 4.439 2.339 -8 ,14852 ,TETRA ,17590603,Sat Nov 27 21:13:44 CET,Sat Nov 27 22:50:23 CET,0.0 0.57 0.826 1.055 1.269 1.448 1.613 1.779 2.061 2.192 2.323 2.253 2.682 2.793 2.999 3.197 3.382 3.469 3.636 3.801 4.049 4.203 4.338 4.538 4.732 4.92 5.102 5.282 5.502 5.712 5.91 6.132 6.361 6.582 6.829 7.097 7.344 7.621 7.934 8.263 8.597 8.971 9.401 9.825 10.287 10.783 11.343 11.927 12.543 13.165 13.765 14.032 13.963 13.73 13.489 13.246 12.944 12.628 12.338 12.025 11.74 11.478 11.22 10.969 10.751 10.546 10.304 10.08 9.874 9.651 9.439 9.27 9.071 8.848 8.678 8.493 8.304 8.114 7.918 7.779 7.627 7.391 7.235 7.069 6.977 6.786 6.579 6.333 6.207 5.784 5.816 5.625 5.402 4.913 4.639 4.322 3.966 3.575 3.124 2.527 0.877 -9 ,5423 ,TETRA ,17590604,Sat Nov 27 21:13:44 CET,Sat Nov 27 23:03:26 CET,0.0 0.804 1.219 1.547 1.829 2.054 2.239 2.41 2.722 2.852 2.973 2.897 3.314 3.423 3.62 3.801 3.976 4.06 4.23 4.396 4.62 4.758 4.904 5.119 5.322 5.51 5.689 5.866 6.091 6.293 6.485 6.728 6.953 7.165 7.422 7.701 7.958 8.242 8.554 8.882 9.199 9.546 9.955 10.359 10.837 11.364 11.936 12.556 13.223 13.865 14.44 14.689 14.699 14.525 14.256 13.984 13.667 13.367 13.1 12.796 12.515 12.262 12.012 11.752 11.506 11.278 11.027 10.8 10.611 10.418 10.199 10.019 9.824 9.605 9.438 9.246 9.035 8.835 8.631 8.474 8.312 8.059 7.881 7.694 7.592 7.376 7.152 6.923 6.808 6.384 6.416 6.275 6.118 5.756 5.554 5.314 5.036 4.687 4.26 3.685 2.019 -10 ,15757 ,TETRA ,17590605,Sat Nov 27 21:14:13 CET,Sat Nov 27 23:04:51 CET,0.0 0.58 0.947 1.226 1.442 1.635 1.805 1.958 2.249 2.374 2.481 2.38 2.791 2.891 3.086 3.269 3.449 3.535 3.703 3.865 4.088 4.226 4.365 4.576 4.778 4.969 5.158 5.338 5.564 5.774 5.977 6.232 6.456 6.669 6.921 7.188 7.437 7.718 8.025 8.352 8.684 9.036 9.436 9.848 10.342 10.87 11.446 12.084 12.782 13.494 14.196 14.533 14.545 14.4 14.164 13.891 13.576 13.242 12.957 12.644 12.371 12.119 11.857 11.609 11.371 11.149 10.913 10.702 10.515 10.327 10.127 9.942 9.732 9.508 9.341 9.164 8.976 8.781 8.58 8.43 8.265 8.011 7.844 7.668 7.582 7.388 7.165 6.941 6.825 6.396 6.416 6.246 6.061 5.655 5.418 5.161 4.882 4.597 4.26 3.8 2.368 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_17.txt deleted file mode 100644 index ae1f338a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13627 ,TETRA ,17590606,Sat Nov 27 21:13:44 CET,Sat Nov 27 23:03:35 CET,0.0 1.114 1.595 1.963 2.252 2.49 2.701 2.889 3.192 3.327 3.459 3.424 3.856 3.972 4.204 4.404 4.59 4.679 4.846 5.009 5.23 5.368 5.503 5.717 5.932 6.119 6.29 6.459 6.684 6.898 7.104 7.335 7.538 7.74 7.985 8.248 8.507 8.806 9.108 9.411 9.714 10.057 10.451 10.827 11.264 11.747 12.287 12.872 13.496 14.089 14.53 14.594 14.442 14.209 13.901 13.58 13.303 13.028 12.765 12.485 12.214 11.944 11.705 11.476 11.221 10.981 10.722 10.487 10.306 10.129 9.954 9.798 9.623 9.442 9.305 9.164 9.018 8.862 8.697 8.58 8.454 8.253 8.105 7.954 7.874 7.709 7.529 7.344 7.247 6.834 6.918 6.799 6.678 6.425 6.284 6.121 5.943 5.748 5.524 5.17 4.302 -2 ,14863 ,TETRA ,17590607,Sat Nov 27 21:13:47 CET,Sat Nov 27 23:03:46 CET,0.0 1.485 2.041 2.458 2.711 2.915 3.092 3.273 3.604 3.745 3.876 3.798 4.217 4.321 4.539 4.767 4.967 5.052 5.22 5.385 5.606 5.741 5.873 6.07 6.269 6.451 6.625 6.799 7.023 7.242 7.445 7.689 7.932 8.148 8.39 8.656 8.913 9.198 9.491 9.795 10.106 10.466 10.88 11.266 11.691 12.144 12.644 13.193 13.75 14.265 14.731 14.885 14.754 14.512 14.241 13.953 13.677 13.411 13.152 12.884 12.651 12.421 12.185 11.934 11.696 11.499 11.292 11.084 10.901 10.708 10.51 10.354 10.188 10.015 9.883 9.746 9.582 9.4 9.228 9.108 8.977 8.772 8.626 8.481 8.408 8.241 8.069 7.886 7.788 7.383 7.485 7.375 7.256 6.971 6.807 6.639 6.445 6.211 5.92 5.526 4.745 -3 ,7874 ,TETRA ,17590608,Sat Nov 27 21:13:44 CET,Sat Nov 27 23:08:22 CET,0.0 1.226 1.801 2.186 2.476 2.724 2.934 3.106 3.431 3.592 3.742 3.719 4.163 4.287 4.496 4.68 4.849 4.932 5.096 5.242 5.45 5.582 5.709 5.927 6.174 6.414 6.642 6.828 7.033 7.236 7.419 7.635 7.848 8.052 8.284 8.55 8.811 9.08 9.365 9.652 9.944 10.276 10.657 11.043 11.486 11.953 12.462 12.999 13.569 14.158 14.661 14.762 14.623 14.373 14.061 13.754 13.457 13.164 12.889 12.586 12.31 12.05 11.804 11.575 11.342 11.112 10.888 10.697 10.521 10.333 10.14 9.988 9.827 9.648 9.503 9.36 9.208 9.046 8.885 8.77 8.653 8.475 8.34 8.184 8.103 7.932 7.747 7.558 7.464 7.053 7.133 7.004 6.858 6.578 6.427 6.261 6.076 5.834 5.534 5.187 4.469 -4 ,5811 ,TETRA ,17590609,Sat Nov 27 21:13:44 CET,Sat Nov 27 23:04:20 CET,0.0 1.479 1.87 2.234 2.512 2.746 2.964 3.148 3.48 3.63 3.778 3.721 4.137 4.243 4.457 4.649 4.832 4.927 5.105 5.278 5.535 5.688 5.832 6.025 6.205 6.379 6.538 6.7 6.909 7.115 7.311 7.535 7.746 7.958 8.214 8.481 8.728 8.986 9.244 9.527 9.835 10.185 10.581 10.95 11.361 11.81 12.33 12.9 13.468 13.995 14.402 14.475 14.315 14.071 13.803 13.514 13.229 12.944 12.667 12.361 12.077 11.83 11.606 11.381 11.159 10.961 10.755 10.567 10.381 10.18 9.983 9.821 9.656 9.481 9.334 9.184 9.039 8.887 8.723 8.599 8.472 8.275 8.124 7.969 7.894 7.738 7.553 7.343 7.229 6.801 6.879 6.762 6.633 6.365 6.23 6.074 5.881 5.662 5.409 5.05 4.13 -5 ,15042 ,TETRA ,17590610,Sat Nov 27 21:13:44 CET,Sat Nov 27 23:05:26 CET,0.0 1.072 1.442 1.746 2.007 2.222 2.443 2.66 3.016 3.174 3.32 3.272 3.705 3.82 4.017 4.21 4.395 4.484 4.649 4.805 5.025 5.16 5.293 5.487 5.667 5.832 5.998 6.176 6.39 6.579 6.785 7.044 7.274 7.496 7.755 8.032 8.293 8.583 8.877 9.171 9.478 9.828 10.233 10.615 11.063 11.54 11.989 12.449 12.991 13.56 14.02 14.127 13.935 13.653 13.355 13.041 12.759 12.478 12.211 11.942 11.713 11.494 11.275 11.055 10.836 10.637 10.431 10.244 10.077 9.901 9.701 9.532 9.375 9.206 9.057 8.899 8.744 8.582 8.416 8.301 8.174 7.977 7.843 7.696 7.62 7.468 7.297 7.079 6.95 6.508 6.556 6.415 6.241 5.813 5.586 5.346 5.065 4.744 4.384 3.924 2.905 -6 ,16647 ,TETRA ,17590611,Sat Nov 27 21:13:44 CET,Sat Nov 27 23:05:38 CET,0.0 0.919 1.248 1.489 1.71 1.909 2.099 2.269 2.581 2.732 2.871 2.803 3.224 3.332 3.558 3.766 3.946 4.03 4.201 4.373 4.61 4.751 4.892 5.111 5.324 5.52 5.694 5.855 6.065 6.268 6.448 6.656 6.862 7.067 7.291 7.54 7.808 8.114 8.428 8.75 9.079 9.435 9.844 10.243 10.663 11.101 11.6 12.094 12.633 13.229 13.673 13.75 13.575 13.313 13.022 12.684 12.351 12.063 11.777 11.473 11.208 10.955 10.726 10.515 10.314 10.102 9.873 9.661 9.469 9.279 9.077 8.909 8.732 8.541 8.397 8.249 8.095 7.94 7.772 7.644 7.511 7.307 7.158 7.0 6.917 6.742 6.563 6.375 6.276 5.862 5.92 5.777 5.633 5.326 5.129 4.923 4.737 4.493 4.176 3.768 2.846 -7 ,4479 ,TETRA ,17590612,Sat Nov 27 21:13:44 CET,Sat Nov 27 23:07:13 CET,0.0 1.2 1.687 2.013 2.3 2.542 2.749 2.939 3.294 3.444 3.579 3.532 3.966 4.091 4.33 4.545 4.748 4.843 5.016 5.182 5.415 5.553 5.691 5.884 6.073 6.266 6.45 6.641 6.883 7.084 7.272 7.498 7.708 7.909 8.149 8.424 8.673 8.937 9.224 9.527 9.837 10.188 10.577 10.941 11.362 11.828 12.351 12.897 13.448 13.954 14.387 14.481 14.268 13.978 13.677 13.34 13.016 12.718 12.434 12.13 11.853 11.605 11.375 11.147 10.926 10.704 10.463 10.252 10.081 9.904 9.706 9.54 9.374 9.195 9.054 8.906 8.755 8.592 8.412 8.297 8.184 8.011 7.889 7.754 7.682 7.527 7.337 7.122 7.023 6.619 6.713 6.601 6.485 6.212 6.063 5.908 5.708 5.457 5.167 4.797 4.231 -8 ,26990 ,TETRA ,17590613,Sat Nov 27 21:13:45 CET,Sat Nov 27 23:05:38 CET,0.0 1.263 1.686 2.01 2.275 2.479 2.678 2.851 3.147 3.304 3.459 3.416 3.844 3.957 4.159 4.366 4.561 4.647 4.823 4.991 5.217 5.364 5.5 5.687 5.875 6.053 6.215 6.378 6.588 6.794 6.995 7.227 7.452 7.671 7.919 8.198 8.448 8.718 9.013 9.308 9.608 9.937 10.325 10.715 11.142 11.596 12.086 12.625 13.197 13.755 14.254 14.396 14.272 14.037 13.745 13.427 13.133 12.847 12.582 12.308 12.047 11.792 11.527 11.273 11.055 10.854 10.642 10.447 10.27 10.082 9.878 9.716 9.546 9.353 9.201 9.052 8.905 8.737 8.555 8.427 8.301 8.118 7.976 7.833 7.765 7.605 7.419 7.221 7.114 6.703 6.793 6.673 6.546 6.271 6.122 5.962 5.785 5.569 5.299 4.959 3.979 -9 ,25317 ,TETRA ,17590614,Sat Nov 27 21:13:45 CET,Sat Nov 27 23:05:59 CET,0.0 0.998 1.395 1.701 1.967 2.18 2.369 2.567 2.963 3.13 3.272 3.232 3.672 3.792 4.006 4.199 4.384 4.476 4.656 4.832 5.086 5.238 5.382 5.591 5.805 6.001 6.17 6.336 6.543 6.744 6.942 7.196 7.438 7.644 7.886 8.171 8.423 8.694 9.003 9.312 9.623 9.996 10.418 10.81 11.244 11.7 12.198 12.718 13.284 13.812 14.225 14.305 14.092 13.829 13.538 13.219 12.926 12.646 12.388 12.114 11.863 11.628 11.396 11.173 10.952 10.751 10.543 10.348 10.168 9.973 9.775 9.61 9.446 9.28 9.13 8.972 8.826 8.674 8.503 8.379 8.249 8.038 7.895 7.757 7.682 7.525 7.359 7.164 7.053 6.64 6.733 6.614 6.492 6.218 6.053 5.872 5.679 5.457 5.184 4.876 4.261 -10 ,8855 ,TETRA ,17590615,Sat Nov 27 21:14:13 CET,Sat Nov 27 23:05:41 CET,0.0 0.975 1.33 1.613 1.891 2.116 2.307 2.485 2.819 2.98 3.125 3.096 3.531 3.654 3.885 4.065 4.25 4.345 4.506 4.653 4.868 5.019 5.169 5.361 5.555 5.75 5.919 6.082 6.298 6.512 6.718 6.951 7.171 7.39 7.641 7.914 8.172 8.446 8.746 9.078 9.406 9.736 10.109 10.491 10.919 11.349 11.833 12.368 12.934 13.517 13.972 13.999 13.811 13.516 13.19 12.866 12.572 12.278 12.005 11.735 11.492 11.263 11.018 10.775 10.555 10.342 10.12 9.939 9.777 9.603 9.417 9.255 9.081 8.884 8.734 8.587 8.431 8.266 8.095 7.972 7.844 7.65 7.512 7.354 7.27 7.1 6.927 6.742 6.646 6.24 6.327 6.209 6.088 5.827 5.689 5.536 5.371 5.179 4.938 4.611 4.006 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt deleted file mode 100644 index fc7dd2a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22793 ,TETRA ,17590616,Sat Nov 27 21:14:13 CET,Sat Nov 27 22:56:57 CET,0.0 0.759 1.199 1.527 1.792 2.026 2.209 2.368 2.656 2.791 2.921 2.855 3.286 3.399 3.608 3.811 4.003 4.095 4.272 4.446 4.695 4.845 4.995 5.22 5.433 5.643 5.841 6.025 6.252 6.467 6.677 6.935 7.184 7.411 7.668 7.96 8.245 8.557 8.885 9.246 9.616 10.02 10.496 10.968 11.526 12.177 12.911 13.687 14.549 15.486 16.387 16.874 16.981 16.897 16.717 16.527 16.336 16.11 15.883 15.643 15.428 15.215 14.994 14.776 14.563 14.365 14.164 13.986 13.813 13.625 13.423 13.243 13.064 12.871 12.718 12.564 12.407 12.241 12.042 11.899 11.756 11.517 11.349 11.196 11.12 10.946 10.744 10.539 10.43 10.004 10.035 9.889 9.743 9.453 9.295 9.108 8.875 8.613 8.33 7.94 6.786 -2 ,13480 ,TETRA ,17590617,Sat Nov 27 21:14:14 CET,Sat Nov 27 23:05:59 CET,0.0 0.794 1.175 1.476 1.73 1.955 2.154 2.331 2.611 2.744 2.875 2.797 3.218 3.331 3.546 3.736 3.911 3.998 4.168 4.335 4.57 4.716 4.853 5.054 5.252 5.443 5.621 5.792 6.022 6.244 6.446 6.689 6.919 7.133 7.39 7.699 8.005 8.328 8.666 9.014 9.372 9.787 10.294 10.798 11.335 11.91 12.574 13.295 14.096 15.016 15.971 16.532 16.693 16.651 16.503 16.323 16.11 15.872 15.67 15.462 15.262 15.061 14.851 14.634 14.427 14.245 14.06 13.884 13.709 13.529 13.342 13.178 13.011 12.831 12.687 12.536 12.381 12.226 12.056 11.931 11.801 11.584 11.433 11.265 11.176 11.007 10.814 10.601 10.488 10.06 10.087 9.947 9.812 9.492 9.307 9.114 8.889 8.61 8.288 7.919 7.092 -3 ,29042 ,TETRA ,17590618,Sat Nov 27 21:14:14 CET,Sat Nov 27 23:04:52 CET,0.0 0.838 1.251 1.576 1.826 2.026 2.208 2.383 2.691 2.832 2.972 2.925 3.35 3.467 3.692 3.905 4.103 4.194 4.37 4.548 4.797 4.949 5.095 5.302 5.502 5.699 5.891 6.082 6.316 6.539 6.771 7.043 7.299 7.543 7.809 8.104 8.383 8.677 9.007 9.37 9.744 10.153 10.626 11.096 11.634 12.235 12.918 13.612 14.365 15.219 16.082 16.569 16.685 16.649 16.536 16.362 16.147 15.938 15.719 15.462 15.239 15.045 14.852 14.661 14.474 14.287 14.088 13.914 13.754 13.585 13.403 13.237 13.055 12.867 12.733 12.596 12.442 12.267 12.083 11.958 11.83 11.619 11.471 11.312 11.227 11.053 10.874 10.677 10.57 10.144 10.154 9.996 9.836 9.495 9.308 9.111 8.88 8.591 8.243 7.829 6.728 -4 ,26139 ,TETRA ,17590619,Sat Nov 27 21:14:14 CET,Sat Nov 27 23:05:47 CET,0.0 1.019 1.492 1.798 2.017 2.224 2.406 2.562 2.845 2.973 3.095 3.014 3.444 3.567 3.774 3.962 4.14 4.23 4.409 4.577 4.817 4.969 5.119 5.34 5.558 5.762 5.948 6.117 6.333 6.558 6.785 7.054 7.307 7.547 7.828 8.131 8.398 8.698 9.032 9.384 9.753 10.166 10.627 11.08 11.61 12.2 12.85 13.532 14.292 15.155 16.026 16.51 16.628 16.573 16.444 16.271 16.076 15.864 15.653 15.43 15.236 15.041 14.824 14.61 14.392 14.19 13.977 13.764 13.583 13.398 13.204 13.033 12.847 12.677 12.535 12.38 12.229 12.065 11.889 11.762 11.63 11.421 11.274 11.109 11.021 10.848 10.677 10.48 10.368 9.951 10.001 9.866 9.722 9.393 9.2 8.982 8.758 8.505 8.215 7.829 6.521 -5 ,30910 ,TETRA ,17590620,Sat Nov 27 21:14:14 CET,Sat Nov 27 23:08:46 CET,0.0 0.86 1.226 1.5 1.731 1.921 2.102 2.283 2.612 2.757 2.888 2.805 3.224 3.339 3.561 3.766 3.969 4.065 4.244 4.416 4.657 4.815 4.972 5.187 5.386 5.594 5.803 5.982 6.208 6.432 6.638 6.899 7.139 7.373 7.66 7.972 8.272 8.595 8.933 9.296 9.686 10.126 10.63 11.129 11.675 12.263 12.932 13.626 14.374 15.227 16.131 16.702 16.853 16.79 16.664 16.474 16.263 16.065 15.87 15.634 15.402 15.19 14.987 14.778 14.57 14.381 14.173 13.984 13.83 13.655 13.472 13.325 13.155 12.972 12.831 12.685 12.522 12.353 12.183 12.058 11.908 11.661 11.5 11.332 11.243 11.046 10.838 10.63 10.515 10.082 10.105 9.958 9.8 9.452 9.247 9.014 8.772 8.5 8.16 7.7 6.786 -6 ,16088 ,TETRA ,17590621,Sat Nov 27 21:14:14 CET,Sat Nov 27 23:06:07 CET,0.0 0.814 1.197 1.487 1.73 1.945 2.137 2.312 2.632 2.77 2.895 2.827 3.254 3.371 3.584 3.769 3.954 4.042 4.21 4.376 4.601 4.748 4.896 5.112 5.322 5.523 5.717 5.895 6.13 6.356 6.569 6.835 7.088 7.325 7.6 7.912 8.196 8.496 8.843 9.222 9.612 10.038 10.511 10.991 11.543 12.147 12.84 13.585 14.423 15.349 16.279 16.788 16.917 16.85 16.644 16.398 16.187 15.971 15.768 15.553 15.331 15.128 14.942 14.742 14.538 14.36 14.176 14.001 13.834 13.647 13.454 13.302 13.138 12.96 12.819 12.671 12.51 12.339 12.152 12.031 11.91 11.704 11.549 11.384 11.305 11.134 10.951 10.734 10.616 10.186 10.23 10.111 9.975 9.672 9.513 9.301 9.016 8.695 8.307 7.665 6.24 -7 ,16019 ,TETRA ,17590622,Sat Nov 27 21:14:14 CET,Sat Nov 27 23:03:59 CET,0.0 0.638 0.991 1.253 1.478 1.687 1.881 2.062 2.39 2.537 2.685 2.65 3.079 3.192 3.408 3.611 3.804 3.893 4.056 4.221 4.467 4.622 4.776 4.995 5.192 5.385 5.576 5.767 6.007 6.224 6.434 6.694 6.954 7.207 7.481 7.794 8.091 8.395 8.718 9.055 9.43 9.854 10.312 10.757 11.258 11.84 12.537 13.267 14.046 14.906 15.828 16.409 16.553 16.489 16.317 16.123 15.928 15.717 15.519 15.304 15.088 14.886 14.692 14.494 14.305 14.125 13.923 13.725 13.545 13.367 13.197 13.049 12.888 12.712 12.555 12.395 12.243 12.081 11.903 11.774 11.639 11.405 11.235 11.076 10.988 10.78 10.568 10.361 10.252 9.833 9.88 9.735 9.592 9.282 9.111 8.924 8.7 8.421 8.056 7.579 6.316 -8 ,1861 ,TETRA ,17590623,Sat Nov 27 21:14:14 CET,Sat Nov 27 23:04:15 CET,0.0 0.811 1.175 1.435 1.683 1.898 2.08 2.259 2.585 2.73 2.863 2.82 3.255 3.367 3.588 3.8 3.99 4.079 4.255 4.427 4.673 4.826 4.962 5.147 5.339 5.536 5.719 5.886 6.098 6.312 6.519 6.756 6.993 7.229 7.489 7.768 8.04 8.338 8.642 8.983 9.343 9.748 10.234 10.699 11.232 11.827 12.465 13.153 13.94 14.837 15.789 16.32 16.44 16.388 16.248 16.057 15.859 15.642 15.413 15.179 14.965 14.768 14.567 14.346 14.132 13.938 13.739 13.558 13.388 13.202 12.993 12.811 12.633 12.449 12.303 12.145 11.961 11.759 11.537 11.377 11.215 10.959 10.771 10.567 10.455 10.227 9.996 9.747 9.607 9.146 9.128 8.952 8.775 8.386 8.163 7.913 7.624 7.32 6.927 6.361 5.057 -9 ,32317 ,TETRA ,17590624,Sat Nov 27 21:14:14 CET,Sat Nov 27 23:04:13 CET,0.0 0.627 0.996 1.282 1.514 1.734 1.935 2.109 2.398 2.525 2.644 2.564 2.994 3.117 3.338 3.523 3.708 3.798 3.96 4.129 4.386 4.539 4.672 4.868 5.067 5.252 5.43 5.602 5.808 6.02 6.23 6.468 6.689 6.908 7.169 7.466 7.773 8.097 8.429 8.776 9.143 9.556 10.035 10.512 11.06 11.669 12.332 13.036 13.832 14.699 15.661 16.271 16.384 16.32 16.185 15.999 15.8 15.583 15.387 15.178 14.982 14.781 14.559 14.346 14.157 13.987 13.79 13.6 13.416 13.218 13.025 12.863 12.688 12.501 12.347 12.197 12.048 11.886 11.706 11.581 11.455 11.237 11.088 10.933 10.846 10.667 10.482 10.287 10.177 9.754 9.794 9.649 9.495 9.166 8.994 8.799 8.551 8.255 7.931 7.545 6.464 -10 ,19305 ,TETRA ,17590625,Sat Nov 27 21:14:16 CET,Sat Nov 27 23:03:53 CET,0.0 0.956 1.328 1.604 1.843 2.054 2.233 2.407 2.733 2.875 3.011 2.94 3.366 3.479 3.69 3.897 4.093 4.188 4.366 4.531 4.751 4.886 5.029 5.235 5.426 5.612 5.796 5.992 6.234 6.452 6.663 6.925 7.175 7.394 7.649 7.938 8.214 8.518 8.843 9.188 9.558 9.974 10.436 10.884 11.404 11.992 12.649 13.349 14.123 14.98 15.86 16.379 16.514 16.469 16.345 16.201 16.018 15.78 15.556 15.333 15.126 14.93 14.747 14.567 14.348 14.138 13.942 13.77 13.622 13.466 13.29 13.134 12.977 12.808 12.669 12.511 12.347 12.187 12.017 11.899 11.767 11.537 11.364 11.185 11.1 10.938 10.762 10.561 10.444 10.014 10.042 9.897 9.749 9.42 9.255 9.079 8.868 8.596 8.306 7.888 6.656 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt deleted file mode 100644 index f36a7232..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21415 ,TETRA ,17590626,Sat Nov 27 21:14:15 CET,Sat Nov 27 23:06:35 CET,0.0 2.581 3.212 3.734 4.152 4.521 4.838 5.133 5.727 6.004 6.254 6.195 6.936 7.166 7.614 8.034 8.44 8.638 9.036 9.408 9.923 10.28 10.635 11.157 11.659 12.116 12.56 13.019 13.605 14.157 14.697 15.34 15.941 16.535 17.279 18.131 18.944 19.835 20.814 21.878 22.998 24.294 25.839 27.396 29.189 31.273 33.779 36.635 39.931 43.654 48.019 51.281 52.907 53.788 54.301 54.554 54.529 54.389 54.254 54.048 53.767 53.492 53.211 52.918 52.659 52.353 51.814 51.22 50.75 50.262 49.733 49.322 48.872 48.363 47.974 47.578 47.17 46.759 46.331 46.031 45.718 45.229 44.903 44.545 44.352 43.97 43.599 43.228 43.025 42.265 42.315 42.079 41.843 41.331 41.03 40.723 40.388 39.986 39.465 38.64 36.014 -2 ,1840 ,TETRA ,17590627,Sat Nov 27 21:14:15 CET,Sat Nov 27 23:05:55 CET,0.0 1.988 2.737 3.368 3.918 4.391 4.821 5.21 5.919 6.26 6.592 6.642 7.488 7.771 8.327 8.845 9.356 9.604 10.071 10.546 11.182 11.539 11.877 12.344 12.809 13.295 13.754 14.197 14.799 15.368 15.902 16.554 17.201 17.818 18.529 19.331 20.118 21.009 21.985 23.038 24.18 25.489 27.014 28.565 30.408 32.462 34.828 37.552 40.738 44.449 48.799 52.086 53.789 54.663 55.082 55.256 55.195 55.032 54.87 54.669 54.431 54.182 53.953 53.73 53.503 53.282 53.043 52.825 52.629 52.396 52.13 51.902 51.653 51.394 51.199 50.996 50.785 50.555 50.265 50.006 49.714 49.277 48.965 48.647 48.482 48.129 47.746 47.331 47.122 46.374 46.419 46.188 45.957 45.428 45.117 44.776 44.386 43.943 43.43 42.75 40.643 -3 ,29641 ,TETRA ,17590628,Sat Nov 27 21:14:17 CET,Sat Nov 27 23:05:42 CET,0.0 1.989 2.767 3.369 3.873 4.301 4.667 4.999 5.585 5.857 6.119 6.078 6.827 7.055 7.49 7.89 8.277 8.477 8.875 9.245 9.771 10.115 10.443 10.928 11.415 11.886 12.342 12.784 13.342 13.898 14.443 15.09 15.73 16.362 17.1 17.936 18.751 19.654 20.63 21.7 22.821 24.056 25.541 27.075 28.899 30.954 33.324 36.024 39.183 42.948 47.542 50.785 52.309 53.283 53.808 53.912 53.833 53.775 53.71 53.559 53.369 53.164 52.931 52.687 52.447 52.218 51.982 51.767 51.553 51.29 51.005 50.788 50.552 50.3 50.108 49.875 49.635 49.399 49.137 48.959 48.772 48.449 48.173 47.862 47.705 47.385 47.06 46.696 46.486 45.763 45.89 45.67 45.429 44.909 44.601 44.233 43.838 43.398 42.891 42.268 40.56 -4 ,12465 ,TETRA ,17590629,Sat Nov 27 21:15:12 CET,Sat Nov 27 23:07:29 CET,0.0 2.169 2.926 3.501 3.983 4.413 4.843 5.232 5.909 6.235 6.557 6.622 7.487 7.78 8.353 8.897 9.398 9.628 10.085 10.55 11.224 11.612 11.955 12.461 12.937 13.404 13.868 14.312 14.87 15.401 15.911 16.551 17.208 17.864 18.609 19.426 20.248 21.175 22.165 23.207 24.353 25.665 27.166 28.697 30.518 32.563 34.968 37.771 41.061 44.935 49.352 52.549 54.113 54.952 55.384 55.585 55.647 55.624 55.576 55.453 55.288 55.083 54.838 54.594 54.351 54.106 53.825 53.59 53.387 53.166 52.929 52.716 52.493 52.266 52.066 51.845 51.628 51.396 51.132 50.95 50.771 50.484 50.281 50.061 49.942 49.7 49.399 49.018 48.8 48.047 48.091 47.854 47.602 46.989 46.653 46.299 45.901 45.44 44.895 44.122 41.34 -5 ,10218 ,TETRA ,17590630,Sat Nov 27 21:15:12 CET,Sat Nov 27 23:06:57 CET,0.0 1.568 2.235 2.772 3.21 3.599 3.94 4.257 4.846 5.126 5.409 5.41 6.173 6.41 6.846 7.256 7.654 7.84 8.207 8.595 9.139 9.47 9.794 10.275 10.745 11.184 11.613 12.044 12.607 13.171 13.713 14.374 15.014 15.631 16.395 17.259 18.056 18.943 19.936 20.986 22.112 23.406 24.923 26.458 28.263 30.283 32.616 35.3 38.477 42.345 46.959 50.504 52.349 53.277 53.711 53.913 53.992 53.948 53.817 53.627 53.45 53.292 53.102 52.875 52.651 52.443 52.195 51.929 51.69 51.46 51.23 51.037 50.814 50.568 50.386 50.122 49.763 49.381 48.981 48.71 48.425 47.974 47.651 47.313 47.147 46.787 46.412 46.048 45.849 45.113 45.207 44.971 44.712 44.145 43.84 43.509 43.112 42.686 42.191 41.534 39.274 -6 ,3978 ,TETRA ,17590631,Sat Nov 27 21:15:12 CET,Sat Nov 27 23:10:08 CET,0.0 1.991 2.755 3.346 3.886 4.37 4.765 5.13 5.828 6.122 6.383 6.355 7.084 7.292 7.736 8.156 8.54 8.729 9.114 9.486 10.019 10.365 10.704 11.183 11.637 12.107 12.58 13.02 13.561 14.099 14.633 15.27 15.898 16.534 17.305 18.147 18.916 19.787 20.75 21.785 22.869 24.095 25.603 27.13 28.941 30.998 33.318 36.028 39.384 43.35 47.958 51.369 53.092 54.019 54.458 54.672 54.798 54.832 54.771 54.6 54.418 54.25 54.046 53.843 53.64 53.421 53.175 52.952 52.756 52.533 52.28 51.968 51.531 51.066 50.709 50.353 49.999 49.612 49.178 48.9 48.629 48.187 47.882 47.577 47.412 47.062 46.693 46.309 46.113 45.374 45.443 45.209 44.961 44.429 44.122 43.791 43.433 42.963 42.364 41.678 38.721 -7 ,12263 ,TETRA ,17590632,Sat Nov 27 21:15:12 CET,Sat Nov 27 23:10:56 CET,0.0 1.906 2.599 3.159 3.634 4.071 4.489 4.886 5.602 5.932 6.246 6.269 7.123 7.408 7.953 8.479 8.999 9.25 9.759 10.246 10.913 11.36 11.801 12.427 13.01 13.513 13.945 14.368 14.938 15.492 16.019 16.67 17.32 17.955 18.7 19.529 20.342 21.227 22.166 23.239 24.418 25.723 27.225 28.74 30.601 32.743 35.162 37.888 41.145 44.92 49.206 52.559 54.493 55.538 56.055 56.315 56.333 56.193 56.015 55.841 55.645 55.428 55.209 54.971 54.739 54.517 54.254 53.987 53.756 53.516 53.271 53.067 52.85 52.622 52.435 52.251 52.057 51.833 51.59 51.424 51.243 50.935 50.707 50.472 50.35 50.103 49.852 49.582 49.433 48.804 48.965 48.797 48.631 48.243 47.999 47.717 47.367 46.984 46.541 45.855 43.524 -8 ,31828 ,TETRA ,17590633,Sat Nov 27 21:15:12 CET,Sat Nov 27 23:08:21 CET,0.0 1.713 2.453 2.988 3.453 3.884 4.296 4.677 5.391 5.742 6.073 6.126 6.992 7.28 7.819 8.329 8.831 9.082 9.573 10.044 10.726 11.176 11.617 12.27 12.892 13.496 14.106 14.697 15.46 16.191 16.912 17.82 18.715 19.503 20.277 21.101 21.905 22.792 23.767 24.821 25.89 27.105 28.651 30.27 32.06 34.093 36.575 39.439 42.713 46.45 50.95 54.373 56.091 57.076 57.667 57.922 57.968 57.881 57.733 57.539 57.345 57.141 56.885 56.623 56.363 56.115 55.869 55.632 55.416 55.196 54.957 54.751 54.529 54.285 54.101 53.911 53.682 53.433 53.182 53.015 52.837 52.551 52.341 52.104 51.986 51.769 51.532 51.243 51.083 50.39 50.482 50.261 50.029 49.471 49.147 48.79 48.417 47.994 47.44 46.675 44.013 -9 ,30540 ,TETRA ,17590634,Sat Nov 27 21:15:12 CET,Sat Nov 27 23:07:55 CET,0.0 2.302 2.99 3.601 4.098 4.53 4.925 5.297 5.98 6.285 6.592 6.654 7.527 7.813 8.364 8.917 9.441 9.687 10.183 10.672 11.362 11.815 12.268 12.927 13.558 14.155 14.68 15.122 15.689 16.259 16.8 17.427 18.047 18.657 19.346 20.121 20.897 21.777 22.719 23.727 24.823 26.114 27.658 29.17 30.937 32.957 35.288 37.856 40.936 44.769 49.401 52.933 54.742 55.677 56.12 56.324 56.369 56.297 56.136 55.962 55.684 55.132 54.473 53.873 53.295 52.733 52.146 51.647 51.219 50.75 50.224 49.786 49.372 48.953 48.612 48.254 47.872 47.48 47.087 46.825 46.57 46.145 45.826 45.5 45.337 45.002 44.634 44.232 44.026 43.289 43.342 43.091 42.819 42.193 41.836 41.492 41.117 40.645 40.141 39.412 37.313 -10 ,26822 ,TETRA ,17590635,Sat Nov 27 21:15:12 CET,Sat Nov 27 23:08:20 CET,0.0 2.746 3.574 4.177 4.696 5.128 5.515 5.894 6.578 6.911 7.225 7.235 8.078 8.329 8.771 9.164 9.539 9.729 10.106 10.466 10.972 11.306 11.651 12.161 12.65 13.121 13.564 13.997 14.571 15.14 15.699 16.37 17.005 17.612 18.336 19.152 19.943 20.818 21.759 22.753 23.833 25.084 26.554 28.088 29.901 31.92 34.233 36.919 40.121 43.902 48.293 51.558 53.343 54.379 54.896 55.111 55.176 55.128 55.071 54.938 54.73 54.509 54.297 54.112 53.908 53.689 53.457 53.233 53.029 52.801 52.539 52.317 52.09 51.857 51.67 51.489 51.292 51.06 50.82 50.66 50.471 50.103 49.82 49.505 49.344 49.018 48.663 48.303 48.114 47.378 47.46 47.216 46.955 46.415 46.105 45.745 45.352 44.847 44.08 43.066 40.577 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt deleted file mode 100644 index 2b379f12..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1572 ,TETRA ,17590636,Sat Nov 27 21:15:12 CET,Sat Nov 27 23:09:39 CET,0.0 1.001 1.591 2.07 2.53 2.957 3.347 3.713 4.421 4.772 5.117 5.206 6.107 6.429 7.037 7.637 8.238 8.533 9.108 9.698 10.579 11.144 11.704 12.531 13.345 14.146 14.956 15.753 16.735 17.59 18.373 19.344 20.304 21.26 22.393 23.698 24.99 26.462 28.129 29.954 31.916 34.199 36.959 39.782 43.158 47.143 51.938 57.569 64.616 73.652 85.929 97.491 105.193 110.769 114.871 118.096 120.63 122.651 124.2 125.64 126.804 127.756 128.581 129.287 129.899 130.424 130.921 131.324 131.649 131.963 132.26 132.473 132.67 132.85 132.985 133.115 133.233 133.339 133.42 133.469 133.518 133.587 133.621 133.644 133.651 133.632 133.592 133.539 133.503 133.098 133.376 133.33 133.278 133.131 133.022 132.881 132.728 132.485 132.179 131.794 130.46 -2 ,18406 ,TETRA ,17590637,Sat Nov 27 21:15:13 CET,Sat Nov 27 23:09:43 CET,0.0 0.984 1.592 2.102 2.581 3.035 3.456 3.845 4.565 4.9 5.223 5.284 6.167 6.483 7.106 7.716 8.325 8.626 9.221 9.811 10.678 11.232 11.722 12.39 13.045 13.686 14.306 14.925 15.764 16.579 17.365 18.35 19.331 20.297 21.437 22.739 24.016 25.441 27.051 28.852 30.803 33.081 35.832 38.664 42.048 46.009 50.823 56.552 63.679 72.696 84.868 96.367 104.109 109.714 113.855 117.048 119.506 121.516 123.099 124.539 125.672 126.592 127.395 128.114 128.734 129.261 129.77 130.19 130.523 130.848 131.174 131.386 131.575 131.768 131.89 132.006 132.113 132.203 132.287 132.344 132.403 132.46 132.474 132.476 132.476 132.454 132.421 132.407 132.389 131.992 132.316 132.268 132.206 132.084 131.98 131.834 131.667 131.474 131.199 130.8 129.656 -3 ,1219 ,TETRA ,17590638,Sat Nov 27 21:15:14 CET,Sat Nov 27 22:52:15 CET,0.0 0.803 1.33 1.799 2.254 2.675 3.091 3.494 4.249 4.61 4.962 5.068 5.973 6.309 6.971 7.616 8.236 8.542 9.157 9.751 10.621 11.206 11.77 12.597 13.418 14.218 15.009 15.786 16.806 17.823 18.844 20.105 21.325 22.535 23.906 25.308 26.603 28.077 29.712 31.461 33.361 35.571 38.239 41.067 44.508 48.487 53.228 58.87 66.053 75.311 87.535 98.795 106.327 111.821 115.916 119.101 121.644 123.716 125.3 126.75 127.916 128.874 129.687 130.381 130.988 131.504 132.002 132.411 132.727 133.017 133.302 133.512 133.705 133.891 134.015 134.134 134.254 134.355 134.446 134.509 134.561 134.613 134.648 134.69 134.702 134.711 134.72 134.702 134.69 134.3 134.6 134.554 134.486 134.294 134.178 134.046 133.88 133.671 133.361 132.902 131.787 -4 ,25940 ,TETRA ,17590639,Sat Nov 27 21:15:14 CET,Sat Nov 27 23:06:55 CET,0.0 1.146 1.76 2.286 2.768 3.218 3.63 4.036 4.816 5.173 5.513 5.617 6.511 6.823 7.428 8.028 8.622 8.913 9.495 10.051 10.776 11.228 11.69 12.368 13.031 13.677 14.303 14.931 15.758 16.581 17.4 18.39 19.361 20.321 21.45 22.75 24.073 25.579 27.218 28.991 30.92 33.145 35.788 38.558 41.935 45.913 50.762 56.442 63.44 72.483 84.686 96.145 103.767 109.242 113.333 116.576 119.088 121.096 122.7 124.172 125.322 126.264 127.09 127.819 128.445 128.957 129.453 129.873 130.209 130.525 130.842 131.086 131.296 131.501 131.663 131.802 131.924 132.032 132.131 132.197 132.258 132.33 132.348 132.356 132.351 132.346 132.359 132.338 132.31 131.907 132.187 132.127 132.063 131.949 131.877 131.785 131.643 131.427 131.16 130.81 129.787 -5 ,21574 ,TETRA ,17590640,Sat Nov 27 21:15:16 CET,Sat Nov 27 23:08:28 CET,0.0 1.04 1.572 2.065 2.529 2.954 3.336 3.712 4.461 4.823 5.193 5.35 6.256 6.584 7.218 7.851 8.489 8.792 9.384 9.969 10.819 11.382 11.944 12.783 13.598 14.395 15.196 15.992 17.026 18.042 19.046 20.183 21.188 22.149 23.293 24.622 25.918 27.354 28.938 30.706 32.626 34.869 37.603 40.443 43.884 47.87 52.647 58.363 65.493 74.556 86.619 97.981 105.663 111.147 115.17 118.339 120.836 122.894 124.517 125.959 127.062 127.953 128.76 129.488 130.106 130.629 131.14 131.58 131.932 132.253 132.57 132.816 133.039 133.251 133.399 133.53 133.661 133.771 133.854 133.904 133.951 134.014 134.028 134.028 134.029 134.003 133.976 133.948 133.921 133.523 133.836 133.792 133.751 133.631 133.523 133.395 133.221 133.016 132.792 132.424 131.408 -6 ,9819 ,TETRA ,17590641,Sat Nov 27 21:15:13 CET,Sat Nov 27 23:07:17 CET,0.0 1.225 1.912 2.466 2.941 3.372 3.762 4.136 4.902 5.286 5.656 5.779 6.674 6.995 7.631 8.257 8.877 9.179 9.778 10.359 11.201 11.763 12.323 13.166 13.999 14.782 15.471 16.112 16.957 17.794 18.629 19.637 20.618 21.587 22.736 24.059 25.358 26.821 28.466 30.254 32.174 34.434 37.178 40.03 43.439 47.368 52.095 57.752 64.831 73.834 85.919 97.339 105.009 110.476 114.519 117.703 120.193 122.259 123.879 125.337 126.48 127.415 128.252 128.989 129.611 130.135 130.652 131.083 131.435 131.783 132.111 132.338 132.546 132.75 132.893 133.031 133.154 133.25 133.347 133.416 133.488 133.584 133.617 133.628 133.635 133.626 133.597 133.564 133.534 133.126 133.428 133.377 133.311 133.165 133.069 132.929 132.759 132.601 132.416 132.121 131.462 -7 ,3333 ,TETRA ,17590642,Sat Nov 27 21:15:14 CET,Sat Nov 27 23:10:42 CET,0.0 1.376 2.073 2.677 3.146 3.538 3.923 4.303 5.021 5.38 5.74 5.836 6.732 7.051 7.664 8.249 8.84 9.139 9.732 10.316 11.145 11.696 12.247 13.047 13.847 14.651 15.432 16.201 17.218 18.203 19.187 20.431 21.645 22.723 23.877 25.206 26.508 27.966 29.58 31.361 33.316 35.613 38.388 41.255 44.726 48.694 53.429 59.121 66.224 75.234 87.386 98.767 106.295 111.75 115.839 118.986 121.417 123.447 125.052 126.521 127.692 128.645 129.485 130.205 130.796 131.31 131.828 132.268 132.624 132.951 133.261 133.503 133.729 133.941 134.09 134.235 134.363 134.47 134.563 134.625 134.686 134.764 134.813 134.85 134.861 134.875 134.868 134.842 134.831 134.438 134.746 134.708 134.662 134.524 134.409 134.282 134.157 133.997 133.784 133.506 132.603 -8 ,19390 ,TETRA ,17590643,Sat Nov 27 21:15:13 CET,Sat Nov 27 23:07:10 CET,0.0 1.027 1.628 2.161 2.652 3.087 3.49 3.864 4.59 4.95 5.294 5.385 6.281 6.604 7.245 7.875 8.487 8.787 9.355 9.85 10.549 11.021 11.478 12.158 12.817 13.452 14.101 14.76 15.614 16.445 17.273 18.307 19.32 20.298 21.473 22.825 24.16 25.657 27.307 29.144 31.104 33.354 36.087 38.914 42.315 46.357 51.233 56.963 64.153 73.233 85.216 96.532 104.157 109.679 113.803 117.042 119.578 121.631 123.225 124.674 125.826 126.772 127.598 128.323 128.935 129.443 129.951 130.381 130.727 131.057 131.36 131.599 131.83 132.03 132.172 132.305 132.422 132.519 132.599 132.66 132.715 132.763 132.772 132.774 132.774 132.766 132.735 132.688 132.663 132.257 132.513 132.446 132.38 132.199 132.089 131.952 131.784 131.568 131.305 130.913 129.868 -9 ,29916 ,TETRA ,17590644,Sat Nov 27 21:15:15 CET,Sat Nov 27 23:08:03 CET,0.0 1.198 1.817 2.302 2.737 3.148 3.549 3.938 4.696 5.071 5.408 5.519 6.347 6.653 7.253 7.818 8.366 8.641 9.188 9.724 10.503 11.01 11.493 12.168 12.811 13.445 14.073 14.684 15.48 16.28 17.083 18.083 19.084 20.076 21.246 22.566 23.838 25.3 26.972 28.79 30.692 32.921 35.634 38.467 41.91 45.835 50.607 56.406 63.589 72.577 84.685 96.039 103.585 109.041 113.183 116.441 118.919 120.903 122.461 123.875 124.991 125.926 126.768 127.506 128.14 128.688 129.209 129.624 129.959 130.28 130.588 130.811 131.017 131.229 131.382 131.525 131.66 131.776 131.88 131.949 132.01 132.092 132.137 132.169 132.177 132.172 132.16 132.143 132.129 131.727 131.997 131.934 131.87 131.72 131.613 131.453 131.283 131.098 130.811 130.426 129.292 -10 ,30913 ,TETRA ,17590645,Sat Nov 27 21:15:15 CET,Sat Nov 27 23:06:46 CET,0.0 0.917 1.445 1.859 2.275 2.687 3.069 3.433 4.102 4.405 4.7 4.785 5.584 5.867 6.421 6.945 7.457 7.712 8.204 8.686 9.409 9.891 10.354 11.023 11.696 12.352 12.989 13.621 14.458 15.293 16.126 17.127 18.096 19.052 20.181 21.498 22.792 24.247 25.876 27.639 29.531 31.749 34.431 37.208 40.531 44.406 49.139 54.774 61.788 70.758 82.936 94.387 101.918 107.365 111.474 114.726 117.262 119.347 120.984 122.423 123.541 124.481 125.313 126.05 126.682 127.204 127.711 128.125 128.449 128.759 129.069 129.304 129.524 129.739 129.885 130.021 130.147 130.256 130.354 130.409 130.467 130.551 130.591 130.613 130.613 130.608 130.6 130.576 130.55 130.136 130.438 130.389 130.338 130.223 130.129 130.013 129.855 129.66 129.412 129.048 128.015 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 7d86d9c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26611 ,TETRA ,17590646,Sat Nov 27 21:15:15 CET,Sat Nov 27 23:07:44 CET,0.0 0.905 1.326 1.645 1.932 2.17 2.385 2.592 2.955 3.124 3.288 3.26 3.718 3.848 4.096 4.331 4.54 4.638 4.82 4.995 5.274 5.449 5.616 5.856 6.091 6.332 6.566 6.781 7.034 7.28 7.533 7.849 8.15 8.433 8.76 9.135 9.496 9.883 10.312 10.773 11.248 11.777 12.402 13.05 13.787 14.601 15.529 16.583 17.819 19.173 20.7 21.842 22.346 22.558 22.635 22.609 22.505 22.387 22.286 22.154 22.012 21.855 21.687 21.521 21.356 21.195 21.021 20.858 20.706 20.536 20.36 20.215 20.067 19.924 19.8 19.657 19.516 19.365 19.208 19.1 18.983 18.795 18.659 18.518 18.45 18.293 18.111 17.905 17.796 17.381 17.445 17.32 17.186 16.899 16.748 16.567 16.384 16.127 15.741 15.174 13.617 -2 ,7734 ,TETRA ,17590647,Sat Nov 27 21:15:15 CET,Sat Nov 27 23:05:20 CET,0.0 0.764 1.237 1.593 1.842 2.053 2.243 2.42 2.739 2.878 3.023 3.0 3.478 3.624 3.887 4.127 4.354 4.467 4.682 4.878 5.154 5.335 5.509 5.743 5.968 6.188 6.4 6.6 6.853 7.093 7.331 7.635 7.946 8.252 8.586 8.969 9.335 9.711 10.116 10.563 11.042 11.567 12.186 12.803 13.509 14.333 15.313 16.391 17.6 18.993 20.586 21.707 22.165 22.321 22.344 22.294 22.214 22.1 21.958 21.778 21.601 21.437 21.27 21.099 20.946 20.793 20.616 20.461 20.323 20.173 20.012 19.88 19.73 19.553 19.42 19.285 19.143 18.999 18.848 18.735 18.614 18.421 18.282 18.132 18.057 17.898 17.718 17.514 17.41 17.004 17.081 16.962 16.827 16.489 16.306 16.115 15.875 15.579 15.223 14.786 13.718 -3 ,20012 ,TETRA ,17590648,Sat Nov 27 21:15:16 CET,Sat Nov 27 23:05:06 CET,0.0 0.951 1.4 1.72 1.977 2.217 2.424 2.614 2.948 3.094 3.244 3.197 3.648 3.782 4.037 4.266 4.482 4.584 4.775 4.963 5.24 5.423 5.6 5.846 6.092 6.324 6.544 6.76 7.034 7.296 7.545 7.842 8.128 8.413 8.746 9.12 9.479 9.879 10.317 10.787 11.286 11.831 12.458 13.086 13.829 14.641 15.559 16.613 17.837 19.235 20.745 21.812 22.326 22.533 22.561 22.478 22.368 22.247 22.111 21.94 21.775 21.612 21.459 21.316 21.182 21.043 20.878 20.729 20.586 20.435 20.285 20.15 20.001 19.847 19.724 19.596 19.464 19.331 19.193 19.083 18.963 18.787 18.667 18.539 18.471 18.319 18.152 17.977 17.885 17.486 17.6 17.482 17.337 17.025 16.849 16.645 16.429 16.192 15.894 15.491 14.677 -4 ,14399 ,TETRA ,17590649,Sat Nov 27 21:15:15 CET,Sat Nov 27 23:07:44 CET,0.0 1.21 1.791 2.232 2.615 2.942 3.199 3.449 3.916 4.113 4.289 4.276 4.759 4.927 5.252 5.552 5.828 5.953 6.196 6.429 6.767 6.972 7.166 7.453 7.734 8.016 8.276 8.496 8.763 9.024 9.264 9.562 9.865 10.143 10.47 10.858 11.23 11.623 12.058 12.529 13.011 13.557 14.2 14.836 15.556 16.365 17.294 18.317 19.525 20.918 22.479 23.566 24.05 24.266 24.296 24.227 24.139 24.024 23.903 23.757 23.606 23.446 23.28 23.13 22.983 22.838 22.67 22.516 22.388 22.242 22.085 21.96 21.822 21.671 21.549 21.414 21.263 21.108 20.944 20.83 20.719 20.526 20.371 20.212 20.133 19.971 19.799 19.594 19.466 19.032 19.103 18.985 18.851 18.525 18.339 18.128 17.883 17.6 17.245 16.768 15.673 -5 ,19381 ,TETRA ,17590650,Sat Nov 27 21:15:15 CET,Sat Nov 27 23:06:46 CET,0.0 0.82 1.216 1.522 1.802 2.046 2.255 2.435 2.772 2.936 3.093 3.062 3.525 3.663 3.92 4.17 4.394 4.493 4.693 4.89 5.173 5.35 5.521 5.768 5.995 6.215 6.44 6.653 6.926 7.193 7.452 7.775 8.065 8.333 8.658 9.021 9.369 9.78 10.236 10.696 11.189 11.75 12.397 13.057 13.837 14.714 15.66 16.704 17.936 19.304 20.789 21.882 22.407 22.613 22.671 22.633 22.534 22.431 22.33 22.204 22.054 21.899 21.736 21.576 21.412 21.265 21.124 20.972 20.826 20.67 20.508 20.377 20.237 20.081 19.953 19.813 19.665 19.502 19.329 19.211 19.092 18.916 18.793 18.663 18.591 18.437 18.284 18.101 17.989 17.574 17.653 17.538 17.411 17.1 16.914 16.713 16.486 16.218 15.859 15.382 14.594 -6 ,9494 ,TETRA ,17590651,Sat Nov 27 21:16:12 CET,Sat Nov 27 23:06:46 CET,0.0 0.707 1.087 1.372 1.645 1.898 2.137 2.337 2.646 2.799 2.954 2.921 3.379 3.508 3.752 3.99 4.228 4.343 4.555 4.757 5.049 5.23 5.396 5.637 5.864 6.09 6.313 6.517 6.771 7.015 7.269 7.584 7.873 8.148 8.465 8.824 9.177 9.566 9.991 10.451 10.925 11.433 12.027 12.636 13.34 14.12 14.996 16.005 17.224 18.657 20.315 21.519 22.061 22.257 22.275 22.239 22.139 21.979 21.823 21.657 21.514 21.365 21.202 20.986 20.748 20.579 20.42 20.268 20.132 19.988 19.834 19.696 19.539 19.368 19.236 19.084 18.921 18.762 18.594 18.475 18.35 18.165 18.041 17.9 17.824 17.657 17.467 17.263 17.156 16.742 16.822 16.706 16.577 16.281 16.108 15.898 15.678 15.422 15.104 14.671 13.612 -7 ,381 ,TETRA ,17590652,Sat Nov 27 21:16:13 CET,Sat Nov 27 23:08:02 CET,0.0 1.258 1.753 2.101 2.379 2.623 2.853 3.049 3.394 3.552 3.698 3.629 4.076 4.199 4.434 4.654 4.858 4.961 5.172 5.367 5.649 5.824 5.991 6.251 6.497 6.724 6.95 7.167 7.452 7.735 8.004 8.319 8.617 8.901 9.218 9.573 9.917 10.305 10.735 11.192 11.689 12.261 12.907 13.549 14.306 15.154 16.105 17.182 18.467 19.874 21.388 22.504 23.039 23.218 23.241 23.218 23.131 23.014 22.89 22.732 22.58 22.426 22.246 22.052 21.872 21.707 21.527 21.361 21.216 21.055 20.886 20.747 20.597 20.436 20.303 20.158 20.014 19.86 19.684 19.568 19.458 19.267 19.125 18.982 18.908 18.755 18.577 18.365 18.26 17.851 17.906 17.776 17.648 17.379 17.227 17.047 16.831 16.586 16.292 15.931 15.29 -8 ,10046 ,TETRA ,17590653,Sat Nov 27 21:16:13 CET,Sat Nov 27 23:07:43 CET,0.0 0.87 1.269 1.588 1.864 2.112 2.338 2.532 2.847 2.997 3.139 3.084 3.541 3.676 3.937 4.179 4.406 4.51 4.709 4.912 5.21 5.395 5.572 5.823 6.068 6.301 6.528 6.758 7.06 7.334 7.591 7.898 8.184 8.475 8.816 9.191 9.551 9.943 10.373 10.827 11.298 11.818 12.439 13.064 13.76 14.553 15.47 16.497 17.699 19.021 20.53 21.6 22.08 22.261 22.292 22.254 22.165 22.053 21.935 21.805 21.681 21.55 21.407 21.25 21.072 20.893 20.701 20.529 20.377 20.214 20.037 19.892 19.737 19.57 19.431 19.279 19.134 18.979 18.799 18.674 18.546 18.345 18.202 18.047 17.957 17.776 17.61 17.446 17.359 16.954 17.042 16.922 16.79 16.482 16.295 16.097 15.895 15.647 15.344 14.969 13.844 -9 ,10638 ,TETRA ,17590654,Sat Nov 27 21:16:13 CET,Sat Nov 27 23:09:26 CET,0.0 1.376 1.918 2.357 2.717 3.037 3.319 3.552 3.899 4.048 4.195 4.138 4.583 4.706 4.942 5.162 5.385 5.497 5.709 5.905 6.184 6.365 6.538 6.791 7.037 7.275 7.503 7.72 8.006 8.286 8.548 8.864 9.172 9.459 9.774 10.137 10.506 10.919 11.354 11.806 12.28 12.829 13.474 14.116 14.882 15.747 16.73 17.788 18.992 20.389 22.013 23.118 23.587 23.806 23.859 23.786 23.665 23.539 23.396 23.211 23.022 22.842 22.675 22.501 22.339 22.193 22.024 21.87 21.738 21.588 21.413 21.261 21.107 20.947 20.823 20.697 20.56 20.415 20.249 20.12 19.985 19.802 19.679 19.533 19.456 19.31 19.149 18.96 18.861 18.457 18.558 18.439 18.31 18.003 17.82 17.616 17.385 17.132 16.816 16.355 15.016 -10 ,28504 ,TETRA ,17590655,Sat Nov 27 21:16:13 CET,Sat Nov 27 23:06:22 CET,0.0 0.978 1.419 1.766 2.064 2.33 2.551 2.76 3.135 3.303 3.459 3.419 3.87 4.004 4.255 4.478 4.699 4.811 5.019 5.207 5.477 5.647 5.812 6.057 6.287 6.499 6.71 6.922 7.2 7.455 7.692 7.984 8.284 8.578 8.915 9.286 9.635 10.038 10.468 10.922 11.403 11.928 12.558 13.195 13.917 14.755 15.73 16.808 18.016 19.429 21.046 22.099 22.591 22.809 22.851 22.807 22.713 22.599 22.491 22.367 22.241 22.105 21.951 21.789 21.633 21.493 21.33 21.158 21.006 20.861 20.694 20.542 20.391 20.231 20.086 19.933 19.782 19.635 19.48 19.362 19.241 19.054 18.916 18.775 18.704 18.544 18.377 18.203 18.11 17.704 17.78 17.659 17.534 17.23 17.047 16.843 16.614 16.349 16.062 15.726 14.84 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 153fc6ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20429 ,TETRA ,17590656,Sat Nov 27 21:16:15 CET,Sat Nov 27 23:08:17 CET,0.0 1.129 1.757 2.301 2.798 3.243 3.661 4.075 4.845 5.212 5.575 5.745 6.613 6.948 7.602 8.234 8.816 9.079 9.584 10.091 10.832 11.311 11.773 12.45 13.137 13.819 14.485 15.144 16.029 16.913 17.791 18.879 19.945 20.983 22.198 23.6 25.005 26.593 28.353 30.281 32.367 34.819 37.803 40.893 44.633 48.954 54.133 60.37 68.188 78.139 91.296 103.418 111.573 117.539 121.948 125.382 128.036 130.173 131.882 133.444 134.655 135.649 136.527 137.288 137.927 138.462 138.997 139.457 139.825 140.169 140.487 140.734 140.972 141.202 141.365 141.51 141.641 141.764 141.887 141.951 142.002 142.075 142.113 142.135 142.129 142.102 142.059 142.013 141.984 141.626 141.82 141.765 141.704 141.51 141.379 141.259 141.092 140.829 140.518 140.124 138.102 -2 ,32245 ,TETRA ,17590657,Sat Nov 27 21:16:13 CET,Sat Nov 27 23:07:43 CET,0.0 1.127 1.793 2.368 2.887 3.384 3.848 4.26 5.026 5.389 5.748 5.922 6.786 7.124 7.79 8.437 9.036 9.333 9.942 10.542 11.435 11.981 12.462 13.175 13.888 14.577 15.245 15.911 16.785 17.63 18.48 19.54 20.587 21.622 22.838 24.243 25.624 27.194 28.947 30.853 32.909 35.294 38.216 41.298 45.023 49.316 54.516 60.735 68.501 78.47 91.759 104.143 112.438 118.371 122.775 126.241 128.945 131.13 132.815 134.335 135.562 136.58 137.477 138.246 138.907 139.471 140.022 140.471 140.823 141.153 141.459 141.706 141.947 142.166 142.326 142.474 142.613 142.753 142.87 142.929 142.976 143.024 143.059 143.1 143.113 143.132 143.136 143.103 143.074 142.733 142.959 142.892 142.818 142.684 142.579 142.441 142.285 142.034 141.682 141.159 139.082 -3 ,4060 ,TETRA ,17590658,Sat Nov 27 21:16:12 CET,Sat Nov 27 23:06:23 CET,0.0 1.306 1.943 2.444 2.904 3.309 3.678 4.031 4.704 5.029 5.352 5.509 6.285 6.569 7.121 7.669 8.2 8.46 8.968 9.472 10.214 10.699 11.185 11.887 12.58 13.265 13.936 14.603 15.472 16.331 17.189 18.235 19.255 20.283 21.505 22.919 24.32 25.885 27.621 29.516 31.602 34.021 36.915 39.943 43.624 47.934 53.114 59.351 67.084 76.705 89.638 102.054 110.314 116.148 120.502 123.901 126.597 128.798 130.522 132.11 133.345 134.349 135.242 136.013 136.668 137.212 137.739 138.197 138.563 138.914 139.247 139.493 139.729 139.962 140.127 140.282 140.425 140.542 140.653 140.725 140.792 140.861 140.89 140.908 140.919 140.936 140.909 140.86 140.834 140.47 140.643 140.587 140.506 140.277 140.133 139.965 139.779 139.521 139.174 138.698 136.988 -4 ,29353 ,TETRA ,17590659,Sat Nov 27 21:16:13 CET,Sat Nov 27 23:07:18 CET,0.0 1.139 1.745 2.26 2.756 3.206 3.622 4.012 4.77 5.148 5.507 5.681 6.541 6.88 7.556 8.2 8.836 9.149 9.765 10.372 11.27 11.855 12.429 13.281 14.128 14.898 15.578 16.245 17.131 17.997 18.853 19.91 20.933 21.947 23.175 24.587 25.955 27.501 29.241 31.142 33.185 35.574 38.49 41.507 45.106 49.37 54.633 60.861 68.637 78.553 91.742 104.21 112.536 118.413 122.781 126.263 128.934 131.042 132.717 134.305 135.555 136.575 137.472 138.249 138.929 139.494 140.028 140.496 140.879 141.235 141.577 141.833 142.068 142.288 142.443 142.583 142.705 142.82 142.93 142.992 143.049 143.123 143.152 143.18 143.193 143.201 143.191 143.168 143.143 142.8 143.03 142.969 142.882 142.668 142.545 142.381 142.172 141.918 141.515 140.926 138.581 -5 ,14789 ,TETRA ,17590660,Sat Nov 27 21:16:14 CET,Sat Nov 27 23:08:32 CET,0.0 1.42 2.148 2.731 3.254 3.711 4.113 4.493 5.203 5.556 5.923 6.113 6.986 7.336 8.003 8.638 9.26 9.57 10.182 10.78 11.666 12.25 12.827 13.694 14.537 15.351 16.123 16.82 17.69 18.536 19.382 20.441 21.466 22.48 23.681 25.066 26.45 28.006 29.72 31.605 33.674 36.069 38.947 41.949 45.594 49.833 54.991 61.226 68.974 78.648 91.551 103.878 112.113 118.024 122.434 125.953 128.695 130.893 132.616 134.162 135.344 136.282 137.135 137.913 138.584 139.136 139.668 140.103 140.455 140.812 141.149 141.408 141.647 141.86 142.01 142.168 142.316 142.434 142.548 142.622 142.686 142.773 142.831 142.871 142.877 142.887 142.87 142.816 142.775 142.427 142.643 142.56 142.474 142.281 142.139 141.938 141.657 141.368 141.081 140.534 138.816 -6 ,20144 ,TETRA ,17590661,Sat Nov 27 21:16:14 CET,Sat Nov 27 23:08:49 CET,0.0 1.384 2.018 2.563 3.061 3.505 3.93 4.337 5.085 5.443 5.79 5.97 6.841 7.167 7.791 8.403 9.02 9.329 9.935 10.539 11.432 12.013 12.593 13.448 14.275 15.09 15.902 16.638 17.532 18.414 19.268 20.308 21.341 22.38 23.608 25.019 26.419 27.98 29.711 31.646 33.728 36.125 39.035 42.082 45.759 50.007 55.204 61.47 69.263 79.196 92.432 104.716 112.972 118.835 123.12 126.49 129.125 131.284 132.98 134.537 135.78 136.785 137.652 138.407 139.063 139.623 140.154 140.592 140.936 141.256 141.559 141.791 142.018 142.219 142.357 142.496 142.642 142.769 142.877 142.941 142.987 143.046 143.064 143.054 143.039 143.0 142.971 142.933 142.904 142.562 142.778 142.705 142.626 142.403 142.274 142.164 141.999 141.742 141.379 140.791 138.612 -7 ,14333 ,TETRA ,17590662,Sat Nov 27 21:16:14 CET,Sat Nov 27 23:08:27 CET,0.0 1.3 1.969 2.515 2.991 3.447 3.895 4.305 5.031 5.383 5.735 5.905 6.763 7.088 7.739 8.374 9.0 9.314 9.926 10.524 11.422 12.008 12.578 13.432 14.263 15.078 15.888 16.687 17.749 18.798 19.831 21.112 22.373 23.615 25.091 26.828 28.395 29.971 31.712 33.597 35.64 38.022 40.918 43.945 47.62 51.932 57.147 63.339 71.124 81.076 94.257 106.637 114.945 120.868 125.24 128.667 131.335 133.53 135.251 136.825 138.068 139.092 139.989 140.772 141.447 142.012 142.573 143.027 143.37 143.702 144.041 144.287 144.491 144.672 144.813 144.963 145.103 145.23 145.327 145.365 145.398 145.414 145.403 145.403 145.408 145.405 145.382 145.327 145.293 144.946 145.13 145.047 144.968 144.799 144.677 144.518 144.332 144.096 143.765 143.212 141.642 -8 ,32340 ,TETRA ,17590663,Sat Nov 27 21:16:14 CET,Sat Nov 27 23:10:07 CET,0.0 1.301 2.043 2.639 3.148 3.605 4.063 4.496 5.281 5.662 6.02 6.19 7.061 7.397 8.062 8.703 9.317 9.621 10.221 10.816 11.683 12.255 12.83 13.67 14.51 15.339 16.136 16.852 17.722 18.591 19.464 20.54 21.571 22.582 23.787 25.182 26.54 28.073 29.779 31.652 33.703 36.095 39.004 42.06 45.75 50.012 55.179 61.371 69.111 79.056 92.367 104.716 112.904 118.777 123.134 126.548 129.217 131.409 133.143 134.708 135.923 136.92 137.818 138.593 139.25 139.809 140.343 140.772 141.108 141.444 141.766 141.999 142.223 142.442 142.594 142.736 142.879 143.019 143.139 143.199 143.248 143.307 143.343 143.363 143.364 143.368 143.354 143.299 143.26 142.904 143.055 142.974 142.91 142.713 142.594 142.46 142.261 142.029 141.753 141.268 139.567 -9 ,5582 ,TETRA ,17590664,Sat Nov 27 21:16:13 CET,Sat Nov 27 23:07:12 CET,0.0 1.154 1.769 2.322 2.837 3.308 3.754 4.181 5.016 5.41 5.769 5.931 6.793 7.139 7.804 8.44 9.077 9.39 10.0 10.605 11.507 12.086 12.649 13.501 14.349 15.175 15.977 16.766 17.816 18.855 19.887 21.176 22.463 23.741 25.207 26.735 28.128 29.687 31.428 33.344 35.404 37.775 40.644 43.641 47.315 51.631 56.809 62.974 70.705 80.513 93.714 106.076 114.289 120.203 124.571 127.962 130.6 132.76 134.446 135.989 137.218 138.244 139.134 139.874 140.512 141.066 141.597 142.038 142.397 142.744 143.078 143.341 143.587 143.793 143.939 144.084 144.216 144.327 144.441 144.509 144.546 144.595 144.612 144.614 144.613 144.611 144.603 144.572 144.534 144.177 144.391 144.326 144.245 144.047 143.924 143.769 143.566 143.302 142.976 142.472 140.671 -10 ,10860 ,TETRA ,17590665,Sat Nov 27 21:16:15 CET,Sat Nov 27 23:06:55 CET,0.0 1.431 2.08 2.657 3.173 3.603 4.013 4.407 5.187 5.563 5.925 6.108 6.983 7.33 7.983 8.612 9.235 9.545 10.162 10.773 11.661 12.238 12.796 13.553 14.244 14.92 15.588 16.26 17.148 18.014 18.86 19.909 20.948 21.961 23.157 24.538 25.93 27.528 29.281 31.184 33.229 35.641 38.601 41.652 45.329 49.652 54.87 61.066 68.81 78.641 91.927 104.284 112.447 118.302 122.589 126.023 128.683 130.802 132.489 134.043 135.247 136.21 137.056 137.805 138.464 139.02 139.554 139.997 140.349 140.674 140.993 141.242 141.48 141.707 141.862 142.011 142.142 142.246 142.355 142.424 142.482 142.573 142.619 142.646 142.657 142.659 142.639 142.613 142.583 142.237 142.447 142.366 142.279 142.066 141.916 141.709 141.469 141.183 140.793 140.252 137.52 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt deleted file mode 100644 index 57442e1c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16309 ,TETRA ,17590666,Sat Nov 27 21:16:13 CET,Sat Nov 27 23:07:44 CET,0.0 0.719 1.167 1.502 1.79 2.048 2.275 2.499 2.921 3.112 3.286 3.266 3.817 3.989 4.318 4.623 4.907 5.037 5.29 5.543 5.924 6.175 6.415 6.765 7.116 7.468 7.813 8.152 8.58 8.988 9.401 9.902 10.382 10.854 11.401 12.01 12.607 13.282 14.043 14.88 15.764 16.748 17.923 19.137 20.571 22.229 24.202 26.503 29.286 32.742 37.176 41.09 43.548 45.211 46.37 47.087 47.543 47.971 48.294 48.487 48.595 48.684 48.742 48.764 48.772 48.776 48.736 48.651 48.553 48.457 48.34 48.206 48.062 47.918 47.813 47.707 47.593 47.472 47.32 47.207 47.091 46.886 46.742 46.593 46.514 46.365 46.202 46.006 45.902 45.468 45.531 45.39 45.246 44.935 44.747 44.508 44.238 43.934 43.56 43.058 41.801 -2 ,24973 ,TETRA ,17590667,Sat Nov 27 21:16:14 CET,Sat Nov 27 23:11:30 CET,0.0 0.839 1.29 1.707 2.057 2.325 2.553 2.765 3.174 3.374 3.566 3.562 4.103 4.272 4.599 4.903 5.201 5.343 5.607 5.859 6.229 6.463 6.697 7.042 7.365 7.685 8.004 8.316 8.729 9.134 9.517 9.985 10.441 10.888 11.417 12.014 12.61 13.28 14.005 14.8 15.664 16.642 17.799 19.003 20.446 22.095 24.069 26.369 29.183 32.718 37.216 41.044 43.453 45.11 46.273 47.125 47.723 48.144 48.436 48.676 48.837 48.952 49.0 48.975 48.927 48.87 48.802 48.742 48.688 48.63 48.564 48.504 48.418 48.309 48.216 48.109 47.989 47.853 47.696 47.582 47.459 47.262 47.131 46.992 46.918 46.756 46.571 46.381 46.281 45.845 45.925 45.786 45.626 45.264 45.081 44.854 44.575 44.273 43.924 43.441 42.046 -3 ,22488 ,TETRA ,17590668,Sat Nov 27 21:16:14 CET,Sat Nov 27 23:07:25 CET,0.0 0.747 1.22 1.599 1.906 2.19 2.446 2.665 3.052 3.238 3.428 3.403 3.935 4.098 4.428 4.737 5.026 5.166 5.441 5.709 6.102 6.359 6.613 6.978 7.33 7.675 8.0 8.314 8.75 9.179 9.585 10.082 10.557 11.014 11.559 12.185 12.797 13.486 14.233 15.028 15.883 16.87 18.05 19.271 20.733 22.375 24.319 26.636 29.484 33.002 37.515 41.468 43.887 45.46 46.531 47.33 47.921 48.341 48.632 48.892 49.06 49.108 49.094 49.094 49.106 49.082 49.007 48.932 48.873 48.808 48.725 48.653 48.561 48.436 48.324 48.201 48.072 47.938 47.794 47.69 47.576 47.401 47.275 47.135 47.06 46.881 46.682 46.467 46.357 45.913 45.944 45.779 45.606 45.225 45.034 44.837 44.576 44.245 43.871 43.394 41.897 -4 ,13122 ,TETRA ,17590669,Sat Nov 27 21:16:15 CET,Sat Nov 27 23:11:01 CET,0.0 0.85 1.225 1.513 1.778 2.025 2.256 2.492 2.898 3.076 3.263 3.255 3.806 3.978 4.304 4.631 4.936 5.08 5.372 5.657 6.064 6.319 6.559 6.92 7.272 7.602 7.927 8.248 8.657 9.049 9.434 9.907 10.379 10.843 11.383 12.005 12.61 13.273 14.004 14.809 15.669 16.641 17.81 19.013 20.444 22.116 24.115 26.437 29.237 32.697 37.156 41.147 43.644 45.297 46.443 47.258 47.834 48.266 48.546 48.747 48.88 48.908 48.917 48.918 48.876 48.839 48.783 48.697 48.603 48.491 48.384 48.286 48.166 48.036 47.918 47.78 47.634 47.482 47.327 47.221 47.104 46.918 46.787 46.633 46.546 46.366 46.171 45.956 45.84 45.388 45.432 45.293 45.151 44.817 44.622 44.405 44.147 43.845 43.498 42.984 41.605 -5 ,15405 ,TETRA ,17590670,Sat Nov 27 21:16:15 CET,Sat Nov 27 23:06:58 CET,0.0 0.662 1.079 1.403 1.675 1.9 2.131 2.355 2.737 2.911 3.077 3.027 3.558 3.71 3.989 4.274 4.57 4.714 4.997 5.267 5.654 5.901 6.151 6.519 6.855 7.173 7.482 7.785 8.199 8.615 9.035 9.534 10.001 10.461 10.993 11.593 12.186 12.852 13.584 14.374 15.214 16.19 17.378 18.586 20.018 21.677 23.659 25.962 28.778 32.268 36.724 40.761 43.313 44.987 46.129 47.015 47.635 48.074 48.376 48.587 48.758 48.895 48.981 49.014 48.986 48.924 48.83 48.735 48.668 48.592 48.5 48.411 48.309 48.212 48.133 48.039 47.937 47.836 47.709 47.608 47.511 47.324 47.177 47.037 46.959 46.789 46.603 46.394 46.283 45.843 45.887 45.727 45.561 45.233 45.029 44.78 44.529 44.265 43.911 43.326 41.561 -6 ,13506 ,TETRA ,17590671,Sat Nov 27 21:16:15 CET,Sat Nov 27 23:10:17 CET,0.0 0.89 1.301 1.641 1.897 2.116 2.329 2.531 2.889 3.07 3.257 3.254 3.8 3.972 4.313 4.63 4.935 5.088 5.38 5.643 6.021 6.268 6.504 6.854 7.21 7.555 7.893 8.222 8.643 9.05 9.446 9.933 10.41 10.876 11.426 12.062 12.68 13.353 14.091 14.895 15.759 16.767 17.971 19.213 20.693 22.373 24.384 26.759 29.62 33.16 37.774 41.815 44.29 45.915 47.023 47.836 48.382 48.717 48.899 48.974 49.015 49.075 49.13 49.163 49.151 49.102 49.003 48.933 48.891 48.823 48.738 48.633 48.517 48.415 48.325 48.215 48.091 47.968 47.833 47.73 47.614 47.427 47.289 47.143 47.075 46.924 46.757 46.582 46.479 46.034 46.118 45.988 45.844 45.52 45.325 45.087 44.85 44.606 44.291 43.816 42.488 -7 ,17190 ,TETRA ,17590672,Sat Nov 27 21:16:15 CET,Sat Nov 27 23:07:19 CET,0.0 0.703 1.134 1.474 1.782 2.052 2.27 2.471 2.863 3.05 3.229 3.201 3.736 3.896 4.204 4.492 4.763 4.897 5.172 5.435 5.806 6.044 6.27 6.615 6.96 7.283 7.617 7.961 8.397 8.795 9.18 9.658 10.113 10.553 11.071 11.668 12.28 12.967 13.702 14.481 15.311 16.286 17.448 18.632 20.044 21.675 23.632 25.888 28.657 32.172 36.741 40.713 43.221 44.888 45.989 46.786 47.351 47.796 48.112 48.338 48.503 48.615 48.657 48.667 48.653 48.613 48.571 48.521 48.458 48.375 48.28 48.19 48.098 47.996 47.907 47.823 47.727 47.61 47.465 47.358 47.241 47.05 46.918 46.761 46.68 46.516 46.323 46.101 45.99 45.552 45.598 45.453 45.29 44.877 44.617 44.325 44.0 43.634 43.162 42.474 40.494 -8 ,19283 ,TETRA ,17590673,Sat Nov 27 21:16:17 CET,Sat Nov 27 23:06:58 CET,0.0 0.765 1.194 1.551 1.817 2.077 2.324 2.549 2.975 3.171 3.356 3.318 3.846 3.995 4.291 4.588 4.87 5.006 5.268 5.528 5.898 6.131 6.371 6.723 7.054 7.378 7.697 8.011 8.424 8.818 9.205 9.686 10.15 10.6 11.126 11.729 12.329 12.999 13.735 14.536 15.371 16.336 17.515 18.72 20.148 21.795 23.756 26.083 28.92 32.375 36.834 40.741 43.143 44.755 45.814 46.457 46.84 47.149 47.416 47.651 47.801 47.897 47.926 47.937 47.946 47.93 47.893 47.826 47.757 47.672 47.55 47.444 47.33 47.18 47.051 46.928 46.805 46.657 46.501 46.395 46.273 46.056 45.912 45.772 45.694 45.532 45.341 45.118 44.995 44.541 44.603 44.453 44.3 43.95 43.737 43.507 43.242 42.915 42.49 41.993 40.648 -9 ,25235 ,TETRA ,17590674,Sat Nov 27 21:16:15 CET,Sat Nov 27 23:07:35 CET,0.0 1.081 1.714 2.174 2.49 2.742 2.991 3.209 3.619 3.823 4.011 3.982 4.515 4.67 4.982 5.276 5.561 5.706 5.987 6.257 6.647 6.888 7.122 7.475 7.816 8.136 8.438 8.744 9.16 9.567 9.958 10.427 10.894 11.355 11.888 12.5 13.111 13.79 14.526 15.318 16.166 17.152 18.324 19.546 21.036 22.733 24.707 27.002 29.83 33.309 37.829 41.842 44.333 46.016 47.181 48.016 48.575 48.992 49.311 49.555 49.703 49.802 49.865 49.904 49.92 49.92 49.89 49.831 49.742 49.618 49.479 49.354 49.227 49.092 48.994 48.896 48.777 48.635 48.477 48.358 48.247 48.078 47.95 47.808 47.734 47.581 47.417 47.236 47.119 46.676 46.747 46.581 46.404 46.041 45.831 45.609 45.379 45.078 44.705 44.234 42.388 -10 ,12730 ,TETRA ,17590675,Sat Nov 27 21:16:15 CET,Sat Nov 27 23:07:13 CET,0.0 0.773 1.211 1.533 1.806 2.065 2.308 2.522 2.908 3.104 3.287 3.234 3.765 3.929 4.237 4.531 4.821 4.964 5.241 5.51 5.894 6.136 6.379 6.732 7.078 7.42 7.738 8.038 8.43 8.827 9.223 9.701 10.159 10.609 11.142 11.747 12.343 13.002 13.737 14.55 15.403 16.367 17.528 18.741 20.191 21.846 23.819 26.132 28.967 32.47 36.942 40.913 43.399 45.015 46.11 46.902 47.463 47.893 48.197 48.431 48.585 48.677 48.731 48.762 48.741 48.67 48.611 48.555 48.472 48.366 48.237 48.132 48.026 47.902 47.792 47.674 47.545 47.407 47.263 47.153 47.036 46.864 46.735 46.601 46.527 46.357 46.18 45.995 45.892 45.457 45.539 45.398 45.252 44.962 44.767 44.532 44.301 44.041 43.7 43.229 42.019 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_20_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_20_17.txt deleted file mode 100644 index c144adf2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_20_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5155 ,TETRA ,17590676,Sat Nov 27 21:17:12 CET,Sat Nov 27 23:10:07 CET,0.0 1.474 2.05 2.406 2.704 2.966 3.157 3.352 3.721 3.882 4.048 4.047 4.524 4.674 4.947 5.199 5.429 5.54 5.764 5.973 6.252 6.424 6.593 6.845 7.095 7.334 7.56 7.781 8.066 8.333 8.603 8.934 9.24 9.527 9.862 10.225 10.553 10.9 11.255 11.627 12.038 12.512 13.024 13.519 14.107 14.759 15.508 16.313 17.173 17.98 18.584 18.688 18.394 17.993 17.556 17.115 16.729 16.339 15.966 15.619 15.292 14.977 14.695 14.412 14.126 13.861 13.586 13.341 13.11 12.847 12.574 12.367 12.165 11.951 11.782 11.602 11.412 11.198 10.975 10.83 10.68 10.445 10.281 10.098 9.995 9.771 9.541 9.318 9.201 8.764 8.789 8.638 8.48 8.136 7.937 7.713 7.471 7.198 6.862 6.416 5.271 -2 ,31760 ,TETRA ,17590677,Sat Nov 27 21:17:12 CET,Sat Nov 27 23:07:25 CET,0.0 1.321 1.855 2.265 2.616 2.916 3.166 3.397 3.84 4.035 4.203 4.204 4.689 4.839 5.105 5.359 5.612 5.731 5.951 6.161 6.445 6.629 6.815 7.077 7.31 7.529 7.751 7.963 8.237 8.51 8.758 9.039 9.31 9.595 9.965 10.361 10.724 11.178 11.687 12.16 12.613 13.092 13.651 14.207 14.785 15.384 16.079 16.823 17.606 18.361 18.937 19.116 18.954 18.597 18.194 17.775 17.376 16.99 16.634 16.267 15.937 15.632 15.327 15.031 14.759 14.514 14.252 14.007 13.796 13.578 13.338 13.131 12.918 12.689 12.512 12.327 12.131 11.933 11.715 11.558 11.395 11.127 10.939 10.738 10.63 10.409 10.18 9.944 9.821 9.383 9.399 9.246 9.086 8.734 8.528 8.282 8.026 7.735 7.36 6.864 5.55 -3 ,1469 ,TETRA ,17590678,Sat Nov 27 21:17:12 CET,Sat Nov 27 23:08:07 CET,0.0 1.17 1.6 1.972 2.276 2.518 2.751 2.974 3.35 3.507 3.656 3.628 4.087 4.219 4.495 4.75 4.971 5.081 5.304 5.523 5.829 6.02 6.205 6.457 6.691 6.926 7.156 7.375 7.656 7.917 8.168 8.462 8.745 9.015 9.326 9.677 10.004 10.38 10.814 11.251 11.68 12.16 12.704 13.242 13.849 14.512 15.262 16.031 16.788 17.502 18.111 18.274 18.074 17.723 17.305 16.878 16.496 16.112 15.757 15.401 15.061 14.737 14.43 14.132 13.854 13.6 13.312 13.045 12.826 12.591 12.334 12.116 11.884 11.632 11.44 11.254 11.065 10.863 10.656 10.515 10.356 10.09 9.901 9.7 9.599 9.389 9.172 8.952 8.827 8.386 8.413 8.261 8.102 7.74 7.531 7.288 7.018 6.728 6.396 5.922 5.082 -4 ,15100 ,TETRA ,17590679,Sat Nov 27 21:17:12 CET,Sat Nov 27 23:11:31 CET,0.0 1.283 1.823 2.193 2.467 2.724 2.97 3.177 3.552 3.719 3.869 3.843 4.3 4.423 4.657 4.894 5.128 5.243 5.461 5.673 5.967 6.143 6.314 6.565 6.8 7.023 7.233 7.431 7.688 7.949 8.204 8.497 8.773 9.04 9.35 9.692 10.008 10.345 10.717 11.12 11.549 12.044 12.606 13.135 13.723 14.348 15.037 15.754 16.513 17.258 17.799 17.769 17.487 17.146 16.732 16.318 15.909 15.477 15.084 14.696 14.358 14.045 13.745 13.457 13.189 12.947 12.687 12.429 12.2 11.979 11.732 11.518 11.313 11.094 10.917 10.727 10.514 10.298 10.085 9.914 9.734 9.48 9.288 9.081 8.977 8.766 8.553 8.321 8.2 7.763 7.784 7.635 7.474 7.117 6.915 6.689 6.458 6.189 5.817 5.299 4.169 -5 ,28491 ,TETRA ,17590680,Sat Nov 27 21:17:13 CET,Sat Nov 27 23:11:41 CET,0.0 1.569 2.093 2.476 2.768 3.041 3.301 3.529 3.891 4.063 4.233 4.232 4.697 4.834 5.108 5.369 5.621 5.746 5.989 6.214 6.531 6.735 6.928 7.198 7.454 7.707 7.939 8.162 8.441 8.704 8.965 9.27 9.554 9.829 10.159 10.526 10.892 11.3 11.701 12.109 12.54 13.018 13.571 14.122 14.712 15.299 16.013 16.794 17.559 18.314 18.928 19.065 18.824 18.431 17.998 17.551 17.15 16.758 16.369 15.955 15.588 15.247 14.925 14.63 14.345 14.073 13.789 13.531 13.302 13.052 12.798 12.593 12.376 12.147 11.969 11.791 11.596 11.383 11.163 11.012 10.847 10.581 10.392 10.197 10.098 9.887 9.642 9.351 9.212 8.772 8.792 8.639 8.473 8.101 7.905 7.684 7.432 7.147 6.833 6.412 5.404 -6 ,30569 ,TETRA ,17590681,Sat Nov 27 21:17:13 CET,Sat Nov 27 23:13:42 CET,0.0 1.71 2.253 2.623 2.948 3.238 3.474 3.702 4.157 4.369 4.553 4.568 5.044 5.191 5.465 5.697 5.923 6.037 6.255 6.466 6.76 6.945 7.122 7.381 7.636 7.872 8.1 8.324 8.61 8.878 9.138 9.444 9.737 10.018 10.325 10.662 10.987 11.331 11.693 12.094 12.518 12.967 13.49 14.048 14.661 15.313 16.005 16.745 17.56 18.325 18.966 19.069 18.869 18.554 18.145 17.721 17.311 16.887 16.504 16.101 15.728 15.404 15.105 14.801 14.511 14.255 13.979 13.732 13.505 13.272 13.055 12.856 12.631 12.405 12.225 12.037 11.84 11.623 11.397 11.242 11.079 10.822 10.629 10.428 10.335 10.142 9.916 9.676 9.561 9.131 9.14 8.977 8.822 8.504 8.313 8.095 7.856 7.549 7.186 6.77 5.617 -7 ,24004 ,TETRA ,17590682,Sat Nov 27 21:17:12 CET,Sat Nov 27 23:07:33 CET,0.0 1.572 2.052 2.41 2.714 2.968 3.203 3.429 3.837 4.002 4.156 4.129 4.593 4.734 4.994 5.262 5.525 5.643 5.863 6.082 6.39 6.573 6.752 7.029 7.301 7.553 7.798 8.027 8.3 8.557 8.801 9.113 9.408 9.674 9.993 10.355 10.695 11.084 11.494 11.882 12.281 12.732 13.246 13.759 14.342 14.938 15.62 16.336 17.104 17.889 18.483 18.613 18.338 17.889 17.475 17.065 16.662 16.274 15.91 15.528 15.189 14.885 14.573 14.252 13.97 13.725 13.455 13.213 12.995 12.733 12.467 12.267 12.055 11.816 11.629 11.433 11.237 11.049 10.851 10.702 10.533 10.266 10.074 9.866 9.762 9.554 9.331 9.09 8.96 8.516 8.524 8.355 8.176 7.797 7.589 7.361 7.104 6.796 6.432 5.997 5.051 -8 ,26011 ,TETRA ,17590683,Sat Nov 27 21:17:12 CET,Sat Nov 27 23:07:56 CET,0.0 1.701 2.194 2.547 2.842 3.1 3.342 3.576 3.986 4.158 4.319 4.306 4.776 4.926 5.208 5.457 5.682 5.788 5.991 6.196 6.474 6.636 6.798 7.053 7.295 7.519 7.741 7.962 8.236 8.49 8.731 9.032 9.329 9.6 9.907 10.268 10.621 11.011 11.41 11.819 12.252 12.711 13.235 13.745 14.337 15.005 15.739 16.465 17.215 18.033 18.764 18.997 18.769 18.386 17.994 17.562 17.124 16.705 16.345 15.972 15.623 15.303 14.977 14.661 14.367 14.094 13.81 13.557 13.335 13.101 12.863 12.667 12.463 12.236 12.055 11.881 11.691 11.483 11.271 11.113 10.95 10.708 10.527 10.34 10.25 10.071 9.872 9.645 9.52 9.081 9.112 8.966 8.819 8.482 8.291 8.083 7.851 7.593 7.272 6.882 6.048 -9 ,21951 ,TETRA ,17590684,Sat Nov 27 21:17:14 CET,Sat Nov 27 23:07:59 CET,0.0 1.298 1.801 2.164 2.45 2.717 2.959 3.186 3.597 3.766 3.915 3.894 4.361 4.498 4.765 5.007 5.243 5.369 5.598 5.814 6.126 6.328 6.51 6.771 7.029 7.281 7.53 7.758 8.038 8.312 8.582 8.897 9.19 9.455 9.752 10.097 10.434 10.781 11.146 11.544 11.969 12.45 12.986 13.531 14.16 14.828 15.548 16.296 17.055 17.804 18.448 18.542 18.309 17.932 17.519 17.102 16.677 16.257 15.869 15.47 15.134 14.824 14.533 14.253 13.983 13.728 13.444 13.191 12.967 12.728 12.474 12.251 12.018 11.789 11.61 11.421 11.226 11.022 10.793 10.627 10.458 10.201 10.025 9.842 9.747 9.54 9.325 9.11 8.987 8.549 8.567 8.392 8.217 7.877 7.676 7.443 7.205 6.938 6.572 6.126 5.025 -10 ,18678 ,TETRA ,17590685,Sat Nov 27 21:17:12 CET,Sat Nov 27 23:08:03 CET,0.0 1.376 1.951 2.365 2.688 2.955 3.179 3.398 3.821 3.998 4.157 4.128 4.591 4.731 4.985 5.215 5.432 5.534 5.744 5.958 6.242 6.412 6.578 6.815 7.039 7.263 7.474 7.672 7.927 8.173 8.415 8.732 9.049 9.338 9.655 10.006 10.34 10.693 11.07 11.469 11.887 12.347 12.877 13.381 13.959 14.614 15.286 15.964 16.709 17.465 18.053 18.122 17.88 17.494 17.067 16.634 16.227 15.828 15.456 15.092 14.751 14.428 14.116 13.805 13.521 13.262 12.977 12.73 12.522 12.29 12.046 11.836 11.597 11.346 11.158 10.965 10.76 10.539 10.281 10.092 9.912 9.657 9.476 9.275 9.17 8.962 8.74 8.488 8.361 7.925 7.951 7.801 7.642 7.273 7.08 6.878 6.635 6.35 6.031 5.592 4.299 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_20_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_20_1h1r.txt deleted file mode 100644 index a9792dc6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_20_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30490 ,TETRA ,17590686,Sat Nov 27 21:17:12 CET,Sat Nov 27 23:08:23 CET,0.0 1.288 1.779 2.132 2.424 2.68 2.915 3.128 3.522 3.702 3.868 3.838 4.289 4.408 4.632 4.847 5.054 5.153 5.344 5.529 5.787 5.953 6.117 6.351 6.566 6.776 6.976 7.17 7.41 7.633 7.856 8.115 8.352 8.579 8.847 9.151 9.451 9.781 10.122 10.476 10.843 11.247 11.71 12.188 12.739 13.29 13.849 14.411 15.007 15.614 15.997 15.858 15.428 14.898 14.368 13.852 13.378 12.915 12.504 12.083 11.697 11.343 11.001 10.68 10.385 10.125 9.85 9.586 9.352 9.103 8.844 8.629 8.406 8.175 7.983 7.78 7.568 7.33 7.089 6.931 6.759 6.497 6.317 6.124 6.023 5.807 5.59 5.365 5.247 4.806 4.834 4.682 4.523 4.19 4.011 3.807 3.565 3.29 2.973 2.519 1.396 -2 ,25670 ,TETRA ,17590687,Sat Nov 27 21:17:14 CET,Sat Nov 27 23:07:50 CET,0.0 0.795 1.251 1.572 1.865 2.128 2.34 2.53 2.871 3.02 3.163 3.12 3.577 3.707 3.951 4.168 4.38 4.481 4.659 4.833 5.079 5.233 5.383 5.598 5.796 6.002 6.212 6.395 6.615 6.842 7.064 7.314 7.569 7.816 8.094 8.401 8.689 9.014 9.356 9.711 10.079 10.477 10.94 11.411 11.933 12.483 13.111 13.767 14.395 14.969 15.352 15.22 14.866 14.4 13.877 13.377 12.937 12.511 12.11 11.689 11.32 10.977 10.632 10.303 10.011 9.747 9.463 9.214 8.995 8.758 8.504 8.288 8.042 7.797 7.616 7.418 7.217 7.013 6.801 6.645 6.486 6.247 6.068 5.881 5.786 5.566 5.338 5.104 4.969 4.52 4.562 4.418 4.261 3.893 3.692 3.486 3.231 2.934 2.585 2.086 0.92 -3 ,11938 ,TETRA ,17590688,Sat Nov 27 21:17:14 CET,Sat Nov 27 23:08:04 CET,0.0 1.006 1.505 1.85 2.139 2.359 2.565 2.766 3.117 3.28 3.441 3.416 3.872 4.001 4.241 4.452 4.659 4.764 4.958 5.138 5.383 5.543 5.71 5.937 6.14 6.327 6.503 6.676 6.906 7.136 7.356 7.614 7.864 8.1 8.366 8.664 8.945 9.271 9.623 9.969 10.308 10.687 11.128 11.567 12.086 12.652 13.246 13.822 14.437 15.027 15.466 15.434 15.089 14.633 14.11 13.61 13.131 12.652 12.249 11.818 11.392 11.023 10.699 10.377 10.054 9.752 9.44 9.162 8.927 8.689 8.428 8.196 7.96 7.719 7.538 7.344 7.129 6.908 6.676 6.506 6.325 6.029 5.829 5.63 5.528 5.307 5.072 4.841 4.716 4.27 4.282 4.126 3.969 3.612 3.397 3.157 2.89 2.57 2.187 1.746 0.627 -4 ,30397 ,TETRA ,17590689,Sat Nov 27 21:17:14 CET,Sat Nov 27 23:08:20 CET,0.0 0.973 1.374 1.748 2.055 2.292 2.486 2.672 3.036 3.191 3.325 3.277 3.732 3.862 4.1 4.31 4.51 4.616 4.825 5.018 5.299 5.475 5.635 5.888 6.139 6.361 6.565 6.766 7.034 7.289 7.536 7.832 8.091 8.325 8.605 8.931 9.247 9.564 9.904 10.273 10.647 11.056 11.492 11.909 12.401 12.986 13.648 14.255 14.843 15.456 15.828 15.671 15.287 14.846 14.372 13.853 13.349 12.907 12.522 12.112 11.748 11.412 11.085 10.771 10.457 10.164 9.864 9.599 9.377 9.135 8.874 8.644 8.388 8.13 7.924 7.708 7.502 7.288 7.07 6.919 6.756 6.499 6.317 6.132 6.036 5.819 5.601 5.379 5.254 4.813 4.86 4.715 4.547 4.14 3.92 3.683 3.402 3.085 2.73 2.273 1.128 -5 ,12769 ,TETRA ,17590690,Sat Nov 27 21:17:15 CET,Sat Nov 27 23:08:16 CET,0.0 1.047 1.503 1.836 2.113 2.36 2.585 2.779 3.109 3.269 3.434 3.417 3.868 3.997 4.236 4.461 4.677 4.778 4.975 5.159 5.424 5.596 5.748 5.956 6.168 6.391 6.603 6.796 7.045 7.292 7.525 7.797 8.063 8.331 8.63 8.944 9.237 9.553 9.893 10.256 10.623 11.02 11.447 11.858 12.353 12.892 13.473 14.087 14.71 15.3 15.723 15.607 15.195 14.685 14.168 13.66 13.184 12.726 12.309 11.897 11.553 11.242 10.929 10.613 10.306 10.019 9.719 9.454 9.216 8.952 8.673 8.452 8.233 8.011 7.825 7.622 7.41 7.187 6.952 6.783 6.611 6.35 6.147 5.924 5.82 5.602 5.358 5.12 4.996 4.556 4.596 4.441 4.276 3.94 3.747 3.514 3.254 2.978 2.631 2.17 1.314 -6 ,8575 ,TETRA ,17590691,Sat Nov 27 21:18:13 CET,Sat Nov 27 23:17:42 CET,0.0 1.338 1.812 2.193 2.474 2.722 2.948 3.147 3.479 3.622 3.759 3.691 4.146 4.277 4.512 4.732 4.943 5.045 5.227 5.395 5.633 5.788 5.946 6.179 6.396 6.598 6.79 6.985 7.23 7.456 7.681 7.942 8.192 8.439 8.723 9.034 9.323 9.621 9.933 10.291 10.672 11.074 11.52 11.97 12.492 13.034 13.614 14.206 14.822 15.355 15.669 15.552 15.135 14.638 14.158 13.663 13.17 12.714 12.324 11.901 11.526 11.196 10.863 10.539 10.239 9.971 9.692 9.435 9.213 8.988 8.742 8.531 8.31 8.084 7.905 7.706 7.501 7.281 7.038 6.871 6.7 6.447 6.268 6.054 5.942 5.726 5.487 5.227 5.096 4.647 4.65 4.485 4.315 3.917 3.694 3.468 3.202 2.9 2.533 1.985 0.845 -7 ,20562 ,TETRA ,17590692,Sat Nov 27 21:18:13 CET,Sat Nov 27 23:11:14 CET,0.0 1.221 1.633 1.925 2.163 2.399 2.626 2.827 3.178 3.332 3.472 3.44 3.903 4.032 4.271 4.493 4.695 4.796 5.001 5.201 5.465 5.616 5.761 5.977 6.189 6.396 6.594 6.777 7.008 7.24 7.462 7.723 7.991 8.244 8.531 8.866 9.171 9.479 9.804 10.16 10.533 10.946 11.422 11.885 12.423 13.021 13.647 14.28 14.919 15.522 15.881 15.741 15.3 14.747 14.227 13.724 13.246 12.781 12.353 11.904 11.508 11.16 10.836 10.51 10.189 9.885 9.576 9.32 9.097 8.857 8.602 8.384 8.162 7.936 7.758 7.569 7.366 7.142 6.902 6.732 6.568 6.312 6.119 5.922 5.818 5.597 5.367 5.123 4.991 4.541 4.545 4.396 4.249 3.887 3.649 3.403 3.173 2.876 2.499 2.043 1.059 -8 ,20896 ,TETRA ,17590693,Sat Nov 27 21:18:13 CET,Sat Nov 27 23:10:16 CET,0.0 0.683 1.103 1.441 1.718 1.944 2.159 2.369 2.727 2.888 3.033 2.989 3.447 3.568 3.796 4.017 4.233 4.341 4.549 4.746 5.041 5.227 5.408 5.669 5.898 6.113 6.317 6.513 6.779 7.027 7.257 7.544 7.816 8.081 8.37 8.672 8.967 9.296 9.643 10.012 10.415 10.841 11.3 11.79 12.328 12.853 13.47 14.113 14.741 15.364 15.795 15.688 15.296 14.824 14.34 13.852 13.385 12.921 12.486 12.062 11.691 11.356 11.029 10.695 10.401 10.131 9.824 9.557 9.31 9.041 8.784 8.564 8.317 8.067 7.876 7.681 7.472 7.243 7.012 6.85 6.679 6.396 6.197 5.987 5.876 5.656 5.421 5.158 5.023 4.58 4.607 4.439 4.255 3.875 3.669 3.458 3.216 2.884 2.503 2.01 0.759 -9 ,24819 ,TETRA ,17590694,Sat Nov 27 21:18:13 CET,Sat Nov 27 23:09:37 CET,0.0 1.12 1.522 1.846 2.119 2.366 2.592 2.778 3.113 3.274 3.43 3.411 3.875 4.01 4.266 4.502 4.702 4.799 4.99 5.173 5.447 5.628 5.801 6.035 6.246 6.449 6.654 6.853 7.096 7.325 7.549 7.818 8.077 8.334 8.631 8.947 9.256 9.596 9.957 10.331 10.709 11.118 11.584 12.026 12.539 13.11 13.728 14.346 14.91 15.399 15.738 15.623 15.209 14.709 14.207 13.703 13.227 12.763 12.357 11.925 11.553 11.228 10.893 10.58 10.292 10.022 9.728 9.462 9.227 8.97 8.7 8.481 8.257 8.029 7.85 7.641 7.415 7.203 6.987 6.831 6.677 6.423 6.242 6.041 5.927 5.711 5.499 5.272 5.152 4.7 4.695 4.542 4.376 4.016 3.828 3.616 3.362 3.071 2.707 2.142 0.706 -10 ,19930 ,TETRA ,17590695,Sat Nov 27 21:18:13 CET,Sat Nov 27 23:17:07 CET,0.0 1.19 1.605 1.909 2.2 2.446 2.663 2.872 3.234 3.394 3.546 3.519 3.978 4.115 4.387 4.617 4.806 4.904 5.103 5.291 5.559 5.726 5.89 6.131 6.352 6.558 6.77 6.995 7.309 7.611 7.9 8.223 8.48 8.712 8.979 9.29 9.589 9.904 10.261 10.63 11.006 11.445 11.934 12.385 12.912 13.458 14.037 14.669 15.302 15.882 16.309 16.198 15.826 15.35 14.822 14.337 13.896 13.464 13.085 12.686 12.322 11.977 11.648 11.351 11.073 10.807 10.507 10.219 9.975 9.716 9.433 9.197 8.957 8.702 8.502 8.297 8.079 7.852 7.626 7.471 7.308 7.047 6.854 6.636 6.526 6.319 6.105 5.856 5.719 5.266 5.278 5.129 4.965 4.576 4.361 4.118 3.855 3.567 3.229 2.738 1.529 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_21_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_21_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 3e9a794e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_21_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19850 ,TETRA ,17667740,Fri Dec 3 06:00:43 CET,Fri Dec 3 07:51:32 CET,0.0 0.636 0.999 1.278 1.516 1.714 1.905 2.08 2.399 2.552 2.688 2.616 3.067 3.182 3.418 3.633 3.823 3.922 4.118 4.301 4.559 4.726 4.891 5.14 5.383 5.605 5.815 6.017 6.274 6.528 6.777 7.078 7.377 7.669 7.993 8.355 8.717 9.112 9.535 9.985 10.449 10.979 11.595 12.211 12.953 13.776 14.729 15.838 17.065 18.406 19.982 21.182 21.738 21.919 21.95 21.9 21.794 21.642 21.48 21.289 21.083 20.885 20.679 20.474 20.284 20.1 19.89 19.696 19.529 19.359 19.184 19.031 18.864 18.68 18.533 18.374 18.199 18.025 17.829 17.691 17.549 17.301 17.122 16.949 16.864 16.687 16.496 16.288 16.168 15.731 15.788 15.641 15.477 15.122 14.932 14.732 14.494 14.215 13.916 13.544 12.613 -2 ,8408 ,TETRA ,17667741,Fri Dec 3 06:01:44 CET,Fri Dec 3 07:53:46 CET,0.0 0.88 1.384 1.733 1.996 2.217 2.431 2.614 2.927 3.08 3.235 3.184 3.644 3.778 4.015 4.219 4.419 4.519 4.71 4.899 5.169 5.336 5.499 5.729 5.953 6.166 6.374 6.581 6.836 7.081 7.322 7.621 7.914 8.205 8.535 8.893 9.253 9.659 10.091 10.543 11.006 11.501 12.098 12.718 13.43 14.221 15.107 16.115 17.325 18.751 20.381 21.559 22.119 22.382 22.447 22.41 22.308 22.166 22.032 21.857 21.691 21.543 21.375 21.204 21.023 20.845 20.655 20.461 20.286 20.116 19.936 19.779 19.611 19.405 19.237 19.079 18.908 18.733 18.548 18.4 18.255 18.037 17.873 17.699 17.603 17.391 17.168 16.929 16.801 16.356 16.383 16.234 16.08 15.728 15.523 15.293 15.041 14.752 14.35 13.807 12.552 -3 ,12491 ,TETRA ,17667742,Fri Dec 3 06:01:44 CET,Fri Dec 3 07:52:51 CET,0.0 0.851 1.266 1.666 1.991 2.24 2.451 2.658 3.043 3.221 3.38 3.335 3.811 3.96 4.217 4.45 4.666 4.766 4.964 5.156 5.423 5.598 5.77 6.021 6.272 6.514 6.727 6.936 7.214 7.469 7.717 8.011 8.298 8.578 8.896 9.247 9.591 9.981 10.406 10.843 11.3 11.839 12.481 13.105 13.812 14.608 15.509 16.527 17.745 19.158 20.753 21.937 22.507 22.761 22.841 22.819 22.748 22.613 22.446 22.252 22.072 21.9 21.699 21.505 21.341 21.19 21.021 20.853 20.697 20.549 20.397 20.246 20.08 19.911 19.771 19.626 19.485 19.337 19.174 19.052 18.925 18.721 18.573 18.401 18.311 18.148 17.975 17.769 17.648 17.207 17.238 17.081 16.906 16.539 16.348 16.141 15.906 15.605 15.205 14.75 13.914 -4 ,26800 ,TETRA ,17667743,Fri Dec 3 06:01:45 CET,Fri Dec 3 07:53:05 CET,0.0 0.854 1.249 1.547 1.785 2.016 2.23 2.425 2.743 2.878 3.007 2.951 3.419 3.558 3.823 4.065 4.28 4.375 4.557 4.741 5.011 5.182 5.349 5.582 5.804 6.026 6.252 6.476 6.749 7.009 7.262 7.557 7.841 8.117 8.428 8.784 9.122 9.504 9.922 10.353 10.809 11.327 11.937 12.547 13.257 14.064 14.98 16.008 17.241 18.647 20.331 21.585 22.144 22.384 22.454 22.432 22.358 22.227 22.068 21.897 21.738 21.571 21.41 21.24 21.058 20.884 20.696 20.512 20.324 20.105 19.87 19.667 19.448 19.213 19.008 18.775 18.569 18.401 18.239 18.126 18.001 17.782 17.611 17.431 17.337 17.134 16.931 16.705 16.575 16.131 16.155 16.004 15.85 15.496 15.291 15.08 14.827 14.5 14.128 13.567 12.048 -5 ,16387 ,TETRA ,17667744,Fri Dec 3 06:01:48 CET,Fri Dec 3 07:53:08 CET,0.0 0.729 1.131 1.426 1.685 1.907 2.118 2.315 2.671 2.834 2.982 2.917 3.373 3.494 3.72 3.937 4.149 4.247 4.441 4.633 4.895 5.062 5.225 5.475 5.716 5.946 6.176 6.388 6.64 6.888 7.14 7.445 7.734 8.008 8.329 8.701 9.053 9.428 9.835 10.284 10.762 11.287 11.869 12.46 13.18 13.985 14.903 15.934 17.178 18.633 20.283 21.463 22.041 22.333 22.415 22.394 22.313 22.156 21.96 21.758 21.571 21.397 21.202 20.998 20.812 20.629 20.433 20.253 20.103 19.94 19.764 19.617 19.457 19.282 19.144 19.003 18.843 18.655 18.464 18.333 18.195 17.973 17.81 17.642 17.554 17.358 17.143 16.908 16.782 16.338 16.366 16.22 16.047 15.695 15.497 15.255 14.979 14.654 14.298 13.813 12.654 -6 ,3905 ,TETRA ,17667745,Fri Dec 3 06:01:49 CET,Fri Dec 3 07:53:15 CET,0.0 0.943 1.393 1.71 1.971 2.199 2.399 2.567 2.885 3.044 3.201 3.168 3.631 3.759 4.009 4.257 4.501 4.615 4.823 5.026 5.313 5.484 5.64 5.871 6.1 6.324 6.541 6.757 7.03 7.28 7.529 7.837 8.137 8.42 8.727 9.075 9.419 9.796 10.209 10.654 11.1 11.614 12.236 12.847 13.565 14.369 15.268 16.286 17.5 18.892 20.438 21.578 22.147 22.43 22.512 22.446 22.318 22.183 22.061 21.904 21.729 21.569 21.409 21.234 21.055 20.875 20.676 20.489 20.318 20.138 19.949 19.788 19.606 19.404 19.242 19.08 18.916 18.732 18.529 18.389 18.243 18.013 17.855 17.658 17.536 17.279 17.013 16.736 16.583 16.112 16.105 15.92 15.716 15.256 15.025 14.815 14.589 14.313 13.963 13.529 12.466 -7 ,15506 ,TETRA ,17667746,Fri Dec 3 06:01:44 CET,Fri Dec 3 07:53:07 CET,0.0 1.029 1.484 1.866 2.148 2.387 2.609 2.803 3.139 3.29 3.447 3.427 3.893 4.021 4.255 4.463 4.669 4.766 4.945 5.12 5.369 5.529 5.69 5.928 6.152 6.36 6.56 6.765 7.031 7.282 7.558 7.904 8.204 8.473 8.782 9.135 9.473 9.841 10.242 10.667 11.119 11.644 12.264 12.911 13.663 14.483 15.407 16.413 17.598 18.971 20.525 21.62 22.119 22.339 22.396 22.341 22.213 22.07 21.923 21.758 21.593 21.421 21.242 21.055 20.875 20.709 20.528 20.373 20.237 20.077 19.89 19.738 19.582 19.404 19.268 19.116 18.945 18.753 18.547 18.415 18.274 18.037 17.877 17.704 17.61 17.405 17.187 16.959 16.839 16.392 16.409 16.265 16.111 15.733 15.515 15.294 15.055 14.773 14.431 13.932 12.704 -8 ,16630 ,TETRA ,17667747,Fri Dec 3 06:01:45 CET,Fri Dec 3 07:52:59 CET,0.0 1.147 1.536 1.828 2.104 2.342 2.55 2.749 3.117 3.28 3.43 3.362 3.813 3.944 4.188 4.394 4.578 4.67 4.857 5.037 5.3 5.473 5.645 5.887 6.117 6.34 6.544 6.742 7.022 7.302 7.56 7.856 8.134 8.398 8.697 9.036 9.384 9.762 10.15 10.586 11.058 11.577 12.181 12.805 13.534 14.316 15.219 16.286 17.566 18.988 20.544 21.674 22.209 22.468 22.528 22.472 22.378 22.268 22.146 21.984 21.816 21.644 21.467 21.308 21.155 20.989 20.793 20.624 20.476 20.31 20.13 19.979 19.815 19.626 19.478 19.33 19.177 19.024 18.84 18.7 18.555 18.334 18.182 18.021 17.936 17.754 17.568 17.367 17.26 16.838 16.906 16.776 16.63 16.296 16.116 15.923 15.694 15.401 15.006 14.521 13.022 -9 ,20277 ,TETRA ,17667748,Fri Dec 3 06:01:44 CET,Fri Dec 3 07:52:53 CET,0.0 0.774 1.141 1.462 1.767 2.044 2.29 2.501 2.873 3.037 3.187 3.136 3.598 3.727 3.973 4.202 4.407 4.508 4.711 4.9 5.179 5.36 5.533 5.782 6.015 6.245 6.472 6.687 6.964 7.241 7.502 7.806 8.097 8.372 8.68 9.032 9.376 9.75 10.155 10.599 11.067 11.582 12.184 12.792 13.506 14.335 15.297 16.337 17.525 18.85 20.36 21.541 22.095 22.32 22.405 22.378 22.264 22.108 21.966 21.801 21.639 21.491 21.335 21.168 21.006 20.821 20.602 20.419 20.256 20.069 19.863 19.692 19.504 19.312 19.167 19.019 18.868 18.713 18.551 18.432 18.305 18.098 17.95 17.791 17.71 17.543 17.356 17.14 17.017 16.571 16.606 16.474 16.321 15.988 15.812 15.604 15.37 15.06 14.63 14.087 13.079 -10 ,28136 ,TETRA ,17667749,Fri Dec 3 06:01:46 CET,Fri Dec 3 07:52:13 CET,0.0 1.003 1.382 1.688 1.946 2.174 2.379 2.559 2.868 3.022 3.172 3.114 3.563 3.686 3.916 4.127 4.326 4.42 4.608 4.805 5.076 5.249 5.421 5.661 5.891 6.108 6.308 6.508 6.778 7.033 7.288 7.605 7.898 8.174 8.488 8.838 9.187 9.59 10.044 10.511 10.978 11.494 12.096 12.711 13.436 14.233 15.141 16.169 17.389 18.759 20.27 21.421 21.932 22.132 22.207 22.21 22.163 22.047 21.897 21.716 21.526 21.345 21.163 20.976 20.773 20.574 20.373 20.2 20.045 19.86 19.666 19.51 19.331 19.124 18.959 18.792 18.625 18.448 18.248 18.109 17.964 17.725 17.557 17.371 17.269 17.066 16.866 16.64 16.517 16.089 16.141 16.001 15.846 15.474 15.259 15.035 14.81 14.553 14.22 13.764 12.69 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_21_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_21_22.txt deleted file mode 100644 index c87447cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_21_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14407 ,TETRA ,17590696,Sat Nov 27 21:18:13 CET,Sat Nov 27 23:12:08 CET,0.0 1.001 1.489 1.844 2.143 2.417 2.661 2.881 3.248 3.417 3.581 3.55 4.015 4.151 4.414 4.652 4.872 4.973 5.163 5.358 5.641 5.813 5.99 6.244 6.479 6.719 6.957 7.181 7.464 7.733 7.991 8.299 8.588 8.864 9.181 9.539 9.882 10.252 10.629 11.022 11.448 11.934 12.48 13.009 13.64 14.347 15.126 15.96 16.869 17.881 18.97 19.549 19.691 19.637 19.473 19.277 19.047 18.813 18.583 18.302 18.045 17.817 17.588 17.357 17.128 16.898 16.656 16.434 16.232 16.034 15.826 15.647 15.449 15.236 15.075 14.911 14.758 14.599 14.397 14.255 14.118 13.907 13.761 13.602 13.515 13.338 13.154 12.949 12.843 12.416 12.463 12.32 12.187 11.893 11.706 11.487 11.241 10.934 10.589 10.163 9.11 -2 ,8895 ,TETRA ,17590697,Sat Nov 27 21:18:13 CET,Sat Nov 27 23:13:10 CET,0.0 1.14 1.724 2.154 2.508 2.788 3.038 3.246 3.613 3.792 3.96 3.947 4.413 4.547 4.808 5.039 5.27 5.383 5.583 5.762 6.019 6.189 6.355 6.591 6.818 7.045 7.276 7.502 7.781 8.046 8.31 8.62 8.914 9.202 9.531 9.881 10.208 10.558 10.92 11.32 11.75 12.226 12.763 13.313 13.958 14.66 15.425 16.245 17.179 18.221 19.296 19.936 20.138 20.123 19.979 19.763 19.525 19.277 19.037 18.781 18.564 18.36 18.132 17.889 17.662 17.468 17.263 17.068 16.899 16.709 16.504 16.345 16.173 15.991 15.849 15.694 15.531 15.364 15.186 15.057 14.922 14.692 14.527 14.36 14.279 14.104 13.911 13.686 13.564 13.125 13.194 13.058 12.904 12.578 12.399 12.193 11.969 11.718 11.414 11.013 9.824 -3 ,5561 ,TETRA ,17590698,Sat Nov 27 21:18:14 CET,Sat Nov 27 23:04:50 CET,0.0 1.317 1.74 2.085 2.394 2.67 2.913 3.127 3.485 3.655 3.824 3.784 4.243 4.384 4.651 4.887 5.118 5.233 5.448 5.643 5.928 6.119 6.309 6.577 6.823 7.053 7.266 7.472 7.735 7.986 8.231 8.533 8.825 9.113 9.449 9.801 10.131 10.494 10.904 11.338 11.751 12.216 12.784 13.35 13.964 14.644 15.419 16.261 17.23 18.292 19.346 19.868 19.992 19.962 19.817 19.626 19.423 19.186 18.948 18.679 18.411 18.155 17.913 17.698 17.486 17.269 17.039 16.818 16.625 16.437 16.228 16.052 15.866 15.665 15.513 15.352 15.171 14.977 14.766 14.61 14.446 14.173 13.982 13.798 13.702 13.501 13.29 13.061 12.938 12.486 12.493 12.335 12.186 11.847 11.652 11.437 11.194 10.915 10.589 10.191 9.545 -4 ,6262 ,TETRA ,17590699,Sat Nov 27 21:18:13 CET,Sat Nov 27 23:09:51 CET,0.0 1.501 2.024 2.389 2.672 2.907 3.127 3.309 3.65 3.819 3.977 3.946 4.415 4.546 4.796 5.03 5.245 5.353 5.567 5.773 6.077 6.266 6.44 6.711 6.987 7.234 7.466 7.679 7.945 8.204 8.443 8.726 9.001 9.264 9.572 9.935 10.278 10.627 11.0 11.405 11.833 12.319 12.898 13.45 14.058 14.704 15.411 16.207 17.155 18.217 19.296 19.936 20.127 20.086 19.923 19.708 19.492 19.251 19.036 18.782 18.519 18.282 18.044 17.813 17.589 17.375 17.151 16.951 16.779 16.592 16.393 16.235 16.06 15.863 15.699 15.524 15.354 15.175 14.986 14.851 14.705 14.474 14.31 14.14 14.057 13.897 13.721 13.527 13.418 12.977 13.03 12.885 12.73 12.361 12.15 11.923 11.641 11.307 10.927 10.489 9.739 -5 ,31229 ,TETRA ,17590700,Sat Nov 27 21:18:13 CET,Sat Nov 27 23:10:30 CET,0.0 1.142 1.571 1.911 2.192 2.462 2.726 2.975 3.39 3.569 3.732 3.712 4.185 4.322 4.589 4.836 5.071 5.185 5.407 5.625 5.938 6.143 6.337 6.603 6.853 7.082 7.297 7.498 7.759 8.016 8.261 8.549 8.815 9.075 9.379 9.716 10.041 10.413 10.814 11.228 11.673 12.183 12.755 13.312 13.945 14.641 15.422 16.266 17.232 18.308 19.426 20.064 20.208 20.16 20.059 19.89 19.675 19.44 19.195 18.919 18.658 18.402 18.159 17.924 17.693 17.489 17.284 17.081 16.882 16.675 16.465 16.285 16.091 15.879 15.711 15.525 15.341 15.156 14.963 14.83 14.69 14.46 14.284 14.096 14.001 13.809 13.607 13.391 13.278 12.852 12.933 12.796 12.638 12.278 12.091 11.902 11.68 11.421 11.12 10.696 9.793 -6 ,24769 ,TETRA ,17590701,Sat Nov 27 21:18:13 CET,Sat Nov 27 23:09:36 CET,0.0 1.315 1.838 2.201 2.506 2.753 2.963 3.153 3.514 3.685 3.85 3.821 4.29 4.428 4.683 4.933 5.169 5.274 5.477 5.67 5.95 6.131 6.315 6.578 6.816 7.039 7.254 7.458 7.724 7.977 8.226 8.526 8.8 9.069 9.377 9.714 10.052 10.412 10.783 11.168 11.596 12.092 12.654 13.201 13.81 14.476 15.222 16.049 16.979 17.976 18.966 19.574 19.806 19.812 19.707 19.517 19.264 19.002 18.758 18.519 18.316 18.112 17.894 17.663 17.436 17.226 17.015 16.811 16.612 16.394 16.171 15.984 15.78 15.566 15.4 15.23 15.052 14.867 14.657 14.497 14.331 14.073 13.897 13.722 13.629 13.431 13.221 13.001 12.89 12.461 12.523 12.385 12.243 11.924 11.737 11.536 11.329 11.058 10.702 10.298 9.605 -7 ,4204 ,TETRA ,17590702,Sat Nov 27 21:18:14 CET,Sat Nov 27 23:11:44 CET,0.0 1.086 1.525 1.897 2.194 2.433 2.654 2.869 3.234 3.382 3.525 3.492 3.971 4.115 4.387 4.651 4.892 5.004 5.226 5.436 5.738 5.941 6.132 6.396 6.647 6.885 7.109 7.314 7.584 7.854 8.113 8.424 8.718 8.989 9.301 9.653 9.978 10.35 10.757 11.169 11.577 12.02 12.573 13.133 13.754 14.445 15.207 16.017 16.938 17.942 18.989 19.627 19.779 19.762 19.648 19.467 19.267 19.045 18.816 18.544 18.278 18.03 17.788 17.551 17.323 17.103 16.853 16.64 16.462 16.259 16.033 15.843 15.649 15.429 15.255 15.084 14.9 14.709 14.509 14.366 14.204 13.953 13.78 13.6 13.514 13.337 13.131 12.901 12.781 12.343 12.404 12.261 12.111 11.728 11.507 11.302 11.075 10.802 10.502 10.144 9.415 -8 ,4592 ,TETRA ,17590703,Sat Nov 27 21:19:13 CET,Sat Nov 27 23:05:27 CET,0.0 1.015 1.407 1.742 2.063 2.349 2.609 2.828 3.202 3.388 3.563 3.55 4.026 4.161 4.41 4.634 4.85 4.959 5.174 5.38 5.678 5.872 6.05 6.299 6.549 6.787 7.004 7.225 7.533 7.828 8.095 8.399 8.687 8.97 9.276 9.616 9.952 10.313 10.712 11.115 11.512 11.958 12.5 13.041 13.654 14.319 15.072 15.927 16.861 17.841 18.839 19.45 19.66 19.652 19.521 19.299 19.035 18.801 18.577 18.315 18.074 17.84 17.616 17.389 17.16 16.935 16.696 16.481 16.288 16.084 15.861 15.674 15.483 15.281 15.113 14.938 14.75 14.548 14.343 14.202 14.058 13.83 13.664 13.487 13.393 13.196 12.985 12.72 12.571 12.098 12.077 11.899 11.716 11.321 11.104 10.846 10.564 10.266 9.874 9.335 8.371 -9 ,16419 ,TETRA ,17590704,Sat Nov 27 21:19:15 CET,Sat Nov 27 23:01:48 CET,0.0 1.074 1.586 1.965 2.277 2.533 2.749 2.946 3.295 3.462 3.622 3.59 4.054 4.186 4.433 4.668 4.892 5.0 5.211 5.406 5.691 5.878 6.052 6.301 6.534 6.757 6.975 7.194 7.478 7.734 7.981 8.284 8.568 8.838 9.151 9.498 9.835 10.196 10.579 10.998 11.422 11.88 12.433 13.049 13.801 14.607 15.461 16.299 17.234 18.333 19.423 20.028 20.169 20.121 19.981 19.781 19.528 19.245 19.003 18.723 18.462 18.228 17.983 17.752 17.541 17.333 17.093 16.872 16.679 16.467 16.248 16.081 15.919 15.742 15.596 15.446 15.286 15.11 14.914 14.777 14.635 14.402 14.238 14.067 13.977 13.79 13.597 13.382 13.264 12.829 12.871 12.715 12.561 12.242 12.054 11.843 11.606 11.335 10.994 10.567 9.682 -10 ,14596 ,TETRA ,17590705,Sat Nov 27 21:19:13 CET,Sat Nov 27 23:11:21 CET,0.0 1.093 1.569 1.913 2.202 2.466 2.695 2.915 3.334 3.514 3.675 3.631 4.085 4.207 4.448 4.667 4.873 4.977 5.177 5.37 5.667 5.864 6.05 6.31 6.552 6.783 7.003 7.214 7.479 7.725 7.971 8.263 8.538 8.829 9.167 9.526 9.872 10.258 10.661 11.089 11.538 12.02 12.574 13.131 13.769 14.437 15.164 16.005 16.987 18.056 19.143 19.763 19.962 19.946 19.83 19.652 19.425 19.179 18.93 18.665 18.424 18.209 18.017 17.813 17.589 17.368 17.135 16.944 16.772 16.572 16.353 16.181 16.001 15.801 15.636 15.459 15.282 15.094 14.894 14.753 14.605 14.366 14.198 14.022 13.922 13.712 13.506 13.291 13.174 12.736 12.781 12.621 12.457 12.091 11.889 11.66 11.408 11.112 10.732 10.223 9.174 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_22_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_22_1h1r.txt deleted file mode 100644 index b20ff464..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_22_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19157 ,TETRA ,17590706,Sat Nov 27 21:19:13 CET,Sat Nov 27 23:10:03 CET,0.0 0.923 1.268 1.54 1.789 2.008 2.186 2.341 2.64 2.795 2.939 2.871 3.305 3.412 3.609 3.802 3.975 4.054 4.217 4.379 4.616 4.765 4.904 5.107 5.301 5.484 5.667 5.853 6.073 6.267 6.46 6.687 6.902 7.116 7.37 7.66 7.937 8.231 8.547 8.876 9.204 9.588 10.026 10.454 10.938 11.488 12.102 12.74 13.475 14.277 15.032 15.409 15.442 15.287 15.045 14.748 14.432 14.126 13.835 13.522 13.269 13.042 12.794 12.522 12.278 12.069 11.844 11.632 11.429 11.206 10.963 10.759 10.548 10.327 10.145 9.952 9.762 9.571 9.369 9.232 9.089 8.86 8.7 8.53 8.442 8.25 8.045 7.811 7.683 7.234 7.224 7.07 6.925 6.577 6.371 6.168 5.946 5.657 5.275 4.777 3.567 -2 ,21520 ,TETRA ,17590707,Sat Nov 27 21:19:13 CET,Sat Nov 27 23:11:21 CET,0.0 0.657 0.958 1.197 1.401 1.573 1.742 1.907 2.218 2.367 2.509 2.453 2.888 2.998 3.197 3.386 3.576 3.664 3.842 4.024 4.289 4.453 4.599 4.796 4.986 5.173 5.351 5.52 5.736 5.938 6.136 6.381 6.609 6.823 7.075 7.356 7.624 7.919 8.234 8.56 8.893 9.273 9.703 10.111 10.58 11.12 11.738 12.394 13.092 13.835 14.588 14.921 14.904 14.72 14.468 14.174 13.899 13.636 13.368 13.078 12.812 12.564 12.322 12.083 11.86 11.659 11.433 11.217 11.03 10.836 10.624 10.449 10.277 10.094 9.937 9.771 9.59 9.397 9.169 9.005 8.849 8.612 8.442 8.261 8.168 7.971 7.749 7.498 7.367 6.921 6.96 6.815 6.662 6.34 6.16 5.929 5.656 5.348 4.97 4.5 2.686 -3 ,29754 ,TETRA ,17590708,Sat Nov 27 21:19:13 CET,Sat Nov 27 23:11:31 CET,0.0 0.652 0.996 1.257 1.483 1.675 1.85 2.02 2.321 2.454 2.6 2.56 2.999 3.118 3.34 3.531 3.716 3.81 3.982 4.147 4.373 4.519 4.671 4.88 5.084 5.288 5.473 5.648 5.869 6.076 6.29 6.56 6.809 7.038 7.294 7.562 7.817 8.108 8.41 8.729 9.068 9.444 9.886 10.334 10.852 11.421 12.069 12.763 13.521 14.309 15.01 15.328 15.325 15.15 14.906 14.647 14.387 14.112 13.832 13.538 13.287 13.061 12.829 12.586 12.355 12.139 11.904 11.684 11.47 11.255 11.04 10.841 10.635 10.416 10.235 10.06 9.88 9.685 9.477 9.331 9.183 8.944 8.772 8.581 8.479 8.284 8.082 7.846 7.723 7.295 7.347 7.204 7.033 6.668 6.486 6.272 6.038 5.782 5.412 4.916 3.521 -4 ,5734 ,TETRA ,17590710,Sat Nov 27 21:19:13 CET,Sat Nov 27 23:12:40 CET,0.0 0.976 1.391 1.636 1.831 2.004 2.178 2.342 2.655 2.806 2.938 2.871 3.299 3.403 3.622 3.834 4.03 4.123 4.297 4.47 4.717 4.868 5.01 5.211 5.407 5.606 5.819 6.008 6.222 6.434 6.643 6.893 7.14 7.38 7.646 7.934 8.214 8.51 8.819 9.153 9.504 9.909 10.386 10.843 11.338 11.895 12.548 13.248 13.994 14.776 15.512 15.877 15.927 15.794 15.558 15.271 14.988 14.726 14.47 14.175 13.913 13.643 13.351 13.098 12.871 12.661 12.446 12.253 12.074 11.871 11.65 11.469 11.292 11.096 10.932 10.765 10.587 10.395 10.185 10.044 9.894 9.654 9.486 9.311 9.224 9.029 8.826 8.612 8.496 8.069 8.119 7.974 7.818 7.466 7.27 7.038 6.782 6.516 6.201 5.712 4.251 -5 ,71 ,TETRA ,17590711,Sat Nov 27 21:19:13 CET,Sat Nov 27 23:09:56 CET,0.0 0.495 0.829 1.091 1.323 1.549 1.766 1.95 2.265 2.402 2.525 2.419 2.838 2.946 3.149 3.325 3.49 3.568 3.729 3.882 4.1 4.254 4.4 4.597 4.781 4.959 5.147 5.329 5.549 5.754 5.947 6.181 6.413 6.639 6.895 7.189 7.479 7.786 8.098 8.437 8.801 9.201 9.645 10.084 10.594 11.116 11.688 12.345 13.082 13.874 14.68 15.059 15.067 14.907 14.675 14.431 14.177 13.907 13.667 13.414 13.151 12.897 12.654 12.423 12.191 11.948 11.691 11.461 11.261 11.064 10.854 10.67 10.463 10.23 10.056 9.879 9.683 9.473 9.271 9.139 8.987 8.73 8.551 8.356 8.259 8.054 7.831 7.598 7.463 7.001 7.025 6.88 6.717 6.356 6.149 5.918 5.645 5.339 4.988 4.459 2.853 -6 ,31885 ,TETRA ,17590712,Sat Nov 27 21:19:13 CET,Sat Nov 27 23:10:06 CET,0.0 0.784 1.141 1.453 1.726 1.954 2.139 2.29 2.552 2.683 2.806 2.734 3.172 3.293 3.517 3.71 3.899 3.997 4.186 4.361 4.607 4.763 4.912 5.137 5.354 5.542 5.717 5.889 6.101 6.301 6.497 6.744 6.972 7.188 7.446 7.73 7.994 8.276 8.575 8.894 9.236 9.626 10.063 10.494 10.987 11.499 12.084 12.73 13.442 14.217 15.032 15.462 15.529 15.423 15.175 14.91 14.644 14.331 14.053 13.77 13.5 13.242 12.994 12.758 12.522 12.291 12.051 11.837 11.648 11.455 11.258 11.089 10.898 10.692 10.537 10.368 10.189 10.01 9.819 9.681 9.53 9.293 9.122 8.934 8.835 8.646 8.443 8.21 8.085 7.653 7.712 7.559 7.403 7.077 6.856 6.601 6.306 5.935 5.523 4.945 2.76 -7 ,32418 ,TETRA ,17590713,Sat Nov 27 21:19:14 CET,Sat Nov 27 23:04:51 CET,0.0 0.632 1.011 1.296 1.533 1.747 1.956 2.15 2.469 2.61 2.749 2.691 3.131 3.243 3.453 3.64 3.823 3.916 4.093 4.269 4.514 4.665 4.815 5.028 5.217 5.394 5.577 5.754 5.985 6.215 6.428 6.68 6.93 7.169 7.437 7.73 7.995 8.279 8.589 8.9 9.231 9.619 10.084 10.548 11.048 11.581 12.204 12.9 13.698 14.554 15.368 15.698 15.686 15.577 15.375 15.136 14.873 14.586 14.319 14.046 13.814 13.578 13.332 13.065 12.796 12.558 12.302 12.077 11.888 11.689 11.477 11.299 11.11 10.907 10.754 10.586 10.389 10.184 9.985 9.846 9.704 9.45 9.268 9.093 8.994 8.781 8.563 8.324 8.195 7.758 7.804 7.664 7.506 7.158 6.96 6.741 6.518 6.276 5.983 5.584 4.232 -8 ,4106 ,TETRA ,17590714,Sat Nov 27 21:19:14 CET,Sat Nov 27 23:11:42 CET,0.0 0.761 1.151 1.446 1.695 1.917 2.119 2.307 2.62 2.743 2.87 2.813 3.244 3.352 3.553 3.754 3.943 4.03 4.203 4.367 4.587 4.721 4.854 5.05 5.232 5.413 5.592 5.758 5.969 6.185 6.391 6.627 6.847 7.065 7.32 7.623 7.908 8.193 8.495 8.807 9.137 9.5 9.92 10.339 10.826 11.374 11.978 12.63 13.357 14.135 14.894 15.263 15.298 15.164 14.964 14.719 14.457 14.174 13.873 13.549 13.288 13.07 12.84 12.609 12.395 12.201 11.987 11.784 11.598 11.383 11.162 10.977 10.768 10.547 10.371 10.188 10.008 9.817 9.615 9.483 9.349 9.112 8.939 8.767 8.671 8.467 8.265 8.032 7.902 7.463 7.516 7.375 7.205 6.758 6.497 6.205 5.881 5.574 5.212 4.72 3.259 -9 ,17577 ,TETRA ,17590715,Sat Nov 27 21:19:14 CET,Sat Nov 27 23:13:31 CET,0.0 0.872 1.251 1.516 1.711 1.88 2.051 2.221 2.52 2.653 2.777 2.694 3.126 3.233 3.426 3.608 3.791 3.883 4.065 4.235 4.474 4.634 4.782 4.973 5.16 5.351 5.537 5.712 5.935 6.158 6.364 6.601 6.818 7.039 7.304 7.584 7.847 8.133 8.439 8.764 9.099 9.47 9.918 10.364 10.87 11.436 12.064 12.711 13.389 14.076 14.689 14.997 15.005 14.818 14.571 14.303 13.997 13.71 13.459 13.177 12.926 12.684 12.443 12.183 11.919 11.686 11.424 11.178 10.974 10.762 10.531 10.332 10.127 9.903 9.726 9.542 9.347 9.139 8.91 8.75 8.58 8.309 8.111 7.901 7.804 7.603 7.39 7.174 7.054 6.608 6.636 6.488 6.325 5.929 5.695 5.447 5.198 4.92 4.571 4.12 2.91 -10 ,20762 ,TETRA ,17590716,Sat Nov 27 21:20:11 CET,Sat Nov 27 23:14:11 CET,0.0 1.236 1.675 2.005 2.276 2.491 2.683 2.865 3.171 3.305 3.433 3.376 3.811 3.918 4.114 4.314 4.508 4.59 4.741 4.893 5.109 5.245 5.384 5.576 5.766 5.962 6.146 6.327 6.558 6.767 6.966 7.211 7.444 7.656 7.903 8.184 8.461 8.762 9.083 9.427 9.78 10.171 10.613 11.053 11.563 12.113 12.75 13.454 14.211 14.976 15.737 16.15 16.183 16.021 15.767 15.478 15.181 14.895 14.619 14.347 14.101 13.859 13.633 13.412 13.193 12.987 12.763 12.543 12.347 12.151 11.943 11.761 11.565 11.352 11.185 11.014 10.838 10.653 10.449 10.303 10.143 9.901 9.73 9.537 9.432 9.213 8.99 8.751 8.622 8.179 8.207 8.05 7.88 7.503 7.287 7.052 6.782 6.49 6.162 5.728 3.452 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_26_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_26_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 85e6a022..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_26_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18229 ,KEBNE ,17070606,Fri Dec 24 20:50:44 CET,Fri Dec 24 22:26:30 CET,0.0 0.961 1.399 1.718 1.979 2.214 2.435 2.626 2.942 3.091 3.231 3.169 3.594 3.702 3.907 4.1 4.288 4.38 4.558 4.736 4.991 5.149 5.295 5.496 5.693 5.889 6.073 6.246 6.462 6.667 6.866 7.108 7.332 7.544 7.798 8.084 8.354 8.652 8.968 9.3 9.641 10.009 10.429 10.852 11.344 11.891 12.48 13.053 13.655 14.305 14.891 15.026 14.832 14.512 14.14 13.773 13.418 13.043 12.685 12.319 11.997 11.671 11.353 11.067 10.79 10.524 10.243 9.987 9.764 9.525 9.252 9.012 8.775 8.537 8.35 8.147 7.924 7.696 7.465 7.302 7.114 6.809 6.606 6.392 6.28 6.042 5.792 5.525 5.382 4.926 4.898 4.731 4.562 4.153 3.905 3.617 3.291 2.944 2.51 1.878 -0.121 -2 ,23979 ,KEBNE ,17070607,Fri Dec 24 20:51:48 CET,Fri Dec 24 22:28:55 CET,0.0 0.66 1.014 1.305 1.54 1.744 1.925 2.078 2.352 2.483 2.612 2.542 2.962 3.068 3.278 3.472 3.657 3.753 3.94 4.106 4.318 4.449 4.589 4.792 4.978 5.161 5.332 5.498 5.716 5.923 6.12 6.369 6.61 6.839 7.111 7.418 7.712 8.027 8.352 8.688 9.053 9.472 9.952 10.409 10.915 11.449 12.058 12.739 13.421 14.102 14.698 14.856 14.679 14.3 13.859 13.418 12.991 12.587 12.222 11.827 11.452 11.112 10.794 10.466 10.15 9.873 9.577 9.303 9.061 8.8 8.528 8.289 8.035 7.778 7.569 7.341 7.103 6.854 6.584 6.408 6.23 5.93 5.707 5.48 5.364 5.121 4.87 4.609 4.478 4.024 4.0 3.828 3.641 3.246 3.018 2.762 2.496 2.2 1.812 1.255 -0.262 -3 ,5339 ,KEBNE ,17070608,Fri Dec 24 20:52:52 CET,Fri Dec 24 22:30:48 CET,0.0 0.73 1.099 1.402 1.666 1.893 2.09 2.273 2.6 2.744 2.885 2.854 3.295 3.419 3.642 3.841 4.022 4.109 4.282 4.446 4.688 4.839 4.979 5.187 5.395 5.591 5.774 5.951 6.176 6.389 6.598 6.849 7.079 7.318 7.604 7.916 8.201 8.499 8.819 9.149 9.491 9.884 10.331 10.744 11.235 11.794 12.381 13.01 13.713 14.418 15.023 15.171 14.975 14.657 14.278 13.903 13.515 13.098 12.72 12.342 12.001 11.674 11.357 11.049 10.741 10.458 10.177 9.916 9.679 9.421 9.145 8.917 8.68 8.433 8.245 8.05 7.841 7.62 7.369 7.191 7.019 6.747 6.55 6.344 6.232 5.993 5.728 5.451 5.301 4.839 4.82 4.631 4.421 3.981 3.737 3.434 3.09 2.741 2.322 1.697 0.343 -4 ,7267 ,KEBNE ,17070609,Fri Dec 24 20:52:54 CET,Fri Dec 24 22:23:30 CET,0.0 1.087 1.544 1.881 2.108 2.284 2.446 2.614 2.93 3.082 3.228 3.17 3.595 3.701 3.899 4.087 4.271 4.368 4.551 4.719 4.973 5.124 5.265 5.491 5.712 5.917 6.103 6.275 6.504 6.731 6.958 7.224 7.464 7.689 7.941 8.229 8.519 8.817 9.119 9.438 9.771 10.158 10.606 11.03 11.509 12.027 12.58 13.181 13.831 14.476 15.073 15.184 14.927 14.575 14.181 13.765 13.362 12.952 12.587 12.217 11.89 11.58 11.268 10.971 10.678 10.405 10.113 9.83 9.588 9.342 9.082 8.864 8.638 8.402 8.185 7.952 7.721 7.492 7.265 7.096 6.915 6.634 6.427 6.204 6.09 5.847 5.583 5.309 5.169 4.708 4.659 4.474 4.286 3.902 3.679 3.422 3.157 2.857 2.49 1.978 0.312 -5 ,5437 ,KEBNE ,17070610,Fri Dec 24 20:53:56 CET,Fri Dec 24 22:28:41 CET,0.0 0.999 1.44 1.785 2.049 2.258 2.439 2.618 2.978 3.14 3.285 3.235 3.66 3.774 3.985 4.18 4.37 4.464 4.642 4.808 5.045 5.195 5.343 5.546 5.729 5.91 6.091 6.265 6.488 6.703 6.914 7.174 7.417 7.641 7.897 8.172 8.437 8.726 9.027 9.346 9.681 10.066 10.512 10.946 11.435 11.957 12.541 13.192 13.847 14.476 15.014 15.066 14.842 14.507 14.103 13.689 13.293 12.91 12.554 12.184 11.857 11.566 11.284 10.975 10.663 10.38 10.077 9.809 9.582 9.344 9.096 8.88 8.649 8.404 8.21 8.016 7.805 7.578 7.34 7.177 7.018 6.751 6.551 6.345 6.242 6.011 5.75 5.47 5.329 4.881 4.863 4.692 4.504 4.092 3.856 3.599 3.304 2.934 2.493 1.889 0.487 -6 ,19701 ,KEBNE ,17070611,Fri Dec 24 20:59:12 CET,Fri Dec 24 22:34:17 CET,0.0 0.913 1.285 1.552 1.783 1.986 2.169 2.332 2.623 2.76 2.887 2.816 3.239 3.345 3.55 3.748 3.946 4.045 4.229 4.404 4.649 4.808 4.96 5.169 5.37 5.564 5.754 5.938 6.17 6.387 6.602 6.866 7.105 7.329 7.589 7.887 8.17 8.469 8.789 9.139 9.497 9.883 10.355 10.838 11.359 11.884 12.47 13.116 13.784 14.46 15.028 15.11 14.882 14.555 14.185 13.763 13.354 12.954 12.6 12.236 11.865 11.516 11.198 10.885 10.571 10.3 10.02 9.76 9.528 9.282 9.025 8.804 8.57 8.333 8.15 7.957 7.762 7.549 7.31 7.132 6.943 6.65 6.442 6.232 6.128 5.901 5.661 5.406 5.269 4.817 4.79 4.615 4.431 4.012 3.778 3.511 3.2 2.856 2.456 1.881 -0.061 -7 ,13847 ,KEBNE ,17070612,Fri Dec 24 21:00:15 CET,Fri Dec 24 22:35:11 CET,0.0 1.334 1.82 2.195 2.5 2.772 3.031 3.281 3.674 3.81 3.936 3.856 4.275 4.387 4.59 4.772 4.948 5.035 5.202 5.359 5.58 5.72 5.865 6.082 6.292 6.499 6.694 6.886 7.128 7.341 7.537 7.781 8.02 8.244 8.502 8.789 9.053 9.357 9.693 10.013 10.34 10.728 11.189 11.632 12.144 12.692 13.263 13.865 14.52 15.19 15.733 15.867 15.668 15.296 14.919 14.559 14.171 13.753 13.37 12.992 12.655 12.35 12.044 11.739 11.463 11.197 10.909 10.652 10.419 10.159 9.885 9.675 9.456 9.212 9.01 8.795 8.582 8.367 8.128 7.951 7.769 7.483 7.285 7.076 6.966 6.742 6.501 6.24 6.097 5.644 5.634 5.466 5.282 4.835 4.588 4.317 3.987 3.596 3.166 2.65 1.327 -8 ,5271 ,KEBNE ,17070613,Fri Dec 24 21:00:14 CET,Fri Dec 24 22:35:36 CET,0.0 0.632 0.985 1.285 1.53 1.745 1.93 2.096 2.399 2.541 2.672 2.593 3.004 3.104 3.305 3.485 3.661 3.752 3.931 4.1 4.343 4.498 4.652 4.867 5.063 5.247 5.422 5.603 5.831 6.035 6.231 6.471 6.69 6.9 7.151 7.435 7.705 7.992 8.292 8.609 8.955 9.356 9.809 10.252 10.75 11.274 11.839 12.444 13.101 13.746 14.349 14.514 14.323 14.004 13.641 13.264 12.865 12.458 12.107 11.718 11.356 10.993 10.604 10.26 9.96 9.694 9.4 9.116 8.874 8.621 8.339 8.102 7.863 7.612 7.417 7.204 6.985 6.767 6.519 6.344 6.165 5.883 5.685 5.47 5.348 5.091 4.823 4.542 4.398 3.94 3.911 3.728 3.537 3.128 2.886 2.616 2.33 1.981 1.505 0.857 -0.769 -9 ,23806 ,KEBNE ,17070614,Fri Dec 24 21:00:18 CET,Fri Dec 24 22:27:55 CET,0.0 0.794 1.184 1.48 1.721 1.917 2.083 2.246 2.548 2.684 2.807 2.744 3.176 3.293 3.525 3.738 3.931 4.029 4.216 4.393 4.656 4.819 4.977 5.198 5.404 5.602 5.787 5.955 6.167 6.38 6.595 6.858 7.096 7.324 7.584 7.854 8.119 8.41 8.718 9.04 9.363 9.752 10.215 10.648 11.135 11.663 12.247 12.876 13.574 14.288 14.868 15.026 14.877 14.567 14.177 13.772 13.382 12.979 12.616 12.228 11.876 11.569 11.262 10.957 10.665 10.406 10.116 9.829 9.582 9.316 9.047 8.827 8.592 8.345 8.149 7.931 7.69 7.444 7.175 6.989 6.805 6.504 6.29 6.065 5.949 5.719 5.48 5.197 5.039 4.571 4.527 4.343 4.16 3.769 3.535 3.271 2.974 2.617 2.204 1.606 -0.441 -10 ,18747 ,KEBNE ,17070615,Fri Dec 24 21:00:14 CET,Fri Dec 24 22:35:50 CET,0.0 0.912 1.322 1.636 1.888 2.085 2.256 2.416 2.726 2.876 3.019 2.979 3.406 3.512 3.713 3.899 4.074 4.162 4.332 4.486 4.707 4.857 5.004 5.211 5.407 5.597 5.77 5.937 6.151 6.35 6.55 6.796 7.021 7.234 7.483 7.752 8.016 8.327 8.647 8.976 9.326 9.7 10.117 10.54 11.03 11.566 12.173 12.826 13.522 14.21 14.839 15.01 14.794 14.461 14.11 13.741 13.344 12.949 12.585 12.217 11.884 11.564 11.245 10.924 10.621 10.337 10.02 9.74 9.49 9.212 8.918 8.689 8.453 8.199 7.997 7.776 7.544 7.304 7.051 6.877 6.697 6.414 6.212 5.986 5.867 5.627 5.353 5.057 4.905 4.448 4.437 4.264 4.06 3.591 3.336 3.062 2.766 2.42 2.003 1.517 0.408 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_26_1oi9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_26_1oi9.txt deleted file mode 100644 index c9f8234e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_26_1oi9.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9283 ,TETRA ,17590717,Sat Nov 27 21:19:14 CET,Sat Nov 27 23:10:38 CET,0.0 0.684 1.029 1.312 1.578 1.797 2.01 2.195 2.47 2.594 2.714 2.635 3.055 3.155 3.345 3.516 3.669 3.74 3.873 4.006 4.213 4.344 4.465 4.64 4.799 4.943 5.089 5.227 5.389 5.551 5.709 5.871 6.023 6.183 6.358 6.547 6.738 6.943 7.14 7.337 7.549 7.786 8.043 8.256 8.438 8.64 8.842 8.954 8.954 8.769 8.199 7.17 6.146 5.107 4.142 3.339 2.658 1.957 1.281 0.612 0.072 -0.395 -0.859 -1.323 -1.746 -2.127 -2.53 -2.897 -3.223 -3.56 -3.901 -4.174 -4.465 -4.776 -5.016 -5.265 -5.531 -5.797 -6.088 -6.297 -6.504 -6.841 -7.078 -7.331 -7.458 -7.72 -8.013 -8.319 -8.477 -8.955 -8.951 -9.129 -9.322 -9.732 -9.949 -10.189 -10.48 -10.826 -11.236 -11.756 -13.419 -2 ,27395 ,TETRA ,17590718,Sat Nov 27 21:19:17 CET,Sat Nov 27 23:10:50 CET,0.0 1.011 1.51 1.881 2.188 2.442 2.662 2.88 3.315 3.507 3.689 3.713 4.155 4.253 4.441 4.624 4.785 4.856 4.995 5.139 5.333 5.446 5.56 5.729 5.88 6.019 6.152 6.28 6.443 6.603 6.759 6.931 7.095 7.252 7.418 7.605 7.78 7.954 8.136 8.351 8.585 8.811 9.04 9.257 9.486 9.711 9.916 10.057 10.111 9.986 9.395 8.34 7.196 6.113 5.224 4.446 3.756 3.064 2.446 1.818 1.25 0.716 0.202 -0.252 -0.679 -1.079 -1.517 -1.925 -2.273 -2.626 -2.979 -3.296 -3.641 -3.992 -4.269 -4.55 -4.839 -5.147 -5.467 -5.695 -5.932 -6.304 -6.568 -6.842 -6.987 -7.287 -7.602 -7.94 -8.113 -8.617 -8.686 -8.879 -9.081 -9.536 -9.784 -10.045 -10.342 -10.719 -11.188 -11.743 -13.109 -3 ,21178 ,TETRA ,17590719,Sat Nov 27 21:19:15 CET,Sat Nov 27 23:10:54 CET,0.0 0.778 1.187 1.47 1.701 1.894 2.087 2.27 2.585 2.725 2.862 2.802 3.218 3.323 3.516 3.689 3.86 3.947 4.115 4.264 4.472 4.609 4.733 4.898 5.046 5.183 5.325 5.461 5.621 5.766 5.91 6.083 6.248 6.402 6.56 6.745 6.926 7.125 7.323 7.516 7.728 7.944 8.154 8.352 8.574 8.78 8.951 9.086 9.138 8.987 8.395 7.397 6.432 5.5 4.637 3.766 2.973 2.244 1.597 0.95 0.377 -0.143 -0.658 -1.13 -1.578 -1.999 -2.42 -2.797 -3.126 -3.46 -3.8 -4.08 -4.382 -4.716 -4.968 -5.231 -5.522 -5.824 -6.128 -6.336 -6.547 -6.885 -7.123 -7.36 -7.483 -7.755 -8.059 -8.403 -8.588 -9.083 -9.108 -9.304 -9.513 -9.967 -10.228 -10.523 -10.85 -11.207 -11.639 -12.222 -13.565 -4 ,29180 ,TETRA ,17590720,Sat Nov 27 21:19:18 CET,Sat Nov 27 23:10:48 CET,0.0 0.95 1.37 1.678 1.93 2.137 2.315 2.476 2.759 2.89 3.019 2.932 3.339 3.434 3.613 3.779 3.933 4.005 4.143 4.282 4.472 4.593 4.711 4.871 5.032 5.204 5.369 5.515 5.698 5.861 6.02 6.236 6.44 6.618 6.809 7.031 7.225 7.412 7.618 7.83 8.051 8.274 8.48 8.667 8.873 9.071 9.253 9.388 9.446 9.308 8.688 7.606 6.585 5.686 4.813 3.978 3.268 2.569 1.91 1.262 0.704 0.197 -0.305 -0.796 -1.254 -1.675 -2.121 -2.531 -2.894 -3.263 -3.629 -3.929 -4.253 -4.613 -4.887 -5.155 -5.449 -5.757 -6.072 -6.297 -6.54 -6.944 -7.216 -7.468 -7.6 -7.909 -8.236 -8.576 -8.766 -9.283 -9.357 -9.571 -9.801 -10.268 -10.516 -10.801 -11.121 -11.479 -11.913 -12.481 -13.647 -5 ,6769 ,TETRA ,17590721,Sat Nov 27 21:19:20 CET,Sat Nov 27 23:10:37 CET,0.0 0.864 1.204 1.459 1.68 1.88 2.064 2.228 2.545 2.685 2.808 2.736 3.162 3.271 3.471 3.655 3.827 3.908 4.046 4.17 4.353 4.472 4.585 4.74 4.897 5.051 5.195 5.329 5.485 5.638 5.803 5.998 6.173 6.336 6.522 6.736 6.937 7.165 7.392 7.609 7.815 8.002 8.226 8.458 8.692 8.897 9.085 9.247 9.316 9.177 8.614 7.62 6.59 5.644 4.802 4.005 3.296 2.639 2.068 1.475 0.949 0.477 0.001 -0.474 -0.927 -1.332 -1.765 -2.147 -2.476 -2.829 -3.198 -3.507 -3.822 -4.145 -4.401 -4.666 -4.95 -5.253 -5.583 -5.82 -6.051 -6.414 -6.668 -6.931 -7.067 -7.355 -7.661 -7.993 -8.17 -8.667 -8.699 -8.9 -9.133 -9.64 -9.897 -10.163 -10.484 -10.894 -11.399 -11.995 -13.273 -6 ,31696 ,TETRA ,17590722,Sat Nov 27 21:19:15 CET,Sat Nov 27 23:10:27 CET,0.0 0.705 1.05 1.322 1.536 1.711 1.871 2.022 2.304 2.436 2.554 2.466 2.886 2.995 3.193 3.37 3.532 3.605 3.736 3.861 4.039 4.154 4.265 4.421 4.573 4.718 4.857 4.99 5.153 5.299 5.446 5.645 5.824 5.976 6.155 6.357 6.544 6.728 6.927 7.145 7.342 7.538 7.758 7.959 8.191 8.433 8.626 8.744 8.805 8.698 8.102 7.097 6.042 5.073 4.246 3.433 2.661 1.954 1.328 0.712 0.161 -0.356 -0.867 -1.347 -1.8 -2.216 -2.629 -2.997 -3.31 -3.651 -4.005 -4.281 -4.58 -4.905 -5.165 -5.442 -5.725 -6.037 -6.366 -6.593 -6.826 -7.177 -7.42 -7.68 -7.823 -8.121 -8.435 -8.751 -8.919 -9.423 -9.482 -9.689 -9.905 -10.369 -10.64 -10.937 -11.274 -11.625 -12.062 -12.64 -14.135 -7 ,711 ,TETRA ,17590723,Sat Nov 27 21:20:11 CET,Sat Nov 27 23:12:14 CET,0.0 0.683 1.042 1.28 1.476 1.65 1.817 1.98 2.26 2.384 2.508 2.435 2.85 2.942 3.115 3.266 3.405 3.473 3.616 3.745 3.926 4.055 4.181 4.349 4.505 4.656 4.796 4.936 5.128 5.302 5.469 5.698 5.897 6.059 6.247 6.466 6.67 6.87 7.073 7.272 7.467 7.707 7.98 8.211 8.447 8.668 8.866 9.018 9.072 8.929 8.376 7.411 6.399 5.467 4.565 3.678 2.897 2.221 1.63 1.013 0.499 0.022 -0.461 -0.915 -1.323 -1.693 -2.124 -2.527 -2.883 -3.254 -3.627 -3.931 -4.247 -4.597 -4.87 -5.153 -5.448 -5.749 -6.067 -6.287 -6.511 -6.86 -7.11 -7.37 -7.502 -7.801 -8.136 -8.474 -8.652 -9.165 -9.234 -9.45 -9.688 -10.19 -10.462 -10.759 -11.075 -11.429 -11.882 -12.482 -13.579 -8 ,11916 ,TETRA ,17590724,Sat Nov 27 21:20:11 CET,Sat Nov 27 23:11:08 CET,0.0 0.73 1.173 1.479 1.707 1.898 2.063 2.227 2.538 2.668 2.783 2.703 3.132 3.235 3.418 3.599 3.768 3.851 4.005 4.137 4.33 4.456 4.577 4.752 4.926 5.094 5.243 5.388 5.569 5.727 5.876 6.043 6.197 6.358 6.539 6.739 6.933 7.144 7.365 7.574 7.781 7.996 8.245 8.5 8.736 8.945 9.154 9.311 9.348 9.206 8.633 7.633 6.655 5.698 4.858 4.083 3.358 2.669 2.012 1.311 0.735 0.234 -0.248 -0.706 -1.137 -1.519 -1.913 -2.288 -2.617 -2.955 -3.312 -3.61 -3.932 -4.281 -4.555 -4.833 -5.116 -5.396 -5.68 -5.888 -6.103 -6.443 -6.69 -6.956 -7.094 -7.382 -7.687 -8.025 -8.21 -8.714 -8.752 -8.946 -9.156 -9.635 -9.915 -10.221 -10.563 -10.969 -11.445 -12.056 -13.227 -9 ,25689 ,TETRA ,17590725,Sat Nov 27 21:20:13 CET,Sat Nov 27 23:10:50 CET,0.0 1.211 1.606 1.933 2.196 2.398 2.574 2.73 3.015 3.145 3.253 3.127 3.531 3.624 3.818 4.016 4.19 4.268 4.424 4.569 4.771 4.907 5.048 5.23 5.382 5.529 5.673 5.826 6.015 6.178 6.322 6.487 6.651 6.8 6.992 7.228 7.423 7.614 7.825 8.052 8.256 8.454 8.68 8.88 9.072 9.267 9.458 9.57 9.592 9.464 8.884 7.875 6.813 5.824 4.955 4.093 3.332 2.661 2.064 1.442 0.912 0.456 0.001 -0.458 -0.92 -1.351 -1.8 -2.196 -2.521 -2.854 -3.21 -3.516 -3.83 -4.156 -4.413 -4.68 -4.962 -5.253 -5.547 -5.749 -5.964 -6.306 -6.539 -6.771 -6.894 -7.15 -7.412 -7.702 -7.858 -8.348 -8.382 -8.575 -8.789 -9.248 -9.518 -9.818 -10.155 -10.553 -11.043 -11.673 -13.115 -10 ,24485 ,TETRA ,17590726,Sat Nov 27 21:20:12 CET,Sat Nov 27 23:12:24 CET,0.0 0.652 1.007 1.277 1.512 1.735 1.927 2.089 2.387 2.523 2.646 2.552 2.97 3.072 3.246 3.407 3.564 3.648 3.806 3.952 4.163 4.294 4.422 4.601 4.76 4.917 5.068 5.194 5.348 5.514 5.68 5.865 6.053 6.25 6.461 6.67 6.867 7.072 7.291 7.525 7.752 7.984 8.231 8.469 8.742 8.99 9.201 9.386 9.496 9.402 8.824 7.686 6.551 5.573 4.717 3.921 3.213 2.554 2.001 1.428 0.858 0.347 -0.117 -0.564 -1.008 -1.444 -1.898 -2.282 -2.617 -2.968 -3.324 -3.611 -3.898 -4.205 -4.446 -4.692 -4.959 -5.241 -5.553 -5.778 -6.007 -6.365 -6.609 -6.862 -6.994 -7.261 -7.553 -7.87 -8.028 -8.51 -8.538 -8.721 -8.908 -9.349 -9.592 -9.857 -10.162 -10.513 -10.945 -11.506 -13.259 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_26_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_26_21.txt deleted file mode 100644 index f8f190e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_26_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22307 ,TETRA ,17590727,Sat Nov 27 21:20:13 CET,Sat Nov 27 23:12:12 CET,0.0 2.448 2.97 3.329 3.641 3.896 4.107 4.314 4.702 4.887 5.051 4.994 5.422 5.538 5.763 5.974 6.16 6.244 6.404 6.551 6.773 6.921 7.059 7.249 7.423 7.582 7.746 7.902 8.065 8.216 8.375 8.57 8.765 8.943 9.133 9.318 9.49 9.692 9.885 10.052 10.189 10.332 10.483 10.599 10.681 10.69 10.617 10.448 10.058 9.27 7.716 5.729 4.006 2.486 1.185 0.049 -0.95 -1.868 -2.65 -3.428 -4.097 -4.687 -5.249 -5.769 -6.249 -6.7 -7.165 -7.571 -7.923 -8.288 -8.672 -8.997 -9.333 -9.67 -9.934 -10.206 -10.48 -10.752 -11.05 -11.275 -11.498 -11.831 -12.068 -12.316 -12.443 -12.702 -12.981 -13.289 -13.445 -13.929 -13.945 -14.126 -14.311 -14.73 -14.986 -15.328 -15.713 -16.133 -16.636 -17.25 -18.7 -2 ,1117 ,TETRA ,17590728,Sat Nov 27 21:20:13 CET,Sat Nov 27 23:20:34 CET,0.0 1.742 2.249 2.597 2.87 3.118 3.35 3.567 3.951 4.12 4.285 4.281 4.732 4.855 5.072 5.287 5.49 5.576 5.758 5.93 6.156 6.302 6.439 6.623 6.792 6.959 7.131 7.293 7.479 7.649 7.808 7.987 8.153 8.315 8.493 8.67 8.826 8.996 9.168 9.331 9.495 9.662 9.816 9.911 9.975 10.023 9.99 9.787 9.383 8.609 7.027 4.964 3.186 1.636 0.337 -0.804 -1.789 -2.698 -3.49 -4.249 -4.896 -5.466 -6.004 -6.523 -7.013 -7.466 -7.953 -8.38 -8.743 -9.124 -9.519 -9.841 -10.166 -10.505 -10.781 -11.077 -11.374 -11.694 -12.021 -12.242 -12.478 -12.838 -13.088 -13.36 -13.505 -13.798 -14.107 -14.451 -14.629 -15.123 -15.159 -15.363 -15.566 -16.024 -16.272 -16.535 -16.866 -17.229 -17.645 -18.156 -19.257 -3 ,15329 ,TETRA ,17590729,Sat Nov 27 21:20:12 CET,Sat Nov 27 23:08:40 CET,0.0 1.806 2.398 2.8 3.107 3.392 3.633 3.848 4.226 4.404 4.573 4.581 5.043 5.177 5.407 5.61 5.798 5.889 6.07 6.242 6.467 6.598 6.726 6.907 7.075 7.243 7.405 7.547 7.719 7.889 8.054 8.243 8.408 8.567 8.745 8.936 9.101 9.272 9.461 9.629 9.777 9.923 10.058 10.166 10.248 10.287 10.218 10.024 9.625 8.835 7.314 5.28 3.513 1.982 0.665 -0.498 -1.505 -2.407 -3.186 -3.978 -4.655 -5.25 -5.815 -6.34 -6.815 -7.26 -7.737 -8.16 -8.524 -8.898 -9.287 -9.621 -9.978 -10.346 -10.624 -10.906 -11.194 -11.493 -11.801 -12.014 -12.238 -12.583 -12.82 -13.064 -13.194 -13.474 -13.767 -14.095 -14.272 -14.768 -14.788 -14.979 -15.178 -15.634 -15.9 -16.201 -16.524 -16.876 -17.264 -17.762 -18.636 -4 ,31010 ,TETRA ,17590730,Sat Nov 27 21:20:13 CET,Sat Nov 27 23:15:54 CET,0.0 1.796 2.371 2.765 3.083 3.383 3.63 3.827 4.169 4.322 4.468 4.428 4.864 4.986 5.211 5.424 5.636 5.736 5.916 6.08 6.307 6.453 6.593 6.784 6.957 7.125 7.29 7.443 7.621 7.795 7.965 8.165 8.354 8.531 8.733 8.942 9.128 9.307 9.481 9.654 9.795 9.922 10.081 10.225 10.331 10.38 10.321 10.123 9.73 8.994 7.481 5.419 3.638 2.079 0.716 -0.506 -1.571 -2.528 -3.34 -4.13 -4.824 -5.442 -6.021 -6.557 -7.058 -7.518 -8.002 -8.436 -8.807 -9.183 -9.572 -9.912 -10.267 -10.619 -10.887 -11.167 -11.451 -11.742 -12.054 -12.271 -12.492 -12.832 -13.068 -13.327 -13.463 -13.746 -14.058 -14.406 -14.573 -15.054 -15.042 -15.216 -15.399 -15.808 -16.057 -16.335 -16.637 -16.986 -17.427 -17.978 -19.259 -5 ,16983 ,TETRA ,17590731,Sat Nov 27 21:20:13 CET,Sat Nov 27 23:11:31 CET,0.0 1.874 2.412 2.79 3.078 3.316 3.529 3.709 4.063 4.224 4.362 4.33 4.774 4.887 5.108 5.333 5.526 5.616 5.794 5.949 6.168 6.312 6.458 6.669 6.866 7.045 7.197 7.346 7.531 7.689 7.853 8.056 8.234 8.393 8.565 8.733 8.903 9.1 9.279 9.424 9.549 9.69 9.834 9.953 10.064 10.116 10.075 9.932 9.572 8.783 7.279 5.304 3.536 2.031 0.728 -0.458 -1.502 -2.451 -3.266 -4.068 -4.745 -5.334 -5.886 -6.412 -6.917 -7.383 -7.854 -8.257 -8.605 -8.966 -9.345 -9.669 -10.0 -10.342 -10.609 -10.89 -11.195 -11.504 -11.809 -12.029 -12.257 -12.623 -12.888 -13.158 -13.289 -13.554 -13.838 -14.145 -14.306 -14.799 -14.844 -15.042 -15.245 -15.715 -15.983 -16.276 -16.599 -16.956 -17.394 -17.924 -19.328 -6 ,19030 ,TETRA ,17590732,Sat Nov 27 21:36:12 CET,Sat Nov 27 23:31:14 CET,0.0 1.461 2.0 2.418 2.747 3.03 3.26 3.468 3.846 4.021 4.192 4.182 4.627 4.759 4.991 5.192 5.385 5.48 5.671 5.854 6.111 6.27 6.428 6.646 6.831 7.005 7.167 7.323 7.516 7.684 7.837 8.039 8.231 8.394 8.571 8.756 8.937 9.117 9.303 9.502 9.677 9.829 9.97 10.08 10.158 10.189 10.147 9.995 9.646 8.886 7.358 5.341 3.567 2.009 0.664 -0.531 -1.595 -2.528 -3.305 -4.084 -4.738 -5.316 -5.874 -6.397 -6.897 -7.348 -7.804 -8.223 -8.589 -8.966 -9.356 -9.694 -10.053 -10.397 -10.656 -10.938 -11.24 -11.55 -11.871 -12.089 -12.316 -12.68 -12.94 -13.21 -13.351 -13.644 -13.953 -14.28 -14.451 -14.956 -14.977 -15.17 -15.376 -15.81 -16.053 -16.326 -16.621 -16.956 -17.338 -17.808 -18.935 -7 ,32301 ,TETRA ,17590733,Sat Nov 27 21:36:12 CET,Sat Nov 27 23:29:34 CET,0.0 1.394 1.928 2.311 2.652 2.968 3.218 3.432 3.788 3.948 4.095 4.063 4.507 4.633 4.898 5.129 5.327 5.42 5.582 5.735 5.954 6.105 6.255 6.458 6.656 6.842 7.014 7.174 7.379 7.574 7.739 7.926 8.11 8.277 8.457 8.652 8.824 9.0 9.178 9.337 9.482 9.622 9.754 9.848 9.919 9.939 9.877 9.703 9.304 8.512 6.997 4.99 3.216 1.645 0.315 -0.831 -1.836 -2.736 -3.542 -4.347 -5.014 -5.612 -6.188 -6.723 -7.215 -7.667 -8.137 -8.567 -8.936 -9.309 -9.702 -10.024 -10.362 -10.715 -10.986 -11.276 -11.579 -11.888 -12.202 -12.419 -12.657 -13.042 -13.293 -13.548 -13.683 -13.96 -14.252 -14.563 -14.729 -15.226 -15.262 -15.46 -15.661 -16.106 -16.364 -16.643 -16.955 -17.333 -17.789 -18.381 -19.945 -8 ,10713 ,TETRA ,17590734,Sat Nov 27 21:36:12 CET,Sat Nov 27 23:27:47 CET,0.0 1.427 1.958 2.394 2.69 2.941 3.171 3.37 3.738 3.912 4.082 4.07 4.503 4.622 4.845 5.062 5.256 5.341 5.515 5.681 5.919 6.057 6.188 6.404 6.605 6.785 6.947 7.1 7.298 7.475 7.626 7.795 7.972 8.137 8.316 8.52 8.691 8.862 9.049 9.23 9.408 9.586 9.751 9.869 9.956 10.011 9.99 9.808 9.389 8.608 7.095 5.065 3.283 1.757 0.442 -0.745 -1.753 -2.671 -3.484 -4.292 -4.987 -5.584 -6.137 -6.668 -7.172 -7.649 -8.133 -8.549 -8.906 -9.266 -9.636 -9.94 -10.276 -10.633 -10.903 -11.181 -11.477 -11.793 -12.116 -12.347 -12.578 -12.924 -13.172 -13.437 -13.578 -13.873 -14.19 -14.544 -14.734 -15.25 -15.288 -15.492 -15.707 -16.153 -16.388 -16.659 -16.977 -17.321 -17.724 -18.311 -19.795 -9 ,3730 ,TETRA ,17590735,Sat Nov 27 21:36:13 CET,Sat Nov 27 23:28:59 CET,0.0 2.008 2.585 2.942 3.234 3.498 3.728 3.932 4.327 4.502 4.66 4.643 5.085 5.203 5.412 5.614 5.813 5.914 6.098 6.266 6.51 6.661 6.796 6.975 7.147 7.317 7.474 7.63 7.82 7.975 8.126 8.305 8.473 8.641 8.832 9.019 9.175 9.34 9.507 9.664 9.821 9.979 10.133 10.246 10.317 10.341 10.292 10.126 9.723 8.922 7.368 5.307 3.524 1.963 0.597 -0.593 -1.617 -2.533 -3.307 -4.067 -4.706 -5.276 -5.823 -6.335 -6.807 -7.238 -7.694 -8.108 -8.47 -8.844 -9.224 -9.545 -9.879 -10.222 -10.486 -10.765 -11.063 -11.369 -11.694 -11.928 -12.163 -12.513 -12.754 -13.009 -13.141 -13.412 -13.708 -14.019 -14.176 -14.658 -14.656 -14.84 -15.038 -15.491 -15.745 -16.018 -16.338 -16.707 -17.129 -17.682 -19.251 -10 ,14944 ,TETRA ,17590736,Sat Nov 27 21:36:13 CET,Sat Nov 27 23:27:45 CET,0.0 1.567 2.069 2.448 2.774 3.061 3.309 3.523 3.896 4.074 4.238 4.216 4.654 4.773 4.996 5.208 5.402 5.498 5.701 5.897 6.15 6.297 6.437 6.631 6.804 6.973 7.13 7.276 7.459 7.629 7.787 7.964 8.13 8.282 8.458 8.653 8.821 8.996 9.184 9.352 9.503 9.65 9.795 9.94 10.064 10.111 10.054 9.872 9.487 8.717 7.186 5.143 3.389 1.892 0.571 -0.644 -1.69 -2.609 -3.398 -4.19 -4.861 -5.441 -6.0 -6.527 -7.018 -7.481 -7.962 -8.378 -8.73 -9.099 -9.475 -9.785 -10.133 -10.496 -10.77 -11.057 -11.35 -11.644 -11.946 -12.15 -12.359 -12.692 -12.931 -13.185 -13.314 -13.576 -13.852 -14.153 -14.318 -14.813 -14.839 -15.023 -15.21 -15.65 -15.895 -16.142 -16.408 -16.717 -17.1 -17.553 -18.394 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_28_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_28_1h1s.txt deleted file mode 100644 index 70fbf0b5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_28_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12175 ,TETRA ,17590737,Sat Nov 27 21:36:13 CET,Sat Nov 27 23:29:24 CET,0.0 0.799 1.235 1.541 1.758 1.939 2.091 2.224 2.48 2.589 2.683 2.405 2.954 3.023 3.147 3.287 3.418 3.482 3.602 3.701 3.844 3.933 4.011 4.12 4.208 4.292 4.379 4.449 4.524 4.579 4.645 4.708 4.74 4.766 4.773 4.786 4.788 4.774 4.73 4.657 4.553 4.407 4.201 3.902 3.469 2.91 2.146 1.107 -0.399 -2.683 -6.358 -10.482 -13.79 -16.546 -18.817 -20.819 -22.532 -24.005 -25.256 -26.515 -27.608 -28.539 -29.391 -30.216 -30.968 -31.644 -32.341 -32.956 -33.492 -34.02 -34.565 -35.054 -35.587 -36.115 -36.5 -36.895 -37.288 -37.71 -38.141 -38.416 -38.708 -39.181 -39.515 -39.851 -40.021 -40.38 -40.747 -41.134 -41.344 -42.067 -41.995 -42.234 -42.487 -43.123 -43.525 -43.956 -44.411 -44.905 -45.486 -46.13 -47.76 -2 ,18037 ,TETRA ,17590738,Sat Nov 27 21:36:13 CET,Sat Nov 27 23:30:36 CET,0.0 0.816 1.159 1.409 1.609 1.801 1.982 2.158 2.47 2.611 2.735 2.488 3.06 3.15 3.282 3.405 3.536 3.596 3.707 3.826 3.981 4.065 4.147 4.264 4.365 4.465 4.56 4.637 4.733 4.828 4.895 4.945 5.015 5.077 5.105 5.115 5.117 5.092 5.015 4.913 4.795 4.648 4.424 4.121 3.716 3.164 2.404 1.397 -0.108 -2.383 -6.049 -10.267 -13.59 -16.301 -18.518 -20.42 -22.071 -23.545 -24.773 -26.017 -27.073 -27.961 -28.821 -29.642 -30.379 -31.056 -31.775 -32.402 -32.925 -33.453 -34.005 -34.467 -34.928 -35.412 -35.794 -36.19 -36.601 -37.013 -37.424 -37.703 -37.991 -38.47 -38.903 -39.427 -39.685 -40.216 -40.769 -41.322 -41.607 -42.472 -42.564 -42.907 -43.249 -43.943 -44.332 -44.763 -45.209 -45.688 -46.276 -47.031 -48.918 -3 ,9771 ,TETRA ,17590739,Sat Nov 27 21:36:13 CET,Sat Nov 27 23:29:14 CET,0.0 1.209 1.807 2.186 2.469 2.719 2.924 3.101 3.429 3.574 3.715 3.521 4.114 4.231 4.457 4.658 4.847 4.936 5.095 5.257 5.501 5.623 5.697 5.786 5.864 5.947 6.033 6.111 6.21 6.289 6.339 6.387 6.45 6.51 6.55 6.58 6.591 6.569 6.522 6.463 6.389 6.279 6.099 5.84 5.484 4.975 4.225 3.201 1.667 -0.665 -4.333 -8.445 -11.721 -14.446 -16.739 -18.703 -20.339 -21.817 -23.079 -24.271 -25.271 -26.17 -27.029 -27.827 -28.559 -29.219 -29.897 -30.52 -31.068 -31.633 -32.206 -32.661 -33.137 -33.653 -34.078 -34.516 -35.029 -35.648 -36.308 -36.765 -37.237 -37.951 -38.431 -38.94 -39.205 -39.742 -40.298 -40.886 -41.183 -42.044 -42.112 -42.461 -42.813 -43.556 -43.974 -44.402 -44.86 -45.368 -45.921 -46.569 -48.42 -4 ,9637 ,TETRA ,17590740,Sat Nov 27 21:36:14 CET,Sat Nov 27 23:29:13 CET,0.0 1.018 1.428 1.678 1.857 2.011 2.159 2.311 2.58 2.693 2.79 2.47 3.004 3.078 3.232 3.38 3.51 3.57 3.686 3.789 3.931 4.007 4.067 4.143 4.205 4.274 4.339 4.39 4.444 4.494 4.538 4.574 4.6 4.621 4.632 4.628 4.618 4.608 4.582 4.51 4.41 4.268 4.046 3.782 3.403 2.863 2.114 1.075 -0.454 -2.738 -6.392 -10.552 -13.838 -16.6 -18.876 -20.742 -22.34 -23.773 -25.001 -26.239 -27.318 -28.255 -29.122 -29.966 -30.748 -31.428 -32.09 -32.67 -33.179 -33.71 -34.262 -34.722 -35.197 -35.681 -36.051 -36.416 -36.82 -37.246 -37.663 -37.95 -38.246 -38.711 -39.061 -39.429 -39.6 -39.963 -40.37 -40.786 -40.995 -41.715 -41.61 -41.847 -42.109 -42.662 -42.956 -43.276 -43.661 -44.176 -44.794 -45.475 -47.173 -5 ,4646 ,TETRA ,17590742,Sat Nov 27 21:36:15 CET,Sat Nov 27 23:29:33 CET,0.0 0.882 1.276 1.551 1.778 1.967 2.134 2.275 2.517 2.639 2.753 2.492 3.04 3.121 3.282 3.434 3.57 3.625 3.723 3.814 3.933 4.012 4.088 4.182 4.261 4.336 4.412 4.478 4.558 4.627 4.682 4.737 4.784 4.828 4.871 4.903 4.896 4.864 4.811 4.716 4.592 4.448 4.239 3.943 3.51 2.946 2.18 1.121 -0.414 -2.639 -6.259 -10.437 -13.712 -16.379 -18.614 -20.567 -22.213 -23.649 -24.871 -26.079 -27.083 -27.993 -28.867 -29.654 -30.358 -31.017 -31.746 -32.378 -32.905 -33.46 -34.037 -34.513 -35.003 -35.49 -35.878 -36.3 -36.725 -37.143 -37.572 -37.879 -38.198 -38.7 -39.053 -39.413 -39.593 -40.021 -40.538 -41.089 -41.387 -42.259 -42.343 -42.696 -43.049 -43.771 -44.147 -44.534 -44.964 -45.47 -46.096 -46.878 -49.05 -6 ,27212 ,TETRA ,17590743,Sat Nov 27 21:36:13 CET,Sat Nov 27 23:31:19 CET,0.0 0.838 1.263 1.567 1.832 2.052 2.224 2.378 2.639 2.757 2.878 2.609 3.155 3.254 3.429 3.573 3.708 3.766 3.872 3.971 4.107 4.182 4.25 4.359 4.468 4.561 4.63 4.694 4.781 4.843 4.89 4.942 4.983 5.017 5.04 5.031 5.004 4.961 4.91 4.846 4.742 4.576 4.338 4.073 3.688 3.158 2.434 1.4 -0.154 -2.435 -6.048 -10.229 -13.514 -16.182 -18.414 -20.359 -22.024 -23.478 -24.765 -26.049 -27.109 -28.013 -28.846 -29.644 -30.392 -31.06 -31.733 -32.331 -32.852 -33.394 -33.943 -34.403 -34.875 -35.357 -35.744 -36.126 -36.505 -36.907 -37.319 -37.63 -37.97 -38.468 -38.791 -39.115 -39.288 -39.673 -40.102 -40.564 -40.809 -41.583 -41.588 -41.85 -42.131 -42.778 -43.121 -43.474 -43.887 -44.366 -44.941 -45.669 -47.41 -7 ,21189 ,TETRA ,17590744,Sat Nov 27 21:36:13 CET,Sat Nov 27 23:29:27 CET,0.0 0.442 0.674 0.878 1.088 1.266 1.434 1.59 1.858 1.975 2.077 1.8 2.342 2.418 2.562 2.688 2.802 2.853 2.948 3.044 3.161 3.232 3.299 3.39 3.496 3.598 3.685 3.764 3.845 3.9 3.943 4.009 4.066 4.104 4.16 4.193 4.177 4.146 4.096 4.013 3.906 3.773 3.562 3.29 2.962 2.488 1.756 0.731 -0.802 -3.055 -6.75 -11.011 -14.309 -17.027 -19.287 -21.227 -22.906 -24.434 -25.758 -27.061 -28.103 -29.023 -29.898 -30.693 -31.442 -32.117 -32.831 -33.466 -33.994 -34.552 -35.14 -35.619 -36.114 -36.62 -36.997 -37.384 -37.805 -38.235 -38.676 -38.97 -39.258 -39.738 -40.075 -40.433 -40.663 -41.18 -41.682 -42.208 -42.481 -43.336 -43.427 -43.758 -44.078 -44.775 -45.157 -45.564 -46.005 -46.506 -47.09 -47.787 -49.563 -8 ,21115 ,TETRA ,17590745,Sat Nov 27 21:36:15 CET,Sat Nov 27 23:29:07 CET,0.0 0.769 1.135 1.376 1.576 1.76 1.912 2.054 2.314 2.438 2.543 2.254 2.809 2.888 3.026 3.167 3.307 3.378 3.506 3.62 3.773 3.859 3.933 4.03 4.115 4.187 4.249 4.302 4.357 4.403 4.454 4.514 4.555 4.592 4.637 4.659 4.655 4.645 4.615 4.546 4.437 4.271 4.041 3.778 3.422 2.924 2.157 1.092 -0.403 -2.615 -6.233 -10.42 -13.711 -16.378 -18.63 -20.554 -22.141 -23.618 -24.908 -26.13 -27.137 -28.017 -28.872 -29.654 -30.358 -31.038 -31.744 -32.334 -32.867 -33.431 -33.983 -34.446 -34.937 -35.443 -35.854 -36.277 -36.687 -37.123 -37.583 -37.887 -38.188 -38.646 -38.962 -39.3 -39.472 -39.828 -40.211 -40.611 -40.828 -41.576 -41.56 -41.804 -42.059 -42.659 -43.007 -43.413 -43.88 -44.39 -44.935 -45.653 -47.381 -9 ,16993 ,TETRA ,17590746,Sat Nov 27 21:37:14 CET,Sat Nov 27 23:34:43 CET,0.0 0.687 1.027 1.285 1.514 1.699 1.855 2.004 2.283 2.408 2.532 2.304 2.881 2.978 3.131 3.269 3.405 3.463 3.567 3.669 3.796 3.876 3.959 4.058 4.16 4.256 4.339 4.416 4.491 4.55 4.595 4.627 4.643 4.66 4.682 4.712 4.737 4.736 4.691 4.63 4.554 4.417 4.184 3.899 3.519 2.992 2.238 1.172 -0.339 -2.55 -6.196 -10.383 -13.689 -16.378 -18.636 -20.626 -22.308 -23.837 -25.118 -26.324 -27.406 -28.355 -29.21 -29.99 -30.704 -31.36 -32.03 -32.649 -33.196 -33.74 -34.289 -34.756 -35.226 -35.7 -36.075 -36.474 -36.904 -37.334 -37.774 -38.07 -38.391 -39.018 -39.503 -40.003 -40.256 -40.761 -41.29 -41.85 -42.131 -42.971 -42.993 -43.299 -43.615 -44.326 -44.733 -45.166 -45.616 -46.112 -46.708 -47.467 -49.221 -10 ,2628 ,TETRA ,17590747,Sat Nov 27 21:37:13 CET,Sat Nov 27 23:30:36 CET,0.0 0.698 1.043 1.321 1.563 1.776 1.957 2.098 2.312 2.41 2.501 2.189 2.73 2.803 2.923 3.05 3.172 3.227 3.337 3.427 3.527 3.595 3.67 3.766 3.842 3.906 3.973 4.033 4.099 4.175 4.241 4.303 4.357 4.394 4.419 4.414 4.397 4.373 4.322 4.23 4.109 3.955 3.759 3.505 3.111 2.576 1.801 0.726 -0.806 -3.06 -6.644 -10.792 -14.11 -16.799 -19.058 -21.069 -22.737 -24.191 -25.441 -26.667 -27.694 -28.586 -29.42 -30.228 -30.998 -31.663 -32.331 -32.946 -33.473 -33.995 -34.568 -35.048 -35.533 -36.024 -36.399 -36.788 -37.168 -37.556 -38.005 -38.325 -38.653 -39.154 -39.489 -39.844 -40.061 -40.586 -41.133 -41.723 -42.027 -42.903 -42.961 -43.277 -43.615 -44.326 -44.727 -45.165 -45.617 -46.102 -46.682 -47.479 -49.627 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_28_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_28_30.txt deleted file mode 100644 index 74fbbe89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_28_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20859 ,TETRA ,17590748,Sat Nov 27 21:37:13 CET,Sat Nov 27 23:31:02 CET,0.0 1.152 1.676 2.056 2.376 2.654 2.91 3.162 3.648 3.861 4.068 4.018 4.692 4.905 5.273 5.593 5.924 6.087 6.401 6.701 7.131 7.414 7.687 8.071 8.448 8.813 9.164 9.522 9.99 10.43 10.857 11.382 11.904 12.417 13.017 13.701 14.355 15.108 15.958 16.85 17.783 18.844 20.115 21.459 23.046 24.862 27.077 29.667 32.784 36.631 41.601 46.109 48.982 50.909 52.267 53.282 54.024 54.581 54.992 55.35 55.619 55.807 55.939 56.042 56.123 56.179 56.204 56.221 56.235 56.237 56.226 56.212 56.181 56.138 56.105 56.055 55.975 55.886 55.787 55.719 55.647 55.529 55.436 55.335 55.29 55.185 55.056 54.904 54.815 54.317 54.504 54.386 54.261 53.991 53.854 53.665 53.438 53.197 52.876 52.452 51.486 -2 ,24012 ,TETRA ,17590749,Sat Nov 27 21:37:13 CET,Sat Nov 27 23:30:59 CET,0.0 1.02 1.491 1.888 2.239 2.586 2.89 3.15 3.624 3.826 4.027 3.973 4.64 4.841 5.222 5.571 5.887 6.045 6.37 6.68 7.12 7.401 7.678 8.085 8.471 8.84 9.203 9.572 10.047 10.508 10.954 11.486 12.006 12.519 13.118 13.801 14.469 15.198 15.989 16.843 17.775 18.854 20.106 21.4 22.954 24.763 26.946 29.456 32.524 36.349 41.303 45.74 48.581 50.557 51.956 52.999 53.778 54.386 54.84 55.237 55.515 55.719 55.894 56.033 56.141 56.222 56.284 56.306 56.299 56.294 56.281 56.257 56.234 56.207 56.171 56.119 56.066 55.997 55.908 55.842 55.766 55.64 55.551 55.434 55.373 55.273 55.157 55.015 54.938 54.446 54.673 54.578 54.467 54.186 54.03 53.85 53.651 53.443 53.141 52.686 51.271 -3 ,21480 ,TETRA ,17590750,Sat Nov 27 21:37:15 CET,Sat Nov 27 23:30:56 CET,0.0 0.81 1.231 1.567 1.827 2.094 2.354 2.584 3.002 3.207 3.412 3.327 3.97 4.135 4.448 4.758 5.057 5.204 5.501 5.791 6.2 6.459 6.725 7.132 7.525 7.901 8.26 8.617 9.079 9.528 9.974 10.512 11.038 11.563 12.179 12.879 13.552 14.29 15.104 16.001 16.941 18.014 19.328 20.674 22.263 24.124 26.363 28.963 32.087 35.925 40.939 45.444 48.278 50.177 51.569 52.634 53.417 54.015 54.451 54.833 55.106 55.313 55.49 55.628 55.739 55.82 55.865 55.89 55.914 55.929 55.926 55.918 55.897 55.855 55.832 55.793 55.734 55.677 55.606 55.551 55.498 55.399 55.321 55.24 55.19 55.077 54.951 54.807 54.728 54.236 54.457 54.345 54.231 53.977 53.824 53.644 53.431 53.202 52.908 52.499 51.287 -4 ,30723 ,TETRA ,17590751,Sat Nov 27 21:37:17 CET,Sat Nov 27 23:30:42 CET,0.0 0.765 1.293 1.712 2.023 2.313 2.597 2.856 3.314 3.522 3.722 3.649 4.298 4.471 4.828 5.163 5.465 5.622 5.933 6.222 6.657 6.939 7.208 7.609 7.997 8.356 8.706 9.054 9.504 9.951 10.399 10.938 11.458 11.969 12.58 13.267 13.926 14.67 15.499 16.393 17.331 18.427 19.742 21.072 22.675 24.507 26.722 29.372 32.561 36.436 41.404 45.925 48.84 50.782 52.158 53.201 53.996 54.589 55.011 55.393 55.68 55.892 56.064 56.2 56.298 56.383 56.439 56.462 56.48 56.485 56.489 56.489 56.454 56.388 56.336 56.287 56.232 56.153 56.056 55.977 55.895 55.76 55.656 55.548 55.496 55.386 55.263 55.125 55.036 54.543 54.788 54.685 54.558 54.278 54.116 53.926 53.68 53.354 52.967 52.436 50.481 -5 ,25186 ,TETRA ,17590752,Sat Nov 27 21:37:14 CET,Sat Nov 27 23:30:42 CET,0.0 0.727 1.212 1.573 1.875 2.159 2.423 2.667 3.102 3.302 3.507 3.441 4.083 4.247 4.563 4.884 5.204 5.353 5.648 5.948 6.39 6.671 6.938 7.332 7.72 8.089 8.452 8.811 9.267 9.706 10.142 10.672 11.18 11.682 12.292 12.998 13.676 14.419 15.227 16.116 17.075 18.177 19.483 20.835 22.442 24.261 26.406 28.888 31.95 35.777 40.705 45.203 48.128 50.084 51.456 52.468 53.238 53.86 54.328 54.734 55.039 55.271 55.424 55.541 55.657 55.741 55.806 55.841 55.854 55.867 55.862 55.838 55.804 55.759 55.718 55.674 55.621 55.552 55.48 55.429 55.354 55.219 55.133 55.036 54.979 54.857 54.725 54.584 54.504 54.013 54.245 54.148 54.037 53.777 53.608 53.404 53.186 52.929 52.629 52.239 50.831 -6 ,1358 ,TETRA ,17590753,Sat Nov 27 21:38:11 CET,Sat Nov 27 23:33:27 CET,0.0 1.021 1.465 1.819 2.121 2.398 2.643 2.876 3.331 3.551 3.763 3.683 4.339 4.525 4.877 5.215 5.549 5.713 6.02 6.303 6.717 6.993 7.263 7.652 8.049 8.458 8.84 9.198 9.653 10.106 10.556 11.079 11.597 12.099 12.691 13.371 14.029 14.785 15.615 16.508 17.448 18.512 19.806 21.155 22.774 24.632 26.735 29.152 32.172 36.014 40.994 45.412 48.279 50.277 51.699 52.755 53.519 54.116 54.583 54.978 55.262 55.471 55.626 55.749 55.853 55.933 56.0 56.045 56.067 56.077 56.083 56.086 56.073 56.051 56.03 55.994 55.945 55.883 55.809 55.747 55.689 55.604 55.532 55.451 55.401 55.283 55.151 55.015 54.945 54.461 54.695 54.584 54.467 54.181 54.007 53.835 53.636 53.418 53.157 52.754 51.578 -7 ,2713 ,TETRA ,17590754,Sat Nov 27 21:38:11 CET,Sat Nov 27 23:31:00 CET,0.0 0.606 0.963 1.274 1.55 1.811 2.069 2.306 2.732 2.96 3.18 3.107 3.761 3.95 4.318 4.684 5.032 5.194 5.505 5.813 6.272 6.566 6.843 7.243 7.634 8.014 8.388 8.751 9.223 9.685 10.152 10.71 11.233 11.754 12.351 13.031 13.7 14.458 15.288 16.163 17.104 18.193 19.509 20.884 22.446 24.234 26.383 28.939 32.114 36.0 40.995 45.439 48.302 50.287 51.71 52.786 53.596 54.235 54.679 55.064 55.376 55.599 55.778 55.918 56.015 56.094 56.159 56.194 56.213 56.219 56.208 56.181 56.14 56.096 56.056 55.991 55.914 55.825 55.721 55.656 55.582 55.453 55.359 55.255 55.201 55.106 54.993 54.841 54.763 54.279 54.492 54.396 54.291 54.043 53.91 53.747 53.557 53.315 52.991 52.546 51.22 -8 ,20638 ,TETRA ,17590755,Sat Nov 27 21:38:14 CET,Sat Nov 27 23:31:31 CET,0.0 0.489 0.874 1.191 1.467 1.702 1.925 2.139 2.536 2.736 2.938 2.838 3.466 3.625 3.947 4.262 4.569 4.719 5.032 5.355 5.806 6.076 6.331 6.705 7.066 7.424 7.768 8.101 8.54 8.969 9.393 9.917 10.434 10.951 11.555 12.232 12.904 13.646 14.462 15.36 16.304 17.347 18.617 19.964 21.569 23.4 25.549 28.07 31.174 35.028 40.026 44.563 47.426 49.401 50.801 51.837 52.62 53.236 53.697 54.084 54.375 54.603 54.781 54.933 55.055 55.138 55.222 55.286 55.316 55.312 55.276 55.238 55.198 55.142 55.09 55.026 54.951 54.867 54.763 54.662 54.532 54.329 54.181 54.012 53.922 53.732 53.52 53.292 53.169 52.634 52.728 52.547 52.361 51.981 51.781 51.541 51.268 50.957 50.561 50.022 48.248 -9 ,31845 ,TETRA ,17590756,Sat Nov 27 21:38:11 CET,Sat Nov 27 23:32:00 CET,0.0 0.894 1.323 1.748 2.152 2.478 2.739 2.982 3.466 3.69 3.896 3.819 4.472 4.653 4.991 5.302 5.62 5.781 6.086 6.374 6.803 7.087 7.354 7.749 8.141 8.516 8.865 9.199 9.659 10.112 10.54 11.061 11.583 12.106 12.724 13.435 14.13 14.889 15.709 16.585 17.515 18.602 19.927 21.296 22.874 24.67 26.846 29.367 32.434 36.268 41.302 45.879 48.816 50.817 52.25 53.352 54.151 54.747 55.175 55.543 55.818 56.007 56.177 56.33 56.448 56.534 56.593 56.631 56.653 56.655 56.638 56.618 56.594 56.57 56.54 56.499 56.449 56.387 56.314 56.245 56.158 56.028 55.945 55.853 55.797 55.684 55.568 55.41 55.326 54.838 55.061 54.971 54.871 54.616 54.454 54.27 54.052 53.807 53.521 53.195 52.103 -10 ,6291 ,TETRA ,17590757,Sat Nov 27 21:38:14 CET,Sat Nov 27 23:33:12 CET,0.0 0.734 1.123 1.444 1.736 2.001 2.241 2.459 2.863 3.051 3.231 3.109 3.736 3.903 4.235 4.541 4.825 4.969 5.254 5.53 5.928 6.181 6.43 6.796 7.171 7.525 7.85 8.172 8.6 9.023 9.448 9.972 10.476 10.966 11.55 12.216 12.865 13.592 14.381 15.23 16.143 17.197 18.466 19.779 21.371 23.2 25.34 27.845 30.948 34.808 39.847 44.37 47.252 49.25 50.649 51.69 52.448 53.031 53.458 53.815 54.062 54.254 54.409 54.541 54.635 54.693 54.727 54.739 54.736 54.711 54.681 54.645 54.604 54.56 54.512 54.453 54.377 54.287 54.192 54.123 54.05 53.927 53.836 53.734 53.676 53.561 53.438 53.29 53.207 52.712 52.886 52.761 52.631 52.33 52.161 51.974 51.771 51.526 51.199 50.746 49.612 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_29_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_29_28.txt deleted file mode 100644 index e498f4dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_29_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31359 ,TETRA ,17590758,Sat Nov 27 21:38:11 CET,Sat Nov 27 23:32:51 CET,0.0 0.521 0.769 0.956 1.122 1.299 1.465 1.594 1.793 1.887 1.987 1.736 2.222 2.285 2.414 2.531 2.633 2.686 2.791 2.892 3.009 3.073 3.142 3.232 3.295 3.359 3.421 3.47 3.516 3.551 3.596 3.642 3.673 3.696 3.701 3.686 3.668 3.652 3.615 3.512 3.369 3.185 2.926 2.624 2.192 1.637 0.891 -0.152 -1.658 -3.87 -7.346 -11.304 -14.38 -16.92 -19.025 -20.824 -22.348 -23.722 -24.916 -26.085 -27.037 -27.871 -28.694 -29.469 -30.172 -30.772 -31.398 -31.967 -32.447 -32.951 -33.478 -33.911 -34.352 -34.8 -35.147 -35.513 -35.892 -36.273 -36.667 -36.951 -37.242 -37.686 -38.004 -38.331 -38.503 -38.869 -39.237 -39.617 -39.813 -40.479 -40.452 -40.686 -40.945 -41.489 -41.782 -42.11 -42.459 -42.86 -43.372 -44.024 -45.886 -2 ,25630 ,TETRA ,17590759,Sat Nov 27 21:38:13 CET,Sat Nov 27 23:32:19 CET,0.0 0.944 1.296 1.574 1.793 1.984 2.158 2.301 2.552 2.665 2.765 2.531 3.029 3.104 3.233 3.354 3.465 3.52 3.635 3.733 3.857 3.934 4.016 4.128 4.21 4.282 4.35 4.412 4.48 4.528 4.569 4.61 4.641 4.67 4.677 4.687 4.688 4.659 4.596 4.49 4.353 4.159 3.893 3.593 3.174 2.608 1.877 0.906 -0.555 -2.763 -6.244 -10.216 -13.347 -15.896 -17.987 -19.819 -21.381 -22.733 -23.878 -25.007 -25.96 -26.815 -27.63 -28.368 -29.042 -29.654 -30.295 -30.869 -31.359 -31.856 -32.36 -32.78 -33.22 -33.677 -34.04 -34.436 -34.847 -35.252 -35.655 -35.926 -36.213 -36.673 -36.99 -37.309 -37.471 -37.797 -38.135 -38.507 -38.705 -39.376 -39.347 -39.581 -39.824 -40.339 -40.625 -40.955 -41.292 -41.668 -42.122 -42.719 -44.397 -3 ,21995 ,TETRA ,17590760,Sat Nov 27 21:38:15 CET,Sat Nov 27 23:32:42 CET,0.0 0.712 1.019 1.221 1.383 1.523 1.651 1.785 2.043 2.152 2.247 1.997 2.487 2.559 2.694 2.811 2.907 2.949 3.037 3.13 3.272 3.354 3.424 3.519 3.596 3.661 3.722 3.794 3.889 3.973 4.045 4.094 4.118 4.125 4.124 4.102 4.076 4.031 3.966 3.884 3.74 3.548 3.298 3.021 2.616 2.043 1.24 0.154 -1.304 -3.47 -7.02 -11.03 -14.179 -16.776 -18.972 -20.876 -22.487 -23.908 -25.089 -26.221 -27.212 -28.114 -28.949 -29.714 -30.426 -31.075 -31.749 -32.349 -32.864 -33.38 -33.896 -34.346 -34.825 -35.296 -35.648 -36.025 -36.415 -36.812 -37.228 -37.521 -37.823 -38.301 -38.631 -38.956 -39.126 -39.481 -39.854 -40.245 -40.445 -41.118 -41.103 -41.353 -41.613 -42.18 -42.48 -42.796 -43.165 -43.565 -44.024 -44.634 -45.993 -4 ,26051 ,TETRA ,17590761,Sat Nov 27 21:38:17 CET,Sat Nov 27 23:32:25 CET,0.0 0.639 0.957 1.186 1.351 1.488 1.611 1.738 1.963 2.069 2.169 1.931 2.422 2.485 2.617 2.75 2.86 2.91 3.014 3.109 3.246 3.337 3.423 3.534 3.624 3.702 3.765 3.822 3.894 3.948 3.999 4.038 4.051 4.061 4.059 4.041 4.012 3.968 3.896 3.788 3.648 3.491 3.257 2.963 2.595 2.103 1.348 0.256 -1.263 -3.439 -6.934 -10.877 -13.968 -16.461 -18.507 -20.298 -21.86 -23.229 -24.353 -25.476 -26.444 -27.28 -28.068 -28.818 -29.507 -30.113 -30.751 -31.327 -31.817 -32.314 -32.836 -33.281 -33.741 -34.224 -34.597 -34.985 -35.385 -35.787 -36.207 -36.498 -36.799 -37.273 -37.601 -37.928 -38.086 -38.393 -38.722 -39.097 -39.288 -39.949 -39.919 -40.155 -40.38 -40.853 -41.146 -41.501 -41.885 -42.299 -42.777 -43.345 -44.686 -5 ,26502 ,TETRA ,17590762,Sat Nov 27 21:38:18 CET,Sat Nov 27 23:32:15 CET,0.0 0.76 1.152 1.422 1.632 1.787 1.927 2.044 2.255 2.356 2.454 2.197 2.679 2.743 2.864 2.977 3.081 3.131 3.221 3.31 3.44 3.513 3.575 3.653 3.724 3.787 3.841 3.888 3.948 4.007 4.046 4.063 4.08 4.097 4.101 4.09 4.051 4.002 3.94 3.834 3.698 3.512 3.25 2.933 2.483 1.913 1.16 0.128 -1.376 -3.597 -7.109 -11.07 -14.197 -16.797 -18.905 -20.723 -22.274 -23.668 -24.872 -26.012 -26.997 -27.876 -28.681 -29.416 -30.071 -30.656 -31.291 -31.873 -32.374 -32.899 -33.444 -33.889 -34.353 -34.828 -35.198 -35.574 -35.951 -36.36 -36.778 -37.043 -37.32 -37.775 -38.092 -38.425 -38.591 -38.939 -39.338 -39.746 -39.952 -40.623 -40.58 -40.81 -41.047 -41.543 -41.827 -42.147 -42.51 -42.903 -43.386 -44.1 -45.764 -6 ,14856 ,TETRA ,17590763,Sat Nov 27 21:38:13 CET,Sat Nov 27 23:32:35 CET,0.0 1.182 1.722 2.035 2.19 2.329 2.466 2.591 2.824 2.942 3.045 2.787 3.274 3.333 3.448 3.562 3.666 3.716 3.81 3.888 3.998 4.072 4.134 4.212 4.29 4.356 4.413 4.47 4.547 4.617 4.666 4.713 4.751 4.776 4.784 4.772 4.755 4.728 4.684 4.633 4.544 4.39 4.137 3.824 3.416 2.846 2.054 1.023 -0.446 -2.643 -6.165 -10.141 -13.249 -15.754 -17.877 -19.708 -21.211 -22.59 -23.767 -24.899 -25.844 -26.645 -27.404 -28.133 -28.831 -29.465 -30.126 -30.74 -31.267 -31.778 -32.294 -32.722 -33.17 -33.652 -34.02 -34.385 -34.765 -35.17 -35.596 -35.889 -36.189 -36.653 -36.973 -37.317 -37.493 -37.852 -38.228 -38.61 -38.819 -39.502 -39.475 -39.706 -39.944 -40.468 -40.759 -41.095 -41.46 -41.835 -42.251 -42.779 -43.89 -7 ,29418 ,TETRA ,17590764,Sat Nov 27 21:38:17 CET,Sat Nov 27 23:32:10 CET,0.0 0.904 1.291 1.552 1.738 1.902 2.053 2.21 2.497 2.622 2.728 2.482 2.981 3.066 3.236 3.39 3.505 3.553 3.645 3.73 3.847 3.925 3.996 4.096 4.189 4.268 4.342 4.408 4.476 4.527 4.567 4.595 4.607 4.619 4.621 4.613 4.591 4.539 4.47 4.377 4.247 4.071 3.816 3.505 3.082 2.518 1.764 0.709 -0.836 -3.06 -6.639 -10.724 -13.826 -16.381 -18.526 -20.352 -21.902 -23.294 -24.485 -25.669 -26.681 -27.554 -28.35 -29.098 -29.782 -30.393 -31.043 -31.627 -32.133 -32.672 -33.232 -33.686 -34.142 -34.591 -34.947 -35.332 -35.719 -36.102 -36.512 -36.8 -37.081 -37.504 -37.806 -38.121 -38.283 -38.619 -38.991 -39.394 -39.595 -40.26 -40.219 -40.443 -40.684 -41.235 -41.528 -41.829 -42.149 -42.511 -42.915 -43.515 -45.325 -8 ,19283 ,TETRA ,17590765,Sat Nov 27 21:38:14 CET,Sat Nov 27 23:31:58 CET,0.0 0.825 1.197 1.47 1.687 1.873 2.04 2.177 2.4 2.507 2.606 2.357 2.868 2.955 3.099 3.231 3.354 3.411 3.501 3.607 3.773 3.853 3.915 3.999 4.076 4.143 4.2 4.261 4.33 4.372 4.4 4.416 4.418 4.426 4.423 4.39 4.356 4.303 4.222 4.137 4.011 3.831 3.585 3.291 2.889 2.35 1.59 0.511 -0.993 -3.194 -6.784 -10.817 -13.957 -16.49 -18.568 -20.352 -21.878 -23.241 -24.401 -25.553 -26.528 -27.411 -28.25 -29.022 -29.731 -30.362 -31.014 -31.594 -32.082 -32.572 -33.077 -33.505 -33.95 -34.416 -34.776 -35.16 -35.581 -36.0 -36.422 -36.714 -37.019 -37.495 -37.808 -38.131 -38.303 -38.632 -38.974 -39.345 -39.539 -40.195 -40.154 -40.405 -40.658 -41.159 -41.434 -41.731 -42.071 -42.487 -42.948 -43.423 -44.406 -9 ,5000 ,TETRA ,17590766,Sat Nov 27 21:38:15 CET,Sat Nov 27 23:31:57 CET,0.0 0.68 1.034 1.302 1.511 1.678 1.815 1.932 2.15 2.256 2.357 2.106 2.607 2.699 2.869 3.021 3.151 3.208 3.306 3.388 3.492 3.552 3.614 3.695 3.759 3.808 3.85 3.891 3.945 3.998 4.042 4.084 4.105 4.115 4.133 4.125 4.102 4.059 3.984 3.877 3.739 3.566 3.314 3.003 2.557 1.981 1.209 0.131 -1.4 -3.587 -7.041 -10.99 -14.124 -16.664 -18.763 -20.629 -22.214 -23.552 -24.737 -25.931 -26.895 -27.735 -28.531 -29.299 -30.001 -30.617 -31.253 -31.843 -32.358 -32.869 -33.408 -33.857 -34.324 -34.802 -35.17 -35.574 -35.974 -36.355 -36.772 -37.077 -37.368 -37.818 -38.144 -38.482 -38.657 -39.006 -39.366 -39.738 -39.936 -40.608 -40.556 -40.772 -41.018 -41.592 -41.908 -42.23 -42.566 -42.938 -43.397 -44.034 -45.617 -10 ,32023 ,TETRA ,17590767,Sat Nov 27 21:38:14 CET,Sat Nov 27 23:32:50 CET,0.0 0.798 1.148 1.393 1.572 1.728 1.873 1.992 2.216 2.338 2.456 2.24 2.744 2.826 2.973 3.1 3.21 3.269 3.39 3.484 3.593 3.671 3.754 3.858 3.943 4.017 4.089 4.159 4.243 4.317 4.381 4.438 4.472 4.497 4.512 4.496 4.451 4.389 4.307 4.196 4.06 3.891 3.655 3.383 2.984 2.422 1.659 0.6 -0.911 -3.118 -6.657 -10.643 -13.765 -16.326 -18.45 -20.287 -21.845 -23.236 -24.423 -25.572 -26.509 -27.336 -28.14 -28.897 -29.591 -30.193 -30.816 -31.372 -31.856 -32.363 -32.882 -33.308 -33.76 -34.222 -34.582 -34.958 -35.335 -35.728 -36.143 -36.439 -36.749 -37.226 -37.552 -37.884 -38.055 -38.42 -38.791 -39.158 -39.352 -40.016 -39.967 -40.196 -40.439 -40.987 -41.276 -41.571 -41.918 -42.314 -42.745 -43.335 -44.822 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_29_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_29_30.txt deleted file mode 100644 index f1c12aa0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_29_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30497 ,TETRA ,17590768,Sat Nov 27 21:38:14 CET,Sat Nov 27 23:34:14 CET,0.0 0.33 0.574 0.798 0.986 1.144 1.292 1.437 1.741 1.887 2.024 1.865 2.405 2.516 2.728 2.93 3.125 3.221 3.405 3.586 3.843 4.004 4.163 4.382 4.589 4.795 4.992 5.181 5.431 5.684 5.927 6.207 6.475 6.737 7.035 7.362 7.687 8.049 8.431 8.849 9.293 9.768 10.313 10.886 11.545 12.256 13.089 14.019 14.984 16.001 17.024 17.55 17.672 17.563 17.312 17.031 16.741 16.441 16.156 15.838 15.534 15.233 14.937 14.653 14.391 14.15 13.883 13.624 13.397 13.171 12.918 12.702 12.478 12.233 12.044 11.854 11.638 11.403 11.175 11.016 10.839 10.56 10.371 10.175 10.078 9.858 9.604 9.338 9.2 8.657 8.753 8.589 8.419 8.042 7.815 7.56 7.291 6.995 6.606 6.061 4.557 -2 ,5047 ,TETRA ,17590769,Sat Nov 27 21:38:14 CET,Sat Nov 27 23:32:27 CET,0.0 0.523 0.823 1.079 1.297 1.481 1.645 1.799 2.099 2.24 2.381 2.22 2.76 2.884 3.114 3.318 3.506 3.596 3.773 3.946 4.182 4.336 4.487 4.699 4.906 5.107 5.304 5.502 5.737 5.952 6.173 6.448 6.707 6.968 7.285 7.633 7.932 8.249 8.605 8.985 9.382 9.825 10.346 10.872 11.482 12.179 12.964 13.787 14.65 15.58 16.562 17.132 17.282 17.193 17.021 16.814 16.555 16.276 16.008 15.721 15.472 15.223 14.971 14.738 14.512 14.285 14.026 13.787 13.584 13.38 13.166 12.978 12.778 12.566 12.403 12.24 12.06 11.855 11.632 11.483 11.334 11.094 10.923 10.741 10.648 10.456 10.246 10.031 9.924 9.405 9.535 9.378 9.207 8.81 8.597 8.371 8.103 7.794 7.406 6.869 5.322 -3 ,26109 ,TETRA ,17590770,Sat Nov 27 21:38:14 CET,Sat Nov 27 23:32:11 CET,0.0 0.321 0.539 0.77 0.969 1.132 1.283 1.432 1.729 1.874 2.007 1.821 2.347 2.456 2.674 2.867 3.039 3.125 3.302 3.463 3.692 3.843 3.987 4.189 4.386 4.579 4.763 4.945 5.198 5.446 5.676 5.959 6.241 6.503 6.811 7.151 7.466 7.829 8.218 8.613 9.033 9.494 10.008 10.53 11.122 11.794 12.565 13.381 14.293 15.336 16.415 17.004 17.114 17.028 16.876 16.697 16.497 16.277 16.055 15.804 15.573 15.354 15.125 14.911 14.701 14.49 14.26 14.042 13.852 13.644 13.421 13.24 13.037 12.823 12.667 12.499 12.315 12.102 11.866 11.712 11.562 11.321 11.142 10.961 10.867 10.66 10.446 10.218 10.095 9.541 9.623 9.459 9.291 8.9 8.677 8.433 8.179 7.897 7.507 6.995 5.856 -4 ,11406 ,TETRA ,17590771,Sat Nov 27 21:38:14 CET,Sat Nov 27 23:35:37 CET,0.0 0.596 0.852 1.063 1.266 1.451 1.62 1.786 2.092 2.224 2.339 2.15 2.681 2.789 3.006 3.202 3.385 3.474 3.653 3.828 4.072 4.23 4.387 4.612 4.83 5.038 5.249 5.461 5.724 5.967 6.2 6.471 6.727 6.963 7.232 7.55 7.872 8.218 8.583 8.964 9.355 9.792 10.322 10.863 11.443 12.072 12.8 13.609 14.507 15.463 16.501 17.13 17.291 17.246 17.119 16.947 16.726 16.451 16.182 15.932 15.715 15.502 15.268 15.028 14.78 14.551 14.324 14.121 13.948 13.758 13.554 13.378 13.186 12.98 12.82 12.649 12.458 12.259 12.054 11.902 11.733 11.469 11.275 11.069 10.963 10.747 10.521 10.263 10.119 9.581 9.714 9.556 9.392 9.012 8.804 8.573 8.329 8.015 7.604 7.063 5.787 -5 ,20761 ,TETRA ,17590772,Sat Nov 27 21:39:10 CET,Sat Nov 27 23:34:26 CET,0.0 0.581 0.852 1.074 1.271 1.45 1.615 1.777 2.046 2.162 2.28 2.097 2.633 2.75 2.965 3.172 3.366 3.452 3.621 3.791 4.031 4.185 4.344 4.583 4.805 5.014 5.206 5.384 5.615 5.847 6.073 6.344 6.617 6.877 7.154 7.459 7.75 8.084 8.456 8.837 9.227 9.672 10.198 10.711 11.32 11.995 12.743 13.561 14.466 15.462 16.468 17.041 17.165 17.112 16.98 16.785 16.562 16.328 16.11 15.861 15.628 15.398 15.168 14.941 14.718 14.515 14.299 14.102 13.919 13.727 13.521 13.339 13.142 12.937 12.779 12.607 12.443 12.271 12.078 11.942 11.799 11.556 11.382 11.207 11.115 10.917 10.713 10.496 10.37 9.83 9.939 9.766 9.585 9.207 8.983 8.723 8.453 8.158 7.785 7.262 5.242 -6 ,19609 ,TETRA ,17590773,Sat Nov 27 21:39:11 CET,Sat Nov 27 23:33:50 CET,0.0 0.378 0.594 0.79 0.977 1.158 1.33 1.485 1.774 1.905 2.029 1.849 2.371 2.477 2.699 2.912 3.103 3.194 3.387 3.565 3.811 3.977 4.133 4.353 4.574 4.792 4.994 5.181 5.435 5.675 5.895 6.173 6.435 6.69 6.978 7.277 7.576 7.916 8.282 8.662 9.066 9.518 10.03 10.552 11.164 11.9 12.707 13.482 14.421 15.512 16.627 17.348 17.554 17.507 17.362 17.143 16.898 16.656 16.435 16.212 15.988 15.756 15.522 15.289 15.045 14.825 14.601 14.398 14.23 14.036 13.812 13.63 13.437 13.206 13.026 12.851 12.659 12.454 12.25 12.112 11.952 11.687 11.501 11.302 11.191 10.936 10.668 10.398 10.264 9.712 9.781 9.616 9.446 9.054 8.816 8.563 8.283 7.945 7.549 7.044 5.748 -7 ,10323 ,TETRA ,17590774,Sat Nov 27 21:39:11 CET,Sat Nov 27 23:35:19 CET,0.0 0.603 0.87 1.075 1.269 1.453 1.622 1.778 2.062 2.196 2.323 2.134 2.661 2.763 2.96 3.152 3.338 3.426 3.595 3.767 4.031 4.198 4.342 4.539 4.733 4.924 5.117 5.306 5.539 5.757 5.966 6.234 6.497 6.741 7.029 7.358 7.661 8.009 8.399 8.796 9.187 9.625 10.115 10.609 11.237 11.95 12.737 13.555 14.454 15.461 16.479 17.064 17.209 17.17 17.05 16.863 16.633 16.388 16.143 15.852 15.588 15.345 15.1 14.857 14.64 14.446 14.216 14.005 13.828 13.637 13.419 13.235 13.049 12.852 12.689 12.527 12.356 12.174 11.979 11.839 11.699 11.466 11.295 11.129 11.039 10.826 10.591 10.328 10.18 9.623 9.727 9.569 9.4 9.025 8.824 8.612 8.369 8.063 7.687 7.178 5.269 -8 ,27072 ,TETRA ,17590775,Sat Nov 27 21:39:11 CET,Sat Nov 27 23:33:10 CET,0.0 0.473 0.738 0.971 1.159 1.327 1.478 1.623 1.894 2.018 2.134 1.93 2.457 2.566 2.777 2.973 3.149 3.242 3.438 3.641 3.93 4.099 4.267 4.509 4.736 4.956 5.175 5.392 5.656 5.905 6.161 6.453 6.718 6.978 7.28 7.62 7.938 8.284 8.668 9.081 9.51 9.996 10.58 11.163 11.835 12.556 13.346 14.222 15.169 16.163 17.191 17.803 17.94 17.805 17.608 17.399 17.137 16.851 16.532 16.167 15.871 15.602 15.323 15.052 14.787 14.539 14.268 14.03 13.825 13.594 13.361 13.159 12.938 12.714 12.542 12.36 12.165 11.955 11.716 11.547 11.377 11.088 10.891 10.707 10.612 10.406 10.173 9.93 9.804 9.261 9.358 9.19 9.022 8.633 8.396 8.141 7.871 7.584 7.2 6.636 4.736 -9 ,14486 ,TETRA ,17590776,Sat Nov 27 21:39:11 CET,Sat Nov 27 23:35:12 CET,0.0 0.807 1.132 1.405 1.636 1.818 1.984 2.143 2.435 2.58 2.715 2.545 3.087 3.204 3.435 3.649 3.832 3.921 4.093 4.249 4.483 4.642 4.811 5.055 5.264 5.46 5.654 5.856 6.116 6.345 6.566 6.849 7.118 7.372 7.658 7.98 8.296 8.621 8.989 9.396 9.808 10.288 10.831 11.333 11.906 12.582 13.382 14.21 15.085 16.058 17.114 17.734 17.877 17.833 17.694 17.507 17.29 17.034 16.777 16.493 16.254 16.03 15.77 15.496 15.258 15.047 14.805 14.597 14.414 14.206 13.989 13.81 13.606 13.39 13.231 13.072 12.892 12.693 12.505 12.372 12.229 12.004 11.84 11.671 11.58 11.366 11.123 10.88 10.764 10.232 10.348 10.182 9.989 9.583 9.368 9.132 8.851 8.502 8.094 7.613 6.365 -10 ,1665 ,TETRA ,17590777,Sat Nov 27 21:39:11 CET,Sat Nov 27 23:33:51 CET,0.0 0.599 0.866 1.068 1.261 1.443 1.599 1.744 1.994 2.117 2.245 2.068 2.6 2.701 2.903 3.107 3.308 3.408 3.595 3.773 4.019 4.174 4.337 4.577 4.796 4.994 5.184 5.377 5.626 5.85 6.07 6.343 6.613 6.874 7.165 7.487 7.793 8.141 8.511 8.889 9.291 9.751 10.302 10.839 11.444 12.115 12.866 13.665 14.529 15.498 16.505 17.059 17.2 17.141 16.97 16.74 16.48 16.244 16.035 15.777 15.527 15.308 15.098 14.887 14.671 14.456 14.236 14.028 13.838 13.644 13.442 13.26 13.066 12.883 12.736 12.58 12.415 12.221 12.02 11.883 11.738 11.51 11.351 11.172 11.07 10.869 10.663 10.441 10.322 9.79 9.898 9.732 9.564 9.185 8.973 8.745 8.498 8.22 7.843 7.32 6.056 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_30_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_30_1h1s.txt deleted file mode 100644 index 18b34734..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_30_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30586 ,TETRA ,17590778,Sat Nov 27 21:39:11 CET,Sat Nov 27 23:34:49 CET,0.0 0.762 1.063 1.287 1.478 1.6 1.696 1.786 1.927 1.981 2.016 1.666 2.097 2.118 2.14 2.149 2.162 2.166 2.153 2.127 2.084 2.051 2.015 1.956 1.892 1.821 1.748 1.666 1.527 1.367 1.2 0.988 0.759 0.517 0.217 -0.163 -0.557 -1.009 -1.539 -2.15 -2.849 -3.705 -4.782 -5.954 -7.458 -9.318 -11.663 -14.643 -18.718 -24.413 -32.89 -41.844 -48.531 -53.831 -58.124 -61.761 -64.782 -67.389 -69.555 -71.631 -73.333 -74.825 -76.207 -77.465 -78.617 -79.647 -80.709 -81.633 -82.416 -83.227 -84.051 -84.71 -85.385 -86.08 -86.607 -87.135 -87.674 -88.24 -88.814 -89.193 -89.576 -90.157 -90.563 -90.984 -91.197 -91.636 -92.086 -92.55 -92.788 -93.548 -93.546 -93.814 -94.092 -94.666 -94.963 -95.271 -95.668 -96.161 -96.653 -97.298 -98.626 -2 ,20351 ,TETRA ,17590779,Sat Nov 27 21:40:13 CET,Sat Nov 27 23:34:18 CET,0.0 0.88 1.192 1.413 1.568 1.692 1.8 1.892 2.053 2.114 2.154 1.827 2.274 2.307 2.371 2.42 2.448 2.462 2.478 2.469 2.437 2.412 2.386 2.336 2.265 2.177 2.083 1.994 1.873 1.728 1.566 1.367 1.163 0.935 0.646 0.307 -0.044 -0.471 -0.992 -1.614 -2.315 -3.157 -4.228 -5.41 -6.929 -8.786 -11.174 -14.237 -18.352 -24.041 -32.46 -41.438 -48.199 -53.519 -57.77 -61.373 -64.39 -67.006 -69.139 -71.172 -72.951 -74.517 -75.928 -77.209 -78.386 -79.437 -80.506 -81.445 -82.236 -83.038 -83.865 -84.541 -85.222 -85.924 -86.468 -87.006 -87.548 -88.118 -88.7 -89.094 -89.501 -90.109 -90.514 -90.932 -91.146 -91.576 -92.023 -92.499 -92.742 -93.509 -93.51 -93.767 -94.043 -94.655 -94.97 -95.309 -95.704 -96.138 -96.593 -97.171 -98.376 -3 ,1564 ,TETRA ,17590780,Sat Nov 27 21:40:14 CET,Sat Nov 27 23:34:50 CET,0.0 0.712 1.021 1.22 1.384 1.512 1.624 1.727 1.874 1.941 2.003 1.687 2.129 2.153 2.198 2.238 2.245 2.249 2.265 2.269 2.25 2.219 2.185 2.141 2.077 2.003 1.919 1.817 1.692 1.564 1.421 1.231 1.025 0.799 0.516 0.168 -0.193 -0.622 -1.137 -1.738 -2.401 -3.195 -4.229 -5.401 -6.891 -8.707 -11.036 -14.013 -18.003 -23.559 -31.95 -40.881 -47.646 -53.046 -57.371 -61.012 -64.046 -66.709 -68.959 -71.092 -72.871 -74.403 -75.809 -77.096 -78.239 -79.269 -80.339 -81.271 -82.066 -82.874 -83.694 -84.38 -85.082 -85.793 -86.335 -86.884 -87.443 -87.996 -88.565 -88.976 -89.391 -89.999 -90.415 -90.856 -91.083 -91.545 -92.024 -92.505 -92.761 -93.547 -93.6 -93.939 -94.317 -95.121 -95.548 -95.964 -96.402 -96.904 -97.477 -98.203 -99.571 -4 ,30933 ,TETRA ,17590781,Sat Nov 27 21:40:14 CET,Sat Nov 27 23:34:24 CET,0.0 0.722 1.06 1.314 1.521 1.658 1.778 1.885 2.033 2.092 2.148 1.823 2.265 2.301 2.34 2.356 2.367 2.374 2.389 2.392 2.367 2.337 2.295 2.229 2.166 2.094 2.011 1.925 1.794 1.649 1.498 1.281 1.032 0.785 0.489 0.128 -0.223 -0.655 -1.172 -1.756 -2.429 -3.262 -4.332 -5.506 -7.0 -8.836 -11.21 -14.245 -18.321 -23.935 -32.351 -41.33 -48.06 -53.411 -57.729 -61.348 -64.336 -66.957 -69.136 -71.213 -72.948 -74.435 -75.808 -77.06 -78.197 -79.21 -80.234 -81.131 -81.898 -82.689 -83.495 -84.148 -84.818 -85.517 -86.065 -86.612 -87.155 -87.722 -88.298 -88.685 -89.076 -89.663 -90.058 -90.469 -90.685 -91.144 -91.602 -92.065 -92.315 -93.081 -93.087 -93.353 -93.625 -94.22 -94.546 -94.896 -95.269 -95.657 -96.073 -96.651 -98.082 -5 ,2400 ,TETRA ,17590782,Sat Nov 27 21:40:14 CET,Sat Nov 27 23:32:16 CET,0.0 0.741 1.024 1.204 1.364 1.498 1.622 1.742 1.916 1.981 2.036 1.713 2.142 2.147 2.164 2.176 2.172 2.186 2.208 2.19 2.173 2.153 2.112 2.042 1.959 1.88 1.793 1.695 1.553 1.399 1.246 1.031 0.809 0.577 0.285 -0.077 -0.467 -0.915 -1.433 -2.032 -2.707 -3.515 -4.567 -5.749 -7.268 -9.126 -11.477 -14.473 -18.563 -24.255 -32.709 -41.74 -48.6 -53.968 -58.226 -61.799 -64.771 -67.343 -69.503 -71.593 -73.314 -74.825 -76.237 -77.501 -78.64 -79.665 -80.712 -81.639 -82.432 -83.226 -84.04 -84.707 -85.369 -86.045 -86.569 -87.102 -87.644 -88.203 -88.768 -89.185 -89.69 -90.519 -91.089 -91.663 -91.944 -92.528 -93.118 -93.713 -94.028 -94.916 -95.022 -95.37 -95.717 -96.451 -96.841 -97.267 -97.718 -98.254 -98.91 -99.734 -101.508 -6 ,25094 ,TETRA ,17590783,Sat Nov 27 21:41:12 CET,Sat Nov 27 23:34:22 CET,0.0 0.574 0.865 1.028 1.171 1.314 1.429 1.523 1.671 1.725 1.777 1.454 1.885 1.909 1.952 1.963 1.95 1.95 1.955 1.952 1.944 1.923 1.883 1.813 1.72 1.621 1.527 1.43 1.282 1.116 0.952 0.74 0.514 0.273 -0.032 -0.392 -0.762 -1.21 -1.746 -2.362 -3.055 -3.885 -4.922 -6.063 -7.584 -9.481 -11.877 -14.934 -19.039 -24.744 -33.246 -42.228 -48.948 -54.174 -58.381 -62.02 -65.068 -67.706 -69.899 -72.026 -73.807 -75.37 -76.834 -78.156 -79.337 -80.381 -81.458 -82.392 -83.177 -83.975 -84.77 -85.428 -86.224 -87.162 -87.891 -88.642 -89.42 -90.198 -90.973 -91.492 -92.023 -92.836 -93.383 -93.951 -94.239 -94.826 -95.438 -96.077 -96.408 -97.303 -97.422 -97.779 -98.153 -98.954 -99.416 -99.895 -100.336 -100.814 -101.381 -102.068 -103.121 -7 ,26101 ,TETRA ,17590784,Sat Nov 27 21:41:14 CET,Sat Nov 27 23:34:48 CET,0.0 1.002 1.381 1.649 1.839 1.966 2.063 2.155 2.301 2.344 2.378 2.055 2.493 2.509 2.529 2.546 2.551 2.551 2.545 2.534 2.528 2.513 2.479 2.417 2.372 2.326 2.257 2.168 2.037 1.908 1.761 1.551 1.349 1.125 0.828 0.46 0.071 -0.37 -0.893 -1.512 -2.211 -3.062 -4.167 -5.391 -6.918 -8.786 -11.204 -14.251 -18.281 -23.904 -32.365 -41.431 -48.182 -53.472 -57.73 -61.374 -64.414 -66.987 -69.143 -71.246 -72.99 -74.474 -75.833 -77.095 -78.249 -79.293 -80.369 -81.309 -82.088 -82.853 -83.644 -84.31 -85.004 -85.715 -86.254 -86.801 -87.345 -87.889 -88.449 -88.838 -89.229 -89.82 -90.244 -90.681 -90.902 -91.354 -91.811 -92.293 -92.537 -93.305 -93.307 -93.567 -93.843 -94.427 -94.742 -95.092 -95.477 -95.853 -96.249 -96.744 -97.814 -8 ,2692 ,TETRA ,17590785,Sat Nov 27 21:41:12 CET,Sat Nov 27 23:35:02 CET,0.0 0.815 1.145 1.358 1.502 1.62 1.724 1.822 1.978 2.033 2.073 1.736 2.167 2.188 2.248 2.306 2.34 2.355 2.371 2.381 2.369 2.34 2.309 2.235 2.157 2.079 1.974 1.862 1.723 1.568 1.388 1.169 0.948 0.725 0.46 0.106 -0.291 -0.755 -1.289 -1.899 -2.592 -3.439 -4.504 -5.686 -7.183 -9.031 -11.428 -14.487 -18.594 -24.244 -32.741 -41.792 -48.518 -53.875 -58.199 -61.799 -64.76 -67.303 -69.462 -71.562 -73.278 -74.749 -76.115 -77.386 -78.538 -79.567 -80.623 -81.541 -82.301 -83.068 -83.856 -84.501 -85.18 -85.88 -86.412 -86.948 -87.494 -88.055 -88.62 -89.036 -89.481 -90.163 -90.643 -91.134 -91.384 -91.901 -92.421 -92.968 -93.253 -94.049 -94.118 -94.421 -94.725 -95.44 -95.886 -96.399 -96.934 -97.507 -98.184 -99.036 -101.111 -9 ,10017 ,TETRA ,17590786,Sat Nov 27 21:41:11 CET,Sat Nov 27 23:34:23 CET,0.0 0.762 1.078 1.289 1.422 1.554 1.698 1.815 1.994 2.059 2.115 1.814 2.261 2.292 2.309 2.322 2.345 2.352 2.344 2.321 2.284 2.25 2.211 2.139 2.053 1.973 1.895 1.802 1.654 1.511 1.357 1.135 0.918 0.689 0.383 0.014 -0.331 -0.692 -1.157 -1.763 -2.459 -3.3 -4.372 -5.557 -7.069 -8.945 -11.37 -14.402 -18.453 -24.073 -32.494 -41.484 -48.196 -53.503 -57.814 -61.488 -64.527 -67.112 -69.247 -71.291 -73.024 -74.525 -75.901 -77.166 -78.3 -79.314 -80.368 -81.294 -82.07 -82.854 -83.65 -84.297 -84.953 -85.628 -86.147 -86.674 -87.206 -87.759 -88.324 -88.695 -89.081 -89.684 -90.104 -90.535 -90.749 -91.173 -91.616 -92.085 -92.33 -93.102 -93.112 -93.418 -93.76 -94.539 -94.987 -95.466 -95.986 -96.577 -97.235 -98.025 -99.483 -10 ,12009 ,TETRA ,17590787,Sat Nov 27 21:41:14 CET,Sat Nov 27 23:34:43 CET,0.0 0.678 0.997 1.214 1.367 1.494 1.612 1.715 1.856 1.918 1.973 1.663 2.115 2.144 2.157 2.164 2.169 2.165 2.149 2.133 2.102 2.08 2.049 1.984 1.924 1.85 1.752 1.67 1.569 1.432 1.266 1.046 0.824 0.585 0.283 -0.07 -0.445 -0.89 -1.409 -2.015 -2.716 -3.565 -4.648 -5.852 -7.346 -9.201 -11.59 -14.609 -18.729 -24.425 -32.839 -41.827 -48.567 -53.858 -58.161 -61.765 -64.695 -67.233 -69.409 -71.539 -73.288 -74.773 -76.165 -77.452 -78.598 -79.621 -80.664 -81.591 -82.397 -83.203 -84.015 -84.682 -85.353 -86.06 -86.613 -87.171 -87.745 -88.319 -88.888 -89.261 -89.648 -90.26 -90.676 -91.099 -91.31 -91.759 -92.223 -92.683 -92.922 -93.693 -93.744 -94.037 -94.331 -94.969 -95.287 -95.629 -96.02 -96.46 -96.975 -97.589 -98.878 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_30_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_30_26.txt deleted file mode 100644 index 75e235d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_30_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4363 ,KEBNE ,17070616,Fri Dec 24 21:00:14 CET,Fri Dec 24 22:38:13 CET,0.0 1.122 1.623 2.048 2.455 2.801 3.111 3.402 3.943 4.201 4.447 4.506 5.151 5.383 5.816 6.243 6.66 6.866 7.267 7.665 8.249 8.614 8.972 9.504 10.029 10.537 11.042 11.545 12.187 12.822 13.451 14.218 14.971 15.71 16.582 17.572 18.531 19.602 20.79 22.064 23.44 25.073 27.016 29.014 31.422 34.235 37.605 41.509 46.33 52.472 60.652 68.277 73.338 76.92 79.537 81.558 83.106 84.326 85.298 86.165 86.807 87.341 87.809 88.184 88.486 88.739 88.989 89.184 89.326 89.464 89.578 89.642 89.693 89.734 89.758 89.768 89.767 89.755 89.737 89.723 89.689 89.62 89.566 89.498 89.462 89.388 89.295 89.18 89.101 88.699 88.804 88.712 88.634 88.418 88.275 88.104 87.903 87.647 87.296 86.849 85.612 -2 ,5394 ,KEBNE ,17070617,Fri Dec 24 21:01:17 CET,Fri Dec 24 22:37:09 CET,0.0 1.249 1.839 2.304 2.698 3.059 3.39 3.694 4.254 4.527 4.787 4.855 5.489 5.728 6.176 6.581 6.978 7.174 7.556 7.936 8.493 8.847 9.201 9.732 10.257 10.781 11.304 11.813 12.484 13.126 13.747 14.503 15.248 15.975 16.827 17.819 18.785 19.863 21.058 22.36 23.74 25.339 27.275 29.286 31.704 34.509 37.898 41.901 46.868 53.105 61.31 68.896 73.852 77.342 79.947 81.981 83.532 84.751 85.684 86.522 87.171 87.703 88.151 88.531 88.843 89.109 89.359 89.545 89.69 89.826 89.946 90.021 90.074 90.134 90.178 90.21 90.238 90.251 90.24 90.226 90.2 90.148 90.104 90.049 90.022 89.962 89.891 89.802 89.742 89.369 89.54 89.454 89.361 89.131 88.978 88.795 88.56 88.288 87.998 87.545 86.079 -3 ,27682 ,KEBNE ,17070618,Fri Dec 24 21:01:18 CET,Fri Dec 24 22:39:03 CET,0.0 0.949 1.465 1.904 2.301 2.637 2.931 3.216 3.767 4.028 4.284 4.372 5.004 5.221 5.664 6.105 6.517 6.715 7.099 7.469 8.018 8.376 8.723 9.233 9.727 10.218 10.704 11.184 11.83 12.465 13.088 13.847 14.579 15.297 16.152 17.135 18.104 19.179 20.369 21.67 23.07 24.673 26.588 28.6 31.026 33.839 37.213 41.181 46.053 52.225 60.477 68.071 73.06 76.595 79.173 81.176 82.709 83.936 84.889 85.746 86.403 86.926 87.356 87.704 88.005 88.264 88.495 88.653 88.766 88.881 88.99 89.056 89.113 89.161 89.175 89.179 89.185 89.166 89.14 89.119 89.084 89.024 88.971 88.895 88.854 88.775 88.682 88.575 88.521 88.156 88.291 88.19 88.095 87.843 87.694 87.542 87.35 87.078 86.728 86.248 84.766 -4 ,22515 ,KEBNE ,17070619,Fri Dec 24 21:01:18 CET,Fri Dec 24 22:39:20 CET,0.0 0.882 1.419 1.836 2.202 2.55 2.881 3.199 3.783 4.044 4.301 4.404 5.047 5.275 5.729 6.168 6.583 6.785 7.178 7.554 8.112 8.473 8.828 9.362 9.883 10.387 10.879 11.374 12.037 12.684 13.312 14.064 14.79 15.505 16.358 17.36 18.332 19.408 20.605 21.893 23.273 24.879 26.82 28.834 31.241 34.023 37.372 41.35 46.299 52.461 60.582 68.095 73.001 76.521 79.124 81.136 82.676 83.904 84.857 85.717 86.371 86.882 87.304 87.644 87.962 88.241 88.483 88.663 88.805 88.93 89.026 89.098 89.165 89.214 89.249 89.276 89.288 89.286 89.25 89.221 89.2 89.152 89.1 89.04 89.01 88.941 88.862 88.762 88.707 88.331 88.487 88.397 88.296 88.071 87.928 87.75 87.545 87.311 87.025 86.556 84.897 -5 ,25640 ,KEBNE ,17070620,Fri Dec 24 21:02:20 CET,Fri Dec 24 22:38:42 CET,0.0 0.782 1.25 1.647 1.997 2.341 2.667 2.96 3.508 3.771 4.025 4.112 4.757 4.988 5.435 5.859 6.272 6.481 6.885 7.269 7.83 8.191 8.547 9.073 9.597 10.105 10.583 11.062 11.699 12.323 12.942 13.693 14.416 15.136 15.995 16.962 17.914 18.993 20.167 21.46 22.877 24.485 26.43 28.451 30.829 33.602 37.003 41.012 45.924 52.141 60.346 67.88 72.826 76.308 78.881 80.899 82.43 83.648 84.567 85.366 85.992 86.512 86.969 87.358 87.686 87.957 88.213 88.406 88.546 88.664 88.763 88.834 88.9 88.957 88.995 89.031 89.062 89.082 89.074 89.052 89.02 88.968 88.934 88.888 88.854 88.794 88.717 88.608 88.557 88.181 88.335 88.268 88.19 87.959 87.806 87.633 87.428 87.188 86.893 86.471 85.316 -6 ,5273 ,KEBNE ,17070621,Fri Dec 24 21:02:20 CET,Fri Dec 24 22:40:42 CET,0.0 0.931 1.476 1.96 2.367 2.73 3.056 3.347 3.875 4.12 4.373 4.463 5.102 5.327 5.76 6.173 6.587 6.79 7.177 7.561 8.117 8.481 8.844 9.352 9.86 10.379 10.884 11.376 12.029 12.661 13.267 14.017 14.774 15.523 16.395 17.381 18.35 19.441 20.641 21.943 23.332 24.945 26.898 28.894 31.288 34.091 37.435 41.353 46.195 52.314 60.448 67.986 72.992 76.563 79.147 81.134 82.631 83.804 84.727 85.565 86.209 86.729 87.19 87.564 87.844 88.088 88.336 88.524 88.639 88.735 88.824 88.87 88.924 88.961 88.965 88.978 88.999 89.002 88.991 88.98 88.957 88.889 88.827 88.763 88.728 88.65 88.554 88.435 88.373 88.001 88.172 88.093 87.999 87.736 87.552 87.352 87.146 86.898 86.587 86.157 84.219 -7 ,3864 ,KEBNE ,17070622,Fri Dec 24 21:03:24 CET,Fri Dec 24 22:39:16 CET,0.0 0.866 1.417 1.868 2.259 2.619 2.939 3.25 3.846 4.116 4.375 4.459 5.091 5.31 5.732 6.13 6.527 6.728 7.128 7.517 8.066 8.416 8.763 9.28 9.786 10.28 10.77 11.26 11.903 12.53 13.126 13.856 14.596 15.319 16.16 17.126 18.075 19.148 20.33 21.611 22.985 24.584 26.527 28.546 30.963 33.756 37.117 41.053 45.964 52.261 60.604 68.245 73.274 76.805 79.354 81.338 82.861 84.07 85.003 85.849 86.507 87.033 87.486 87.878 88.207 88.468 88.715 88.904 89.039 89.173 89.296 89.389 89.472 89.531 89.559 89.566 89.557 89.558 89.544 89.515 89.482 89.414 89.344 89.266 89.226 89.136 89.042 88.922 88.854 88.48 88.621 88.518 88.409 88.135 87.982 87.816 87.6 87.356 87.042 86.569 85.132 -8 ,19511 ,KEBNE ,17070623,Fri Dec 24 21:02:21 CET,Fri Dec 24 22:39:58 CET,0.0 1.303 1.842 2.321 2.752 3.121 3.463 3.783 4.372 4.647 4.902 4.992 5.645 5.879 6.334 6.778 7.194 7.394 7.792 8.181 8.743 9.108 9.461 9.968 10.473 10.975 11.471 11.965 12.609 13.238 13.847 14.581 15.298 16.003 16.843 17.811 18.76 19.828 21.005 22.286 23.683 25.329 27.303 29.319 31.765 34.594 37.924 41.885 46.836 53.052 61.229 68.809 73.779 77.311 79.923 81.93 83.439 84.633 85.55 86.371 87.017 87.543 87.989 88.372 88.695 88.962 89.214 89.414 89.563 89.695 89.811 89.893 89.939 89.94 89.917 89.881 89.826 89.756 89.688 89.63 89.566 89.44 89.327 89.202 89.137 89.004 88.854 88.669 88.566 88.137 88.172 88.035 87.893 87.57 87.411 87.252 87.069 86.837 86.564 86.198 84.713 -9 ,17368 ,KEBNE ,17070624,Fri Dec 24 21:02:21 CET,Fri Dec 24 22:39:35 CET,0.0 0.952 1.539 2.009 2.407 2.761 3.083 3.394 3.957 4.223 4.476 4.547 5.184 5.412 5.857 6.301 6.722 6.916 7.3 7.679 8.224 8.58 8.93 9.436 9.934 10.425 10.899 11.368 12.006 12.64 13.253 13.997 14.735 15.461 16.298 17.258 18.212 19.286 20.484 21.805 23.217 24.843 26.79 28.797 31.199 33.966 37.283 41.207 46.125 52.426 60.739 68.323 73.279 76.774 79.363 81.372 82.898 84.122 85.06 85.848 86.437 86.938 87.385 87.759 88.048 88.281 88.518 88.718 88.856 88.959 89.05 89.116 89.169 89.213 89.244 89.265 89.272 89.243 89.197 89.183 89.158 89.09 89.043 88.994 88.96 88.875 88.775 88.648 88.577 88.192 88.321 88.218 88.102 87.815 87.668 87.526 87.348 87.113 86.797 86.355 84.692 -10 ,26177 ,KEBNE ,17070625,Fri Dec 24 21:02:21 CET,Fri Dec 24 22:39:34 CET,0.0 0.809 1.302 1.734 2.145 2.511 2.842 3.14 3.704 3.974 4.231 4.312 4.95 5.177 5.61 6.028 6.428 6.62 7.009 7.4 7.952 8.3 8.657 9.182 9.683 10.189 10.698 11.185 11.829 12.476 13.1 13.862 14.616 15.346 16.191 17.153 18.109 19.185 20.357 21.634 23.023 24.639 26.58 28.614 31.067 33.873 37.231 41.192 46.083 52.316 60.583 68.176 73.098 76.591 79.211 81.206 82.719 83.938 84.881 85.722 86.367 86.909 87.375 87.745 88.05 88.304 88.555 88.751 88.887 89.024 89.158 89.23 89.281 89.339 89.371 89.386 89.398 89.389 89.372 89.349 89.314 89.273 89.246 89.196 89.162 89.097 89.029 88.944 88.885 88.502 88.657 88.567 88.466 88.229 88.082 87.916 87.721 87.485 87.203 86.779 85.299 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_30_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_30_31.txt deleted file mode 100644 index 84db8fb7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_30_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32519 ,TETRA ,17590788,Sat Nov 27 21:41:12 CET,Sat Nov 27 23:33:32 CET,0.0 1.003 1.427 1.809 2.133 2.395 2.667 2.956 3.484 3.697 3.887 3.866 4.469 4.663 5.025 5.357 5.676 5.83 6.126 6.426 6.862 7.134 7.399 7.786 8.174 8.556 8.924 9.285 9.76 10.226 10.67 11.171 11.649 12.123 12.675 13.323 13.967 14.705 15.546 16.447 17.394 18.469 19.714 20.968 22.463 24.192 26.316 28.864 31.938 35.698 40.573 44.945 47.665 49.476 50.695 51.602 52.286 52.819 53.2 53.467 53.636 53.822 54.02 54.166 54.271 54.334 54.378 54.401 54.402 54.406 54.408 54.397 54.367 54.296 54.224 54.153 54.083 54.012 53.941 53.886 53.82 53.718 53.649 53.542 53.471 53.347 53.222 53.075 52.991 52.551 52.699 52.594 52.48 52.21 52.063 51.89 51.67 51.404 51.077 50.601 49.064 -2 ,566 ,TETRA ,17590789,Sat Nov 27 21:41:13 CET,Sat Nov 27 23:34:30 CET,0.0 1.03 1.514 1.886 2.22 2.537 2.821 3.078 3.561 3.801 4.031 4.012 4.59 4.769 5.128 5.455 5.776 5.933 6.212 6.475 6.879 7.156 7.431 7.823 8.181 8.52 8.876 9.243 9.709 10.178 10.644 11.171 11.664 12.159 12.759 13.407 14.029 14.738 15.511 16.347 17.25 18.289 19.548 20.869 22.451 24.238 26.397 28.976 32.011 35.765 40.601 44.923 47.672 49.463 50.734 51.705 52.42 52.974 53.369 53.69 53.915 54.073 54.196 54.29 54.347 54.373 54.388 54.399 54.395 54.361 54.307 54.262 54.194 54.105 54.035 53.963 53.875 53.77 53.672 53.609 53.534 53.398 53.31 53.219 53.158 53.028 52.889 52.725 52.64 52.201 52.352 52.238 52.116 51.827 51.672 51.508 51.296 51.058 50.777 50.343 48.956 -3 ,14693 ,TETRA ,17590790,Sat Nov 27 21:41:13 CET,Sat Nov 27 23:37:56 CET,0.0 0.733 1.174 1.531 1.834 2.085 2.304 2.511 2.911 3.114 3.309 3.245 3.813 3.978 4.324 4.66 4.975 5.123 5.412 5.691 6.073 6.313 6.558 6.937 7.313 7.687 8.052 8.4 8.843 9.262 9.681 10.206 10.707 11.21 11.823 12.518 13.174 13.898 14.695 15.54 16.449 17.504 18.773 20.113 21.708 23.52 25.7 28.267 31.373 35.24 40.223 44.628 47.445 49.349 50.688 51.694 52.447 53.001 53.373 53.686 53.94 54.138 54.299 54.404 54.472 54.527 54.572 54.598 54.611 54.615 54.568 54.506 54.444 54.376 54.329 54.286 54.233 54.163 54.072 54.01 53.952 53.856 53.788 53.702 53.655 53.57 53.471 53.332 53.256 52.828 53.016 52.925 52.834 52.644 52.528 52.386 52.216 52.001 51.783 51.549 51.058 -4 ,31944 ,TETRA ,17590791,Sat Nov 27 21:41:13 CET,Sat Nov 27 23:34:17 CET,0.0 0.833 1.224 1.542 1.826 2.108 2.386 2.641 3.11 3.321 3.526 3.519 4.106 4.292 4.647 4.982 5.309 5.468 5.786 6.104 6.546 6.814 7.074 7.474 7.889 8.285 8.665 9.043 9.513 9.97 10.429 10.984 11.519 12.045 12.67 13.352 13.983 14.694 15.489 16.367 17.319 18.424 19.723 21.012 22.547 24.312 26.422 28.878 31.846 35.569 40.407 44.633 47.325 49.179 50.497 51.51 52.239 52.785 53.191 53.531 53.765 53.949 54.093 54.187 54.248 54.297 54.341 54.364 54.371 54.353 54.309 54.25 54.181 54.109 54.046 53.953 53.85 53.757 53.661 53.595 53.518 53.365 53.233 53.108 53.053 52.928 52.775 52.609 52.521 52.068 52.196 52.082 51.968 51.687 51.529 51.351 51.147 50.918 50.632 50.245 48.794 -5 ,9939 ,TETRA ,17590792,Sat Nov 27 21:42:14 CET,Sat Nov 27 23:39:58 CET,0.0 0.785 1.22 1.576 1.883 2.161 2.415 2.658 3.116 3.335 3.541 3.509 4.093 4.263 4.603 4.944 5.266 5.419 5.718 6.011 6.418 6.683 6.94 7.323 7.698 8.049 8.41 8.777 9.226 9.64 10.056 10.593 11.108 11.6 12.173 12.825 13.501 14.266 15.06 15.91 16.862 17.956 19.22 20.534 22.102 23.899 26.051 28.607 31.743 35.62 40.501 44.845 47.646 49.543 50.922 51.935 52.66 53.218 53.655 54.05 54.316 54.506 54.672 54.816 54.917 54.968 54.978 54.967 54.957 54.925 54.867 54.8 54.731 54.679 54.628 54.561 54.475 54.374 54.273 54.192 54.115 54.01 53.922 53.826 53.774 53.658 53.532 53.389 53.307 52.872 53.03 52.916 52.805 52.526 52.362 52.186 51.986 51.728 51.394 50.961 49.786 -6 ,24332 ,TETRA ,17590793,Sat Nov 27 21:42:13 CET,Sat Nov 27 23:34:36 CET,0.0 0.837 1.249 1.576 1.849 2.093 2.333 2.571 3.011 3.21 3.404 3.357 3.936 4.111 4.449 4.773 5.066 5.202 5.476 5.744 6.135 6.387 6.641 7.03 7.407 7.773 8.137 8.502 8.971 9.416 9.842 10.362 10.88 11.393 11.985 12.663 13.321 14.033 14.833 15.706 16.642 17.706 18.925 20.194 21.708 23.425 25.489 27.9 30.887 34.656 39.499 43.786 46.487 48.318 49.618 50.578 51.277 51.786 52.151 52.485 52.743 52.928 53.056 53.152 53.224 53.259 53.271 53.286 53.297 53.281 53.247 53.221 53.181 53.129 53.08 53.019 52.947 52.87 52.787 52.722 52.65 52.523 52.425 52.315 52.258 52.141 52.008 51.849 51.762 51.325 51.469 51.364 51.25 50.98 50.819 50.636 50.435 50.193 49.86 49.437 48.312 -7 ,8185 ,TETRA ,17590794,Sat Nov 27 21:42:14 CET,Sat Nov 27 23:34:21 CET,0.0 0.784 1.156 1.448 1.716 1.981 2.237 2.486 2.965 3.184 3.4 3.398 3.98 4.157 4.502 4.829 5.167 5.332 5.634 5.923 6.365 6.641 6.903 7.287 7.653 8.017 8.363 8.687 9.119 9.539 9.965 10.514 11.032 11.531 12.114 12.775 13.425 14.147 14.927 15.763 16.663 17.723 19.031 20.37 21.958 23.787 25.949 28.454 31.499 35.278 40.107 44.317 46.919 48.724 50.01 50.969 51.684 52.199 52.598 52.973 53.27 53.497 53.668 53.792 53.896 53.997 54.084 54.143 54.181 54.187 54.174 54.165 54.149 54.106 54.057 54.006 53.935 53.858 53.782 53.722 53.662 53.568 53.491 53.394 53.335 53.23 53.131 53.001 52.924 52.487 52.663 52.569 52.468 52.261 52.145 52.004 51.824 51.61 51.35 51.019 50.032 -8 ,8270 ,TETRA ,17590795,Sat Nov 27 21:42:16 CET,Sat Nov 27 23:34:13 CET,0.0 1.263 1.747 2.113 2.441 2.72 2.983 3.226 3.678 3.892 4.095 4.069 4.661 4.849 5.187 5.498 5.788 5.928 6.207 6.468 6.846 7.108 7.381 7.792 8.18 8.544 8.894 9.222 9.639 10.057 10.481 11.004 11.5 11.982 12.56 13.236 13.892 14.614 15.397 16.23 17.137 18.206 19.49 20.787 22.324 24.099 26.232 28.729 31.72 35.472 40.345 44.584 47.245 49.095 50.438 51.423 52.128 52.694 53.12 53.444 53.652 53.809 53.915 53.996 54.059 54.095 54.119 54.134 54.144 54.134 54.105 54.077 54.022 53.959 53.921 53.856 53.759 53.662 53.563 53.489 53.407 53.269 53.164 53.047 52.99 52.865 52.725 52.557 52.457 52.009 52.137 52.019 51.907 51.626 51.459 51.276 51.059 50.804 50.524 50.108 48.988 -9 ,4342 ,TETRA ,17590796,Sat Nov 27 21:43:13 CET,Sat Nov 27 23:35:04 CET,0.0 0.748 1.106 1.408 1.69 1.939 2.17 2.389 2.785 2.973 3.158 3.087 3.649 3.811 4.134 4.426 4.713 4.858 5.13 5.393 5.79 6.063 6.336 6.727 7.105 7.465 7.793 8.103 8.522 8.944 9.371 9.901 10.413 10.922 11.527 12.194 12.841 13.562 14.365 15.257 16.194 17.265 18.552 19.86 21.448 23.289 25.422 27.904 31.013 34.9 39.785 43.982 46.664 48.555 49.805 50.676 51.334 51.851 52.273 52.648 52.93 53.137 53.286 53.386 53.443 53.486 53.519 53.538 53.544 53.528 53.498 53.476 53.447 53.379 53.312 53.244 53.166 53.071 52.962 52.885 52.807 52.685 52.581 52.458 52.399 52.288 52.151 51.994 51.903 51.452 51.595 51.486 51.367 51.076 50.897 50.698 50.486 50.227 49.893 49.507 48.339 -10 ,22737 ,TETRA ,17590797,Sat Nov 27 21:44:11 CET,Sat Nov 27 23:36:16 CET,0.0 1.097 1.627 2.029 2.338 2.619 2.883 3.12 3.576 3.793 3.996 3.978 4.57 4.75 5.094 5.428 5.748 5.9 6.192 6.493 6.938 7.237 7.535 7.96 8.37 8.767 9.13 9.476 9.932 10.362 10.781 11.301 11.803 12.286 12.859 13.565 14.262 14.991 15.776 16.657 17.632 18.754 20.075 21.364 22.827 24.518 26.555 28.948 31.928 35.627 40.352 44.655 47.394 49.241 50.55 51.554 52.299 52.868 53.307 53.672 53.949 54.186 54.38 54.533 54.651 54.723 54.782 54.815 54.807 54.768 54.735 54.714 54.674 54.61 54.55 54.492 54.429 54.362 54.291 54.234 54.172 54.063 53.982 53.891 53.834 53.711 53.584 53.429 53.345 52.903 53.046 52.929 52.792 52.5 52.341 52.171 51.983 51.736 51.415 50.968 49.568 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_31_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_31_26.txt deleted file mode 100644 index 8937a2d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_31_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20693 ,TETRA ,17590798,Sat Nov 27 21:44:14 CET,Sat Nov 27 23:36:17 CET,0.0 0.83 1.343 1.757 2.098 2.396 2.674 2.935 3.435 3.655 3.859 3.891 4.41 4.571 4.912 5.241 5.542 5.686 5.962 6.226 6.605 6.844 7.08 7.415 7.748 8.08 8.405 8.725 9.12 9.497 9.868 10.329 10.787 11.23 11.733 12.301 12.854 13.471 14.159 14.908 15.701 16.608 17.672 18.75 20.017 21.455 23.154 25.101 27.49 30.436 34.057 37.087 38.865 40.081 40.827 41.23 41.514 41.751 41.886 41.98 42.05 42.068 42.063 42.03 41.965 41.907 41.839 41.758 41.663 41.548 41.433 41.33 41.217 41.085 40.966 40.853 40.751 40.63 40.466 40.346 40.231 40.05 39.928 39.809 39.748 39.618 39.472 39.3 39.204 38.791 38.892 38.781 38.662 38.372 38.212 38.044 37.86 37.646 37.357 36.976 36.038 -2 ,31004 ,TETRA ,17590799,Sat Nov 27 21:45:11 CET,Sat Nov 27 23:25:18 CET,0.0 1.067 1.527 1.873 2.187 2.495 2.782 3.04 3.536 3.759 3.96 4.008 4.547 4.72 5.061 5.394 5.715 5.863 6.132 6.389 6.767 7.011 7.256 7.606 7.942 8.276 8.604 8.921 9.326 9.719 10.096 10.552 10.993 11.422 11.916 12.478 13.034 13.649 14.318 15.04 15.82 16.721 17.783 18.856 20.129 21.55 23.235 25.223 27.544 30.289 33.647 36.536 38.296 39.405 40.188 40.759 41.106 41.329 41.473 41.574 41.621 41.615 41.604 41.586 41.535 41.466 41.39 41.318 41.23 41.125 41.0 40.875 40.757 40.644 40.558 40.471 40.362 40.24 40.101 40.002 39.904 39.731 39.6 39.463 39.386 39.216 39.036 38.855 38.767 38.358 38.47 38.357 38.233 37.96 37.805 37.661 37.488 37.258 36.988 36.687 36.149 -3 ,22271 ,TETRA ,17590800,Sat Nov 27 21:45:11 CET,Sat Nov 27 23:38:47 CET,0.0 1.061 1.52 1.873 2.177 2.444 2.687 2.909 3.333 3.536 3.73 3.737 4.252 4.418 4.728 5.032 5.342 5.484 5.769 6.055 6.459 6.729 6.998 7.392 7.761 8.103 8.42 8.727 9.13 9.515 9.886 10.341 10.793 11.237 11.753 12.325 12.873 13.48 14.14 14.856 15.618 16.48 17.533 18.611 19.858 21.284 22.992 24.96 27.302 30.141 33.632 36.599 38.448 39.608 40.35 40.888 41.256 41.505 41.664 41.768 41.796 41.797 41.773 41.718 41.647 41.575 41.501 41.424 41.346 41.256 41.155 41.068 40.97 40.861 40.768 40.652 40.525 40.393 40.254 40.159 40.048 39.868 39.742 39.607 39.538 39.382 39.22 39.06 38.975 38.566 38.677 38.574 38.456 38.187 38.047 37.902 37.726 37.511 37.218 36.843 36.058 -4 ,25085 ,TETRA ,17590801,Sat Nov 27 21:46:13 CET,Sat Nov 27 23:41:10 CET,0.0 0.893 1.344 1.72 2.045 2.35 2.623 2.868 3.303 3.499 3.696 3.725 4.258 4.432 4.75 5.042 5.335 5.48 5.759 6.037 6.429 6.68 6.928 7.28 7.616 7.951 8.283 8.604 9.009 9.397 9.782 10.249 10.695 11.134 11.649 12.232 12.797 13.431 14.113 14.831 15.605 16.498 17.553 18.634 19.942 21.401 23.092 25.076 27.421 30.225 33.681 36.601 38.367 39.52 40.302 40.792 41.079 41.255 41.356 41.391 41.383 41.352 41.297 41.248 41.188 41.1 40.989 40.882 40.779 40.683 40.581 40.48 40.383 40.278 40.183 40.08 39.97 39.854 39.716 39.604 39.481 39.309 39.192 39.052 38.976 38.825 38.679 38.51 38.416 38.001 38.09 37.977 37.856 37.583 37.427 37.258 37.078 36.859 36.567 36.224 35.34 -5 ,2817 ,TETRA ,17590802,Sat Nov 27 21:46:15 CET,Sat Nov 27 23:40:57 CET,0.0 0.91 1.385 1.778 2.089 2.35 2.591 2.825 3.267 3.471 3.669 3.692 4.219 4.377 4.677 4.97 5.259 5.401 5.678 5.944 6.327 6.571 6.807 7.157 7.496 7.821 8.134 8.44 8.837 9.229 9.611 10.071 10.53 10.976 11.485 12.043 12.588 13.214 13.896 14.615 15.386 16.285 17.34 18.406 19.67 21.124 22.849 24.798 27.096 29.983 33.611 36.665 38.529 39.698 40.47 40.996 41.31 41.492 41.604 41.713 41.755 41.745 41.715 41.651 41.583 41.517 41.424 41.336 41.266 41.175 41.057 40.951 40.83 40.703 40.608 40.515 40.413 40.298 40.18 40.089 39.987 39.835 39.723 39.592 39.521 39.377 39.226 39.066 38.986 38.584 38.688 38.573 38.452 38.185 38.031 37.855 37.638 37.385 37.112 36.802 35.94 -6 ,25347 ,TETRA ,17590803,Sat Nov 27 21:47:11 CET,Sat Nov 27 23:40:51 CET,0.0 1.038 1.54 1.886 2.164 2.421 2.673 2.919 3.359 3.563 3.761 3.785 4.32 4.493 4.797 5.083 5.359 5.494 5.763 6.019 6.383 6.625 6.868 7.224 7.566 7.901 8.235 8.558 8.976 9.387 9.77 10.225 10.69 11.141 11.666 12.289 12.904 13.57 14.279 15.05 15.866 16.787 17.841 18.872 20.144 21.604 23.275 25.218 27.592 30.479 34.0 36.956 38.747 39.876 40.574 41.071 41.447 41.699 41.859 41.96 41.994 42.012 41.998 41.953 41.906 41.839 41.748 41.684 41.616 41.516 41.409 41.305 41.2 41.084 40.989 40.898 40.796 40.672 40.535 40.449 40.36 40.201 40.081 39.946 39.873 39.73 39.584 39.41 39.318 38.916 39.026 38.925 38.816 38.558 38.414 38.246 38.066 37.85 37.561 37.188 36.348 -7 ,13660 ,TETRA ,17590804,Sat Nov 27 21:48:12 CET,Sat Nov 27 23:42:53 CET,0.0 0.836 1.264 1.575 1.871 2.157 2.444 2.711 3.183 3.397 3.592 3.596 4.118 4.273 4.569 4.864 5.153 5.292 5.557 5.806 6.18 6.426 6.662 6.997 7.324 7.654 7.976 8.278 8.67 9.064 9.436 9.881 10.328 10.762 11.261 11.827 12.388 13.023 13.692 14.39 15.138 16.056 17.191 18.271 19.499 20.923 22.61 24.555 26.889 29.694 33.243 36.222 38.018 39.193 39.951 40.485 40.833 41.035 41.139 41.227 41.294 41.318 41.31 41.289 41.256 41.205 41.115 41.007 40.914 40.821 40.722 40.628 40.518 40.394 40.305 40.194 40.057 39.927 39.796 39.702 39.608 39.446 39.312 39.172 39.095 38.916 38.724 38.526 38.425 38.008 38.09 37.973 37.852 37.571 37.404 37.216 36.979 36.703 36.356 35.862 34.719 -8 ,11208 ,TETRA ,17590805,Sat Nov 27 21:48:12 CET,Sat Nov 27 23:40:27 CET,0.0 0.919 1.358 1.727 2.066 2.373 2.643 2.885 3.337 3.534 3.719 3.733 4.27 4.458 4.811 5.131 5.429 5.575 5.864 6.149 6.555 6.802 7.036 7.369 7.691 8.017 8.347 8.678 9.126 9.558 9.967 10.457 10.932 11.396 11.939 12.569 13.165 13.778 14.432 15.162 15.933 16.791 17.798 18.852 20.118 21.508 23.151 25.066 27.345 30.075 33.474 36.445 38.194 39.271 40.008 40.501 40.819 41.042 41.162 41.208 41.21 41.205 41.179 41.113 41.042 40.971 40.878 40.786 40.71 40.631 40.537 40.452 40.367 40.269 40.162 40.045 39.925 39.802 39.672 39.575 39.474 39.302 39.169 39.028 38.952 38.794 38.62 38.421 38.314 37.883 37.922 37.787 37.654 37.365 37.207 37.029 36.812 36.549 36.252 35.91 34.883 -9 ,4064 ,TETRA ,17590806,Sat Nov 27 21:48:12 CET,Sat Nov 27 23:40:36 CET,0.0 1.004 1.483 1.868 2.212 2.538 2.832 3.083 3.534 3.741 3.932 3.95 4.483 4.663 4.982 5.28 5.579 5.724 6.002 6.284 6.714 6.984 7.239 7.609 7.966 8.318 8.661 8.99 9.436 9.875 10.285 10.79 11.276 11.746 12.294 12.91 13.507 14.153 14.852 15.628 16.411 17.248 18.261 19.316 20.566 21.994 23.683 25.627 27.951 30.75 34.239 37.125 38.798 39.891 40.634 41.171 41.536 41.774 41.92 42.004 42.035 42.056 42.057 42.014 41.944 41.86 41.778 41.705 41.623 41.52 41.409 41.316 41.205 41.094 41.006 40.905 40.791 40.662 40.532 40.432 40.322 40.155 40.037 39.901 39.824 39.677 39.527 39.368 39.282 38.873 38.968 38.862 38.755 38.483 38.325 38.157 37.972 37.75 37.461 37.074 36.22 -10 ,17741 ,TETRA ,17590807,Sat Nov 27 21:48:14 CET,Sat Nov 27 23:40:26 CET,0.0 0.923 1.406 1.788 2.121 2.438 2.722 2.96 3.389 3.594 3.794 3.819 4.354 4.534 4.859 5.165 5.462 5.612 5.898 6.167 6.574 6.846 7.11 7.478 7.835 8.186 8.521 8.856 9.276 9.654 10.018 10.472 10.915 11.348 11.842 12.407 12.972 13.594 14.276 15.008 15.773 16.646 17.686 18.79 20.118 21.523 23.153 25.07 27.331 30.086 33.558 36.504 38.282 39.413 40.114 40.592 40.916 41.15 41.298 41.377 41.41 41.405 41.379 41.353 41.307 41.244 41.173 41.08 40.981 40.872 40.721 40.563 40.389 40.223 40.099 39.955 39.798 39.63 39.435 39.3 39.161 38.942 38.782 38.592 38.492 38.298 38.102 37.875 37.75 37.305 37.308 37.146 36.99 36.632 36.424 36.201 35.949 35.626 35.218 34.698 33.322 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_32_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_32_1h1s.txt deleted file mode 100644 index f1f0636d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_32_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5654 ,TETRA ,17590808,Sat Nov 27 21:21:13 CET,Sat Nov 27 23:15:25 CET,0.0 1.026 1.576 2.042 2.463 2.845 3.196 3.534 4.176 4.453 4.692 4.578 5.369 5.577 5.957 6.308 6.654 6.825 7.143 7.451 7.912 8.218 8.508 8.904 9.297 9.696 10.11 10.526 11.027 11.498 11.966 12.544 13.105 13.65 14.302 15.05 15.783 16.599 17.475 18.428 19.45 20.624 22.018 23.442 25.166 27.149 29.489 32.241 35.595 39.69 44.985 49.697 52.643 54.621 55.994 56.936 57.601 58.098 58.447 58.742 58.93 59.049 59.108 59.142 59.17 59.181 59.17 59.13 59.061 58.976 58.878 58.789 58.695 58.589 58.507 58.417 58.311 58.172 58.011 57.892 57.762 57.563 57.417 57.258 57.179 57.014 56.801 56.552 56.433 55.777 55.996 55.858 55.697 55.295 55.052 54.81 54.542 54.223 53.845 53.269 51.553 -2 ,11074 ,TETRA ,17590809,Sat Nov 27 21:21:15 CET,Sat Nov 27 23:14:04 CET,0.0 0.904 1.489 1.986 2.403 2.775 3.134 3.485 4.148 4.446 4.686 4.518 5.29 5.482 5.85 6.233 6.595 6.764 7.106 7.424 7.87 8.166 8.453 8.881 9.3 9.692 10.079 10.468 10.966 11.449 11.92 12.485 13.038 13.585 14.221 14.949 15.665 16.476 17.361 18.309 19.321 20.485 21.874 23.311 25.034 26.983 29.37 32.195 35.58 39.731 45.048 49.775 52.726 54.763 56.172 57.163 57.886 58.42 58.777 59.025 59.18 59.309 59.372 59.398 59.425 59.414 59.369 59.309 59.252 59.177 59.074 58.992 58.904 58.649 58.335 58.002 57.633 57.239 56.847 56.582 56.308 55.863 55.544 55.207 55.042 54.711 54.364 53.997 53.788 52.991 53.042 52.765 52.476 51.86 51.541 51.22 50.865 50.437 49.9 49.178 47.578 -3 ,23068 ,TETRA ,17590810,Sat Nov 27 21:21:13 CET,Sat Nov 27 23:14:36 CET,0.0 0.997 1.511 1.958 2.368 2.763 3.11 3.422 3.998 4.277 4.549 4.468 5.276 5.508 5.96 6.385 6.775 6.952 7.26 7.56 7.982 8.256 8.542 8.963 9.373 9.783 10.186 10.567 11.061 11.55 12.018 12.578 13.139 13.691 14.331 15.056 15.767 16.558 17.416 18.37 19.401 20.564 21.966 23.412 25.124 27.081 29.404 32.157 35.583 39.846 45.277 50.125 53.193 55.202 56.582 57.559 58.238 58.724 59.054 59.336 59.535 59.693 59.813 59.87 59.904 59.903 59.839 59.736 59.627 59.485 59.299 59.159 59.037 58.896 58.777 58.648 58.523 58.388 58.233 58.135 58.012 57.795 57.655 57.502 57.413 57.219 57.011 56.791 56.665 56.013 56.232 56.069 55.902 55.555 55.316 55.018 54.679 54.285 53.814 53.141 51.255 -4 ,23777 ,TETRA ,17590811,Sat Nov 27 21:21:13 CET,Sat Nov 27 23:15:18 CET,0.0 1.181 1.793 2.248 2.657 3.054 3.425 3.751 4.369 4.674 4.986 4.952 5.856 6.13 6.668 7.181 7.678 7.93 8.43 8.925 9.631 10.084 10.528 11.187 11.819 12.427 13.033 13.644 14.461 15.261 16.058 16.996 17.739 18.313 18.948 19.684 20.404 21.213 22.107 23.1 24.207 25.459 26.926 28.412 30.152 32.157 34.548 37.319 40.665 44.796 50.171 54.868 57.771 59.733 61.063 62.013 62.729 63.251 63.607 63.89 64.07 64.2 64.278 64.309 64.318 64.292 64.226 64.157 64.074 63.972 63.865 63.761 63.64 63.496 63.38 63.266 63.148 63.031 62.878 62.759 62.626 62.382 62.207 62.021 61.925 61.632 61.224 60.794 60.562 59.753 59.812 59.539 59.26 58.648 58.316 57.945 57.527 57.058 56.445 55.704 53.675 -5 ,5780 ,TETRA ,17590812,Sat Nov 27 21:21:13 CET,Sat Nov 27 23:15:57 CET,0.0 0.908 1.427 1.892 2.293 2.655 3.017 3.385 4.071 4.389 4.728 4.805 5.767 6.087 6.682 7.269 7.769 7.971 8.361 8.728 9.255 9.597 9.932 10.436 10.923 11.373 11.784 12.161 12.653 13.14 13.614 14.198 14.763 15.316 15.979 16.725 17.467 18.289 19.162 20.092 21.112 22.286 23.653 25.09 26.811 28.783 31.114 33.835 37.201 41.382 46.786 51.593 54.544 56.448 57.793 58.794 59.479 59.982 60.337 60.63 60.828 60.948 61.032 61.055 61.029 60.997 60.961 60.918 60.876 60.817 60.724 60.624 60.516 60.395 60.289 60.183 60.059 59.929 59.799 59.693 59.576 59.397 59.253 59.084 59.0 58.823 58.624 58.407 58.285 57.649 57.91 57.767 57.603 57.159 56.906 56.646 56.352 55.988 55.543 54.922 52.928 -6 ,2500 ,TETRA ,17590813,Sat Nov 27 21:21:13 CET,Sat Nov 27 23:15:07 CET,0.0 0.84 1.395 1.862 2.253 2.604 2.938 3.27 3.899 4.198 4.527 4.55 5.464 5.746 6.286 6.829 7.362 7.613 8.101 8.586 9.285 9.743 10.211 10.902 11.562 12.195 12.797 13.274 13.764 14.247 14.72 15.276 15.816 16.344 16.961 17.687 18.415 19.225 20.099 21.039 22.048 23.23 24.642 26.1 27.826 29.786 32.115 34.872 38.236 42.35 47.666 52.405 55.398 57.364 58.707 59.715 60.444 60.98 61.346 61.617 61.776 61.876 61.929 61.953 61.938 61.887 61.832 61.765 61.676 61.571 61.456 61.371 61.275 61.137 61.006 60.861 60.694 60.517 60.335 60.209 60.084 59.869 59.711 59.525 59.429 59.247 59.043 58.841 58.725 58.071 58.24 58.017 57.764 57.156 56.832 56.508 56.143 55.699 55.151 54.448 52.146 -7 ,23378 ,TETRA ,17590814,Sat Nov 27 21:21:14 CET,Sat Nov 27 23:14:06 CET,0.0 1.121 1.721 2.21 2.639 3.019 3.377 3.717 4.362 4.67 4.963 4.901 5.804 6.081 6.61 7.112 7.605 7.85 8.35 8.824 9.389 9.681 9.966 10.386 10.774 11.162 11.56 11.941 12.43 12.912 13.38 13.947 14.495 15.042 15.685 16.422 17.138 17.938 18.824 19.766 20.767 21.92 23.291 24.714 26.426 28.384 30.722 33.446 36.757 40.909 46.312 51.107 54.11 56.1 57.476 58.462 59.186 59.743 60.105 60.356 60.512 60.629 60.704 60.74 60.756 60.754 60.734 60.677 60.598 60.522 60.452 60.382 60.276 60.153 60.065 59.956 59.812 59.672 59.533 59.43 59.323 59.124 58.973 58.818 58.698 58.356 57.988 57.608 57.415 56.643 56.761 56.497 56.228 55.688 55.397 55.079 54.717 54.306 53.779 53.055 51.565 -8 ,9387 ,TETRA ,17590815,Sat Nov 27 21:21:14 CET,Sat Nov 27 23:13:47 CET,0.0 0.588 0.964 1.279 1.603 1.893 2.141 2.385 2.859 3.072 3.271 3.092 3.851 4.022 4.371 4.703 5.012 5.166 5.466 5.776 6.234 6.524 6.801 7.206 7.614 8.004 8.386 8.768 9.26 9.731 10.186 10.75 11.296 11.827 12.464 13.185 13.888 14.666 15.551 16.52 17.53 18.707 20.123 21.561 23.275 25.266 27.627 30.337 33.704 37.937 43.253 47.976 50.947 52.946 54.319 55.306 56.035 56.573 56.941 57.221 57.423 57.548 57.617 57.643 57.636 57.632 57.615 57.568 57.511 57.443 57.353 57.263 57.148 57.033 56.944 56.829 56.674 56.48 56.299 56.186 56.052 55.821 55.639 55.435 55.322 55.095 54.891 54.665 54.548 53.903 54.119 53.961 53.797 53.403 53.132 52.785 52.395 51.977 51.498 50.834 49.192 -9 ,4076 ,TETRA ,17590816,Sat Nov 27 21:21:14 CET,Sat Nov 27 23:16:17 CET,0.0 0.906 1.451 1.92 2.321 2.685 3.02 3.333 3.879 4.104 4.315 4.143 4.907 5.093 5.464 5.824 6.151 6.314 6.636 6.946 7.396 7.672 7.956 8.374 8.764 9.154 9.544 9.93 10.433 10.92 11.405 11.988 12.538 13.076 13.723 14.472 15.205 16.018 16.903 17.839 18.863 20.068 21.465 22.894 24.623 26.624 28.978 31.696 35.027 39.232 44.596 49.281 52.252 54.221 55.582 56.56 57.227 57.715 58.066 58.379 58.576 58.693 58.769 58.818 58.828 58.831 58.832 58.801 58.761 58.696 58.606 58.521 58.421 58.308 58.206 58.082 57.946 57.801 57.64 57.53 57.427 57.254 57.113 56.938 56.846 56.662 56.469 56.249 56.126 55.483 55.708 55.559 55.399 55.021 54.797 54.535 54.183 53.748 53.161 52.386 50.513 -10 ,760 ,TETRA ,17590817,Sat Nov 27 21:21:13 CET,Sat Nov 27 23:02:00 CET,0.0 1.09 1.702 2.197 2.624 2.999 3.347 3.672 4.297 4.599 4.889 4.82 5.718 5.988 6.493 6.996 7.505 7.765 8.254 8.711 9.391 9.845 10.284 10.861 11.327 11.749 12.177 12.577 13.081 13.579 14.063 14.656 15.25 15.834 16.519 17.295 18.06 18.891 19.785 20.765 21.829 23.044 24.487 25.969 27.732 29.739 32.121 34.933 38.344 42.525 47.891 52.668 55.641 57.642 59.008 59.988 60.697 61.224 61.574 61.863 62.079 62.203 62.284 62.354 62.377 62.367 62.333 62.274 62.203 62.111 62.01 61.907 61.775 61.639 61.546 61.434 61.305 61.176 60.95 60.696 60.391 59.925 59.614 59.296 59.126 58.794 58.456 58.066 57.844 57.052 57.146 56.888 56.619 56.062 55.761 55.425 55.06 54.636 54.14 53.505 51.412 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_32_1oiu.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_32_1oiu.txt deleted file mode 100644 index 782d60fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_32_1oiu.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20822 ,TETRA ,17590818,Sat Nov 27 21:21:13 CET,Sat Nov 27 23:13:41 CET,0.0 2.059 2.762 3.371 3.899 4.375 4.82 5.237 6.01 6.37 6.73 6.822 7.786 8.124 8.796 9.448 10.072 10.379 10.987 11.595 12.523 13.12 13.684 14.527 15.38 16.129 16.774 17.408 18.226 19.003 19.764 20.709 21.619 22.501 23.543 24.723 25.899 27.251 28.699 30.281 32.007 33.989 36.401 38.889 41.914 45.379 49.522 54.381 60.303 67.766 77.244 85.395 90.528 94.149 96.763 98.586 99.804 100.779 101.518 102.115 102.555 102.913 103.217 103.434 103.595 103.726 103.783 103.791 103.81 103.81 103.787 103.743 103.668 103.597 103.548 103.491 103.4 103.275 103.156 103.079 102.985 102.8 102.662 102.502 102.404 102.205 101.987 101.73 101.6 100.992 101.179 101.011 100.801 100.345 100.049 99.675 99.249 98.705 98.084 97.264 93.322 -2 ,12050 ,TETRA ,17590819,Sat Nov 27 21:21:14 CET,Sat Nov 27 23:16:54 CET,0.0 2.29 3.123 3.743 4.27 4.772 5.229 5.648 6.419 6.797 7.177 7.291 8.267 8.605 9.239 9.849 10.447 10.744 11.333 11.919 12.793 13.381 13.95 14.752 15.531 16.303 17.063 17.802 18.769 19.735 20.69 21.838 22.959 24.094 25.468 27.052 28.58 30.258 31.899 33.442 35.105 37.073 39.464 41.928 44.898 48.355 52.489 57.329 63.181 70.399 79.848 88.275 93.538 97.039 99.5 101.333 102.668 103.684 104.435 105.074 105.537 105.881 106.172 106.399 106.53 106.612 106.686 106.717 106.733 106.755 106.747 106.708 106.639 106.549 106.481 106.405 106.303 106.151 105.915 105.716 105.499 105.128 104.859 104.557 104.395 104.082 103.759 103.402 103.198 102.467 102.55 102.322 102.085 101.544 101.236 100.874 100.465 100.004 99.442 98.564 94.474 -3 ,10375 ,TETRA ,17590820,Sat Nov 27 21:21:15 CET,Sat Nov 27 23:15:06 CET,0.0 2.25 3.012 3.651 4.189 4.628 5.047 5.432 6.105 6.417 6.719 6.724 7.576 7.851 8.362 8.867 9.379 9.63 10.127 10.614 11.311 11.754 12.19 12.846 13.482 14.098 14.719 15.323 16.075 16.85 17.632 18.564 19.464 20.338 21.379 22.573 23.743 25.066 26.533 28.134 29.864 31.863 34.25 36.702 39.663 43.098 47.181 51.978 57.914 65.258 74.822 83.281 88.473 92.085 94.644 96.452 97.742 98.74 99.457 100.066 100.54 100.903 101.173 101.353 101.476 101.576 101.65 101.665 101.623 101.576 101.528 101.453 101.363 101.269 101.196 101.117 101.028 100.918 100.792 100.681 100.556 100.381 100.227 100.038 99.947 99.746 99.537 99.318 99.169 98.456 98.535 98.302 98.052 97.477 97.175 96.849 96.428 95.933 95.338 94.456 91.563 -4 ,23725 ,TETRA ,17590821,Sat Nov 27 21:21:15 CET,Sat Nov 27 23:14:24 CET,0.0 1.941 2.725 3.343 3.868 4.363 4.806 5.226 6.028 6.404 6.769 6.817 7.763 8.096 8.759 9.391 10.011 10.315 10.896 11.475 12.318 12.877 13.434 14.229 15.019 15.789 16.55 17.307 18.303 19.298 20.289 21.468 22.491 23.405 24.5 25.765 26.983 28.33 29.807 31.422 33.161 35.206 37.655 40.123 43.075 46.508 50.63 55.468 61.393 68.737 78.262 86.619 91.833 95.408 97.841 99.619 100.947 101.966 102.71 103.287 103.68 103.997 104.26 104.427 104.549 104.658 104.73 104.766 104.776 104.755 104.728 104.709 104.679 104.578 104.471 104.373 104.254 104.116 103.967 103.87 103.703 103.34 103.061 102.754 102.608 102.301 101.968 101.631 101.448 100.714 100.77 100.538 100.295 99.736 99.393 98.99 98.554 98.054 97.426 96.549 87.776 -5 ,16342 ,TETRA ,17590822,Sat Nov 27 21:21:15 CET,Sat Nov 27 23:19:35 CET,0.0 2.231 2.949 3.553 4.065 4.551 5.007 5.432 6.248 6.629 7.005 7.082 8.042 8.365 8.956 9.493 10.003 10.252 10.752 11.237 11.925 12.378 12.823 13.451 14.064 14.67 15.258 15.837 16.597 17.351 18.092 18.995 19.88 20.76 21.831 23.091 24.287 25.598 27.058 28.664 30.422 32.429 34.767 37.164 40.052 43.422 47.534 52.373 58.26 65.622 75.322 83.957 89.235 92.781 95.313 97.1 98.376 99.392 100.164 100.799 101.238 101.613 101.904 102.118 102.273 102.373 102.447 102.474 102.472 102.459 102.41 102.252 101.976 101.672 101.434 101.198 100.959 100.687 100.397 100.192 99.974 99.645 99.415 99.149 99.001 98.685 98.357 98.007 97.821 97.1 97.186 96.937 96.68 96.145 95.843 95.514 95.128 94.671 94.085 93.231 88.91 -6 ,12632 ,TETRA ,17590823,Sat Nov 27 21:22:11 CET,Sat Nov 27 23:18:49 CET,0.0 1.872 2.657 3.276 3.784 4.26 4.687 5.06 5.716 6.035 6.341 6.336 7.179 7.451 7.974 8.481 8.98 9.218 9.7 10.172 10.86 11.314 11.743 12.38 13.016 13.628 14.229 14.824 15.609 16.373 17.102 18.004 18.903 19.781 20.837 22.047 23.212 24.527 25.992 27.601 29.346 31.369 33.793 36.34 39.42 42.959 47.164 52.038 57.947 65.254 74.594 82.876 88.067 91.593 94.087 95.92 97.252 98.288 99.066 99.629 100.006 100.34 100.609 100.824 101.008 101.123 101.201 101.232 101.244 101.25 101.242 101.215 101.137 101.048 100.984 100.908 100.825 100.708 100.558 100.444 100.313 100.128 99.988 99.817 99.729 99.539 99.315 99.069 98.941 98.323 98.478 98.328 98.165 97.744 97.511 97.232 96.886 96.448 95.856 95.057 92.14 -7 ,32596 ,TETRA ,17590824,Sat Nov 27 21:22:11 CET,Sat Nov 27 23:16:03 CET,0.0 1.794 2.534 3.151 3.674 4.138 4.566 4.974 5.735 6.104 6.474 6.557 7.526 7.858 8.51 9.161 9.806 10.118 10.698 11.191 11.849 12.298 12.749 13.406 14.032 14.652 15.294 15.926 16.725 17.492 18.249 19.182 20.091 21.008 22.07 23.25 24.392 25.688 27.146 28.723 30.433 32.455 34.905 37.386 40.298 43.733 47.913 52.756 58.693 66.029 75.458 83.747 89.054 92.663 95.149 97.001 98.346 99.395 100.18 100.828 101.295 101.384 101.179 100.942 100.708 100.486 100.224 99.958 99.705 99.427 99.122 98.872 98.603 98.296 98.067 97.83 97.567 97.299 97.028 96.835 96.618 96.277 96.027 95.743 95.595 95.274 94.914 94.531 94.346 93.638 93.737 93.498 93.256 92.696 92.319 91.89 91.411 90.884 90.274 89.344 85.139 -8 ,24441 ,TETRA ,17590825,Sat Nov 27 21:22:12 CET,Sat Nov 27 23:17:16 CET,0.0 1.791 2.532 3.121 3.626 4.12 4.589 5.013 5.796 6.168 6.52 6.579 7.538 7.858 8.451 8.989 9.494 9.737 10.207 10.665 11.331 11.772 12.212 12.869 13.517 14.131 14.745 15.358 16.138 16.913 17.68 18.605 19.509 20.417 21.5 22.711 23.926 25.293 26.752 28.334 30.065 32.086 34.476 36.948 39.96 43.447 47.604 52.498 58.471 65.897 75.532 84.154 89.52 93.181 95.8 97.643 98.912 99.884 100.631 101.27 101.734 102.11 102.393 102.556 102.659 102.742 102.783 102.774 102.755 102.7 102.624 102.545 102.445 102.338 102.238 102.127 102.016 101.883 101.718 101.596 101.46 101.258 101.115 100.944 100.857 100.682 100.46 100.192 100.052 99.436 99.592 99.395 99.202 98.779 98.498 98.132 97.685 97.212 96.657 95.824 92.213 -9 ,23659 ,TETRA ,17590826,Sat Nov 27 21:22:12 CET,Sat Nov 27 23:15:38 CET,0.0 2.054 2.77 3.379 3.891 4.365 4.834 5.284 6.094 6.433 6.734 6.752 7.613 7.892 8.421 8.913 9.396 9.637 10.124 10.604 11.304 11.75 12.183 12.812 13.427 14.047 14.667 15.261 16.031 16.799 17.544 18.466 19.393 20.297 21.343 22.518 23.696 25.034 26.493 28.068 29.759 31.734 34.131 36.619 39.607 43.038 47.154 51.979 57.884 65.305 74.823 83.404 88.825 92.421 94.929 96.829 98.235 99.244 99.996 100.66 101.133 101.488 101.764 101.927 101.997 102.034 102.095 102.157 102.16 102.144 102.107 102.04 101.947 101.847 101.778 101.686 101.561 101.366 101.091 100.887 100.682 100.359 100.115 99.848 99.701 99.415 99.123 98.802 98.633 97.924 98.017 97.774 97.507 96.894 96.541 96.179 95.76 95.254 94.699 93.958 91.158 -10 ,5552 ,TETRA ,17590827,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:16:16 CET,0.0 1.786 2.439 3.012 3.536 4.012 4.465 4.887 5.706 6.102 6.477 6.562 7.523 7.849 8.475 9.1 9.725 10.027 10.632 11.224 12.072 12.62 13.171 13.994 14.766 15.53 16.302 17.061 18.015 18.853 19.602 20.521 21.41 22.309 23.393 24.607 25.773 27.078 28.529 30.097 31.801 33.797 36.153 38.586 41.527 44.896 48.949 53.786 59.688 67.001 76.478 84.889 90.225 93.806 96.283 98.163 99.537 100.576 101.354 102.017 102.494 102.832 103.093 103.29 103.415 103.462 103.435 103.409 103.401 103.379 103.345 103.306 103.255 103.169 103.072 102.954 102.82 102.675 102.528 102.424 102.303 102.081 101.922 101.754 101.664 101.493 101.286 101.022 100.869 100.24 100.402 100.213 99.994 99.511 99.256 98.98 98.638 98.191 97.639 96.945 94.153 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_32_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_32_30.txt deleted file mode 100644 index 80365d22..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/CDK2/water/Summary_FEP_32_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26609 ,KEBNE ,17026655,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 16:41:11 CET,0.0 1.029 1.591 2.092 2.531 2.936 3.312 3.684 4.405 4.743 5.081 5.157 6.033 6.334 6.922 7.487 8.036 8.309 8.844 9.366 10.135 10.653 11.17 11.908 12.627 13.355 14.062 14.752 15.68 16.596 17.488 18.591 19.678 20.757 22.041 23.493 24.93 26.552 28.325 30.253 32.358 34.808 37.768 40.877 44.646 49.055 54.467 60.918 68.96 79.299 93.326 106.832 116.071 122.802 127.817 131.785 134.879 137.391 139.397 141.234 142.697 143.924 144.982 145.904 146.72 147.409 148.075 148.623 149.068 149.513 149.949 150.28 150.594 150.912 151.137 151.334 151.511 151.649 151.746 151.801 151.859 151.952 152.018 152.06 152.073 152.094 152.075 152.038 152.018 151.6 151.939 151.877 151.798 151.609 151.487 151.338 151.148 150.905 150.614 150.162 147.186 -2 ,11559 ,KEBNE ,17026656,Wed Dec 22 15:03:50 CET,Wed Dec 22 16:42:52 CET,0.0 1.638 2.395 3.003 3.52 3.958 4.347 4.721 5.431 5.764 6.087 6.136 7.005 7.297 7.866 8.416 8.957 9.224 9.756 10.28 11.05 11.546 12.028 12.753 13.464 14.159 14.855 15.56 16.48 17.371 18.254 19.351 20.43 21.485 22.737 24.184 25.63 27.284 29.114 31.077 33.187 35.679 38.715 41.886 45.698 50.131 55.518 61.961 70.045 80.431 94.544 107.958 117.167 123.917 128.998 133.056 136.2 138.729 140.728 142.586 144.029 145.21 146.283 147.229 148.035 148.722 149.396 149.946 150.389 150.823 151.251 151.59 151.908 152.207 152.417 152.622 152.821 153.007 153.171 153.277 153.377 153.505 153.578 153.645 153.677 153.723 153.747 153.732 153.702 153.265 153.598 153.524 153.438 153.268 153.141 153.003 152.859 152.692 152.401 151.884 149.986 -3 ,6470 ,KEBNE ,17026657,Wed Dec 22 15:03:54 CET,Wed Dec 22 16:34:58 CET,0.0 1.463 2.222 2.841 3.386 3.893 4.376 4.833 5.678 6.074 6.459 6.599 7.593 7.954 8.674 9.373 10.065 10.413 11.082 11.739 12.712 13.348 13.987 14.921 15.827 16.728 17.616 18.496 19.658 20.811 21.962 23.388 24.77 25.991 27.277 28.733 30.164 31.774 33.556 35.508 37.629 40.111 43.146 46.29 50.111 54.53 59.798 66.225 74.281 84.616 98.822 112.345 121.512 128.173 133.171 137.142 140.249 142.783 144.781 146.61 148.043 149.211 150.275 151.22 152.031 152.734 153.418 153.977 154.427 154.859 155.277 155.589 155.877 156.161 156.373 156.571 156.743 156.914 157.087 157.193 157.287 157.413 157.479 157.54 157.574 157.618 157.606 157.569 157.553 157.125 157.472 157.418 157.357 157.261 157.175 157.011 156.83 156.599 156.281 155.856 153.982 -4 ,6733 ,KEBNE ,17026658,Wed Dec 22 15:03:58 CET,Wed Dec 22 16:35:53 CET,0.0 1.564 2.21 2.811 3.342 3.829 4.297 4.742 5.603 6.01 6.361 6.415 7.294 7.582 8.144 8.703 9.265 9.546 10.099 10.633 11.397 11.895 12.385 13.111 13.828 14.531 15.216 15.883 16.777 17.677 18.564 19.654 20.744 21.829 23.088 24.556 26.016 27.63 29.414 31.372 33.49 35.972 39.001 42.149 45.954 50.382 55.747 62.24 70.395 80.85 95.076 108.675 117.889 124.499 129.479 133.445 136.528 139.053 141.034 142.842 144.296 145.471 146.497 147.421 148.206 148.873 149.541 150.098 150.548 150.975 151.371 151.671 151.935 152.2 152.415 152.618 152.825 153.011 153.181 153.29 153.377 153.465 153.514 153.559 153.574 153.613 153.657 153.673 153.664 153.252 153.612 153.564 153.503 153.289 153.11 152.909 152.69 152.326 151.856 151.43 149.841 -5 ,2277 ,KEBNE ,17026659,Wed Dec 22 15:03:58 CET,Wed Dec 22 16:37:00 CET,0.0 1.08 1.679 2.173 2.6 2.989 3.379 3.766 4.467 4.796 5.12 5.152 6.025 6.33 6.931 7.509 8.046 8.307 8.822 9.334 10.097 10.608 11.115 11.85 12.56 13.269 13.978 14.675 15.583 16.474 17.348 18.425 19.485 20.528 21.779 23.234 24.654 26.259 28.069 30.045 32.163 34.622 37.622 40.733 44.535 48.957 54.247 60.616 68.651 79.0 93.098 106.637 115.836 122.477 127.438 131.42 134.553 137.093 139.122 140.973 142.43 143.636 144.663 145.558 146.367 147.048 147.695 148.25 148.696 149.107 149.518 149.835 150.127 150.417 150.632 150.844 151.042 151.22 151.399 151.499 151.582 151.671 151.706 151.73 151.733 151.725 151.684 151.653 151.646 151.227 151.589 151.552 151.504 151.353 151.255 151.113 150.921 150.701 150.376 149.902 148.194 -6 ,11632 ,KEBNE ,17026660,Wed Dec 22 15:03:54 CET,Wed Dec 22 16:37:19 CET,0.0 1.386 2.11 2.716 3.249 3.726 4.179 4.627 5.464 5.866 6.279 6.456 7.453 7.809 8.442 9.012 9.568 9.85 10.409 10.936 11.704 12.208 12.693 13.412 14.14 14.851 15.556 16.263 17.175 18.057 18.937 20.014 21.072 22.132 23.397 24.837 26.258 27.869 29.679 31.674 33.82 36.322 39.316 42.426 46.218 50.664 56.003 62.417 70.599 81.067 95.235 108.733 117.877 124.573 129.611 133.561 136.663 139.222 141.268 143.141 144.58 145.759 146.821 147.755 148.576 149.273 149.914 150.446 150.877 151.272 151.668 151.992 152.305 152.599 152.811 153.009 153.193 153.369 153.535 153.628 153.709 153.84 153.911 153.961 153.982 154.014 154.023 154.009 153.997 153.562 153.921 153.891 153.843 153.704 153.598 153.457 153.309 153.12 152.758 152.218 150.234 -7 ,9286 ,KEBNE ,17026661,Wed Dec 22 15:03:52 CET,Wed Dec 22 16:39:20 CET,0.0 1.587 2.386 3.047 3.637 4.214 4.741 5.233 6.2 6.659 7.11 7.368 8.413 8.808 9.533 10.245 10.949 11.301 12.006 12.706 13.746 14.409 15.046 15.995 16.924 17.728 18.433 19.132 20.061 20.985 21.879 22.974 24.069 25.145 26.414 27.883 29.337 30.976 32.784 34.728 36.823 39.273 42.276 45.431 49.262 53.728 59.104 65.6 73.723 84.075 98.21 111.662 120.817 127.455 132.454 136.455 139.577 142.132 144.143 146.027 147.528 148.721 149.777 150.718 151.538 152.236 152.909 153.459 153.892 154.314 154.711 155.017 155.322 155.616 155.831 156.03 156.22 156.405 156.584 156.695 156.779 156.871 156.925 156.98 157.001 157.029 157.038 157.04 157.045 156.629 156.982 156.935 156.874 156.723 156.625 156.494 156.323 156.085 155.762 155.252 153.647 -8 ,32124 ,KEBNE ,17026662,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:42:52 CET,0.0 1.072 1.662 2.124 2.531 2.937 3.336 3.704 4.405 4.73 5.054 5.114 5.986 6.298 6.908 7.492 8.064 8.336 8.867 9.394 10.178 10.69 11.183 11.911 12.652 13.377 14.06 14.737 15.652 16.551 17.434 18.52 19.585 20.647 21.932 23.41 24.853 26.48 28.269 30.207 32.317 34.81 37.862 41.042 44.851 49.256 54.617 61.087 69.216 79.664 93.783 107.25 116.417 123.13 128.191 132.161 135.29 137.843 139.834 141.682 143.135 144.33 145.404 146.326 147.127 147.8 148.441 148.976 149.41 149.836 150.223 150.521 150.825 151.129 151.34 151.534 151.725 151.902 152.06 152.157 152.246 152.335 152.344 152.32 152.304 152.265 152.219 152.121 152.046 151.568 151.803 151.697 151.563 151.265 151.124 150.949 150.708 150.432 150.057 149.483 147.315 -9 ,14589 ,KEBNE ,17026663,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:44:54 CET,0.0 1.246 1.946 2.576 3.152 3.67 4.139 4.597 5.468 5.869 6.263 6.423 7.428 7.809 8.464 9.014 9.542 9.8 10.322 10.841 11.603 12.101 12.593 13.328 14.054 14.778 15.478 16.159 17.071 17.963 18.83 19.918 20.999 22.067 23.321 24.761 26.196 27.834 29.639 31.587 33.705 36.183 39.207 42.369 46.177 50.569 55.89 62.279 70.313 80.712 94.943 108.533 117.686 124.299 129.26 133.225 136.359 138.937 140.96 142.786 144.206 145.398 146.479 147.413 148.214 148.896 149.564 150.128 150.573 150.987 151.405 151.742 152.046 152.318 152.519 152.712 152.873 153.0 153.144 153.244 153.33 153.458 153.535 153.579 153.595 153.65 153.684 153.686 153.665 153.231 153.56 153.493 153.431 153.296 153.199 153.071 152.886 152.634 152.244 151.692 149.108 -10 ,9897 ,KEBNE ,17026664,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:42:13 CET,0.0 1.186 1.882 2.463 2.989 3.487 3.99 4.478 5.382 5.801 6.212 6.365 7.308 7.606 8.178 8.736 9.287 9.555 10.083 10.612 11.387 11.882 12.365 13.095 13.807 14.498 15.197 15.885 16.795 17.715 18.61 19.685 20.747 21.799 23.035 24.439 25.841 27.458 29.241 31.184 33.316 35.788 38.773 41.922 45.735 50.153 55.541 62.016 70.126 80.556 94.705 108.2 117.384 124.064 129.042 132.977 136.102 138.643 140.646 142.499 143.955 145.158 146.248 147.207 148.022 148.69 149.288 149.807 150.254 150.675 151.086 151.41 151.702 151.945 152.111 152.272 152.42 152.547 152.665 152.729 152.773 152.831 152.846 152.841 152.829 152.786 152.742 152.669 152.621 152.165 152.428 152.347 152.251 151.998 151.855 151.686 151.472 151.208 150.779 149.901 145.909 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18631-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18631-1.txt deleted file mode 100644 index 56e921be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18631-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28310 ,KEBNE ,17026690,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:55:34 CET,0.0 1.066 1.578 1.982 2.322 2.648 2.954 3.224 3.703 3.92 4.119 4.103 4.651 4.808 5.133 5.425 5.682 5.809 6.051 6.292 6.633 6.847 7.051 7.331 7.597 7.853 8.11 8.362 8.679 8.982 9.286 9.648 9.987 10.312 10.681 11.087 11.469 11.901 12.391 12.915 13.479 14.111 14.817 15.515 16.325 17.241 18.286 19.41 20.684 22.127 23.729 24.816 25.201 25.283 25.135 24.892 24.6 24.22 23.856 23.488 23.132 22.781 22.461 22.158 21.845 21.523 21.181 20.865 20.579 20.279 19.954 19.681 19.393 19.064 18.798 18.54 18.27 17.992 17.688 17.468 17.242 16.875 16.604 16.328 16.188 15.899 15.603 15.271 15.077 14.512 14.452 14.24 14.022 13.526 13.237 12.89 12.499 12.099 11.583 10.835 8.792 -2 ,29403 ,KEBNE ,17026691,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:55:45 CET,0.0 1.06 1.521 1.877 2.174 2.425 2.644 2.855 3.244 3.415 3.576 3.516 4.041 4.18 4.469 4.75 5.003 5.12 5.344 5.558 5.854 6.039 6.22 6.501 6.799 7.085 7.349 7.59 7.886 8.181 8.472 8.808 9.138 9.463 9.826 10.235 10.63 11.073 11.558 12.068 12.607 13.224 13.934 14.63 15.443 16.337 17.307 18.423 19.742 21.206 22.871 23.966 24.34 24.423 24.286 23.992 23.674 23.33 22.975 22.622 22.323 22.032 21.716 21.377 21.04 20.719 20.384 20.09 19.818 19.525 19.213 18.944 18.668 18.343 18.074 17.813 17.542 17.251 16.928 16.714 16.505 16.145 15.876 15.602 15.459 15.151 14.803 14.423 14.232 13.662 13.582 13.367 13.123 12.554 12.247 11.926 11.548 11.116 10.602 9.941 7.809 -3 ,26468 ,KEBNE ,17026692,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:55:05 CET,0.0 1.012 1.447 1.809 2.108 2.368 2.609 2.826 3.192 3.35 3.503 3.438 3.986 4.148 4.443 4.703 4.947 5.071 5.31 5.532 5.844 6.052 6.258 6.541 6.812 7.079 7.341 7.597 7.925 8.239 8.526 8.872 9.243 9.596 9.991 10.433 10.848 11.299 11.774 12.28 12.833 13.46 14.175 14.881 15.671 16.529 17.514 18.64 19.917 21.304 22.879 23.835 24.133 24.11 23.936 23.697 23.43 23.115 22.778 22.355 21.942 21.561 21.148 20.759 20.416 20.086 19.719 19.38 19.078 18.768 18.445 18.179 17.887 17.56 17.304 17.038 16.762 16.468 16.144 15.911 15.684 15.322 15.056 14.765 14.615 14.312 13.957 13.57 13.357 12.764 12.678 12.418 12.128 11.493 11.153 10.786 10.359 9.842 9.239 8.495 6.403 -4 ,14096 ,KEBNE ,17026693,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:54:15 CET,0.0 0.782 1.214 1.552 1.836 2.077 2.304 2.518 2.908 3.082 3.249 3.176 3.697 3.834 4.113 4.403 4.669 4.798 5.053 5.288 5.614 5.832 6.047 6.362 6.661 6.946 7.217 7.475 7.807 8.123 8.428 8.8 9.147 9.475 9.863 10.297 10.717 11.165 11.639 12.132 12.653 13.279 14.028 14.789 15.663 16.601 17.637 18.782 20.074 21.497 23.076 24.092 24.401 24.39 24.192 23.876 23.505 23.099 22.748 22.396 22.073 21.734 21.38 21.052 20.706 20.349 19.958 19.62 19.319 18.987 18.646 18.37 18.071 17.758 17.521 17.262 16.988 16.715 16.416 16.203 15.992 15.63 15.347 15.053 14.906 14.595 14.272 13.928 13.752 13.191 13.127 12.894 12.62 12.037 11.703 11.345 10.987 10.552 9.983 9.111 7.033 -5 ,16217 ,KEBNE ,17026694,Wed Dec 22 15:04:56 CET,Wed Dec 22 16:50:49 CET,0.0 0.967 1.487 1.89 2.222 2.532 2.807 3.043 3.462 3.643 3.819 3.779 4.317 4.482 4.796 5.052 5.295 5.418 5.646 5.862 6.176 6.38 6.576 6.851 7.126 7.39 7.644 7.89 8.194 8.485 8.78 9.148 9.491 9.81 10.186 10.615 11.034 11.476 11.94 12.461 13.016 13.615 14.326 15.046 15.87 16.771 17.807 18.979 20.316 21.784 23.373 24.417 24.75 24.783 24.655 24.406 24.075 23.709 23.345 22.935 22.57 22.231 21.917 21.601 21.258 20.917 20.549 20.229 19.939 19.615 19.25 18.956 18.668 18.34 18.076 17.818 17.563 17.297 17.007 16.81 16.603 16.246 15.995 15.746 15.62 15.339 14.996 14.615 14.422 13.86 13.775 13.534 13.265 12.661 12.314 11.945 11.543 11.078 10.509 9.789 7.863 -6 ,6221 ,KEBNE ,17026695,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:54:30 CET,0.0 0.841 1.239 1.606 1.918 2.173 2.417 2.636 3.035 3.221 3.401 3.351 3.88 4.023 4.322 4.614 4.878 4.998 5.217 5.43 5.742 5.943 6.138 6.421 6.706 7.001 7.287 7.541 7.874 8.193 8.497 8.855 9.196 9.545 9.949 10.401 10.811 11.245 11.73 12.258 12.798 13.384 14.066 14.751 15.547 16.446 17.484 18.582 19.838 21.325 22.927 23.916 24.227 24.243 24.107 23.895 23.613 23.276 22.967 22.628 22.282 21.947 21.613 21.289 20.965 20.634 20.296 19.984 19.691 19.397 19.078 18.801 18.508 18.19 17.942 17.672 17.376 17.053 16.691 16.438 16.179 15.799 15.518 15.175 15.004 14.649 14.268 13.879 13.679 13.109 13.021 12.76 12.47 11.85 11.512 11.132 10.745 10.331 9.808 9.023 6.438 -7 ,4240 ,KEBNE ,17026696,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:55:33 CET,0.0 0.947 1.395 1.729 2.014 2.249 2.459 2.644 2.971 3.138 3.313 3.243 3.777 3.92 4.184 4.451 4.697 4.816 5.052 5.272 5.59 5.786 5.983 6.276 6.538 6.791 7.043 7.288 7.598 7.89 8.17 8.509 8.837 9.163 9.556 10.013 10.442 10.883 11.362 11.876 12.415 13.023 13.728 14.453 15.29 16.2 17.245 18.423 19.789 21.302 22.892 23.921 24.21 24.203 24.074 23.839 23.566 23.235 22.9 22.557 22.216 21.842 21.457 21.107 20.797 20.501 20.175 19.872 19.595 19.3 18.982 18.721 18.45 18.141 17.884 17.62 17.345 17.034 16.728 16.542 16.346 15.971 15.691 15.412 15.266 14.97 14.671 14.367 14.2 13.643 13.553 13.317 13.068 12.452 12.116 11.806 11.487 11.062 10.51 9.784 7.611 -8 ,10927 ,KEBNE ,17026697,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:54:03 CET,0.0 0.744 1.173 1.5 1.78 2.033 2.267 2.491 2.88 3.065 3.247 3.205 3.745 3.888 4.161 4.407 4.65 4.775 5.01 5.236 5.564 5.772 5.969 6.267 6.563 6.826 7.078 7.33 7.648 7.951 8.239 8.593 8.931 9.271 9.67 10.097 10.513 10.996 11.527 12.054 12.588 13.212 13.958 14.69 15.519 16.466 17.562 18.739 20.052 21.501 23.089 24.172 24.568 24.57 24.368 24.094 23.795 23.491 23.173 22.794 22.443 22.097 21.765 21.431 21.096 20.796 20.466 20.148 19.87 19.594 19.274 18.977 18.683 18.366 18.124 17.88 17.601 17.3 17.004 16.789 16.54 16.131 15.848 15.578 15.433 15.12 14.778 14.372 14.156 13.554 13.379 13.073 12.759 12.083 11.688 11.248 10.755 10.174 9.433 8.374 5.271 -9 ,19030 ,KEBNE ,17026698,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:54:47 CET,0.0 0.718 1.157 1.553 1.861 2.122 2.348 2.572 2.955 3.118 3.281 3.208 3.735 3.87 4.133 4.396 4.649 4.772 5.014 5.258 5.62 5.838 6.033 6.337 6.649 6.954 7.249 7.524 7.864 8.189 8.51 8.889 9.25 9.598 9.994 10.43 10.85 11.34 11.878 12.412 12.962 13.583 14.278 14.993 15.874 16.818 17.842 18.978 20.278 21.79 23.391 24.354 24.701 24.742 24.582 24.308 24.017 23.714 23.357 22.957 22.6 22.231 21.867 21.531 21.208 20.902 20.557 20.201 19.871 19.535 19.212 18.935 18.619 18.284 18.016 17.727 17.444 17.146 16.817 16.574 16.301 15.88 15.58 15.27 15.122 14.835 14.532 14.188 13.999 13.429 13.35 13.106 12.837 12.254 11.93 11.563 11.132 10.589 9.985 9.194 6.412 -10 ,30465 ,KEBNE ,17026699,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:54:17 CET,0.0 0.89 1.354 1.697 2.0 2.277 2.525 2.764 3.182 3.353 3.518 3.473 4.021 4.184 4.509 4.823 5.118 5.249 5.475 5.69 6.013 6.234 6.447 6.747 7.037 7.305 7.57 7.825 8.138 8.45 8.741 9.081 9.434 9.778 10.164 10.611 11.057 11.521 11.993 12.504 13.054 13.674 14.403 15.118 15.938 16.845 17.871 19.037 20.364 21.816 23.301 24.181 24.428 24.369 24.163 23.919 23.667 23.352 23.007 22.603 22.234 21.938 21.62 21.286 20.988 20.691 20.363 20.053 19.782 19.495 19.173 18.89 18.579 18.262 18.008 17.738 17.464 17.171 16.845 16.612 16.36 15.977 15.707 15.426 15.286 14.977 14.648 14.272 14.069 13.498 13.406 13.141 12.868 12.342 12.048 11.676 11.266 10.806 10.197 9.351 6.516 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index b2e5211a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4595 ,TETRA ,17590850,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:35:14 CET,0.0 1.367 1.867 2.234 2.575 2.888 3.147 3.381 3.811 4.003 4.185 4.166 4.711 4.86 5.147 5.434 5.715 5.84 6.071 6.297 6.616 6.816 7.0 7.264 7.526 7.785 8.038 8.282 8.59 8.872 9.135 9.436 9.722 10.009 10.348 10.718 11.06 11.424 11.811 12.216 12.625 13.066 13.581 14.062 14.575 15.141 15.716 16.261 16.822 17.262 17.334 16.855 16.117 15.297 14.551 13.865 13.225 12.606 12.039 11.481 10.994 10.508 10.027 9.551 9.087 8.675 8.247 7.876 7.566 7.229 6.855 6.535 6.2 5.846 5.572 5.279 4.966 4.663 4.355 4.118 3.862 3.475 3.197 2.88 2.715 2.401 2.073 1.711 1.522 0.944 0.903 0.662 0.415 -0.109 -0.405 -0.737 -1.104 -1.496 -1.967 -2.735 -4.599 -2 ,1406 ,TETRA ,17590851,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:36:13 CET,0.0 1.452 1.986 2.375 2.712 3.039 3.344 3.613 4.096 4.314 4.519 4.539 5.099 5.27 5.592 5.861 6.111 6.235 6.466 6.68 6.974 7.159 7.344 7.622 7.894 8.151 8.4 8.633 8.925 9.208 9.476 9.795 10.114 10.416 10.734 11.101 11.453 11.825 12.234 12.641 13.05 13.509 14.026 14.519 15.073 15.64 16.22 16.785 17.343 17.825 17.906 17.457 16.837 16.105 15.4 14.701 14.031 13.366 12.766 12.158 11.611 11.112 10.63 10.172 9.737 9.302 8.837 8.44 8.094 7.73 7.355 7.061 6.741 6.374 6.079 5.777 5.476 5.167 4.83 4.581 4.316 3.906 3.607 3.286 3.138 2.821 2.469 2.106 1.926 1.359 1.289 1.048 0.799 0.267 -0.017 -0.363 -0.746 -1.154 -1.667 -2.352 -4.132 -3 ,21326 ,TETRA ,17590852,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:44:18 CET,0.0 1.506 2.007 2.406 2.717 3.017 3.289 3.508 3.95 4.172 4.373 4.35 4.89 5.032 5.344 5.632 5.904 6.035 6.267 6.497 6.836 7.05 7.274 7.588 7.866 8.125 8.38 8.647 8.973 9.272 9.558 9.89 10.194 10.484 10.843 11.249 11.624 12.005 12.397 12.806 13.226 13.691 14.19 14.657 15.187 15.72 16.274 16.846 17.39 17.814 17.92 17.437 16.703 15.982 15.281 14.508 13.762 13.114 12.534 11.906 11.387 10.918 10.429 9.954 9.514 9.116 8.728 8.371 8.022 7.668 7.309 7.004 6.69 6.352 6.074 5.792 5.512 5.206 4.855 4.616 4.375 3.987 3.708 3.422 3.269 2.944 2.628 2.305 2.128 1.557 1.521 1.295 1.062 0.539 0.256 -0.056 -0.397 -0.766 -1.224 -1.859 -3.428 -4 ,8181 ,TETRA ,17590853,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:34:32 CET,0.0 1.412 1.956 2.356 2.678 2.949 3.2 3.435 3.843 4.036 4.217 4.154 4.698 4.851 5.125 5.389 5.64 5.755 5.972 6.188 6.492 6.687 6.886 7.168 7.429 7.68 7.925 8.153 8.451 8.734 8.983 9.268 9.549 9.837 10.164 10.514 10.838 11.186 11.562 11.956 12.351 12.777 13.257 13.727 14.24 14.781 15.375 15.942 16.495 16.884 16.928 16.45 15.713 14.931 14.185 13.417 12.686 12.025 11.421 10.779 10.241 9.758 9.285 8.822 8.368 7.964 7.535 7.132 6.804 6.466 6.101 5.797 5.449 5.08 4.811 4.532 4.226 3.859 3.479 3.234 2.973 2.552 2.266 1.991 1.839 1.492 1.131 0.763 0.564 -0.028 -0.08 -0.326 -0.584 -1.153 -1.475 -1.806 -2.192 -2.603 -3.122 -3.863 -5.411 -5 ,28695 ,TETRA ,17590854,Sat Nov 27 21:22:14 CET,Sat Nov 27 23:36:26 CET,0.0 1.332 1.861 2.257 2.628 2.914 3.151 3.376 3.805 4.004 4.188 4.149 4.696 4.855 5.146 5.415 5.674 5.796 6.039 6.26 6.558 6.751 6.937 7.217 7.486 7.738 7.978 8.213 8.507 8.775 9.043 9.38 9.693 9.989 10.323 10.675 11.008 11.371 11.77 12.191 12.614 13.048 13.535 14.036 14.553 15.095 15.686 16.223 16.736 17.146 17.252 16.832 16.078 15.296 14.579 13.859 13.173 12.532 11.981 11.411 10.89 10.405 9.942 9.475 9.023 8.614 8.183 7.779 7.424 7.084 6.743 6.452 6.148 5.828 5.543 5.248 4.944 4.632 4.328 4.099 3.845 3.44 3.143 2.847 2.699 2.368 1.998 1.585 1.377 0.784 0.737 0.507 0.265 -0.244 -0.551 -0.901 -1.302 -1.768 -2.265 -2.974 -4.828 -6 ,20849 ,TETRA ,17590855,Sat Nov 27 21:22:14 CET,Sat Nov 27 23:36:40 CET,0.0 1.165 1.621 1.995 2.307 2.567 2.815 3.053 3.456 3.634 3.82 3.788 4.339 4.494 4.774 5.022 5.258 5.378 5.605 5.813 6.09 6.277 6.476 6.765 7.031 7.281 7.526 7.757 8.05 8.343 8.619 8.935 9.229 9.521 9.874 10.243 10.577 10.934 11.299 11.682 12.079 12.51 12.985 13.446 13.969 14.511 15.119 15.735 16.303 16.76 16.898 16.477 15.843 15.145 14.412 13.695 13.06 12.439 11.858 11.273 10.743 10.244 9.766 9.326 8.92 8.533 8.132 7.77 7.436 7.093 6.72 6.407 6.086 5.737 5.459 5.169 4.862 4.544 4.232 4.008 3.748 3.315 3.017 2.696 2.528 2.215 1.906 1.56 1.374 0.812 0.778 0.52 0.241 -0.363 -0.719 -1.103 -1.494 -1.905 -2.418 -3.106 -4.66 -7 ,5979 ,TETRA ,17590856,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:37:38 CET,0.0 1.448 2.049 2.509 2.914 3.257 3.536 3.795 4.225 4.423 4.621 4.598 5.154 5.311 5.591 5.867 6.141 6.277 6.516 6.717 7.006 7.204 7.4 7.683 7.945 8.194 8.44 8.668 8.94 9.208 9.478 9.798 10.079 10.341 10.647 10.982 11.307 11.664 12.045 12.438 12.841 13.286 13.779 14.248 14.757 15.27 15.839 16.432 16.926 17.276 17.389 16.99 16.342 15.63 14.905 14.192 13.547 12.972 12.445 11.851 11.313 10.815 10.348 9.909 9.469 9.073 8.68 8.334 8.024 7.682 7.325 7.027 6.715 6.38 6.106 5.836 5.556 5.242 4.915 4.684 4.445 4.08 3.808 3.52 3.374 3.065 2.751 2.423 2.245 1.675 1.679 1.467 1.238 0.728 0.426 0.104 -0.258 -0.682 -1.251 -2.212 -5.375 -8 ,14656 ,TETRA ,17590857,Sat Nov 27 21:22:13 CET,Sat Nov 27 23:38:56 CET,0.0 0.981 1.438 1.82 2.158 2.432 2.689 2.931 3.351 3.543 3.715 3.635 4.17 4.322 4.622 4.905 5.159 5.284 5.53 5.753 6.078 6.296 6.505 6.792 7.064 7.336 7.593 7.825 8.111 8.389 8.661 8.991 9.308 9.611 9.955 10.322 10.677 11.056 11.44 11.85 12.291 12.764 13.287 13.808 14.382 14.955 15.53 16.094 16.646 17.105 17.259 16.803 16.093 15.3 14.527 13.812 13.158 12.5 11.905 11.299 10.74 10.219 9.716 9.232 8.781 8.362 7.882 7.453 7.1 6.728 6.346 6.043 5.718 5.361 5.077 4.78 4.483 4.168 3.82 3.576 3.33 2.947 2.681 2.39 2.236 1.928 1.597 1.215 1.017 0.436 0.393 0.156 -0.1 -0.659 -0.975 -1.328 -1.709 -2.138 -2.621 -3.325 -5.28 -9 ,27304 ,TETRA ,17590858,Sat Nov 27 21:22:14 CET,Sat Nov 27 23:35:52 CET,0.0 1.31 1.871 2.308 2.64 2.93 3.187 3.433 3.873 4.061 4.229 4.17 4.711 4.864 5.162 5.438 5.693 5.807 6.026 6.246 6.566 6.777 6.988 7.293 7.598 7.895 8.16 8.405 8.707 8.993 9.27 9.58 9.864 10.146 10.47 10.815 11.151 11.51 11.887 12.29 12.706 13.173 13.687 14.159 14.704 15.293 15.921 16.518 17.052 17.501 17.689 17.31 16.606 15.834 15.101 14.408 13.759 13.107 12.525 11.93 11.392 10.893 10.404 9.922 9.462 9.037 8.596 8.209 7.865 7.505 7.143 6.843 6.511 6.152 5.878 5.598 5.296 4.967 4.631 4.407 4.172 3.789 3.517 3.225 3.076 2.736 2.367 1.972 1.761 1.173 1.136 0.888 0.614 0.057 -0.247 -0.577 -0.951 -1.374 -1.896 -2.587 -4.346 -10 ,25314 ,TETRA ,17590859,Sat Nov 27 21:22:14 CET,Sat Nov 27 23:39:23 CET,0.0 1.235 1.732 2.126 2.436 2.709 2.957 3.198 3.676 3.898 4.097 4.063 4.609 4.768 5.065 5.329 5.571 5.695 5.933 6.149 6.457 6.653 6.851 7.143 7.419 7.682 7.922 8.151 8.449 8.731 9.002 9.344 9.674 9.987 10.361 10.746 11.091 11.458 11.833 12.23 12.643 13.114 13.614 14.082 14.626 15.157 15.69 16.248 16.809 17.283 17.451 17.011 16.325 15.555 14.759 13.964 13.28 12.648 12.093 11.53 11.026 10.576 10.144 9.733 9.329 8.932 8.512 8.149 7.821 7.482 7.132 6.793 6.42 6.054 5.781 5.502 5.202 4.884 4.552 4.318 4.083 3.729 3.474 3.204 3.065 2.784 2.503 2.175 1.985 1.409 1.389 1.174 0.961 0.47 0.184 -0.13 -0.501 -0.964 -1.471 -2.15 -3.984 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt deleted file mode 100644 index fae729e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13865 ,TETRA ,17590860,Sat Nov 27 21:22:16 CET,Sat Nov 27 23:38:23 CET,0.0 1.472 2.079 2.557 2.903 3.234 3.534 3.775 4.197 4.396 4.599 4.612 5.169 5.348 5.708 6.027 6.318 6.469 6.757 7.034 7.444 7.693 7.933 8.286 8.637 8.976 9.301 9.62 10.019 10.406 10.775 11.228 11.694 12.139 12.654 13.232 13.765 14.332 14.958 15.642 16.336 17.111 18.008 18.925 20.049 21.293 22.677 24.21 26.026 28.12 30.397 32.074 32.809 33.0 32.972 32.898 32.707 32.431 32.18 31.879 31.583 31.291 30.97 30.661 30.366 30.046 29.694 29.379 29.09 28.788 28.46 28.181 27.873 27.531 27.273 27.011 26.73 26.425 26.121 25.904 25.682 25.307 25.01 24.714 24.575 24.29 23.953 23.585 23.388 22.827 22.722 22.479 22.232 21.683 21.384 21.029 20.606 20.128 19.603 18.852 15.843 -2 ,26709 ,TETRA ,17590861,Sat Nov 27 21:22:15 CET,Sat Nov 27 23:36:56 CET,0.0 1.93 2.63 3.157 3.584 3.967 4.295 4.602 5.15 5.386 5.605 5.631 6.215 6.407 6.765 7.125 7.464 7.629 7.939 8.231 8.664 8.926 9.176 9.539 9.89 10.228 10.549 10.86 11.274 11.665 12.04 12.529 12.996 13.426 13.937 14.501 15.042 15.655 16.311 16.997 17.713 18.517 19.474 20.436 21.552 22.778 24.119 25.612 27.404 29.464 31.706 33.224 33.887 34.198 34.268 34.217 34.055 33.791 33.536 33.269 33.011 32.757 32.488 32.194 31.877 31.58 31.269 30.981 30.721 30.43 30.132 29.882 29.579 29.263 29.016 28.733 28.434 28.121 27.771 27.521 27.277 26.881 26.6 26.313 26.166 25.882 25.582 25.249 25.066 24.509 24.377 24.113 23.834 23.214 22.889 22.533 22.109 21.559 20.891 20.032 16.382 -3 ,13663 ,TETRA ,17590862,Sat Nov 27 21:23:12 CET,Sat Nov 27 23:36:39 CET,0.0 1.589 2.103 2.461 2.816 3.166 3.474 3.753 4.277 4.511 4.718 4.725 5.306 5.498 5.854 6.187 6.51 6.668 6.953 7.223 7.623 7.881 8.12 8.46 8.79 9.112 9.434 9.767 10.181 10.545 10.911 11.343 11.752 12.145 12.597 13.132 13.658 14.23 14.849 15.493 16.163 16.939 17.843 18.778 19.864 20.999 22.292 23.767 25.485 27.48 29.846 31.509 32.171 32.375 32.385 32.274 32.081 31.85 31.606 31.309 31.04 30.796 30.523 30.234 29.952 29.695 29.418 29.135 28.875 28.614 28.317 28.055 27.784 27.498 27.261 27.003 26.74 26.463 26.145 25.922 25.7 25.353 25.105 24.844 24.701 24.388 24.068 23.732 23.538 22.973 22.898 22.675 22.417 21.832 21.513 21.161 20.771 20.285 19.669 18.797 15.861 -4 ,26899 ,TETRA ,17590863,Sat Nov 27 21:23:12 CET,Sat Nov 27 23:38:52 CET,0.0 2.154 2.756 3.191 3.569 3.897 4.199 4.478 4.987 5.236 5.465 5.463 6.019 6.199 6.535 6.857 7.186 7.345 7.638 7.926 8.344 8.602 8.851 9.217 9.56 9.904 10.265 10.608 11.037 11.448 11.841 12.322 12.779 13.229 13.741 14.296 14.81 15.37 15.999 16.666 17.353 18.138 19.041 19.935 21.043 22.348 23.776 25.338 27.136 29.17 31.518 33.17 33.868 34.09 34.11 34.051 33.895 33.698 33.479 33.181 32.913 32.649 32.358 32.061 31.774 31.47 31.113 30.792 30.489 30.169 29.844 29.559 29.257 28.933 28.686 28.457 28.217 27.938 27.607 27.354 27.085 26.671 26.403 26.13 25.988 25.693 25.356 24.995 24.809 24.256 24.141 23.879 23.625 23.049 22.707 22.36 21.924 21.375 20.709 19.763 16.906 -5 ,13612 ,TETRA ,17590864,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:37:37 CET,0.0 1.209 1.789 2.221 2.561 2.874 3.158 3.439 3.952 4.183 4.391 4.393 4.97 5.154 5.507 5.856 6.173 6.333 6.65 6.942 7.357 7.628 7.884 8.254 8.623 8.975 9.299 9.624 10.069 10.486 10.865 11.312 11.749 12.162 12.634 13.177 13.703 14.3 14.971 15.664 16.375 17.17 18.094 19.018 20.078 21.276 22.637 24.095 25.743 27.66 29.938 31.709 32.518 32.809 32.774 32.579 32.337 32.083 31.803 31.481 31.166 30.818 30.501 30.21 29.894 29.591 29.265 28.946 28.661 28.362 28.04 27.778 27.494 27.185 26.953 26.702 26.417 26.129 25.82 25.585 25.343 24.959 24.682 24.394 24.245 23.943 23.63 23.282 23.086 22.541 22.478 22.232 21.972 21.435 21.127 20.772 20.36 19.86 19.227 18.484 16.371 -6 ,28834 ,TETRA ,17590865,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:36:06 CET,0.0 1.558 2.069 2.522 2.923 3.253 3.552 3.803 4.256 4.489 4.704 4.727 5.289 5.467 5.838 6.18 6.499 6.657 6.975 7.289 7.75 8.033 8.294 8.683 9.048 9.401 9.747 10.074 10.478 10.884 11.274 11.728 12.2 12.663 13.174 13.735 14.286 14.897 15.54 16.201 16.89 17.684 18.639 19.594 20.677 21.913 23.326 24.925 26.782 28.832 31.217 32.933 33.561 33.781 33.829 33.675 33.444 33.199 32.887 32.533 32.189 31.832 31.482 31.139 30.798 30.508 30.211 29.91 29.612 29.281 28.972 28.715 28.421 28.109 27.861 27.582 27.256 26.92 26.605 26.393 26.152 25.741 25.452 25.146 24.991 24.662 24.301 23.886 23.665 23.087 22.966 22.714 22.455 21.865 21.506 21.106 20.665 20.184 19.627 18.847 16.075 -7 ,26958 ,TETRA ,17590866,Sat Nov 27 21:23:12 CET,Sat Nov 27 23:34:36 CET,0.0 2.006 2.711 3.194 3.582 3.95 4.286 4.558 5.061 5.293 5.508 5.545 6.123 6.315 6.684 7.04 7.381 7.535 7.816 8.106 8.528 8.789 9.052 9.437 9.806 10.165 10.501 10.818 11.208 11.579 11.956 12.416 12.853 13.283 13.806 14.382 14.925 15.511 16.141 16.831 17.579 18.392 19.319 20.294 21.428 22.641 23.987 25.519 27.304 29.37 31.693 33.295 34.026 34.307 34.338 34.233 34.035 33.791 33.542 33.233 32.919 32.602 32.284 32.01 31.732 31.436 31.09 30.76 30.469 30.15 29.837 29.576 29.292 29.001 28.764 28.494 28.196 27.893 27.564 27.341 27.116 26.729 26.442 26.15 26.0 25.688 25.377 25.039 24.855 24.303 24.221 23.977 23.72 23.136 22.8 22.447 22.049 21.562 20.985 20.151 17.611 -8 ,5061 ,TETRA ,17590867,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:34:53 CET,0.0 1.521 2.083 2.505 2.867 3.201 3.5 3.775 4.272 4.489 4.687 4.697 5.263 5.445 5.807 6.148 6.451 6.596 6.908 7.199 7.596 7.851 8.094 8.45 8.805 9.143 9.468 9.785 10.182 10.562 10.92 11.339 11.749 12.162 12.654 13.196 13.704 14.306 14.978 15.666 16.382 17.186 18.133 19.072 20.173 21.401 22.779 24.364 26.229 28.339 30.771 32.556 33.34 33.632 33.686 33.616 33.457 33.199 32.928 32.617 32.288 31.986 31.7 31.405 31.106 30.817 30.499 30.2 29.946 29.672 29.373 29.136 28.877 28.578 28.344 28.095 27.834 27.563 27.261 27.041 26.803 26.407 26.115 25.808 25.649 25.291 24.892 24.494 24.288 23.727 23.666 23.428 23.165 22.586 22.266 21.918 21.509 21.008 20.447 19.645 16.899 -9 ,9302 ,TETRA ,17590868,Sat Nov 27 21:23:12 CET,Sat Nov 27 23:38:55 CET,0.0 2.11 2.637 3.102 3.505 3.854 4.154 4.434 4.995 5.244 5.476 5.527 6.111 6.311 6.692 7.053 7.401 7.571 7.885 8.164 8.578 8.857 9.11 9.458 9.816 10.165 10.474 10.772 11.187 11.576 11.926 12.349 12.767 13.188 13.677 14.221 14.74 15.308 15.941 16.64 17.374 18.191 19.12 20.034 21.118 22.311 23.695 25.254 27.07 29.198 31.628 33.404 34.108 34.343 34.429 34.444 34.387 34.211 33.989 33.719 33.403 33.073 32.741 32.423 32.124 31.836 31.534 31.227 30.943 30.636 30.276 29.964 29.642 29.329 29.08 28.812 28.539 28.25 27.93 27.695 27.434 27.023 26.743 26.471 26.335 26.018 25.672 25.299 25.091 24.514 24.415 24.173 23.93 23.366 23.037 22.688 22.289 21.785 21.127 20.231 17.56 -10 ,1267 ,TETRA ,17590869,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:35:48 CET,0.0 1.686 2.299 2.785 3.19 3.537 3.862 4.164 4.716 4.954 5.174 5.223 5.815 6.024 6.437 6.81 7.156 7.328 7.651 7.955 8.409 8.687 8.96 9.397 9.811 10.181 10.538 10.877 11.319 11.742 12.122 12.577 13.019 13.444 13.921 14.451 14.986 15.592 16.251 16.921 17.601 18.397 19.325 20.242 21.29 22.47 23.849 25.402 27.252 29.378 31.749 33.507 34.265 34.549 34.606 34.551 34.427 34.24 33.986 33.647 33.358 33.086 32.792 32.462 32.098 31.768 31.44 31.128 30.831 30.524 30.204 29.916 29.634 29.36 29.142 28.895 28.612 28.318 28.016 27.805 27.594 27.261 27.007 26.739 26.594 26.27 25.943 25.601 25.416 24.848 24.728 24.468 24.204 23.636 23.312 22.968 22.556 22.047 21.443 20.606 17.909 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18626-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18626-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 8b44dd27..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18626-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31127 ,KEBNE ,17026700,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:53:41 CET,0.0 0.782 1.099 1.354 1.6 1.791 1.972 2.173 2.534 2.685 2.82 2.73 3.225 3.35 3.591 3.808 4.008 4.105 4.299 4.482 4.731 4.886 5.039 5.276 5.5 5.703 5.904 6.102 6.342 6.567 6.809 7.104 7.357 7.589 7.873 8.199 8.486 8.798 9.153 9.508 9.862 10.255 10.721 11.206 11.751 12.313 12.927 13.606 14.339 15.088 15.827 16.263 16.272 16.096 15.87 15.595 15.319 15.037 14.763 14.462 14.186 13.924 13.657 13.388 13.132 12.904 12.654 12.426 12.238 12.046 11.835 11.662 11.458 11.243 11.094 10.925 10.749 10.558 10.358 10.234 10.115 9.912 9.747 9.557 9.463 9.259 9.034 8.808 8.677 8.183 8.221 8.048 7.87 7.441 7.201 6.938 6.666 6.396 6.063 5.611 4.155 -2 ,5874 ,KEBNE ,17026701,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:53:05 CET,0.0 1.043 1.408 1.678 1.929 2.157 2.363 2.551 2.889 3.048 3.195 3.105 3.603 3.728 3.971 4.204 4.409 4.51 4.708 4.904 5.178 5.343 5.493 5.707 5.919 6.117 6.299 6.48 6.72 6.952 7.171 7.424 7.662 7.88 8.146 8.489 8.805 9.113 9.449 9.787 10.124 10.523 10.97 11.398 11.902 12.461 13.088 13.754 14.474 15.262 16.03 16.342 16.397 16.295 16.06 15.748 15.452 15.187 14.944 14.681 14.42 14.173 13.922 13.693 13.463 13.24 13.016 12.785 12.59 12.389 12.165 11.977 11.789 11.589 11.423 11.243 11.049 10.852 10.659 10.52 10.381 10.16 9.982 9.798 9.705 9.5 9.271 8.998 8.841 8.337 8.406 8.262 8.101 7.747 7.568 7.371 7.158 6.89 6.519 5.996 4.432 -3 ,14748 ,KEBNE ,17026702,Wed Dec 22 15:04:52 CET,Wed Dec 22 16:54:45 CET,0.0 0.911 1.346 1.696 1.958 2.18 2.384 2.586 2.958 3.127 3.282 3.207 3.7 3.828 4.063 4.263 4.458 4.553 4.741 4.932 5.197 5.362 5.525 5.755 5.975 6.192 6.396 6.587 6.844 7.088 7.314 7.582 7.829 8.055 8.33 8.646 8.944 9.256 9.595 9.964 10.346 10.774 11.257 11.718 12.236 12.795 13.4 14.105 14.92 15.69 16.399 16.709 16.641 16.434 16.205 15.925 15.622 15.296 14.98 14.661 14.372 14.099 13.831 13.589 13.359 13.14 12.912 12.697 12.487 12.255 12.022 11.821 11.611 11.401 11.238 11.078 10.898 10.697 10.509 10.371 10.221 9.985 9.807 9.632 9.547 9.355 9.146 8.942 8.837 8.359 8.423 8.272 8.112 7.779 7.615 7.439 7.227 6.988 6.73 6.322 4.408 -4 ,17679 ,KEBNE ,17026703,Wed Dec 22 15:05:54 CET,Wed Dec 22 16:55:39 CET,0.0 1.715 2.153 2.506 2.8 3.069 3.312 3.521 3.9 4.075 4.227 4.123 4.598 4.728 4.979 5.205 5.42 5.524 5.719 5.897 6.148 6.314 6.478 6.717 6.936 7.141 7.342 7.535 7.767 7.989 8.204 8.464 8.728 8.976 9.26 9.571 9.856 10.174 10.516 10.867 11.219 11.617 12.105 12.599 13.116 13.669 14.296 14.959 15.693 16.445 17.14 17.414 17.38 17.194 16.915 16.61 16.299 15.986 15.713 15.429 15.137 14.871 14.629 14.38 14.138 13.912 13.652 13.423 13.234 13.023 12.79 12.59 12.381 12.164 12.004 11.833 11.645 11.441 11.225 11.083 10.926 10.667 10.478 10.264 10.16 9.963 9.744 9.514 9.401 8.924 8.983 8.837 8.685 8.334 8.138 7.915 7.677 7.415 7.046 6.614 5.071 -5 ,16610 ,KEBNE ,17026704,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:54:05 CET,0.0 0.843 1.241 1.554 1.804 2.04 2.246 2.418 2.732 2.881 3.022 2.924 3.405 3.53 3.777 3.983 4.168 4.26 4.435 4.608 4.85 5.0 5.147 5.368 5.589 5.806 6.01 6.2 6.443 6.682 6.903 7.159 7.431 7.681 7.943 8.233 8.517 8.83 9.155 9.501 9.884 10.31 10.782 11.255 11.802 12.38 12.991 13.672 14.434 15.233 16.025 16.329 16.3 16.126 15.859 15.562 15.287 15.005 14.729 14.442 14.154 13.883 13.607 13.324 13.079 12.857 12.576 12.335 12.142 11.937 11.714 11.515 11.314 11.096 10.923 10.741 10.548 10.369 10.195 10.068 9.947 9.751 9.591 9.423 9.327 9.124 8.942 8.746 8.63 8.148 8.225 8.078 7.922 7.569 7.379 7.213 7.012 6.757 6.444 6.047 4.775 -6 ,22858 ,KEBNE ,17026705,Wed Dec 22 15:05:54 CET,Wed Dec 22 16:55:19 CET,0.0 0.634 0.963 1.261 1.521 1.735 1.925 2.092 2.399 2.56 2.706 2.59 3.075 3.204 3.429 3.623 3.812 3.909 4.103 4.29 4.547 4.709 4.879 5.113 5.326 5.533 5.728 5.924 6.162 6.377 6.594 6.872 7.144 7.408 7.694 7.999 8.302 8.635 8.994 9.383 9.778 10.201 10.707 11.215 11.78 12.36 12.998 13.714 14.515 15.309 15.976 16.314 16.338 16.182 15.945 15.652 15.378 15.116 14.84 14.522 14.239 13.982 13.724 13.483 13.259 13.05 12.814 12.576 12.377 12.192 11.981 11.785 11.577 11.358 11.196 11.04 10.878 10.698 10.5 10.354 10.204 9.964 9.787 9.601 9.496 9.275 9.053 8.818 8.696 8.213 8.29 8.146 7.995 7.653 7.454 7.238 7.017 6.737 6.386 5.899 4.618 -7 ,15460 ,KEBNE ,17026706,Wed Dec 22 15:05:54 CET,Wed Dec 22 16:54:34 CET,0.0 1.01 1.378 1.644 1.892 2.099 2.291 2.476 2.793 2.932 3.073 2.977 3.472 3.596 3.826 4.04 4.231 4.324 4.493 4.656 4.894 5.045 5.198 5.416 5.629 5.824 6.005 6.193 6.453 6.695 6.895 7.136 7.389 7.627 7.897 8.213 8.514 8.835 9.19 9.552 9.921 10.334 10.844 11.345 11.868 12.433 13.054 13.715 14.446 15.235 16.029 16.421 16.393 16.248 16.014 15.705 15.415 15.126 14.864 14.573 14.297 14.049 13.812 13.577 13.324 13.079 12.817 12.584 12.358 12.112 11.885 11.708 11.517 11.314 11.142 10.96 10.784 10.595 10.384 10.241 10.103 9.877 9.708 9.519 9.429 9.243 9.016 8.765 8.642 8.157 8.265 8.132 7.975 7.63 7.434 7.223 6.997 6.731 6.396 5.908 4.359 -8 ,13385 ,KEBNE ,17026707,Wed Dec 22 15:05:54 CET,Wed Dec 22 16:54:17 CET,0.0 1.048 1.384 1.628 1.871 2.102 2.289 2.475 2.821 2.977 3.117 2.997 3.464 3.572 3.783 3.987 4.189 4.28 4.462 4.649 4.914 5.078 5.233 5.449 5.666 5.883 6.084 6.274 6.508 6.735 6.959 7.229 7.489 7.741 8.028 8.335 8.624 8.946 9.294 9.649 10.017 10.43 10.906 11.384 11.949 12.557 13.205 13.866 14.565 15.321 16.084 16.431 16.409 16.267 16.03 15.781 15.528 15.237 14.963 14.677 14.425 14.188 13.95 13.707 13.455 13.223 12.995 12.791 12.621 12.444 12.263 12.104 11.917 11.716 11.548 11.375 11.201 11.01 10.817 10.682 10.534 10.287 10.105 9.906 9.81 9.615 9.401 9.184 9.068 8.6 8.698 8.55 8.399 8.054 7.849 7.629 7.397 7.119 6.793 6.38 5.1 -9 ,4019 ,KEBNE ,17026708,Wed Dec 22 15:05:54 CET,Wed Dec 22 16:55:01 CET,0.0 0.526 0.894 1.186 1.416 1.614 1.807 1.996 2.339 2.491 2.63 2.532 3.014 3.132 3.351 3.553 3.747 3.841 4.03 4.203 4.457 4.622 4.776 5.002 5.224 5.419 5.599 5.779 6.005 6.228 6.447 6.695 6.933 7.162 7.415 7.692 7.974 8.291 8.617 8.967 9.338 9.766 10.257 10.723 11.243 11.794 12.431 13.161 13.916 14.665 15.42 15.81 15.849 15.728 15.532 15.308 15.042 14.791 14.564 14.285 14.039 13.816 13.601 13.384 13.151 12.934 12.699 12.482 12.303 12.111 11.903 11.738 11.567 11.372 11.208 11.037 10.852 10.64 10.422 10.281 10.137 9.906 9.753 9.589 9.503 9.325 9.117 8.891 8.763 8.279 8.38 8.246 8.104 7.793 7.594 7.362 7.123 6.875 6.604 6.218 4.255 -10 ,17482 ,KEBNE ,17026709,Wed Dec 22 15:05:54 CET,Wed Dec 22 16:54:22 CET,0.0 0.948 1.355 1.655 1.895 2.142 2.373 2.571 2.936 3.102 3.255 3.164 3.651 3.779 4.034 4.268 4.483 4.591 4.794 4.979 5.22 5.374 5.531 5.756 5.978 6.19 6.381 6.559 6.787 7.011 7.233 7.507 7.756 7.98 8.231 8.536 8.839 9.164 9.511 9.868 10.256 10.697 11.174 11.634 12.162 12.731 13.339 13.97 14.685 15.425 16.05 16.29 16.287 16.144 15.902 15.634 15.369 15.078 14.769 14.424 14.146 13.919 13.682 13.437 13.194 12.957 12.696 12.44 12.206 11.959 11.713 11.513 11.297 11.078 10.925 10.764 10.582 10.395 10.195 10.054 9.904 9.661 9.488 9.316 9.229 9.047 8.852 8.629 8.519 8.062 8.168 8.027 7.874 7.517 7.315 7.12 6.912 6.658 6.331 5.866 4.916 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index f4ee675f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23778 ,TETRA ,17590870,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:36:32 CET,0.0 0.661 0.97 1.225 1.469 1.668 1.825 1.997 2.318 2.448 2.569 2.454 2.918 3.022 3.242 3.441 3.623 3.714 3.891 4.051 4.283 4.426 4.557 4.76 4.955 5.135 5.314 5.482 5.689 5.883 6.081 6.333 6.565 6.776 7.014 7.281 7.549 7.852 8.174 8.501 8.823 9.213 9.674 10.094 10.584 11.137 11.729 12.321 12.957 13.596 14.164 14.367 14.277 14.049 13.742 13.407 13.071 12.741 12.427 12.114 11.861 11.608 11.323 11.052 10.811 10.573 10.314 10.069 9.857 9.654 9.439 9.24 9.019 8.773 8.583 8.397 8.205 7.995 7.759 7.605 7.445 7.187 7.015 6.835 6.746 6.561 6.345 6.115 5.997 5.517 5.592 5.445 5.304 4.971 4.772 4.555 4.291 3.979 3.627 3.181 2.111 -2 ,19488 ,TETRA ,17590871,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:33:29 CET,0.0 1.28 1.635 1.96 2.19 2.391 2.571 2.727 3.035 3.163 3.282 3.184 3.673 3.796 4.037 4.247 4.454 4.552 4.725 4.906 5.179 5.34 5.5 5.736 5.948 6.137 6.318 6.503 6.736 6.951 7.156 7.404 7.641 7.876 8.148 8.438 8.702 8.994 9.325 9.665 9.998 10.345 10.754 11.176 11.669 12.198 12.777 13.379 13.98 14.594 15.141 15.283 15.129 14.864 14.573 14.269 13.944 13.628 13.366 13.081 12.785 12.511 12.248 11.983 11.712 11.445 11.175 10.953 10.757 10.544 10.316 10.121 9.912 9.689 9.512 9.332 9.143 8.946 8.743 8.601 8.432 8.144 7.954 7.776 7.687 7.489 7.284 7.067 6.954 6.479 6.56 6.412 6.249 5.903 5.726 5.543 5.348 5.092 4.781 4.421 3.557 -3 ,21405 ,TETRA ,17590872,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:33:12 CET,0.0 0.736 1.04 1.295 1.523 1.735 1.94 2.127 2.466 2.615 2.74 2.623 3.103 3.219 3.416 3.603 3.793 3.879 4.035 4.189 4.409 4.549 4.688 4.881 5.061 5.235 5.41 5.586 5.809 6.025 6.224 6.464 6.698 6.917 7.169 7.452 7.738 8.046 8.355 8.684 9.025 9.403 9.82 10.219 10.696 11.229 11.799 12.376 13.033 13.734 14.322 14.49 14.42 14.177 13.869 13.573 13.28 12.965 12.658 12.368 12.127 11.873 11.606 11.374 11.145 10.925 10.669 10.428 10.229 10.023 9.796 9.61 9.42 9.201 9.048 8.897 8.716 8.531 8.332 8.187 8.027 7.755 7.581 7.408 7.312 7.105 6.898 6.705 6.596 6.125 6.233 6.089 5.936 5.616 5.44 5.243 5.022 4.782 4.491 4.126 2.971 -4 ,20710 ,TETRA ,17590873,Sat Nov 27 21:23:14 CET,Sat Nov 27 23:32:50 CET,0.0 0.481 0.762 0.985 1.193 1.386 1.562 1.718 1.993 2.124 2.256 2.146 2.614 2.729 2.941 3.138 3.325 3.415 3.595 3.764 4.01 4.151 4.282 4.474 4.66 4.852 5.043 5.232 5.472 5.7 5.915 6.152 6.374 6.609 6.883 7.168 7.446 7.761 8.092 8.427 8.763 9.138 9.582 10.025 10.515 11.006 11.539 12.12 12.732 13.413 14.043 14.235 14.157 13.944 13.667 13.359 13.016 12.684 12.397 12.051 11.727 11.455 11.208 10.974 10.737 10.51 10.263 10.038 9.851 9.661 9.451 9.266 9.069 8.855 8.691 8.522 8.345 8.17 7.962 7.805 7.654 7.416 7.24 7.062 6.975 6.787 6.576 6.337 6.213 5.743 5.854 5.708 5.549 5.219 5.034 4.841 4.64 4.399 4.106 3.716 2.761 -5 ,14580 ,TETRA ,17590874,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:33:43 CET,0.0 0.836 1.219 1.448 1.63 1.804 1.975 2.135 2.405 2.535 2.673 2.566 3.047 3.17 3.389 3.594 3.789 3.888 4.07 4.23 4.459 4.609 4.763 4.969 5.152 5.333 5.508 5.674 5.896 6.12 6.331 6.578 6.813 7.051 7.331 7.623 7.893 8.205 8.529 8.869 9.25 9.675 10.151 10.606 11.116 11.665 12.254 12.895 13.594 14.251 14.784 15.006 14.945 14.7 14.399 14.091 13.791 13.513 13.248 12.911 12.594 12.31 12.029 11.763 11.517 11.287 11.048 10.836 10.628 10.405 10.179 9.995 9.797 9.576 9.38 9.18 8.992 8.775 8.526 8.36 8.195 7.905 7.706 7.512 7.407 7.179 6.949 6.718 6.593 6.104 6.169 6.018 5.866 5.525 5.326 5.123 4.907 4.658 4.35 3.893 2.95 -6 ,12602 ,TETRA ,17590875,Sat Nov 27 21:23:13 CET,Sat Nov 27 23:34:29 CET,0.0 0.491 0.794 1.054 1.271 1.455 1.625 1.779 2.074 2.212 2.341 2.23 2.704 2.81 3.018 3.215 3.386 3.464 3.635 3.804 4.043 4.195 4.338 4.534 4.737 4.935 5.118 5.295 5.512 5.729 5.94 6.185 6.428 6.656 6.917 7.213 7.47 7.762 8.085 8.409 8.741 9.09 9.494 9.924 10.417 10.938 11.478 12.042 12.691 13.375 14.017 14.25 14.158 13.935 13.688 13.432 13.147 12.84 12.551 12.244 11.982 11.747 11.507 11.253 11.013 10.786 10.534 10.321 10.123 9.897 9.668 9.478 9.28 9.072 8.915 8.747 8.555 8.362 8.152 7.999 7.84 7.608 7.447 7.262 7.163 6.967 6.765 6.552 6.432 5.956 6.067 5.928 5.777 5.46 5.278 5.096 4.907 4.655 4.367 3.979 3.15 -7 ,11871 ,TETRA ,17590876,Sat Nov 27 21:23:12 CET,Sat Nov 27 23:33:16 CET,0.0 0.88 1.218 1.511 1.743 1.931 2.095 2.243 2.523 2.658 2.784 2.651 3.117 3.222 3.414 3.594 3.771 3.861 4.045 4.223 4.459 4.603 4.745 4.951 5.145 5.317 5.487 5.655 5.864 6.064 6.266 6.516 6.742 6.958 7.211 7.483 7.745 8.036 8.336 8.655 8.998 9.365 9.774 10.179 10.634 11.133 11.694 12.297 12.971 13.629 14.212 14.455 14.385 14.176 13.894 13.626 13.358 13.084 12.82 12.514 12.248 12.02 11.785 11.547 11.321 11.126 10.91 10.696 10.515 10.32 10.114 9.93 9.728 9.522 9.358 9.185 8.999 8.809 8.615 8.478 8.334 8.098 7.934 7.76 7.667 7.488 7.304 7.117 7.004 6.524 6.648 6.518 6.358 6.0 5.808 5.597 5.383 5.139 4.844 4.475 3.674 -8 ,25256 ,TETRA ,17590877,Sat Nov 27 21:24:13 CET,Sat Nov 27 23:35:51 CET,0.0 0.649 0.911 1.134 1.322 1.498 1.687 1.866 2.174 2.308 2.424 2.271 2.728 2.829 3.032 3.242 3.422 3.505 3.682 3.856 4.083 4.226 4.361 4.55 4.728 4.897 5.065 5.229 5.439 5.646 5.847 6.084 6.304 6.516 6.764 7.025 7.268 7.545 7.847 8.178 8.516 8.886 9.304 9.726 10.233 10.754 11.295 11.888 12.557 13.242 13.85 14.068 13.979 13.801 13.598 13.337 13.053 12.764 12.5 12.226 11.955 11.708 11.462 11.216 10.965 10.726 10.486 10.255 10.037 9.819 9.598 9.409 9.22 9.019 8.87 8.713 8.543 8.366 8.178 8.041 7.887 7.644 7.481 7.312 7.221 7.026 6.825 6.608 6.493 6.031 6.162 6.027 5.872 5.525 5.352 5.171 4.969 4.748 4.452 4.107 3.434 -9 ,32002 ,TETRA ,17590878,Sat Nov 27 21:24:13 CET,Sat Nov 27 23:34:50 CET,0.0 0.896 1.232 1.493 1.703 1.887 2.042 2.196 2.482 2.608 2.74 2.637 3.111 3.217 3.415 3.614 3.814 3.906 4.074 4.241 4.49 4.651 4.806 5.027 5.243 5.447 5.635 5.806 6.022 6.24 6.454 6.692 6.904 7.127 7.399 7.685 7.941 8.227 8.548 8.874 9.197 9.569 9.989 10.403 10.882 11.393 11.959 12.544 13.186 13.85 14.516 14.803 14.705 14.487 14.222 13.939 13.662 13.388 13.107 12.788 12.499 12.225 11.955 11.713 11.5 11.302 11.064 10.824 10.616 10.407 10.2 10.028 9.837 9.638 9.494 9.346 9.181 9.004 8.807 8.667 8.521 8.301 8.138 7.967 7.88 7.689 7.479 7.257 7.137 6.655 6.777 6.655 6.514 6.216 6.042 5.835 5.601 5.325 5.009 4.622 3.245 -10 ,19920 ,TETRA ,17590879,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:34:43 CET,0.0 1.138 1.555 1.891 2.153 2.399 2.613 2.816 3.185 3.346 3.498 3.397 3.873 3.981 4.19 4.393 4.578 4.667 4.85 5.028 5.29 5.45 5.593 5.799 6.0 6.191 6.389 6.593 6.839 7.058 7.263 7.503 7.724 7.937 8.181 8.465 8.747 9.069 9.404 9.74 10.085 10.452 10.866 11.288 11.763 12.245 12.832 13.482 14.11 14.74 15.297 15.444 15.327 15.085 14.791 14.484 14.161 13.83 13.543 13.232 12.939 12.694 12.466 12.224 11.994 11.776 11.53 11.319 11.128 10.935 10.737 10.542 10.331 10.148 10.008 9.844 9.666 9.473 9.272 9.138 8.989 8.744 8.582 8.413 8.327 8.151 7.962 7.745 7.631 7.158 7.262 7.132 6.996 6.688 6.507 6.303 6.078 5.828 5.545 5.134 4.046 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index d276ba54..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4061 ,TETRA ,17590880,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:36:03 CET,0.0 1.347 1.74 2.085 2.379 2.582 2.781 2.993 3.337 3.479 3.632 3.598 4.092 4.208 4.429 4.643 4.827 4.915 5.1 5.288 5.541 5.698 5.849 6.059 6.26 6.445 6.631 6.81 7.027 7.236 7.439 7.684 7.909 8.126 8.364 8.621 8.878 9.16 9.477 9.785 10.074 10.398 10.765 11.106 11.502 11.931 12.383 12.816 13.214 13.574 13.696 13.393 12.974 12.509 12.017 11.515 11.052 10.6 10.174 9.742 9.377 9.032 8.696 8.385 8.081 7.81 7.536 7.283 7.068 6.833 6.584 6.375 6.149 5.921 5.733 5.52 5.301 5.06 4.803 4.642 4.474 4.184 3.976 3.767 3.663 3.447 3.217 2.97 2.834 2.333 2.396 2.232 2.057 1.657 1.428 1.176 0.871 0.504 0.116 -0.37 -1.746 -2 ,10037 ,TETRA ,17590881,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:37:55 CET,0.0 1.058 1.501 1.823 2.1 2.313 2.506 2.698 3.04 3.199 3.363 3.314 3.801 3.926 4.177 4.387 4.579 4.676 4.851 5.007 5.249 5.415 5.573 5.799 6.009 6.212 6.411 6.603 6.855 7.099 7.328 7.579 7.806 8.024 8.257 8.524 8.785 9.071 9.37 9.666 9.969 10.296 10.65 11.006 11.4 11.817 12.272 12.696 13.09 13.358 13.397 13.056 12.548 12.029 11.49 10.937 10.424 9.947 9.524 9.086 8.696 8.341 7.996 7.666 7.348 7.059 6.764 6.494 6.243 5.979 5.728 5.519 5.296 5.06 4.878 4.701 4.506 4.298 4.086 3.934 3.775 3.503 3.301 3.098 2.996 2.785 2.562 2.318 2.196 1.715 1.781 1.609 1.438 1.097 0.919 0.699 0.452 0.2 -0.117 -0.616 -1.824 -3 ,14463 ,TETRA ,17590882,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:34:53 CET,0.0 1.561 2.025 2.367 2.653 2.901 3.148 3.379 3.753 3.94 4.115 4.039 4.535 4.674 4.944 5.177 5.395 5.504 5.7 5.887 6.151 6.325 6.484 6.704 6.923 7.133 7.329 7.519 7.772 8.027 8.27 8.56 8.843 9.101 9.38 9.674 9.937 10.215 10.497 10.796 11.13 11.479 11.815 12.145 12.519 12.937 13.374 13.761 14.119 14.423 14.569 14.274 13.768 13.239 12.729 12.198 11.663 11.19 10.798 10.344 9.929 9.587 9.262 8.942 8.631 8.344 8.049 7.802 7.578 7.326 7.073 6.86 6.627 6.387 6.194 5.972 5.745 5.507 5.249 5.079 4.916 4.659 4.472 4.282 4.19 3.983 3.743 3.474 3.332 2.83 2.889 2.74 2.578 2.216 2.014 1.776 1.478 1.167 0.852 0.392 -0.858 -4 ,19539 ,TETRA ,17590883,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:35:02 CET,0.0 1.889 2.357 2.703 2.946 3.162 3.369 3.559 3.905 4.058 4.206 4.129 4.625 4.762 5.027 5.267 5.477 5.574 5.748 5.899 6.134 6.292 6.44 6.64 6.834 7.033 7.224 7.41 7.644 7.858 8.047 8.261 8.478 8.685 8.917 9.179 9.441 9.712 9.997 10.293 10.566 10.878 11.258 11.631 12.04 12.424 12.819 13.209 13.564 13.9 14.047 13.82 13.393 12.884 12.366 11.869 11.402 10.951 10.565 10.157 9.771 9.431 9.112 8.79 8.495 8.219 7.922 7.661 7.436 7.184 6.894 6.659 6.43 6.189 6.004 5.804 5.581 5.355 5.124 4.961 4.785 4.51 4.32 4.126 4.029 3.831 3.602 3.356 3.242 2.752 2.816 2.667 2.502 2.144 1.953 1.757 1.55 1.268 0.904 0.428 -0.787 -5 ,29384 ,TETRA ,17590884,Sat Nov 27 21:23:17 CET,Sat Nov 27 23:34:34 CET,0.0 1.582 2.015 2.352 2.614 2.844 3.062 3.27 3.638 3.794 3.936 3.837 4.317 4.438 4.698 4.934 5.145 5.255 5.456 5.639 5.895 6.05 6.218 6.457 6.674 6.874 7.062 7.226 7.434 7.659 7.871 8.115 8.345 8.562 8.799 9.065 9.328 9.629 9.945 10.237 10.528 10.865 11.254 11.626 12.018 12.409 12.851 13.292 13.692 14.061 14.227 13.939 13.502 12.995 12.477 11.948 11.471 11.031 10.637 10.24 9.877 9.534 9.212 8.902 8.586 8.305 8.017 7.747 7.503 7.245 6.978 6.755 6.52 6.286 6.107 5.916 5.699 5.463 5.225 5.066 4.907 4.641 4.453 4.255 4.147 3.913 3.671 3.435 3.295 2.794 2.854 2.691 2.529 2.184 1.977 1.746 1.512 1.234 0.904 0.485 -0.721 -6 ,18056 ,TETRA ,17590885,Sat Nov 27 21:24:13 CET,Sat Nov 27 23:33:31 CET,0.0 1.529 2.038 2.413 2.714 2.954 3.164 3.358 3.708 3.876 4.046 3.987 4.471 4.591 4.812 5.014 5.2 5.292 5.466 5.634 5.884 6.038 6.195 6.439 6.663 6.864 7.054 7.25 7.51 7.74 7.944 8.183 8.403 8.616 8.877 9.184 9.477 9.768 10.066 10.4 10.748 11.12 11.519 11.9 12.269 12.649 13.075 13.487 13.918 14.323 14.492 14.116 13.537 12.93 12.398 11.881 11.395 10.923 10.494 10.064 9.689 9.331 8.977 8.651 8.344 8.056 7.756 7.481 7.225 6.956 6.676 6.457 6.222 5.942 5.715 5.481 5.24 4.996 4.74 4.559 4.388 4.13 3.945 3.756 3.658 3.435 3.188 2.925 2.784 2.277 2.326 2.152 1.969 1.567 1.345 1.119 0.851 0.548 0.226 -0.2 -1.495 -7 ,398 ,TETRA ,17590886,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:35:30 CET,0.0 1.391 1.858 2.149 2.403 2.654 2.849 3.039 3.405 3.581 3.741 3.661 4.15 4.267 4.469 4.668 4.847 4.937 5.131 5.32 5.574 5.722 5.873 6.1 6.306 6.503 6.692 6.879 7.107 7.312 7.51 7.759 8.005 8.248 8.515 8.798 9.059 9.333 9.614 9.909 10.219 10.545 10.908 11.269 11.666 12.087 12.524 12.951 13.407 13.732 13.826 13.612 13.131 12.584 12.047 11.556 11.102 10.647 10.253 9.835 9.442 9.116 8.814 8.504 8.212 7.946 7.648 7.387 7.158 6.919 6.675 6.472 6.24 5.986 5.811 5.624 5.413 5.207 4.985 4.82 4.661 4.411 4.229 4.036 3.936 3.726 3.503 3.261 3.129 2.646 2.737 2.581 2.417 2.068 1.866 1.66 1.426 1.142 0.85 0.474 -0.55 -8 ,25676 ,TETRA ,17590887,Sat Nov 27 21:23:16 CET,Sat Nov 27 23:35:33 CET,0.0 1.704 2.177 2.543 2.874 3.147 3.393 3.625 4.03 4.222 4.396 4.32 4.817 4.959 5.223 5.425 5.629 5.738 5.945 6.144 6.425 6.592 6.762 7.003 7.228 7.436 7.616 7.793 8.023 8.247 8.464 8.734 8.983 9.221 9.496 9.774 10.033 10.32 10.63 10.965 11.298 11.665 12.069 12.439 12.858 13.301 13.76 14.195 14.584 14.904 14.97 14.642 14.155 13.577 13.006 12.49 12.01 11.558 11.163 10.738 10.352 10.002 9.666 9.349 9.049 8.779 8.508 8.253 8.031 7.775 7.49 7.269 7.047 6.815 6.629 6.426 6.218 5.999 5.753 5.595 5.44 5.178 4.993 4.807 4.711 4.496 4.256 4.016 3.891 3.392 3.448 3.295 3.137 2.75 2.531 2.327 2.107 1.849 1.546 1.094 -0.204 -9 ,26916 ,TETRA ,17590888,Sat Nov 27 21:24:13 CET,Sat Nov 27 23:34:17 CET,0.0 1.476 1.874 2.192 2.434 2.662 2.864 3.05 3.345 3.488 3.635 3.537 4.02 4.139 4.354 4.551 4.748 4.839 4.998 5.168 5.435 5.585 5.718 5.919 6.13 6.322 6.499 6.681 6.905 7.131 7.361 7.62 7.847 8.058 8.316 8.589 8.837 9.102 9.381 9.681 9.986 10.321 10.708 11.101 11.524 11.891 12.274 12.688 13.088 13.435 13.535 13.264 12.808 12.24 11.714 11.245 10.818 10.371 9.949 9.515 9.155 8.851 8.548 8.259 7.986 7.697 7.367 7.08 6.847 6.614 6.336 6.094 5.867 5.647 5.461 5.249 5.03 4.808 4.573 4.411 4.256 4.017 3.83 3.619 3.517 3.308 3.067 2.805 2.673 2.187 2.287 2.148 2.0 1.633 1.417 1.183 0.93 0.639 0.276 -0.218 -1.245 -10 ,18647 ,TETRA ,17590889,Sat Nov 27 21:24:13 CET,Sat Nov 27 23:39:45 CET,0.0 1.079 1.502 1.845 2.122 2.412 2.68 2.871 3.201 3.351 3.497 3.424 3.902 4.023 4.258 4.474 4.675 4.772 4.95 5.12 5.367 5.517 5.657 5.859 6.046 6.24 6.431 6.602 6.817 7.015 7.207 7.431 7.628 7.832 8.068 8.326 8.572 8.832 9.113 9.387 9.687 10.023 10.374 10.729 11.135 11.574 12.049 12.459 12.862 13.212 13.225 12.82 12.326 11.825 11.323 10.825 10.361 9.931 9.584 9.211 8.87 8.57 8.266 7.944 7.637 7.368 7.085 6.808 6.565 6.327 6.067 5.839 5.596 5.344 5.151 4.952 4.743 4.534 4.315 4.162 4.001 3.748 3.581 3.404 3.309 3.115 2.909 2.667 2.536 2.049 2.15 2.004 1.854 1.526 1.327 1.108 0.861 0.559 0.215 -0.228 -1.18 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index e8cef8a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32324 ,KEBNE ,17026710,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:56:32 CET,0.0 0.61 0.964 1.194 1.401 1.603 1.801 1.979 2.282 2.422 2.553 2.423 2.893 3.01 3.228 3.438 3.632 3.718 3.886 4.055 4.281 4.415 4.545 4.745 4.946 5.134 5.313 5.476 5.665 5.86 6.062 6.294 6.525 6.756 7.02 7.296 7.552 7.827 8.117 8.417 8.725 9.066 9.46 9.867 10.315 10.796 11.339 11.94 12.603 13.23 13.761 13.92 13.735 13.408 13.044 12.67 12.289 11.908 11.569 11.189 10.825 10.505 10.183 9.848 9.542 9.263 8.975 8.724 8.497 8.243 7.986 7.789 7.568 7.328 7.147 6.951 6.73 6.5 6.265 6.098 5.925 5.655 5.452 5.233 5.126 4.904 4.668 4.424 4.296 3.807 3.861 3.704 3.535 3.194 3.005 2.808 2.601 2.331 1.998 1.551 0.575 -2 ,2885 ,KEBNE ,17026711,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:56:29 CET,0.0 1.032 1.392 1.668 1.913 2.128 2.296 2.453 2.751 2.89 3.021 2.911 3.382 3.485 3.685 3.885 4.064 4.145 4.299 4.436 4.646 4.804 4.958 5.17 5.363 5.552 5.733 5.893 6.105 6.324 6.532 6.766 6.987 7.198 7.453 7.753 8.037 8.333 8.649 8.983 9.316 9.676 10.085 10.501 10.961 11.452 11.979 12.552 13.154 13.75 14.262 14.31 14.061 13.681 13.214 12.742 12.332 11.968 11.643 11.263 10.916 10.598 10.283 9.974 9.686 9.433 9.135 8.856 8.609 8.332 8.051 7.813 7.554 7.299 7.117 6.931 6.731 6.497 6.228 6.044 5.86 5.563 5.348 5.125 5.011 4.777 4.507 4.231 4.108 3.613 3.633 3.462 3.287 2.906 2.698 2.468 2.188 1.857 1.479 1.036 -0.542 -3 ,25310 ,KEBNE ,17026712,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:56:42 CET,0.0 0.653 0.949 1.203 1.419 1.611 1.786 1.958 2.244 2.368 2.491 2.359 2.824 2.942 3.153 3.336 3.505 3.586 3.742 3.895 4.117 4.256 4.39 4.586 4.777 4.96 5.13 5.294 5.502 5.711 5.922 6.161 6.373 6.583 6.841 7.128 7.394 7.676 8.001 8.368 8.727 9.109 9.546 9.962 10.427 10.928 11.474 12.049 12.619 13.175 13.636 13.744 13.542 13.239 12.861 12.46 12.095 11.697 11.331 10.954 10.616 10.317 10.03 9.771 9.519 9.244 8.951 8.687 8.454 8.214 7.938 7.708 7.476 7.245 7.061 6.843 6.628 6.428 6.221 6.058 5.882 5.623 5.43 5.227 5.122 4.9 4.682 4.456 4.327 3.834 3.883 3.725 3.572 3.211 2.98 2.728 2.441 2.119 1.733 1.269 0.162 -4 ,30353 ,KEBNE ,17026713,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:55:52 CET,0.0 1.156 1.522 1.795 2.041 2.264 2.454 2.618 2.927 3.064 3.193 3.084 3.557 3.667 3.871 4.056 4.225 4.304 4.456 4.612 4.846 4.994 5.149 5.386 5.6 5.783 5.956 6.132 6.366 6.588 6.794 7.048 7.31 7.569 7.861 8.178 8.475 8.793 9.124 9.457 9.804 10.179 10.606 11.054 11.54 12.027 12.531 13.111 13.778 14.422 15.0 15.162 14.975 14.676 14.31 13.866 13.46 13.094 12.749 12.388 12.053 11.718 11.403 11.113 10.835 10.572 10.285 10.017 9.779 9.515 9.228 8.995 8.744 8.478 8.275 8.076 7.871 7.656 7.425 7.262 7.103 6.849 6.669 6.483 6.385 6.168 5.93 5.668 5.538 5.064 5.142 4.992 4.835 4.506 4.325 4.112 3.86 3.578 3.26 2.798 1.746 -5 ,15513 ,KEBNE ,17026714,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:54:54 CET,0.0 0.777 1.046 1.263 1.457 1.631 1.783 1.924 2.177 2.29 2.405 2.271 2.734 2.845 3.053 3.251 3.442 3.525 3.684 3.857 4.087 4.235 4.384 4.588 4.781 4.957 5.129 5.291 5.483 5.678 5.87 6.091 6.299 6.501 6.743 7.001 7.248 7.518 7.82 8.159 8.482 8.819 9.208 9.613 10.08 10.552 11.082 11.666 12.27 12.857 13.375 13.502 13.283 12.979 12.686 12.363 12.017 11.699 11.42 11.084 10.772 10.497 10.212 9.931 9.666 9.43 9.18 8.926 8.697 8.444 8.175 7.967 7.756 7.531 7.344 7.145 6.928 6.699 6.471 6.322 6.174 5.929 5.737 5.534 5.426 5.2 4.965 4.696 4.557 4.065 4.095 3.929 3.772 3.434 3.234 2.987 2.726 2.454 2.131 1.709 0.553 -6 ,15602 ,KEBNE ,17026715,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:55:31 CET,0.0 0.684 1.005 1.284 1.493 1.675 1.846 2.009 2.326 2.458 2.59 2.503 2.979 3.092 3.304 3.512 3.705 3.79 3.957 4.124 4.358 4.497 4.623 4.813 5.009 5.185 5.351 5.519 5.737 5.954 6.163 6.396 6.622 6.852 7.115 7.4 7.654 7.935 8.239 8.554 8.881 9.237 9.648 10.047 10.496 10.998 11.548 12.11 12.701 13.29 13.813 14.035 13.899 13.576 13.216 12.809 12.394 12.0 11.651 11.289 10.958 10.661 10.357 10.064 9.801 9.547 9.268 9.009 8.78 8.524 8.245 8.03 7.814 7.573 7.382 7.18 6.964 6.747 6.517 6.355 6.182 5.916 5.728 5.529 5.429 5.212 4.97 4.718 4.588 4.104 4.169 4.007 3.84 3.487 3.298 3.072 2.821 2.527 2.189 1.787 0.874 -7 ,32548 ,KEBNE ,17026716,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:55:23 CET,0.0 0.826 1.149 1.4 1.606 1.77 1.931 2.081 2.335 2.458 2.574 2.446 2.916 3.016 3.204 3.404 3.592 3.678 3.853 4.02 4.261 4.421 4.561 4.749 4.944 5.135 5.313 5.475 5.673 5.874 6.071 6.315 6.559 6.789 7.054 7.354 7.645 7.938 8.231 8.548 8.895 9.282 9.706 10.116 10.584 11.089 11.628 12.229 12.885 13.493 14.006 14.09 13.86 13.539 13.185 12.824 12.439 12.051 11.695 11.313 10.991 10.684 10.363 10.043 9.735 9.461 9.162 8.897 8.669 8.415 8.157 7.942 7.71 7.473 7.287 7.08 6.87 6.665 6.444 6.284 6.109 5.824 5.626 5.429 5.322 5.1 4.89 4.652 4.521 4.014 4.028 3.857 3.68 3.326 3.129 2.922 2.7 2.423 2.034 1.564 0.426 -8 ,25948 ,KEBNE ,17026717,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:57:24 CET,0.0 0.641 0.955 1.207 1.419 1.629 1.819 1.983 2.296 2.438 2.579 2.48 2.95 3.062 3.288 3.501 3.683 3.765 3.918 4.071 4.281 4.412 4.551 4.759 4.968 5.177 5.368 5.55 5.777 5.996 6.216 6.471 6.695 6.888 7.107 7.364 7.631 7.915 8.192 8.473 8.768 9.106 9.482 9.846 10.287 10.765 11.31 11.911 12.498 13.062 13.513 13.565 13.357 13.037 12.66 12.275 11.897 11.519 11.184 10.811 10.453 10.127 9.832 9.564 9.296 9.022 8.727 8.451 8.21 7.962 7.689 7.452 7.194 6.94 6.757 6.553 6.336 6.102 5.845 5.675 5.511 5.25 5.052 4.856 4.755 4.528 4.279 4.015 3.883 3.39 3.433 3.276 3.1 2.705 2.505 2.303 2.09 1.824 1.483 0.95 -0.412 -9 ,16836 ,KEBNE ,17026718,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:56:44 CET,0.0 0.765 1.151 1.438 1.667 1.87 2.052 2.232 2.598 2.769 2.914 2.8 3.264 3.371 3.578 3.777 3.972 4.066 4.232 4.393 4.625 4.781 4.932 5.148 5.365 5.575 5.775 5.961 6.199 6.43 6.639 6.878 7.12 7.352 7.595 7.851 8.101 8.384 8.698 9.028 9.351 9.699 10.101 10.476 10.901 11.382 11.924 12.497 13.112 13.76 14.306 14.43 14.226 13.941 13.637 13.273 12.867 12.479 12.139 11.782 11.485 11.209 10.933 10.676 10.412 10.159 9.889 9.645 9.43 9.197 8.954 8.751 8.532 8.296 8.102 7.889 7.67 7.434 7.19 7.013 6.822 6.539 6.35 6.144 6.035 5.804 5.536 5.267 5.141 4.657 4.725 4.582 4.412 4.006 3.811 3.611 3.353 3.057 2.711 2.248 0.881 -10 ,2765 ,KEBNE ,17026719,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:54:39 CET,0.0 0.579 0.956 1.25 1.46 1.653 1.841 2.012 2.301 2.439 2.578 2.495 2.97 3.074 3.289 3.491 3.67 3.761 3.948 4.131 4.386 4.541 4.685 4.879 5.072 5.264 5.442 5.609 5.823 6.04 6.238 6.465 6.694 6.927 7.203 7.492 7.755 8.05 8.357 8.695 9.043 9.405 9.86 10.318 10.796 11.307 11.889 12.474 13.075 13.705 14.196 14.196 13.949 13.629 13.24 12.82 12.417 12.054 11.732 11.352 10.988 10.646 10.306 9.997 9.735 9.489 9.21 8.957 8.741 8.515 8.285 8.092 7.878 7.642 7.448 7.237 7.017 6.806 6.594 6.451 6.296 6.012 5.802 5.591 5.488 5.276 5.047 4.815 4.687 4.195 4.222 4.05 3.881 3.473 3.249 3.023 2.775 2.485 2.12 1.595 0.051 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt deleted file mode 100644 index f65c1a19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20682 ,TETRA ,17590890,Sat Nov 27 21:24:13 CET,Sat Nov 27 23:37:48 CET,0.0 0.889 1.315 1.648 1.891 2.107 2.313 2.504 2.885 3.058 3.208 3.103 3.579 3.706 3.949 4.164 4.372 4.478 4.68 4.859 5.129 5.311 5.464 5.671 5.874 6.074 6.271 6.476 6.738 6.962 7.158 7.382 7.593 7.787 8.008 8.255 8.491 8.779 9.087 9.378 9.657 10.001 10.421 10.774 11.161 11.58 11.983 12.402 12.832 13.059 12.929 12.42 11.798 11.172 10.587 10.032 9.539 9.052 8.596 8.143 7.748 7.37 7.003 6.67 6.35 6.046 5.712 5.419 5.153 4.866 4.561 4.299 4.049 3.779 3.546 3.321 3.106 2.865 2.598 2.421 2.238 1.924 1.694 1.46 1.343 1.109 0.845 0.556 0.407 -0.113 -0.073 -0.246 -0.432 -0.83 -1.057 -1.299 -1.556 -1.863 -2.261 -2.824 -4.754 -2 ,18623 ,TETRA ,17590891,Sat Nov 27 21:24:15 CET,Sat Nov 27 23:36:02 CET,0.0 1.267 1.735 2.034 2.279 2.53 2.75 2.937 3.325 3.508 3.656 3.567 4.044 4.159 4.404 4.635 4.824 4.919 5.099 5.269 5.508 5.657 5.806 6.021 6.236 6.451 6.658 6.844 7.073 7.302 7.522 7.77 8.011 8.259 8.534 8.829 9.126 9.443 9.752 10.05 10.358 10.699 11.093 11.491 11.928 12.373 12.824 13.249 13.658 13.995 13.96 13.361 12.716 12.077 11.437 10.818 10.247 9.703 9.209 8.709 8.282 7.907 7.567 7.24 6.918 6.621 6.297 6.003 5.746 5.467 5.186 4.943 4.694 4.437 4.218 3.98 3.737 3.486 3.228 3.049 2.857 2.558 2.35 2.125 2.011 1.785 1.517 1.215 1.071 0.579 0.653 0.483 0.291 -0.136 -0.371 -0.615 -0.877 -1.175 -1.58 -2.128 -3.78 -3 ,8923 ,TETRA ,17590892,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:35:34 CET,0.0 0.955 1.423 1.829 2.178 2.463 2.681 2.873 3.242 3.416 3.581 3.505 3.986 4.112 4.365 4.58 4.783 4.898 5.105 5.277 5.523 5.689 5.847 6.075 6.293 6.497 6.684 6.856 7.089 7.305 7.513 7.768 7.999 8.221 8.475 8.738 8.988 9.264 9.547 9.849 10.157 10.496 10.88 11.23 11.616 12.006 12.389 12.765 13.086 13.267 13.222 12.772 12.122 11.438 10.816 10.186 9.607 9.103 8.655 8.175 7.76 7.397 7.035 6.68 6.341 6.032 5.704 5.389 5.112 4.828 4.533 4.309 4.074 3.801 3.578 3.358 3.138 2.897 2.634 2.452 2.278 1.994 1.783 1.563 1.449 1.233 1.0 0.736 0.601 0.102 0.155 0.003 -0.148 -0.52 -0.744 -0.981 -1.243 -1.576 -1.971 -2.466 -4.004 -4 ,32635 ,TETRA ,17590893,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:40:12 CET,0.0 1.368 1.802 2.157 2.489 2.76 2.999 3.212 3.544 3.688 3.821 3.713 4.201 4.332 4.57 4.765 4.957 5.056 5.235 5.407 5.668 5.826 5.975 6.185 6.39 6.587 6.765 6.943 7.191 7.417 7.621 7.869 8.093 8.292 8.52 8.778 9.033 9.312 9.59 9.884 10.21 10.55 10.897 11.208 11.565 11.988 12.432 12.839 13.224 13.515 13.511 13.037 12.468 11.866 11.211 10.569 9.994 9.475 9.037 8.606 8.207 7.827 7.451 7.094 6.776 6.463 6.103 5.793 5.532 5.243 4.942 4.715 4.489 4.234 4.031 3.811 3.574 3.343 3.093 2.907 2.718 2.42 2.209 1.991 1.881 1.662 1.437 1.188 1.045 0.527 0.538 0.367 0.19 -0.225 -0.469 -0.722 -1.03 -1.375 -1.738 -2.266 -4.989 -5 ,9322 ,TETRA ,17590894,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:37:59 CET,0.0 1.285 1.649 1.908 2.142 2.385 2.604 2.812 3.168 3.319 3.464 3.386 3.878 4.01 4.237 4.451 4.676 4.784 4.986 5.179 5.447 5.61 5.771 5.992 6.189 6.388 6.595 6.775 6.97 7.163 7.362 7.609 7.839 8.05 8.294 8.558 8.818 9.102 9.402 9.715 10.017 10.344 10.729 11.078 11.423 11.795 12.216 12.624 13.061 13.412 13.38 12.916 12.294 11.671 11.071 10.501 9.974 9.455 8.985 8.521 8.099 7.709 7.356 7.01 6.663 6.349 6.033 5.749 5.501 5.243 4.972 4.75 4.519 4.252 4.033 3.813 3.597 3.366 3.113 2.941 2.76 2.472 2.276 2.072 1.964 1.745 1.514 1.255 1.113 0.605 0.64 0.489 0.333 -0.027 -0.229 -0.453 -0.71 -1.021 -1.373 -1.87 -3.277 -6 ,1255 ,TETRA ,17590895,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:36:38 CET,0.0 1.723 2.2 2.54 2.835 3.091 3.336 3.564 3.92 4.088 4.247 4.143 4.617 4.726 4.95 5.166 5.361 5.452 5.632 5.812 6.054 6.209 6.367 6.584 6.785 6.979 7.16 7.329 7.552 7.772 7.973 8.213 8.45 8.663 8.888 9.148 9.399 9.656 9.921 10.199 10.505 10.863 11.242 11.581 11.98 12.385 12.782 13.175 13.517 13.797 13.875 13.404 12.664 11.913 11.203 10.537 9.965 9.443 8.987 8.5 8.045 7.651 7.287 6.935 6.594 6.263 5.931 5.642 5.375 5.092 4.808 4.58 4.336 4.068 3.851 3.623 3.401 3.172 2.921 2.737 2.542 2.227 1.994 1.75 1.621 1.369 1.106 0.822 0.678 0.176 0.217 0.033 -0.157 -0.544 -0.766 -1.034 -1.34 -1.664 -2.022 -2.531 -4.558 -7 ,24394 ,TETRA ,17590896,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:38:06 CET,0.0 1.472 2.033 2.416 2.73 2.985 3.22 3.42 3.77 3.928 4.081 4.009 4.502 4.635 4.88 5.102 5.31 5.409 5.61 5.804 6.07 6.24 6.389 6.619 6.856 7.06 7.253 7.446 7.693 7.921 8.131 8.385 8.632 8.858 9.112 9.402 9.659 9.92 10.203 10.493 10.793 11.12 11.485 11.836 12.208 12.589 12.992 13.409 13.802 14.044 13.968 13.469 12.85 12.213 11.601 11.009 10.492 10.013 9.561 9.092 8.682 8.289 7.904 7.556 7.235 6.944 6.649 6.378 6.136 5.868 5.56 5.3 5.048 4.787 4.574 4.368 4.157 3.917 3.655 3.483 3.309 3.01 2.796 2.582 2.476 2.252 2.008 1.755 1.62 1.118 1.157 0.986 0.806 0.431 0.232 0.001 -0.246 -0.522 -0.838 -1.334 -3.006 -8 ,17754 ,TETRA ,17590897,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:35:21 CET,0.0 1.222 1.704 2.018 2.305 2.577 2.785 2.997 3.393 3.56 3.706 3.634 4.109 4.221 4.427 4.625 4.826 4.921 5.097 5.258 5.489 5.647 5.807 6.03 6.222 6.401 6.588 6.776 7.002 7.201 7.394 7.625 7.83 8.022 8.248 8.517 8.788 9.062 9.329 9.61 9.917 10.249 10.618 10.981 11.356 11.749 12.162 12.595 12.996 13.276 13.307 12.889 12.356 11.769 11.17 10.591 10.056 9.546 9.086 8.622 8.212 7.822 7.456 7.119 6.784 6.474 6.142 5.834 5.576 5.305 5.02 4.795 4.557 4.305 4.106 3.894 3.671 3.438 3.185 2.996 2.797 2.492 2.295 2.091 1.977 1.751 1.52 1.264 1.126 0.626 0.685 0.513 0.333 -0.023 -0.233 -0.483 -0.752 -1.044 -1.382 -1.885 -4.068 -9 ,9267 ,TETRA ,17590898,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:35:41 CET,0.0 1.203 1.673 2.046 2.347 2.599 2.85 3.057 3.403 3.586 3.756 3.691 4.176 4.286 4.487 4.689 4.885 4.982 5.178 5.341 5.554 5.703 5.856 6.077 6.287 6.481 6.666 6.842 7.076 7.303 7.515 7.751 7.958 8.17 8.421 8.672 8.908 9.166 9.42 9.704 10.022 10.344 10.699 11.06 11.447 11.819 12.172 12.499 12.784 13.026 13.065 12.581 11.94 11.311 10.705 10.107 9.566 9.073 8.65 8.207 7.804 7.432 7.073 6.736 6.415 6.118 5.804 5.518 5.266 5.01 4.743 4.506 4.258 4.003 3.815 3.601 3.358 3.115 2.865 2.69 2.505 2.203 1.993 1.773 1.658 1.436 1.202 0.943 0.802 0.296 0.351 0.194 0.021 -0.374 -0.598 -0.865 -1.15 -1.47 -1.86 -2.369 -3.982 -10 ,13305 ,TETRA ,17590899,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:39:02 CET,0.0 1.282 1.684 1.986 2.272 2.529 2.744 2.95 3.338 3.517 3.687 3.607 4.094 4.214 4.415 4.613 4.811 4.91 5.11 5.306 5.57 5.725 5.867 6.085 6.29 6.48 6.674 6.856 7.08 7.292 7.493 7.737 7.967 8.184 8.422 8.664 8.903 9.162 9.44 9.742 10.053 10.384 10.754 11.129 11.521 11.919 12.367 12.782 13.141 13.385 13.342 12.786 12.111 11.418 10.75 10.164 9.634 9.129 8.67 8.178 7.722 7.28 6.86 6.484 6.16 5.857 5.522 5.219 4.957 4.685 4.386 4.13 3.86 3.583 3.375 3.158 2.927 2.69 2.441 2.275 2.103 1.823 1.632 1.437 1.332 1.114 0.889 0.634 0.499 0.003 0.06 -0.12 -0.307 -0.696 -0.91 -1.153 -1.429 -1.722 -2.121 -2.609 -4.368 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index a23ffe81..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14395 ,TETRA ,17590900,Sat Nov 27 21:24:14 CET,Sat Nov 27 23:42:56 CET,0.0 0.706 1.058 1.373 1.662 1.893 2.065 2.244 2.557 2.691 2.829 2.734 3.211 3.324 3.535 3.735 3.928 4.015 4.182 4.35 4.597 4.754 4.897 5.11 5.318 5.524 5.724 5.91 6.149 6.38 6.59 6.853 7.106 7.341 7.623 7.911 8.187 8.513 8.858 9.211 9.573 9.968 10.427 10.88 11.418 12.012 12.663 13.357 14.104 14.931 15.781 16.208 16.298 16.226 16.043 15.818 15.585 15.337 15.087 14.802 14.537 14.277 14.029 13.821 13.614 13.416 13.201 12.999 12.818 12.617 12.4 12.218 12.026 11.808 11.646 11.481 11.295 11.107 10.912 10.773 10.623 10.37 10.201 10.039 9.951 9.759 9.556 9.337 9.22 8.746 8.844 8.712 8.571 8.241 8.046 7.838 7.621 7.372 7.055 6.645 5.299 -2 ,19857 ,TETRA ,17590901,Sat Nov 27 21:24:17 CET,Sat Nov 27 23:41:56 CET,0.0 0.886 1.274 1.543 1.756 1.961 2.142 2.312 2.635 2.774 2.919 2.822 3.297 3.409 3.625 3.832 4.026 4.115 4.279 4.45 4.71 4.873 5.026 5.247 5.447 5.639 5.824 6.009 6.251 6.478 6.693 6.939 7.171 7.398 7.672 7.977 8.256 8.553 8.879 9.242 9.624 10.045 10.52 10.972 11.479 12.041 12.691 13.415 14.196 15.012 15.826 16.275 16.404 16.357 16.228 16.043 15.808 15.567 15.343 15.066 14.817 14.618 14.398 14.152 13.929 13.72 13.48 13.268 13.091 12.896 12.687 12.508 12.302 12.096 11.947 11.793 11.635 11.462 11.266 11.129 10.988 10.759 10.582 10.383 10.281 10.092 9.889 9.643 9.517 9.037 9.117 8.967 8.808 8.47 8.285 8.075 7.822 7.529 7.202 6.832 5.86 -3 ,32221 ,TETRA ,17590902,Sat Nov 27 21:24:15 CET,Sat Nov 27 23:36:10 CET,0.0 0.676 0.999 1.282 1.506 1.689 1.846 1.985 2.261 2.397 2.522 2.389 2.85 2.962 3.173 3.36 3.529 3.612 3.776 3.925 4.15 4.301 4.442 4.645 4.845 5.028 5.217 5.408 5.653 5.884 6.097 6.377 6.64 6.876 7.148 7.459 7.763 8.077 8.411 8.791 9.176 9.588 10.062 10.514 11.026 11.594 12.273 13.053 13.862 14.682 15.589 16.168 16.264 16.157 15.977 15.742 15.494 15.213 14.943 14.66 14.409 14.173 13.938 13.724 13.513 13.288 13.031 12.798 12.603 12.409 12.209 12.033 11.837 11.626 11.472 11.317 11.127 10.932 10.74 10.607 10.468 10.249 10.094 9.928 9.84 9.661 9.468 9.261 9.149 8.676 8.769 8.622 8.46 8.114 7.919 7.708 7.485 7.24 6.893 6.45 5.188 -4 ,15758 ,TETRA ,17590903,Sat Nov 27 21:24:18 CET,Sat Nov 27 23:36:09 CET,0.0 0.551 0.837 1.071 1.268 1.456 1.628 1.776 2.043 2.176 2.31 2.195 2.664 2.785 3.018 3.227 3.419 3.512 3.698 3.859 4.094 4.255 4.402 4.608 4.805 4.996 5.191 5.375 5.613 5.839 6.051 6.299 6.533 6.762 7.019 7.309 7.588 7.888 8.23 8.593 8.967 9.376 9.842 10.308 10.836 11.433 12.118 12.852 13.653 14.539 15.416 15.873 15.949 15.9 15.756 15.527 15.3 15.071 14.845 14.577 14.312 14.071 13.834 13.611 13.39 13.196 13.003 12.811 12.639 12.448 12.24 12.067 11.877 11.679 11.527 11.372 11.204 11.018 10.827 10.692 10.545 10.306 10.128 9.933 9.832 9.643 9.454 9.239 9.12 8.642 8.731 8.579 8.414 8.047 7.86 7.658 7.405 7.125 6.843 6.404 4.809 -5 ,6786 ,TETRA ,17590904,Sat Nov 27 21:24:16 CET,Sat Nov 27 23:36:30 CET,0.0 0.812 1.082 1.321 1.524 1.687 1.845 2.021 2.353 2.488 2.617 2.493 2.966 3.073 3.273 3.484 3.698 3.792 3.965 4.129 4.363 4.514 4.654 4.857 5.062 5.258 5.436 5.604 5.82 6.023 6.232 6.49 6.721 6.955 7.226 7.517 7.795 8.097 8.437 8.789 9.134 9.511 9.944 10.372 10.884 11.443 12.086 12.792 13.549 14.375 15.216 15.723 15.872 15.836 15.722 15.55 15.333 15.086 14.858 14.613 14.374 14.151 13.934 13.713 13.493 13.298 13.101 12.912 12.756 12.582 12.387 12.227 12.04 11.847 11.691 11.519 11.363 11.211 11.03 10.893 10.75 10.534 10.381 10.217 10.14 9.982 9.786 9.572 9.467 9.008 9.133 8.999 8.862 8.554 8.379 8.192 7.975 7.735 7.411 6.962 5.918 -6 ,20617 ,TETRA ,17590905,Sat Nov 27 21:24:15 CET,Sat Nov 27 23:41:47 CET,0.0 0.773 1.089 1.326 1.534 1.716 1.882 2.043 2.336 2.471 2.597 2.479 2.958 3.064 3.28 3.502 3.703 3.799 3.988 4.17 4.419 4.571 4.73 4.95 5.151 5.342 5.53 5.706 5.931 6.156 6.382 6.649 6.898 7.139 7.413 7.72 8.007 8.323 8.651 8.999 9.37 9.78 10.237 10.677 11.197 11.766 12.401 13.079 13.859 14.711 15.521 15.979 16.022 15.879 15.695 15.444 15.194 14.941 14.673 14.404 14.153 13.92 13.712 13.504 13.281 13.073 12.872 12.679 12.497 12.303 12.084 11.894 11.695 11.486 11.333 11.18 11.014 10.828 10.624 10.478 10.332 10.086 9.907 9.732 9.643 9.446 9.248 9.048 8.936 8.473 8.561 8.403 8.247 7.924 7.729 7.505 7.292 7.058 6.774 6.404 5.347 -7 ,23766 ,TETRA ,17590906,Sat Nov 27 21:24:16 CET,Sat Nov 27 23:35:38 CET,0.0 1.079 1.378 1.601 1.791 1.986 2.195 2.38 2.682 2.816 2.934 2.804 3.28 3.39 3.584 3.775 3.957 4.049 4.223 4.38 4.608 4.758 4.899 5.111 5.316 5.505 5.694 5.87 6.081 6.29 6.495 6.731 6.96 7.188 7.447 7.737 8.021 8.355 8.706 9.052 9.411 9.811 10.282 10.742 11.238 11.783 12.429 13.143 13.917 14.713 15.488 15.918 16.038 15.976 15.775 15.523 15.253 14.971 14.683 14.372 14.097 13.842 13.587 13.332 13.07 12.825 12.584 12.359 12.153 11.934 11.702 11.503 11.291 11.075 10.897 10.724 10.553 10.361 10.18 10.05 9.899 9.667 9.504 9.328 9.239 9.048 8.839 8.626 8.517 8.056 8.136 7.984 7.846 7.531 7.331 7.112 6.892 6.65 6.368 5.899 4.453 -8 ,14342 ,TETRA ,17590907,Sat Nov 27 21:25:12 CET,Sat Nov 27 23:38:30 CET,0.0 1.297 1.697 1.973 2.211 2.409 2.571 2.741 3.065 3.212 3.353 3.23 3.707 3.824 4.035 4.238 4.438 4.536 4.721 4.901 5.161 5.321 5.468 5.68 5.894 6.098 6.279 6.444 6.671 6.906 7.14 7.421 7.701 7.979 8.258 8.54 8.804 9.089 9.415 9.759 10.104 10.494 10.951 11.406 11.924 12.502 13.143 13.835 14.627 15.482 16.377 16.925 17.068 17.038 16.887 16.643 16.369 16.096 15.84 15.591 15.379 15.153 14.915 14.683 14.463 14.249 14.013 13.804 13.619 13.42 13.216 13.046 12.851 12.621 12.456 12.295 12.113 11.924 11.739 11.616 11.478 11.243 11.07 10.889 10.799 10.609 10.409 10.192 10.082 9.607 9.673 9.523 9.377 9.068 8.879 8.665 8.459 8.214 7.893 7.457 6.186 -9 ,27119 ,TETRA ,17590908,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:38:11 CET,0.0 0.676 1.048 1.306 1.52 1.735 1.939 2.123 2.459 2.601 2.724 2.613 3.099 3.214 3.433 3.629 3.824 3.926 4.109 4.286 4.554 4.722 4.881 5.102 5.309 5.515 5.717 5.905 6.147 6.395 6.649 6.93 7.167 7.401 7.681 7.992 8.277 8.588 8.918 9.276 9.66 10.073 10.543 10.993 11.499 12.061 12.683 13.371 14.15 15.018 15.907 16.371 16.433 16.309 16.147 15.933 15.686 15.452 15.218 14.956 14.693 14.435 14.182 13.948 13.729 13.508 13.275 13.065 12.877 12.671 12.446 12.254 12.057 11.852 11.684 11.509 11.319 11.12 10.918 10.762 10.599 10.349 10.167 9.975 9.877 9.677 9.463 9.233 9.108 8.62 8.678 8.508 8.338 7.979 7.772 7.557 7.336 7.07 6.698 6.228 4.729 -10 ,967 ,TETRA ,17590909,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:40:09 CET,0.0 0.607 0.954 1.217 1.449 1.674 1.862 2.023 2.334 2.472 2.61 2.508 2.995 3.12 3.354 3.555 3.734 3.829 4.015 4.184 4.411 4.561 4.706 4.921 5.127 5.321 5.509 5.694 5.947 6.181 6.39 6.634 6.87 7.11 7.384 7.682 7.968 8.276 8.6 8.93 9.302 9.713 10.177 10.644 11.171 11.759 12.413 13.122 13.924 14.813 15.682 16.217 16.371 16.334 16.175 15.939 15.733 15.528 15.263 14.972 14.752 14.544 14.324 14.101 13.893 13.706 13.51 13.298 13.105 12.917 12.72 12.564 12.381 12.169 12.009 11.851 11.694 11.52 11.33 11.19 11.038 10.802 10.635 10.463 10.376 10.187 9.978 9.777 9.674 9.21 9.316 9.181 9.037 8.712 8.528 8.327 8.083 7.807 7.513 7.137 5.67 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index a5fab52a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2225 ,TETRA ,17590910,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:38:46 CET,0.0 1.549 2.112 2.553 2.867 3.137 3.376 3.583 3.988 4.185 4.359 4.308 4.815 4.947 5.2 5.454 5.69 5.796 5.988 6.169 6.43 6.599 6.761 6.988 7.197 7.405 7.61 7.796 8.034 8.264 8.47 8.709 8.932 9.142 9.401 9.687 9.936 10.204 10.494 10.784 11.066 11.4 11.8 12.178 12.586 13.046 13.573 14.107 14.663 15.171 15.457 15.376 15.068 14.664 14.255 13.813 13.378 12.965 12.592 12.214 11.877 11.569 11.283 10.997 10.715 10.444 10.15 9.887 9.659 9.422 9.179 8.975 8.749 8.507 8.326 8.124 7.9 7.667 7.441 7.286 7.119 6.873 6.69 6.494 6.396 6.197 5.996 5.773 5.647 5.164 5.232 5.071 4.911 4.576 4.402 4.193 3.935 3.668 3.351 2.87 1.095 -2 ,22331 ,TETRA ,17590911,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:38:54 CET,0.0 0.871 1.325 1.695 1.992 2.244 2.474 2.664 2.987 3.138 3.285 3.183 3.669 3.804 4.053 4.289 4.496 4.595 4.802 4.988 5.228 5.384 5.536 5.766 5.995 6.192 6.386 6.574 6.809 7.039 7.257 7.52 7.775 8.021 8.312 8.655 8.966 9.279 9.604 9.94 10.29 10.674 11.126 11.586 12.099 12.602 13.122 13.668 14.201 14.686 15.028 14.975 14.679 14.298 13.883 13.436 13.03 12.655 12.309 11.933 11.583 11.261 10.944 10.643 10.376 10.121 9.837 9.577 9.348 9.131 8.902 8.697 8.482 8.253 8.068 7.871 7.681 7.479 7.261 7.111 6.95 6.658 6.463 6.277 6.173 5.969 5.755 5.53 5.404 4.905 4.982 4.813 4.643 4.301 4.105 3.881 3.626 3.339 2.977 2.46 1.105 -3 ,27975 ,TETRA ,17590912,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:36:51 CET,0.0 1.276 1.669 1.985 2.278 2.535 2.774 2.978 3.325 3.493 3.653 3.593 4.088 4.215 4.457 4.686 4.901 5.002 5.197 5.375 5.616 5.772 5.929 6.162 6.379 6.575 6.77 6.965 7.206 7.43 7.636 7.884 8.129 8.365 8.648 8.958 9.236 9.545 9.873 10.22 10.574 10.956 11.389 11.797 12.251 12.73 13.249 13.802 14.356 14.901 15.269 15.234 14.979 14.61 14.225 13.811 13.397 13.028 12.687 12.325 12.009 11.685 11.366 11.064 10.767 10.519 10.256 10.001 9.771 9.512 9.251 9.044 8.811 8.578 8.409 8.21 7.991 7.785 7.575 7.417 7.237 6.95 6.761 6.57 6.467 6.246 6.009 5.769 5.647 5.156 5.216 5.057 4.894 4.518 4.293 4.041 3.745 3.403 3.037 2.54 0.449 -4 ,28524 ,TETRA ,17590913,Sat Nov 27 21:25:15 CET,Sat Nov 27 23:37:37 CET,0.0 1.309 1.783 2.116 2.365 2.549 2.744 2.948 3.324 3.481 3.627 3.554 4.046 4.17 4.394 4.61 4.811 4.909 5.092 5.264 5.516 5.669 5.818 6.048 6.248 6.425 6.602 6.767 6.976 7.188 7.396 7.633 7.857 8.075 8.337 8.617 8.86 9.125 9.422 9.743 10.06 10.409 10.803 11.2 11.65 12.103 12.585 13.071 13.603 14.118 14.442 14.362 14.068 13.725 13.347 12.964 12.617 12.244 11.901 11.563 11.268 10.999 10.724 10.437 10.168 9.928 9.673 9.432 9.209 8.988 8.755 8.551 8.334 8.099 7.924 7.747 7.555 7.341 7.115 6.969 6.805 6.532 6.345 6.16 6.067 5.854 5.614 5.382 5.258 4.768 4.844 4.692 4.515 4.116 3.901 3.644 3.375 3.076 2.686 2.195 0.184 -5 ,17463 ,TETRA ,17590914,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:41:02 CET,0.0 1.259 1.717 2.042 2.308 2.535 2.762 2.968 3.302 3.451 3.599 3.524 4.005 4.118 4.336 4.561 4.784 4.88 5.066 5.246 5.504 5.677 5.844 6.088 6.315 6.52 6.717 6.905 7.135 7.358 7.576 7.838 8.078 8.306 8.568 8.847 9.12 9.411 9.714 10.041 10.377 10.757 11.207 11.635 12.108 12.598 13.129 13.668 14.179 14.671 15.015 15.016 14.767 14.383 13.997 13.618 13.242 12.864 12.518 12.154 11.809 11.475 11.151 10.849 10.563 10.302 10.033 9.778 9.547 9.304 9.057 8.853 8.639 8.405 8.218 8.036 7.841 7.634 7.428 7.281 7.114 6.836 6.639 6.44 6.338 6.117 5.876 5.619 5.493 4.999 5.022 4.838 4.655 4.304 4.11 3.883 3.607 3.299 2.942 2.437 0.672 -6 ,4356 ,TETRA ,17590915,Sat Nov 27 21:25:15 CET,Sat Nov 27 23:42:53 CET,0.0 1.456 1.893 2.258 2.551 2.794 3.01 3.205 3.569 3.747 3.906 3.833 4.325 4.453 4.703 4.904 5.094 5.193 5.382 5.555 5.825 6.016 6.189 6.42 6.639 6.855 7.066 7.26 7.51 7.747 7.971 8.229 8.471 8.704 8.982 9.295 9.596 9.93 10.273 10.636 10.983 11.362 11.818 12.237 12.674 13.112 13.561 14.051 14.634 15.119 15.382 15.3 14.995 14.61 14.175 13.72 13.295 12.891 12.525 12.12 11.751 11.421 11.109 10.805 10.518 10.269 9.991 9.722 9.498 9.276 9.039 8.831 8.605 8.382 8.208 8.014 7.804 7.591 7.383 7.24 7.086 6.826 6.636 6.45 6.358 6.144 5.905 5.66 5.524 5.026 5.088 4.928 4.763 4.37 4.148 3.897 3.603 3.263 2.914 2.405 0.497 -7 ,15002 ,TETRA ,17590916,Sat Nov 27 21:25:14 CET,Sat Nov 27 23:44:32 CET,0.0 1.537 1.994 2.342 2.621 2.868 3.088 3.296 3.642 3.799 3.947 3.853 4.35 4.489 4.743 4.976 5.188 5.284 5.467 5.644 5.908 6.083 6.239 6.443 6.64 6.853 7.056 7.234 7.45 7.652 7.854 8.104 8.346 8.576 8.826 9.099 9.359 9.635 9.925 10.23 10.575 10.975 11.406 11.797 12.221 12.688 13.189 13.7 14.262 14.78 15.048 14.917 14.645 14.319 13.942 13.539 13.154 12.794 12.478 12.146 11.847 11.56 11.24 10.92 10.662 10.423 10.135 9.859 9.645 9.446 9.23 9.053 8.852 8.638 8.47 8.267 8.055 7.849 7.644 7.501 7.324 7.027 6.828 6.63 6.53 6.32 6.081 5.81 5.672 5.163 5.215 5.058 4.898 4.511 4.263 3.997 3.702 3.376 3.012 2.537 0.418 -8 ,10493 ,TETRA ,17590917,Sat Nov 27 21:48:16 CET,Sun Nov 28 00:04:07 CET,0.0 2.133 2.652 3.014 3.321 3.574 3.794 3.996 4.372 4.55 4.709 4.625 5.115 5.248 5.495 5.721 5.926 6.028 6.24 6.44 6.708 6.879 7.038 7.281 7.522 7.746 7.974 8.193 8.477 8.776 9.046 9.323 9.586 9.837 10.11 10.402 10.668 10.964 11.307 11.659 12.007 12.376 12.775 13.175 13.651 14.169 14.709 15.271 15.862 16.403 16.751 16.745 16.468 16.087 15.707 15.275 14.85 14.467 14.109 13.712 13.34 13.007 12.691 12.395 12.132 11.897 11.645 11.391 11.152 10.902 10.646 10.432 10.196 9.95 9.757 9.552 9.327 9.079 8.825 8.65 8.47 8.191 8.002 7.805 7.703 7.495 7.269 7.011 6.865 6.368 6.441 6.285 6.097 5.673 5.432 5.177 4.904 4.586 4.193 3.682 1.75 -9 ,18205 ,TETRA ,17590918,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:40:59 CET,0.0 1.373 1.97 2.391 2.705 2.928 3.126 3.335 3.744 3.918 4.081 4.012 4.503 4.63 4.848 5.043 5.242 5.344 5.549 5.74 6.012 6.188 6.356 6.578 6.777 6.981 7.17 7.346 7.576 7.787 7.994 8.242 8.462 8.68 8.973 9.3 9.588 9.901 10.221 10.551 10.906 11.297 11.71 12.111 12.552 13.009 13.511 14.017 14.531 15.052 15.436 15.344 15.005 14.619 14.243 13.814 13.399 13.028 12.683 12.323 12.014 11.726 11.436 11.146 10.881 10.646 10.379 10.141 9.921 9.678 9.43 9.21 8.986 8.761 8.576 8.391 8.202 7.997 7.788 7.635 7.471 7.19 6.99 6.794 6.695 6.493 6.264 6.021 5.888 5.393 5.453 5.284 5.109 4.709 4.487 4.264 4.025 3.729 3.382 2.852 1.192 -10 ,26315 ,TETRA ,17590919,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:37:53 CET,0.0 1.241 1.712 2.071 2.362 2.607 2.836 3.065 3.486 3.661 3.822 3.743 4.233 4.364 4.616 4.852 5.073 5.179 5.376 5.559 5.81 5.967 6.13 6.369 6.583 6.782 6.97 7.159 7.401 7.618 7.812 8.051 8.297 8.527 8.797 9.091 9.357 9.651 9.962 10.28 10.608 10.97 11.406 11.827 12.266 12.749 13.275 13.765 14.265 14.828 15.281 15.239 14.931 14.531 14.121 13.702 13.3 12.904 12.548 12.179 11.844 11.542 11.25 10.985 10.744 10.522 10.262 9.998 9.769 9.551 9.319 9.109 8.89 8.662 8.48 8.3 8.123 7.926 7.699 7.54 7.387 7.138 6.936 6.73 6.629 6.414 6.185 5.932 5.797 5.298 5.364 5.205 5.036 4.682 4.48 4.244 4.0 3.715 3.319 2.769 0.975 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index cb8ab825..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8425 ,TETRA ,17590920,Sat Nov 27 21:25:13 CET,Sat Nov 27 23:25:46 CET,0.0 0.992 1.328 1.668 1.948 2.159 2.339 2.508 2.807 2.934 3.041 2.877 3.347 3.457 3.664 3.867 4.048 4.132 4.292 4.457 4.704 4.851 4.989 5.186 5.368 5.557 5.75 5.926 6.14 6.352 6.561 6.81 7.045 7.265 7.527 7.82 8.095 8.393 8.73 9.074 9.402 9.779 10.247 10.705 11.198 11.74 12.358 13.021 13.746 14.523 15.274 15.653 15.666 15.502 15.268 15.027 14.773 14.465 14.191 13.936 13.696 13.476 13.255 13.026 12.798 12.579 12.345 12.124 11.936 11.743 11.543 11.371 11.176 10.963 10.786 10.613 10.454 10.266 10.047 9.901 9.749 9.523 9.365 9.193 9.103 8.915 8.715 8.487 8.364 7.886 7.97 7.826 7.68 7.369 7.204 7.021 6.826 6.62 6.363 5.972 5.034 -2 ,31088 ,TETRA ,17590921,Sat Nov 27 21:25:14 CET,Sat Nov 27 23:37:17 CET,0.0 0.7 1.066 1.332 1.562 1.761 1.926 2.088 2.411 2.559 2.693 2.558 3.019 3.132 3.348 3.531 3.693 3.772 3.925 4.081 4.315 4.465 4.609 4.805 4.988 5.167 5.333 5.501 5.727 5.939 6.138 6.388 6.648 6.889 7.157 7.451 7.719 8.016 8.352 8.71 9.09 9.497 9.953 10.413 10.923 11.479 12.077 12.741 13.466 14.183 14.912 15.303 15.32 15.169 14.971 14.734 14.476 14.206 13.965 13.711 13.482 13.251 13.016 12.795 12.574 12.371 12.151 11.954 11.776 11.581 11.384 11.208 11.019 10.818 10.651 10.475 10.306 10.129 9.911 9.76 9.607 9.355 9.183 9.02 8.934 8.751 8.562 8.366 8.264 7.801 7.866 7.692 7.531 7.218 7.041 6.846 6.613 6.377 6.107 5.681 4.843 -3 ,26300 ,TETRA ,17590922,Sat Nov 27 21:25:15 CET,Sat Nov 27 23:36:15 CET,0.0 0.667 0.997 1.266 1.487 1.685 1.889 2.068 2.373 2.507 2.639 2.534 3.004 3.11 3.339 3.554 3.75 3.845 4.022 4.182 4.431 4.596 4.751 4.983 5.21 5.426 5.638 5.843 6.105 6.353 6.581 6.856 7.123 7.373 7.649 7.944 8.234 8.559 8.91 9.253 9.582 9.977 10.461 10.925 11.432 11.999 12.622 13.263 13.971 14.702 15.438 15.77 15.726 15.575 15.342 15.078 14.826 14.592 14.354 14.059 13.783 13.516 13.244 13.001 12.772 12.549 12.318 12.081 11.862 11.648 11.433 11.259 11.058 10.841 10.666 10.49 10.315 10.118 9.917 9.776 9.626 9.389 9.224 9.055 8.958 8.742 8.508 8.262 8.132 7.638 7.707 7.565 7.405 7.022 6.815 6.605 6.412 6.19 5.89 5.525 4.57 -4 ,3764 ,TETRA ,17590923,Sat Nov 27 21:25:15 CET,Sat Nov 27 23:37:26 CET,0.0 0.717 1.167 1.509 1.747 1.948 2.114 2.282 2.606 2.748 2.875 2.755 3.227 3.336 3.536 3.735 3.929 4.013 4.168 4.325 4.568 4.726 4.874 5.078 5.272 5.465 5.647 5.818 6.036 6.241 6.457 6.721 6.958 7.194 7.474 7.775 8.045 8.327 8.647 9.0 9.35 9.745 10.219 10.69 11.198 11.725 12.321 12.952 13.631 14.37 15.119 15.509 15.551 15.422 15.2 14.927 14.63 14.349 14.093 13.807 13.548 13.31 13.091 12.886 12.668 12.434 12.193 11.989 11.803 11.604 11.389 11.204 11.007 10.796 10.632 10.462 10.287 10.113 9.927 9.792 9.651 9.438 9.294 9.141 9.057 8.876 8.677 8.461 8.354 7.9 8.037 7.914 7.776 7.488 7.315 7.108 6.899 6.674 6.357 5.95 5.047 -5 ,8419 ,TETRA ,17590924,Sat Nov 27 21:25:15 CET,Sat Nov 27 23:37:53 CET,0.0 0.752 1.106 1.408 1.649 1.863 2.057 2.241 2.579 2.721 2.859 2.761 3.23 3.343 3.577 3.795 4.006 4.111 4.318 4.516 4.788 4.959 5.119 5.339 5.552 5.747 5.939 6.117 6.332 6.55 6.765 7.026 7.278 7.509 7.782 8.107 8.436 8.8 9.157 9.512 9.87 10.248 10.675 11.104 11.627 12.197 12.821 13.557 14.339 15.09 15.794 16.198 16.221 16.053 15.814 15.548 15.296 15.029 14.74 14.415 14.15 13.895 13.641 13.409 13.201 12.995 12.743 12.492 12.273 12.073 11.879 11.717 11.537 11.328 11.153 10.956 10.763 10.567 10.361 10.225 10.08 9.841 9.669 9.498 9.41 9.229 9.03 8.813 8.688 8.203 8.274 8.117 7.955 7.604 7.421 7.238 7.055 6.809 6.431 5.907 4.699 -6 ,8806 ,TETRA ,17590925,Sat Nov 27 21:25:16 CET,Sat Nov 27 23:36:46 CET,0.0 0.562 0.895 1.201 1.426 1.608 1.781 1.942 2.224 2.357 2.492 2.37 2.831 2.936 3.138 3.34 3.548 3.644 3.808 3.968 4.201 4.348 4.502 4.734 4.94 5.138 5.33 5.499 5.716 5.941 6.163 6.414 6.638 6.844 7.096 7.401 7.704 8.023 8.355 8.709 9.077 9.487 9.945 10.388 10.916 11.503 12.137 12.793 13.516 14.34 15.141 15.583 15.643 15.497 15.276 14.999 14.726 14.459 14.209 13.955 13.692 13.433 13.19 12.955 12.725 12.509 12.272 12.049 11.854 11.654 11.457 11.285 11.078 10.845 10.668 10.507 10.349 10.158 9.936 9.778 9.622 9.395 9.232 9.074 8.993 8.816 8.608 8.375 8.253 7.782 7.888 7.739 7.58 7.233 7.023 6.796 6.552 6.284 5.97 5.543 4.548 -7 ,17438 ,TETRA ,17590926,Sat Nov 27 21:25:18 CET,Sat Nov 27 23:36:46 CET,0.0 1.135 1.576 1.893 2.13 2.328 2.503 2.666 2.962 3.102 3.234 3.124 3.585 3.693 3.913 4.106 4.279 4.369 4.549 4.721 4.975 5.138 5.302 5.533 5.745 5.948 6.14 6.323 6.561 6.796 7.02 7.266 7.513 7.773 8.069 8.389 8.677 8.975 9.296 9.639 9.999 10.399 10.87 11.324 11.836 12.412 13.06 13.755 14.499 15.279 16.014 16.42 16.449 16.255 16.025 15.783 15.508 15.217 14.935 14.648 14.395 14.162 13.926 13.679 13.447 13.249 13.034 12.813 12.603 12.369 12.136 11.961 11.778 11.568 11.416 11.275 11.12 10.944 10.743 10.603 10.461 10.237 10.059 9.874 9.788 9.611 9.403 9.173 9.054 8.576 8.659 8.503 8.335 7.991 7.783 7.568 7.357 7.068 6.736 6.371 5.653 -8 ,17443 ,TETRA ,17590927,Sat Nov 27 21:25:15 CET,Sat Nov 27 23:38:19 CET,0.0 0.805 1.134 1.392 1.663 1.931 2.143 2.335 2.677 2.837 2.987 2.887 3.368 3.482 3.691 3.898 4.093 4.184 4.351 4.52 4.774 4.921 5.061 5.271 5.465 5.645 5.825 6.007 6.248 6.475 6.7 6.973 7.227 7.469 7.736 8.024 8.293 8.593 8.922 9.271 9.639 10.047 10.518 10.996 11.528 12.086 12.708 13.367 14.077 14.847 15.5 15.783 15.809 15.711 15.525 15.275 15.01 14.731 14.451 14.157 13.901 13.676 13.454 13.231 13.012 12.789 12.551 12.328 12.113 11.895 11.694 11.514 11.308 11.089 10.917 10.748 10.567 10.368 10.159 10.009 9.85 9.614 9.441 9.256 9.163 8.958 8.755 8.55 8.435 7.967 8.054 7.912 7.765 7.441 7.251 7.042 6.817 6.568 6.284 5.845 4.845 -9 ,9066 ,TETRA ,17590928,Sat Nov 27 21:48:17 CET,Sun Nov 28 00:04:33 CET,0.0 0.74 1.056 1.252 1.427 1.628 1.83 2.01 2.326 2.456 2.571 2.425 2.904 3.012 3.208 3.39 3.563 3.644 3.811 3.98 4.199 4.336 4.47 4.662 4.85 5.028 5.205 5.379 5.599 5.83 6.047 6.287 6.527 6.757 7.007 7.281 7.564 7.883 8.209 8.568 8.954 9.371 9.834 10.269 10.752 11.297 11.938 12.636 13.424 14.243 15.06 15.44 15.414 15.245 15.009 14.741 14.468 14.215 13.995 13.725 13.442 13.197 12.963 12.737 12.513 12.285 12.049 11.838 11.652 11.444 11.215 11.026 10.824 10.606 10.438 10.274 10.104 9.921 9.725 9.589 9.451 9.225 9.054 8.882 8.793 8.597 8.397 8.195 8.084 7.607 7.669 7.513 7.362 7.035 6.842 6.617 6.38 6.133 5.843 5.44 4.188 -10 ,1619 ,TETRA ,17590929,Sat Nov 27 21:49:13 CET,Sat Nov 27 23:46:51 CET,0.0 0.589 0.897 1.148 1.339 1.526 1.695 1.849 2.141 2.285 2.435 2.341 2.81 2.923 3.158 3.362 3.543 3.632 3.792 3.959 4.207 4.352 4.498 4.718 4.916 5.11 5.304 5.487 5.711 5.919 6.13 6.4 6.649 6.877 7.137 7.431 7.722 8.05 8.394 8.721 9.064 9.449 9.896 10.344 10.878 11.453 12.094 12.802 13.555 14.318 15.019 15.339 15.287 15.128 14.933 14.689 14.408 14.1 13.814 13.512 13.233 12.95 12.677 12.433 12.194 11.967 11.737 11.509 11.293 11.081 10.866 10.693 10.494 10.277 10.118 9.951 9.783 9.607 9.388 9.238 9.098 8.859 8.698 8.53 8.438 8.232 8.02 7.821 7.716 7.252 7.381 7.25 7.111 6.801 6.604 6.404 6.191 5.895 5.55 5.142 4.075 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt deleted file mode 100644 index 7d81a822..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18700 ,TETRA ,17590930,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:21:09 CET,0.0 0.631 0.984 1.281 1.517 1.732 1.923 2.108 2.437 2.586 2.733 2.636 3.118 3.237 3.46 3.659 3.854 3.953 4.139 4.312 4.559 4.719 4.874 5.089 5.304 5.521 5.708 5.877 6.096 6.313 6.518 6.748 6.978 7.205 7.451 7.723 7.985 8.268 8.566 8.863 9.155 9.48 9.866 10.243 10.638 11.068 11.568 12.099 12.635 13.152 13.524 13.457 13.156 12.772 12.393 12.028 11.688 11.342 11.02 10.667 10.356 10.092 9.827 9.559 9.298 9.055 8.794 8.572 8.388 8.188 7.987 7.813 7.611 7.386 7.219 7.053 6.879 6.698 6.495 6.352 6.204 5.97 5.799 5.626 5.541 5.358 5.144 4.902 4.777 4.292 4.421 4.296 4.151 3.818 3.647 3.463 3.238 3.012 2.744 2.338 0.985 -2 ,16707 ,TETRA ,17590931,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:01:47 CET,0.0 0.665 1.014 1.277 1.514 1.707 1.861 1.991 2.243 2.375 2.509 2.384 2.854 2.962 3.153 3.332 3.517 3.607 3.781 3.937 4.162 4.302 4.435 4.635 4.825 5.007 5.188 5.359 5.567 5.789 5.998 6.229 6.465 6.686 6.924 7.202 7.476 7.75 8.031 8.341 8.654 8.969 9.316 9.675 10.085 10.512 11.001 11.567 12.151 12.658 12.991 12.929 12.674 12.342 11.964 11.571 11.19 10.838 10.51 10.155 9.829 9.534 9.248 8.957 8.711 8.5 8.27 8.065 7.881 7.688 7.473 7.288 7.097 6.901 6.758 6.606 6.438 6.266 6.091 5.97 5.844 5.625 5.459 5.291 5.206 5.032 4.849 4.639 4.53 4.065 4.187 4.052 3.904 3.592 3.411 3.222 3.024 2.808 2.593 2.31 1.514 -3 ,27765 ,TETRA ,17590932,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:01:06 CET,0.0 0.719 1.05 1.314 1.546 1.753 1.927 2.09 2.378 2.501 2.625 2.507 2.976 3.089 3.309 3.499 3.675 3.763 3.939 4.114 4.353 4.493 4.635 4.839 5.02 5.196 5.37 5.54 5.761 5.971 6.168 6.392 6.603 6.811 7.058 7.326 7.587 7.867 8.144 8.453 8.793 9.156 9.555 9.947 10.384 10.842 11.343 11.869 12.43 12.904 13.225 13.199 12.891 12.492 12.056 11.62 11.184 10.782 10.44 10.083 9.772 9.506 9.26 9.027 8.796 8.563 8.307 8.075 7.873 7.657 7.426 7.229 7.034 6.832 6.674 6.514 6.336 6.145 5.947 5.809 5.672 5.445 5.273 5.096 4.999 4.787 4.582 4.362 4.233 3.753 3.874 3.748 3.616 3.328 3.166 2.983 2.782 2.54 2.23 1.861 1.226 -4 ,18176 ,TETRA ,17590933,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:00:51 CET,0.0 0.934 1.273 1.559 1.793 1.996 2.186 2.357 2.662 2.812 2.963 2.846 3.308 3.411 3.621 3.819 3.998 4.09 4.274 4.449 4.692 4.849 4.986 5.168 5.344 5.512 5.682 5.848 6.07 6.287 6.483 6.715 6.945 7.168 7.408 7.675 7.945 8.238 8.534 8.827 9.145 9.494 9.873 10.245 10.675 11.157 11.64 12.113 12.619 13.104 13.486 13.497 13.247 12.899 12.483 12.044 11.644 11.25 10.886 10.48 10.098 9.768 9.461 9.175 8.91 8.648 8.356 8.099 7.895 7.688 7.455 7.247 7.035 6.819 6.655 6.489 6.323 6.151 5.961 5.826 5.679 5.438 5.258 5.072 4.981 4.792 4.582 4.348 4.232 3.759 3.87 3.732 3.58 3.264 3.105 2.938 2.759 2.534 2.282 1.98 1.01 -5 ,6955 ,TETRA ,17590934,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:00:36 CET,0.0 0.964 1.301 1.572 1.804 2.033 2.247 2.427 2.751 2.909 3.052 2.937 3.413 3.537 3.767 3.974 4.166 4.257 4.436 4.597 4.813 4.955 5.094 5.291 5.48 5.666 5.84 6.005 6.218 6.428 6.64 6.885 7.107 7.316 7.559 7.833 8.079 8.339 8.628 8.938 9.244 9.581 9.973 10.36 10.814 11.273 11.738 12.214 12.691 13.119 13.426 13.37 13.111 12.783 12.432 12.06 11.696 11.344 11.024 10.704 10.415 10.132 9.864 9.624 9.402 9.198 8.971 8.758 8.572 8.361 8.132 7.943 7.757 7.543 7.366 7.207 7.039 6.85 6.657 6.533 6.402 6.186 6.031 5.865 5.78 5.602 5.406 5.181 5.062 4.596 4.71 4.577 4.442 4.139 3.975 3.791 3.586 3.369 3.114 2.722 1.824 -6 ,31443 ,TETRA ,17590935,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:01:50 CET,0.0 0.521 0.81 1.054 1.278 1.482 1.67 1.84 2.117 2.25 2.39 2.289 2.772 2.902 3.139 3.338 3.525 3.616 3.803 3.981 4.22 4.367 4.513 4.729 4.931 5.121 5.31 5.488 5.702 5.905 6.111 6.371 6.611 6.824 7.072 7.355 7.615 7.868 8.143 8.437 8.739 9.07 9.454 9.835 10.251 10.708 11.207 11.732 12.289 12.807 13.199 13.26 13.01 12.645 12.302 11.938 11.596 11.259 10.916 10.561 10.243 9.954 9.692 9.438 9.195 8.963 8.716 8.504 8.31 8.088 7.846 7.651 7.454 7.243 7.076 6.887 6.692 6.506 6.301 6.143 5.99 5.754 5.565 5.37 5.27 5.065 4.861 4.645 4.525 4.05 4.143 4.002 3.863 3.558 3.379 3.188 2.993 2.768 2.497 2.099 0.858 -7 ,30687 ,TETRA ,17590936,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sun Nov 28 00:03:19 CET,0.0 0.949 1.297 1.582 1.796 1.985 2.175 2.341 2.651 2.803 2.952 2.851 3.324 3.436 3.651 3.854 4.048 4.138 4.316 4.491 4.739 4.902 5.05 5.261 5.465 5.646 5.809 5.973 6.182 6.383 6.577 6.798 7.017 7.239 7.483 7.743 7.998 8.281 8.583 8.878 9.185 9.538 9.915 10.275 10.674 11.099 11.577 12.083 12.621 13.101 13.411 13.367 13.098 12.709 12.294 11.909 11.559 11.247 10.962 10.661 10.376 10.101 9.821 9.552 9.319 9.098 8.857 8.629 8.425 8.217 7.99 7.799 7.593 7.368 7.202 7.03 6.853 6.661 6.446 6.304 6.157 5.911 5.75 5.577 5.484 5.295 5.083 4.856 4.74 4.267 4.39 4.265 4.129 3.829 3.665 3.487 3.278 3.037 2.746 2.344 1.487 -8 ,10119 ,TETRA ,17590937,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sat Nov 27 23:58:02 CET,0.0 0.457 0.778 1.03 1.245 1.421 1.572 1.727 2.012 2.141 2.264 2.141 2.621 2.752 2.987 3.202 3.42 3.522 3.704 3.856 4.076 4.226 4.365 4.581 4.794 4.978 5.148 5.311 5.536 5.747 5.952 6.217 6.467 6.684 6.923 7.179 7.414 7.681 7.967 8.281 8.585 8.908 9.291 9.67 10.128 10.621 11.106 11.588 12.121 12.606 12.919 12.887 12.639 12.323 11.972 11.589 11.192 10.805 10.464 10.081 9.739 9.444 9.171 8.921 8.69 8.473 8.218 7.98 7.781 7.566 7.323 7.12 6.939 6.759 6.601 6.421 6.228 6.036 5.839 5.7 5.562 5.362 5.2 5.035 4.953 4.763 4.568 4.346 4.23 3.759 3.859 3.721 3.586 3.32 3.158 2.972 2.763 2.522 2.223 1.793 1.044 -9 ,28363 ,TETRA ,17590938,Sat Nov 27 21:50:13 CET,Sat Nov 27 23:57:58 CET,0.0 0.738 1.08 1.374 1.645 1.859 2.027 2.19 2.498 2.64 2.781 2.692 3.165 3.276 3.482 3.664 3.847 3.942 4.125 4.305 4.554 4.712 4.87 5.076 5.255 5.43 5.613 5.797 6.02 6.243 6.45 6.681 6.913 7.145 7.412 7.707 7.974 8.243 8.541 8.86 9.192 9.546 9.919 10.281 10.696 11.123 11.574 12.108 12.667 13.166 13.576 13.617 13.369 13.028 12.627 12.19 11.794 11.413 11.033 10.623 10.286 9.993 9.708 9.427 9.169 8.945 8.683 8.43 8.223 8.011 7.77 7.554 7.337 7.116 6.94 6.759 6.576 6.374 6.167 6.027 5.871 5.649 5.49 5.306 5.207 5.01 4.811 4.575 4.445 3.976 4.096 3.959 3.822 3.536 3.369 3.152 2.924 2.696 2.419 2.024 0.982 -10 ,20042 ,TETRA ,17590939,Sat Nov 27 22:00:40 CET,Sun Nov 28 00:12:13 CET,0.0 0.831 1.184 1.433 1.638 1.803 1.965 2.12 2.415 2.569 2.718 2.621 3.112 3.241 3.457 3.657 3.845 3.931 4.097 4.257 4.489 4.644 4.786 4.987 5.185 5.369 5.556 5.75 6.0 6.22 6.424 6.676 6.898 7.112 7.371 7.66 7.937 8.233 8.546 8.868 9.212 9.586 10.001 10.401 10.826 11.268 11.741 12.229 12.716 13.171 13.454 13.346 13.053 12.708 12.33 11.914 11.523 11.146 10.8 10.441 10.114 9.812 9.527 9.25 8.982 8.744 8.498 8.258 8.048 7.843 7.616 7.405 7.189 6.991 6.84 6.668 6.486 6.293 6.09 5.951 5.794 5.559 5.401 5.229 5.136 4.939 4.74 4.524 4.407 3.935 4.051 3.921 3.795 3.534 3.385 3.202 2.999 2.769 2.513 2.222 1.291 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index ea84bcfd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30659 ,KEBNE ,17026720,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:56:58 CET,0.0 1.204 1.628 1.986 2.234 2.452 2.657 2.849 3.185 3.331 3.471 3.373 3.856 3.962 4.164 4.37 4.582 4.686 4.873 5.04 5.293 5.455 5.602 5.828 6.056 6.283 6.498 6.689 6.941 7.186 7.426 7.719 7.982 8.238 8.542 8.873 9.182 9.536 9.935 10.349 10.784 11.263 11.832 12.41 13.055 13.769 14.595 15.55 16.625 17.746 18.945 19.757 20.026 19.975 19.792 19.511 19.185 18.876 18.613 18.313 18.019 17.745 17.461 17.188 16.928 16.666 16.371 16.095 15.837 15.559 15.274 15.038 14.799 14.565 14.383 14.186 13.972 13.746 13.497 13.319 13.136 12.836 12.613 12.387 12.272 12.02 11.744 11.43 11.257 10.738 10.73 10.522 10.308 9.879 9.636 9.348 9.04 8.704 8.277 7.612 5.069 -2 ,13908 ,KEBNE ,17026721,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:56:07 CET,0.0 1.537 2.024 2.312 2.559 2.79 2.985 3.17 3.562 3.728 3.864 3.749 4.245 4.366 4.591 4.823 5.04 5.134 5.329 5.531 5.811 5.975 6.138 6.375 6.596 6.814 7.026 7.237 7.52 7.793 8.056 8.362 8.65 8.933 9.239 9.581 9.921 10.296 10.698 11.117 11.545 12.026 12.587 13.131 13.772 14.509 15.358 16.283 17.312 18.471 19.755 20.62 20.952 21.0 20.933 20.786 20.542 20.291 20.043 19.731 19.441 19.173 18.886 18.59 18.317 18.05 17.758 17.503 17.282 17.022 16.728 16.507 16.272 16.004 15.802 15.585 15.343 15.097 14.861 14.679 14.472 14.145 13.917 13.676 13.547 13.305 13.053 12.762 12.601 12.084 12.117 11.947 11.764 11.345 11.101 10.818 10.496 10.171 9.738 9.042 6.616 -3 ,14500 ,KEBNE ,17026722,Wed Dec 22 15:05:55 CET,Wed Dec 22 16:56:18 CET,0.0 1.47 1.935 2.27 2.574 2.83 3.04 3.251 3.622 3.804 3.992 3.959 4.461 4.592 4.831 5.057 5.274 5.382 5.593 5.792 6.089 6.274 6.442 6.687 6.924 7.144 7.361 7.567 7.827 8.075 8.325 8.644 8.939 9.212 9.522 9.882 10.227 10.62 11.065 11.517 12.007 12.56 13.164 13.772 14.476 15.254 16.159 17.165 18.29 19.595 20.989 21.827 22.188 22.286 22.219 22.093 21.924 21.714 21.494 21.24 21.004 20.797 20.57 20.315 20.067 19.846 19.608 19.39 19.198 18.976 18.746 18.571 18.383 18.178 18.003 17.817 17.623 17.412 17.197 17.032 16.83 16.513 16.286 16.044 15.923 15.675 15.396 15.096 14.937 14.416 14.392 14.19 13.982 13.548 13.31 13.043 12.732 12.326 11.85 11.181 8.899 -4 ,2363 ,KEBNE ,17026723,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:57:57 CET,0.0 1.091 1.41 1.675 1.875 2.078 2.273 2.463 2.823 2.984 3.133 3.035 3.53 3.659 3.906 4.115 4.33 4.439 4.649 4.839 5.096 5.268 5.43 5.656 5.885 6.111 6.312 6.508 6.777 7.021 7.26 7.564 7.843 8.119 8.469 8.832 9.157 9.544 9.966 10.391 10.826 11.343 11.944 12.5 13.133 13.865 14.703 15.595 16.605 17.724 18.919 19.757 20.055 20.065 19.937 19.725 19.489 19.253 19.003 18.718 18.445 18.192 17.947 17.671 17.377 17.092 16.78 16.511 16.296 16.064 15.816 15.596 15.357 15.112 14.906 14.688 14.449 14.18 13.905 13.722 13.534 13.235 13.016 12.78 12.658 12.386 12.108 11.816 11.653 11.13 11.121 10.918 10.717 10.307 10.073 9.806 9.494 9.109 8.657 8.029 5.912 -5 ,4689 ,KEBNE ,17026724,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:56:20 CET,0.0 1.043 1.44 1.749 2.029 2.284 2.489 2.668 2.992 3.15 3.303 3.209 3.694 3.821 4.039 4.238 4.439 4.54 4.732 4.921 5.2 5.376 5.547 5.797 6.038 6.283 6.514 6.715 6.973 7.228 7.474 7.77 8.049 8.324 8.649 9.009 9.358 9.734 10.126 10.541 10.975 11.463 12.045 12.624 13.273 13.993 14.834 15.744 16.774 17.968 19.246 20.081 20.322 20.248 20.079 19.836 19.598 19.331 19.025 18.668 18.331 18.032 17.738 17.43 17.163 16.921 16.653 16.395 16.16 15.914 15.643 15.418 15.174 14.915 14.694 14.434 14.14 13.835 13.54 13.347 13.138 12.798 12.574 12.327 12.184 11.867 11.548 11.224 11.061 10.532 10.503 10.293 10.069 9.546 9.226 8.846 8.426 7.993 7.498 6.883 4.193 -6 ,15128 ,KEBNE ,17026725,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:57:57 CET,0.0 0.784 1.144 1.442 1.698 1.889 2.08 2.269 2.59 2.739 2.882 2.796 3.286 3.405 3.628 3.839 4.052 4.158 4.346 4.528 4.826 5.013 5.183 5.426 5.658 5.877 6.08 6.276 6.532 6.779 7.014 7.295 7.572 7.858 8.179 8.515 8.842 9.198 9.582 9.989 10.412 10.893 11.46 12.02 12.663 13.405 14.26 15.167 16.234 17.438 18.735 19.574 19.846 19.869 19.788 19.606 19.347 19.063 18.799 18.477 18.156 17.865 17.587 17.305 17.041 16.813 16.529 16.25 16.015 15.777 15.52 15.292 15.041 14.76 14.541 14.316 14.058 13.8 13.561 13.391 13.204 12.899 12.684 12.449 12.32 12.061 11.814 11.557 11.415 10.919 10.968 10.804 10.637 10.263 10.017 9.756 9.47 9.145 8.755 8.156 5.185 -7 ,26295 ,KEBNE ,17026726,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:57:43 CET,0.0 1.406 1.791 2.074 2.365 2.66 2.903 3.103 3.472 3.656 3.815 3.751 4.258 4.39 4.646 4.899 5.147 5.261 5.472 5.669 5.951 6.133 6.314 6.583 6.832 7.06 7.294 7.522 7.795 8.06 8.312 8.615 8.896 9.144 9.43 9.765 10.087 10.441 10.82 11.236 11.68 12.158 12.695 13.242 13.883 14.584 15.367 16.234 17.21 18.316 19.485 20.179 20.355 20.239 20.017 19.74 19.434 19.108 18.776 18.428 18.112 17.789 17.465 17.147 16.851 16.58 16.269 15.974 15.712 15.426 15.121 14.876 14.616 14.332 14.111 13.868 13.612 13.371 13.124 12.944 12.754 12.454 12.238 12.004 11.876 11.599 11.337 11.044 10.88 10.365 10.377 10.204 10.012 9.562 9.298 9.007 8.705 8.349 7.888 7.326 4.942 -8 ,28611 ,KEBNE ,17026727,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:57:42 CET,0.0 1.037 1.428 1.77 2.017 2.257 2.467 2.649 2.99 3.143 3.29 3.231 3.729 3.849 4.083 4.295 4.5 4.601 4.809 5.012 5.291 5.463 5.639 5.89 6.124 6.354 6.562 6.76 7.033 7.307 7.554 7.843 8.137 8.425 8.752 9.113 9.452 9.806 10.188 10.607 11.046 11.549 12.137 12.699 13.333 14.079 14.946 15.879 16.921 18.038 19.228 19.962 20.157 20.07 19.835 19.547 19.254 18.945 18.647 18.318 18.022 17.756 17.463 17.148 16.853 16.592 16.32 16.077 15.839 15.579 15.29 15.027 14.746 14.441 14.227 14.024 13.783 13.525 13.279 13.114 12.932 12.583 12.314 12.014 11.86 11.556 11.238 10.925 10.755 10.221 10.22 10.026 9.821 9.36 9.079 8.769 8.435 8.034 7.566 6.957 5.444 -9 ,22404 ,KEBNE ,17026728,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:58:03 CET,0.0 1.462 1.839 2.162 2.441 2.658 2.837 3.008 3.284 3.41 3.546 3.449 3.954 4.087 4.309 4.518 4.715 4.809 4.996 5.18 5.45 5.623 5.802 6.062 6.301 6.525 6.733 6.926 7.163 7.402 7.643 7.934 8.22 8.497 8.8 9.139 9.474 9.833 10.213 10.621 11.051 11.525 12.09 12.663 13.318 14.056 14.905 15.815 16.833 18.075 19.537 20.521 20.776 20.758 20.626 20.457 20.27 19.964 19.666 19.363 19.089 18.841 18.586 18.29 17.98 17.717 17.451 17.215 17.006 16.783 16.542 16.331 16.108 15.892 15.721 15.531 15.335 15.109 14.872 14.705 14.522 14.214 13.985 13.761 13.646 13.414 13.165 12.873 12.712 12.201 12.235 12.06 11.862 11.408 11.16 10.888 10.581 10.222 9.754 9.111 6.18 -10 ,21709 ,KEBNE ,17026729,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:57:08 CET,0.0 1.637 2.116 2.47 2.732 2.961 3.191 3.399 3.768 3.926 4.065 3.956 4.448 4.577 4.813 5.021 5.211 5.31 5.505 5.692 5.974 6.152 6.307 6.532 6.76 7.008 7.246 7.448 7.711 7.968 8.217 8.502 8.761 9.01 9.31 9.662 9.997 10.364 10.792 11.249 11.691 12.171 12.731 13.302 13.942 14.608 15.357 16.207 17.215 18.367 19.52 20.166 20.354 20.311 20.121 19.867 19.586 19.3 19.022 18.668 18.319 18.002 17.676 17.349 17.066 16.806 16.499 16.206 15.957 15.69 15.405 15.171 14.92 14.647 14.426 14.181 13.935 13.7 13.426 13.221 13.019 12.718 12.492 12.253 12.133 11.882 11.601 11.298 11.149 10.648 10.691 10.504 10.274 9.763 9.495 9.232 8.911 8.511 8.075 7.471 5.152 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt deleted file mode 100644 index c2450a98..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25618 ,TETRA ,17590940,Sat Nov 27 22:00:40 CET,Sun Nov 28 00:15:49 CET,0.0 1.073 1.484 1.856 2.174 2.443 2.679 2.887 3.238 3.403 3.573 3.517 4.026 4.175 4.453 4.701 4.931 5.05 5.281 5.496 5.817 6.021 6.199 6.457 6.711 6.947 7.183 7.412 7.699 7.963 8.219 8.528 8.822 9.091 9.401 9.773 10.125 10.495 10.884 11.298 11.731 12.211 12.761 13.292 13.912 14.614 15.376 16.17 17.049 17.957 18.79 19.097 19.027 18.828 18.574 18.284 17.926 17.546 17.209 16.822 16.474 16.139 15.798 15.481 15.171 14.881 14.584 14.311 14.06 13.792 13.497 13.246 12.983 12.693 12.473 12.256 12.025 11.785 11.531 11.352 11.167 10.871 10.659 10.419 10.283 10.006 9.717 9.403 9.243 8.72 8.712 8.524 8.32 7.86 7.587 7.284 6.928 6.551 6.116 5.427 1.87 -2 ,19932 ,TETRA ,17590941,Sat Nov 27 22:00:40 CET,Sun Nov 28 00:12:36 CET,0.0 1.223 1.645 1.946 2.198 2.442 2.656 2.843 3.181 3.332 3.475 3.377 3.873 4.002 4.235 4.456 4.666 4.767 4.957 5.142 5.422 5.595 5.763 6.01 6.259 6.499 6.717 6.933 7.206 7.476 7.742 8.047 8.346 8.628 8.938 9.281 9.611 9.979 10.358 10.751 11.193 11.692 12.234 12.768 13.395 14.088 14.848 15.649 16.509 17.389 18.173 18.541 18.552 18.37 18.117 17.816 17.494 17.152 16.802 16.444 16.143 15.873 15.607 15.325 15.045 14.788 14.51 14.249 14.013 13.755 13.484 13.261 13.034 12.801 12.607 12.401 12.201 11.986 11.746 11.574 11.392 11.1 10.887 10.651 10.526 10.267 9.99 9.692 9.535 9.014 9.026 8.832 8.621 8.154 7.899 7.616 7.308 6.934 6.444 5.816 3.147 -3 ,5798 ,TETRA ,17590942,Sat Nov 27 22:00:40 CET,Sun Nov 28 00:15:24 CET,0.0 1.133 1.472 1.72 1.987 2.244 2.467 2.642 2.98 3.156 3.311 3.207 3.705 3.854 4.125 4.365 4.606 4.712 4.902 5.091 5.372 5.555 5.733 5.991 6.232 6.467 6.709 6.937 7.216 7.494 7.776 8.116 8.414 8.678 8.985 9.339 9.689 10.062 10.456 10.877 11.306 11.795 12.357 12.904 13.527 14.181 14.923 15.763 16.697 17.695 18.682 19.112 19.129 18.978 18.702 18.371 18.031 17.666 17.317 16.913 16.55 16.222 15.866 15.542 15.252 14.97 14.659 14.38 14.142 13.885 13.608 13.375 13.131 12.88 12.668 12.439 12.212 11.972 11.725 11.55 11.36 11.055 10.836 10.609 10.497 10.274 10.028 9.762 9.62 9.114 9.16 8.987 8.797 8.356 8.117 7.861 7.543 7.161 6.658 5.911 3.649 -4 ,22129 ,TETRA ,17590943,Sat Nov 27 22:00:40 CET,Sun Nov 28 00:14:35 CET,0.0 1.418 1.961 2.373 2.668 2.941 3.183 3.377 3.744 3.922 4.097 4.093 4.611 4.747 5.027 5.307 5.563 5.68 5.902 6.1 6.387 6.583 6.775 7.046 7.294 7.524 7.747 7.967 8.246 8.514 8.769 9.089 9.394 9.664 9.957 10.31 10.662 11.021 11.407 11.83 12.246 12.717 13.3 13.872 14.495 15.172 15.919 16.643 17.446 18.373 19.309 19.687 19.569 19.267 18.877 18.442 18.022 17.629 17.236 16.827 16.474 16.125 15.772 15.447 15.139 14.83 14.499 14.215 13.97 13.698 13.397 13.138 12.869 12.588 12.367 12.137 11.892 11.626 11.34 11.146 10.933 10.589 10.358 10.114 9.982 9.706 9.416 9.11 8.942 8.409 8.414 8.223 8.01 7.539 7.289 7.012 6.7 6.352 5.863 5.135 2.837 -5 ,26181 ,TETRA ,17590944,Sat Nov 27 22:00:42 CET,Sun Nov 28 00:12:37 CET,0.0 0.871 1.211 1.502 1.763 2.0 2.197 2.378 2.738 2.901 3.056 2.997 3.498 3.633 3.879 4.107 4.347 4.462 4.671 4.868 5.141 5.323 5.505 5.765 6.016 6.249 6.459 6.668 6.959 7.222 7.453 7.743 8.02 8.288 8.597 8.934 9.266 9.623 10.024 10.46 10.882 11.375 11.974 12.553 13.213 13.869 14.566 15.335 16.156 17.042 17.94 18.387 18.416 18.232 17.941 17.607 17.282 16.938 16.603 16.246 15.925 15.644 15.368 15.072 14.786 14.523 14.228 13.964 13.734 13.467 13.188 12.958 12.715 12.449 12.23 12.003 11.763 11.5 11.207 11.023 10.816 10.463 10.23 9.968 9.836 9.567 9.263 8.947 8.785 8.259 8.24 8.011 7.777 7.27 6.97 6.627 6.239 5.816 5.266 4.475 0.967 -6 ,1696 ,TETRA ,17590945,Sat Nov 27 22:00:45 CET,Sun Nov 28 00:13:23 CET,0.0 0.973 1.358 1.684 1.98 2.237 2.448 2.646 3.023 3.192 3.351 3.258 3.75 3.89 4.154 4.39 4.616 4.72 4.905 5.088 5.362 5.541 5.715 5.963 6.188 6.402 6.624 6.834 7.105 7.361 7.597 7.902 8.205 8.482 8.791 9.142 9.489 9.879 10.284 10.705 11.132 11.597 12.14 12.66 13.273 13.987 14.764 15.577 16.464 17.421 18.3 18.643 18.561 18.314 17.99 17.633 17.32 16.983 16.661 16.346 16.042 15.721 15.388 15.08 14.793 14.517 14.204 13.911 13.66 13.39 13.087 12.838 12.581 12.309 12.101 11.868 11.625 11.381 11.101 10.899 10.684 10.347 10.123 9.879 9.747 9.455 9.149 8.83 8.669 8.146 8.138 7.936 7.721 7.276 7.014 6.714 6.361 5.921 5.359 4.487 1.337 -7 ,18448 ,TETRA ,17590946,Sat Nov 27 22:01:40 CET,Sun Nov 28 00:06:42 CET,0.0 1.584 2.152 2.544 2.807 3.039 3.263 3.459 3.816 3.97 4.128 4.074 4.57 4.697 4.93 5.148 5.362 5.461 5.651 5.837 6.106 6.289 6.465 6.704 6.932 7.161 7.378 7.592 7.871 8.117 8.353 8.651 8.93 9.199 9.51 9.851 10.173 10.542 10.933 11.318 11.741 12.247 12.813 13.341 13.935 14.589 15.322 16.136 17.02 17.916 18.745 19.126 19.154 19.014 18.782 18.49 18.166 17.818 17.49 17.14 16.821 16.517 16.204 15.893 15.59 15.313 15.009 14.733 14.47 14.171 13.86 13.605 13.34 13.047 12.817 12.578 12.337 12.093 11.828 11.641 11.446 11.112 10.87 10.612 10.476 10.21 9.948 9.667 9.505 8.974 8.951 8.757 8.572 8.121 7.851 7.54 7.173 6.746 6.204 5.465 2.995 -8 ,11094 ,TETRA ,17590947,Sat Nov 27 22:02:40 CET,Sun Nov 28 00:14:30 CET,0.0 1.22 1.626 1.931 2.203 2.443 2.668 2.863 3.22 3.398 3.57 3.501 4.0 4.129 4.349 4.552 4.759 4.87 5.096 5.31 5.595 5.769 5.936 6.166 6.38 6.598 6.823 7.042 7.31 7.573 7.829 8.126 8.424 8.705 9.011 9.355 9.679 10.059 10.487 10.893 11.297 11.773 12.338 12.897 13.522 14.147 14.832 15.596 16.403 17.204 17.955 18.213 18.057 17.76 17.396 17.015 16.66 16.323 16.003 15.651 15.336 15.051 14.751 14.42 14.099 13.801 13.494 13.246 13.036 12.816 12.561 12.337 12.112 11.869 11.669 11.441 11.202 10.972 10.735 10.563 10.377 10.091 9.882 9.662 9.548 9.29 9.023 8.765 8.63 8.137 8.2 8.038 7.865 7.474 7.25 6.995 6.724 6.441 6.113 5.693 4.16 -9 ,30804 ,TETRA ,17590948,Sat Nov 27 22:02:40 CET,Sun Nov 28 00:14:34 CET,0.0 1.393 1.804 2.134 2.432 2.71 2.952 3.144 3.494 3.665 3.823 3.774 4.29 4.429 4.699 4.953 5.183 5.295 5.503 5.692 5.975 6.165 6.35 6.609 6.848 7.086 7.332 7.553 7.812 8.077 8.347 8.66 8.945 9.216 9.532 9.896 10.241 10.59 10.956 11.353 11.783 12.239 12.728 13.22 13.797 14.432 15.163 15.953 16.843 17.845 18.768 19.217 19.201 18.962 18.706 18.405 18.063 17.718 17.405 17.065 16.76 16.461 16.147 15.848 15.583 15.342 15.08 14.84 14.615 14.366 14.1 13.87 13.63 13.376 13.171 12.962 12.743 12.501 12.251 12.081 11.897 11.615 11.407 11.181 11.07 10.84 10.588 10.316 10.168 9.651 9.69 9.52 9.338 8.975 8.781 8.542 8.238 7.914 7.544 7.063 5.929 -10 ,19431 ,TETRA ,17590949,Sat Nov 27 22:03:38 CET,Sun Nov 28 00:17:14 CET,0.0 0.824 1.203 1.526 1.809 2.088 2.351 2.574 2.967 3.14 3.313 3.304 3.821 3.962 4.238 4.481 4.709 4.823 5.048 5.276 5.592 5.784 5.959 6.216 6.479 6.728 6.97 7.209 7.494 7.76 8.026 8.341 8.645 8.953 9.328 9.73 10.102 10.52 10.965 11.424 11.91 12.456 13.055 13.631 14.28 14.97 15.717 16.518 17.409 18.3 19.125 19.425 19.25 18.971 18.66 18.335 17.999 17.64 17.292 16.947 16.639 16.344 16.064 15.757 15.449 15.184 14.909 14.657 14.44 14.208 13.957 13.746 13.521 13.283 13.083 12.868 12.634 12.386 12.147 11.988 11.817 11.525 11.325 11.112 10.995 10.756 10.516 10.25 10.11 9.618 9.658 9.488 9.309 8.945 8.729 8.48 8.201 7.872 7.507 7.025 4.853 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index a3e096ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1680 ,TETRA ,17590950,Sat Nov 27 22:04:39 CET,Sun Nov 28 00:16:52 CET,0.0 1.107 1.53 1.874 2.168 2.434 2.661 2.867 3.236 3.413 3.593 3.547 4.056 4.193 4.462 4.725 4.962 5.077 5.31 5.522 5.815 6.008 6.202 6.496 6.767 7.003 7.229 7.454 7.752 8.026 8.286 8.607 8.913 9.205 9.543 9.927 10.283 10.67 11.106 11.558 12.018 12.539 13.138 13.718 14.378 15.103 15.914 16.76 17.674 18.658 19.696 20.227 20.252 20.099 19.821 19.465 19.106 18.747 18.397 18.009 17.649 17.319 17.008 16.708 16.416 16.157 15.884 15.629 15.403 15.163 14.898 14.671 14.453 14.224 14.039 13.836 13.608 13.366 13.106 12.933 12.76 12.481 12.279 12.058 11.945 11.709 11.47 11.243 11.108 10.599 10.661 10.494 10.324 9.956 9.75 9.516 9.218 8.88 8.513 7.967 6.566 -2 ,12156 ,TETRA ,17590951,Sat Nov 27 22:04:41 CET,Sun Nov 28 00:18:16 CET,0.0 0.85 1.198 1.494 1.778 2.046 2.282 2.489 2.852 3.026 3.186 3.119 3.625 3.764 4.033 4.291 4.536 4.654 4.874 5.087 5.399 5.593 5.78 6.041 6.288 6.548 6.791 7.021 7.316 7.579 7.841 8.163 8.458 8.742 9.075 9.433 9.767 10.145 10.545 10.953 11.39 11.863 12.379 12.922 13.58 14.307 15.093 15.965 16.999 18.068 19.035 19.526 19.589 19.489 19.318 19.077 18.804 18.506 18.217 17.902 17.573 17.236 16.908 16.595 16.321 16.065 15.749 15.466 15.229 14.97 14.697 14.464 14.227 13.996 13.814 13.607 13.377 13.139 12.896 12.728 12.56 12.311 12.12 11.906 11.788 11.519 11.243 10.968 10.823 10.326 10.407 10.254 10.087 9.734 9.535 9.297 9.035 8.75 8.412 7.992 6.885 -3 ,536 ,TETRA ,17590952,Sat Nov 27 22:04:42 CET,Sun Nov 28 00:17:48 CET,0.0 1.489 1.992 2.313 2.573 2.798 3.009 3.199 3.555 3.73 3.887 3.812 4.327 4.46 4.725 4.983 5.228 5.342 5.544 5.749 6.045 6.222 6.401 6.673 6.924 7.157 7.385 7.601 7.886 8.166 8.425 8.736 9.034 9.333 9.675 10.04 10.392 10.769 11.18 11.618 12.057 12.554 13.119 13.659 14.269 14.958 15.726 16.569 17.564 18.592 19.586 20.082 20.121 19.956 19.685 19.375 19.039 18.693 18.323 17.878 17.498 17.175 16.854 16.533 16.217 15.925 15.589 15.274 15.019 14.744 14.454 14.212 13.958 13.696 13.49 13.263 13.019 12.763 12.487 12.297 12.102 11.794 11.599 11.4 11.289 11.064 10.842 10.605 10.465 9.949 9.966 9.796 9.62 9.25 9.057 8.818 8.511 8.139 7.746 7.304 5.356 -4 ,32692 ,TETRA ,17590953,Sat Nov 27 22:04:44 CET,Sun Nov 28 00:16:59 CET,0.0 0.84 1.226 1.561 1.854 2.124 2.366 2.582 2.961 3.128 3.303 3.272 3.789 3.935 4.209 4.466 4.712 4.829 5.045 5.255 5.574 5.781 5.967 6.239 6.495 6.73 6.965 7.192 7.477 7.744 8.0 8.308 8.602 8.889 9.227 9.621 10.009 10.423 10.845 11.277 11.727 12.235 12.82 13.402 14.074 14.77 15.564 16.416 17.341 18.34 19.323 19.864 19.919 19.732 19.426 19.01 18.621 18.277 17.937 17.579 17.257 16.938 16.619 16.334 16.059 15.805 15.537 15.275 15.035 14.799 14.549 14.327 14.107 13.861 13.658 13.453 13.225 12.971 12.697 12.508 12.314 12.028 11.826 11.603 11.487 11.229 10.955 10.676 10.54 10.052 10.112 9.947 9.77 9.409 9.219 8.983 8.719 8.411 8.006 7.537 5.972 -5 ,24698 ,TETRA ,17590954,Sat Nov 27 22:05:39 CET,Sun Nov 28 00:20:35 CET,0.0 1.575 2.046 2.382 2.66 2.914 3.157 3.405 3.843 4.037 4.231 4.207 4.72 4.873 5.157 5.421 5.684 5.809 6.029 6.238 6.55 6.75 6.941 7.196 7.431 7.665 7.899 8.12 8.404 8.684 8.941 9.269 9.595 9.891 10.231 10.596 10.937 11.319 11.726 12.144 12.578 13.078 13.682 14.29 15.0 15.783 16.632 17.553 18.557 19.611 20.747 21.404 21.496 21.368 21.171 20.905 20.599 20.31 20.017 19.675 19.386 19.096 18.787 18.504 18.213 17.953 17.695 17.436 17.188 16.922 16.648 16.435 16.215 15.959 15.76 15.555 15.333 15.107 14.869 14.704 14.524 14.234 14.038 13.822 13.712 13.486 13.256 13.013 12.872 12.359 12.386 12.208 12.01 11.567 11.334 11.095 10.824 10.508 10.16 9.71 8.388 -6 ,18453 ,TETRA ,17590955,Sat Nov 27 22:05:40 CET,Sun Nov 28 00:21:53 CET,0.0 1.421 1.928 2.333 2.686 2.98 3.233 3.463 3.883 4.064 4.235 4.211 4.742 4.899 5.181 5.455 5.714 5.834 6.061 6.268 6.576 6.793 6.989 7.259 7.515 7.739 7.961 8.188 8.497 8.791 9.071 9.398 9.706 9.998 10.338 10.728 11.103 11.514 11.942 12.393 12.868 13.381 13.949 14.521 15.183 15.912 16.701 17.498 18.423 19.472 20.498 21.065 21.155 21.045 20.837 20.573 20.229 19.834 19.471 19.052 18.644 18.274 17.927 17.597 17.282 16.986 16.683 16.403 16.157 15.893 15.587 15.332 15.068 14.8 14.597 14.379 14.15 13.91 13.651 13.464 13.285 13.022 12.833 12.62 12.509 12.28 12.033 11.772 11.639 11.146 11.197 11.029 10.842 10.438 10.219 9.966 9.686 9.365 8.952 8.408 6.751 -7 ,19695 ,TETRA ,17590956,Sat Nov 27 22:05:42 CET,Sun Nov 28 00:20:42 CET,0.0 1.089 1.47 1.782 2.021 2.233 2.439 2.624 2.96 3.128 3.288 3.225 3.74 3.876 4.143 4.395 4.617 4.727 4.955 5.185 5.496 5.674 5.86 6.138 6.399 6.643 6.855 7.056 7.313 7.571 7.825 8.114 8.384 8.648 8.953 9.29 9.627 9.995 10.38 10.794 11.216 11.662 12.202 12.751 13.383 14.057 14.781 15.578 16.492 17.431 18.283 18.633 18.601 18.422 18.168 17.915 17.618 17.298 17.008 16.68 16.376 16.065 15.768 15.508 15.256 15.026 14.771 14.514 14.275 14.039 13.793 13.589 13.364 13.117 12.914 12.694 12.474 12.229 11.971 11.796 11.625 11.366 11.187 10.994 10.879 10.641 10.418 10.164 10.013 9.5 9.55 9.389 9.217 8.801 8.559 8.326 8.069 7.769 7.407 6.902 5.25 -8 ,21495 ,TETRA ,17590957,Sat Nov 27 22:05:45 CET,Sun Nov 28 00:20:46 CET,0.0 0.753 1.173 1.53 1.81 2.041 2.26 2.465 2.839 3.008 3.16 3.095 3.586 3.709 3.971 4.237 4.477 4.592 4.828 5.063 5.377 5.566 5.751 6.014 6.262 6.497 6.734 6.971 7.254 7.504 7.749 8.05 8.359 8.637 8.944 9.297 9.642 10.047 10.459 10.882 11.315 11.788 12.36 12.925 13.568 14.231 14.939 15.729 16.632 17.575 18.559 19.033 19.079 18.946 18.657 18.295 17.932 17.607 17.33 17.013 16.711 16.4 16.08 15.776 15.476 15.203 14.923 14.663 14.414 14.154 13.891 13.662 13.416 13.176 13.0 12.806 12.601 12.381 12.137 11.971 11.799 11.516 11.312 11.109 11.008 10.795 10.549 10.272 10.139 9.647 9.689 9.532 9.375 9.008 8.784 8.548 8.303 8.013 7.667 7.199 5.269 -9 ,5811 ,TETRA ,17590958,Sat Nov 27 22:05:40 CET,Sun Nov 28 00:19:57 CET,0.0 1.294 1.793 2.221 2.543 2.799 3.025 3.198 3.514 3.68 3.842 3.788 4.299 4.438 4.702 4.97 5.223 5.339 5.555 5.761 6.07 6.267 6.453 6.715 6.953 7.176 7.391 7.608 7.882 8.148 8.41 8.713 8.994 9.275 9.614 9.982 10.333 10.713 11.108 11.517 11.97 12.494 13.072 13.651 14.299 14.998 15.802 16.62 17.478 18.443 19.426 19.976 20.079 20.007 19.789 19.421 19.029 18.66 18.318 17.954 17.617 17.286 16.962 16.651 16.345 16.061 15.751 15.476 15.249 15.013 14.739 14.497 14.264 14.021 13.823 13.605 13.382 13.161 12.925 12.755 12.567 12.287 12.093 11.875 11.768 11.547 11.312 11.078 10.949 10.436 10.463 10.299 10.097 9.637 9.395 9.145 8.887 8.592 8.245 7.777 6.078 -10 ,21805 ,TETRA ,17590959,Sat Nov 27 22:05:40 CET,Sun Nov 28 00:19:56 CET,0.0 1.343 1.763 2.106 2.395 2.671 2.922 3.148 3.559 3.739 3.904 3.873 4.388 4.536 4.836 5.123 5.391 5.514 5.738 5.953 6.27 6.469 6.667 6.962 7.23 7.481 7.721 7.943 8.23 8.512 8.787 9.115 9.425 9.73 10.083 10.46 10.811 11.207 11.648 12.121 12.58 13.069 13.654 14.228 14.878 15.597 16.392 17.229 18.176 19.235 20.292 20.858 20.928 20.789 20.573 20.283 19.925 19.594 19.337 19.03 18.736 18.447 18.138 17.832 17.538 17.276 16.989 16.721 16.499 16.277 16.02 15.803 15.588 15.361 15.194 15.007 14.788 14.563 14.319 14.13 13.943 13.656 13.449 13.245 13.145 12.931 12.674 12.389 12.25 11.769 11.838 11.672 11.492 11.089 10.886 10.676 10.435 10.16 9.833 9.346 7.581 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index 0cbff03d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25829 ,KEBNE ,17026730,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:53:47 CET,0.0 1.519 2.099 2.506 2.838 3.097 3.311 3.512 3.895 4.08 4.242 4.162 4.676 4.815 5.074 5.307 5.523 5.636 5.847 6.042 6.306 6.463 6.619 6.849 7.058 7.248 7.439 7.637 7.901 8.15 8.389 8.672 8.938 9.198 9.496 9.819 10.119 10.449 10.81 11.205 11.632 12.111 12.658 13.189 13.78 14.436 15.186 16.021 16.963 17.924 18.848 19.327 19.36 19.244 19.028 18.696 18.355 18.033 17.724 17.393 17.094 16.805 16.514 16.237 15.993 15.763 15.514 15.281 15.062 14.828 14.57 14.346 14.111 13.872 13.69 13.484 13.266 13.042 12.804 12.634 12.464 12.21 12.017 11.794 11.681 11.459 11.218 10.962 10.82 10.318 10.365 10.197 10.035 9.644 9.411 9.148 8.831 8.48 8.072 7.481 5.735 -2 ,1815 ,KEBNE ,17026731,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:54:21 CET,0.0 0.979 1.413 1.711 1.989 2.232 2.451 2.657 3.016 3.176 3.332 3.231 3.73 3.853 4.071 4.294 4.518 4.619 4.823 5.034 5.328 5.518 5.7 5.96 6.202 6.413 6.609 6.817 7.099 7.374 7.629 7.923 8.21 8.475 8.763 9.076 9.391 9.742 10.11 10.507 10.921 11.38 11.92 12.454 13.038 13.67 14.377 15.134 15.989 16.904 17.785 18.173 18.128 17.89 17.616 17.312 16.965 16.589 16.248 15.897 15.56 15.227 14.907 14.603 14.286 13.978 13.662 13.384 13.145 12.898 12.619 12.383 12.137 11.88 11.687 11.485 11.266 11.028 10.79 10.627 10.461 10.207 10.016 9.809 9.7 9.49 9.267 9.009 8.871 8.369 8.411 8.239 8.05 7.597 7.367 7.134 6.857 6.525 6.138 5.584 3.81 -3 ,31110 ,KEBNE ,17026732,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:53:47 CET,0.0 1.686 2.066 2.412 2.744 3.03 3.275 3.476 3.829 3.992 4.145 4.063 4.571 4.708 4.99 5.249 5.453 5.551 5.739 5.927 6.198 6.367 6.545 6.802 7.035 7.263 7.49 7.713 7.985 8.242 8.493 8.786 9.081 9.37 9.704 10.076 10.407 10.743 11.097 11.472 11.86 12.299 12.82 13.352 13.937 14.586 15.348 16.146 17.034 18.012 18.918 19.33 19.308 19.091 18.762 18.37 17.989 17.621 17.289 16.932 16.596 16.296 15.985 15.657 15.349 15.052 14.748 14.47 14.233 13.991 13.734 13.52 13.279 13.019 12.823 12.627 12.42 12.209 11.972 11.798 11.619 11.323 11.092 10.858 10.746 10.526 10.308 10.043 9.893 9.383 9.427 9.25 9.059 8.639 8.414 8.171 7.907 7.619 7.194 6.477 4.43 -4 ,27646 ,KEBNE ,17026733,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:55:23 CET,0.0 2.191 2.732 3.108 3.372 3.609 3.831 4.04 4.41 4.587 4.748 4.671 5.18 5.306 5.548 5.781 6.002 6.113 6.334 6.54 6.826 7.004 7.179 7.429 7.664 7.891 8.094 8.28 8.516 8.774 9.037 9.319 9.587 9.85 10.158 10.515 10.865 11.247 11.645 12.068 12.535 13.065 13.64 14.165 14.759 15.445 16.23 17.034 17.899 18.833 19.715 20.131 20.175 20.017 19.749 19.432 19.087 18.713 18.36 17.996 17.673 17.356 17.037 16.738 16.448 16.177 15.876 15.592 15.342 15.068 14.781 14.548 14.303 14.047 13.859 13.662 13.439 13.201 12.949 12.772 12.589 12.305 12.107 11.902 11.796 11.571 11.318 11.049 10.91 10.396 10.421 10.258 10.074 9.649 9.399 9.137 8.879 8.552 8.128 7.569 5.597 -5 ,30130 ,KEBNE ,17026734,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:54:21 CET,0.0 1.502 1.997 2.33 2.585 2.812 3.024 3.235 3.645 3.833 4.003 3.956 4.479 4.614 4.87 5.092 5.295 5.398 5.597 5.799 6.092 6.286 6.476 6.733 6.985 7.224 7.456 7.68 7.958 8.233 8.496 8.779 9.036 9.3 9.615 9.958 10.28 10.638 11.015 11.402 11.798 12.246 12.79 13.343 13.95 14.586 15.301 16.074 16.914 17.823 18.773 19.328 19.426 19.292 19.005 18.635 18.282 17.919 17.587 17.221 16.882 16.553 16.209 15.905 15.63 15.365 15.064 14.79 14.558 14.32 14.066 13.839 13.589 13.331 13.142 12.946 12.73 12.497 12.264 12.109 11.95 11.679 11.487 11.286 11.175 10.94 10.688 10.425 10.297 9.796 9.834 9.677 9.507 9.108 8.879 8.619 8.323 7.971 7.552 7.052 5.886 -6 ,3789 ,KEBNE ,17026735,Wed Dec 22 15:06:57 CET,Wed Dec 22 16:54:00 CET,0.0 2.536 2.973 3.292 3.581 3.837 4.049 4.257 4.64 4.805 4.963 4.91 5.423 5.565 5.829 6.057 6.272 6.376 6.551 6.725 7.003 7.182 7.362 7.626 7.863 8.091 8.316 8.524 8.769 9.008 9.238 9.528 9.813 10.084 10.41 10.751 11.081 11.454 11.852 12.279 12.73 13.203 13.724 14.223 14.778 15.406 16.11 16.855 17.698 18.659 19.665 20.207 20.234 20.026 19.752 19.436 19.103 18.771 18.454 18.106 17.793 17.509 17.224 16.928 16.655 16.412 16.139 15.875 15.639 15.385 15.117 14.891 14.626 14.352 14.155 13.954 13.74 13.513 13.286 13.109 12.909 12.603 12.397 12.179 12.066 11.838 11.589 11.323 11.168 10.646 10.681 10.514 10.342 9.963 9.747 9.498 9.201 8.867 8.537 8.096 6.604 -7 ,607 ,KEBNE ,17026736,Wed Dec 22 15:07:59 CET,Wed Dec 22 16:55:22 CET,0.0 1.875 2.381 2.687 2.948 3.183 3.416 3.615 3.932 4.085 4.236 4.147 4.645 4.769 5.006 5.239 5.46 5.565 5.773 5.984 6.282 6.469 6.642 6.889 7.126 7.347 7.56 7.754 8.005 8.264 8.519 8.819 9.117 9.38 9.664 10.002 10.333 10.695 11.077 11.462 11.868 12.351 12.891 13.395 13.977 14.657 15.392 16.135 17.051 18.112 19.082 19.497 19.563 19.456 19.243 18.961 18.632 18.323 18.022 17.661 17.326 17.028 16.754 16.476 16.216 15.98 15.727 15.491 15.287 15.084 14.853 14.629 14.387 14.144 13.945 13.74 13.538 13.311 13.061 12.879 12.696 12.427 12.229 12.015 11.906 11.691 11.452 11.183 11.036 10.526 10.587 10.422 10.22 9.783 9.553 9.299 9.022 8.695 8.302 7.799 6.117 -8 ,31937 ,KEBNE ,17026737,Wed Dec 22 15:07:59 CET,Wed Dec 22 16:55:11 CET,0.0 1.756 2.186 2.462 2.692 2.926 3.169 3.384 3.72 3.885 4.065 4.005 4.504 4.631 4.862 5.095 5.329 5.435 5.659 5.866 6.155 6.345 6.517 6.781 7.026 7.242 7.459 7.681 7.964 8.218 8.464 8.748 9.012 9.274 9.574 9.926 10.255 10.594 10.962 11.365 11.794 12.265 12.786 13.303 13.93 14.621 15.332 16.085 16.995 17.939 18.82 19.305 19.443 19.354 19.113 18.849 18.552 18.235 17.943 17.614 17.317 17.053 16.765 16.482 16.234 15.986 15.717 15.467 15.244 15.009 14.769 14.557 14.335 14.091 13.888 13.68 13.444 13.19 12.92 12.732 12.537 12.244 12.037 11.818 11.698 11.425 11.155 10.878 10.719 10.191 10.2 10.019 9.813 9.365 9.127 8.88 8.573 8.199 7.777 7.179 5.581 -9 ,15100 ,KEBNE ,17026738,Wed Dec 22 15:07:58 CET,Wed Dec 22 16:55:04 CET,0.0 1.193 1.623 1.95 2.226 2.466 2.673 2.856 3.205 3.377 3.533 3.436 3.936 4.078 4.336 4.551 4.763 4.872 5.07 5.25 5.511 5.688 5.856 6.096 6.327 6.548 6.753 6.948 7.216 7.479 7.729 8.02 8.298 8.573 8.884 9.221 9.546 9.897 10.256 10.654 11.076 11.547 12.112 12.659 13.254 13.914 14.65 15.426 16.314 17.304 18.275 18.725 18.653 18.396 18.067 17.686 17.307 16.915 16.561 16.18 15.822 15.499 15.176 14.849 14.553 14.296 14.005 13.731 13.495 13.252 13.0 12.772 12.531 12.286 12.089 11.884 11.66 11.415 11.159 10.979 10.791 10.496 10.278 10.048 9.934 9.694 9.435 9.173 9.039 8.53 8.535 8.335 8.146 7.718 7.461 7.19 6.907 6.618 6.263 5.758 3.849 -10 ,3975 ,KEBNE ,17026739,Wed Dec 22 15:07:58 CET,Wed Dec 22 16:54:51 CET,0.0 1.179 1.673 2.006 2.3 2.544 2.734 2.91 3.264 3.422 3.572 3.479 3.974 4.101 4.348 4.583 4.808 4.918 5.118 5.305 5.578 5.758 5.938 6.181 6.409 6.634 6.853 7.057 7.3 7.538 7.778 8.068 8.344 8.611 8.91 9.246 9.577 9.944 10.34 10.776 11.222 11.679 12.222 12.755 13.335 13.955 14.652 15.45 16.344 17.321 18.274 18.679 18.672 18.509 18.201 17.843 17.527 17.172 16.79 16.404 16.074 15.779 15.485 15.187 14.908 14.652 14.369 14.114 13.888 13.646 13.378 13.151 12.916 12.668 12.471 12.261 12.041 11.82 11.599 11.434 11.261 10.988 10.792 10.576 10.462 10.234 10.002 9.748 9.609 9.109 9.143 8.965 8.784 8.397 8.164 7.915 7.635 7.331 7.021 6.528 3.759 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt deleted file mode 100644 index f6d7b481..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19107 ,TETRA ,17590960,Sat Nov 27 22:06:39 CET,Sun Nov 28 00:17:28 CET,0.0 1.187 1.625 1.941 2.227 2.508 2.767 2.977 3.362 3.552 3.733 3.678 4.192 4.332 4.6 4.85 5.072 5.177 5.374 5.565 5.855 6.046 6.232 6.501 6.757 6.994 7.201 7.398 7.665 7.927 8.182 8.471 8.751 9.024 9.342 9.718 10.063 10.417 10.8 11.188 11.594 12.079 12.605 13.076 13.639 14.284 14.971 15.67 16.423 17.278 18.119 18.413 18.375 18.181 17.855 17.509 17.179 16.838 16.526 16.164 15.839 15.566 15.285 14.989 14.692 14.416 14.126 13.855 13.62 13.374 13.091 12.863 12.654 12.437 12.244 12.03 11.812 11.593 11.363 11.194 11.006 10.705 10.505 10.282 10.163 9.933 9.701 9.439 9.286 8.769 8.794 8.6 8.401 7.959 7.69 7.393 7.075 6.76 6.353 5.661 3.266 -2 ,29958 ,TETRA ,17590961,Sat Nov 27 22:06:41 CET,Sun Nov 28 00:16:40 CET,0.0 1.675 2.21 2.588 2.89 3.152 3.391 3.604 3.97 4.139 4.305 4.218 4.714 4.853 5.127 5.375 5.617 5.724 5.929 6.127 6.39 6.564 6.736 6.963 7.2 7.44 7.653 7.854 8.103 8.345 8.601 8.92 9.22 9.509 9.819 10.153 10.465 10.826 11.241 11.675 12.108 12.589 13.145 13.65 14.207 14.837 15.535 16.258 17.003 17.785 18.539 18.824 18.757 18.526 18.237 17.903 17.578 17.236 16.914 16.577 16.245 15.907 15.557 15.249 14.971 14.7 14.404 14.112 13.859 13.598 13.312 13.066 12.795 12.514 12.3 12.084 11.861 11.623 11.364 11.19 11.028 10.746 10.525 10.296 10.18 9.949 9.708 9.432 9.274 8.742 8.744 8.551 8.341 7.87 7.611 7.336 7.054 6.745 6.343 5.788 3.501 -3 ,5195 ,TETRA ,17590962,Sat Nov 27 22:06:39 CET,Sun Nov 28 00:16:23 CET,0.0 1.527 2.073 2.432 2.731 2.974 3.205 3.436 3.871 4.04 4.188 4.132 4.65 4.79 5.054 5.302 5.537 5.647 5.846 6.049 6.357 6.54 6.712 6.968 7.204 7.421 7.638 7.862 8.149 8.403 8.65 8.966 9.256 9.526 9.836 10.178 10.501 10.844 11.22 11.619 12.031 12.486 12.999 13.514 14.118 14.757 15.425 16.15 16.997 17.893 18.719 19.185 19.23 19.024 18.712 18.339 17.983 17.623 17.25 16.84 16.462 16.121 15.798 15.482 15.178 14.888 14.577 14.307 14.057 13.777 13.492 13.261 13.017 12.753 12.546 12.34 12.129 11.889 11.637 11.465 11.278 10.975 10.759 10.534 10.411 10.164 9.92 9.644 9.505 9.007 9.044 8.872 8.687 8.242 7.993 7.738 7.429 7.098 6.704 6.145 3.513 -4 ,23338 ,TETRA ,17590963,Sat Nov 27 22:06:38 CET,Sun Nov 28 00:19:36 CET,0.0 1.367 1.866 2.204 2.497 2.756 2.985 3.196 3.583 3.764 3.917 3.812 4.321 4.466 4.717 4.935 5.142 5.251 5.464 5.662 5.949 6.131 6.32 6.581 6.813 7.048 7.287 7.499 7.759 8.019 8.276 8.579 8.838 9.079 9.357 9.67 9.979 10.321 10.712 11.126 11.53 11.946 12.437 12.953 13.53 14.198 14.96 15.748 16.598 17.471 18.339 18.71 18.691 18.502 18.222 17.873 17.538 17.21 16.872 16.491 16.139 15.815 15.504 15.228 14.966 14.706 14.438 14.183 13.944 13.68 13.382 13.143 12.911 12.672 12.484 12.279 12.053 11.812 11.56 11.397 11.223 10.925 10.718 10.491 10.373 10.121 9.838 9.558 9.408 8.888 8.909 8.721 8.525 8.123 7.892 7.62 7.336 7.022 6.633 6.066 3.622 -5 ,19601 ,TETRA ,17590964,Sat Nov 27 22:07:41 CET,Sun Nov 28 00:18:30 CET,0.0 1.425 1.866 2.19 2.482 2.769 3.035 3.26 3.659 3.84 4.003 3.957 4.469 4.601 4.85 5.099 5.346 5.459 5.663 5.856 6.128 6.303 6.484 6.745 6.987 7.235 7.475 7.697 7.957 8.205 8.472 8.784 9.062 9.322 9.627 9.974 10.319 10.692 11.085 11.529 11.976 12.468 13.052 13.593 14.155 14.783 15.506 16.271 17.114 18.049 19.014 19.459 19.464 19.228 18.895 18.534 18.17 17.806 17.471 17.133 16.794 16.488 16.225 15.947 15.658 15.39 15.109 14.84 14.595 14.339 14.077 13.847 13.588 13.325 13.133 12.935 12.718 12.48 12.218 12.037 11.86 11.572 11.361 11.159 11.055 10.815 10.559 10.286 10.128 9.6 9.634 9.448 9.261 8.823 8.571 8.317 8.049 7.739 7.354 6.811 5.119 -6 ,31582 ,TETRA ,17590965,Sat Nov 27 22:07:41 CET,Sun Nov 28 00:17:34 CET,0.0 1.919 2.322 2.668 2.987 3.245 3.459 3.646 3.978 4.139 4.305 4.244 4.756 4.892 5.13 5.358 5.584 5.69 5.897 6.094 6.367 6.536 6.699 6.942 7.175 7.4 7.618 7.826 8.105 8.355 8.583 8.88 9.179 9.462 9.769 10.098 10.433 10.804 11.183 11.583 11.986 12.434 12.97 13.465 14.041 14.701 15.441 16.199 16.948 17.786 18.613 18.923 18.87 18.641 18.326 18.007 17.68 17.296 16.94 16.56 16.193 15.868 15.57 15.283 15.007 14.756 14.46 14.17 13.905 13.632 13.358 13.127 12.881 12.616 12.415 12.215 11.997 11.746 11.49 11.315 11.136 10.863 10.659 10.435 10.314 10.067 9.788 9.485 9.33 8.802 8.831 8.662 8.482 8.012 7.739 7.441 7.096 6.712 6.308 5.714 3.905 -7 ,26887 ,TETRA ,17590966,Sat Nov 27 22:07:41 CET,Sun Nov 28 00:18:03 CET,0.0 1.624 2.126 2.49 2.818 3.085 3.302 3.494 3.859 4.052 4.217 4.132 4.644 4.779 5.038 5.3 5.55 5.663 5.878 6.082 6.357 6.519 6.684 6.951 7.208 7.436 7.66 7.87 8.13 8.371 8.619 8.944 9.228 9.485 9.791 10.125 10.45 10.823 11.202 11.627 12.077 12.553 13.084 13.573 14.121 14.747 15.464 16.222 17.011 17.825 18.595 18.933 18.89 18.662 18.377 18.03 17.682 17.349 17.01 16.654 16.338 16.011 15.671 15.376 15.108 14.837 14.521 14.224 13.961 13.687 13.4 13.163 12.932 12.685 12.478 12.242 11.992 11.743 11.482 11.305 11.125 10.84 10.637 10.415 10.305 10.081 9.823 9.555 9.413 8.9 8.941 8.752 8.531 8.068 7.819 7.555 7.297 6.994 6.566 5.97 3.448 -8 ,19366 ,TETRA ,17590967,Sat Nov 27 22:07:41 CET,Sun Nov 28 00:17:00 CET,0.0 1.589 2.043 2.463 2.797 3.075 3.314 3.531 3.924 4.099 4.282 4.251 4.765 4.904 5.161 5.396 5.624 5.745 5.99 6.188 6.445 6.628 6.814 7.077 7.313 7.529 7.742 7.953 8.234 8.51 8.795 9.12 9.391 9.632 9.926 10.267 10.575 10.911 11.284 11.675 12.081 12.57 13.134 13.666 14.22 14.83 15.549 16.304 17.117 17.968 18.701 18.878 18.781 18.593 18.306 17.966 17.595 17.207 16.847 16.479 16.175 15.888 15.594 15.304 15.019 14.757 14.456 14.189 13.968 13.725 13.476 13.25 13.001 12.749 12.547 12.324 12.092 11.863 11.611 11.445 11.283 10.993 10.778 10.556 10.439 10.185 9.91 9.612 9.46 8.941 8.96 8.778 8.597 8.212 7.982 7.718 7.406 7.033 6.611 6.09 4.408 -9 ,27909 ,TETRA ,17590968,Sat Nov 27 22:07:43 CET,Sun Nov 28 00:18:01 CET,0.0 2.05 2.599 3.03 3.372 3.64 3.877 4.09 4.476 4.646 4.808 4.756 5.272 5.404 5.657 5.888 6.12 6.238 6.463 6.682 7.002 7.211 7.409 7.674 7.933 8.18 8.394 8.594 8.865 9.119 9.342 9.614 9.894 10.164 10.473 10.828 11.169 11.516 11.882 12.281 12.687 13.159 13.695 14.213 14.797 15.427 16.138 16.933 17.801 18.671 19.421 19.719 19.643 19.365 18.997 18.592 18.213 17.811 17.434 17.081 16.752 16.433 16.115 15.794 15.488 15.22 14.943 14.677 14.437 14.18 13.908 13.689 13.458 13.21 12.996 12.758 12.52 12.275 12.017 11.824 11.63 11.351 11.158 10.96 10.839 10.589 10.339 10.064 9.916 9.4 9.433 9.271 9.121 8.753 8.51 8.209 7.852 7.452 6.993 6.37 4.554 -10 ,22376 ,TETRA ,17590969,Sat Nov 27 22:08:39 CET,Sun Nov 28 00:18:49 CET,0.0 1.454 1.919 2.269 2.568 2.858 3.115 3.336 3.723 3.898 4.062 3.979 4.49 4.625 4.88 5.137 5.372 5.48 5.68 5.863 6.14 6.325 6.492 6.732 6.969 7.189 7.41 7.619 7.867 8.126 8.383 8.692 8.991 9.246 9.552 9.912 10.238 10.601 10.976 11.353 11.76 12.243 12.8 13.34 13.923 14.52 15.187 15.877 16.642 17.497 18.328 18.69 18.686 18.536 18.254 17.91 17.565 17.233 16.908 16.524 16.199 15.891 15.569 15.248 14.94 14.681 14.4 14.124 13.882 13.615 13.326 13.09 12.842 12.583 12.391 12.174 11.919 11.666 11.409 11.221 11.038 10.773 10.587 10.379 10.264 10.019 9.766 9.479 9.32 8.797 8.827 8.653 8.45 7.978 7.734 7.488 7.202 6.868 6.454 5.828 3.466 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18627-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18627-1.txt deleted file mode 100644 index 520b58a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18627-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15006 ,KEBNE ,17026740,Wed Dec 22 15:07:59 CET,Wed Dec 22 16:56:12 CET,0.0 0.728 1.156 1.514 1.786 2.016 2.209 2.391 2.715 2.858 3.008 2.957 3.461 3.59 3.826 4.054 4.261 4.354 4.529 4.703 4.957 5.115 5.266 5.5 5.728 5.922 6.105 6.304 6.563 6.796 7.024 7.308 7.562 7.801 8.073 8.363 8.622 8.906 9.225 9.554 9.9 10.296 10.74 11.16 11.61 12.069 12.601 13.179 13.768 14.322 14.741 14.692 14.329 13.863 13.34 12.834 12.371 11.931 11.51 11.063 10.662 10.309 9.975 9.628 9.269 8.955 8.644 8.34 8.083 7.814 7.529 7.301 7.053 6.793 6.586 6.367 6.144 5.91 5.665 5.493 5.316 5.04 4.836 4.616 4.502 4.271 4.031 3.756 3.605 3.101 3.142 2.966 2.791 2.403 2.175 1.925 1.655 1.319 0.902 0.447 -0.878 -2 ,9105 ,KEBNE ,17026741,Wed Dec 22 15:07:58 CET,Wed Dec 22 16:57:37 CET,0.0 1.044 1.393 1.652 1.86 2.063 2.252 2.435 2.766 2.903 3.039 2.928 3.416 3.539 3.762 3.968 4.159 4.259 4.444 4.596 4.822 4.971 5.116 5.339 5.557 5.755 5.939 6.114 6.34 6.55 6.739 6.963 7.193 7.433 7.711 8.019 8.306 8.604 8.914 9.235 9.559 9.9 10.298 10.704 11.159 11.641 12.15 12.681 13.192 13.646 13.937 13.745 13.339 12.892 12.432 11.936 11.437 10.97 10.547 10.094 9.707 9.371 9.022 8.66 8.323 8.026 7.705 7.413 7.164 6.91 6.639 6.414 6.172 5.908 5.71 5.49 5.255 5.009 4.746 4.565 4.378 4.091 3.892 3.684 3.58 3.355 3.1 2.825 2.682 2.176 2.186 1.995 1.821 1.444 1.214 0.95 0.679 0.394 0.06 -0.415 -1.456 -3 ,12625 ,KEBNE ,17026742,Wed Dec 22 15:07:58 CET,Wed Dec 22 16:56:41 CET,0.0 0.833 1.194 1.51 1.757 1.967 2.166 2.335 2.637 2.785 2.932 2.825 3.296 3.406 3.601 3.785 3.974 4.073 4.264 4.442 4.676 4.815 4.948 5.142 5.346 5.55 5.733 5.903 6.123 6.34 6.543 6.776 7.004 7.225 7.471 7.76 8.028 8.308 8.602 8.897 9.209 9.555 9.966 10.38 10.836 11.322 11.821 12.326 12.848 13.287 13.521 13.318 12.885 12.343 11.816 11.276 10.768 10.288 9.842 9.385 8.976 8.626 8.274 7.911 7.592 7.311 7.002 6.717 6.466 6.203 5.919 5.674 5.42 5.164 4.964 4.749 4.524 4.292 4.035 3.852 3.667 3.375 3.164 2.938 2.816 2.568 2.317 2.055 1.926 1.434 1.465 1.29 1.112 0.727 0.507 0.241 -0.05 -0.339 -0.67 -1.092 -1.986 -4 ,21554 ,KEBNE ,17026743,Wed Dec 22 15:07:59 CET,Wed Dec 22 16:57:05 CET,0.0 0.819 1.169 1.437 1.673 1.874 2.058 2.231 2.541 2.68 2.821 2.728 3.199 3.309 3.536 3.756 3.953 4.041 4.203 4.36 4.585 4.729 4.877 5.079 5.267 5.449 5.617 5.789 6.009 6.208 6.407 6.651 6.873 7.093 7.359 7.642 7.9 8.18 8.483 8.799 9.124 9.489 9.885 10.269 10.699 11.131 11.62 12.166 12.71 13.216 13.516 13.352 12.96 12.482 12.019 11.553 11.12 10.723 10.362 9.985 9.65 9.346 9.024 8.702 8.416 8.139 7.841 7.572 7.322 7.06 6.781 6.548 6.292 6.018 5.814 5.619 5.418 5.186 4.943 4.773 4.594 4.313 4.111 3.89 3.781 3.57 3.341 3.076 2.936 2.431 2.471 2.305 2.136 1.763 1.552 1.324 1.065 0.778 0.448 0.035 -1.0 -5 ,30632 ,KEBNE ,17026744,Wed Dec 22 15:07:58 CET,Wed Dec 22 16:56:32 CET,0.0 0.764 1.097 1.347 1.574 1.789 1.972 2.122 2.393 2.516 2.641 2.505 2.963 3.068 3.27 3.46 3.631 3.726 3.928 4.112 4.361 4.514 4.663 4.866 5.047 5.217 5.382 5.556 5.78 5.973 6.148 6.366 6.599 6.828 7.077 7.338 7.581 7.867 8.174 8.471 8.772 9.119 9.503 9.861 10.286 10.712 11.172 11.692 12.219 12.691 13.006 12.852 12.434 11.947 11.462 10.983 10.514 10.05 9.62 9.181 8.804 8.462 8.124 7.787 7.448 7.142 6.827 6.524 6.255 5.964 5.666 5.431 5.175 4.9 4.693 4.487 4.261 4.011 3.754 3.574 3.396 3.129 2.94 2.739 2.632 2.41 2.176 1.921 1.781 1.283 1.36 1.207 1.046 0.683 0.466 0.233 -0.032 -0.358 -0.742 -1.284 -2.505 -6 ,6727 ,KEBNE ,17026745,Wed Dec 22 15:07:58 CET,Wed Dec 22 16:56:14 CET,0.0 0.736 1.089 1.363 1.603 1.844 2.055 2.225 2.52 2.677 2.821 2.703 3.189 3.315 3.538 3.746 3.937 4.032 4.211 4.369 4.587 4.73 4.874 5.064 5.246 5.443 5.632 5.797 6.007 6.217 6.425 6.668 6.896 7.129 7.397 7.68 7.951 8.238 8.537 8.85 9.168 9.514 9.919 10.306 10.733 11.173 11.648 12.147 12.646 13.121 13.422 13.217 12.823 12.394 11.904 11.39 10.911 10.484 10.086 9.645 9.275 8.91 8.525 8.179 7.864 7.541 7.197 6.919 6.671 6.394 6.086 5.834 5.59 5.34 5.131 4.916 4.71 4.483 4.242 4.071 3.886 3.613 3.413 3.204 3.101 2.884 2.654 2.384 2.228 1.719 1.756 1.576 1.395 1.025 0.803 0.556 0.285 -0.031 -0.376 -0.826 -1.789 -7 ,25894 ,KEBNE ,17026746,Wed Dec 22 15:07:59 CET,Wed Dec 22 16:56:01 CET,0.0 0.787 1.1 1.401 1.672 1.872 2.063 2.236 2.548 2.709 2.853 2.764 3.245 3.353 3.56 3.755 3.943 4.037 4.22 4.386 4.629 4.784 4.926 5.123 5.315 5.501 5.68 5.864 6.1 6.313 6.515 6.744 6.971 7.199 7.463 7.757 8.04 8.335 8.624 8.93 9.247 9.59 9.974 10.346 10.767 11.211 11.682 12.181 12.715 13.167 13.406 13.214 12.754 12.226 11.713 11.204 10.724 10.236 9.781 9.336 8.957 8.6 8.235 7.888 7.545 7.236 6.934 6.644 6.391 6.116 5.825 5.597 5.348 5.088 4.885 4.662 4.424 4.167 3.907 3.737 3.558 3.273 3.076 2.867 2.754 2.527 2.29 2.023 1.885 1.389 1.459 1.291 1.111 0.712 0.493 0.272 0.034 -0.247 -0.602 -1.014 -1.733 -8 ,13337 ,KEBNE ,17026747,Wed Dec 22 15:07:58 CET,Wed Dec 22 16:57:08 CET,0.0 0.887 1.309 1.593 1.824 2.035 2.224 2.408 2.724 2.861 2.997 2.886 3.373 3.49 3.705 3.902 4.108 4.207 4.404 4.606 4.879 5.044 5.195 5.404 5.602 5.802 6.005 6.196 6.423 6.631 6.828 7.064 7.286 7.487 7.729 8.001 8.252 8.536 8.834 9.135 9.455 9.833 10.25 10.654 11.127 11.627 12.118 12.597 13.11 13.513 13.697 13.476 13.039 12.525 12.011 11.511 10.986 10.484 10.062 9.644 9.283 8.942 8.589 8.247 7.91 7.59 7.266 6.979 6.721 6.456 6.186 5.947 5.691 5.438 5.246 5.032 4.808 4.563 4.3 4.123 3.933 3.627 3.419 3.202 3.081 2.829 2.578 2.316 2.18 1.674 1.728 1.566 1.385 1.003 0.79 0.565 0.325 0.026 -0.35 -0.802 -1.899 -9 ,2528 ,KEBNE ,17026748,Wed Dec 22 15:09:01 CET,Wed Dec 22 16:58:34 CET,0.0 1.013 1.412 1.7 1.95 2.191 2.387 2.536 2.823 2.974 3.109 2.972 3.437 3.547 3.755 3.936 4.107 4.199 4.375 4.527 4.742 4.888 5.036 5.243 5.442 5.634 5.811 5.98 6.195 6.392 6.589 6.835 7.043 7.238 7.493 7.779 8.023 8.293 8.589 8.911 9.252 9.616 10.034 10.432 10.864 11.305 11.786 12.292 12.783 13.244 13.53 13.366 12.958 12.448 11.957 11.457 10.95 10.461 10.03 9.622 9.273 8.924 8.575 8.237 7.91 7.603 7.262 6.96 6.703 6.433 6.146 5.906 5.665 5.406 5.187 4.969 4.751 4.515 4.276 4.117 3.948 3.645 3.43 3.212 3.098 2.87 2.636 2.396 2.26 1.748 1.811 1.644 1.472 1.095 0.866 0.609 0.353 0.088 -0.248 -0.714 -2.069 -10 ,11952 ,KEBNE ,17026749,Wed Dec 22 15:09:00 CET,Wed Dec 22 16:56:45 CET,0.0 1.284 1.698 2.037 2.302 2.52 2.732 2.943 3.309 3.472 3.627 3.561 4.064 4.195 4.439 4.654 4.849 4.943 5.125 5.309 5.58 5.738 5.896 6.14 6.356 6.55 6.73 6.906 7.133 7.342 7.53 7.762 7.974 8.181 8.435 8.692 8.937 9.23 9.538 9.845 10.157 10.513 10.919 11.295 11.707 12.122 12.578 13.09 13.606 14.064 14.308 14.067 13.631 13.136 12.658 12.167 11.663 11.161 10.71 10.268 9.871 9.489 9.121 8.779 8.446 8.123 7.789 7.503 7.242 6.956 6.674 6.441 6.193 5.931 5.715 5.497 5.277 5.043 4.802 4.636 4.456 4.168 3.967 3.75 3.644 3.43 3.2 2.949 2.818 2.334 2.404 2.229 2.035 1.604 1.369 1.127 0.864 0.537 0.16 -0.3 -1.59 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt deleted file mode 100644 index b7824879..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29995 ,TETRA ,17590970,Sat Nov 27 22:08:40 CET,Sun Nov 28 00:15:48 CET,0.0 0.73 1.079 1.33 1.561 1.752 1.95 2.129 2.417 2.547 2.671 2.569 3.041 3.149 3.369 3.567 3.753 3.844 4.02 4.182 4.416 4.568 4.704 4.895 5.088 5.281 5.468 5.644 5.876 6.099 6.304 6.541 6.776 7.018 7.292 7.579 7.839 8.123 8.414 8.714 9.039 9.384 9.77 10.134 10.51 10.943 11.426 11.865 12.256 12.537 12.621 12.241 11.609 10.963 10.396 9.866 9.313 8.751 8.285 7.838 7.449 7.085 6.722 6.374 6.05 5.741 5.395 5.078 4.807 4.526 4.233 3.992 3.738 3.466 3.251 3.027 2.787 2.54 2.293 2.12 1.936 1.648 1.45 1.227 1.11 0.881 0.624 0.344 0.209 -0.292 -0.242 -0.419 -0.608 -1.022 -1.237 -1.47 -1.725 -1.995 -2.318 -2.757 -3.829 -2 ,18351 ,TETRA ,17590971,Sat Nov 27 22:08:40 CET,Sun Nov 28 00:20:26 CET,0.0 0.935 1.248 1.531 1.808 2.028 2.197 2.346 2.609 2.741 2.863 2.73 3.204 3.312 3.519 3.701 3.874 3.965 4.14 4.306 4.56 4.705 4.833 5.031 5.21 5.38 5.549 5.714 5.922 6.134 6.349 6.596 6.817 7.013 7.258 7.53 7.767 8.025 8.283 8.55 8.844 9.165 9.527 9.885 10.273 10.664 11.134 11.668 12.13 12.479 12.594 12.276 11.749 11.173 10.609 10.041 9.497 8.972 8.524 8.051 7.619 7.245 6.897 6.563 6.233 5.931 5.612 5.311 5.056 4.799 4.513 4.271 4.029 3.769 3.557 3.344 3.126 2.889 2.639 2.46 2.277 2.018 1.833 1.613 1.492 1.262 1.01 0.739 0.605 0.107 0.186 0.031 -0.14 -0.56 -0.804 -1.044 -1.296 -1.605 -1.963 -2.389 -3.316 -3 ,20626 ,TETRA ,17590972,Sat Nov 27 22:08:39 CET,Sun Nov 28 00:15:24 CET,0.0 0.988 1.302 1.583 1.81 1.997 2.192 2.366 2.646 2.782 2.908 2.778 3.252 3.363 3.563 3.757 3.952 4.05 4.24 4.41 4.649 4.8 4.936 5.147 5.359 5.541 5.699 5.863 6.078 6.256 6.426 6.639 6.842 7.037 7.252 7.502 7.756 8.033 8.336 8.637 8.932 9.266 9.645 10.008 10.416 10.842 11.29 11.729 12.108 12.441 12.563 12.2 11.623 11.003 10.415 9.839 9.311 8.812 8.38 7.923 7.513 7.158 6.811 6.479 6.154 5.849 5.541 5.26 5.001 4.718 4.439 4.209 3.957 3.698 3.495 3.278 3.05 2.819 2.584 2.412 2.221 1.91 1.698 1.492 1.382 1.147 0.896 0.626 0.491 -0.01 0.049 -0.116 -0.292 -0.691 -0.909 -1.169 -1.493 -1.825 -2.229 -2.815 -4.214 -4 ,14229 ,TETRA ,17590973,Sat Nov 27 22:09:38 CET,Sun Nov 28 00:29:19 CET,0.0 1.354 1.702 1.949 2.158 2.364 2.566 2.757 3.107 3.272 3.434 3.373 3.87 3.995 4.216 4.422 4.623 4.714 4.896 5.065 5.306 5.468 5.629 5.835 6.023 6.215 6.395 6.553 6.749 6.945 7.137 7.371 7.598 7.817 8.062 8.352 8.616 8.87 9.15 9.456 9.764 10.069 10.414 10.771 11.173 11.575 12.008 12.474 12.927 13.26 13.233 12.702 12.064 11.41 10.739 10.077 9.514 9.03 8.604 8.139 7.706 7.325 6.963 6.608 6.281 5.979 5.654 5.363 5.104 4.83 4.542 4.302 4.056 3.788 3.562 3.327 3.087 2.829 2.574 2.399 2.218 1.929 1.718 1.492 1.377 1.135 0.88 0.614 0.468 -0.048 -0.03 -0.199 -0.368 -0.785 -1.019 -1.268 -1.55 -1.845 -2.172 -2.6 -3.566 -5 ,641 ,TETRA ,17590974,Sat Nov 27 22:09:38 CET,Sun Nov 28 00:27:38 CET,0.0 1.027 1.429 1.729 1.981 2.209 2.41 2.577 2.855 2.987 3.117 2.986 3.458 3.57 3.78 3.986 4.197 4.296 4.484 4.662 4.892 5.031 5.166 5.348 5.527 5.707 5.887 6.063 6.272 6.479 6.676 6.926 7.163 7.371 7.623 7.912 8.164 8.43 8.714 9.016 9.315 9.639 10.025 10.376 10.767 11.179 11.607 12.069 12.523 12.892 13.052 12.739 12.213 11.652 11.048 10.467 9.962 9.488 9.053 8.556 8.11 7.723 7.35 6.997 6.664 6.356 6.02 5.708 5.44 5.167 4.881 4.633 4.38 4.129 3.93 3.72 3.495 3.237 2.972 2.8 2.623 2.335 2.129 1.92 1.804 1.557 1.299 1.028 0.889 0.392 0.462 0.297 0.127 -0.252 -0.477 -0.722 -0.99 -1.272 -1.619 -2.079 -3.364 -6 ,3533 ,TETRA ,17590975,Sat Nov 27 22:09:41 CET,Sun Nov 28 00:29:32 CET,0.0 0.801 1.159 1.387 1.615 1.841 2.026 2.186 2.471 2.598 2.72 2.588 3.059 3.173 3.38 3.574 3.763 3.85 4.007 4.16 4.388 4.527 4.661 4.88 5.092 5.276 5.447 5.623 5.854 6.063 6.261 6.517 6.765 6.98 7.219 7.495 7.743 7.999 8.291 8.62 8.936 9.264 9.64 9.988 10.394 10.842 11.268 11.655 12.04 12.346 12.327 11.88 11.365 10.836 10.297 9.73 9.176 8.656 8.179 7.68 7.214 6.79 6.401 6.04 5.709 5.4 5.071 4.777 4.523 4.262 3.986 3.743 3.477 3.204 2.986 2.752 2.513 2.268 2.019 1.837 1.643 1.33 1.119 0.902 0.778 0.531 0.278 0.015 -0.122 -0.624 -0.563 -0.724 -0.909 -1.305 -1.509 -1.727 -1.975 -2.275 -2.61 -3.042 -4.265 -7 ,11495 ,TETRA ,17590976,Sat Nov 27 22:09:38 CET,Sun Nov 28 00:21:51 CET,0.0 0.757 1.066 1.313 1.51 1.688 1.853 2.009 2.304 2.446 2.574 2.435 2.9 3.008 3.205 3.403 3.595 3.687 3.87 4.047 4.29 4.429 4.56 4.761 4.951 5.124 5.295 5.463 5.666 5.861 6.054 6.291 6.518 6.727 6.961 7.207 7.449 7.726 8.025 8.335 8.636 8.957 9.314 9.649 10.024 10.41 10.83 11.26 11.668 12.045 12.167 11.743 11.132 10.523 9.923 9.342 8.811 8.305 7.858 7.378 6.957 6.603 6.243 5.881 5.566 5.276 4.939 4.634 4.371 4.096 3.811 3.565 3.305 3.031 2.813 2.583 2.344 2.114 1.867 1.684 1.497 1.195 0.99 0.776 0.665 0.436 0.167 -0.113 -0.246 -0.741 -0.675 -0.835 -1.01 -1.384 -1.597 -1.836 -2.085 -2.362 -2.758 -3.311 -4.723 -8 ,12223 ,TETRA ,17590977,Sat Nov 27 22:09:38 CET,Sun Nov 28 00:24:08 CET,0.0 1.075 1.457 1.706 1.957 2.189 2.36 2.51 2.8 2.94 3.084 2.991 3.471 3.587 3.808 4.023 4.227 4.319 4.499 4.665 4.898 5.053 5.198 5.403 5.583 5.755 5.939 6.112 6.331 6.544 6.745 6.985 7.216 7.448 7.713 7.994 8.254 8.53 8.817 9.102 9.394 9.724 10.077 10.436 10.867 11.282 11.753 12.264 12.707 13.061 13.11 12.692 12.139 11.528 10.932 10.391 9.915 9.462 9.047 8.611 8.223 7.854 7.483 7.136 6.791 6.478 6.165 5.883 5.632 5.364 5.088 4.839 4.566 4.296 4.085 3.864 3.644 3.411 3.159 2.979 2.789 2.494 2.285 2.074 1.964 1.729 1.488 1.231 1.102 0.605 0.679 0.529 0.373 0.01 -0.2 -0.438 -0.671 -0.945 -1.316 -1.83 -2.979 -9 ,17068 ,TETRA ,17590978,Sat Nov 27 22:10:38 CET,Sun Nov 28 00:21:57 CET,0.0 0.736 1.071 1.316 1.534 1.762 1.981 2.172 2.51 2.652 2.787 2.673 3.143 3.248 3.444 3.636 3.821 3.907 4.079 4.241 4.473 4.618 4.772 5.01 5.221 5.416 5.596 5.777 6.013 6.228 6.43 6.66 6.882 7.092 7.318 7.581 7.822 8.074 8.358 8.65 8.93 9.239 9.608 9.97 10.379 10.8 11.214 11.631 12.041 12.372 12.426 12.075 11.552 10.932 10.306 9.69 9.134 8.641 8.176 7.681 7.265 6.896 6.539 6.201 5.869 5.56 5.235 4.928 4.663 4.395 4.112 3.883 3.641 3.37 3.148 2.919 2.674 2.413 2.146 1.956 1.769 1.491 1.299 1.096 0.982 0.74 0.486 0.213 0.067 -0.444 -0.388 -0.546 -0.72 -1.113 -1.323 -1.541 -1.787 -2.068 -2.416 -2.916 -4.118 -10 ,20907 ,TETRA ,17590979,Sat Nov 27 22:10:39 CET,Sun Nov 28 00:23:24 CET,0.0 0.666 0.994 1.286 1.554 1.787 2.007 2.207 2.516 2.652 2.791 2.685 3.161 3.271 3.491 3.716 3.925 4.022 4.198 4.365 4.62 4.788 4.938 5.136 5.339 5.537 5.704 5.869 6.074 6.273 6.478 6.732 6.968 7.184 7.444 7.728 7.986 8.253 8.544 8.846 9.148 9.457 9.803 10.157 10.557 10.991 11.406 11.766 12.132 12.438 12.473 12.097 11.55 10.976 10.383 9.811 9.264 8.732 8.263 7.765 7.315 6.933 6.587 6.252 5.926 5.612 5.274 4.977 4.722 4.449 4.161 3.913 3.666 3.408 3.202 2.975 2.728 2.481 2.226 2.04 1.852 1.552 1.344 1.142 1.034 0.803 0.551 0.272 0.129 -0.374 -0.335 -0.506 -0.691 -1.108 -1.338 -1.595 -1.886 -2.217 -2.615 -3.133 -4.638 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt deleted file mode 100644 index b0cf7f2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32379 ,TETRA ,17590980,Sat Nov 27 22:10:41 CET,Sun Nov 28 00:23:49 CET,0.0 1.933 2.501 2.912 3.273 3.595 3.878 4.119 4.539 4.728 4.899 4.864 5.362 5.503 5.749 5.994 6.245 6.354 6.569 6.773 7.067 7.257 7.437 7.688 7.931 8.172 8.377 8.558 8.8 9.052 9.297 9.584 9.869 10.129 10.4 10.691 10.97 11.267 11.571 11.878 12.175 12.5 12.84 13.138 13.468 13.801 14.138 14.415 14.589 14.532 14.043 13.005 11.91 10.915 10.0 9.123 8.319 7.567 6.933 6.29 5.715 5.214 4.739 4.27 3.827 3.429 3.019 2.646 2.321 1.989 1.643 1.36 1.062 0.738 0.48 0.212 -0.048 -0.313 -0.603 -0.806 -1.014 -1.344 -1.582 -1.828 -1.956 -2.222 -2.504 -2.782 -2.928 -3.447 -3.418 -3.61 -3.818 -4.267 -4.528 -4.804 -5.103 -5.46 -5.89 -6.454 -7.956 -2 ,9566 ,TETRA ,17590981,Sat Nov 27 22:10:43 CET,Sun Nov 28 00:23:03 CET,0.0 2.116 2.605 2.975 3.308 3.586 3.829 4.06 4.456 4.64 4.812 4.762 5.273 5.412 5.678 5.931 6.177 6.291 6.492 6.694 6.996 7.162 7.312 7.562 7.806 8.031 8.244 8.452 8.719 8.949 9.157 9.431 9.699 9.942 10.224 10.534 10.808 11.106 11.437 11.751 12.049 12.39 12.742 13.067 13.439 13.778 14.113 14.39 14.557 14.51 13.887 12.785 11.686 10.621 9.641 8.766 7.996 7.292 6.685 6.054 5.527 5.068 4.607 4.141 3.707 3.332 2.954 2.618 2.311 1.977 1.631 1.342 1.047 0.745 0.506 0.238 -0.055 -0.359 -0.677 -0.879 -1.083 -1.429 -1.668 -1.909 -2.033 -2.291 -2.565 -2.839 -2.989 -3.526 -3.504 -3.684 -3.879 -4.353 -4.633 -4.928 -5.257 -5.683 -6.15 -6.728 -8.775 -3 ,24153 ,TETRA ,17590982,Sat Nov 27 22:10:45 CET,Sun Nov 28 00:22:18 CET,0.0 1.565 2.113 2.47 2.759 3.041 3.304 3.538 3.946 4.121 4.295 4.266 4.769 4.899 5.146 5.39 5.626 5.739 5.958 6.163 6.431 6.598 6.755 6.979 7.206 7.433 7.632 7.817 8.069 8.314 8.553 8.819 9.054 9.277 9.543 9.841 10.121 10.44 10.749 11.052 11.359 11.68 12.011 12.335 12.711 13.058 13.396 13.709 13.903 13.815 13.187 12.026 10.861 9.805 8.879 8.029 7.257 6.53 5.848 5.178 4.644 4.144 3.64 3.188 2.786 2.408 1.984 1.593 1.26 0.903 0.515 0.19 -0.149 -0.497 -0.755 -1.012 -1.295 -1.609 -1.941 -2.171 -2.408 -2.78 -3.034 -3.303 -3.444 -3.728 -4.008 -4.297 -4.459 -5.002 -4.981 -5.174 -5.377 -5.816 -6.081 -6.35 -6.654 -7.021 -7.488 -8.168 -9.987 -4 ,28850 ,TETRA ,17590983,Sat Nov 27 22:10:39 CET,Sun Nov 28 00:24:01 CET,0.0 2.111 2.691 3.062 3.384 3.657 3.9 4.146 4.608 4.796 4.979 4.958 5.474 5.625 5.893 6.16 6.425 6.544 6.755 6.963 7.259 7.438 7.607 7.844 8.064 8.29 8.509 8.71 8.968 9.211 9.448 9.753 10.033 10.277 10.564 10.864 11.127 11.416 11.71 12.024 12.356 12.711 13.081 13.392 13.722 14.075 14.397 14.654 14.826 14.731 14.157 13.1 11.981 10.94 10.066 9.281 8.518 7.773 7.127 6.491 5.958 5.492 5.032 4.583 4.166 3.794 3.401 3.029 2.703 2.372 2.03 1.742 1.438 1.134 0.892 0.62 0.335 0.048 -0.253 -0.462 -0.67 -0.998 -1.236 -1.475 -1.598 -1.871 -2.167 -2.49 -2.651 -3.179 -3.168 -3.368 -3.577 -4.011 -4.264 -4.559 -4.875 -5.244 -5.677 -6.218 -7.827 -5 ,6400 ,TETRA ,17590984,Sat Nov 27 22:10:41 CET,Sun Nov 28 00:24:47 CET,0.0 2.422 2.961 3.349 3.638 3.884 4.146 4.398 4.806 4.974 5.137 5.126 5.657 5.816 6.087 6.323 6.556 6.67 6.883 7.09 7.39 7.566 7.721 7.956 8.182 8.391 8.592 8.785 9.033 9.266 9.5 9.784 10.033 10.255 10.522 10.822 11.095 11.389 11.693 11.993 12.294 12.616 12.964 13.297 13.669 14.013 14.315 14.616 14.845 14.77 14.155 13.102 12.026 10.966 10.002 9.119 8.328 7.601 6.965 6.294 5.719 5.204 4.724 4.282 3.863 3.478 3.043 2.652 2.325 1.984 1.621 1.295 0.953 0.608 0.34 0.058 -0.245 -0.558 -0.855 -1.061 -1.286 -1.651 -1.912 -2.161 -2.281 -2.543 -2.842 -3.155 -3.32 -3.872 -3.866 -4.057 -4.264 -4.714 -4.973 -5.258 -5.548 -5.853 -6.255 -6.813 -8.881 -6 ,963 ,TETRA ,17590985,Sat Nov 27 21:26:17 CET,Sat Nov 27 23:35:52 CET,0.0 2.774 3.37 3.801 4.136 4.39 4.631 4.867 5.297 5.5 5.675 5.63 6.14 6.283 6.531 6.768 7.004 7.125 7.36 7.576 7.865 8.036 8.215 8.485 8.73 8.964 9.196 9.409 9.659 9.911 10.166 10.452 10.689 10.92 11.211 11.531 11.826 12.14 12.46 12.775 13.083 13.4 13.761 14.107 14.461 14.814 15.153 15.401 15.548 15.537 15.067 13.957 12.828 11.859 10.987 10.128 9.32 8.561 7.901 7.264 6.739 6.264 5.79 5.343 4.914 4.521 4.116 3.752 3.448 3.115 2.749 2.439 2.134 1.822 1.566 1.298 1.012 0.693 0.337 0.106 -0.112 -0.458 -0.695 -0.939 -1.069 -1.346 -1.632 -1.904 -2.063 -2.618 -2.639 -2.84 -3.043 -3.473 -3.701 -3.98 -4.298 -4.678 -5.168 -5.716 -7.224 -7 ,16088 ,TETRA ,17590986,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:38:43 CET,0.0 1.868 2.469 2.909 3.26 3.557 3.797 4.005 4.406 4.599 4.777 4.702 5.2 5.343 5.624 5.907 6.159 6.275 6.504 6.717 7.007 7.191 7.356 7.571 7.784 7.992 8.195 8.386 8.627 8.867 9.106 9.385 9.639 9.887 10.153 10.434 10.705 10.994 11.325 11.65 11.958 12.28 12.628 12.985 13.383 13.755 14.111 14.443 14.664 14.662 14.182 13.091 11.951 10.928 10.002 9.097 8.289 7.558 6.918 6.273 5.721 5.215 4.74 4.292 3.854 3.446 3.007 2.634 2.324 1.985 1.635 1.351 1.039 0.699 0.426 0.151 -0.135 -0.463 -0.779 -0.977 -1.19 -1.53 -1.764 -2.012 -2.147 -2.421 -2.708 -3.016 -3.191 -3.753 -3.793 -4.013 -4.224 -4.695 -4.981 -5.304 -5.667 -6.051 -6.432 -7.051 -8.95 -8 ,23710 ,TETRA ,17590987,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:41:30 CET,0.0 1.886 2.456 2.877 3.214 3.498 3.73 3.961 4.4 4.568 4.718 4.654 5.154 5.293 5.552 5.787 5.994 6.095 6.297 6.48 6.742 6.914 7.083 7.333 7.579 7.808 8.02 8.232 8.503 8.729 8.947 9.22 9.469 9.697 9.959 10.276 10.567 10.841 11.121 11.432 11.747 12.063 12.432 12.764 13.126 13.489 13.792 14.043 14.188 14.125 13.583 12.495 11.337 10.259 9.354 8.524 7.781 7.05 6.423 5.812 5.258 4.758 4.28 3.843 3.438 3.07 2.685 2.324 2.003 1.674 1.346 1.06 0.769 0.467 0.22 -0.038 -0.313 -0.582 -0.866 -1.07 -1.279 -1.616 -1.855 -2.099 -2.231 -2.498 -2.783 -3.105 -3.28 -3.83 -3.836 -4.025 -4.214 -4.595 -4.82 -5.077 -5.369 -5.716 -6.151 -6.759 -8.431 -9 ,1125 ,TETRA ,17590988,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:37:41 CET,0.0 2.681 3.26 3.68 4.037 4.351 4.618 4.837 5.263 5.448 5.619 5.605 6.1 6.247 6.559 6.842 7.079 7.191 7.411 7.609 7.884 8.062 8.237 8.488 8.727 8.96 9.177 9.386 9.648 9.898 10.14 10.413 10.668 10.904 11.162 11.443 11.708 11.988 12.282 12.6 12.939 13.303 13.67 14.014 14.376 14.7 15.044 15.332 15.482 15.397 14.939 14.037 13.019 12.035 11.15 10.348 9.605 8.904 8.322 7.741 7.23 6.752 6.26 5.809 5.389 5.004 4.62 4.272 3.96 3.637 3.29 2.995 2.689 2.357 2.098 1.843 1.571 1.277 0.966 0.748 0.534 0.195 -0.052 -0.315 -0.449 -0.711 -0.987 -1.275 -1.426 -1.975 -2.009 -2.207 -2.423 -2.897 -3.136 -3.391 -3.675 -3.964 -4.381 -4.953 -6.421 -10 ,893 ,TETRA ,17590989,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:38:16 CET,0.0 1.662 2.142 2.524 2.812 3.071 3.301 3.507 3.897 4.09 4.276 4.261 4.781 4.925 5.188 5.446 5.68 5.795 6.029 6.238 6.514 6.687 6.876 7.169 7.433 7.67 7.887 8.092 8.349 8.587 8.806 9.068 9.325 9.559 9.821 10.126 10.41 10.704 11.018 11.344 11.667 12.021 12.435 12.81 13.191 13.544 13.903 14.219 14.368 14.265 13.645 12.531 11.44 10.4 9.395 8.435 7.545 6.729 6.052 5.393 4.826 4.303 3.789 3.33 2.894 2.465 2.026 1.641 1.308 0.955 0.605 0.331 0.041 -0.27 -0.519 -0.775 -1.044 -1.339 -1.647 -1.861 -2.081 -2.409 -2.641 -2.884 -3.004 -3.262 -3.548 -3.841 -4.001 -4.533 -4.493 -4.664 -4.849 -5.287 -5.55 -5.814 -6.082 -6.391 -6.86 -7.497 -10.057 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt deleted file mode 100644 index 7bf14e80..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14622 ,TETRA ,17590990,Sat Nov 27 21:26:13 CET,Sat Nov 27 23:37:28 CET,0.0 0.958 1.412 1.78 2.091 2.354 2.598 2.851 3.324 3.519 3.692 3.648 4.183 4.332 4.628 4.921 5.192 5.315 5.571 5.812 6.136 6.338 6.543 6.847 7.136 7.416 7.7 7.981 8.336 8.669 8.987 9.369 9.731 10.078 10.479 10.912 11.319 11.76 12.228 12.734 13.268 13.86 14.565 15.292 16.155 17.097 18.15 19.327 20.65 22.144 23.807 24.941 25.395 25.506 25.441 25.255 24.999 24.709 24.435 24.161 23.885 23.588 23.303 23.039 22.781 22.519 22.213 21.92 21.662 21.401 21.126 20.893 20.644 20.379 20.158 19.922 19.682 19.42 19.144 18.955 18.736 18.409 18.192 17.963 17.851 17.584 17.259 16.899 16.714 16.168 16.153 15.955 15.743 15.241 14.962 14.669 14.348 13.968 13.478 12.8 10.973 -2 ,26802 ,TETRA ,17590991,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:42:59 CET,0.0 1.277 1.794 2.18 2.512 2.818 3.1 3.351 3.819 4.029 4.208 4.152 4.697 4.853 5.168 5.473 5.766 5.903 6.153 6.403 6.762 6.992 7.218 7.532 7.819 8.104 8.386 8.673 9.047 9.392 9.726 10.112 10.481 10.844 11.263 11.711 12.124 12.607 13.156 13.717 14.272 14.898 15.617 16.314 17.127 18.041 19.074 20.254 21.622 23.126 24.777 25.913 26.338 26.437 26.363 26.156 25.864 25.531 25.214 24.882 24.564 24.243 23.921 23.608 23.326 23.069 22.77 22.469 22.189 21.906 21.626 21.384 21.126 20.853 20.644 20.428 20.198 19.959 19.708 19.513 19.301 18.977 18.76 18.527 18.401 18.124 17.801 17.455 17.28 16.73 16.707 16.491 16.264 15.774 15.486 15.178 14.843 14.421 13.915 13.235 11.556 -3 ,24217 ,TETRA ,17590992,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:37:45 CET,0.0 1.018 1.414 1.754 2.061 2.319 2.543 2.744 3.119 3.314 3.5 3.459 4.0 4.152 4.441 4.695 4.947 5.07 5.3 5.517 5.835 6.041 6.25 6.555 6.842 7.108 7.354 7.597 7.927 8.252 8.573 8.963 9.326 9.645 9.998 10.414 10.805 11.235 11.707 12.212 12.759 13.384 14.111 14.835 15.668 16.559 17.552 18.685 19.943 21.397 23.093 24.305 24.828 24.966 24.884 24.736 24.539 24.314 24.105 23.851 23.597 23.336 23.048 22.748 22.457 22.199 21.911 21.632 21.402 21.176 20.932 20.709 20.47 20.212 20.009 19.79 19.561 19.33 19.08 18.903 18.721 18.421 18.204 17.983 17.862 17.609 17.339 17.054 16.907 16.394 16.404 16.206 15.992 15.554 15.324 15.067 14.763 14.396 13.959 13.351 10.874 -4 ,8854 ,TETRA ,17590993,Sat Nov 27 21:26:15 CET,Sat Nov 27 23:37:57 CET,0.0 0.825 1.255 1.587 1.885 2.184 2.455 2.699 3.117 3.309 3.497 3.433 3.957 4.099 4.386 4.648 4.893 5.016 5.26 5.473 5.769 5.97 6.168 6.46 6.748 7.026 7.28 7.527 7.867 8.207 8.531 8.912 9.278 9.634 10.04 10.489 10.922 11.395 11.905 12.453 13.023 13.675 14.447 15.208 16.094 17.108 18.232 19.427 20.85 22.474 24.242 25.515 26.037 26.166 26.09 25.91 25.672 25.417 25.165 24.861 24.591 24.356 24.106 23.849 23.611 23.344 23.042 22.767 22.531 22.3 22.036 21.811 21.578 21.32 21.12 20.914 20.699 20.471 20.219 20.044 19.852 19.541 19.331 19.12 19.004 18.753 18.484 18.19 18.037 17.517 17.546 17.362 17.164 16.726 16.48 16.203 15.897 15.521 15.019 14.425 12.595 -5 ,12914 ,TETRA ,17590994,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:37:51 CET,0.0 1.073 1.497 1.803 2.06 2.288 2.508 2.72 3.106 3.285 3.456 3.399 3.927 4.069 4.356 4.636 4.889 5.014 5.257 5.486 5.83 6.046 6.248 6.549 6.826 7.084 7.33 7.569 7.897 8.204 8.483 8.816 9.152 9.482 9.877 10.332 10.76 11.206 11.656 12.154 12.701 13.335 14.094 14.826 15.672 16.599 17.628 18.796 20.157 21.702 23.371 24.518 25.003 25.196 25.229 25.076 24.85 24.63 24.414 24.139 23.872 23.623 23.359 23.093 22.844 22.595 22.327 22.059 21.817 21.561 21.286 21.073 20.833 20.573 20.374 20.159 19.936 19.696 19.436 19.257 19.072 18.791 18.582 18.343 18.218 17.968 17.692 17.394 17.237 16.709 16.726 16.542 16.363 15.963 15.73 15.463 15.163 14.799 14.343 13.723 12.078 -6 ,20446 ,TETRA ,17590995,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:37:50 CET,0.0 0.807 1.269 1.619 1.901 2.156 2.389 2.606 2.989 3.162 3.327 3.255 3.788 3.948 4.24 4.5 4.743 4.863 5.104 5.335 5.655 5.85 6.042 6.329 6.608 6.876 7.133 7.381 7.704 8.023 8.333 8.698 9.046 9.384 9.789 10.247 10.67 11.123 11.64 12.187 12.723 13.334 14.073 14.827 15.693 16.611 17.6 18.699 19.996 21.438 23.046 24.168 24.637 24.763 24.683 24.517 24.325 24.119 23.908 23.65 23.37 23.088 22.812 22.539 22.26 21.988 21.701 21.461 21.251 21.011 20.749 20.523 20.288 20.068 19.887 19.687 19.478 19.236 18.97 18.794 18.604 18.291 18.073 17.851 17.737 17.487 17.231 16.96 16.821 16.311 16.317 16.116 15.926 15.49 15.233 14.969 14.652 14.257 13.763 13.166 11.529 -7 ,16745 ,TETRA ,17590996,Sat Nov 27 21:26:13 CET,Sat Nov 27 23:38:38 CET,0.0 1.158 1.612 1.943 2.208 2.426 2.645 2.856 3.242 3.419 3.583 3.507 4.036 4.174 4.46 4.748 5.018 5.143 5.367 5.596 5.939 6.143 6.344 6.64 6.917 7.18 7.439 7.69 8.026 8.35 8.654 9.026 9.385 9.727 10.13 10.577 11.002 11.469 11.962 12.495 13.062 13.686 14.409 15.128 15.95 16.881 17.993 19.207 20.541 22.04 23.579 24.632 25.116 25.245 25.141 24.972 24.797 24.576 24.312 24.02 23.756 23.458 23.168 22.895 22.621 22.376 22.107 21.838 21.592 21.348 21.073 20.817 20.546 20.285 20.083 19.867 19.637 19.382 19.097 18.9 18.715 18.441 18.228 17.997 17.88 17.632 17.363 17.074 16.923 16.402 16.443 16.256 16.052 15.577 15.302 15.013 14.683 14.308 13.865 13.2 11.427 -8 ,26724 ,TETRA ,17590997,Sat Nov 27 21:26:12 CET,Sat Nov 27 23:37:46 CET,0.0 1.227 1.678 2.021 2.309 2.568 2.806 3.039 3.433 3.596 3.751 3.686 4.22 4.36 4.633 4.89 5.128 5.246 5.483 5.712 6.027 6.241 6.454 6.742 7.024 7.304 7.563 7.795 8.094 8.391 8.687 9.05 9.4 9.72 10.104 10.55 10.978 11.45 11.948 12.473 13.017 13.638 14.347 15.043 15.868 16.769 17.782 18.935 20.283 21.808 23.431 24.491 24.978 25.122 25.015 24.842 24.672 24.464 24.237 23.982 23.728 23.467 23.204 22.936 22.66 22.405 22.133 21.878 21.649 21.409 21.16 20.949 20.707 20.43 20.221 19.991 19.748 19.521 19.283 19.103 18.897 18.554 18.329 18.117 18.007 17.754 17.49 17.211 17.05 16.499 16.44 16.218 16.013 15.583 15.321 15.032 14.705 14.324 13.832 13.159 10.971 -9 ,20012 ,TETRA ,17590998,Sat Nov 27 21:26:13 CET,Sat Nov 27 23:30:27 CET,0.0 1.04 1.436 1.742 1.995 2.226 2.446 2.652 3.017 3.178 3.339 3.273 3.797 3.938 4.211 4.461 4.701 4.817 5.041 5.265 5.6 5.814 6.018 6.319 6.61 6.878 7.13 7.367 7.672 7.995 8.332 8.711 9.041 9.364 9.743 10.173 10.587 11.04 11.526 12.04 12.588 13.196 13.928 14.678 15.536 16.491 17.575 18.737 20.041 21.551 23.216 24.415 24.9 25.023 25.026 24.899 24.699 24.472 24.223 23.944 23.677 23.407 23.142 22.87 22.59 22.321 22.031 21.755 21.513 21.258 20.969 20.732 20.5 20.243 20.035 19.806 19.567 19.336 19.083 18.891 18.689 18.359 18.132 17.907 17.786 17.514 17.24 16.956 16.808 16.294 16.32 16.128 15.921 15.428 15.138 14.846 14.535 14.139 13.651 13.013 11.289 -10 ,22404 ,TETRA ,17590999,Sat Nov 27 21:26:14 CET,Sat Nov 27 23:37:59 CET,0.0 0.926 1.363 1.717 2.027 2.299 2.524 2.723 3.085 3.253 3.424 3.384 3.92 4.067 4.35 4.625 4.885 5.008 5.254 5.501 5.842 6.05 6.256 6.545 6.814 7.069 7.308 7.559 7.896 8.207 8.518 8.883 9.225 9.576 9.977 10.41 10.81 11.261 11.765 12.29 12.833 13.434 14.142 14.847 15.648 16.521 17.516 18.639 19.942 21.477 23.201 24.383 24.883 25.048 25.017 24.867 24.656 24.432 24.194 23.909 23.619 23.331 23.066 22.794 22.508 22.239 21.968 21.723 21.51 21.27 21.016 20.79 20.527 20.247 20.042 19.839 19.617 19.364 19.079 18.883 18.698 18.38 18.134 17.887 17.762 17.493 17.207 16.893 16.71 16.147 16.107 15.903 15.681 15.19 14.927 14.638 14.287 13.889 13.439 12.812 10.271 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt deleted file mode 100644 index d0bbcc6c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7864 ,TETRA ,17591000,Sat Nov 27 21:26:14 CET,Sat Nov 27 23:38:40 CET,0.0 2.027 2.579 3.018 3.393 3.714 4.022 4.307 4.784 5.022 5.248 5.256 5.831 6.009 6.353 6.68 6.992 7.13 7.387 7.65 8.031 8.28 8.529 8.885 9.214 9.528 9.837 10.134 10.518 10.879 11.214 11.624 12.021 12.402 12.868 13.391 13.904 14.498 15.137 15.784 16.454 17.251 18.185 19.125 20.203 21.391 22.736 24.232 25.994 28.072 30.462 32.156 32.901 33.19 33.278 33.241 33.097 32.843 32.6 32.367 32.11 31.83 31.543 31.226 30.891 30.616 30.351 30.1 29.869 29.622 29.336 29.073 28.788 28.485 28.242 27.991 27.729 27.468 27.195 26.989 26.752 26.34 26.047 25.744 25.594 25.303 24.994 24.63 24.431 23.876 23.754 23.478 23.206 22.61 22.264 21.841 21.344 20.766 20.072 19.134 15.585 -2 ,16684 ,TETRA ,17591001,Sat Nov 27 21:26:13 CET,Sat Nov 27 23:38:01 CET,0.0 2.285 2.886 3.35 3.759 4.117 4.455 4.755 5.291 5.533 5.733 5.734 6.307 6.492 6.826 7.138 7.456 7.613 7.907 8.18 8.57 8.83 9.079 9.437 9.776 10.086 10.402 10.722 11.125 11.505 11.866 12.306 12.728 13.129 13.603 14.143 14.663 15.216 15.809 16.458 17.151 17.941 18.832 19.729 20.845 22.106 23.506 25.065 26.858 28.837 31.187 33.014 33.884 34.371 34.637 34.729 34.694 34.544 34.366 34.204 34.027 33.79 33.508 33.219 32.953 32.691 32.385 32.107 31.867 31.606 31.338 31.11 30.829 30.52 30.287 30.041 29.757 29.431 29.102 28.896 28.673 28.303 28.06 27.802 27.658 27.339 27.001 26.622 26.405 25.836 25.764 25.506 25.241 24.616 24.235 23.83 23.424 22.96 22.381 21.559 14.257 -3 ,11853 ,TETRA ,17591002,Sat Nov 27 21:26:14 CET,Sat Nov 27 23:38:41 CET,0.0 2.116 2.798 3.324 3.762 4.152 4.478 4.785 5.327 5.573 5.798 5.833 6.412 6.596 6.942 7.28 7.588 7.733 8.019 8.302 8.725 8.99 9.243 9.61 9.951 10.284 10.596 10.885 11.272 11.635 11.983 12.416 12.825 13.223 13.72 14.3 14.836 15.414 16.048 16.702 17.37 18.161 19.111 20.043 21.116 22.345 23.73 25.257 27.048 29.087 31.472 33.292 34.168 34.487 34.559 34.547 34.472 34.297 34.022 33.676 33.35 33.048 32.752 32.445 32.136 31.837 31.508 31.171 30.884 30.627 30.334 30.072 29.814 29.546 29.316 29.068 28.813 28.54 28.234 27.997 27.762 27.407 27.164 26.903 26.754 26.431 26.078 25.695 25.511 24.966 24.922 24.7 24.449 23.867 23.529 23.19 22.807 22.324 21.694 20.806 18.677 -4 ,1087 ,TETRA ,17591003,Sat Nov 27 21:26:14 CET,Sat Nov 27 23:35:56 CET,0.0 2.042 2.654 3.138 3.514 3.81 4.107 4.432 5.074 5.345 5.589 5.646 6.227 6.421 6.769 7.105 7.445 7.616 7.953 8.25 8.64 8.896 9.146 9.537 9.91 10.24 10.567 10.889 11.292 11.671 12.052 12.532 12.982 13.4 13.891 14.458 14.996 15.579 16.207 16.88 17.577 18.356 19.29 20.203 21.256 22.469 23.896 25.518 27.406 29.594 32.081 33.981 34.865 35.293 35.462 35.437 35.273 35.062 34.849 34.579 34.327 34.079 33.809 33.521 33.23 32.949 32.615 32.294 32.032 31.749 31.429 31.163 30.869 30.535 30.29 30.038 29.77 29.448 29.068 28.821 28.585 28.227 27.971 27.694 27.55 27.24 26.892 26.506 26.3 25.745 25.695 25.451 25.185 24.595 24.265 23.903 23.476 23.033 22.548 21.818 18.405 -5 ,27139 ,TETRA ,17591004,Sat Nov 27 21:26:14 CET,Sat Nov 27 23:38:38 CET,0.0 2.559 3.124 3.558 3.911 4.209 4.47 4.736 5.222 5.432 5.643 5.652 6.222 6.419 6.812 7.143 7.442 7.589 7.872 8.146 8.548 8.8 9.05 9.443 9.811 10.136 10.441 10.749 11.175 11.573 11.948 12.379 12.767 13.146 13.582 14.082 14.584 15.15 15.752 16.394 17.074 17.831 18.704 19.583 20.623 21.798 23.168 24.697 26.412 28.401 30.801 32.538 33.335 33.666 33.747 33.723 33.608 33.438 33.24 32.978 32.73 32.488 32.214 31.946 31.68 31.404 31.104 30.825 30.587 30.321 30.019 29.766 29.512 29.248 29.03 28.793 28.527 28.251 27.963 27.762 27.561 27.24 26.988 26.707 26.567 26.287 25.998 25.682 25.503 24.949 24.869 24.635 24.362 23.792 23.502 23.164 22.785 22.361 21.827 20.952 13.753 -6 ,19694 ,TETRA ,17591005,Sat Nov 27 21:27:13 CET,Sat Nov 27 23:40:36 CET,0.0 2.267 2.806 3.305 3.729 4.088 4.42 4.716 5.195 5.405 5.605 5.63 6.22 6.416 6.809 7.151 7.449 7.601 7.906 8.185 8.577 8.826 9.062 9.408 9.738 10.044 10.348 10.651 11.035 11.417 11.79 12.259 12.713 13.126 13.6 14.134 14.656 15.237 15.857 16.504 17.206 18.007 18.93 19.884 20.972 22.17 23.528 25.031 26.843 29.025 31.475 33.246 34.14 34.612 34.809 34.798 34.724 34.538 34.301 34.059 33.79 33.51 33.228 32.982 32.747 32.494 32.204 31.943 31.711 31.46 31.172 30.904 30.624 30.344 30.149 29.925 29.648 29.36 29.053 28.837 28.619 28.275 28.018 27.746 27.586 27.226 26.906 26.595 26.424 25.875 25.781 25.535 25.265 24.665 24.355 24.022 23.599 23.072 22.412 21.592 19.029 -7 ,12936 ,TETRA ,17591006,Sat Nov 27 21:27:13 CET,Sat Nov 27 23:46:28 CET,0.0 2.233 2.785 3.176 3.533 3.874 4.171 4.449 4.958 5.179 5.389 5.417 5.989 6.175 6.525 6.875 7.206 7.36 7.668 7.939 8.309 8.549 8.786 9.149 9.495 9.819 10.129 10.421 10.802 11.163 11.51 11.961 12.397 12.802 13.25 13.764 14.269 14.806 15.393 16.025 16.685 17.434 18.315 19.225 20.287 21.446 22.787 24.262 25.958 27.962 30.312 32.036 32.843 33.231 33.398 33.361 33.239 33.072 32.884 32.627 32.361 32.105 31.858 31.611 31.32 31.023 30.709 30.435 30.181 29.902 29.634 29.428 29.202 28.932 28.717 28.466 28.201 27.94 27.662 27.446 27.214 26.854 26.577 26.296 26.163 25.879 25.572 25.219 25.02 24.453 24.391 24.155 23.913 23.393 23.05 22.649 22.198 21.679 21.068 20.231 16.077 -8 ,24986 ,TETRA ,17591007,Sat Nov 27 21:27:13 CET,Sat Nov 27 23:38:53 CET,0.0 1.758 2.413 2.901 3.287 3.594 3.873 4.165 4.716 4.965 5.196 5.212 5.792 5.982 6.346 6.689 7.025 7.173 7.443 7.728 8.145 8.41 8.672 9.038 9.394 9.752 10.091 10.414 10.819 11.202 11.577 12.037 12.487 12.916 13.406 13.942 14.471 15.055 15.658 16.315 16.997 17.764 18.671 19.588 20.678 21.895 23.3 24.864 26.65 28.797 31.239 33.022 33.953 34.311 34.411 34.368 34.226 34.07 33.873 33.598 33.324 33.053 32.79 32.501 32.203 31.933 31.64 31.346 31.106 30.876 30.609 30.369 30.102 29.812 29.582 29.348 29.099 28.834 28.533 28.306 28.079 27.704 27.425 27.128 26.982 26.67 26.312 25.932 25.739 25.187 25.114 24.875 24.62 24.061 23.725 23.357 22.985 22.56 21.948 21.128 17.545 -9 ,23197 ,TETRA ,17591008,Sat Nov 27 21:27:13 CET,Sat Nov 27 23:36:08 CET,0.0 1.831 2.369 2.812 3.206 3.55 3.85 4.115 4.593 4.816 5.021 5.034 5.615 5.817 6.201 6.554 6.885 7.042 7.328 7.605 8.007 8.253 8.501 8.872 9.228 9.586 9.921 10.235 10.654 11.056 11.433 11.877 12.303 12.719 13.206 13.77 14.308 14.863 15.466 16.123 16.803 17.542 18.402 19.28 20.312 21.486 22.848 24.373 26.061 28.014 30.285 31.943 32.687 32.949 32.971 32.916 32.847 32.697 32.492 32.227 31.981 31.783 31.576 31.327 31.035 30.767 30.494 30.185 29.881 29.588 29.306 29.06 28.799 28.529 28.286 28.022 27.737 27.448 27.17 26.959 26.746 26.413 26.149 25.863 25.716 25.439 25.132 24.766 24.573 24.009 23.934 23.717 23.478 22.905 22.528 22.109 21.673 21.153 20.56 19.764 15.871 -10 ,4878 ,TETRA ,17591009,Sat Nov 27 21:27:13 CET,Sat Nov 27 23:39:53 CET,0.0 2.212 2.799 3.236 3.612 3.949 4.231 4.483 4.946 5.159 5.37 5.4 5.976 6.166 6.545 6.914 7.248 7.392 7.665 7.925 8.291 8.526 8.757 9.12 9.479 9.811 10.106 10.382 10.76 11.145 11.532 11.977 12.396 12.814 13.296 13.811 14.313 14.886 15.518 16.199 16.907 17.679 18.585 19.499 20.545 21.741 23.132 24.697 26.572 28.628 30.731 32.248 33.05 33.412 33.447 33.284 33.092 32.874 32.628 32.382 32.154 31.887 31.578 31.243 30.913 30.605 30.256 29.944 29.662 29.368 29.066 28.803 28.523 28.228 27.995 27.766 27.528 27.26 26.94 26.699 26.465 26.12 25.871 25.603 25.459 25.146 24.804 24.422 24.226 23.644 23.514 23.261 23.004 22.403 22.048 21.658 21.229 20.722 20.097 19.222 16.008 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index 63b5aacd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13836 ,TETRA ,17591010,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:38:08 CET,0.0 1.729 2.255 2.619 2.939 3.213 3.457 3.68 4.064 4.249 4.429 4.364 4.871 5.019 5.306 5.563 5.804 5.924 6.148 6.36 6.655 6.837 7.024 7.287 7.535 7.774 8.011 8.245 8.525 8.795 9.066 9.383 9.671 9.959 10.281 10.644 10.999 11.371 11.769 12.184 12.626 13.129 13.68 14.22 14.844 15.502 16.211 16.99 17.843 18.723 19.485 19.682 19.561 19.312 19.005 18.652 18.292 17.926 17.571 17.205 16.872 16.563 16.265 15.969 15.663 15.384 15.097 14.83 14.59 14.326 14.054 13.847 13.63 13.374 13.185 13.002 12.796 12.587 12.37 12.206 12.037 11.76 11.553 11.341 11.229 11.002 10.758 10.487 10.354 9.871 9.933 9.77 9.596 9.226 8.992 8.722 8.451 8.155 7.755 7.212 5.293 -2 ,16344 ,TETRA ,17591011,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:37:31 CET,0.0 1.102 1.542 1.921 2.246 2.502 2.726 2.961 3.411 3.596 3.764 3.734 4.234 4.361 4.606 4.837 5.049 5.156 5.379 5.593 5.873 6.053 6.24 6.512 6.776 7.016 7.24 7.465 7.756 8.03 8.286 8.579 8.863 9.149 9.469 9.807 10.123 10.481 10.852 11.219 11.597 12.017 12.514 13.001 13.548 14.143 14.76 15.423 16.167 16.944 17.649 17.913 17.865 17.665 17.43 17.143 16.827 16.514 16.235 15.917 15.635 15.373 15.114 14.872 14.634 14.415 14.169 13.942 13.742 13.529 13.293 13.091 12.871 12.635 12.45 12.252 12.046 11.82 11.575 11.417 11.247 10.979 10.812 10.643 10.554 10.37 10.154 9.906 9.778 9.293 9.362 9.21 9.027 8.631 8.423 8.189 7.939 7.645 7.285 6.854 5.259 -3 ,6198 ,TETRA ,17591012,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:40:49 CET,0.0 1.445 1.958 2.316 2.603 2.877 3.147 3.38 3.75 3.914 4.058 3.968 4.465 4.591 4.827 5.064 5.301 5.408 5.622 5.822 6.097 6.28 6.45 6.692 6.941 7.176 7.391 7.604 7.866 8.125 8.379 8.672 8.949 9.2 9.487 9.817 10.141 10.484 10.835 11.209 11.626 12.079 12.579 13.101 13.69 14.338 15.062 15.841 16.668 17.511 18.3 18.602 18.539 18.292 17.967 17.61 17.254 16.922 16.601 16.24 15.915 15.619 15.325 15.031 14.747 14.49 14.203 13.941 13.724 13.481 13.219 12.991 12.727 12.464 12.282 12.081 11.871 11.643 11.393 11.224 11.045 10.734 10.519 10.304 10.187 9.956 9.699 9.414 9.27 8.774 8.848 8.693 8.53 8.152 7.925 7.679 7.404 7.068 6.638 6.06 4.351 -4 ,11777 ,TETRA ,17591013,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:42:19 CET,0.0 1.515 2.025 2.371 2.672 2.923 3.162 3.383 3.783 3.979 4.16 4.12 4.637 4.785 5.076 5.361 5.626 5.749 5.969 6.178 6.477 6.673 6.872 7.134 7.378 7.623 7.867 8.106 8.396 8.677 8.96 9.3 9.617 9.913 10.249 10.629 10.988 11.366 11.753 12.144 12.549 13.021 13.576 14.12 14.753 15.433 16.187 16.984 17.843 18.77 19.65 20.047 20.022 19.834 19.587 19.24 18.853 18.476 18.085 17.685 17.35 17.032 16.734 16.451 16.166 15.907 15.632 15.383 15.177 14.943 14.686 14.456 14.209 13.968 13.778 13.57 13.346 13.113 12.899 12.756 12.588 12.294 12.093 11.884 11.772 11.546 11.304 11.045 10.91 10.416 10.467 10.296 10.116 9.702 9.47 9.225 8.93 8.585 8.168 7.609 6.097 -5 ,16747 ,TETRA ,17591014,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:38:28 CET,0.0 1.429 1.97 2.367 2.69 2.98 3.228 3.455 3.841 4.013 4.181 4.138 4.628 4.761 5.027 5.275 5.518 5.634 5.857 6.064 6.345 6.536 6.725 6.999 7.247 7.477 7.691 7.884 8.13 8.374 8.61 8.89 9.153 9.409 9.723 10.084 10.415 10.767 11.137 11.511 11.912 12.367 12.867 13.348 13.883 14.467 15.093 15.798 16.557 17.319 18.105 18.446 18.366 18.154 17.881 17.513 17.142 16.77 16.436 16.065 15.714 15.426 15.137 14.823 14.529 14.27 13.992 13.725 13.497 13.269 13.026 12.822 12.603 12.364 12.173 11.978 11.781 11.573 11.344 11.181 11.015 10.755 10.572 10.387 10.29 10.079 9.856 9.607 9.472 8.977 9.035 8.865 8.678 8.3 8.098 7.87 7.602 7.258 6.825 6.221 4.327 -6 ,23233 ,TETRA ,17591015,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:38:32 CET,0.0 1.913 2.478 2.904 3.236 3.528 3.776 4.002 4.427 4.615 4.783 4.762 5.291 5.44 5.718 5.975 6.223 6.342 6.571 6.81 7.152 7.35 7.544 7.834 8.103 8.357 8.605 8.839 9.124 9.397 9.658 9.961 10.262 10.544 10.854 11.198 11.534 11.882 12.222 12.579 12.979 13.458 14.002 14.528 15.12 15.739 16.402 17.132 17.908 18.727 19.56 19.881 19.792 19.577 19.286 18.951 18.596 18.223 17.884 17.522 17.189 16.889 16.606 16.318 16.027 15.76 15.462 15.175 14.931 14.682 14.414 14.181 13.936 13.687 13.489 13.298 13.09 12.84 12.576 12.406 12.248 11.999 11.813 11.612 11.502 11.27 11.023 10.755 10.613 10.111 10.157 9.978 9.796 9.428 9.205 8.938 8.644 8.314 7.882 7.209 4.748 -7 ,24239 ,TETRA ,17591016,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:39:25 CET,0.0 1.243 1.735 2.08 2.371 2.629 2.849 3.066 3.467 3.656 3.84 3.784 4.292 4.427 4.686 4.943 5.182 5.297 5.52 5.731 6.022 6.21 6.384 6.634 6.892 7.126 7.35 7.586 7.878 8.15 8.403 8.681 8.955 9.224 9.542 9.902 10.236 10.619 11.025 11.436 11.863 12.331 12.873 13.413 14.022 14.683 15.416 16.167 16.996 17.872 18.691 19.077 19.043 18.82 18.494 18.137 17.776 17.425 17.128 16.794 16.453 16.137 15.848 15.566 15.305 15.068 14.802 14.538 14.299 14.049 13.794 13.593 13.377 13.135 12.941 12.738 12.537 12.32 12.07 11.894 11.726 11.459 11.252 11.036 10.931 10.7 10.439 10.164 10.02 9.514 9.544 9.372 9.18 8.764 8.558 8.301 8.011 7.694 7.291 6.726 4.46 -8 ,20739 ,TETRA ,17591017,Sat Nov 27 21:27:15 CET,Sat Nov 27 23:41:55 CET,0.0 1.047 1.462 1.788 2.069 2.319 2.573 2.825 3.259 3.455 3.636 3.592 4.101 4.24 4.501 4.745 4.989 5.105 5.319 5.543 5.853 6.026 6.19 6.439 6.693 6.934 7.153 7.357 7.629 7.917 8.195 8.495 8.772 9.05 9.372 9.733 10.095 10.466 10.838 11.241 11.662 12.112 12.604 13.098 13.651 14.235 14.906 15.636 16.433 17.268 18.037 18.421 18.438 18.259 17.981 17.651 17.3 16.945 16.607 16.238 15.919 15.623 15.298 14.978 14.701 14.458 14.195 13.929 13.693 13.462 13.229 13.01 12.746 12.48 12.295 12.085 11.833 11.546 11.24 11.028 10.81 10.447 10.18 9.93 9.808 9.533 9.234 8.93 8.782 8.279 8.286 8.096 7.91 7.499 7.25 6.968 6.642 6.277 5.872 5.3 3.133 -9 ,18098 ,TETRA ,17591018,Sat Nov 27 21:27:14 CET,Sat Nov 27 23:37:29 CET,0.0 1.43 1.899 2.269 2.585 2.876 3.131 3.362 3.776 3.961 4.122 4.056 4.552 4.691 4.957 5.196 5.43 5.54 5.739 5.925 6.196 6.374 6.544 6.786 7.024 7.249 7.456 7.656 7.911 8.155 8.389 8.683 8.978 9.25 9.549 9.889 10.205 10.55 10.913 11.298 11.706 12.142 12.653 13.172 13.754 14.396 15.134 15.884 16.64 17.44 18.181 18.472 18.412 18.197 17.893 17.511 17.137 16.778 16.448 16.086 15.734 15.399 15.091 14.811 14.53 14.252 13.968 13.707 13.466 13.221 12.963 12.742 12.5 12.245 12.044 11.826 11.608 11.385 11.151 10.99 10.826 10.571 10.37 10.14 10.022 9.779 9.525 9.269 9.124 8.616 8.664 8.501 8.317 7.92 7.702 7.445 7.147 6.812 6.411 5.835 3.776 -10 ,10626 ,TETRA ,17591019,Sat Nov 27 21:27:17 CET,Sat Nov 27 23:39:24 CET,0.0 1.426 1.873 2.227 2.572 2.877 3.102 3.29 3.659 3.847 4.019 3.957 4.46 4.592 4.84 5.087 5.315 5.434 5.669 5.885 6.175 6.347 6.512 6.768 7.017 7.256 7.486 7.699 7.961 8.217 8.471 8.765 9.051 9.343 9.679 10.055 10.408 10.786 11.204 11.625 12.032 12.501 13.042 13.539 14.1 14.739 15.443 16.198 17.043 17.914 18.684 18.937 18.814 18.577 18.26 17.949 17.616 17.243 16.898 16.511 16.147 15.816 15.488 15.152 14.831 14.54 14.252 14.001 13.779 13.536 13.274 13.055 12.809 12.539 12.334 12.128 11.922 11.697 11.458 11.295 11.106 10.799 10.594 10.381 10.267 10.047 9.801 9.517 9.368 8.855 8.874 8.693 8.511 8.121 7.893 7.627 7.335 7.002 6.588 6.034 4.267 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt deleted file mode 100644 index 25d689c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19207 ,TETRA ,17591020,Sat Nov 27 21:27:15 CET,Sat Nov 27 23:39:55 CET,0.0 1.466 1.894 2.24 2.524 2.762 2.997 3.231 3.638 3.819 3.982 3.933 4.438 4.558 4.805 5.04 5.271 5.376 5.577 5.794 6.101 6.271 6.445 6.705 6.915 7.116 7.324 7.517 7.773 8.022 8.245 8.501 8.751 9.013 9.312 9.651 9.987 10.327 10.674 11.034 11.438 11.911 12.417 12.882 13.419 13.972 14.597 15.327 16.107 16.869 17.458 17.565 17.326 16.992 16.571 16.095 15.673 15.266 14.885 14.477 14.1 13.745 13.409 13.096 12.798 12.51 12.191 11.901 11.659 11.389 11.09 10.855 10.611 10.345 10.135 9.928 9.723 9.504 9.26 9.084 8.904 8.608 8.394 8.184 8.081 7.863 7.622 7.36 7.216 6.713 6.783 6.607 6.406 5.98 5.737 5.466 5.167 4.786 4.3 3.78 2.267 -2 ,3895 ,TETRA ,17591021,Sat Nov 27 21:27:15 CET,Sat Nov 27 23:37:45 CET,0.0 1.481 1.899 2.2 2.482 2.74 2.966 3.176 3.562 3.726 3.878 3.8 4.297 4.428 4.68 4.902 5.108 5.209 5.402 5.573 5.824 6.007 6.189 6.441 6.676 6.882 7.077 7.288 7.551 7.783 7.995 8.25 8.494 8.729 9.006 9.323 9.623 9.945 10.275 10.619 10.98 11.379 11.839 12.279 12.79 13.365 13.979 14.642 15.355 16.054 16.749 16.92 16.673 16.293 15.864 15.412 14.988 14.586 14.23 13.831 13.462 13.13 12.763 12.427 12.147 11.863 11.542 11.261 11.019 10.763 10.477 10.234 9.993 9.75 9.56 9.346 9.11 8.871 8.621 8.444 8.272 8.009 7.818 7.612 7.499 7.254 6.991 6.694 6.537 6.033 6.083 5.889 5.679 5.251 4.973 4.59 4.145 3.663 3.069 2.358 -0.663 -3 ,3011 ,TETRA ,17591022,Sat Nov 27 21:27:15 CET,Sat Nov 27 23:39:31 CET,0.0 0.972 1.386 1.687 1.968 2.212 2.418 2.607 2.985 3.145 3.291 3.197 3.678 3.805 4.052 4.266 4.471 4.568 4.757 4.939 5.174 5.33 5.486 5.694 5.909 6.127 6.33 6.526 6.778 7.022 7.254 7.51 7.773 8.021 8.284 8.579 8.861 9.181 9.523 9.879 10.235 10.623 11.079 11.522 12.027 12.568 13.174 13.822 14.488 15.164 15.714 15.759 15.507 15.157 14.791 14.429 14.058 13.649 13.27 12.862 12.501 12.174 11.858 11.561 11.252 10.954 10.648 10.374 10.134 9.856 9.541 9.297 9.062 8.804 8.579 8.342 8.111 7.871 7.591 7.388 7.17 6.821 6.574 6.305 6.162 5.868 5.565 5.211 5.017 4.47 4.458 4.273 4.066 3.542 3.225 2.834 2.388 1.953 1.311 0.326 -2.937 -4 ,17147 ,TETRA ,17591023,Sat Nov 27 21:27:15 CET,Sat Nov 27 23:38:01 CET,0.0 1.236 1.69 2.011 2.262 2.483 2.684 2.877 3.241 3.407 3.57 3.512 4.002 4.122 4.373 4.62 4.856 4.969 5.175 5.355 5.606 5.771 5.922 6.143 6.377 6.607 6.82 7.005 7.235 7.467 7.707 7.996 8.258 8.512 8.806 9.126 9.438 9.772 10.111 10.476 10.865 11.288 11.742 12.183 12.702 13.256 13.875 14.547 15.242 15.895 16.485 16.662 16.454 16.109 15.708 15.275 14.892 14.515 14.15 13.759 13.43 13.126 12.784 12.446 12.142 11.848 11.527 11.254 11.022 10.769 10.513 10.294 10.035 9.769 9.569 9.355 9.126 8.874 8.611 8.432 8.238 7.931 7.727 7.516 7.401 7.162 6.907 6.621 6.461 5.931 5.956 5.786 5.588 5.114 4.86 4.589 4.297 3.979 3.617 3.108 0.864 -5 ,12017 ,TETRA ,17591024,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:42:39 CET,0.0 1.317 1.775 2.147 2.465 2.741 2.971 3.195 3.599 3.785 3.954 3.898 4.405 4.533 4.774 5.01 5.219 5.321 5.519 5.705 5.98 6.168 6.342 6.571 6.802 7.035 7.271 7.509 7.811 8.09 8.351 8.64 8.906 9.161 9.457 9.781 10.083 10.401 10.752 11.114 11.487 11.919 12.417 12.922 13.464 14.034 14.639 15.255 15.945 16.672 17.27 17.387 17.195 16.863 16.468 16.072 15.678 15.232 14.826 14.424 14.056 13.708 13.372 13.047 12.732 12.457 12.18 11.924 11.685 11.423 11.132 10.876 10.623 10.367 10.161 9.937 9.692 9.445 9.192 9.018 8.832 8.537 8.34 8.126 8.009 7.76 7.505 7.242 7.108 6.609 6.647 6.474 6.282 5.838 5.586 5.317 5.017 4.694 4.344 3.789 1.071 -6 ,1490 ,TETRA ,17591025,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:41:08 CET,0.0 0.893 1.264 1.611 1.889 2.139 2.371 2.569 2.915 3.077 3.241 3.171 3.658 3.775 3.996 4.211 4.433 4.543 4.766 4.986 5.271 5.445 5.622 5.874 6.109 6.328 6.54 6.75 7.014 7.256 7.494 7.795 8.063 8.297 8.592 8.941 9.254 9.581 9.924 10.292 10.678 11.119 11.629 12.098 12.614 13.182 13.81 14.458 15.145 15.808 16.316 16.443 16.212 15.863 15.472 15.04 14.643 14.269 13.915 13.548 13.226 12.894 12.558 12.24 11.949 11.676 11.365 11.089 10.827 10.554 10.289 10.067 9.818 9.552 9.359 9.162 8.954 8.733 8.506 8.338 8.15 7.835 7.597 7.367 7.252 7.01 6.75 6.459 6.294 5.762 5.783 5.592 5.383 4.961 4.729 4.471 4.199 3.876 3.409 2.732 1.089 -7 ,28962 ,TETRA ,17591026,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:46:34 CET,0.0 1.023 1.43 1.766 2.037 2.274 2.493 2.694 3.037 3.195 3.345 3.263 3.769 3.91 4.146 4.346 4.553 4.658 4.875 5.08 5.361 5.553 5.735 5.981 6.21 6.429 6.643 6.857 7.118 7.374 7.623 7.907 8.17 8.41 8.702 9.029 9.334 9.666 10.002 10.367 10.741 11.145 11.598 12.044 12.556 13.105 13.703 14.314 14.998 15.682 16.157 16.252 16.058 15.733 15.4 15.016 14.623 14.273 13.948 13.584 13.248 12.944 12.64 12.323 12.016 11.739 11.455 11.194 10.943 10.654 10.359 10.12 9.876 9.62 9.411 9.187 8.951 8.707 8.469 8.317 8.136 7.826 7.624 7.422 7.317 7.079 6.792 6.493 6.354 5.86 5.896 5.718 5.526 4.984 4.658 4.348 4.044 3.738 3.321 2.752 1.549 -8 ,23155 ,TETRA ,17591027,Sat Nov 27 21:29:12 CET,Sat Nov 27 23:39:22 CET,0.0 0.995 1.452 1.759 2.032 2.305 2.528 2.725 3.108 3.275 3.41 3.291 3.775 3.907 4.162 4.405 4.62 4.721 4.921 5.116 5.407 5.589 5.768 6.052 6.323 6.567 6.796 7.008 7.266 7.519 7.774 8.074 8.343 8.591 8.894 9.236 9.542 9.862 10.205 10.582 10.984 11.44 11.954 12.428 12.936 13.448 14.016 14.614 15.259 15.894 16.401 16.488 16.276 15.944 15.588 15.161 14.694 14.245 13.863 13.484 13.146 12.799 12.426 12.086 11.769 11.472 11.151 10.858 10.599 10.313 10.014 9.772 9.514 9.241 9.022 8.788 8.545 8.289 8.025 7.847 7.656 7.368 7.173 6.948 6.834 6.586 6.303 5.998 5.844 5.334 5.356 5.168 4.977 4.528 4.269 4.03 3.751 3.392 2.969 2.323 -0.819 -9 ,17216 ,TETRA ,17591028,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:39:57 CET,0.0 1.265 1.698 2.083 2.376 2.615 2.855 3.059 3.398 3.546 3.686 3.616 4.116 4.247 4.476 4.704 4.945 5.052 5.251 5.445 5.719 5.899 6.074 6.316 6.534 6.731 6.919 7.114 7.374 7.613 7.831 8.1 8.362 8.615 8.916 9.23 9.534 9.865 10.227 10.616 10.987 11.361 11.786 12.224 12.75 13.314 13.904 14.534 15.242 15.913 16.417 16.504 16.297 16.004 15.674 15.311 14.915 14.51 14.143 13.759 13.428 13.11 12.788 12.455 12.134 11.848 11.525 11.224 10.981 10.746 10.492 10.274 10.034 9.788 9.605 9.388 9.148 8.908 8.661 8.49 8.311 8.023 7.816 7.597 7.482 7.254 7.002 6.702 6.545 6.038 6.082 5.894 5.694 5.266 5.03 4.771 4.494 4.156 3.752 3.165 1.106 -10 ,23169 ,TETRA ,17591029,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:38:57 CET,0.0 0.963 1.399 1.74 2.022 2.257 2.468 2.667 3.045 3.206 3.353 3.267 3.76 3.876 4.095 4.305 4.505 4.611 4.81 4.982 5.23 5.383 5.528 5.744 5.95 6.158 6.374 6.587 6.851 7.103 7.33 7.588 7.847 8.09 8.371 8.687 8.97 9.266 9.594 9.947 10.299 10.683 11.125 11.572 12.085 12.622 13.233 13.871 14.485 15.153 15.758 15.795 15.466 15.072 14.659 14.236 13.826 13.406 13.022 12.604 12.245 11.914 11.584 11.268 10.964 10.692 10.398 10.132 9.91 9.676 9.417 9.189 8.944 8.7 8.517 8.312 8.084 7.839 7.586 7.416 7.236 6.942 6.737 6.525 6.411 6.171 5.904 5.613 5.472 4.97 5.024 4.854 4.66 4.203 3.956 3.712 3.435 3.106 2.689 2.125 0.42 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18636-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18636-1.txt deleted file mode 100644 index d538c16d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18636-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28913 ,KEBNE ,17026751,Wed Dec 22 15:09:00 CET,Wed Dec 22 16:58:11 CET,0.0 1.01 1.386 1.705 1.983 2.221 2.445 2.634 2.972 3.143 3.303 3.243 3.745 3.88 4.13 4.359 4.589 4.711 4.939 5.152 5.433 5.6 5.771 6.03 6.269 6.501 6.728 6.944 7.23 7.509 7.786 8.1 8.389 8.693 9.049 9.428 9.792 10.194 10.621 11.044 11.482 11.953 12.46 12.991 13.66 14.397 15.142 15.935 16.842 17.803 18.759 19.206 19.2 19.021 18.763 18.48 18.181 17.876 17.604 17.298 16.99 16.702 16.411 16.133 15.877 15.641 15.379 15.128 14.921 14.714 14.488 14.284 14.066 13.837 13.66 13.481 13.294 13.103 12.9 12.761 12.617 12.369 12.192 12.014 11.923 11.738 11.533 11.289 11.17 10.694 10.784 10.652 10.518 10.201 10.007 9.784 9.548 9.261 8.952 8.557 7.365 -2 ,24252 ,KEBNE ,17026752,Wed Dec 22 15:09:01 CET,Wed Dec 22 16:56:44 CET,0.0 1.636 2.188 2.602 2.925 3.168 3.369 3.552 3.92 4.095 4.264 4.237 4.745 4.887 5.146 5.386 5.613 5.725 5.943 6.147 6.454 6.648 6.83 7.089 7.336 7.576 7.799 8.011 8.283 8.542 8.802 9.113 9.399 9.685 10.026 10.389 10.727 11.118 11.558 12.007 12.462 12.983 13.563 14.125 14.771 15.461 16.186 16.906 17.763 18.693 19.464 19.786 19.757 19.544 19.287 18.991 18.677 18.352 18.04 17.733 17.467 17.197 16.927 16.671 16.423 16.193 15.941 15.714 15.522 15.31 15.086 14.891 14.701 14.515 14.352 14.172 13.984 13.79 13.586 13.443 13.29 13.04 12.868 12.691 12.599 12.422 12.214 11.966 11.842 11.362 11.422 11.275 11.132 10.811 10.634 10.444 10.231 9.994 9.69 9.273 8.259 -3 ,9338 ,KEBNE ,17026753,Wed Dec 22 15:09:04 CET,Wed Dec 22 16:53:28 CET,0.0 1.485 1.959 2.334 2.666 2.943 3.178 3.383 3.754 3.926 4.092 4.043 4.551 4.699 4.967 5.218 5.467 5.578 5.807 6.047 6.386 6.591 6.786 7.064 7.319 7.56 7.813 8.072 8.368 8.643 8.915 9.231 9.528 9.812 10.145 10.532 10.91 11.322 11.762 12.224 12.715 13.229 13.787 14.342 14.975 15.683 16.455 17.282 18.164 18.973 19.673 19.921 19.767 19.515 19.231 18.9 18.549 18.183 17.852 17.521 17.222 16.929 16.644 16.392 16.161 15.942 15.701 15.479 15.291 15.088 14.873 14.687 14.476 14.249 14.084 13.921 13.744 13.559 13.364 13.226 13.095 12.88 12.708 12.526 12.434 12.241 12.014 11.779 11.665 11.196 11.308 11.167 11.012 10.711 10.542 10.368 10.197 9.992 9.751 9.443 8.56 -4 ,24489 ,KEBNE ,17026754,Wed Dec 22 15:09:01 CET,Wed Dec 22 16:57:22 CET,0.0 1.441 1.887 2.204 2.465 2.703 2.94 3.155 3.529 3.695 3.851 3.791 4.29 4.433 4.685 4.908 5.123 5.232 5.439 5.63 5.907 6.089 6.273 6.541 6.783 7.024 7.263 7.473 7.754 8.037 8.301 8.617 8.915 9.204 9.534 9.887 10.196 10.525 10.893 11.286 11.691 12.122 12.625 13.129 13.68 14.26 14.876 15.507 16.197 16.945 17.615 17.812 17.721 17.505 17.252 16.935 16.556 16.209 15.88 15.506 15.202 14.928 14.644 14.369 14.106 13.859 13.599 13.366 13.159 12.944 12.712 12.503 12.273 12.041 11.866 11.673 11.48 11.279 11.064 10.913 10.754 10.506 10.322 10.126 10.018 9.789 9.545 9.286 9.164 8.685 8.749 8.587 8.422 8.094 7.899 7.678 7.437 7.154 6.825 6.36 5.183 -5 ,32210 ,KEBNE ,17026755,Wed Dec 22 15:09:01 CET,Wed Dec 22 16:58:34 CET,0.0 0.727 1.054 1.341 1.598 1.824 2.034 2.225 2.582 2.758 2.919 2.839 3.307 3.418 3.655 3.892 4.098 4.195 4.385 4.564 4.834 5.012 5.18 5.419 5.642 5.844 6.04 6.243 6.504 6.746 6.982 7.267 7.53 7.762 8.028 8.338 8.631 8.945 9.282 9.636 9.986 10.351 10.775 11.219 11.747 12.298 12.871 13.49 14.201 14.906 15.447 15.577 15.432 15.16 14.85 14.532 14.229 13.9 13.569 13.236 12.928 12.644 12.373 12.097 11.832 11.587 11.321 11.092 10.904 10.698 10.475 10.288 10.091 9.873 9.706 9.537 9.356 9.16 8.964 8.833 8.693 8.46 8.281 8.078 7.975 7.792 7.61 7.396 7.273 6.809 6.934 6.814 6.686 6.392 6.203 6.004 5.804 5.564 5.301 4.988 4.313 -6 ,9860 ,KEBNE ,17026756,Wed Dec 22 15:09:01 CET,Wed Dec 22 16:56:40 CET,0.0 1.076 1.505 1.827 2.107 2.356 2.607 2.843 3.242 3.436 3.652 3.682 4.223 4.37 4.641 4.92 5.176 5.294 5.507 5.717 6.042 6.24 6.427 6.714 6.987 7.235 7.486 7.722 8.002 8.275 8.534 8.857 9.157 9.426 9.744 10.105 10.458 10.849 11.256 11.692 12.154 12.636 13.169 13.714 14.361 15.047 15.77 16.557 17.414 18.273 18.984 19.217 19.115 18.866 18.52 18.149 17.78 17.388 17.054 16.722 16.413 16.138 15.858 15.568 15.309 15.07 14.807 14.569 14.362 14.141 13.893 13.678 13.455 13.218 13.031 12.845 12.658 12.452 12.234 12.075 11.89 11.61 11.426 11.23 11.131 10.931 10.705 10.458 10.323 9.821 9.884 9.72 9.546 9.215 9.056 8.867 8.638 8.359 8.04 7.653 6.864 -7 ,13277 ,KEBNE ,17026757,Wed Dec 22 15:09:00 CET,Wed Dec 22 16:56:20 CET,0.0 1.054 1.44 1.771 2.074 2.369 2.633 2.843 3.166 3.317 3.47 3.387 3.897 4.045 4.323 4.577 4.814 4.925 5.132 5.334 5.612 5.794 5.974 6.224 6.457 6.677 6.903 7.126 7.404 7.688 7.965 8.278 8.578 8.849 9.15 9.513 9.869 10.266 10.684 11.105 11.545 12.049 12.609 13.143 13.744 14.418 15.213 16.032 16.858 17.713 18.507 18.891 18.893 18.676 18.407 18.118 17.804 17.465 17.125 16.768 16.466 16.198 15.925 15.647 15.377 15.124 14.86 14.629 14.42 14.194 13.951 13.766 13.585 13.371 13.199 13.021 12.829 12.62 12.41 12.272 12.133 11.892 11.709 11.535 11.437 11.216 11.007 10.781 10.662 10.185 10.311 10.178 10.036 9.729 9.537 9.327 9.083 8.816 8.513 8.059 6.744 -8 ,23943 ,KEBNE ,17026758,Wed Dec 22 15:09:01 CET,Wed Dec 22 16:59:12 CET,0.0 0.681 0.97 1.222 1.467 1.676 1.871 2.063 2.398 2.556 2.731 2.703 3.213 3.352 3.644 3.92 4.159 4.274 4.488 4.684 4.957 5.128 5.291 5.532 5.759 5.976 6.193 6.396 6.674 6.973 7.24 7.541 7.829 8.098 8.417 8.753 9.044 9.377 9.732 10.108 10.527 10.972 11.474 11.971 12.51 13.115 13.814 14.563 15.34 16.074 16.793 17.066 16.941 16.698 16.42 16.104 15.752 15.412 15.112 14.794 14.516 14.269 14.018 13.754 13.505 13.275 13.003 12.733 12.512 12.294 12.056 11.864 11.668 11.444 11.255 11.048 10.841 10.64 10.432 10.285 10.135 9.905 9.734 9.544 9.448 9.265 9.065 8.828 8.71 8.239 8.339 8.192 8.047 7.728 7.553 7.377 7.168 6.907 6.581 6.128 5.161 -9 ,22720 ,KEBNE ,17026759,Wed Dec 22 15:09:01 CET,Wed Dec 22 16:56:58 CET,0.0 1.244 1.66 1.954 2.229 2.469 2.69 2.898 3.256 3.401 3.56 3.524 4.021 4.147 4.385 4.628 4.846 4.942 5.131 5.319 5.58 5.755 5.933 6.171 6.384 6.59 6.812 7.045 7.344 7.617 7.859 8.131 8.405 8.666 8.959 9.296 9.632 9.994 10.352 10.718 11.128 11.592 12.077 12.538 13.07 13.677 14.349 15.047 15.809 16.564 17.239 17.507 17.4 17.154 16.801 16.466 16.209 15.938 15.662 15.343 15.048 14.776 14.522 14.265 14.019 13.803 13.557 13.337 13.136 12.913 12.693 12.515 12.334 12.156 12.015 11.854 11.681 11.506 11.327 11.198 11.062 10.85 10.687 10.52 10.436 10.256 10.066 9.869 9.755 9.29 9.42 9.3 9.158 8.798 8.61 8.436 8.242 8.025 7.755 7.392 6.259 -10 ,30334 ,KEBNE ,17026760,Wed Dec 22 15:09:01 CET,Wed Dec 22 16:58:09 CET,0.0 1.35 1.828 2.198 2.481 2.746 3.006 3.228 3.595 3.765 3.952 3.915 4.427 4.567 4.816 5.058 5.282 5.394 5.619 5.835 6.156 6.356 6.53 6.776 7.014 7.236 7.464 7.696 7.976 8.24 8.511 8.82 9.096 9.382 9.708 10.056 10.399 10.782 11.174 11.568 11.985 12.436 12.937 13.479 14.117 14.774 15.475 16.199 17.053 17.995 18.778 19.069 19.03 18.821 18.551 18.252 17.952 17.625 17.288 16.922 16.585 16.289 15.997 15.714 15.464 15.242 14.995 14.761 14.552 14.332 14.104 13.912 13.703 13.483 13.3 13.116 12.936 12.733 12.534 12.401 12.257 12.017 11.842 11.652 11.56 11.395 11.21 11.013 10.914 10.452 10.56 10.423 10.279 9.98 9.805 9.614 9.421 9.211 8.946 8.536 7.207 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index 3aceed4e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18376 ,TETRA ,17591030,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:38:26 CET,0.0 1.95 2.399 2.746 3.063 3.347 3.606 3.822 4.21 4.389 4.581 4.589 5.098 5.238 5.504 5.755 5.992 6.11 6.339 6.56 6.865 7.049 7.229 7.504 7.757 7.992 8.232 8.457 8.734 8.989 9.231 9.525 9.802 10.058 10.365 10.716 11.031 11.361 11.713 12.083 12.456 12.872 13.338 13.814 14.366 14.935 15.553 16.197 16.867 17.442 17.698 17.408 16.964 16.484 15.983 15.442 14.88 14.352 13.904 13.465 13.054 12.622 12.182 11.784 11.438 11.119 10.756 10.43 10.147 9.835 9.49 9.209 8.909 8.573 8.315 8.065 7.796 7.503 7.187 6.954 6.728 6.391 6.132 5.864 5.739 5.465 5.138 4.804 4.634 4.099 4.086 3.879 3.649 3.183 2.931 2.649 2.334 1.957 1.403 0.646 -2.295 -2 ,23837 ,TETRA ,17591031,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:41:31 CET,0.0 2.185 2.726 3.099 3.419 3.724 3.978 4.205 4.651 4.856 5.044 5.012 5.512 5.655 5.928 6.19 6.44 6.558 6.788 7.002 7.304 7.488 7.663 7.904 8.122 8.345 8.563 8.76 9.002 9.239 9.471 9.758 10.03 10.276 10.559 10.856 11.128 11.45 11.777 12.088 12.407 12.753 13.16 13.553 14.002 14.484 14.975 15.506 16.068 16.608 16.854 16.627 16.198 15.643 15.073 14.539 14.006 13.466 13.015 12.535 12.068 11.644 11.259 10.889 10.532 10.194 9.832 9.522 9.251 8.953 8.608 8.325 8.04 7.716 7.479 7.241 6.98 6.717 6.454 6.26 6.06 5.742 5.514 5.269 5.143 4.884 4.586 4.292 4.13 3.612 3.629 3.417 3.199 2.754 2.478 2.161 1.825 1.401 0.953 0.337 -2.572 -3 ,7148 ,TETRA ,17591032,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:41:32 CET,0.0 1.738 2.186 2.501 2.799 3.046 3.236 3.442 3.817 3.966 4.105 4.013 4.493 4.61 4.861 5.103 5.323 5.429 5.619 5.794 6.051 6.205 6.352 6.593 6.83 7.044 7.245 7.441 7.704 7.944 8.166 8.445 8.713 8.974 9.274 9.592 9.886 10.191 10.53 10.898 11.238 11.629 12.097 12.531 13.006 13.521 14.112 14.747 15.409 16.026 16.35 16.175 15.798 15.242 14.661 14.081 13.492 12.957 12.515 12.027 11.582 11.191 10.813 10.452 10.09 9.742 9.349 8.987 8.68 8.332 7.965 7.671 7.386 7.083 6.83 6.577 6.32 6.046 5.771 5.572 5.358 5.064 4.857 4.619 4.5 4.237 3.946 3.655 3.486 2.935 2.917 2.724 2.517 2.057 1.799 1.534 1.235 0.85 0.398 -0.219 -2.391 -4 ,10796 ,TETRA ,17591033,Sat Nov 27 21:28:15 CET,Sat Nov 27 23:40:58 CET,0.0 1.894 2.414 2.739 3.006 3.271 3.51 3.72 4.091 4.265 4.447 4.416 4.908 5.036 5.304 5.551 5.764 5.871 6.089 6.318 6.657 6.858 7.049 7.327 7.592 7.839 8.075 8.303 8.562 8.782 9.011 9.306 9.573 9.833 10.145 10.473 10.781 11.101 11.448 11.811 12.155 12.546 13.008 13.453 13.917 14.414 14.996 15.597 16.168 16.745 17.13 16.891 16.44 15.889 15.299 14.73 14.167 13.621 13.141 12.643 12.215 11.813 11.418 11.019 10.633 10.288 9.912 9.58 9.278 8.939 8.604 8.336 8.053 7.745 7.502 7.26 7.0 6.727 6.458 6.264 6.05 5.721 5.502 5.27 5.138 4.878 4.614 4.31 4.148 3.605 3.556 3.357 3.139 2.671 2.428 2.164 1.867 1.502 1.022 0.307 -1.934 -5 ,9676 ,TETRA ,17591034,Sat Nov 27 21:28:15 CET,Sat Nov 27 23:42:15 CET,0.0 1.357 1.858 2.23 2.58 2.887 3.128 3.372 3.824 4.007 4.168 4.099 4.598 4.75 5.026 5.269 5.498 5.607 5.805 6.002 6.293 6.477 6.645 6.877 7.102 7.323 7.553 7.769 8.029 8.285 8.519 8.8 9.071 9.315 9.608 9.922 10.206 10.525 10.855 11.192 11.543 11.944 12.422 12.866 13.361 13.914 14.517 15.109 15.692 16.268 16.639 16.519 16.126 15.619 15.094 14.556 14.027 13.509 13.012 12.501 12.074 11.693 11.317 10.918 10.554 10.237 9.918 9.62 9.351 9.075 8.779 8.52 8.236 7.947 7.716 7.466 7.213 6.969 6.692 6.498 6.302 5.971 5.742 5.51 5.39 5.126 4.822 4.504 4.342 3.81 3.824 3.65 3.44 2.908 2.609 2.303 1.983 1.625 1.257 0.662 -1.317 -6 ,2233 ,TETRA ,17591035,Sat Nov 27 21:29:12 CET,Sat Nov 27 23:39:13 CET,0.0 1.798 2.288 2.638 2.922 3.176 3.424 3.635 4.007 4.182 4.336 4.283 4.782 4.924 5.205 5.477 5.715 5.828 6.055 6.268 6.556 6.734 6.914 7.164 7.394 7.611 7.819 8.033 8.301 8.552 8.801 9.09 9.357 9.605 9.885 10.199 10.5 10.845 11.214 11.587 11.957 12.357 12.806 13.224 13.709 14.225 14.783 15.374 15.974 16.484 16.71 16.374 15.819 15.235 14.592 13.94 13.333 12.754 12.249 11.714 11.253 10.84 10.427 10.025 9.65 9.298 8.918 8.587 8.305 7.972 7.602 7.309 7.012 6.69 6.436 6.181 5.91 5.62 5.332 5.136 4.909 4.553 4.304 4.047 3.911 3.628 3.34 3.027 2.876 2.357 2.307 2.099 1.889 1.398 1.117 0.823 0.505 0.13 -0.379 -1.104 -3.53 -7 ,6949 ,TETRA ,17591036,Sat Nov 27 21:28:15 CET,Sat Nov 27 23:39:42 CET,0.0 1.348 1.818 2.162 2.467 2.764 3.046 3.29 3.696 3.872 4.041 3.994 4.493 4.626 4.882 5.136 5.368 5.481 5.704 5.9 6.181 6.36 6.524 6.761 6.994 7.23 7.457 7.668 7.946 8.219 8.481 8.785 9.065 9.331 9.643 9.998 10.334 10.682 11.038 11.397 11.768 12.197 12.687 13.133 13.631 14.191 14.761 15.293 15.888 16.483 16.822 16.597 16.071 15.454 14.805 14.171 13.601 13.07 12.57 12.03 11.558 11.13 10.712 10.319 9.958 9.612 9.229 8.892 8.608 8.293 7.963 7.683 7.388 7.099 6.86 6.591 6.319 6.041 5.751 5.554 5.347 5.015 4.779 4.53 4.399 4.136 3.847 3.513 3.344 2.832 2.866 2.674 2.46 1.975 1.681 1.37 1.049 0.61 -0.005 -0.679 -2.798 -8 ,19287 ,TETRA ,17591037,Sat Nov 27 21:28:15 CET,Sat Nov 27 23:40:23 CET,0.0 1.62 2.087 2.434 2.696 2.946 3.202 3.435 3.845 4.018 4.173 4.102 4.59 4.728 5.008 5.274 5.523 5.638 5.849 6.065 6.373 6.556 6.738 7.001 7.253 7.5 7.731 7.96 8.267 8.539 8.786 9.08 9.356 9.627 9.943 10.285 10.609 10.952 11.316 11.727 12.138 12.555 13.022 13.49 14.012 14.562 15.158 15.735 16.346 16.918 17.23 16.955 16.388 15.782 15.182 14.557 13.955 13.385 12.847 12.265 11.723 11.228 10.77 10.317 9.889 9.527 9.129 8.756 8.426 8.072 7.672 7.341 7.037 6.725 6.454 6.173 5.895 5.608 5.308 5.089 4.845 4.476 4.233 3.974 3.833 3.539 3.255 2.917 2.721 2.169 2.118 1.904 1.694 1.207 0.919 0.622 0.284 -0.16 -0.713 -1.497 -4.527 -9 ,25447 ,TETRA ,17591038,Sat Nov 27 21:28:17 CET,Sat Nov 27 23:41:36 CET,0.0 1.385 1.882 2.265 2.572 2.837 3.067 3.27 3.655 3.837 3.998 3.935 4.436 4.58 4.839 5.059 5.269 5.375 5.592 5.792 6.055 6.219 6.375 6.608 6.831 7.032 7.229 7.428 7.681 7.906 8.121 8.404 8.674 8.934 9.235 9.566 9.88 10.21 10.566 10.934 11.302 11.701 12.152 12.607 13.111 13.596 14.071 14.564 15.105 15.59 15.739 15.349 14.819 14.22 13.61 12.986 12.378 11.82 11.326 10.811 10.356 9.94 9.535 9.138 8.74 8.372 8.02 7.698 7.407 7.094 6.746 6.455 6.165 5.872 5.631 5.372 5.105 4.841 4.567 4.361 4.137 3.782 3.553 3.307 3.172 2.897 2.585 2.255 2.086 1.545 1.497 1.302 1.104 0.674 0.439 0.184 -0.092 -0.46 -1.014 -1.717 -4.168 -10 ,23411 ,TETRA ,17591039,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:40:43 CET,0.0 1.638 2.156 2.575 2.895 3.158 3.386 3.595 3.975 4.149 4.322 4.304 4.8 4.941 5.21 5.455 5.693 5.799 6.005 6.213 6.497 6.674 6.844 7.093 7.327 7.556 7.778 7.974 8.237 8.486 8.722 9.023 9.311 9.583 9.889 10.234 10.547 10.867 11.211 11.566 11.956 12.383 12.83 13.267 13.736 14.193 14.69 15.232 15.774 16.282 16.601 16.395 15.926 15.338 14.711 14.087 13.517 12.979 12.462 11.925 11.482 11.063 10.632 10.231 9.842 9.459 9.074 8.733 8.441 8.125 7.791 7.517 7.218 6.901 6.64 6.366 6.081 5.798 5.516 5.306 5.08 4.719 4.466 4.223 4.097 3.83 3.567 3.263 3.09 2.554 2.543 2.34 2.117 1.622 1.351 1.063 0.732 0.313 -0.232 -1.078 -3.327 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index e79555b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30610 ,TETRA ,17591040,Sat Nov 27 21:28:14 CET,Sat Nov 27 23:40:36 CET,0.0 1.204 1.806 2.26 2.66 3.036 3.383 3.678 4.215 4.483 4.728 4.721 5.413 5.652 6.111 6.545 6.966 7.174 7.565 7.945 8.503 8.863 9.207 9.716 10.21 10.681 11.136 11.577 12.164 12.748 13.335 14.041 14.72 15.398 16.178 17.058 17.919 18.866 19.922 21.074 22.29 23.695 25.373 27.033 29.002 31.305 34.062 37.316 41.175 45.917 52.128 57.492 60.787 62.93 64.367 65.402 66.105 66.592 66.911 67.15 67.275 67.342 67.373 67.38 67.37 67.336 67.286 67.214 67.115 66.986 66.837 66.699 66.563 66.396 66.24 66.082 65.899 65.705 65.508 65.354 65.183 64.892 64.686 64.455 64.324 64.072 63.806 63.509 63.36 62.807 62.8 62.596 62.379 61.873 61.596 61.295 60.937 60.504 59.989 59.262 56.92 -2 ,541 ,TETRA ,17591041,Sat Nov 27 21:28:16 CET,Sat Nov 27 23:42:26 CET,0.0 1.275 1.831 2.288 2.711 3.088 3.45 3.795 4.428 4.709 4.969 5.033 5.745 5.989 6.454 6.887 7.32 7.535 7.938 8.321 8.878 9.255 9.615 10.113 10.605 11.102 11.594 12.086 12.724 13.331 13.925 14.647 15.368 16.052 16.824 17.699 18.564 19.527 20.564 21.719 22.965 24.365 26.04 27.783 29.822 32.121 34.848 38.04 41.933 46.667 52.615 57.905 61.17 63.202 64.542 65.526 66.265 66.783 67.124 67.398 67.557 67.622 67.638 67.649 67.614 67.543 67.462 67.386 67.293 67.166 67.017 66.869 66.696 66.528 66.398 66.243 66.072 65.882 65.676 65.533 65.377 65.104 64.895 64.682 64.566 64.316 64.05 63.751 63.593 63.043 63.031 62.818 62.611 62.137 61.849 61.51 61.126 60.67 60.089 59.379 57.739 -3 ,1981 ,TETRA ,17591042,Sat Nov 27 21:28:16 CET,Sat Nov 27 23:40:21 CET,0.0 1.469 2.055 2.555 2.987 3.357 3.703 4.038 4.622 4.894 5.167 5.222 5.903 6.128 6.583 7.032 7.463 7.666 8.084 8.506 9.102 9.476 9.835 10.355 10.859 11.361 11.844 12.301 12.897 13.497 14.085 14.785 15.459 16.121 16.903 17.779 18.639 19.608 20.666 21.787 22.994 24.411 26.102 27.856 29.934 32.275 35.087 38.345 42.227 47.021 53.043 58.365 61.642 63.664 65.018 66.058 66.799 67.285 67.613 67.856 67.994 68.071 68.099 68.095 68.037 67.942 67.819 67.707 67.615 67.481 67.305 67.159 67.01 66.838 66.696 66.551 66.382 66.179 65.96 65.81 65.647 65.354 65.13 64.906 64.792 64.543 64.254 63.934 63.765 63.195 63.18 62.954 62.714 62.212 61.925 61.598 61.209 60.765 60.238 59.542 57.789 -4 ,23092 ,TETRA ,17591043,Sat Nov 27 21:28:17 CET,Sat Nov 27 23:40:36 CET,0.0 1.418 2.016 2.452 2.8 3.119 3.461 3.8 4.373 4.636 4.89 4.915 5.602 5.832 6.272 6.699 7.104 7.295 7.682 8.066 8.63 8.995 9.337 9.837 10.34 10.821 11.294 11.769 12.382 12.971 13.534 14.215 14.879 15.537 16.31 17.194 18.058 19.017 20.079 21.199 22.394 23.783 25.417 27.09 29.112 31.439 34.152 37.284 41.178 45.973 52.135 57.531 60.812 62.985 64.495 65.562 66.277 66.791 67.131 67.374 67.537 67.661 67.738 67.773 67.77 67.706 67.6 67.504 67.416 67.326 67.204 67.073 66.923 66.752 66.607 66.442 66.251 66.044 65.829 65.673 65.491 65.179 64.959 64.757 64.659 64.411 64.131 63.828 63.67 63.118 63.105 62.886 62.635 62.088 61.798 61.486 61.123 60.649 60.09 59.336 56.92 -5 ,29536 ,TETRA ,17591044,Sat Nov 27 21:28:16 CET,Sat Nov 27 23:40:37 CET,0.0 1.216 1.859 2.354 2.778 3.184 3.542 3.849 4.468 4.763 5.029 5.073 5.762 5.997 6.453 6.875 7.285 7.479 7.857 8.232 8.777 9.132 9.485 9.998 10.498 10.984 11.439 11.884 12.494 13.104 13.706 14.415 15.087 15.75 16.508 17.379 18.248 19.192 20.214 21.333 22.564 23.962 25.601 27.276 29.233 31.502 34.254 37.42 41.245 45.999 51.954 57.097 60.35 62.515 63.967 64.99 65.678 66.172 66.508 66.772 66.97 67.105 67.173 67.188 67.18 67.133 67.048 66.95 66.834 66.711 66.606 66.506 66.358 66.181 66.018 65.844 65.672 65.48 65.267 65.11 64.942 64.67 64.459 64.234 64.118 63.868 63.599 63.317 63.168 62.632 62.674 62.469 62.257 61.774 61.461 61.12 60.781 60.39 59.872 59.143 57.099 -6 ,21161 ,TETRA ,17591045,Sat Nov 27 21:28:18 CET,Sat Nov 27 23:39:39 CET,0.0 1.298 1.953 2.469 2.883 3.256 3.608 3.958 4.559 4.819 5.076 5.098 5.772 5.989 6.422 6.852 7.265 7.465 7.84 8.204 8.743 9.096 9.442 9.95 10.457 10.949 11.426 11.895 12.49 13.071 13.647 14.363 15.064 15.738 16.519 17.395 18.234 19.193 20.275 21.418 22.62 23.989 25.626 27.317 29.327 31.665 34.423 37.604 41.461 46.144 52.132 57.449 60.723 62.864 64.316 65.363 66.069 66.547 66.899 67.185 67.341 67.418 67.445 67.44 67.4 67.338 67.261 67.171 67.063 66.939 66.788 66.626 66.456 66.277 66.131 65.965 65.762 65.554 65.357 65.221 65.056 64.763 64.564 64.366 64.257 64.024 63.76 63.465 63.312 62.766 62.779 62.578 62.36 61.84 61.554 61.249 60.902 60.494 59.966 59.258 57.233 -7 ,6580 ,TETRA ,17591046,Sat Nov 27 21:28:16 CET,Sat Nov 27 23:40:27 CET,0.0 1.12 1.733 2.255 2.713 3.074 3.388 3.692 4.266 4.54 4.802 4.867 5.561 5.787 6.216 6.644 7.05 7.251 7.651 8.027 8.571 8.922 9.266 9.773 10.254 10.72 11.185 11.652 12.275 12.878 13.448 14.15 14.834 15.489 16.268 17.169 18.039 19.006 20.069 21.19 22.38 23.734 25.374 27.07 29.069 31.384 34.148 37.4 41.342 46.132 52.209 57.58 60.869 62.986 64.436 65.466 66.185 66.69 67.036 67.314 67.504 67.617 67.667 67.693 67.666 67.592 67.493 67.391 67.291 67.171 67.002 66.857 66.722 66.57 66.43 66.263 66.077 65.861 65.617 65.443 65.245 64.939 64.745 64.54 64.431 64.188 63.916 63.612 63.449 62.914 62.947 62.726 62.501 62.025 61.737 61.429 61.062 60.622 60.086 59.391 57.543 -8 ,29128 ,TETRA ,17591047,Sat Nov 27 21:28:16 CET,Sat Nov 27 23:40:29 CET,0.0 1.424 2.06 2.511 2.892 3.244 3.57 3.891 4.463 4.726 5.0 5.07 5.773 6.003 6.455 6.899 7.319 7.525 7.922 8.298 8.857 9.235 9.606 10.132 10.612 11.072 11.546 12.026 12.654 13.25 13.818 14.509 15.212 15.898 16.673 17.575 18.466 19.429 20.45 21.577 22.801 24.237 25.953 27.682 29.746 32.059 34.764 37.887 41.681 46.423 52.481 57.666 60.848 62.999 64.446 65.479 66.197 66.712 67.068 67.316 67.456 67.543 67.584 67.561 67.49 67.401 67.302 67.218 67.132 67.029 66.899 66.772 66.608 66.408 66.266 66.126 65.964 65.769 65.544 65.387 65.228 64.946 64.736 64.511 64.379 64.09 63.787 63.448 63.27 62.704 62.701 62.497 62.264 61.716 61.418 61.103 60.734 60.272 59.688 58.98 57.263 -9 ,30433 ,TETRA ,17591048,Sat Nov 27 21:28:17 CET,Sat Nov 27 23:41:42 CET,0.0 1.151 1.706 2.204 2.634 2.981 3.298 3.608 4.161 4.415 4.668 4.706 5.402 5.632 6.08 6.522 6.967 7.184 7.581 7.984 8.568 8.935 9.305 9.833 10.326 10.822 11.311 11.765 12.357 12.939 13.49 14.184 14.885 15.55 16.313 17.18 18.059 19.047 20.092 21.218 22.442 23.848 25.513 27.239 29.311 31.649 34.404 37.614 41.458 46.168 52.192 57.502 60.765 62.873 64.277 65.336 66.1 66.618 66.967 67.222 67.402 67.523 67.581 67.607 67.583 67.532 67.439 67.337 67.248 67.133 66.998 66.857 66.705 66.542 66.403 66.247 66.062 65.857 65.64 65.481 65.313 65.057 64.857 64.612 64.487 64.237 63.953 63.626 63.458 62.907 62.913 62.697 62.47 61.971 61.685 61.36 61.002 60.598 60.068 59.395 57.724 -10 ,29687 ,TETRA ,17591049,Sat Nov 27 21:29:11 CET,Sat Nov 27 23:43:29 CET,0.0 1.584 2.222 2.673 3.086 3.503 3.877 4.22 4.832 5.102 5.364 5.43 6.123 6.348 6.806 7.255 7.679 7.884 8.278 8.665 9.232 9.604 9.981 10.522 11.032 11.5 11.961 12.433 13.045 13.628 14.194 14.897 15.582 16.253 17.038 17.924 18.786 19.75 20.811 21.946 23.154 24.533 26.176 27.866 29.865 32.188 35.005 38.255 42.113 46.802 52.803 58.189 61.453 63.656 65.153 66.159 66.893 67.423 67.765 68.018 68.166 68.254 68.315 68.346 68.308 68.234 68.128 68.023 67.939 67.828 67.663 67.508 67.348 67.18 67.039 66.877 66.704 66.495 66.245 66.082 65.925 65.655 65.458 65.252 65.14 64.91 64.656 64.366 64.21 63.653 63.641 63.451 63.25 62.774 62.49 62.163 61.805 61.404 60.934 60.309 58.35 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt deleted file mode 100644 index 7a7c1ce3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3005 ,TETRA ,17591050,Sat Nov 27 21:29:11 CET,Sat Nov 27 23:47:33 CET,0.0 1.837 2.569 3.112 3.522 3.868 4.201 4.5 5.047 5.308 5.544 5.493 6.137 6.339 6.708 7.04 7.345 7.492 7.785 8.061 8.408 8.624 8.828 9.129 9.44 9.712 9.963 10.215 10.545 10.856 11.127 11.444 11.754 12.053 12.38 12.712 12.998 13.31 13.658 14.008 14.31 14.602 14.926 15.162 15.395 15.636 15.77 15.683 15.293 14.324 12.249 9.328 6.656 4.345 2.292 0.406 -1.221 -2.677 -3.922 -5.157 -6.224 -7.18 -8.093 -8.946 -9.747 -10.479 -11.227 -11.89 -12.468 -13.081 -13.728 -14.248 -14.771 -15.329 -15.75 -16.185 -16.665 -17.179 -17.711 -18.07 -18.432 -18.991 -19.394 -19.825 -20.048 -20.51 -20.994 -21.485 -21.737 -22.493 -22.573 -22.868 -23.201 -23.96 -24.356 -24.755 -25.217 -25.792 -26.501 -27.316 -29.336 -2 ,13293 ,TETRA ,17591051,Sat Nov 27 21:29:13 CET,Sat Nov 27 23:43:19 CET,0.0 1.883 2.59 3.171 3.663 4.064 4.374 4.645 5.191 5.447 5.691 5.709 6.373 6.57 6.952 7.283 7.597 7.753 8.026 8.272 8.616 8.832 9.042 9.338 9.627 9.899 10.165 10.425 10.738 11.043 11.356 11.718 12.018 12.272 12.55 12.898 13.246 13.58 13.874 14.169 14.503 14.85 15.155 15.439 15.729 15.889 15.951 15.874 15.49 14.601 12.444 9.354 6.806 4.605 2.664 0.965 -0.608 -2.064 -3.301 -4.541 -5.61 -6.601 -7.524 -8.366 -9.156 -9.87 -10.597 -11.264 -11.846 -12.451 -13.093 -13.621 -14.156 -14.715 -15.168 -15.63 -16.1 -16.586 -17.089 -17.436 -17.797 -18.369 -18.778 -19.207 -19.419 -19.887 -20.383 -20.882 -21.151 -21.909 -22.024 -22.341 -22.665 -23.345 -23.724 -24.141 -24.572 -25.059 -25.701 -26.563 -28.425 -3 ,16440 ,TETRA ,17591052,Sat Nov 27 21:29:13 CET,Sat Nov 27 23:44:36 CET,0.0 2.209 2.952 3.481 3.912 4.324 4.67 4.983 5.559 5.821 6.054 6.009 6.652 6.832 7.193 7.512 7.796 7.941 8.208 8.458 8.824 9.043 9.255 9.566 9.88 10.164 10.422 10.692 11.032 11.35 11.633 11.974 12.313 12.612 12.931 13.249 13.545 13.875 14.224 14.593 14.929 15.233 15.523 15.77 16.038 16.254 16.362 16.251 15.859 15.078 13.179 10.331 7.695 5.39 3.431 1.677 0.101 -1.337 -2.567 -3.806 -4.866 -5.802 -6.714 -7.59 -8.39 -9.106 -9.876 -10.578 -11.179 -11.792 -12.424 -12.951 -13.498 -14.059 -14.495 -14.949 -15.407 -15.884 -16.389 -16.739 -17.096 -17.659 -18.054 -18.444 -18.653 -19.12 -19.608 -20.101 -20.353 -21.119 -21.226 -21.535 -21.884 -22.623 -23.003 -23.428 -23.909 -24.439 -25.05 -25.872 -28.237 -4 ,4966 ,TETRA ,17591053,Sat Nov 27 21:29:13 CET,Sat Nov 27 23:44:40 CET,0.0 1.781 2.491 3.011 3.451 3.855 4.208 4.509 5.048 5.278 5.474 5.389 6.024 6.203 6.546 6.872 7.167 7.311 7.594 7.849 8.191 8.423 8.66 8.976 9.27 9.554 9.818 10.053 10.34 10.64 10.94 11.269 11.565 11.823 12.094 12.402 12.703 13.021 13.333 13.654 13.964 14.282 14.646 14.938 15.141 15.26 15.334 15.237 14.774 13.81 11.87 9.36 7.007 4.751 2.764 0.985 -0.604 -2.035 -3.254 -4.487 -5.566 -6.559 -7.488 -8.349 -9.169 -9.915 -10.692 -11.39 -11.975 -12.549 -13.15 -13.669 -14.207 -14.772 -15.224 -15.691 -16.164 -16.653 -17.152 -17.505 -17.872 -18.425 -18.816 -19.22 -19.433 -19.883 -20.343 -20.832 -21.097 -21.847 -21.96 -22.287 -22.625 -23.317 -23.691 -24.099 -24.544 -25.038 -25.645 -26.426 -28.204 -5 ,10333 ,TETRA ,17591054,Sat Nov 27 21:29:13 CET,Sat Nov 27 23:45:21 CET,0.0 2.214 2.922 3.463 3.91 4.314 4.673 4.969 5.478 5.725 5.958 5.926 6.555 6.728 7.076 7.404 7.713 7.868 8.151 8.407 8.796 9.045 9.272 9.605 9.915 10.201 10.48 10.74 11.073 11.394 11.693 12.018 12.323 12.641 12.983 13.313 13.641 14.001 14.339 14.672 15.037 15.421 15.768 16.028 16.238 16.392 16.458 16.428 16.068 15.077 12.919 9.854 7.127 4.767 2.748 0.942 -0.604 -2.006 -3.236 -4.467 -5.541 -6.53 -7.459 -8.297 -9.091 -9.829 -10.593 -11.275 -11.867 -12.496 -13.158 -13.697 -14.26 -14.846 -15.306 -15.776 -16.252 -16.746 -17.255 -17.612 -17.981 -18.562 -18.966 -19.394 -19.615 -20.068 -20.526 -21.001 -21.252 -21.997 -22.133 -22.48 -22.8 -23.454 -23.836 -24.246 -24.674 -25.162 -25.768 -26.579 -28.858 -6 ,3511 ,TETRA ,17591055,Sat Nov 27 21:29:13 CET,Sat Nov 27 23:44:41 CET,0.0 2.503 3.324 3.89 4.329 4.709 5.025 5.298 5.813 6.061 6.289 6.265 6.928 7.121 7.461 7.779 8.099 8.257 8.552 8.806 9.176 9.408 9.613 9.92 10.217 10.501 10.778 11.036 11.344 11.638 11.912 12.223 12.525 12.829 13.156 13.476 13.765 14.087 14.413 14.713 15.014 15.343 15.685 15.97 16.236 16.438 16.539 16.479 16.188 15.488 13.585 10.508 7.834 5.562 3.528 1.616 -0.02 -1.425 -2.64 -3.865 -4.91 -5.856 -6.79 -7.673 -8.499 -9.254 -10.022 -10.695 -11.271 -11.856 -12.463 -12.99 -13.555 -14.149 -14.611 -15.09 -15.569 -16.055 -16.555 -16.909 -17.292 -17.875 -18.262 -18.676 -18.897 -19.343 -19.811 -20.282 -20.526 -21.27 -21.33 -21.636 -21.965 -22.663 -23.045 -23.451 -23.919 -24.433 -25.032 -25.874 -28.068 -7 ,16621 ,TETRA ,17591056,Sat Nov 27 21:29:13 CET,Sat Nov 27 23:42:58 CET,0.0 1.98 2.789 3.325 3.765 4.143 4.461 4.765 5.35 5.614 5.856 5.845 6.495 6.683 7.037 7.367 7.672 7.817 8.116 8.421 8.831 9.073 9.298 9.644 9.963 10.234 10.481 10.716 11.018 11.315 11.613 11.98 12.313 12.621 12.977 13.313 13.612 13.926 14.217 14.538 14.858 15.123 15.358 15.572 15.789 16.004 16.15 16.072 15.674 14.644 12.42 9.404 6.618 4.206 2.153 0.273 -1.332 -2.732 -3.945 -5.169 -6.218 -7.16 -8.077 -8.946 -9.761 -10.501 -11.254 -11.898 -12.454 -13.075 -13.709 -14.228 -14.78 -15.363 -15.819 -16.27 -16.725 -17.2 -17.708 -18.088 -18.479 -19.054 -19.457 -19.886 -20.109 -20.55 -21.01 -21.494 -21.744 -22.506 -22.638 -22.946 -23.275 -23.986 -24.353 -24.778 -25.266 -25.796 -26.454 -27.315 -29.426 -8 ,15838 ,TETRA ,17591057,Sat Nov 27 21:30:12 CET,Sat Nov 27 23:43:51 CET,0.0 1.67 2.373 2.881 3.292 3.696 4.055 4.369 4.937 5.214 5.468 5.431 6.077 6.251 6.591 6.921 7.224 7.373 7.651 7.93 8.355 8.615 8.859 9.188 9.481 9.784 10.102 10.403 10.767 11.106 11.425 11.766 12.049 12.325 12.639 12.976 13.289 13.589 13.902 14.236 14.537 14.855 15.188 15.425 15.622 15.788 15.857 15.787 15.464 14.456 12.069 8.754 6.04 3.805 1.823 0.039 -1.572 -3.061 -4.314 -5.574 -6.666 -7.612 -8.526 -9.399 -10.201 -10.955 -11.74 -12.42 -13.0 -13.638 -14.302 -14.821 -15.348 -15.914 -16.373 -16.837 -17.318 -17.845 -18.395 -18.76 -19.124 -19.682 -20.089 -20.525 -20.742 -21.19 -21.643 -22.14 -22.415 -23.173 -23.253 -23.555 -23.88 -24.577 -24.929 -25.312 -25.79 -26.368 -27.004 -27.829 -29.667 -9 ,2319 ,TETRA ,17591058,Sat Nov 27 21:30:12 CET,Sat Nov 27 23:40:52 CET,0.0 1.86 2.5 3.001 3.459 3.831 4.153 4.468 5.056 5.299 5.516 5.478 6.13 6.327 6.693 7.018 7.322 7.47 7.755 8.027 8.376 8.599 8.845 9.183 9.467 9.743 10.014 10.274 10.617 10.935 11.196 11.502 11.789 12.059 12.384 12.724 13.03 13.357 13.681 14.028 14.365 14.651 14.919 15.13 15.33 15.501 15.588 15.468 14.988 13.921 11.87 9.046 6.491 4.255 2.262 0.425 -1.162 -2.638 -3.914 -5.128 -6.2 -7.164 -8.066 -8.914 -9.712 -10.449 -11.201 -11.868 -12.461 -13.056 -13.687 -14.232 -14.769 -15.311 -15.739 -16.183 -16.644 -17.143 -17.662 -18.017 -18.404 -19.017 -19.428 -19.835 -20.045 -20.489 -20.939 -21.409 -21.664 -22.421 -22.539 -22.849 -23.152 -23.852 -24.246 -24.666 -25.139 -25.691 -26.324 -27.135 -29.098 -10 ,8873 ,TETRA ,17591059,Sat Nov 27 21:30:11 CET,Sat Nov 27 23:48:16 CET,0.0 2.019 2.662 3.183 3.639 4.051 4.436 4.755 5.241 5.473 5.714 5.701 6.368 6.578 6.962 7.294 7.628 7.796 8.109 8.406 8.804 9.046 9.28 9.605 9.903 10.189 10.463 10.717 11.018 11.3 11.583 11.924 12.242 12.533 12.835 13.145 13.435 13.756 14.093 14.422 14.747 15.066 15.359 15.628 15.916 16.152 16.262 16.139 15.709 14.855 12.742 9.687 7.129 4.901 2.912 1.111 -0.468 -1.909 -3.167 -4.427 -5.566 -6.58 -7.49 -8.35 -9.177 -9.917 -10.67 -11.344 -11.939 -12.574 -13.233 -13.761 -14.297 -14.859 -15.295 -15.755 -16.223 -16.71 -17.228 -17.604 -18.0 -18.572 -18.949 -19.329 -19.537 -19.994 -20.473 -20.975 -21.231 -21.979 -22.086 -22.402 -22.716 -23.434 -23.841 -24.264 -24.739 -25.27 -25.881 -26.763 -28.788 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt deleted file mode 100644 index 18d847ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13494 ,TETRA ,17591060,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:44:40 CET,0.0 1.64 2.308 2.873 3.318 3.737 4.12 4.472 5.14 5.448 5.744 5.843 6.554 6.799 7.276 7.751 8.216 8.445 8.896 9.324 9.93 10.333 10.732 11.309 11.864 12.402 12.922 13.43 14.092 14.735 15.379 16.156 16.903 17.648 18.515 19.489 20.445 21.51 22.656 23.911 25.262 26.812 28.667 30.522 32.71 35.207 38.175 41.709 45.975 51.209 57.947 63.705 67.177 69.481 71.057 72.162 72.942 73.505 73.873 74.177 74.35 74.448 74.515 74.538 74.501 74.43 74.345 74.252 74.145 74.012 73.861 73.721 73.567 73.38 73.223 73.057 72.873 72.68 72.473 72.317 72.149 71.91 71.736 71.537 71.433 71.201 70.927 70.615 70.442 69.889 69.875 69.656 69.413 68.859 68.56 68.219 67.815 67.318 66.692 65.841 63.354 -2 ,30697 ,TETRA ,17591061,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:44:16 CET,0.0 1.858 2.573 3.128 3.586 4.015 4.414 4.793 5.478 5.803 6.109 6.214 6.952 7.22 7.72 8.212 8.704 8.942 9.384 9.804 10.417 10.839 11.249 11.816 12.369 12.912 13.435 13.935 14.592 15.249 15.902 16.706 17.502 18.266 19.153 20.157 21.125 22.22 23.409 24.682 26.02 27.55 29.376 31.257 33.527 36.136 39.265 42.932 47.37 52.698 59.39 65.221 68.806 71.204 72.821 73.988 74.812 75.437 75.866 76.171 76.364 76.465 76.516 76.511 76.46 76.405 76.324 76.216 76.1 75.974 75.832 75.695 75.54 75.366 75.214 75.032 74.832 74.635 74.42 74.239 74.031 73.717 73.504 73.271 73.141 72.864 72.567 72.249 72.071 71.497 71.444 71.189 70.93 70.367 70.059 69.713 69.287 68.767 68.171 67.418 64.507 -3 ,30598 ,TETRA ,17591062,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:46:00 CET,0.0 2.261 3.019 3.591 4.067 4.493 4.885 5.234 5.887 6.202 6.512 6.642 7.359 7.626 8.167 8.686 9.164 9.39 9.845 10.29 10.921 11.331 11.734 12.326 12.896 13.452 13.983 14.501 15.186 15.84 16.464 17.236 18.021 18.793 19.685 20.737 21.766 22.851 24.0 25.259 26.641 28.194 30.021 31.923 34.211 36.814 39.857 43.403 47.673 53.021 59.93 65.88 69.546 71.993 73.679 74.864 75.664 76.249 76.662 76.957 77.108 77.232 77.323 77.34 77.315 77.258 77.174 77.084 76.98 76.829 76.643 76.485 76.307 76.12 75.964 75.797 75.623 75.408 75.181 75.019 74.833 74.554 74.353 74.103 73.963 73.686 73.392 73.062 72.887 72.316 72.275 72.028 71.75 71.137 70.8 70.431 70.023 69.529 68.855 67.954 65.125 -4 ,2822 ,TETRA ,17591063,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:43:02 CET,0.0 1.767 2.405 2.919 3.381 3.811 4.204 4.557 5.216 5.532 5.833 5.944 6.653 6.903 7.405 7.887 8.349 8.569 8.999 9.41 10.006 10.405 10.777 11.304 11.837 12.378 12.896 13.39 14.045 14.68 15.301 16.054 16.783 17.524 18.41 19.407 20.391 21.48 22.644 23.896 25.234 26.762 28.571 30.466 32.734 35.324 38.412 41.977 46.281 51.646 58.484 64.426 68.06 70.443 72.096 73.305 74.163 74.774 75.181 75.49 75.673 75.757 75.812 75.819 75.75 75.672 75.579 75.467 75.358 75.234 75.085 74.947 74.798 74.63 74.473 74.297 74.112 73.915 73.705 73.56 73.404 73.136 72.926 72.69 72.566 72.307 72.03 71.734 71.571 71.005 70.962 70.735 70.511 70.008 69.706 69.36 68.946 68.476 67.945 67.143 64.583 -5 ,15958 ,TETRA ,17591064,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:42:57 CET,0.0 2.419 3.197 3.757 4.263 4.709 5.09 5.444 6.09 6.387 6.688 6.8 7.516 7.771 8.249 8.707 9.156 9.382 9.816 10.234 10.848 11.249 11.649 12.217 12.764 13.304 13.826 14.336 15.018 15.681 16.313 17.061 17.783 18.507 19.36 20.324 21.279 22.367 23.542 24.8 26.152 27.686 29.498 31.349 33.541 36.107 39.206 42.773 47.087 52.3 59.031 65.046 68.643 71.071 72.755 73.849 74.593 75.151 75.521 75.81 75.985 76.097 76.191 76.205 76.155 76.112 76.027 75.91 75.794 75.64 75.467 75.324 75.16 74.978 74.817 74.64 74.448 74.241 74.01 73.846 73.681 73.402 73.188 72.917 72.787 72.537 72.217 71.86 71.689 71.148 71.191 70.978 70.727 70.138 69.821 69.498 69.119 68.676 68.104 67.189 63.485 -6 ,17229 ,TETRA ,17591065,Sat Nov 27 21:30:14 CET,Sat Nov 27 23:42:58 CET,0.0 1.636 2.38 2.955 3.463 3.894 4.27 4.611 5.263 5.562 5.834 5.949 6.681 6.953 7.467 7.943 8.395 8.613 9.053 9.487 10.092 10.483 10.873 11.453 12.025 12.584 13.13 13.648 14.303 14.944 15.576 16.366 17.151 17.903 18.755 19.725 20.715 21.824 23.005 24.264 25.593 27.134 28.976 30.827 33.032 35.62 38.71 42.236 46.47 51.808 58.732 64.686 68.251 70.549 72.127 73.279 74.105 74.693 75.085 75.399 75.592 75.714 75.766 75.75 75.696 75.618 75.523 75.415 75.307 75.182 75.034 74.894 74.723 74.535 74.38 74.208 74.028 73.833 73.618 73.461 73.284 72.996 72.786 72.558 72.445 72.2 71.906 71.592 71.426 70.866 70.855 70.633 70.378 69.802 69.496 69.185 68.827 68.336 67.687 66.855 64.119 -7 ,7951 ,TETRA ,17591066,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:45:34 CET,0.0 1.921 2.678 3.236 3.712 4.157 4.588 4.968 5.581 5.872 6.164 6.256 6.975 7.242 7.762 8.253 8.734 8.969 9.416 9.846 10.484 10.888 11.29 11.891 12.46 13.002 13.537 14.076 14.759 15.413 16.061 16.849 17.617 18.38 19.286 20.288 21.25 22.322 23.492 24.771 26.132 27.692 29.554 31.454 33.676 36.159 39.116 42.6 46.847 52.197 59.016 64.887 68.535 70.909 72.493 73.61 74.382 74.953 75.317 75.586 75.769 75.865 75.894 75.889 75.829 75.76 75.678 75.554 75.434 75.298 75.136 74.99 74.845 74.682 74.535 74.387 74.213 74.013 73.82 73.682 73.525 73.24 73.025 72.804 72.683 72.425 72.135 71.809 71.639 71.075 71.004 70.753 70.489 69.881 69.527 69.137 68.701 68.203 67.593 66.749 63.796 -8 ,30206 ,TETRA ,17591067,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:44:14 CET,0.0 1.751 2.498 3.049 3.491 3.896 4.28 4.629 5.274 5.581 5.871 5.983 6.692 6.943 7.462 7.97 8.444 8.673 9.118 9.549 10.17 10.561 10.941 11.515 12.076 12.615 13.141 13.666 14.35 15.002 15.65 16.436 17.189 17.932 18.825 19.842 20.806 21.863 22.998 24.237 25.627 27.243 29.114 31.021 33.323 35.972 39.11 42.714 47.057 52.403 59.147 65.067 68.695 71.026 72.579 73.697 74.503 75.113 75.542 75.833 75.992 76.088 76.149 76.18 76.17 76.139 76.073 75.989 75.907 75.803 75.674 75.531 75.378 75.202 75.026 74.852 74.673 74.473 74.243 74.074 73.892 73.589 73.371 73.157 73.037 72.733 72.429 72.138 71.975 71.416 71.373 71.149 70.924 70.343 70.015 69.674 69.261 68.781 68.241 67.42 65.06 -9 ,11399 ,TETRA ,17591068,Sat Nov 27 21:30:14 CET,Sat Nov 27 23:43:32 CET,0.0 1.692 2.415 2.99 3.467 3.893 4.277 4.633 5.282 5.583 5.872 5.981 6.702 6.964 7.454 7.918 8.358 8.574 9.008 9.423 10.039 10.421 10.792 11.372 11.947 12.503 13.029 13.536 14.189 14.825 15.457 16.238 17.007 17.766 18.644 19.615 20.535 21.579 22.751 24.027 25.401 26.946 28.791 30.709 33.025 35.631 38.662 42.263 46.596 51.848 58.512 64.311 67.828 70.179 71.766 72.868 73.645 74.174 74.56 74.885 75.067 75.19 75.258 75.259 75.223 75.157 75.051 74.95 74.847 74.694 74.527 74.401 74.262 74.103 73.968 73.789 73.589 73.388 73.159 72.983 72.8 72.494 72.272 72.037 71.905 71.643 71.361 71.019 70.836 70.266 70.201 69.97 69.74 69.195 68.86 68.488 68.087 67.648 67.092 66.261 63.925 -10 ,31862 ,TETRA ,17591069,Sat Nov 27 21:30:14 CET,Sat Nov 27 23:42:29 CET,0.0 1.708 2.439 3.051 3.527 3.934 4.33 4.688 5.324 5.62 5.916 6.034 6.746 6.994 7.486 7.973 8.437 8.663 9.114 9.553 10.169 10.563 10.953 11.532 12.093 12.643 13.176 13.688 14.36 15.019 15.668 16.447 17.214 17.979 18.874 19.898 20.903 22.012 23.225 24.503 25.867 27.45 29.315 31.179 33.367 35.914 38.938 42.5 46.876 52.235 58.994 64.783 68.24 70.484 72.043 73.174 73.968 74.527 74.912 75.226 75.397 75.484 75.529 75.519 75.471 75.381 75.227 75.083 74.956 74.787 74.591 74.432 74.253 74.033 73.862 73.685 73.481 73.238 72.96 72.783 72.603 72.27 72.033 71.819 71.697 71.404 71.102 70.771 70.593 70.042 70.024 69.8 69.546 69.003 68.697 68.333 67.933 67.472 66.83 65.847 63.043 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index 015390f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16930 ,TETRA ,17591070,Sat Nov 27 21:30:14 CET,Sat Nov 27 23:42:20 CET,0.0 1.259 1.869 2.355 2.776 3.171 3.535 3.888 4.568 4.876 5.161 5.224 5.966 6.219 6.71 7.188 7.655 7.88 8.322 8.75 9.36 9.762 10.164 10.763 11.352 11.922 12.468 13.002 13.707 14.392 15.061 15.889 16.698 17.48 18.397 19.481 20.535 21.702 22.995 24.371 25.841 27.544 29.601 31.755 34.308 37.27 40.877 45.132 50.326 56.892 65.518 73.245 78.178 81.627 84.145 86.048 87.462 88.581 89.413 90.135 90.706 91.129 91.455 91.732 91.937 92.091 92.23 92.319 92.366 92.395 92.434 92.453 92.426 92.378 92.334 92.285 92.238 92.176 92.085 92.011 91.934 91.792 91.688 91.571 91.506 91.356 91.183 90.987 90.884 90.405 90.549 90.417 90.285 89.908 89.673 89.426 89.165 88.845 88.456 87.835 85.623 -2 ,17396 ,TETRA ,17591071,Sat Nov 27 21:30:16 CET,Sat Nov 27 23:42:43 CET,0.0 1.535 2.218 2.677 3.1 3.483 3.827 4.136 4.709 4.993 5.278 5.327 6.07 6.324 6.812 7.303 7.779 8.009 8.446 8.869 9.499 9.898 10.282 10.848 11.404 11.95 12.495 13.049 13.757 14.425 15.088 15.906 16.703 17.483 18.423 19.49 20.512 21.673 22.938 24.3 25.793 27.523 29.587 31.75 34.333 37.291 40.875 45.109 50.333 56.859 65.398 73.149 78.023 81.457 83.98 85.899 87.305 88.392 89.206 89.883 90.407 90.826 91.172 91.462 91.716 91.929 92.097 92.219 92.31 92.358 92.377 92.391 92.401 92.383 92.354 92.312 92.247 92.174 92.086 92.03 91.985 91.888 91.8 91.695 91.638 91.516 91.368 91.193 91.093 90.604 90.759 90.639 90.495 90.143 89.949 89.723 89.456 89.161 88.779 88.282 86.312 -3 ,24202 ,TETRA ,17591072,Sat Nov 27 21:30:14 CET,Sat Nov 27 23:43:11 CET,0.0 1.257 1.876 2.369 2.792 3.188 3.56 3.91 4.558 4.866 5.162 5.235 5.97 6.232 6.743 7.22 7.692 7.916 8.343 8.772 9.397 9.801 10.202 10.79 11.365 11.909 12.442 12.988 13.703 14.388 15.07 15.918 16.729 17.517 18.453 19.52 20.569 21.771 23.094 24.483 25.957 27.688 29.766 31.899 34.484 37.479 41.091 45.41 50.728 57.219 65.685 73.512 78.539 82.0 84.515 86.458 87.863 88.977 89.84 90.585 91.118 91.507 91.827 92.104 92.313 92.464 92.612 92.709 92.751 92.763 92.756 92.75 92.736 92.684 92.63 92.551 92.448 92.351 92.237 92.15 92.059 91.894 91.77 91.64 91.564 91.399 91.232 91.031 90.918 90.422 90.513 90.362 90.189 89.752 89.518 89.264 88.991 88.674 88.246 87.595 85.262 -4 ,31824 ,TETRA ,17591073,Sat Nov 27 21:30:16 CET,Sat Nov 27 23:42:58 CET,0.0 1.21 1.796 2.303 2.764 3.144 3.494 3.82 4.423 4.706 4.97 5.012 5.747 5.998 6.494 6.969 7.427 7.653 8.096 8.521 9.14 9.549 9.944 10.516 11.071 11.606 12.139 12.674 13.364 14.036 14.681 15.478 16.272 17.044 17.96 19.006 20.026 21.163 22.407 23.794 25.318 27.052 29.099 31.211 33.767 36.716 40.252 44.453 49.592 55.998 64.465 72.19 77.152 80.639 83.15 85.05 86.449 87.524 88.378 89.151 89.703 90.11 90.453 90.73 90.94 91.086 91.204 91.286 91.336 91.363 91.359 91.338 91.313 91.275 91.252 91.226 91.174 91.097 91.011 90.941 90.849 90.699 90.573 90.43 90.365 90.219 90.026 89.812 89.703 89.199 89.278 89.113 88.931 88.483 88.259 88.014 87.738 87.4 86.974 86.445 84.165 -5 ,4484 ,TETRA ,17591074,Sat Nov 27 21:30:14 CET,Sat Nov 27 23:42:22 CET,0.0 1.519 2.214 2.744 3.242 3.686 4.056 4.392 5.026 5.313 5.586 5.617 6.357 6.619 7.125 7.611 8.083 8.308 8.761 9.205 9.83 10.226 10.619 11.217 11.806 12.375 12.916 13.462 14.172 14.831 15.481 16.278 17.049 17.821 18.744 19.8 20.833 21.97 23.208 24.561 26.078 27.854 29.932 32.072 34.641 37.595 41.146 45.347 50.419 56.775 65.244 72.993 78.008 81.517 84.109 86.041 87.371 88.405 89.247 90.013 90.586 91.018 91.356 91.631 91.872 92.043 92.17 92.257 92.316 92.375 92.422 92.426 92.37 92.3 92.275 92.228 92.151 92.066 91.956 91.872 91.786 91.655 91.545 91.407 91.327 91.136 90.917 90.676 90.548 90.037 90.143 89.991 89.823 89.394 89.156 88.895 88.598 88.233 87.778 87.243 85.73 -6 ,4157 ,TETRA ,17591075,Sat Nov 27 22:10:40 CET,Sun Nov 28 00:23:23 CET,0.0 1.048 1.623 2.083 2.505 2.894 3.237 3.588 4.242 4.528 4.799 4.836 5.571 5.822 6.302 6.762 7.224 7.449 7.87 8.279 8.892 9.3 9.697 10.284 10.855 11.39 11.906 12.416 13.099 13.79 14.468 15.292 16.102 16.898 17.82 18.881 19.945 21.133 22.455 23.879 25.392 27.167 29.275 31.421 34.036 37.059 40.65 44.925 50.146 56.671 65.361 73.165 78.152 81.557 84.035 85.914 87.276 88.382 89.222 89.934 90.466 90.888 91.223 91.484 91.717 91.897 92.034 92.141 92.214 92.253 92.287 92.294 92.247 92.19 92.165 92.139 92.094 92.022 91.91 91.833 91.759 91.607 91.485 91.344 91.272 91.128 90.953 90.744 90.626 90.119 90.222 90.086 89.951 89.627 89.428 89.199 88.961 88.67 88.313 87.774 86.289 -7 ,24712 ,TETRA ,17591076,Sat Nov 27 22:10:41 CET,Sun Nov 28 00:23:58 CET,0.0 1.329 1.977 2.496 2.942 3.347 3.724 4.079 4.693 5.002 5.305 5.367 6.114 6.378 6.891 7.378 7.844 8.07 8.513 8.943 9.568 9.978 10.384 10.983 11.554 12.111 12.666 13.201 13.889 14.565 15.235 16.055 16.868 17.667 18.588 19.628 20.658 21.819 23.115 24.527 26.024 27.77 29.837 31.959 34.556 37.537 41.097 45.324 50.555 57.098 65.645 73.469 78.516 82.014 84.452 86.292 87.72 88.828 89.641 90.366 90.942 91.405 91.75 92.008 92.224 92.378 92.497 92.587 92.644 92.674 92.666 92.652 92.643 92.613 92.574 92.525 92.479 92.429 92.343 92.262 92.172 92.011 91.875 91.734 91.661 91.501 91.339 91.156 91.048 90.561 90.709 90.562 90.402 90.01 89.782 89.558 89.323 89.02 88.586 87.978 86.315 -8 ,5259 ,TETRA ,17591077,Sat Nov 27 22:10:43 CET,Sun Nov 28 00:23:36 CET,0.0 1.361 2.002 2.508 2.934 3.328 3.712 4.056 4.677 4.984 5.28 5.366 6.131 6.411 6.926 7.396 7.848 8.072 8.509 8.94 9.561 9.966 10.372 10.953 11.529 12.094 12.634 13.169 13.87 14.541 15.202 16.036 16.859 17.652 18.58 19.64 20.677 21.83 23.085 24.475 25.984 27.704 29.747 31.888 34.512 37.53 41.172 45.499 50.741 57.22 65.787 73.572 78.531 82.002 84.558 86.495 87.961 89.111 89.941 90.663 91.203 91.595 91.913 92.163 92.348 92.501 92.636 92.737 92.802 92.846 92.882 92.9 92.891 92.862 92.835 92.795 92.732 92.662 92.573 92.493 92.405 92.267 92.147 91.996 91.918 91.762 91.593 91.391 91.276 90.769 90.861 90.685 90.511 90.153 89.955 89.717 89.427 89.048 88.591 87.978 86.426 -9 ,834 ,TETRA ,17591078,Sat Nov 27 22:10:45 CET,Sun Nov 28 00:23:45 CET,0.0 1.262 1.902 2.41 2.838 3.227 3.586 3.921 4.528 4.806 5.082 5.14 5.875 6.127 6.62 7.072 7.511 7.735 8.176 8.602 9.22 9.619 10.015 10.592 11.168 11.729 12.267 12.814 13.542 14.223 14.885 15.711 16.516 17.303 18.225 19.287 20.305 21.418 22.662 24.04 25.53 27.239 29.28 31.404 33.984 36.973 40.543 44.743 49.94 56.5 65.111 72.957 78.029 81.497 83.951 85.794 87.169 88.255 89.079 89.802 90.352 90.76 91.096 91.394 91.629 91.805 91.979 92.097 92.152 92.197 92.238 92.25 92.235 92.216 92.199 92.159 92.084 92.007 91.925 91.864 91.794 91.646 91.531 91.413 91.358 91.242 91.083 90.905 90.806 90.31 90.424 90.287 90.137 89.751 89.532 89.275 88.97 88.633 88.218 87.702 86.189 -10 ,3648 ,TETRA ,17591079,Sat Nov 27 22:10:41 CET,Sun Nov 28 00:15:58 CET,0.0 1.282 1.876 2.35 2.762 3.176 3.545 3.869 4.48 4.759 5.028 5.056 5.789 6.041 6.553 7.044 7.503 7.72 8.142 8.558 9.163 9.56 9.957 10.538 11.107 11.66 12.198 12.725 13.421 14.094 14.741 15.536 16.321 17.097 18.01 19.057 20.091 21.26 22.537 23.914 25.404 27.134 29.21 31.349 33.912 36.913 40.499 44.701 49.938 56.464 64.938 72.524 77.523 81.054 83.515 85.319 86.653 87.748 88.564 89.221 89.729 90.156 90.51 90.785 91.014 91.204 91.352 91.45 91.517 91.556 91.542 91.528 91.524 91.485 91.442 91.405 91.35 91.272 91.162 91.078 91.017 90.922 90.827 90.692 90.616 90.459 90.29 90.108 89.997 89.498 89.644 89.503 89.343 88.988 88.801 88.576 88.296 87.988 87.609 87.068 85.471 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_18639-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_18639-1.txt deleted file mode 100644 index 43eeed42..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_18639-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4263 ,KEBNE ,17026761,Wed Dec 22 15:09:00 CET,Wed Dec 22 16:58:46 CET,0.0 1.921 2.703 3.307 3.784 4.196 4.581 4.941 5.613 5.932 6.247 6.366 7.132 7.402 7.935 8.469 8.98 9.215 9.68 10.147 10.825 11.261 11.685 12.312 12.92 13.511 14.084 14.661 15.432 16.178 16.907 17.788 18.653 19.492 20.466 21.588 22.679 23.904 25.262 26.758 28.389 30.236 32.421 34.7 37.45 40.664 44.505 48.983 54.523 61.512 70.719 79.064 84.499 88.348 91.104 93.222 94.826 96.046 96.949 97.764 98.389 98.838 99.194 99.512 99.787 99.981 100.132 100.252 100.325 100.37 100.42 100.443 100.443 100.435 100.409 100.354 100.293 100.233 100.151 100.082 100.004 99.863 99.744 99.615 99.541 99.385 99.217 99.025 98.92 98.421 98.541 98.381 98.182 97.773 97.537 97.263 96.965 96.622 96.154 95.444 93.096 -2 ,76 ,KEBNE ,17026762,Wed Dec 22 15:09:01 CET,Wed Dec 22 16:59:15 CET,0.0 1.733 2.356 2.87 3.345 3.763 4.162 4.541 5.188 5.5 5.813 5.916 6.68 6.957 7.482 7.993 8.496 8.734 9.191 9.635 10.296 10.706 11.1 11.708 12.311 12.907 13.497 14.066 14.795 15.527 16.256 17.129 17.975 18.805 19.794 20.944 22.061 23.317 24.7 26.194 27.815 29.669 31.874 34.159 36.925 40.147 44.009 48.552 54.16 61.161 70.303 78.722 84.139 87.871 90.604 92.725 94.331 95.543 96.421 97.217 97.833 98.324 98.727 99.046 99.314 99.505 99.657 99.772 99.846 99.902 99.943 99.956 99.942 99.909 99.871 99.822 99.749 99.657 99.543 99.462 99.378 99.21 99.081 98.949 98.885 98.746 98.587 98.413 98.315 97.818 97.94 97.787 97.607 97.19 96.964 96.707 96.404 96.027 95.579 94.908 92.997 -3 ,31185 ,KEBNE ,17026763,Wed Dec 22 15:09:00 CET,Wed Dec 22 16:58:06 CET,0.0 1.378 2.067 2.62 3.085 3.475 3.842 4.191 4.858 5.164 5.454 5.538 6.279 6.53 7.03 7.529 8.035 8.279 8.744 9.2 9.862 10.285 10.704 11.335 11.946 12.539 13.123 13.694 14.429 15.139 15.845 16.725 17.59 18.438 19.427 20.559 21.672 22.903 24.265 25.752 27.355 29.214 31.404 33.679 36.411 39.574 43.358 47.815 53.362 60.318 69.654 78.188 83.64 87.432 90.174 92.276 93.848 95.091 96.045 96.893 97.532 98.018 98.431 98.783 99.051 99.246 99.411 99.514 99.593 99.67 99.728 99.768 99.78 99.758 99.743 99.706 99.633 99.546 99.444 99.368 99.286 99.144 99.038 98.898 98.816 98.665 98.495 98.302 98.199 97.719 97.889 97.744 97.562 97.11 96.856 96.56 96.236 95.893 95.381 94.703 92.384 -4 ,10378 ,KEBNE ,17026764,Wed Dec 22 15:09:01 CET,Wed Dec 22 16:58:35 CET,0.0 1.837 2.599 3.157 3.645 4.077 4.444 4.79 5.453 5.781 6.098 6.208 6.962 7.22 7.739 8.243 8.731 8.967 9.43 9.882 10.552 10.992 11.416 12.032 12.626 13.205 13.782 14.344 15.078 15.803 16.514 17.378 18.221 19.07 20.08 21.206 22.294 23.539 24.921 26.41 28.026 29.894 32.111 34.419 37.191 40.364 44.162 48.659 54.198 61.164 70.336 78.727 84.154 87.963 90.653 92.748 94.43 95.735 96.698 97.504 98.086 98.561 98.971 99.314 99.606 99.819 100.002 100.128 100.212 100.275 100.308 100.326 100.333 100.342 100.34 100.332 100.308 100.262 100.181 100.096 100.018 99.881 99.754 99.618 99.539 99.359 99.18 98.989 98.87 98.362 98.468 98.298 98.138 97.814 97.582 97.296 97.009 96.664 96.142 95.407 93.143 -5 ,19692 ,KEBNE ,17026765,Wed Dec 22 15:10:03 CET,Wed Dec 22 16:59:17 CET,0.0 1.79 2.434 2.939 3.409 3.811 4.163 4.482 5.103 5.411 5.711 5.817 6.568 6.834 7.342 7.84 8.331 8.564 9.023 9.482 10.158 10.584 11.002 11.615 12.22 12.816 13.383 13.939 14.665 15.378 16.093 16.963 17.81 18.647 19.616 20.727 21.843 23.105 24.493 25.983 27.575 29.423 31.637 33.935 36.681 39.837 43.682 48.22 53.766 60.683 69.737 78.067 83.511 87.324 90.111 92.229 93.766 94.998 95.927 96.718 97.328 97.793 98.178 98.493 98.753 98.978 99.157 99.26 99.339 99.415 99.484 99.531 99.55 99.526 99.486 99.439 99.37 99.28 99.186 99.11 99.019 98.882 98.789 98.665 98.591 98.447 98.292 98.086 97.962 97.446 97.543 97.402 97.247 96.856 96.617 96.365 96.045 95.604 95.068 94.358 91.938 -6 ,6239 ,KEBNE ,17026766,Wed Dec 22 15:10:03 CET,Wed Dec 22 17:00:14 CET,0.0 1.971 2.655 3.193 3.682 4.102 4.481 4.831 5.507 5.827 6.117 6.208 6.958 7.218 7.733 8.235 8.703 8.928 9.38 9.823 10.482 10.926 11.36 11.968 12.565 13.172 13.763 14.334 15.073 15.788 16.497 17.366 18.205 19.024 20.006 21.142 22.253 23.499 24.871 26.376 27.999 29.855 32.071 34.366 37.091 40.212 44.029 48.528 54.001 60.941 70.059 78.454 83.934 87.716 90.434 92.56 94.199 95.455 96.377 97.196 97.85 98.342 98.714 99.027 99.301 99.5 99.681 99.828 99.917 99.987 100.063 100.105 100.117 100.124 100.132 100.137 100.114 100.072 100.0 99.928 99.853 99.725 99.613 99.482 99.415 99.276 99.115 98.917 98.8 98.29 98.371 98.218 98.06 97.688 97.458 97.183 96.853 96.445 95.934 95.186 92.791 -7 ,12414 ,KEBNE ,17026767,Wed Dec 22 15:10:03 CET,Wed Dec 22 17:00:21 CET,0.0 1.911 2.622 3.173 3.675 4.111 4.507 4.905 5.676 6.021 6.342 6.482 7.263 7.562 8.128 8.668 9.191 9.439 9.92 10.378 11.039 11.479 11.922 12.592 13.254 13.891 14.519 15.134 15.913 16.661 17.377 18.245 19.119 19.984 20.981 22.124 23.25 24.516 25.899 27.409 29.038 30.907 33.172 35.506 38.284 41.469 45.238 49.692 55.288 62.337 71.518 79.802 85.137 88.887 91.6 93.682 95.302 96.582 97.527 98.333 98.901 99.345 99.731 100.052 100.317 100.503 100.646 100.748 100.818 100.866 100.863 100.84 100.808 100.758 100.712 100.647 100.559 100.468 100.376 100.297 100.205 100.031 99.906 99.785 99.72 99.581 99.404 99.193 99.082 98.585 98.685 98.517 98.347 97.946 97.638 97.32 96.985 96.602 96.134 95.466 93.447 -8 ,784 ,KEBNE ,17026768,Wed Dec 22 15:10:03 CET,Wed Dec 22 17:00:10 CET,0.0 1.265 1.903 2.457 2.959 3.385 3.759 4.126 4.824 5.144 5.462 5.574 6.349 6.635 7.159 7.659 8.156 8.395 8.855 9.313 9.985 10.428 10.873 11.496 12.091 12.692 13.292 13.86 14.585 15.305 16.009 16.89 17.764 18.596 19.565 20.681 21.79 23.034 24.404 25.897 27.482 29.302 31.498 33.794 36.568 39.797 43.639 48.162 53.725 60.719 70.008 78.356 83.805 87.639 90.348 92.421 94.018 95.258 96.174 96.993 97.592 98.028 98.394 98.679 98.899 99.072 99.237 99.359 99.438 99.511 99.566 99.577 99.568 99.542 99.511 99.47 99.398 99.315 99.236 99.178 99.089 98.913 98.796 98.675 98.61 98.443 98.247 98.036 97.917 97.419 97.57 97.439 97.28 96.9 96.679 96.4 96.094 95.716 95.216 94.582 91.855 -9 ,19555 ,KEBNE ,17026769,Wed Dec 22 15:10:07 CET,Wed Dec 22 16:53:00 CET,0.0 1.989 2.7 3.26 3.723 4.135 4.502 4.863 5.56 5.887 6.206 6.317 7.08 7.347 7.869 8.366 8.846 9.088 9.565 10.036 10.723 11.156 11.587 12.233 12.858 13.455 14.033 14.605 15.354 16.087 16.791 17.646 18.491 19.319 20.312 21.443 22.54 23.774 25.14 26.6 28.165 29.981 32.159 34.438 37.151 40.29 44.083 48.545 53.972 60.809 70.022 78.495 83.9 87.62 90.318 92.361 93.897 95.094 96.007 96.83 97.434 97.901 98.309 98.651 98.929 99.153 99.355 99.493 99.559 99.586 99.606 99.619 99.633 99.611 99.57 99.532 99.48 99.406 99.309 99.238 99.154 98.984 98.848 98.721 98.665 98.521 98.328 98.104 97.987 97.48 97.549 97.383 97.212 96.786 96.516 96.214 95.917 95.538 95.03 94.321 91.194 -10 ,5807 ,KEBNE ,17026770,Wed Dec 22 15:10:07 CET,Wed Dec 22 16:56:15 CET,0.0 1.717 2.397 2.919 3.37 3.769 4.143 4.505 5.192 5.518 5.83 5.968 6.738 7.018 7.589 8.139 8.643 8.882 9.345 9.804 10.477 10.915 11.354 11.998 12.607 13.183 13.755 14.332 15.092 15.847 16.578 17.451 18.312 19.158 20.141 21.262 22.368 23.625 24.998 26.506 28.143 29.989 32.188 34.46 37.167 40.308 44.12 48.63 54.199 61.212 70.436 78.892 84.41 88.24 91.017 93.173 94.774 96.005 96.968 97.831 98.468 98.947 99.36 99.727 100.026 100.217 100.376 100.506 100.579 100.619 100.637 100.651 100.667 100.664 100.626 100.586 100.544 100.465 100.382 100.323 100.24 100.096 99.986 99.873 99.813 99.656 99.482 99.283 99.167 98.671 98.803 98.658 98.506 98.155 97.956 97.734 97.438 97.076 96.573 95.793 92.976 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index e3ad037c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17260 ,TETRA ,17591080,Sat Nov 27 22:11:39 CET,Sun Nov 28 00:29:05 CET,0.0 0.894 1.365 1.793 2.158 2.455 2.701 2.931 3.383 3.574 3.761 3.766 4.322 4.476 4.755 5.02 5.289 5.425 5.659 5.877 6.183 6.373 6.57 6.855 7.117 7.375 7.625 7.868 8.181 8.468 8.733 9.073 9.398 9.679 9.999 10.378 10.728 11.096 11.494 11.906 12.338 12.802 13.3 13.767 14.288 14.835 15.349 15.831 16.28 16.527 16.293 15.407 14.411 13.405 12.424 11.508 10.661 9.863 9.167 8.497 7.918 7.381 6.858 6.371 5.914 5.46 4.981 4.574 4.223 3.842 3.435 3.088 2.738 2.369 2.068 1.755 1.436 1.118 0.767 0.514 0.267 -0.115 -0.378 -0.663 -0.82 -1.118 -1.44 -1.796 -1.973 -2.55 -2.598 -2.827 -3.072 -3.607 -3.884 -4.157 -4.467 -4.854 -5.358 -6.03 -8.116 -2 ,4350 ,TETRA ,17591081,Sat Nov 27 22:11:41 CET,Sun Nov 28 00:28:00 CET,0.0 1.532 2.074 2.5 2.881 3.215 3.501 3.764 4.228 4.44 4.625 4.583 5.142 5.318 5.644 5.937 6.209 6.344 6.602 6.834 7.171 7.385 7.592 7.898 8.177 8.449 8.717 8.952 9.231 9.5 9.766 10.081 10.377 10.659 11.0 11.386 11.724 12.088 12.485 12.884 13.29 13.74 14.237 14.69 15.203 15.736 16.241 16.74 17.161 17.388 17.212 16.365 15.307 14.243 13.263 12.307 11.424 10.643 9.961 9.245 8.593 8.028 7.52 6.993 6.478 6.026 5.552 5.12 4.748 4.356 3.948 3.628 3.289 2.916 2.631 2.336 2.025 1.71 1.391 1.174 0.939 0.55 0.268 -0.015 -0.158 -0.461 -0.79 -1.14 -1.311 -1.862 -1.856 -2.066 -2.293 -2.746 -2.99 -3.263 -3.578 -4.015 -4.558 -5.177 -7.064 -3 ,548 ,TETRA ,17591082,Sat Nov 27 22:11:43 CET,Sun Nov 28 00:26:23 CET,0.0 1.655 2.241 2.688 3.06 3.37 3.645 3.91 4.381 4.6 4.808 4.829 5.392 5.564 5.892 6.219 6.517 6.662 6.944 7.212 7.588 7.812 8.031 8.335 8.615 8.888 9.143 9.376 9.655 9.945 10.25 10.596 10.917 11.216 11.553 11.967 12.35 12.709 13.085 13.487 13.904 14.342 14.817 15.298 15.828 16.361 16.888 17.383 17.837 18.056 17.801 16.916 15.887 14.835 13.815 12.873 12.003 11.19 10.484 9.772 9.157 8.583 8.012 7.442 6.917 6.426 5.912 5.476 5.089 4.687 4.266 3.908 3.544 3.179 2.883 2.556 2.226 1.896 1.525 1.273 1.026 0.627 0.344 0.052 -0.105 -0.444 -0.809 -1.182 -1.375 -1.965 -2.003 -2.214 -2.438 -2.939 -3.226 -3.548 -3.912 -4.352 -4.869 -5.55 -7.163 -4 ,17911 ,TETRA ,17591083,Sat Nov 27 22:11:44 CET,Sun Nov 28 00:26:16 CET,0.0 1.81 2.34 2.715 3.022 3.323 3.588 3.825 4.285 4.509 4.714 4.713 5.266 5.412 5.704 6.002 6.28 6.408 6.633 6.855 7.205 7.425 7.633 7.917 8.19 8.454 8.693 8.927 9.239 9.539 9.823 10.162 10.464 10.732 11.062 11.443 11.796 12.193 12.629 13.054 13.485 13.961 14.473 14.976 15.515 16.07 16.647 17.173 17.609 17.856 17.668 16.841 15.809 14.802 13.829 12.822 11.902 11.081 10.386 9.69 9.049 8.445 7.867 7.313 6.793 6.336 5.851 5.396 5.007 4.622 4.223 3.886 3.529 3.145 2.847 2.544 2.231 1.912 1.574 1.331 1.086 0.705 0.435 0.15 -0.003 -0.33 -0.697 -1.08 -1.264 -1.835 -1.886 -2.123 -2.36 -2.872 -3.142 -3.432 -3.771 -4.148 -4.578 -5.159 -6.792 -5 ,26532 ,TETRA ,17591084,Sat Nov 27 22:11:40 CET,Sun Nov 28 00:29:22 CET,0.0 1.223 1.802 2.251 2.626 2.974 3.276 3.544 4.043 4.278 4.497 4.501 5.05 5.21 5.523 5.831 6.118 6.249 6.499 6.754 7.115 7.342 7.561 7.858 8.143 8.414 8.679 8.935 9.247 9.547 9.842 10.201 10.533 10.829 11.157 11.536 11.889 12.247 12.613 13.02 13.447 13.869 14.343 14.827 15.347 15.867 16.412 16.917 17.287 17.443 17.139 16.243 15.183 14.127 13.173 12.275 11.443 10.664 9.971 9.275 8.674 8.112 7.568 7.07 6.591 6.145 5.673 5.248 4.886 4.508 4.104 3.754 3.396 3.029 2.727 2.423 2.116 1.79 1.455 1.214 0.958 0.544 0.263 -0.022 -0.175 -0.486 -0.814 -1.168 -1.345 -1.897 -1.902 -2.134 -2.361 -2.837 -3.115 -3.432 -3.77 -4.124 -4.595 -5.282 -6.943 -6 ,29978 ,TETRA ,17591085,Sat Nov 27 22:11:43 CET,Sun Nov 28 00:29:14 CET,0.0 1.853 2.5 2.96 3.379 3.759 4.067 4.312 4.77 4.98 5.177 5.172 5.733 5.892 6.18 6.466 6.746 6.882 7.143 7.378 7.681 7.894 8.113 8.41 8.681 8.944 9.206 9.461 9.782 10.083 10.369 10.697 11.003 11.3 11.629 11.983 12.335 12.731 13.128 13.499 13.865 14.278 14.748 15.202 15.693 16.176 16.672 17.185 17.623 17.88 17.705 16.795 15.678 14.581 13.602 12.726 11.935 11.179 10.499 9.814 9.221 8.653 8.097 7.589 7.115 6.682 6.214 5.771 5.383 4.994 4.593 4.257 3.891 3.496 3.204 2.911 2.598 2.257 1.901 1.655 1.392 0.959 0.662 0.375 0.228 -0.079 -0.404 -0.75 -0.933 -1.508 -1.521 -1.723 -1.938 -2.435 -2.715 -3.037 -3.396 -3.763 -4.189 -4.758 -6.734 -7 ,30859 ,TETRA ,17591086,Sat Nov 27 22:11:45 CET,Sun Nov 28 00:25:12 CET,0.0 1.591 2.161 2.584 2.931 3.264 3.568 3.818 4.244 4.429 4.61 4.587 5.134 5.293 5.599 5.875 6.152 6.289 6.548 6.799 7.168 7.401 7.612 7.895 8.167 8.446 8.728 8.99 9.322 9.631 9.896 10.215 10.525 10.828 11.173 11.524 11.871 12.267 12.671 13.075 13.482 13.904 14.379 14.861 15.402 15.944 16.471 16.979 17.412 17.604 17.351 16.439 15.342 14.301 13.323 12.38 11.555 10.801 10.099 9.363 8.713 8.125 7.578 7.065 6.587 6.14 5.664 5.244 4.88 4.495 4.089 3.751 3.399 3.033 2.754 2.456 2.148 1.823 1.465 1.208 0.943 0.544 0.267 -0.019 -0.164 -0.476 -0.803 -1.141 -1.307 -1.867 -1.881 -2.084 -2.302 -2.816 -3.109 -3.409 -3.745 -4.128 -4.609 -5.235 -7.3 -8 ,22065 ,TETRA ,17591087,Sat Nov 27 22:11:41 CET,Sun Nov 28 00:24:53 CET,0.0 1.643 2.219 2.716 3.118 3.459 3.761 4.04 4.537 4.758 4.969 4.965 5.515 5.672 5.977 6.258 6.519 6.644 6.887 7.113 7.436 7.651 7.858 8.152 8.432 8.7 8.947 9.195 9.516 9.815 10.104 10.462 10.783 11.073 11.42 11.806 12.141 12.489 12.871 13.251 13.634 14.088 14.612 15.095 15.613 16.137 16.675 17.187 17.618 17.838 17.633 16.815 15.799 14.72 13.673 12.725 11.884 11.115 10.434 9.727 9.123 8.579 8.03 7.508 7.033 6.581 6.096 5.681 5.318 4.939 4.551 4.213 3.848 3.474 3.196 2.894 2.58 2.249 1.885 1.642 1.399 1.01 0.731 0.441 0.285 -0.034 -0.37 -0.742 -0.95 -1.544 -1.566 -1.781 -1.998 -2.474 -2.75 -3.066 -3.443 -3.862 -4.313 -4.917 -6.488 -9 ,15229 ,TETRA ,17591088,Sat Nov 27 22:11:41 CET,Sun Nov 28 00:23:33 CET,0.0 1.735 2.391 2.854 3.238 3.559 3.802 4.032 4.494 4.703 4.919 4.95 5.509 5.678 5.996 6.292 6.57 6.71 6.976 7.21 7.533 7.735 7.936 8.239 8.519 8.776 9.023 9.263 9.569 9.86 10.143 10.491 10.82 11.124 11.459 11.843 12.219 12.607 13.009 13.4 13.796 14.26 14.769 15.253 15.771 16.291 16.838 17.348 17.788 18.068 17.904 17.016 15.978 14.978 13.985 13.047 12.207 11.379 10.652 9.945 9.345 8.807 8.28 7.763 7.285 6.841 6.339 5.897 5.524 5.142 4.748 4.402 4.048 3.69 3.407 3.111 2.805 2.509 2.201 1.978 1.745 1.358 1.068 0.778 0.639 0.341 0.004 -0.349 -0.528 -1.092 -1.12 -1.331 -1.542 -2.033 -2.327 -2.636 -2.999 -3.395 -3.804 -4.386 -5.796 -10 ,10817 ,TETRA ,17591089,Sat Nov 27 22:11:41 CET,Sun Nov 28 00:27:48 CET,0.0 2.039 2.569 2.959 3.298 3.646 3.975 4.251 4.741 4.94 5.121 5.106 5.655 5.823 6.125 6.411 6.685 6.814 7.057 7.288 7.635 7.847 8.043 8.318 8.578 8.843 9.091 9.329 9.639 9.936 10.203 10.505 10.802 11.085 11.416 11.79 12.146 12.513 12.877 13.262 13.658 14.092 14.61 15.075 15.572 16.098 16.585 17.024 17.432 17.666 17.418 16.514 15.483 14.452 13.453 12.498 11.63 10.831 10.129 9.413 8.769 8.182 7.605 7.065 6.586 6.137 5.655 5.234 4.871 4.47 4.046 3.706 3.349 2.982 2.685 2.378 2.071 1.744 1.411 1.175 0.919 0.528 0.252 -0.049 -0.202 -0.523 -0.861 -1.212 -1.393 -1.96 -1.97 -2.183 -2.408 -2.901 -3.178 -3.479 -3.8 -4.18 -4.633 -5.24 -6.849 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index bc13957a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18746 ,TETRA ,17591090,Sat Nov 27 22:12:42 CET,Sun Nov 28 00:26:26 CET,0.0 1.399 2.023 2.523 2.958 3.371 3.78 4.141 4.791 5.091 5.377 5.439 6.185 6.443 6.944 7.422 7.875 8.107 8.557 8.977 9.593 9.994 10.404 11.012 11.585 12.149 12.717 13.281 14.006 14.719 15.434 16.302 17.154 18.004 19.009 20.139 21.24 22.473 23.83 25.295 26.872 28.72 30.943 33.227 35.978 39.197 43.071 47.737 53.507 60.687 70.17 78.738 84.304 88.14 90.859 92.914 94.448 95.669 96.599 97.415 98.025 98.498 98.902 99.241 99.493 99.684 99.836 99.941 100.008 100.038 100.055 100.066 100.066 100.057 100.035 99.978 99.919 99.853 99.738 99.648 99.548 99.383 99.258 99.104 99.016 98.828 98.631 98.407 98.286 97.765 97.853 97.699 97.497 97.011 96.755 96.477 96.145 95.734 95.203 94.457 91.652 -2 ,12628 ,TETRA ,17591091,Sat Nov 27 22:12:43 CET,Sun Nov 28 00:29:05 CET,0.0 1.76 2.469 3.006 3.438 3.811 4.175 4.533 5.199 5.508 5.804 5.862 6.625 6.895 7.384 7.854 8.324 8.55 8.996 9.444 10.091 10.509 10.917 11.512 12.112 12.715 13.297 13.871 14.636 15.374 16.092 16.963 17.786 18.592 19.549 20.636 21.703 22.897 24.222 25.682 27.238 29.03 31.198 33.461 36.214 39.399 43.193 47.645 53.175 60.136 69.242 77.432 82.701 86.413 89.118 91.131 92.497 93.483 94.228 94.841 95.279 95.593 95.814 95.969 96.085 96.171 96.208 96.201 96.168 96.1 95.978 95.874 95.775 95.674 95.611 95.538 95.459 95.351 95.195 95.086 94.965 94.756 94.618 94.48 94.406 94.246 94.048 93.811 93.691 93.183 93.251 93.071 92.859 92.316 92.03 91.761 91.452 91.093 90.62 89.769 87.47 -3 ,24345 ,TETRA ,17591092,Sat Nov 27 22:12:42 CET,Sun Nov 28 00:25:59 CET,0.0 1.653 2.32 2.851 3.389 3.867 4.25 4.597 5.238 5.531 5.814 5.876 6.623 6.885 7.4 7.895 8.371 8.606 9.067 9.514 10.156 10.587 11.014 11.618 12.206 12.78 13.346 13.907 14.63 15.338 16.036 16.9 17.749 18.574 19.55 20.672 21.776 22.997 24.328 25.788 27.378 29.186 31.359 33.628 36.331 39.498 43.31 47.747 53.224 60.133 69.157 77.282 82.476 86.15 88.763 90.704 92.152 93.267 94.065 94.749 95.281 95.666 95.924 96.118 96.295 96.45 96.579 96.656 96.731 96.773 96.762 96.747 96.729 96.683 96.627 96.572 96.491 96.399 96.283 96.196 96.119 95.968 95.833 95.677 95.598 95.445 95.249 94.968 94.82 94.302 94.374 94.183 93.969 93.517 93.287 93.021 92.676 92.29 91.822 91.113 88.414 -4 ,23952 ,TETRA ,17591093,Sat Nov 27 22:12:42 CET,Sun Nov 28 00:24:00 CET,0.0 1.623 2.229 2.736 3.167 3.562 3.937 4.279 4.893 5.185 5.475 5.546 6.307 6.568 7.079 7.585 8.062 8.295 8.745 9.18 9.828 10.248 10.644 11.226 11.823 12.415 12.99 13.556 14.29 15.004 15.706 16.558 17.383 18.202 19.182 20.318 21.429 22.657 24.008 25.479 27.075 28.943 31.164 33.443 36.176 39.325 43.099 47.518 53.027 60.004 69.16 77.581 82.868 86.462 89.068 91.038 92.46 93.537 94.356 95.049 95.531 95.901 96.208 96.449 96.656 96.824 96.951 97.021 97.074 97.114 97.135 97.145 97.14 97.114 97.068 97.016 96.962 96.882 96.761 96.669 96.567 96.366 96.223 96.041 95.935 95.732 95.513 95.283 95.167 94.656 94.708 94.517 94.318 93.895 93.634 93.358 93.025 92.594 92.102 91.303 88.343 -5 ,27812 ,TETRA ,17591094,Sat Nov 27 22:12:42 CET,Sun Nov 28 00:27:24 CET,0.0 1.946 2.612 3.092 3.517 3.917 4.308 4.686 5.361 5.659 5.958 6.053 6.824 7.111 7.653 8.151 8.621 8.844 9.273 9.698 10.345 10.772 11.191 11.811 12.408 12.991 13.57 14.133 14.86 15.586 16.304 17.176 18.027 18.874 19.878 20.98 22.015 23.199 24.538 26.045 27.703 29.582 31.853 34.2 36.967 40.116 43.966 48.594 54.316 61.449 70.8 79.291 84.726 88.487 91.211 93.319 94.876 96.114 97.055 97.895 98.511 98.955 99.314 99.601 99.813 99.968 100.133 100.248 100.314 100.349 100.351 100.345 100.322 100.302 100.29 100.261 100.214 100.162 100.085 100.01 99.922 99.774 99.661 99.506 99.424 99.269 99.084 98.855 98.732 98.23 98.292 98.122 97.957 97.544 97.281 96.972 96.621 96.199 95.599 94.781 92.506 -6 ,9697 ,TETRA ,17591095,Sat Nov 27 22:12:42 CET,Sun Nov 28 00:29:51 CET,0.0 1.762 2.405 2.897 3.343 3.746 4.135 4.495 5.111 5.404 5.695 5.776 6.529 6.78 7.287 7.787 8.262 8.493 8.948 9.395 10.041 10.459 10.868 11.462 12.046 12.622 13.18 13.722 14.441 15.157 15.856 16.704 17.545 18.369 19.338 20.471 21.591 22.832 24.204 25.719 27.344 29.213 31.479 33.804 36.573 39.771 43.613 48.177 53.776 60.745 69.903 78.261 83.633 87.315 89.954 91.94 93.421 94.589 95.503 96.317 96.87 97.276 97.635 97.94 98.169 98.341 98.497 98.614 98.673 98.697 98.706 98.69 98.653 98.608 98.565 98.504 98.418 98.303 98.172 98.084 97.992 97.824 97.691 97.532 97.439 97.243 97.027 96.781 96.652 96.135 96.193 96.027 95.851 95.425 95.182 94.885 94.51 94.077 93.532 92.787 90.607 -7 ,13591 ,TETRA ,17591096,Sat Nov 27 22:12:42 CET,Sun Nov 28 00:19:00 CET,0.0 1.423 2.037 2.51 2.937 3.336 3.674 4.004 4.674 4.992 5.292 5.364 6.134 6.395 6.912 7.423 7.919 8.164 8.641 9.096 9.758 10.18 10.588 11.216 11.827 12.413 13.001 13.575 14.323 15.046 15.747 16.622 17.486 18.32 19.299 20.43 21.536 22.77 24.144 25.648 27.278 29.158 31.391 33.693 36.444 39.657 43.549 48.145 53.854 61.041 70.354 78.909 84.478 88.324 91.148 93.312 94.952 96.265 97.243 98.093 98.735 99.219 99.607 99.923 100.185 100.395 100.568 100.699 100.785 100.833 100.852 100.856 100.839 100.788 100.746 100.688 100.616 100.545 100.448 100.368 100.27 100.1 99.967 99.808 99.726 99.562 99.385 99.179 99.06 98.563 98.713 98.563 98.382 97.978 97.756 97.519 97.221 96.867 96.395 95.671 93.242 -8 ,19677 ,TETRA ,17591097,Sat Nov 27 22:13:39 CET,Sun Nov 28 00:27:23 CET,0.0 1.834 2.52 3.029 3.465 3.855 4.234 4.605 5.307 5.624 5.916 6.002 6.762 7.024 7.534 8.014 8.471 8.702 9.16 9.606 10.259 10.685 11.102 11.713 12.311 12.905 13.499 14.079 14.845 15.588 16.304 17.181 18.038 18.889 19.893 21.045 22.158 23.38 24.753 26.257 27.855 29.699 31.939 34.26 37.013 40.216 44.081 48.633 54.24 61.314 70.639 79.198 84.706 88.442 91.077 93.081 94.563 95.658 96.459 97.131 97.586 97.888 98.13 98.313 98.458 98.596 98.727 98.802 98.806 98.782 98.743 98.681 98.628 98.575 98.502 98.404 98.271 98.136 97.98 97.838 97.691 97.465 97.273 97.067 96.968 96.765 96.555 96.308 96.181 95.679 95.776 95.618 95.418 94.975 94.718 94.436 94.132 93.744 93.236 92.484 90.226 -9 ,12278 ,TETRA ,17591098,Sat Nov 27 22:13:38 CET,Sun Nov 28 00:27:22 CET,0.0 1.769 2.361 2.862 3.34 3.775 4.153 4.503 5.131 5.417 5.695 5.777 6.542 6.805 7.319 7.824 8.292 8.511 8.945 9.384 10.045 10.474 10.884 11.486 12.076 12.645 13.201 13.752 14.478 15.2 15.897 16.745 17.585 18.405 19.373 20.482 21.582 22.823 24.188 25.667 27.262 29.141 31.37 33.653 36.42 39.627 43.457 47.938 53.458 60.338 69.402 77.853 83.258 87.011 89.69 91.65 93.075 94.176 94.977 95.662 96.157 96.524 96.846 97.138 97.379 97.554 97.72 97.842 97.916 97.98 98.025 98.033 98.033 98.028 98.0 97.939 97.843 97.733 97.628 97.547 97.447 97.27 97.151 96.999 96.909 96.732 96.532 96.283 96.146 95.638 95.707 95.526 95.337 94.913 94.663 94.359 93.961 93.548 93.078 92.373 89.974 -10 ,8795 ,TETRA ,17591099,Sat Nov 27 22:14:39 CET,Sun Nov 28 00:31:03 CET,0.0 1.633 2.253 2.76 3.211 3.621 4.008 4.358 4.999 5.307 5.593 5.649 6.41 6.683 7.227 7.737 8.219 8.449 8.893 9.332 9.987 10.411 10.821 11.436 12.044 12.633 13.222 13.797 14.536 15.261 15.977 16.858 17.729 18.578 19.564 20.691 21.802 23.055 24.419 25.916 27.539 29.371 31.573 33.892 36.657 39.81 43.619 48.161 53.789 60.878 70.236 78.719 84.059 87.753 90.392 92.355 93.803 94.902 95.666 96.322 96.802 97.197 97.576 97.886 98.093 98.264 98.447 98.556 98.618 98.657 98.687 98.702 98.694 98.654 98.6 98.546 98.477 98.374 98.252 98.157 98.038 97.833 97.681 97.518 97.431 97.244 97.037 96.807 96.681 96.165 96.218 96.018 95.824 95.341 95.021 94.684 94.339 93.915 93.37 92.657 90.291 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt deleted file mode 100644 index 1be3c543..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16158 ,TETRA ,17591100,Sat Nov 27 22:14:40 CET,Sun Nov 28 00:29:19 CET,0.0 1.308 1.904 2.354 2.688 2.975 3.252 3.521 3.967 4.161 4.356 4.23 4.895 5.071 5.386 5.672 5.942 6.084 6.361 6.624 6.997 7.229 7.455 7.784 8.092 8.38 8.67 8.95 9.315 9.67 10.011 10.423 10.807 11.165 11.591 12.077 12.516 12.98 13.479 14.009 14.554 15.156 15.851 16.521 17.293 18.123 19.005 19.956 20.988 22.011 22.803 22.984 22.792 22.36 21.846 21.277 20.667 20.073 19.526 18.922 18.368 17.862 17.377 16.907 16.443 16.007 15.519 15.063 14.658 14.225 13.793 13.417 13.009 12.592 12.277 11.974 11.677 11.378 11.071 10.854 10.615 10.208 9.914 9.58 9.39 8.999 8.598 8.162 7.939 7.225 7.205 6.95 6.677 6.101 5.799 5.468 5.109 4.698 4.208 3.571 1.686 -2 ,15817 ,TETRA ,17591101,Sat Nov 27 22:14:40 CET,Sun Nov 28 00:30:59 CET,0.0 1.605 2.137 2.551 2.913 3.231 3.508 3.767 4.245 4.463 4.663 4.567 5.236 5.405 5.726 6.029 6.319 6.456 6.72 6.981 7.357 7.595 7.817 8.136 8.453 8.762 9.057 9.334 9.688 10.036 10.359 10.746 11.126 11.479 11.893 12.35 12.763 13.216 13.709 14.21 14.727 15.329 16.02 16.685 17.424 18.213 19.103 20.046 21.051 22.012 22.834 23.022 22.588 21.984 21.412 20.754 20.059 19.408 18.82 18.206 17.681 17.185 16.728 16.339 15.961 15.596 15.213 14.858 14.547 14.217 13.836 13.501 13.15 12.805 12.536 12.244 11.926 11.597 11.268 11.042 10.816 10.443 10.181 9.922 9.776 9.458 9.137 8.787 8.601 7.922 8.001 7.771 7.513 6.944 6.644 6.314 5.946 5.578 5.145 4.521 2.769 -3 ,23460 ,TETRA ,17591102,Sat Nov 27 22:14:40 CET,Sun Nov 28 00:29:49 CET,0.0 1.654 2.237 2.65 2.99 3.27 3.548 3.825 4.279 4.469 4.655 4.552 5.221 5.395 5.724 6.03 6.327 6.468 6.751 7.034 7.407 7.647 7.888 8.224 8.545 8.857 9.146 9.411 9.752 10.07 10.379 10.771 11.146 11.5 11.9 12.35 12.785 13.259 13.772 14.306 14.836 15.417 16.099 16.747 17.461 18.235 19.099 20.058 21.092 22.1 23.022 23.374 23.21 22.845 22.379 21.893 21.394 20.873 20.412 19.939 19.516 19.127 18.744 18.356 17.975 17.607 17.21 16.866 16.57 16.249 15.897 15.592 15.281 14.962 14.704 14.439 14.157 13.862 13.55 13.325 13.101 12.757 12.506 12.242 12.102 11.806 11.48 11.122 10.926 10.248 10.327 10.117 9.895 9.41 9.145 8.862 8.56 8.219 7.789 7.206 5.23 -4 ,28544 ,TETRA ,17591103,Sat Nov 27 22:14:40 CET,Sun Nov 28 00:29:13 CET,0.0 1.443 1.937 2.334 2.703 3.062 3.387 3.679 4.16 4.386 4.6 4.479 5.143 5.309 5.628 5.925 6.225 6.368 6.618 6.873 7.259 7.499 7.733 8.053 8.346 8.637 8.92 9.187 9.526 9.857 10.177 10.56 10.93 11.287 11.686 12.116 12.533 12.993 13.502 14.047 14.598 15.194 15.875 16.542 17.269 18.062 18.963 19.922 20.981 22.076 22.939 23.106 22.76 22.264 21.75 21.189 20.637 20.065 19.541 18.989 18.48 17.99 17.503 17.049 16.601 16.188 15.76 15.361 15.003 14.626 14.223 13.867 13.477 13.061 12.754 12.442 12.104 11.743 11.351 11.076 10.792 10.352 10.051 9.736 9.57 9.223 8.861 8.466 8.258 7.561 7.56 7.304 7.043 6.468 6.144 5.78 5.362 4.89 4.397 3.716 1.697 -5 ,20533 ,TETRA ,17591104,Sat Nov 27 22:15:21 CET,Sun Nov 28 00:31:11 CET,0.0 1.667 2.274 2.711 3.098 3.451 3.759 4.034 4.528 4.745 4.957 4.894 5.594 5.8 6.169 6.509 6.826 6.969 7.233 7.496 7.896 8.152 8.389 8.74 9.086 9.407 9.698 9.977 10.355 10.719 11.054 11.464 11.869 12.245 12.663 13.12 13.573 14.079 14.61 15.163 15.725 16.33 17.049 17.763 18.533 19.358 20.295 21.272 22.343 23.488 24.435 24.668 24.451 23.946 23.315 22.691 22.061 21.435 20.919 20.385 19.875 19.385 18.893 18.404 17.927 17.465 16.975 16.552 16.187 15.798 15.376 15.014 14.626 14.218 13.89 13.553 13.206 12.852 12.489 12.236 11.963 11.506 11.198 10.884 10.709 10.317 9.919 9.503 9.284 8.585 8.604 8.347 8.064 7.382 7.004 6.599 6.166 5.714 5.175 4.345 2.047 -6 ,14999 ,TETRA ,17591105,Sat Nov 27 22:15:21 CET,Sun Nov 28 00:33:26 CET,0.0 1.548 2.096 2.553 2.953 3.301 3.608 3.881 4.375 4.604 4.821 4.747 5.424 5.596 5.932 6.253 6.562 6.708 6.982 7.243 7.626 7.877 8.108 8.437 8.751 9.042 9.331 9.604 9.94 10.273 10.614 11.025 11.399 11.756 12.18 12.651 13.109 13.603 14.109 14.647 15.2 15.823 16.572 17.295 18.09 18.975 19.966 21.036 22.209 23.389 24.515 25.063 25.02 24.756 24.395 23.97 23.506 23.04 22.627 22.165 21.752 21.37 20.974 20.604 20.244 19.898 19.52 19.16 18.843 18.503 18.147 17.859 17.544 17.202 16.92 16.61 16.293 15.983 15.68 15.47 15.235 14.861 14.61 14.349 14.213 13.925 13.624 13.295 13.105 12.423 12.493 12.289 12.066 11.545 11.26 10.951 10.597 10.193 9.719 9.122 7.511 -7 ,11774 ,TETRA ,17591106,Sat Nov 27 22:14:41 CET,Sun Nov 28 00:30:12 CET,0.0 1.298 1.903 2.351 2.702 3.029 3.335 3.596 4.081 4.314 4.535 4.445 5.123 5.316 5.691 6.024 6.321 6.461 6.738 7.006 7.384 7.62 7.842 8.162 8.475 8.782 9.076 9.366 9.744 10.095 10.422 10.818 11.195 11.542 11.94 12.377 12.795 13.276 13.798 14.341 14.889 15.48 16.158 16.85 17.617 18.456 19.403 20.374 21.383 22.413 23.318 23.47 23.114 22.529 21.86 21.201 20.537 19.858 19.233 18.619 18.14 17.698 17.225 16.787 16.372 15.976 15.564 15.172 14.815 14.453 14.082 13.753 13.419 13.083 12.825 12.556 12.262 11.935 11.573 11.328 11.079 10.68 10.416 10.149 9.999 9.671 9.333 8.966 8.766 8.07 8.121 7.9 7.667 7.109 6.755 6.344 5.909 5.416 4.809 4.036 1.957 -8 ,21165 ,TETRA ,17591107,Sat Nov 27 22:14:43 CET,Sun Nov 28 00:30:45 CET,0.0 1.953 2.549 2.975 3.341 3.692 3.987 4.241 4.712 4.922 5.117 5.024 5.702 5.876 6.224 6.556 6.856 6.996 7.258 7.526 7.924 8.169 8.392 8.698 8.995 9.277 9.548 9.822 10.18 10.511 10.848 11.26 11.644 12.005 12.412 12.874 13.309 13.809 14.341 14.889 15.478 16.121 16.865 17.593 18.416 19.312 20.327 21.41 22.532 23.664 24.807 25.363 25.312 25.02 24.602 24.148 23.618 23.064 22.59 22.097 21.653 21.212 20.769 20.343 19.938 19.555 19.133 18.753 18.423 18.089 17.734 17.42 17.082 16.714 16.424 16.133 15.834 15.509 15.139 14.881 14.628 14.227 13.93 13.614 13.452 13.119 12.774 12.415 12.22 11.527 11.585 11.351 11.117 10.63 10.344 10.025 9.658 9.243 8.73 7.829 5.158 -9 ,8930 ,TETRA ,17591108,Sat Nov 27 22:14:47 CET,Sun Nov 28 00:31:08 CET,0.0 1.463 2.001 2.429 2.764 3.067 3.359 3.633 4.132 4.361 4.572 4.461 5.135 5.309 5.634 5.941 6.225 6.36 6.631 6.895 7.285 7.535 7.774 8.13 8.449 8.743 9.032 9.298 9.634 9.962 10.287 10.681 11.049 11.391 11.796 12.267 12.71 13.165 13.666 14.217 14.762 15.352 16.047 16.739 17.522 18.358 19.267 20.273 21.351 22.412 23.323 23.619 23.444 23.052 22.5 21.822 21.163 20.487 19.857 19.204 18.667 18.23 17.827 17.455 17.078 16.719 16.322 15.961 15.662 15.329 14.965 14.659 14.341 14.01 13.746 13.471 13.194 12.907 12.583 12.355 12.125 11.762 11.509 11.238 11.086 10.761 10.439 10.097 9.903 9.214 9.237 9.007 8.749 8.14 7.823 7.503 7.155 6.723 6.191 5.477 3.164 -10 ,26183 ,TETRA ,17591109,Sat Nov 27 22:14:42 CET,Sun Nov 28 00:31:33 CET,0.0 1.335 1.87 2.292 2.646 2.959 3.253 3.519 3.99 4.212 4.424 4.33 4.996 5.168 5.51 5.844 6.162 6.3 6.554 6.806 7.175 7.416 7.654 8.001 8.315 8.61 8.9 9.184 9.55 9.892 10.22 10.613 10.992 11.353 11.758 12.211 12.638 13.119 13.639 14.172 14.717 15.315 16.008 16.683 17.444 18.292 19.217 20.182 21.209 22.223 23.117 23.273 22.881 22.378 21.853 21.274 20.708 20.137 19.594 19.002 18.411 17.822 17.241 16.666 16.126 15.667 15.188 14.752 14.37 13.966 13.533 13.161 12.776 12.394 12.098 11.771 11.43 11.071 10.682 10.411 10.124 9.668 9.352 9.027 8.849 8.45 8.041 7.627 7.398 6.667 6.63 6.356 6.071 5.447 5.086 4.669 4.203 3.658 2.946 2.04 -0.911 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index f4965d2a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17361 ,TETRA ,17591110,Sat Nov 27 22:14:42 CET,Sun Nov 28 00:30:00 CET,0.0 2.267 2.948 3.422 3.809 4.162 4.478 4.767 5.296 5.528 5.744 5.759 6.323 6.487 6.822 7.152 7.445 7.59 7.852 8.084 8.431 8.656 8.878 9.194 9.481 9.762 10.033 10.296 10.634 10.949 11.223 11.52 11.808 12.081 12.386 12.752 13.105 13.465 13.838 14.224 14.616 15.039 15.55 16.053 16.584 17.073 17.546 18.035 18.501 18.796 18.552 17.585 16.514 15.461 14.45 13.525 12.702 11.939 11.299 10.654 10.061 9.543 9.077 8.633 8.226 7.855 7.451 7.069 6.709 6.324 5.936 5.601 5.265 4.938 4.664 4.363 4.041 3.712 3.374 3.127 2.865 2.464 2.181 1.883 1.729 1.421 1.121 0.804 0.615 0.033 0.03 -0.177 -0.404 -0.859 -1.117 -1.412 -1.732 -2.134 -2.626 -3.281 -5.137 -2 ,9968 ,TETRA ,17591111,Sat Nov 27 22:14:44 CET,Sun Nov 28 00:29:21 CET,0.0 1.64 2.202 2.612 2.94 3.221 3.492 3.753 4.244 4.465 4.656 4.634 5.199 5.376 5.676 5.939 6.192 6.305 6.514 6.732 7.044 7.24 7.439 7.724 8.0 8.254 8.483 8.708 8.998 9.281 9.547 9.863 10.173 10.458 10.761 11.1 11.418 11.744 12.1 12.506 12.936 13.395 13.877 14.311 14.775 15.244 15.764 16.287 16.705 16.915 16.657 15.739 14.809 13.894 12.941 12.039 11.214 10.433 9.76 9.099 8.508 7.932 7.367 6.834 6.354 5.941 5.493 5.065 4.682 4.292 3.906 3.577 3.225 2.857 2.562 2.249 1.931 1.604 1.262 1.021 0.776 0.408 0.136 -0.165 -0.311 -0.595 -0.918 -1.278 -1.46 -2.028 -2.038 -2.261 -2.503 -3.047 -3.334 -3.623 -3.957 -4.339 -4.785 -5.477 -7.747 -3 ,11052 ,TETRA ,17591112,Sat Nov 27 22:14:47 CET,Sun Nov 28 00:25:24 CET,0.0 2.24 2.867 3.307 3.695 4.048 4.358 4.633 5.127 5.346 5.547 5.541 6.118 6.305 6.646 6.947 7.245 7.403 7.691 7.943 8.277 8.473 8.662 8.95 9.252 9.553 9.822 10.063 10.363 10.644 10.91 11.232 11.536 11.815 12.134 12.489 12.825 13.182 13.553 13.95 14.391 14.855 15.317 15.784 16.335 16.858 17.291 17.662 17.975 18.149 17.839 16.89 15.776 14.709 13.795 12.959 12.179 11.426 10.796 10.163 9.591 9.095 8.622 8.159 7.716 7.291 6.841 6.45 6.11 5.767 5.4 5.082 4.757 4.422 4.159 3.89 3.607 3.312 2.997 2.776 2.557 2.21 1.964 1.7 1.564 1.271 0.935 0.584 0.399 -0.201 -0.268 -0.495 -0.72 -1.179 -1.426 -1.679 -1.96 -2.301 -2.728 -3.319 -4.633 -4 ,29986 ,TETRA ,17591113,Sat Nov 27 21:51:12 CET,Sun Nov 28 00:03:44 CET,0.0 1.484 2.047 2.494 2.864 3.181 3.438 3.678 4.14 4.344 4.532 4.492 5.037 5.205 5.528 5.822 6.1 6.23 6.482 6.732 7.079 7.29 7.49 7.77 8.047 8.334 8.601 8.858 9.181 9.491 9.8 10.168 10.509 10.824 11.185 11.581 11.951 12.362 12.817 13.296 13.743 14.193 14.72 15.256 15.865 16.465 17.083 17.672 18.185 18.577 18.574 17.913 16.993 15.995 15.071 14.205 13.422 12.676 11.995 11.303 10.721 10.19 9.654 9.142 8.68 8.267 7.803 7.37 6.997 6.621 6.231 5.89 5.526 5.149 4.874 4.598 4.293 3.951 3.593 3.362 3.128 2.739 2.465 2.186 2.039 1.737 1.421 1.085 0.895 0.316 0.293 0.084 -0.135 -0.619 -0.896 -1.209 -1.544 -1.915 -2.361 -2.956 -5.412 -5 ,23333 ,TETRA ,17591114,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sat Nov 27 23:44:46 CET,0.0 1.62 2.216 2.65 3.015 3.334 3.628 3.888 4.358 4.59 4.803 4.798 5.348 5.495 5.775 6.053 6.327 6.456 6.715 6.972 7.321 7.535 7.746 8.059 8.36 8.637 8.883 9.126 9.445 9.744 10.038 10.416 10.763 11.084 11.455 11.827 12.169 12.549 12.931 13.32 13.738 14.225 14.807 15.346 15.884 16.439 17.03 17.599 18.083 18.392 18.364 17.792 17.0 16.119 15.249 14.428 13.661 12.9 12.244 11.614 11.039 10.501 9.995 9.511 9.062 8.649 8.209 7.826 7.499 7.145 6.779 6.492 6.184 5.828 5.542 5.255 4.949 4.627 4.303 4.078 3.837 3.474 3.216 2.935 2.796 2.522 2.23 1.884 1.707 1.162 1.199 1.005 0.78 0.302 0.052 -0.233 -0.539 -0.882 -1.321 -1.898 -3.573 -6 ,1614 ,TETRA ,17591115,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:04:23 CET,0.0 1.869 2.44 2.852 3.179 3.478 3.773 4.041 4.503 4.718 4.916 4.882 5.44 5.602 5.894 6.155 6.414 6.545 6.784 6.997 7.324 7.556 7.771 8.068 8.357 8.631 8.876 9.117 9.445 9.75 10.03 10.369 10.704 11.009 11.33 11.69 12.04 12.407 12.782 13.173 13.615 14.122 14.655 15.141 15.683 16.195 16.689 17.212 17.653 17.847 17.572 16.894 16.012 15.091 14.254 13.427 12.672 11.949 11.306 10.676 10.108 9.575 9.06 8.566 8.099 7.679 7.219 6.783 6.422 6.066 5.707 5.409 5.072 4.696 4.404 4.109 3.784 3.45 3.13 2.899 2.644 2.255 1.997 1.738 1.608 1.322 1.017 0.697 0.533 -0.012 0.011 -0.19 -0.418 -0.9 -1.153 -1.439 -1.749 -2.089 -2.535 -3.219 -5.623 -7 ,21170 ,TETRA ,17591116,Sat Nov 27 21:51:12 CET,Sat Nov 27 23:50:25 CET,0.0 1.42 2.126 2.582 2.88 3.156 3.413 3.642 4.067 4.266 4.455 4.445 4.997 5.161 5.464 5.761 6.028 6.149 6.405 6.658 7.016 7.236 7.439 7.733 8.006 8.267 8.509 8.728 9.024 9.315 9.604 9.976 10.317 10.619 10.966 11.337 11.68 12.06 12.452 12.867 13.293 13.714 14.202 14.722 15.304 15.924 16.5 17.012 17.491 17.745 17.379 16.349 15.311 14.314 13.359 12.452 11.643 10.878 10.195 9.523 8.952 8.427 7.935 7.491 7.067 6.653 6.201 5.793 5.434 5.042 4.639 4.316 3.982 3.628 3.338 3.049 2.762 2.437 2.084 1.855 1.62 1.236 0.956 0.657 0.497 0.159 -0.174 -0.508 -0.678 -1.239 -1.246 -1.444 -1.665 -2.177 -2.45 -2.742 -3.058 -3.416 -3.877 -4.491 -6.094 -8 ,19495 ,TETRA ,17591117,Sat Nov 27 21:51:12 CET,Sun Nov 28 00:04:21 CET,0.0 2.01 2.633 3.198 3.658 3.998 4.297 4.568 5.028 5.245 5.455 5.477 6.054 6.216 6.519 6.788 7.039 7.166 7.411 7.652 8.003 8.225 8.452 8.783 9.088 9.378 9.644 9.884 10.19 10.469 10.758 11.127 11.45 11.742 12.054 12.405 12.755 13.134 13.518 13.889 14.287 14.727 15.193 15.642 16.148 16.661 17.222 17.768 18.256 18.587 18.437 17.616 16.65 15.711 14.847 14.015 13.236 12.522 11.894 11.268 10.71 10.196 9.674 9.156 8.675 8.223 7.756 7.321 6.92 6.503 6.083 5.74 5.394 5.048 4.778 4.496 4.206 3.913 3.585 3.348 3.114 2.77 2.521 2.259 2.12 1.81 1.482 1.142 0.961 0.395 0.378 0.165 -0.058 -0.567 -0.844 -1.136 -1.462 -1.85 -2.348 -2.933 -5.251 -9 ,11913 ,TETRA ,17591118,Sat Nov 27 21:51:14 CET,Sun Nov 28 00:04:56 CET,0.0 1.928 2.525 2.975 3.312 3.605 3.894 4.145 4.585 4.79 4.983 4.975 5.535 5.703 6.021 6.302 6.553 6.681 6.924 7.146 7.48 7.703 7.911 8.207 8.494 8.767 9.039 9.304 9.626 9.913 10.17 10.469 10.77 11.074 11.418 11.768 12.114 12.51 12.922 13.356 13.796 14.245 14.716 15.138 15.584 16.044 16.542 17.141 17.759 18.06 17.731 16.799 15.733 14.65 13.649 12.732 11.909 11.143 10.459 9.77 9.169 8.636 8.128 7.635 7.19 6.783 6.344 5.951 5.616 5.262 4.881 4.566 4.24 3.91 3.65 3.372 3.074 2.764 2.456 2.235 2.007 1.661 1.409 1.148 1.01 0.723 0.426 0.092 -0.084 -0.65 -0.659 -0.869 -1.078 -1.504 -1.762 -2.065 -2.378 -2.745 -3.167 -3.732 -5.879 -10 ,990 ,TETRA ,17591119,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:04:02 CET,0.0 1.456 2.007 2.441 2.859 3.214 3.507 3.774 4.267 4.49 4.687 4.65 5.199 5.36 5.679 5.99 6.274 6.401 6.64 6.88 7.244 7.465 7.676 7.979 8.255 8.524 8.777 9.001 9.294 9.587 9.865 10.191 10.499 10.784 11.108 11.457 11.782 12.142 12.518 12.925 13.329 13.763 14.263 14.755 15.291 15.767 16.189 16.568 16.852 16.897 16.491 15.544 14.469 13.46 12.565 11.704 10.896 10.132 9.416 8.705 8.112 7.586 7.064 6.526 6.035 5.604 5.144 4.73 4.387 4.018 3.624 3.3 2.962 2.619 2.35 2.06 1.742 1.42 1.09 0.857 0.607 0.215 -0.048 -0.327 -0.47 -0.768 -1.095 -1.451 -1.646 -2.23 -2.245 -2.456 -2.676 -3.166 -3.445 -3.741 -4.06 -4.422 -4.898 -5.619 -7.281 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index 74dcad37..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,57 ,KEBNE ,17026771,Wed Dec 22 15:10:03 CET,Wed Dec 22 17:02:39 CET,0.0 1.185 1.692 2.086 2.398 2.665 2.911 3.139 3.542 3.726 3.906 3.869 4.413 4.583 4.901 5.186 5.446 5.581 5.838 6.065 6.387 6.588 6.77 7.025 7.286 7.542 7.789 8.016 8.297 8.57 8.837 9.151 9.451 9.744 10.09 10.463 10.787 11.145 11.533 11.93 12.344 12.783 13.252 13.685 14.138 14.627 15.116 15.56 15.918 16.067 15.733 14.758 13.711 12.615 11.587 10.662 9.822 9.049 8.359 7.629 6.981 6.39 5.826 5.294 4.793 4.321 3.811 3.336 2.915 2.486 2.059 1.711 1.353 0.952 0.63 0.308 -0.026 -0.365 -0.727 -0.985 -1.255 -1.708 -2.023 -2.346 -2.512 -2.85 -3.214 -3.615 -3.827 -4.419 -4.481 -4.737 -5.011 -5.639 -6.003 -6.394 -6.829 -7.33 -7.915 -8.724 -11.629 -2 ,21796 ,KEBNE ,17026772,Wed Dec 22 15:10:03 CET,Wed Dec 22 17:04:11 CET,0.0 1.078 1.571 1.945 2.256 2.533 2.786 3.034 3.505 3.717 3.912 3.884 4.43 4.593 4.898 5.166 5.43 5.558 5.781 6.003 6.338 6.536 6.717 6.976 7.23 7.47 7.706 7.957 8.279 8.57 8.846 9.159 9.436 9.706 10.024 10.364 10.685 11.019 11.355 11.71 12.121 12.57 13.026 13.427 13.84 14.243 14.617 14.956 15.273 15.401 14.904 13.786 12.626 11.537 10.583 9.652 8.773 7.982 7.294 6.574 5.931 5.367 4.834 4.325 3.853 3.418 2.927 2.447 2.038 1.621 1.173 0.799 0.419 0.022 -0.291 -0.613 -0.943 -1.29 -1.666 -1.927 -2.193 -2.639 -2.984 -3.342 -3.516 -3.855 -4.207 -4.59 -4.769 -5.333 -5.368 -5.595 -5.839 -6.376 -6.674 -7.055 -7.478 -7.916 -8.459 -9.187 -11.649 -3 ,8005 ,KEBNE ,17026773,Wed Dec 22 15:10:03 CET,Wed Dec 22 17:03:02 CET,0.0 1.05 1.596 2.074 2.441 2.739 3.004 3.239 3.675 3.874 4.059 4.029 4.567 4.724 5.013 5.289 5.538 5.648 5.877 6.105 6.445 6.659 6.863 7.15 7.414 7.675 7.912 8.131 8.421 8.693 8.943 9.245 9.548 9.838 10.164 10.521 10.851 11.205 11.563 11.937 12.342 12.766 13.207 13.614 14.066 14.559 15.046 15.414 15.61 15.525 14.843 13.588 12.373 11.203 10.101 9.124 8.244 7.368 6.585 5.804 5.122 4.511 3.922 3.29 2.69 2.198 1.697 1.23 0.812 0.367 -0.109 -0.486 -0.866 -1.299 -1.658 -2.01 -2.376 -2.781 -3.184 -3.45 -3.728 -4.151 -4.463 -4.819 -5.017 -5.406 -5.781 -6.194 -6.411 -7.016 -7.108 -7.383 -7.685 -8.36 -8.751 -9.16 -9.566 -10.003 -10.547 -11.304 -13.386 -4 ,31690 ,KEBNE ,17026774,Wed Dec 22 15:10:03 CET,Wed Dec 22 17:02:57 CET,0.0 1.219 1.76 2.21 2.572 2.891 3.201 3.493 4.012 4.24 4.44 4.446 5.0 5.16 5.479 5.8 6.102 6.234 6.479 6.718 7.056 7.272 7.478 7.751 8.012 8.257 8.49 8.726 9.024 9.314 9.606 9.944 10.247 10.536 10.887 11.26 11.582 11.922 12.274 12.644 13.019 13.408 13.849 14.267 14.692 15.102 15.525 15.903 16.122 16.071 15.627 14.653 13.566 12.49 11.415 10.385 9.431 8.592 7.898 7.192 6.542 5.902 5.294 4.75 4.254 3.791 3.3 2.865 2.463 2.024 1.566 1.174 0.765 0.333 0.002 -0.326 -0.673 -1.05 -1.46 -1.74 -2.023 -2.439 -2.741 -3.072 -3.242 -3.622 -4.018 -4.421 -4.643 -5.249 -5.326 -5.58 -5.87 -6.52 -6.845 -7.184 -7.601 -8.09 -8.632 -9.339 -11.588 -5 ,11193 ,KEBNE ,17026775,Wed Dec 22 15:10:03 CET,Wed Dec 22 17:03:57 CET,0.0 1.221 1.702 2.092 2.399 2.689 2.966 3.222 3.671 3.862 4.045 3.992 4.512 4.657 4.962 5.262 5.535 5.663 5.903 6.13 6.435 6.628 6.815 7.076 7.334 7.576 7.799 8.018 8.32 8.615 8.881 9.183 9.469 9.737 10.036 10.36 10.678 11.018 11.33 11.636 11.966 12.314 12.678 13.006 13.376 13.815 14.329 14.79 15.014 14.867 14.229 13.112 11.903 10.68 9.532 8.475 7.566 6.734 5.977 5.212 4.573 4.006 3.463 2.955 2.458 1.97 1.439 0.961 0.56 0.157 -0.258 -0.586 -0.937 -1.324 -1.623 -1.952 -2.311 -2.685 -3.078 -3.362 -3.653 -4.099 -4.425 -4.756 -4.932 -5.315 -5.691 -6.086 -6.299 -6.908 -7.012 -7.263 -7.514 -8.034 -8.323 -8.641 -8.991 -9.398 -9.927 -10.666 -13.389 -6 ,24896 ,KEBNE ,17026776,Wed Dec 22 15:10:03 CET,Wed Dec 22 17:03:49 CET,0.0 1.23 1.712 2.121 2.484 2.772 3.029 3.289 3.758 3.956 4.153 4.125 4.649 4.798 5.088 5.363 5.614 5.73 5.965 6.194 6.519 6.717 6.9 7.173 7.434 7.7 7.963 8.202 8.485 8.76 9.026 9.3 9.565 9.833 10.129 10.451 10.75 11.062 11.404 11.767 12.12 12.517 12.949 13.323 13.702 14.155 14.629 15.008 15.295 15.328 14.849 13.667 12.378 11.189 10.162 9.198 8.31 7.504 6.768 6.0 5.32 4.695 4.119 3.581 3.036 2.489 1.921 1.439 1.036 0.626 0.192 -0.164 -0.52 -0.906 -1.226 -1.571 -1.908 -2.245 -2.595 -2.851 -3.144 -3.592 -3.883 -4.175 -4.325 -4.649 -5.016 -5.426 -5.647 -6.248 -6.316 -6.546 -6.797 -7.369 -7.675 -7.995 -8.328 -8.729 -9.243 -9.859 -11.658 -7 ,31306 ,KEBNE ,17026777,Wed Dec 22 15:10:03 CET,Wed Dec 22 17:02:32 CET,0.0 1.022 1.471 1.824 2.112 2.382 2.65 2.905 3.322 3.507 3.683 3.642 4.178 4.329 4.631 4.94 5.218 5.342 5.586 5.817 6.153 6.375 6.574 6.841 7.085 7.316 7.53 7.742 8.029 8.292 8.529 8.818 9.089 9.336 9.621 9.946 10.272 10.617 10.951 11.308 11.666 12.037 12.435 12.81 13.208 13.63 14.06 14.404 14.665 14.763 14.387 13.356 12.2 11.099 10.153 9.234 8.35 7.5 6.762 6.045 5.422 4.85 4.264 3.704 3.194 2.738 2.277 1.838 1.436 1.045 0.663 0.35 0.021 -0.322 -0.583 -0.864 -1.179 -1.512 -1.864 -2.103 -2.356 -2.767 -3.047 -3.337 -3.484 -3.769 -4.093 -4.469 -4.658 -5.233 -5.261 -5.476 -5.696 -6.241 -6.551 -6.916 -7.339 -7.768 -8.29 -8.991 -11.973 -8 ,18651 ,KEBNE ,17026778,Wed Dec 22 15:11:04 CET,Wed Dec 22 17:05:03 CET,0.0 1.318 1.813 2.182 2.482 2.776 3.035 3.249 3.651 3.851 4.046 4.026 4.56 4.714 5.023 5.305 5.554 5.672 5.897 6.108 6.414 6.603 6.791 7.071 7.329 7.571 7.801 8.024 8.317 8.598 8.856 9.15 9.436 9.712 10.019 10.348 10.645 10.967 11.338 11.726 12.077 12.451 12.872 13.262 13.711 14.159 14.592 14.991 15.25 15.368 15.041 13.938 12.748 11.607 10.569 9.626 8.785 7.967 7.265 6.525 5.856 5.265 4.661 4.091 3.585 3.102 2.591 2.139 1.734 1.307 0.867 0.511 0.15 -0.236 -0.544 -0.861 -1.204 -1.57 -1.956 -2.22 -2.493 -2.934 -3.248 -3.567 -3.726 -4.08 -4.456 -4.857 -5.078 -5.687 -5.795 -6.047 -6.297 -6.859 -7.212 -7.588 -7.956 -8.413 -8.989 -9.753 -11.912 -9 ,10090 ,KEBNE ,17026779,Wed Dec 22 15:11:04 CET,Wed Dec 22 17:04:22 CET,0.0 1.307 1.869 2.301 2.654 2.973 3.244 3.47 3.869 4.064 4.253 4.219 4.756 4.919 5.241 5.545 5.826 5.962 6.212 6.425 6.729 6.929 7.113 7.365 7.618 7.851 8.077 8.302 8.564 8.809 9.05 9.34 9.62 9.888 10.187 10.516 10.836 11.18 11.54 11.893 12.243 12.639 13.082 13.466 13.881 14.308 14.676 15.0 15.266 15.304 14.824 13.729 12.589 11.547 10.557 9.647 8.862 8.14 7.48 6.752 6.1 5.546 5.031 4.556 4.105 3.665 3.195 2.768 2.379 1.967 1.552 1.22 0.85 0.447 0.131 -0.194 -0.517 -0.845 -1.17 -1.398 -1.641 -2.017 -2.282 -2.557 -2.706 -3.024 -3.354 -3.726 -3.912 -4.48 -4.478 -4.688 -4.933 -5.494 -5.828 -6.179 -6.53 -6.925 -7.427 -8.127 -9.967 -10 ,7795 ,KEBNE ,17026780,Wed Dec 22 15:11:08 CET,Wed Dec 22 17:00:04 CET,0.0 1.235 1.752 2.136 2.492 2.825 3.122 3.38 3.837 4.031 4.206 4.147 4.662 4.8 5.072 5.316 5.537 5.642 5.849 6.064 6.39 6.584 6.767 7.038 7.282 7.523 7.778 8.022 8.324 8.601 8.858 9.15 9.415 9.659 9.943 10.261 10.56 10.901 11.266 11.628 11.995 12.418 12.887 13.309 13.735 14.134 14.517 14.835 15.048 15.018 14.443 13.356 12.257 11.2 10.23 9.278 8.424 7.663 6.991 6.316 5.737 5.192 4.642 4.114 3.606 3.126 2.622 2.2 1.848 1.466 1.06 0.726 0.383 0.015 -0.294 -0.615 -0.938 -1.269 -1.603 -1.838 -2.093 -2.496 -2.788 -3.118 -3.29 -3.645 -4.021 -4.441 -4.662 -5.259 -5.358 -5.614 -5.871 -6.411 -6.702 -7.006 -7.356 -7.774 -8.292 -8.982 -11.078 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt deleted file mode 100644 index 90f58ab4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12470 ,TETRA ,17591120,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:08:48 CET,0.0 1.785 2.392 2.848 3.195 3.479 3.758 4.018 4.464 4.676 4.879 4.864 5.399 5.556 5.867 6.137 6.394 6.525 6.767 6.986 7.307 7.527 7.743 8.048 8.339 8.614 8.863 9.101 9.409 9.716 10.01 10.346 10.674 10.973 11.297 11.664 12.017 12.406 12.823 13.276 13.752 14.252 14.802 15.34 15.955 16.6 17.264 17.931 18.591 19.129 19.337 18.875 18.18 17.418 16.567 15.679 14.89 14.156 13.465 12.753 12.115 11.513 10.933 10.372 9.819 9.298 8.773 8.332 7.965 7.563 7.116 6.749 6.37 5.972 5.66 5.322 4.964 4.595 4.234 3.988 3.712 3.24 2.905 2.564 2.391 2.034 1.664 1.286 1.084 0.471 0.389 0.13 -0.141 -0.703 -1.008 -1.352 -1.747 -2.197 -2.76 -3.528 -5.969 -2 ,807 ,TETRA ,17591121,Sat Nov 27 21:51:16 CET,Sun Nov 28 00:07:32 CET,0.0 1.785 2.372 2.794 3.129 3.421 3.717 4.019 4.551 4.779 4.988 4.986 5.542 5.709 6.018 6.305 6.583 6.727 6.985 7.228 7.577 7.806 8.041 8.364 8.673 8.966 9.244 9.537 9.903 10.229 10.557 10.94 11.286 11.62 12.014 12.473 12.881 13.282 13.706 14.149 14.616 15.125 15.673 16.192 16.82 17.514 18.206 18.877 19.583 20.209 20.528 20.087 19.325 18.561 17.813 17.05 16.198 15.3 14.525 13.753 13.089 12.524 11.999 11.463 10.96 10.503 10.014 9.559 9.156 8.754 8.324 7.944 7.549 7.126 6.796 6.46 6.11 5.768 5.382 5.087 4.804 4.389 4.093 3.772 3.596 3.242 2.89 2.506 2.298 1.703 1.615 1.372 1.115 0.54 0.219 -0.136 -0.532 -0.982 -1.51 -2.251 -4.85 -3 ,28934 ,TETRA ,17591122,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:07:57 CET,0.0 1.794 2.308 2.724 3.078 3.387 3.661 3.928 4.423 4.627 4.814 4.797 5.349 5.509 5.815 6.102 6.39 6.536 6.813 7.062 7.399 7.623 7.83 8.14 8.45 8.732 8.991 9.239 9.559 9.874 10.185 10.54 10.866 11.194 11.566 11.962 12.331 12.743 13.183 13.638 14.117 14.65 15.25 15.832 16.429 17.07 17.797 18.491 19.159 19.759 20.067 19.706 18.985 18.039 17.066 16.181 15.305 14.375 13.528 12.759 12.114 11.527 10.972 10.439 9.887 9.337 8.788 8.287 7.852 7.416 6.969 6.591 6.174 5.72 5.373 5.0 4.602 4.202 3.806 3.534 3.254 2.821 2.497 2.152 1.969 1.585 1.191 0.776 0.563 -0.035 -0.089 -0.327 -0.589 -1.188 -1.527 -1.887 -2.296 -2.756 -3.308 -4.019 -7.272 -4 ,27048 ,TETRA ,17591123,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:02:51 CET,0.0 2.635 3.285 3.696 4.08 4.456 4.771 5.03 5.521 5.772 6.012 6.066 6.627 6.805 7.158 7.514 7.824 7.954 8.208 8.461 8.838 9.084 9.306 9.618 9.914 10.193 10.465 10.727 11.067 11.373 11.642 11.99 12.34 12.668 13.021 13.402 13.78 14.189 14.603 15.034 15.486 15.972 16.522 17.061 17.661 18.231 18.816 19.476 20.114 20.556 20.64 20.156 19.481 18.734 17.924 17.087 16.28 15.521 14.845 14.169 13.558 12.971 12.402 11.888 11.428 11.002 10.535 10.114 9.767 9.397 9.005 8.671 8.314 7.91 7.589 7.289 6.981 6.638 6.271 6.009 5.743 5.352 5.07 4.759 4.592 4.256 3.92 3.546 3.347 2.76 2.708 2.479 2.235 1.632 1.266 0.904 0.537 0.077 -0.545 -1.269 -2.927 -5 ,22585 ,TETRA ,17591124,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:08:22 CET,0.0 1.753 2.299 2.669 3.0 3.32 3.605 3.856 4.312 4.514 4.709 4.684 5.216 5.371 5.669 5.952 6.225 6.355 6.602 6.838 7.169 7.389 7.608 7.903 8.178 8.466 8.75 9.023 9.366 9.676 9.959 10.281 10.596 10.904 11.246 11.619 11.985 12.384 12.793 13.206 13.631 14.088 14.617 15.178 15.776 16.356 16.972 17.6 18.176 18.569 18.574 17.943 17.095 16.193 15.319 14.537 13.858 13.182 12.521 11.784 11.094 10.495 9.952 9.418 8.897 8.416 7.922 7.489 7.102 6.691 6.253 5.885 5.492 5.09 4.807 4.502 4.173 3.819 3.437 3.177 2.915 2.514 2.218 1.904 1.743 1.406 1.049 0.679 0.48 -0.114 -0.191 -0.44 -0.7 -1.259 -1.603 -1.985 -2.391 -2.866 -3.411 -4.087 -6.912 -6 ,25460 ,TETRA ,17591125,Sat Nov 27 21:51:13 CET,Sun Nov 28 00:04:52 CET,0.0 1.829 2.443 2.921 3.313 3.636 3.95 4.241 4.759 4.996 5.221 5.237 5.789 5.942 6.217 6.487 6.754 6.888 7.14 7.383 7.727 7.938 8.149 8.454 8.745 9.031 9.298 9.56 9.904 10.214 10.482 10.779 11.087 11.419 11.781 12.163 12.518 12.886 13.284 13.706 14.123 14.576 15.101 15.613 16.192 16.802 17.448 18.091 18.743 19.325 19.574 19.258 18.588 17.793 17.007 16.262 15.594 14.961 14.394 13.816 13.246 12.684 12.149 11.633 11.129 10.674 10.218 9.797 9.426 9.042 8.638 8.294 7.942 7.569 7.268 6.948 6.614 6.266 5.882 5.613 5.339 4.914 4.627 4.327 4.163 3.812 3.454 3.084 2.885 2.259 2.098 1.817 1.537 0.973 0.666 0.32 -0.081 -0.555 -1.125 -1.928 -6.005 -7 ,2102 ,TETRA ,17591126,Sat Nov 27 21:51:56 CET,Sun Nov 28 00:07:51 CET,0.0 1.592 2.062 2.422 2.714 2.985 3.253 3.496 3.926 4.129 4.334 4.371 4.938 5.12 5.474 5.785 6.07 6.209 6.477 6.735 7.099 7.331 7.559 7.868 8.136 8.399 8.666 8.923 9.262 9.605 9.929 10.303 10.658 10.968 11.3 11.668 11.996 12.347 12.736 13.158 13.612 14.107 14.649 15.153 15.695 16.293 16.917 17.5 18.089 18.545 18.505 17.754 16.802 15.804 14.805 13.884 13.092 12.358 11.695 10.988 10.333 9.724 9.113 8.517 7.961 7.457 6.93 6.431 5.995 5.557 5.115 4.752 4.378 3.986 3.655 3.328 3.001 2.639 2.249 1.975 1.696 1.27 0.962 0.627 0.458 0.117 -0.244 -0.63 -0.833 -1.433 -1.526 -1.787 -2.063 -2.663 -2.986 -3.307 -3.685 -4.149 -4.674 -5.389 -7.977 -8 ,19205 ,TETRA ,17591127,Sat Nov 27 21:51:58 CET,Sun Nov 28 00:11:16 CET,0.0 1.422 2.031 2.482 2.859 3.186 3.466 3.759 4.346 4.611 4.846 4.865 5.42 5.583 5.886 6.191 6.478 6.609 6.876 7.138 7.516 7.777 8.021 8.362 8.714 9.053 9.372 9.671 10.034 10.361 10.665 11.02 11.351 11.67 12.031 12.421 12.807 13.25 13.703 14.152 14.653 15.215 15.81 16.378 16.989 17.626 18.303 18.936 19.534 20.056 20.2 19.776 19.103 18.305 17.509 16.735 15.951 15.125 14.364 13.602 12.937 12.285 11.639 11.026 10.446 9.932 9.388 8.883 8.444 7.962 7.44 7.014 6.6 6.185 5.859 5.513 5.141 4.761 4.348 4.052 3.778 3.353 3.018 2.659 2.487 2.146 1.781 1.36 1.131 0.535 0.445 0.171 -0.133 -0.733 -1.025 -1.366 -1.778 -2.289 -2.898 -3.588 -5.604 -9 ,4948 ,TETRA ,17591128,Sat Nov 27 21:51:56 CET,Sun Nov 28 00:11:48 CET,0.0 1.708 2.263 2.697 3.101 3.474 3.807 4.125 4.665 4.88 5.091 5.125 5.684 5.856 6.191 6.512 6.811 6.954 7.238 7.497 7.823 8.032 8.257 8.607 8.943 9.264 9.566 9.835 10.173 10.511 10.834 11.221 11.603 11.952 12.332 12.768 13.192 13.657 14.109 14.549 15.026 15.55 16.157 16.758 17.451 18.199 18.968 19.676 20.372 21.05 21.436 21.054 20.368 19.66 18.892 18.121 17.388 16.675 16.01 15.323 14.741 14.216 13.702 13.156 12.615 12.131 11.612 11.162 10.785 10.377 9.939 9.558 9.136 8.694 8.35 7.988 7.623 7.263 6.881 6.601 6.306 5.854 5.528 5.174 4.998 4.66 4.29 3.874 3.656 3.064 2.982 2.731 2.477 1.909 1.568 1.168 0.728 0.227 -0.359 -1.177 -4.559 -10 ,3819 ,TETRA ,17591129,Sat Nov 27 21:51:56 CET,Sun Nov 28 00:11:56 CET,0.0 1.945 2.473 2.865 3.194 3.495 3.76 4.016 4.511 4.729 4.921 4.901 5.44 5.605 5.916 6.224 6.526 6.662 6.913 7.144 7.476 7.692 7.902 8.216 8.515 8.785 9.027 9.26 9.563 9.876 10.186 10.535 10.862 11.186 11.56 11.96 12.341 12.739 13.144 13.57 14.016 14.504 15.042 15.56 16.153 16.811 17.479 18.11 18.758 19.356 19.662 19.328 18.682 17.949 17.186 16.454 15.764 15.117 14.55 13.968 13.413 12.886 12.355 11.812 11.312 10.868 10.419 10.016 9.659 9.291 8.903 8.579 8.232 7.85 7.542 7.219 6.889 6.558 6.205 5.953 5.696 5.298 5.011 4.697 4.526 4.16 3.742 3.312 3.104 2.493 2.383 2.144 1.894 1.344 1.038 0.702 0.314 -0.075 -0.526 -1.241 -4.284 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index bb95ff32..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11998 ,TETRA ,17591130,Sat Nov 27 21:51:56 CET,Sun Nov 28 00:05:16 CET,0.0 2.24 2.985 3.547 4.062 4.528 4.934 5.313 6.011 6.346 6.679 6.817 7.651 7.952 8.529 9.085 9.635 9.906 10.431 10.942 11.684 12.164 12.627 13.314 14.023 14.719 15.389 16.052 16.913 17.772 18.618 19.638 20.627 21.603 22.757 24.07 25.359 26.816 28.427 30.171 32.057 34.279 36.946 39.677 42.958 46.779 51.409 57.003 63.946 72.648 84.402 95.311 102.521 107.653 111.42 114.376 116.583 118.314 119.668 120.867 121.808 122.611 123.296 123.843 124.305 124.686 125.03 125.311 125.536 125.699 125.796 125.832 125.84 125.844 125.829 125.79 125.712 125.634 125.59 125.554 125.513 125.425 125.328 125.224 125.17 125.019 124.847 124.649 124.531 124.033 124.158 124.006 123.825 123.368 123.084 122.781 122.448 121.991 121.37 120.536 117.295 -2 ,30647 ,TETRA ,17591131,Sat Nov 27 21:51:56 CET,Sun Nov 28 00:11:12 CET,0.0 2.215 3.075 3.724 4.219 4.643 5.035 5.392 6.084 6.441 6.784 6.911 7.727 8.029 8.602 9.143 9.677 9.936 10.437 10.927 11.674 12.172 12.654 13.345 14.04 14.731 15.4 16.067 16.93 17.748 18.549 19.546 20.528 21.485 22.618 23.917 25.193 26.652 28.284 30.064 31.961 34.164 36.807 39.547 42.858 46.7 51.368 56.848 63.677 72.447 84.163 94.99 102.083 107.124 110.875 113.873 116.138 117.862 119.215 120.404 121.303 122.037 122.661 123.168 123.583 123.944 124.311 124.604 124.81 125.001 125.172 125.288 125.392 125.482 125.506 125.484 125.462 125.438 125.394 125.341 125.286 125.165 125.036 124.874 124.777 124.595 124.44 124.239 124.113 123.598 123.669 123.485 123.271 122.795 122.511 122.186 121.864 121.533 121.111 120.44 113.14 -3 ,18775 ,TETRA ,17591132,Sat Nov 27 21:51:56 CET,Sun Nov 28 00:07:11 CET,0.0 1.734 2.377 2.92 3.378 3.782 4.198 4.601 5.326 5.678 6.022 6.151 6.975 7.275 7.839 8.377 8.908 9.171 9.702 10.218 10.961 11.449 11.921 12.612 13.292 13.954 14.604 15.24 16.069 16.902 17.729 18.733 19.715 20.684 21.823 23.114 24.391 25.832 27.422 29.151 31.011 33.176 35.801 38.528 41.859 45.76 50.424 55.89 62.727 71.536 83.197 93.981 101.031 106.05 109.748 112.587 114.741 116.443 117.804 119.037 119.962 120.734 121.394 121.944 122.404 122.761 123.089 123.333 123.512 123.662 123.791 123.869 123.932 123.979 123.974 123.967 123.967 123.942 123.87 123.81 123.746 123.619 123.519 123.396 123.328 123.207 123.068 122.878 122.77 122.264 122.381 122.204 121.99 121.567 121.295 120.951 120.591 120.176 119.54 118.643 112.425 -4 ,17435 ,TETRA ,17591133,Sat Nov 27 21:52:47 CET,Sun Nov 28 00:14:30 CET,0.0 1.835 2.536 3.091 3.588 4.038 4.442 4.843 5.627 5.986 6.325 6.466 7.31 7.622 8.217 8.808 9.39 9.678 10.245 10.797 11.586 12.097 12.609 13.355 14.052 14.73 15.41 16.066 16.909 17.727 18.53 19.524 20.48 21.416 22.536 23.816 25.086 26.529 28.116 29.84 31.684 33.821 36.42 39.166 42.488 46.286 50.88 56.26 62.878 71.389 82.84 93.636 100.868 106.003 109.707 112.52 114.676 116.459 117.872 119.153 120.099 120.841 121.508 122.09 122.565 122.938 123.281 123.529 123.721 123.901 124.056 124.172 124.258 124.311 124.345 124.376 124.388 124.369 124.308 124.265 124.21 124.06 123.957 123.864 123.811 123.691 123.567 123.416 123.307 122.797 122.902 122.757 122.619 122.238 121.996 121.723 121.363 120.907 120.332 119.536 116.379 -5 ,7325 ,TETRA ,17591134,Sat Nov 27 21:52:48 CET,Sun Nov 28 00:15:08 CET,0.0 1.829 2.621 3.191 3.7 4.15 4.553 4.939 5.675 6.005 6.323 6.416 7.239 7.538 8.094 8.637 9.157 9.409 9.921 10.42 11.113 11.567 12.037 12.733 13.424 14.094 14.734 15.361 16.185 17.016 17.854 18.885 19.88 20.844 21.987 23.284 24.539 25.958 27.514 29.216 31.073 33.218 35.796 38.477 41.709 45.434 49.887 55.282 62.073 70.628 82.1 92.883 100.076 105.237 109.044 112.023 114.282 116.064 117.429 118.649 119.579 120.296 120.899 121.411 121.82 122.146 122.458 122.695 122.893 123.108 123.302 123.405 123.478 123.529 123.556 123.573 123.562 123.531 123.503 123.484 123.41 123.281 123.198 123.07 122.998 122.85 122.674 122.451 122.32 121.819 121.924 121.748 121.578 121.145 120.875 120.585 120.249 119.844 119.288 118.385 114.91 -7 ,15846 ,TETRA ,17591136,Sat Nov 27 21:52:48 CET,Sun Nov 28 00:13:57 CET,0.0 2.023 2.77 3.362 3.902 4.353 4.75 5.161 5.925 6.278 6.606 6.726 7.547 7.84 8.425 8.982 9.524 9.791 10.308 10.806 11.548 12.041 12.52 13.21 13.883 14.546 15.211 15.861 16.695 17.503 18.302 19.31 20.302 21.253 22.374 23.689 24.981 26.423 28.028 29.783 31.658 33.823 36.454 39.183 42.454 46.303 50.936 56.443 63.325 72.123 83.998 95.087 102.411 107.651 111.505 114.448 116.665 118.403 119.715 120.909 121.839 122.583 123.207 123.686 124.099 124.474 124.814 125.064 125.231 125.387 125.539 125.649 125.735 125.764 125.762 125.762 125.755 125.724 125.641 125.556 125.465 125.301 125.177 125.037 124.957 124.793 124.623 124.441 124.331 123.826 123.893 123.713 123.537 123.106 122.819 122.492 122.144 121.797 121.405 120.841 113.084 -8 ,19225 ,TETRA ,17591137,Sat Nov 27 21:53:32 CET,Sun Nov 28 00:31:39 CET,0.0 1.694 2.41 2.999 3.481 3.895 4.282 4.647 5.343 5.677 6.005 6.114 6.908 7.185 7.73 8.265 8.791 9.041 9.53 10.038 10.792 11.279 11.757 12.454 13.132 13.8 14.471 15.123 15.958 16.793 17.629 18.628 19.617 20.607 21.774 23.126 24.46 25.943 27.55 29.288 31.159 33.334 35.955 38.671 41.988 45.861 50.493 56.026 62.865 71.567 83.327 94.282 101.465 106.542 110.32 113.324 115.582 117.369 118.771 120.024 120.975 121.736 122.365 122.897 123.359 123.736 124.088 124.375 124.606 124.789 124.917 125.008 125.079 125.147 125.182 125.185 125.18 125.167 125.114 125.058 125.003 124.911 124.829 124.683 124.605 124.465 124.284 124.082 123.978 123.488 123.613 123.467 123.305 122.905 122.66 122.36 122.01 121.611 121.077 120.408 118.033 -9 ,25240 ,TETRA ,17591138,Sat Nov 27 21:53:33 CET,Sun Nov 28 00:11:58 CET,0.0 1.682 2.387 2.937 3.439 3.918 4.359 4.788 5.593 5.942 6.263 6.364 7.176 7.471 8.047 8.574 9.089 9.353 9.886 10.395 11.125 11.606 12.087 12.796 13.487 14.158 14.811 15.461 16.316 17.143 17.947 18.943 19.915 20.872 22.024 23.347 24.634 26.088 27.699 29.455 31.325 33.475 36.091 38.812 42.065 45.854 50.472 55.987 62.861 71.633 83.351 94.277 101.494 106.664 110.484 113.417 115.646 117.393 118.711 119.871 120.76 121.477 122.089 122.596 122.992 123.32 123.642 123.876 124.016 124.13 124.248 124.311 124.349 124.377 124.376 124.36 124.345 124.332 124.282 124.201 124.112 123.963 123.857 123.752 123.688 123.52 123.297 123.055 122.934 122.432 122.556 122.405 122.227 121.82 121.571 121.254 120.893 120.511 120.037 119.372 114.509 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt deleted file mode 100644 index ea905884..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14589 ,TETRA ,17591140,Sat Nov 27 21:54:17 CET,Sun Nov 28 00:19:09 CET,0.0 1.994 2.605 3.08 3.505 3.93 4.332 4.715 5.425 5.747 6.071 6.214 7.047 7.358 7.946 8.5 9.032 9.288 9.787 10.282 11.025 11.52 12.002 12.694 13.379 14.069 14.76 15.429 16.274 17.109 17.944 18.962 19.955 20.942 22.109 23.469 24.793 26.246 27.864 29.654 31.64 33.912 36.604 39.439 42.899 46.978 51.851 57.601 64.756 73.872 86.288 97.989 105.69 111.069 114.992 118.08 120.484 122.409 123.879 125.17 126.152 126.959 127.653 128.232 128.729 129.132 129.498 129.778 129.977 130.157 130.3 130.392 130.459 130.471 130.455 130.432 130.418 130.392 130.323 130.279 130.241 130.127 130.021 129.879 129.788 129.585 129.348 129.067 128.916 128.404 128.498 128.325 128.118 127.655 127.38 127.056 126.68 126.258 125.731 124.93 121.378 -2 ,12339 ,TETRA ,17591141,Sat Nov 27 21:54:17 CET,Sun Nov 28 00:16:01 CET,0.0 1.776 2.525 3.138 3.646 4.106 4.527 4.902 5.596 5.939 6.284 6.426 7.256 7.565 8.144 8.703 9.278 9.565 10.102 10.599 11.321 11.803 12.284 12.995 13.701 14.401 15.084 15.749 16.605 17.46 18.333 19.419 20.462 21.474 22.668 24.043 25.408 26.94 28.64 30.485 32.458 34.735 37.523 40.439 43.901 47.878 52.679 58.385 65.465 74.612 86.936 98.518 106.251 111.652 115.598 118.689 121.069 122.975 124.419 125.635 126.518 127.228 127.843 128.367 128.788 129.117 129.419 129.67 129.858 130.006 130.127 130.219 130.304 130.343 130.327 130.298 130.282 130.264 130.24 130.186 130.091 129.948 129.841 129.686 129.595 129.421 129.221 128.97 128.825 128.293 128.326 128.128 127.937 127.501 127.213 126.883 126.532 126.1 125.569 124.759 121.26 -3 ,7521 ,TETRA ,17591142,Sat Nov 27 21:55:04 CET,Sun Nov 28 00:13:50 CET,0.0 1.696 2.459 3.036 3.508 3.957 4.397 4.792 5.521 5.879 6.206 6.299 7.122 7.432 8.029 8.579 9.112 9.375 9.891 10.402 11.139 11.624 12.109 12.804 13.476 14.139 14.798 15.455 16.319 17.183 18.043 19.085 20.104 21.112 22.3 23.671 25.033 26.535 28.154 29.917 31.848 34.095 36.768 39.569 42.991 46.938 51.714 57.421 64.597 73.681 85.679 96.885 104.419 109.85 113.823 116.879 119.237 121.15 122.592 123.87 124.883 125.673 126.325 126.851 127.249 127.573 127.868 128.076 128.213 128.319 128.424 128.494 128.537 128.568 128.561 128.537 128.499 128.409 128.228 128.082 127.944 127.689 127.476 127.259 127.149 126.906 126.623 126.29 126.115 125.584 125.687 125.548 125.394 124.977 124.702 124.389 124.029 123.56 122.991 122.17 116.898 -4 ,21946 ,TETRA ,17591143,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:50:59 CET,0.0 1.947 2.724 3.27 3.737 4.171 4.598 5.014 5.777 6.118 6.435 6.546 7.374 7.679 8.269 8.832 9.371 9.642 10.175 10.688 11.44 11.936 12.417 13.125 13.825 14.507 15.186 15.839 16.691 17.535 18.361 19.396 20.423 21.427 22.622 23.991 25.334 26.891 28.611 30.436 32.385 34.637 37.358 40.166 43.548 47.518 52.355 58.097 65.29 74.495 86.873 98.545 106.211 111.548 115.371 118.292 120.493 122.236 123.595 124.766 125.65 126.384 127.01 127.513 127.916 128.239 128.535 128.756 128.902 129.033 129.162 129.241 129.288 129.299 129.289 129.286 129.263 129.217 129.156 129.095 129.032 128.941 128.858 128.752 128.697 128.555 128.346 128.113 127.98 127.448 127.536 127.387 127.247 126.859 126.595 126.301 125.972 125.583 125.093 124.446 121.725 -5 ,24964 ,TETRA ,17591144,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:50:50 CET,0.0 1.825 2.588 3.193 3.688 4.124 4.544 4.945 5.677 6.021 6.355 6.482 7.3 7.592 8.188 8.766 9.309 9.575 10.097 10.615 11.391 11.898 12.403 13.144 13.854 14.549 15.237 15.903 16.769 17.62 18.455 19.482 20.494 21.483 22.653 23.995 25.309 26.813 28.49 30.294 32.256 34.542 37.271 40.106 43.55 47.568 52.433 58.255 65.54 74.776 87.011 98.273 105.784 111.29 115.331 118.354 120.618 122.438 123.8 124.997 125.941 126.667 127.272 127.798 128.23 128.579 128.896 129.153 129.353 129.5 129.6 129.664 129.681 129.648 129.625 129.607 129.575 129.515 129.423 129.344 129.245 129.048 128.904 128.734 128.645 128.479 128.268 128.005 127.87 127.342 127.379 127.21 127.015 126.511 126.225 125.899 125.503 125.065 124.507 123.641 118.578 -6 ,28925 ,TETRA ,17591145,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:54:33 CET,0.0 1.764 2.487 3.064 3.55 3.988 4.43 4.843 5.571 5.914 6.238 6.323 7.131 7.419 7.947 8.499 9.081 9.351 9.868 10.356 11.079 11.572 12.057 12.75 13.418 14.094 14.752 15.385 16.211 17.047 17.886 18.894 19.887 20.883 22.051 23.389 24.705 26.18 27.836 29.667 31.663 33.97 36.74 39.564 42.948 46.934 51.789 57.55 64.703 73.862 86.166 97.658 105.325 110.821 114.874 118.049 120.499 122.472 123.988 125.317 126.329 127.114 127.78 128.328 128.767 129.137 129.468 129.709 129.903 130.087 130.215 130.293 130.353 130.384 130.391 130.376 130.32 130.23 130.119 130.044 129.964 129.791 129.666 129.529 129.446 129.286 129.111 128.883 128.746 128.215 128.225 128.025 127.834 127.319 127.018 126.691 126.298 125.834 125.273 124.428 115.818 -7 ,26191 ,TETRA ,17591146,Sat Nov 27 21:31:13 CET,Sat Nov 27 23:59:18 CET,0.0 1.799 2.53 3.121 3.635 4.076 4.462 4.85 5.647 6.027 6.385 6.54 7.38 7.687 8.314 8.917 9.486 9.769 10.329 10.867 11.635 12.137 12.637 13.374 14.102 14.807 15.473 16.133 17.015 17.888 18.726 19.745 20.78 21.82 23.036 24.393 25.706 27.208 28.879 30.707 32.72 35.047 37.827 40.702 44.124 48.117 52.957 58.751 66.04 75.381 88.017 99.854 107.541 113.049 117.044 120.08 122.396 124.221 125.63 126.905 127.913 128.728 129.407 129.955 130.384 130.742 131.121 131.428 131.663 131.868 132.046 132.165 132.273 132.371 132.416 132.453 132.47 132.422 132.343 132.311 132.272 132.166 132.083 131.964 131.895 131.766 131.604 131.408 131.307 130.817 130.965 130.818 130.664 130.325 130.082 129.78 129.447 129.003 128.441 127.772 120.16 -8 ,28829 ,TETRA ,17591147,Sat Nov 27 21:31:13 CET,Sat Nov 27 23:50:26 CET,0.0 1.687 2.328 2.847 3.314 3.764 4.19 4.603 5.35 5.69 6.021 6.165 6.982 7.272 7.856 8.416 8.956 9.227 9.754 10.252 10.975 11.456 11.942 12.643 13.329 14.019 14.693 15.34 16.189 17.037 17.867 18.875 19.899 20.927 22.118 23.455 24.758 26.238 27.903 29.718 31.666 33.906 36.594 39.413 42.846 46.862 51.761 57.576 64.789 73.995 86.305 97.874 105.606 111.161 115.252 118.353 120.707 122.589 124.022 125.263 126.203 126.978 127.655 128.239 128.73 129.106 129.457 129.747 129.951 130.114 130.247 130.328 130.402 130.478 130.525 130.557 130.563 130.551 130.519 130.492 130.445 130.338 130.254 130.139 130.077 129.953 129.822 129.63 129.504 128.989 129.039 128.851 128.64 128.139 127.886 127.631 127.325 126.936 126.435 125.722 123.083 -9 ,18730 ,TETRA ,17591148,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:57:12 CET,0.0 1.868 2.66 3.25 3.709 4.118 4.504 4.899 5.67 6.027 6.366 6.483 7.314 7.625 8.229 8.797 9.336 9.602 10.133 10.653 11.423 11.934 12.428 13.148 13.861 14.555 15.232 15.903 16.812 17.679 18.485 19.497 20.508 21.512 22.697 24.044 25.367 26.854 28.504 30.3 32.245 34.506 37.254 40.138 43.624 47.713 52.646 58.467 65.737 75.067 87.709 99.498 107.316 112.89 117.02 120.256 122.673 124.529 125.937 127.221 128.231 129.004 129.62 130.15 130.624 131.019 131.341 131.551 131.736 131.909 132.0 132.049 132.103 132.167 132.181 132.142 132.104 132.067 132.001 131.934 131.859 131.729 131.629 131.493 131.419 131.284 131.124 130.942 130.838 130.346 130.434 130.245 130.042 129.587 129.314 129.01 128.637 128.14 127.585 126.904 122.196 -10 ,26386 ,TETRA ,17591149,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:53:29 CET,0.0 1.649 2.37 2.956 3.461 3.882 4.311 4.749 5.538 5.893 6.218 6.323 7.149 7.463 8.083 8.657 9.191 9.456 10.005 10.553 11.312 11.792 12.282 13.001 13.686 14.37 15.063 15.742 16.604 17.45 18.309 19.37 20.394 21.397 22.587 23.94 25.262 26.748 28.44 30.323 32.353 34.691 37.459 40.29 43.693 47.668 52.458 58.182 65.377 74.586 86.907 98.386 106.076 111.645 115.777 119.006 121.504 123.469 124.996 126.366 127.362 128.142 128.849 129.45 129.907 130.298 130.684 130.99 131.206 131.369 131.513 131.62 131.703 131.743 131.752 131.733 131.693 131.641 131.552 131.471 131.384 131.234 131.121 130.99 130.907 130.738 130.569 130.377 130.247 129.724 129.836 129.655 129.446 129.012 128.751 128.475 128.178 127.816 127.28 126.512 120.813 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt deleted file mode 100644 index 122a19b7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19043 ,TETRA ,17591150,Sat Nov 27 21:31:13 CET,Sat Nov 27 23:53:59 CET,0.0 1.823 2.554 3.152 3.678 4.149 4.583 5.006 5.828 6.202 6.55 6.692 7.533 7.846 8.447 9.039 9.613 9.905 10.488 11.045 11.864 12.402 12.937 13.72 14.482 15.213 15.94 16.652 17.548 18.435 19.321 20.408 21.465 22.508 23.762 25.183 26.551 28.077 29.789 31.661 33.644 35.97 38.786 41.676 45.171 49.222 54.17 60.072 67.336 76.485 88.787 100.401 108.083 113.566 117.603 120.724 123.129 125.064 126.542 127.843 128.836 129.662 130.374 130.984 131.494 131.879 132.244 132.558 132.785 132.977 133.14 133.247 133.343 133.416 133.464 133.512 133.54 133.552 133.555 133.534 133.497 133.437 133.385 133.311 133.25 133.112 132.997 132.874 132.798 132.331 132.473 132.342 132.201 131.891 131.706 131.495 131.24 130.905 130.441 129.808 124.961 -2 ,28876 ,TETRA ,17591151,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:55:24 CET,0.0 2.29 3.046 3.632 4.119 4.578 5.008 5.414 6.149 6.495 6.835 6.97 7.805 8.123 8.729 9.311 9.918 10.215 10.754 11.281 12.059 12.576 13.088 13.829 14.546 15.248 15.927 16.588 17.481 18.35 19.206 20.287 21.326 22.347 23.572 24.954 26.314 27.863 29.569 31.417 33.404 35.727 38.502 41.362 44.83 48.872 53.728 59.491 66.715 75.964 88.499 100.244 108.096 113.71 117.81 120.976 123.461 125.504 127.035 128.379 129.442 130.297 131.051 131.691 132.184 132.547 132.885 133.18 133.412 133.612 133.776 133.896 134.024 134.133 134.186 134.222 134.257 134.257 134.226 134.203 134.162 134.077 134.001 133.928 133.885 133.764 133.622 133.473 133.374 132.88 133.01 132.864 132.693 132.304 132.107 131.904 131.651 131.335 130.908 130.19 126.733 -3 ,17157 ,TETRA ,17591152,Sat Nov 27 21:31:12 CET,Sat Nov 27 23:49:57 CET,0.0 2.7 3.452 4.1 4.683 5.243 5.733 6.168 7.014 7.378 7.721 7.894 8.746 9.077 9.71 10.297 10.867 11.145 11.686 12.234 13.044 13.558 14.061 14.803 15.514 16.225 16.925 17.612 18.506 19.379 20.236 21.289 22.316 23.344 24.571 25.954 27.298 28.805 30.48 32.298 34.281 36.576 39.338 42.231 45.691 49.711 54.59 60.36 67.53 76.723 89.138 100.817 108.523 113.919 117.882 121.009 123.455 125.407 126.897 128.229 129.228 130.045 130.79 131.425 131.934 132.331 132.698 132.995 133.235 133.465 133.68 133.831 133.962 134.085 134.176 134.252 134.311 134.334 134.304 134.278 134.259 134.225 134.195 134.124 134.068 133.955 133.848 133.714 133.632 133.168 133.32 133.188 133.031 132.665 132.452 132.166 131.842 131.473 131.036 130.434 128.012 -4 ,652 ,TETRA ,17591153,Sat Nov 27 21:31:14 CET,Sat Nov 27 23:49:33 CET,0.0 1.869 2.549 3.083 3.576 4.037 4.499 4.929 5.706 6.083 6.434 6.595 7.449 7.769 8.386 8.986 9.58 9.869 10.434 10.983 11.765 12.268 12.782 13.556 14.296 15.006 15.715 16.424 17.362 18.282 19.154 20.2 21.245 22.285 23.509 24.905 26.266 27.803 29.502 31.345 33.317 35.575 38.323 41.192 44.62 48.567 53.329 59.017 66.072 75.041 87.058 98.402 106.066 111.59 115.675 118.835 121.245 123.17 124.678 126.056 127.101 127.922 128.638 129.225 129.699 130.096 130.459 130.736 130.938 131.127 131.289 131.383 131.485 131.59 131.65 131.697 131.71 131.699 131.675 131.667 131.67 131.66 131.635 131.601 131.571 131.468 131.32 131.13 131.022 130.538 130.702 130.58 130.44 130.058 129.818 129.55 129.251 128.901 128.487 127.878 125.367 -5 ,25217 ,TETRA ,17591154,Sat Nov 27 21:31:13 CET,Sat Nov 27 23:50:52 CET,0.0 2.387 3.216 3.885 4.473 4.985 5.442 5.862 6.607 6.956 7.305 7.48 8.335 8.657 9.293 9.907 10.515 10.82 11.413 11.995 12.846 13.38 13.878 14.608 15.353 16.101 16.824 17.519 18.415 19.285 20.14 21.201 22.263 23.303 24.516 25.904 27.268 28.838 30.579 32.452 34.479 36.818 39.654 42.633 46.255 50.413 55.361 61.218 68.565 77.935 90.412 102.076 109.824 115.32 119.357 122.518 124.998 127.009 128.558 129.92 130.949 131.789 132.538 133.168 133.679 134.11 134.498 134.797 135.02 135.229 135.419 135.532 135.621 135.69 135.717 135.724 135.737 135.725 135.673 135.636 135.586 135.489 135.411 135.303 135.235 135.077 134.93 134.785 134.702 134.238 134.372 134.238 134.115 133.783 133.57 133.328 133.019 132.609 132.043 131.23 127.688 -6 ,10378 ,TETRA ,17591155,Sat Nov 27 21:31:14 CET,Sat Nov 27 23:49:37 CET,0.0 2.456 3.317 3.979 4.586 5.107 5.548 5.946 6.678 7.02 7.367 7.516 8.348 8.655 9.245 9.82 10.385 10.666 11.208 11.722 12.477 12.982 13.482 14.217 14.932 15.634 16.333 17.018 17.901 18.778 19.644 20.686 21.691 22.684 23.873 25.246 26.616 28.144 29.806 31.633 33.609 35.879 38.659 41.537 44.942 48.895 53.728 59.542 66.847 76.191 88.665 100.374 108.176 113.673 117.711 120.851 123.287 125.284 126.798 128.16 129.252 130.133 130.915 131.553 132.059 132.491 132.901 133.237 133.514 133.768 133.995 134.156 134.307 134.443 134.521 134.59 134.632 134.644 134.666 134.686 134.687 134.651 134.597 134.516 134.471 134.38 134.283 134.171 134.103 133.653 133.861 133.738 133.598 133.317 133.145 132.935 132.703 132.398 131.93 131.263 128.039 -7 ,23453 ,TETRA ,17591156,Sat Nov 27 21:32:14 CET,Sat Nov 27 23:54:21 CET,0.0 1.963 2.688 3.337 3.914 4.408 4.868 5.281 5.992 6.336 6.685 6.872 7.725 8.039 8.659 9.269 9.865 10.167 10.744 11.284 12.072 12.595 13.115 13.869 14.602 15.321 16.035 16.741 17.696 18.625 19.503 20.569 21.604 22.626 23.849 25.238 26.584 28.114 29.841 31.738 33.784 36.176 39.041 41.99 45.574 49.727 54.691 60.574 67.899 77.224 89.762 101.516 109.372 115.023 119.228 122.523 125.042 127.048 128.619 130.041 131.122 131.992 132.73 133.341 133.849 134.268 134.639 134.936 135.186 135.423 135.632 135.779 135.906 136.03 136.109 136.167 136.213 136.226 136.229 136.206 136.163 136.103 136.058 135.988 135.938 135.835 135.681 135.489 135.4 134.94 135.112 134.992 134.867 134.564 134.347 134.099 133.837 133.552 133.156 132.447 129.968 -8 ,1525 ,TETRA ,17591157,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:54:12 CET,0.0 3.071 3.804 4.361 4.84 5.286 5.722 6.106 6.812 7.154 7.48 7.595 8.417 8.728 9.328 9.886 10.43 10.7 11.225 11.743 12.498 12.999 13.502 14.228 14.929 15.612 16.276 16.936 17.82 18.691 19.544 20.585 21.618 22.639 23.845 25.233 26.598 28.13 29.808 31.62 33.557 35.811 38.549 41.407 44.855 48.881 53.755 59.544 66.794 76.102 88.657 100.447 108.392 114.133 118.363 121.609 124.08 126.078 127.645 129.05 130.12 130.998 131.777 132.431 132.964 133.398 133.779 134.066 134.272 134.452 134.593 134.695 134.821 134.943 135.002 135.038 135.085 135.126 135.136 135.132 135.105 135.034 134.978 134.9 134.859 134.756 134.61 134.432 134.333 133.859 133.985 133.828 133.672 133.264 133.031 132.78 132.502 132.186 131.71 131.04 127.371 -9 ,27618 ,TETRA ,17591158,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:51:04 CET,0.0 2.223 2.968 3.562 4.08 4.556 5.008 5.437 6.238 6.615 6.974 7.128 7.97 8.289 8.907 9.493 10.052 10.327 10.878 11.414 12.191 12.702 13.224 13.999 14.743 15.45 16.138 16.838 17.755 18.649 19.522 20.586 21.62 22.622 23.825 25.219 26.59 28.145 29.851 31.696 33.697 36.031 38.843 41.756 45.253 49.304 54.217 60.095 67.426 76.742 89.296 101.163 109.077 114.671 118.75 121.942 124.399 126.351 127.854 129.192 130.249 131.128 131.898 132.561 133.109 133.574 133.991 134.289 134.544 134.792 135.002 135.159 135.3 135.42 135.482 135.51 135.539 135.567 135.549 135.522 135.497 135.426 135.367 135.302 135.257 135.158 135.021 134.823 134.718 134.236 134.399 134.251 134.054 133.589 133.302 132.992 132.622 132.168 131.634 130.952 127.097 -10 ,31149 ,TETRA ,17591159,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:54:42 CET,0.0 2.824 3.454 3.994 4.439 4.857 5.271 5.668 6.385 6.731 7.071 7.208 8.04 8.353 8.962 9.543 10.102 10.385 10.94 11.464 12.215 12.702 13.199 13.933 14.645 15.346 16.024 16.691 17.563 18.416 19.258 20.29 21.308 22.325 23.525 24.894 26.237 27.765 29.472 31.34 33.368 35.72 38.544 41.445 44.907 48.901 53.766 59.608 66.898 76.166 88.54 100.084 107.733 113.258 117.289 120.353 122.744 124.689 126.185 127.541 128.6 129.453 130.2 130.847 131.368 131.787 132.202 132.54 132.803 133.064 133.324 133.502 133.641 133.746 133.796 133.826 133.846 133.863 133.878 133.864 133.82 133.725 133.658 133.587 133.537 133.428 133.287 133.104 133.01 132.534 132.66 132.509 132.343 131.954 131.725 131.464 131.16 130.805 130.35 129.611 127.663 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18631-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18631-1.txt deleted file mode 100644 index e41422b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18631-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5115 ,KEBNE ,17026781,Wed Dec 22 15:11:04 CET,Wed Dec 22 16:45:25 CET,0.0 1.078 1.601 1.939 2.247 2.527 2.783 3.029 3.46 3.654 3.844 3.823 4.358 4.524 4.81 5.068 5.337 5.47 5.732 5.995 6.364 6.579 6.779 7.07 7.342 7.618 7.896 8.162 8.502 8.831 9.157 9.526 9.874 10.24 10.674 11.142 11.573 12.049 12.573 13.118 13.674 14.312 15.046 15.773 16.637 17.585 18.645 19.805 21.123 22.56 24.039 24.909 25.078 24.958 24.698 24.306 23.88 23.452 23.048 22.614 22.201 21.822 21.458 21.073 20.685 20.329 19.956 19.608 19.293 18.963 18.615 18.327 18.018 17.69 17.426 17.132 16.827 16.509 16.155 15.913 15.679 15.299 15.012 14.694 14.537 14.217 13.87 13.464 13.237 12.661 12.552 12.312 12.049 11.435 11.084 10.688 10.246 9.745 9.104 8.229 6.129 -2 ,23067 ,KEBNE ,17026782,Wed Dec 22 15:11:04 CET,Wed Dec 22 16:45:18 CET,0.0 1.253 1.727 2.127 2.454 2.723 2.966 3.204 3.641 3.832 4.011 3.988 4.515 4.666 4.972 5.262 5.541 5.68 5.939 6.18 6.529 6.752 6.967 7.275 7.571 7.852 8.116 8.381 8.729 9.053 9.355 9.725 10.096 10.453 10.868 11.334 11.769 12.244 12.745 13.27 13.834 14.454 15.176 15.932 16.774 17.678 18.73 19.896 21.194 22.644 24.19 25.052 25.176 24.971 24.667 24.327 23.945 23.558 23.193 22.746 22.314 21.927 21.541 21.166 20.819 20.494 20.118 19.759 19.461 19.147 18.803 18.505 18.186 17.848 17.575 17.288 16.979 16.643 16.285 16.049 15.818 15.438 15.161 14.867 14.714 14.385 14.024 13.643 13.435 12.869 12.765 12.505 12.22 11.627 11.278 10.888 10.467 9.972 9.392 8.564 6.193 -3 ,12407 ,KEBNE ,17026783,Wed Dec 22 15:12:06 CET,Wed Dec 22 16:46:05 CET,0.0 0.984 1.516 1.974 2.364 2.66 2.936 3.177 3.606 3.801 3.978 3.959 4.487 4.65 4.981 5.277 5.543 5.67 5.928 6.178 6.535 6.757 6.962 7.272 7.578 7.873 8.158 8.43 8.772 9.09 9.397 9.769 10.123 10.484 10.906 11.356 11.804 12.29 12.806 13.37 13.95 14.591 15.322 16.057 16.902 17.853 18.97 20.139 21.441 22.853 24.216 25.052 25.228 25.111 24.878 24.562 24.164 23.729 23.343 22.937 22.54 22.165 21.781 21.388 21.015 20.665 20.274 19.912 19.584 19.237 18.89 18.603 18.297 17.96 17.685 17.393 17.088 16.768 16.438 16.207 15.96 15.556 15.268 14.982 14.838 14.525 14.169 13.779 13.574 13.005 12.895 12.638 12.354 11.739 11.406 11.056 10.668 10.218 9.606 8.826 6.656 -4 ,2147 ,KEBNE ,17026784,Wed Dec 22 15:12:06 CET,Wed Dec 22 16:47:44 CET,0.0 1.036 1.531 1.889 2.199 2.483 2.737 2.967 3.386 3.578 3.765 3.771 4.307 4.455 4.733 5.0 5.265 5.397 5.66 5.909 6.253 6.473 6.687 6.993 7.284 7.567 7.843 8.117 8.464 8.787 9.101 9.468 9.823 10.164 10.566 11.028 11.457 11.938 12.453 12.985 13.56 14.222 14.971 15.713 16.58 17.53 18.595 19.761 21.072 22.477 23.903 24.76 25.016 24.972 24.749 24.377 23.955 23.538 23.127 22.656 22.242 21.862 21.476 21.09 20.702 20.338 19.952 19.597 19.285 18.946 18.57 18.251 17.926 17.593 17.354 17.098 16.792 16.467 16.125 15.877 15.616 15.206 14.925 14.628 14.474 14.162 13.81 13.422 13.216 12.647 12.57 12.325 12.054 11.461 11.126 10.744 10.301 9.787 9.169 8.342 5.954 -5 ,21273 ,KEBNE ,17026789,Wed Dec 22 15:13:07 CET,Wed Dec 22 16:48:59 CET,0.0 1.055 1.531 1.868 2.153 2.436 2.695 2.922 3.355 3.56 3.747 3.733 4.271 4.433 4.733 5.01 5.281 5.413 5.671 5.927 6.288 6.509 6.716 7.004 7.288 7.574 7.843 8.109 8.449 8.774 9.102 9.507 9.889 10.237 10.647 11.11 11.537 12.006 12.52 13.062 13.638 14.294 15.027 15.737 16.552 17.47 18.54 19.675 20.932 22.292 23.638 24.426 24.614 24.483 24.158 23.754 23.325 22.875 22.469 21.978 21.518 21.12 20.709 20.332 19.968 19.591 19.209 18.884 18.601 18.278 17.927 17.63 17.305 16.966 16.712 16.443 16.148 15.836 15.488 15.251 15.013 14.612 14.331 14.023 13.856 13.534 13.199 12.828 12.629 12.08 12.012 11.775 11.502 10.903 10.575 10.21 9.798 9.298 8.715 7.886 5.838 -6 ,20283 ,KEBNE ,17026790,Wed Dec 22 15:13:07 CET,Wed Dec 22 16:49:33 CET,0.0 1.2 1.668 2.01 2.324 2.612 2.869 3.114 3.539 3.722 3.897 3.863 4.393 4.552 4.856 5.147 5.419 5.546 5.779 6.001 6.337 6.559 6.775 7.087 7.386 7.673 7.946 8.206 8.551 8.89 9.211 9.585 9.935 10.28 10.688 11.128 11.552 12.007 12.498 13.044 13.632 14.294 15.041 15.779 16.639 17.597 18.652 19.79 21.031 22.341 23.721 24.52 24.649 24.47 24.177 23.828 23.418 22.951 22.531 22.107 21.699 21.302 20.898 20.476 20.081 19.712 19.304 18.923 18.585 18.248 17.898 17.598 17.279 16.954 16.698 16.412 16.109 15.787 15.435 15.188 14.936 14.536 14.25 13.946 13.793 13.478 13.13 12.751 12.549 11.979 11.863 11.605 11.331 10.697 10.344 9.975 9.518 8.999 8.403 7.596 5.155 -7 ,1514 ,KEBNE ,17026791,Wed Dec 22 15:13:08 CET,Wed Dec 22 16:48:22 CET,0.0 2.683 3.287 3.677 4.03 4.319 4.586 4.824 5.244 5.443 5.638 5.631 6.157 6.296 6.573 6.854 7.12 7.251 7.506 7.75 8.096 8.314 8.514 8.805 9.104 9.398 9.68 9.948 10.283 10.607 10.923 11.304 11.667 12.025 12.442 12.891 13.314 13.793 14.311 14.844 15.416 16.078 16.824 17.559 18.419 19.351 20.387 21.545 22.849 24.209 25.62 26.447 26.619 26.444 26.121 25.74 25.338 24.936 24.568 24.164 23.765 23.397 23.036 22.647 22.256 21.908 21.524 21.154 20.819 20.478 20.133 19.844 19.551 19.221 18.94 18.649 18.33 17.999 17.665 17.435 17.195 16.798 16.527 16.249 16.093 15.762 15.399 15.017 14.824 14.254 14.148 13.916 13.671 13.112 12.757 12.366 11.936 11.414 10.762 9.935 7.408 -8 ,27096 ,KEBNE ,17026792,Wed Dec 22 15:13:08 CET,Wed Dec 22 16:47:23 CET,0.0 1.032 1.487 1.857 2.167 2.445 2.715 2.944 3.358 3.548 3.725 3.684 4.217 4.376 4.663 4.946 5.207 5.337 5.594 5.824 6.145 6.356 6.568 6.871 7.159 7.445 7.712 7.977 8.333 8.672 8.989 9.356 9.711 10.061 10.496 10.98 11.419 11.909 12.438 12.99 13.561 14.21 14.969 15.694 16.521 17.436 18.476 19.654 20.983 22.4 23.825 24.641 24.786 24.673 24.438 24.081 23.671 23.259 22.869 22.421 21.996 21.6 21.22 20.845 20.484 20.147 19.771 19.427 19.123 18.773 18.398 18.088 17.777 17.445 17.165 16.883 16.595 16.279 15.947 15.719 15.474 15.079 14.8 14.509 14.36 14.036 13.679 13.292 13.088 12.522 12.423 12.181 11.926 11.344 11.031 10.677 10.259 9.768 9.216 8.481 6.097 -9 ,17027 ,KEBNE ,17026793,Wed Dec 22 15:13:08 CET,Wed Dec 22 16:48:25 CET,0.0 1.125 1.57 1.932 2.245 2.516 2.762 2.997 3.453 3.66 3.849 3.834 4.363 4.523 4.834 5.134 5.418 5.552 5.794 6.017 6.355 6.569 6.776 7.089 7.4 7.685 7.952 8.224 8.582 8.928 9.249 9.627 9.987 10.336 10.745 11.216 11.666 12.149 12.648 13.172 13.743 14.376 15.101 15.83 16.678 17.608 18.658 19.8 21.061 22.426 23.802 24.597 24.793 24.637 24.323 23.963 23.583 23.178 22.763 22.313 21.913 21.542 21.171 20.811 20.475 20.158 19.816 19.476 19.157 18.83 18.495 18.203 17.885 17.549 17.279 16.996 16.701 16.37 16.014 15.783 15.535 15.132 14.861 14.566 14.408 14.078 13.706 13.316 13.113 12.547 12.459 12.218 11.961 11.366 11.026 10.659 10.263 9.815 9.133 8.118 4.587 -10 ,10181 ,KEBNE ,17026794,Wed Dec 22 15:14:10 CET,Wed Dec 22 16:50:50 CET,0.0 1.455 1.955 2.334 2.656 2.93 3.161 3.369 3.772 3.963 4.143 4.114 4.654 4.823 5.125 5.408 5.682 5.808 6.05 6.283 6.633 6.856 7.066 7.382 7.692 7.992 8.283 8.555 8.895 9.23 9.55 9.93 10.297 10.643 11.045 11.51 11.96 12.457 12.993 13.543 14.115 14.758 15.464 16.165 16.974 17.841 18.841 19.95 21.236 22.649 24.075 24.934 25.166 25.087 24.845 24.491 24.121 23.754 23.379 22.944 22.543 22.174 21.8 21.423 21.056 20.716 20.338 20.004 19.7 19.35 18.985 18.68 18.345 17.989 17.72 17.438 17.133 16.783 16.408 16.161 15.908 15.498 15.206 14.913 14.758 14.43 14.091 13.721 13.513 12.938 12.818 12.556 12.267 11.628 11.29 10.93 10.516 10.048 9.474 8.643 5.459 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index c51a57ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,436 ,TETRA ,17591160,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:24:42 CET,0.0 1.331 1.881 2.311 2.675 2.98 3.267 3.522 3.953 4.153 4.358 4.374 4.925 5.102 5.419 5.722 6.007 6.138 6.39 6.645 7.005 7.217 7.428 7.747 8.043 8.306 8.563 8.82 9.144 9.442 9.722 10.052 10.369 10.673 11.033 11.44 11.807 12.186 12.597 13.023 13.43 13.895 14.455 14.988 15.557 16.17 16.817 17.417 18.051 18.552 18.683 18.203 17.44 16.639 15.874 15.092 14.346 13.676 13.04 12.351 11.766 11.244 10.721 10.204 9.725 9.3 8.829 8.393 8.02 7.627 7.212 6.87 6.512 6.125 5.824 5.514 5.183 4.83 4.464 4.209 3.951 3.551 3.26 2.948 2.79 2.46 2.105 1.717 1.499 0.91 0.831 0.586 0.33 -0.27 -0.612 -0.966 -1.375 -1.855 -2.469 -3.248 -4.977 -2 ,15597 ,TETRA ,17591161,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:22:41 CET,0.0 1.405 1.991 2.432 2.785 3.093 3.379 3.641 4.118 4.33 4.54 4.552 5.101 5.28 5.612 5.921 6.215 6.355 6.616 6.871 7.225 7.441 7.655 7.958 8.243 8.522 8.793 9.055 9.396 9.708 9.995 10.348 10.695 11.013 11.36 11.746 12.116 12.525 12.954 13.406 13.879 14.398 14.971 15.514 16.097 16.684 17.297 17.92 18.556 19.057 19.153 18.607 17.855 17.053 16.254 15.469 14.748 14.069 13.44 12.761 12.16 11.627 11.102 10.586 10.1 9.636 9.118 8.682 8.305 7.913 7.499 7.129 6.756 6.384 6.088 5.758 5.405 5.064 4.706 4.444 4.164 3.713 3.404 3.072 2.891 2.522 2.14 1.728 1.517 0.93 0.823 0.577 0.332 -0.249 -0.575 -0.918 -1.34 -1.819 -2.375 -3.131 -4.984 -3 ,13766 ,TETRA ,17591162,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:22:01 CET,0.0 1.438 2.017 2.459 2.83 3.152 3.434 3.68 4.125 4.347 4.565 4.597 5.143 5.311 5.634 5.926 6.204 6.345 6.625 6.88 7.231 7.461 7.687 8.006 8.298 8.576 8.855 9.122 9.449 9.75 10.043 10.395 10.732 11.067 11.437 11.835 12.231 12.653 13.07 13.515 13.965 14.434 14.96 15.479 16.063 16.638 17.241 17.87 18.487 18.977 19.139 18.681 17.987 17.199 16.396 15.633 14.891 14.191 13.557 12.888 12.323 11.813 11.305 10.797 10.322 9.876 9.377 8.95 8.6 8.205 7.784 7.453 7.1 6.716 6.405 6.089 5.777 5.452 5.084 4.823 4.559 4.14 3.842 3.53 3.364 2.993 2.615 2.233 2.023 1.443 1.329 1.066 0.806 0.211 -0.123 -0.476 -0.844 -1.279 -1.849 -2.632 -4.345 -4 ,14794 ,TETRA ,17591163,Sat Nov 27 21:33:12 CET,Sat Nov 27 23:23:09 CET,0.0 1.3 1.872 2.295 2.66 2.971 3.247 3.512 4.003 4.227 4.434 4.462 5.016 5.187 5.513 5.82 6.106 6.246 6.499 6.73 7.073 7.298 7.508 7.791 8.058 8.327 8.583 8.827 9.152 9.473 9.767 10.104 10.436 10.753 11.111 11.5 11.861 12.259 12.67 13.088 13.559 14.096 14.691 15.286 15.924 16.56 17.211 17.838 18.448 18.932 19.026 18.477 17.704 16.83 15.951 15.157 14.431 13.741 13.114 12.423 11.812 11.269 10.767 10.293 9.831 9.4 8.934 8.497 8.109 7.723 7.332 7.003 6.662 6.302 6.015 5.709 5.391 5.047 4.659 4.399 4.12 3.658 3.363 3.072 2.926 2.619 2.272 1.893 1.694 1.116 1.005 0.715 0.393 -0.319 -0.708 -1.13 -1.635 -2.236 -2.956 -3.982 -6.875 -5 ,6151 ,TETRA ,17591164,Sat Nov 27 21:33:16 CET,Sat Nov 27 23:23:10 CET,0.0 1.059 1.643 2.07 2.434 2.755 3.053 3.325 3.821 4.057 4.279 4.304 4.848 5.023 5.342 5.62 5.893 6.029 6.287 6.532 6.873 7.098 7.326 7.651 7.945 8.228 8.52 8.795 9.135 9.451 9.75 10.114 10.447 10.758 11.135 11.554 11.931 12.33 12.766 13.197 13.643 14.158 14.671 15.136 15.699 16.303 16.932 17.543 18.074 18.511 18.635 18.132 17.36 16.531 15.767 14.998 14.268 13.589 12.961 12.313 11.747 11.239 10.756 10.273 9.814 9.375 8.89 8.477 8.116 7.713 7.295 6.967 6.622 6.236 5.938 5.636 5.322 4.99 4.623 4.362 4.106 3.708 3.427 3.139 2.989 2.654 2.277 1.848 1.611 0.993 0.866 0.614 0.354 -0.221 -0.551 -0.919 -1.337 -1.839 -2.406 -3.148 -5.231 -6 ,15420 ,TETRA ,17591165,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:23:28 CET,0.0 1.23 1.798 2.258 2.645 2.98 3.286 3.563 4.052 4.277 4.488 4.512 5.069 5.246 5.578 5.876 6.157 6.299 6.572 6.817 7.165 7.396 7.613 7.926 8.232 8.526 8.806 9.065 9.394 9.716 10.034 10.392 10.724 11.031 11.368 11.752 12.122 12.535 12.952 13.362 13.785 14.254 14.809 15.351 15.956 16.568 17.249 17.968 18.602 19.063 19.138 18.608 17.842 17.062 16.313 15.551 14.813 14.12 13.502 12.858 12.263 11.72 11.205 10.677 10.181 9.73 9.248 8.804 8.408 8.013 7.613 7.288 6.963 6.606 6.315 6.009 5.674 5.331 4.974 4.714 4.453 4.056 3.771 3.466 3.306 2.974 2.622 2.23 2.021 1.44 1.359 1.113 0.859 0.321 0.004 -0.348 -0.718 -1.167 -1.726 -2.458 -4.538 -7 ,14479 ,TETRA ,17591166,Sat Nov 27 21:33:13 CET,Sat Nov 27 23:23:17 CET,0.0 1.46 2.061 2.518 2.911 3.26 3.547 3.81 4.302 4.525 4.738 4.752 5.305 5.487 5.813 6.116 6.399 6.531 6.785 7.04 7.396 7.621 7.842 8.156 8.455 8.734 8.999 9.261 9.6 9.923 10.243 10.63 10.983 11.317 11.708 12.125 12.519 12.962 13.444 13.933 14.423 14.936 15.497 16.022 16.577 17.192 17.87 18.518 19.077 19.512 19.624 19.057 18.299 17.494 16.698 15.905 15.141 14.422 13.772 13.099 12.527 11.999 11.474 10.962 10.493 10.085 9.621 9.199 8.827 8.418 7.999 7.645 7.294 6.931 6.639 6.342 6.028 5.69 5.337 5.085 4.823 4.414 4.123 3.819 3.669 3.36 3.019 2.65 2.461 1.882 1.785 1.539 1.276 0.658 0.31 -0.057 -0.45 -0.92 -1.468 -2.209 -4.1 -8 ,17724 ,TETRA ,17591167,Sat Nov 27 21:33:13 CET,Sat Nov 27 23:24:02 CET,0.0 1.05 1.606 2.033 2.391 2.708 3.006 3.279 3.768 3.995 4.204 4.206 4.758 4.936 5.25 5.545 5.831 5.972 6.258 6.523 6.878 7.108 7.332 7.665 7.982 8.271 8.536 8.787 9.125 9.442 9.739 10.084 10.402 10.702 11.058 11.442 11.788 12.169 12.57 12.996 13.44 13.909 14.428 14.93 15.521 16.113 16.711 17.344 17.962 18.451 18.529 18.003 17.19 16.338 15.515 14.708 13.977 13.283 12.638 11.972 11.372 10.815 10.271 9.761 9.283 8.835 8.364 7.937 7.556 7.163 6.758 6.412 6.046 5.654 5.334 5.011 4.675 4.322 3.97 3.717 3.456 3.054 2.757 2.445 2.282 1.928 1.558 1.181 0.982 0.397 0.3 0.061 -0.196 -0.752 -1.057 -1.409 -1.825 -2.287 -2.852 -3.621 -5.857 -9 ,8931 ,TETRA ,17591168,Sat Nov 27 21:33:15 CET,Sat Nov 27 23:24:07 CET,0.0 2.079 2.68 3.102 3.47 3.799 4.1 4.385 4.857 5.058 5.239 5.231 5.776 5.947 6.265 6.548 6.82 6.967 7.24 7.476 7.812 8.029 8.24 8.542 8.83 9.112 9.385 9.637 9.952 10.258 10.552 10.897 11.224 11.531 11.877 12.27 12.641 13.036 13.476 13.908 14.349 14.866 15.409 15.921 16.49 17.06 17.689 18.304 18.851 19.331 19.504 19.034 18.264 17.451 16.678 15.924 15.19 14.512 13.905 13.261 12.682 12.153 11.644 11.158 10.695 10.259 9.795 9.387 9.029 8.65 8.254 7.92 7.572 7.192 6.887 6.565 6.229 5.897 5.557 5.31 5.058 4.667 4.379 4.08 3.922 3.578 3.211 2.801 2.588 1.995 1.904 1.659 1.396 0.836 0.519 0.161 -0.311 -0.937 -1.705 -2.694 -5.342 -10 ,1865 ,TETRA ,17591169,Sat Nov 27 21:33:16 CET,Sat Nov 27 23:23:37 CET,0.0 1.443 1.974 2.397 2.734 3.052 3.343 3.6 4.061 4.272 4.477 4.497 5.043 5.211 5.539 5.859 6.149 6.282 6.54 6.79 7.143 7.374 7.601 7.914 8.2 8.48 8.761 9.028 9.353 9.66 9.97 10.337 10.677 11.001 11.37 11.784 12.172 12.571 12.972 13.406 13.881 14.398 14.971 15.492 16.059 16.645 17.258 17.886 18.491 18.988 19.098 18.59 17.848 17.038 16.212 15.375 14.618 13.909 13.26 12.56 11.958 11.411 10.873 10.381 9.923 9.508 9.066 8.648 8.248 7.816 7.384 7.026 6.66 6.276 5.989 5.685 5.357 5.018 4.655 4.396 4.125 3.711 3.424 3.119 2.954 2.604 2.229 1.843 1.64 1.059 0.995 0.759 0.497 -0.096 -0.42 -0.788 -1.197 -1.611 -2.147 -2.922 -5.009 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt deleted file mode 100644 index 20401c39..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15979 ,TETRA ,17591170,Sat Nov 27 21:33:19 CET,Sat Nov 27 23:21:43 CET,0.0 2.241 2.834 3.285 3.676 4.044 4.345 4.617 5.104 5.327 5.542 5.581 6.147 6.341 6.699 7.032 7.34 7.484 7.769 8.034 8.414 8.669 8.917 9.275 9.615 9.951 10.27 10.578 10.974 11.328 11.676 12.101 12.492 12.876 13.344 13.859 14.357 14.915 15.514 16.123 16.748 17.46 18.285 19.119 20.115 21.245 22.498 23.909 25.48 27.121 28.828 29.898 30.203 30.148 29.904 29.554 29.202 28.832 28.462 28.072 27.712 27.339 26.949 26.578 26.194 25.831 25.465 25.129 24.829 24.517 24.178 23.881 23.576 23.243 22.969 22.681 22.386 22.087 21.778 21.557 21.316 20.933 20.663 20.373 20.221 19.904 19.54 19.147 18.948 18.403 18.292 18.038 17.785 17.227 16.899 16.526 16.123 15.651 15.045 14.195 11.666 -2 ,23930 ,TETRA ,17591171,Sat Nov 27 21:33:13 CET,Sat Nov 27 23:26:26 CET,0.0 1.724 2.314 2.816 3.243 3.579 3.856 4.119 4.612 4.852 5.079 5.109 5.666 5.852 6.199 6.529 6.843 6.99 7.263 7.528 7.936 8.195 8.448 8.807 9.149 9.489 9.803 10.102 10.502 10.866 11.223 11.679 12.109 12.509 12.955 13.486 13.998 14.555 15.159 15.802 16.472 17.182 18.024 18.896 19.88 20.985 22.29 23.671 25.205 26.976 28.916 30.031 30.296 30.289 30.146 29.895 29.557 29.136 28.735 28.289 27.866 27.477 27.09 26.694 26.306 25.963 25.595 25.245 24.95 24.637 24.304 24.023 23.714 23.381 23.113 22.829 22.542 22.231 21.874 21.622 21.368 20.955 20.649 20.311 20.143 19.817 19.463 19.084 18.886 18.342 18.239 17.993 17.75 17.187 16.845 16.476 16.05 15.56 14.984 14.213 10.855 -3 ,4518 ,TETRA ,17591172,Sat Nov 27 21:33:12 CET,Sat Nov 27 23:21:50 CET,0.0 2.041 2.692 3.185 3.559 3.855 4.142 4.427 4.942 5.175 5.394 5.407 5.947 6.12 6.454 6.778 7.069 7.214 7.509 7.779 8.166 8.415 8.659 9.032 9.4 9.749 10.074 10.38 10.776 11.164 11.526 11.967 12.37 12.741 13.198 13.738 14.242 14.777 15.361 15.989 16.651 17.394 18.234 19.043 19.988 21.045 22.269 23.659 25.22 26.902 28.63 29.739 30.077 29.995 29.779 29.501 29.113 28.668 28.225 27.763 27.345 26.967 26.6 26.228 25.851 25.488 25.117 24.769 24.462 24.129 23.779 23.509 23.188 22.825 22.555 22.268 21.963 21.656 21.336 21.103 20.849 20.444 20.158 19.862 19.718 19.418 19.078 18.713 18.518 17.981 17.91 17.667 17.407 16.793 16.443 16.084 15.674 15.193 14.576 13.716 10.523 -4 ,8041 ,TETRA ,17591173,Sat Nov 27 21:33:13 CET,Sat Nov 27 23:21:51 CET,0.0 1.514 2.186 2.652 3.032 3.382 3.668 3.929 4.436 4.67 4.881 4.921 5.491 5.672 6.01 6.338 6.648 6.794 7.076 7.349 7.726 7.967 8.215 8.57 8.897 9.234 9.561 9.863 10.253 10.619 10.982 11.417 11.828 12.229 12.695 13.235 13.752 14.299 14.886 15.514 16.171 16.907 17.75 18.529 19.433 20.474 21.652 22.99 24.484 26.125 27.961 29.143 29.525 29.505 29.342 29.106 28.781 28.424 28.048 27.59 27.181 26.814 26.442 26.072 25.701 25.349 24.971 24.625 24.328 24.018 23.664 23.369 23.059 22.712 22.446 22.191 21.934 21.652 21.351 21.131 20.895 20.529 20.267 19.958 19.793 19.475 19.123 18.739 18.544 17.998 17.906 17.68 17.424 16.835 16.515 16.103 15.558 14.895 14.094 13.008 8.988 -5 ,10018 ,TETRA ,17591174,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:21:37 CET,0.0 2.223 2.863 3.32 3.722 4.053 4.359 4.618 5.099 5.324 5.543 5.62 6.186 6.365 6.704 7.03 7.342 7.484 7.755 8.038 8.462 8.722 8.967 9.32 9.658 9.985 10.299 10.59 10.968 11.336 11.698 12.133 12.53 12.92 13.382 13.901 14.399 14.931 15.492 16.114 16.784 17.541 18.415 19.243 20.199 21.241 22.429 23.778 25.301 26.979 28.707 29.712 30.038 29.979 29.712 29.335 28.952 28.574 28.197 27.763 27.356 26.974 26.586 26.203 25.835 25.491 25.127 24.801 24.503 24.177 23.821 23.512 23.188 22.838 22.566 22.298 22.024 21.716 21.385 21.155 20.904 20.51 20.238 19.951 19.791 19.454 19.126 18.768 18.559 17.993 17.879 17.642 17.39 16.782 16.431 16.044 15.615 15.125 14.502 13.646 10.527 -6 ,24141 ,TETRA ,17591175,Sat Nov 27 21:33:15 CET,Sat Nov 27 23:22:16 CET,0.0 1.602 2.218 2.646 3.012 3.333 3.63 3.923 4.454 4.68 4.89 4.946 5.529 5.715 6.043 6.365 6.663 6.809 7.092 7.367 7.754 7.996 8.236 8.586 8.933 9.26 9.568 9.869 10.263 10.647 11.02 11.467 11.915 12.341 12.807 13.344 13.877 14.439 15.015 15.619 16.285 17.043 17.885 18.701 19.666 20.737 21.939 23.303 24.884 26.657 28.505 29.667 30.002 29.915 29.689 29.364 29.015 28.633 28.226 27.787 27.396 27.042 26.683 26.314 25.954 25.634 25.286 24.945 24.646 24.318 23.973 23.685 23.364 23.016 22.732 22.44 22.148 21.846 21.532 21.31 21.073 20.688 20.408 20.102 19.946 19.611 19.253 18.888 18.688 18.137 18.039 17.794 17.536 16.951 16.612 16.249 15.835 15.327 14.73 13.915 11.787 -7 ,24826 ,TETRA ,17591176,Sat Nov 27 21:33:18 CET,Sat Nov 27 23:22:06 CET,0.0 1.563 2.154 2.594 2.992 3.345 3.654 3.942 4.477 4.725 4.937 4.964 5.528 5.716 6.067 6.382 6.674 6.825 7.117 7.396 7.786 8.029 8.267 8.61 8.942 9.255 9.572 9.877 10.277 10.671 11.043 11.486 11.906 12.318 12.804 13.333 13.832 14.392 14.995 15.63 16.277 17.004 17.868 18.708 19.689 20.788 22.035 23.332 24.746 26.351 28.115 29.222 29.423 29.273 29.05 28.731 28.334 27.928 27.544 27.121 26.735 26.366 25.989 25.602 25.243 24.918 24.575 24.248 23.959 23.651 23.304 23.007 22.698 22.357 22.089 21.84 21.557 21.227 20.895 20.651 20.386 19.976 19.699 19.41 19.257 18.935 18.577 18.142 17.903 17.338 17.218 16.968 16.713 16.143 15.809 15.417 14.98 14.444 13.799 13.033 11.193 -8 ,1613 ,TETRA ,17591177,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:22:16 CET,0.0 1.411 1.998 2.451 2.831 3.185 3.496 3.78 4.31 4.564 4.794 4.824 5.393 5.581 5.926 6.255 6.582 6.73 7.012 7.295 7.694 7.948 8.196 8.559 8.9 9.213 9.516 9.816 10.194 10.571 10.933 11.364 11.778 12.167 12.634 13.175 13.695 14.25 14.852 15.51 16.161 16.859 17.68 18.496 19.432 20.447 21.6 22.9 24.319 25.884 27.602 28.607 28.907 28.892 28.717 28.47 28.17 27.835 27.504 27.105 26.723 26.362 25.971 25.577 25.213 24.878 24.489 24.111 23.789 23.458 23.121 22.836 22.528 22.199 21.942 21.67 21.379 21.08 20.759 20.527 20.286 19.909 19.638 19.357 19.212 18.866 18.482 18.109 17.92 17.369 17.288 17.056 16.787 16.201 15.879 15.524 15.131 14.645 14.018 13.211 11.022 -9 ,20559 ,TETRA ,17591178,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:25:00 CET,0.0 1.516 2.068 2.532 2.961 3.339 3.631 3.903 4.408 4.642 4.873 4.93 5.489 5.66 6.007 6.347 6.664 6.811 7.087 7.367 7.785 8.042 8.294 8.65 8.99 9.314 9.616 9.908 10.29 10.666 11.018 11.442 11.837 12.222 12.689 13.198 13.709 14.29 14.884 15.496 16.14 16.875 17.736 18.588 19.58 20.678 21.933 23.303 24.793 26.396 28.122 29.216 29.599 29.659 29.502 29.252 28.949 28.568 28.18 27.738 27.351 27.0 26.624 26.245 25.873 25.514 25.137 24.804 24.513 24.203 23.868 23.578 23.275 22.951 22.698 22.437 22.154 21.836 21.496 21.266 21.022 20.629 20.347 20.055 19.899 19.558 19.202 18.845 18.646 18.087 17.961 17.697 17.432 16.862 16.531 16.174 15.771 15.322 14.773 13.988 11.744 -10 ,24856 ,TETRA ,17591179,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:23:00 CET,0.0 1.904 2.521 2.998 3.38 3.725 4.033 4.297 4.786 5.015 5.225 5.258 5.822 6.012 6.365 6.701 7.017 7.171 7.471 7.754 8.15 8.397 8.642 8.988 9.3 9.616 9.925 10.231 10.629 11.008 11.372 11.814 12.234 12.619 13.082 13.615 14.123 14.695 15.342 15.992 16.641 17.391 18.241 19.077 20.043 21.115 22.356 23.704 25.134 26.668 28.286 29.293 29.584 29.546 29.309 28.951 28.606 28.241 27.867 27.454 27.071 26.696 26.309 25.949 25.611 25.264 24.873 24.526 24.223 23.901 23.561 23.27 22.963 22.631 22.363 22.074 21.77 21.464 21.136 20.905 20.665 20.271 20.002 19.7 19.536 19.215 18.868 18.493 18.299 17.746 17.642 17.413 17.179 16.633 16.294 15.922 15.532 15.064 14.486 13.686 10.997 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18626-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18626-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 11c001d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18626-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2751 ,KEBNE ,17026795,Wed Dec 22 15:14:10 CET,Wed Dec 22 16:48:10 CET,0.0 0.854 1.212 1.5 1.761 2.009 2.229 2.429 2.785 2.939 3.096 3.048 3.533 3.661 3.904 4.124 4.336 4.442 4.648 4.852 5.125 5.293 5.457 5.69 5.92 6.139 6.349 6.546 6.8 7.042 7.273 7.559 7.823 8.066 8.342 8.651 8.959 9.292 9.646 10.02 10.408 10.832 11.289 11.725 12.232 12.807 13.446 14.147 14.915 15.655 16.288 16.514 16.413 16.212 15.974 15.689 15.359 15.028 14.727 14.396 14.093 13.811 13.528 13.251 12.996 12.744 12.457 12.201 11.979 11.743 11.498 11.295 11.083 10.862 10.68 10.486 10.273 10.051 9.837 9.689 9.522 9.237 9.034 8.835 8.732 8.497 8.229 7.939 7.799 7.325 7.372 7.211 7.046 6.651 6.407 6.142 5.86 5.532 5.112 4.534 3.006 -2 ,8458 ,KEBNE ,17026796,Wed Dec 22 15:14:10 CET,Wed Dec 22 16:47:52 CET,0.0 1.158 1.604 1.964 2.256 2.512 2.711 2.894 3.247 3.409 3.563 3.51 3.991 4.124 4.382 4.615 4.833 4.935 5.133 5.327 5.617 5.799 5.97 6.211 6.431 6.636 6.824 7.006 7.256 7.498 7.722 7.993 8.265 8.53 8.829 9.144 9.434 9.762 10.115 10.487 10.888 11.334 11.808 12.267 12.826 13.438 14.056 14.713 15.456 16.178 16.863 17.17 17.081 16.796 16.444 16.1 15.758 15.415 15.101 14.762 14.461 14.163 13.877 13.591 13.296 13.037 12.777 12.55 12.347 12.119 11.87 11.658 11.437 11.203 11.013 10.811 10.606 10.404 10.187 10.039 9.891 9.631 9.433 9.222 9.111 8.895 8.674 8.424 8.296 7.815 7.827 7.649 7.461 7.083 6.865 6.631 6.394 6.098 5.684 5.108 3.23 -3 ,4420 ,KEBNE ,17026797,Wed Dec 22 15:14:10 CET,Wed Dec 22 16:48:10 CET,0.0 1.3 1.751 2.061 2.336 2.577 2.803 3.004 3.36 3.526 3.68 3.614 4.084 4.214 4.472 4.699 4.892 4.982 5.166 5.353 5.614 5.775 5.932 6.171 6.398 6.617 6.836 7.049 7.308 7.549 7.773 8.032 8.302 8.574 8.881 9.199 9.487 9.801 10.149 10.514 10.904 11.348 11.836 12.309 12.826 13.398 14.063 14.78 15.516 16.239 16.955 17.291 17.212 16.983 16.704 16.364 16.012 15.659 15.339 15.021 14.751 14.488 14.21 13.937 13.662 13.4 13.124 12.875 12.657 12.428 12.185 11.969 11.741 11.512 11.341 11.151 10.943 10.729 10.511 10.365 10.204 9.936 9.751 9.554 9.451 9.232 8.994 8.748 8.609 8.127 8.184 8.025 7.856 7.484 7.247 6.988 6.733 6.418 6.02 5.466 3.58 -4 ,27447 ,KEBNE ,17026798,Wed Dec 22 15:14:10 CET,Wed Dec 22 16:47:47 CET,0.0 1.072 1.483 1.817 2.105 2.359 2.587 2.794 3.161 3.33 3.488 3.413 3.889 4.023 4.276 4.5 4.704 4.799 4.993 5.176 5.431 5.609 5.791 6.028 6.244 6.455 6.649 6.845 7.093 7.325 7.56 7.826 8.086 8.336 8.613 8.919 9.205 9.524 9.882 10.274 10.677 11.12 11.611 12.087 12.637 13.235 13.887 14.586 15.339 16.066 16.765 17.043 16.92 16.662 16.362 16.024 15.682 15.363 15.063 14.727 14.396 14.097 13.815 13.541 13.282 13.024 12.75 12.505 12.286 12.041 11.793 11.591 11.372 11.133 10.934 10.74 10.545 10.338 10.114 9.959 9.807 9.55 9.359 9.155 9.047 8.812 8.552 8.279 8.137 7.653 7.692 7.534 7.367 6.987 6.775 6.537 6.247 5.906 5.457 4.815 2.866 -5 ,9662 ,KEBNE ,17026799,Wed Dec 22 15:14:10 CET,Wed Dec 22 16:48:18 CET,0.0 0.96 1.409 1.738 2.004 2.263 2.495 2.678 3.046 3.224 3.385 3.349 3.837 3.969 4.211 4.434 4.65 4.757 4.955 5.147 5.418 5.596 5.775 6.015 6.245 6.472 6.684 6.886 7.147 7.395 7.627 7.904 8.171 8.421 8.704 9.007 9.309 9.659 10.011 10.386 10.778 11.177 11.629 12.107 12.661 13.22 13.842 14.542 15.274 16.02 16.703 16.952 16.871 16.622 16.347 16.039 15.7 15.349 15.017 14.673 14.345 14.045 13.746 13.467 13.214 12.958 12.684 12.441 12.213 11.972 11.722 11.516 11.297 11.073 10.905 10.712 10.491 10.252 10.017 9.865 9.697 9.412 9.209 9.006 8.904 8.689 8.451 8.187 8.049 7.56 7.602 7.443 7.262 6.874 6.653 6.411 6.141 5.809 5.363 4.816 3.383 -6 ,5041 ,KEBNE ,17026800,Wed Dec 22 15:14:10 CET,Wed Dec 22 16:46:36 CET,0.0 0.905 1.322 1.644 1.927 2.164 2.38 2.586 2.931 3.089 3.246 3.194 3.676 3.797 4.027 4.253 4.463 4.562 4.763 4.948 5.2 5.361 5.524 5.753 5.973 6.197 6.414 6.616 6.865 7.121 7.371 7.653 7.911 8.157 8.439 8.762 9.081 9.422 9.794 10.18 10.566 10.982 11.454 11.931 12.468 13.039 13.668 14.359 15.104 15.854 16.508 16.733 16.686 16.494 16.189 15.834 15.479 15.124 14.777 14.409 14.091 13.829 13.575 13.298 13.034 12.806 12.559 12.322 12.099 11.857 11.619 11.422 11.201 10.954 10.773 10.581 10.368 10.134 9.891 9.728 9.558 9.315 9.141 8.948 8.846 8.625 8.387 8.126 7.992 7.511 7.554 7.4 7.239 6.853 6.632 6.399 6.119 5.8 5.402 4.847 3.144 -7 ,29353 ,KEBNE ,17026801,Wed Dec 22 15:14:10 CET,Wed Dec 22 16:47:50 CET,0.0 0.996 1.461 1.797 2.099 2.316 2.495 2.675 2.994 3.147 3.302 3.252 3.735 3.861 4.094 4.322 4.556 4.67 4.885 5.08 5.353 5.52 5.676 5.908 6.125 6.323 6.515 6.704 6.944 7.179 7.407 7.679 7.938 8.187 8.481 8.815 9.123 9.454 9.81 10.175 10.554 10.967 11.456 11.943 12.464 13.031 13.679 14.393 15.164 15.9 16.544 16.772 16.628 16.359 16.043 15.705 15.347 14.999 14.675 14.337 14.031 13.73 13.428 13.147 12.89 12.638 12.365 12.098 11.868 11.641 11.391 11.179 10.957 10.725 10.536 10.332 10.12 9.893 9.671 9.51 9.33 9.072 8.881 8.662 8.553 8.346 8.133 7.9 7.766 7.272 7.3 7.118 6.929 6.518 6.29 6.063 5.814 5.548 5.235 4.709 2.421 -8 ,10757 ,KEBNE ,17026802,Wed Dec 22 15:15:12 CET,Wed Dec 22 16:47:38 CET,0.0 1.329 1.805 2.135 2.419 2.676 2.895 3.089 3.476 3.665 3.826 3.754 4.235 4.362 4.606 4.837 5.037 5.14 5.354 5.559 5.838 6.005 6.167 6.395 6.608 6.837 7.054 7.249 7.501 7.74 7.977 8.261 8.53 8.79 9.095 9.419 9.711 10.036 10.405 10.801 11.207 11.652 12.147 12.628 13.178 13.759 14.373 15.02 15.756 16.525 17.201 17.501 17.41 17.105 16.753 16.41 16.056 15.717 15.394 15.009 14.672 14.38 14.085 13.817 13.571 13.327 13.058 12.793 12.55 12.308 12.073 11.88 11.67 11.431 11.236 11.036 10.824 10.606 10.387 10.233 10.074 9.829 9.64 9.43 9.324 9.09 8.836 8.587 8.458 7.977 8.009 7.831 7.64 7.257 7.038 6.774 6.456 6.101 5.696 5.156 3.468 -9 ,9350 ,KEBNE ,17026803,Wed Dec 22 15:15:12 CET,Wed Dec 22 16:49:27 CET,0.0 0.967 1.395 1.726 1.983 2.223 2.453 2.658 3.025 3.188 3.336 3.274 3.764 3.9 4.142 4.36 4.55 4.652 4.844 5.02 5.278 5.44 5.604 5.837 6.054 6.261 6.476 6.676 6.915 7.155 7.384 7.654 7.918 8.172 8.464 8.775 9.071 9.392 9.74 10.11 10.494 10.924 11.381 11.848 12.413 13.006 13.628 14.306 15.056 15.845 16.558 16.767 16.641 16.404 16.11 15.761 15.395 15.039 14.737 14.428 14.13 13.845 13.568 13.298 13.046 12.799 12.52 12.278 12.063 11.827 11.574 11.354 11.125 10.905 10.733 10.542 10.334 10.111 9.887 9.735 9.582 9.328 9.143 8.938 8.829 8.615 8.38 8.102 7.956 7.469 7.505 7.346 7.171 6.779 6.552 6.299 6.028 5.694 5.3 4.817 3.17 -10 ,1759 ,KEBNE ,17026804,Wed Dec 22 15:15:12 CET,Wed Dec 22 16:49:58 CET,0.0 1.15 1.646 1.962 2.238 2.484 2.699 2.894 3.265 3.432 3.586 3.531 4.015 4.145 4.396 4.632 4.85 4.951 5.146 5.345 5.614 5.784 5.957 6.209 6.44 6.642 6.848 7.048 7.283 7.499 7.711 7.988 8.255 8.508 8.778 9.082 9.387 9.718 10.07 10.425 10.791 11.22 11.72 12.19 12.732 13.316 13.964 14.663 15.382 16.123 16.795 17.027 16.909 16.682 16.43 16.095 15.712 15.337 15.011 14.677 14.362 14.046 13.732 13.434 13.169 12.934 12.666 12.412 12.193 11.956 11.693 11.478 11.273 11.045 10.853 10.652 10.446 10.234 10.003 9.852 9.7 9.442 9.255 9.054 8.949 8.736 8.51 8.256 8.117 7.63 7.667 7.5 7.312 6.908 6.707 6.488 6.222 5.916 5.543 4.943 2.892 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 5305ef6e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12643 ,TETRA ,17591180,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:21:19 CET,0.0 1.014 1.442 1.742 2.01 2.264 2.489 2.692 3.046 3.195 3.336 3.26 3.728 3.847 4.082 4.3 4.499 4.597 4.787 4.967 5.228 5.395 5.557 5.799 6.028 6.24 6.449 6.653 6.907 7.142 7.352 7.61 7.884 8.148 8.438 8.755 9.062 9.392 9.729 10.088 10.478 10.89 11.327 11.777 12.281 12.807 13.405 14.039 14.73 15.461 16.133 16.305 16.156 15.898 15.553 15.188 14.825 14.464 14.138 13.76 13.427 13.128 12.83 12.547 12.272 12.02 11.744 11.483 11.271 11.042 10.794 10.595 10.384 10.145 9.95 9.762 9.562 9.328 9.084 8.929 8.767 8.503 8.32 8.124 8.019 7.803 7.569 7.316 7.185 6.701 6.735 6.577 6.404 6.003 5.79 5.57 5.329 5.059 4.712 4.283 2.948 -2 ,14451 ,TETRA ,17591181,Sat Nov 27 21:34:13 CET,Sat Nov 27 23:24:27 CET,0.0 1.099 1.498 1.775 2.019 2.26 2.48 2.677 3.028 3.182 3.325 3.279 3.764 3.893 4.139 4.352 4.556 4.658 4.843 5.014 5.261 5.432 5.593 5.822 6.044 6.241 6.438 6.637 6.873 7.102 7.326 7.593 7.851 8.106 8.397 8.7 8.996 9.321 9.654 9.991 10.337 10.742 11.197 11.644 12.173 12.746 13.379 14.042 14.733 15.435 16.044 16.17 15.969 15.676 15.338 14.95 14.568 14.185 13.839 13.472 13.136 12.847 12.565 12.282 12.026 11.785 11.509 11.248 11.02 10.79 10.544 10.322 10.094 9.868 9.68 9.48 9.272 9.047 8.805 8.643 8.48 8.223 8.035 7.828 7.725 7.506 7.254 7.009 6.881 6.388 6.416 6.254 6.096 5.705 5.491 5.274 4.996 4.674 4.328 3.874 2.573 -3 ,6978 ,TETRA ,17591182,Sat Nov 27 21:33:14 CET,Sat Nov 27 23:23:46 CET,0.0 1.215 1.65 1.983 2.257 2.485 2.673 2.843 3.167 3.324 3.473 3.411 3.875 3.991 4.229 4.452 4.647 4.743 4.935 5.118 5.378 5.555 5.721 5.936 6.139 6.334 6.528 6.718 6.962 7.201 7.434 7.717 7.99 8.238 8.513 8.825 9.117 9.425 9.753 10.106 10.478 10.876 11.333 11.78 12.28 12.821 13.407 14.022 14.72 15.431 16.004 16.104 15.927 15.688 15.411 15.109 14.743 14.369 14.057 13.713 13.373 13.049 12.738 12.451 12.192 11.956 11.686 11.433 11.205 10.962 10.707 10.486 10.256 10.015 9.832 9.631 9.413 9.205 8.982 8.819 8.649 8.372 8.178 7.982 7.88 7.665 7.436 7.21 7.094 6.609 6.631 6.461 6.285 5.895 5.67 5.442 5.199 4.907 4.515 4.003 3.027 -4 ,14290 ,TETRA ,17591183,Sat Nov 27 21:34:13 CET,Sat Nov 27 23:22:21 CET,0.0 2.042 2.676 3.094 3.39 3.606 3.811 4.006 4.33 4.469 4.598 4.492 4.958 5.089 5.324 5.527 5.729 5.828 6.021 6.206 6.483 6.655 6.808 7.029 7.255 7.482 7.692 7.88 8.123 8.365 8.592 8.863 9.122 9.357 9.617 9.918 10.218 10.544 10.87 11.202 11.566 12.003 12.49 12.939 13.437 13.971 14.581 15.218 15.884 16.566 17.136 17.301 17.169 16.926 16.624 16.248 15.883 15.545 15.246 14.91 14.602 14.323 14.049 13.776 13.502 13.253 12.981 12.733 12.513 12.273 12.026 11.813 11.575 11.33 11.148 10.963 10.763 10.555 10.331 10.168 10.003 9.759 9.58 9.381 9.279 9.068 8.841 8.581 8.446 7.967 8.013 7.857 7.697 7.327 7.115 6.885 6.626 6.307 5.909 5.329 3.518 -5 ,1770 ,TETRA ,17591184,Sat Nov 27 21:34:13 CET,Sat Nov 27 23:25:30 CET,0.0 1.104 1.575 1.905 2.157 2.39 2.597 2.796 3.147 3.292 3.437 3.378 3.857 3.982 4.222 4.435 4.634 4.736 4.934 5.123 5.395 5.566 5.729 5.957 6.171 6.398 6.621 6.816 7.059 7.291 7.505 7.756 7.993 8.234 8.505 8.814 9.125 9.437 9.765 10.113 10.467 10.853 11.313 11.782 12.308 12.848 13.423 14.05 14.734 15.403 15.974 16.139 15.997 15.732 15.424 15.064 14.681 14.316 13.97 13.578 13.25 12.969 12.655 12.347 12.069 11.796 11.517 11.282 11.072 10.836 10.581 10.378 10.157 9.903 9.713 9.522 9.313 9.092 8.872 8.724 8.57 8.329 8.151 7.96 7.86 7.651 7.424 7.177 7.04 6.553 6.61 6.447 6.273 5.896 5.676 5.446 5.201 4.931 4.592 4.054 2.134 -6 ,27201 ,TETRA ,17591185,Sat Nov 27 21:35:12 CET,Sat Nov 27 23:22:34 CET,0.0 1.035 1.486 1.845 2.116 2.34 2.549 2.754 3.12 3.275 3.414 3.341 3.809 3.923 4.148 4.366 4.581 4.683 4.869 5.042 5.302 5.469 5.624 5.853 6.079 6.283 6.475 6.671 6.917 7.144 7.362 7.632 7.897 8.141 8.411 8.71 8.996 9.31 9.644 9.989 10.348 10.749 11.221 11.689 12.207 12.732 13.287 13.925 14.638 15.297 15.856 16.039 15.933 15.651 15.298 14.939 14.598 14.244 13.903 13.548 13.227 12.94 12.65 12.35 12.077 11.828 11.539 11.274 11.045 10.795 10.538 10.344 10.127 9.88 9.7 9.52 9.321 9.105 8.896 8.745 8.571 8.303 8.117 7.918 7.809 7.584 7.36 7.118 6.984 6.501 6.535 6.382 6.208 5.816 5.611 5.378 5.123 4.848 4.498 3.991 2.845 -7 ,24241 ,TETRA ,17591186,Sat Nov 27 21:34:14 CET,Sat Nov 27 23:23:15 CET,0.0 1.164 1.633 1.987 2.26 2.487 2.706 2.905 3.251 3.422 3.578 3.5 3.973 4.101 4.338 4.558 4.764 4.861 5.058 5.242 5.49 5.653 5.808 6.014 6.216 6.425 6.626 6.818 7.07 7.309 7.532 7.808 8.056 8.283 8.546 8.846 9.15 9.487 9.841 10.195 10.553 10.971 11.443 11.896 12.415 12.959 13.559 14.227 14.954 15.653 16.202 16.279 16.044 15.694 15.318 14.969 14.622 14.246 13.895 13.536 13.199 12.893 12.606 12.328 12.043 11.762 11.475 11.226 10.992 10.747 10.499 10.28 10.051 9.803 9.608 9.418 9.22 9.012 8.783 8.62 8.457 8.197 8.014 7.807 7.698 7.484 7.273 7.049 6.924 6.454 6.516 6.35 6.172 5.793 5.565 5.324 5.082 4.778 4.38 3.855 2.43 -8 ,18773 ,TETRA ,17591187,Sat Nov 27 21:34:13 CET,Sat Nov 27 23:23:15 CET,0.0 1.104 1.477 1.756 2.008 2.231 2.43 2.612 2.971 3.135 3.293 3.232 3.707 3.835 4.071 4.282 4.49 4.593 4.798 4.991 5.241 5.407 5.57 5.793 6.001 6.206 6.403 6.6 6.864 7.112 7.341 7.619 7.893 8.151 8.439 8.751 9.038 9.36 9.69 10.024 10.373 10.783 11.274 11.737 12.242 12.789 13.38 14.003 14.688 15.383 15.95 16.072 15.906 15.591 15.191 14.806 14.471 14.131 13.804 13.442 13.117 12.84 12.561 12.269 11.983 11.727 11.461 11.208 10.988 10.749 10.481 10.28 10.063 9.818 9.631 9.422 9.208 8.987 8.753 8.6 8.429 8.151 7.965 7.768 7.667 7.47 7.257 7.018 6.889 6.416 6.454 6.284 6.112 5.769 5.568 5.338 5.064 4.738 4.362 3.871 2.509 -9 ,5733 ,TETRA ,17591188,Sat Nov 27 21:34:14 CET,Sat Nov 27 23:23:03 CET,0.0 0.942 1.393 1.73 1.987 2.202 2.409 2.602 2.943 3.104 3.253 3.18 3.653 3.769 3.994 4.214 4.418 4.517 4.707 4.887 5.146 5.312 5.469 5.689 5.911 6.127 6.313 6.487 6.718 6.944 7.169 7.444 7.688 7.922 8.196 8.502 8.8 9.115 9.45 9.801 10.169 10.578 11.042 11.478 11.946 12.462 13.076 13.722 14.381 15.055 15.669 15.856 15.703 15.45 15.16 14.821 14.485 14.134 13.805 13.476 13.152 12.829 12.535 12.275 12.029 11.784 11.497 11.228 10.996 10.757 10.503 10.292 10.07 9.834 9.654 9.46 9.255 9.052 8.83 8.669 8.513 8.278 8.104 7.911 7.808 7.595 7.376 7.124 6.986 6.507 6.548 6.391 6.22 5.838 5.625 5.382 5.128 4.845 4.472 3.874 2.294 -10 ,4078 ,TETRA ,17591189,Sat Nov 27 21:34:14 CET,Sat Nov 27 23:22:39 CET,0.0 1.023 1.437 1.735 1.967 2.172 2.36 2.532 2.863 3.019 3.167 3.1 3.575 3.699 3.944 4.171 4.378 4.474 4.659 4.843 5.099 5.26 5.415 5.631 5.832 6.04 6.236 6.422 6.673 6.922 7.159 7.428 7.705 7.974 8.279 8.606 8.904 9.237 9.593 9.954 10.307 10.696 11.168 11.64 12.147 12.66 13.239 13.896 14.603 15.321 15.937 16.094 15.921 15.618 15.305 14.968 14.589 14.183 13.811 13.435 13.12 12.824 12.514 12.231 11.957 11.696 11.421 11.177 10.962 10.718 10.457 10.245 10.021 9.782 9.598 9.404 9.192 8.986 8.769 8.611 8.445 8.167 7.967 7.765 7.658 7.427 7.199 6.965 6.842 6.36 6.41 6.264 6.086 5.679 5.471 5.249 4.98 4.655 4.295 3.806 2.516 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index 5f341a25..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10312 ,TETRA ,17591190,Sat Nov 27 21:34:15 CET,Sat Nov 27 23:21:11 CET,0.0 1.457 1.935 2.313 2.617 2.881 3.136 3.362 3.77 3.946 4.109 4.054 4.534 4.672 4.939 5.173 5.405 5.519 5.731 5.925 6.207 6.392 6.554 6.79 7.03 7.256 7.465 7.651 7.888 8.121 8.352 8.625 8.884 9.13 9.405 9.701 9.986 10.305 10.637 10.977 11.325 11.713 12.155 12.591 13.054 13.528 14.024 14.504 14.987 15.393 15.499 15.097 14.565 13.999 13.411 12.854 12.346 11.846 11.4 10.957 10.554 10.181 9.826 9.488 9.171 8.874 8.562 8.265 7.994 7.726 7.458 7.239 6.993 6.731 6.528 6.318 6.095 5.855 5.598 5.413 5.221 4.918 4.705 4.481 4.361 4.121 3.87 3.614 3.486 2.995 3.032 2.873 2.703 2.322 2.104 1.848 1.542 1.199 0.839 0.381 -0.892 -2 ,29969 ,TETRA ,17591191,Sat Nov 27 21:34:15 CET,Sat Nov 27 23:24:45 CET,0.0 1.557 2.12 2.529 2.82 3.091 3.362 3.585 3.954 4.128 4.289 4.238 4.721 4.86 5.11 5.338 5.556 5.667 5.883 6.079 6.358 6.524 6.685 6.923 7.158 7.375 7.577 7.774 8.033 8.284 8.512 8.774 9.02 9.277 9.571 9.868 10.145 10.45 10.772 11.11 11.447 11.813 12.225 12.596 13.011 13.485 13.995 14.513 14.99 15.415 15.631 15.326 14.805 14.267 13.702 13.123 12.631 12.163 11.72 11.259 10.845 10.494 10.175 9.857 9.552 9.254 8.929 8.638 8.39 8.133 7.856 7.62 7.371 7.117 6.908 6.688 6.473 6.24 5.992 5.822 5.643 5.349 5.141 4.936 4.83 4.601 4.361 4.105 3.967 3.484 3.536 3.369 3.173 2.76 2.559 2.329 2.062 1.765 1.395 0.876 -0.852 -3 ,9316 ,TETRA ,17591192,Sat Nov 27 21:34:15 CET,Sat Nov 27 23:21:14 CET,0.0 2.179 2.724 3.08 3.419 3.698 3.941 4.173 4.582 4.761 4.924 4.89 5.385 5.516 5.778 6.024 6.258 6.37 6.566 6.751 7.028 7.203 7.376 7.629 7.871 8.112 8.321 8.519 8.77 8.989 9.206 9.474 9.728 9.975 10.265 10.567 10.838 11.129 11.444 11.771 12.09 12.437 12.815 13.2 13.655 14.114 14.596 15.062 15.511 15.877 15.959 15.598 15.071 14.514 13.966 13.409 12.908 12.445 12.016 11.562 11.162 10.795 10.445 10.108 9.792 9.497 9.169 8.882 8.628 8.364 8.085 7.844 7.605 7.35 7.149 6.946 6.723 6.48 6.221 6.042 5.869 5.61 5.423 5.217 5.106 4.864 4.601 4.324 4.176 3.676 3.694 3.526 3.341 2.9 2.656 2.381 2.08 1.729 1.288 0.772 -0.245 -4 ,30793 ,TETRA ,17591193,Sat Nov 27 21:34:15 CET,Sat Nov 27 23:21:18 CET,0.0 1.433 1.936 2.304 2.6 2.874 3.145 3.381 3.796 3.999 4.19 4.187 4.67 4.802 5.062 5.305 5.524 5.626 5.836 6.037 6.32 6.497 6.662 6.894 7.118 7.335 7.546 7.745 7.982 8.212 8.457 8.743 8.991 9.223 9.506 9.827 10.11 10.419 10.749 11.083 11.412 11.775 12.199 12.62 13.055 13.473 13.95 14.452 14.941 15.344 15.407 15.096 14.639 14.056 13.472 12.947 12.477 12.005 11.556 11.093 10.706 10.346 9.989 9.661 9.331 9.024 8.712 8.425 8.171 7.902 7.621 7.385 7.134 6.873 6.654 6.423 6.2 5.969 5.72 5.538 5.351 5.046 4.84 4.646 4.532 4.275 4.013 3.74 3.596 3.107 3.165 2.997 2.801 2.405 2.202 1.969 1.693 1.373 0.995 0.492 -0.889 -5 ,19019 ,TETRA ,17591194,Sat Nov 27 21:34:16 CET,Sat Nov 27 23:21:44 CET,0.0 1.5 1.925 2.303 2.629 2.885 3.142 3.428 3.932 4.131 4.297 4.264 4.753 4.89 5.169 5.443 5.676 5.775 5.961 6.138 6.393 6.564 6.739 6.993 7.231 7.453 7.655 7.85 8.098 8.327 8.543 8.811 9.086 9.355 9.649 9.964 10.26 10.568 10.883 11.211 11.554 11.927 12.355 12.776 13.215 13.661 14.158 14.66 15.099 15.416 15.527 15.225 14.741 14.21 13.662 13.102 12.578 12.084 11.667 11.225 10.799 10.406 10.045 9.718 9.39 9.064 8.734 8.44 8.193 7.942 7.659 7.415 7.152 6.883 6.692 6.475 6.21 5.944 5.693 5.521 5.347 5.07 4.875 4.661 4.546 4.305 4.064 3.826 3.685 3.182 3.223 3.055 2.882 2.534 2.311 2.062 1.831 1.549 1.187 0.596 -1.385 -6 ,3008 ,TETRA ,17591195,Sat Nov 27 21:34:18 CET,Sat Nov 27 23:21:32 CET,0.0 1.334 1.832 2.188 2.507 2.784 3.029 3.237 3.608 3.783 3.952 3.918 4.407 4.548 4.827 5.077 5.304 5.417 5.631 5.828 6.092 6.264 6.44 6.699 6.933 7.143 7.346 7.544 7.812 8.064 8.299 8.551 8.793 9.04 9.295 9.581 9.863 10.172 10.509 10.857 11.182 11.538 11.974 12.379 12.82 13.288 13.78 14.267 14.729 15.112 15.24 14.932 14.456 13.928 13.403 12.899 12.409 11.945 11.519 11.065 10.668 10.305 9.963 9.637 9.319 9.019 8.712 8.451 8.205 7.934 7.649 7.412 7.154 6.874 6.659 6.433 6.199 5.959 5.714 5.543 5.354 5.068 4.876 4.65 4.527 4.284 4.025 3.747 3.606 3.122 3.179 3.01 2.833 2.492 2.283 2.041 1.78 1.463 1.052 0.528 -1.125 -7 ,4566 ,TETRA ,17591196,Sat Nov 27 21:34:16 CET,Sat Nov 27 23:22:15 CET,0.0 1.722 2.204 2.58 2.877 3.14 3.386 3.611 3.983 4.17 4.347 4.298 4.776 4.908 5.164 5.392 5.608 5.715 5.924 6.115 6.38 6.546 6.701 6.931 7.162 7.384 7.587 7.781 8.03 8.261 8.484 8.751 9.008 9.248 9.514 9.799 10.075 10.383 10.698 11.038 11.382 11.753 12.174 12.569 13.022 13.486 13.959 14.416 14.886 15.333 15.47 15.162 14.667 14.109 13.566 13.015 12.484 11.979 11.535 11.086 10.701 10.352 10.0 9.648 9.292 8.961 8.634 8.341 8.075 7.798 7.504 7.266 7.018 6.738 6.521 6.295 6.056 5.802 5.533 5.358 5.179 4.889 4.686 4.476 4.366 4.138 3.907 3.65 3.506 3.005 3.021 2.841 2.659 2.26 2.018 1.756 1.444 1.095 0.688 0.171 -1.301 -8 ,14068 ,TETRA ,17591197,Sat Nov 27 21:34:15 CET,Sat Nov 27 23:21:48 CET,0.0 1.801 2.329 2.732 3.046 3.308 3.545 3.78 4.179 4.342 4.492 4.454 4.945 5.073 5.335 5.57 5.785 5.896 6.1 6.29 6.563 6.738 6.908 7.156 7.387 7.595 7.8 8.001 8.255 8.493 8.725 9.008 9.267 9.503 9.771 10.063 10.34 10.65 10.976 11.33 11.691 12.045 12.447 12.84 13.264 13.727 14.225 14.703 15.186 15.609 15.77 15.423 14.926 14.411 13.858 13.332 12.872 12.454 12.051 11.605 11.227 10.847 10.464 10.116 9.779 9.484 9.183 8.89 8.641 8.382 8.087 7.84 7.596 7.342 7.139 6.925 6.713 6.495 6.252 6.083 5.915 5.648 5.445 5.231 5.115 4.866 4.616 4.361 4.225 3.738 3.796 3.621 3.438 3.063 2.836 2.584 2.329 2.046 1.574 0.776 -1.421 -9 ,30263 ,TETRA ,17591198,Sat Nov 27 21:34:18 CET,Sat Nov 27 23:21:15 CET,0.0 2.3 3.053 3.498 3.781 4.029 4.26 4.483 4.882 5.056 5.22 5.201 5.707 5.839 6.093 6.327 6.531 6.637 6.853 7.064 7.341 7.511 7.681 7.918 8.161 8.391 8.592 8.79 9.052 9.295 9.524 9.786 10.026 10.264 10.538 10.831 11.112 11.434 11.778 12.118 12.464 12.851 13.265 13.665 14.128 14.582 15.055 15.537 16.032 16.435 16.519 16.172 15.687 15.137 14.581 14.034 13.512 13.02 12.592 12.145 11.741 11.378 11.02 10.683 10.369 10.07 9.753 9.464 9.221 8.958 8.672 8.439 8.195 7.943 7.73 7.513 7.302 7.071 6.832 6.672 6.5 6.218 6.008 5.793 5.683 5.438 5.179 4.896 4.742 4.237 4.247 4.078 3.92 3.553 3.322 3.069 2.79 2.479 2.094 1.559 0.146 -10 ,31538 ,TETRA ,17591199,Sat Nov 27 21:34:16 CET,Sat Nov 27 23:22:39 CET,0.0 1.879 2.46 2.811 3.138 3.423 3.656 3.865 4.227 4.395 4.554 4.505 4.997 5.14 5.424 5.674 5.884 5.99 6.207 6.403 6.674 6.857 7.032 7.283 7.507 7.715 7.921 8.116 8.376 8.613 8.831 9.097 9.355 9.591 9.861 10.165 10.437 10.734 11.052 11.39 11.719 12.067 12.476 12.86 13.292 13.746 14.202 14.658 15.107 15.451 15.543 15.219 14.736 14.159 13.582 13.035 12.53 12.055 11.622 11.197 10.832 10.487 10.145 9.823 9.515 9.207 8.872 8.572 8.308 8.027 7.742 7.51 7.249 6.978 6.774 6.569 6.361 6.138 5.905 5.737 5.549 5.259 5.048 4.816 4.704 4.469 4.217 3.949 3.808 3.292 3.274 3.104 2.938 2.575 2.369 2.13 1.862 1.556 1.096 0.422 -1.962 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 2d9e5048..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30130 ,KEBNE ,17026805,Wed Dec 22 15:15:12 CET,Wed Dec 22 16:48:53 CET,0.0 0.649 1.076 1.404 1.658 1.888 2.105 2.291 2.615 2.764 2.906 2.821 3.296 3.42 3.65 3.866 4.064 4.167 4.364 4.545 4.789 4.948 5.101 5.317 5.518 5.715 5.918 6.104 6.341 6.56 6.76 7.009 7.239 7.46 7.717 8.001 8.278 8.594 8.934 9.283 9.647 10.05 10.479 10.886 11.372 11.899 12.469 13.068 13.697 14.317 14.796 14.848 14.569 14.167 13.76 13.325 12.902 12.516 12.164 11.789 11.444 11.105 10.763 10.442 10.148 9.872 9.571 9.305 9.076 8.843 8.591 8.371 8.147 7.913 7.722 7.525 7.319 7.091 6.854 6.684 6.503 6.228 6.022 5.8 5.691 5.457 5.223 4.979 4.843 4.361 4.393 4.222 4.036 3.64 3.431 3.207 2.956 2.634 2.232 1.697 -0.177 -2 ,32041 ,KEBNE ,17026806,Wed Dec 22 15:19:18 CET,Wed Dec 22 16:51:59 CET,0.0 1.19 1.701 2.043 2.317 2.548 2.751 2.938 3.267 3.441 3.613 3.544 4.02 4.137 4.367 4.577 4.761 4.849 5.033 5.216 5.459 5.605 5.757 5.994 6.213 6.415 6.611 6.792 7.025 7.258 7.476 7.728 7.98 8.228 8.499 8.79 9.075 9.388 9.72 10.064 10.416 10.804 11.242 11.672 12.133 12.605 13.173 13.812 14.475 15.036 15.49 15.636 15.42 15.058 14.629 14.174 13.756 13.391 13.067 12.684 12.343 12.052 11.767 11.477 11.189 10.918 10.631 10.37 10.142 9.887 9.625 9.406 9.159 8.904 8.711 8.511 8.304 8.069 7.822 7.655 7.48 7.207 7.006 6.796 6.693 6.472 6.235 5.979 5.837 5.35 5.372 5.19 4.999 4.608 4.388 4.136 3.86 3.558 3.156 2.592 1.006 -3 ,24026 ,KEBNE ,17026807,Wed Dec 22 15:23:29 CET,Wed Dec 22 16:48:33 CET,0.0 1.109 1.466 1.753 1.981 2.2 2.415 2.609 2.957 3.105 3.243 3.185 3.661 3.777 3.995 4.196 4.384 4.476 4.654 4.825 5.088 5.252 5.406 5.633 5.851 6.053 6.24 6.419 6.655 6.878 7.083 7.339 7.584 7.809 8.068 8.369 8.658 8.972 9.307 9.642 9.981 10.368 10.797 11.213 11.708 12.227 12.793 13.378 13.988 14.611 15.093 15.089 14.822 14.496 14.106 13.67 13.247 12.831 12.451 12.051 11.682 11.342 11.014 10.699 10.381 10.09 9.806 9.542 9.303 9.04 8.765 8.523 8.264 8.013 7.824 7.62 7.404 7.18 6.94 6.772 6.591 6.293 6.08 5.872 5.771 5.56 5.315 5.052 4.912 4.416 4.422 4.245 4.074 3.672 3.462 3.251 2.996 2.704 2.351 1.824 0.447 -4 ,26040 ,KEBNE ,17026808,Wed Dec 22 15:27:36 CET,Wed Dec 22 16:58:05 CET,0.0 1.115 1.532 1.836 2.109 2.363 2.577 2.752 3.069 3.214 3.358 3.28 3.749 3.869 4.087 4.299 4.513 4.614 4.789 4.951 5.19 5.342 5.487 5.698 5.9 6.093 6.282 6.457 6.683 6.909 7.119 7.376 7.626 7.856 8.112 8.407 8.689 8.988 9.319 9.654 9.984 10.373 10.834 11.256 11.707 12.184 12.707 13.266 13.865 14.49 14.997 15.067 14.822 14.496 14.137 13.734 13.329 12.937 12.587 12.203 11.855 11.541 11.217 10.902 10.604 10.33 10.055 9.8 9.564 9.311 9.053 8.828 8.577 8.321 8.13 7.926 7.706 7.476 7.237 7.072 6.892 6.6 6.41 6.206 6.099 5.886 5.653 5.394 5.252 4.766 4.795 4.64 4.47 4.035 3.796 3.556 3.276 2.958 2.59 2.122 0.376 -5 ,30515 ,KEBNE ,17026809,Wed Dec 22 15:27:33 CET,Wed Dec 22 16:56:33 CET,0.0 1.034 1.428 1.694 1.928 2.152 2.36 2.544 2.859 3.009 3.162 3.089 3.551 3.675 3.927 4.156 4.365 4.461 4.64 4.81 5.045 5.204 5.367 5.584 5.784 5.982 6.177 6.366 6.607 6.832 7.036 7.276 7.516 7.752 8.024 8.319 8.586 8.883 9.21 9.544 9.885 10.266 10.695 11.138 11.646 12.185 12.776 13.377 14.021 14.638 15.08 15.166 14.986 14.661 14.239 13.8 13.417 13.037 12.683 12.284 11.915 11.591 11.286 10.968 10.647 10.367 10.079 9.797 9.543 9.299 9.038 8.798 8.547 8.292 8.088 7.88 7.67 7.444 7.191 7.015 6.84 6.547 6.333 6.115 6.001 5.762 5.52 5.274 5.138 4.651 4.687 4.521 4.34 3.939 3.712 3.465 3.191 2.876 2.496 1.98 0.454 -6 ,16023 ,KEBNE ,17026810,Wed Dec 22 15:29:36 CET,Wed Dec 22 17:02:02 CET,0.0 1.364 1.816 2.11 2.387 2.627 2.848 3.047 3.391 3.544 3.695 3.634 4.097 4.224 4.466 4.671 4.871 4.975 5.166 5.337 5.585 5.74 5.892 6.107 6.31 6.518 6.708 6.898 7.154 7.385 7.605 7.873 8.124 8.356 8.616 8.913 9.186 9.471 9.783 10.128 10.495 10.892 11.333 11.761 12.259 12.797 13.377 13.976 14.573 15.172 15.674 15.665 15.39 15.011 14.601 14.178 13.774 13.398 13.039 12.652 12.299 11.979 11.669 11.366 11.071 10.806 10.515 10.239 10.009 9.775 9.521 9.292 9.051 8.804 8.61 8.412 8.198 7.96 7.714 7.547 7.381 7.109 6.908 6.716 6.618 6.395 6.159 5.925 5.797 5.308 5.323 5.161 4.993 4.616 4.412 4.186 3.937 3.639 3.25 2.723 1.488 -7 ,2803 ,KEBNE ,17026812,Wed Dec 22 15:29:36 CET,Wed Dec 22 17:02:47 CET,0.0 0.865 1.266 1.579 1.846 2.081 2.287 2.49 2.878 3.039 3.174 3.087 3.559 3.689 3.927 4.135 4.339 4.437 4.627 4.807 5.053 5.214 5.372 5.595 5.802 5.998 6.194 6.376 6.592 6.798 7.001 7.243 7.488 7.733 8.005 8.291 8.562 8.854 9.162 9.481 9.809 10.183 10.623 11.028 11.463 11.957 12.529 13.132 13.727 14.313 14.816 14.878 14.639 14.296 13.929 13.525 13.095 12.691 12.317 11.925 11.583 11.246 10.932 10.642 10.355 10.083 9.791 9.524 9.266 8.993 8.73 8.516 8.287 8.037 7.831 7.608 7.388 7.169 6.94 6.772 6.596 6.322 6.126 5.901 5.778 5.537 5.282 5.0 4.851 4.361 4.419 4.264 4.1 3.726 3.513 3.276 3.011 2.717 2.344 1.829 0.35 -8 ,730 ,KEBNE ,17026813,Wed Dec 22 15:29:36 CET,Wed Dec 22 17:02:28 CET,0.0 1.004 1.398 1.699 1.948 2.182 2.397 2.588 2.91 3.048 3.178 3.099 3.566 3.678 3.888 4.081 4.267 4.36 4.544 4.72 4.955 5.113 5.272 5.498 5.727 5.936 6.121 6.314 6.563 6.787 7.009 7.264 7.496 7.73 8.006 8.324 8.623 8.927 9.247 9.59 9.943 10.32 10.757 11.191 11.658 12.159 12.7 13.283 13.913 14.498 14.951 15.047 14.871 14.519 14.151 13.759 13.356 12.981 12.629 12.254 11.928 11.613 11.303 11.027 10.745 10.472 10.18 9.908 9.667 9.4 9.132 8.907 8.657 8.389 8.191 7.99 7.771 7.551 7.327 7.173 7.006 6.713 6.496 6.285 6.181 5.949 5.69 5.424 5.282 4.79 4.834 4.673 4.5 4.121 3.895 3.646 3.345 2.981 2.565 2.088 1.065 -9 ,18211 ,KEBNE ,17026814,Wed Dec 22 15:29:36 CET,Wed Dec 22 17:01:57 CET,0.0 1.288 1.764 2.116 2.398 2.627 2.832 3.024 3.35 3.485 3.624 3.576 4.054 4.171 4.397 4.595 4.791 4.891 5.064 5.23 5.486 5.658 5.814 6.029 6.239 6.452 6.652 6.829 7.059 7.289 7.512 7.76 7.989 8.217 8.473 8.761 9.026 9.307 9.623 9.973 10.355 10.759 11.174 11.575 12.041 12.506 13.036 13.63 14.22 14.803 15.312 15.393 15.204 14.9 14.512 14.108 13.737 13.364 12.986 12.58 12.218 11.89 11.584 11.274 10.974 10.708 10.407 10.13 9.898 9.654 9.401 9.186 8.941 8.69 8.512 8.313 8.097 7.873 7.641 7.484 7.313 7.027 6.825 6.603 6.482 6.246 5.995 5.727 5.587 5.111 5.185 5.026 4.852 4.505 4.308 4.056 3.768 3.433 3.011 2.401 0.121 -10 ,19053 ,KEBNE ,17026815,Wed Dec 22 15:29:36 CET,Wed Dec 22 17:02:17 CET,0.0 1.529 1.962 2.237 2.47 2.684 2.878 3.055 3.36 3.507 3.652 3.581 4.057 4.178 4.408 4.637 4.849 4.943 5.136 5.318 5.57 5.734 5.879 6.079 6.29 6.503 6.691 6.862 7.086 7.304 7.5 7.725 7.954 8.186 8.462 8.765 9.055 9.371 9.693 10.02 10.37 10.769 11.21 11.631 12.08 12.56 13.115 13.695 14.291 14.899 15.38 15.463 15.22 14.861 14.482 14.066 13.668 13.279 12.92 12.557 12.241 11.932 11.611 11.293 10.982 10.71 10.439 10.179 9.955 9.728 9.47 9.241 8.993 8.746 8.554 8.357 8.161 7.937 7.69 7.526 7.355 7.078 6.877 6.666 6.559 6.322 6.062 5.8 5.665 5.176 5.207 5.037 4.862 4.491 4.267 4.018 3.757 3.44 3.053 2.584 1.247 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt deleted file mode 100644 index 13e261a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9600 ,TETRA ,17591200,Sat Nov 27 21:34:16 CET,Sat Nov 27 23:21:44 CET,0.0 1.429 2.038 2.52 2.878 3.163 3.419 3.669 4.105 4.297 4.473 4.428 4.911 5.046 5.3 5.541 5.778 5.888 6.103 6.303 6.577 6.757 6.93 7.182 7.427 7.656 7.866 8.062 8.306 8.537 8.762 9.04 9.3 9.544 9.813 10.103 10.368 10.654 10.98 11.302 11.616 11.976 12.388 12.772 13.182 13.581 13.983 14.366 14.711 14.984 14.938 14.455 13.818 13.108 12.417 11.789 11.241 10.719 10.264 9.768 9.3 8.867 8.469 8.105 7.749 7.422 7.07 6.749 6.479 6.184 5.88 5.635 5.376 5.096 4.872 4.65 4.418 4.167 3.901 3.718 3.531 3.23 3.014 2.8 2.686 2.428 2.164 1.891 1.747 1.245 1.261 1.079 0.88 0.447 0.225 -0.033 -0.346 -0.681 -1.094 -1.653 -3.484 -2 ,14310 ,TETRA ,17591201,Sat Nov 27 21:34:16 CET,Sat Nov 27 23:21:22 CET,0.0 1.582 2.127 2.5 2.806 3.052 3.31 3.566 3.96 4.124 4.284 4.251 4.754 4.903 5.166 5.412 5.648 5.756 5.955 6.148 6.421 6.597 6.769 7.005 7.234 7.468 7.685 7.885 8.144 8.391 8.62 8.87 9.087 9.309 9.572 9.853 10.127 10.435 10.76 11.076 11.398 11.763 12.162 12.533 12.954 13.375 13.817 14.236 14.6 14.874 14.839 14.311 13.667 13.011 12.384 11.767 11.177 10.611 10.099 9.604 9.169 8.765 8.369 7.975 7.6 7.251 6.873 6.55 6.275 5.978 5.663 5.401 5.14 4.869 4.646 4.404 4.159 3.906 3.64 3.452 3.254 2.96 2.752 2.514 2.389 2.134 1.851 1.561 1.421 0.927 0.934 0.755 0.572 0.171 -0.068 -0.338 -0.629 -0.961 -1.387 -1.966 -3.5 -3 ,8825 ,TETRA ,17591202,Sat Nov 27 21:35:12 CET,Sat Nov 27 23:22:52 CET,0.0 1.635 2.12 2.539 2.878 3.154 3.401 3.611 3.982 4.147 4.312 4.28 4.763 4.907 5.176 5.415 5.646 5.757 5.968 6.179 6.454 6.629 6.804 7.048 7.293 7.517 7.719 7.928 8.182 8.425 8.661 8.929 9.175 9.394 9.641 9.925 10.185 10.478 10.807 11.116 11.423 11.783 12.184 12.578 13.025 13.449 13.896 14.336 14.713 14.954 14.885 14.367 13.666 12.945 12.243 11.588 10.999 10.444 9.968 9.459 8.998 8.586 8.189 7.809 7.45 7.106 6.75 6.442 6.166 5.879 5.57 5.311 5.05 4.776 4.563 4.34 4.097 3.843 3.579 3.394 3.204 2.899 2.691 2.487 2.376 2.129 1.887 1.617 1.466 0.963 0.981 0.805 0.608 0.153 -0.085 -0.321 -0.586 -0.903 -1.303 -1.877 -3.669 -4 ,27116 ,TETRA ,17591203,Sat Nov 27 21:35:12 CET,Sat Nov 27 23:25:04 CET,0.0 1.759 2.288 2.703 3.054 3.356 3.635 3.895 4.341 4.523 4.68 4.623 5.122 5.273 5.524 5.743 5.953 6.055 6.252 6.456 6.738 6.905 7.075 7.324 7.563 7.79 7.999 8.202 8.462 8.707 8.946 9.224 9.465 9.686 9.952 10.252 10.525 10.808 11.114 11.428 11.759 12.124 12.509 12.893 13.343 13.796 14.243 14.67 15.098 15.384 15.285 14.764 14.132 13.487 12.856 12.244 11.66 11.11 10.618 10.117 9.667 9.247 8.835 8.434 8.056 7.717 7.371 7.065 6.798 6.512 6.202 5.937 5.672 5.403 5.174 4.927 4.676 4.42 4.162 3.981 3.786 3.483 3.27 3.051 2.937 2.686 2.423 2.145 1.998 1.497 1.516 1.342 1.159 0.758 0.527 0.282 0.007 -0.324 -0.727 -1.222 -2.733 -5 ,11505 ,TETRA ,17591204,Sat Nov 27 21:35:13 CET,Sat Nov 27 23:23:12 CET,0.0 2.074 2.594 2.981 3.322 3.631 3.872 4.079 4.463 4.638 4.805 4.762 5.253 5.387 5.646 5.889 6.115 6.221 6.42 6.625 6.925 7.106 7.276 7.519 7.745 7.951 8.146 8.335 8.574 8.796 9.018 9.293 9.557 9.815 10.104 10.404 10.68 10.955 11.26 11.595 11.927 12.291 12.664 13.027 13.452 13.895 14.365 14.813 15.238 15.572 15.56 15.069 14.403 13.74 13.121 12.534 11.98 11.448 10.961 10.439 9.985 9.586 9.198 8.812 8.444 8.113 7.762 7.439 7.166 6.877 6.563 6.313 6.07 5.799 5.579 5.355 5.118 4.87 4.623 4.454 4.262 3.958 3.75 3.516 3.39 3.14 2.88 2.608 2.462 1.955 1.992 1.841 1.678 1.269 1.035 0.791 0.499 0.165 -0.231 -0.79 -2.264 -6 ,27729 ,TETRA ,17591205,Sat Nov 27 21:35:13 CET,Sat Nov 27 23:22:49 CET,0.0 2.299 2.905 3.289 3.622 3.907 4.164 4.404 4.771 4.932 5.107 5.102 5.589 5.726 5.978 6.206 6.404 6.499 6.706 6.903 7.178 7.361 7.53 7.757 7.983 8.207 8.417 8.612 8.85 9.08 9.294 9.543 9.798 10.047 10.334 10.645 10.929 11.242 11.563 11.886 12.204 12.54 12.932 13.326 13.751 14.177 14.632 15.084 15.474 15.735 15.722 15.241 14.602 13.935 13.265 12.617 12.046 11.532 11.047 10.558 10.12 9.712 9.348 8.997 8.646 8.319 7.982 7.681 7.413 7.125 6.822 6.558 6.282 5.987 5.751 5.514 5.27 5.012 4.744 4.555 4.357 4.052 3.832 3.606 3.495 3.265 3.015 2.744 2.598 2.093 2.104 1.914 1.722 1.337 1.109 0.86 0.586 0.25 -0.18 -0.744 -2.194 -7 ,684 ,TETRA ,17591206,Sat Nov 27 21:35:13 CET,Sat Nov 27 23:23:43 CET,0.0 1.612 2.152 2.544 2.881 3.185 3.44 3.653 4.029 4.207 4.366 4.324 4.812 4.943 5.215 5.47 5.702 5.811 6.011 6.194 6.466 6.644 6.817 7.071 7.297 7.509 7.721 7.913 8.15 8.386 8.613 8.887 9.141 9.373 9.643 9.95 10.234 10.535 10.845 11.172 11.515 11.879 12.287 12.69 13.119 13.54 13.981 14.399 14.774 15.054 15.022 14.538 13.865 13.166 12.497 11.817 11.208 10.657 10.157 9.665 9.247 8.852 8.458 8.066 7.695 7.379 7.044 6.721 6.443 6.144 5.818 5.554 5.292 5.012 4.783 4.55 4.314 4.052 3.777 3.592 3.396 3.079 2.864 2.647 2.534 2.275 1.985 1.688 1.534 1.03 1.047 0.865 0.67 0.257 0.034 -0.219 -0.508 -0.839 -1.236 -1.788 -3.037 -8 ,23486 ,TETRA ,17591207,Sat Nov 27 21:35:13 CET,Sat Nov 27 23:22:42 CET,0.0 1.832 2.332 2.718 3.023 3.273 3.505 3.731 4.128 4.309 4.476 4.429 4.923 5.063 5.308 5.525 5.748 5.848 6.027 6.221 6.51 6.683 6.843 7.085 7.325 7.555 7.763 7.953 8.194 8.431 8.668 8.948 9.208 9.457 9.75 10.064 10.36 10.664 10.962 11.285 11.631 12.003 12.43 12.86 13.298 13.695 14.104 14.522 14.911 15.198 15.237 14.785 14.114 13.433 12.754 12.119 11.527 10.963 10.486 9.991 9.545 9.141 8.745 8.361 8.01 7.696 7.345 7.032 6.76 6.461 6.16 5.905 5.637 5.35 5.117 4.873 4.626 4.378 4.107 3.915 3.724 3.405 3.184 2.961 2.846 2.609 2.337 2.054 1.91 1.401 1.4 1.22 1.041 0.648 0.419 0.171 -0.1 -0.422 -0.803 -1.32 -2.873 -9 ,16616 ,TETRA ,17591208,Sat Nov 27 21:35:13 CET,Sat Nov 27 23:24:04 CET,0.0 1.448 1.951 2.344 2.707 2.997 3.241 3.47 3.839 4.002 4.167 4.124 4.609 4.741 4.978 5.204 5.419 5.521 5.721 5.919 6.23 6.426 6.593 6.817 7.047 7.275 7.492 7.694 7.946 8.186 8.412 8.682 8.932 9.156 9.405 9.7 9.989 10.285 10.596 10.928 11.273 11.642 12.041 12.434 12.855 13.26 13.684 14.098 14.444 14.633 14.502 13.946 13.295 12.64 11.98 11.359 10.767 10.19 9.699 9.22 8.771 8.333 7.938 7.583 7.235 6.901 6.542 6.221 5.936 5.649 5.358 5.105 4.824 4.531 4.321 4.101 3.87 3.634 3.376 3.188 2.995 2.67 2.417 2.172 2.049 1.774 1.5 1.228 1.087 0.589 0.598 0.416 0.234 -0.166 -0.408 -0.672 -0.956 -1.293 -1.686 -2.206 -3.588 -10 ,2328 ,TETRA ,17591209,Sat Nov 27 21:35:13 CET,Sat Nov 27 23:23:02 CET,0.0 1.205 1.702 2.119 2.442 2.687 2.927 3.151 3.536 3.729 3.903 3.861 4.356 4.497 4.765 5.008 5.224 5.332 5.54 5.731 6.012 6.194 6.365 6.605 6.836 7.063 7.272 7.468 7.714 7.948 8.17 8.428 8.669 8.9 9.177 9.476 9.734 10.026 10.359 10.696 11.035 11.401 11.809 12.194 12.592 13.01 13.457 13.873 14.207 14.44 14.382 13.82 13.14 12.42 11.725 11.105 10.538 9.993 9.5 9.002 8.561 8.157 7.783 7.415 7.049 6.701 6.339 6.037 5.777 5.484 5.149 4.868 4.592 4.315 4.102 3.874 3.629 3.374 3.112 2.926 2.736 2.437 2.223 2.008 1.893 1.644 1.401 1.132 0.988 0.489 0.528 0.364 0.174 -0.261 -0.494 -0.741 -1.017 -1.356 -1.73 -2.246 -3.906 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 632afad2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28 ,TETRA ,17591210,Sat Nov 27 21:35:14 CET,Sat Nov 27 23:23:35 CET,0.0 1.054 1.479 1.794 2.062 2.263 2.437 2.609 2.903 3.049 3.199 3.12 3.599 3.729 3.976 4.203 4.417 4.509 4.672 4.844 5.117 5.293 5.463 5.705 5.926 6.138 6.347 6.553 6.828 7.08 7.305 7.572 7.83 8.082 8.376 8.7 9.002 9.33 9.694 10.095 10.497 10.924 11.427 11.918 12.461 13.046 13.702 14.427 15.233 16.072 16.878 17.268 17.277 17.127 16.902 16.634 16.35 16.068 15.782 15.446 15.158 14.91 14.657 14.39 14.129 13.903 13.659 13.425 13.227 13.014 12.78 12.581 12.367 12.143 11.969 11.793 11.61 11.389 11.144 10.978 10.817 10.573 10.396 10.204 10.107 9.899 9.676 9.44 9.311 8.836 8.867 8.707 8.542 8.167 7.962 7.726 7.449 7.153 6.836 6.383 5.133 -2 ,4977 ,TETRA ,17591211,Sat Nov 27 21:35:15 CET,Sat Nov 27 23:24:03 CET,0.0 1.281 1.698 1.996 2.228 2.443 2.643 2.818 3.142 3.296 3.457 3.393 3.859 3.986 4.236 4.453 4.659 4.763 4.96 5.157 5.433 5.596 5.757 5.985 6.198 6.412 6.624 6.819 7.059 7.295 7.524 7.799 8.061 8.299 8.581 8.914 9.217 9.563 9.93 10.299 10.699 11.145 11.652 12.135 12.658 13.212 13.849 14.579 15.363 16.158 16.988 17.375 17.345 17.197 16.985 16.706 16.397 16.092 15.799 15.476 15.192 14.929 14.669 14.408 14.162 13.942 13.709 13.479 13.262 13.029 12.785 12.588 12.381 12.176 12.017 11.845 11.662 11.452 11.238 11.091 10.931 10.663 10.484 10.308 10.213 10.012 9.794 9.544 9.413 8.939 8.982 8.819 8.645 8.282 8.091 7.873 7.598 7.298 6.946 6.459 5.052 -3 ,18173 ,TETRA ,17591212,Sat Nov 27 21:35:17 CET,Sat Nov 27 23:23:44 CET,0.0 1.278 1.869 2.313 2.589 2.804 2.994 3.203 3.573 3.724 3.876 3.799 4.279 4.408 4.643 4.872 5.086 5.186 5.385 5.568 5.839 6.013 6.158 6.384 6.614 6.821 7.014 7.208 7.46 7.699 7.925 8.185 8.435 8.683 8.972 9.288 9.59 9.918 10.271 10.649 11.059 11.525 12.043 12.556 13.163 13.785 14.464 15.191 15.989 16.846 17.646 18.04 18.011 17.812 17.532 17.205 16.903 16.603 16.314 16.023 15.737 15.454 15.189 14.924 14.679 14.454 14.214 14.001 13.812 13.608 13.391 13.204 12.997 12.761 12.581 12.405 12.21 11.983 11.743 11.593 11.434 11.172 10.981 10.785 10.689 10.5 10.3 10.066 9.942 9.468 9.522 9.383 9.232 8.878 8.678 8.462 8.216 7.923 7.545 7.006 5.743 -4 ,2984 ,TETRA ,17591213,Sat Nov 27 21:35:14 CET,Sat Nov 27 23:22:49 CET,0.0 1.4 1.817 2.124 2.408 2.651 2.857 3.042 3.355 3.513 3.672 3.621 4.101 4.222 4.456 4.667 4.868 4.965 5.16 5.354 5.622 5.784 5.945 6.181 6.401 6.616 6.822 7.026 7.281 7.528 7.768 8.04 8.309 8.569 8.85 9.156 9.451 9.773 10.136 10.523 10.903 11.33 11.821 12.298 12.843 13.419 14.075 14.806 15.593 16.427 17.226 17.555 17.493 17.303 17.072 16.8 16.506 16.201 15.928 15.64 15.371 15.11 14.852 14.586 14.334 14.106 13.852 13.619 13.409 13.182 12.953 12.766 12.567 12.347 12.169 11.99 11.803 11.595 11.368 11.205 11.039 10.786 10.601 10.41 10.315 10.108 9.897 9.675 9.555 9.085 9.139 8.985 8.824 8.454 8.245 8.025 7.773 7.474 7.107 6.601 5.137 -5 ,3922 ,TETRA ,17591214,Sat Nov 27 21:35:14 CET,Sat Nov 27 23:23:14 CET,0.0 1.197 1.685 2.031 2.3 2.526 2.729 2.919 3.276 3.441 3.593 3.522 4.009 4.148 4.38 4.583 4.779 4.879 5.072 5.247 5.501 5.671 5.831 6.05 6.271 6.493 6.699 6.899 7.154 7.386 7.609 7.86 8.105 8.353 8.63 8.951 9.259 9.577 9.929 10.31 10.702 11.128 11.59 12.042 12.58 13.174 13.819 14.501 15.268 16.058 16.811 17.193 17.159 16.924 16.643 16.34 16.044 15.758 15.474 15.151 14.863 14.604 14.355 14.104 13.841 13.602 13.361 13.14 12.942 12.736 12.523 12.331 12.126 11.918 11.75 11.55 11.328 11.127 10.912 10.744 10.574 10.314 10.134 9.954 9.852 9.65 9.44 9.2 9.081 8.61 8.664 8.51 8.35 8.009 7.811 7.581 7.32 7.04 6.661 6.103 4.945 -6 ,31598 ,TETRA ,17591215,Sat Nov 27 22:14:48 CET,Sun Nov 28 00:03:13 CET,0.0 1.113 1.536 1.867 2.136 2.383 2.615 2.827 3.195 3.352 3.498 3.418 3.894 4.022 4.269 4.513 4.746 4.851 5.051 5.248 5.525 5.694 5.855 6.081 6.302 6.523 6.734 6.933 7.188 7.433 7.663 7.939 8.224 8.488 8.775 9.096 9.391 9.716 10.074 10.459 10.838 11.271 11.774 12.272 12.835 13.404 14.045 14.773 15.551 16.361 17.126 17.508 17.558 17.384 17.112 16.859 16.599 16.304 16.013 15.707 15.44 15.216 14.982 14.711 14.443 14.202 13.952 13.713 13.502 13.274 13.042 12.848 12.635 12.414 12.233 12.047 11.862 11.668 11.455 11.3 11.138 10.878 10.691 10.506 10.413 10.192 9.948 9.704 9.577 9.1 9.149 8.982 8.813 8.452 8.232 7.993 7.74 7.448 7.09 6.604 5.234 -7 ,15913 ,TETRA ,17591216,Sat Nov 27 21:35:14 CET,Sat Nov 27 23:23:54 CET,0.0 1.111 1.597 1.964 2.245 2.484 2.683 2.86 3.193 3.334 3.476 3.407 3.88 3.993 4.208 4.415 4.631 4.734 4.92 5.109 5.372 5.533 5.696 5.927 6.146 6.36 6.57 6.768 7.025 7.279 7.517 7.799 8.07 8.324 8.603 8.923 9.232 9.554 9.899 10.259 10.643 11.08 11.592 12.106 12.679 13.254 13.864 14.54 15.285 16.064 16.823 17.215 17.257 17.141 16.93 16.653 16.379 16.085 15.799 15.493 15.204 14.936 14.685 14.443 14.196 13.965 13.718 13.483 13.271 13.048 12.802 12.59 12.373 12.148 11.97 11.781 11.583 11.379 11.171 11.018 10.857 10.603 10.427 10.245 10.146 9.927 9.693 9.455 9.33 8.868 8.95 8.798 8.628 8.251 8.03 7.8 7.563 7.281 6.926 6.436 5.243 -8 ,23735 ,TETRA ,17591217,Sat Nov 27 22:14:42 CET,Sun Nov 28 00:04:00 CET,0.0 1.216 1.631 1.975 2.258 2.5 2.736 2.955 3.329 3.487 3.637 3.581 4.055 4.181 4.433 4.661 4.88 4.987 5.176 5.352 5.608 5.779 5.951 6.194 6.423 6.631 6.822 7.015 7.289 7.54 7.766 8.044 8.312 8.564 8.858 9.196 9.507 9.836 10.201 10.574 10.962 11.409 11.916 12.418 12.951 13.535 14.216 14.924 15.74 16.673 17.551 18.014 18.066 17.903 17.64 17.338 17.058 16.75 16.453 16.14 15.84 15.556 15.291 15.038 14.789 14.566 14.309 14.069 13.863 13.645 13.414 13.215 13.005 12.784 12.609 12.432 12.248 12.049 11.834 11.688 11.529 11.265 11.066 10.853 10.743 10.516 10.276 10.002 9.862 9.383 9.424 9.262 9.091 8.717 8.52 8.294 8.028 7.693 7.24 6.526 4.412 -9 ,28713 ,TETRA ,17591218,Sat Nov 27 22:14:47 CET,Sun Nov 28 00:03:12 CET,0.0 1.272 1.713 2.043 2.297 2.503 2.696 2.872 3.187 3.345 3.496 3.431 3.916 4.041 4.274 4.497 4.713 4.812 4.998 5.176 5.426 5.593 5.76 5.996 6.228 6.445 6.648 6.841 7.087 7.325 7.565 7.862 8.143 8.411 8.709 9.043 9.354 9.686 10.047 10.423 10.802 11.23 11.728 12.214 12.773 13.406 14.111 14.82 15.554 16.282 17.012 17.378 17.391 17.283 17.061 16.771 16.45 16.15 15.887 15.578 15.288 15.039 14.788 14.52 14.274 14.045 13.797 13.577 13.376 13.148 12.911 12.71 12.495 12.271 12.091 11.901 11.707 11.51 11.293 11.14 10.982 10.732 10.56 10.376 10.278 10.072 9.846 9.599 9.474 9.001 9.058 8.9 8.729 8.352 8.128 7.883 7.605 7.298 6.924 6.445 4.703 -10 ,18023 ,TETRA ,17591219,Sat Nov 27 22:14:43 CET,Sun Nov 28 00:04:02 CET,0.0 1.326 1.765 2.1 2.362 2.612 2.847 3.051 3.38 3.54 3.704 3.649 4.124 4.241 4.488 4.728 4.954 5.065 5.266 5.451 5.723 5.89 6.049 6.274 6.497 6.72 6.928 7.113 7.36 7.604 7.833 8.114 8.376 8.623 8.907 9.236 9.548 9.872 10.226 10.599 10.976 11.387 11.857 12.345 12.919 13.543 14.201 14.87 15.635 16.456 17.267 17.697 17.681 17.515 17.273 16.974 16.708 16.446 16.18 15.87 15.584 15.331 15.078 14.822 14.573 14.341 14.066 13.816 13.601 13.374 13.147 12.954 12.746 12.515 12.348 12.178 12.001 11.808 11.58 11.426 11.274 11.012 10.82 10.638 10.546 10.337 10.112 9.87 9.739 9.265 9.305 9.148 8.988 8.605 8.397 8.179 7.942 7.672 7.327 6.868 5.174 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index 026451f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10609 ,TETRA ,17591220,Sat Nov 27 22:14:44 CET,Sun Nov 28 00:03:12 CET,0.0 1.922 2.392 2.758 3.087 3.375 3.612 3.837 4.232 4.41 4.59 4.552 5.044 5.181 5.434 5.684 5.914 6.019 6.228 6.44 6.745 6.919 7.084 7.33 7.571 7.804 8.023 8.239 8.51 8.751 8.969 9.241 9.519 9.777 10.058 10.363 10.661 10.991 11.342 11.693 12.048 12.432 12.882 13.341 13.811 14.295 14.811 15.325 15.883 16.436 16.837 16.793 16.475 16.092 15.683 15.217 14.742 14.3 13.92 13.517 13.145 12.796 12.465 12.154 11.869 11.588 11.287 11.041 10.819 10.583 10.334 10.112 9.867 9.602 9.397 9.195 8.98 8.755 8.523 8.353 8.174 7.899 7.719 7.531 7.436 7.238 7.002 6.752 6.622 6.136 6.175 6.006 5.832 5.421 5.191 4.953 4.67 4.356 3.981 3.444 2.055 -2 ,20063 ,TETRA ,17591221,Sat Nov 27 22:16:21 CET,Sun Nov 28 00:06:33 CET,0.0 1.524 2.033 2.452 2.806 3.078 3.307 3.538 3.979 4.159 4.332 4.297 4.789 4.925 5.176 5.422 5.664 5.776 5.996 6.211 6.505 6.691 6.869 7.127 7.368 7.596 7.815 8.026 8.283 8.528 8.769 9.049 9.309 9.56 9.852 10.164 10.464 10.785 11.129 11.488 11.85 12.247 12.69 13.12 13.594 14.094 14.656 15.224 15.79 16.337 16.677 16.54 16.204 15.814 15.35 14.881 14.484 14.089 13.698 13.298 12.95 12.643 12.331 12.021 11.723 11.445 11.142 10.861 10.624 10.382 10.124 9.899 9.666 9.433 9.247 9.04 8.812 8.584 8.364 8.203 8.021 7.752 7.568 7.36 7.252 7.019 6.773 6.51 6.372 5.879 5.926 5.771 5.607 5.223 4.997 4.769 4.504 4.186 3.816 3.249 1.257 -3 ,16739 ,TETRA ,17591222,Sat Nov 27 22:15:20 CET,Sun Nov 28 00:03:49 CET,0.0 1.315 1.79 2.181 2.512 2.765 2.981 3.207 3.625 3.805 3.984 3.963 4.458 4.598 4.854 5.088 5.317 5.431 5.664 5.883 6.174 6.358 6.524 6.775 7.037 7.276 7.492 7.687 7.931 8.164 8.395 8.684 8.952 9.202 9.486 9.798 10.107 10.454 10.812 11.17 11.545 11.962 12.411 12.843 13.349 13.879 14.424 14.979 15.565 16.133 16.539 16.473 16.179 15.765 15.28 14.798 14.362 13.965 13.591 13.189 12.833 12.504 12.181 11.879 11.589 11.304 11.006 10.738 10.493 10.23 9.955 9.729 9.504 9.261 9.061 8.865 8.654 8.426 8.198 8.026 7.842 7.563 7.365 7.149 7.037 6.806 6.55 6.277 6.143 5.649 5.668 5.495 5.313 4.937 4.71 4.447 4.158 3.844 3.443 2.91 1.458 -4 ,20292 ,TETRA ,17591223,Sat Nov 27 22:15:21 CET,Sun Nov 28 00:02:09 CET,0.0 1.829 2.338 2.721 3.082 3.384 3.642 3.881 4.293 4.474 4.649 4.627 5.119 5.262 5.544 5.799 6.033 6.147 6.358 6.566 6.88 7.067 7.236 7.472 7.695 7.893 8.084 8.282 8.544 8.798 9.039 9.322 9.58 9.822 10.088 10.394 10.706 11.041 11.39 11.767 12.141 12.527 12.963 13.389 13.871 14.402 14.989 15.55 16.105 16.665 17.04 16.953 16.633 16.223 15.79 15.33 14.895 14.489 14.092 13.678 13.314 12.985 12.661 12.342 12.032 11.747 11.473 11.219 10.986 10.739 10.48 10.256 10.027 9.798 9.598 9.381 9.163 8.941 8.711 8.537 8.345 8.059 7.862 7.646 7.533 7.3 7.064 6.808 6.679 6.196 6.227 6.059 5.88 5.509 5.304 5.06 4.791 4.478 4.057 3.503 1.658 -5 ,11366 ,TETRA ,17591224,Sat Nov 27 22:15:21 CET,Sun Nov 28 00:03:10 CET,0.0 1.751 2.275 2.726 3.057 3.324 3.554 3.769 4.199 4.398 4.571 4.558 5.07 5.214 5.474 5.705 5.923 6.032 6.241 6.442 6.73 6.904 7.078 7.339 7.574 7.792 8.002 8.206 8.473 8.736 8.984 9.288 9.576 9.827 10.099 10.404 10.697 11.004 11.326 11.678 12.062 12.477 12.922 13.35 13.839 14.34 14.892 15.479 16.078 16.647 17.016 16.971 16.666 16.268 15.845 15.383 14.945 14.512 14.098 13.691 13.356 13.018 12.664 12.348 12.051 11.775 11.492 11.234 10.996 10.748 10.487 10.271 10.05 9.815 9.631 9.433 9.228 9.011 8.775 8.612 8.434 8.16 7.982 7.79 7.686 7.454 7.203 6.937 6.797 6.314 6.347 6.163 5.963 5.536 5.321 5.057 4.735 4.389 3.997 3.481 1.5 -6 ,22372 ,TETRA ,17591225,Sat Nov 27 22:15:21 CET,Sun Nov 28 00:02:49 CET,0.0 1.539 2.04 2.39 2.686 2.978 3.254 3.496 3.906 4.089 4.26 4.223 4.711 4.853 5.132 5.377 5.592 5.699 5.906 6.098 6.376 6.555 6.732 6.991 7.226 7.446 7.656 7.864 8.142 8.387 8.618 8.897 9.156 9.409 9.705 10.049 10.378 10.701 11.019 11.361 11.716 12.096 12.519 12.93 13.409 13.923 14.456 15.029 15.623 16.125 16.436 16.316 15.951 15.523 15.079 14.628 14.212 13.826 13.469 13.069 12.698 12.366 12.041 11.723 11.434 11.162 10.87 10.632 10.41 10.157 9.9 9.665 9.401 9.137 8.94 8.733 8.521 8.312 8.093 7.925 7.752 7.49 7.3 7.098 6.993 6.774 6.542 6.283 6.149 5.675 5.724 5.554 5.376 4.963 4.742 4.52 4.259 3.933 3.562 3.062 1.683 -7 ,20572 ,TETRA ,17591226,Sat Nov 27 22:15:23 CET,Sun Nov 28 00:03:09 CET,0.0 1.629 2.085 2.442 2.767 3.06 3.296 3.506 3.906 4.079 4.252 4.248 4.744 4.875 5.161 5.422 5.655 5.77 5.995 6.204 6.493 6.679 6.854 7.099 7.333 7.557 7.765 7.968 8.227 8.46 8.681 8.949 9.201 9.467 9.768 10.073 10.369 10.697 11.043 11.383 11.714 12.08 12.517 12.943 13.404 13.891 14.458 15.035 15.593 16.118 16.464 16.41 16.088 15.645 15.193 14.75 14.324 13.915 13.556 13.166 12.826 12.517 12.204 11.889 11.593 11.314 11.003 10.727 10.488 10.235 9.965 9.754 9.55 9.315 9.13 8.937 8.721 8.498 8.255 8.082 7.905 7.63 7.43 7.227 7.122 6.892 6.637 6.348 6.202 5.713 5.752 5.594 5.428 5.063 4.844 4.595 4.333 4.023 3.641 3.144 1.099 -8 ,3523 ,TETRA ,17591227,Sat Nov 27 22:15:21 CET,Sun Nov 28 00:06:42 CET,0.0 1.918 2.486 2.872 3.168 3.436 3.685 3.917 4.299 4.476 4.65 4.62 5.12 5.27 5.556 5.806 6.037 6.152 6.383 6.604 6.898 7.072 7.234 7.482 7.718 7.937 8.159 8.371 8.628 8.879 9.121 9.411 9.687 9.951 10.262 10.589 10.89 11.229 11.582 11.932 12.298 12.694 13.145 13.603 14.115 14.663 15.25 15.857 16.45 16.955 17.31 17.243 16.864 16.418 16.005 15.536 15.075 14.651 14.244 13.826 13.459 13.117 12.788 12.466 12.161 11.878 11.581 11.299 11.048 10.808 10.553 10.338 10.11 9.855 9.658 9.454 9.237 8.996 8.743 8.57 8.395 8.122 7.934 7.741 7.635 7.402 7.157 6.892 6.753 6.264 6.321 6.166 5.999 5.641 5.436 5.193 4.906 4.589 4.207 3.7 1.948 -9 ,17050 ,TETRA ,17591228,Sat Nov 27 22:16:21 CET,Sun Nov 28 00:04:10 CET,0.0 1.596 2.138 2.555 2.882 3.126 3.356 3.604 4.048 4.232 4.405 4.386 4.888 5.027 5.287 5.53 5.751 5.858 6.07 6.271 6.563 6.744 6.912 7.169 7.425 7.661 7.87 8.076 8.356 8.622 8.859 9.128 9.395 9.65 9.941 10.256 10.55 10.877 11.205 11.525 11.865 12.266 12.739 13.172 13.623 14.13 14.689 15.25 15.857 16.414 16.765 16.763 16.48 16.038 15.6 15.141 14.674 14.224 13.836 13.466 13.139 12.828 12.529 12.223 11.922 11.651 11.378 11.127 10.887 10.638 10.368 10.138 9.916 9.671 9.471 9.278 9.072 8.845 8.598 8.423 8.248 7.985 7.804 7.612 7.513 7.295 7.057 6.812 6.678 6.191 6.245 6.089 5.922 5.548 5.335 5.094 4.838 4.554 4.175 3.571 1.283 -10 ,31238 ,TETRA ,17591229,Sat Nov 27 22:16:23 CET,Sun Nov 28 00:05:10 CET,0.0 1.838 2.369 2.777 3.086 3.337 3.567 3.772 4.15 4.332 4.503 4.489 4.994 5.142 5.412 5.652 5.871 5.984 6.205 6.405 6.689 6.87 7.035 7.258 7.482 7.71 7.923 8.119 8.376 8.622 8.846 9.123 9.391 9.643 9.929 10.236 10.523 10.843 11.19 11.538 11.902 12.306 12.76 13.202 13.701 14.211 14.762 15.337 15.898 16.416 16.773 16.727 16.411 15.959 15.481 15.003 14.567 14.139 13.731 13.324 12.977 12.638 12.308 11.997 11.691 11.407 11.112 10.833 10.596 10.36 10.095 9.874 9.644 9.406 9.216 9.003 8.79 8.569 8.328 8.164 7.991 7.719 7.529 7.323 7.213 6.98 6.74 6.486 6.345 5.863 5.917 5.76 5.587 5.189 4.977 4.753 4.502 4.198 3.722 3.005 1.261 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 30f9acd9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14953 ,TETRA ,17591230,Sat Nov 27 22:16:25 CET,Sun Nov 28 00:02:52 CET,0.0 1.081 1.478 1.778 2.03 2.246 2.448 2.658 3.037 3.197 3.348 3.269 3.743 3.862 4.089 4.297 4.49 4.59 4.793 4.988 5.257 5.434 5.606 5.831 6.044 6.262 6.46 6.643 6.901 7.15 7.379 7.656 7.912 8.149 8.432 8.762 9.078 9.398 9.735 10.114 10.504 10.923 11.4 11.9 12.497 13.09 13.694 14.356 15.092 15.827 16.516 16.791 16.716 16.549 16.28 15.959 15.665 15.35 15.062 14.767 14.481 14.222 13.961 13.698 13.453 13.222 12.981 12.744 12.533 12.317 12.069 11.856 11.642 11.407 11.213 11.027 10.844 10.642 10.422 10.261 10.103 9.854 9.676 9.487 9.385 9.171 8.934 8.688 8.56 8.089 8.153 7.975 7.784 7.424 7.22 6.979 6.723 6.413 6.021 5.526 4.264 -2 ,25559 ,TETRA ,17591231,Sat Nov 27 22:17:21 CET,Sun Nov 28 00:06:43 CET,0.0 1.302 1.726 2.049 2.329 2.567 2.776 2.961 3.279 3.42 3.545 3.459 3.938 4.063 4.31 4.526 4.735 4.834 5.025 5.211 5.464 5.63 5.792 6.02 6.243 6.454 6.655 6.847 7.103 7.354 7.587 7.852 8.106 8.362 8.64 8.953 9.257 9.566 9.908 10.28 10.65 11.062 11.539 12.0 12.543 13.139 13.794 14.477 15.203 15.968 16.689 17.036 17.037 16.861 16.596 16.297 15.989 15.677 15.397 15.111 14.832 14.575 14.322 14.066 13.812 13.565 13.295 13.058 12.853 12.627 12.384 12.172 11.95 11.732 11.557 11.372 11.189 10.98 10.757 10.613 10.463 10.208 10.022 9.828 9.723 9.513 9.297 9.072 8.952 8.474 8.513 8.346 8.171 7.818 7.615 7.363 7.098 6.828 6.469 5.952 4.433 -3 ,9138 ,TETRA ,17591232,Sat Nov 27 22:16:21 CET,Sun Nov 28 00:05:32 CET,0.0 1.067 1.476 1.753 1.994 2.234 2.443 2.623 2.987 3.161 3.309 3.222 3.701 3.835 4.074 4.302 4.512 4.612 4.807 4.99 5.266 5.449 5.624 5.859 6.073 6.28 6.474 6.663 6.908 7.142 7.372 7.653 7.918 8.163 8.448 8.761 9.053 9.377 9.73 10.094 10.46 10.882 11.368 11.855 12.42 13.014 13.654 14.339 15.106 15.903 16.709 17.076 17.069 16.903 16.653 16.34 16.039 15.743 15.449 15.132 14.825 14.536 14.267 14.02 13.768 13.51 13.229 12.982 12.776 12.568 12.34 12.128 11.909 11.682 11.483 11.271 11.065 10.868 10.648 10.474 10.303 10.043 9.858 9.666 9.568 9.37 9.143 8.875 8.742 8.267 8.345 8.201 8.032 7.675 7.475 7.252 6.981 6.658 6.281 5.735 4.222 -4 ,32069 ,TETRA ,17591233,Sat Nov 27 22:16:21 CET,Sun Nov 28 00:05:37 CET,0.0 2.267 2.91 3.395 3.732 3.947 4.155 4.361 4.719 4.873 5.022 4.957 5.428 5.554 5.817 6.06 6.271 6.369 6.554 6.733 6.997 7.174 7.33 7.553 7.768 7.958 8.149 8.347 8.6 8.833 9.059 9.334 9.595 9.829 10.087 10.378 10.653 10.954 11.28 11.628 12.001 12.41 12.869 13.339 13.857 14.4 15.038 15.734 16.469 17.229 17.971 18.271 18.216 18.016 17.746 17.449 17.135 16.803 16.497 16.19 15.924 15.675 15.421 15.16 14.882 14.63 14.378 14.148 13.928 13.697 13.472 13.274 13.061 12.823 12.62 12.418 12.216 11.996 11.767 11.605 11.442 11.176 10.986 10.803 10.708 10.508 10.293 10.053 9.924 9.449 9.513 9.362 9.195 8.832 8.649 8.443 8.181 7.889 7.544 6.999 5.626 -5 ,32482 ,TETRA ,17591234,Sat Nov 27 22:16:21 CET,Sun Nov 28 00:03:43 CET,0.0 1.098 1.56 1.89 2.207 2.46 2.669 2.859 3.19 3.355 3.522 3.464 3.955 4.089 4.32 4.539 4.748 4.848 5.05 5.243 5.501 5.66 5.808 6.018 6.232 6.442 6.646 6.846 7.092 7.323 7.551 7.835 8.102 8.351 8.641 8.944 9.224 9.539 9.886 10.242 10.603 11.019 11.517 12.008 12.542 13.114 13.734 14.4 15.142 15.928 16.683 17.014 16.963 16.754 16.479 16.187 15.88 15.591 15.325 15.01 14.736 14.485 14.217 13.954 13.702 13.459 13.205 12.97 12.767 12.55 12.309 12.108 11.886 11.661 11.484 11.285 11.072 10.856 10.646 10.491 10.325 10.072 9.896 9.706 9.601 9.385 9.173 8.942 8.808 8.316 8.343 8.185 8.025 7.685 7.482 7.242 6.969 6.67 6.304 5.82 4.131 -6 ,32744 ,TETRA ,17591235,Sat Nov 27 22:16:22 CET,Sun Nov 28 00:04:21 CET,0.0 1.026 1.425 1.759 2.031 2.281 2.516 2.705 3.015 3.166 3.312 3.249 3.738 3.87 4.112 4.336 4.552 4.652 4.829 5.002 5.269 5.443 5.611 5.85 6.078 6.295 6.502 6.7 6.954 7.202 7.42 7.662 7.914 8.175 8.46 8.756 9.055 9.379 9.699 10.05 10.434 10.851 11.333 11.798 12.318 12.892 13.537 14.212 14.928 15.673 16.334 16.604 16.553 16.371 16.121 15.798 15.485 15.191 14.883 14.559 14.274 13.995 13.716 13.448 13.193 12.954 12.698 12.463 12.259 12.04 11.81 11.613 11.409 11.177 10.983 10.788 10.597 10.39 10.16 10.006 9.847 9.599 9.426 9.238 9.141 8.934 8.699 8.443 8.309 7.828 7.878 7.728 7.566 7.206 7.0 6.788 6.546 6.248 5.847 5.307 3.801 -7 ,28095 ,TETRA ,17591236,Sat Nov 27 22:17:21 CET,Sun Nov 28 00:05:50 CET,0.0 1.221 1.652 1.968 2.22 2.435 2.635 2.816 3.15 3.308 3.449 3.365 3.839 3.956 4.184 4.4 4.604 4.707 4.904 5.085 5.34 5.501 5.664 5.903 6.122 6.323 6.519 6.712 6.962 7.202 7.428 7.701 7.954 8.192 8.479 8.807 9.106 9.424 9.78 10.148 10.534 10.967 11.465 11.948 12.465 13.057 13.732 14.42 15.161 15.908 16.65 17.007 16.994 16.826 16.572 16.259 15.901 15.537 15.213 14.89 14.603 14.323 14.029 13.761 13.517 13.269 13.0 12.757 12.548 12.32 12.074 11.873 11.655 11.424 11.244 11.052 10.856 10.656 10.433 10.278 10.115 9.854 9.672 9.478 9.377 9.161 8.931 8.704 8.585 8.106 8.151 7.991 7.82 7.454 7.248 7.004 6.733 6.423 6.055 5.537 3.908 -8 ,17098 ,TETRA ,17591237,Sat Nov 27 22:17:20 CET,Sun Nov 28 00:06:53 CET,0.0 1.118 1.471 1.802 2.12 2.423 2.676 2.885 3.226 3.386 3.542 3.469 3.948 4.078 4.329 4.547 4.737 4.835 5.038 5.242 5.533 5.713 5.878 6.111 6.337 6.557 6.761 6.952 7.192 7.426 7.654 7.921 8.18 8.428 8.708 9.013 9.3 9.615 9.962 10.339 10.726 11.125 11.579 12.058 12.595 13.163 13.793 14.443 15.139 15.88 16.568 16.856 16.763 16.52 16.242 15.945 15.66 15.354 15.058 14.731 14.433 14.145 13.853 13.585 13.33 13.095 12.854 12.618 12.404 12.176 11.933 11.723 11.484 11.229 11.04 10.861 10.667 10.453 10.227 10.069 9.902 9.63 9.441 9.25 9.149 8.937 8.716 8.478 8.342 7.864 7.923 7.763 7.594 7.244 7.036 6.799 6.535 6.239 5.892 5.471 4.376 -9 ,17578 ,TETRA ,17591238,Sat Nov 27 22:17:20 CET,Sun Nov 28 00:05:11 CET,0.0 1.247 1.674 2.012 2.31 2.58 2.803 2.992 3.305 3.462 3.611 3.538 4.023 4.149 4.372 4.577 4.779 4.879 5.081 5.269 5.523 5.686 5.842 6.074 6.291 6.478 6.666 6.862 7.125 7.379 7.612 7.887 8.147 8.393 8.682 9.003 9.309 9.638 9.978 10.33 10.69 11.104 11.581 12.07 12.65 13.246 13.878 14.57 15.343 16.154 16.863 17.136 17.064 16.826 16.541 16.205 15.863 15.547 15.244 14.907 14.59 14.316 14.052 13.779 13.506 13.248 12.963 12.708 12.491 12.27 12.048 11.845 11.619 11.394 11.22 11.032 10.84 10.639 10.436 10.287 10.121 9.862 9.683 9.492 9.386 9.176 8.959 8.72 8.597 8.124 8.179 8.022 7.843 7.463 7.263 7.035 6.775 6.47 6.095 5.604 4.057 -10 ,15209 ,TETRA ,17591239,Sat Nov 27 22:23:22 CET,Sun Nov 28 00:12:35 CET,0.0 1.112 1.529 1.831 2.105 2.337 2.543 2.728 3.037 3.192 3.352 3.295 3.772 3.898 4.131 4.35 4.56 4.668 4.871 5.048 5.305 5.471 5.634 5.87 6.1 6.32 6.522 6.716 6.968 7.216 7.449 7.722 7.987 8.24 8.527 8.842 9.141 9.451 9.792 10.157 10.529 10.939 11.398 11.881 12.461 13.056 13.703 14.416 15.163 15.923 16.665 17.004 16.945 16.723 16.434 16.101 15.801 15.505 15.212 14.887 14.592 14.333 14.08 13.825 13.581 13.343 13.08 12.838 12.627 12.412 12.189 11.997 11.776 11.552 11.388 11.192 10.972 10.763 10.536 10.368 10.202 9.952 9.765 9.552 9.446 9.229 9.003 8.767 8.639 8.173 8.255 8.086 7.902 7.504 7.288 7.055 6.803 6.528 6.194 5.748 4.562 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt deleted file mode 100644 index 4f68bccd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,267 ,TETRA ,17591240,Sat Nov 27 22:23:24 CET,Sun Nov 28 00:14:17 CET,0.0 1.134 1.628 1.955 2.251 2.548 2.782 2.975 3.348 3.517 3.66 3.607 4.096 4.22 4.447 4.655 4.856 4.958 5.153 5.336 5.596 5.759 5.92 6.146 6.362 6.579 6.778 6.967 7.208 7.444 7.669 7.912 8.135 8.362 8.637 8.935 9.212 9.52 9.847 10.198 10.55 10.925 11.374 11.806 12.249 12.733 13.264 13.779 14.343 14.869 15.206 15.126 14.828 14.427 13.978 13.535 13.103 12.686 12.302 11.919 11.591 11.287 10.989 10.711 10.453 10.209 9.951 9.714 9.51 9.285 9.044 8.851 8.643 8.427 8.255 8.069 7.88 7.685 7.477 7.327 7.16 6.893 6.711 6.523 6.43 6.22 6.006 5.787 5.663 5.192 5.274 5.122 4.96 4.61 4.411 4.206 3.993 3.737 3.404 2.912 1.518 -2 ,32476 ,TETRA ,17591241,Sat Nov 27 22:23:26 CET,Sun Nov 28 00:12:33 CET,0.0 0.919 1.358 1.719 2.034 2.274 2.493 2.714 3.087 3.238 3.382 3.321 3.796 3.92 4.147 4.361 4.573 4.674 4.861 5.051 5.325 5.492 5.652 5.882 6.101 6.316 6.519 6.706 6.945 7.17 7.377 7.621 7.86 8.106 8.39 8.697 8.998 9.344 9.708 10.053 10.391 10.756 11.184 11.591 12.043 12.524 13.028 13.563 14.114 14.615 14.947 14.856 14.569 14.182 13.768 13.383 13.005 12.623 12.281 11.918 11.593 11.304 11.006 10.71 10.43 10.175 9.906 9.643 9.418 9.196 8.949 8.736 8.513 8.286 8.111 7.92 7.719 7.516 7.299 7.146 6.987 6.726 6.543 6.354 6.257 6.058 5.845 5.619 5.496 5.018 5.088 4.938 4.788 4.446 4.25 4.044 3.801 3.52 3.196 2.753 1.688 -3 ,27490 ,TETRA ,17591242,Sat Nov 27 22:24:23 CET,Sun Nov 28 00:12:23 CET,0.0 1.226 1.685 2.0 2.28 2.538 2.777 2.99 3.347 3.504 3.65 3.567 4.039 4.161 4.397 4.617 4.818 4.915 5.113 5.3 5.543 5.699 5.856 6.082 6.297 6.494 6.687 6.884 7.127 7.355 7.58 7.846 8.081 8.297 8.558 8.856 9.138 9.436 9.76 10.095 10.439 10.831 11.263 11.68 12.172 12.697 13.241 13.796 14.352 14.894 15.266 15.15 14.841 14.444 13.989 13.567 13.168 12.768 12.421 12.053 11.718 11.411 11.072 10.75 10.476 10.221 9.948 9.701 9.481 9.25 8.996 8.793 8.593 8.351 8.158 7.967 7.782 7.595 7.374 7.217 7.057 6.813 6.656 6.471 6.368 6.158 5.921 5.69 5.573 5.092 5.163 5.029 4.889 4.557 4.36 4.131 3.877 3.571 3.186 2.719 1.475 -4 ,4102 ,TETRA ,17591243,Sat Nov 27 22:24:25 CET,Sun Nov 28 00:12:17 CET,0.0 1.215 1.691 2.04 2.316 2.55 2.769 2.967 3.293 3.436 3.589 3.529 4.005 4.129 4.364 4.591 4.805 4.905 5.103 5.289 5.533 5.693 5.853 6.073 6.276 6.48 6.677 6.869 7.118 7.341 7.553 7.827 8.081 8.308 8.574 8.892 9.19 9.501 9.839 10.19 10.553 10.938 11.361 11.768 12.219 12.709 13.238 13.801 14.367 14.846 15.189 15.086 14.729 14.266 13.815 13.376 12.969 12.573 12.201 11.848 11.538 11.226 10.909 10.615 10.327 10.038 9.751 9.51 9.296 9.063 8.812 8.602 8.393 8.169 7.988 7.796 7.58 7.357 7.138 6.988 6.834 6.594 6.426 6.248 6.153 5.959 5.758 5.531 5.411 4.938 5.002 4.856 4.703 4.37 4.149 3.91 3.669 3.36 3.002 2.568 0.999 -5 ,31228 ,TETRA ,17591244,Sat Nov 27 22:24:28 CET,Sun Nov 28 00:13:11 CET,0.0 1.604 1.984 2.268 2.519 2.74 2.943 3.124 3.48 3.659 3.828 3.762 4.236 4.366 4.623 4.864 5.072 5.173 5.368 5.547 5.8 5.96 6.121 6.363 6.591 6.808 7.006 7.194 7.441 7.668 7.881 8.149 8.402 8.639 8.907 9.191 9.466 9.782 10.126 10.474 10.813 11.171 11.593 12.016 12.486 12.961 13.494 14.095 14.708 15.284 15.684 15.566 15.214 14.813 14.415 14.0 13.582 13.188 12.84 12.484 12.161 11.842 11.526 11.222 10.93 10.671 10.404 10.155 9.944 9.731 9.502 9.294 9.075 8.851 8.67 8.483 8.296 8.099 7.875 7.713 7.551 7.297 7.12 6.935 6.84 6.642 6.427 6.201 6.078 5.609 5.691 5.552 5.399 5.057 4.861 4.642 4.398 4.109 3.744 3.273 2.138 -6 ,17695 ,TETRA ,17591245,Sat Nov 27 22:24:27 CET,Sun Nov 28 00:12:34 CET,0.0 1.374 1.876 2.205 2.472 2.723 2.943 3.131 3.482 3.652 3.808 3.73 4.203 4.328 4.583 4.81 5.01 5.108 5.304 5.493 5.749 5.92 6.081 6.299 6.515 6.728 6.918 7.088 7.303 7.506 7.709 7.963 8.199 8.427 8.698 8.993 9.289 9.613 9.946 10.297 10.657 11.033 11.451 11.873 12.325 12.823 13.38 13.937 14.516 15.086 15.421 15.308 14.981 14.567 14.141 13.69 13.274 12.879 12.503 12.153 11.868 11.583 11.264 10.971 10.704 10.443 10.176 9.927 9.701 9.471 9.233 9.022 8.798 8.574 8.399 8.207 8.006 7.803 7.591 7.443 7.284 7.034 6.851 6.653 6.551 6.338 6.119 5.884 5.761 5.281 5.349 5.213 5.072 4.731 4.548 4.354 4.101 3.823 3.491 3.063 1.94 -7 ,11284 ,TETRA ,17591246,Sat Nov 27 22:24:24 CET,Sun Nov 28 00:12:40 CET,0.0 0.987 1.463 1.812 2.093 2.328 2.556 2.774 3.162 3.329 3.472 3.399 3.884 4.003 4.23 4.457 4.672 4.778 4.97 5.144 5.401 5.555 5.698 5.924 6.149 6.356 6.551 6.738 6.989 7.226 7.438 7.701 7.952 8.193 8.472 8.76 9.04 9.353 9.648 9.967 10.316 10.694 11.102 11.484 11.942 12.451 13.027 13.593 14.174 14.724 15.06 14.963 14.658 14.289 13.889 13.446 13.047 12.682 12.326 11.957 11.608 11.288 10.998 10.707 10.433 10.178 9.906 9.666 9.452 9.209 8.957 8.753 8.54 8.329 8.154 7.965 7.772 7.566 7.336 7.173 7.017 6.779 6.603 6.407 6.31 6.114 5.896 5.665 5.545 5.065 5.136 4.993 4.828 4.465 4.243 4.01 3.755 3.455 3.101 2.572 1.41 -8 ,8856 ,TETRA ,17591247,Sat Nov 27 22:24:27 CET,Sun Nov 28 00:12:47 CET,0.0 1.345 1.866 2.22 2.473 2.711 2.919 3.089 3.434 3.601 3.749 3.685 4.174 4.293 4.507 4.714 4.929 5.037 5.238 5.415 5.654 5.802 5.955 6.196 6.422 6.637 6.833 7.017 7.247 7.468 7.691 7.951 8.192 8.413 8.673 8.985 9.288 9.61 9.944 10.278 10.621 11.021 11.47 11.887 12.346 12.847 13.388 13.933 14.493 14.994 15.353 15.37 15.091 14.697 14.28 13.835 13.408 13.022 12.689 12.314 11.953 11.621 11.303 11.002 10.712 10.436 10.159 9.912 9.684 9.443 9.182 8.972 8.774 8.575 8.403 8.205 8.005 7.812 7.613 7.462 7.3 7.034 6.85 6.663 6.561 6.367 6.179 5.941 5.804 5.317 5.382 5.242 5.092 4.731 4.526 4.326 4.04 3.667 3.291 2.864 1.793 -9 ,13082 ,TETRA ,17591248,Sat Nov 27 22:24:28 CET,Sun Nov 28 00:12:33 CET,0.0 1.32 1.833 2.163 2.435 2.72 2.963 3.155 3.514 3.682 3.844 3.786 4.268 4.393 4.629 4.846 5.05 5.155 5.35 5.533 5.801 5.975 6.138 6.359 6.574 6.776 6.974 7.164 7.402 7.636 7.85 8.107 8.357 8.6 8.881 9.17 9.44 9.756 10.093 10.438 10.774 11.121 11.532 11.949 12.411 12.897 13.452 14.02 14.577 15.082 15.439 15.392 15.084 14.708 14.302 13.863 13.427 13.018 12.66 12.304 11.991 11.681 11.374 11.094 10.829 10.563 10.272 10.02 9.793 9.548 9.288 9.072 8.858 8.64 8.47 8.289 8.103 7.91 7.704 7.558 7.408 7.181 7.006 6.821 6.73 6.543 6.336 6.109 5.991 5.518 5.585 5.423 5.256 4.901 4.714 4.516 4.298 4.029 3.69 3.254 2.249 -10 ,12213 ,TETRA ,17591249,Sat Nov 27 22:24:30 CET,Sun Nov 28 00:12:33 CET,0.0 1.111 1.523 1.875 2.155 2.378 2.588 2.777 3.144 3.296 3.431 3.353 3.833 3.953 4.185 4.42 4.635 4.73 4.915 5.1 5.36 5.523 5.678 5.887 6.091 6.302 6.513 6.715 6.966 7.197 7.402 7.64 7.879 8.114 8.381 8.694 9.001 9.304 9.634 9.986 10.321 10.694 11.102 11.508 11.995 12.5 13.039 13.61 14.212 14.786 15.156 15.125 14.865 14.511 14.098 13.661 13.222 12.796 12.436 12.062 11.729 11.424 11.115 10.819 10.54 10.277 10.003 9.758 9.537 9.295 9.034 8.819 8.595 8.363 8.184 7.985 7.775 7.579 7.38 7.223 7.052 6.803 6.637 6.462 6.367 6.173 5.96 5.729 5.613 5.138 5.199 5.055 4.903 4.548 4.343 4.105 3.859 3.608 3.285 2.812 1.706 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index fa71e676..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,542 ,KEBNE ,17026816,Wed Dec 22 15:29:36 CET,Wed Dec 22 17:02:04 CET,0.0 1.202 1.628 1.973 2.257 2.512 2.749 2.982 3.438 3.625 3.779 3.716 4.207 4.352 4.645 4.917 5.163 5.278 5.493 5.703 5.996 6.178 6.371 6.65 6.899 7.13 7.347 7.559 7.838 8.12 8.401 8.722 9.01 9.291 9.632 10.018 10.371 10.752 11.15 11.567 12.01 12.505 13.072 13.624 14.247 14.931 15.697 16.508 17.396 18.376 19.33 19.82 19.81 19.591 19.284 18.926 18.535 18.147 17.786 17.374 16.997 16.66 16.328 15.998 15.681 15.381 15.066 14.774 14.519 14.236 13.933 13.692 13.451 13.186 12.964 12.737 12.504 12.256 11.986 11.793 11.59 11.255 11.028 10.8 10.674 10.418 10.144 9.831 9.667 9.155 9.104 8.907 8.711 8.265 8.024 7.752 7.424 7.068 6.638 5.91 3.796 -2 ,17908 ,KEBNE ,17026817,Wed Dec 22 15:29:36 CET,Wed Dec 22 17:02:27 CET,0.0 1.078 1.513 1.881 2.162 2.39 2.599 2.789 3.139 3.321 3.497 3.456 3.95 4.094 4.37 4.597 4.815 4.925 5.151 5.375 5.679 5.862 6.034 6.295 6.553 6.797 7.031 7.253 7.526 7.785 8.05 8.37 8.669 8.951 9.277 9.641 9.987 10.374 10.783 11.212 11.673 12.177 12.748 13.317 13.964 14.663 15.426 16.238 17.117 18.113 19.131 19.571 19.51 19.301 18.985 18.6 18.221 17.858 17.522 17.14 16.792 16.459 16.118 15.79 15.487 15.195 14.883 14.605 14.36 14.104 13.827 13.59 13.335 13.054 12.833 12.607 12.376 12.133 11.868 11.683 11.494 11.187 10.949 10.695 10.564 10.296 10.005 9.688 9.529 9.012 8.982 8.783 8.549 8.046 7.808 7.548 7.209 6.814 6.348 5.721 3.743 -3 ,3355 ,KEBNE ,17026818,Wed Dec 22 15:29:36 CET,Wed Dec 22 17:01:55 CET,0.0 1.319 1.843 2.212 2.471 2.711 2.932 3.136 3.544 3.72 3.872 3.82 4.325 4.461 4.708 4.938 5.152 5.263 5.483 5.685 5.97 6.15 6.318 6.57 6.813 7.036 7.255 7.476 7.758 8.02 8.261 8.554 8.847 9.126 9.45 9.818 10.169 10.544 10.954 11.393 11.849 12.331 12.872 13.421 14.029 14.724 15.492 16.282 17.164 18.111 19.048 19.58 19.634 19.422 19.104 18.745 18.333 17.947 17.596 17.186 16.808 16.462 16.121 15.774 15.443 15.128 14.781 14.486 14.24 13.975 13.683 13.433 13.161 12.869 12.654 12.428 12.174 11.91 11.643 11.447 11.238 10.918 10.686 10.432 10.305 10.054 9.784 9.481 9.324 8.825 8.805 8.613 8.414 7.962 7.686 7.385 7.043 6.683 6.253 5.639 3.352 -4 ,6240 ,KEBNE ,17026819,Wed Dec 22 15:29:36 CET,Wed Dec 22 17:02:03 CET,0.0 1.306 1.782 2.128 2.392 2.643 2.87 3.071 3.416 3.578 3.74 3.689 4.187 4.32 4.583 4.833 5.057 5.163 5.362 5.545 5.822 6.01 6.195 6.461 6.71 6.947 7.17 7.38 7.648 7.914 8.167 8.465 8.75 9.028 9.344 9.709 10.066 10.445 10.869 11.3 11.73 12.231 12.782 13.322 13.958 14.664 15.464 16.32 17.318 18.406 19.417 19.858 19.835 19.632 19.318 18.937 18.567 18.201 17.852 17.466 17.111 16.781 16.452 16.122 15.806 15.505 15.182 14.89 14.634 14.376 14.096 13.844 13.581 13.325 13.121 12.894 12.645 12.384 12.107 11.906 11.707 11.394 11.175 10.951 10.829 10.56 10.289 10.011 9.858 9.352 9.337 9.137 8.929 8.47 8.159 7.831 7.518 7.111 6.622 6.011 3.886 -5 ,4137 ,KEBNE ,17026820,Wed Dec 22 15:29:36 CET,Wed Dec 22 17:02:10 CET,0.0 1.39 1.919 2.29 2.586 2.838 3.075 3.279 3.615 3.784 3.954 3.922 4.41 4.535 4.788 5.038 5.279 5.391 5.606 5.803 6.091 6.279 6.451 6.689 6.916 7.142 7.362 7.572 7.846 8.1 8.336 8.639 8.934 9.214 9.54 9.898 10.23 10.594 11.001 11.426 11.872 12.352 12.898 13.441 14.069 14.769 15.543 16.376 17.298 18.26 19.118 19.487 19.443 19.245 18.97 18.654 18.323 17.957 17.593 17.198 16.838 16.504 16.158 15.822 15.52 15.247 14.943 14.664 14.422 14.163 13.874 13.625 13.355 13.064 12.851 12.622 12.368 12.114 11.85 11.658 11.45 11.128 10.895 10.643 10.522 10.254 9.949 9.628 9.459 8.947 8.94 8.746 8.547 8.109 7.866 7.598 7.283 6.909 6.492 5.904 3.536 -6 ,17670 ,KEBNE ,17026821,Wed Dec 22 15:34:43 CET,Wed Dec 22 17:08:18 CET,0.0 1.351 1.793 2.118 2.38 2.627 2.866 3.088 3.465 3.639 3.803 3.738 4.231 4.363 4.614 4.86 5.1 5.21 5.421 5.627 5.917 6.103 6.286 6.554 6.802 7.03 7.25 7.455 7.72 7.995 8.248 8.532 8.817 9.094 9.414 9.779 10.138 10.549 10.978 11.412 11.85 12.324 12.873 13.428 14.063 14.746 15.516 16.352 17.264 18.202 19.084 19.53 19.577 19.409 19.13 18.777 18.419 18.051 17.686 17.297 16.946 16.619 16.296 15.978 15.69 15.419 15.108 14.832 14.574 14.288 14.005 13.773 13.512 13.232 13.021 12.796 12.572 12.33 12.051 11.855 11.66 11.354 11.128 10.895 10.773 10.506 10.226 9.935 9.775 9.27 9.247 9.04 8.827 8.361 8.099 7.803 7.477 7.085 6.568 5.871 3.654 -7 ,16313 ,KEBNE ,17026822,Wed Dec 22 15:34:43 CET,Wed Dec 22 17:07:17 CET,0.0 1.024 1.455 1.808 2.113 2.384 2.649 2.882 3.259 3.422 3.582 3.541 4.034 4.173 4.426 4.652 4.873 4.977 5.183 5.394 5.676 5.851 6.033 6.295 6.539 6.777 7.007 7.224 7.507 7.782 8.048 8.355 8.632 8.914 9.265 9.637 9.964 10.323 10.72 11.134 11.565 12.071 12.645 13.197 13.837 14.538 15.31 16.149 17.052 17.973 18.869 19.263 19.219 18.97 18.618 18.266 17.897 17.468 17.083 16.706 16.337 15.996 15.678 15.368 15.045 14.732 14.414 14.117 13.846 13.556 13.26 13.025 12.774 12.501 12.281 12.044 11.797 11.536 11.262 11.077 10.881 10.571 10.357 10.113 9.979 9.715 9.443 9.15 8.993 8.492 8.469 8.262 8.034 7.545 7.294 7.007 6.67 6.284 5.813 5.195 3.058 -8 ,25402 ,KEBNE ,17026823,Wed Dec 22 15:34:43 CET,Wed Dec 22 17:07:38 CET,0.0 1.1 1.583 1.929 2.215 2.465 2.694 2.899 3.262 3.438 3.618 3.581 4.062 4.192 4.448 4.696 4.925 5.035 5.254 5.463 5.747 5.922 6.099 6.364 6.615 6.852 7.079 7.289 7.556 7.818 8.076 8.389 8.681 8.965 9.285 9.645 9.995 10.375 10.788 11.203 11.628 12.105 12.679 13.251 13.904 14.611 15.381 16.214 17.118 18.053 18.985 19.428 19.368 19.122 18.811 18.453 18.102 17.741 17.384 16.972 16.602 16.266 15.94 15.625 15.314 15.015 14.69 14.412 14.164 13.884 13.586 13.319 13.037 12.75 12.521 12.289 12.047 11.789 11.516 11.324 11.125 10.798 10.574 10.334 10.21 9.971 9.715 9.425 9.257 8.743 8.735 8.518 8.297 7.846 7.579 7.289 6.966 6.593 6.146 5.57 3.317 -9 ,12988 ,KEBNE ,17026824,Wed Dec 22 15:34:43 CET,Wed Dec 22 17:07:42 CET,0.0 1.442 1.919 2.284 2.575 2.821 3.045 3.25 3.616 3.779 3.931 3.865 4.353 4.491 4.767 5.018 5.249 5.357 5.56 5.761 6.055 6.239 6.411 6.662 6.906 7.136 7.367 7.585 7.845 8.095 8.336 8.633 8.929 9.208 9.531 9.898 10.248 10.618 11.012 11.439 11.89 12.398 12.992 13.566 14.211 14.926 15.683 16.516 17.454 18.4 19.314 19.754 19.801 19.649 19.388 19.06 18.681 18.281 17.925 17.532 17.151 16.809 16.485 16.169 15.878 15.602 15.301 15.033 14.778 14.487 14.188 13.943 13.692 13.431 13.209 12.961 12.71 12.453 12.188 12.003 11.801 11.487 11.264 11.023 10.898 10.644 10.367 10.06 9.894 9.378 9.359 9.183 8.981 8.483 8.237 7.966 7.647 7.301 6.86 6.251 3.75 -10 ,23322 ,KEBNE ,17026825,Wed Dec 22 15:34:43 CET,Wed Dec 22 17:07:45 CET,0.0 1.45 1.947 2.28 2.626 2.947 3.187 3.409 3.792 3.949 4.099 4.016 4.499 4.638 4.9 5.153 5.395 5.505 5.717 5.927 6.214 6.404 6.589 6.85 7.108 7.346 7.564 7.782 8.063 8.332 8.593 8.91 9.215 9.485 9.797 10.16 10.492 10.862 11.271 11.691 12.122 12.596 13.151 13.71 14.316 14.957 15.715 16.531 17.386 18.311 19.195 19.594 19.562 19.36 19.06 18.673 18.316 17.95 17.591 17.222 16.891 16.58 16.253 15.913 15.58 15.3 15.001 14.723 14.486 14.218 13.91 13.662 13.413 13.13 12.9 12.654 12.405 12.162 11.894 11.703 11.504 11.174 10.945 10.705 10.584 10.326 10.045 9.746 9.584 9.075 9.073 8.881 8.661 8.206 7.957 7.651 7.305 6.914 6.458 5.832 3.541 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt deleted file mode 100644 index 0a9f62cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7634 ,TETRA ,17591250,Sat Nov 27 22:26:22 CET,Sun Nov 28 00:16:35 CET,0.0 1.418 1.942 2.28 2.562 2.819 3.067 3.298 3.671 3.837 4.003 3.971 4.472 4.613 4.874 5.108 5.334 5.446 5.68 5.901 6.197 6.385 6.563 6.826 7.065 7.278 7.492 7.712 7.989 8.241 8.485 8.797 9.095 9.352 9.643 9.991 10.339 10.701 11.074 11.479 11.877 12.319 12.846 13.355 13.899 14.474 15.112 15.78 16.484 17.172 17.657 17.557 17.163 16.639 16.073 15.547 15.065 14.6 14.147 13.667 13.25 12.848 12.45 12.063 11.701 11.372 11.029 10.703 10.418 10.119 9.793 9.535 9.269 8.987 8.763 8.522 8.266 7.993 7.704 7.499 7.297 6.988 6.753 6.506 6.38 6.121 5.851 5.555 5.399 4.882 4.871 4.679 4.477 4.049 3.808 3.53 3.22 2.839 2.337 1.655 -0.396 -2 ,22781 ,TETRA ,17591251,Sat Nov 27 22:29:25 CET,Sun Nov 28 00:19:02 CET,0.0 1.384 1.909 2.27 2.577 2.838 3.064 3.293 3.711 3.886 4.057 4.03 4.522 4.656 4.924 5.173 5.396 5.514 5.741 5.937 6.225 6.42 6.597 6.842 7.082 7.321 7.558 7.78 8.048 8.301 8.544 8.837 9.133 9.418 9.727 10.055 10.381 10.731 11.089 11.463 11.829 12.233 12.712 13.184 13.691 14.234 14.902 15.602 16.277 16.923 17.396 17.373 17.036 16.554 16.038 15.49 14.96 14.466 14.016 13.543 13.113 12.713 12.339 11.968 11.604 11.276 10.935 10.628 10.362 10.071 9.75 9.482 9.201 8.896 8.657 8.419 8.161 7.88 7.595 7.404 7.208 6.894 6.674 6.424 6.285 6.004 5.71 5.407 5.256 4.743 4.727 4.538 4.328 3.872 3.619 3.318 2.975 2.597 2.135 1.52 -0.793 -3 ,13308 ,TETRA ,17591252,Sat Nov 27 22:29:27 CET,Sun Nov 28 00:19:09 CET,0.0 1.253 1.755 2.139 2.449 2.727 2.962 3.179 3.569 3.736 3.91 3.906 4.415 4.568 4.84 5.101 5.351 5.473 5.704 5.913 6.211 6.403 6.588 6.849 7.085 7.297 7.521 7.754 8.045 8.314 8.566 8.856 9.137 9.403 9.697 10.038 10.366 10.724 11.116 11.511 11.911 12.379 12.924 13.456 14.038 14.606 15.197 15.848 16.595 17.307 17.78 17.746 17.385 16.91 16.413 15.92 15.408 14.894 14.424 13.909 13.447 13.051 12.672 12.3 11.944 11.611 11.266 10.939 10.642 10.342 10.034 9.781 9.517 9.227 9.002 8.778 8.54 8.269 7.984 7.794 7.593 7.283 7.063 6.818 6.689 6.427 6.159 5.879 5.725 5.213 5.208 5.013 4.81 4.324 4.063 3.801 3.481 3.131 2.731 2.117 -0.565 -4 ,1637 ,TETRA ,17591253,Sat Nov 27 22:29:29 CET,Sun Nov 28 00:19:07 CET,0.0 1.309 1.803 2.17 2.482 2.766 3.0 3.214 3.609 3.772 3.922 3.856 4.353 4.488 4.757 5.005 5.235 5.346 5.558 5.759 6.04 6.224 6.409 6.673 6.916 7.154 7.378 7.598 7.873 8.138 8.412 8.722 9.004 9.281 9.583 9.928 10.27 10.621 10.987 11.378 11.782 12.221 12.737 13.243 13.804 14.395 15.009 15.643 16.346 16.986 17.383 17.266 16.89 16.41 15.898 15.375 14.829 14.293 13.827 13.348 12.92 12.519 12.133 11.775 11.421 11.076 10.712 10.391 10.108 9.8 9.479 9.224 8.956 8.666 8.45 8.216 7.946 7.678 7.402 7.21 7.015 6.699 6.475 6.232 6.107 5.854 5.58 5.291 5.137 4.617 4.573 4.377 4.19 3.746 3.496 3.207 2.86 2.497 2.066 1.457 -0.79 -5 ,9900 ,TETRA ,17591254,Sat Nov 27 22:29:30 CET,Sun Nov 28 00:18:58 CET,0.0 1.267 1.846 2.371 2.736 2.987 3.223 3.454 3.87 4.056 4.235 4.217 4.719 4.859 5.12 5.352 5.568 5.676 5.907 6.129 6.43 6.626 6.808 7.056 7.298 7.53 7.751 7.961 8.218 8.461 8.71 9.021 9.301 9.56 9.866 10.206 10.536 10.905 11.281 11.687 12.127 12.598 13.121 13.618 14.177 14.776 15.426 16.099 16.753 17.346 17.743 17.689 17.29 16.783 16.259 15.724 15.229 14.775 14.368 13.907 13.47 13.069 12.682 12.308 11.956 11.633 11.284 10.963 10.69 10.407 10.098 9.83 9.551 9.252 9.013 8.767 8.506 8.235 7.949 7.741 7.532 7.223 7.0 6.756 6.632 6.365 6.085 5.795 5.634 5.123 5.135 4.947 4.744 4.314 4.066 3.793 3.473 3.097 2.654 2.072 0.277 -6 ,16767 ,TETRA ,17591255,Sat Nov 27 22:33:24 CET,Sun Nov 28 00:21:18 CET,0.0 1.816 2.267 2.636 2.974 3.271 3.521 3.745 4.139 4.306 4.472 4.451 4.951 5.096 5.361 5.597 5.823 5.937 6.158 6.371 6.678 6.87 7.043 7.291 7.544 7.78 8.003 8.224 8.514 8.781 9.039 9.347 9.628 9.902 10.204 10.527 10.842 11.186 11.552 11.963 12.371 12.787 13.267 13.742 14.292 14.889 15.549 16.242 16.991 17.678 18.19 18.234 17.888 17.371 16.788 16.234 15.724 15.216 14.757 14.261 13.795 13.395 13.022 12.676 12.34 12.009 11.657 11.328 11.024 10.714 10.394 10.121 9.837 9.541 9.318 9.091 8.843 8.587 8.331 8.137 7.925 7.594 7.356 7.104 6.975 6.711 6.444 6.158 5.997 5.483 5.505 5.316 5.108 4.694 4.436 4.125 3.787 3.39 2.955 2.34 0.591 -7 ,3960 ,TETRA ,17591256,Sat Nov 27 22:33:25 CET,Sun Nov 28 00:21:29 CET,0.0 1.296 1.813 2.174 2.493 2.768 2.989 3.193 3.588 3.764 3.932 3.91 4.417 4.562 4.843 5.098 5.325 5.435 5.653 5.856 6.157 6.358 6.549 6.817 7.07 7.315 7.546 7.758 8.031 8.309 8.565 8.86 9.133 9.398 9.702 10.048 10.385 10.734 11.113 11.507 11.914 12.383 12.918 13.41 13.945 14.539 15.203 15.894 16.612 17.273 17.753 17.717 17.35 16.874 16.334 15.743 15.171 14.637 14.166 13.685 13.262 12.889 12.515 12.131 11.775 11.462 11.115 10.791 10.521 10.233 9.927 9.682 9.429 9.152 8.919 8.671 8.407 8.134 7.853 7.642 7.427 7.121 6.899 6.648 6.521 6.267 5.998 5.69 5.522 5.009 5.029 4.862 4.675 4.224 3.967 3.678 3.368 3.037 2.552 1.857 -0.202 -8 ,32508 ,TETRA ,17591257,Sat Nov 27 22:33:28 CET,Sun Nov 28 00:21:27 CET,0.0 1.827 2.541 3.057 3.465 3.795 4.062 4.282 4.673 4.849 5.006 4.941 5.436 5.574 5.828 6.077 6.317 6.43 6.647 6.85 7.141 7.327 7.497 7.734 7.967 8.197 8.419 8.633 8.901 9.161 9.417 9.708 9.986 10.251 10.545 10.878 11.191 11.547 11.936 12.342 12.772 13.229 13.724 14.198 14.725 15.311 15.955 16.6 17.305 17.981 18.452 18.426 18.064 17.544 16.988 16.437 15.898 15.363 14.906 14.445 14.007 13.618 13.264 12.918 12.573 12.25 11.895 11.578 11.312 11.021 10.719 10.466 10.195 9.918 9.704 9.477 9.237 8.981 8.71 8.523 8.325 7.984 7.743 7.502 7.37 7.093 6.813 6.519 6.355 5.831 5.832 5.653 5.459 5.013 4.771 4.497 4.163 3.792 3.361 2.764 1.119 -9 ,29994 ,TETRA ,17591258,Sat Nov 27 22:33:30 CET,Sun Nov 28 00:21:14 CET,0.0 1.347 1.861 2.238 2.555 2.829 3.07 3.272 3.62 3.792 3.959 3.895 4.389 4.526 4.779 5.032 5.272 5.39 5.619 5.835 6.131 6.314 6.5 6.762 7.014 7.25 7.471 7.697 7.971 8.229 8.498 8.832 9.14 9.418 9.727 10.087 10.429 10.788 11.176 11.562 11.979 12.437 12.931 13.409 13.937 14.519 15.147 15.785 16.401 17.004 17.505 17.499 17.21 16.808 16.365 15.849 15.311 14.796 14.319 13.822 13.364 12.952 12.576 12.198 11.851 11.543 11.2 10.88 10.594 10.282 9.951 9.675 9.399 9.128 8.903 8.664 8.415 8.157 7.879 7.679 7.471 7.137 6.901 6.65 6.524 6.27 6.003 5.707 5.542 5.031 5.026 4.83 4.622 4.18 3.925 3.628 3.289 2.903 2.473 1.925 0.358 -10 ,12303 ,TETRA ,17591259,Sat Nov 27 22:34:23 CET,Sun Nov 28 00:23:54 CET,0.0 1.303 1.813 2.213 2.543 2.798 3.019 3.223 3.618 3.802 3.968 3.918 4.415 4.554 4.811 5.068 5.296 5.4 5.608 5.81 6.11 6.308 6.493 6.748 6.983 7.2 7.419 7.632 7.9 8.153 8.404 8.707 8.993 9.266 9.554 9.886 10.211 10.543 10.903 11.28 11.651 12.057 12.553 13.043 13.54 14.054 14.626 15.201 15.766 16.277 16.575 16.384 15.983 15.528 15.062 14.545 14.001 13.489 13.049 12.592 12.164 11.763 11.376 11.009 10.677 10.356 9.979 9.634 9.352 9.066 8.772 8.527 8.258 7.968 7.727 7.468 7.198 6.919 6.637 6.439 6.229 5.907 5.687 5.45 5.325 5.058 4.771 4.466 4.304 3.795 3.818 3.631 3.431 2.982 2.726 2.468 2.169 1.802 1.351 0.736 -1.376 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index 02166e8d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7223 ,TETRA ,17591260,Sat Nov 27 22:34:27 CET,Sun Nov 28 00:24:32 CET,0.0 1.21 1.634 1.978 2.303 2.594 2.841 3.075 3.475 3.629 3.787 3.774 4.279 4.419 4.7 4.97 5.223 5.342 5.566 5.787 6.117 6.325 6.511 6.771 7.031 7.281 7.512 7.742 8.047 8.324 8.583 8.899 9.192 9.477 9.812 10.175 10.512 10.893 11.307 11.747 12.197 12.649 13.182 13.751 14.395 15.057 15.773 16.525 17.318 18.088 18.713 18.852 18.719 18.393 17.952 17.503 17.045 16.603 16.202 15.772 15.373 15.0 14.643 14.306 13.972 13.649 13.308 12.992 12.71 12.419 12.123 11.868 11.599 11.31 11.081 10.851 10.609 10.352 10.094 9.915 9.724 9.405 9.186 8.958 8.835 8.574 8.309 8.041 7.906 7.412 7.422 7.239 7.064 6.675 6.448 6.182 5.878 5.54 5.142 4.574 3.066 -2 ,23191 ,TETRA ,17591261,Sat Nov 27 22:34:24 CET,Sun Nov 28 00:23:10 CET,0.0 1.432 1.929 2.308 2.633 2.909 3.163 3.381 3.767 3.965 4.147 4.116 4.613 4.755 5.04 5.302 5.557 5.68 5.908 6.131 6.446 6.646 6.828 7.084 7.349 7.605 7.845 8.067 8.34 8.616 8.887 9.214 9.528 9.836 10.196 10.575 10.931 11.318 11.728 12.16 12.582 13.034 13.563 14.095 14.714 15.377 16.08 16.806 17.636 18.503 19.153 19.268 19.092 18.746 18.33 17.881 17.415 16.975 16.582 16.142 15.747 15.382 15.018 14.672 14.347 14.043 13.717 13.407 13.111 12.811 12.518 12.274 12.013 11.743 11.528 11.301 11.063 10.813 10.544 10.357 10.166 9.864 9.65 9.421 9.307 9.057 8.767 8.456 8.302 7.798 7.825 7.646 7.441 7.0 6.759 6.493 6.194 5.835 5.416 4.877 3.516 -3 ,14242 ,TETRA ,17591262,Sat Nov 27 22:34:25 CET,Sun Nov 28 00:22:59 CET,0.0 1.376 1.748 2.094 2.412 2.664 2.897 3.122 3.521 3.722 3.919 3.905 4.41 4.56 4.843 5.097 5.327 5.44 5.67 5.887 6.193 6.384 6.581 6.878 7.141 7.385 7.621 7.847 8.135 8.413 8.678 8.997 9.307 9.581 9.916 10.306 10.646 11.002 11.393 11.814 12.266 12.784 13.35 13.872 14.464 15.119 15.822 16.542 17.341 18.158 18.831 18.99 18.798 18.45 18.02 17.53 17.029 16.565 16.152 15.721 15.331 14.98 14.637 14.298 13.974 13.66 13.326 13.028 12.772 12.503 12.213 11.965 11.7 11.423 11.206 10.976 10.74 10.491 10.218 10.027 9.83 9.532 9.33 9.1 8.978 8.741 8.473 8.18 8.026 7.52 7.527 7.342 7.158 6.732 6.485 6.209 5.899 5.521 5.08 4.397 1.66 -4 ,23629 ,TETRA ,17591263,Sat Nov 27 22:34:24 CET,Sun Nov 28 00:24:48 CET,0.0 1.168 1.646 1.999 2.27 2.523 2.776 3.021 3.435 3.61 3.781 3.747 4.252 4.398 4.679 4.943 5.184 5.3 5.515 5.718 6.031 6.229 6.411 6.67 6.929 7.173 7.402 7.632 7.93 8.222 8.508 8.835 9.13 9.425 9.776 10.147 10.503 10.871 11.252 11.669 12.098 12.581 13.125 13.663 14.279 14.938 15.624 16.328 17.096 17.88 18.596 18.746 18.466 18.058 17.579 17.054 16.576 16.135 15.714 15.276 14.883 14.516 14.158 13.809 13.471 13.138 12.79 12.499 12.25 11.957 11.632 11.377 11.113 10.818 10.591 10.356 10.106 9.848 9.582 9.398 9.201 8.881 8.664 8.441 8.327 8.077 7.803 7.516 7.359 6.853 6.854 6.668 6.48 6.033 5.769 5.507 5.232 4.892 4.448 3.883 2.287 -5 ,19000 ,TETRA ,17591264,Sat Nov 27 22:34:25 CET,Sun Nov 28 00:24:50 CET,0.0 1.701 2.197 2.611 2.911 3.162 3.396 3.612 4.014 4.208 4.379 4.35 4.859 5.0 5.273 5.518 5.75 5.866 6.083 6.299 6.605 6.799 6.981 7.238 7.51 7.759 7.987 8.221 8.529 8.806 9.067 9.385 9.69 9.963 10.281 10.67 11.029 11.402 11.81 12.251 12.707 13.216 13.764 14.272 14.875 15.535 16.248 16.99 17.777 18.562 19.189 19.309 19.007 18.536 18.083 17.636 17.168 16.696 16.28 15.851 15.442 15.076 14.717 14.37 14.039 13.721 13.394 13.101 12.836 12.547 12.25 12.006 11.747 11.466 11.235 11.003 10.778 10.539 10.277 10.09 9.899 9.613 9.404 9.179 9.063 8.808 8.548 8.279 8.131 7.622 7.63 7.461 7.275 6.862 6.628 6.355 6.059 5.74 5.368 4.835 3.126 -6 ,30598 ,TETRA ,17591265,Sat Nov 27 22:34:28 CET,Sun Nov 28 00:23:01 CET,0.0 1.434 1.932 2.322 2.667 2.97 3.241 3.473 3.855 4.034 4.21 4.184 4.698 4.849 5.13 5.386 5.637 5.761 5.973 6.172 6.488 6.683 6.868 7.152 7.421 7.676 7.923 8.151 8.441 8.723 8.988 9.308 9.616 9.917 10.266 10.629 10.972 11.362 11.794 12.247 12.694 13.162 13.71 14.272 14.874 15.493 16.19 16.953 17.761 18.516 19.179 19.4 19.168 18.796 18.399 17.937 17.494 17.079 16.658 16.209 15.841 15.49 15.117 14.757 14.431 14.132 13.804 13.508 13.242 12.941 12.637 12.384 12.101 11.802 11.586 11.368 11.13 10.877 10.603 10.411 10.226 9.94 9.729 9.517 9.403 9.149 8.878 8.591 8.437 7.928 7.91 7.712 7.509 7.079 6.836 6.567 6.271 5.94 5.558 4.914 1.52 -7 ,14481 ,TETRA ,17591266,Sat Nov 27 22:34:29 CET,Sun Nov 28 00:22:30 CET,0.0 1.298 1.808 2.182 2.492 2.759 3.002 3.213 3.602 3.79 3.971 3.949 4.446 4.584 4.851 5.111 5.353 5.47 5.689 5.908 6.219 6.407 6.599 6.879 7.139 7.377 7.611 7.841 8.138 8.414 8.669 8.988 9.293 9.588 9.911 10.271 10.638 11.023 11.42 11.834 12.278 12.764 13.308 13.852 14.467 15.125 15.846 16.583 17.381 18.215 18.894 19.069 18.791 18.376 17.929 17.429 16.956 16.514 16.13 15.712 15.319 14.952 14.613 14.282 13.95 13.638 13.292 12.975 12.695 12.411 12.13 11.897 11.655 11.388 11.176 10.952 10.708 10.464 10.218 10.039 9.845 9.539 9.322 9.09 8.968 8.71 8.428 8.121 7.947 7.424 7.422 7.234 7.04 6.617 6.383 6.126 5.814 5.471 5.082 4.513 2.502 -8 ,11786 ,TETRA ,17591267,Sat Nov 27 22:34:24 CET,Sun Nov 28 00:22:55 CET,0.0 1.404 1.853 2.168 2.455 2.728 2.997 3.232 3.636 3.821 3.99 3.967 4.462 4.601 4.892 5.16 5.392 5.505 5.718 5.922 6.227 6.42 6.613 6.904 7.17 7.414 7.647 7.884 8.2 8.505 8.792 9.119 9.42 9.701 10.045 10.421 10.759 11.135 11.533 11.935 12.34 12.784 13.302 13.843 14.455 15.101 15.812 16.545 17.283 17.998 18.548 18.61 18.309 17.885 17.455 17.01 16.572 16.146 15.745 15.307 14.907 14.523 14.142 13.79 13.463 13.16 12.831 12.541 12.304 12.041 11.727 11.47 11.211 10.936 10.731 10.52 10.288 10.023 9.742 9.553 9.352 9.036 8.832 8.616 8.496 8.246 7.976 7.67 7.511 7.003 7.032 6.87 6.685 6.254 6.014 5.758 5.471 5.153 4.749 4.233 3.099 -9 ,17550 ,TETRA ,17591268,Sat Nov 27 22:34:28 CET,Sun Nov 28 00:23:00 CET,0.0 1.769 2.333 2.753 3.062 3.319 3.549 3.763 4.164 4.341 4.503 4.454 4.953 5.095 5.379 5.65 5.895 6.012 6.232 6.437 6.737 6.932 7.12 7.386 7.629 7.882 8.126 8.346 8.635 8.92 9.188 9.502 9.804 10.106 10.45 10.811 11.135 11.489 11.876 12.288 12.739 13.252 13.836 14.382 15.004 15.677 16.385 17.15 17.951 18.721 19.383 19.548 19.259 18.852 18.397 17.941 17.521 17.074 16.644 16.191 15.768 15.391 15.034 14.682 14.344 14.022 13.682 13.383 13.119 12.825 12.505 12.252 12.004 11.729 11.502 11.267 11.023 10.773 10.51 10.321 10.131 9.829 9.602 9.366 9.25 8.994 8.711 8.421 8.268 7.767 7.794 7.616 7.417 6.971 6.734 6.486 6.168 5.789 5.355 4.742 2.345 -10 ,17483 ,TETRA ,17591269,Sat Nov 27 22:34:25 CET,Sun Nov 28 00:23:56 CET,0.0 1.743 2.342 2.707 3.018 3.274 3.503 3.75 4.198 4.387 4.56 4.51 5.015 5.166 5.436 5.688 5.928 6.039 6.247 6.458 6.77 6.969 7.157 7.422 7.677 7.919 8.146 8.371 8.675 8.959 9.23 9.548 9.853 10.152 10.484 10.849 11.198 11.563 11.96 12.396 12.84 13.32 13.87 14.409 14.996 15.617 16.313 17.084 17.908 18.746 19.43 19.58 19.372 18.967 18.513 18.052 17.591 17.16 16.775 16.332 15.931 15.58 15.22 14.852 14.501 14.193 13.865 13.545 13.273 12.988 12.689 12.445 12.181 11.913 11.702 11.476 11.237 10.983 10.704 10.511 10.32 10.02 9.801 9.564 9.436 9.171 8.9 8.61 8.461 7.965 7.983 7.807 7.603 7.17 6.948 6.685 6.395 6.056 5.645 5.097 2.956 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index c77379b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28290 ,KEBNE ,17026826,Wed Dec 22 15:34:43 CET,Wed Dec 22 17:09:11 CET,0.0 1.841 2.397 2.793 3.15 3.456 3.741 3.987 4.387 4.579 4.762 4.713 5.216 5.362 5.632 5.885 6.118 6.233 6.445 6.641 6.959 7.16 7.336 7.6 7.853 8.088 8.313 8.536 8.832 9.123 9.396 9.709 9.99 10.259 10.581 10.938 11.282 11.663 12.081 12.518 12.948 13.439 14.035 14.598 15.228 15.93 16.662 17.455 18.363 19.337 20.259 20.623 20.57 20.367 20.065 19.708 19.364 19.01 18.673 18.337 18.009 17.668 17.341 17.043 16.752 16.48 16.172 15.881 15.638 15.375 15.093 14.853 14.595 14.33 14.115 13.891 13.656 13.4 13.141 12.956 12.756 12.454 12.235 12.0 11.882 11.634 11.371 11.092 10.933 10.428 10.43 10.242 10.045 9.605 9.366 9.086 8.757 8.402 7.954 7.307 5.429 -2 ,5798 ,KEBNE ,17026827,Wed Dec 22 15:34:43 CET,Wed Dec 22 17:08:36 CET,0.0 1.919 2.511 2.898 3.225 3.52 3.785 4.011 4.393 4.565 4.725 4.662 5.158 5.293 5.573 5.845 6.095 6.207 6.413 6.619 6.941 7.15 7.337 7.613 7.877 8.122 8.354 8.574 8.87 9.154 9.422 9.733 10.015 10.291 10.613 10.961 11.299 11.68 12.077 12.501 12.951 13.43 13.975 14.523 15.161 15.872 16.667 17.514 18.467 19.47 20.471 20.967 21.019 20.849 20.541 20.244 19.958 19.624 19.274 18.887 18.555 18.259 17.95 17.642 17.356 17.094 16.82 16.55 16.295 16.03 15.755 15.508 15.248 14.986 14.778 14.556 14.315 14.059 13.782 13.596 13.404 13.102 12.884 12.647 12.526 12.268 12.002 11.707 11.553 11.055 11.066 10.876 10.681 10.226 9.962 9.68 9.358 9.001 8.579 7.978 5.969 -3 ,32359 ,KEBNE ,17026828,Wed Dec 22 15:34:43 CET,Wed Dec 22 17:07:49 CET,0.0 1.708 2.225 2.58 2.868 3.199 3.558 3.836 4.238 4.437 4.621 4.577 5.081 5.225 5.494 5.751 5.985 6.094 6.317 6.533 6.829 7.017 7.195 7.449 7.7 7.935 8.153 8.368 8.655 8.937 9.2 9.506 9.811 10.108 10.443 10.81 11.154 11.526 11.922 12.345 12.8 13.303 13.884 14.464 15.116 15.823 16.61 17.453 18.367 19.331 20.27 20.66 20.631 20.429 20.114 19.74 19.374 19.009 18.633 18.236 17.89 17.574 17.259 16.935 16.629 16.356 16.079 15.81 15.573 15.318 15.036 14.809 14.556 14.274 14.057 13.834 13.594 13.349 13.104 12.937 12.752 12.435 12.213 11.983 11.865 11.616 11.332 11.047 10.906 10.409 10.448 10.269 10.074 9.64 9.387 9.107 8.796 8.452 8.025 7.407 4.375 -4 ,18105 ,KEBNE ,17026829,Wed Dec 22 15:34:43 CET,Wed Dec 22 17:07:21 CET,0.0 1.944 2.541 2.97 3.291 3.562 3.826 4.078 4.503 4.688 4.853 4.792 5.286 5.421 5.691 5.95 6.188 6.3 6.525 6.739 7.039 7.229 7.404 7.663 7.923 8.168 8.414 8.648 8.924 9.19 9.454 9.766 10.06 10.344 10.662 11.015 11.347 11.715 12.119 12.548 13.004 13.527 14.122 14.698 15.34 16.025 16.796 17.655 18.554 19.477 20.392 20.83 20.885 20.715 20.46 20.158 19.829 19.503 19.184 18.832 18.497 18.169 17.855 17.54 17.223 16.923 16.602 16.323 16.077 15.807 15.514 15.278 15.039 14.779 14.574 14.367 14.15 13.913 13.663 13.486 13.291 12.991 12.784 12.564 12.45 12.196 11.928 11.65 11.501 10.99 10.969 10.772 10.573 10.112 9.845 9.57 9.236 8.865 8.455 7.862 6.519 -5 ,27873 ,KEBNE ,17026830,Wed Dec 22 15:35:44 CET,Wed Dec 22 17:09:11 CET,0.0 1.721 2.243 2.655 3.012 3.311 3.534 3.741 4.156 4.349 4.524 4.472 4.981 5.129 5.4 5.652 5.884 6.003 6.233 6.436 6.725 6.909 7.083 7.335 7.587 7.823 8.047 8.278 8.573 8.852 9.121 9.449 9.765 10.065 10.413 10.79 11.138 11.52 11.933 12.368 12.807 13.282 13.826 14.365 14.987 15.675 16.432 17.234 18.134 19.126 20.059 20.491 20.489 20.295 20.001 19.638 19.303 18.983 18.656 18.287 17.95 17.629 17.315 17.005 16.707 16.434 16.122 15.834 15.579 15.312 15.037 14.805 14.558 14.306 14.112 13.917 13.711 13.472 13.207 13.021 12.831 12.534 12.325 12.102 11.982 11.728 11.468 11.193 11.048 10.547 10.554 10.369 10.167 9.731 9.476 9.213 8.927 8.562 8.11 7.549 5.711 -6 ,8333 ,KEBNE ,17026831,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:09:41 CET,0.0 2.601 3.17 3.544 3.881 4.177 4.424 4.645 5.018 5.185 5.359 5.332 5.834 5.974 6.242 6.495 6.728 6.841 7.06 7.269 7.561 7.756 7.95 8.208 8.449 8.692 8.932 9.157 9.434 9.689 9.936 10.255 10.564 10.847 11.169 11.543 11.904 12.289 12.723 13.177 13.622 14.104 14.669 15.229 15.857 16.55 17.339 18.195 19.105 20.026 20.859 21.201 21.146 20.954 20.675 20.333 20.005 19.659 19.317 18.946 18.617 18.299 17.982 17.686 17.378 17.071 16.777 16.504 16.246 15.985 15.716 15.486 15.241 14.98 14.776 14.565 14.339 14.105 13.847 13.662 13.478 13.186 12.981 12.769 12.653 12.409 12.16 11.878 11.725 11.224 11.234 11.054 10.866 10.405 10.142 9.865 9.558 9.219 8.787 8.166 6.195 -7 ,14594 ,KEBNE ,17026832,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:09:36 CET,0.0 2.153 2.687 3.092 3.436 3.691 3.933 4.183 4.613 4.798 4.97 4.936 5.446 5.598 5.878 6.123 6.349 6.457 6.659 6.86 7.163 7.35 7.532 7.792 8.038 8.285 8.528 8.752 9.029 9.31 9.578 9.908 10.214 10.5 10.835 11.204 11.557 11.94 12.353 12.794 13.247 13.751 14.328 14.879 15.503 16.217 17.016 17.85 18.779 19.809 20.794 21.283 21.312 21.123 20.844 20.504 20.142 19.775 19.427 19.026 18.656 18.342 18.039 17.741 17.453 17.167 16.841 16.538 16.28 16.013 15.728 15.491 15.257 15.018 14.82 14.594 14.359 14.109 13.816 13.611 13.41 13.109 12.893 12.665 12.548 12.299 12.032 11.755 11.615 11.123 11.113 10.906 10.69 10.219 9.967 9.698 9.387 9.03 8.563 7.984 6.077 -8 ,306 ,KEBNE ,17026833,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:09:11 CET,0.0 1.867 2.434 2.809 3.121 3.406 3.667 3.904 4.311 4.487 4.657 4.635 5.152 5.301 5.568 5.815 6.052 6.164 6.379 6.585 6.868 7.047 7.235 7.507 7.765 8.01 8.246 8.473 8.769 9.06 9.32 9.626 9.933 10.228 10.556 10.928 11.281 11.649 12.04 12.465 12.919 13.433 14.032 14.614 15.277 15.978 16.73 17.581 18.521 19.535 20.547 20.987 20.989 20.791 20.49 20.146 19.812 19.462 19.105 18.729 18.386 18.053 17.735 17.418 17.102 16.813 16.496 16.209 15.972 15.723 15.453 15.218 14.983 14.746 14.539 14.313 14.086 13.836 13.575 13.403 13.205 12.888 12.682 12.45 12.329 12.098 11.853 11.592 11.448 10.95 10.975 10.794 10.593 10.161 9.922 9.648 9.31 8.937 8.464 7.828 5.397 -9 ,17883 ,KEBNE ,17026834,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:11:14 CET,0.0 2.098 2.627 3.04 3.416 3.708 3.95 4.197 4.625 4.799 4.973 4.95 5.456 5.601 5.871 6.113 6.351 6.464 6.684 6.892 7.192 7.387 7.571 7.842 8.098 8.328 8.547 8.777 9.081 9.358 9.612 9.91 10.215 10.514 10.863 11.262 11.624 12.02 12.453 12.884 13.331 13.839 14.408 14.964 15.606 16.311 17.096 17.933 18.826 19.803 20.771 21.179 21.117 20.909 20.642 20.342 19.991 19.621 19.277 18.889 18.538 18.235 17.948 17.653 17.363 17.091 16.8 16.527 16.28 16.007 15.726 15.511 15.275 15.015 14.811 14.588 14.361 14.128 13.874 13.693 13.5 13.183 12.967 12.75 12.632 12.374 12.105 11.82 11.664 11.157 11.156 10.96 10.764 10.338 10.086 9.817 9.488 9.058 8.455 7.509 4.513 -10 ,31084 ,KEBNE ,17026835,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:11:11 CET,0.0 1.704 2.324 2.812 3.162 3.466 3.718 3.92 4.305 4.483 4.65 4.618 5.126 5.272 5.567 5.825 6.05 6.163 6.394 6.619 6.931 7.129 7.316 7.581 7.838 8.086 8.325 8.552 8.84 9.114 9.377 9.686 9.976 10.252 10.564 10.93 11.297 11.684 12.087 12.524 12.987 13.492 14.061 14.622 15.243 15.891 16.661 17.531 18.477 19.46 20.398 20.874 20.89 20.739 20.482 20.134 19.772 19.4 19.043 18.657 18.33 18.029 17.725 17.416 17.124 16.862 16.573 16.307 16.071 15.823 15.547 15.301 15.048 14.781 14.577 14.369 14.14 13.896 13.651 13.48 13.287 12.96 12.741 12.519 12.394 12.134 11.864 11.581 11.428 10.919 10.934 10.748 10.546 10.112 9.873 9.61 9.309 8.97 8.56 7.975 6.097 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt deleted file mode 100644 index c6dcfee6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16332 ,TETRA ,17591270,Sat Nov 27 22:34:25 CET,Sun Nov 28 00:24:05 CET,0.0 1.662 2.171 2.573 2.919 3.222 3.483 3.71 4.121 4.312 4.494 4.478 4.997 5.158 5.453 5.711 5.96 6.078 6.302 6.524 6.846 7.043 7.228 7.499 7.751 7.991 8.225 8.444 8.739 9.032 9.304 9.624 9.935 10.235 10.566 10.935 11.295 11.692 12.114 12.538 12.976 13.477 14.071 14.635 15.246 15.953 16.749 17.605 18.498 19.393 20.3 20.629 20.493 20.21 19.847 19.454 19.058 18.673 18.305 17.913 17.531 17.173 16.85 16.518 16.18 15.876 15.565 15.261 14.988 14.712 14.425 14.167 13.886 13.593 13.384 13.164 12.924 12.668 12.385 12.195 11.985 11.639 11.408 11.158 11.035 10.791 10.508 10.208 10.05 9.527 9.509 9.31 9.092 8.618 8.347 8.036 7.702 7.285 6.772 6.082 3.605 -2 ,22205 ,TETRA ,17591271,Sat Nov 27 22:34:26 CET,Sun Nov 28 00:23:52 CET,0.0 1.792 2.345 2.769 3.089 3.365 3.593 3.802 4.227 4.42 4.593 4.56 5.072 5.226 5.516 5.772 6.022 6.144 6.375 6.593 6.899 7.085 7.267 7.542 7.796 8.041 8.27 8.485 8.762 9.034 9.306 9.636 9.956 10.255 10.59 10.965 11.332 11.739 12.165 12.594 13.058 13.578 14.156 14.708 15.342 16.036 16.781 17.562 18.402 19.285 20.117 20.455 20.339 20.034 19.681 19.293 18.861 18.411 18.017 17.617 17.235 16.883 16.552 16.237 15.926 15.62 15.287 14.988 14.731 14.453 14.155 13.907 13.648 13.36 13.131 12.899 12.656 12.412 12.145 11.956 11.76 11.443 11.223 10.964 10.828 10.563 10.276 9.957 9.798 9.292 9.29 9.09 8.873 8.433 8.191 7.9 7.573 7.182 6.685 5.861 2.503 -3 ,20913 ,TETRA ,17591272,Sat Nov 27 22:34:28 CET,Sun Nov 28 00:23:52 CET,0.0 1.66 2.26 2.704 3.043 3.328 3.578 3.812 4.226 4.415 4.594 4.564 5.086 5.247 5.538 5.791 6.03 6.149 6.37 6.582 6.896 7.084 7.262 7.522 7.77 8.003 8.222 8.434 8.708 8.976 9.243 9.567 9.881 10.171 10.491 10.853 11.208 11.592 11.996 12.423 12.88 13.378 13.944 14.53 15.172 15.875 16.657 17.443 18.347 19.298 20.117 20.436 20.318 20.018 19.656 19.293 18.894 18.441 18.029 17.635 17.275 16.919 16.54 16.183 15.869 15.553 15.215 14.901 14.622 14.352 14.079 13.835 13.57 13.301 13.082 12.853 12.619 12.363 12.096 11.906 11.702 11.39 11.168 10.937 10.822 10.573 10.286 9.989 9.837 9.326 9.334 9.151 8.943 8.479 8.229 7.954 7.618 7.202 6.717 6.082 3.512 -4 ,20491 ,TETRA ,17591273,Sat Nov 27 22:34:30 CET,Sun Nov 28 00:24:38 CET,0.0 1.547 2.048 2.434 2.76 3.038 3.285 3.527 3.945 4.138 4.323 4.294 4.797 4.934 5.197 5.468 5.726 5.847 6.086 6.308 6.619 6.814 6.997 7.247 7.491 7.738 7.977 8.221 8.543 8.812 9.057 9.374 9.677 9.96 10.293 10.67 11.029 11.413 11.816 12.242 12.686 13.177 13.736 14.283 14.927 15.625 16.411 17.228 18.061 18.936 19.798 20.173 20.052 19.74 19.318 18.89 18.503 18.111 17.733 17.339 16.99 16.656 16.327 16.017 15.709 15.406 15.077 14.77 14.493 14.211 13.931 13.68 13.411 13.131 12.92 12.7 12.461 12.212 11.945 11.749 11.545 11.226 11.008 10.783 10.659 10.404 10.13 9.828 9.666 9.142 9.113 8.91 8.711 8.285 8.046 7.773 7.439 7.059 6.615 5.988 4.078 -5 ,23732 ,TETRA ,17591274,Sat Nov 27 22:34:32 CET,Sun Nov 28 00:23:39 CET,0.0 2.017 2.578 2.966 3.293 3.567 3.821 4.05 4.448 4.64 4.819 4.776 5.282 5.428 5.7 5.964 6.222 6.344 6.573 6.792 7.101 7.297 7.492 7.773 8.035 8.271 8.497 8.723 9.022 9.305 9.561 9.877 10.179 10.468 10.823 11.227 11.604 11.989 12.402 12.843 13.283 13.779 14.36 14.924 15.556 16.233 16.982 17.791 18.628 19.495 20.284 20.518 20.452 20.228 19.875 19.48 19.073 18.664 18.293 17.892 17.522 17.185 16.871 16.546 16.222 15.931 15.615 15.321 15.074 14.808 14.525 14.287 14.029 13.757 13.532 13.302 13.061 12.798 12.524 12.334 12.142 11.812 11.564 11.311 11.185 10.927 10.654 10.359 10.201 9.686 9.67 9.482 9.292 8.847 8.594 8.339 8.031 7.644 7.14 6.439 3.996 -6 ,24492 ,TETRA ,17591275,Sat Nov 27 22:34:26 CET,Sun Nov 28 00:24:36 CET,0.0 1.652 2.159 2.584 2.937 3.217 3.453 3.656 4.022 4.202 4.38 4.333 4.843 4.983 5.242 5.513 5.771 5.887 6.109 6.33 6.632 6.824 7.02 7.293 7.535 7.763 7.992 8.211 8.487 8.74 8.991 9.315 9.63 9.919 10.232 10.603 10.963 11.335 11.73 12.162 12.624 13.142 13.723 14.268 14.883 15.555 16.315 17.118 18.006 18.956 19.798 20.13 20.013 19.713 19.342 18.952 18.575 18.174 17.783 17.378 17.022 16.704 16.377 16.041 15.735 15.438 15.086 14.779 14.523 14.235 13.942 13.703 13.453 13.19 12.973 12.738 12.488 12.23 11.945 11.759 11.574 11.271 11.04 10.789 10.663 10.404 10.117 9.789 9.618 9.094 9.076 8.875 8.667 8.186 7.906 7.605 7.279 6.897 6.406 5.729 3.531 -7 ,22528 ,TETRA ,17591276,Sat Nov 27 22:34:27 CET,Sun Nov 28 00:23:50 CET,0.0 1.591 2.226 2.683 3.022 3.323 3.595 3.826 4.225 4.409 4.575 4.531 5.034 5.175 5.444 5.708 5.962 6.073 6.29 6.512 6.816 7.01 7.197 7.455 7.708 7.959 8.183 8.386 8.662 8.934 9.196 9.506 9.798 10.089 10.444 10.831 11.166 11.524 11.918 12.351 12.807 13.312 13.905 14.481 15.099 15.756 16.5 17.334 18.25 19.16 19.967 20.325 20.256 19.995 19.636 19.217 18.815 18.43 18.058 17.668 17.334 17.013 16.677 16.332 15.989 15.675 15.359 15.072 14.814 14.531 14.245 14.021 13.758 13.477 13.267 13.034 12.796 12.539 12.267 12.087 11.888 11.581 11.374 11.141 11.014 10.753 10.472 10.155 9.981 9.453 9.457 9.271 9.071 8.619 8.362 8.081 7.76 7.375 6.897 6.22 4.365 -8 ,5538 ,TETRA ,17591277,Sat Nov 27 22:34:28 CET,Sun Nov 28 00:23:50 CET,0.0 1.717 2.308 2.718 3.055 3.359 3.641 3.894 4.323 4.508 4.674 4.631 5.14 5.296 5.592 5.85 6.095 6.214 6.442 6.658 6.961 7.168 7.37 7.648 7.902 8.146 8.393 8.625 8.921 9.201 9.469 9.789 10.07 10.339 10.685 11.081 11.463 11.87 12.294 12.753 13.214 13.713 14.271 14.821 15.452 16.129 16.88 17.659 18.511 19.476 20.438 20.844 20.781 20.529 20.151 19.735 19.339 18.941 18.595 18.212 17.821 17.452 17.104 16.764 16.428 16.117 15.798 15.514 15.262 14.98 14.684 14.43 14.151 13.869 13.656 13.426 13.184 12.939 12.674 12.49 12.285 11.934 11.696 11.467 11.35 11.099 10.831 10.546 10.391 9.872 9.882 9.702 9.498 9.03 8.772 8.503 8.186 7.824 7.286 6.339 3.083 -9 ,15233 ,TETRA ,17591278,Sat Nov 27 22:34:30 CET,Sun Nov 28 00:24:34 CET,0.0 1.424 1.984 2.439 2.806 3.083 3.318 3.541 3.946 4.139 4.329 4.314 4.825 4.974 5.241 5.491 5.72 5.828 6.051 6.269 6.586 6.783 6.974 7.254 7.514 7.758 7.987 8.206 8.498 8.787 9.06 9.383 9.698 10.003 10.35 10.731 11.09 11.482 11.905 12.354 12.808 13.316 13.92 14.511 15.171 15.836 16.563 17.377 18.238 19.107 19.933 20.309 20.195 19.901 19.561 19.183 18.819 18.419 17.995 17.56 17.184 16.843 16.505 16.163 15.841 15.529 15.209 14.918 14.63 14.329 14.032 13.787 13.522 13.242 13.027 12.803 12.562 12.3 12.02 11.822 11.604 11.246 11.009 10.778 10.66 10.408 10.122 9.812 9.652 9.137 9.136 8.942 8.739 8.308 8.056 7.778 7.468 7.086 6.584 5.916 3.361 -10 ,11946 ,TETRA ,17591279,Sat Nov 27 22:34:27 CET,Sun Nov 28 00:24:57 CET,0.0 1.594 2.078 2.471 2.819 3.126 3.39 3.616 4.022 4.207 4.374 4.335 4.835 4.965 5.226 5.477 5.704 5.819 6.046 6.267 6.577 6.769 6.961 7.228 7.485 7.737 7.969 8.198 8.494 8.774 9.027 9.337 9.659 9.962 10.294 10.666 11.027 11.423 11.831 12.257 12.711 13.22 13.799 14.351 14.961 15.641 16.421 17.247 18.131 19.059 19.98 20.306 20.167 19.869 19.484 19.083 18.688 18.3 17.951 17.55 17.185 16.865 16.547 16.233 15.928 15.627 15.305 14.998 14.725 14.454 14.148 13.879 13.612 13.348 13.142 12.917 12.683 12.431 12.162 11.973 11.766 11.442 11.225 10.988 10.861 10.6 10.313 10.013 9.862 9.346 9.317 9.117 8.906 8.46 8.207 7.909 7.59 7.24 6.786 6.093 3.694 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18627-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18627-1.txt deleted file mode 100644 index 7eff5445..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18627-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22010 ,KEBNE ,17026836,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:10:03 CET,0.0 1.219 1.72 2.065 2.317 2.556 2.766 2.942 3.266 3.423 3.568 3.489 3.956 4.073 4.298 4.496 4.703 4.805 4.999 5.192 5.464 5.643 5.807 6.029 6.248 6.459 6.665 6.865 7.105 7.327 7.545 7.793 8.031 8.263 8.541 8.85 9.132 9.44 9.759 10.09 10.432 10.802 11.222 11.638 12.119 12.608 13.1 13.602 14.077 14.516 14.75 14.456 13.898 13.298 12.693 12.106 11.544 11.007 10.527 10.032 9.602 9.222 8.856 8.505 8.172 7.849 7.495 7.171 6.883 6.586 6.296 6.056 5.805 5.531 5.309 5.084 4.846 4.6 4.334 4.139 3.94 3.637 3.412 3.172 3.046 2.783 2.509 2.215 2.072 1.591 1.62 1.429 1.226 0.787 0.54 0.257 -0.051 -0.388 -0.827 -1.422 -3.111 -2 ,16170 ,KEBNE ,17026837,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:11:26 CET,0.0 1.293 1.758 2.17 2.526 2.786 3.0 3.18 3.511 3.681 3.823 3.735 4.213 4.337 4.565 4.778 4.974 5.064 5.243 5.429 5.69 5.848 6.006 6.238 6.452 6.662 6.875 7.079 7.332 7.57 7.799 8.073 8.334 8.57 8.83 9.126 9.412 9.712 10.008 10.33 10.688 11.079 11.518 11.951 12.445 12.967 13.512 14.058 14.578 15.044 15.367 15.164 14.659 14.103 13.542 12.952 12.408 11.896 11.408 10.898 10.461 10.083 9.694 9.304 8.937 8.629 8.293 7.961 7.679 7.372 7.062 6.819 6.552 6.267 6.042 5.815 5.579 5.321 5.058 4.87 4.673 4.363 4.138 3.9 3.777 3.529 3.269 2.984 2.831 2.328 2.314 2.129 1.951 1.548 1.304 1.02 0.698 0.327 -0.084 -0.613 -1.935 -3 ,8375 ,KEBNE ,17026838,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:09:59 CET,0.0 1.066 1.491 1.825 2.114 2.366 2.583 2.767 3.113 3.277 3.44 3.397 3.872 3.995 4.238 4.463 4.679 4.778 4.953 5.117 5.361 5.534 5.703 5.931 6.141 6.334 6.525 6.715 6.948 7.174 7.4 7.659 7.901 8.148 8.424 8.721 9.005 9.325 9.669 10.003 10.326 10.7 11.131 11.532 11.992 12.477 12.988 13.526 14.086 14.583 14.824 14.573 14.087 13.466 12.836 12.25 11.678 11.105 10.598 10.091 9.683 9.306 8.914 8.538 8.19 7.866 7.521 7.195 6.901 6.594 6.27 6.005 5.734 5.44 5.219 4.998 4.761 4.512 4.254 4.072 3.884 3.567 3.335 3.108 2.991 2.751 2.493 2.194 2.037 1.537 1.54 1.339 1.142 0.743 0.523 0.285 0.002 -0.351 -0.768 -1.345 -2.956 -4 ,14287 ,KEBNE ,17026839,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:11:45 CET,0.0 1.298 1.792 2.153 2.454 2.702 2.927 3.117 3.454 3.614 3.763 3.691 4.163 4.283 4.519 4.739 4.942 5.041 5.23 5.413 5.671 5.838 5.996 6.215 6.427 6.635 6.829 7.015 7.261 7.493 7.712 7.966 8.205 8.442 8.711 8.995 9.255 9.564 9.892 10.224 10.573 10.955 11.401 11.837 12.294 12.773 13.316 13.9 14.492 14.962 15.221 15.012 14.511 13.95 13.357 12.756 12.206 11.674 11.194 10.701 10.263 9.861 9.47 9.104 8.749 8.414 8.061 7.732 7.444 7.142 6.833 6.585 6.316 6.024 5.8 5.571 5.329 5.071 4.797 4.607 4.406 4.074 3.843 3.619 3.51 3.283 3.035 2.76 2.602 2.078 2.066 1.885 1.681 1.24 0.998 0.738 0.462 0.129 -0.234 -0.723 -1.983 -5 ,11360 ,KEBNE ,17026840,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:11:21 CET,0.0 1.154 1.593 1.896 2.175 2.442 2.68 2.893 3.256 3.417 3.568 3.492 3.972 4.104 4.353 4.58 4.789 4.89 5.073 5.249 5.516 5.676 5.823 6.052 6.276 6.484 6.676 6.856 7.092 7.328 7.554 7.816 8.053 8.275 8.548 8.845 9.108 9.401 9.716 10.037 10.366 10.734 11.159 11.569 12.02 12.505 13.037 13.565 14.069 14.516 14.767 14.566 14.093 13.51 12.928 12.357 11.821 11.318 10.863 10.364 9.919 9.517 9.118 8.747 8.394 8.072 7.743 7.438 7.171 6.903 6.598 6.335 6.064 5.778 5.557 5.322 5.088 4.837 4.569 4.381 4.174 3.852 3.625 3.386 3.263 3.008 2.75 2.486 2.343 1.836 1.842 1.657 1.465 1.045 0.813 0.559 0.263 -0.081 -0.509 -1.085 -2.784 -6 ,10462 ,KEBNE ,17026841,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:09:51 CET,0.0 0.914 1.333 1.664 1.937 2.206 2.443 2.636 2.968 3.114 3.258 3.184 3.66 3.784 4.031 4.262 4.46 4.552 4.751 4.952 5.218 5.389 5.551 5.777 5.987 6.185 6.396 6.598 6.848 7.082 7.288 7.523 7.758 8.005 8.306 8.615 8.898 9.214 9.53 9.857 10.208 10.591 11.031 11.45 11.903 12.402 12.937 13.484 14.067 14.555 14.765 14.554 14.079 13.503 12.943 12.38 11.856 11.374 10.92 10.43 9.992 9.614 9.257 8.891 8.544 8.238 7.922 7.631 7.354 7.054 6.753 6.499 6.224 5.939 5.727 5.501 5.254 5.002 4.735 4.541 4.333 4.005 3.783 3.556 3.436 3.18 2.921 2.644 2.498 1.994 2.005 1.838 1.668 1.281 1.054 0.806 0.517 0.189 -0.191 -0.735 -2.272 -7 ,31127 ,KEBNE ,17026842,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:09:38 CET,0.0 1.191 1.575 1.904 2.178 2.419 2.645 2.834 3.153 3.306 3.463 3.398 3.873 3.994 4.23 4.461 4.686 4.794 4.989 5.172 5.435 5.601 5.756 5.974 6.188 6.387 6.582 6.78 7.022 7.26 7.488 7.739 7.975 8.21 8.483 8.77 9.035 9.324 9.636 9.974 10.322 10.694 11.123 11.531 11.983 12.477 13.004 13.538 14.046 14.471 14.678 14.474 14.012 13.478 12.922 12.376 11.855 11.337 10.887 10.412 9.972 9.569 9.183 8.815 8.471 8.156 7.819 7.521 7.256 6.954 6.634 6.376 6.118 5.841 5.616 5.385 5.149 4.913 4.652 4.459 4.264 3.957 3.739 3.504 3.384 3.145 2.885 2.593 2.438 1.937 1.945 1.763 1.565 1.132 0.881 0.617 0.329 -0.017 -0.451 -1.043 -2.289 -8 ,22063 ,KEBNE ,17026843,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:09:44 CET,0.0 1.232 1.718 2.052 2.319 2.549 2.761 2.953 3.283 3.441 3.594 3.505 3.973 4.099 4.318 4.532 4.742 4.842 5.044 5.228 5.482 5.638 5.787 6.01 6.224 6.425 6.625 6.812 7.035 7.244 7.449 7.708 7.955 8.198 8.492 8.808 9.105 9.431 9.763 10.103 10.465 10.877 11.336 11.771 12.261 12.784 13.346 13.9 14.46 14.94 15.177 14.948 14.412 13.802 13.215 12.65 12.121 11.611 11.144 10.653 10.202 9.801 9.405 9.016 8.649 8.307 7.949 7.624 7.34 7.036 6.706 6.428 6.145 5.862 5.641 5.401 5.152 4.896 4.629 4.445 4.248 3.931 3.711 3.479 3.355 3.094 2.828 2.563 2.424 1.92 1.913 1.717 1.524 1.099 0.865 0.62 0.314 -0.035 -0.459 -1.055 -2.218 -9 ,457 ,KEBNE ,17026844,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:11:02 CET,0.0 1.259 1.763 2.154 2.461 2.698 2.921 3.135 3.494 3.651 3.802 3.729 4.197 4.319 4.56 4.794 5.002 5.1 5.295 5.48 5.755 5.919 6.068 6.291 6.513 6.716 6.913 7.105 7.342 7.576 7.795 8.049 8.294 8.527 8.801 9.114 9.394 9.678 9.977 10.299 10.643 11.035 11.48 11.896 12.351 12.851 13.438 14.036 14.572 15.037 15.26 14.981 14.483 13.868 13.249 12.681 12.146 11.643 11.206 10.754 10.338 9.936 9.546 9.161 8.797 8.479 8.14 7.816 7.539 7.267 6.971 6.713 6.45 6.168 5.939 5.709 5.473 5.226 4.95 4.758 4.567 4.269 4.063 3.839 3.72 3.468 3.193 2.891 2.744 2.245 2.236 2.06 1.873 1.449 1.217 0.96 0.681 0.336 -0.088 -0.645 -2.335 -10 ,10990 ,KEBNE ,17026845,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:10:06 CET,0.0 1.219 1.651 1.972 2.245 2.492 2.707 2.897 3.246 3.405 3.554 3.492 3.972 4.098 4.329 4.544 4.759 4.863 5.055 5.233 5.481 5.64 5.797 6.025 6.236 6.45 6.656 6.836 7.067 7.302 7.53 7.795 8.046 8.281 8.541 8.823 9.103 9.413 9.74 10.077 10.418 10.798 11.245 11.681 12.146 12.658 13.213 13.737 14.291 14.788 15.017 14.831 14.4 13.867 13.321 12.78 12.244 11.698 11.207 10.719 10.281 9.881 9.502 9.123 8.762 8.45 8.106 7.774 7.5 7.215 6.901 6.637 6.358 6.072 5.853 5.616 5.362 5.102 4.827 4.632 4.438 4.138 3.923 3.692 3.572 3.317 3.041 2.75 2.606 2.115 2.138 1.959 1.768 1.364 1.13 0.861 0.566 0.242 -0.203 -0.746 -2.018 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt deleted file mode 100644 index eded0738..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1375 ,TETRA ,17591280,Sat Nov 27 22:34:28 CET,Sun Nov 28 00:25:02 CET,0.0 0.896 1.358 1.665 1.926 2.16 2.343 2.507 2.888 3.068 3.223 3.169 3.641 3.763 4.003 4.222 4.424 4.528 4.72 4.893 5.154 5.321 5.483 5.721 5.948 6.159 6.346 6.521 6.754 6.983 7.208 7.469 7.701 7.914 8.163 8.462 8.745 9.039 9.354 9.667 9.98 10.326 10.697 11.06 11.48 11.913 12.356 12.806 13.258 13.588 13.612 13.153 12.501 11.835 11.205 10.595 10.012 9.46 8.984 8.487 8.039 7.646 7.261 6.882 6.515 6.185 5.845 5.52 5.235 4.927 4.589 4.323 4.042 3.746 3.517 3.274 3.014 2.739 2.456 2.268 2.074 1.75 1.52 1.29 1.175 0.943 0.673 0.368 0.215 -0.293 -0.287 -0.469 -0.668 -1.116 -1.35 -1.598 -1.881 -2.202 -2.6 -3.129 -4.461 -2 ,24122 ,TETRA ,17591281,Sat Nov 27 22:34:30 CET,Sun Nov 28 00:25:04 CET,0.0 1.134 1.497 1.769 2.019 2.256 2.458 2.651 3.023 3.192 3.349 3.311 3.797 3.922 4.155 4.379 4.583 4.675 4.855 5.039 5.308 5.474 5.633 5.866 6.077 6.276 6.47 6.655 6.896 7.123 7.335 7.594 7.847 8.097 8.37 8.663 8.954 9.258 9.572 9.896 10.223 10.577 10.972 11.36 11.769 12.2 12.671 13.118 13.563 13.932 13.981 13.55 12.934 12.261 11.668 11.077 10.469 9.92 9.461 8.981 8.532 8.13 7.749 7.371 7.011 6.665 6.287 5.96 5.673 5.371 5.054 4.793 4.528 4.241 4.004 3.761 3.519 3.258 2.985 2.799 2.598 2.285 2.07 1.838 1.718 1.477 1.222 0.938 0.79 0.292 0.306 0.121 -0.079 -0.472 -0.7 -0.967 -1.256 -1.575 -1.934 -2.443 -4.188 -3 ,670 ,TETRA ,17591282,Sat Nov 27 22:34:33 CET,Sun Nov 28 00:24:47 CET,0.0 1.291 1.791 2.137 2.426 2.669 2.879 3.059 3.367 3.519 3.67 3.587 4.066 4.208 4.45 4.669 4.881 4.98 5.169 5.353 5.612 5.78 5.942 6.16 6.371 6.579 6.777 6.959 7.196 7.43 7.646 7.899 8.133 8.354 8.617 8.919 9.191 9.479 9.792 10.126 10.455 10.798 11.188 11.58 12.022 12.472 12.974 13.495 13.965 14.33 14.453 14.042 13.419 12.754 12.121 11.512 10.94 10.401 9.917 9.433 9.01 8.611 8.197 7.787 7.402 7.051 6.698 6.379 6.092 5.809 5.515 5.262 4.986 4.698 4.48 4.252 4.008 3.742 3.464 3.278 3.078 2.75 2.519 2.284 2.16 1.902 1.656 1.381 1.231 0.729 0.75 0.579 0.398 -0.003 -0.241 -0.505 -0.791 -1.11 -1.524 -2.076 -3.415 -4 ,22435 ,TETRA ,17591283,Sat Nov 27 22:34:27 CET,Sun Nov 28 00:24:48 CET,0.0 0.906 1.298 1.602 1.887 2.128 2.349 2.549 2.919 3.095 3.25 3.178 3.659 3.787 4.013 4.219 4.414 4.513 4.71 4.885 5.125 5.288 5.445 5.656 5.858 6.065 6.266 6.448 6.672 6.886 7.1 7.362 7.603 7.833 8.101 8.39 8.657 8.955 9.27 9.579 9.892 10.227 10.614 10.98 11.381 11.832 12.307 12.761 13.214 13.578 13.673 13.265 12.671 12.06 11.432 10.812 10.255 9.736 9.254 8.756 8.298 7.875 7.472 7.074 6.711 6.379 6.022 5.689 5.404 5.123 4.817 4.563 4.292 3.983 3.743 3.502 3.249 2.988 2.707 2.509 2.302 1.964 1.727 1.503 1.386 1.139 0.881 0.587 0.426 -0.092 -0.099 -0.284 -0.471 -0.869 -1.091 -1.361 -1.66 -2.028 -2.493 -3.061 -4.604 -5 ,18833 ,TETRA ,17591284,Sat Nov 27 22:34:27 CET,Sun Nov 28 00:24:48 CET,0.0 1.238 1.678 1.989 2.236 2.469 2.674 2.845 3.188 3.356 3.51 3.438 3.916 4.035 4.261 4.481 4.674 4.764 4.956 5.144 5.399 5.567 5.719 5.918 6.126 6.342 6.556 6.759 6.99 7.215 7.433 7.676 7.923 8.156 8.422 8.716 8.986 9.277 9.584 9.912 10.257 10.63 11.031 11.425 11.856 12.302 12.786 13.269 13.726 14.085 14.113 13.689 13.086 12.437 11.857 11.269 10.661 10.107 9.632 9.13 8.664 8.229 7.814 7.429 7.079 6.759 6.411 6.09 5.819 5.527 5.214 4.953 4.659 4.329 4.082 3.85 3.612 3.357 3.073 2.866 2.67 2.375 2.152 1.914 1.787 1.531 1.263 0.976 0.826 0.311 0.289 0.093 -0.115 -0.549 -0.787 -1.066 -1.387 -1.738 -2.144 -2.689 -3.929 -6 ,17397 ,TETRA ,17591285,Sat Nov 27 22:34:30 CET,Sun Nov 28 00:23:42 CET,0.0 1.362 1.895 2.22 2.472 2.705 2.905 3.094 3.454 3.615 3.767 3.706 4.182 4.305 4.528 4.748 4.976 5.078 5.262 5.438 5.704 5.874 6.03 6.251 6.462 6.66 6.846 7.033 7.281 7.509 7.708 7.955 8.202 8.43 8.691 8.982 9.25 9.536 9.871 10.219 10.568 10.951 11.367 11.763 12.19 12.632 13.1 13.574 14.05 14.446 14.547 14.142 13.568 12.916 12.257 11.598 10.979 10.407 9.899 9.389 8.95 8.549 8.14 7.754 7.404 7.087 6.736 6.404 6.125 5.821 5.484 5.219 4.959 4.672 4.441 4.209 3.976 3.737 3.479 3.292 3.095 2.796 2.586 2.354 2.229 1.973 1.71 1.424 1.269 0.764 0.802 0.635 0.451 0.034 -0.192 -0.442 -0.729 -1.061 -1.464 -2.025 -3.674 -7 ,21449 ,TETRA ,17591286,Sat Nov 27 22:34:31 CET,Sun Nov 28 00:23:44 CET,0.0 0.963 1.382 1.749 2.053 2.295 2.513 2.724 3.099 3.261 3.412 3.327 3.793 3.911 4.139 4.35 4.562 4.661 4.853 5.035 5.278 5.44 5.598 5.819 6.038 6.239 6.428 6.611 6.836 7.058 7.272 7.528 7.772 8.005 8.278 8.577 8.849 9.138 9.437 9.759 10.091 10.447 10.872 11.282 11.702 12.099 12.536 13.015 13.487 13.867 13.954 13.545 12.973 12.37 11.776 11.192 10.631 10.071 9.572 9.063 8.602 8.192 7.8 7.418 7.076 6.761 6.424 6.105 5.828 5.543 5.235 4.978 4.711 4.427 4.201 3.966 3.723 3.46 3.182 2.997 2.799 2.474 2.24 1.991 1.865 1.616 1.346 1.043 0.887 0.377 0.381 0.187 -0.008 -0.447 -0.704 -0.988 -1.288 -1.632 -2.067 -2.672 -3.914 -8 ,12277 ,TETRA ,17591287,Sat Nov 27 22:34:28 CET,Sun Nov 28 00:23:42 CET,0.0 1.367 1.78 2.093 2.364 2.592 2.816 3.014 3.341 3.49 3.634 3.544 4.013 4.134 4.358 4.563 4.752 4.852 5.06 5.253 5.513 5.672 5.834 6.065 6.268 6.475 6.681 6.864 7.09 7.313 7.52 7.772 8.023 8.253 8.512 8.792 9.065 9.379 9.693 9.991 10.313 10.689 11.08 11.459 11.9 12.352 12.831 13.295 13.727 14.09 14.204 13.806 13.186 12.543 11.936 11.325 10.741 10.194 9.728 9.244 8.786 8.36 7.954 7.578 7.219 6.874 6.487 6.15 5.876 5.589 5.286 5.017 4.745 4.451 4.206 3.959 3.706 3.456 3.18 2.981 2.78 2.459 2.232 1.994 1.868 1.595 1.303 1.024 0.881 0.365 0.353 0.151 -0.054 -0.465 -0.699 -0.983 -1.303 -1.663 -2.049 -2.593 -4.298 -9 ,23195 ,TETRA ,17591288,Sat Nov 27 22:34:30 CET,Sun Nov 28 00:23:27 CET,0.0 1.149 1.629 1.964 2.231 2.48 2.711 2.922 3.282 3.446 3.607 3.56 4.046 4.169 4.414 4.657 4.872 4.971 5.156 5.331 5.574 5.72 5.867 6.099 6.318 6.517 6.711 6.89 7.107 7.323 7.538 7.787 8.021 8.243 8.502 8.796 9.071 9.365 9.677 10.011 10.363 10.728 11.12 11.532 11.997 12.445 12.906 13.352 13.779 14.147 14.221 13.783 13.124 12.454 11.839 11.217 10.608 10.062 9.575 9.045 8.572 8.155 7.755 7.354 6.983 6.649 6.295 5.978 5.71 5.425 5.114 4.852 4.575 4.285 4.054 3.8 3.552 3.304 3.031 2.835 2.633 2.326 2.11 1.882 1.765 1.511 1.237 0.943 0.789 0.275 0.277 0.1 -0.092 -0.519 -0.751 -1.0 -1.298 -1.63 -2.053 -2.619 -4.055 -10 ,30053 ,TETRA ,17591289,Sat Nov 27 22:34:32 CET,Sun Nov 28 00:23:32 CET,0.0 1.151 1.59 1.953 2.242 2.496 2.704 2.889 3.22 3.372 3.517 3.441 3.916 4.039 4.27 4.488 4.679 4.772 4.959 5.138 5.394 5.554 5.714 5.949 6.166 6.372 6.564 6.752 6.994 7.22 7.438 7.701 7.952 8.2 8.468 8.741 9.006 9.3 9.624 9.959 10.291 10.656 11.076 11.474 11.897 12.321 12.776 13.222 13.629 13.965 14.018 13.584 12.981 12.362 11.77 11.176 10.595 10.048 9.561 9.049 8.585 8.177 7.771 7.379 7.022 6.689 6.35 6.041 5.767 5.468 5.141 4.87 4.585 4.294 4.071 3.833 3.586 3.309 3.014 2.82 2.625 2.322 2.108 1.899 1.781 1.511 1.242 0.967 0.812 0.298 0.292 0.107 -0.089 -0.526 -0.757 -1.006 -1.273 -1.573 -1.953 -2.489 -4.029 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt deleted file mode 100644 index b6d553bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28744 ,TETRA ,17591290,Sat Nov 27 22:34:32 CET,Sun Nov 28 00:23:25 CET,0.0 1.545 2.144 2.596 2.963 3.285 3.579 3.83 4.268 4.467 4.644 4.622 5.131 5.292 5.579 5.838 6.08 6.195 6.416 6.635 6.941 7.132 7.318 7.583 7.834 8.074 8.296 8.498 8.759 9.004 9.25 9.538 9.795 10.049 10.338 10.627 10.895 11.197 11.517 11.86 12.215 12.57 12.93 13.256 13.634 14.029 14.337 14.572 14.728 14.626 14.014 12.955 11.862 10.803 9.836 8.937 8.131 7.389 6.718 6.029 5.443 4.91 4.409 3.961 3.546 3.155 2.727 2.326 1.968 1.594 1.218 0.916 0.589 0.231 -0.035 -0.31 -0.606 -0.91 -1.222 -1.431 -1.652 -2.018 -2.28 -2.566 -2.709 -2.976 -3.261 -3.582 -3.743 -4.266 -4.267 -4.457 -4.663 -5.131 -5.398 -5.695 -6.023 -6.386 -6.807 -7.413 -9.799 -2 ,8 ,TETRA ,17591291,Sat Nov 27 22:35:00 CET,Sun Nov 28 00:23:32 CET,0.0 1.971 2.656 3.134 3.48 3.787 4.05 4.293 4.739 4.94 5.133 5.155 5.671 5.822 6.104 6.372 6.63 6.748 6.955 7.157 7.45 7.637 7.817 8.061 8.307 8.553 8.783 8.993 9.259 9.517 9.759 10.03 10.294 10.536 10.801 11.106 11.388 11.703 12.038 12.389 12.75 13.111 13.5 13.87 14.259 14.618 14.963 15.275 15.498 15.524 15.024 13.944 12.832 11.771 10.748 9.792 8.977 8.222 7.541 6.873 6.292 5.767 5.28 4.812 4.364 3.951 3.51 3.11 2.771 2.42 2.048 1.738 1.416 1.073 0.811 0.549 0.248 -0.089 -0.42 -0.634 -0.862 -1.225 -1.472 -1.735 -1.875 -2.172 -2.47 -2.778 -2.953 -3.491 -3.523 -3.74 -3.976 -4.512 -4.803 -5.097 -5.428 -5.829 -6.299 -6.912 -8.81 -3 ,3722 ,TETRA ,17591292,Sat Nov 27 22:34:55 CET,Sun Nov 28 00:23:25 CET,0.0 2.126 2.759 3.214 3.554 3.859 4.127 4.374 4.822 5.025 5.208 5.188 5.69 5.841 6.129 6.388 6.614 6.726 6.951 7.175 7.483 7.676 7.868 8.146 8.409 8.65 8.875 9.089 9.364 9.62 9.865 10.16 10.434 10.696 10.993 11.305 11.587 11.882 12.203 12.532 12.842 13.184 13.597 13.951 14.301 14.699 15.12 15.435 15.643 15.648 15.129 14.064 12.948 11.88 10.924 10.029 9.214 8.461 7.781 7.104 6.535 6.018 5.516 5.041 4.598 4.197 3.764 3.361 3.006 2.634 2.265 1.965 1.651 1.321 1.056 0.767 0.467 0.132 -0.216 -0.437 -0.662 -1.008 -1.261 -1.538 -1.674 -1.947 -2.28 -2.627 -2.793 -3.322 -3.352 -3.565 -3.794 -4.306 -4.588 -4.896 -5.241 -5.646 -6.122 -6.787 -8.918 -4 ,19950 ,TETRA ,17591293,Sat Nov 27 22:34:56 CET,Sun Nov 28 00:23:38 CET,0.0 2.416 3.111 3.617 3.989 4.294 4.564 4.809 5.269 5.469 5.653 5.649 6.147 6.294 6.578 6.823 7.063 7.182 7.398 7.609 7.921 8.121 8.301 8.554 8.79 9.005 9.223 9.444 9.72 9.97 10.207 10.497 10.755 10.998 11.288 11.602 11.886 12.2 12.544 12.887 13.224 13.576 13.961 14.337 14.719 15.086 15.459 15.797 16.057 16.11 15.683 14.609 13.487 12.481 11.524 10.618 9.832 9.111 8.477 7.825 7.246 6.719 6.216 5.74 5.292 4.878 4.435 4.044 3.704 3.353 2.985 2.659 2.32 1.98 1.715 1.438 1.149 0.847 0.538 0.325 0.104 -0.225 -0.465 -0.721 -0.856 -1.143 -1.445 -1.776 -1.953 -2.495 -2.537 -2.737 -2.952 -3.446 -3.715 -3.997 -4.304 -4.653 -5.1 -5.72 -7.712 -5 ,16318 ,TETRA ,17591294,Sat Nov 27 22:34:59 CET,Sun Nov 28 00:23:29 CET,0.0 1.753 2.341 2.801 3.185 3.524 3.805 4.057 4.523 4.724 4.905 4.905 5.411 5.557 5.84 6.096 6.34 6.465 6.698 6.903 7.184 7.371 7.549 7.812 8.062 8.289 8.501 8.698 8.95 9.194 9.42 9.681 9.933 10.179 10.458 10.788 11.095 11.411 11.742 12.062 12.393 12.737 13.101 13.461 13.847 14.198 14.52 14.857 15.111 15.105 14.602 13.48 12.359 11.321 10.345 9.444 8.663 7.942 7.3 6.655 6.082 5.553 5.026 4.538 4.103 3.704 3.289 2.913 2.573 2.216 1.845 1.536 1.208 0.871 0.611 0.346 0.068 -0.233 -0.556 -0.776 -1.0 -1.363 -1.627 -1.894 -2.022 -2.309 -2.623 -2.937 -3.098 -3.626 -3.677 -3.902 -4.128 -4.613 -4.885 -5.18 -5.505 -5.86 -6.331 -7.04 -9.268 -6 ,8558 ,TETRA ,17591295,Sat Nov 27 22:34:56 CET,Sun Nov 28 00:23:27 CET,0.0 1.833 2.416 2.865 3.263 3.589 3.869 4.126 4.557 4.753 4.953 4.967 5.478 5.63 5.895 6.13 6.363 6.481 6.704 6.914 7.225 7.424 7.612 7.874 8.125 8.36 8.583 8.793 9.051 9.299 9.538 9.819 10.078 10.33 10.621 10.939 11.256 11.571 11.881 12.218 12.565 12.94 13.326 13.686 14.048 14.419 14.78 15.052 15.254 15.245 14.697 13.577 12.487 11.432 10.476 9.595 8.793 8.049 7.384 6.706 6.119 5.571 5.041 4.571 4.139 3.732 3.294 2.906 2.578 2.236 1.858 1.551 1.247 0.903 0.62 0.34 0.052 -0.243 -0.541 -0.758 -0.984 -1.345 -1.606 -1.897 -2.047 -2.334 -2.636 -2.97 -3.145 -3.677 -3.684 -3.889 -4.107 -4.589 -4.888 -5.206 -5.551 -5.986 -6.468 -7.088 -9.521 -7 ,28769 ,TETRA ,17591296,Sat Nov 27 22:34:58 CET,Sun Nov 28 00:23:31 CET,0.0 1.991 2.611 3.063 3.469 3.797 4.071 4.341 4.824 5.033 5.232 5.243 5.746 5.897 6.182 6.453 6.702 6.812 7.017 7.22 7.518 7.721 7.908 8.16 8.389 8.606 8.831 9.046 9.312 9.571 9.821 10.105 10.363 10.596 10.868 11.195 11.498 11.795 12.097 12.4 12.699 13.054 13.45 13.759 14.08 14.426 14.779 15.111 15.34 15.342 14.847 13.728 12.612 11.568 10.625 9.736 8.913 8.169 7.54 6.875 6.294 5.804 5.326 4.853 4.402 3.98 3.528 3.133 2.809 2.474 2.106 1.787 1.449 1.091 0.805 0.513 0.216 -0.091 -0.409 -0.643 -0.888 -1.26 -1.523 -1.799 -1.938 -2.233 -2.544 -2.875 -3.057 -3.607 -3.63 -3.833 -4.048 -4.515 -4.786 -5.1 -5.476 -5.873 -6.319 -6.934 -8.465 -8 ,16382 ,TETRA ,17591297,Sat Nov 27 22:35:00 CET,Sun Nov 28 00:23:43 CET,0.0 1.73 2.361 2.842 3.219 3.539 3.82 4.076 4.516 4.71 4.899 4.902 5.414 5.562 5.846 6.129 6.381 6.498 6.725 6.934 7.233 7.435 7.623 7.878 8.131 8.364 8.582 8.804 9.081 9.341 9.597 9.893 10.171 10.43 10.728 11.065 11.367 11.687 12.026 12.366 12.68 13.027 13.398 13.74 14.135 14.504 14.876 15.236 15.505 15.549 15.073 13.969 12.805 11.711 10.698 9.778 8.976 8.24 7.606 6.96 6.401 5.889 5.386 4.889 4.447 4.056 3.635 3.246 2.893 2.534 2.169 1.863 1.54 1.18 0.898 0.626 0.343 0.049 -0.262 -0.476 -0.696 -1.071 -1.336 -1.607 -1.748 -2.035 -2.329 -2.643 -2.801 -3.329 -3.36 -3.554 -3.758 -4.243 -4.52 -4.803 -5.134 -5.515 -5.973 -6.619 -8.156 -9 ,8318 ,TETRA ,17591298,Sat Nov 27 22:35:01 CET,Sun Nov 28 00:23:21 CET,0.0 1.469 2.111 2.552 2.913 3.253 3.543 3.776 4.185 4.379 4.552 4.527 5.032 5.18 5.467 5.748 6.004 6.13 6.36 6.567 6.885 7.082 7.27 7.533 7.775 8.007 8.222 8.43 8.707 8.961 9.188 9.446 9.696 9.955 10.253 10.553 10.838 11.152 11.491 11.864 12.227 12.605 13.028 13.394 13.765 14.137 14.487 14.767 14.986 15.02 14.508 13.395 12.236 11.163 10.171 9.265 8.472 7.734 7.085 6.426 5.833 5.303 4.814 4.35 3.9 3.477 3.035 2.647 2.307 1.956 1.6 1.3 0.969 0.627 0.366 0.093 -0.187 -0.479 -0.779 -0.988 -1.21 -1.576 -1.823 -2.087 -2.232 -2.515 -2.82 -3.15 -3.325 -3.861 -3.891 -4.104 -4.323 -4.799 -5.093 -5.43 -5.787 -6.148 -6.614 -7.285 -9.376 -10 ,13286 ,TETRA ,17591299,Sat Nov 27 22:34:56 CET,Sun Nov 28 00:23:43 CET,0.0 2.341 3.007 3.463 3.855 4.201 4.506 4.783 5.253 5.456 5.644 5.626 6.136 6.293 6.603 6.899 7.152 7.266 7.492 7.712 8.023 8.219 8.401 8.655 8.903 9.155 9.393 9.607 9.87 10.126 10.368 10.637 10.878 11.125 11.42 11.734 12.041 12.359 12.683 13.037 13.414 13.769 14.101 14.437 14.806 15.168 15.508 15.812 16.02 16.0 15.455 14.376 13.3 12.268 11.258 10.315 9.486 8.728 8.087 7.434 6.84 6.311 5.81 5.319 4.846 4.42 3.987 3.608 3.258 2.887 2.519 2.21 1.901 1.575 1.302 1.016 0.727 0.438 0.13 -0.093 -0.314 -0.682 -0.934 -1.185 -1.322 -1.622 -1.952 -2.31 -2.496 -3.03 -3.047 -3.246 -3.454 -3.961 -4.247 -4.537 -4.887 -5.319 -5.802 -6.473 -8.334 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt deleted file mode 100644 index 44529be1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2658 ,TETRA ,17591300,Sat Nov 27 22:34:56 CET,Sun Nov 28 00:24:02 CET,0.0 1.21 1.746 2.087 2.419 2.745 3.014 3.251 3.67 3.863 4.046 4.025 4.564 4.721 5.02 5.31 5.583 5.725 6.004 6.262 6.611 6.825 7.039 7.358 7.663 7.951 8.234 8.516 8.864 9.199 9.53 9.924 10.293 10.641 11.062 11.542 11.992 12.475 12.974 13.519 14.12 14.771 15.507 16.245 17.084 18.016 19.112 20.313 21.668 23.179 24.781 25.792 26.137 26.18 26.071 25.871 25.605 25.293 24.975 24.646 24.337 24.008 23.666 23.328 23.016 22.733 22.42 22.121 21.843 21.554 21.26 21.006 20.726 20.421 20.179 19.94 19.703 19.423 19.12 18.909 18.675 18.329 18.093 17.828 17.688 17.39 17.069 16.733 16.558 16.035 16.014 15.795 15.568 15.076 14.807 14.49 14.107 13.665 13.042 12.116 9.964 -2 ,10781 ,TETRA ,17591301,Sat Nov 27 22:34:58 CET,Sun Nov 28 00:26:54 CET,0.0 2.558 3.258 3.658 3.97 4.25 4.5 4.733 5.165 5.363 5.555 5.539 6.082 6.244 6.557 6.862 7.152 7.289 7.545 7.787 8.128 8.338 8.544 8.857 9.171 9.474 9.763 10.048 10.41 10.739 11.066 11.46 11.836 12.212 12.632 13.096 13.549 14.027 14.532 15.075 15.652 16.319 17.077 17.809 18.675 19.652 20.705 21.834 23.127 24.609 26.268 27.294 27.598 27.623 27.498 27.291 27.042 26.762 26.451 26.101 25.809 25.515 25.189 24.852 24.514 24.203 23.883 23.591 23.329 23.056 22.77 22.528 22.262 21.977 21.755 21.521 21.254 20.962 20.677 20.478 20.272 19.933 19.703 19.458 19.325 19.052 18.754 18.417 18.231 17.688 17.618 17.391 17.169 16.663 16.366 16.052 15.691 15.292 14.804 14.123 12.219 -3 ,19868 ,TETRA ,17591302,Sat Nov 27 22:35:00 CET,Sun Nov 28 00:25:55 CET,0.0 1.159 1.7 2.118 2.47 2.768 3.034 3.284 3.718 3.906 4.086 4.072 4.614 4.774 5.09 5.399 5.675 5.807 6.07 6.309 6.651 6.879 7.107 7.424 7.707 7.981 8.264 8.54 8.883 9.221 9.554 9.944 10.322 10.692 11.119 11.589 12.031 12.523 13.056 13.625 14.224 14.879 15.626 16.375 17.236 18.174 19.264 20.49 21.864 23.327 24.866 25.888 26.282 26.357 26.212 25.912 25.592 25.308 25.005 24.636 24.29 23.977 23.668 23.351 23.048 22.767 22.443 22.13 21.88 21.617 21.318 21.063 20.794 20.509 20.289 20.054 19.785 19.508 19.218 19.01 18.797 18.449 18.192 17.914 17.776 17.494 17.194 16.881 16.716 16.197 16.197 15.983 15.739 15.218 14.932 14.6 14.248 13.844 13.348 12.677 10.792 -4 ,28774 ,TETRA ,17591303,Sat Nov 27 22:34:57 CET,Sun Nov 28 00:27:09 CET,0.0 1.201 1.725 2.117 2.43 2.697 2.934 3.168 3.593 3.792 3.979 3.935 4.462 4.615 4.913 5.208 5.49 5.623 5.884 6.137 6.504 6.733 6.941 7.247 7.544 7.837 8.123 8.391 8.726 9.052 9.371 9.76 10.145 10.508 10.92 11.376 11.807 12.304 12.833 13.379 13.965 14.615 15.368 16.102 16.955 17.923 18.998 20.167 21.502 22.978 24.561 25.609 25.971 25.981 25.804 25.548 25.25 24.924 24.596 24.224 23.879 23.536 23.195 22.87 22.555 22.246 21.89 21.568 21.313 21.047 20.75 20.497 20.227 19.934 19.687 19.434 19.177 18.9 18.613 18.42 18.217 17.886 17.658 17.409 17.278 17.001 16.697 16.377 16.204 15.679 15.668 15.46 15.243 14.746 14.45 14.136 13.799 13.409 12.9 12.216 10.353 -5 ,24747 ,TETRA ,17591304,Sat Nov 27 22:34:59 CET,Sun Nov 28 00:26:55 CET,0.0 1.406 1.896 2.289 2.608 2.913 3.18 3.427 3.886 4.087 4.278 4.248 4.797 4.969 5.268 5.552 5.821 5.949 6.202 6.439 6.775 6.994 7.201 7.505 7.806 8.096 8.374 8.636 8.976 9.31 9.632 10.002 10.357 10.726 11.153 11.627 12.102 12.617 13.155 13.715 14.283 14.919 15.673 16.431 17.312 18.298 19.391 20.547 21.852 23.333 24.927 25.984 26.353 26.376 26.256 26.018 25.687 25.325 24.985 24.649 24.319 23.961 23.622 23.32 23.026 22.736 22.411 22.106 21.833 21.543 21.234 20.964 20.694 20.419 20.193 19.942 19.677 19.403 19.113 18.922 18.719 18.382 18.138 17.883 17.76 17.477 17.157 16.84 16.67 16.143 16.106 15.892 15.673 15.157 14.871 14.58 14.245 13.833 13.333 12.641 10.586 -6 ,4838 ,TETRA ,17591305,Sat Nov 27 22:35:01 CET,Sun Nov 28 00:25:17 CET,0.0 0.885 1.415 1.817 2.159 2.448 2.699 2.932 3.35 3.537 3.724 3.72 4.26 4.423 4.726 5.007 5.284 5.419 5.685 5.943 6.285 6.503 6.72 7.027 7.336 7.64 7.923 8.195 8.535 8.863 9.179 9.555 9.912 10.263 10.677 11.132 11.557 12.026 12.556 13.124 13.713 14.382 15.163 15.922 16.778 17.697 18.748 19.95 21.335 22.838 24.391 25.394 25.755 25.772 25.577 25.327 25.069 24.762 24.449 24.076 23.728 23.399 23.053 22.727 22.44 22.161 21.841 21.552 21.302 21.03 20.718 20.451 20.182 19.901 19.688 19.455 19.196 18.936 18.675 18.484 18.259 17.895 17.647 17.393 17.258 16.964 16.651 16.305 16.121 15.591 15.567 15.346 15.114 14.625 14.346 14.052 13.743 13.352 12.866 12.189 10.179 -7 ,5187 ,TETRA ,17591306,Sat Nov 27 22:34:58 CET,Sun Nov 28 00:24:57 CET,0.0 1.406 1.93 2.318 2.639 2.95 3.23 3.476 3.912 4.101 4.289 4.289 4.84 5.015 5.335 5.624 5.901 6.033 6.296 6.549 6.888 7.104 7.327 7.649 7.944 8.218 8.479 8.746 9.112 9.451 9.769 10.161 10.538 10.885 11.278 11.721 12.151 12.647 13.176 13.713 14.283 14.946 15.697 16.438 17.305 18.254 19.355 20.598 21.981 23.518 25.18 26.241 26.652 26.7 26.55 26.305 26.051 25.766 25.468 25.131 24.77 24.44 24.131 23.817 23.506 23.197 22.872 22.586 22.32 22.032 21.726 21.467 21.209 20.938 20.71 20.467 20.218 19.942 19.629 19.406 19.185 18.85 18.61 18.359 18.232 17.961 17.665 17.336 17.158 16.627 16.623 16.429 16.216 15.735 15.461 15.159 14.807 14.389 13.894 13.255 11.399 -8 ,18267 ,TETRA ,17591307,Sat Nov 27 21:59:39 CET,Sat Nov 27 23:44:50 CET,0.0 1.23 1.706 2.06 2.383 2.676 2.931 3.171 3.618 3.822 4.02 4.019 4.562 4.732 5.052 5.349 5.633 5.769 6.024 6.264 6.607 6.829 7.04 7.342 7.64 7.929 8.215 8.486 8.827 9.151 9.471 9.861 10.232 10.583 10.99 11.458 11.894 12.373 12.891 13.436 14.008 14.657 15.421 16.183 17.065 18.007 19.036 20.193 21.52 22.989 24.584 25.667 26.085 26.171 26.069 25.844 25.552 25.252 24.963 24.606 24.271 23.964 23.616 23.26 22.938 22.641 22.323 22.01 21.728 21.431 21.119 20.861 20.596 20.317 20.086 19.84 19.574 19.291 19.017 18.83 18.616 18.273 18.049 17.822 17.693 17.41 17.111 16.776 16.593 16.056 16.018 15.801 15.572 15.066 14.777 14.468 14.125 13.692 13.122 12.429 9.692 -9 ,1726 ,TETRA ,17591308,Sat Nov 27 21:59:39 CET,Sat Nov 27 23:55:08 CET,0.0 1.021 1.564 1.973 2.312 2.594 2.839 3.077 3.508 3.694 3.879 3.881 4.423 4.585 4.905 5.201 5.465 5.59 5.837 6.082 6.449 6.684 6.914 7.241 7.539 7.823 8.093 8.359 8.712 9.037 9.347 9.737 10.112 10.463 10.899 11.415 11.879 12.374 12.932 13.502 14.07 14.718 15.451 16.185 17.057 18.015 19.114 20.333 21.709 23.259 24.933 25.99 26.347 26.399 26.295 26.076 25.787 25.495 25.213 24.897 24.574 24.255 23.94 23.621 23.305 23.02 22.729 22.432 22.154 21.865 21.578 21.334 21.066 20.785 20.553 20.307 20.055 19.796 19.514 19.311 19.102 18.769 18.53 18.285 18.156 17.874 17.566 17.227 17.049 16.52 16.504 16.289 16.06 15.585 15.325 15.027 14.677 14.229 13.679 13.03 11.222 -10 ,17373 ,TETRA ,17591309,Sat Nov 27 22:34:58 CET,Sun Nov 28 00:24:35 CET,0.0 1.588 2.174 2.571 2.898 3.18 3.431 3.661 4.107 4.315 4.498 4.459 4.995 5.15 5.446 5.739 6.016 6.145 6.398 6.651 6.993 7.211 7.431 7.743 8.054 8.352 8.622 8.893 9.245 9.57 9.89 10.268 10.644 11.015 11.43 11.899 12.347 12.844 13.412 14.015 14.6 15.243 16.012 16.789 17.649 18.598 19.715 20.904 22.234 23.752 25.401 26.456 26.81 26.869 26.768 26.557 26.268 25.933 25.62 25.285 24.969 24.656 24.332 24.012 23.688 23.367 23.042 22.746 22.469 22.202 21.921 21.66 21.375 21.057 20.805 20.561 20.325 20.06 19.775 19.581 19.374 19.026 18.767 18.505 18.379 18.103 17.801 17.491 17.33 16.801 16.763 16.559 16.333 15.831 15.545 15.244 14.905 14.492 13.958 13.216 11.354 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt deleted file mode 100644 index e3a365ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2443 ,TETRA ,17591310,Sat Nov 27 22:34:59 CET,Sun Nov 28 00:24:20 CET,0.0 2.09 2.737 3.248 3.611 3.943 4.277 4.576 5.06 5.279 5.499 5.549 6.104 6.282 6.638 6.973 7.274 7.419 7.694 7.962 8.352 8.608 8.858 9.202 9.54 9.874 10.189 10.505 10.924 11.327 11.717 12.175 12.605 13.013 13.479 14.006 14.519 15.094 15.709 16.341 17.0 17.743 18.632 19.51 20.503 21.644 22.96 24.369 25.945 27.758 29.728 31.061 31.586 31.669 31.506 31.247 30.95 30.65 30.342 29.976 29.637 29.294 28.931 28.579 28.246 27.918 27.569 27.267 27.006 26.705 26.36 26.084 25.795 25.494 25.252 24.986 24.72 24.43 24.126 23.919 23.701 23.355 23.099 22.835 22.699 22.403 22.086 21.728 21.538 20.993 20.889 20.655 20.394 19.76 19.41 19.04 18.632 18.165 17.582 16.774 14.029 -2 ,22541 ,TETRA ,17591311,Sat Nov 27 22:35:01 CET,Sun Nov 28 00:24:32 CET,0.0 1.767 2.396 2.916 3.327 3.69 4.01 4.305 4.843 5.086 5.325 5.407 5.971 6.157 6.528 6.871 7.188 7.337 7.632 7.92 8.322 8.57 8.811 9.185 9.554 9.904 10.233 10.552 10.978 11.379 11.766 12.241 12.67 13.057 13.512 14.045 14.568 15.167 15.824 16.491 17.159 17.914 18.809 19.688 20.713 21.862 23.166 24.593 26.171 27.903 29.816 31.155 31.706 31.81 31.671 31.469 31.191 30.863 30.542 30.181 29.846 29.522 29.176 28.837 28.508 28.193 27.857 27.538 27.257 26.955 26.611 26.332 26.054 25.748 25.504 25.237 24.963 24.682 24.388 24.173 23.934 23.542 23.262 22.97 22.828 22.545 22.213 21.858 21.673 21.128 21.052 20.835 20.601 20.066 19.748 19.381 18.994 18.565 17.976 17.183 14.425 -3 ,19648 ,TETRA ,17591312,Sat Nov 27 22:35:04 CET,Sun Nov 28 00:24:22 CET,0.0 2.146 2.775 3.181 3.521 3.837 4.155 4.465 4.977 5.199 5.428 5.504 6.064 6.247 6.611 6.957 7.301 7.464 7.772 8.074 8.498 8.766 9.023 9.369 9.703 10.038 10.351 10.666 11.076 11.459 11.836 12.293 12.715 13.121 13.6 14.139 14.648 15.205 15.817 16.452 17.11 17.876 18.77 19.678 20.753 21.9 23.18 24.626 26.229 27.983 30.001 31.352 31.808 31.915 31.814 31.594 31.357 31.063 30.728 30.351 30.0 29.683 29.34 28.971 28.624 28.3 27.949 27.62 27.331 27.026 26.686 26.411 26.133 25.823 25.568 25.299 25.026 24.74 24.431 24.215 23.98 23.594 23.327 23.037 22.886 22.584 22.274 21.945 21.762 21.226 21.159 20.918 20.663 20.13 19.803 19.404 18.984 18.474 17.833 16.954 13.313 -4 ,2810 ,TETRA ,17591313,Sat Nov 27 22:34:58 CET,Sun Nov 28 00:24:44 CET,0.0 1.881 2.538 3.064 3.47 3.799 4.108 4.389 4.918 5.173 5.415 5.483 6.044 6.221 6.562 6.883 7.182 7.333 7.647 7.946 8.346 8.586 8.819 9.182 9.545 9.899 10.241 10.557 10.945 11.316 11.677 12.134 12.567 12.955 13.411 13.946 14.45 14.989 15.593 16.263 16.966 17.736 18.589 19.465 20.514 21.677 22.995 24.451 26.126 27.96 29.894 31.17 31.714 31.849 31.746 31.489 31.14 30.767 30.422 30.062 29.741 29.422 29.084 28.743 28.418 28.105 27.769 27.455 27.177 26.902 26.598 26.315 26.007 25.699 25.453 25.183 24.899 24.602 24.284 24.063 23.836 23.48 23.221 22.935 22.783 22.463 22.12 21.756 21.571 21.041 20.982 20.755 20.527 19.999 19.678 19.311 18.905 18.451 17.817 16.993 14.049 -5 ,28523 ,TETRA ,17591314,Sat Nov 27 22:35:02 CET,Sun Nov 28 00:25:11 CET,0.0 1.768 2.456 2.955 3.341 3.675 3.967 4.243 4.754 4.978 5.189 5.249 5.829 6.029 6.411 6.757 7.079 7.232 7.522 7.815 8.246 8.512 8.758 9.107 9.451 9.792 10.119 10.43 10.831 11.201 11.557 12.015 12.465 12.888 13.388 13.963 14.498 15.065 15.674 16.348 17.064 17.835 18.704 19.578 20.576 21.683 22.985 24.426 26.024 27.834 29.848 31.099 31.537 31.649 31.564 31.309 30.976 30.646 30.34 30.007 29.687 29.371 29.047 28.72 28.409 28.115 27.806 27.514 27.238 26.945 26.62 26.341 26.039 25.713 25.47 25.203 24.916 24.605 24.27 24.042 23.803 23.415 23.131 22.84 22.684 22.359 22.03 21.687 21.504 20.96 20.865 20.627 20.385 19.817 19.487 19.118 18.709 18.246 17.675 16.919 13.285 -6 ,6461 ,TETRA ,17591315,Sat Nov 27 22:34:59 CET,Sun Nov 28 00:24:19 CET,0.0 1.892 2.48 2.943 3.31 3.61 3.88 4.148 4.646 4.885 5.103 5.124 5.69 5.881 6.235 6.559 6.859 7.001 7.286 7.576 8.006 8.279 8.538 8.903 9.246 9.572 9.886 10.203 10.618 11.019 11.405 11.844 12.259 12.672 13.159 13.705 14.223 14.804 15.445 16.118 16.794 17.55 18.448 19.346 20.37 21.555 22.937 24.399 26.046 27.928 29.981 31.329 31.865 31.961 31.838 31.61 31.286 30.914 30.547 30.168 29.83 29.482 29.135 28.805 28.485 28.182 27.848 27.529 27.236 26.92 26.589 26.332 26.056 25.759 25.521 25.243 24.952 24.661 24.34 24.114 23.883 23.52 23.245 22.952 22.812 22.52 22.188 21.817 21.607 21.039 20.95 20.722 20.464 19.894 19.59 19.231 18.835 18.412 17.875 17.075 14.227 -7 ,23144 ,TETRA ,17591316,Sat Nov 27 22:35:00 CET,Sun Nov 28 00:23:56 CET,0.0 2.234 2.881 3.357 3.743 4.08 4.385 4.674 5.174 5.392 5.612 5.646 6.212 6.396 6.737 7.084 7.413 7.557 7.845 8.128 8.532 8.792 9.04 9.407 9.748 10.071 10.385 10.686 11.077 11.465 11.85 12.293 12.721 13.144 13.616 14.141 14.674 15.28 15.917 16.574 17.26 18.02 18.866 19.719 20.731 21.854 23.106 24.496 26.126 27.984 30.04 31.362 31.827 31.899 31.765 31.518 31.222 30.883 30.547 30.164 29.803 29.475 29.143 28.812 28.494 28.174 27.823 27.519 27.221 26.883 26.532 26.238 25.936 25.615 25.364 25.1 24.811 24.51 24.204 23.983 23.756 23.408 23.145 22.861 22.722 22.441 22.113 21.745 21.555 21.016 20.945 20.703 20.448 19.906 19.571 19.206 18.84 18.399 17.783 16.851 13.39 -8 ,28414 ,TETRA ,17591317,Sat Nov 27 22:34:59 CET,Sun Nov 28 00:24:12 CET,0.0 2.233 2.933 3.472 3.859 4.185 4.481 4.767 5.323 5.586 5.812 5.84 6.404 6.604 6.967 7.295 7.62 7.777 8.071 8.349 8.75 9.008 9.256 9.621 9.987 10.337 10.673 11.003 11.426 11.831 12.212 12.658 13.088 13.505 13.993 14.552 15.069 15.625 16.239 16.892 17.567 18.338 19.245 20.15 21.178 22.273 23.584 25.045 26.617 28.361 30.375 31.649 32.147 32.285 32.189 31.976 31.687 31.329 30.965 30.624 30.315 29.982 29.643 29.301 28.959 28.642 28.304 27.995 27.717 27.415 27.093 26.828 26.546 26.24 25.999 25.748 25.467 25.158 24.849 24.635 24.418 24.079 23.824 23.543 23.394 23.069 22.709 22.33 22.131 21.573 21.486 21.256 21.014 20.469 20.156 19.796 19.368 18.881 18.235 17.319 14.597 -9 ,9116 ,TETRA ,17591318,Sat Nov 27 22:35:00 CET,Sun Nov 28 00:24:20 CET,0.0 2.54 3.242 3.74 4.163 4.536 4.849 5.135 5.695 5.941 6.162 6.224 6.799 6.99 7.352 7.692 8.009 8.171 8.486 8.777 9.189 9.443 9.69 10.062 10.421 10.767 11.104 11.417 11.818 12.227 12.622 13.068 13.479 13.903 14.421 14.992 15.526 16.073 16.661 17.305 17.985 18.762 19.664 20.531 21.532 22.654 23.901 25.32 26.985 28.846 30.87 32.226 32.762 32.866 32.734 32.482 32.192 31.868 31.538 31.183 30.846 30.501 30.158 29.843 29.521 29.19 28.839 28.54 28.275 27.97 27.646 27.379 27.1 26.795 26.545 26.281 25.997 25.704 25.395 25.179 24.963 24.619 24.363 24.065 23.909 23.595 23.231 22.843 22.647 22.097 22.013 21.772 21.514 20.964 20.628 20.261 19.877 19.41 18.815 17.979 15.041 -10 ,21406 ,TETRA ,17591319,Sat Nov 27 22:35:02 CET,Sun Nov 28 00:24:18 CET,0.0 2.075 2.743 3.216 3.598 3.975 4.302 4.583 5.115 5.366 5.604 5.676 6.252 6.447 6.806 7.148 7.471 7.629 7.94 8.226 8.626 8.886 9.127 9.474 9.813 10.148 10.47 10.784 11.17 11.54 11.912 12.341 12.761 13.179 13.663 14.19 14.695 15.262 15.861 16.498 17.161 17.929 18.83 19.702 20.697 21.794 23.097 24.561 26.179 28.051 30.175 31.521 32.062 32.219 32.16 32.013 31.797 31.473 31.105 30.71 30.351 30.02 29.69 29.349 29.014 28.715 28.38 28.054 27.777 27.481 27.17 26.919 26.643 26.337 26.097 25.844 25.577 25.293 24.995 24.78 24.555 24.206 23.957 23.677 23.525 23.228 22.912 22.553 22.365 21.834 21.777 21.539 21.289 20.741 20.434 20.095 19.685 19.169 18.563 17.787 14.624 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index b7df5ef6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20064 ,TETRA ,17591320,Sat Nov 27 22:35:04 CET,Sun Nov 28 00:23:57 CET,0.0 1.042 1.456 1.8 2.078 2.342 2.581 2.786 3.172 3.349 3.51 3.46 3.954 4.094 4.355 4.597 4.828 4.939 5.154 5.36 5.649 5.831 6.017 6.28 6.53 6.773 6.982 7.194 7.488 7.759 8.02 8.323 8.6 8.877 9.196 9.547 9.889 10.259 10.635 11.023 11.452 11.947 12.473 12.974 13.568 14.233 14.967 15.69 16.455 17.255 18.001 18.294 18.177 17.876 17.484 17.059 16.648 16.236 15.871 15.478 15.123 14.818 14.485 14.163 13.879 13.599 13.296 13.026 12.785 12.513 12.216 11.981 11.745 11.498 11.302 11.086 10.847 10.601 10.354 10.171 9.984 9.691 9.481 9.26 9.149 8.91 8.642 8.358 8.203 7.691 7.693 7.521 7.339 6.916 6.69 6.449 6.184 5.861 5.444 4.858 3.101 -2 ,30109 ,TETRA ,17591321,Sat Nov 27 22:34:59 CET,Sun Nov 28 00:23:46 CET,0.0 1.104 1.553 1.871 2.135 2.401 2.648 2.865 3.241 3.42 3.595 3.571 4.077 4.216 4.486 4.751 4.995 5.107 5.327 5.534 5.814 6.0 6.182 6.425 6.661 6.894 7.121 7.338 7.621 7.897 8.15 8.458 8.744 9.003 9.301 9.636 9.968 10.332 10.71 11.102 11.512 11.957 12.478 13.015 13.587 14.185 14.892 15.641 16.45 17.3 18.086 18.387 18.298 18.093 17.764 17.373 16.993 16.613 16.275 15.899 15.54 15.209 14.906 14.598 14.276 13.972 13.642 13.347 13.101 12.859 12.595 12.359 12.1 11.813 11.594 11.383 11.166 10.939 10.696 10.531 10.359 10.076 9.875 9.664 9.556 9.323 9.073 8.81 8.665 8.168 8.197 8.025 7.844 7.447 7.224 6.976 6.71 6.389 5.976 5.41 3.688 -3 ,8022 ,TETRA ,17591322,Sat Nov 27 22:35:04 CET,Sun Nov 28 00:24:13 CET,0.0 1.052 1.473 1.788 2.074 2.367 2.614 2.825 3.222 3.402 3.571 3.519 4.012 4.152 4.423 4.683 4.918 5.03 5.243 5.447 5.751 5.94 6.124 6.396 6.646 6.879 7.111 7.328 7.597 7.852 8.096 8.399 8.695 8.97 9.285 9.662 10.046 10.435 10.816 11.201 11.612 12.076 12.59 13.121 13.723 14.351 15.036 15.755 16.532 17.352 18.081 18.295 18.166 17.876 17.511 17.11 16.721 16.348 16.002 15.602 15.225 14.894 14.578 14.268 13.983 13.722 13.434 13.179 12.947 12.679 12.407 12.181 11.931 11.677 11.471 11.248 11.013 10.772 10.531 10.357 10.169 9.877 9.662 9.432 9.313 9.069 8.82 8.55 8.403 7.899 7.905 7.727 7.543 7.124 6.897 6.657 6.39 6.073 5.697 5.117 3.235 -4 ,408 ,TETRA ,17591323,Sat Nov 27 22:35:00 CET,Sun Nov 28 00:26:12 CET,0.0 1.375 1.803 2.122 2.412 2.675 2.902 3.107 3.483 3.662 3.826 3.786 4.292 4.431 4.674 4.912 5.147 5.261 5.467 5.672 5.981 6.169 6.35 6.605 6.84 7.062 7.284 7.509 7.798 8.064 8.325 8.64 8.922 9.189 9.502 9.86 10.225 10.609 10.986 11.399 11.836 12.315 12.851 13.371 13.969 14.589 15.247 15.962 16.731 17.503 18.214 18.447 18.325 18.045 17.664 17.29 16.91 16.513 16.153 15.766 15.421 15.1 14.783 14.474 14.178 13.894 13.591 13.315 13.065 12.807 12.537 12.308 12.053 11.776 11.56 11.347 11.126 10.883 10.622 10.446 10.261 9.947 9.725 9.507 9.396 9.174 8.932 8.64 8.485 7.985 7.991 7.813 7.629 7.224 6.989 6.731 6.417 6.066 5.703 5.203 3.765 -5 ,18905 ,TETRA ,17591324,Sat Nov 27 22:35:02 CET,Sun Nov 28 00:26:00 CET,0.0 1.407 1.929 2.302 2.598 2.854 3.084 3.299 3.708 3.88 4.04 3.991 4.496 4.653 4.915 5.156 5.387 5.506 5.738 5.956 6.257 6.436 6.612 6.868 7.107 7.339 7.568 7.797 8.093 8.364 8.628 8.948 9.243 9.53 9.859 10.206 10.535 10.885 11.268 11.669 12.077 12.532 13.034 13.542 14.134 14.768 15.451 16.162 16.955 17.768 18.455 18.704 18.591 18.345 18.04 17.669 17.294 16.916 16.565 16.189 15.836 15.505 15.171 14.86 14.552 14.263 13.975 13.707 13.475 13.232 12.963 12.735 12.46 12.169 11.961 11.74 11.511 11.283 11.048 10.876 10.689 10.384 10.171 9.956 9.841 9.604 9.355 9.072 8.918 8.41 8.421 8.244 8.06 7.665 7.433 7.176 6.895 6.582 6.208 5.693 4.079 -6 ,27273 ,TETRA ,17591325,Sat Nov 27 22:35:27 CET,Sun Nov 28 00:24:35 CET,0.0 1.158 1.636 2.003 2.308 2.585 2.824 3.042 3.443 3.62 3.782 3.75 4.25 4.391 4.669 4.916 5.134 5.242 5.46 5.67 5.974 6.158 6.328 6.585 6.835 7.067 7.283 7.496 7.764 8.018 8.274 8.567 8.851 9.132 9.448 9.8 10.14 10.51 10.901 11.321 11.755 12.213 12.709 13.201 13.793 14.419 15.079 15.797 16.583 17.41 18.138 18.337 18.185 17.877 17.471 17.065 16.696 16.316 15.969 15.609 15.264 14.927 14.61 14.3 13.988 13.704 13.411 13.146 12.905 12.651 12.387 12.165 11.924 11.669 11.471 11.259 11.033 10.791 10.538 10.353 10.171 9.893 9.699 9.494 9.382 9.147 8.902 8.636 8.489 7.979 7.975 7.791 7.592 7.176 6.958 6.702 6.414 6.097 5.707 5.175 3.512 -7 ,7421 ,TETRA ,17591326,Sat Nov 27 22:35:29 CET,Sun Nov 28 00:24:26 CET,0.0 1.753 2.254 2.611 2.913 3.201 3.441 3.643 4.03 4.219 4.394 4.367 4.876 5.029 5.317 5.578 5.829 5.945 6.161 6.375 6.684 6.873 7.05 7.307 7.554 7.789 8.006 8.225 8.513 8.775 9.027 9.337 9.626 9.907 10.241 10.595 10.918 11.27 11.655 12.053 12.486 12.967 13.479 13.983 14.582 15.217 15.919 16.691 17.456 18.191 18.886 19.153 19.003 18.655 18.26 17.864 17.485 17.077 16.705 16.332 15.991 15.67 15.345 15.023 14.705 14.419 14.135 13.861 13.62 13.363 13.085 12.847 12.593 12.333 12.125 11.899 11.672 11.447 11.202 11.028 10.843 10.552 10.344 10.124 10.016 9.781 9.528 9.259 9.108 8.615 8.648 8.476 8.29 7.846 7.607 7.323 7.019 6.694 6.291 5.729 3.748 -8 ,1827 ,TETRA ,17591327,Sat Nov 27 22:35:30 CET,Sun Nov 28 00:24:45 CET,0.0 1.672 2.176 2.562 2.87 3.142 3.381 3.602 4.012 4.185 4.347 4.313 4.819 4.968 5.246 5.495 5.727 5.839 6.055 6.276 6.586 6.774 6.964 7.232 7.478 7.722 7.955 8.171 8.441 8.694 8.942 9.244 9.545 9.842 10.179 10.536 10.877 11.246 11.631 12.032 12.454 12.942 13.489 14.017 14.611 15.25 15.915 16.607 17.38 18.154 18.85 19.071 18.944 18.63 18.237 17.801 17.371 16.953 16.595 16.197 15.822 15.504 15.193 14.871 14.555 14.263 13.95 13.681 13.442 13.175 12.882 12.647 12.395 12.114 11.909 11.704 11.486 11.259 11.016 10.839 10.643 10.326 10.116 9.895 9.778 9.551 9.313 9.053 8.912 8.417 8.434 8.254 8.072 7.665 7.445 7.204 6.887 6.527 6.125 5.488 3.809 -9 ,25781 ,TETRA ,17591328,Sat Nov 27 22:35:33 CET,Sun Nov 28 00:24:28 CET,0.0 1.501 2.004 2.347 2.621 2.862 3.101 3.326 3.703 3.875 4.049 4.025 4.522 4.655 4.932 5.209 5.461 5.577 5.804 6.017 6.304 6.491 6.673 6.924 7.178 7.421 7.644 7.862 8.14 8.416 8.686 8.991 9.287 9.566 9.878 10.229 10.555 10.916 11.297 11.7 12.121 12.589 13.128 13.636 14.219 14.86 15.544 16.234 16.992 17.821 18.539 18.765 18.612 18.34 18.013 17.632 17.259 16.882 16.505 16.109 15.748 15.418 15.113 14.828 14.558 14.291 13.986 13.705 13.462 13.21 12.929 12.687 12.432 12.164 11.954 11.741 11.527 11.3 11.061 10.889 10.708 10.42 10.228 10.023 9.909 9.682 9.431 9.152 9.008 8.514 8.531 8.357 8.161 7.733 7.494 7.224 6.912 6.558 6.133 5.535 4.109 -10 ,8266 ,TETRA ,17591329,Sat Nov 27 22:35:27 CET,Sun Nov 28 00:24:31 CET,0.0 1.431 1.889 2.217 2.512 2.797 3.059 3.295 3.709 3.899 4.078 4.056 4.552 4.694 4.967 5.206 5.432 5.547 5.762 5.968 6.267 6.458 6.634 6.889 7.144 7.376 7.599 7.822 8.106 8.385 8.646 8.943 9.23 9.508 9.831 10.169 10.474 10.828 11.21 11.61 12.04 12.506 13.02 13.535 14.115 14.742 15.453 16.188 16.96 17.751 18.491 18.792 18.696 18.432 18.088 17.714 17.347 16.981 16.64 16.294 15.969 15.637 15.323 15.019 14.708 14.413 14.08 13.788 13.55 13.293 13.016 12.775 12.522 12.26 12.048 11.835 11.611 11.373 11.125 10.953 10.769 10.452 10.234 10.011 9.892 9.661 9.416 9.139 8.994 8.503 8.529 8.353 8.163 7.722 7.455 7.166 6.843 6.469 6.077 5.535 3.841 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt deleted file mode 100644 index 10753a32..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14972 ,TETRA ,17591330,Sat Nov 27 22:35:30 CET,Sun Nov 28 00:25:37 CET,0.0 1.503 2.011 2.385 2.699 2.949 3.151 3.348 3.736 3.914 4.078 4.033 4.525 4.667 4.922 5.149 5.382 5.494 5.697 5.899 6.188 6.362 6.531 6.78 7.017 7.232 7.429 7.62 7.887 8.146 8.395 8.698 8.97 9.219 9.52 9.865 10.192 10.54 10.897 11.269 11.641 12.051 12.54 13.036 13.587 14.159 14.792 15.439 16.124 16.838 17.389 17.498 17.276 16.902 16.469 16.011 15.594 15.19 14.8 14.378 13.984 13.631 13.313 13.0 12.694 12.411 12.108 11.834 11.588 11.342 11.088 10.863 10.62 10.361 10.144 9.89 9.623 9.362 9.095 8.909 8.72 8.422 8.208 7.978 7.861 7.618 7.352 7.073 6.922 6.416 6.413 6.222 6.025 5.623 5.388 5.111 4.798 4.446 4.08 3.534 1.37 -2 ,25098 ,TETRA ,17591331,Sat Nov 27 22:35:28 CET,Sun Nov 28 00:24:01 CET,0.0 1.253 1.737 2.082 2.351 2.604 2.829 3.031 3.41 3.583 3.746 3.688 4.178 4.325 4.587 4.808 5.023 5.137 5.36 5.564 5.849 6.035 6.207 6.445 6.689 6.927 7.15 7.354 7.618 7.874 8.116 8.404 8.67 8.935 9.238 9.573 9.9 10.245 10.6 10.981 11.382 11.798 12.261 12.733 13.266 13.841 14.474 15.11 15.784 16.467 16.997 17.076 16.828 16.424 15.977 15.505 15.046 14.604 14.182 13.722 13.308 12.942 12.591 12.258 11.958 11.69 11.403 11.152 10.919 10.652 10.362 10.113 9.872 9.617 9.402 9.171 8.926 8.656 8.379 8.199 8.012 7.719 7.513 7.296 7.182 6.938 6.664 6.379 6.24 5.74 5.733 5.544 5.337 4.906 4.675 4.412 4.138 3.794 3.388 2.889 0.95 -3 ,1011 ,TETRA ,17591332,Sat Nov 27 22:35:28 CET,Sun Nov 28 00:27:20 CET,0.0 1.191 1.707 2.102 2.405 2.67 2.898 3.098 3.453 3.613 3.766 3.703 4.192 4.33 4.587 4.826 5.058 5.17 5.382 5.582 5.872 6.056 6.234 6.49 6.734 6.966 7.186 7.386 7.64 7.884 8.121 8.423 8.693 8.944 9.255 9.594 9.911 10.258 10.623 11.004 11.376 11.782 12.261 12.727 13.24 13.775 14.359 14.966 15.578 16.243 16.799 16.719 16.43 16.09 15.698 15.272 14.836 14.399 13.984 13.529 13.129 12.779 12.437 12.108 11.79 11.495 11.184 10.89 10.613 10.315 10.008 9.735 9.462 9.211 9.017 8.8 8.564 8.288 7.995 7.807 7.618 7.321 7.114 6.895 6.769 6.501 6.235 5.943 5.785 5.272 5.254 5.067 4.872 4.403 4.132 3.839 3.547 3.228 2.825 2.289 -0.094 -4 ,15549 ,TETRA ,17591333,Sat Nov 27 22:35:30 CET,Sun Nov 28 00:27:44 CET,0.0 1.271 1.762 2.139 2.456 2.718 2.961 3.171 3.537 3.709 3.875 3.826 4.308 4.439 4.689 4.927 5.146 5.253 5.462 5.666 5.965 6.143 6.306 6.546 6.775 6.997 7.206 7.412 7.693 7.959 8.212 8.503 8.773 9.032 9.316 9.62 9.911 10.246 10.605 10.987 11.391 11.813 12.291 12.757 13.264 13.801 14.365 14.953 15.605 16.262 16.795 16.842 16.595 16.257 15.837 15.367 14.894 14.425 14.025 13.619 13.257 12.913 12.578 12.238 11.915 11.636 11.339 11.051 10.785 10.504 10.217 9.981 9.719 9.444 9.231 9.001 8.77 8.528 8.263 8.072 7.874 7.559 7.337 7.113 6.991 6.722 6.451 6.174 6.023 5.5 5.472 5.28 5.073 4.556 4.274 3.999 3.676 3.296 2.866 2.301 0.204 -5 ,15974 ,TETRA ,17591334,Sat Nov 27 22:35:32 CET,Sun Nov 28 00:24:26 CET,0.0 1.3 2.027 2.526 2.851 3.118 3.343 3.561 3.983 4.161 4.321 4.276 4.757 4.883 5.137 5.381 5.605 5.709 5.909 6.104 6.374 6.551 6.726 6.969 7.195 7.417 7.633 7.838 8.093 8.328 8.557 8.847 9.129 9.389 9.669 9.985 10.298 10.638 11.008 11.391 11.783 12.201 12.686 13.169 13.693 14.265 14.943 15.66 16.355 17.005 17.515 17.561 17.302 16.876 16.404 15.93 15.473 15.058 14.674 14.239 13.855 13.512 13.171 12.848 12.544 12.243 11.925 11.646 11.4 11.137 10.855 10.618 10.368 10.1 9.881 9.652 9.428 9.196 8.929 8.741 8.552 8.25 8.041 7.816 7.705 7.476 7.204 6.902 6.751 6.253 6.253 6.066 5.879 5.463 5.198 4.883 4.553 4.173 3.719 3.126 1.193 -6 ,25891 ,TETRA ,17591335,Sat Nov 27 22:35:33 CET,Sun Nov 28 00:24:13 CET,0.0 1.097 1.517 1.879 2.187 2.445 2.677 2.898 3.284 3.455 3.623 3.577 4.071 4.208 4.459 4.699 4.925 5.031 5.237 5.429 5.707 5.89 6.066 6.315 6.559 6.792 7.012 7.236 7.508 7.754 7.998 8.279 8.554 8.824 9.119 9.452 9.765 10.102 10.46 10.81 11.187 11.64 12.134 12.607 13.144 13.726 14.367 14.982 15.626 16.284 16.776 16.804 16.549 16.135 15.69 15.276 14.851 14.412 14.022 13.609 13.217 12.854 12.507 12.174 11.867 11.577 11.268 11.009 10.769 10.493 10.197 9.961 9.716 9.437 9.218 8.994 8.768 8.514 8.232 8.038 7.838 7.548 7.342 7.1 6.977 6.735 6.479 6.208 6.064 5.563 5.561 5.357 5.144 4.681 4.436 4.173 3.877 3.519 3.074 2.493 0.643 -7 ,28267 ,TETRA ,17591336,Sat Nov 27 22:35:29 CET,Sun Nov 28 00:24:12 CET,0.0 1.315 1.779 2.139 2.451 2.718 2.937 3.144 3.541 3.699 3.841 3.764 4.256 4.396 4.654 4.889 5.098 5.196 5.396 5.597 5.874 6.047 6.214 6.449 6.678 6.895 7.115 7.327 7.574 7.815 8.048 8.317 8.562 8.802 9.088 9.417 9.727 10.057 10.398 10.736 11.114 11.555 12.042 12.515 13.042 13.615 14.228 14.864 15.565 16.268 16.823 16.843 16.561 16.15 15.676 15.22 14.777 14.306 13.871 13.434 13.055 12.706 12.363 12.016 11.702 11.419 11.115 10.847 10.592 10.307 10.023 9.789 9.545 9.273 9.046 8.814 8.579 8.329 8.059 7.873 7.684 7.391 7.187 6.98 6.866 6.602 6.334 6.042 5.888 5.379 5.367 5.184 4.992 4.554 4.299 4.007 3.683 3.34 2.933 2.404 0.297 -8 ,28979 ,TETRA ,17591337,Sat Nov 27 22:35:30 CET,Sun Nov 28 00:24:14 CET,0.0 1.6 2.152 2.527 2.83 3.111 3.349 3.573 3.974 4.142 4.301 4.257 4.746 4.873 5.118 5.349 5.57 5.674 5.868 6.068 6.352 6.527 6.696 6.941 7.182 7.408 7.619 7.827 8.088 8.32 8.552 8.837 9.103 9.362 9.668 10.005 10.319 10.672 11.041 11.419 11.816 12.252 12.733 13.209 13.753 14.318 14.937 15.599 16.276 16.912 17.414 17.438 17.129 16.756 16.358 15.911 15.437 14.974 14.581 14.179 13.816 13.468 13.131 12.813 12.515 12.231 11.909 11.619 11.375 11.125 10.841 10.589 10.331 10.053 9.847 9.63 9.38 9.125 8.859 8.673 8.475 8.169 7.956 7.723 7.606 7.376 7.123 6.833 6.684 6.186 6.182 5.983 5.775 5.32 5.081 4.831 4.552 4.23 3.845 3.249 0.701 -9 ,23030 ,TETRA ,17591338,Sat Nov 27 22:35:33 CET,Sun Nov 28 00:24:20 CET,0.0 1.227 1.658 2.02 2.307 2.551 2.782 2.995 3.374 3.55 3.717 3.665 4.159 4.293 4.537 4.78 5.012 5.124 5.349 5.555 5.83 6.007 6.183 6.431 6.671 6.892 7.1 7.309 7.584 7.847 8.096 8.404 8.685 8.941 9.24 9.568 9.868 10.198 10.563 10.954 11.343 11.748 12.222 12.69 13.233 13.807 14.411 15.027 15.646 16.284 16.808 16.853 16.553 16.123 15.671 15.206 14.755 14.3 13.884 13.438 13.044 12.7 12.357 12.009 11.688 11.401 11.085 10.813 10.558 10.283 10.0 9.737 9.448 9.167 8.961 8.737 8.499 8.252 7.995 7.822 7.645 7.355 7.142 6.921 6.8 6.546 6.291 6.002 5.841 5.318 5.302 5.116 4.913 4.483 4.238 3.968 3.688 3.363 2.913 2.256 0.17 -10 ,30955 ,TETRA ,17591339,Sat Nov 27 22:35:29 CET,Sun Nov 28 00:24:06 CET,0.0 1.317 1.793 2.152 2.465 2.744 2.985 3.206 3.582 3.74 3.892 3.84 4.335 4.468 4.731 4.976 5.196 5.302 5.517 5.727 6.014 6.189 6.356 6.604 6.846 7.078 7.298 7.513 7.787 8.048 8.302 8.609 8.882 9.137 9.44 9.783 10.115 10.46 10.824 11.193 11.553 11.958 12.463 12.977 13.53 14.088 14.696 15.3 15.93 16.575 17.064 17.121 16.85 16.465 16.022 15.562 15.156 14.751 14.355 13.925 13.55 13.217 12.869 12.521 12.19 11.885 11.574 11.29 11.039 10.781 10.489 10.232 9.975 9.703 9.489 9.272 9.052 8.82 8.549 8.355 8.16 7.862 7.647 7.412 7.288 7.047 6.814 6.555 6.411 5.908 5.911 5.714 5.512 5.108 4.867 4.592 4.296 3.951 3.494 2.852 0.579 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18636-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18636-1.txt deleted file mode 100644 index 033e92de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18636-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30499 ,KEBNE ,17026846,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:10:03 CET,0.0 1.622 2.16 2.596 2.991 3.316 3.597 3.842 4.272 4.477 4.66 4.654 5.172 5.326 5.605 5.861 6.104 6.227 6.478 6.709 7.033 7.237 7.431 7.708 7.969 8.223 8.457 8.679 8.973 9.25 9.513 9.829 10.126 10.411 10.741 11.113 11.464 11.845 12.252 12.693 13.15 13.646 14.223 14.776 15.353 15.973 16.69 17.425 18.187 19.005 19.8 20.045 19.861 19.537 19.168 18.797 18.435 18.057 17.698 17.318 16.99 16.714 16.433 16.138 15.847 15.574 15.285 15.026 14.8 14.56 14.319 14.106 13.863 13.62 13.445 13.256 13.059 12.848 12.62 12.458 12.289 12.038 11.867 11.689 11.593 11.393 11.182 10.948 10.831 10.363 10.417 10.253 10.095 9.784 9.608 9.405 9.178 8.93 8.635 8.251 6.95 -2 ,18657 ,KEBNE ,17026847,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:10:21 CET,0.0 1.887 2.38 2.751 3.069 3.346 3.599 3.837 4.262 4.458 4.654 4.646 5.157 5.308 5.583 5.83 6.069 6.189 6.416 6.638 6.948 7.135 7.312 7.584 7.86 8.131 8.381 8.612 8.918 9.209 9.484 9.811 10.108 10.4 10.741 11.09 11.423 11.814 12.219 12.612 13.029 13.507 14.047 14.585 15.196 15.841 16.542 17.283 18.086 18.862 19.478 19.649 19.501 19.206 18.821 18.399 18.018 17.653 17.287 16.897 16.573 16.28 15.976 15.681 15.401 15.137 14.852 14.596 14.383 14.151 13.886 13.665 13.453 13.239 13.07 12.891 12.703 12.508 12.294 12.141 11.977 11.692 11.489 11.302 11.213 11.026 10.824 10.591 10.469 9.997 10.055 9.887 9.72 9.384 9.188 8.975 8.734 8.492 8.198 7.777 6.541 -3 ,7661 ,KEBNE ,17026848,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:10:13 CET,0.0 2.248 2.779 3.138 3.472 3.75 3.985 4.216 4.63 4.813 4.987 4.953 5.474 5.635 5.943 6.226 6.481 6.602 6.82 7.042 7.374 7.575 7.768 8.053 8.325 8.573 8.825 9.076 9.37 9.647 9.907 10.212 10.509 10.79 11.113 11.48 11.812 12.167 12.546 12.944 13.377 13.865 14.407 14.919 15.505 16.133 16.835 17.57 18.341 19.122 19.819 20.016 19.87 19.587 19.212 18.775 18.35 17.989 17.668 17.303 16.959 16.655 16.352 16.04 15.755 15.499 15.219 14.964 14.747 14.512 14.265 14.059 13.826 13.585 13.399 13.203 13.008 12.793 12.562 12.406 12.249 12.008 11.836 11.638 11.538 11.334 11.096 10.839 10.713 10.243 10.322 10.174 10.012 9.644 9.45 9.252 9.03 8.79 8.524 8.137 7.028 -4 ,17328 ,KEBNE ,17026849,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:10:17 CET,0.0 2.179 2.975 3.451 3.789 4.068 4.302 4.516 4.923 5.125 5.32 5.308 5.825 5.987 6.26 6.505 6.753 6.873 7.083 7.292 7.607 7.815 8.013 8.291 8.552 8.797 9.041 9.27 9.549 9.815 10.079 10.406 10.715 11.007 11.341 11.699 12.023 12.387 12.79 13.212 13.666 14.159 14.712 15.246 15.845 16.461 17.142 17.892 18.613 19.342 20.038 20.275 20.117 19.754 19.349 18.968 18.598 18.211 17.845 17.469 17.156 16.87 16.578 16.301 16.039 15.769 15.478 15.227 15.008 14.778 14.533 14.319 14.082 13.847 13.676 13.484 13.274 13.069 12.858 12.702 12.539 12.289 12.108 11.918 11.819 11.624 11.416 11.182 11.058 10.585 10.675 10.535 10.394 10.054 9.837 9.611 9.385 9.116 8.774 8.385 6.896 -5 ,8897 ,KEBNE ,17026850,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:09:50 CET,0.0 1.081 1.61 2.042 2.386 2.685 2.952 3.188 3.604 3.792 3.965 3.946 4.458 4.615 4.925 5.216 5.483 5.612 5.868 6.088 6.391 6.59 6.778 7.063 7.333 7.574 7.816 8.058 8.346 8.625 8.898 9.203 9.493 9.772 10.093 10.457 10.803 11.17 11.576 12.004 12.425 12.914 13.457 13.951 14.548 15.203 15.903 16.632 17.383 18.141 18.839 19.038 18.9 18.613 18.252 17.831 17.392 17.015 16.691 16.324 15.977 15.646 15.319 15.014 14.729 14.455 14.174 13.926 13.702 13.454 13.191 12.983 12.784 12.571 12.39 12.196 11.99 11.779 11.557 11.408 11.258 11.014 10.839 10.659 10.566 10.371 10.146 9.899 9.774 9.304 9.405 9.258 9.093 8.765 8.596 8.406 8.189 7.93 7.612 7.167 6.258 -6 ,19926 ,KEBNE ,17026851,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:10:03 CET,0.0 1.755 2.386 2.845 3.188 3.474 3.737 3.995 4.437 4.64 4.824 4.799 5.308 5.458 5.733 5.994 6.247 6.373 6.608 6.821 7.117 7.306 7.494 7.769 8.047 8.314 8.555 8.795 9.103 9.392 9.669 10.007 10.306 10.581 10.916 11.304 11.666 12.041 12.439 12.859 13.306 13.799 14.352 14.877 15.467 16.101 16.743 17.447 18.204 18.892 19.568 19.826 19.686 19.393 19.054 18.709 18.363 17.98 17.617 17.266 16.946 16.625 16.309 16.013 15.725 15.461 15.182 14.926 14.695 14.446 14.19 13.98 13.766 13.542 13.36 13.164 12.965 12.765 12.556 12.41 12.255 12.003 11.816 11.611 11.504 11.293 11.078 10.86 10.749 10.279 10.361 10.216 10.058 9.701 9.496 9.265 8.993 8.702 8.367 7.95 6.171 -7 ,28989 ,KEBNE ,17026852,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:11:28 CET,0.0 1.879 2.349 2.717 3.041 3.348 3.65 3.917 4.344 4.534 4.722 4.724 5.231 5.375 5.665 5.951 6.205 6.318 6.544 6.76 7.068 7.264 7.459 7.733 7.993 8.25 8.48 8.701 8.994 9.272 9.543 9.885 10.211 10.504 10.838 11.223 11.572 11.932 12.315 12.707 13.123 13.618 14.182 14.733 15.35 15.976 16.652 17.367 18.125 18.88 19.484 19.649 19.481 19.19 18.831 18.427 18.018 17.621 17.286 16.934 16.584 16.252 15.948 15.647 15.348 15.082 14.799 14.542 14.311 14.062 13.804 13.595 13.375 13.144 12.975 12.804 12.609 12.404 12.19 12.033 11.872 11.618 11.433 11.247 11.15 10.936 10.714 10.481 10.357 9.885 9.975 9.834 9.689 9.388 9.207 9.004 8.79 8.522 8.158 7.571 6.448 -8 ,9309 ,KEBNE ,17026853,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:09:52 CET,0.0 1.722 2.296 2.713 3.071 3.375 3.637 3.877 4.29 4.471 4.655 4.652 5.159 5.318 5.603 5.867 6.123 6.248 6.497 6.735 7.061 7.258 7.463 7.777 8.05 8.299 8.538 8.764 9.057 9.345 9.619 9.935 10.238 10.535 10.874 11.231 11.581 11.996 12.43 12.87 13.333 13.849 14.46 15.044 15.65 16.297 17.01 17.748 18.574 19.392 20.036 20.242 20.103 19.815 19.467 19.076 18.689 18.307 17.928 17.543 17.205 16.882 16.578 16.292 16.019 15.756 15.472 15.2 14.966 14.726 14.471 14.259 14.049 13.828 13.648 13.454 13.244 13.032 12.803 12.635 12.465 12.206 12.027 11.84 11.738 11.515 11.299 11.073 10.948 10.477 10.551 10.412 10.26 9.884 9.684 9.47 9.238 8.982 8.686 8.251 6.996 -9 ,2096 ,KEBNE ,17026854,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:10:02 CET,0.0 0.905 1.336 1.709 2.011 2.271 2.515 2.751 3.179 3.365 3.53 3.478 3.977 4.119 4.388 4.653 4.892 5.004 5.233 5.457 5.778 5.978 6.171 6.438 6.688 6.942 7.187 7.421 7.723 8.015 8.282 8.592 8.886 9.19 9.544 9.922 10.295 10.699 11.103 11.533 11.983 12.445 12.967 13.487 14.07 14.721 15.472 16.245 17.042 17.892 18.642 18.791 18.625 18.33 18.014 17.678 17.282 16.9 16.538 16.154 15.834 15.538 15.239 14.931 14.64 14.388 14.109 13.839 13.609 13.378 13.131 12.927 12.705 12.465 12.282 12.093 11.895 11.666 11.425 11.273 11.113 10.844 10.661 10.483 10.391 10.191 9.973 9.751 9.641 9.173 9.25 9.1 8.946 8.613 8.415 8.201 7.953 7.651 7.306 6.806 5.122 -10 ,19299 ,KEBNE ,17026855,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:11:35 CET,0.0 1.308 1.778 2.172 2.47 2.754 3.018 3.237 3.642 3.849 4.043 4.044 4.555 4.706 5.004 5.301 5.58 5.705 5.936 6.154 6.457 6.647 6.838 7.12 7.377 7.604 7.823 8.052 8.349 8.627 8.897 9.216 9.518 9.799 10.114 10.471 10.814 11.184 11.589 12.015 12.453 12.95 13.503 14.027 14.63 15.279 15.978 16.746 17.557 18.374 19.034 19.251 19.136 18.822 18.448 18.054 17.667 17.293 16.946 16.592 16.264 15.936 15.611 15.296 14.999 14.737 14.455 14.187 13.968 13.741 13.478 13.263 13.052 12.827 12.638 12.44 12.245 12.052 11.845 11.697 11.534 11.278 11.103 10.912 10.813 10.605 10.374 10.147 10.03 9.546 9.602 9.457 9.303 8.945 8.732 8.501 8.258 7.977 7.633 7.18 5.147 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index 6163e297..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22693 ,TETRA ,17591340,Sat Nov 27 22:35:29 CET,Sun Nov 28 00:25:31 CET,0.0 1.349 1.779 2.144 2.467 2.732 2.945 3.145 3.515 3.689 3.854 3.8 4.284 4.424 4.692 4.931 5.159 5.272 5.492 5.691 5.969 6.151 6.325 6.577 6.813 7.035 7.252 7.463 7.738 7.992 8.223 8.506 8.776 9.03 9.335 9.678 9.987 10.302 10.635 11.005 11.394 11.818 12.315 12.792 13.298 13.838 14.401 14.996 15.61 16.103 16.372 16.083 15.568 15.014 14.466 13.878 13.303 12.769 12.247 11.708 11.244 10.818 10.406 10.023 9.659 9.31 8.938 8.597 8.293 7.964 7.628 7.342 7.031 6.721 6.483 6.226 5.968 5.71 5.421 5.213 5.007 4.659 4.398 4.126 3.993 3.705 3.388 3.064 2.896 2.365 2.305 2.093 1.855 1.336 1.069 0.757 0.41 0.018 -0.442 -1.118 -3.751 -2 ,29853 ,TETRA ,17591341,Sat Nov 27 22:35:30 CET,Sun Nov 28 00:25:31 CET,0.0 2.139 2.733 3.083 3.375 3.647 3.889 4.1 4.483 4.671 4.847 4.805 5.28 5.41 5.66 5.892 6.1 6.207 6.432 6.645 6.94 7.126 7.307 7.562 7.805 8.041 8.262 8.468 8.739 9.008 9.244 9.512 9.777 10.04 10.348 10.685 11.011 11.356 11.717 12.092 12.454 12.849 13.343 13.817 14.29 14.78 15.33 15.92 16.555 17.126 17.421 17.144 16.633 16.038 15.385 14.759 14.188 13.639 13.147 12.648 12.218 11.815 11.408 11.022 10.635 10.265 9.893 9.565 9.255 8.936 8.611 8.323 8.036 7.743 7.497 7.25 6.994 6.7 6.394 6.186 5.97 5.625 5.386 5.109 4.959 4.668 4.368 4.066 3.908 3.391 3.324 3.101 2.883 2.408 2.125 1.805 1.468 1.073 0.573 -0.07 -2.523 -3 ,23623 ,TETRA ,17591342,Sat Nov 27 22:35:33 CET,Sun Nov 28 00:25:28 CET,0.0 1.291 1.78 2.103 2.413 2.741 3.005 3.208 3.57 3.746 3.92 3.877 4.363 4.499 4.752 5.003 5.242 5.35 5.556 5.763 6.067 6.249 6.415 6.664 6.911 7.147 7.373 7.586 7.847 8.104 8.352 8.629 8.9 9.173 9.477 9.806 10.108 10.437 10.812 11.194 11.573 11.998 12.483 12.945 13.454 14.001 14.593 15.181 15.75 16.269 16.625 16.457 16.024 15.512 14.949 14.408 13.881 13.358 12.876 12.387 11.981 11.62 11.23 10.815 10.418 10.068 9.703 9.362 9.071 8.773 8.453 8.175 7.886 7.595 7.358 7.095 6.812 6.521 6.211 5.99 5.771 5.419 5.167 4.92 4.796 4.53 4.244 3.913 3.729 3.203 3.175 2.975 2.751 2.245 2.004 1.719 1.36 0.939 0.411 -0.285 -2.858 -4 ,17611 ,TETRA ,17591343,Sat Nov 27 22:35:35 CET,Sun Nov 28 00:24:34 CET,0.0 1.123 1.682 2.088 2.402 2.657 2.891 3.105 3.509 3.701 3.863 3.82 4.3 4.425 4.685 4.931 5.161 5.268 5.466 5.667 5.966 6.145 6.313 6.567 6.804 7.039 7.264 7.465 7.718 7.977 8.224 8.518 8.813 9.077 9.373 9.712 10.038 10.381 10.735 11.107 11.487 11.921 12.414 12.878 13.403 13.991 14.619 15.24 15.872 16.441 16.783 16.598 16.17 15.613 15.059 14.48 13.879 13.359 12.941 12.456 11.988 11.554 11.112 10.7 10.322 9.961 9.589 9.247 8.955 8.657 8.319 8.039 7.744 7.434 7.204 6.967 6.703 6.428 6.149 5.934 5.702 5.339 5.079 4.814 4.686 4.436 4.121 3.787 3.616 3.098 3.082 2.866 2.632 2.124 1.846 1.559 1.238 0.837 0.314 -0.418 -3.157 -5 ,14516 ,TETRA ,17591344,Sat Nov 27 22:36:26 CET,Sun Nov 28 00:24:08 CET,0.0 2.408 3.021 3.384 3.697 3.958 4.188 4.397 4.776 4.952 5.122 5.079 5.564 5.701 5.952 6.193 6.431 6.543 6.74 6.931 7.208 7.379 7.544 7.786 8.017 8.244 8.464 8.675 8.951 9.21 9.459 9.759 10.032 10.281 10.559 10.877 11.184 11.514 11.883 12.276 12.635 13.046 13.551 14.023 14.526 15.047 15.63 16.237 16.863 17.401 17.643 17.4 16.896 16.287 15.669 15.069 14.513 13.972 13.471 12.959 12.498 12.077 11.681 11.289 10.883 10.498 10.109 9.759 9.455 9.147 8.828 8.553 8.262 7.954 7.699 7.421 7.131 6.846 6.547 6.339 6.116 5.76 5.529 5.285 5.149 4.865 4.563 4.238 4.075 3.565 3.565 3.368 3.144 2.636 2.355 2.055 1.687 1.255 0.816 0.194 -2.206 -6 ,17700 ,TETRA ,17591345,Sat Nov 27 22:36:28 CET,Sun Nov 28 00:24:38 CET,0.0 1.473 1.97 2.327 2.647 2.922 3.169 3.379 3.743 3.924 4.103 4.089 4.59 4.737 4.997 5.244 5.469 5.581 5.789 5.975 6.246 6.422 6.608 6.87 7.106 7.343 7.571 7.782 8.053 8.3 8.531 8.821 9.102 9.378 9.673 9.98 10.298 10.652 11.02 11.408 11.802 12.211 12.689 13.153 13.665 14.207 14.787 15.389 16.004 16.534 16.846 16.651 16.176 15.599 14.999 14.403 13.847 13.334 12.861 12.355 11.904 11.487 11.077 10.67 10.284 9.928 9.55 9.214 8.914 8.59 8.245 7.946 7.636 7.335 7.079 6.811 6.541 6.249 5.966 5.773 5.558 5.224 4.991 4.735 4.604 4.336 4.047 3.737 3.568 3.016 2.892 2.67 2.452 1.951 1.647 1.31 0.938 0.47 -0.092 -0.753 -3.508 -7 ,539 ,TETRA ,17591346,Sat Nov 27 22:36:30 CET,Sun Nov 28 00:24:22 CET,0.0 1.407 1.878 2.254 2.563 2.813 3.022 3.23 3.597 3.759 3.916 3.863 4.358 4.507 4.778 5.041 5.281 5.392 5.602 5.803 6.114 6.304 6.48 6.735 6.982 7.224 7.436 7.633 7.896 8.155 8.396 8.687 8.955 9.209 9.519 9.857 10.168 10.523 10.885 11.256 11.646 12.059 12.531 12.979 13.461 13.977 14.595 15.219 15.806 16.361 16.685 16.414 15.87 15.259 14.643 14.04 13.48 12.948 12.472 11.946 11.455 11.009 10.584 10.194 9.839 9.511 9.13 8.739 8.394 8.041 7.678 7.389 7.096 6.791 6.54 6.271 5.999 5.71 5.4 5.188 4.978 4.628 4.378 4.12 3.98 3.702 3.391 3.033 2.856 2.335 2.315 2.122 1.916 1.43 1.158 0.867 0.513 0.097 -0.365 -1.062 -3.427 -8 ,5888 ,TETRA ,17591347,Sat Nov 27 22:36:31 CET,Sun Nov 28 00:23:53 CET,0.0 2.095 2.638 2.995 3.283 3.514 3.711 3.915 4.301 4.477 4.645 4.613 5.105 5.243 5.51 5.747 5.957 6.067 6.285 6.49 6.779 6.955 7.121 7.373 7.617 7.838 8.044 8.251 8.522 8.782 9.02 9.299 9.577 9.844 10.14 10.472 10.797 11.145 11.503 11.864 12.232 12.632 13.088 13.545 14.035 14.562 15.157 15.715 16.298 16.829 17.069 16.815 16.248 15.617 14.984 14.353 13.761 13.198 12.716 12.223 11.76 11.342 10.937 10.542 10.176 9.847 9.485 9.141 8.858 8.573 8.246 7.961 7.665 7.346 7.105 6.845 6.573 6.313 6.029 5.821 5.605 5.244 4.987 4.736 4.6 4.296 4.002 3.692 3.518 2.989 2.942 2.73 2.504 2.021 1.747 1.433 1.081 0.654 0.174 -0.446 -2.139 -9 ,11177 ,TETRA ,17591348,Sat Nov 27 22:37:26 CET,Sun Nov 28 00:26:41 CET,0.0 1.3 1.742 2.089 2.372 2.6 2.801 3.009 3.393 3.568 3.737 3.702 4.19 4.331 4.601 4.854 5.094 5.205 5.42 5.627 5.928 6.128 6.309 6.562 6.797 7.023 7.238 7.437 7.705 7.963 8.212 8.519 8.787 9.045 9.359 9.702 10.01 10.337 10.683 11.04 11.422 11.857 12.345 12.803 13.328 13.89 14.484 15.06 15.639 16.189 16.593 16.552 16.172 15.626 15.056 14.476 13.926 13.404 12.914 12.404 11.947 11.534 11.123 10.716 10.336 9.97 9.583 9.255 8.951 8.61 8.251 7.96 7.658 7.344 7.104 6.846 6.569 6.287 5.99 5.788 5.574 5.216 4.976 4.722 4.583 4.273 3.95 3.621 3.455 2.935 2.896 2.695 2.471 2.008 1.752 1.431 1.071 0.7 0.211 -0.44 -2.881 -10 ,27413 ,TETRA ,17591349,Sat Nov 27 22:36:26 CET,Sun Nov 28 00:23:51 CET,0.0 1.548 2.032 2.364 2.636 2.89 3.116 3.347 3.746 3.913 4.077 4.031 4.504 4.635 4.9 5.148 5.387 5.501 5.708 5.92 6.22 6.398 6.57 6.825 7.069 7.3 7.528 7.742 8.009 8.255 8.494 8.799 9.085 9.343 9.645 9.981 10.296 10.653 11.039 11.429 11.83 12.264 12.747 13.207 13.709 14.237 14.826 15.451 16.105 16.716 17.13 16.999 16.523 15.988 15.455 14.892 14.351 13.821 13.341 12.823 12.361 11.937 11.526 11.131 10.744 10.412 10.066 9.719 9.421 9.108 8.769 8.517 8.253 7.944 7.701 7.468 7.227 6.953 6.655 6.458 6.255 5.9 5.656 5.401 5.268 4.999 4.698 4.373 4.202 3.675 3.606 3.384 3.151 2.673 2.392 2.061 1.702 1.307 0.853 0.199 -2.443 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index d928e10f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27710 ,TETRA ,17591350,Sat Nov 27 22:36:29 CET,Sun Nov 28 00:28:39 CET,0.0 1.517 2.252 2.891 3.386 3.816 4.187 4.527 5.143 5.428 5.702 5.794 6.496 6.739 7.226 7.688 8.132 8.348 8.755 9.155 9.763 10.156 10.536 11.092 11.622 12.13 12.635 13.123 13.756 14.375 14.964 15.723 16.484 17.192 18.012 18.948 19.829 20.788 21.883 23.075 24.323 25.777 27.519 29.301 31.386 33.708 36.485 39.748 43.658 48.361 54.356 59.579 62.683 64.633 65.96 66.921 67.593 68.067 68.364 68.56 68.665 68.716 68.707 68.642 68.555 68.455 68.335 68.207 68.067 67.906 67.736 67.574 67.384 67.173 67.005 66.821 66.631 66.433 66.208 66.038 65.853 65.552 65.331 65.102 64.978 64.705 64.416 64.101 63.928 63.375 63.328 63.106 62.884 62.402 62.112 61.764 61.36 60.89 60.321 59.576 57.58 -2 ,7946 ,TETRA ,17591351,Sat Nov 27 22:36:27 CET,Sun Nov 28 00:27:33 CET,0.0 1.629 2.331 2.865 3.323 3.749 4.139 4.504 5.166 5.463 5.752 5.863 6.561 6.812 7.295 7.766 8.233 8.455 8.876 9.293 9.895 10.279 10.651 11.189 11.71 12.224 12.719 13.204 13.835 14.437 15.026 15.756 16.455 17.14 17.956 18.872 19.775 20.778 21.869 23.045 24.304 25.738 27.432 29.154 31.182 33.532 36.37 39.625 43.426 48.168 54.253 59.467 62.665 64.775 66.188 67.166 67.851 68.317 68.598 68.803 68.904 68.94 68.954 68.933 68.86 68.776 68.676 68.559 68.416 68.233 68.029 67.866 67.689 67.488 67.324 67.148 66.953 66.731 66.494 66.329 66.151 65.866 65.65 65.42 65.298 65.017 64.692 64.338 64.16 63.6 63.558 63.337 63.109 62.604 62.291 61.939 61.568 61.112 60.501 59.659 57.632 -3 ,19163 ,TETRA ,17591352,Sat Nov 27 22:36:27 CET,Sun Nov 28 00:29:13 CET,0.0 1.341 2.02 2.559 3.023 3.422 3.796 4.15 4.808 5.111 5.391 5.472 6.171 6.417 6.882 7.345 7.804 8.026 8.447 8.846 9.44 9.829 10.195 10.736 11.279 11.799 12.298 12.786 13.422 14.047 14.644 15.371 16.098 16.807 17.627 18.534 19.425 20.414 21.481 22.64 23.889 25.333 27.04 28.774 30.845 33.236 36.059 39.286 43.146 47.888 53.994 59.24 62.381 64.419 65.81 66.8 67.472 67.919 68.207 68.407 68.488 68.521 68.546 68.521 68.446 68.364 68.261 68.137 68.004 67.853 67.68 67.519 67.353 67.167 66.999 66.821 66.634 66.419 66.194 66.035 65.859 65.563 65.324 65.039 64.884 64.555 64.202 63.872 63.704 63.149 63.107 62.881 62.649 62.127 61.83 61.492 61.101 60.654 60.118 59.386 57.803 -4 ,8788 ,TETRA ,17591353,Sat Nov 27 22:36:29 CET,Sun Nov 28 00:29:06 CET,0.0 1.426 2.072 2.613 3.074 3.491 3.881 4.239 4.91 5.212 5.486 5.581 6.28 6.533 7.01 7.465 7.919 8.141 8.56 8.967 9.574 9.965 10.34 10.882 11.408 11.929 12.43 12.911 13.525 14.117 14.709 15.46 16.204 16.905 17.716 18.638 19.538 20.535 21.616 22.784 24.037 25.497 27.22 28.957 31.009 33.381 36.235 39.54 43.508 48.257 54.241 59.476 62.685 64.794 66.204 67.138 67.735 68.159 68.41 68.587 68.68 68.708 68.715 68.688 68.613 68.517 68.377 68.222 68.085 67.9 67.682 67.515 67.337 67.133 66.96 66.765 66.557 66.337 66.101 65.94 65.757 65.431 65.195 64.948 64.825 64.576 64.298 63.979 63.804 63.246 63.171 62.917 62.666 62.134 61.827 61.474 61.072 60.641 60.116 59.363 57.06 -5 ,31181 ,TETRA ,17591354,Sat Nov 27 22:36:31 CET,Sun Nov 28 00:29:16 CET,0.0 1.503 2.142 2.667 3.126 3.536 3.91 4.277 4.938 5.245 5.538 5.636 6.338 6.596 7.104 7.588 8.031 8.249 8.679 9.081 9.662 10.039 10.403 10.929 11.443 11.947 12.438 12.917 13.546 14.157 14.748 15.467 16.184 16.885 17.697 18.625 19.515 20.511 21.62 22.805 24.044 25.473 27.192 28.944 31.011 33.339 36.096 39.322 43.194 47.965 53.958 59.094 62.244 64.313 65.696 66.673 67.34 67.777 68.055 68.263 68.388 68.442 68.443 68.403 68.352 68.28 68.147 68.003 67.885 67.747 67.573 67.432 67.261 67.047 66.872 66.684 66.483 66.274 66.046 65.875 65.7 65.406 65.18 64.942 64.817 64.569 64.293 63.974 63.806 63.258 63.214 62.987 62.761 62.255 61.963 61.633 61.242 60.782 60.207 59.408 56.925 -6 ,8933 ,TETRA ,17591355,Sat Nov 27 22:36:32 CET,Sun Nov 28 00:29:08 CET,0.0 1.387 2.101 2.671 3.201 3.673 4.073 4.435 5.112 5.425 5.716 5.822 6.529 6.775 7.244 7.704 8.141 8.358 8.776 9.172 9.765 10.153 10.528 11.077 11.604 12.119 12.623 13.104 13.731 14.355 14.959 15.675 16.358 17.038 17.848 18.772 19.679 20.686 21.778 22.966 24.236 25.686 27.4 29.098 31.13 33.485 36.241 39.471 43.401 48.234 54.265 59.379 62.512 64.611 66.027 67.035 67.697 68.124 68.419 68.623 68.717 68.759 68.773 68.738 68.663 68.584 68.488 68.368 68.234 68.067 67.883 67.733 67.55 67.338 67.179 67.016 66.828 66.611 66.376 66.205 66.026 65.737 65.521 65.266 65.135 64.884 64.601 64.297 64.139 63.592 63.54 63.314 63.087 62.545 62.222 61.873 61.484 61.022 60.462 59.615 57.608 -7 ,11445 ,TETRA ,17591356,Sat Nov 27 22:37:27 CET,Sun Nov 28 00:30:00 CET,0.0 1.323 1.969 2.483 2.93 3.343 3.721 4.071 4.724 5.026 5.311 5.424 6.127 6.384 6.88 7.34 7.775 7.992 8.418 8.821 9.409 9.786 10.159 10.706 11.221 11.725 12.23 12.726 13.362 13.984 14.603 15.346 16.049 16.727 17.542 18.48 19.389 20.389 21.487 22.708 23.995 25.447 27.174 28.935 31.05 33.458 36.259 39.493 43.432 48.303 54.428 59.635 62.798 64.845 66.2 67.139 67.754 68.168 68.424 68.617 68.745 68.807 68.816 68.769 68.677 68.573 68.444 68.318 68.207 68.068 67.895 67.734 67.564 67.38 67.23 67.071 66.886 66.656 66.389 66.214 66.034 65.728 65.518 65.291 65.167 64.89 64.58 64.257 64.084 63.526 63.437 63.175 62.918 62.368 62.043 61.701 61.342 60.901 60.336 59.592 57.605 -8 ,9945 ,TETRA ,17591357,Sat Nov 27 22:37:28 CET,Sun Nov 28 00:29:08 CET,0.0 1.977 2.674 3.235 3.702 4.118 4.489 4.85 5.532 5.838 6.126 6.213 6.907 7.152 7.616 8.083 8.552 8.777 9.198 9.611 10.223 10.601 10.971 11.518 12.04 12.553 13.054 13.531 14.149 14.765 15.371 16.101 16.814 17.517 18.352 19.293 20.193 21.195 22.293 23.477 24.712 26.112 27.771 29.48 31.531 33.893 36.716 39.971 43.886 48.692 54.758 59.929 63.004 65.012 66.401 67.415 68.085 68.521 68.793 68.97 69.043 69.078 69.08 69.054 68.99 68.878 68.754 68.627 68.499 68.348 68.165 68.019 67.856 67.651 67.479 67.277 67.064 66.86 66.63 66.461 66.267 65.952 65.74 65.513 65.399 65.149 64.853 64.534 64.375 63.838 63.813 63.587 63.347 62.794 62.474 62.128 61.746 61.307 60.772 60.091 58.17 -9 ,17564 ,TETRA ,17591358,Sat Nov 27 22:37:30 CET,Sun Nov 28 00:28:51 CET,0.0 1.238 1.911 2.499 3.015 3.46 3.844 4.192 4.847 5.151 5.445 5.551 6.244 6.502 7.008 7.478 7.929 8.146 8.568 8.971 9.539 9.913 10.286 10.829 11.356 11.871 12.377 12.872 13.517 14.14 14.74 15.48 16.209 16.914 17.746 18.687 19.595 20.617 21.712 22.862 24.076 25.452 27.127 28.858 30.877 33.185 35.976 39.253 43.188 47.967 53.949 59.127 62.382 64.547 65.916 66.817 67.446 67.911 68.232 68.45 68.58 68.639 68.626 68.574 68.504 68.419 68.295 68.151 68.038 67.926 67.76 67.603 67.437 67.245 67.078 66.895 66.701 66.488 66.261 66.086 65.901 65.622 65.407 65.159 65.029 64.765 64.489 64.177 64.003 63.446 63.401 63.182 62.944 62.394 62.086 61.745 61.344 60.836 60.197 59.379 56.956 -10 ,15678 ,TETRA ,17591359,Sat Nov 27 22:37:27 CET,Sun Nov 28 00:29:59 CET,0.0 1.604 2.321 2.865 3.333 3.745 4.128 4.493 5.185 5.499 5.774 5.848 6.543 6.792 7.268 7.712 8.135 8.349 8.778 9.174 9.755 10.144 10.516 11.049 11.554 12.051 12.544 13.032 13.676 14.279 14.86 15.583 16.279 16.963 17.791 18.725 19.609 20.586 21.683 22.875 24.152 25.615 27.298 29.013 31.136 33.568 36.371 39.602 43.458 48.263 54.404 59.58 62.673 64.739 66.108 67.041 67.682 68.179 68.527 68.736 68.848 68.902 68.887 68.822 68.757 68.688 68.565 68.43 68.319 68.183 67.999 67.831 67.656 67.459 67.292 67.101 66.899 66.707 66.499 66.345 66.171 65.871 65.661 65.441 65.319 65.059 64.758 64.389 64.176 63.583 63.535 63.326 63.086 62.535 62.225 61.889 61.482 60.988 60.424 59.651 56.976 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt deleted file mode 100644 index 3776d967..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31307 ,TETRA ,17591360,Sat Nov 27 22:37:29 CET,Sun Nov 28 00:31:26 CET,0.0 2.167 2.915 3.43 3.869 4.277 4.64 4.949 5.513 5.773 6.004 5.99 6.632 6.844 7.267 7.635 7.959 8.113 8.409 8.686 9.099 9.373 9.629 9.967 10.28 10.586 10.881 11.174 11.544 11.879 12.184 12.513 12.816 13.127 13.489 13.861 14.19 14.545 14.93 15.304 15.651 16.025 16.416 16.744 17.081 17.35 17.547 17.632 17.373 16.486 14.456 11.566 8.95 6.646 4.664 2.853 1.193 -0.326 -1.607 -2.892 -4.001 -5.01 -5.995 -6.906 -7.745 -8.486 -9.244 -9.938 -10.539 -11.167 -11.822 -12.361 -12.918 -13.483 -13.923 -14.408 -14.913 -15.414 -15.939 -16.294 -16.655 -17.236 -17.642 -18.065 -18.285 -18.744 -19.227 -19.753 -20.033 -20.795 -20.948 -21.266 -21.603 -22.363 -22.776 -23.213 -23.677 -24.222 -24.868 -25.722 -28.145 -2 ,23178 ,TETRA ,17591361,Sat Nov 27 22:37:31 CET,Sun Nov 28 00:30:22 CET,0.0 2.286 3.035 3.611 4.089 4.493 4.869 5.191 5.738 5.987 6.23 6.244 6.888 7.088 7.467 7.83 8.164 8.319 8.623 8.895 9.292 9.553 9.785 10.101 10.42 10.739 11.024 11.292 11.622 11.936 12.234 12.594 12.951 13.267 13.62 14.013 14.367 14.733 15.083 15.411 15.744 16.13 16.528 16.889 17.281 17.593 17.791 17.841 17.595 16.812 14.902 12.106 9.578 7.299 5.264 3.357 1.671 0.215 -1.07 -2.36 -3.435 -4.409 -5.364 -6.275 -7.105 -7.846 -8.632 -9.361 -9.982 -10.618 -11.282 -11.836 -12.405 -13.009 -13.497 -13.989 -14.491 -14.999 -15.521 -15.893 -16.274 -16.875 -17.297 -17.725 -17.945 -18.397 -18.87 -19.372 -19.631 -20.37 -20.493 -20.821 -21.174 -21.927 -22.335 -22.781 -23.26 -23.806 -24.457 -25.287 -27.201 -3 ,28172 ,TETRA ,17591362,Sat Nov 27 22:37:33 CET,Sun Nov 28 00:30:39 CET,0.0 3.099 4.06 4.651 5.081 5.474 5.815 6.12 6.641 6.888 7.131 7.133 7.782 7.99 8.36 8.714 9.048 9.206 9.509 9.796 10.194 10.444 10.686 11.018 11.334 11.642 11.923 12.177 12.517 12.841 13.149 13.518 13.844 14.155 14.499 14.894 15.299 15.68 16.047 16.442 16.826 17.199 17.584 17.908 18.184 18.437 18.597 18.548 18.234 17.444 15.381 12.32 9.646 7.24 5.166 3.286 1.624 0.17 -1.098 -2.414 -3.532 -4.527 -5.48 -6.342 -7.149 -7.911 -8.701 -9.394 -10.016 -10.675 -11.356 -11.901 -12.452 -13.051 -13.514 -13.986 -14.484 -14.996 -15.507 -15.857 -16.234 -16.84 -17.258 -17.688 -17.912 -18.382 -18.874 -19.394 -19.669 -20.412 -20.522 -20.837 -21.17 -21.875 -22.279 -22.738 -23.202 -23.713 -24.362 -25.231 -27.395 -4 ,1805 ,TETRA ,17591363,Sat Nov 27 22:37:27 CET,Sun Nov 28 00:31:45 CET,0.0 2.146 2.868 3.4 3.874 4.28 4.628 4.949 5.531 5.796 6.039 6.059 6.727 6.942 7.325 7.675 7.997 8.15 8.438 8.715 9.119 9.367 9.596 9.957 10.304 10.609 10.906 11.183 11.527 11.848 12.148 12.5 12.838 13.154 13.495 13.868 14.228 14.632 15.049 15.466 15.857 16.242 16.639 16.951 17.249 17.545 17.788 17.84 17.591 16.756 14.717 11.859 9.269 6.949 4.889 3.05 1.425 -0.067 -1.369 -2.659 -3.758 -4.765 -5.726 -6.618 -7.445 -8.202 -8.992 -9.701 -10.306 -10.937 -11.597 -12.136 -12.709 -13.3 -13.756 -14.225 -14.705 -15.216 -15.758 -16.145 -16.533 -17.114 -17.53 -17.979 -18.206 -18.674 -19.179 -19.702 -19.969 -20.713 -20.834 -21.149 -21.47 -22.168 -22.57 -23.016 -23.509 -24.068 -24.729 -25.628 -27.729 -5 ,8772 ,TETRA ,17591364,Sat Nov 27 22:37:28 CET,Sun Nov 28 00:31:38 CET,0.0 1.937 2.725 3.3 3.764 4.162 4.497 4.813 5.384 5.655 5.898 5.885 6.542 6.754 7.127 7.476 7.811 7.966 8.265 8.555 8.975 9.23 9.47 9.814 10.142 10.463 10.773 11.081 11.464 11.792 12.085 12.425 12.758 13.08 13.428 13.786 14.105 14.451 14.82 15.177 15.547 15.95 16.365 16.7 17.003 17.269 17.476 17.467 17.154 16.29 14.213 11.326 8.644 6.239 4.176 2.35 0.701 -0.793 -2.047 -3.336 -4.467 -5.475 -6.427 -7.302 -8.128 -8.903 -9.71 -10.419 -11.024 -11.679 -12.378 -12.94 -13.503 -14.074 -14.517 -14.986 -15.471 -15.972 -16.503 -16.874 -17.26 -17.858 -18.273 -18.708 -18.934 -19.392 -19.864 -20.404 -20.707 -21.488 -21.63 -21.945 -22.3 -23.067 -23.483 -23.929 -24.407 -24.946 -25.626 -26.519 -29.023 -6 ,28686 ,TETRA ,17591365,Sat Nov 27 22:37:29 CET,Sun Nov 28 00:31:44 CET,0.0 2.161 2.962 3.593 4.061 4.42 4.743 5.04 5.607 5.858 6.084 6.063 6.695 6.892 7.265 7.622 7.969 8.129 8.433 8.715 9.111 9.355 9.589 9.942 10.284 10.591 10.888 11.185 11.547 11.885 12.219 12.586 12.907 13.203 13.535 13.917 14.259 14.629 15.01 15.384 15.772 16.149 16.554 16.91 17.209 17.44 17.583 17.519 17.128 16.241 14.2 11.217 8.535 6.184 4.132 2.258 0.596 -0.88 -2.157 -3.461 -4.594 -5.6 -6.559 -7.474 -8.333 -9.122 -9.925 -10.608 -11.215 -11.852 -12.507 -13.066 -13.639 -14.226 -14.677 -15.141 -15.624 -16.14 -16.677 -17.041 -17.417 -18.003 -18.412 -18.849 -19.074 -19.529 -20.023 -20.557 -20.837 -21.592 -21.718 -22.039 -22.375 -23.068 -23.463 -23.927 -24.443 -25.022 -25.656 -26.501 -28.463 -7 ,8855 ,TETRA ,17591366,Sat Nov 27 22:37:31 CET,Sun Nov 28 00:31:34 CET,0.0 2.079 2.874 3.453 3.913 4.318 4.676 4.993 5.576 5.833 6.074 6.084 6.735 6.926 7.285 7.642 7.971 8.123 8.412 8.695 9.094 9.344 9.581 9.908 10.226 10.536 10.833 11.104 11.419 11.745 12.101 12.494 12.847 13.17 13.524 13.91 14.267 14.644 15.012 15.394 15.774 16.17 16.582 16.914 17.207 17.481 17.717 17.723 17.394 16.498 14.469 11.577 8.905 6.535 4.426 2.51 0.811 -0.725 -2.045 -3.353 -4.436 -5.392 -6.358 -7.291 -8.148 -8.919 -9.724 -10.451 -11.077 -11.727 -12.405 -12.954 -13.517 -14.103 -14.564 -15.044 -15.537 -16.037 -16.537 -16.903 -17.299 -17.891 -18.291 -18.721 -18.946 -19.417 -19.906 -20.403 -20.673 -21.425 -21.559 -21.876 -22.215 -22.949 -23.353 -23.833 -24.402 -25.049 -25.804 -26.747 -29.381 -8 ,23127 ,TETRA ,17591367,Sat Nov 27 22:38:27 CET,Sun Nov 28 00:33:44 CET,0.0 2.026 2.782 3.36 3.856 4.27 4.619 4.923 5.474 5.731 5.96 5.954 6.599 6.802 7.199 7.537 7.838 7.984 8.283 8.579 8.978 9.213 9.447 9.801 10.13 10.434 10.72 10.992 11.329 11.654 11.961 12.307 12.662 13.011 13.384 13.763 14.123 14.533 14.936 15.333 15.717 16.113 16.519 16.849 17.172 17.443 17.582 17.553 17.298 16.457 14.392 11.37 8.637 6.28 4.168 2.255 0.6 -0.882 -2.138 -3.406 -4.496 -5.496 -6.463 -7.362 -8.201 -8.965 -9.765 -10.468 -11.065 -11.687 -12.366 -12.924 -13.478 -14.065 -14.522 -14.998 -15.498 -16.011 -16.543 -16.91 -17.292 -17.912 -18.341 -18.773 -19.0 -19.471 -19.952 -20.481 -20.762 -21.501 -21.599 -21.905 -22.229 -22.941 -23.338 -23.774 -24.243 -24.762 -25.379 -26.227 -28.218 -9 ,9098 ,TETRA ,17591368,Sat Nov 27 22:38:27 CET,Sun Nov 28 00:31:14 CET,0.0 2.079 2.827 3.405 3.892 4.296 4.64 4.957 5.554 5.821 6.064 6.076 6.724 6.922 7.284 7.607 7.898 8.043 8.354 8.645 9.035 9.29 9.531 9.846 10.151 10.459 10.747 10.993 11.299 11.588 11.873 12.223 12.548 12.872 13.228 13.596 13.942 14.28 14.641 15.021 15.368 15.744 16.145 16.503 16.823 17.037 17.177 17.196 16.911 16.021 14.036 11.171 8.519 6.136 4.029 2.115 0.456 -1.044 -2.368 -3.661 -4.775 -5.77 -6.707 -7.606 -8.459 -9.229 -10.025 -10.729 -11.336 -11.972 -12.635 -13.183 -13.758 -14.36 -14.826 -15.299 -15.796 -16.325 -16.869 -17.227 -17.586 -18.171 -18.608 -19.07 -19.3 -19.77 -20.25 -20.738 -21.003 -21.762 -21.957 -22.311 -22.682 -23.527 -24.004 -24.484 -24.929 -25.463 -26.14 -26.934 -28.761 -10 ,19387 ,TETRA ,17591369,Sat Nov 27 22:38:28 CET,Sun Nov 28 00:32:28 CET,0.0 1.988 2.742 3.302 3.724 4.108 4.465 4.793 5.409 5.675 5.922 5.923 6.551 6.727 7.072 7.418 7.761 7.928 8.239 8.526 8.952 9.211 9.436 9.755 10.068 10.366 10.647 10.94 11.301 11.615 11.911 12.268 12.606 12.923 13.302 13.672 13.997 14.383 14.776 15.148 15.502 15.864 16.231 16.555 16.918 17.194 17.342 17.316 17.043 16.295 14.453 11.669 9.0 6.642 4.585 2.746 1.134 -0.357 -1.65 -2.913 -3.996 -4.972 -5.908 -6.797 -7.642 -8.417 -9.204 -9.898 -10.51 -11.154 -11.813 -12.347 -12.907 -13.52 -13.99 -14.453 -14.931 -15.424 -15.941 -16.306 -16.692 -17.292 -17.704 -18.138 -18.359 -18.803 -19.293 -19.8 -20.057 -20.809 -20.948 -21.26 -21.577 -22.288 -22.699 -23.149 -23.651 -24.204 -24.862 -25.69 -27.775 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt deleted file mode 100644 index ba6cdb40..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25475 ,TETRA ,17591370,Sat Nov 27 22:38:31 CET,Sun Nov 28 00:30:04 CET,0.0 1.5 2.298 2.993 3.644 4.191 4.631 5.014 5.712 6.037 6.338 6.489 7.232 7.515 8.048 8.559 9.037 9.272 9.747 10.2 10.849 11.272 11.686 12.285 12.851 13.408 13.969 14.509 15.211 15.898 16.566 17.384 18.181 18.954 19.846 20.848 21.826 22.943 24.154 25.451 26.846 28.431 30.32 32.267 34.577 37.218 40.339 43.947 48.278 53.55 60.169 65.938 69.441 71.69 73.206 74.275 75.047 75.574 75.899 76.126 76.242 76.296 76.287 76.231 76.151 76.071 75.979 75.871 75.761 75.625 75.463 75.317 75.165 74.975 74.786 74.584 74.377 74.142 73.89 73.72 73.53 73.21 72.995 72.769 72.645 72.362 72.032 71.679 71.49 70.931 70.91 70.685 70.431 69.887 69.576 69.205 68.78 68.255 67.584 66.725 63.912 -2 ,22751 ,TETRA ,17591371,Sat Nov 27 22:38:27 CET,Sun Nov 28 00:30:29 CET,0.0 1.446 2.179 2.786 3.284 3.702 4.089 4.472 5.192 5.521 5.844 6.029 6.748 7.024 7.557 8.059 8.552 8.79 9.239 9.673 10.312 10.731 11.157 11.766 12.346 12.933 13.491 14.024 14.721 15.402 16.072 16.874 17.637 18.395 19.311 20.357 21.362 22.457 23.645 24.935 26.32 27.904 29.774 31.703 33.988 36.616 39.764 43.416 47.78 53.109 59.87 65.549 68.952 71.231 72.827 73.902 74.575 75.058 75.365 75.593 75.733 75.797 75.816 75.784 75.715 75.63 75.515 75.395 75.271 75.114 74.927 74.743 74.535 74.331 74.162 73.974 73.769 73.549 73.318 73.131 72.925 72.621 72.407 72.148 72.009 71.731 71.421 71.073 70.884 70.317 70.233 69.985 69.734 69.168 68.834 68.451 68.027 67.543 66.944 66.201 63.807 -3 ,10391 ,TETRA ,17591372,Sat Nov 27 22:38:28 CET,Sun Nov 28 00:30:21 CET,0.0 2.033 2.781 3.381 3.88 4.342 4.763 5.129 5.834 6.174 6.494 6.66 7.386 7.667 8.214 8.704 9.177 9.412 9.87 10.321 10.967 11.383 11.798 12.404 12.984 13.55 14.109 14.655 15.372 16.047 16.706 17.524 18.333 19.124 20.009 21.01 22.004 23.12 24.347 25.689 27.141 28.756 30.632 32.553 34.819 37.446 40.563 44.144 48.457 53.717 60.379 66.152 69.646 71.91 73.419 74.454 75.153 75.639 75.935 76.132 76.266 76.351 76.376 76.346 76.302 76.232 76.111 75.999 75.888 75.726 75.524 75.354 75.173 74.964 74.801 74.627 74.408 74.173 73.936 73.762 73.577 73.271 73.05 72.788 72.637 72.319 72.006 71.664 71.477 70.919 70.88 70.655 70.406 69.769 69.385 69.02 68.602 68.077 67.502 66.698 64.218 -4 ,18494 ,TETRA ,17591373,Sat Nov 27 22:38:28 CET,Sun Nov 28 00:30:30 CET,0.0 1.856 2.617 3.207 3.708 4.149 4.565 4.952 5.64 5.966 6.287 6.443 7.166 7.429 7.932 8.432 8.935 9.178 9.641 10.091 10.764 11.195 11.596 12.187 12.771 13.33 13.872 14.39 15.062 15.737 16.397 17.203 17.987 18.745 19.643 20.667 21.664 22.773 23.993 25.315 26.698 28.263 30.122 32.075 34.369 36.972 40.137 43.792 48.136 53.437 60.094 65.782 69.281 71.559 73.092 74.213 74.953 75.465 75.842 76.09 76.223 76.306 76.337 76.317 76.256 76.177 76.075 75.934 75.794 75.657 75.47 75.287 75.081 74.856 74.68 74.492 74.287 74.06 73.8 73.611 73.408 73.04 72.787 72.55 72.411 72.108 71.797 71.439 71.238 70.663 70.611 70.383 70.138 69.586 69.262 68.908 68.5 67.992 67.372 66.509 63.731 -5 ,9775 ,TETRA ,17591374,Sat Nov 27 22:38:31 CET,Sun Nov 28 00:30:07 CET,0.0 2.07 2.825 3.416 3.923 4.368 4.766 5.132 5.819 6.142 6.453 6.607 7.334 7.618 8.16 8.665 9.139 9.368 9.827 10.281 10.934 11.354 11.764 12.354 12.949 13.54 14.105 14.642 15.333 16.003 16.668 17.469 18.239 19.011 19.928 20.961 21.953 23.05 24.231 25.537 26.952 28.556 30.484 32.446 34.741 37.391 40.531 44.099 48.364 53.607 60.268 66.124 69.753 72.099 73.655 74.723 75.436 75.95 76.303 76.527 76.623 76.678 76.706 76.706 76.654 76.563 76.444 76.326 76.201 76.05 75.891 75.733 75.549 75.33 75.152 74.974 74.765 74.529 74.278 74.114 73.931 73.616 73.374 73.098 72.954 72.642 72.304 71.926 71.73 71.167 71.103 70.872 70.625 70.068 69.731 69.318 68.812 68.215 67.541 66.586 63.409 -6 ,25145 ,TETRA ,17591375,Sat Nov 27 22:38:28 CET,Sun Nov 28 00:31:52 CET,0.0 1.663 2.394 2.95 3.46 3.904 4.306 4.688 5.421 5.745 6.047 6.213 6.947 7.214 7.744 8.252 8.737 8.98 9.447 9.887 10.525 10.948 11.364 11.945 12.502 13.061 13.61 14.155 14.865 15.546 16.209 17.021 17.824 18.601 19.502 20.538 21.544 22.653 23.868 25.173 26.546 28.15 30.074 32.033 34.393 37.08 40.282 44.004 48.396 53.693 60.432 66.151 69.598 71.886 73.422 74.486 75.214 75.683 75.975 76.199 76.326 76.377 76.367 76.313 76.235 76.137 76.03 75.903 75.768 75.62 75.432 75.264 75.066 74.832 74.66 74.481 74.27 74.021 73.735 73.538 73.341 73.033 72.814 72.571 72.438 72.131 71.81 71.485 71.304 70.744 70.67 70.433 70.174 69.53 69.148 68.724 68.226 67.674 67.025 66.155 62.922 -7 ,31872 ,TETRA ,17591376,Sat Nov 27 22:38:30 CET,Sun Nov 28 00:31:13 CET,0.0 1.771 2.528 3.185 3.703 4.147 4.542 4.923 5.64 5.965 6.269 6.412 7.144 7.43 7.949 8.441 8.914 9.147 9.6 10.033 10.682 11.104 11.514 12.108 12.692 13.275 13.839 14.375 15.072 15.754 16.41 17.206 17.973 18.725 19.622 20.66 21.665 22.761 23.959 25.258 26.655 28.237 30.112 32.069 34.382 36.949 39.994 43.57 47.891 53.218 59.953 65.69 69.11 71.35 72.867 73.914 74.624 75.094 75.392 75.599 75.726 75.809 75.816 75.779 75.717 75.648 75.548 75.403 75.264 75.12 74.956 74.813 74.661 74.469 74.306 74.133 73.944 73.736 73.493 73.305 73.102 72.802 72.575 72.327 72.202 71.923 71.617 71.262 71.072 70.509 70.451 70.215 69.948 69.367 69.038 68.661 68.228 67.736 67.152 66.352 63.932 -8 ,22222 ,TETRA ,17591377,Sat Nov 27 22:38:32 CET,Sun Nov 28 00:33:17 CET,0.0 2.437 3.25 3.868 4.379 4.834 5.241 5.622 6.357 6.693 7.008 7.162 7.889 8.162 8.679 9.19 9.68 9.915 10.376 10.825 11.467 11.889 12.312 12.922 13.51 14.082 14.636 15.188 15.903 16.588 17.269 18.101 18.887 19.662 20.562 21.561 22.547 23.639 24.822 26.117 27.514 29.086 30.974 32.928 35.224 37.829 40.938 44.561 48.869 54.172 60.88 66.66 70.217 72.504 74.066 75.121 75.821 76.348 76.702 76.941 77.082 77.16 77.169 77.129 77.066 77.0 76.896 76.748 76.586 76.425 76.253 76.094 75.901 75.686 75.514 75.318 75.112 74.887 74.646 74.48 74.291 73.958 73.712 73.457 73.32 73.023 72.695 72.317 72.116 71.539 71.46 71.218 70.956 70.385 70.054 69.674 69.225 68.697 68.102 67.242 64.256 -9 ,11568 ,TETRA ,17591378,Sat Nov 27 22:38:33 CET,Sun Nov 28 00:32:18 CET,0.0 1.972 2.74 3.334 3.847 4.319 4.742 5.104 5.791 6.11 6.419 6.578 7.304 7.574 8.096 8.596 9.096 9.342 9.802 10.244 10.887 11.307 11.724 12.333 12.932 13.496 14.033 14.564 15.268 15.946 16.607 17.422 18.196 18.957 19.857 20.895 21.918 23.016 24.21 25.526 26.915 28.49 30.347 32.253 34.567 37.242 40.369 43.98 48.316 53.617 60.339 66.129 69.599 71.788 73.293 74.338 75.012 75.47 75.772 76.003 76.154 76.235 76.243 76.202 76.167 76.111 75.987 75.847 75.714 75.576 75.414 75.258 75.083 74.881 74.709 74.515 74.298 74.081 73.856 73.683 73.489 73.165 72.944 72.701 72.562 72.287 71.974 71.612 71.426 70.862 70.803 70.57 70.31 69.736 69.414 69.035 68.603 68.106 67.486 66.644 63.905 -10 ,10612 ,TETRA ,17591379,Sat Nov 27 22:38:28 CET,Sun Nov 28 00:30:33 CET,0.0 1.84 2.527 3.087 3.585 4.03 4.453 4.838 5.556 5.886 6.199 6.358 7.066 7.333 7.891 8.421 8.899 9.132 9.586 10.022 10.668 11.086 11.492 12.084 12.657 13.233 13.792 14.328 15.019 15.682 16.328 17.128 17.909 18.672 19.557 20.556 21.535 22.637 23.868 25.209 26.624 28.21 30.098 32.044 34.323 36.915 40.011 43.569 47.84 53.16 59.927 65.652 69.092 71.332 72.86 73.918 74.648 75.168 75.483 75.687 75.803 75.853 75.865 75.845 75.775 75.687 75.587 75.465 75.328 75.165 74.972 74.802 74.619 74.421 74.254 74.047 73.812 73.58 73.335 73.139 72.929 72.601 72.359 72.067 71.911 71.604 71.289 70.961 70.778 70.219 70.168 69.944 69.684 69.102 68.774 68.382 67.931 67.379 66.605 65.591 62.222 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index b5f1a8b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19487 ,TETRA ,17591380,Sat Nov 27 22:38:29 CET,Sun Nov 28 00:30:04 CET,0.0 1.841 2.601 3.144 3.623 4.032 4.396 4.76 5.458 5.78 6.088 6.201 6.959 7.241 7.767 8.267 8.747 8.981 9.444 9.896 10.539 10.963 11.385 11.997 12.6 13.18 13.742 14.301 15.03 15.755 16.462 17.318 18.161 18.977 19.944 21.054 22.125 23.326 24.635 26.038 27.553 29.316 31.438 33.625 36.225 39.204 42.824 47.11 52.29 58.813 67.433 75.133 80.07 83.515 85.974 87.786 89.107 90.159 90.947 91.581 92.045 92.414 92.701 92.915 93.064 93.164 93.248 93.295 93.315 93.327 93.307 93.274 93.248 93.22 93.169 93.102 93.043 92.963 92.86 92.774 92.673 92.509 92.392 92.258 92.178 91.988 91.779 91.573 91.465 90.964 91.044 90.891 90.71 90.322 90.087 89.817 89.523 89.164 88.748 88.139 86.696 -2 ,21873 ,TETRA ,17591381,Sat Nov 27 22:38:31 CET,Sun Nov 28 00:30:26 CET,0.0 1.365 2.062 2.575 3.026 3.439 3.816 4.162 4.802 5.118 5.41 5.49 6.237 6.501 7.025 7.533 8.031 8.276 8.731 9.159 9.789 10.202 10.617 11.235 11.835 12.417 12.982 13.542 14.285 15.018 15.713 16.544 17.356 18.153 19.104 20.18 21.238 22.439 23.763 25.208 26.75 28.504 30.58 32.734 35.355 38.422 42.078 46.279 51.427 57.893 66.362 74.134 79.124 82.59 85.056 86.867 88.23 89.318 90.117 90.8 91.324 91.724 92.045 92.296 92.47 92.574 92.665 92.73 92.763 92.791 92.801 92.771 92.709 92.638 92.581 92.516 92.44 92.328 92.217 92.153 92.067 91.908 91.779 91.636 91.561 91.392 91.198 90.966 90.839 90.342 90.444 90.291 90.122 89.722 89.492 89.238 88.924 88.53 88.061 87.445 85.755 -3 ,22269 ,TETRA ,17591382,Sat Nov 27 22:38:33 CET,Sun Nov 28 00:30:05 CET,0.0 1.577 2.483 3.204 3.832 4.319 4.71 5.069 5.749 6.066 6.361 6.453 7.197 7.467 7.995 8.5 8.985 9.221 9.69 10.148 10.797 11.223 11.641 12.246 12.839 13.42 13.984 14.524 15.235 15.957 16.665 17.51 18.334 19.146 20.109 21.209 22.282 23.477 24.788 26.209 27.76 29.573 31.721 33.907 36.522 39.534 43.146 47.437 52.698 59.265 67.853 75.552 80.458 83.836 86.266 88.11 89.468 90.512 91.284 91.895 92.333 92.679 92.986 93.254 93.462 93.599 93.693 93.749 93.765 93.769 93.746 93.711 93.68 93.636 93.569 93.479 93.382 93.283 93.177 93.088 92.986 92.833 92.717 92.567 92.484 92.314 92.132 91.916 91.797 91.309 91.401 91.239 91.066 90.689 90.475 90.23 89.936 89.602 89.236 88.736 87.369 -4 ,2462 ,TETRA ,17591383,Sat Nov 27 22:39:25 CET,Sun Nov 28 00:31:07 CET,0.0 1.317 1.938 2.441 2.912 3.345 3.736 4.097 4.79 5.108 5.393 5.463 6.202 6.475 6.986 7.475 7.946 8.18 8.661 9.126 9.782 10.191 10.595 11.201 11.803 12.393 12.961 13.518 14.233 14.928 15.621 16.471 17.316 18.14 19.096 20.183 21.242 22.419 23.72 25.158 26.709 28.488 30.615 32.814 35.45 38.485 42.14 46.426 51.618 58.085 66.592 74.305 79.303 82.767 85.186 86.963 88.318 89.37 90.11 90.734 91.203 91.576 91.889 92.144 92.334 92.458 92.567 92.656 92.697 92.706 92.693 92.661 92.625 92.572 92.516 92.449 92.362 92.259 92.141 92.05 91.951 91.78 91.636 91.475 91.393 91.219 91.018 90.806 90.695 90.196 90.247 90.061 89.871 89.44 89.18 88.896 88.599 88.268 87.802 87.14 85.637 -5 ,21644 ,TETRA ,17591384,Sat Nov 27 22:41:25 CET,Sun Nov 28 00:33:21 CET,0.0 1.172 1.834 2.395 2.884 3.308 3.705 4.074 4.741 5.064 5.374 5.479 6.217 6.483 7.01 7.505 7.995 8.236 8.693 9.147 9.81 10.231 10.65 11.276 11.888 12.467 13.029 13.588 14.314 15.029 15.72 16.548 17.367 18.184 19.149 20.246 21.309 22.505 23.837 25.267 26.795 28.604 30.791 33.014 35.642 38.666 42.313 46.606 51.867 58.422 66.959 74.61 79.487 82.878 85.332 87.185 88.567 89.636 90.399 91.058 91.562 91.95 92.262 92.499 92.665 92.775 92.877 92.943 92.959 92.961 92.94 92.906 92.863 92.821 92.783 92.716 92.626 92.514 92.367 92.255 92.142 91.964 91.84 91.708 91.636 91.479 91.283 91.048 90.919 90.413 90.474 90.311 90.158 89.788 89.563 89.302 89.005 88.652 88.198 87.625 85.915 -6 ,21353 ,TETRA ,17591385,Sat Nov 27 22:40:26 CET,Sun Nov 28 00:33:52 CET,0.0 1.49 2.142 2.634 3.11 3.539 3.932 4.306 4.957 5.261 5.558 5.66 6.4 6.667 7.201 7.702 8.188 8.431 8.897 9.345 10.009 10.433 10.841 11.436 12.021 12.606 13.17 13.729 14.47 15.182 15.873 16.707 17.521 18.331 19.282 20.383 21.461 22.656 23.982 25.422 26.963 28.739 30.832 32.99 35.574 38.559 42.181 46.442 51.651 58.149 66.497 74.065 78.987 82.397 84.855 86.641 87.95 88.952 89.683 90.317 90.763 91.097 91.385 91.61 91.781 91.911 92.004 92.062 92.105 92.13 92.132 92.111 92.059 91.987 91.929 91.861 91.77 91.654 91.52 91.415 91.294 91.117 90.999 90.852 90.767 90.587 90.402 90.179 90.05 89.55 89.641 89.481 89.293 88.884 88.658 88.401 88.1 87.761 87.338 86.717 84.866 -7 ,19362 ,TETRA ,17591386,Sat Nov 27 22:40:27 CET,Sun Nov 28 00:38:44 CET,0.0 1.139 1.797 2.357 2.819 3.229 3.612 3.978 4.638 4.951 5.261 5.39 6.151 6.425 6.934 7.43 7.919 8.16 8.622 9.064 9.712 10.139 10.561 11.177 11.78 12.365 12.933 13.504 14.251 14.962 15.655 16.517 17.367 18.191 19.158 20.25 21.332 22.565 23.902 25.324 26.861 28.638 30.748 32.93 35.566 38.617 42.272 46.543 51.72 58.212 66.826 74.654 79.634 83.073 85.48 87.281 88.635 89.694 90.486 91.143 91.611 91.977 92.269 92.487 92.644 92.768 92.892 92.97 92.995 92.994 92.965 92.933 92.887 92.833 92.791 92.726 92.642 92.545 92.421 92.324 92.221 92.057 91.929 91.791 91.716 91.548 91.365 91.155 91.035 90.542 90.645 90.501 90.332 89.926 89.694 89.434 89.134 88.785 88.391 87.849 86.283 -8 ,20540 ,TETRA ,17591387,Sat Nov 27 22:40:29 CET,Sun Nov 28 00:31:36 CET,0.0 1.458 2.173 2.71 3.167 3.618 4.062 4.435 5.09 5.4 5.699 5.809 6.543 6.794 7.291 7.779 8.268 8.512 8.981 9.435 10.112 10.554 10.977 11.589 12.18 12.749 13.313 13.875 14.611 15.323 16.02 16.885 17.742 18.558 19.497 20.572 21.621 22.823 24.154 25.584 27.117 28.887 31.012 33.188 35.792 38.815 42.421 46.682 52.003 58.689 67.363 75.189 80.164 83.574 85.973 87.734 89.072 90.119 90.853 91.484 91.978 92.34 92.634 92.88 93.06 93.184 93.272 93.325 93.363 93.376 93.372 93.358 93.314 93.253 93.203 93.153 93.092 93.0 92.89 92.807 92.708 92.525 92.381 92.227 92.142 91.948 91.741 91.533 91.418 90.913 90.993 90.835 90.672 90.284 90.034 89.756 89.456 89.101 88.642 88.025 86.332 -9 ,29386 ,TETRA ,17591388,Sat Nov 27 22:40:27 CET,Sun Nov 28 00:32:43 CET,0.0 1.538 2.194 2.737 3.241 3.686 4.085 4.446 5.113 5.436 5.735 5.822 6.569 6.835 7.332 7.82 8.304 8.544 9.009 9.459 10.11 10.54 10.966 11.583 12.17 12.744 13.313 13.862 14.579 15.299 16.001 16.841 17.672 18.488 19.431 20.499 21.549 22.728 24.041 25.457 26.975 28.765 30.898 33.079 35.702 38.735 42.36 46.637 51.91 58.487 67.052 74.795 79.693 83.036 85.47 87.319 88.648 89.697 90.476 91.109 91.588 91.962 92.248 92.474 92.667 92.825 92.947 93.018 93.055 93.066 93.041 93.004 92.952 92.883 92.818 92.745 92.661 92.557 92.437 92.342 92.243 92.076 91.956 91.828 91.756 91.597 91.414 91.201 91.073 90.565 90.643 90.491 90.339 89.982 89.776 89.544 89.261 88.932 88.524 87.988 86.528 -10 ,8980 ,TETRA ,17591389,Sat Nov 27 22:40:28 CET,Sun Nov 28 00:32:49 CET,0.0 1.326 1.953 2.501 2.964 3.378 3.767 4.134 4.813 5.12 5.414 5.533 6.289 6.561 7.084 7.59 8.067 8.305 8.784 9.234 9.872 10.299 10.728 11.348 11.949 12.547 13.135 13.708 14.439 15.139 15.825 16.673 17.501 18.317 19.279 20.359 21.428 22.63 23.927 25.328 26.862 28.655 30.797 33.027 35.661 38.678 42.377 46.732 51.968 58.49 67.067 74.867 79.823 83.161 85.472 87.22 88.547 89.594 90.362 90.987 91.442 91.791 92.116 92.397 92.565 92.675 92.78 92.854 92.9 92.916 92.893 92.858 92.809 92.749 92.694 92.62 92.533 92.428 92.301 92.211 92.12 91.964 91.845 91.701 91.62 91.456 91.277 91.062 90.94 90.452 90.545 90.392 90.213 89.792 89.576 89.337 89.058 88.706 88.277 87.689 86.022 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_18639-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_18639-1.txt deleted file mode 100644 index 7a3da6c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_18639-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18720 ,KEBNE ,17026856,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:13:26 CET,0.0 1.75 2.459 3.018 3.492 3.938 4.348 4.721 5.416 5.753 6.082 6.222 6.981 7.294 7.9 8.417 8.921 9.171 9.659 10.147 10.862 11.33 11.785 12.441 13.079 13.686 14.285 14.881 15.659 16.432 17.179 18.069 18.945 19.819 20.832 21.972 23.08 24.326 25.728 27.273 28.908 30.799 33.075 35.398 38.205 41.464 45.36 49.912 55.503 62.484 71.532 79.783 85.061 88.725 91.36 93.333 94.847 96.02 96.861 97.587 98.119 98.502 98.813 99.08 99.284 99.405 99.494 99.575 99.628 99.647 99.654 99.656 99.649 99.622 99.577 99.513 99.411 99.289 99.172 99.081 98.974 98.768 98.622 98.478 98.402 98.238 98.045 97.822 97.684 97.164 97.205 97.03 96.847 96.426 96.158 95.871 95.561 95.165 94.574 93.752 91.403 -2 ,2198 ,KEBNE ,17026857,Wed Dec 22 15:36:47 CET,Wed Dec 22 17:15:13 CET,0.0 2.092 2.823 3.373 3.862 4.33 4.766 5.143 5.838 6.167 6.479 6.613 7.375 7.666 8.239 8.777 9.305 9.559 10.041 10.509 11.194 11.641 12.085 12.733 13.361 13.988 14.6 15.198 15.995 16.775 17.517 18.41 19.301 20.178 21.222 22.417 23.567 24.852 26.258 27.768 29.382 31.265 33.546 35.865 38.62 41.855 45.749 50.27 55.834 62.819 71.91 80.23 85.584 89.224 91.861 93.89 95.402 96.572 97.432 98.169 98.709 99.102 99.436 99.723 99.952 100.128 100.261 100.326 100.362 100.391 100.384 100.357 100.32 100.273 100.221 100.157 100.075 99.965 99.846 99.752 99.643 99.469 99.344 99.198 99.113 98.933 98.745 98.511 98.376 97.879 97.958 97.782 97.577 97.128 96.883 96.605 96.26 95.859 95.38 94.679 92.619 -3 ,24962 ,KEBNE ,17026858,Wed Dec 22 15:36:48 CET,Wed Dec 22 17:14:15 CET,0.0 1.829 2.52 3.089 3.559 3.998 4.411 4.81 5.572 5.91 6.223 6.353 7.116 7.413 7.973 8.508 9.028 9.281 9.778 10.251 10.949 11.41 11.861 12.53 13.172 13.789 14.394 14.984 15.752 16.521 17.268 18.166 19.064 19.937 20.957 22.128 23.272 24.56 25.982 27.52 29.175 31.089 33.349 35.668 38.458 41.695 45.591 50.163 55.747 62.709 71.819 80.11 85.423 89.053 91.688 93.71 95.167 96.313 97.177 97.909 98.462 98.893 99.254 99.527 99.735 99.904 100.061 100.173 100.236 100.257 100.251 100.246 100.233 100.205 100.16 100.091 100.007 99.901 99.768 99.666 99.558 99.383 99.246 99.079 98.99 98.808 98.607 98.383 98.259 97.746 97.796 97.621 97.433 97.033 96.777 96.481 96.153 95.747 95.209 94.44 92.458 -4 ,8545 ,KEBNE ,17026859,Wed Dec 22 15:47:10 CET,Wed Dec 22 17:23:47 CET,0.0 1.954 2.714 3.322 3.838 4.253 4.633 5.011 5.695 6.024 6.351 6.506 7.278 7.572 8.131 8.674 9.192 9.444 9.947 10.431 11.126 11.583 12.022 12.668 13.307 13.927 14.547 15.147 15.909 16.664 17.406 18.311 19.2 20.064 21.075 22.247 23.394 24.669 26.062 27.598 29.277 31.181 33.449 35.777 38.564 41.789 45.617 50.14 55.719 62.677 71.875 80.215 85.545 89.297 91.974 93.956 95.472 96.665 97.538 98.291 98.853 99.277 99.586 99.822 100.021 100.177 100.305 100.378 100.415 100.429 100.435 100.431 100.415 100.391 100.355 100.285 100.191 100.098 99.985 99.881 99.768 99.592 99.463 99.312 99.225 99.036 98.834 98.623 98.513 98.027 98.102 97.936 97.755 97.322 97.077 96.782 96.458 96.087 95.564 94.876 92.423 -5 ,12981 ,KEBNE ,17026860,Wed Dec 22 15:47:14 CET,Wed Dec 22 17:16:24 CET,0.0 1.917 2.597 3.144 3.603 4.045 4.462 4.823 5.502 5.839 6.167 6.312 7.087 7.379 7.942 8.487 9.006 9.258 9.74 10.2 10.893 11.339 11.775 12.439 13.079 13.678 14.279 14.888 15.673 16.429 17.184 18.097 18.993 19.879 20.912 22.09 23.237 24.52 25.95 27.514 29.188 31.094 33.358 35.698 38.472 41.667 45.522 50.075 55.673 62.667 71.883 80.21 85.506 89.217 91.874 93.852 95.334 96.464 97.343 98.123 98.685 99.09 99.418 99.673 99.872 100.057 100.229 100.322 100.354 100.376 100.364 100.33 100.282 100.222 100.184 100.119 100.036 99.951 99.836 99.747 99.638 99.43 99.289 99.153 99.079 98.916 98.738 98.531 98.416 97.928 98.013 97.853 97.671 97.226 96.949 96.642 96.315 95.939 95.451 94.61 90.474 -6 ,4295 ,KEBNE ,17026861,Wed Dec 22 15:47:14 CET,Wed Dec 22 17:15:25 CET,0.0 2.016 2.881 3.536 4.062 4.55 4.986 5.377 6.085 6.417 6.743 6.905 7.673 7.961 8.526 9.062 9.576 9.827 10.318 10.792 11.49 11.948 12.389 13.03 13.664 14.276 14.873 15.464 16.228 16.977 17.72 18.612 19.478 20.338 21.361 22.52 23.65 24.916 26.311 27.839 29.479 31.377 33.663 36.003 38.799 42.052 45.934 50.501 56.168 63.199 72.312 80.629 85.996 89.784 92.522 94.562 96.025 97.139 97.993 98.702 99.191 99.559 99.863 100.127 100.314 100.44 100.568 100.656 100.69 100.705 100.709 100.686 100.645 100.595 100.543 100.468 100.382 100.284 100.174 100.088 99.989 99.817 99.677 99.517 99.428 99.241 99.014 98.772 98.659 98.169 98.23 98.061 97.886 97.472 97.218 96.931 96.607 96.212 95.725 95.064 93.006 -7 ,19792 ,KEBNE ,17026862,Wed Dec 22 15:47:11 CET,Wed Dec 22 17:15:40 CET,0.0 1.425 2.076 2.676 3.283 3.785 4.191 4.59 5.315 5.632 5.943 6.079 6.84 7.127 7.68 8.199 8.698 8.94 9.421 9.886 10.579 11.037 11.479 12.134 12.769 13.379 13.988 14.582 15.345 16.1 16.841 17.748 18.633 19.502 20.528 21.712 22.871 24.17 25.595 27.118 28.729 30.604 32.877 35.203 37.964 41.116 44.919 49.427 55.036 62.024 71.056 79.262 84.509 88.167 90.813 92.818 94.354 95.55 96.432 97.143 97.666 98.078 98.406 98.685 98.891 99.049 99.196 99.274 99.307 99.335 99.322 99.287 99.268 99.236 99.187 99.125 99.042 98.943 98.823 98.74 98.647 98.468 98.337 98.193 98.12 97.955 97.767 97.54 97.415 96.917 96.973 96.801 96.615 96.16 95.885 95.572 95.224 94.793 94.273 93.568 91.331 -8 ,15195 ,KEBNE ,17026863,Wed Dec 22 15:47:14 CET,Wed Dec 22 17:19:56 CET,0.0 3.227 3.928 4.507 5.036 5.49 5.875 6.246 6.975 7.313 7.64 7.783 8.542 8.829 9.395 9.935 10.451 10.703 11.191 11.654 12.335 12.787 13.226 13.875 14.514 15.138 15.749 16.342 17.114 17.873 18.608 19.499 20.368 21.228 22.261 23.443 24.586 25.864 27.274 28.806 30.451 32.346 34.619 36.975 39.782 43.017 46.892 51.421 56.999 64.057 73.258 81.535 86.73 90.292 92.946 94.978 96.43 97.582 98.481 99.261 99.811 100.233 100.598 100.872 101.094 101.28 101.437 101.531 101.59 101.629 101.65 101.657 101.623 101.562 101.508 101.432 101.337 101.234 101.129 101.034 100.915 100.74 100.597 100.417 100.321 100.123 99.914 99.69 99.566 99.051 99.087 98.906 98.726 98.296 98.035 97.741 97.391 96.998 96.521 95.77 93.261 -9 ,8997 ,KEBNE ,17026864,Wed Dec 22 15:47:15 CET,Wed Dec 22 17:29:41 CET,0.0 1.568 2.347 2.98 3.478 3.914 4.321 4.704 5.38 5.708 6.04 6.187 6.954 7.244 7.809 8.348 8.869 9.124 9.609 10.076 10.745 11.19 11.63 12.259 12.871 13.47 14.072 14.663 15.422 16.171 16.91 17.813 18.689 19.55 20.58 21.76 22.925 24.214 25.599 27.096 28.729 30.637 32.911 35.254 38.064 41.281 45.133 49.653 55.179 62.166 71.428 79.794 85.053 88.715 91.359 93.343 94.882 96.085 96.946 97.678 98.217 98.619 98.931 99.184 99.389 99.551 99.687 99.76 99.793 99.8 99.805 99.802 99.768 99.721 99.682 99.615 99.513 99.39 99.257 99.159 99.042 98.869 98.755 98.613 98.539 98.365 98.159 97.915 97.784 97.289 97.328 97.129 96.936 96.511 96.261 95.989 95.681 95.322 94.846 94.123 92.165 -10 ,3594 ,KEBNE ,17026865,Wed Dec 22 15:51:18 CET,Wed Dec 22 17:27:50 CET,0.0 1.732 2.462 3.017 3.488 3.917 4.333 4.731 5.441 5.785 6.12 6.259 7.018 7.311 7.882 8.423 8.939 9.191 9.689 10.168 10.855 11.303 11.751 12.403 13.042 13.671 14.284 14.892 15.673 16.436 17.192 18.117 19.009 19.875 20.897 22.06 23.194 24.46 25.868 27.413 29.078 30.953 33.202 35.545 38.353 41.603 45.517 50.103 55.688 62.719 72.007 80.456 85.827 89.488 92.137 94.177 95.671 96.821 97.675 98.415 98.963 99.348 99.657 99.928 100.138 100.289 100.433 100.543 100.605 100.637 100.651 100.643 100.621 100.557 100.49 100.423 100.344 100.25 100.143 100.067 99.972 99.802 99.662 99.507 99.426 99.259 99.061 98.822 98.703 98.215 98.271 98.08 97.889 97.479 97.229 96.931 96.588 96.189 95.718 95.12 92.637 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index c00417eb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25668 ,TETRA ,17591390,Sat Nov 27 22:40:30 CET,Sun Nov 28 00:32:18 CET,0.0 2.165 2.875 3.394 3.805 4.126 4.444 4.749 5.276 5.537 5.777 5.826 6.391 6.58 6.926 7.253 7.579 7.729 7.996 8.247 8.619 8.865 9.081 9.388 9.701 10.016 10.306 10.564 10.899 11.227 11.549 11.942 12.31 12.637 13.001 13.397 13.76 14.144 14.538 14.973 15.424 15.906 16.476 17.033 17.618 18.199 18.8 19.412 19.998 20.398 20.313 19.525 18.526 17.472 16.435 15.432 14.545 13.736 13.009 12.258 11.595 10.995 10.392 9.835 9.323 8.85 8.365 7.922 7.526 7.109 6.684 6.333 5.965 5.566 5.245 4.918 4.577 4.227 3.874 3.616 3.347 2.926 2.628 2.315 2.147 1.805 1.456 1.074 0.878 0.309 0.24 0.006 -0.234 -0.755 -1.057 -1.388 -1.766 -2.215 -2.758 -3.415 -4.923 -2 ,29697 ,TETRA ,17591391,Sat Nov 27 22:40:32 CET,Sun Nov 28 00:31:56 CET,0.0 1.639 2.309 2.781 3.191 3.55 3.831 4.108 4.628 4.85 5.06 5.096 5.652 5.835 6.176 6.494 6.808 6.953 7.225 7.481 7.837 8.066 8.284 8.589 8.886 9.178 9.457 9.731 10.07 10.373 10.668 11.039 11.411 11.763 12.141 12.562 12.963 13.385 13.841 14.303 14.763 15.264 15.818 16.345 16.935 17.587 18.259 18.836 19.338 19.705 19.601 18.742 17.719 16.656 15.6 14.621 13.755 12.94 12.209 11.476 10.817 10.216 9.646 9.125 8.622 8.144 7.639 7.178 6.788 6.386 5.969 5.62 5.233 4.825 4.519 4.203 3.872 3.534 3.17 2.919 2.655 2.224 1.93 1.623 1.466 1.143 0.798 0.417 0.217 -0.35 -0.401 -0.622 -0.855 -1.379 -1.671 -1.996 -2.372 -2.771 -3.253 -3.878 -5.4 -3 ,15709 ,TETRA ,17591392,Sat Nov 27 22:41:25 CET,Sun Nov 28 00:31:32 CET,0.0 1.495 2.146 2.678 3.228 3.691 4.054 4.352 4.868 5.102 5.323 5.354 5.902 6.085 6.433 6.756 7.071 7.224 7.518 7.789 8.169 8.403 8.628 8.96 9.274 9.564 9.838 10.098 10.443 10.777 11.081 11.434 11.774 12.102 12.476 12.884 13.255 13.663 14.108 14.569 15.032 15.53 16.1 16.622 17.177 17.775 18.381 18.963 19.519 19.905 19.763 18.902 17.805 16.671 15.639 14.678 13.785 12.928 12.162 11.403 10.742 10.125 9.542 8.982 8.439 7.945 7.433 6.986 6.598 6.18 5.741 5.378 5.001 4.604 4.29 3.974 3.651 3.312 2.967 2.717 2.443 2.027 1.74 1.423 1.254 0.916 0.586 0.217 0.015 -0.552 -0.602 -0.838 -1.088 -1.615 -1.9 -2.214 -2.557 -2.979 -3.487 -4.133 -5.806 -4 ,631 ,TETRA ,17591393,Sat Nov 27 22:41:28 CET,Sun Nov 28 00:31:47 CET,0.0 1.24 1.805 2.243 2.623 2.966 3.283 3.589 4.147 4.385 4.597 4.617 5.175 5.362 5.693 6.004 6.304 6.446 6.717 6.974 7.356 7.593 7.81 8.134 8.437 8.727 9.01 9.276 9.621 9.949 10.26 10.637 10.993 11.327 11.701 12.122 12.521 12.939 13.393 13.873 14.366 14.907 15.512 16.077 16.672 17.266 17.885 18.482 18.96 19.209 19.008 18.134 17.039 15.972 14.917 13.89 12.981 12.116 11.367 10.618 9.943 9.33 8.754 8.208 7.704 7.24 6.752 6.307 5.912 5.513 5.101 4.737 4.345 3.93 3.616 3.305 2.973 2.618 2.249 2.002 1.748 1.335 1.034 0.714 0.552 0.228 -0.119 -0.491 -0.68 -1.249 -1.301 -1.523 -1.753 -2.302 -2.642 -3.016 -3.404 -3.831 -4.34 -4.984 -6.62 -5 ,30527 ,TETRA ,17591394,Sat Nov 27 22:41:30 CET,Sun Nov 28 00:31:34 CET,0.0 2.676 3.687 4.394 4.88 5.25 5.544 5.798 6.284 6.51 6.728 6.775 7.338 7.519 7.859 8.176 8.466 8.613 8.904 9.164 9.518 9.752 9.982 10.299 10.59 10.874 11.154 11.413 11.738 12.052 12.359 12.739 13.106 13.441 13.799 14.179 14.539 14.932 15.359 15.81 16.268 16.774 17.343 17.852 18.388 18.944 19.552 20.152 20.664 20.986 20.802 19.954 18.92 17.849 16.829 15.858 14.971 14.156 13.439 12.69 12.029 11.437 10.862 10.295 9.762 9.283 8.782 8.334 7.942 7.528 7.088 6.722 6.346 5.962 5.66 5.334 4.988 4.631 4.261 4.01 3.751 3.34 3.047 2.741 2.578 2.239 1.892 1.525 1.334 0.765 0.712 0.475 0.226 -0.298 -0.589 -0.918 -1.29 -1.707 -2.192 -2.84 -4.584 -6 ,14813 ,TETRA ,17591395,Sat Nov 27 22:41:31 CET,Sun Nov 28 00:31:44 CET,0.0 1.845 2.524 2.989 3.427 3.788 4.091 4.365 4.866 5.11 5.34 5.39 5.953 6.133 6.484 6.818 7.128 7.279 7.558 7.823 8.19 8.424 8.655 8.965 9.275 9.571 9.843 10.109 10.451 10.765 11.046 11.384 11.726 12.06 12.413 12.806 13.181 13.598 14.046 14.486 14.944 15.448 15.997 16.529 17.129 17.708 18.274 18.835 19.339 19.658 19.449 18.551 17.472 16.428 15.449 14.487 13.594 12.751 12.002 11.212 10.522 9.915 9.312 8.725 8.213 7.744 7.238 6.795 6.413 6.015 5.587 5.219 4.843 4.45 4.138 3.819 3.48 3.132 2.788 2.544 2.278 1.848 1.552 1.263 1.112 0.778 0.447 0.105 -0.09 -0.66 -0.711 -0.942 -1.181 -1.683 -1.965 -2.274 -2.618 -3.016 -3.494 -4.138 -6.009 -7 ,10870 ,TETRA ,17591396,Sat Nov 27 22:43:26 CET,Sun Nov 28 00:40:08 CET,0.0 1.892 2.594 3.1 3.51 3.871 4.186 4.458 4.963 5.186 5.383 5.403 5.952 6.124 6.469 6.792 7.096 7.25 7.526 7.775 8.133 8.363 8.598 8.935 9.242 9.526 9.801 10.071 10.403 10.732 11.047 11.412 11.766 12.099 12.481 12.914 13.296 13.698 14.143 14.607 15.069 15.563 16.102 16.589 17.143 17.727 18.294 18.835 19.353 19.697 19.585 18.858 17.841 16.731 15.692 14.717 13.822 12.98 12.254 11.508 10.852 10.272 9.699 9.143 8.629 8.158 7.642 7.171 6.764 6.333 5.887 5.515 5.129 4.739 4.438 4.116 3.779 3.435 3.07 2.804 2.521 2.078 1.78 1.472 1.308 0.982 0.643 0.258 0.058 -0.512 -0.589 -0.822 -1.067 -1.628 -1.937 -2.281 -2.649 -3.069 -3.579 -4.211 -5.895 -8 ,12843 ,TETRA ,17591397,Sat Nov 27 22:43:29 CET,Sun Nov 28 00:33:45 CET,0.0 1.544 2.186 2.649 3.057 3.41 3.713 3.992 4.476 4.7 4.921 4.965 5.523 5.704 6.034 6.365 6.689 6.835 7.113 7.384 7.771 8.006 8.226 8.54 8.852 9.16 9.43 9.679 10.009 10.321 10.619 10.971 11.313 11.638 12.026 12.453 12.842 13.263 13.692 14.144 14.616 15.107 15.65 16.175 16.752 17.336 17.932 18.516 19.022 19.345 19.248 18.475 17.425 16.261 15.177 14.215 13.348 12.501 11.731 10.947 10.285 9.707 9.134 8.59 8.078 7.582 7.064 6.609 6.215 5.795 5.346 4.975 4.589 4.185 3.866 3.533 3.188 2.832 2.461 2.21 1.956 1.556 1.263 0.947 0.789 0.451 0.098 -0.268 -0.462 -1.033 -1.104 -1.329 -1.57 -2.122 -2.417 -2.732 -3.089 -3.482 -3.988 -4.656 -6.444 -9 ,1005 ,TETRA ,17591398,Sat Nov 27 22:43:27 CET,Sun Nov 28 00:33:59 CET,0.0 2.345 3.057 3.584 4.026 4.388 4.679 4.954 5.469 5.701 5.904 5.888 6.43 6.617 6.982 7.304 7.588 7.719 7.993 8.259 8.619 8.859 9.089 9.411 9.721 10.014 10.295 10.565 10.906 11.225 11.536 11.899 12.244 12.588 12.968 13.375 13.767 14.16 14.549 14.982 15.457 15.974 16.523 17.027 17.601 18.22 18.821 19.38 19.906 20.281 20.172 19.345 18.28 17.216 16.247 15.261 14.353 13.567 12.872 12.145 11.495 10.893 10.336 9.792 9.274 8.808 8.297 7.832 7.433 7.009 6.565 6.196 5.811 5.392 5.059 4.725 4.371 4.024 3.674 3.429 3.169 2.757 2.471 2.165 2.009 1.676 1.322 0.961 0.774 0.213 0.147 -0.077 -0.305 -0.874 -1.192 -1.516 -1.869 -2.273 -2.775 -3.425 -5.005 -10 ,13617 ,TETRA ,17591399,Sat Nov 27 22:43:27 CET,Sun Nov 28 00:34:04 CET,0.0 1.533 2.14 2.609 2.984 3.301 3.601 3.88 4.372 4.6 4.819 4.858 5.418 5.598 5.929 6.231 6.526 6.669 6.948 7.207 7.561 7.789 8.007 8.324 8.634 8.92 9.189 9.457 9.794 10.114 10.414 10.767 11.116 11.454 11.836 12.255 12.652 13.081 13.53 13.987 14.443 14.922 15.449 15.957 16.536 17.13 17.734 18.334 18.869 19.179 18.976 18.145 17.125 16.082 15.039 14.029 13.115 12.275 11.544 10.783 10.094 9.48 8.898 8.344 7.834 7.365 6.873 6.427 6.03 5.623 5.189 4.822 4.455 4.061 3.739 3.407 3.07 2.71 2.316 2.051 1.798 1.405 1.124 0.825 0.67 0.347 0.017 -0.346 -0.542 -1.112 -1.15 -1.365 -1.592 -2.092 -2.394 -2.758 -3.135 -3.548 -4.061 -4.743 -6.372 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index e06a6ec1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17402 ,TETRA ,17591400,Sat Nov 27 22:43:28 CET,Sun Nov 28 00:35:52 CET,0.0 1.845 2.515 3.076 3.568 4.008 4.411 4.791 5.485 5.805 6.113 6.244 7.024 7.305 7.838 8.356 8.861 9.1 9.576 10.053 10.736 11.186 11.622 12.245 12.867 13.486 14.088 14.666 15.421 16.163 16.888 17.768 18.641 19.502 20.528 21.711 22.864 24.146 25.54 27.064 28.691 30.547 32.808 35.152 37.988 41.281 45.176 49.737 55.379 62.47 71.672 80.149 85.675 89.445 92.12 94.118 95.62 96.73 97.501 98.173 98.657 99.006 99.275 99.486 99.637 99.715 99.76 99.786 99.793 99.774 99.71 99.638 99.56 99.458 99.357 99.248 99.144 99.038 98.908 98.815 98.708 98.52 98.382 98.202 98.103 97.91 97.697 97.447 97.308 96.789 96.821 96.649 96.451 96.029 95.807 95.55 95.246 94.861 94.405 93.778 91.874 -2 ,19736 ,TETRA ,17591401,Sat Nov 27 22:43:30 CET,Sun Nov 28 00:35:40 CET,0.0 2.681 3.657 4.299 4.782 5.202 5.602 6.006 6.767 7.099 7.41 7.532 8.301 8.583 9.122 9.648 10.139 10.375 10.855 11.339 12.016 12.445 12.879 13.516 14.143 14.756 15.343 15.927 16.687 17.428 18.169 19.08 19.958 20.81 21.813 22.958 24.084 25.342 26.733 28.251 29.905 31.812 34.083 36.449 39.297 42.575 46.48 51.105 56.799 63.845 73.08 81.553 86.974 90.706 93.381 95.405 96.904 98.052 98.894 99.588 100.088 100.496 100.819 101.059 101.248 101.395 101.532 101.621 101.65 101.638 101.597 101.557 101.509 101.43 101.357 101.285 101.207 101.093 100.954 100.852 100.725 100.494 100.34 100.187 100.101 99.891 99.652 99.397 99.25 98.712 98.733 98.547 98.342 97.927 97.691 97.379 97.032 96.641 96.109 95.297 91.698 -3 ,25529 ,TETRA ,17591402,Sat Nov 27 22:46:28 CET,Sun Nov 28 00:39:24 CET,0.0 1.405 2.103 2.625 3.091 3.52 3.919 4.306 5.03 5.372 5.692 5.802 6.57 6.853 7.389 7.92 8.437 8.685 9.168 9.636 10.329 10.767 11.192 11.83 12.464 13.094 13.702 14.278 15.041 15.792 16.518 17.427 18.315 19.167 20.169 21.336 22.496 23.775 25.16 26.679 28.314 30.188 32.445 34.804 37.636 40.911 44.804 49.359 54.977 62.058 71.377 79.84 85.198 88.887 91.539 93.526 95.022 96.228 97.11 97.832 98.377 98.792 99.116 99.388 99.617 99.774 99.902 99.997 100.036 100.038 100.014 99.97 99.923 99.866 99.812 99.743 99.657 99.553 99.424 99.329 99.224 99.039 98.893 98.727 98.643 98.466 98.255 97.984 97.829 97.308 97.37 97.216 97.041 96.588 96.276 95.925 95.555 95.09 94.526 93.818 91.535 -4 ,17006 ,TETRA ,17591403,Sat Nov 27 22:46:29 CET,Sun Nov 28 00:39:38 CET,0.0 1.647 2.373 2.93 3.404 3.826 4.223 4.602 5.298 5.625 5.942 6.075 6.844 7.127 7.679 8.204 8.714 8.965 9.441 9.901 10.581 11.024 11.456 12.092 12.706 13.291 13.881 14.478 15.241 15.989 16.731 17.641 18.543 19.426 20.441 21.619 22.768 24.024 25.426 26.975 28.63 30.538 32.831 35.184 38.004 41.225 45.092 49.692 55.371 62.5 71.706 80.01 85.267 88.893 91.503 93.467 94.945 96.086 96.945 97.676 98.214 98.637 98.952 99.195 99.382 99.512 99.609 99.655 99.67 99.668 99.658 99.633 99.596 99.54 99.482 99.408 99.312 99.211 99.078 98.965 98.852 98.678 98.54 98.38 98.287 98.098 97.895 97.658 97.534 97.03 97.087 96.908 96.71 96.215 95.944 95.626 95.205 94.77 94.323 93.668 90.969 -5 ,1967 ,TETRA ,17591404,Sat Nov 27 22:46:31 CET,Sun Nov 28 00:39:06 CET,0.0 1.392 2.186 2.754 3.227 3.659 4.065 4.458 5.149 5.453 5.751 5.864 6.628 6.9 7.447 7.977 8.472 8.716 9.19 9.644 10.326 10.789 11.233 11.865 12.499 13.112 13.689 14.262 15.012 15.739 16.463 17.381 18.286 19.149 20.142 21.295 22.436 23.706 25.118 26.641 28.282 30.211 32.511 34.855 37.663 40.935 44.868 49.425 55.039 62.164 71.49 79.909 85.305 89.016 91.641 93.592 95.047 96.194 97.05 97.759 98.276 98.679 98.988 99.235 99.439 99.591 99.716 99.788 99.818 99.814 99.801 99.779 99.737 99.687 99.625 99.532 99.423 99.311 99.176 99.073 98.954 98.748 98.613 98.466 98.384 98.194 97.965 97.703 97.558 97.047 97.096 96.916 96.719 96.27 96.012 95.72 95.392 94.988 94.433 93.658 91.227 -6 ,2043 ,TETRA ,17591405,Sat Nov 27 22:46:33 CET,Sun Nov 28 00:38:48 CET,0.0 1.647 2.375 2.958 3.467 3.94 4.352 4.708 5.361 5.69 6.001 6.098 6.856 7.134 7.677 8.183 8.665 8.902 9.379 9.852 10.544 10.996 11.439 12.081 12.7 13.31 13.912 14.493 15.243 15.981 16.71 17.626 18.524 19.39 20.405 21.572 22.721 24.003 25.417 26.915 28.513 30.368 32.613 34.955 37.741 40.981 44.898 49.468 55.094 62.181 71.48 79.976 85.416 89.15 91.77 93.767 95.272 96.443 97.312 98.066 98.63 99.035 99.367 99.649 99.845 99.985 100.102 100.19 100.253 100.27 100.248 100.214 100.165 100.102 100.037 99.962 99.88 99.775 99.631 99.537 99.442 99.237 99.081 98.927 98.842 98.656 98.46 98.205 98.056 97.536 97.579 97.4 97.203 96.773 96.53 96.241 95.894 95.487 94.939 94.177 91.782 -7 ,8284 ,TETRA ,17591406,Sat Nov 27 22:49:28 CET,Sun Nov 28 00:41:14 CET,0.0 1.555 2.327 2.884 3.349 3.819 4.257 4.612 5.271 5.592 5.912 6.07 6.845 7.124 7.651 8.174 8.687 8.933 9.411 9.871 10.536 10.969 11.391 12.022 12.641 13.252 13.853 14.44 15.219 15.979 16.703 17.572 18.441 19.31 20.327 21.485 22.614 23.881 25.288 26.805 28.429 30.31 32.541 34.855 37.653 40.872 44.731 49.272 54.856 61.918 71.302 79.851 85.365 89.136 91.801 93.804 95.305 96.463 97.33 98.057 98.576 98.971 99.29 99.576 99.812 99.986 100.118 100.194 100.234 100.263 100.253 100.231 100.215 100.183 100.127 100.039 99.934 99.819 99.644 99.5 99.35 99.083 98.885 98.684 98.573 98.326 98.043 97.737 97.573 97.011 96.943 96.709 96.477 96.012 95.743 95.451 95.11 94.604 93.911 93.131 91.021 -8 ,9679 ,TETRA ,17591407,Sat Nov 27 22:49:30 CET,Sun Nov 28 00:41:28 CET,0.0 1.651 2.376 2.904 3.369 3.778 4.157 4.544 5.262 5.598 5.935 6.095 6.873 7.165 7.721 8.24 8.735 8.981 9.458 9.92 10.602 11.044 11.47 12.096 12.726 13.346 13.95 14.537 15.294 16.037 16.767 17.661 18.54 19.408 20.441 21.618 22.76 24.02 25.409 26.916 28.548 30.459 32.718 35.044 37.86 41.107 44.981 49.545 55.205 62.278 71.428 79.802 85.234 88.958 91.611 93.617 95.105 96.273 97.153 97.907 98.481 98.897 99.224 99.494 99.678 99.803 99.905 99.966 100.002 100.036 100.052 100.028 99.983 99.927 99.879 99.825 99.761 99.673 99.557 99.462 99.353 99.176 99.042 98.882 98.794 98.586 98.359 98.132 98.008 97.497 97.544 97.371 97.179 96.73 96.458 96.16 95.825 95.363 94.794 93.945 90.88 -9 ,12163 ,TETRA ,17591408,Sat Nov 27 22:49:31 CET,Sun Nov 28 00:42:41 CET,0.0 2.097 2.986 3.538 4.029 4.465 4.851 5.241 6.013 6.354 6.664 6.784 7.557 7.838 8.387 8.905 9.387 9.631 10.124 10.603 11.293 11.746 12.188 12.822 13.448 14.057 14.644 15.223 15.995 16.752 17.502 18.417 19.297 20.156 21.17 22.315 23.417 24.671 26.06 27.575 29.21 31.116 33.385 35.705 38.522 41.798 45.714 50.304 55.949 63.003 72.408 80.992 86.386 90.107 92.669 94.602 96.123 97.261 98.093 98.839 99.388 99.804 100.143 100.413 100.61 100.752 100.87 100.947 100.984 100.993 100.985 100.976 100.95 100.9 100.852 100.781 100.676 100.545 100.406 100.306 100.189 99.994 99.854 99.696 99.611 99.442 99.245 99.013 98.88 98.362 98.402 98.217 98.031 97.611 97.321 96.995 96.655 96.233 95.721 95.02 93.165 -10 ,23229 ,TETRA ,17591409,Sat Nov 27 22:49:33 CET,Sun Nov 28 00:42:16 CET,0.0 2.166 2.839 3.381 3.854 4.278 4.674 5.054 5.76 6.091 6.403 6.535 7.301 7.573 8.116 8.646 9.158 9.409 9.895 10.351 11.011 11.441 11.865 12.494 13.107 13.718 14.333 14.931 15.704 16.462 17.192 18.085 18.964 19.823 20.834 22.002 23.141 24.406 25.806 27.341 28.992 30.885 33.146 35.495 38.346 41.614 45.496 50.081 55.705 62.736 72.086 80.611 86.042 89.731 92.32 94.297 95.795 96.949 97.783 98.499 99.04 99.425 99.763 100.056 100.276 100.419 100.508 100.572 100.618 100.648 100.65 100.648 100.625 100.558 100.504 100.441 100.352 100.239 100.092 99.981 99.852 99.643 99.502 99.345 99.255 99.062 98.853 98.611 98.488 97.985 98.032 97.852 97.664 97.211 96.923 96.619 96.286 95.857 95.291 94.533 92.028 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt deleted file mode 100644 index 8e8ba7aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29313 ,TETRA ,17591410,Sat Nov 27 22:50:27 CET,Sun Nov 28 00:43:53 CET,0.0 1.257 1.772 2.176 2.528 2.857 3.163 3.419 3.869 4.08 4.279 4.192 4.861 5.025 5.333 5.637 5.925 6.071 6.368 6.655 7.062 7.314 7.562 7.917 8.259 8.592 8.907 9.212 9.608 9.982 10.336 10.758 11.155 11.538 11.975 12.477 12.952 13.465 14.017 14.588 15.189 15.866 16.611 17.307 18.12 19.012 19.99 21.049 22.17 23.303 24.375 24.755 24.621 24.253 23.761 23.256 22.749 22.175 21.673 21.185 20.702 20.246 19.809 19.391 18.988 18.602 18.199 17.846 17.549 17.242 16.916 16.634 16.341 16.032 15.783 15.511 15.213 14.898 14.569 14.36 14.149 13.799 13.56 13.293 13.15 12.873 12.576 12.226 12.023 11.339 11.375 11.137 10.87 10.233 9.889 9.543 9.126 8.604 8.001 7.351 6.06 -2 ,7892 ,TETRA ,17591411,Sat Nov 27 22:50:27 CET,Sun Nov 28 00:43:44 CET,0.0 1.487 2.021 2.433 2.786 3.1 3.368 3.612 4.07 4.27 4.458 4.334 4.986 5.158 5.494 5.784 6.058 6.203 6.48 6.743 7.102 7.324 7.544 7.862 8.182 8.492 8.778 9.061 9.432 9.805 10.169 10.602 11.012 11.383 11.832 12.343 12.793 13.304 13.867 14.434 15.037 15.696 16.444 17.212 18.081 18.999 19.996 21.064 22.233 23.456 24.614 25.007 24.826 24.463 23.974 23.439 22.922 22.39 21.877 21.333 20.871 20.448 20.012 19.589 19.172 18.767 18.339 17.964 17.63 17.262 16.882 16.572 16.239 15.882 15.615 15.345 15.076 14.803 14.493 14.263 14.016 13.643 13.393 13.12 12.978 12.697 12.392 12.068 11.895 11.24 11.323 11.104 10.882 10.392 10.108 9.788 9.441 9.079 8.647 7.981 5.785 -3 ,24623 ,TETRA ,17591412,Sat Nov 27 22:50:29 CET,Sun Nov 28 00:44:34 CET,0.0 1.172 1.703 2.116 2.488 2.8 3.056 3.298 3.748 3.949 4.148 4.024 4.669 4.837 5.151 5.438 5.711 5.844 6.101 6.351 6.718 6.95 7.172 7.506 7.825 8.125 8.405 8.675 9.034 9.372 9.682 10.044 10.408 10.768 11.188 11.67 12.137 12.646 13.184 13.744 14.335 15.003 15.747 16.472 17.308 18.191 19.185 20.272 21.432 22.632 23.687 24.058 23.925 23.556 23.088 22.557 22.034 21.522 21.039 20.509 20.022 19.565 19.118 18.694 18.285 17.889 17.465 17.094 16.77 16.44 16.086 15.776 15.454 15.114 14.85 14.576 14.28 13.963 13.659 13.446 13.209 12.84 12.579 12.293 12.146 11.864 11.572 11.245 11.073 10.423 10.505 10.303 10.088 9.585 9.313 9.013 8.629 8.141 7.625 6.998 5.168 -4 ,17792 ,TETRA ,17591413,Sat Nov 27 22:50:31 CET,Sun Nov 28 00:44:25 CET,0.0 1.209 1.685 2.084 2.443 2.748 3.005 3.234 3.64 3.83 4.024 3.924 4.592 4.771 5.087 5.374 5.661 5.806 6.076 6.335 6.715 6.967 7.212 7.532 7.824 8.115 8.393 8.661 9.037 9.416 9.773 10.186 10.558 10.911 11.327 11.784 12.206 12.667 13.154 13.693 14.322 15.022 15.788 16.536 17.388 18.3 19.265 20.334 21.564 22.816 23.911 24.358 24.3 23.979 23.54 23.077 22.619 22.142 21.704 21.203 20.737 20.327 19.936 19.557 19.182 18.846 18.477 18.127 17.822 17.503 17.158 16.862 16.568 16.279 16.04 15.776 15.501 15.215 14.918 14.717 14.515 14.189 13.947 13.678 13.54 13.228 12.861 12.476 12.273 11.584 11.577 11.319 11.052 10.451 10.118 9.778 9.375 8.898 8.381 7.772 6.309 -5 ,21315 ,TETRA ,17591414,Sat Nov 27 22:51:27 CET,Sun Nov 28 00:30:43 CET,0.0 1.237 1.742 2.14 2.472 2.766 3.041 3.293 3.724 3.929 4.131 4.036 4.697 4.887 5.251 5.58 5.891 6.047 6.35 6.633 7.022 7.268 7.515 7.859 8.183 8.5 8.807 9.115 9.511 9.889 10.25 10.665 11.06 11.437 11.87 12.349 12.806 13.298 13.827 14.39 14.961 15.581 16.279 16.996 17.856 18.796 19.824 20.908 22.071 23.212 24.224 24.574 24.431 24.042 23.526 22.962 22.422 21.882 21.367 20.832 20.343 19.895 19.455 19.025 18.599 18.198 17.812 17.455 17.124 16.796 16.464 16.184 15.886 15.558 15.31 15.053 14.77 14.49 14.19 13.972 13.753 13.394 13.141 12.875 12.721 12.402 12.099 11.778 11.603 10.947 11.038 10.837 10.615 10.128 9.847 9.527 9.187 8.828 8.385 7.763 5.94 -6 ,3229 ,TETRA ,17591415,Sat Nov 27 22:52:28 CET,Sun Nov 28 00:30:42 CET,0.0 1.486 2.033 2.457 2.809 3.113 3.388 3.63 4.073 4.291 4.496 4.39 5.051 5.224 5.57 5.891 6.171 6.305 6.578 6.844 7.209 7.432 7.654 7.978 8.287 8.586 8.874 9.158 9.509 9.847 10.176 10.567 10.932 11.267 11.667 12.12 12.548 13.026 13.553 14.071 14.596 15.221 15.949 16.702 17.559 18.459 19.492 20.608 21.805 22.996 24.083 24.489 24.29 23.878 23.4 22.903 22.423 21.905 21.403 20.871 20.396 19.972 19.515 19.04 18.614 18.231 17.809 17.415 17.089 16.749 16.398 16.101 15.782 15.465 15.234 14.979 14.693 14.393 14.072 13.843 13.605 13.246 12.999 12.74 12.603 12.319 12.021 11.68 11.489 10.824 10.908 10.701 10.482 10.002 9.735 9.439 9.106 8.746 8.314 7.55 5.813 -7 ,29965 ,TETRA ,17591416,Sat Nov 27 22:57:28 CET,Sun Nov 28 00:48:48 CET,0.0 1.447 1.976 2.361 2.696 2.983 3.249 3.491 3.932 4.133 4.332 4.226 4.878 5.036 5.342 5.642 5.932 6.074 6.34 6.597 6.971 7.195 7.415 7.738 8.056 8.385 8.705 9.011 9.402 9.78 10.138 10.561 10.969 11.359 11.812 12.31 12.784 13.3 13.85 14.42 14.991 15.639 16.38 17.096 17.943 18.845 19.791 20.836 22.01 23.179 24.286 24.754 24.592 24.195 23.755 23.261 22.764 22.266 21.787 21.282 20.852 20.455 20.059 19.671 19.285 18.924 18.531 18.17 17.853 17.528 17.19 16.9 16.604 16.302 16.055 15.785 15.496 15.198 14.898 14.686 14.46 14.098 13.848 13.59 13.452 13.163 12.854 12.519 12.345 11.708 11.823 11.611 11.392 10.895 10.616 10.32 9.979 9.597 9.155 8.518 6.804 -8 ,28627 ,TETRA ,17591417,Sat Nov 27 22:57:28 CET,Sun Nov 28 00:51:05 CET,0.0 1.13 1.592 1.967 2.302 2.593 2.841 3.081 3.527 3.731 3.927 3.82 4.466 4.629 4.95 5.266 5.591 5.74 5.997 6.243 6.614 6.86 7.095 7.436 7.773 8.108 8.42 8.712 9.1 9.468 9.819 10.252 10.659 11.045 11.5 11.999 12.463 12.98 13.539 14.126 14.729 15.412 16.199 16.922 17.748 18.639 19.591 20.615 21.679 22.805 23.858 24.228 24.083 23.713 23.238 22.681 22.166 21.655 21.154 20.632 20.164 19.73 19.297 18.868 18.458 18.089 17.712 17.37 17.063 16.739 16.388 16.081 15.764 15.444 15.19 14.924 14.644 14.361 14.069 13.862 13.644 13.293 13.046 12.79 12.659 12.385 12.087 11.775 11.613 10.966 11.06 10.861 10.651 10.168 9.9 9.616 9.288 8.928 8.503 7.943 6.043 -9 ,14898 ,TETRA ,17591418,Sat Nov 27 22:57:30 CET,Sun Nov 28 00:51:07 CET,0.0 1.499 2.088 2.476 2.807 3.113 3.385 3.627 4.061 4.255 4.449 4.347 5.005 5.178 5.5 5.786 6.053 6.187 6.456 6.701 7.035 7.26 7.488 7.812 8.11 8.407 8.697 8.972 9.326 9.651 9.973 10.395 10.778 11.127 11.564 12.089 12.593 13.121 13.682 14.269 14.876 15.56 16.337 17.082 17.916 18.831 19.874 20.958 22.083 23.251 24.279 24.675 24.522 24.126 23.652 23.13 22.594 22.056 21.57 21.05 20.577 20.144 19.707 19.279 18.883 18.485 18.079 17.736 17.412 17.062 16.688 16.378 16.046 15.687 15.421 15.142 14.836 14.513 14.161 13.917 13.66 13.245 12.955 12.645 12.493 12.212 11.902 11.549 11.371 10.714 10.813 10.614 10.397 9.911 9.626 9.328 9.015 8.581 8.049 7.425 5.712 -10 ,8516 ,TETRA ,17591419,Sat Nov 27 22:57:34 CET,Sun Nov 28 00:50:23 CET,0.0 1.374 1.889 2.299 2.637 2.92 3.179 3.425 3.862 4.068 4.27 4.166 4.822 4.992 5.339 5.67 5.979 6.122 6.389 6.643 7.0 7.225 7.443 7.759 8.07 8.377 8.668 8.951 9.313 9.657 9.978 10.338 10.682 11.029 11.433 11.893 12.346 12.834 13.361 13.929 14.512 15.161 15.903 16.635 17.448 18.294 19.229 20.241 21.372 22.561 23.612 24.029 23.878 23.468 22.997 22.486 21.971 21.457 20.967 20.441 19.938 19.476 19.053 18.623 18.193 17.806 17.399 17.014 16.685 16.342 15.965 15.654 15.315 14.944 14.663 14.369 14.06 13.729 13.397 13.174 12.925 12.538 12.262 11.969 11.824 11.521 11.187 10.785 10.564 9.875 9.916 9.686 9.444 8.984 8.731 8.432 8.106 7.734 7.299 6.729 4.92 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index 5532fe93..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29076 ,TETRA ,17591420,Sat Nov 27 22:57:34 CET,Sun Nov 28 00:47:42 CET,0.0 1.53 2.183 2.666 3.076 3.432 3.731 3.995 4.467 4.69 4.902 4.935 5.502 5.677 6.003 6.337 6.636 6.77 7.039 7.3 7.661 7.893 8.123 8.439 8.735 9.027 9.318 9.609 9.962 10.283 10.591 10.95 11.291 11.61 11.975 12.39 12.78 13.181 13.585 14.039 14.528 15.039 15.63 16.203 16.833 17.479 18.115 18.748 19.343 19.683 19.525 18.736 17.72 16.683 15.663 14.698 13.856 13.035 12.297 11.569 10.93 10.333 9.769 9.252 8.759 8.287 7.785 7.331 6.933 6.523 6.095 5.732 5.358 4.989 4.715 4.421 4.093 3.748 3.381 3.131 2.881 2.45 2.153 1.873 1.724 1.394 1.041 0.672 0.475 -0.102 -0.154 -0.384 -0.624 -1.138 -1.433 -1.764 -2.144 -2.573 -3.13 -3.873 -5.855 -2 ,10532 ,TETRA ,17591421,Sat Nov 27 22:58:07 CET,Sun Nov 28 00:49:07 CET,0.0 2.868 3.586 4.101 4.529 4.886 5.2 5.482 5.986 6.222 6.44 6.455 6.993 7.168 7.515 7.824 8.118 8.264 8.544 8.802 9.16 9.387 9.608 9.915 10.203 10.491 10.763 11.033 11.37 11.676 11.969 12.32 12.658 12.982 13.351 13.754 14.127 14.513 14.924 15.357 15.792 16.295 16.877 17.401 17.996 18.628 19.194 19.707 20.204 20.474 20.285 19.481 18.478 17.404 16.415 15.502 14.666 13.884 13.161 12.398 11.747 11.176 10.615 10.073 9.559 9.084 8.586 8.138 7.763 7.369 6.935 6.571 6.198 5.812 5.519 5.228 4.92 4.591 4.251 4.013 3.761 3.363 3.096 2.822 2.667 2.339 2.018 1.675 1.489 0.918 0.866 0.641 0.392 -0.158 -0.467 -0.803 -1.162 -1.594 -2.104 -2.731 -5.219 -3 ,31097 ,TETRA ,17591422,Sat Nov 27 22:58:08 CET,Sun Nov 28 00:49:06 CET,0.0 3.414 4.301 4.835 5.255 5.602 5.919 6.21 6.706 6.936 7.152 7.162 7.714 7.883 8.209 8.533 8.833 8.979 9.257 9.512 9.887 10.133 10.359 10.682 10.997 11.284 11.552 11.805 12.143 12.469 12.785 13.161 13.501 13.82 14.187 14.595 14.992 15.429 15.888 16.372 16.845 17.371 17.961 18.495 19.061 19.633 20.267 20.906 21.451 21.855 21.791 20.961 19.925 18.877 17.884 16.936 16.102 15.311 14.592 13.86 13.235 12.652 12.07 11.528 11.018 10.552 10.043 9.594 9.211 8.802 8.372 8.015 7.648 7.255 6.949 6.641 6.311 5.951 5.588 5.339 5.091 4.697 4.409 4.12 3.971 3.65 3.308 2.937 2.74 2.17 2.108 1.865 1.605 1.034 0.719 0.376 -0.011 -0.442 -0.948 -1.641 -3.639 -4 ,6332 ,TETRA ,17591423,Sat Nov 27 22:58:10 CET,Sun Nov 28 00:48:35 CET,0.0 1.695 2.397 2.868 3.229 3.575 3.892 4.168 4.671 4.9 5.112 5.141 5.702 5.888 6.237 6.559 6.871 7.019 7.304 7.577 7.957 8.196 8.421 8.741 9.051 9.356 9.64 9.915 10.254 10.561 10.853 11.221 11.579 11.913 12.289 12.702 13.104 13.517 13.936 14.391 14.865 15.374 15.944 16.473 17.044 17.628 18.238 18.845 19.35 19.681 19.58 18.752 17.713 16.693 15.726 14.778 13.905 13.099 12.404 11.678 11.034 10.469 9.925 9.383 8.857 8.376 7.874 7.434 7.057 6.653 6.23 5.88 5.49 5.078 4.777 4.469 4.142 3.782 3.403 3.15 2.888 2.477 2.193 1.886 1.72 1.405 1.075 0.705 0.517 -0.056 -0.11 -0.338 -0.576 -1.087 -1.378 -1.721 -2.094 -2.526 -3.074 -3.751 -5.253 -5 ,15314 ,TETRA ,17591424,Sat Nov 27 22:58:12 CET,Sun Nov 28 00:48:31 CET,0.0 2.353 3.004 3.462 3.863 4.216 4.529 4.802 5.281 5.492 5.711 5.757 6.305 6.472 6.79 7.088 7.371 7.514 7.795 8.064 8.448 8.684 8.912 9.244 9.548 9.843 10.135 10.415 10.75 11.058 11.357 11.711 12.055 12.374 12.728 13.136 13.533 13.94 14.367 14.818 15.278 15.817 16.411 16.968 17.594 18.21 18.863 19.52 20.082 20.426 20.266 19.41 18.354 17.313 16.345 15.419 14.585 13.796 13.08 12.346 11.701 11.135 10.599 10.07 9.557 9.097 8.625 8.185 7.8 7.402 6.983 6.638 6.262 5.866 5.573 5.258 4.929 4.584 4.206 3.949 3.707 3.336 3.065 2.783 2.641 2.317 1.944 1.578 1.396 0.835 0.798 0.569 0.321 -0.214 -0.509 -0.84 -1.199 -1.596 -2.158 -2.864 -4.782 -6 ,28547 ,TETRA ,17591425,Sat Nov 27 23:00:07 CET,Sun Nov 28 00:50:47 CET,0.0 2.124 2.864 3.38 3.78 4.144 4.44 4.705 5.214 5.444 5.651 5.673 6.237 6.407 6.727 7.036 7.335 7.475 7.732 7.983 8.346 8.584 8.819 9.159 9.473 9.771 10.052 10.321 10.673 10.991 11.287 11.644 12.003 12.363 12.742 13.152 13.575 14.035 14.503 14.984 15.439 15.9 16.458 17.029 17.654 18.306 18.972 19.565 20.014 20.199 19.954 19.073 18.017 17.009 16.053 15.103 14.234 13.45 12.743 11.987 11.326 10.719 10.116 9.578 9.092 8.631 8.147 7.719 7.35 6.967 6.572 6.23 5.853 5.451 5.142 4.822 4.496 4.166 3.823 3.579 3.314 2.892 2.599 2.296 2.138 1.816 1.481 1.108 0.922 0.362 0.325 0.11 -0.12 -0.637 -0.95 -1.29 -1.657 -2.139 -2.721 -3.551 -6.794 -7 ,11655 ,TETRA ,17591426,Sat Nov 27 23:00:08 CET,Sun Nov 28 00:50:46 CET,0.0 1.837 2.519 3.02 3.446 3.816 4.133 4.405 4.888 5.11 5.321 5.335 5.885 6.063 6.389 6.688 6.972 7.112 7.407 7.683 8.059 8.302 8.528 8.857 9.173 9.46 9.739 10.022 10.376 10.695 11.012 11.396 11.744 12.07 12.441 12.856 13.257 13.702 14.163 14.62 15.077 15.567 16.134 16.693 17.277 17.846 18.434 18.991 19.487 19.821 19.717 18.904 17.814 16.7 15.703 14.771 13.894 13.067 12.325 11.584 10.939 10.357 9.794 9.255 8.761 8.31 7.84 7.408 7.02 6.611 6.186 5.831 5.453 5.053 4.745 4.437 4.133 3.807 3.444 3.187 2.923 2.518 2.239 1.955 1.809 1.493 1.144 0.765 0.575 0.01 -0.053 -0.284 -0.528 -1.05 -1.35 -1.666 -2.009 -2.425 -2.935 -3.607 -5.282 -8 ,1426 ,TETRA ,17591427,Sat Nov 27 23:00:11 CET,Sun Nov 28 00:51:37 CET,0.0 1.502 2.141 2.637 3.035 3.364 3.656 3.948 4.442 4.657 4.866 4.897 5.458 5.649 6.009 6.343 6.655 6.798 7.066 7.323 7.694 7.928 8.148 8.451 8.747 9.041 9.313 9.578 9.929 10.252 10.554 10.912 11.251 11.572 11.956 12.396 12.8 13.225 13.665 14.132 14.613 15.139 15.726 16.294 16.886 17.477 18.112 18.688 19.19 19.595 19.565 18.806 17.774 16.693 15.716 14.831 13.975 13.154 12.448 11.711 11.061 10.483 9.937 9.416 8.925 8.468 7.99 7.553 7.177 6.807 6.415 6.078 5.739 5.383 5.076 4.755 4.435 4.094 3.742 3.498 3.231 2.793 2.487 2.191 2.042 1.712 1.364 0.996 0.806 0.246 0.206 -0.025 -0.274 -0.798 -1.089 -1.434 -1.829 -2.278 -2.808 -3.56 -5.724 -9 ,2088 ,TETRA ,17591428,Sat Nov 27 23:00:12 CET,Sun Nov 28 00:51:16 CET,0.0 1.643 2.468 3.178 3.65 3.988 4.314 4.634 5.166 5.39 5.597 5.614 6.167 6.359 6.714 7.024 7.335 7.484 7.762 8.036 8.397 8.625 8.857 9.169 9.446 9.715 9.989 10.264 10.61 10.924 11.232 11.616 11.97 12.3 12.681 13.109 13.506 13.932 14.388 14.855 15.324 15.823 16.391 16.932 17.539 18.221 18.92 19.517 20.041 20.403 20.277 19.451 18.441 17.406 16.405 15.447 14.616 13.844 13.145 12.388 11.734 11.187 10.635 10.101 9.599 9.125 8.648 8.217 7.812 7.391 6.971 6.617 6.245 5.864 5.547 5.224 4.915 4.594 4.262 4.029 3.782 3.388 3.099 2.798 2.649 2.329 1.99 1.632 1.443 0.877 0.835 0.603 0.307 -0.315 -0.617 -0.969 -1.357 -1.825 -2.421 -3.161 -4.83 -10 ,23968 ,TETRA ,17591429,Sat Nov 27 23:00:07 CET,Sun Nov 28 00:51:27 CET,0.0 1.796 2.442 2.936 3.349 3.728 4.053 4.346 4.887 5.126 5.333 5.335 5.886 6.076 6.433 6.757 7.066 7.213 7.482 7.737 8.117 8.359 8.594 8.918 9.232 9.537 9.831 10.12 10.482 10.823 11.141 11.514 11.877 12.211 12.583 12.987 13.368 13.784 14.235 14.697 15.132 15.603 16.146 16.658 17.203 17.775 18.4 19.014 19.539 19.854 19.686 18.781 17.677 16.611 15.637 14.691 13.797 12.98 12.275 11.532 10.883 10.321 9.756 9.213 8.709 8.234 7.729 7.296 6.933 6.54 6.121 5.772 5.41 5.036 4.748 4.444 4.129 3.809 3.464 3.206 2.943 2.535 2.253 1.96 1.798 1.46 1.113 0.747 0.557 -0.019 -0.104 -0.336 -0.563 -1.101 -1.397 -1.724 -2.121 -2.555 -3.03 -3.67 -5.657 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index ff4600d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11096 ,KEBNE ,17026866,Wed Dec 22 15:51:18 CET,Wed Dec 22 17:26:52 CET,0.0 1.443 2.008 2.461 2.818 3.129 3.414 3.66 4.15 4.384 4.598 4.622 5.163 5.327 5.644 5.938 6.209 6.342 6.594 6.828 7.166 7.385 7.597 7.881 8.15 8.417 8.676 8.928 9.232 9.508 9.766 10.079 10.386 10.671 10.989 11.352 11.692 12.048 12.43 12.837 13.268 13.719 14.181 14.628 15.129 15.617 16.082 16.485 16.779 16.837 16.366 15.187 13.885 12.674 11.56 10.497 9.512 8.583 7.784 7.002 6.333 5.728 5.134 4.562 4.028 3.537 3.021 2.542 2.117 1.685 1.249 0.889 0.498 0.077 -0.26 -0.609 -0.957 -1.327 -1.722 -1.988 -2.266 -2.691 -2.994 -3.333 -3.511 -3.862 -4.217 -4.599 -4.8 -5.387 -5.468 -5.694 -5.95 -6.575 -6.922 -7.271 -7.659 -8.116 -8.644 -9.38 -11.738 -2 ,391 ,KEBNE ,17026867,Wed Dec 22 15:51:19 CET,Wed Dec 22 17:26:36 CET,0.0 1.62 2.249 2.686 3.028 3.351 3.65 3.909 4.371 4.593 4.799 4.796 5.335 5.505 5.83 6.132 6.414 6.548 6.788 7.018 7.374 7.605 7.819 8.11 8.382 8.645 8.892 9.121 9.416 9.703 9.972 10.301 10.626 10.923 11.248 11.605 11.938 12.297 12.655 13.022 13.424 13.843 14.283 14.696 15.142 15.575 16.038 16.489 16.823 16.887 16.303 15.054 13.752 12.524 11.377 10.296 9.341 8.453 7.666 6.881 6.181 5.518 4.902 4.345 3.805 3.311 2.795 2.326 1.902 1.445 0.97 0.583 0.192 -0.222 -0.549 -0.891 -1.251 -1.625 -2.013 -2.281 -2.566 -3.044 -3.376 -3.72 -3.905 -4.271 -4.647 -5.055 -5.264 -5.848 -5.961 -6.218 -6.477 -7.016 -7.331 -7.698 -8.094 -8.533 -9.114 -9.981 -12.756 -3 ,6970 ,KEBNE ,17026868,Wed Dec 22 15:51:19 CET,Wed Dec 22 17:28:37 CET,0.0 1.575 2.127 2.552 2.902 3.221 3.522 3.79 4.254 4.457 4.657 4.652 5.189 5.356 5.659 5.935 6.209 6.345 6.603 6.841 7.179 7.395 7.617 7.912 8.19 8.462 8.711 8.958 9.261 9.534 9.81 10.139 10.446 10.753 11.112 11.507 11.863 12.226 12.596 12.988 13.38 13.812 14.322 14.789 15.292 15.797 16.285 16.747 17.118 17.203 16.718 15.522 14.249 13.032 11.921 10.872 9.924 9.058 8.317 7.568 6.894 6.269 5.669 5.083 4.542 4.053 3.51 3.034 2.637 2.214 1.785 1.428 1.023 0.593 0.267 -0.079 -0.436 -0.801 -1.209 -1.494 -1.776 -2.215 -2.517 -2.853 -3.031 -3.393 -3.765 -4.152 -4.357 -4.94 -5.003 -5.238 -5.5 -6.085 -6.403 -6.744 -7.135 -7.623 -8.208 -8.943 -11.27 -4 ,1926 ,KEBNE ,17026869,Wed Dec 22 15:51:19 CET,Wed Dec 22 17:28:33 CET,0.0 1.75 2.383 2.835 3.219 3.549 3.833 4.102 4.583 4.785 4.964 4.941 5.479 5.649 5.971 6.252 6.506 6.631 6.879 7.124 7.48 7.7 7.912 8.21 8.475 8.737 9.0 9.244 9.538 9.833 10.128 10.462 10.778 11.067 11.392 11.765 12.107 12.471 12.844 13.225 13.598 14.006 14.473 14.901 15.368 15.86 16.32 16.695 16.993 17.061 16.563 15.444 14.205 12.974 11.839 10.794 9.851 8.962 8.169 7.369 6.685 6.065 5.464 4.882 4.321 3.796 3.273 2.806 2.363 1.91 1.459 1.089 0.716 0.312 -0.006 -0.334 -0.683 -1.058 -1.454 -1.729 -2.017 -2.467 -2.775 -3.081 -3.252 -3.619 -3.999 -4.413 -4.622 -5.212 -5.315 -5.575 -5.848 -6.427 -6.765 -7.135 -7.546 -8.011 -8.578 -9.402 -12.069 -5 ,17902 ,KEBNE ,17026870,Wed Dec 22 15:51:18 CET,Wed Dec 22 17:26:51 CET,0.0 1.672 2.375 2.925 3.325 3.652 3.946 4.201 4.648 4.864 5.061 5.065 5.591 5.739 6.05 6.362 6.651 6.783 7.037 7.292 7.647 7.855 8.058 8.352 8.625 8.901 9.151 9.382 9.694 9.995 10.279 10.622 10.94 11.229 11.573 11.95 12.279 12.63 12.996 13.396 13.802 14.225 14.707 15.148 15.629 16.107 16.549 16.927 17.227 17.324 16.87 15.734 14.464 13.213 12.098 11.056 10.117 9.222 8.439 7.636 6.941 6.324 5.711 5.119 4.555 4.041 3.523 3.051 2.631 2.2 1.727 1.343 0.97 0.582 0.27 -0.058 -0.396 -0.761 -1.141 -1.404 -1.697 -2.156 -2.455 -2.781 -2.951 -3.308 -3.703 -4.099 -4.309 -4.91 -5.028 -5.284 -5.539 -6.072 -6.402 -6.792 -7.21 -7.678 -8.275 -9.104 -11.552 -6 ,3390 ,KEBNE ,17026871,Wed Dec 22 15:51:18 CET,Wed Dec 22 17:26:33 CET,0.0 1.262 1.891 2.37 2.773 3.09 3.371 3.654 4.173 4.39 4.573 4.56 5.107 5.274 5.564 5.855 6.153 6.283 6.52 6.755 7.1 7.315 7.515 7.824 8.134 8.414 8.663 8.903 9.206 9.512 9.802 10.116 10.404 10.685 11.014 11.367 11.692 12.043 12.404 12.755 13.116 13.523 13.964 14.357 14.779 15.204 15.636 16.015 16.308 16.341 15.728 14.555 13.356 12.16 11.049 10.034 9.06 8.137 7.35 6.566 5.899 5.281 4.68 4.11 3.561 3.046 2.5 2.014 1.6 1.166 0.715 0.334 -0.075 -0.502 -0.838 -1.182 -1.535 -1.902 -2.292 -2.562 -2.863 -3.35 -3.668 -4.006 -4.175 -4.518 -4.903 -5.307 -5.528 -6.116 -6.217 -6.477 -6.748 -7.339 -7.668 -8.043 -8.44 -8.88 -9.46 -10.216 -12.772 -7 ,8343 ,KEBNE ,17026872,Wed Dec 22 15:51:22 CET,Wed Dec 22 17:21:36 CET,0.0 1.411 2.089 2.568 2.939 3.277 3.592 3.861 4.325 4.531 4.728 4.728 5.26 5.432 5.761 6.07 6.339 6.461 6.709 6.952 7.309 7.531 7.741 8.038 8.336 8.611 8.848 9.088 9.401 9.693 9.968 10.302 10.619 10.928 11.285 11.637 11.955 12.318 12.705 13.116 13.531 13.95 14.379 14.791 15.263 15.756 16.264 16.743 17.089 17.183 16.71 15.522 14.238 13.009 11.92 10.906 9.941 9.061 8.29 7.488 6.796 6.197 5.605 5.0 4.437 3.942 3.418 2.944 2.542 2.131 1.675 1.292 0.922 0.506 0.173 -0.169 -0.527 -0.907 -1.316 -1.589 -1.87 -2.311 -2.631 -2.963 -3.13 -3.484 -3.87 -4.285 -4.501 -5.094 -5.199 -5.442 -5.698 -6.285 -6.624 -6.987 -7.386 -7.839 -8.354 -9.126 -11.691 -8 ,29874 ,KEBNE ,17026873,Wed Dec 22 15:51:22 CET,Wed Dec 22 17:21:54 CET,0.0 1.679 2.222 2.654 3.041 3.403 3.717 3.972 4.432 4.65 4.856 4.866 5.409 5.579 5.926 6.236 6.507 6.636 6.895 7.144 7.472 7.687 7.896 8.189 8.464 8.718 8.971 9.223 9.527 9.806 10.075 10.398 10.717 11.016 11.34 11.689 11.995 12.327 12.684 13.048 13.459 13.916 14.404 14.882 15.398 15.871 16.319 16.778 17.147 17.269 16.744 15.527 14.323 13.14 11.985 10.914 9.961 9.087 8.327 7.558 6.873 6.23 5.625 5.053 4.518 4.027 3.496 3.009 2.588 2.165 1.72 1.327 0.922 0.495 0.159 -0.162 -0.502 -0.882 -1.285 -1.565 -1.848 -2.27 -2.555 -2.866 -3.035 -3.395 -3.785 -4.237 -4.466 -5.07 -5.237 -5.511 -5.783 -6.376 -6.688 -7.012 -7.386 -7.856 -8.46 -9.214 -11.617 -9 ,26810 ,KEBNE ,17026874,Wed Dec 22 15:51:22 CET,Wed Dec 22 17:22:04 CET,0.0 1.27 1.836 2.277 2.661 2.995 3.293 3.567 4.008 4.219 4.438 4.445 4.973 5.145 5.481 5.8 6.09 6.223 6.484 6.741 7.09 7.3 7.516 7.823 8.105 8.368 8.605 8.831 9.113 9.39 9.668 9.996 10.307 10.615 10.963 11.326 11.667 12.048 12.448 12.869 13.288 13.708 14.182 14.661 15.181 15.688 16.179 16.582 16.845 16.864 16.362 15.23 13.999 12.776 11.614 10.55 9.625 8.755 7.97 7.168 6.455 5.822 5.228 4.666 4.122 3.609 3.063 2.581 2.179 1.759 1.312 0.931 0.524 0.103 -0.222 -0.557 -0.9 -1.249 -1.632 -1.916 -2.207 -2.66 -2.973 -3.29 -3.457 -3.825 -4.223 -4.62 -4.825 -5.415 -5.524 -5.779 -6.044 -6.64 -6.971 -7.309 -7.689 -8.168 -8.72 -9.386 -11.395 -10 ,7067 ,KEBNE ,17026875,Wed Dec 22 15:51:22 CET,Wed Dec 22 17:22:01 CET,0.0 1.421 2.027 2.502 2.847 3.144 3.434 3.692 4.139 4.35 4.556 4.573 5.109 5.275 5.585 5.866 6.143 6.286 6.546 6.784 7.12 7.345 7.56 7.843 8.123 8.402 8.655 8.879 9.176 9.459 9.73 10.072 10.393 10.693 11.03 11.416 11.773 12.135 12.496 12.868 13.259 13.697 14.202 14.656 15.132 15.596 16.035 16.458 16.812 16.906 16.433 15.281 14.043 12.853 11.761 10.717 9.76 8.88 8.102 7.296 6.577 5.948 5.35 4.768 4.213 3.715 3.214 2.764 2.36 1.912 1.441 1.056 0.666 0.263 -0.063 -0.406 -0.761 -1.117 -1.484 -1.749 -2.027 -2.46 -2.769 -3.083 -3.244 -3.607 -3.983 -4.362 -4.575 -5.172 -5.268 -5.515 -5.776 -6.361 -6.69 -7.052 -7.468 -7.965 -8.602 -9.43 -11.834 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt deleted file mode 100644 index 45f7fae0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22925 ,TETRA ,17591430,Sat Nov 27 23:00:12 CET,Sun Nov 28 00:52:30 CET,0.0 2.521 3.201 3.682 4.086 4.431 4.741 5.028 5.558 5.785 5.992 6.02 6.564 6.736 7.089 7.441 7.757 7.905 8.191 8.453 8.829 9.08 9.322 9.652 9.968 10.273 10.57 10.852 11.196 11.533 11.842 12.207 12.577 12.919 13.303 13.745 14.171 14.629 15.096 15.568 16.045 16.576 17.174 17.736 18.382 19.065 19.768 20.438 21.09 21.625 21.718 21.072 20.209 19.29 18.384 17.452 16.567 15.698 14.928 14.175 13.508 12.887 12.272 11.704 11.165 10.646 10.094 9.612 9.205 8.771 8.291 7.893 7.495 7.074 6.746 6.405 6.042 5.656 5.262 4.998 4.713 4.246 3.92 3.576 3.398 3.014 2.599 2.176 1.95 1.344 1.231 0.969 0.703 0.111 -0.21 -0.567 -0.978 -1.453 -2.035 -2.794 -5.493 -2 ,10855 ,TETRA ,17591431,Sat Nov 27 23:00:09 CET,Sun Nov 28 00:54:25 CET,0.0 1.808 2.425 2.908 3.316 3.658 3.964 4.257 4.805 5.045 5.272 5.33 5.896 6.086 6.437 6.773 7.083 7.224 7.501 7.781 8.165 8.397 8.63 8.968 9.29 9.614 9.928 10.216 10.557 10.891 11.224 11.627 12.015 12.385 12.788 13.222 13.649 14.09 14.521 14.995 15.499 16.047 16.657 17.221 17.87 18.565 19.301 20.025 20.672 21.147 21.316 20.851 20.011 19.059 18.097 17.168 16.372 15.629 14.923 14.159 13.46 12.853 12.279 11.731 11.204 10.703 10.172 9.684 9.261 8.833 8.385 7.993 7.59 7.165 6.82 6.458 6.076 5.695 5.296 5.021 4.747 4.288 3.962 3.63 3.458 3.076 2.682 2.287 2.072 1.479 1.371 1.118 0.847 0.215 -0.128 -0.513 -0.939 -1.391 -1.987 -2.79 -5.434 -3 ,23849 ,TETRA ,17591432,Sat Nov 27 23:00:11 CET,Sun Nov 28 00:54:14 CET,0.0 1.828 2.456 2.92 3.292 3.633 3.963 4.253 4.755 4.99 5.215 5.248 5.8 5.995 6.369 6.709 7.021 7.163 7.439 7.725 8.142 8.384 8.6 8.929 9.251 9.534 9.808 10.08 10.429 10.755 11.067 11.457 11.806 12.132 12.536 12.977 13.374 13.803 14.276 14.772 15.25 15.748 16.306 16.834 17.447 18.115 18.764 19.409 20.02 20.473 20.58 19.994 19.11 18.157 17.213 16.277 15.438 14.671 13.961 13.198 12.533 11.946 11.349 10.743 10.154 9.614 9.092 8.621 8.201 7.763 7.293 6.914 6.514 6.068 5.73 5.395 5.046 4.67 4.277 4.012 3.735 3.295 2.993 2.67 2.497 2.122 1.72 1.308 1.097 0.51 0.411 0.159 -0.122 -0.756 -1.12 -1.515 -1.932 -2.438 -3.055 -3.812 -5.566 -4 ,7275 ,TETRA ,17591433,Sat Nov 27 23:01:08 CET,Sun Nov 28 00:52:33 CET,0.0 2.032 2.666 3.102 3.492 3.824 4.106 4.373 4.867 5.098 5.313 5.33 5.873 6.047 6.408 6.745 7.046 7.192 7.467 7.733 8.108 8.347 8.586 8.912 9.222 9.506 9.776 10.066 10.452 10.81 11.146 11.542 11.892 12.226 12.627 13.05 13.448 13.862 14.299 14.793 15.333 15.916 16.53 17.128 17.825 18.497 19.154 19.812 20.447 20.925 20.995 20.38 19.551 18.663 17.65 16.691 15.839 15.003 14.254 13.464 12.774 12.168 11.621 11.086 10.55 10.067 9.57 9.099 8.671 8.234 7.785 7.419 7.024 6.619 6.314 5.981 5.608 5.209 4.807 4.533 4.24 3.791 3.483 3.147 2.967 2.608 2.251 1.876 1.676 1.093 0.975 0.696 0.397 -0.228 -0.576 -0.95 -1.373 -1.866 -2.44 -3.206 -6.278 -5 ,17187 ,TETRA ,17591434,Sat Nov 27 23:01:11 CET,Sun Nov 28 00:52:26 CET,0.0 1.74 2.416 2.863 3.224 3.568 3.889 4.178 4.741 4.999 5.222 5.277 5.843 6.039 6.39 6.708 7.015 7.162 7.432 7.684 8.055 8.289 8.511 8.85 9.184 9.507 9.805 10.1 10.481 10.805 11.118 11.519 11.891 12.236 12.628 13.045 13.436 13.875 14.35 14.835 15.343 15.922 16.538 17.114 17.76 18.452 19.209 19.973 20.692 21.238 21.431 20.872 20.041 19.173 18.288 17.376 16.542 15.774 15.054 14.284 13.615 13.007 12.423 11.89 11.383 10.91 10.393 9.894 9.474 9.049 8.606 8.231 7.825 7.402 7.072 6.733 6.363 5.958 5.549 5.263 4.964 4.499 4.168 3.824 3.651 3.28 2.887 2.481 2.276 1.685 1.557 1.307 1.049 0.464 0.102 -0.357 -0.888 -1.402 -1.994 -2.816 -5.532 -6 ,31631 ,TETRA ,17591435,Sat Nov 27 23:01:13 CET,Sun Nov 28 00:52:32 CET,0.0 1.679 2.349 2.831 3.204 3.51 3.81 4.093 4.59 4.826 5.049 5.097 5.665 5.856 6.187 6.51 6.832 6.982 7.25 7.489 7.856 8.092 8.317 8.644 8.95 9.238 9.513 9.789 10.139 10.457 10.758 11.148 11.518 11.855 12.249 12.672 13.051 13.461 13.899 14.355 14.822 15.323 15.895 16.453 17.049 17.66 18.297 18.922 19.538 20.051 20.136 19.455 18.478 17.446 16.486 15.582 14.705 13.856 13.103 12.351 11.717 11.133 10.561 10.014 9.493 9.005 8.473 8.006 7.62 7.205 6.741 6.336 5.915 5.488 5.154 4.803 4.44 4.056 3.653 3.37 3.076 2.635 2.325 1.984 1.811 1.467 1.082 0.662 0.441 -0.155 -0.253 -0.505 -0.761 -1.371 -1.721 -2.094 -2.512 -2.999 -3.575 -4.311 -6.727 -7 ,12369 ,TETRA ,17591436,Sat Nov 27 23:01:08 CET,Sun Nov 28 00:52:23 CET,0.0 2.314 2.973 3.465 3.888 4.261 4.605 4.894 5.36 5.581 5.801 5.838 6.386 6.576 6.929 7.26 7.573 7.725 8.012 8.291 8.684 8.919 9.145 9.468 9.778 10.086 10.375 10.639 10.986 11.319 11.635 12.018 12.398 12.758 13.159 13.579 13.942 14.36 14.831 15.285 15.752 16.291 16.916 17.502 18.158 18.836 19.514 20.249 20.929 21.454 21.553 20.917 20.044 19.061 18.082 17.143 16.294 15.455 14.691 13.926 13.247 12.612 12.018 11.467 10.928 10.446 9.916 9.426 9.004 8.567 8.12 7.745 7.359 6.941 6.607 6.268 5.905 5.52 5.119 4.83 4.535 4.076 3.745 3.389 3.214 2.87 2.507 2.124 1.909 1.305 1.177 0.909 0.642 0.052 -0.305 -0.724 -1.168 -1.65 -2.208 -2.989 -5.578 -8 ,19295 ,TETRA ,17591437,Sat Nov 27 23:02:05 CET,Sun Nov 28 00:43:42 CET,0.0 1.488 2.127 2.635 3.061 3.424 3.753 4.042 4.551 4.79 5.018 5.061 5.619 5.804 6.157 6.482 6.779 6.918 7.198 7.476 7.866 8.111 8.354 8.712 9.048 9.354 9.643 9.916 10.266 10.602 10.921 11.309 11.664 12.001 12.392 12.804 13.197 13.635 14.084 14.543 15.037 15.595 16.214 16.831 17.519 18.213 18.895 19.529 20.155 20.641 20.733 20.193 19.344 18.493 17.609 16.69 15.839 14.981 14.209 13.462 12.819 12.226 11.612 11.029 10.494 9.98 9.451 8.98 8.56 8.105 7.635 7.267 6.861 6.424 6.09 5.731 5.36 4.986 4.599 4.318 4.012 3.531 3.207 2.874 2.7 2.361 2.006 1.598 1.384 0.785 0.663 0.376 0.089 -0.497 -0.864 -1.269 -1.698 -2.204 -2.802 -3.591 -6.352 -9 ,16670 ,TETRA ,17591438,Sat Nov 27 23:03:06 CET,Sun Nov 28 00:42:09 CET,0.0 1.988 2.715 3.208 3.611 4.015 4.343 4.6 5.076 5.301 5.515 5.55 6.121 6.306 6.631 6.948 7.26 7.403 7.675 7.942 8.321 8.548 8.77 9.098 9.405 9.716 10.014 10.297 10.668 11.016 11.326 11.69 12.05 12.386 12.768 13.197 13.6 14.035 14.499 15.007 15.535 16.103 16.722 17.303 17.954 18.635 19.375 20.137 20.837 21.355 21.443 20.888 19.992 19.009 18.086 17.188 16.398 15.692 15.006 14.243 13.613 13.052 12.48 11.937 11.404 10.894 10.356 9.861 9.451 9.027 8.562 8.19 7.798 7.38 7.066 6.727 6.373 6.013 5.639 5.376 5.092 4.645 4.329 3.998 3.823 3.457 3.07 2.657 2.433 1.829 1.729 1.48 1.21 0.569 0.2 -0.183 -0.599 -1.072 -1.642 -2.468 -5.666 -10 ,15735 ,TETRA ,17591439,Sat Nov 27 23:05:06 CET,Sun Nov 28 00:57:17 CET,0.0 3.294 3.98 4.453 4.868 5.243 5.558 5.865 6.445 6.681 6.884 6.92 7.482 7.662 8.005 8.332 8.641 8.792 9.079 9.357 9.751 9.99 10.228 10.561 10.873 11.167 11.447 11.739 12.117 12.456 12.765 13.134 13.476 13.809 14.203 14.614 14.992 15.415 15.881 16.393 16.935 17.503 18.139 18.763 19.419 20.083 20.787 21.483 22.115 22.605 22.71 22.041 21.056 19.994 18.975 17.982 17.076 16.265 15.584 14.854 14.188 13.564 12.959 12.408 11.902 11.408 10.868 10.408 10.014 9.587 9.136 8.76 8.366 7.96 7.635 7.305 6.937 6.542 6.153 5.88 5.59 5.137 4.822 4.506 4.347 3.996 3.609 3.192 2.967 2.359 2.237 1.979 1.715 1.117 0.795 0.455 0.054 -0.437 -1.084 -1.896 -4.311 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index 21eab860..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6626 ,TETRA ,17591440,Sat Nov 27 23:04:08 CET,Sun Nov 28 00:55:22 CET,0.0 2.079 2.958 3.616 4.132 4.603 5.045 5.447 6.192 6.548 6.906 7.075 7.895 8.208 8.797 9.364 9.913 10.183 10.715 11.238 12.018 12.515 12.989 13.689 14.396 15.088 15.749 16.4 17.26 18.109 18.954 20.011 21.04 22.034 23.193 24.535 25.869 27.348 28.966 30.745 32.658 34.865 37.558 40.354 43.701 47.592 52.284 57.867 64.792 73.49 85.08 95.734 102.665 107.632 111.285 114.077 116.236 117.939 119.209 120.309 121.165 121.894 122.496 122.977 123.362 123.665 123.911 124.114 124.303 124.448 124.539 124.586 124.634 124.683 124.695 124.689 124.663 124.624 124.571 124.514 124.451 124.333 124.228 124.124 124.071 123.925 123.738 123.509 123.388 122.883 122.932 122.759 122.577 122.146 121.878 121.565 121.191 120.725 120.201 119.402 116.426 -2 ,16745 ,TETRA ,17591441,Sat Nov 27 23:04:08 CET,Sun Nov 28 00:54:49 CET,0.0 1.729 2.492 3.093 3.623 4.089 4.508 4.923 5.695 6.049 6.402 6.56 7.374 7.682 8.285 8.87 9.441 9.71 10.23 10.751 11.527 12.038 12.53 13.251 13.959 14.641 15.298 15.955 16.848 17.713 18.544 19.562 20.568 21.558 22.719 24.059 25.394 26.891 28.551 30.345 32.28 34.539 37.241 40.049 43.44 47.343 52.098 57.751 64.708 73.445 85.005 95.83 102.881 107.842 111.466 114.265 116.407 118.052 119.29 120.428 121.305 121.999 122.595 123.086 123.482 123.807 124.117 124.373 124.543 124.694 124.849 124.951 125.033 125.083 125.093 125.086 125.063 125.029 124.968 124.909 124.85 124.746 124.66 124.556 124.503 124.375 124.196 123.981 123.873 123.383 123.476 123.314 123.115 122.641 122.38 122.122 121.814 121.428 120.89 120.02 116.563 -4 ,31513 ,TETRA ,17591443,Sat Nov 27 23:04:08 CET,Sun Nov 28 00:54:59 CET,0.0 1.79 2.534 3.123 3.633 4.102 4.549 4.977 5.765 6.113 6.442 6.595 7.419 7.725 8.309 8.877 9.45 9.731 10.268 10.787 11.54 12.035 12.523 13.241 13.943 14.642 15.321 15.974 16.856 17.731 18.579 19.622 20.651 21.652 22.808 24.136 25.456 26.965 28.636 30.44 32.387 34.629 37.323 40.113 43.463 47.363 52.063 57.622 64.462 73.075 84.55 95.217 102.264 107.262 110.87 113.608 115.734 117.458 118.756 119.888 120.769 121.471 122.066 122.581 122.992 123.33 123.655 123.904 124.086 124.255 124.389 124.453 124.504 124.556 124.581 124.579 124.544 124.466 124.383 124.325 124.25 124.126 124.038 123.92 123.85 123.708 123.537 123.309 123.178 122.675 122.75 122.583 122.397 121.98 121.72 121.408 121.05 120.629 120.127 119.412 114.165 -5 ,16406 ,TETRA ,17591444,Sat Nov 27 23:04:08 CET,Sun Nov 28 00:54:58 CET,0.0 1.997 2.797 3.371 3.878 4.353 4.783 5.176 5.939 6.304 6.653 6.818 7.653 7.963 8.556 9.134 9.701 9.98 10.53 11.065 11.838 12.341 12.83 13.55 14.275 14.982 15.664 16.35 17.25 18.115 18.941 19.951 20.977 21.987 23.163 24.508 25.819 27.293 28.922 30.711 32.642 34.887 37.61 40.425 43.807 47.738 52.472 58.072 65.028 73.89 85.765 96.668 103.688 108.636 112.255 115.07 117.245 118.933 120.193 121.329 122.202 122.879 123.43 123.871 124.254 124.593 124.893 125.124 125.305 125.447 125.554 125.626 125.667 125.678 125.679 125.677 125.661 125.626 125.573 125.53 125.476 125.35 125.228 125.089 125.014 124.857 124.697 124.5 124.38 123.886 123.964 123.794 123.611 123.175 122.93 122.637 122.271 121.808 121.233 120.399 112.498 -6 ,30282 ,TETRA ,17591445,Sat Nov 27 23:04:08 CET,Sun Nov 28 00:55:21 CET,0.0 2.078 2.895 3.528 4.027 4.494 4.941 5.347 6.096 6.443 6.785 6.945 7.773 8.093 8.736 9.34 9.893 10.168 10.723 11.27 12.039 12.532 13.023 13.741 14.448 15.149 15.842 16.516 17.381 18.225 19.059 20.087 21.087 22.085 23.283 24.644 25.994 27.524 29.186 30.992 32.939 35.181 37.913 40.743 44.117 48.012 52.666 58.186 65.057 73.853 85.445 95.928 102.74 107.47 110.931 113.636 115.715 117.415 118.704 119.805 120.653 121.355 121.978 122.502 122.9 123.211 123.499 123.713 123.877 124.003 124.11 124.189 124.201 124.194 124.201 124.2 124.191 124.145 124.051 123.983 123.908 123.77 123.653 123.502 123.428 123.279 123.096 122.889 122.783 122.297 122.381 122.225 122.04 121.57 121.301 121.014 120.685 120.268 119.734 118.889 115.703 -7 ,15358 ,TETRA ,17591446,Sat Nov 27 23:04:09 CET,Sun Nov 28 00:55:21 CET,0.0 1.86 2.6 3.181 3.688 4.151 4.595 5.052 5.918 6.289 6.631 6.777 7.597 7.908 8.549 9.17 9.753 10.035 10.59 11.13 11.912 12.415 12.909 13.64 14.361 15.072 15.762 16.428 17.3 18.174 19.024 20.075 21.109 22.132 23.329 24.664 25.979 27.462 29.107 30.891 32.817 35.058 37.726 40.481 43.84 47.734 52.422 58.06 65.048 73.806 85.509 96.34 103.38 108.38 112.038 114.861 116.994 118.667 119.934 121.037 121.909 122.608 123.207 123.717 124.123 124.428 124.708 124.959 125.155 125.298 125.407 125.483 125.552 125.598 125.613 125.626 125.62 125.589 125.552 125.526 125.48 125.36 125.261 125.142 125.072 124.918 124.739 124.542 124.434 123.926 123.971 123.789 123.597 123.144 122.891 122.621 122.246 121.75 121.187 120.403 117.377 -8 ,8265 ,TETRA ,17591447,Sat Nov 27 23:05:06 CET,Sun Nov 28 00:50:06 CET,0.0 1.506 2.203 2.732 3.262 3.749 4.202 4.615 5.357 5.707 6.045 6.186 7.002 7.303 7.895 8.477 9.031 9.299 9.847 10.383 11.138 11.634 12.125 12.848 13.561 14.246 14.923 15.603 16.481 17.338 18.195 19.237 20.231 21.2 22.368 23.729 25.042 26.509 28.143 29.923 31.844 34.073 36.733 39.51 42.904 46.826 51.533 57.086 63.95 72.674 84.226 94.956 102.024 106.982 110.593 113.356 115.473 117.163 118.437 119.585 120.48 121.173 121.748 122.231 122.638 122.971 123.267 123.502 123.678 123.825 123.947 124.013 124.071 124.1 124.075 124.058 124.039 123.98 123.921 123.875 123.82 123.692 123.582 123.476 123.414 123.281 123.117 122.904 122.781 122.284 122.384 122.225 122.046 121.603 121.357 121.049 120.634 120.153 119.565 118.746 115.825 -9 ,26729 ,TETRA ,17591448,Sat Nov 27 23:06:05 CET,Sun Nov 28 00:58:15 CET,0.0 1.666 2.357 2.981 3.52 4.022 4.506 4.914 5.645 6.002 6.342 6.477 7.3 7.608 8.208 8.776 9.325 9.604 10.144 10.653 11.391 11.891 12.4 13.139 13.859 14.571 15.256 15.919 16.792 17.652 18.506 19.547 20.574 21.582 22.772 24.141 25.468 26.944 28.566 30.336 32.272 34.52 37.189 39.969 43.332 47.214 51.916 57.483 64.43 73.323 85.107 95.983 103.041 108.063 111.815 114.65 116.788 118.494 119.805 120.992 121.91 122.657 123.272 123.745 124.138 124.473 124.774 125.014 125.212 125.373 125.487 125.563 125.636 125.677 125.674 125.669 125.658 125.625 125.571 125.527 125.464 125.34 125.234 125.121 125.065 124.924 124.733 124.509 124.391 123.899 123.992 123.828 123.646 123.262 123.045 122.757 122.408 121.991 121.45 120.732 118.534 -10 ,17901 ,TETRA ,17591449,Sat Nov 27 23:05:07 CET,Sun Nov 28 00:53:07 CET,0.0 1.664 2.398 3.04 3.56 4.02 4.466 4.881 5.655 6.016 6.341 6.455 7.27 7.575 8.177 8.766 9.328 9.604 10.155 10.699 11.476 11.966 12.453 13.172 13.863 14.561 15.25 15.919 16.795 17.65 18.504 19.555 20.581 21.583 22.748 24.08 25.386 26.851 28.489 30.291 32.236 34.504 37.212 40.024 43.422 47.396 52.192 57.795 64.707 73.443 84.997 95.748 102.818 107.846 111.494 114.229 116.307 117.967 119.251 120.38 121.265 121.97 122.524 123.002 123.403 123.732 124.043 124.269 124.437 124.6 124.725 124.798 124.85 124.883 124.904 124.915 124.916 124.896 124.857 124.809 124.721 124.571 124.476 124.365 124.302 124.163 123.999 123.82 123.723 123.233 123.318 123.153 122.969 122.534 122.279 121.987 121.63 121.198 120.666 119.955 117.092 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt deleted file mode 100644 index 5831b13c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30779 ,TETRA ,17591450,Sat Nov 27 23:05:06 CET,Sun Nov 28 00:56:56 CET,0.0 1.935 2.726 3.357 3.907 4.374 4.815 5.242 6.022 6.394 6.753 6.913 7.741 8.067 8.69 9.284 9.861 10.15 10.718 11.257 12.024 12.53 13.038 13.793 14.526 15.23 15.911 16.575 17.466 18.344 19.212 20.283 21.333 22.38 23.615 25.03 26.404 27.948 29.651 31.482 33.479 35.824 38.603 41.458 44.898 48.926 53.844 59.653 66.865 75.981 88.175 99.559 107.049 112.338 116.202 119.153 121.35 123.066 124.343 125.554 126.567 127.344 127.98 128.512 128.959 129.313 129.614 129.862 130.04 130.185 130.309 130.396 130.47 130.493 130.497 130.499 130.486 130.462 130.426 130.374 130.294 130.134 130.01 129.876 129.805 129.655 129.476 129.272 129.16 128.661 128.732 128.543 128.344 127.88 127.587 127.254 126.888 126.462 125.883 125.141 121.65 -2 ,1540 ,TETRA ,17591451,Sat Nov 27 23:05:08 CET,Sun Nov 28 00:57:46 CET,0.0 1.689 2.409 3.011 3.515 3.98 4.42 4.845 5.661 6.03 6.387 6.567 7.414 7.757 8.401 9.015 9.603 9.889 10.455 11.012 11.813 12.331 12.836 13.588 14.316 15.036 15.765 16.469 17.396 18.299 19.167 20.237 21.307 22.366 23.611 25.023 26.398 27.941 29.626 31.471 33.464 35.772 38.611 41.562 45.085 49.17 54.087 59.877 67.019 76.179 88.451 99.799 107.307 112.589 116.511 119.538 121.862 123.729 125.136 126.42 127.4 128.199 128.9 129.451 129.896 130.25 130.565 130.793 130.956 131.101 131.213 131.279 131.331 131.364 131.359 131.337 131.299 131.234 131.141 131.084 131.014 130.882 130.788 130.645 130.56 130.399 130.221 130.003 129.873 129.347 129.344 129.157 128.985 128.574 128.309 127.983 127.614 127.163 126.588 125.649 122.535 -3 ,24662 ,TETRA ,17591452,Sat Nov 27 23:05:07 CET,Sun Nov 28 00:56:36 CET,0.0 1.35 2.108 2.708 3.224 3.683 4.116 4.519 5.269 5.62 5.944 6.081 6.911 7.228 7.835 8.441 9.04 9.319 9.859 10.391 11.197 11.722 12.22 12.958 13.676 14.359 15.027 15.699 16.581 17.451 18.32 19.389 20.448 21.493 22.71 24.101 25.476 27.011 28.672 30.499 32.502 34.831 37.633 40.54 44.098 48.222 53.184 59.08 66.346 75.544 87.814 99.309 106.928 112.274 116.074 118.905 121.051 122.846 124.265 125.504 126.457 127.187 127.795 128.308 128.723 129.067 129.392 129.646 129.814 129.924 130.022 130.089 130.099 130.1 130.102 130.089 130.058 129.996 129.914 129.858 129.793 129.655 129.537 129.415 129.344 129.183 129.002 128.761 128.613 128.064 128.031 127.84 127.659 127.261 127.023 126.768 126.423 125.95 125.36 124.508 120.545 -4 ,797 ,TETRA ,17591453,Sat Nov 27 23:05:08 CET,Sun Nov 28 00:50:47 CET,0.0 1.785 2.489 3.073 3.609 4.116 4.581 4.992 5.757 6.117 6.466 6.658 7.503 7.831 8.474 9.088 9.689 9.977 10.523 11.074 11.881 12.392 12.89 13.637 14.379 15.112 15.827 16.524 17.43 18.318 19.197 20.275 21.326 22.364 23.592 24.984 26.344 27.887 29.608 31.438 33.394 35.704 38.502 41.399 44.874 48.908 53.776 59.58 66.836 75.997 88.173 99.498 106.933 112.199 116.038 119.011 121.291 123.118 124.532 125.759 126.688 127.426 128.052 128.604 129.054 129.402 129.725 129.978 130.146 130.285 130.404 130.496 130.558 130.58 130.59 130.581 130.545 130.511 130.485 130.455 130.413 130.297 130.191 130.082 130.025 129.909 129.742 129.496 129.363 128.874 128.955 128.775 128.596 128.146 127.87 127.556 127.187 126.786 126.311 125.511 122.097 -5 ,12191 ,TETRA ,17591454,Sat Nov 27 23:05:09 CET,Sun Nov 28 00:47:31 CET,0.0 3.565 4.6 5.237 5.759 6.248 6.715 7.148 7.922 8.28 8.615 8.762 9.585 9.916 10.565 11.153 11.721 12.006 12.568 13.115 13.919 14.441 14.947 15.684 16.414 17.151 17.871 18.577 19.509 20.428 21.323 22.395 23.433 24.469 25.694 27.089 28.474 30.028 31.725 33.586 35.596 37.904 40.677 43.559 47.039 51.078 55.969 61.768 68.926 78.01 90.162 101.492 108.944 114.265 118.233 121.29 123.63 125.529 126.984 128.223 129.155 129.881 130.483 130.998 131.427 131.798 132.122 132.342 132.516 132.677 132.815 132.911 132.988 133.037 133.046 133.038 133.026 132.975 132.883 132.808 132.74 132.618 132.502 132.37 132.285 132.095 131.92 131.713 131.592 131.088 131.138 130.976 130.789 130.314 130.013 129.672 129.322 128.896 128.305 127.473 124.391 -6 ,15605 ,TETRA ,17591455,Sat Nov 27 23:05:07 CET,Sun Nov 28 00:55:55 CET,0.0 1.681 2.488 3.104 3.627 4.094 4.541 4.957 5.72 6.088 6.444 6.62 7.439 7.748 8.371 8.967 9.544 9.83 10.378 10.91 11.696 12.211 12.725 13.477 14.213 14.935 15.64 16.337 17.248 18.145 19.031 20.114 21.167 22.188 23.412 24.826 26.182 27.68 29.346 31.168 33.144 35.474 38.286 41.2 44.752 48.875 53.811 59.607 66.782 76.014 88.364 99.858 107.534 112.924 116.807 119.769 122.002 123.808 125.181 126.342 127.198 127.887 128.498 128.988 129.397 129.749 130.045 130.295 130.503 130.68 130.832 130.929 130.977 131.011 131.026 131.032 131.032 130.994 130.938 130.903 130.835 130.685 130.598 130.489 130.419 130.273 130.107 129.889 129.757 129.247 129.32 129.153 128.977 128.54 128.273 127.972 127.619 127.189 126.592 125.685 121.476 -7 ,4441 ,TETRA ,17591456,Sat Nov 27 23:05:08 CET,Sun Nov 28 00:51:02 CET,0.0 1.885 2.651 3.252 3.771 4.229 4.649 5.044 5.813 6.191 6.552 6.738 7.573 7.881 8.467 9.04 9.609 9.89 10.457 11.025 11.837 12.359 12.873 13.632 14.375 15.079 15.765 16.46 17.375 18.27 19.158 20.234 21.292 22.343 23.539 24.91 26.267 27.792 29.48 31.342 33.367 35.673 38.481 41.45 45.012 49.068 53.889 59.661 66.957 76.27 88.653 100.204 107.778 113.048 116.854 119.851 122.152 123.922 125.246 126.374 127.241 127.937 128.516 129.001 129.386 129.714 130.019 130.249 130.409 130.556 130.701 130.799 130.882 130.921 130.916 130.909 130.891 130.846 130.787 130.723 130.63 130.475 130.344 130.189 130.11 129.929 129.73 129.496 129.356 128.839 128.912 128.738 128.54 128.052 127.755 127.443 127.082 126.669 126.122 125.338 122.356 -8 ,29416 ,TETRA ,17591457,Sat Nov 27 23:06:06 CET,Sun Nov 28 00:57:00 CET,0.0 1.859 2.573 3.16 3.704 4.178 4.608 5.031 5.792 6.158 6.501 6.645 7.47 7.783 8.391 8.969 9.536 9.824 10.377 10.913 11.711 12.247 12.78 13.546 14.274 14.984 15.697 16.395 17.295 18.189 19.059 20.11 21.154 22.2 23.439 24.852 26.248 27.801 29.492 31.344 33.34 35.629 38.417 41.334 44.868 48.931 53.818 59.691 66.934 76.136 88.45 99.689 106.921 112.054 115.903 118.935 121.165 122.877 124.186 125.347 126.231 126.94 127.551 128.06 128.475 128.812 129.129 129.385 129.569 129.728 129.875 129.94 129.98 130.044 130.088 130.095 130.082 130.073 130.026 129.963 129.885 129.755 129.642 129.52 129.447 129.274 129.088 128.86 128.728 128.233 128.341 128.164 127.967 127.532 127.27 126.979 126.621 126.141 125.571 124.788 121.095 -9 ,351 ,TETRA ,17591458,Sat Nov 27 23:07:05 CET,Sun Nov 28 00:58:55 CET,0.0 1.577 2.296 2.839 3.35 3.826 4.258 4.659 5.406 5.766 6.12 6.289 7.121 7.438 8.053 8.646 9.224 9.513 10.076 10.618 11.407 11.913 12.421 13.175 13.91 14.614 15.296 15.978 16.886 17.798 18.697 19.764 20.816 21.866 23.072 24.446 25.812 27.349 29.048 30.922 32.939 35.238 37.992 40.879 44.352 48.384 53.269 59.024 66.221 75.508 87.93 99.39 106.884 112.18 116.123 119.241 121.575 123.335 124.684 125.887 126.813 127.532 128.136 128.646 129.052 129.386 129.679 129.904 130.091 130.245 130.366 130.448 130.52 130.575 130.585 130.568 130.537 130.468 130.371 130.298 130.213 130.072 129.956 129.827 129.75 129.583 129.432 129.242 129.11 128.594 128.625 128.417 128.199 127.754 127.505 127.207 126.86 126.429 125.826 124.998 119.692 -10 ,24603 ,TETRA ,17591459,Sat Nov 27 23:06:05 CET,Sun Nov 28 00:55:43 CET,0.0 2.342 3.152 3.764 4.316 4.797 5.215 5.613 6.379 6.753 7.105 7.277 8.121 8.437 9.044 9.64 10.215 10.502 11.07 11.623 12.419 12.934 13.437 14.186 14.919 15.631 16.336 17.026 17.926 18.822 19.718 20.79 21.83 22.867 24.067 25.434 26.775 28.289 29.985 31.818 33.783 36.105 38.92 41.801 45.309 49.397 54.336 60.176 67.345 76.54 88.847 100.345 108.053 113.477 117.288 120.19 122.51 124.406 125.791 126.939 127.801 128.509 129.115 129.644 130.098 130.461 130.813 131.043 131.197 131.355 131.504 131.59 131.643 131.68 131.699 131.704 131.683 131.639 131.578 131.519 131.451 131.372 131.295 131.19 131.129 130.981 130.812 130.597 130.463 129.961 130.026 129.851 129.666 129.242 128.995 128.699 128.333 127.908 127.349 126.528 123.037 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt deleted file mode 100644 index 685ca0ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13240 ,TETRA ,17591460,Sat Nov 27 23:06:05 CET,Sun Nov 28 01:00:29 CET,0.0 3.081 3.899 4.533 5.103 5.619 6.083 6.508 7.304 7.685 8.059 8.263 9.095 9.42 10.058 10.68 11.278 11.563 12.126 12.688 13.501 14.017 14.522 15.286 16.034 16.755 17.453 18.141 19.069 19.956 20.813 21.89 22.946 23.976 25.189 26.561 27.919 29.488 31.21 33.066 35.109 37.459 40.271 43.211 46.779 50.92 55.915 61.809 69.059 78.316 90.802 102.485 110.232 115.762 119.861 123.1 125.567 127.496 128.982 130.308 131.327 132.163 132.899 133.518 134.021 134.433 134.821 135.149 135.399 135.606 135.791 135.937 136.065 136.181 136.275 136.339 136.35 136.346 136.353 136.348 136.319 136.237 136.169 136.104 136.063 135.97 135.837 135.662 135.552 135.063 135.189 135.031 134.854 134.503 134.279 134.0 133.649 133.248 132.632 131.5 126.031 -2 ,23017 ,TETRA ,17591461,Sat Nov 27 23:06:06 CET,Sun Nov 28 00:52:29 CET,0.0 2.279 3.068 3.74 4.322 4.843 5.347 5.833 6.664 7.046 7.423 7.626 8.471 8.802 9.431 10.058 10.65 10.934 11.505 12.081 12.915 13.443 13.962 14.729 15.468 16.197 16.919 17.616 18.533 19.427 20.317 21.431 22.506 23.548 24.792 26.217 27.619 29.223 30.99 32.89 34.938 37.304 40.154 43.098 46.627 50.721 55.684 61.616 69.006 78.4 91.007 102.794 110.563 116.092 120.203 123.374 125.782 127.703 129.142 130.436 131.469 132.301 133.021 133.642 134.171 134.569 134.902 135.179 135.408 135.612 135.788 135.927 136.064 136.181 136.257 136.305 136.309 136.318 136.335 136.313 136.253 136.167 136.111 136.013 135.957 135.85 135.712 135.547 135.445 134.966 135.087 134.943 134.767 134.351 134.138 133.887 133.572 133.222 132.733 131.997 127.735 -3 ,11068 ,TETRA ,17591462,Sat Nov 27 23:06:06 CET,Sun Nov 28 00:58:03 CET,0.0 4.016 4.846 5.461 6.006 6.523 7.013 7.463 8.29 8.681 9.043 9.211 10.038 10.362 11.014 11.622 12.226 12.53 13.102 13.654 14.453 14.965 15.463 16.191 16.924 17.661 18.397 19.136 20.083 20.973 21.84 22.926 24.001 25.044 26.259 27.635 28.992 30.537 32.232 34.096 36.145 38.502 41.324 44.253 47.806 51.915 56.9 62.929 70.358 79.704 92.223 103.825 111.536 117.046 121.079 124.229 126.629 128.526 130.006 131.354 132.415 133.274 134.028 134.646 135.115 135.492 135.874 136.182 136.405 136.602 136.803 136.944 137.048 137.126 137.181 137.223 137.233 137.239 137.245 137.22 137.168 137.076 136.999 136.913 136.864 136.74 136.574 136.358 136.25 135.78 135.904 135.783 135.656 135.341 135.137 134.887 134.586 134.216 133.72 132.958 128.947 -4 ,12450 ,TETRA ,17591463,Sat Nov 27 23:06:07 CET,Sun Nov 28 00:57:52 CET,0.0 2.419 3.196 3.824 4.357 4.828 5.281 5.717 6.548 6.942 7.31 7.534 8.403 8.741 9.42 10.059 10.643 10.939 11.514 12.064 12.875 13.411 13.944 14.731 15.497 16.244 16.967 17.683 18.634 19.549 20.422 21.509 22.595 23.661 24.907 26.333 27.75 29.318 31.021 32.911 34.995 37.428 40.317 43.286 46.858 50.977 55.957 61.89 69.302 78.76 91.412 103.107 110.817 116.34 120.435 123.623 125.99 127.87 129.344 130.644 131.616 132.413 133.148 133.769 134.251 134.632 134.997 135.301 135.55 135.778 135.97 136.111 136.235 136.321 136.368 136.412 136.455 136.475 136.47 136.456 136.424 136.368 136.315 136.226 136.172 136.068 135.947 135.774 135.674 135.213 135.338 135.188 135.019 134.582 134.344 134.076 133.763 133.397 132.916 132.148 128.299 -6 ,18303 ,TETRA ,17591465,Sat Nov 27 23:06:06 CET,Sun Nov 28 00:53:23 CET,0.0 2.49 3.252 3.877 4.408 4.906 5.395 5.841 6.673 7.072 7.436 7.626 8.47 8.799 9.431 10.034 10.626 10.917 11.483 12.033 12.824 13.331 13.834 14.588 15.314 16.033 16.746 17.438 18.358 19.257 20.139 21.218 22.263 23.291 24.549 26.008 27.393 28.939 30.657 32.515 34.492 36.786 39.595 42.523 46.027 50.154 55.148 61.09 68.549 77.998 90.606 102.35 110.102 115.56 119.595 122.762 125.175 127.12 128.643 129.999 131.056 131.927 132.67 133.265 133.736 134.126 134.513 134.81 135.032 135.241 135.399 135.507 135.612 135.698 135.744 135.78 135.812 135.847 135.857 135.834 135.789 135.695 135.633 135.553 135.49 135.336 135.196 135.033 134.93 134.452 134.557 134.399 134.228 133.855 133.645 133.377 133.065 132.705 132.186 131.4 127.062 -7 ,1618 ,TETRA ,17591466,Sat Nov 27 23:06:06 CET,Sun Nov 28 00:58:45 CET,0.0 2.271 3.123 3.769 4.329 4.852 5.323 5.76 6.532 6.908 7.286 7.486 8.326 8.65 9.278 9.893 10.487 10.789 11.391 11.957 12.783 13.337 13.875 14.646 15.376 16.102 16.837 17.548 18.476 19.406 20.322 21.436 22.508 23.546 24.782 26.212 27.62 29.182 30.911 32.836 34.947 37.358 40.186 43.124 46.697 50.845 55.843 61.756 69.094 78.452 91.025 102.826 110.586 116.198 120.36 123.551 125.961 127.889 129.382 130.704 131.732 132.587 133.317 133.912 134.42 134.854 135.258 135.58 135.811 136.014 136.203 136.317 136.416 136.499 136.551 136.592 136.609 136.613 136.606 136.585 136.556 136.504 136.454 136.374 136.316 136.193 136.044 135.859 135.77 135.313 135.449 135.303 135.155 134.838 134.628 134.353 134.026 133.661 133.156 132.381 129.768 -8 ,17418 ,TETRA ,17591467,Sat Nov 27 23:06:06 CET,Sun Nov 28 00:58:05 CET,0.0 2.315 3.199 3.835 4.395 4.903 5.374 5.824 6.662 7.042 7.404 7.602 8.436 8.756 9.382 9.986 10.581 10.874 11.435 11.971 12.748 13.253 13.759 14.522 15.268 15.996 16.709 17.415 18.318 19.182 20.045 21.112 22.159 23.182 24.376 25.754 27.128 28.658 30.369 32.254 34.283 36.624 39.447 42.398 45.941 50.065 55.069 61.024 68.393 77.769 90.21 101.797 109.575 115.16 119.241 122.409 124.84 126.739 128.239 129.584 130.572 131.333 131.985 132.563 133.075 133.508 133.88 134.172 134.413 134.641 134.852 135.019 135.155 135.247 135.293 135.344 135.402 135.414 135.378 135.336 135.287 135.198 135.105 135.0 134.954 134.843 134.718 134.568 134.468 134.008 134.159 134.021 133.846 133.43 133.176 132.889 132.588 132.235 131.767 131.058 127.779 -9 ,6230 ,TETRA ,17591468,Sat Nov 27 23:06:08 CET,Sun Nov 28 00:58:19 CET,0.0 1.622 2.329 2.942 3.474 3.982 4.474 4.902 5.674 6.044 6.405 6.59 7.437 7.787 8.432 9.046 9.654 9.946 10.511 11.059 11.852 12.364 12.879 13.641 14.382 15.126 15.847 16.55 17.493 18.411 19.291 20.372 21.455 22.521 23.767 25.192 26.6 28.183 29.908 31.798 33.85 36.225 39.076 42.002 45.514 49.664 54.676 60.559 67.941 77.412 90.01 101.619 109.282 114.807 118.879 122.049 124.503 126.442 127.877 129.135 130.124 130.947 131.687 132.328 132.852 133.273 133.679 133.993 134.217 134.427 134.627 134.769 134.885 134.972 135.031 135.086 135.12 135.122 135.097 135.076 135.058 134.987 134.918 134.843 134.795 134.673 134.52 134.345 134.249 133.78 133.898 133.762 133.623 133.284 133.059 132.799 132.502 132.126 131.662 131.04 128.582 -10 ,26536 ,TETRA ,17591469,Sat Nov 27 23:07:05 CET,Sun Nov 28 00:59:26 CET,0.0 2.264 3.046 3.678 4.214 4.719 5.208 5.636 6.418 6.793 7.15 7.331 8.167 8.486 9.113 9.74 10.359 10.655 11.22 11.778 12.603 13.145 13.683 14.467 15.227 15.963 16.67 17.374 18.301 19.19 20.054 21.127 22.202 23.269 24.535 25.975 27.37 28.939 30.688 32.605 34.642 36.996 39.842 42.766 46.312 50.463 55.414 61.27 68.59 77.847 90.213 101.786 109.453 114.9 118.854 121.941 124.353 126.258 127.718 129.063 130.093 130.915 131.627 132.242 132.729 133.114 133.493 133.784 133.995 134.183 134.349 134.456 134.55 134.637 134.684 134.7 134.715 134.735 134.735 134.719 134.681 134.604 134.535 134.464 134.42 134.308 134.178 134.021 133.93 133.457 133.551 133.388 133.229 132.879 132.654 132.381 132.07 131.729 131.299 130.609 124.245 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_23_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_23_62.txt deleted file mode 100644 index f2cc01bd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_23_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4994 ,TETRA ,17600225,Sun Nov 28 10:34:37 CET,Sun Nov 28 12:23:43 CET,0.0 1.371 1.777 2.084 2.341 2.582 2.8 3.001 3.376 3.538 3.698 3.809 4.124 4.259 4.514 4.749 4.977 5.097 5.337 5.558 5.874 6.076 6.268 6.55 6.827 7.099 7.36 7.607 7.936 8.252 8.545 8.889 9.222 9.577 9.981 10.393 10.772 11.182 11.623 12.083 12.557 13.079 13.67 14.234 14.844 15.467 16.154 16.904 17.706 18.526 19.227 19.508 19.423 19.17 18.9 18.619 18.343 18.065 17.803 17.513 17.235 16.993 16.76 16.527 16.31 16.115 15.911 15.711 15.525 15.339 15.14 14.957 14.774 14.586 14.424 14.246 14.074 13.903 13.72 13.59 13.449 13.23 13.083 12.929 12.845 12.669 12.494 12.305 12.21 11.947 11.925 11.798 11.67 11.397 11.254 11.084 10.905 10.744 10.539 10.224 8.581 -2 ,11717 ,TETRA ,17600226,Sun Nov 28 10:34:51 CET,Sun Nov 28 12:29:50 CET,0.0 1.547 1.988 2.357 2.663 2.971 3.247 3.499 3.978 4.187 4.387 4.592 4.967 5.144 5.458 5.739 6.007 6.135 6.385 6.632 6.991 7.226 7.453 7.783 8.113 8.418 8.687 8.949 9.284 9.604 9.937 10.338 10.709 11.053 11.426 11.839 12.234 12.637 13.037 13.48 13.972 14.496 15.07 15.645 16.266 16.903 17.617 18.378 19.198 20.015 20.796 21.163 21.076 20.831 20.566 20.255 19.904 19.56 19.258 18.943 18.692 18.45 18.185 17.937 17.706 17.49 17.257 17.051 16.879 16.68 16.449 16.251 16.059 15.87 15.717 15.568 15.418 15.265 15.104 14.979 14.841 14.632 14.481 14.322 14.241 14.069 13.886 13.679 13.57 13.284 13.237 13.097 12.951 12.656 12.488 12.302 12.104 11.886 11.626 11.305 10.259 -3 ,7556 ,TETRA ,17600227,Sun Nov 28 10:34:56 CET,Sun Nov 28 12:30:57 CET,0.0 1.269 1.707 2.051 2.318 2.559 2.796 3.015 3.38 3.539 3.711 3.868 4.201 4.354 4.656 4.94 5.192 5.304 5.534 5.772 6.105 6.299 6.486 6.775 7.051 7.302 7.549 7.78 8.067 8.335 8.601 8.927 9.24 9.555 9.907 10.289 10.656 11.069 11.535 11.993 12.454 12.976 13.526 14.035 14.606 15.26 16.017 16.758 17.505 18.315 18.956 19.095 19.002 18.795 18.54 18.259 17.949 17.623 17.346 17.056 16.794 16.562 16.32 16.087 15.876 15.681 15.461 15.24 15.046 14.85 14.649 14.473 14.265 14.05 13.883 13.711 13.55 13.379 13.197 13.071 12.942 12.743 12.602 12.449 12.37 12.205 12.022 11.83 11.719 11.426 11.388 11.292 11.182 10.909 10.772 10.596 10.392 10.2 9.956 9.614 8.287 -4 ,31218 ,TETRA ,17600228,Sun Nov 28 10:34:47 CET,Sun Nov 28 12:33:48 CET,0.0 1.534 1.99 2.4 2.768 3.081 3.344 3.597 4.079 4.303 4.515 4.69 5.048 5.207 5.505 5.799 6.08 6.222 6.498 6.744 7.086 7.301 7.518 7.833 8.132 8.42 8.703 8.978 9.321 9.652 9.978 10.358 10.719 11.064 11.467 11.909 12.305 12.753 13.223 13.688 14.198 14.78 15.399 16.008 16.69 17.403 18.167 18.962 19.865 20.746 21.45 21.664 21.572 21.396 21.15 20.859 20.566 20.259 19.977 19.686 19.416 19.18 18.951 18.743 18.537 18.33 18.122 17.918 17.737 17.553 17.36 17.195 17.023 16.858 16.719 16.567 16.419 16.246 16.039 15.896 15.759 15.548 15.4 15.24 15.158 14.996 14.816 14.633 14.541 14.268 14.243 14.125 13.996 13.742 13.622 13.477 13.296 13.092 12.845 12.471 10.857 -5 ,14314 ,TETRA ,17600229,Sun Nov 28 10:34:50 CET,Sun Nov 28 12:33:25 CET,0.0 0.718 1.066 1.373 1.648 1.916 2.184 2.436 2.896 3.104 3.295 3.459 3.817 3.982 4.297 4.605 4.892 5.033 5.317 5.585 5.959 6.201 6.426 6.749 7.061 7.355 7.634 7.88 8.165 8.437 8.717 9.06 9.374 9.675 10.032 10.425 10.787 11.192 11.619 12.035 12.454 12.948 13.519 14.043 14.65 15.331 16.094 16.891 17.727 18.567 19.384 19.759 19.707 19.504 19.25 18.962 18.653 18.348 18.07 17.796 17.554 17.291 17.016 16.751 16.518 16.322 16.117 15.931 15.753 15.549 15.351 15.199 15.014 14.806 14.66 14.508 14.334 14.154 13.974 13.853 13.712 13.487 13.351 13.215 13.14 12.978 12.803 12.612 12.515 12.239 12.202 12.084 11.973 11.737 11.611 11.471 11.296 11.115 10.861 10.495 8.845 -6 ,25105 ,TETRA ,17600230,Sun Nov 28 10:34:48 CET,Sun Nov 28 12:20:29 CET,0.0 1.324 1.75 2.085 2.365 2.619 2.875 3.1 3.511 3.696 3.858 3.998 4.317 4.455 4.719 4.962 5.198 5.311 5.54 5.774 6.104 6.311 6.515 6.801 7.07 7.328 7.572 7.808 8.106 8.386 8.652 8.97 9.277 9.573 9.922 10.304 10.662 11.079 11.524 11.961 12.417 12.914 13.469 14.026 14.649 15.303 16.036 16.862 17.765 18.674 19.506 19.857 19.823 19.594 19.297 18.976 18.674 18.418 18.151 17.836 17.579 17.354 17.13 16.906 16.676 16.461 16.247 16.041 15.851 15.66 15.452 15.274 15.098 14.905 14.746 14.596 14.437 14.261 14.084 13.968 13.853 13.651 13.496 13.341 13.262 13.102 12.929 12.746 12.648 12.365 12.296 12.18 12.067 11.792 11.631 11.447 11.252 11.035 10.769 10.403 9.187 -7 ,1212 ,TETRA ,17600231,Sun Nov 28 10:34:48 CET,Sun Nov 28 12:33:39 CET,0.0 1.264 1.728 2.091 2.394 2.662 2.9 3.12 3.538 3.727 3.905 4.043 4.38 4.537 4.83 5.103 5.367 5.494 5.737 5.982 6.324 6.527 6.727 7.019 7.297 7.556 7.808 8.06 8.403 8.757 9.097 9.477 9.821 10.163 10.558 10.971 11.351 11.783 12.263 12.766 13.251 13.775 14.376 14.953 15.596 16.267 16.995 17.734 18.543 19.377 20.148 20.386 20.16 19.847 19.541 19.228 18.912 18.586 18.29 17.973 17.701 17.449 17.192 16.946 16.71 16.501 16.285 16.079 15.905 15.722 15.52 15.355 15.169 14.973 14.829 14.672 14.502 14.333 14.158 14.034 13.914 13.712 13.566 13.412 13.33 13.176 13.032 12.856 12.756 12.48 12.444 12.325 12.197 11.923 11.775 11.61 11.414 11.193 10.932 10.644 9.371 -8 ,17455 ,TETRA ,17600232,Sun Nov 28 10:34:49 CET,Sun Nov 28 12:30:35 CET,0.0 1.247 1.758 2.139 2.452 2.754 3.041 3.302 3.786 4.011 4.22 4.417 4.792 4.974 5.31 5.622 5.917 6.052 6.304 6.547 6.907 7.131 7.332 7.619 7.892 8.137 8.385 8.638 8.945 9.236 9.535 9.904 10.249 10.578 10.939 11.332 11.709 12.121 12.567 13.034 13.516 14.019 14.599 15.188 15.816 16.471 17.193 17.955 18.759 19.597 20.396 20.759 20.775 20.609 20.347 20.048 19.725 19.412 19.141 18.862 18.598 18.335 18.083 17.851 17.617 17.392 17.156 16.956 16.796 16.622 16.429 16.261 16.078 15.89 15.752 15.602 15.436 15.259 15.061 14.931 14.807 14.589 14.437 14.288 14.218 14.078 13.892 13.682 13.583 13.309 13.259 13.137 13.008 12.738 12.59 12.419 12.226 12.007 11.753 11.391 10.159 -9 ,11195 ,TETRA ,17600233,Sun Nov 28 10:34:50 CET,Sun Nov 28 12:29:34 CET,0.0 0.811 1.246 1.603 1.866 2.107 2.329 2.518 2.887 3.074 3.23 3.332 3.672 3.81 4.076 4.341 4.597 4.719 4.965 5.213 5.554 5.757 5.952 6.236 6.493 6.728 6.949 7.162 7.445 7.719 7.983 8.31 8.63 8.931 9.268 9.634 9.978 10.358 10.77 11.216 11.662 12.123 12.652 13.18 13.776 14.419 15.123 15.879 16.7 17.478 18.113 18.299 18.181 17.939 17.652 17.382 17.13 16.875 16.599 16.295 16.027 15.755 15.483 15.24 15.012 14.799 14.578 14.386 14.203 14.001 13.799 13.631 13.456 13.276 13.131 12.969 12.81 12.653 12.48 12.351 12.213 12.014 11.883 11.732 11.654 11.512 11.353 11.182 11.099 10.821 10.79 10.673 10.543 10.286 10.142 9.982 9.783 9.556 9.301 8.929 7.707 -10 ,3794 ,TETRA ,17600234,Sun Nov 28 10:34:52 CET,Sun Nov 28 12:20:33 CET,0.0 1.176 1.692 2.13 2.487 2.79 3.074 3.325 3.764 3.958 4.14 4.32 4.692 4.864 5.182 5.493 5.785 5.919 6.176 6.421 6.772 6.99 7.198 7.506 7.811 8.094 8.355 8.6 8.898 9.171 9.422 9.709 9.984 10.25 10.573 10.947 11.296 11.674 12.072 12.469 12.887 13.41 13.992 14.518 15.097 15.735 16.481 17.234 18.082 19.03 19.89 20.289 20.227 19.992 19.722 19.421 19.1 18.77 18.487 18.205 17.951 17.726 17.494 17.25 17.03 16.827 16.61 16.415 16.243 16.054 15.852 15.693 15.522 15.324 15.168 15.011 14.858 14.708 14.545 14.428 14.309 14.128 13.993 13.843 13.768 13.61 13.443 13.262 13.164 12.88 12.827 12.713 12.584 12.27 12.102 11.917 11.698 11.439 11.157 10.724 8.895 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_23_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_23_64.txt deleted file mode 100644 index 6cc3b349..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_23_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29267 ,TETRA ,17600235,Sun Nov 28 10:34:50 CET,Sun Nov 28 12:31:20 CET,0.0 0.924 1.216 1.467 1.684 1.886 2.071 2.224 2.515 2.671 2.82 2.865 3.159 3.27 3.487 3.686 3.872 3.96 4.131 4.296 4.517 4.656 4.789 4.957 5.099 5.232 5.361 5.491 5.66 5.83 5.993 6.172 6.359 6.549 6.739 6.939 7.128 7.32 7.534 7.77 7.991 8.22 8.478 8.689 8.892 9.064 9.206 9.304 9.305 9.116 8.471 7.455 6.513 5.684 4.938 4.215 3.545 2.941 2.441 1.947 1.516 1.131 0.766 0.409 0.06 -0.256 -0.567 -0.849 -1.097 -1.344 -1.591 -1.804 -2.031 -2.269 -2.453 -2.634 -2.828 -3.026 -3.226 -3.366 -3.508 -3.737 -3.9 -4.059 -4.144 -4.328 -4.525 -4.73 -4.83 -5.124 -5.152 -5.275 -5.404 -5.702 -5.856 -5.986 -6.147 -6.354 -6.585 -6.938 -8.494 -2 ,1802 ,TETRA ,17600236,Sun Nov 28 10:34:52 CET,Sun Nov 28 12:29:41 CET,0.0 1.268 1.688 1.999 2.223 2.415 2.608 2.78 3.073 3.208 3.318 3.338 3.64 3.751 3.952 4.131 4.303 4.377 4.517 4.661 4.868 4.992 5.121 5.323 5.518 5.708 5.886 6.064 6.287 6.478 6.649 6.853 7.067 7.267 7.474 7.687 7.88 8.078 8.291 8.531 8.76 8.957 9.177 9.394 9.596 9.803 9.993 10.087 10.058 9.84 9.183 8.142 7.208 6.364 5.599 4.925 4.312 3.756 3.286 2.812 2.378 1.973 1.604 1.253 0.93 0.623 0.282 -0.005 -0.237 -0.485 -0.751 -0.969 -1.198 -1.432 -1.609 -1.795 -1.995 -2.194 -2.398 -2.541 -2.685 -2.917 -3.077 -3.24 -3.325 -3.498 -3.674 -3.849 -3.94 -4.232 -4.242 -4.367 -4.5 -4.778 -4.937 -5.11 -5.279 -5.444 -5.644 -5.913 -6.814 -3 ,25550 ,TETRA ,17600237,Sun Nov 28 10:34:56 CET,Sun Nov 28 12:20:43 CET,0.0 1.074 1.413 1.665 1.874 2.034 2.178 2.308 2.518 2.611 2.715 2.752 3.042 3.15 3.343 3.52 3.714 3.802 3.952 4.115 4.36 4.503 4.632 4.821 5.01 5.178 5.321 5.468 5.649 5.837 6.026 6.236 6.436 6.621 6.816 7.021 7.217 7.415 7.605 7.793 8.009 8.244 8.475 8.693 8.912 9.145 9.342 9.411 9.352 9.146 8.55 7.498 6.552 5.727 4.979 4.259 3.623 3.08 2.609 2.119 1.716 1.363 1.011 0.684 0.37 0.064 -0.243 -0.514 -0.75 -0.992 -1.259 -1.468 -1.663 -1.866 -2.03 -2.204 -2.383 -2.58 -2.788 -2.928 -3.064 -3.263 -3.414 -3.577 -3.66 -3.825 -4.004 -4.198 -4.295 -4.587 -4.597 -4.708 -4.827 -5.094 -5.24 -5.387 -5.54 -5.71 -5.901 -6.175 -7.267 -4 ,9957 ,TETRA ,17600238,Sun Nov 28 10:34:48 CET,Sun Nov 28 12:30:28 CET,0.0 1.15 1.557 1.867 2.137 2.377 2.566 2.741 3.036 3.152 3.278 3.348 3.643 3.751 3.958 4.149 4.332 4.425 4.606 4.766 4.984 5.117 5.243 5.42 5.599 5.778 5.932 6.071 6.256 6.43 6.594 6.788 6.964 7.123 7.284 7.461 7.646 7.857 8.079 8.289 8.47 8.656 8.887 9.105 9.319 9.512 9.691 9.807 9.805 9.602 8.934 7.922 7.013 6.187 5.42 4.698 4.07 3.486 2.967 2.456 2.013 1.616 1.239 0.871 0.537 0.245 -0.078 -0.368 -0.613 -0.876 -1.15 -1.37 -1.581 -1.8 -1.978 -2.159 -2.336 -2.525 -2.728 -2.86 -3.0 -3.225 -3.375 -3.542 -3.629 -3.801 -3.985 -4.172 -4.271 -4.581 -4.602 -4.707 -4.817 -5.066 -5.219 -5.39 -5.545 -5.687 -5.905 -6.193 -7.142 -5 ,11575 ,TETRA ,17600239,Sun Nov 28 10:34:49 CET,Sun Nov 28 12:29:58 CET,0.0 1.405 1.853 2.139 2.384 2.595 2.781 2.971 3.292 3.442 3.576 3.616 3.906 4.013 4.206 4.388 4.569 4.654 4.816 4.962 5.187 5.34 5.475 5.651 5.808 5.956 6.1 6.252 6.463 6.643 6.788 6.95 7.125 7.294 7.467 7.658 7.83 7.998 8.177 8.353 8.541 8.775 8.997 9.169 9.355 9.524 9.644 9.71 9.683 9.442 8.76 7.732 6.759 5.857 5.078 4.356 3.697 3.084 2.555 2.034 1.592 1.19 0.808 0.458 0.137 -0.148 -0.436 -0.695 -0.924 -1.169 -1.421 -1.623 -1.839 -2.076 -2.261 -2.439 -2.616 -2.801 -3.0 -3.14 -3.287 -3.509 -3.654 -3.806 -3.882 -4.047 -4.226 -4.414 -4.517 -4.818 -4.838 -4.951 -5.066 -5.303 -5.427 -5.572 -5.739 -5.912 -6.117 -6.388 -7.025 -6 ,185 ,TETRA ,17600240,Sun Nov 28 10:34:52 CET,Sun Nov 28 12:19:50 CET,0.0 1.351 1.752 2.081 2.331 2.553 2.762 2.944 3.225 3.324 3.422 3.427 3.713 3.801 3.968 4.136 4.293 4.369 4.523 4.671 4.86 4.98 5.105 5.269 5.414 5.547 5.678 5.82 5.99 6.148 6.31 6.498 6.663 6.813 6.994 7.192 7.369 7.55 7.753 7.974 8.183 8.4 8.656 8.875 9.075 9.251 9.383 9.493 9.527 9.373 8.774 7.715 6.683 5.749 4.962 4.263 3.663 3.07 2.523 1.995 1.547 1.14 0.752 0.388 0.05 -0.25 -0.549 -0.814 -1.051 -1.304 -1.569 -1.778 -1.997 -2.235 -2.417 -2.609 -2.8 -2.996 -3.211 -3.356 -3.51 -3.759 -3.927 -4.097 -4.181 -4.351 -4.529 -4.728 -4.836 -5.14 -5.162 -5.275 -5.379 -5.6 -5.742 -5.904 -6.09 -6.274 -6.46 -6.769 -8.164 -7 ,29391 ,TETRA ,17600241,Sun Nov 28 10:34:49 CET,Sun Nov 28 12:30:56 CET,0.0 1.021 1.38 1.651 1.862 2.039 2.216 2.373 2.599 2.699 2.795 2.784 3.051 3.138 3.298 3.439 3.587 3.658 3.796 3.927 4.1 4.209 4.317 4.477 4.628 4.778 4.924 5.053 5.208 5.361 5.508 5.672 5.822 5.979 6.161 6.341 6.502 6.677 6.868 7.057 7.233 7.429 7.645 7.842 8.05 8.242 8.376 8.468 8.532 8.371 7.744 6.748 5.864 5.073 4.318 3.608 3.001 2.445 1.959 1.491 1.08 0.7 0.342 0.014 -0.287 -0.564 -0.868 -1.15 -1.394 -1.651 -1.916 -2.14 -2.369 -2.597 -2.774 -2.965 -3.16 -3.351 -3.56 -3.714 -3.863 -4.08 -4.237 -4.414 -4.507 -4.689 -4.862 -5.04 -5.147 -5.452 -5.491 -5.611 -5.748 -6.054 -6.197 -6.338 -6.487 -6.674 -6.903 -7.191 -8.101 -8 ,9518 ,TETRA ,17600242,Sun Nov 28 10:35:00 CET,Sun Nov 28 12:30:40 CET,0.0 0.926 1.358 1.706 1.96 2.134 2.323 2.532 2.895 3.039 3.177 3.236 3.543 3.658 3.874 4.072 4.251 4.341 4.508 4.654 4.869 5.018 5.16 5.342 5.512 5.665 5.807 5.945 6.12 6.28 6.435 6.653 6.857 7.031 7.234 7.466 7.697 7.946 8.193 8.428 8.643 8.852 9.066 9.27 9.491 9.697 9.842 9.944 9.991 9.837 9.284 8.379 7.476 6.61 5.833 5.097 4.439 3.852 3.337 2.819 2.377 1.973 1.581 1.203 0.865 0.557 0.218 -0.075 -0.326 -0.595 -0.864 -1.07 -1.297 -1.533 -1.705 -1.884 -2.071 -2.274 -2.489 -2.632 -2.775 -2.996 -3.159 -3.338 -3.426 -3.599 -3.778 -3.983 -4.1 -4.413 -4.439 -4.557 -4.668 -4.933 -5.092 -5.269 -5.45 -5.631 -5.842 -6.116 -6.702 -9 ,32134 ,TETRA ,17600243,Sun Nov 28 10:35:01 CET,Sun Nov 28 12:21:02 CET,0.0 1.377 1.814 2.139 2.382 2.575 2.752 2.904 3.181 3.315 3.433 3.452 3.716 3.795 3.964 4.128 4.285 4.364 4.517 4.655 4.846 4.965 5.077 5.251 5.424 5.589 5.747 5.887 6.065 6.231 6.39 6.565 6.727 6.895 7.073 7.277 7.472 7.662 7.857 8.049 8.242 8.428 8.605 8.776 8.947 9.072 9.181 9.26 9.254 9.029 8.337 7.271 6.306 5.455 4.707 4.019 3.369 2.776 2.28 1.794 1.387 1.026 0.689 0.379 0.076 -0.218 -0.511 -0.78 -1.017 -1.258 -1.516 -1.727 -1.947 -2.182 -2.365 -2.566 -2.769 -2.967 -3.17 -3.305 -3.443 -3.658 -3.811 -3.973 -4.057 -4.235 -4.417 -4.595 -4.69 -4.989 -4.996 -5.099 -5.215 -5.471 -5.59 -5.72 -5.885 -6.056 -6.247 -6.552 -7.347 -10 ,10521 ,TETRA ,17600244,Sun Nov 28 10:35:00 CET,Sun Nov 28 12:15:35 CET,0.0 0.887 1.237 1.527 1.792 1.999 2.156 2.319 2.593 2.725 2.872 2.966 3.277 3.38 3.581 3.786 3.993 4.081 4.25 4.438 4.702 4.852 4.983 5.171 5.362 5.54 5.693 5.833 6.017 6.194 6.362 6.569 6.781 6.978 7.183 7.384 7.559 7.746 7.933 8.132 8.325 8.529 8.769 8.991 9.198 9.362 9.496 9.567 9.524 9.272 8.607 7.601 6.615 5.75 5.006 4.311 3.671 3.081 2.584 2.107 1.687 1.303 0.958 0.636 0.314 0.008 -0.32 -0.606 -0.827 -1.058 -1.313 -1.511 -1.711 -1.941 -2.121 -2.296 -2.48 -2.685 -2.905 -3.052 -3.208 -3.433 -3.586 -3.753 -3.834 -3.999 -4.18 -4.372 -4.473 -4.792 -4.825 -4.928 -5.037 -5.308 -5.457 -5.604 -5.759 -5.946 -6.179 -6.421 -6.94 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_23_66.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_23_66.txt deleted file mode 100644 index 9a9fda64..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_23_66.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12479 ,KEBNE ,17026927,Wed Dec 22 15:51:19 CET,Wed Dec 22 17:31:00 CET,0.0 0.779 1.128 1.405 1.641 1.854 2.062 2.235 2.523 2.657 2.778 2.823 3.134 3.238 3.43 3.622 3.806 3.896 4.074 4.24 4.478 4.636 4.793 5.025 5.242 5.44 5.624 5.786 5.984 6.184 6.383 6.624 6.854 7.074 7.326 7.604 7.855 8.111 8.399 8.729 9.08 9.466 9.881 10.272 10.712 11.155 11.6 12.078 12.587 12.986 13.225 13.167 12.854 12.466 12.082 11.712 11.362 11.019 10.711 10.403 10.12 9.856 9.605 9.357 9.129 8.917 8.699 8.503 8.313 8.111 7.908 7.753 7.597 7.411 7.261 7.116 6.967 6.812 6.646 6.526 6.41 6.232 6.104 5.969 5.894 5.747 5.605 5.45 5.371 5.113 5.135 5.046 4.939 4.695 4.57 4.452 4.293 4.118 3.95 3.674 3.143 -2 ,9903 ,KEBNE ,17026928,Wed Dec 22 15:51:19 CET,Wed Dec 22 17:31:14 CET,0.0 0.574 0.887 1.151 1.368 1.537 1.688 1.836 2.09 2.205 2.32 2.347 2.628 2.727 2.925 3.118 3.31 3.397 3.561 3.718 3.953 4.099 4.236 4.443 4.638 4.829 5.013 5.178 5.388 5.601 5.813 6.072 6.308 6.523 6.78 7.08 7.349 7.616 7.913 8.225 8.54 8.907 9.312 9.682 10.082 10.489 10.948 11.395 11.876 12.371 12.67 12.594 12.266 11.898 11.53 11.146 10.789 10.463 10.153 9.821 9.524 9.255 9.007 8.769 8.553 8.35 8.126 7.917 7.727 7.527 7.327 7.164 6.993 6.82 6.687 6.545 6.39 6.228 6.057 5.946 5.84 5.67 5.543 5.409 5.339 5.186 5.021 4.857 4.778 4.515 4.533 4.434 4.327 4.095 3.97 3.841 3.695 3.517 3.296 2.968 1.837 -3 ,11807 ,KEBNE ,17026929,Wed Dec 22 15:51:19 CET,Wed Dec 22 17:31:31 CET,0.0 0.739 1.051 1.313 1.519 1.709 1.877 2.021 2.308 2.459 2.598 2.635 2.94 3.049 3.263 3.475 3.671 3.768 3.953 4.123 4.369 4.531 4.685 4.901 5.108 5.297 5.478 5.654 5.871 6.085 6.278 6.498 6.72 6.93 7.176 7.463 7.726 8.006 8.327 8.704 9.062 9.398 9.809 10.21 10.655 11.11 11.59 12.107 12.624 13.103 13.439 13.389 13.09 12.702 12.317 11.942 11.602 11.27 10.963 10.656 10.357 10.057 9.786 9.546 9.314 9.09 8.854 8.651 8.47 8.279 8.076 7.902 7.73 7.559 7.426 7.29 7.144 6.981 6.808 6.682 6.553 6.363 6.231 6.09 6.014 5.867 5.697 5.498 5.405 5.145 5.173 5.091 4.977 4.715 4.586 4.445 4.289 4.12 3.933 3.682 3.015 -4 ,19745 ,KEBNE ,17026930,Wed Dec 22 15:51:19 CET,Wed Dec 22 17:31:20 CET,0.0 0.417 0.742 0.997 1.243 1.439 1.597 1.742 2.001 2.125 2.248 2.293 2.596 2.71 2.917 3.116 3.317 3.416 3.597 3.74 3.926 4.056 4.203 4.418 4.599 4.78 4.977 5.172 5.424 5.668 5.888 6.148 6.407 6.68 6.997 7.35 7.67 7.998 8.35 8.721 9.1 9.497 9.924 10.333 10.821 11.332 11.877 12.425 12.94 13.439 13.784 13.634 13.276 12.88 12.47 12.067 11.69 11.342 11.049 10.747 10.464 10.187 9.92 9.671 9.448 9.237 9.013 8.823 8.644 8.455 8.275 8.119 7.939 7.759 7.624 7.48 7.334 7.173 7.01 6.909 6.791 6.594 6.465 6.327 6.256 6.106 5.947 5.778 5.694 5.418 5.423 5.318 5.206 4.973 4.831 4.673 4.516 4.36 4.168 3.903 3.382 -5 ,24950 ,KEBNE ,17026931,Wed Dec 22 15:51:18 CET,Wed Dec 22 17:31:12 CET,0.0 0.984 1.302 1.564 1.78 1.97 2.156 2.309 2.585 2.718 2.836 2.869 3.176 3.299 3.543 3.752 3.933 4.018 4.182 4.345 4.596 4.755 4.912 5.133 5.338 5.543 5.747 5.946 6.188 6.402 6.612 6.87 7.109 7.329 7.581 7.865 8.147 8.445 8.727 9.025 9.33 9.645 10.027 10.394 10.768 11.213 11.718 12.233 12.763 13.278 13.715 13.758 13.492 13.172 12.815 12.423 12.039 11.678 11.37 11.049 10.78 10.537 10.294 10.062 9.842 9.631 9.412 9.225 9.066 8.908 8.743 8.585 8.419 8.26 8.13 7.989 7.845 7.694 7.543 7.436 7.312 7.125 7.003 6.856 6.775 6.617 6.466 6.309 6.218 5.931 5.937 5.84 5.743 5.544 5.427 5.295 5.154 4.973 4.738 4.409 3.587 -6 ,30944 ,KEBNE ,17026932,Wed Dec 22 15:51:19 CET,Wed Dec 22 17:31:14 CET,0.0 0.534 0.858 1.091 1.304 1.502 1.671 1.819 2.046 2.155 2.262 2.292 2.594 2.711 2.93 3.137 3.329 3.412 3.57 3.731 3.955 4.097 4.238 4.445 4.639 4.821 4.985 5.15 5.372 5.595 5.812 6.054 6.283 6.507 6.76 7.053 7.323 7.588 7.877 8.189 8.489 8.805 9.201 9.587 9.988 10.407 10.86 11.334 11.804 12.216 12.519 12.432 12.121 11.782 11.433 11.06 10.692 10.338 10.039 9.733 9.453 9.191 8.933 8.691 8.447 8.228 8.007 7.8 7.617 7.421 7.228 7.075 6.913 6.735 6.594 6.449 6.3 6.142 5.957 5.833 5.72 5.544 5.409 5.269 5.2 5.04 4.87 4.702 4.617 4.351 4.34 4.237 4.13 3.922 3.809 3.663 3.497 3.312 3.084 2.826 2.288 -7 ,20136 ,KEBNE ,17026933,Wed Dec 22 15:52:21 CET,Wed Dec 22 17:32:30 CET,0.0 0.641 0.912 1.115 1.322 1.496 1.65 1.804 2.086 2.217 2.342 2.38 2.661 2.773 2.97 3.137 3.306 3.388 3.56 3.732 3.958 4.103 4.247 4.45 4.648 4.83 4.994 5.167 5.38 5.583 5.804 6.068 6.311 6.538 6.794 7.09 7.381 7.682 7.997 8.341 8.699 9.069 9.443 9.777 10.192 10.689 11.21 11.707 12.126 12.479 12.705 12.6 12.323 11.928 11.534 11.178 10.816 10.424 10.095 9.794 9.506 9.236 8.975 8.739 8.522 8.296 8.047 7.817 7.62 7.427 7.221 7.051 6.868 6.68 6.534 6.361 6.189 6.03 5.855 5.733 5.604 5.393 5.25 5.111 5.041 4.891 4.726 4.563 4.481 4.208 4.211 4.112 3.988 3.702 3.558 3.397 3.214 3.028 2.792 2.485 1.94 -8 ,12043 ,KEBNE ,17026934,Wed Dec 22 15:52:21 CET,Wed Dec 22 17:31:23 CET,0.0 0.897 1.272 1.573 1.811 2.02 2.222 2.395 2.678 2.811 2.953 3.039 3.351 3.468 3.709 3.934 4.137 4.238 4.429 4.607 4.853 4.999 5.138 5.346 5.546 5.725 5.894 6.06 6.268 6.458 6.634 6.838 7.042 7.24 7.471 7.731 7.98 8.262 8.571 8.901 9.22 9.563 9.967 10.346 10.79 11.27 11.737 12.187 12.685 13.154 13.463 13.341 13.065 12.755 12.384 11.99 11.617 11.272 10.951 10.623 10.34 10.068 9.8 9.555 9.329 9.119 8.893 8.688 8.513 8.34 8.16 8.007 7.845 7.666 7.527 7.383 7.226 7.052 6.861 6.739 6.626 6.447 6.31 6.157 6.084 5.946 5.784 5.601 5.511 5.233 5.202 5.084 4.957 4.705 4.57 4.414 4.251 4.07 3.862 3.612 3.116 -9 ,23532 ,KEBNE ,17026935,Wed Dec 22 15:52:21 CET,Wed Dec 22 17:31:56 CET,0.0 1.031 1.373 1.613 1.817 2.026 2.215 2.363 2.618 2.718 2.815 2.861 3.155 3.269 3.466 3.65 3.835 3.926 4.109 4.276 4.497 4.628 4.766 4.977 5.165 5.34 5.504 5.676 5.924 6.159 6.374 6.617 6.84 7.063 7.321 7.598 7.849 8.117 8.422 8.729 9.028 9.35 9.726 10.119 10.584 11.1 11.626 12.149 12.698 13.207 13.546 13.464 13.144 12.748 12.334 11.934 11.564 11.2 10.877 10.544 10.258 10.011 9.777 9.547 9.324 9.109 8.881 8.676 8.5 8.326 8.143 7.983 7.811 7.614 7.465 7.33 7.184 7.023 6.855 6.737 6.601 6.394 6.268 6.136 6.069 5.935 5.802 5.661 5.575 5.298 5.262 5.143 5.028 4.79 4.655 4.508 4.351 4.143 3.871 3.558 2.638 -10 ,2082 ,KEBNE ,17026936,Wed Dec 22 15:52:21 CET,Wed Dec 22 17:32:34 CET,0.0 0.732 1.064 1.364 1.61 1.832 2.012 2.148 2.418 2.564 2.695 2.744 3.051 3.164 3.374 3.555 3.714 3.792 3.941 4.104 4.349 4.497 4.641 4.843 5.028 5.204 5.372 5.531 5.734 5.934 6.128 6.367 6.605 6.823 7.061 7.321 7.562 7.833 8.127 8.426 8.744 9.088 9.469 9.846 10.258 10.683 11.146 11.621 12.13 12.596 12.902 12.89 12.632 12.259 11.841 11.426 11.074 10.751 10.463 10.151 9.863 9.613 9.377 9.133 8.899 8.691 8.467 8.262 8.077 7.889 7.69 7.502 7.305 7.113 6.969 6.809 6.638 6.477 6.312 6.199 6.087 5.904 5.774 5.644 5.571 5.42 5.249 5.076 4.994 4.732 4.727 4.616 4.489 4.229 4.107 3.966 3.812 3.656 3.491 3.246 2.657 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_26_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_26_23.txt deleted file mode 100644 index 08b9214a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_26_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26939 ,KEBNE ,17026937,Wed Dec 22 15:53:24 CET,Wed Dec 22 17:34:09 CET,0.0 1.11 1.473 1.708 1.87 1.998 2.128 2.252 2.481 2.583 2.67 2.661 2.879 2.943 3.072 3.191 3.286 3.328 3.417 3.504 3.632 3.717 3.795 3.897 3.997 4.09 4.184 4.278 4.353 4.399 4.446 4.493 4.526 4.558 4.578 4.572 4.559 4.536 4.506 4.448 4.34 4.184 3.962 3.685 3.295 2.8 2.114 1.185 -0.133 -2.09 -5.224 -8.749 -11.435 -13.626 -15.429 -16.939 -18.213 -19.338 -20.289 -21.229 -22.021 -22.697 -23.341 -23.942 -24.501 -25.02 -25.539 -25.991 -26.387 -26.797 -27.2 -27.525 -27.863 -28.205 -28.469 -28.736 -29.004 -29.288 -29.587 -29.779 -29.972 -30.266 -30.461 -30.677 -30.794 -31.029 -31.264 -31.522 -31.664 -32.001 -32.125 -32.283 -32.462 -32.819 -32.993 -33.198 -33.43 -33.675 -33.966 -34.366 -35.364 -2 ,6291 ,KEBNE ,17026938,Wed Dec 22 15:53:24 CET,Wed Dec 22 17:34:30 CET,0.0 1.163 1.561 1.84 2.092 2.306 2.463 2.585 2.81 2.929 3.034 3.067 3.303 3.388 3.553 3.7 3.833 3.893 3.996 4.089 4.222 4.297 4.364 4.474 4.567 4.643 4.71 4.777 4.866 4.945 5.002 5.041 5.064 5.088 5.107 5.11 5.108 5.099 5.055 4.98 4.868 4.704 4.497 4.255 3.9 3.433 2.797 1.929 0.644 -1.346 -4.467 -7.92 -10.684 -12.948 -14.781 -16.369 -17.722 -18.924 -19.949 -20.932 -21.735 -22.457 -23.154 -23.783 -24.34 -24.846 -25.388 -25.878 -26.316 -26.771 -27.236 -27.629 -28.032 -28.44 -28.755 -29.081 -29.404 -29.73 -30.081 -30.327 -30.584 -30.991 -31.263 -31.547 -31.707 -32.039 -32.367 -32.711 -32.882 -33.237 -33.43 -33.648 -33.863 -34.312 -34.558 -34.81 -35.085 -35.401 -35.779 -36.304 -38.136 -3 ,5786 ,KEBNE ,17026939,Wed Dec 22 15:55:30 CET,Wed Dec 22 17:36:04 CET,0.0 0.901 1.148 1.337 1.498 1.622 1.724 1.821 1.996 2.071 2.145 2.127 2.336 2.404 2.539 2.662 2.783 2.845 2.953 3.038 3.157 3.229 3.286 3.369 3.448 3.518 3.587 3.659 3.742 3.804 3.855 3.894 3.934 3.974 3.99 4.016 4.033 4.021 3.997 3.95 3.867 3.727 3.523 3.282 2.939 2.439 1.721 0.783 -0.491 -2.399 -5.49 -8.911 -11.547 -13.709 -15.528 -17.089 -18.398 -19.535 -20.469 -21.389 -22.163 -22.836 -23.463 -24.035 -24.558 -25.038 -25.541 -25.987 -26.376 -26.789 -27.203 -27.521 -27.837 -28.163 -28.42 -28.689 -28.959 -29.229 -29.511 -29.705 -29.908 -30.231 -30.456 -30.681 -30.801 -31.043 -31.276 -31.532 -31.664 -31.979 -32.075 -32.217 -32.365 -32.703 -32.882 -33.063 -33.238 -33.455 -33.745 -34.075 -35.319 -4 ,7240 ,KEBNE ,17026940,Wed Dec 22 15:53:24 CET,Wed Dec 22 17:34:51 CET,0.0 1.478 1.8 1.988 2.152 2.301 2.403 2.5 2.664 2.731 2.822 2.856 3.078 3.147 3.265 3.375 3.482 3.533 3.626 3.702 3.801 3.866 3.929 4.016 4.086 4.152 4.216 4.278 4.352 4.411 4.463 4.511 4.551 4.571 4.585 4.599 4.604 4.601 4.569 4.505 4.413 4.278 4.082 3.832 3.469 2.976 2.259 1.311 0.008 -1.931 -5.008 -8.486 -11.215 -13.422 -15.225 -16.799 -18.115 -19.236 -20.182 -21.093 -21.878 -22.574 -23.204 -23.792 -24.334 -24.811 -25.311 -25.762 -26.142 -26.525 -26.933 -27.267 -27.598 -27.945 -28.215 -28.493 -28.772 -29.061 -29.369 -29.579 -29.793 -30.129 -30.364 -30.601 -30.719 -30.969 -31.24 -31.513 -31.653 -31.98 -32.091 -32.239 -32.391 -32.739 -32.924 -33.135 -33.361 -33.606 -33.887 -34.237 -35.121 -5 ,182 ,KEBNE ,17026941,Wed Dec 22 15:53:24 CET,Wed Dec 22 17:34:14 CET,0.0 1.681 2.119 2.422 2.656 2.843 2.985 3.123 3.384 3.486 3.574 3.617 3.849 3.92 4.058 4.18 4.293 4.344 4.435 4.534 4.703 4.796 4.868 4.963 5.044 5.119 5.193 5.245 5.305 5.376 5.439 5.497 5.536 5.572 5.609 5.617 5.596 5.559 5.508 5.452 5.373 5.252 5.06 4.823 4.505 4.024 3.297 2.337 1.029 -0.94 -4.054 -7.554 -10.356 -12.652 -14.525 -16.132 -17.507 -18.705 -19.695 -20.678 -21.516 -22.234 -22.907 -23.544 -24.137 -24.673 -25.231 -25.713 -26.117 -26.544 -26.983 -27.334 -27.704 -28.094 -28.384 -28.679 -28.987 -29.303 -29.636 -29.885 -30.147 -30.531 -30.779 -31.046 -31.198 -31.523 -31.844 -32.157 -32.319 -32.66 -32.813 -33.002 -33.196 -33.604 -33.843 -34.117 -34.44 -34.799 -35.213 -35.803 -37.688 -6 ,14872 ,KEBNE ,17026942,Wed Dec 22 15:53:24 CET,Wed Dec 22 17:34:18 CET,0.0 0.612 0.873 1.053 1.231 1.417 1.57 1.685 1.849 1.922 1.998 1.989 2.2 2.264 2.369 2.474 2.576 2.624 2.712 2.783 2.894 2.967 3.044 3.146 3.227 3.303 3.367 3.422 3.49 3.54 3.568 3.598 3.634 3.662 3.678 3.702 3.708 3.681 3.645 3.584 3.496 3.366 3.179 2.933 2.563 2.079 1.417 0.536 -0.686 -2.57 -5.648 -9.023 -11.675 -13.846 -15.61 -17.133 -18.394 -19.498 -20.452 -21.357 -22.126 -22.812 -23.446 -24.029 -24.564 -25.043 -25.534 -25.97 -26.336 -26.704 -27.078 -27.391 -27.72 -28.061 -28.319 -28.579 -28.843 -29.107 -29.382 -29.577 -29.78 -30.084 -30.288 -30.506 -30.623 -30.859 -31.092 -31.354 -31.496 -31.819 -31.931 -32.079 -32.236 -32.589 -32.763 -32.93 -33.132 -33.388 -33.67 -33.987 -34.546 -7 ,25431 ,KEBNE ,17026943,Wed Dec 22 15:53:28 CET,Wed Dec 22 17:29:25 CET,0.0 1.166 1.423 1.619 1.792 1.938 2.062 2.167 2.375 2.463 2.539 2.545 2.776 2.853 2.999 3.14 3.255 3.3 3.376 3.454 3.576 3.653 3.734 3.843 3.931 4.008 4.074 4.131 4.205 4.283 4.349 4.412 4.477 4.528 4.573 4.617 4.654 4.682 4.689 4.68 4.612 4.472 4.25 3.954 3.548 3.03 2.334 1.39 0.068 -1.893 -5.046 -8.541 -11.273 -13.519 -15.34 -16.883 -18.181 -19.301 -20.241 -21.151 -21.917 -22.594 -23.221 -23.806 -24.351 -24.843 -25.343 -25.781 -26.152 -26.521 -26.887 -27.195 -27.517 -27.842 -28.103 -28.379 -28.642 -28.905 -29.174 -29.359 -29.554 -29.845 -30.047 -30.268 -30.377 -30.603 -30.85 -31.101 -31.226 -31.524 -31.617 -31.762 -31.926 -32.272 -32.453 -32.651 -32.857 -33.088 -33.358 -33.703 -34.256 -8 ,20097 ,KEBNE ,17026944,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:34:42 CET,0.0 0.833 1.175 1.431 1.632 1.818 1.988 2.122 2.332 2.431 2.519 2.537 2.757 2.819 2.936 3.046 3.155 3.208 3.301 3.39 3.502 3.568 3.64 3.732 3.815 3.889 3.95 4.012 4.092 4.163 4.225 4.284 4.321 4.36 4.401 4.416 4.407 4.388 4.345 4.282 4.195 4.067 3.878 3.631 3.291 2.857 2.24 1.312 -0.055 -2.092 -5.327 -8.936 -11.762 -14.07 -15.971 -17.605 -19.043 -20.366 -21.446 -22.463 -23.322 -24.093 -24.83 -25.51 -26.127 -26.679 -27.257 -27.773 -28.199 -28.62 -29.059 -29.413 -29.768 -30.131 -30.421 -30.73 -31.038 -31.364 -31.703 -31.924 -32.147 -32.499 -32.76 -33.024 -33.153 -33.431 -33.729 -34.034 -34.193 -34.545 -34.715 -34.903 -35.1 -35.525 -35.747 -35.964 -36.204 -36.473 -36.833 -37.389 -39.143 -9 ,16712 ,KEBNE ,17026945,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:33:50 CET,0.0 0.6 0.839 1.02 1.178 1.313 1.419 1.514 1.699 1.78 1.853 1.809 2.017 2.088 2.217 2.336 2.449 2.495 2.569 2.655 2.771 2.834 2.893 2.978 3.067 3.147 3.206 3.256 3.321 3.369 3.411 3.455 3.492 3.523 3.543 3.563 3.565 3.541 3.506 3.44 3.343 3.211 3.015 2.78 2.439 1.964 1.303 0.372 -0.973 -2.94 -6.071 -9.64 -12.423 -14.674 -16.525 -18.15 -19.55 -20.767 -21.788 -22.782 -23.619 -24.352 -25.018 -25.639 -26.233 -26.762 -27.304 -27.78 -28.173 -28.574 -28.992 -29.343 -29.726 -30.124 -30.417 -30.717 -31.027 -31.338 -31.667 -31.893 -32.123 -32.501 -32.763 -33.03 -33.164 -33.443 -33.742 -34.044 -34.202 -34.549 -34.716 -34.905 -35.09 -35.483 -35.707 -35.971 -36.264 -36.583 -36.953 -37.421 -39.05 -10 ,26648 ,KEBNE ,17026946,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:34:02 CET,0.0 0.713 0.969 1.131 1.293 1.468 1.617 1.746 1.976 2.075 2.172 2.2 2.418 2.494 2.635 2.764 2.883 2.933 3.019 3.103 3.222 3.297 3.377 3.48 3.58 3.67 3.745 3.806 3.881 3.952 4.016 4.093 4.143 4.169 4.196 4.203 4.194 4.17 4.124 4.066 3.997 3.891 3.722 3.496 3.134 2.649 2.047 1.171 -0.193 -2.212 -5.422 -8.944 -11.658 -13.856 -15.653 -17.235 -18.591 -19.771 -20.766 -21.74 -22.575 -23.326 -24.021 -24.645 -25.208 -25.694 -26.173 -26.61 -27.007 -27.435 -27.887 -28.267 -28.65 -29.043 -29.359 -29.679 -29.985 -30.276 -30.563 -30.758 -30.961 -31.293 -31.528 -31.769 -31.895 -32.165 -32.449 -32.74 -32.898 -33.242 -33.382 -33.56 -33.759 -34.186 -34.394 -34.624 -34.906 -35.23 -35.582 -36.01 -37.339 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_26_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_26_57.txt deleted file mode 100644 index 6872d6ab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_26_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12342 ,TETRA ,17600245,Sun Nov 28 10:35:02 CET,Sun Nov 28 12:20:56 CET,0.0 1.376 1.707 1.971 2.19 2.368 2.523 2.653 2.913 3.027 3.144 3.233 3.478 3.559 3.71 3.86 3.995 4.06 4.181 4.295 4.471 4.578 4.672 4.793 4.898 5.024 5.138 5.213 5.304 5.408 5.513 5.623 5.713 5.807 5.925 6.019 6.066 6.109 6.163 6.209 6.24 6.264 6.238 6.146 5.995 5.747 5.37 4.826 3.997 2.728 0.556 -2.026 -4.109 -5.901 -7.408 -8.65 -9.682 -10.636 -11.426 -12.166 -12.828 -13.445 -14.019 -14.532 -14.991 -15.417 -15.879 -16.277 -16.601 -16.926 -17.261 -17.543 -17.847 -18.151 -18.381 -18.619 -18.859 -19.118 -19.388 -19.57 -19.755 -20.037 -20.221 -20.414 -20.518 -20.739 -20.964 -21.196 -21.317 -21.615 -21.7 -21.854 -22.015 -22.333 -22.502 -22.687 -22.893 -23.118 -23.37 -23.769 -25.019 -2 ,28156 ,TETRA ,17600246,Sun Nov 28 10:35:00 CET,Sun Nov 28 12:34:45 CET,0.0 1.61 2.072 2.4 2.663 2.874 3.07 3.272 3.607 3.753 3.878 3.968 4.224 4.307 4.46 4.619 4.77 4.841 4.972 5.084 5.235 5.334 5.423 5.555 5.69 5.809 5.904 5.993 6.133 6.253 6.355 6.477 6.589 6.684 6.777 6.881 6.966 7.027 7.085 7.134 7.18 7.224 7.205 7.129 6.979 6.743 6.417 5.861 4.94 3.493 1.045 -1.82 -4.048 -5.85 -7.338 -8.655 -9.788 -10.767 -11.569 -12.32 -12.987 -13.59 -14.129 -14.616 -15.093 -15.557 -16.036 -16.45 -16.791 -17.136 -17.48 -17.771 -18.087 -18.408 -18.655 -18.91 -19.185 -19.477 -19.767 -19.958 -20.152 -20.447 -20.65 -20.865 -20.979 -21.214 -21.457 -21.713 -21.848 -22.163 -22.255 -22.4 -22.539 -22.801 -22.945 -23.116 -23.309 -23.531 -23.833 -24.269 -25.717 -3 ,19605 ,TETRA ,17600247,Sun Nov 28 10:35:02 CET,Sun Nov 28 12:34:30 CET,0.0 1.566 1.996 2.322 2.581 2.8 2.996 3.181 3.495 3.63 3.752 3.812 4.049 4.147 4.32 4.457 4.59 4.655 4.772 4.875 5.031 5.133 5.23 5.366 5.498 5.623 5.733 5.836 5.975 6.109 6.223 6.361 6.482 6.564 6.658 6.765 6.862 6.957 7.021 7.063 7.101 7.118 7.114 7.072 6.949 6.759 6.442 5.91 5.173 3.976 1.786 -0.806 -2.875 -4.574 -5.973 -7.213 -8.317 -9.273 -10.057 -10.85 -11.568 -12.201 -12.753 -13.271 -13.751 -14.182 -14.632 -15.029 -15.363 -15.716 -16.076 -16.365 -16.679 -16.99 -17.222 -17.47 -17.729 -17.997 -18.282 -18.482 -18.67 -18.949 -19.158 -19.385 -19.496 -19.709 -19.939 -20.177 -20.301 -20.609 -20.7 -20.849 -20.994 -21.279 -21.434 -21.619 -21.827 -22.043 -22.314 -22.691 -23.825 -4 ,26933 ,TETRA ,17600248,Sun Nov 28 10:35:00 CET,Sun Nov 28 12:49:20 CET,0.0 1.531 1.965 2.24 2.459 2.652 2.822 2.962 3.219 3.332 3.436 3.505 3.751 3.828 3.983 4.139 4.281 4.352 4.488 4.62 4.812 4.932 5.043 5.199 5.332 5.425 5.521 5.64 5.782 5.89 5.99 6.098 6.181 6.256 6.354 6.466 6.55 6.633 6.721 6.8 6.877 6.915 6.887 6.832 6.718 6.513 6.149 5.607 4.783 3.373 0.898 -2.007 -4.355 -6.272 -7.881 -9.262 -10.418 -11.46 -12.368 -13.292 -14.055 -14.706 -15.336 -15.926 -16.464 -16.942 -17.456 -17.916 -18.296 -18.68 -19.068 -19.401 -19.737 -20.083 -20.355 -20.618 -20.867 -21.11 -21.362 -21.545 -21.744 -22.062 -22.297 -22.532 -22.651 -22.913 -23.172 -23.439 -23.587 -23.926 -24.086 -24.26 -24.439 -24.839 -25.06 -25.284 -25.516 -25.749 -26.039 -26.443 -27.451 -5 ,16920 ,TETRA ,17600249,Sun Nov 28 10:35:03 CET,Sun Nov 28 12:34:33 CET,0.0 1.888 2.328 2.699 2.955 3.148 3.34 3.507 3.796 3.931 4.056 4.129 4.405 4.517 4.707 4.881 5.033 5.098 5.22 5.349 5.542 5.653 5.754 5.881 5.997 6.114 6.215 6.314 6.442 6.542 6.63 6.727 6.811 6.892 6.986 7.075 7.131 7.195 7.264 7.3 7.312 7.284 7.234 7.149 6.973 6.727 6.356 5.827 4.957 3.577 1.345 -1.354 -3.629 -5.46 -6.934 -8.228 -9.322 -10.259 -11.04 -11.803 -12.466 -13.073 -13.635 -14.177 -14.716 -15.198 -15.685 -16.115 -16.495 -16.871 -17.222 -17.509 -17.804 -18.104 -18.333 -18.574 -18.828 -19.091 -19.38 -19.577 -19.77 -20.089 -20.304 -20.503 -20.613 -20.845 -21.077 -21.326 -21.454 -21.777 -21.903 -22.044 -22.187 -22.565 -22.767 -22.969 -23.181 -23.415 -23.657 -23.98 -24.871 -6 ,25545 ,TETRA ,17600250,Sun Nov 28 10:35:08 CET,Sun Nov 28 12:34:41 CET,0.0 1.473 1.942 2.308 2.568 2.757 2.936 3.115 3.419 3.54 3.674 3.757 4.003 4.106 4.297 4.456 4.604 4.682 4.836 4.972 5.153 5.265 5.37 5.531 5.69 5.845 5.978 6.094 6.233 6.369 6.477 6.574 6.672 6.76 6.863 6.985 7.078 7.158 7.225 7.281 7.328 7.347 7.334 7.283 7.151 6.927 6.583 6.018 5.125 3.767 1.396 -1.4 -3.564 -5.304 -6.761 -8.039 -9.109 -10.052 -10.876 -11.703 -12.413 -13.027 -13.633 -14.204 -14.699 -15.166 -15.638 -16.069 -16.486 -16.915 -17.378 -17.79 -18.216 -18.624 -18.921 -19.223 -19.535 -19.866 -20.209 -20.433 -20.652 -20.996 -21.236 -21.478 -21.604 -21.867 -22.132 -22.426 -22.585 -22.938 -23.094 -23.269 -23.431 -23.785 -24.012 -24.263 -24.516 -24.785 -25.109 -25.529 -26.829 -7 ,591 ,TETRA ,17600251,Sun Nov 28 10:35:08 CET,Sun Nov 28 12:27:23 CET,0.0 1.094 1.459 1.775 2.006 2.202 2.363 2.49 2.707 2.81 2.92 2.968 3.218 3.314 3.492 3.639 3.773 3.843 3.983 4.119 4.303 4.425 4.55 4.719 4.848 4.973 5.09 5.176 5.286 5.383 5.482 5.597 5.699 5.785 5.861 5.94 6.024 6.122 6.191 6.219 6.221 6.193 6.151 6.08 5.982 5.785 5.441 4.921 4.0 2.529 0.154 -2.544 -4.678 -6.446 -7.959 -9.3 -10.414 -11.377 -12.175 -12.941 -13.614 -14.207 -14.761 -15.302 -15.828 -16.311 -16.79 -17.2 -17.555 -17.923 -18.305 -18.621 -18.947 -19.288 -19.543 -19.799 -20.082 -20.38 -20.689 -20.893 -21.091 -21.404 -21.627 -21.85 -21.959 -22.189 -22.441 -22.71 -22.839 -23.144 -23.279 -23.447 -23.627 -23.999 -24.158 -24.313 -24.482 -24.689 -24.938 -25.261 -25.885 -8 ,30659 ,TETRA ,17600252,Sun Nov 28 10:35:01 CET,Sun Nov 28 12:36:27 CET,0.0 1.809 2.254 2.51 2.732 2.935 3.125 3.285 3.599 3.747 3.873 3.943 4.194 4.291 4.465 4.616 4.754 4.824 4.952 5.07 5.238 5.358 5.483 5.64 5.774 5.887 5.987 6.088 6.22 6.345 6.464 6.615 6.76 6.871 6.982 7.098 7.192 7.295 7.424 7.551 7.635 7.65 7.598 7.537 7.445 7.259 6.907 6.309 5.335 3.897 1.616 -1.134 -3.309 -5.093 -6.622 -7.958 -9.074 -10.021 -10.828 -11.62 -12.292 -12.879 -13.406 -13.9 -14.369 -14.788 -15.208 -15.587 -15.911 -16.241 -16.609 -16.919 -17.236 -17.577 -17.835 -18.095 -18.357 -18.633 -18.913 -19.1 -19.302 -19.611 -19.817 -20.023 -20.129 -20.346 -20.567 -20.805 -20.937 -21.253 -21.338 -21.494 -21.645 -21.946 -22.126 -22.326 -22.564 -22.869 -23.206 -23.606 -24.903 -9 ,7070 ,TETRA ,17600253,Sun Nov 28 10:35:03 CET,Sun Nov 28 12:37:29 CET,0.0 1.592 1.966 2.273 2.524 2.725 2.902 3.07 3.398 3.533 3.642 3.705 3.956 4.052 4.232 4.39 4.517 4.586 4.734 4.849 5.012 5.124 5.228 5.376 5.499 5.606 5.713 5.821 5.961 6.085 6.203 6.319 6.411 6.523 6.657 6.771 6.862 6.973 7.086 7.178 7.253 7.287 7.288 7.275 7.185 6.946 6.556 5.978 5.065 3.709 1.484 -1.124 -3.177 -4.883 -6.345 -7.646 -8.748 -9.709 -10.551 -11.368 -12.039 -12.643 -13.244 -13.824 -14.317 -14.776 -15.306 -15.757 -16.125 -16.48 -16.82 -17.107 -17.404 -17.702 -17.937 -18.18 -18.431 -18.696 -18.967 -19.153 -19.339 -19.624 -19.829 -20.039 -20.144 -20.363 -20.588 -20.839 -20.977 -21.308 -21.427 -21.571 -21.704 -22.009 -22.178 -22.354 -22.55 -22.76 -23.016 -23.395 -24.101 -10 ,25474 ,TETRA ,17600254,Sun Nov 28 10:35:05 CET,Sun Nov 28 12:35:46 CET,0.0 1.816 2.228 2.515 2.757 2.956 3.141 3.312 3.599 3.722 3.83 3.884 4.116 4.205 4.381 4.547 4.692 4.752 4.877 4.994 5.146 5.236 5.32 5.443 5.551 5.657 5.768 5.874 5.991 6.105 6.228 6.345 6.425 6.51 6.635 6.761 6.859 6.957 7.035 7.1 7.14 7.122 7.046 6.933 6.745 6.458 6.059 5.479 4.612 3.278 1.017 -1.722 -3.903 -5.707 -7.243 -8.582 -9.738 -10.756 -11.64 -12.505 -13.2 -13.812 -14.402 -14.961 -15.472 -15.925 -16.381 -16.787 -17.139 -17.5 -17.87 -18.17 -18.485 -18.807 -19.058 -19.32 -19.578 -19.855 -20.138 -20.316 -20.503 -20.8 -21.011 -21.231 -21.344 -21.593 -21.842 -22.077 -22.197 -22.502 -22.577 -22.71 -22.868 -23.241 -23.418 -23.603 -23.821 -24.053 -24.315 -24.662 -26.008 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_26_68.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_26_68.txt deleted file mode 100644 index 5b2d4671..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_26_68.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2909 ,TETRA ,17600255,Sun Nov 28 10:35:01 CET,Sun Nov 28 12:34:57 CET,0.0 1.216 1.643 1.959 2.199 2.409 2.617 2.822 3.167 3.325 3.472 3.575 3.84 3.956 4.201 4.44 4.654 4.761 4.97 5.154 5.412 5.576 5.728 5.932 6.13 6.335 6.518 6.687 6.908 7.128 7.35 7.61 7.846 8.06 8.296 8.548 8.773 9.016 9.285 9.563 9.825 10.138 10.529 10.866 11.21 11.569 11.953 12.316 12.641 12.856 12.631 11.93 11.253 10.617 10.002 9.446 8.917 8.405 7.97 7.524 7.126 6.759 6.398 6.057 5.745 5.461 5.173 4.917 4.686 4.441 4.179 3.962 3.75 3.521 3.329 3.127 2.909 2.679 2.438 2.272 2.112 1.875 1.699 1.495 1.387 1.175 0.954 0.694 0.535 0.22 0.045 -0.106 -0.241 -0.521 -0.679 -0.885 -1.106 -1.302 -1.537 -1.83 -2.443 -2 ,9150 ,TETRA ,17600256,Sun Nov 28 10:35:03 CET,Sun Nov 28 12:33:29 CET,0.0 2.055 2.59 2.902 3.144 3.39 3.634 3.811 4.133 4.293 4.436 4.561 4.836 4.95 5.198 5.444 5.648 5.739 5.926 6.107 6.348 6.503 6.66 6.883 7.067 7.236 7.407 7.58 7.804 8.008 8.218 8.475 8.706 8.911 9.148 9.432 9.686 9.949 10.232 10.506 10.803 11.144 11.51 11.84 12.153 12.47 12.793 13.122 13.444 13.653 13.54 13.063 12.488 11.826 11.181 10.561 9.977 9.425 8.934 8.439 8.019 7.641 7.265 6.91 6.576 6.271 5.955 5.67 5.429 5.165 4.882 4.656 4.415 4.156 3.955 3.741 3.516 3.304 3.096 2.936 2.767 2.502 2.322 2.135 2.04 1.848 1.642 1.429 1.314 1.055 0.964 0.825 0.66 0.291 0.096 -0.121 -0.365 -0.646 -1.004 -1.469 -3.405 -3 ,11109 ,TETRA ,17600257,Sun Nov 28 10:35:07 CET,Sun Nov 28 12:21:23 CET,0.0 2.012 2.643 3.085 3.41 3.672 3.865 4.049 4.422 4.583 4.728 4.831 5.101 5.22 5.433 5.63 5.815 5.902 6.07 6.225 6.456 6.61 6.76 6.976 7.162 7.343 7.527 7.698 7.909 8.109 8.291 8.488 8.676 8.879 9.103 9.34 9.562 9.789 10.022 10.261 10.508 10.775 11.09 11.392 11.737 12.114 12.434 12.714 12.962 13.118 13.048 12.584 12.016 11.45 10.927 10.456 10.03 9.595 9.196 8.807 8.477 8.176 7.878 7.592 7.325 7.088 6.845 6.623 6.428 6.219 6.003 5.833 5.657 5.466 5.307 5.134 4.943 4.754 4.577 4.447 4.315 4.125 3.998 3.853 3.769 3.595 3.418 3.245 3.152 2.901 2.858 2.764 2.66 2.43 2.294 2.138 1.963 1.756 1.476 1.101 -0.435 -4 ,7321 ,TETRA ,17600258,Sun Nov 28 10:35:09 CET,Sun Nov 28 12:33:05 CET,0.0 0.941 1.357 1.69 1.952 2.17 2.356 2.541 2.902 3.051 3.184 3.262 3.527 3.642 3.863 4.049 4.203 4.28 4.44 4.598 4.813 4.954 5.096 5.285 5.451 5.621 5.789 5.944 6.143 6.32 6.489 6.702 6.908 7.106 7.339 7.605 7.847 8.117 8.406 8.681 8.961 9.252 9.562 9.864 10.192 10.565 10.965 11.301 11.563 11.734 11.642 11.098 10.533 9.97 9.441 8.968 8.544 8.124 7.729 7.33 6.981 6.676 6.397 6.12 5.857 5.616 5.373 5.157 4.955 4.747 4.539 4.365 4.185 3.99 3.831 3.672 3.511 3.339 3.16 3.035 2.897 2.679 2.542 2.405 2.327 2.165 1.991 1.8 1.708 1.459 1.386 1.272 1.148 0.857 0.698 0.534 0.362 0.164 -0.046 -0.321 -1.216 -5 ,17891 ,TETRA ,17600259,Sun Nov 28 10:35:11 CET,Sun Nov 28 12:32:49 CET,0.0 1.208 1.579 1.901 2.212 2.455 2.652 2.848 3.204 3.366 3.508 3.618 3.873 3.979 4.214 4.435 4.64 4.739 4.935 5.126 5.383 5.533 5.673 5.893 6.111 6.318 6.515 6.691 6.896 7.088 7.286 7.531 7.772 7.997 8.229 8.481 8.719 8.966 9.231 9.528 9.828 10.121 10.458 10.799 11.184 11.592 12.018 12.357 12.584 12.709 12.515 11.904 11.196 10.467 9.776 9.169 8.625 8.102 7.637 7.162 6.724 6.325 5.944 5.563 5.211 4.901 4.569 4.258 3.99 3.716 3.429 3.182 2.923 2.658 2.453 2.235 2.027 1.829 1.623 1.481 1.323 1.057 0.881 0.712 0.623 0.421 0.198 -0.033 -0.155 -0.435 -0.567 -0.724 -0.874 -1.204 -1.411 -1.613 -1.833 -2.113 -2.425 -2.849 -4.425 -6 ,16376 ,TETRA ,17600260,Sun Nov 28 10:35:14 CET,Sun Nov 28 12:33:16 CET,0.0 1.725 2.176 2.525 2.789 3.026 3.256 3.456 3.773 3.935 4.103 4.248 4.531 4.651 4.872 5.087 5.304 5.41 5.59 5.749 5.992 6.153 6.311 6.53 6.73 6.937 7.131 7.309 7.522 7.722 7.927 8.17 8.405 8.642 8.926 9.219 9.494 9.777 10.053 10.345 10.627 10.964 11.383 11.726 12.05 12.369 12.672 12.959 13.199 13.373 13.253 12.639 11.955 11.247 10.529 9.839 9.274 8.813 8.424 8.023 7.628 7.244 6.881 6.553 6.244 5.935 5.606 5.325 5.081 4.818 4.548 4.33 4.115 3.891 3.714 3.53 3.322 3.1 2.878 2.718 2.556 2.307 2.127 1.926 1.812 1.574 1.328 1.064 0.928 0.643 0.496 0.321 0.144 -0.229 -0.431 -0.643 -0.887 -1.18 -1.532 -2.037 -3.862 -7 ,18497 ,TETRA ,17600261,Sun Nov 28 10:35:12 CET,Sun Nov 28 12:32:42 CET,0.0 1.618 2.048 2.348 2.626 2.859 3.049 3.222 3.56 3.712 3.838 3.925 4.183 4.304 4.531 4.727 4.909 4.988 5.137 5.281 5.491 5.625 5.741 5.917 6.096 6.269 6.432 6.58 6.775 6.971 7.16 7.386 7.586 7.767 7.974 8.192 8.399 8.636 8.891 9.149 9.406 9.707 10.036 10.298 10.595 10.951 11.293 11.599 11.869 12.025 11.962 11.5 10.929 10.382 9.857 9.346 8.893 8.497 8.149 7.761 7.412 7.119 6.831 6.546 6.283 6.036 5.787 5.571 5.382 5.189 4.977 4.797 4.609 4.41 4.266 4.115 3.956 3.802 3.634 3.505 3.363 3.136 2.973 2.794 2.701 2.513 2.312 2.095 1.978 1.714 1.619 1.482 1.337 1.001 0.806 0.601 0.375 0.098 -0.244 -0.759 -4.159 -8 ,10590 ,TETRA ,17600262,Sun Nov 28 10:35:11 CET,Sun Nov 28 12:34:27 CET,0.0 1.401 1.848 2.174 2.452 2.712 2.937 3.135 3.513 3.682 3.832 3.979 4.261 4.39 4.633 4.857 5.066 5.171 5.377 5.564 5.817 5.971 6.121 6.337 6.539 6.725 6.908 7.081 7.308 7.537 7.744 7.985 8.257 8.524 8.815 9.121 9.372 9.64 9.946 10.26 10.56 10.874 11.232 11.585 11.942 12.284 12.671 13.08 13.389 13.554 13.507 13.01 12.451 11.905 11.377 10.848 10.342 9.854 9.42 8.985 8.608 8.253 7.902 7.573 7.262 6.969 6.65 6.362 6.107 5.846 5.585 5.369 5.133 4.868 4.668 4.466 4.243 4.0 3.751 3.588 3.415 3.147 2.966 2.783 2.69 2.487 2.261 2.021 1.887 1.586 1.417 1.238 1.046 0.636 0.406 0.178 -0.037 -0.285 -0.609 -1.046 -3.257 -9 ,1292 ,TETRA ,17600263,Sun Nov 28 10:35:13 CET,Sun Nov 28 12:34:14 CET,0.0 2.173 2.733 3.112 3.394 3.656 3.902 4.15 4.606 4.804 4.986 5.171 5.457 5.607 5.908 6.173 6.415 6.525 6.717 6.875 7.1 7.254 7.401 7.602 7.792 7.978 8.157 8.334 8.566 8.779 8.975 9.204 9.425 9.64 9.858 10.082 10.293 10.53 10.793 11.065 11.358 11.705 12.084 12.397 12.732 13.091 13.42 13.686 13.93 14.082 13.862 13.237 12.519 11.78 11.144 10.601 10.097 9.593 9.145 8.698 8.292 7.918 7.561 7.205 6.862 6.556 6.235 5.939 5.673 5.386 5.09 4.847 4.592 4.329 4.12 3.906 3.684 3.435 3.178 3.008 2.825 2.537 2.345 2.143 2.039 1.811 1.572 1.33 1.202 0.916 0.77 0.614 0.449 0.055 -0.155 -0.38 -0.673 -1.016 -1.429 -1.963 -3.465 -10 ,7670 ,TETRA ,17600264,Sun Nov 28 10:35:15 CET,Sun Nov 28 12:22:08 CET,0.0 1.989 2.455 2.777 3.019 3.245 3.458 3.643 3.958 4.101 4.237 4.361 4.655 4.787 5.029 5.234 5.409 5.491 5.655 5.821 6.052 6.202 6.36 6.572 6.749 6.92 7.108 7.308 7.568 7.8 8.007 8.259 8.497 8.71 8.935 9.19 9.443 9.715 9.996 10.284 10.568 10.856 11.189 11.512 11.874 12.22 12.5 12.734 12.87 12.865 12.632 11.99 11.276 10.609 9.981 9.358 8.773 8.23 7.775 7.332 6.949 6.601 6.25 5.902 5.575 5.299 5.017 4.743 4.499 4.246 3.972 3.739 3.501 3.259 3.067 2.866 2.658 2.437 2.203 2.039 1.865 1.569 1.361 1.156 1.035 0.765 0.501 0.265 0.156 -0.107 -0.201 -0.335 -0.486 -0.846 -1.053 -1.275 -1.513 -1.802 -2.139 -2.568 -4.218 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_28.txt deleted file mode 100644 index 16607801..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22496 ,TETRA ,17600265,Sun Nov 28 10:35:11 CET,Sun Nov 28 12:30:20 CET,0.0 1.592 2.035 2.424 2.788 3.091 3.345 3.575 3.982 4.172 4.343 4.466 4.797 4.935 5.209 5.467 5.698 5.813 6.039 6.246 6.536 6.721 6.906 7.172 7.416 7.63 7.825 8.026 8.293 8.542 8.789 9.084 9.354 9.607 9.886 10.212 10.541 10.917 11.326 11.732 12.125 12.552 13.018 13.417 13.852 14.329 14.831 15.319 15.817 16.279 16.556 16.471 16.142 15.739 15.339 14.915 14.507 14.126 13.82 13.474 13.154 12.877 12.585 12.293 12.015 11.766 11.51 11.261 11.041 10.812 10.568 10.383 10.189 9.968 9.805 9.635 9.448 9.261 9.065 8.932 8.794 8.571 8.409 8.247 8.166 7.994 7.8 7.586 7.482 7.197 7.146 6.998 6.861 6.593 6.443 6.281 6.084 5.866 5.607 5.276 4.2 -2 ,11482 ,TETRA ,17600266,Sun Nov 28 10:35:12 CET,Sun Nov 28 12:31:18 CET,0.0 1.657 2.178 2.582 2.914 3.225 3.504 3.717 4.084 4.262 4.43 4.57 4.893 5.041 5.299 5.51 5.719 5.826 6.03 6.222 6.488 6.649 6.797 7.013 7.225 7.43 7.63 7.824 8.087 8.345 8.587 8.868 9.107 9.33 9.58 9.861 10.164 10.489 10.811 11.142 11.489 11.909 12.378 12.812 13.297 13.8 14.35 14.915 15.447 15.941 16.214 16.038 15.684 15.298 14.912 14.501 14.112 13.734 13.371 13.0 12.667 12.366 12.082 11.81 11.571 11.345 11.092 10.863 10.677 10.496 10.296 10.118 9.926 9.736 9.59 9.435 9.278 9.121 8.941 8.807 8.678 8.473 8.315 8.164 8.092 7.933 7.759 7.568 7.468 7.183 7.172 7.04 6.901 6.638 6.481 6.305 6.119 5.92 5.682 5.284 3.714 -3 ,21134 ,TETRA ,17600267,Sun Nov 28 10:35:13 CET,Sun Nov 28 12:29:28 CET,0.0 1.414 1.879 2.203 2.463 2.704 2.894 3.057 3.387 3.564 3.764 3.919 4.217 4.36 4.703 5.01 5.265 5.385 5.613 5.825 6.13 6.322 6.513 6.771 6.984 7.194 7.414 7.623 7.9 8.168 8.414 8.703 8.971 9.23 9.509 9.804 10.103 10.442 10.787 11.13 11.503 11.923 12.378 12.781 13.206 13.621 14.083 14.614 15.121 15.485 15.558 15.284 14.937 14.524 14.084 13.642 13.202 12.786 12.404 12.016 11.693 11.391 11.085 10.813 10.564 10.324 10.059 9.821 9.623 9.403 9.159 8.959 8.762 8.565 8.423 8.279 8.118 7.954 7.782 7.663 7.546 7.36 7.217 7.074 7.004 6.859 6.701 6.529 6.438 6.16 6.118 6.001 5.887 5.645 5.498 5.315 5.12 4.896 4.645 4.325 3.012 -4 ,16572 ,TETRA ,17600268,Sun Nov 28 10:35:12 CET,Sun Nov 28 12:24:28 CET,0.0 2.115 2.619 2.955 3.235 3.487 3.745 4.01 4.472 4.68 4.854 4.956 5.27 5.402 5.677 5.952 6.21 6.328 6.559 6.776 7.066 7.249 7.416 7.654 7.896 8.12 8.343 8.559 8.838 9.125 9.418 9.775 10.097 10.383 10.695 11.035 11.368 11.737 12.115 12.515 12.915 13.338 13.783 14.191 14.674 15.19 15.734 16.268 16.764 17.208 17.521 17.429 17.154 16.839 16.486 16.118 15.765 15.425 15.127 14.831 14.583 14.345 14.105 13.868 13.622 13.389 13.156 12.922 12.678 12.406 12.125 11.911 11.688 11.45 11.271 11.081 10.879 10.665 10.434 10.282 10.123 9.867 9.697 9.534 9.451 9.269 9.049 8.784 8.656 8.345 8.231 8.075 7.918 7.573 7.376 7.137 6.882 6.588 6.236 5.822 4.361 -5 ,23968 ,TETRA ,17600269,Sun Nov 28 10:35:13 CET,Sun Nov 28 12:27:19 CET,0.0 2.075 2.651 3.058 3.377 3.685 3.947 4.156 4.532 4.719 4.916 5.112 5.458 5.609 5.92 6.206 6.474 6.6 6.825 7.031 7.308 7.49 7.68 7.955 8.186 8.383 8.579 8.769 9.011 9.248 9.476 9.745 10.017 10.298 10.611 10.959 11.311 11.682 12.072 12.464 12.839 13.29 13.775 14.171 14.618 15.101 15.609 16.113 16.631 17.12 17.436 17.369 17.015 16.522 16.072 15.65 15.232 14.832 14.47 14.117 13.807 13.512 13.221 12.928 12.651 12.397 12.129 11.889 11.705 11.506 11.282 11.11 10.917 10.717 10.572 10.422 10.259 10.085 9.915 9.792 9.656 9.451 9.311 9.166 9.092 8.94 8.782 8.597 8.501 8.233 8.197 8.077 7.953 7.69 7.559 7.389 7.164 6.908 6.606 6.236 4.638 -6 ,25445 ,TETRA ,17600270,Sun Nov 28 10:35:22 CET,Sun Nov 28 12:28:56 CET,0.0 1.748 2.205 2.509 2.764 3.0 3.233 3.443 3.788 3.943 4.084 4.17 4.471 4.59 4.818 5.031 5.238 5.335 5.526 5.712 5.967 6.112 6.249 6.446 6.646 6.833 6.987 7.145 7.37 7.579 7.782 8.032 8.26 8.481 8.746 9.039 9.315 9.602 9.897 10.205 10.51 10.843 11.223 11.592 12.009 12.464 12.954 13.442 13.93 14.328 14.624 14.547 14.158 13.719 13.271 12.838 12.421 11.976 11.549 11.104 10.711 10.341 10.001 9.722 9.478 9.235 8.973 8.741 8.538 8.335 8.125 7.955 7.774 7.577 7.42 7.25 7.078 6.912 6.747 6.63 6.505 6.303 6.159 6.004 5.921 5.745 5.553 5.359 5.264 4.983 4.916 4.789 4.667 4.383 4.23 4.074 3.884 3.67 3.427 3.108 1.436 -7 ,13282 ,TETRA ,17600271,Sun Nov 28 10:35:12 CET,Sun Nov 28 12:31:34 CET,0.0 1.939 2.482 2.845 3.179 3.459 3.67 3.86 4.177 4.32 4.459 4.524 4.819 4.935 5.16 5.388 5.6 5.698 5.885 6.088 6.378 6.549 6.723 6.961 7.17 7.383 7.591 7.781 8.023 8.254 8.485 8.775 9.055 9.316 9.607 9.941 10.294 10.69 11.08 11.499 11.937 12.338 12.764 13.171 13.589 14.019 14.449 14.845 15.209 15.533 15.639 15.398 15.019 14.593 14.187 13.795 13.435 13.093 12.784 12.443 12.127 11.84 11.57 11.312 11.058 10.814 10.567 10.346 10.145 9.925 9.686 9.493 9.302 9.121 8.983 8.84 8.691 8.524 8.346 8.217 8.083 7.889 7.747 7.592 7.521 7.39 7.246 7.087 6.997 6.711 6.699 6.606 6.518 6.311 6.181 6.03 5.843 5.625 5.363 4.961 3.541 -8 ,8227 ,TETRA ,17600272,Sun Nov 28 10:35:13 CET,Sun Nov 28 12:30:45 CET,0.0 4.285 4.83 5.227 5.548 5.824 6.071 6.284 6.656 6.815 6.965 7.084 7.42 7.563 7.862 8.15 8.414 8.536 8.763 8.964 9.229 9.406 9.585 9.822 10.027 10.239 10.45 10.654 10.918 11.168 11.395 11.653 11.934 12.228 12.549 12.902 13.239 13.606 13.958 14.296 14.649 15.028 15.448 15.831 16.256 16.758 17.276 17.75 18.233 18.657 18.831 18.563 18.184 17.818 17.455 17.067 16.712 16.328 15.928 15.527 15.182 14.857 14.543 14.262 14.004 13.779 13.543 13.32 13.124 12.917 12.683 12.485 12.296 12.1 11.942 11.768 11.594 11.424 11.213 11.062 10.928 10.706 10.516 10.3 10.2 10.016 9.847 9.66 9.549 9.245 9.144 8.999 8.837 8.495 8.298 8.067 7.822 7.541 7.21 6.741 4.392 -9 ,12610 ,TETRA ,17600273,Sun Nov 28 10:35:12 CET,Sun Nov 28 12:22:16 CET,0.0 1.904 2.516 2.95 3.292 3.581 3.808 4.016 4.414 4.578 4.736 4.832 5.13 5.249 5.495 5.718 5.924 6.026 6.225 6.41 6.655 6.819 6.989 7.239 7.477 7.712 7.949 8.168 8.425 8.663 8.885 9.134 9.372 9.596 9.839 10.12 10.371 10.63 10.911 11.199 11.511 11.861 12.217 12.542 12.901 13.276 13.691 14.086 14.474 14.782 14.823 14.572 14.191 13.737 13.31 12.914 12.554 12.223 11.915 11.601 11.316 11.048 10.805 10.554 10.317 10.093 9.858 9.661 9.483 9.297 9.089 8.919 8.748 8.564 8.432 8.305 8.164 8.005 7.828 7.705 7.58 7.384 7.231 7.065 6.985 6.826 6.663 6.478 6.379 6.099 6.106 6.01 5.909 5.691 5.549 5.374 5.2 5.028 4.811 4.474 2.841 -10 ,8792 ,TETRA ,17600274,Sun Nov 28 10:35:22 CET,Sun Nov 28 12:17:25 CET,0.0 2.401 2.903 3.226 3.497 3.734 3.93 4.105 4.443 4.6 4.746 4.836 5.148 5.283 5.545 5.763 5.954 6.043 6.209 6.379 6.636 6.798 6.952 7.184 7.409 7.631 7.847 8.038 8.273 8.501 8.722 9.006 9.275 9.523 9.8 10.096 10.378 10.667 10.968 11.298 11.656 12.056 12.488 12.873 13.287 13.738 14.224 14.704 15.146 15.481 15.598 15.337 14.926 14.497 14.06 13.629 13.25 12.882 12.517 12.141 11.794 11.474 11.188 10.933 10.683 10.448 10.196 9.978 9.79 9.571 9.338 9.147 8.946 8.739 8.58 8.408 8.23 8.051 7.858 7.73 7.604 7.416 7.28 7.127 7.047 6.867 6.67 6.471 6.365 6.078 6.012 5.889 5.756 5.431 5.256 5.041 4.816 4.597 4.34 3.984 2.415 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_30.txt deleted file mode 100644 index c1f72b35..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30315 ,TETRA ,17600275,Sun Nov 28 10:35:22 CET,Sun Nov 28 12:37:57 CET,0.0 1.254 1.637 1.873 2.04 2.197 2.345 2.481 2.717 2.831 2.939 2.943 3.223 3.318 3.483 3.645 3.807 3.887 4.033 4.157 4.364 4.49 4.593 4.748 4.915 5.082 5.231 5.363 5.521 5.67 5.815 5.981 6.133 6.279 6.451 6.629 6.793 6.976 7.144 7.313 7.477 7.634 7.816 8.007 8.196 8.324 8.433 8.503 8.412 8.04 7.219 6.015 4.918 4.052 3.322 2.635 2.023 1.465 1.0 0.54 0.154 -0.175 -0.491 -0.799 -1.075 -1.333 -1.619 -1.874 -2.093 -2.317 -2.549 -2.748 -2.941 -3.136 -3.291 -3.454 -3.633 -3.803 -3.97 -4.091 -4.212 -4.395 -4.522 -4.646 -4.713 -4.859 -4.998 -5.154 -5.239 -5.524 -5.505 -5.605 -5.702 -5.929 -6.066 -6.199 -6.322 -6.468 -6.655 -6.914 -7.627 -2 ,14302 ,TETRA ,17600276,Sun Nov 28 10:35:22 CET,Sun Nov 28 12:38:14 CET,0.0 1.127 1.479 1.731 1.938 2.117 2.298 2.467 2.759 2.895 3.024 3.088 3.378 3.472 3.654 3.814 3.967 4.04 4.177 4.315 4.506 4.619 4.716 4.855 4.991 5.116 5.243 5.371 5.523 5.663 5.794 5.938 6.087 6.244 6.404 6.559 6.708 6.864 7.002 7.152 7.319 7.52 7.722 7.871 8.004 8.084 8.142 8.178 8.092 7.753 7.026 5.982 5.019 4.175 3.46 2.805 2.22 1.698 1.247 0.801 0.424 0.075 -0.265 -0.582 -0.883 -1.147 -1.405 -1.636 -1.85 -2.08 -2.312 -2.488 -2.673 -2.879 -3.039 -3.216 -3.395 -3.567 -3.751 -3.88 -4.012 -4.228 -4.37 -4.505 -4.578 -4.721 -4.873 -5.043 -5.125 -5.403 -5.397 -5.494 -5.594 -5.813 -5.94 -6.094 -6.258 -6.416 -6.602 -6.835 -7.341 -3 ,24287 ,TETRA ,17600277,Sun Nov 28 10:35:24 CET,Sun Nov 28 12:31:59 CET,0.0 1.221 1.533 1.766 1.949 2.105 2.252 2.381 2.602 2.695 2.798 2.817 3.087 3.171 3.32 3.456 3.602 3.674 3.805 3.925 4.089 4.194 4.295 4.445 4.579 4.689 4.8 4.906 5.038 5.173 5.305 5.447 5.566 5.693 5.844 6.003 6.163 6.331 6.482 6.627 6.779 6.94 7.092 7.209 7.351 7.494 7.59 7.597 7.515 7.258 6.559 5.512 4.605 3.811 3.08 2.392 1.802 1.31 0.876 0.419 0.03 -0.307 -0.638 -0.95 -1.239 -1.509 -1.78 -2.025 -2.251 -2.478 -2.705 -2.888 -3.068 -3.252 -3.407 -3.565 -3.714 -3.88 -4.057 -4.179 -4.304 -4.506 -4.658 -4.81 -4.89 -5.058 -5.22 -5.397 -5.506 -5.821 -5.845 -5.954 -6.067 -6.286 -6.393 -6.511 -6.669 -6.858 -7.055 -7.31 -7.698 -4 ,23983 ,TETRA ,17600278,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:32:25 CET,0.0 1.258 1.61 1.875 2.068 2.22 2.353 2.468 2.668 2.771 2.882 2.895 3.175 3.262 3.429 3.599 3.763 3.832 3.952 4.067 4.241 4.354 4.449 4.579 4.708 4.826 4.954 5.088 5.255 5.408 5.543 5.685 5.802 5.926 6.064 6.214 6.363 6.529 6.715 6.888 7.054 7.225 7.392 7.542 7.683 7.799 7.844 7.784 7.636 7.295 6.594 5.532 4.521 3.679 2.923 2.216 1.58 1.017 0.552 0.081 -0.319 -0.667 -0.999 -1.312 -1.61 -1.879 -2.154 -2.394 -2.596 -2.819 -3.065 -3.259 -3.464 -3.685 -3.862 -4.043 -4.224 -4.405 -4.588 -4.718 -4.857 -5.075 -5.22 -5.358 -5.424 -5.559 -5.699 -5.85 -5.925 -6.194 -6.184 -6.281 -6.379 -6.624 -6.749 -6.871 -6.995 -7.12 -7.288 -7.513 -7.913 -5 ,234 ,TETRA ,17600279,Sun Nov 28 10:35:22 CET,Sun Nov 28 12:17:12 CET,0.0 1.381 1.78 2.092 2.337 2.522 2.688 2.866 3.174 3.294 3.406 3.427 3.722 3.821 4.003 4.163 4.321 4.406 4.551 4.677 4.868 4.988 5.101 5.269 5.426 5.567 5.704 5.842 6.014 6.175 6.326 6.484 6.606 6.72 6.874 7.03 7.154 7.283 7.427 7.592 7.749 7.898 8.003 8.102 8.214 8.289 8.326 8.291 8.178 7.854 7.071 6.016 5.065 4.229 3.527 2.884 2.318 1.816 1.375 0.922 0.537 0.188 -0.157 -0.48 -0.77 -1.023 -1.284 -1.518 -1.724 -1.94 -2.173 -2.376 -2.585 -2.79 -2.945 -3.108 -3.272 -3.438 -3.61 -3.727 -3.846 -4.04 -4.18 -4.313 -4.382 -4.52 -4.668 -4.823 -4.901 -5.19 -5.192 -5.295 -5.387 -5.615 -5.733 -5.84 -5.973 -6.127 -6.308 -6.561 -7.117 -6 ,14830 ,TETRA ,17600280,Sun Nov 28 10:35:22 CET,Sun Nov 28 12:19:03 CET,0.0 0.849 1.186 1.416 1.594 1.754 1.915 2.064 2.305 2.417 2.526 2.519 2.779 2.86 3.011 3.156 3.293 3.357 3.479 3.602 3.792 3.906 4.005 4.144 4.285 4.418 4.554 4.682 4.831 4.988 5.147 5.342 5.519 5.673 5.845 6.026 6.19 6.357 6.535 6.712 6.861 7.031 7.26 7.452 7.598 7.728 7.837 7.852 7.721 7.363 6.66 5.684 4.793 4.001 3.319 2.678 2.086 1.558 1.098 0.609 0.192 -0.161 -0.487 -0.8 -1.095 -1.359 -1.63 -1.871 -2.083 -2.302 -2.521 -2.7 -2.887 -3.086 -3.255 -3.426 -3.602 -3.787 -3.96 -4.072 -4.198 -4.392 -4.518 -4.666 -4.748 -4.922 -5.099 -5.277 -5.37 -5.678 -5.668 -5.763 -5.886 -6.161 -6.295 -6.448 -6.594 -6.755 -6.949 -7.186 -7.7 -7 ,22875 ,TETRA ,17600281,Sun Nov 28 10:35:22 CET,Sun Nov 28 12:15:22 CET,0.0 1.81 2.15 2.399 2.593 2.747 2.873 2.986 3.216 3.332 3.433 3.439 3.716 3.803 3.968 4.111 4.251 4.321 4.45 4.57 4.743 4.865 4.984 5.144 5.298 5.436 5.559 5.669 5.806 5.949 6.079 6.218 6.36 6.486 6.617 6.776 6.915 7.049 7.204 7.353 7.476 7.628 7.783 7.911 8.021 8.08 8.134 8.188 8.109 7.755 6.982 5.935 4.984 4.158 3.464 2.826 2.258 1.742 1.288 0.836 0.448 0.097 -0.248 -0.587 -0.894 -1.16 -1.427 -1.657 -1.859 -2.071 -2.301 -2.488 -2.68 -2.896 -3.075 -3.269 -3.466 -3.649 -3.835 -3.968 -4.108 -4.327 -4.471 -4.629 -4.711 -4.871 -5.034 -5.216 -5.305 -5.587 -5.574 -5.665 -5.758 -5.956 -6.074 -6.213 -6.356 -6.494 -6.645 -6.836 -7.412 -8 ,6811 ,TETRA ,17600282,Sun Nov 28 10:35:22 CET,Sun Nov 28 12:20:54 CET,0.0 1.405 1.78 2.028 2.234 2.421 2.587 2.749 3.035 3.15 3.247 3.264 3.536 3.63 3.807 3.953 4.082 4.143 4.266 4.384 4.528 4.623 4.737 4.898 5.045 5.188 5.313 5.42 5.569 5.717 5.851 6.012 6.16 6.298 6.454 6.647 6.816 6.972 7.139 7.306 7.467 7.632 7.814 7.971 8.093 8.196 8.306 8.392 8.372 8.153 7.562 6.584 5.613 4.763 4.053 3.433 2.877 2.334 1.868 1.418 1.038 0.702 0.382 0.077 -0.213 -0.48 -0.758 -1.015 -1.239 -1.466 -1.691 -1.867 -2.065 -2.278 -2.441 -2.609 -2.785 -2.961 -3.134 -3.251 -3.371 -3.56 -3.689 -3.839 -3.916 -4.057 -4.209 -4.37 -4.464 -4.753 -4.726 -4.821 -4.92 -5.127 -5.237 -5.352 -5.478 -5.643 -5.889 -6.16 -6.499 -9 ,6508 ,TETRA ,17600283,Sun Nov 28 10:35:22 CET,Sun Nov 28 12:31:46 CET,0.0 1.587 1.943 2.216 2.457 2.657 2.816 2.963 3.275 3.428 3.562 3.588 3.872 3.971 4.162 4.354 4.513 4.584 4.737 4.887 5.084 5.198 5.316 5.498 5.654 5.794 5.938 6.073 6.241 6.401 6.551 6.739 6.919 7.076 7.257 7.445 7.61 7.782 7.948 8.108 8.261 8.417 8.588 8.762 8.93 9.05 9.129 9.154 9.081 8.839 8.124 6.981 5.974 5.134 4.412 3.716 3.112 2.594 2.139 1.671 1.268 0.91 0.57 0.25 -0.045 -0.31 -0.595 -0.844 -1.056 -1.29 -1.538 -1.744 -1.95 -2.155 -2.317 -2.473 -2.632 -2.81 -2.996 -3.128 -3.266 -3.475 -3.625 -3.778 -3.856 -4.012 -4.18 -4.385 -4.491 -4.784 -4.781 -4.886 -4.997 -5.248 -5.383 -5.54 -5.708 -5.894 -6.119 -6.409 -6.948 -10 ,29522 ,TETRA ,17600284,Sun Nov 28 10:35:24 CET,Sun Nov 28 12:31:47 CET,0.0 0.567 0.823 1.066 1.254 1.384 1.505 1.634 1.881 1.987 2.073 2.064 2.345 2.43 2.575 2.729 2.864 2.922 3.043 3.153 3.312 3.407 3.497 3.634 3.771 3.9 4.022 4.143 4.288 4.423 4.552 4.708 4.853 4.998 5.162 5.342 5.503 5.651 5.789 5.904 6.032 6.184 6.351 6.49 6.591 6.692 6.802 6.816 6.702 6.408 5.634 4.537 3.575 2.72 2.005 1.398 0.854 0.339 -0.13 -0.599 -0.991 -1.347 -1.695 -2.037 -2.346 -2.607 -2.878 -3.126 -3.333 -3.535 -3.749 -3.929 -4.115 -4.31 -4.463 -4.619 -4.78 -4.96 -5.14 -5.257 -5.392 -5.596 -5.733 -5.889 -5.963 -6.099 -6.25 -6.414 -6.5 -6.776 -6.772 -6.877 -6.985 -7.203 -7.331 -7.487 -7.654 -7.824 -8.018 -8.252 -8.756 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_32.txt deleted file mode 100644 index 91e62699..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31946 ,TETRA ,17600285,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:23:41 CET,0.0 1.02 1.375 1.644 1.857 2.022 2.17 2.304 2.534 2.649 2.767 2.796 3.062 3.141 3.294 3.438 3.578 3.649 3.784 3.908 4.075 4.196 4.322 4.494 4.643 4.781 4.923 5.05 5.2 5.339 5.471 5.632 5.781 5.915 6.076 6.29 6.481 6.662 6.856 7.029 7.191 7.384 7.591 7.767 7.986 8.212 8.393 8.53 8.568 8.42 7.912 7.132 6.415 5.737 5.134 4.598 4.124 3.666 3.256 2.858 2.532 2.236 1.947 1.684 1.433 1.199 0.955 0.746 0.573 0.39 0.189 0.023 -0.144 -0.326 -0.466 -0.604 -0.754 -0.917 -1.086 -1.219 -1.365 -1.557 -1.692 -1.836 -1.911 -2.055 -2.192 -2.348 -2.43 -2.709 -2.712 -2.817 -2.922 -3.167 -3.309 -3.456 -3.628 -3.829 -4.036 -4.28 -4.886 -2 ,31860 ,TETRA ,17600286,Sun Nov 28 10:35:22 CET,Sun Nov 28 12:32:44 CET,0.0 1.124 1.512 1.785 1.969 2.119 2.271 2.412 2.63 2.736 2.834 2.825 3.11 3.206 3.393 3.565 3.715 3.791 3.93 4.062 4.25 4.36 4.463 4.61 4.75 4.885 5.022 5.154 5.328 5.508 5.676 5.86 6.038 6.21 6.392 6.559 6.71 6.891 7.09 7.285 7.476 7.684 7.911 8.13 8.386 8.654 8.879 9.06 9.174 9.16 8.806 8.099 7.464 6.869 6.278 5.713 5.212 4.763 4.374 3.977 3.649 3.354 3.071 2.8 2.528 2.284 2.03 1.797 1.585 1.362 1.138 0.951 0.761 0.57 0.422 0.271 0.12 -0.041 -0.204 -0.319 -0.448 -0.657 -0.81 -0.969 -1.044 -1.206 -1.381 -1.555 -1.646 -1.941 -1.975 -2.083 -2.18 -2.392 -2.525 -2.666 -2.811 -2.992 -3.168 -3.352 -3.66 -3 ,10286 ,TETRA ,17600287,Sun Nov 28 10:35:23 CET,Sun Nov 28 12:30:26 CET,0.0 0.728 0.95 1.131 1.31 1.489 1.645 1.805 2.081 2.178 2.273 2.293 2.572 2.663 2.832 2.991 3.138 3.2 3.32 3.448 3.635 3.764 3.905 4.093 4.258 4.415 4.555 4.68 4.849 5.017 5.173 5.351 5.53 5.684 5.843 6.03 6.204 6.383 6.556 6.744 6.925 7.099 7.312 7.519 7.73 7.907 8.039 8.145 8.177 8.058 7.635 6.833 6.067 5.428 4.868 4.348 3.874 3.407 2.999 2.593 2.252 1.957 1.673 1.408 1.146 0.904 0.66 0.447 0.257 0.045 -0.175 -0.353 -0.555 -0.776 -0.931 -1.082 -1.253 -1.46 -1.687 -1.816 -1.931 -2.118 -2.241 -2.373 -2.447 -2.603 -2.768 -2.93 -3.011 -3.282 -3.274 -3.377 -3.495 -3.744 -3.864 -3.983 -4.107 -4.236 -4.392 -4.582 -4.976 -4 ,22877 ,TETRA ,17600288,Sun Nov 28 10:35:22 CET,Sun Nov 28 12:31:53 CET,0.0 1.163 1.458 1.704 1.895 2.033 2.166 2.303 2.567 2.688 2.807 2.85 3.128 3.206 3.371 3.524 3.652 3.722 3.86 3.989 4.171 4.285 4.398 4.566 4.726 4.882 5.037 5.177 5.343 5.504 5.658 5.816 5.963 6.103 6.253 6.43 6.594 6.765 6.943 7.115 7.284 7.46 7.664 7.862 8.064 8.244 8.393 8.494 8.522 8.425 7.995 7.23 6.489 5.84 5.244 4.71 4.249 3.8 3.409 3.006 2.625 2.293 1.983 1.703 1.448 1.2 0.928 0.676 0.465 0.253 0.022 -0.167 -0.349 -0.531 -0.672 -0.82 -0.97 -1.129 -1.302 -1.427 -1.552 -1.744 -1.875 -2.008 -2.083 -2.248 -2.426 -2.611 -2.701 -2.979 -2.991 -3.098 -3.199 -3.404 -3.516 -3.653 -3.801 -3.98 -4.206 -4.493 -5.181 -5 ,6034 ,TETRA ,17600289,Sun Nov 28 10:35:23 CET,Sun Nov 28 12:31:43 CET,0.0 0.97 1.247 1.447 1.656 1.849 2.004 2.124 2.342 2.458 2.572 2.595 2.863 2.952 3.104 3.255 3.417 3.492 3.623 3.746 3.907 4.011 4.124 4.275 4.414 4.55 4.678 4.804 4.965 5.126 5.278 5.462 5.638 5.792 5.971 6.181 6.361 6.548 6.745 6.943 7.139 7.332 7.544 7.751 7.969 8.168 8.345 8.478 8.528 8.45 8.007 7.225 6.531 5.863 5.263 4.717 4.225 3.787 3.405 3.01 2.658 2.34 2.044 1.772 1.515 1.284 1.049 0.833 0.633 0.426 0.218 0.046 -0.136 -0.328 -0.477 -0.637 -0.796 -0.971 -1.174 -1.309 -1.434 -1.64 -1.793 -1.931 -2.0 -2.152 -2.309 -2.485 -2.584 -2.866 -2.867 -2.973 -3.073 -3.268 -3.387 -3.524 -3.682 -3.851 -4.041 -4.265 -4.763 -6 ,8454 ,TETRA ,17600290,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:32:05 CET,0.0 0.969 1.343 1.618 1.854 2.05 2.234 2.398 2.688 2.823 2.951 3.057 3.399 3.543 3.809 4.066 4.294 4.379 4.506 4.616 4.78 4.884 4.99 5.155 5.301 5.434 5.564 5.686 5.847 5.992 6.125 6.284 6.428 6.577 6.74 6.91 7.074 7.252 7.441 7.639 7.842 8.05 8.277 8.486 8.699 8.893 9.043 9.143 9.2 9.074 8.639 7.937 7.25 6.65 6.102 5.595 5.127 4.679 4.283 3.88 3.523 3.225 2.953 2.674 2.397 2.153 1.921 1.71 1.518 1.321 1.116 0.946 0.776 0.608 0.473 0.327 0.174 0.009 -0.155 -0.263 -0.376 -0.559 -0.701 -0.851 -0.929 -1.092 -1.25 -1.402 -1.486 -1.764 -1.741 -1.837 -1.926 -2.13 -2.254 -2.374 -2.514 -2.676 -2.843 -3.109 -3.668 -7 ,25245 ,TETRA ,17600291,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:31:48 CET,0.0 0.88 1.178 1.41 1.609 1.784 1.916 2.034 2.249 2.346 2.446 2.463 2.729 2.81 2.972 3.129 3.275 3.339 3.461 3.578 3.733 3.837 3.939 4.084 4.227 4.361 4.481 4.595 4.736 4.873 4.999 5.15 5.299 5.437 5.587 5.752 5.903 6.053 6.214 6.385 6.567 6.763 6.95 7.126 7.32 7.506 7.679 7.814 7.881 7.788 7.35 6.617 5.886 5.225 4.632 4.074 3.584 3.141 2.762 2.368 2.024 1.731 1.457 1.196 0.96 0.743 0.506 0.295 0.124 -0.069 -0.281 -0.449 -0.619 -0.79 -0.93 -1.075 -1.222 -1.387 -1.572 -1.69 -1.807 -1.993 -2.123 -2.261 -2.33 -2.474 -2.626 -2.784 -2.864 -3.144 -3.157 -3.262 -3.358 -3.573 -3.698 -3.832 -3.988 -4.182 -4.421 -4.728 -5.639 -8 ,4372 ,TETRA ,17600292,Sun Nov 28 10:35:23 CET,Sun Nov 28 12:24:28 CET,0.0 1.113 1.463 1.686 1.855 2.036 2.203 2.357 2.623 2.743 2.866 2.89 3.154 3.237 3.389 3.534 3.672 3.739 3.865 3.989 4.172 4.285 4.401 4.569 4.722 4.865 5.003 5.136 5.297 5.439 5.578 5.751 5.909 6.059 6.243 6.447 6.626 6.817 6.997 7.166 7.337 7.516 7.707 7.885 8.072 8.24 8.403 8.551 8.592 8.48 8.097 7.35 6.604 5.929 5.331 4.802 4.32 3.857 3.467 3.088 2.758 2.462 2.179 1.918 1.679 1.454 1.211 0.998 0.828 0.644 0.435 0.253 0.061 -0.134 -0.283 -0.437 -0.596 -0.746 -0.903 -1.02 -1.133 -1.313 -1.439 -1.565 -1.634 -1.764 -1.892 -2.039 -2.118 -2.396 -2.369 -2.466 -2.567 -2.796 -2.92 -3.037 -3.172 -3.348 -3.578 -3.842 -4.254 -9 ,10411 ,TETRA ,17600293,Sun Nov 28 10:35:25 CET,Sun Nov 28 12:21:41 CET,0.0 1.818 2.321 2.662 2.923 3.134 3.323 3.506 3.854 4.007 4.158 4.252 4.556 4.686 4.925 5.106 5.262 5.338 5.473 5.601 5.789 5.905 6.014 6.173 6.328 6.476 6.607 6.728 6.887 7.031 7.165 7.32 7.461 7.609 7.775 7.946 8.107 8.283 8.472 8.662 8.85 9.055 9.265 9.444 9.639 9.827 9.994 10.119 10.167 10.041 9.59 8.831 8.103 7.433 6.826 6.283 5.805 5.369 4.983 4.589 4.245 3.933 3.637 3.36 3.11 2.869 2.602 2.373 2.173 1.962 1.753 1.582 1.403 1.203 1.046 0.899 0.758 0.61 0.443 0.316 0.178 -0.028 -0.167 -0.3 -0.368 -0.527 -0.686 -0.853 -0.95 -1.235 -1.237 -1.336 -1.449 -1.689 -1.803 -1.923 -2.054 -2.21 -2.427 -2.771 -3.632 -10 ,2855 ,TETRA ,17600294,Sun Nov 28 10:35:23 CET,Sun Nov 28 12:32:46 CET,0.0 0.606 0.901 1.174 1.391 1.599 1.763 1.891 2.146 2.268 2.369 2.375 2.651 2.748 2.913 3.049 3.182 3.246 3.365 3.476 3.632 3.734 3.829 3.964 4.102 4.232 4.364 4.492 4.648 4.788 4.92 5.088 5.238 5.378 5.537 5.708 5.862 6.029 6.203 6.381 6.567 6.756 6.956 7.147 7.344 7.542 7.714 7.837 7.94 7.889 7.497 6.82 6.122 5.462 4.866 4.329 3.849 3.396 3.026 2.652 2.33 2.048 1.756 1.468 1.222 0.996 0.751 0.528 0.328 0.127 -0.074 -0.24 -0.423 -0.611 -0.765 -0.925 -1.078 -1.236 -1.413 -1.532 -1.647 -1.825 -1.951 -2.084 -2.151 -2.292 -2.439 -2.598 -2.685 -2.968 -2.956 -3.054 -3.164 -3.387 -3.497 -3.629 -3.79 -3.95 -4.11 -4.304 -4.648 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_33.txt deleted file mode 100644 index 9e3b0fb5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16730 ,TETRA ,17600295,Sun Nov 28 10:35:25 CET,Sun Nov 28 12:31:57 CET,0.0 0.775 1.06 1.277 1.48 1.668 1.843 2.011 2.326 2.468 2.587 2.629 2.898 2.989 3.151 3.299 3.443 3.511 3.64 3.761 3.929 4.041 4.151 4.304 4.454 4.592 4.719 4.846 5.011 5.158 5.299 5.474 5.633 5.784 5.957 6.145 6.327 6.52 6.717 6.915 7.115 7.334 7.577 7.81 8.039 8.263 8.508 8.728 8.894 8.967 8.776 8.229 7.641 7.095 6.58 6.09 5.666 5.272 4.924 4.581 4.286 4.017 3.753 3.506 3.269 3.042 2.808 2.596 2.41 2.222 2.031 1.871 1.698 1.529 1.406 1.269 1.121 0.971 0.807 0.696 0.591 0.408 0.268 0.132 0.068 -0.071 -0.214 -0.366 -0.446 -0.714 -0.709 -0.791 -0.882 -1.093 -1.195 -1.309 -1.451 -1.604 -1.768 -2.028 -2.576 -2 ,2071 ,TETRA ,17600296,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:33:16 CET,0.0 0.56 0.811 1.026 1.207 1.364 1.503 1.621 1.845 1.952 2.052 2.067 2.34 2.428 2.595 2.742 2.889 2.964 3.1 3.22 3.399 3.515 3.624 3.768 3.902 4.028 4.149 4.266 4.415 4.557 4.689 4.849 5.008 5.151 5.313 5.492 5.653 5.838 6.047 6.238 6.42 6.624 6.85 7.077 7.317 7.55 7.8 8.027 8.231 8.325 8.142 7.684 7.173 6.685 6.212 5.748 5.333 4.953 4.6 4.247 3.93 3.645 3.392 3.138 2.884 2.66 2.437 2.235 2.064 1.885 1.694 1.535 1.366 1.188 1.047 0.899 0.753 0.597 0.423 0.301 0.171 -0.002 -0.115 -0.245 -0.313 -0.454 -0.598 -0.74 -0.82 -1.089 -1.072 -1.159 -1.253 -1.459 -1.578 -1.712 -1.859 -2.01 -2.193 -2.428 -3.029 -3 ,24195 ,TETRA ,17600297,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:33:05 CET,0.0 0.517 0.753 0.945 1.098 1.234 1.367 1.469 1.665 1.764 1.867 1.873 2.135 2.204 2.356 2.514 2.651 2.716 2.841 2.968 3.146 3.25 3.352 3.517 3.671 3.816 3.96 4.093 4.264 4.421 4.56 4.736 4.912 5.066 5.233 5.413 5.598 5.798 5.99 6.186 6.383 6.594 6.832 7.072 7.351 7.604 7.823 7.998 8.106 8.148 7.967 7.467 6.918 6.333 5.774 5.275 4.831 4.438 4.101 3.743 3.414 3.135 2.898 2.668 2.447 2.257 2.063 1.865 1.69 1.519 1.339 1.182 1.01 0.837 0.717 0.595 0.451 0.297 0.138 0.028 -0.086 -0.265 -0.39 -0.52 -0.588 -0.719 -0.846 -0.987 -1.061 -1.324 -1.306 -1.391 -1.476 -1.654 -1.753 -1.879 -2.023 -2.174 -2.372 -2.615 -3.105 -4 ,30759 ,TETRA ,17600298,Sun Nov 28 10:35:25 CET,Sun Nov 28 12:43:47 CET,0.0 1.502 1.792 2.025 2.228 2.41 2.573 2.712 2.988 3.124 3.236 3.244 3.502 3.582 3.741 3.893 4.03 4.095 4.217 4.334 4.481 4.573 4.672 4.821 4.961 5.085 5.208 5.341 5.505 5.658 5.807 5.979 6.141 6.308 6.503 6.704 6.878 7.054 7.254 7.449 7.637 7.861 8.115 8.353 8.597 8.842 9.095 9.307 9.48 9.548 9.351 8.874 8.354 7.819 7.313 6.846 6.46 6.102 5.767 5.433 5.14 4.874 4.619 4.381 4.162 3.949 3.714 3.508 3.337 3.165 2.99 2.84 2.679 2.501 2.351 2.19 2.025 1.861 1.704 1.602 1.49 1.312 1.192 1.066 1.002 0.864 0.725 0.587 0.512 0.264 0.274 0.172 0.066 -0.138 -0.258 -0.385 -0.516 -0.677 -0.863 -1.09 -1.524 -5 ,16651 ,TETRA ,17600299,Sun Nov 28 10:35:25 CET,Sun Nov 28 12:31:50 CET,0.0 0.62 0.9 1.093 1.254 1.45 1.618 1.738 1.934 2.016 2.102 2.113 2.392 2.488 2.663 2.837 3.015 3.087 3.208 3.328 3.501 3.617 3.723 3.885 4.049 4.188 4.316 4.442 4.605 4.767 4.92 5.087 5.238 5.388 5.563 5.756 5.926 6.097 6.275 6.466 6.663 6.876 7.122 7.364 7.638 7.899 8.134 8.359 8.565 8.631 8.424 7.948 7.392 6.858 6.393 5.962 5.576 5.194 4.848 4.502 4.192 3.929 3.684 3.442 3.224 3.032 2.814 2.616 2.453 2.274 2.079 1.911 1.734 1.565 1.439 1.299 1.147 0.991 0.832 0.72 0.605 0.433 0.319 0.206 0.142 -0.003 -0.163 -0.323 -0.407 -0.69 -0.713 -0.821 -0.928 -1.132 -1.231 -1.351 -1.492 -1.63 -1.791 -2.036 -2.765 -6 ,4801 ,TETRA ,17600300,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:31:25 CET,0.0 0.462 0.716 0.925 1.096 1.213 1.313 1.427 1.644 1.735 1.831 1.839 2.095 2.157 2.291 2.425 2.558 2.621 2.743 2.859 3.042 3.16 3.26 3.398 3.536 3.676 3.813 3.939 4.1 4.244 4.362 4.5 4.646 4.789 4.944 5.12 5.293 5.48 5.675 5.879 6.102 6.335 6.581 6.821 7.083 7.356 7.616 7.861 8.072 8.169 8.009 7.466 6.884 6.342 5.828 5.369 4.956 4.546 4.191 3.843 3.534 3.268 3.025 2.777 2.532 2.329 2.12 1.92 1.736 1.54 1.353 1.188 0.996 0.813 0.674 0.534 0.401 0.266 0.133 0.037 -0.067 -0.237 -0.353 -0.476 -0.542 -0.683 -0.831 -0.978 -1.052 -1.314 -1.307 -1.405 -1.498 -1.696 -1.809 -1.925 -2.049 -2.208 -2.401 -2.648 -3.232 -7 ,15971 ,TETRA ,17600301,Sun Nov 28 10:35:25 CET,Sun Nov 28 12:31:18 CET,0.0 0.593 0.91 1.13 1.305 1.451 1.574 1.68 1.853 1.94 2.029 2.014 2.274 2.353 2.503 2.641 2.779 2.845 2.966 3.079 3.248 3.355 3.456 3.593 3.718 3.847 3.977 4.1 4.245 4.383 4.526 4.677 4.802 4.929 5.087 5.276 5.453 5.632 5.823 6.026 6.225 6.434 6.682 6.929 7.194 7.458 7.707 7.916 8.067 8.116 7.894 7.399 6.867 6.335 5.844 5.389 4.966 4.57 4.221 3.873 3.555 3.262 2.977 2.704 2.467 2.248 2.021 1.809 1.623 1.441 1.254 1.102 0.934 0.756 0.625 0.495 0.36 0.211 0.054 -0.06 -0.172 -0.332 -0.442 -0.559 -0.621 -0.754 -0.891 -1.035 -1.114 -1.383 -1.381 -1.483 -1.584 -1.798 -1.91 -2.023 -2.14 -2.27 -2.43 -2.601 -3.012 -8 ,743 ,TETRA ,17600302,Sun Nov 28 10:35:25 CET,Sun Nov 28 12:31:05 CET,0.0 0.614 0.881 1.051 1.222 1.388 1.526 1.636 1.837 1.944 2.041 2.031 2.295 2.369 2.524 2.681 2.834 2.907 3.037 3.159 3.332 3.447 3.578 3.769 3.923 4.055 4.189 4.332 4.503 4.645 4.787 4.96 5.119 5.271 5.452 5.67 5.881 6.09 6.285 6.496 6.709 6.929 7.185 7.421 7.67 7.956 8.239 8.493 8.777 9.015 8.915 8.403 7.848 7.328 6.852 6.399 5.978 5.59 5.246 4.891 4.595 4.34 4.09 3.841 3.6 3.383 3.163 2.955 2.774 2.595 2.408 2.251 2.083 1.911 1.781 1.65 1.51 1.346 1.17 1.06 0.953 0.786 0.668 0.544 0.475 0.328 0.182 0.013 -0.078 -0.361 -0.368 -0.472 -0.584 -0.839 -0.976 -1.116 -1.272 -1.455 -1.667 -1.92 -2.419 -9 ,17557 ,TETRA ,17600303,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:20:17 CET,0.0 0.664 0.871 1.046 1.198 1.32 1.461 1.603 1.859 1.972 2.089 2.123 2.406 2.5 2.675 2.821 2.95 3.022 3.169 3.298 3.491 3.621 3.739 3.903 4.06 4.196 4.328 4.463 4.634 4.795 4.943 5.109 5.277 5.443 5.641 5.877 6.101 6.347 6.619 6.888 7.137 7.385 7.666 7.916 8.172 8.431 8.671 8.853 8.999 9.027 8.768 8.268 7.711 7.167 6.653 6.172 5.752 5.37 5.031 4.694 4.41 4.121 3.818 3.53 3.252 3.009 2.774 2.54 2.306 2.069 1.838 1.646 1.448 1.265 1.134 0.998 0.856 0.697 0.529 0.417 0.305 0.133 0.014 -0.116 -0.182 -0.322 -0.479 -0.634 -0.712 -0.987 -0.987 -1.076 -1.172 -1.385 -1.512 -1.644 -1.788 -1.939 -2.068 -2.274 -2.966 -10 ,27533 ,TETRA ,17600304,Sun Nov 28 10:35:25 CET,Sun Nov 28 12:31:20 CET,0.0 0.362 0.578 0.785 0.958 1.096 1.23 1.345 1.559 1.654 1.738 1.709 1.966 2.041 2.178 2.314 2.44 2.501 2.626 2.747 2.913 3.014 3.117 3.255 3.379 3.501 3.616 3.732 3.895 4.05 4.189 4.362 4.529 4.685 4.874 5.068 5.241 5.423 5.601 5.812 6.038 6.275 6.544 6.802 7.077 7.324 7.559 7.784 7.974 8.106 7.948 7.377 6.808 6.25 5.745 5.3 4.872 4.487 4.159 3.817 3.534 3.264 3.012 2.79 2.565 2.351 2.123 1.931 1.771 1.596 1.414 1.262 1.106 0.939 0.806 0.673 0.534 0.383 0.221 0.107 -0.013 -0.201 -0.328 -0.455 -0.521 -0.655 -0.785 -0.918 -0.998 -1.266 -1.245 -1.336 -1.424 -1.613 -1.726 -1.85 -1.985 -2.144 -2.344 -2.63 -3.151 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_34.txt deleted file mode 100644 index 956af975..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26099 ,TETRA ,17600305,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:31:45 CET,0.0 1.744 2.179 2.473 2.73 2.952 3.127 3.274 3.552 3.673 3.789 3.837 4.105 4.191 4.359 4.527 4.687 4.762 4.913 5.053 5.254 5.391 5.527 5.712 5.888 6.062 6.229 6.383 6.571 6.761 6.941 7.134 7.326 7.52 7.749 7.993 8.203 8.43 8.671 8.923 9.182 9.452 9.747 10.043 10.362 10.71 11.065 11.359 11.619 11.836 11.848 11.469 11.027 10.553 10.078 9.656 9.28 8.912 8.574 8.234 7.914 7.647 7.412 7.17 6.943 6.736 6.522 6.328 6.155 5.974 5.772 5.602 5.44 5.268 5.132 5.004 4.868 4.703 4.541 4.445 4.33 4.147 4.026 3.888 3.823 3.692 3.557 3.422 3.347 3.092 3.097 2.998 2.89 2.671 2.56 2.432 2.278 2.099 1.899 1.667 0.783 -2 ,2781 ,TETRA ,17600306,Sun Nov 28 10:35:29 CET,Sun Nov 28 12:20:36 CET,0.0 1.335 1.806 2.14 2.455 2.72 2.942 3.151 3.541 3.71 3.872 4.004 4.345 4.482 4.714 4.929 5.153 5.265 5.475 5.676 5.994 6.187 6.36 6.606 6.839 7.06 7.272 7.471 7.7 7.929 8.165 8.418 8.633 8.838 9.092 9.378 9.625 9.908 10.223 10.536 10.867 11.233 11.652 12.094 12.614 13.118 13.574 13.999 14.353 14.553 14.507 14.08 13.556 13.031 12.531 12.061 11.635 11.26 10.933 10.585 10.269 9.98 9.717 9.448 9.186 8.947 8.706 8.506 8.335 8.153 7.968 7.812 7.639 7.468 7.34 7.203 7.054 6.895 6.734 6.624 6.504 6.329 6.208 6.063 5.992 5.854 5.718 5.572 5.498 5.24 5.264 5.182 5.087 4.888 4.784 4.659 4.518 4.369 4.196 3.985 3.635 -3 ,16410 ,TETRA ,17600307,Sun Nov 28 10:35:25 CET,Sun Nov 28 12:32:25 CET,0.0 1.266 1.671 1.96 2.204 2.403 2.582 2.748 3.024 3.155 3.271 3.299 3.581 3.683 3.87 4.044 4.208 4.285 4.428 4.561 4.751 4.879 4.997 5.162 5.331 5.505 5.665 5.811 5.991 6.157 6.327 6.528 6.72 6.895 7.08 7.294 7.497 7.702 7.921 8.163 8.414 8.72 9.067 9.375 9.717 10.075 10.456 10.818 11.104 11.33 11.362 11.022 10.574 10.092 9.603 9.129 8.728 8.366 8.032 7.682 7.353 7.048 6.766 6.516 6.283 6.069 5.85 5.653 5.479 5.292 5.098 4.937 4.774 4.611 4.491 4.369 4.227 4.082 3.939 3.834 3.725 3.557 3.424 3.286 3.219 3.081 2.946 2.805 2.723 2.435 2.401 2.297 2.193 1.988 1.87 1.746 1.612 1.46 1.291 1.073 0.553 -4 ,4034 ,TETRA ,17600308,Sun Nov 28 10:35:30 CET,Sun Nov 28 12:32:02 CET,0.0 1.241 1.657 2.004 2.217 2.424 2.622 2.796 3.123 3.275 3.417 3.483 3.788 3.905 4.11 4.29 4.464 4.548 4.712 4.867 5.091 5.231 5.363 5.562 5.764 5.944 6.11 6.276 6.491 6.693 6.878 7.109 7.321 7.504 7.714 7.943 8.165 8.415 8.686 9.002 9.349 9.71 10.112 10.498 10.957 11.436 11.898 12.342 12.776 13.099 13.14 12.839 12.387 11.905 11.458 11.022 10.627 10.287 9.984 9.676 9.394 9.127 8.869 8.627 8.404 8.187 7.961 7.758 7.579 7.406 7.215 7.053 6.888 6.706 6.574 6.449 6.303 6.156 6.004 5.885 5.774 5.606 5.487 5.377 5.318 5.184 5.029 4.86 4.777 4.509 4.497 4.406 4.307 4.074 3.958 3.852 3.727 3.581 3.41 3.194 2.788 -5 ,14124 ,TETRA ,17600309,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:32:57 CET,0.0 1.888 2.467 2.91 3.273 3.573 3.832 4.051 4.418 4.6 4.767 4.858 5.168 5.3 5.553 5.783 5.989 6.081 6.251 6.419 6.672 6.851 7.026 7.26 7.486 7.701 7.905 8.103 8.345 8.582 8.822 9.095 9.35 9.587 9.849 10.143 10.412 10.701 11.018 11.347 11.694 12.076 12.483 12.854 13.228 13.628 14.059 14.459 14.836 15.079 15.032 14.658 14.204 13.711 13.186 12.67 12.269 11.922 11.617 11.299 11.012 10.752 10.469 10.189 9.942 9.719 9.497 9.302 9.124 8.95 8.777 8.603 8.397 8.19 8.027 7.855 7.683 7.492 7.298 7.16 7.017 6.816 6.678 6.525 6.441 6.276 6.104 5.889 5.766 5.464 5.407 5.287 5.161 4.893 4.739 4.575 4.38 4.148 3.891 3.556 2.85 -6 ,25239 ,TETRA ,17600310,Sun Nov 28 10:35:29 CET,Sun Nov 28 12:33:41 CET,0.0 0.688 0.995 1.203 1.381 1.573 1.768 1.94 2.204 2.308 2.416 2.437 2.714 2.81 2.99 3.155 3.312 3.394 3.556 3.694 3.883 4.01 4.14 4.32 4.492 4.66 4.816 4.97 5.163 5.349 5.524 5.732 5.937 6.124 6.348 6.602 6.838 7.085 7.338 7.594 7.858 8.134 8.424 8.709 9.051 9.417 9.765 10.088 10.381 10.554 10.579 10.225 9.75 9.277 8.817 8.403 8.023 7.668 7.34 7.002 6.712 6.462 6.234 6.006 5.786 5.572 5.328 5.12 4.952 4.769 4.577 4.417 4.252 4.081 3.948 3.807 3.658 3.523 3.385 3.276 3.16 2.994 2.877 2.759 2.7 2.574 2.446 2.304 2.232 1.973 1.979 1.886 1.798 1.567 1.438 1.318 1.161 0.981 0.775 0.451 -0.311 -7 ,7925 ,TETRA ,17600311,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:35:17 CET,0.0 1.767 2.298 2.676 2.98 3.233 3.458 3.675 4.048 4.211 4.372 4.465 4.762 4.884 5.101 5.319 5.534 5.648 5.872 6.078 6.385 6.575 6.741 6.963 7.155 7.325 7.484 7.624 7.82 8.028 8.226 8.455 8.661 8.855 9.073 9.326 9.56 9.801 10.077 10.357 10.661 11.016 11.33 11.61 11.972 12.346 12.691 12.986 13.282 13.513 13.472 13.121 12.68 12.156 11.668 11.233 10.822 10.449 10.115 9.777 9.486 9.212 8.944 8.679 8.411 8.164 7.91 7.683 7.493 7.294 7.079 6.902 6.714 6.511 6.363 6.22 6.069 5.916 5.746 5.625 5.502 5.281 5.125 4.978 4.905 4.751 4.588 4.418 4.317 4.021 3.967 3.853 3.731 3.449 3.286 3.122 2.968 2.787 2.57 2.252 1.389 -8 ,25902 ,TETRA ,17600312,Sun Nov 28 10:35:29 CET,Sun Nov 28 12:30:41 CET,0.0 1.381 1.93 2.313 2.572 2.798 3.002 3.193 3.492 3.629 3.765 3.838 4.166 4.278 4.484 4.689 4.873 4.962 5.128 5.285 5.492 5.616 5.756 5.97 6.164 6.334 6.478 6.614 6.799 6.981 7.17 7.402 7.612 7.798 7.994 8.214 8.42 8.639 8.876 9.13 9.403 9.707 10.036 10.355 10.709 11.054 11.413 11.751 12.058 12.302 12.405 12.202 11.713 11.202 10.786 10.364 9.912 9.447 9.043 8.642 8.314 8.033 7.76 7.51 7.267 7.03 6.78 6.551 6.35 6.151 5.946 5.773 5.596 5.408 5.266 5.124 4.987 4.831 4.662 4.559 4.445 4.25 4.111 3.955 3.88 3.724 3.533 3.322 3.212 2.915 2.89 2.782 2.668 2.394 2.243 2.086 1.912 1.732 1.506 1.137 0.307 -9 ,25750 ,TETRA ,17600313,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:34:08 CET,0.0 1.353 1.692 1.935 2.185 2.416 2.606 2.757 3.043 3.194 3.332 3.389 3.691 3.814 4.013 4.19 4.353 4.44 4.628 4.792 5.018 5.171 5.309 5.494 5.672 5.854 6.03 6.193 6.392 6.589 6.781 7.015 7.236 7.45 7.69 7.937 8.174 8.43 8.7 8.983 9.297 9.635 9.964 10.27 10.625 10.98 11.331 11.65 11.973 12.269 12.378 12.119 11.661 11.211 10.796 10.368 9.98 9.648 9.331 8.982 8.652 8.341 8.052 7.777 7.5 7.242 6.981 6.763 6.583 6.388 6.176 5.995 5.803 5.585 5.418 5.251 5.071 4.89 4.71 4.578 4.436 4.211 4.066 3.92 3.841 3.684 3.522 3.341 3.24 2.967 2.969 2.861 2.735 2.47 2.334 2.204 2.053 1.874 1.662 1.376 0.676 -10 ,11496 ,TETRA ,17600314,Sun Nov 28 10:35:29 CET,Sun Nov 28 12:29:54 CET,0.0 1.285 1.712 1.99 2.219 2.433 2.639 2.806 3.068 3.2 3.34 3.423 3.707 3.8 3.99 4.185 4.375 4.464 4.643 4.812 5.034 5.172 5.318 5.532 5.713 5.871 6.018 6.157 6.337 6.53 6.743 6.999 7.231 7.452 7.692 7.946 8.185 8.458 8.728 8.988 9.273 9.585 9.932 10.269 10.644 11.057 11.55 12.032 12.509 12.95 13.209 13.055 12.682 12.282 11.884 11.51 11.141 10.752 10.387 10.004 9.691 9.407 9.146 8.915 8.687 8.465 8.227 8.002 7.806 7.614 7.416 7.251 7.066 6.86 6.697 6.523 6.352 6.179 6.012 5.907 5.792 5.609 5.48 5.345 5.273 5.111 4.936 4.764 4.675 4.394 4.374 4.276 4.166 3.918 3.785 3.636 3.469 3.28 3.067 2.805 2.108 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_37.txt deleted file mode 100644 index c82c3754..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24737 ,TETRA ,17600315,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:35:36 CET,0.0 2.001 2.583 2.968 3.257 3.498 3.72 3.912 4.241 4.392 4.546 4.659 4.969 5.081 5.299 5.514 5.719 5.813 5.994 6.176 6.44 6.603 6.755 6.97 7.18 7.408 7.631 7.841 8.134 8.404 8.636 8.897 9.139 9.359 9.608 9.895 10.152 10.396 10.636 10.882 11.123 11.36 11.62 11.845 12.062 12.279 12.456 12.534 12.501 12.229 11.451 10.295 9.224 8.273 7.455 6.725 6.04 5.408 4.892 4.358 3.885 3.477 3.088 2.712 2.355 2.031 1.706 1.432 1.194 0.935 0.655 0.424 0.186 -0.068 -0.265 -0.469 -0.674 -0.884 -1.096 -1.231 -1.378 -1.62 -1.779 -1.937 -2.021 -2.201 -2.381 -2.571 -2.677 -2.981 -2.992 -3.109 -3.237 -3.517 -3.674 -3.849 -4.061 -4.305 -4.573 -4.931 -5.818 -2 ,2419 ,TETRA ,17600316,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:34:57 CET,0.0 2.205 2.727 3.064 3.366 3.646 3.907 4.148 4.553 4.724 4.905 5.06 5.399 5.539 5.8 6.052 6.257 6.36 6.572 6.768 7.049 7.226 7.403 7.658 7.877 8.074 8.262 8.44 8.67 8.898 9.114 9.353 9.584 9.804 10.044 10.302 10.524 10.756 11.006 11.253 11.474 11.732 12.045 12.321 12.584 12.805 13.007 13.125 13.087 12.813 12.075 10.941 9.912 9.013 8.204 7.468 6.822 6.208 5.685 5.176 4.727 4.325 3.936 3.576 3.245 2.934 2.608 2.325 2.095 1.857 1.604 1.379 1.124 0.873 0.7 0.524 0.321 0.11 -0.087 -0.224 -0.36 -0.553 -0.687 -0.838 -0.922 -1.096 -1.266 -1.448 -1.546 -1.843 -1.919 -2.052 -2.181 -2.442 -2.569 -2.701 -2.85 -3.051 -3.276 -3.493 -3.948 -3 ,29990 ,TETRA ,17600317,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:32:46 CET,0.0 1.9 2.328 2.677 2.96 3.183 3.36 3.543 3.891 4.041 4.187 4.244 4.559 4.694 4.935 5.153 5.357 5.457 5.638 5.814 6.062 6.213 6.37 6.599 6.806 7.009 7.214 7.408 7.634 7.847 8.055 8.285 8.493 8.701 8.931 9.181 9.422 9.668 9.92 10.172 10.426 10.712 11.024 11.296 11.589 11.856 12.023 12.086 12.042 11.746 10.936 9.686 8.56 7.613 6.774 6.027 5.375 4.767 4.202 3.628 3.175 2.776 2.394 2.018 1.644 1.307 0.973 0.691 0.446 0.2 -0.041 -0.244 -0.466 -0.703 -0.879 -1.055 -1.233 -1.429 -1.628 -1.759 -1.903 -2.127 -2.289 -2.468 -2.553 -2.737 -2.919 -3.084 -3.175 -3.477 -3.529 -3.653 -3.759 -3.979 -4.104 -4.237 -4.377 -4.549 -4.74 -4.985 -5.601 -4 ,24745 ,TETRA ,17600318,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:32:33 CET,0.0 1.643 2.194 2.631 2.955 3.196 3.411 3.61 3.98 4.139 4.292 4.403 4.726 4.87 5.131 5.367 5.568 5.659 5.845 6.024 6.267 6.414 6.563 6.783 6.984 7.159 7.33 7.51 7.74 7.945 8.132 8.351 8.56 8.756 8.987 9.253 9.505 9.774 10.037 10.293 10.548 10.806 11.066 11.313 11.569 11.771 11.921 12.002 11.91 11.576 10.729 9.45 8.303 7.303 6.465 5.721 5.061 4.449 3.916 3.411 2.978 2.572 2.184 1.817 1.493 1.207 0.9 0.631 0.4 0.151 -0.113 -0.331 -0.558 -0.795 -0.968 -1.155 -1.37 -1.59 -1.808 -1.958 -2.115 -2.359 -2.53 -2.712 -2.802 -2.971 -3.148 -3.333 -3.427 -3.716 -3.73 -3.845 -3.968 -4.261 -4.414 -4.551 -4.7 -4.888 -5.077 -5.308 -6.069 -5 ,14202 ,TETRA ,17600319,Sun Nov 28 10:35:32 CET,Sun Nov 28 12:22:04 CET,0.0 2.017 2.416 2.698 2.889 3.068 3.254 3.435 3.776 3.921 4.039 4.068 4.367 4.48 4.669 4.831 4.987 5.058 5.196 5.338 5.534 5.655 5.763 5.922 6.079 6.226 6.369 6.503 6.666 6.808 6.946 7.128 7.304 7.458 7.622 7.797 7.964 8.136 8.322 8.507 8.688 8.909 9.155 9.384 9.641 9.864 10.015 10.083 10.038 9.778 9.005 7.796 6.691 5.694 4.818 4.027 3.312 2.693 2.167 1.633 1.193 0.788 0.381 0.022 -0.296 -0.593 -0.911 -1.202 -1.452 -1.707 -1.955 -2.159 -2.38 -2.614 -2.799 -2.987 -3.184 -3.384 -3.583 -3.72 -3.866 -4.108 -4.271 -4.435 -4.523 -4.709 -4.902 -5.101 -5.201 -5.502 -5.53 -5.642 -5.754 -5.993 -6.154 -6.327 -6.491 -6.714 -6.993 -7.296 -7.963 -6 ,14879 ,TETRA ,17600320,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:35:23 CET,0.0 2.458 3.11 3.632 4.044 4.396 4.725 4.999 5.455 5.645 5.809 5.928 6.251 6.39 6.66 6.908 7.129 7.237 7.447 7.639 7.908 8.086 8.249 8.468 8.669 8.866 9.056 9.231 9.445 9.648 9.844 10.089 10.319 10.525 10.758 11.005 11.232 11.453 11.671 11.912 12.181 12.445 12.689 12.912 13.133 13.34 13.535 13.619 13.526 13.179 12.356 11.196 10.101 9.101 8.244 7.498 6.857 6.266 5.748 5.237 4.817 4.45 4.096 3.75 3.42 3.111 2.791 2.508 2.262 1.999 1.729 1.511 1.291 1.065 0.89 0.714 0.534 0.336 0.127 -0.011 -0.159 -0.397 -0.568 -0.747 -0.829 -0.996 -1.168 -1.354 -1.453 -1.739 -1.758 -1.872 -1.992 -2.273 -2.422 -2.569 -2.731 -2.926 -3.162 -3.459 -4.186 -7 ,9537 ,TETRA ,17600321,Sun Nov 28 10:35:28 CET,Sun Nov 28 12:35:44 CET,0.0 1.942 2.578 3.028 3.428 3.784 4.04 4.245 4.645 4.809 4.961 5.084 5.393 5.516 5.772 6.008 6.223 6.327 6.523 6.711 6.982 7.162 7.326 7.547 7.766 7.969 8.161 8.341 8.565 8.778 8.979 9.216 9.452 9.674 9.901 10.13 10.369 10.634 10.888 11.122 11.345 11.585 11.822 12.015 12.216 12.427 12.623 12.732 12.679 12.377 11.641 10.512 9.472 8.579 7.734 6.978 6.346 5.743 5.211 4.672 4.225 3.844 3.466 3.118 2.808 2.523 2.237 1.98 1.741 1.478 1.198 0.963 0.715 0.469 0.291 0.113 -0.09 -0.321 -0.552 -0.702 -0.852 -1.087 -1.254 -1.425 -1.511 -1.683 -1.857 -2.044 -2.145 -2.438 -2.444 -2.552 -2.675 -2.941 -3.073 -3.218 -3.38 -3.551 -3.757 -4.059 -4.645 -8 ,9136 ,TETRA ,17600322,Sun Nov 28 10:35:32 CET,Sun Nov 28 12:33:55 CET,0.0 1.873 2.425 2.834 3.107 3.322 3.53 3.723 4.112 4.293 4.458 4.598 4.923 5.038 5.25 5.461 5.647 5.738 5.926 6.121 6.406 6.586 6.753 6.975 7.188 7.381 7.57 7.744 7.956 8.168 8.372 8.609 8.805 8.988 9.206 9.436 9.651 9.886 10.126 10.352 10.578 10.822 11.058 11.267 11.496 11.697 11.827 11.847 11.68 11.245 10.286 9.035 7.972 7.007 6.15 5.377 4.721 4.113 3.577 3.063 2.616 2.228 1.866 1.509 1.171 0.874 0.581 0.318 0.077 -0.175 -0.43 -0.636 -0.842 -1.058 -1.229 -1.398 -1.576 -1.758 -1.932 -2.054 -2.185 -2.397 -2.544 -2.692 -2.767 -2.925 -3.081 -3.238 -3.329 -3.617 -3.602 -3.702 -3.808 -4.026 -4.149 -4.271 -4.4 -4.541 -4.723 -4.956 -5.471 -9 ,1390 ,TETRA ,17600323,Sun Nov 28 10:35:33 CET,Sun Nov 28 12:33:16 CET,0.0 1.694 2.204 2.585 2.912 3.239 3.542 3.807 4.257 4.446 4.623 4.783 5.122 5.282 5.575 5.829 6.061 6.182 6.422 6.634 6.939 7.138 7.306 7.523 7.73 7.92 8.093 8.252 8.446 8.628 8.787 8.971 9.156 9.327 9.493 9.685 9.88 10.084 10.304 10.524 10.721 10.924 11.161 11.406 11.698 11.951 12.111 12.183 12.111 11.779 10.845 9.503 8.34 7.349 6.475 5.694 5.019 4.388 3.855 3.336 2.884 2.477 2.11 1.774 1.452 1.164 0.869 0.589 0.322 0.047 -0.205 -0.416 -0.625 -0.829 -1.001 -1.184 -1.371 -1.549 -1.727 -1.865 -2.014 -2.23 -2.376 -2.532 -2.607 -2.765 -2.935 -3.098 -3.184 -3.485 -3.474 -3.576 -3.685 -3.925 -4.052 -4.197 -4.356 -4.539 -4.737 -5.003 -5.714 -10 ,14523 ,TETRA ,17600324,Sun Nov 28 10:35:32 CET,Sun Nov 28 12:34:18 CET,0.0 1.858 2.403 2.866 3.273 3.62 3.897 4.136 4.542 4.724 4.888 5.001 5.321 5.454 5.723 5.975 6.187 6.294 6.511 6.708 6.974 7.131 7.276 7.497 7.72 7.92 8.111 8.302 8.544 8.774 8.987 9.235 9.472 9.685 9.906 10.144 10.345 10.537 10.747 10.968 11.203 11.454 11.731 11.975 12.191 12.412 12.592 12.661 12.615 12.324 11.517 10.311 9.224 8.283 7.456 6.703 6.039 5.437 4.944 4.45 4.013 3.633 3.262 2.921 2.617 2.333 2.03 1.748 1.493 1.241 0.993 0.798 0.598 0.385 0.222 0.057 -0.115 -0.298 -0.501 -0.646 -0.794 -1.018 -1.174 -1.339 -1.428 -1.612 -1.8 -1.997 -2.102 -2.397 -2.406 -2.513 -2.624 -2.871 -3.011 -3.163 -3.342 -3.547 -3.787 -4.052 -4.684 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_38.txt deleted file mode 100644 index c36409a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_38.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7117 ,KEBNE ,17026947,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:34:17 CET,0.0 6.825 7.271 7.632 7.91 8.166 8.424 8.658 9.047 9.219 9.395 9.528 9.852 10.003 10.279 10.536 10.795 10.903 11.101 11.3 11.574 11.742 11.903 12.131 12.346 12.572 12.817 13.027 13.256 13.486 13.704 13.954 14.191 14.436 14.727 15.019 15.272 15.553 15.865 16.179 16.498 16.842 17.229 17.563 17.89 18.231 18.53 18.751 18.872 18.69 17.929 16.853 15.897 15.03 14.268 13.555 12.935 12.379 11.879 11.377 10.954 10.597 10.26 9.927 9.623 9.345 9.049 8.791 8.556 8.305 8.046 7.82 7.59 7.373 7.207 7.019 6.82 6.623 6.43 6.293 6.156 5.957 5.806 5.644 5.56 5.386 5.194 4.98 4.871 4.555 4.515 4.395 4.271 3.973 3.801 3.631 3.456 3.234 2.945 2.59 1.443 -2 ,8639 ,KEBNE ,17026948,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:34:29 CET,0.0 4.288 4.791 5.153 5.441 5.686 5.916 6.143 6.583 6.776 6.937 7.045 7.379 7.521 7.796 8.038 8.24 8.342 8.543 8.727 8.986 9.152 9.319 9.564 9.807 10.033 10.232 10.42 10.665 10.918 11.167 11.454 11.708 11.93 12.192 12.49 12.755 13.006 13.242 13.481 13.719 13.979 14.264 14.51 14.783 15.074 15.324 15.453 15.466 15.28 14.623 13.572 12.579 11.716 10.985 10.297 9.7 9.139 8.628 8.122 7.696 7.32 6.96 6.631 6.335 6.058 5.755 5.476 5.232 4.965 4.693 4.483 4.263 4.027 3.85 3.672 3.485 3.298 3.114 2.986 2.843 2.601 2.423 2.256 2.176 1.998 1.821 1.646 1.556 1.261 1.19 1.043 0.902 0.584 0.425 0.246 0.032 -0.18 -0.436 -0.783 -2.038 -3 ,29552 ,KEBNE ,17026949,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:34:37 CET,0.0 2.424 2.986 3.387 3.71 3.969 4.2 4.415 4.763 4.911 5.047 5.14 5.465 5.603 5.834 6.045 6.262 6.367 6.564 6.749 7.004 7.184 7.358 7.591 7.817 8.027 8.243 8.457 8.707 8.949 9.187 9.465 9.74 10.026 10.322 10.636 10.936 11.227 11.523 11.82 12.107 12.386 12.704 13.032 13.363 13.673 13.944 14.118 14.159 14.003 13.45 12.479 11.532 10.682 9.954 9.253 8.587 8.004 7.519 7.022 6.599 6.214 5.841 5.488 5.164 4.877 4.583 4.331 4.112 3.885 3.643 3.429 3.203 2.972 2.787 2.596 2.403 2.205 2.0 1.856 1.708 1.479 1.324 1.168 1.086 0.911 0.724 0.519 0.401 0.084 0.058 -0.058 -0.175 -0.42 -0.55 -0.698 -0.871 -1.05 -1.266 -1.602 -2.982 -4 ,14428 ,KEBNE ,17026950,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:34:13 CET,0.0 3.244 3.724 4.047 4.322 4.577 4.842 5.067 5.445 5.612 5.76 5.864 6.185 6.33 6.603 6.847 7.074 7.173 7.35 7.531 7.803 7.974 8.138 8.37 8.582 8.769 8.944 9.116 9.316 9.512 9.715 9.945 10.167 10.387 10.651 10.948 11.211 11.481 11.778 12.07 12.358 12.699 13.074 13.41 13.782 14.125 14.425 14.665 14.813 14.793 14.226 13.087 12.009 11.049 10.231 9.517 8.864 8.246 7.703 7.162 6.713 6.297 5.906 5.563 5.243 4.955 4.647 4.384 4.171 3.934 3.675 3.463 3.241 3.01 2.833 2.661 2.484 2.301 2.103 1.956 1.806 1.577 1.418 1.241 1.144 0.939 0.727 0.51 0.394 0.076 0.017 -0.11 -0.257 -0.604 -0.798 -1.008 -1.225 -1.481 -1.8 -2.207 -3.953 -5 ,2092 ,KEBNE ,17026951,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:34:22 CET,0.0 2.238 2.852 3.291 3.635 3.92 4.14 4.362 4.774 4.947 5.107 5.218 5.534 5.664 5.899 6.113 6.313 6.41 6.612 6.808 7.074 7.244 7.403 7.616 7.827 8.037 8.234 8.418 8.657 8.885 9.11 9.37 9.584 9.785 10.007 10.252 10.498 10.749 11.005 11.258 11.508 11.792 12.107 12.373 12.634 12.902 13.143 13.296 13.299 13.09 12.472 11.538 10.661 9.834 9.078 8.397 7.817 7.286 6.831 6.381 5.974 5.605 5.252 4.915 4.598 4.315 4.018 3.747 3.523 3.293 3.047 2.841 2.643 2.435 2.261 2.078 1.89 1.702 1.51 1.375 1.238 1.029 0.885 0.729 0.646 0.481 0.304 0.103 0.0 -0.297 -0.348 -0.474 -0.613 -0.91 -1.073 -1.242 -1.426 -1.675 -1.957 -2.246 -3.201 -6 ,2835 ,KEBNE ,17026952,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:34:33 CET,0.0 2.509 3.085 3.519 3.879 4.172 4.445 4.724 5.216 5.42 5.594 5.758 6.093 6.227 6.471 6.693 6.904 7.002 7.181 7.364 7.634 7.796 7.957 8.187 8.407 8.621 8.823 9.025 9.295 9.556 9.783 10.039 10.276 10.493 10.759 11.06 11.337 11.643 11.968 12.302 12.623 12.954 13.296 13.622 13.998 14.384 14.782 15.11 15.298 15.27 14.892 14.099 13.218 12.341 11.493 10.683 9.984 9.382 8.873 8.355 7.908 7.496 7.11 6.752 6.415 6.108 5.769 5.46 5.218 4.983 4.736 4.539 4.333 4.112 3.937 3.751 3.565 3.377 3.184 3.051 2.912 2.687 2.522 2.372 2.301 2.129 1.948 1.771 1.67 1.379 1.365 1.244 1.114 0.837 0.681 0.51 0.34 0.103 -0.233 -0.618 -2.265 -7 ,27529 ,KEBNE ,17026953,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:33:59 CET,0.0 3.246 3.811 4.282 4.634 4.916 5.184 5.439 5.895 6.122 6.338 6.501 6.837 6.97 7.2 7.429 7.652 7.754 7.961 8.163 8.432 8.606 8.778 9.033 9.28 9.508 9.721 9.918 10.165 10.403 10.625 10.882 11.121 11.352 11.632 11.951 12.26 12.587 12.92 13.269 13.617 13.974 14.346 14.712 15.109 15.424 15.715 15.983 16.147 16.162 15.637 14.658 13.722 12.833 12.063 11.375 10.777 10.229 9.741 9.257 8.829 8.416 8.032 7.699 7.384 7.084 6.793 6.546 6.317 6.073 5.822 5.606 5.387 5.171 4.998 4.817 4.629 4.429 4.224 4.081 3.922 3.669 3.49 3.301 3.21 3.016 2.805 2.574 2.454 2.142 2.086 1.952 1.816 1.49 1.293 1.09 0.864 0.614 0.322 -0.101 -2.599 -8 ,3327 ,KEBNE ,17026954,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:34:24 CET,0.0 3.575 4.016 4.348 4.666 4.926 5.147 5.346 5.702 5.87 6.036 6.16 6.473 6.601 6.868 7.115 7.307 7.399 7.595 7.783 8.049 8.216 8.377 8.586 8.766 8.954 9.144 9.329 9.563 9.779 9.97 10.181 10.393 10.607 10.836 11.078 11.311 11.557 11.83 12.115 12.393 12.695 13.009 13.279 13.559 13.814 14.061 14.289 14.399 14.256 13.638 12.633 11.709 10.849 10.096 9.433 8.841 8.322 7.871 7.411 7.023 6.668 6.313 5.968 5.654 5.375 5.067 4.793 4.552 4.288 4.035 3.817 3.581 3.354 3.18 3.003 2.822 2.631 2.42 2.278 2.133 1.891 1.722 1.55 1.461 1.273 1.079 0.867 0.76 0.454 0.427 0.308 0.19 -0.057 -0.192 -0.349 -0.542 -0.778 -1.037 -1.36 -2.772 -9 ,1868 ,KEBNE ,17026955,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:34:20 CET,0.0 8.78 9.36 9.782 10.096 10.352 10.565 10.746 11.111 11.284 11.451 11.561 11.865 11.987 12.195 12.386 12.575 12.665 12.835 12.984 13.205 13.355 13.504 13.713 13.905 14.09 14.267 14.437 14.651 14.847 15.042 15.289 15.526 15.746 16.003 16.287 16.545 16.814 17.078 17.348 17.648 17.967 18.3 18.627 19.015 19.384 19.697 19.974 20.125 20.06 19.619 18.62 17.655 16.801 16.049 15.359 14.751 14.185 13.702 13.231 12.813 12.44 12.075 11.735 11.429 11.142 10.83 10.537 10.29 10.049 9.807 9.598 9.355 9.108 8.93 8.748 8.561 8.361 8.153 8.014 7.864 7.631 7.469 7.292 7.194 6.984 6.79 6.607 6.512 6.222 6.198 6.084 5.959 5.657 5.495 5.322 5.143 4.954 4.668 4.255 2.814 -10 ,13201 ,KEBNE ,17026956,Wed Dec 22 15:53:25 CET,Wed Dec 22 17:34:18 CET,0.0 2.17 2.662 3.013 3.297 3.576 3.831 4.054 4.437 4.605 4.758 4.876 5.205 5.341 5.579 5.795 5.995 6.088 6.27 6.456 6.725 6.888 7.043 7.277 7.486 7.677 7.869 8.058 8.291 8.513 8.729 8.985 9.217 9.433 9.674 9.924 10.161 10.417 10.697 10.996 11.288 11.601 11.937 12.254 12.583 12.87 13.146 13.336 13.349 13.153 12.493 11.431 10.421 9.544 8.754 8.021 7.392 6.81 6.312 5.834 5.402 4.999 4.643 4.312 3.995 3.706 3.398 3.122 2.871 2.612 2.348 2.127 1.904 1.672 1.495 1.302 1.091 0.873 0.65 0.499 0.342 0.09 -0.083 -0.257 -0.342 -0.514 -0.693 -0.889 -0.994 -1.298 -1.332 -1.455 -1.592 -1.921 -2.097 -2.27 -2.47 -2.696 -2.977 -3.411 -4.96 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_39.txt deleted file mode 100644 index bc8b8796..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15668 ,TETRA ,17600325,Sun Nov 28 10:35:33 CET,Sun Nov 28 12:34:26 CET,0.0 2.879 3.538 3.992 4.383 4.735 5.011 5.255 5.699 5.895 6.078 6.242 6.603 6.784 7.109 7.385 7.623 7.738 7.979 8.203 8.505 8.705 8.905 9.184 9.435 9.671 9.889 10.095 10.359 10.605 10.845 11.134 11.392 11.632 11.91 12.212 12.482 12.75 13.041 13.358 13.65 13.955 14.291 14.534 14.777 15.033 15.238 15.345 15.349 15.103 14.327 13.149 12.089 11.203 10.416 9.692 9.043 8.447 7.939 7.432 6.982 6.59 6.207 5.829 5.496 5.199 4.891 4.593 4.33 4.068 3.807 3.607 3.401 3.172 2.987 2.8 2.597 2.387 2.172 2.007 1.847 1.628 1.458 1.282 1.196 1.017 0.84 0.642 0.541 0.25 0.234 0.105 -0.03 -0.297 -0.427 -0.577 -0.776 -1.007 -1.296 -1.654 -3.269 -2 ,9217 ,TETRA ,17600326,Sun Nov 28 10:35:32 CET,Sun Nov 28 12:34:44 CET,0.0 2.464 2.964 3.328 3.668 3.962 4.232 4.485 4.911 5.097 5.267 5.413 5.749 5.907 6.19 6.433 6.655 6.763 6.986 7.194 7.465 7.649 7.837 8.096 8.339 8.578 8.798 8.999 9.249 9.487 9.72 10.009 10.273 10.523 10.814 11.121 11.41 11.708 12.008 12.304 12.599 12.874 13.129 13.411 13.735 13.982 14.188 14.305 14.247 13.99 13.233 12.061 10.974 9.984 9.097 8.326 7.665 7.046 6.507 5.962 5.506 5.102 4.717 4.359 4.016 3.694 3.342 3.029 2.772 2.502 2.23 2.005 1.768 1.512 1.315 1.129 0.93 0.724 0.511 0.368 0.221 -0.028 -0.194 -0.365 -0.454 -0.637 -0.828 -1.03 -1.139 -1.445 -1.507 -1.629 -1.749 -2.007 -2.162 -2.351 -2.555 -2.789 -3.061 -3.501 -4.521 -3 ,16433 ,TETRA ,17600327,Sun Nov 28 10:35:35 CET,Sun Nov 28 12:34:03 CET,0.0 3.642 4.444 5.006 5.455 5.83 6.195 6.52 7.052 7.309 7.543 7.804 8.211 8.415 8.766 9.094 9.377 9.514 9.801 10.047 10.379 10.605 10.825 11.132 11.435 11.728 11.989 12.242 12.558 12.862 13.15 13.48 13.794 14.072 14.371 14.723 15.086 15.49 15.922 16.296 16.659 17.094 17.495 17.849 18.182 18.478 18.817 19.023 18.97 18.75 18.218 17.216 16.162 15.18 14.327 13.576 12.882 12.193 11.611 11.08 10.644 10.25 9.872 9.514 9.174 8.812 8.4 8.036 7.696 7.332 6.961 6.664 6.371 6.074 5.837 5.584 5.322 5.047 4.769 4.582 4.391 4.1 3.888 3.659 3.542 3.3 3.061 2.814 2.676 2.335 2.248 2.096 1.939 1.607 1.433 1.235 1.002 0.736 0.469 0.187 -0.803 -4 ,12345 ,TETRA ,17600328,Sun Nov 28 10:35:32 CET,Sun Nov 28 12:32:31 CET,0.0 2.022 2.598 3.057 3.392 3.685 3.949 4.206 4.696 4.906 5.109 5.294 5.625 5.774 6.066 6.347 6.602 6.722 6.95 7.155 7.45 7.653 7.854 8.148 8.437 8.725 9.014 9.299 9.648 9.976 10.284 10.655 11.032 11.386 11.801 12.282 12.714 13.171 13.667 14.17 14.694 15.267 15.868 16.422 17.031 17.641 18.219 18.705 19.041 19.187 18.878 17.927 16.998 16.098 15.229 14.469 13.804 13.182 12.629 12.077 11.587 11.154 10.762 10.393 10.039 9.695 9.327 8.985 8.709 8.452 8.173 7.933 7.681 7.427 7.233 7.004 6.759 6.518 6.269 6.096 5.911 5.626 5.426 5.227 5.13 4.923 4.711 4.486 4.358 4.027 3.955 3.783 3.609 3.253 3.06 2.825 2.547 2.222 1.853 1.399 -0.354 -5 ,7040 ,TETRA ,17600329,Sun Nov 28 10:35:33 CET,Sun Nov 28 12:33:11 CET,0.0 2.431 2.931 3.325 3.662 3.971 4.257 4.503 4.908 5.085 5.259 5.416 5.756 5.908 6.206 6.469 6.721 6.841 7.059 7.272 7.572 7.755 7.93 8.205 8.474 8.716 8.94 9.159 9.449 9.715 9.966 10.258 10.521 10.766 11.037 11.34 11.632 11.95 12.295 12.633 12.943 13.288 13.659 13.987 14.372 14.827 15.334 15.609 15.516 15.143 14.187 12.804 11.607 10.561 9.575 8.638 7.822 7.09 6.46 5.859 5.361 4.897 4.433 4.0 3.592 3.209 2.81 2.484 2.212 1.932 1.657 1.439 1.214 0.973 0.788 0.594 0.38 0.156 -0.076 -0.236 -0.401 -0.657 -0.844 -1.04 -1.134 -1.34 -1.555 -1.776 -1.889 -2.223 -2.309 -2.453 -2.597 -2.9 -3.084 -3.287 -3.497 -3.746 -4.041 -4.472 -5.63 -6 ,30658 ,TETRA ,17600330,Sun Nov 28 10:35:38 CET,Sun Nov 28 12:33:16 CET,0.0 3.085 3.642 4.098 4.455 4.777 5.049 5.276 5.682 5.886 6.074 6.218 6.55 6.704 6.973 7.203 7.443 7.568 7.773 7.962 8.253 8.429 8.6 8.862 9.105 9.315 9.515 9.715 9.971 10.209 10.424 10.679 10.923 11.155 11.411 11.683 11.929 12.186 12.46 12.716 12.966 13.243 13.539 13.819 14.118 14.411 14.705 14.972 15.116 14.936 14.24 13.028 11.853 10.856 10.016 9.242 8.561 7.987 7.493 6.984 6.54 6.165 5.82 5.484 5.177 4.885 4.562 4.268 4.027 3.78 3.496 3.274 3.049 2.79 2.601 2.422 2.229 2.021 1.806 1.667 1.531 1.306 1.16 1.014 0.928 0.757 0.572 0.373 0.271 -0.023 -0.018 -0.116 -0.23 -0.475 -0.598 -0.728 -0.898 -1.088 -1.352 -1.744 -3.237 -7 ,3944 ,TETRA ,17600331,Sun Nov 28 10:35:38 CET,Sun Nov 28 12:32:59 CET,0.0 5.767 6.689 7.425 8.01 8.496 8.914 9.283 9.984 10.276 10.529 10.778 11.156 11.356 11.732 12.067 12.407 12.577 12.9 13.23 13.695 13.962 14.201 14.547 14.906 15.239 15.552 15.855 16.227 16.555 16.871 17.255 17.592 17.924 18.315 18.689 19.021 19.408 19.8 20.2 20.608 21.051 21.507 21.935 22.451 22.963 23.497 23.948 24.352 24.603 24.498 24.036 23.375 22.664 22.016 21.396 20.828 20.278 19.798 19.35 18.934 18.537 18.157 17.798 17.469 17.163 16.808 16.449 16.155 15.871 15.56 15.299 15.031 14.753 14.546 14.325 14.086 13.839 13.579 13.398 13.22 12.957 12.762 12.541 12.428 12.201 11.953 11.711 11.593 11.269 11.192 11.029 10.85 10.455 10.256 10.062 9.841 9.586 9.295 8.913 7.594 -8 ,8289 ,TETRA ,17600332,Sun Nov 28 10:35:32 CET,Sun Nov 28 12:34:04 CET,0.0 2.245 2.801 3.232 3.594 3.882 4.129 4.391 4.858 5.042 5.258 5.554 5.932 6.091 6.372 6.642 6.903 7.029 7.265 7.476 7.801 8.008 8.184 8.438 8.705 8.96 9.203 9.438 9.722 9.969 10.197 10.471 10.735 10.996 11.278 11.599 11.905 12.194 12.476 12.767 13.049 13.327 13.632 13.888 14.127 14.349 14.534 14.617 14.499 14.131 13.27 11.992 10.852 9.86 8.997 8.204 7.525 6.918 6.404 5.888 5.418 5.009 4.632 4.251 3.903 3.602 3.266 2.969 2.708 2.414 2.107 1.876 1.641 1.382 1.186 0.984 0.768 0.547 0.34 0.201 0.044 -0.203 -0.374 -0.546 -0.634 -0.836 -1.05 -1.246 -1.346 -1.646 -1.682 -1.815 -1.942 -2.216 -2.376 -2.555 -2.741 -2.937 -3.187 -3.555 -4.474 -9 ,15102 ,TETRA ,17600333,Sun Nov 28 10:35:33 CET,Sun Nov 28 12:33:55 CET,0.0 3.306 3.914 4.427 4.821 5.114 5.379 5.625 6.062 6.259 6.452 6.624 6.952 7.096 7.369 7.635 7.882 7.997 8.215 8.426 8.736 8.935 9.126 9.397 9.647 9.88 10.113 10.34 10.638 10.93 11.195 11.492 11.759 12.017 12.308 12.618 12.921 13.223 13.52 13.849 14.192 14.57 15.001 15.405 15.851 16.318 16.842 17.278 17.552 17.681 17.227 16.201 15.29 14.473 13.743 13.083 12.474 11.902 11.396 10.886 10.446 10.056 9.695 9.327 8.968 8.643 8.3 7.994 7.736 7.47 7.191 6.97 6.737 6.495 6.303 6.083 5.854 5.634 5.402 5.25 5.098 4.863 4.708 4.539 4.449 4.263 4.085 3.877 3.761 3.458 3.412 3.288 3.162 2.911 2.765 2.581 2.395 2.177 1.92 1.631 0.823 -10 ,18141 ,TETRA ,17600334,Sun Nov 28 10:35:34 CET,Sun Nov 28 12:33:49 CET,0.0 2.449 2.955 3.375 3.727 4.036 4.309 4.547 4.94 5.104 5.273 5.436 5.777 5.931 6.22 6.475 6.687 6.794 7.015 7.236 7.547 7.733 7.94 8.263 8.527 8.771 9.021 9.262 9.597 9.918 10.175 10.457 10.74 11.022 11.348 11.728 12.067 12.399 12.745 13.09 13.443 13.836 14.261 14.657 15.092 15.49 15.887 16.23 16.415 16.416 16.132 15.358 14.466 13.663 12.936 12.223 11.575 10.987 10.505 10.045 9.624 9.239 8.872 8.511 8.182 7.896 7.584 7.288 7.031 6.775 6.502 6.264 6.041 5.805 5.619 5.426 5.227 5.026 4.816 4.681 4.539 4.297 4.134 3.969 3.881 3.703 3.523 3.318 3.208 2.895 2.886 2.775 2.652 2.374 2.218 2.067 1.926 1.73 1.483 1.052 -1.487 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_40.txt deleted file mode 100644 index 1131509e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_40.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -6 ,12877 ,KEBNE ,17026962,Wed Dec 22 15:55:30 CET,Wed Dec 22 17:36:38 CET,0.0 9.543 10.695 11.504 12.205 12.799 13.242 13.589 14.139 14.369 14.585 14.815 15.192 15.373 15.716 16.045 16.348 16.496 16.778 17.038 17.392 17.617 17.831 18.1 18.339 18.556 18.745 18.915 19.139 19.347 19.564 19.871 20.149 20.363 20.568 20.773 20.947 21.133 21.314 21.523 21.725 21.866 21.959 21.991 21.96 21.831 21.567 21.143 20.449 19.296 17.241 14.634 12.46 10.652 9.173 7.89 6.768 5.757 4.914 4.094 3.377 2.745 2.163 1.63 1.122 0.65 0.158 -0.283 -0.649 -1.033 -1.446 -1.794 -2.165 -2.55 -2.841 -3.141 -3.46 -3.805 -4.163 -4.393 -4.626 -4.993 -5.247 -5.521 -5.658 -5.934 -6.242 -6.568 -6.739 -7.142 -7.279 -7.46 -7.65 -8.075 -8.299 -8.515 -8.787 -9.121 -9.502 -10.003 -13.844 -7 ,13824 ,KEBNE ,17026963,Wed Dec 22 15:55:33 CET,Wed Dec 22 17:32:33 CET,0.0 6.757 7.607 8.15 8.602 9.023 9.382 9.671 10.19 10.444 10.694 10.966 11.339 11.527 11.845 12.123 12.375 12.491 12.713 12.934 13.249 13.441 13.612 13.859 14.101 14.321 14.514 14.668 14.846 15.005 15.163 15.392 15.599 15.765 15.933 16.094 16.226 16.344 16.458 16.542 16.614 16.728 16.778 16.72 16.588 16.322 15.895 15.315 14.456 13.098 10.681 7.783 5.444 3.46 1.828 0.445 -0.727 -1.754 -2.616 -3.471 -4.189 -4.822 -5.431 -5.978 -6.485 -6.959 -7.442 -7.876 -8.249 -8.619 -9.007 -9.322 -9.631 -9.954 -10.201 -10.454 -10.715 -11.003 -11.308 -11.502 -11.7 -12.027 -12.263 -12.49 -12.602 -12.846 -13.115 -13.401 -13.548 -13.921 -14.062 -14.235 -14.41 -14.764 -14.959 -15.185 -15.461 -15.751 -16.109 -16.576 -18.743 -8 ,10683 ,KEBNE ,17026964,Wed Dec 22 15:55:30 CET,Wed Dec 22 17:36:50 CET,0.0 7.596 8.535 9.222 9.744 10.146 10.489 10.784 11.324 11.586 11.83 12.083 12.465 12.662 13.022 13.333 13.617 13.751 14.015 14.245 14.547 14.724 14.879 15.131 15.366 15.56 15.75 15.917 16.118 16.31 16.49 16.678 16.825 16.952 17.109 17.308 17.493 17.664 17.828 17.981 18.1 18.204 18.262 18.277 18.279 18.192 17.904 17.374 16.581 15.27 12.942 10.234 8.048 6.214 4.686 3.377 2.302 1.328 0.47 -0.373 -1.083 -1.741 -2.393 -2.969 -3.501 -4.008 -4.532 -4.995 -5.389 -5.787 -6.17 -6.47 -6.781 -7.096 -7.343 -7.6 -7.858 -8.12 -8.396 -8.593 -8.794 -9.104 -9.321 -9.554 -9.676 -9.928 -10.21 -10.499 -10.636 -10.994 -11.115 -11.302 -11.491 -11.883 -12.102 -12.33 -12.566 -12.824 -13.137 -13.543 -16.911 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_41.txt deleted file mode 100644 index 438608f1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_41.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8454 ,TETRA ,17600335,Sun Nov 28 10:35:38 CET,Sun Nov 28 12:33:05 CET,0.0 4.137 5.046 5.591 5.997 6.376 6.678 6.946 7.453 7.671 7.865 8.069 8.417 8.558 8.826 9.086 9.338 9.457 9.671 9.877 10.181 10.375 10.561 10.845 11.116 11.355 11.583 11.789 12.048 12.298 12.525 12.808 13.077 13.312 13.589 13.902 14.153 14.398 14.642 14.907 15.181 15.422 15.692 15.965 16.239 16.399 16.427 16.401 16.286 15.837 14.639 12.901 11.415 10.154 9.074 8.095 7.249 6.515 5.882 5.247 4.696 4.221 3.782 3.34 2.911 2.536 2.134 1.786 1.506 1.217 0.905 0.643 0.376 0.105 -0.098 -0.309 -0.534 -0.769 -0.999 -1.151 -1.306 -1.542 -1.713 -1.902 -1.997 -2.186 -2.399 -2.62 -2.726 -3.039 -3.088 -3.225 -3.374 -3.685 -3.86 -4.051 -4.251 -4.461 -4.689 -4.969 -6.016 -2 ,7445 ,TETRA ,17600336,Sun Nov 28 10:35:33 CET,Sun Nov 28 12:31:42 CET,0.0 2.895 3.595 4.122 4.553 4.917 5.216 5.497 6.028 6.258 6.462 6.648 6.999 7.153 7.445 7.689 7.909 8.025 8.244 8.456 8.788 8.986 9.168 9.444 9.696 9.921 10.129 10.339 10.601 10.837 11.063 11.329 11.576 11.817 12.092 12.373 12.65 12.949 13.239 13.513 13.782 14.077 14.413 14.701 14.927 15.079 15.199 15.191 14.887 14.228 12.95 11.167 9.617 8.338 7.291 6.37 5.583 4.867 4.248 3.632 3.09 2.608 2.178 1.798 1.437 1.11 0.755 0.429 0.158 -0.13 -0.419 -0.647 -0.899 -1.163 -1.349 -1.543 -1.779 -2.035 -2.289 -2.456 -2.62 -2.877 -3.059 -3.257 -3.359 -3.562 -3.774 -3.991 -4.104 -4.413 -4.448 -4.57 -4.715 -5.026 -5.18 -5.349 -5.545 -5.761 -6.001 -6.367 -7.596 -3 ,30428 ,TETRA ,17600337,Sun Nov 28 10:35:35 CET,Sun Nov 28 12:32:07 CET,0.0 6.318 7.012 7.513 7.921 8.259 8.579 8.907 9.453 9.687 9.907 10.174 10.579 10.789 11.196 11.564 11.88 12.01 12.244 12.473 12.798 12.998 13.197 13.495 13.78 14.025 14.224 14.393 14.629 14.879 15.102 15.351 15.585 15.812 16.059 16.304 16.536 16.782 17.021 17.25 17.471 17.728 18.039 18.301 18.522 18.668 18.762 18.748 18.483 17.919 16.707 14.974 13.554 12.306 11.17 10.14 9.278 8.537 7.896 7.206 6.604 6.109 5.647 5.239 4.867 4.524 4.167 3.837 3.564 3.279 2.979 2.736 2.494 2.253 2.056 1.836 1.612 1.383 1.153 0.999 0.836 0.572 0.39 0.21 0.121 -0.058 -0.232 -0.429 -0.536 -0.841 -0.876 -1.005 -1.14 -1.396 -1.536 -1.701 -1.886 -2.087 -2.333 -2.684 -3.929 -4 ,8757 ,TETRA ,17600338,Sun Nov 28 10:35:41 CET,Sun Nov 28 12:26:40 CET,0.0 5.163 6.015 6.613 7.073 7.44 7.754 8.021 8.5 8.732 8.95 9.192 9.571 9.755 10.07 10.365 10.639 10.761 10.987 11.205 11.506 11.686 11.859 12.102 12.319 12.541 12.754 12.935 13.203 13.467 13.677 13.924 14.15 14.36 14.603 14.876 15.122 15.344 15.557 15.774 15.991 16.238 16.493 16.679 16.846 16.957 16.969 16.856 16.534 15.896 14.656 12.925 11.424 10.131 8.999 8.038 7.193 6.433 5.814 5.185 4.619 4.144 3.708 3.293 2.918 2.588 2.241 1.925 1.66 1.383 1.083 0.837 0.573 0.29 0.084 -0.124 -0.329 -0.532 -0.746 -0.889 -1.035 -1.274 -1.446 -1.616 -1.699 -1.881 -2.113 -2.353 -2.46 -2.758 -2.783 -2.899 -3.027 -3.331 -3.497 -3.685 -3.886 -4.091 -4.331 -4.673 -5.83 -6 ,1580 ,TETRA ,17600340,Sun Nov 28 10:35:42 CET,Sun Nov 28 12:34:02 CET,0.0 4.529 5.257 5.773 6.217 6.572 6.879 7.172 7.66 7.87 8.082 8.304 8.648 8.798 9.117 9.464 9.801 9.943 10.191 10.426 10.754 10.952 11.132 11.371 11.599 11.832 12.042 12.23 12.477 12.723 12.952 13.218 13.477 13.721 13.99 14.257 14.505 14.783 15.05 15.302 15.528 15.777 16.055 16.283 16.493 16.703 16.911 17.004 16.894 16.502 15.383 13.79 12.51 11.403 10.445 9.55 8.749 8.061 7.487 6.911 6.405 5.946 5.521 5.14 4.797 4.481 4.138 3.818 3.552 3.292 3.013 2.779 2.528 2.259 2.06 1.85 1.642 1.435 1.212 1.058 0.902 0.669 0.499 0.323 0.236 0.039 -0.177 -0.384 -0.494 -0.819 -0.88 -1.012 -1.137 -1.433 -1.604 -1.788 -1.976 -2.134 -2.321 -2.601 -4.258 -7 ,21795 ,TETRA ,17600341,Sun Nov 28 10:35:43 CET,Sun Nov 28 12:34:02 CET,0.0 5.665 6.409 7.001 7.432 7.767 8.085 8.389 8.96 9.222 9.465 9.745 10.143 10.334 10.694 11.039 11.349 11.482 11.72 11.945 12.28 12.499 12.717 13.029 13.318 13.613 13.889 14.116 14.4 14.701 15.006 15.336 15.62 15.894 16.196 16.523 16.803 17.111 17.439 17.716 17.967 18.238 18.523 18.763 19.015 19.267 19.461 19.539 19.482 19.165 18.247 16.887 15.649 14.561 13.588 12.739 11.998 11.311 10.713 10.114 9.608 9.151 8.707 8.29 7.907 7.557 7.176 6.814 6.523 6.249 5.969 5.744 5.498 5.226 5.024 4.817 4.602 4.387 4.164 4.013 3.859 3.604 3.416 3.225 3.125 2.909 2.705 2.517 2.408 2.094 2.075 1.949 1.809 1.481 1.296 1.124 0.942 0.705 0.415 0.095 -0.845 -9 ,29654 ,TETRA ,17600343,Sun Nov 28 10:35:53 CET,Sun Nov 28 12:33:47 CET,0.0 5.612 6.518 7.021 7.401 7.749 8.088 8.376 8.861 9.073 9.291 9.541 9.886 10.037 10.349 10.661 10.939 11.066 11.316 11.542 11.838 12.031 12.237 12.534 12.799 13.046 13.29 13.531 13.806 14.045 14.29 14.573 14.826 15.069 15.331 15.616 15.87 16.137 16.429 16.703 16.957 17.246 17.584 17.916 18.213 18.417 18.53 18.497 18.136 17.436 16.292 14.718 13.265 11.958 10.833 9.81 8.947 8.204 7.574 6.951 6.411 5.909 5.44 5.022 4.645 4.299 3.929 3.607 3.332 3.042 2.747 2.509 2.257 1.995 1.802 1.599 1.377 1.14 0.896 0.744 0.589 0.341 0.169 -0.002 -0.089 -0.271 -0.463 -0.664 -0.774 -1.091 -1.155 -1.282 -1.403 -1.684 -1.837 -2.0 -2.198 -2.449 -2.754 -3.164 -3.933 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_42.txt deleted file mode 100644 index 6fca1b68..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_42.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7550 ,TETRA ,17600345,Sun Nov 28 10:35:44 CET,Sun Nov 28 12:33:18 CET,0.0 2.741 3.129 3.403 3.642 3.866 4.099 4.318 4.669 4.835 5.005 5.079 5.37 5.483 5.69 5.903 6.11 6.206 6.401 6.583 6.83 6.999 7.163 7.37 7.552 7.74 7.917 8.077 8.295 8.499 8.693 8.933 9.149 9.346 9.578 9.838 10.076 10.334 10.598 10.881 11.188 11.508 11.871 12.238 12.649 13.078 13.538 13.994 14.464 14.903 15.21 15.166 14.895 14.582 14.247 13.897 13.577 13.273 13.003 12.724 12.456 12.201 11.941 11.694 11.47 11.249 11.014 10.818 10.659 10.483 10.294 10.138 9.974 9.8 9.664 9.52 9.366 9.205 9.047 8.937 8.808 8.617 8.487 8.342 8.267 8.127 7.977 7.781 7.679 7.39 7.382 7.281 7.163 6.914 6.771 6.57 6.35 6.143 5.891 5.442 2.669 -2 ,262 ,TETRA ,17600346,Sun Nov 28 10:35:42 CET,Sun Nov 28 12:25:29 CET,0.0 2.518 2.999 3.331 3.577 3.793 3.981 4.182 4.59 4.778 4.933 5.035 5.378 5.518 5.758 5.998 6.229 6.329 6.533 6.72 6.991 7.158 7.297 7.5 7.702 7.893 8.087 8.284 8.527 8.749 8.955 9.206 9.419 9.611 9.854 10.116 10.358 10.614 10.892 11.219 11.559 11.934 12.376 12.778 13.204 13.666 14.198 14.781 15.325 15.777 16.036 15.962 15.721 15.387 15.024 14.654 14.294 13.97 13.687 13.398 13.133 12.899 12.673 12.443 12.234 12.026 11.791 11.587 11.424 11.27 11.106 10.955 10.783 10.597 10.451 10.311 10.172 10.01 9.849 9.746 9.634 9.45 9.314 9.177 9.11 8.968 8.817 8.655 8.57 8.294 8.314 8.231 8.139 7.881 7.748 7.623 7.492 7.333 7.134 6.87 5.522 -3 ,21766 ,TETRA ,17600347,Sun Nov 28 10:35:42 CET,Sun Nov 28 12:28:03 CET,0.0 5.635 6.2 6.536 6.815 7.046 7.242 7.398 7.7 7.859 8.015 8.124 8.433 8.55 8.768 8.966 9.162 9.265 9.458 9.638 9.895 10.059 10.213 10.428 10.634 10.823 11.001 11.171 11.398 11.628 11.84 12.078 12.285 12.479 12.714 12.954 13.168 13.416 13.694 13.987 14.273 14.575 14.915 15.269 15.709 16.165 16.652 17.165 17.661 18.157 18.579 18.611 18.372 18.037 17.698 17.386 17.095 16.821 16.566 16.286 16.043 15.799 15.555 15.328 15.128 14.945 14.737 14.554 14.393 14.227 14.058 13.914 13.753 13.57 13.436 13.295 13.144 12.986 12.819 12.71 12.593 12.405 12.271 12.129 12.063 11.91 11.721 11.537 11.449 11.17 11.153 11.056 10.955 10.74 10.619 10.482 10.321 10.121 9.861 9.584 8.647 -4 ,19764 ,TETRA ,17600348,Sun Nov 28 10:35:43 CET,Sun Nov 28 12:32:39 CET,0.0 6.147 6.596 6.945 7.228 7.456 7.655 7.844 8.191 8.343 8.489 8.559 8.855 8.968 9.169 9.357 9.538 9.621 9.788 9.948 10.179 10.33 10.472 10.666 10.849 11.025 11.203 11.379 11.589 11.786 11.981 12.206 12.429 12.652 12.903 13.187 13.457 13.753 14.05 14.345 14.641 14.968 15.326 15.692 16.13 16.57 17.055 17.571 18.078 18.542 18.897 18.948 18.728 18.397 18.051 17.714 17.371 17.061 16.799 16.509 16.266 16.043 15.803 15.572 15.373 15.205 15.025 14.834 14.648 14.459 14.273 14.114 13.942 13.764 13.627 13.486 13.333 13.169 12.998 12.872 12.732 12.505 12.353 12.193 12.114 11.95 11.752 11.548 11.441 11.143 11.097 10.981 10.858 10.562 10.405 10.261 10.104 9.885 9.602 9.205 8.017 -6 ,18073 ,TETRA ,17600350,Sun Nov 28 10:35:44 CET,Sun Nov 28 12:33:24 CET,0.0 2.515 2.956 3.297 3.54 3.743 3.931 4.113 4.415 4.545 4.685 4.76 5.053 5.168 5.381 5.578 5.759 5.845 6.034 6.205 6.418 6.553 6.685 6.873 7.055 7.239 7.417 7.586 7.796 7.994 8.172 8.387 8.604 8.806 9.042 9.296 9.533 9.791 10.065 10.36 10.663 11.01 11.396 11.743 12.137 12.563 12.983 13.406 13.871 14.32 14.639 14.575 14.333 14.053 13.762 13.454 13.159 12.858 12.545 12.236 11.983 11.742 11.509 11.285 11.068 10.864 10.644 10.449 10.284 10.097 9.894 9.72 9.54 9.362 9.219 9.069 8.913 8.757 8.601 8.493 8.384 8.21 8.097 7.982 7.914 7.767 7.597 7.425 7.349 7.083 7.077 6.979 6.885 6.644 6.509 6.364 6.178 5.991 5.753 5.342 3.694 -7 ,24855 ,TETRA ,17600351,Sun Nov 28 10:35:43 CET,Sun Nov 28 12:33:05 CET,0.0 4.634 5.175 5.554 5.832 6.077 6.285 6.465 6.841 6.996 7.116 7.166 7.466 7.574 7.772 7.964 8.128 8.21 8.374 8.521 8.718 8.843 8.97 9.155 9.335 9.517 9.686 9.851 10.073 10.281 10.479 10.715 10.926 11.111 11.327 11.586 11.824 12.071 12.333 12.623 12.937 13.278 13.648 13.998 14.394 14.789 15.239 15.729 16.203 16.638 16.933 16.895 16.614 16.302 15.981 15.639 15.308 15.01 14.748 14.447 14.192 13.973 13.743 13.528 13.328 13.137 12.93 12.74 12.57 12.385 12.197 12.042 11.867 11.685 11.543 11.395 11.251 11.099 10.954 10.846 10.727 10.533 10.396 10.267 10.193 10.021 9.861 9.699 9.608 9.33 9.324 9.217 9.088 8.804 8.656 8.488 8.291 8.014 7.682 7.315 5.396 -8 ,8006 ,TETRA ,17600352,Sun Nov 28 10:35:46 CET,Sun Nov 28 12:33:12 CET,0.0 1.995 2.546 2.851 3.091 3.277 3.449 3.639 4.027 4.199 4.335 4.404 4.712 4.813 5.006 5.189 5.357 5.442 5.604 5.759 5.995 6.143 6.272 6.457 6.646 6.823 6.989 7.156 7.367 7.566 7.769 8.005 8.222 8.432 8.664 8.918 9.181 9.467 9.757 10.058 10.354 10.687 11.085 11.455 11.864 12.324 12.801 13.272 13.74 14.159 14.513 14.524 14.301 14.002 13.67 13.331 13.018 12.711 12.419 12.112 11.846 11.605 11.362 11.117 10.88 10.673 10.461 10.263 10.096 9.919 9.736 9.592 9.441 9.285 9.166 9.039 8.892 8.728 8.554 8.436 8.311 8.137 8.027 7.911 7.849 7.701 7.548 7.392 7.308 7.025 7.021 6.899 6.776 6.527 6.388 6.247 6.082 5.845 5.573 5.25 3.125 -9 ,31130 ,TETRA ,17600353,Sun Nov 28 10:35:43 CET,Sun Nov 28 12:33:48 CET,0.0 2.042 2.407 2.692 2.914 3.121 3.315 3.488 3.778 3.905 4.037 4.095 4.389 4.499 4.707 4.897 5.063 5.14 5.288 5.434 5.658 5.804 5.941 6.141 6.334 6.505 6.677 6.858 7.08 7.267 7.449 7.669 7.875 8.085 8.319 8.592 8.85 9.116 9.409 9.719 10.042 10.382 10.747 11.122 11.541 11.967 12.417 12.869 13.339 13.776 14.088 14.011 13.762 13.43 13.072 12.738 12.44 12.139 11.853 11.554 11.291 11.057 10.827 10.609 10.409 10.214 10.012 9.832 9.669 9.51 9.339 9.186 9.02 8.849 8.728 8.602 8.455 8.297 8.135 8.026 7.906 7.72 7.604 7.468 7.394 7.25 7.11 6.971 6.896 6.616 6.607 6.508 6.399 6.166 6.035 5.864 5.645 5.418 5.194 4.872 3.679 -10 ,27285 ,TETRA ,17600354,Sun Nov 28 10:35:53 CET,Sun Nov 28 12:33:20 CET,0.0 7.517 7.985 8.283 8.524 8.756 8.962 9.127 9.437 9.581 9.714 9.782 10.065 10.172 10.372 10.555 10.733 10.826 10.995 11.137 11.365 11.514 11.646 11.837 12.026 12.208 12.372 12.531 12.731 12.92 13.102 13.323 13.541 13.76 13.999 14.242 14.475 14.743 15.042 15.334 15.613 15.928 16.28 16.629 17.043 17.485 17.953 18.426 18.881 19.256 19.533 19.458 19.188 18.874 18.541 18.213 17.899 17.573 17.29 17.001 16.73 16.474 16.225 15.994 15.765 15.553 15.346 15.158 14.991 14.815 14.636 14.498 14.356 14.202 14.074 13.937 13.799 13.661 13.517 13.421 13.32 13.159 13.042 12.911 12.844 12.707 12.559 12.393 12.309 12.052 12.057 11.956 11.834 11.558 11.425 11.285 11.125 10.933 10.722 10.482 8.349 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_43.txt deleted file mode 100644 index a8563b8b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22156 ,TETRA ,17600355,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:33:11 CET,0.0 2.061 2.437 2.736 2.994 3.243 3.447 3.624 3.991 4.158 4.298 4.39 4.696 4.797 4.988 5.171 5.336 5.41 5.558 5.707 5.916 6.05 6.189 6.388 6.568 6.737 6.896 7.058 7.267 7.446 7.611 7.793 7.96 8.131 8.315 8.496 8.655 8.819 9.0 9.192 9.356 9.51 9.687 9.858 10.065 10.258 10.423 10.524 10.47 10.197 9.545 8.591 7.694 6.902 6.207 5.573 5.051 4.585 4.165 3.755 3.407 3.074 2.736 2.424 2.14 1.884 1.62 1.383 1.159 0.927 0.708 0.519 0.321 0.127 -0.019 -0.172 -0.338 -0.51 -0.682 -0.799 -0.915 -1.105 -1.248 -1.394 -1.464 -1.603 -1.746 -1.914 -2.01 -2.305 -2.3 -2.4 -2.505 -2.711 -2.81 -2.921 -3.073 -3.226 -3.381 -3.669 -4.413 -2 ,29095 ,TETRA ,17600356,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:33:14 CET,0.0 2.019 2.5 2.788 3.015 3.236 3.453 3.648 3.981 4.13 4.262 4.31 4.597 4.697 4.874 5.054 5.251 5.344 5.508 5.666 5.864 5.983 6.109 6.295 6.465 6.616 6.749 6.882 7.062 7.232 7.387 7.563 7.727 7.891 8.08 8.254 8.408 8.569 8.737 8.939 9.142 9.36 9.577 9.744 9.909 10.078 10.221 10.252 10.154 9.877 9.212 8.25 7.376 6.599 5.902 5.283 4.727 4.228 3.807 3.368 3.003 2.694 2.402 2.116 1.828 1.577 1.324 1.093 0.888 0.666 0.441 0.262 0.079 -0.118 -0.283 -0.46 -0.632 -0.808 -1.009 -1.136 -1.254 -1.437 -1.566 -1.699 -1.767 -1.908 -2.056 -2.213 -2.301 -2.58 -2.577 -2.687 -2.794 -3.026 -3.15 -3.277 -3.419 -3.588 -3.795 -4.027 -4.658 -3 ,21833 ,TETRA ,17600357,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:22:39 CET,0.0 1.945 2.386 2.692 2.909 3.114 3.333 3.527 3.841 3.981 4.122 4.188 4.472 4.567 4.757 4.926 5.074 5.147 5.295 5.436 5.646 5.78 5.909 6.101 6.262 6.401 6.55 6.676 6.818 6.969 7.114 7.288 7.451 7.61 7.789 7.977 8.146 8.331 8.527 8.716 8.907 9.099 9.284 9.446 9.621 9.779 9.888 9.954 9.942 9.707 9.116 8.236 7.403 6.639 5.947 5.301 4.723 4.216 3.792 3.37 3.006 2.67 2.343 2.055 1.793 1.545 1.274 1.026 0.804 0.579 0.359 0.169 -0.027 -0.224 -0.381 -0.552 -0.724 -0.881 -1.047 -1.17 -1.298 -1.514 -1.661 -1.797 -1.868 -2.022 -2.181 -2.344 -2.421 -2.693 -2.686 -2.783 -2.869 -3.075 -3.194 -3.3 -3.419 -3.566 -3.784 -4.021 -4.72 -4 ,5165 ,TETRA ,17600358,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:25:07 CET,0.0 2.038 2.492 2.8 3.057 3.246 3.412 3.586 3.892 4.014 4.135 4.165 4.443 4.55 4.768 4.947 5.106 5.178 5.302 5.427 5.61 5.742 5.865 6.025 6.189 6.341 6.496 6.651 6.836 7.005 7.174 7.369 7.545 7.713 7.881 8.068 8.234 8.386 8.549 8.711 8.885 9.059 9.217 9.363 9.511 9.644 9.764 9.817 9.767 9.546 8.983 8.103 7.236 6.46 5.793 5.185 4.641 4.143 3.705 3.265 2.903 2.579 2.257 1.947 1.655 1.392 1.131 0.898 0.695 0.493 0.277 0.091 -0.101 -0.296 -0.452 -0.622 -0.79 -0.96 -1.133 -1.252 -1.374 -1.553 -1.679 -1.807 -1.873 -2.016 -2.173 -2.346 -2.432 -2.713 -2.684 -2.781 -2.888 -3.129 -3.253 -3.373 -3.528 -3.692 -3.867 -4.065 -4.353 -5 ,27237 ,TETRA ,17600359,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:32:56 CET,0.0 1.964 2.459 2.833 3.134 3.381 3.59 3.775 4.121 4.279 4.428 4.536 4.83 4.938 5.151 5.334 5.523 5.626 5.821 6.011 6.281 6.453 6.605 6.799 6.981 7.149 7.308 7.448 7.613 7.786 7.946 8.109 8.266 8.418 8.588 8.771 8.935 9.12 9.33 9.526 9.717 9.926 10.137 10.325 10.502 10.664 10.803 10.846 10.754 10.499 9.916 8.99 8.082 7.268 6.558 5.923 5.373 4.856 4.398 3.935 3.527 3.185 2.862 2.541 2.247 1.979 1.698 1.447 1.238 1.03 0.82 0.646 0.459 0.269 0.119 -0.041 -0.212 -0.392 -0.566 -0.687 -0.815 -1.001 -1.129 -1.267 -1.337 -1.484 -1.637 -1.796 -1.882 -2.169 -2.168 -2.267 -2.37 -2.595 -2.72 -2.839 -2.969 -3.108 -3.287 -3.553 -4.278 -6 ,16917 ,TETRA ,17600360,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:32:46 CET,0.0 2.564 2.999 3.324 3.586 3.803 4.003 4.184 4.489 4.62 4.759 4.841 5.125 5.213 5.39 5.552 5.702 5.776 5.936 6.094 6.294 6.424 6.564 6.76 6.928 7.09 7.248 7.396 7.579 7.746 7.894 8.068 8.232 8.392 8.577 8.772 8.971 9.18 9.384 9.577 9.748 9.954 10.176 10.367 10.572 10.722 10.827 10.894 10.837 10.582 9.958 9.001 8.108 7.315 6.627 5.987 5.419 4.907 4.451 3.976 3.586 3.246 2.906 2.588 2.299 2.049 1.788 1.538 1.323 1.109 0.888 0.712 0.523 0.327 0.189 0.038 -0.124 -0.285 -0.455 -0.574 -0.704 -0.905 -1.04 -1.179 -1.255 -1.426 -1.597 -1.766 -1.855 -2.15 -2.151 -2.248 -2.339 -2.52 -2.625 -2.751 -2.895 -3.058 -3.26 -3.515 -3.838 -7 ,31113 ,TETRA ,17600361,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:33:47 CET,0.0 1.562 1.978 2.294 2.53 2.744 2.932 3.084 3.366 3.509 3.629 3.65 3.934 4.024 4.195 4.351 4.505 4.587 4.74 4.879 5.071 5.19 5.302 5.449 5.576 5.702 5.818 5.934 6.105 6.267 6.407 6.56 6.713 6.853 7.005 7.169 7.317 7.471 7.641 7.825 8.003 8.182 8.354 8.522 8.702 8.849 8.964 9.004 8.922 8.69 8.035 7.013 6.136 5.351 4.655 4.04 3.494 2.974 2.524 2.089 1.724 1.399 1.093 0.812 0.544 0.292 0.024 -0.212 -0.413 -0.628 -0.852 -1.028 -1.213 -1.414 -1.569 -1.734 -1.906 -2.082 -2.264 -2.393 -2.528 -2.739 -2.884 -3.02 -3.088 -3.239 -3.406 -3.585 -3.675 -3.962 -3.96 -4.061 -4.169 -4.391 -4.52 -4.671 -4.82 -5.008 -5.25 -5.527 -6.287 -8 ,23525 ,TETRA ,17600362,Sun Nov 28 10:35:57 CET,Sun Nov 28 12:33:45 CET,0.0 1.252 1.657 1.982 2.207 2.38 2.552 2.715 2.998 3.124 3.254 3.295 3.57 3.665 3.84 4.002 4.143 4.214 4.347 4.477 4.68 4.799 4.904 5.051 5.204 5.35 5.49 5.655 5.887 6.079 6.242 6.44 6.627 6.778 6.929 7.099 7.258 7.412 7.567 7.751 7.94 8.111 8.281 8.443 8.603 8.727 8.833 8.916 8.95 8.773 8.161 7.255 6.448 5.725 5.092 4.508 3.988 3.497 3.071 2.638 2.257 1.922 1.606 1.305 1.021 0.773 0.512 0.28 0.083 -0.13 -0.348 -0.533 -0.725 -0.919 -1.064 -1.206 -1.357 -1.528 -1.709 -1.828 -1.944 -2.119 -2.251 -2.398 -2.474 -2.634 -2.8 -2.959 -3.041 -3.317 -3.28 -3.363 -3.453 -3.674 -3.789 -3.911 -4.057 -4.201 -4.409 -4.705 -5.31 -9 ,24882 ,TETRA ,17600363,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:30:59 CET,0.0 1.466 1.845 2.132 2.395 2.608 2.774 2.933 3.252 3.389 3.513 3.572 3.859 3.961 4.168 4.373 4.55 4.63 4.787 4.933 5.134 5.267 5.4 5.579 5.748 5.908 6.057 6.194 6.371 6.542 6.704 6.894 7.068 7.23 7.411 7.6 7.77 7.967 8.179 8.373 8.539 8.712 8.923 9.098 9.27 9.405 9.471 9.551 9.577 9.382 8.79 7.839 6.955 6.152 5.476 4.875 4.341 3.869 3.445 3.004 2.623 2.289 1.988 1.692 1.398 1.126 0.856 0.626 0.42 0.203 -0.024 -0.216 -0.407 -0.602 -0.748 -0.895 -1.045 -1.2 -1.372 -1.489 -1.603 -1.778 -1.9 -2.03 -2.099 -2.245 -2.402 -2.556 -2.632 -2.917 -2.938 -3.046 -3.146 -3.365 -3.483 -3.609 -3.747 -3.892 -4.057 -4.294 -4.78 -10 ,31588 ,TETRA ,17600364,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:35:53 CET,0.0 1.786 2.224 2.558 2.817 3.058 3.267 3.442 3.755 3.898 4.034 4.109 4.402 4.5 4.673 4.833 4.978 5.049 5.181 5.299 5.484 5.602 5.713 5.876 6.03 6.179 6.322 6.454 6.626 6.789 6.939 7.122 7.301 7.453 7.618 7.805 7.974 8.146 8.306 8.477 8.662 8.853 9.043 9.206 9.363 9.51 9.645 9.718 9.695 9.441 8.774 7.813 6.936 6.132 5.387 4.722 4.137 3.602 3.149 2.701 2.33 2.001 1.697 1.417 1.159 0.923 0.666 0.438 0.241 0.033 -0.172 -0.345 -0.529 -0.712 -0.859 -1.016 -1.174 -1.343 -1.527 -1.656 -1.78 -1.953 -2.071 -2.188 -2.25 -2.386 -2.532 -2.686 -2.767 -3.044 -3.015 -3.105 -3.203 -3.403 -3.514 -3.635 -3.765 -3.907 -4.061 -4.252 -5.178 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_46.txt deleted file mode 100644 index f8cf6153..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1177 ,TETRA ,17600365,Sun Nov 28 10:35:55 CET,Sun Nov 28 12:34:55 CET,0.0 1.692 2.082 2.364 2.597 2.781 2.94 3.092 3.346 3.458 3.567 3.584 3.858 3.969 4.154 4.317 4.469 4.54 4.662 4.776 4.961 5.086 5.207 5.368 5.506 5.641 5.773 5.887 6.027 6.168 6.317 6.498 6.636 6.754 6.916 7.084 7.232 7.414 7.591 7.739 7.887 8.042 8.163 8.255 8.365 8.465 8.49 8.375 8.126 7.606 6.471 4.969 3.679 2.584 1.68 0.86 0.108 -0.53 -1.049 -1.584 -2.028 -2.405 -2.76 -3.095 -3.407 -3.691 -4.004 -4.29 -4.521 -4.746 -4.987 -5.198 -5.415 -5.64 -5.816 -5.991 -6.169 -6.364 -6.567 -6.702 -6.835 -7.034 -7.177 -7.326 -7.4 -7.55 -7.709 -7.873 -7.96 -8.245 -8.235 -8.34 -8.445 -8.675 -8.81 -8.944 -9.062 -9.199 -9.399 -9.631 -10.138 -2 ,22884 ,TETRA ,17600366,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:34:53 CET,0.0 2.065 2.509 2.82 3.028 3.214 3.396 3.564 3.877 4.015 4.14 4.185 4.49 4.617 4.851 5.038 5.207 5.282 5.429 5.57 5.771 5.916 6.059 6.252 6.43 6.588 6.729 6.876 7.083 7.267 7.412 7.559 7.695 7.831 7.992 8.147 8.293 8.462 8.617 8.753 8.887 9.02 9.146 9.272 9.401 9.48 9.473 9.373 9.09 8.482 7.353 5.917 4.719 3.673 2.747 1.936 1.244 0.643 0.138 -0.384 -0.834 -1.225 -1.605 -1.958 -2.273 -2.557 -2.84 -3.097 -3.34 -3.589 -3.831 -4.034 -4.244 -4.466 -4.631 -4.786 -4.957 -5.141 -5.324 -5.451 -5.584 -5.781 -5.916 -6.058 -6.131 -6.279 -6.443 -6.63 -6.723 -7.013 -7.012 -7.114 -7.222 -7.446 -7.554 -7.674 -7.809 -7.946 -8.12 -8.36 -8.864 -3 ,16397 ,TETRA ,17600367,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:34:42 CET,0.0 2.307 2.843 3.198 3.48 3.723 3.944 4.144 4.479 4.638 4.795 4.886 5.194 5.326 5.557 5.753 5.925 6.009 6.163 6.301 6.496 6.616 6.755 6.964 7.124 7.264 7.403 7.548 7.733 7.907 8.058 8.211 8.341 8.45 8.565 8.69 8.822 8.974 9.137 9.264 9.347 9.464 9.64 9.772 9.822 9.802 9.71 9.556 9.285 8.73 7.565 6.056 4.797 3.724 2.834 2.041 1.348 0.719 0.177 -0.35 -0.794 -1.182 -1.553 -1.893 -2.21 -2.502 -2.799 -3.071 -3.313 -3.554 -3.801 -4.009 -4.211 -4.409 -4.575 -4.75 -4.93 -5.116 -5.296 -5.423 -5.555 -5.763 -5.913 -6.062 -6.139 -6.291 -6.437 -6.603 -6.692 -6.971 -6.954 -7.06 -7.184 -7.428 -7.558 -7.689 -7.827 -7.981 -8.176 -8.372 -8.902 -4 ,4873 ,TETRA ,17600368,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:34:00 CET,0.0 1.621 2.125 2.443 2.725 2.969 3.161 3.328 3.627 3.76 3.887 3.974 4.272 4.371 4.558 4.742 4.928 5.012 5.163 5.305 5.513 5.649 5.778 5.945 6.104 6.256 6.4 6.536 6.692 6.847 6.994 7.167 7.331 7.466 7.609 7.779 7.937 8.09 8.24 8.378 8.506 8.668 8.86 8.978 9.047 9.076 9.058 8.962 8.69 8.092 6.939 5.426 4.128 3.064 2.219 1.465 0.765 0.151 -0.37 -0.893 -1.338 -1.725 -2.076 -2.411 -2.73 -3.017 -3.32 -3.584 -3.814 -4.05 -4.295 -4.506 -4.726 -4.942 -5.102 -5.278 -5.458 -5.647 -5.851 -5.986 -6.129 -6.355 -6.511 -6.663 -6.735 -6.881 -7.03 -7.187 -7.275 -7.558 -7.542 -7.65 -7.759 -7.999 -8.136 -8.288 -8.441 -8.584 -8.765 -8.981 -9.525 -5 ,4955 ,TETRA ,17600369,Sun Nov 28 10:35:57 CET,Sun Nov 28 12:34:07 CET,0.0 1.082 1.464 1.787 2.019 2.268 2.507 2.694 3.014 3.172 3.317 3.369 3.669 3.775 3.968 4.128 4.287 4.373 4.533 4.694 4.937 5.074 5.2 5.369 5.501 5.617 5.741 5.873 6.032 6.167 6.296 6.468 6.621 6.766 6.933 7.109 7.274 7.453 7.643 7.813 7.955 8.072 8.176 8.264 8.346 8.402 8.399 8.302 8.024 7.459 6.353 4.906 3.666 2.597 1.664 0.83 0.128 -0.498 -1.038 -1.548 -1.981 -2.374 -2.756 -3.121 -3.437 -3.733 -4.047 -4.306 -4.525 -4.754 -4.997 -5.194 -5.391 -5.596 -5.768 -5.951 -6.14 -6.33 -6.509 -6.638 -6.777 -6.998 -7.148 -7.289 -7.363 -7.525 -7.697 -7.874 -7.959 -8.244 -8.245 -8.347 -8.457 -8.702 -8.84 -8.988 -9.139 -9.301 -9.474 -9.65 -10.018 -6 ,748 ,TETRA ,17600370,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:32:39 CET,0.0 2.692 3.184 3.521 3.791 4.01 4.196 4.36 4.676 4.82 4.954 5.001 5.296 5.417 5.618 5.793 5.969 6.055 6.222 6.379 6.603 6.737 6.856 7.022 7.179 7.332 7.466 7.596 7.775 7.933 8.076 8.264 8.442 8.586 8.753 8.953 9.13 9.3 9.445 9.587 9.727 9.849 9.982 10.09 10.144 10.199 10.199 10.052 9.73 9.126 8.001 6.467 5.164 4.077 3.172 2.389 1.706 1.087 0.543 -0.01 -0.491 -0.906 -1.268 -1.623 -1.963 -2.273 -2.584 -2.849 -3.082 -3.337 -3.605 -3.818 -4.032 -4.252 -4.426 -4.598 -4.769 -4.944 -5.141 -5.272 -5.4 -5.605 -5.741 -5.879 -5.954 -6.111 -6.273 -6.456 -6.55 -6.843 -6.829 -6.923 -7.028 -7.254 -7.381 -7.515 -7.659 -7.82 -8.008 -8.259 -8.905 -7 ,13794 ,TETRA ,17600371,Sun Nov 28 10:35:55 CET,Sun Nov 28 12:32:46 CET,0.0 2.269 2.736 3.095 3.344 3.594 3.827 4.027 4.349 4.487 4.62 4.678 4.987 5.102 5.319 5.52 5.699 5.784 5.952 6.115 6.336 6.47 6.604 6.801 6.992 7.168 7.325 7.471 7.661 7.839 8.0 8.189 8.352 8.497 8.665 8.835 8.971 9.134 9.326 9.51 9.644 9.756 9.855 9.932 9.974 9.979 9.944 9.802 9.518 9.001 7.995 6.591 5.346 4.31 3.462 2.686 1.985 1.355 0.827 0.313 -0.13 -0.515 -0.87 -1.203 -1.516 -1.806 -2.105 -2.368 -2.592 -2.814 -3.047 -3.247 -3.461 -3.675 -3.829 -3.986 -4.147 -4.311 -4.495 -4.632 -4.766 -4.953 -5.095 -5.25 -5.325 -5.485 -5.648 -5.815 -5.907 -6.205 -6.205 -6.313 -6.432 -6.68 -6.794 -6.919 -7.056 -7.208 -7.369 -7.589 -8.221 -8 ,28735 ,TETRA ,17600372,Sun Nov 28 10:35:58 CET,Sun Nov 28 12:33:35 CET,0.0 1.694 2.178 2.523 2.775 3.004 3.234 3.426 3.728 3.866 3.995 4.066 4.352 4.457 4.681 4.88 5.045 5.128 5.306 5.473 5.708 5.846 5.965 6.134 6.283 6.432 6.581 6.722 6.896 7.067 7.231 7.407 7.553 7.696 7.87 8.054 8.228 8.41 8.605 8.788 8.952 9.104 9.208 9.275 9.322 9.331 9.261 9.123 8.877 8.286 7.098 5.54 4.259 3.203 2.279 1.463 0.764 0.149 -0.36 -0.894 -1.349 -1.735 -2.117 -2.477 -2.814 -3.119 -3.409 -3.671 -3.901 -4.14 -4.396 -4.607 -4.82 -5.043 -5.208 -5.381 -5.57 -5.753 -5.934 -6.073 -6.215 -6.422 -6.567 -6.722 -6.801 -6.958 -7.129 -7.317 -7.413 -7.705 -7.7 -7.802 -7.912 -8.143 -8.264 -8.395 -8.533 -8.697 -8.875 -9.064 -9.66 -9 ,25425 ,TETRA ,17600373,Sun Nov 28 10:35:59 CET,Sun Nov 28 12:33:29 CET,0.0 1.831 2.26 2.568 2.858 3.106 3.299 3.463 3.736 3.857 3.972 3.988 4.275 4.372 4.551 4.704 4.858 4.935 5.068 5.179 5.334 5.44 5.544 5.681 5.824 5.963 6.083 6.206 6.384 6.563 6.738 6.932 7.088 7.228 7.392 7.559 7.692 7.833 8.0 8.162 8.313 8.445 8.571 8.677 8.747 8.777 8.768 8.671 8.369 7.747 6.597 5.163 3.946 2.928 2.039 1.244 0.571 -0.039 -0.583 -1.123 -1.577 -1.964 -2.325 -2.673 -3.01 -3.318 -3.626 -3.905 -4.139 -4.371 -4.615 -4.821 -5.03 -5.248 -5.412 -5.576 -5.748 -5.933 -6.137 -6.274 -6.416 -6.637 -6.788 -6.944 -7.025 -7.183 -7.337 -7.507 -7.597 -7.882 -7.856 -7.957 -8.069 -8.305 -8.438 -8.596 -8.774 -8.961 -9.148 -9.336 -10.141 -10 ,23525 ,TETRA ,17600374,Sun Nov 28 10:35:54 CET,Sun Nov 28 12:26:02 CET,0.0 1.09 1.46 1.753 1.993 2.193 2.376 2.532 2.789 2.92 3.039 3.064 3.341 3.433 3.604 3.772 3.933 4.007 4.151 4.295 4.503 4.627 4.728 4.874 5.043 5.207 5.351 5.475 5.604 5.741 5.884 6.051 6.191 6.316 6.477 6.659 6.82 6.988 7.141 7.31 7.504 7.695 7.86 7.985 8.114 8.193 8.204 8.107 7.8 7.217 6.123 4.693 3.428 2.311 1.405 0.606 -0.09 -0.696 -1.22 -1.75 -2.199 -2.579 -2.938 -3.298 -3.631 -3.916 -4.22 -4.491 -4.723 -4.971 -5.227 -5.438 -5.649 -5.862 -6.029 -6.206 -6.39 -6.583 -6.777 -6.899 -7.026 -7.224 -7.366 -7.524 -7.608 -7.801 -8.0 -8.178 -8.278 -8.583 -8.586 -8.7 -8.83 -9.104 -9.239 -9.387 -9.532 -9.669 -9.826 -10.012 -10.481 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_47.txt deleted file mode 100644 index 1124246b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_27_47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28660 ,TETRA ,17600375,Sun Nov 28 10:35:55 CET,Sun Nov 28 12:22:12 CET,0.0 1.949 2.55 2.922 3.208 3.519 3.83 4.08 4.506 4.68 4.859 5.045 5.416 5.605 5.967 6.306 6.621 6.771 7.059 7.301 7.625 7.827 8.013 8.273 8.5 8.688 8.869 9.056 9.282 9.468 9.639 9.84 10.045 10.269 10.528 10.814 11.082 11.344 11.593 11.84 12.079 12.31 12.516 12.66 12.727 12.735 12.711 12.536 12.159 11.443 10.068 8.328 6.863 5.606 4.569 3.674 2.885 2.2 1.64 1.06 0.543 0.093 -0.339 -0.75 -1.127 -1.482 -1.865 -2.196 -2.482 -2.772 -3.054 -3.285 -3.544 -3.841 -4.056 -4.253 -4.466 -4.699 -4.938 -5.094 -5.252 -5.507 -5.69 -5.903 -6.014 -6.223 -6.431 -6.649 -6.759 -7.065 -7.087 -7.216 -7.348 -7.596 -7.741 -7.901 -8.073 -8.269 -8.468 -8.712 -9.761 -2 ,6486 ,TETRA ,17600376,Sun Nov 28 10:35:55 CET,Sun Nov 28 12:33:03 CET,0.0 1.923 2.279 2.585 2.825 3.007 3.165 3.306 3.559 3.684 3.795 3.806 4.1 4.226 4.464 4.685 4.892 4.999 5.198 5.368 5.614 5.77 5.903 6.095 6.282 6.441 6.591 6.737 6.911 7.086 7.258 7.457 7.662 7.844 8.031 8.226 8.384 8.536 8.679 8.836 9.0 9.176 9.353 9.474 9.554 9.578 9.512 9.326 8.938 8.245 6.919 5.204 3.793 2.614 1.603 0.674 -0.119 -0.799 -1.373 -1.946 -2.443 -2.873 -3.288 -3.691 -4.072 -4.41 -4.748 -5.039 -5.302 -5.589 -5.892 -6.158 -6.43 -6.684 -6.878 -7.087 -7.293 -7.498 -7.726 -7.899 -8.073 -8.335 -8.519 -8.718 -8.821 -9.005 -9.195 -9.398 -9.505 -9.828 -9.896 -10.032 -10.176 -10.461 -10.608 -10.789 -10.998 -11.236 -11.498 -11.835 -12.998 -3 ,17490 ,TETRA ,17600377,Sun Nov 28 10:35:57 CET,Sun Nov 28 12:32:47 CET,0.0 2.64 3.206 3.62 3.915 4.175 4.403 4.634 5.037 5.208 5.362 5.475 5.788 5.915 6.159 6.369 6.567 6.669 6.877 7.072 7.334 7.501 7.665 7.89 8.091 8.274 8.441 8.591 8.77 8.952 9.138 9.359 9.565 9.756 9.972 10.187 10.353 10.51 10.686 10.865 11.028 11.185 11.334 11.482 11.57 11.574 11.516 11.316 10.928 10.192 8.729 6.949 5.489 4.291 3.26 2.341 1.58 0.903 0.308 -0.263 -0.736 -1.169 -1.584 -1.971 -2.338 -2.682 -3.033 -3.341 -3.611 -3.881 -4.161 -4.392 -4.62 -4.86 -5.059 -5.256 -5.445 -5.644 -5.872 -6.031 -6.186 -6.431 -6.594 -6.773 -6.87 -7.052 -7.225 -7.415 -7.52 -7.839 -7.868 -7.973 -8.085 -8.344 -8.477 -8.618 -8.77 -8.93 -9.094 -9.321 -9.963 -4 ,12438 ,TETRA ,17600378,Sun Nov 28 10:35:59 CET,Sun Nov 28 12:33:54 CET,0.0 1.886 2.431 2.869 3.218 3.5 3.743 3.952 4.295 4.446 4.585 4.674 4.989 5.124 5.38 5.617 5.83 5.924 6.098 6.269 6.495 6.631 6.757 6.947 7.135 7.316 7.498 7.66 7.843 8.045 8.25 8.46 8.64 8.808 9.002 9.213 9.418 9.643 9.84 10.035 10.233 10.412 10.59 10.698 10.77 10.791 10.703 10.511 10.172 9.544 8.26 6.609 5.211 3.973 2.946 2.044 1.248 0.541 -0.051 -0.628 -1.118 -1.564 -1.991 -2.365 -2.703 -3.027 -3.371 -3.68 -3.954 -4.23 -4.525 -4.774 -5.016 -5.262 -5.452 -5.659 -5.893 -6.128 -6.378 -6.557 -6.738 -7.021 -7.217 -7.413 -7.512 -7.724 -7.956 -8.192 -8.305 -8.617 -8.639 -8.764 -8.895 -9.164 -9.306 -9.45 -9.616 -9.812 -10.032 -10.306 -10.985 -5 ,31232 ,TETRA ,17600379,Sun Nov 28 10:36:00 CET,Sun Nov 28 12:34:11 CET,0.0 2.697 3.285 3.691 4.016 4.279 4.492 4.708 5.077 5.238 5.393 5.483 5.803 5.934 6.141 6.335 6.532 6.622 6.788 6.938 7.147 7.274 7.39 7.574 7.746 7.894 8.025 8.148 8.335 8.539 8.72 8.913 9.082 9.244 9.416 9.592 9.759 9.91 10.086 10.278 10.444 10.621 10.776 10.866 10.969 11.062 11.051 10.894 10.508 9.795 8.506 6.837 5.433 4.233 3.208 2.288 1.499 0.817 0.232 -0.354 -0.86 -1.303 -1.73 -2.131 -2.502 -2.832 -3.163 -3.479 -3.761 -4.058 -4.364 -4.616 -4.884 -5.159 -5.373 -5.589 -5.813 -6.04 -6.276 -6.44 -6.602 -6.84 -7.008 -7.181 -7.27 -7.457 -7.652 -7.84 -7.936 -8.242 -8.27 -8.393 -8.519 -8.783 -8.924 -9.071 -9.238 -9.425 -9.63 -9.904 -10.395 -6 ,31398 ,TETRA ,17600380,Sun Nov 28 10:35:55 CET,Sun Nov 28 12:32:35 CET,0.0 1.159 1.6 1.901 2.144 2.366 2.574 2.769 3.14 3.314 3.454 3.505 3.824 3.946 4.171 4.388 4.587 4.68 4.858 5.035 5.284 5.427 5.568 5.781 5.974 6.15 6.319 6.483 6.673 6.819 6.959 7.113 7.252 7.398 7.56 7.717 7.843 7.969 8.097 8.212 8.314 8.415 8.553 8.661 8.687 8.665 8.619 8.451 8.087 7.42 6.068 4.358 2.921 1.672 0.602 -0.327 -1.113 -1.827 -2.425 -2.99 -3.476 -3.913 -4.314 -4.7 -5.082 -5.436 -5.82 -6.168 -6.442 -6.702 -6.995 -7.256 -7.53 -7.811 -8.023 -8.243 -8.46 -8.672 -8.892 -9.045 -9.203 -9.467 -9.664 -9.858 -9.951 -10.143 -10.349 -10.584 -10.712 -11.047 -11.098 -11.233 -11.38 -11.688 -11.85 -12.013 -12.175 -12.371 -12.609 -12.877 -13.465 -7 ,2918 ,TETRA ,17600381,Sun Nov 28 10:35:55 CET,Sun Nov 28 12:32:52 CET,0.0 1.623 2.063 2.34 2.583 2.79 2.967 3.141 3.424 3.529 3.655 3.746 4.057 4.169 4.407 4.637 4.835 4.936 5.134 5.309 5.538 5.681 5.829 6.045 6.243 6.43 6.6 6.749 6.937 7.109 7.261 7.451 7.647 7.824 8.004 8.195 8.365 8.54 8.705 8.836 8.951 9.092 9.265 9.436 9.607 9.702 9.74 9.719 9.538 8.998 7.782 6.104 4.625 3.327 2.22 1.274 0.461 -0.273 -0.904 -1.536 -2.081 -2.563 -3.0 -3.385 -3.739 -4.067 -4.419 -4.737 -5.016 -5.319 -5.627 -5.882 -6.144 -6.413 -6.621 -6.835 -7.05 -7.268 -7.496 -7.646 -7.802 -8.061 -8.233 -8.414 -8.507 -8.689 -8.88 -9.086 -9.192 -9.502 -9.54 -9.664 -9.801 -10.078 -10.226 -10.401 -10.57 -10.736 -10.91 -11.121 -12.065 -8 ,13036 ,TETRA ,17600382,Sun Nov 28 10:35:57 CET,Sun Nov 28 12:34:53 CET,0.0 2.348 2.891 3.293 3.67 3.98 4.221 4.444 4.838 4.998 5.14 5.214 5.527 5.664 5.916 6.136 6.316 6.396 6.567 6.743 6.988 7.143 7.285 7.487 7.676 7.851 8.028 8.209 8.438 8.641 8.82 9.047 9.257 9.424 9.589 9.786 9.981 10.163 10.331 10.492 10.643 10.812 11.017 11.159 11.263 11.364 11.393 11.265 10.931 10.28 8.915 7.1 5.562 4.252 3.171 2.201 1.373 0.635 0.008 -0.606 -1.121 -1.566 -2.003 -2.4 -2.755 -3.081 -3.415 -3.715 -3.984 -4.276 -4.587 -4.837 -5.086 -5.349 -5.56 -5.781 -5.998 -6.211 -6.417 -6.552 -6.699 -6.939 -7.099 -7.276 -7.37 -7.552 -7.752 -7.977 -8.091 -8.393 -8.412 -8.535 -8.662 -8.941 -9.095 -9.259 -9.435 -9.633 -9.842 -10.116 -10.756 -9 ,27297 ,TETRA ,17600383,Sun Nov 28 10:35:59 CET,Sun Nov 28 12:34:44 CET,0.0 2.468 3.072 3.514 3.849 4.145 4.411 4.655 5.066 5.23 5.406 5.586 5.923 6.05 6.287 6.558 6.836 6.95 7.128 7.299 7.549 7.707 7.856 8.062 8.244 8.407 8.56 8.714 8.898 9.062 9.215 9.405 9.58 9.74 9.922 10.111 10.285 10.46 10.631 10.796 10.942 11.094 11.251 11.371 11.462 11.5 11.45 11.31 10.988 10.268 8.859 7.068 5.6 4.306 3.207 2.259 1.458 0.744 0.115 -0.496 -1.018 -1.471 -1.901 -2.298 -2.647 -2.97 -3.317 -3.617 -3.871 -4.142 -4.428 -4.654 -4.881 -5.122 -5.301 -5.485 -5.672 -5.861 -6.067 -6.204 -6.345 -6.576 -6.769 -6.96 -7.045 -7.224 -7.403 -7.589 -7.683 -7.988 -7.978 -8.086 -8.208 -8.462 -8.589 -8.717 -8.884 -9.084 -9.292 -9.548 -10.345 -10 ,26668 ,TETRA ,17600384,Sun Nov 28 10:35:56 CET,Sun Nov 28 12:26:14 CET,0.0 1.623 2.007 2.269 2.486 2.703 2.884 3.016 3.269 3.385 3.496 3.531 3.817 3.91 4.073 4.207 4.342 4.413 4.531 4.636 4.797 4.907 5.014 5.164 5.308 5.439 5.562 5.68 5.828 5.984 6.127 6.283 6.424 6.547 6.688 6.845 6.992 7.147 7.291 7.416 7.542 7.689 7.848 7.968 8.038 8.051 8.028 7.895 7.561 6.919 5.643 3.99 2.563 1.318 0.226 -0.718 -1.519 -2.262 -2.893 -3.476 -3.971 -4.422 -4.856 -5.268 -5.643 -5.993 -6.366 -6.706 -7.005 -7.292 -7.575 -7.821 -8.074 -8.318 -8.503 -8.699 -8.906 -9.113 -9.321 -9.465 -9.608 -9.832 -9.987 -10.146 -10.231 -10.426 -10.631 -10.866 -10.989 -11.289 -11.309 -11.434 -11.568 -11.847 -12.001 -12.155 -12.339 -12.583 -12.829 -13.138 -13.721 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_29.txt deleted file mode 100644 index a0710e1d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_29.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26208 ,TETRA ,17600385,Sun Nov 28 10:35:58 CET,Sun Nov 28 12:23:35 CET,0.0 1.677 2.312 2.712 3.028 3.319 3.575 3.786 4.18 4.365 4.547 4.653 4.974 5.091 5.323 5.541 5.743 5.847 6.048 6.254 6.548 6.74 6.933 7.2 7.46 7.69 7.868 8.048 8.298 8.52 8.717 8.956 9.174 9.39 9.664 9.972 10.272 10.571 10.855 11.159 11.477 11.805 12.138 12.38 12.594 12.837 13.114 13.385 13.572 13.56 13.099 12.081 11.043 10.131 9.294 8.513 7.838 7.217 6.657 6.091 5.598 5.15 4.704 4.285 3.9 3.54 3.178 2.849 2.568 2.29 1.996 1.743 1.476 1.197 0.988 0.774 0.569 0.368 0.134 -0.058 -0.269 -0.606 -0.841 -1.088 -1.215 -1.466 -1.734 -2.03 -2.184 -2.531 -2.655 -2.843 -3.039 -3.533 -3.815 -4.075 -4.36 -4.717 -5.203 -5.877 -8.81 -2 ,11500 ,TETRA ,17600386,Sun Nov 28 10:35:56 CET,Sun Nov 28 12:26:17 CET,0.0 6.022 6.871 7.406 7.852 8.26 8.548 8.775 9.154 9.35 9.556 9.73 10.068 10.225 10.517 10.796 11.065 11.188 11.417 11.615 11.889 12.085 12.279 12.556 12.794 13.002 13.189 13.362 13.607 13.829 14.022 14.265 14.525 14.774 15.025 15.289 15.545 15.807 16.083 16.338 16.602 16.916 17.237 17.527 17.781 17.969 18.092 18.136 18.171 17.973 17.174 15.97 14.929 14.006 13.143 12.32 11.588 10.918 10.341 9.749 9.2 8.703 8.239 7.803 7.399 7.028 6.643 6.316 6.024 5.716 5.403 5.14 4.851 4.542 4.3 4.056 3.829 3.604 3.359 3.173 2.966 2.663 2.461 2.258 2.15 1.916 1.677 1.415 1.288 0.984 0.91 0.772 0.64 0.327 0.137 -0.084 -0.324 -0.566 -0.893 -1.312 -3.928 -3 ,2255 ,TETRA ,17600387,Sun Nov 28 10:35:58 CET,Sun Nov 28 12:23:27 CET,0.0 4.269 5.067 5.53 5.884 6.185 6.428 6.654 7.111 7.331 7.522 7.682 8.042 8.2 8.483 8.735 8.943 9.038 9.223 9.396 9.623 9.765 9.916 10.151 10.375 10.591 10.796 10.992 11.251 11.482 11.69 11.955 12.193 12.402 12.65 12.927 13.166 13.392 13.647 13.923 14.191 14.482 14.804 15.1 15.434 15.78 16.032 16.172 16.262 16.157 15.459 14.302 13.256 12.264 11.361 10.536 9.824 9.173 8.587 7.988 7.462 6.991 6.543 6.119 5.733 5.371 4.971 4.613 4.318 4.001 3.67 3.41 3.13 2.812 2.557 2.305 2.051 1.772 1.475 1.279 1.086 0.78 0.556 0.328 0.214 -0.028 -0.303 -0.591 -0.731 -1.043 -1.162 -1.342 -1.526 -1.952 -2.193 -2.451 -2.762 -3.129 -3.53 -4.022 -6.626 -5 ,32654 ,TETRA ,17600389,Sun Nov 28 10:35:57 CET,Sun Nov 28 12:34:59 CET,0.0 8.112 8.929 9.461 9.833 10.154 10.407 10.625 11.018 11.194 11.356 11.454 11.783 11.92 12.17 12.405 12.626 12.742 12.961 13.139 13.373 13.516 13.659 13.879 14.117 14.345 14.551 14.747 14.989 15.204 15.386 15.612 15.846 16.058 16.299 16.583 16.838 17.114 17.406 17.676 17.941 18.225 18.509 18.734 18.963 19.194 19.417 19.583 19.647 19.484 18.762 17.572 16.465 15.442 14.506 13.659 12.92 12.252 11.67 11.079 10.556 10.088 9.647 9.216 8.82 8.464 8.076 7.72 7.403 7.083 6.776 6.522 6.249 5.945 5.716 5.493 5.248 4.988 4.724 4.532 4.333 4.008 3.783 3.563 3.452 3.234 2.998 2.737 2.609 2.281 2.188 2.031 1.862 1.493 1.287 1.054 0.772 0.439 0.033 -0.449 -4.98 -6 ,23303 ,TETRA ,17600390,Sun Nov 28 10:35:57 CET,Sun Nov 28 12:33:55 CET,0.0 2.144 2.699 3.043 3.336 3.591 3.83 4.05 4.408 4.569 4.729 4.843 5.156 5.274 5.511 5.743 5.959 6.058 6.258 6.445 6.702 6.868 7.025 7.235 7.427 7.601 7.769 7.938 8.155 8.378 8.599 8.842 9.08 9.336 9.638 9.952 10.227 10.51 10.778 11.017 11.258 11.547 11.872 12.141 12.385 12.611 12.847 13.025 13.12 12.966 12.242 11.08 9.927 8.897 7.985 7.096 6.32 5.654 5.071 4.468 3.951 3.503 3.081 2.686 2.319 1.961 1.563 1.203 0.9 0.58 0.218 -0.087 -0.386 -0.692 -0.925 -1.154 -1.398 -1.66 -1.924 -2.111 -2.306 -2.609 -2.807 -3.006 -3.12 -3.368 -3.615 -3.876 -4.023 -4.361 -4.477 -4.629 -4.789 -5.152 -5.372 -5.612 -5.871 -6.175 -6.525 -7.004 -9.402 -8 ,7264 ,TETRA ,17600392,Sun Nov 28 10:36:00 CET,Sun Nov 28 12:34:08 CET,0.0 2.373 2.864 3.195 3.46 3.692 3.93 4.165 4.566 4.723 4.881 5.017 5.32 5.434 5.67 5.913 6.131 6.243 6.466 6.652 6.902 7.064 7.21 7.417 7.662 7.906 8.116 8.307 8.55 8.775 9.003 9.304 9.55 9.757 10.011 10.341 10.678 10.952 11.174 11.413 11.664 11.953 12.276 12.55 12.854 13.138 13.357 13.561 13.782 13.807 13.157 11.996 10.836 9.744 8.817 8.0 7.261 6.608 6.07 5.56 5.114 4.708 4.321 3.94 3.584 3.267 2.94 2.651 2.395 2.091 1.765 1.515 1.25 0.962 0.745 0.53 0.294 0.037 -0.223 -0.414 -0.617 -0.91 -1.106 -1.325 -1.441 -1.69 -1.953 -2.211 -2.346 -2.686 -2.784 -2.95 -3.114 -3.456 -3.638 -3.864 -4.162 -4.513 -4.967 -5.535 -7.747 -9 ,4579 ,TETRA ,17600393,Sun Nov 28 10:36:03 CET,Sun Nov 28 12:33:56 CET,0.0 1.309 1.899 2.295 2.6 2.864 3.095 3.3 3.692 3.878 4.044 4.164 4.475 4.591 4.827 5.047 5.253 5.352 5.539 5.727 6.004 6.173 6.333 6.571 6.804 7.019 7.222 7.41 7.65 7.881 8.105 8.39 8.675 8.939 9.213 9.497 9.758 10.041 10.329 10.611 10.858 11.128 11.494 11.806 12.1 12.368 12.567 12.746 12.863 12.746 12.146 11.159 10.149 9.163 8.286 7.475 6.756 6.117 5.542 4.946 4.447 3.99 3.552 3.146 2.752 2.389 2.013 1.678 1.398 1.102 0.794 0.546 0.275 -0.013 -0.237 -0.477 -0.717 -0.949 -1.198 -1.385 -1.577 -1.89 -2.108 -2.336 -2.452 -2.692 -2.949 -3.223 -3.376 -3.73 -3.838 -3.991 -4.138 -4.467 -4.645 -4.825 -5.016 -5.229 -5.521 -5.938 -10.133 -10 ,23985 ,TETRA ,17600394,Sun Nov 28 10:35:57 CET,Sun Nov 28 12:34:58 CET,0.0 2.143 2.632 2.969 3.235 3.5 3.729 3.914 4.263 4.431 4.587 4.681 4.984 5.101 5.317 5.517 5.73 5.838 6.046 6.259 6.556 6.724 6.876 7.105 7.343 7.566 7.765 7.953 8.199 8.435 8.642 8.889 9.116 9.328 9.585 9.871 10.145 10.446 10.713 10.951 11.217 11.501 11.783 12.031 12.318 12.617 12.862 12.966 12.939 12.784 12.113 11.017 9.936 8.894 8.048 7.335 6.654 6.024 5.496 4.962 4.506 4.105 3.722 3.326 2.939 2.59 2.195 1.835 1.551 1.244 0.902 0.604 0.28 -0.036 -0.254 -0.471 -0.702 -0.942 -1.207 -1.4 -1.607 -1.939 -2.171 -2.395 -2.503 -2.742 -3.012 -3.31 -3.467 -3.828 -3.951 -4.111 -4.285 -4.697 -4.935 -5.196 -5.478 -5.773 -6.093 -6.524 -9.487 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_42.txt deleted file mode 100644 index 54fcfb55..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11813 ,TETRA ,17600395,Sun Nov 28 10:35:59 CET,Sun Nov 28 12:35:45 CET,0.0 0.602 0.955 1.261 1.498 1.692 1.859 2.033 2.36 2.497 2.64 2.742 3.059 3.166 3.347 3.508 3.68 3.765 3.915 4.062 4.273 4.412 4.534 4.704 4.873 5.032 5.184 5.336 5.525 5.704 5.888 6.111 6.319 6.516 6.748 6.992 7.226 7.492 7.755 8.015 8.297 8.635 9.03 9.416 9.842 10.282 10.746 11.244 11.737 12.139 12.408 12.279 11.964 11.609 11.218 10.815 10.44 10.05 9.698 9.352 9.032 8.742 8.456 8.182 7.933 7.696 7.443 7.21 6.998 6.786 6.57 6.39 6.198 5.991 5.83 5.658 5.483 5.308 5.129 5.002 4.87 4.658 4.507 4.362 4.285 4.119 3.935 3.726 3.607 3.311 3.26 3.13 2.995 2.71 2.558 2.391 2.204 1.995 1.746 1.44 0.541 -2 ,25830 ,TETRA ,17600396,Sun Nov 28 10:35:57 CET,Sun Nov 28 12:35:12 CET,0.0 0.77 1.088 1.314 1.511 1.69 1.858 2.025 2.335 2.458 2.561 2.598 2.885 2.984 3.185 3.385 3.561 3.643 3.811 3.975 4.198 4.331 4.457 4.635 4.805 4.971 5.132 5.299 5.526 5.737 5.935 6.16 6.369 6.582 6.825 7.091 7.347 7.612 7.902 8.219 8.547 8.918 9.334 9.745 10.198 10.651 11.176 11.699 12.177 12.621 12.891 12.779 12.485 12.101 11.662 11.211 10.795 10.411 10.074 9.737 9.406 9.093 8.79 8.502 8.24 7.99 7.733 7.505 7.304 7.092 6.867 6.693 6.527 6.34 6.194 6.032 5.859 5.695 5.515 5.388 5.261 5.053 4.905 4.751 4.672 4.503 4.324 4.135 4.026 3.715 3.594 3.435 3.275 2.961 2.79 2.596 2.381 2.143 1.881 1.537 0.702 -3 ,29057 ,TETRA ,17600397,Sun Nov 28 10:35:58 CET,Sun Nov 28 12:35:07 CET,0.0 0.729 1.039 1.269 1.459 1.627 1.8 1.954 2.225 2.344 2.45 2.5 2.791 2.897 3.107 3.305 3.476 3.556 3.707 3.862 4.073 4.203 4.336 4.527 4.705 4.879 5.05 5.21 5.418 5.619 5.807 6.04 6.273 6.491 6.733 6.999 7.244 7.514 7.814 8.132 8.455 8.796 9.171 9.537 9.967 10.443 10.908 11.359 11.856 12.34 12.703 12.677 12.407 12.104 11.789 11.463 11.127 10.808 10.486 10.055 9.684 9.389 9.104 8.828 8.576 8.354 8.115 7.899 7.705 7.503 7.289 7.107 6.928 6.74 6.593 6.435 6.26 6.086 5.902 5.77 5.633 5.416 5.274 5.136 5.06 4.889 4.713 4.525 4.427 4.156 4.137 4.03 3.907 3.636 3.503 3.35 3.187 3.015 2.81 2.547 1.987 -4 ,31489 ,TETRA ,17600398,Sun Nov 28 10:36:00 CET,Sun Nov 28 12:33:56 CET,0.0 0.838 1.206 1.449 1.645 1.838 2.011 2.164 2.423 2.56 2.708 2.783 3.072 3.177 3.374 3.557 3.724 3.801 3.947 4.086 4.292 4.418 4.539 4.737 4.938 5.117 5.275 5.432 5.638 5.838 6.028 6.24 6.431 6.62 6.865 7.131 7.359 7.606 7.872 8.152 8.437 8.756 9.133 9.487 9.901 10.371 10.86 11.35 11.849 12.348 12.661 12.585 12.296 11.867 11.424 11.001 10.577 10.168 9.798 9.404 9.063 8.767 8.485 8.192 7.903 7.645 7.37 7.113 6.893 6.652 6.378 6.167 5.955 5.723 5.551 5.371 5.183 4.994 4.806 4.676 4.533 4.314 4.157 3.997 3.917 3.742 3.543 3.348 3.249 2.965 2.912 2.797 2.69 2.438 2.292 2.127 1.939 1.736 1.499 1.227 0.504 -5 ,25831 ,TETRA ,17600399,Sun Nov 28 10:36:02 CET,Sun Nov 28 12:33:56 CET,0.0 0.892 1.262 1.501 1.699 1.893 2.078 2.225 2.459 2.572 2.682 2.701 2.981 3.065 3.235 3.408 3.569 3.643 3.776 3.904 4.101 4.237 4.374 4.557 4.722 4.882 5.037 5.182 5.37 5.555 5.737 5.956 6.15 6.33 6.531 6.767 6.996 7.248 7.532 7.797 8.052 8.349 8.685 9.027 9.424 9.842 10.274 10.702 11.154 11.632 11.986 11.929 11.647 11.244 10.844 10.462 10.1 9.718 9.325 8.928 8.593 8.29 7.995 7.671 7.351 7.083 6.828 6.604 6.405 6.202 5.994 5.828 5.657 5.474 5.338 5.187 5.021 4.847 4.657 4.511 4.352 4.114 3.946 3.767 3.671 3.465 3.257 3.025 2.895 2.587 2.5 2.36 2.201 1.841 1.66 1.489 1.3 1.112 0.911 0.615 -0.415 -6 ,3995 ,TETRA ,17600400,Sun Nov 28 10:35:58 CET,Sun Nov 28 12:33:53 CET,0.0 0.757 1.074 1.302 1.488 1.647 1.797 1.925 2.176 2.296 2.401 2.411 2.681 2.762 2.908 3.059 3.226 3.308 3.457 3.594 3.796 3.917 4.032 4.21 4.388 4.559 4.718 4.866 5.061 5.252 5.422 5.633 5.854 6.072 6.32 6.594 6.857 7.147 7.448 7.74 8.048 8.402 8.803 9.184 9.618 10.076 10.576 11.123 11.674 12.156 12.477 12.438 12.143 11.739 11.347 10.964 10.592 10.247 9.926 9.568 9.256 8.971 8.677 8.387 8.104 7.845 7.581 7.361 7.167 6.944 6.713 6.518 6.318 6.102 5.92 5.743 5.577 5.403 5.213 5.079 4.946 4.735 4.577 4.412 4.331 4.17 4.002 3.814 3.711 3.417 3.339 3.183 3.025 2.699 2.514 2.303 2.063 1.79 1.458 1.066 0.238 -7 ,110 ,TETRA ,17600401,Sun Nov 28 10:36:00 CET,Sun Nov 28 12:30:34 CET,0.0 0.76 1.174 1.498 1.72 1.902 2.082 2.251 2.539 2.669 2.792 2.843 3.142 3.251 3.444 3.626 3.802 3.883 4.03 4.175 4.38 4.509 4.635 4.818 4.986 5.133 5.279 5.429 5.616 5.785 5.967 6.201 6.416 6.628 6.874 7.127 7.359 7.631 7.916 8.186 8.471 8.771 9.118 9.49 9.916 10.367 10.838 11.309 11.811 12.31 12.623 12.525 12.21 11.781 11.323 10.867 10.442 10.041 9.68 9.312 8.977 8.669 8.372 8.071 7.8 7.575 7.343 7.122 6.931 6.729 6.508 6.302 6.059 5.805 5.61 5.413 5.2 4.97 4.74 4.583 4.415 4.147 3.959 3.773 3.675 3.454 3.225 2.995 2.873 2.561 2.476 2.337 2.196 1.902 1.743 1.57 1.361 1.143 0.906 0.588 -0.181 -8 ,11326 ,TETRA ,17600402,Sun Nov 28 10:36:02 CET,Sun Nov 28 12:35:22 CET,0.0 1.153 1.509 1.756 1.963 2.162 2.329 2.462 2.704 2.815 2.933 2.993 3.294 3.411 3.61 3.82 4.022 4.112 4.28 4.441 4.677 4.814 4.942 5.137 5.333 5.535 5.749 5.948 6.183 6.405 6.628 6.899 7.15 7.385 7.649 7.927 8.176 8.437 8.727 9.044 9.382 9.774 10.25 10.717 11.2 11.684 12.206 12.782 13.437 14.076 14.552 14.555 14.338 14.009 13.611 13.193 12.78 12.363 11.971 11.583 11.225 10.887 10.566 10.249 9.968 9.729 9.48 9.252 9.053 8.838 8.602 8.404 8.197 7.977 7.808 7.633 7.455 7.28 7.084 6.94 6.786 6.538 6.37 6.203 6.118 5.921 5.71 5.493 5.372 5.066 4.948 4.8 4.645 4.29 4.086 3.877 3.667 3.449 3.195 2.768 1.657 -9 ,3669 ,TETRA ,17600403,Sun Nov 28 10:36:05 CET,Sun Nov 28 12:35:42 CET,0.0 0.932 1.272 1.521 1.735 1.931 2.108 2.276 2.563 2.687 2.793 2.812 3.105 3.214 3.427 3.636 3.818 3.897 4.052 4.193 4.394 4.532 4.677 4.889 5.071 5.24 5.41 5.578 5.787 5.985 6.16 6.344 6.535 6.732 6.954 7.212 7.469 7.742 8.021 8.306 8.592 8.889 9.215 9.548 9.948 10.388 10.866 11.349 11.891 12.426 12.807 12.819 12.621 12.299 11.905 11.48 11.056 10.659 10.297 9.887 9.537 9.225 8.922 8.631 8.345 8.081 7.802 7.548 7.327 7.096 6.847 6.627 6.386 6.127 5.931 5.749 5.565 5.368 5.162 5.015 4.868 4.647 4.478 4.305 4.219 4.015 3.815 3.629 3.536 3.266 3.24 3.129 3.008 2.713 2.555 2.4 2.233 2.045 1.821 1.559 0.869 -10 ,6243 ,TETRA ,17600404,Sun Nov 28 10:36:03 CET,Sun Nov 28 12:35:26 CET,0.0 0.707 0.946 1.137 1.32 1.493 1.649 1.803 2.075 2.198 2.311 2.343 2.623 2.719 2.891 3.053 3.219 3.299 3.45 3.586 3.772 3.899 4.024 4.201 4.382 4.55 4.699 4.849 5.052 5.246 5.434 5.659 5.85 6.021 6.208 6.422 6.644 6.891 7.144 7.393 7.661 7.985 8.343 8.669 9.048 9.478 9.92 10.358 10.86 11.321 11.568 11.465 11.189 10.834 10.419 9.982 9.55 9.154 8.818 8.431 8.061 7.718 7.39 7.097 6.814 6.559 6.311 6.08 5.87 5.645 5.389 5.167 4.947 4.716 4.538 4.351 4.157 3.955 3.735 3.587 3.439 3.204 3.038 2.86 2.768 2.589 2.414 2.238 2.143 1.869 1.848 1.744 1.623 1.357 1.217 1.024 0.791 0.538 0.242 -0.108 -0.803 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_44.txt deleted file mode 100644 index 9b3853f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27525 ,TETRA ,17600405,Sun Nov 28 10:36:04 CET,Sun Nov 28 12:34:58 CET,0.0 1.643 2.09 2.469 2.764 2.96 3.15 3.356 3.716 3.881 4.053 4.191 4.51 4.642 4.913 5.164 5.385 5.494 5.715 5.912 6.186 6.368 6.547 6.811 7.063 7.287 7.492 7.69 7.947 8.184 8.397 8.668 8.94 9.196 9.487 9.794 10.066 10.366 10.672 10.988 11.325 11.664 12.052 12.458 12.899 13.349 13.832 14.356 14.934 15.476 15.834 15.755 15.414 15.001 14.602 14.16 13.719 13.319 12.986 12.667 12.381 12.102 11.836 11.575 11.309 11.07 10.804 10.55 10.325 10.096 9.871 9.695 9.518 9.311 9.133 8.946 8.753 8.549 8.347 8.207 8.053 7.805 7.643 7.484 7.401 7.228 7.043 6.861 6.758 6.465 6.43 6.319 6.191 5.941 5.816 5.693 5.566 5.416 5.231 5.021 4.181 -2 ,14486 ,TETRA ,17600406,Sun Nov 28 10:36:15 CET,Sun Nov 28 12:40:01 CET,0.0 1.296 1.687 2.019 2.282 2.497 2.692 2.867 3.163 3.294 3.419 3.489 3.785 3.902 4.129 4.358 4.62 4.746 4.957 5.157 5.453 5.632 5.803 6.024 6.223 6.425 6.611 6.796 7.043 7.269 7.484 7.742 7.965 8.177 8.421 8.677 8.939 9.242 9.571 9.93 10.316 10.747 11.203 11.638 12.106 12.581 13.101 13.606 14.106 14.567 14.927 14.851 14.49 13.993 13.526 13.109 12.669 12.224 11.84 11.443 11.085 10.772 10.486 10.208 9.92 9.654 9.389 9.152 8.951 8.736 8.505 8.316 8.116 7.91 7.749 7.571 7.382 7.185 6.988 6.863 6.726 6.492 6.322 6.129 6.028 5.833 5.643 5.445 5.325 5.014 4.912 4.768 4.641 4.373 4.237 4.096 3.927 3.726 3.473 3.188 2.256 -3 ,6181 ,TETRA ,17600407,Sun Nov 28 10:36:13 CET,Sun Nov 28 12:40:21 CET,0.0 1.346 1.782 2.116 2.362 2.588 2.799 2.993 3.334 3.486 3.642 3.746 4.062 4.18 4.413 4.646 4.869 4.98 5.172 5.348 5.605 5.758 5.904 6.125 6.339 6.544 6.743 6.933 7.172 7.397 7.617 7.874 8.12 8.372 8.662 8.977 9.282 9.614 9.964 10.333 10.712 11.106 11.527 11.92 12.342 12.8 13.319 13.833 14.316 14.787 15.147 15.076 14.761 14.324 13.872 13.416 12.982 12.583 12.232 11.846 11.483 11.159 10.835 10.524 10.211 9.921 9.62 9.342 9.109 8.864 8.628 8.446 8.261 8.064 7.908 7.758 7.593 7.399 7.214 7.096 6.965 6.748 6.598 6.447 6.364 6.182 5.998 5.814 5.716 5.439 5.388 5.255 5.118 4.83 4.652 4.429 4.157 3.84 3.468 2.972 1.641 -4 ,7687 ,TETRA ,17600408,Sun Nov 28 10:36:17 CET,Sun Nov 28 12:36:37 CET,0.0 1.588 1.974 2.291 2.555 2.832 3.114 3.347 3.761 3.939 4.092 4.162 4.467 4.58 4.79 4.989 5.183 5.282 5.462 5.61 5.833 5.978 6.114 6.316 6.511 6.689 6.86 7.034 7.248 7.446 7.635 7.896 8.171 8.418 8.686 8.971 9.228 9.512 9.831 10.146 10.454 10.809 11.202 11.574 12.043 12.57 13.116 13.678 14.287 14.875 15.297 15.23 14.854 14.414 13.927 13.44 13.003 12.588 12.203 11.798 11.461 11.154 10.828 10.493 10.162 9.867 9.59 9.341 9.115 8.883 8.639 8.413 8.153 7.893 7.712 7.534 7.36 7.179 6.964 6.797 6.629 6.361 6.178 6.003 5.911 5.727 5.549 5.346 5.223 4.909 4.831 4.708 4.577 4.253 4.076 3.889 3.656 3.401 3.106 2.731 1.809 -5 ,7596 ,TETRA ,17600409,Sun Nov 28 10:36:19 CET,Sun Nov 28 12:35:39 CET,0.0 1.088 1.536 1.873 2.166 2.416 2.649 2.835 3.152 3.295 3.427 3.509 3.832 3.972 4.246 4.479 4.692 4.798 5.004 5.213 5.514 5.688 5.846 6.072 6.285 6.5 6.719 6.921 7.161 7.385 7.606 7.874 8.13 8.384 8.682 9.005 9.288 9.576 9.874 10.181 10.525 10.915 11.327 11.71 12.123 12.586 13.083 13.559 14.068 14.632 15.125 15.073 14.718 14.239 13.737 13.27 12.833 12.389 11.948 11.476 11.048 10.662 10.295 9.935 9.605 9.3 8.965 8.668 8.406 8.134 7.892 7.715 7.533 7.337 7.184 7.025 6.855 6.67 6.479 6.347 6.206 6.002 5.858 5.692 5.606 5.433 5.253 5.074 4.987 4.717 4.695 4.569 4.445 4.188 4.026 3.86 3.7 3.516 3.325 3.034 2.168 -6 ,17895 ,TETRA ,17600410,Sun Nov 28 10:36:13 CET,Sun Nov 28 12:35:48 CET,0.0 1.316 1.662 1.946 2.216 2.456 2.65 2.836 3.192 3.349 3.508 3.62 3.945 4.08 4.292 4.473 4.672 4.775 4.962 5.142 5.405 5.575 5.738 5.956 6.159 6.349 6.546 6.736 6.959 7.189 7.408 7.656 7.899 8.133 8.403 8.709 9.011 9.332 9.68 10.071 10.438 10.807 11.217 11.601 12.008 12.445 12.953 13.516 14.08 14.524 14.847 14.81 14.536 14.139 13.722 13.302 12.874 12.48 12.137 11.797 11.496 11.21 10.888 10.547 10.265 10.017 9.732 9.507 9.326 9.122 8.912 8.73 8.538 8.332 8.169 8.007 7.842 7.668 7.481 7.35 7.214 7.005 6.866 6.725 6.647 6.486 6.318 6.143 6.054 5.776 5.741 5.624 5.5 5.224 5.081 4.919 4.735 4.541 4.328 4.063 3.238 -7 ,11040 ,TETRA ,17600411,Sun Nov 28 10:36:14 CET,Sun Nov 28 12:35:14 CET,0.0 2.112 2.447 2.683 2.928 3.148 3.353 3.553 3.89 4.039 4.199 4.314 4.644 4.775 5.026 5.282 5.52 5.63 5.848 6.07 6.361 6.539 6.71 6.945 7.179 7.409 7.635 7.853 8.113 8.364 8.607 8.885 9.164 9.437 9.731 10.061 10.39 10.74 11.11 11.509 11.905 12.339 12.849 13.349 13.916 14.498 15.149 15.828 16.51 17.223 17.809 17.986 17.886 17.583 17.213 16.826 16.445 16.083 15.728 15.341 15.0 14.688 14.388 14.083 13.793 13.557 13.303 13.057 12.851 12.63 12.388 12.189 11.991 11.781 11.602 11.425 11.246 11.046 10.845 10.703 10.548 10.31 10.147 9.967 9.87 9.687 9.513 9.324 9.224 8.937 8.895 8.78 8.643 8.335 8.181 8.016 7.832 7.619 7.363 7.015 6.008 -8 ,14052 ,TETRA ,17600412,Sun Nov 28 10:36:15 CET,Sun Nov 28 12:34:31 CET,0.0 1.062 1.386 1.665 1.9 2.087 2.277 2.465 2.803 2.943 3.076 3.158 3.47 3.607 3.876 4.11 4.334 4.449 4.669 4.861 5.127 5.301 5.467 5.694 5.893 6.072 6.241 6.402 6.626 6.861 7.086 7.341 7.577 7.81 8.069 8.348 8.61 8.882 9.175 9.495 9.802 10.131 10.508 10.872 11.289 11.72 12.195 12.713 13.255 13.75 14.027 13.915 13.672 13.296 12.849 12.418 12.014 11.596 11.217 10.833 10.489 10.174 9.868 9.582 9.327 9.108 8.88 8.661 8.448 8.221 7.987 7.79 7.565 7.317 7.137 6.965 6.783 6.584 6.355 6.187 6.016 5.742 5.543 5.341 5.242 5.043 4.834 4.615 4.501 4.197 4.116 3.979 3.821 3.483 3.295 3.095 2.876 2.619 2.337 1.963 0.834 -9 ,154 ,TETRA ,17600413,Sun Nov 28 10:36:17 CET,Sun Nov 28 12:33:57 CET,0.0 0.87 1.294 1.603 1.882 2.141 2.344 2.555 2.993 3.186 3.327 3.395 3.698 3.816 4.046 4.245 4.422 4.518 4.717 4.91 5.172 5.334 5.484 5.695 5.907 6.109 6.298 6.475 6.695 6.914 7.129 7.384 7.625 7.848 8.133 8.474 8.78 9.103 9.425 9.722 10.026 10.38 10.775 11.133 11.575 12.053 12.529 13.061 13.632 14.136 14.382 14.269 13.95 13.496 13.022 12.564 12.111 11.686 11.312 10.869 10.475 10.142 9.822 9.519 9.25 9.007 8.743 8.507 8.296 8.077 7.856 7.666 7.466 7.25 7.076 6.905 6.737 6.559 6.367 6.219 6.053 5.798 5.617 5.423 5.325 5.114 4.881 4.647 4.525 4.212 4.094 3.939 3.789 3.454 3.276 3.088 2.866 2.623 2.347 1.987 0.986 -10 ,25319 ,TETRA ,17600414,Sun Nov 28 10:49:17 CET,Sun Nov 28 12:47:11 CET,0.0 0.745 1.102 1.441 1.695 1.92 2.155 2.358 2.707 2.874 3.047 3.167 3.481 3.611 3.835 4.046 4.266 4.373 4.577 4.768 5.027 5.192 5.352 5.566 5.775 5.991 6.19 6.386 6.659 6.923 7.167 7.443 7.699 7.941 8.227 8.568 8.882 9.2 9.549 9.937 10.354 10.848 11.381 11.861 12.399 13.001 13.669 14.301 14.971 15.622 16.057 15.97 15.58 15.167 14.789 14.399 14.002 13.62 13.263 12.894 12.581 12.3 12.035 11.765 11.487 11.2 10.912 10.679 10.47 10.251 10.025 9.838 9.638 9.427 9.262 9.089 8.9 8.7 8.486 8.336 8.19 7.949 7.771 7.596 7.5 7.295 7.101 6.894 6.78 6.493 6.449 6.326 6.186 5.856 5.693 5.514 5.321 5.139 4.911 4.585 3.669 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_45.txt deleted file mode 100644 index 084a3c55..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_45.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2712 ,TETRA ,17600415,Sun Nov 28 10:49:17 CET,Sun Nov 28 12:48:27 CET,0.0 1.336 1.819 2.17 2.458 2.696 2.916 3.127 3.486 3.634 3.762 3.851 4.164 4.284 4.511 4.72 4.919 5.014 5.192 5.356 5.579 5.726 5.863 6.062 6.262 6.444 6.62 6.787 7.003 7.232 7.459 7.709 7.942 8.175 8.435 8.732 9.029 9.318 9.637 10.013 10.372 10.726 11.136 11.56 12.003 12.444 12.891 13.336 13.823 14.236 14.444 14.224 13.797 13.357 12.959 12.548 12.11 11.664 11.256 10.832 10.444 10.089 9.75 9.44 9.155 8.875 8.57 8.273 7.997 7.72 7.436 7.205 6.969 6.733 6.569 6.396 6.205 6.001 5.794 5.653 5.501 5.244 5.065 4.889 4.794 4.594 4.388 4.163 4.047 3.751 3.717 3.605 3.479 3.169 3.009 2.838 2.641 2.412 2.113 1.67 0.495 -2 ,812 ,TETRA ,17600416,Sun Nov 28 10:49:20 CET,Sun Nov 28 12:47:54 CET,0.0 0.997 1.355 1.626 1.861 2.051 2.229 2.394 2.696 2.841 2.971 3.002 3.304 3.413 3.613 3.801 3.978 4.069 4.236 4.39 4.63 4.781 4.923 5.13 5.327 5.509 5.685 5.85 6.059 6.27 6.469 6.687 6.882 7.08 7.319 7.593 7.857 8.129 8.406 8.708 9.012 9.334 9.705 10.062 10.457 10.875 11.332 11.745 12.086 12.328 12.321 11.892 11.301 10.663 10.102 9.597 9.096 8.62 8.207 7.774 7.409 7.089 6.76 6.437 6.137 5.877 5.616 5.368 5.135 4.897 4.654 4.445 4.22 3.983 3.803 3.618 3.439 3.251 3.036 2.883 2.73 2.491 2.302 2.099 1.997 1.78 1.541 1.276 1.14 0.826 0.712 0.553 0.391 0.042 -0.144 -0.333 -0.542 -0.79 -1.089 -1.479 -2.828 -3 ,24958 ,TETRA ,17600417,Sun Nov 28 10:52:56 CET,Sun Nov 28 12:53:02 CET,0.0 1.924 2.481 2.861 3.151 3.391 3.582 3.754 4.092 4.249 4.384 4.441 4.751 4.878 5.127 5.37 5.596 5.699 5.901 6.077 6.316 6.489 6.672 6.92 7.138 7.355 7.555 7.735 7.968 8.198 8.434 8.719 8.974 9.205 9.465 9.748 10.004 10.285 10.58 10.864 11.153 11.467 11.822 12.144 12.501 12.905 13.305 13.688 14.111 14.49 14.551 14.183 13.759 13.28 12.773 12.277 11.809 11.353 10.948 10.53 10.144 9.791 9.457 9.136 8.824 8.541 8.246 7.98 7.749 7.471 7.164 6.912 6.656 6.418 6.239 6.054 5.85 5.626 5.397 5.246 5.095 4.864 4.7 4.511 4.415 4.216 3.998 3.776 3.66 3.359 3.314 3.207 3.09 2.812 2.642 2.435 2.193 1.914 1.589 1.182 -0.193 -4 ,18145 ,TETRA ,17600418,Sun Nov 28 11:40:15 CET,Sun Nov 28 13:38:50 CET,0.0 1.9 2.264 2.502 2.72 2.931 3.124 3.312 3.643 3.787 3.92 3.971 4.266 4.376 4.574 4.752 4.935 5.032 5.222 5.408 5.678 5.837 5.974 6.17 6.364 6.552 6.728 6.899 7.097 7.274 7.47 7.728 7.984 8.223 8.494 8.786 9.04 9.333 9.633 9.923 10.238 10.601 10.989 11.323 11.691 12.111 12.556 12.974 13.374 13.638 13.547 13.065 12.501 11.909 11.346 10.81 10.309 9.845 9.43 9.018 8.674 8.382 8.093 7.776 7.472 7.208 6.935 6.67 6.413 6.155 5.91 5.712 5.507 5.298 5.151 4.991 4.813 4.64 4.452 4.308 4.15 3.889 3.708 3.524 3.428 3.232 3.021 2.785 2.671 2.366 2.285 2.146 2.007 1.726 1.568 1.386 1.189 0.973 0.704 0.28 -1.104 -5 ,21710 ,TETRA ,17600419,Sun Nov 28 11:40:17 CET,Sun Nov 28 13:39:42 CET,0.0 1.603 1.99 2.286 2.521 2.764 2.99 3.174 3.513 3.675 3.824 3.917 4.233 4.357 4.585 4.801 4.999 5.096 5.289 5.471 5.744 5.941 6.138 6.388 6.619 6.841 7.03 7.21 7.444 7.669 7.897 8.158 8.39 8.606 8.858 9.129 9.396 9.703 10.016 10.313 10.635 11.01 11.428 11.845 12.265 12.7 13.139 13.567 14.003 14.315 14.308 13.832 13.25 12.657 12.051 11.465 10.937 10.451 10.012 9.559 9.18 8.846 8.525 8.223 7.922 7.615 7.294 7.02 6.791 6.544 6.28 6.063 5.845 5.634 5.473 5.302 5.119 4.93 4.732 4.594 4.456 4.232 4.075 3.91 3.827 3.657 3.47 3.269 3.16 2.864 2.822 2.701 2.569 2.294 2.134 1.951 1.759 1.56 1.323 1.005 0.237 -6 ,2610 ,TETRA ,17600420,Sun Nov 28 11:40:19 CET,Sun Nov 28 13:39:05 CET,0.0 1.405 1.81 2.053 2.28 2.491 2.671 2.842 3.149 3.302 3.447 3.53 3.842 3.964 4.208 4.445 4.68 4.788 4.982 5.166 5.418 5.586 5.757 5.993 6.219 6.425 6.615 6.801 7.028 7.239 7.441 7.686 7.92 8.129 8.365 8.642 8.907 9.191 9.492 9.795 10.115 10.457 10.826 11.17 11.525 11.913 12.297 12.621 12.898 13.123 13.267 13.148 12.729 12.176 11.646 11.087 10.538 10.022 9.586 9.105 8.62 8.226 7.897 7.593 7.3 7.014 6.723 6.465 6.24 5.978 5.676 5.43 5.176 4.908 4.697 4.477 4.252 4.014 3.757 3.576 3.387 3.092 2.893 2.694 2.592 2.356 2.105 1.852 1.713 1.384 1.303 1.168 1.013 0.682 0.499 0.295 0.073 -0.177 -0.466 -0.841 -2.174 -7 ,8702 ,TETRA ,17600421,Sun Nov 28 11:40:14 CET,Sun Nov 28 13:39:19 CET,0.0 1.389 1.756 2.043 2.334 2.629 2.87 3.044 3.349 3.487 3.619 3.699 3.99 4.097 4.312 4.503 4.678 4.768 4.951 5.112 5.329 5.481 5.635 5.848 6.041 6.225 6.416 6.598 6.803 7.01 7.218 7.456 7.685 7.897 8.14 8.425 8.699 9.027 9.376 9.706 9.993 10.289 10.635 10.966 11.367 11.821 12.26 12.641 13.004 13.288 13.293 12.851 12.264 11.689 11.152 10.628 10.135 9.656 9.233 8.804 8.422 8.071 7.734 7.413 7.113 6.835 6.512 6.204 5.919 5.626 5.348 5.113 4.851 4.562 4.338 4.115 3.879 3.626 3.378 3.211 3.04 2.774 2.577 2.373 2.269 2.06 1.858 1.652 1.541 1.23 1.169 1.039 0.897 0.566 0.384 0.185 -0.042 -0.287 -0.608 -1.035 -2.223 -8 ,14184 ,TETRA ,17600422,Sun Nov 28 11:40:18 CET,Sun Nov 28 13:39:55 CET,0.0 1.812 2.382 2.875 3.271 3.586 3.865 4.142 4.642 4.826 4.973 5.045 5.358 5.489 5.728 5.941 6.135 6.227 6.394 6.545 6.743 6.856 6.982 7.189 7.391 7.572 7.738 7.9 8.097 8.301 8.511 8.761 8.994 9.217 9.467 9.741 10.011 10.294 10.6 10.926 11.231 11.541 11.902 12.258 12.65 13.041 13.448 13.861 14.238 14.56 14.773 14.575 14.079 13.54 13.013 12.495 12.038 11.591 11.154 10.702 10.322 9.985 9.668 9.36 9.014 8.698 8.396 8.101 7.83 7.536 7.251 7.044 6.818 6.564 6.387 6.2 5.999 5.814 5.614 5.477 5.33 5.08 4.911 4.73 4.636 4.456 4.265 4.058 3.949 3.647 3.609 3.494 3.362 3.043 2.882 2.722 2.554 2.383 2.153 1.823 0.822 -9 ,23660 ,TETRA ,17600423,Sun Nov 28 11:40:15 CET,Sun Nov 28 13:39:44 CET,0.0 1.187 1.659 2.055 2.394 2.683 2.974 3.228 3.693 3.908 4.07 4.135 4.428 4.544 4.801 5.043 5.25 5.34 5.51 5.675 5.915 6.069 6.219 6.448 6.655 6.844 7.036 7.236 7.467 7.669 7.861 8.079 8.298 8.522 8.771 9.053 9.321 9.602 9.902 10.208 10.533 10.9 11.3 11.657 12.017 12.378 12.759 13.149 13.557 13.821 13.745 13.329 12.784 12.165 11.568 11.009 10.505 10.027 9.598 9.153 8.732 8.359 7.999 7.627 7.281 6.983 6.675 6.402 6.152 5.889 5.624 5.405 5.183 4.949 4.758 4.554 4.351 4.154 3.94 3.77 3.591 3.327 3.141 2.94 2.833 2.626 2.415 2.181 2.061 1.761 1.695 1.539 1.372 1.054 0.867 0.662 0.453 0.225 -0.058 -0.524 -2.321 -10 ,22009 ,TETRA ,17600424,Sun Nov 28 11:40:16 CET,Sun Nov 28 13:39:57 CET,0.0 1.797 2.227 2.553 2.831 3.053 3.239 3.402 3.725 3.885 4.037 4.15 4.465 4.599 4.835 5.044 5.263 5.375 5.588 5.78 6.05 6.221 6.372 6.573 6.757 6.922 7.083 7.238 7.429 7.632 7.836 8.075 8.308 8.539 8.803 9.091 9.349 9.609 9.881 10.159 10.446 10.777 11.189 11.565 11.928 12.328 12.781 13.269 13.732 14.08 14.261 14.001 13.555 13.114 12.641 12.164 11.742 11.335 10.966 10.561 10.178 9.829 9.485 9.163 8.85 8.55 8.246 7.982 7.757 7.526 7.284 7.087 6.868 6.614 6.42 6.225 6.029 5.811 5.573 5.414 5.251 5.015 4.859 4.687 4.597 4.399 4.17 3.935 3.817 3.504 3.438 3.289 3.135 2.792 2.601 2.41 2.194 1.967 1.693 1.343 0.398 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_48.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_48.txt deleted file mode 100644 index 1e760935..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_28_48.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24506 ,TETRA ,17600425,Sun Nov 28 11:40:15 CET,Sun Nov 28 13:37:24 CET,0.0 1.736 2.184 2.539 2.83 3.073 3.288 3.483 3.867 4.033 4.19 4.317 4.637 4.769 5.021 5.244 5.441 5.54 5.729 5.902 6.148 6.325 6.502 6.717 6.892 7.067 7.241 7.404 7.61 7.796 7.97 8.187 8.39 8.58 8.8 9.031 9.231 9.436 9.649 9.861 10.073 10.29 10.496 10.682 10.902 11.095 11.221 11.256 11.185 10.936 10.243 9.075 7.978 7.018 6.126 5.29 4.574 3.955 3.438 2.917 2.462 2.045 1.628 1.238 0.866 0.517 0.171 -0.147 -0.449 -0.765 -1.082 -1.353 -1.636 -1.903 -2.097 -2.297 -2.512 -2.747 -2.993 -3.163 -3.341 -3.616 -3.814 -4.024 -4.13 -4.353 -4.579 -4.811 -4.926 -5.239 -5.338 -5.488 -5.638 -5.971 -6.156 -6.335 -6.549 -6.827 -7.154 -7.596 -9.118 -2 ,17508 ,TETRA ,17600426,Sun Nov 28 11:40:17 CET,Sun Nov 28 13:37:41 CET,0.0 1.514 1.889 2.195 2.468 2.704 2.905 3.073 3.347 3.49 3.618 3.643 3.932 4.046 4.268 4.457 4.621 4.708 4.878 5.037 5.264 5.403 5.531 5.718 5.888 6.031 6.177 6.339 6.552 6.725 6.89 7.09 7.276 7.462 7.664 7.87 8.076 8.304 8.539 8.769 8.967 9.18 9.425 9.647 9.864 10.051 10.245 10.388 10.388 10.141 9.487 8.499 7.538 6.645 5.815 5.06 4.399 3.782 3.243 2.717 2.261 1.851 1.45 1.047 0.672 0.337 -0.016 -0.345 -0.642 -0.941 -1.25 -1.498 -1.758 -2.036 -2.253 -2.487 -2.721 -2.956 -3.201 -3.373 -3.551 -3.822 -4.02 -4.233 -4.33 -4.526 -4.758 -5.002 -5.139 -5.477 -5.589 -5.759 -5.928 -6.279 -6.473 -6.675 -6.918 -7.203 -7.525 -7.976 -9.365 -3 ,26993 ,TETRA ,17600427,Sun Nov 28 11:40:19 CET,Sun Nov 28 13:38:07 CET,0.0 1.84 2.321 2.665 2.964 3.227 3.464 3.664 3.99 4.14 4.295 4.391 4.706 4.838 5.085 5.299 5.5 5.596 5.782 5.948 6.159 6.285 6.413 6.608 6.784 6.945 7.1 7.25 7.424 7.584 7.742 7.948 8.152 8.33 8.537 8.763 8.97 9.216 9.462 9.673 9.876 10.096 10.332 10.545 10.762 10.923 11.037 11.129 11.061 10.763 10.037 8.943 7.949 7.007 6.127 5.313 4.567 3.871 3.267 2.639 2.064 1.545 1.037 0.556 0.125 -0.261 -0.645 -0.982 -1.282 -1.6 -1.932 -2.202 -2.489 -2.798 -3.027 -3.253 -3.487 -3.737 -3.988 -4.159 -4.34 -4.626 -4.822 -5.021 -5.131 -5.356 -5.584 -5.831 -5.956 -6.271 -6.379 -6.534 -6.69 -7.053 -7.263 -7.473 -7.68 -7.925 -8.224 -8.628 -10.474 -4 ,29079 ,TETRA ,17600428,Sun Nov 28 11:40:21 CET,Sun Nov 28 13:37:45 CET,0.0 1.927 2.449 2.808 3.096 3.378 3.619 3.803 4.133 4.271 4.4 4.452 4.755 4.865 5.071 5.266 5.439 5.516 5.67 5.824 6.038 6.16 6.283 6.472 6.642 6.794 6.942 7.1 7.295 7.477 7.663 7.882 8.066 8.242 8.456 8.681 8.876 9.074 9.304 9.517 9.699 9.903 10.104 10.273 10.506 10.754 10.929 11.023 10.994 10.741 10.028 8.851 7.799 6.887 6.05 5.282 4.603 3.991 3.449 2.893 2.391 1.925 1.485 1.076 0.694 0.35 -0.009 -0.334 -0.627 -0.939 -1.245 -1.5 -1.78 -2.073 -2.292 -2.495 -2.702 -2.919 -3.147 -3.323 -3.497 -3.762 -3.952 -4.134 -4.224 -4.416 -4.631 -4.858 -4.972 -5.274 -5.347 -5.488 -5.642 -5.984 -6.151 -6.343 -6.572 -6.802 -7.065 -7.467 -9.183 -5 ,16632 ,TETRA ,17600429,Sun Nov 28 11:40:15 CET,Sun Nov 28 13:37:20 CET,0.0 2.271 2.932 3.36 3.651 3.867 4.046 4.241 4.585 4.714 4.84 4.91 5.208 5.317 5.525 5.723 5.908 5.999 6.155 6.296 6.52 6.659 6.789 6.98 7.146 7.308 7.472 7.62 7.804 7.977 8.141 8.34 8.523 8.694 8.895 9.11 9.292 9.47 9.639 9.815 9.999 10.191 10.39 10.571 10.756 10.924 11.038 11.08 11.05 10.797 10.079 8.893 7.751 6.769 5.9 5.088 4.358 3.676 3.092 2.507 1.993 1.547 1.125 0.733 0.368 0.038 -0.31 -0.624 -0.885 -1.173 -1.479 -1.73 -1.99 -2.259 -2.479 -2.701 -2.922 -3.157 -3.399 -3.56 -3.723 -3.967 -4.135 -4.321 -4.428 -4.655 -4.881 -5.127 -5.251 -5.567 -5.655 -5.819 -5.99 -6.331 -6.517 -6.73 -6.95 -7.204 -7.514 -7.882 -9.077 -6 ,17908 ,TETRA ,17600430,Sun Nov 28 11:40:19 CET,Sun Nov 28 13:37:42 CET,0.0 1.753 2.153 2.492 2.797 3.058 3.262 3.43 3.725 3.864 4.005 4.084 4.379 4.479 4.664 4.856 5.061 5.158 5.331 5.491 5.69 5.816 5.943 6.129 6.3 6.46 6.626 6.775 6.95 7.118 7.28 7.469 7.641 7.812 8.026 8.249 8.439 8.633 8.831 9.014 9.19 9.38 9.589 9.773 9.976 10.195 10.321 10.348 10.307 10.065 9.341 8.237 7.222 6.273 5.424 4.618 3.891 3.224 2.613 1.994 1.474 1.029 0.589 0.178 -0.193 -0.537 -0.898 -1.227 -1.514 -1.811 -2.13 -2.393 -2.649 -2.913 -3.111 -3.305 -3.512 -3.733 -3.952 -4.117 -4.297 -4.568 -4.757 -4.957 -5.061 -5.273 -5.482 -5.714 -5.843 -6.17 -6.266 -6.429 -6.601 -6.976 -7.188 -7.428 -7.691 -7.979 -8.282 -8.638 -11.368 -7 ,20215 ,TETRA ,17600431,Sun Nov 28 11:40:16 CET,Sun Nov 28 13:37:31 CET,0.0 1.587 2.054 2.382 2.669 2.901 3.102 3.285 3.605 3.743 3.874 3.925 4.216 4.331 4.558 4.773 4.957 5.043 5.203 5.358 5.591 5.733 5.872 6.078 6.256 6.419 6.596 6.746 6.918 7.083 7.245 7.438 7.611 7.781 7.98 8.186 8.377 8.589 8.79 8.981 9.18 9.397 9.599 9.778 9.99 10.174 10.318 10.444 10.468 10.231 9.547 8.47 7.416 6.431 5.529 4.679 3.883 3.177 2.601 2.009 1.491 1.054 0.634 0.222 -0.139 -0.477 -0.843 -1.139 -1.391 -1.653 -1.917 -2.152 -2.407 -2.678 -2.882 -3.09 -3.308 -3.526 -3.761 -3.934 -4.117 -4.419 -4.633 -4.857 -4.983 -5.217 -5.428 -5.686 -5.825 -6.179 -6.278 -6.439 -6.597 -6.927 -7.138 -7.384 -7.659 -7.978 -8.354 -8.86 -11.708 -8 ,1630 ,TETRA ,17600432,Sun Nov 28 11:40:18 CET,Sun Nov 28 13:37:29 CET,0.0 2.347 2.847 3.207 3.495 3.718 3.923 4.108 4.424 4.57 4.716 4.818 5.135 5.255 5.476 5.694 5.906 6.006 6.186 6.362 6.633 6.796 6.939 7.148 7.369 7.602 7.834 8.052 8.294 8.499 8.697 8.909 9.11 9.312 9.525 9.736 9.948 10.201 10.463 10.737 11.005 11.248 11.503 11.745 11.988 12.231 12.439 12.572 12.598 12.382 11.653 10.506 9.461 8.501 7.628 6.824 6.156 5.574 5.057 4.525 4.031 3.587 3.164 2.755 2.376 2.042 1.693 1.357 1.058 0.744 0.426 0.179 -0.075 -0.348 -0.564 -0.804 -1.07 -1.34 -1.609 -1.797 -1.994 -2.282 -2.488 -2.716 -2.832 -3.078 -3.352 -3.646 -3.79 -4.115 -4.251 -4.425 -4.604 -5.0 -5.22 -5.457 -5.712 -5.983 -6.279 -6.651 -7.738 -9 ,13878 ,TETRA ,17600433,Sun Nov 28 11:40:16 CET,Sun Nov 28 13:37:25 CET,0.0 1.832 2.305 2.588 2.832 3.045 3.233 3.41 3.716 3.857 3.978 4.023 4.318 4.427 4.627 4.816 5.011 5.105 5.251 5.389 5.58 5.703 5.817 5.974 6.144 6.31 6.455 6.601 6.777 6.941 7.094 7.284 7.472 7.646 7.829 8.02 8.205 8.402 8.62 8.828 9.002 9.175 9.371 9.565 9.758 9.889 9.984 10.032 9.938 9.589 8.826 7.772 6.772 5.857 5.048 4.298 3.643 3.046 2.483 1.901 1.42 1.005 0.614 0.24 -0.111 -0.42 -0.734 -1.03 -1.287 -1.552 -1.837 -2.065 -2.291 -2.538 -2.731 -2.931 -3.146 -3.374 -3.61 -3.765 -3.935 -4.204 -4.393 -4.586 -4.678 -4.872 -5.076 -5.3 -5.416 -5.733 -5.8 -5.924 -6.05 -6.352 -6.522 -6.694 -6.887 -7.098 -7.328 -7.656 -9.913 -10 ,3597 ,TETRA ,17600434,Sun Nov 28 11:40:18 CET,Sun Nov 28 13:37:39 CET,0.0 1.705 2.357 2.844 3.138 3.396 3.66 3.906 4.281 4.441 4.586 4.674 4.973 5.091 5.318 5.541 5.743 5.837 6.015 6.185 6.44 6.595 6.741 6.948 7.138 7.316 7.491 7.656 7.843 8.021 8.19 8.374 8.542 8.703 8.89 9.092 9.268 9.453 9.636 9.839 10.038 10.209 10.409 10.584 10.711 10.81 10.909 11.0 10.973 10.685 9.923 8.768 7.699 6.733 5.863 5.086 4.412 3.791 3.241 2.649 2.096 1.603 1.174 0.788 0.416 0.058 -0.314 -0.647 -0.952 -1.251 -1.538 -1.782 -2.03 -2.273 -2.452 -2.648 -2.855 -3.064 -3.29 -3.453 -3.628 -3.899 -4.083 -4.277 -4.375 -4.575 -4.781 -4.997 -5.12 -5.433 -5.517 -5.68 -5.842 -6.162 -6.346 -6.558 -6.785 -7.041 -7.358 -7.788 -9.279 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_29_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_29_42.txt deleted file mode 100644 index d0851673..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_29_42.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27711 ,TETRA ,17600435,Sun Nov 28 11:40:20 CET,Sun Nov 28 13:43:46 CET,0.0 1.575 2.002 2.303 2.537 2.727 2.9 3.062 3.329 3.455 3.577 3.597 3.891 3.985 4.159 4.336 4.511 4.598 4.781 4.96 5.196 5.336 5.471 5.672 5.865 6.04 6.21 6.383 6.595 6.795 7.0 7.254 7.504 7.746 8.02 8.324 8.609 8.916 9.237 9.57 9.943 10.368 10.832 11.28 11.832 12.467 13.187 13.991 14.86 15.835 16.92 17.606 17.828 17.8 17.663 17.49 17.294 17.095 16.912 16.71 16.53 16.346 16.139 15.936 15.732 15.525 15.306 15.084 14.872 14.669 14.463 14.28 14.085 13.864 13.688 13.515 13.337 13.149 12.936 12.792 12.65 12.415 12.242 12.057 11.958 11.748 11.51 11.25 11.118 10.788 10.629 10.458 10.282 9.868 9.626 9.368 9.076 8.714 8.251 7.534 3.119 -2 ,970 ,TETRA ,17600436,Sun Nov 28 11:40:22 CET,Sun Nov 28 13:43:22 CET,0.0 1.374 1.806 2.121 2.394 2.632 2.852 3.062 3.432 3.606 3.759 3.844 4.17 4.301 4.553 4.793 5.011 5.123 5.329 5.513 5.794 5.967 6.127 6.382 6.632 6.87 7.096 7.309 7.567 7.794 8.016 8.29 8.553 8.802 9.087 9.412 9.73 10.07 10.441 10.827 11.216 11.66 12.161 12.658 13.245 13.898 14.623 15.423 16.363 17.384 18.391 19.057 19.344 19.448 19.39 19.211 18.995 18.751 18.517 18.26 18.033 17.804 17.562 17.336 17.118 16.924 16.699 16.464 16.263 16.056 15.825 15.622 15.414 15.195 15.023 14.839 14.643 14.445 14.219 14.063 13.913 13.65 13.461 13.283 13.187 12.978 12.76 12.498 12.359 12.05 11.945 11.764 11.562 11.142 10.9 10.635 10.353 9.999 9.529 8.776 5.135 -4 ,28549 ,TETRA ,17600438,Sun Nov 28 11:41:07 CET,Sun Nov 28 13:39:19 CET,0.0 1.961 2.323 2.569 2.776 2.978 3.173 3.334 3.598 3.73 3.856 3.903 4.2 4.302 4.521 4.752 4.95 5.037 5.212 5.382 5.615 5.78 5.935 6.14 6.344 6.543 6.743 6.931 7.154 7.376 7.6 7.864 8.125 8.386 8.689 9.022 9.332 9.673 10.042 10.443 10.864 11.313 11.816 12.311 12.898 13.559 14.31 15.154 16.132 17.23 18.438 19.162 19.297 19.186 19.012 18.775 18.51 18.256 18.019 17.774 17.549 17.332 17.09 16.848 16.581 16.333 16.095 15.862 15.653 15.414 15.156 14.935 14.72 14.504 14.32 14.13 13.935 13.738 13.538 13.402 13.268 13.033 12.849 12.676 12.59 12.396 12.205 11.985 11.868 11.583 11.512 11.377 11.242 10.912 10.718 10.544 10.366 10.113 9.763 9.288 7.707 -5 ,6901 ,TETRA ,17600439,Sun Nov 28 11:41:05 CET,Sun Nov 28 13:40:20 CET,0.0 1.226 1.624 1.881 2.099 2.303 2.507 2.68 2.949 3.081 3.224 3.314 3.636 3.758 3.978 4.177 4.372 4.466 4.653 4.823 5.049 5.2 5.353 5.574 5.783 5.996 6.201 6.382 6.61 6.844 7.057 7.3 7.556 7.803 8.099 8.437 8.745 9.092 9.466 9.855 10.275 10.745 11.28 11.814 12.432 13.119 13.905 14.779 15.824 16.956 18.063 18.784 19.048 19.003 18.797 18.531 18.246 17.967 17.665 17.287 16.957 16.679 16.409 16.125 15.842 15.572 15.302 15.077 14.879 14.678 14.48 14.301 14.113 13.921 13.755 13.584 13.415 13.224 12.996 12.83 12.662 12.393 12.198 11.998 11.896 11.697 11.489 11.247 11.117 10.797 10.699 10.558 10.405 10.04 9.828 9.605 9.373 9.13 8.879 8.564 6.353 -6 ,10533 ,TETRA ,17600440,Sun Nov 28 11:41:08 CET,Sun Nov 28 13:40:27 CET,0.0 1.583 1.98 2.225 2.464 2.668 2.827 2.992 3.319 3.461 3.597 3.67 3.984 4.097 4.325 4.546 4.754 4.85 5.035 5.219 5.487 5.649 5.798 6.019 6.234 6.431 6.611 6.783 7.015 7.238 7.453 7.698 7.934 8.177 8.458 8.761 9.043 9.36 9.694 10.055 10.456 10.911 11.42 11.909 12.479 13.125 13.864 14.697 15.62 16.57 17.601 18.261 18.51 18.556 18.482 18.328 18.121 17.869 17.624 17.361 17.114 16.867 16.621 16.4 16.19 15.968 15.699 15.456 15.245 15.022 14.787 14.598 14.406 14.171 13.981 13.81 13.613 13.368 13.081 12.878 12.683 12.401 12.184 11.962 11.86 11.643 11.406 11.163 11.04 10.741 10.662 10.504 10.318 9.921 9.7 9.439 9.138 8.796 8.372 7.719 4.532 -7 ,19925 ,TETRA ,17600441,Sun Nov 28 11:41:10 CET,Sun Nov 28 13:39:21 CET,0.0 1.65 2.047 2.352 2.576 2.744 2.896 3.042 3.332 3.461 3.576 3.634 3.935 4.045 4.27 4.468 4.642 4.731 4.927 5.123 5.37 5.526 5.678 5.884 6.09 6.295 6.482 6.657 6.886 7.124 7.353 7.607 7.846 8.06 8.309 8.606 8.896 9.21 9.542 9.914 10.308 10.737 11.237 11.711 12.267 12.881 13.553 14.342 15.182 16.069 17.04 17.611 17.748 17.66 17.473 17.267 17.06 16.811 16.572 16.304 16.046 15.824 15.602 15.381 15.162 14.944 14.728 14.543 14.359 14.159 13.96 13.767 13.567 13.374 13.221 13.059 12.884 12.692 12.471 12.317 12.156 11.924 11.772 11.598 11.506 11.311 11.094 10.86 10.742 10.431 10.313 10.146 9.983 9.632 9.443 9.246 9.005 8.708 8.39 8.002 6.548 -8 ,1598 ,TETRA ,17600442,Sun Nov 28 11:41:06 CET,Sun Nov 28 13:38:39 CET,0.0 1.603 2.013 2.279 2.497 2.672 2.842 3.01 3.284 3.409 3.55 3.642 3.948 4.063 4.283 4.484 4.672 4.763 4.941 5.111 5.352 5.505 5.645 5.85 6.057 6.256 6.441 6.624 6.859 7.086 7.318 7.602 7.858 8.106 8.4 8.711 9.02 9.398 9.845 10.29 10.699 11.151 11.676 12.19 12.767 13.424 14.193 15.063 16.004 16.978 18.061 18.715 18.88 18.814 18.619 18.402 18.179 17.924 17.669 17.406 17.177 16.966 16.763 16.549 16.335 16.138 15.931 15.743 15.567 15.371 15.164 14.99 14.802 14.598 14.436 14.27 14.086 13.898 13.704 13.561 13.406 13.155 12.983 12.8 12.697 12.475 12.255 12.026 11.897 11.584 11.458 11.283 11.106 10.691 10.467 10.266 10.026 9.729 9.397 8.975 7.309 -9 ,14342 ,TETRA ,17600443,Sun Nov 28 11:42:41 CET,Sun Nov 28 13:41:11 CET,0.0 1.201 1.603 1.885 2.127 2.332 2.53 2.72 3.043 3.188 3.322 3.388 3.704 3.829 4.044 4.245 4.452 4.549 4.729 4.901 5.143 5.295 5.447 5.674 5.89 6.098 6.299 6.496 6.752 6.987 7.213 7.473 7.732 7.987 8.277 8.613 8.931 9.282 9.663 10.061 10.469 10.925 11.461 11.996 12.603 13.297 14.13 15.047 16.035 17.171 18.399 19.154 19.289 19.23 19.119 18.924 18.722 18.5 18.25 17.926 17.658 17.431 17.194 16.959 16.744 16.554 16.333 16.129 15.936 15.705 15.463 15.272 15.069 14.847 14.677 14.504 14.32 14.121 13.911 13.768 13.627 13.417 13.269 13.104 13.019 12.844 12.654 12.45 12.336 12.021 11.918 11.782 11.644 11.314 11.138 10.937 10.685 10.397 10.077 9.66 7.657 -10 ,14793 ,TETRA ,17600444,Sun Nov 28 11:50:32 CET,Sun Nov 28 13:48:06 CET,0.0 1.187 1.586 1.895 2.17 2.389 2.602 2.804 3.121 3.264 3.416 3.497 3.822 3.952 4.205 4.443 4.664 4.763 4.952 5.142 5.402 5.564 5.72 5.946 6.166 6.387 6.598 6.792 7.035 7.271 7.504 7.781 8.034 8.275 8.559 8.88 9.194 9.529 9.862 10.221 10.621 11.064 11.571 12.085 12.665 13.289 13.999 14.813 15.762 16.793 17.902 18.622 18.903 18.959 18.845 18.659 18.418 18.133 17.875 17.616 17.395 17.167 16.911 16.663 16.444 16.24 16.019 15.816 15.627 15.436 15.222 15.033 14.84 14.638 14.474 14.282 14.075 13.881 13.682 13.536 13.385 13.146 12.968 12.769 12.664 12.459 12.246 11.998 11.857 11.524 11.388 11.223 11.053 10.672 10.429 10.156 9.876 9.491 8.986 8.223 4.257 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_30_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_30_31.txt deleted file mode 100644 index 00e64d2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_30_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20339 ,TETRA ,17600445,Sun Nov 28 11:50:34 CET,Sun Nov 28 13:47:23 CET,0.0 0.342 0.597 0.831 1.044 1.252 1.43 1.586 1.877 2.016 2.152 2.215 2.521 2.625 2.834 3.049 3.273 3.38 3.584 3.782 4.071 4.256 4.433 4.702 4.959 5.192 5.424 5.655 5.944 6.231 6.526 6.866 7.183 7.493 7.857 8.268 8.682 9.134 9.6 10.107 10.665 11.303 12.057 12.843 13.766 14.835 16.083 17.451 19.071 21.001 23.424 25.529 26.771 27.584 28.138 28.53 28.824 29.032 29.161 29.26 29.324 29.377 29.409 29.406 29.387 29.369 29.347 29.324 29.292 29.237 29.179 29.134 29.088 29.037 28.992 28.929 28.849 28.781 28.711 28.65 28.59 28.505 28.44 28.361 28.321 28.236 28.146 28.058 28.005 27.782 27.83 27.765 27.695 27.539 27.463 27.381 27.287 27.18 27.064 26.919 26.545 -2 ,16403 ,TETRA ,17600446,Sun Nov 28 11:50:36 CET,Sun Nov 28 13:48:16 CET,0.0 0.604 0.902 1.174 1.38 1.556 1.725 1.891 2.201 2.334 2.455 2.498 2.812 2.924 3.144 3.351 3.545 3.634 3.815 4.001 4.281 4.467 4.642 4.897 5.147 5.387 5.61 5.82 6.107 6.398 6.668 7.004 7.339 7.672 8.066 8.495 8.913 9.367 9.847 10.358 10.901 11.528 12.258 13.005 13.907 14.934 16.147 17.521 19.09 20.908 23.12 25.029 26.199 26.963 27.486 27.882 28.159 28.36 28.515 28.637 28.701 28.734 28.751 28.752 28.744 28.719 28.681 28.655 28.629 28.586 28.534 28.478 28.416 28.36 28.309 28.247 28.181 28.116 28.042 27.988 27.93 27.836 27.775 27.711 27.676 27.6 27.522 27.431 27.381 27.167 27.227 27.157 27.088 26.974 26.91 26.825 26.723 26.62 26.491 26.33 25.94 -3 ,25022 ,TETRA ,17600447,Sun Nov 28 11:50:38 CET,Sun Nov 28 13:47:23 CET,0.0 0.958 1.264 1.501 1.71 1.941 2.161 2.343 2.659 2.802 2.944 3.02 3.348 3.478 3.699 3.902 4.099 4.2 4.402 4.59 4.855 5.02 5.197 5.464 5.726 5.991 6.24 6.48 6.792 7.074 7.326 7.656 8.003 8.317 8.654 9.04 9.423 9.845 10.302 10.792 11.335 11.951 12.665 13.388 14.21 15.17 16.298 17.531 19.058 21.021 23.531 25.661 26.95 27.792 28.327 28.685 28.931 29.096 29.206 29.309 29.371 29.398 29.417 29.433 29.434 29.422 29.389 29.349 29.303 29.245 29.188 29.134 29.066 28.985 28.926 28.871 28.812 28.755 28.683 28.618 28.555 28.468 28.398 28.311 28.272 28.205 28.135 28.048 27.998 27.782 27.825 27.762 27.703 27.563 27.485 27.399 27.285 27.161 27.041 26.912 26.66 -4 ,10176 ,TETRA ,17600448,Sun Nov 28 12:16:22 CET,Sun Nov 28 13:57:38 CET,0.0 0.658 0.988 1.216 1.407 1.584 1.758 1.911 2.177 2.307 2.433 2.458 2.76 2.869 3.09 3.294 3.483 3.578 3.772 3.965 4.236 4.404 4.558 4.793 5.055 5.306 5.529 5.745 6.026 6.288 6.531 6.847 7.158 7.454 7.809 8.215 8.606 9.023 9.463 9.944 10.466 11.076 11.812 12.531 13.386 14.358 15.44 16.722 18.282 20.181 22.607 24.719 25.994 26.784 27.334 27.742 28.017 28.223 28.333 28.399 28.462 28.505 28.53 28.539 28.538 28.538 28.519 28.49 28.46 28.427 28.376 28.318 28.274 28.225 28.167 28.099 28.035 27.967 27.882 27.833 27.788 27.694 27.624 27.552 27.516 27.445 27.365 27.277 27.229 27.012 27.065 27.0 26.934 26.796 26.709 26.619 26.54 26.43 26.298 26.161 25.703 -5 ,38 ,TETRA ,17600449,Sun Nov 28 12:16:22 CET,Sun Nov 28 13:56:46 CET,0.0 0.835 1.106 1.312 1.496 1.684 1.86 2.016 2.301 2.441 2.581 2.625 2.937 3.059 3.273 3.465 3.653 3.758 3.964 4.15 4.421 4.596 4.765 5.004 5.245 5.488 5.729 5.967 6.264 6.553 6.837 7.171 7.478 7.769 8.112 8.506 8.904 9.332 9.782 10.269 10.817 11.444 12.174 12.932 13.806 14.784 15.965 17.32 18.875 20.827 23.335 25.47 26.713 27.456 27.937 28.301 28.561 28.748 28.875 28.959 29.012 29.039 29.03 29.015 29.004 28.977 28.925 28.882 28.848 28.791 28.711 28.648 28.592 28.539 28.49 28.427 28.365 28.309 28.251 28.202 28.14 28.049 27.991 27.918 27.874 27.766 27.65 27.554 27.508 27.284 27.358 27.296 27.233 27.093 27.014 26.924 26.839 26.751 26.647 26.536 26.246 -6 ,10319 ,TETRA ,17600450,Sun Nov 28 12:17:21 CET,Sun Nov 28 14:01:48 CET,0.0 0.731 1.102 1.379 1.619 1.8 1.96 2.128 2.454 2.603 2.742 2.818 3.116 3.228 3.452 3.684 3.914 4.018 4.227 4.438 4.719 4.896 5.08 5.336 5.583 5.819 6.046 6.287 6.591 6.883 7.184 7.539 7.872 8.191 8.552 8.944 9.34 9.775 10.233 10.752 11.311 11.935 12.673 13.41 14.282 15.253 16.364 17.634 19.152 21.04 23.463 25.515 26.725 27.508 28.041 28.44 28.709 28.891 29.032 29.13 29.178 29.205 29.217 29.213 29.195 29.187 29.171 29.141 29.103 29.059 29.009 28.953 28.888 28.818 28.766 28.715 28.662 28.591 28.499 28.436 28.376 28.286 28.218 28.144 28.106 28.0 27.883 27.794 27.75 27.523 27.577 27.505 27.435 27.295 27.214 27.133 27.04 26.932 26.826 26.661 26.266 -7 ,8508 ,TETRA ,17600451,Sun Nov 28 12:18:20 CET,Sun Nov 28 14:11:33 CET,0.0 0.638 0.984 1.249 1.458 1.664 1.873 2.073 2.447 2.615 2.757 2.829 3.171 3.314 3.582 3.821 4.034 4.151 4.394 4.619 4.906 5.074 5.246 5.52 5.791 6.045 6.284 6.523 6.845 7.144 7.442 7.808 8.13 8.45 8.844 9.266 9.65 10.066 10.529 11.044 11.622 12.291 13.026 13.746 14.607 15.601 16.763 18.099 19.676 21.542 23.929 26.057 27.384 28.205 28.724 29.1 29.359 29.512 29.589 29.652 29.684 29.705 29.729 29.735 29.714 29.685 29.656 29.623 29.589 29.549 29.503 29.46 29.41 29.345 29.275 29.18 29.078 28.981 28.88 28.804 28.722 28.592 28.515 28.43 28.379 28.277 28.176 28.085 28.036 27.807 27.827 27.747 27.67 27.521 27.429 27.319 27.21 27.091 26.924 26.684 26.279 -8 ,2156 ,TETRA ,17600452,Sun Nov 28 12:19:21 CET,Sun Nov 28 14:01:16 CET,0.0 0.71 1.004 1.258 1.477 1.651 1.83 1.998 2.292 2.428 2.565 2.628 2.951 3.077 3.309 3.518 3.718 3.821 4.022 4.201 4.471 4.662 4.842 5.086 5.337 5.588 5.828 6.052 6.336 6.612 6.875 7.192 7.506 7.821 8.191 8.617 9.016 9.448 9.933 10.459 11.015 11.633 12.367 13.158 14.112 15.152 16.346 17.709 19.302 21.249 23.713 25.837 27.081 27.892 28.461 28.86 29.107 29.251 29.331 29.419 29.475 29.492 29.508 29.511 29.496 29.468 29.424 29.366 29.301 29.217 29.125 29.057 28.991 28.911 28.841 28.784 28.728 28.631 28.526 28.472 28.416 28.338 28.285 28.219 28.183 28.1 28.015 27.917 27.864 27.646 27.693 27.63 27.565 27.425 27.335 27.247 27.145 27.026 26.908 26.699 26.187 -9 ,23045 ,TETRA ,17600453,Sun Nov 28 12:20:21 CET,Sun Nov 28 14:06:31 CET,0.0 0.593 0.911 1.193 1.413 1.571 1.74 1.907 2.238 2.389 2.526 2.577 2.882 3.002 3.238 3.462 3.682 3.787 3.974 4.167 4.474 4.661 4.84 5.1 5.336 5.567 5.79 6.012 6.304 6.586 6.866 7.211 7.546 7.87 8.258 8.684 9.099 9.563 10.062 10.616 11.192 11.822 12.565 13.335 14.216 15.203 16.389 17.783 19.481 21.493 24.063 26.306 27.667 28.544 29.096 29.47 29.726 29.897 30.011 30.12 30.181 30.207 30.233 30.229 30.21 30.192 30.154 30.116 30.082 30.043 29.997 29.945 29.883 29.817 29.765 29.707 29.63 29.555 29.48 29.424 29.367 29.261 29.19 29.117 29.079 29.002 28.924 28.846 28.795 28.561 28.597 28.527 28.451 28.304 28.217 28.107 28.0 27.881 27.745 27.573 27.094 -10 ,23419 ,TETRA ,17600454,Sun Nov 28 12:21:19 CET,Sun Nov 28 14:08:06 CET,0.0 0.883 1.184 1.438 1.681 1.901 2.087 2.252 2.557 2.691 2.83 2.888 3.189 3.307 3.546 3.767 3.978 4.077 4.263 4.454 4.74 4.914 5.087 5.343 5.592 5.838 6.071 6.292 6.587 6.877 7.151 7.478 7.79 8.087 8.454 8.891 9.308 9.773 10.258 10.756 11.291 11.932 12.709 13.502 14.403 15.367 16.494 17.812 19.378 21.283 23.694 25.765 27.037 27.883 28.431 28.812 29.078 29.27 29.383 29.456 29.514 29.545 29.566 29.576 29.576 29.574 29.558 29.538 29.515 29.478 29.437 29.394 29.341 29.278 29.226 29.163 29.102 29.051 28.985 28.933 28.88 28.794 28.724 28.641 28.592 28.488 28.398 28.315 28.265 28.042 28.126 28.071 28.011 27.87 27.773 27.665 27.556 27.445 27.3 27.048 26.345 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_30_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_30_32.txt deleted file mode 100644 index 48b6d5a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_30_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16050 ,KEBNE ,17026967,Wed Dec 22 15:55:31 CET,Wed Dec 22 17:35:59 CET,0.0 0.698 0.988 1.191 1.364 1.539 1.702 1.844 2.083 2.207 2.337 2.359 2.643 2.744 2.926 3.084 3.228 3.292 3.422 3.551 3.73 3.846 3.948 4.103 4.271 4.433 4.584 4.736 4.937 5.127 5.313 5.531 5.725 5.903 6.114 6.365 6.591 6.828 7.103 7.39 7.687 8.03 8.39 8.737 9.154 9.594 10.041 10.524 11.082 11.663 12.18 12.357 12.26 12.032 11.776 11.495 11.222 10.953 10.699 10.419 10.15 9.934 9.747 9.545 9.346 9.153 8.945 8.761 8.59 8.42 8.245 8.092 7.925 7.745 7.599 7.439 7.27 7.105 6.945 6.83 6.702 6.499 6.346 6.185 6.109 5.95 5.783 5.598 5.491 5.198 5.178 5.06 4.93 4.63 4.48 4.331 4.136 3.905 3.681 3.416 2.543 -2 ,2713 ,KEBNE ,17026968,Wed Dec 22 15:55:30 CET,Wed Dec 22 17:35:29 CET,0.0 0.73 1.016 1.231 1.393 1.555 1.717 1.849 2.075 2.192 2.308 2.317 2.599 2.682 2.856 3.035 3.182 3.25 3.39 3.52 3.709 3.834 3.956 4.137 4.299 4.437 4.572 4.706 4.887 5.07 5.241 5.45 5.646 5.828 6.026 6.248 6.471 6.723 7.005 7.301 7.591 7.894 8.235 8.593 9.008 9.445 9.92 10.424 10.952 11.479 11.967 12.104 11.986 11.797 11.554 11.259 10.954 10.7 10.47 10.2 9.939 9.699 9.477 9.259 9.066 8.89 8.685 8.503 8.338 8.174 8.005 7.854 7.694 7.505 7.359 7.214 7.062 6.896 6.719 6.603 6.492 6.328 6.215 6.098 6.034 5.894 5.742 5.573 5.48 5.207 5.193 5.099 5.005 4.801 4.681 4.56 4.438 4.273 4.04 3.752 2.567 -3 ,8210 ,KEBNE ,17026969,Wed Dec 22 15:55:31 CET,Wed Dec 22 17:36:34 CET,0.0 0.856 1.135 1.35 1.545 1.714 1.857 1.991 2.239 2.341 2.433 2.431 2.724 2.812 2.972 3.14 3.298 3.375 3.509 3.622 3.789 3.91 4.036 4.221 4.391 4.547 4.692 4.818 4.986 5.166 5.326 5.512 5.713 5.906 6.121 6.359 6.593 6.852 7.118 7.383 7.673 8.005 8.355 8.688 9.081 9.529 10.015 10.536 11.099 11.653 12.113 12.256 12.188 12.037 11.819 11.55 11.286 11.042 10.802 10.546 10.316 10.112 9.924 9.717 9.512 9.316 9.105 8.921 8.759 8.6 8.435 8.286 8.137 7.991 7.864 7.725 7.584 7.441 7.301 7.204 7.096 6.922 6.798 6.666 6.6 6.468 6.328 6.187 6.102 5.814 5.807 5.704 5.59 5.325 5.191 5.066 4.911 4.735 4.525 4.216 3.3 -4 ,8935 ,KEBNE ,17026970,Wed Dec 22 15:55:31 CET,Wed Dec 22 17:36:10 CET,0.0 0.731 0.988 1.213 1.423 1.592 1.717 1.837 2.088 2.213 2.329 2.345 2.632 2.723 2.888 3.049 3.208 3.283 3.427 3.583 3.821 3.968 4.104 4.293 4.473 4.65 4.817 4.966 5.148 5.324 5.492 5.693 5.895 6.082 6.287 6.514 6.733 6.974 7.238 7.511 7.792 8.104 8.457 8.796 9.185 9.619 10.074 10.56 11.113 11.658 12.152 12.336 12.254 12.077 11.856 11.602 11.354 11.105 10.87 10.636 10.433 10.227 10.004 9.798 9.613 9.435 9.212 9.022 8.871 8.701 8.53 8.387 8.239 8.084 7.964 7.834 7.682 7.528 7.383 7.283 7.167 6.986 6.87 6.76 6.701 6.551 6.389 6.219 6.135 5.867 5.863 5.747 5.626 5.385 5.25 5.114 4.967 4.79 4.573 4.208 2.955 -5 ,25618 ,KEBNE ,17026971,Wed Dec 22 15:55:30 CET,Wed Dec 22 17:35:39 CET,0.0 0.437 0.702 0.937 1.167 1.36 1.482 1.598 1.837 1.954 2.075 2.106 2.386 2.473 2.645 2.837 3.03 3.111 3.26 3.405 3.611 3.732 3.846 4.027 4.209 4.376 4.538 4.693 4.89 5.079 5.264 5.503 5.721 5.903 6.096 6.317 6.542 6.792 7.054 7.328 7.605 7.904 8.262 8.619 9.023 9.451 9.904 10.399 10.955 11.5 11.976 12.191 12.165 12.028 11.826 11.57 11.326 11.065 10.822 10.576 10.304 10.055 9.829 9.605 9.401 9.223 9.022 8.831 8.689 8.541 8.371 8.229 8.077 7.9 7.756 7.61 7.457 7.294 7.125 7.019 6.906 6.704 6.566 6.433 6.367 6.215 6.046 5.877 5.786 5.508 5.488 5.39 5.279 5.035 4.911 4.769 4.615 4.452 4.229 3.898 2.79 -6 ,29917 ,KEBNE ,17026972,Wed Dec 22 15:55:30 CET,Wed Dec 22 17:35:49 CET,0.0 0.657 0.915 1.166 1.376 1.539 1.672 1.808 2.081 2.212 2.336 2.375 2.674 2.767 2.942 3.108 3.252 3.318 3.449 3.567 3.729 3.842 3.972 4.182 4.379 4.565 4.754 4.931 5.147 5.356 5.554 5.784 6.006 6.217 6.452 6.726 6.994 7.281 7.577 7.901 8.253 8.617 9.018 9.43 9.89 10.36 10.861 11.412 12.039 12.688 13.31 13.615 13.572 13.404 13.201 12.966 12.729 12.495 12.281 12.06 11.855 11.652 11.459 11.279 11.104 10.931 10.739 10.567 10.412 10.23 10.04 9.897 9.74 9.574 9.45 9.327 9.193 9.041 8.885 8.779 8.679 8.523 8.41 8.292 8.226 8.084 7.935 7.765 7.672 7.39 7.383 7.276 7.171 6.956 6.828 6.691 6.54 6.368 6.195 5.944 5.219 -7 ,6654 ,KEBNE ,17026973,Wed Dec 22 15:55:30 CET,Wed Dec 22 17:35:56 CET,0.0 1.099 1.428 1.696 1.902 2.088 2.241 2.368 2.588 2.7 2.815 2.846 3.139 3.228 3.394 3.551 3.701 3.776 3.927 4.065 4.266 4.395 4.513 4.678 4.852 5.03 5.186 5.332 5.529 5.72 5.902 6.118 6.322 6.514 6.742 6.978 7.185 7.425 7.675 7.945 8.234 8.557 8.945 9.308 9.728 10.207 10.736 11.269 11.817 12.403 12.952 13.202 13.195 13.026 12.804 12.579 12.325 12.062 11.84 11.592 11.346 11.118 10.905 10.7 10.499 10.296 10.062 9.868 9.717 9.554 9.384 9.239 9.077 8.913 8.786 8.644 8.49 8.328 8.164 8.052 7.931 7.752 7.621 7.464 7.388 7.242 7.088 6.936 6.847 6.566 6.568 6.458 6.334 6.054 5.891 5.703 5.51 5.285 4.98 4.506 3.173 -8 ,19037 ,KEBNE ,17026974,Wed Dec 22 15:55:31 CET,Wed Dec 22 17:35:51 CET,0.0 0.745 0.998 1.214 1.378 1.529 1.672 1.806 2.032 2.135 2.235 2.234 2.522 2.611 2.788 2.955 3.108 3.188 3.352 3.501 3.704 3.832 3.961 4.146 4.324 4.508 4.683 4.839 5.039 5.239 5.424 5.646 5.863 6.058 6.277 6.518 6.729 6.971 7.235 7.508 7.814 8.165 8.549 8.92 9.344 9.784 10.282 10.802 11.344 11.931 12.419 12.52 12.395 12.185 11.96 11.715 11.425 11.131 10.898 10.651 10.412 10.187 9.948 9.704 9.474 9.258 9.023 8.819 8.642 8.454 8.266 8.112 7.952 7.781 7.633 7.471 7.324 7.177 7.007 6.887 6.764 6.579 6.449 6.325 6.265 6.135 5.983 5.796 5.697 5.404 5.369 5.264 5.153 4.901 4.763 4.608 4.415 4.202 3.981 3.678 2.57 -9 ,12206 ,KEBNE ,17026975,Wed Dec 22 15:55:31 CET,Wed Dec 22 17:36:02 CET,0.0 0.578 0.877 1.108 1.31 1.489 1.649 1.793 2.048 2.169 2.281 2.3 2.604 2.701 2.872 3.04 3.21 3.291 3.44 3.584 3.796 3.925 4.044 4.221 4.385 4.541 4.694 4.834 5.021 5.205 5.379 5.582 5.767 5.946 6.153 6.382 6.606 6.847 7.107 7.372 7.637 7.938 8.28 8.622 9.024 9.454 9.93 10.474 11.072 11.658 12.138 12.249 12.105 11.902 11.686 11.442 11.165 10.885 10.621 10.352 10.123 9.889 9.651 9.416 9.192 8.985 8.778 8.6 8.439 8.268 8.089 7.945 7.799 7.642 7.513 7.377 7.233 7.085 6.924 6.821 6.722 6.543 6.419 6.279 6.204 6.063 5.924 5.78 5.703 5.439 5.469 5.387 5.298 5.086 4.954 4.784 4.57 4.355 4.149 3.884 2.632 -10 ,30843 ,KEBNE ,17026976,Wed Dec 22 15:55:31 CET,Wed Dec 22 17:36:40 CET,0.0 0.75 1.057 1.266 1.452 1.601 1.722 1.828 2.039 2.142 2.232 2.199 2.482 2.584 2.786 2.955 3.129 3.22 3.375 3.515 3.704 3.819 3.933 4.094 4.243 4.387 4.531 4.675 4.856 5.017 5.177 5.382 5.576 5.756 5.958 6.186 6.4 6.643 6.911 7.181 7.467 7.801 8.193 8.575 9.011 9.479 9.99 10.531 11.076 11.62 12.117 12.313 12.207 11.959 11.73 11.482 11.21 10.945 10.709 10.454 10.217 9.989 9.758 9.542 9.343 9.16 8.98 8.814 8.659 8.506 8.343 8.213 8.08 7.919 7.792 7.668 7.534 7.393 7.238 7.134 7.025 6.825 6.686 6.542 6.465 6.313 6.156 5.984 5.894 5.613 5.601 5.49 5.356 5.023 4.83 4.635 4.437 4.213 3.944 3.598 2.751 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_30_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_30_38.txt deleted file mode 100644 index 01943ea1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_30_38.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25701 ,TETRA ,17600455,Sun Nov 28 12:21:20 CET,Sun Nov 28 14:08:10 CET,0.0 2.492 3.002 3.33 3.605 3.857 4.06 4.247 4.604 4.754 4.899 4.998 5.337 5.46 5.682 5.92 6.162 6.278 6.489 6.675 6.958 7.136 7.306 7.555 7.787 8.008 8.214 8.409 8.666 8.905 9.142 9.429 9.686 9.934 10.216 10.523 10.808 11.104 11.421 11.766 12.132 12.545 13.011 13.459 13.937 14.444 14.973 15.513 16.044 16.496 16.859 16.688 16.232 15.732 15.235 14.747 14.278 13.852 13.474 13.063 12.732 12.436 12.122 11.833 11.563 11.311 11.059 10.823 10.613 10.392 10.159 9.968 9.766 9.55 9.387 9.217 9.04 8.858 8.664 8.535 8.405 8.209 8.067 7.907 7.825 7.662 7.494 7.302 7.207 6.919 6.898 6.787 6.671 6.425 6.295 6.139 5.964 5.77 5.504 5.152 3.973 -2 ,451 ,TETRA ,17600456,Sun Nov 28 12:21:20 CET,Sun Nov 28 14:08:41 CET,0.0 2.668 3.205 3.585 3.904 4.144 4.351 4.544 4.869 5.032 5.192 5.307 5.642 5.776 6.037 6.287 6.512 6.614 6.829 7.036 7.321 7.496 7.665 7.911 8.151 8.389 8.611 8.822 9.091 9.352 9.614 9.928 10.218 10.474 10.753 11.076 11.39 11.736 12.108 12.506 12.926 13.372 13.886 14.384 14.92 15.481 16.079 16.721 17.385 17.987 18.33 18.158 17.739 17.313 16.898 16.481 16.091 15.704 15.348 14.973 14.632 14.326 14.047 13.786 13.529 13.272 13.002 12.76 12.557 12.345 12.113 11.922 11.712 11.487 11.311 11.121 10.928 10.747 10.553 10.414 10.268 10.031 9.874 9.72 9.642 9.479 9.305 9.124 9.025 8.721 8.691 8.568 8.441 8.182 8.026 7.857 7.676 7.457 7.212 6.892 5.788 -3 ,31314 ,TETRA ,17600457,Sun Nov 28 12:21:20 CET,Sun Nov 28 14:09:09 CET,0.0 3.455 4.06 4.506 4.845 5.152 5.433 5.636 5.999 6.197 6.386 6.534 6.886 7.037 7.32 7.59 7.858 7.989 8.226 8.452 8.769 8.968 9.162 9.431 9.697 9.949 10.182 10.421 10.715 10.97 11.215 11.497 11.777 12.061 12.39 12.749 13.09 13.465 13.845 14.235 14.644 15.099 15.638 16.174 16.724 17.282 17.958 18.675 19.36 19.999 20.616 20.893 20.813 20.589 20.267 19.913 19.583 19.22 18.865 18.561 18.3 18.031 17.765 17.498 17.24 17.007 16.754 16.528 16.318 16.094 15.864 15.664 15.448 15.228 15.057 14.884 14.709 14.511 14.307 14.177 14.038 13.805 13.643 13.483 13.396 13.22 13.056 12.873 12.765 12.449 12.432 12.316 12.191 11.929 11.791 11.641 11.435 11.194 10.934 10.629 9.135 -4 ,23093 ,TETRA ,17600458,Sun Nov 28 12:21:21 CET,Sun Nov 28 14:08:50 CET,0.0 1.865 2.35 2.717 2.99 3.194 3.393 3.584 3.942 4.093 4.232 4.318 4.641 4.767 5.015 5.264 5.479 5.579 5.784 6.002 6.308 6.496 6.673 6.931 7.171 7.387 7.591 7.781 8.039 8.282 8.517 8.81 9.083 9.353 9.668 10.009 10.331 10.675 11.048 11.46 11.857 12.291 12.816 13.31 13.809 14.348 14.983 15.651 16.338 16.879 17.158 17.184 16.996 16.668 16.298 15.892 15.442 14.996 14.636 14.306 14.024 13.734 13.439 13.154 12.893 12.65 12.368 12.116 11.906 11.678 11.44 11.234 11.023 10.8 10.63 10.466 10.285 10.095 9.892 9.747 9.6 9.373 9.213 9.048 8.969 8.792 8.585 8.379 8.274 7.968 7.943 7.828 7.694 7.409 7.243 7.037 6.817 6.588 6.328 5.965 5.073 -5 ,12391 ,TETRA ,17600459,Sun Nov 28 12:21:21 CET,Sun Nov 28 14:09:11 CET,0.0 3.192 3.744 4.095 4.387 4.631 4.82 5.019 5.39 5.549 5.702 5.787 6.12 6.259 6.551 6.841 7.082 7.189 7.411 7.614 7.881 8.049 8.21 8.448 8.672 8.878 9.081 9.278 9.537 9.799 10.039 10.331 10.619 10.886 11.181 11.508 11.826 12.149 12.5 12.889 13.281 13.717 14.206 14.663 15.183 15.745 16.342 16.941 17.564 18.06 18.143 17.821 17.466 17.104 16.687 16.215 15.763 15.349 14.966 14.561 14.22 13.904 13.578 13.256 12.945 12.659 12.375 12.133 11.933 11.719 11.485 11.291 11.096 10.892 10.736 10.578 10.406 10.224 10.038 9.907 9.768 9.547 9.385 9.202 9.106 8.922 8.731 8.52 8.409 8.116 8.104 7.969 7.816 7.502 7.333 7.145 6.94 6.722 6.496 6.181 4.785 -6 ,12090 ,TETRA ,17600460,Sun Nov 28 12:21:21 CET,Sun Nov 28 14:07:08 CET,0.0 2.215 2.731 3.157 3.464 3.722 3.996 4.237 4.638 4.804 4.986 5.166 5.509 5.648 5.923 6.192 6.462 6.597 6.849 7.079 7.395 7.61 7.828 8.139 8.426 8.687 8.935 9.166 9.46 9.757 10.033 10.359 10.673 10.965 11.28 11.609 11.924 12.266 12.626 12.998 13.381 13.785 14.228 14.706 15.283 15.883 16.57 17.254 17.915 18.6 19.163 19.278 19.071 18.753 18.428 18.097 17.767 17.426 17.088 16.75 16.45 16.177 15.919 15.675 15.45 15.216 14.949 14.687 14.455 14.242 14.006 13.798 13.584 13.357 13.183 13.005 12.825 12.643 12.461 12.337 12.204 11.994 11.843 11.683 11.605 11.435 11.254 11.057 10.944 10.627 10.586 10.468 10.342 10.075 9.926 9.759 9.56 9.324 9.063 8.66 6.788 -7 ,12340 ,TETRA ,17600461,Sun Nov 28 12:21:21 CET,Sun Nov 28 14:08:49 CET,0.0 3.113 3.6 3.939 4.228 4.476 4.708 4.936 5.357 5.537 5.712 5.868 6.213 6.36 6.634 6.862 7.091 7.206 7.412 7.603 7.885 8.07 8.256 8.528 8.78 9.013 9.243 9.464 9.745 10.014 10.271 10.577 10.855 11.131 11.455 11.819 12.172 12.542 12.93 13.352 13.769 14.205 14.711 15.231 15.765 16.263 16.818 17.401 18.016 18.479 18.661 18.44 18.044 17.672 17.297 16.877 16.48 16.097 15.754 15.399 15.07 14.774 14.468 14.163 13.885 13.627 13.365 13.125 12.91 12.679 12.443 12.254 12.049 11.842 11.682 11.512 11.343 11.162 10.955 10.819 10.691 10.49 10.344 10.191 10.113 9.935 9.74 9.544 9.445 9.142 9.089 8.953 8.812 8.516 8.358 8.182 7.991 7.773 7.507 7.106 6.094 -8 ,30563 ,TETRA ,17600462,Sun Nov 28 12:22:19 CET,Sun Nov 28 14:09:07 CET,0.0 2.244 2.767 3.105 3.391 3.625 3.844 4.07 4.472 4.64 4.793 4.888 5.209 5.331 5.566 5.794 6.021 6.132 6.337 6.535 6.821 6.998 7.167 7.413 7.638 7.854 8.076 8.298 8.587 8.851 9.094 9.386 9.663 9.945 10.285 10.653 11.003 11.389 11.775 12.134 12.504 12.926 13.416 13.886 14.398 14.952 15.56 16.134 16.639 17.211 17.786 17.758 17.482 17.184 16.82 16.408 16.041 15.686 15.326 14.95 14.617 14.314 14.025 13.752 13.499 13.27 13.022 12.783 12.575 12.356 12.136 11.957 11.758 11.553 11.394 11.221 11.048 10.867 10.669 10.534 10.389 10.151 9.974 9.795 9.71 9.546 9.378 9.197 9.092 8.779 8.731 8.601 8.485 8.211 8.045 7.873 7.693 7.495 7.244 6.888 5.021 -9 ,21230 ,TETRA ,17600463,Sun Nov 28 12:22:19 CET,Sun Nov 28 14:09:07 CET,0.0 2.067 2.454 2.765 3.06 3.342 3.58 3.811 4.261 4.459 4.633 4.736 5.054 5.178 5.45 5.703 5.928 6.036 6.238 6.428 6.693 6.855 7.016 7.245 7.457 7.671 7.874 8.063 8.324 8.584 8.834 9.147 9.439 9.708 10.021 10.371 10.688 11.02 11.377 11.758 12.149 12.592 13.128 13.629 14.168 14.738 15.324 15.961 16.619 17.255 17.755 17.748 17.455 17.051 16.677 16.335 16.013 15.682 15.349 15.012 14.715 14.438 14.179 13.926 13.678 13.455 13.205 12.962 12.746 12.513 12.258 12.038 11.816 11.609 11.444 11.269 11.085 10.888 10.669 10.521 10.38 10.165 10.013 9.841 9.748 9.563 9.377 9.158 9.046 8.744 8.708 8.596 8.467 8.143 7.987 7.844 7.66 7.443 7.178 6.773 5.069 -10 ,26443 ,TETRA ,17600464,Sun Nov 28 12:22:19 CET,Sun Nov 28 14:09:20 CET,0.0 1.772 2.143 2.469 2.778 3.041 3.266 3.471 3.807 3.949 4.088 4.185 4.507 4.639 4.89 5.152 5.387 5.496 5.711 5.915 6.216 6.393 6.557 6.819 7.078 7.328 7.566 7.787 8.073 8.348 8.609 8.918 9.224 9.534 9.884 10.272 10.626 10.987 11.366 11.78 12.211 12.677 13.204 13.691 14.247 14.86 15.532 16.216 16.935 17.622 18.051 18.014 17.68 17.267 16.811 16.355 15.926 15.495 15.176 14.848 14.514 14.219 13.949 13.695 13.436 13.203 12.987 12.779 12.575 12.355 12.14 11.951 11.746 11.538 11.375 11.204 11.03 10.848 10.65 10.516 10.378 10.167 10.009 9.834 9.747 9.571 9.393 9.217 9.125 8.82 8.801 8.69 8.573 8.317 8.178 8.016 7.831 7.616 7.356 7.043 5.672 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_31_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_31_34.txt deleted file mode 100644 index 819ec789..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_31_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14111 ,TETRA ,17600465,Sun Nov 28 12:22:20 CET,Sun Nov 28 14:09:38 CET,0.0 0.825 1.18 1.454 1.699 1.93 2.141 2.32 2.648 2.805 2.949 3.035 3.332 3.462 3.703 3.921 4.104 4.183 4.318 4.449 4.654 4.784 4.908 5.068 5.235 5.399 5.542 5.677 5.836 5.99 6.134 6.296 6.461 6.618 6.794 6.989 7.155 7.323 7.508 7.698 7.862 8.039 8.241 8.407 8.522 8.589 8.607 8.567 8.378 7.915 6.881 5.389 4.104 2.967 2.001 1.15 0.396 -0.272 -0.865 -1.459 -1.954 -2.405 -2.827 -3.22 -3.617 -3.993 -4.369 -4.73 -5.064 -5.41 -5.763 -6.048 -6.343 -6.652 -6.905 -7.18 -7.453 -7.715 -7.991 -8.197 -8.411 -8.721 -8.941 -9.159 -9.275 -9.538 -9.814 -10.099 -10.259 -10.608 -10.78 -10.962 -11.167 -11.622 -11.853 -12.112 -12.411 -12.756 -13.125 -13.529 -14.869 -2 ,28775 ,TETRA ,17600466,Sun Nov 28 12:23:20 CET,Sun Nov 28 14:18:15 CET,0.0 1.168 1.626 1.932 2.2 2.417 2.58 2.725 2.986 3.118 3.243 3.3 3.578 3.678 3.87 4.042 4.21 4.293 4.444 4.588 4.797 4.925 5.051 5.23 5.395 5.559 5.711 5.849 6.01 6.158 6.307 6.481 6.648 6.808 6.98 7.167 7.35 7.539 7.725 7.917 8.118 8.304 8.469 8.587 8.69 8.772 8.822 8.814 8.618 8.105 7.046 5.585 4.318 3.235 2.268 1.398 0.68 0.026 -0.581 -1.204 -1.754 -2.24 -2.68 -3.075 -3.439 -3.787 -4.158 -4.488 -4.773 -5.061 -5.382 -5.669 -5.989 -6.33 -6.588 -6.862 -7.14 -7.412 -7.69 -7.88 -8.07 -8.372 -8.579 -8.796 -8.906 -9.133 -9.365 -9.588 -9.719 -10.061 -10.195 -10.361 -10.532 -10.925 -11.137 -11.35 -11.57 -11.81 -12.147 -12.614 -14.731 -3 ,5206 ,TETRA ,17600467,Sun Nov 28 12:23:20 CET,Sun Nov 28 14:20:11 CET,0.0 0.826 1.109 1.342 1.569 1.785 1.943 2.08 2.337 2.456 2.568 2.627 2.904 3.004 3.174 3.337 3.5 3.577 3.726 3.866 4.048 4.163 4.28 4.453 4.62 4.769 4.906 5.046 5.214 5.364 5.513 5.684 5.84 5.979 6.116 6.275 6.425 6.597 6.769 6.927 7.098 7.267 7.436 7.565 7.678 7.734 7.735 7.724 7.565 7.066 6.031 4.647 3.392 2.256 1.292 0.464 -0.247 -0.907 -1.498 -2.078 -2.58 -3.026 -3.438 -3.847 -4.226 -4.542 -4.889 -5.198 -5.462 -5.747 -6.037 -6.278 -6.522 -6.784 -6.992 -7.196 -7.399 -7.608 -7.838 -8.005 -8.176 -8.463 -8.686 -8.917 -9.035 -9.283 -9.553 -9.848 -10.0 -10.336 -10.472 -10.633 -10.798 -11.221 -11.45 -11.662 -11.918 -12.216 -12.559 -13.005 -14.253 -4 ,21732 ,TETRA ,17600468,Sun Nov 28 12:23:20 CET,Sun Nov 28 14:10:29 CET,0.0 1.109 1.425 1.671 1.917 2.123 2.297 2.455 2.743 2.863 2.988 3.097 3.39 3.513 3.745 3.949 4.128 4.218 4.395 4.548 4.741 4.869 4.995 5.174 5.344 5.501 5.63 5.751 5.908 6.058 6.221 6.42 6.595 6.758 6.948 7.14 7.321 7.502 7.679 7.864 8.041 8.239 8.425 8.573 8.721 8.832 8.907 8.895 8.701 8.25 7.219 5.743 4.441 3.276 2.263 1.368 0.595 -0.088 -0.681 -1.314 -1.877 -2.339 -2.762 -3.177 -3.55 -3.883 -4.236 -4.546 -4.816 -5.104 -5.413 -5.678 -5.961 -6.272 -6.515 -6.743 -6.971 -7.227 -7.496 -7.671 -7.845 -8.137 -8.36 -8.593 -8.708 -8.965 -9.219 -9.464 -9.597 -9.915 -10.038 -10.19 -10.355 -10.727 -10.924 -11.154 -11.414 -11.714 -12.105 -12.646 -14.291 -5 ,21745 ,TETRA ,17600469,Sun Nov 28 12:24:19 CET,Sun Nov 28 14:21:58 CET,0.0 0.907 1.316 1.613 1.872 2.097 2.294 2.476 2.825 3.0 3.158 3.252 3.523 3.625 3.817 4.002 4.153 4.228 4.391 4.537 4.722 4.838 4.943 5.104 5.256 5.39 5.544 5.695 5.874 6.047 6.205 6.383 6.553 6.717 6.892 7.08 7.269 7.464 7.655 7.833 7.997 8.154 8.32 8.469 8.635 8.757 8.813 8.797 8.599 8.138 7.109 5.691 4.449 3.348 2.372 1.534 0.848 0.241 -0.305 -0.88 -1.38 -1.847 -2.294 -2.697 -3.061 -3.388 -3.743 -4.07 -4.347 -4.63 -4.922 -5.167 -5.444 -5.744 -5.964 -6.181 -6.415 -6.658 -6.914 -7.096 -7.287 -7.567 -7.766 -7.977 -8.081 -8.306 -8.533 -8.792 -8.933 -9.253 -9.331 -9.502 -9.699 -10.095 -10.303 -10.525 -10.764 -11.001 -11.258 -11.599 -13.026 -6 ,18959 ,TETRA ,17600470,Sun Nov 28 12:24:19 CET,Sun Nov 28 14:10:51 CET,0.0 1.383 1.829 2.123 2.363 2.596 2.809 3.013 3.366 3.52 3.651 3.723 4.005 4.105 4.303 4.504 4.686 4.764 4.908 5.039 5.229 5.35 5.465 5.636 5.79 5.924 6.054 6.184 6.358 6.536 6.707 6.895 7.094 7.287 7.477 7.683 7.863 8.043 8.231 8.417 8.621 8.821 8.98 9.107 9.227 9.323 9.338 9.257 9.076 8.555 7.42 5.992 4.736 3.62 2.615 1.736 0.964 0.232 -0.414 -1.073 -1.626 -2.128 -2.594 -3.023 -3.431 -3.799 -4.183 -4.523 -4.823 -5.136 -5.456 -5.715 -5.982 -6.258 -6.465 -6.674 -6.908 -7.176 -7.461 -7.673 -7.886 -8.192 -8.402 -8.608 -8.715 -8.922 -9.122 -9.349 -9.477 -9.797 -9.933 -10.112 -10.291 -10.686 -10.916 -11.151 -11.37 -11.647 -11.988 -12.37 -13.273 -7 ,18600 ,TETRA ,17600471,Sun Nov 28 12:24:19 CET,Sun Nov 28 14:12:35 CET,0.0 0.668 0.998 1.229 1.415 1.582 1.744 1.917 2.237 2.381 2.535 2.649 2.93 3.037 3.24 3.429 3.598 3.673 3.829 3.985 4.198 4.328 4.445 4.621 4.795 4.951 5.107 5.258 5.45 5.627 5.775 5.94 6.097 6.257 6.444 6.635 6.809 6.997 7.195 7.388 7.559 7.718 7.859 7.967 8.069 8.15 8.181 8.113 7.915 7.44 6.363 4.911 3.66 2.565 1.643 0.854 0.13 -0.52 -1.086 -1.697 -2.203 -2.646 -3.086 -3.503 -3.893 -4.246 -4.597 -4.905 -5.173 -5.456 -5.747 -5.985 -6.246 -6.521 -6.729 -6.954 -7.185 -7.411 -7.645 -7.824 -8.014 -8.311 -8.521 -8.752 -8.873 -9.116 -9.382 -9.679 -9.838 -10.178 -10.35 -10.533 -10.715 -11.103 -11.333 -11.59 -11.853 -12.148 -12.506 -12.968 -14.336 -8 ,32741 ,TETRA ,17600472,Sun Nov 28 12:24:19 CET,Sun Nov 28 14:11:27 CET,0.0 0.916 1.309 1.579 1.803 2.031 2.221 2.374 2.672 2.809 2.931 2.977 3.227 3.316 3.498 3.692 3.885 3.979 4.147 4.312 4.547 4.675 4.789 4.957 5.126 5.288 5.435 5.579 5.769 5.944 6.105 6.299 6.474 6.63 6.818 7.021 7.203 7.404 7.597 7.785 7.974 8.15 8.32 8.474 8.629 8.754 8.812 8.754 8.543 8.094 7.085 5.597 4.338 3.278 2.357 1.55 0.813 0.094 -0.503 -1.056 -1.522 -1.943 -2.366 -2.79 -3.223 -3.64 -4.061 -4.432 -4.761 -5.106 -5.471 -5.753 -6.026 -6.323 -6.558 -6.803 -7.058 -7.318 -7.591 -7.779 -7.967 -8.26 -8.484 -8.711 -8.816 -9.027 -9.259 -9.517 -9.648 -9.956 -10.062 -10.226 -10.412 -10.802 -11.011 -11.236 -11.486 -11.768 -12.101 -12.472 -13.621 -9 ,32487 ,TETRA ,17600473,Sun Nov 28 12:24:20 CET,Sun Nov 28 14:10:57 CET,0.0 0.965 1.212 1.4 1.577 1.72 1.844 1.946 2.136 2.217 2.294 2.289 2.525 2.597 2.723 2.837 2.942 2.991 3.093 3.183 3.303 3.377 3.455 3.573 3.67 3.757 3.844 3.931 4.03 4.126 4.221 4.333 4.441 4.541 4.656 4.784 4.903 5.03 5.152 5.269 5.386 5.516 5.643 5.746 5.857 5.957 6.008 5.948 5.758 5.303 4.15 2.574 1.173 -0.131 -1.282 -2.322 -3.226 -4.04 -4.734 -5.405 -5.974 -6.487 -7.014 -7.514 -7.964 -8.367 -8.777 -9.153 -9.472 -9.798 -10.153 -10.442 -10.75 -11.073 -11.326 -11.593 -11.856 -12.125 -12.406 -12.6 -12.81 -13.15 -13.371 -13.602 -13.726 -13.974 -14.245 -14.532 -14.686 -15.028 -15.169 -15.338 -15.515 -15.898 -16.13 -16.381 -16.65 -16.937 -17.25 -17.761 -19.317 -10 ,20793 ,TETRA ,17600474,Sun Nov 28 12:25:19 CET,Sun Nov 28 14:15:32 CET,0.0 1.041 1.422 1.761 2.039 2.282 2.505 2.707 3.028 3.166 3.287 3.33 3.604 3.707 3.897 4.063 4.21 4.289 4.464 4.621 4.812 4.934 5.055 5.219 5.382 5.54 5.683 5.822 5.999 6.162 6.315 6.487 6.654 6.82 6.992 7.179 7.361 7.55 7.723 7.874 8.009 8.139 8.264 8.379 8.507 8.614 8.654 8.588 8.394 7.923 6.85 5.338 3.999 2.828 1.848 0.956 0.151 -0.542 -1.114 -1.667 -2.17 -2.651 -3.113 -3.563 -3.979 -4.342 -4.717 -5.051 -5.334 -5.603 -5.868 -6.089 -6.331 -6.58 -6.772 -6.983 -7.2 -7.42 -7.633 -7.785 -7.963 -8.255 -8.455 -8.652 -8.75 -8.941 -9.152 -9.399 -9.522 -9.832 -9.938 -10.073 -10.214 -10.511 -10.679 -10.899 -11.159 -11.439 -11.783 -12.221 -13.23 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_32_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_32_43.txt deleted file mode 100644 index 178146a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_32_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31515 ,KEBNE ,17026977,Wed Dec 22 15:55:31 CET,Wed Dec 22 17:36:28 CET,0.0 1.088 1.531 1.825 2.047 2.266 2.453 2.623 2.955 3.097 3.223 3.237 3.512 3.606 3.792 3.972 4.156 4.252 4.438 4.596 4.807 4.943 5.071 5.257 5.449 5.634 5.802 5.949 6.143 6.323 6.477 6.678 6.877 7.06 7.269 7.489 7.698 7.936 8.186 8.423 8.641 8.902 9.204 9.494 9.84 10.191 10.536 10.855 11.155 11.382 11.361 11.006 10.57 10.098 9.645 9.204 8.812 8.448 8.112 7.782 7.504 7.242 6.947 6.623 6.323 6.059 5.785 5.54 5.341 5.156 4.941 4.754 4.576 4.39 4.237 4.077 3.921 3.768 3.602 3.483 3.367 3.186 3.054 2.921 2.853 2.716 2.571 2.415 2.337 2.065 2.085 1.99 1.898 1.727 1.627 1.513 1.358 1.165 0.983 0.789 0.097 -2 ,6137 ,KEBNE ,17026978,Wed Dec 22 15:55:35 CET,Wed Dec 22 17:31:48 CET,0.0 1.061 1.502 1.849 2.111 2.323 2.499 2.66 2.921 3.037 3.154 3.211 3.518 3.634 3.842 4.032 4.213 4.294 4.452 4.613 4.836 4.975 5.114 5.315 5.497 5.668 5.843 6.004 6.203 6.39 6.57 6.795 6.999 7.183 7.399 7.642 7.879 8.114 8.338 8.598 8.871 9.162 9.45 9.709 10.032 10.352 10.628 10.917 11.197 11.394 11.361 11.031 10.616 10.126 9.65 9.211 8.807 8.442 8.115 7.751 7.442 7.167 6.888 6.614 6.356 6.13 5.892 5.667 5.475 5.285 5.086 4.912 4.726 4.549 4.425 4.292 4.144 3.983 3.828 3.725 3.61 3.423 3.294 3.175 3.113 2.983 2.854 2.714 2.637 2.356 2.37 2.282 2.199 2.011 1.9 1.769 1.636 1.52 1.374 1.204 0.74 -3 ,6316 ,KEBNE ,17026979,Wed Dec 22 15:55:35 CET,Wed Dec 22 17:29:30 CET,0.0 1.417 1.742 2.002 2.256 2.48 2.676 2.876 3.258 3.408 3.544 3.62 3.927 4.033 4.216 4.375 4.539 4.618 4.763 4.895 5.088 5.219 5.35 5.541 5.714 5.872 6.016 6.156 6.356 6.554 6.731 6.936 7.142 7.332 7.539 7.756 7.967 8.212 8.464 8.724 8.982 9.262 9.578 9.87 10.196 10.53 10.894 11.257 11.557 11.781 11.739 11.426 11.014 10.535 10.074 9.66 9.312 8.984 8.663 8.342 8.059 7.803 7.559 7.315 7.093 6.887 6.667 6.463 6.269 6.049 5.801 5.605 5.436 5.272 5.138 4.995 4.852 4.703 4.546 4.438 4.322 4.142 4.021 3.881 3.804 3.664 3.517 3.354 3.26 2.95 2.931 2.828 2.734 2.547 2.447 2.358 2.246 2.092 1.918 1.732 1.193 -4 ,29592 ,KEBNE ,17026980,Wed Dec 22 15:55:34 CET,Wed Dec 22 17:29:44 CET,0.0 1.75 2.117 2.338 2.528 2.715 2.889 3.048 3.301 3.403 3.498 3.513 3.797 3.877 4.04 4.209 4.361 4.427 4.557 4.691 4.88 4.993 5.12 5.308 5.469 5.614 5.753 5.891 6.064 6.225 6.378 6.563 6.735 6.897 7.09 7.297 7.5 7.725 7.968 8.219 8.464 8.729 9.026 9.297 9.594 9.937 10.348 10.755 11.064 11.228 11.078 10.548 9.958 9.445 8.978 8.51 8.079 7.677 7.336 6.983 6.664 6.396 6.146 5.891 5.643 5.418 5.186 4.976 4.801 4.624 4.439 4.28 4.099 3.911 3.781 3.648 3.501 3.346 3.185 3.077 2.968 2.797 2.673 2.533 2.461 2.319 2.18 2.031 1.956 1.689 1.697 1.592 1.491 1.278 1.162 1.029 0.879 0.716 0.489 0.229 -0.144 -5 ,21996 ,KEBNE ,17026981,Wed Dec 22 15:55:30 CET,Wed Dec 22 17:36:24 CET,0.0 1.379 1.721 2.014 2.28 2.495 2.659 2.806 3.068 3.195 3.306 3.297 3.579 3.685 3.892 4.091 4.29 4.384 4.551 4.693 4.895 5.023 5.145 5.337 5.505 5.644 5.779 5.931 6.143 6.334 6.512 6.719 6.915 7.099 7.314 7.545 7.745 7.956 8.18 8.405 8.632 8.88 9.147 9.379 9.643 9.949 10.265 10.58 10.889 11.094 11.036 10.657 10.14 9.639 9.214 8.782 8.377 8.028 7.695 7.336 7.036 6.77 6.523 6.288 6.072 5.857 5.623 5.416 5.231 5.048 4.858 4.693 4.528 4.352 4.213 4.076 3.925 3.768 3.609 3.5 3.388 3.205 3.078 2.942 2.875 2.737 2.582 2.429 2.356 2.089 2.095 1.989 1.884 1.688 1.584 1.463 1.337 1.218 1.024 0.717 0.087 -6 ,20357 ,KEBNE ,17026982,Wed Dec 22 15:55:31 CET,Wed Dec 22 17:36:47 CET,0.0 1.749 2.087 2.414 2.667 2.853 3.037 3.221 3.536 3.655 3.771 3.81 4.091 4.188 4.373 4.554 4.738 4.827 4.993 5.146 5.372 5.52 5.653 5.835 5.997 6.14 6.285 6.425 6.595 6.761 6.921 7.106 7.28 7.45 7.642 7.843 8.036 8.269 8.524 8.777 9.032 9.294 9.546 9.785 10.073 10.382 10.685 10.981 11.268 11.459 11.454 11.146 10.696 10.205 9.743 9.324 8.954 8.594 8.253 7.916 7.625 7.349 7.092 6.851 6.608 6.389 6.167 5.954 5.767 5.579 5.386 5.218 5.044 4.864 4.719 4.569 4.422 4.274 4.103 3.982 3.873 3.694 3.566 3.451 3.392 3.269 3.14 2.994 2.911 2.632 2.647 2.562 2.478 2.284 2.165 2.041 1.909 1.759 1.574 1.334 0.778 -7 ,25401 ,KEBNE ,17026983,Wed Dec 22 15:55:30 CET,Wed Dec 22 17:37:29 CET,0.0 0.924 1.247 1.521 1.746 1.932 2.107 2.257 2.545 2.677 2.777 2.772 3.053 3.139 3.311 3.483 3.638 3.707 3.853 4.002 4.221 4.354 4.477 4.645 4.797 4.951 5.099 5.24 5.433 5.605 5.75 5.939 6.127 6.293 6.478 6.683 6.867 7.063 7.291 7.534 7.78 8.05 8.322 8.574 8.868 9.177 9.484 9.808 10.104 10.265 10.237 9.888 9.429 8.942 8.514 8.136 7.772 7.416 7.107 6.792 6.517 6.27 6.038 5.819 5.588 5.379 5.174 5.003 4.852 4.681 4.503 4.35 4.182 4.009 3.871 3.734 3.598 3.459 3.311 3.205 3.091 2.908 2.784 2.651 2.583 2.446 2.305 2.165 2.088 1.804 1.793 1.688 1.589 1.421 1.33 1.222 1.102 0.963 0.789 0.548 0.165 -8 ,993 ,KEBNE ,17026984,Wed Dec 22 15:55:30 CET,Wed Dec 22 17:37:02 CET,0.0 1.693 2.032 2.285 2.486 2.676 2.845 2.993 3.282 3.413 3.538 3.602 3.899 3.994 4.187 4.369 4.531 4.618 4.797 4.951 5.159 5.297 5.434 5.607 5.762 5.924 6.082 6.236 6.435 6.647 6.861 7.094 7.296 7.486 7.698 7.91 8.109 8.318 8.524 8.742 8.97 9.22 9.499 9.782 10.095 10.393 10.729 11.057 11.308 11.442 11.383 10.992 10.547 10.113 9.633 9.147 8.71 8.304 7.957 7.607 7.304 7.043 6.787 6.543 6.319 6.123 5.907 5.689 5.504 5.31 5.108 4.936 4.757 4.575 4.444 4.308 4.159 4.0 3.824 3.707 3.587 3.398 3.269 3.125 3.049 2.906 2.76 2.59 2.496 2.212 2.229 2.131 2.02 1.792 1.67 1.523 1.357 1.183 0.991 0.727 -0.372 -9 ,13880 ,KEBNE ,17026985,Wed Dec 22 15:55:31 CET,Wed Dec 22 17:37:19 CET,0.0 1.376 1.855 2.102 2.301 2.482 2.643 2.775 2.995 3.106 3.227 3.253 3.535 3.632 3.831 4.009 4.165 4.231 4.365 4.498 4.704 4.842 4.965 5.138 5.305 5.464 5.621 5.772 5.965 6.154 6.335 6.531 6.715 6.89 7.085 7.312 7.535 7.774 8.014 8.255 8.483 8.714 8.978 9.234 9.521 9.84 10.182 10.49 10.766 10.996 10.998 10.652 10.191 9.728 9.301 8.853 8.453 8.104 7.801 7.502 7.22 6.942 6.684 6.45 6.224 5.997 5.753 5.54 5.359 5.175 4.979 4.825 4.68 4.522 4.396 4.267 4.133 3.993 3.824 3.698 3.583 3.411 3.283 3.15 3.085 2.952 2.806 2.649 2.567 2.283 2.303 2.213 2.112 1.863 1.73 1.607 1.467 1.299 1.112 0.859 0.243 -10 ,12390 ,KEBNE ,17026986,Wed Dec 22 15:55:31 CET,Wed Dec 22 17:36:09 CET,0.0 1.461 1.89 2.184 2.461 2.697 2.9 3.089 3.42 3.562 3.69 3.752 4.052 4.17 4.4 4.601 4.772 4.846 4.976 5.113 5.323 5.452 5.573 5.754 5.936 6.096 6.229 6.37 6.558 6.74 6.938 7.169 7.38 7.581 7.785 8.011 8.241 8.479 8.709 8.933 9.162 9.429 9.743 10.013 10.293 10.61 10.941 11.25 11.518 11.71 11.705 11.365 10.951 10.524 10.072 9.623 9.223 8.852 8.515 8.158 7.859 7.603 7.366 7.14 6.925 6.713 6.481 6.272 6.095 5.914 5.713 5.544 5.353 5.151 5.009 4.866 4.716 4.562 4.405 4.295 4.182 4.013 3.896 3.77 3.704 3.567 3.428 3.281 3.203 2.921 2.926 2.826 2.722 2.517 2.418 2.31 2.179 2.009 1.829 1.645 0.966 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_32_46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_32_46.txt deleted file mode 100644 index dd0d7427..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_32_46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2478 ,KEBNE ,17026987,Wed Dec 22 15:55:31 CET,Wed Dec 22 17:37:45 CET,0.0 1.369 1.689 1.915 2.105 2.276 2.46 2.632 2.907 3.032 3.14 3.143 3.425 3.513 3.68 3.842 3.996 4.066 4.212 4.37 4.598 4.73 4.857 5.039 5.196 5.337 5.483 5.616 5.784 5.963 6.124 6.301 6.474 6.632 6.799 6.99 7.165 7.349 7.547 7.754 7.93 8.092 8.281 8.458 8.631 8.755 8.821 8.847 8.803 8.615 8.117 7.325 6.545 5.837 5.201 4.61 4.084 3.612 3.203 2.81 2.469 2.153 1.873 1.619 1.365 1.116 0.843 0.611 0.422 0.223 0.02 -0.146 -0.338 -0.539 -0.699 -0.878 -1.052 -1.224 -1.407 -1.538 -1.677 -1.881 -2.02 -2.152 -2.22 -2.375 -2.527 -2.689 -2.777 -3.065 -3.038 -3.126 -3.225 -3.439 -3.551 -3.664 -3.783 -3.932 -4.127 -4.376 -4.844 -2 ,6035 ,KEBNE ,17026988,Wed Dec 22 15:55:31 CET,Wed Dec 22 17:37:10 CET,0.0 0.904 1.255 1.554 1.778 1.962 2.141 2.292 2.538 2.653 2.757 2.756 3.07 3.187 3.381 3.55 3.718 3.796 3.935 4.07 4.269 4.401 4.514 4.665 4.801 4.928 5.066 5.199 5.367 5.534 5.691 5.875 6.039 6.189 6.363 6.552 6.729 6.913 7.078 7.24 7.399 7.559 7.732 7.89 8.075 8.257 8.445 8.58 8.621 8.47 7.881 6.967 6.145 5.394 4.712 4.076 3.539 3.079 2.661 2.225 1.852 1.519 1.216 0.945 0.68 0.444 0.209 -0.01 -0.208 -0.413 -0.614 -0.781 -0.958 -1.145 -1.284 -1.426 -1.579 -1.741 -1.914 -2.033 -2.149 -2.323 -2.454 -2.594 -2.664 -2.802 -2.938 -3.076 -3.154 -3.435 -3.423 -3.526 -3.631 -3.825 -3.936 -4.055 -4.168 -4.305 -4.486 -4.717 -5.464 -3 ,28087 ,KEBNE ,17026989,Wed Dec 22 15:55:30 CET,Wed Dec 22 17:37:17 CET,0.0 0.714 1.065 1.341 1.541 1.707 1.874 2.031 2.272 2.387 2.498 2.502 2.787 2.876 3.053 3.212 3.366 3.434 3.569 3.709 3.878 3.988 4.104 4.272 4.438 4.604 4.762 4.901 5.069 5.226 5.376 5.549 5.707 5.849 6.014 6.184 6.336 6.505 6.677 6.855 7.027 7.217 7.425 7.585 7.74 7.861 7.969 8.015 7.93 7.651 7.019 6.084 5.201 4.444 3.81 3.206 2.665 2.19 1.77 1.337 0.951 0.608 0.298 0.002 -0.277 -0.545 -0.825 -1.058 -1.261 -1.472 -1.689 -1.872 -2.064 -2.267 -2.413 -2.559 -2.712 -2.873 -3.048 -3.166 -3.298 -3.496 -3.632 -3.786 -3.855 -3.99 -4.148 -4.302 -4.371 -4.645 -4.646 -4.756 -4.854 -5.057 -5.167 -5.296 -5.45 -5.619 -5.818 -6.08 -6.566 -4 ,26594 ,KEBNE ,17026990,Wed Dec 22 15:56:33 CET,Wed Dec 22 17:38:16 CET,0.0 1.283 1.657 1.903 2.116 2.314 2.488 2.647 2.929 3.043 3.15 3.165 3.446 3.537 3.716 3.867 4.009 4.077 4.196 4.316 4.486 4.583 4.678 4.814 4.966 5.123 5.263 5.384 5.53 5.672 5.797 5.946 6.099 6.253 6.434 6.632 6.811 7.003 7.217 7.431 7.622 7.832 8.056 8.248 8.45 8.645 8.823 8.946 9.002 8.881 8.369 7.537 6.724 5.985 5.322 4.728 4.217 3.75 3.332 2.893 2.518 2.202 1.899 1.613 1.359 1.116 0.849 0.618 0.421 0.216 -0.001 -0.185 -0.377 -0.576 -0.73 -0.89 -1.049 -1.215 -1.384 -1.497 -1.624 -1.824 -1.949 -2.075 -2.144 -2.295 -2.446 -2.596 -2.671 -2.941 -2.901 -2.994 -3.102 -3.315 -3.432 -3.565 -3.708 -3.877 -4.059 -4.236 -4.507 -5 ,18218 ,KEBNE ,17026991,Wed Dec 22 15:56:33 CET,Wed Dec 22 17:37:50 CET,0.0 1.288 1.665 1.948 2.206 2.42 2.586 2.718 2.964 3.09 3.211 3.229 3.496 3.587 3.769 3.964 4.138 4.222 4.381 4.503 4.668 4.776 4.886 5.058 5.239 5.395 5.528 5.661 5.828 5.986 6.14 6.333 6.518 6.689 6.86 7.026 7.179 7.35 7.526 7.719 7.901 8.094 8.32 8.498 8.677 8.847 8.986 9.068 9.095 8.996 8.528 7.686 6.884 6.16 5.487 4.87 4.347 3.868 3.449 3.03 2.664 2.324 1.999 1.705 1.448 1.216 0.969 0.753 0.567 0.378 0.178 0.012 -0.152 -0.331 -0.481 -0.636 -0.794 -0.957 -1.13 -1.253 -1.383 -1.583 -1.71 -1.839 -1.91 -2.063 -2.216 -2.368 -2.445 -2.728 -2.721 -2.812 -2.918 -3.191 -3.34 -3.47 -3.593 -3.758 -3.945 -4.137 -4.556 -6 ,7421 ,KEBNE ,17026992,Wed Dec 22 15:56:33 CET,Wed Dec 22 17:37:36 CET,0.0 1.063 1.438 1.739 1.992 2.217 2.418 2.595 2.916 3.059 3.179 3.207 3.496 3.588 3.757 3.909 4.051 4.121 4.266 4.401 4.569 4.678 4.788 4.947 5.098 5.246 5.375 5.501 5.698 5.876 6.035 6.233 6.417 6.589 6.769 6.945 7.097 7.258 7.429 7.599 7.768 7.956 8.15 8.322 8.495 8.661 8.812 8.909 8.928 8.827 8.352 7.516 6.685 5.936 5.309 4.728 4.209 3.726 3.304 2.881 2.523 2.206 1.903 1.622 1.364 1.119 0.847 0.61 0.418 0.223 0.011 -0.172 -0.358 -0.541 -0.685 -0.836 -0.996 -1.168 -1.349 -1.472 -1.599 -1.792 -1.925 -2.059 -2.126 -2.274 -2.434 -2.586 -2.661 -2.95 -2.907 -2.997 -3.089 -3.273 -3.379 -3.492 -3.607 -3.759 -3.935 -4.111 -4.599 -7 ,6399 ,KEBNE ,17026993,Wed Dec 22 15:56:35 CET,Wed Dec 22 17:38:13 CET,0.0 1.777 2.221 2.52 2.742 2.94 3.129 3.307 3.629 3.774 3.899 3.95 4.263 4.389 4.602 4.782 4.965 5.055 5.223 5.371 5.591 5.729 5.858 6.073 6.264 6.437 6.599 6.746 6.934 7.117 7.3 7.488 7.653 7.818 7.997 8.19 8.376 8.553 8.723 8.896 9.052 9.23 9.429 9.604 9.819 10.023 10.16 10.233 10.241 10.079 9.508 8.61 7.804 7.094 6.451 5.855 5.311 4.822 4.413 4.002 3.637 3.314 3.011 2.725 2.46 2.216 1.965 1.733 1.53 1.328 1.108 0.925 0.736 0.527 0.37 0.219 0.062 -0.102 -0.273 -0.391 -0.509 -0.699 -0.833 -0.975 -1.05 -1.191 -1.326 -1.467 -1.547 -1.844 -1.815 -1.901 -1.984 -2.162 -2.277 -2.397 -2.51 -2.626 -2.756 -2.952 -3.508 -8 ,30543 ,KEBNE ,17026994,Wed Dec 22 15:56:33 CET,Wed Dec 22 17:37:31 CET,0.0 1.147 1.533 1.788 1.996 2.166 2.313 2.426 2.66 2.806 2.954 2.998 3.296 3.394 3.575 3.766 3.926 3.997 4.142 4.275 4.469 4.595 4.718 4.901 5.08 5.254 5.406 5.551 5.745 5.924 6.085 6.272 6.44 6.602 6.8 7.003 7.186 7.375 7.573 7.782 7.991 8.192 8.394 8.602 8.832 9.031 9.242 9.41 9.435 9.293 8.77 7.86 7.051 6.334 5.695 5.103 4.572 4.102 3.704 3.321 2.978 2.652 2.345 2.072 1.818 1.586 1.337 1.118 0.93 0.719 0.518 0.356 0.188 0.013 -0.139 -0.297 -0.451 -0.604 -0.77 -0.884 -0.999 -1.181 -1.305 -1.441 -1.509 -1.651 -1.801 -1.944 -2.03 -2.323 -2.319 -2.409 -2.507 -2.714 -2.825 -2.956 -3.106 -3.266 -3.413 -3.59 -3.941 -9 ,12654 ,KEBNE ,17026995,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:40:15 CET,0.0 1.686 2.006 2.237 2.441 2.619 2.775 2.931 3.182 3.295 3.41 3.425 3.718 3.813 3.978 4.107 4.235 4.305 4.459 4.605 4.797 4.917 5.039 5.221 5.389 5.543 5.684 5.822 5.997 6.143 6.27 6.441 6.604 6.745 6.931 7.124 7.278 7.455 7.636 7.816 8.012 8.219 8.425 8.608 8.769 8.889 9.007 9.104 9.133 8.959 8.347 7.445 6.597 5.833 5.186 4.589 4.05 3.534 3.086 2.656 2.294 1.977 1.671 1.391 1.142 0.907 0.667 0.449 0.25 0.047 -0.159 -0.325 -0.516 -0.719 -0.874 -1.035 -1.202 -1.374 -1.537 -1.642 -1.754 -1.936 -2.062 -2.189 -2.252 -2.376 -2.511 -2.649 -2.72 -2.997 -2.977 -3.076 -3.188 -3.425 -3.543 -3.651 -3.779 -3.936 -4.126 -4.333 -4.738 -10 ,3888 ,KEBNE ,17026996,Wed Dec 22 15:56:32 CET,Wed Dec 22 17:38:34 CET,0.0 1.98 2.422 2.728 2.97 3.178 3.364 3.52 3.82 3.957 4.071 4.087 4.37 4.455 4.644 4.815 4.954 5.027 5.188 5.334 5.522 5.643 5.763 5.934 6.087 6.236 6.381 6.516 6.7 6.872 7.001 7.147 7.287 7.42 7.584 7.769 7.932 8.09 8.241 8.399 8.577 8.756 8.952 9.149 9.33 9.472 9.584 9.66 9.688 9.557 9.011 8.131 7.346 6.632 5.973 5.382 4.85 4.374 3.982 3.556 3.182 2.861 2.562 2.285 2.032 1.795 1.533 1.294 1.095 0.89 0.675 0.504 0.319 0.128 -0.014 -0.163 -0.322 -0.48 -0.632 -0.744 -0.856 -1.021 -1.136 -1.253 -1.315 -1.45 -1.608 -1.774 -1.851 -2.129 -2.091 -2.176 -2.268 -2.479 -2.6 -2.739 -2.894 -3.047 -3.198 -3.372 -3.832 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_32_47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_32_47.txt deleted file mode 100644 index 416892af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_32_47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30696 ,KEBNE ,17026997,Wed Dec 22 15:56:33 CET,Wed Dec 22 17:38:41 CET,0.0 3.847 4.41 4.746 5.031 5.278 5.504 5.729 6.14 6.31 6.468 6.596 6.929 7.055 7.276 7.491 7.693 7.788 7.974 8.151 8.395 8.554 8.706 8.909 9.114 9.322 9.501 9.665 9.866 10.043 10.213 10.424 10.632 10.826 11.039 11.287 11.517 11.74 11.957 12.172 12.384 12.615 12.885 13.112 13.33 13.53 13.656 13.69 13.603 13.278 12.449 11.226 10.147 9.189 8.357 7.617 6.966 6.386 5.894 5.381 4.942 4.573 4.228 3.895 3.572 3.286 3.007 2.743 2.511 2.272 2.019 1.825 1.622 1.394 1.212 1.032 0.848 0.66 0.469 0.335 0.203 -0.009 -0.16 -0.324 -0.41 -0.568 -0.734 -0.922 -1.022 -1.32 -1.349 -1.493 -1.651 -1.965 -2.125 -2.308 -2.499 -2.734 -2.994 -3.246 -3.947 -2 ,19779 ,KEBNE ,17026998,Wed Dec 22 15:56:39 CET,Wed Dec 22 17:30:00 CET,0.0 1.747 2.249 2.621 2.916 3.161 3.372 3.577 3.989 4.156 4.281 4.384 4.729 4.865 5.106 5.318 5.513 5.605 5.787 5.966 6.216 6.373 6.521 6.733 6.941 7.133 7.308 7.472 7.648 7.799 7.949 8.111 8.259 8.433 8.681 8.946 9.164 9.396 9.633 9.856 10.071 10.299 10.548 10.771 10.996 11.225 11.415 11.494 11.398 11.088 10.38 9.282 8.288 7.427 6.654 5.94 5.334 4.787 4.289 3.768 3.343 2.987 2.61 2.222 1.867 1.547 1.216 0.91 0.638 0.365 0.082 -0.153 -0.384 -0.624 -0.816 -1.01 -1.215 -1.439 -1.662 -1.808 -1.966 -2.22 -2.395 -2.564 -2.648 -2.833 -3.037 -3.253 -3.364 -3.669 -3.668 -3.785 -3.923 -4.226 -4.39 -4.57 -4.789 -5.032 -5.298 -5.592 -6.123 -3 ,12931 ,KEBNE ,17026999,Wed Dec 22 15:56:39 CET,Wed Dec 22 17:33:05 CET,0.0 1.836 2.222 2.524 2.713 2.857 2.996 3.152 3.426 3.534 3.639 3.644 3.929 4.03 4.202 4.345 4.51 4.614 4.817 4.993 5.248 5.415 5.567 5.78 5.993 6.195 6.378 6.544 6.747 6.94 7.128 7.345 7.554 7.748 7.961 8.193 8.408 8.639 8.864 9.083 9.314 9.576 9.831 10.03 10.275 10.549 10.768 10.871 10.858 10.584 9.78 8.643 7.607 6.687 5.896 5.195 4.581 4.032 3.538 3.028 2.588 2.193 1.828 1.497 1.183 0.895 0.588 0.285 0.013 -0.265 -0.528 -0.733 -0.968 -1.225 -1.409 -1.597 -1.796 -1.998 -2.199 -2.344 -2.495 -2.722 -2.879 -3.047 -3.135 -3.318 -3.511 -3.688 -3.77 -4.057 -4.057 -4.169 -4.304 -4.601 -4.758 -4.923 -5.098 -5.333 -5.589 -5.938 -6.866 -4 ,25344 ,KEBNE ,17027000,Wed Dec 22 15:56:34 CET,Wed Dec 22 17:38:27 CET,0.0 2.436 2.922 3.271 3.561 3.803 4.031 4.264 4.735 4.951 5.152 5.332 5.657 5.766 5.965 6.168 6.372 6.47 6.673 6.856 7.093 7.242 7.383 7.579 7.771 7.954 8.115 8.264 8.443 8.62 8.784 8.979 9.175 9.358 9.566 9.815 10.036 10.262 10.509 10.747 10.979 11.213 11.471 11.725 11.976 12.187 12.371 12.491 12.436 12.111 11.361 10.281 9.3 8.457 7.723 7.01 6.365 5.795 5.313 4.85 4.454 4.095 3.742 3.411 3.102 2.817 2.537 2.287 2.063 1.815 1.53 1.299 1.063 0.822 0.641 0.446 0.23 0.015 -0.195 -0.341 -0.483 -0.705 -0.854 -1.006 -1.087 -1.245 -1.412 -1.608 -1.712 -2.009 -2.023 -2.137 -2.254 -2.543 -2.706 -2.89 -3.114 -3.355 -3.642 -3.963 -4.638 -5 ,7531 ,KEBNE ,17027001,Wed Dec 22 15:56:35 CET,Wed Dec 22 17:38:39 CET,0.0 1.658 2.013 2.294 2.519 2.685 2.863 3.088 3.5 3.673 3.84 3.968 4.29 4.421 4.682 4.931 5.165 5.269 5.466 5.673 5.956 6.125 6.28 6.492 6.698 6.881 7.05 7.211 7.408 7.591 7.777 8.004 8.215 8.414 8.633 8.869 9.083 9.308 9.536 9.773 10.018 10.273 10.542 10.772 10.994 11.199 11.379 11.51 11.539 11.294 10.52 9.293 8.148 7.198 6.42 5.722 5.109 4.538 4.041 3.565 3.162 2.798 2.448 2.112 1.8 1.52 1.233 0.983 0.772 0.557 0.323 0.112 -0.119 -0.363 -0.544 -0.718 -0.892 -1.061 -1.237 -1.367 -1.505 -1.721 -1.874 -2.037 -2.117 -2.288 -2.465 -2.659 -2.769 -3.084 -3.109 -3.231 -3.355 -3.613 -3.76 -3.931 -4.109 -4.292 -4.51 -4.768 -5.919 -6 ,6587 ,KEBNE ,17027002,Wed Dec 22 15:56:35 CET,Wed Dec 22 17:37:22 CET,0.0 1.575 2.08 2.496 2.858 3.179 3.456 3.67 4.028 4.189 4.342 4.439 4.762 4.897 5.138 5.37 5.586 5.691 5.894 6.067 6.308 6.466 6.615 6.815 7.0 7.19 7.373 7.538 7.739 7.929 8.113 8.332 8.536 8.726 8.934 9.149 9.351 9.582 9.808 10.022 10.241 10.49 10.749 10.959 11.181 11.404 11.561 11.618 11.554 11.254 10.482 9.322 8.279 7.376 6.575 5.854 5.217 4.597 4.096 3.606 3.149 2.745 2.367 2.017 1.695 1.403 1.107 0.844 0.613 0.39 0.142 -0.086 -0.309 -0.534 -0.708 -0.893 -1.094 -1.312 -1.54 -1.69 -1.843 -2.077 -2.221 -2.365 -2.449 -2.635 -2.823 -3.043 -3.167 -3.477 -3.478 -3.586 -3.704 -3.969 -4.115 -4.276 -4.439 -4.626 -4.88 -5.209 -5.95 -7 ,20239 ,KEBNE ,17027003,Wed Dec 22 15:56:34 CET,Wed Dec 22 17:37:44 CET,0.0 1.545 1.959 2.252 2.521 2.757 2.961 3.164 3.526 3.67 3.806 3.856 4.166 4.289 4.532 4.764 4.983 5.078 5.246 5.406 5.641 5.787 5.932 6.136 6.31 6.475 6.65 6.815 7.004 7.2 7.4 7.631 7.828 7.995 8.186 8.405 8.608 8.808 9.026 9.267 9.49 9.695 9.909 10.11 10.317 10.507 10.619 10.679 10.656 10.374 9.647 8.517 7.482 6.495 5.6 4.847 4.176 3.545 3.018 2.481 2.01 1.581 1.156 0.767 0.432 0.129 -0.197 -0.483 -0.728 -0.992 -1.277 -1.511 -1.743 -1.971 -2.156 -2.353 -2.542 -2.738 -2.949 -3.1 -3.262 -3.492 -3.643 -3.806 -3.896 -4.102 -4.306 -4.496 -4.593 -4.904 -4.965 -5.107 -5.246 -5.557 -5.733 -5.914 -6.088 -6.276 -6.513 -6.87 -7.999 -8 ,28730 ,KEBNE ,17027004,Wed Dec 22 15:56:35 CET,Wed Dec 22 17:38:00 CET,0.0 1.035 1.446 1.739 2.022 2.259 2.463 2.661 3.003 3.155 3.302 3.388 3.69 3.808 4.037 4.26 4.475 4.576 4.767 4.942 5.2 5.356 5.498 5.701 5.883 6.055 6.214 6.363 6.553 6.736 6.905 7.092 7.273 7.458 7.654 7.852 8.055 8.285 8.506 8.717 8.925 9.13 9.352 9.56 9.744 9.883 9.971 10.009 9.958 9.652 8.933 7.899 6.899 5.959 5.155 4.439 3.802 3.234 2.743 2.273 1.868 1.488 1.121 0.773 0.467 0.181 -0.143 -0.421 -0.658 -0.922 -1.202 -1.431 -1.666 -1.914 -2.105 -2.294 -2.512 -2.75 -2.98 -3.136 -3.288 -3.515 -3.668 -3.822 -3.904 -4.079 -4.277 -4.49 -4.595 -4.906 -4.917 -5.036 -5.169 -5.462 -5.624 -5.8 -6.002 -6.203 -6.413 -6.66 -7.56 -9 ,3718 ,KEBNE ,17027005,Wed Dec 22 15:56:35 CET,Wed Dec 22 17:37:55 CET,0.0 1.933 2.559 2.966 3.339 3.656 3.912 4.13 4.505 4.672 4.833 4.936 5.255 5.385 5.626 5.834 6.026 6.126 6.314 6.491 6.742 6.907 7.066 7.283 7.5 7.699 7.876 8.045 8.269 8.469 8.622 8.799 8.973 9.135 9.337 9.576 9.794 10.019 10.241 10.471 10.7 10.931 11.177 11.402 11.651 11.888 12.062 12.157 12.159 11.951 11.227 10.091 9.115 8.243 7.456 6.746 6.106 5.524 5.043 4.577 4.173 3.817 3.474 3.152 2.854 2.564 2.259 1.993 1.768 1.548 1.301 1.091 0.898 0.698 0.533 0.364 0.194 0.012 -0.176 -0.31 -0.453 -0.678 -0.825 -0.961 -1.035 -1.193 -1.366 -1.553 -1.652 -1.948 -1.98 -2.096 -2.202 -2.466 -2.623 -2.764 -2.904 -3.076 -3.292 -3.644 -4.993 -10 ,1788 ,KEBNE ,17027006,Wed Dec 22 15:56:35 CET,Wed Dec 22 17:38:00 CET,0.0 2.937 3.516 3.939 4.245 4.512 4.756 4.961 5.307 5.466 5.626 5.784 6.14 6.283 6.517 6.724 6.931 7.033 7.211 7.377 7.614 7.766 7.929 8.161 8.365 8.564 8.763 8.943 9.147 9.344 9.539 9.758 9.955 10.151 10.38 10.634 10.861 11.076 11.291 11.519 11.765 12.037 12.317 12.549 12.767 12.958 13.101 13.165 13.109 12.863 12.186 11.127 10.119 9.169 8.365 7.685 7.1 6.56 6.079 5.611 5.19 4.792 4.427 4.108 3.803 3.506 3.2 2.943 2.732 2.504 2.253 2.049 1.848 1.638 1.466 1.286 1.112 0.938 0.747 0.616 0.485 0.286 0.145 -0.002 -0.079 -0.239 -0.419 -0.623 -0.722 -1.019 -1.051 -1.188 -1.311 -1.566 -1.707 -1.855 -2.001 -2.18 -2.455 -2.83 -3.621 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_32.txt deleted file mode 100644 index a6c1aaf7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5857 ,TETRA ,17600475,Sun Nov 28 12:25:19 CET,Sun Nov 28 14:22:03 CET,0.0 0.858 1.205 1.477 1.661 1.815 1.959 2.095 2.381 2.51 2.611 2.632 2.925 3.017 3.185 3.351 3.501 3.563 3.679 3.799 3.978 4.094 4.205 4.363 4.507 4.641 4.778 4.917 5.085 5.241 5.397 5.566 5.735 5.908 6.095 6.298 6.486 6.676 6.864 7.074 7.29 7.51 7.758 7.991 8.253 8.525 8.805 9.078 9.329 9.458 9.286 8.842 8.367 7.882 7.438 7.024 6.644 6.316 6.014 5.671 5.367 5.094 4.824 4.579 4.355 4.148 3.927 3.724 3.541 3.336 3.125 2.959 2.783 2.593 2.447 2.306 2.159 2.015 1.873 1.771 1.661 1.456 1.322 1.193 1.122 0.984 0.834 0.668 0.587 0.318 0.311 0.207 0.105 -0.143 -0.28 -0.403 -0.536 -0.693 -0.876 -1.067 -1.639 -2 ,7127 ,TETRA ,17600476,Sun Nov 28 12:25:19 CET,Sun Nov 28 14:15:05 CET,0.0 0.68 0.975 1.201 1.399 1.562 1.709 1.864 2.169 2.291 2.396 2.414 2.692 2.785 2.972 3.149 3.311 3.393 3.544 3.675 3.842 3.95 4.061 4.23 4.393 4.542 4.68 4.82 5.01 5.191 5.363 5.553 5.72 5.88 6.064 6.266 6.448 6.628 6.823 7.016 7.209 7.431 7.68 7.915 8.159 8.412 8.703 8.988 9.216 9.356 9.329 8.978 8.528 8.054 7.618 7.22 6.842 6.491 6.171 5.834 5.536 5.268 5.021 4.789 4.567 4.355 4.126 3.929 3.764 3.592 3.409 3.254 3.09 2.919 2.793 2.671 2.536 2.398 2.251 2.14 2.035 1.88 1.771 1.657 1.596 1.465 1.312 1.143 1.064 0.797 0.813 0.708 0.606 0.394 0.276 0.149 0.005 -0.143 -0.309 -0.532 -1.223 -3 ,21476 ,TETRA ,17600477,Sun Nov 28 12:26:18 CET,Sun Nov 28 14:16:58 CET,0.0 0.928 1.213 1.437 1.637 1.804 1.939 2.084 2.349 2.46 2.564 2.572 2.851 2.938 3.104 3.252 3.392 3.465 3.612 3.734 3.893 3.995 4.096 4.256 4.412 4.551 4.679 4.808 4.976 5.133 5.286 5.476 5.651 5.803 5.987 6.201 6.39 6.579 6.771 6.987 7.212 7.429 7.664 7.899 8.166 8.43 8.682 8.93 9.142 9.271 9.185 8.789 8.351 7.891 7.456 7.046 6.664 6.294 5.957 5.625 5.351 5.114 4.852 4.586 4.35 4.141 3.922 3.714 3.529 3.323 3.118 2.968 2.81 2.632 2.49 2.344 2.192 2.032 1.858 1.737 1.62 1.452 1.32 1.181 1.116 0.974 0.81 0.626 0.523 0.236 0.232 0.136 0.031 -0.232 -0.378 -0.532 -0.685 -0.868 -1.076 -1.361 -2.356 -4 ,12320 ,TETRA ,17600478,Sun Nov 28 12:26:19 CET,Sun Nov 28 14:16:32 CET,0.0 0.854 1.181 1.444 1.67 1.876 2.082 2.239 2.488 2.608 2.715 2.727 2.997 3.093 3.277 3.439 3.591 3.664 3.8 3.933 4.134 4.258 4.372 4.54 4.686 4.815 4.949 5.078 5.237 5.379 5.518 5.688 5.847 6.002 6.189 6.386 6.557 6.759 6.979 7.181 7.384 7.609 7.844 8.08 8.359 8.634 8.909 9.161 9.361 9.51 9.459 9.083 8.632 8.179 7.743 7.294 6.905 6.543 6.199 5.852 5.571 5.312 5.049 4.799 4.565 4.352 4.139 3.942 3.752 3.567 3.387 3.232 3.064 2.889 2.756 2.618 2.471 2.318 2.165 2.047 1.929 1.764 1.639 1.495 1.415 1.261 1.114 0.959 0.878 0.605 0.607 0.512 0.409 0.187 0.075 -0.038 -0.175 -0.358 -0.567 -0.839 -1.777 -5 ,20561 ,TETRA ,17600479,Sun Nov 28 12:27:19 CET,Sun Nov 28 14:17:28 CET,0.0 1.171 1.482 1.672 1.834 1.971 2.075 2.172 2.379 2.49 2.59 2.578 2.842 2.921 3.069 3.208 3.338 3.399 3.52 3.642 3.821 3.928 4.04 4.21 4.377 4.533 4.676 4.796 4.939 5.097 5.253 5.439 5.606 5.761 5.92 6.102 6.293 6.482 6.681 6.897 7.112 7.335 7.574 7.792 8.033 8.283 8.531 8.784 9.039 9.217 9.111 8.654 8.151 7.636 7.173 6.782 6.425 6.062 5.737 5.409 5.094 4.802 4.536 4.29 4.062 3.847 3.626 3.428 3.259 3.068 2.855 2.676 2.495 2.314 2.17 2.021 1.869 1.711 1.547 1.434 1.305 1.099 0.966 0.832 0.767 0.624 0.47 0.319 0.241 -0.032 -0.015 -0.104 -0.196 -0.396 -0.517 -0.658 -0.814 -0.983 -1.192 -1.485 -2.391 -6 ,29832 ,TETRA ,17600480,Sun Nov 28 12:27:19 CET,Sun Nov 28 14:17:17 CET,0.0 0.846 1.105 1.272 1.428 1.591 1.753 1.906 2.199 2.323 2.42 2.411 2.683 2.779 2.955 3.116 3.266 3.339 3.493 3.63 3.822 3.945 4.061 4.231 4.38 4.525 4.666 4.797 4.964 5.125 5.273 5.436 5.599 5.761 5.95 6.163 6.366 6.585 6.806 7.023 7.254 7.512 7.776 8.024 8.284 8.54 8.796 9.028 9.217 9.311 9.184 8.723 8.241 7.764 7.303 6.88 6.493 6.125 5.817 5.464 5.149 4.886 4.631 4.379 4.139 3.931 3.709 3.502 3.314 3.107 2.902 2.737 2.562 2.38 2.242 2.11 1.964 1.81 1.652 1.541 1.438 1.286 1.166 1.016 0.944 0.803 0.641 0.484 0.4 0.123 0.097 -0.01 -0.119 -0.408 -0.567 -0.732 -0.903 -1.08 -1.292 -1.55 -2.452 -7 ,28784 ,TETRA ,17600481,Sun Nov 28 12:27:19 CET,Sun Nov 28 14:17:13 CET,0.0 0.811 1.09 1.315 1.518 1.677 1.811 1.937 2.15 2.248 2.348 2.351 2.623 2.707 2.864 3.006 3.153 3.225 3.369 3.518 3.722 3.84 3.957 4.116 4.255 4.398 4.542 4.683 4.857 5.01 5.156 5.324 5.481 5.635 5.807 6.009 6.19 6.375 6.589 6.793 6.996 7.214 7.451 7.675 7.903 8.199 8.533 8.811 9.046 9.202 9.142 8.733 8.228 7.749 7.302 6.862 6.448 6.066 5.738 5.396 5.089 4.812 4.535 4.267 4.026 3.819 3.605 3.402 3.235 3.064 2.872 2.708 2.538 2.364 2.233 2.086 1.927 1.778 1.625 1.515 1.399 1.218 1.085 0.935 0.861 0.709 0.549 0.397 0.323 0.058 0.03 -0.074 -0.168 -0.394 -0.524 -0.665 -0.828 -1.019 -1.246 -1.569 -2.37 -8 ,16739 ,TETRA ,17600482,Sun Nov 28 12:28:19 CET,Sun Nov 28 14:18:47 CET,0.0 0.802 1.111 1.353 1.563 1.745 1.899 2.039 2.304 2.439 2.561 2.566 2.848 2.935 3.104 3.259 3.395 3.461 3.586 3.689 3.858 3.974 4.083 4.248 4.392 4.516 4.637 4.757 4.906 5.045 5.187 5.364 5.539 5.701 5.866 6.058 6.257 6.455 6.643 6.833 7.036 7.274 7.533 7.785 8.055 8.307 8.548 8.779 8.983 9.125 9.065 8.649 8.184 7.721 7.25 6.803 6.429 6.064 5.73 5.376 5.062 4.777 4.488 4.214 3.963 3.742 3.519 3.337 3.166 2.968 2.772 2.62 2.456 2.274 2.134 1.991 1.843 1.684 1.524 1.414 1.286 1.093 0.945 0.769 0.683 0.51 0.317 0.127 0.035 -0.253 -0.266 -0.373 -0.483 -0.729 -0.897 -1.058 -1.2 -1.356 -1.52 -1.748 -2.582 -9 ,21952 ,TETRA ,17600483,Sun Nov 28 12:28:19 CET,Sun Nov 28 14:20:36 CET,0.0 0.691 0.947 1.141 1.318 1.461 1.602 1.729 1.941 2.041 2.135 2.102 2.364 2.437 2.594 2.748 2.881 2.948 3.083 3.208 3.375 3.476 3.576 3.711 3.848 3.999 4.142 4.269 4.423 4.572 4.725 4.913 5.084 5.254 5.453 5.661 5.849 6.048 6.267 6.488 6.725 7.006 7.319 7.646 8.008 8.384 8.718 8.939 9.146 9.284 9.143 8.643 8.093 7.563 7.036 6.546 6.145 5.774 5.412 5.017 4.692 4.396 4.112 3.855 3.619 3.41 3.179 2.972 2.797 2.615 2.42 2.249 2.071 1.896 1.767 1.635 1.489 1.335 1.171 1.054 0.94 0.759 0.623 0.486 0.416 0.28 0.15 0.017 -0.056 -0.327 -0.316 -0.407 -0.511 -0.739 -0.852 -0.985 -1.146 -1.304 -1.48 -1.725 -2.419 -10 ,27060 ,TETRA ,17600484,Sun Nov 28 12:28:19 CET,Sun Nov 28 14:25:33 CET,0.0 0.559 0.843 1.081 1.292 1.471 1.636 1.789 2.055 2.183 2.304 2.359 2.667 2.785 3.01 3.199 3.35 3.416 3.535 3.653 3.827 3.942 4.057 4.216 4.367 4.525 4.675 4.81 4.971 5.122 5.268 5.437 5.6 5.756 5.928 6.117 6.296 6.476 6.654 6.855 7.063 7.284 7.555 7.8 8.06 8.306 8.525 8.78 9.048 9.202 9.118 8.73 8.28 7.8 7.35 6.92 6.542 6.205 5.902 5.58 5.268 4.977 4.71 4.451 4.213 4.002 3.765 3.543 3.351 3.162 2.971 2.807 2.618 2.412 2.256 2.101 1.956 1.804 1.63 1.507 1.387 1.203 1.072 0.936 0.864 0.709 0.55 0.379 0.296 0.023 0.014 -0.08 -0.189 -0.455 -0.588 -0.714 -0.849 -1.018 -1.222 -1.514 -2.461 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_35.txt deleted file mode 100644 index d180d212..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7982 ,TETRA ,17600485,Sun Nov 28 12:29:19 CET,Sun Nov 28 14:25:36 CET,0.0 1.256 1.586 1.848 2.069 2.263 2.445 2.591 2.83 2.946 3.051 3.062 3.345 3.438 3.615 3.785 3.943 4.016 4.166 4.313 4.515 4.633 4.746 4.921 5.084 5.231 5.374 5.504 5.67 5.832 5.985 6.157 6.314 6.486 6.696 6.894 7.08 7.281 7.485 7.686 7.896 8.117 8.328 8.546 8.793 9.011 9.199 9.381 9.471 9.398 9.006 8.265 7.575 6.921 6.306 5.722 5.181 4.691 4.273 3.881 3.551 3.25 2.97 2.699 2.441 2.206 1.952 1.729 1.542 1.35 1.159 0.999 0.822 0.631 0.484 0.336 0.168 -0.009 -0.18 -0.305 -0.434 -0.626 -0.752 -0.883 -0.953 -1.105 -1.274 -1.457 -1.546 -1.82 -1.801 -1.905 -2.03 -2.277 -2.392 -2.505 -2.631 -2.812 -3.054 -3.357 -4.436 -2 ,17026 ,TETRA ,17600486,Sun Nov 28 12:29:19 CET,Sun Nov 28 14:25:33 CET,0.0 1.159 1.492 1.77 1.99 2.186 2.368 2.52 2.791 2.897 2.993 3.015 3.318 3.42 3.597 3.756 3.91 3.98 4.098 4.213 4.384 4.495 4.609 4.771 4.92 5.069 5.214 5.351 5.524 5.697 5.85 6.022 6.181 6.321 6.476 6.642 6.784 6.948 7.144 7.344 7.547 7.761 7.978 8.18 8.403 8.618 8.815 8.943 8.979 8.885 8.46 7.712 6.979 6.293 5.714 5.186 4.69 4.254 3.86 3.443 3.098 2.796 2.506 2.231 1.964 1.719 1.465 1.245 1.058 0.869 0.668 0.504 0.342 0.16 0.014 -0.14 -0.304 -0.471 -0.638 -0.756 -0.875 -1.052 -1.168 -1.28 -1.347 -1.488 -1.633 -1.802 -1.886 -2.157 -2.128 -2.222 -2.323 -2.563 -2.703 -2.832 -2.965 -3.131 -3.332 -3.527 -3.952 -3 ,30607 ,TETRA ,17600487,Sun Nov 28 12:29:22 CET,Sun Nov 28 14:25:54 CET,0.0 1.095 1.46 1.682 1.856 2.049 2.24 2.395 2.64 2.751 2.865 2.892 3.185 3.274 3.424 3.585 3.759 3.836 3.973 4.12 4.32 4.431 4.527 4.674 4.82 4.951 5.078 5.209 5.394 5.567 5.721 5.915 6.102 6.268 6.443 6.632 6.806 6.985 7.18 7.379 7.544 7.716 7.924 8.125 8.349 8.558 8.742 8.86 8.853 8.708 8.234 7.43 6.666 5.928 5.258 4.653 4.115 3.644 3.243 2.827 2.476 2.175 1.88 1.594 1.311 1.054 0.798 0.568 0.376 0.185 -0.025 -0.201 -0.382 -0.573 -0.716 -0.86 -1.011 -1.176 -1.348 -1.462 -1.581 -1.769 -1.89 -2.012 -2.078 -2.222 -2.382 -2.546 -2.631 -2.902 -2.894 -2.999 -3.105 -3.329 -3.452 -3.582 -3.72 -3.881 -4.068 -4.301 -4.819 -4 ,20083 ,TETRA ,17600488,Sun Nov 28 12:29:23 CET,Sun Nov 28 14:25:40 CET,0.0 0.976 1.323 1.583 1.821 2.021 2.207 2.374 2.636 2.76 2.892 2.944 3.237 3.342 3.53 3.705 3.879 3.955 4.094 4.231 4.414 4.53 4.641 4.8 4.952 5.098 5.236 5.363 5.536 5.718 5.882 6.066 6.242 6.411 6.599 6.799 6.99 7.19 7.384 7.566 7.736 7.929 8.149 8.35 8.584 8.815 9.016 9.172 9.237 9.125 8.699 7.961 7.205 6.501 5.882 5.31 4.784 4.317 3.921 3.501 3.124 2.801 2.491 2.192 1.931 1.71 1.478 1.253 1.046 0.83 0.612 0.441 0.258 0.055 -0.099 -0.254 -0.42 -0.58 -0.741 -0.861 -0.981 -1.17 -1.302 -1.443 -1.513 -1.648 -1.797 -1.963 -2.045 -2.32 -2.321 -2.421 -2.52 -2.719 -2.834 -2.953 -3.078 -3.212 -3.36 -3.606 -4.243 -5 ,19347 ,TETRA ,17600489,Sun Nov 28 12:29:19 CET,Sun Nov 28 14:26:45 CET,0.0 1.237 1.612 1.881 2.109 2.317 2.491 2.657 2.973 3.129 3.268 3.313 3.603 3.7 3.878 4.043 4.182 4.252 4.406 4.556 4.771 4.912 5.041 5.218 5.401 5.585 5.77 5.94 6.143 6.332 6.514 6.728 6.919 7.088 7.263 7.462 7.649 7.838 8.063 8.309 8.542 8.766 8.996 9.216 9.437 9.654 9.84 9.982 10.043 9.948 9.499 8.722 8.012 7.355 6.738 6.149 5.628 5.154 4.751 4.363 4.008 3.687 3.394 3.12 2.856 2.607 2.349 2.12 1.93 1.732 1.519 1.338 1.144 0.937 0.782 0.614 0.437 0.269 0.103 -0.015 -0.145 -0.347 -0.48 -0.61 -0.676 -0.81 -0.95 -1.113 -1.196 -1.467 -1.459 -1.565 -1.667 -1.892 -2.016 -2.16 -2.301 -2.445 -2.636 -2.905 -3.594 -6 ,27606 ,TETRA ,17600490,Sun Nov 28 12:29:19 CET,Sun Nov 28 14:26:28 CET,0.0 1.07 1.454 1.713 1.891 2.077 2.259 2.421 2.689 2.802 2.912 2.951 3.259 3.358 3.555 3.733 3.877 3.944 4.095 4.249 4.47 4.603 4.725 4.899 5.064 5.21 5.34 5.477 5.648 5.799 5.933 6.097 6.262 6.416 6.597 6.797 6.98 7.177 7.366 7.553 7.759 7.977 8.195 8.415 8.65 8.855 9.02 9.114 9.152 9.052 8.608 7.831 7.086 6.413 5.779 5.189 4.668 4.196 3.776 3.349 2.98 2.645 2.338 2.058 1.792 1.548 1.301 1.077 0.887 0.68 0.459 0.293 0.119 -0.064 -0.199 -0.342 -0.489 -0.659 -0.848 -0.962 -1.076 -1.267 -1.395 -1.525 -1.596 -1.745 -1.891 -2.041 -2.122 -2.401 -2.412 -2.512 -2.616 -2.805 -2.905 -3.023 -3.154 -3.303 -3.5 -3.769 -4.309 -7 ,24799 ,TETRA ,17600491,Sun Nov 28 12:29:21 CET,Sun Nov 28 14:26:59 CET,0.0 1.521 1.899 2.177 2.4 2.587 2.763 2.921 3.179 3.285 3.38 3.374 3.642 3.713 3.858 4.028 4.181 4.242 4.375 4.515 4.705 4.814 4.924 5.083 5.231 5.378 5.527 5.673 5.86 6.029 6.174 6.342 6.502 6.653 6.839 7.039 7.23 7.445 7.65 7.828 8.013 8.23 8.485 8.723 8.94 9.126 9.287 9.381 9.405 9.309 8.901 8.167 7.428 6.74 6.119 5.534 5.025 4.569 4.172 3.781 3.448 3.148 2.853 2.562 2.299 2.075 1.836 1.614 1.428 1.235 1.028 0.858 0.672 0.474 0.319 0.162 -0.001 -0.17 -0.35 -0.476 -0.6 -0.789 -0.922 -1.058 -1.13 -1.282 -1.434 -1.599 -1.681 -1.959 -1.947 -2.051 -2.162 -2.374 -2.491 -2.622 -2.772 -2.927 -3.101 -3.353 -3.916 -8 ,31298 ,TETRA ,17600492,Sun Nov 28 12:29:22 CET,Sun Nov 28 14:26:28 CET,0.0 1.607 1.976 2.219 2.407 2.577 2.728 2.871 3.153 3.279 3.396 3.428 3.714 3.816 4.01 4.179 4.329 4.405 4.557 4.685 4.851 4.956 5.061 5.202 5.331 5.481 5.623 5.741 5.892 6.037 6.168 6.324 6.482 6.64 6.816 6.995 7.176 7.367 7.541 7.718 7.904 8.093 8.289 8.482 8.659 8.808 8.965 9.088 9.076 8.916 8.468 7.687 6.93 6.242 5.629 5.05 4.521 4.043 3.615 3.182 2.845 2.539 2.237 1.961 1.697 1.444 1.188 0.97 0.78 0.577 0.355 0.176 -0.006 -0.189 -0.335 -0.487 -0.636 -0.798 -0.973 -1.087 -1.202 -1.386 -1.516 -1.646 -1.714 -1.86 -2.009 -2.162 -2.244 -2.532 -2.52 -2.616 -2.718 -2.918 -3.031 -3.168 -3.354 -3.567 -3.779 -4.028 -4.823 -9 ,27883 ,TETRA ,17600493,Sun Nov 28 12:29:19 CET,Sun Nov 28 14:26:45 CET,0.0 0.672 1.009 1.248 1.422 1.583 1.752 1.905 2.156 2.277 2.385 2.377 2.643 2.723 2.897 3.044 3.174 3.239 3.379 3.526 3.731 3.863 4.003 4.19 4.352 4.503 4.645 4.783 4.954 5.112 5.258 5.418 5.576 5.748 5.928 6.104 6.271 6.447 6.635 6.832 7.022 7.209 7.437 7.656 7.846 8.025 8.213 8.396 8.464 8.306 7.839 7.068 6.344 5.656 5.025 4.435 3.913 3.444 3.028 2.618 2.272 1.965 1.66 1.358 1.086 0.848 0.584 0.336 0.145 -0.037 -0.231 -0.399 -0.59 -0.774 -0.908 -1.055 -1.207 -1.371 -1.552 -1.678 -1.8 -1.985 -2.11 -2.248 -2.323 -2.474 -2.618 -2.754 -2.83 -3.111 -3.115 -3.214 -3.314 -3.551 -3.691 -3.839 -3.994 -4.169 -4.345 -4.583 -5.526 -10 ,13409 ,TETRA ,17600494,Sun Nov 28 12:29:21 CET,Sun Nov 28 14:27:04 CET,0.0 1.617 2.088 2.381 2.644 2.85 3.043 3.24 3.582 3.729 3.846 3.862 4.144 4.234 4.408 4.576 4.743 4.82 4.969 5.117 5.306 5.417 5.531 5.706 5.87 6.024 6.165 6.29 6.445 6.608 6.768 6.939 7.097 7.253 7.436 7.63 7.815 8.016 8.207 8.389 8.572 8.77 8.998 9.206 9.431 9.642 9.795 9.91 9.945 9.823 9.369 8.554 7.819 7.158 6.509 5.904 5.394 4.933 4.547 4.163 3.812 3.504 3.2 2.912 2.662 2.429 2.182 1.971 1.784 1.573 1.348 1.172 0.991 0.795 0.641 0.474 0.311 0.165 0.008 -0.107 -0.231 -0.439 -0.588 -0.738 -0.811 -0.956 -1.108 -1.27 -1.357 -1.646 -1.659 -1.764 -1.864 -2.106 -2.236 -2.37 -2.517 -2.671 -2.847 -3.056 -3.495 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_36.txt deleted file mode 100644 index b2780e80..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_36.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24594 ,TETRA ,17600495,Sun Nov 28 12:29:23 CET,Sun Nov 28 14:27:23 CET,0.0 1.832 2.312 2.627 2.904 3.105 3.266 3.429 3.763 3.917 4.055 4.134 4.436 4.551 4.783 4.992 5.17 5.256 5.426 5.572 5.8 5.953 6.091 6.291 6.479 6.667 6.855 7.027 7.232 7.418 7.594 7.794 7.992 8.191 8.42 8.677 8.913 9.176 9.454 9.722 10.005 10.284 10.573 10.829 11.061 11.304 11.586 11.845 11.985 11.947 11.516 10.656 9.84 9.107 8.464 7.923 7.465 7.043 6.644 6.236 5.886 5.575 5.286 5.002 4.734 4.495 4.25 4.036 3.847 3.646 3.429 3.249 3.065 2.874 2.727 2.568 2.395 2.225 2.067 1.966 1.853 1.68 1.56 1.434 1.375 1.252 1.116 0.951 0.863 0.586 0.584 0.499 0.413 0.199 0.073 -0.055 -0.193 -0.365 -0.546 -0.749 -1.328 -2 ,30252 ,TETRA ,17600496,Sun Nov 28 12:29:25 CET,Sun Nov 28 14:26:52 CET,0.0 1.752 2.306 2.672 2.937 3.139 3.342 3.53 3.881 4.051 4.194 4.273 4.581 4.702 4.907 5.099 5.284 5.374 5.577 5.781 6.044 6.201 6.344 6.545 6.748 6.95 7.143 7.329 7.545 7.733 7.925 8.163 8.387 8.597 8.82 9.064 9.288 9.5 9.715 9.93 10.143 10.383 10.629 10.858 11.14 11.423 11.654 11.852 11.974 11.948 11.639 10.894 10.121 9.384 8.75 8.199 7.735 7.328 6.962 6.567 6.201 5.881 5.573 5.273 4.999 4.758 4.491 4.254 4.07 3.882 3.683 3.524 3.354 3.164 3.014 2.862 2.71 2.554 2.39 2.273 2.161 2.0 1.872 1.724 1.652 1.515 1.368 1.214 1.13 0.847 0.861 0.767 0.67 0.447 0.324 0.196 0.078 -0.067 -0.25 -0.49 -1.075 -3 ,1889 ,TETRA ,17600497,Sun Nov 28 12:29:19 CET,Sun Nov 28 14:31:28 CET,0.0 1.672 2.101 2.512 2.874 3.143 3.338 3.523 3.846 3.993 4.143 4.239 4.541 4.653 4.862 5.066 5.258 5.355 5.564 5.754 6.002 6.16 6.308 6.507 6.683 6.861 7.041 7.199 7.394 7.595 7.789 8.002 8.2 8.386 8.586 8.803 9.01 9.227 9.446 9.676 9.915 10.148 10.388 10.649 10.919 11.163 11.415 11.593 11.685 11.719 11.497 10.787 10.014 9.319 8.683 8.076 7.54 7.083 6.696 6.294 5.95 5.65 5.361 5.087 4.836 4.606 4.359 4.115 3.903 3.704 3.507 3.353 3.188 3.012 2.87 2.718 2.563 2.395 2.212 2.087 1.963 1.781 1.651 1.511 1.437 1.272 1.108 0.949 0.867 0.586 0.59 0.488 0.396 0.204 0.098 -0.018 -0.135 -0.246 -0.388 -0.569 -1.031 -4 ,4521 ,TETRA ,17600498,Sun Nov 28 12:29:20 CET,Sun Nov 28 14:31:49 CET,0.0 1.309 1.702 2.118 2.396 2.585 2.756 2.914 3.208 3.331 3.46 3.561 3.867 3.972 4.173 4.378 4.56 4.642 4.799 4.958 5.199 5.345 5.487 5.696 5.895 6.084 6.251 6.412 6.606 6.776 6.95 7.171 7.373 7.56 7.774 8.005 8.22 8.435 8.66 8.91 9.16 9.403 9.681 9.969 10.295 10.64 10.966 11.258 11.487 11.486 11.039 10.281 9.577 8.924 8.312 7.766 7.287 6.837 6.444 6.036 5.686 5.392 5.12 4.857 4.605 4.367 4.119 3.893 3.689 3.474 3.259 3.082 2.9 2.717 2.571 2.416 2.255 2.083 1.884 1.748 1.618 1.426 1.3 1.168 1.098 0.954 0.798 0.623 0.538 0.265 0.289 0.195 0.104 -0.073 -0.181 -0.307 -0.443 -0.586 -0.741 -0.955 -1.374 -5 ,19058 ,TETRA ,17600499,Sun Nov 28 12:29:22 CET,Sun Nov 28 14:26:49 CET,0.0 1.68 2.091 2.375 2.683 2.953 3.166 3.339 3.638 3.803 3.964 4.009 4.306 4.428 4.626 4.822 5.004 5.092 5.287 5.475 5.711 5.853 5.993 6.191 6.387 6.574 6.743 6.897 7.096 7.288 7.461 7.683 7.883 8.074 8.318 8.581 8.806 9.015 9.232 9.467 9.719 9.982 10.258 10.49 10.711 10.949 11.165 11.32 11.451 11.494 11.157 10.414 9.71 9.066 8.46 7.887 7.364 6.889 6.474 6.07 5.715 5.397 5.103 4.829 4.577 4.335 4.075 3.856 3.673 3.481 3.283 3.108 2.918 2.728 2.577 2.424 2.28 2.118 1.938 1.813 1.679 1.469 1.324 1.18 1.107 0.95 0.785 0.616 0.531 0.248 0.273 0.184 0.085 -0.106 -0.205 -0.322 -0.451 -0.59 -0.761 -0.993 -1.454 -6 ,28905 ,TETRA ,17600500,Sun Nov 28 12:29:24 CET,Sun Nov 28 14:26:30 CET,0.0 1.554 2.124 2.5 2.793 3.07 3.316 3.532 3.883 4.045 4.207 4.334 4.651 4.785 5.087 5.356 5.594 5.704 5.902 6.101 6.396 6.576 6.732 6.952 7.167 7.37 7.57 7.769 8.002 8.215 8.422 8.645 8.865 9.093 9.352 9.624 9.865 10.105 10.32 10.531 10.762 11.042 11.325 11.573 11.871 12.169 12.42 12.623 12.805 12.814 12.438 11.669 10.872 10.142 9.524 8.969 8.47 8.002 7.59 7.185 6.833 6.519 6.21 5.916 5.638 5.385 5.136 4.909 4.704 4.498 4.292 4.117 3.93 3.739 3.593 3.444 3.286 3.128 2.967 2.853 2.735 2.545 2.407 2.259 2.184 2.036 1.882 1.725 1.646 1.36 1.373 1.269 1.159 0.909 0.78 0.657 0.526 0.371 0.175 -0.063 -0.735 -7 ,15874 ,TETRA ,17600501,Sun Nov 28 12:29:20 CET,Sun Nov 28 14:26:41 CET,0.0 1.537 2.098 2.471 2.723 2.913 3.116 3.318 3.631 3.765 3.904 3.978 4.277 4.38 4.597 4.807 4.987 5.075 5.251 5.423 5.673 5.828 5.964 6.159 6.339 6.494 6.654 6.819 7.029 7.227 7.416 7.629 7.825 8.002 8.194 8.411 8.62 8.848 9.105 9.362 9.615 9.871 10.14 10.406 10.678 10.943 11.211 11.463 11.642 11.627 11.329 10.619 9.796 9.072 8.456 7.873 7.364 6.915 6.522 6.109 5.742 5.393 5.061 4.773 4.501 4.25 3.998 3.771 3.559 3.329 3.095 2.903 2.706 2.499 2.345 2.197 2.038 1.85 1.671 1.555 1.417 1.18 1.01 0.844 0.761 0.582 0.411 0.236 0.138 -0.155 -0.153 -0.248 -0.365 -0.61 -0.729 -0.847 -0.956 -1.113 -1.284 -1.482 -1.725 -8 ,12219 ,TETRA ,17600502,Sun Nov 28 12:29:22 CET,Sun Nov 28 14:27:00 CET,0.0 2.297 2.829 3.264 3.585 3.865 4.113 4.325 4.675 4.837 4.995 5.091 5.406 5.53 5.774 5.982 6.177 6.278 6.473 6.639 6.89 7.049 7.196 7.408 7.603 7.803 7.991 8.155 8.362 8.574 8.777 9.006 9.214 9.414 9.641 9.883 10.114 10.355 10.573 10.786 11.019 11.277 11.555 11.82 12.141 12.46 12.716 12.892 12.96 12.828 12.323 11.487 10.711 10.035 9.396 8.801 8.285 7.826 7.422 7.004 6.654 6.34 6.056 5.799 5.538 5.291 5.041 4.815 4.62 4.423 4.222 4.053 3.878 3.705 3.565 3.414 3.258 3.089 2.904 2.785 2.661 2.46 2.32 2.176 2.106 1.964 1.807 1.65 1.57 1.289 1.285 1.197 1.109 0.92 0.822 0.692 0.558 0.435 0.279 0.067 -0.576 -9 ,10138 ,TETRA ,17600503,Sun Nov 28 12:29:24 CET,Sun Nov 28 14:27:34 CET,0.0 1.653 2.152 2.476 2.733 2.951 3.144 3.326 3.659 3.814 3.957 4.028 4.337 4.461 4.669 4.854 5.04 5.133 5.316 5.479 5.698 5.841 5.977 6.174 6.359 6.527 6.694 6.857 7.059 7.254 7.451 7.698 7.939 8.15 8.363 8.582 8.795 9.024 9.237 9.452 9.68 9.943 10.209 10.43 10.688 10.926 11.102 11.247 11.305 11.292 11.032 10.27 9.519 8.92 8.354 7.8 7.313 6.861 6.473 6.068 5.727 5.429 5.134 4.847 4.574 4.327 4.073 3.852 3.66 3.456 3.244 3.073 2.897 2.696 2.527 2.362 2.202 2.044 1.879 1.759 1.635 1.432 1.3 1.169 1.095 0.943 0.792 0.632 0.551 0.282 0.29 0.188 0.097 -0.142 -0.287 -0.419 -0.55 -0.739 -0.978 -1.249 -1.742 -10 ,4095 ,TETRA ,17600504,Sun Nov 28 12:29:26 CET,Sun Nov 28 14:26:29 CET,0.0 1.349 1.79 2.108 2.376 2.591 2.789 2.99 3.35 3.499 3.629 3.737 4.072 4.196 4.401 4.578 4.779 4.878 5.054 5.226 5.463 5.618 5.774 5.973 6.166 6.354 6.528 6.696 6.91 7.12 7.315 7.542 7.737 7.916 8.136 8.383 8.606 8.846 9.101 9.344 9.591 9.861 10.153 10.423 10.755 11.09 11.328 11.503 11.647 11.66 11.343 10.688 10.031 9.365 8.717 8.095 7.536 7.022 6.564 6.11 5.739 5.42 5.117 4.822 4.552 4.317 4.071 3.844 3.648 3.449 3.231 3.048 2.871 2.693 2.553 2.406 2.241 2.066 1.89 1.768 1.64 1.452 1.325 1.189 1.115 0.965 0.79 0.59 0.49 0.197 0.194 0.087 -0.017 -0.243 -0.351 -0.467 -0.6 -0.753 -0.966 -1.282 -1.848 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_37.txt deleted file mode 100644 index 5091a4e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20011 ,TETRA ,17600505,Sun Nov 28 12:29:20 CET,Sun Nov 28 14:24:39 CET,0.0 1.478 1.932 2.281 2.56 2.785 2.975 3.156 3.48 3.629 3.779 3.881 4.206 4.35 4.611 4.844 5.061 5.161 5.363 5.552 5.812 5.98 6.145 6.379 6.596 6.806 6.997 7.18 7.406 7.612 7.813 8.071 8.336 8.575 8.843 9.13 9.375 9.63 9.894 10.168 10.454 10.764 11.068 11.343 11.685 12.001 12.277 12.529 12.666 12.618 12.218 11.392 10.609 9.909 9.261 8.675 8.12 7.597 7.166 6.735 6.326 5.956 5.625 5.304 5.004 4.718 4.415 4.147 3.903 3.657 3.413 3.21 2.988 2.756 2.581 2.399 2.213 2.021 1.828 1.686 1.521 1.259 1.091 0.927 0.843 0.678 0.509 0.325 0.228 -0.075 -0.11 -0.232 -0.353 -0.595 -0.737 -0.892 -1.081 -1.31 -1.566 -1.926 -2.525 -2 ,25141 ,TETRA ,17600506,Sun Nov 28 12:29:21 CET,Sun Nov 28 14:27:40 CET,0.0 2.145 2.674 3.092 3.456 3.74 3.966 4.16 4.531 4.699 4.857 4.95 5.263 5.39 5.611 5.82 6.024 6.119 6.287 6.441 6.673 6.821 6.955 7.147 7.338 7.529 7.706 7.865 8.07 8.271 8.46 8.694 8.905 9.094 9.337 9.594 9.82 10.073 10.297 10.499 10.711 10.945 11.201 11.423 11.629 11.816 12.02 12.199 12.283 12.159 11.592 10.695 9.862 9.078 8.373 7.756 7.19 6.658 6.215 5.785 5.414 5.058 4.711 4.406 4.122 3.861 3.59 3.34 3.137 2.916 2.673 2.49 2.308 2.124 1.98 1.826 1.66 1.492 1.302 1.161 1.022 0.797 0.638 0.485 0.411 0.246 0.071 -0.126 -0.239 -0.548 -0.583 -0.699 -0.816 -1.107 -1.283 -1.439 -1.577 -1.74 -1.95 -2.204 -2.937 -3 ,7308 ,TETRA ,17600507,Sun Nov 28 12:29:22 CET,Sun Nov 28 14:27:41 CET,0.0 1.24 1.572 1.848 2.046 2.22 2.399 2.553 2.802 2.917 3.035 3.064 3.333 3.424 3.605 3.767 3.922 3.989 4.113 4.239 4.415 4.527 4.639 4.799 4.944 5.089 5.227 5.37 5.595 5.841 6.078 6.334 6.538 6.727 6.969 7.251 7.51 7.768 8.033 8.303 8.56 8.824 9.128 9.427 9.725 9.972 10.192 10.361 10.454 10.392 9.919 9.008 8.142 7.378 6.689 6.037 5.466 4.934 4.481 4.047 3.679 3.358 3.045 2.739 2.433 2.139 1.846 1.591 1.38 1.168 0.94 0.741 0.529 0.302 0.121 -0.051 -0.234 -0.433 -0.632 -0.766 -0.895 -1.087 -1.226 -1.368 -1.437 -1.58 -1.738 -1.918 -2.005 -2.289 -2.309 -2.427 -2.548 -2.803 -2.944 -3.098 -3.274 -3.5 -3.736 -4.072 -5.424 -4 ,11279 ,TETRA ,17600508,Sun Nov 28 12:29:25 CET,Sun Nov 28 14:27:40 CET,0.0 1.773 2.216 2.537 2.811 3.054 3.273 3.459 3.82 3.995 4.135 4.182 4.469 4.576 4.797 5.015 5.233 5.348 5.556 5.742 6.012 6.171 6.31 6.509 6.698 6.887 7.071 7.249 7.482 7.696 7.881 8.102 8.339 8.564 8.795 9.035 9.265 9.512 9.757 9.995 10.23 10.488 10.764 11.009 11.267 11.498 11.736 11.984 12.114 12.004 11.488 10.609 9.791 9.034 8.338 7.68 7.101 6.585 6.142 5.697 5.309 4.973 4.64 4.33 4.047 3.775 3.492 3.243 3.036 2.826 2.6 2.414 2.229 2.022 1.85 1.67 1.491 1.315 1.121 0.979 0.836 0.625 0.477 0.327 0.251 0.081 -0.092 -0.267 -0.359 -0.639 -0.66 -0.768 -0.88 -1.137 -1.26 -1.392 -1.546 -1.718 -1.923 -2.218 -4.043 -5 ,3351 ,TETRA ,17600509,Sun Nov 28 12:29:26 CET,Sun Nov 28 14:27:39 CET,0.0 1.839 2.231 2.521 2.751 2.959 3.157 3.325 3.626 3.757 3.875 3.922 4.221 4.321 4.51 4.672 4.818 4.895 5.047 5.19 5.403 5.524 5.63 5.799 5.956 6.097 6.237 6.375 6.543 6.702 6.857 7.046 7.221 7.37 7.539 7.709 7.861 8.053 8.26 8.444 8.632 8.859 9.089 9.278 9.463 9.637 9.791 9.887 9.887 9.666 8.99 8.02 7.135 6.3 5.553 4.893 4.326 3.817 3.38 2.93 2.55 2.219 1.897 1.576 1.282 1.017 0.733 0.484 0.272 0.032 -0.228 -0.429 -0.626 -0.834 -1.006 -1.174 -1.343 -1.533 -1.736 -1.876 -2.015 -2.211 -2.358 -2.527 -2.612 -2.792 -2.986 -3.182 -3.276 -3.577 -3.578 -3.674 -3.784 -4.034 -4.18 -4.332 -4.465 -4.646 -4.878 -5.254 -6.051 -6 ,4693 ,TETRA ,17600510,Sun Nov 28 12:29:22 CET,Sun Nov 28 14:31:58 CET,0.0 1.207 1.55 1.805 2.003 2.205 2.38 2.535 2.789 2.91 3.021 3.059 3.35 3.442 3.604 3.759 3.936 4.022 4.171 4.319 4.535 4.666 4.799 4.978 5.152 5.337 5.505 5.674 5.91 6.12 6.311 6.537 6.759 6.967 7.2 7.461 7.706 7.973 8.251 8.527 8.799 9.091 9.438 9.762 10.052 10.312 10.543 10.737 10.827 10.698 10.267 9.475 8.663 7.899 7.208 6.587 6.035 5.527 5.069 4.614 4.227 3.897 3.586 3.272 2.992 2.747 2.483 2.252 2.056 1.845 1.613 1.417 1.212 1.008 0.851 0.688 0.536 0.374 0.175 0.036 -0.091 -0.282 -0.421 -0.575 -0.658 -0.827 -1.002 -1.18 -1.27 -1.567 -1.616 -1.758 -1.907 -2.192 -2.338 -2.513 -2.715 -2.944 -3.195 -3.504 -5.126 -7 ,19149 ,TETRA ,17600511,Sun Nov 28 12:29:24 CET,Sun Nov 28 14:32:40 CET,0.0 2.086 2.442 2.75 3.017 3.222 3.424 3.597 3.919 4.075 4.215 4.292 4.598 4.722 4.96 5.185 5.393 5.504 5.734 5.954 6.281 6.475 6.642 6.872 7.07 7.265 7.451 7.629 7.871 8.094 8.299 8.527 8.748 8.972 9.238 9.536 9.817 10.122 10.423 10.721 11.038 11.369 11.701 11.985 12.327 12.676 12.989 13.243 13.351 13.269 12.771 11.968 11.188 10.415 9.711 9.039 8.44 7.909 7.428 6.946 6.532 6.156 5.809 5.48 5.187 4.927 4.648 4.395 4.171 3.933 3.678 3.454 3.222 2.987 2.816 2.649 2.469 2.27 2.047 1.908 1.781 1.576 1.419 1.242 1.153 0.977 0.783 0.572 0.468 0.18 0.127 0.006 -0.105 -0.362 -0.521 -0.683 -0.857 -1.06 -1.287 -1.638 -3.053 -8 ,5166 ,TETRA ,17600512,Sun Nov 28 12:29:22 CET,Sun Nov 28 14:28:35 CET,0.0 2.243 2.803 3.188 3.482 3.761 4.029 4.259 4.661 4.845 5.022 5.179 5.511 5.645 5.898 6.118 6.322 6.423 6.611 6.778 7.029 7.195 7.347 7.558 7.76 7.962 8.154 8.339 8.563 8.767 8.97 9.222 9.455 9.65 9.875 10.14 10.4 10.692 10.991 11.27 11.543 11.837 12.18 12.494 12.802 13.089 13.32 13.492 13.616 13.59 13.103 12.203 11.33 10.495 9.752 9.057 8.45 7.915 7.446 6.967 6.537 6.135 5.772 5.454 5.169 4.923 4.65 4.398 4.186 3.961 3.73 3.547 3.343 3.128 2.968 2.794 2.624 2.459 2.272 2.13 1.981 1.753 1.605 1.456 1.372 1.192 0.983 0.756 0.642 0.333 0.279 0.144 0.013 -0.261 -0.423 -0.606 -0.816 -1.038 -1.293 -1.635 -2.639 -9 ,12625 ,TETRA ,17600513,Sun Nov 28 12:29:23 CET,Sun Nov 28 14:28:58 CET,0.0 1.331 1.838 2.222 2.567 2.861 3.105 3.307 3.651 3.798 3.946 4.024 4.333 4.454 4.706 4.951 5.163 5.264 5.457 5.632 5.877 6.038 6.198 6.417 6.622 6.808 6.969 7.136 7.361 7.563 7.762 8.002 8.224 8.44 8.678 8.918 9.152 9.413 9.68 9.956 10.239 10.54 10.862 11.163 11.47 11.775 12.066 12.284 12.411 12.346 11.885 11.092 10.232 9.41 8.679 7.989 7.41 6.882 6.393 5.927 5.529 5.159 4.819 4.498 4.179 3.888 3.588 3.303 3.059 2.824 2.595 2.404 2.209 1.998 1.821 1.648 1.464 1.255 1.043 0.91 0.78 0.582 0.441 0.289 0.21 0.042 -0.123 -0.282 -0.365 -0.658 -0.655 -0.748 -0.845 -1.063 -1.2 -1.374 -1.554 -1.728 -1.914 -2.26 -3.149 -10 ,13060 ,TETRA ,17600514,Sun Nov 28 12:29:22 CET,Sun Nov 28 14:27:59 CET,0.0 2.158 2.63 2.968 3.239 3.512 3.777 4.008 4.379 4.536 4.672 4.752 5.061 5.172 5.379 5.596 5.801 5.888 6.054 6.218 6.471 6.639 6.79 6.999 7.206 7.402 7.586 7.761 7.971 8.162 8.351 8.59 8.833 9.068 9.33 9.603 9.817 10.009 10.227 10.471 10.691 10.923 11.183 11.4 11.635 11.856 12.053 12.214 12.29 12.186 11.609 10.64 9.843 9.151 8.493 7.863 7.31 6.794 6.343 5.901 5.538 5.224 4.912 4.621 4.336 4.048 3.756 3.494 3.26 3.021 2.791 2.602 2.365 2.115 1.947 1.783 1.617 1.439 1.244 1.123 0.99 0.75 0.579 0.405 0.317 0.141 -0.035 -0.214 -0.31 -0.608 -0.631 -0.744 -0.862 -1.141 -1.309 -1.508 -1.734 -2.002 -2.293 -2.651 -3.677 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_64.txt deleted file mode 100644 index 60160919..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_33_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26945 ,KEBNE ,17027007,Wed Dec 22 15:56:35 CET,Wed Dec 22 17:37:02 CET,0.0 6.211 6.9 7.316 7.642 7.905 8.167 8.407 8.802 8.977 9.141 9.263 9.567 9.674 9.885 10.097 10.301 10.401 10.605 10.804 11.074 11.231 11.375 11.586 11.791 11.975 12.146 12.306 12.504 12.7 12.879 13.111 13.354 13.567 13.777 14.008 14.235 14.462 14.7 14.967 15.228 15.478 15.732 15.972 16.204 16.38 16.496 16.56 16.519 16.277 15.548 14.316 13.172 12.149 11.289 10.533 9.865 9.241 8.665 8.102 7.64 7.241 6.86 6.486 6.143 5.835 5.516 5.218 4.966 4.711 4.439 4.231 4.013 3.773 3.587 3.393 3.201 3.01 2.809 2.669 2.527 2.308 2.152 1.981 1.899 1.735 1.537 1.334 1.24 0.952 0.935 0.823 0.714 0.454 0.312 0.162 -0.02 -0.229 -0.479 -0.83 -2.722 -2 ,17091 ,KEBNE ,17027008,Wed Dec 22 15:56:33 CET,Wed Dec 22 17:37:01 CET,0.0 2.611 3.058 3.422 3.755 4.054 4.288 4.488 4.865 5.04 5.196 5.269 5.582 5.728 5.998 6.222 6.441 6.549 6.751 6.945 7.22 7.396 7.564 7.794 8.001 8.228 8.463 8.674 8.944 9.21 9.462 9.76 10.061 10.347 10.674 11.03 11.321 11.599 11.862 12.107 12.373 12.633 12.908 13.163 13.374 13.595 13.797 13.907 13.892 13.572 12.665 11.288 10.079 9.037 8.108 7.258 6.537 5.882 5.297 4.698 4.181 3.739 3.348 2.999 2.67 2.354 2.014 1.71 1.436 1.142 0.84 0.591 0.348 0.101 -0.102 -0.301 -0.486 -0.679 -0.889 -1.038 -1.193 -1.434 -1.614 -1.812 -1.906 -2.1 -2.321 -2.546 -2.664 -2.987 -3.036 -3.167 -3.309 -3.597 -3.754 -3.937 -4.136 -4.334 -4.553 -4.865 -6.159 -3 ,31586 ,KEBNE ,17027009,Wed Dec 22 15:56:34 CET,Wed Dec 22 17:36:34 CET,0.0 2.757 3.253 3.635 3.944 4.189 4.418 4.638 5.021 5.192 5.346 5.445 5.767 5.891 6.122 6.328 6.539 6.641 6.843 7.046 7.303 7.46 7.616 7.837 8.052 8.262 8.441 8.62 8.874 9.086 9.279 9.511 9.736 9.95 10.197 10.488 10.755 11.031 11.332 11.649 11.966 12.271 12.562 12.809 13.06 13.328 13.543 13.665 13.679 13.435 12.645 11.492 10.407 9.411 8.542 7.738 7.026 6.369 5.805 5.271 4.802 4.341 3.885 3.488 3.133 2.792 2.432 2.113 1.84 1.566 1.303 1.109 0.904 0.662 0.478 0.289 0.082 -0.13 -0.349 -0.495 -0.643 -0.872 -1.024 -1.2 -1.302 -1.498 -1.705 -1.917 -2.029 -2.354 -2.403 -2.537 -2.667 -2.94 -3.109 -3.28 -3.458 -3.671 -3.932 -4.296 -5.541 -4 ,21018 ,KEBNE ,17027010,Wed Dec 22 15:56:33 CET,Wed Dec 22 17:36:32 CET,0.0 2.959 3.551 3.919 4.258 4.604 4.907 5.162 5.609 5.816 6.02 6.253 6.63 6.812 7.158 7.454 7.712 7.84 8.108 8.358 8.656 8.833 8.987 9.185 9.387 9.574 9.764 9.935 10.134 10.324 10.503 10.714 10.926 11.137 11.391 11.661 11.882 12.101 12.339 12.621 12.896 13.163 13.462 13.727 14.016 14.313 14.545 14.66 14.66 14.414 13.62 12.259 11.046 10.023 9.135 8.347 7.64 6.994 6.42 5.843 5.357 4.901 4.474 4.105 3.773 3.484 3.196 2.925 2.685 2.435 2.157 1.941 1.73 1.507 1.329 1.141 0.954 0.756 0.545 0.4 0.252 0.02 -0.148 -0.331 -0.424 -0.612 -0.81 -1.03 -1.152 -1.467 -1.486 -1.605 -1.762 -2.088 -2.228 -2.387 -2.576 -2.787 -3.062 -3.449 -4.97 -5 ,9234 ,KEBNE ,17027011,Wed Dec 22 15:56:34 CET,Wed Dec 22 17:37:12 CET,0.0 2.016 2.43 2.785 3.083 3.329 3.593 3.855 4.234 4.387 4.54 4.681 5.007 5.131 5.372 5.581 5.774 5.876 6.074 6.252 6.497 6.649 6.807 7.047 7.275 7.48 7.66 7.834 8.05 8.256 8.455 8.687 8.923 9.15 9.389 9.634 9.837 10.049 10.301 10.569 10.81 11.052 11.326 11.555 11.768 11.92 12.037 12.1 11.989 11.619 10.802 9.67 8.602 7.587 6.699 5.911 5.201 4.499 3.92 3.418 2.96 2.519 2.094 1.685 1.312 1.001 0.699 0.418 0.157 -0.121 -0.395 -0.618 -0.86 -1.106 -1.297 -1.503 -1.709 -1.905 -2.119 -2.275 -2.431 -2.675 -2.853 -3.042 -3.139 -3.346 -3.542 -3.746 -3.867 -4.179 -4.227 -4.35 -4.467 -4.72 -4.869 -5.047 -5.248 -5.468 -5.727 -6.054 -8.379 -6 ,15411 ,KEBNE ,17027012,Wed Dec 22 15:56:35 CET,Wed Dec 22 17:36:13 CET,0.0 2.145 2.637 3.026 3.305 3.49 3.682 3.885 4.257 4.421 4.574 4.673 4.986 5.107 5.348 5.572 5.762 5.86 6.061 6.259 6.531 6.679 6.818 7.044 7.245 7.411 7.571 7.723 7.939 8.163 8.364 8.61 8.845 9.049 9.296 9.586 9.847 10.1 10.361 10.601 10.838 11.115 11.376 11.607 11.852 12.074 12.258 12.339 12.286 11.971 11.156 9.974 8.916 7.976 7.109 6.296 5.59 4.992 4.449 3.858 3.362 2.951 2.545 2.137 1.754 1.402 1.052 0.75 0.491 0.231 -0.052 -0.304 -0.565 -0.832 -1.035 -1.238 -1.446 -1.664 -1.872 -2.003 -2.141 -2.361 -2.514 -2.687 -2.782 -2.969 -3.164 -3.383 -3.493 -3.801 -3.838 -3.968 -4.12 -4.426 -4.577 -4.748 -4.944 -5.153 -5.377 -5.702 -9.372 -7 ,7830 ,KEBNE ,17027013,Wed Dec 22 15:56:36 CET,Wed Dec 22 17:36:05 CET,0.0 3.599 4.273 4.742 5.084 5.393 5.689 5.964 6.456 6.658 6.846 7.035 7.382 7.538 7.849 8.098 8.314 8.411 8.575 8.733 8.957 9.103 9.26 9.477 9.656 9.834 10.015 10.182 10.403 10.615 10.796 11.005 11.223 11.428 11.644 11.878 12.093 12.342 12.591 12.841 13.106 13.393 13.712 13.979 14.202 14.377 14.546 14.672 14.672 14.463 13.737 12.528 11.379 10.388 9.549 8.765 8.064 7.382 6.78 6.203 5.733 5.301 4.878 4.458 4.043 3.67 3.3 2.992 2.728 2.446 2.16 1.919 1.659 1.393 1.186 0.973 0.746 0.516 0.294 0.135 -0.04 -0.291 -0.455 -0.634 -0.727 -0.914 -1.118 -1.348 -1.467 -1.788 -1.823 -1.952 -2.091 -2.375 -2.525 -2.686 -2.872 -3.073 -3.331 -3.66 -4.781 -8 ,28851 ,KEBNE ,17027014,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:39:10 CET,0.0 2.248 2.84 3.254 3.581 3.844 4.083 4.333 4.79 4.979 5.162 5.338 5.708 5.864 6.108 6.348 6.553 6.659 6.88 7.096 7.399 7.578 7.746 7.995 8.219 8.402 8.573 8.755 9.003 9.247 9.488 9.759 10.041 10.313 10.582 10.877 11.151 11.423 11.675 11.943 12.216 12.501 12.807 13.076 13.365 13.627 13.799 13.866 13.852 13.618 12.839 11.513 10.269 9.242 8.355 7.535 6.848 6.246 5.721 5.191 4.734 4.322 3.916 3.519 3.163 2.857 2.518 2.196 1.915 1.616 1.322 1.104 0.889 0.658 0.465 0.278 0.095 -0.094 -0.288 -0.429 -0.582 -0.834 -1.01 -1.175 -1.263 -1.442 -1.631 -1.842 -1.952 -2.259 -2.279 -2.402 -2.55 -2.837 -2.973 -3.134 -3.328 -3.548 -3.788 -4.09 -5.399 -9 ,23408 ,KEBNE ,17027015,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:39:09 CET,0.0 2.525 3.084 3.487 3.822 4.126 4.397 4.638 5.044 5.226 5.385 5.518 5.862 6.018 6.287 6.523 6.739 6.835 7.019 7.2 7.452 7.61 7.765 7.962 8.138 8.311 8.471 8.627 8.841 9.061 9.277 9.52 9.742 9.936 10.159 10.434 10.676 10.906 11.146 11.421 11.687 11.938 12.222 12.473 12.717 12.954 13.171 13.3 13.296 13.055 12.31 11.123 10.018 9.041 8.177 7.406 6.66 5.899 5.27 4.692 4.211 3.798 3.409 3.039 2.709 2.409 2.089 1.797 1.539 1.27 0.997 0.775 0.544 0.308 0.124 -0.065 -0.253 -0.443 -0.655 -0.808 -0.973 -1.225 -1.402 -1.603 -1.697 -1.873 -2.072 -2.311 -2.426 -2.735 -2.788 -2.914 -3.038 -3.314 -3.469 -3.634 -3.83 -4.027 -4.255 -4.607 -5.614 -10 ,6176 ,KEBNE ,17027016,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:37:52 CET,0.0 2.067 2.631 3.009 3.345 3.642 3.907 4.147 4.558 4.732 4.902 5.018 5.357 5.49 5.736 5.964 6.166 6.27 6.468 6.649 6.905 7.065 7.227 7.47 7.682 7.873 8.053 8.228 8.476 8.722 8.946 9.18 9.399 9.613 9.852 10.107 10.331 10.602 10.89 11.163 11.409 11.639 11.917 12.178 12.44 12.635 12.777 12.852 12.788 12.522 11.694 10.417 9.314 8.326 7.449 6.654 5.948 5.288 4.672 4.074 3.624 3.237 2.867 2.497 2.144 1.824 1.491 1.199 0.955 0.687 0.385 0.131 -0.132 -0.38 -0.554 -0.738 -0.934 -1.134 -1.339 -1.476 -1.622 -1.861 -2.02 -2.183 -2.267 -2.436 -2.609 -2.787 -2.889 -3.194 -3.285 -3.428 -3.564 -3.86 -3.995 -4.134 -4.346 -4.614 -4.91 -5.261 -6.955 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_35_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_35_36.txt deleted file mode 100644 index d1b4eebc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_35_36.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22020 ,TETRA ,17600515,Sun Nov 28 12:29:24 CET,Sun Nov 28 14:28:17 CET,0.0 1.432 1.748 2.014 2.289 2.526 2.701 2.849 3.105 3.222 3.338 3.367 3.678 3.792 3.99 4.182 4.368 4.456 4.613 4.755 4.957 5.084 5.22 5.422 5.608 5.784 5.954 6.125 6.34 6.543 6.734 6.961 7.184 7.392 7.619 7.879 8.132 8.405 8.701 8.991 9.277 9.589 9.953 10.322 10.727 11.176 11.67 12.175 12.684 13.135 13.477 13.448 13.205 12.877 12.526 12.168 11.815 11.497 11.224 10.954 10.688 10.434 10.196 9.946 9.718 9.53 9.325 9.121 8.942 8.768 8.581 8.418 8.261 8.108 7.979 7.851 7.725 7.583 7.432 7.316 7.179 6.971 6.837 6.699 6.63 6.491 6.333 6.167 6.078 5.786 5.829 5.747 5.651 5.449 5.335 5.203 5.061 4.922 4.779 4.575 3.846 -2 ,20095 ,TETRA ,17600516,Sun Nov 28 12:29:25 CET,Sun Nov 28 14:27:55 CET,0.0 1.189 1.658 1.985 2.212 2.402 2.591 2.77 3.077 3.208 3.329 3.396 3.707 3.802 3.99 4.182 4.365 4.454 4.62 4.779 5.011 5.165 5.319 5.547 5.757 5.946 6.144 6.326 6.547 6.767 6.968 7.202 7.439 7.668 7.919 8.183 8.435 8.703 8.974 9.253 9.529 9.846 10.251 10.632 11.004 11.407 11.836 12.301 12.779 13.138 13.333 13.215 12.984 12.7 12.384 12.065 11.742 11.407 11.125 10.827 10.554 10.314 10.086 9.875 9.674 9.476 9.27 9.095 8.937 8.767 8.598 8.45 8.286 8.106 7.964 7.819 7.672 7.527 7.381 7.273 7.157 6.987 6.866 6.732 6.669 6.556 6.433 6.302 6.224 5.961 5.987 5.898 5.8 5.557 5.436 5.313 5.167 4.997 4.808 4.623 4.206 -3 ,21802 ,TETRA ,17600517,Sun Nov 28 12:30:41 CET,Sun Nov 28 14:27:41 CET,0.0 0.891 1.295 1.6 1.854 2.055 2.229 2.4 2.687 2.798 2.911 2.951 3.251 3.351 3.541 3.72 3.901 3.995 4.155 4.304 4.547 4.699 4.836 5.022 5.199 5.38 5.546 5.698 5.902 6.106 6.311 6.553 6.774 6.989 7.231 7.477 7.718 7.987 8.28 8.586 8.908 9.244 9.598 9.959 10.372 10.808 11.277 11.788 12.309 12.822 13.204 13.174 12.863 12.438 12.042 11.649 11.299 10.992 10.699 10.384 10.112 9.856 9.593 9.349 9.127 8.922 8.701 8.512 8.351 8.171 7.983 7.824 7.652 7.48 7.347 7.199 7.053 6.908 6.752 6.634 6.509 6.32 6.192 6.069 6.006 5.878 5.751 5.607 5.528 5.254 5.292 5.208 5.114 4.903 4.782 4.664 4.544 4.4 4.24 4.042 3.549 -4 ,24897 ,TETRA ,17600518,Sun Nov 28 12:29:48 CET,Sun Nov 28 14:25:47 CET,0.0 0.558 0.876 1.124 1.326 1.523 1.69 1.839 2.158 2.307 2.42 2.419 2.718 2.821 3.018 3.193 3.357 3.44 3.61 3.769 3.974 4.115 4.257 4.45 4.619 4.782 4.945 5.106 5.315 5.52 5.709 5.925 6.147 6.368 6.613 6.891 7.147 7.407 7.692 8.003 8.328 8.683 9.079 9.474 9.965 10.475 10.976 11.468 11.936 12.311 12.625 12.582 12.264 11.915 11.576 11.237 10.929 10.613 10.323 10.039 9.789 9.541 9.299 9.092 8.895 8.706 8.516 8.336 8.168 7.998 7.823 7.663 7.497 7.328 7.187 7.032 6.855 6.662 6.454 6.32 6.196 6.002 5.86 5.7 5.617 5.462 5.295 5.116 5.022 4.711 4.725 4.641 4.564 4.392 4.3 4.198 4.065 3.913 3.765 3.615 3.179 -5 ,32054 ,TETRA ,17600519,Sun Nov 28 12:29:48 CET,Sun Nov 28 14:25:40 CET,0.0 0.976 1.401 1.709 1.951 2.138 2.309 2.446 2.732 2.869 2.992 3.043 3.34 3.448 3.665 3.86 4.044 4.138 4.3 4.444 4.662 4.808 4.95 5.151 5.352 5.543 5.726 5.901 6.13 6.353 6.563 6.801 7.02 7.228 7.474 7.74 7.986 8.268 8.569 8.883 9.215 9.575 9.959 10.321 10.716 11.159 11.649 12.103 12.57 13.109 13.597 13.727 13.514 13.118 12.722 12.343 12.014 11.723 11.45 11.159 10.901 10.65 10.411 10.187 9.971 9.777 9.567 9.382 9.233 9.074 8.9 8.75 8.589 8.421 8.287 8.15 8.021 7.886 7.724 7.619 7.519 7.342 7.226 7.112 7.046 6.919 6.794 6.645 6.567 6.293 6.322 6.229 6.124 5.917 5.807 5.676 5.52 5.338 5.117 4.843 3.328 -6 ,16257 ,TETRA ,17600520,Sun Nov 28 12:29:49 CET,Sun Nov 28 14:27:55 CET,0.0 1.496 1.92 2.201 2.401 2.58 2.754 2.923 3.206 3.343 3.483 3.573 3.898 4.001 4.198 4.384 4.551 4.631 4.775 4.913 5.126 5.261 5.392 5.573 5.744 5.924 6.098 6.27 6.493 6.7 6.898 7.123 7.328 7.542 7.795 8.059 8.298 8.555 8.823 9.116 9.439 9.776 10.17 10.57 10.986 11.402 11.838 12.301 12.799 13.312 13.728 13.765 13.585 13.287 12.944 12.589 12.254 11.923 11.592 11.275 11.018 10.772 10.546 10.33 10.112 9.903 9.69 9.501 9.332 9.138 8.927 8.769 8.609 8.433 8.299 8.168 8.023 7.874 7.725 7.618 7.504 7.34 7.236 7.129 7.072 6.958 6.832 6.672 6.583 6.3 6.318 6.215 6.122 5.931 5.81 5.684 5.572 5.454 5.303 5.119 4.801 -7 ,337 ,TETRA ,17600521,Sun Nov 28 12:30:41 CET,Sun Nov 28 14:26:20 CET,0.0 1.05 1.35 1.573 1.774 1.96 2.15 2.31 2.563 2.682 2.802 2.837 3.148 3.261 3.457 3.628 3.787 3.858 3.995 4.141 4.358 4.503 4.641 4.823 5.003 5.185 5.368 5.528 5.717 5.907 6.086 6.3 6.496 6.686 6.926 7.198 7.46 7.75 8.037 8.322 8.613 8.947 9.331 9.679 10.065 10.499 10.997 11.539 12.094 12.557 12.887 12.956 12.783 12.515 12.234 11.939 11.657 11.367 11.106 10.832 10.55 10.274 10.023 9.805 9.596 9.393 9.173 8.962 8.779 8.598 8.422 8.277 8.12 7.964 7.851 7.735 7.608 7.469 7.314 7.207 7.102 6.936 6.815 6.686 6.617 6.469 6.308 6.15 6.071 5.778 5.791 5.707 5.623 5.457 5.368 5.248 5.108 4.942 4.766 4.587 4.176 -8 ,12413 ,TETRA ,17600522,Sun Nov 28 12:30:40 CET,Sun Nov 28 14:30:05 CET,0.0 1.292 1.638 1.878 2.066 2.22 2.375 2.523 2.802 2.927 3.054 3.113 3.407 3.507 3.695 3.874 4.053 4.137 4.299 4.467 4.723 4.891 5.042 5.247 5.447 5.622 5.783 5.944 6.148 6.355 6.558 6.798 7.031 7.248 7.487 7.754 7.999 8.26 8.544 8.838 9.152 9.508 9.868 10.185 10.547 10.959 11.431 11.929 12.379 12.765 13.132 13.079 12.772 12.425 12.073 11.707 11.35 11.017 10.741 10.464 10.202 9.953 9.727 9.516 9.326 9.154 8.959 8.774 8.6 8.407 8.205 8.038 7.863 7.69 7.555 7.425 7.293 7.141 6.984 6.88 6.78 6.621 6.509 6.394 6.336 6.209 6.072 5.912 5.819 5.533 5.516 5.398 5.281 5.059 4.952 4.833 4.701 4.54 4.365 4.166 3.469 -9 ,17488 ,TETRA ,17600523,Sun Nov 28 12:31:38 CET,Sun Nov 28 14:18:41 CET,0.0 1.389 1.779 2.057 2.292 2.491 2.652 2.805 3.088 3.214 3.35 3.401 3.703 3.811 4.018 4.218 4.402 4.492 4.665 4.825 5.064 5.213 5.352 5.554 5.744 5.923 6.097 6.281 6.526 6.752 6.96 7.182 7.388 7.604 7.853 8.114 8.375 8.656 8.932 9.216 9.538 9.913 10.338 10.757 11.201 11.647 12.096 12.546 13.018 13.478 13.803 13.696 13.434 13.152 12.834 12.493 12.15 11.812 11.506 11.21 10.941 10.695 10.47 10.252 10.058 9.875 9.659 9.457 9.292 9.126 8.944 8.795 8.644 8.484 8.356 8.233 8.101 7.955 7.801 7.697 7.595 7.431 7.317 7.195 7.131 6.985 6.822 6.664 6.589 6.308 6.319 6.215 6.105 5.884 5.776 5.665 5.52 5.307 5.091 4.88 4.313 -10 ,10945 ,TETRA ,17600524,Sun Nov 28 12:30:42 CET,Sun Nov 28 14:27:30 CET,0.0 1.287 1.686 2.006 2.228 2.436 2.626 2.792 3.102 3.241 3.366 3.407 3.711 3.804 3.993 4.188 4.362 4.438 4.583 4.737 4.961 5.102 5.244 5.452 5.639 5.827 6.006 6.169 6.373 6.569 6.775 7.017 7.217 7.41 7.652 7.908 8.149 8.449 8.759 9.069 9.386 9.71 10.073 10.445 10.851 11.258 11.728 12.21 12.699 13.195 13.549 13.492 13.231 12.902 12.597 12.291 11.964 11.616 11.291 10.987 10.709 10.442 10.183 9.925 9.693 9.477 9.248 9.041 8.86 8.675 8.481 8.317 8.143 7.973 7.843 7.704 7.562 7.41 7.247 7.135 7.02 6.838 6.707 6.57 6.507 6.373 6.223 6.071 5.995 5.724 5.756 5.674 5.59 5.383 5.265 5.146 5.029 4.905 4.721 4.434 3.834 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_35_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_35_37.txt deleted file mode 100644 index aec5c636..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_35_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24525 ,TETRA ,17600525,Sun Nov 28 12:30:42 CET,Sun Nov 28 14:27:40 CET,0.0 0.762 1.23 1.558 1.806 2.029 2.239 2.434 2.785 2.943 3.089 3.193 3.541 3.675 3.917 4.162 4.396 4.513 4.725 4.907 5.177 5.351 5.503 5.73 5.956 6.15 6.33 6.516 6.765 6.998 7.203 7.441 7.669 7.9 8.168 8.459 8.735 9.027 9.341 9.676 10.005 10.365 10.789 11.197 11.613 12.044 12.505 12.944 13.359 13.787 14.063 13.887 13.508 13.093 12.677 12.281 11.914 11.532 11.172 10.818 10.524 10.255 9.992 9.742 9.506 9.286 9.041 8.803 8.596 8.389 8.163 7.977 7.793 7.58 7.418 7.269 7.116 6.966 6.813 6.689 6.546 6.33 6.208 6.084 6.013 5.869 5.716 5.541 5.443 5.145 5.119 5.014 4.906 4.641 4.486 4.316 4.122 3.904 3.626 3.309 2.595 -2 ,24032 ,TETRA ,17600526,Sun Nov 28 12:30:44 CET,Sun Nov 28 14:27:37 CET,0.0 1.272 1.691 2.001 2.264 2.479 2.667 2.862 3.225 3.38 3.52 3.607 3.929 4.046 4.265 4.482 4.685 4.777 4.958 5.137 5.407 5.6 5.792 6.044 6.272 6.487 6.686 6.867 7.101 7.331 7.551 7.812 8.061 8.288 8.54 8.823 9.102 9.402 9.716 10.05 10.381 10.731 11.103 11.44 11.831 12.246 12.645 13.03 13.447 13.847 14.125 14.071 13.752 13.323 12.905 12.524 12.146 11.765 11.421 11.078 10.769 10.48 10.202 9.936 9.694 9.474 9.262 9.078 8.911 8.742 8.567 8.404 8.206 7.992 7.832 7.673 7.515 7.358 7.185 7.073 6.97 6.798 6.666 6.525 6.454 6.315 6.158 5.982 5.892 5.59 5.546 5.437 5.328 5.049 4.899 4.737 4.556 4.396 4.22 3.968 3.253 -3 ,31978 ,TETRA ,17600527,Sun Nov 28 12:30:42 CET,Sun Nov 28 14:26:40 CET,0.0 1.442 1.841 2.13 2.386 2.603 2.809 3.018 3.357 3.501 3.653 3.745 4.059 4.169 4.39 4.604 4.804 4.902 5.078 5.256 5.519 5.685 5.841 6.057 6.263 6.462 6.664 6.853 7.082 7.307 7.526 7.777 8.007 8.232 8.498 8.805 9.091 9.383 9.703 10.035 10.356 10.701 11.088 11.466 11.883 12.323 12.772 13.204 13.665 14.038 14.225 14.111 13.745 13.305 12.873 12.478 12.103 11.72 11.377 11.041 10.74 10.44 10.144 9.883 9.66 9.451 9.217 9.006 8.827 8.626 8.424 8.26 8.084 7.893 7.737 7.573 7.403 7.217 6.996 6.851 6.719 6.507 6.36 6.217 6.149 6.009 5.849 5.68 5.593 5.304 5.275 5.16 5.039 4.783 4.648 4.519 4.403 4.247 4.033 3.735 2.883 -4 ,237 ,TETRA ,17600528,Sun Nov 28 12:31:42 CET,Sun Nov 28 14:29:45 CET,0.0 1.073 1.422 1.706 1.924 2.116 2.343 2.588 3.025 3.215 3.365 3.432 3.758 3.883 4.109 4.315 4.509 4.604 4.788 4.972 5.251 5.42 5.577 5.806 6.023 6.235 6.458 6.692 6.996 7.25 7.462 7.717 7.959 8.19 8.458 8.761 9.053 9.38 9.717 10.03 10.329 10.663 11.027 11.388 11.817 12.26 12.703 13.149 13.582 13.927 14.015 13.688 13.153 12.596 12.071 11.593 11.153 10.71 10.34 9.985 9.668 9.373 9.074 8.788 8.538 8.305 8.061 7.844 7.652 7.446 7.215 6.998 6.755 6.499 6.302 6.108 5.902 5.687 5.471 5.321 5.162 4.904 4.724 4.537 4.442 4.239 4.039 3.84 3.73 3.43 3.428 3.323 3.201 2.919 2.768 2.614 2.442 2.266 2.022 1.616 0.739 -5 ,16708 ,TETRA ,17600529,Sun Nov 28 12:31:38 CET,Sun Nov 28 14:29:48 CET,0.0 0.917 1.342 1.676 1.953 2.186 2.415 2.619 3.002 3.184 3.35 3.432 3.747 3.87 4.123 4.377 4.603 4.701 4.889 5.075 5.34 5.513 5.674 5.891 6.095 6.306 6.517 6.714 6.963 7.196 7.414 7.677 7.929 8.149 8.405 8.684 8.95 9.245 9.551 9.88 10.212 10.555 10.928 11.297 11.684 12.063 12.455 12.88 13.347 13.833 14.155 13.973 13.639 13.246 12.837 12.46 12.053 11.629 11.268 10.899 10.567 10.282 10.024 9.796 9.589 9.396 9.192 8.981 8.776 8.571 8.375 8.209 8.041 7.875 7.735 7.564 7.366 7.17 6.974 6.848 6.72 6.498 6.335 6.169 6.085 5.9 5.677 5.439 5.321 5.018 5.001 4.885 4.762 4.482 4.334 4.174 4.009 3.82 3.585 3.285 2.114 -6 ,15992 ,TETRA ,17600530,Sun Nov 28 12:31:41 CET,Sun Nov 28 14:28:11 CET,0.0 1.377 1.787 2.132 2.44 2.694 2.919 3.125 3.466 3.615 3.765 3.863 4.195 4.327 4.588 4.83 5.026 5.121 5.321 5.51 5.775 5.937 6.095 6.32 6.533 6.746 6.948 7.139 7.383 7.614 7.837 8.103 8.361 8.594 8.858 9.163 9.455 9.771 10.099 10.442 10.794 11.163 11.564 11.952 12.384 12.85 13.356 13.846 14.296 14.615 14.683 14.391 13.965 13.468 12.983 12.527 12.094 11.706 11.366 10.997 10.672 10.382 10.111 9.861 9.625 9.407 9.16 8.935 8.756 8.574 8.381 8.223 8.056 7.868 7.717 7.564 7.407 7.248 7.077 6.956 6.829 6.615 6.456 6.309 6.243 6.099 5.939 5.765 5.674 5.386 5.406 5.307 5.201 4.978 4.858 4.705 4.526 4.365 4.189 3.961 3.491 -7 ,24052 ,TETRA ,17600531,Sun Nov 28 12:31:38 CET,Sun Nov 28 14:30:26 CET,0.0 1.035 1.406 1.713 1.965 2.193 2.412 2.609 2.952 3.102 3.244 3.296 3.598 3.724 3.959 4.194 4.405 4.509 4.74 4.947 5.211 5.368 5.529 5.773 6.011 6.225 6.415 6.601 6.833 7.049 7.257 7.514 7.78 8.027 8.275 8.545 8.811 9.104 9.421 9.751 10.097 10.499 10.937 11.311 11.723 12.15 12.572 13.019 13.483 13.834 13.982 13.706 13.269 12.79 12.323 11.894 11.512 11.162 10.821 10.463 10.134 9.842 9.566 9.312 9.083 8.858 8.619 8.401 8.199 7.992 7.778 7.595 7.403 7.208 7.072 6.923 6.773 6.626 6.466 6.35 6.22 6.027 5.895 5.763 5.695 5.558 5.417 5.245 5.15 4.875 4.893 4.786 4.69 4.464 4.334 4.192 4.007 3.813 3.589 3.279 2.388 -8 ,11024 ,TETRA ,17600532,Sun Nov 28 12:31:38 CET,Sun Nov 28 14:28:53 CET,0.0 0.777 1.016 1.189 1.325 1.45 1.572 1.694 1.939 2.054 2.164 2.186 2.474 2.562 2.72 2.876 3.023 3.096 3.239 3.366 3.54 3.659 3.775 3.931 4.085 4.239 4.394 4.537 4.694 4.838 4.98 5.162 5.344 5.512 5.696 5.897 6.094 6.306 6.528 6.769 7.02 7.282 7.587 7.886 8.197 8.54 8.901 9.268 9.646 9.925 10.105 9.969 9.623 9.226 8.794 8.353 7.95 7.551 7.173 6.798 6.499 6.232 5.965 5.697 5.443 5.207 4.957 4.745 4.54 4.329 4.128 3.957 3.777 3.587 3.44 3.278 3.114 2.961 2.803 2.692 2.575 2.397 2.274 2.142 2.066 1.893 1.733 1.579 1.499 1.224 1.237 1.128 1.014 0.784 0.656 0.507 0.343 0.165 -0.09 -0.444 -1.337 -9 ,27081 ,TETRA ,17600533,Sun Nov 28 12:31:41 CET,Sun Nov 28 14:29:32 CET,0.0 1.168 1.496 1.745 1.967 2.177 2.366 2.535 2.851 2.987 3.118 3.185 3.478 3.58 3.792 3.977 4.157 4.245 4.418 4.595 4.839 4.983 5.127 5.34 5.553 5.76 5.945 6.127 6.355 6.557 6.747 6.983 7.225 7.469 7.736 8.02 8.282 8.548 8.839 9.144 9.458 9.818 10.211 10.586 11.011 11.451 11.86 12.303 12.788 13.161 13.354 13.092 12.57 12.064 11.589 11.079 10.595 10.153 9.766 9.363 9.011 8.71 8.434 8.173 7.912 7.674 7.412 7.167 6.97 6.78 6.587 6.425 6.262 6.086 5.946 5.811 5.674 5.522 5.356 5.238 5.113 4.916 4.785 4.639 4.565 4.431 4.298 4.154 4.076 3.792 3.793 3.686 3.581 3.331 3.18 3.006 2.846 2.687 2.472 2.17 1.073 -10 ,29353 ,TETRA ,17600534,Sun Nov 28 12:31:38 CET,Sun Nov 28 14:29:50 CET,0.0 1.434 1.804 2.128 2.382 2.593 2.797 2.991 3.323 3.467 3.6 3.673 4.001 4.128 4.369 4.593 4.812 4.914 5.106 5.31 5.607 5.769 5.92 6.14 6.344 6.546 6.751 6.947 7.197 7.437 7.657 7.925 8.185 8.415 8.678 8.981 9.266 9.572 9.894 10.229 10.561 10.904 11.301 11.698 12.116 12.549 13.036 13.479 13.871 14.266 14.498 14.285 13.885 13.453 13.006 12.591 12.212 11.863 11.538 11.192 10.886 10.589 10.292 10.017 9.766 9.535 9.3 9.081 8.901 8.726 8.533 8.364 8.178 7.983 7.834 7.687 7.537 7.379 7.218 7.098 6.971 6.769 6.624 6.479 6.402 6.247 6.098 5.937 5.848 5.564 5.549 5.441 5.338 5.129 5.013 4.862 4.683 4.5 4.295 4.011 3.053 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_35_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_35_49.txt deleted file mode 100644 index f6dbaa41..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_35_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28854 ,TETRA ,17600535,Sun Nov 28 12:31:40 CET,Sun Nov 28 14:28:15 CET,0.0 1.209 1.626 1.924 2.18 2.404 2.611 2.806 3.154 3.323 3.484 3.59 3.906 4.031 4.281 4.522 4.754 4.867 5.073 5.275 5.566 5.753 5.928 6.178 6.42 6.641 6.845 7.045 7.327 7.6 7.854 8.148 8.425 8.715 9.052 9.397 9.708 10.037 10.394 10.772 11.182 11.673 12.253 12.848 13.507 14.166 14.9 15.711 16.605 17.487 18.352 18.756 18.741 18.576 18.355 18.143 17.925 17.677 17.434 17.196 16.996 16.802 16.619 16.449 16.262 16.054 15.83 15.655 15.504 15.315 15.099 14.923 14.731 14.523 14.358 14.205 14.075 13.929 13.762 13.647 13.538 13.378 13.268 13.152 13.083 12.94 12.798 12.632 12.543 12.272 12.277 12.174 12.065 11.814 11.667 11.509 11.346 11.165 10.955 10.689 9.905 -2 ,9317 ,TETRA ,17600536,Sun Nov 28 12:31:40 CET,Sun Nov 28 14:28:25 CET,0.0 1.01 1.524 1.883 2.173 2.442 2.675 2.879 3.268 3.449 3.615 3.743 4.082 4.21 4.452 4.685 4.903 5.014 5.23 5.429 5.704 5.881 6.065 6.343 6.603 6.847 7.076 7.295 7.568 7.834 8.097 8.414 8.729 9.008 9.314 9.664 9.976 10.312 10.695 11.11 11.512 11.958 12.491 13.024 13.653 14.326 15.053 15.847 16.778 17.762 18.745 19.247 19.286 19.125 18.87 18.623 18.346 18.049 17.812 17.581 17.362 17.12 16.848 16.594 16.365 16.159 15.947 15.748 15.58 15.41 15.234 15.091 14.937 14.766 14.625 14.483 14.343 14.195 14.027 13.908 13.786 13.593 13.445 13.292 13.226 13.097 12.942 12.758 12.655 12.379 12.389 12.288 12.187 11.941 11.8 11.675 11.56 11.416 11.206 10.88 10.13 -3 ,4533 ,TETRA ,17600537,Sun Nov 28 12:31:40 CET,Sun Nov 28 14:28:32 CET,0.0 1.154 1.538 1.82 2.039 2.242 2.44 2.629 2.972 3.129 3.269 3.324 3.64 3.771 4.014 4.238 4.449 4.554 4.755 4.948 5.233 5.411 5.577 5.82 6.06 6.299 6.534 6.748 7.015 7.278 7.516 7.81 8.122 8.416 8.732 9.082 9.414 9.791 10.204 10.619 11.031 11.485 11.999 12.506 13.087 13.704 14.421 15.201 16.02 16.79 17.461 17.699 17.63 17.47 17.28 17.036 16.738 16.428 16.133 15.834 15.581 15.349 15.128 14.9 14.659 14.436 14.191 13.965 13.773 13.574 13.4 13.265 13.102 12.917 12.775 12.638 12.499 12.355 12.211 12.101 11.979 11.794 11.669 11.533 11.462 11.322 11.166 10.973 10.877 10.596 10.564 10.454 10.347 10.09 9.954 9.822 9.665 9.481 9.266 9.014 8.024 -4 ,13338 ,TETRA ,17600538,Sun Nov 28 12:31:40 CET,Sun Nov 28 14:27:26 CET,0.0 1.185 1.601 1.905 2.183 2.431 2.643 2.845 3.23 3.407 3.571 3.681 4.027 4.17 4.423 4.677 4.93 5.057 5.307 5.538 5.874 6.086 6.282 6.573 6.853 7.111 7.357 7.582 7.858 8.128 8.392 8.706 9.002 9.284 9.61 9.97 10.319 10.699 11.081 11.473 11.894 12.378 12.931 13.459 14.05 14.68 15.366 16.069 16.788 17.543 18.337 18.803 18.887 18.767 18.507 18.196 17.884 17.586 17.338 17.076 16.833 16.611 16.384 16.16 15.951 15.746 15.521 15.313 15.129 14.945 14.77 14.616 14.454 14.292 14.161 14.018 13.861 13.689 13.514 13.387 13.244 13.03 12.896 12.769 12.7 12.565 12.421 12.252 12.165 11.885 11.851 11.736 11.604 11.321 11.154 10.974 10.797 10.587 10.32 9.99 9.039 -5 ,3334 ,TETRA ,17600539,Sun Nov 28 12:31:40 CET,Sun Nov 28 14:27:45 CET,0.0 1.28 1.77 2.126 2.433 2.69 2.92 3.123 3.492 3.673 3.835 3.923 4.242 4.381 4.655 4.91 5.16 5.285 5.538 5.775 6.089 6.28 6.462 6.727 6.995 7.249 7.481 7.706 7.996 8.271 8.539 8.869 9.175 9.463 9.793 10.152 10.481 10.849 11.263 11.665 12.063 12.516 13.046 13.581 14.179 14.799 15.457 16.149 16.955 17.878 18.773 19.237 19.265 19.08 18.771 18.451 18.161 17.875 17.596 17.275 16.991 16.757 16.54 16.327 16.12 15.928 15.714 15.497 15.3 15.092 14.882 14.72 14.556 14.379 14.244 14.104 13.951 13.791 13.626 13.513 13.392 13.196 13.045 12.884 12.806 12.644 12.491 12.336 12.254 11.97 11.969 11.871 11.77 11.531 11.385 11.216 11.011 10.767 10.515 10.245 9.221 -6 ,29943 ,TETRA ,17600540,Sun Nov 28 12:31:40 CET,Sun Nov 28 14:25:56 CET,0.0 1.113 1.589 1.969 2.285 2.538 2.763 2.978 3.364 3.536 3.709 3.837 4.194 4.339 4.598 4.845 5.077 5.197 5.433 5.655 5.983 6.186 6.373 6.657 6.94 7.19 7.428 7.662 7.978 8.273 8.55 8.882 9.204 9.507 9.847 10.235 10.601 10.99 11.401 11.82 12.261 12.763 13.345 13.91 14.51 15.104 15.758 16.501 17.314 18.126 18.871 19.209 19.228 19.151 19.002 18.782 18.544 18.306 18.083 17.86 17.661 17.475 17.286 17.096 16.896 16.669 16.417 16.201 16.021 15.846 15.666 15.513 15.361 15.206 15.08 14.946 14.813 14.667 14.507 14.401 14.297 14.122 13.977 13.838 13.775 13.638 13.469 13.291 13.205 12.916 12.865 12.742 12.604 12.331 12.209 12.072 11.916 11.712 11.476 11.222 10.334 -7 ,17685 ,TETRA ,17600541,Sun Nov 28 12:32:38 CET,Sun Nov 28 14:30:10 CET,0.0 2.281 2.683 2.982 3.205 3.403 3.621 3.82 4.128 4.262 4.389 4.451 4.765 4.875 5.092 5.306 5.512 5.614 5.799 5.966 6.203 6.357 6.513 6.739 6.956 7.168 7.363 7.546 7.791 8.026 8.239 8.49 8.727 8.963 9.257 9.606 9.954 10.342 10.759 11.191 11.641 12.141 12.701 13.23 13.822 14.468 15.181 15.909 16.686 17.546 18.365 18.799 18.865 18.795 18.679 18.517 18.325 18.109 17.879 17.626 17.407 17.216 17.017 16.808 16.617 16.438 16.224 16.024 15.858 15.672 15.463 15.295 15.119 14.915 14.769 14.63 14.485 14.342 14.192 14.087 13.98 13.809 13.68 13.531 13.452 13.311 13.17 13.013 12.93 12.648 12.636 12.541 12.435 12.176 12.029 11.859 11.651 11.418 11.173 10.817 9.791 -8 ,28346 ,TETRA ,17600542,Sun Nov 28 12:32:38 CET,Sun Nov 28 14:30:30 CET,0.0 1.108 1.567 1.905 2.175 2.421 2.659 2.882 3.239 3.393 3.545 3.637 3.972 4.118 4.399 4.678 4.938 5.063 5.297 5.523 5.856 6.064 6.26 6.541 6.821 7.088 7.33 7.551 7.821 8.079 8.339 8.673 8.998 9.293 9.624 9.989 10.336 10.732 11.146 11.549 11.944 12.385 12.901 13.399 13.975 14.601 15.287 15.974 16.723 17.55 18.311 18.647 18.626 18.478 18.315 18.08 17.797 17.531 17.273 16.996 16.735 16.474 16.208 15.951 15.712 15.495 15.25 15.031 14.839 14.628 14.418 14.235 14.053 13.865 13.713 13.564 13.404 13.238 13.065 12.95 12.836 12.639 12.493 12.34 12.259 12.088 11.912 11.74 11.654 11.376 11.337 11.22 11.105 10.867 10.734 10.571 10.392 10.211 9.983 9.677 8.884 -9 ,3905 ,TETRA ,17600543,Sun Nov 28 12:32:38 CET,Sun Nov 28 14:29:46 CET,0.0 0.909 1.296 1.633 1.929 2.145 2.327 2.494 2.803 2.95 3.089 3.194 3.51 3.639 3.893 4.124 4.356 4.467 4.665 4.861 5.153 5.334 5.51 5.76 5.999 6.229 6.444 6.662 6.949 7.224 7.492 7.798 8.085 8.364 8.693 9.054 9.391 9.755 10.136 10.551 10.988 11.472 12.027 12.578 13.212 13.892 14.599 15.323 16.13 17.004 17.85 18.23 18.144 17.919 17.682 17.437 17.175 16.907 16.652 16.324 16.03 15.763 15.505 15.281 15.089 14.914 14.715 14.546 14.413 14.266 14.098 13.96 13.807 13.632 13.484 13.326 13.18 13.027 12.85 12.723 12.596 12.407 12.274 12.121 12.04 11.875 11.701 11.517 11.41 11.118 11.092 10.961 10.824 10.553 10.41 10.264 10.13 9.953 9.712 9.424 8.747 -10 ,18596 ,TETRA ,17600544,Sun Nov 28 12:32:38 CET,Sun Nov 28 14:30:07 CET,0.0 0.9 1.351 1.727 2.046 2.318 2.561 2.801 3.229 3.412 3.589 3.734 4.076 4.223 4.491 4.736 4.971 5.084 5.319 5.548 5.885 6.074 6.232 6.476 6.713 6.924 7.125 7.336 7.61 7.874 8.146 8.469 8.761 9.036 9.356 9.726 10.08 10.452 10.84 11.237 11.638 12.114 12.663 13.184 13.783 14.449 15.2 15.996 16.853 17.738 18.638 19.199 19.375 19.354 19.214 18.973 18.705 18.449 18.229 18.004 17.78 17.567 17.368 17.182 16.99 16.797 16.585 16.387 16.216 16.043 15.882 15.758 15.618 15.461 15.315 15.155 15.005 14.84 14.662 14.553 14.449 14.278 14.145 14.003 13.929 13.772 13.606 13.417 13.317 13.022 13.009 12.9 12.783 12.524 12.364 12.178 12.009 11.852 11.636 11.349 10.668 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_35_52.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_35_52.txt deleted file mode 100644 index c3cc7916..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_35_52.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29040 ,TETRA ,17600545,Sun Nov 28 12:32:39 CET,Sun Nov 28 14:30:06 CET,0.0 1.532 2.018 2.324 2.556 2.818 3.073 3.29 3.67 3.847 4.002 4.076 4.401 4.548 4.819 5.057 5.254 5.345 5.528 5.692 5.923 6.075 6.227 6.461 6.678 6.872 7.051 7.239 7.487 7.711 7.935 8.191 8.425 8.651 8.894 9.169 9.428 9.69 9.971 10.259 10.533 10.833 11.177 11.515 11.886 12.238 12.572 12.868 13.074 13.088 12.69 11.841 11.025 10.342 9.716 9.104 8.564 8.086 7.662 7.238 6.874 6.52 6.152 5.805 5.487 5.224 4.976 4.742 4.546 4.326 4.071 3.867 3.653 3.424 3.235 3.039 2.835 2.618 2.404 2.256 2.084 1.794 1.599 1.425 1.34 1.151 0.951 0.749 0.639 0.322 0.244 0.106 -0.03 -0.323 -0.488 -0.656 -0.856 -1.099 -1.364 -1.702 -2.958 -2 ,2493 ,TETRA ,17600546,Sun Nov 28 12:33:34 CET,Sun Nov 28 14:31:36 CET,0.0 1.943 2.437 2.812 3.166 3.45 3.696 3.931 4.381 4.599 4.796 4.929 5.287 5.451 5.737 6.007 6.238 6.344 6.544 6.738 7.023 7.191 7.355 7.599 7.832 8.051 8.262 8.477 8.736 8.974 9.198 9.455 9.709 9.963 10.258 10.575 10.866 11.166 11.474 11.787 12.106 12.455 12.822 13.137 13.466 13.785 14.059 14.324 14.591 14.725 14.422 13.626 12.82 12.066 11.396 10.769 10.221 9.726 9.3 8.876 8.483 8.148 7.852 7.552 7.266 7.011 6.746 6.515 6.32 6.105 5.848 5.626 5.394 5.152 4.97 4.787 4.614 4.435 4.226 4.079 3.945 3.738 3.585 3.433 3.356 3.186 3.004 2.828 2.748 2.469 2.469 2.361 2.246 2.001 1.875 1.716 1.549 1.365 1.158 0.914 0.153 -3 ,8742 ,TETRA ,17600547,Sun Nov 28 12:32:39 CET,Sun Nov 28 14:29:22 CET,0.0 1.39 1.882 2.243 2.529 2.777 2.986 3.179 3.571 3.762 3.941 4.066 4.405 4.56 4.837 5.082 5.324 5.439 5.659 5.887 6.223 6.448 6.667 6.973 7.273 7.569 7.849 8.096 8.397 8.67 8.913 9.196 9.455 9.69 9.935 10.196 10.451 10.733 11.035 11.328 11.632 11.959 12.292 12.612 12.955 13.319 13.681 14.036 14.359 14.462 14.206 13.54 12.838 12.172 11.548 10.951 10.431 9.967 9.535 9.087 8.698 8.373 8.066 7.755 7.464 7.189 6.894 6.635 6.427 6.224 6.003 5.786 5.544 5.308 5.133 4.956 4.771 4.589 4.4 4.274 4.144 3.903 3.728 3.555 3.468 3.286 3.097 2.89 2.789 2.498 2.481 2.378 2.261 1.963 1.806 1.647 1.475 1.29 1.021 0.646 -0.696 -4 ,2303 ,TETRA ,17600548,Sun Nov 28 12:32:42 CET,Sun Nov 28 14:29:44 CET,0.0 1.634 2.103 2.424 2.703 2.963 3.187 3.402 3.781 3.949 4.121 4.262 4.618 4.759 5.019 5.272 5.505 5.615 5.819 6.002 6.261 6.428 6.597 6.839 7.054 7.274 7.482 7.658 7.879 8.099 8.316 8.581 8.835 9.094 9.388 9.667 9.941 10.266 10.59 10.907 11.217 11.529 11.86 12.19 12.585 12.988 13.399 13.757 13.993 14.095 13.918 13.358 12.692 12.031 11.453 10.916 10.387 9.881 9.458 8.993 8.581 8.225 7.853 7.497 7.171 6.878 6.564 6.282 6.051 5.805 5.539 5.313 5.082 4.846 4.663 4.478 4.279 4.065 3.841 3.688 3.525 3.268 3.097 2.922 2.828 2.627 2.419 2.185 2.054 1.728 1.617 1.472 1.341 1.07 0.918 0.731 0.519 0.272 -0.074 -0.55 -2.08 -5 ,15905 ,TETRA ,17600549,Sun Nov 28 12:32:39 CET,Sun Nov 28 14:30:08 CET,0.0 1.676 2.199 2.582 2.894 3.202 3.509 3.788 4.236 4.424 4.609 4.733 5.062 5.205 5.484 5.741 5.974 6.081 6.302 6.527 6.818 6.988 7.16 7.388 7.592 7.786 7.968 8.151 8.398 8.63 8.841 9.094 9.343 9.585 9.855 10.131 10.367 10.629 10.903 11.168 11.437 11.721 12.043 12.359 12.68 12.969 13.245 13.54 13.815 13.933 13.664 12.946 12.175 11.387 10.694 10.061 9.515 9.041 8.621 8.175 7.781 7.414 7.034 6.689 6.395 6.147 5.854 5.58 5.36 5.128 4.885 4.675 4.454 4.224 4.04 3.851 3.669 3.485 3.284 3.138 2.979 2.745 2.604 2.443 2.355 2.187 1.999 1.792 1.685 1.39 1.35 1.222 1.095 0.792 0.616 0.411 0.196 -0.021 -0.286 -0.658 -1.837 -6 ,20923 ,TETRA ,17600550,Sun Nov 28 12:32:40 CET,Sun Nov 28 14:29:45 CET,0.0 0.879 1.304 1.596 1.827 2.011 2.199 2.362 2.606 2.716 2.81 2.792 3.076 3.158 3.332 3.523 3.709 3.802 3.968 4.112 4.322 4.452 4.574 4.744 4.905 5.061 5.194 5.315 5.469 5.613 5.747 5.923 6.098 6.262 6.46 6.674 6.869 7.071 7.28 7.511 7.747 7.978 8.211 8.434 8.696 8.966 9.212 9.397 9.499 9.403 8.962 8.185 7.339 6.519 5.777 5.14 4.606 4.13 3.691 3.211 2.808 2.443 2.092 1.774 1.472 1.197 0.909 0.652 0.433 0.192 -0.063 -0.262 -0.466 -0.678 -0.842 -1.021 -1.204 -1.405 -1.629 -1.771 -1.917 -2.149 -2.303 -2.455 -2.535 -2.705 -2.865 -3.063 -3.172 -3.467 -3.487 -3.6 -3.721 -3.995 -4.146 -4.3 -4.466 -4.64 -4.834 -5.12 -6.346 -7 ,31111 ,TETRA ,17600551,Sun Nov 28 12:32:39 CET,Sun Nov 28 14:29:26 CET,0.0 1.8 2.318 2.678 2.96 3.186 3.406 3.596 3.933 4.094 4.232 4.287 4.615 4.758 5.042 5.313 5.559 5.663 5.844 6.018 6.278 6.444 6.604 6.826 7.035 7.248 7.447 7.628 7.868 8.101 8.313 8.579 8.825 9.042 9.29 9.575 9.842 10.118 10.404 10.688 10.976 11.294 11.645 11.968 12.32 12.69 13.095 13.448 13.673 13.731 13.491 12.901 12.225 11.628 11.062 10.508 10.032 9.569 9.14 8.682 8.27 7.914 7.595 7.271 6.933 6.632 6.321 6.043 5.813 5.572 5.317 5.103 4.872 4.612 4.408 4.214 4.011 3.797 3.586 3.438 3.277 3.021 2.854 2.687 2.593 2.39 2.178 1.964 1.854 1.538 1.482 1.353 1.2 0.854 0.677 0.488 0.279 0.071 -0.226 -0.673 -1.872 -8 ,30413 ,TETRA ,17600552,Sun Nov 28 12:32:40 CET,Sun Nov 28 14:29:29 CET,0.0 0.996 1.396 1.68 1.942 2.191 2.415 2.645 3.08 3.263 3.425 3.54 3.855 3.973 4.2 4.425 4.639 4.722 4.871 5.034 5.269 5.415 5.575 5.813 6.036 6.263 6.474 6.666 6.915 7.157 7.382 7.632 7.858 8.071 8.308 8.56 8.788 9.029 9.289 9.563 9.837 10.14 10.48 10.789 11.143 11.513 11.871 12.217 12.495 12.615 12.389 11.632 10.822 10.134 9.515 8.95 8.397 7.885 7.48 7.064 6.69 6.345 6.013 5.697 5.395 5.093 4.761 4.47 4.228 3.982 3.723 3.492 3.23 2.957 2.754 2.55 2.344 2.136 1.915 1.764 1.619 1.393 1.229 1.068 0.982 0.804 0.635 0.446 0.337 0.027 -0.034 -0.16 -0.278 -0.526 -0.662 -0.808 -0.961 -1.169 -1.435 -1.763 -2.688 -9 ,4742 ,TETRA ,17600553,Sun Nov 28 12:32:39 CET,Sun Nov 28 14:30:56 CET,0.0 1.227 1.681 2.014 2.272 2.535 2.79 3.019 3.409 3.581 3.746 3.909 4.263 4.423 4.727 4.981 5.19 5.295 5.49 5.678 5.944 6.107 6.26 6.473 6.675 6.864 7.053 7.244 7.481 7.698 7.914 8.172 8.426 8.67 8.927 9.221 9.493 9.77 10.057 10.329 10.586 10.882 11.232 11.555 11.87 12.174 12.511 12.864 13.197 13.345 13.171 12.646 12.015 11.379 10.724 10.123 9.602 9.103 8.658 8.194 7.799 7.445 7.083 6.741 6.42 6.119 5.803 5.526 5.277 5.008 4.748 4.535 4.318 4.106 3.943 3.772 3.606 3.454 3.298 3.168 3.019 2.798 2.649 2.488 2.4 2.224 2.04 1.844 1.737 1.421 1.377 1.262 1.147 0.875 0.734 0.593 0.42 0.219 -0.028 -0.378 -1.248 -10 ,28123 ,TETRA ,17600554,Sun Nov 28 12:32:40 CET,Sun Nov 28 14:29:34 CET,0.0 1.765 2.454 2.914 3.255 3.546 3.821 4.083 4.527 4.72 4.906 5.043 5.393 5.547 5.822 6.062 6.276 6.373 6.557 6.742 7.009 7.175 7.328 7.553 7.764 7.961 8.15 8.323 8.545 8.756 8.95 9.18 9.402 9.612 9.836 10.078 10.312 10.571 10.864 11.174 11.492 11.801 12.113 12.442 12.828 13.221 13.602 13.933 14.198 14.322 14.057 13.381 12.626 11.928 11.318 10.757 10.267 9.788 9.334 8.896 8.528 8.196 7.879 7.585 7.325 7.081 6.807 6.559 6.354 6.127 5.868 5.653 5.432 5.197 5.014 4.828 4.625 4.405 4.196 4.064 3.918 3.697 3.553 3.374 3.281 3.119 2.922 2.693 2.595 2.296 2.208 2.045 1.882 1.558 1.37 1.167 0.942 0.699 0.382 -0.051 -1.154 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_37_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_37_50.txt deleted file mode 100644 index 753ebfdd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_37_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9906 ,TETRA ,17600555,Sun Nov 28 12:32:42 CET,Sun Nov 28 14:30:32 CET,0.0 0.772 1.091 1.328 1.544 1.737 1.93 2.108 2.433 2.582 2.714 2.774 3.087 3.207 3.447 3.678 3.878 3.977 4.179 4.371 4.641 4.804 4.952 5.15 5.347 5.551 5.755 5.946 6.192 6.439 6.676 6.943 7.192 7.451 7.76 8.087 8.386 8.704 9.03 9.373 9.733 10.134 10.606 11.096 11.611 12.133 12.715 13.331 14.007 14.614 15.149 15.334 15.168 14.878 14.553 14.247 13.947 13.611 13.324 13.052 12.805 12.567 12.33 12.095 11.877 11.678 11.413 11.171 10.998 10.821 10.633 10.477 10.303 10.126 9.978 9.814 9.662 9.517 9.352 9.218 9.077 8.881 8.747 8.608 8.537 8.391 8.246 8.087 8.003 7.723 7.732 7.632 7.522 7.279 7.152 7.012 6.861 6.68 6.456 6.219 5.675 -2 ,24672 ,TETRA ,17600556,Sun Nov 28 12:32:43 CET,Sun Nov 28 14:31:44 CET,0.0 0.691 0.981 1.243 1.478 1.674 1.842 1.999 2.301 2.434 2.553 2.595 2.897 3.011 3.225 3.426 3.61 3.7 3.872 4.042 4.288 4.458 4.636 4.884 5.103 5.296 5.488 5.686 5.933 6.159 6.385 6.651 6.891 7.141 7.437 7.756 8.052 8.354 8.676 9.026 9.392 9.778 10.228 10.698 11.232 11.798 12.373 12.927 13.51 14.102 14.584 14.768 14.716 14.515 14.249 13.944 13.624 13.323 13.052 12.768 12.506 12.249 12.002 11.78 11.544 11.314 11.113 10.921 10.742 10.573 10.391 10.233 10.071 9.901 9.77 9.632 9.482 9.321 9.152 9.045 8.93 8.733 8.603 8.477 8.407 8.256 8.093 7.92 7.832 7.553 7.549 7.451 7.337 7.087 6.941 6.776 6.605 6.423 6.187 5.878 5.283 -3 ,26803 ,TETRA ,17600557,Sun Nov 28 12:32:45 CET,Sun Nov 28 14:31:43 CET,0.0 0.792 1.106 1.378 1.598 1.788 1.964 2.117 2.388 2.525 2.657 2.712 3.02 3.129 3.34 3.54 3.737 3.837 4.033 4.218 4.467 4.61 4.745 4.939 5.13 5.315 5.483 5.65 5.873 6.08 6.289 6.55 6.78 6.989 7.233 7.518 7.807 8.134 8.502 8.885 9.273 9.708 10.202 10.678 11.178 11.694 12.281 12.925 13.592 14.211 14.706 14.83 14.666 14.394 14.071 13.726 13.408 13.086 12.803 12.501 12.22 11.959 11.697 11.479 11.281 11.083 10.876 10.689 10.513 10.322 10.132 9.968 9.791 9.606 9.458 9.304 9.156 9.016 8.867 8.758 8.637 8.45 8.324 8.18 8.105 7.964 7.811 7.651 7.569 7.288 7.254 7.14 7.029 6.772 6.636 6.484 6.318 6.152 5.959 5.666 4.871 -4 ,12713 ,TETRA ,17600558,Sun Nov 28 12:33:36 CET,Sun Nov 28 14:33:50 CET,0.0 0.561 0.871 1.106 1.321 1.554 1.77 1.962 2.314 2.472 2.608 2.667 2.986 3.093 3.312 3.523 3.721 3.815 3.998 4.163 4.38 4.535 4.695 4.931 5.153 5.357 5.557 5.751 6.004 6.243 6.463 6.724 6.987 7.249 7.536 7.835 8.116 8.433 8.791 9.178 9.578 10.008 10.457 10.886 11.374 11.901 12.501 13.129 13.774 14.378 14.865 14.966 14.801 14.528 14.231 13.917 13.624 13.305 13.0 12.705 12.441 12.195 11.939 11.681 11.43 11.203 10.96 10.741 10.553 10.354 10.148 9.969 9.786 9.613 9.478 9.32 9.16 9.004 8.837 8.726 8.614 8.421 8.288 8.155 8.084 7.94 7.785 7.61 7.511 7.226 7.231 7.138 7.039 6.824 6.691 6.542 6.387 6.215 6.006 5.722 5.109 -5 ,168 ,TETRA ,17600559,Sun Nov 28 12:33:38 CET,Sun Nov 28 14:32:51 CET,0.0 1.473 1.81 2.054 2.28 2.456 2.619 2.768 3.043 3.176 3.306 3.373 3.682 3.778 3.979 4.185 4.376 4.462 4.623 4.774 5.002 5.153 5.298 5.518 5.728 5.934 6.138 6.329 6.566 6.798 7.024 7.297 7.572 7.838 8.124 8.445 8.764 9.092 9.427 9.77 10.131 10.537 10.974 11.409 11.898 12.379 12.931 13.557 14.235 14.928 15.537 15.73 15.596 15.342 15.055 14.717 14.376 14.052 13.765 13.492 13.247 13.01 12.78 12.559 12.348 12.158 11.947 11.755 11.586 11.395 11.196 11.048 10.904 10.74 10.602 10.447 10.286 10.123 9.954 9.844 9.715 9.507 9.38 9.249 9.181 9.045 8.908 8.773 8.686 8.39 8.338 8.209 8.085 7.816 7.677 7.528 7.35 7.128 6.867 6.627 6.139 -6 ,9236 ,TETRA ,17600560,Sun Nov 28 12:33:34 CET,Sun Nov 28 14:32:04 CET,0.0 0.825 1.094 1.295 1.475 1.643 1.815 1.991 2.301 2.43 2.551 2.61 2.921 3.034 3.253 3.457 3.662 3.761 3.953 4.145 4.406 4.581 4.763 5.022 5.253 5.461 5.661 5.867 6.134 6.383 6.619 6.902 7.163 7.41 7.701 8.016 8.306 8.604 8.917 9.277 9.664 10.075 10.537 10.983 11.495 12.022 12.578 13.164 13.785 14.482 15.051 15.151 14.996 14.766 14.5 14.182 13.846 13.542 13.284 13.003 12.755 12.527 12.288 12.036 11.82 11.637 11.426 11.23 11.048 10.863 10.677 10.517 10.348 10.158 10.006 9.853 9.697 9.538 9.369 9.252 9.134 8.938 8.79 8.637 8.562 8.419 8.273 8.089 7.996 7.721 7.708 7.603 7.499 7.297 7.168 7.027 6.883 6.709 6.508 6.287 5.807 -7 ,28951 ,TETRA ,17600561,Sun Nov 28 12:34:06 CET,Sun Nov 28 14:34:44 CET,0.0 0.853 1.207 1.441 1.609 1.763 1.919 2.062 2.324 2.449 2.57 2.6 2.89 2.98 3.175 3.376 3.559 3.649 3.823 3.993 4.247 4.401 4.552 4.786 5.01 5.217 5.42 5.614 5.843 6.068 6.302 6.587 6.866 7.131 7.431 7.752 8.024 8.323 8.657 9.013 9.392 9.802 10.274 10.738 11.265 11.856 12.486 13.085 13.732 14.353 14.751 14.806 14.654 14.368 14.046 13.71 13.382 13.068 12.783 12.491 12.227 11.989 11.763 11.541 11.325 11.12 10.896 10.701 10.537 10.358 10.17 10.005 9.834 9.661 9.515 9.366 9.224 9.081 8.917 8.796 8.682 8.505 8.368 8.233 8.17 8.036 7.892 7.743 7.663 7.401 7.425 7.33 7.234 7.001 6.867 6.738 6.578 6.407 6.211 5.961 5.569 -8 ,5935 ,TETRA ,17600562,Sun Nov 28 12:33:35 CET,Sun Nov 28 14:30:47 CET,0.0 0.7 0.993 1.21 1.416 1.618 1.797 1.961 2.252 2.378 2.497 2.551 2.869 2.98 3.175 3.355 3.544 3.642 3.831 4.01 4.252 4.402 4.554 4.768 4.968 5.161 5.336 5.507 5.735 5.943 6.15 6.418 6.666 6.901 7.174 7.485 7.785 8.106 8.436 8.786 9.156 9.561 10.022 10.498 11.038 11.589 12.157 12.758 13.434 14.142 14.743 14.888 14.734 14.478 14.162 13.82 13.508 13.194 12.901 12.571 12.289 12.059 11.826 11.584 11.368 11.172 10.935 10.722 10.539 10.339 10.14 9.974 9.79 9.597 9.447 9.296 9.14 8.966 8.791 8.672 8.549 8.36 8.223 8.079 8.009 7.868 7.72 7.559 7.47 7.194 7.186 7.076 6.968 6.748 6.629 6.491 6.347 6.185 5.998 5.774 5.289 -9 ,22850 ,TETRA ,17600563,Sun Nov 28 12:33:37 CET,Sun Nov 28 14:30:42 CET,0.0 0.554 0.804 1.025 1.232 1.407 1.56 1.703 1.973 2.093 2.207 2.256 2.562 2.664 2.871 3.079 3.276 3.371 3.552 3.732 3.987 4.141 4.296 4.515 4.732 4.947 5.156 5.358 5.62 5.876 6.119 6.404 6.671 6.912 7.168 7.457 7.741 8.067 8.408 8.748 9.104 9.515 9.999 10.467 10.981 11.51 12.075 12.649 13.251 13.876 14.411 14.593 14.529 14.342 14.078 13.764 13.461 13.151 12.86 12.573 12.311 12.06 11.787 11.517 11.279 11.066 10.854 10.661 10.491 10.321 10.141 9.987 9.835 9.674 9.535 9.389 9.242 9.087 8.915 8.793 8.666 8.478 8.35 8.214 8.141 7.991 7.845 7.695 7.625 7.366 7.369 7.269 7.166 6.934 6.808 6.659 6.476 6.292 6.11 5.853 5.304 -10 ,13353 ,TETRA ,17600564,Sun Nov 28 12:33:39 CET,Sun Nov 28 14:31:16 CET,0.0 0.433 0.708 0.969 1.211 1.409 1.59 1.746 2.013 2.141 2.273 2.34 2.647 2.748 2.939 3.139 3.344 3.444 3.629 3.813 4.063 4.215 4.372 4.613 4.858 5.076 5.268 5.46 5.712 5.95 6.174 6.445 6.715 6.963 7.234 7.539 7.825 8.17 8.546 8.911 9.287 9.706 10.197 10.674 11.195 11.754 12.33 12.914 13.586 14.327 14.943 15.062 14.907 14.678 14.413 14.138 13.847 13.555 13.307 13.05 12.801 12.581 12.373 12.161 11.946 11.75 11.562 11.382 11.221 11.055 10.877 10.724 10.545 10.34 10.181 10.027 9.876 9.727 9.572 9.465 9.352 9.158 9.022 8.886 8.815 8.655 8.486 8.304 8.21 7.931 7.915 7.814 7.711 7.492 7.38 7.239 7.078 6.905 6.674 6.38 5.944 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_37_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_37_53.txt deleted file mode 100644 index b5c842ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_37_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4554 ,TETRA ,17600565,Sun Nov 28 12:33:42 CET,Sun Nov 28 14:31:06 CET,0.0 0.705 1.093 1.379 1.577 1.772 1.96 2.149 2.483 2.632 2.762 2.792 3.094 3.198 3.371 3.52 3.658 3.721 3.84 3.963 4.146 4.258 4.371 4.541 4.705 4.871 5.04 5.194 5.388 5.57 5.738 5.943 6.133 6.306 6.538 6.812 7.041 7.263 7.484 7.704 7.917 8.131 8.353 8.575 8.804 9.016 9.187 9.268 9.243 9.034 8.496 7.522 6.512 5.542 4.641 3.852 3.164 2.508 1.92 1.341 0.848 0.405 -0.012 -0.414 -0.787 -1.115 -1.466 -1.788 -2.067 -2.363 -2.663 -2.906 -3.172 -3.454 -3.67 -3.885 -4.114 -4.357 -4.589 -4.747 -4.919 -5.165 -5.334 -5.517 -5.614 -5.826 -6.048 -6.284 -6.403 -6.716 -6.799 -6.954 -7.096 -7.387 -7.561 -7.767 -7.968 -8.177 -8.436 -8.784 -9.599 -2 ,17400 ,TETRA ,17600566,Sun Nov 28 12:33:35 CET,Sun Nov 28 14:30:46 CET,0.0 0.585 0.848 1.056 1.26 1.447 1.594 1.728 1.993 2.117 2.245 2.291 2.598 2.707 2.921 3.099 3.259 3.34 3.508 3.668 3.89 4.04 4.181 4.377 4.548 4.698 4.849 4.981 5.145 5.312 5.469 5.65 5.813 5.976 6.17 6.374 6.553 6.741 6.943 7.136 7.339 7.558 7.791 8.026 8.263 8.446 8.611 8.724 8.759 8.7 8.308 7.487 6.713 5.99 5.312 4.705 4.177 3.669 3.24 2.821 2.438 2.083 1.736 1.411 1.118 0.853 0.57 0.321 0.107 -0.106 -0.326 -0.521 -0.728 -0.942 -1.098 -1.263 -1.432 -1.6 -1.777 -1.898 -2.027 -2.245 -2.394 -2.537 -2.611 -2.759 -2.916 -3.087 -3.184 -3.482 -3.466 -3.57 -3.671 -3.906 -4.045 -4.177 -4.326 -4.518 -4.726 -4.965 -5.788 -3 ,4632 ,TETRA ,17600567,Sun Nov 28 12:33:36 CET,Sun Nov 28 14:31:03 CET,0.0 0.678 1.051 1.365 1.622 1.844 2.048 2.22 2.541 2.696 2.841 2.917 3.211 3.297 3.466 3.627 3.785 3.862 4.015 4.161 4.366 4.498 4.619 4.779 4.929 5.077 5.23 5.366 5.521 5.696 5.876 6.082 6.296 6.519 6.765 7.026 7.265 7.522 7.778 8.023 8.287 8.57 8.855 9.124 9.381 9.571 9.744 9.861 9.868 9.632 8.896 7.846 6.844 5.865 4.99 4.197 3.506 2.872 2.302 1.72 1.218 0.762 0.327 -0.062 -0.425 -0.749 -1.088 -1.413 -1.702 -1.998 -2.298 -2.553 -2.817 -3.088 -3.297 -3.508 -3.735 -3.978 -4.227 -4.397 -4.583 -4.897 -5.113 -5.325 -5.438 -5.678 -5.927 -6.171 -6.301 -6.658 -6.788 -6.927 -7.078 -7.446 -7.642 -7.853 -8.071 -8.304 -8.599 -9.047 -9.824 -4 ,15542 ,TETRA ,17600568,Sun Nov 28 12:33:35 CET,Sun Nov 28 14:31:39 CET,0.0 0.841 1.19 1.447 1.667 1.878 2.036 2.18 2.472 2.595 2.717 2.768 3.083 3.195 3.422 3.624 3.799 3.881 4.036 4.183 4.386 4.521 4.658 4.856 5.032 5.212 5.385 5.54 5.733 5.938 6.142 6.356 6.545 6.729 6.948 7.186 7.41 7.654 7.905 8.123 8.331 8.572 8.84 9.11 9.375 9.571 9.724 9.909 10.117 10.056 9.45 8.367 7.323 6.385 5.548 4.781 4.096 3.453 2.887 2.326 1.836 1.386 0.959 0.581 0.242 -0.074 -0.427 -0.749 -1.02 -1.308 -1.606 -1.838 -2.082 -2.345 -2.545 -2.76 -2.993 -3.224 -3.471 -3.643 -3.827 -4.143 -4.355 -4.565 -4.67 -4.89 -5.131 -5.378 -5.504 -5.839 -5.929 -6.091 -6.271 -6.666 -6.897 -7.14 -7.374 -7.647 -7.958 -8.351 -9.431 -5 ,15498 ,TETRA ,17600569,Sun Nov 28 12:33:36 CET,Sun Nov 28 14:31:43 CET,0.0 0.769 1.134 1.469 1.739 1.955 2.152 2.33 2.649 2.791 2.904 2.911 3.215 3.317 3.475 3.62 3.786 3.88 4.062 4.216 4.421 4.544 4.663 4.843 5.033 5.211 5.377 5.534 5.731 5.916 6.063 6.224 6.409 6.58 6.75 6.935 7.118 7.319 7.519 7.736 7.971 8.202 8.416 8.606 8.793 8.979 9.13 9.184 9.157 8.935 8.29 7.256 6.26 5.352 4.522 3.747 3.026 2.37 1.84 1.314 0.833 0.383 -0.048 -0.447 -0.826 -1.176 -1.539 -1.856 -2.118 -2.386 -2.672 -2.912 -3.169 -3.442 -3.641 -3.843 -4.052 -4.273 -4.516 -4.682 -4.845 -5.114 -5.308 -5.5 -5.601 -5.811 -6.027 -6.286 -6.44 -6.797 -6.964 -7.131 -7.291 -7.677 -7.88 -8.084 -8.33 -8.59 -8.865 -9.267 -10.602 -6 ,29665 ,TETRA ,17600570,Sun Nov 28 12:33:38 CET,Sun Nov 28 14:31:49 CET,0.0 1.283 1.744 2.032 2.239 2.41 2.585 2.725 2.951 3.05 3.15 3.145 3.433 3.517 3.685 3.844 3.994 4.071 4.22 4.354 4.547 4.668 4.777 4.942 5.092 5.221 5.355 5.497 5.677 5.852 6.012 6.193 6.377 6.536 6.7 6.891 7.068 7.254 7.465 7.694 7.91 8.124 8.376 8.583 8.775 9.01 9.251 9.44 9.431 9.133 8.484 7.445 6.472 5.556 4.695 3.903 3.189 2.533 1.964 1.423 0.956 0.515 0.096 -0.296 -0.666 -0.997 -1.34 -1.663 -1.945 -2.246 -2.565 -2.821 -3.083 -3.356 -3.567 -3.778 -4.0 -4.24 -4.516 -4.699 -4.856 -5.108 -5.298 -5.496 -5.596 -5.808 -6.034 -6.265 -6.384 -6.709 -6.777 -6.924 -7.083 -7.417 -7.586 -7.776 -7.98 -8.2 -8.463 -8.836 -9.945 -7 ,5613 ,TETRA ,17600571,Sun Nov 28 12:33:41 CET,Sun Nov 28 14:32:41 CET,0.0 0.68 1.009 1.33 1.607 1.823 2.022 2.217 2.593 2.763 2.906 2.944 3.24 3.342 3.557 3.766 3.949 4.039 4.221 4.399 4.667 4.826 4.986 5.239 5.469 5.659 5.819 5.962 6.146 6.325 6.494 6.694 6.878 7.054 7.24 7.445 7.626 7.806 8.003 8.202 8.426 8.684 8.934 9.155 9.393 9.622 9.823 9.951 9.972 9.809 9.337 8.467 7.472 6.557 5.784 5.072 4.412 3.789 3.231 2.69 2.206 1.753 1.326 0.931 0.551 0.195 -0.16 -0.468 -0.735 -1.012 -1.301 -1.542 -1.801 -2.078 -2.277 -2.469 -2.679 -2.915 -3.168 -3.337 -3.513 -3.8 -3.994 -4.192 -4.302 -4.527 -4.739 -4.963 -5.085 -5.42 -5.524 -5.68 -5.84 -6.208 -6.409 -6.629 -6.868 -7.128 -7.424 -7.766 -8.395 -8 ,8055 ,TETRA ,17600572,Sun Nov 28 12:33:43 CET,Sun Nov 28 14:30:42 CET,0.0 1.052 1.466 1.759 2.04 2.268 2.459 2.654 3.003 3.139 3.267 3.349 3.681 3.812 4.048 4.255 4.452 4.54 4.696 4.85 5.07 5.215 5.364 5.582 5.783 5.964 6.137 6.288 6.478 6.685 6.875 7.093 7.298 7.458 7.616 7.805 7.994 8.196 8.417 8.64 8.855 9.089 9.356 9.608 9.876 10.115 10.289 10.398 10.401 10.172 9.481 8.428 7.469 6.675 6.0 5.376 4.821 4.32 3.889 3.442 3.06 2.735 2.406 2.098 1.824 1.568 1.291 1.036 0.828 0.612 0.376 0.184 -0.015 -0.232 -0.395 -0.544 -0.71 -0.89 -1.07 -1.2 -1.337 -1.552 -1.702 -1.838 -1.908 -2.072 -2.235 -2.405 -2.499 -2.792 -2.802 -2.912 -3.017 -3.232 -3.369 -3.52 -3.675 -3.876 -4.13 -4.424 -5.127 -9 ,22455 ,TETRA ,17600573,Sun Nov 28 12:33:36 CET,Sun Nov 28 14:31:12 CET,0.0 1.139 1.587 1.991 2.36 2.679 2.973 3.252 3.744 3.96 4.148 4.271 4.602 4.738 4.992 5.214 5.402 5.499 5.712 5.908 6.157 6.304 6.46 6.686 6.88 7.057 7.215 7.359 7.541 7.719 7.887 8.063 8.215 8.369 8.548 8.747 8.935 9.142 9.357 9.547 9.737 9.941 10.14 10.308 10.505 10.719 10.919 11.062 11.111 10.993 10.379 9.294 8.29 7.372 6.545 5.786 5.093 4.452 3.893 3.345 2.87 2.445 2.037 1.657 1.301 0.962 0.617 0.3 0.01 -0.289 -0.592 -0.843 -1.107 -1.388 -1.597 -1.829 -2.091 -2.352 -2.615 -2.791 -2.97 -3.239 -3.427 -3.632 -3.735 -3.961 -4.219 -4.484 -4.615 -4.944 -5.022 -5.168 -5.327 -5.679 -5.886 -6.11 -6.357 -6.625 -6.951 -7.388 -8.282 -10 ,20004 ,TETRA ,17600574,Sun Nov 28 12:33:36 CET,Sun Nov 28 14:33:26 CET,0.0 0.902 1.306 1.576 1.804 1.987 2.144 2.289 2.565 2.699 2.827 2.843 3.138 3.235 3.407 3.563 3.718 3.795 3.939 4.077 4.293 4.431 4.558 4.738 4.914 5.085 5.251 5.413 5.61 5.79 5.941 6.121 6.294 6.461 6.66 6.855 7.034 7.242 7.474 7.673 7.824 8.012 8.231 8.458 8.722 8.928 9.094 9.21 9.253 9.146 8.585 7.559 6.565 5.631 4.814 4.043 3.345 2.723 2.184 1.652 1.202 0.802 0.415 0.051 -0.279 -0.591 -0.92 -1.218 -1.477 -1.741 -2.022 -2.252 -2.49 -2.747 -2.947 -3.161 -3.385 -3.606 -3.824 -3.974 -4.129 -4.366 -4.539 -4.728 -4.825 -5.03 -5.246 -5.471 -5.587 -5.909 -5.971 -6.099 -6.243 -6.579 -6.764 -6.959 -7.16 -7.387 -7.69 -8.048 -8.857 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_37_56.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_37_56.txt deleted file mode 100644 index 1f018f87..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_37_56.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18682 ,KEBNE ,17027017,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:40:46 CET,0.0 1.904 2.351 2.685 2.96 3.189 3.407 3.606 3.937 4.095 4.232 4.296 4.626 4.737 4.957 5.18 5.387 5.479 5.633 5.795 6.037 6.198 6.355 6.577 6.789 6.986 7.167 7.334 7.558 7.765 7.961 8.215 8.444 8.649 8.88 9.127 9.369 9.625 9.899 10.232 10.558 10.874 11.227 11.546 11.929 12.352 12.789 13.186 13.573 13.849 13.837 13.448 12.856 12.196 11.588 11.017 10.457 9.944 9.5 9.044 8.644 8.284 7.916 7.551 7.212 6.902 6.566 6.255 5.982 5.7 5.422 5.195 4.945 4.674 4.473 4.262 4.035 3.808 3.576 3.403 3.226 2.972 2.789 2.593 2.494 2.279 2.051 1.821 1.702 1.386 1.343 1.206 1.068 0.778 0.612 0.427 0.241 0.025 -0.27 -0.634 -1.462 -2 ,27051 ,KEBNE ,17027018,Wed Dec 22 15:58:40 CET,Wed Dec 22 17:36:05 CET,0.0 0.878 1.264 1.617 1.915 2.133 2.337 2.539 2.9 3.062 3.226 3.327 3.636 3.76 3.999 4.223 4.44 4.538 4.716 4.887 5.142 5.305 5.467 5.699 5.915 6.123 6.324 6.509 6.732 6.939 7.155 7.414 7.645 7.871 8.111 8.387 8.663 8.956 9.276 9.599 9.928 10.309 10.745 11.143 11.55 11.999 12.511 12.996 13.434 13.73 13.717 13.305 12.715 12.073 11.443 10.834 10.263 9.681 9.163 8.667 8.233 7.825 7.418 7.056 6.72 6.409 6.086 5.778 5.504 5.229 4.946 4.71 4.467 4.222 4.028 3.814 3.582 3.346 3.106 2.938 2.78 2.548 2.378 2.17 2.054 1.837 1.632 1.42 1.306 0.984 0.925 0.794 0.652 0.356 0.203 0.041 -0.141 -0.374 -0.661 -1.05 -2.362 -3 ,12869 ,KEBNE ,17027019,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:39:45 CET,0.0 1.869 2.248 2.539 2.815 3.065 3.28 3.479 3.837 3.989 4.122 4.186 4.51 4.639 4.874 5.089 5.296 5.394 5.568 5.748 6.031 6.2 6.366 6.619 6.842 7.054 7.259 7.452 7.699 7.936 8.159 8.446 8.729 8.97 9.225 9.506 9.78 10.085 10.389 10.681 10.984 11.336 11.716 12.063 12.453 12.86 13.285 13.734 14.136 14.332 14.249 13.731 13.156 12.589 12.0 11.378 10.8 10.294 9.834 9.387 9.0 8.628 8.263 7.902 7.545 7.217 6.885 6.588 6.319 6.03 5.739 5.509 5.261 4.989 4.788 4.588 4.392 4.193 3.98 3.83 3.665 3.413 3.234 3.036 2.932 2.725 2.523 2.307 2.185 1.852 1.789 1.653 1.502 1.165 1.004 0.851 0.674 0.468 0.246 -0.022 -0.675 -4 ,19398 ,KEBNE ,17027020,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:40:18 CET,0.0 1.439 1.858 2.183 2.462 2.71 2.926 3.111 3.427 3.576 3.723 3.804 4.14 4.264 4.5 4.719 4.913 5.007 5.2 5.383 5.62 5.756 5.895 6.103 6.301 6.499 6.69 6.882 7.116 7.324 7.528 7.786 8.031 8.262 8.547 8.866 9.14 9.409 9.708 10.031 10.361 10.725 11.124 11.514 11.916 12.346 12.802 13.158 13.427 13.606 13.504 13.027 12.485 11.901 11.279 10.651 10.083 9.541 9.04 8.531 8.084 7.675 7.273 6.878 6.509 6.159 5.796 5.487 5.222 4.95 4.661 4.414 4.162 3.889 3.653 3.419 3.196 2.972 2.743 2.578 2.404 2.126 1.939 1.749 1.647 1.436 1.23 1.001 0.867 0.541 0.486 0.347 0.211 -0.095 -0.281 -0.472 -0.667 -0.86 -1.066 -1.358 -2.188 -5 ,22729 ,KEBNE ,17027021,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:39:42 CET,0.0 1.811 2.368 2.81 3.186 3.471 3.717 3.932 4.293 4.459 4.609 4.698 5.022 5.162 5.408 5.622 5.836 5.941 6.14 6.327 6.599 6.773 6.948 7.195 7.422 7.646 7.863 8.074 8.341 8.583 8.803 9.069 9.304 9.532 9.827 10.148 10.436 10.74 11.076 11.406 11.724 12.064 12.429 12.789 13.211 13.653 14.068 14.439 14.748 14.964 14.942 14.524 14.02 13.392 12.716 12.102 11.517 10.922 10.393 9.871 9.434 9.02 8.606 8.226 7.871 7.545 7.215 6.907 6.627 6.346 6.064 5.837 5.609 5.357 5.151 4.942 4.726 4.509 4.287 4.136 3.98 3.728 3.548 3.349 3.246 3.049 2.847 2.616 2.494 2.174 2.124 1.987 1.837 1.492 1.301 1.107 0.905 0.695 0.441 0.125 -0.78 -6 ,25020 ,KEBNE ,17027022,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:40:36 CET,0.0 1.99 2.478 2.791 3.094 3.374 3.642 3.9 4.315 4.493 4.663 4.812 5.17 5.34 5.666 5.928 6.163 6.281 6.501 6.703 6.979 7.141 7.29 7.514 7.755 7.999 8.219 8.41 8.663 8.899 9.125 9.4 9.657 9.895 10.147 10.428 10.69 10.951 11.243 11.56 11.871 12.196 12.539 12.865 13.254 13.665 14.098 14.502 14.832 15.047 14.993 14.513 13.873 13.171 12.545 11.953 11.398 10.86 10.365 9.858 9.413 9.019 8.631 8.238 7.853 7.499 7.144 6.854 6.625 6.372 6.097 5.86 5.596 5.322 5.113 4.898 4.685 4.471 4.234 4.066 3.891 3.626 3.449 3.264 3.17 2.963 2.744 2.503 2.377 2.05 1.98 1.839 1.685 1.337 1.148 0.941 0.733 0.478 0.184 -0.205 -1.337 -7 ,30530 ,KEBNE ,17027023,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:39:15 CET,0.0 1.463 1.944 2.302 2.599 2.844 3.079 3.307 3.686 3.853 4.011 4.13 4.464 4.597 4.829 5.048 5.278 5.385 5.586 5.783 6.067 6.24 6.394 6.612 6.839 7.052 7.243 7.441 7.697 7.938 8.162 8.42 8.664 8.881 9.135 9.419 9.688 9.995 10.313 10.645 10.995 11.364 11.763 12.152 12.551 12.917 13.327 13.727 14.007 14.083 13.893 13.378 12.698 11.99 11.3 10.677 10.14 9.612 9.142 8.625 8.177 7.787 7.405 7.046 6.707 6.387 6.063 5.787 5.539 5.279 5.01 4.783 4.54 4.285 4.075 3.86 3.637 3.398 3.166 3.011 2.837 2.549 2.361 2.177 2.084 1.891 1.682 1.47 1.36 1.047 0.962 0.812 0.657 0.312 0.129 -0.045 -0.241 -0.468 -0.729 -1.046 -1.902 -8 ,16149 ,KEBNE ,17027024,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:38:59 CET,0.0 2.156 2.768 3.188 3.552 3.871 4.15 4.388 4.761 4.921 5.08 5.2 5.524 5.651 5.885 6.093 6.305 6.414 6.64 6.84 7.112 7.299 7.47 7.687 7.914 8.135 8.343 8.554 8.827 9.072 9.306 9.573 9.812 10.036 10.307 10.624 10.917 11.232 11.575 11.918 12.235 12.59 12.971 13.299 13.66 14.044 14.45 14.86 15.297 15.59 15.536 15.051 14.396 13.717 13.094 12.501 11.961 11.452 10.99 10.529 10.132 9.786 9.452 9.102 8.765 8.459 8.131 7.84 7.573 7.282 6.987 6.75 6.5 6.238 6.045 5.851 5.643 5.408 5.159 4.997 4.831 4.573 4.392 4.208 4.118 3.917 3.697 3.48 3.373 3.071 3.031 2.9 2.761 2.438 2.272 2.108 1.926 1.698 1.416 1.053 -0.193 -9 ,24028 ,KEBNE ,17027025,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:39:53 CET,0.0 1.068 1.523 1.87 2.207 2.489 2.72 2.927 3.286 3.457 3.624 3.734 4.056 4.188 4.434 4.676 4.914 5.026 5.239 5.433 5.716 5.897 6.056 6.275 6.49 6.693 6.887 7.083 7.326 7.551 7.756 7.992 8.24 8.475 8.703 8.948 9.227 9.536 9.828 10.131 10.457 10.812 11.166 11.515 11.951 12.409 12.838 13.24 13.614 13.91 14.038 13.738 13.218 12.633 12.053 11.476 10.975 10.51 10.075 9.634 9.274 8.916 8.519 8.13 7.772 7.443 7.104 6.803 6.53 6.257 5.962 5.696 5.411 5.104 4.86 4.608 4.366 4.119 3.871 3.7 3.518 3.24 3.038 2.811 2.681 2.417 2.155 1.899 1.78 1.455 1.393 1.25 1.106 0.798 0.64 0.462 0.251 0.025 -0.205 -0.476 -1.308 -10 ,28768 ,KEBNE ,17027026,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:40:22 CET,0.0 1.767 2.248 2.589 2.857 3.069 3.281 3.482 3.822 3.975 4.11 4.167 4.481 4.602 4.821 5.048 5.285 5.394 5.593 5.781 6.033 6.184 6.329 6.519 6.701 6.892 7.088 7.273 7.521 7.768 8.008 8.281 8.526 8.776 9.056 9.344 9.62 9.928 10.241 10.563 10.9 11.301 11.723 12.086 12.48 12.851 13.2 13.538 13.922 14.337 14.519 14.099 13.406 12.693 12.021 11.378 10.824 10.306 9.848 9.422 9.03 8.636 8.229 7.835 7.443 7.077 6.718 6.4 6.143 5.899 5.641 5.421 5.187 4.944 4.745 4.536 4.31 4.079 3.849 3.691 3.53 3.266 3.085 2.899 2.801 2.588 2.37 2.155 2.042 1.73 1.655 1.516 1.391 1.166 1.038 0.889 0.741 0.573 0.366 0.168 -0.294 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_38_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_38_39.txt deleted file mode 100644 index c4d80897..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_38_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8591 ,TETRA ,17600575,Sun Nov 28 12:33:36 CET,Sun Nov 28 14:30:34 CET,0.0 1.504 1.927 2.268 2.531 2.756 2.97 3.17 3.52 3.672 3.821 3.935 4.258 4.385 4.633 4.86 5.08 5.188 5.394 5.589 5.87 6.048 6.224 6.472 6.714 6.954 7.182 7.399 7.678 7.936 8.173 8.471 8.762 9.033 9.336 9.695 10.049 10.424 10.811 11.208 11.607 12.027 12.528 13.024 13.541 14.054 14.584 15.122 15.632 15.966 15.88 15.317 14.638 14.001 13.452 12.935 12.425 11.903 11.439 10.948 10.472 10.034 9.626 9.245 8.902 8.583 8.239 7.935 7.676 7.405 7.12 6.883 6.642 6.386 6.175 5.956 5.743 5.527 5.287 5.119 4.939 4.652 4.468 4.279 4.18 3.971 3.74 3.489 3.36 3.036 2.939 2.796 2.641 2.295 2.113 1.919 1.682 1.405 1.097 0.73 -0.267 -2 ,6350 ,TETRA ,17600576,Sun Nov 28 12:33:38 CET,Sun Nov 28 14:30:07 CET,0.0 1.324 1.809 2.167 2.442 2.695 2.909 3.094 3.446 3.605 3.756 3.845 4.178 4.327 4.616 4.865 5.086 5.195 5.416 5.618 5.892 6.076 6.249 6.5 6.748 6.963 7.161 7.361 7.641 7.921 8.18 8.499 8.799 9.081 9.414 9.764 10.089 10.44 10.805 11.201 11.594 12.016 12.506 12.971 13.495 14.046 14.622 15.22 15.789 16.168 16.274 15.97 15.413 14.747 14.101 13.494 12.916 12.362 11.857 11.343 10.895 10.486 10.103 9.721 9.357 9.036 8.695 8.386 8.125 7.838 7.535 7.299 7.049 6.777 6.562 6.335 6.109 5.888 5.663 5.497 5.321 5.057 4.883 4.703 4.6 4.38 4.164 3.914 3.782 3.463 3.391 3.244 3.09 2.759 2.577 2.367 2.126 1.841 1.492 1.112 -0.012 -3 ,5033 ,TETRA ,17600577,Sun Nov 28 12:33:38 CET,Sun Nov 28 14:30:56 CET,0.0 1.006 1.384 1.687 1.974 2.203 2.42 2.616 2.945 3.114 3.269 3.354 3.67 3.802 4.07 4.306 4.503 4.603 4.8 4.988 5.274 5.462 5.642 5.894 6.126 6.331 6.526 6.728 6.993 7.245 7.478 7.753 8.034 8.306 8.61 8.961 9.297 9.65 10.03 10.425 10.807 11.232 11.713 12.145 12.634 13.155 13.698 14.183 14.604 15.003 15.183 14.896 14.401 13.834 13.234 12.625 12.077 11.6 11.168 10.696 10.293 9.931 9.572 9.223 8.882 8.558 8.203 7.886 7.613 7.307 6.988 6.753 6.511 6.231 6.008 5.793 5.581 5.335 5.05 4.839 4.625 4.333 4.144 3.954 3.856 3.634 3.376 3.076 2.914 2.543 2.387 2.209 2.046 1.705 1.518 1.319 1.11 0.896 0.633 0.251 -0.906 -4 ,8301 ,TETRA ,17600578,Sun Nov 28 12:33:38 CET,Sun Nov 28 14:31:50 CET,0.0 1.104 1.47 1.726 1.961 2.199 2.408 2.591 2.905 3.043 3.183 3.272 3.612 3.741 3.977 4.185 4.387 4.487 4.669 4.844 5.102 5.259 5.401 5.616 5.827 6.039 6.26 6.475 6.738 6.975 7.195 7.445 7.693 7.936 8.22 8.552 8.866 9.191 9.509 9.845 10.203 10.601 11.062 11.491 11.949 12.402 12.912 13.402 13.805 14.107 14.137 13.643 12.996 12.372 11.771 11.151 10.551 9.975 9.458 8.953 8.495 8.058 7.653 7.283 6.934 6.613 6.27 5.95 5.659 5.371 5.099 4.865 4.61 4.333 4.122 3.904 3.665 3.429 3.188 3.019 2.838 2.55 2.347 2.112 1.981 1.734 1.49 1.242 1.117 0.799 0.73 0.575 0.415 0.081 -0.093 -0.284 -0.496 -0.751 -1.062 -1.466 -2.961 -5 ,13895 ,TETRA ,17600579,Sun Nov 28 12:33:40 CET,Sun Nov 28 14:31:51 CET,0.0 0.979 1.405 1.677 1.942 2.181 2.375 2.56 2.915 3.066 3.21 3.315 3.646 3.773 4.018 4.24 4.45 4.554 4.758 4.966 5.253 5.419 5.581 5.826 6.061 6.301 6.542 6.757 7.005 7.241 7.471 7.738 7.999 8.272 8.587 8.909 9.216 9.561 9.92 10.285 10.65 11.027 11.455 11.903 12.413 12.869 13.334 13.848 14.336 14.726 14.82 14.47 13.939 13.313 12.668 12.014 11.437 10.925 10.464 9.982 9.556 9.177 8.789 8.382 7.986 7.603 7.189 6.818 6.491 6.167 5.848 5.594 5.359 5.1 4.887 4.681 4.465 4.219 3.959 3.791 3.621 3.351 3.157 2.956 2.856 2.654 2.442 2.225 2.105 1.784 1.716 1.581 1.435 1.092 0.862 0.592 0.304 -0.023 -0.397 -0.848 -2.437 -6 ,11530 ,TETRA ,17600580,Sun Nov 28 12:33:42 CET,Sun Nov 28 14:31:49 CET,0.0 2.486 2.997 3.399 3.703 3.954 4.167 4.363 4.748 4.933 5.113 5.262 5.606 5.749 6.024 6.259 6.49 6.615 6.87 7.105 7.443 7.671 7.881 8.171 8.459 8.739 9.018 9.267 9.572 9.886 10.185 10.529 10.843 11.146 11.5 11.905 12.306 12.717 13.127 13.576 14.055 14.58 15.218 15.841 16.435 16.962 17.461 17.927 18.38 18.767 18.898 18.572 18.013 17.409 16.753 15.994 15.28 14.655 14.103 13.518 13.028 12.602 12.16 11.739 11.353 10.997 10.642 10.323 10.028 9.714 9.399 9.134 8.85 8.562 8.338 8.103 7.866 7.623 7.369 7.194 7.004 6.712 6.525 6.334 6.23 6.008 5.79 5.549 5.415 5.087 5.022 4.888 4.757 4.46 4.294 4.118 3.934 3.721 3.473 3.134 2.24 -7 ,6762 ,TETRA ,17600581,Sun Nov 28 12:33:38 CET,Sun Nov 28 14:31:51 CET,0.0 1.329 1.713 2.021 2.277 2.503 2.71 2.908 3.269 3.42 3.559 3.658 3.984 4.114 4.375 4.618 4.836 4.947 5.164 5.362 5.638 5.823 6.002 6.239 6.465 6.68 6.898 7.11 7.369 7.625 7.855 8.113 8.361 8.607 8.902 9.238 9.557 9.897 10.256 10.613 10.969 11.372 11.85 12.303 12.782 13.261 13.773 14.284 14.809 15.236 15.308 14.928 14.349 13.715 13.085 12.446 11.877 11.351 10.867 10.373 9.949 9.577 9.207 8.847 8.514 8.196 7.862 7.579 7.313 7.021 6.722 6.473 6.222 5.953 5.749 5.55 5.335 5.108 4.874 4.707 4.527 4.253 4.068 3.88 3.786 3.592 3.356 3.068 2.913 2.552 2.415 2.259 2.107 1.787 1.611 1.4 1.18 0.965 0.727 0.387 -0.853 -8 ,10025 ,TETRA ,17600582,Sun Nov 28 12:33:38 CET,Sun Nov 28 14:31:52 CET,0.0 1.087 1.497 1.822 2.078 2.286 2.484 2.663 2.997 3.17 3.327 3.412 3.719 3.839 4.088 4.337 4.56 4.658 4.85 5.042 5.306 5.455 5.61 5.862 6.097 6.323 6.546 6.753 7.012 7.268 7.513 7.808 8.076 8.332 8.636 8.957 9.255 9.602 9.957 10.288 10.629 11.005 11.445 11.867 12.313 12.767 13.248 13.772 14.266 14.601 14.647 14.203 13.57 12.879 12.211 11.626 11.066 10.529 10.075 9.598 9.159 8.762 8.388 8.048 7.736 7.436 7.104 6.812 6.553 6.27 5.964 5.711 5.46 5.201 4.999 4.785 4.564 4.34 4.11 3.946 3.782 3.53 3.347 3.153 3.05 2.803 2.522 2.221 2.058 1.696 1.543 1.346 1.158 0.774 0.556 0.316 0.076 -0.189 -0.494 -0.827 -1.821 -9 ,6462 ,TETRA ,17600583,Sun Nov 28 12:33:38 CET,Sun Nov 28 14:30:44 CET,0.0 1.576 2.052 2.4 2.682 2.923 3.139 3.33 3.685 3.861 4.025 4.125 4.47 4.617 4.861 5.089 5.321 5.432 5.66 5.884 6.191 6.386 6.582 6.872 7.138 7.39 7.648 7.887 8.187 8.489 8.763 9.072 9.36 9.616 9.907 10.249 10.584 10.932 11.285 11.652 12.034 12.438 12.882 13.322 13.819 14.317 14.8 15.263 15.719 16.062 16.064 15.637 15.001 14.336 13.667 13.015 12.458 11.925 11.437 10.922 10.456 10.043 9.667 9.299 8.936 8.596 8.241 7.926 7.651 7.376 7.088 6.847 6.586 6.32 6.122 5.904 5.653 5.402 5.155 4.981 4.798 4.518 4.321 4.115 4.011 3.787 3.555 3.299 3.161 2.829 2.734 2.581 2.431 2.085 1.9 1.707 1.489 1.233 0.906 0.48 -3.002 -10 ,30190 ,TETRA ,17600584,Sun Nov 28 12:33:40 CET,Sun Nov 28 14:30:27 CET,0.0 1.095 1.513 1.8 2.051 2.298 2.51 2.698 3.062 3.233 3.388 3.485 3.826 3.967 4.225 4.481 4.726 4.845 5.082 5.296 5.589 5.778 5.952 6.208 6.469 6.718 6.961 7.206 7.519 7.807 8.084 8.408 8.712 9.004 9.339 9.732 10.095 10.444 10.811 11.201 11.602 12.052 12.535 12.978 13.487 14.012 14.576 15.142 15.658 16.114 16.205 15.818 15.248 14.615 14.028 13.425 12.865 12.351 11.869 11.37 10.927 10.515 10.125 9.743 9.386 9.074 8.745 8.438 8.172 7.906 7.607 7.34 7.066 6.783 6.572 6.358 6.136 5.903 5.664 5.509 5.341 5.063 4.872 4.697 4.609 4.398 4.17 3.922 3.781 3.441 3.345 3.184 3.023 2.673 2.493 2.322 2.108 1.86 1.555 1.071 -0.196 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_38_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_38_40.txt deleted file mode 100644 index 5ae90c46..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_38_40.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18802 ,TETRA ,17600585,Sun Nov 28 12:33:39 CET,Sun Nov 28 14:31:03 CET,0.0 2.943 3.562 3.992 4.348 4.634 4.913 5.187 5.667 5.88 6.076 6.238 6.588 6.738 7.021 7.292 7.541 7.663 7.903 8.129 8.44 8.635 8.824 9.094 9.328 9.547 9.762 9.985 10.295 10.558 10.775 11.019 11.251 11.47 11.7 11.96 12.203 12.446 12.698 12.94 13.168 13.379 13.553 13.656 13.716 13.751 13.732 13.594 13.121 12.06 10.087 7.556 5.438 3.698 2.182 0.793 -0.378 -1.405 -2.265 -3.135 -3.907 -4.568 -5.179 -5.752 -6.283 -6.781 -7.312 -7.776 -8.175 -8.581 -8.978 -9.303 -9.643 -10.008 -10.287 -10.58 -10.894 -11.195 -11.48 -11.665 -11.867 -12.187 -12.399 -12.624 -12.749 -13.009 -13.274 -13.548 -13.692 -14.05 -14.138 -14.302 -14.5 -14.964 -15.208 -15.462 -15.753 -16.099 -16.488 -16.97 -18.282 -2 ,9556 ,TETRA ,17600586,Sun Nov 28 12:33:39 CET,Sun Nov 28 14:30:31 CET,0.0 2.554 3.271 3.782 4.167 4.48 4.772 5.047 5.54 5.755 5.959 6.158 6.528 6.698 7.034 7.343 7.627 7.776 8.063 8.31 8.64 8.859 9.071 9.37 9.642 9.893 10.137 10.365 10.64 10.889 11.132 11.424 11.688 11.945 12.241 12.567 12.869 13.192 13.529 13.883 14.238 14.559 14.903 15.155 15.254 15.265 15.2 15.008 14.584 13.832 12.263 10.072 8.22 6.588 5.154 3.832 2.701 1.721 0.875 -0.004 -0.768 -1.438 -2.076 -2.662 -3.198 -3.686 -4.201 -4.659 -5.057 -5.485 -5.926 -6.262 -6.61 -6.995 -7.287 -7.594 -7.923 -8.255 -8.594 -8.817 -9.028 -9.355 -9.586 -9.826 -9.96 -10.236 -10.521 -10.813 -10.953 -11.317 -11.427 -11.6 -11.785 -12.18 -12.393 -12.619 -12.854 -13.124 -13.437 -13.8 -14.72 -3 ,15070 ,TETRA ,17600587,Sun Nov 28 12:33:40 CET,Sun Nov 28 14:30:31 CET,0.0 3.586 4.337 4.826 5.196 5.522 5.818 6.073 6.478 6.664 6.837 6.964 7.31 7.463 7.755 8.018 8.262 8.383 8.598 8.795 9.065 9.228 9.385 9.612 9.832 10.046 10.248 10.428 10.654 10.879 11.078 11.305 11.532 11.774 12.052 12.307 12.507 12.704 12.905 13.13 13.371 13.612 13.859 14.05 14.224 14.398 14.545 14.497 14.139 13.404 11.794 9.55 7.568 5.834 4.36 3.028 1.897 0.903 0.048 -0.789 -1.504 -2.153 -2.777 -3.37 -3.901 -4.375 -4.873 -5.319 -5.709 -6.112 -6.523 -6.86 -7.214 -7.593 -7.887 -8.17 -8.463 -8.775 -9.094 -9.319 -9.54 -9.863 -10.102 -10.373 -10.515 -10.796 -11.092 -11.423 -11.606 -11.996 -12.117 -12.276 -12.457 -12.838 -13.043 -13.291 -13.542 -13.843 -14.235 -14.692 -15.881 -4 ,19805 ,TETRA ,17600588,Sun Nov 28 12:33:39 CET,Sun Nov 28 14:30:51 CET,0.0 2.437 3.106 3.603 3.99 4.302 4.593 4.87 5.353 5.566 5.766 5.96 6.329 6.508 6.817 7.095 7.368 7.507 7.785 8.048 8.397 8.611 8.821 9.116 9.387 9.672 9.945 10.187 10.503 10.785 11.042 11.344 11.599 11.807 12.035 12.294 12.541 12.8 13.054 13.297 13.519 13.745 13.983 14.188 14.339 14.418 14.407 14.173 13.691 12.918 11.367 9.275 7.513 5.996 4.687 3.487 2.45 1.518 0.732 -0.09 -0.848 -1.501 -2.109 -2.696 -3.249 -3.764 -4.312 -4.795 -5.211 -5.626 -6.041 -6.378 -6.718 -7.063 -7.318 -7.583 -7.864 -8.152 -8.434 -8.63 -8.855 -9.195 -9.422 -9.667 -9.793 -10.049 -10.32 -10.607 -10.761 -11.131 -11.239 -11.405 -11.576 -11.963 -12.175 -12.408 -12.676 -12.956 -13.318 -13.883 -16.32 -6 ,21440 ,TETRA ,17600590,Sun Nov 28 12:34:06 CET,Sun Nov 28 14:31:57 CET,0.0 2.324 2.894 3.365 3.781 4.113 4.413 4.69 5.118 5.304 5.49 5.652 6.0 6.153 6.429 6.67 6.897 7.006 7.207 7.414 7.723 7.897 8.052 8.281 8.487 8.674 8.854 9.042 9.281 9.502 9.703 9.926 10.136 10.338 10.585 10.817 11.008 11.212 11.401 11.583 11.764 11.939 12.089 12.249 12.446 12.573 12.583 12.375 11.869 11.01 9.344 7.121 5.226 3.593 2.125 0.766 -0.373 -1.396 -2.33 -3.252 -3.994 -4.647 -5.268 -5.837 -6.346 -6.807 -7.293 -7.729 -8.102 -8.482 -8.881 -9.227 -9.598 -9.983 -10.27 -10.553 -10.847 -11.151 -11.458 -11.668 -11.882 -12.227 -12.479 -12.738 -12.872 -13.148 -13.437 -13.763 -13.938 -14.318 -14.485 -14.691 -14.906 -15.352 -15.599 -15.889 -16.202 -16.572 -17.021 -17.561 -19.172 -7 ,3097 ,TETRA ,17600591,Sun Nov 28 12:34:06 CET,Sun Nov 28 14:31:23 CET,0.0 3.269 4.052 4.594 4.992 5.317 5.647 5.97 6.499 6.745 6.98 7.221 7.602 7.768 8.06 8.316 8.55 8.67 8.904 9.124 9.443 9.65 9.845 10.12 10.384 10.62 10.831 11.029 11.263 11.466 11.66 11.902 12.125 12.326 12.556 12.813 13.029 13.225 13.446 13.693 13.938 14.192 14.454 14.677 14.849 14.926 14.91 14.755 14.379 13.531 11.701 9.446 7.616 5.979 4.525 3.312 2.245 1.267 0.444 -0.374 -1.068 -1.684 -2.273 -2.845 -3.374 -3.843 -4.338 -4.779 -5.141 -5.505 -5.888 -6.209 -6.538 -6.887 -7.154 -7.424 -7.726 -8.034 -8.343 -8.563 -8.787 -9.134 -9.366 -9.609 -9.741 -10.009 -10.284 -10.565 -10.717 -11.092 -11.201 -11.378 -11.568 -11.99 -12.226 -12.479 -12.784 -13.125 -13.461 -13.893 -15.676 -8 ,13123 ,TETRA ,17600592,Sun Nov 28 12:34:06 CET,Sun Nov 28 14:31:11 CET,0.0 2.534 3.238 3.754 4.177 4.557 4.911 5.252 5.834 6.096 6.371 6.674 7.088 7.31 7.721 8.092 8.427 8.586 8.903 9.2 9.576 9.783 9.975 10.255 10.499 10.706 10.895 11.071 11.304 11.524 11.715 11.946 12.168 12.382 12.639 12.937 13.235 13.546 13.855 14.136 14.38 14.618 14.889 15.164 15.417 15.622 15.712 15.518 15.006 14.112 12.344 10.012 8.09 6.441 4.945 3.5 2.217 1.084 0.104 -0.89 -1.716 -2.433 -3.157 -3.859 -4.485 -5.048 -5.619 -6.104 -6.518 -6.942 -7.378 -7.753 -8.143 -8.525 -8.818 -9.119 -9.41 -9.704 -10.033 -10.266 -10.492 -10.85 -11.114 -11.373 -11.501 -11.776 -12.065 -12.384 -12.556 -12.944 -13.101 -13.295 -13.488 -13.857 -14.041 -14.241 -14.463 -14.722 -15.014 -15.382 -16.683 -9 ,27254 ,TETRA ,17600593,Sun Nov 28 12:34:07 CET,Sun Nov 28 14:30:37 CET,0.0 2.167 2.816 3.334 3.76 4.127 4.422 4.663 5.116 5.324 5.504 5.641 5.998 6.152 6.444 6.737 7.013 7.14 7.373 7.582 7.875 8.074 8.266 8.53 8.772 9.0 9.223 9.432 9.682 9.909 10.109 10.342 10.555 10.761 10.995 11.221 11.438 11.664 11.885 12.112 12.335 12.561 12.894 13.256 13.494 13.537 13.422 13.188 12.699 11.779 10.107 7.915 6.029 4.435 3.069 1.862 0.819 -0.13 -0.965 -1.817 -2.561 -3.206 -3.8 -4.348 -4.858 -5.328 -5.807 -6.227 -6.592 -6.978 -7.373 -7.694 -8.031 -8.375 -8.642 -8.921 -9.223 -9.544 -9.854 -10.066 -10.283 -10.622 -10.863 -11.116 -11.252 -11.521 -11.787 -12.085 -12.244 -12.615 -12.743 -12.921 -13.108 -13.534 -13.762 -14.001 -14.262 -14.555 -14.913 -15.416 -16.855 -10 ,15000 ,TETRA ,17600594,Sun Nov 28 12:34:08 CET,Sun Nov 28 14:31:37 CET,0.0 3.036 3.809 4.374 4.834 5.231 5.577 5.866 6.366 6.586 6.786 7.0 7.389 7.572 7.906 8.189 8.437 8.562 8.793 8.995 9.279 9.464 9.646 9.898 10.119 10.328 10.542 10.749 10.977 11.185 11.394 11.632 11.849 12.063 12.283 12.491 12.692 12.917 13.135 13.344 13.544 13.701 13.833 13.939 14.037 14.1 14.05 13.863 13.471 12.593 10.871 8.593 6.622 4.906 3.466 2.196 1.082 0.107 -0.717 -1.558 -2.32 -3.029 -3.706 -4.306 -4.828 -5.299 -5.791 -6.227 -6.602 -7.002 -7.426 -7.773 -8.135 -8.509 -8.797 -9.108 -9.427 -9.754 -10.11 -10.372 -10.652 -11.086 -11.398 -11.717 -11.877 -12.197 -12.525 -12.873 -13.052 -13.454 -13.666 -13.875 -14.093 -14.608 -14.894 -15.203 -15.569 -16.004 -16.518 -17.183 -19.209 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_39_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_39_41.txt deleted file mode 100644 index 0a6473fe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_39_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30231 ,KEBNE ,17027027,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:40:32 CET,0.0 3.174 3.942 4.478 4.928 5.352 5.72 6.03 6.596 6.85 7.087 7.331 7.731 7.94 8.315 8.65 8.971 9.127 9.395 9.638 9.981 10.194 10.399 10.666 10.937 11.216 11.476 11.712 12.002 12.283 12.558 12.877 13.167 13.436 13.75 14.108 14.421 14.74 15.091 15.424 15.765 16.149 16.555 16.961 17.427 17.88 18.273 18.478 18.494 18.292 17.8 16.985 15.908 14.727 13.61 12.592 11.677 10.82 10.021 9.225 8.568 7.985 7.426 6.868 6.332 5.854 5.365 4.932 4.553 4.145 3.721 3.358 2.968 2.584 2.287 1.965 1.636 1.302 0.961 0.72 0.464 0.052 -0.247 -0.559 -0.709 -1.021 -1.384 -1.755 -1.942 -2.338 -2.564 -2.776 -2.99 -3.441 -3.716 -4.033 -4.373 -4.8 -5.295 -5.946 -8.282 -2 ,16059 ,KEBNE ,17027028,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:41:07 CET,0.0 3.344 4.076 4.602 5.017 5.326 5.596 5.853 6.35 6.591 6.803 6.986 7.372 7.557 7.887 8.183 8.468 8.601 8.846 9.078 9.415 9.631 9.838 10.133 10.393 10.636 10.88 11.123 11.43 11.712 11.986 12.311 12.606 12.876 13.185 13.541 13.872 14.231 14.616 15.013 15.403 15.824 16.291 16.727 17.223 17.737 18.24 18.7 19.113 19.412 19.173 18.265 17.242 16.235 15.342 14.489 13.717 12.998 12.358 11.73 11.235 10.771 10.296 9.871 9.474 9.115 8.737 8.381 8.074 7.754 7.394 7.086 6.779 6.472 6.241 6.006 5.753 5.489 5.218 5.027 4.843 4.544 4.332 4.117 3.998 3.763 3.511 3.227 3.092 2.747 2.606 2.429 2.24 1.839 1.626 1.393 1.134 0.83 0.49 0.048 -2.309 -3 ,6712 ,KEBNE ,17027029,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:40:29 CET,0.0 3.219 3.853 4.326 4.712 5.027 5.303 5.551 5.992 6.192 6.385 6.55 6.912 7.064 7.341 7.609 7.847 7.957 8.173 8.395 8.717 8.915 9.114 9.4 9.661 9.911 10.142 10.354 10.64 10.92 11.169 11.462 11.772 12.07 12.377 12.721 13.051 13.41 13.783 14.147 14.527 14.926 15.32 15.697 16.104 16.472 16.826 17.156 17.378 17.369 16.91 15.881 14.768 13.703 12.79 11.964 11.217 10.554 9.98 9.396 8.891 8.43 7.976 7.524 7.116 6.746 6.347 5.99 5.668 5.32 4.955 4.667 4.379 4.078 3.836 3.589 3.345 3.089 2.817 2.633 2.453 2.168 1.962 1.754 1.648 1.423 1.163 0.892 0.758 0.412 0.313 0.144 -0.043 -0.411 -0.602 -0.812 -1.052 -1.342 -1.67 -2.094 -3.544 -4 ,16440 ,KEBNE ,17027030,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:41:47 CET,0.0 3.913 4.662 5.222 5.637 5.961 6.268 6.566 7.098 7.352 7.606 7.884 8.29 8.486 8.823 9.102 9.361 9.486 9.733 9.964 10.297 10.512 10.715 10.997 11.255 11.483 11.718 11.951 12.237 12.516 12.779 13.091 13.389 13.673 13.988 14.344 14.684 15.021 15.37 15.749 16.129 16.553 17.047 17.498 17.967 18.415 18.869 19.335 19.778 20.022 19.85 19.182 18.344 17.407 16.515 15.718 14.973 14.274 13.687 13.086 12.548 12.069 11.613 11.16 10.726 10.319 9.892 9.532 9.215 8.875 8.52 8.226 7.933 7.629 7.394 7.157 6.918 6.675 6.405 6.22 6.03 5.708 5.489 5.265 5.147 4.91 4.664 4.388 4.238 3.885 3.766 3.605 3.433 3.05 2.848 2.639 2.389 2.109 1.789 1.278 -0.506 -5 ,1237 ,KEBNE ,17027031,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:41:09 CET,0.0 3.556 4.243 4.678 5.018 5.307 5.573 5.842 6.313 6.519 6.718 6.877 7.238 7.412 7.744 8.041 8.301 8.429 8.673 8.902 9.231 9.438 9.638 9.93 10.201 10.448 10.691 10.938 11.248 11.528 11.794 12.127 12.444 12.741 13.069 13.419 13.757 14.124 14.515 14.927 15.349 15.817 16.341 16.828 17.378 17.929 18.463 18.939 19.345 19.634 19.378 18.617 17.871 17.033 16.188 15.393 14.702 14.049 13.459 12.833 12.292 11.826 11.369 10.919 10.498 10.134 9.74 9.357 9.031 8.709 8.377 8.084 7.769 7.459 7.211 6.949 6.678 6.38 6.054 5.849 5.654 5.353 5.131 4.884 4.759 4.507 4.249 3.951 3.784 3.415 3.254 3.041 2.8 2.232 1.904 1.532 1.111 0.691 0.223 -0.447 -2.527 -6 ,4135 ,KEBNE ,17027032,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:41:10 CET,0.0 2.928 3.676 4.201 4.635 5.014 5.343 5.655 6.26 6.544 6.789 7.017 7.423 7.626 7.987 8.308 8.601 8.748 9.043 9.319 9.685 9.907 10.12 10.409 10.668 10.928 11.182 11.414 11.707 11.982 12.25 12.58 12.893 13.182 13.508 13.853 14.174 14.524 14.922 15.342 15.743 16.155 16.603 17.045 17.526 18.02 18.529 18.994 19.389 19.57 19.185 18.242 17.252 16.312 15.437 14.578 13.789 13.089 12.485 11.851 11.303 10.803 10.317 9.863 9.43 9.03 8.627 8.283 7.984 7.667 7.335 7.06 6.781 6.492 6.257 6.006 5.755 5.497 5.231 5.052 4.864 4.567 4.356 4.131 4.013 3.769 3.491 3.193 3.038 2.677 2.534 2.36 2.178 1.773 1.555 1.315 1.058 0.795 0.455 -0.019 -1.407 -7 ,19737 ,KEBNE ,17027033,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:41:17 CET,0.0 3.211 3.861 4.323 4.699 5.022 5.311 5.594 6.128 6.364 6.571 6.749 7.133 7.307 7.635 7.947 8.235 8.369 8.623 8.872 9.233 9.45 9.654 9.948 10.223 10.492 10.736 10.968 11.277 11.571 11.852 12.181 12.486 12.782 13.123 13.467 13.773 14.123 14.499 14.901 15.297 15.692 16.102 16.494 16.957 17.449 17.969 18.46 18.863 19.018 18.659 17.783 16.927 16.079 15.205 14.372 13.676 13.043 12.465 11.886 11.386 10.93 10.48 10.043 9.651 9.305 8.946 8.613 8.309 7.985 7.642 7.375 7.103 6.819 6.61 6.388 6.151 5.915 5.671 5.498 5.319 5.004 4.775 4.548 4.428 4.182 3.941 3.709 3.588 3.24 3.115 2.944 2.77 2.398 2.183 1.926 1.654 1.379 1.027 0.596 -0.513 -8 ,25259 ,KEBNE ,17027034,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:41:30 CET,0.0 4.519 5.118 5.526 5.905 6.247 6.535 6.808 7.296 7.511 7.719 7.911 8.28 8.463 8.853 9.198 9.526 9.687 9.986 10.275 10.687 10.954 11.21 11.558 11.849 12.105 12.35 12.573 12.844 13.103 13.351 13.653 13.943 14.209 14.518 14.862 15.189 15.554 15.926 16.315 16.714 17.151 17.674 18.171 18.682 19.165 19.669 20.176 20.667 21.078 21.162 20.742 20.153 19.49 18.814 18.131 17.512 16.94 16.436 15.913 15.397 14.923 14.466 14.021 13.587 13.176 12.765 12.413 12.116 11.799 11.463 11.19 10.909 10.606 10.365 10.117 9.867 9.624 9.364 9.17 8.969 8.654 8.439 8.227 8.117 7.893 7.651 7.39 7.253 6.905 6.799 6.65 6.493 6.133 5.936 5.742 5.55 5.313 5.002 4.563 3.125 -9 ,15973 ,KEBNE ,17027035,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:41:31 CET,0.0 3.886 4.696 5.267 5.712 6.064 6.331 6.542 6.923 7.104 7.27 7.352 7.678 7.806 8.034 8.234 8.453 8.557 8.741 8.929 9.2 9.361 9.504 9.706 9.922 10.136 10.333 10.515 10.732 10.948 11.155 11.383 11.606 11.841 12.111 12.386 12.634 12.909 13.21 13.508 13.812 14.139 14.491 14.817 15.175 15.526 15.868 16.231 16.534 16.607 16.248 15.441 14.533 13.635 12.837 12.042 11.288 10.611 10.007 9.352 8.76 8.251 7.782 7.301 6.864 6.507 6.112 5.743 5.417 5.074 4.717 4.431 4.12 3.784 3.521 3.246 2.983 2.712 2.418 2.214 2.004 1.696 1.48 1.25 1.14 0.911 0.654 0.375 0.225 -0.117 -0.214 -0.372 -0.554 -0.971 -1.19 -1.434 -1.701 -1.995 -2.371 -2.976 -5.41 -10 ,22149 ,KEBNE ,17027036,Wed Dec 22 15:58:38 CET,Wed Dec 22 17:40:37 CET,0.0 2.842 3.475 3.964 4.348 4.678 4.958 5.204 5.648 5.859 6.064 6.25 6.627 6.795 7.095 7.373 7.657 7.791 8.041 8.27 8.594 8.813 9.017 9.291 9.553 9.795 10.03 10.258 10.545 10.826 11.093 11.393 11.658 11.909 12.203 12.53 12.848 13.199 13.569 13.955 14.35 14.778 15.254 15.725 16.222 16.676 17.123 17.587 18.031 18.375 18.331 17.753 16.951 15.953 14.929 14.043 13.335 12.646 12.039 11.448 10.919 10.434 9.967 9.513 9.114 8.765 8.366 7.985 7.663 7.334 7.0 6.727 6.424 6.11 5.869 5.612 5.341 5.064 4.8 4.618 4.427 4.128 3.921 3.71 3.597 3.354 3.113 2.872 2.741 2.393 2.284 2.108 1.927 1.576 1.396 1.189 0.934 0.675 0.348 -0.177 -1.489 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_40_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_40_41.txt deleted file mode 100644 index d74bcdaa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_40_41.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18748 ,TETRA ,17600595,Sun Nov 28 12:34:06 CET,Sun Nov 28 14:32:58 CET,0.0 3.464 4.255 4.835 5.315 5.712 6.048 6.367 6.925 7.182 7.437 7.683 8.101 8.299 8.671 9.007 9.324 9.48 9.781 10.059 10.453 10.71 10.965 11.326 11.652 11.962 12.277 12.574 12.954 13.322 13.667 14.093 14.496 14.874 15.298 15.762 16.208 16.71 17.254 17.8 18.366 19.012 19.769 20.509 21.325 22.21 23.255 24.415 25.656 27.041 28.635 29.676 30.025 30.107 30.033 29.832 29.565 29.254 28.931 28.587 28.274 27.951 27.626 27.33 27.082 26.834 26.549 26.292 26.054 25.831 25.599 25.356 25.096 24.807 24.556 24.281 23.975 23.674 23.377 23.178 22.974 22.641 22.399 22.153 22.027 21.756 21.455 21.122 20.937 20.535 20.324 20.106 19.875 19.317 18.978 18.614 18.22 17.762 17.144 16.234 12.603 -2 ,9346 ,TETRA ,17600596,Sun Nov 28 12:34:09 CET,Sun Nov 28 14:31:28 CET,0.0 4.053 4.871 5.402 5.867 6.323 6.706 7.004 7.491 7.709 7.914 8.086 8.485 8.68 9.033 9.375 9.715 9.878 10.183 10.461 10.863 11.13 11.387 11.747 12.073 12.38 12.696 12.999 13.385 13.74 14.063 14.47 14.856 15.241 15.711 16.216 16.688 17.188 17.736 18.323 18.92 19.585 20.345 21.091 21.918 22.825 23.914 25.15 26.526 28.037 29.452 30.237 30.454 30.243 29.868 29.447 29.032 28.599 28.173 27.797 27.545 27.33 27.096 26.843 26.597 26.345 26.042 25.756 25.526 25.308 25.079 24.866 24.608 24.321 24.101 23.879 23.633 23.367 23.084 22.887 22.672 22.344 22.118 21.866 21.737 21.472 21.172 20.86 20.693 20.313 20.128 19.918 19.698 19.221 18.958 18.669 18.311 17.863 17.371 16.706 10.942 -3 ,19798 ,TETRA ,17600597,Sun Nov 28 12:34:07 CET,Sun Nov 28 14:32:14 CET,0.0 12.299 13.328 14.067 14.686 15.222 15.641 15.988 16.619 16.9 17.166 17.453 17.893 18.125 18.551 18.941 19.31 19.488 19.828 20.164 20.665 20.97 21.253 21.665 22.025 22.341 22.632 22.917 23.297 23.654 24.013 24.432 24.814 25.185 25.616 26.091 26.541 27.03 27.551 28.103 28.699 29.371 30.162 30.958 31.843 32.799 33.903 35.115 36.47 38.009 39.661 40.695 40.976 40.941 40.736 40.448 40.133 39.782 39.429 39.026 38.667 38.364 38.08 37.808 37.54 37.275 36.966 36.696 36.464 36.196 35.921 35.695 35.459 35.205 34.989 34.763 34.534 34.266 33.961 33.758 33.538 33.172 32.91 32.613 32.456 32.15 31.798 31.406 31.217 30.825 30.599 30.359 30.088 29.491 29.154 28.754 28.298 27.763 27.124 26.244 15.391 -4 ,24741 ,TETRA ,17600598,Sun Nov 28 12:34:07 CET,Sun Nov 28 14:31:50 CET,0.0 3.73 4.539 5.124 5.568 5.95 6.289 6.577 7.073 7.294 7.498 7.683 8.081 8.264 8.622 8.965 9.273 9.423 9.707 9.97 10.359 10.608 10.847 11.187 11.501 11.812 12.116 12.391 12.729 13.059 13.377 13.757 14.113 14.458 14.866 15.323 15.777 16.29 16.814 17.329 17.902 18.596 19.354 20.071 20.904 21.832 22.87 23.965 25.198 26.575 28.045 28.945 29.292 29.385 29.319 29.161 28.942 28.677 28.395 28.078 27.777 27.476 27.197 26.923 26.63 26.341 26.044 25.787 25.549 25.282 24.995 24.76 24.514 24.256 24.049 23.823 23.576 23.314 23.036 22.844 22.639 22.292 22.054 21.808 21.681 21.425 21.139 20.819 20.635 20.222 19.98 19.745 19.501 18.982 18.689 18.347 17.942 17.469 16.906 16.092 3.896 -5 ,32393 ,TETRA ,17600599,Sun Nov 28 12:34:07 CET,Sun Nov 28 14:31:19 CET,0.0 5.083 5.796 6.364 6.81 7.162 7.485 7.773 8.297 8.543 8.776 8.985 9.415 9.621 9.988 10.315 10.619 10.765 11.051 11.335 11.728 11.986 12.237 12.585 12.919 13.249 13.557 13.837 14.204 14.573 14.935 15.377 15.806 16.217 16.666 17.148 17.617 18.109 18.636 19.191 19.76 20.414 21.194 21.986 22.875 23.854 24.978 26.238 27.641 29.275 31.16 32.477 33.052 33.203 33.047 32.799 32.546 32.3 32.074 31.794 31.543 31.307 31.055 30.826 30.592 30.358 30.122 29.88 29.658 29.415 29.162 28.954 28.719 28.46 28.246 28.004 27.75 27.502 27.232 27.047 26.854 26.538 26.31 26.067 25.94 25.666 25.361 25.005 24.815 24.416 24.172 23.953 23.736 23.27 22.994 22.674 22.322 21.892 21.303 20.508 14.802 -6 ,22818 ,TETRA ,17600600,Sun Nov 28 12:34:09 CET,Sun Nov 28 14:31:39 CET,0.0 3.853 4.738 5.342 5.829 6.244 6.588 6.905 7.484 7.745 7.992 8.236 8.649 8.836 9.204 9.538 9.83 9.976 10.284 10.578 10.971 11.225 11.471 11.811 12.132 12.447 12.757 13.065 13.467 13.833 14.165 14.555 14.946 15.337 15.765 16.224 16.709 17.244 17.77 18.328 18.957 19.667 20.452 21.22 22.047 22.954 24.01 25.195 26.555 27.995 29.555 30.645 30.983 31.0 30.843 30.526 30.165 29.798 29.425 28.987 28.583 28.208 27.825 27.484 27.153 26.82 26.478 26.151 25.863 25.568 25.258 24.996 24.719 24.437 24.219 23.992 23.76 23.477 23.155 22.947 22.712 22.296 22.01 21.72 21.579 21.301 21.005 20.689 20.518 20.135 19.961 19.751 19.527 19.034 18.746 18.414 18.012 17.556 17.02 16.229 12.298 -9 ,31818 ,TETRA ,17600603,Sun Nov 28 12:34:08 CET,Sun Nov 28 14:30:48 CET,0.0 4.032 5.006 5.687 6.207 6.65 7.017 7.344 7.911 8.155 8.385 8.629 9.057 9.28 9.705 10.087 10.449 10.624 10.967 11.309 11.803 12.095 12.35 12.708 13.054 13.384 13.693 13.99 14.378 14.755 15.115 15.547 15.955 16.332 16.787 17.288 17.753 18.262 18.818 19.394 19.965 20.606 21.368 22.147 23.046 23.982 25.047 26.24 27.549 28.963 30.291 31.015 31.192 31.114 30.895 30.59 30.275 29.962 29.647 29.251 28.863 28.518 28.157 27.768 27.4 27.061 26.724 26.423 26.154 25.885 25.594 25.332 25.04 24.735 24.501 24.248 23.964 23.691 23.415 23.212 23.001 22.636 22.358 22.068 21.921 21.623 21.309 20.955 20.769 20.392 20.18 19.943 19.686 19.143 18.86 18.539 18.201 17.786 17.215 16.468 13.072 -10 ,9977 ,TETRA ,17600604,Sun Nov 28 12:34:08 CET,Sun Nov 28 14:32:53 CET,0.0 4.376 5.143 5.669 6.087 6.447 6.762 7.038 7.55 7.81 8.047 8.264 8.68 8.875 9.248 9.61 9.961 10.121 10.432 10.732 11.162 11.458 11.737 12.098 12.415 12.732 13.056 13.385 13.801 14.181 14.556 15.02 15.459 15.851 16.293 16.789 17.259 17.779 18.344 18.949 19.603 20.357 21.226 22.037 22.934 23.939 25.078 26.339 27.793 29.471 31.41 32.68 33.023 32.853 32.577 32.284 31.955 31.648 31.339 30.978 30.63 30.304 29.978 29.645 29.328 29.052 28.757 28.472 28.232 27.986 27.712 27.468 27.188 26.862 26.601 26.331 26.04 25.745 25.443 25.23 25.006 24.641 24.377 24.077 23.917 23.595 23.26 22.892 22.693 22.288 22.047 21.811 21.574 20.987 20.622 20.239 19.815 19.302 18.636 17.68 14.303 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_42_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_42_44.txt deleted file mode 100644 index b2da8361..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_42_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2738 ,TETRA ,17600605,Sun Nov 28 12:34:08 CET,Sun Nov 28 14:32:50 CET,0.0 1.57 1.96 2.185 2.368 2.57 2.774 2.938 3.227 3.38 3.509 3.538 3.826 3.928 4.142 4.334 4.521 4.619 4.792 4.939 5.143 5.269 5.386 5.555 5.72 5.885 6.042 6.189 6.371 6.542 6.712 6.926 7.133 7.326 7.56 7.827 8.071 8.332 8.618 8.934 9.25 9.56 9.886 10.203 10.566 10.928 11.298 11.688 12.087 12.424 12.629 12.53 12.239 11.881 11.517 11.144 10.804 10.507 10.231 9.923 9.656 9.412 9.169 8.944 8.723 8.516 8.306 8.114 7.948 7.774 7.581 7.426 7.271 7.109 6.992 6.857 6.713 6.575 6.417 6.303 6.185 6.008 5.879 5.737 5.665 5.519 5.378 5.228 5.148 4.886 4.867 4.759 4.658 4.445 4.313 4.187 4.063 3.933 3.75 3.471 2.658 -2 ,13718 ,TETRA ,17600606,Sun Nov 28 12:34:08 CET,Sun Nov 28 14:32:12 CET,0.0 1.794 2.142 2.391 2.61 2.819 2.977 3.125 3.43 3.566 3.691 3.721 3.997 4.086 4.249 4.412 4.584 4.671 4.848 5.024 5.276 5.424 5.564 5.76 5.93 6.087 6.254 6.438 6.663 6.88 7.084 7.314 7.55 7.77 8.002 8.269 8.53 8.793 9.049 9.333 9.613 9.922 10.302 10.669 11.097 11.524 11.929 12.385 12.836 13.203 13.446 13.344 13.024 12.645 12.307 11.971 11.643 11.332 11.043 10.729 10.437 10.18 9.941 9.722 9.518 9.327 9.138 8.963 8.791 8.611 8.425 8.28 8.117 7.943 7.824 7.691 7.544 7.397 7.253 7.15 7.034 6.857 6.741 6.625 6.56 6.415 6.275 6.134 6.062 5.802 5.803 5.712 5.616 5.412 5.291 5.145 4.97 4.784 4.585 4.337 3.993 -3 ,16493 ,TETRA ,17600607,Sun Nov 28 12:34:08 CET,Sun Nov 28 14:32:02 CET,0.0 1.517 1.942 2.294 2.565 2.783 2.965 3.144 3.489 3.64 3.79 3.868 4.158 4.266 4.471 4.656 4.832 4.914 5.075 5.219 5.421 5.564 5.708 5.911 6.104 6.292 6.477 6.645 6.858 7.082 7.285 7.506 7.708 7.896 8.125 8.399 8.668 8.955 9.248 9.536 9.822 10.144 10.536 10.937 11.335 11.719 12.121 12.54 12.97 13.323 13.545 13.421 13.13 12.793 12.422 12.075 11.74 11.411 11.102 10.799 10.548 10.301 10.048 9.804 9.596 9.415 9.218 9.04 8.881 8.71 8.536 8.379 8.207 8.038 7.913 7.782 7.637 7.486 7.335 7.227 7.108 6.926 6.813 6.701 6.635 6.484 6.336 6.173 6.084 5.805 5.807 5.708 5.588 5.335 5.2 5.054 4.912 4.728 4.484 4.211 3.114 -4 ,27469 ,TETRA ,17600608,Sun Nov 28 12:34:10 CET,Sun Nov 28 14:32:01 CET,0.0 1.501 1.836 2.102 2.314 2.505 2.683 2.845 3.139 3.275 3.393 3.415 3.708 3.817 4.019 4.206 4.386 4.475 4.65 4.813 5.047 5.199 5.337 5.527 5.722 5.913 6.083 6.243 6.455 6.655 6.846 7.098 7.343 7.565 7.807 8.066 8.316 8.627 8.961 9.257 9.526 9.834 10.188 10.52 10.881 11.253 11.644 12.041 12.448 12.792 12.981 12.817 12.495 12.146 11.779 11.437 11.134 10.824 10.542 10.259 9.989 9.736 9.503 9.284 9.068 8.873 8.677 8.501 8.337 8.162 7.989 7.84 7.685 7.522 7.391 7.252 7.105 6.948 6.79 6.682 6.569 6.392 6.284 6.19 6.133 5.998 5.841 5.677 5.602 5.341 5.354 5.27 5.179 4.996 4.869 4.705 4.56 4.407 4.204 3.943 3.373 -5 ,16631 ,TETRA ,17600609,Sun Nov 28 12:34:12 CET,Sun Nov 28 14:32:54 CET,0.0 0.856 1.223 1.44 1.626 1.8 1.962 2.118 2.382 2.505 2.633 2.689 2.981 3.085 3.275 3.448 3.616 3.699 3.864 4.017 4.228 4.362 4.489 4.667 4.85 5.042 5.237 5.417 5.619 5.813 6.003 6.228 6.448 6.661 6.891 7.126 7.345 7.59 7.854 8.133 8.427 8.723 9.058 9.409 9.806 10.191 10.574 10.994 11.406 11.776 12.098 12.117 11.912 11.604 11.224 10.847 10.516 10.197 9.904 9.626 9.381 9.146 8.919 8.681 8.452 8.257 8.059 7.879 7.716 7.55 7.369 7.213 7.046 6.872 6.739 6.594 6.44 6.27 6.098 5.981 5.858 5.661 5.514 5.362 5.287 5.142 4.992 4.82 4.726 4.445 4.405 4.288 4.171 3.922 3.782 3.623 3.427 3.212 2.962 2.614 1.731 -6 ,15854 ,TETRA ,17600610,Sun Nov 28 12:34:08 CET,Sun Nov 28 14:31:23 CET,0.0 0.776 1.121 1.417 1.621 1.767 1.924 2.084 2.377 2.513 2.644 2.691 2.984 3.096 3.31 3.507 3.685 3.779 3.955 4.11 4.339 4.484 4.62 4.814 4.995 5.159 5.301 5.439 5.636 5.828 6.01 6.236 6.478 6.717 6.954 7.203 7.442 7.689 7.934 8.214 8.522 8.839 9.224 9.59 9.964 10.391 10.872 11.328 11.786 12.205 12.546 12.492 12.178 11.824 11.471 11.125 10.809 10.5 10.207 9.912 9.662 9.432 9.207 8.977 8.742 8.528 8.31 8.12 7.966 7.805 7.626 7.478 7.337 7.188 7.069 6.936 6.787 6.646 6.502 6.391 6.278 6.109 5.988 5.864 5.795 5.645 5.502 5.36 5.279 5.007 5.023 4.927 4.812 4.558 4.435 4.315 4.188 4.021 3.793 3.528 2.845 -7 ,22252 ,TETRA ,17600611,Sun Nov 28 12:34:09 CET,Sun Nov 28 14:32:00 CET,0.0 2.258 2.75 3.027 3.251 3.465 3.65 3.815 4.093 4.227 4.367 4.434 4.742 4.859 5.068 5.281 5.489 5.585 5.774 5.941 6.175 6.325 6.462 6.646 6.81 6.972 7.136 7.291 7.495 7.701 7.883 8.079 8.275 8.472 8.698 8.956 9.196 9.449 9.718 10.013 10.32 10.659 11.038 11.412 11.809 12.211 12.657 13.103 13.552 13.952 14.191 14.036 13.732 13.385 13.01 12.644 12.303 11.97 11.671 11.356 11.077 10.833 10.609 10.409 10.212 10.011 9.79 9.593 9.42 9.248 9.076 8.92 8.755 8.587 8.449 8.311 8.18 8.038 7.88 7.77 7.663 7.505 7.39 7.269 7.204 7.072 6.932 6.768 6.685 6.429 6.437 6.338 6.247 6.055 5.933 5.797 5.644 5.458 5.262 5.0 3.697 -8 ,23854 ,TETRA ,17600612,Sun Nov 28 12:34:10 CET,Sun Nov 28 14:32:02 CET,0.0 0.885 1.239 1.505 1.735 1.941 2.119 2.28 2.604 2.748 2.884 2.975 3.286 3.401 3.632 3.849 4.047 4.133 4.281 4.413 4.609 4.75 4.886 5.077 5.247 5.407 5.585 5.761 5.96 6.159 6.369 6.59 6.78 6.977 7.213 7.467 7.697 7.933 8.202 8.483 8.777 9.114 9.487 9.827 10.19 10.612 11.05 11.454 11.875 12.262 12.563 12.528 12.257 11.944 11.611 11.272 10.969 10.663 10.363 10.051 9.785 9.534 9.284 9.038 8.806 8.61 8.396 8.199 8.026 7.857 7.688 7.534 7.356 7.179 7.051 6.92 6.787 6.642 6.477 6.363 6.258 6.097 5.977 5.839 5.769 5.609 5.441 5.297 5.218 4.952 4.944 4.848 4.755 4.549 4.435 4.303 4.165 4.034 3.865 3.617 3.09 -9 ,5415 ,TETRA ,17600613,Sun Nov 28 12:35:05 CET,Sun Nov 28 14:34:50 CET,0.0 1.654 1.963 2.216 2.417 2.571 2.722 2.87 3.154 3.283 3.39 3.414 3.713 3.815 4.016 4.198 4.374 4.464 4.619 4.774 5.009 5.158 5.291 5.473 5.659 5.843 6.017 6.185 6.395 6.593 6.78 6.993 7.206 7.416 7.632 7.858 8.085 8.338 8.599 8.878 9.165 9.456 9.796 10.156 10.555 10.942 11.349 11.751 12.1 12.419 12.638 12.427 12.047 11.693 11.354 10.996 10.652 10.35 10.09 9.804 9.537 9.278 9.04 8.833 8.637 8.443 8.237 8.048 7.882 7.71 7.523 7.363 7.199 7.031 6.905 6.772 6.631 6.48 6.329 6.226 6.113 5.942 5.817 5.675 5.601 5.449 5.29 5.122 5.033 4.756 4.744 4.654 4.546 4.315 4.188 4.037 3.87 3.696 3.486 3.219 2.454 -10 ,736 ,TETRA ,17600614,Sun Nov 28 12:35:05 CET,Sun Nov 28 14:33:24 CET,0.0 0.703 1.07 1.389 1.627 1.822 1.994 2.162 2.477 2.604 2.736 2.815 3.104 3.202 3.383 3.558 3.721 3.798 3.943 4.086 4.307 4.445 4.57 4.752 4.953 5.149 5.313 5.469 5.679 5.873 6.045 6.244 6.432 6.611 6.818 7.056 7.283 7.51 7.745 8.0 8.262 8.575 8.931 9.262 9.619 9.997 10.393 10.786 11.187 11.523 11.709 11.491 11.123 10.781 10.44 10.119 9.834 9.526 9.235 8.921 8.625 8.344 8.074 7.847 7.641 7.455 7.257 7.062 6.89 6.719 6.54 6.37 6.181 6.002 5.862 5.715 5.574 5.431 5.275 5.166 5.052 4.863 4.743 4.62 4.551 4.408 4.255 4.094 4.011 3.754 3.768 3.681 3.566 3.293 3.16 3.027 2.894 2.739 2.519 2.244 1.485 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_42_51.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_42_51.txt deleted file mode 100644 index ce5f995f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_42_51.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24065 ,TETRA ,17600615,Sun Nov 28 12:35:05 CET,Sun Nov 28 14:34:11 CET,0.0 1.255 1.71 2.054 2.331 2.586 2.817 3.013 3.37 3.527 3.681 3.799 4.134 4.275 4.527 4.768 5.011 5.132 5.355 5.572 5.883 6.07 6.258 6.539 6.795 7.037 7.276 7.494 7.763 8.024 8.272 8.555 8.805 9.052 9.347 9.679 10.001 10.359 10.759 11.166 11.553 11.984 12.511 13.013 13.549 14.111 14.738 15.386 16.035 16.602 17.042 17.114 16.926 16.638 16.317 15.999 15.694 15.382 15.108 14.845 14.599 14.358 14.134 13.916 13.698 13.499 13.28 13.075 12.884 12.675 12.474 12.323 12.158 11.967 11.815 11.657 11.508 11.365 11.209 11.103 10.991 10.816 10.687 10.536 10.46 10.292 10.115 9.942 9.85 9.588 9.567 9.458 9.355 9.098 8.951 8.8 8.616 8.376 8.08 7.712 6.185 -2 ,30491 ,TETRA ,17600616,Sun Nov 28 12:35:05 CET,Sun Nov 28 14:32:48 CET,0.0 1.519 1.942 2.246 2.516 2.747 2.954 3.128 3.481 3.656 3.803 3.89 4.207 4.338 4.575 4.784 4.967 5.057 5.242 5.421 5.692 5.869 6.028 6.234 6.433 6.635 6.833 7.029 7.279 7.506 7.729 8.006 8.262 8.517 8.826 9.169 9.502 9.883 10.273 10.673 11.107 11.581 12.082 12.532 13.056 13.627 14.234 14.854 15.463 16.082 16.637 16.729 16.534 16.271 15.973 15.632 15.296 14.98 14.71 14.451 14.195 13.951 13.7 13.46 13.246 13.051 12.841 12.635 12.464 12.287 12.083 11.902 11.717 11.538 11.405 11.266 11.118 10.959 10.779 10.644 10.517 10.333 10.194 10.046 9.967 9.807 9.633 9.431 9.329 9.05 8.995 8.869 8.741 8.462 8.282 8.088 7.891 7.658 7.387 7.022 6.212 -3 ,18185 ,TETRA ,17600617,Sun Nov 28 12:35:08 CET,Sun Nov 28 14:32:47 CET,0.0 1.397 1.789 2.095 2.324 2.53 2.716 2.876 3.174 3.313 3.463 3.58 3.89 4.011 4.244 4.46 4.68 4.791 4.997 5.192 5.485 5.679 5.865 6.133 6.406 6.671 6.924 7.162 7.445 7.712 7.979 8.302 8.596 8.856 9.138 9.446 9.738 10.052 10.385 10.743 11.124 11.546 12.0 12.411 12.873 13.386 13.93 14.494 15.108 15.741 16.264 16.349 16.211 15.954 15.629 15.298 14.991 14.701 14.444 14.17 13.914 13.677 13.444 13.242 13.052 12.844 12.615 12.417 12.249 12.074 11.887 11.719 11.553 11.391 11.257 11.118 10.975 10.816 10.641 10.529 10.412 10.221 10.082 9.917 9.835 9.67 9.49 9.315 9.221 8.934 8.87 8.751 8.636 8.375 8.22 8.044 7.835 7.564 7.248 6.854 4.156 -4 ,22596 ,TETRA ,17600618,Sun Nov 28 12:35:05 CET,Sun Nov 28 14:33:31 CET,0.0 0.896 1.214 1.504 1.755 2.074 2.371 2.567 2.912 3.076 3.23 3.317 3.645 3.78 4.028 4.259 4.474 4.583 4.796 5.007 5.313 5.497 5.664 5.924 6.181 6.41 6.636 6.868 7.159 7.431 7.676 7.949 8.228 8.492 8.788 9.125 9.45 9.818 10.2 10.6 11.032 11.471 11.928 12.37 12.877 13.412 14.013 14.646 15.292 15.973 16.576 16.773 16.669 16.465 16.219 15.942 15.635 15.345 15.091 14.778 14.481 14.204 13.942 13.709 13.49 13.304 13.106 12.918 12.755 12.567 12.37 12.214 12.045 11.87 11.733 11.598 11.465 11.311 11.15 11.041 10.919 10.715 10.573 10.423 10.344 10.187 10.036 9.866 9.776 9.523 9.511 9.397 9.276 8.995 8.835 8.646 8.446 8.241 8.004 7.621 5.774 -5 ,1801 ,TETRA ,17600619,Sun Nov 28 12:35:08 CET,Sun Nov 28 14:33:43 CET,0.0 1.085 1.409 1.704 1.972 2.204 2.394 2.565 2.875 3.024 3.163 3.245 3.555 3.676 3.911 4.155 4.385 4.496 4.698 4.882 5.158 5.329 5.488 5.73 5.976 6.205 6.412 6.612 6.864 7.114 7.35 7.622 7.892 8.166 8.501 8.87 9.223 9.618 10.029 10.44 10.848 11.315 11.86 12.37 12.945 13.562 14.189 14.837 15.51 16.082 16.521 16.617 16.383 16.072 15.772 15.422 15.066 14.74 14.462 14.155 13.869 13.625 13.386 13.149 12.925 12.708 12.484 12.285 12.114 11.933 11.736 11.567 11.383 11.194 11.045 10.89 10.742 10.577 10.391 10.262 10.134 9.94 9.807 9.673 9.602 9.444 9.273 9.076 8.966 8.683 8.621 8.489 8.368 8.118 7.966 7.788 7.601 7.357 7.069 6.714 5.018 -6 ,27246 ,TETRA ,17600620,Sun Nov 28 12:35:06 CET,Sun Nov 28 14:34:52 CET,0.0 1.253 1.604 1.865 2.088 2.289 2.474 2.643 2.961 3.109 3.235 3.29 3.588 3.712 3.963 4.194 4.401 4.51 4.722 4.922 5.21 5.397 5.586 5.863 6.108 6.324 6.53 6.734 6.993 7.242 7.476 7.741 8.008 8.272 8.568 8.887 9.189 9.502 9.813 10.158 10.536 10.954 11.413 11.872 12.441 13.02 13.579 14.196 14.906 15.608 16.212 16.38 16.232 15.981 15.699 15.392 15.092 14.808 14.541 14.256 13.998 13.766 13.53 13.292 13.059 12.838 12.603 12.389 12.21 12.041 11.869 11.703 11.527 11.355 11.217 11.066 10.896 10.716 10.536 10.414 10.286 10.085 9.942 9.784 9.708 9.562 9.401 9.226 9.129 8.835 8.779 8.672 8.551 8.281 8.134 7.986 7.841 7.658 7.416 7.09 6.008 -7 ,32379 ,TETRA ,17600621,Sun Nov 28 12:35:05 CET,Sun Nov 28 14:34:51 CET,0.0 0.911 1.363 1.722 1.997 2.251 2.491 2.727 3.134 3.309 3.483 3.618 3.927 4.062 4.31 4.52 4.713 4.809 4.999 5.179 5.449 5.622 5.787 6.039 6.277 6.496 6.714 6.92 7.18 7.43 7.683 8.012 8.323 8.616 8.938 9.302 9.669 10.064 10.477 10.91 11.358 11.803 12.248 12.671 13.134 13.636 14.208 14.774 15.374 16.027 16.605 16.781 16.636 16.348 16.007 15.68 15.382 15.086 14.8 14.507 14.239 13.982 13.736 13.494 13.276 13.085 12.882 12.699 12.553 12.391 12.203 12.03 11.859 11.701 11.58 11.447 11.298 11.14 10.964 10.841 10.719 10.532 10.406 10.277 10.204 10.046 9.893 9.729 9.634 9.355 9.315 9.199 9.079 8.825 8.699 8.563 8.396 8.191 7.924 7.566 5.149 -8 ,18520 ,TETRA ,17600622,Sun Nov 28 12:35:05 CET,Sun Nov 28 14:34:11 CET,0.0 0.63 0.924 1.168 1.425 1.672 1.909 2.132 2.49 2.647 2.8 2.914 3.244 3.396 3.678 3.935 4.177 4.294 4.519 4.733 5.042 5.245 5.444 5.721 5.979 6.223 6.449 6.672 6.958 7.209 7.458 7.761 8.04 8.291 8.595 8.953 9.261 9.572 9.914 10.278 10.662 11.119 11.633 12.097 12.623 13.192 13.785 14.404 15.06 15.728 16.293 16.464 16.376 16.184 15.946 15.654 15.359 15.059 14.783 14.482 14.214 13.974 13.722 13.479 13.251 13.043 12.833 12.631 12.448 12.258 12.068 11.919 11.767 11.617 11.495 11.352 11.186 11.012 10.839 10.719 10.601 10.415 10.274 10.133 10.057 9.891 9.726 9.539 9.444 9.178 9.129 9.015 8.893 8.612 8.444 8.253 8.034 7.818 7.54 7.161 6.099 -9 ,5134 ,TETRA ,17600623,Sun Nov 28 12:35:07 CET,Sun Nov 28 14:33:45 CET,0.0 1.294 1.776 2.13 2.374 2.58 2.774 2.945 3.243 3.4 3.538 3.605 3.894 4.006 4.237 4.447 4.639 4.747 4.972 5.185 5.486 5.682 5.879 6.163 6.439 6.69 6.92 7.15 7.448 7.729 7.99 8.303 8.598 8.87 9.186 9.528 9.83 10.138 10.487 10.86 11.235 11.642 12.092 12.516 12.977 13.476 14.026 14.558 15.113 15.693 16.127 16.179 15.968 15.682 15.336 14.954 14.626 14.314 14.023 13.741 13.489 13.237 12.973 12.72 12.485 12.258 12.032 11.842 11.666 11.472 11.253 11.075 10.914 10.746 10.595 10.424 10.249 10.056 9.845 9.723 9.62 9.451 9.328 9.188 9.11 8.956 8.784 8.593 8.5 8.24 8.194 8.067 7.942 7.67 7.513 7.352 7.189 6.985 6.736 6.392 5.712 -10 ,23033 ,TETRA ,17600624,Sun Nov 28 12:35:08 CET,Sun Nov 28 14:33:37 CET,0.0 0.99 1.407 1.698 1.955 2.193 2.419 2.639 3.021 3.184 3.345 3.478 3.795 3.926 4.182 4.405 4.613 4.724 4.938 5.145 5.429 5.598 5.761 5.994 6.22 6.434 6.643 6.85 7.127 7.365 7.586 7.918 8.243 8.527 8.853 9.206 9.533 9.891 10.269 10.673 11.098 11.565 12.095 12.601 13.166 13.764 14.382 15.034 15.749 16.403 16.93 17.022 16.85 16.656 16.39 16.081 15.789 15.498 15.239 14.965 14.724 14.514 14.294 14.078 13.885 13.684 13.46 13.267 13.096 12.929 12.753 12.588 12.406 12.234 12.098 11.952 11.803 11.649 11.486 11.368 11.251 11.068 10.94 10.801 10.726 10.562 10.392 10.222 10.128 9.86 9.847 9.742 9.618 9.319 9.147 8.973 8.77 8.502 8.191 7.852 6.83 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_42_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_42_54.txt deleted file mode 100644 index 10844fbc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_42_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18032 ,TETRA ,17600625,Sun Nov 28 12:35:10 CET,Sun Nov 28 14:34:10 CET,0.0 0.523 0.787 1.006 1.197 1.358 1.514 1.658 1.9 2.017 2.126 2.162 2.462 2.569 2.752 2.914 3.062 3.138 3.274 3.392 3.571 3.677 3.79 3.974 4.132 4.286 4.431 4.558 4.715 4.858 4.995 5.172 5.342 5.492 5.652 5.835 6.003 6.17 6.359 6.537 6.701 6.89 7.115 7.3 7.463 7.613 7.743 7.833 7.829 7.606 6.943 6.008 5.193 4.381 3.624 2.993 2.455 1.945 1.505 1.055 0.669 0.339 0.011 -0.301 -0.582 -0.826 -1.081 -1.319 -1.53 -1.742 -1.96 -2.145 -2.351 -2.566 -2.72 -2.879 -3.038 -3.205 -3.387 -3.509 -3.633 -3.84 -3.978 -4.117 -4.197 -4.358 -4.511 -4.659 -4.741 -5.016 -5.013 -5.104 -5.204 -5.429 -5.545 -5.682 -5.838 -5.996 -6.172 -6.423 -6.935 -2 ,23031 ,TETRA ,17600626,Sun Nov 28 12:35:06 CET,Sun Nov 28 14:32:28 CET,0.0 0.67 0.886 1.056 1.199 1.339 1.488 1.622 1.832 1.934 2.033 1.995 2.27 2.353 2.49 2.62 2.747 2.813 2.937 3.045 3.194 3.293 3.378 3.505 3.634 3.748 3.856 3.96 4.088 4.206 4.344 4.504 4.648 4.789 4.955 5.138 5.3 5.482 5.677 5.863 6.04 6.221 6.394 6.557 6.748 6.905 7.004 7.086 7.102 6.915 6.263 5.322 4.471 3.673 2.959 2.312 1.742 1.206 0.734 0.267 -0.128 -0.486 -0.838 -1.185 -1.506 -1.787 -2.074 -2.321 -2.535 -2.763 -2.996 -3.187 -3.385 -3.585 -3.74 -3.905 -4.079 -4.247 -4.42 -4.54 -4.663 -4.865 -5.0 -5.129 -5.201 -5.359 -5.523 -5.695 -5.784 -6.054 -6.048 -6.154 -6.26 -6.466 -6.579 -6.705 -6.843 -7.011 -7.202 -7.39 -7.735 -3 ,5875 ,TETRA ,17600627,Sun Nov 28 12:35:06 CET,Sun Nov 28 14:33:46 CET,0.0 0.549 0.8 1.048 1.261 1.422 1.56 1.694 1.926 2.018 2.109 2.094 2.354 2.424 2.569 2.719 2.854 2.923 3.064 3.179 3.341 3.447 3.557 3.716 3.852 3.989 4.124 4.242 4.391 4.533 4.654 4.799 4.946 5.083 5.231 5.39 5.536 5.688 5.853 6.029 6.197 6.354 6.55 6.765 6.977 7.149 7.296 7.388 7.341 7.108 6.45 5.43 4.516 3.673 2.942 2.284 1.702 1.186 0.726 0.265 -0.141 -0.515 -0.861 -1.18 -1.486 -1.766 -2.056 -2.327 -2.553 -2.778 -3.016 -3.213 -3.424 -3.635 -3.794 -3.956 -4.126 -4.302 -4.475 -4.595 -4.718 -4.916 -5.063 -5.21 -5.287 -5.446 -5.611 -5.782 -5.876 -6.171 -6.178 -6.269 -6.371 -6.6 -6.723 -6.863 -7.008 -7.17 -7.365 -7.626 -8.156 -4 ,11049 ,TETRA ,17600628,Sun Nov 28 12:35:08 CET,Sun Nov 28 14:33:11 CET,0.0 0.989 1.364 1.6 1.778 1.92 2.071 2.216 2.43 2.531 2.635 2.634 2.892 2.967 3.12 3.285 3.456 3.537 3.684 3.812 3.99 4.098 4.196 4.344 4.503 4.66 4.798 4.926 5.091 5.245 5.393 5.556 5.692 5.833 6.0 6.188 6.369 6.555 6.748 6.936 7.113 7.299 7.497 7.674 7.859 8.033 8.167 8.244 8.197 7.973 7.435 6.546 5.651 4.839 4.116 3.427 2.81 2.284 1.841 1.389 0.999 0.652 0.308 -0.015 -0.313 -0.579 -0.834 -1.063 -1.283 -1.503 -1.712 -1.883 -2.068 -2.265 -2.408 -2.547 -2.692 -2.844 -2.996 -3.108 -3.232 -3.417 -3.543 -3.688 -3.766 -3.908 -4.07 -4.255 -4.341 -4.609 -4.607 -4.693 -4.789 -5.007 -5.11 -5.235 -5.378 -5.523 -5.699 -5.91 -6.27 -5 ,11019 ,TETRA ,17600629,Sun Nov 28 12:35:11 CET,Sun Nov 28 14:32:42 CET,0.0 1.018 1.317 1.541 1.743 1.925 2.088 2.243 2.507 2.619 2.727 2.741 3.015 3.116 3.29 3.456 3.627 3.715 3.892 4.044 4.242 4.368 4.492 4.66 4.799 4.92 5.039 5.161 5.325 5.477 5.613 5.779 5.943 6.085 6.246 6.443 6.616 6.796 6.981 7.16 7.332 7.514 7.723 7.903 8.094 8.27 8.384 8.462 8.449 8.237 7.673 6.725 5.848 5.068 4.368 3.704 3.112 2.583 2.114 1.653 1.285 0.952 0.62 0.303 -0.006 -0.285 -0.555 -0.799 -1.02 -1.249 -1.473 -1.654 -1.851 -2.06 -2.233 -2.413 -2.589 -2.76 -2.925 -3.042 -3.167 -3.361 -3.496 -3.636 -3.709 -3.861 -4.014 -4.176 -4.262 -4.525 -4.517 -4.609 -4.705 -4.957 -5.09 -5.207 -5.344 -5.509 -5.697 -5.922 -6.257 -6 ,8404 ,TETRA ,17600630,Sun Nov 28 12:35:06 CET,Sun Nov 28 14:32:29 CET,0.0 0.719 1.068 1.322 1.53 1.706 1.857 2.011 2.297 2.409 2.509 2.52 2.772 2.847 2.987 3.14 3.299 3.369 3.514 3.663 3.844 3.943 4.039 4.187 4.323 4.456 4.594 4.723 4.885 5.035 5.171 5.353 5.521 5.664 5.81 5.954 6.111 6.294 6.468 6.637 6.818 6.999 7.161 7.302 7.454 7.601 7.73 7.834 7.847 7.641 6.98 5.956 4.989 4.108 3.341 2.666 2.086 1.562 1.125 0.684 0.291 -0.058 -0.389 -0.703 -0.998 -1.255 -1.531 -1.785 -1.999 -2.214 -2.43 -2.617 -2.819 -3.013 -3.153 -3.307 -3.467 -3.634 -3.803 -3.917 -4.035 -4.221 -4.355 -4.487 -4.551 -4.704 -4.877 -5.056 -5.149 -5.416 -5.386 -5.465 -5.571 -5.809 -5.915 -6.03 -6.178 -6.338 -6.499 -6.682 -7.009 -7 ,22761 ,TETRA ,17600631,Sun Nov 28 12:35:08 CET,Sun Nov 28 14:34:56 CET,0.0 0.702 0.972 1.17 1.352 1.524 1.688 1.822 2.058 2.163 2.255 2.23 2.501 2.59 2.731 2.859 3.005 3.078 3.206 3.325 3.498 3.611 3.713 3.854 3.989 4.118 4.246 4.37 4.533 4.685 4.819 4.977 5.129 5.268 5.426 5.609 5.77 5.94 6.125 6.317 6.512 6.704 6.908 7.078 7.241 7.439 7.627 7.743 7.75 7.554 6.99 6.024 5.145 4.402 3.712 3.038 2.444 1.906 1.427 0.95 0.544 0.184 -0.153 -0.459 -0.738 -1.002 -1.287 -1.54 -1.755 -1.978 -2.223 -2.428 -2.634 -2.847 -3.008 -3.176 -3.357 -3.54 -3.718 -3.847 -3.978 -4.186 -4.329 -4.478 -4.557 -4.713 -4.877 -5.04 -5.124 -5.408 -5.413 -5.522 -5.637 -5.879 -5.994 -6.119 -6.259 -6.434 -6.631 -6.868 -7.487 -8 ,19835 ,TETRA ,17600632,Sun Nov 28 12:35:09 CET,Sun Nov 28 14:35:13 CET,0.0 0.647 0.977 1.226 1.409 1.585 1.751 1.908 2.191 2.306 2.392 2.375 2.646 2.747 2.946 3.113 3.256 3.334 3.475 3.582 3.734 3.847 3.962 4.124 4.268 4.411 4.559 4.69 4.857 5.032 5.197 5.384 5.557 5.71 5.876 6.062 6.227 6.399 6.586 6.763 6.934 7.12 7.288 7.448 7.629 7.763 7.879 7.99 8.039 7.896 7.335 6.384 5.489 4.666 3.963 3.326 2.743 2.182 1.712 1.278 0.913 0.583 0.261 -0.039 -0.311 -0.559 -0.823 -1.055 -1.257 -1.47 -1.686 -1.869 -2.055 -2.255 -2.41 -2.572 -2.746 -2.92 -3.093 -3.213 -3.344 -3.543 -3.665 -3.791 -3.855 -3.986 -4.127 -4.284 -4.368 -4.635 -4.618 -4.719 -4.826 -5.036 -5.158 -5.292 -5.433 -5.57 -5.714 -5.916 -6.266 -9 ,7148 ,TETRA ,17600633,Sun Nov 28 12:35:12 CET,Sun Nov 28 14:36:59 CET,0.0 0.821 1.028 1.197 1.368 1.519 1.643 1.762 1.987 2.088 2.183 2.166 2.441 2.522 2.666 2.807 2.939 2.998 3.116 3.236 3.408 3.513 3.615 3.755 3.877 3.988 4.102 4.224 4.386 4.538 4.668 4.813 4.955 5.094 5.25 5.407 5.55 5.695 5.853 6.032 6.214 6.419 6.633 6.816 7.002 7.148 7.287 7.383 7.346 7.121 6.478 5.486 4.546 3.7 2.99 2.374 1.836 1.309 0.834 0.362 -0.029 -0.365 -0.68 -0.984 -1.279 -1.552 -1.837 -2.088 -2.303 -2.517 -2.741 -2.93 -3.115 -3.301 -3.453 -3.612 -3.768 -3.944 -4.14 -4.265 -4.395 -4.599 -4.731 -4.869 -4.945 -5.099 -5.253 -5.413 -5.498 -5.765 -5.745 -5.834 -5.937 -6.153 -6.256 -6.363 -6.464 -6.571 -6.709 -6.907 -7.195 -10 ,9777 ,TETRA ,17600634,Sun Nov 28 12:35:13 CET,Sun Nov 28 14:36:52 CET,0.0 1.142 1.538 1.822 2.064 2.267 2.451 2.621 2.939 3.089 3.208 3.256 3.56 3.67 3.869 4.027 4.175 4.257 4.404 4.531 4.724 4.845 4.967 5.135 5.277 5.411 5.54 5.665 5.821 5.974 6.12 6.294 6.451 6.6 6.767 6.945 7.101 7.269 7.463 7.648 7.828 8.012 8.19 8.345 8.511 8.68 8.826 8.904 8.891 8.719 8.093 7.034 6.079 5.241 4.507 3.859 3.275 2.728 2.252 1.789 1.406 1.056 0.725 0.42 0.114 -0.178 -0.469 -0.716 -0.921 -1.127 -1.341 -1.519 -1.716 -1.928 -2.082 -2.231 -2.387 -2.569 -2.76 -2.885 -3.014 -3.221 -3.363 -3.508 -3.582 -3.729 -3.889 -4.052 -4.133 -4.403 -4.39 -4.47 -4.556 -4.773 -4.89 -5.003 -5.121 -5.252 -5.405 -5.579 -5.946 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_43_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_43_42.txt deleted file mode 100644 index 7ccde0ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_43_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24968 ,KEBNE ,17027037,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:39:32 CET,0.0 1.164 1.491 1.734 1.932 2.1 2.261 2.427 2.724 2.862 2.994 3.032 3.343 3.447 3.628 3.815 3.995 4.08 4.26 4.448 4.709 4.862 5.019 5.256 5.465 5.656 5.836 6.01 6.235 6.456 6.684 6.97 7.242 7.49 7.774 8.093 8.39 8.718 9.07 9.437 9.827 10.251 10.732 11.213 11.768 12.377 13.082 13.883 14.806 15.797 16.798 17.428 17.673 17.755 17.695 17.537 17.359 17.196 17.04 16.855 16.671 16.495 16.322 16.134 15.94 15.757 15.557 15.385 15.243 15.092 14.909 14.752 14.608 14.456 14.322 14.156 13.992 13.844 13.687 13.57 13.443 13.245 13.097 12.932 12.848 12.684 12.503 12.305 12.219 11.946 11.865 11.733 11.61 11.333 11.189 11.052 10.879 10.678 10.428 10.073 8.402 -2 ,7030 ,KEBNE ,17027038,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:39:50 CET,0.0 1.15 1.464 1.725 1.962 2.177 2.367 2.516 2.758 2.866 2.974 2.995 3.299 3.404 3.591 3.768 3.94 4.025 4.185 4.338 4.573 4.72 4.861 5.076 5.28 5.471 5.662 5.838 6.062 6.297 6.521 6.78 7.015 7.258 7.55 7.851 8.127 8.424 8.756 9.112 9.482 9.897 10.384 10.873 11.418 12.018 12.714 13.486 14.334 15.281 16.315 17.0 17.289 17.372 17.227 16.972 16.783 16.619 16.429 16.191 15.993 15.816 15.621 15.417 15.235 15.081 14.907 14.747 14.596 14.403 14.209 14.039 13.863 13.685 13.549 13.431 13.296 13.117 12.903 12.759 12.604 12.352 12.172 11.998 11.904 11.701 11.504 11.287 11.174 10.871 10.802 10.649 10.49 10.176 9.979 9.755 9.534 9.314 9.03 8.553 6.746 -3 ,5415 ,KEBNE ,17027039,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:39:44 CET,0.0 0.981 1.342 1.647 1.88 2.09 2.274 2.445 2.748 2.876 3.003 3.063 3.376 3.487 3.711 3.915 4.108 4.205 4.388 4.564 4.806 4.97 5.136 5.366 5.573 5.753 5.942 6.142 6.391 6.628 6.841 7.086 7.336 7.585 7.863 8.174 8.479 8.794 9.14 9.522 9.932 10.399 10.902 11.382 11.962 12.6 13.312 14.117 15.057 16.118 17.272 18.086 18.441 18.544 18.517 18.387 18.221 18.039 17.866 17.66 17.408 17.175 16.963 16.742 16.507 16.281 16.063 15.881 15.719 15.537 15.339 15.174 14.971 14.712 14.506 14.317 14.127 13.933 13.74 13.612 13.48 13.244 13.088 12.94 12.852 12.65 12.442 12.234 12.129 11.842 11.768 11.626 11.485 11.191 11.018 10.803 10.592 10.324 9.974 9.504 6.931 -4 ,18791 ,KEBNE ,17027040,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:38:52 CET,0.0 1.308 1.712 1.967 2.149 2.334 2.506 2.65 2.916 3.04 3.163 3.2 3.49 3.588 3.78 3.976 4.171 4.266 4.451 4.624 4.851 4.989 5.121 5.326 5.532 5.724 5.913 6.097 6.326 6.547 6.757 7.003 7.225 7.44 7.714 8.021 8.295 8.603 8.946 9.307 9.684 10.11 10.587 11.047 11.581 12.187 12.871 13.635 14.503 15.447 16.45 17.057 17.257 17.231 17.131 17.021 16.896 16.747 16.59 16.406 16.219 16.027 15.823 15.638 15.464 15.3 15.123 14.953 14.814 14.664 14.511 14.38 14.242 14.11 13.987 13.841 13.676 13.473 13.267 13.148 13.035 12.865 12.738 12.594 12.514 12.318 12.104 11.891 11.777 11.482 11.427 11.27 11.106 10.812 10.668 10.502 10.309 10.08 9.786 9.402 8.285 -5 ,5717 ,KEBNE ,17027041,Wed Dec 22 15:58:38 CET,Wed Dec 22 17:39:37 CET,0.0 1.12 1.467 1.713 1.91 2.087 2.261 2.422 2.69 2.792 2.882 2.865 3.168 3.272 3.486 3.677 3.841 3.921 4.085 4.251 4.488 4.64 4.784 4.993 5.195 5.382 5.558 5.738 5.96 6.173 6.412 6.702 6.96 7.202 7.471 7.77 8.065 8.39 8.74 9.108 9.492 9.917 10.406 10.878 11.424 12.032 12.712 13.459 14.32 15.308 16.353 17.012 17.204 17.174 17.081 16.937 16.763 16.584 16.414 16.235 16.048 15.866 15.699 15.503 15.298 15.109 14.922 14.756 14.595 14.417 14.228 14.081 13.919 13.746 13.622 13.496 13.352 13.189 13.011 12.883 12.749 12.528 12.372 12.229 12.159 11.98 11.78 11.596 11.498 11.205 11.146 11.01 10.867 10.589 10.424 10.238 10.033 9.768 9.463 9.006 7.101 -6 ,16941 ,KEBNE ,17027042,Wed Dec 22 15:58:36 CET,Wed Dec 22 17:39:08 CET,0.0 1.302 1.682 1.959 2.168 2.348 2.527 2.672 2.921 3.043 3.162 3.187 3.483 3.582 3.762 3.945 4.112 4.192 4.363 4.528 4.754 4.9 5.048 5.27 5.469 5.651 5.829 5.998 6.212 6.424 6.629 6.877 7.121 7.361 7.646 7.958 8.248 8.563 8.903 9.263 9.634 10.047 10.524 10.999 11.543 12.152 12.834 13.571 14.391 15.3 16.335 17.025 17.249 17.271 17.149 16.96 16.763 16.55 16.35 16.145 15.961 15.775 15.567 15.362 15.168 14.996 14.805 14.612 14.435 14.255 14.087 13.922 13.725 13.53 13.377 13.229 13.08 12.916 12.731 12.593 12.455 12.242 12.087 11.929 11.846 11.669 11.478 11.278 11.178 10.877 10.804 10.665 10.51 10.176 9.998 9.798 9.59 9.344 9.036 8.672 7.183 -7 ,15945 ,KEBNE ,17027043,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:39:46 CET,0.0 0.853 1.208 1.5 1.716 1.884 2.048 2.201 2.469 2.593 2.707 2.723 3.01 3.118 3.32 3.504 3.69 3.777 3.939 4.092 4.302 4.431 4.559 4.766 4.97 5.147 5.318 5.487 5.721 5.966 6.189 6.451 6.7 6.933 7.203 7.501 7.8 8.144 8.505 8.869 9.262 9.712 10.205 10.689 11.255 11.853 12.528 13.305 14.155 15.005 15.966 16.687 17.006 17.111 17.021 16.84 16.673 16.512 16.348 16.12 15.896 15.706 15.522 15.33 15.141 14.958 14.766 14.614 14.479 14.32 14.151 14.01 13.855 13.697 13.57 13.436 13.29 13.125 12.934 12.8 12.662 12.44 12.29 12.132 12.047 11.88 11.69 11.45 11.313 10.994 10.898 10.756 10.614 10.282 10.105 9.921 9.714 9.447 9.121 8.724 7.486 -8 ,2302 ,KEBNE ,17027044,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:39:15 CET,0.0 0.987 1.308 1.546 1.749 1.942 2.118 2.284 2.597 2.732 2.859 2.91 3.221 3.326 3.514 3.712 3.915 4.009 4.179 4.338 4.574 4.72 4.864 5.089 5.292 5.477 5.672 5.856 6.089 6.32 6.535 6.798 7.04 7.268 7.556 7.869 8.162 8.474 8.785 9.13 9.517 9.933 10.393 10.861 11.409 12.008 12.703 13.483 14.348 15.337 16.446 17.241 17.586 17.667 17.585 17.46 17.326 17.157 16.985 16.805 16.655 16.507 16.348 16.18 16.004 15.813 15.598 15.417 15.263 15.107 14.946 14.799 14.62 14.42 14.281 14.133 13.966 13.803 13.631 13.512 13.396 13.211 13.07 12.912 12.827 12.666 12.511 12.338 12.238 11.937 11.878 11.752 11.617 11.265 11.062 10.84 10.59 10.34 10.007 9.546 8.406 -9 ,21589 ,KEBNE ,17027045,Wed Dec 22 15:58:37 CET,Wed Dec 22 17:38:36 CET,0.0 2.194 2.532 2.784 2.98 3.134 3.29 3.454 3.735 3.846 3.965 4.007 4.303 4.398 4.585 4.764 4.936 5.024 5.192 5.35 5.585 5.747 5.914 6.125 6.307 6.494 6.674 6.853 7.079 7.29 7.498 7.754 8.001 8.238 8.502 8.792 9.083 9.395 9.721 10.07 10.428 10.848 11.361 11.856 12.405 13.014 13.697 14.467 15.353 16.303 17.36 18.095 18.348 18.383 18.337 18.251 18.137 17.992 17.83 17.642 17.454 17.254 17.058 16.871 16.684 16.5 16.301 16.122 15.951 15.769 15.568 15.389 15.2 14.994 14.839 14.683 14.509 14.331 14.144 14.011 13.87 13.637 13.477 13.306 13.216 13.035 12.838 12.617 12.507 12.221 12.129 11.996 11.862 11.564 11.388 11.192 10.965 10.687 10.375 9.935 8.398 -10 ,24603 ,KEBNE ,17027046,Wed Dec 22 15:58:38 CET,Wed Dec 22 17:39:02 CET,0.0 0.782 1.122 1.366 1.601 1.773 1.919 2.084 2.389 2.517 2.628 2.63 2.923 3.022 3.197 3.384 3.58 3.669 3.838 3.993 4.224 4.37 4.516 4.729 4.928 5.121 5.302 5.483 5.71 5.919 6.128 6.378 6.616 6.844 7.098 7.388 7.675 7.982 8.307 8.65 9.025 9.457 9.933 10.401 10.956 11.545 12.203 12.923 13.746 14.754 15.806 16.473 16.726 16.744 16.618 16.434 16.267 16.108 15.953 15.766 15.583 15.421 15.248 15.05 14.851 14.675 14.499 14.337 14.174 13.987 13.804 13.671 13.532 13.386 13.267 13.13 12.98 12.813 12.639 12.517 12.384 12.179 12.017 11.839 11.755 11.591 11.422 11.239 11.137 10.838 10.778 10.661 10.544 10.275 10.093 9.909 9.733 9.492 9.207 8.84 7.273 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_45_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_45_42.txt deleted file mode 100644 index 87358e91..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_45_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1158 ,TETRA ,17600635,Sun Nov 28 12:35:08 CET,Sun Nov 28 14:34:22 CET,0.0 0.601 0.867 1.079 1.265 1.449 1.615 1.749 1.953 2.041 2.128 2.138 2.432 2.522 2.7 2.871 3.017 3.081 3.209 3.341 3.545 3.677 3.798 3.975 4.141 4.293 4.456 4.616 4.807 5.003 5.193 5.401 5.591 5.788 6.025 6.271 6.505 6.765 7.033 7.302 7.581 7.906 8.297 8.672 9.091 9.55 10.037 10.533 11.058 11.602 12.066 12.15 12.0 11.731 11.43 11.097 10.754 10.41 10.091 9.795 9.538 9.291 9.05 8.826 8.615 8.403 8.167 7.944 7.741 7.555 7.361 7.19 7.019 6.84 6.69 6.526 6.356 6.179 5.992 5.866 5.74 5.537 5.398 5.244 5.161 4.997 4.829 4.664 4.573 4.291 4.256 4.144 4.015 3.736 3.6 3.429 3.25 3.054 2.755 2.336 0.807 -2 ,30731 ,TETRA ,17600636,Sun Nov 28 12:35:08 CET,Sun Nov 28 14:32:10 CET,0.0 0.427 0.607 0.762 0.929 1.075 1.196 1.319 1.561 1.677 1.776 1.759 2.035 2.111 2.243 2.384 2.527 2.593 2.719 2.844 3.031 3.141 3.257 3.423 3.588 3.76 3.935 4.1 4.301 4.496 4.669 4.869 5.066 5.257 5.478 5.724 5.962 6.218 6.48 6.749 7.039 7.342 7.689 8.066 8.485 8.916 9.38 9.857 10.375 10.898 11.35 11.48 11.33 11.06 10.785 10.478 10.167 9.881 9.622 9.331 9.034 8.76 8.476 8.189 7.923 7.672 7.398 7.152 6.953 6.731 6.495 6.316 6.128 5.932 5.767 5.577 5.379 5.173 4.966 4.832 4.695 4.47 4.313 4.151 4.063 3.883 3.698 3.5 3.4 3.12 3.069 2.939 2.807 2.537 2.393 2.207 1.989 1.768 1.492 1.077 -0.185 -3 ,30471 ,TETRA ,17600637,Sun Nov 28 12:35:08 CET,Sun Nov 28 14:33:35 CET,0.0 0.529 0.788 0.966 1.107 1.219 1.328 1.447 1.687 1.792 1.894 1.904 2.182 2.271 2.464 2.631 2.78 2.859 3.012 3.146 3.337 3.452 3.561 3.734 3.899 4.045 4.189 4.333 4.524 4.71 4.886 5.096 5.3 5.494 5.725 5.983 6.216 6.466 6.74 7.035 7.327 7.65 8.021 8.384 8.813 9.27 9.75 10.24 10.734 11.224 11.695 11.868 11.752 11.534 11.252 10.884 10.523 10.18 9.878 9.585 9.299 9.025 8.751 8.482 8.236 8.01 7.77 7.547 7.352 7.162 6.979 6.813 6.643 6.47 6.332 6.188 6.022 5.844 5.672 5.55 5.418 5.22 5.079 4.932 4.854 4.679 4.496 4.3 4.195 3.907 3.859 3.74 3.61 3.298 3.123 2.959 2.784 2.58 2.321 2.013 1.116 -4 ,14515 ,TETRA ,17600638,Sun Nov 28 12:35:10 CET,Sun Nov 28 14:34:03 CET,0.0 0.577 0.851 1.068 1.229 1.383 1.514 1.644 1.869 1.974 2.077 2.075 2.34 2.417 2.582 2.75 2.896 2.969 3.109 3.238 3.424 3.546 3.668 3.842 3.992 4.126 4.263 4.414 4.613 4.795 4.977 5.189 5.383 5.578 5.802 6.042 6.28 6.539 6.807 7.094 7.383 7.715 8.117 8.509 8.955 9.412 9.911 10.476 11.094 11.76 12.308 12.376 12.167 11.87 11.555 11.186 10.841 10.536 10.239 9.9 9.597 9.317 9.035 8.746 8.473 8.235 7.981 7.754 7.551 7.327 7.091 6.884 6.672 6.449 6.273 6.108 5.945 5.771 5.588 5.459 5.325 5.111 4.959 4.81 4.732 4.559 4.364 4.163 4.069 3.778 3.724 3.603 3.49 3.245 3.094 2.924 2.748 2.577 2.378 2.083 1.299 -5 ,24449 ,TETRA ,17600639,Sun Nov 28 12:35:12 CET,Sun Nov 28 14:33:17 CET,0.0 0.666 0.907 1.106 1.275 1.426 1.568 1.701 1.948 2.062 2.168 2.168 2.444 2.526 2.682 2.835 2.978 3.045 3.185 3.318 3.492 3.601 3.703 3.852 3.99 4.129 4.272 4.412 4.596 4.783 4.954 5.138 5.325 5.511 5.716 5.956 6.2 6.448 6.698 6.971 7.284 7.62 7.997 8.405 8.861 9.327 9.831 10.334 10.853 11.364 11.766 11.789 11.548 11.193 10.832 10.462 10.095 9.757 9.461 9.147 8.868 8.61 8.345 8.097 7.866 7.651 7.424 7.219 7.047 6.851 6.631 6.445 6.258 6.066 5.903 5.74 5.579 5.404 5.214 5.086 4.96 4.771 4.644 4.512 4.436 4.259 4.062 3.846 3.737 3.437 3.345 3.194 3.043 2.736 2.567 2.379 2.158 1.894 1.576 1.092 -0.724 -6 ,30732 ,TETRA ,17600640,Sun Nov 28 12:35:15 CET,Sun Nov 28 14:33:28 CET,0.0 1.15 1.523 1.753 1.958 2.13 2.264 2.393 2.633 2.737 2.835 2.826 3.104 3.196 3.389 3.566 3.717 3.789 3.923 4.051 4.24 4.36 4.47 4.635 4.803 4.969 5.117 5.262 5.456 5.621 5.774 5.983 6.189 6.397 6.656 6.917 7.143 7.392 7.659 7.945 8.255 8.592 8.955 9.308 9.713 10.154 10.622 11.117 11.632 12.09 12.479 12.531 12.304 11.989 11.638 11.313 11.013 10.709 10.416 10.084 9.804 9.551 9.294 9.031 8.764 8.521 8.279 8.068 7.876 7.672 7.457 7.264 7.056 6.854 6.699 6.529 6.352 6.171 5.978 5.841 5.703 5.484 5.33 5.179 5.104 4.938 4.753 4.554 4.445 4.15 4.114 4.0 3.879 3.629 3.507 3.371 3.204 2.985 2.694 2.276 0.887 -7 ,21328 ,TETRA ,17600641,Sun Nov 28 12:35:08 CET,Sun Nov 28 14:33:40 CET,0.0 0.625 0.864 1.066 1.206 1.332 1.462 1.582 1.827 1.945 2.049 2.053 2.341 2.435 2.613 2.778 2.942 3.02 3.176 3.333 3.546 3.68 3.809 3.99 4.158 4.313 4.465 4.611 4.805 5.001 5.187 5.394 5.582 5.774 6.011 6.283 6.527 6.781 7.045 7.311 7.588 7.903 8.28 8.662 9.102 9.585 10.117 10.688 11.303 11.909 12.396 12.575 12.458 12.203 11.932 11.617 11.29 10.961 10.651 10.328 10.058 9.803 9.553 9.304 9.057 8.847 8.626 8.412 8.213 8.013 7.81 7.635 7.459 7.275 7.121 6.966 6.814 6.649 6.476 6.354 6.223 6.01 5.866 5.725 5.653 5.492 5.323 5.148 5.061 4.79 4.77 4.655 4.522 4.203 4.038 3.874 3.706 3.513 3.25 2.862 1.84 -8 ,26757 ,TETRA ,17600642,Sun Nov 28 12:35:09 CET,Sun Nov 28 14:34:04 CET,0.0 0.771 1.002 1.216 1.386 1.502 1.633 1.761 1.999 2.112 2.217 2.225 2.488 2.57 2.735 2.887 3.05 3.128 3.269 3.402 3.583 3.696 3.809 3.98 4.149 4.312 4.466 4.616 4.822 5.012 5.185 5.394 5.602 5.811 6.04 6.28 6.502 6.76 7.045 7.33 7.639 7.99 8.377 8.744 9.137 9.556 10.04 10.553 11.101 11.664 12.114 12.111 11.862 11.588 11.303 11.001 10.704 10.391 10.082 9.748 9.441 9.175 8.923 8.668 8.43 8.213 7.962 7.72 7.513 7.3 7.08 6.893 6.695 6.505 6.353 6.185 6.02 5.852 5.669 5.542 5.428 5.25 5.107 4.946 4.86 4.695 4.532 4.351 4.259 3.979 3.955 3.833 3.702 3.445 3.285 3.099 2.913 2.716 2.515 2.237 0.938 -9 ,24322 ,TETRA ,17600643,Sun Nov 28 12:35:10 CET,Sun Nov 28 14:34:23 CET,0.0 0.774 1.022 1.253 1.441 1.572 1.717 1.866 2.112 2.217 2.334 2.37 2.645 2.726 2.872 3.008 3.143 3.21 3.336 3.451 3.616 3.729 3.846 4.021 4.191 4.348 4.506 4.659 4.85 5.031 5.194 5.398 5.586 5.763 5.994 6.264 6.508 6.76 7.026 7.316 7.626 7.967 8.356 8.723 9.123 9.537 9.974 10.447 10.975 11.515 11.996 12.061 11.761 11.352 10.987 10.648 10.293 9.902 9.534 9.159 8.824 8.527 8.244 7.953 7.658 7.385 7.113 6.88 6.672 6.463 6.266 6.103 5.92 5.726 5.574 5.403 5.215 5.025 4.813 4.659 4.513 4.275 4.102 3.932 3.847 3.66 3.453 3.232 3.126 2.843 2.78 2.653 2.516 2.193 2.018 1.83 1.624 1.389 1.084 0.695 -0.507 -10 ,1745 ,TETRA ,17600644,Sun Nov 28 12:35:35 CET,Sun Nov 28 14:32:58 CET,0.0 0.376 0.604 0.807 0.976 1.122 1.243 1.345 1.565 1.68 1.777 1.764 2.026 2.108 2.28 2.446 2.612 2.687 2.826 2.967 3.163 3.292 3.421 3.602 3.771 3.932 4.08 4.223 4.415 4.598 4.776 4.995 5.202 5.409 5.653 5.923 6.187 6.48 6.785 7.074 7.375 7.726 8.116 8.494 8.924 9.396 9.918 10.465 11.056 11.658 12.186 12.351 12.225 12.02 11.737 11.403 11.087 10.781 10.488 10.157 9.86 9.599 9.338 9.09 8.853 8.65 8.456 8.257 8.063 7.856 7.639 7.465 7.289 7.081 6.917 6.742 6.558 6.383 6.189 6.057 5.936 5.75 5.617 5.47 5.389 5.222 5.042 4.855 4.758 4.467 4.41 4.275 4.143 3.853 3.706 3.567 3.389 3.145 2.862 2.496 1.284 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_46_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_46_43.txt deleted file mode 100644 index 97d190b8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_46_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14394 ,TETRA ,17600645,Sun Nov 28 12:35:39 CET,Sun Nov 28 14:32:57 CET,0.0 0.698 0.989 1.178 1.341 1.489 1.634 1.765 1.991 2.105 2.214 2.209 2.49 2.585 2.772 2.936 3.091 3.165 3.32 3.472 3.674 3.808 3.941 4.119 4.293 4.464 4.619 4.766 4.968 5.164 5.346 5.589 5.819 6.029 6.26 6.501 6.724 6.986 7.293 7.602 7.906 8.231 8.605 8.991 9.444 9.928 10.461 11.056 11.724 12.454 13.188 13.619 13.731 13.719 13.595 13.403 13.217 12.993 12.769 12.538 12.335 12.16 11.977 11.794 11.624 11.461 11.279 11.111 10.969 10.822 10.665 10.533 10.397 10.253 10.135 10.012 9.884 9.75 9.612 9.508 9.399 9.212 9.065 8.921 8.855 8.723 8.584 8.45 8.374 8.102 8.134 8.038 7.941 7.73 7.603 7.466 7.333 7.17 6.968 6.759 6.378 -2 ,23594 ,TETRA ,17600646,Sun Nov 28 12:35:36 CET,Sun Nov 28 14:33:10 CET,0.0 0.464 0.725 0.948 1.128 1.276 1.412 1.533 1.76 1.864 1.955 1.924 2.214 2.303 2.478 2.628 2.771 2.844 2.974 3.106 3.295 3.406 3.519 3.7 3.872 4.03 4.182 4.321 4.483 4.65 4.827 5.031 5.225 5.419 5.639 5.866 6.099 6.363 6.631 6.906 7.192 7.522 7.924 8.308 8.722 9.176 9.687 10.256 10.926 11.637 12.287 12.575 12.578 12.495 12.355 12.176 11.982 11.777 11.554 11.303 11.097 10.911 10.719 10.529 10.339 10.146 9.963 9.797 9.643 9.489 9.324 9.185 9.045 8.886 8.763 8.65 8.519 8.372 8.216 8.116 8.01 7.841 7.727 7.605 7.548 7.435 7.287 7.119 7.034 6.759 6.788 6.703 6.617 6.418 6.313 6.203 6.066 5.902 5.721 5.504 4.998 -3 ,13010 ,TETRA ,17600647,Sun Nov 28 12:35:37 CET,Sun Nov 28 14:32:44 CET,0.0 0.596 0.788 0.965 1.114 1.249 1.376 1.498 1.734 1.838 1.936 1.943 2.23 2.316 2.469 2.615 2.759 2.83 2.963 3.102 3.297 3.408 3.525 3.695 3.855 4.009 4.148 4.288 4.482 4.681 4.865 5.073 5.27 5.461 5.677 5.918 6.143 6.392 6.662 6.925 7.208 7.523 7.88 8.264 8.706 9.163 9.658 10.189 10.831 11.588 12.372 12.791 12.859 12.767 12.571 12.345 12.128 11.903 11.699 11.491 11.301 11.131 10.966 10.786 10.613 10.458 10.289 10.142 10.008 9.851 9.688 9.565 9.44 9.303 9.2 9.078 8.942 8.803 8.666 8.582 8.494 8.345 8.227 8.106 8.045 7.907 7.765 7.64 7.577 7.317 7.356 7.273 7.181 6.983 6.865 6.73 6.589 6.445 6.245 5.929 5.175 -4 ,779 ,TETRA ,17600648,Sun Nov 28 12:35:36 CET,Sun Nov 28 14:35:17 CET,0.0 0.414 0.653 0.819 0.968 1.102 1.226 1.352 1.552 1.654 1.756 1.735 2.019 2.101 2.257 2.403 2.538 2.605 2.74 2.872 3.065 3.185 3.297 3.463 3.625 3.781 3.927 4.065 4.239 4.415 4.588 4.801 5.01 5.206 5.431 5.682 5.917 6.173 6.451 6.75 7.055 7.383 7.771 8.159 8.606 9.094 9.621 10.195 10.836 11.505 12.14 12.464 12.493 12.417 12.274 12.048 11.814 11.582 11.362 11.145 10.952 10.773 10.603 10.41 10.223 10.067 9.903 9.746 9.602 9.456 9.3 9.158 9.009 8.861 8.751 8.638 8.514 8.379 8.247 8.156 8.066 7.916 7.796 7.672 7.608 7.474 7.333 7.183 7.104 6.827 6.856 6.759 6.667 6.487 6.363 6.21 6.044 5.871 5.691 5.445 4.877 -5 ,23273 ,TETRA ,17600649,Sun Nov 28 12:35:37 CET,Sun Nov 28 14:34:51 CET,0.0 0.315 0.576 0.777 0.954 1.102 1.228 1.341 1.553 1.657 1.757 1.746 2.031 2.118 2.289 2.447 2.592 2.66 2.795 2.926 3.12 3.246 3.369 3.542 3.696 3.845 3.99 4.126 4.312 4.491 4.668 4.884 5.085 5.292 5.52 5.763 5.989 6.243 6.524 6.821 7.132 7.482 7.876 8.234 8.644 9.108 9.622 10.188 10.863 11.592 12.236 12.571 12.667 12.626 12.488 12.306 12.097 11.888 11.675 11.449 11.26 11.071 10.894 10.719 10.548 10.38 10.191 10.05 9.94 9.805 9.66 9.544 9.423 9.286 9.178 9.073 8.959 8.828 8.687 8.587 8.483 8.338 8.244 8.127 8.063 7.941 7.815 7.678 7.604 7.329 7.324 7.22 7.108 6.877 6.769 6.639 6.485 6.312 6.1 5.861 5.398 -6 ,5749 ,TETRA ,17600650,Sun Nov 28 12:35:40 CET,Sun Nov 28 14:33:13 CET,0.0 0.663 0.934 1.12 1.262 1.395 1.518 1.633 1.855 1.972 2.078 2.059 2.349 2.433 2.598 2.759 2.921 3.001 3.161 3.308 3.512 3.644 3.763 3.942 4.116 4.273 4.435 4.588 4.77 4.95 5.124 5.325 5.513 5.688 5.901 6.152 6.39 6.644 6.912 7.199 7.493 7.818 8.201 8.583 9.013 9.501 10.07 10.675 11.319 12.002 12.769 13.235 13.32 13.268 13.131 12.944 12.743 12.517 12.312 12.101 11.898 11.706 11.508 11.324 11.156 10.998 10.809 10.62 10.471 10.321 10.152 10.004 9.847 9.689 9.57 9.447 9.331 9.206 9.058 8.956 8.857 8.692 8.565 8.439 8.377 8.244 8.111 7.94 7.844 7.555 7.55 7.447 7.348 7.112 6.958 6.807 6.653 6.472 6.233 5.927 5.045 -7 ,26543 ,TETRA ,17600651,Sun Nov 28 12:35:41 CET,Sun Nov 28 14:33:05 CET,0.0 0.426 0.652 0.833 0.981 1.127 1.249 1.365 1.582 1.686 1.793 1.797 2.096 2.186 2.369 2.547 2.701 2.773 2.924 3.084 3.313 3.456 3.586 3.766 3.936 4.099 4.266 4.41 4.592 4.772 4.937 5.151 5.367 5.568 5.795 6.037 6.26 6.512 6.779 7.065 7.383 7.734 8.124 8.491 8.902 9.374 9.898 10.454 11.086 11.73 12.393 12.771 12.833 12.777 12.644 12.492 12.334 12.135 11.946 11.76 11.588 11.413 11.248 11.079 10.904 10.732 10.557 10.409 10.269 10.111 9.945 9.793 9.631 9.469 9.343 9.204 9.048 8.883 8.71 8.602 8.483 8.279 8.145 8.004 7.933 7.789 7.643 7.5 7.423 7.148 7.163 7.076 6.984 6.782 6.676 6.566 6.433 6.246 6.028 5.75 5.165 -8 ,24974 ,TETRA ,17600652,Sun Nov 28 12:35:36 CET,Sun Nov 28 14:34:54 CET,0.0 0.534 0.741 0.889 1.046 1.194 1.332 1.459 1.681 1.787 1.889 1.896 2.205 2.296 2.483 2.666 2.837 2.918 3.071 3.216 3.429 3.573 3.717 3.917 4.103 4.27 4.435 4.605 4.817 5.006 5.202 5.455 5.682 5.9 6.161 6.455 6.73 7.021 7.328 7.67 8.034 8.413 8.835 9.264 9.764 10.342 11.02 11.712 12.452 13.293 14.193 14.693 14.788 14.757 14.646 14.495 14.327 14.111 13.886 13.663 13.466 13.272 13.068 12.859 12.638 12.445 12.255 12.079 11.93 11.773 11.587 11.427 11.265 11.095 10.975 10.852 10.714 10.581 10.456 10.345 10.226 10.065 9.946 9.819 9.755 9.626 9.49 9.345 9.271 9.011 9.037 8.943 8.85 8.652 8.549 8.438 8.303 8.166 8.026 7.827 7.471 -9 ,21021 ,TETRA ,17600653,Sun Nov 28 12:35:37 CET,Sun Nov 28 14:34:54 CET,0.0 0.526 0.809 1.004 1.165 1.337 1.504 1.644 1.868 1.975 2.072 2.039 2.322 2.407 2.562 2.702 2.844 2.917 3.061 3.193 3.382 3.499 3.615 3.797 3.969 4.133 4.287 4.431 4.615 4.79 4.957 5.16 5.356 5.548 5.778 6.038 6.282 6.55 6.835 7.128 7.427 7.757 8.125 8.5 8.966 9.472 10.008 10.578 11.205 11.89 12.61 13.056 13.182 13.163 13.051 12.889 12.711 12.518 12.334 12.104 11.881 11.689 11.52 11.355 11.177 11.008 10.84 10.692 10.549 10.394 10.223 10.068 9.916 9.769 9.661 9.556 9.439 9.302 9.162 9.058 8.939 8.748 8.623 8.501 8.432 8.276 8.108 7.943 7.869 7.605 7.628 7.537 7.438 7.23 7.117 6.991 6.866 6.741 6.556 6.329 5.813 -10 ,10466 ,TETRA ,17600654,Sun Nov 28 12:35:37 CET,Sun Nov 28 14:34:52 CET,0.0 0.536 0.768 0.954 1.12 1.249 1.367 1.49 1.699 1.788 1.878 1.848 2.135 2.217 2.37 2.518 2.658 2.727 2.871 3.008 3.198 3.315 3.429 3.592 3.747 3.899 4.059 4.216 4.406 4.582 4.75 4.965 5.18 5.37 5.579 5.818 6.053 6.307 6.577 6.866 7.172 7.512 7.889 8.262 8.727 9.239 9.765 10.337 11.009 11.758 12.521 12.966 13.082 13.017 12.887 12.746 12.559 12.361 12.177 11.948 11.718 11.502 11.303 11.12 10.948 10.761 10.559 10.395 10.262 10.126 9.979 9.852 9.709 9.562 9.444 9.312 9.186 9.056 8.904 8.798 8.69 8.517 8.404 8.29 8.238 8.126 7.999 7.866 7.79 7.521 7.545 7.464 7.371 7.144 7.019 6.875 6.725 6.575 6.363 6.083 5.447 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_47_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_47_43.txt deleted file mode 100644 index 64e63205..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_47_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22759 ,TETRA ,17600655,Sun Nov 28 12:35:40 CET,Sun Nov 28 14:33:53 CET,0.0 0.373 0.609 0.806 0.954 1.095 1.245 1.388 1.64 1.754 1.867 1.897 2.211 2.31 2.474 2.627 2.781 2.853 2.995 3.142 3.352 3.477 3.6 3.794 3.988 4.169 4.328 4.47 4.652 4.838 5.039 5.296 5.535 5.752 5.992 6.282 6.571 6.877 7.199 7.533 7.883 8.29 8.776 9.259 9.797 10.353 10.998 11.736 12.582 13.506 14.46 15.092 15.301 15.295 15.174 14.951 14.697 14.462 14.232 13.964 13.728 13.513 13.277 13.042 12.831 12.62 12.387 12.189 12.01 11.812 11.604 11.419 11.22 11.024 10.871 10.711 10.543 10.365 10.183 10.05 9.912 9.703 9.559 9.394 9.309 9.141 8.938 8.724 8.627 8.343 8.329 8.201 8.069 7.774 7.6 7.415 7.224 7.02 6.778 6.47 5.451 -2 ,3794 ,TETRA ,17600656,Sun Nov 28 12:35:37 CET,Sun Nov 28 14:33:16 CET,0.0 0.551 0.791 0.985 1.167 1.318 1.44 1.583 1.855 1.965 2.062 2.067 2.374 2.475 2.658 2.823 2.976 3.051 3.203 3.352 3.551 3.682 3.82 4.015 4.199 4.371 4.532 4.686 4.885 5.086 5.285 5.524 5.758 5.973 6.222 6.496 6.761 7.059 7.375 7.715 8.058 8.441 8.893 9.352 9.892 10.492 11.161 11.858 12.646 13.523 14.437 15.007 15.178 15.154 15.029 14.842 14.664 14.459 14.226 13.983 13.748 13.503 13.276 13.065 12.851 12.648 12.432 12.225 12.039 11.845 11.644 11.475 11.294 11.094 10.936 10.771 10.601 10.428 10.238 10.102 9.957 9.736 9.591 9.425 9.337 9.156 8.939 8.723 8.618 8.303 8.231 8.1 7.981 7.681 7.495 7.308 7.101 6.881 6.653 6.32 5.548 -3 ,12301 ,TETRA ,17600657,Sun Nov 28 12:35:38 CET,Sun Nov 28 14:32:59 CET,0.0 0.442 0.656 0.843 1.019 1.166 1.295 1.429 1.691 1.808 1.913 1.912 2.209 2.3 2.483 2.66 2.812 2.887 3.03 3.163 3.358 3.485 3.612 3.798 3.981 4.165 4.338 4.496 4.704 4.918 5.127 5.363 5.604 5.842 6.102 6.389 6.659 6.958 7.275 7.596 7.923 8.311 8.76 9.192 9.71 10.281 10.917 11.653 12.509 13.447 14.442 15.081 15.297 15.264 15.119 14.942 14.74 14.516 14.317 14.07 13.828 13.612 13.375 13.142 12.933 12.732 12.497 12.274 12.087 11.89 11.687 11.519 11.346 11.169 11.028 10.875 10.724 10.577 10.421 10.297 10.161 9.914 9.724 9.54 9.456 9.293 9.107 8.914 8.816 8.52 8.497 8.384 8.26 7.981 7.82 7.646 7.466 7.279 7.071 6.77 6.038 -4 ,28817 ,TETRA ,17600658,Sun Nov 28 12:35:41 CET,Sun Nov 28 14:32:57 CET,0.0 0.418 0.678 0.888 1.076 1.231 1.367 1.489 1.7 1.804 1.901 1.903 2.196 2.285 2.458 2.621 2.763 2.831 2.97 3.11 3.317 3.449 3.579 3.771 3.946 4.115 4.289 4.46 4.679 4.882 5.071 5.289 5.523 5.779 6.064 6.354 6.618 6.918 7.245 7.581 7.914 8.286 8.721 9.159 9.681 10.266 10.915 11.634 12.468 13.348 14.298 14.908 15.059 14.985 14.814 14.609 14.375 14.093 13.836 13.582 13.375 13.168 12.949 12.734 12.51 12.304 12.081 11.888 11.721 11.541 11.339 11.171 11.004 10.828 10.696 10.55 10.379 10.189 9.998 9.873 9.744 9.529 9.372 9.2 9.114 8.947 8.771 8.579 8.465 8.152 8.105 7.977 7.851 7.575 7.426 7.238 6.986 6.71 6.431 6.038 5.093 -5 ,21486 ,TETRA ,17600659,Sun Nov 28 12:35:42 CET,Sun Nov 28 14:33:16 CET,0.0 0.397 0.669 0.922 1.127 1.303 1.468 1.641 1.999 2.155 2.297 2.351 2.676 2.796 3.035 3.274 3.481 3.58 3.773 3.937 4.156 4.3 4.432 4.616 4.814 5.007 5.198 5.387 5.632 5.856 6.051 6.295 6.54 6.773 7.041 7.335 7.604 7.896 8.231 8.592 8.949 9.351 9.818 10.262 10.787 11.369 12.052 12.844 13.723 14.667 15.638 16.22 16.438 16.47 16.335 16.093 15.843 15.616 15.4 15.173 14.963 14.735 14.485 14.248 14.036 13.823 13.6 13.413 13.245 13.055 12.856 12.684 12.491 12.281 12.12 11.96 11.794 11.624 11.438 11.308 11.188 11.001 10.855 10.71 10.634 10.459 10.282 10.101 10.013 9.728 9.692 9.582 9.469 9.221 9.064 8.891 8.723 8.521 8.271 7.964 7.333 -6 ,6586 ,TETRA ,17600660,Sun Nov 28 12:35:37 CET,Sun Nov 28 14:32:12 CET,0.0 1.552 1.831 2.043 2.215 2.372 2.512 2.641 2.855 2.956 3.069 3.061 3.34 3.422 3.588 3.749 3.904 3.982 4.135 4.279 4.479 4.606 4.729 4.911 5.096 5.277 5.449 5.608 5.805 5.996 6.187 6.423 6.645 6.848 7.091 7.364 7.617 7.893 8.19 8.522 8.902 9.297 9.705 10.115 10.609 11.171 11.805 12.535 13.354 14.239 15.216 15.803 15.962 15.914 15.781 15.624 15.392 15.118 14.874 14.647 14.44 14.238 14.043 13.854 13.658 13.455 13.237 13.042 12.862 12.643 12.423 12.255 12.074 11.878 11.718 11.546 11.367 11.182 10.979 10.836 10.692 10.446 10.261 10.051 9.948 9.76 9.571 9.362 9.229 8.886 8.825 8.704 8.581 8.324 8.164 7.986 7.79 7.6 7.36 7.022 6.36 -7 ,3283 ,TETRA ,17600661,Sun Nov 28 12:35:37 CET,Sun Nov 28 14:32:57 CET,0.0 0.602 0.93 1.146 1.34 1.523 1.683 1.829 2.086 2.197 2.303 2.314 2.632 2.731 2.911 3.082 3.242 3.323 3.483 3.635 3.842 3.977 4.116 4.31 4.486 4.651 4.805 4.953 5.146 5.342 5.538 5.768 5.991 6.217 6.473 6.751 7.017 7.306 7.616 7.955 8.328 8.762 9.244 9.673 10.171 10.74 11.399 12.119 12.923 13.852 14.815 15.325 15.457 15.392 15.228 14.994 14.739 14.502 14.292 14.074 13.848 13.616 13.369 13.124 12.912 12.702 12.48 12.282 12.092 11.87 11.638 11.459 11.274 11.076 10.918 10.75 10.572 10.391 10.197 10.053 9.9 9.666 9.505 9.337 9.243 9.044 8.866 8.689 8.588 8.287 8.233 8.094 7.958 7.678 7.516 7.331 7.117 6.849 6.558 6.208 5.477 -8 ,14227 ,TETRA ,17600662,Sun Nov 28 12:35:40 CET,Sun Nov 28 14:32:53 CET,0.0 0.773 1.053 1.326 1.53 1.712 1.875 2.02 2.279 2.392 2.495 2.487 2.794 2.889 3.081 3.277 3.459 3.548 3.716 3.881 4.126 4.282 4.432 4.642 4.837 5.025 5.214 5.409 5.671 5.91 6.12 6.37 6.617 6.863 7.161 7.501 7.823 8.158 8.498 8.873 9.281 9.703 10.165 10.631 11.159 11.751 12.425 13.159 13.985 14.868 15.862 16.475 16.593 16.537 16.382 16.172 15.935 15.65 15.381 15.104 14.87 14.668 14.446 14.207 13.977 13.776 13.559 13.354 13.177 12.991 12.797 12.636 12.453 12.237 12.073 11.903 11.728 11.554 11.366 11.217 11.041 10.77 10.576 10.369 10.268 10.041 9.788 9.542 9.416 9.102 9.096 8.99 8.871 8.606 8.461 8.301 8.121 7.928 7.681 7.365 6.811 -9 ,26409 ,TETRA ,17600663,Sun Nov 28 12:35:41 CET,Sun Nov 28 14:32:25 CET,0.0 0.622 0.829 1.043 1.258 1.439 1.596 1.737 1.981 2.084 2.181 2.161 2.457 2.562 2.748 2.911 3.085 3.178 3.351 3.502 3.706 3.837 3.966 4.144 4.331 4.514 4.68 4.842 5.066 5.289 5.482 5.722 5.979 6.238 6.52 6.805 7.084 7.407 7.763 8.158 8.553 9.003 9.523 10.01 10.557 11.154 11.844 12.593 13.37 14.09 14.734 15.049 15.1 14.99 14.749 14.494 14.262 13.999 13.782 13.601 13.467 13.36 13.248 13.123 12.991 12.869 12.738 12.609 12.494 12.371 12.239 12.122 11.998 11.881 11.783 11.678 11.576 11.463 11.344 11.27 11.191 11.053 10.96 10.869 10.823 10.729 10.613 10.485 10.418 10.153 10.195 10.108 10.022 9.837 9.731 9.608 9.453 9.282 9.109 8.855 8.382 -10 ,15714 ,TETRA ,17600664,Sun Nov 28 12:35:38 CET,Sun Nov 28 14:32:47 CET,0.0 0.496 0.767 0.968 1.156 1.323 1.463 1.597 1.858 1.981 2.1 2.148 2.47 2.586 2.814 3.023 3.225 3.326 3.534 3.725 3.95 4.099 4.25 4.457 4.646 4.824 4.992 5.154 5.371 5.577 5.768 5.995 6.217 6.435 6.694 6.973 7.242 7.545 7.852 8.173 8.509 8.88 9.344 9.86 10.454 11.102 11.816 12.564 13.391 14.289 15.216 15.827 16.034 16.023 15.909 15.7 15.46 15.22 14.998 14.777 14.565 14.361 14.161 13.935 13.701 13.493 13.282 13.086 12.914 12.728 12.517 12.345 12.156 11.952 11.798 11.634 11.472 11.296 11.096 10.963 10.836 10.631 10.488 10.332 10.249 10.087 9.906 9.711 9.602 9.302 9.284 9.179 9.058 8.805 8.671 8.503 8.328 8.104 7.826 7.5 6.595 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_48_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_48_42.txt deleted file mode 100644 index 7492f59b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_48_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28142 ,TETRA ,17600665,Sun Nov 28 12:35:41 CET,Sun Nov 28 14:32:56 CET,0.0 0.964 1.297 1.505 1.656 1.809 1.963 2.104 2.378 2.512 2.644 2.686 2.982 3.075 3.242 3.413 3.592 3.677 3.832 3.987 4.223 4.377 4.519 4.725 4.921 5.12 5.316 5.495 5.718 5.936 6.144 6.383 6.605 6.831 7.114 7.432 7.734 8.062 8.412 8.782 9.174 9.597 10.08 10.564 11.126 11.769 12.506 13.313 14.207 15.188 16.287 17.083 17.463 17.612 17.617 17.585 17.493 17.321 17.133 16.948 16.804 16.65 16.484 16.333 16.176 16.019 15.856 15.711 15.58 15.424 15.248 15.107 14.963 14.809 14.686 14.564 14.446 14.316 14.158 14.05 13.95 13.798 13.684 13.556 13.49 13.353 13.198 13.028 12.942 12.664 12.643 12.544 12.44 12.2 12.066 11.9 11.715 11.538 11.333 11.024 10.364 -2 ,24816 ,TETRA ,17600666,Sun Nov 28 12:35:43 CET,Sun Nov 28 14:32:52 CET,0.0 1.409 1.77 1.985 2.213 2.425 2.609 2.78 3.081 3.215 3.339 3.371 3.662 3.762 3.936 4.116 4.301 4.387 4.544 4.698 4.927 5.062 5.189 5.379 5.563 5.745 5.924 6.095 6.325 6.55 6.759 6.997 7.227 7.453 7.708 7.997 8.274 8.572 8.916 9.288 9.671 10.108 10.626 11.123 11.678 12.3 13.002 13.823 14.76 15.757 16.937 17.782 18.155 18.314 18.347 18.292 18.183 18.046 17.903 17.735 17.57 17.411 17.242 17.082 16.925 16.77 16.595 16.432 16.298 16.156 16.006 15.867 15.714 15.55 15.419 15.285 15.148 15.009 14.86 14.748 14.635 14.464 14.345 14.208 14.136 13.996 13.833 13.64 13.531 13.231 13.178 13.064 12.95 12.685 12.511 12.322 12.133 11.907 11.65 11.312 10.479 -3 ,11669 ,TETRA ,17600667,Sun Nov 28 12:35:39 CET,Sun Nov 28 14:33:01 CET,0.0 0.898 1.193 1.396 1.579 1.755 1.94 2.12 2.435 2.563 2.689 2.743 3.059 3.166 3.373 3.57 3.75 3.834 4.006 4.178 4.41 4.554 4.695 4.901 5.109 5.3 5.472 5.641 5.862 6.077 6.277 6.535 6.793 7.029 7.293 7.605 7.911 8.237 8.587 8.963 9.36 9.798 10.318 10.844 11.43 12.065 12.819 13.646 14.584 15.657 16.874 17.678 17.969 18.067 18.061 17.987 17.864 17.707 17.552 17.382 17.231 17.086 16.912 16.721 16.521 16.329 16.116 15.926 15.767 15.585 15.377 15.217 15.057 14.871 14.722 14.57 14.408 14.236 14.073 13.969 13.864 13.709 13.598 13.474 13.41 13.263 13.108 12.956 12.869 12.595 12.586 12.497 12.392 12.144 12.001 11.849 11.676 11.475 11.231 10.93 9.842 -4 ,13016 ,TETRA ,17600668,Sun Nov 28 12:35:38 CET,Sun Nov 28 14:33:19 CET,0.0 1.027 1.371 1.615 1.8 1.989 2.152 2.3 2.589 2.723 2.842 2.898 3.201 3.311 3.531 3.713 3.879 3.962 4.129 4.292 4.527 4.686 4.833 5.041 5.235 5.412 5.591 5.779 6.019 6.242 6.456 6.708 6.961 7.208 7.475 7.766 8.048 8.359 8.707 9.08 9.458 9.863 10.337 10.825 11.388 12.001 12.682 13.46 14.369 15.417 16.597 17.39 17.761 17.94 17.965 17.894 17.776 17.64 17.507 17.344 17.199 17.054 16.887 16.711 16.531 16.379 16.216 16.06 15.923 15.776 15.622 15.488 15.34 15.176 15.048 14.915 14.771 14.622 14.473 14.366 14.239 14.028 13.892 13.756 13.686 13.544 13.398 13.234 13.135 12.843 12.836 12.737 12.631 12.376 12.228 12.064 11.881 11.689 11.493 11.211 10.228 -5 ,4624 ,TETRA ,17600669,Sun Nov 28 12:35:40 CET,Sun Nov 28 14:33:17 CET,0.0 0.548 0.86 1.127 1.369 1.585 1.766 1.933 2.269 2.427 2.571 2.619 2.924 3.026 3.23 3.436 3.621 3.715 3.907 4.082 4.333 4.498 4.648 4.853 5.054 5.247 5.418 5.58 5.793 6.009 6.236 6.52 6.792 7.047 7.327 7.639 7.94 8.261 8.614 8.987 9.371 9.802 10.31 10.817 11.397 12.044 12.774 13.595 14.527 15.513 16.609 17.372 17.716 17.876 17.904 17.871 17.797 17.689 17.569 17.422 17.268 17.103 16.935 16.772 16.62 16.464 16.281 16.11 15.963 15.814 15.657 15.523 15.384 15.245 15.128 14.997 14.859 14.711 14.561 14.46 14.355 14.181 14.048 13.915 13.85 13.704 13.543 13.382 13.295 13.017 12.99 12.865 12.74 12.469 12.32 12.158 11.977 11.767 11.504 11.164 10.232 -6 ,21957 ,TETRA ,17600670,Sun Nov 28 12:35:41 CET,Sun Nov 28 14:33:28 CET,0.0 1.631 1.995 2.224 2.418 2.609 2.779 2.929 3.218 3.353 3.489 3.562 3.873 3.985 4.194 4.399 4.58 4.666 4.839 5.004 5.235 5.372 5.505 5.708 5.91 6.112 6.315 6.515 6.753 6.963 7.163 7.402 7.637 7.862 8.116 8.406 8.689 8.998 9.343 9.719 10.11 10.547 11.07 11.603 12.222 12.887 13.611 14.402 15.298 16.336 17.505 18.356 18.736 18.814 18.77 18.68 18.566 18.426 18.291 18.14 17.974 17.814 17.647 17.476 17.313 17.156 16.992 16.857 16.73 16.573 16.417 16.274 16.117 15.963 15.832 15.681 15.522 15.356 15.177 15.053 14.929 14.739 14.608 14.463 14.383 14.237 14.077 13.883 13.786 13.505 13.489 13.38 13.255 12.997 12.863 12.698 12.517 12.321 12.041 11.646 10.601 -7 ,2145 ,TETRA ,17600671,Sun Nov 28 12:35:43 CET,Sun Nov 28 14:33:47 CET,0.0 0.873 1.175 1.433 1.669 1.881 2.049 2.187 2.437 2.553 2.666 2.689 2.982 3.09 3.295 3.475 3.645 3.731 3.896 4.064 4.315 4.464 4.603 4.798 4.983 5.169 5.355 5.545 5.783 6.012 6.238 6.508 6.762 6.999 7.262 7.569 7.881 8.207 8.54 8.892 9.268 9.714 10.231 10.733 11.36 12.043 12.788 13.622 14.54 15.572 16.766 17.627 17.995 18.151 18.191 18.15 18.082 17.979 17.85 17.677 17.49 17.294 17.095 16.9 16.706 16.518 16.325 16.169 16.032 15.879 15.725 15.595 15.453 15.307 15.187 15.052 14.904 14.758 14.606 14.494 14.384 14.209 14.082 13.947 13.879 13.739 13.568 13.373 13.277 12.994 12.961 12.843 12.72 12.467 12.317 12.162 11.997 11.81 11.592 11.267 10.2 -8 ,16477 ,TETRA ,17600672,Sun Nov 28 12:35:39 CET,Sun Nov 28 14:32:53 CET,0.0 1.094 1.385 1.602 1.806 2.006 2.175 2.318 2.588 2.72 2.848 2.921 3.237 3.341 3.536 3.711 3.866 3.941 4.084 4.219 4.423 4.572 4.727 4.93 5.114 5.3 5.485 5.665 5.887 6.095 6.307 6.572 6.819 7.064 7.356 7.675 7.969 8.292 8.645 9.008 9.382 9.821 10.326 10.819 11.384 12.005 12.722 13.509 14.427 15.501 16.7 17.473 17.774 17.9 17.926 17.886 17.809 17.694 17.574 17.419 17.245 17.072 16.914 16.775 16.625 16.467 16.308 16.165 16.032 15.873 15.706 15.574 15.43 15.268 15.14 15.008 14.873 14.736 14.581 14.475 14.366 14.183 14.056 13.917 13.836 13.673 13.514 13.348 13.248 12.962 12.927 12.809 12.69 12.456 12.317 12.144 11.953 11.738 11.474 11.127 10.194 -9 ,24744 ,TETRA ,17600673,Sun Nov 28 12:35:42 CET,Sun Nov 28 14:32:49 CET,0.0 0.578 0.829 1.052 1.259 1.434 1.59 1.732 1.977 2.087 2.189 2.218 2.523 2.623 2.833 3.029 3.209 3.3 3.468 3.624 3.843 3.992 4.138 4.341 4.537 4.726 4.898 5.054 5.259 5.461 5.654 5.89 6.127 6.365 6.644 6.951 7.249 7.574 7.913 8.269 8.64 9.063 9.565 10.065 10.656 11.304 12.025 12.835 13.755 14.825 16.001 16.85 17.224 17.335 17.34 17.304 17.217 17.101 16.955 16.741 16.542 16.354 16.135 15.906 15.696 15.509 15.314 15.141 14.989 14.827 14.639 14.476 14.322 14.162 14.026 13.884 13.742 13.599 13.444 13.338 13.233 13.058 12.938 12.814 12.744 12.59 12.428 12.222 12.116 11.841 11.825 11.72 11.595 11.323 11.169 10.992 10.81 10.597 10.362 10.039 9.092 -10 ,22621 ,TETRA ,17600674,Sun Nov 28 12:35:44 CET,Sun Nov 28 14:34:10 CET,0.0 0.683 1.005 1.247 1.422 1.585 1.75 1.912 2.201 2.32 2.423 2.452 2.755 2.851 3.034 3.22 3.391 3.47 3.623 3.778 3.999 4.135 4.275 4.483 4.683 4.881 5.068 5.241 5.466 5.681 5.896 6.166 6.411 6.646 6.92 7.228 7.517 7.823 8.161 8.525 8.89 9.298 9.77 10.255 10.833 11.454 12.196 13.045 13.973 15.031 16.233 17.101 17.481 17.637 17.665 17.646 17.613 17.495 17.363 17.222 17.091 16.95 16.791 16.65 16.514 16.378 16.225 16.073 15.937 15.805 15.666 15.544 15.413 15.269 15.158 15.042 14.907 14.766 14.624 14.525 14.417 14.248 14.117 13.97 13.899 13.751 13.6 13.436 13.352 13.089 13.09 12.989 12.872 12.62 12.479 12.32 12.127 11.921 11.69 11.401 10.591 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_49_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_49_50.txt deleted file mode 100644 index 4f436e85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_49_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7100 ,TETRA ,17600675,Sun Nov 28 12:35:40 CET,Sun Nov 28 14:33:44 CET,0.0 0.728 1.04 1.259 1.455 1.66 1.85 2.033 2.356 2.482 2.602 2.631 2.927 3.025 3.201 3.366 3.531 3.613 3.766 3.902 4.1 4.231 4.359 4.532 4.71 4.89 5.046 5.189 5.366 5.54 5.726 5.947 6.151 6.349 6.583 6.85 7.104 7.369 7.631 7.904 8.18 8.477 8.811 9.119 9.44 9.751 10.061 10.393 10.689 10.857 10.753 10.251 9.683 9.12 8.578 8.033 7.532 7.049 6.63 6.214 5.839 5.508 5.18 4.87 4.581 4.317 4.051 3.811 3.601 3.375 3.136 2.934 2.719 2.488 2.31 2.143 1.967 1.782 1.592 1.466 1.344 1.146 0.997 0.832 0.746 0.574 0.396 0.198 0.094 -0.221 -0.301 -0.44 -0.583 -0.862 -0.983 -1.104 -1.287 -1.499 -1.719 -1.986 -2.777 -2 ,31684 ,TETRA ,17600676,Sun Nov 28 12:36:05 CET,Sun Nov 28 14:33:40 CET,0.0 0.954 1.346 1.627 1.833 2.016 2.166 2.302 2.556 2.69 2.818 2.856 3.15 3.259 3.474 3.662 3.83 3.905 4.066 4.224 4.448 4.59 4.724 4.924 5.107 5.287 5.473 5.648 5.861 6.064 6.264 6.515 6.741 6.937 7.161 7.412 7.665 7.944 8.196 8.438 8.716 9.027 9.368 9.719 10.148 10.58 10.951 11.243 11.497 11.7 11.636 11.136 10.561 9.983 9.405 8.855 8.343 7.882 7.487 7.07 6.722 6.391 6.058 5.762 5.482 5.227 4.966 4.727 4.502 4.268 4.032 3.845 3.649 3.434 3.265 3.088 2.901 2.702 2.499 2.374 2.26 2.085 1.948 1.81 1.74 1.578 1.401 1.216 1.124 0.836 0.832 0.721 0.605 0.352 0.21 0.069 -0.08 -0.238 -0.398 -0.605 -1.039 -3 ,9834 ,TETRA ,17600677,Sun Nov 28 12:36:06 CET,Sun Nov 28 14:33:03 CET,0.0 0.694 0.979 1.19 1.366 1.545 1.71 1.848 2.091 2.201 2.31 2.336 2.625 2.723 2.897 3.058 3.23 3.32 3.479 3.618 3.817 3.955 4.085 4.28 4.485 4.673 4.84 4.996 5.184 5.358 5.53 5.746 5.961 6.161 6.375 6.597 6.804 7.024 7.261 7.519 7.789 8.093 8.424 8.734 9.055 9.38 9.75 10.102 10.377 10.53 10.478 10.005 9.355 8.705 8.131 7.613 7.128 6.67 6.268 5.852 5.489 5.173 4.878 4.579 4.272 3.988 3.709 3.466 3.252 3.027 2.788 2.596 2.39 2.17 2.011 1.842 1.667 1.486 1.296 1.165 1.026 0.822 0.672 0.509 0.429 0.266 0.101 -0.059 -0.141 -0.426 -0.441 -0.555 -0.681 -0.95 -1.095 -1.259 -1.418 -1.57 -1.758 -2.019 -2.653 -4 ,3267 ,TETRA ,17600678,Sun Nov 28 12:36:06 CET,Sun Nov 28 14:33:47 CET,0.0 0.764 1.067 1.292 1.477 1.633 1.772 1.903 2.14 2.249 2.383 2.449 2.73 2.834 3.028 3.2 3.382 3.466 3.616 3.761 3.982 4.125 4.261 4.466 4.671 4.865 5.04 5.196 5.389 5.585 5.785 6.023 6.236 6.435 6.664 6.917 7.178 7.449 7.732 8.034 8.331 8.628 8.956 9.291 9.635 9.972 10.31 10.642 10.949 11.154 11.109 10.68 10.115 9.522 8.948 8.405 7.931 7.499 7.112 6.715 6.331 5.961 5.617 5.311 5.046 4.792 4.497 4.224 4.012 3.81 3.594 3.401 3.187 2.972 2.81 2.643 2.468 2.274 2.074 1.938 1.795 1.586 1.447 1.291 1.207 1.032 0.862 0.685 0.585 0.297 0.291 0.184 0.068 -0.177 -0.314 -0.478 -0.646 -0.815 -0.997 -1.206 -1.54 -5 ,19030 ,TETRA ,17600679,Sun Nov 28 12:36:08 CET,Sun Nov 28 14:34:40 CET,0.0 0.449 0.776 1.027 1.223 1.406 1.573 1.716 1.97 2.082 2.195 2.235 2.517 2.613 2.818 3.007 3.184 3.269 3.43 3.584 3.812 3.961 4.097 4.291 4.481 4.68 4.88 5.068 5.283 5.477 5.672 5.913 6.146 6.373 6.63 6.895 7.139 7.387 7.655 7.956 8.25 8.559 8.91 9.247 9.592 9.923 10.272 10.596 10.921 11.206 11.191 10.7 10.097 9.529 8.976 8.429 7.934 7.467 7.051 6.635 6.279 5.928 5.582 5.27 4.969 4.692 4.402 4.151 3.944 3.728 3.504 3.322 3.124 2.898 2.726 2.558 2.381 2.193 2.0 1.871 1.734 1.518 1.37 1.224 1.151 0.995 0.823 0.617 0.514 0.227 0.194 0.072 -0.05 -0.292 -0.415 -0.553 -0.734 -0.951 -1.171 -1.404 -1.995 -6 ,23694 ,TETRA ,17600680,Sun Nov 28 12:36:06 CET,Sun Nov 28 14:36:59 CET,0.0 0.686 0.958 1.178 1.352 1.52 1.674 1.797 2.057 2.195 2.319 2.368 2.655 2.766 2.972 3.152 3.314 3.386 3.537 3.688 3.898 4.036 4.166 4.344 4.517 4.679 4.836 4.992 5.192 5.387 5.573 5.782 5.989 6.186 6.41 6.673 6.921 7.184 7.444 7.692 7.941 8.251 8.629 8.957 9.317 9.687 10.059 10.409 10.704 10.893 10.772 10.289 9.696 9.09 8.533 8.002 7.519 7.066 6.674 6.275 5.921 5.606 5.295 4.995 4.72 4.455 4.149 3.869 3.645 3.419 3.174 2.978 2.783 2.579 2.412 2.234 2.049 1.847 1.643 1.514 1.374 1.154 1.009 0.848 0.763 0.579 0.379 0.184 0.079 -0.221 -0.278 -0.404 -0.535 -0.81 -0.965 -1.14 -1.327 -1.549 -1.84 -2.199 -3.395 -7 ,5150 ,TETRA ,17600681,Sun Nov 28 12:36:06 CET,Sun Nov 28 14:33:02 CET,0.0 0.685 0.93 1.134 1.351 1.55 1.714 1.857 2.126 2.249 2.356 2.369 2.653 2.759 2.966 3.154 3.328 3.411 3.58 3.748 3.98 4.127 4.269 4.458 4.645 4.831 5.009 5.18 5.395 5.594 5.777 5.994 6.198 6.389 6.61 6.851 7.08 7.332 7.589 7.869 8.156 8.457 8.8 9.149 9.524 9.893 10.288 10.631 10.884 11.04 10.941 10.48 9.935 9.369 8.795 8.245 7.762 7.315 6.915 6.501 6.135 5.82 5.51 5.199 4.916 4.65 4.365 4.103 3.878 3.651 3.41 3.208 2.994 2.783 2.623 2.449 2.261 2.067 1.862 1.718 1.57 1.352 1.211 1.057 0.977 0.794 0.596 0.401 0.298 0.009 -0.017 -0.13 -0.243 -0.503 -0.641 -0.78 -0.938 -1.098 -1.272 -1.519 -2.024 -8 ,16086 ,TETRA ,17600682,Sun Nov 28 12:36:08 CET,Sun Nov 28 14:32:24 CET,0.0 1.733 2.171 2.487 2.713 2.918 3.102 3.267 3.567 3.714 3.854 3.915 4.207 4.303 4.485 4.654 4.825 4.906 5.051 5.187 5.394 5.518 5.636 5.803 5.95 6.096 6.249 6.392 6.568 6.738 6.903 7.118 7.317 7.496 7.721 7.968 8.191 8.477 8.802 9.101 9.385 9.678 10.012 10.341 10.691 11.023 11.313 11.602 11.897 12.092 12.055 11.639 11.051 10.452 9.892 9.344 8.818 8.304 7.857 7.416 7.028 6.684 6.359 6.035 5.734 5.468 5.2 4.968 4.76 4.543 4.324 4.13 3.923 3.706 3.534 3.361 3.183 3.011 2.83 2.693 2.553 2.342 2.196 2.05 1.975 1.823 1.669 1.494 1.401 1.114 1.05 0.917 0.779 0.481 0.321 0.152 -0.019 -0.212 -0.388 -0.594 -1.097 -9 ,4424 ,TETRA ,17600683,Sun Nov 28 12:36:10 CET,Sun Nov 28 14:33:02 CET,0.0 0.627 0.914 1.142 1.357 1.525 1.675 1.815 2.044 2.158 2.269 2.286 2.57 2.662 2.841 3.031 3.2 3.268 3.404 3.541 3.752 3.901 4.036 4.212 4.38 4.547 4.701 4.849 5.045 5.23 5.403 5.615 5.817 5.998 6.212 6.469 6.709 6.949 7.201 7.459 7.728 8.031 8.374 8.699 9.047 9.417 9.799 10.116 10.428 10.687 10.608 10.105 9.467 8.87 8.302 7.732 7.227 6.77 6.38 5.99 5.634 5.3 4.987 4.678 4.385 4.132 3.866 3.611 3.385 3.15 2.907 2.698 2.479 2.258 2.092 1.926 1.75 1.571 1.382 1.253 1.112 0.896 0.746 0.592 0.512 0.333 0.142 -0.049 -0.143 -0.445 -0.473 -0.574 -0.687 -0.927 -1.063 -1.225 -1.402 -1.585 -1.788 -2.043 -2.702 -10 ,6876 ,TETRA ,17600684,Sun Nov 28 12:36:12 CET,Sun Nov 28 14:32:48 CET,0.0 0.441 0.683 0.851 1.0 1.159 1.309 1.452 1.72 1.844 1.956 1.983 2.272 2.365 2.533 2.685 2.847 2.928 3.089 3.24 3.442 3.57 3.691 3.872 4.043 4.202 4.359 4.526 4.759 4.968 5.155 5.396 5.621 5.826 6.053 6.289 6.513 6.747 6.996 7.276 7.574 7.865 8.183 8.512 8.883 9.275 9.669 10.014 10.257 10.337 10.176 9.672 9.059 8.466 7.929 7.407 6.932 6.498 6.091 5.654 5.273 4.932 4.615 4.302 3.995 3.727 3.448 3.193 2.964 2.726 2.495 2.292 2.078 1.875 1.715 1.554 1.387 1.204 1.01 0.88 0.749 0.543 0.4 0.239 0.15 -0.023 -0.195 -0.394 -0.5 -0.789 -0.818 -0.928 -1.041 -1.28 -1.413 -1.545 -1.685 -1.861 -2.07 -2.328 -2.943 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_51_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_51_54.txt deleted file mode 100644 index 6a22f14a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_51_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22859 ,TETRA ,17600685,Sun Nov 28 12:36:05 CET,Sun Nov 28 14:35:34 CET,0.0 1.363 1.794 2.091 2.31 2.508 2.674 2.838 3.146 3.287 3.425 3.493 3.778 3.888 4.073 4.252 4.441 4.527 4.682 4.824 5.024 5.158 5.294 5.485 5.664 5.842 6.003 6.135 6.3 6.458 6.598 6.761 6.919 7.077 7.249 7.422 7.601 7.798 7.996 8.195 8.372 8.545 8.709 8.841 8.974 9.114 9.216 9.274 9.236 8.915 8.048 6.772 5.593 4.454 3.373 2.348 1.447 0.692 0.071 -0.583 -1.168 -1.697 -2.2 -2.647 -3.048 -3.427 -3.83 -4.18 -4.466 -4.756 -5.072 -5.35 -5.643 -5.956 -6.212 -6.472 -6.744 -7.016 -7.285 -7.463 -7.649 -7.95 -8.141 -8.333 -8.436 -8.664 -8.91 -9.158 -9.295 -9.626 -9.761 -9.916 -10.068 -10.438 -10.632 -10.813 -11.008 -11.239 -11.556 -12.029 -13.238 -2 ,29152 ,TETRA ,17600686,Sun Nov 28 12:36:06 CET,Sun Nov 28 14:37:38 CET,0.0 1.853 2.317 2.611 2.836 3.043 3.238 3.405 3.682 3.818 3.944 3.992 4.275 4.387 4.581 4.772 4.952 5.035 5.199 5.345 5.523 5.63 5.73 5.87 6.015 6.163 6.311 6.468 6.661 6.828 6.992 7.177 7.334 7.478 7.649 7.832 7.99 8.161 8.353 8.53 8.702 8.875 9.065 9.262 9.427 9.572 9.684 9.691 9.559 9.142 8.159 6.785 5.458 4.236 3.167 2.226 1.418 0.673 0.021 -0.633 -1.207 -1.715 -2.184 -2.659 -3.112 -3.523 -3.954 -4.331 -4.658 -5.017 -5.397 -5.693 -5.984 -6.285 -6.525 -6.776 -7.037 -7.294 -7.554 -7.738 -7.925 -8.225 -8.439 -8.641 -8.743 -8.993 -9.256 -9.516 -9.662 -10.013 -10.124 -10.284 -10.458 -10.831 -11.042 -11.263 -11.504 -11.777 -12.086 -12.465 -14.338 -3 ,11089 ,TETRA ,17600687,Sun Nov 28 12:36:06 CET,Sun Nov 28 14:37:01 CET,0.0 1.962 2.453 2.741 2.97 3.157 3.327 3.519 3.873 4.031 4.155 4.18 4.47 4.584 4.798 4.968 5.115 5.187 5.334 5.468 5.657 5.792 5.934 6.136 6.308 6.464 6.616 6.762 6.958 7.146 7.305 7.476 7.642 7.814 8.01 8.229 8.455 8.667 8.85 9.039 9.227 9.426 9.672 9.877 10.052 10.184 10.266 10.272 10.138 9.814 8.988 7.694 6.44 5.279 4.284 3.393 2.585 1.818 1.168 0.531 -0.033 -0.558 -1.069 -1.548 -1.993 -2.397 -2.807 -3.178 -3.507 -3.847 -4.196 -4.473 -4.771 -5.086 -5.324 -5.565 -5.813 -6.076 -6.339 -6.523 -6.718 -7.024 -7.235 -7.465 -7.589 -7.833 -8.082 -8.339 -8.474 -8.801 -8.931 -9.11 -9.297 -9.651 -9.833 -10.055 -10.289 -10.511 -10.792 -11.148 -12.268 -4 ,5758 ,TETRA ,17600688,Sun Nov 28 12:36:07 CET,Sun Nov 28 14:34:59 CET,0.0 1.482 1.823 2.078 2.298 2.492 2.678 2.866 3.185 3.317 3.458 3.524 3.804 3.917 4.13 4.32 4.472 4.547 4.698 4.846 5.056 5.167 5.261 5.405 5.565 5.729 5.885 6.034 6.238 6.428 6.577 6.749 6.926 7.094 7.273 7.479 7.695 7.92 8.121 8.313 8.498 8.696 8.949 9.183 9.399 9.559 9.644 9.653 9.552 9.183 8.258 6.88 5.605 4.452 3.464 2.572 1.761 1.019 0.369 -0.275 -0.826 -1.31 -1.783 -2.257 -2.7 -3.092 -3.503 -3.881 -4.22 -4.55 -4.886 -5.171 -5.469 -5.783 -6.024 -6.276 -6.538 -6.822 -7.117 -7.324 -7.538 -7.858 -8.072 -8.302 -8.425 -8.69 -8.964 -9.247 -9.394 -9.731 -9.863 -10.027 -10.2 -10.58 -10.789 -11.013 -11.246 -11.531 -11.915 -12.383 -14.129 -5 ,7501 ,TETRA ,17600689,Sun Nov 28 12:36:09 CET,Sun Nov 28 14:34:58 CET,0.0 1.56 1.984 2.268 2.486 2.668 2.82 2.969 3.24 3.372 3.498 3.515 3.78 3.879 4.077 4.266 4.435 4.512 4.654 4.797 5.003 5.134 5.247 5.41 5.565 5.7 5.838 5.986 6.163 6.328 6.495 6.676 6.83 6.985 7.167 7.364 7.555 7.764 7.992 8.231 8.453 8.648 8.816 8.95 9.078 9.168 9.217 9.186 8.994 8.526 7.549 6.132 4.827 3.583 2.456 1.485 0.676 -0.038 -0.692 -1.379 -1.978 -2.517 -3.025 -3.494 -3.929 -4.337 -4.784 -5.184 -5.53 -5.879 -6.218 -6.492 -6.781 -7.098 -7.355 -7.608 -7.871 -8.142 -8.414 -8.605 -8.791 -9.089 -9.295 -9.502 -9.612 -9.839 -10.079 -10.339 -10.472 -10.798 -10.922 -11.082 -11.255 -11.635 -11.836 -12.042 -12.27 -12.533 -12.826 -13.213 -14.155 -6 ,17517 ,TETRA ,17600690,Sun Nov 28 12:36:12 CET,Sun Nov 28 14:35:03 CET,0.0 1.623 2.052 2.399 2.667 2.892 3.103 3.281 3.583 3.716 3.842 3.892 4.175 4.28 4.489 4.679 4.836 4.915 5.078 5.232 5.439 5.578 5.717 5.903 6.074 6.242 6.403 6.542 6.714 6.894 7.055 7.224 7.391 7.545 7.709 7.906 8.089 8.26 8.446 8.64 8.812 8.984 9.192 9.402 9.613 9.802 9.9 9.901 9.771 9.378 8.509 7.181 5.881 4.694 3.678 2.737 1.905 1.196 0.572 -0.125 -0.719 -1.213 -1.711 -2.221 -2.707 -3.15 -3.601 -3.984 -4.315 -4.661 -5.022 -5.303 -5.612 -5.946 -6.194 -6.452 -6.703 -6.962 -7.238 -7.419 -7.602 -7.894 -8.101 -8.323 -8.438 -8.681 -8.932 -9.203 -9.342 -9.67 -9.799 -9.969 -10.153 -10.526 -10.735 -10.976 -11.197 -11.422 -11.732 -12.181 -13.571 -7 ,13901 ,TETRA ,17600691,Sun Nov 28 12:36:10 CET,Sun Nov 28 14:34:56 CET,0.0 3.195 3.594 3.859 4.058 4.245 4.44 4.605 4.875 5.021 5.151 5.19 5.456 5.542 5.723 5.898 6.065 6.143 6.277 6.41 6.606 6.73 6.85 7.022 7.174 7.318 7.471 7.616 7.782 7.929 8.049 8.183 8.331 8.466 8.614 8.768 8.913 9.089 9.266 9.446 9.637 9.828 10.034 10.227 10.399 10.526 10.626 10.633 10.445 9.965 8.972 7.582 6.335 5.152 4.082 3.163 2.379 1.635 0.95 0.259 -0.314 -0.855 -1.383 -1.854 -2.29 -2.668 -3.048 -3.407 -3.745 -4.098 -4.454 -4.743 -5.032 -5.342 -5.591 -5.839 -6.084 -6.341 -6.622 -6.82 -7.031 -7.35 -7.547 -7.751 -7.867 -8.116 -8.396 -8.7 -8.845 -9.177 -9.32 -9.503 -9.687 -10.069 -10.269 -10.485 -10.731 -10.976 -11.271 -11.708 -14.464 -8 ,3504 ,TETRA ,17600692,Sun Nov 28 12:36:06 CET,Sun Nov 28 14:38:07 CET,0.0 1.329 1.696 1.984 2.232 2.461 2.652 2.814 3.092 3.209 3.326 3.38 3.663 3.765 3.952 4.148 4.326 4.406 4.558 4.702 4.901 5.033 5.159 5.337 5.519 5.684 5.848 6.01 6.201 6.367 6.522 6.707 6.862 6.989 7.128 7.279 7.437 7.627 7.824 8.008 8.175 8.333 8.478 8.607 8.742 8.843 8.928 8.949 8.792 8.391 7.43 6.106 4.829 3.655 2.678 1.778 0.982 0.279 -0.305 -0.905 -1.461 -1.972 -2.46 -2.911 -3.332 -3.712 -4.112 -4.478 -4.78 -5.099 -5.463 -5.765 -6.077 -6.404 -6.646 -6.892 -7.157 -7.432 -7.717 -7.907 -8.098 -8.4 -8.623 -8.866 -8.991 -9.237 -9.493 -9.754 -9.886 -10.211 -10.328 -10.483 -10.651 -11.018 -11.223 -11.466 -11.732 -12.019 -12.349 -12.808 -14.211 -9 ,28156 ,TETRA ,17600693,Sun Nov 28 12:36:08 CET,Sun Nov 28 14:37:58 CET,0.0 2.214 2.761 3.075 3.309 3.49 3.662 3.842 4.135 4.258 4.389 4.476 4.766 4.875 5.068 5.247 5.423 5.504 5.659 5.819 6.039 6.162 6.283 6.461 6.628 6.793 6.945 7.088 7.257 7.413 7.565 7.758 7.952 8.119 8.301 8.511 8.728 8.968 9.184 9.366 9.537 9.717 9.906 10.079 10.241 10.336 10.352 10.311 10.161 9.756 8.845 7.5 6.199 5.084 4.14 3.223 2.396 1.656 1.009 0.354 -0.197 -0.669 -1.135 -1.603 -2.037 -2.424 -2.835 -3.205 -3.534 -3.886 -4.249 -4.56 -4.884 -5.209 -5.457 -5.703 -5.953 -6.206 -6.471 -6.664 -6.876 -7.194 -7.392 -7.599 -7.707 -7.934 -8.169 -8.432 -8.574 -8.897 -8.985 -9.124 -9.263 -9.616 -9.825 -10.028 -10.275 -10.575 -10.922 -11.317 -12.579 -10 ,28994 ,TETRA ,17600694,Sun Nov 28 12:36:08 CET,Sun Nov 28 14:37:06 CET,0.0 1.521 1.956 2.256 2.523 2.743 2.922 3.077 3.368 3.504 3.625 3.676 3.956 4.068 4.261 4.425 4.592 4.682 4.856 4.998 5.212 5.348 5.473 5.655 5.821 5.969 6.101 6.251 6.463 6.643 6.807 7.012 7.204 7.378 7.585 7.805 8.001 8.216 8.446 8.653 8.87 9.133 9.372 9.581 9.786 9.963 10.089 10.067 9.902 9.477 8.478 7.091 5.855 4.719 3.734 2.816 1.964 1.204 0.537 -0.177 -0.792 -1.314 -1.827 -2.309 -2.771 -3.2 -3.641 -4.047 -4.373 -4.692 -5.044 -5.336 -5.64 -5.954 -6.18 -6.422 -6.679 -6.95 -7.233 -7.436 -7.648 -7.964 -8.18 -8.397 -8.514 -8.769 -9.042 -9.327 -9.472 -9.8 -9.93 -10.107 -10.295 -10.704 -10.94 -11.179 -11.425 -11.669 -11.96 -12.4 -13.577 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_52_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_52_53.txt deleted file mode 100644 index e8c23eec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_52_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27978 ,TETRA ,17600695,Sun Nov 28 12:36:07 CET,Sun Nov 28 14:35:24 CET,0.0 0.73 1.077 1.361 1.576 1.741 1.861 1.974 2.21 2.316 2.42 2.441 2.726 2.809 2.967 3.142 3.328 3.411 3.548 3.683 3.895 4.029 4.166 4.361 4.539 4.72 4.895 5.055 5.251 5.441 5.615 5.823 6.02 6.195 6.38 6.593 6.824 7.064 7.307 7.561 7.82 8.1 8.417 8.721 9.048 9.385 9.705 9.968 10.143 10.232 10.014 9.418 8.821 8.196 7.566 6.978 6.435 5.927 5.476 4.998 4.564 4.178 3.816 3.484 3.162 2.86 2.562 2.278 2.011 1.738 1.447 1.206 0.958 0.681 0.472 0.271 0.051 -0.168 -0.376 -0.528 -0.7 -0.958 -1.143 -1.36 -1.468 -1.689 -1.938 -2.209 -2.344 -2.68 -2.784 -2.946 -3.126 -3.542 -3.755 -3.976 -4.214 -4.489 -4.825 -5.292 -6.632 -2 ,26240 ,TETRA ,17600696,Sun Nov 28 12:36:09 CET,Sun Nov 28 14:35:57 CET,0.0 1.248 1.564 1.788 1.982 2.145 2.313 2.451 2.682 2.799 2.916 2.945 3.236 3.332 3.504 3.657 3.814 3.889 4.042 4.185 4.397 4.538 4.66 4.825 4.998 5.165 5.316 5.469 5.65 5.805 5.96 6.159 6.351 6.521 6.727 6.949 7.137 7.354 7.601 7.861 8.108 8.366 8.65 8.926 9.239 9.548 9.817 10.088 10.336 10.377 9.974 9.122 8.276 7.531 6.99 6.544 6.11 5.698 5.331 4.915 4.527 4.2 3.892 3.59 3.308 3.06 2.798 2.55 2.337 2.112 1.859 1.653 1.447 1.223 1.05 0.874 0.683 0.487 0.286 0.139 -0.007 -0.232 -0.395 -0.564 -0.65 -0.822 -0.993 -1.166 -1.26 -1.569 -1.611 -1.718 -1.83 -2.092 -2.24 -2.39 -2.537 -2.697 -2.914 -3.232 -3.898 -3 ,6035 ,TETRA ,17600697,Sun Nov 28 12:36:08 CET,Sun Nov 28 14:36:14 CET,0.0 1.44 1.857 2.21 2.485 2.697 2.906 3.108 3.456 3.626 3.787 3.842 4.136 4.247 4.465 4.673 4.871 4.959 5.115 5.261 5.465 5.592 5.712 5.886 6.054 6.224 6.405 6.575 6.77 6.949 7.125 7.337 7.535 7.734 7.988 8.224 8.406 8.617 8.85 9.118 9.42 9.75 10.07 10.335 10.627 10.923 11.22 11.492 11.675 11.722 11.519 10.939 10.254 9.568 8.937 8.335 7.781 7.247 6.79 6.347 5.957 5.58 5.188 4.823 4.479 4.163 3.847 3.566 3.32 3.054 2.782 2.559 2.324 2.077 1.882 1.684 1.466 1.222 0.973 0.81 0.645 0.369 0.17 -0.029 -0.142 -0.372 -0.62 -0.915 -1.059 -1.385 -1.479 -1.648 -1.822 -2.197 -2.39 -2.591 -2.836 -3.128 -3.493 -3.929 -5.352 -4 ,21704 ,TETRA ,17600698,Sun Nov 28 12:36:10 CET,Sun Nov 28 14:36:46 CET,0.0 1.213 1.615 1.908 2.128 2.32 2.495 2.638 2.892 3.019 3.14 3.161 3.461 3.554 3.742 3.891 4.02 4.091 4.232 4.37 4.566 4.683 4.801 4.975 5.132 5.291 5.458 5.618 5.81 5.996 6.171 6.378 6.563 6.74 6.949 7.165 7.373 7.594 7.832 8.065 8.282 8.518 8.777 9.045 9.324 9.612 9.921 10.205 10.479 10.654 10.46 9.811 9.157 8.542 7.944 7.332 6.767 6.24 5.763 5.287 4.883 4.507 4.126 3.765 3.42 3.109 2.787 2.487 2.215 1.939 1.663 1.424 1.159 0.882 0.679 0.484 0.276 0.042 -0.208 -0.386 -0.563 -0.826 -1.016 -1.221 -1.324 -1.538 -1.787 -2.051 -2.189 -2.532 -2.65 -2.817 -2.986 -3.367 -3.565 -3.784 -4.038 -4.326 -4.683 -5.179 -6.8 -5 ,23439 ,TETRA ,17600699,Sun Nov 28 12:36:07 CET,Sun Nov 28 14:35:29 CET,0.0 0.992 1.318 1.601 1.842 2.035 2.189 2.358 2.683 2.823 2.952 3.015 3.326 3.435 3.63 3.808 3.973 4.061 4.245 4.414 4.642 4.771 4.887 5.061 5.231 5.408 5.579 5.74 5.944 6.125 6.298 6.521 6.74 6.938 7.146 7.366 7.577 7.812 8.055 8.294 8.545 8.816 9.096 9.374 9.708 10.015 10.323 10.612 10.764 10.812 10.718 10.255 9.639 8.963 8.324 7.721 7.152 6.589 6.089 5.585 5.135 4.742 4.362 3.979 3.627 3.318 2.991 2.692 2.44 2.188 1.906 1.66 1.427 1.19 0.997 0.787 0.573 0.35 0.101 -0.075 -0.255 -0.532 -0.733 -0.959 -1.068 -1.275 -1.501 -1.751 -1.886 -2.236 -2.327 -2.485 -2.656 -3.0 -3.193 -3.426 -3.696 -3.992 -4.328 -4.818 -7.056 -6 ,28813 ,TETRA ,17600700,Sun Nov 28 12:36:07 CET,Sun Nov 28 14:35:57 CET,0.0 0.97 1.376 1.673 1.897 2.093 2.299 2.489 2.804 2.94 3.064 3.11 3.415 3.518 3.72 3.913 4.102 4.193 4.371 4.527 4.752 4.906 5.048 5.233 5.402 5.56 5.711 5.861 6.045 6.22 6.388 6.582 6.774 6.968 7.182 7.398 7.6 7.816 8.055 8.309 8.578 8.866 9.16 9.433 9.717 9.983 10.245 10.493 10.646 10.637 10.341 9.626 8.895 8.211 7.561 6.952 6.393 5.86 5.388 4.904 4.483 4.1 3.718 3.353 3.007 2.691 2.361 2.052 1.779 1.5 1.218 0.969 0.668 0.338 0.108 -0.114 -0.346 -0.585 -0.837 -1.005 -1.179 -1.471 -1.688 -1.911 -2.022 -2.263 -2.509 -2.767 -2.909 -3.272 -3.472 -3.676 -3.894 -4.385 -4.638 -4.894 -5.174 -5.501 -5.9 -6.36 -7.694 -7 ,16775 ,TETRA ,17600701,Sun Nov 28 12:36:09 CET,Sun Nov 28 14:36:07 CET,0.0 1.184 1.487 1.73 1.947 2.142 2.314 2.486 2.776 2.894 3.013 3.057 3.354 3.445 3.634 3.816 3.997 4.087 4.24 4.393 4.618 4.737 4.853 5.05 5.24 5.411 5.562 5.71 5.899 6.066 6.235 6.449 6.645 6.823 7.031 7.27 7.495 7.734 7.997 8.262 8.53 8.82 9.127 9.39 9.675 9.983 10.308 10.624 10.868 10.912 10.557 9.831 9.134 8.57 8.009 7.42 6.911 6.443 6.064 5.682 5.33 5.012 4.711 4.435 4.179 3.943 3.709 3.51 3.329 3.125 2.905 2.726 2.545 2.366 2.217 2.057 1.888 1.712 1.539 1.418 1.29 1.088 0.935 0.779 0.703 0.541 0.369 0.177 0.082 -0.204 -0.208 -0.319 -0.437 -0.674 -0.793 -0.918 -1.086 -1.291 -1.544 -1.942 -3.445 -8 ,25001 ,TETRA ,17600702,Sun Nov 28 12:36:09 CET,Sun Nov 28 14:36:01 CET,0.0 1.231 1.679 1.932 2.124 2.308 2.496 2.672 3.002 3.157 3.288 3.334 3.641 3.736 3.906 4.054 4.185 4.257 4.411 4.556 4.751 4.867 4.987 5.162 5.324 5.476 5.629 5.779 5.971 6.139 6.292 6.485 6.679 6.871 7.104 7.38 7.628 7.896 8.17 8.45 8.741 9.039 9.334 9.617 9.928 10.227 10.577 10.888 11.081 11.177 10.96 10.33 9.589 8.842 8.195 7.569 7.011 6.523 6.072 5.584 5.154 4.763 4.389 4.038 3.712 3.42 3.11 2.821 2.562 2.302 2.045 1.829 1.604 1.374 1.177 0.957 0.725 0.474 0.218 0.044 -0.134 -0.423 -0.631 -0.847 -0.963 -1.2 -1.435 -1.694 -1.823 -2.141 -2.221 -2.372 -2.541 -2.912 -3.148 -3.42 -3.683 -4.006 -4.409 -4.938 -6.333 -9 ,6174 ,TETRA ,17600703,Sun Nov 28 12:36:11 CET,Sun Nov 28 14:36:00 CET,0.0 1.322 1.727 2.019 2.264 2.452 2.634 2.787 3.053 3.171 3.276 3.307 3.618 3.716 3.895 4.083 4.262 4.342 4.493 4.636 4.853 4.994 5.128 5.313 5.487 5.652 5.812 5.976 6.182 6.374 6.544 6.744 6.952 7.151 7.38 7.623 7.841 8.076 8.325 8.604 8.905 9.204 9.539 9.877 10.233 10.573 10.901 11.223 11.479 11.64 11.655 11.306 10.798 10.287 9.794 9.301 8.853 8.445 8.081 7.715 7.407 7.138 6.871 6.605 6.355 6.113 5.83 5.564 5.332 5.101 4.855 4.644 4.433 4.219 4.052 3.877 3.693 3.492 3.289 3.149 3.008 2.798 2.643 2.475 2.385 2.19 1.993 1.788 1.674 1.357 1.306 1.183 1.058 0.764 0.591 0.378 0.153 -0.088 -0.387 -0.764 -1.94 -10 ,19867 ,TETRA ,17600704,Sun Nov 28 12:36:08 CET,Sun Nov 28 14:35:53 CET,0.0 0.976 1.275 1.492 1.687 1.853 2.03 2.215 2.496 2.594 2.694 2.714 3.015 3.106 3.268 3.431 3.58 3.659 3.816 3.951 4.155 4.291 4.415 4.583 4.755 4.927 5.078 5.216 5.388 5.549 5.707 5.892 6.069 6.233 6.419 6.627 6.831 7.062 7.293 7.529 7.789 8.073 8.377 8.679 9.02 9.365 9.69 9.95 10.154 10.239 9.985 9.331 8.572 7.839 7.182 6.545 5.984 5.488 5.041 4.591 4.204 3.836 3.477 3.133 2.804 2.505 2.177 1.88 1.626 1.344 1.059 0.836 0.592 0.329 0.126 -0.08 -0.289 -0.507 -0.738 -0.896 -1.064 -1.347 -1.555 -1.767 -1.871 -2.104 -2.362 -2.622 -2.755 -3.098 -3.203 -3.366 -3.529 -3.892 -4.101 -4.321 -4.569 -4.873 -5.231 -5.736 -7.494 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_53_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_53_54.txt deleted file mode 100644 index 00991c59..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_53_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17611 ,TETRA ,17600705,Sun Nov 28 12:36:11 CET,Sun Nov 28 14:36:28 CET,0.0 0.625 0.986 1.233 1.438 1.61 1.755 1.899 2.154 2.262 2.37 2.376 2.675 2.78 2.97 3.143 3.307 3.384 3.541 3.689 3.901 4.05 4.195 4.384 4.571 4.764 4.952 5.136 5.374 5.612 5.846 6.118 6.37 6.607 6.897 7.23 7.535 7.869 8.224 8.584 8.962 9.408 9.947 10.482 11.092 11.761 12.526 13.42 14.472 15.67 17.031 18.09 18.623 18.803 18.824 18.81 18.748 18.627 18.466 18.292 18.134 17.965 17.782 17.616 17.469 17.325 17.178 17.044 16.92 16.771 16.607 16.473 16.315 16.162 16.046 15.91 15.774 15.635 15.479 15.374 15.271 15.09 14.954 14.811 14.741 14.616 14.494 14.356 14.263 13.973 13.971 13.873 13.763 13.499 13.361 13.2 13.022 12.826 12.595 12.294 10.868 -2 ,26250 ,TETRA ,17600706,Sun Nov 28 12:36:13 CET,Sun Nov 28 14:35:57 CET,0.0 1.36 1.652 1.876 2.046 2.211 2.363 2.513 2.767 2.877 2.984 2.985 3.29 3.39 3.575 3.753 3.921 4.002 4.157 4.307 4.526 4.667 4.802 4.993 5.178 5.365 5.569 5.762 5.992 6.205 6.4 6.645 6.884 7.116 7.379 7.682 7.993 8.333 8.701 9.101 9.515 9.967 10.478 11.028 11.701 12.401 13.174 14.035 15.056 16.247 17.576 18.552 18.982 19.186 19.242 19.184 19.079 18.937 18.768 18.565 18.388 18.22 18.043 17.876 17.71 17.554 17.4 17.258 17.108 16.941 16.783 16.657 16.524 16.382 16.27 16.152 16.02 15.862 15.696 15.574 15.438 15.229 15.087 14.953 14.887 14.766 14.642 14.499 14.421 14.141 14.121 14.013 13.903 13.664 13.526 13.381 13.204 12.986 12.711 12.394 11.6 -3 ,23488 ,TETRA ,17600707,Sun Nov 28 12:36:09 CET,Sun Nov 28 14:35:43 CET,0.0 0.783 1.093 1.318 1.499 1.695 1.884 2.024 2.253 2.361 2.47 2.49 2.778 2.866 3.043 3.213 3.369 3.445 3.584 3.72 3.941 4.096 4.243 4.451 4.648 4.831 4.998 5.165 5.391 5.615 5.834 6.091 6.333 6.561 6.833 7.149 7.45 7.793 8.164 8.524 8.904 9.358 9.871 10.351 10.931 11.601 12.348 13.176 14.136 15.233 16.413 17.236 17.597 17.732 17.777 17.741 17.672 17.567 17.43 17.277 17.127 16.971 16.804 16.642 16.483 16.309 16.113 15.942 15.786 15.618 15.431 15.281 15.117 14.927 14.798 14.678 14.547 14.405 14.239 14.117 14.001 13.827 13.699 13.566 13.5 13.354 13.202 13.039 12.946 12.655 12.662 12.562 12.445 12.148 12.002 11.847 11.652 11.452 11.205 10.854 10.144 -4 ,8214 ,TETRA ,17600708,Sun Nov 28 12:36:36 CET,Sun Nov 28 14:37:37 CET,0.0 1.027 1.284 1.472 1.666 1.849 1.999 2.146 2.39 2.486 2.589 2.621 2.916 3.006 3.201 3.389 3.556 3.64 3.803 3.948 4.162 4.3 4.44 4.645 4.838 5.025 5.205 5.389 5.621 5.84 6.061 6.316 6.559 6.809 7.098 7.411 7.707 8.022 8.363 8.738 9.144 9.594 10.092 10.607 11.236 11.954 12.75 13.571 14.502 15.597 16.854 17.762 18.179 18.353 18.434 18.414 18.331 18.242 18.097 17.876 17.702 17.547 17.375 17.198 17.027 16.877 16.721 16.586 16.472 16.348 16.216 16.087 15.939 15.801 15.701 15.585 15.452 15.313 15.172 15.075 14.98 14.824 14.692 14.553 14.484 14.332 14.181 14.023 13.937 13.66 13.672 13.563 13.447 13.203 13.061 12.901 12.731 12.556 12.334 12.025 11.239 -5 ,15829 ,TETRA ,17600709,Sun Nov 28 12:38:35 CET,Sun Nov 28 14:41:12 CET,0.0 0.756 1.037 1.234 1.391 1.565 1.716 1.84 2.093 2.205 2.314 2.326 2.628 2.729 2.926 3.1 3.267 3.354 3.532 3.692 3.904 4.052 4.208 4.414 4.592 4.778 4.957 5.132 5.367 5.594 5.808 6.072 6.323 6.559 6.85 7.181 7.484 7.812 8.187 8.571 8.956 9.396 9.926 10.436 11.028 11.706 12.476 13.354 14.379 15.582 16.929 17.893 18.371 18.577 18.656 18.643 18.583 18.494 18.367 18.236 18.115 17.966 17.81 17.66 17.506 17.368 17.206 17.038 16.871 16.7 16.542 16.413 16.275 16.107 15.974 15.848 15.711 15.566 15.427 15.329 15.22 15.038 14.906 14.769 14.69 14.519 14.349 14.177 14.082 13.772 13.728 13.628 13.535 13.343 13.222 13.098 12.95 12.755 12.558 12.322 11.446 -6 ,19065 ,TETRA ,17600710,Sun Nov 28 12:38:35 CET,Sun Nov 28 14:43:35 CET,0.0 0.676 0.95 1.166 1.354 1.528 1.701 1.839 2.058 2.158 2.267 2.276 2.572 2.668 2.85 3.029 3.212 3.299 3.464 3.617 3.839 3.98 4.113 4.312 4.51 4.705 4.884 5.058 5.3 5.53 5.741 5.993 6.242 6.486 6.772 7.085 7.387 7.714 8.058 8.437 8.836 9.278 9.776 10.264 10.861 11.516 12.239 13.048 13.986 15.076 16.295 17.155 17.566 17.735 17.759 17.71 17.61 17.49 17.363 17.194 17.039 16.914 16.783 16.646 16.502 16.356 16.197 16.044 15.906 15.759 15.61 15.479 15.33 15.154 15.018 14.884 14.733 14.579 14.432 14.335 14.233 14.074 13.962 13.838 13.769 13.618 13.467 13.3 13.205 12.927 12.895 12.774 12.668 12.438 12.295 12.131 11.936 11.719 11.477 11.164 10.61 -7 ,29347 ,TETRA ,17600711,Sun Nov 28 12:37:34 CET,Sun Nov 28 14:37:28 CET,0.0 0.606 0.889 1.12 1.327 1.501 1.646 1.785 2.05 2.176 2.3 2.328 2.631 2.73 2.919 3.096 3.267 3.356 3.521 3.672 3.895 4.041 4.18 4.38 4.578 4.771 4.952 5.119 5.34 5.572 5.787 6.026 6.273 6.516 6.8 7.108 7.412 7.75 8.11 8.491 8.879 9.344 9.888 10.414 11.044 11.745 12.513 13.349 14.289 15.408 16.697 17.58 18.006 18.17 18.18 18.115 18.004 17.878 17.738 17.579 17.453 17.317 17.139 16.966 16.817 16.658 16.463 16.302 16.18 16.041 15.877 15.738 15.598 15.448 15.315 15.168 15.022 14.87 14.724 14.634 14.545 14.381 14.256 14.112 14.039 13.91 13.771 13.609 13.519 13.235 13.225 13.126 13.025 12.782 12.64 12.497 12.346 12.179 11.983 11.696 10.785 -8 ,16870 ,TETRA ,17600712,Sun Nov 28 12:37:36 CET,Sun Nov 28 14:37:21 CET,0.0 1.286 1.674 1.931 2.154 2.348 2.528 2.686 2.941 3.074 3.211 3.254 3.551 3.642 3.819 3.999 4.189 4.278 4.449 4.633 4.878 5.031 5.189 5.41 5.603 5.79 5.975 6.145 6.367 6.59 6.811 7.08 7.334 7.576 7.856 8.176 8.469 8.775 9.131 9.52 9.922 10.39 10.949 11.488 12.093 12.759 13.536 14.416 15.417 16.535 17.836 18.756 19.105 19.272 19.388 19.432 19.397 19.294 19.163 18.994 18.824 18.674 18.516 18.352 18.201 18.045 17.868 17.719 17.584 17.42 17.237 17.094 16.959 16.808 16.688 16.571 16.453 16.326 16.195 16.092 15.98 15.832 15.721 15.585 15.508 15.342 15.163 14.95 14.843 14.561 14.548 14.442 14.343 14.077 13.928 13.769 13.575 13.348 13.077 12.719 11.5 -9 ,4666 ,TETRA ,17600713,Sun Nov 28 12:37:37 CET,Sun Nov 28 14:37:09 CET,0.0 0.556 0.845 1.088 1.301 1.494 1.663 1.81 2.068 2.184 2.308 2.339 2.637 2.736 2.913 3.088 3.267 3.353 3.534 3.694 3.893 4.028 4.165 4.35 4.539 4.732 4.911 5.089 5.317 5.534 5.74 5.989 6.25 6.51 6.792 7.099 7.399 7.738 8.111 8.501 8.92 9.412 9.975 10.525 11.147 11.827 12.631 13.546 14.587 15.742 17.018 17.936 18.38 18.588 18.651 18.611 18.51 18.399 18.261 18.09 17.934 17.789 17.64 17.483 17.347 17.214 17.051 16.911 16.785 16.634 16.467 16.335 16.205 16.052 15.926 15.795 15.647 15.501 15.344 15.233 15.124 14.958 14.844 14.709 14.64 14.507 14.364 14.229 14.156 13.888 13.899 13.795 13.674 13.397 13.236 13.056 12.862 12.676 12.473 12.237 11.759 -10 ,21244 ,TETRA ,17600714,Sun Nov 28 12:37:40 CET,Sun Nov 28 14:37:20 CET,0.0 0.621 0.863 1.04 1.196 1.333 1.465 1.603 1.88 1.997 2.115 2.144 2.432 2.521 2.684 2.854 3.029 3.114 3.272 3.425 3.643 3.775 3.898 4.093 4.297 4.496 4.689 4.867 5.089 5.305 5.517 5.765 6.01 6.249 6.519 6.82 7.102 7.425 7.792 8.159 8.538 8.985 9.525 10.055 10.637 11.3 12.07 12.96 13.993 15.124 16.329 17.142 17.474 17.597 17.6 17.527 17.44 17.334 17.196 17.018 16.84 16.678 16.52 16.36 16.212 16.086 15.945 15.803 15.677 15.547 15.393 15.252 15.114 14.96 14.824 14.695 14.567 14.431 14.3 14.206 14.096 13.905 13.781 13.662 13.603 13.485 13.352 13.178 13.09 12.817 12.796 12.675 12.56 12.325 12.184 12.034 11.887 11.677 11.404 11.127 10.192 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_53_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_53_58.txt deleted file mode 100644 index 3bd3ce9d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_53_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16911 ,TETRA ,17600715,Sun Nov 28 12:37:42 CET,Sun Nov 28 14:37:23 CET,0.0 1.59 2.077 2.409 2.675 2.907 3.123 3.329 3.684 3.841 3.998 4.083 4.391 4.516 4.783 5.007 5.214 5.324 5.539 5.734 5.985 6.152 6.302 6.496 6.695 6.88 7.061 7.243 7.471 7.685 7.876 8.116 8.344 8.541 8.77 9.04 9.306 9.575 9.888 10.222 10.537 10.894 11.307 11.682 12.069 12.47 12.924 13.427 13.925 14.355 14.563 14.346 13.942 13.463 12.998 12.561 12.162 11.793 11.464 11.107 10.766 10.465 10.191 9.927 9.674 9.434 9.178 8.963 8.765 8.555 8.349 8.168 7.976 7.769 7.612 7.469 7.32 7.137 6.94 6.813 6.679 6.472 6.337 6.199 6.122 5.951 5.783 5.603 5.502 5.192 5.182 5.079 4.973 4.732 4.608 4.468 4.302 4.136 3.959 3.723 3.027 -2 ,23543 ,TETRA ,17600716,Sun Nov 28 12:38:37 CET,Sun Nov 28 14:44:44 CET,0.0 1.73 2.197 2.542 2.837 3.07 3.264 3.459 3.835 4.009 4.167 4.262 4.583 4.699 4.96 5.214 5.427 5.53 5.725 5.9 6.151 6.325 6.484 6.707 6.922 7.117 7.304 7.488 7.728 7.955 8.153 8.396 8.635 8.86 9.127 9.415 9.668 9.944 10.249 10.567 10.896 11.249 11.639 12.017 12.434 12.886 13.365 13.82 14.276 14.676 14.937 14.828 14.488 13.998 13.478 13.02 12.627 12.267 11.941 11.633 11.355 11.072 10.804 10.546 10.295 10.058 9.803 9.566 9.354 9.146 8.936 8.746 8.534 8.312 8.147 7.975 7.797 7.616 7.443 7.321 7.188 6.978 6.832 6.686 6.615 6.454 6.275 6.094 6.005 5.711 5.7 5.602 5.492 5.239 5.105 4.94 4.758 4.592 4.405 4.11 3.103 -3 ,31159 ,TETRA ,17600717,Sun Nov 28 12:38:36 CET,Sun Nov 28 14:39:22 CET,0.0 1.672 2.2 2.581 2.883 3.176 3.416 3.638 4.056 4.24 4.411 4.518 4.839 4.972 5.225 5.438 5.637 5.74 5.942 6.132 6.394 6.557 6.711 6.927 7.132 7.312 7.484 7.656 7.874 8.081 8.29 8.549 8.798 9.026 9.277 9.552 9.801 10.091 10.399 10.694 11.01 11.4 11.829 12.209 12.622 13.029 13.457 13.911 14.4 14.86 15.135 14.989 14.619 14.196 13.793 13.376 12.952 12.527 12.174 11.853 11.556 11.276 10.994 10.698 10.426 10.182 9.916 9.676 9.468 9.268 9.076 8.897 8.704 8.501 8.34 8.173 8.005 7.837 7.66 7.535 7.398 7.179 7.039 6.901 6.819 6.655 6.49 6.308 6.214 5.915 5.932 5.838 5.729 5.498 5.388 5.267 5.136 4.982 4.759 4.487 3.865 -4 ,18406 ,TETRA ,17600718,Sun Nov 28 12:38:38 CET,Sun Nov 28 14:39:42 CET,0.0 1.844 2.322 2.687 2.995 3.269 3.509 3.731 4.12 4.289 4.457 4.597 4.927 5.046 5.273 5.494 5.716 5.825 6.023 6.199 6.444 6.607 6.761 6.999 7.229 7.437 7.63 7.804 8.021 8.236 8.442 8.688 8.933 9.143 9.376 9.653 9.915 10.217 10.54 10.844 11.161 11.529 11.934 12.321 12.755 13.208 13.687 14.15 14.571 14.942 15.178 15.045 14.721 14.326 13.917 13.452 13.035 12.697 12.413 12.077 11.761 11.483 11.206 10.947 10.707 10.488 10.241 10.005 9.801 9.591 9.383 9.209 9.007 8.787 8.621 8.456 8.303 8.162 8.01 7.884 7.749 7.547 7.411 7.26 7.179 7.025 6.868 6.707 6.623 6.332 6.34 6.235 6.123 5.884 5.773 5.664 5.52 5.314 5.013 4.734 4.226 -5 ,20695 ,TETRA ,17600719,Sun Nov 28 12:38:39 CET,Sun Nov 28 14:39:05 CET,0.0 1.342 1.866 2.229 2.518 2.765 2.996 3.217 3.611 3.775 3.929 4.011 4.341 4.474 4.702 4.906 5.09 5.186 5.389 5.561 5.781 5.921 6.061 6.28 6.502 6.711 6.903 7.082 7.32 7.562 7.783 8.037 8.286 8.524 8.794 9.102 9.371 9.648 9.963 10.263 10.543 10.855 11.234 11.615 12.041 12.511 13.019 13.506 13.972 14.459 14.781 14.591 14.201 13.799 13.391 12.924 12.464 12.077 11.729 11.35 11.031 10.747 10.491 10.242 10.008 9.785 9.523 9.299 9.1 8.883 8.663 8.47 8.254 8.013 7.843 7.685 7.51 7.324 7.133 6.993 6.85 6.643 6.491 6.322 6.238 6.072 5.889 5.705 5.613 5.299 5.282 5.164 5.041 4.774 4.636 4.5 4.355 4.203 4.03 3.784 2.98 -6 ,1246 ,TETRA ,17600720,Sun Nov 28 12:38:42 CET,Sun Nov 28 14:39:20 CET,0.0 1.456 1.91 2.234 2.501 2.757 3.003 3.236 3.626 3.801 3.954 4.015 4.333 4.455 4.678 4.885 5.079 5.175 5.375 5.569 5.813 5.958 6.104 6.331 6.552 6.756 6.948 7.127 7.349 7.559 7.76 7.997 8.216 8.433 8.688 8.949 9.197 9.469 9.751 10.061 10.392 10.737 11.131 11.521 11.939 12.4 12.917 13.384 13.837 14.22 14.401 14.267 13.941 13.53 13.077 12.627 12.225 11.86 11.544 11.188 10.86 10.587 10.318 10.058 9.809 9.57 9.317 9.084 8.875 8.646 8.417 8.234 8.048 7.858 7.711 7.559 7.396 7.218 7.031 6.906 6.769 6.548 6.394 6.232 6.154 5.999 5.83 5.642 5.537 5.235 5.235 5.12 5.001 4.755 4.621 4.496 4.371 4.21 4.007 3.749 2.854 -7 ,26461 ,TETRA ,17600721,Sun Nov 28 12:38:36 CET,Sun Nov 28 14:37:47 CET,0.0 2.344 2.924 3.36 3.718 3.993 4.249 4.496 4.905 5.095 5.27 5.415 5.772 5.918 6.199 6.478 6.755 6.886 7.118 7.324 7.603 7.786 7.963 8.208 8.438 8.654 8.846 9.012 9.231 9.462 9.707 9.994 10.232 10.44 10.673 10.949 11.233 11.531 11.851 12.176 12.503 12.895 13.33 13.734 14.16 14.606 15.096 15.554 16.034 16.524 16.785 16.572 16.127 15.614 15.171 14.761 14.381 14.017 13.667 13.325 13.026 12.742 12.472 12.209 11.955 11.723 11.455 11.205 10.997 10.782 10.543 10.336 10.128 9.914 9.75 9.577 9.4 9.233 9.063 8.953 8.842 8.652 8.505 8.349 8.275 8.123 7.967 7.804 7.722 7.43 7.399 7.29 7.182 6.944 6.796 6.639 6.497 6.352 6.176 5.886 5.204 -8 ,27439 ,TETRA ,17600722,Sun Nov 28 12:38:38 CET,Sun Nov 28 14:38:22 CET,0.0 1.76 2.221 2.586 2.877 3.098 3.316 3.534 3.885 4.026 4.176 4.269 4.579 4.704 4.947 5.179 5.425 5.537 5.736 5.926 6.183 6.329 6.484 6.733 6.97 7.193 7.41 7.622 7.855 8.06 8.266 8.504 8.736 8.967 9.23 9.514 9.767 10.036 10.336 10.645 10.943 11.251 11.63 12.02 12.438 12.861 13.327 13.822 14.344 14.792 15.001 14.845 14.52 14.127 13.693 13.298 12.913 12.511 12.175 11.833 11.515 11.221 10.94 10.69 10.466 10.248 10.012 9.805 9.616 9.401 9.174 8.99 8.797 8.595 8.429 8.26 8.095 7.925 7.751 7.633 7.513 7.318 7.182 7.057 6.985 6.824 6.679 6.527 6.439 6.145 6.143 6.047 5.94 5.667 5.504 5.365 5.223 5.042 4.855 4.628 3.581 -9 ,3345 ,TETRA ,17600723,Sun Nov 28 12:38:41 CET,Sun Nov 28 14:38:00 CET,0.0 1.948 2.47 2.878 3.223 3.502 3.726 3.934 4.359 4.547 4.715 4.839 5.177 5.303 5.559 5.791 6.001 6.098 6.287 6.479 6.755 6.917 7.059 7.282 7.507 7.706 7.887 8.067 8.3 8.516 8.715 8.958 9.191 9.412 9.694 10.001 10.259 10.53 10.819 11.15 11.462 11.762 12.106 12.455 12.846 13.261 13.721 14.193 14.655 15.044 15.294 15.201 14.853 14.449 14.059 13.67 13.301 12.946 12.61 12.23 11.902 11.596 11.315 11.072 10.809 10.543 10.273 10.041 9.841 9.633 9.417 9.239 9.064 8.872 8.717 8.566 8.406 8.235 8.057 7.944 7.823 7.604 7.461 7.329 7.259 7.104 6.93 6.739 6.642 6.358 6.366 6.268 6.15 5.857 5.706 5.545 5.366 5.207 5.023 4.745 3.997 -10 ,10688 ,TETRA ,17600724,Sun Nov 28 12:38:37 CET,Sun Nov 28 14:37:54 CET,0.0 1.675 2.097 2.419 2.697 2.971 3.221 3.426 3.781 3.951 4.101 4.159 4.48 4.609 4.845 5.071 5.306 5.405 5.58 5.763 6.012 6.165 6.315 6.525 6.727 6.916 7.077 7.237 7.446 7.659 7.858 8.076 8.293 8.514 8.783 9.076 9.353 9.634 9.913 10.2 10.485 10.796 11.143 11.506 11.964 12.429 12.906 13.413 13.888 14.256 14.431 14.231 13.828 13.342 12.883 12.483 12.087 11.66 11.288 10.954 10.674 10.423 10.179 9.93 9.67 9.435 9.199 8.988 8.809 8.633 8.443 8.27 8.112 7.95 7.801 7.641 7.475 7.297 7.112 6.996 6.882 6.7 6.565 6.425 6.359 6.225 6.069 5.893 5.803 5.521 5.522 5.423 5.303 5.045 4.919 4.771 4.619 4.434 4.2 3.89 2.636 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_54_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_54_37.txt deleted file mode 100644 index 541e8b09..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_54_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4007 ,KEBNE ,17070627,Fri Dec 24 21:02:21 CET,Fri Dec 24 22:43:37 CET,0.0 1.698 2.149 2.459 2.74 2.999 3.221 3.422 3.784 3.942 4.088 4.188 4.506 4.631 4.872 5.097 5.301 5.4 5.605 5.797 6.063 6.239 6.416 6.668 6.9 7.11 7.301 7.505 7.775 8.016 8.248 8.508 8.748 8.989 9.261 9.555 9.816 10.085 10.388 10.705 11.007 11.33 11.712 12.1 12.515 12.923 13.347 13.715 14.03 14.232 14.136 13.608 12.886 12.209 11.628 11.038 10.492 9.971 9.519 9.065 8.665 8.326 7.996 7.663 7.341 7.038 6.721 6.469 6.255 6.034 5.815 5.625 5.413 5.199 5.041 4.863 4.653 4.426 4.175 3.983 3.786 3.495 3.278 3.04 2.928 2.727 2.54 2.326 2.2 1.873 1.751 1.591 1.43 1.084 0.892 0.673 0.426 0.164 -0.164 -0.68 -1.917 -2 ,13568 ,KEBNE ,17070628,Fri Dec 24 21:03:24 CET,Fri Dec 24 22:44:28 CET,0.0 0.993 1.362 1.65 1.896 2.131 2.336 2.5 2.801 2.949 3.092 3.175 3.48 3.603 3.848 4.076 4.297 4.405 4.612 4.806 5.09 5.252 5.407 5.644 5.856 6.058 6.25 6.439 6.692 6.929 7.146 7.402 7.641 7.863 8.122 8.4 8.669 8.979 9.301 9.621 9.954 10.307 10.71 11.12 11.591 12.087 12.582 13.07 13.617 14.087 14.249 13.947 13.295 12.592 11.985 11.417 10.877 10.382 9.961 9.537 9.136 8.766 8.429 8.113 7.82 7.542 7.258 7.012 6.783 6.535 6.282 6.072 5.844 5.594 5.4 5.19 4.967 4.753 4.532 4.368 4.199 3.961 3.799 3.601 3.495 3.317 3.138 2.927 2.814 2.525 2.49 2.377 2.258 1.999 1.854 1.689 1.483 1.261 1.017 0.715 -0.659 -3 ,30937 ,KEBNE ,17070629,Fri Dec 24 21:03:23 CET,Fri Dec 24 22:44:08 CET,0.0 1.227 1.72 2.136 2.49 2.772 2.984 3.163 3.514 3.695 3.857 3.927 4.223 4.332 4.543 4.753 4.961 5.06 5.257 5.453 5.709 5.862 6.016 6.241 6.454 6.653 6.83 7.002 7.255 7.501 7.735 8.035 8.311 8.555 8.837 9.138 9.401 9.685 9.992 10.322 10.662 11.032 11.451 11.854 12.306 12.721 13.209 13.741 14.048 14.14 13.931 13.413 12.845 12.254 11.682 11.124 10.62 10.174 9.768 9.354 8.986 8.659 8.332 8.001 7.685 7.376 7.059 6.798 6.562 6.312 6.06 5.835 5.592 5.344 5.165 4.983 4.789 4.592 4.378 4.233 4.086 3.857 3.7 3.526 3.434 3.25 3.045 2.818 2.714 2.415 2.398 2.258 2.114 1.829 1.68 1.516 1.34 1.149 0.872 0.546 -0.552 -4 ,7480 ,KEBNE ,17070630,Fri Dec 24 21:03:24 CET,Fri Dec 24 22:43:56 CET,0.0 1.288 1.743 2.082 2.338 2.546 2.746 2.943 3.324 3.486 3.626 3.72 4.041 4.168 4.408 4.623 4.83 4.927 5.111 5.29 5.527 5.677 5.828 6.062 6.284 6.48 6.659 6.835 7.078 7.32 7.541 7.794 8.046 8.285 8.546 8.845 9.134 9.427 9.718 10.009 10.322 10.686 11.084 11.446 11.862 12.287 12.705 13.135 13.533 13.822 13.892 13.558 12.994 12.421 11.854 11.31 10.787 10.263 9.802 9.344 8.954 8.605 8.273 7.975 7.706 7.432 7.138 6.901 6.676 6.429 6.163 5.93 5.689 5.45 5.258 5.04 4.828 4.633 4.422 4.265 4.108 3.874 3.714 3.549 3.457 3.255 3.037 2.81 2.693 2.387 2.29 2.13 1.97 1.587 1.364 1.127 0.867 0.57 0.265 -0.135 -1.289 -5 ,607 ,KEBNE ,17070631,Fri Dec 24 21:03:24 CET,Fri Dec 24 22:44:19 CET,0.0 1.074 1.475 1.809 2.114 2.363 2.587 2.784 3.17 3.383 3.566 3.659 3.968 4.082 4.312 4.554 4.776 4.872 5.052 5.222 5.478 5.647 5.8 6.014 6.218 6.425 6.633 6.83 7.079 7.31 7.513 7.754 7.992 8.226 8.499 8.809 9.112 9.44 9.765 10.075 10.383 10.717 11.091 11.457 11.863 12.293 12.785 13.29 13.739 13.974 13.865 13.381 12.789 12.2 11.62 11.012 10.465 9.966 9.536 9.103 8.695 8.305 7.919 7.569 7.225 6.89 6.559 6.249 5.968 5.696 5.424 5.186 4.938 4.695 4.489 4.273 4.051 3.811 3.567 3.395 3.213 2.918 2.703 2.474 2.368 2.164 1.925 1.666 1.536 1.197 1.086 0.908 0.714 0.262 0.03 -0.207 -0.483 -0.799 -1.124 -1.513 -2.533 -6 ,22347 ,KEBNE ,17070632,Fri Dec 24 21:04:28 CET,Fri Dec 24 22:45:55 CET,0.0 0.916 1.259 1.535 1.789 2.015 2.209 2.393 2.747 2.909 3.054 3.127 3.433 3.542 3.76 3.97 4.17 4.269 4.459 4.641 4.903 5.062 5.2 5.406 5.611 5.803 5.988 6.165 6.393 6.614 6.827 7.084 7.315 7.518 7.761 8.049 8.324 8.608 8.9 9.203 9.532 9.899 10.304 10.703 11.134 11.575 12.024 12.42 12.741 12.939 12.846 12.36 11.743 11.093 10.507 9.94 9.393 8.897 8.49 8.048 7.642 7.284 6.923 6.575 6.244 5.933 5.621 5.343 5.102 4.858 4.613 4.418 4.211 3.982 3.791 3.59 3.381 3.154 2.911 2.741 2.566 2.31 2.13 1.937 1.846 1.653 1.426 1.165 1.019 0.698 0.626 0.478 0.315 -0.079 -0.297 -0.526 -0.789 -1.047 -1.303 -1.688 -2.551 -7 ,12480 ,KEBNE ,17070633,Fri Dec 24 21:05:31 CET,Fri Dec 24 22:46:40 CET,0.0 0.998 1.381 1.706 1.983 2.216 2.479 2.737 3.163 3.345 3.495 3.578 3.883 4.003 4.245 4.468 4.668 4.765 4.946 5.115 5.359 5.52 5.665 5.857 6.059 6.276 6.475 6.655 6.894 7.123 7.34 7.607 7.849 8.062 8.303 8.569 8.824 9.116 9.438 9.743 10.036 10.379 10.764 11.114 11.523 11.92 12.308 12.715 13.032 13.151 13.027 12.593 11.961 11.311 10.689 10.078 9.492 8.936 8.439 7.942 7.504 7.093 6.715 6.373 6.055 5.758 5.459 5.206 4.985 4.757 4.512 4.294 4.05 3.795 3.61 3.416 3.21 3.001 2.77 2.605 2.445 2.203 2.04 1.859 1.754 1.535 1.322 1.102 0.976 0.651 0.574 0.425 0.251 -0.114 -0.312 -0.506 -0.718 -1.001 -1.331 -1.769 -3.22 -8 ,2041 ,KEBNE ,17070634,Fri Dec 24 21:09:41 CET,Fri Dec 24 22:50:33 CET,0.0 1.569 2.037 2.351 2.622 2.874 3.086 3.272 3.615 3.775 3.918 4.008 4.328 4.453 4.686 4.906 5.103 5.204 5.42 5.618 5.87 6.014 6.156 6.374 6.574 6.759 6.944 7.123 7.355 7.577 7.782 8.028 8.254 8.479 8.738 9.016 9.275 9.556 9.863 10.176 10.488 10.826 11.229 11.609 12.007 12.427 12.872 13.31 13.652 13.812 13.694 13.134 12.475 11.757 11.036 10.383 9.837 9.285 8.747 8.219 7.764 7.367 7.015 6.693 6.386 6.103 5.792 5.508 5.258 4.988 4.698 4.471 4.252 4.029 3.863 3.691 3.495 3.285 3.081 2.938 2.788 2.545 2.362 2.162 2.069 1.894 1.709 1.485 1.358 1.042 0.982 0.841 0.706 0.407 0.225 0.005 -0.243 -0.479 -0.717 -1.084 -2.381 -9 ,2182 ,KEBNE ,17070635,Fri Dec 24 21:10:45 CET,Fri Dec 24 22:51:35 CET,0.0 1.719 2.215 2.526 2.768 3.004 3.228 3.441 3.83 4.0 4.16 4.278 4.6 4.724 4.96 5.177 5.373 5.471 5.657 5.822 6.064 6.216 6.369 6.596 6.808 7.01 7.192 7.356 7.573 7.801 8.017 8.267 8.528 8.788 9.061 9.349 9.62 9.901 10.219 10.553 10.878 11.239 11.619 11.976 12.399 12.847 13.295 13.7 14.048 14.269 14.221 13.774 13.12 12.423 11.816 11.228 10.673 10.175 9.731 9.28 8.914 8.585 8.22 7.885 7.601 7.336 7.062 6.806 6.567 6.322 6.086 5.883 5.673 5.471 5.303 5.101 4.892 4.695 4.498 4.357 4.212 3.962 3.777 3.598 3.499 3.286 3.078 2.827 2.678 2.347 2.244 2.086 1.909 1.493 1.226 0.899 0.566 0.209 -0.236 -0.773 -2.108 -10 ,14461 ,KEBNE ,17070636,Fri Dec 24 21:10:45 CET,Fri Dec 24 22:51:15 CET,0.0 1.523 2.022 2.369 2.678 2.918 3.106 3.279 3.615 3.76 3.885 3.949 4.241 4.344 4.55 4.748 4.944 5.037 5.21 5.384 5.644 5.811 5.97 6.196 6.413 6.614 6.8 6.974 7.206 7.446 7.675 7.933 8.175 8.406 8.674 8.973 9.25 9.552 9.872 10.208 10.539 10.883 11.28 11.659 12.067 12.494 12.966 13.408 13.766 14.009 13.94 13.326 12.649 12.005 11.389 10.794 10.273 9.774 9.295 8.819 8.427 8.084 7.75 7.409 7.079 6.794 6.489 6.21 5.965 5.705 5.454 5.231 4.971 4.7 4.493 4.285 4.063 3.842 3.61 3.443 3.269 2.985 2.784 2.587 2.492 2.281 2.071 1.854 1.732 1.418 1.371 1.243 1.094 0.778 0.612 0.41 0.16 -0.141 -0.461 -0.89 -2.464 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_56_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_56_43.txt deleted file mode 100644 index 999c451c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_56_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1557 ,KEBNE ,17027047,Wed Dec 22 16:00:42 CET,Wed Dec 22 17:42:57 CET,0.0 1.032 1.306 1.512 1.672 1.808 1.922 2.04 2.286 2.414 2.541 2.561 2.866 2.975 3.193 3.397 3.587 3.672 3.837 4.008 4.242 4.387 4.528 4.718 4.906 5.094 5.287 5.48 5.731 5.974 6.204 6.471 6.69 6.896 7.169 7.484 7.793 8.122 8.459 8.823 9.196 9.606 10.079 10.551 11.114 11.723 12.398 13.129 13.891 14.684 15.501 15.923 15.993 15.869 15.616 15.345 15.068 14.764 14.485 14.194 13.945 13.71 13.441 13.174 12.94 12.716 12.475 12.252 12.045 11.83 11.593 11.395 11.195 10.987 10.819 10.639 10.439 10.239 10.034 9.875 9.703 9.466 9.305 9.127 9.034 8.826 8.602 8.366 8.244 7.929 7.855 7.716 7.57 7.257 7.078 6.878 6.635 6.344 5.974 5.461 4.046 -2 ,14588 ,KEBNE ,17027048,Wed Dec 22 16:00:42 CET,Wed Dec 22 17:42:45 CET,0.0 1.19 1.508 1.751 1.928 2.105 2.272 2.419 2.67 2.789 2.905 2.91 3.205 3.298 3.472 3.635 3.803 3.887 4.049 4.207 4.429 4.563 4.697 4.902 5.098 5.277 5.453 5.631 5.851 6.06 6.275 6.549 6.817 7.062 7.314 7.593 7.868 8.152 8.453 8.777 9.125 9.535 10.017 10.495 11.041 11.61 12.198 12.798 13.476 14.216 14.934 15.243 15.238 15.067 14.749 14.412 14.122 13.864 13.615 13.335 13.068 12.811 12.547 12.279 12.031 11.797 11.528 11.284 11.076 10.859 10.613 10.393 10.139 9.861 9.643 9.418 9.185 8.94 8.684 8.507 8.324 8.025 7.826 7.61 7.497 7.28 7.042 6.775 6.628 6.299 6.211 6.055 5.891 5.536 5.323 5.107 4.877 4.614 4.3 3.778 1.608 -3 ,5496 ,KEBNE ,17027049,Wed Dec 22 16:00:42 CET,Wed Dec 22 17:42:28 CET,0.0 0.504 0.818 1.066 1.266 1.436 1.609 1.755 1.99 2.11 2.237 2.278 2.59 2.702 2.902 3.092 3.267 3.349 3.507 3.665 3.884 4.013 4.146 4.345 4.527 4.713 4.896 5.059 5.26 5.468 5.675 5.912 6.153 6.395 6.666 6.95 7.22 7.529 7.853 8.199 8.585 8.99 9.436 9.879 10.395 10.965 11.625 12.344 13.117 13.947 14.809 15.239 15.268 15.154 14.933 14.667 14.398 14.09 13.783 13.503 13.226 12.943 12.667 12.392 12.143 11.916 11.673 11.448 11.254 11.053 10.839 10.665 10.483 10.267 10.09 9.906 9.704 9.5 9.295 9.154 9.01 8.769 8.6 8.426 8.337 8.158 7.941 7.696 7.58 7.268 7.198 7.045 6.877 6.51 6.307 6.083 5.833 5.54 5.161 4.631 3.291 -4 ,19211 ,KEBNE ,17027050,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:43:10 CET,0.0 1.016 1.294 1.491 1.681 1.858 2.007 2.145 2.413 2.531 2.647 2.665 2.976 3.076 3.255 3.436 3.622 3.716 3.902 4.07 4.294 4.437 4.587 4.803 4.999 5.184 5.355 5.521 5.754 5.964 6.15 6.379 6.605 6.836 7.101 7.386 7.679 8.016 8.367 8.729 9.107 9.523 9.994 10.46 10.998 11.554 12.209 12.973 13.776 14.62 15.424 15.789 15.802 15.626 15.345 15.035 14.707 14.352 14.026 13.675 13.361 13.074 12.803 12.563 12.318 12.071 11.796 11.56 11.372 11.168 10.919 10.709 10.51 10.284 10.099 9.906 9.698 9.484 9.279 9.144 8.991 8.746 8.574 8.389 8.292 8.087 7.869 7.628 7.499 7.175 7.084 6.929 6.776 6.421 6.208 5.989 5.761 5.52 5.202 4.689 3.111 -5 ,18591 ,KEBNE ,17027051,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:42:30 CET,0.0 0.874 1.221 1.456 1.663 1.867 2.057 2.222 2.5 2.629 2.761 2.818 3.137 3.247 3.452 3.655 3.85 3.932 4.087 4.246 4.484 4.644 4.79 4.969 5.151 5.345 5.523 5.699 5.941 6.158 6.36 6.608 6.851 7.086 7.351 7.643 7.922 8.229 8.547 8.88 9.224 9.614 10.085 10.531 11.039 11.579 12.149 12.787 13.518 14.264 15.007 15.399 15.357 15.204 14.992 14.713 14.416 14.122 13.843 13.548 13.277 13.017 12.753 12.496 12.263 12.046 11.792 11.546 11.335 11.118 10.896 10.71 10.516 10.32 10.168 10.001 9.804 9.595 9.385 9.229 9.077 8.845 8.672 8.491 8.397 8.187 7.95 7.705 7.581 7.265 7.19 7.047 6.887 6.463 6.22 5.96 5.669 5.355 4.976 4.479 2.745 -6 ,10725 ,KEBNE ,17027052,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:43:00 CET,0.0 0.805 1.185 1.505 1.746 1.933 2.098 2.258 2.562 2.702 2.825 2.832 3.149 3.255 3.447 3.642 3.826 3.913 4.075 4.232 4.462 4.606 4.75 4.958 5.149 5.345 5.527 5.691 5.902 6.102 6.305 6.556 6.79 7.013 7.275 7.567 7.854 8.152 8.457 8.785 9.143 9.535 9.977 10.433 10.949 11.5 12.112 12.787 13.518 14.281 15.061 15.389 15.32 15.15 14.875 14.604 14.351 14.04 13.747 13.447 13.157 12.901 12.668 12.432 12.19 11.955 11.716 11.499 11.282 11.056 10.806 10.586 10.387 10.188 10.023 9.834 9.628 9.419 9.2 9.05 8.9 8.654 8.471 8.279 8.183 7.983 7.772 7.534 7.414 7.108 7.044 6.902 6.743 6.437 6.265 6.04 5.793 5.525 5.215 4.769 3.319 -7 ,21173 ,KEBNE ,17027053,Wed Dec 22 16:00:47 CET,Wed Dec 22 17:39:02 CET,0.0 0.452 0.726 1.002 1.234 1.421 1.573 1.721 2.008 2.125 2.23 2.271 2.571 2.667 2.853 3.028 3.189 3.262 3.407 3.565 3.797 3.944 4.086 4.275 4.465 4.656 4.849 5.045 5.284 5.51 5.722 5.971 6.225 6.47 6.741 7.028 7.314 7.648 8.001 8.361 8.729 9.13 9.587 10.052 10.558 11.099 11.742 12.435 13.214 14.047 14.859 15.312 15.368 15.194 14.996 14.756 14.445 14.153 13.893 13.591 13.32 13.065 12.798 12.541 12.31 12.091 11.825 11.586 11.392 11.18 10.948 10.755 10.566 10.377 10.229 10.072 9.903 9.721 9.538 9.404 9.243 8.978 8.811 8.657 8.571 8.377 8.166 7.942 7.82 7.514 7.493 7.362 7.209 6.872 6.69 6.489 6.276 6.029 5.712 5.233 3.892 -8 ,604 ,KEBNE ,17027054,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:38:25 CET,0.0 0.78 1.061 1.302 1.496 1.663 1.814 1.952 2.224 2.365 2.505 2.558 2.875 2.987 3.212 3.431 3.63 3.722 3.908 4.088 4.346 4.504 4.66 4.898 5.123 5.345 5.562 5.768 6.029 6.266 6.499 6.791 7.062 7.318 7.616 7.956 8.291 8.653 9.033 9.407 9.777 10.176 10.607 11.049 11.574 12.142 12.78 13.479 14.224 14.955 15.603 15.856 15.79 15.597 15.369 15.123 14.843 14.537 14.248 13.964 13.717 13.443 13.171 12.946 12.707 12.475 12.237 12.015 11.83 11.631 11.42 11.23 11.004 10.771 10.583 10.382 10.199 9.996 9.774 9.614 9.439 9.185 9.018 8.844 8.751 8.568 8.374 8.169 8.064 7.767 7.729 7.585 7.435 7.119 6.936 6.736 6.516 6.231 5.884 5.378 3.591 -9 ,1834 ,KEBNE ,17027055,Wed Dec 22 16:00:42 CET,Wed Dec 22 17:43:44 CET,0.0 0.94 1.195 1.396 1.585 1.767 1.929 2.064 2.28 2.387 2.496 2.516 2.828 2.927 3.092 3.246 3.401 3.475 3.625 3.766 3.957 4.089 4.229 4.424 4.597 4.77 4.93 5.077 5.281 5.484 5.68 5.902 6.136 6.363 6.607 6.869 7.122 7.404 7.705 8.062 8.463 8.906 9.392 9.838 10.369 10.936 11.556 12.28 13.034 13.764 14.462 14.851 14.864 14.672 14.435 14.212 13.972 13.685 13.415 13.112 12.83 12.555 12.277 12.004 11.73 11.489 11.247 11.018 10.822 10.588 10.333 10.141 9.949 9.727 9.547 9.372 9.176 8.981 8.77 8.615 8.469 8.23 8.057 7.874 7.77 7.563 7.341 7.096 6.975 6.672 6.617 6.471 6.319 5.971 5.78 5.574 5.294 4.952 4.587 4.1 2.788 -10 ,10329 ,KEBNE ,17027056,Wed Dec 22 16:00:42 CET,Wed Dec 22 17:42:54 CET,0.0 0.424 0.638 0.811 0.999 1.185 1.355 1.507 1.772 1.891 2.005 2.028 2.338 2.45 2.645 2.821 2.996 3.076 3.245 3.43 3.691 3.853 4.015 4.232 4.437 4.642 4.82 4.984 5.212 5.432 5.628 5.869 6.113 6.354 6.649 6.976 7.265 7.566 7.898 8.234 8.576 8.989 9.461 9.925 10.461 11.026 11.635 12.266 12.996 13.775 14.434 14.754 14.804 14.639 14.333 13.998 13.686 13.359 13.041 12.711 12.422 12.152 11.879 11.623 11.368 11.115 10.841 10.597 10.396 10.176 9.945 9.756 9.553 9.318 9.131 8.946 8.74 8.529 8.318 8.163 7.996 7.743 7.572 7.393 7.302 7.097 6.861 6.649 6.537 6.214 6.141 5.995 5.835 5.496 5.298 5.083 4.844 4.576 4.276 3.813 2.04 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_56_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_56_57.txt deleted file mode 100644 index 32b49d47..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_56_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7 ,TETRA ,17600725,Sun Nov 28 12:38:37 CET,Sun Nov 28 14:39:08 CET,0.0 0.481 0.726 0.935 1.143 1.331 1.498 1.646 1.911 2.025 2.147 2.208 2.514 2.629 2.868 3.095 3.296 3.39 3.579 3.772 4.044 4.216 4.386 4.624 4.852 5.071 5.277 5.486 5.759 6.016 6.268 6.579 6.865 7.137 7.462 7.838 8.217 8.624 9.066 9.535 10.021 10.593 11.273 11.932 12.673 13.499 14.468 15.549 16.827 18.319 20.029 21.376 22.09 22.471 22.658 22.711 22.653 22.566 22.496 22.393 22.256 22.113 21.972 21.835 21.704 21.577 21.443 21.318 21.203 21.06 20.906 20.787 20.65 20.502 20.388 20.266 20.133 20.002 19.866 19.76 19.646 19.482 19.37 19.245 19.183 19.045 18.885 18.717 18.636 18.388 18.428 18.347 18.259 18.056 17.937 17.807 17.65 17.448 17.226 17.015 16.439 -2 ,29750 ,TETRA ,17600726,Sun Nov 28 12:38:39 CET,Sun Nov 28 14:39:08 CET,0.0 0.823 1.136 1.393 1.6 1.792 1.969 2.125 2.384 2.507 2.64 2.697 3.017 3.137 3.374 3.576 3.764 3.857 4.033 4.206 4.471 4.647 4.81 5.045 5.266 5.468 5.672 5.887 6.188 6.48 6.755 7.09 7.397 7.681 8.031 8.439 8.82 9.232 9.69 10.17 10.649 11.205 11.897 12.628 13.462 14.392 15.468 16.655 18.026 19.623 21.46 22.82 23.468 23.739 23.872 23.918 23.851 23.744 23.642 23.541 23.439 23.334 23.204 23.053 22.904 22.773 22.643 22.505 22.374 22.253 22.125 22.005 21.888 21.77 21.667 21.559 21.434 21.289 21.152 21.06 20.961 20.798 20.682 20.559 20.495 20.359 20.211 20.035 19.946 19.68 19.693 19.598 19.487 19.259 19.144 19.003 18.822 18.611 18.351 18.106 17.634 -3 ,6901 ,TETRA ,17600727,Sun Nov 28 12:38:41 CET,Sun Nov 28 14:39:09 CET,0.0 0.622 0.904 1.158 1.389 1.586 1.746 1.905 2.211 2.36 2.51 2.595 2.933 3.052 3.258 3.459 3.662 3.766 3.971 4.161 4.409 4.565 4.741 5.022 5.277 5.512 5.731 5.952 6.278 6.602 6.9 7.256 7.591 7.902 8.273 8.689 9.069 9.482 9.914 10.39 10.898 11.456 12.112 12.751 13.505 14.371 15.389 16.548 17.852 19.326 21.019 22.33 22.998 23.317 23.502 23.561 23.505 23.409 23.305 23.203 23.085 22.966 22.847 22.699 22.534 22.376 22.22 22.077 21.944 21.821 21.703 21.594 21.461 21.307 21.186 21.068 20.947 20.82 20.686 20.586 20.478 20.301 20.167 20.022 19.948 19.807 19.668 19.532 19.46 19.198 19.217 19.129 19.032 18.814 18.684 18.556 18.407 18.211 17.979 17.687 16.799 -4 ,21627 ,TETRA ,17600728,Sun Nov 28 12:38:43 CET,Sun Nov 28 14:39:15 CET,0.0 0.973 1.23 1.433 1.607 1.766 1.917 2.063 2.336 2.46 2.588 2.636 2.947 3.056 3.263 3.463 3.66 3.761 3.946 4.121 4.389 4.566 4.735 4.981 5.215 5.438 5.656 5.881 6.168 6.425 6.671 6.985 7.293 7.597 7.97 8.385 8.757 9.16 9.608 10.064 10.54 11.116 11.781 12.423 13.182 14.015 14.969 16.056 17.344 18.797 20.493 21.831 22.517 22.89 23.084 23.156 23.112 23.022 22.901 22.77 22.654 22.512 22.337 22.18 22.059 21.941 21.797 21.656 21.532 21.385 21.22 21.095 20.981 20.851 20.73 20.618 20.503 20.364 20.219 20.116 20.013 19.851 19.726 19.596 19.528 19.386 19.247 19.069 18.972 18.714 18.73 18.646 18.528 18.252 18.112 17.96 17.795 17.608 17.39 17.145 16.737 -5 ,23647 ,TETRA ,17600729,Sun Nov 28 12:40:34 CET,Sun Nov 28 14:39:59 CET,0.0 1.161 1.581 1.898 2.14 2.339 2.528 2.702 3.022 3.168 3.31 3.369 3.688 3.8 4.002 4.214 4.43 4.529 4.714 4.885 5.14 5.328 5.519 5.782 6.022 6.269 6.505 6.719 6.995 7.278 7.55 7.855 8.157 8.456 8.798 9.178 9.537 9.917 10.321 10.77 11.246 11.777 12.39 13.013 13.775 14.645 15.616 16.678 17.887 19.269 20.831 22.004 22.635 22.975 23.185 23.27 23.284 23.257 23.16 23.03 22.901 22.756 22.605 22.453 22.303 22.173 22.027 21.889 21.762 21.629 21.508 21.397 21.275 21.132 21.016 20.917 20.814 20.703 20.579 20.487 20.391 20.231 20.107 19.979 19.917 19.783 19.642 19.489 19.407 19.143 19.15 19.053 18.949 18.709 18.572 18.42 18.244 18.051 17.846 17.594 16.985 -6 ,20412 ,TETRA ,17600730,Sun Nov 28 12:40:35 CET,Sun Nov 28 14:39:56 CET,0.0 0.731 0.999 1.229 1.448 1.677 1.866 2.017 2.289 2.426 2.567 2.636 2.955 3.077 3.308 3.523 3.734 3.844 4.054 4.244 4.516 4.702 4.878 5.116 5.342 5.551 5.746 5.951 6.224 6.492 6.756 7.076 7.388 7.688 8.033 8.412 8.791 9.21 9.637 10.088 10.567 11.152 11.864 12.538 13.296 14.124 15.11 16.231 17.546 19.07 20.776 22.051 22.654 22.995 23.179 23.268 23.307 23.28 23.199 23.059 22.91 22.785 22.657 22.515 22.365 22.212 22.056 21.912 21.789 21.665 21.513 21.375 21.232 21.076 20.945 20.82 20.697 20.56 20.416 20.324 20.237 20.083 19.961 19.84 19.771 19.613 19.451 19.28 19.187 18.91 18.878 18.77 18.663 18.403 18.25 18.107 17.965 17.806 17.621 17.343 16.596 -7 ,10121 ,TETRA ,17600731,Sun Nov 28 12:40:37 CET,Sun Nov 28 14:41:41 CET,0.0 0.645 0.952 1.192 1.385 1.557 1.717 1.874 2.179 2.335 2.493 2.581 2.914 3.037 3.263 3.463 3.663 3.759 3.932 4.111 4.389 4.565 4.733 4.971 5.199 5.425 5.658 5.888 6.175 6.451 6.713 7.034 7.355 7.664 7.994 8.362 8.738 9.146 9.584 10.058 10.578 11.169 11.833 12.493 13.266 14.087 15.015 16.043 17.25 18.699 20.396 21.622 22.22 22.511 22.633 22.639 22.552 22.426 22.326 22.23 22.116 21.97 21.805 21.649 21.491 21.343 21.189 21.038 20.908 20.772 20.612 20.47 20.314 20.151 20.032 19.917 19.813 19.692 19.539 19.436 19.329 19.171 19.056 18.928 18.864 18.729 18.583 18.422 18.348 18.09 18.098 18.009 17.923 17.759 17.642 17.498 17.351 17.184 16.988 16.773 16.143 -8 ,5 ,TETRA ,17600732,Sun Nov 28 12:40:39 CET,Sun Nov 28 14:42:13 CET,0.0 0.498 0.761 1.002 1.206 1.4 1.593 1.747 2.013 2.138 2.262 2.307 2.624 2.738 2.96 3.161 3.346 3.441 3.625 3.795 4.053 4.221 4.382 4.608 4.826 5.047 5.259 5.46 5.717 5.959 6.203 6.502 6.782 7.068 7.406 7.773 8.124 8.523 8.962 9.43 9.904 10.441 11.078 11.723 12.483 13.331 14.276 15.341 16.605 18.068 19.811 21.044 21.636 21.943 22.073 22.103 22.076 22.007 21.921 21.837 21.733 21.588 21.436 21.269 21.102 20.948 20.774 20.62 20.476 20.317 20.142 19.979 19.813 19.648 19.519 19.374 19.228 19.102 18.974 18.881 18.777 18.602 18.487 18.372 18.309 18.178 18.039 17.908 17.833 17.577 17.608 17.517 17.414 17.188 17.065 16.949 16.815 16.638 16.421 16.191 15.729 -9 ,25444 ,TETRA ,17600733,Sun Nov 28 12:40:35 CET,Sun Nov 28 14:46:09 CET,0.0 0.622 0.841 1.029 1.218 1.395 1.551 1.7 1.989 2.122 2.239 2.265 2.571 2.688 2.91 3.117 3.307 3.395 3.575 3.744 3.988 4.146 4.302 4.553 4.799 5.034 5.256 5.471 5.754 6.02 6.269 6.571 6.876 7.183 7.538 7.932 8.303 8.689 9.096 9.538 10.02 10.558 11.196 11.828 12.546 13.387 14.368 15.5 16.778 18.201 19.921 21.315 21.994 22.288 22.391 22.404 22.368 22.261 22.143 22.027 21.914 21.81 21.68 21.523 21.363 21.231 21.104 20.967 20.841 20.708 20.561 20.433 20.298 20.142 20.01 19.885 19.756 19.613 19.464 19.372 19.28 19.13 19.01 18.872 18.802 18.658 18.513 18.353 18.268 18.017 18.043 17.969 17.881 17.659 17.533 17.4 17.251 17.077 16.853 16.55 16.138 -10 ,23147 ,TETRA ,17600734,Sun Nov 28 12:40:36 CET,Sun Nov 28 14:46:32 CET,0.0 0.665 0.966 1.175 1.413 1.635 1.809 1.95 2.194 2.319 2.445 2.487 2.793 2.898 3.089 3.277 3.467 3.564 3.759 3.956 4.243 4.43 4.607 4.853 5.084 5.303 5.524 5.742 6.019 6.271 6.508 6.794 7.11 7.42 7.759 8.157 8.541 8.951 9.382 9.841 10.342 10.889 11.525 12.167 12.917 13.778 14.729 15.836 17.196 18.76 20.57 21.971 22.678 23.037 23.214 23.251 23.242 23.198 23.101 22.978 22.858 22.747 22.637 22.529 22.402 22.272 22.126 21.988 21.851 21.693 21.538 21.423 21.298 21.161 21.038 20.911 20.79 20.657 20.513 20.407 20.298 20.126 19.998 19.847 19.759 19.574 19.394 19.2 19.09 18.788 18.714 18.576 18.44 18.151 17.986 17.811 17.634 17.432 17.166 16.762 15.702 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_56_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_56_58.txt deleted file mode 100644 index f53862d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_56_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3968 ,TETRA ,17600735,Sun Nov 28 12:43:33 CET,Sun Nov 28 14:43:39 CET,0.0 2.234 2.744 3.065 3.307 3.523 3.731 3.911 4.216 4.37 4.522 4.578 4.915 5.044 5.261 5.454 5.632 5.729 5.937 6.134 6.43 6.606 6.762 7.008 7.237 7.443 7.643 7.825 8.047 8.268 8.495 8.749 8.961 9.145 9.359 9.619 9.861 10.11 10.373 10.63 10.909 11.254 11.619 11.949 12.262 12.576 12.892 13.14 13.325 13.359 13.022 12.309 11.622 10.934 10.298 9.67 9.115 8.645 8.191 7.685 7.276 6.917 6.563 6.211 5.845 5.531 5.246 4.985 4.754 4.529 4.289 4.072 3.843 3.596 3.394 3.205 3.034 2.846 2.637 2.491 2.341 2.118 1.961 1.802 1.721 1.547 1.351 1.12 1.003 0.684 0.64 0.52 0.398 0.138 -0.007 -0.162 -0.355 -0.586 -0.851 -1.166 -2.551 -2 ,24592 ,TETRA ,17600736,Sun Nov 28 12:43:36 CET,Sun Nov 28 14:43:32 CET,0.0 2.112 2.506 2.78 2.999 3.177 3.347 3.527 3.863 4.011 4.133 4.166 4.483 4.601 4.829 5.036 5.224 5.318 5.49 5.643 5.877 6.025 6.161 6.369 6.567 6.753 6.924 7.096 7.329 7.547 7.748 7.968 8.169 8.365 8.612 8.895 9.148 9.412 9.682 9.933 10.186 10.509 10.887 11.218 11.566 11.894 12.197 12.54 12.797 12.824 12.465 11.689 10.931 10.189 9.533 8.884 8.257 7.718 7.26 6.791 6.376 6.009 5.667 5.342 5.031 4.737 4.439 4.179 3.956 3.716 3.457 3.234 2.999 2.77 2.591 2.405 2.21 2.01 1.818 1.684 1.548 1.323 1.156 0.988 0.906 0.737 0.553 0.347 0.24 -0.061 -0.113 -0.229 -0.351 -0.649 -0.815 -1.004 -1.206 -1.388 -1.597 -1.871 -3.167 -3 ,15243 ,TETRA ,17600737,Sun Nov 28 12:44:34 CET,Sun Nov 28 14:44:18 CET,0.0 1.814 2.274 2.653 2.961 3.194 3.38 3.57 3.897 4.04 4.172 4.222 4.528 4.65 4.888 5.092 5.279 5.368 5.548 5.728 5.976 6.128 6.272 6.491 6.688 6.866 7.037 7.199 7.411 7.609 7.791 8.005 8.199 8.401 8.63 8.858 9.102 9.356 9.599 9.855 10.112 10.405 10.764 11.081 11.412 11.762 12.087 12.379 12.617 12.66 12.305 11.508 10.699 9.962 9.282 8.654 8.074 7.514 7.015 6.531 6.144 5.791 5.454 5.141 4.828 4.542 4.255 4.0 3.786 3.548 3.266 3.026 2.789 2.551 2.377 2.202 2.013 1.82 1.619 1.469 1.316 1.074 0.905 0.737 0.654 0.482 0.288 0.084 -0.029 -0.353 -0.401 -0.526 -0.656 -0.956 -1.11 -1.266 -1.459 -1.683 -1.948 -2.235 -2.98 -4 ,8 ,TETRA ,17600738,Sun Nov 28 12:44:36 CET,Sun Nov 28 14:44:33 CET,0.0 1.297 1.73 2.048 2.308 2.52 2.707 2.868 3.167 3.315 3.465 3.553 3.89 4.002 4.207 4.395 4.569 4.655 4.83 4.988 5.21 5.351 5.478 5.674 5.861 6.029 6.198 6.366 6.582 6.791 6.984 7.213 7.419 7.604 7.805 8.02 8.234 8.473 8.721 8.977 9.234 9.52 9.862 10.161 10.437 10.728 11.04 11.301 11.432 11.398 11.071 10.294 9.51 8.759 8.031 7.369 6.787 6.272 5.819 5.35 4.906 4.483 4.083 3.706 3.365 3.084 2.807 2.544 2.306 2.035 1.746 1.526 1.293 1.039 0.841 0.648 0.455 0.246 0.03 -0.12 -0.274 -0.507 -0.672 -0.841 -0.931 -1.126 -1.327 -1.525 -1.623 -1.925 -1.944 -2.059 -2.188 -2.445 -2.578 -2.728 -2.909 -3.128 -3.418 -3.803 -5.248 -5 ,9401 ,TETRA ,17600739,Sun Nov 28 12:44:34 CET,Sun Nov 28 14:45:24 CET,0.0 1.445 1.837 2.13 2.37 2.565 2.75 2.924 3.219 3.367 3.517 3.573 3.868 3.983 4.205 4.399 4.558 4.641 4.822 5.003 5.259 5.411 5.558 5.778 5.993 6.192 6.371 6.531 6.727 6.942 7.156 7.38 7.567 7.767 8.015 8.266 8.521 8.808 9.078 9.348 9.614 9.88 10.181 10.449 10.714 11.038 11.367 11.606 11.832 11.948 11.623 10.787 9.97 9.221 8.519 7.847 7.265 6.746 6.275 5.819 5.417 5.02 4.648 4.311 3.986 3.682 3.359 3.061 2.81 2.563 2.316 2.114 1.902 1.664 1.482 1.304 1.116 0.932 0.731 0.574 0.422 0.201 0.035 -0.143 -0.23 -0.405 -0.587 -0.765 -0.858 -1.16 -1.163 -1.276 -1.41 -1.689 -1.844 -2.009 -2.175 -2.378 -2.63 -2.958 -4.61 -6 ,14920 ,TETRA ,17600740,Sun Nov 28 12:44:35 CET,Sun Nov 28 14:45:24 CET,0.0 1.639 2.071 2.354 2.556 2.734 2.904 3.079 3.41 3.551 3.684 3.75 4.066 4.169 4.356 4.541 4.732 4.828 5.014 5.185 5.416 5.564 5.702 5.901 6.091 6.274 6.45 6.613 6.815 7.003 7.195 7.421 7.636 7.862 8.103 8.363 8.616 8.86 9.121 9.418 9.736 10.077 10.438 10.768 11.111 11.44 11.747 12.054 12.293 12.361 12.044 11.261 10.423 9.62 8.927 8.285 7.704 7.181 6.723 6.261 5.859 5.499 5.164 4.846 4.559 4.292 3.973 3.691 3.463 3.216 2.968 2.768 2.552 2.333 2.164 1.988 1.803 1.593 1.374 1.237 1.089 0.847 0.687 0.517 0.429 0.259 0.077 -0.138 -0.251 -0.542 -0.561 -0.688 -0.828 -1.101 -1.232 -1.378 -1.55 -1.763 -2.015 -2.275 -3.108 -7 ,19977 ,TETRA ,17600741,Sun Nov 28 12:44:37 CET,Sun Nov 28 14:47:59 CET,0.0 1.321 1.653 1.95 2.214 2.437 2.635 2.812 3.16 3.332 3.494 3.547 3.856 3.989 4.256 4.487 4.704 4.804 4.973 5.127 5.369 5.538 5.689 5.892 6.083 6.261 6.435 6.613 6.835 7.039 7.248 7.482 7.708 7.921 8.134 8.384 8.621 8.862 9.124 9.411 9.684 9.966 10.298 10.612 10.957 11.288 11.566 11.765 11.89 11.899 11.519 10.698 9.898 9.125 8.375 7.688 7.088 6.561 6.112 5.648 5.245 4.887 4.549 4.242 3.945 3.641 3.313 3.032 2.801 2.565 2.317 2.117 1.9 1.678 1.511 1.333 1.15 0.951 0.735 0.584 0.426 0.185 0.03 -0.114 -0.186 -0.345 -0.535 -0.725 -0.819 -1.119 -1.149 -1.267 -1.398 -1.689 -1.862 -2.048 -2.239 -2.448 -2.674 -2.939 -3.909 -8 ,13457 ,TETRA ,17600742,Sun Nov 28 12:44:40 CET,Sun Nov 28 14:47:57 CET,0.0 1.532 1.916 2.216 2.467 2.698 2.91 3.106 3.471 3.635 3.795 3.906 4.243 4.37 4.595 4.791 4.97 5.06 5.252 5.445 5.705 5.851 5.998 6.235 6.453 6.648 6.845 7.041 7.308 7.56 7.787 8.044 8.291 8.517 8.74 8.996 9.249 9.521 9.796 10.043 10.284 10.55 10.83 11.092 11.414 11.736 12.016 12.254 12.438 12.469 12.15 11.49 10.769 10.036 9.344 8.715 8.154 7.63 7.147 6.637 6.237 5.907 5.555 5.214 4.916 4.648 4.35 4.083 3.859 3.629 3.393 3.191 2.97 2.739 2.567 2.391 2.204 2.013 1.814 1.665 1.512 1.283 1.127 0.97 0.882 0.705 0.541 0.375 0.28 -0.028 -0.064 -0.187 -0.311 -0.551 -0.688 -0.847 -1.035 -1.258 -1.51 -1.834 -3.16 -9 ,22712 ,TETRA ,17600743,Sun Nov 28 12:44:34 CET,Sun Nov 28 14:57:57 CET,0.0 2.038 2.448 2.721 2.956 3.169 3.357 3.533 3.843 3.979 4.108 4.162 4.483 4.593 4.801 4.995 5.194 5.288 5.454 5.612 5.839 5.987 6.13 6.351 6.577 6.777 6.958 7.129 7.342 7.55 7.747 7.966 8.176 8.379 8.627 8.906 9.15 9.409 9.672 9.931 10.18 10.444 10.779 11.122 11.484 11.824 12.135 12.41 12.651 12.813 12.524 11.722 10.929 10.161 9.445 8.795 8.204 7.653 7.168 6.684 6.269 5.903 5.548 5.214 4.893 4.574 4.232 3.948 3.722 3.476 3.189 2.925 2.657 2.423 2.253 2.062 1.864 1.68 1.498 1.373 1.231 0.957 0.764 0.589 0.499 0.305 0.112 -0.071 -0.169 -0.476 -0.532 -0.658 -0.782 -1.051 -1.216 -1.405 -1.591 -1.794 -2.069 -2.409 -3.679 -10 ,20118 ,TETRA ,17600744,Sun Nov 28 12:44:35 CET,Sun Nov 28 14:45:24 CET,0.0 1.279 1.647 1.965 2.255 2.515 2.748 2.934 3.247 3.402 3.563 3.649 3.974 4.094 4.314 4.52 4.708 4.799 4.979 5.156 5.406 5.564 5.71 5.907 6.109 6.309 6.492 6.658 6.881 7.117 7.344 7.619 7.858 8.066 8.308 8.56 8.785 9.057 9.36 9.644 9.92 10.22 10.573 10.91 11.251 11.59 11.877 12.099 12.269 12.283 11.941 11.246 10.515 9.773 9.062 8.415 7.879 7.367 6.881 6.415 6.025 5.684 5.357 5.013 4.691 4.397 4.079 3.81 3.587 3.343 3.088 2.879 2.662 2.436 2.26 2.078 1.89 1.696 1.489 1.346 1.21 1.004 0.843 0.665 0.58 0.409 0.225 0.033 -0.068 -0.362 -0.365 -0.48 -0.608 -0.88 -1.02 -1.179 -1.388 -1.608 -1.847 -2.188 -3.828 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_60_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_60_37.txt deleted file mode 100644 index e6c72684..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_60_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24786 ,KEBNE ,17027057,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:41:52 CET,0.0 0.64 0.943 1.207 1.445 1.627 1.772 1.918 2.207 2.34 2.468 2.523 2.824 2.923 3.114 3.311 3.514 3.622 3.821 4.009 4.288 4.464 4.628 4.866 5.094 5.312 5.523 5.719 5.972 6.222 6.462 6.758 7.03 7.272 7.565 7.885 8.178 8.499 8.843 9.201 9.559 9.966 10.415 10.81 11.257 11.769 12.309 12.823 13.358 13.914 14.277 14.216 13.926 13.514 13.091 12.669 12.236 11.838 11.49 11.097 10.739 10.408 10.085 9.782 9.478 9.165 8.847 8.573 8.329 8.07 7.798 7.555 7.302 7.046 6.853 6.659 6.45 6.223 5.999 5.864 5.72 5.488 5.324 5.145 5.054 4.863 4.66 4.459 4.358 4.053 4.028 3.911 3.788 3.484 3.31 3.139 2.965 2.739 2.46 2.132 1.325 -2 ,21227 ,KEBNE ,17027058,Wed Dec 22 16:00:44 CET,Wed Dec 22 17:41:28 CET,0.0 1.106 1.53 1.82 2.077 2.298 2.48 2.648 2.966 3.127 3.286 3.361 3.664 3.78 4.001 4.219 4.419 4.508 4.679 4.849 5.098 5.252 5.4 5.614 5.823 6.021 6.208 6.397 6.638 6.86 7.068 7.319 7.577 7.818 8.085 8.377 8.654 8.945 9.244 9.556 9.893 10.271 10.687 11.1 11.57 12.054 12.594 13.206 13.835 14.388 14.763 14.746 14.457 13.968 13.501 13.059 12.636 12.24 11.861 11.46 11.097 10.784 10.491 10.197 9.926 9.677 9.379 9.103 8.879 8.653 8.403 8.189 7.961 7.713 7.531 7.35 7.166 6.982 6.79 6.658 6.519 6.298 6.15 6.005 5.924 5.741 5.56 5.362 5.251 4.951 4.925 4.81 4.694 4.443 4.295 4.13 3.964 3.784 3.561 3.275 2.671 -3 ,8379 ,KEBNE ,17027059,Wed Dec 22 16:00:44 CET,Wed Dec 22 17:41:06 CET,0.0 1.122 1.571 1.865 2.102 2.323 2.524 2.699 3.019 3.169 3.312 3.393 3.7 3.807 4.006 4.208 4.418 4.519 4.705 4.872 5.11 5.273 5.437 5.651 5.849 6.06 6.269 6.454 6.693 6.962 7.234 7.528 7.783 8.024 8.324 8.653 8.957 9.267 9.58 9.945 10.349 10.774 11.225 11.659 12.154 12.699 13.266 13.815 14.39 14.888 15.224 15.227 14.925 14.437 13.87 13.301 12.794 12.339 11.964 11.557 11.217 10.946 10.666 10.395 10.149 9.919 9.659 9.417 9.212 9.008 8.781 8.591 8.387 8.158 7.988 7.819 7.623 7.41 7.193 7.037 6.871 6.603 6.418 6.222 6.12 5.919 5.709 5.486 5.365 5.06 5.033 4.907 4.77 4.438 4.257 4.088 3.906 3.664 3.36 2.994 2.11 -4 ,5413 ,KEBNE ,17027060,Wed Dec 22 16:02:45 CET,Wed Dec 22 17:43:14 CET,0.0 0.765 1.136 1.444 1.677 1.859 2.033 2.213 2.578 2.757 2.908 2.955 3.254 3.357 3.558 3.747 3.931 4.02 4.193 4.362 4.603 4.762 4.931 5.186 5.418 5.638 5.847 6.042 6.289 6.525 6.746 7.018 7.28 7.525 7.796 8.097 8.387 8.697 9.032 9.381 9.739 10.124 10.553 10.981 11.492 12.035 12.562 13.079 13.587 14.038 14.301 14.179 13.816 13.312 12.808 12.334 11.874 11.379 10.927 10.465 10.042 9.672 9.328 9.0 8.696 8.406 8.101 7.84 7.607 7.372 7.129 6.918 6.702 6.479 6.304 6.127 5.94 5.731 5.519 5.376 5.231 5.008 4.843 4.659 4.568 4.401 4.23 4.044 3.944 3.65 3.624 3.5 3.368 3.076 2.917 2.749 2.562 2.359 2.151 1.877 1.002 -5 ,3007 ,KEBNE ,17027061,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:41:51 CET,0.0 0.744 1.087 1.405 1.654 1.846 2.026 2.192 2.49 2.619 2.74 2.795 3.088 3.196 3.42 3.651 3.884 3.993 4.187 4.357 4.603 4.769 4.916 5.109 5.299 5.484 5.663 5.852 6.099 6.317 6.52 6.76 7.011 7.275 7.568 7.91 8.229 8.557 8.92 9.291 9.663 10.059 10.481 10.868 11.354 11.88 12.395 12.926 13.464 13.989 14.287 14.16 13.801 13.378 12.992 12.546 12.081 11.643 11.244 10.824 10.451 10.102 9.773 9.443 9.122 8.844 8.575 8.32 8.092 7.866 7.631 7.428 7.205 6.968 6.786 6.602 6.404 6.201 6.0 5.86 5.704 5.431 5.256 5.093 5.006 4.82 4.623 4.417 4.303 4.0 3.981 3.866 3.74 3.444 3.283 3.118 2.941 2.755 2.481 2.139 1.406 -6 ,2169 ,KEBNE ,17027062,Wed Dec 22 16:00:44 CET,Wed Dec 22 17:40:46 CET,0.0 0.873 1.312 1.665 1.934 2.152 2.331 2.47 2.744 2.89 3.021 3.066 3.389 3.522 3.778 4.034 4.296 4.41 4.594 4.769 5.024 5.191 5.356 5.586 5.804 6.018 6.209 6.386 6.608 6.838 7.07 7.339 7.602 7.846 8.118 8.433 8.723 9.028 9.367 9.71 10.068 10.465 10.905 11.335 11.772 12.241 12.808 13.361 13.955 14.555 14.893 14.796 14.522 14.143 13.703 13.238 12.781 12.321 11.93 11.533 11.178 10.846 10.519 10.218 9.94 9.676 9.396 9.154 8.932 8.697 8.462 8.272 8.061 7.844 7.675 7.5 7.326 7.143 6.942 6.805 6.668 6.451 6.303 6.156 6.074 5.896 5.722 5.538 5.435 5.125 5.108 4.983 4.842 4.542 4.367 4.173 3.993 3.817 3.608 3.367 2.516 -7 ,13596 ,KEBNE ,17027063,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:41:12 CET,0.0 1.059 1.278 1.47 1.621 1.769 1.905 2.032 2.255 2.354 2.446 2.43 2.702 2.779 2.937 3.105 3.262 3.332 3.465 3.599 3.807 3.941 4.07 4.253 4.447 4.634 4.791 4.934 5.131 5.33 5.503 5.691 5.875 6.048 6.245 6.464 6.673 6.899 7.153 7.427 7.691 7.994 8.346 8.674 9.042 9.424 9.825 10.228 10.625 11.036 11.265 11.083 10.643 10.063 9.488 8.927 8.423 7.925 7.458 7.016 6.656 6.309 5.977 5.68 5.393 5.112 4.816 4.562 4.345 4.118 3.865 3.657 3.446 3.218 3.045 2.866 2.671 2.481 2.281 2.135 1.991 1.768 1.607 1.439 1.353 1.166 0.964 0.762 0.67 0.383 0.36 0.244 0.126 -0.149 -0.303 -0.465 -0.655 -0.855 -1.092 -1.383 -2.237 -8 ,25268 ,KEBNE ,17027064,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:40:50 CET,0.0 0.959 1.299 1.56 1.784 1.971 2.14 2.303 2.616 2.762 2.901 2.963 3.276 3.39 3.607 3.809 4.003 4.099 4.289 4.474 4.742 4.912 5.078 5.322 5.547 5.76 5.968 6.17 6.427 6.667 6.883 7.142 7.403 7.653 7.949 8.279 8.575 8.889 9.228 9.591 9.955 10.351 10.784 11.198 11.71 12.271 12.835 13.392 14.024 14.588 14.958 14.908 14.56 14.101 13.561 12.975 12.445 11.961 11.537 11.098 10.714 10.394 10.086 9.782 9.5 9.234 8.936 8.669 8.453 8.229 7.982 7.766 7.538 7.303 7.128 6.944 6.75 6.539 6.326 6.194 6.059 5.836 5.677 5.522 5.442 5.272 5.085 4.89 4.786 4.481 4.434 4.303 4.164 3.865 3.693 3.506 3.309 3.099 2.862 2.527 1.901 -9 ,6197 ,KEBNE ,17027065,Wed Dec 22 16:00:42 CET,Wed Dec 22 17:40:59 CET,0.0 0.709 1.08 1.351 1.56 1.757 1.948 2.144 2.487 2.617 2.738 2.785 3.075 3.195 3.45 3.67 3.877 3.978 4.167 4.348 4.61 4.771 4.923 5.141 5.35 5.547 5.738 5.939 6.183 6.419 6.674 6.97 7.228 7.464 7.742 8.059 8.371 8.697 9.024 9.365 9.722 10.111 10.53 10.947 11.423 11.913 12.496 13.111 13.665 14.125 14.373 14.187 13.814 13.426 13.01 12.522 12.058 11.631 11.248 10.847 10.477 10.152 9.837 9.532 9.243 8.965 8.676 8.419 8.185 7.923 7.655 7.446 7.231 7.019 6.858 6.673 6.473 6.272 6.061 5.904 5.737 5.49 5.323 5.145 5.049 4.85 4.639 4.417 4.304 3.994 3.941 3.822 3.704 3.437 3.271 3.103 2.928 2.72 2.49 2.194 1.402 -10 ,3957 ,KEBNE ,17027066,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:41:39 CET,0.0 0.806 1.141 1.374 1.576 1.798 1.985 2.141 2.44 2.575 2.705 2.767 3.068 3.19 3.422 3.632 3.827 3.919 4.106 4.279 4.537 4.702 4.857 5.084 5.305 5.523 5.736 5.931 6.175 6.422 6.653 6.929 7.178 7.39 7.645 7.931 8.189 8.468 8.786 9.106 9.425 9.789 10.215 10.616 11.077 11.604 12.184 12.798 13.447 13.995 14.298 14.211 13.87 13.425 12.953 12.507 12.075 11.634 11.24 10.848 10.486 10.134 9.784 9.453 9.158 8.9 8.61 8.335 8.108 7.862 7.601 7.382 7.159 6.952 6.784 6.583 6.365 6.147 5.938 5.795 5.648 5.421 5.253 5.069 4.972 4.781 4.578 4.372 4.267 3.966 3.926 3.789 3.636 3.284 3.077 2.849 2.617 2.366 2.104 1.831 1.052 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_60_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_60_61.txt deleted file mode 100644 index 69582baf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_60_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6532 ,TETRA ,17600745,Sun Nov 28 12:44:35 CET,Sun Nov 28 14:41:52 CET,0.0 4.05 4.653 5.039 5.329 5.581 5.82 6.046 6.478 6.677 6.859 6.986 7.321 7.476 7.783 8.071 8.358 8.493 8.739 8.976 9.331 9.556 9.763 10.055 10.331 10.597 10.868 11.114 11.415 11.725 12.028 12.393 12.743 13.071 13.443 13.851 14.252 14.682 15.107 15.563 16.063 16.621 17.256 17.875 18.57 19.27 20.028 20.814 21.583 22.378 23.188 23.495 23.388 23.13 22.78 22.378 22.004 21.669 21.334 20.941 20.563 20.23 19.897 19.558 19.239 18.943 18.639 18.392 18.183 17.95 17.697 17.463 17.224 16.976 16.778 16.576 16.38 16.196 15.989 15.827 15.665 15.425 15.246 15.061 14.97 14.769 14.558 14.323 14.192 13.876 13.819 13.687 13.535 13.217 13.05 12.842 12.605 12.354 12.078 11.748 10.57 -2 ,21885 ,TETRA ,17600746,Sun Nov 28 12:44:37 CET,Sun Nov 28 14:41:30 CET,0.0 1.234 1.642 1.973 2.245 2.494 2.725 2.935 3.34 3.531 3.71 3.837 4.174 4.322 4.643 4.954 5.233 5.367 5.625 5.866 6.2 6.416 6.636 6.946 7.237 7.503 7.757 8.003 8.325 8.667 8.99 9.344 9.667 9.971 10.33 10.751 11.155 11.585 12.042 12.532 13.034 13.578 14.194 14.773 15.405 16.098 16.86 17.64 18.453 19.257 19.9 20.118 20.036 19.789 19.503 19.19 18.855 18.492 18.16 17.844 17.546 17.233 16.885 16.53 16.209 15.943 15.647 15.346 15.106 14.867 14.602 14.391 14.175 13.958 13.799 13.617 13.414 13.213 13.009 12.862 12.708 12.476 12.316 12.151 12.065 11.879 11.686 11.494 11.391 11.096 11.058 10.935 10.796 10.514 10.367 10.179 9.964 9.755 9.524 9.142 7.485 -3 ,190 ,TETRA ,17600747,Sun Nov 28 12:44:39 CET,Sun Nov 28 14:40:49 CET,0.0 1.523 2.058 2.437 2.76 3.057 3.309 3.535 3.945 4.14 4.321 4.454 4.794 4.946 5.246 5.537 5.822 5.954 6.205 6.463 6.838 7.072 7.288 7.586 7.874 8.158 8.436 8.704 9.04 9.364 9.696 10.1 10.462 10.797 11.179 11.588 11.961 12.378 12.813 13.28 13.804 14.372 14.999 15.643 16.359 17.063 17.787 18.55 19.396 20.216 20.867 21.007 20.846 20.594 20.282 19.918 19.543 19.145 18.77 18.372 18.006 17.68 17.373 17.07 16.785 16.523 16.258 16.02 15.773 15.52 15.283 15.075 14.835 14.573 14.391 14.2 14.004 13.808 13.574 13.404 13.236 12.989 12.829 12.671 12.591 12.421 12.232 12.025 11.912 11.607 11.543 11.409 11.271 10.971 10.798 10.624 10.444 10.227 9.958 9.619 8.301 -4 ,15212 ,TETRA ,17600748,Sun Nov 28 12:45:35 CET,Sun Nov 28 14:41:47 CET,0.0 1.086 1.48 1.825 2.15 2.443 2.703 2.943 3.363 3.559 3.738 3.895 4.252 4.411 4.732 5.033 5.31 5.447 5.704 5.949 6.286 6.506 6.727 7.023 7.314 7.603 7.875 8.138 8.469 8.796 9.111 9.478 9.818 10.128 10.489 10.914 11.319 11.756 12.221 12.686 13.147 13.662 14.241 14.79 15.438 16.135 16.85 17.555 18.294 19.053 19.733 19.801 19.455 19.01 18.576 18.161 17.739 17.309 16.934 16.553 16.195 15.888 15.615 15.35 15.089 14.859 14.614 14.378 14.182 13.978 13.758 13.571 13.371 13.157 12.983 12.781 12.568 12.362 12.153 12.016 11.876 11.633 11.47 11.309 11.221 11.026 10.82 10.621 10.51 10.179 10.055 9.895 9.708 9.327 9.157 8.968 8.724 8.486 8.221 7.835 6.913 -5 ,11508 ,TETRA ,17600749,Sun Nov 28 12:45:37 CET,Sun Nov 28 14:43:54 CET,0.0 1.609 2.055 2.39 2.653 2.882 3.104 3.35 3.82 4.021 4.201 4.345 4.696 4.854 5.16 5.441 5.726 5.861 6.098 6.345 6.721 6.958 7.18 7.493 7.797 8.096 8.395 8.666 8.994 9.311 9.627 9.987 10.325 10.671 11.062 11.458 11.817 12.228 12.683 13.146 13.611 14.155 14.792 15.394 16.034 16.713 17.486 18.267 19.029 19.746 20.302 20.389 20.159 19.798 19.39 18.972 18.575 18.171 17.791 17.394 17.056 16.754 16.43 16.119 15.851 15.614 15.376 15.142 14.919 14.692 14.447 14.234 14.016 13.788 13.618 13.44 13.241 13.038 12.835 12.69 12.545 12.323 12.17 12.015 11.935 11.761 11.553 11.342 11.245 10.949 10.872 10.746 10.612 10.307 10.151 9.946 9.705 9.467 9.225 8.886 7.905 -6 ,3248 ,TETRA ,17600750,Sun Nov 28 12:47:35 CET,Sun Nov 28 14:43:43 CET,0.0 1.679 2.086 2.409 2.658 2.876 3.087 3.277 3.586 3.73 3.886 4.017 4.356 4.489 4.748 5.01 5.251 5.356 5.577 5.8 6.112 6.309 6.503 6.791 7.076 7.364 7.638 7.89 8.221 8.544 8.843 9.2 9.555 9.894 10.267 10.676 11.057 11.487 11.946 12.397 12.866 13.378 13.966 14.568 15.243 15.965 16.73 17.534 18.379 19.177 19.806 19.966 19.8 19.455 19.076 18.735 18.366 17.957 17.587 17.208 16.877 16.563 16.249 15.945 15.653 15.368 15.038 14.737 14.501 14.253 13.976 13.735 13.492 13.264 13.087 12.901 12.707 12.523 12.34 12.201 12.054 11.802 11.619 11.439 11.344 11.136 10.939 10.759 10.658 10.36 10.293 10.153 10.01 9.697 9.538 9.371 9.185 8.957 8.678 8.309 6.854 -7 ,31470 ,TETRA ,17600751,Sun Nov 28 12:50:34 CET,Sun Nov 28 14:47:56 CET,0.0 1.538 1.984 2.349 2.666 2.942 3.197 3.431 3.854 4.061 4.246 4.377 4.748 4.919 5.219 5.505 5.786 5.918 6.187 6.455 6.828 7.057 7.273 7.585 7.886 8.188 8.479 8.757 9.115 9.454 9.769 10.156 10.536 10.879 11.254 11.669 12.05 12.468 12.929 13.376 13.823 14.337 14.927 15.497 16.141 16.827 17.553 18.324 19.111 19.784 20.31 20.483 20.312 19.95 19.497 19.064 18.662 18.272 17.925 17.536 17.193 16.896 16.602 16.309 16.014 15.739 15.453 15.195 14.968 14.712 14.443 14.216 13.987 13.751 13.558 13.362 13.152 12.937 12.705 12.538 12.367 12.105 11.934 11.771 11.686 11.507 11.323 11.096 10.97 10.654 10.568 10.442 10.309 10.018 9.857 9.67 9.456 9.2 8.877 8.428 6.946 -8 ,17882 ,TETRA ,17600752,Sun Nov 28 12:49:34 CET,Sun Nov 28 14:45:43 CET,0.0 1.717 2.202 2.598 2.94 3.201 3.433 3.645 4.035 4.213 4.385 4.523 4.859 5.01 5.319 5.609 5.884 6.012 6.258 6.508 6.883 7.111 7.326 7.633 7.923 8.205 8.468 8.727 9.067 9.388 9.686 10.037 10.378 10.705 11.072 11.483 11.885 12.326 12.8 13.288 13.748 14.247 14.827 15.397 16.036 16.711 17.408 18.147 18.938 19.665 20.259 20.383 20.169 19.818 19.402 18.963 18.557 18.165 17.794 17.41 17.06 16.735 16.432 16.139 15.857 15.585 15.274 14.997 14.775 14.552 14.312 14.112 13.885 13.635 13.447 13.237 13.025 12.821 12.608 12.462 12.306 12.056 11.885 11.718 11.638 11.465 11.276 11.066 10.941 10.62 10.533 10.394 10.258 9.96 9.788 9.604 9.417 9.18 8.805 8.274 6.586 -9 ,15251 ,TETRA ,17600753,Sun Nov 28 12:49:36 CET,Sun Nov 28 14:45:20 CET,0.0 2.142 2.698 3.098 3.413 3.715 3.997 4.253 4.707 4.912 5.101 5.241 5.587 5.731 6.001 6.262 6.518 6.641 6.879 7.1 7.431 7.651 7.859 8.163 8.446 8.719 8.975 9.206 9.509 9.791 10.071 10.424 10.749 11.043 11.389 11.814 12.208 12.597 13.014 13.479 13.976 14.519 15.128 15.718 16.394 17.111 17.838 18.594 19.401 20.165 20.806 20.888 20.539 20.108 19.655 19.23 18.852 18.452 18.065 17.648 17.297 16.994 16.696 16.403 16.105 15.807 15.496 15.219 14.986 14.738 14.464 14.23 14.003 13.788 13.614 13.428 13.226 13.02 12.813 12.673 12.533 12.283 12.094 11.906 11.818 11.651 11.471 11.278 11.166 10.862 10.845 10.723 10.588 10.314 10.16 9.991 9.797 9.554 9.309 8.953 7.729 -10 ,20368 ,TETRA ,17600754,Sun Nov 28 12:49:38 CET,Sun Nov 28 14:47:09 CET,0.0 1.844 2.344 2.747 3.049 3.326 3.591 3.837 4.268 4.456 4.638 4.796 5.151 5.309 5.608 5.882 6.146 6.279 6.532 6.769 7.099 7.308 7.516 7.823 8.105 8.362 8.611 8.869 9.211 9.523 9.805 10.141 10.465 10.77 11.139 11.594 12.036 12.484 12.96 13.44 13.901 14.413 14.988 15.541 16.161 16.842 17.579 18.334 19.11 19.832 20.51 20.69 20.483 20.133 19.782 19.416 19.02 18.638 18.323 17.978 17.638 17.316 16.988 16.687 16.426 16.172 15.899 15.663 15.459 15.229 14.993 14.811 14.618 14.413 14.251 14.07 13.883 13.692 13.464 13.3 13.138 12.913 12.77 12.617 12.531 12.355 12.168 11.969 11.869 11.577 11.549 11.431 11.312 11.048 10.886 10.691 10.485 10.242 9.919 9.556 8.423 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_60_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_60_63.txt deleted file mode 100644 index 3d333198..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_60_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31274 ,TETRA ,17600755,Sun Nov 28 12:49:40 CET,Sun Nov 28 14:47:26 CET,0.0 0.536 0.762 0.996 1.19 1.338 1.477 1.602 1.814 1.916 2.009 1.982 2.257 2.331 2.469 2.629 2.799 2.872 3.018 3.16 3.358 3.487 3.617 3.799 3.948 4.088 4.225 4.375 4.565 4.731 4.894 5.087 5.28 5.442 5.599 5.792 5.995 6.207 6.426 6.655 6.889 7.137 7.397 7.629 7.876 8.122 8.365 8.568 8.673 8.608 8.156 7.308 6.5 5.798 5.142 4.528 3.996 3.49 3.037 2.586 2.19 1.834 1.494 1.179 0.888 0.618 0.341 0.101 -0.107 -0.327 -0.569 -0.767 -0.959 -1.154 -1.313 -1.482 -1.649 -1.811 -1.977 -2.098 -2.23 -2.434 -2.562 -2.711 -2.796 -2.955 -3.133 -3.324 -3.419 -3.714 -3.727 -3.834 -3.95 -4.192 -4.299 -4.423 -4.562 -4.718 -4.906 -5.129 -5.545 -2 ,27087 ,TETRA ,17600756,Sun Nov 28 12:49:34 CET,Sun Nov 28 14:46:20 CET,0.0 1.078 1.48 1.715 1.898 2.066 2.231 2.396 2.68 2.799 2.913 2.929 3.217 3.324 3.533 3.717 3.894 3.977 4.133 4.288 4.501 4.635 4.758 4.946 5.145 5.337 5.526 5.698 5.904 6.09 6.261 6.453 6.628 6.797 6.999 7.223 7.428 7.668 7.92 8.139 8.351 8.596 8.853 9.08 9.322 9.561 9.775 9.942 10.049 9.969 9.515 8.743 7.914 7.115 6.372 5.699 5.147 4.649 4.202 3.746 3.355 3.019 2.691 2.365 2.065 1.793 1.505 1.25 1.034 0.815 0.591 0.408 0.212 0.001 -0.164 -0.331 -0.511 -0.691 -0.867 -0.994 -1.132 -1.352 -1.505 -1.656 -1.73 -1.889 -2.045 -2.197 -2.279 -2.562 -2.557 -2.661 -2.773 -2.991 -3.105 -3.23 -3.392 -3.564 -3.719 -3.951 -4.487 -3 ,32137 ,TETRA ,17600757,Sun Nov 28 12:48:35 CET,Sun Nov 28 14:45:11 CET,0.0 0.725 0.98 1.182 1.344 1.502 1.666 1.82 2.08 2.198 2.314 2.355 2.66 2.759 2.974 3.203 3.415 3.499 3.648 3.796 3.999 4.129 4.253 4.412 4.564 4.727 4.878 5.018 5.205 5.382 5.539 5.736 5.961 6.167 6.37 6.584 6.781 6.988 7.222 7.466 7.684 7.939 8.258 8.526 8.78 9.056 9.334 9.533 9.655 9.631 9.204 8.388 7.587 6.823 6.133 5.485 4.885 4.321 3.848 3.398 3.01 2.654 2.316 1.994 1.689 1.402 1.104 0.854 0.637 0.413 0.172 -0.029 -0.227 -0.428 -0.592 -0.766 -0.942 -1.122 -1.293 -1.41 -1.531 -1.73 -1.882 -2.03 -2.099 -2.255 -2.426 -2.59 -2.676 -2.966 -2.956 -3.055 -3.16 -3.378 -3.488 -3.607 -3.747 -3.924 -4.104 -4.31 -4.814 -4 ,16699 ,TETRA ,17600758,Sun Nov 28 12:48:37 CET,Sun Nov 28 14:45:07 CET,0.0 0.939 1.252 1.509 1.713 1.879 2.014 2.142 2.399 2.52 2.632 2.666 2.953 3.044 3.219 3.371 3.53 3.609 3.764 3.927 4.154 4.3 4.438 4.627 4.797 4.955 5.104 5.235 5.41 5.584 5.747 5.941 6.132 6.306 6.502 6.718 6.913 7.149 7.408 7.63 7.847 8.103 8.376 8.637 8.909 9.146 9.392 9.58 9.647 9.519 9.056 8.19 7.342 6.584 5.873 5.22 4.651 4.137 3.685 3.232 2.823 2.463 2.138 1.836 1.552 1.276 0.981 0.719 0.486 0.244 0.011 -0.174 -0.365 -0.555 -0.709 -0.878 -1.047 -1.221 -1.402 -1.534 -1.662 -1.857 -1.998 -2.134 -2.204 -2.364 -2.539 -2.719 -2.814 -3.105 -3.09 -3.19 -3.297 -3.51 -3.63 -3.764 -3.908 -4.078 -4.264 -4.522 -4.962 -5 ,29553 ,TETRA ,17600759,Sun Nov 28 12:49:39 CET,Sun Nov 28 14:46:27 CET,0.0 0.782 1.106 1.307 1.479 1.623 1.763 1.927 2.25 2.382 2.497 2.53 2.822 2.923 3.128 3.309 3.476 3.559 3.715 3.847 4.024 4.155 4.282 4.462 4.623 4.758 4.906 5.05 5.221 5.389 5.552 5.748 5.924 6.08 6.264 6.468 6.663 6.879 7.097 7.313 7.538 7.799 8.074 8.306 8.563 8.818 9.074 9.296 9.387 9.303 8.919 8.148 7.365 6.623 5.912 5.266 4.692 4.167 3.722 3.273 2.863 2.512 2.186 1.868 1.579 1.311 1.011 0.733 0.504 0.281 0.044 -0.156 -0.359 -0.583 -0.767 -0.96 -1.157 -1.344 -1.518 -1.64 -1.774 -1.979 -2.124 -2.279 -2.361 -2.535 -2.721 -2.913 -2.996 -3.267 -3.274 -3.38 -3.493 -3.733 -3.869 -4.01 -4.153 -4.309 -4.492 -4.72 -5.325 -6 ,2562 ,TETRA ,17600760,Sun Nov 28 12:49:35 CET,Sun Nov 28 14:47:25 CET,0.0 1.032 1.436 1.742 1.999 2.21 2.388 2.559 2.864 2.979 3.09 3.095 3.39 3.483 3.653 3.814 3.961 4.035 4.169 4.304 4.506 4.631 4.752 4.923 5.082 5.223 5.364 5.504 5.677 5.833 5.975 6.155 6.337 6.517 6.727 6.956 7.184 7.421 7.645 7.881 8.13 8.372 8.615 8.854 9.108 9.371 9.641 9.866 10.023 9.995 9.523 8.702 7.881 7.08 6.322 5.646 5.083 4.57 4.106 3.647 3.249 2.891 2.555 2.226 1.922 1.656 1.385 1.128 0.883 0.633 0.388 0.187 -0.017 -0.225 -0.38 -0.534 -0.701 -0.87 -1.049 -1.186 -1.328 -1.529 -1.681 -1.844 -1.918 -2.088 -2.262 -2.424 -2.507 -2.792 -2.806 -2.911 -3.008 -3.224 -3.347 -3.476 -3.616 -3.78 -3.956 -4.142 -4.501 -7 ,12135 ,TETRA ,17600761,Sun Nov 28 12:48:35 CET,Sun Nov 28 14:44:46 CET,0.0 0.565 0.886 1.085 1.243 1.391 1.539 1.676 1.894 1.986 2.085 2.09 2.385 2.486 2.66 2.826 2.989 3.06 3.209 3.34 3.517 3.638 3.753 3.919 4.064 4.193 4.33 4.475 4.668 4.853 5.036 5.267 5.482 5.68 5.907 6.13 6.335 6.566 6.801 7.043 7.278 7.522 7.78 8.021 8.291 8.535 8.73 8.882 8.967 8.885 8.45 7.582 6.755 6.031 5.354 4.728 4.19 3.68 3.207 2.722 2.294 1.896 1.532 1.217 0.898 0.609 0.33 0.072 -0.151 -0.375 -0.602 -0.8 -1.013 -1.233 -1.402 -1.569 -1.745 -1.929 -2.125 -2.257 -2.382 -2.595 -2.744 -2.887 -2.959 -3.108 -3.275 -3.464 -3.566 -3.866 -3.874 -3.982 -4.094 -4.314 -4.426 -4.557 -4.693 -4.848 -5.05 -5.361 -5.921 -8 ,340 ,TETRA ,17600762,Sun Nov 28 12:48:37 CET,Sun Nov 28 14:45:12 CET,0.0 0.479 0.714 0.862 1.023 1.2 1.359 1.52 1.784 1.89 1.995 1.972 2.266 2.369 2.553 2.712 2.861 2.936 3.078 3.205 3.389 3.504 3.607 3.752 3.899 4.051 4.202 4.342 4.54 4.741 4.919 5.12 5.308 5.484 5.682 5.922 6.167 6.442 6.709 6.966 7.212 7.474 7.77 8.023 8.29 8.558 8.808 8.99 9.082 9.016 8.533 7.653 6.786 5.964 5.257 4.669 4.167 3.692 3.234 2.755 2.363 2.026 1.689 1.362 1.056 0.771 0.476 0.222 0.014 -0.211 -0.455 -0.648 -0.852 -1.077 -1.258 -1.443 -1.629 -1.819 -2.02 -2.153 -2.279 -2.49 -2.645 -2.8 -2.873 -3.022 -3.189 -3.362 -3.455 -3.736 -3.733 -3.832 -3.942 -4.192 -4.328 -4.467 -4.617 -4.794 -5.011 -5.303 -5.921 -9 ,31916 ,TETRA ,17600763,Sun Nov 28 12:48:38 CET,Sun Nov 28 14:46:25 CET,0.0 1.118 1.549 1.883 2.144 2.328 2.502 2.67 2.962 3.088 3.213 3.254 3.538 3.63 3.788 3.932 4.095 4.181 4.35 4.516 4.759 4.902 5.03 5.214 5.379 5.53 5.67 5.81 6.005 6.189 6.367 6.576 6.758 6.934 7.151 7.379 7.564 7.767 7.987 8.203 8.432 8.698 8.984 9.243 9.528 9.763 9.93 10.078 10.2 10.195 9.819 9.039 8.243 7.475 6.796 6.198 5.671 5.177 4.747 4.309 3.926 3.585 3.244 2.925 2.642 2.37 2.073 1.825 1.622 1.405 1.178 0.991 0.797 0.601 0.443 0.277 0.099 -0.088 -0.278 -0.416 -0.556 -0.772 -0.922 -1.073 -1.155 -1.317 -1.483 -1.669 -1.767 -2.069 -2.061 -2.169 -2.28 -2.503 -2.633 -2.766 -2.907 -3.079 -3.253 -3.451 -3.896 -10 ,30087 ,TETRA ,17600764,Sun Nov 28 12:48:41 CET,Sun Nov 28 14:45:54 CET,0.0 0.739 1.118 1.387 1.606 1.791 1.963 2.125 2.427 2.578 2.721 2.78 3.089 3.203 3.419 3.597 3.742 3.816 3.966 4.107 4.31 4.434 4.547 4.708 4.861 5.019 5.172 5.32 5.524 5.714 5.891 6.091 6.279 6.468 6.676 6.888 7.081 7.279 7.489 7.729 7.986 8.245 8.529 8.802 9.102 9.429 9.712 9.919 10.029 9.982 9.678 8.958 8.157 7.428 6.766 6.119 5.548 5.042 4.587 4.13 3.735 3.376 3.051 2.755 2.483 2.225 1.939 1.692 1.489 1.272 1.041 0.847 0.651 0.44 0.271 0.098 -0.095 -0.297 -0.502 -0.65 -0.806 -1.038 -1.193 -1.349 -1.421 -1.572 -1.748 -1.935 -2.024 -2.316 -2.321 -2.429 -2.528 -2.733 -2.85 -2.995 -3.152 -3.31 -3.545 -3.856 -4.47 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_60_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_60_65.txt deleted file mode 100644 index 42f55893..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_60_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30921 ,TETRA ,17600765,Sun Nov 28 12:49:37 CET,Sun Nov 28 14:47:28 CET,0.0 0.532 0.783 0.962 1.125 1.276 1.426 1.576 1.834 1.942 2.04 2.064 2.353 2.432 2.586 2.741 2.897 2.974 3.12 3.264 3.469 3.593 3.708 3.867 4.036 4.207 4.364 4.514 4.699 4.864 5.031 5.238 5.426 5.599 5.793 5.994 6.2 6.444 6.683 6.924 7.15 7.39 7.645 7.853 8.088 8.355 8.615 8.825 9.044 9.126 8.842 8.15 7.347 6.617 5.996 5.399 4.839 4.347 3.911 3.454 3.069 2.728 2.412 2.098 1.794 1.519 1.216 0.956 0.73 0.493 0.258 0.061 -0.148 -0.355 -0.512 -0.68 -0.858 -1.04 -1.233 -1.377 -1.522 -1.731 -1.868 -2.008 -2.082 -2.235 -2.409 -2.607 -2.704 -3.006 -3.055 -3.175 -3.294 -3.532 -3.665 -3.817 -3.996 -4.188 -4.356 -4.555 -4.988 -2 ,30138 ,TETRA ,17600766,Sun Nov 28 12:49:36 CET,Sun Nov 28 14:45:44 CET,0.0 0.923 1.181 1.375 1.575 1.743 1.904 2.05 2.318 2.444 2.546 2.562 2.858 2.958 3.125 3.286 3.455 3.534 3.681 3.823 4.02 4.137 4.253 4.435 4.609 4.768 4.921 5.083 5.284 5.472 5.646 5.833 6.016 6.196 6.407 6.639 6.85 7.065 7.293 7.536 7.786 8.043 8.288 8.506 8.747 9.004 9.264 9.474 9.627 9.593 9.176 8.471 7.742 6.999 6.314 5.68 5.114 4.622 4.216 3.798 3.406 3.051 2.731 2.412 2.113 1.836 1.537 1.273 1.048 0.815 0.566 0.362 0.15 -0.058 -0.21 -0.369 -0.536 -0.705 -0.892 -1.035 -1.187 -1.412 -1.566 -1.729 -1.808 -1.974 -2.141 -2.312 -2.401 -2.687 -2.686 -2.806 -2.945 -3.204 -3.349 -3.504 -3.667 -3.843 -4.069 -4.36 -4.887 -3 ,27185 ,TETRA ,17600767,Sun Nov 28 12:49:37 CET,Sun Nov 28 14:46:15 CET,0.0 0.765 1.034 1.217 1.395 1.57 1.739 1.875 2.111 2.227 2.328 2.329 2.611 2.707 2.889 3.051 3.204 3.28 3.432 3.585 3.791 3.911 4.027 4.198 4.365 4.522 4.681 4.839 5.027 5.196 5.349 5.542 5.741 5.929 6.129 6.349 6.563 6.8 7.041 7.296 7.541 7.785 8.061 8.344 8.653 8.941 9.183 9.385 9.543 9.523 9.155 8.407 7.665 6.969 6.329 5.73 5.211 4.733 4.304 3.897 3.538 3.189 2.861 2.553 2.267 2.002 1.717 1.465 1.249 1.015 0.76 0.554 0.346 0.131 -0.033 -0.194 -0.359 -0.531 -0.719 -0.864 -1.007 -1.223 -1.377 -1.528 -1.605 -1.758 -1.914 -2.066 -2.142 -2.422 -2.417 -2.52 -2.635 -2.864 -2.98 -3.127 -3.283 -3.453 -3.637 -3.85 -4.442 -4 ,20185 ,TETRA ,17600768,Sun Nov 28 12:49:39 CET,Sun Nov 28 14:45:45 CET,0.0 1.012 1.294 1.545 1.78 1.997 2.179 2.335 2.627 2.763 2.885 2.928 3.223 3.318 3.512 3.698 3.865 3.945 4.097 4.246 4.462 4.603 4.741 4.939 5.12 5.29 5.452 5.59 5.752 5.927 6.104 6.302 6.485 6.651 6.852 7.093 7.31 7.528 7.755 7.989 8.231 8.481 8.745 8.971 9.203 9.463 9.71 9.903 10.025 9.987 9.576 8.834 8.091 7.348 6.676 6.048 5.499 5.012 4.576 4.132 3.759 3.427 3.108 2.788 2.471 2.184 1.882 1.616 1.402 1.185 0.943 0.746 0.557 0.349 0.188 0.032 -0.138 -0.315 -0.499 -0.637 -0.771 -0.973 -1.112 -1.256 -1.331 -1.483 -1.641 -1.815 -1.905 -2.188 -2.164 -2.264 -2.372 -2.622 -2.76 -2.885 -3.02 -3.177 -3.352 -3.591 -4.005 -5 ,5014 ,TETRA ,17600769,Sun Nov 28 12:49:41 CET,Sun Nov 28 14:45:25 CET,0.0 0.805 1.06 1.251 1.427 1.591 1.743 1.883 2.133 2.252 2.369 2.39 2.691 2.793 2.967 3.123 3.275 3.352 3.491 3.617 3.813 3.945 4.077 4.271 4.45 4.608 4.76 4.906 5.091 5.269 5.429 5.627 5.813 5.982 6.2 6.442 6.657 6.89 7.125 7.36 7.613 7.897 8.205 8.481 8.762 9.041 9.317 9.556 9.733 9.784 9.458 8.714 7.926 7.162 6.527 5.964 5.428 4.925 4.477 4.033 3.645 3.31 3.001 2.708 2.435 2.167 1.883 1.646 1.435 1.208 0.978 0.779 0.575 0.38 0.227 0.06 -0.113 -0.285 -0.464 -0.589 -0.716 -0.921 -1.066 -1.206 -1.276 -1.431 -1.608 -1.796 -1.896 -2.189 -2.212 -2.32 -2.432 -2.673 -2.812 -2.966 -3.126 -3.314 -3.544 -3.789 -4.335 -6 ,20188 ,TETRA ,17600770,Sun Nov 28 12:49:37 CET,Sun Nov 28 14:49:54 CET,0.0 0.896 1.155 1.36 1.518 1.684 1.873 2.021 2.278 2.408 2.517 2.527 2.821 2.917 3.095 3.262 3.422 3.496 3.649 3.805 4.008 4.139 4.278 4.465 4.62 4.768 4.918 5.074 5.286 5.479 5.662 5.865 6.044 6.219 6.413 6.633 6.862 7.106 7.348 7.6 7.857 8.111 8.386 8.643 8.91 9.185 9.446 9.645 9.795 9.83 9.502 8.731 7.855 7.093 6.429 5.808 5.274 4.786 4.349 3.898 3.52 3.173 2.831 2.493 2.175 1.906 1.639 1.401 1.181 0.952 0.707 0.494 0.286 0.066 -0.1 -0.269 -0.452 -0.645 -0.845 -0.971 -1.1 -1.316 -1.463 -1.607 -1.686 -1.855 -2.021 -2.203 -2.305 -2.598 -2.611 -2.733 -2.861 -3.11 -3.239 -3.38 -3.528 -3.701 -3.886 -4.132 -4.671 -7 ,27507 ,TETRA ,17600771,Sun Nov 28 12:49:37 CET,Sun Nov 28 14:50:07 CET,0.0 0.753 1.108 1.337 1.525 1.699 1.842 1.979 2.241 2.372 2.487 2.51 2.806 2.901 3.072 3.23 3.379 3.449 3.589 3.727 3.928 4.053 4.178 4.364 4.535 4.705 4.873 5.029 5.219 5.392 5.547 5.73 5.914 6.098 6.321 6.555 6.759 6.974 7.211 7.46 7.704 7.958 8.244 8.528 8.839 9.113 9.336 9.549 9.727 9.762 9.451 8.786 8.066 7.333 6.657 6.048 5.483 4.943 4.502 4.069 3.682 3.323 2.982 2.663 2.366 2.094 1.804 1.543 1.301 1.065 0.835 0.614 0.376 0.129 -0.07 -0.267 -0.472 -0.688 -0.898 -1.031 -1.161 -1.354 -1.495 -1.648 -1.729 -1.898 -2.076 -2.265 -2.357 -2.647 -2.671 -2.783 -2.893 -3.141 -3.279 -3.422 -3.574 -3.765 -4.002 -4.274 -4.881 -8 ,12645 ,TETRA ,17600772,Sun Nov 28 12:49:37 CET,Sun Nov 28 14:46:24 CET,0.0 0.803 1.077 1.315 1.535 1.702 1.838 1.984 2.261 2.387 2.504 2.532 2.819 2.912 3.099 3.275 3.438 3.517 3.675 3.826 4.049 4.189 4.313 4.488 4.666 4.832 4.984 5.135 5.324 5.507 5.688 5.889 6.076 6.279 6.51 6.731 6.927 7.144 7.375 7.628 7.893 8.152 8.454 8.726 8.992 9.279 9.586 9.882 10.101 10.174 9.918 9.245 8.554 7.861 7.215 6.62 6.065 5.568 5.135 4.679 4.285 3.943 3.578 3.209 2.895 2.632 2.359 2.107 1.883 1.643 1.387 1.177 0.968 0.747 0.572 0.405 0.244 0.074 -0.117 -0.245 -0.367 -0.567 -0.715 -0.868 -0.942 -1.096 -1.264 -1.442 -1.526 -1.793 -1.795 -1.919 -2.042 -2.27 -2.388 -2.5 -2.641 -2.824 -3.038 -3.326 -4.125 -9 ,4928 ,TETRA ,17600773,Sun Nov 28 12:49:38 CET,Sun Nov 28 14:46:12 CET,0.0 0.707 0.99 1.218 1.427 1.617 1.796 1.96 2.225 2.332 2.434 2.442 2.741 2.842 3.034 3.221 3.399 3.483 3.644 3.793 3.981 4.105 4.231 4.41 4.575 4.73 4.883 5.034 5.232 5.408 5.566 5.777 5.981 6.167 6.382 6.598 6.786 6.998 7.233 7.477 7.715 7.966 8.267 8.565 8.899 9.211 9.49 9.779 10.014 10.058 9.744 9.094 8.404 7.704 7.053 6.429 5.87 5.353 4.902 4.447 4.044 3.685 3.329 2.996 2.701 2.427 2.148 1.908 1.695 1.476 1.24 1.024 0.792 0.565 0.396 0.229 0.052 -0.137 -0.337 -0.47 -0.598 -0.808 -0.963 -1.136 -1.224 -1.4 -1.574 -1.761 -1.86 -2.141 -2.132 -2.242 -2.362 -2.601 -2.73 -2.862 -3.0 -3.2 -3.442 -3.717 -4.356 -10 ,28274 ,TETRA ,17600774,Sun Nov 28 12:49:37 CET,Sun Nov 28 14:45:35 CET,0.0 1.006 1.315 1.546 1.726 1.868 2.018 2.165 2.445 2.573 2.684 2.7 2.991 3.087 3.276 3.444 3.601 3.677 3.818 3.952 4.153 4.285 4.421 4.612 4.783 4.948 5.103 5.252 5.449 5.634 5.82 6.039 6.234 6.416 6.614 6.821 7.013 7.233 7.472 7.71 7.946 8.2 8.46 8.69 8.939 9.228 9.549 9.827 10.038 10.064 9.708 8.991 8.249 7.541 6.887 6.273 5.735 5.245 4.821 4.386 4.002 3.652 3.298 2.95 2.638 2.373 2.097 1.844 1.633 1.409 1.171 0.974 0.763 0.54 0.374 0.21 0.043 -0.135 -0.336 -0.473 -0.612 -0.813 -0.955 -1.114 -1.19 -1.339 -1.5 -1.681 -1.782 -2.082 -2.097 -2.204 -2.321 -2.587 -2.726 -2.881 -3.053 -3.238 -3.445 -3.729 -4.58 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_61_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_61_50.txt deleted file mode 100644 index 9b7412aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_61_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23596 ,KEBNE ,17027067,Wed Dec 22 16:00:44 CET,Wed Dec 22 17:41:23 CET,0.0 1.217 1.525 1.764 1.978 2.162 2.339 2.5 2.787 2.921 3.035 3.062 3.35 3.449 3.653 3.848 4.029 4.111 4.266 4.425 4.645 4.787 4.94 5.165 5.37 5.559 5.738 5.911 6.135 6.351 6.566 6.816 7.053 7.286 7.563 7.876 8.165 8.472 8.792 9.123 9.475 9.874 10.347 10.814 11.329 11.88 12.492 13.112 13.704 14.298 14.757 14.73 14.365 13.864 13.407 12.918 12.415 11.922 11.467 10.978 10.567 10.215 9.871 9.537 9.197 8.871 8.525 8.204 7.923 7.638 7.348 7.102 6.839 6.568 6.354 6.123 5.881 5.631 5.373 5.197 5.01 4.723 4.539 4.349 4.251 4.034 3.786 3.545 3.423 3.112 3.038 2.895 2.732 2.368 2.156 1.927 1.687 1.446 1.183 0.839 -0.76 -2 ,15773 ,KEBNE ,17027068,Wed Dec 22 16:00:44 CET,Wed Dec 22 17:40:50 CET,0.0 0.742 1.117 1.365 1.558 1.746 1.91 2.063 2.338 2.458 2.574 2.596 2.9 3.011 3.226 3.436 3.624 3.715 3.894 4.07 4.321 4.487 4.642 4.853 5.065 5.277 5.475 5.667 5.906 6.134 6.37 6.644 6.874 7.087 7.347 7.649 7.944 8.249 8.563 8.903 9.247 9.619 10.065 10.522 11.017 11.514 12.051 12.613 13.208 13.78 14.165 14.064 13.714 13.196 12.594 12.027 11.501 11.006 10.546 10.078 9.677 9.296 8.913 8.546 8.209 7.884 7.514 7.175 6.879 6.574 6.252 5.979 5.701 5.406 5.19 4.966 4.726 4.479 4.235 4.072 3.89 3.594 3.398 3.179 3.063 2.843 2.605 2.353 2.211 1.874 1.768 1.609 1.437 1.052 0.839 0.627 0.406 0.157 -0.142 -0.54 -1.596 -3 ,4743 ,KEBNE ,17027069,Wed Dec 22 16:00:44 CET,Wed Dec 22 17:40:41 CET,0.0 1.272 1.59 1.835 2.071 2.281 2.446 2.595 2.852 2.968 3.099 3.171 3.47 3.573 3.799 4.021 4.214 4.306 4.486 4.662 4.921 5.09 5.249 5.476 5.686 5.879 6.073 6.256 6.497 6.74 6.964 7.226 7.477 7.713 7.991 8.302 8.59 8.913 9.253 9.599 9.969 10.381 10.83 11.283 11.797 12.313 12.85 13.386 13.988 14.598 15.022 15.048 14.76 14.336 13.867 13.398 12.947 12.483 12.064 11.614 11.204 10.84 10.486 10.133 9.776 9.45 9.131 8.827 8.545 8.257 7.958 7.714 7.459 7.195 6.977 6.736 6.505 6.262 5.982 5.801 5.627 5.337 5.117 4.879 4.768 4.549 4.314 4.064 3.928 3.605 3.505 3.348 3.194 2.848 2.653 2.455 2.231 1.973 1.693 1.324 0.455 -4 ,9319 ,KEBNE ,17027070,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:40:42 CET,0.0 1.095 1.419 1.681 1.89 2.068 2.245 2.423 2.739 2.877 3.005 3.056 3.369 3.48 3.696 3.89 4.069 4.156 4.328 4.499 4.749 4.913 5.069 5.299 5.524 5.721 5.904 6.096 6.339 6.575 6.793 7.039 7.286 7.531 7.808 8.101 8.383 8.694 9.016 9.359 9.719 10.086 10.493 10.928 11.411 11.879 12.415 13.019 13.638 14.218 14.544 14.413 14.083 13.619 13.115 12.609 12.127 11.646 11.189 10.714 10.259 9.847 9.473 9.102 8.76 8.459 8.138 7.849 7.593 7.328 7.056 6.828 6.59 6.33 6.112 5.892 5.674 5.443 5.197 5.02 4.832 4.544 4.352 4.15 4.042 3.811 3.563 3.306 3.183 2.871 2.77 2.608 2.444 2.104 1.902 1.682 1.455 1.195 0.899 0.514 -0.564 -5 ,14146 ,KEBNE ,17027071,Wed Dec 22 16:00:44 CET,Wed Dec 22 17:40:18 CET,0.0 0.781 1.105 1.329 1.504 1.674 1.834 1.971 2.232 2.372 2.501 2.526 2.827 2.933 3.127 3.303 3.478 3.568 3.741 3.902 4.135 4.288 4.439 4.663 4.873 5.08 5.293 5.498 5.746 5.986 6.223 6.489 6.738 6.983 7.256 7.539 7.808 8.124 8.465 8.817 9.181 9.584 10.038 10.459 10.932 11.465 12.026 12.599 13.244 13.872 14.288 14.183 13.828 13.362 12.811 12.253 11.741 11.232 10.747 10.254 9.834 9.444 9.06 8.698 8.354 8.028 7.67 7.343 7.063 6.778 6.47 6.202 5.932 5.649 5.414 5.174 4.936 4.683 4.417 4.233 4.038 3.737 3.534 3.328 3.217 2.992 2.76 2.509 2.381 2.059 1.981 1.828 1.663 1.321 1.126 0.919 0.703 0.446 0.096 -0.322 -1.287 -6 ,20148 ,KEBNE ,17027072,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:41:26 CET,0.0 0.887 1.16 1.41 1.61 1.79 1.966 2.118 2.416 2.562 2.688 2.728 3.009 3.107 3.292 3.466 3.629 3.713 3.88 4.04 4.268 4.42 4.569 4.785 4.996 5.185 5.374 5.564 5.795 6.026 6.255 6.518 6.763 6.994 7.256 7.541 7.804 8.106 8.434 8.763 9.108 9.497 9.955 10.395 10.878 11.403 11.992 12.606 13.239 13.887 14.33 14.151 13.715 13.229 12.74 12.18 11.596 11.036 10.548 10.056 9.611 9.2 8.809 8.428 8.076 7.761 7.416 7.113 6.859 6.573 6.269 6.021 5.764 5.49 5.271 5.059 4.834 4.59 4.339 4.168 3.992 3.71 3.508 3.3 3.198 2.982 2.739 2.472 2.329 1.998 1.881 1.702 1.508 1.084 0.86 0.626 0.369 0.064 -0.275 -0.713 -1.807 -7 ,13451 ,KEBNE ,17027073,Wed Dec 22 16:00:42 CET,Wed Dec 22 17:40:46 CET,0.0 0.722 0.996 1.267 1.475 1.656 1.832 1.989 2.284 2.427 2.563 2.622 2.93 3.043 3.258 3.465 3.656 3.745 3.92 4.091 4.333 4.488 4.636 4.836 5.025 5.22 5.414 5.608 5.868 6.109 6.326 6.597 6.873 7.122 7.393 7.712 8.025 8.352 8.702 9.068 9.436 9.82 10.256 10.68 11.16 11.673 12.236 12.844 13.446 13.954 14.271 14.146 13.72 13.231 12.747 12.237 11.708 11.188 10.73 10.238 9.812 9.412 8.997 8.59 8.17 7.795 7.445 7.126 6.848 6.566 6.272 6.026 5.763 5.484 5.263 5.037 4.816 4.589 4.335 4.145 3.957 3.669 3.456 3.232 3.118 2.881 2.641 2.379 2.244 1.927 1.811 1.641 1.466 1.076 0.855 0.651 0.429 0.191 -0.08 -0.481 -1.791 -8 ,29355 ,KEBNE ,17027074,Wed Dec 22 16:00:42 CET,Wed Dec 22 17:41:56 CET,0.0 0.814 1.109 1.349 1.549 1.742 1.913 2.067 2.354 2.487 2.613 2.657 2.961 3.067 3.276 3.472 3.656 3.751 3.932 4.096 4.32 4.462 4.607 4.833 5.043 5.234 5.425 5.608 5.85 6.086 6.308 6.558 6.786 7.007 7.254 7.516 7.767 8.048 8.349 8.68 9.011 9.354 9.741 10.121 10.568 11.057 11.619 12.199 12.793 13.406 13.85 13.748 13.32 12.783 12.284 11.788 11.31 10.861 10.434 9.962 9.523 9.153 8.804 8.448 8.116 7.806 7.463 7.151 6.87 6.564 6.253 5.998 5.737 5.458 5.231 4.996 4.757 4.512 4.242 4.06 3.879 3.587 3.37 3.143 3.027 2.787 2.548 2.292 2.159 1.839 1.757 1.604 1.416 1.036 0.851 0.629 0.368 0.09 -0.208 -0.562 -1.254 -9 ,13601 ,KEBNE ,17027075,Wed Dec 22 16:00:42 CET,Wed Dec 22 17:41:17 CET,0.0 0.822 1.095 1.315 1.52 1.712 1.888 2.04 2.292 2.412 2.535 2.589 2.886 2.99 3.195 3.391 3.576 3.667 3.842 4.015 4.255 4.398 4.541 4.766 4.979 5.182 5.381 5.567 5.803 6.026 6.225 6.472 6.718 6.955 7.244 7.578 7.872 8.175 8.518 8.865 9.205 9.59 10.044 10.465 10.94 11.512 12.117 12.681 13.271 13.902 14.358 14.324 13.991 13.532 13.046 12.528 12.032 11.556 11.119 10.637 10.193 9.809 9.425 9.024 8.663 8.33 7.967 7.654 7.373 7.054 6.74 6.49 6.234 5.965 5.747 5.529 5.306 5.055 4.774 4.59 4.397 4.111 3.928 3.727 3.616 3.379 3.142 2.892 2.762 2.44 2.333 2.171 1.994 1.632 1.432 1.206 0.971 0.713 0.399 -0.001 -1.211 -10 ,19043 ,KEBNE ,17027076,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:41:04 CET,0.0 0.865 1.156 1.393 1.609 1.772 1.917 2.061 2.333 2.461 2.588 2.651 2.958 3.067 3.271 3.476 3.673 3.768 3.956 4.135 4.376 4.523 4.673 4.898 5.119 5.341 5.552 5.745 5.977 6.202 6.419 6.663 6.897 7.121 7.393 7.701 7.986 8.31 8.652 8.994 9.351 9.765 10.26 10.738 11.225 11.715 12.249 12.823 13.411 13.959 14.326 14.145 13.69 13.162 12.607 12.044 11.488 10.953 10.502 10.047 9.637 9.241 8.836 8.451 8.089 7.743 7.38 7.058 6.774 6.471 6.152 5.881 5.608 5.334 5.115 4.869 4.611 4.348 4.06 3.87 3.681 3.372 3.162 2.943 2.83 2.6 2.35 2.069 1.925 1.604 1.519 1.375 1.223 0.89 0.677 0.438 0.203 -0.056 -0.386 -0.849 -2.364 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_61_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_61_65.txt deleted file mode 100644 index 08172cfb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_61_65.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24671 ,TETRA ,17600775,Sun Nov 28 12:49:38 CET,Sun Nov 28 14:45:52 CET,0.0 2.556 3.113 3.484 3.798 4.081 4.328 4.56 4.951 5.123 5.289 5.378 5.692 5.828 6.087 6.324 6.537 6.637 6.826 7.014 7.285 7.449 7.607 7.841 8.052 8.266 8.483 8.678 8.923 9.161 9.387 9.651 9.919 10.178 10.434 10.682 10.931 11.21 11.516 11.813 12.107 12.421 12.724 13.021 13.311 13.553 13.777 13.942 13.997 13.741 12.833 11.399 10.059 8.861 7.799 6.832 5.948 5.125 4.44 3.769 3.174 2.623 2.113 1.618 1.144 0.735 0.302 -0.099 -0.454 -0.824 -1.203 -1.527 -1.86 -2.199 -2.468 -2.754 -3.058 -3.368 -3.689 -3.912 -4.141 -4.491 -4.738 -5.005 -5.142 -5.417 -5.693 -6.01 -6.184 -6.54 -6.666 -6.84 -7.036 -7.47 -7.704 -7.954 -8.23 -8.58 -8.951 -9.425 -13.204 -2 ,1802 ,TETRA ,17600776,Sun Nov 28 12:49:40 CET,Sun Nov 28 14:45:52 CET,0.0 1.678 2.095 2.389 2.638 2.848 3.055 3.258 3.589 3.753 3.913 4.004 4.303 4.414 4.649 4.879 5.09 5.185 5.373 5.558 5.812 5.964 6.109 6.318 6.516 6.705 6.893 7.093 7.344 7.556 7.748 8.005 8.269 8.501 8.74 9.005 9.271 9.57 9.86 10.133 10.408 10.723 11.105 11.477 11.83 12.117 12.367 12.572 12.678 12.563 12.019 10.984 9.889 8.86 7.888 6.993 6.201 5.446 4.759 4.035 3.41 2.851 2.312 1.8 1.33 0.9 0.441 0.029 -0.338 -0.701 -1.056 -1.362 -1.682 -2.002 -2.245 -2.509 -2.8 -3.097 -3.401 -3.62 -3.853 -4.208 -4.458 -4.715 -4.853 -5.158 -5.47 -5.799 -5.973 -6.349 -6.549 -6.757 -6.977 -7.462 -7.718 -8.006 -8.321 -8.658 -9.045 -9.528 -11.14 -3 ,22418 ,TETRA ,17600777,Sun Nov 28 12:49:42 CET,Sun Nov 28 14:45:46 CET,0.0 1.303 1.763 2.101 2.362 2.589 2.785 2.953 3.273 3.443 3.602 3.682 3.995 4.127 4.367 4.59 4.815 4.921 5.106 5.286 5.565 5.749 5.929 6.171 6.384 6.586 6.784 6.979 7.225 7.454 7.678 7.972 8.239 8.466 8.728 9.009 9.266 9.528 9.788 10.062 10.343 10.624 10.929 11.257 11.595 11.916 12.274 12.557 12.684 12.619 12.076 10.977 9.942 8.933 7.988 7.048 6.153 5.369 4.677 3.968 3.337 2.752 2.168 1.6 1.101 0.653 0.181 -0.245 -0.621 -1.02 -1.435 -1.773 -2.116 -2.455 -2.716 -2.986 -3.275 -3.583 -3.895 -4.108 -4.335 -4.682 -4.928 -5.184 -5.307 -5.577 -5.867 -6.165 -6.331 -6.7 -6.878 -7.087 -7.297 -7.718 -7.956 -8.243 -8.566 -8.908 -9.359 -9.951 -11.844 -4 ,1817 ,TETRA ,17600778,Sun Nov 28 12:49:37 CET,Sun Nov 28 14:55:07 CET,0.0 1.573 2.066 2.409 2.667 2.889 3.087 3.29 3.676 3.844 3.999 4.1 4.418 4.538 4.753 4.965 5.167 5.268 5.459 5.644 5.889 6.042 6.196 6.408 6.611 6.804 6.982 7.156 7.391 7.62 7.84 8.086 8.294 8.491 8.745 9.031 9.271 9.499 9.734 9.982 10.247 10.52 10.812 11.121 11.45 11.746 12.002 12.173 12.253 12.137 11.531 10.428 9.313 8.265 7.275 6.346 5.505 4.7 4.03 3.317 2.663 2.106 1.553 1.006 0.511 0.08 -0.365 -0.781 -1.133 -1.495 -1.892 -2.214 -2.557 -2.922 -3.208 -3.5 -3.798 -4.107 -4.428 -4.648 -4.871 -5.241 -5.502 -5.768 -5.905 -6.184 -6.47 -6.776 -6.947 -7.318 -7.461 -7.657 -7.869 -8.298 -8.527 -8.781 -9.087 -9.464 -9.893 -10.453 -13.048 -6 ,23109 ,TETRA ,17600780,Sun Nov 28 12:49:39 CET,Sun Nov 28 14:46:49 CET,0.0 2.158 2.62 2.932 3.199 3.435 3.631 3.816 4.18 4.348 4.507 4.612 4.931 5.063 5.298 5.512 5.729 5.824 5.988 6.148 6.39 6.551 6.71 6.937 7.142 7.338 7.518 7.681 7.913 8.147 8.361 8.598 8.824 9.041 9.295 9.589 9.847 10.106 10.375 10.637 10.891 11.177 11.537 11.9 12.23 12.547 12.816 12.997 13.164 13.176 12.686 11.548 10.332 9.181 8.129 7.163 6.325 5.55 4.819 4.06 3.413 2.831 2.282 1.763 1.263 0.809 0.362 -0.053 -0.424 -0.819 -1.244 -1.584 -1.93 -2.296 -2.57 -2.858 -3.179 -3.518 -3.865 -4.109 -4.371 -4.78 -5.054 -5.315 -5.451 -5.746 -6.05 -6.375 -6.551 -6.928 -7.125 -7.33 -7.554 -8.071 -8.355 -8.657 -8.963 -9.283 -9.658 -10.179 -12.267 -7 ,26541 ,TETRA ,17600781,Sun Nov 28 12:49:40 CET,Sun Nov 28 14:45:29 CET,0.0 1.919 2.382 2.737 3.034 3.276 3.497 3.703 4.032 4.174 4.32 4.431 4.763 4.894 5.134 5.369 5.587 5.684 5.877 6.077 6.371 6.545 6.696 6.926 7.146 7.353 7.543 7.71 7.932 8.15 8.368 8.659 8.93 9.15 9.4 9.687 9.95 10.222 10.5 10.81 11.11 11.393 11.704 11.989 12.255 12.527 12.844 13.081 13.194 13.093 12.384 11.177 10.024 8.946 7.963 7.042 6.217 5.412 4.684 3.935 3.295 2.738 2.207 1.701 1.229 0.82 0.395 0.01 -0.321 -0.664 -1.005 -1.282 -1.589 -1.907 -2.142 -2.379 -2.635 -2.923 -3.215 -3.4 -3.599 -3.94 -4.184 -4.452 -4.59 -4.866 -5.149 -5.453 -5.617 -5.974 -6.126 -6.319 -6.532 -7.001 -7.256 -7.51 -7.765 -8.091 -8.529 -9.127 -10.994 -8 ,17284 ,TETRA ,17600782,Sun Nov 28 12:49:37 CET,Sun Nov 28 14:47:23 CET,0.0 2.305 2.83 3.173 3.465 3.716 3.952 4.155 4.494 4.651 4.795 4.886 5.197 5.312 5.532 5.747 5.957 6.062 6.273 6.474 6.729 6.886 7.049 7.297 7.52 7.723 7.919 8.119 8.361 8.578 8.791 9.038 9.268 9.495 9.759 10.05 10.33 10.631 10.905 11.159 11.433 11.731 12.064 12.377 12.689 12.984 13.263 13.454 13.531 13.379 12.705 11.573 10.37 9.21 8.176 7.224 6.327 5.454 4.744 4.064 3.429 2.861 2.357 1.898 1.457 1.038 0.618 0.251 -0.088 -0.464 -0.855 -1.155 -1.473 -1.819 -2.077 -2.334 -2.6 -2.882 -3.176 -3.388 -3.608 -3.942 -4.186 -4.436 -4.562 -4.831 -5.103 -5.403 -5.568 -5.929 -6.083 -6.261 -6.44 -6.824 -7.062 -7.32 -7.569 -7.854 -8.202 -8.626 -10.128 -9 ,26140 ,TETRA ,17600783,Sun Nov 28 12:49:39 CET,Sun Nov 28 14:47:50 CET,0.0 2.272 2.826 3.228 3.597 3.876 4.114 4.323 4.694 4.859 5.008 5.116 5.448 5.586 5.841 6.098 6.347 6.454 6.653 6.834 7.089 7.265 7.427 7.645 7.887 8.132 8.345 8.552 8.811 9.05 9.27 9.527 9.775 9.997 10.229 10.498 10.763 11.066 11.37 11.665 11.974 12.294 12.66 12.987 13.307 13.652 14.006 14.234 14.286 14.034 13.3 12.067 10.829 9.739 8.774 7.867 6.988 6.163 5.44 4.651 3.946 3.34 2.755 2.216 1.744 1.324 0.9 0.511 0.155 -0.227 -0.603 -0.911 -1.255 -1.619 -1.9 -2.198 -2.494 -2.803 -3.15 -3.384 -3.628 -4.022 -4.303 -4.61 -4.76 -5.045 -5.344 -5.699 -5.893 -6.269 -6.437 -6.621 -6.808 -7.258 -7.504 -7.75 -8.032 -8.365 -8.781 -9.346 -11.867 -10 ,32228 ,TETRA ,17600784,Sun Nov 28 12:49:41 CET,Sun Nov 28 14:48:27 CET,0.0 2.551 3.043 3.346 3.594 3.834 4.048 4.243 4.599 4.765 4.911 4.991 5.303 5.423 5.638 5.848 6.063 6.162 6.334 6.494 6.734 6.885 7.023 7.226 7.42 7.599 7.78 7.971 8.205 8.416 8.634 8.891 9.123 9.351 9.618 9.889 10.121 10.364 10.618 10.883 11.149 11.407 11.663 11.926 12.228 12.521 12.757 12.897 12.893 12.634 11.823 10.522 9.363 8.225 7.166 6.206 5.32 4.476 3.728 2.991 2.374 1.799 1.227 0.703 0.228 -0.21 -0.671 -1.092 -1.449 -1.819 -2.23 -2.561 -2.894 -3.251 -3.527 -3.809 -4.113 -4.439 -4.768 -4.987 -5.215 -5.587 -5.846 -6.111 -6.257 -6.565 -6.88 -7.209 -7.377 -7.759 -7.967 -8.176 -8.389 -8.846 -9.101 -9.376 -9.663 -10.011 -10.428 -10.945 -13.146 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_63_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_63_53.txt deleted file mode 100644 index 7a173079..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_63_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14401 ,TETRA ,17600785,Sun Nov 28 12:49:43 CET,Sun Nov 28 14:50:22 CET,0.0 0.749 0.991 1.16 1.332 1.5 1.635 1.763 1.993 2.101 2.208 2.212 2.489 2.564 2.716 2.857 2.997 3.067 3.202 3.325 3.508 3.632 3.741 3.888 4.038 4.195 4.341 4.476 4.656 4.831 4.989 5.173 5.361 5.536 5.748 5.982 6.208 6.464 6.721 6.963 7.199 7.47 7.795 8.122 8.476 8.858 9.295 9.708 10.117 10.507 10.647 10.31 9.855 9.33 8.778 8.279 7.848 7.438 7.057 6.639 6.266 5.954 5.659 5.347 5.011 4.698 4.402 4.139 3.903 3.667 3.434 3.229 3.001 2.767 2.577 2.38 2.195 2.011 1.799 1.651 1.504 1.262 1.088 0.907 0.813 0.623 0.447 0.262 0.162 -0.137 -0.163 -0.283 -0.397 -0.659 -0.823 -1.011 -1.213 -1.443 -1.731 -2.119 -3.303 -2 ,27911 ,TETRA ,17600786,Sun Nov 28 12:49:37 CET,Sun Nov 28 15:04:28 CET,0.0 0.52 0.77 0.98 1.173 1.327 1.45 1.558 1.772 1.875 1.965 1.949 2.234 2.319 2.471 2.608 2.737 2.806 2.936 3.064 3.259 3.384 3.501 3.647 3.79 3.938 4.088 4.232 4.413 4.586 4.745 4.935 5.107 5.266 5.456 5.682 5.898 6.124 6.362 6.609 6.861 7.121 7.41 7.71 8.06 8.43 8.829 9.228 9.572 9.833 9.897 9.537 8.995 8.423 7.892 7.38 6.886 6.408 5.992 5.561 5.152 4.82 4.526 4.234 3.947 3.678 3.376 3.079 2.83 2.595 2.349 2.129 1.914 1.675 1.482 1.284 1.068 0.847 0.623 0.468 0.303 0.063 -0.107 -0.291 -0.381 -0.565 -0.776 -1.004 -1.12 -1.443 -1.493 -1.616 -1.748 -2.034 -2.197 -2.38 -2.581 -2.787 -3.042 -3.374 -3.967 -3 ,5653 ,TETRA ,17600787,Sun Nov 28 12:50:36 CET,Sun Nov 28 14:49:53 CET,0.0 0.393 0.629 0.811 0.995 1.161 1.306 1.444 1.689 1.806 1.909 1.909 2.198 2.28 2.438 2.599 2.75 2.819 2.951 3.086 3.274 3.392 3.507 3.669 3.836 3.988 4.125 4.266 4.443 4.621 4.793 4.977 5.159 5.333 5.529 5.757 5.967 6.185 6.42 6.685 6.969 7.278 7.623 7.981 8.392 8.812 9.244 9.685 10.105 10.447 10.624 10.42 9.997 9.49 8.981 8.48 8.01 7.56 7.154 6.714 6.334 6.014 5.691 5.376 5.081 4.8 4.503 4.236 4.009 3.773 3.488 3.25 3.027 2.793 2.607 2.409 2.208 1.998 1.78 1.623 1.461 1.206 1.02 0.824 0.729 0.547 0.357 0.152 0.039 -0.271 -0.322 -0.452 -0.582 -0.861 -1.028 -1.211 -1.428 -1.68 -1.939 -2.223 -3.079 -4 ,14869 ,TETRA ,17600788,Sun Nov 28 12:52:35 CET,Sun Nov 28 14:51:15 CET,0.0 0.529 0.789 0.986 1.167 1.324 1.446 1.569 1.82 1.931 2.035 2.031 2.316 2.399 2.556 2.719 2.865 2.931 3.059 3.183 3.353 3.465 3.576 3.725 3.862 3.999 4.142 4.276 4.46 4.646 4.818 5.032 5.225 5.406 5.614 5.839 6.053 6.29 6.548 6.823 7.096 7.376 7.697 8.009 8.344 8.703 9.088 9.436 9.778 10.088 10.191 9.947 9.55 9.068 8.557 8.021 7.554 7.105 6.684 6.289 5.949 5.625 5.288 4.956 4.656 4.384 4.089 3.823 3.603 3.378 3.143 2.943 2.727 2.484 2.291 2.087 1.872 1.65 1.432 1.284 1.131 0.9 0.737 0.563 0.475 0.293 0.093 -0.117 -0.225 -0.538 -0.595 -0.729 -0.857 -1.13 -1.283 -1.451 -1.634 -1.831 -2.037 -2.317 -3.182 -5 ,18091 ,TETRA ,17600789,Sun Nov 28 12:52:37 CET,Sun Nov 28 14:51:19 CET,0.0 0.439 0.678 0.857 1.009 1.143 1.26 1.381 1.641 1.761 1.868 1.856 2.146 2.234 2.374 2.503 2.631 2.696 2.827 2.951 3.137 3.261 3.391 3.561 3.699 3.838 3.984 4.128 4.305 4.466 4.621 4.809 4.991 5.18 5.407 5.648 5.863 6.087 6.319 6.576 6.846 7.133 7.435 7.712 8.049 8.435 8.847 9.249 9.674 10.045 10.125 9.778 9.247 8.666 8.181 7.696 7.21 6.758 6.34 5.894 5.496 5.14 4.791 4.444 4.112 3.821 3.523 3.252 3.03 2.798 2.549 2.352 2.159 1.936 1.75 1.561 1.359 1.145 0.925 0.77 0.603 0.336 0.16 -0.01 -0.104 -0.292 -0.491 -0.707 -0.81 -1.118 -1.148 -1.269 -1.398 -1.674 -1.833 -1.997 -2.195 -2.431 -2.676 -3.033 -4.054 -6 ,524 ,TETRA ,17600790,Sun Nov 28 12:52:39 CET,Sun Nov 28 14:52:06 CET,0.0 0.679 0.923 1.098 1.262 1.392 1.503 1.619 1.858 1.968 2.063 2.045 2.326 2.41 2.568 2.721 2.877 2.954 3.096 3.212 3.389 3.516 3.629 3.799 3.965 4.124 4.268 4.41 4.601 4.778 4.946 5.137 5.314 5.476 5.672 5.907 6.142 6.394 6.633 6.889 7.164 7.454 7.808 8.166 8.54 8.925 9.348 9.754 10.139 10.48 10.658 10.393 9.933 9.414 8.891 8.368 7.879 7.417 7.004 6.603 6.25 5.905 5.58 5.271 4.981 4.722 4.438 4.188 3.961 3.709 3.453 3.232 3.003 2.78 2.597 2.417 2.235 2.037 1.826 1.681 1.543 1.331 1.172 0.997 0.917 0.745 0.554 0.387 0.294 -0.014 -0.058 -0.18 -0.306 -0.581 -0.727 -0.879 -1.052 -1.277 -1.536 -1.887 -2.863 -7 ,22469 ,TETRA ,17600791,Sun Nov 28 12:52:41 CET,Sun Nov 28 14:51:19 CET,0.0 0.633 0.892 1.053 1.203 1.361 1.491 1.624 1.865 1.963 2.056 2.029 2.311 2.391 2.541 2.693 2.839 2.909 3.053 3.189 3.37 3.482 3.591 3.75 3.923 4.09 4.239 4.379 4.556 4.729 4.897 5.105 5.3 5.481 5.691 5.924 6.172 6.47 6.759 7.019 7.264 7.54 7.854 8.162 8.533 8.918 9.307 9.706 10.103 10.436 10.583 10.264 9.758 9.275 8.752 8.225 7.755 7.327 6.944 6.513 6.115 5.762 5.425 5.115 4.836 4.559 4.251 3.97 3.726 3.489 3.253 3.058 2.845 2.612 2.449 2.282 2.084 1.874 1.677 1.542 1.38 1.135 0.965 0.772 0.679 0.482 0.252 0.016 -0.103 -0.416 -0.469 -0.603 -0.735 -1.006 -1.148 -1.302 -1.472 -1.669 -1.871 -2.145 -2.926 -8 ,9191 ,TETRA ,17600792,Sun Nov 28 12:52:35 CET,Sun Nov 28 14:54:27 CET,0.0 0.449 0.61 0.763 0.922 1.066 1.192 1.309 1.524 1.611 1.706 1.72 2.01 2.092 2.249 2.395 2.521 2.582 2.708 2.843 3.036 3.137 3.243 3.418 3.579 3.73 3.881 4.029 4.21 4.387 4.55 4.736 4.915 5.088 5.298 5.533 5.766 6.025 6.287 6.552 6.828 7.134 7.462 7.787 8.18 8.574 8.959 9.341 9.73 10.059 10.18 9.955 9.522 9.032 8.564 8.091 7.628 7.212 6.841 6.429 6.047 5.703 5.365 5.029 4.718 4.442 4.134 3.856 3.635 3.397 3.14 2.932 2.707 2.471 2.292 2.103 1.906 1.699 1.483 1.341 1.192 0.952 0.792 0.615 0.53 0.369 0.179 -0.031 -0.139 -0.44 -0.471 -0.603 -0.741 -1.018 -1.175 -1.361 -1.551 -1.737 -1.986 -2.322 -3.12 -9 ,11409 ,TETRA ,17600793,Sun Nov 28 12:52:35 CET,Sun Nov 28 14:53:57 CET,0.0 0.595 0.875 1.098 1.297 1.49 1.641 1.758 1.966 2.053 2.137 2.112 2.388 2.454 2.592 2.734 2.872 2.936 3.056 3.177 3.372 3.505 3.626 3.798 3.954 4.092 4.227 4.364 4.552 4.738 4.92 5.121 5.308 5.483 5.684 5.925 6.159 6.41 6.685 6.949 7.22 7.536 7.877 8.197 8.549 8.928 9.338 9.721 10.093 10.402 10.482 10.14 9.622 9.131 8.612 8.037 7.513 7.066 6.653 6.208 5.832 5.485 5.142 4.823 4.533 4.265 3.987 3.735 3.503 3.269 3.039 2.832 2.608 2.384 2.206 2.015 1.828 1.634 1.426 1.283 1.132 0.891 0.722 0.551 0.463 0.29 0.114 -0.085 -0.193 -0.509 -0.552 -0.673 -0.797 -1.072 -1.246 -1.411 -1.581 -1.785 -2.035 -2.338 -3.089 -10 ,2550 ,TETRA ,17600794,Sun Nov 28 12:52:38 CET,Sun Nov 28 14:51:15 CET,0.0 1.118 1.398 1.571 1.72 1.859 1.977 2.099 2.349 2.462 2.555 2.522 2.8 2.881 3.035 3.203 3.347 3.408 3.536 3.666 3.855 3.97 4.088 4.26 4.406 4.548 4.689 4.824 5.017 5.2 5.371 5.579 5.762 5.937 6.133 6.351 6.567 6.822 7.098 7.361 7.639 7.961 8.31 8.656 9.017 9.377 9.81 10.245 10.645 11.007 11.162 10.917 10.523 10.052 9.551 9.024 8.512 8.04 7.632 7.211 6.861 6.567 6.276 5.985 5.683 5.404 5.124 4.856 4.627 4.393 4.152 3.944 3.721 3.496 3.317 3.136 2.951 2.758 2.552 2.4 2.241 1.998 1.843 1.692 1.609 1.431 1.248 1.063 0.967 0.665 0.646 0.538 0.411 0.126 -0.024 -0.196 -0.392 -0.606 -0.846 -1.203 -1.942 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_63_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_63_58.txt deleted file mode 100644 index beae4f2c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_63_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16227 ,TETRA ,17600795,Sun Nov 28 12:52:40 CET,Sun Nov 28 14:51:48 CET,0.0 0.814 1.105 1.287 1.458 1.609 1.748 1.893 2.129 2.242 2.355 2.357 2.653 2.754 2.951 3.123 3.289 3.379 3.561 3.728 3.969 4.127 4.29 4.52 4.71 4.901 5.081 5.243 5.469 5.68 5.882 6.121 6.337 6.554 6.796 7.068 7.342 7.642 7.952 8.266 8.573 8.907 9.294 9.666 10.096 10.581 11.103 11.613 12.172 12.578 12.687 12.486 12.084 11.689 11.266 10.791 10.311 9.864 9.497 9.132 8.814 8.505 8.191 7.907 7.648 7.421 7.18 6.931 6.718 6.506 6.269 6.068 5.864 5.655 5.492 5.336 5.174 4.983 4.788 4.658 4.517 4.291 4.135 3.977 3.898 3.749 3.596 3.43 3.341 3.042 3.048 2.935 2.819 2.579 2.456 2.34 2.206 2.043 1.837 1.537 0.873 -2 ,505 ,TETRA ,17600796,Sun Nov 28 12:52:36 CET,Sun Nov 28 14:52:16 CET,0.0 0.547 0.762 0.957 1.118 1.261 1.424 1.572 1.834 1.951 2.063 2.065 2.359 2.461 2.663 2.832 2.998 3.091 3.259 3.413 3.626 3.76 3.897 4.091 4.276 4.46 4.642 4.813 5.033 5.245 5.442 5.676 5.889 6.098 6.353 6.628 6.893 7.177 7.461 7.758 8.09 8.485 8.931 9.323 9.738 10.179 10.66 11.113 11.53 11.901 12.103 11.833 11.428 11.015 10.604 10.188 9.781 9.388 9.031 8.663 8.328 8.046 7.793 7.542 7.29 7.045 6.793 6.563 6.355 6.143 5.914 5.721 5.528 5.32 5.156 4.993 4.821 4.632 4.447 4.325 4.187 3.952 3.8 3.656 3.584 3.433 3.269 3.089 2.992 2.702 2.691 2.59 2.491 2.267 2.143 2.015 1.877 1.722 1.54 1.302 0.724 -3 ,10165 ,TETRA ,17600797,Sun Nov 28 12:52:38 CET,Sun Nov 28 14:51:51 CET,0.0 0.691 1.006 1.214 1.413 1.611 1.791 1.971 2.301 2.439 2.566 2.611 2.928 3.04 3.258 3.466 3.665 3.754 3.908 4.057 4.275 4.415 4.558 4.781 4.978 5.153 5.328 5.504 5.724 5.919 6.109 6.335 6.555 6.768 7.006 7.265 7.512 7.773 8.047 8.341 8.652 8.997 9.382 9.751 10.179 10.665 11.161 11.621 12.089 12.523 12.734 12.531 12.132 11.67 11.249 10.838 10.416 10.017 9.676 9.305 8.977 8.687 8.393 8.122 7.873 7.641 7.39 7.159 6.951 6.736 6.52 6.339 6.155 5.969 5.821 5.658 5.491 5.319 5.143 5.024 4.896 4.682 4.53 4.383 4.309 4.158 3.998 3.821 3.725 3.423 3.421 3.322 3.214 2.966 2.843 2.701 2.52 2.329 2.132 1.883 1.411 -4 ,5230 ,TETRA ,17600798,Sun Nov 28 12:52:40 CET,Sun Nov 28 14:52:41 CET,0.0 0.974 1.247 1.459 1.638 1.783 1.908 2.05 2.322 2.431 2.538 2.562 2.871 2.971 3.159 3.353 3.54 3.625 3.771 3.909 4.134 4.283 4.42 4.609 4.782 4.946 5.103 5.266 5.471 5.661 5.853 6.085 6.295 6.491 6.72 6.968 7.222 7.52 7.823 8.115 8.418 8.775 9.19 9.581 9.994 10.41 10.874 11.342 11.819 12.302 12.627 12.505 12.144 11.718 11.286 10.85 10.429 10.071 9.759 9.412 9.096 8.809 8.551 8.291 8.038 7.776 7.479 7.232 7.03 6.827 6.612 6.426 6.225 6.021 5.875 5.732 5.568 5.393 5.23 5.111 4.98 4.793 4.651 4.494 4.418 4.259 4.081 3.908 3.82 3.526 3.53 3.423 3.316 3.095 2.976 2.849 2.708 2.563 2.391 2.185 1.861 -5 ,16050 ,TETRA ,17600799,Sun Nov 28 12:52:42 CET,Sun Nov 28 14:51:32 CET,0.0 0.627 0.838 1.033 1.217 1.377 1.519 1.664 1.927 2.054 2.186 2.212 2.513 2.607 2.778 2.941 3.103 3.186 3.349 3.502 3.713 3.847 3.977 4.158 4.336 4.494 4.644 4.815 5.036 5.239 5.435 5.66 5.883 6.096 6.327 6.576 6.819 7.082 7.359 7.655 7.976 8.324 8.68 9.068 9.514 9.967 10.439 10.868 11.319 11.687 11.807 11.678 11.363 10.92 10.474 10.033 9.604 9.189 8.834 8.499 8.188 7.888 7.584 7.275 6.997 6.757 6.51 6.287 6.09 5.891 5.68 5.495 5.313 5.12 4.944 4.759 4.583 4.41 4.21 4.071 3.935 3.723 3.582 3.418 3.327 3.152 2.985 2.813 2.712 2.398 2.404 2.299 2.189 1.952 1.829 1.685 1.528 1.369 1.208 0.983 0.373 -6 ,22195 ,TETRA ,17600800,Sun Nov 28 12:52:36 CET,Sun Nov 28 14:51:10 CET,0.0 0.599 0.872 1.1 1.33 1.545 1.702 1.826 2.058 2.162 2.264 2.271 2.571 2.669 2.839 3.01 3.171 3.248 3.398 3.536 3.736 3.869 4.004 4.194 4.382 4.561 4.715 4.865 5.073 5.286 5.488 5.728 5.963 6.184 6.427 6.709 6.988 7.281 7.572 7.868 8.179 8.526 8.905 9.259 9.688 10.147 10.588 11.033 11.508 11.892 12.032 11.834 11.436 10.919 10.351 9.824 9.361 8.897 8.466 8.036 7.669 7.335 7.018 6.714 6.443 6.195 5.916 5.663 5.442 5.227 5.025 4.859 4.683 4.495 4.343 4.182 4.017 3.85 3.677 3.562 3.444 3.26 3.119 2.964 2.889 2.739 2.566 2.379 2.286 1.992 1.98 1.876 1.754 1.471 1.344 1.217 1.059 0.882 0.677 0.384 -0.195 -7 ,2941 ,TETRA ,17600801,Sun Nov 28 12:52:38 CET,Sun Nov 28 14:51:23 CET,0.0 0.667 0.968 1.171 1.356 1.525 1.664 1.794 2.043 2.153 2.259 2.288 2.599 2.707 2.92 3.112 3.269 3.34 3.499 3.663 3.886 4.029 4.158 4.338 4.517 4.693 4.866 5.034 5.235 5.422 5.603 5.823 6.04 6.248 6.488 6.753 7.008 7.274 7.554 7.855 8.15 8.491 8.915 9.332 9.786 10.243 10.717 11.174 11.64 12.038 12.247 12.047 11.656 11.22 10.764 10.289 9.847 9.442 9.095 8.765 8.464 8.169 7.876 7.603 7.346 7.116 6.887 6.682 6.498 6.296 6.091 5.916 5.728 5.513 5.329 5.147 4.959 4.774 4.609 4.496 4.369 4.164 4.023 3.877 3.8 3.633 3.451 3.267 3.176 2.884 2.906 2.819 2.712 2.456 2.315 2.16 1.991 1.811 1.579 1.326 0.734 -8 ,20789 ,TETRA ,17600802,Sun Nov 28 12:52:40 CET,Sun Nov 28 14:53:31 CET,0.0 0.538 0.873 1.091 1.242 1.385 1.538 1.684 1.948 2.072 2.186 2.202 2.513 2.623 2.807 2.979 3.146 3.224 3.378 3.534 3.756 3.899 4.029 4.205 4.389 4.566 4.729 4.893 5.098 5.284 5.472 5.706 5.929 6.143 6.379 6.64 6.889 7.165 7.466 7.786 8.115 8.468 8.881 9.285 9.739 10.219 10.694 11.201 11.728 12.122 12.333 12.142 11.72 11.238 10.78 10.371 9.993 9.631 9.312 8.995 8.716 8.421 8.111 7.824 7.556 7.309 7.06 6.835 6.638 6.436 6.213 6.015 5.813 5.612 5.452 5.281 5.104 4.907 4.706 4.577 4.448 4.243 4.088 3.935 3.866 3.72 3.555 3.365 3.269 2.977 3.012 2.916 2.803 2.536 2.39 2.24 2.101 1.951 1.735 1.37 0.553 -9 ,24236 ,TETRA ,17600803,Sun Nov 28 12:52:42 CET,Sun Nov 28 14:52:48 CET,0.0 0.387 0.602 0.794 0.984 1.169 1.343 1.494 1.719 1.83 1.943 1.956 2.247 2.337 2.521 2.681 2.836 2.921 3.094 3.246 3.456 3.599 3.746 3.943 4.128 4.308 4.473 4.633 4.84 5.029 5.228 5.461 5.671 5.879 6.098 6.329 6.567 6.848 7.166 7.5 7.821 8.159 8.539 8.908 9.341 9.775 10.175 10.558 10.979 11.4 11.611 11.441 11.079 10.623 10.171 9.707 9.283 8.892 8.528 8.152 7.808 7.504 7.207 6.926 6.665 6.401 6.134 5.905 5.693 5.464 5.232 5.049 4.854 4.648 4.495 4.339 4.175 3.998 3.806 3.664 3.522 3.309 3.166 3.027 2.962 2.821 2.663 2.5 2.408 2.11 2.124 2.022 1.907 1.606 1.442 1.268 1.07 0.856 0.647 0.468 0.215 -10 ,31945 ,TETRA ,17600804,Sun Nov 28 12:52:37 CET,Sun Nov 28 14:57:46 CET,0.0 0.4 0.657 0.861 1.053 1.233 1.385 1.518 1.761 1.871 1.987 2.012 2.302 2.401 2.599 2.773 2.933 3.011 3.164 3.318 3.528 3.663 3.797 3.986 4.162 4.334 4.504 4.658 4.854 5.046 5.226 5.439 5.643 5.85 6.101 6.359 6.599 6.874 7.164 7.449 7.741 8.06 8.432 8.809 9.211 9.641 10.114 10.602 11.051 11.418 11.645 11.473 11.127 10.732 10.296 9.864 9.496 9.108 8.764 8.436 8.131 7.823 7.482 7.18 6.922 6.676 6.426 6.213 6.02 5.803 5.582 5.407 5.22 5.015 4.85 4.681 4.512 4.342 4.158 4.033 3.907 3.683 3.522 3.37 3.296 3.145 2.988 2.821 2.731 2.437 2.453 2.362 2.262 2.04 1.925 1.807 1.683 1.541 1.386 1.203 0.773 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_63_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_63_64.txt deleted file mode 100644 index 2dc7116f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_63_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13971 ,TETRA ,17600805,Sun Nov 28 12:52:40 CET,Sun Nov 28 14:56:40 CET,0.0 0.737 0.995 1.216 1.423 1.628 1.818 1.985 2.279 2.407 2.518 2.532 2.835 2.934 3.111 3.289 3.464 3.543 3.702 3.85 4.07 4.211 4.336 4.523 4.701 4.865 5.022 5.181 5.389 5.583 5.767 6.002 6.232 6.452 6.708 6.999 7.281 7.582 7.899 8.219 8.55 8.925 9.331 9.734 10.191 10.696 11.278 11.896 12.501 13.116 13.726 13.916 13.798 13.519 13.209 12.897 12.584 12.279 12.01 11.713 11.439 11.188 10.939 10.687 10.441 10.216 9.979 9.765 9.58 9.377 9.162 8.982 8.782 8.577 8.422 8.255 8.092 7.931 7.76 7.644 7.526 7.332 7.184 7.029 6.947 6.769 6.578 6.365 6.253 5.948 5.935 5.811 5.675 5.412 5.283 5.141 4.977 4.779 4.532 4.273 3.802 -2 ,4458 ,TETRA ,17600806,Sun Nov 28 12:52:42 CET,Sun Nov 28 14:50:29 CET,0.0 0.523 0.736 0.893 1.021 1.162 1.319 1.466 1.714 1.832 1.957 2.003 2.307 2.402 2.572 2.732 2.891 2.97 3.119 3.258 3.464 3.598 3.736 3.944 4.144 4.335 4.509 4.687 4.916 5.122 5.317 5.56 5.793 6.019 6.277 6.553 6.819 7.109 7.419 7.738 8.061 8.426 8.849 9.245 9.694 10.198 10.775 11.435 12.129 12.811 13.404 13.615 13.52 13.228 12.872 12.54 12.236 11.934 11.661 11.348 11.04 10.78 10.536 10.281 10.035 9.826 9.611 9.407 9.215 9.014 8.816 8.642 8.455 8.247 8.071 7.898 7.721 7.529 7.342 7.216 7.078 6.863 6.71 6.547 6.464 6.3 6.122 5.921 5.811 5.496 5.465 5.34 5.203 4.926 4.798 4.645 4.469 4.296 4.086 3.792 2.903 -3 ,4189 ,TETRA ,17600807,Sun Nov 28 12:52:38 CET,Sun Nov 28 14:52:11 CET,0.0 0.849 1.144 1.361 1.539 1.698 1.843 1.976 2.22 2.343 2.459 2.489 2.794 2.889 3.072 3.243 3.403 3.478 3.635 3.8 4.032 4.178 4.318 4.516 4.71 4.908 5.088 5.256 5.471 5.673 5.866 6.102 6.324 6.545 6.794 7.066 7.335 7.617 7.907 8.228 8.586 8.949 9.347 9.751 10.197 10.672 11.225 11.809 12.456 13.077 13.507 13.613 13.515 13.312 13.024 12.703 12.388 12.064 11.773 11.466 11.183 10.921 10.673 10.417 10.17 9.923 9.629 9.383 9.179 8.964 8.72 8.505 8.286 8.061 7.895 7.721 7.523 7.323 7.116 6.972 6.82 6.562 6.382 6.202 6.119 5.966 5.805 5.626 5.525 5.212 5.165 5.04 4.907 4.605 4.448 4.282 4.104 3.899 3.667 3.376 2.699 -4 ,24793 ,TETRA ,17600808,Sun Nov 28 12:52:38 CET,Sun Nov 28 14:51:06 CET,0.0 0.841 1.182 1.41 1.602 1.772 1.917 2.063 2.354 2.474 2.589 2.621 2.918 3.016 3.2 3.379 3.542 3.615 3.77 3.918 4.131 4.271 4.397 4.579 4.759 4.943 5.138 5.326 5.557 5.786 5.991 6.22 6.462 6.697 6.965 7.272 7.553 7.847 8.166 8.505 8.841 9.203 9.63 10.065 10.557 11.099 11.746 12.431 13.122 13.812 14.445 14.673 14.522 14.276 13.978 13.647 13.348 13.042 12.766 12.455 12.153 11.859 11.556 11.274 11.021 10.794 10.55 10.317 10.116 9.907 9.692 9.523 9.351 9.159 9.004 8.838 8.66 8.483 8.291 8.162 8.029 7.796 7.633 7.47 7.387 7.208 7.031 6.851 6.75 6.457 6.447 6.34 6.221 5.954 5.816 5.663 5.501 5.305 5.013 4.7 4.328 -5 ,22169 ,TETRA ,17600809,Sun Nov 28 12:52:39 CET,Sun Nov 28 14:51:13 CET,0.0 0.602 0.88 1.087 1.267 1.422 1.566 1.692 1.912 2.014 2.118 2.111 2.396 2.488 2.656 2.814 2.979 3.055 3.196 3.343 3.545 3.682 3.821 4.015 4.202 4.383 4.563 4.724 4.92 5.113 5.306 5.527 5.739 5.954 6.189 6.453 6.709 6.99 7.3 7.622 7.957 8.327 8.729 9.12 9.591 10.112 10.687 11.335 12.007 12.613 13.167 13.317 13.127 12.832 12.512 12.183 11.876 11.56 11.245 10.892 10.589 10.351 10.128 9.901 9.687 9.486 9.266 9.062 8.846 8.615 8.394 8.214 8.029 7.842 7.697 7.542 7.374 7.196 7.017 6.877 6.718 6.475 6.314 6.142 6.05 5.86 5.669 5.485 5.384 5.077 5.053 4.948 4.83 4.566 4.431 4.295 4.147 3.951 3.732 3.471 2.684 -6 ,4247 ,TETRA ,17600810,Sun Nov 28 12:52:42 CET,Sun Nov 28 14:51:11 CET,0.0 0.555 0.819 1.054 1.259 1.416 1.551 1.675 1.934 2.061 2.183 2.206 2.517 2.622 2.83 3.013 3.178 3.258 3.412 3.562 3.787 3.932 4.068 4.261 4.44 4.632 4.826 5.005 5.238 5.461 5.664 5.893 6.123 6.366 6.65 6.96 7.267 7.58 7.883 8.209 8.544 8.922 9.37 9.782 10.276 10.838 11.42 12.003 12.615 13.283 13.825 13.911 13.762 13.493 13.168 12.845 12.505 12.166 11.856 11.508 11.194 10.907 10.617 10.336 10.07 9.825 9.589 9.373 9.172 8.956 8.745 8.567 8.349 8.126 7.971 7.808 7.635 7.454 7.274 7.152 7.018 6.799 6.641 6.473 6.391 6.226 6.05 5.855 5.749 5.455 5.444 5.332 5.205 4.903 4.737 4.571 4.408 4.178 3.919 3.681 2.953 -7 ,25094 ,TETRA ,17600811,Sun Nov 28 12:52:44 CET,Sun Nov 28 14:51:17 CET,0.0 0.488 0.737 0.979 1.196 1.366 1.514 1.67 1.972 2.095 2.218 2.232 2.524 2.616 2.805 2.984 3.151 3.242 3.43 3.597 3.824 3.968 4.1 4.289 4.496 4.701 4.881 5.046 5.263 5.471 5.682 5.937 6.163 6.383 6.64 6.912 7.165 7.455 7.774 8.102 8.428 8.795 9.212 9.598 10.012 10.478 11.01 11.571 12.176 12.811 13.43 13.623 13.499 13.245 12.894 12.529 12.172 11.817 11.477 11.095 10.765 10.452 10.144 9.875 9.619 9.383 9.147 8.932 8.735 8.514 8.278 8.087 7.886 7.671 7.499 7.305 7.095 6.885 6.664 6.516 6.366 6.115 5.947 5.782 5.708 5.545 5.359 5.169 5.069 4.78 4.764 4.666 4.559 4.283 4.112 3.929 3.733 3.508 3.186 2.747 1.919 -8 ,16338 ,TETRA ,17600812,Sun Nov 28 12:53:34 CET,Sun Nov 28 14:53:06 CET,0.0 0.929 1.32 1.557 1.76 1.918 2.061 2.209 2.468 2.576 2.687 2.711 3.006 3.104 3.297 3.48 3.645 3.719 3.863 4.005 4.225 4.377 4.52 4.707 4.89 5.068 5.232 5.399 5.623 5.833 6.022 6.237 6.463 6.694 6.947 7.219 7.49 7.776 8.063 8.381 8.745 9.159 9.6 9.999 10.438 10.934 11.501 12.103 12.704 13.358 13.987 14.241 14.189 13.958 13.621 13.212 12.82 12.425 12.07 11.702 11.364 11.057 10.792 10.565 10.347 10.142 9.888 9.634 9.423 9.212 8.987 8.805 8.63 8.444 8.297 8.124 7.923 7.719 7.526 7.405 7.282 7.071 6.922 6.759 6.67 6.492 6.306 6.119 6.02 5.729 5.723 5.608 5.477 5.163 4.99 4.823 4.633 4.413 4.106 3.73 2.921 -9 ,13905 ,TETRA ,17600813,Sun Nov 28 12:53:36 CET,Sun Nov 28 14:52:24 CET,0.0 0.441 0.719 0.941 1.098 1.232 1.367 1.522 1.805 1.913 2.013 2.02 2.325 2.429 2.645 2.854 3.057 3.152 3.313 3.457 3.648 3.785 3.926 4.112 4.29 4.473 4.66 4.83 5.039 5.242 5.437 5.675 5.909 6.134 6.379 6.646 6.905 7.179 7.472 7.794 8.112 8.459 8.863 9.268 9.747 10.237 10.762 11.328 11.929 12.537 13.043 13.189 13.114 12.968 12.736 12.443 12.138 11.848 11.58 11.293 11.04 10.793 10.54 10.282 10.029 9.796 9.539 9.31 9.111 8.903 8.699 8.535 8.361 8.17 8.022 7.855 7.671 7.473 7.255 7.111 6.972 6.748 6.586 6.43 6.35 6.167 5.976 5.783 5.677 5.374 5.346 5.231 5.108 4.839 4.679 4.512 4.34 4.124 3.839 3.382 2.17 -10 ,14031 ,TETRA ,17600814,Sun Nov 28 12:53:38 CET,Sun Nov 28 14:51:34 CET,0.0 0.625 0.902 1.121 1.29 1.431 1.576 1.71 1.953 2.069 2.178 2.211 2.512 2.61 2.803 2.973 3.122 3.195 3.335 3.47 3.673 3.806 3.937 4.132 4.326 4.51 4.671 4.82 5.026 5.231 5.433 5.678 5.917 6.152 6.411 6.684 6.954 7.243 7.548 7.874 8.199 8.553 8.972 9.41 9.901 10.398 10.966 11.593 12.273 12.93 13.43 13.524 13.347 13.091 12.74 12.373 12.067 11.742 11.429 11.097 10.817 10.578 10.331 10.091 9.874 9.674 9.466 9.277 9.096 8.889 8.666 8.482 8.288 8.082 7.905 7.711 7.509 7.302 7.101 6.97 6.84 6.628 6.471 6.301 6.216 6.02 5.804 5.594 5.488 5.18 5.119 4.973 4.833 4.573 4.42 4.251 4.058 3.829 3.575 3.239 2.275 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_63_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_63_65.txt deleted file mode 100644 index 3ff80844..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_63_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1902 ,TETRA ,17600815,Sun Nov 28 12:53:40 CET,Sun Nov 28 14:51:19 CET,0.0 0.598 0.899 1.087 1.248 1.39 1.535 1.675 1.925 2.041 2.148 2.15 2.454 2.551 2.767 2.967 3.125 3.2 3.351 3.495 3.718 3.863 4.002 4.199 4.364 4.525 4.698 4.872 5.1 5.318 5.509 5.751 5.98 6.186 6.415 6.667 6.902 7.15 7.442 7.768 8.098 8.453 8.85 9.237 9.662 10.105 10.614 11.12 11.644 12.145 12.448 12.317 11.991 11.619 11.202 10.772 10.36 9.984 9.655 9.301 8.981 8.677 8.365 8.067 7.787 7.537 7.261 6.986 6.748 6.507 6.257 6.048 5.814 5.57 5.4 5.217 5.034 4.86 4.672 4.54 4.41 4.202 4.049 3.884 3.794 3.594 3.365 3.12 3.004 2.673 2.61 2.484 2.345 2.015 1.827 1.652 1.477 1.246 0.94 0.548 -0.686 -2 ,16537 ,TETRA ,17600816,Sun Nov 28 12:53:34 CET,Sun Nov 28 14:51:24 CET,0.0 0.666 0.917 1.119 1.296 1.451 1.599 1.748 2.026 2.151 2.266 2.274 2.574 2.671 2.875 3.075 3.253 3.34 3.511 3.667 3.883 4.029 4.176 4.385 4.591 4.789 4.972 5.16 5.389 5.586 5.782 6.032 6.275 6.512 6.782 7.071 7.342 7.615 7.908 8.237 8.56 8.897 9.298 9.692 10.119 10.579 11.089 11.597 12.106 12.561 12.854 12.705 12.284 11.789 11.302 10.831 10.37 9.915 9.505 9.102 8.737 8.404 8.059 7.719 7.414 7.147 6.891 6.676 6.499 6.306 6.081 5.891 5.686 5.463 5.288 5.107 4.917 4.696 4.476 4.312 4.121 3.823 3.623 3.439 3.345 3.138 2.918 2.682 2.559 2.22 2.12 1.965 1.81 1.498 1.325 1.136 0.941 0.7 0.434 0.106 -0.628 -3 ,17723 ,TETRA ,17600817,Sun Nov 28 12:53:35 CET,Sun Nov 28 14:53:27 CET,0.0 0.722 1.021 1.241 1.409 1.557 1.704 1.846 2.124 2.248 2.36 2.365 2.671 2.772 2.968 3.139 3.317 3.402 3.55 3.7 3.911 4.048 4.185 4.383 4.572 4.747 4.91 5.07 5.283 5.487 5.688 5.924 6.146 6.356 6.599 6.866 7.112 7.375 7.65 7.958 8.3 8.67 9.054 9.442 9.872 10.319 10.828 11.327 11.829 12.341 12.726 12.737 12.471 12.098 11.694 11.273 10.882 10.508 10.185 9.863 9.568 9.284 8.984 8.701 8.459 8.237 8.003 7.799 7.605 7.392 7.19 7.033 6.845 6.648 6.504 6.355 6.201 6.033 5.85 5.715 5.566 5.355 5.221 5.07 4.997 4.852 4.69 4.505 4.397 4.09 4.082 3.961 3.83 3.558 3.421 3.285 3.121 2.933 2.721 2.464 1.769 -4 ,31976 ,TETRA ,17600818,Sun Nov 28 12:53:36 CET,Sun Nov 28 14:53:21 CET,0.0 0.71 0.99 1.26 1.49 1.655 1.821 1.984 2.279 2.416 2.527 2.545 2.861 2.974 3.164 3.33 3.492 3.569 3.718 3.863 4.07 4.202 4.33 4.523 4.703 4.87 5.032 5.188 5.388 5.579 5.767 6.004 6.221 6.424 6.66 6.916 7.16 7.428 7.709 7.994 8.294 8.634 9.039 9.428 9.811 10.232 10.738 11.26 11.75 12.182 12.511 12.39 12.044 11.681 11.309 10.883 10.47 10.102 9.75 9.39 9.087 8.802 8.527 8.262 7.995 7.727 7.424 7.148 6.919 6.7 6.479 6.278 6.044 5.798 5.609 5.398 5.179 4.968 4.75 4.596 4.448 4.221 4.066 3.902 3.81 3.614 3.421 3.234 3.14 2.843 2.807 2.668 2.519 2.216 2.04 1.827 1.611 1.371 1.081 0.728 0.134 -5 ,6561 ,TETRA ,17600819,Sun Nov 28 12:53:39 CET,Sun Nov 28 14:51:38 CET,0.0 0.879 1.129 1.362 1.544 1.721 1.892 2.025 2.283 2.415 2.53 2.534 2.844 2.944 3.122 3.303 3.478 3.557 3.711 3.856 4.068 4.212 4.345 4.535 4.722 4.904 5.07 5.234 5.459 5.673 5.881 6.12 6.333 6.529 6.765 7.031 7.273 7.536 7.822 8.124 8.444 8.804 9.199 9.563 9.961 10.383 10.85 11.33 11.823 12.312 12.649 12.598 12.259 11.8 11.367 10.952 10.555 10.183 9.822 9.441 9.116 8.805 8.492 8.188 7.906 7.654 7.382 7.126 6.905 6.695 6.474 6.282 6.088 5.884 5.722 5.558 5.385 5.203 5.019 4.887 4.745 4.513 4.351 4.178 4.086 3.907 3.709 3.506 3.404 3.097 3.078 2.961 2.82 2.517 2.362 2.2 2.014 1.81 1.569 1.276 0.707 -6 ,10685 ,TETRA ,17600820,Sun Nov 28 12:53:41 CET,Sun Nov 28 14:51:33 CET,0.0 0.59 0.874 1.084 1.27 1.458 1.624 1.763 2.022 2.155 2.266 2.261 2.559 2.663 2.853 3.025 3.186 3.267 3.437 3.59 3.805 3.942 4.075 4.264 4.445 4.632 4.815 4.982 5.184 5.378 5.569 5.795 5.993 6.195 6.444 6.712 6.969 7.238 7.526 7.828 8.139 8.483 8.863 9.251 9.702 10.177 10.705 11.25 11.787 12.289 12.614 12.598 12.366 11.984 11.563 11.154 10.754 10.367 10.008 9.623 9.3 8.988 8.664 8.368 8.078 7.798 7.515 7.273 7.049 6.793 6.534 6.329 6.114 5.868 5.674 5.49 5.31 5.136 4.974 4.864 4.747 4.543 4.387 4.239 4.16 3.974 3.785 3.578 3.465 3.159 3.109 2.979 2.858 2.609 2.468 2.318 2.158 1.978 1.748 1.424 0.69 -7 ,10893 ,TETRA ,17600821,Sun Nov 28 12:53:35 CET,Sun Nov 28 14:54:02 CET,0.0 0.444 0.783 1.003 1.158 1.293 1.429 1.567 1.844 1.964 2.063 2.063 2.352 2.442 2.632 2.799 2.955 3.032 3.188 3.34 3.552 3.684 3.81 3.973 4.127 4.29 4.461 4.62 4.833 5.04 5.225 5.443 5.638 5.828 6.053 6.304 6.56 6.827 7.099 7.385 7.679 8.019 8.405 8.79 9.225 9.682 10.184 10.701 11.183 11.58 11.818 11.737 11.48 11.128 10.716 10.299 9.909 9.535 9.196 8.836 8.485 8.158 7.84 7.534 7.262 7.001 6.719 6.475 6.265 6.05 5.81 5.609 5.4 5.159 4.98 4.79 4.577 4.354 4.133 3.981 3.813 3.558 3.384 3.209 3.123 2.956 2.788 2.607 2.505 2.206 2.182 2.076 1.954 1.685 1.55 1.395 1.21 0.989 0.733 0.396 -0.708 -8 ,22949 ,TETRA ,17600822,Sun Nov 28 12:53:40 CET,Sun Nov 28 14:53:30 CET,0.0 0.647 0.918 1.129 1.308 1.476 1.634 1.779 2.061 2.188 2.298 2.324 2.61 2.706 2.905 3.085 3.248 3.326 3.475 3.613 3.822 3.965 4.097 4.277 4.452 4.624 4.786 4.939 5.122 5.295 5.477 5.7 5.908 6.105 6.332 6.593 6.841 7.108 7.378 7.651 7.942 8.285 8.673 9.044 9.495 9.96 10.436 10.908 11.378 11.843 12.089 11.965 11.695 11.361 10.974 10.561 10.142 9.743 9.369 8.974 8.659 8.371 8.073 7.781 7.515 7.292 7.048 6.82 6.618 6.416 6.214 6.045 5.861 5.657 5.505 5.346 5.18 5.007 4.817 4.687 4.557 4.366 4.222 4.073 4.001 3.836 3.658 3.47 3.362 3.039 3.011 2.889 2.768 2.523 2.385 2.238 2.067 1.861 1.587 1.228 0.266 -9 ,14283 ,TETRA ,17600823,Sun Nov 28 12:53:35 CET,Sun Nov 28 14:51:30 CET,0.0 0.738 1.019 1.246 1.455 1.625 1.777 1.926 2.211 2.348 2.47 2.506 2.805 2.903 3.09 3.264 3.432 3.515 3.694 3.855 4.066 4.211 4.351 4.536 4.717 4.905 5.082 5.253 5.482 5.715 5.926 6.153 6.367 6.573 6.825 7.108 7.372 7.637 7.922 8.232 8.541 8.876 9.245 9.621 10.027 10.474 10.967 11.459 11.99 12.473 12.789 12.722 12.384 11.959 11.442 10.911 10.503 10.14 9.792 9.41 9.055 8.732 8.424 8.103 7.799 7.536 7.274 7.041 6.834 6.638 6.423 6.229 6.044 5.855 5.7 5.541 5.371 5.195 5.002 4.862 4.712 4.471 4.306 4.119 4.016 3.817 3.621 3.401 3.295 3.002 2.976 2.855 2.717 2.421 2.272 2.121 1.956 1.754 1.51 1.14 0.245 -10 ,4877 ,TETRA ,17600824,Sun Nov 28 12:53:38 CET,Sun Nov 28 14:50:59 CET,0.0 0.722 0.989 1.253 1.492 1.68 1.842 1.989 2.253 2.382 2.508 2.525 2.832 2.945 3.157 3.352 3.531 3.611 3.769 3.923 4.138 4.276 4.406 4.582 4.757 4.944 5.113 5.264 5.466 5.667 5.854 6.088 6.324 6.537 6.78 7.052 7.302 7.594 7.914 8.228 8.539 8.878 9.263 9.63 10.041 10.477 10.965 11.505 12.04 12.555 12.939 12.813 12.432 11.953 11.474 11.008 10.532 10.105 9.761 9.393 9.073 8.78 8.462 8.175 7.91 7.654 7.381 7.145 6.933 6.699 6.472 6.284 6.09 5.864 5.675 5.495 5.317 5.116 4.913 4.779 4.636 4.417 4.256 4.073 3.974 3.765 3.569 3.361 3.245 2.93 2.876 2.734 2.585 2.276 2.107 1.918 1.71 1.501 1.284 0.95 -0.02 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_64_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_64_54.txt deleted file mode 100644 index d03b4e3d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_64_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11503 ,TETRA ,17600825,Sun Nov 28 12:54:34 CET,Sun Nov 28 14:52:32 CET,0.0 1.15 1.405 1.58 1.718 1.856 1.984 2.097 2.338 2.445 2.538 2.533 2.825 2.921 3.108 3.271 3.431 3.51 3.664 3.805 4.011 4.154 4.287 4.476 4.665 4.848 5.029 5.216 5.442 5.638 5.829 6.069 6.302 6.524 6.774 7.055 7.352 7.677 8.012 8.36 8.719 9.147 9.641 10.083 10.582 11.159 11.797 12.499 13.289 14.174 15.149 15.656 15.74 15.667 15.48 15.239 14.997 14.733 14.492 14.249 14.023 13.794 13.564 13.351 13.155 12.974 12.751 12.544 12.367 12.179 11.988 11.827 11.662 11.495 11.362 11.215 11.058 10.895 10.724 10.601 10.474 10.272 10.125 9.972 9.898 9.744 9.56 9.363 9.263 8.983 8.962 8.85 8.738 8.473 8.327 8.18 8.007 7.817 7.582 7.255 6.405 -2 ,15351 ,TETRA ,17600826,Sun Nov 28 12:54:35 CET,Sun Nov 28 14:52:20 CET,0.0 0.948 1.271 1.514 1.689 1.865 2.013 2.141 2.378 2.493 2.602 2.611 2.906 3.004 3.187 3.36 3.529 3.615 3.778 3.938 4.171 4.316 4.46 4.672 4.864 5.033 5.191 5.352 5.577 5.783 5.965 6.19 6.42 6.641 6.889 7.161 7.423 7.722 8.038 8.373 8.72 9.093 9.519 9.945 10.452 11.028 11.661 12.345 13.113 13.973 14.887 15.445 15.554 15.42 15.217 14.959 14.694 14.442 14.213 13.951 13.663 13.385 13.142 12.915 12.681 12.459 12.222 12.011 11.817 11.605 11.391 11.224 11.046 10.838 10.673 10.513 10.341 10.161 9.98 9.849 9.715 9.493 9.332 9.163 9.076 8.903 8.716 8.51 8.401 8.1 8.046 7.918 7.789 7.493 7.317 7.109 6.896 6.638 6.309 5.859 4.774 -3 ,9454 ,TETRA ,17600827,Sun Nov 28 12:54:38 CET,Sun Nov 28 14:52:09 CET,0.0 0.671 0.89 1.07 1.259 1.428 1.586 1.73 1.982 2.1 2.205 2.213 2.508 2.603 2.787 2.959 3.108 3.186 3.355 3.509 3.729 3.866 3.994 4.183 4.361 4.526 4.685 4.849 5.069 5.282 5.494 5.744 5.971 6.189 6.453 6.758 7.058 7.375 7.704 8.059 8.427 8.829 9.277 9.741 10.28 10.847 11.494 12.209 13.012 13.868 14.742 15.23 15.346 15.267 15.103 14.922 14.679 14.397 14.129 13.859 13.617 13.373 13.128 12.879 12.642 12.434 12.2 11.974 11.781 11.598 11.41 11.237 11.054 10.867 10.72 10.576 10.426 10.246 10.062 9.939 9.792 9.558 9.405 9.252 9.171 8.996 8.822 8.641 8.55 8.265 8.228 8.107 7.97 7.698 7.564 7.413 7.228 6.954 6.637 6.265 5.251 -4 ,16617 ,TETRA ,17600828,Sun Nov 28 12:54:40 CET,Sun Nov 28 14:51:37 CET,0.0 0.712 0.954 1.123 1.288 1.44 1.586 1.724 1.991 2.109 2.216 2.229 2.532 2.645 2.839 3.003 3.18 3.266 3.416 3.569 3.796 3.926 4.058 4.252 4.437 4.628 4.81 4.984 5.202 5.397 5.581 5.803 6.015 6.214 6.45 6.723 6.979 7.257 7.569 7.91 8.27 8.68 9.163 9.645 10.196 10.777 11.431 12.153 12.894 13.679 14.538 15.082 15.222 15.154 14.988 14.783 14.551 14.305 14.071 13.8 13.544 13.308 13.089 12.871 12.668 12.462 12.231 12.035 11.861 11.655 11.433 11.256 11.06 10.863 10.714 10.549 10.376 10.205 10.031 9.913 9.779 9.566 9.42 9.262 9.181 9.023 8.865 8.696 8.597 8.31 8.304 8.177 8.031 7.741 7.596 7.444 7.281 7.101 6.87 6.573 5.723 -5 ,31081 ,TETRA ,17600829,Sun Nov 28 12:57:35 CET,Sun Nov 28 14:55:19 CET,0.0 0.694 0.948 1.127 1.283 1.405 1.508 1.62 1.852 1.957 2.061 2.051 2.334 2.417 2.59 2.759 2.918 2.994 3.138 3.281 3.482 3.606 3.721 3.88 4.043 4.207 4.373 4.535 4.739 4.939 5.138 5.375 5.603 5.838 6.104 6.387 6.663 6.977 7.313 7.659 8.021 8.418 8.846 9.267 9.769 10.327 10.974 11.685 12.463 13.34 14.239 14.723 14.841 14.789 14.624 14.376 14.131 13.885 13.595 13.287 13.031 12.807 12.59 12.371 12.146 11.929 11.713 11.505 11.313 11.115 10.904 10.703 10.499 10.311 10.161 10.0 9.839 9.674 9.499 9.38 9.263 9.077 8.936 8.795 8.723 8.567 8.396 8.212 8.121 7.844 7.808 7.697 7.582 7.311 7.133 6.96 6.813 6.623 6.363 6.029 5.093 -6 ,23497 ,TETRA ,17600830,Sun Nov 28 12:57:37 CET,Sun Nov 28 14:55:53 CET,0.0 0.507 0.766 0.975 1.153 1.317 1.453 1.573 1.823 1.94 2.053 2.085 2.4 2.505 2.696 2.883 3.071 3.153 3.296 3.441 3.665 3.805 3.934 4.12 4.298 4.471 4.647 4.819 5.053 5.286 5.508 5.765 5.996 6.228 6.501 6.804 7.098 7.421 7.772 8.13 8.48 8.853 9.266 9.689 10.214 10.788 11.423 12.106 12.86 13.708 14.619 15.168 15.271 15.173 14.995 14.743 14.487 14.248 14.024 13.792 13.563 13.338 13.108 12.883 12.649 12.413 12.177 11.979 11.804 11.602 11.392 11.201 10.999 10.812 10.665 10.506 10.327 10.138 9.965 9.849 9.715 9.497 9.342 9.173 9.085 8.912 8.729 8.53 8.424 8.117 8.025 7.886 7.757 7.471 7.316 7.129 6.917 6.69 6.405 6.066 5.092 -7 ,26994 ,TETRA ,17600831,Sun Nov 28 12:57:39 CET,Sun Nov 28 14:55:02 CET,0.0 0.708 0.961 1.13 1.298 1.476 1.617 1.738 1.97 2.078 2.188 2.208 2.512 2.611 2.788 2.965 3.127 3.201 3.346 3.484 3.694 3.832 3.969 4.184 4.381 4.549 4.707 4.858 5.066 5.264 5.448 5.69 5.929 6.142 6.38 6.672 6.98 7.311 7.659 8.037 8.422 8.835 9.301 9.756 10.287 10.875 11.525 12.242 13.013 13.811 14.679 15.198 15.343 15.3 15.131 14.869 14.592 14.319 14.051 13.762 13.493 13.247 13.02 12.805 12.593 12.394 12.179 11.967 11.792 11.623 11.438 11.269 11.075 10.87 10.706 10.546 10.394 10.232 10.062 9.94 9.813 9.63 9.494 9.339 9.258 9.092 8.907 8.701 8.602 8.312 8.271 8.141 8.017 7.759 7.609 7.44 7.275 7.088 6.843 6.512 5.431 -8 ,12624 ,TETRA ,17600832,Sun Nov 28 12:57:41 CET,Sun Nov 28 14:54:44 CET,0.0 0.782 1.084 1.321 1.48 1.626 1.757 1.887 2.161 2.289 2.414 2.444 2.737 2.842 3.019 3.182 3.35 3.434 3.596 3.75 3.966 4.098 4.229 4.417 4.603 4.798 4.994 5.171 5.395 5.61 5.811 6.056 6.292 6.517 6.769 7.033 7.289 7.579 7.898 8.252 8.625 9.051 9.546 10.018 10.524 11.073 11.737 12.476 13.267 14.144 15.108 15.621 15.716 15.679 15.572 15.426 15.23 14.987 14.738 14.448 14.155 13.904 13.659 13.426 13.223 13.029 12.811 12.6 12.423 12.221 12.006 11.842 11.656 11.436 11.267 11.1 10.921 10.752 10.591 10.473 10.342 10.133 9.988 9.851 9.778 9.611 9.448 9.271 9.17 8.878 8.852 8.738 8.62 8.331 8.157 7.98 7.787 7.561 7.332 7.014 6.273 -9 ,1747 ,TETRA ,17600833,Sun Nov 28 13:06:36 CET,Sun Nov 28 15:05:53 CET,0.0 0.627 0.896 1.128 1.337 1.493 1.62 1.736 1.968 2.093 2.203 2.184 2.487 2.59 2.768 2.925 3.083 3.161 3.301 3.435 3.641 3.779 3.914 4.118 4.314 4.492 4.672 4.845 5.064 5.282 5.494 5.752 6.004 6.238 6.478 6.749 7.025 7.348 7.697 8.054 8.426 8.833 9.317 9.801 10.34 10.919 11.549 12.236 13.018 13.858 14.693 15.158 15.248 15.155 14.963 14.738 14.492 14.222 13.977 13.713 13.46 13.225 12.96 12.696 12.477 12.291 12.074 11.871 11.704 11.507 11.287 11.107 10.92 10.723 10.576 10.428 10.26 10.07 9.869 9.736 9.599 9.378 9.22 9.046 8.955 8.772 8.581 8.385 8.282 7.989 7.966 7.85 7.739 7.505 7.341 7.164 6.973 6.732 6.43 6.088 4.734 -10 ,21127 ,TETRA ,17600834,Sun Nov 28 13:13:34 CET,Sun Nov 28 15:13:02 CET,0.0 0.571 0.791 0.973 1.157 1.318 1.462 1.597 1.839 1.952 2.06 2.066 2.366 2.462 2.644 2.818 2.997 3.089 3.254 3.406 3.626 3.765 3.894 4.074 4.255 4.432 4.6 4.761 4.976 5.176 5.372 5.628 5.873 6.101 6.364 6.657 6.917 7.206 7.543 7.89 8.246 8.659 9.149 9.621 10.141 10.691 11.318 12.003 12.737 13.503 14.294 14.716 14.745 14.615 14.434 14.215 13.961 13.701 13.446 13.167 12.924 12.703 12.477 12.252 12.05 11.85 11.629 11.428 11.241 11.044 10.839 10.667 10.487 10.301 10.158 10.005 9.832 9.657 9.49 9.375 9.249 9.033 8.882 8.741 8.669 8.504 8.322 8.124 8.02 7.716 7.689 7.586 7.465 7.166 7.014 6.851 6.664 6.469 6.265 5.979 5.006 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_65_66.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_65_66.txt deleted file mode 100644 index 78cc178e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_65_66.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25099 ,TETRA ,17600835,Sun Nov 28 13:14:34 CET,Sun Nov 28 15:13:50 CET,0.0 0.736 1.025 1.242 1.429 1.601 1.749 1.894 2.164 2.294 2.424 2.475 2.787 2.895 3.105 3.296 3.486 3.58 3.762 3.948 4.215 4.376 4.531 4.758 4.975 5.185 5.391 5.596 5.858 6.104 6.344 6.642 6.937 7.233 7.574 7.956 8.318 8.718 9.148 9.578 10.021 10.533 11.131 11.734 12.473 13.285 14.176 15.171 16.317 17.624 19.147 20.261 20.754 20.951 21.031 21.002 20.842 20.626 20.403 20.183 20.012 19.85 19.687 19.533 19.379 19.211 19.018 18.842 18.68 18.524 18.362 18.199 18.019 17.83 17.677 17.511 17.336 17.164 16.971 16.827 16.687 16.484 16.341 16.193 16.109 15.936 15.766 15.591 15.491 15.21 15.198 15.088 14.965 14.702 14.556 14.37 14.161 13.937 13.661 13.323 12.433 -2 ,28277 ,TETRA ,17600836,Sun Nov 28 13:14:36 CET,Sun Nov 28 15:13:52 CET,0.0 0.521 0.808 1.053 1.256 1.445 1.598 1.729 1.98 2.109 2.237 2.291 2.607 2.714 2.929 3.125 3.302 3.391 3.557 3.721 3.973 4.135 4.283 4.499 4.708 4.921 5.134 5.348 5.617 5.879 6.136 6.433 6.724 6.995 7.31 7.683 8.028 8.396 8.802 9.228 9.67 10.159 10.722 11.306 12.009 12.783 13.665 14.614 15.632 16.822 18.19 19.08 19.441 19.565 19.585 19.562 19.481 19.357 19.234 19.12 18.99 18.842 18.691 18.527 18.378 18.233 18.06 17.913 17.776 17.615 17.459 17.338 17.188 17.02 16.885 16.742 16.587 16.41 16.229 16.096 15.958 15.757 15.617 15.464 15.383 15.216 15.042 14.848 14.739 14.45 14.405 14.273 14.141 13.861 13.695 13.526 13.33 13.101 12.824 12.432 11.127 -3 ,14672 ,TETRA ,17600837,Sun Nov 28 13:14:37 CET,Sun Nov 28 15:11:29 CET,0.0 0.565 0.831 1.071 1.28 1.48 1.66 1.805 2.078 2.21 2.335 2.362 2.667 2.776 2.984 3.174 3.368 3.468 3.652 3.819 4.055 4.211 4.363 4.591 4.815 5.024 5.224 5.42 5.677 5.937 6.177 6.464 6.753 7.029 7.359 7.727 8.072 8.446 8.843 9.262 9.688 10.177 10.779 11.399 12.114 12.899 13.809 14.808 15.932 17.205 18.656 19.784 20.372 20.637 20.733 20.731 20.681 20.585 20.459 20.313 20.157 20.001 19.844 19.688 19.532 19.379 19.211 19.047 18.903 18.752 18.587 18.437 18.257 18.07 17.927 17.784 17.633 17.452 17.265 17.152 17.034 16.824 16.677 16.524 16.444 16.272 16.101 15.918 15.811 15.526 15.465 15.325 15.18 14.871 14.705 14.519 14.295 14.028 13.743 13.414 12.282 -4 ,11946 ,TETRA ,17600838,Sun Nov 28 13:14:40 CET,Sun Nov 28 15:10:45 CET,0.0 0.655 0.961 1.204 1.394 1.559 1.717 1.871 2.156 2.289 2.432 2.508 2.819 2.929 3.135 3.322 3.503 3.594 3.772 3.943 4.186 4.348 4.503 4.732 4.959 5.167 5.364 5.552 5.801 6.053 6.306 6.601 6.881 7.166 7.51 7.891 8.236 8.604 9.002 9.453 9.926 10.45 11.058 11.628 12.299 13.071 13.954 14.945 16.075 17.392 18.936 20.071 20.578 20.788 20.85 20.773 20.653 20.543 20.448 20.32 20.15 19.969 19.791 19.63 19.482 19.325 19.142 18.976 18.817 18.658 18.502 18.358 18.198 18.022 17.877 17.742 17.616 17.473 17.306 17.186 17.069 16.888 16.764 16.641 16.576 16.431 16.258 16.068 15.979 15.699 15.649 15.525 15.371 15.05 14.89 14.696 14.488 14.291 14.059 13.713 12.693 -5 ,13262 ,TETRA ,17600839,Sun Nov 28 13:14:35 CET,Sun Nov 28 15:10:30 CET,0.0 0.853 1.12 1.348 1.55 1.758 1.956 2.111 2.372 2.495 2.618 2.643 2.948 3.047 3.244 3.443 3.63 3.715 3.885 4.064 4.341 4.526 4.688 4.902 5.119 5.328 5.525 5.724 5.99 6.23 6.452 6.731 7.003 7.274 7.587 7.916 8.232 8.594 8.987 9.408 9.843 10.317 10.882 11.449 12.129 12.893 13.754 14.736 15.886 17.179 18.622 19.656 20.133 20.356 20.421 20.423 20.356 20.244 20.14 20.019 19.886 19.734 19.572 19.398 19.223 19.069 18.911 18.753 18.604 18.462 18.313 18.185 18.055 17.901 17.775 17.642 17.502 17.365 17.221 17.107 16.994 16.812 16.669 16.514 16.433 16.266 16.083 15.902 15.813 15.535 15.493 15.364 15.234 14.979 14.837 14.668 14.484 14.275 13.991 13.647 13.064 -6 ,3801 ,TETRA ,17600840,Sun Nov 28 13:14:38 CET,Sun Nov 28 15:11:00 CET,0.0 0.54 0.807 1.025 1.201 1.367 1.533 1.693 1.986 2.113 2.233 2.258 2.568 2.685 2.899 3.089 3.269 3.372 3.579 3.754 4.005 4.167 4.32 4.537 4.743 4.944 5.133 5.318 5.566 5.819 6.083 6.4 6.682 6.945 7.249 7.595 7.934 8.3 8.69 9.112 9.569 10.09 10.703 11.317 12.016 12.78 13.675 14.687 15.871 17.23 18.723 19.867 20.401 20.599 20.667 20.657 20.594 20.508 20.399 20.258 20.108 19.953 19.8 19.648 19.494 19.344 19.171 19.004 18.863 18.716 18.56 18.424 18.278 18.123 17.988 17.846 17.705 17.556 17.378 17.26 17.15 16.962 16.823 16.676 16.604 16.458 16.291 16.12 16.038 15.766 15.72 15.6 15.484 15.229 15.09 14.935 14.77 14.591 14.369 14.085 13.492 -7 ,6366 ,TETRA ,17600841,Sun Nov 28 13:14:36 CET,Sun Nov 28 15:11:30 CET,0.0 0.614 0.961 1.242 1.463 1.656 1.833 1.985 2.275 2.407 2.532 2.585 2.905 3.02 3.24 3.446 3.631 3.718 3.899 4.077 4.342 4.519 4.682 4.933 5.19 5.427 5.651 5.879 6.161 6.412 6.661 6.962 7.239 7.512 7.831 8.188 8.547 8.941 9.357 9.81 10.293 10.823 11.426 12.017 12.693 13.459 14.345 15.323 16.435 17.749 19.22 20.272 20.759 21.009 21.122 21.076 20.927 20.752 20.555 20.294 20.057 19.847 19.628 19.431 19.234 19.031 18.817 18.609 18.434 18.246 18.036 17.862 17.663 17.46 17.308 17.147 16.972 16.78 16.575 16.418 16.261 16.029 15.852 15.659 15.558 15.362 15.179 14.992 14.897 14.626 14.591 14.477 14.365 14.124 13.969 13.787 13.601 13.39 13.143 12.81 12.153 -8 ,20252 ,TETRA ,17600842,Sun Nov 28 13:14:36 CET,Sun Nov 28 15:11:08 CET,0.0 0.535 0.835 1.046 1.254 1.436 1.569 1.72 2.026 2.151 2.268 2.299 2.605 2.72 2.94 3.129 3.313 3.404 3.585 3.76 4.004 4.162 4.314 4.541 4.752 4.956 5.173 5.371 5.616 5.864 6.099 6.375 6.65 6.929 7.257 7.598 7.91 8.272 8.688 9.128 9.564 10.045 10.615 11.232 11.982 12.771 13.633 14.621 15.737 16.993 18.476 19.521 20.011 20.24 20.304 20.27 20.167 20.04 19.91 19.746 19.593 19.445 19.296 19.136 18.962 18.813 18.647 18.489 18.344 18.194 18.054 17.932 17.79 17.623 17.48 17.317 17.149 16.975 16.797 16.668 16.533 16.325 16.177 16.021 15.937 15.77 15.582 15.39 15.302 15.025 15.005 14.895 14.763 14.468 14.299 14.12 13.928 13.691 13.4 13.037 12.118 -9 ,11650 ,TETRA ,17600843,Sun Nov 28 13:14:36 CET,Sun Nov 28 15:13:30 CET,0.0 0.782 1.1 1.347 1.551 1.726 1.895 2.062 2.358 2.487 2.614 2.67 2.98 3.097 3.309 3.507 3.695 3.783 3.953 4.123 4.375 4.536 4.696 4.942 5.187 5.42 5.628 5.836 6.125 6.379 6.62 6.913 7.191 7.469 7.784 8.135 8.483 8.853 9.231 9.649 10.099 10.595 11.158 11.714 12.377 13.152 14.031 14.981 16.097 17.423 19.04 20.228 20.753 20.986 21.087 21.138 21.1 20.977 20.838 20.684 20.561 20.435 20.272 20.083 19.91 19.765 19.604 19.456 19.314 19.146 18.968 18.821 18.646 18.447 18.281 18.112 17.967 17.821 17.662 17.538 17.408 17.2 17.044 16.877 16.793 16.627 16.435 16.204 16.085 15.779 15.707 15.57 15.427 15.096 14.903 14.704 14.492 14.251 13.969 13.635 12.817 -10 ,9445 ,TETRA ,17600844,Sun Nov 28 13:14:37 CET,Sun Nov 28 15:12:51 CET,0.0 1.058 1.333 1.6 1.836 2.037 2.231 2.419 2.741 2.898 3.058 3.129 3.45 3.567 3.779 3.983 4.181 4.282 4.482 4.663 4.922 5.091 5.254 5.485 5.706 5.92 6.133 6.351 6.63 6.885 7.134 7.446 7.752 8.042 8.366 8.724 9.078 9.456 9.849 10.271 10.729 11.234 11.791 12.364 13.049 13.824 14.725 15.733 16.841 18.057 19.508 20.535 20.922 21.028 20.988 20.87 20.707 20.533 20.379 20.207 20.018 19.813 19.602 19.412 19.244 19.076 18.884 18.704 18.546 18.381 18.197 18.036 17.868 17.694 17.565 17.427 17.27 17.107 16.935 16.81 16.681 16.485 16.347 16.193 16.109 15.922 15.717 15.493 15.371 15.063 15.003 14.877 14.74 14.423 14.241 14.036 13.811 13.587 13.345 12.992 11.831 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_66_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_66_62.txt deleted file mode 100644 index 3dca4217..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_66_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9203 ,TETRA ,17600845,Sun Nov 28 13:14:40 CET,Sun Nov 28 15:11:39 CET,0.0 1.401 1.875 2.188 2.46 2.712 2.932 3.138 3.537 3.699 3.838 3.938 4.261 4.396 4.638 4.878 5.119 5.236 5.452 5.657 5.951 6.131 6.306 6.57 6.822 7.061 7.293 7.52 7.821 8.123 8.41 8.753 9.087 9.414 9.786 10.168 10.526 10.916 11.328 11.751 12.196 12.685 13.249 13.837 14.487 15.134 15.836 16.581 17.343 18.096 18.821 19.115 18.937 18.588 18.191 17.792 17.405 17.016 16.652 16.291 15.992 15.698 15.412 15.148 14.906 14.684 14.425 14.189 13.98 13.758 13.54 13.336 13.12 12.915 12.752 12.576 12.399 12.218 12.028 11.897 11.756 11.521 11.357 11.194 11.107 10.938 10.743 10.527 10.421 10.13 10.066 9.942 9.82 9.551 9.383 9.2 9.028 8.804 8.507 8.127 6.526 -2 ,12022 ,TETRA ,17600846,Sun Nov 28 13:14:42 CET,Sun Nov 28 15:11:43 CET,0.0 1.5 1.945 2.274 2.566 2.839 3.072 3.288 3.669 3.828 3.973 4.069 4.391 4.531 4.791 5.025 5.241 5.35 5.575 5.793 6.096 6.285 6.466 6.719 6.968 7.218 7.484 7.752 8.07 8.351 8.607 8.914 9.202 9.472 9.791 10.164 10.531 10.916 11.31 11.718 12.145 12.615 13.16 13.683 14.253 14.882 15.576 16.331 17.161 17.971 18.627 18.825 18.652 18.308 17.916 17.535 17.165 16.793 16.477 16.136 15.829 15.534 15.246 15.002 14.757 14.521 14.277 14.037 13.822 13.599 13.376 13.209 13.031 12.842 12.692 12.523 12.353 12.178 11.979 11.821 11.668 11.467 11.319 11.155 11.069 10.889 10.704 10.515 10.413 10.117 10.055 9.913 9.766 9.508 9.366 9.191 8.987 8.743 8.47 8.173 7.327 -3 ,32130 ,TETRA ,17600847,Sun Nov 28 13:14:36 CET,Sun Nov 28 15:13:18 CET,0.0 1.24 1.628 1.956 2.243 2.507 2.737 2.949 3.336 3.491 3.636 3.727 4.039 4.18 4.441 4.675 4.904 5.017 5.238 5.448 5.747 5.941 6.136 6.45 6.766 7.05 7.308 7.553 7.877 8.194 8.502 8.879 9.227 9.555 9.949 10.382 10.788 11.216 11.658 12.155 12.643 13.111 13.635 14.171 14.776 15.422 16.113 16.821 17.575 18.256 18.729 18.823 18.664 18.371 18.014 17.641 17.287 16.923 16.586 16.197 15.807 15.438 15.106 14.811 14.524 14.234 13.936 13.685 13.442 13.194 12.969 12.781 12.589 12.38 12.206 12.026 11.826 11.62 11.404 11.255 11.098 10.845 10.665 10.477 10.388 10.204 10.002 9.788 9.689 9.411 9.339 9.203 9.054 8.709 8.538 8.378 8.202 7.997 7.762 7.42 6.296 -4 ,21612 ,TETRA ,17600848,Sun Nov 28 13:14:37 CET,Sun Nov 28 15:14:01 CET,0.0 1.088 1.518 1.912 2.276 2.558 2.811 3.043 3.447 3.632 3.816 3.976 4.312 4.47 4.757 5.021 5.284 5.408 5.635 5.858 6.179 6.386 6.58 6.844 7.11 7.376 7.63 7.873 8.18 8.483 8.784 9.133 9.461 9.784 10.161 10.568 10.951 11.401 11.88 12.343 12.794 13.268 13.812 14.382 15.026 15.672 16.404 17.157 17.971 18.773 19.382 19.564 19.403 19.084 18.666 18.216 17.783 17.411 17.09 16.719 16.394 16.096 15.795 15.526 15.293 15.069 14.837 14.622 14.4 14.148 13.9 13.71 13.517 13.323 13.168 13.007 12.842 12.668 12.489 12.36 12.222 11.989 11.812 11.639 11.554 11.375 11.201 11.014 10.91 10.63 10.592 10.484 10.367 10.082 9.912 9.735 9.549 9.333 9.076 8.74 7.634 -5 ,6615 ,TETRA ,17600849,Sun Nov 28 13:14:37 CET,Sun Nov 28 15:11:39 CET,0.0 1.108 1.536 1.881 2.178 2.418 2.632 2.842 3.268 3.481 3.676 3.823 4.169 4.324 4.603 4.88 5.147 5.277 5.542 5.771 6.085 6.298 6.498 6.782 7.067 7.337 7.591 7.839 8.161 8.477 8.759 9.103 9.45 9.775 10.142 10.532 10.896 11.274 11.682 12.123 12.569 13.059 13.614 14.175 14.855 15.554 16.274 16.999 17.65 18.306 18.883 19.095 19.074 18.818 18.456 18.049 17.633 17.268 16.943 16.583 16.257 15.944 15.644 15.378 15.114 14.868 14.614 14.369 14.151 13.935 13.721 13.532 13.321 13.102 12.943 12.79 12.624 12.441 12.247 12.115 11.974 11.757 11.612 11.452 11.36 11.179 11.002 10.801 10.7 10.425 10.39 10.272 10.149 9.882 9.727 9.544 9.343 9.136 8.891 8.557 7.887 -6 ,17893 ,TETRA ,17600850,Sun Nov 28 13:14:40 CET,Sun Nov 28 15:11:07 CET,0.0 0.71 1.065 1.352 1.599 1.816 2.016 2.215 2.581 2.742 2.885 2.979 3.297 3.431 3.703 3.968 4.218 4.332 4.554 4.773 5.092 5.293 5.48 5.752 6.01 6.252 6.487 6.722 7.034 7.317 7.577 7.894 8.204 8.493 8.824 9.209 9.575 9.971 10.389 10.814 11.25 11.746 12.319 12.882 13.496 14.131 14.865 15.65 16.45 17.199 17.78 17.989 17.85 17.522 17.147 16.792 16.459 16.126 15.817 15.473 15.154 14.864 14.575 14.283 13.998 13.731 13.453 13.222 13.036 12.819 12.592 12.416 12.22 12.005 11.844 11.687 11.521 11.344 11.157 11.024 10.889 10.686 10.549 10.39 10.3 10.117 9.937 9.755 9.657 9.371 9.28 9.134 9.011 8.729 8.559 8.368 8.187 8.018 7.806 7.532 6.663 -7 ,25985 ,TETRA ,17600851,Sun Nov 28 13:14:37 CET,Sun Nov 28 15:12:34 CET,0.0 1.283 1.716 2.025 2.291 2.535 2.782 3.017 3.448 3.64 3.815 3.969 4.292 4.445 4.739 5.012 5.258 5.371 5.6 5.827 6.14 6.345 6.556 6.856 7.139 7.417 7.691 7.952 8.264 8.562 8.849 9.196 9.527 9.847 10.222 10.661 11.091 11.542 12.003 12.506 13.067 13.643 14.265 14.883 15.571 16.298 17.09 17.898 18.753 19.617 20.302 20.472 20.285 19.952 19.554 19.15 18.754 18.381 18.064 17.729 17.422 17.135 16.817 16.49 16.217 15.993 15.756 15.538 15.339 15.114 14.882 14.699 14.512 14.313 14.148 13.97 13.792 13.621 13.443 13.315 13.171 12.931 12.772 12.615 12.539 12.384 12.204 11.998 11.884 11.589 11.524 11.404 11.276 10.954 10.766 10.568 10.367 10.157 9.892 9.547 8.177 -8 ,5593 ,TETRA ,17600852,Sun Nov 28 13:14:39 CET,Sun Nov 28 15:13:29 CET,0.0 1.448 1.937 2.264 2.548 2.782 3.011 3.242 3.64 3.826 4.008 4.164 4.517 4.68 4.982 5.28 5.571 5.704 5.949 6.192 6.54 6.751 6.962 7.27 7.538 7.776 8.007 8.228 8.518 8.811 9.09 9.416 9.726 10.02 10.351 10.718 11.067 11.433 11.812 12.227 12.668 13.156 13.724 14.266 14.883 15.54 16.213 16.941 17.776 18.642 19.348 19.552 19.393 19.094 18.767 18.424 18.106 17.779 17.447 17.084 16.766 16.489 16.209 15.924 15.655 15.41 15.162 14.921 14.696 14.488 14.272 14.087 13.897 13.692 13.526 13.349 13.172 12.99 12.786 12.643 12.508 12.291 12.124 11.941 11.852 11.674 11.486 11.313 11.211 10.923 10.878 10.753 10.618 10.324 10.159 9.967 9.776 9.578 9.315 8.9 7.225 -9 ,12843 ,TETRA ,17600853,Sun Nov 28 13:14:41 CET,Sun Nov 28 15:12:00 CET,0.0 3.073 3.616 3.968 4.28 4.561 4.806 5.017 5.379 5.557 5.731 5.881 6.223 6.383 6.692 6.961 7.204 7.329 7.566 7.792 8.119 8.327 8.531 8.831 9.135 9.426 9.684 9.921 10.223 10.506 10.762 11.068 11.36 11.635 11.981 12.363 12.703 13.075 13.461 13.879 14.325 14.818 15.37 15.925 16.556 17.206 17.925 18.689 19.479 20.165 20.567 20.52 20.312 20.012 19.623 19.219 18.833 18.473 18.161 17.832 17.541 17.277 17.005 16.727 16.457 16.203 15.943 15.711 15.507 15.281 15.037 14.835 14.611 14.388 14.226 14.055 13.878 13.69 13.474 13.328 13.19 12.954 12.782 12.607 12.513 12.31 12.1 11.874 11.76 11.467 11.394 11.253 11.116 10.862 10.689 10.471 10.265 10.045 9.772 9.402 8.517 -10 ,25814 ,TETRA ,17600854,Sun Nov 28 13:14:43 CET,Sun Nov 28 15:10:56 CET,0.0 0.835 1.214 1.51 1.772 2.007 2.242 2.481 2.892 3.067 3.249 3.409 3.75 3.9 4.202 4.481 4.736 4.861 5.097 5.318 5.627 5.817 6.004 6.266 6.522 6.768 6.999 7.23 7.52 7.808 8.106 8.448 8.762 9.063 9.403 9.788 10.17 10.576 10.997 11.445 11.902 12.389 12.921 13.46 14.057 14.648 15.299 15.97 16.694 17.505 18.177 18.305 18.135 17.789 17.374 16.978 16.627 16.281 15.941 15.6 15.323 15.067 14.791 14.51 14.252 14.02 13.779 13.578 13.394 13.186 12.964 12.779 12.597 12.4 12.241 12.084 11.921 11.736 11.539 11.403 11.263 11.045 10.894 10.755 10.679 10.5 10.309 10.109 10.005 9.719 9.655 9.527 9.402 9.14 9.006 8.868 8.701 8.519 8.283 7.911 6.922 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_66_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_66_64.txt deleted file mode 100644 index c703ef26..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_66_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8110 ,TETRA ,17600855,Sun Nov 28 13:14:37 CET,Sun Nov 28 15:13:25 CET,0.0 1.904 2.337 2.684 2.975 3.206 3.419 3.641 4.017 4.161 4.298 4.351 4.656 4.778 5.016 5.227 5.413 5.49 5.642 5.816 6.065 6.201 6.344 6.559 6.76 6.939 7.105 7.283 7.523 7.742 7.937 8.158 8.371 8.561 8.767 8.981 9.195 9.423 9.63 9.871 10.112 10.329 10.508 10.656 10.823 10.966 11.046 11.081 11.022 10.687 9.852 8.636 7.578 6.651 5.812 5.024 4.276 3.607 3.047 2.484 2.018 1.619 1.219 0.84 0.505 0.187 -0.162 -0.477 -0.75 -1.036 -1.349 -1.62 -1.91 -2.224 -2.485 -2.754 -3.001 -3.252 -3.514 -3.682 -3.862 -4.142 -4.321 -4.506 -4.602 -4.8 -5.02 -5.281 -5.425 -5.751 -5.807 -5.953 -6.113 -6.452 -6.635 -6.827 -7.066 -7.347 -7.647 -8.052 -9.476 -2 ,4796 ,TETRA ,17600856,Sun Nov 28 13:14:38 CET,Sun Nov 28 15:12:45 CET,0.0 0.962 1.302 1.613 1.896 2.13 2.337 2.541 2.893 3.035 3.16 3.219 3.52 3.628 3.828 4.023 4.214 4.309 4.496 4.673 4.913 5.067 5.212 5.416 5.619 5.813 5.996 6.153 6.345 6.528 6.7 6.922 7.143 7.344 7.566 7.787 7.989 8.256 8.503 8.73 8.972 9.199 9.476 9.712 9.95 10.158 10.29 10.393 10.328 10.038 9.339 8.157 7.046 6.041 5.172 4.427 3.734 3.082 2.533 1.968 1.491 1.079 0.642 0.218 -0.148 -0.476 -0.816 -1.124 -1.4 -1.678 -1.965 -2.222 -2.492 -2.765 -2.975 -3.184 -3.408 -3.664 -3.921 -4.087 -4.268 -4.567 -4.759 -4.964 -5.081 -5.316 -5.554 -5.805 -5.926 -6.244 -6.323 -6.469 -6.617 -6.956 -7.14 -7.325 -7.536 -7.784 -8.05 -8.357 -10.465 -3 ,31054 ,TETRA ,17600857,Sun Nov 28 13:14:40 CET,Sun Nov 28 15:12:47 CET,0.0 3.853 4.359 4.702 4.961 5.172 5.343 5.519 5.84 5.974 6.106 6.175 6.475 6.577 6.773 6.946 7.126 7.218 7.385 7.539 7.76 7.899 8.026 8.202 8.387 8.562 8.721 8.887 9.096 9.281 9.454 9.679 9.896 10.075 10.269 10.493 10.693 10.906 11.15 11.393 11.614 11.824 12.029 12.22 12.393 12.53 12.635 12.642 12.481 12.096 11.283 10.114 9.038 7.983 7.045 6.185 5.371 4.653 4.054 3.462 2.938 2.432 1.948 1.498 1.088 0.732 0.365 0.017 -0.29 -0.593 -0.901 -1.167 -1.452 -1.737 -1.958 -2.188 -2.418 -2.657 -2.907 -3.092 -3.282 -3.559 -3.763 -3.987 -4.1 -4.332 -4.56 -4.785 -4.917 -5.246 -5.314 -5.47 -5.632 -5.986 -6.191 -6.416 -6.65 -6.867 -7.084 -7.397 -8.512 -4 ,8997 ,TETRA ,17600858,Sun Nov 28 13:14:42 CET,Sun Nov 28 15:12:20 CET,0.0 2.492 3.144 3.596 3.971 4.29 4.537 4.769 5.211 5.399 5.577 5.71 6.051 6.193 6.463 6.715 6.965 7.09 7.316 7.492 7.703 7.841 7.976 8.174 8.372 8.575 8.765 8.95 9.188 9.4 9.597 9.827 10.046 10.262 10.512 10.778 10.997 11.23 11.45 11.633 11.825 12.039 12.266 12.449 12.619 12.788 12.937 13.0 12.9 12.625 11.887 10.674 9.595 8.625 7.737 6.928 6.205 5.518 4.92 4.28 3.712 3.255 2.825 2.398 1.995 1.632 1.269 0.939 0.634 0.328 0.022 -0.225 -0.472 -0.737 -0.944 -1.159 -1.4 -1.66 -1.923 -2.094 -2.266 -2.542 -2.742 -2.957 -3.064 -3.293 -3.543 -3.793 -3.92 -4.234 -4.27 -4.41 -4.572 -4.911 -5.093 -5.273 -5.466 -5.697 -5.986 -6.441 -7.898 -5 ,12843 ,TETRA ,17600859,Sun Nov 28 13:14:38 CET,Sun Nov 28 15:13:34 CET,0.0 2.313 2.782 3.084 3.347 3.566 3.736 3.914 4.297 4.473 4.629 4.72 5.019 5.134 5.346 5.542 5.737 5.829 6.008 6.19 6.428 6.574 6.715 6.907 7.07 7.22 7.366 7.505 7.701 7.89 8.056 8.249 8.423 8.595 8.797 9.015 9.241 9.462 9.651 9.828 10.01 10.235 10.498 10.749 11.0 11.218 11.389 11.505 11.456 11.082 10.217 9.018 7.941 6.968 6.107 5.32 4.605 3.956 3.399 2.825 2.316 1.852 1.387 0.93 0.542 0.216 -0.134 -0.439 -0.693 -0.96 -1.261 -1.52 -1.782 -2.054 -2.268 -2.495 -2.735 -2.984 -3.231 -3.407 -3.596 -3.894 -4.098 -4.3 -4.411 -4.642 -4.868 -5.1 -5.225 -5.547 -5.649 -5.804 -5.965 -6.27 -6.438 -6.619 -6.813 -7.057 -7.331 -7.743 -9.398 -6 ,11436 ,TETRA ,17600860,Sun Nov 28 13:14:40 CET,Sun Nov 28 15:13:15 CET,0.0 3.065 3.45 3.769 4.057 4.305 4.524 4.719 5.081 5.262 5.444 5.61 5.937 6.053 6.262 6.448 6.614 6.695 6.859 7.007 7.211 7.348 7.484 7.669 7.83 7.993 8.145 8.288 8.478 8.654 8.834 9.028 9.189 9.348 9.513 9.681 9.843 10.026 10.212 10.406 10.604 10.822 11.077 11.29 11.502 11.746 11.93 12.034 12.034 11.722 10.86 9.693 8.604 7.61 6.709 5.877 5.148 4.502 3.956 3.429 2.976 2.566 2.161 1.767 1.385 0.997 0.596 0.246 -0.057 -0.366 -0.687 -0.96 -1.252 -1.536 -1.75 -1.964 -2.189 -2.424 -2.672 -2.857 -3.043 -3.338 -3.543 -3.742 -3.854 -4.102 -4.355 -4.618 -4.757 -5.104 -5.213 -5.367 -5.531 -5.892 -6.064 -6.257 -6.517 -6.815 -7.153 -7.584 -9.385 -7 ,28797 ,TETRA ,17600861,Sun Nov 28 13:14:42 CET,Sun Nov 28 15:12:02 CET,0.0 2.203 2.563 2.847 3.081 3.259 3.441 3.633 3.951 4.097 4.23 4.281 4.575 4.682 4.883 5.08 5.268 5.364 5.538 5.671 5.843 5.969 6.108 6.304 6.473 6.641 6.814 6.979 7.179 7.367 7.546 7.754 7.959 8.147 8.357 8.599 8.807 8.995 9.177 9.385 9.597 9.796 9.975 10.117 10.267 10.414 10.55 10.675 10.71 10.476 9.779 8.648 7.585 6.616 5.757 4.958 4.229 3.561 2.992 2.433 1.951 1.528 1.118 0.724 0.36 0.015 -0.341 -0.658 -0.927 -1.194 -1.488 -1.753 -2.037 -2.325 -2.547 -2.78 -3.017 -3.257 -3.513 -3.691 -3.874 -4.159 -4.364 -4.583 -4.694 -4.916 -5.136 -5.375 -5.505 -5.823 -5.909 -6.076 -6.224 -6.514 -6.682 -6.89 -7.144 -7.416 -7.747 -8.178 -9.546 -8 ,14404 ,TETRA ,17600862,Sun Nov 28 13:14:44 CET,Sun Nov 28 15:11:58 CET,0.0 1.249 1.764 2.137 2.427 2.68 2.877 3.064 3.417 3.572 3.725 3.82 4.137 4.259 4.49 4.725 4.949 5.055 5.262 5.447 5.674 5.815 5.967 6.176 6.358 6.534 6.707 6.872 7.077 7.257 7.422 7.627 7.817 7.997 8.195 8.41 8.605 8.823 9.053 9.256 9.452 9.649 9.84 10.013 10.186 10.329 10.423 10.443 10.395 10.137 9.323 8.135 7.068 6.086 5.217 4.402 3.712 3.138 2.618 2.064 1.592 1.176 0.772 0.395 0.04 -0.296 -0.645 -0.968 -1.243 -1.518 -1.811 -2.071 -2.341 -2.614 -2.831 -3.047 -3.272 -3.512 -3.75 -3.912 -4.088 -4.374 -4.578 -4.782 -4.88 -5.078 -5.282 -5.522 -5.661 -5.991 -6.062 -6.195 -6.34 -6.668 -6.868 -7.116 -7.369 -7.638 -7.983 -8.434 -9.92 -9 ,22624 ,TETRA ,17600863,Sun Nov 28 13:15:34 CET,Sun Nov 28 15:12:53 CET,0.0 3.043 3.537 3.886 4.146 4.372 4.579 4.729 5.015 5.149 5.278 5.344 5.647 5.756 5.95 6.118 6.3 6.394 6.576 6.745 6.986 7.141 7.267 7.453 7.633 7.78 7.925 8.064 8.235 8.408 8.595 8.83 9.022 9.189 9.402 9.618 9.793 9.976 10.174 10.393 10.616 10.847 11.076 11.274 11.482 11.667 11.806 11.898 11.862 11.533 10.792 9.729 8.654 7.647 6.768 5.985 5.318 4.703 4.135 3.577 3.115 2.685 2.28 1.893 1.518 1.199 0.875 0.571 0.288 -0.026 -0.35 -0.608 -0.857 -1.116 -1.332 -1.561 -1.795 -2.046 -2.308 -2.485 -2.673 -2.982 -3.194 -3.381 -3.469 -3.667 -3.89 -4.13 -4.255 -4.586 -4.669 -4.815 -4.982 -5.321 -5.498 -5.727 -5.989 -6.252 -6.557 -6.969 -8.641 -10 ,16835 ,TETRA ,17600864,Sun Nov 28 13:15:38 CET,Sun Nov 28 15:13:03 CET,0.0 2.021 2.489 2.797 3.033 3.314 3.578 3.768 4.089 4.241 4.405 4.514 4.816 4.941 5.175 5.382 5.572 5.663 5.845 6.01 6.216 6.341 6.467 6.661 6.845 7.012 7.166 7.324 7.523 7.706 7.891 8.089 8.287 8.485 8.696 8.922 9.117 9.317 9.509 9.705 9.915 10.109 10.282 10.444 10.649 10.847 10.981 11.013 10.914 10.621 9.817 8.569 7.392 6.352 5.436 4.618 3.895 3.207 2.618 2.055 1.577 1.1 0.623 0.186 -0.221 -0.6 -1.008 -1.368 -1.669 -1.957 -2.265 -2.545 -2.839 -3.135 -3.352 -3.581 -3.825 -4.083 -4.354 -4.534 -4.718 -5.017 -5.23 -5.437 -5.539 -5.748 -5.969 -6.21 -6.343 -6.676 -6.744 -6.898 -7.057 -7.367 -7.539 -7.738 -7.956 -8.216 -8.531 -8.922 -10.533 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_67_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_67_26.txt deleted file mode 100644 index 9bbf0269..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_67_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19415 ,TETRA ,17600865,Sun Nov 28 13:15:34 CET,Sun Nov 28 15:13:51 CET,0.0 2.461 2.809 3.057 3.255 3.425 3.597 3.757 4.033 4.157 4.265 4.311 4.585 4.685 4.87 5.052 5.233 5.319 5.485 5.647 5.887 6.052 6.215 6.424 6.602 6.791 6.984 7.17 7.418 7.653 7.87 8.126 8.38 8.633 8.926 9.242 9.549 9.908 10.298 10.699 11.116 11.594 12.153 12.721 13.405 14.163 15.031 15.987 17.072 18.347 19.854 20.97 21.548 21.83 21.957 21.978 21.94 21.875 21.781 21.647 21.529 21.411 21.27 21.131 21.01 20.893 20.756 20.628 20.506 20.385 20.246 20.135 20.016 19.863 19.745 19.624 19.499 19.367 19.198 19.081 18.965 18.786 18.673 18.559 18.5 18.35 18.174 18.013 17.93 17.702 17.69 17.593 17.486 17.294 17.195 17.062 16.881 16.67 16.422 16.084 14.833 -2 ,13986 ,TETRA ,17600866,Sun Nov 28 13:15:36 CET,Sun Nov 28 15:13:35 CET,0.0 1.54 1.84 2.087 2.292 2.457 2.61 2.744 2.991 3.11 3.227 3.285 3.575 3.685 3.884 4.094 4.298 4.391 4.555 4.72 4.96 5.108 5.261 5.483 5.677 5.859 6.049 6.237 6.469 6.682 6.897 7.155 7.394 7.636 7.935 8.272 8.586 8.935 9.314 9.713 10.128 10.605 11.158 11.721 12.415 13.19 14.041 15.009 16.149 17.507 19.085 20.323 20.958 21.242 21.384 21.424 21.385 21.313 21.211 21.073 20.921 20.775 20.639 20.496 20.345 20.191 20.042 19.898 19.77 19.638 19.489 19.365 19.234 19.088 18.973 18.855 18.736 18.609 18.46 18.358 18.252 18.056 17.913 17.77 17.695 17.541 17.388 17.223 17.134 16.887 16.836 16.741 16.63 16.379 16.234 16.052 15.826 15.591 15.281 14.877 13.922 -3 ,28862 ,TETRA ,17600867,Sun Nov 28 13:15:35 CET,Sun Nov 28 15:13:37 CET,0.0 1.012 1.359 1.605 1.826 2.022 2.194 2.353 2.646 2.779 2.905 2.972 3.241 3.359 3.576 3.765 3.939 4.021 4.182 4.346 4.585 4.735 4.878 5.079 5.266 5.451 5.643 5.829 6.065 6.301 6.531 6.817 7.085 7.338 7.626 7.954 8.274 8.617 8.988 9.391 9.846 10.366 10.959 11.537 12.194 12.918 13.739 14.699 15.826 17.164 18.721 19.857 20.388 20.616 20.717 20.759 20.758 20.728 20.655 20.545 20.42 20.276 20.139 20.023 19.905 19.793 19.664 19.527 19.407 19.284 19.143 19.021 18.891 18.747 18.641 18.526 18.387 18.237 18.086 17.991 17.894 17.73 17.614 17.494 17.425 17.265 17.089 16.891 16.795 16.552 16.512 16.406 16.288 16.013 15.869 15.745 15.615 15.466 15.268 14.959 13.825 -4 ,4640 ,TETRA ,17600868,Sun Nov 28 13:15:36 CET,Sun Nov 28 15:13:47 CET,0.0 2.054 2.337 2.52 2.727 2.943 3.123 3.262 3.5 3.62 3.735 3.785 4.059 4.158 4.357 4.546 4.717 4.798 4.976 5.158 5.406 5.566 5.72 5.928 6.134 6.339 6.537 6.727 6.979 7.213 7.431 7.696 7.95 8.2 8.49 8.815 9.128 9.468 9.845 10.257 10.687 11.167 11.727 12.303 12.97 13.719 14.591 15.556 16.635 17.874 19.316 20.308 20.799 21.096 21.22 21.208 21.119 21.001 20.878 20.751 20.642 20.515 20.361 20.206 20.051 19.885 19.72 19.587 19.464 19.336 19.179 19.038 18.89 18.735 18.62 18.497 18.358 18.204 18.047 17.936 17.823 17.65 17.524 17.39 17.324 17.204 17.087 16.95 16.867 16.622 16.565 16.458 16.346 16.083 15.947 15.785 15.609 15.394 15.11 14.782 13.675 -5 ,5799 ,TETRA ,17600869,Sun Nov 28 13:15:38 CET,Sun Nov 28 15:14:50 CET,0.0 0.971 1.279 1.505 1.69 1.869 2.044 2.202 2.467 2.592 2.715 2.778 3.045 3.133 3.31 3.484 3.665 3.758 3.924 4.08 4.304 4.453 4.609 4.821 5.01 5.201 5.39 5.571 5.805 6.027 6.254 6.523 6.771 7.022 7.321 7.648 7.948 8.278 8.645 9.057 9.485 9.949 10.507 11.094 11.778 12.541 13.421 14.419 15.562 16.836 18.266 19.309 19.839 20.094 20.212 20.245 20.233 20.179 20.09 19.998 19.895 19.772 19.646 19.522 19.384 19.248 19.109 18.972 18.849 18.713 18.562 18.443 18.324 18.2 18.092 17.971 17.855 17.739 17.608 17.504 17.397 17.24 17.132 17.026 16.966 16.833 16.694 16.523 16.432 16.187 16.142 16.042 15.934 15.731 15.625 15.495 15.348 15.159 14.918 14.655 13.688 -6 ,5970 ,TETRA ,17600870,Sun Nov 28 13:15:40 CET,Sun Nov 28 15:14:23 CET,0.0 1.105 1.495 1.789 2.02 2.238 2.45 2.634 2.969 3.126 3.283 3.438 3.753 3.885 4.134 4.36 4.569 4.674 4.879 5.081 5.363 5.535 5.706 5.947 6.184 6.427 6.655 6.87 7.134 7.386 7.651 7.962 8.244 8.526 8.865 9.245 9.605 9.999 10.43 10.891 11.362 11.881 12.494 13.12 13.86 14.679 15.626 16.706 17.961 19.415 21.043 22.285 22.958 23.297 23.436 23.475 23.447 23.341 23.217 23.075 22.922 22.759 22.574 22.392 22.239 22.092 21.907 21.713 21.554 21.392 21.186 21.004 20.836 20.672 20.544 20.408 20.253 20.088 19.922 19.803 19.678 19.501 19.388 19.262 19.186 19.024 18.863 18.711 18.637 18.404 18.353 18.242 18.126 17.86 17.706 17.544 17.375 17.171 16.932 16.625 14.146 -7 ,14149 ,TETRA ,17600871,Sun Nov 28 13:20:35 CET,Sun Nov 28 15:21:29 CET,0.0 1.143 1.393 1.621 1.822 1.999 2.157 2.314 2.606 2.739 2.869 2.918 3.182 3.279 3.463 3.652 3.84 3.932 4.106 4.266 4.486 4.633 4.772 4.969 5.175 5.381 5.564 5.745 6.003 6.249 6.475 6.756 7.031 7.3 7.61 7.951 8.273 8.619 8.998 9.399 9.816 10.295 10.842 11.408 12.091 12.826 13.696 14.721 15.905 17.255 18.839 20.112 20.716 21.001 21.16 21.217 21.201 21.139 21.053 20.932 20.793 20.675 20.56 20.415 20.262 20.124 20.0 19.877 19.75 19.618 19.474 19.352 19.223 19.06 18.929 18.807 18.674 18.515 18.345 18.232 18.125 17.97 17.858 17.73 17.659 17.515 17.353 17.185 17.106 16.87 16.831 16.726 16.624 16.387 16.231 16.058 15.854 15.642 15.372 15.001 14.126 -8 ,4875 ,TETRA ,17600872,Sun Nov 28 13:20:37 CET,Sun Nov 28 15:21:31 CET,0.0 1.275 1.637 1.906 2.104 2.278 2.443 2.593 2.886 3.015 3.131 3.197 3.475 3.586 3.79 3.978 4.148 4.232 4.41 4.595 4.856 5.015 5.16 5.366 5.572 5.76 5.943 6.123 6.362 6.611 6.85 7.119 7.372 7.628 7.941 8.29 8.622 8.995 9.39 9.795 10.213 10.689 11.26 11.811 12.437 13.147 13.977 14.924 16.021 17.346 18.971 20.179 20.753 21.026 21.139 21.15 21.116 21.062 20.983 20.838 20.668 20.499 20.322 20.164 20.02 19.877 19.7 19.527 19.391 19.236 19.055 18.913 18.754 18.593 18.473 18.344 18.213 18.079 17.941 17.848 17.752 17.585 17.468 17.339 17.266 17.112 16.96 16.797 16.703 16.461 16.454 16.358 16.254 16.037 15.915 15.762 15.572 15.37 15.123 14.777 13.422 -9 ,21176 ,TETRA ,17600873,Sun Nov 28 13:20:38 CET,Sun Nov 28 15:18:20 CET,0.0 0.78 1.058 1.283 1.468 1.64 1.814 1.956 2.232 2.367 2.5 2.576 2.86 2.977 3.172 3.349 3.535 3.624 3.798 3.971 4.218 4.364 4.502 4.727 4.96 5.185 5.397 5.602 5.858 6.115 6.371 6.662 6.918 7.149 7.418 7.745 8.077 8.431 8.813 9.21 9.613 10.084 10.645 11.226 11.89 12.616 13.482 14.44 15.551 16.83 18.278 19.318 19.796 20.027 20.141 20.19 20.115 19.978 19.87 19.747 19.624 19.481 19.33 19.178 19.037 18.91 18.782 18.669 18.558 18.433 18.294 18.172 18.046 17.909 17.804 17.698 17.572 17.44 17.318 17.225 17.124 16.968 16.853 16.715 16.636 16.473 16.303 16.143 16.054 15.804 15.761 15.656 15.549 15.316 15.175 15.015 14.852 14.664 14.457 14.16 12.715 -10 ,9024 ,TETRA ,17600874,Sun Nov 28 13:20:35 CET,Sun Nov 28 15:18:20 CET,0.0 1.303 1.609 1.874 2.099 2.296 2.476 2.633 2.92 3.064 3.202 3.29 3.577 3.691 3.914 4.126 4.319 4.412 4.6 4.782 5.041 5.202 5.354 5.59 5.813 6.011 6.204 6.396 6.639 6.887 7.135 7.429 7.703 7.967 8.29 8.648 8.971 9.312 9.668 10.051 10.471 10.949 11.485 12.027 12.701 13.475 14.352 15.334 16.457 17.743 19.206 20.204 20.69 20.966 21.076 21.089 21.017 20.907 20.79 20.63 20.462 20.306 20.161 20.013 19.875 19.747 19.598 19.461 19.32 19.154 18.974 18.812 18.64 18.454 18.308 18.162 17.999 17.833 17.676 17.554 17.42 17.211 17.063 16.912 16.831 16.654 16.472 16.277 16.159 15.886 15.765 15.638 15.513 15.216 15.055 14.887 14.709 14.507 14.233 13.868 12.508 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_67_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_67_37.txt deleted file mode 100644 index 897fd028..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_67_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16766 ,TETRA ,17600875,Sun Nov 28 13:37:35 CET,Sun Nov 28 15:36:11 CET,0.0 1.126 1.584 1.917 2.166 2.367 2.547 2.739 3.083 3.221 3.344 3.389 3.652 3.741 3.909 4.086 4.258 4.344 4.523 4.692 4.924 5.062 5.205 5.413 5.571 5.699 5.816 5.918 6.054 6.215 6.367 6.513 6.654 6.793 6.936 7.067 7.18 7.301 7.41 7.485 7.536 7.582 7.579 7.532 7.447 7.288 7.0 6.493 5.678 4.407 2.245 -0.426 -2.593 -4.377 -5.868 -7.174 -8.284 -9.233 -10.028 -10.812 -11.458 -12.027 -12.577 -13.092 -13.552 -13.954 -14.388 -14.775 -15.118 -15.494 -15.866 -16.156 -16.449 -16.753 -16.986 -17.214 -17.457 -17.707 -17.965 -18.15 -18.335 -18.618 -18.817 -19.027 -19.131 -19.353 -19.596 -19.851 -19.981 -20.295 -20.347 -20.49 -20.643 -20.952 -21.11 -21.27 -21.435 -21.648 -21.939 -22.262 -23.012 -2 ,28108 ,TETRA ,17600876,Sun Nov 28 13:37:35 CET,Sun Nov 28 15:35:49 CET,0.0 0.629 0.866 1.007 1.132 1.27 1.386 1.483 1.654 1.729 1.8 1.779 2.007 2.067 2.185 2.281 2.364 2.405 2.49 2.586 2.721 2.796 2.86 2.947 3.031 3.114 3.192 3.249 3.319 3.392 3.459 3.525 3.582 3.631 3.679 3.716 3.735 3.753 3.769 3.775 3.774 3.753 3.666 3.529 3.324 2.996 2.5 1.803 0.776 -0.71 -3.096 -5.898 -8.176 -10.081 -11.631 -12.957 -14.082 -15.053 -15.893 -16.755 -17.463 -18.058 -18.625 -19.178 -19.682 -20.108 -20.547 -20.949 -21.304 -21.661 -22.019 -22.313 -22.609 -22.917 -23.162 -23.418 -23.679 -23.931 -24.176 -24.348 -24.527 -24.812 -25.013 -25.218 -25.32 -25.529 -25.758 -26.011 -26.141 -26.48 -26.596 -26.746 -26.895 -27.238 -27.397 -27.565 -27.767 -27.979 -28.207 -28.45 -29.105 -3 ,11685 ,TETRA ,17600877,Sun Nov 28 13:37:35 CET,Sun Nov 28 15:35:17 CET,0.0 0.806 1.123 1.403 1.632 1.826 1.988 2.139 2.436 2.575 2.692 2.725 2.984 3.064 3.219 3.385 3.532 3.601 3.724 3.824 3.974 4.072 4.162 4.289 4.407 4.522 4.637 4.74 4.871 5.003 5.103 5.208 5.311 5.409 5.541 5.694 5.814 5.907 5.993 6.06 6.098 6.131 6.137 6.095 6.004 5.822 5.466 4.956 4.163 2.85 0.646 -1.988 -4.175 -6.071 -7.731 -9.16 -10.368 -11.45 -12.337 -13.192 -13.925 -14.579 -15.206 -15.762 -16.251 -16.69 -17.145 -17.544 -17.875 -18.211 -18.553 -18.833 -19.124 -19.429 -19.665 -19.91 -20.152 -20.398 -20.658 -20.833 -21.005 -21.282 -21.48 -21.687 -21.797 -22.024 -22.248 -22.463 -22.575 -22.889 -22.969 -23.098 -23.222 -23.487 -23.627 -23.783 -23.98 -24.219 -24.473 -24.808 -25.869 -4 ,25121 ,TETRA ,17600878,Sun Nov 28 13:38:34 CET,Sun Nov 28 15:36:56 CET,0.0 0.725 1.04 1.313 1.553 1.771 1.949 2.096 2.36 2.482 2.596 2.652 2.921 3.01 3.176 3.345 3.505 3.576 3.711 3.833 4.018 4.141 4.24 4.368 4.5 4.633 4.753 4.867 5.014 5.137 5.241 5.375 5.509 5.614 5.707 5.8 5.895 5.995 6.084 6.15 6.202 6.249 6.27 6.258 6.199 6.022 5.705 5.235 4.475 3.19 0.984 -1.644 -3.871 -5.749 -7.295 -8.621 -9.741 -10.729 -11.583 -12.41 -13.102 -13.724 -14.292 -14.797 -15.256 -15.687 -16.154 -16.553 -16.893 -17.246 -17.597 -17.883 -18.171 -18.482 -18.739 -18.997 -19.257 -19.514 -19.782 -19.98 -20.178 -20.467 -20.655 -20.852 -20.952 -21.157 -21.386 -21.63 -21.771 -22.113 -22.242 -22.4 -22.551 -22.898 -23.087 -23.279 -23.498 -23.738 -23.98 -24.225 -24.733 -5 ,16275 ,TETRA ,17600879,Sun Nov 28 13:38:36 CET,Sun Nov 28 15:36:39 CET,0.0 0.851 1.142 1.414 1.642 1.829 1.983 2.112 2.345 2.459 2.562 2.581 2.85 2.939 3.099 3.253 3.408 3.484 3.632 3.764 3.929 4.035 4.146 4.308 4.458 4.598 4.722 4.83 4.96 5.075 5.19 5.325 5.443 5.561 5.701 5.846 5.978 6.097 6.205 6.303 6.366 6.399 6.412 6.381 6.296 6.128 5.821 5.325 4.556 3.28 1.086 -1.564 -3.796 -5.627 -7.136 -8.456 -9.587 -10.589 -11.429 -12.237 -12.938 -13.565 -14.133 -14.663 -15.147 -15.594 -16.077 -16.503 -16.865 -17.216 -17.571 -17.866 -18.16 -18.451 -18.678 -18.921 -19.177 -19.456 -19.751 -19.95 -20.15 -20.445 -20.655 -20.883 -21.003 -21.251 -21.505 -21.757 -21.878 -22.199 -22.251 -22.378 -22.513 -22.8 -22.958 -23.124 -23.3 -23.528 -23.793 -24.087 -25.019 -6 ,15566 ,TETRA ,17600880,Sun Nov 28 13:38:37 CET,Sun Nov 28 15:36:47 CET,0.0 1.139 1.491 1.771 1.985 2.159 2.322 2.462 2.688 2.801 2.915 2.939 3.197 3.278 3.423 3.585 3.752 3.821 3.956 4.088 4.269 4.386 4.497 4.639 4.769 4.907 5.048 5.165 5.295 5.413 5.523 5.663 5.788 5.909 6.056 6.191 6.305 6.406 6.484 6.565 6.644 6.706 6.725 6.688 6.609 6.457 6.154 5.677 4.9 3.539 1.254 -1.343 -3.464 -5.276 -6.784 -8.086 -9.17 -10.102 -10.906 -11.713 -12.385 -12.964 -13.522 -14.055 -14.541 -14.987 -15.436 -15.825 -16.184 -16.553 -16.907 -17.192 -17.5 -17.823 -18.071 -18.311 -18.545 -18.804 -19.077 -19.262 -19.448 -19.742 -19.958 -20.183 -20.297 -20.53 -20.768 -21.005 -21.119 -21.43 -21.516 -21.665 -21.803 -22.063 -22.216 -22.381 -22.56 -22.79 -23.076 -23.477 -24.486 -7 ,14126 ,TETRA ,17600881,Sun Nov 28 13:38:34 CET,Sun Nov 28 15:36:49 CET,0.0 1.151 1.617 1.886 2.105 2.295 2.467 2.616 2.9 3.019 3.126 3.158 3.407 3.487 3.652 3.823 3.967 4.031 4.161 4.266 4.407 4.517 4.619 4.754 4.888 5.019 5.144 5.252 5.383 5.513 5.627 5.753 5.869 5.972 6.086 6.202 6.301 6.387 6.454 6.501 6.526 6.545 6.532 6.456 6.318 6.107 5.774 5.295 4.517 3.225 0.943 -1.833 -4.117 -6.073 -7.69 -9.063 -10.205 -11.197 -12.063 -12.9 -13.577 -14.189 -14.778 -15.325 -15.827 -16.272 -16.71 -17.075 -17.391 -17.737 -18.094 -18.373 -18.681 -19.017 -19.256 -19.497 -19.757 -20.022 -20.285 -20.462 -20.645 -20.958 -21.18 -21.403 -21.524 -21.752 -21.959 -22.192 -22.326 -22.659 -22.737 -22.88 -23.021 -23.31 -23.467 -23.633 -23.813 -23.995 -24.224 -24.538 -25.381 -8 ,17503 ,TETRA ,17600882,Sun Nov 28 13:38:35 CET,Sun Nov 28 15:37:07 CET,0.0 0.711 1.023 1.267 1.473 1.657 1.82 1.966 2.222 2.338 2.444 2.511 2.801 2.917 3.107 3.271 3.421 3.49 3.618 3.733 3.891 4.003 4.105 4.245 4.38 4.502 4.609 4.704 4.83 4.957 5.08 5.214 5.324 5.419 5.517 5.612 5.684 5.764 5.847 5.914 5.966 5.988 5.968 5.923 5.825 5.65 5.356 4.835 3.952 2.585 0.309 -2.368 -4.535 -6.397 -7.934 -9.232 -10.323 -11.281 -12.1 -12.917 -13.616 -14.232 -14.806 -15.342 -15.845 -16.295 -16.77 -17.192 -17.548 -17.923 -18.314 -18.612 -18.915 -19.232 -19.472 -19.737 -20.015 -20.298 -20.587 -20.777 -20.971 -21.271 -21.474 -21.692 -21.807 -22.043 -22.273 -22.508 -22.642 -22.975 -23.049 -23.184 -23.341 -23.694 -23.885 -24.109 -24.37 -24.633 -24.907 -25.21 -26.144 -9 ,20402 ,TETRA ,17600883,Sun Nov 28 13:38:37 CET,Sun Nov 28 15:37:32 CET,0.0 0.716 0.988 1.217 1.453 1.683 1.873 2.024 2.264 2.364 2.453 2.449 2.7 2.787 2.959 3.11 3.235 3.297 3.411 3.502 3.644 3.744 3.828 3.946 4.076 4.207 4.341 4.467 4.62 4.779 4.919 5.078 5.244 5.399 5.56 5.711 5.834 5.965 6.077 6.151 6.192 6.214 6.207 6.139 6.013 5.788 5.396 4.815 3.893 2.464 0.1 -2.736 -5.022 -6.922 -8.502 -9.857 -11.034 -12.079 -12.959 -13.832 -14.574 -15.232 -15.841 -16.396 -16.92 -17.36 -17.807 -18.217 -18.557 -18.914 -19.276 -19.586 -19.91 -20.234 -20.483 -20.752 -21.04 -21.318 -21.604 -21.812 -22.017 -22.309 -22.52 -22.754 -22.87 -23.092 -23.323 -23.582 -23.726 -24.068 -24.171 -24.317 -24.461 -24.777 -24.963 -25.158 -25.349 -25.561 -25.775 -26.079 -26.83 -10 ,27334 ,TETRA ,17600884,Sun Nov 28 13:38:34 CET,Sun Nov 28 15:37:08 CET,0.0 0.321 0.528 0.691 0.813 0.92 1.009 1.101 1.275 1.353 1.427 1.393 1.628 1.689 1.801 1.907 1.997 2.044 2.144 2.223 2.335 2.408 2.472 2.562 2.647 2.737 2.823 2.89 2.963 3.035 3.106 3.182 3.251 3.308 3.358 3.4 3.418 3.428 3.444 3.448 3.435 3.398 3.306 3.166 2.97 2.679 2.269 1.732 0.881 -0.463 -2.728 -5.389 -7.492 -9.276 -10.784 -12.094 -13.199 -14.158 -14.982 -15.814 -16.519 -17.137 -17.738 -18.3 -18.819 -19.297 -19.788 -20.21 -20.544 -20.873 -21.231 -21.536 -21.852 -22.181 -22.424 -22.667 -22.947 -23.236 -23.511 -23.702 -23.899 -24.204 -24.432 -24.665 -24.773 -25.001 -25.254 -25.522 -25.651 -25.972 -26.063 -26.217 -26.373 -26.678 -26.852 -27.042 -27.239 -27.461 -27.72 -28.101 -28.707 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_67_60.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_67_60.txt deleted file mode 100644 index 637a5abf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_67_60.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31397 ,KEBNE ,17027077,Wed Dec 22 16:00:44 CET,Wed Dec 22 17:41:36 CET,0.0 0.729 1.029 1.235 1.376 1.494 1.605 1.73 1.993 2.104 2.194 2.188 2.43 2.502 2.633 2.762 2.879 2.93 3.03 3.126 3.254 3.334 3.418 3.545 3.653 3.752 3.84 3.914 4.002 4.068 4.135 4.209 4.272 4.342 4.411 4.468 4.505 4.536 4.552 4.547 4.521 4.476 4.408 4.296 4.11 3.82 3.401 2.784 1.825 0.387 -2.059 -4.927 -7.112 -8.889 -10.342 -11.646 -12.801 -13.787 -14.629 -15.448 -16.108 -16.672 -17.211 -17.743 -18.21 -18.604 -19.015 -19.395 -19.732 -20.07 -20.413 -20.701 -20.999 -21.303 -21.534 -21.764 -22.0 -22.256 -22.516 -22.693 -22.882 -23.168 -23.361 -23.559 -23.657 -23.843 -24.026 -24.23 -24.342 -24.657 -24.72 -24.843 -24.953 -25.186 -25.325 -25.49 -25.679 -25.857 -26.064 -26.316 -26.834 -2 ,21982 ,KEBNE ,17027078,Wed Dec 22 16:00:42 CET,Wed Dec 22 17:41:44 CET,0.0 0.529 0.787 0.974 1.135 1.264 1.392 1.505 1.728 1.838 1.932 1.932 2.18 2.254 2.38 2.483 2.588 2.644 2.758 2.864 2.998 3.078 3.15 3.257 3.36 3.449 3.541 3.633 3.735 3.816 3.896 3.984 4.052 4.116 4.188 4.254 4.3 4.332 4.361 4.37 4.35 4.311 4.226 4.095 3.887 3.615 3.26 2.741 1.818 0.306 -2.094 -4.889 -7.081 -8.829 -10.269 -11.521 -12.599 -13.546 -14.342 -15.133 -15.809 -16.411 -16.986 -17.499 -17.96 -18.371 -18.792 -19.173 -19.495 -19.839 -20.209 -20.501 -20.796 -21.096 -21.322 -21.555 -21.798 -22.051 -22.307 -22.478 -22.658 -22.948 -23.14 -23.339 -23.442 -23.653 -23.863 -24.076 -24.187 -24.485 -24.52 -24.641 -24.774 -25.075 -25.231 -25.387 -25.559 -25.734 -25.921 -26.157 -26.73 -3 ,17937 ,KEBNE ,17027079,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:41:10 CET,0.0 0.561 0.748 0.918 1.068 1.191 1.303 1.408 1.603 1.689 1.77 1.758 2.003 2.079 2.222 2.353 2.467 2.517 2.615 2.708 2.826 2.899 2.979 3.092 3.174 3.245 3.324 3.405 3.505 3.591 3.673 3.762 3.839 3.911 3.989 4.063 4.109 4.135 4.149 4.161 4.149 4.092 4.016 3.903 3.689 3.403 2.975 2.355 1.43 -0.017 -2.41 -5.133 -7.281 -9.042 -10.505 -11.792 -12.894 -13.854 -14.656 -15.429 -16.088 -16.652 -17.167 -17.661 -18.126 -18.544 -18.962 -19.329 -19.648 -19.975 -20.32 -20.598 -20.886 -21.178 -21.398 -21.626 -21.854 -22.091 -22.332 -22.498 -22.675 -22.935 -23.114 -23.301 -23.396 -23.588 -23.779 -23.985 -24.089 -24.395 -24.434 -24.553 -24.666 -24.934 -25.094 -25.247 -25.389 -25.547 -25.749 -26.032 -26.414 -4 ,6199 ,KEBNE ,17027080,Wed Dec 22 16:00:42 CET,Wed Dec 22 17:41:59 CET,0.0 0.349 0.558 0.765 0.92 1.017 1.118 1.225 1.414 1.506 1.607 1.622 1.867 1.931 2.041 2.15 2.265 2.321 2.421 2.509 2.634 2.709 2.78 2.885 2.977 3.062 3.136 3.201 3.294 3.393 3.46 3.542 3.638 3.713 3.788 3.848 3.885 3.905 3.905 3.9 3.891 3.858 3.789 3.677 3.483 3.202 2.79 2.173 1.269 -0.099 -2.464 -5.188 -7.294 -9.07 -10.576 -11.87 -12.929 -13.837 -14.63 -15.403 -16.056 -16.638 -17.181 -17.683 -18.139 -18.555 -18.982 -19.362 -19.68 -20.008 -20.352 -20.626 -20.91 -21.205 -21.422 -21.645 -21.891 -22.14 -22.386 -22.555 -22.736 -23.022 -23.213 -23.416 -23.522 -23.737 -23.959 -24.185 -24.299 -24.598 -24.646 -24.768 -24.9 -25.184 -25.339 -25.503 -25.656 -25.811 -26.007 -26.281 -27.041 -5 ,24356 ,KEBNE ,17027081,Wed Dec 22 16:00:42 CET,Wed Dec 22 17:41:00 CET,0.0 0.491 0.734 0.934 1.116 1.254 1.367 1.482 1.696 1.779 1.851 1.835 2.084 2.151 2.261 2.374 2.497 2.558 2.664 2.757 2.878 2.95 3.025 3.125 3.22 3.309 3.385 3.464 3.571 3.655 3.724 3.819 3.903 3.98 4.056 4.106 4.15 4.184 4.205 4.205 4.176 4.126 4.014 3.855 3.664 3.403 3.003 2.411 1.467 -0.012 -2.409 -5.184 -7.411 -9.231 -10.739 -12.027 -13.112 -14.075 -14.897 -15.694 -16.35 -16.925 -17.493 -18.038 -18.534 -18.983 -19.439 -19.825 -20.144 -20.472 -20.836 -21.123 -21.388 -21.664 -21.884 -22.113 -22.349 -22.602 -22.865 -23.044 -23.228 -23.517 -23.727 -23.937 -24.04 -24.246 -24.44 -24.658 -24.771 -25.075 -25.127 -25.251 -25.376 -25.643 -25.779 -25.924 -26.088 -26.285 -26.495 -26.731 -27.221 -6 ,12848 ,KEBNE ,17027082,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:42:26 CET,0.0 0.59 0.887 1.101 1.259 1.411 1.576 1.724 1.965 2.07 2.166 2.174 2.418 2.493 2.621 2.747 2.861 2.911 3.011 3.101 3.221 3.3 3.37 3.48 3.582 3.67 3.758 3.83 3.914 3.994 4.075 4.169 4.24 4.305 4.376 4.443 4.495 4.516 4.531 4.558 4.555 4.523 4.447 4.296 4.097 3.833 3.44 2.904 1.982 0.478 -1.837 -4.464 -6.615 -8.408 -9.859 -11.13 -12.229 -13.191 -14.005 -14.816 -15.497 -16.07 -16.596 -17.08 -17.525 -17.937 -18.376 -18.752 -19.072 -19.411 -19.75 -20.026 -20.308 -20.578 -20.784 -21.01 -21.245 -21.48 -21.728 -21.913 -22.11 -22.414 -22.625 -22.828 -22.933 -23.147 -23.359 -23.596 -23.724 -24.045 -24.12 -24.245 -24.369 -24.673 -24.85 -25.021 -25.205 -25.406 -25.614 -25.864 -26.48 -7 ,9395 ,KEBNE ,17027083,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:41:41 CET,0.0 0.408 0.659 0.826 0.969 1.12 1.26 1.369 1.554 1.643 1.721 1.711 1.965 2.038 2.163 2.278 2.388 2.445 2.548 2.642 2.797 2.888 2.964 3.059 3.141 3.223 3.291 3.358 3.458 3.551 3.618 3.699 3.777 3.84 3.899 3.962 4.015 4.057 4.091 4.1 4.064 3.999 3.896 3.762 3.581 3.314 2.901 2.247 1.248 -0.183 -2.504 -5.286 -7.504 -9.29 -10.743 -11.981 -13.039 -13.981 -14.79 -15.577 -16.242 -16.842 -17.4 -17.904 -18.37 -18.784 -19.213 -19.601 -19.921 -20.246 -20.589 -20.876 -21.171 -21.468 -21.696 -21.927 -22.159 -22.409 -22.661 -22.831 -23.016 -23.294 -23.479 -23.673 -23.776 -23.985 -24.209 -24.451 -24.58 -24.904 -24.962 -25.093 -25.239 -25.525 -25.667 -25.819 -25.985 -26.188 -26.396 -26.628 -27.279 -8 ,10128 ,KEBNE ,17027084,Wed Dec 22 16:00:43 CET,Wed Dec 22 17:42:12 CET,0.0 0.69 0.969 1.163 1.323 1.486 1.625 1.747 1.953 2.046 2.128 2.118 2.362 2.429 2.546 2.651 2.751 2.802 2.894 2.982 3.121 3.206 3.282 3.383 3.47 3.545 3.621 3.703 3.808 3.906 3.984 4.056 4.125 4.205 4.283 4.34 4.385 4.422 4.454 4.487 4.483 4.424 4.319 4.205 4.034 3.777 3.375 2.769 1.881 0.515 -1.813 -4.561 -6.717 -8.503 -9.988 -11.236 -12.294 -13.241 -14.033 -14.798 -15.454 -16.052 -16.628 -17.154 -17.63 -18.041 -18.456 -18.839 -19.166 -19.492 -19.829 -20.104 -20.392 -20.693 -20.922 -21.159 -21.395 -21.63 -21.879 -22.056 -22.239 -22.5 -22.671 -22.848 -22.948 -23.173 -23.396 -23.63 -23.75 -24.067 -24.12 -24.251 -24.385 -24.655 -24.809 -24.988 -25.178 -25.378 -25.608 -25.847 -26.193 -9 ,32451 ,KEBNE ,17027085,Wed Dec 22 16:00:44 CET,Wed Dec 22 17:41:08 CET,0.0 0.601 0.838 1.041 1.213 1.359 1.489 1.598 1.778 1.859 1.954 1.982 2.229 2.299 2.428 2.546 2.664 2.717 2.82 2.918 3.02 3.089 3.164 3.274 3.369 3.451 3.529 3.599 3.685 3.774 3.851 3.928 3.996 4.05 4.111 4.167 4.202 4.239 4.26 4.263 4.27 4.235 4.144 4.032 3.844 3.584 3.172 2.568 1.686 0.309 -2.013 -4.806 -7.017 -8.797 -10.257 -11.567 -12.687 -13.653 -14.456 -15.255 -15.92 -16.486 -17.021 -17.501 -17.934 -18.323 -18.734 -19.111 -19.426 -19.749 -20.084 -20.37 -20.662 -20.956 -21.173 -21.382 -21.601 -21.836 -22.078 -22.239 -22.408 -22.667 -22.848 -23.039 -23.132 -23.322 -23.513 -23.719 -23.831 -24.136 -24.198 -24.325 -24.456 -24.719 -24.854 -25.015 -25.225 -25.456 -25.663 -25.853 -26.361 -10 ,28337 ,KEBNE ,17027086,Wed Dec 22 16:02:45 CET,Wed Dec 22 17:43:53 CET,0.0 0.608 0.85 1.03 1.186 1.319 1.436 1.554 1.774 1.87 1.954 1.966 2.206 2.268 2.373 2.473 2.579 2.629 2.716 2.806 2.951 3.036 3.109 3.21 3.294 3.37 3.441 3.506 3.588 3.661 3.733 3.804 3.871 3.948 4.03 4.112 4.168 4.208 4.256 4.294 4.296 4.271 4.225 4.133 3.932 3.628 3.201 2.593 1.688 0.227 -2.228 -4.989 -7.138 -8.934 -10.442 -11.714 -12.772 -13.727 -14.548 -15.349 -16.04 -16.64 -17.185 -17.678 -18.12 -18.531 -18.954 -19.307 -19.618 -19.951 -20.28 -20.547 -20.83 -21.119 -21.351 -21.608 -21.857 -22.098 -22.353 -22.531 -22.702 -22.959 -23.148 -23.344 -23.44 -23.631 -23.833 -24.046 -24.151 -24.449 -24.487 -24.608 -24.732 -24.993 -25.136 -25.289 -25.449 -25.612 -25.781 -26.0 -26.688 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_68_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_68_54.txt deleted file mode 100644 index fbd7ac9c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_68_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11422 ,TETRA ,17600885,Sun Nov 28 13:39:34 CET,Sun Nov 28 15:36:55 CET,0.0 1.504 1.811 1.999 2.137 2.266 2.387 2.5 2.685 2.782 2.869 2.845 3.057 3.115 3.232 3.347 3.443 3.49 3.579 3.657 3.758 3.82 3.876 3.969 4.056 4.116 4.168 4.222 4.274 4.311 4.351 4.405 4.471 4.507 4.524 4.536 4.522 4.499 4.47 4.412 4.308 4.165 3.985 3.751 3.403 2.984 2.41 1.548 0.283 -1.576 -4.529 -7.893 -10.535 -12.691 -14.491 -16.053 -17.407 -18.574 -19.55 -20.514 -21.337 -22.069 -22.756 -23.406 -23.992 -24.496 -24.998 -25.442 -25.823 -26.222 -26.66 -27.019 -27.366 -27.715 -27.992 -28.285 -28.587 -28.884 -29.185 -29.412 -29.643 -29.984 -30.229 -30.466 -30.585 -30.84 -31.121 -31.41 -31.554 -31.894 -32.047 -32.215 -32.378 -32.721 -32.91 -33.11 -33.344 -33.621 -33.929 -34.329 -35.606 -2 ,20650 ,TETRA ,17600886,Sun Nov 28 13:39:36 CET,Sun Nov 28 15:35:40 CET,0.0 0.943 1.199 1.425 1.627 1.776 1.9 2.0 2.155 2.228 2.314 2.34 2.544 2.592 2.704 2.826 2.928 2.973 3.055 3.126 3.235 3.306 3.368 3.44 3.513 3.582 3.648 3.713 3.78 3.812 3.839 3.87 3.898 3.917 3.925 3.927 3.909 3.875 3.833 3.792 3.727 3.597 3.408 3.195 2.894 2.463 1.865 1.042 -0.192 -2.043 -5.008 -8.36 -11.0 -13.129 -14.907 -16.438 -17.678 -18.781 -19.735 -20.692 -21.531 -22.267 -22.94 -23.559 -24.123 -24.62 -25.119 -25.559 -25.937 -26.315 -26.705 -27.036 -27.396 -27.776 -28.057 -28.33 -28.625 -28.946 -29.261 -29.472 -29.688 -30.021 -30.252 -30.49 -30.61 -30.856 -31.112 -31.383 -31.528 -31.858 -31.971 -32.12 -32.289 -32.683 -32.877 -33.083 -33.321 -33.601 -33.964 -34.444 -36.106 -3 ,5278 ,TETRA ,17600887,Sun Nov 28 13:39:34 CET,Sun Nov 28 15:36:10 CET,0.0 1.544 1.934 2.177 2.349 2.49 2.612 2.738 2.946 3.031 3.111 3.101 3.313 3.371 3.488 3.594 3.684 3.73 3.814 3.899 4.019 4.08 4.136 4.217 4.296 4.358 4.414 4.464 4.517 4.559 4.592 4.624 4.646 4.664 4.684 4.688 4.67 4.643 4.61 4.563 4.493 4.381 4.196 3.969 3.632 3.201 2.612 1.775 0.59 -1.164 -4.041 -7.368 -9.981 -12.166 -13.956 -15.51 -16.838 -18.007 -19.008 -19.973 -20.773 -21.45 -22.082 -22.681 -23.234 -23.725 -24.236 -24.704 -25.095 -25.474 -25.881 -26.212 -26.54 -26.896 -27.17 -27.443 -27.717 -27.989 -28.28 -28.48 -28.683 -29.018 -29.25 -29.485 -29.602 -29.831 -30.078 -30.358 -30.493 -30.803 -30.903 -31.075 -31.247 -31.615 -31.827 -32.043 -32.241 -32.471 -32.768 -33.123 -34.857 -4 ,17395 ,TETRA ,17600888,Sun Nov 28 13:39:36 CET,Sun Nov 28 15:36:43 CET,0.0 1.012 1.369 1.568 1.721 1.853 1.969 2.08 2.284 2.369 2.435 2.416 2.624 2.686 2.8 2.908 2.997 3.04 3.142 3.226 3.342 3.429 3.506 3.599 3.669 3.723 3.772 3.823 3.891 3.945 3.994 4.053 4.104 4.149 4.185 4.208 4.201 4.184 4.175 4.135 4.069 3.951 3.737 3.467 3.096 2.637 2.011 1.166 -0.01 -1.809 -4.691 -7.973 -10.57 -12.706 -14.506 -16.069 -17.384 -18.546 -19.531 -20.481 -21.258 -21.933 -22.604 -23.226 -23.763 -24.244 -24.759 -25.219 -25.618 -26.024 -26.421 -26.739 -27.066 -27.406 -27.676 -27.957 -28.238 -28.535 -28.844 -29.064 -29.286 -29.602 -29.825 -30.061 -30.184 -30.435 -30.675 -30.92 -31.059 -31.393 -31.499 -31.662 -31.841 -32.235 -32.443 -32.667 -32.915 -33.19 -33.479 -33.782 -34.813 -5 ,7774 ,TETRA ,17600889,Sun Nov 28 13:39:34 CET,Sun Nov 28 15:37:11 CET,0.0 0.723 1.026 1.273 1.439 1.593 1.749 1.854 2.019 2.095 2.17 2.195 2.441 2.517 2.659 2.803 2.931 2.991 3.095 3.182 3.316 3.399 3.468 3.571 3.663 3.751 3.827 3.877 3.95 4.035 4.12 4.183 4.219 4.249 4.276 4.307 4.329 4.322 4.287 4.265 4.213 4.094 3.936 3.731 3.39 2.929 2.303 1.46 0.283 -1.455 -4.343 -7.666 -10.307 -12.478 -14.28 -15.832 -17.191 -18.383 -19.359 -20.312 -21.136 -21.855 -22.528 -23.155 -23.721 -24.236 -24.768 -25.231 -25.618 -26.009 -26.414 -26.757 -27.105 -27.473 -27.76 -28.039 -28.321 -28.627 -28.946 -29.158 -29.378 -29.728 -29.975 -30.217 -30.34 -30.591 -30.853 -31.122 -31.271 -31.621 -31.745 -31.902 -32.067 -32.431 -32.624 -32.84 -33.054 -33.28 -33.573 -33.942 -34.97 -6 ,12533 ,TETRA ,17600890,Sun Nov 28 13:39:33 CET,Sun Nov 28 15:37:06 CET,0.0 0.769 0.96 1.135 1.291 1.417 1.528 1.628 1.781 1.846 1.915 1.894 2.105 2.174 2.319 2.446 2.546 2.585 2.66 2.73 2.826 2.888 2.943 3.007 3.061 3.111 3.15 3.198 3.251 3.284 3.321 3.363 3.39 3.407 3.426 3.439 3.443 3.429 3.377 3.334 3.303 3.228 3.073 2.855 2.539 2.112 1.518 0.689 -0.526 -2.372 -5.41 -8.895 -11.552 -13.668 -15.39 -16.884 -18.174 -19.304 -20.236 -21.158 -21.955 -22.649 -23.292 -23.896 -24.464 -24.966 -25.462 -25.902 -26.288 -26.686 -27.11 -27.46 -27.811 -28.17 -28.442 -28.729 -29.03 -29.335 -29.64 -29.832 -30.029 -30.359 -30.576 -30.79 -30.9 -31.129 -31.398 -31.691 -31.833 -32.18 -32.302 -32.449 -32.593 -32.953 -33.16 -33.361 -33.591 -33.852 -34.149 -34.478 -35.777 -7 ,11087 ,TETRA ,17600891,Sun Nov 28 13:39:36 CET,Sun Nov 28 15:36:40 CET,0.0 1.481 1.757 1.956 2.142 2.289 2.404 2.507 2.696 2.772 2.843 2.845 3.066 3.125 3.228 3.317 3.4 3.44 3.515 3.591 3.706 3.779 3.84 3.923 3.989 4.061 4.123 4.165 4.221 4.273 4.314 4.36 4.405 4.434 4.453 4.455 4.456 4.447 4.393 4.327 4.237 4.109 3.937 3.701 3.376 2.985 2.395 1.546 0.337 -1.499 -4.423 -7.763 -10.394 -12.524 -14.32 -15.891 -17.23 -18.385 -19.346 -20.312 -21.139 -21.871 -22.562 -23.185 -23.745 -24.242 -24.758 -25.236 -25.651 -26.061 -26.47 -26.825 -27.189 -27.562 -27.847 -28.127 -28.414 -28.702 -28.995 -29.194 -29.405 -29.738 -29.973 -30.214 -30.333 -30.569 -30.807 -31.051 -31.191 -31.541 -31.683 -31.843 -31.996 -32.373 -32.593 -32.805 -33.021 -33.269 -33.552 -33.926 -35.063 -8 ,24047 ,TETRA ,17600892,Sun Nov 28 13:40:35 CET,Sun Nov 28 15:37:58 CET,0.0 0.942 1.209 1.434 1.57 1.682 1.8 1.903 2.086 2.175 2.251 2.228 2.439 2.502 2.613 2.722 2.824 2.874 2.968 3.055 3.179 3.248 3.307 3.384 3.455 3.519 3.57 3.624 3.7 3.765 3.818 3.878 3.922 3.961 4.015 4.06 4.093 4.119 4.126 4.109 4.044 3.917 3.716 3.477 3.149 2.69 2.072 1.206 -0.03 -1.868 -4.833 -8.298 -11.066 -13.248 -15.053 -16.641 -17.975 -19.118 -20.056 -20.969 -21.752 -22.46 -23.135 -23.744 -24.301 -24.796 -25.318 -25.787 -26.188 -26.601 -27.022 -27.356 -27.692 -28.045 -28.32 -28.603 -28.892 -29.19 -29.494 -29.707 -29.924 -30.256 -30.498 -30.742 -30.861 -31.12 -31.402 -31.693 -31.84 -32.165 -32.284 -32.459 -32.65 -33.075 -33.305 -33.539 -33.781 -34.065 -34.404 -34.821 -36.153 -9 ,17181 ,TETRA ,17600893,Sun Nov 28 13:40:35 CET,Sun Nov 28 15:38:18 CET,0.0 0.693 0.992 1.179 1.317 1.468 1.605 1.707 1.876 1.952 2.025 2.013 2.219 2.279 2.4 2.495 2.573 2.615 2.704 2.78 2.891 2.961 3.022 3.117 3.194 3.259 3.339 3.406 3.478 3.538 3.584 3.638 3.683 3.706 3.712 3.715 3.703 3.682 3.661 3.612 3.533 3.413 3.218 2.982 2.656 2.209 1.597 0.743 -0.502 -2.379 -5.485 -8.996 -11.696 -13.889 -15.728 -17.304 -18.638 -19.806 -20.793 -21.76 -22.563 -23.25 -23.908 -24.524 -25.074 -25.574 -26.1 -26.552 -26.946 -27.368 -27.795 -28.148 -28.509 -28.872 -29.143 -29.408 -29.69 -30.005 -30.337 -30.566 -30.807 -31.168 -31.402 -31.642 -31.77 -32.025 -32.276 -32.55 -32.696 -33.028 -33.14 -33.306 -33.479 -33.851 -34.054 -34.274 -34.499 -34.756 -35.092 -35.537 -37.318 -10 ,18716 ,TETRA ,17600894,Sun Nov 28 13:40:37 CET,Sun Nov 28 15:38:41 CET,0.0 1.076 1.406 1.611 1.804 1.951 2.086 2.213 2.401 2.485 2.579 2.603 2.821 2.881 2.98 3.071 3.16 3.194 3.258 3.341 3.438 3.482 3.525 3.579 3.631 3.692 3.746 3.798 3.879 3.944 3.993 4.04 4.077 4.099 4.101 4.102 4.099 4.084 4.048 3.99 3.914 3.786 3.601 3.396 3.076 2.618 1.998 1.129 -0.134 -1.986 -5.029 -8.533 -11.221 -13.367 -15.157 -16.709 -18.031 -19.2 -20.195 -21.182 -21.998 -22.707 -23.355 -23.952 -24.498 -25.006 -25.544 -26.003 -26.407 -26.82 -27.229 -27.571 -27.925 -28.281 -28.561 -28.854 -29.143 -29.433 -29.739 -29.952 -30.175 -30.552 -30.791 -31.026 -31.157 -31.411 -31.671 -31.946 -32.096 -32.442 -32.575 -32.745 -32.925 -33.302 -33.522 -33.75 -33.984 -34.262 -34.598 -35.028 -36.439 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_68_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_68_64.txt deleted file mode 100644 index 0bf22113..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/protein/Summary_FEP_68_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5374 ,TETRA ,17600895,Sun Nov 28 13:40:38 CET,Sun Nov 28 15:37:22 CET,0.0 2.224 2.564 2.767 2.947 3.113 3.286 3.426 3.637 3.725 3.804 3.821 4.033 4.086 4.192 4.289 4.378 4.421 4.495 4.571 4.69 4.755 4.817 4.922 5.013 5.092 5.165 5.218 5.273 5.32 5.344 5.368 5.386 5.379 5.365 5.356 5.348 5.294 5.196 5.077 4.922 4.711 4.435 4.123 3.68 3.072 2.215 1.078 -0.499 -2.804 -6.425 -10.479 -13.581 -16.054 -18.066 -19.751 -21.159 -22.407 -23.449 -24.429 -25.262 -25.999 -26.686 -27.329 -27.913 -28.45 -29.005 -29.481 -29.876 -30.288 -30.74 -31.115 -31.488 -31.87 -32.16 -32.444 -32.73 -33.04 -33.372 -33.601 -33.834 -34.17 -34.398 -34.634 -34.749 -34.989 -35.264 -35.565 -35.711 -36.05 -36.182 -36.348 -36.502 -36.846 -37.045 -37.257 -37.469 -37.704 -37.981 -38.34 -39.848 -2 ,3819 ,TETRA ,17600896,Sun Nov 28 13:41:34 CET,Sun Nov 28 15:38:59 CET,0.0 1.506 1.876 2.087 2.26 2.432 2.573 2.689 2.876 2.969 3.053 3.039 3.239 3.291 3.399 3.517 3.62 3.664 3.746 3.823 3.928 3.991 4.046 4.123 4.179 4.208 4.244 4.291 4.353 4.383 4.395 4.414 4.427 4.432 4.429 4.397 4.334 4.25 4.135 4.011 3.857 3.626 3.334 3.006 2.522 1.894 1.05 -0.099 -1.741 -4.085 -7.671 -11.641 -14.706 -17.21 -19.281 -21.033 -22.481 -23.748 -24.841 -25.912 -26.796 -27.555 -28.253 -28.885 -29.468 -30.004 -30.553 -31.027 -31.418 -31.801 -32.215 -32.574 -32.942 -33.325 -33.618 -33.921 -34.243 -34.572 -34.892 -35.1 -35.325 -35.684 -35.925 -36.165 -36.289 -36.554 -36.809 -37.075 -37.219 -37.569 -37.697 -37.853 -38.009 -38.359 -38.551 -38.758 -38.994 -39.261 -39.539 -39.942 -43.584 -3 ,13112 ,TETRA ,17600897,Sun Nov 28 13:41:33 CET,Sun Nov 28 15:39:27 CET,0.0 1.036 1.39 1.648 1.841 1.995 2.133 2.251 2.432 2.524 2.619 2.615 2.823 2.884 2.989 3.069 3.151 3.192 3.259 3.321 3.43 3.492 3.542 3.623 3.693 3.743 3.789 3.833 3.884 3.934 3.963 3.975 3.982 3.979 3.971 3.943 3.902 3.834 3.719 3.581 3.419 3.213 2.918 2.556 2.092 1.5 0.661 -0.449 -1.994 -4.303 -7.953 -11.975 -15.004 -17.446 -19.484 -21.233 -22.708 -23.998 -25.086 -26.14 -27.003 -27.755 -28.462 -29.131 -29.741 -30.269 -30.797 -31.258 -31.66 -32.067 -32.472 -32.8 -33.139 -33.489 -33.763 -34.047 -34.335 -34.628 -34.929 -35.14 -35.364 -35.706 -35.94 -36.17 -36.284 -36.533 -36.808 -37.101 -37.248 -37.586 -37.691 -37.853 -38.023 -38.372 -38.56 -38.784 -39.038 -39.318 -39.66 -40.153 -41.914 -4 ,18528 ,TETRA ,17600898,Sun Nov 28 13:41:35 CET,Sun Nov 28 15:39:16 CET,0.0 0.809 1.161 1.4 1.58 1.753 1.904 2.05 2.313 2.42 2.508 2.487 2.713 2.787 2.919 3.03 3.115 3.155 3.227 3.307 3.42 3.484 3.546 3.624 3.683 3.738 3.796 3.846 3.897 3.944 3.98 4.016 4.037 4.047 4.05 4.027 3.98 3.92 3.836 3.722 3.583 3.381 3.09 2.742 2.274 1.667 0.826 -0.306 -1.877 -4.162 -7.891 -12.035 -15.174 -17.685 -19.726 -21.464 -22.916 -24.199 -25.289 -26.343 -27.213 -27.959 -28.662 -29.315 -29.909 -30.433 -30.985 -31.478 -31.882 -32.302 -32.738 -33.098 -33.464 -33.842 -34.137 -34.435 -34.731 -35.038 -35.351 -35.563 -35.793 -36.145 -36.381 -36.632 -36.761 -37.019 -37.281 -37.554 -37.691 -38.03 -38.144 -38.307 -38.472 -38.81 -38.982 -39.17 -39.416 -39.703 -40.013 -40.396 -47.763 -5 ,19445 ,TETRA ,17600899,Sun Nov 28 13:43:33 CET,Sun Nov 28 15:44:18 CET,0.0 1.188 1.421 1.589 1.758 1.905 2.039 2.158 2.348 2.445 2.551 2.59 2.816 2.885 2.984 3.091 3.216 3.274 3.366 3.455 3.574 3.636 3.707 3.801 3.89 3.972 4.048 4.119 4.192 4.258 4.312 4.361 4.389 4.399 4.405 4.399 4.374 4.341 4.296 4.197 4.037 3.821 3.52 3.174 2.727 2.135 1.312 0.214 -1.36 -3.664 -7.226 -11.157 -14.203 -16.655 -18.654 -20.31 -21.692 -22.901 -23.906 -24.9 -25.733 -26.448 -27.125 -27.761 -28.337 -28.854 -29.382 -29.837 -30.241 -30.659 -31.075 -31.426 -31.794 -32.164 -32.446 -32.742 -33.037 -33.332 -33.642 -33.856 -34.061 -34.37 -34.597 -34.834 -34.954 -35.191 -35.435 -35.704 -35.84 -36.173 -36.295 -36.462 -36.634 -36.996 -37.174 -37.373 -37.628 -37.929 -38.242 -38.63 -40.172 -6 ,4614 ,TETRA ,17600900,Sun Nov 28 13:44:34 CET,Sun Nov 28 15:46:15 CET,0.0 1.027 1.355 1.609 1.81 1.997 2.138 2.249 2.455 2.553 2.654 2.701 2.933 3.01 3.152 3.275 3.379 3.423 3.506 3.584 3.671 3.72 3.773 3.832 3.879 3.947 4.004 4.033 4.072 4.102 4.123 4.153 4.167 4.168 4.146 4.107 4.058 3.984 3.908 3.803 3.658 3.45 3.151 2.815 2.357 1.743 0.899 -0.22 -1.787 -4.093 -7.722 -11.722 -14.778 -17.207 -19.218 -20.977 -22.45 -23.715 -24.773 -25.826 -26.699 -27.451 -28.155 -28.793 -29.373 -29.889 -30.427 -30.908 -31.314 -31.735 -32.175 -32.536 -32.89 -33.269 -33.569 -33.866 -34.161 -34.466 -34.796 -35.026 -35.255 -35.601 -35.839 -36.077 -36.203 -36.473 -36.761 -37.049 -37.187 -37.527 -37.624 -37.778 -37.943 -38.287 -38.467 -38.654 -38.888 -39.167 -39.502 -39.968 -41.702 -7 ,26656 ,TETRA ,17600901,Sun Nov 28 13:47:33 CET,Sun Nov 28 15:43:38 CET,0.0 1.881 2.191 2.435 2.625 2.773 2.916 3.027 3.214 3.297 3.377 3.385 3.606 3.668 3.776 3.877 3.976 4.019 4.102 4.177 4.273 4.326 4.376 4.451 4.507 4.567 4.622 4.66 4.701 4.735 4.772 4.807 4.819 4.829 4.833 4.811 4.774 4.718 4.637 4.541 4.399 4.182 3.916 3.593 3.106 2.486 1.664 0.547 -1.004 -3.238 -6.776 -10.717 -13.742 -16.204 -18.232 -19.931 -21.364 -22.62 -23.657 -24.67 -25.524 -26.263 -26.971 -27.637 -28.23 -28.755 -29.306 -29.784 -30.173 -30.583 -31.024 -31.39 -31.761 -32.133 -32.426 -32.719 -33.006 -33.31 -33.638 -33.864 -34.084 -34.412 -34.641 -34.885 -35.004 -35.246 -35.519 -35.786 -35.921 -36.254 -36.373 -36.541 -36.718 -37.062 -37.256 -37.48 -37.713 -37.986 -38.294 -38.681 -40.366 -8 ,11943 ,TETRA ,17600902,Sun Nov 28 13:47:36 CET,Sun Nov 28 15:43:38 CET,0.0 2.767 3.053 3.264 3.437 3.59 3.714 3.841 4.095 4.193 4.277 4.29 4.506 4.574 4.705 4.81 4.926 4.987 5.084 5.161 5.269 5.335 5.399 5.482 5.534 5.572 5.619 5.665 5.7 5.733 5.769 5.803 5.828 5.845 5.857 5.851 5.813 5.746 5.664 5.549 5.395 5.185 4.906 4.573 4.098 3.485 2.675 1.567 -0.052 -2.329 -5.882 -9.908 -12.977 -15.416 -17.404 -19.134 -20.608 -21.89 -22.961 -24.021 -24.909 -25.686 -26.405 -27.059 -27.653 -28.182 -28.731 -29.228 -29.646 -30.075 -30.529 -30.902 -31.277 -31.656 -31.953 -32.26 -32.562 -32.871 -33.191 -33.41 -33.639 -33.984 -34.23 -34.485 -34.608 -34.866 -35.148 -35.442 -35.588 -35.934 -36.034 -36.184 -36.346 -36.709 -36.907 -37.12 -37.34 -37.607 -38.005 -38.447 -39.887 -9 ,2938 ,TETRA ,17600903,Sun Nov 28 13:48:34 CET,Sun Nov 28 15:44:41 CET,0.0 0.954 1.294 1.581 1.842 2.035 2.181 2.315 2.565 2.659 2.748 2.773 2.987 3.051 3.174 3.266 3.347 3.391 3.469 3.536 3.636 3.708 3.77 3.832 3.884 3.939 3.991 4.039 4.081 4.11 4.125 4.138 4.165 4.173 4.164 4.153 4.113 4.036 3.951 3.857 3.738 3.553 3.273 2.931 2.473 1.862 0.991 -0.111 -1.637 -3.951 -7.559 -11.561 -14.691 -17.204 -19.258 -20.987 -22.424 -23.662 -24.726 -25.773 -26.639 -27.429 -28.163 -28.821 -29.45 -30.027 -30.593 -31.068 -31.47 -31.89 -32.334 -32.702 -33.072 -33.434 -33.703 -33.982 -34.266 -34.562 -34.878 -35.096 -35.314 -35.642 -35.862 -36.09 -36.209 -36.461 -36.715 -36.969 -37.103 -37.438 -37.538 -37.689 -37.85 -38.197 -38.388 -38.611 -38.833 -39.05 -39.29 -39.577 -41.248 -10 ,15145 ,TETRA ,17600904,Sun Nov 28 13:48:35 CET,Sun Nov 28 15:44:53 CET,0.0 1.128 1.436 1.686 1.92 2.1 2.253 2.384 2.574 2.664 2.754 2.763 2.976 3.033 3.147 3.248 3.344 3.387 3.474 3.555 3.636 3.688 3.74 3.79 3.846 3.905 3.947 3.985 4.023 4.049 4.074 4.1 4.106 4.112 4.123 4.113 4.07 3.999 3.908 3.797 3.652 3.449 3.156 2.798 2.3 1.668 0.837 -0.277 -1.835 -4.152 -7.796 -11.787 -14.839 -17.29 -19.285 -21.001 -22.457 -23.731 -24.79 -25.802 -26.651 -27.392 -28.089 -28.746 -29.352 -29.888 -30.419 -30.891 -31.307 -31.729 -32.154 -32.502 -32.862 -33.225 -33.513 -33.815 -34.11 -34.411 -34.719 -34.927 -35.136 -35.461 -35.684 -35.917 -36.035 -36.272 -36.527 -36.801 -36.951 -37.301 -37.432 -37.595 -37.754 -38.114 -38.302 -38.51 -38.791 -39.111 -39.437 -39.771 -41.527 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_23_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_23_62.txt deleted file mode 100644 index 8271b47e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_23_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15195 ,TETRA ,17600905,Sun Nov 28 13:57:35 CET,Sun Nov 28 15:31:29 CET,0.0 3.171 3.709 4.131 4.479 4.811 5.12 5.406 5.96 6.205 6.438 6.699 7.031 7.199 7.538 7.862 8.174 8.324 8.607 8.885 9.259 9.48 9.704 10.037 10.354 10.654 10.934 11.203 11.559 11.901 12.235 12.612 12.961 13.313 13.718 14.163 14.594 15.076 15.556 16.028 16.543 17.083 17.691 18.304 18.994 19.749 20.58 21.45 22.365 23.288 24.12 24.47 24.416 24.212 23.947 23.63 23.32 23.016 22.737 22.42 22.117 21.856 21.606 21.364 21.126 20.904 20.665 20.427 20.23 20.031 19.811 19.627 19.428 19.221 19.06 18.886 18.689 18.485 18.287 18.148 17.99 17.761 17.6 17.43 17.345 17.164 16.996 16.802 16.681 16.403 16.276 16.128 15.981 15.684 15.532 15.361 15.17 14.961 14.688 14.206 12.448 -2 ,49 ,TETRA ,17600906,Sun Nov 28 13:58:35 CET,Sun Nov 28 15:33:37 CET,0.0 2.99 3.506 3.952 4.284 4.549 4.778 4.993 5.395 5.59 5.795 6.019 6.348 6.506 6.803 7.088 7.356 7.481 7.735 7.98 8.307 8.518 8.725 9.011 9.28 9.526 9.775 10.032 10.34 10.625 10.909 11.25 11.577 11.888 12.249 12.638 13.007 13.428 13.868 14.315 14.766 15.25 15.835 16.418 17.055 17.723 18.44 19.256 20.074 20.868 21.693 22.02 21.987 21.825 21.594 21.31 21.014 20.729 20.446 20.126 19.832 19.557 19.286 19.03 18.774 18.514 18.255 18.041 17.866 17.678 17.477 17.295 17.101 16.914 16.754 16.578 16.41 16.238 16.034 15.899 15.776 15.579 15.436 15.28 15.19 14.984 14.757 14.532 14.414 14.146 14.062 13.944 13.809 13.497 13.309 13.088 12.849 12.598 12.318 11.914 10.285 -3 ,13049 ,TETRA ,17600907,Sun Nov 28 14:01:37 CET,Sun Nov 28 15:39:17 CET,0.0 1.722 2.294 2.754 3.139 3.463 3.754 4.022 4.51 4.725 4.939 5.18 5.513 5.703 6.084 6.417 6.716 6.86 7.135 7.403 7.781 8.025 8.262 8.599 8.919 9.214 9.487 9.756 10.117 10.472 10.809 11.197 11.556 11.901 12.291 12.708 13.115 13.569 14.055 14.567 15.081 15.646 16.299 16.941 17.666 18.444 19.309 20.189 21.137 22.064 22.912 23.331 23.353 23.214 22.972 22.666 22.356 22.053 21.749 21.429 21.157 20.886 20.601 20.333 20.08 19.832 19.582 19.366 19.17 18.951 18.705 18.501 18.304 18.12 17.976 17.821 17.663 17.488 17.308 17.195 17.08 16.891 16.733 16.575 16.493 16.301 16.09 15.871 15.755 15.483 15.382 15.258 15.13 14.86 14.707 14.541 14.366 14.158 13.908 13.583 11.8 -4 ,29580 ,TETRA ,17600908,Sun Nov 28 14:02:35 CET,Sun Nov 28 15:38:57 CET,0.0 2.063 2.594 2.993 3.334 3.641 3.935 4.195 4.675 4.901 5.11 5.357 5.706 5.872 6.181 6.499 6.809 6.953 7.225 7.478 7.849 8.099 8.342 8.687 9.026 9.351 9.664 9.973 10.343 10.68 10.994 11.375 11.752 12.097 12.493 12.956 13.37 13.806 14.274 14.757 15.258 15.857 16.546 17.161 17.879 18.692 19.597 20.483 21.411 22.382 23.225 23.605 23.574 23.389 23.151 22.857 22.539 22.245 21.972 21.677 21.395 21.135 20.899 20.666 20.431 20.199 19.949 19.724 19.501 19.265 19.01 18.765 18.515 18.278 18.094 17.901 17.706 17.513 17.303 17.156 17.009 16.769 16.577 16.362 16.261 16.066 15.846 15.631 15.519 15.233 15.08 14.92 14.754 14.386 14.19 13.962 13.703 13.379 13.02 12.476 11.101 -5 ,18429 ,TETRA ,17600909,Sun Nov 28 14:07:35 CET,Sun Nov 28 15:46:37 CET,0.0 2.201 2.737 3.16 3.519 3.805 4.061 4.312 4.761 4.946 5.128 5.34 5.66 5.816 6.117 6.409 6.687 6.814 7.074 7.328 7.662 7.876 8.092 8.406 8.689 8.961 9.24 9.501 9.834 10.16 10.447 10.78 11.103 11.411 11.76 12.133 12.493 12.874 13.268 13.7 14.174 14.685 15.228 15.776 16.45 17.166 17.913 18.72 19.641 20.531 21.276 21.545 21.484 21.288 21.033 20.714 20.373 20.035 19.712 19.366 19.066 18.79 18.52 18.285 18.074 17.881 17.656 17.444 17.26 17.06 16.837 16.641 16.437 16.239 16.098 15.949 15.786 15.621 15.447 15.31 15.155 14.919 14.761 14.558 14.442 14.247 14.062 13.85 13.742 13.479 13.365 13.227 13.061 12.68 12.508 12.335 12.103 11.819 11.506 11.111 8.839 -6 ,32009 ,TETRA ,17600910,Sun Nov 28 14:07:34 CET,Sun Nov 28 15:45:26 CET,0.0 2.121 2.651 3.053 3.368 3.669 3.967 4.239 4.684 4.887 5.083 5.289 5.635 5.817 6.147 6.443 6.715 6.851 7.117 7.355 7.668 7.883 8.114 8.463 8.784 9.054 9.311 9.545 9.841 10.141 10.426 10.777 11.118 11.448 11.842 12.287 12.682 13.108 13.577 14.032 14.486 14.985 15.563 16.15 16.793 17.471 18.225 19.014 19.838 20.656 21.428 21.779 21.712 21.537 21.307 21.018 20.702 20.368 20.073 19.766 19.509 19.27 19.028 18.811 18.601 18.399 18.162 17.952 17.775 17.568 17.323 17.121 16.923 16.71 16.536 16.353 16.163 15.971 15.767 15.626 15.485 15.273 15.114 14.934 14.845 14.666 14.478 14.262 14.136 13.859 13.739 13.592 13.45 13.16 12.996 12.804 12.544 12.275 11.971 11.471 9.72 -7 ,7489 ,TETRA ,17600911,Sun Nov 28 14:08:34 CET,Sun Nov 28 15:47:48 CET,0.0 1.903 2.423 2.842 3.191 3.528 3.849 4.123 4.596 4.82 5.037 5.288 5.626 5.804 6.162 6.5 6.82 6.963 7.226 7.497 7.896 8.141 8.365 8.66 8.943 9.238 9.516 9.795 10.177 10.525 10.859 11.243 11.607 11.986 12.414 12.849 13.243 13.685 14.185 14.705 15.236 15.821 16.446 17.047 17.754 18.511 19.299 20.156 21.082 21.974 22.789 23.17 23.134 22.931 22.648 22.341 22.057 21.77 21.489 21.204 20.966 20.728 20.483 20.242 19.995 19.778 19.56 19.352 19.159 18.967 18.753 18.572 18.383 18.181 18.036 17.876 17.699 17.52 17.344 17.231 17.098 16.845 16.675 16.515 16.43 16.243 16.019 15.78 15.666 15.404 15.284 15.139 14.983 14.64 14.478 14.323 14.12 13.847 13.546 13.14 11.748 -8 ,32460 ,TETRA ,17600912,Sun Nov 28 14:08:34 CET,Sun Nov 28 15:49:15 CET,0.0 2.33 2.87 3.234 3.572 3.88 4.148 4.376 4.802 5.009 5.194 5.373 5.69 5.846 6.133 6.406 6.655 6.772 7.015 7.248 7.561 7.754 7.942 8.233 8.521 8.795 9.067 9.336 9.671 9.992 10.288 10.635 10.961 11.263 11.633 12.041 12.411 12.839 13.317 13.8 14.317 14.899 15.556 16.178 16.847 17.586 18.381 19.185 20.069 21.001 21.883 22.238 22.136 21.857 21.537 21.192 20.847 20.539 20.23 19.845 19.506 19.212 18.948 18.691 18.444 18.227 17.999 17.796 17.591 17.353 17.125 16.955 16.767 16.541 16.37 16.212 16.044 15.857 15.669 15.546 15.406 15.184 15.034 14.862 14.768 14.589 14.401 14.187 14.054 13.74 13.534 13.355 13.184 12.874 12.719 12.518 12.275 11.981 11.563 11.053 9.767 -9 ,31502 ,TETRA ,17600913,Sun Nov 28 14:09:35 CET,Sun Nov 28 15:51:23 CET,0.0 2.174 2.712 3.097 3.46 3.798 4.081 4.312 4.742 4.943 5.134 5.332 5.669 5.844 6.149 6.433 6.722 6.863 7.123 7.363 7.698 7.897 8.096 8.411 8.713 9.003 9.269 9.509 9.821 10.131 10.429 10.788 11.127 11.447 11.805 12.185 12.551 12.945 13.356 13.797 14.243 14.713 15.279 15.849 16.47 17.156 17.908 18.658 19.481 20.385 21.241 21.596 21.542 21.309 21.035 20.722 20.427 20.159 19.899 19.624 19.386 19.152 18.909 18.665 18.439 18.236 18.001 17.778 17.577 17.378 17.184 17.012 16.824 16.62 16.452 16.283 16.115 15.927 15.729 15.595 15.462 15.247 15.084 14.911 14.817 14.616 14.409 14.17 14.04 13.748 13.577 13.401 13.218 12.878 12.707 12.524 12.33 12.058 11.722 11.353 9.887 -10 ,4941 ,TETRA ,17600914,Sun Nov 28 14:09:34 CET,Sun Nov 28 15:48:42 CET,0.0 2.384 3.003 3.467 3.84 4.135 4.429 4.715 5.189 5.395 5.588 5.806 6.14 6.323 6.67 6.996 7.302 7.446 7.744 8.047 8.46 8.709 8.971 9.335 9.65 9.964 10.265 10.567 10.945 11.288 11.627 12.039 12.447 12.808 13.203 13.65 14.089 14.577 15.098 15.605 16.081 16.623 17.238 17.866 18.588 19.342 20.188 21.046 21.928 22.829 23.619 23.981 23.966 23.766 23.476 23.173 22.837 22.485 22.187 21.879 21.597 21.334 21.076 20.809 20.553 20.325 20.111 19.926 19.728 19.493 19.264 19.093 18.918 18.732 18.588 18.432 18.263 18.083 17.855 17.691 17.541 17.302 17.13 16.932 16.819 16.593 16.369 16.115 15.97 15.675 15.494 15.306 15.099 14.672 14.47 14.264 14.017 13.727 13.371 12.889 10.722 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_23_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_23_64.txt deleted file mode 100644 index c7f833e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_23_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10453 ,TETRA ,17600915,Sun Nov 28 14:09:34 CET,Sun Nov 28 15:58:44 CET,0.0 2.261 2.752 3.064 3.343 3.59 3.803 3.988 4.321 4.476 4.627 4.763 5.051 5.174 5.421 5.653 5.869 5.965 6.136 6.292 6.541 6.72 6.887 7.128 7.352 7.555 7.744 7.916 8.124 8.33 8.537 8.776 8.987 9.198 9.444 9.689 9.922 10.179 10.456 10.723 10.978 11.254 11.559 11.841 12.14 12.405 12.615 12.787 12.879 12.793 12.297 11.352 10.454 9.635 8.885 8.207 7.591 7.005 6.487 5.961 5.511 5.115 4.739 4.369 4.013 3.684 3.336 3.012 2.723 2.44 2.145 1.882 1.606 1.334 1.122 0.892 0.673 0.46 0.233 0.071 -0.096 -0.36 -0.542 -0.733 -0.845 -1.074 -1.283 -1.492 -1.611 -1.926 -2.081 -2.232 -2.397 -2.764 -2.968 -3.193 -3.472 -3.774 -4.087 -4.423 -5.48 -2 ,3216 ,TETRA ,17600916,Sun Nov 28 14:09:34 CET,Sun Nov 28 15:49:17 CET,0.0 1.057 1.497 1.824 2.101 2.346 2.558 2.742 3.082 3.246 3.392 3.516 3.812 3.951 4.215 4.439 4.639 4.738 4.922 5.096 5.342 5.504 5.667 5.889 6.087 6.288 6.475 6.639 6.856 7.085 7.301 7.54 7.75 7.955 8.197 8.439 8.665 8.919 9.186 9.462 9.714 9.971 10.281 10.564 10.849 11.137 11.388 11.58 11.675 11.595 11.191 10.312 9.389 8.537 7.763 7.073 6.466 5.901 5.385 4.827 4.351 3.934 3.531 3.165 2.822 2.485 2.147 1.842 1.576 1.311 1.012 0.767 0.521 0.271 0.067 -0.139 -0.34 -0.55 -0.783 -0.954 -1.123 -1.377 -1.553 -1.748 -1.852 -2.061 -2.28 -2.503 -2.622 -2.92 -3.022 -3.15 -3.289 -3.617 -3.789 -3.958 -4.162 -4.418 -4.72 -5.102 -5.954 -3 ,10271 ,TETRA ,17600917,Sun Nov 28 14:09:34 CET,Sun Nov 28 15:57:29 CET,0.0 1.556 2.029 2.393 2.64 2.87 3.104 3.319 3.663 3.813 3.957 4.07 4.371 4.506 4.752 5.002 5.238 5.341 5.524 5.704 5.964 6.118 6.278 6.513 6.704 6.888 7.067 7.242 7.454 7.638 7.826 8.056 8.266 8.467 8.698 8.949 9.201 9.463 9.708 9.957 10.209 10.487 10.792 11.066 11.368 11.654 11.908 12.105 12.212 12.184 11.793 10.937 10.059 9.231 8.503 7.812 7.182 6.598 6.081 5.566 5.104 4.69 4.299 3.91 3.541 3.205 2.874 2.587 2.333 2.066 1.793 1.555 1.292 1.023 0.815 0.594 0.366 0.131 -0.105 -0.264 -0.434 -0.694 -0.876 -1.064 -1.157 -1.355 -1.568 -1.792 -1.903 -2.186 -2.286 -2.434 -2.591 -2.928 -3.124 -3.328 -3.551 -3.799 -4.096 -4.467 -5.146 -4 ,32475 ,TETRA ,17600918,Sun Nov 28 14:09:34 CET,Sun Nov 28 15:49:23 CET,0.0 1.6 2.084 2.425 2.734 2.998 3.219 3.436 3.794 3.943 4.084 4.208 4.493 4.618 4.863 5.093 5.302 5.405 5.622 5.814 6.071 6.237 6.386 6.606 6.807 7.0 7.194 7.383 7.625 7.847 8.05 8.278 8.491 8.698 8.942 9.2 9.444 9.709 9.966 10.207 10.444 10.718 11.02 11.277 11.539 11.8 12.057 12.288 12.427 12.359 11.863 10.963 10.093 9.26 8.488 7.741 7.076 6.503 5.998 5.482 5.039 4.631 4.238 3.874 3.544 3.242 2.901 2.594 2.332 2.06 1.767 1.518 1.28 1.014 0.8 0.588 0.356 0.105 -0.136 -0.301 -0.482 -0.745 -0.916 -1.102 -1.199 -1.403 -1.627 -1.856 -1.976 -2.275 -2.415 -2.572 -2.737 -3.087 -3.268 -3.466 -3.663 -3.904 -4.214 -4.617 -5.762 -5 ,12394 ,TETRA ,17600919,Sun Nov 28 14:09:35 CET,Sun Nov 28 15:48:14 CET,0.0 1.383 1.84 2.207 2.483 2.721 2.964 3.173 3.544 3.723 3.869 3.985 4.273 4.4 4.647 4.883 5.108 5.225 5.439 5.631 5.901 6.07 6.235 6.47 6.702 6.921 7.122 7.307 7.557 7.795 7.996 8.224 8.447 8.662 8.897 9.153 9.394 9.627 9.875 10.152 10.427 10.702 10.989 11.252 11.554 11.847 12.116 12.343 12.458 12.426 11.993 11.078 10.183 9.355 8.61 7.942 7.317 6.707 6.18 5.684 5.259 4.872 4.497 4.121 3.751 3.425 3.1 2.805 2.548 2.285 2.008 1.785 1.552 1.297 1.088 0.869 0.656 0.441 0.2 0.025 -0.15 -0.413 -0.599 -0.793 -0.896 -1.112 -1.339 -1.589 -1.716 -2.015 -2.133 -2.276 -2.428 -2.744 -2.901 -3.086 -3.333 -3.62 -3.919 -4.35 -6.298 -6 ,16288 ,TETRA ,17600920,Sun Nov 28 14:09:35 CET,Sun Nov 28 15:48:47 CET,0.0 1.866 2.401 2.786 3.172 3.537 3.835 4.055 4.431 4.61 4.764 4.885 5.158 5.277 5.525 5.764 5.972 6.068 6.257 6.439 6.698 6.86 7.012 7.22 7.43 7.626 7.787 7.938 8.151 8.358 8.571 8.83 9.055 9.263 9.506 9.777 10.019 10.264 10.508 10.768 11.04 11.317 11.612 11.899 12.194 12.454 12.687 12.88 12.983 12.909 12.434 11.541 10.659 9.837 9.09 8.387 7.756 7.187 6.683 6.197 5.792 5.415 5.044 4.699 4.39 4.101 3.801 3.536 3.29 3.021 2.745 2.505 2.243 1.979 1.771 1.543 1.318 1.104 0.879 0.715 0.541 0.275 0.083 -0.116 -0.212 -0.428 -0.67 -0.891 -1.0 -1.29 -1.398 -1.55 -1.721 -2.087 -2.286 -2.495 -2.718 -2.99 -3.312 -3.708 -4.8 -7 ,5065 ,TETRA ,17600921,Sun Nov 28 14:10:36 CET,Sun Nov 28 15:51:09 CET,0.0 0.934 1.37 1.742 2.018 2.257 2.507 2.753 3.154 3.317 3.469 3.582 3.854 3.973 4.206 4.414 4.613 4.72 4.921 5.113 5.383 5.531 5.679 5.908 6.116 6.312 6.495 6.659 6.871 7.073 7.262 7.497 7.728 7.919 8.136 8.398 8.635 8.885 9.143 9.416 9.698 9.988 10.302 10.595 10.908 11.192 11.431 11.644 11.791 11.72 11.212 10.338 9.505 8.722 7.986 7.293 6.682 6.115 5.596 5.054 4.601 4.207 3.826 3.468 3.133 2.823 2.499 2.207 1.94 1.654 1.364 1.124 0.868 0.599 0.398 0.187 -0.042 -0.289 -0.541 -0.71 -0.879 -1.157 -1.365 -1.583 -1.695 -1.921 -2.15 -2.399 -2.523 -2.804 -2.922 -3.074 -3.223 -3.578 -3.796 -4.024 -4.297 -4.615 -4.972 -5.455 -6.978 -8 ,1679 ,TETRA ,17600922,Sun Nov 28 14:11:35 CET,Sun Nov 28 15:51:56 CET,0.0 1.293 1.809 2.189 2.462 2.682 2.908 3.124 3.533 3.733 3.907 4.059 4.354 4.484 4.731 4.966 5.191 5.295 5.484 5.663 5.947 6.122 6.275 6.496 6.726 6.939 7.116 7.289 7.512 7.712 7.917 8.162 8.379 8.589 8.838 9.102 9.336 9.576 9.816 10.055 10.303 10.581 10.907 11.193 11.466 11.727 11.954 12.151 12.272 12.236 11.85 11.028 10.139 9.277 8.535 7.857 7.223 6.633 6.123 5.627 5.179 4.775 4.385 4.006 3.659 3.33 3.002 2.716 2.459 2.196 1.923 1.697 1.462 1.21 0.989 0.76 0.54 0.312 0.077 -0.084 -0.254 -0.524 -0.702 -0.88 -0.973 -1.18 -1.434 -1.762 -1.944 -2.296 -2.506 -2.691 -2.888 -3.298 -3.52 -3.785 -4.063 -4.329 -4.622 -5.023 -6.353 -9 ,8927 ,TETRA ,17600923,Sun Nov 28 14:11:35 CET,Sun Nov 28 15:52:00 CET,0.0 1.372 1.845 2.208 2.518 2.777 3.006 3.218 3.599 3.766 3.928 4.052 4.346 4.485 4.739 4.972 5.187 5.289 5.478 5.657 5.929 6.093 6.234 6.428 6.603 6.774 6.946 7.106 7.311 7.523 7.715 7.938 8.161 8.369 8.623 8.896 9.127 9.37 9.636 9.923 10.191 10.467 10.76 11.048 11.377 11.702 12.0 12.205 12.307 12.256 11.794 10.9 9.993 9.156 8.38 7.65 7.033 6.465 5.961 5.448 5.0 4.605 4.228 3.843 3.469 3.131 2.758 2.421 2.142 1.862 1.559 1.314 1.074 0.807 0.596 0.389 0.191 -0.024 -0.25 -0.393 -0.548 -0.832 -1.025 -1.203 -1.296 -1.501 -1.728 -1.969 -2.082 -2.358 -2.438 -2.568 -2.716 -3.07 -3.263 -3.468 -3.702 -3.984 -4.305 -4.736 -6.317 -10 ,1647 ,TETRA ,17600924,Sun Nov 28 14:12:34 CET,Sun Nov 28 16:01:42 CET,0.0 1.246 1.771 2.138 2.434 2.693 2.916 3.115 3.481 3.652 3.82 3.97 4.265 4.396 4.671 4.923 5.135 5.235 5.417 5.581 5.813 5.964 6.112 6.315 6.501 6.685 6.871 7.047 7.264 7.466 7.652 7.886 8.11 8.318 8.534 8.778 9.012 9.25 9.497 9.755 10.009 10.283 10.609 10.898 11.141 11.389 11.665 11.887 11.987 11.882 11.413 10.523 9.642 8.811 8.058 7.362 6.695 6.094 5.59 5.04 4.541 4.127 3.755 3.373 2.989 2.655 2.327 2.022 1.758 1.496 1.216 0.979 0.736 0.488 0.292 0.081 -0.135 -0.353 -0.583 -0.744 -0.905 -1.171 -1.367 -1.566 -1.669 -1.889 -2.121 -2.362 -2.48 -2.764 -2.869 -3.014 -3.17 -3.471 -3.632 -3.832 -4.075 -4.346 -4.663 -5.144 -6.967 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_23_66.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_23_66.txt deleted file mode 100644 index a70a206a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_23_66.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12696 ,KEBNE ,17027087,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:36:44 CET,0.0 0.767 1.152 1.513 1.878 2.215 2.518 2.795 3.22 3.392 3.549 3.652 3.934 4.059 4.301 4.535 4.737 4.84 5.046 5.228 5.492 5.654 5.803 6.032 6.259 6.476 6.685 6.889 7.147 7.385 7.626 7.909 8.164 8.406 8.689 9.016 9.305 9.616 9.942 10.282 10.631 10.991 11.412 11.839 12.323 12.829 13.362 13.912 14.459 14.949 15.255 15.165 14.87 14.517 14.142 13.725 13.332 12.982 12.669 12.323 12.01 11.716 11.427 11.159 10.889 10.639 10.39 10.159 9.952 9.738 9.52 9.344 9.157 8.955 8.793 8.622 8.453 8.274 8.084 7.943 7.781 7.526 7.347 7.159 7.067 6.891 6.726 6.551 6.449 6.188 6.096 5.958 5.806 5.506 5.334 5.137 4.922 4.697 4.42 3.978 3.05 -2 ,27525 ,KEBNE ,17027088,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:38:07 CET,0.0 1.559 2.02 2.39 2.686 2.926 3.15 3.36 3.723 3.886 4.046 4.191 4.488 4.633 4.894 5.134 5.356 5.459 5.649 5.828 6.089 6.261 6.431 6.693 6.93 7.143 7.354 7.554 7.819 8.08 8.326 8.617 8.873 9.116 9.396 9.692 9.985 10.304 10.659 11.046 11.422 11.835 12.289 12.741 13.233 13.716 14.245 14.816 15.413 15.927 16.273 16.235 15.955 15.588 15.143 14.673 14.281 13.926 13.592 13.235 12.897 12.585 12.299 12.045 11.799 11.549 11.285 11.02 10.791 10.59 10.381 10.19 9.976 9.766 9.605 9.422 9.243 9.063 8.866 8.725 8.572 8.323 8.15 7.979 7.894 7.716 7.53 7.334 7.229 6.962 6.878 6.759 6.609 6.295 6.157 6.006 5.821 5.613 5.37 5.014 3.787 -3 ,7100 ,KEBNE ,17027089,Wed Dec 22 16:02:47 CET,Wed Dec 22 17:36:59 CET,0.0 1.033 1.512 1.927 2.23 2.447 2.644 2.831 3.175 3.339 3.495 3.611 3.896 4.025 4.275 4.514 4.74 4.843 5.031 5.214 5.477 5.643 5.81 6.054 6.28 6.492 6.704 6.902 7.146 7.384 7.61 7.88 8.128 8.36 8.632 8.928 9.229 9.565 9.898 10.225 10.595 11.016 11.475 11.916 12.407 12.923 13.456 14.01 14.621 15.222 15.702 15.664 15.28 14.852 14.446 14.057 13.707 13.361 13.033 12.695 12.409 12.159 11.895 11.63 11.378 11.136 10.877 10.64 10.438 10.212 9.974 9.791 9.598 9.395 9.24 9.084 8.913 8.727 8.546 8.423 8.282 8.062 7.903 7.738 7.656 7.48 7.293 7.084 6.983 6.733 6.633 6.493 6.355 6.058 5.899 5.725 5.528 5.297 5.04 4.686 3.529 -4 ,26581 ,KEBNE ,17027090,Wed Dec 22 16:02:45 CET,Wed Dec 22 17:38:20 CET,0.0 1.214 1.731 2.14 2.475 2.721 2.914 3.107 3.476 3.639 3.79 3.889 4.167 4.291 4.545 4.783 5.001 5.109 5.302 5.467 5.723 5.897 6.063 6.294 6.526 6.764 6.99 7.196 7.436 7.659 7.871 8.133 8.387 8.642 8.933 9.248 9.558 9.886 10.232 10.576 10.929 11.328 11.781 12.236 12.737 13.263 13.862 14.456 14.996 15.496 15.839 15.761 15.458 15.082 14.686 14.296 13.924 13.552 13.2 12.856 12.549 12.253 11.95 11.673 11.425 11.192 10.943 10.717 10.516 10.31 10.096 9.897 9.694 9.493 9.339 9.177 8.994 8.806 8.614 8.479 8.337 8.122 7.981 7.819 7.734 7.561 7.366 7.16 7.059 6.801 6.724 6.609 6.481 6.177 6.018 5.855 5.647 5.392 5.107 4.747 3.961 -5 ,13853 ,KEBNE ,17027091,Wed Dec 22 16:02:49 CET,Wed Dec 22 17:32:30 CET,0.0 1.143 1.57 1.903 2.144 2.338 2.552 2.748 3.122 3.302 3.467 3.63 3.935 4.07 4.328 4.573 4.81 4.921 5.118 5.315 5.607 5.794 5.983 6.248 6.499 6.72 6.922 7.127 7.399 7.644 7.868 8.146 8.423 8.683 8.962 9.283 9.591 9.908 10.228 10.563 10.914 11.3 11.74 12.165 12.638 13.156 13.718 14.273 14.859 15.432 15.852 15.874 15.63 15.305 14.917 14.512 14.121 13.724 13.371 13.025 12.73 12.453 12.185 11.939 11.707 11.49 11.246 11.01 10.806 10.588 10.369 10.179 9.97 9.759 9.584 9.411 9.236 9.049 8.865 8.731 8.573 8.342 8.196 8.025 7.934 7.759 7.575 7.374 7.271 7.019 6.945 6.812 6.678 6.391 6.218 6.022 5.799 5.545 5.257 4.919 2.319 -6 ,10250 ,KEBNE ,17027092,Wed Dec 22 16:02:45 CET,Wed Dec 22 17:36:37 CET,0.0 0.929 1.352 1.672 1.909 2.155 2.403 2.627 2.975 3.122 3.283 3.428 3.713 3.836 4.083 4.326 4.541 4.64 4.835 5.018 5.282 5.448 5.604 5.844 6.076 6.279 6.46 6.652 6.919 7.161 7.396 7.668 7.906 8.147 8.437 8.743 9.022 9.328 9.662 10.009 10.36 10.738 11.178 11.604 12.065 12.546 13.047 13.594 14.186 14.718 15.084 15.025 14.753 14.398 14.033 13.636 13.245 12.888 12.556 12.201 11.887 11.616 11.358 11.089 10.824 10.579 10.321 10.093 9.888 9.675 9.443 9.245 9.054 8.854 8.691 8.516 8.329 8.137 7.943 7.811 7.67 7.434 7.275 7.117 7.034 6.86 6.658 6.437 6.326 6.065 5.983 5.858 5.719 5.396 5.231 5.048 4.761 4.409 4.018 3.525 2.353 -7 ,9745 ,KEBNE ,17027093,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:37:38 CET,0.0 1.287 1.721 2.045 2.322 2.57 2.792 3.01 3.375 3.529 3.683 3.825 4.124 4.254 4.489 4.721 4.935 5.036 5.236 5.429 5.71 5.892 6.058 6.306 6.541 6.755 6.976 7.188 7.45 7.709 7.942 8.207 8.469 8.731 9.013 9.31 9.588 9.883 10.222 10.586 10.948 11.33 11.78 12.218 12.679 13.172 13.686 14.216 14.779 15.296 15.695 15.658 15.336 14.917 14.507 14.11 13.725 13.334 12.965 12.613 12.301 12.012 11.758 11.489 11.216 10.971 10.73 10.504 10.288 10.075 9.866 9.683 9.483 9.278 9.115 8.951 8.787 8.615 8.43 8.296 8.152 7.927 7.778 7.613 7.525 7.344 7.15 6.945 6.836 6.576 6.517 6.404 6.284 6.018 5.875 5.708 5.516 5.302 5.016 4.638 3.539 -8 ,1824 ,KEBNE ,17027094,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:36:35 CET,0.0 0.917 1.332 1.692 1.995 2.254 2.473 2.668 3.039 3.198 3.338 3.451 3.737 3.866 4.124 4.354 4.557 4.651 4.839 5.029 5.318 5.507 5.683 5.925 6.163 6.394 6.598 6.786 7.028 7.275 7.508 7.778 8.058 8.327 8.611 8.931 9.226 9.545 9.896 10.252 10.613 11.01 11.447 11.863 12.347 12.851 13.381 13.97 14.604 15.135 15.453 15.376 15.071 14.719 14.327 13.92 13.537 13.158 12.815 12.454 12.151 11.887 11.616 11.358 11.117 10.89 10.625 10.376 10.173 9.953 9.719 9.529 9.33 9.125 8.958 8.789 8.624 8.444 8.245 8.111 7.968 7.741 7.597 7.443 7.361 7.186 6.994 6.796 6.688 6.43 6.342 6.21 6.088 5.836 5.695 5.529 5.331 5.079 4.812 4.478 3.574 -9 ,14236 ,KEBNE ,17027095,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:37:50 CET,0.0 1.167 1.633 1.969 2.209 2.427 2.644 2.851 3.205 3.352 3.509 3.68 3.992 4.128 4.394 4.639 4.846 4.953 5.151 5.34 5.62 5.787 5.95 6.19 6.411 6.613 6.815 7.025 7.284 7.518 7.742 8.021 8.289 8.528 8.791 9.101 9.399 9.719 10.077 10.432 10.794 11.22 11.682 12.111 12.578 13.054 13.613 14.244 14.831 15.337 15.741 15.763 15.513 15.189 14.864 14.502 14.098 13.703 13.377 13.043 12.746 12.476 12.177 11.885 11.637 11.412 11.163 10.933 10.726 10.507 10.276 10.083 9.885 9.672 9.514 9.366 9.199 9.016 8.832 8.701 8.565 8.353 8.208 8.048 7.96 7.786 7.6 7.409 7.306 7.047 6.944 6.807 6.673 6.373 6.215 6.041 5.818 5.577 5.304 4.925 3.911 -10 ,12276 ,KEBNE ,17027096,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:37:56 CET,0.0 1.258 1.711 2.072 2.383 2.637 2.851 3.063 3.474 3.65 3.797 3.938 4.24 4.375 4.618 4.846 5.073 5.18 5.384 5.589 5.869 6.042 6.236 6.524 6.779 7.016 7.243 7.455 7.736 8.012 8.258 8.552 8.831 9.085 9.367 9.679 9.992 10.323 10.661 11.034 11.42 11.825 12.276 12.705 13.206 13.744 14.303 14.834 15.371 15.93 16.297 16.263 15.96 15.56 15.139 14.733 14.365 14.015 13.708 13.389 13.108 12.837 12.555 12.296 12.057 11.812 11.556 11.33 11.128 10.917 10.7 10.519 10.324 10.108 9.943 9.778 9.612 9.44 9.247 9.103 8.948 8.716 8.559 8.386 8.295 8.114 7.938 7.752 7.644 7.38 7.285 7.144 7.0 6.685 6.513 6.344 6.126 5.866 5.609 5.284 3.915 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_26_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_26_23.txt deleted file mode 100644 index f0bbf86d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_26_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28764 ,KEBNE ,17027097,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:36:45 CET,0.0 1.103 1.529 1.849 2.156 2.433 2.686 2.927 3.3 3.435 3.549 3.618 3.828 3.926 4.106 4.281 4.454 4.522 4.645 4.756 4.907 5.002 5.1 5.243 5.368 5.479 5.582 5.678 5.794 5.888 5.971 6.07 6.158 6.223 6.286 6.337 6.374 6.411 6.415 6.392 6.358 6.295 6.153 5.975 5.709 5.311 4.731 3.876 2.623 0.692 -2.448 -5.953 -8.73 -10.983 -12.852 -14.48 -15.869 -17.082 -18.111 -19.136 -20.006 -20.765 -21.481 -22.145 -22.756 -23.299 -23.866 -24.383 -24.814 -25.248 -25.695 -26.069 -26.464 -26.877 -27.192 -27.511 -27.821 -28.145 -28.509 -28.751 -28.984 -29.361 -29.632 -29.902 -30.04 -30.319 -30.619 -30.95 -31.12 -31.454 -31.681 -31.875 -32.067 -32.473 -32.712 -32.994 -33.286 -33.631 -34.143 -34.758 -36.195 -2 ,19423 ,KEBNE ,17027098,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:36:34 CET,0.0 1.641 2.096 2.435 2.738 3.027 3.275 3.481 3.854 4.013 4.138 4.22 4.445 4.554 4.753 4.934 5.107 5.179 5.301 5.424 5.598 5.697 5.781 5.894 6.012 6.125 6.219 6.298 6.434 6.56 6.634 6.726 6.812 6.876 6.938 6.999 7.029 7.042 7.037 7.016 7.012 6.952 6.77 6.524 6.184 5.738 5.069 4.106 2.796 0.857 -2.302 -5.863 -8.687 -10.949 -12.777 -14.371 -15.764 -17.011 -18.043 -19.046 -19.907 -20.655 -21.357 -22.005 -22.603 -23.146 -23.715 -24.246 -24.713 -25.212 -25.736 -26.149 -26.579 -27.041 -27.398 -27.76 -28.103 -28.432 -28.778 -29.017 -29.255 -29.615 -29.86 -30.118 -30.255 -30.54 -30.835 -31.143 -31.307 -31.631 -31.836 -32.042 -32.258 -32.692 -32.942 -33.22 -33.529 -33.9 -34.307 -34.764 -37.466 -3 ,1881 ,KEBNE ,17027099,Wed Dec 22 16:02:47 CET,Wed Dec 22 17:38:15 CET,0.0 1.486 1.865 2.177 2.451 2.681 2.93 3.161 3.474 3.598 3.718 3.83 4.054 4.146 4.295 4.419 4.538 4.605 4.76 4.887 5.042 5.148 5.255 5.401 5.531 5.664 5.779 5.869 5.979 6.065 6.145 6.243 6.315 6.369 6.434 6.486 6.508 6.548 6.569 6.529 6.458 6.357 6.184 5.95 5.614 5.15 4.504 3.63 2.355 0.437 -2.651 -6.204 -8.958 -11.196 -13.08 -14.711 -16.105 -17.305 -18.308 -19.329 -20.23 -21.007 -21.714 -22.369 -22.973 -23.506 -24.045 -24.544 -24.984 -25.429 -25.897 -26.278 -26.656 -27.043 -27.341 -27.664 -27.999 -28.325 -28.664 -28.906 -29.168 -29.588 -29.867 -30.148 -30.29 -30.582 -30.889 -31.21 -31.379 -31.712 -31.924 -32.111 -32.313 -32.767 -33.011 -33.263 -33.562 -33.93 -34.345 -34.87 -36.29 -4 ,21102 ,KEBNE ,17027100,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:36:58 CET,0.0 1.328 1.804 2.081 2.303 2.489 2.656 2.856 3.284 3.46 3.603 3.729 3.965 4.066 4.242 4.389 4.517 4.583 4.721 4.848 5.013 5.1 5.183 5.296 5.386 5.478 5.568 5.643 5.74 5.829 5.912 6.005 6.084 6.15 6.201 6.23 6.257 6.269 6.257 6.236 6.187 6.09 5.927 5.701 5.372 4.95 4.318 3.404 2.135 0.226 -2.855 -6.365 -9.13 -11.371 -13.211 -14.763 -16.081 -17.245 -18.212 -19.161 -20.011 -20.755 -21.423 -22.033 -22.594 -23.116 -23.627 -24.072 -24.476 -24.892 -25.344 -25.727 -26.103 -26.474 -26.755 -27.055 -27.358 -27.67 -28.001 -28.226 -28.44 -28.778 -29.033 -29.319 -29.469 -29.752 -30.029 -30.337 -30.502 -30.828 -31.037 -31.227 -31.429 -31.865 -32.103 -32.338 -32.573 -32.855 -33.235 -33.782 -35.006 -5 ,8606 ,KEBNE ,17027101,Wed Dec 22 16:02:45 CET,Wed Dec 22 17:36:34 CET,0.0 2.045 2.651 3.048 3.348 3.591 3.816 4.022 4.34 4.478 4.625 4.746 4.964 5.056 5.229 5.396 5.554 5.626 5.758 5.893 6.073 6.169 6.277 6.433 6.563 6.679 6.768 6.83 6.914 7.004 7.093 7.188 7.27 7.342 7.411 7.476 7.525 7.562 7.558 7.522 7.479 7.42 7.27 7.072 6.826 6.436 5.845 4.976 3.686 1.743 -1.443 -5.052 -7.838 -10.094 -11.951 -13.565 -14.925 -16.135 -17.178 -18.195 -19.042 -19.782 -20.482 -21.133 -21.751 -22.319 -22.898 -23.408 -23.842 -24.28 -24.719 -25.104 -25.505 -25.912 -26.232 -26.553 -26.904 -27.285 -27.685 -27.953 -28.221 -28.652 -28.946 -29.238 -29.391 -29.72 -30.063 -30.399 -30.567 -30.892 -31.088 -31.28 -31.486 -31.929 -32.174 -32.453 -32.767 -33.122 -33.523 -34.016 -35.735 -6 ,19119 ,KEBNE ,17027102,Wed Dec 22 16:02:47 CET,Wed Dec 22 17:38:05 CET,0.0 1.794 2.288 2.628 2.886 3.132 3.354 3.531 3.844 3.987 4.106 4.205 4.448 4.559 4.738 4.884 5.009 5.068 5.186 5.306 5.46 5.546 5.627 5.753 5.876 5.989 6.081 6.152 6.236 6.305 6.362 6.439 6.527 6.605 6.656 6.676 6.692 6.692 6.674 6.653 6.596 6.489 6.332 6.121 5.796 5.368 4.817 4.036 2.742 0.783 -2.244 -5.756 -8.577 -10.846 -12.707 -14.311 -15.685 -16.898 -17.93 -18.948 -19.8 -20.559 -21.265 -21.92 -22.532 -23.083 -23.64 -24.13 -24.562 -25.019 -25.479 -25.865 -26.274 -26.686 -26.998 -27.333 -27.686 -28.017 -28.346 -28.594 -28.855 -29.244 -29.516 -29.79 -29.93 -30.224 -30.531 -30.856 -31.021 -31.343 -31.549 -31.749 -31.976 -32.459 -32.707 -32.995 -33.33 -33.681 -34.044 -34.553 -36.255 -7 ,397 ,KEBNE ,17027103,Wed Dec 22 16:02:45 CET,Wed Dec 22 17:38:36 CET,0.0 1.263 1.665 1.927 2.134 2.349 2.55 2.73 3.069 3.199 3.303 3.358 3.569 3.654 3.815 3.98 4.154 4.228 4.347 4.451 4.596 4.69 4.783 4.917 5.036 5.132 5.209 5.279 5.389 5.5 5.597 5.716 5.82 5.894 5.955 6.009 6.036 6.039 6.03 6.001 5.951 5.878 5.732 5.5 5.175 4.769 4.175 3.315 2.026 0.122 -2.966 -6.517 -9.27 -11.556 -13.48 -15.086 -16.445 -17.656 -18.68 -19.703 -20.574 -21.326 -22.033 -22.698 -23.303 -23.838 -24.406 -24.927 -25.36 -25.784 -26.22 -26.607 -27.007 -27.41 -27.726 -28.048 -28.383 -28.732 -29.108 -29.366 -29.636 -30.065 -30.354 -30.673 -30.837 -31.155 -31.474 -31.793 -31.949 -32.254 -32.421 -32.626 -32.851 -33.332 -33.625 -33.948 -34.269 -34.638 -35.044 -35.537 -38.462 -8 ,21422 ,KEBNE ,17027104,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:36:34 CET,0.0 1.657 2.098 2.363 2.583 2.771 2.932 3.109 3.479 3.642 3.797 3.956 4.199 4.301 4.467 4.621 4.759 4.823 4.949 5.069 5.257 5.367 5.456 5.579 5.69 5.79 5.892 5.992 6.107 6.198 6.285 6.378 6.448 6.52 6.608 6.685 6.728 6.739 6.724 6.685 6.641 6.569 6.407 6.19 5.865 5.407 4.819 4.014 2.739 0.771 -2.363 -5.877 -8.597 -10.835 -12.72 -14.351 -15.735 -16.932 -17.94 -18.963 -19.838 -20.593 -21.293 -21.937 -22.536 -23.078 -23.641 -24.142 -24.568 -24.994 -25.435 -25.799 -26.191 -26.622 -26.933 -27.242 -27.566 -27.914 -28.274 -28.509 -28.776 -29.205 -29.484 -29.757 -29.894 -30.179 -30.493 -30.826 -30.993 -31.333 -31.569 -31.774 -31.993 -32.504 -32.78 -33.07 -33.384 -33.709 -34.06 -34.551 -36.511 -9 ,27542 ,KEBNE ,17027105,Wed Dec 22 16:02:47 CET,Wed Dec 22 17:37:16 CET,0.0 1.549 1.952 2.289 2.584 2.827 3.033 3.214 3.541 3.675 3.798 3.903 4.12 4.219 4.402 4.563 4.714 4.791 4.942 5.07 5.245 5.371 5.487 5.627 5.767 5.911 6.043 6.135 6.24 6.34 6.421 6.502 6.56 6.616 6.682 6.74 6.787 6.816 6.825 6.812 6.757 6.67 6.518 6.292 5.981 5.562 4.968 4.121 2.823 0.919 -2.129 -5.694 -8.511 -10.777 -12.628 -14.258 -15.684 -16.93 -17.958 -18.962 -19.813 -20.56 -21.279 -21.94 -22.539 -23.096 -23.676 -24.199 -24.643 -25.082 -25.545 -25.933 -26.328 -26.729 -27.044 -27.372 -27.697 -28.024 -28.399 -28.664 -28.921 -29.319 -29.603 -29.903 -30.05 -30.354 -30.681 -31.011 -31.177 -31.509 -31.726 -31.911 -32.12 -32.575 -32.828 -33.114 -33.418 -33.785 -34.269 -34.816 -36.183 -10 ,6278 ,KEBNE ,17027106,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:38:23 CET,0.0 1.367 1.825 2.159 2.419 2.639 2.84 3.049 3.393 3.526 3.666 3.794 4.018 4.113 4.277 4.421 4.552 4.609 4.718 4.834 4.988 5.077 5.172 5.307 5.408 5.486 5.569 5.647 5.729 5.823 5.918 6.026 6.123 6.2 6.263 6.304 6.327 6.345 6.357 6.353 6.308 6.212 6.069 5.858 5.538 5.14 4.561 3.704 2.434 0.46 -2.623 -6.009 -8.727 -10.992 -12.888 -14.522 -15.905 -17.12 -18.155 -19.154 -19.996 -20.738 -21.443 -22.115 -22.712 -23.238 -23.805 -24.311 -24.726 -25.172 -25.646 -26.048 -26.477 -26.898 -27.222 -27.558 -27.887 -28.223 -28.577 -28.809 -29.048 -29.452 -29.755 -30.066 -30.223 -30.558 -30.907 -31.262 -31.442 -31.785 -32.025 -32.23 -32.443 -32.919 -33.189 -33.46 -33.756 -34.101 -34.489 -34.979 -36.74 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_26_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_26_57.txt deleted file mode 100644 index 29118839..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_26_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20656 ,TETRA ,17600925,Sun Nov 28 14:11:35 CET,Sun Nov 28 15:52:28 CET,0.0 1.935 2.543 2.97 3.27 3.509 3.72 3.906 4.225 4.366 4.5 4.644 4.889 4.997 5.212 5.436 5.666 5.77 5.945 6.089 6.277 6.404 6.537 6.726 6.893 7.038 7.178 7.313 7.485 7.655 7.803 7.956 8.083 8.21 8.347 8.476 8.599 8.73 8.872 8.983 9.041 9.076 9.084 9.059 8.989 8.815 8.49 7.999 7.226 5.91 3.562 0.724 -1.508 -3.381 -4.98 -6.339 -7.497 -8.565 -9.483 -10.363 -11.132 -11.821 -12.45 -13.046 -13.607 -14.099 -14.583 -15.028 -15.416 -15.834 -16.298 -16.655 -17.008 -17.386 -17.68 -17.967 -18.267 -18.606 -18.984 -19.252 -19.511 -19.885 -20.16 -20.452 -20.596 -20.891 -21.202 -21.524 -21.686 -22.0 -22.182 -22.366 -22.573 -23.014 -23.249 -23.506 -23.773 -24.052 -24.402 -24.893 -26.618 -2 ,14638 ,TETRA ,17600926,Sun Nov 28 14:12:35 CET,Sun Nov 28 15:53:37 CET,0.0 1.711 2.205 2.54 2.821 3.061 3.257 3.421 3.708 3.847 3.984 4.124 4.355 4.456 4.634 4.801 4.971 5.042 5.186 5.336 5.51 5.615 5.739 5.931 6.096 6.225 6.35 6.482 6.626 6.749 6.88 7.048 7.197 7.328 7.461 7.599 7.725 7.842 7.937 8.02 8.067 8.064 8.037 7.989 7.899 7.738 7.439 6.884 5.974 4.606 2.323 -0.398 -2.592 -4.387 -5.854 -7.12 -8.215 -9.22 -10.08 -10.928 -11.63 -12.243 -12.807 -13.328 -13.814 -14.26 -14.733 -15.149 -15.52 -15.92 -16.324 -16.637 -16.975 -17.337 -17.614 -17.896 -18.178 -18.466 -18.755 -18.952 -19.161 -19.492 -19.733 -19.992 -20.125 -20.402 -20.701 -21.03 -21.2 -21.519 -21.705 -21.891 -22.099 -22.538 -22.766 -23.024 -23.326 -23.645 -24.007 -24.521 -26.378 -3 ,21022 ,TETRA ,17600927,Sun Nov 28 14:13:34 CET,Sun Nov 28 15:56:11 CET,0.0 1.852 2.389 2.816 3.138 3.386 3.607 3.815 4.172 4.333 4.506 4.686 4.946 5.075 5.296 5.491 5.665 5.753 5.931 6.094 6.299 6.416 6.538 6.712 6.869 7.023 7.168 7.293 7.439 7.564 7.69 7.848 7.995 8.136 8.285 8.434 8.579 8.696 8.776 8.848 8.905 8.949 8.966 8.93 8.813 8.633 8.32 7.824 7.003 5.653 3.442 0.85 -1.218 -2.947 -4.441 -5.759 -6.896 -7.9 -8.735 -9.556 -10.297 -10.957 -11.555 -12.128 -12.635 -13.09 -13.57 -14.003 -14.379 -14.734 -15.115 -15.489 -15.9 -16.32 -16.64 -16.955 -17.276 -17.587 -17.89 -18.102 -18.326 -18.67 -18.901 -19.139 -19.266 -19.52 -19.78 -20.057 -20.207 -20.525 -20.716 -20.882 -21.049 -21.406 -21.621 -21.866 -22.122 -22.408 -22.736 -23.187 -24.386 -4 ,32637 ,TETRA ,17600928,Sun Nov 28 14:15:35 CET,Sun Nov 28 15:59:41 CET,0.0 1.648 2.141 2.486 2.757 3.005 3.239 3.458 3.83 3.992 4.143 4.298 4.552 4.681 4.892 5.064 5.223 5.305 5.451 5.575 5.75 5.873 5.998 6.167 6.336 6.492 6.622 6.745 6.903 7.053 7.197 7.359 7.5 7.63 7.773 7.923 8.053 8.16 8.266 8.363 8.421 8.464 8.49 8.46 8.346 8.138 7.784 7.261 6.428 5.083 2.763 0.021 -2.13 -3.92 -5.456 -6.846 -8.055 -9.115 -10.027 -10.91 -11.64 -12.341 -13.039 -13.665 -14.243 -14.779 -15.332 -15.825 -16.252 -16.676 -17.12 -17.509 -17.896 -18.28 -18.578 -18.893 -19.235 -19.587 -19.932 -20.17 -20.425 -20.839 -21.127 -21.426 -21.572 -21.857 -22.154 -22.462 -22.629 -22.948 -23.162 -23.355 -23.559 -24.019 -24.256 -24.513 -24.788 -25.081 -25.434 -25.921 -27.308 -5 ,10867 ,TETRA ,17600929,Sun Nov 28 14:16:35 CET,Sun Nov 28 15:59:46 CET,0.0 2.136 2.697 3.028 3.339 3.634 3.868 4.062 4.405 4.557 4.712 4.875 5.139 5.26 5.479 5.698 5.895 5.987 6.161 6.327 6.551 6.68 6.819 7.016 7.206 7.374 7.52 7.661 7.836 7.989 8.117 8.262 8.389 8.493 8.601 8.742 8.892 9.033 9.149 9.292 9.404 9.431 9.437 9.418 9.329 9.152 8.834 8.347 7.576 6.221 3.8 1.022 -1.209 -3.104 -4.694 -6.067 -7.26 -8.336 -9.218 -10.061 -10.774 -11.434 -12.08 -12.667 -13.196 -13.696 -14.24 -14.722 -15.124 -15.54 -15.976 -16.34 -16.718 -17.097 -17.4 -17.726 -18.05 -18.387 -18.74 -18.98 -19.229 -19.589 -19.833 -20.113 -20.256 -20.546 -20.837 -21.13 -21.286 -21.595 -21.802 -22.001 -22.209 -22.658 -22.922 -23.225 -23.547 -23.917 -24.351 -24.804 -26.047 -6 ,719 ,TETRA ,17600930,Sun Nov 28 14:18:35 CET,Sun Nov 28 16:03:57 CET,0.0 1.592 2.159 2.595 2.953 3.225 3.442 3.634 3.979 4.144 4.291 4.423 4.664 4.774 4.976 5.182 5.375 5.47 5.648 5.816 6.062 6.208 6.35 6.531 6.687 6.829 6.947 7.07 7.245 7.395 7.527 7.67 7.798 7.929 8.067 8.205 8.352 8.504 8.626 8.715 8.775 8.815 8.812 8.778 8.672 8.429 8.063 7.533 6.701 5.358 3.068 0.422 -1.736 -3.562 -5.079 -6.356 -7.462 -8.514 -9.446 -10.362 -11.156 -11.861 -12.518 -13.131 -13.694 -14.163 -14.622 -15.084 -15.5 -15.917 -16.356 -16.721 -17.096 -17.488 -17.792 -18.096 -18.396 -18.683 -18.971 -19.17 -19.374 -19.694 -19.924 -20.194 -20.336 -20.628 -20.968 -21.326 -21.507 -21.839 -22.043 -22.23 -22.416 -22.792 -23.002 -23.256 -23.545 -23.844 -24.198 -24.7 -25.999 -7 ,16296 ,TETRA ,17600931,Sun Nov 28 14:17:35 CET,Sun Nov 28 16:01:29 CET,0.0 2.188 2.777 3.164 3.446 3.679 3.894 4.103 4.458 4.607 4.751 4.867 5.094 5.211 5.438 5.656 5.857 5.956 6.144 6.308 6.515 6.625 6.716 6.851 6.988 7.126 7.262 7.382 7.535 7.695 7.836 7.992 8.13 8.218 8.31 8.426 8.521 8.607 8.692 8.765 8.8 8.838 8.861 8.842 8.775 8.608 8.292 7.77 6.933 5.692 3.553 0.754 -1.541 -3.425 -5.032 -6.41 -7.584 -8.647 -9.571 -10.474 -11.26 -11.979 -12.64 -13.243 -13.803 -14.331 -14.878 -15.353 -15.748 -16.15 -16.564 -16.909 -17.288 -17.701 -18.0 -18.288 -18.59 -18.88 -19.193 -19.428 -19.657 -19.996 -20.235 -20.486 -20.617 -20.896 -21.179 -21.461 -21.615 -21.929 -22.141 -22.329 -22.521 -22.93 -23.135 -23.365 -23.617 -23.883 -24.222 -24.68 -26.407 -8 ,14493 ,TETRA ,17600932,Sun Nov 28 14:17:35 CET,Sun Nov 28 16:01:43 CET,0.0 1.771 2.366 2.761 3.051 3.299 3.51 3.72 4.098 4.266 4.424 4.58 4.818 4.926 5.148 5.367 5.568 5.664 5.847 6.014 6.234 6.365 6.486 6.642 6.804 6.966 7.117 7.262 7.43 7.574 7.715 7.872 7.998 8.123 8.256 8.401 8.555 8.689 8.775 8.85 8.934 8.999 9.03 9.019 8.953 8.784 8.468 7.967 7.167 5.895 3.635 0.848 -1.418 -3.324 -4.954 -6.349 -7.48 -8.472 -9.312 -10.155 -10.869 -11.493 -12.083 -12.63 -13.135 -13.603 -14.099 -14.539 -14.907 -15.263 -15.635 -15.98 -16.333 -16.671 -16.944 -17.224 -17.491 -17.765 -18.067 -18.275 -18.482 -18.813 -19.045 -19.292 -19.425 -19.689 -19.973 -20.288 -20.442 -20.749 -20.955 -21.14 -21.322 -21.72 -21.949 -22.194 -22.46 -22.792 -23.191 -23.729 -25.055 -9 ,2069 ,TETRA ,17600933,Sun Nov 28 14:17:35 CET,Sun Nov 28 16:01:37 CET,0.0 1.852 2.374 2.761 3.1 3.389 3.622 3.82 4.134 4.262 4.386 4.523 4.777 4.916 5.178 5.403 5.606 5.701 5.886 6.077 6.334 6.483 6.627 6.83 7.023 7.2 7.348 7.48 7.626 7.785 7.951 8.093 8.212 8.329 8.444 8.566 8.673 8.777 8.859 8.917 8.982 9.016 8.996 8.929 8.8 8.59 8.258 7.748 6.894 5.504 3.186 0.511 -1.638 -3.444 -4.954 -6.276 -7.392 -8.383 -9.256 -10.117 -10.826 -11.442 -12.031 -12.578 -13.073 -13.533 -14.028 -14.45 -14.799 -15.171 -15.588 -15.933 -16.263 -16.615 -16.892 -17.163 -17.44 -17.725 -18.034 -18.256 -18.495 -18.842 -19.065 -19.315 -19.453 -19.747 -20.055 -20.389 -20.555 -20.862 -21.047 -21.222 -21.411 -21.829 -22.063 -22.283 -22.489 -22.731 -23.083 -23.57 -24.675 -10 ,32328 ,TETRA ,17600934,Sun Nov 28 14:17:35 CET,Sun Nov 28 16:01:46 CET,0.0 1.56 2.082 2.445 2.728 2.985 3.201 3.378 3.71 3.869 4.021 4.177 4.417 4.526 4.734 4.946 5.175 5.29 5.511 5.702 5.932 6.058 6.173 6.351 6.516 6.663 6.805 6.938 7.091 7.215 7.345 7.503 7.647 7.793 7.956 8.095 8.207 8.324 8.425 8.51 8.578 8.631 8.683 8.708 8.634 8.457 8.168 7.689 6.878 5.557 3.3 0.54 -1.733 -3.578 -5.138 -6.502 -7.675 -8.732 -9.633 -10.52 -11.261 -11.94 -12.6 -13.217 -13.789 -14.315 -14.832 -15.276 -15.69 -16.129 -16.572 -16.943 -17.322 -17.707 -17.994 -18.269 -18.552 -18.861 -19.17 -19.368 -19.567 -19.876 -20.11 -20.359 -20.486 -20.723 -20.958 -21.216 -21.356 -21.652 -21.806 -21.961 -22.114 -22.497 -22.713 -22.931 -23.146 -23.374 -23.696 -24.183 -25.691 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_26_68.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_26_68.txt deleted file mode 100644 index 2d08412b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_26_68.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21870 ,TETRA ,17600935,Sun Nov 28 14:18:35 CET,Sun Nov 28 16:07:52 CET,0.0 1.624 2.088 2.429 2.676 2.905 3.147 3.393 3.82 4.007 4.172 4.332 4.604 4.75 5.002 5.253 5.493 5.598 5.796 5.994 6.277 6.446 6.606 6.849 7.076 7.284 7.473 7.655 7.885 8.097 8.31 8.57 8.793 8.995 9.229 9.474 9.723 10.008 10.289 10.581 10.898 11.234 11.584 11.909 12.262 12.63 13.048 13.44 13.723 13.862 13.631 12.906 12.141 11.405 10.729 10.127 9.574 9.042 8.567 8.068 7.655 7.311 6.969 6.652 6.365 6.095 5.776 5.467 5.203 4.897 4.542 4.24 3.926 3.593 3.348 3.108 2.842 2.566 2.305 2.126 1.93 1.62 1.39 1.129 0.992 0.721 0.44 0.161 0.03 -0.242 -0.431 -0.581 -0.748 -1.151 -1.384 -1.608 -1.862 -2.154 -2.487 -3.02 -5.155 -2 ,12586 ,TETRA ,17600936,Sun Nov 28 14:19:34 CET,Sun Nov 28 16:03:57 CET,0.0 1.49 1.897 2.184 2.459 2.726 2.962 3.17 3.57 3.751 3.919 4.114 4.381 4.518 4.788 5.034 5.269 5.385 5.608 5.826 6.134 6.323 6.498 6.746 6.977 7.211 7.443 7.653 7.935 8.19 8.401 8.657 8.895 9.11 9.377 9.68 9.937 10.207 10.498 10.802 11.112 11.452 11.82 12.16 12.526 12.904 13.279 13.596 13.876 14.031 13.891 13.317 12.606 11.891 11.205 10.605 10.074 9.524 9.017 8.522 8.106 7.711 7.332 6.967 6.616 6.299 5.956 5.644 5.376 5.103 4.812 4.565 4.3 4.033 3.835 3.627 3.405 3.153 2.895 2.723 2.536 2.237 2.037 1.818 1.702 1.481 1.255 0.995 0.843 0.578 0.404 0.219 0.006 -0.496 -0.814 -1.077 -1.31 -1.624 -2.055 -2.653 -4.726 -3 ,24009 ,TETRA ,17600937,Sun Nov 28 14:19:34 CET,Sun Nov 28 16:09:43 CET,0.0 1.278 1.726 2.059 2.31 2.518 2.741 2.958 3.34 3.519 3.686 3.854 4.107 4.237 4.491 4.719 4.937 5.04 5.239 5.43 5.692 5.855 6.009 6.235 6.462 6.681 6.874 7.053 7.277 7.484 7.681 7.929 8.188 8.423 8.685 8.979 9.246 9.53 9.833 10.129 10.415 10.757 11.154 11.512 11.878 12.241 12.595 12.912 13.218 13.4 13.247 12.616 11.892 11.187 10.496 9.873 9.295 8.725 8.226 7.706 7.247 6.839 6.442 6.061 5.72 5.402 5.047 4.735 4.474 4.204 3.916 3.656 3.381 3.076 2.818 2.564 2.314 2.056 1.793 1.602 1.402 1.113 0.908 0.694 0.579 0.323 0.058 -0.211 -0.351 -0.617 -0.79 -0.938 -1.097 -1.435 -1.617 -1.825 -2.091 -2.378 -2.714 -3.234 -5.438 -4 ,1761 ,TETRA ,17600938,Sun Nov 28 14:20:34 CET,Sun Nov 28 16:09:56 CET,0.0 2.076 2.519 2.878 3.223 3.495 3.754 3.983 4.359 4.536 4.702 4.866 5.128 5.26 5.502 5.737 5.96 6.071 6.276 6.448 6.704 6.879 7.046 7.269 7.466 7.662 7.86 8.063 8.323 8.56 8.776 9.026 9.263 9.494 9.753 10.047 10.323 10.596 10.877 11.17 11.484 11.795 12.137 12.49 12.854 13.22 13.584 13.923 14.221 14.417 14.288 13.693 12.945 12.191 11.518 10.877 10.288 9.742 9.275 8.808 8.386 8.009 7.625 7.252 6.908 6.585 6.247 5.926 5.649 5.37 5.071 4.824 4.571 4.287 4.066 3.829 3.587 3.369 3.154 3.005 2.843 2.592 2.422 2.259 2.17 1.973 1.775 1.563 1.448 1.201 1.047 0.89 0.719 0.369 0.171 -0.051 -0.257 -0.497 -0.821 -1.16 -2.199 -5 ,10700 ,TETRA ,17600939,Sun Nov 28 14:21:36 CET,Sun Nov 28 16:07:37 CET,0.0 1.352 1.865 2.201 2.503 2.785 3.005 3.201 3.579 3.762 3.936 4.119 4.389 4.532 4.791 5.029 5.26 5.375 5.576 5.756 6.025 6.197 6.375 6.644 6.898 7.13 7.332 7.528 7.764 7.985 8.196 8.458 8.71 8.94 9.196 9.458 9.705 9.989 10.28 10.586 10.905 11.242 11.623 11.971 12.328 12.715 13.084 13.43 13.752 13.926 13.812 13.243 12.531 11.813 11.118 10.457 9.87 9.328 8.859 8.383 7.962 7.588 7.217 6.841 6.481 6.162 5.823 5.514 5.248 4.949 4.632 4.38 4.121 3.845 3.622 3.404 3.188 2.953 2.704 2.527 2.346 2.049 1.806 1.542 1.411 1.144 0.86 0.563 0.413 0.142 -0.105 -0.309 -0.521 -0.989 -1.24 -1.539 -1.872 -2.195 -2.555 -3.011 -4.674 -6 ,20785 ,TETRA ,17600940,Sun Nov 28 14:22:34 CET,Sun Nov 28 16:12:00 CET,0.0 1.25 1.81 2.214 2.575 2.872 3.097 3.316 3.734 3.921 4.096 4.302 4.574 4.709 4.973 5.204 5.4 5.502 5.715 5.919 6.194 6.348 6.502 6.72 6.913 7.116 7.305 7.487 7.727 7.959 8.169 8.4 8.629 8.865 9.121 9.385 9.654 9.936 10.214 10.502 10.788 11.11 11.486 11.837 12.221 12.621 13.01 13.392 13.728 13.874 13.644 13.043 12.393 11.698 11.006 10.363 9.814 9.305 8.806 8.288 7.869 7.478 7.091 6.739 6.408 6.092 5.746 5.424 5.14 4.852 4.562 4.315 4.045 3.758 3.541 3.328 3.102 2.873 2.649 2.488 2.309 2.032 1.841 1.636 1.537 1.335 1.106 0.866 0.739 0.485 0.338 0.178 -0.005 -0.386 -0.606 -0.867 -1.14 -1.432 -1.758 -2.142 -3.456 -7 ,8146 ,TETRA ,17600941,Sun Nov 28 14:22:34 CET,Sun Nov 28 16:11:39 CET,0.0 1.85 2.325 2.666 2.986 3.289 3.528 3.745 4.141 4.324 4.489 4.682 4.961 5.112 5.391 5.619 5.823 5.924 6.111 6.294 6.578 6.746 6.902 7.126 7.332 7.531 7.724 7.912 8.149 8.35 8.556 8.832 9.078 9.292 9.53 9.812 10.077 10.34 10.633 10.947 11.255 11.591 11.95 12.3 12.701 13.095 13.484 13.826 14.11 14.26 14.081 13.493 12.788 12.073 11.381 10.736 10.168 9.616 9.132 8.668 8.245 7.858 7.476 7.107 6.765 6.436 6.089 5.768 5.482 5.204 4.899 4.628 4.36 4.087 3.883 3.67 3.444 3.21 2.949 2.769 2.589 2.304 2.101 1.894 1.787 1.566 1.328 1.055 0.918 0.667 0.497 0.329 0.141 -0.285 -0.518 -0.769 -1.057 -1.363 -1.671 -2.131 -4.017 -8 ,17923 ,TETRA ,17600942,Sun Nov 28 14:23:34 CET,Sun Nov 28 16:12:04 CET,0.0 1.107 1.605 1.98 2.271 2.521 2.767 2.999 3.392 3.571 3.742 3.902 4.143 4.267 4.501 4.733 4.981 5.096 5.295 5.474 5.714 5.877 6.046 6.284 6.499 6.694 6.884 7.07 7.31 7.543 7.763 8.017 8.245 8.468 8.725 9.0 9.264 9.567 9.882 10.198 10.506 10.811 11.147 11.48 11.838 12.202 12.596 12.955 13.241 13.393 13.23 12.621 11.911 11.232 10.599 10.002 9.44 8.882 8.399 7.924 7.502 7.111 6.722 6.355 5.993 5.649 5.285 4.959 4.691 4.407 4.105 3.849 3.58 3.287 3.039 2.785 2.521 2.26 2.001 1.827 1.641 1.345 1.151 0.949 0.845 0.614 0.348 0.051 -0.104 -0.389 -0.617 -0.789 -0.978 -1.389 -1.622 -1.907 -2.19 -2.458 -2.785 -3.251 -5.089 -9 ,25792 ,TETRA ,17600943,Sun Nov 28 14:25:35 CET,Sun Nov 28 16:13:11 CET,0.0 1.254 1.641 1.967 2.228 2.479 2.723 2.947 3.31 3.479 3.645 3.818 4.081 4.208 4.432 4.643 4.842 4.944 5.157 5.361 5.652 5.836 6.009 6.246 6.455 6.647 6.836 7.024 7.264 7.489 7.703 7.958 8.201 8.416 8.68 9.001 9.27 9.538 9.826 10.118 10.417 10.754 11.138 11.49 11.851 12.236 12.61 12.911 13.205 13.428 13.318 12.79 12.17 11.519 10.848 10.201 9.631 9.091 8.627 8.151 7.718 7.316 6.921 6.547 6.193 5.861 5.516 5.215 4.933 4.632 4.34 4.089 3.824 3.547 3.333 3.121 2.902 2.673 2.429 2.251 2.065 1.77 1.562 1.335 1.222 1.008 0.781 0.529 0.398 0.147 -0.012 -0.16 -0.323 -0.707 -0.921 -1.173 -1.456 -1.747 -2.191 -2.73 -4.265 -10 ,21369 ,TETRA ,17600944,Sun Nov 28 14:26:36 CET,Sun Nov 28 16:17:52 CET,0.0 2.161 2.811 3.221 3.501 3.747 4.007 4.237 4.606 4.775 4.933 5.107 5.372 5.516 5.77 6.007 6.219 6.324 6.54 6.741 7.029 7.21 7.374 7.6 7.806 8.019 8.232 8.432 8.684 8.917 9.13 9.375 9.614 9.838 10.101 10.389 10.645 10.898 11.19 11.507 11.815 12.154 12.521 12.863 13.201 13.53 13.88 14.227 14.546 14.689 14.465 13.918 13.254 12.544 11.831 11.152 10.57 10.003 9.501 8.999 8.553 8.18 7.831 7.468 7.116 6.798 6.461 6.152 5.883 5.601 5.29 5.029 4.755 4.467 4.246 4.028 3.818 3.589 3.338 3.177 3.013 2.727 2.525 2.298 2.181 1.943 1.688 1.424 1.286 1.028 0.87 0.707 0.534 0.17 -0.034 -0.257 -0.527 -0.811 -1.141 -1.613 -3.554 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_28.txt deleted file mode 100644 index bcbe0586..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23584 ,TETRA ,17600945,Sun Nov 28 14:26:36 CET,Sun Nov 28 16:14:52 CET,0.0 2.612 3.069 3.432 3.762 4.062 4.323 4.543 4.909 5.087 5.271 5.446 5.735 5.877 6.155 6.418 6.644 6.757 7.02 7.274 7.606 7.795 7.968 8.221 8.465 8.713 8.95 9.154 9.407 9.661 9.897 10.173 10.447 10.709 11.002 11.326 11.64 11.986 12.351 12.689 12.992 13.338 13.721 14.067 14.461 14.895 15.344 15.775 16.176 16.502 16.591 16.263 15.771 15.253 14.753 14.236 13.758 13.307 12.901 12.494 12.132 11.791 11.477 11.185 10.869 10.586 10.324 10.076 9.865 9.642 9.4 9.195 8.972 8.771 8.61 8.43 8.255 8.068 7.878 7.748 7.603 7.346 7.159 6.966 6.869 6.657 6.418 6.198 6.096 5.826 5.74 5.595 5.437 5.099 4.919 4.674 4.384 4.081 3.674 3.119 1.356 -2 ,1108 ,TETRA ,17600946,Sun Nov 28 14:27:36 CET,Sun Nov 28 16:15:04 CET,0.0 1.783 2.25 2.58 2.871 3.155 3.396 3.621 4.016 4.189 4.37 4.585 4.905 5.064 5.367 5.649 5.923 6.057 6.299 6.508 6.803 6.996 7.179 7.458 7.721 7.969 8.216 8.44 8.69 8.934 9.18 9.457 9.742 10.031 10.34 10.671 10.982 11.291 11.606 11.937 12.288 12.683 13.106 13.467 13.849 14.276 14.763 15.261 15.744 16.15 16.307 16.052 15.621 15.141 14.644 14.126 13.628 13.18 12.804 12.41 12.025 11.68 11.374 11.082 10.814 10.571 10.311 10.066 9.846 9.603 9.333 9.109 8.881 8.636 8.438 8.239 8.017 7.778 7.533 7.361 7.197 6.951 6.783 6.608 6.506 6.27 6.042 5.831 5.72 5.435 5.296 5.139 4.981 4.636 4.403 4.127 3.837 3.501 3.069 2.5 0.882 -3 ,13336 ,TETRA ,17600947,Sun Nov 28 14:26:36 CET,Sun Nov 28 16:11:48 CET,0.0 2.841 3.423 3.772 4.08 4.358 4.607 4.826 5.23 5.422 5.595 5.771 6.088 6.247 6.546 6.796 6.998 7.091 7.288 7.491 7.816 8.02 8.197 8.447 8.69 8.904 9.102 9.305 9.569 9.808 10.016 10.261 10.48 10.703 10.979 11.234 11.47 11.748 12.029 12.304 12.577 12.883 13.227 13.517 13.842 14.203 14.605 15.028 15.345 15.537 15.596 15.277 14.837 14.358 13.896 13.456 13.02 12.621 12.273 11.906 11.572 11.255 10.953 10.664 10.362 10.062 9.768 9.518 9.287 9.015 8.726 8.501 8.256 7.992 7.79 7.592 7.376 7.144 6.921 6.775 6.631 6.381 6.194 5.997 5.882 5.656 5.412 5.119 4.959 4.647 4.462 4.284 4.117 3.762 3.556 3.348 3.135 2.841 2.456 2.005 0.173 -4 ,30240 ,TETRA ,17600948,Sun Nov 28 14:26:36 CET,Sun Nov 28 16:10:23 CET,0.0 2.136 2.731 3.146 3.456 3.742 4.012 4.252 4.65 4.807 4.955 5.091 5.372 5.492 5.769 6.08 6.388 6.524 6.747 6.954 7.25 7.434 7.602 7.829 8.046 8.253 8.456 8.661 8.929 9.158 9.363 9.609 9.833 10.044 10.284 10.553 10.83 11.114 11.373 11.66 11.966 12.275 12.622 12.952 13.329 13.737 14.127 14.484 14.797 15.016 15.054 14.757 14.356 13.912 13.478 13.045 12.622 12.214 11.858 11.513 11.18 10.879 10.6 10.322 10.052 9.805 9.54 9.295 9.09 8.85 8.574 8.352 8.137 7.929 7.751 7.541 7.311 7.077 6.865 6.721 6.552 6.273 6.071 5.879 5.787 5.558 5.33 5.105 4.977 4.676 4.544 4.35 4.148 3.817 3.621 3.357 3.072 2.784 2.381 1.849 -0.432 -5 ,29018 ,TETRA ,17600949,Sun Nov 28 14:26:36 CET,Sun Nov 28 16:15:14 CET,0.0 1.693 2.233 2.658 3.02 3.301 3.551 3.769 4.14 4.299 4.446 4.548 4.827 4.949 5.158 5.354 5.551 5.651 5.822 5.981 6.234 6.396 6.548 6.763 6.97 7.154 7.324 7.507 7.755 7.969 8.163 8.413 8.647 8.856 9.101 9.381 9.623 9.873 10.151 10.447 10.752 11.071 11.419 11.755 12.125 12.53 12.963 13.371 13.76 14.047 14.104 13.824 13.393 12.941 12.485 12.029 11.603 11.197 10.848 10.493 10.173 9.853 9.557 9.29 9.019 8.748 8.46 8.216 8.006 7.788 7.541 7.335 7.115 6.856 6.662 6.485 6.302 6.088 5.845 5.657 5.461 5.178 4.998 4.812 4.707 4.479 4.222 3.958 3.815 3.499 3.309 3.128 2.934 2.516 2.297 2.059 1.769 1.459 1.045 0.347 -2.088 -6 ,28754 ,TETRA ,17600950,Sun Nov 28 14:27:37 CET,Sun Nov 28 16:15:11 CET,0.0 2.163 2.699 3.141 3.556 3.937 4.236 4.474 4.869 5.033 5.204 5.384 5.688 5.836 6.101 6.337 6.556 6.652 6.831 6.991 7.244 7.417 7.565 7.78 7.984 8.189 8.382 8.563 8.808 9.043 9.261 9.516 9.75 9.957 10.198 10.466 10.7 10.954 11.222 11.505 11.787 12.079 12.423 12.755 13.142 13.546 13.941 14.317 14.656 14.927 15.0 14.674 14.184 13.709 13.277 12.86 12.466 12.058 11.685 11.325 10.997 10.693 10.397 10.118 9.858 9.615 9.363 9.129 8.907 8.66 8.405 8.186 7.964 7.742 7.561 7.39 7.21 7.014 6.826 6.682 6.527 6.279 6.102 5.924 5.825 5.586 5.337 5.106 4.987 4.713 4.569 4.402 4.222 3.838 3.638 3.389 3.121 2.843 2.481 1.939 -0.149 -7 ,21962 ,TETRA ,17600951,Sun Nov 28 14:27:40 CET,Sun Nov 28 16:15:13 CET,0.0 2.311 2.861 3.38 3.802 4.095 4.366 4.606 4.981 5.148 5.319 5.504 5.802 5.929 6.168 6.411 6.646 6.744 6.926 7.087 7.307 7.471 7.63 7.871 8.104 8.301 8.483 8.664 8.893 9.11 9.326 9.574 9.806 10.019 10.247 10.501 10.749 10.994 11.256 11.557 11.862 12.184 12.512 12.835 13.207 13.589 14.021 14.441 14.864 15.233 15.316 15.072 14.676 14.187 13.695 13.22 12.799 12.39 11.987 11.562 11.21 10.896 10.584 10.284 10.008 9.769 9.519 9.287 9.083 8.827 8.538 8.308 8.062 7.809 7.612 7.402 7.188 6.963 6.723 6.558 6.384 6.117 5.934 5.753 5.666 5.46 5.221 4.996 4.873 4.566 4.42 4.25 4.061 3.646 3.428 3.203 2.948 2.682 2.315 1.759 -0.577 -8 ,2812 ,TETRA ,17600952,Sun Nov 28 14:27:35 CET,Sun Nov 28 16:15:29 CET,0.0 2.386 2.976 3.376 3.693 3.963 4.217 4.456 4.885 5.064 5.22 5.366 5.645 5.764 6.013 6.236 6.443 6.544 6.743 6.953 7.252 7.425 7.587 7.821 8.04 8.237 8.431 8.638 8.911 9.156 9.378 9.639 9.878 10.108 10.378 10.659 10.924 11.201 11.465 11.757 12.073 12.412 12.766 13.089 13.436 13.784 14.164 14.505 14.835 15.15 15.197 14.8 14.376 13.856 13.295 12.838 12.418 12.033 11.697 11.317 10.964 10.663 10.353 10.049 9.786 9.539 9.23 8.948 8.739 8.513 8.258 8.057 7.86 7.634 7.458 7.268 7.029 6.759 6.481 6.293 6.109 5.825 5.619 5.42 5.32 5.101 4.849 4.583 4.452 4.155 4.007 3.834 3.653 3.254 3.049 2.847 2.602 2.298 1.895 1.336 -1.088 -9 ,22094 ,TETRA ,17600953,Sun Nov 28 14:27:35 CET,Sun Nov 28 16:16:47 CET,0.0 2.111 2.616 3.028 3.35 3.622 3.885 4.111 4.484 4.654 4.823 4.969 5.26 5.391 5.642 5.886 6.124 6.233 6.419 6.599 6.875 7.065 7.243 7.484 7.711 7.913 8.082 8.27 8.526 8.749 8.95 9.187 9.435 9.659 9.902 10.187 10.459 10.745 11.044 11.341 11.651 12.005 12.393 12.775 13.223 13.692 14.152 14.561 14.948 15.248 15.354 15.117 14.604 14.05 13.568 13.074 12.586 12.156 11.754 11.281 10.845 10.472 10.16 9.862 9.556 9.283 8.996 8.751 8.538 8.288 8.031 7.821 7.601 7.377 7.202 7.019 6.824 6.619 6.386 6.233 6.093 5.832 5.64 5.455 5.357 5.141 4.909 4.649 4.522 4.245 4.134 3.989 3.834 3.458 3.231 2.983 2.701 2.364 1.991 1.473 -1.101 -10 ,18655 ,TETRA ,17600954,Sun Nov 28 14:28:37 CET,Sun Nov 28 16:17:32 CET,0.0 1.636 2.232 2.675 3.064 3.357 3.589 3.799 4.17 4.34 4.497 4.618 4.895 5.02 5.259 5.487 5.705 5.81 6.014 6.215 6.497 6.67 6.844 7.09 7.322 7.539 7.739 7.92 8.152 8.402 8.629 8.882 9.126 9.335 9.569 9.827 10.063 10.338 10.636 10.936 11.227 11.552 11.925 12.252 12.602 12.978 13.368 13.741 14.074 14.301 14.312 14.002 13.554 13.07 12.582 12.13 11.715 11.313 10.933 10.532 10.193 9.869 9.534 9.208 8.914 8.624 8.302 8.037 7.822 7.595 7.351 7.156 6.927 6.678 6.511 6.338 6.156 5.934 5.7 5.549 5.38 5.098 4.898 4.692 4.585 4.366 4.143 3.911 3.783 3.489 3.365 3.197 3.01 2.613 2.402 2.167 1.896 1.605 1.283 0.838 -1.442 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_30.txt deleted file mode 100644 index 82cf3a44..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7362 ,TETRA ,17600955,Sun Nov 28 14:28:36 CET,Sun Nov 28 16:19:17 CET,0.0 1.628 2.055 2.361 2.603 2.805 2.991 3.167 3.479 3.601 3.721 3.793 4.036 4.125 4.311 4.488 4.647 4.722 4.863 5.0 5.188 5.306 5.417 5.583 5.74 5.883 6.012 6.131 6.295 6.461 6.614 6.794 6.961 7.107 7.271 7.441 7.6 7.774 7.945 8.119 8.303 8.497 8.711 8.9 9.077 9.214 9.315 9.391 9.364 9.149 8.518 7.482 6.557 5.739 5.006 4.317 3.712 3.163 2.697 2.23 1.821 1.474 1.143 0.804 0.499 0.24 -0.049 -0.308 -0.535 -0.77 -1.008 -1.218 -1.438 -1.658 -1.83 -2.016 -2.204 -2.393 -2.586 -2.72 -2.869 -3.121 -3.303 -3.479 -3.564 -3.739 -3.937 -4.149 -4.246 -4.509 -4.602 -4.728 -4.844 -5.1 -5.257 -5.439 -5.623 -5.842 -6.153 -6.572 -7.389 -2 ,9881 ,TETRA ,17600956,Sun Nov 28 14:28:37 CET,Sun Nov 28 16:16:24 CET,0.0 1.565 2.135 2.53 2.855 3.107 3.33 3.529 3.829 3.943 4.067 4.17 4.437 4.54 4.733 4.938 5.15 5.253 5.458 5.643 5.881 6.03 6.183 6.398 6.587 6.774 6.957 7.131 7.343 7.543 7.731 7.932 8.119 8.288 8.454 8.631 8.798 8.971 9.149 9.328 9.49 9.644 9.81 9.952 10.101 10.248 10.364 10.408 10.37 10.141 9.47 8.428 7.458 6.595 5.83 5.145 4.57 4.056 3.603 3.139 2.727 2.349 2.0 1.682 1.373 1.087 0.799 0.529 0.277 0.022 -0.242 -0.465 -0.688 -0.933 -1.125 -1.314 -1.525 -1.749 -1.975 -2.128 -2.269 -2.482 -2.639 -2.81 -2.899 -3.082 -3.277 -3.486 -3.601 -3.882 -3.989 -4.135 -4.289 -4.607 -4.784 -4.998 -5.237 -5.507 -5.822 -6.269 -7.349 -3 ,20019 ,TETRA ,17600957,Sun Nov 28 14:28:36 CET,Sun Nov 28 16:16:46 CET,0.0 1.554 1.962 2.255 2.508 2.71 2.887 3.069 3.444 3.619 3.796 3.964 4.249 4.388 4.643 4.877 5.094 5.193 5.382 5.558 5.799 5.942 6.07 6.256 6.438 6.608 6.765 6.908 7.089 7.266 7.446 7.661 7.851 8.015 8.209 8.437 8.634 8.825 9.035 9.243 9.415 9.581 9.768 9.951 10.138 10.305 10.436 10.509 10.474 10.255 9.637 8.638 7.699 6.859 6.128 5.471 4.903 4.376 3.884 3.414 3.017 2.65 2.305 1.964 1.659 1.393 1.109 0.848 0.605 0.36 0.123 -0.085 -0.3 -0.523 -0.697 -0.886 -1.088 -1.286 -1.486 -1.619 -1.761 -2.001 -2.18 -2.366 -2.457 -2.65 -2.849 -3.054 -3.169 -3.451 -3.539 -3.661 -3.784 -4.062 -4.24 -4.448 -4.665 -4.881 -5.146 -5.544 -6.875 -4 ,14280 ,TETRA ,17600958,Sun Nov 28 14:28:37 CET,Sun Nov 28 16:17:01 CET,0.0 1.236 1.711 2.116 2.433 2.684 2.934 3.178 3.575 3.735 3.858 3.928 4.188 4.292 4.494 4.677 4.838 4.923 5.086 5.222 5.412 5.529 5.635 5.798 5.962 6.105 6.234 6.362 6.537 6.7 6.852 7.033 7.205 7.37 7.547 7.725 7.893 8.069 8.241 8.423 8.609 8.803 9.008 9.183 9.349 9.483 9.588 9.676 9.663 9.414 8.751 7.741 6.795 5.982 5.272 4.589 3.99 3.467 3.012 2.513 2.074 1.713 1.39 1.068 0.751 0.475 0.189 -0.067 -0.289 -0.537 -0.795 -1.0 -1.215 -1.459 -1.643 -1.821 -2.014 -2.218 -2.426 -2.569 -2.727 -2.971 -3.13 -3.294 -3.377 -3.543 -3.718 -3.908 -4.001 -4.257 -4.326 -4.47 -4.624 -4.943 -5.117 -5.33 -5.57 -5.823 -6.133 -6.557 -7.593 -5 ,30199 ,TETRA ,17600959,Sun Nov 28 14:28:37 CET,Sun Nov 28 16:17:09 CET,0.0 1.094 1.626 1.963 2.239 2.475 2.694 2.89 3.201 3.338 3.472 3.556 3.807 3.911 4.106 4.286 4.456 4.54 4.698 4.843 5.047 5.17 5.289 5.468 5.641 5.803 5.952 6.082 6.246 6.409 6.571 6.763 6.94 7.109 7.294 7.476 7.641 7.821 8.004 8.187 8.356 8.527 8.719 8.898 9.099 9.277 9.366 9.371 9.309 9.058 8.408 7.431 6.494 5.648 4.889 4.191 3.6 3.073 2.612 2.137 1.731 1.369 1.02 0.695 0.384 0.107 -0.192 -0.476 -0.726 -0.996 -1.27 -1.482 -1.698 -1.922 -2.097 -2.278 -2.464 -2.664 -2.88 -3.028 -3.177 -3.407 -3.577 -3.759 -3.851 -4.054 -4.267 -4.482 -4.597 -4.872 -4.935 -5.059 -5.187 -5.471 -5.637 -5.808 -6.017 -6.248 -6.518 -6.835 -7.503 -6 ,23236 ,TETRA ,17600960,Sun Nov 28 14:28:39 CET,Sun Nov 28 16:18:05 CET,0.0 1.358 1.789 2.119 2.397 2.629 2.823 2.996 3.308 3.45 3.575 3.642 3.905 4.005 4.19 4.356 4.522 4.607 4.763 4.902 5.091 5.206 5.314 5.48 5.635 5.777 5.91 6.041 6.2 6.36 6.514 6.672 6.82 6.964 7.136 7.315 7.457 7.602 7.774 7.956 8.104 8.254 8.449 8.614 8.77 8.884 8.952 9.008 8.969 8.705 8.08 7.082 6.164 5.346 4.611 3.95 3.353 2.812 2.318 1.798 1.365 1.002 0.67 0.352 0.047 -0.238 -0.518 -0.769 -0.985 -1.205 -1.461 -1.678 -1.884 -2.095 -2.266 -2.44 -2.629 -2.843 -3.078 -3.23 -3.378 -3.61 -3.772 -3.951 -4.042 -4.236 -4.445 -4.674 -4.794 -5.088 -5.241 -5.408 -5.567 -5.904 -6.08 -6.27 -6.482 -6.719 -6.996 -7.375 -8.758 -7 ,4802 ,TETRA ,17600961,Sun Nov 28 14:28:36 CET,Sun Nov 28 16:18:24 CET,0.0 0.973 1.483 1.875 2.174 2.412 2.617 2.807 3.142 3.286 3.43 3.55 3.816 3.911 4.085 4.259 4.436 4.517 4.669 4.821 5.036 5.164 5.283 5.45 5.603 5.746 5.884 6.02 6.19 6.337 6.473 6.63 6.777 6.928 7.109 7.296 7.457 7.632 7.811 7.982 8.154 8.34 8.518 8.668 8.823 8.964 9.062 9.1 9.053 8.802 8.109 7.051 6.091 5.208 4.41 3.696 3.08 2.547 2.103 1.661 1.251 0.866 0.513 0.193 -0.101 -0.37 -0.663 -0.935 -1.154 -1.376 -1.632 -1.839 -2.047 -2.271 -2.449 -2.629 -2.813 -3.0 -3.196 -3.337 -3.484 -3.704 -3.857 -4.032 -4.124 -4.3 -4.488 -4.703 -4.817 -5.089 -5.137 -5.262 -5.396 -5.684 -5.855 -6.055 -6.289 -6.542 -6.863 -7.391 -8.632 -8 ,22889 ,TETRA ,17600962,Sun Nov 28 14:28:37 CET,Sun Nov 28 16:16:01 CET,0.0 0.95 1.348 1.675 1.907 2.094 2.266 2.443 2.763 2.892 3.009 3.076 3.327 3.429 3.613 3.786 3.942 4.009 4.15 4.281 4.461 4.59 4.723 4.92 5.106 5.27 5.431 5.586 5.78 5.955 6.117 6.33 6.534 6.71 6.879 7.073 7.276 7.485 7.704 7.92 8.123 8.339 8.568 8.774 8.97 9.122 9.243 9.282 9.194 8.936 8.268 7.208 6.262 5.434 4.696 4.014 3.419 2.886 2.409 1.944 1.541 1.16 0.807 0.482 0.186 -0.085 -0.37 -0.635 -0.877 -1.137 -1.395 -1.589 -1.793 -2.005 -2.179 -2.364 -2.563 -2.767 -2.97 -3.117 -3.262 -3.494 -3.667 -3.841 -3.927 -4.111 -4.323 -4.544 -4.647 -4.917 -5.006 -5.138 -5.277 -5.6 -5.787 -5.975 -6.188 -6.458 -6.761 -7.208 -8.944 -9 ,400 ,TETRA ,17600963,Sun Nov 28 14:29:36 CET,Sun Nov 28 16:17:18 CET,0.0 1.417 1.888 2.219 2.446 2.616 2.78 2.929 3.208 3.357 3.496 3.597 3.862 3.958 4.149 4.353 4.528 4.609 4.774 4.926 5.119 5.235 5.346 5.51 5.659 5.797 5.932 6.064 6.229 6.38 6.52 6.686 6.833 6.967 7.135 7.313 7.477 7.655 7.84 8.028 8.209 8.392 8.585 8.761 8.941 9.117 9.262 9.327 9.291 9.077 8.433 7.487 6.606 5.783 5.056 4.385 3.773 3.228 2.765 2.277 1.865 1.503 1.144 0.806 0.498 0.227 -0.072 -0.339 -0.569 -0.816 -1.053 -1.251 -1.472 -1.703 -1.892 -2.09 -2.288 -2.496 -2.723 -2.881 -3.031 -3.26 -3.416 -3.575 -3.659 -3.834 -4.015 -4.208 -4.309 -4.581 -4.669 -4.8 -4.935 -5.212 -5.374 -5.568 -5.814 -6.076 -6.339 -6.701 -7.653 -10 ,10164 ,TETRA ,17600964,Sun Nov 28 14:29:37 CET,Sun Nov 28 16:17:27 CET,0.0 1.019 1.449 1.709 1.898 2.085 2.252 2.404 2.685 2.807 2.919 2.976 3.223 3.315 3.497 3.673 3.839 3.92 4.077 4.221 4.42 4.541 4.658 4.832 4.996 5.149 5.278 5.405 5.577 5.732 5.883 6.054 6.209 6.369 6.563 6.757 6.927 7.1 7.273 7.455 7.635 7.832 8.028 8.18 8.326 8.461 8.588 8.634 8.539 8.306 7.681 6.686 5.779 4.922 4.164 3.494 2.908 2.356 1.878 1.404 0.994 0.623 0.262 -0.069 -0.374 -0.657 -0.978 -1.268 -1.499 -1.732 -1.963 -2.148 -2.338 -2.541 -2.709 -2.891 -3.074 -3.276 -3.487 -3.621 -3.762 -3.997 -4.164 -4.349 -4.439 -4.609 -4.779 -4.959 -5.061 -5.329 -5.419 -5.556 -5.71 -6.066 -6.265 -6.475 -6.72 -6.982 -7.264 -7.642 -8.988 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_32.txt deleted file mode 100644 index 2a8e1020..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9441 ,TETRA ,17600965,Sun Nov 28 14:29:39 CET,Sun Nov 28 16:17:52 CET,0.0 1.457 1.933 2.234 2.466 2.675 2.862 3.018 3.305 3.431 3.554 3.628 3.888 3.989 4.172 4.357 4.546 4.628 4.774 4.926 5.134 5.263 5.39 5.562 5.734 5.889 6.033 6.178 6.361 6.544 6.721 6.924 7.12 7.311 7.505 7.708 7.913 8.13 8.348 8.561 8.784 9.021 9.263 9.486 9.727 9.96 10.184 10.418 10.629 10.689 10.453 9.877 9.189 8.525 7.972 7.464 6.998 6.581 6.218 5.823 5.447 5.106 4.815 4.549 4.286 4.045 3.804 3.571 3.369 3.168 2.95 2.767 2.576 2.362 2.183 2.011 1.849 1.672 1.477 1.342 1.203 0.991 0.834 0.675 0.593 0.423 0.253 0.066 -0.029 -0.281 -0.337 -0.459 -0.594 -0.891 -1.05 -1.202 -1.373 -1.574 -1.845 -2.23 -3.061 -2 ,31413 ,TETRA ,17600966,Sun Nov 28 14:29:40 CET,Sun Nov 28 16:17:14 CET,0.0 1.233 1.661 1.989 2.294 2.553 2.775 2.966 3.267 3.393 3.521 3.603 3.861 3.959 4.147 4.336 4.514 4.601 4.762 4.908 5.117 5.261 5.395 5.582 5.754 5.907 6.063 6.218 6.413 6.59 6.755 6.96 7.153 7.322 7.502 7.702 7.906 8.129 8.353 8.575 8.807 9.049 9.284 9.518 9.786 10.058 10.314 10.515 10.65 10.67 10.433 9.803 9.126 8.503 7.928 7.373 6.884 6.448 6.067 5.682 5.323 4.99 4.687 4.4 4.123 3.869 3.602 3.367 3.169 2.961 2.742 2.55 2.334 2.109 1.936 1.753 1.557 1.358 1.153 1.015 0.881 0.654 0.486 0.328 0.248 0.081 -0.093 -0.281 -0.379 -0.633 -0.685 -0.799 -0.92 -1.201 -1.388 -1.613 -1.853 -2.137 -2.5 -2.984 -4.188 -3 ,2038 ,TETRA ,17600967,Sun Nov 28 14:29:36 CET,Sun Nov 28 16:18:32 CET,0.0 1.387 1.889 2.238 2.492 2.685 2.878 3.068 3.395 3.532 3.645 3.729 4.008 4.142 4.388 4.599 4.793 4.878 5.045 5.205 5.427 5.565 5.689 5.864 6.037 6.199 6.353 6.505 6.695 6.871 7.032 7.221 7.402 7.57 7.751 7.955 8.146 8.342 8.554 8.772 8.994 9.245 9.525 9.77 10.01 10.275 10.555 10.772 10.912 10.924 10.632 10.012 9.359 8.74 8.173 7.622 7.113 6.671 6.282 5.861 5.495 5.184 4.883 4.583 4.311 4.064 3.799 3.561 3.353 3.122 2.889 2.704 2.512 2.32 2.17 2.01 1.85 1.676 1.491 1.364 1.23 1.021 0.875 0.719 0.639 0.462 0.27 0.066 -0.036 -0.301 -0.393 -0.527 -0.685 -1.023 -1.205 -1.403 -1.614 -1.851 -2.13 -2.5 -3.566 -4 ,10889 ,TETRA ,17600968,Sun Nov 28 14:29:40 CET,Sun Nov 28 16:18:49 CET,0.0 1.608 2.15 2.538 2.866 3.16 3.392 3.602 4.013 4.194 4.361 4.511 4.812 4.956 5.206 5.433 5.638 5.741 5.942 6.122 6.387 6.557 6.721 6.956 7.177 7.391 7.581 7.778 8.031 8.252 8.48 8.751 8.985 9.183 9.373 9.577 9.778 9.984 10.189 10.404 10.63 10.865 11.124 11.391 11.655 11.87 12.09 12.319 12.471 12.451 12.174 11.607 10.977 10.322 9.719 9.163 8.651 8.171 7.757 7.341 6.976 6.648 6.33 6.037 5.765 5.501 5.212 4.957 4.729 4.48 4.23 4.039 3.84 3.617 3.441 3.266 3.101 2.93 2.744 2.616 2.48 2.26 2.101 1.944 1.87 1.715 1.543 1.334 1.22 0.952 0.869 0.737 0.599 0.307 0.132 -0.07 -0.288 -0.522 -0.831 -1.255 -2.26 -5 ,9480 ,TETRA ,17600969,Sun Nov 28 14:29:37 CET,Sun Nov 28 16:18:19 CET,0.0 1.965 2.37 2.622 2.86 3.093 3.308 3.493 3.794 3.931 4.059 4.146 4.407 4.514 4.718 4.91 5.096 5.184 5.34 5.494 5.714 5.836 5.952 6.136 6.316 6.475 6.625 6.781 6.977 7.16 7.343 7.563 7.757 7.93 8.131 8.345 8.536 8.737 8.947 9.152 9.367 9.586 9.834 10.078 10.326 10.561 10.778 10.975 11.156 11.233 11.0 10.416 9.729 9.079 8.489 7.922 7.419 6.964 6.581 6.208 5.871 5.556 5.254 4.96 4.684 4.441 4.188 3.953 3.745 3.532 3.309 3.121 2.925 2.733 2.586 2.416 2.24 2.063 1.868 1.732 1.592 1.373 1.222 1.059 0.973 0.804 0.629 0.454 0.363 0.101 0.014 -0.103 -0.229 -0.497 -0.641 -0.799 -0.965 -1.154 -1.387 -1.759 -2.742 -6 ,1768 ,TETRA ,17600970,Sun Nov 28 14:29:37 CET,Sun Nov 28 16:18:17 CET,0.0 1.292 1.703 2.019 2.28 2.516 2.718 2.919 3.296 3.453 3.594 3.692 3.948 4.051 4.259 4.449 4.619 4.698 4.853 5.004 5.215 5.345 5.472 5.641 5.811 5.984 6.143 6.294 6.481 6.657 6.828 7.035 7.222 7.386 7.582 7.802 7.999 8.205 8.43 8.684 8.944 9.21 9.477 9.711 9.951 10.195 10.438 10.626 10.776 10.877 10.688 10.115 9.462 8.841 8.272 7.706 7.208 6.745 6.346 5.97 5.625 5.309 5.006 4.711 4.44 4.194 3.923 3.682 3.469 3.246 3.025 2.838 2.646 2.455 2.301 2.132 1.96 1.775 1.573 1.435 1.297 1.086 0.933 0.774 0.689 0.516 0.338 0.154 0.048 -0.219 -0.295 -0.425 -0.55 -0.8 -0.935 -1.114 -1.329 -1.589 -1.953 -2.35 -3.137 -7 ,5969 ,TETRA ,17600971,Sun Nov 28 14:29:37 CET,Sun Nov 28 16:18:03 CET,0.0 1.404 1.764 2.034 2.269 2.501 2.714 2.885 3.195 3.318 3.424 3.483 3.739 3.844 4.048 4.226 4.391 4.478 4.646 4.788 5.007 5.149 5.268 5.438 5.6 5.757 5.91 6.051 6.226 6.4 6.562 6.748 6.924 7.096 7.303 7.503 7.679 7.887 8.093 8.303 8.526 8.774 9.067 9.32 9.582 9.852 10.096 10.313 10.487 10.504 10.225 9.634 8.956 8.275 7.687 7.149 6.655 6.206 5.834 5.481 5.162 4.875 4.603 4.318 4.045 3.799 3.536 3.309 3.118 2.905 2.672 2.494 2.316 2.113 1.941 1.762 1.587 1.418 1.228 1.091 0.957 0.732 0.577 0.414 0.331 0.175 0.027 -0.14 -0.243 -0.51 -0.564 -0.67 -0.79 -1.052 -1.202 -1.377 -1.574 -1.775 -2.095 -2.66 -3.719 -8 ,8900 ,TETRA ,17600972,Sun Nov 28 14:29:36 CET,Sun Nov 28 16:17:41 CET,0.0 1.477 1.967 2.308 2.554 2.742 2.918 3.097 3.421 3.574 3.72 3.827 4.091 4.201 4.413 4.591 4.765 4.849 5.013 5.17 5.399 5.543 5.672 5.853 6.031 6.203 6.357 6.502 6.691 6.872 7.032 7.225 7.413 7.591 7.799 8.006 8.185 8.391 8.621 8.851 9.073 9.311 9.565 9.794 10.03 10.27 10.512 10.735 10.903 10.939 10.665 10.062 9.446 8.828 8.257 7.712 7.201 6.723 6.312 5.913 5.56 5.243 4.958 4.675 4.399 4.155 3.898 3.665 3.462 3.246 3.017 2.829 2.623 2.4 2.245 2.085 1.909 1.723 1.536 1.398 1.247 1.027 0.875 0.728 0.655 0.488 0.31 0.13 0.034 -0.232 -0.305 -0.424 -0.545 -0.829 -0.987 -1.159 -1.35 -1.561 -1.809 -2.168 -3.106 -9 ,27603 ,TETRA ,17600973,Sun Nov 28 14:29:37 CET,Sun Nov 28 16:19:01 CET,0.0 0.947 1.346 1.665 1.908 2.109 2.304 2.477 2.765 2.905 3.039 3.12 3.374 3.477 3.679 3.861 4.034 4.122 4.284 4.436 4.668 4.821 4.977 5.205 5.416 5.618 5.802 5.973 6.178 6.352 6.514 6.712 6.903 7.079 7.285 7.495 7.686 7.894 8.123 8.367 8.61 8.865 9.128 9.361 9.61 9.86 10.112 10.327 10.459 10.451 10.175 9.611 8.964 8.301 7.719 7.189 6.7 6.245 5.83 5.429 5.096 4.79 4.483 4.183 3.908 3.655 3.393 3.158 2.954 2.75 2.525 2.33 2.129 1.912 1.748 1.587 1.427 1.255 1.078 0.953 0.819 0.621 0.483 0.342 0.267 0.09 -0.102 -0.298 -0.392 -0.65 -0.7 -0.809 -0.939 -1.196 -1.325 -1.482 -1.671 -1.912 -2.195 -2.524 -3.47 -10 ,25072 ,TETRA ,17600974,Sun Nov 28 14:29:40 CET,Sun Nov 28 16:18:33 CET,0.0 1.343 1.755 2.067 2.312 2.523 2.709 2.879 3.209 3.364 3.494 3.567 3.821 3.928 4.133 4.33 4.518 4.612 4.784 4.93 5.136 5.269 5.39 5.558 5.725 5.885 6.034 6.17 6.35 6.528 6.705 6.915 7.095 7.266 7.458 7.667 7.864 8.068 8.292 8.522 8.748 8.985 9.238 9.47 9.733 9.974 10.2 10.45 10.645 10.681 10.411 9.755 9.07 8.441 7.859 7.312 6.827 6.374 5.962 5.551 5.199 4.88 4.579 4.281 3.994 3.736 3.477 3.247 3.048 2.834 2.605 2.417 2.214 2.004 1.846 1.678 1.498 1.309 1.108 0.973 0.847 0.634 0.479 0.329 0.248 0.078 -0.11 -0.326 -0.449 -0.735 -0.871 -1.034 -1.196 -1.525 -1.703 -1.913 -2.151 -2.393 -2.724 -3.166 -4.319 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_33.txt deleted file mode 100644 index 14a1491f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27107 ,TETRA ,17600975,Sun Nov 28 14:29:40 CET,Sun Nov 28 16:17:19 CET,0.0 2.143 2.628 3.013 3.318 3.54 3.734 3.93 4.272 4.408 4.535 4.625 4.88 4.992 5.222 5.423 5.594 5.676 5.84 5.99 6.196 6.338 6.478 6.674 6.867 7.04 7.195 7.343 7.533 7.724 7.917 8.154 8.362 8.543 8.744 8.983 9.232 9.499 9.788 10.084 10.368 10.678 11.03 11.362 11.725 12.055 12.382 12.716 13.034 13.259 13.245 12.88 12.4 11.918 11.446 10.983 10.556 10.155 9.786 9.418 9.087 8.78 8.497 8.236 7.999 7.787 7.564 7.35 7.141 6.901 6.649 6.451 6.242 6.022 5.854 5.676 5.486 5.288 5.085 4.944 4.8 4.562 4.39 4.203 4.107 3.922 3.735 3.546 3.445 3.202 3.156 3.038 2.916 2.649 2.504 2.353 2.172 1.938 1.66 1.356 0.359 -2 ,23384 ,TETRA ,17600976,Sun Nov 28 14:29:40 CET,Sun Nov 28 16:17:04 CET,0.0 1.287 1.743 2.112 2.407 2.644 2.852 3.04 3.4 3.573 3.725 3.825 4.091 4.202 4.434 4.651 4.83 4.913 5.091 5.261 5.493 5.651 5.792 5.977 6.155 6.323 6.491 6.649 6.853 7.046 7.227 7.448 7.661 7.861 8.082 8.302 8.509 8.743 8.991 9.251 9.518 9.787 10.07 10.366 10.71 11.059 11.421 11.759 12.046 12.279 12.348 12.046 11.585 11.068 10.581 10.14 9.713 9.296 8.937 8.576 8.247 7.941 7.639 7.355 7.098 6.866 6.627 6.413 6.213 5.996 5.782 5.604 5.41 5.214 5.06 4.891 4.705 4.518 4.329 4.193 4.063 3.871 3.732 3.582 3.505 3.342 3.167 2.991 2.896 2.635 2.562 2.442 2.317 2.053 1.891 1.708 1.506 1.259 0.98 0.536 -0.797 -3 ,190 ,TETRA ,17600977,Sun Nov 28 14:29:42 CET,Sun Nov 28 16:17:20 CET,0.0 1.617 2.135 2.521 2.842 3.103 3.331 3.524 3.851 4.011 4.165 4.292 4.552 4.665 4.894 5.098 5.287 5.375 5.546 5.7 5.915 6.06 6.193 6.385 6.554 6.719 6.894 7.048 7.243 7.442 7.62 7.83 8.045 8.243 8.456 8.69 8.909 9.135 9.38 9.65 9.924 10.225 10.533 10.82 11.155 11.505 11.876 12.248 12.573 12.766 12.783 12.495 12.075 11.603 11.113 10.66 10.238 9.832 9.47 9.077 8.724 8.413 8.132 7.874 7.619 7.378 7.128 6.918 6.721 6.504 6.284 6.105 5.928 5.733 5.564 5.377 5.195 5.018 4.823 4.684 4.541 4.322 4.17 4.01 3.928 3.745 3.568 3.379 3.275 3.029 2.966 2.843 2.722 2.464 2.307 2.134 1.958 1.75 1.484 1.094 0.026 -4 ,25477 ,TETRA ,17600978,Sun Nov 28 14:29:43 CET,Sun Nov 28 16:17:01 CET,0.0 0.981 1.389 1.701 1.942 2.161 2.353 2.537 2.9 3.054 3.194 3.322 3.611 3.734 3.962 4.177 4.373 4.47 4.665 4.842 5.084 5.229 5.354 5.537 5.72 5.892 6.059 6.226 6.426 6.606 6.784 7.012 7.228 7.416 7.634 7.879 8.104 8.335 8.565 8.82 9.086 9.373 9.696 10.01 10.339 10.667 11.048 11.416 11.735 11.971 11.997 11.665 11.187 10.682 10.205 9.764 9.36 8.976 8.617 8.244 7.926 7.625 7.321 7.053 6.825 6.606 6.355 6.134 5.945 5.738 5.52 5.342 5.161 4.971 4.818 4.645 4.469 4.293 4.114 3.99 3.862 3.656 3.495 3.329 3.249 3.092 2.936 2.748 2.644 2.39 2.292 2.154 2.024 1.745 1.591 1.426 1.239 1.014 0.758 0.395 -0.861 -5 ,7574 ,TETRA ,17600979,Sun Nov 28 14:29:40 CET,Sun Nov 28 16:17:18 CET,0.0 1.693 2.182 2.494 2.747 2.968 3.179 3.364 3.699 3.844 3.968 4.067 4.335 4.439 4.633 4.819 5.001 5.09 5.265 5.425 5.637 5.78 5.907 6.087 6.273 6.446 6.609 6.759 6.955 7.155 7.349 7.568 7.759 7.946 8.162 8.396 8.618 8.859 9.115 9.371 9.634 9.93 10.261 10.582 10.95 11.322 11.674 12.014 12.331 12.54 12.52 12.162 11.665 11.158 10.688 10.223 9.776 9.357 9.002 8.641 8.332 8.07 7.801 7.513 7.242 7.002 6.738 6.496 6.29 6.083 5.874 5.704 5.52 5.314 5.166 5.019 4.858 4.693 4.527 4.408 4.279 4.076 3.927 3.78 3.705 3.549 3.39 3.209 3.113 2.859 2.777 2.657 2.532 2.261 2.105 1.935 1.738 1.49 1.215 0.876 -0.109 -6 ,14510 ,TETRA ,17600980,Sun Nov 28 14:29:40 CET,Sun Nov 28 16:17:25 CET,0.0 1.368 1.755 2.06 2.337 2.573 2.763 2.93 3.246 3.393 3.531 3.621 3.878 3.98 4.183 4.388 4.584 4.679 4.874 5.052 5.285 5.439 5.588 5.797 6.0 6.195 6.376 6.541 6.749 6.951 7.148 7.392 7.606 7.787 7.988 8.221 8.45 8.685 8.93 9.181 9.436 9.708 10.018 10.315 10.635 10.988 11.353 11.67 11.951 12.174 12.205 11.87 11.422 10.947 10.482 10.017 9.567 9.142 8.766 8.377 8.035 7.737 7.431 7.122 6.843 6.599 6.329 6.075 5.853 5.616 5.389 5.207 5.007 4.78 4.603 4.424 4.225 4.015 3.799 3.649 3.498 3.276 3.121 2.955 2.865 2.679 2.497 2.286 2.172 1.902 1.789 1.659 1.521 1.196 1.011 0.815 0.608 0.371 0.049 -0.374 -1.601 -7 ,19341 ,TETRA ,17600981,Sun Nov 28 14:29:40 CET,Sun Nov 28 16:17:57 CET,0.0 1.696 2.23 2.552 2.802 3.044 3.254 3.452 3.789 3.945 4.082 4.168 4.435 4.557 4.791 4.993 5.19 5.284 5.451 5.609 5.835 5.971 6.093 6.282 6.478 6.656 6.815 6.965 7.168 7.376 7.572 7.784 7.972 8.161 8.39 8.646 8.88 9.123 9.37 9.63 9.894 10.166 10.482 10.793 11.158 11.548 11.923 12.294 12.672 12.952 13.011 12.7 12.222 11.691 11.198 10.716 10.288 9.91 9.56 9.19 8.874 8.597 8.336 8.087 7.841 7.613 7.353 7.115 6.925 6.718 6.496 6.307 6.105 5.914 5.773 5.612 5.444 5.27 5.084 4.964 4.838 4.617 4.461 4.296 4.209 4.05 3.884 3.705 3.615 3.356 3.279 3.156 3.011 2.711 2.556 2.383 2.185 1.951 1.667 1.259 0.29 -8 ,13562 ,TETRA ,17600982,Sun Nov 28 14:29:42 CET,Sun Nov 28 16:17:24 CET,0.0 1.209 1.685 2.012 2.282 2.491 2.69 2.877 3.197 3.346 3.487 3.59 3.862 3.981 4.193 4.38 4.553 4.638 4.808 4.977 5.218 5.367 5.52 5.734 5.923 6.112 6.297 6.46 6.659 6.853 7.038 7.262 7.479 7.675 7.897 8.136 8.351 8.59 8.855 9.14 9.426 9.727 10.065 10.381 10.709 11.026 11.353 11.692 12.002 12.209 12.262 11.939 11.476 11.008 10.526 10.009 9.534 9.109 8.722 8.322 7.966 7.635 7.315 7.032 6.783 6.548 6.297 6.074 5.872 5.66 5.431 5.235 5.043 4.835 4.682 4.544 4.395 4.225 4.048 3.932 3.808 3.615 3.476 3.336 3.265 3.101 2.922 2.738 2.649 2.399 2.325 2.214 2.09 1.786 1.616 1.419 1.175 0.912 0.646 0.224 -1.032 -9 ,23477 ,TETRA ,17600983,Sun Nov 28 14:29:40 CET,Sun Nov 28 16:18:06 CET,0.0 1.442 1.936 2.33 2.67 2.928 3.125 3.301 3.647 3.814 3.962 4.066 4.332 4.445 4.646 4.834 5.011 5.09 5.243 5.381 5.568 5.706 5.845 6.034 6.22 6.414 6.588 6.749 6.951 7.135 7.31 7.514 7.702 7.89 8.101 8.327 8.534 8.767 9.032 9.291 9.558 9.86 10.208 10.549 10.892 11.248 11.626 11.988 12.311 12.553 12.632 12.319 11.827 11.323 10.846 10.37 9.896 9.476 9.121 8.764 8.443 8.095 7.749 7.459 7.214 6.986 6.742 6.541 6.36 6.168 5.969 5.795 5.61 5.413 5.279 5.145 4.986 4.819 4.636 4.511 4.382 4.176 4.042 3.896 3.817 3.652 3.475 3.296 3.21 2.961 2.896 2.777 2.653 2.389 2.241 2.079 1.902 1.69 1.404 1.013 -0.107 -10 ,32051 ,TETRA ,17600984,Sun Nov 28 14:29:42 CET,Sun Nov 28 16:18:06 CET,0.0 0.915 1.405 1.763 2.03 2.23 2.385 2.554 2.864 3.003 3.138 3.226 3.49 3.604 3.83 4.021 4.2 4.287 4.463 4.652 4.919 5.08 5.233 5.442 5.623 5.808 5.998 6.167 6.39 6.613 6.817 7.061 7.299 7.532 7.782 8.039 8.283 8.537 8.794 9.051 9.317 9.606 9.935 10.237 10.561 10.92 11.293 11.639 11.949 12.172 12.2 11.873 11.408 10.881 10.377 9.909 9.463 9.065 8.717 8.343 7.999 7.694 7.403 7.114 6.84 6.608 6.362 6.137 5.957 5.745 5.511 5.336 5.152 4.96 4.809 4.644 4.476 4.298 4.11 3.985 3.855 3.644 3.49 3.325 3.245 3.078 2.877 2.651 2.529 2.261 2.178 2.047 1.905 1.567 1.367 1.15 0.925 0.68 0.415 0.118 -0.849 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_34.txt deleted file mode 100644 index e70f886d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,260 ,TETRA ,17600985,Sun Nov 28 14:29:44 CET,Sun Nov 28 16:19:09 CET,0.0 2.063 2.804 3.316 3.717 4.078 4.41 4.685 5.14 5.332 5.498 5.64 5.931 6.068 6.329 6.558 6.778 6.896 7.139 7.371 7.672 7.854 8.039 8.32 8.569 8.793 9.025 9.248 9.53 9.806 10.065 10.352 10.615 10.871 11.168 11.495 11.82 12.183 12.552 12.938 13.317 13.717 14.187 14.625 15.087 15.588 16.128 16.661 17.174 17.604 17.9 17.796 17.43 16.955 16.492 16.058 15.647 15.243 14.863 14.482 14.159 13.863 13.563 13.264 12.985 12.743 12.486 12.25 12.053 11.846 11.631 11.442 11.239 11.036 10.868 10.69 10.521 10.363 10.198 10.075 9.94 9.729 9.592 9.451 9.371 9.206 9.042 8.861 8.768 8.514 8.442 8.335 8.22 7.906 7.716 7.526 7.307 7.05 6.721 6.297 5.601 -2 ,9571 ,TETRA ,17600986,Sun Nov 28 14:29:40 CET,Sun Nov 28 16:19:03 CET,0.0 1.552 2.076 2.478 2.788 3.064 3.316 3.544 3.946 4.112 4.268 4.425 4.737 4.881 5.134 5.392 5.636 5.743 5.943 6.129 6.395 6.584 6.761 6.994 7.201 7.425 7.657 7.854 8.095 8.317 8.542 8.819 9.068 9.309 9.58 9.864 10.143 10.462 10.789 11.118 11.432 11.777 12.188 12.593 13.035 13.468 13.955 14.476 14.994 15.465 15.737 15.575 15.267 14.905 14.499 14.091 13.724 13.388 13.06 12.706 12.359 12.056 11.807 11.563 11.332 11.122 10.898 10.682 10.479 10.274 10.06 9.856 9.622 9.398 9.238 9.078 8.911 8.741 8.57 8.441 8.303 8.074 7.916 7.757 7.674 7.494 7.308 7.11 7.009 6.757 6.708 6.593 6.456 6.163 5.998 5.822 5.629 5.398 5.156 4.865 4.056 -3 ,15121 ,TETRA ,17600987,Sun Nov 28 14:30:09 CET,Sun Nov 28 16:18:19 CET,0.0 2.175 2.738 3.121 3.491 3.83 4.098 4.301 4.654 4.836 5.012 5.162 5.444 5.57 5.811 6.039 6.255 6.357 6.578 6.783 7.046 7.213 7.366 7.583 7.804 8.022 8.234 8.438 8.692 8.933 9.148 9.401 9.653 9.886 10.173 10.526 10.861 11.212 11.541 11.874 12.209 12.573 13.001 13.423 13.924 14.429 14.963 15.476 15.974 16.409 16.657 16.51 16.126 15.678 15.223 14.78 14.355 13.928 13.555 13.183 12.865 12.579 12.294 12.026 11.766 11.52 11.262 11.022 10.81 10.585 10.341 10.124 9.9 9.66 9.468 9.274 9.074 8.873 8.692 8.575 8.454 8.261 8.118 7.975 7.9 7.705 7.489 7.284 7.18 6.932 6.869 6.745 6.617 6.362 6.229 6.058 5.826 5.583 5.306 4.973 4.12 -4 ,6694 ,TETRA ,17600988,Sun Nov 28 14:29:39 CET,Sun Nov 28 16:18:57 CET,0.0 1.491 2.021 2.329 2.632 2.942 3.196 3.398 3.732 3.884 4.043 4.196 4.481 4.611 4.852 5.077 5.291 5.391 5.583 5.775 6.056 6.234 6.392 6.598 6.821 7.048 7.247 7.441 7.683 7.92 8.144 8.394 8.638 8.875 9.139 9.43 9.706 10.006 10.33 10.637 10.948 11.298 11.696 12.095 12.529 12.968 13.435 13.919 14.408 14.845 15.092 14.915 14.524 14.109 13.706 13.289 12.88 12.489 12.152 11.813 11.49 11.187 10.907 10.632 10.374 10.119 9.836 9.596 9.373 9.135 8.897 8.701 8.496 8.273 8.098 7.919 7.726 7.526 7.334 7.199 7.047 6.818 6.669 6.511 6.424 6.24 6.043 5.837 5.727 5.462 5.38 5.244 5.104 4.822 4.658 4.484 4.289 4.079 3.832 3.465 2.66 -5 ,6375 ,TETRA ,17600989,Sun Nov 28 14:29:40 CET,Sun Nov 28 16:18:09 CET,0.0 2.395 2.973 3.366 3.659 3.918 4.168 4.391 4.746 4.915 5.088 5.255 5.55 5.69 5.968 6.229 6.483 6.608 6.839 7.051 7.345 7.536 7.737 8.052 8.315 8.526 8.747 8.961 9.237 9.487 9.708 9.971 10.219 10.472 10.771 11.101 11.408 11.733 12.095 12.465 12.831 13.231 13.664 14.098 14.577 15.092 15.656 16.22 16.792 17.236 17.458 17.295 16.895 16.482 16.05 15.564 15.116 14.706 14.351 14.006 13.697 13.404 13.116 12.822 12.538 12.268 11.994 11.765 11.563 11.34 11.111 10.912 10.71 10.52 10.364 10.201 10.044 9.882 9.712 9.599 9.469 9.258 9.121 8.984 8.907 8.745 8.585 8.395 8.295 8.047 7.986 7.869 7.739 7.478 7.329 7.147 6.946 6.736 6.504 6.185 5.379 -6 ,15772 ,TETRA ,17600990,Sun Nov 28 14:29:42 CET,Sun Nov 28 16:17:45 CET,0.0 1.645 2.245 2.69 3.064 3.403 3.707 3.992 4.468 4.657 4.837 5.024 5.339 5.5 5.8 6.065 6.312 6.439 6.691 6.947 7.296 7.5 7.704 7.996 8.267 8.557 8.842 9.075 9.33 9.578 9.823 10.119 10.399 10.653 10.95 11.299 11.618 11.931 12.26 12.61 12.984 13.403 13.834 14.26 14.777 15.313 15.858 16.398 16.934 17.463 17.828 17.694 17.313 16.858 16.411 15.972 15.547 15.128 14.76 14.405 14.087 13.789 13.504 13.229 12.968 12.722 12.457 12.224 12.022 11.809 11.583 11.378 11.165 10.965 10.813 10.646 10.46 10.263 10.058 9.916 9.764 9.49 9.301 9.101 8.995 8.776 8.537 8.294 8.17 7.898 7.796 7.652 7.507 7.189 7.002 6.797 6.565 6.311 5.972 5.577 4.897 -7 ,8924 ,TETRA ,17600991,Sun Nov 28 14:29:45 CET,Sun Nov 28 16:17:22 CET,0.0 1.261 1.734 2.115 2.428 2.724 2.98 3.192 3.564 3.728 3.871 4.009 4.32 4.467 4.733 4.98 5.216 5.322 5.496 5.673 5.971 6.155 6.318 6.561 6.796 7.006 7.214 7.425 7.703 7.968 8.201 8.453 8.697 8.942 9.216 9.518 9.794 10.086 10.403 10.734 11.075 11.431 11.826 12.213 12.607 13.014 13.48 13.961 14.448 14.898 15.172 14.999 14.619 14.226 13.807 13.377 13.005 12.642 12.295 11.944 11.62 11.325 11.043 10.754 10.49 10.256 9.999 9.77 9.571 9.364 9.149 8.968 8.769 8.545 8.38 8.214 8.051 7.893 7.722 7.601 7.465 7.243 7.102 6.956 6.875 6.71 6.539 6.361 6.267 6.024 5.964 5.851 5.741 5.496 5.337 5.167 4.973 4.749 4.496 4.113 2.85 -8 ,25000 ,TETRA ,17600992,Sun Nov 28 14:29:41 CET,Sun Nov 28 16:20:37 CET,0.0 1.501 2.067 2.494 2.855 3.15 3.402 3.64 4.042 4.194 4.342 4.507 4.812 4.945 5.209 5.486 5.729 5.83 6.026 6.229 6.5 6.668 6.839 7.095 7.333 7.553 7.773 7.98 8.242 8.491 8.727 9.006 9.255 9.497 9.763 10.036 10.339 10.688 11.021 11.355 11.691 12.073 12.536 12.96 13.391 13.843 14.322 14.827 15.322 15.721 15.947 15.817 15.491 15.069 14.621 14.152 13.723 13.361 13.033 12.69 12.344 12.002 11.675 11.35 11.078 10.856 10.631 10.44 10.262 10.046 9.826 9.649 9.458 9.26 9.099 8.916 8.72 8.517 8.299 8.153 8.024 7.833 7.693 7.54 7.461 7.309 7.129 6.931 6.827 6.572 6.491 6.362 6.216 5.882 5.715 5.546 5.348 5.136 4.893 4.561 3.747 -9 ,19742 ,TETRA ,17600993,Sun Nov 28 14:29:42 CET,Sun Nov 28 16:20:40 CET,0.0 1.818 2.405 2.851 3.17 3.451 3.72 3.958 4.38 4.579 4.757 4.896 5.183 5.31 5.579 5.851 6.09 6.207 6.441 6.657 6.938 7.111 7.284 7.548 7.795 8.029 8.262 8.464 8.708 8.955 9.201 9.497 9.762 10.013 10.3 10.593 10.865 11.155 11.458 11.79 12.158 12.563 12.997 13.378 13.798 14.276 14.78 15.294 15.8 16.273 16.621 16.511 16.137 15.681 15.225 14.771 14.348 13.954 13.586 13.193 12.841 12.536 12.246 11.977 11.737 11.511 11.258 11.029 10.836 10.634 10.412 10.211 9.998 9.783 9.61 9.413 9.221 9.038 8.845 8.713 8.578 8.36 8.189 8.01 7.924 7.745 7.557 7.366 7.267 7.007 6.935 6.813 6.659 6.294 6.107 5.923 5.711 5.46 5.172 4.768 3.744 -10 ,27416 ,TETRA ,17600994,Sun Nov 28 14:29:44 CET,Sun Nov 28 16:18:17 CET,0.0 1.315 1.935 2.36 2.689 3.006 3.272 3.494 3.908 4.089 4.257 4.445 4.762 4.91 5.149 5.375 5.599 5.697 5.892 6.092 6.37 6.541 6.691 6.894 7.096 7.301 7.507 7.7 7.962 8.217 8.453 8.72 8.97 9.201 9.478 9.837 10.19 10.556 10.897 11.22 11.563 11.949 12.375 12.818 13.31 13.769 14.296 14.846 15.387 15.846 16.094 15.955 15.587 15.15 14.683 14.216 13.808 13.458 13.129 12.766 12.463 12.187 11.92 11.653 11.361 11.109 10.863 10.631 10.425 10.212 10.002 9.825 9.64 9.442 9.296 9.156 8.989 8.794 8.597 8.471 8.35 8.163 8.018 7.848 7.757 7.561 7.357 7.161 7.05 6.775 6.663 6.527 6.392 6.052 5.857 5.66 5.454 5.243 5.009 4.656 3.871 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_37.txt deleted file mode 100644 index 4f9249bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11923 ,TETRA ,17600995,Sun Nov 28 14:30:08 CET,Sun Nov 28 16:19:33 CET,0.0 2.369 3.077 3.521 3.845 4.135 4.393 4.617 5.04 5.237 5.413 5.626 5.938 6.078 6.338 6.603 6.851 6.959 7.197 7.431 7.728 7.903 8.073 8.316 8.529 8.733 8.935 9.108 9.344 9.591 9.807 10.042 10.265 10.476 10.707 10.975 11.229 11.478 11.718 11.969 12.226 12.493 12.811 13.084 13.353 13.611 13.839 14.018 14.058 13.889 13.254 12.237 11.304 10.415 9.614 8.932 8.335 7.773 7.297 6.839 6.463 6.119 5.772 5.419 5.05 4.697 4.338 4.026 3.755 3.475 3.182 2.928 2.668 2.397 2.187 1.969 1.744 1.507 1.241 1.061 0.888 0.621 0.438 0.255 0.155 -0.064 -0.272 -0.477 -0.596 -0.883 -0.996 -1.14 -1.276 -1.552 -1.729 -1.921 -2.101 -2.299 -2.576 -2.943 -3.75 -2 ,21436 ,TETRA ,17600996,Sun Nov 28 14:30:07 CET,Sun Nov 28 16:19:04 CET,0.0 2.215 2.84 3.362 3.792 4.158 4.473 4.771 5.304 5.521 5.717 5.949 6.273 6.441 6.76 7.037 7.275 7.397 7.637 7.867 8.242 8.477 8.682 8.958 9.215 9.466 9.701 9.917 10.176 10.429 10.665 10.919 11.153 11.381 11.639 11.93 12.206 12.484 12.778 13.093 13.408 13.723 14.071 14.421 14.785 15.101 15.373 15.604 15.725 15.611 15.06 14.101 13.166 12.3 11.515 10.808 10.19 9.616 9.1 8.589 8.155 7.758 7.378 7.021 6.694 6.392 6.083 5.799 5.538 5.274 4.994 4.76 4.537 4.303 4.115 3.928 3.74 3.544 3.326 3.156 2.988 2.746 2.568 2.387 2.293 2.081 1.868 1.644 1.522 1.239 1.144 1.012 0.869 0.553 0.405 0.229 0.0 -0.259 -0.568 -1.01 -1.917 -3 ,4615 ,TETRA ,17600997,Sun Nov 28 14:30:08 CET,Sun Nov 28 16:18:56 CET,0.0 1.54 2.156 2.61 2.963 3.242 3.507 3.791 4.298 4.525 4.74 4.959 5.293 5.466 5.783 6.057 6.307 6.429 6.644 6.848 7.141 7.319 7.497 7.748 7.958 8.149 8.328 8.494 8.714 8.927 9.131 9.382 9.608 9.804 10.028 10.299 10.575 10.882 11.199 11.518 11.851 12.177 12.498 12.782 13.037 13.281 13.495 13.657 13.748 13.614 13.096 12.208 11.3 10.484 9.752 9.067 8.469 7.92 7.438 6.967 6.563 6.198 5.849 5.51 5.18 4.882 4.568 4.263 4.002 3.755 3.496 3.273 3.041 2.794 2.6 2.384 2.154 1.932 1.71 1.554 1.39 1.138 0.974 0.798 0.709 0.526 0.323 0.097 -0.022 -0.309 -0.441 -0.603 -0.773 -1.09 -1.274 -1.501 -1.709 -1.93 -2.182 -2.556 -3.625 -4 ,2699 ,TETRA ,17600998,Sun Nov 28 14:30:11 CET,Sun Nov 28 16:19:05 CET,0.0 2.03 2.529 2.93 3.28 3.577 3.823 4.045 4.436 4.621 4.796 4.948 5.237 5.367 5.625 5.859 6.083 6.189 6.385 6.581 6.858 7.027 7.185 7.404 7.613 7.806 7.979 8.147 8.355 8.557 8.757 8.977 9.185 9.403 9.668 9.929 10.14 10.366 10.606 10.844 11.102 11.396 11.696 12.002 12.339 12.653 12.944 13.157 13.27 13.193 12.715 11.747 10.754 9.883 9.11 8.417 7.809 7.234 6.74 6.257 5.831 5.453 5.097 4.735 4.384 4.083 3.769 3.479 3.238 2.986 2.7 2.471 2.24 1.984 1.785 1.575 1.357 1.138 0.906 0.75 0.584 0.315 0.12 -0.094 -0.203 -0.427 -0.66 -0.889 -0.995 -1.266 -1.327 -1.455 -1.596 -1.925 -2.131 -2.358 -2.625 -2.92 -3.254 -3.743 -4.956 -5 ,431 ,TETRA ,17600999,Sun Nov 28 14:30:12 CET,Sun Nov 28 16:19:11 CET,0.0 2.426 3.067 3.561 3.95 4.253 4.533 4.781 5.227 5.423 5.605 5.796 6.094 6.234 6.496 6.743 6.984 7.104 7.339 7.552 7.827 8.008 8.2 8.496 8.784 9.051 9.3 9.521 9.819 10.119 10.385 10.655 10.886 11.107 11.362 11.629 11.863 12.118 12.368 12.649 12.939 13.211 13.521 13.822 14.103 14.339 14.559 14.724 14.805 14.641 14.006 13.018 12.055 11.208 10.462 9.767 9.156 8.606 8.118 7.609 7.185 6.812 6.441 6.081 5.753 5.46 5.151 4.876 4.644 4.403 4.154 3.942 3.724 3.478 3.276 3.08 2.884 2.683 2.455 2.292 2.128 1.866 1.675 1.472 1.366 1.157 0.947 0.706 0.586 0.317 0.234 0.09 -0.069 -0.407 -0.567 -0.729 -0.938 -1.205 -1.543 -1.982 -2.909 -6 ,16261 ,TETRA ,17601000,Sun Nov 28 14:30:08 CET,Sun Nov 28 16:19:07 CET,0.0 2.252 2.904 3.371 3.744 4.06 4.336 4.611 5.09 5.291 5.48 5.679 6.002 6.155 6.392 6.612 6.839 6.946 7.143 7.337 7.617 7.79 7.966 8.215 8.455 8.695 8.927 9.15 9.434 9.674 9.872 10.103 10.316 10.54 10.8 11.089 11.352 11.592 11.824 12.069 12.332 12.622 12.916 13.16 13.462 13.791 14.039 14.224 14.345 14.259 13.67 12.626 11.614 10.704 9.898 9.116 8.425 7.797 7.254 6.732 6.282 5.887 5.544 5.198 4.84 4.505 4.163 3.852 3.566 3.29 3.032 2.821 2.602 2.369 2.144 1.894 1.649 1.421 1.211 1.06 0.905 0.675 0.513 0.337 0.246 0.065 -0.126 -0.343 -0.46 -0.734 -0.808 -0.941 -1.084 -1.391 -1.566 -1.745 -1.931 -2.138 -2.441 -2.847 -3.883 -7 ,23880 ,TETRA ,17601001,Sun Nov 28 14:30:09 CET,Sun Nov 28 16:19:07 CET,0.0 1.805 2.467 2.936 3.284 3.591 3.853 4.088 4.536 4.747 4.954 5.156 5.471 5.629 5.908 6.166 6.424 6.546 6.773 6.989 7.272 7.448 7.614 7.852 8.119 8.362 8.568 8.775 9.034 9.275 9.515 9.804 10.078 10.323 10.587 10.878 11.157 11.437 11.72 11.998 12.282 12.597 12.937 13.272 13.58 13.857 14.153 14.347 14.402 14.309 13.813 12.884 11.97 11.161 10.457 9.774 9.144 8.55 8.026 7.51 7.071 6.693 6.342 5.979 5.636 5.33 5.006 4.711 4.454 4.198 3.932 3.702 3.463 3.225 3.028 2.819 2.604 2.384 2.156 2.003 1.835 1.541 1.346 1.164 1.075 0.894 0.711 0.494 0.365 0.076 -0.043 -0.194 -0.349 -0.68 -0.854 -1.06 -1.311 -1.536 -1.75 -2.052 -3.213 -8 ,15276 ,TETRA ,17601002,Sun Nov 28 14:30:11 CET,Sun Nov 28 16:18:56 CET,0.0 1.995 2.626 3.006 3.393 3.723 3.991 4.235 4.672 4.872 5.058 5.261 5.571 5.712 5.982 6.234 6.457 6.564 6.778 6.972 7.266 7.46 7.639 7.897 8.126 8.337 8.564 8.764 8.988 9.201 9.388 9.621 9.85 10.063 10.314 10.592 10.838 11.086 11.328 11.558 11.806 12.085 12.372 12.637 12.9 13.115 13.316 13.509 13.612 13.483 12.918 11.948 11.039 10.22 9.467 8.759 8.131 7.563 7.076 6.601 6.186 5.806 5.435 5.054 4.69 4.392 4.103 3.847 3.606 3.331 3.04 2.799 2.548 2.284 2.087 1.888 1.675 1.44 1.217 1.073 0.921 0.677 0.485 0.278 0.173 -0.042 -0.265 -0.491 -0.611 -0.896 -0.971 -1.107 -1.267 -1.612 -1.807 -2.023 -2.256 -2.485 -2.749 -3.059 -3.654 -9 ,20965 ,TETRA ,17601003,Sun Nov 28 14:30:12 CET,Sun Nov 28 16:19:05 CET,0.0 2.281 3.052 3.54 3.901 4.21 4.485 4.736 5.201 5.417 5.614 5.823 6.149 6.317 6.624 6.908 7.168 7.276 7.465 7.642 7.901 8.066 8.226 8.462 8.684 8.892 9.089 9.269 9.512 9.773 10.035 10.338 10.635 10.905 11.167 11.448 11.693 11.928 12.174 12.415 12.66 12.908 13.18 13.44 13.692 13.951 14.168 14.33 14.427 14.273 13.713 12.785 11.873 11.038 10.276 9.607 9.016 8.475 8.005 7.51 7.074 6.708 6.377 6.055 5.741 5.456 5.175 4.929 4.707 4.464 4.212 4.004 3.792 3.572 3.383 3.184 2.993 2.797 2.579 2.41 2.226 1.935 1.723 1.511 1.409 1.212 1.02 0.81 0.691 0.402 0.256 0.114 -0.017 -0.319 -0.48 -0.654 -0.905 -1.199 -1.498 -1.899 -2.839 -10 ,14535 ,TETRA ,17601004,Sun Nov 28 14:30:14 CET,Sun Nov 28 16:18:56 CET,0.0 2.345 3.039 3.529 3.876 4.194 4.473 4.699 5.097 5.285 5.47 5.663 5.963 6.107 6.408 6.695 6.967 7.109 7.402 7.66 7.99 8.204 8.415 8.686 8.9 9.091 9.286 9.464 9.675 9.888 10.091 10.328 10.554 10.757 10.991 11.251 11.481 11.724 11.974 12.232 12.493 12.749 13.029 13.304 13.586 13.857 14.117 14.287 14.311 14.165 13.576 12.574 11.65 10.814 10.079 9.4 8.778 8.21 7.737 7.256 6.81 6.412 6.033 5.669 5.349 5.057 4.744 4.471 4.246 4.018 3.752 3.519 3.296 3.061 2.881 2.705 2.52 2.322 2.106 1.962 1.821 1.593 1.414 1.231 1.149 0.976 0.795 0.592 0.484 0.214 0.141 0.021 -0.116 -0.431 -0.605 -0.796 -1.02 -1.275 -1.558 -1.892 -2.97 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_38.txt deleted file mode 100644 index 98348454..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_38.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17774 ,KEBNE ,17027107,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:36:35 CET,0.0 4.14 4.9 5.414 5.834 6.206 6.523 6.801 7.326 7.563 7.765 7.983 8.324 8.519 8.871 9.181 9.466 9.603 9.871 10.137 10.505 10.719 10.926 11.245 11.536 11.789 12.042 12.29 12.591 12.867 13.13 13.45 13.771 14.09 14.452 14.842 15.197 15.574 15.973 16.375 16.775 17.207 17.66 18.083 18.576 19.085 19.646 20.162 20.519 20.738 20.579 19.905 19.116 18.365 17.666 17.004 16.426 15.89 15.421 14.953 14.555 14.199 13.848 13.514 13.194 12.877 12.522 12.225 11.988 11.741 11.472 11.246 11.004 10.741 10.548 10.365 10.173 9.951 9.726 9.577 9.42 9.128 8.893 8.651 8.523 8.259 7.99 7.705 7.557 7.25 7.067 6.875 6.69 6.32 6.122 5.916 5.669 5.401 5.103 4.651 2.233 -2 ,25229 ,KEBNE ,17027108,Wed Dec 22 16:02:46 CET,Wed Dec 22 17:36:37 CET,0.0 4.967 5.749 6.297 6.758 7.146 7.48 7.756 8.236 8.454 8.655 8.882 9.215 9.381 9.701 9.995 10.253 10.378 10.614 10.838 11.181 11.377 11.556 11.84 12.112 12.386 12.639 12.858 13.138 13.408 13.69 14.029 14.33 14.616 14.947 15.296 15.614 15.96 16.323 16.669 17.028 17.434 17.87 18.284 18.738 19.192 19.677 20.123 20.462 20.714 20.567 19.887 19.123 18.371 17.705 17.081 16.492 15.933 15.458 14.981 14.567 14.192 13.817 13.462 13.144 12.856 12.551 12.267 12.013 11.747 11.466 11.231 10.992 10.746 10.561 10.377 10.18 9.965 9.733 9.564 9.373 9.072 8.86 8.624 8.489 8.21 7.947 7.698 7.575 7.262 7.076 6.91 6.724 6.334 6.147 5.924 5.634 5.297 4.916 4.421 3.206 -3 ,32285 ,KEBNE ,17027109,Wed Dec 22 16:02:47 CET,Wed Dec 22 17:37:27 CET,0.0 4.634 5.409 6.064 6.564 6.968 7.309 7.594 8.079 8.309 8.541 8.81 9.158 9.348 9.703 10.017 10.287 10.418 10.685 10.926 11.245 11.454 11.655 11.934 12.22 12.501 12.756 13.002 13.333 13.653 13.948 14.28 14.606 14.929 15.293 15.658 15.998 16.376 16.719 17.071 17.445 17.846 18.28 18.672 19.108 19.525 19.944 20.365 20.717 20.938 20.783 20.103 19.326 18.561 17.863 17.221 16.636 16.093 15.634 15.147 14.691 14.289 13.916 13.553 13.219 12.924 12.598 12.312 12.085 11.835 11.556 11.334 11.106 10.869 10.684 10.488 10.286 10.083 9.872 9.717 9.551 9.297 9.125 8.938 8.834 8.602 8.348 8.08 7.946 7.648 7.529 7.384 7.237 6.923 6.745 6.548 6.328 6.041 5.699 5.317 3.785 -4 ,1105 ,KEBNE ,17027110,Wed Dec 22 16:02:47 CET,Wed Dec 22 17:36:41 CET,0.0 6.108 6.943 7.476 7.901 8.241 8.549 8.839 9.367 9.6 9.816 10.042 10.36 10.536 10.855 11.138 11.416 11.545 11.79 12.03 12.376 12.594 12.797 13.089 13.361 13.623 13.897 14.149 14.441 14.717 14.986 15.305 15.584 15.832 16.125 16.457 16.766 17.067 17.386 17.741 18.081 18.465 18.885 19.298 19.763 20.205 20.662 21.071 21.413 21.616 21.535 20.965 20.264 19.596 18.929 18.218 17.56 16.995 16.5 15.987 15.548 15.152 14.775 14.401 14.047 13.737 13.42 13.155 12.935 12.676 12.405 12.19 11.94 11.68 11.5 11.318 11.119 10.912 10.699 10.559 10.417 10.188 10.025 9.848 9.754 9.554 9.358 9.142 9.015 8.715 8.57 8.388 8.2 7.851 7.668 7.46 7.255 7.012 6.659 6.136 4.296 -5 ,14767 ,KEBNE ,17027111,Wed Dec 22 16:03:48 CET,Wed Dec 22 17:39:25 CET,0.0 6.198 7.093 7.799 8.342 8.791 9.168 9.504 10.065 10.32 10.573 10.869 11.218 11.421 11.814 12.146 12.43 12.558 12.815 13.063 13.43 13.667 13.877 14.174 14.448 14.705 14.953 15.207 15.525 15.834 16.137 16.483 16.814 17.124 17.468 17.82 18.143 18.49 18.86 19.266 19.697 20.157 20.638 21.063 21.555 22.086 22.591 23.034 23.437 23.725 23.535 22.793 22.079 21.412 20.76 20.084 19.467 18.908 18.405 17.875 17.404 17.014 16.663 16.318 15.992 15.702 15.385 15.102 14.881 14.646 14.391 14.172 13.897 13.599 13.385 13.157 12.902 12.644 12.392 12.221 12.052 11.803 11.631 11.432 11.317 11.079 10.842 10.577 10.43 10.118 9.971 9.813 9.642 9.246 9.025 8.812 8.572 8.275 7.929 7.51 5.417 -6 ,23077 ,KEBNE ,17027112,Wed Dec 22 16:03:48 CET,Wed Dec 22 17:39:57 CET,0.0 4.378 5.069 5.542 5.949 6.301 6.608 6.905 7.427 7.648 7.876 8.169 8.512 8.678 8.968 9.269 9.559 9.69 9.927 10.15 10.488 10.702 10.897 11.169 11.42 11.671 11.918 12.142 12.432 12.699 12.945 13.251 13.531 13.78 14.072 14.408 14.729 15.068 15.422 15.79 16.174 16.574 17.02 17.429 17.843 18.298 18.777 19.197 19.588 19.883 19.749 19.145 18.424 17.694 17.04 16.419 15.823 15.251 14.752 14.268 13.85 13.481 13.16 12.846 12.522 12.216 11.892 11.62 11.389 11.112 10.808 10.572 10.349 10.102 9.89 9.677 9.451 9.197 8.929 8.739 8.533 8.201 7.975 7.741 7.626 7.399 7.153 6.886 6.751 6.47 6.368 6.201 6.029 5.665 5.448 5.221 4.957 4.639 4.264 3.797 2.354 -7 ,13281 ,KEBNE ,17027113,Wed Dec 22 16:03:48 CET,Wed Dec 22 17:39:23 CET,0.0 5.886 6.761 7.325 7.788 8.132 8.443 8.742 9.219 9.423 9.615 9.847 10.172 10.314 10.6 10.884 11.158 11.29 11.546 11.781 12.107 12.31 12.496 12.768 13.04 13.297 13.531 13.749 14.032 14.322 14.601 14.943 15.27 15.564 15.876 16.214 16.541 16.883 17.234 17.592 17.972 18.392 18.847 19.279 19.734 20.179 20.595 20.992 21.367 21.621 21.463 20.779 20.06 19.35 18.691 18.103 17.561 17.003 16.486 15.973 15.552 15.18 14.809 14.468 14.161 13.865 13.55 13.278 13.035 12.715 12.352 12.063 11.766 11.466 11.23 10.981 10.736 10.495 10.259 10.112 9.955 9.715 9.558 9.386 9.289 9.078 8.846 8.603 8.479 8.185 8.056 7.896 7.721 7.364 7.171 6.951 6.7 6.394 6.061 5.59 3.45 -8 ,25620 ,KEBNE ,17027114,Wed Dec 22 16:03:48 CET,Wed Dec 22 17:38:34 CET,0.0 5.522 6.549 7.178 7.693 8.189 8.602 8.926 9.43 9.648 9.852 10.072 10.392 10.553 10.842 11.108 11.37 11.5 11.756 11.987 12.297 12.49 12.665 12.933 13.208 13.472 13.735 14.002 14.333 14.613 14.883 15.219 15.535 15.835 16.165 16.505 16.817 17.147 17.493 17.865 18.227 18.628 19.089 19.506 19.964 20.456 20.901 21.272 21.629 21.872 21.766 21.15 20.408 19.665 18.982 18.325 17.726 17.19 16.725 16.222 15.78 15.4 15.017 14.663 14.332 14.022 13.711 13.428 13.185 12.942 12.68 12.452 12.199 11.927 11.729 11.538 11.352 11.164 10.958 10.811 10.654 10.402 10.227 10.06 9.979 9.774 9.549 9.344 9.228 8.939 8.836 8.692 8.548 8.237 8.068 7.858 7.619 7.343 7.013 6.571 5.179 -9 ,29257 ,KEBNE ,17027115,Wed Dec 22 16:03:49 CET,Wed Dec 22 17:34:35 CET,0.0 4.08 4.856 5.434 5.921 6.303 6.607 6.898 7.422 7.64 7.855 8.113 8.451 8.625 8.968 9.292 9.591 9.734 10.018 10.291 10.666 10.895 11.106 11.393 11.666 11.921 12.149 12.368 12.657 12.92 13.165 13.47 13.792 14.099 14.435 14.837 15.229 15.626 16.037 16.473 16.888 17.277 17.726 18.165 18.601 19.038 19.472 19.911 20.293 20.522 20.427 19.811 19.079 18.394 17.787 17.205 16.655 16.135 15.666 15.194 14.791 14.398 14.02 13.671 13.348 13.036 12.712 12.433 12.188 11.93 11.665 11.455 11.244 11.014 10.808 10.579 10.338 10.101 9.864 9.706 9.549 9.297 9.127 8.955 8.86 8.634 8.376 8.087 7.932 7.617 7.48 7.318 7.123 6.702 6.46 6.181 5.85 5.446 4.941 4.372 3.037 -10 ,22290 ,KEBNE ,17027116,Wed Dec 22 16:05:52 CET,Wed Dec 22 17:39:40 CET,0.0 4.231 4.927 5.424 5.844 6.197 6.519 6.79 7.276 7.496 7.718 7.979 8.319 8.499 8.819 9.132 9.431 9.566 9.833 10.077 10.42 10.645 10.857 11.15 11.422 11.669 11.888 12.094 12.363 12.626 12.887 13.203 13.492 13.773 14.073 14.395 14.702 15.025 15.366 15.725 16.091 16.49 16.924 17.311 17.705 18.088 18.515 18.954 19.312 19.528 19.392 18.734 17.992 17.239 16.528 15.852 15.255 14.709 14.235 13.78 13.402 13.044 12.681 12.324 11.978 11.632 11.256 10.938 10.664 10.373 10.05 9.766 9.477 9.196 8.986 8.771 8.545 8.307 8.056 7.884 7.707 7.44 7.249 7.042 6.931 6.711 6.491 6.241 6.106 5.807 5.707 5.576 5.44 5.133 4.953 4.754 4.536 4.312 4.031 3.681 2.035 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_39.txt deleted file mode 100644 index 7d099769..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10033 ,TETRA ,17601005,Sun Nov 28 14:30:09 CET,Sun Nov 28 16:20:14 CET,0.0 5.407 6.205 6.824 7.294 7.688 8.058 8.379 8.962 9.211 9.438 9.716 10.059 10.245 10.62 10.939 11.23 11.377 11.65 11.895 12.228 12.457 12.665 12.958 13.238 13.477 13.701 13.944 14.268 14.549 14.808 15.123 15.41 15.668 15.966 16.288 16.589 16.904 17.246 17.617 17.979 18.362 18.778 19.177 19.588 19.94 20.313 20.7 20.963 21.031 20.747 19.912 18.956 18.083 17.281 16.538 15.883 15.274 14.726 14.171 13.686 13.254 12.83 12.41 12.035 11.696 11.332 11.017 10.737 10.426 10.096 9.829 9.561 9.274 9.041 8.808 8.571 8.316 8.066 7.89 7.703 7.424 7.23 7.025 6.92 6.7 6.434 6.138 5.994 5.691 5.549 5.389 5.234 4.862 4.632 4.39 4.103 3.775 3.451 2.96 0.842 -2 ,21767 ,TETRA ,17601006,Sun Nov 28 14:30:10 CET,Sun Nov 28 16:20:35 CET,0.0 4.1 4.9 5.505 5.968 6.328 6.631 6.916 7.46 7.699 7.911 8.161 8.505 8.679 9.004 9.332 9.619 9.76 10.039 10.297 10.658 10.879 11.097 11.372 11.6 11.83 12.044 12.262 12.547 12.79 13.018 13.309 13.584 13.844 14.13 14.43 14.721 15.039 15.38 15.703 16.041 16.434 16.877 17.398 17.985 18.524 19.057 19.593 20.045 20.186 19.837 18.919 17.919 17.016 16.215 15.413 14.701 14.097 13.581 13.041 12.541 12.086 11.657 11.259 10.886 10.543 10.202 9.895 9.621 9.329 9.031 8.788 8.535 8.28 8.08 7.866 7.644 7.421 7.195 7.042 6.882 6.621 6.421 6.194 6.076 5.843 5.591 5.317 5.174 4.87 4.726 4.557 4.368 4.002 3.826 3.623 3.376 3.036 2.635 2.129 0.747 -3 ,6718 ,TETRA ,17601007,Sun Nov 28 14:30:10 CET,Sun Nov 28 16:20:21 CET,0.0 4.563 5.397 5.935 6.366 6.784 7.16 7.486 8.039 8.281 8.52 8.813 9.157 9.336 9.701 10.066 10.387 10.524 10.789 11.044 11.436 11.667 11.862 12.149 12.42 12.661 12.902 13.134 13.404 13.664 13.903 14.188 14.479 14.752 15.051 15.348 15.608 15.905 16.243 16.605 16.948 17.296 17.682 18.049 18.475 18.889 19.284 19.728 20.06 20.053 19.584 18.711 17.849 17.014 16.23 15.496 14.836 14.204 13.653 13.121 12.65 12.228 11.844 11.484 11.122 10.792 10.477 10.19 9.942 9.682 9.363 9.071 8.782 8.513 8.324 8.125 7.91 7.69 7.469 7.309 7.141 6.873 6.691 6.506 6.409 6.2 5.964 5.731 5.616 5.333 5.234 5.088 4.929 4.593 4.419 4.201 3.969 3.723 3.408 2.96 1.71 -4 ,17139 ,TETRA ,17601008,Sun Nov 28 14:30:13 CET,Sun Nov 28 16:20:16 CET,0.0 4.507 5.316 5.861 6.351 6.784 7.132 7.433 7.936 8.18 8.413 8.651 8.983 9.15 9.476 9.785 10.071 10.217 10.496 10.765 11.154 11.388 11.597 11.874 12.131 12.405 12.67 12.911 13.206 13.479 13.756 14.078 14.365 14.623 14.915 15.245 15.555 15.899 16.279 16.64 16.953 17.284 17.644 17.963 18.306 18.68 19.041 19.325 19.497 19.511 19.26 18.509 17.599 16.724 15.915 15.157 14.496 13.887 13.356 12.803 12.306 11.869 11.465 11.089 10.74 10.407 10.065 9.765 9.493 9.223 8.937 8.692 8.436 8.161 7.939 7.705 7.463 7.199 6.934 6.754 6.56 6.261 6.029 5.77 5.639 5.371 5.112 4.843 4.691 4.368 4.211 4.05 3.879 3.469 3.236 2.989 2.691 2.351 2.001 1.556 0.569 -5 ,16771 ,TETRA ,17601009,Sun Nov 28 14:30:10 CET,Sun Nov 28 16:21:10 CET,0.0 4.047 4.875 5.492 5.994 6.443 6.838 7.174 7.737 7.993 8.257 8.609 8.985 9.194 9.559 9.866 10.127 10.249 10.499 10.751 11.102 11.308 11.503 11.793 12.076 12.333 12.57 12.805 13.094 13.368 13.632 13.944 14.222 14.476 14.788 15.122 15.419 15.734 16.058 16.401 16.739 17.092 17.51 17.909 18.306 18.698 19.035 19.283 19.522 19.617 19.227 18.207 17.151 16.146 15.299 14.554 13.845 13.211 12.68 12.133 11.656 11.245 10.825 10.433 10.084 9.756 9.378 9.041 8.768 8.469 8.157 7.914 7.661 7.387 7.158 6.925 6.688 6.432 6.176 5.991 5.79 5.468 5.225 4.979 4.86 4.613 4.349 4.049 3.888 3.567 3.415 3.245 3.063 2.666 2.438 2.184 1.925 1.649 1.297 0.79 -0.685 -6 ,28835 ,TETRA ,17601010,Sun Nov 28 14:30:11 CET,Sun Nov 28 16:21:11 CET,0.0 4.293 5.158 5.795 6.297 6.701 7.055 7.383 7.949 8.196 8.445 8.757 9.114 9.314 9.696 10.046 10.35 10.496 10.783 11.061 11.438 11.657 11.869 12.178 12.488 12.772 13.026 13.263 13.562 13.855 14.135 14.437 14.732 15.047 15.391 15.729 16.058 16.391 16.73 17.082 17.445 17.878 18.312 18.7 19.14 19.557 19.951 20.317 20.605 20.781 20.568 19.766 18.914 18.027 17.21 16.475 15.818 15.225 14.695 14.148 13.644 13.199 12.807 12.423 12.053 11.719 11.341 10.991 10.702 10.409 10.111 9.859 9.606 9.364 9.165 8.952 8.746 8.528 8.3 8.143 7.978 7.703 7.514 7.317 7.208 6.98 6.734 6.461 6.314 6.014 5.863 5.688 5.521 5.16 4.97 4.78 4.578 4.276 3.897 3.434 1.776 -7 ,8446 ,TETRA ,17601011,Sun Nov 28 14:30:13 CET,Sun Nov 28 16:20:19 CET,0.0 5.503 6.272 6.849 7.336 7.721 8.024 8.338 8.933 9.172 9.39 9.652 9.988 10.155 10.483 10.8 11.092 11.228 11.485 11.731 12.075 12.29 12.489 12.776 13.049 13.293 13.528 13.749 14.041 14.322 14.563 14.845 15.115 15.369 15.652 15.961 16.252 16.571 16.899 17.233 17.58 17.928 18.292 18.628 18.979 19.357 19.734 20.025 20.209 20.223 19.785 18.793 17.738 16.761 15.921 15.159 14.468 13.841 13.28 12.729 12.253 11.788 11.354 10.94 10.515 10.122 9.763 9.472 9.207 8.928 8.61 8.337 8.08 7.824 7.622 7.38 7.124 6.878 6.616 6.433 6.25 5.971 5.773 5.575 5.475 5.265 5.028 4.768 4.632 4.333 4.211 4.063 3.923 3.582 3.386 3.172 2.926 2.678 2.381 1.913 -0.199 -8 ,1095 ,TETRA ,17601012,Sun Nov 28 14:30:16 CET,Sun Nov 28 16:20:17 CET,0.0 3.685 4.521 5.133 5.547 5.931 6.301 6.617 7.171 7.414 7.668 8.006 8.373 8.579 8.991 9.351 9.667 9.825 10.109 10.364 10.768 11.038 11.281 11.611 11.923 12.218 12.502 12.77 13.083 13.383 13.672 14.0 14.318 14.634 14.989 15.346 15.676 16.052 16.444 16.818 17.175 17.556 17.978 18.315 18.668 19.051 19.408 19.711 19.966 20.018 19.578 18.673 17.783 16.977 16.226 15.546 14.938 14.38 13.892 13.38 12.948 12.559 12.178 11.809 11.452 11.13 10.812 10.538 10.298 10.034 9.738 9.5 9.245 8.955 8.738 8.522 8.285 8.016 7.745 7.562 7.366 7.09 6.909 6.719 6.623 6.396 6.138 5.877 5.732 5.411 5.252 5.072 4.889 4.493 4.292 4.078 3.807 3.515 3.168 2.673 0.928 -9 ,3977 ,TETRA ,17601013,Sun Nov 28 14:30:10 CET,Sun Nov 28 16:19:05 CET,0.0 3.38 4.176 4.732 5.221 5.68 6.073 6.418 7.05 7.309 7.523 7.755 8.092 8.291 8.685 9.036 9.336 9.482 9.76 10.016 10.397 10.632 10.851 11.162 11.449 11.727 11.999 12.244 12.535 12.828 13.107 13.445 13.764 14.056 14.389 14.748 15.094 15.444 15.82 16.223 16.585 16.954 17.372 17.739 18.074 18.421 18.824 19.148 19.321 19.349 18.942 18.098 17.233 16.423 15.659 14.963 14.382 13.846 13.359 12.833 12.374 11.977 11.594 11.228 10.894 10.563 10.228 9.943 9.674 9.387 9.076 8.811 8.531 8.246 8.02 7.788 7.552 7.302 7.031 6.848 6.676 6.4 6.211 6.033 5.943 5.728 5.486 5.232 5.103 4.81 4.72 4.583 4.426 4.086 3.908 3.71 3.455 3.177 2.929 2.514 0.63 -10 ,10740 ,TETRA ,17601014,Sun Nov 28 14:30:10 CET,Sun Nov 28 16:19:06 CET,0.0 7.712 8.499 9.079 9.584 10.003 10.345 10.694 11.295 11.536 11.762 12.052 12.413 12.597 12.946 13.295 13.625 13.763 13.991 14.215 14.547 14.759 14.955 15.229 15.483 15.719 15.951 16.164 16.447 16.739 17.016 17.342 17.662 17.949 18.258 18.604 18.925 19.287 19.667 20.024 20.349 20.689 21.083 21.47 21.895 22.33 22.736 23.062 23.321 23.367 22.848 21.877 20.912 20.068 19.278 18.496 17.839 17.227 16.682 16.146 15.641 15.175 14.75 14.348 13.98 13.619 13.229 12.893 12.598 12.291 11.974 11.713 11.459 11.206 11.003 10.787 10.55 10.298 10.045 9.874 9.692 9.394 9.181 8.968 8.856 8.616 8.388 8.171 8.052 7.765 7.654 7.497 7.318 6.89 6.663 6.45 6.212 5.928 5.617 5.104 3.374 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_40.txt deleted file mode 100644 index 07608b0b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_40.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29959 ,KEBNE ,17027117,Wed Dec 22 16:05:51 CET,Wed Dec 22 17:39:55 CET,0.0 6.375 7.597 8.378 8.989 9.445 9.866 10.234 10.879 11.176 11.432 11.777 12.158 12.358 12.717 13.03 13.315 13.464 13.734 13.962 14.325 14.565 14.781 15.109 15.443 15.735 16.0 16.267 16.576 16.88 17.2 17.575 17.888 18.148 18.451 18.772 19.043 19.31 19.556 19.784 20.019 20.244 20.431 20.573 20.671 20.709 20.679 20.446 19.875 18.841 16.736 14.027 11.816 9.957 8.376 6.951 5.708 4.579 3.618 2.679 1.886 1.191 0.517 -0.122 -0.687 -1.173 -1.678 -2.134 -2.514 -2.897 -3.316 -3.706 -4.109 -4.498 -4.796 -5.099 -5.408 -5.725 -6.046 -6.267 -6.509 -6.891 -7.146 -7.402 -7.528 -7.81 -8.14 -8.484 -8.651 -8.995 -9.142 -9.322 -9.521 -9.963 -10.235 -10.523 -10.822 -11.183 -11.656 -12.278 -15.219 -3 ,32236 ,KEBNE ,17027119,Wed Dec 22 16:05:52 CET,Wed Dec 22 17:40:43 CET,0.0 10.936 12.244 13.138 13.79 14.346 14.853 15.292 16.013 16.325 16.61 16.955 17.324 17.532 17.952 18.337 18.661 18.82 19.143 19.458 19.877 20.129 20.378 20.72 21.025 21.305 21.577 21.837 22.166 22.467 22.721 22.995 23.26 23.522 23.802 24.087 24.368 24.662 24.943 25.172 25.38 25.618 25.855 26.084 26.315 26.495 26.583 26.473 25.983 24.895 22.772 20.154 18.092 16.344 14.844 13.497 12.305 11.23 10.352 9.485 8.713 8.032 7.395 6.79 6.226 5.73 5.223 4.776 4.399 4.003 3.596 3.259 2.901 2.516 2.229 1.932 1.61 1.278 0.957 0.749 0.539 0.225 -0.006 -0.276 -0.428 -0.743 -1.065 -1.421 -1.605 -1.971 -2.199 -2.42 -2.648 -3.117 -3.371 -3.649 -3.97 -4.332 -4.783 -5.389 -7.601 -5 ,10164 ,KEBNE ,17027121,Wed Dec 22 16:05:56 CET,Wed Dec 22 17:35:48 CET,0.0 10.419 11.875 12.849 13.545 14.088 14.548 14.991 15.74 16.075 16.391 16.804 17.219 17.452 17.879 18.29 18.663 18.821 19.12 19.411 19.814 20.058 20.277 20.565 20.834 21.113 21.38 21.622 21.949 22.267 22.559 22.89 23.168 23.405 23.679 23.985 24.264 24.549 24.838 25.091 25.297 25.502 25.728 25.885 25.975 26.042 26.004 25.737 25.117 23.996 22.02 19.511 17.427 15.584 13.898 12.404 11.148 10.107 9.241 8.355 7.623 6.984 6.375 5.818 5.294 4.799 4.277 3.836 3.471 3.087 2.672 2.33 1.966 1.566 1.257 0.925 0.596 0.266 -0.1 -0.352 -0.61 -1.009 -1.285 -1.569 -1.711 -1.993 -2.304 -2.647 -2.821 -3.166 -3.355 -3.555 -3.782 -4.307 -4.581 -4.882 -5.23 -5.586 -5.949 -6.51 -8.743 -8 ,27780 ,KEBNE ,17027124,Wed Dec 22 16:06:54 CET,Wed Dec 22 17:41:04 CET,0.0 6.459 7.807 8.744 9.425 9.945 10.424 10.908 11.714 12.04 12.344 12.77 13.176 13.394 13.803 14.179 14.527 14.701 15.026 15.32 15.734 15.987 16.22 16.548 16.878 17.197 17.471 17.713 18.018 18.285 18.54 18.836 19.095 19.352 19.648 19.929 20.167 20.403 20.608 20.846 21.087 21.29 21.51 21.702 21.858 21.98 21.948 21.73 21.238 20.218 18.069 15.297 13.116 11.266 9.705 8.332 7.108 6.007 5.06 4.144 3.423 2.822 2.26 1.708 1.167 0.702 0.227 -0.204 -0.557 -0.948 -1.374 -1.714 -2.051 -2.411 -2.699 -2.997 -3.318 -3.658 -4.008 -4.248 -4.494 -4.879 -5.149 -5.414 -5.561 -5.882 -6.207 -6.558 -6.736 -7.092 -7.31 -7.526 -7.757 -8.226 -8.465 -8.743 -9.074 -9.448 -9.888 -10.529 -13.094 -10 ,15916 ,KEBNE ,17027126,Wed Dec 22 16:06:54 CET,Wed Dec 22 17:40:48 CET,0.0 12.385 13.482 14.175 14.73 15.183 15.581 15.941 16.642 16.963 17.23 17.582 17.958 18.162 18.541 18.911 19.257 19.405 19.704 20.007 20.368 20.599 20.848 21.186 21.506 21.798 22.076 22.344 22.646 22.902 23.15 23.488 23.79 24.041 24.319 24.606 24.853 25.094 25.334 25.58 25.804 26.015 26.239 26.436 26.528 26.472 26.362 26.122 25.598 24.605 22.659 20.173 18.024 16.197 14.667 13.287 12.096 11.031 10.131 9.243 8.487 7.802 7.171 6.615 6.097 5.603 5.055 4.555 4.115 3.691 3.291 2.944 2.568 2.176 1.87 1.542 1.192 0.838 0.494 0.258 0.014 -0.378 -0.658 -0.946 -1.095 -1.379 -1.704 -2.043 -2.205 -2.562 -2.745 -2.946 -3.167 -3.658 -3.951 -4.265 -4.614 -5.017 -5.474 -6.056 -8.673 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_41.txt deleted file mode 100644 index c14af337..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_41.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23447 ,TETRA ,17601015,Sun Nov 28 14:30:38 CET,Sun Nov 28 16:19:05 CET,0.0 5.598 6.772 7.563 8.147 8.633 9.075 9.458 10.101 10.406 10.678 10.961 11.301 11.478 11.814 12.117 12.402 12.536 12.787 13.037 13.361 13.554 13.753 14.048 14.327 14.581 14.805 15.019 15.306 15.576 15.813 16.103 16.389 16.619 16.856 17.137 17.408 17.683 17.951 18.219 18.489 18.783 19.086 19.346 19.615 19.88 20.09 20.204 20.19 19.875 18.957 17.457 16.071 14.887 13.842 12.918 12.132 11.41 10.77 10.114 9.544 9.061 8.615 8.19 7.803 7.436 7.045 6.71 6.424 6.134 5.82 5.545 5.271 4.988 4.763 4.538 4.315 4.078 3.824 3.642 3.461 3.182 2.978 2.761 2.662 2.477 2.289 2.06 1.926 1.625 1.506 1.353 1.172 0.724 0.484 0.231 -0.038 -0.32 -0.67 -1.134 -2.468 -2 ,357 ,TETRA ,17601016,Sun Nov 28 14:30:10 CET,Sun Nov 28 16:21:06 CET,0.0 9.944 11.174 11.918 12.547 13.109 13.56 13.945 14.614 14.912 15.174 15.54 15.945 16.18 16.621 17.031 17.411 17.579 17.875 18.141 18.512 18.752 18.981 19.29 19.584 19.873 20.134 20.39 20.717 21.012 21.297 21.621 21.905 22.177 22.497 22.825 23.13 23.488 23.857 24.23 24.594 24.954 25.337 25.675 25.999 26.326 26.65 26.877 26.936 26.692 25.889 24.531 23.202 22.026 20.992 20.053 19.262 18.534 17.891 17.23 16.628 16.104 15.602 15.125 14.685 14.289 13.869 13.487 13.161 12.825 12.469 12.173 11.867 11.547 11.301 11.043 10.763 10.47 10.183 9.998 9.811 9.512 9.293 9.052 8.927 8.66 8.393 8.123 7.984 7.658 7.481 7.316 7.144 6.794 6.602 6.394 6.181 5.923 5.603 5.174 3.798 -3 ,31640 ,TETRA ,17601017,Sun Nov 28 14:30:12 CET,Sun Nov 28 16:21:07 CET,0.0 7.878 8.84 9.545 10.061 10.469 10.849 11.173 11.736 12.012 12.267 12.58 12.934 13.139 13.549 13.885 14.189 14.33 14.591 14.853 15.24 15.474 15.687 15.987 16.263 16.514 16.741 16.956 17.243 17.511 17.776 18.108 18.384 18.618 18.873 19.166 19.443 19.723 20.013 20.313 20.615 20.926 21.253 21.521 21.78 22.069 22.313 22.449 22.427 22.143 21.264 19.869 18.654 17.565 16.572 15.693 14.947 14.248 13.629 13.02 12.478 11.982 11.487 11.036 10.617 10.22 9.806 9.445 9.135 8.811 8.486 8.205 7.906 7.596 7.35 7.102 6.86 6.606 6.338 6.161 5.97 5.654 5.412 5.138 5.003 4.729 4.435 4.126 3.956 3.619 3.421 3.222 3.016 2.573 2.345 2.093 1.814 1.471 1.044 0.557 -1.04 -4 ,469 ,TETRA ,17601018,Sun Nov 28 14:30:14 CET,Sun Nov 28 16:19:19 CET,0.0 4.605 5.785 6.498 7.002 7.45 7.849 8.186 8.823 9.124 9.383 9.681 10.038 10.213 10.515 10.821 11.122 11.253 11.512 11.773 12.12 12.332 12.532 12.824 13.111 13.361 13.608 13.859 14.164 14.438 14.675 14.935 15.219 15.515 15.835 16.192 16.514 16.841 17.174 17.478 17.768 18.08 18.408 18.693 18.972 19.238 19.487 19.607 19.555 19.298 18.408 16.976 15.738 14.689 13.736 12.85 12.105 11.428 10.843 10.267 9.794 9.344 8.881 8.462 8.078 7.743 7.384 7.018 6.685 6.349 6.007 5.719 5.427 5.136 4.901 4.636 4.364 4.079 3.787 3.607 3.412 3.101 2.899 2.682 2.567 2.33 2.071 1.808 1.672 1.365 1.232 1.058 0.844 0.421 0.234 -0.018 -0.335 -0.669 -1.047 -1.507 -2.982 -6 ,7104 ,TETRA ,17601020,Sun Nov 28 14:30:11 CET,Sun Nov 28 16:19:21 CET,0.0 7.744 9.027 9.912 10.558 11.063 11.508 11.872 12.482 12.768 13.04 13.373 13.729 13.919 14.311 14.675 15.021 15.185 15.48 15.745 16.128 16.393 16.653 17.026 17.341 17.637 17.915 18.15 18.443 18.697 18.929 19.193 19.432 19.66 19.915 20.201 20.476 20.769 21.063 21.34 21.619 21.951 22.331 22.689 23.034 23.336 23.584 23.74 23.788 23.558 22.698 21.276 19.963 18.812 17.821 16.899 16.058 15.29 14.654 14.04 13.504 13.03 12.579 12.149 11.745 11.38 11.001 10.655 10.364 10.069 9.765 9.516 9.232 8.917 8.68 8.427 8.16 7.891 7.619 7.423 7.221 6.93 6.723 6.501 6.391 6.171 5.93 5.671 5.524 5.196 5.039 4.871 4.696 4.283 4.047 3.807 3.546 3.225 2.855 2.386 0.434 -7 ,27978 ,TETRA ,17601021,Sun Nov 28 14:30:14 CET,Sun Nov 28 16:19:16 CET,0.0 10.991 12.153 12.974 13.615 14.121 14.583 14.98 15.635 15.93 16.205 16.572 16.955 17.166 17.566 17.932 18.281 18.45 18.765 19.054 19.458 19.705 19.941 20.278 20.587 20.894 21.215 21.522 21.871 22.181 22.463 22.789 23.126 23.453 23.823 24.215 24.542 24.874 25.218 25.554 25.893 26.274 26.686 27.027 27.384 27.724 28.009 28.255 28.369 28.086 27.138 25.791 24.455 23.221 22.15 21.127 20.205 19.359 18.657 17.992 17.422 16.897 16.394 15.932 15.537 15.209 14.858 14.54 14.257 13.976 13.694 13.447 13.2 12.948 12.737 12.51 12.255 12.016 11.8 11.648 11.481 11.215 11.05 10.878 10.781 10.582 10.376 10.127 9.988 9.689 9.526 9.348 9.173 8.781 8.574 8.345 8.102 7.82 7.444 6.947 5.189 -8 ,22750 ,TETRA ,17601022,Sun Nov 28 14:30:16 CET,Sun Nov 28 16:19:31 CET,0.0 6.197 7.318 8.043 8.554 9.002 9.385 9.727 10.389 10.684 10.927 11.21 11.574 11.784 12.199 12.577 12.891 13.044 13.361 13.635 14.009 14.248 14.471 14.78 15.086 15.36 15.614 15.871 16.189 16.486 16.744 17.028 17.307 17.558 17.841 18.155 18.441 18.744 19.054 19.346 19.627 19.91 20.182 20.428 20.695 21.028 21.302 21.349 21.257 20.922 20.036 18.605 17.275 16.14 15.122 14.192 13.374 12.627 11.993 11.331 10.756 10.259 9.793 9.362 8.949 8.566 8.168 7.813 7.516 7.215 6.907 6.658 6.396 6.122 5.902 5.67 5.431 5.185 4.929 4.756 4.589 4.342 4.163 3.968 3.87 3.674 3.468 3.227 3.104 2.817 2.722 2.572 2.42 2.125 1.964 1.781 1.573 1.314 0.94 0.38 -1.761 -9 ,12280 ,TETRA ,17601023,Sun Nov 28 14:30:12 CET,Sun Nov 28 16:19:17 CET,0.0 7.365 8.479 9.213 9.766 10.186 10.56 10.877 11.418 11.679 11.919 12.204 12.57 12.77 13.174 13.566 13.912 14.072 14.385 14.666 15.048 15.299 15.533 15.861 16.165 16.423 16.655 16.877 17.143 17.39 17.628 17.921 18.206 18.473 18.78 19.125 19.449 19.767 20.049 20.31 20.572 20.862 21.206 21.532 21.885 22.224 22.534 22.782 22.888 22.698 21.775 20.259 18.833 17.58 16.553 15.64 14.849 14.153 13.563 12.958 12.443 12.006 11.565 11.135 10.749 10.398 10.042 9.737 9.474 9.188 8.892 8.64 8.367 8.095 7.888 7.673 7.443 7.205 6.966 6.8 6.616 6.324 6.135 5.947 5.85 5.639 5.407 5.154 5.019 4.721 4.613 4.457 4.295 3.982 3.804 3.614 3.406 3.148 2.823 2.299 -0.329 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_42.txt deleted file mode 100644 index dd426db3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3288 ,TETRA ,17601025,Sun Nov 28 14:30:14 CET,Sun Nov 28 16:19:16 CET,0.0 4.877 5.565 6.029 6.385 6.654 6.904 7.152 7.565 7.738 7.907 8.062 8.363 8.525 8.831 9.109 9.367 9.486 9.716 9.926 10.228 10.43 10.624 10.881 11.121 11.36 11.586 11.812 12.113 12.395 12.656 12.955 13.23 13.497 13.81 14.155 14.472 14.79 15.115 15.475 15.841 16.261 16.744 17.191 17.689 18.216 18.786 19.367 19.977 20.56 21.095 21.276 21.058 20.712 20.33 19.937 19.582 19.268 18.99 18.673 18.4 18.129 17.846 17.575 17.277 16.999 16.7 16.411 16.173 15.932 15.674 15.467 15.259 15.026 14.841 14.661 14.486 14.297 14.079 13.926 13.78 13.568 13.406 13.224 13.126 12.933 12.729 12.475 12.327 12.029 11.882 11.732 11.574 11.224 11.015 10.773 10.521 10.24 9.904 9.464 7.602 -2 ,22776 ,TETRA ,17601026,Sun Nov 28 14:30:16 CET,Sun Nov 28 16:19:13 CET,0.0 4.14 4.848 5.205 5.487 5.77 6.044 6.296 6.715 6.896 7.072 7.23 7.523 7.668 7.955 8.199 8.426 8.539 8.746 8.965 9.272 9.462 9.647 9.9 10.129 10.355 10.589 10.796 11.05 11.29 11.52 11.809 12.092 12.349 12.631 12.954 13.256 13.581 13.933 14.302 14.663 15.069 15.569 16.051 16.587 17.129 17.677 18.265 18.896 19.576 20.126 20.204 20.025 19.715 19.346 18.974 18.656 18.347 18.022 17.698 17.413 17.134 16.871 16.626 16.379 16.138 15.891 15.665 15.46 15.245 15.031 14.853 14.651 14.429 14.269 14.111 13.938 13.762 13.58 13.451 13.318 13.1 12.945 12.768 12.661 12.451 12.244 12.018 11.901 11.631 11.474 11.308 11.151 10.769 10.56 10.344 10.09 9.808 9.45 8.945 6.956 -3 ,12024 ,TETRA ,17601027,Sun Nov 28 14:30:40 CET,Sun Nov 28 16:18:22 CET,0.0 3.994 4.626 5.079 5.436 5.735 5.993 6.195 6.579 6.787 6.978 7.137 7.421 7.548 7.808 8.059 8.292 8.405 8.617 8.806 9.087 9.27 9.442 9.684 9.911 10.131 10.351 10.57 10.844 11.102 11.344 11.634 11.915 12.172 12.465 12.804 13.146 13.513 13.863 14.217 14.593 15.001 15.432 15.867 16.393 16.915 17.464 18.042 18.676 19.305 19.813 19.905 19.755 19.501 19.186 18.844 18.487 18.122 17.801 17.492 17.203 16.931 16.651 16.394 16.172 15.949 15.703 15.491 15.31 15.111 14.9 14.72 14.521 14.322 14.168 13.997 13.825 13.628 13.425 13.293 13.149 12.929 12.777 12.607 12.517 12.338 12.161 11.97 11.861 11.592 11.482 11.344 11.2 10.883 10.726 10.576 10.387 10.175 9.863 9.352 7.347 -4 ,29401 ,TETRA ,17601028,Sun Nov 28 14:30:42 CET,Sun Nov 28 16:18:59 CET,0.0 8.379 9.263 9.83 10.257 10.623 10.957 11.219 11.674 11.909 12.125 12.385 12.736 12.909 13.207 13.479 13.732 13.851 14.075 14.298 14.629 14.831 15.022 15.315 15.616 15.881 16.12 16.364 16.68 16.97 17.248 17.588 17.903 18.195 18.524 18.87 19.18 19.521 19.888 20.229 20.555 20.936 21.363 21.807 22.318 22.874 23.478 24.108 24.793 25.405 25.916 26.021 25.831 25.56 25.249 24.904 24.541 24.143 23.775 23.437 23.161 22.91 22.657 22.413 22.183 21.956 21.699 21.473 21.286 21.081 20.853 20.666 20.472 20.227 20.018 19.815 19.619 19.397 19.157 19.007 18.851 18.594 18.426 18.268 18.191 18.026 17.838 17.626 17.514 17.242 17.122 16.98 16.826 16.437 16.213 15.95 15.636 15.309 14.974 14.536 12.629 -5 ,16237 ,TETRA ,17601029,Sun Nov 28 14:30:43 CET,Sun Nov 28 16:18:33 CET,0.0 3.413 3.989 4.387 4.757 5.075 5.341 5.577 5.974 6.163 6.333 6.497 6.8 6.945 7.236 7.497 7.738 7.854 8.076 8.271 8.558 8.743 8.899 9.138 9.396 9.644 9.873 10.105 10.391 10.646 10.896 11.19 11.472 11.748 12.07 12.435 12.769 13.113 13.485 13.866 14.258 14.684 15.165 15.634 16.135 16.728 17.366 17.989 18.656 19.281 19.807 19.91 19.678 19.349 19.02 18.684 18.356 18.026 17.738 17.436 17.143 16.862 16.573 16.294 16.032 15.783 15.543 15.336 15.157 14.969 14.766 14.593 14.41 14.21 14.05 13.885 13.712 13.525 13.309 13.156 13.011 12.782 12.618 12.443 12.35 12.157 11.953 11.734 11.623 11.372 11.306 11.189 11.063 10.748 10.552 10.356 10.144 9.798 9.405 8.929 6.75 -6 ,11880 ,TETRA ,17601030,Sun Nov 28 14:30:38 CET,Sun Nov 28 16:19:09 CET,0.0 3.897 4.662 5.234 5.697 6.075 6.414 6.677 7.048 7.205 7.373 7.544 7.844 7.99 8.259 8.505 8.729 8.838 9.064 9.26 9.519 9.69 9.853 10.088 10.323 10.562 10.789 10.991 11.248 11.505 11.748 12.043 12.318 12.573 12.861 13.176 13.478 13.814 14.175 14.534 14.888 15.286 15.745 16.17 16.654 17.213 17.817 18.413 19.059 19.714 20.237 20.331 20.125 19.808 19.491 19.164 18.846 18.529 18.213 17.868 17.551 17.262 16.994 16.723 16.458 16.212 15.957 15.733 15.52 15.301 15.086 14.912 14.726 14.513 14.339 14.156 13.961 13.754 13.54 13.388 13.22 12.945 12.764 12.568 12.472 12.283 12.073 11.861 11.75 11.473 11.354 11.222 11.074 10.731 10.554 10.349 10.079 9.731 9.345 8.87 6.917 -7 ,18625 ,TETRA ,17601031,Sun Nov 28 14:30:38 CET,Sun Nov 28 16:19:09 CET,0.0 4.565 5.208 5.713 6.08 6.367 6.625 6.837 7.242 7.428 7.589 7.75 8.057 8.213 8.506 8.771 9.019 9.147 9.384 9.602 9.919 10.111 10.291 10.545 10.789 11.025 11.238 11.438 11.7 11.959 12.201 12.484 12.765 13.036 13.323 13.654 13.975 14.304 14.652 15.026 15.432 15.846 16.293 16.749 17.255 17.781 18.38 18.97 19.56 20.143 20.604 20.705 20.526 20.229 19.85 19.458 19.089 18.741 18.408 18.046 17.725 17.44 17.156 16.868 16.584 16.314 16.028 15.75 15.502 15.257 14.986 14.744 14.492 14.255 14.081 13.88 13.667 13.445 13.201 13.027 12.841 12.537 12.335 12.136 12.027 11.804 11.589 11.354 11.212 10.906 10.717 10.539 10.354 9.948 9.723 9.493 9.237 8.965 8.6 8.145 5.877 -8 ,11169 ,TETRA ,17601032,Sun Nov 28 14:30:40 CET,Sun Nov 28 16:20:50 CET,0.0 2.882 3.635 4.167 4.526 4.797 5.038 5.265 5.692 5.889 6.07 6.266 6.578 6.733 7.047 7.319 7.537 7.644 7.865 8.068 8.361 8.564 8.758 9.026 9.279 9.527 9.766 9.982 10.269 10.544 10.799 11.102 11.377 11.636 11.935 12.265 12.56 12.865 13.182 13.523 13.896 14.335 14.826 15.278 15.785 16.35 16.967 17.552 18.185 18.871 19.385 19.49 19.352 19.112 18.805 18.437 18.08 17.74 17.436 17.127 16.865 16.629 16.372 16.101 15.846 15.611 15.331 15.078 14.888 14.683 14.451 14.26 14.048 13.811 13.614 13.405 13.196 12.987 12.744 12.568 12.404 12.14 11.953 11.76 11.655 11.439 11.202 10.95 10.823 10.545 10.429 10.275 10.111 9.73 9.504 9.257 8.988 8.682 8.289 7.775 5.926 -9 ,23415 ,TETRA ,17601033,Sun Nov 28 14:30:43 CET,Sun Nov 28 16:20:08 CET,0.0 3.572 4.232 4.667 5.047 5.362 5.627 5.852 6.239 6.433 6.613 6.802 7.13 7.295 7.579 7.818 8.038 8.151 8.371 8.587 8.902 9.089 9.269 9.527 9.773 9.996 10.194 10.39 10.641 10.884 11.128 11.421 11.7 11.966 12.263 12.592 12.892 13.216 13.556 13.894 14.258 14.654 15.095 15.536 16.015 16.527 17.088 17.67 18.312 18.939 19.407 19.519 19.374 19.116 18.811 18.467 18.126 17.789 17.471 17.144 16.857 16.581 16.312 16.065 15.83 15.607 15.365 15.138 14.947 14.748 14.537 14.353 14.161 13.962 13.804 13.64 13.472 13.3 13.115 12.977 12.819 12.576 12.424 12.272 12.188 12.007 11.823 11.601 11.47 11.2 11.113 10.989 10.859 10.537 10.361 10.175 9.912 9.609 9.296 8.74 5.94 -10 ,22893 ,TETRA ,17601034,Sun Nov 28 14:30:38 CET,Sun Nov 28 16:18:31 CET,0.0 2.662 3.281 3.693 3.991 4.267 4.518 4.724 5.093 5.269 5.437 5.598 5.908 6.068 6.343 6.589 6.82 6.926 7.129 7.329 7.622 7.815 8.004 8.28 8.536 8.765 8.98 9.188 9.447 9.684 9.921 10.219 10.496 10.757 11.049 11.349 11.653 11.997 12.347 12.706 13.078 13.482 13.938 14.398 14.913 15.446 16.03 16.633 17.26 17.89 18.405 18.507 18.358 18.121 17.839 17.514 17.175 16.838 16.533 16.222 15.933 15.65 15.367 15.116 14.88 14.66 14.432 14.222 14.036 13.846 13.646 13.474 13.296 13.094 12.94 12.776 12.605 12.427 12.225 12.084 11.938 11.716 11.556 11.384 11.284 11.079 10.902 10.709 10.611 10.365 10.29 10.144 9.996 9.705 9.525 9.32 9.11 8.862 8.539 8.084 6.103 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_43.txt deleted file mode 100644 index 1741de33..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30685 ,TETRA ,17601035,Sun Nov 28 14:30:39 CET,Sun Nov 28 16:21:13 CET,0.0 2.005 2.615 2.956 3.224 3.451 3.649 3.846 4.216 4.385 4.548 4.696 4.982 5.106 5.35 5.575 5.766 5.858 6.048 6.236 6.493 6.656 6.824 7.049 7.258 7.47 7.661 7.837 8.073 8.268 8.463 8.722 8.947 9.148 9.384 9.657 9.903 10.152 10.417 10.683 10.937 11.201 11.5 11.782 12.091 12.378 12.637 12.875 13.029 13.008 12.577 11.775 10.929 10.114 9.405 8.775 8.219 7.699 7.235 6.756 6.337 5.949 5.57 5.229 4.903 4.609 4.307 4.032 3.797 3.541 3.27 3.045 2.81 2.579 2.405 2.231 2.052 1.866 1.665 1.523 1.366 1.116 0.959 0.796 0.716 0.543 0.35 0.172 0.069 -0.202 -0.255 -0.377 -0.5 -0.793 -0.968 -1.153 -1.354 -1.574 -1.856 -2.247 -3.067 -2 ,19915 ,TETRA ,17601036,Sun Nov 28 14:30:42 CET,Sun Nov 28 16:21:14 CET,0.0 2.34 2.825 3.206 3.542 3.829 4.048 4.23 4.552 4.693 4.83 4.939 5.214 5.343 5.559 5.741 5.927 6.018 6.196 6.355 6.573 6.705 6.825 7.006 7.178 7.337 7.498 7.66 7.866 8.051 8.222 8.428 8.629 8.813 9.014 9.247 9.45 9.652 9.889 10.13 10.357 10.601 10.865 11.104 11.369 11.636 11.864 12.062 12.206 12.168 11.79 11.05 10.258 9.485 8.81 8.206 7.653 7.156 6.719 6.271 5.881 5.529 5.203 4.906 4.634 4.381 4.111 3.864 3.642 3.398 3.155 2.961 2.755 2.546 2.382 2.219 2.054 1.876 1.693 1.57 1.441 1.247 1.108 0.946 0.862 0.695 0.512 0.312 0.214 -0.044 -0.11 -0.238 -0.37 -0.706 -0.912 -1.133 -1.326 -1.562 -1.9 -2.347 -3.73 -3 ,27500 ,TETRA ,17601037,Sun Nov 28 14:30:43 CET,Sun Nov 28 16:20:26 CET,0.0 1.365 1.879 2.281 2.613 2.879 3.087 3.261 3.587 3.739 3.877 3.984 4.262 4.384 4.612 4.824 5.017 5.108 5.289 5.469 5.723 5.868 5.997 6.186 6.378 6.562 6.738 6.91 7.117 7.3 7.475 7.685 7.881 8.076 8.298 8.527 8.739 8.974 9.218 9.453 9.681 9.943 10.241 10.504 10.759 10.991 11.21 11.4 11.526 11.447 10.974 10.117 9.243 8.441 7.717 7.081 6.515 5.945 5.452 4.996 4.599 4.233 3.879 3.537 3.214 2.923 2.625 2.356 2.126 1.894 1.645 1.446 1.245 1.033 0.868 0.698 0.518 0.32 0.117 -0.018 -0.159 -0.394 -0.55 -0.709 -0.799 -0.985 -1.167 -1.351 -1.451 -1.715 -1.787 -1.919 -2.049 -2.321 -2.471 -2.624 -2.792 -3.006 -3.258 -3.57 -4.632 -4 ,9097 ,TETRA ,17601038,Sun Nov 28 14:30:41 CET,Sun Nov 28 16:20:25 CET,0.0 2.321 2.955 3.387 3.717 3.986 4.225 4.461 4.885 5.059 5.221 5.34 5.618 5.751 5.981 6.19 6.392 6.488 6.675 6.852 7.115 7.283 7.432 7.633 7.825 8.012 8.196 8.383 8.626 8.836 9.019 9.225 9.417 9.606 9.821 10.062 10.288 10.507 10.726 10.956 11.171 11.412 11.69 11.947 12.219 12.466 12.705 12.89 12.993 12.933 12.525 11.774 10.983 10.237 9.568 8.943 8.366 7.846 7.379 6.892 6.486 6.107 5.752 5.433 5.128 4.851 4.56 4.302 4.074 3.834 3.599 3.397 3.164 2.914 2.73 2.556 2.372 2.187 1.998 1.858 1.71 1.472 1.3 1.134 1.048 0.865 0.681 0.481 0.375 0.108 0.051 -0.073 -0.2 -0.47 -0.632 -0.8 -0.975 -1.187 -1.422 -1.718 -2.807 -5 ,12089 ,TETRA ,17601039,Sun Nov 28 14:30:41 CET,Sun Nov 28 16:20:00 CET,0.0 1.731 2.286 2.678 2.986 3.241 3.486 3.728 4.094 4.236 4.373 4.502 4.781 4.904 5.155 5.375 5.578 5.674 5.849 6.01 6.243 6.391 6.535 6.746 6.932 7.099 7.264 7.434 7.651 7.856 8.049 8.257 8.464 8.655 8.868 9.108 9.324 9.547 9.779 10.022 10.266 10.503 10.766 11.035 11.313 11.571 11.833 12.079 12.2 12.096 11.617 10.771 9.933 9.202 8.542 7.891 7.328 6.842 6.419 5.975 5.579 5.238 4.91 4.599 4.311 4.05 3.768 3.506 3.28 3.046 2.809 2.617 2.411 2.191 2.01 1.822 1.636 1.437 1.239 1.102 0.948 0.718 0.559 0.387 0.292 0.078 -0.146 -0.384 -0.504 -0.793 -0.89 -1.023 -1.165 -1.506 -1.698 -1.881 -2.083 -2.323 -2.574 -2.905 -3.997 -6 ,19488 ,TETRA ,17601040,Sun Nov 28 14:30:42 CET,Sun Nov 28 16:20:00 CET,0.0 1.886 2.41 2.824 3.153 3.413 3.652 3.882 4.248 4.406 4.571 4.731 5.034 5.164 5.396 5.609 5.817 5.91 6.081 6.253 6.486 6.626 6.761 6.963 7.158 7.332 7.507 7.671 7.853 8.025 8.208 8.443 8.66 8.854 9.081 9.318 9.528 9.749 9.988 10.224 10.445 10.688 10.971 11.249 11.512 11.752 11.995 12.186 12.271 12.222 11.817 10.971 10.127 9.375 8.668 8.001 7.43 6.887 6.423 5.97 5.562 5.176 4.798 4.455 4.141 3.865 3.584 3.322 3.1 2.867 2.624 2.427 2.224 2.005 1.828 1.651 1.467 1.278 1.087 0.945 0.794 0.551 0.389 0.22 0.129 -0.055 -0.268 -0.5 -0.619 -0.904 -0.979 -1.091 -1.209 -1.455 -1.598 -1.771 -1.951 -2.164 -2.421 -2.802 -3.926 -7 ,4812 ,TETRA ,17601041,Sun Nov 28 14:30:44 CET,Sun Nov 28 16:20:10 CET,0.0 3.464 3.965 4.334 4.643 4.903 5.14 5.362 5.739 5.887 6.03 6.138 6.402 6.52 6.736 6.937 7.154 7.257 7.438 7.601 7.83 7.965 8.095 8.305 8.505 8.706 8.893 9.044 9.227 9.432 9.639 9.867 10.078 10.266 10.47 10.7 10.906 11.135 11.389 11.663 11.939 12.221 12.537 12.808 13.075 13.352 13.592 13.768 13.887 13.868 13.468 12.621 11.773 11.013 10.336 9.703 9.125 8.588 8.133 7.675 7.267 6.9 6.551 6.222 5.917 5.64 5.36 5.108 4.884 4.636 4.376 4.186 3.986 3.764 3.596 3.413 3.21 3.009 2.808 2.67 2.528 2.301 2.14 1.976 1.9 1.742 1.549 1.332 1.227 0.966 0.921 0.799 0.676 0.407 0.27 0.111 -0.088 -0.293 -0.497 -0.758 -1.873 -8 ,14748 ,TETRA ,17601042,Sun Nov 28 14:30:45 CET,Sun Nov 28 16:19:55 CET,0.0 1.675 2.199 2.626 2.965 3.23 3.472 3.691 4.056 4.217 4.364 4.462 4.734 4.862 5.101 5.313 5.508 5.604 5.786 5.959 6.21 6.357 6.493 6.695 6.899 7.084 7.242 7.393 7.591 7.778 7.97 8.202 8.398 8.578 8.787 9.028 9.253 9.488 9.729 9.975 10.218 10.475 10.75 11.008 11.29 11.553 11.779 11.992 12.133 12.064 11.602 10.797 10.031 9.288 8.574 7.911 7.348 6.825 6.37 5.916 5.53 5.172 4.805 4.459 4.145 3.867 3.573 3.307 3.068 2.828 2.583 2.371 2.158 1.929 1.756 1.583 1.394 1.204 1.017 0.89 0.753 0.526 0.368 0.209 0.128 -0.053 -0.256 -0.462 -0.567 -0.835 -0.896 -1.021 -1.151 -1.456 -1.622 -1.79 -1.978 -2.176 -2.423 -2.783 -3.645 -9 ,14383 ,TETRA ,17601043,Sun Nov 28 14:30:41 CET,Sun Nov 28 16:19:13 CET,0.0 2.4 2.989 3.374 3.656 3.938 4.219 4.449 4.803 4.974 5.142 5.253 5.517 5.635 5.871 6.096 6.287 6.373 6.542 6.712 6.951 7.104 7.253 7.476 7.687 7.882 8.071 8.239 8.432 8.637 8.84 9.059 9.262 9.445 9.645 9.868 10.087 10.325 10.586 10.825 11.043 11.279 11.538 11.799 12.098 12.399 12.677 12.899 13.028 12.934 12.464 11.628 10.825 10.107 9.45 8.803 8.249 7.752 7.296 6.855 6.465 6.107 5.771 5.453 5.16 4.9 4.62 4.357 4.13 3.893 3.646 3.439 3.226 3.002 2.821 2.643 2.461 2.267 2.066 1.929 1.784 1.539 1.374 1.215 1.133 0.949 0.771 0.59 0.485 0.214 0.159 0.046 -0.07 -0.307 -0.446 -0.62 -0.825 -1.056 -1.331 -1.7 -2.469 -10 ,6493 ,TETRA ,17601044,Sun Nov 28 14:30:41 CET,Sun Nov 28 16:19:05 CET,0.0 2.278 2.857 3.308 3.647 3.924 4.17 4.395 4.797 4.969 5.136 5.325 5.622 5.752 6.009 6.262 6.519 6.646 6.872 7.065 7.322 7.477 7.622 7.844 8.032 8.219 8.431 8.622 8.851 9.076 9.31 9.573 9.79 10.008 10.277 10.612 10.948 11.266 11.567 11.85 12.109 12.368 12.64 12.897 13.148 13.379 13.589 13.802 13.967 13.964 13.604 12.84 12.012 11.239 10.548 9.917 9.361 8.864 8.435 7.978 7.573 7.213 6.862 6.534 6.228 5.955 5.678 5.42 5.186 4.941 4.688 4.488 4.291 4.079 3.914 3.749 3.568 3.379 3.19 3.058 2.929 2.722 2.566 2.407 2.328 2.159 1.962 1.756 1.645 1.366 1.295 1.182 1.067 0.782 0.603 0.423 0.238 0.017 -0.218 -0.535 -1.997 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_46.txt deleted file mode 100644 index b7b47c90..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15840 ,TETRA ,17601045,Sun Nov 28 14:30:41 CET,Sun Nov 28 16:19:28 CET,0.0 1.999 2.553 2.949 3.276 3.533 3.755 3.956 4.31 4.464 4.603 4.71 4.975 5.085 5.298 5.482 5.665 5.756 5.932 6.088 6.308 6.456 6.59 6.77 6.943 7.101 7.253 7.412 7.598 7.768 7.922 8.079 8.231 8.391 8.59 8.815 8.995 9.161 9.324 9.488 9.648 9.805 9.953 10.102 10.267 10.38 10.439 10.415 10.248 9.856 8.955 7.628 6.498 5.532 4.679 3.855 3.121 2.526 2.036 1.536 1.104 0.718 0.365 0.035 -0.287 -0.582 -0.877 -1.146 -1.381 -1.618 -1.871 -2.07 -2.278 -2.506 -2.685 -2.877 -3.087 -3.309 -3.53 -3.68 -3.837 -4.075 -4.242 -4.433 -4.529 -4.702 -4.877 -5.058 -5.154 -5.419 -5.47 -5.595 -5.72 -6.01 -6.177 -6.353 -6.581 -6.845 -7.166 -7.603 -8.443 -2 ,3095 ,TETRA ,17601046,Sun Nov 28 14:30:42 CET,Sun Nov 28 16:19:56 CET,0.0 1.901 2.442 2.837 3.121 3.361 3.582 3.801 4.245 4.434 4.6 4.753 5.038 5.162 5.401 5.597 5.779 5.863 6.018 6.172 6.385 6.514 6.653 6.849 7.025 7.192 7.33 7.476 7.671 7.846 8.012 8.185 8.33 8.476 8.659 8.873 9.041 9.208 9.397 9.566 9.727 9.903 10.095 10.262 10.406 10.524 10.606 10.593 10.438 10.018 9.071 7.762 6.627 5.626 4.784 4.05 3.381 2.773 2.273 1.774 1.339 0.947 0.573 0.219 -0.1 -0.387 -0.689 -0.962 -1.203 -1.459 -1.738 -1.964 -2.179 -2.408 -2.593 -2.774 -2.963 -3.16 -3.358 -3.501 -3.658 -3.911 -4.075 -4.236 -4.317 -4.501 -4.705 -4.918 -5.032 -5.319 -5.413 -5.555 -5.705 -6.034 -6.214 -6.392 -6.601 -6.844 -7.104 -7.449 -8.495 -3 ,27006 ,TETRA ,17601047,Sun Nov 28 14:30:44 CET,Sun Nov 28 16:19:32 CET,0.0 1.576 2.021 2.39 2.673 2.891 3.082 3.259 3.572 3.719 3.852 3.961 4.247 4.369 4.581 4.771 4.949 5.038 5.205 5.355 5.563 5.701 5.836 6.035 6.213 6.363 6.499 6.63 6.807 6.984 7.148 7.332 7.489 7.638 7.83 8.054 8.246 8.425 8.601 8.773 8.937 9.107 9.28 9.432 9.59 9.727 9.804 9.773 9.611 9.209 8.312 7.089 6.0 4.994 4.107 3.349 2.691 2.095 1.58 1.057 0.616 0.221 -0.145 -0.479 -0.806 -1.104 -1.419 -1.695 -1.925 -2.175 -2.429 -2.634 -2.853 -3.081 -3.269 -3.469 -3.666 -3.862 -4.078 -4.228 -4.38 -4.623 -4.787 -4.951 -5.03 -5.188 -5.375 -5.605 -5.72 -5.995 -6.07 -6.187 -6.3 -6.581 -6.766 -6.944 -7.151 -7.423 -7.709 -8.075 -8.867 -4 ,25520 ,TETRA ,17601048,Sun Nov 28 14:30:41 CET,Sun Nov 28 16:19:58 CET,0.0 2.258 2.879 3.258 3.543 3.821 4.051 4.228 4.571 4.739 4.884 4.988 5.264 5.372 5.571 5.771 5.959 6.05 6.221 6.38 6.595 6.731 6.864 7.043 7.215 7.376 7.516 7.641 7.8 7.963 8.117 8.292 8.453 8.605 8.792 8.991 9.179 9.384 9.579 9.76 9.925 10.105 10.293 10.444 10.592 10.701 10.753 10.729 10.542 10.076 9.127 7.848 6.73 5.761 4.93 4.158 3.469 2.835 2.296 1.77 1.31 0.916 0.542 0.177 -0.156 -0.442 -0.735 -0.99 -1.22 -1.463 -1.706 -1.916 -2.143 -2.367 -2.539 -2.732 -2.93 -3.129 -3.335 -3.476 -3.625 -3.876 -4.048 -4.207 -4.292 -4.473 -4.663 -4.892 -5.018 -5.311 -5.436 -5.601 -5.778 -6.166 -6.378 -6.613 -6.862 -7.115 -7.434 -7.929 -9.306 -5 ,15527 ,TETRA ,17601049,Sun Nov 28 14:30:43 CET,Sun Nov 28 16:19:47 CET,0.0 2.117 2.638 3.008 3.356 3.633 3.833 4.013 4.344 4.489 4.625 4.726 5.0 5.126 5.366 5.561 5.738 5.834 6.018 6.181 6.408 6.535 6.657 6.853 7.036 7.202 7.368 7.521 7.712 7.892 8.053 8.239 8.418 8.588 8.76 8.949 9.131 9.322 9.525 9.705 9.869 10.05 10.229 10.375 10.498 10.576 10.62 10.583 10.388 9.971 9.095 7.833 6.697 5.69 4.816 4.047 3.373 2.767 2.261 1.753 1.311 0.921 0.563 0.217 -0.105 -0.389 -0.695 -0.976 -1.216 -1.48 -1.754 -1.964 -2.188 -2.418 -2.594 -2.777 -2.962 -3.155 -3.362 -3.516 -3.673 -3.903 -4.06 -4.225 -4.311 -4.499 -4.707 -4.909 -5.021 -5.305 -5.369 -5.488 -5.62 -5.919 -6.074 -6.231 -6.406 -6.608 -6.87 -7.23 -8.498 -6 ,23847 ,TETRA ,17601050,Sun Nov 28 14:30:45 CET,Sun Nov 28 16:20:16 CET,0.0 1.997 2.627 3.08 3.427 3.697 3.899 4.089 4.449 4.631 4.796 4.919 5.194 5.296 5.507 5.726 5.915 6.002 6.164 6.321 6.552 6.708 6.853 7.057 7.262 7.444 7.603 7.76 7.97 8.163 8.336 8.539 8.72 8.872 9.048 9.239 9.397 9.558 9.712 9.871 10.047 10.224 10.404 10.553 10.685 10.787 10.82 10.765 10.565 10.1 9.159 7.933 6.87 5.918 5.054 4.28 3.604 2.992 2.471 1.98 1.559 1.156 0.775 0.429 0.103 -0.194 -0.499 -0.773 -1.016 -1.275 -1.536 -1.737 -1.949 -2.176 -2.347 -2.537 -2.739 -2.933 -3.138 -3.28 -3.437 -3.671 -3.832 -4.007 -4.094 -4.277 -4.466 -4.66 -4.766 -5.036 -5.091 -5.212 -5.349 -5.672 -5.844 -6.026 -6.233 -6.435 -6.646 -7.015 -7.879 -7 ,14986 ,TETRA ,17601051,Sun Nov 28 14:30:47 CET,Sun Nov 28 16:20:00 CET,0.0 1.77 2.266 2.598 2.881 3.125 3.337 3.541 3.882 4.038 4.194 4.341 4.607 4.716 4.939 5.164 5.387 5.481 5.66 5.824 6.013 6.134 6.268 6.458 6.633 6.801 6.961 7.108 7.293 7.453 7.579 7.729 7.869 7.992 8.154 8.355 8.536 8.713 8.886 9.056 9.207 9.346 9.498 9.63 9.761 9.847 9.887 9.863 9.7 9.282 8.335 7.107 6.055 5.105 4.254 3.482 2.808 2.223 1.712 1.196 0.732 0.317 -0.057 -0.404 -0.723 -1.017 -1.315 -1.582 -1.826 -2.077 -2.335 -2.554 -2.789 -3.042 -3.231 -3.417 -3.614 -3.82 -4.039 -4.191 -4.349 -4.588 -4.744 -4.903 -4.983 -5.146 -5.322 -5.522 -5.623 -5.892 -5.951 -6.071 -6.198 -6.475 -6.639 -6.816 -6.993 -7.186 -7.452 -7.846 -9.051 -8 ,26782 ,TETRA ,17601052,Sun Nov 28 14:30:41 CET,Sun Nov 28 16:20:30 CET,0.0 1.681 2.124 2.484 2.764 2.997 3.223 3.419 3.759 3.914 4.059 4.166 4.438 4.56 4.772 4.949 5.134 5.229 5.404 5.554 5.773 5.916 6.048 6.233 6.399 6.561 6.719 6.867 7.04 7.2 7.353 7.537 7.723 7.902 8.086 8.264 8.439 8.628 8.811 8.996 9.161 9.298 9.471 9.642 9.766 9.824 9.832 9.8 9.619 9.166 8.232 6.969 5.858 4.872 4.02 3.25 2.59 2.007 1.502 1.011 0.568 0.162 -0.22 -0.565 -0.868 -1.164 -1.488 -1.767 -2.003 -2.242 -2.504 -2.73 -2.946 -3.17 -3.349 -3.537 -3.733 -3.939 -4.166 -4.323 -4.483 -4.736 -4.907 -5.081 -5.178 -5.363 -5.544 -5.748 -5.856 -6.131 -6.187 -6.308 -6.455 -6.763 -6.929 -7.113 -7.318 -7.577 -7.849 -8.217 -9.133 -9 ,12197 ,TETRA ,17601053,Sun Nov 28 14:30:42 CET,Sun Nov 28 16:19:32 CET,0.0 1.803 2.339 2.73 3.041 3.293 3.496 3.691 4.024 4.172 4.312 4.422 4.702 4.828 5.052 5.261 5.465 5.555 5.711 5.855 6.065 6.203 6.338 6.532 6.714 6.884 7.04 7.194 7.385 7.563 7.741 7.924 8.078 8.227 8.399 8.59 8.761 8.947 9.141 9.315 9.482 9.653 9.835 10.005 10.165 10.286 10.333 10.302 10.124 9.724 8.885 7.656 6.556 5.589 4.74 3.966 3.299 2.694 2.173 1.675 1.251 0.859 0.48 0.124 -0.207 -0.51 -0.841 -1.132 -1.366 -1.605 -1.856 -2.059 -2.275 -2.515 -2.7 -2.884 -3.073 -3.278 -3.5 -3.644 -3.798 -4.048 -4.21 -4.374 -4.454 -4.622 -4.81 -4.999 -5.105 -5.388 -5.459 -5.575 -5.699 -5.996 -6.165 -6.345 -6.546 -6.784 -7.078 -7.44 -8.5 -10 ,20506 ,TETRA ,17601054,Sun Nov 28 14:30:44 CET,Sun Nov 28 16:19:56 CET,0.0 1.499 1.989 2.325 2.602 2.872 3.131 3.37 3.745 3.899 4.057 4.206 4.495 4.623 4.855 5.069 5.283 5.389 5.585 5.781 6.056 6.226 6.394 6.625 6.833 7.017 7.197 7.361 7.552 7.742 7.91 8.091 8.252 8.397 8.557 8.745 8.924 9.103 9.292 9.469 9.63 9.808 10.007 10.176 10.312 10.406 10.455 10.448 10.309 9.886 8.913 7.649 6.581 5.626 4.767 3.983 3.311 2.722 2.173 1.617 1.173 0.794 0.435 0.083 -0.244 -0.543 -0.851 -1.129 -1.38 -1.651 -1.933 -2.151 -2.364 -2.59 -2.767 -2.946 -3.128 -3.327 -3.533 -3.679 -3.837 -4.067 -4.226 -4.399 -4.489 -4.667 -4.838 -5.027 -5.133 -5.396 -5.452 -5.569 -5.689 -5.98 -6.167 -6.378 -6.597 -6.848 -7.151 -7.55 -9.101 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_47.txt deleted file mode 100644 index e3b2e37a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_27_47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29070 ,TETRA ,17601055,Sun Nov 28 14:30:46 CET,Sun Nov 28 16:19:27 CET,0.0 3.48 4.161 4.634 4.983 5.249 5.485 5.709 6.096 6.275 6.449 6.642 6.945 7.079 7.367 7.608 7.812 7.919 8.135 8.331 8.596 8.764 8.919 9.147 9.361 9.55 9.729 9.9 10.128 10.361 10.563 10.774 10.963 11.14 11.349 11.577 11.79 12.011 12.231 12.435 12.613 12.802 13.003 13.172 13.308 13.413 13.492 13.453 13.209 12.63 11.418 9.689 8.122 6.795 5.687 4.689 3.811 2.988 2.254 1.565 0.995 0.469 -0.034 -0.491 -0.919 -1.3 -1.699 -2.066 -2.374 -2.693 -3.022 -3.285 -3.568 -3.864 -4.094 -4.349 -4.61 -4.861 -5.13 -5.327 -5.54 -5.854 -6.044 -6.242 -6.354 -6.594 -6.828 -7.068 -7.204 -7.522 -7.641 -7.807 -7.969 -8.275 -8.439 -8.609 -8.815 -9.064 -9.369 -9.838 -11.12 -2 ,8620 ,TETRA ,17601056,Sun Nov 28 14:30:48 CET,Sun Nov 28 16:19:06 CET,0.0 2.597 3.27 3.726 4.085 4.366 4.617 4.859 5.293 5.492 5.657 5.812 6.115 6.256 6.509 6.714 6.887 6.976 7.149 7.303 7.526 7.659 7.779 7.959 8.15 8.349 8.527 8.698 8.904 9.08 9.241 9.426 9.588 9.745 9.923 10.088 10.258 10.44 10.602 10.763 10.907 11.055 11.224 11.341 11.425 11.463 11.423 11.309 11.007 10.312 8.934 7.2 5.706 4.362 3.192 2.155 1.274 0.468 -0.23 -0.917 -1.504 -2.016 -2.498 -2.961 -3.4 -3.793 -4.194 -4.552 -4.859 -5.194 -5.538 -5.802 -6.083 -6.392 -6.616 -6.842 -7.092 -7.35 -7.617 -7.796 -7.983 -8.274 -8.469 -8.694 -8.809 -9.041 -9.305 -9.586 -9.73 -10.046 -10.172 -10.326 -10.472 -10.831 -11.028 -11.234 -11.497 -11.816 -12.175 -12.656 -13.6 -3 ,24760 ,TETRA ,17601057,Sun Nov 28 14:30:42 CET,Sun Nov 28 16:18:51 CET,0.0 1.616 2.104 2.502 2.854 3.127 3.357 3.583 3.957 4.111 4.255 4.373 4.65 4.774 5.026 5.259 5.463 5.556 5.727 5.893 6.148 6.319 6.471 6.671 6.865 7.047 7.217 7.385 7.598 7.785 7.952 8.161 8.35 8.517 8.711 8.903 9.07 9.251 9.439 9.628 9.808 9.966 10.109 10.237 10.347 10.439 10.472 10.358 10.088 9.527 8.284 6.569 5.031 3.711 2.61 1.639 0.833 0.091 -0.581 -1.244 -1.8 -2.298 -2.781 -3.23 -3.655 -4.041 -4.435 -4.784 -5.085 -5.44 -5.822 -6.107 -6.395 -6.683 -6.902 -7.124 -7.366 -7.633 -7.891 -8.079 -8.284 -8.587 -8.786 -8.994 -9.113 -9.347 -9.593 -9.871 -10.019 -10.353 -10.507 -10.677 -10.855 -11.243 -11.439 -11.65 -11.879 -12.091 -12.38 -13.04 -15.212 -4 ,6215 ,TETRA ,17601058,Sun Nov 28 14:31:08 CET,Sun Nov 28 16:20:17 CET,0.0 2.321 2.885 3.327 3.655 3.893 4.112 4.32 4.681 4.858 5.036 5.212 5.517 5.663 5.939 6.186 6.396 6.485 6.66 6.831 7.055 7.184 7.316 7.534 7.766 7.985 8.176 8.34 8.542 8.737 8.894 9.055 9.217 9.388 9.563 9.745 9.929 10.15 10.366 10.557 10.766 10.988 11.214 11.385 11.536 11.666 11.706 11.613 11.329 10.716 9.45 7.708 6.13 4.792 3.64 2.587 1.66 0.86 0.183 -0.524 -1.129 -1.673 -2.184 -2.649 -3.09 -3.492 -3.902 -4.259 -4.558 -4.869 -5.207 -5.501 -5.801 -6.101 -6.329 -6.561 -6.799 -7.049 -7.32 -7.505 -7.687 -7.973 -8.184 -8.397 -8.499 -8.712 -8.943 -9.21 -9.357 -9.679 -9.826 -9.988 -10.147 -10.514 -10.727 -10.981 -11.277 -11.611 -11.963 -12.351 -13.122 -5 ,8920 ,TETRA ,17601059,Sun Nov 28 14:31:09 CET,Sun Nov 28 16:20:06 CET,0.0 2.868 3.357 3.752 4.138 4.439 4.716 4.959 5.347 5.512 5.674 5.868 6.176 6.324 6.62 6.89 7.127 7.242 7.455 7.646 7.904 8.064 8.234 8.482 8.698 8.91 9.107 9.28 9.494 9.699 9.924 10.186 10.384 10.574 10.793 11.017 11.243 11.473 11.681 11.88 12.081 12.311 12.543 12.745 12.909 12.986 13.042 13.01 12.754 12.118 10.771 8.995 7.481 6.179 4.999 3.946 3.052 2.254 1.577 0.899 0.318 -0.195 -0.675 -1.134 -1.562 -1.96 -2.381 -2.761 -3.093 -3.43 -3.777 -4.082 -4.408 -4.745 -5.002 -5.283 -5.558 -5.809 -6.083 -6.274 -6.479 -6.832 -7.074 -7.313 -7.43 -7.665 -7.93 -8.212 -8.357 -8.673 -8.808 -8.972 -9.135 -9.503 -9.699 -9.939 -10.224 -10.501 -10.8 -11.169 -11.87 -6 ,2184 ,TETRA ,17601060,Sun Nov 28 14:31:11 CET,Sun Nov 28 16:19:56 CET,0.0 1.918 2.484 2.875 3.192 3.459 3.665 3.839 4.16 4.303 4.431 4.523 4.787 4.891 5.08 5.255 5.434 5.528 5.726 5.903 6.131 6.266 6.4 6.597 6.763 6.912 7.055 7.192 7.358 7.52 7.706 7.955 8.165 8.354 8.575 8.811 9.022 9.246 9.465 9.682 9.888 10.093 10.296 10.463 10.614 10.719 10.777 10.699 10.427 9.878 8.683 7.018 5.457 4.026 2.805 1.783 0.878 0.06 -0.616 -1.3 -1.888 -2.405 -2.909 -3.374 -3.802 -4.204 -4.623 -4.988 -5.304 -5.634 -5.966 -6.236 -6.53 -6.836 -7.064 -7.303 -7.557 -7.81 -8.072 -8.25 -8.434 -8.741 -8.952 -9.169 -9.282 -9.509 -9.75 -9.997 -10.125 -10.443 -10.587 -10.747 -10.911 -11.258 -11.455 -11.672 -11.902 -12.155 -12.432 -12.792 -13.567 -7 ,31687 ,TETRA ,17601061,Sun Nov 28 14:31:13 CET,Sun Nov 28 16:19:24 CET,0.0 3.644 4.288 4.668 4.98 5.237 5.449 5.639 5.976 6.144 6.308 6.488 6.794 6.938 7.203 7.436 7.654 7.762 7.975 8.189 8.478 8.637 8.799 9.034 9.224 9.398 9.57 9.723 9.917 10.099 10.254 10.447 10.625 10.786 10.964 11.154 11.333 11.519 11.699 11.88 12.041 12.186 12.343 12.471 12.599 12.683 12.675 12.579 12.299 11.621 10.208 8.421 6.895 5.605 4.483 3.462 2.578 1.788 1.084 0.424 -0.137 -0.682 -1.24 -1.756 -2.213 -2.629 -3.038 -3.383 -3.667 -3.97 -4.287 -4.541 -4.817 -5.117 -5.366 -5.615 -5.863 -6.147 -6.432 -6.604 -6.776 -7.06 -7.265 -7.492 -7.61 -7.851 -8.106 -8.385 -8.536 -8.865 -9.025 -9.208 -9.399 -9.791 -10.008 -10.247 -10.537 -10.848 -11.224 -11.766 -12.817 -8 ,32343 ,TETRA ,17601062,Sun Nov 28 14:31:08 CET,Sun Nov 28 16:19:11 CET,0.0 2.376 3.188 3.683 3.978 4.252 4.493 4.708 5.055 5.21 5.349 5.449 5.742 5.876 6.113 6.325 6.497 6.579 6.738 6.884 7.103 7.249 7.386 7.581 7.784 7.982 8.163 8.337 8.531 8.696 8.858 9.043 9.21 9.363 9.54 9.73 9.886 10.044 10.225 10.407 10.579 10.756 10.919 11.055 11.192 11.278 11.285 11.195 10.902 10.295 8.982 7.183 5.705 4.416 3.301 2.307 1.433 0.661 -0.008 -0.679 -1.254 -1.768 -2.242 -2.671 -3.084 -3.46 -3.847 -4.213 -4.52 -4.825 -5.145 -5.408 -5.681 -5.971 -6.192 -6.41 -6.645 -6.896 -7.152 -7.329 -7.509 -7.8 -8.008 -8.222 -8.324 -8.522 -8.742 -8.988 -9.124 -9.452 -9.578 -9.721 -9.875 -10.211 -10.4 -10.591 -10.79 -11.059 -11.437 -11.845 -12.782 -9 ,20870 ,TETRA ,17601063,Sun Nov 28 14:31:09 CET,Sun Nov 28 16:19:11 CET,0.0 2.119 2.596 2.975 3.278 3.513 3.734 3.924 4.206 4.345 4.498 4.614 4.888 5.013 5.256 5.511 5.739 5.848 6.063 6.25 6.506 6.677 6.848 7.08 7.284 7.479 7.672 7.848 8.052 8.247 8.433 8.66 8.89 9.101 9.316 9.537 9.735 9.94 10.151 10.378 10.582 10.768 10.99 11.177 11.32 11.415 11.468 11.425 11.184 10.582 9.262 7.54 6.015 4.682 3.507 2.453 1.562 0.752 0.042 -0.659 -1.256 -1.79 -2.303 -2.777 -3.216 -3.621 -4.039 -4.419 -4.743 -5.075 -5.432 -5.726 -6.034 -6.375 -6.62 -6.855 -7.109 -7.366 -7.617 -7.781 -7.946 -8.209 -8.399 -8.605 -8.718 -8.959 -9.227 -9.512 -9.656 -9.982 -10.16 -10.35 -10.54 -10.937 -11.145 -11.36 -11.619 -11.936 -12.299 -12.769 -13.932 -10 ,12890 ,TETRA ,17601064,Sun Nov 28 14:31:09 CET,Sun Nov 28 16:19:28 CET,0.0 3.108 3.763 4.239 4.604 4.869 5.085 5.303 5.688 5.86 6.026 6.18 6.472 6.595 6.786 6.964 7.153 7.235 7.388 7.548 7.794 7.946 8.077 8.256 8.428 8.594 8.76 8.915 9.11 9.301 9.491 9.734 9.944 10.129 10.34 10.592 10.834 11.067 11.279 11.482 11.689 11.877 12.055 12.215 12.334 12.415 12.463 12.399 12.142 11.548 10.271 8.495 6.941 5.602 4.454 3.431 2.528 1.724 1.033 0.348 -0.247 -0.783 -1.273 -1.713 -2.123 -2.501 -2.885 -3.21 -3.489 -3.795 -4.117 -4.378 -4.639 -4.929 -5.174 -5.432 -5.685 -5.925 -6.17 -6.338 -6.518 -6.808 -7.016 -7.233 -7.337 -7.543 -7.766 -7.999 -8.127 -8.456 -8.644 -8.832 -9.029 -9.451 -9.671 -9.899 -10.14 -10.412 -10.723 -11.116 -12.141 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_29.txt deleted file mode 100644 index c3bb7f09..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16289 ,TETRA ,17601065,Sun Nov 28 14:31:08 CET,Sun Nov 28 16:19:23 CET,0.0 2.972 3.603 4.082 4.443 4.777 5.07 5.335 5.814 6.021 6.196 6.354 6.673 6.832 7.13 7.408 7.667 7.792 8.059 8.302 8.623 8.83 9.026 9.305 9.554 9.761 9.981 10.221 10.515 10.787 11.036 11.313 11.586 11.844 12.144 12.495 12.809 13.13 13.487 13.868 14.243 14.633 15.035 15.43 15.875 16.274 16.641 16.963 17.265 17.486 17.211 16.374 15.546 14.7 13.883 13.137 12.446 11.769 11.175 10.571 10.062 9.641 9.25 8.88 8.537 8.214 7.879 7.568 7.279 6.981 6.661 6.395 6.137 5.823 5.552 5.295 5.016 4.72 4.433 4.233 4.027 3.69 3.434 3.163 3.029 2.769 2.487 2.2 2.06 1.748 1.548 1.359 1.166 0.731 0.484 0.206 -0.102 -0.429 -0.774 -1.207 -5.482 -2 ,3464 ,TETRA ,17601066,Sun Nov 28 14:31:08 CET,Sun Nov 28 16:19:30 CET,0.0 2.474 3.179 3.706 4.239 4.626 4.888 5.115 5.584 5.811 6.01 6.216 6.546 6.717 7.026 7.313 7.573 7.696 7.929 8.139 8.437 8.633 8.829 9.101 9.364 9.635 9.888 10.117 10.409 10.678 10.927 11.22 11.49 11.733 11.994 12.296 12.639 13.009 13.329 13.659 13.983 14.316 14.721 15.088 15.479 15.895 16.301 16.668 17.019 17.253 17.039 16.287 15.508 14.812 14.145 13.509 12.933 12.379 11.868 11.288 10.775 10.357 9.948 9.542 9.164 8.802 8.401 8.04 7.733 7.412 7.072 6.787 6.496 6.206 5.977 5.725 5.464 5.2 4.919 4.718 4.511 4.175 3.931 3.68 3.549 3.279 3.0 2.717 2.55 2.208 2.027 1.849 1.658 1.259 1.039 0.801 0.54 0.212 -0.207 -0.876 -3.972 -3 ,19408 ,TETRA ,17601067,Sun Nov 28 14:31:11 CET,Sun Nov 28 16:19:18 CET,0.0 3.642 4.441 5.011 5.446 5.795 6.094 6.365 6.852 7.056 7.234 7.415 7.736 7.901 8.222 8.548 8.865 8.998 9.238 9.459 9.774 9.984 10.184 10.458 10.712 10.942 11.157 11.375 11.665 11.939 12.181 12.489 12.804 13.08 13.4 13.79 14.153 14.493 14.829 15.209 15.595 15.977 16.393 16.805 17.243 17.665 18.092 18.472 18.742 18.772 18.403 17.675 16.929 16.198 15.447 14.714 14.032 13.394 12.835 12.249 11.728 11.241 10.748 10.284 9.841 9.427 9.031 8.674 8.339 8.0 7.648 7.35 7.049 6.746 6.515 6.279 6.052 5.815 5.565 5.376 5.167 4.845 4.617 4.387 4.27 4.025 3.754 3.475 3.344 3.055 2.907 2.742 2.565 2.142 1.921 1.664 1.363 1.027 0.626 -0.011 -3.184 -4 ,10230 ,TETRA ,17601068,Sun Nov 28 14:31:12 CET,Sun Nov 28 16:19:08 CET,0.0 2.984 3.63 4.031 4.334 4.621 4.884 5.137 5.578 5.751 5.923 6.121 6.446 6.606 6.92 7.236 7.54 7.679 7.946 8.191 8.513 8.712 8.905 9.18 9.429 9.676 9.929 10.169 10.447 10.726 10.981 11.233 11.462 11.678 11.958 12.304 12.651 12.991 13.326 13.685 14.013 14.35 14.758 15.162 15.591 16.049 16.508 16.86 17.171 17.376 17.111 16.288 15.411 14.613 13.883 13.174 12.535 11.97 11.484 10.993 10.575 10.187 9.762 9.326 8.931 8.561 8.155 7.781 7.453 7.133 6.775 6.448 6.126 5.817 5.565 5.296 5.042 4.773 4.491 4.308 4.114 3.803 3.575 3.34 3.213 2.924 2.632 2.315 2.148 1.819 1.596 1.396 1.176 0.687 0.425 0.145 -0.164 -0.523 -0.945 -1.56 -3.973 -5 ,31351 ,TETRA ,17601069,Sun Nov 28 14:31:08 CET,Sun Nov 28 16:19:06 CET,0.0 2.516 3.176 3.716 4.098 4.406 4.686 4.96 5.441 5.658 5.86 6.051 6.365 6.525 6.833 7.118 7.391 7.518 7.754 7.978 8.288 8.492 8.692 8.985 9.265 9.531 9.778 10.002 10.286 10.551 10.804 11.107 11.4 11.691 12.01 12.344 12.646 12.965 13.311 13.681 14.058 14.414 14.803 15.195 15.629 16.073 16.517 16.915 17.158 17.288 17.172 16.48 15.659 14.769 13.94 13.167 12.433 11.741 11.126 10.526 10.002 9.537 9.109 8.698 8.303 7.923 7.515 7.155 6.851 6.546 6.218 5.943 5.648 5.321 5.069 4.804 4.537 4.258 3.957 3.749 3.528 3.182 2.953 2.724 2.597 2.33 2.06 1.769 1.633 1.349 1.198 1.007 0.806 0.36 0.096 -0.19 -0.514 -0.919 -1.374 -1.944 -4.365 -6 ,644 ,TETRA ,17601070,Sun Nov 28 14:31:11 CET,Sun Nov 28 16:19:11 CET,0.0 2.879 3.453 3.879 4.265 4.581 4.85 5.07 5.481 5.681 5.866 6.039 6.356 6.501 6.786 7.037 7.248 7.358 7.598 7.827 8.122 8.3 8.462 8.685 8.901 9.116 9.317 9.521 9.778 10.019 10.264 10.526 10.747 10.966 11.228 11.524 11.791 12.056 12.355 12.68 12.996 13.341 13.728 14.1 14.495 14.888 15.29 15.663 15.926 15.948 15.59 14.841 14.063 13.278 12.524 11.752 11.06 10.489 9.99 9.478 9.039 8.658 8.276 7.893 7.534 7.216 6.883 6.576 6.307 6.029 5.746 5.512 5.268 5.022 4.813 4.562 4.272 3.964 3.652 3.434 3.213 2.862 2.619 2.371 2.242 1.954 1.652 1.335 1.168 0.841 0.614 0.408 0.204 -0.205 -0.439 -0.738 -1.06 -1.388 -1.782 -2.343 -5.332 -7 ,23402 ,TETRA ,17601071,Sun Nov 28 14:31:10 CET,Sun Nov 28 16:19:53 CET,0.0 3.958 4.675 5.164 5.537 5.841 6.126 6.364 6.77 6.964 7.149 7.325 7.644 7.799 8.095 8.385 8.653 8.778 9.017 9.248 9.549 9.738 9.933 10.213 10.477 10.725 10.965 11.192 11.476 11.766 12.033 12.327 12.615 12.891 13.204 13.534 13.844 14.176 14.523 14.878 15.249 15.66 16.108 16.568 17.05 17.489 17.928 18.326 18.767 19.13 18.972 18.231 17.379 16.521 15.674 14.892 14.23 13.625 13.064 12.475 11.974 11.546 11.149 10.753 10.385 10.05 9.687 9.356 9.059 8.759 8.461 8.2 7.922 7.637 7.422 7.202 6.962 6.7 6.423 6.243 6.068 5.798 5.597 5.381 5.27 5.039 4.809 4.578 4.452 4.15 4.0 3.806 3.586 3.088 2.835 2.59 2.316 1.962 1.569 0.982 -0.903 -8 ,6247 ,TETRA ,17601072,Sun Nov 28 14:31:11 CET,Sun Nov 28 16:19:32 CET,0.0 2.661 3.279 3.723 4.049 4.376 4.673 4.919 5.367 5.576 5.764 5.939 6.262 6.416 6.698 6.977 7.208 7.316 7.549 7.77 8.079 8.267 8.442 8.704 8.948 9.16 9.361 9.56 9.84 10.116 10.383 10.709 11.017 11.312 11.625 11.98 12.325 12.674 13.043 13.435 13.823 14.213 14.626 15.022 15.448 15.87 16.274 16.579 16.779 16.864 16.642 15.994 15.211 14.447 13.703 12.995 12.362 11.77 11.267 10.76 10.298 9.886 9.499 9.122 8.764 8.442 8.1 7.785 7.482 7.155 6.831 6.57 6.319 6.072 5.87 5.642 5.421 5.229 5.008 4.837 4.678 4.433 4.242 4.054 3.96 3.754 3.519 3.252 3.112 2.824 2.69 2.517 2.331 1.897 1.649 1.381 1.071 0.713 0.312 -0.28 -2.958 -9 ,1015 ,TETRA ,17601073,Sun Nov 28 14:31:14 CET,Sun Nov 28 16:20:36 CET,0.0 3.01 3.738 4.178 4.503 4.806 5.102 5.366 5.841 6.049 6.235 6.431 6.769 6.929 7.212 7.504 7.799 7.943 8.216 8.457 8.77 8.961 9.154 9.43 9.67 9.91 10.154 10.377 10.635 10.884 11.114 11.384 11.68 11.975 12.292 12.616 12.925 13.264 13.621 13.993 14.363 14.763 15.227 15.686 16.161 16.598 16.977 17.278 17.523 17.524 17.16 16.325 15.389 14.513 13.704 13.012 12.36 11.756 11.24 10.685 10.19 9.75 9.331 8.932 8.559 8.208 7.843 7.496 7.177 6.865 6.543 6.261 5.956 5.634 5.367 5.094 4.816 4.53 4.237 4.03 3.819 3.487 3.255 3.016 2.888 2.616 2.325 2.042 1.908 1.597 1.394 1.192 0.985 0.566 0.339 0.081 -0.248 -0.659 -1.089 -1.677 -4.603 -10 ,27960 ,TETRA ,17601074,Sun Nov 28 14:31:15 CET,Sun Nov 28 16:20:53 CET,0.0 4.115 5.051 5.584 5.96 6.317 6.62 6.888 7.389 7.598 7.782 7.959 8.274 8.427 8.702 8.958 9.204 9.33 9.562 9.765 10.064 10.259 10.453 10.732 11.003 11.255 11.494 11.718 12.02 12.306 12.559 12.855 13.123 13.368 13.65 13.972 14.272 14.606 14.968 15.326 15.7 16.108 16.574 16.998 17.456 17.975 18.441 18.811 19.125 19.255 18.972 18.137 17.247 16.381 15.582 14.78 13.96 13.224 12.583 11.944 11.407 10.937 10.512 10.102 9.717 9.359 8.97 8.641 8.341 8.011 7.691 7.438 7.172 6.891 6.651 6.407 6.197 5.99 5.773 5.617 5.439 5.138 4.935 4.705 4.584 4.335 4.045 3.753 3.611 3.291 3.138 2.96 2.777 2.412 2.182 1.92 1.652 1.325 0.923 0.391 -3.419 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_42.txt deleted file mode 100644 index 74d4bd7a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10477 ,TETRA ,17601075,Sun Nov 28 14:31:09 CET,Sun Nov 28 16:19:45 CET,0.0 1.295 1.826 2.198 2.487 2.695 2.9 3.095 3.459 3.626 3.784 3.931 4.217 4.338 4.576 4.804 5.015 5.113 5.306 5.495 5.775 5.961 6.131 6.369 6.593 6.819 7.031 7.217 7.455 7.673 7.877 8.128 8.372 8.622 8.935 9.254 9.541 9.858 10.193 10.542 10.908 11.315 11.816 12.307 12.823 13.374 13.958 14.561 15.179 15.755 16.275 16.345 16.114 15.776 15.399 15.05 14.7 14.339 13.997 13.633 13.31 13.013 12.714 12.409 12.125 11.876 11.594 11.34 11.141 10.917 10.671 10.463 10.238 10.01 9.835 9.653 9.463 9.266 9.065 8.934 8.789 8.546 8.383 8.209 8.116 7.918 7.707 7.499 7.398 7.142 7.075 6.961 6.845 6.592 6.441 6.278 6.119 5.939 5.652 5.248 3.79 -2 ,22376 ,TETRA ,17601076,Sun Nov 28 14:31:10 CET,Sun Nov 28 16:21:08 CET,0.0 1.378 1.843 2.198 2.514 2.783 3.012 3.223 3.618 3.786 3.936 4.062 4.367 4.51 4.78 5.06 5.313 5.425 5.64 5.853 6.173 6.354 6.512 6.764 7.012 7.233 7.435 7.625 7.882 8.134 8.358 8.635 8.906 9.143 9.398 9.7 10.006 10.321 10.642 10.98 11.336 11.783 12.294 12.756 13.287 13.821 14.387 15.015 15.666 16.292 16.893 17.075 16.869 16.501 16.104 15.761 15.428 15.062 14.721 14.376 14.073 13.797 13.536 13.272 13.005 12.755 12.488 12.246 12.039 11.817 11.578 11.374 11.151 10.919 10.746 10.563 10.364 10.159 9.952 9.805 9.65 9.409 9.254 9.109 9.03 8.853 8.676 8.501 8.405 8.157 8.105 7.998 7.883 7.623 7.469 7.299 7.114 6.887 6.616 6.25 5.15 -3 ,21988 ,TETRA ,17601077,Sun Nov 28 14:31:10 CET,Sun Nov 28 16:21:06 CET,0.0 1.592 2.109 2.494 2.79 3.038 3.256 3.468 3.833 3.977 4.13 4.313 4.633 4.762 4.987 5.213 5.433 5.539 5.76 5.984 6.316 6.532 6.717 6.964 7.221 7.47 7.688 7.909 8.197 8.452 8.712 9.04 9.331 9.596 9.892 10.207 10.495 10.823 11.16 11.475 11.819 12.203 12.646 13.087 13.569 14.081 14.662 15.29 15.964 16.57 17.104 17.276 17.146 16.939 16.655 16.308 15.974 15.667 15.376 15.051 14.748 14.485 14.234 13.991 13.748 13.513 13.279 13.074 12.895 12.69 12.471 12.297 12.112 11.915 11.764 11.605 11.44 11.26 11.059 10.912 10.758 10.539 10.399 10.25 10.164 9.985 9.79 9.582 9.48 9.206 9.089 8.954 8.82 8.511 8.338 8.163 7.954 7.673 7.336 6.907 6.062 -4 ,11447 ,TETRA ,17601078,Sun Nov 28 14:31:13 CET,Sun Nov 28 16:23:30 CET,0.0 1.738 2.349 2.746 3.033 3.273 3.507 3.723 4.122 4.31 4.482 4.637 4.945 5.085 5.341 5.603 5.829 5.931 6.133 6.325 6.586 6.75 6.917 7.139 7.343 7.561 7.773 7.959 8.189 8.415 8.651 8.942 9.223 9.484 9.775 10.113 10.417 10.724 11.057 11.409 11.768 12.161 12.638 13.118 13.631 14.171 14.756 15.389 16.091 16.77 17.295 17.459 17.286 16.951 16.567 16.177 15.823 15.434 15.072 14.714 14.395 14.095 13.819 13.552 13.257 12.969 12.679 12.434 12.221 11.989 11.744 11.548 11.346 11.12 10.952 10.776 10.571 10.362 10.153 10.001 9.86 9.667 9.527 9.37 9.282 9.108 8.945 8.768 8.675 8.436 8.367 8.238 8.096 7.769 7.594 7.412 7.202 6.973 6.707 6.33 5.102 -5 ,12945 ,TETRA ,17601079,Sun Nov 28 14:31:14 CET,Sun Nov 28 16:23:08 CET,0.0 1.187 1.721 2.061 2.329 2.568 2.773 2.968 3.346 3.523 3.668 3.772 4.056 4.171 4.406 4.653 4.877 4.984 5.183 5.368 5.659 5.847 6.012 6.257 6.497 6.72 6.947 7.168 7.45 7.72 7.953 8.191 8.423 8.682 9.013 9.384 9.704 10.023 10.358 10.708 11.06 11.435 11.883 12.339 12.85 13.355 13.905 14.501 15.106 15.71 16.275 16.465 16.406 16.195 15.912 15.63 15.356 15.057 14.758 14.43 14.131 13.869 13.626 13.38 13.125 12.901 12.666 12.419 12.199 11.985 11.77 11.6 11.426 11.231 11.072 10.909 10.734 10.564 10.389 10.255 10.115 9.913 9.761 9.596 9.511 9.333 9.165 9.001 8.908 8.654 8.577 8.453 8.317 8.008 7.847 7.694 7.521 7.294 6.941 6.473 5.211 -6 ,15683 ,TETRA ,17601080,Sun Nov 28 14:31:11 CET,Sun Nov 28 16:21:07 CET,0.0 1.338 1.847 2.228 2.542 2.831 3.086 3.31 3.733 3.911 4.061 4.174 4.457 4.587 4.821 5.023 5.22 5.328 5.532 5.72 5.991 6.158 6.32 6.544 6.754 6.963 7.17 7.371 7.633 7.882 8.108 8.365 8.6 8.83 9.105 9.417 9.695 9.995 10.341 10.707 11.097 11.536 12.011 12.482 13.026 13.569 14.151 14.785 15.44 16.052 16.567 16.645 16.457 16.111 15.697 15.281 14.873 14.499 14.226 13.975 13.699 13.421 13.155 12.886 12.629 12.391 12.135 11.863 11.622 11.42 11.211 11.034 10.848 10.655 10.51 10.346 10.17 9.988 9.779 9.617 9.435 9.16 8.971 8.769 8.666 8.452 8.208 7.945 7.819 7.542 7.416 7.28 7.149 6.853 6.682 6.469 6.244 6.013 5.754 5.396 4.102 -7 ,14532 ,TETRA ,17601081,Sun Nov 28 14:31:13 CET,Sun Nov 28 16:21:22 CET,0.0 1.497 1.971 2.326 2.627 2.878 3.091 3.282 3.604 3.757 3.906 4.037 4.325 4.454 4.679 4.884 5.094 5.199 5.397 5.579 5.841 6.006 6.167 6.398 6.62 6.843 7.047 7.234 7.471 7.708 7.941 8.209 8.471 8.721 9.008 9.327 9.616 9.934 10.286 10.642 10.991 11.371 11.813 12.256 12.757 13.29 13.877 14.521 15.163 15.794 16.445 16.705 16.676 16.505 16.221 15.84 15.478 15.163 14.866 14.536 14.233 13.963 13.671 13.37 13.109 12.874 12.608 12.364 12.168 11.965 11.741 11.549 11.347 11.145 10.98 10.8 10.615 10.42 10.212 10.076 9.939 9.714 9.545 9.358 9.262 9.059 8.844 8.633 8.521 8.256 8.152 8.014 7.865 7.529 7.342 7.144 6.945 6.751 6.531 6.208 5.475 -8 ,12391 ,TETRA ,17601082,Sun Nov 28 14:31:15 CET,Sun Nov 28 16:20:25 CET,0.0 1.155 1.677 2.116 2.464 2.748 2.989 3.18 3.51 3.672 3.828 3.958 4.246 4.37 4.609 4.824 5.02 5.12 5.314 5.487 5.729 5.887 6.04 6.258 6.482 6.693 6.892 7.087 7.315 7.542 7.771 8.045 8.31 8.541 8.796 9.102 9.407 9.744 10.092 10.438 10.78 11.143 11.595 12.072 12.596 13.144 13.74 14.346 14.97 15.588 16.036 16.086 15.885 15.542 15.202 14.853 14.48 14.115 13.755 13.373 13.044 12.757 12.502 12.226 11.947 11.697 11.431 11.191 10.977 10.758 10.507 10.266 10.029 9.821 9.653 9.477 9.295 9.078 8.846 8.689 8.519 8.271 8.106 7.93 7.834 7.638 7.446 7.236 7.113 6.833 6.724 6.588 6.431 6.076 5.888 5.702 5.482 5.2 4.847 4.439 3.363 -9 ,1986 ,TETRA ,17601083,Sun Nov 28 14:31:12 CET,Sun Nov 28 16:20:03 CET,0.0 1.386 1.867 2.206 2.512 2.758 2.961 3.147 3.481 3.656 3.834 4.004 4.306 4.444 4.72 4.984 5.241 5.35 5.524 5.71 5.999 6.185 6.359 6.589 6.818 7.055 7.275 7.488 7.759 7.997 8.232 8.511 8.776 9.028 9.296 9.6 9.893 10.214 10.571 10.952 11.344 11.761 12.241 12.693 13.216 13.822 14.46 15.125 15.794 16.442 17.048 17.121 16.868 16.558 16.202 15.797 15.387 14.965 14.584 14.217 13.915 13.633 13.334 13.05 12.793 12.558 12.332 12.138 11.962 11.775 11.576 11.415 11.237 11.05 10.91 10.759 10.608 10.447 10.258 10.123 9.987 9.768 9.614 9.461 9.378 9.196 9.014 8.84 8.747 8.49 8.429 8.313 8.198 7.959 7.82 7.654 7.45 7.21 6.922 6.537 5.574 -10 ,19907 ,TETRA ,17601084,Sun Nov 28 14:31:10 CET,Sun Nov 28 16:20:34 CET,0.0 1.301 1.814 2.254 2.579 2.85 3.103 3.309 3.703 3.892 4.055 4.212 4.518 4.656 4.902 5.12 5.328 5.433 5.664 5.891 6.212 6.401 6.569 6.821 7.084 7.314 7.513 7.707 7.943 8.164 8.371 8.627 8.866 9.092 9.354 9.634 9.919 10.262 10.629 10.976 11.332 11.74 12.19 12.608 13.105 13.682 14.278 14.928 15.648 16.376 17.05 17.188 16.978 16.732 16.427 16.019 15.652 15.325 14.98 14.62 14.31 14.011 13.716 13.429 13.131 12.847 12.571 12.331 12.122 11.9 11.674 11.495 11.295 11.073 10.902 10.728 10.536 10.337 10.145 10.004 9.833 9.58 9.419 9.242 9.151 8.952 8.732 8.499 8.375 8.096 7.986 7.848 7.699 7.361 7.153 6.911 6.633 6.334 6.0 5.506 4.046 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_44.txt deleted file mode 100644 index 5056f8dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9519 ,TETRA ,17601085,Sun Nov 28 14:31:12 CET,Sun Nov 28 16:20:33 CET,0.0 2.409 3.094 3.625 4.062 4.418 4.739 5.018 5.519 5.753 5.967 6.22 6.564 6.73 7.057 7.382 7.676 7.812 8.079 8.341 8.676 8.88 9.081 9.372 9.651 9.91 10.155 10.388 10.686 10.967 11.226 11.557 11.902 12.214 12.572 12.971 13.329 13.722 14.12 14.522 14.966 15.482 16.064 16.616 17.209 17.841 18.571 19.324 20.14 20.984 21.785 22.191 22.107 21.831 21.468 21.078 20.696 20.313 19.981 19.644 19.321 19.028 18.723 18.401 18.082 17.789 17.514 17.282 17.065 16.819 16.562 16.346 16.127 15.909 15.742 15.562 15.378 15.2 15.011 14.885 14.756 14.529 14.373 14.214 14.134 13.971 13.778 13.561 13.444 13.182 13.073 12.95 12.81 12.464 12.289 12.111 11.898 11.66 11.375 10.835 9.278 -2 ,22178 ,TETRA ,17601086,Sun Nov 28 14:31:15 CET,Sun Nov 28 16:20:12 CET,0.0 2.264 2.954 3.443 3.796 4.116 4.414 4.679 5.152 5.35 5.541 5.759 6.077 6.236 6.541 6.822 7.085 7.215 7.453 7.688 8.056 8.295 8.512 8.809 9.084 9.337 9.576 9.8 10.083 10.36 10.636 10.954 11.251 11.537 11.852 12.196 12.521 12.886 13.278 13.685 14.089 14.522 15.027 15.518 16.086 16.717 17.411 18.233 19.164 19.98 20.633 20.868 20.76 20.46 20.093 19.706 19.334 18.957 18.591 18.226 17.896 17.586 17.292 17.009 16.749 16.52 16.264 16.014 15.798 15.576 15.328 15.104 14.874 14.649 14.472 14.286 14.077 13.85 13.628 13.473 13.316 13.076 12.893 12.703 12.609 12.41 12.197 11.964 11.83 11.55 11.436 11.308 11.167 10.83 10.637 10.438 10.21 9.952 9.673 9.309 7.995 -3 ,9481 ,TETRA ,17601087,Sun Nov 28 14:31:17 CET,Sun Nov 28 16:19:41 CET,0.0 3.58 4.202 4.601 4.921 5.206 5.513 5.809 6.269 6.467 6.655 6.848 7.184 7.352 7.636 7.909 8.173 8.301 8.548 8.782 9.12 9.337 9.542 9.839 10.113 10.364 10.619 10.868 11.165 11.446 11.722 12.049 12.36 12.678 13.052 13.441 13.81 14.222 14.636 15.057 15.492 15.982 16.559 17.116 17.721 18.352 19.014 19.727 20.531 21.382 22.199 22.493 22.474 22.339 22.142 21.887 21.585 21.291 21.019 20.726 20.424 20.108 19.802 19.511 19.214 18.953 18.691 18.445 18.216 17.963 17.704 17.481 17.239 16.986 16.777 16.56 16.35 16.15 15.956 15.809 15.648 15.39 15.219 15.038 14.942 14.747 14.534 14.316 14.201 13.93 13.814 13.664 13.499 13.157 12.968 12.767 12.545 12.275 11.932 11.512 10.012 -4 ,28505 ,TETRA ,17601088,Sun Nov 28 14:31:12 CET,Sun Nov 28 16:20:17 CET,0.0 2.116 2.743 3.207 3.543 3.844 4.122 4.375 4.857 5.061 5.232 5.369 5.683 5.837 6.112 6.393 6.662 6.784 7.02 7.246 7.588 7.814 8.02 8.303 8.563 8.806 9.036 9.277 9.615 9.933 10.232 10.574 10.898 11.207 11.545 11.932 12.318 12.727 13.143 13.59 14.064 14.577 15.149 15.702 16.325 16.972 17.653 18.421 19.273 20.208 21.138 21.556 21.53 21.315 21.051 20.765 20.438 20.12 19.843 19.537 19.267 19.034 18.813 18.592 18.368 18.151 17.896 17.674 17.465 17.248 17.062 16.908 16.734 16.548 16.396 16.224 16.051 15.872 15.688 15.564 15.425 15.204 15.046 14.874 14.792 14.618 14.431 14.234 14.131 13.874 13.762 13.63 13.502 13.215 13.045 12.861 12.665 12.465 12.238 11.908 10.701 -5 ,3353 ,TETRA ,17601089,Sun Nov 28 14:31:13 CET,Sun Nov 28 16:20:16 CET,0.0 2.07 2.715 3.147 3.488 3.803 4.084 4.313 4.744 4.953 5.132 5.294 5.594 5.731 6.026 6.323 6.598 6.723 6.954 7.176 7.494 7.705 7.911 8.208 8.499 8.778 9.047 9.297 9.617 9.929 10.21 10.522 10.834 11.14 11.477 11.843 12.188 12.572 12.958 13.344 13.765 14.262 14.807 15.313 15.907 16.531 17.231 17.964 18.732 19.601 20.425 20.773 20.666 20.355 20.016 19.654 19.295 18.94 18.59 18.219 17.899 17.611 17.326 17.053 16.792 16.542 16.267 16.013 15.8 15.584 15.346 15.141 14.931 14.713 14.546 14.371 14.187 13.989 13.759 13.606 13.45 13.2 13.034 12.853 12.753 12.558 12.358 12.134 12.008 11.728 11.578 11.426 11.288 11.013 10.845 10.629 10.386 10.124 9.834 9.475 8.101 -6 ,20132 ,TETRA ,17601090,Sun Nov 28 14:31:37 CET,Sun Nov 28 16:20:33 CET,0.0 2.111 2.75 3.243 3.588 3.859 4.133 4.38 4.807 5.0 5.197 5.417 5.743 5.906 6.194 6.452 6.698 6.812 7.038 7.263 7.574 7.778 7.963 8.22 8.477 8.724 8.989 9.267 9.589 9.861 10.125 10.446 10.751 11.034 11.347 11.708 12.09 12.535 12.994 13.454 13.907 14.381 14.9 15.395 15.981 16.636 17.349 18.123 18.998 19.84 20.52 20.875 20.849 20.638 20.364 20.007 19.643 19.286 18.958 18.595 18.262 17.954 17.641 17.357 17.097 16.858 16.598 16.347 16.131 15.909 15.674 15.47 15.255 15.031 14.854 14.67 14.476 14.264 14.049 13.903 13.74 13.483 13.303 13.113 13.011 12.799 12.589 12.376 12.261 11.999 11.882 11.743 11.601 11.289 11.121 10.925 10.701 10.461 10.204 9.876 8.44 -7 ,17391 ,TETRA ,17601091,Sun Nov 28 14:31:37 CET,Sun Nov 28 16:21:46 CET,0.0 2.018 2.616 3.015 3.333 3.645 3.935 4.207 4.696 4.896 5.063 5.225 5.535 5.686 5.989 6.278 6.542 6.661 6.879 7.084 7.391 7.59 7.78 8.051 8.312 8.562 8.79 9.015 9.307 9.605 9.892 10.217 10.525 10.819 11.163 11.545 11.922 12.329 12.747 13.186 13.645 14.151 14.728 15.306 15.94 16.571 17.251 18.025 18.902 19.752 20.431 20.674 20.591 20.4 20.185 19.903 19.619 19.348 19.066 18.726 18.425 18.16 17.876 17.587 17.315 17.066 16.808 16.578 16.371 16.147 15.912 15.722 15.535 15.341 15.191 15.035 14.863 14.68 14.5 14.37 14.214 13.973 13.827 13.67 13.582 13.389 13.177 12.966 12.853 12.583 12.463 12.329 12.194 11.861 11.658 11.45 11.214 10.909 10.539 10.106 8.639 -8 ,10742 ,TETRA ,17601092,Sun Nov 28 14:31:41 CET,Sun Nov 28 16:20:27 CET,0.0 3.303 3.986 4.467 4.854 5.189 5.515 5.808 6.258 6.44 6.615 6.775 7.076 7.208 7.461 7.723 7.977 8.099 8.328 8.542 8.846 9.04 9.237 9.515 9.768 10.007 10.241 10.476 10.762 11.025 11.285 11.58 11.854 12.121 12.434 12.778 13.1 13.493 13.935 14.39 14.829 15.284 15.804 16.326 16.942 17.6 18.303 19.013 19.778 20.586 21.358 21.722 21.649 21.382 21.1 20.826 20.54 20.253 19.956 19.616 19.322 19.038 18.752 18.495 18.247 17.994 17.707 17.456 17.23 16.994 16.754 16.549 16.342 16.128 15.951 15.766 15.565 15.351 15.129 14.972 14.813 14.574 14.403 14.222 14.132 13.94 13.737 13.531 13.427 13.168 13.054 12.906 12.746 12.415 12.24 12.058 11.854 11.607 11.328 10.952 9.769 -9 ,20614 ,TETRA ,17601093,Sun Nov 28 14:31:37 CET,Sun Nov 28 16:20:12 CET,0.0 2.153 2.755 3.213 3.583 3.907 4.207 4.459 4.897 5.106 5.297 5.497 5.823 5.982 6.293 6.564 6.819 6.949 7.202 7.436 7.769 7.976 8.17 8.447 8.719 8.974 9.199 9.414 9.703 9.987 10.237 10.521 10.806 11.084 11.407 11.757 12.07 12.407 12.779 13.164 13.567 14.02 14.512 14.997 15.561 16.209 16.956 17.733 18.566 19.364 20.085 20.394 20.339 20.063 19.733 19.39 19.026 18.657 18.32 17.971 17.672 17.391 17.08 16.765 16.479 16.231 15.983 15.729 15.476 15.207 14.917 14.678 14.455 14.22 14.036 13.859 13.664 13.448 13.227 13.074 12.917 12.691 12.517 12.327 12.236 12.041 11.826 11.601 11.486 11.221 11.095 10.951 10.784 10.405 10.227 10.046 9.846 9.61 9.352 9.054 7.334 -10 ,25127 ,TETRA ,17601094,Sun Nov 28 14:31:37 CET,Sun Nov 28 16:20:05 CET,0.0 2.094 2.705 3.178 3.555 3.856 4.113 4.369 4.816 5.003 5.16 5.288 5.583 5.72 5.979 6.215 6.455 6.581 6.824 7.044 7.338 7.525 7.712 8.001 8.286 8.533 8.759 8.992 9.287 9.54 9.778 10.083 10.383 10.661 10.958 11.28 11.599 11.95 12.311 12.698 13.119 13.577 14.102 14.62 15.226 15.896 16.633 17.416 18.211 18.986 19.715 20.048 20.025 19.868 19.629 19.268 18.889 18.551 18.223 17.854 17.523 17.255 17.018 16.785 16.565 16.338 16.103 15.904 15.724 15.544 15.36 15.197 15.024 14.832 14.674 14.518 14.339 14.149 13.969 13.846 13.721 13.542 13.406 13.248 13.165 12.972 12.781 12.583 12.474 12.22 12.118 11.98 11.828 11.494 11.307 11.124 10.911 10.636 10.352 10.006 9.017 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_45.txt deleted file mode 100644 index 45d37f0e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_45.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27686 ,TETRA ,17601095,Sun Nov 28 14:31:38 CET,Sun Nov 28 16:22:35 CET,0.0 2.195 2.828 3.258 3.558 3.835 4.093 4.328 4.772 4.963 5.142 5.328 5.642 5.785 6.069 6.345 6.599 6.718 6.934 7.144 7.45 7.652 7.843 8.094 8.338 8.572 8.791 9.0 9.26 9.502 9.727 9.994 10.26 10.525 10.827 11.169 11.469 11.745 12.034 12.352 12.675 13.05 13.482 13.885 14.318 14.795 15.334 15.874 16.427 16.972 17.404 17.437 17.168 16.659 16.164 15.783 15.435 15.086 14.774 14.446 14.157 13.891 13.619 13.347 13.099 12.892 12.666 12.429 12.221 12.009 11.76 11.533 11.327 11.134 10.979 10.82 10.658 10.487 10.291 10.157 10.026 9.811 9.657 9.481 9.388 9.206 9.02 8.812 8.706 8.452 8.401 8.278 8.153 7.874 7.671 7.452 7.248 7.027 6.766 6.395 4.571 -2 ,10664 ,TETRA ,17601096,Sun Nov 28 14:31:38 CET,Sun Nov 28 16:22:02 CET,0.0 2.823 3.539 3.969 4.288 4.599 4.869 5.085 5.436 5.594 5.742 5.893 6.203 6.347 6.615 6.858 7.091 7.202 7.42 7.621 7.891 8.068 8.246 8.502 8.741 8.961 9.174 9.388 9.66 9.926 10.173 10.467 10.75 10.99 11.268 11.59 11.896 12.23 12.58 12.93 13.293 13.72 14.188 14.606 15.085 15.613 16.199 16.782 17.387 17.972 18.373 18.449 18.216 17.812 17.371 16.927 16.531 16.16 15.801 15.416 15.095 14.819 14.525 14.23 13.953 13.692 13.428 13.192 12.967 12.722 12.476 12.256 12.022 11.795 11.609 11.409 11.207 10.989 10.762 10.615 10.44 10.126 9.936 9.751 9.657 9.469 9.259 9.036 8.92 8.64 8.499 8.34 8.184 7.851 7.664 7.474 7.299 7.094 6.817 6.487 5.391 -3 ,16181 ,TETRA ,17601097,Sun Nov 28 14:31:40 CET,Sun Nov 28 16:21:31 CET,0.0 1.744 2.378 2.82 3.187 3.508 3.769 4.01 4.44 4.625 4.81 4.987 5.295 5.447 5.75 6.03 6.26 6.363 6.549 6.732 7.005 7.162 7.318 7.563 7.768 7.951 8.143 8.341 8.599 8.847 9.086 9.355 9.595 9.826 10.098 10.389 10.673 10.992 11.314 11.641 11.99 12.375 12.804 13.208 13.64 14.083 14.599 15.167 15.747 16.305 16.683 16.674 16.465 16.138 15.753 15.349 14.96 14.594 14.262 13.938 13.666 13.389 13.117 12.86 12.61 12.379 12.138 11.898 11.684 11.494 11.302 11.117 10.911 10.706 10.55 10.367 10.165 9.962 9.758 9.624 9.489 9.274 9.118 8.949 8.867 8.693 8.492 8.284 8.175 7.906 7.818 7.703 7.59 7.328 7.184 7.011 6.789 6.562 6.309 5.916 4.799 -4 ,19000 ,TETRA ,17601098,Sun Nov 28 14:31:39 CET,Sun Nov 28 16:22:08 CET,0.0 2.363 2.952 3.382 3.747 4.048 4.308 4.561 5.004 5.193 5.367 5.521 5.828 5.961 6.209 6.45 6.669 6.771 6.958 7.138 7.408 7.574 7.734 7.97 8.203 8.43 8.642 8.844 9.109 9.354 9.581 9.852 10.123 10.39 10.685 11.015 11.305 11.607 11.943 12.3 12.676 13.079 13.514 13.944 14.428 14.898 15.406 16.0 16.691 17.34 17.749 17.701 17.376 16.915 16.506 16.1 15.67 15.263 14.92 14.556 14.213 13.896 13.569 13.254 12.973 12.714 12.434 12.176 11.953 11.715 11.461 11.239 11.004 10.764 10.577 10.394 10.206 9.985 9.755 9.598 9.43 9.159 8.969 8.784 8.687 8.48 8.273 8.028 7.886 7.593 7.451 7.297 7.13 6.745 6.549 6.354 6.153 5.909 5.601 5.228 4.371 -5 ,26081 ,TETRA ,17601099,Sun Nov 28 14:31:41 CET,Sun Nov 28 16:21:58 CET,0.0 2.311 2.909 3.34 3.678 3.929 4.129 4.339 4.761 4.939 5.091 5.233 5.526 5.656 5.913 6.159 6.402 6.52 6.734 6.943 7.237 7.419 7.605 7.862 8.095 8.3 8.507 8.736 9.031 9.314 9.584 9.896 10.203 10.491 10.808 11.178 11.518 11.865 12.214 12.576 12.968 13.392 13.863 14.315 14.815 15.364 15.938 16.489 17.075 17.632 17.96 17.86 17.534 17.132 16.72 16.297 15.933 15.576 15.211 14.836 14.524 14.235 13.929 13.601 13.297 13.032 12.748 12.503 12.275 12.032 11.792 11.588 11.365 11.128 10.929 10.729 10.544 10.355 10.154 10.015 9.88 9.671 9.525 9.374 9.289 9.114 8.938 8.756 8.664 8.408 8.331 8.2 8.049 7.717 7.53 7.341 7.132 6.872 6.534 6.101 4.856 -6 ,11738 ,TETRA ,17601100,Sun Nov 28 14:31:44 CET,Sun Nov 28 16:22:00 CET,0.0 1.944 2.445 2.842 3.172 3.445 3.712 3.948 4.346 4.512 4.683 4.871 5.179 5.323 5.575 5.819 6.056 6.167 6.392 6.596 6.877 7.059 7.23 7.488 7.725 7.935 8.146 8.35 8.605 8.846 9.093 9.407 9.665 9.89 10.155 10.454 10.73 11.021 11.325 11.663 12.033 12.42 12.851 13.267 13.722 14.216 14.78 15.347 15.909 16.504 16.963 16.999 16.702 16.296 15.876 15.449 15.053 14.655 14.273 13.879 13.557 13.264 12.966 12.681 12.406 12.144 11.865 11.6 11.369 11.134 10.878 10.667 10.445 10.206 10.02 9.833 9.64 9.442 9.222 9.056 8.883 8.629 8.458 8.262 8.16 7.95 7.707 7.455 7.331 7.06 6.967 6.838 6.697 6.388 6.196 5.963 5.728 5.503 5.268 4.946 4.108 -7 ,435 ,TETRA ,17601101,Sun Nov 28 14:31:40 CET,Sun Nov 28 16:22:11 CET,0.0 2.275 2.869 3.34 3.721 4.024 4.286 4.532 4.969 5.168 5.359 5.544 5.852 5.992 6.253 6.501 6.753 6.878 7.121 7.353 7.655 7.838 8.039 8.326 8.578 8.824 9.071 9.305 9.593 9.876 10.175 10.536 10.876 11.156 11.442 11.766 12.06 12.372 12.702 13.07 13.458 13.879 14.337 14.765 15.238 15.75 16.322 16.909 17.519 18.093 18.535 18.631 18.417 18.032 17.61 17.166 16.683 16.234 15.869 15.477 15.126 14.821 14.504 14.193 13.917 13.666 13.397 13.137 12.921 12.701 12.454 12.236 11.995 11.76 11.575 11.363 11.146 10.937 10.71 10.535 10.343 10.072 9.907 9.718 9.62 9.42 9.221 9.016 8.898 8.608 8.45 8.29 8.118 7.742 7.537 7.323 7.096 6.854 6.575 6.216 5.231 -8 ,23123 ,TETRA ,17601102,Sun Nov 28 14:31:40 CET,Sun Nov 28 16:21:27 CET,0.0 1.706 2.336 2.784 3.17 3.487 3.773 4.031 4.434 4.602 4.769 4.974 5.312 5.472 5.769 6.071 6.348 6.464 6.689 6.926 7.26 7.466 7.656 7.899 8.13 8.348 8.533 8.719 8.983 9.215 9.426 9.676 9.907 10.131 10.4 10.7 11.0 11.337 11.67 12.003 12.338 12.726 13.223 13.693 14.173 14.684 15.214 15.746 16.275 16.748 17.094 17.082 16.851 16.576 16.241 15.876 15.529 15.198 14.896 14.574 14.3 14.057 13.803 13.526 13.261 13.029 12.782 12.557 12.372 12.176 11.961 11.789 11.61 11.413 11.261 11.099 10.924 10.748 10.562 10.431 10.286 10.061 9.907 9.736 9.654 9.49 9.292 9.065 8.948 8.683 8.604 8.479 8.353 8.071 7.912 7.745 7.569 7.263 6.855 6.48 5.405 -9 ,13262 ,TETRA ,17601103,Sun Nov 28 14:31:41 CET,Sun Nov 28 16:21:34 CET,0.0 2.286 2.85 3.309 3.667 3.957 4.201 4.404 4.744 4.905 5.059 5.224 5.536 5.663 5.915 6.193 6.459 6.574 6.794 6.984 7.239 7.404 7.59 7.86 8.077 8.312 8.539 8.735 8.977 9.21 9.444 9.736 10.031 10.303 10.584 10.883 11.183 11.532 11.893 12.254 12.613 13.01 13.495 13.954 14.468 15.037 15.609 16.156 16.714 17.279 17.694 17.665 17.376 17.013 16.639 16.225 15.81 15.428 15.092 14.713 14.363 14.051 13.729 13.434 13.156 12.895 12.617 12.345 12.122 11.894 11.639 11.436 11.227 11.011 10.84 10.647 10.444 10.229 10.016 9.872 9.715 9.457 9.282 9.117 9.038 8.871 8.671 8.464 8.362 8.099 7.983 7.829 7.677 7.373 7.2 7.016 6.811 6.555 6.248 5.81 4.352 -10 ,1251 ,TETRA ,17601104,Sun Nov 28 14:31:44 CET,Sun Nov 28 16:21:21 CET,0.0 1.971 2.552 2.996 3.332 3.628 3.921 4.165 4.576 4.749 4.896 5.031 5.325 5.45 5.683 5.917 6.137 6.231 6.419 6.613 6.882 7.057 7.243 7.53 7.792 8.023 8.245 8.461 8.732 8.98 9.219 9.501 9.759 10.002 10.289 10.608 10.911 11.253 11.611 11.975 12.358 12.788 13.279 13.75 14.247 14.761 15.286 15.781 16.315 16.876 17.263 17.145 16.847 16.518 16.128 15.68 15.248 14.849 14.5 14.132 13.793 13.507 13.215 12.919 12.641 12.38 12.097 11.833 11.597 11.346 11.086 10.865 10.647 10.447 10.278 10.09 9.9 9.69 9.467 9.311 9.146 8.893 8.715 8.527 8.435 8.242 8.038 7.813 7.705 7.448 7.361 7.226 7.069 6.759 6.589 6.378 6.117 5.847 5.556 5.2 3.868 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_48.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_48.txt deleted file mode 100644 index 1a190eaf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_28_48.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10969 ,TETRA ,17601105,Sun Nov 28 14:31:45 CET,Sun Nov 28 16:20:26 CET,0.0 1.695 2.331 2.754 3.076 3.358 3.594 3.796 4.173 4.337 4.485 4.618 4.919 5.053 5.295 5.51 5.709 5.808 6.013 6.216 6.482 6.64 6.796 7.014 7.215 7.41 7.612 7.803 8.031 8.261 8.474 8.709 8.913 9.082 9.318 9.611 9.858 10.137 10.391 10.568 10.771 11.016 11.27 11.506 11.71 11.901 12.059 12.099 12.024 11.765 11.146 10.129 9.124 8.197 7.3 6.484 5.76 5.082 4.512 3.944 3.431 2.975 2.55 2.158 1.795 1.459 1.102 0.793 0.541 0.261 -0.052 -0.316 -0.585 -0.865 -1.083 -1.313 -1.562 -1.819 -2.093 -2.288 -2.494 -2.818 -3.053 -3.298 -3.413 -3.648 -3.893 -4.146 -4.289 -4.616 -4.774 -4.947 -5.129 -5.503 -5.7 -5.922 -6.165 -6.422 -6.754 -7.245 -8.669 -2 ,17778 ,TETRA ,17601106,Sun Nov 28 14:31:40 CET,Sun Nov 28 16:20:38 CET,0.0 2.03 2.465 2.772 3.058 3.317 3.564 3.773 4.207 4.411 4.559 4.673 4.973 5.138 5.463 5.724 5.933 6.045 6.262 6.457 6.724 6.893 7.066 7.296 7.502 7.691 7.872 8.053 8.265 8.459 8.654 8.893 9.136 9.359 9.596 9.864 10.126 10.397 10.671 10.936 11.179 11.426 11.715 11.956 12.15 12.376 12.549 12.605 12.574 12.33 11.527 10.338 9.314 8.401 7.585 6.832 6.137 5.492 4.921 4.333 3.838 3.415 3.012 2.622 2.247 1.895 1.525 1.206 0.923 0.631 0.321 0.049 -0.234 -0.518 -0.731 -0.951 -1.185 -1.443 -1.706 -1.882 -2.068 -2.363 -2.566 -2.778 -2.889 -3.133 -3.389 -3.634 -3.764 -4.075 -4.185 -4.321 -4.468 -4.874 -5.112 -5.348 -5.621 -5.939 -6.307 -6.777 -8.506 -3 ,2090 ,TETRA ,17601107,Sun Nov 28 14:31:43 CET,Sun Nov 28 16:20:04 CET,0.0 1.775 2.284 2.672 2.988 3.254 3.513 3.765 4.239 4.442 4.628 4.803 5.102 5.242 5.483 5.684 5.868 5.957 6.144 6.326 6.58 6.737 6.882 7.088 7.298 7.501 7.681 7.852 8.06 8.269 8.491 8.74 8.958 9.154 9.363 9.626 9.873 10.124 10.397 10.65 10.896 11.204 11.568 11.794 12.013 12.284 12.541 12.759 12.816 12.67 12.168 11.291 10.464 9.571 8.692 7.934 7.236 6.59 6.049 5.503 5.028 4.605 4.2 3.811 3.453 3.117 2.742 2.395 2.074 1.731 1.403 1.15 0.9 0.647 0.446 0.239 0.025 -0.198 -0.431 -0.603 -0.777 -1.043 -1.243 -1.458 -1.565 -1.781 -2.017 -2.268 -2.398 -2.712 -2.863 -3.037 -3.238 -3.649 -3.868 -4.129 -4.44 -4.773 -5.166 -5.728 -7.426 -4 ,27433 ,TETRA ,17601108,Sun Nov 28 14:31:45 CET,Sun Nov 28 16:20:24 CET,0.0 2.479 3.152 3.618 3.968 4.266 4.506 4.714 5.097 5.269 5.421 5.568 5.862 5.985 6.228 6.457 6.669 6.773 6.972 7.146 7.388 7.543 7.7 7.928 8.143 8.336 8.495 8.645 8.841 9.031 9.226 9.471 9.697 9.905 10.123 10.343 10.534 10.759 11.039 11.3 11.548 11.861 12.202 12.485 12.758 13.003 13.205 13.383 13.528 13.494 12.988 11.957 10.965 10.083 9.285 8.556 7.886 7.249 6.685 6.126 5.654 5.202 4.766 4.366 3.995 3.639 3.249 2.926 2.652 2.354 2.046 1.8 1.536 1.252 1.043 0.829 0.593 0.34 0.072 -0.127 -0.337 -0.671 -0.905 -1.152 -1.28 -1.547 -1.8 -2.058 -2.207 -2.525 -2.647 -2.801 -2.967 -3.334 -3.547 -3.798 -4.053 -4.356 -4.69 -5.225 -7.724 -5 ,26885 ,TETRA ,17601109,Sun Nov 28 14:31:41 CET,Sun Nov 28 16:20:04 CET,0.0 2.205 2.844 3.297 3.662 4.022 4.311 4.545 4.949 5.131 5.324 5.552 5.859 5.973 6.182 6.379 6.566 6.661 6.833 7.004 7.266 7.423 7.559 7.75 7.928 8.083 8.236 8.407 8.624 8.818 9.015 9.265 9.498 9.714 9.946 10.221 10.493 10.765 11.04 11.304 11.584 11.89 12.216 12.49 12.697 12.86 13.058 13.23 13.266 13.043 12.304 11.207 10.194 9.31 8.537 7.811 7.139 6.475 5.878 5.259 4.702 4.206 3.721 3.283 2.885 2.504 2.101 1.749 1.433 1.069 0.691 0.382 0.072 -0.215 -0.437 -0.672 -0.92 -1.19 -1.463 -1.647 -1.826 -2.08 -2.264 -2.459 -2.571 -2.833 -3.095 -3.387 -3.55 -3.887 -4.064 -4.237 -4.42 -4.839 -5.071 -5.339 -5.641 -5.959 -6.357 -6.977 -8.887 -6 ,25892 ,TETRA ,17601110,Sun Nov 28 14:31:39 CET,Sun Nov 28 16:20:19 CET,0.0 2.258 2.659 2.991 3.295 3.576 3.827 4.032 4.406 4.589 4.753 4.907 5.209 5.33 5.542 5.758 5.971 6.08 6.295 6.495 6.752 6.896 7.046 7.288 7.511 7.711 7.895 8.071 8.293 8.499 8.689 8.901 9.098 9.288 9.524 9.771 9.976 10.183 10.395 10.609 10.82 11.033 11.25 11.445 11.678 11.947 12.184 12.31 12.31 12.121 11.58 10.69 9.736 8.793 7.947 7.207 6.554 5.948 5.412 4.849 4.373 3.963 3.56 3.165 2.796 2.45 2.061 1.701 1.386 1.043 0.666 0.363 0.072 -0.235 -0.477 -0.733 -1.013 -1.302 -1.596 -1.802 -2.011 -2.335 -2.561 -2.795 -2.924 -3.182 -3.429 -3.688 -3.829 -4.14 -4.281 -4.454 -4.634 -5.009 -5.227 -5.517 -5.896 -6.333 -6.802 -7.316 -9.028 -7 ,22607 ,TETRA ,17601111,Sun Nov 28 14:31:41 CET,Sun Nov 28 16:21:13 CET,0.0 2.076 2.531 2.874 3.172 3.416 3.641 3.831 4.168 4.339 4.489 4.589 4.877 5.014 5.256 5.47 5.676 5.776 5.964 6.143 6.407 6.576 6.749 6.972 7.172 7.368 7.546 7.729 7.971 8.204 8.418 8.645 8.839 9.029 9.29 9.603 9.884 10.165 10.449 10.721 10.99 11.245 11.436 11.607 11.774 11.921 12.061 12.118 12.063 11.771 11.002 9.852 8.742 7.765 6.948 6.189 5.469 4.813 4.264 3.675 3.14 2.685 2.236 1.803 1.402 1.026 0.641 0.326 0.063 -0.24 -0.562 -0.817 -1.106 -1.401 -1.619 -1.859 -2.117 -2.389 -2.67 -2.862 -3.048 -3.338 -3.553 -3.78 -3.893 -4.139 -4.414 -4.698 -4.847 -5.169 -5.331 -5.499 -5.675 -6.064 -6.277 -6.524 -6.793 -7.106 -7.504 -7.992 -9.471 -8 ,15238 ,TETRA ,17601112,Sun Nov 28 14:31:43 CET,Sun Nov 28 16:21:13 CET,0.0 2.289 2.882 3.303 3.656 3.979 4.259 4.498 4.884 5.06 5.232 5.386 5.683 5.81 6.051 6.275 6.51 6.621 6.799 6.967 7.231 7.4 7.551 7.765 7.982 8.176 8.365 8.555 8.782 8.997 9.2 9.441 9.662 9.883 10.127 10.377 10.591 10.786 11.008 11.255 11.518 11.808 12.087 12.344 12.607 12.831 13.083 13.289 13.296 13.11 12.564 11.597 10.636 9.711 8.87 8.035 7.184 6.422 5.836 5.242 4.715 4.245 3.785 3.357 2.96 2.571 2.172 1.831 1.523 1.207 0.871 0.587 0.282 -0.021 -0.228 -0.452 -0.707 -0.968 -1.234 -1.424 -1.627 -1.943 -2.152 -2.363 -2.476 -2.718 -2.96 -3.205 -3.341 -3.655 -3.796 -3.952 -4.114 -4.5 -4.72 -4.938 -5.226 -5.598 -5.961 -6.441 -8.83 -9 ,24695 ,TETRA ,17601113,Sun Nov 28 14:31:45 CET,Sun Nov 28 16:21:13 CET,0.0 2.034 2.569 2.989 3.342 3.61 3.819 4.011 4.375 4.547 4.695 4.799 5.101 5.241 5.486 5.725 5.97 6.086 6.3 6.506 6.808 6.996 7.182 7.443 7.672 7.889 8.091 8.281 8.519 8.738 8.938 9.188 9.434 9.643 9.859 10.089 10.299 10.53 10.759 10.978 11.206 11.437 11.681 11.917 12.164 12.356 12.481 12.558 12.511 12.225 11.532 10.441 9.414 8.487 7.641 6.873 6.195 5.607 5.095 4.522 3.995 3.554 3.151 2.767 2.412 2.079 1.7 1.345 1.036 0.72 0.372 0.08 -0.215 -0.541 -0.797 -1.072 -1.347 -1.602 -1.873 -2.066 -2.265 -2.578 -2.796 -3.018 -3.139 -3.408 -3.684 -3.965 -4.112 -4.429 -4.587 -4.765 -4.951 -5.337 -5.563 -5.83 -6.132 -6.463 -6.838 -7.351 -9.642 -10 ,8679 ,TETRA ,17601114,Sun Nov 28 14:31:47 CET,Sun Nov 28 16:21:12 CET,0.0 2.271 2.833 3.275 3.64 3.929 4.163 4.378 4.761 4.94 5.106 5.236 5.518 5.638 5.872 6.105 6.317 6.415 6.607 6.796 7.06 7.22 7.381 7.626 7.861 8.074 8.274 8.463 8.705 8.936 9.135 9.352 9.567 9.775 9.988 10.219 10.421 10.645 10.914 11.165 11.404 11.676 11.973 12.262 12.584 12.819 12.968 13.105 13.23 13.198 12.677 11.732 10.844 9.982 9.232 8.573 7.974 7.362 6.804 6.26 5.797 5.386 4.983 4.581 4.2 3.853 3.475 3.159 2.902 2.611 2.315 2.079 1.818 1.541 1.327 1.116 0.903 0.66 0.396 0.204 0.003 -0.28 -0.47 -0.675 -0.789 -1.035 -1.274 -1.519 -1.652 -1.965 -2.079 -2.238 -2.412 -2.804 -3.025 -3.252 -3.511 -3.844 -4.224 -4.716 -6.106 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_29_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_29_42.txt deleted file mode 100644 index e2800171..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_29_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22628 ,TETRA ,17601115,Sun Nov 28 14:31:41 CET,Sun Nov 28 16:20:59 CET,0.0 2.098 2.673 3.09 3.481 3.806 4.089 4.332 4.749 4.935 5.123 5.328 5.643 5.792 6.093 6.381 6.666 6.791 7.01 7.237 7.567 7.766 7.954 8.228 8.487 8.733 8.969 9.21 9.514 9.793 10.079 10.423 10.726 11.005 11.344 11.728 12.08 12.482 12.914 13.343 13.798 14.321 14.926 15.526 16.234 17.012 17.897 18.864 19.881 21.006 22.26 23.071 23.287 23.237 23.095 22.936 22.707 22.428 22.163 21.882 21.629 21.378 21.11 20.836 20.569 20.317 20.048 19.798 19.574 19.344 19.093 18.883 18.662 18.42 18.235 18.031 17.812 17.598 17.382 17.22 17.041 16.764 16.566 16.334 16.202 15.913 15.645 15.414 15.279 14.965 14.786 14.615 14.418 13.976 13.745 13.497 13.208 12.858 12.403 11.778 8.877 -2 ,13790 ,TETRA ,17601116,Sun Nov 28 14:31:42 CET,Sun Nov 28 16:20:59 CET,0.0 2.732 3.289 3.685 4.05 4.365 4.658 4.929 5.354 5.54 5.716 5.905 6.225 6.375 6.662 6.944 7.22 7.352 7.589 7.805 8.12 8.321 8.517 8.809 9.081 9.331 9.573 9.807 10.097 10.365 10.626 10.932 11.224 11.523 11.894 12.29 12.657 13.085 13.557 14.032 14.505 15.05 15.681 16.31 17.002 17.729 18.589 19.486 20.45 21.597 22.754 23.442 23.669 23.618 23.366 23.05 22.781 22.524 22.251 21.948 21.676 21.39 21.099 20.825 20.541 20.28 20.035 19.814 19.605 19.377 19.12 18.889 18.655 18.42 18.235 18.039 17.834 17.608 17.369 17.203 17.027 16.756 16.57 16.374 16.27 16.038 15.794 15.565 15.447 15.158 15.013 14.859 14.686 14.229 13.948 13.656 13.358 13.06 12.687 12.138 9.167 -3 ,17180 ,TETRA ,17601117,Sun Nov 28 14:31:43 CET,Sun Nov 28 16:20:59 CET,0.0 1.477 1.948 2.288 2.592 2.885 3.149 3.394 3.817 4.011 4.198 4.412 4.738 4.9 5.233 5.525 5.784 5.908 6.14 6.351 6.657 6.874 7.083 7.343 7.586 7.823 8.085 8.36 8.708 9.035 9.309 9.603 9.91 10.229 10.575 10.917 11.229 11.576 11.991 12.492 13.003 13.548 14.198 14.83 15.511 16.21 17.031 17.952 18.902 19.967 21.145 21.851 22.093 22.077 21.949 21.769 21.559 21.283 20.952 20.606 20.319 20.051 19.773 19.47 19.172 18.895 18.605 18.347 18.113 17.868 17.608 17.408 17.203 16.969 16.792 16.616 16.428 16.214 15.986 15.836 15.685 15.429 15.249 15.048 14.932 14.708 14.472 14.203 14.041 13.707 13.462 13.257 13.059 12.571 12.284 12.003 11.677 11.283 10.826 10.17 7.958 -4 ,29335 ,TETRA ,17601118,Sun Nov 28 14:31:45 CET,Sun Nov 28 16:20:59 CET,0.0 1.947 2.529 2.904 3.241 3.571 3.835 4.067 4.515 4.716 4.899 5.068 5.378 5.532 5.828 6.088 6.326 6.443 6.663 6.871 7.166 7.361 7.567 7.867 8.147 8.43 8.715 8.977 9.291 9.593 9.875 10.197 10.52 10.85 11.206 11.589 11.964 12.356 12.779 13.256 13.763 14.3 14.888 15.458 16.108 16.82 17.61 18.495 19.497 20.641 21.842 22.528 22.694 22.673 22.533 22.284 22.006 21.728 21.444 21.167 20.943 20.697 20.405 20.114 19.832 19.558 19.271 19.016 18.799 18.571 18.314 18.075 17.828 17.564 17.357 17.155 16.951 16.741 16.513 16.343 16.163 15.878 15.67 15.465 15.359 15.126 14.889 14.647 14.518 14.222 14.065 13.894 13.709 13.305 13.078 12.834 12.537 12.202 11.797 11.16 9.232 -5 ,19085 ,TETRA ,17601119,Sun Nov 28 14:31:42 CET,Sun Nov 28 16:21:24 CET,0.0 2.389 2.993 3.443 3.838 4.162 4.45 4.712 5.14 5.319 5.488 5.643 5.945 6.079 6.337 6.58 6.83 6.954 7.187 7.42 7.753 7.951 8.136 8.394 8.654 8.899 9.124 9.356 9.662 9.953 10.227 10.532 10.847 11.172 11.535 11.944 12.326 12.749 13.193 13.63 14.083 14.578 15.176 15.794 16.439 17.128 17.923 18.866 19.931 20.968 22.143 22.927 23.093 23.049 22.921 22.677 22.422 22.153 21.861 21.533 21.217 20.936 20.695 20.45 20.181 19.923 19.667 19.431 19.197 18.972 18.748 18.537 18.309 18.076 17.902 17.712 17.516 17.317 17.088 16.929 16.767 16.515 16.35 16.17 16.072 15.855 15.63 15.401 15.26 14.95 14.772 14.599 14.408 13.968 13.719 13.463 13.178 12.845 12.471 11.971 9.716 -6 ,28512 ,TETRA ,17601120,Sun Nov 28 14:31:44 CET,Sun Nov 28 16:21:06 CET,0.0 2.007 2.598 2.984 3.259 3.514 3.764 4.017 4.506 4.722 4.907 5.082 5.408 5.561 5.839 6.089 6.341 6.475 6.735 6.959 7.261 7.461 7.657 7.92 8.161 8.413 8.643 8.859 9.144 9.417 9.675 9.985 10.284 10.572 10.925 11.338 11.714 12.093 12.477 12.869 13.296 13.768 14.303 14.835 15.473 16.262 17.148 18.033 18.997 20.095 21.371 22.128 22.371 22.431 22.312 22.07 21.796 21.482 21.198 20.906 20.638 20.383 20.146 19.928 19.704 19.471 19.207 18.959 18.737 18.512 18.278 18.071 17.85 17.622 17.452 17.267 17.055 16.837 16.6 16.424 16.243 15.951 15.733 15.519 15.41 15.177 14.928 14.653 14.511 14.217 14.046 13.858 13.627 13.168 12.954 12.715 12.429 12.072 11.655 11.055 9.246 -7 ,9394 ,TETRA ,17601121,Sun Nov 28 14:31:42 CET,Sun Nov 28 16:20:49 CET,0.0 2.619 3.148 3.549 3.854 4.127 4.382 4.628 5.03 5.206 5.376 5.549 5.866 6.005 6.263 6.509 6.761 6.879 7.099 7.315 7.631 7.837 8.032 8.312 8.563 8.797 9.045 9.286 9.585 9.872 10.161 10.5 10.797 11.075 11.41 11.796 12.153 12.526 12.936 13.372 13.836 14.354 14.945 15.525 16.175 16.904 17.78 18.703 19.71 20.838 21.992 22.764 23.013 23.008 22.877 22.673 22.416 22.115 21.836 21.549 21.282 21.013 20.746 20.473 20.203 19.957 19.687 19.433 19.208 18.962 18.709 18.512 18.299 18.066 17.887 17.689 17.489 17.281 17.061 16.874 16.667 16.388 16.194 15.962 15.835 15.609 15.381 15.113 14.963 14.661 14.494 14.318 14.119 13.623 13.335 13.018 12.628 12.173 11.694 11.068 8.354 -8 ,30859 ,TETRA ,17601122,Sun Nov 28 14:32:08 CET,Sun Nov 28 16:21:05 CET,0.0 2.277 2.848 3.249 3.608 3.935 4.218 4.448 4.9 5.118 5.303 5.465 5.781 5.935 6.224 6.498 6.766 6.899 7.143 7.349 7.662 7.879 8.094 8.398 8.681 8.951 9.213 9.468 9.767 10.054 10.346 10.68 11.014 11.347 11.701 12.093 12.462 12.854 13.267 13.682 14.119 14.596 15.158 15.758 16.428 17.131 17.968 18.887 19.861 21.006 22.271 23.051 23.255 23.219 23.066 22.798 22.488 22.186 21.913 21.631 21.362 21.061 20.766 20.492 20.197 19.927 19.645 19.384 19.158 18.942 18.725 18.52 18.314 18.105 17.932 17.741 17.531 17.308 17.07 16.897 16.716 16.439 16.234 16.0 15.89 15.697 15.489 15.259 15.132 14.847 14.728 14.579 14.419 14.098 13.925 13.724 13.519 13.258 12.909 12.453 11.129 -9 ,11763 ,TETRA ,17601123,Sun Nov 28 14:32:08 CET,Sun Nov 28 16:22:14 CET,0.0 1.531 2.066 2.499 2.854 3.16 3.442 3.701 4.13 4.342 4.545 4.771 5.113 5.275 5.588 5.903 6.191 6.33 6.599 6.847 7.181 7.385 7.595 7.892 8.15 8.384 8.627 8.87 9.18 9.466 9.734 10.075 10.416 10.737 11.097 11.488 11.862 12.263 12.674 13.106 13.548 14.055 14.641 15.212 15.868 16.587 17.412 18.312 19.345 20.512 21.762 22.617 22.893 22.938 22.838 22.597 22.357 22.102 21.834 21.539 21.273 21.022 20.77 20.516 20.249 19.992 19.729 19.481 19.253 19.026 18.767 18.549 18.331 18.089 17.898 17.693 17.481 17.257 16.994 16.808 16.624 16.342 16.141 15.926 15.811 15.573 15.323 15.059 14.921 14.626 14.432 14.227 14.012 13.532 13.276 13.036 12.788 12.462 12.009 11.34 8.925 -10 ,2600 ,TETRA ,17601124,Sun Nov 28 14:32:07 CET,Sun Nov 28 16:20:50 CET,0.0 1.774 2.31 2.655 2.958 3.251 3.499 3.717 4.136 4.348 4.528 4.69 5.005 5.16 5.479 5.789 6.066 6.19 6.431 6.668 6.987 7.178 7.361 7.627 7.892 8.151 8.402 8.637 8.923 9.206 9.485 9.833 10.164 10.48 10.839 11.239 11.635 12.058 12.481 12.923 13.365 13.87 14.487 15.095 15.749 16.413 17.259 18.233 19.249 20.367 21.609 22.426 22.667 22.651 22.554 22.342 22.049 21.783 21.52 21.221 20.958 20.693 20.416 20.165 19.916 19.674 19.397 19.135 18.923 18.694 18.433 18.205 17.972 17.732 17.539 17.343 17.156 16.945 16.698 16.525 16.345 16.066 15.861 15.639 15.53 15.303 15.039 14.771 14.643 14.355 14.163 13.969 13.783 13.418 13.225 12.997 12.714 12.356 11.916 11.297 8.704 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_30_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_30_31.txt deleted file mode 100644 index 421ec3ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_30_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13382 ,TETRA ,17601125,Sun Nov 28 14:32:09 CET,Sun Nov 28 16:20:06 CET,0.0 0.927 1.309 1.59 1.855 2.138 2.395 2.614 2.991 3.186 3.376 3.524 3.815 3.953 4.229 4.489 4.747 4.866 5.092 5.324 5.65 5.853 6.056 6.355 6.641 6.913 7.177 7.445 7.794 8.117 8.425 8.799 9.154 9.491 9.872 10.302 10.726 11.199 11.71 12.246 12.816 13.465 14.25 15.065 16.014 17.079 18.341 19.786 21.458 23.427 25.846 27.925 29.166 29.967 30.48 30.829 31.091 31.266 31.352 31.402 31.432 31.421 31.377 31.316 31.25 31.19 31.132 31.088 31.041 30.982 30.916 30.849 30.789 30.718 30.636 30.546 30.472 30.399 30.311 30.244 30.169 30.056 29.983 29.912 29.869 29.775 29.677 29.565 29.504 29.303 29.293 29.21 29.108 28.883 28.78 28.667 28.522 28.357 28.13 27.827 26.778 -2 ,572 ,TETRA ,17601126,Sun Nov 28 14:32:08 CET,Sun Nov 28 16:20:42 CET,0.0 1.214 1.647 1.934 2.183 2.424 2.64 2.832 3.179 3.331 3.484 3.644 3.956 4.102 4.384 4.623 4.839 4.949 5.172 5.388 5.689 5.876 6.06 6.326 6.594 6.862 7.121 7.365 7.679 7.981 8.268 8.618 8.964 9.296 9.672 10.111 10.535 10.995 11.487 12.012 12.583 13.223 13.986 14.777 15.698 16.746 17.966 19.369 21.02 23.023 25.503 27.629 28.885 29.637 30.162 30.507 30.717 30.841 30.906 30.951 30.962 30.952 30.942 30.923 30.88 30.84 30.791 30.723 30.658 30.602 30.533 30.456 30.372 30.285 30.211 30.134 30.059 29.969 29.846 29.764 29.688 29.572 29.485 29.377 29.324 29.212 29.074 28.918 28.837 28.625 28.575 28.477 28.377 28.14 28.009 27.854 27.663 27.463 27.263 26.93 26.076 -3 ,18743 ,TETRA ,17601127,Sun Nov 28 14:32:10 CET,Sun Nov 28 16:20:23 CET,0.0 1.287 1.658 1.931 2.177 2.416 2.64 2.825 3.149 3.301 3.45 3.588 3.908 4.048 4.303 4.546 4.788 4.902 5.123 5.336 5.647 5.844 6.031 6.31 6.567 6.813 7.065 7.32 7.659 7.966 8.248 8.597 8.939 9.266 9.641 10.075 10.495 10.955 11.466 12.019 12.591 13.226 13.99 14.786 15.711 16.776 18.035 19.444 21.085 22.982 25.407 27.577 28.825 29.603 30.1 30.44 30.672 30.815 30.885 30.933 30.957 30.953 30.939 30.882 30.805 30.736 30.67 30.61 30.55 30.488 30.426 30.357 30.266 30.175 30.107 30.022 29.931 29.838 29.733 29.663 29.581 29.447 29.358 29.262 29.214 29.124 29.021 28.894 28.813 28.598 28.58 28.495 28.41 28.224 28.104 27.967 27.812 27.651 27.47 27.255 26.656 -4 ,9966 ,TETRA ,17601128,Sun Nov 28 14:32:08 CET,Sun Nov 28 16:21:25 CET,0.0 1.144 1.542 1.858 2.142 2.385 2.616 2.84 3.242 3.42 3.587 3.738 4.038 4.165 4.401 4.627 4.856 4.974 5.2 5.414 5.736 5.948 6.156 6.459 6.745 7.015 7.271 7.521 7.847 8.164 8.467 8.816 9.162 9.499 9.895 10.359 10.791 11.254 11.759 12.301 12.858 13.494 14.271 15.077 16.014 17.051 18.255 19.654 21.346 23.354 25.792 27.849 29.065 29.861 30.392 30.755 30.975 31.114 31.196 31.227 31.232 31.24 31.212 31.155 31.098 31.039 30.971 30.904 30.836 30.76 30.681 30.615 30.547 30.464 30.391 30.307 30.226 30.156 30.073 30.008 29.934 29.82 29.747 29.661 29.616 29.509 29.383 29.246 29.172 28.959 28.934 28.842 28.721 28.481 28.361 28.226 28.075 27.926 27.764 27.507 26.925 -5 ,14874 ,TETRA ,17601129,Sun Nov 28 14:32:08 CET,Sun Nov 28 16:20:20 CET,0.0 0.454 0.788 1.033 1.287 1.539 1.766 1.978 2.373 2.549 2.715 2.877 3.182 3.321 3.615 3.89 4.139 4.264 4.501 4.716 5.033 5.246 5.452 5.736 6.009 6.276 6.537 6.792 7.12 7.441 7.744 8.104 8.458 8.802 9.195 9.632 10.053 10.539 11.065 11.637 12.239 12.901 13.679 14.475 15.428 16.486 17.707 19.127 20.796 22.759 25.195 27.244 28.493 29.301 29.82 30.162 30.393 30.557 30.645 30.702 30.712 30.684 30.644 30.602 30.565 30.521 30.448 30.366 30.294 30.218 30.136 30.061 29.967 29.858 29.775 29.692 29.611 29.522 29.424 29.348 29.266 29.132 29.034 28.939 28.885 28.768 28.651 28.532 28.469 28.268 28.249 28.161 28.065 27.851 27.739 27.627 27.486 27.276 26.986 26.674 26.003 -6 ,31019 ,TETRA ,17601130,Sun Nov 28 14:32:08 CET,Sun Nov 28 16:20:17 CET,0.0 1.279 1.721 2.048 2.335 2.567 2.776 2.967 3.3 3.467 3.627 3.762 4.065 4.199 4.436 4.661 4.891 5.005 5.225 5.436 5.752 5.948 6.129 6.404 6.669 6.923 7.183 7.435 7.739 8.017 8.297 8.667 9.026 9.356 9.721 10.146 10.575 11.048 11.564 12.102 12.668 13.327 14.102 14.907 15.848 16.904 18.168 19.594 21.308 23.348 25.871 27.951 29.127 29.886 30.399 30.749 30.976 31.125 31.21 31.258 31.269 31.264 31.233 31.185 31.12 31.038 30.956 30.875 30.813 30.729 30.577 30.441 30.309 30.175 30.06 29.947 29.837 29.705 29.574 29.489 29.402 29.25 29.136 29.042 28.994 28.878 28.743 28.595 28.521 28.299 28.231 28.123 28.034 27.864 27.766 27.641 27.442 27.19 26.927 26.578 25.757 -7 ,24251 ,TETRA ,17601131,Sun Nov 28 14:32:09 CET,Sun Nov 28 16:21:05 CET,0.0 1.199 1.629 1.984 2.282 2.516 2.732 2.956 3.331 3.49 3.653 3.794 4.095 4.235 4.503 4.746 4.974 5.085 5.309 5.523 5.821 6.015 6.199 6.462 6.731 6.997 7.244 7.488 7.812 8.138 8.452 8.811 9.156 9.506 9.911 10.354 10.772 11.23 11.742 12.313 12.904 13.562 14.347 15.153 16.116 17.19 18.421 19.813 21.497 23.542 26.071 28.175 29.365 30.117 30.623 30.949 31.172 31.295 31.352 31.394 31.401 31.382 31.353 31.318 31.284 31.236 31.164 31.102 31.041 30.964 30.865 30.756 30.632 30.525 30.457 30.381 30.292 30.216 30.132 30.06 29.98 29.846 29.755 29.658 29.603 29.488 29.376 29.261 29.192 28.98 28.952 28.869 28.786 28.605 28.508 28.391 28.251 28.105 27.928 27.667 26.882 -8 ,17358 ,TETRA ,17601132,Sun Nov 28 14:32:09 CET,Sun Nov 28 16:21:04 CET,0.0 0.903 1.288 1.608 1.88 2.11 2.32 2.504 2.841 3.009 3.181 3.332 3.639 3.784 4.069 4.329 4.552 4.66 4.888 5.108 5.405 5.588 5.774 6.044 6.314 6.589 6.851 7.095 7.416 7.732 8.024 8.378 8.721 9.056 9.431 9.849 10.271 10.745 11.265 11.805 12.37 13.038 13.833 14.635 15.574 16.64 17.906 19.339 21.024 23.04 25.54 27.668 28.952 29.718 30.196 30.534 30.737 30.856 30.937 31.002 31.041 31.052 31.043 31.001 30.944 30.896 30.831 30.752 30.667 30.573 30.469 30.395 30.33 30.243 30.163 30.089 30.013 29.922 29.824 29.749 29.683 29.585 29.489 29.385 29.334 29.226 29.108 28.979 28.911 28.706 28.688 28.606 28.516 28.324 28.219 28.088 27.94 27.781 27.569 27.241 26.446 -9 ,12210 ,TETRA ,17601133,Sun Nov 28 14:32:11 CET,Sun Nov 28 16:20:10 CET,0.0 0.953 1.348 1.652 1.9 2.122 2.329 2.528 2.888 3.056 3.217 3.341 3.634 3.767 4.036 4.296 4.524 4.633 4.863 5.077 5.367 5.56 5.756 6.061 6.366 6.642 6.91 7.173 7.528 7.859 8.161 8.526 8.873 9.208 9.611 10.061 10.477 10.939 11.432 11.966 12.551 13.219 13.987 14.765 15.698 16.744 17.968 19.365 20.996 22.996 25.536 27.687 28.931 29.675 30.17 30.535 30.773 30.915 31.004 31.075 31.104 31.096 31.075 31.04 30.987 30.919 30.836 30.75 30.677 30.605 30.515 30.426 30.319 30.215 30.142 30.062 29.974 29.866 29.739 29.656 29.57 29.425 29.327 29.223 29.159 29.014 28.854 28.694 28.62 28.401 28.348 28.247 28.13 27.879 27.736 27.588 27.427 27.235 27.007 26.703 25.947 -10 ,27334 ,TETRA ,17601134,Sun Nov 28 14:32:14 CET,Sun Nov 28 16:20:25 CET,0.0 0.869 1.337 1.728 2.059 2.325 2.568 2.794 3.19 3.355 3.514 3.654 3.961 4.1 4.349 4.585 4.81 4.923 5.145 5.373 5.714 5.927 6.121 6.405 6.686 6.95 7.192 7.427 7.737 8.033 8.329 8.697 9.05 9.385 9.794 10.245 10.667 11.125 11.604 12.146 12.745 13.412 14.19 14.949 15.844 16.894 18.13 19.555 21.27 23.325 25.836 27.963 29.243 30.045 30.534 30.837 31.028 31.14 31.189 31.224 31.248 31.235 31.2 31.155 31.104 31.052 30.989 30.931 30.871 30.793 30.695 30.607 30.514 30.417 30.341 30.267 30.178 30.066 29.957 29.89 29.817 29.68 29.58 29.473 29.416 29.288 29.149 29.013 28.933 28.702 28.63 28.522 28.405 28.137 28.005 27.878 27.719 27.513 27.274 27.016 26.57 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_30_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_30_32.txt deleted file mode 100644 index a4065939..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_30_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27575 ,KEBNE ,17027127,Wed Dec 22 16:06:54 CET,Wed Dec 22 17:39:36 CET,0.0 1.288 1.679 2.013 2.307 2.553 2.767 2.964 3.356 3.54 3.699 3.823 4.11 4.229 4.476 4.714 4.922 5.022 5.216 5.406 5.671 5.836 6.003 6.244 6.462 6.674 6.874 7.067 7.312 7.531 7.747 8.008 8.255 8.491 8.77 9.065 9.328 9.619 9.933 10.259 10.595 10.973 11.386 11.786 12.246 12.732 13.256 13.828 14.467 15.074 15.613 15.788 15.667 15.43 15.159 14.875 14.605 14.348 14.091 13.809 13.557 13.318 13.08 12.853 12.649 12.45 12.234 12.04 11.871 11.696 11.486 11.311 11.133 10.942 10.786 10.621 10.456 10.279 10.097 9.97 9.83 9.608 9.459 9.304 9.23 9.085 8.912 8.704 8.602 8.335 8.254 8.134 8.012 7.725 7.556 7.377 7.165 6.915 6.612 6.173 4.823 -2 ,15701 ,KEBNE ,17027128,Wed Dec 22 16:06:55 CET,Wed Dec 22 17:40:04 CET,0.0 2.509 2.95 3.276 3.533 3.728 3.906 4.076 4.357 4.501 4.644 4.731 5.003 5.121 5.347 5.538 5.724 5.81 5.992 6.178 6.42 6.584 6.753 6.985 7.208 7.428 7.626 7.813 8.052 8.274 8.49 8.75 9.006 9.254 9.54 9.867 10.156 10.453 10.789 11.133 11.483 11.886 12.329 12.724 13.17 13.664 14.213 14.798 15.405 16.014 16.571 16.83 16.81 16.62 16.382 16.142 15.882 15.615 15.378 15.126 14.881 14.641 14.398 14.161 13.944 13.743 13.527 13.345 13.178 13.005 12.825 12.664 12.49 12.303 12.15 11.992 11.83 11.649 11.456 11.328 11.192 10.964 10.805 10.632 10.537 10.353 10.18 9.994 9.877 9.598 9.535 9.418 9.283 8.994 8.831 8.634 8.411 8.169 7.912 7.558 6.452 -3 ,26110 ,KEBNE ,17027129,Wed Dec 22 16:06:55 CET,Wed Dec 22 17:39:59 CET,0.0 0.994 1.39 1.717 1.988 2.189 2.343 2.492 2.825 2.991 3.137 3.236 3.513 3.627 3.852 4.07 4.279 4.387 4.575 4.727 4.951 5.097 5.234 5.426 5.607 5.796 5.974 6.144 6.367 6.574 6.764 6.979 7.202 7.42 7.664 7.95 8.217 8.509 8.839 9.169 9.493 9.861 10.279 10.681 11.139 11.663 12.229 12.766 13.359 14.0 14.588 14.803 14.699 14.511 14.304 14.029 13.734 13.45 13.204 12.934 12.684 12.447 12.217 12.024 11.845 11.655 11.455 11.263 11.088 10.911 10.729 10.574 10.399 10.207 10.054 9.886 9.717 9.558 9.384 9.259 9.132 8.927 8.781 8.622 8.535 8.332 8.115 7.907 7.793 7.522 7.438 7.315 7.197 6.924 6.772 6.59 6.4 6.173 5.868 5.465 4.048 -4 ,18700 ,KEBNE ,17027130,Wed Dec 22 16:06:55 CET,Wed Dec 22 17:39:46 CET,0.0 1.06 1.43 1.722 1.999 2.244 2.462 2.691 3.079 3.229 3.375 3.494 3.771 3.874 4.074 4.269 4.456 4.545 4.734 4.938 5.236 5.411 5.561 5.767 5.961 6.136 6.306 6.48 6.702 6.916 7.12 7.351 7.568 7.794 8.079 8.383 8.653 8.929 9.206 9.516 9.848 10.211 10.635 11.053 11.49 11.961 12.49 13.022 13.582 14.178 14.714 14.856 14.749 14.581 14.368 14.107 13.853 13.583 13.327 13.069 12.839 12.62 12.383 12.157 11.95 11.761 11.568 11.361 11.167 10.971 10.772 10.608 10.439 10.269 10.126 9.975 9.835 9.679 9.497 9.368 9.246 9.062 8.917 8.766 8.689 8.531 8.351 8.136 8.015 7.728 7.593 7.436 7.295 7.026 6.865 6.696 6.532 6.309 6.014 5.605 4.081 -5 ,10426 ,KEBNE ,17027131,Wed Dec 22 16:06:55 CET,Wed Dec 22 17:39:47 CET,0.0 1.281 1.707 2.038 2.331 2.596 2.829 3.021 3.371 3.519 3.657 3.756 4.037 4.159 4.395 4.616 4.825 4.922 5.109 5.288 5.531 5.683 5.828 6.032 6.215 6.396 6.583 6.748 6.942 7.138 7.334 7.575 7.811 8.032 8.282 8.565 8.834 9.122 9.436 9.77 10.109 10.473 10.893 11.3 11.747 12.209 12.726 13.305 13.955 14.608 15.202 15.431 15.359 15.128 14.857 14.588 14.317 14.052 13.804 13.506 13.244 13.005 12.785 12.576 12.357 12.155 11.954 11.761 11.58 11.394 11.194 11.024 10.846 10.658 10.511 10.37 10.226 10.055 9.874 9.744 9.594 9.344 9.158 8.959 8.857 8.647 8.408 8.142 8.014 7.747 7.653 7.522 7.392 7.082 6.89 6.65 6.381 6.064 5.707 5.356 3.907 -6 ,11884 ,KEBNE ,17027132,Wed Dec 22 16:06:54 CET,Wed Dec 22 17:40:09 CET,0.0 1.797 2.281 2.633 2.942 3.219 3.474 3.703 4.104 4.278 4.418 4.546 4.872 5.023 5.285 5.548 5.806 5.932 6.173 6.399 6.721 6.91 7.07 7.29 7.507 7.715 7.899 8.076 8.311 8.536 8.766 9.046 9.301 9.527 9.774 10.071 10.35 10.638 10.944 11.264 11.602 11.97 12.379 12.785 13.244 13.708 14.233 14.817 15.438 16.089 16.651 16.822 16.736 16.551 16.276 15.934 15.575 15.251 14.989 14.714 14.473 14.241 14.0 13.76 13.533 13.313 13.08 12.877 12.701 12.523 12.345 12.197 12.029 11.837 11.691 11.543 11.386 11.22 11.046 10.937 10.822 10.615 10.467 10.306 10.221 10.046 9.868 9.677 9.571 9.305 9.233 9.111 8.971 8.674 8.517 8.336 8.14 7.9 7.602 7.249 6.207 -7 ,10943 ,KEBNE ,17027133,Wed Dec 22 16:06:55 CET,Wed Dec 22 17:39:49 CET,0.0 1.278 1.731 2.053 2.352 2.597 2.83 3.056 3.45 3.619 3.772 3.891 4.177 4.292 4.505 4.711 4.901 4.991 5.169 5.345 5.586 5.739 5.898 6.118 6.319 6.512 6.698 6.881 7.097 7.287 7.473 7.714 7.945 8.172 8.439 8.711 8.962 9.248 9.546 9.852 10.165 10.518 10.94 11.359 11.839 12.34 12.888 13.447 14.072 14.715 15.269 15.498 15.45 15.274 15.024 14.734 14.458 14.2 13.965 13.704 13.454 13.221 12.987 12.747 12.524 12.316 12.101 11.907 11.724 11.528 11.324 11.147 10.955 10.757 10.604 10.435 10.255 10.078 9.885 9.744 9.605 9.383 9.221 9.052 8.968 8.786 8.57 8.335 8.221 7.95 7.873 7.746 7.609 7.307 7.137 6.955 6.752 6.506 6.151 5.673 4.278 -8 ,18550 ,KEBNE ,17027134,Wed Dec 22 16:06:55 CET,Wed Dec 22 17:39:49 CET,0.0 1.679 2.142 2.445 2.687 2.9 3.086 3.261 3.574 3.719 3.859 3.958 4.243 4.359 4.564 4.77 4.978 5.071 5.249 5.425 5.673 5.823 5.963 6.173 6.371 6.552 6.733 6.913 7.131 7.342 7.55 7.785 8.016 8.239 8.488 8.773 9.031 9.313 9.627 9.943 10.28 10.655 11.089 11.532 12.019 12.525 13.042 13.583 14.215 14.896 15.491 15.739 15.709 15.542 15.284 15.021 14.76 14.483 14.239 13.968 13.706 13.46 13.227 13.001 12.775 12.565 12.358 12.166 11.995 11.818 11.633 11.478 11.3 11.104 10.967 10.827 10.667 10.498 10.32 10.196 10.069 9.86 9.701 9.537 9.449 9.276 9.101 8.9 8.789 8.52 8.452 8.333 8.206 7.9 7.741 7.56 7.364 7.169 6.855 6.363 5.078 -9 ,2615 ,KEBNE ,17027135,Wed Dec 22 16:06:54 CET,Wed Dec 22 17:40:01 CET,0.0 1.275 1.711 2.035 2.325 2.567 2.775 2.95 3.235 3.365 3.494 3.59 3.878 3.993 4.204 4.411 4.615 4.719 4.913 5.085 5.326 5.486 5.641 5.847 6.041 6.226 6.394 6.564 6.805 7.032 7.231 7.464 7.71 7.966 8.255 8.549 8.802 9.085 9.386 9.707 10.04 10.402 10.835 11.272 11.743 12.22 12.762 13.363 13.984 14.609 15.153 15.348 15.263 15.047 14.792 14.517 14.255 14.001 13.761 13.504 13.256 13.023 12.79 12.542 12.312 12.112 11.914 11.735 11.555 11.35 11.133 10.962 10.783 10.593 10.441 10.289 10.136 9.966 9.798 9.681 9.542 9.311 9.139 8.949 8.853 8.64 8.4 8.183 8.075 7.8 7.695 7.548 7.391 7.061 6.864 6.643 6.403 6.138 5.846 5.41 3.845 -10 ,31022 ,KEBNE ,17027136,Wed Dec 22 16:07:57 CET,Wed Dec 22 17:40:54 CET,0.0 1.113 1.568 1.889 2.147 2.357 2.542 2.715 3.039 3.182 3.313 3.386 3.67 3.797 4.037 4.252 4.445 4.536 4.708 4.874 5.122 5.273 5.417 5.632 5.834 6.025 6.203 6.368 6.584 6.79 6.989 7.233 7.479 7.722 8.003 8.306 8.574 8.858 9.18 9.52 9.844 10.201 10.619 11.029 11.485 11.963 12.478 13.055 13.693 14.3 14.848 15.066 14.95 14.697 14.446 14.165 13.875 13.605 13.361 13.12 12.883 12.662 12.44 12.209 11.996 11.786 11.553 11.345 11.159 10.964 10.759 10.591 10.416 10.238 10.096 9.941 9.776 9.602 9.426 9.302 9.169 8.953 8.805 8.648 8.567 8.4 8.214 8.017 7.914 7.652 7.572 7.444 7.32 7.072 6.906 6.694 6.459 6.193 5.86 5.405 3.523 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_30_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_30_38.txt deleted file mode 100644 index 49a8692a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_30_38.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17956 ,TETRA ,17601135,Sun Nov 28 14:32:10 CET,Sun Nov 28 16:22:14 CET,0.0 3.47 4.199 4.738 5.18 5.561 5.877 6.154 6.669 6.909 7.124 7.338 7.682 7.861 8.2 8.512 8.805 8.953 9.225 9.483 9.867 10.087 10.295 10.6 10.895 11.164 11.434 11.7 12.025 12.319 12.587 12.938 13.283 13.619 14.038 14.483 14.891 15.343 15.815 16.307 16.799 17.334 17.962 18.595 19.338 20.13 20.969 21.849 22.748 23.64 24.259 24.273 23.895 23.455 23.054 22.656 22.231 21.812 21.503 21.217 20.945 20.67 20.424 20.192 19.95 19.726 19.497 19.268 19.06 18.857 18.626 18.403 18.148 17.889 17.693 17.481 17.259 17.029 16.781 16.615 16.444 16.153 15.944 15.741 15.638 15.418 15.175 14.921 14.792 14.494 14.368 14.215 14.041 13.674 13.472 13.249 13.014 12.738 12.352 11.797 10.297 -2 ,12766 ,TETRA ,17601136,Sun Nov 28 14:32:11 CET,Sun Nov 28 16:22:10 CET,0.0 3.217 3.965 4.55 4.986 5.331 5.608 5.863 6.328 6.528 6.719 6.916 7.24 7.384 7.672 7.974 8.242 8.362 8.596 8.832 9.177 9.415 9.677 10.053 10.409 10.752 11.07 11.356 11.698 12.034 12.394 12.866 13.293 13.663 14.043 14.429 14.787 15.189 15.627 16.065 16.508 16.995 17.572 18.14 18.78 19.479 20.245 21.018 21.854 22.737 23.494 23.758 23.701 23.457 23.115 22.733 22.326 21.954 21.599 21.206 20.868 20.537 20.206 19.904 19.63 19.378 19.063 18.747 18.482 18.207 17.91 17.68 17.437 17.172 16.962 16.735 16.527 16.333 16.138 15.993 15.822 15.549 15.366 15.182 15.081 14.862 14.627 14.349 14.189 13.868 13.732 13.573 13.389 12.971 12.748 12.512 12.248 11.941 11.593 11.072 9.201 -3 ,28294 ,TETRA ,17601137,Sun Nov 28 14:32:14 CET,Sun Nov 28 16:22:11 CET,0.0 5.563 6.467 7.11 7.566 7.967 8.311 8.624 9.213 9.465 9.697 9.954 10.311 10.501 10.856 11.174 11.456 11.593 11.852 12.094 12.494 12.751 12.95 13.237 13.538 13.833 14.119 14.384 14.711 15.017 15.294 15.627 15.945 16.244 16.592 16.984 17.361 17.76 18.193 18.666 19.143 19.67 20.25 20.798 21.433 22.118 22.837 23.544 24.331 25.252 26.007 26.2 26.066 25.774 25.426 25.019 24.612 24.227 23.851 23.471 23.143 22.839 22.545 22.269 21.988 21.693 21.396 21.149 20.932 20.706 20.463 20.249 20.044 19.836 19.664 19.482 19.298 19.109 18.908 18.76 18.603 18.38 18.209 18.028 17.935 17.723 17.483 17.236 17.111 16.813 16.689 16.536 16.367 16.011 15.806 15.584 15.303 14.929 14.485 13.966 12.16 -4 ,9506 ,TETRA ,17601138,Sun Nov 28 14:32:10 CET,Sun Nov 28 16:21:52 CET,0.0 3.831 4.625 5.224 5.668 6.041 6.403 6.715 7.236 7.482 7.712 7.947 8.292 8.465 8.79 9.117 9.429 9.57 9.844 10.099 10.449 10.671 10.886 11.199 11.502 11.798 12.077 12.348 12.699 13.021 13.331 13.725 14.084 14.413 14.79 15.181 15.539 15.949 16.387 16.839 17.318 17.849 18.482 19.091 19.788 20.55 21.36 22.24 23.201 24.194 25.092 25.508 25.445 25.13 24.78 24.448 24.121 23.773 23.438 23.058 22.724 22.416 22.091 21.773 21.462 21.163 20.872 20.634 20.418 20.193 19.962 19.752 19.532 19.32 19.155 18.982 18.788 18.583 18.395 18.27 18.132 17.897 17.745 17.58 17.478 17.281 17.105 16.907 16.79 16.506 16.396 16.225 16.024 15.617 15.4 15.134 14.809 14.435 13.99 13.368 10.915 -5 ,21824 ,TETRA ,17601139,Sun Nov 28 14:32:11 CET,Sun Nov 28 16:21:53 CET,0.0 4.198 5.008 5.561 6.016 6.418 6.723 7.0 7.53 7.777 8.009 8.278 8.628 8.809 9.161 9.497 9.793 9.932 10.212 10.476 10.833 11.048 11.273 11.623 11.942 12.26 12.566 12.839 13.199 13.56 13.889 14.262 14.632 14.986 15.378 15.813 16.234 16.698 17.186 17.698 18.222 18.805 19.469 20.097 20.803 21.58 22.396 23.199 24.01 24.848 25.582 25.768 25.677 25.442 25.126 24.788 24.43 24.094 23.764 23.388 23.071 22.792 22.51 22.22 21.95 21.695 21.423 21.184 20.964 20.738 20.504 20.287 20.059 19.828 19.639 19.453 19.277 19.1 18.906 18.769 18.622 18.365 18.17 17.978 17.886 17.694 17.493 17.284 17.176 16.899 16.767 16.604 16.43 16.058 15.86 15.638 15.384 15.092 14.769 14.242 12.269 -7 ,14866 ,TETRA ,17601141,Sun Nov 28 14:32:16 CET,Sun Nov 28 16:21:28 CET,0.0 4.267 5.113 5.677 6.127 6.543 6.925 7.262 7.84 8.096 8.33 8.59 8.933 9.103 9.431 9.722 9.997 10.135 10.397 10.647 10.99 11.209 11.419 11.716 12.011 12.289 12.55 12.807 13.146 13.467 13.755 14.083 14.397 14.694 15.028 15.411 15.77 16.138 16.559 17.03 17.515 18.033 18.594 19.14 19.754 20.419 21.138 21.885 22.709 23.568 24.364 24.545 24.327 23.986 23.623 23.279 22.918 22.53 22.165 21.824 21.534 21.243 20.942 20.672 20.42 20.151 19.855 19.62 19.416 19.199 18.966 18.768 18.544 18.279 18.083 17.903 17.719 17.505 17.261 17.089 16.925 16.672 16.492 16.296 16.186 15.977 15.773 15.558 15.437 15.137 15.002 14.852 14.701 14.351 14.142 13.885 13.597 13.241 12.848 12.35 10.355 -8 ,24973 ,TETRA ,17601142,Sun Nov 28 14:32:11 CET,Sun Nov 28 16:23:48 CET,0.0 3.827 4.478 5.05 5.548 5.928 6.274 6.588 7.12 7.343 7.568 7.834 8.19 8.374 8.704 9.009 9.29 9.423 9.702 9.959 10.318 10.548 10.764 11.069 11.379 11.709 12.037 12.339 12.711 13.066 13.39 13.763 14.123 14.487 14.906 15.352 15.784 16.227 16.689 17.197 17.702 18.239 18.888 19.535 20.243 20.988 21.795 22.605 23.477 24.409 25.242 25.498 25.274 24.9 24.515 24.134 23.732 23.327 22.964 22.594 22.244 21.914 21.594 21.281 20.985 20.699 20.402 20.147 19.921 19.677 19.417 19.203 18.971 18.714 18.517 18.32 18.109 17.87 17.632 17.485 17.324 17.058 16.857 16.645 16.542 16.334 16.13 15.91 15.784 15.49 15.386 15.245 15.09 14.714 14.514 14.307 14.061 13.751 13.363 12.971 11.685 -9 ,891 ,TETRA ,17601143,Sun Nov 28 14:32:14 CET,Sun Nov 28 16:24:09 CET,0.0 5.278 6.19 6.789 7.261 7.614 7.913 8.209 8.736 8.975 9.2 9.423 9.767 9.957 10.329 10.669 10.976 11.126 11.397 11.636 11.988 12.208 12.413 12.704 12.976 13.235 13.49 13.739 14.074 14.391 14.685 15.056 15.417 15.737 16.103 16.514 16.899 17.309 17.739 18.189 18.643 19.147 19.751 20.328 20.992 21.71 22.467 23.295 24.146 24.995 25.775 26.042 25.962 25.718 25.394 25.004 24.614 24.239 23.904 23.553 23.227 22.934 22.649 22.368 22.096 21.858 21.606 21.358 21.143 20.931 20.703 20.505 20.303 20.091 19.92 19.742 19.548 19.347 19.138 18.986 18.835 18.6 18.427 18.238 18.148 17.964 17.749 17.528 17.409 17.103 16.923 16.752 16.587 16.194 15.967 15.728 15.459 15.156 14.792 14.085 10.739 -10 ,12952 ,TETRA ,17601144,Sun Nov 28 14:32:16 CET,Sun Nov 28 16:22:05 CET,0.0 3.465 4.397 5.077 5.599 6.049 6.442 6.763 7.297 7.522 7.732 7.979 8.328 8.508 8.838 9.163 9.471 9.607 9.867 10.12 10.49 10.717 10.93 11.245 11.539 11.812 12.066 12.314 12.639 12.953 13.259 13.626 13.975 14.304 14.661 15.057 15.433 15.831 16.261 16.741 17.234 17.754 18.384 19.006 19.664 20.355 21.11 21.864 22.681 23.517 24.272 24.536 24.33 23.969 23.557 23.147 22.76 22.39 22.042 21.643 21.29 20.987 20.715 20.445 20.184 19.941 19.66 19.395 19.179 18.959 18.71 18.496 18.28 18.05 17.871 17.69 17.487 17.282 17.084 16.942 16.79 16.546 16.379 16.207 16.126 15.959 15.75 15.505 15.386 15.11 15.007 14.86 14.707 14.358 14.153 13.944 13.737 13.482 13.164 12.748 10.866 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_31_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_31_34.txt deleted file mode 100644 index 441d4711..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_31_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11912 ,TETRA ,17601145,Sun Nov 28 14:32:12 CET,Sun Nov 28 16:20:23 CET,0.0 2.099 2.598 2.922 3.235 3.521 3.744 3.925 4.222 4.352 4.485 4.617 4.876 4.986 5.202 5.417 5.612 5.701 5.865 6.023 6.232 6.366 6.519 6.746 6.931 7.092 7.262 7.42 7.602 7.79 7.987 8.212 8.413 8.594 8.792 9.0 9.19 9.412 9.658 9.88 10.069 10.269 10.459 10.581 10.68 10.739 10.721 10.644 10.447 9.997 8.958 7.487 6.198 5.018 3.896 2.922 2.095 1.338 0.705 0.061 -0.506 -1.01 -1.503 -1.982 -2.41 -2.786 -3.192 -3.574 -3.902 -4.238 -4.585 -4.88 -5.176 -5.494 -5.735 -5.948 -6.187 -6.463 -6.739 -6.926 -7.111 -7.423 -7.667 -7.92 -8.053 -8.32 -8.595 -8.871 -9.004 -9.296 -9.464 -9.644 -9.832 -10.233 -10.445 -10.662 -10.893 -11.15 -11.557 -12.108 -13.596 -2 ,12995 ,TETRA ,17601146,Sun Nov 28 14:32:11 CET,Sun Nov 28 16:23:08 CET,0.0 1.067 1.504 1.785 2.031 2.27 2.497 2.702 3.053 3.223 3.385 3.547 3.816 3.943 4.155 4.355 4.56 4.652 4.813 4.973 5.192 5.317 5.444 5.609 5.756 5.911 6.06 6.2 6.364 6.517 6.668 6.832 6.983 7.128 7.305 7.496 7.665 7.83 7.985 8.138 8.293 8.447 8.594 8.752 8.93 9.017 9.008 8.925 8.669 8.113 6.992 5.422 4.037 2.834 1.79 0.859 0.053 -0.668 -1.306 -1.986 -2.587 -3.115 -3.623 -4.107 -4.551 -4.969 -5.39 -5.727 -6.022 -6.339 -6.663 -6.93 -7.212 -7.497 -7.718 -7.947 -8.198 -8.455 -8.719 -8.908 -9.111 -9.432 -9.647 -9.881 -9.998 -10.243 -10.525 -10.825 -10.978 -11.276 -11.429 -11.586 -11.761 -12.149 -12.355 -12.6 -12.891 -13.187 -13.547 -14.125 -15.518 -3 ,17101 ,TETRA ,17601147,Sun Nov 28 14:32:12 CET,Sun Nov 28 16:20:53 CET,0.0 0.925 1.34 1.656 1.956 2.237 2.465 2.653 2.969 3.109 3.251 3.4 3.659 3.777 4.0 4.197 4.378 4.462 4.631 4.797 5.025 5.165 5.294 5.485 5.67 5.86 6.049 6.221 6.433 6.608 6.749 6.902 7.053 7.208 7.384 7.554 7.693 7.853 8.01 8.169 8.342 8.537 8.716 8.826 8.917 8.964 8.955 8.857 8.562 7.966 6.785 5.119 3.634 2.382 1.364 0.41 -0.432 -1.163 -1.81 -2.432 -2.953 -3.436 -3.897 -4.33 -4.745 -5.11 -5.487 -5.839 -6.143 -6.484 -6.831 -7.109 -7.416 -7.731 -7.962 -8.211 -8.477 -8.737 -9.013 -9.206 -9.403 -9.713 -9.936 -10.178 -10.302 -10.543 -10.79 -11.076 -11.231 -11.535 -11.716 -11.881 -12.051 -12.454 -12.669 -12.897 -13.169 -13.468 -13.826 -14.291 -16.265 -4 ,8075 ,TETRA ,17601148,Sun Nov 28 14:32:14 CET,Sun Nov 28 16:20:33 CET,0.0 1.111 1.463 1.736 1.986 2.268 2.517 2.718 3.071 3.227 3.37 3.5 3.758 3.878 4.101 4.306 4.507 4.602 4.784 4.961 5.202 5.348 5.486 5.691 5.885 6.06 6.225 6.381 6.578 6.759 6.937 7.15 7.322 7.49 7.701 7.912 8.099 8.303 8.511 8.708 8.902 9.09 9.274 9.445 9.615 9.773 9.896 9.85 9.586 9.036 7.916 6.391 5.046 3.877 2.839 1.918 1.133 0.409 -0.209 -0.836 -1.391 -1.883 -2.351 -2.796 -3.23 -3.631 -4.049 -4.429 -4.751 -5.08 -5.437 -5.727 -6.036 -6.369 -6.626 -6.909 -7.199 -7.493 -7.809 -8.038 -8.272 -8.621 -8.865 -9.115 -9.24 -9.519 -9.804 -10.097 -10.254 -10.553 -10.75 -10.927 -11.09 -11.484 -11.705 -11.93 -12.198 -12.532 -12.921 -13.444 -14.898 -5 ,24103 ,TETRA ,17601149,Sun Nov 28 14:32:15 CET,Sun Nov 28 16:20:51 CET,0.0 1.294 1.764 2.106 2.366 2.591 2.791 2.959 3.243 3.37 3.493 3.589 3.835 3.944 4.144 4.32 4.487 4.573 4.768 4.955 5.194 5.333 5.44 5.59 5.755 5.916 6.056 6.184 6.341 6.485 6.639 6.827 6.99 7.129 7.278 7.443 7.602 7.777 7.955 8.138 8.321 8.486 8.644 8.798 8.957 9.129 9.258 9.267 9.087 8.561 7.397 5.795 4.382 3.135 2.065 1.093 0.257 -0.513 -1.207 -1.901 -2.491 -3.008 -3.511 -3.977 -4.408 -4.804 -5.219 -5.6 -5.926 -6.277 -6.661 -6.945 -7.218 -7.532 -7.777 -8.014 -8.265 -8.538 -8.827 -9.033 -9.241 -9.559 -9.776 -9.992 -10.102 -10.323 -10.553 -10.79 -10.925 -11.224 -11.392 -11.569 -11.756 -12.148 -12.368 -12.613 -12.883 -13.151 -13.453 -13.933 -15.389 -6 ,10883 ,TETRA ,17601150,Sun Nov 28 14:32:17 CET,Sun Nov 28 16:20:14 CET,0.0 1.805 2.266 2.64 2.957 3.227 3.481 3.705 4.053 4.224 4.395 4.57 4.827 4.935 5.154 5.361 5.553 5.635 5.797 5.969 6.214 6.369 6.508 6.696 6.896 7.089 7.255 7.405 7.596 7.786 7.964 8.166 8.359 8.534 8.729 8.935 9.13 9.335 9.526 9.737 9.963 10.183 10.385 10.553 10.701 10.835 10.919 10.872 10.661 10.151 9.001 7.432 6.066 4.887 3.844 2.871 2.042 1.295 0.642 0.001 -0.553 -1.049 -1.526 -1.986 -2.408 -2.78 -3.167 -3.52 -3.816 -4.132 -4.466 -4.744 -5.04 -5.346 -5.587 -5.823 -6.054 -6.305 -6.598 -6.794 -6.984 -7.283 -7.488 -7.707 -7.821 -8.05 -8.294 -8.567 -8.726 -9.028 -9.182 -9.358 -9.542 -9.96 -10.184 -10.407 -10.671 -11.013 -11.417 -11.933 -13.787 -7 ,17083 ,TETRA ,17601151,Sun Nov 28 14:32:12 CET,Sun Nov 28 16:20:26 CET,0.0 1.292 1.747 2.087 2.383 2.658 2.918 3.169 3.568 3.727 3.881 4.052 4.322 4.453 4.686 4.886 5.07 5.164 5.331 5.468 5.669 5.8 5.917 6.086 6.265 6.426 6.578 6.723 6.897 7.077 7.255 7.446 7.607 7.76 7.927 8.1 8.258 8.429 8.641 8.853 9.046 9.242 9.435 9.6 9.773 9.919 9.991 9.992 9.798 9.272 8.185 6.627 5.214 4.0 2.96 2.043 1.244 0.508 -0.132 -0.766 -1.301 -1.784 -2.231 -2.64 -3.038 -3.399 -3.777 -4.129 -4.43 -4.745 -5.066 -5.335 -5.618 -5.919 -6.179 -6.436 -6.686 -6.938 -7.21 -7.396 -7.586 -7.887 -8.093 -8.317 -8.447 -8.723 -8.989 -9.299 -9.465 -9.772 -10.0 -10.204 -10.412 -10.841 -11.056 -11.317 -11.587 -11.912 -12.331 -12.908 -14.744 -8 ,16036 ,TETRA ,17601152,Sun Nov 28 14:32:13 CET,Sun Nov 28 16:20:56 CET,0.0 2.571 3.048 3.429 3.755 4.043 4.285 4.508 4.935 5.116 5.276 5.443 5.716 5.857 6.107 6.33 6.542 6.64 6.825 7.01 7.272 7.426 7.567 7.751 7.903 8.05 8.201 8.339 8.516 8.687 8.835 9.011 9.188 9.352 9.51 9.685 9.862 10.038 10.21 10.377 10.539 10.707 10.897 11.046 11.165 11.249 11.285 11.216 10.99 10.495 9.408 7.866 6.456 5.235 4.204 3.307 2.496 1.754 1.11 0.479 -0.041 -0.516 -0.981 -1.427 -1.841 -2.211 -2.6 -2.943 -3.227 -3.534 -3.868 -4.147 -4.434 -4.75 -5.008 -5.258 -5.513 -5.771 -6.024 -6.202 -6.391 -6.694 -6.913 -7.149 -7.271 -7.523 -7.784 -8.057 -8.202 -8.506 -8.679 -8.857 -9.067 -9.534 -9.779 -10.017 -10.281 -10.595 -10.946 -11.428 -12.513 -9 ,25180 ,TETRA ,17601153,Sun Nov 28 14:32:14 CET,Sun Nov 28 16:20:51 CET,0.0 1.053 1.509 1.899 2.212 2.446 2.641 2.814 3.148 3.309 3.448 3.566 3.812 3.926 4.144 4.357 4.55 4.644 4.817 4.99 5.249 5.394 5.518 5.697 5.888 6.068 6.221 6.37 6.572 6.773 6.955 7.16 7.356 7.543 7.739 7.939 8.131 8.337 8.557 8.772 8.965 9.156 9.353 9.507 9.66 9.791 9.864 9.874 9.71 9.184 8.055 6.515 5.167 3.96 2.9 1.988 1.174 0.425 -0.218 -0.852 -1.376 -1.849 -2.309 -2.735 -3.141 -3.515 -3.888 -4.223 -4.531 -4.849 -5.174 -5.457 -5.752 -6.068 -6.324 -6.598 -6.889 -7.173 -7.454 -7.65 -7.849 -8.161 -8.374 -8.586 -8.697 -8.931 -9.179 -9.466 -9.617 -9.914 -10.077 -10.241 -10.418 -10.83 -11.073 -11.325 -11.621 -11.977 -12.387 -12.913 -14.434 -10 ,11438 ,TETRA ,17601154,Sun Nov 28 14:32:38 CET,Sun Nov 28 16:20:35 CET,0.0 1.218 1.637 1.942 2.18 2.41 2.626 2.829 3.158 3.288 3.418 3.54 3.794 3.921 4.161 4.374 4.566 4.651 4.808 4.956 5.17 5.301 5.437 5.65 5.854 6.046 6.227 6.393 6.601 6.811 7.004 7.21 7.386 7.552 7.739 7.939 8.123 8.315 8.504 8.698 8.901 9.104 9.306 9.477 9.637 9.763 9.843 9.781 9.572 9.149 8.122 6.618 5.184 3.892 2.834 1.915 1.118 0.419 -0.198 -0.834 -1.388 -1.88 -2.351 -2.788 -3.198 -3.579 -4.01 -4.397 -4.694 -5.044 -5.423 -5.71 -6.021 -6.373 -6.658 -6.935 -7.195 -7.457 -7.727 -7.923 -8.143 -8.501 -8.743 -8.993 -9.127 -9.403 -9.696 -10.009 -10.163 -10.47 -10.676 -10.855 -11.042 -11.448 -11.688 -11.93 -12.174 -12.472 -12.876 -13.362 -14.932 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_32_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_32_43.txt deleted file mode 100644 index 136b7da2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_32_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27728 ,KEBNE ,17027137,Wed Dec 22 16:07:57 CET,Wed Dec 22 17:42:51 CET,0.0 2.893 3.429 3.758 3.999 4.211 4.406 4.574 4.889 5.037 5.167 5.257 5.533 5.651 5.865 6.066 6.263 6.356 6.54 6.717 6.957 7.103 7.243 7.453 7.649 7.827 7.992 8.16 8.376 8.578 8.768 8.989 9.198 9.403 9.644 9.909 10.151 10.411 10.69 10.987 11.277 11.583 11.951 12.287 12.622 12.98 13.357 13.742 14.126 14.452 14.498 14.101 13.589 13.104 12.644 12.146 11.684 11.267 10.891 10.505 10.165 9.866 9.579 9.292 9.002 8.732 8.47 8.25 8.055 7.851 7.636 7.455 7.269 7.062 6.898 6.735 6.573 6.4 6.213 6.072 5.929 5.717 5.566 5.407 5.329 5.166 4.99 4.797 4.69 4.427 4.369 4.255 4.132 3.832 3.673 3.525 3.352 3.142 2.91 2.537 1.507 -2 ,18117 ,KEBNE ,17027138,Wed Dec 22 16:07:58 CET,Wed Dec 22 17:42:00 CET,0.0 1.779 2.151 2.421 2.666 2.871 3.074 3.262 3.574 3.71 3.841 3.942 4.222 4.331 4.519 4.692 4.873 4.959 5.119 5.273 5.495 5.635 5.779 5.993 6.183 6.355 6.522 6.686 6.878 7.062 7.249 7.482 7.707 7.917 8.161 8.409 8.639 8.912 9.193 9.468 9.755 10.059 10.41 10.748 11.115 11.496 11.883 12.262 12.634 12.97 13.056 12.736 12.293 11.752 11.236 10.758 10.321 9.926 9.558 9.171 8.85 8.547 8.237 7.96 7.704 7.46 7.208 6.969 6.758 6.542 6.307 6.125 5.954 5.763 5.608 5.444 5.261 5.071 4.89 4.775 4.648 4.445 4.299 4.151 4.073 3.892 3.7 3.503 3.393 3.12 3.054 2.916 2.768 2.442 2.232 2.028 1.816 1.522 1.188 0.735 -0.941 -3 ,2192 ,KEBNE ,17027139,Wed Dec 22 16:07:57 CET,Wed Dec 22 17:43:30 CET,0.0 2.699 3.407 3.841 4.158 4.4 4.606 4.794 5.14 5.301 5.448 5.554 5.836 5.96 6.212 6.444 6.65 6.749 6.944 7.126 7.385 7.56 7.719 7.924 8.114 8.293 8.463 8.628 8.845 9.044 9.247 9.496 9.716 9.923 10.173 10.446 10.681 10.93 11.208 11.494 11.77 12.081 12.422 12.759 13.12 13.466 13.863 14.266 14.623 14.881 15.002 14.744 14.307 13.826 13.366 12.911 12.46 12.035 11.666 11.292 10.953 10.66 10.387 10.107 9.831 9.582 9.308 9.067 8.865 8.648 8.421 8.237 8.047 7.847 7.703 7.547 7.381 7.207 7.019 6.889 6.752 6.543 6.396 6.246 6.17 6.009 5.833 5.631 5.526 5.263 5.222 5.105 4.969 4.679 4.519 4.343 4.154 3.946 3.68 3.231 2.301 -4 ,22143 ,KEBNE ,17027140,Wed Dec 22 16:07:57 CET,Wed Dec 22 17:43:47 CET,0.0 2.511 3.024 3.393 3.681 3.905 4.11 4.304 4.66 4.829 4.965 5.048 5.332 5.448 5.656 5.852 6.037 6.133 6.313 6.484 6.718 6.867 7.008 7.201 7.403 7.595 7.766 7.937 8.168 8.379 8.575 8.798 9.013 9.217 9.456 9.724 9.979 10.269 10.563 10.845 11.131 11.434 11.784 12.12 12.486 12.882 13.293 13.695 14.09 14.432 14.563 14.268 13.78 13.253 12.757 12.287 11.85 11.404 11.004 10.627 10.3 10.002 9.721 9.455 9.194 8.944 8.657 8.408 8.204 7.989 7.776 7.589 7.388 7.189 7.032 6.866 6.691 6.489 6.283 6.146 6.005 5.794 5.643 5.485 5.406 5.234 5.04 4.84 4.735 4.456 4.366 4.236 4.099 3.767 3.586 3.407 3.21 3.006 2.783 2.524 1.895 -5 ,14356 ,KEBNE ,17027141,Wed Dec 22 16:07:57 CET,Wed Dec 22 17:42:28 CET,0.0 1.597 2.035 2.316 2.57 2.798 2.993 3.166 3.492 3.648 3.803 3.906 4.174 4.291 4.515 4.721 4.919 5.015 5.193 5.353 5.585 5.732 5.872 6.087 6.284 6.46 6.627 6.784 6.989 7.18 7.372 7.607 7.821 8.028 8.264 8.523 8.763 9.028 9.303 9.558 9.813 10.115 10.465 10.769 11.096 11.453 11.82 12.206 12.587 12.852 12.848 12.467 12.006 11.517 11.054 10.612 10.172 9.769 9.396 9.001 8.663 8.355 8.054 7.785 7.539 7.296 7.039 6.807 6.613 6.416 6.199 6.018 5.818 5.603 5.442 5.271 5.083 4.89 4.7 4.564 4.419 4.212 4.078 3.928 3.845 3.669 3.487 3.301 3.207 2.946 2.869 2.734 2.598 2.31 2.139 1.947 1.757 1.519 1.212 0.821 -0.394 -6 ,3810 ,KEBNE ,17027142,Wed Dec 22 16:07:57 CET,Wed Dec 22 17:41:37 CET,0.0 1.134 1.524 1.817 2.074 2.316 2.543 2.744 3.08 3.233 3.387 3.527 3.815 3.945 4.187 4.375 4.547 4.636 4.805 4.959 5.197 5.345 5.468 5.652 5.83 6.006 6.182 6.347 6.558 6.766 6.961 7.183 7.39 7.599 7.848 8.102 8.327 8.587 8.861 9.135 9.417 9.718 10.068 10.405 10.771 11.141 11.522 11.905 12.293 12.617 12.681 12.388 11.958 11.5 11.011 10.502 10.046 9.626 9.278 8.936 8.612 8.312 8.032 7.77 7.503 7.239 6.983 6.776 6.574 6.342 6.105 5.921 5.733 5.544 5.389 5.225 5.064 4.89 4.705 4.582 4.454 4.256 4.107 3.93 3.84 3.666 3.498 3.323 3.227 2.951 2.867 2.739 2.598 2.291 2.128 1.927 1.701 1.472 1.224 0.88 -0.429 -7 ,4722 ,KEBNE ,17027143,Wed Dec 22 16:07:57 CET,Wed Dec 22 17:41:39 CET,0.0 1.484 1.912 2.237 2.503 2.733 2.941 3.12 3.445 3.6 3.744 3.86 4.141 4.258 4.49 4.705 4.887 4.975 5.152 5.321 5.564 5.724 5.866 6.071 6.271 6.45 6.623 6.78 6.981 7.178 7.369 7.611 7.836 8.043 8.269 8.514 8.753 9.02 9.294 9.572 9.86 10.175 10.54 10.87 11.218 11.594 11.976 12.321 12.643 12.908 12.949 12.605 12.132 11.623 11.159 10.694 10.263 9.842 9.454 9.072 8.754 8.462 8.151 7.863 7.602 7.351 7.086 6.855 6.649 6.431 6.211 6.032 5.841 5.637 5.462 5.276 5.095 4.898 4.682 4.527 4.352 4.082 3.899 3.704 3.603 3.385 3.167 2.949 2.829 2.532 2.389 2.245 2.12 1.864 1.726 1.568 1.356 1.092 0.817 0.465 -0.327 -8 ,5576 ,KEBNE ,17027144,Wed Dec 22 16:07:57 CET,Wed Dec 22 17:43:24 CET,0.0 1.388 1.833 2.112 2.344 2.564 2.785 2.98 3.286 3.439 3.585 3.686 3.963 4.083 4.313 4.517 4.706 4.8 4.983 5.141 5.367 5.521 5.663 5.869 6.069 6.243 6.403 6.564 6.769 6.957 7.153 7.39 7.604 7.827 8.071 8.312 8.541 8.8 9.087 9.372 9.664 10.007 10.385 10.723 11.093 11.504 11.934 12.36 12.775 13.112 13.254 12.964 12.504 11.994 11.468 10.956 10.477 10.035 9.664 9.274 8.924 8.573 8.233 7.94 7.658 7.405 7.158 6.946 6.764 6.568 6.353 6.166 5.943 5.685 5.496 5.314 5.137 4.97 4.795 4.664 4.539 4.354 4.208 4.03 3.932 3.749 3.553 3.318 3.199 2.923 2.82 2.696 2.569 2.265 2.093 1.905 1.674 1.379 1.074 0.744 -0.51 -9 ,29508 ,KEBNE ,17027145,Wed Dec 22 16:07:58 CET,Wed Dec 22 17:41:49 CET,0.0 1.805 2.283 2.626 2.957 3.256 3.508 3.723 4.12 4.282 4.43 4.542 4.822 4.947 5.175 5.386 5.576 5.664 5.844 6.021 6.251 6.394 6.528 6.717 6.898 7.071 7.269 7.464 7.685 7.891 8.092 8.338 8.572 8.79 9.02 9.263 9.502 9.766 10.044 10.306 10.576 10.881 11.196 11.503 11.848 12.208 12.619 13.045 13.453 13.756 13.807 13.428 12.917 12.415 11.929 11.453 11.01 10.572 10.176 9.789 9.45 9.164 8.872 8.572 8.294 8.036 7.771 7.526 7.316 7.099 6.87 6.683 6.498 6.301 6.135 5.957 5.782 5.601 5.411 5.285 5.161 4.964 4.816 4.663 4.587 4.412 4.227 4.02 3.918 3.664 3.603 3.48 3.349 3.032 2.872 2.702 2.521 2.326 2.106 1.825 1.041 -10 ,26608 ,KEBNE ,17027146,Wed Dec 22 16:07:57 CET,Wed Dec 22 17:41:59 CET,0.0 1.552 2.071 2.452 2.694 2.924 3.152 3.38 3.776 3.925 4.066 4.167 4.433 4.537 4.751 4.957 5.143 5.231 5.406 5.584 5.841 6.009 6.164 6.381 6.586 6.787 7.001 7.203 7.438 7.658 7.86 8.1 8.339 8.572 8.823 9.086 9.329 9.578 9.825 10.092 10.401 10.729 11.061 11.382 11.756 12.149 12.534 12.904 13.295 13.632 13.719 13.383 12.878 12.369 11.891 11.448 10.992 10.548 10.182 9.82 9.497 9.193 8.897 8.616 8.358 8.121 7.88 7.658 7.469 7.263 7.032 6.849 6.668 6.472 6.304 6.121 5.939 5.767 5.581 5.445 5.311 5.09 4.93 4.764 4.679 4.506 4.324 4.144 4.056 3.795 3.718 3.582 3.445 3.208 3.078 2.928 2.762 2.572 2.327 1.907 1.024 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_32_46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_32_46.txt deleted file mode 100644 index 9c52ab05..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_32_46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29353 ,KEBNE ,17027147,Wed Dec 22 16:07:57 CET,Wed Dec 22 17:43:16 CET,0.0 1.47 1.915 2.257 2.508 2.725 2.934 3.115 3.423 3.563 3.699 3.788 4.059 4.166 4.358 4.54 4.704 4.781 4.939 5.091 5.298 5.433 5.563 5.742 5.91 6.073 6.223 6.358 6.542 6.719 6.886 7.072 7.232 7.388 7.58 7.797 7.99 8.196 8.416 8.626 8.833 9.067 9.323 9.561 9.773 9.946 10.11 10.214 10.245 10.142 9.721 8.946 8.172 7.439 6.747 6.132 5.618 5.136 4.716 4.297 3.91 3.547 3.213 2.911 2.639 2.386 2.122 1.886 1.669 1.438 1.201 1.01 0.809 0.598 0.436 0.262 0.087 -0.092 -0.286 -0.425 -0.561 -0.765 -0.911 -1.083 -1.18 -1.366 -1.549 -1.754 -1.864 -2.137 -2.198 -2.326 -2.461 -2.757 -2.932 -3.133 -3.388 -3.687 -4.016 -4.481 -5.839 -2 ,11803 ,KEBNE ,17027148,Wed Dec 22 16:07:58 CET,Wed Dec 22 17:42:08 CET,0.0 1.229 1.627 1.978 2.258 2.486 2.699 2.877 3.179 3.316 3.441 3.52 3.798 3.907 4.09 4.264 4.427 4.511 4.677 4.827 5.039 5.175 5.306 5.49 5.666 5.827 5.972 6.111 6.282 6.447 6.604 6.786 6.96 7.13 7.326 7.544 7.741 7.943 8.148 8.356 8.56 8.763 8.982 9.186 9.408 9.626 9.812 9.943 10.024 9.95 9.497 8.686 7.893 7.141 6.486 5.906 5.374 4.883 4.457 4.028 3.677 3.378 3.077 2.785 2.528 2.285 2.014 1.785 1.596 1.39 1.161 0.951 0.712 0.458 0.269 0.093 -0.072 -0.247 -0.43 -0.56 -0.695 -0.89 -1.037 -1.246 -1.371 -1.609 -1.852 -2.098 -2.213 -2.49 -2.555 -2.678 -2.814 -3.107 -3.276 -3.454 -3.627 -3.867 -4.15 -4.583 -5.736 -3 ,27285 ,KEBNE ,17027149,Wed Dec 22 16:07:58 CET,Wed Dec 22 17:42:29 CET,0.0 1.101 1.481 1.745 1.949 2.135 2.327 2.521 2.817 2.946 3.074 3.155 3.44 3.569 3.788 3.969 4.137 4.222 4.381 4.538 4.768 4.907 5.034 5.212 5.378 5.538 5.696 5.848 6.027 6.19 6.349 6.55 6.74 6.921 7.115 7.315 7.507 7.716 7.935 8.164 8.396 8.607 8.824 9.03 9.221 9.4 9.576 9.73 9.808 9.73 9.312 8.57 7.841 7.148 6.488 5.862 5.292 4.782 4.355 3.946 3.584 3.238 2.903 2.595 2.31 2.052 1.79 1.561 1.359 1.142 0.916 0.731 0.532 0.332 0.175 0.0 -0.17 -0.342 -0.532 -0.661 -0.791 -1.008 -1.158 -1.308 -1.391 -1.577 -1.768 -1.953 -2.045 -2.303 -2.353 -2.485 -2.619 -2.897 -3.05 -3.206 -3.379 -3.59 -3.9 -4.362 -5.842 -4 ,11831 ,KEBNE ,17027150,Wed Dec 22 16:07:58 CET,Wed Dec 22 17:42:24 CET,0.0 1.333 1.721 2.048 2.328 2.533 2.721 2.895 3.202 3.351 3.485 3.561 3.829 3.93 4.115 4.284 4.448 4.531 4.686 4.828 5.036 5.166 5.285 5.458 5.629 5.792 5.939 6.085 6.275 6.442 6.599 6.792 6.971 7.135 7.317 7.525 7.725 7.932 8.157 8.386 8.595 8.81 9.056 9.268 9.473 9.696 9.901 10.033 10.069 9.973 9.569 8.8 8.049 7.345 6.703 6.125 5.606 5.124 4.697 4.251 3.858 3.514 3.188 2.878 2.592 2.327 2.046 1.804 1.591 1.369 1.137 0.947 0.758 0.552 0.385 0.216 0.043 -0.148 -0.349 -0.487 -0.635 -0.857 -1.023 -1.197 -1.276 -1.44 -1.628 -1.822 -1.928 -2.209 -2.279 -2.393 -2.506 -2.77 -2.916 -3.069 -3.23 -3.426 -3.716 -4.054 -4.646 -5 ,7182 ,KEBNE ,17027151,Wed Dec 22 16:07:58 CET,Wed Dec 22 17:42:12 CET,0.0 1.349 1.851 2.222 2.536 2.792 3.002 3.182 3.502 3.638 3.758 3.801 4.053 4.156 4.353 4.535 4.707 4.785 4.939 5.091 5.313 5.455 5.582 5.764 5.935 6.095 6.238 6.377 6.556 6.717 6.883 7.079 7.256 7.419 7.592 7.777 7.961 8.171 8.372 8.555 8.744 8.961 9.207 9.428 9.656 9.862 10.043 10.207 10.304 10.208 9.726 8.919 8.178 7.464 6.771 6.155 5.634 5.143 4.7 4.27 3.917 3.586 3.262 2.961 2.681 2.419 2.145 1.912 1.697 1.466 1.238 1.048 0.849 0.636 0.479 0.319 0.152 -0.018 -0.198 -0.325 -0.48 -0.708 -0.844 -0.997 -1.082 -1.249 -1.417 -1.613 -1.72 -1.998 -2.066 -2.184 -2.322 -2.637 -2.8 -2.996 -3.228 -3.483 -3.749 -4.051 -4.741 -6 ,13289 ,KEBNE ,17027152,Wed Dec 22 16:09:00 CET,Wed Dec 22 17:44:42 CET,0.0 1.402 1.875 2.245 2.502 2.741 2.964 3.133 3.39 3.51 3.636 3.709 3.965 4.06 4.245 4.412 4.571 4.647 4.789 4.928 5.122 5.245 5.368 5.541 5.711 5.879 6.028 6.178 6.372 6.54 6.707 6.913 7.086 7.254 7.456 7.663 7.851 8.056 8.268 8.471 8.674 8.885 9.112 9.341 9.58 9.788 9.976 10.114 10.164 10.048 9.576 8.758 8.011 7.312 6.645 6.014 5.462 4.979 4.56 4.127 3.749 3.412 3.096 2.799 2.516 2.265 2.012 1.78 1.573 1.362 1.142 0.96 0.77 0.569 0.413 0.254 0.087 -0.098 -0.318 -0.475 -0.619 -0.832 -0.984 -1.142 -1.225 -1.4 -1.598 -1.812 -1.924 -2.208 -2.288 -2.417 -2.554 -2.84 -2.992 -3.164 -3.373 -3.611 -3.869 -4.189 -5.09 -7 ,26745 ,KEBNE ,17027153,Wed Dec 22 16:08:59 CET,Wed Dec 22 17:42:59 CET,0.0 1.165 1.577 1.949 2.244 2.475 2.678 2.852 3.13 3.256 3.385 3.464 3.724 3.83 4.011 4.188 4.369 4.447 4.589 4.731 4.931 5.058 5.195 5.392 5.551 5.703 5.866 6.005 6.17 6.363 6.551 6.754 6.937 7.095 7.271 7.466 7.669 7.883 8.081 8.295 8.512 8.725 8.943 9.14 9.375 9.593 9.763 9.904 9.975 9.874 9.445 8.67 7.886 7.172 6.521 5.925 5.416 4.942 4.512 4.084 3.7 3.348 3.027 2.733 2.44 2.168 1.898 1.655 1.445 1.227 1.0 0.813 0.613 0.408 0.243 0.066 -0.12 -0.312 -0.498 -0.624 -0.758 -0.959 -1.109 -1.272 -1.357 -1.548 -1.738 -1.914 -2.002 -2.258 -2.278 -2.382 -2.5 -2.786 -2.936 -3.088 -3.279 -3.497 -3.755 -4.173 -5.459 -8 ,18951 ,KEBNE ,17027154,Wed Dec 22 16:09:00 CET,Wed Dec 22 17:42:46 CET,0.0 1.444 1.899 2.205 2.479 2.711 2.908 3.088 3.424 3.582 3.715 3.816 4.088 4.188 4.36 4.512 4.665 4.74 4.886 5.027 5.225 5.355 5.472 5.648 5.824 5.977 6.125 6.273 6.465 6.655 6.842 7.057 7.247 7.417 7.609 7.824 8.017 8.211 8.413 8.631 8.86 9.094 9.329 9.55 9.766 9.961 10.149 10.285 10.333 10.25 9.879 9.122 8.353 7.613 6.955 6.36 5.814 5.313 4.88 4.437 4.05 3.708 3.384 3.081 2.79 2.514 2.241 2.0 1.784 1.551 1.303 1.091 0.853 0.595 0.401 0.207 0.007 -0.195 -0.39 -0.523 -0.663 -0.893 -1.054 -1.215 -1.295 -1.472 -1.671 -1.881 -1.993 -2.278 -2.37 -2.509 -2.651 -2.943 -3.102 -3.265 -3.442 -3.673 -3.924 -4.244 -4.998 -9 ,3968 ,KEBNE ,17027155,Wed Dec 22 16:09:00 CET,Wed Dec 22 17:42:45 CET,0.0 1.287 1.72 2.083 2.396 2.648 2.844 3.032 3.341 3.468 3.596 3.686 3.959 4.072 4.278 4.46 4.614 4.692 4.856 5.017 5.24 5.37 5.502 5.697 5.877 6.054 6.22 6.376 6.575 6.757 6.931 7.129 7.296 7.45 7.63 7.831 8.022 8.221 8.416 8.621 8.833 9.046 9.282 9.514 9.733 9.909 10.095 10.286 10.368 10.259 9.833 9.034 8.226 7.519 6.893 6.304 5.768 5.274 4.826 4.374 4.003 3.67 3.353 3.057 2.771 2.471 2.151 1.866 1.619 1.376 1.13 0.928 0.721 0.515 0.356 0.197 0.033 -0.149 -0.344 -0.472 -0.599 -0.807 -0.962 -1.123 -1.207 -1.393 -1.57 -1.752 -1.856 -2.131 -2.201 -2.336 -2.486 -2.809 -2.976 -3.147 -3.337 -3.559 -3.881 -4.365 -5.308 -10 ,30635 ,KEBNE ,17027156,Wed Dec 22 16:08:59 CET,Wed Dec 22 17:44:12 CET,0.0 1.612 1.935 2.176 2.377 2.577 2.759 2.907 3.204 3.346 3.468 3.54 3.815 3.926 4.12 4.278 4.428 4.507 4.669 4.83 5.057 5.204 5.35 5.563 5.762 5.955 6.144 6.311 6.506 6.683 6.828 7.014 7.202 7.372 7.577 7.789 7.963 8.146 8.344 8.561 8.778 9.002 9.222 9.421 9.658 9.894 10.064 10.169 10.237 10.136 9.663 8.918 8.159 7.41 6.745 6.156 5.628 5.131 4.717 4.301 3.917 3.577 3.274 2.97 2.679 2.42 2.127 1.853 1.615 1.36 1.098 0.867 0.611 0.356 0.162 -0.047 -0.255 -0.472 -0.707 -0.877 -1.05 -1.288 -1.459 -1.647 -1.743 -1.951 -2.177 -2.414 -2.53 -2.806 -2.884 -3.023 -3.164 -3.459 -3.628 -3.829 -4.048 -4.282 -4.573 -5.002 -6.205 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_32_47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_32_47.txt deleted file mode 100644 index 8a47e4bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_32_47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6895 ,KEBNE ,17027157,Wed Dec 22 16:09:00 CET,Wed Dec 22 17:42:20 CET,0.0 2.105 2.738 3.199 3.554 3.853 4.088 4.28 4.614 4.766 4.914 5.04 5.329 5.455 5.67 5.869 6.054 6.136 6.291 6.443 6.654 6.791 6.93 7.114 7.284 7.451 7.601 7.753 7.952 8.123 8.28 8.479 8.693 8.911 9.141 9.376 9.602 9.854 10.123 10.408 10.689 10.954 11.228 11.512 11.804 12.048 12.276 12.427 12.467 12.256 11.463 10.237 9.084 8.031 7.073 6.15 5.353 4.646 4.009 3.359 2.812 2.337 1.877 1.456 1.061 0.683 0.301 -0.042 -0.353 -0.671 -1.007 -1.292 -1.578 -1.858 -2.091 -2.349 -2.611 -2.882 -3.155 -3.336 -3.527 -3.83 -4.047 -4.281 -4.397 -4.624 -4.88 -5.182 -5.336 -5.665 -5.833 -5.998 -6.182 -6.597 -6.799 -7.011 -7.271 -7.55 -7.838 -8.238 -9.627 -2 ,32363 ,KEBNE ,17027158,Wed Dec 22 16:09:00 CET,Wed Dec 22 17:42:44 CET,0.0 1.598 2.147 2.587 2.92 3.189 3.386 3.551 3.861 4.005 4.141 4.238 4.513 4.629 4.857 5.059 5.257 5.356 5.526 5.682 5.925 6.064 6.174 6.341 6.509 6.67 6.815 6.948 7.12 7.292 7.448 7.625 7.79 7.947 8.156 8.383 8.569 8.756 8.944 9.131 9.33 9.531 9.727 9.901 10.078 10.266 10.411 10.472 10.4 10.068 9.332 8.245 7.13 6.132 5.244 4.398 3.642 2.938 2.295 1.637 1.096 0.642 0.223 -0.185 -0.574 -0.925 -1.293 -1.634 -1.91 -2.189 -2.494 -2.741 -2.992 -3.254 -3.467 -3.688 -3.922 -4.18 -4.453 -4.633 -4.822 -5.139 -5.357 -5.58 -5.69 -5.921 -6.181 -6.439 -6.57 -6.883 -6.99 -7.148 -7.313 -7.659 -7.86 -8.083 -8.307 -8.575 -8.904 -9.306 -10.653 -3 ,32235 ,KEBNE ,17027159,Wed Dec 22 16:09:00 CET,Wed Dec 22 17:42:55 CET,0.0 1.809 2.294 2.643 2.968 3.263 3.484 3.674 3.975 4.121 4.267 4.372 4.645 4.747 4.945 5.136 5.306 5.386 5.541 5.683 5.884 6.011 6.146 6.332 6.485 6.634 6.782 6.918 7.092 7.285 7.475 7.695 7.913 8.118 8.363 8.624 8.855 9.099 9.348 9.606 9.868 10.145 10.451 10.705 10.952 11.202 11.415 11.564 11.602 11.33 10.517 9.396 8.335 7.287 6.332 5.466 4.671 3.93 3.288 2.672 2.155 1.677 1.216 0.796 0.4 0.052 -0.314 -0.671 -0.978 -1.294 -1.633 -1.897 -2.156 -2.44 -2.658 -2.891 -3.144 -3.417 -3.705 -3.896 -4.092 -4.427 -4.668 -4.902 -5.032 -5.329 -5.603 -5.864 -6.016 -6.351 -6.51 -6.687 -6.889 -7.359 -7.597 -7.853 -8.14 -8.448 -8.875 -9.462 -11.052 -4 ,18964 ,KEBNE ,17027160,Wed Dec 22 16:09:00 CET,Wed Dec 22 17:44:24 CET,0.0 2.113 2.688 3.107 3.409 3.641 3.843 4.053 4.398 4.546 4.699 4.816 5.1 5.229 5.468 5.685 5.894 5.992 6.179 6.352 6.585 6.735 6.877 7.083 7.282 7.466 7.642 7.803 8.016 8.22 8.396 8.596 8.787 8.968 9.164 9.383 9.603 9.837 10.063 10.296 10.525 10.758 11.022 11.262 11.528 11.77 11.966 12.107 12.123 11.892 11.093 9.803 8.544 7.442 6.482 5.604 4.805 4.08 3.458 2.796 2.219 1.71 1.242 0.823 0.42 0.041 -0.359 -0.745 -1.075 -1.384 -1.701 -1.968 -2.26 -2.564 -2.791 -3.034 -3.289 -3.548 -3.819 -4.02 -4.223 -4.515 -4.725 -4.94 -5.045 -5.271 -5.509 -5.746 -5.873 -6.184 -6.299 -6.456 -6.613 -6.924 -7.096 -7.29 -7.507 -7.772 -8.107 -8.555 -9.99 -5 ,2157 ,KEBNE ,17027161,Wed Dec 22 16:09:00 CET,Wed Dec 22 17:44:08 CET,0.0 2.271 2.771 3.095 3.389 3.629 3.865 4.11 4.506 4.66 4.806 4.944 5.231 5.356 5.596 5.802 5.987 6.08 6.264 6.436 6.662 6.788 6.911 7.085 7.241 7.403 7.552 7.691 7.876 8.041 8.191 8.372 8.546 8.736 8.944 9.128 9.289 9.476 9.674 9.858 10.042 10.256 10.492 10.676 10.858 11.009 11.111 11.176 11.119 10.816 10.101 8.948 7.763 6.693 5.692 4.732 3.947 3.289 2.694 2.082 1.555 1.093 0.666 0.273 -0.102 -0.444 -0.786 -1.109 -1.389 -1.673 -1.96 -2.198 -2.448 -2.709 -2.921 -3.154 -3.396 -3.645 -3.904 -4.072 -4.247 -4.529 -4.731 -4.937 -5.041 -5.26 -5.495 -5.754 -5.893 -6.211 -6.33 -6.481 -6.633 -6.929 -7.101 -7.313 -7.578 -7.88 -8.214 -8.628 -9.606 -6 ,31833 ,KEBNE ,17027162,Wed Dec 22 16:10:03 CET,Wed Dec 22 17:43:35 CET,0.0 1.524 1.977 2.333 2.628 2.855 3.045 3.222 3.544 3.679 3.81 3.933 4.219 4.338 4.575 4.787 4.967 5.055 5.221 5.38 5.619 5.759 5.901 6.131 6.352 6.572 6.794 7.012 7.275 7.483 7.662 7.881 8.087 8.301 8.524 8.729 8.932 9.165 9.393 9.605 9.813 10.032 10.28 10.494 10.718 10.919 11.062 11.138 11.148 10.953 10.203 8.859 7.576 6.521 5.604 4.775 4.024 3.33 2.741 2.16 1.666 1.207 0.762 0.357 -0.008 -0.339 -0.682 -0.985 -1.247 -1.526 -1.825 -2.098 -2.39 -2.693 -2.932 -3.163 -3.401 -3.662 -3.935 -4.115 -4.296 -4.58 -4.784 -5.026 -5.154 -5.384 -5.631 -5.92 -6.072 -6.393 -6.499 -6.654 -6.841 -7.244 -7.433 -7.636 -7.87 -8.158 -8.508 -8.911 -10.345 -7 ,9596 ,KEBNE ,17027163,Wed Dec 22 16:10:03 CET,Wed Dec 22 17:44:36 CET,0.0 2.917 3.402 3.761 4.071 4.329 4.555 4.777 5.139 5.277 5.402 5.499 5.787 5.896 6.105 6.308 6.466 6.543 6.703 6.864 7.074 7.204 7.343 7.52 7.675 7.847 8.003 8.138 8.315 8.48 8.628 8.813 8.992 9.186 9.401 9.612 9.801 10.0 10.224 10.434 10.636 10.862 11.099 11.308 11.548 11.768 11.946 12.096 12.109 11.885 11.176 10.031 8.889 7.778 6.81 5.953 5.214 4.522 3.949 3.402 2.93 2.499 2.078 1.677 1.296 0.942 0.574 0.256 -0.011 -0.285 -0.573 -0.822 -1.082 -1.351 -1.56 -1.787 -2.024 -2.262 -2.498 -2.655 -2.821 -3.073 -3.263 -3.481 -3.592 -3.808 -4.029 -4.261 -4.382 -4.673 -4.764 -4.908 -5.065 -5.418 -5.613 -5.83 -6.064 -6.298 -6.558 -6.912 -7.991 -8 ,20671 ,KEBNE ,17027164,Wed Dec 22 16:10:02 CET,Wed Dec 22 17:43:24 CET,0.0 1.674 2.242 2.641 2.909 3.129 3.34 3.521 3.825 3.97 4.127 4.285 4.575 4.707 4.962 5.19 5.37 5.449 5.621 5.791 6.047 6.209 6.361 6.576 6.774 6.962 7.142 7.303 7.49 7.663 7.837 8.048 8.238 8.409 8.6 8.805 8.996 9.203 9.423 9.638 9.864 10.113 10.365 10.572 10.781 10.961 11.122 11.269 11.34 11.115 10.34 9.21 8.119 7.108 6.164 5.327 4.625 3.975 3.393 2.808 2.284 1.793 1.344 0.939 0.553 0.189 -0.181 -0.521 -0.828 -1.134 -1.453 -1.72 -1.989 -2.27 -2.495 -2.732 -2.974 -3.219 -3.483 -3.657 -3.838 -4.132 -4.328 -4.532 -4.641 -4.877 -5.127 -5.393 -5.534 -5.851 -5.968 -6.113 -6.271 -6.615 -6.836 -7.106 -7.382 -7.667 -8.015 -8.528 -10.065 -9 ,8681 ,KEBNE ,17027165,Wed Dec 22 16:11:05 CET,Wed Dec 22 17:45:49 CET,0.0 1.714 2.294 2.724 3.038 3.293 3.516 3.748 4.161 4.333 4.5 4.658 4.95 5.075 5.306 5.517 5.733 5.834 6.021 6.208 6.464 6.624 6.776 6.986 7.181 7.384 7.59 7.766 7.984 8.211 8.427 8.662 8.872 9.067 9.279 9.523 9.763 10.024 10.3 10.569 10.842 11.138 11.432 11.689 11.943 12.142 12.305 12.442 12.492 12.273 11.492 10.223 9.037 7.983 7.057 6.178 5.4 4.687 4.072 3.435 2.886 2.444 2.033 1.646 1.261 0.879 0.477 0.127 -0.166 -0.473 -0.783 -1.025 -1.286 -1.559 -1.761 -1.967 -2.19 -2.438 -2.689 -2.854 -3.038 -3.336 -3.544 -3.757 -3.864 -4.128 -4.429 -4.712 -4.843 -5.155 -5.268 -5.419 -5.592 -5.983 -6.19 -6.395 -6.641 -6.933 -7.289 -7.79 -9.129 -10 ,31655 ,KEBNE ,17027166,Wed Dec 22 16:10:02 CET,Wed Dec 22 17:45:01 CET,0.0 1.662 2.151 2.469 2.718 2.962 3.172 3.341 3.641 3.788 3.911 3.975 4.229 4.336 4.586 4.826 5.03 5.115 5.279 5.439 5.676 5.818 5.947 6.127 6.3 6.457 6.618 6.775 6.947 7.13 7.301 7.486 7.665 7.838 8.033 8.229 8.418 8.637 8.885 9.135 9.38 9.64 9.874 10.073 10.289 10.486 10.659 10.783 10.744 10.476 9.835 8.711 7.723 6.789 5.789 4.876 4.114 3.424 2.816 2.192 1.654 1.173 0.72 0.307 -0.094 -0.484 -0.885 -1.241 -1.545 -1.839 -2.151 -2.42 -2.701 -2.982 -3.198 -3.441 -3.716 -4.021 -4.335 -4.532 -4.738 -5.078 -5.321 -5.571 -5.699 -5.979 -6.256 -6.51 -6.637 -6.946 -7.039 -7.189 -7.343 -7.66 -7.853 -8.077 -8.348 -8.651 -9.071 -9.721 -11.651 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_32.txt deleted file mode 100644 index 6deb7d2a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23281 ,TETRA ,17601155,Sun Nov 28 14:32:39 CET,Sun Nov 28 16:20:02 CET,0.0 1.4 1.877 2.244 2.573 2.845 3.044 3.214 3.498 3.639 3.771 3.872 4.146 4.252 4.468 4.689 4.883 4.965 5.117 5.261 5.475 5.609 5.723 5.89 6.06 6.222 6.374 6.52 6.71 6.903 7.077 7.271 7.454 7.63 7.829 8.049 8.271 8.497 8.719 8.949 9.191 9.474 9.797 10.084 10.369 10.675 11.004 11.327 11.621 11.825 11.773 11.313 10.771 10.221 9.688 9.163 8.683 8.26 7.898 7.511 7.165 6.859 6.553 6.269 6.006 5.766 5.52 5.306 5.121 4.928 4.727 4.553 4.369 4.158 3.997 3.849 3.678 3.478 3.275 3.13 2.974 2.73 2.558 2.38 2.289 2.092 1.883 1.658 1.534 1.247 1.123 0.971 0.824 0.497 0.3 0.09 -0.131 -0.374 -0.688 -1.082 -3.219 -2 ,6897 ,TETRA ,17601156,Sun Nov 28 14:32:38 CET,Sun Nov 28 16:20:46 CET,0.0 1.345 1.706 1.979 2.224 2.407 2.548 2.692 2.954 3.073 3.193 3.279 3.542 3.645 3.819 3.989 4.148 4.228 4.394 4.547 4.766 4.896 5.027 5.233 5.43 5.618 5.785 5.938 6.137 6.326 6.505 6.706 6.892 7.075 7.259 7.471 7.702 7.938 8.167 8.414 8.686 8.976 9.257 9.522 9.831 10.151 10.472 10.798 11.09 11.245 11.132 10.674 10.123 9.571 9.047 8.552 8.101 7.677 7.285 6.876 6.532 6.225 5.919 5.627 5.353 5.092 4.825 4.592 4.392 4.171 3.921 3.718 3.508 3.297 3.136 2.97 2.804 2.632 2.446 2.313 2.174 1.972 1.83 1.673 1.589 1.41 1.235 1.058 0.965 0.711 0.662 0.553 0.433 0.157 0.006 -0.18 -0.376 -0.575 -0.842 -1.239 -2.216 -3 ,25775 ,TETRA ,17601157,Sun Nov 28 14:32:38 CET,Sun Nov 28 16:21:23 CET,0.0 1.446 1.863 2.206 2.493 2.741 2.964 3.168 3.518 3.664 3.794 3.86 4.116 4.22 4.416 4.62 4.8 4.875 5.019 5.151 5.337 5.463 5.587 5.766 5.924 6.07 6.212 6.356 6.535 6.698 6.857 7.064 7.254 7.427 7.631 7.856 8.06 8.294 8.582 8.884 9.167 9.446 9.719 9.987 10.301 10.598 10.911 11.212 11.47 11.598 11.454 10.935 10.384 9.852 9.323 8.813 8.369 7.95 7.55 7.165 6.848 6.545 6.243 5.962 5.7 5.46 5.214 4.987 4.789 4.572 4.345 4.158 3.965 3.763 3.601 3.444 3.273 3.09 2.897 2.752 2.611 2.403 2.259 2.107 2.027 1.866 1.664 1.446 1.345 1.083 0.997 0.868 0.739 0.453 0.282 0.092 -0.123 -0.383 -0.706 -1.135 -2.802 -4 ,8907 ,TETRA ,17601158,Sun Nov 28 14:32:39 CET,Sun Nov 28 16:21:05 CET,0.0 1.459 1.895 2.175 2.403 2.593 2.762 2.933 3.227 3.36 3.48 3.568 3.834 3.933 4.108 4.274 4.449 4.534 4.685 4.845 5.068 5.19 5.304 5.486 5.666 5.832 5.989 6.147 6.345 6.532 6.712 6.919 7.119 7.302 7.506 7.728 7.931 8.165 8.417 8.652 8.886 9.166 9.5 9.798 10.119 10.443 10.763 11.085 11.345 11.479 11.359 10.868 10.289 9.72 9.21 8.748 8.309 7.879 7.507 7.137 6.805 6.495 6.188 5.884 5.576 5.274 4.952 4.677 4.471 4.259 4.022 3.825 3.627 3.422 3.252 3.072 2.887 2.707 2.517 2.386 2.246 2.028 1.879 1.71 1.614 1.425 1.248 1.051 0.93 0.652 0.591 0.469 0.353 0.121 -0.028 -0.211 -0.406 -0.621 -0.872 -1.317 -3.312 -5 ,31055 ,TETRA ,17601159,Sun Nov 28 14:32:39 CET,Sun Nov 28 16:21:23 CET,0.0 1.079 1.47 1.774 2.042 2.28 2.49 2.671 2.957 3.094 3.227 3.295 3.551 3.649 3.841 4.03 4.21 4.3 4.462 4.619 4.857 5.019 5.176 5.38 5.559 5.734 5.901 6.065 6.271 6.453 6.635 6.87 7.079 7.26 7.461 7.675 7.891 8.128 8.365 8.623 8.892 9.173 9.481 9.772 10.087 10.41 10.72 10.98 11.223 11.387 11.296 10.837 10.281 9.743 9.235 8.69 8.188 7.751 7.385 7.019 6.66 6.334 6.038 5.754 5.492 5.249 4.991 4.765 4.558 4.338 4.12 3.929 3.729 3.528 3.367 3.197 3.024 2.852 2.657 2.524 2.397 2.185 2.027 1.863 1.78 1.612 1.446 1.266 1.159 0.884 0.778 0.635 0.498 0.212 0.041 -0.151 -0.341 -0.577 -0.956 -1.548 -3.877 -6 ,13534 ,TETRA ,17601160,Sun Nov 28 14:32:39 CET,Sun Nov 28 16:20:07 CET,0.0 1.315 1.751 2.023 2.232 2.415 2.603 2.788 3.103 3.239 3.382 3.534 3.82 3.939 4.182 4.425 4.653 4.751 4.94 5.135 5.393 5.533 5.659 5.84 6.017 6.186 6.335 6.476 6.655 6.83 7.001 7.204 7.411 7.605 7.808 8.038 8.256 8.474 8.699 8.939 9.192 9.457 9.738 10.011 10.335 10.665 10.988 11.289 11.531 11.658 11.527 11.03 10.436 9.865 9.325 8.794 8.312 7.859 7.472 7.077 6.72 6.408 6.11 5.828 5.567 5.322 5.057 4.801 4.578 4.363 4.13 3.938 3.75 3.541 3.367 3.187 2.997 2.789 2.57 2.434 2.293 2.065 1.904 1.727 1.639 1.463 1.281 1.085 0.984 0.722 0.631 0.495 0.353 0.072 -0.067 -0.234 -0.448 -0.679 -0.953 -1.349 -2.106 -7 ,13454 ,TETRA ,17601161,Sun Nov 28 14:32:38 CET,Sun Nov 28 16:20:20 CET,0.0 1.277 1.722 2.035 2.266 2.469 2.653 2.833 3.2 3.366 3.504 3.602 3.867 3.965 4.161 4.352 4.505 4.579 4.737 4.884 5.102 5.244 5.371 5.546 5.711 5.88 6.048 6.202 6.383 6.553 6.719 6.907 7.094 7.274 7.473 7.695 7.898 8.113 8.332 8.555 8.798 9.069 9.378 9.69 10.003 10.296 10.62 10.902 11.122 11.274 11.134 10.599 10.022 9.428 8.858 8.301 7.815 7.405 7.042 6.676 6.334 6.015 5.706 5.403 5.124 4.88 4.628 4.406 4.21 3.998 3.783 3.613 3.436 3.238 3.069 2.89 2.705 2.512 2.314 2.177 2.036 1.821 1.676 1.526 1.451 1.292 1.132 0.957 0.853 0.589 0.498 0.356 0.209 -0.077 -0.235 -0.435 -0.649 -0.878 -1.168 -1.603 -2.979 -8 ,18735 ,TETRA ,17601162,Sun Nov 28 14:32:39 CET,Sun Nov 28 16:20:10 CET,0.0 1.573 2.031 2.329 2.585 2.818 3.034 3.23 3.526 3.664 3.794 3.878 4.136 4.232 4.419 4.607 4.779 4.862 5.029 5.183 5.397 5.527 5.644 5.813 5.978 6.135 6.289 6.44 6.627 6.806 6.973 7.176 7.384 7.574 7.782 7.994 8.187 8.416 8.662 8.908 9.15 9.411 9.701 9.986 10.322 10.651 10.971 11.287 11.582 11.746 11.637 11.138 10.595 10.082 9.569 9.072 8.591 8.136 7.759 7.37 7.027 6.724 6.408 6.116 5.856 5.613 5.357 5.112 4.903 4.687 4.455 4.262 4.057 3.836 3.66 3.489 3.309 3.122 2.942 2.809 2.663 2.435 2.286 2.134 2.046 1.846 1.636 1.434 1.342 1.091 1.022 0.903 0.78 0.495 0.329 0.149 -0.078 -0.374 -0.698 -1.107 -2.49 -9 ,26460 ,TETRA ,17601163,Sun Nov 28 14:32:39 CET,Sun Nov 28 16:20:05 CET,0.0 1.132 1.52 1.832 2.084 2.294 2.482 2.661 2.994 3.134 3.263 3.366 3.644 3.758 3.96 4.166 4.363 4.45 4.626 4.788 4.996 5.123 5.247 5.426 5.592 5.745 5.897 6.06 6.267 6.459 6.623 6.808 6.987 7.147 7.343 7.584 7.791 7.994 8.207 8.446 8.705 8.957 9.227 9.512 9.828 10.145 10.47 10.743 10.97 11.118 11.034 10.593 10.08 9.585 9.111 8.609 8.134 7.678 7.289 6.909 6.571 6.253 5.909 5.574 5.278 5.026 4.77 4.53 4.318 4.085 3.846 3.658 3.451 3.233 3.063 2.898 2.737 2.568 2.37 2.226 2.075 1.849 1.695 1.532 1.457 1.296 1.112 0.919 0.819 0.555 0.463 0.314 0.169 -0.115 -0.279 -0.475 -0.711 -0.99 -1.328 -1.746 -3.528 -10 ,21393 ,TETRA ,17601164,Sun Nov 28 14:32:41 CET,Sun Nov 28 16:20:18 CET,0.0 0.649 1.005 1.279 1.521 1.729 1.908 2.065 2.355 2.502 2.643 2.741 3.003 3.117 3.34 3.537 3.707 3.785 3.937 4.087 4.301 4.426 4.543 4.721 4.883 5.04 5.203 5.361 5.566 5.758 5.942 6.142 6.326 6.504 6.71 6.941 7.149 7.376 7.63 7.879 8.104 8.37 8.666 8.952 9.268 9.582 9.912 10.229 10.523 10.677 10.553 10.116 9.601 9.06 8.52 8.011 7.572 7.156 6.777 6.388 6.049 5.738 5.444 5.163 4.893 4.639 4.384 4.141 3.91 3.674 3.448 3.262 3.067 2.872 2.71 2.536 2.358 2.177 1.993 1.85 1.705 1.507 1.361 1.198 1.105 0.906 0.72 0.525 0.414 0.141 0.067 -0.055 -0.186 -0.475 -0.637 -0.794 -0.987 -1.267 -1.616 -2.083 -3.349 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_35.txt deleted file mode 100644 index cb7e6ded..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11437 ,TETRA ,17601165,Sun Nov 28 14:32:44 CET,Sun Nov 28 16:20:01 CET,0.0 1.756 2.244 2.557 2.804 3.022 3.216 3.386 3.693 3.827 3.944 4.023 4.281 4.385 4.596 4.8 4.989 5.07 5.22 5.384 5.628 5.773 5.913 6.113 6.304 6.48 6.642 6.799 6.992 7.18 7.362 7.579 7.774 7.952 8.156 8.372 8.586 8.829 9.067 9.293 9.516 9.767 10.052 10.322 10.594 10.849 11.086 11.276 11.394 11.342 10.962 10.212 9.463 8.763 8.136 7.566 7.056 6.569 6.132 5.697 5.292 4.925 4.611 4.299 3.993 3.726 3.439 3.181 2.961 2.733 2.493 2.296 2.089 1.875 1.712 1.538 1.362 1.172 0.964 0.822 0.684 0.456 0.292 0.125 0.043 -0.118 -0.297 -0.483 -0.58 -0.837 -0.891 -1.001 -1.12 -1.401 -1.56 -1.73 -1.937 -2.177 -2.439 -2.761 -3.769 -2 ,22038 ,TETRA ,17601166,Sun Nov 28 14:32:42 CET,Sun Nov 28 16:20:54 CET,0.0 0.997 1.406 1.717 1.984 2.216 2.439 2.644 2.994 3.134 3.26 3.355 3.62 3.721 3.925 4.12 4.3 4.382 4.539 4.702 4.937 5.082 5.213 5.394 5.56 5.727 5.893 6.04 6.233 6.419 6.595 6.809 7.0 7.176 7.368 7.584 7.811 8.071 8.325 8.558 8.799 9.068 9.366 9.62 9.851 10.09 10.324 10.512 10.623 10.554 10.153 9.443 8.722 8.044 7.432 6.855 6.32 5.831 5.401 4.968 4.607 4.271 3.948 3.651 3.363 3.102 2.843 2.605 2.389 2.174 1.946 1.745 1.534 1.316 1.143 0.971 0.8 0.613 0.411 0.269 0.128 -0.095 -0.267 -0.453 -0.534 -0.694 -0.878 -1.077 -1.183 -1.452 -1.583 -1.729 -1.86 -2.162 -2.333 -2.544 -2.822 -3.124 -3.474 -3.947 -5.069 -3 ,4147 ,TETRA ,17601167,Sun Nov 28 14:32:40 CET,Sun Nov 28 16:21:44 CET,0.0 1.286 1.724 2.106 2.416 2.654 2.868 3.054 3.359 3.503 3.646 3.772 4.05 4.172 4.398 4.604 4.797 4.886 5.047 5.197 5.426 5.577 5.719 5.918 6.105 6.287 6.467 6.63 6.823 7.012 7.195 7.404 7.603 7.799 8.016 8.24 8.447 8.663 8.888 9.127 9.365 9.619 9.882 10.111 10.367 10.649 10.94 11.157 11.261 11.202 10.835 10.165 9.473 8.817 8.217 7.666 7.16 6.674 6.254 5.841 5.479 5.129 4.796 4.484 4.185 3.931 3.668 3.413 3.186 2.961 2.734 2.53 2.301 2.082 1.914 1.733 1.543 1.341 1.128 0.971 0.812 0.584 0.426 0.255 0.172 0.01 -0.167 -0.365 -0.468 -0.726 -0.783 -0.894 -1.013 -1.284 -1.439 -1.619 -1.833 -2.107 -2.409 -2.742 -3.475 -4 ,26843 ,TETRA ,17601168,Sun Nov 28 14:32:42 CET,Sun Nov 28 16:21:10 CET,0.0 1.251 1.697 2.046 2.314 2.547 2.763 2.962 3.29 3.422 3.551 3.665 3.946 4.06 4.277 4.493 4.683 4.771 4.934 5.09 5.308 5.446 5.585 5.777 5.952 6.114 6.271 6.43 6.626 6.81 6.983 7.189 7.386 7.565 7.779 8.017 8.222 8.434 8.647 8.863 9.096 9.346 9.632 9.885 10.137 10.389 10.604 10.776 10.906 10.889 10.554 9.861 9.151 8.496 7.91 7.341 6.806 6.338 5.923 5.482 5.1 4.766 4.429 4.123 3.843 3.574 3.307 3.068 2.86 2.635 2.385 2.182 1.976 1.757 1.578 1.389 1.207 1.025 0.827 0.698 0.568 0.353 0.207 0.066 -0.012 -0.183 -0.349 -0.531 -0.634 -0.911 -1.026 -1.168 -1.334 -1.695 -1.878 -2.059 -2.241 -2.457 -2.719 -3.119 -3.975 -5 ,16541 ,TETRA ,17601169,Sun Nov 28 14:32:44 CET,Sun Nov 28 16:21:04 CET,0.0 1.339 1.78 2.142 2.414 2.648 2.862 3.042 3.386 3.553 3.734 3.946 4.268 4.425 4.72 4.964 5.158 5.243 5.389 5.541 5.76 5.888 6.005 6.178 6.339 6.494 6.659 6.8 6.973 7.147 7.318 7.533 7.731 7.918 8.122 8.328 8.524 8.739 8.967 9.205 9.438 9.669 9.92 10.152 10.388 10.618 10.85 11.058 11.186 11.154 10.755 10.035 9.325 8.611 7.998 7.444 6.934 6.473 6.058 5.633 5.284 4.972 4.661 4.376 4.116 3.873 3.608 3.36 3.134 2.897 2.651 2.446 2.233 2.021 1.855 1.658 1.457 1.277 1.076 0.929 0.79 0.571 0.403 0.227 0.143 -0.044 -0.258 -0.486 -0.607 -0.891 -1.04 -1.208 -1.371 -1.717 -1.883 -2.066 -2.266 -2.468 -2.748 -3.144 -4.867 -6 ,2627 ,TETRA ,17601170,Sun Nov 28 14:32:41 CET,Sun Nov 28 16:20:44 CET,0.0 1.825 2.396 2.823 3.198 3.49 3.764 4.036 4.519 4.719 4.895 5.074 5.357 5.476 5.697 5.88 6.046 6.135 6.306 6.467 6.687 6.818 6.941 7.122 7.307 7.486 7.65 7.796 7.983 8.162 8.337 8.546 8.734 8.91 9.115 9.339 9.547 9.766 9.975 10.195 10.433 10.682 10.956 11.229 11.49 11.742 12.018 12.251 12.416 12.405 12.029 11.271 10.536 9.839 9.176 8.576 8.056 7.579 7.147 6.731 6.378 6.043 5.715 5.407 5.129 4.883 4.611 4.356 4.132 3.889 3.648 3.453 3.248 3.041 2.865 2.684 2.513 2.328 2.129 1.998 1.863 1.639 1.477 1.306 1.221 1.05 0.877 0.692 0.587 0.323 0.248 0.125 0.001 -0.252 -0.411 -0.586 -0.749 -0.928 -1.128 -1.418 -2.038 -7 ,10271 ,TETRA ,17601171,Sun Nov 28 14:32:39 CET,Sun Nov 28 16:20:40 CET,0.0 2.035 2.499 2.823 3.106 3.339 3.577 3.852 4.359 4.59 4.815 5.086 5.42 5.586 5.885 6.152 6.408 6.539 6.796 7.043 7.391 7.604 7.799 8.058 8.29 8.52 8.733 8.927 9.181 9.415 9.622 9.856 10.08 10.295 10.527 10.79 11.037 11.287 11.543 11.782 12.034 12.287 12.558 12.822 13.075 13.306 13.522 13.696 13.809 13.761 13.378 12.714 11.996 11.285 10.674 10.121 9.621 9.16 8.748 8.307 7.926 7.601 7.292 6.996 6.711 6.433 6.153 5.919 5.703 5.47 5.224 5.017 4.802 4.583 4.416 4.246 4.07 3.886 3.686 3.546 3.41 3.182 3.021 2.856 2.767 2.587 2.406 2.197 2.081 1.812 1.746 1.629 1.508 1.249 1.106 0.947 0.772 0.563 0.29 -0.083 -1.416 -8 ,25325 ,TETRA ,17601172,Sun Nov 28 14:32:41 CET,Sun Nov 28 16:20:31 CET,0.0 1.787 2.382 2.821 3.155 3.433 3.7 3.947 4.396 4.6 4.783 4.962 5.247 5.371 5.618 5.866 6.108 6.218 6.408 6.593 6.911 7.115 7.297 7.532 7.722 7.896 8.06 8.218 8.428 8.615 8.782 8.993 9.209 9.417 9.633 9.868 10.103 10.352 10.603 10.855 11.095 11.319 11.561 11.808 12.074 12.311 12.53 12.707 12.835 12.854 12.52 11.818 11.099 10.433 9.869 9.334 8.813 8.359 7.982 7.587 7.219 6.881 6.569 6.278 5.999 5.746 5.48 5.237 5.043 4.842 4.618 4.426 4.231 4.039 3.881 3.716 3.547 3.365 3.167 3.027 2.896 2.699 2.56 2.42 2.345 2.167 1.98 1.801 1.7 1.424 1.329 1.205 1.083 0.817 0.674 0.511 0.319 0.081 -0.202 -0.546 -1.405 -9 ,24925 ,TETRA ,17601173,Sun Nov 28 14:32:44 CET,Sun Nov 28 16:20:49 CET,0.0 1.407 1.955 2.313 2.605 2.848 3.062 3.237 3.531 3.68 3.831 3.979 4.248 4.34 4.529 4.715 4.905 4.997 5.16 5.317 5.542 5.688 5.825 6.019 6.197 6.353 6.505 6.656 6.844 7.012 7.171 7.357 7.564 7.763 7.951 8.154 8.344 8.548 8.757 8.952 9.16 9.384 9.612 9.848 10.124 10.39 10.606 10.774 10.908 10.91 10.548 9.855 9.184 8.529 7.907 7.324 6.804 6.354 5.954 5.53 5.171 4.848 4.53 4.21 3.901 3.641 3.381 3.142 2.925 2.694 2.461 2.264 2.053 1.826 1.659 1.496 1.327 1.142 0.949 0.817 0.683 0.475 0.33 0.184 0.106 -0.066 -0.246 -0.432 -0.528 -0.785 -0.859 -0.985 -1.123 -1.433 -1.588 -1.746 -1.928 -2.129 -2.358 -2.661 -3.589 -10 ,12453 ,TETRA ,17601174,Sun Nov 28 14:32:45 CET,Sun Nov 28 16:20:30 CET,0.0 1.382 1.885 2.187 2.445 2.65 2.828 3.018 3.345 3.476 3.61 3.731 4.009 4.136 4.373 4.587 4.793 4.89 5.056 5.218 5.446 5.584 5.711 5.895 6.059 6.203 6.366 6.526 6.714 6.903 7.078 7.279 7.485 7.681 7.899 8.13 8.335 8.552 8.756 8.973 9.214 9.463 9.73 9.991 10.259 10.499 10.759 11.001 11.158 11.168 10.832 10.132 9.431 8.774 8.184 7.626 7.108 6.624 6.204 5.766 5.391 5.065 4.761 4.454 4.164 3.905 3.619 3.366 3.144 2.91 2.679 2.489 2.273 2.049 1.883 1.705 1.521 1.33 1.139 1.003 0.852 0.622 0.469 0.306 0.222 0.059 -0.108 -0.303 -0.409 -0.674 -0.754 -0.882 -1.013 -1.295 -1.455 -1.615 -1.798 -2.001 -2.244 -2.575 -3.743 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_36.txt deleted file mode 100644 index 87bf299f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_36.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13032 ,TETRA ,17601175,Sun Nov 28 14:32:42 CET,Sun Nov 28 16:21:56 CET,0.0 1.945 2.505 2.879 3.189 3.454 3.682 3.881 4.254 4.438 4.617 4.792 5.097 5.236 5.515 5.784 6.01 6.111 6.317 6.52 6.801 6.965 7.124 7.368 7.584 7.774 7.951 8.122 8.353 8.578 8.78 9.007 9.217 9.429 9.688 9.953 10.199 10.472 10.741 11.002 11.264 11.544 11.846 12.143 12.49 12.82 13.125 13.383 13.576 13.632 13.372 12.749 12.083 11.438 10.834 10.284 9.786 9.34 8.95 8.551 8.191 7.861 7.548 7.245 6.95 6.681 6.407 6.155 5.938 5.707 5.467 5.277 5.079 4.865 4.691 4.515 4.344 4.162 3.957 3.809 3.659 3.435 3.283 3.113 3.025 2.85 2.671 2.49 2.397 2.141 2.084 1.964 1.825 1.514 1.34 1.155 0.991 0.817 0.533 0.13 -0.578 -2 ,12250 ,TETRA ,17601176,Sun Nov 28 14:32:44 CET,Sun Nov 28 16:21:54 CET,0.0 1.616 2.119 2.554 2.91 3.161 3.399 3.629 3.998 4.156 4.304 4.434 4.706 4.824 5.08 5.332 5.56 5.664 5.857 6.032 6.297 6.473 6.632 6.847 7.054 7.244 7.423 7.6 7.83 8.033 8.221 8.462 8.686 8.9 9.139 9.387 9.623 9.882 10.156 10.411 10.647 10.908 11.219 11.521 11.844 12.156 12.46 12.731 12.933 12.976 12.667 12.026 11.351 10.684 10.068 9.5 9.002 8.545 8.141 7.717 7.341 7.011 6.693 6.385 6.097 5.831 5.545 5.29 5.072 4.846 4.613 4.409 4.196 3.987 3.821 3.653 3.481 3.292 3.081 2.94 2.805 2.598 2.446 2.285 2.206 2.039 1.862 1.68 1.583 1.325 1.251 1.126 1.009 0.75 0.59 0.425 0.26 0.057 -0.187 -0.512 -1.182 -3 ,25704 ,TETRA ,17601177,Sun Nov 28 14:32:46 CET,Sun Nov 28 16:22:43 CET,0.0 2.268 2.893 3.326 3.682 3.977 4.234 4.479 4.887 5.051 5.216 5.381 5.667 5.805 6.071 6.318 6.546 6.655 6.852 7.027 7.291 7.464 7.622 7.859 8.091 8.296 8.483 8.661 8.896 9.119 9.33 9.578 9.808 10.015 10.246 10.515 10.784 11.054 11.297 11.538 11.793 12.08 12.387 12.677 12.986 13.271 13.555 13.792 13.915 13.882 13.582 12.958 12.282 11.607 10.971 10.401 9.895 9.442 9.048 8.617 8.24 7.924 7.605 7.289 7.005 6.75 6.485 6.244 6.037 5.825 5.608 5.428 5.222 4.99 4.824 4.665 4.498 4.308 4.09 3.928 3.759 3.519 3.365 3.202 3.116 2.933 2.723 2.475 2.336 2.034 1.878 1.715 1.547 1.165 0.953 0.708 0.42 0.144 -0.121 -0.526 -1.581 -4 ,8259 ,TETRA ,17601178,Sun Nov 28 14:32:42 CET,Sun Nov 28 16:22:08 CET,0.0 1.428 2.013 2.428 2.736 2.998 3.229 3.45 3.855 4.042 4.206 4.348 4.627 4.742 4.978 5.195 5.408 5.513 5.711 5.904 6.149 6.307 6.47 6.698 6.909 7.104 7.301 7.488 7.704 7.913 8.106 8.313 8.501 8.695 8.923 9.17 9.407 9.661 9.935 10.213 10.472 10.742 11.07 11.368 11.673 11.988 12.293 12.578 12.775 12.8 12.557 11.981 11.298 10.622 10.023 9.493 9.026 8.568 8.158 7.752 7.385 7.042 6.701 6.376 6.085 5.806 5.488 5.213 4.987 4.738 4.473 4.268 4.056 3.819 3.634 3.44 3.228 3.008 2.782 2.628 2.462 2.194 2.008 1.841 1.761 1.576 1.382 1.181 1.076 0.807 0.731 0.597 0.436 0.068 -0.146 -0.393 -0.671 -0.954 -1.245 -1.66 -2.884 -5 ,15909 ,TETRA ,17601179,Sun Nov 28 14:32:42 CET,Sun Nov 28 16:21:14 CET,0.0 2.225 2.814 3.249 3.608 3.9 4.144 4.38 4.8 4.98 5.153 5.322 5.614 5.747 5.997 6.237 6.459 6.567 6.779 6.981 7.264 7.454 7.637 7.876 8.095 8.296 8.475 8.647 8.878 9.094 9.298 9.538 9.775 9.995 10.227 10.483 10.723 10.985 11.25 11.527 11.793 12.071 12.39 12.68 12.991 13.269 13.498 13.687 13.852 13.91 13.649 13.026 12.324 11.608 10.989 10.442 9.929 9.455 9.05 8.623 8.243 7.906 7.588 7.295 7.022 6.755 6.46 6.204 5.987 5.774 5.561 5.373 5.154 4.926 4.762 4.591 4.41 4.219 4.014 3.879 3.748 3.534 3.39 3.235 3.151 2.983 2.812 2.63 2.528 2.268 2.232 2.13 2.023 1.787 1.65 1.496 1.315 1.083 0.8 0.463 -0.41 -6 ,6013 ,TETRA ,17601180,Sun Nov 28 14:32:44 CET,Sun Nov 28 16:21:47 CET,0.0 2.313 2.907 3.354 3.688 3.966 4.226 4.435 4.791 4.96 5.114 5.254 5.541 5.672 5.911 6.13 6.344 6.443 6.635 6.83 7.094 7.247 7.385 7.582 7.773 7.97 8.176 8.364 8.586 8.797 8.985 9.213 9.449 9.675 9.916 10.169 10.41 10.671 10.949 11.229 11.521 11.843 12.166 12.457 12.791 13.129 13.45 13.715 13.893 13.923 13.648 13.027 12.349 11.701 11.087 10.521 10.011 9.542 9.139 8.724 8.354 8.013 7.698 7.406 7.074 6.748 6.425 6.163 5.948 5.721 5.483 5.282 5.081 4.862 4.688 4.519 4.345 4.158 3.954 3.816 3.682 3.466 3.305 3.137 3.058 2.907 2.747 2.568 2.457 2.182 2.117 1.996 1.866 1.594 1.436 1.276 1.099 0.891 0.618 0.233 -0.769 -7 ,17291 ,TETRA ,17601181,Sun Nov 28 14:32:46 CET,Sun Nov 28 16:21:53 CET,0.0 1.761 2.274 2.681 2.992 3.272 3.546 3.783 4.157 4.321 4.49 4.646 4.948 5.098 5.374 5.63 5.867 5.983 6.199 6.413 6.709 6.883 7.056 7.317 7.561 7.791 8.015 8.232 8.502 8.737 8.963 9.224 9.476 9.746 10.068 10.389 10.675 10.977 11.297 11.622 11.905 12.202 12.521 12.839 13.19 13.515 13.851 14.153 14.338 14.342 14.028 13.397 12.736 12.071 11.471 10.901 10.386 9.917 9.508 9.096 8.726 8.388 8.065 7.758 7.473 7.206 6.928 6.679 6.47 6.261 6.043 5.847 5.635 5.415 5.249 5.079 4.892 4.699 4.503 4.363 4.224 4.018 3.856 3.674 3.58 3.386 3.193 3.0 2.897 2.622 2.565 2.424 2.257 1.907 1.696 1.461 1.15 0.829 0.572 0.289 -0.596 -8 ,16544 ,TETRA ,17601182,Sun Nov 28 14:32:47 CET,Sun Nov 28 16:21:53 CET,0.0 1.628 2.066 2.457 2.767 3.019 3.248 3.452 3.811 3.979 4.146 4.318 4.604 4.738 5.012 5.239 5.441 5.537 5.72 5.899 6.153 6.316 6.48 6.71 6.914 7.109 7.293 7.47 7.673 7.861 8.05 8.274 8.484 8.682 8.906 9.162 9.399 9.634 9.877 10.135 10.408 10.717 11.062 11.367 11.666 11.98 12.317 12.597 12.817 12.936 12.779 12.192 11.514 10.829 10.212 9.663 9.145 8.655 8.244 7.846 7.491 7.17 6.851 6.522 6.231 5.984 5.715 5.468 5.244 5.006 4.758 4.553 4.337 4.119 3.962 3.807 3.646 3.454 3.257 3.131 2.993 2.774 2.616 2.448 2.365 2.195 2.006 1.817 1.71 1.432 1.339 1.199 1.061 0.785 0.641 0.497 0.321 0.115 -0.135 -0.521 -1.662 -9 ,27635 ,TETRA ,17601183,Sun Nov 28 14:32:43 CET,Sun Nov 28 16:21:41 CET,0.0 2.221 2.766 3.117 3.448 3.764 4.025 4.244 4.581 4.743 4.904 5.045 5.323 5.434 5.654 5.865 6.068 6.171 6.36 6.54 6.815 6.989 7.148 7.389 7.623 7.822 7.996 8.161 8.38 8.592 8.796 9.021 9.249 9.458 9.656 9.89 10.137 10.391 10.643 10.905 11.175 11.472 11.776 12.07 12.406 12.735 13.046 13.305 13.488 13.559 13.381 12.79 12.096 11.425 10.818 10.265 9.786 9.343 8.953 8.546 8.183 7.852 7.541 7.248 6.954 6.689 6.426 6.185 5.983 5.775 5.548 5.354 5.164 4.956 4.784 4.617 4.441 4.26 4.08 3.959 3.828 3.598 3.437 3.272 3.191 3.009 2.821 2.64 2.548 2.288 2.225 2.097 1.962 1.712 1.548 1.351 1.168 0.958 0.685 0.371 -0.35 -10 ,12553 ,TETRA ,17601184,Sun Nov 28 14:32:44 CET,Sun Nov 28 16:21:35 CET,0.0 2.007 2.616 3.082 3.461 3.778 4.018 4.236 4.648 4.828 5.0 5.166 5.463 5.609 5.874 6.117 6.338 6.44 6.631 6.821 7.081 7.234 7.392 7.629 7.857 8.068 8.255 8.433 8.655 8.858 9.068 9.317 9.546 9.774 10.017 10.269 10.533 10.82 11.077 11.331 11.599 11.897 12.215 12.501 12.83 13.168 13.468 13.726 13.919 13.925 13.703 13.104 12.408 11.691 10.984 10.291 9.613 9.014 8.515 8.003 7.581 7.194 6.798 6.437 6.1 5.772 5.427 5.123 4.869 4.609 4.335 4.105 3.87 3.629 3.437 3.235 3.019 2.807 2.609 2.472 2.33 2.11 1.956 1.778 1.687 1.503 1.309 1.097 0.987 0.72 0.64 0.509 0.373 0.075 -0.091 -0.268 -0.464 -0.712 -1.053 -1.483 -2.445 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_37.txt deleted file mode 100644 index 8ddbe624..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29115 ,TETRA ,17601185,Sun Nov 28 14:32:43 CET,Sun Nov 28 16:21:54 CET,0.0 3.023 3.587 4.05 4.42 4.719 4.996 5.223 5.582 5.769 5.97 6.17 6.465 6.608 6.894 7.152 7.379 7.48 7.657 7.822 8.069 8.237 8.41 8.654 8.878 9.104 9.31 9.512 9.764 9.986 10.201 10.457 10.705 10.932 11.185 11.483 11.76 12.058 12.371 12.668 12.963 13.276 13.613 13.943 14.264 14.552 14.837 15.074 15.201 15.158 14.807 14.028 13.158 12.33 11.601 10.96 10.4 9.868 9.391 8.919 8.488 8.101 7.762 7.446 7.138 6.852 6.546 6.276 6.045 5.796 5.526 5.285 5.026 4.769 4.574 4.362 4.145 3.932 3.699 3.534 3.368 3.117 2.95 2.775 2.68 2.476 2.27 2.063 1.941 1.653 1.545 1.388 1.211 0.838 0.64 0.445 0.228 -0.027 -0.333 -0.728 -2.047 -2 ,15909 ,TETRA ,17601186,Sun Nov 28 14:33:08 CET,Sun Nov 28 16:21:05 CET,0.0 2.057 2.64 3.053 3.347 3.592 3.821 4.036 4.427 4.602 4.766 4.909 5.195 5.321 5.539 5.755 5.976 6.083 6.283 6.47 6.736 6.906 7.072 7.312 7.512 7.691 7.873 8.048 8.277 8.491 8.687 8.909 9.117 9.32 9.546 9.794 10.026 10.254 10.479 10.754 11.057 11.386 11.751 12.051 12.375 12.754 13.195 13.513 13.627 13.604 13.178 12.289 11.411 10.624 9.91 9.261 8.665 8.09 7.592 7.091 6.667 6.286 5.905 5.54 5.189 4.86 4.531 4.234 3.956 3.661 3.372 3.123 2.86 2.599 2.396 2.194 1.983 1.766 1.533 1.367 1.199 0.927 0.728 0.515 0.415 0.242 0.061 -0.143 -0.246 -0.513 -0.61 -0.755 -0.915 -1.231 -1.417 -1.625 -1.831 -2.085 -2.402 -2.768 -3.901 -3 ,10037 ,TETRA ,17601187,Sun Nov 28 14:33:12 CET,Sun Nov 28 16:21:08 CET,0.0 2.808 3.428 3.856 4.186 4.445 4.692 4.91 5.277 5.438 5.595 5.747 6.048 6.187 6.474 6.743 6.968 7.072 7.264 7.449 7.707 7.852 7.996 8.209 8.392 8.579 8.762 8.942 9.177 9.392 9.615 9.888 10.137 10.372 10.634 10.928 11.206 11.48 11.767 12.079 12.391 12.7 13.044 13.372 13.707 14.056 14.422 14.729 14.882 14.856 14.53 13.838 13.08 12.327 11.632 10.962 10.347 9.801 9.322 8.837 8.43 8.05 7.681 7.335 7.012 6.731 6.429 6.152 5.928 5.693 5.431 5.218 4.998 4.753 4.563 4.374 4.177 3.978 3.784 3.655 3.526 3.323 3.164 2.996 2.911 2.725 2.529 2.315 2.199 1.917 1.806 1.664 1.528 1.214 1.019 0.798 0.564 0.316 0.033 -0.372 -2.312 -4 ,19588 ,TETRA ,17601188,Sun Nov 28 14:33:13 CET,Sun Nov 28 16:20:55 CET,0.0 2.035 2.495 2.847 3.16 3.413 3.657 3.873 4.274 4.447 4.603 4.729 5.001 5.12 5.347 5.57 5.771 5.859 6.032 6.203 6.467 6.623 6.764 6.964 7.153 7.353 7.536 7.702 7.906 8.098 8.302 8.535 8.739 8.93 9.142 9.393 9.619 9.852 10.1 10.358 10.634 10.965 11.364 11.734 12.114 12.443 12.701 12.925 13.099 13.091 12.716 11.93 11.053 10.178 9.441 8.81 8.272 7.798 7.367 6.928 6.539 6.176 5.834 5.503 5.191 4.923 4.641 4.384 4.16 3.912 3.658 3.45 3.22 2.984 2.809 2.617 2.417 2.229 2.035 1.892 1.739 1.508 1.355 1.189 1.095 0.898 0.69 0.458 0.331 0.043 -0.058 -0.216 -0.385 -0.74 -0.937 -1.14 -1.353 -1.587 -1.888 -2.302 -3.476 -5 ,886 ,TETRA ,17601189,Sun Nov 28 14:33:09 CET,Sun Nov 28 16:21:52 CET,0.0 2.286 2.804 3.162 3.469 3.737 3.976 4.207 4.582 4.738 4.884 4.997 5.28 5.405 5.64 5.886 6.114 6.22 6.435 6.652 6.957 7.143 7.324 7.57 7.805 8.024 8.201 8.366 8.578 8.764 8.974 9.246 9.494 9.718 9.948 10.18 10.393 10.634 10.9 11.172 11.423 11.734 12.061 12.315 12.606 12.877 13.118 13.358 13.538 13.504 13.059 12.206 11.384 10.634 9.957 9.336 8.781 8.253 7.783 7.311 6.881 6.506 6.19 5.903 5.605 5.317 5.02 4.761 4.539 4.302 4.052 3.85 3.618 3.37 3.183 3.003 2.814 2.6 2.37 2.202 2.049 1.824 1.657 1.48 1.391 1.206 1.011 0.829 0.731 0.458 0.382 0.263 0.129 -0.159 -0.311 -0.51 -0.741 -0.994 -1.249 -1.597 -2.938 -6 ,24061 ,TETRA ,17601190,Sun Nov 28 14:33:11 CET,Sun Nov 28 16:21:57 CET,0.0 2.801 3.387 3.799 4.128 4.427 4.706 4.931 5.275 5.438 5.582 5.672 5.948 6.08 6.346 6.568 6.777 6.888 7.098 7.303 7.611 7.795 7.967 8.199 8.413 8.615 8.813 9.014 9.259 9.495 9.718 9.978 10.24 10.476 10.733 11.04 11.33 11.635 11.946 12.226 12.503 12.806 13.141 13.477 13.817 14.139 14.441 14.693 14.865 14.799 14.304 13.431 12.607 11.846 11.152 10.498 9.898 9.349 8.88 8.404 7.983 7.581 7.189 6.831 6.487 6.17 5.844 5.537 5.265 4.976 4.682 4.452 4.211 3.956 3.75 3.536 3.325 3.115 2.88 2.708 2.541 2.286 2.096 1.895 1.798 1.606 1.416 1.213 1.098 0.818 0.7 0.56 0.41 0.1 -0.066 -0.256 -0.476 -0.74 -1.02 -1.311 -2.436 -7 ,21365 ,TETRA ,17601191,Sun Nov 28 14:33:08 CET,Sun Nov 28 16:21:18 CET,0.0 2.799 3.395 3.788 4.104 4.369 4.593 4.792 5.186 5.366 5.514 5.639 5.924 6.063 6.329 6.547 6.756 6.861 7.051 7.24 7.494 7.642 7.793 8.007 8.205 8.385 8.554 8.719 8.934 9.143 9.342 9.573 9.785 10.005 10.272 10.564 10.818 11.06 11.336 11.624 11.911 12.251 12.627 12.955 13.285 13.577 13.852 14.104 14.257 14.269 13.876 12.991 12.138 11.348 10.604 9.931 9.351 8.782 8.257 7.747 7.299 6.904 6.554 6.224 5.905 5.606 5.284 5.003 4.762 4.515 4.266 4.045 3.807 3.562 3.377 3.195 3.004 2.804 2.574 2.392 2.201 1.897 1.684 1.458 1.342 1.103 0.847 0.567 0.427 0.14 0.018 -0.139 -0.312 -0.679 -0.883 -1.096 -1.319 -1.559 -1.824 -2.243 -3.611 -8 ,17358 ,TETRA ,17601192,Sun Nov 28 14:33:09 CET,Sun Nov 28 16:21:17 CET,0.0 2.109 2.631 2.972 3.262 3.526 3.756 3.958 4.344 4.533 4.719 4.93 5.229 5.36 5.607 5.846 6.095 6.212 6.426 6.627 6.892 7.044 7.183 7.393 7.596 7.785 7.98 8.179 8.448 8.7 8.932 9.198 9.456 9.699 9.949 10.228 10.494 10.769 11.071 11.361 11.666 12.03 12.399 12.736 13.102 13.423 13.718 13.991 14.15 14.124 13.695 12.782 11.868 11.076 10.402 9.76 9.169 8.624 8.145 7.681 7.286 6.926 6.563 6.21 5.904 5.623 5.327 5.063 4.839 4.604 4.344 4.123 3.896 3.678 3.502 3.326 3.143 2.931 2.719 2.572 2.417 2.154 1.964 1.782 1.686 1.492 1.294 1.066 0.944 0.653 0.525 0.364 0.201 -0.112 -0.277 -0.463 -0.688 -0.941 -1.26 -1.711 -3.448 -9 ,10421 ,TETRA ,17601193,Sun Nov 28 14:33:09 CET,Sun Nov 28 16:21:11 CET,0.0 3.04 3.709 4.139 4.455 4.719 4.96 5.215 5.617 5.779 5.942 6.093 6.391 6.53 6.775 7.022 7.27 7.37 7.546 7.726 7.988 8.144 8.291 8.501 8.69 8.88 9.062 9.243 9.479 9.696 9.897 10.146 10.387 10.603 10.844 11.105 11.347 11.599 11.882 12.145 12.376 12.67 13.02 13.34 13.687 14.032 14.387 14.686 14.87 14.872 14.445 13.64 12.842 12.012 11.286 10.646 10.055 9.517 9.058 8.576 8.144 7.763 7.401 7.059 6.743 6.458 6.159 5.87 5.623 5.381 5.117 4.896 4.671 4.425 4.231 4.032 3.818 3.601 3.392 3.246 3.079 2.807 2.624 2.448 2.36 2.168 1.946 1.715 1.591 1.295 1.2 1.074 0.941 0.611 0.425 0.227 -0.001 -0.312 -0.664 -1.101 -2.228 -10 ,1512 ,TETRA ,17601194,Sun Nov 28 14:33:12 CET,Sun Nov 28 16:21:45 CET,0.0 2.619 3.148 3.607 4.004 4.334 4.606 4.849 5.258 5.442 5.619 5.785 6.076 6.207 6.451 6.662 6.859 6.955 7.135 7.303 7.558 7.728 7.89 8.13 8.355 8.557 8.746 8.92 9.134 9.348 9.547 9.764 9.973 10.186 10.415 10.65 10.879 11.124 11.367 11.615 11.875 12.152 12.45 12.708 12.959 13.204 13.454 13.661 13.777 13.753 13.318 12.485 11.697 10.981 10.309 9.677 9.133 8.651 8.245 7.813 7.408 7.055 6.731 6.421 6.122 5.836 5.527 5.253 5.02 4.78 4.526 4.309 4.094 3.865 3.686 3.485 3.279 3.09 2.887 2.746 2.588 2.322 2.138 1.918 1.789 1.535 1.294 1.047 0.918 0.619 0.466 0.311 0.173 -0.131 -0.313 -0.502 -0.716 -0.973 -1.293 -1.753 -3.364 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_64.txt deleted file mode 100644 index 164b0c98..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_33_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15807 ,KEBNE ,17027167,Wed Dec 22 16:10:02 CET,Wed Dec 22 17:43:03 CET,0.0 2.357 3.113 3.623 4.014 4.362 4.671 4.94 5.375 5.571 5.751 5.949 6.275 6.449 6.78 7.084 7.367 7.501 7.765 8.015 8.356 8.562 8.754 9.058 9.348 9.599 9.831 10.048 10.332 10.594 10.831 11.12 11.383 11.641 11.958 12.303 12.613 12.932 13.251 13.581 13.927 14.288 14.69 15.056 15.425 15.814 16.112 16.254 16.33 16.162 15.498 14.372 13.278 12.172 11.165 10.277 9.53 8.885 8.303 7.693 7.152 6.662 6.209 5.783 5.377 4.999 4.605 4.261 3.958 3.635 3.304 3.028 2.724 2.399 2.151 1.908 1.659 1.402 1.13 0.944 0.751 0.442 0.211 -0.031 -0.15 -0.398 -0.638 -0.906 -1.053 -1.354 -1.485 -1.648 -1.826 -2.233 -2.456 -2.686 -2.959 -3.295 -3.681 -4.143 -5.401 -2 ,27651 ,KEBNE ,17027168,Wed Dec 22 16:10:02 CET,Wed Dec 22 17:43:58 CET,0.0 3.159 3.781 4.292 4.719 5.076 5.391 5.674 6.117 6.301 6.469 6.669 6.99 7.146 7.448 7.741 8.001 8.126 8.38 8.623 8.954 9.165 9.367 9.642 9.913 10.179 10.419 10.638 10.926 11.207 11.473 11.768 12.041 12.291 12.558 12.848 13.144 13.47 13.782 14.097 14.416 14.741 15.105 15.448 15.813 16.175 16.509 16.771 16.874 16.733 16.063 14.888 13.727 12.629 11.592 10.646 9.815 9.078 8.461 7.832 7.287 6.807 6.372 5.934 5.477 5.066 4.648 4.277 3.952 3.611 3.273 3.004 2.722 2.418 2.178 1.941 1.694 1.412 1.098 0.881 0.66 0.307 0.076 -0.142 -0.254 -0.481 -0.714 -0.974 -1.114 -1.404 -1.516 -1.665 -1.818 -2.171 -2.374 -2.592 -2.846 -3.124 -3.427 -3.88 -5.879 -3 ,31583 ,KEBNE ,17027169,Wed Dec 22 16:10:02 CET,Wed Dec 22 17:44:18 CET,0.0 2.787 3.408 3.9 4.302 4.648 4.959 5.238 5.72 5.942 6.157 6.379 6.715 6.904 7.253 7.581 7.879 8.012 8.272 8.507 8.833 9.048 9.255 9.552 9.827 10.102 10.362 10.578 10.852 11.127 11.381 11.687 11.975 12.241 12.547 12.875 13.177 13.487 13.791 14.115 14.473 14.853 15.241 15.602 16.002 16.394 16.779 17.089 17.24 17.17 16.518 15.303 14.214 13.177 12.236 11.381 10.656 10.013 9.433 8.82 8.269 7.802 7.36 6.916 6.525 6.194 5.828 5.477 5.168 4.87 4.569 4.297 4.021 3.714 3.453 3.206 2.949 2.661 2.362 2.167 1.962 1.621 1.383 1.13 0.996 0.712 0.408 0.092 -0.072 -0.396 -0.577 -0.762 -0.948 -1.353 -1.565 -1.785 -2.035 -2.348 -2.727 -3.221 -4.706 -4 ,11529 ,KEBNE ,17027170,Wed Dec 22 16:10:02 CET,Wed Dec 22 17:44:37 CET,0.0 3.59 4.411 4.994 5.464 5.833 6.197 6.51 6.985 7.219 7.418 7.613 7.92 8.076 8.371 8.653 8.945 9.081 9.322 9.544 9.849 10.039 10.218 10.476 10.737 10.988 11.227 11.445 11.719 11.989 12.252 12.58 12.878 13.134 13.425 13.749 14.041 14.338 14.647 14.962 15.267 15.611 15.996 16.328 16.694 17.051 17.359 17.601 17.717 17.628 17.022 15.899 14.775 13.733 12.787 11.943 11.196 10.506 9.902 9.293 8.773 8.301 7.848 7.426 7.016 6.637 6.237 5.867 5.551 5.244 4.934 4.653 4.368 4.075 3.836 3.591 3.348 3.109 2.858 2.676 2.49 2.206 2.01 1.8 1.679 1.441 1.19 0.903 0.763 0.459 0.308 0.141 -0.02 -0.362 -0.55 -0.756 -0.999 -1.293 -1.645 -2.201 -5.133 -5 ,2760 ,KEBNE ,17027171,Wed Dec 22 16:10:02 CET,Wed Dec 22 17:43:58 CET,0.0 2.597 3.314 3.817 4.237 4.578 4.875 5.151 5.641 5.869 6.083 6.339 6.678 6.856 7.186 7.483 7.767 7.899 8.157 8.411 8.728 8.93 9.133 9.4 9.653 9.911 10.148 10.383 10.689 10.961 11.211 11.513 11.79 12.037 12.341 12.669 12.953 13.26 13.571 13.871 14.193 14.547 14.941 15.289 15.63 15.996 16.392 16.684 16.78 16.675 16.102 14.972 13.89 12.873 11.931 11.071 10.268 9.518 8.917 8.356 7.86 7.395 6.967 6.56 6.144 5.745 5.321 4.959 4.65 4.332 4.024 3.762 3.473 3.181 2.973 2.764 2.536 2.284 2.019 1.834 1.639 1.317 1.076 0.834 0.711 0.46 0.19 -0.101 -0.246 -0.559 -0.699 -0.857 -1.023 -1.387 -1.588 -1.827 -2.08 -2.333 -2.702 -3.301 -5.11 -6 ,14417 ,KEBNE ,17027172,Wed Dec 22 16:10:02 CET,Wed Dec 22 17:42:49 CET,0.0 2.939 3.738 4.29 4.692 5.045 5.378 5.686 6.242 6.471 6.689 6.946 7.281 7.465 7.813 8.114 8.382 8.51 8.756 8.989 9.305 9.507 9.704 9.98 10.239 10.488 10.718 10.94 11.216 11.481 11.734 12.019 12.292 12.548 12.837 13.144 13.418 13.724 14.047 14.361 14.669 15.031 15.435 15.791 16.156 16.483 16.763 16.96 17.075 16.948 16.223 14.797 13.423 12.197 11.05 10.03 9.211 8.496 7.86 7.253 6.743 6.23 5.706 5.231 4.796 4.424 4.053 3.715 3.417 3.103 2.771 2.497 2.216 1.915 1.675 1.421 1.155 0.884 0.601 0.398 0.189 -0.127 -0.332 -0.537 -0.654 -0.904 -1.159 -1.428 -1.557 -1.849 -1.963 -2.11 -2.268 -2.608 -2.814 -3.049 -3.297 -3.565 -3.925 -4.4 -6.588 -7 ,18886 ,KEBNE ,17027173,Wed Dec 22 16:10:03 CET,Wed Dec 22 17:43:33 CET,0.0 2.897 3.735 4.235 4.588 4.925 5.246 5.534 6.052 6.28 6.487 6.716 7.062 7.245 7.546 7.805 8.057 8.181 8.43 8.672 9.014 9.219 9.405 9.679 9.923 10.157 10.386 10.605 10.876 11.116 11.367 11.675 11.954 12.225 12.531 12.865 13.159 13.447 13.759 14.09 14.45 14.825 15.207 15.573 15.933 16.266 16.562 16.776 16.934 16.915 16.228 14.994 13.899 12.886 11.982 11.173 10.401 9.627 8.964 8.345 7.806 7.318 6.836 6.378 5.95 5.54 5.118 4.75 4.429 4.082 3.736 3.467 3.174 2.847 2.596 2.356 2.107 1.841 1.554 1.357 1.164 0.864 0.652 0.426 0.308 0.08 -0.152 -0.401 -0.54 -0.85 -0.976 -1.127 -1.288 -1.647 -1.852 -2.088 -2.35 -2.658 -3.028 -3.471 -4.917 -8 ,14808 ,KEBNE ,17027174,Wed Dec 22 16:11:04 CET,Wed Dec 22 17:45:53 CET,0.0 4.297 5.059 5.544 5.937 6.286 6.605 6.89 7.361 7.563 7.742 7.907 8.214 8.373 8.694 9.01 9.286 9.415 9.667 9.894 10.195 10.382 10.563 10.842 11.106 11.35 11.577 11.795 12.076 12.333 12.579 12.883 13.187 13.451 13.751 14.091 14.394 14.716 15.055 15.379 15.691 16.036 16.43 16.797 17.152 17.505 17.845 18.085 18.225 18.121 17.488 16.268 15.134 14.138 13.189 12.343 11.589 10.847 10.18 9.553 9.021 8.534 8.062 7.595 7.163 6.764 6.331 5.948 5.623 5.272 4.919 4.645 4.364 4.061 3.815 3.574 3.328 3.057 2.78 2.592 2.398 2.097 1.883 1.653 1.536 1.298 1.021 0.734 0.598 0.284 0.108 -0.062 -0.226 -0.612 -0.803 -1.006 -1.275 -1.575 -1.967 -2.508 -4.577 -9 ,5838 ,KEBNE ,17027175,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:54:14 CET,0.0 3.705 4.567 5.087 5.481 5.822 6.129 6.395 6.852 7.058 7.254 7.48 7.826 8.006 8.315 8.6 8.857 8.983 9.233 9.489 9.883 10.118 10.326 10.616 10.888 11.143 11.372 11.587 11.887 12.208 12.482 12.757 13.051 13.322 13.604 13.927 14.234 14.554 14.877 15.201 15.508 15.841 16.22 16.561 16.917 17.267 17.609 17.892 18.023 17.86 17.135 15.999 14.846 13.732 12.802 11.936 11.16 10.423 9.763 9.136 8.592 8.092 7.618 7.179 6.765 6.386 5.994 5.648 5.351 5.044 4.705 4.422 4.144 3.866 3.643 3.398 3.151 2.886 2.606 2.419 2.224 1.918 1.702 1.472 1.356 1.109 0.853 0.572 0.418 0.096 -0.065 -0.233 -0.411 -0.833 -1.071 -1.34 -1.63 -1.921 -2.246 -2.811 -4.651 -10 ,4963 ,KEBNE ,17027176,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:54:22 CET,0.0 3.01 3.899 4.464 4.893 5.252 5.58 5.881 6.399 6.618 6.807 7.031 7.37 7.545 7.845 8.148 8.438 8.562 8.804 9.045 9.381 9.59 9.793 10.067 10.311 10.547 10.774 10.984 11.264 11.538 11.793 12.074 12.331 12.589 12.882 13.222 13.536 13.83 14.149 14.506 14.856 15.204 15.586 15.927 16.253 16.557 16.88 17.123 17.195 17.057 16.369 15.211 14.14 13.157 12.232 11.373 10.635 9.961 9.371 8.757 8.221 7.747 7.311 6.914 6.544 6.182 5.791 5.459 5.176 4.878 4.559 4.295 4.021 3.735 3.511 3.279 3.035 2.785 2.528 2.339 2.149 1.863 1.639 1.395 1.275 1.04 0.796 0.521 0.378 0.068 -0.097 -0.281 -0.477 -0.915 -1.159 -1.427 -1.707 -2.075 -2.523 -3.084 -5.361 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_35_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_35_36.txt deleted file mode 100644 index 20474ea5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_35_36.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16956 ,TETRA ,17601195,Sun Nov 28 14:33:09 CET,Sun Nov 28 16:21:56 CET,0.0 1.227 1.586 1.875 2.125 2.36 2.578 2.767 3.108 3.254 3.392 3.495 3.787 3.923 4.153 4.361 4.567 4.666 4.86 5.035 5.3 5.483 5.641 5.854 6.063 6.26 6.448 6.629 6.849 7.067 7.28 7.543 7.789 8.014 8.281 8.574 8.843 9.133 9.46 9.793 10.127 10.51 10.905 11.286 11.749 12.22 12.703 13.197 13.71 14.216 14.613 14.485 14.151 13.815 13.428 13.026 12.646 12.261 11.916 11.582 11.297 11.034 10.758 10.489 10.227 9.982 9.731 9.504 9.317 9.119 8.908 8.731 8.549 8.357 8.205 8.044 7.874 7.697 7.534 7.419 7.285 7.074 6.918 6.756 6.68 6.511 6.31 6.101 5.997 5.736 5.681 5.565 5.445 5.172 5.025 4.869 4.666 4.453 4.224 3.916 3.203 -2 ,26480 ,TETRA ,17601196,Sun Nov 28 14:33:12 CET,Sun Nov 28 16:22:02 CET,0.0 1.598 2.043 2.367 2.636 2.859 3.072 3.273 3.628 3.79 3.942 4.054 4.325 4.438 4.652 4.847 5.041 5.138 5.331 5.513 5.773 5.938 6.095 6.304 6.506 6.719 6.925 7.104 7.335 7.561 7.761 7.994 8.228 8.464 8.725 9.015 9.296 9.598 9.916 10.227 10.556 10.942 11.365 11.752 12.166 12.618 13.134 13.658 14.127 14.522 14.774 14.675 14.371 14.016 13.649 13.251 12.86 12.474 12.114 11.749 11.447 11.174 10.915 10.658 10.389 10.153 9.904 9.671 9.478 9.275 9.069 8.905 8.73 8.529 8.366 8.207 8.049 7.877 7.678 7.542 7.415 7.215 7.076 6.931 6.852 6.696 6.53 6.305 6.178 5.903 5.839 5.73 5.604 5.321 5.17 5.006 4.813 4.596 4.343 3.964 3.134 -3 ,21202 ,TETRA ,17601197,Sun Nov 28 14:33:14 CET,Sun Nov 28 16:22:18 CET,0.0 2.161 2.628 2.948 3.224 3.485 3.723 3.933 4.289 4.457 4.614 4.719 5.001 5.122 5.342 5.568 5.778 5.881 6.083 6.276 6.534 6.687 6.832 7.045 7.259 7.462 7.655 7.841 8.072 8.284 8.485 8.734 8.982 9.225 9.494 9.777 10.047 10.334 10.641 10.954 11.263 11.62 12.028 12.419 12.858 13.301 13.784 14.302 14.812 15.266 15.522 15.39 15.097 14.729 14.345 13.971 13.608 13.263 12.963 12.612 12.286 12.013 11.753 11.503 11.259 11.015 10.746 10.516 10.314 10.107 9.903 9.722 9.536 9.34 9.184 9.03 8.869 8.694 8.505 8.372 8.235 8.02 7.873 7.719 7.639 7.48 7.301 7.119 7.027 6.753 6.673 6.552 6.428 6.173 6.025 5.855 5.671 5.463 5.215 4.924 4.305 -4 ,3183 ,TETRA ,17601198,Sun Nov 28 14:33:15 CET,Sun Nov 28 16:22:05 CET,0.0 1.56 2.012 2.372 2.682 2.932 3.172 3.383 3.757 3.918 4.055 4.169 4.447 4.577 4.866 5.123 5.354 5.461 5.659 5.832 6.049 6.196 6.348 6.565 6.776 6.982 7.183 7.369 7.606 7.844 8.065 8.315 8.583 8.864 9.161 9.472 9.761 10.059 10.356 10.655 10.98 11.338 11.726 12.138 12.615 13.093 13.62 14.129 14.584 14.992 15.297 15.238 14.947 14.605 14.253 13.853 13.459 13.106 12.805 12.482 12.18 11.891 11.618 11.37 11.122 10.892 10.654 10.436 10.23 10.015 9.801 9.607 9.392 9.168 8.988 8.805 8.62 8.432 8.235 8.092 7.939 7.692 7.513 7.328 7.243 7.068 6.876 6.687 6.591 6.328 6.262 6.145 6.017 5.706 5.555 5.408 5.221 5.001 4.692 4.244 3.202 -5 ,9962 ,TETRA ,17601199,Sun Nov 28 14:33:09 CET,Sun Nov 28 16:23:20 CET,0.0 1.057 1.427 1.751 2.031 2.247 2.458 2.658 3.016 3.166 3.311 3.452 3.747 3.876 4.113 4.333 4.541 4.643 4.834 5.008 5.272 5.437 5.589 5.806 6.014 6.209 6.391 6.57 6.81 7.042 7.271 7.551 7.795 8.014 8.264 8.538 8.797 9.07 9.377 9.71 10.038 10.402 10.813 11.188 11.592 12.029 12.525 13.064 13.601 14.04 14.289 14.139 13.781 13.421 13.07 12.684 12.298 11.926 11.586 11.215 10.885 10.607 10.351 10.097 9.839 9.589 9.336 9.112 8.906 8.692 8.478 8.307 8.139 7.967 7.816 7.649 7.487 7.319 7.145 7.028 6.9 6.701 6.564 6.422 6.347 6.188 6.008 5.798 5.69 5.419 5.349 5.232 5.115 4.835 4.649 4.456 4.253 3.997 3.685 3.257 2.197 -6 ,29533 ,TETRA ,17601200,Sun Nov 28 14:33:09 CET,Sun Nov 28 16:22:49 CET,0.0 1.577 2.091 2.467 2.743 2.949 3.146 3.345 3.677 3.825 3.975 4.095 4.372 4.49 4.717 4.93 5.121 5.22 5.409 5.585 5.848 6.021 6.177 6.398 6.619 6.821 7.0 7.171 7.412 7.638 7.839 8.081 8.322 8.554 8.81 9.082 9.355 9.656 9.963 10.291 10.648 11.04 11.486 11.905 12.329 12.801 13.318 13.821 14.331 14.745 15.018 14.904 14.537 14.13 13.707 13.274 12.897 12.527 12.17 11.809 11.5 11.216 10.92 10.628 10.36 10.109 9.857 9.643 9.434 9.221 9.009 8.837 8.662 8.454 8.283 8.096 7.886 7.693 7.52 7.388 7.244 7.018 6.846 6.679 6.6 6.416 6.21 5.992 5.887 5.628 5.57 5.45 5.319 5.01 4.855 4.699 4.496 4.258 3.959 3.582 2.357 -7 ,28782 ,TETRA ,17601201,Sun Nov 28 14:33:10 CET,Sun Nov 28 16:25:30 CET,0.0 1.589 2.141 2.55 2.912 3.182 3.412 3.639 3.99 4.145 4.295 4.412 4.694 4.808 5.039 5.267 5.484 5.583 5.76 5.945 6.21 6.365 6.521 6.752 6.966 7.169 7.366 7.549 7.778 7.992 8.196 8.438 8.65 8.86 9.123 9.427 9.72 10.025 10.332 10.647 10.971 11.349 11.786 12.194 12.638 13.114 13.637 14.147 14.663 15.108 15.357 15.29 15.039 14.718 14.338 13.919 13.543 13.19 12.861 12.541 12.25 11.978 11.729 11.485 11.241 11.004 10.757 10.543 10.343 10.134 9.935 9.768 9.591 9.407 9.241 9.068 8.898 8.705 8.492 8.353 8.217 8.001 7.844 7.683 7.604 7.451 7.288 7.094 6.985 6.721 6.649 6.527 6.406 6.126 5.954 5.762 5.572 5.349 5.088 4.741 3.765 -8 ,8674 ,TETRA ,17601202,Sun Nov 28 14:33:11 CET,Sun Nov 28 16:22:19 CET,0.0 1.048 1.525 1.908 2.2 2.444 2.669 2.877 3.235 3.404 3.57 3.713 4.012 4.148 4.41 4.648 4.862 4.968 5.155 5.328 5.594 5.768 5.933 6.177 6.417 6.631 6.819 6.982 7.201 7.424 7.632 7.878 8.096 8.296 8.537 8.814 9.083 9.377 9.707 10.057 10.404 10.778 11.206 11.639 12.101 12.555 13.075 13.599 14.101 14.58 14.851 14.714 14.405 14.018 13.615 13.214 12.841 12.491 12.17 11.837 11.496 11.173 10.892 10.636 10.399 10.172 9.932 9.721 9.549 9.353 9.122 8.925 8.732 8.545 8.395 8.232 8.071 7.892 7.695 7.56 7.427 7.229 7.089 6.933 6.846 6.675 6.496 6.308 6.218 5.961 5.893 5.778 5.656 5.385 5.24 5.092 4.919 4.695 4.415 4.094 3.385 -9 ,21123 ,TETRA ,17601203,Sun Nov 28 14:33:12 CET,Sun Nov 28 16:22:11 CET,0.0 1.416 1.759 2.037 2.316 2.554 2.75 2.921 3.244 3.391 3.524 3.638 3.929 4.062 4.296 4.52 4.74 4.841 5.024 5.202 5.452 5.611 5.77 5.986 6.196 6.399 6.591 6.786 7.043 7.282 7.492 7.737 7.982 8.207 8.465 8.766 9.033 9.305 9.623 9.986 10.33 10.705 11.13 11.512 11.935 12.368 12.842 13.368 13.918 14.41 14.725 14.635 14.354 14.005 13.622 13.227 12.864 12.488 12.137 11.784 11.473 11.194 10.922 10.655 10.401 10.168 9.922 9.702 9.5 9.281 9.048 8.844 8.637 8.431 8.259 8.066 7.873 7.677 7.457 7.3 7.143 6.91 6.745 6.568 6.484 6.313 6.141 5.969 5.876 5.611 5.547 5.432 5.304 5.0 4.833 4.662 4.467 4.287 4.088 3.728 2.959 -10 ,10246 ,TETRA ,17601204,Sun Nov 28 14:33:38 CET,Sun Nov 28 16:23:05 CET,0.0 1.163 1.556 1.842 2.086 2.326 2.524 2.69 3.011 3.169 3.312 3.415 3.699 3.818 4.067 4.295 4.503 4.604 4.799 4.992 5.26 5.414 5.565 5.786 5.989 6.187 6.383 6.572 6.811 7.035 7.249 7.505 7.744 7.97 8.246 8.555 8.824 9.121 9.436 9.736 10.052 10.423 10.861 11.263 11.688 12.151 12.636 13.142 13.672 14.173 14.472 14.32 13.938 13.496 13.082 12.679 12.33 11.988 11.674 11.342 11.027 10.746 10.484 10.199 9.93 9.709 9.456 9.232 9.051 8.855 8.638 8.454 8.267 8.071 7.921 7.769 7.597 7.398 7.189 7.057 6.932 6.737 6.59 6.433 6.351 6.194 6.04 5.862 5.754 5.483 5.428 5.317 5.187 4.894 4.744 4.585 4.399 4.191 3.991 3.652 2.758 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_35_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_35_37.txt deleted file mode 100644 index 93a1655c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_35_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29716 ,TETRA ,17601205,Sun Nov 28 14:33:10 CET,Sun Nov 28 16:21:50 CET,0.0 1.56 2.016 2.387 2.641 2.851 3.047 3.251 3.63 3.797 3.944 4.068 4.367 4.495 4.729 4.952 5.144 5.233 5.415 5.581 5.792 5.945 6.101 6.31 6.503 6.692 6.876 7.053 7.272 7.474 7.679 7.958 8.237 8.496 8.788 9.118 9.439 9.754 10.048 10.341 10.63 10.95 11.309 11.661 12.07 12.489 12.927 13.393 13.801 14.141 14.328 13.996 13.53 13.056 12.575 12.103 11.659 11.24 10.826 10.396 10.039 9.687 9.345 9.035 8.724 8.44 8.178 7.951 7.747 7.535 7.286 7.076 6.867 6.601 6.372 6.168 5.962 5.748 5.532 5.385 5.244 5.023 4.862 4.696 4.614 4.443 4.25 4.051 3.951 3.679 3.622 3.508 3.382 3.099 2.943 2.758 2.555 2.33 2.073 1.741 0.91 -2 ,23675 ,TETRA ,17601206,Sun Nov 28 14:33:10 CET,Sun Nov 28 16:22:05 CET,0.0 1.192 1.588 1.894 2.12 2.312 2.491 2.655 2.954 3.098 3.236 3.332 3.6 3.708 3.933 4.151 4.353 4.459 4.655 4.821 5.064 5.223 5.368 5.572 5.767 5.955 6.132 6.301 6.521 6.725 6.913 7.135 7.355 7.57 7.826 8.11 8.367 8.636 8.912 9.186 9.482 9.824 10.187 10.553 11.016 11.52 12.025 12.488 12.926 13.336 13.519 13.266 12.819 12.304 11.817 11.337 10.852 10.391 9.979 9.559 9.199 8.862 8.538 8.232 7.945 7.682 7.395 7.137 6.917 6.678 6.416 6.19 5.974 5.766 5.603 5.437 5.256 5.043 4.798 4.624 4.447 4.186 4.008 3.811 3.708 3.479 3.24 2.98 2.837 2.535 2.402 2.238 2.069 1.692 1.442 1.143 0.835 0.504 0.11 -0.37 -1.421 -3 ,2898 ,TETRA ,17601207,Sun Nov 28 14:33:11 CET,Sun Nov 28 16:22:10 CET,0.0 1.573 2.083 2.416 2.705 2.985 3.222 3.428 3.802 3.975 4.135 4.27 4.558 4.677 4.899 5.116 5.339 5.442 5.618 5.796 6.055 6.215 6.369 6.579 6.762 6.938 7.108 7.275 7.494 7.712 7.927 8.177 8.409 8.63 8.875 9.132 9.375 9.636 9.909 10.185 10.473 10.796 11.163 11.536 11.979 12.413 12.817 13.241 13.65 13.998 14.171 13.942 13.565 13.146 12.691 12.24 11.847 11.475 11.123 10.761 10.463 10.177 9.896 9.637 9.386 9.148 8.886 8.652 8.458 8.239 8.007 7.819 7.627 7.417 7.243 7.076 6.899 6.708 6.494 6.348 6.193 5.924 5.739 5.559 5.473 5.303 5.111 4.892 4.781 4.51 4.417 4.27 4.116 3.794 3.63 3.443 3.216 2.945 2.628 2.145 1.04 -4 ,13047 ,TETRA ,17601208,Sun Nov 28 14:33:13 CET,Sun Nov 28 16:22:10 CET,0.0 0.926 1.325 1.603 1.847 2.07 2.25 2.415 2.751 2.904 3.052 3.188 3.47 3.578 3.775 3.981 4.184 4.279 4.455 4.609 4.839 4.993 5.136 5.352 5.567 5.764 5.947 6.123 6.348 6.576 6.815 7.105 7.373 7.629 7.916 8.225 8.519 8.819 9.129 9.456 9.795 10.171 10.584 10.98 11.424 11.884 12.363 12.83 13.266 13.591 13.652 13.327 12.895 12.406 11.935 11.481 11.051 10.622 10.227 9.831 9.483 9.174 8.864 8.566 8.294 8.043 7.777 7.529 7.304 7.068 6.822 6.616 6.401 6.186 6.02 5.846 5.669 5.481 5.28 5.141 4.988 4.745 4.565 4.367 4.272 4.064 3.827 3.582 3.465 3.19 3.092 2.96 2.825 2.518 2.353 2.149 1.903 1.617 1.291 0.921 -0.091 -5 ,6481 ,TETRA ,17601209,Sun Nov 28 14:33:13 CET,Sun Nov 28 16:22:19 CET,0.0 4.092 4.86 5.305 5.663 5.985 6.25 6.481 6.918 7.123 7.314 7.47 7.761 7.885 8.106 8.296 8.469 8.556 8.732 8.907 9.151 9.305 9.448 9.647 9.85 10.046 10.234 10.415 10.642 10.882 11.118 11.392 11.648 11.885 12.164 12.495 12.802 13.123 13.482 13.857 14.205 14.592 15.036 15.426 15.843 16.301 16.787 17.268 17.723 18.055 18.218 17.907 17.395 16.915 16.49 16.057 15.66 15.301 14.95 14.573 14.253 13.971 13.688 13.412 13.131 12.836 12.516 12.215 11.968 11.727 11.476 11.285 11.082 10.872 10.689 10.471 10.243 10.015 9.787 9.634 9.478 9.221 9.038 8.855 8.758 8.552 8.333 8.095 7.973 7.695 7.615 7.475 7.314 6.922 6.714 6.493 6.25 5.992 5.646 5.209 3.106 -6 ,12960 ,TETRA ,17601210,Sun Nov 28 14:33:15 CET,Sun Nov 28 16:22:10 CET,0.0 1.882 2.408 2.743 3.012 3.237 3.431 3.622 3.966 4.115 4.249 4.348 4.648 4.782 5.006 5.226 5.458 5.575 5.772 5.945 6.213 6.374 6.535 6.767 6.982 7.202 7.395 7.566 7.79 8.002 8.19 8.43 8.666 8.891 9.165 9.45 9.705 9.984 10.277 10.587 10.926 11.292 11.675 12.025 12.41 12.801 13.191 13.592 14.002 14.321 14.412 14.114 13.665 13.213 12.777 12.338 11.929 11.538 11.168 10.791 10.461 10.155 9.85 9.561 9.292 9.046 8.782 8.536 8.33 8.129 7.921 7.726 7.499 7.261 7.073 6.892 6.727 6.551 6.352 6.212 6.071 5.853 5.704 5.545 5.458 5.275 5.059 4.826 4.709 4.432 4.338 4.196 4.031 3.649 3.459 3.274 3.03 2.731 2.355 1.857 0.099 -7 ,5671 ,TETRA ,17601211,Sun Nov 28 14:33:13 CET,Sun Nov 28 16:22:29 CET,0.0 1.654 2.161 2.556 2.891 3.194 3.468 3.691 4.069 4.254 4.431 4.588 4.877 4.992 5.223 5.448 5.654 5.753 5.958 6.176 6.48 6.645 6.785 6.994 7.2 7.403 7.591 7.758 7.972 8.185 8.395 8.634 8.852 9.093 9.384 9.678 9.944 10.237 10.54 10.861 11.188 11.542 11.979 12.392 12.841 13.304 13.782 14.274 14.701 14.98 15.079 14.917 14.527 14.012 13.498 12.988 12.511 12.066 11.667 11.252 10.899 10.598 10.312 10.013 9.709 9.433 9.12 8.817 8.582 8.359 8.124 7.919 7.706 7.493 7.321 7.141 6.95 6.737 6.515 6.373 6.231 6.008 5.841 5.652 5.554 5.367 5.159 4.92 4.804 4.532 4.446 4.314 4.183 3.875 3.691 3.512 3.31 3.071 2.779 2.44 0.999 -8 ,27806 ,TETRA ,17601212,Sun Nov 28 14:33:13 CET,Sun Nov 28 16:22:27 CET,0.0 2.687 3.341 3.8 4.123 4.37 4.602 4.834 5.23 5.422 5.603 5.738 6.026 6.155 6.397 6.612 6.835 6.96 7.184 7.369 7.649 7.821 7.978 8.223 8.464 8.69 8.878 9.041 9.26 9.477 9.674 9.91 10.138 10.348 10.584 10.843 11.082 11.348 11.627 11.917 12.204 12.51 12.875 13.259 13.669 14.072 14.512 14.961 15.384 15.706 15.827 15.568 15.144 14.688 14.23 13.762 13.335 12.96 12.619 12.251 11.943 11.665 11.377 11.096 10.845 10.622 10.384 10.139 9.911 9.69 9.462 9.274 9.073 8.835 8.645 8.454 8.249 8.048 7.845 7.697 7.55 7.314 7.143 6.964 6.857 6.634 6.43 6.201 6.062 5.749 5.602 5.437 5.258 4.876 4.655 4.416 4.148 3.838 3.39 2.796 1.134 -9 ,7162 ,TETRA ,17601213,Sun Nov 28 14:33:13 CET,Sun Nov 28 16:21:39 CET,0.0 1.664 2.204 2.56 2.841 3.095 3.339 3.56 3.943 4.117 4.268 4.372 4.682 4.825 5.074 5.299 5.508 5.607 5.793 5.971 6.218 6.369 6.522 6.753 6.977 7.172 7.348 7.522 7.749 7.961 8.151 8.395 8.638 8.861 9.105 9.368 9.633 9.922 10.207 10.492 10.789 11.107 11.455 11.8 12.233 12.709 13.201 13.666 14.067 14.385 14.546 14.318 13.868 13.349 12.831 12.338 11.875 11.403 10.979 10.579 10.215 9.883 9.559 9.241 8.951 8.674 8.377 8.113 7.88 7.624 7.361 7.148 6.919 6.689 6.508 6.307 6.097 5.868 5.642 5.498 5.344 5.081 4.885 4.694 4.601 4.407 4.212 3.995 3.884 3.603 3.503 3.361 3.225 2.96 2.803 2.616 2.409 2.179 1.828 1.326 -0.063 -10 ,25566 ,TETRA ,17601214,Sun Nov 28 14:33:13 CET,Sun Nov 28 16:21:52 CET,0.0 1.829 2.256 2.58 2.841 3.054 3.276 3.47 3.786 3.933 4.065 4.159 4.439 4.555 4.756 4.947 5.136 5.229 5.416 5.587 5.832 5.992 6.129 6.328 6.54 6.733 6.925 7.108 7.313 7.519 7.722 7.963 8.203 8.423 8.656 8.926 9.197 9.503 9.829 10.148 10.48 10.865 11.304 11.724 12.198 12.688 13.185 13.644 14.083 14.459 14.582 14.278 13.822 13.3 12.775 12.273 11.821 11.395 11.004 10.605 10.231 9.894 9.573 9.269 8.986 8.7 8.399 8.148 7.924 7.682 7.428 7.218 7.006 6.771 6.586 6.393 6.196 5.993 5.764 5.615 5.459 5.206 5.047 4.873 4.782 4.599 4.383 4.168 4.062 3.792 3.719 3.587 3.439 3.1 2.903 2.676 2.433 2.188 1.898 1.477 0.189 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_35_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_35_49.txt deleted file mode 100644 index 6bc2eaa2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_35_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16755 ,TETRA ,17601215,Sun Nov 28 14:33:11 CET,Sun Nov 28 16:20:54 CET,0.0 1.655 2.16 2.635 2.99 3.249 3.49 3.699 4.111 4.298 4.45 4.596 4.899 5.043 5.312 5.546 5.76 5.868 6.084 6.275 6.544 6.729 6.924 7.213 7.465 7.695 7.911 8.11 8.362 8.588 8.812 9.11 9.396 9.679 10.013 10.371 10.712 11.088 11.482 11.874 12.286 12.765 13.316 13.885 14.53 15.175 15.848 16.579 17.41 18.286 19.047 19.355 19.285 19.006 18.653 18.303 17.984 17.686 17.401 17.088 16.789 16.495 16.21 15.937 15.694 15.478 15.251 15.044 14.86 14.663 14.449 14.279 14.099 13.902 13.735 13.559 13.386 13.2 12.996 12.849 12.708 12.491 12.314 12.136 12.055 11.878 11.692 11.497 11.388 11.126 11.008 10.856 10.715 10.414 10.224 10.005 9.759 9.442 9.131 8.843 8.176 -2 ,23165 ,TETRA ,17601216,Sun Nov 28 14:33:13 CET,Sun Nov 28 16:22:35 CET,0.0 2.735 3.305 3.719 4.046 4.335 4.592 4.841 5.301 5.483 5.643 5.802 6.098 6.227 6.477 6.741 6.987 7.096 7.313 7.518 7.812 8.006 8.199 8.466 8.71 8.957 9.198 9.437 9.773 10.083 10.358 10.707 11.025 11.328 11.695 12.086 12.449 12.843 13.248 13.679 14.131 14.615 15.187 15.748 16.343 16.989 17.705 18.447 19.227 20.031 20.75 21.057 20.996 20.77 20.494 20.178 19.846 19.553 19.296 18.974 18.647 18.364 18.114 17.856 17.616 17.406 17.18 16.979 16.804 16.611 16.397 16.215 16.029 15.84 15.695 15.531 15.338 15.132 14.926 14.776 14.613 14.37 14.213 14.052 13.95 13.732 13.537 13.345 13.25 13.002 12.924 12.795 12.656 12.331 12.153 11.965 11.764 11.527 11.198 10.815 9.054 -3 ,4347 ,TETRA ,17601217,Sun Nov 28 14:33:15 CET,Sun Nov 28 16:22:25 CET,0.0 1.594 2.155 2.612 2.947 3.215 3.457 3.72 4.225 4.428 4.616 4.806 5.127 5.283 5.588 5.871 6.112 6.224 6.452 6.683 7.006 7.207 7.403 7.679 7.941 8.195 8.429 8.661 8.987 9.292 9.583 9.932 10.258 10.555 10.872 11.248 11.611 11.992 12.404 12.854 13.322 13.81 14.36 14.899 15.521 16.215 16.925 17.622 18.364 19.139 19.849 20.067 19.915 19.584 19.234 18.897 18.565 18.243 17.944 17.623 17.341 17.079 16.819 16.574 16.344 16.115 15.864 15.63 15.422 15.206 14.984 14.805 14.614 14.404 14.232 14.046 13.843 13.64 13.448 13.319 13.184 12.927 12.729 12.522 12.41 12.188 11.952 11.714 11.59 11.301 11.15 10.995 10.832 10.476 10.278 10.064 9.841 9.58 9.281 8.849 7.802 -4 ,8726 ,TETRA ,17601218,Sun Nov 28 14:33:16 CET,Sun Nov 28 16:22:26 CET,0.0 1.219 1.753 2.144 2.443 2.697 2.919 3.138 3.54 3.708 3.859 4.009 4.308 4.442 4.698 4.951 5.214 5.336 5.556 5.767 6.094 6.307 6.499 6.771 7.035 7.287 7.535 7.782 8.077 8.365 8.668 9.025 9.371 9.694 10.051 10.43 10.797 11.21 11.623 12.052 12.487 12.975 13.513 14.027 14.64 15.286 16.005 16.751 17.487 18.3 19.12 19.462 19.461 19.242 18.917 18.605 18.296 17.979 17.668 17.343 17.065 16.772 16.492 16.241 16.01 15.777 15.506 15.267 15.052 14.822 14.569 14.366 14.161 13.924 13.737 13.555 13.379 13.197 13.007 12.881 12.749 12.53 12.367 12.19 12.092 11.892 11.701 11.491 11.368 11.085 10.992 10.847 10.699 10.41 10.245 10.069 9.872 9.624 9.244 8.756 7.948 -5 ,22676 ,TETRA ,17601219,Sun Nov 28 14:33:38 CET,Sun Nov 28 16:22:00 CET,0.0 1.287 1.773 2.11 2.359 2.598 2.851 3.075 3.424 3.582 3.734 3.874 4.173 4.302 4.551 4.792 5.007 5.116 5.317 5.5 5.775 5.954 6.127 6.368 6.609 6.831 7.043 7.25 7.52 7.787 8.039 8.345 8.633 8.909 9.214 9.536 9.857 10.205 10.582 10.983 11.389 11.842 12.354 12.84 13.393 14.015 14.689 15.371 16.109 16.871 17.49 17.666 17.568 17.365 17.074 16.758 16.433 16.13 15.879 15.581 15.315 15.075 14.814 14.58 14.367 14.151 13.922 13.715 13.528 13.328 13.124 12.958 12.79 12.604 12.451 12.287 12.119 11.953 11.777 11.652 11.524 11.329 11.177 11.001 10.905 10.711 10.512 10.307 10.206 9.937 9.823 9.678 9.536 9.218 9.036 8.827 8.605 8.358 8.052 7.664 6.632 -6 ,31006 ,TETRA ,17601220,Sun Nov 28 14:33:40 CET,Sun Nov 28 16:22:01 CET,0.0 2.13 2.644 2.994 3.316 3.603 3.847 4.079 4.5 4.687 4.89 5.109 5.424 5.578 5.864 6.129 6.387 6.508 6.733 6.957 7.266 7.449 7.625 7.873 8.119 8.362 8.592 8.818 9.124 9.417 9.698 10.05 10.375 10.668 11.006 11.39 11.763 12.149 12.544 12.948 13.39 13.903 14.472 15.034 15.67 16.346 17.075 17.826 18.577 19.353 20.049 20.301 20.264 20.024 19.72 19.391 19.005 18.619 18.314 18.034 17.808 17.587 17.336 17.075 16.827 16.594 16.323 16.082 15.896 15.702 15.482 15.308 15.14 14.953 14.791 14.622 14.454 14.284 14.101 13.967 13.829 13.624 13.478 13.309 13.225 13.06 12.878 12.686 12.596 12.346 12.279 12.153 12.027 11.778 11.637 11.437 11.204 10.971 10.686 10.234 8.454 -7 ,14300 ,TETRA ,17601221,Sun Nov 28 14:33:38 CET,Sun Nov 28 16:21:56 CET,0.0 1.931 2.52 2.946 3.282 3.563 3.825 4.056 4.465 4.646 4.819 4.987 5.29 5.434 5.721 5.991 6.24 6.355 6.569 6.782 7.11 7.324 7.524 7.803 8.071 8.35 8.616 8.854 9.154 9.439 9.712 10.042 10.353 10.65 11.002 11.385 11.759 12.179 12.607 13.037 13.468 13.953 14.504 15.043 15.658 16.309 17.018 17.751 18.544 19.34 19.993 20.202 20.088 19.886 19.543 19.155 18.862 18.578 18.287 17.975 17.693 17.427 17.156 16.903 16.655 16.42 16.184 15.959 15.765 15.564 15.351 15.169 14.972 14.768 14.602 14.43 14.263 14.077 13.868 13.727 13.582 13.324 13.137 12.941 12.836 12.625 12.389 12.136 12.001 11.702 11.562 11.417 11.245 10.877 10.702 10.523 10.31 10.028 9.663 9.234 8.112 -8 ,2257 ,TETRA ,17601222,Sun Nov 28 14:33:40 CET,Sun Nov 28 16:21:56 CET,0.0 2.042 2.483 2.855 3.178 3.447 3.672 3.871 4.245 4.436 4.629 4.792 5.089 5.227 5.491 5.74 5.977 6.091 6.314 6.533 6.838 7.029 7.217 7.505 7.788 8.057 8.295 8.516 8.803 9.07 9.333 9.647 9.93 10.192 10.498 10.846 11.185 11.566 11.975 12.398 12.845 13.318 13.828 14.341 14.941 15.577 16.265 16.992 17.766 18.525 19.228 19.531 19.447 19.196 18.889 18.556 18.193 17.856 17.562 17.247 16.977 16.743 16.502 16.256 16.036 15.834 15.593 15.383 15.199 15.008 14.808 14.631 14.458 14.268 14.114 13.952 13.774 13.575 13.378 13.243 13.093 12.862 12.691 12.505 12.414 12.218 12.006 11.79 11.68 11.412 11.32 11.169 11.003 10.676 10.527 10.382 10.205 9.962 9.64 9.221 7.849 -9 ,30725 ,TETRA ,17601223,Sun Nov 28 14:33:38 CET,Sun Nov 28 16:21:59 CET,0.0 3.886 4.397 4.752 5.063 5.331 5.541 5.761 6.22 6.422 6.6 6.765 7.084 7.248 7.533 7.799 8.086 8.217 8.439 8.663 8.997 9.195 9.384 9.661 9.922 10.186 10.449 10.695 10.985 11.253 11.508 11.803 12.09 12.362 12.67 13.026 13.386 13.791 14.207 14.641 15.098 15.595 16.16 16.684 17.282 17.925 18.641 19.391 20.168 20.991 21.734 21.993 21.864 21.6 21.328 21.013 20.664 20.317 20.01 19.667 19.335 19.046 18.789 18.527 18.258 18.022 17.786 17.579 17.401 17.208 17.013 16.849 16.654 16.464 16.314 16.135 15.953 15.756 15.536 15.375 15.229 15.003 14.835 14.679 14.599 14.398 14.15 13.87 13.71 13.399 13.266 13.132 13.002 12.678 12.491 12.29 12.082 11.833 11.533 11.102 9.943 -10 ,27756 ,TETRA ,17601224,Sun Nov 28 14:33:40 CET,Sun Nov 28 16:22:15 CET,0.0 1.269 1.826 2.126 2.407 2.67 2.886 3.089 3.498 3.689 3.874 4.102 4.425 4.588 4.904 5.169 5.414 5.531 5.751 5.967 6.273 6.468 6.664 6.933 7.196 7.458 7.695 7.896 8.134 8.37 8.606 8.881 9.132 9.378 9.677 10.007 10.301 10.633 11.007 11.398 11.787 12.203 12.702 13.18 13.703 14.285 14.896 15.512 16.242 17.02 17.709 17.981 17.913 17.599 17.149 16.707 16.338 16.048 15.814 15.557 15.302 15.057 14.835 14.605 14.324 14.039 13.748 13.517 13.334 13.146 12.965 12.817 12.648 12.456 12.298 12.119 11.935 11.736 11.514 11.364 11.223 10.993 10.828 10.667 10.578 10.379 10.136 9.877 9.758 9.485 9.395 9.253 9.094 8.764 8.608 8.432 8.181 7.886 7.584 7.111 5.994 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_35_52.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_35_52.txt deleted file mode 100644 index 6cf281f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_35_52.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4249 ,TETRA ,17601225,Sun Nov 28 14:33:42 CET,Sun Nov 28 16:23:06 CET,0.0 2.324 2.899 3.265 3.607 3.905 4.16 4.411 4.836 5.034 5.228 5.404 5.712 5.851 6.114 6.342 6.537 6.637 6.844 7.03 7.276 7.446 7.615 7.838 8.043 8.24 8.427 8.616 8.852 9.081 9.299 9.552 9.827 10.09 10.341 10.601 10.855 11.136 11.449 11.773 12.095 12.446 12.824 13.137 13.462 13.817 14.197 14.583 14.924 15.155 15.091 14.485 13.742 13.017 12.367 11.77 11.222 10.708 10.252 9.772 9.358 8.991 8.631 8.289 7.965 7.649 7.303 6.994 6.721 6.435 6.15 5.926 5.706 5.479 5.285 5.079 4.887 4.686 4.449 4.286 4.131 3.877 3.704 3.529 3.43 3.23 3.01 2.721 2.567 2.278 2.184 2.031 1.87 1.49 1.276 1.063 0.848 0.578 0.191 -0.374 -2.23 -2 ,27522 ,TETRA ,17601226,Sun Nov 28 14:33:39 CET,Sun Nov 28 16:22:14 CET,0.0 1.778 2.337 2.757 3.056 3.335 3.597 3.807 4.198 4.384 4.545 4.713 5.015 5.145 5.391 5.609 5.818 5.925 6.129 6.319 6.585 6.754 6.925 7.167 7.412 7.672 7.916 8.146 8.428 8.661 8.887 9.161 9.401 9.647 9.925 10.225 10.521 10.817 11.129 11.44 11.752 12.109 12.486 12.855 13.238 13.601 13.999 14.362 14.675 14.923 14.814 14.157 13.477 12.78 12.115 11.523 10.992 10.485 10.013 9.537 9.15 8.786 8.427 8.085 7.773 7.478 7.157 6.855 6.586 6.315 6.04 5.819 5.573 5.28 5.065 4.866 4.648 4.422 4.194 4.032 3.855 3.596 3.411 3.203 3.098 2.895 2.68 2.442 2.317 2.025 1.878 1.711 1.557 1.235 1.042 0.829 0.604 0.33 -0.049 -0.536 -2.317 -3 ,4328 ,TETRA ,17601227,Sun Nov 28 14:33:40 CET,Sun Nov 28 16:22:39 CET,0.0 2.797 3.416 3.832 4.171 4.442 4.7 4.935 5.345 5.526 5.7 5.892 6.216 6.372 6.678 6.956 7.211 7.338 7.574 7.788 8.095 8.295 8.48 8.74 8.987 9.213 9.437 9.654 9.918 10.153 10.374 10.654 10.906 11.126 11.386 11.689 11.956 12.244 12.558 12.898 13.262 13.644 14.06 14.46 14.877 15.305 15.714 16.065 16.386 16.562 16.403 15.696 14.887 14.122 13.396 12.756 12.187 11.593 11.08 10.617 10.194 9.792 9.395 8.973 8.56 8.177 7.798 7.483 7.222 6.953 6.664 6.399 6.128 5.871 5.662 5.448 5.236 5.034 4.827 4.676 4.514 4.27 4.098 3.905 3.805 3.609 3.391 3.142 3.013 2.728 2.599 2.437 2.263 1.89 1.691 1.499 1.29 1.012 0.666 0.239 -1.733 -4 ,7443 ,TETRA ,17601228,Sun Nov 28 14:33:42 CET,Sun Nov 28 16:21:53 CET,0.0 1.795 2.308 2.698 2.992 3.248 3.455 3.63 3.971 4.15 4.317 4.448 4.742 4.874 5.107 5.332 5.542 5.641 5.843 6.032 6.292 6.458 6.626 6.859 7.061 7.258 7.454 7.642 7.883 8.108 8.307 8.537 8.754 8.964 9.204 9.47 9.738 10.033 10.322 10.653 10.99 11.35 11.769 12.164 12.598 12.997 13.383 13.76 14.087 14.278 14.12 13.496 12.783 12.08 11.46 10.89 10.343 9.811 9.356 8.887 8.468 8.094 7.729 7.384 7.065 6.773 6.466 6.185 5.943 5.689 5.42 5.198 4.973 4.716 4.508 4.289 4.055 3.818 3.568 3.393 3.22 2.956 2.754 2.536 2.422 2.179 1.942 1.707 1.581 1.29 1.145 0.975 0.807 0.456 0.231 -0.024 -0.263 -0.524 -0.892 -1.405 -2.971 -5 ,29581 ,TETRA ,17601229,Sun Nov 28 14:33:39 CET,Sun Nov 28 16:22:24 CET,0.0 1.718 2.352 2.78 3.08 3.303 3.513 3.709 4.04 4.197 4.344 4.458 4.748 4.871 5.104 5.35 5.584 5.689 5.88 6.055 6.308 6.462 6.6 6.796 6.998 7.207 7.406 7.582 7.805 8.028 8.242 8.49 8.712 8.919 9.157 9.433 9.709 10.004 10.315 10.632 10.95 11.293 11.662 12.016 12.405 12.79 13.178 13.553 13.892 14.054 13.889 13.305 12.617 11.954 11.301 10.661 10.088 9.576 9.141 8.687 8.292 7.923 7.553 7.208 6.892 6.598 6.264 5.965 5.711 5.443 5.17 4.953 4.73 4.487 4.297 4.093 3.861 3.615 3.359 3.174 2.99 2.691 2.481 2.274 2.168 1.953 1.728 1.483 1.348 1.05 0.867 0.666 0.454 0.023 -0.192 -0.444 -0.763 -1.137 -1.597 -2.231 -4.243 -6 ,30936 ,TETRA ,17601230,Sun Nov 28 14:33:39 CET,Sun Nov 28 16:22:07 CET,0.0 1.902 2.463 2.875 3.208 3.482 3.747 3.985 4.404 4.594 4.781 4.961 5.259 5.391 5.643 5.876 6.097 6.21 6.429 6.641 6.944 7.132 7.305 7.556 7.778 7.987 8.188 8.367 8.607 8.837 9.055 9.323 9.57 9.802 10.066 10.345 10.604 10.883 11.173 11.47 11.776 12.105 12.484 12.844 13.206 13.571 13.929 14.254 14.555 14.725 14.5 13.828 13.057 12.295 11.608 10.962 10.353 9.784 9.299 8.833 8.455 8.112 7.772 7.451 7.125 6.826 6.527 6.264 6.035 5.783 5.521 5.299 5.073 4.843 4.658 4.475 4.287 4.086 3.886 3.734 3.563 3.301 3.12 2.924 2.828 2.647 2.43 2.189 2.058 1.758 1.614 1.472 1.323 0.993 0.802 0.58 0.324 0.037 -0.334 -0.875 -2.978 -7 ,2823 ,TETRA ,17601231,Sun Nov 28 14:33:41 CET,Sun Nov 28 16:22:17 CET,0.0 1.933 2.463 2.92 3.283 3.55 3.783 4.019 4.448 4.631 4.799 4.949 5.254 5.395 5.649 5.883 6.106 6.218 6.428 6.62 6.893 7.072 7.238 7.471 7.695 7.905 8.118 8.331 8.592 8.828 9.066 9.352 9.608 9.833 10.083 10.377 10.657 10.944 11.238 11.56 11.89 12.232 12.626 12.996 13.368 13.769 14.208 14.563 14.866 15.081 14.912 14.349 13.674 12.97 12.337 11.722 11.15 10.645 10.179 9.677 9.235 8.842 8.48 8.148 7.824 7.521 7.204 6.911 6.647 6.363 6.082 5.847 5.584 5.288 5.062 4.834 4.605 4.38 4.134 3.954 3.772 3.482 3.281 3.08 2.98 2.784 2.582 2.38 2.267 1.986 1.874 1.713 1.534 1.118 0.906 0.69 0.437 0.141 -0.227 -0.723 -2.394 -8 ,31304 ,TETRA ,17601232,Sun Nov 28 14:33:44 CET,Sun Nov 28 16:22:01 CET,0.0 2.058 2.536 2.895 3.203 3.47 3.716 3.942 4.367 4.573 4.752 4.904 5.2 5.344 5.636 5.91 6.156 6.271 6.49 6.696 6.971 7.134 7.286 7.541 7.79 7.988 8.177 8.363 8.602 8.837 9.062 9.329 9.598 9.879 10.179 10.48 10.782 11.108 11.412 11.713 12.036 12.375 12.722 13.112 13.554 13.929 14.31 14.674 14.986 15.151 14.999 14.481 13.807 13.136 12.503 11.877 11.306 10.776 10.309 9.823 9.395 9.016 8.661 8.324 7.992 7.675 7.355 7.067 6.812 6.566 6.298 6.047 5.791 5.539 5.34 5.132 4.906 4.666 4.417 4.248 4.072 3.804 3.609 3.384 3.269 3.055 2.836 2.601 2.475 2.191 2.077 1.921 1.758 1.434 1.235 1.009 0.745 0.464 0.142 -0.302 -2.116 -9 ,16783 ,TETRA ,17601233,Sun Nov 28 14:33:40 CET,Sun Nov 28 16:22:43 CET,0.0 1.995 2.59 2.986 3.292 3.583 3.838 4.043 4.432 4.607 4.77 4.908 5.209 5.358 5.62 5.863 6.099 6.212 6.424 6.619 6.905 7.09 7.261 7.512 7.761 8.0 8.212 8.412 8.668 8.896 9.14 9.462 9.771 10.067 10.375 10.681 10.958 11.244 11.557 11.891 12.215 12.562 12.95 13.316 13.74 14.166 14.592 14.976 15.254 15.45 15.264 14.574 13.863 13.156 12.516 11.914 11.358 10.84 10.381 9.924 9.517 9.14 8.778 8.44 8.113 7.81 7.5 7.205 6.941 6.689 6.426 6.198 5.959 5.707 5.508 5.304 5.085 4.863 4.636 4.475 4.308 4.052 3.867 3.646 3.535 3.313 3.05 2.784 2.648 2.344 2.224 2.076 1.921 1.585 1.385 1.16 0.919 0.645 0.31 -0.242 -3.163 -10 ,13902 ,TETRA ,17601234,Sun Nov 28 14:33:40 CET,Sun Nov 28 16:23:18 CET,0.0 1.379 1.852 2.26 2.622 2.873 3.086 3.289 3.644 3.795 3.931 4.05 4.346 4.477 4.741 4.999 5.246 5.367 5.579 5.769 6.052 6.237 6.416 6.666 6.885 7.095 7.301 7.495 7.746 7.98 8.198 8.472 8.726 8.97 9.243 9.52 9.789 10.094 10.415 10.741 11.061 11.407 11.784 12.129 12.492 12.867 13.279 13.671 13.966 14.048 13.797 13.214 12.555 11.835 11.167 10.568 10.005 9.481 9.018 8.534 8.111 7.732 7.372 7.018 6.684 6.383 6.073 5.791 5.537 5.269 4.985 4.757 4.526 4.288 4.1 3.882 3.646 3.42 3.203 3.057 2.906 2.66 2.469 2.263 2.165 1.967 1.743 1.503 1.368 1.052 0.891 0.734 0.56 0.166 -0.047 -0.241 -0.463 -0.727 -1.063 -1.616 -3.402 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_37_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_37_50.txt deleted file mode 100644 index 866b1771..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_37_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7096 ,TETRA ,17601235,Sun Nov 28 14:33:40 CET,Sun Nov 28 16:24:09 CET,0.0 1.284 1.688 1.986 2.238 2.454 2.676 2.875 3.215 3.373 3.52 3.644 3.944 4.08 4.324 4.556 4.777 4.891 5.115 5.311 5.589 5.765 5.931 6.169 6.408 6.651 6.887 7.121 7.41 7.67 7.916 8.209 8.488 8.743 9.025 9.348 9.654 9.987 10.354 10.763 11.183 11.63 12.133 12.605 13.117 13.7 14.343 14.994 15.735 16.467 17.112 17.353 17.249 16.978 16.657 16.321 15.965 15.633 15.342 15.019 14.723 14.458 14.213 13.971 13.72 13.486 13.246 13.037 12.84 12.603 12.368 12.208 12.053 11.883 11.749 11.605 11.454 11.291 11.118 10.992 10.861 10.656 10.512 10.367 10.29 10.12 9.957 9.781 9.681 9.43 9.374 9.258 9.132 8.851 8.684 8.482 8.252 8.012 7.719 7.275 6.152 -2 ,664 ,TETRA ,17601236,Sun Nov 28 14:33:40 CET,Sun Nov 28 16:23:23 CET,0.0 0.783 1.214 1.484 1.726 1.967 2.175 2.369 2.708 2.86 3.01 3.114 3.399 3.522 3.762 4.0 4.224 4.333 4.53 4.7 4.94 5.099 5.262 5.491 5.704 5.914 6.125 6.324 6.573 6.817 7.048 7.315 7.562 7.799 8.075 8.392 8.692 9.008 9.361 9.719 10.089 10.516 10.974 11.432 11.961 12.497 13.076 13.701 14.381 15.041 15.605 15.746 15.579 15.345 15.078 14.786 14.496 14.191 13.912 13.632 13.353 13.086 12.84 12.616 12.391 12.179 11.955 11.733 11.548 11.365 11.167 10.994 10.819 10.636 10.489 10.331 10.156 9.969 9.783 9.658 9.529 9.337 9.204 9.058 8.979 8.816 8.643 8.454 8.359 8.112 8.057 7.941 7.818 7.56 7.422 7.278 7.119 6.911 6.667 6.342 5.691 -3 ,16425 ,TETRA ,17601237,Sun Nov 28 14:33:40 CET,Sun Nov 28 16:23:47 CET,0.0 1.267 1.76 2.093 2.423 2.729 2.953 3.124 3.435 3.575 3.708 3.816 4.101 4.22 4.462 4.687 4.902 5.001 5.178 5.36 5.619 5.778 5.939 6.19 6.409 6.612 6.831 7.05 7.326 7.585 7.844 8.154 8.442 8.716 9.016 9.339 9.653 9.989 10.351 10.733 11.116 11.548 12.032 12.492 13.015 13.569 14.186 14.849 15.541 16.242 16.799 16.962 16.878 16.655 16.363 16.075 15.774 15.469 15.193 14.845 14.535 14.273 13.999 13.744 13.501 13.273 13.037 12.824 12.632 12.433 12.234 12.065 11.879 11.683 11.535 11.366 11.188 11.023 10.854 10.733 10.607 10.405 10.273 10.135 10.053 9.882 9.713 9.536 9.444 9.19 9.117 9.002 8.885 8.625 8.482 8.323 8.12 7.837 7.501 7.122 6.381 -4 ,15897 ,TETRA ,17601238,Sun Nov 28 14:33:41 CET,Sun Nov 28 16:23:42 CET,0.0 1.022 1.501 1.842 2.118 2.384 2.646 2.838 3.184 3.358 3.512 3.661 3.97 4.108 4.359 4.587 4.81 4.918 5.133 5.34 5.621 5.8 5.975 6.21 6.431 6.651 6.864 7.066 7.321 7.567 7.807 8.097 8.364 8.628 8.923 9.239 9.564 9.929 10.306 10.682 11.083 11.534 12.039 12.544 13.095 13.683 14.324 14.974 15.642 16.287 16.88 17.115 17.064 16.86 16.575 16.277 15.986 15.682 15.396 15.104 14.828 14.584 14.356 14.133 13.924 13.703 13.448 13.238 13.056 12.859 12.645 12.477 12.314 12.12 11.967 11.812 11.645 11.472 11.298 11.176 11.038 10.809 10.66 10.516 10.436 10.241 10.042 9.87 9.776 9.524 9.464 9.339 9.208 8.92 8.756 8.572 8.351 8.101 7.816 7.506 6.898 -5 ,22466 ,TETRA ,17601239,Sun Nov 28 14:33:44 CET,Sun Nov 28 16:24:04 CET,0.0 1.184 1.6 1.895 2.166 2.414 2.635 2.831 3.184 3.353 3.512 3.646 3.944 4.08 4.327 4.56 4.79 4.89 5.084 5.288 5.558 5.744 5.931 6.184 6.404 6.606 6.818 7.019 7.284 7.546 7.789 8.065 8.328 8.611 8.933 9.249 9.557 9.906 10.276 10.664 11.064 11.495 11.966 12.429 12.963 13.553 14.179 14.813 15.501 16.17 16.79 17.036 16.915 16.67 16.389 16.053 15.73 15.422 15.138 14.841 14.565 14.3 14.025 13.751 13.499 13.264 13.026 12.815 12.62 12.415 12.198 12.007 11.802 11.595 11.439 11.273 11.102 10.928 10.745 10.62 10.491 10.282 10.126 9.955 9.868 9.68 9.484 9.295 9.198 8.933 8.846 8.718 8.58 8.279 8.123 7.952 7.748 7.472 7.161 6.821 6.03 -6 ,1251 ,TETRA ,17601240,Sun Nov 28 14:33:46 CET,Sun Nov 28 16:24:05 CET,0.0 1.419 1.852 2.2 2.517 2.781 3.012 3.204 3.557 3.722 3.875 4.016 4.301 4.419 4.664 4.881 5.072 5.172 5.382 5.571 5.833 6.003 6.166 6.411 6.649 6.864 7.066 7.256 7.494 7.735 7.956 8.22 8.488 8.745 9.038 9.355 9.665 10.017 10.384 10.771 11.166 11.587 12.084 12.557 13.091 13.649 14.247 14.934 15.655 16.334 16.879 17.031 16.891 16.648 16.349 15.984 15.652 15.326 15.016 14.716 14.452 14.205 13.96 13.716 13.501 13.304 13.093 12.893 12.706 12.518 12.32 12.145 11.97 11.791 11.642 11.477 11.307 11.133 10.958 10.831 10.683 10.466 10.329 10.175 10.093 9.937 9.784 9.627 9.541 9.292 9.228 9.121 9.009 8.744 8.565 8.37 8.183 7.937 7.656 7.343 6.449 -7 ,2555 ,TETRA ,17601241,Sun Nov 28 14:33:42 CET,Sun Nov 28 16:23:33 CET,0.0 1.609 2.116 2.419 2.668 2.889 3.079 3.26 3.637 3.801 3.938 4.037 4.329 4.456 4.697 4.911 5.103 5.204 5.4 5.583 5.848 6.021 6.181 6.404 6.623 6.835 7.036 7.23 7.491 7.75 8.002 8.298 8.57 8.842 9.152 9.503 9.829 10.158 10.518 10.902 11.303 11.736 12.22 12.708 13.289 13.874 14.475 15.118 15.782 16.476 17.115 17.294 17.116 16.858 16.575 16.25 15.923 15.603 15.307 15.0 14.72 14.47 14.205 13.944 13.714 13.5 13.256 13.029 12.836 12.631 12.422 12.241 12.031 11.797 11.623 11.446 11.263 11.087 10.9 10.755 10.606 10.391 10.242 10.07 9.975 9.779 9.576 9.372 9.265 9.003 8.941 8.824 8.695 8.408 8.242 8.047 7.839 7.618 7.316 6.938 6.017 -8 ,24745 ,TETRA ,17601242,Sun Nov 28 14:33:44 CET,Sun Nov 28 16:23:51 CET,0.0 1.322 1.86 2.227 2.514 2.756 2.961 3.155 3.483 3.627 3.767 3.872 4.15 4.269 4.503 4.726 4.933 5.037 5.234 5.404 5.667 5.856 6.047 6.305 6.547 6.79 7.011 7.222 7.504 7.773 8.023 8.319 8.606 8.886 9.208 9.541 9.873 10.256 10.65 11.042 11.43 11.86 12.344 12.812 13.345 13.943 14.621 15.297 15.966 16.649 17.279 17.479 17.358 17.095 16.79 16.488 16.176 15.876 15.579 15.234 14.928 14.657 14.385 14.129 13.891 13.673 13.437 13.183 12.948 12.713 12.444 12.227 12.024 11.817 11.666 11.511 11.351 11.169 10.942 10.789 10.647 10.419 10.238 10.032 9.93 9.727 9.519 9.31 9.195 8.918 8.812 8.671 8.515 8.174 8.005 7.813 7.578 7.339 7.067 6.739 6.037 -9 ,23706 ,TETRA ,17601243,Sun Nov 28 14:33:46 CET,Sun Nov 28 16:24:01 CET,0.0 2.257 2.753 3.082 3.373 3.614 3.854 4.087 4.485 4.657 4.817 4.944 5.237 5.373 5.64 5.884 6.107 6.209 6.4 6.592 6.871 7.061 7.242 7.48 7.719 7.959 8.182 8.391 8.663 8.917 9.155 9.439 9.71 9.971 10.249 10.545 10.832 11.161 11.521 11.892 12.275 12.679 13.125 13.571 14.074 14.612 15.191 15.817 16.495 17.2 17.802 17.988 17.897 17.655 17.35 17.02 16.71 16.435 16.172 15.883 15.614 15.356 15.13 14.914 14.694 14.495 14.275 14.066 13.881 13.675 13.46 13.292 13.125 12.929 12.767 12.601 12.416 12.229 12.051 11.931 11.805 11.61 11.475 11.319 11.218 11.007 10.811 10.605 10.501 10.242 10.169 10.045 9.913 9.635 9.481 9.299 9.101 8.842 8.551 8.207 7.493 -10 ,19433 ,TETRA ,17601244,Sun Nov 28 14:33:48 CET,Sun Nov 28 16:23:32 CET,0.0 1.283 1.677 1.986 2.237 2.463 2.691 2.918 3.308 3.472 3.619 3.748 4.041 4.164 4.409 4.639 4.863 4.975 5.174 5.358 5.62 5.793 5.96 6.191 6.425 6.649 6.86 7.079 7.347 7.597 7.841 8.128 8.405 8.673 8.992 9.344 9.678 10.024 10.377 10.761 11.159 11.607 12.094 12.56 13.095 13.673 14.324 14.991 15.681 16.368 16.97 17.165 17.064 16.843 16.566 16.237 15.9 15.575 15.261 14.944 14.665 14.398 14.147 13.911 13.685 13.454 13.2 12.98 12.784 12.581 12.377 12.21 12.027 11.821 11.662 11.497 11.313 11.126 10.943 10.812 10.67 10.455 10.304 10.135 10.053 9.881 9.688 9.483 9.376 9.113 9.033 8.906 8.769 8.479 8.314 8.126 7.923 7.686 7.424 7.109 6.028 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_37_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_37_53.txt deleted file mode 100644 index a8b176cc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_37_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14856 ,TETRA ,17601245,Sun Nov 28 14:33:41 CET,Sun Nov 28 16:27:03 CET,0.0 1.06 1.478 1.817 2.101 2.335 2.532 2.708 3.03 3.184 3.321 3.41 3.691 3.811 4.06 4.277 4.466 4.566 4.768 4.964 5.255 5.442 5.617 5.856 6.073 6.28 6.49 6.678 6.887 7.099 7.312 7.564 7.798 8.014 8.258 8.523 8.773 9.044 9.345 9.663 9.975 10.294 10.639 10.959 11.317 11.688 12.081 12.469 12.753 12.851 12.619 11.953 11.213 10.456 9.732 9.073 8.442 7.833 7.298 6.77 6.314 5.894 5.496 5.105 4.73 4.402 4.066 3.746 3.48 3.211 2.918 2.655 2.373 2.088 1.87 1.645 1.415 1.178 0.906 0.718 0.535 0.259 0.072 -0.125 -0.229 -0.447 -0.676 -0.935 -1.073 -1.365 -1.496 -1.645 -1.811 -2.189 -2.365 -2.551 -2.803 -3.1 -3.461 -3.97 -5.089 -2 ,10005 ,TETRA ,17601246,Sun Nov 28 14:33:43 CET,Sun Nov 28 16:27:03 CET,0.0 2.841 3.442 3.829 4.084 4.299 4.5 4.673 4.977 5.106 5.238 5.361 5.651 5.768 6.009 6.237 6.439 6.529 6.696 6.864 7.102 7.257 7.406 7.612 7.81 8.0 8.179 8.342 8.558 8.768 8.957 9.193 9.429 9.646 9.905 10.219 10.51 10.812 11.1 11.365 11.646 11.959 12.315 12.654 13.001 13.36 13.742 14.076 14.33 14.509 14.17 13.284 12.495 11.762 11.117 10.532 9.996 9.494 9.051 8.598 8.189 7.828 7.487 7.156 6.842 6.528 6.209 5.943 5.703 5.443 5.188 4.996 4.787 4.548 4.358 4.17 3.984 3.786 3.564 3.41 3.248 3.011 2.85 2.679 2.584 2.387 2.208 1.996 1.873 1.598 1.5 1.363 1.228 0.92 0.756 0.575 0.388 0.182 -0.07 -0.396 -1.354 -3 ,3975 ,TETRA ,17601247,Sun Nov 28 14:33:45 CET,Sun Nov 28 16:24:04 CET,0.0 1.584 2.131 2.493 2.818 3.07 3.305 3.53 3.868 4.017 4.162 4.251 4.525 4.633 4.851 5.062 5.25 5.342 5.515 5.683 5.943 6.093 6.217 6.408 6.599 6.784 6.98 7.178 7.417 7.643 7.852 8.107 8.351 8.59 8.86 9.128 9.368 9.628 9.922 10.221 10.509 10.82 11.163 11.483 11.84 12.236 12.61 12.933 13.222 13.364 13.175 12.566 11.839 11.056 10.333 9.688 9.142 8.651 8.204 7.737 7.352 7.015 6.67 6.341 6.051 5.783 5.472 5.212 5.002 4.766 4.504 4.282 4.057 3.821 3.64 3.457 3.261 3.057 2.835 2.683 2.54 2.309 2.138 1.957 1.86 1.653 1.448 1.232 1.125 0.857 0.746 0.604 0.48 0.248 0.113 -0.041 -0.21 -0.409 -0.649 -1.064 -2.262 -4 ,22483 ,TETRA ,17601248,Sun Nov 28 14:33:48 CET,Sun Nov 28 16:24:04 CET,0.0 1.319 1.85 2.248 2.588 2.875 3.127 3.36 3.757 3.925 4.073 4.189 4.476 4.591 4.826 5.045 5.236 5.335 5.526 5.706 5.958 6.103 6.254 6.477 6.677 6.878 7.072 7.259 7.491 7.72 7.939 8.155 8.363 8.572 8.809 9.059 9.282 9.521 9.775 10.034 10.305 10.609 10.925 11.209 11.534 11.916 12.332 12.674 12.949 13.056 12.756 11.994 11.194 10.452 9.765 9.074 8.464 7.921 7.414 6.892 6.458 6.072 5.707 5.359 5.019 4.719 4.437 4.194 3.961 3.706 3.45 3.239 3.022 2.78 2.593 2.408 2.227 2.03 1.812 1.666 1.503 1.22 1.02 0.825 0.715 0.489 0.284 0.057 -0.053 -0.324 -0.428 -0.583 -0.756 -1.14 -1.339 -1.563 -1.818 -2.094 -2.482 -2.911 -3.513 -5 ,21375 ,TETRA ,17601249,Sun Nov 28 14:33:42 CET,Sun Nov 28 16:24:02 CET,0.0 1.363 1.763 2.118 2.444 2.72 2.952 3.162 3.516 3.656 3.789 3.886 4.17 4.285 4.482 4.666 4.866 4.968 5.154 5.324 5.553 5.703 5.853 6.054 6.24 6.418 6.58 6.746 6.97 7.179 7.372 7.593 7.796 7.996 8.24 8.506 8.752 9.007 9.276 9.566 9.859 10.181 10.534 10.853 11.203 11.583 11.942 12.246 12.536 12.685 12.476 11.807 11.048 10.311 9.624 8.964 8.348 7.73 7.194 6.659 6.169 5.745 5.353 4.973 4.61 4.284 3.93 3.606 3.335 3.058 2.769 2.525 2.271 1.999 1.789 1.578 1.361 1.131 0.882 0.715 0.552 0.285 0.077 -0.147 -0.264 -0.52 -0.783 -1.052 -1.19 -1.483 -1.584 -1.718 -1.859 -2.174 -2.332 -2.494 -2.686 -2.91 -3.183 -3.543 -4.354 -6 ,11146 ,TETRA ,17601250,Sun Nov 28 14:34:09 CET,Sun Nov 28 16:23:26 CET,0.0 1.341 1.895 2.279 2.593 2.875 3.121 3.34 3.744 3.915 4.051 4.131 4.408 4.531 4.793 5.037 5.258 5.357 5.54 5.707 5.939 6.105 6.269 6.492 6.69 6.887 7.077 7.257 7.485 7.695 7.896 8.132 8.356 8.583 8.848 9.133 9.39 9.672 9.993 10.339 10.666 11.003 11.397 11.74 12.078 12.435 12.808 13.123 13.37 13.465 13.204 12.491 11.723 10.973 10.247 9.508 8.83 8.236 7.72 7.18 6.71 6.303 5.92 5.582 5.291 5.019 4.718 4.447 4.217 3.977 3.692 3.436 3.183 2.91 2.694 2.45 2.177 1.929 1.691 1.501 1.29 0.983 0.792 0.605 0.498 0.258 0.025 -0.201 -0.326 -0.626 -0.766 -0.932 -1.099 -1.433 -1.623 -1.831 -2.071 -2.341 -2.65 -3.051 -3.961 -7 ,4772 ,TETRA ,17601251,Sun Nov 28 14:34:09 CET,Sun Nov 28 16:23:56 CET,0.0 1.191 1.564 1.886 2.178 2.428 2.623 2.803 3.166 3.323 3.46 3.571 3.866 3.996 4.238 4.473 4.705 4.814 5.016 5.199 5.459 5.611 5.752 5.955 6.163 6.356 6.506 6.656 6.867 7.067 7.258 7.475 7.68 7.893 8.137 8.409 8.674 8.966 9.276 9.573 9.872 10.215 10.608 10.968 11.345 11.708 12.047 12.358 12.621 12.774 12.547 11.829 11.014 10.261 9.571 8.867 8.227 7.658 7.149 6.634 6.167 5.732 5.331 4.949 4.588 4.261 3.923 3.617 3.352 3.071 2.777 2.537 2.273 1.986 1.771 1.553 1.326 1.089 0.844 0.671 0.495 0.211 0.001 -0.218 -0.333 -0.582 -0.838 -1.101 -1.233 -1.525 -1.691 -1.876 -2.067 -2.47 -2.679 -2.897 -3.153 -3.445 -3.744 -4.11 -5.065 -8 ,25539 ,TETRA ,17601252,Sun Nov 28 14:34:09 CET,Sun Nov 28 16:23:44 CET,0.0 1.267 1.916 2.331 2.642 2.906 3.155 3.358 3.701 3.861 4.005 4.121 4.405 4.522 4.747 4.967 5.154 5.247 5.436 5.607 5.865 6.035 6.195 6.41 6.595 6.794 7.011 7.207 7.445 7.682 7.915 8.162 8.362 8.581 8.848 9.112 9.348 9.592 9.859 10.139 10.412 10.702 11.018 11.311 11.642 11.979 12.268 12.495 12.679 12.748 12.497 11.856 11.16 10.464 9.86 9.314 8.784 8.266 7.818 7.38 7.003 6.66 6.326 6.006 5.692 5.379 5.046 4.752 4.499 4.212 3.897 3.64 3.38 3.133 2.933 2.722 2.514 2.289 2.071 1.938 1.805 1.593 1.441 1.266 1.168 0.96 0.77 0.587 0.482 0.189 0.062 -0.08 -0.236 -0.555 -0.735 -0.937 -1.144 -1.354 -1.595 -1.944 -2.57 -9 ,8246 ,TETRA ,17601253,Sun Nov 28 14:34:08 CET,Sun Nov 28 16:24:28 CET,0.0 1.129 1.585 1.919 2.133 2.347 2.581 2.809 3.17 3.324 3.468 3.591 3.896 4.011 4.211 4.415 4.615 4.708 4.879 5.035 5.263 5.413 5.572 5.791 5.971 6.152 6.365 6.569 6.779 6.973 7.16 7.41 7.666 7.906 8.16 8.431 8.692 8.964 9.238 9.497 9.757 10.062 10.422 10.767 11.16 11.551 11.911 12.239 12.497 12.593 12.386 11.787 11.046 10.297 9.576 8.907 8.291 7.705 7.193 6.668 6.209 5.809 5.426 5.05 4.682 4.347 4.002 3.693 3.429 3.155 2.867 2.632 2.381 2.116 1.915 1.702 1.484 1.264 1.027 0.863 0.689 0.391 0.189 -0.008 -0.111 -0.322 -0.544 -0.785 -0.92 -1.216 -1.311 -1.442 -1.578 -1.892 -2.059 -2.219 -2.39 -2.584 -2.847 -3.26 -4.489 -10 ,5582 ,TETRA ,17601254,Sun Nov 28 14:34:09 CET,Sun Nov 28 16:24:05 CET,0.0 1.489 1.952 2.321 2.614 2.863 3.085 3.27 3.574 3.717 3.875 3.986 4.265 4.387 4.615 4.836 5.069 5.183 5.378 5.562 5.864 6.068 6.246 6.515 6.79 7.039 7.262 7.482 7.787 8.066 8.297 8.547 8.786 8.992 9.21 9.454 9.698 9.976 10.241 10.491 10.774 11.088 11.393 11.673 11.998 12.321 12.604 12.874 13.116 13.222 13.004 12.338 11.567 10.848 10.197 9.582 9.032 8.539 8.098 7.648 7.264 6.916 6.586 6.272 5.986 5.733 5.462 5.2 4.971 4.745 4.491 4.268 4.049 3.789 3.572 3.366 3.158 2.936 2.703 2.545 2.377 2.09 1.909 1.741 1.648 1.442 1.226 0.993 0.872 0.579 0.468 0.347 0.23 -0.044 -0.22 -0.435 -0.651 -0.897 -1.187 -1.524 -2.522 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_37_56.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_37_56.txt deleted file mode 100644 index cc744b27..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_37_56.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18672 ,KEBNE ,17027177,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:56:08 CET,0.0 2.92 3.582 4.074 4.481 4.829 5.117 5.38 5.903 6.14 6.358 6.588 6.917 7.091 7.446 7.756 8.034 8.159 8.371 8.574 8.879 9.07 9.249 9.502 9.743 9.981 10.208 10.421 10.681 10.922 11.155 11.44 11.719 11.981 12.261 12.567 12.862 13.173 13.518 13.898 14.279 14.676 15.134 15.581 16.067 16.589 17.127 17.657 18.168 18.603 18.737 18.299 17.707 17.116 16.602 16.092 15.55 15.049 14.6 14.123 13.704 13.323 12.972 12.645 12.345 12.043 11.724 11.448 11.199 10.927 10.652 10.422 10.174 9.908 9.694 9.474 9.246 9.012 8.771 8.597 8.402 8.099 7.887 7.657 7.546 7.319 7.082 6.829 6.683 6.371 6.234 6.069 5.893 5.499 5.284 5.075 4.846 4.603 4.33 3.93 2.811 -2 ,4158 ,KEBNE ,17027178,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:55:59 CET,0.0 1.655 2.223 2.575 2.887 3.191 3.448 3.653 4.05 4.255 4.429 4.575 4.871 4.995 5.244 5.473 5.688 5.802 6.016 6.206 6.481 6.66 6.832 7.073 7.304 7.54 7.761 7.972 8.234 8.476 8.732 9.029 9.278 9.505 9.774 10.067 10.352 10.663 10.985 11.313 11.661 12.036 12.424 12.799 13.198 13.601 14.069 14.533 14.932 15.22 15.218 14.87 14.355 13.801 13.249 12.698 12.198 11.69 11.244 10.806 10.402 10.04 9.691 9.347 9.029 8.718 8.371 8.067 7.809 7.531 7.251 7.04 6.813 6.563 6.36 6.146 5.93 5.696 5.448 5.289 5.127 4.861 4.669 4.476 4.373 4.162 3.936 3.672 3.536 3.241 3.154 3.01 2.847 2.532 2.345 2.134 1.913 1.652 1.339 0.993 -0.254 -3 ,20290 ,KEBNE ,17027179,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:56:18 CET,0.0 2.954 3.537 3.913 4.257 4.587 4.878 5.144 5.63 5.817 5.977 6.145 6.463 6.616 6.867 7.098 7.324 7.428 7.655 7.863 8.156 8.354 8.553 8.867 9.145 9.374 9.585 9.787 10.034 10.275 10.512 10.777 11.027 11.293 11.584 11.893 12.193 12.506 12.842 13.172 13.498 13.883 14.3 14.666 15.09 15.544 16.014 16.463 16.911 17.333 17.488 17.171 16.675 16.167 15.677 15.186 14.698 14.236 13.82 13.389 12.984 12.627 12.312 12.019 11.72 11.408 11.089 10.829 10.597 10.34 10.081 9.865 9.597 9.301 9.087 8.864 8.636 8.414 8.197 8.037 7.87 7.621 7.437 7.248 7.156 6.975 6.78 6.557 6.421 6.113 5.992 5.849 5.699 5.323 5.119 4.923 4.677 4.384 4.06 3.674 2.487 -4 ,28362 ,KEBNE ,17027180,Wed Dec 22 16:21:27 CET,Wed Dec 22 17:57:58 CET,0.0 2.024 2.603 3.014 3.331 3.576 3.806 4.022 4.394 4.564 4.723 4.865 5.168 5.305 5.572 5.809 6.018 6.128 6.352 6.553 6.819 6.98 7.138 7.364 7.581 7.79 7.995 8.199 8.449 8.698 8.936 9.202 9.452 9.69 9.966 10.268 10.555 10.881 11.222 11.562 11.917 12.293 12.707 13.097 13.524 13.953 14.377 14.811 15.227 15.515 15.579 15.22 14.65 14.061 13.53 12.996 12.502 12.058 11.665 11.251 10.886 10.538 10.183 9.84 9.512 9.224 8.942 8.675 8.435 8.2 7.949 7.732 7.514 7.282 7.098 6.919 6.726 6.507 6.276 6.127 5.986 5.754 5.579 5.383 5.282 5.078 4.848 4.589 4.454 4.162 4.037 3.877 3.728 3.384 3.197 3.003 2.778 2.479 2.162 1.849 0.574 -5 ,27427 ,KEBNE ,17027181,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:55:54 CET,0.0 1.723 2.326 2.74 3.036 3.325 3.586 3.813 4.194 4.349 4.514 4.677 4.985 5.137 5.419 5.668 5.922 6.046 6.286 6.502 6.791 6.972 7.161 7.444 7.688 7.9 8.105 8.309 8.569 8.827 9.1 9.421 9.686 9.928 10.209 10.542 10.869 11.219 11.565 11.901 12.276 12.714 13.187 13.632 14.127 14.653 15.212 15.723 16.202 16.592 16.712 16.421 15.873 15.295 14.801 14.238 13.614 13.042 12.576 12.092 11.653 11.236 10.815 10.416 10.034 9.692 9.354 9.053 8.776 8.49 8.189 7.932 7.665 7.371 7.139 6.908 6.678 6.438 6.179 6.006 5.837 5.549 5.347 5.147 5.041 4.832 4.622 4.393 4.267 3.968 3.846 3.687 3.511 3.146 2.949 2.748 2.531 2.266 1.972 1.627 0.569 -6 ,27285 ,KEBNE ,17027182,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:55:47 CET,0.0 1.782 2.381 2.839 3.147 3.386 3.622 3.836 4.203 4.37 4.525 4.673 4.987 5.128 5.371 5.621 5.862 5.969 6.17 6.354 6.622 6.802 6.978 7.236 7.479 7.708 7.923 8.135 8.4 8.634 8.874 9.156 9.406 9.667 9.973 10.299 10.61 10.941 11.282 11.619 11.954 12.339 12.76 13.156 13.601 14.057 14.547 15.043 15.521 15.882 16.048 15.734 15.16 14.618 14.071 13.498 12.959 12.451 11.998 11.529 11.12 10.75 10.418 10.115 9.81 9.504 9.159 8.853 8.599 8.344 8.076 7.858 7.637 7.398 7.225 7.042 6.819 6.574 6.326 6.149 5.983 5.748 5.576 5.399 5.292 5.045 4.775 4.485 4.334 4.019 3.873 3.697 3.509 3.091 2.847 2.573 2.258 1.898 1.488 0.998 -0.197 -7 ,25662 ,KEBNE ,17027183,Wed Dec 22 16:21:27 CET,Wed Dec 22 17:56:14 CET,0.0 2.028 2.553 2.961 3.351 3.708 3.982 4.228 4.653 4.837 5.019 5.209 5.512 5.662 5.954 6.215 6.472 6.596 6.837 7.071 7.404 7.611 7.794 8.059 8.332 8.588 8.833 9.076 9.381 9.659 9.901 10.175 10.435 10.696 11.023 11.372 11.683 12.016 12.372 12.767 13.189 13.617 14.037 14.425 14.834 15.254 15.751 16.2 16.588 16.905 16.995 16.745 16.283 15.767 15.269 14.766 14.285 13.846 13.446 13.043 12.677 12.3 11.932 11.603 11.299 10.985 10.638 10.3 10.006 9.707 9.365 9.104 8.868 8.629 8.445 8.256 8.062 7.86 7.64 7.485 7.319 7.045 6.863 6.677 6.578 6.379 6.188 5.969 5.845 5.554 5.414 5.267 5.12 4.753 4.553 4.349 4.122 3.855 3.566 3.184 1.933 -8 ,18360 ,KEBNE ,17027184,Wed Dec 22 16:21:27 CET,Wed Dec 22 17:57:29 CET,0.0 2.645 3.257 3.65 4.002 4.31 4.568 4.796 5.215 5.408 5.574 5.713 6.013 6.167 6.469 6.723 6.941 7.045 7.251 7.446 7.724 7.899 8.069 8.299 8.516 8.727 8.917 9.102 9.338 9.573 9.805 10.095 10.391 10.667 10.987 11.34 11.656 11.989 12.351 12.712 13.074 13.475 13.931 14.369 14.831 15.315 15.865 16.416 16.892 17.237 17.326 16.928 16.337 15.705 15.047 14.432 13.91 13.39 12.916 12.43 12.019 11.651 11.273 10.886 10.486 10.136 9.787 9.457 9.163 8.846 8.52 8.255 7.983 7.702 7.469 7.231 6.998 6.743 6.458 6.272 6.094 5.81 5.6 5.358 5.225 4.964 4.695 4.42 4.285 3.988 3.866 3.711 3.543 3.184 2.988 2.783 2.56 2.309 2.0 1.627 0.482 -9 ,26736 ,KEBNE ,17027185,Wed Dec 22 16:21:25 CET,Wed Dec 22 17:56:32 CET,0.0 2.133 2.682 3.09 3.412 3.691 3.939 4.168 4.571 4.778 4.968 5.135 5.449 5.592 5.884 6.161 6.413 6.53 6.749 6.962 7.251 7.429 7.609 7.861 8.098 8.313 8.52 8.722 8.973 9.204 9.421 9.714 10.01 10.288 10.605 10.961 11.273 11.578 11.911 12.272 12.647 13.054 13.516 13.959 14.427 14.912 15.397 15.891 16.381 16.798 16.955 16.55 16.03 15.513 14.969 14.373 13.78 13.246 12.765 12.285 11.898 11.546 11.186 10.852 10.54 10.247 9.943 9.671 9.434 9.172 8.886 8.661 8.44 8.211 8.032 7.849 7.651 7.432 7.219 7.074 6.913 6.649 6.469 6.288 6.203 6.046 5.871 5.665 5.544 5.243 5.106 4.939 4.766 4.394 4.194 3.982 3.739 3.45 3.067 2.614 0.947 -10 ,9421 ,KEBNE ,17027186,Wed Dec 22 16:21:25 CET,Wed Dec 22 17:55:53 CET,0.0 2.807 3.403 3.825 4.201 4.555 4.845 5.093 5.541 5.752 5.954 6.158 6.46 6.579 6.811 7.09 7.361 7.471 7.68 7.891 8.183 8.363 8.534 8.771 8.998 9.212 9.43 9.663 9.963 10.222 10.448 10.717 10.976 11.22 11.494 11.795 12.069 12.394 12.768 13.132 13.506 13.918 14.369 14.8 15.274 15.792 16.362 16.849 17.218 17.533 17.648 17.347 16.853 16.214 15.543 14.91 14.36 13.843 13.364 12.835 12.392 12.015 11.649 11.285 10.919 10.576 10.218 9.904 9.639 9.366 9.078 8.819 8.52 8.21 7.978 7.748 7.501 7.253 7.005 6.837 6.663 6.377 6.177 5.965 5.852 5.623 5.396 5.138 5.005 4.702 4.537 4.374 4.207 3.866 3.675 3.463 3.21 2.886 2.54 2.129 0.395 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_38_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_38_39.txt deleted file mode 100644 index a504d89f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_38_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3989 ,TETRA ,17601255,Sun Nov 28 14:34:09 CET,Sun Nov 28 16:25:45 CET,0.0 1.549 2.01 2.36 2.669 2.941 3.165 3.378 3.879 4.105 4.281 4.462 4.817 5.001 5.32 5.61 5.869 5.993 6.238 6.47 6.778 6.984 7.193 7.497 7.817 8.107 8.356 8.593 8.88 9.15 9.415 9.739 10.033 10.333 10.67 11.011 11.354 11.73 12.127 12.534 12.936 13.355 13.81 14.275 14.794 15.254 15.707 16.136 16.542 16.8 16.599 15.886 15.047 14.279 13.552 12.803 12.108 11.446 10.868 10.294 9.777 9.319 8.865 8.405 7.985 7.604 7.191 6.816 6.484 6.141 5.782 5.494 5.197 4.874 4.625 4.37 4.112 3.835 3.546 3.345 3.137 2.813 2.587 2.348 2.224 1.962 1.681 1.41 1.262 0.934 0.747 0.568 0.395 -0.008 -0.223 -0.454 -0.727 -1.028 -1.384 -1.959 -3.617 -2 ,12951 ,TETRA ,17601256,Sun Nov 28 14:34:09 CET,Sun Nov 28 16:26:00 CET,0.0 1.557 2.027 2.351 2.639 2.903 3.163 3.414 3.893 4.105 4.296 4.473 4.779 4.93 5.206 5.462 5.714 5.833 6.071 6.315 6.648 6.857 7.056 7.324 7.595 7.872 8.122 8.363 8.685 8.998 9.283 9.593 9.884 10.176 10.522 10.888 11.227 11.612 12.011 12.418 12.843 13.304 13.794 14.242 14.75 15.305 15.89 16.447 16.972 17.407 17.502 16.979 16.247 15.455 14.726 13.994 13.294 12.666 12.065 11.429 10.907 10.459 10.018 9.589 9.176 8.777 8.367 7.997 7.665 7.314 6.952 6.658 6.341 6.021 5.785 5.533 5.261 4.988 4.713 4.526 4.325 4.004 3.781 3.54 3.414 3.138 2.85 2.566 2.423 2.11 1.952 1.765 1.555 1.109 0.878 0.638 0.366 0.058 -0.286 -0.778 -2.373 -3 ,1797 ,TETRA ,17601257,Sun Nov 28 14:34:11 CET,Sun Nov 28 16:26:11 CET,0.0 1.793 2.359 2.756 3.123 3.443 3.715 3.962 4.419 4.62 4.788 4.955 5.275 5.423 5.724 6.024 6.298 6.415 6.628 6.842 7.152 7.349 7.544 7.827 8.092 8.341 8.595 8.854 9.162 9.433 9.687 9.987 10.282 10.57 10.893 11.258 11.601 11.977 12.367 12.749 13.142 13.576 14.064 14.548 15.068 15.611 16.197 16.792 17.248 17.387 17.263 16.755 16.077 15.315 14.604 13.915 13.219 12.589 12.04 11.48 11.007 10.57 10.121 9.677 9.275 8.889 8.461 8.103 7.794 7.451 7.106 6.835 6.534 6.19 5.914 5.639 5.366 5.066 4.744 4.532 4.311 3.948 3.713 3.473 3.336 3.04 2.737 2.437 2.289 1.964 1.746 1.548 1.356 0.906 0.656 0.397 0.125 -0.205 -0.624 -1.188 -2.834 -4 ,3214 ,TETRA ,17601258,Sun Nov 28 14:34:10 CET,Sun Nov 28 16:25:57 CET,0.0 1.555 2.109 2.539 2.877 3.165 3.436 3.672 4.074 4.268 4.458 4.643 4.972 5.138 5.428 5.689 5.936 6.056 6.29 6.515 6.838 7.033 7.219 7.497 7.768 8.017 8.249 8.482 8.767 9.016 9.262 9.58 9.895 10.179 10.499 10.852 11.181 11.545 11.927 12.312 12.708 13.154 13.68 14.207 14.791 15.375 15.984 16.647 17.27 17.717 17.809 17.367 16.676 15.901 15.164 14.406 13.715 13.104 12.549 11.975 11.471 10.988 10.524 10.114 9.73 9.353 8.953 8.591 8.267 7.931 7.587 7.296 6.983 6.64 6.352 6.066 5.803 5.527 5.223 5.01 4.797 4.467 4.234 3.975 3.841 3.581 3.311 3.022 2.867 2.527 2.331 2.156 1.968 1.544 1.316 1.043 0.762 0.469 0.099 -0.412 -1.786 -5 ,5063 ,TETRA ,17601259,Sun Nov 28 14:34:12 CET,Sun Nov 28 16:26:04 CET,0.0 1.731 2.334 2.769 3.087 3.353 3.595 3.814 4.177 4.361 4.534 4.701 5.028 5.19 5.476 5.746 6.001 6.119 6.342 6.558 6.874 7.078 7.276 7.547 7.801 8.048 8.297 8.539 8.839 9.127 9.403 9.717 10.017 10.312 10.64 11.012 11.354 11.715 12.109 12.487 12.895 13.355 13.829 14.285 14.784 15.286 15.833 16.373 16.837 17.186 17.262 16.661 15.785 14.982 14.261 13.555 12.887 12.246 11.658 11.035 10.502 10.043 9.59 9.142 8.734 8.376 7.985 7.639 7.343 7.033 6.712 6.436 6.148 5.85 5.613 5.346 5.073 4.802 4.525 4.33 4.121 3.802 3.587 3.374 3.265 3.024 2.776 2.523 2.384 2.068 1.879 1.685 1.484 1.04 0.79 0.509 0.202 -0.143 -0.575 -1.204 -3.022 -6 ,17782 ,TETRA ,17601260,Sun Nov 28 14:34:09 CET,Sun Nov 28 16:25:54 CET,0.0 1.225 1.72 2.1 2.439 2.733 2.981 3.204 3.604 3.793 3.978 4.158 4.493 4.667 4.989 5.291 5.568 5.694 5.941 6.185 6.552 6.786 7.004 7.327 7.63 7.902 8.149 8.397 8.72 9.019 9.297 9.625 9.937 10.226 10.569 10.95 11.312 11.73 12.149 12.554 12.952 13.378 13.882 14.39 14.975 15.57 16.162 16.777 17.384 17.795 17.78 17.23 16.469 15.661 14.89 14.177 13.527 12.91 12.299 11.68 11.166 10.692 10.254 9.828 9.394 8.99 8.587 8.214 7.89 7.571 7.207 6.898 6.585 6.24 5.969 5.687 5.403 5.13 4.856 4.657 4.443 4.124 3.894 3.64 3.508 3.241 2.979 2.701 2.551 2.229 2.034 1.852 1.657 1.199 0.964 0.721 0.427 0.097 -0.309 -0.832 -2.177 -7 ,31913 ,TETRA ,17601261,Sun Nov 28 14:34:09 CET,Sun Nov 28 16:25:50 CET,0.0 1.752 2.302 2.717 3.051 3.333 3.578 3.797 4.244 4.463 4.651 4.867 5.213 5.372 5.668 5.966 6.255 6.38 6.629 6.873 7.187 7.394 7.605 7.9 8.195 8.491 8.776 9.045 9.374 9.697 10.019 10.369 10.685 11.004 11.385 11.796 12.152 12.505 12.868 13.256 13.643 14.09 14.573 14.997 15.506 16.091 16.682 17.178 17.654 18.032 17.921 17.349 16.645 15.856 15.118 14.385 13.645 12.983 12.419 11.81 11.268 10.805 10.383 9.982 9.561 9.134 8.71 8.362 8.054 7.731 7.384 7.1 6.784 6.414 6.149 5.892 5.629 5.352 5.064 4.876 4.678 4.357 4.133 3.896 3.766 3.481 3.173 2.854 2.687 2.351 2.16 1.977 1.789 1.363 1.136 0.904 0.622 0.279 -0.107 -0.576 -3.197 -8 ,1839 ,TETRA ,17601262,Sun Nov 28 14:34:11 CET,Sun Nov 28 16:26:06 CET,0.0 1.584 2.096 2.479 2.822 3.131 3.386 3.606 3.981 4.145 4.304 4.45 4.767 4.911 5.17 5.412 5.652 5.772 6.006 6.224 6.525 6.713 6.903 7.18 7.444 7.711 7.962 8.199 8.498 8.767 9.006 9.296 9.586 9.853 10.169 10.532 10.865 11.22 11.603 12.006 12.394 12.814 13.298 13.758 14.283 14.828 15.419 16.048 16.58 16.816 16.686 16.179 15.492 14.816 14.087 13.323 12.611 11.933 11.325 10.686 10.116 9.596 9.117 8.675 8.243 7.853 7.461 7.096 6.789 6.472 6.11 5.81 5.514 5.197 4.951 4.694 4.424 4.131 3.809 3.591 3.369 3.012 2.775 2.547 2.424 2.162 1.888 1.599 1.437 1.102 0.93 0.75 0.548 0.095 -0.135 -0.372 -0.661 -0.995 -1.392 -1.88 -3.995 -9 ,30372 ,TETRA ,17601263,Sun Nov 28 14:34:13 CET,Sun Nov 28 16:26:01 CET,0.0 2.593 3.301 3.716 4.056 4.344 4.601 4.84 5.25 5.449 5.639 5.82 6.131 6.28 6.579 6.856 7.122 7.252 7.504 7.737 8.048 8.237 8.421 8.701 8.973 9.238 9.501 9.74 10.027 10.297 10.548 10.852 11.148 11.434 11.769 12.143 12.469 12.801 13.161 13.569 14.009 14.481 15.024 15.538 16.062 16.578 17.169 17.793 18.366 18.763 18.755 18.161 17.33 16.472 15.707 14.989 14.296 13.626 13.051 12.473 11.941 11.463 10.994 10.545 10.166 9.818 9.439 9.086 8.758 8.419 8.073 7.782 7.474 7.178 6.951 6.696 6.439 6.178 5.893 5.68 5.458 5.123 4.88 4.64 4.518 4.264 3.991 3.674 3.508 3.178 3.002 2.815 2.62 2.202 1.971 1.703 1.411 1.072 0.68 0.193 -2.759 -10 ,32436 ,TETRA ,17601264,Sun Nov 28 14:34:14 CET,Sun Nov 28 16:26:13 CET,0.0 1.806 2.429 2.933 3.345 3.682 3.987 4.252 4.687 4.871 5.055 5.291 5.652 5.829 6.135 6.416 6.699 6.845 7.119 7.373 7.719 7.933 8.155 8.476 8.762 9.019 9.261 9.496 9.818 10.129 10.411 10.752 11.069 11.372 11.702 12.066 12.451 12.839 13.201 13.58 13.979 14.421 14.902 15.363 15.89 16.457 17.054 17.597 18.075 18.443 18.439 17.821 16.985 16.22 15.484 14.742 14.062 13.394 12.791 12.158 11.6 11.101 10.628 10.176 9.719 9.306 8.874 8.483 8.173 7.852 7.515 7.229 6.918 6.596 6.351 6.097 5.851 5.606 5.344 5.163 4.974 4.669 4.439 4.198 4.071 3.794 3.516 3.225 3.073 2.751 2.594 2.412 2.211 1.784 1.531 1.244 0.922 0.558 0.067 -0.564 -2.457 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_38_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_38_40.txt deleted file mode 100644 index 60f2d5f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_38_40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31208 ,TETRA ,17601265,Sun Nov 28 14:34:17 CET,Sun Nov 28 16:26:09 CET,0.0 4.326 5.346 5.936 6.398 6.797 7.159 7.464 7.99 8.209 8.402 8.621 8.964 9.131 9.445 9.758 10.047 10.182 10.443 10.675 10.987 11.185 11.371 11.624 11.85 12.054 12.23 12.394 12.614 12.825 13.028 13.279 13.508 13.712 13.94 14.18 14.397 14.62 14.843 15.085 15.314 15.534 15.755 15.934 16.067 16.143 16.14 16.004 15.664 14.971 13.552 11.564 9.764 8.222 6.865 5.601 4.532 3.617 2.82 2.031 1.342 0.706 0.101 -0.467 -0.979 -1.464 -1.978 -2.421 -2.801 -3.202 -3.624 -3.982 -4.351 -4.741 -5.052 -5.368 -5.725 -6.108 -6.471 -6.709 -6.976 -7.399 -7.677 -7.974 -8.135 -8.452 -8.777 -9.133 -9.318 -9.678 -9.896 -10.104 -10.326 -10.823 -11.081 -11.374 -11.691 -12.029 -12.424 -13.0 -16.184 -2 ,22630 ,TETRA ,17601266,Sun Nov 28 14:34:10 CET,Sun Nov 28 16:26:30 CET,0.0 3.692 4.528 5.235 5.801 6.237 6.61 6.93 7.534 7.786 7.967 8.149 8.481 8.646 8.953 9.212 9.433 9.545 9.788 10.023 10.323 10.517 10.699 10.924 11.135 11.34 11.547 11.738 11.968 12.192 12.395 12.641 12.895 13.138 13.424 13.727 13.975 14.241 14.506 14.775 15.028 15.252 15.481 15.667 15.836 15.949 15.977 15.89 15.563 14.675 12.817 10.683 8.873 7.209 5.765 4.492 3.404 2.441 1.593 0.737 -0.002 -0.641 -1.227 -1.774 -2.289 -2.774 -3.268 -3.707 -4.097 -4.498 -4.906 -5.254 -5.622 -5.992 -6.273 -6.569 -6.871 -7.173 -7.503 -7.75 -7.996 -8.368 -8.622 -8.882 -9.019 -9.297 -9.604 -9.934 -10.101 -10.457 -10.666 -10.875 -11.101 -11.575 -11.813 -12.045 -12.316 -12.694 -13.165 -13.69 -14.975 -3 ,4435 ,TETRA ,17601267,Sun Nov 28 14:34:14 CET,Sun Nov 28 16:26:07 CET,0.0 3.642 4.458 4.981 5.41 5.731 6.018 6.304 6.831 7.056 7.254 7.485 7.823 7.979 8.283 8.57 8.841 8.977 9.225 9.449 9.777 9.983 10.174 10.448 10.714 10.942 11.145 11.339 11.56 11.771 11.972 12.185 12.394 12.61 12.867 13.159 13.448 13.761 14.051 14.336 14.583 14.78 14.985 15.174 15.351 15.448 15.457 15.403 15.094 14.284 12.639 10.47 8.701 7.147 5.806 4.583 3.459 2.458 1.602 0.742 -0.003 -0.662 -1.269 -1.817 -2.319 -2.79 -3.307 -3.765 -4.153 -4.571 -5.01 -5.363 -5.732 -6.117 -6.409 -6.721 -7.04 -7.357 -7.707 -7.964 -8.215 -8.606 -8.89 -9.181 -9.331 -9.636 -9.948 -10.267 -10.439 -10.807 -11.018 -11.225 -11.435 -11.922 -12.219 -12.527 -12.897 -13.314 -13.836 -14.582 -17.237 -4 ,21601 ,TETRA ,17601268,Sun Nov 28 14:34:15 CET,Sun Nov 28 16:25:42 CET,0.0 3.277 4.114 4.702 5.133 5.527 5.856 6.13 6.623 6.862 7.089 7.346 7.702 7.88 8.191 8.481 8.755 8.887 9.133 9.35 9.66 9.858 10.053 10.33 10.58 10.806 11.013 11.211 11.471 11.726 11.947 12.183 12.411 12.624 12.868 13.14 13.387 13.611 13.87 14.161 14.383 14.601 14.809 14.97 15.094 15.142 15.124 14.985 14.617 13.843 12.389 10.34 8.444 6.82 5.424 4.19 3.132 2.172 1.273 0.351 -0.382 -1.01 -1.637 -2.262 -2.83 -3.345 -3.88 -4.346 -4.748 -5.168 -5.626 -6.006 -6.396 -6.808 -7.125 -7.444 -7.772 -8.124 -8.528 -8.811 -9.079 -9.466 -9.731 -10.003 -10.146 -10.457 -10.782 -11.127 -11.305 -11.665 -11.855 -12.06 -12.266 -12.706 -12.987 -13.301 -13.631 -14.036 -14.495 -15.1 -17.485 -5 ,24230 ,TETRA ,17601269,Sun Nov 28 14:34:12 CET,Sun Nov 28 16:25:30 CET,0.0 3.693 4.396 4.912 5.38 5.761 6.094 6.411 6.916 7.134 7.337 7.557 7.884 8.038 8.332 8.634 8.91 9.04 9.299 9.546 9.88 10.09 10.294 10.578 10.844 11.085 11.307 11.515 11.764 11.988 12.207 12.47 12.705 12.916 13.172 13.471 13.73 13.968 14.189 14.406 14.639 14.859 15.052 15.237 15.387 15.466 15.479 15.339 14.975 14.276 12.77 10.62 8.8 7.22 5.865 4.693 3.653 2.729 1.951 1.151 0.455 -0.21 -0.887 -1.522 -2.096 -2.598 -3.133 -3.617 -4.039 -4.457 -4.872 -5.229 -5.593 -5.962 -6.267 -6.581 -6.891 -7.226 -7.586 -7.831 -8.076 -8.459 -8.727 -9.001 -9.147 -9.449 -9.787 -10.145 -10.321 -10.676 -10.878 -11.087 -11.317 -11.848 -12.145 -12.476 -12.848 -13.252 -13.717 -14.438 -17.829 -6 ,5861 ,TETRA ,17601270,Sun Nov 28 14:34:11 CET,Sun Nov 28 16:26:03 CET,0.0 3.424 4.222 4.751 5.201 5.577 5.899 6.186 6.686 6.919 7.126 7.328 7.675 7.847 8.157 8.449 8.722 8.853 9.102 9.337 9.662 9.868 10.052 10.304 10.56 10.795 11.019 11.218 11.457 11.703 11.915 12.164 12.407 12.626 12.877 13.132 13.352 13.569 13.791 14.015 14.21 14.404 14.639 14.87 15.059 15.168 15.189 15.068 14.724 13.964 12.491 10.53 8.751 7.104 5.609 4.301 3.175 2.155 1.303 0.45 -0.291 -0.947 -1.589 -2.204 -2.763 -3.294 -3.87 -4.36 -4.77 -5.203 -5.656 -6.034 -6.44 -6.852 -7.166 -7.494 -7.829 -8.174 -8.534 -8.786 -9.046 -9.473 -9.788 -10.108 -10.27 -10.594 -10.932 -11.303 -11.488 -11.85 -12.042 -12.237 -12.449 -12.932 -13.2 -13.497 -13.852 -14.269 -14.783 -15.439 -17.469 -7 ,8379 ,TETRA ,17601271,Sun Nov 28 14:34:14 CET,Sun Nov 28 16:26:06 CET,0.0 2.964 3.707 4.281 4.841 5.259 5.592 5.904 6.417 6.644 6.852 7.072 7.41 7.578 7.904 8.214 8.514 8.653 8.91 9.146 9.484 9.689 9.868 10.124 10.372 10.589 10.796 11.014 11.282 11.523 11.762 12.032 12.288 12.555 12.846 13.137 13.403 13.678 13.937 14.191 14.466 14.754 15.039 15.243 15.393 15.512 15.592 15.564 15.264 14.583 13.169 11.251 9.403 7.781 6.448 5.235 4.127 3.133 2.272 1.4 0.668 0.03 -0.557 -1.111 -1.638 -2.128 -2.644 -3.091 -3.471 -3.886 -4.335 -4.716 -5.102 -5.473 -5.756 -6.06 -6.38 -6.71 -7.052 -7.29 -7.536 -7.919 -8.183 -8.447 -8.588 -8.886 -9.172 -9.457 -9.621 -9.986 -10.18 -10.386 -10.618 -11.093 -11.362 -11.66 -11.979 -12.366 -12.826 -13.449 -15.607 -8 ,26274 ,TETRA ,17601272,Sun Nov 28 14:34:12 CET,Sun Nov 28 16:26:32 CET,0.0 3.097 3.767 4.267 4.722 5.154 5.524 5.841 6.392 6.646 6.879 7.165 7.527 7.702 8.029 8.319 8.577 8.698 8.93 9.145 9.46 9.658 9.842 10.11 10.372 10.623 10.84 11.048 11.337 11.603 11.838 12.087 12.295 12.494 12.716 12.944 13.141 13.349 13.563 13.785 14.002 14.192 14.393 14.572 14.711 14.793 14.828 14.691 14.302 13.549 12.075 10.151 8.299 6.605 5.179 3.954 2.927 1.984 1.157 0.344 -0.394 -1.047 -1.619 -2.158 -2.657 -3.125 -3.658 -4.146 -4.57 -4.997 -5.43 -5.798 -6.194 -6.602 -6.92 -7.261 -7.606 -7.955 -8.322 -8.569 -8.82 -9.198 -9.454 -9.734 -9.882 -10.197 -10.517 -10.826 -10.993 -11.346 -11.519 -11.734 -11.952 -12.374 -12.623 -12.917 -13.253 -13.629 -14.087 -14.718 -16.751 -9 ,11290 ,TETRA ,17601273,Sun Nov 28 14:34:14 CET,Sun Nov 28 16:26:34 CET,0.0 4.914 5.728 6.284 6.744 7.167 7.497 7.771 8.278 8.519 8.741 9.012 9.386 9.594 9.939 10.222 10.477 10.6 10.87 11.144 11.516 11.76 11.988 12.284 12.532 12.758 12.988 13.195 13.453 13.707 13.932 14.157 14.33 14.51 14.74 14.974 15.194 15.414 15.624 15.812 15.988 16.178 16.322 16.386 16.412 16.361 16.212 16.005 15.617 14.764 13.107 10.917 8.924 7.189 5.747 4.501 3.415 2.425 1.534 0.658 -0.1 -0.778 -1.411 -2.019 -2.567 -3.067 -3.613 -4.107 -4.528 -4.966 -5.435 -5.817 -6.222 -6.651 -6.997 -7.357 -7.704 -8.046 -8.4 -8.648 -8.904 -9.3 -9.564 -9.86 -10.017 -10.321 -10.626 -10.954 -11.121 -11.47 -11.686 -11.904 -12.14 -12.612 -12.856 -13.135 -13.466 -13.862 -14.344 -14.946 -19.201 -10 ,29408 ,TETRA ,17601274,Sun Nov 28 14:34:16 CET,Sun Nov 28 16:27:25 CET,0.0 3.164 3.89 4.391 4.795 5.146 5.482 5.795 6.378 6.665 6.932 7.221 7.565 7.727 8.044 8.372 8.671 8.801 9.047 9.275 9.582 9.771 9.962 10.245 10.511 10.777 11.029 11.267 11.579 11.872 12.136 12.431 12.678 12.901 13.141 13.372 13.574 13.802 14.043 14.267 14.455 14.638 14.832 14.998 15.143 15.208 15.172 15.003 14.63 13.843 12.24 9.902 7.878 6.223 4.817 3.564 2.465 1.464 0.614 -0.212 -0.945 -1.603 -2.228 -2.823 -3.37 -3.853 -4.343 -4.781 -5.169 -5.569 -5.978 -6.317 -6.673 -7.045 -7.341 -7.652 -7.983 -8.305 -8.626 -8.859 -9.101 -9.477 -9.732 -9.997 -10.143 -10.458 -10.799 -11.183 -11.37 -11.728 -11.964 -12.201 -12.445 -12.945 -13.218 -13.513 -13.829 -14.218 -14.696 -15.296 -17.042 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_39_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_39_41.txt deleted file mode 100644 index f3f96d45..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_39_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27799 ,KEBNE ,17027187,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:56:56 CET,0.0 4.542 5.278 5.789 6.179 6.501 6.787 7.063 7.559 7.783 7.977 8.151 8.477 8.64 8.957 9.233 9.493 9.625 9.882 10.115 10.441 10.64 10.829 11.101 11.357 11.6 11.823 12.039 12.334 12.604 12.839 13.114 13.378 13.642 13.961 14.314 14.634 14.946 15.255 15.588 15.935 16.291 16.689 17.082 17.492 17.885 18.292 18.725 19.06 19.201 19.004 18.369 17.598 16.763 15.967 15.306 14.682 14.051 13.5 12.926 12.429 11.969 11.499 11.052 10.644 10.269 9.889 9.536 9.208 8.879 8.534 8.242 7.952 7.639 7.399 7.162 6.907 6.626 6.343 6.158 5.961 5.649 5.426 5.196 5.076 4.832 4.567 4.276 4.112 3.782 3.639 3.472 3.281 2.885 2.663 2.392 2.112 1.782 1.355 0.782 -0.963 -2 ,14029 ,KEBNE ,17027188,Wed Dec 22 16:21:25 CET,Wed Dec 22 17:58:02 CET,0.0 3.586 4.36 4.91 5.385 5.775 6.082 6.359 6.882 7.115 7.331 7.579 7.941 8.13 8.468 8.794 9.105 9.259 9.539 9.781 10.118 10.329 10.532 10.831 11.106 11.369 11.613 11.847 12.158 12.461 12.739 13.059 13.364 13.656 13.994 14.364 14.697 15.048 15.417 15.793 16.209 16.672 17.165 17.609 18.1 18.645 19.208 19.73 20.15 20.466 20.511 20.01 19.311 18.523 17.708 16.927 16.225 15.583 15.02 14.423 13.874 13.393 12.942 12.499 12.081 11.718 11.312 10.921 10.573 10.204 9.842 9.537 9.198 8.865 8.618 8.359 8.072 7.749 7.416 7.199 6.997 6.684 6.445 6.187 6.051 5.753 5.473 5.201 5.054 4.735 4.554 4.354 4.136 3.712 3.503 3.256 2.945 2.57 2.131 1.521 -1.085 -3 ,31080 ,KEBNE ,17027189,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:58:26 CET,0.0 3.294 4.113 4.672 5.116 5.508 5.855 6.173 6.77 7.017 7.23 7.468 7.813 7.984 8.303 8.59 8.865 9.011 9.299 9.587 9.984 10.215 10.434 10.758 11.06 11.323 11.574 11.819 12.127 12.437 12.74 13.065 13.348 13.596 13.871 14.195 14.519 14.85 15.178 15.525 15.889 16.284 16.704 17.154 17.685 18.174 18.662 19.111 19.485 19.748 19.633 18.979 18.155 17.362 16.618 15.899 15.251 14.624 14.043 13.445 12.929 12.48 12.036 11.592 11.181 10.811 10.395 10.019 9.705 9.385 9.047 8.763 8.469 8.157 7.908 7.635 7.355 7.069 6.768 6.562 6.348 6.003 5.761 5.505 5.371 5.084 4.779 4.484 4.33 4.009 3.872 3.707 3.51 3.047 2.803 2.555 2.268 1.904 1.458 0.903 -1.022 -4 ,32036 ,KEBNE ,17027190,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:56:53 CET,0.0 3.264 4.229 4.829 5.345 5.779 6.112 6.394 6.935 7.164 7.367 7.568 7.893 8.055 8.385 8.719 9.015 9.148 9.391 9.619 9.956 10.18 10.383 10.678 10.953 11.194 11.423 11.646 11.939 12.213 12.469 12.771 13.068 13.344 13.649 13.993 14.311 14.671 15.041 15.393 15.764 16.183 16.647 17.058 17.497 17.967 18.471 18.927 19.348 19.61 19.439 18.809 18.091 17.36 16.597 15.793 15.029 14.325 13.709 13.067 12.499 12.025 11.585 11.134 10.7 10.326 9.939 9.581 9.257 8.911 8.551 8.247 7.932 7.606 7.357 7.098 6.835 6.566 6.272 6.066 5.857 5.537 5.296 5.042 4.912 4.646 4.367 4.066 3.907 3.574 3.377 3.182 2.991 2.59 2.367 2.111 1.817 1.513 1.166 0.616 -1.194 -5 ,9931 ,KEBNE ,17027191,Wed Dec 22 16:21:27 CET,Wed Dec 22 17:56:50 CET,0.0 3.508 4.349 4.899 5.324 5.702 6.027 6.327 6.881 7.127 7.357 7.616 7.983 8.182 8.549 8.872 9.173 9.32 9.59 9.827 10.178 10.394 10.581 10.862 11.138 11.392 11.632 11.87 12.186 12.477 12.741 13.053 13.345 13.625 13.951 14.3 14.632 15.013 15.42 15.792 16.161 16.586 17.029 17.45 17.922 18.394 18.853 19.286 19.697 19.975 19.836 19.22 18.52 17.748 16.988 16.236 15.547 14.924 14.381 13.795 13.276 12.83 12.395 11.96 11.551 11.183 10.792 10.443 10.142 9.8 9.392 9.059 8.731 8.358 8.058 7.766 7.463 7.134 6.795 6.579 6.367 6.038 5.805 5.551 5.419 5.159 4.885 4.588 4.432 4.098 3.899 3.696 3.488 3.025 2.751 2.476 2.175 1.798 1.325 0.777 -0.879 -6 ,5373 ,KEBNE ,17027192,Wed Dec 22 16:21:27 CET,Wed Dec 22 17:56:51 CET,0.0 4.596 5.334 5.802 6.179 6.507 6.787 7.062 7.583 7.811 8.031 8.268 8.623 8.804 9.142 9.458 9.741 9.876 10.153 10.406 10.734 10.941 11.147 11.442 11.704 11.968 12.234 12.488 12.818 13.137 13.442 13.803 14.119 14.406 14.73 15.055 15.363 15.695 16.05 16.424 16.81 17.213 17.644 18.066 18.529 19.005 19.471 19.884 20.241 20.456 20.357 19.703 18.875 18.033 17.192 16.373 15.615 14.912 14.292 13.655 13.132 12.657 12.165 11.718 11.301 10.907 10.498 10.128 9.813 9.491 9.135 8.827 8.513 8.188 7.941 7.693 7.425 7.139 6.843 6.643 6.433 6.102 5.87 5.619 5.49 5.229 4.961 4.688 4.554 4.239 4.056 3.88 3.691 3.254 3.021 2.76 2.455 2.133 1.753 1.202 -1.07 -7 ,31859 ,KEBNE ,17027193,Wed Dec 22 16:21:27 CET,Wed Dec 22 17:59:08 CET,0.0 3.497 4.284 4.881 5.343 5.727 6.072 6.39 6.936 7.176 7.396 7.638 7.989 8.156 8.461 8.756 9.022 9.143 9.386 9.62 9.948 10.16 10.37 10.68 10.972 11.25 11.518 11.778 12.114 12.437 12.737 13.095 13.443 13.746 14.065 14.417 14.736 15.068 15.421 15.792 16.162 16.543 16.954 17.364 17.839 18.32 18.766 19.174 19.567 19.787 19.608 18.938 18.131 17.333 16.532 15.773 15.078 14.406 13.806 13.177 12.643 12.161 11.678 11.217 10.784 10.386 9.99 9.636 9.325 9.019 8.68 8.388 8.091 7.776 7.539 7.277 6.994 6.724 6.443 6.246 6.055 5.754 5.528 5.291 5.168 4.902 4.622 4.336 4.186 3.869 3.706 3.533 3.358 2.939 2.699 2.462 2.181 1.825 1.408 0.862 -1.099 -8 ,8100 ,KEBNE ,17027194,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:58:12 CET,0.0 3.131 3.915 4.447 4.92 5.355 5.724 6.045 6.559 6.763 6.952 7.147 7.48 7.65 7.981 8.294 8.576 8.716 8.991 9.226 9.546 9.749 9.949 10.238 10.526 10.798 11.035 11.263 11.561 11.832 12.087 12.404 12.688 12.958 13.27 13.613 13.941 14.291 14.646 15.018 15.414 15.841 16.327 16.777 17.245 17.75 18.294 18.784 19.15 19.343 19.132 18.339 17.386 16.44 15.61 14.811 14.017 13.277 12.662 12.043 11.493 10.982 10.468 9.984 9.546 9.159 8.766 8.41 8.093 7.748 7.368 7.056 6.751 6.443 6.2 5.939 5.674 5.393 5.085 4.878 4.67 4.331 4.08 3.824 3.701 3.449 3.196 2.929 2.777 2.461 2.313 2.13 1.931 1.484 1.238 0.996 0.731 0.411 0.059 -0.404 -1.85 -9 ,13249 ,KEBNE ,17027195,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:56:43 CET,0.0 3.147 3.954 4.533 4.978 5.335 5.653 5.941 6.423 6.632 6.837 7.059 7.383 7.539 7.845 8.141 8.414 8.543 8.81 9.056 9.38 9.584 9.779 10.059 10.336 10.6 10.846 11.091 11.428 11.723 11.972 12.269 12.554 12.828 13.14 13.463 13.759 14.093 14.453 14.807 15.139 15.52 15.947 16.345 16.796 17.25 17.703 18.124 18.471 18.652 18.441 17.669 16.785 15.887 15.049 14.284 13.626 13.046 12.502 11.911 11.39 10.928 10.497 10.087 9.687 9.311 8.918 8.57 8.266 7.95 7.63 7.357 7.058 6.761 6.529 6.286 6.035 5.763 5.491 5.304 5.097 4.76 4.525 4.292 4.174 3.942 3.707 3.443 3.299 2.985 2.847 2.687 2.51 2.1 1.878 1.659 1.393 1.056 0.686 0.108 -1.957 -10 ,14498 ,KEBNE ,17027196,Wed Dec 22 16:21:27 CET,Wed Dec 22 17:58:52 CET,0.0 3.667 4.399 4.965 5.408 5.772 6.124 6.457 7.07 7.349 7.602 7.879 8.252 8.454 8.805 9.144 9.476 9.629 9.913 10.176 10.533 10.768 10.991 11.329 11.654 11.953 12.242 12.524 12.887 13.209 13.501 13.828 14.1 14.355 14.663 15.008 15.327 15.674 16.027 16.384 16.759 17.159 17.594 18.012 18.443 18.849 19.221 19.566 19.857 19.996 19.769 19.058 18.252 17.412 16.579 15.811 15.143 14.503 13.925 13.338 12.803 12.326 11.864 11.408 10.991 10.596 10.176 9.81 9.5 9.182 8.828 8.519 8.186 7.829 7.562 7.291 6.997 6.679 6.332 6.09 5.856 5.482 5.211 4.941 4.804 4.52 4.211 3.868 3.689 3.33 3.087 2.869 2.631 2.125 1.851 1.545 1.202 0.824 0.365 -0.216 -2.225 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_40_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_40_41.txt deleted file mode 100644 index 0bf6d949..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_40_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9793 ,TETRA ,17601275,Sun Nov 28 14:34:13 CET,Sun Nov 28 16:27:00 CET,0.0 5.293 6.339 7.021 7.581 8.046 8.427 8.787 9.45 9.739 10.029 10.391 10.825 11.071 11.511 11.909 12.298 12.49 12.854 13.192 13.65 13.913 14.13 14.445 14.758 15.059 15.339 15.614 15.975 16.335 16.68 17.062 17.428 17.812 18.278 18.795 19.277 19.777 20.303 20.881 21.495 22.185 22.96 23.74 24.682 25.669 26.756 27.935 29.258 30.716 32.105 32.813 32.995 32.989 32.861 32.641 32.386 32.097 31.766 31.427 31.126 30.841 30.563 30.279 30.016 29.778 29.51 29.247 28.998 28.738 28.463 28.235 27.984 27.7 27.481 27.241 26.974 26.702 26.408 26.199 26.0 25.671 25.419 25.145 24.998 24.684 24.339 23.968 23.772 23.4 23.117 22.88 22.642 22.1 21.761 21.374 20.931 20.382 19.75 18.939 15.152 -2 ,349 ,TETRA ,17601276,Sun Nov 28 14:34:14 CET,Sun Nov 28 16:26:06 CET,0.0 5.329 6.121 6.819 7.394 7.846 8.219 8.562 9.208 9.516 9.811 10.146 10.549 10.77 11.184 11.531 11.852 12.008 12.325 12.628 13.036 13.309 13.584 13.974 14.359 14.734 15.068 15.377 15.769 16.148 16.516 16.971 17.388 17.75 18.169 18.643 19.079 19.541 20.033 20.554 21.09 21.717 22.456 23.16 23.991 24.904 25.884 27.018 28.393 29.902 31.395 32.344 32.623 32.596 32.436 32.189 31.909 31.622 31.32 30.928 30.507 30.1 29.737 29.416 29.111 28.803 28.463 28.15 27.882 27.613 27.311 27.04 26.731 26.413 26.18 25.923 25.641 25.339 25.037 24.831 24.625 24.293 24.041 23.773 23.634 23.352 23.062 22.736 22.553 22.195 21.958 21.73 21.475 20.921 20.58 20.207 19.828 19.345 18.706 17.789 13.496 -3 ,5755 ,TETRA ,17601277,Sun Nov 28 14:34:14 CET,Sun Nov 28 16:26:07 CET,0.0 3.478 4.29 4.899 5.391 5.792 6.155 6.514 7.149 7.418 7.687 8.024 8.437 8.656 9.064 9.434 9.776 9.944 10.275 10.585 11.03 11.306 11.569 11.956 12.326 12.664 13.004 13.325 13.71 14.09 14.466 14.896 15.284 15.657 16.078 16.534 16.969 17.447 17.962 18.515 19.107 19.766 20.511 21.237 22.063 23.012 24.079 25.209 26.463 27.891 29.382 30.276 30.642 30.742 30.662 30.409 30.099 29.797 29.513 29.208 28.902 28.599 28.319 28.065 27.782 27.483 27.171 26.894 26.663 26.408 26.096 25.837 25.578 25.309 25.103 24.88 24.621 24.339 24.056 23.855 23.62 23.253 22.995 22.708 22.567 22.288 22.003 21.698 21.533 21.196 20.983 20.761 20.511 19.975 19.66 19.308 18.915 18.474 17.866 16.909 12.563 -4 ,21201 ,TETRA ,17601278,Sun Nov 28 14:34:17 CET,Sun Nov 28 16:27:59 CET,0.0 7.52 8.531 9.211 9.752 10.226 10.644 11.005 11.686 12.006 12.298 12.638 13.069 13.321 13.761 14.143 14.509 14.681 15.011 15.34 15.81 16.101 16.388 16.801 17.2 17.576 17.907 18.233 18.66 19.071 19.446 19.882 20.32 20.727 21.198 21.748 22.252 22.788 23.371 23.977 24.603 25.325 26.18 27.036 27.982 28.981 30.089 31.17 32.391 33.793 35.225 36.042 36.245 36.25 36.146 35.966 35.638 35.19 34.767 34.341 33.968 33.631 33.291 32.957 32.595 32.249 31.907 31.592 31.278 30.912 30.54 30.242 29.925 29.585 29.332 29.072 28.8 28.51 28.2 27.982 27.751 27.387 27.131 26.848 26.703 26.404 26.099 25.796 25.627 25.285 25.079 24.88 24.648 24.124 23.775 23.266 22.675 22.023 21.266 20.255 14.976 -5 ,5145 ,TETRA ,17601279,Sun Nov 28 14:34:18 CET,Sun Nov 28 16:26:06 CET,0.0 4.014 4.944 5.622 6.198 6.705 7.14 7.466 8.0 8.269 8.53 8.818 9.211 9.418 9.833 10.219 10.57 10.746 11.078 11.383 11.801 12.066 12.322 12.711 13.099 13.454 13.788 14.115 14.509 14.874 15.23 15.665 16.116 16.532 16.982 17.523 18.047 18.61 19.2 19.798 20.406 21.073 21.843 22.591 23.458 24.382 25.434 26.662 27.995 29.319 30.65 31.536 31.814 31.754 31.588 31.384 31.133 30.832 30.524 30.192 29.872 29.58 29.288 28.985 28.686 28.411 28.104 27.797 27.527 27.232 26.904 26.627 26.327 26.027 25.769 25.484 25.217 24.957 24.669 24.46 24.249 23.889 23.62 23.315 23.153 22.843 22.519 22.174 21.992 21.62 21.331 21.087 20.823 20.208 19.87 19.517 19.1 18.538 17.862 16.987 12.673 -6 ,4750 ,TETRA ,17601280,Sun Nov 28 14:34:14 CET,Sun Nov 28 16:26:31 CET,0.0 3.713 4.716 5.426 6.001 6.423 6.807 7.139 7.669 7.917 8.149 8.411 8.812 9.027 9.443 9.829 10.192 10.362 10.674 10.966 11.377 11.639 11.883 12.249 12.616 12.936 13.217 13.514 13.908 14.27 14.623 15.036 15.418 15.779 16.198 16.66 17.101 17.562 18.05 18.586 19.153 19.779 20.49 21.206 22.013 22.898 23.912 24.991 26.218 27.701 29.25 30.115 30.356 30.306 30.139 29.94 29.748 29.506 29.248 28.96 28.652 28.333 27.988 27.633 27.313 27.013 26.662 26.34 26.058 25.768 25.486 25.245 24.982 24.711 24.489 24.225 23.944 23.678 23.397 23.174 22.921 22.505 22.207 21.889 21.722 21.377 21.028 20.665 20.48 20.127 19.876 19.646 19.403 18.869 18.548 18.198 17.815 17.329 16.738 15.967 11.663 -7 ,30711 ,TETRA ,17601281,Sun Nov 28 14:34:14 CET,Sun Nov 28 16:26:15 CET,0.0 4.478 5.41 6.085 6.632 7.069 7.498 7.902 8.57 8.862 9.128 9.439 9.857 10.09 10.528 10.966 11.369 11.541 11.858 12.152 12.578 12.866 13.131 13.494 13.833 14.131 14.412 14.7 15.065 15.408 15.753 16.167 16.572 16.964 17.429 17.988 18.506 19.044 19.643 20.277 20.928 21.655 22.45 23.23 24.173 25.173 26.223 27.366 28.702 30.11 31.501 32.372 32.65 32.638 32.467 32.223 31.879 31.477 31.099 30.684 30.3 29.986 29.727 29.45 29.177 28.925 28.614 28.309 28.027 27.728 27.412 27.132 26.84 26.543 26.312 26.057 25.789 25.507 25.202 24.995 24.765 24.397 24.149 23.886 23.748 23.448 23.14 22.806 22.622 22.261 22.05 21.862 21.642 21.087 20.752 20.347 19.872 19.272 18.558 17.546 12.636 -8 ,23875 ,TETRA ,17601282,Sun Nov 28 14:34:38 CET,Sun Nov 28 16:25:54 CET,0.0 10.427 11.458 12.137 12.652 13.058 13.434 13.811 14.469 14.738 15.004 15.36 15.778 15.996 16.391 16.772 17.134 17.308 17.641 17.948 18.375 18.637 18.897 19.269 19.632 19.996 20.347 20.671 21.082 21.477 21.847 22.293 22.693 23.062 23.51 24.021 24.512 25.051 25.618 26.242 26.886 27.563 28.339 29.091 29.959 30.936 32.039 33.202 34.443 35.765 37.14 37.879 38.028 37.938 37.719 37.398 36.975 36.503 36.115 35.735 35.374 35.005 34.616 34.256 33.93 33.645 33.364 33.102 32.849 32.582 32.293 32.02 31.723 31.42 31.19 30.973 30.739 30.476 30.207 30.009 29.791 29.44 29.186 28.906 28.759 28.44 28.089 27.736 27.553 27.2 26.995 26.783 26.537 25.972 25.65 25.262 24.794 24.268 23.635 22.743 18.043 -9 ,3878 ,TETRA ,17601283,Sun Nov 28 14:34:38 CET,Sun Nov 28 16:26:50 CET,0.0 4.677 5.77 6.47 6.942 7.355 7.733 8.054 8.652 8.925 9.17 9.464 9.867 10.074 10.467 10.836 11.166 11.324 11.645 11.958 12.398 12.684 12.961 13.354 13.714 14.044 14.348 14.663 15.08 15.47 15.862 16.281 16.636 17.001 17.433 17.9 18.319 18.778 19.307 19.894 20.525 21.222 22.02 22.808 23.684 24.641 25.731 26.941 28.284 29.636 30.982 31.81 31.988 31.852 31.662 31.438 31.14 30.815 30.513 30.196 29.909 29.606 29.289 28.99 28.719 28.452 28.144 27.878 27.633 27.347 27.013 26.72 26.412 26.084 25.824 25.563 25.298 25.009 24.692 24.478 24.255 23.893 23.633 23.342 23.19 22.888 22.564 22.196 22.008 21.65 21.353 21.089 20.823 20.258 19.954 19.593 19.182 18.731 18.139 17.297 12.586 -10 ,17115 ,TETRA ,17601284,Sun Nov 28 14:34:38 CET,Sun Nov 28 16:27:54 CET,0.0 6.028 6.974 7.615 8.111 8.551 8.891 9.196 9.784 10.054 10.314 10.59 10.976 11.176 11.554 11.93 12.291 12.456 12.765 13.072 13.522 13.808 14.095 14.529 14.931 15.275 15.611 15.94 16.343 16.727 17.083 17.525 17.946 18.34 18.796 19.303 19.818 20.393 21.014 21.671 22.315 23.058 23.945 24.777 25.676 26.632 27.728 28.917 30.209 31.629 33.096 33.868 33.993 33.932 33.749 33.443 33.108 32.723 32.366 31.968 31.565 31.223 30.888 30.554 30.249 29.952 29.621 29.322 29.06 28.771 28.427 28.123 27.82 27.516 27.278 27.021 26.737 26.441 26.119 25.892 25.66 25.282 25.01 24.709 24.555 24.235 23.891 23.507 23.308 22.941 22.63 22.364 22.105 21.488 21.088 20.657 20.195 19.713 19.119 18.198 14.298 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_42_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_42_44.txt deleted file mode 100644 index 019ecbd5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_42_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17119 ,TETRA ,17601285,Sun Nov 28 14:34:41 CET,Sun Nov 28 16:26:00 CET,0.0 1.215 1.604 1.916 2.183 2.413 2.6 2.764 3.087 3.238 3.382 3.497 3.77 3.891 4.108 4.325 4.549 4.657 4.844 5.006 5.249 5.4 5.546 5.77 5.979 6.173 6.36 6.541 6.783 7.024 7.243 7.484 7.723 7.951 8.205 8.496 8.77 9.055 9.38 9.716 10.039 10.38 10.759 11.146 11.599 12.089 12.621 13.214 13.821 14.346 14.728 14.774 14.585 14.297 13.955 13.607 13.288 12.967 12.672 12.373 12.113 11.845 11.569 11.318 11.095 10.889 10.661 10.445 10.255 10.059 9.849 9.665 9.467 9.244 9.067 8.895 8.727 8.558 8.381 8.248 8.107 7.875 7.698 7.534 7.456 7.278 7.081 6.882 6.779 6.524 6.438 6.313 6.176 5.9 5.757 5.615 5.469 5.264 4.981 4.644 3.816 -2 ,8885 ,TETRA ,17601286,Sun Nov 28 14:34:39 CET,Sun Nov 28 16:24:48 CET,0.0 1.67 2.203 2.629 2.95 3.218 3.479 3.709 4.123 4.302 4.456 4.626 4.943 5.086 5.334 5.579 5.832 5.949 6.161 6.358 6.636 6.809 6.967 7.189 7.399 7.597 7.802 8.01 8.268 8.507 8.732 9.004 9.274 9.528 9.797 10.104 10.399 10.695 11.006 11.322 11.655 12.031 12.426 12.796 13.234 13.704 14.188 14.723 15.261 15.78 16.241 16.282 16.049 15.728 15.373 15.023 14.704 14.352 14.03 13.691 13.38 13.11 12.86 12.622 12.383 12.161 11.937 11.75 11.575 11.379 11.174 10.998 10.82 10.643 10.502 10.341 10.163 9.981 9.787 9.655 9.524 9.32 9.184 9.044 8.97 8.808 8.625 8.436 8.338 8.093 8.015 7.892 7.764 7.49 7.336 7.164 6.966 6.763 6.503 6.134 4.761 -3 ,5088 ,TETRA ,17601287,Sun Nov 28 14:34:39 CET,Sun Nov 28 16:25:04 CET,0.0 1.444 1.869 2.214 2.487 2.731 2.956 3.153 3.505 3.654 3.78 3.899 4.177 4.283 4.492 4.697 4.904 5.001 5.18 5.351 5.6 5.766 5.931 6.161 6.372 6.58 6.775 6.956 7.181 7.39 7.589 7.819 8.05 8.285 8.56 8.86 9.116 9.408 9.744 10.078 10.403 10.761 11.173 11.562 12.018 12.527 13.063 13.585 14.127 14.658 15.061 15.08 14.823 14.498 14.155 13.821 13.478 13.117 12.785 12.454 12.169 11.899 11.636 11.39 11.158 10.937 10.701 10.483 10.286 10.084 9.869 9.692 9.521 9.344 9.197 9.041 8.896 8.741 8.562 8.433 8.294 8.093 7.957 7.807 7.733 7.57 7.389 7.191 7.089 6.844 6.757 6.633 6.5 6.22 6.075 5.913 5.743 5.535 5.249 4.889 3.47 -4 ,5333 ,TETRA ,17601288,Sun Nov 28 14:34:42 CET,Sun Nov 28 16:25:04 CET,0.0 1.429 1.869 2.237 2.533 2.768 2.967 3.151 3.5 3.672 3.832 3.943 4.224 4.355 4.578 4.801 5.014 5.111 5.288 5.45 5.699 5.857 6.009 6.235 6.446 6.654 6.863 7.052 7.274 7.498 7.717 7.964 8.183 8.404 8.675 8.948 9.202 9.491 9.795 10.136 10.491 10.862 11.267 11.648 12.1 12.588 13.095 13.616 14.172 14.74 15.224 15.304 15.073 14.716 14.374 14.032 13.676 13.337 13.039 12.737 12.48 12.232 11.983 11.746 11.513 11.29 11.059 10.84 10.649 10.47 10.289 10.137 9.975 9.796 9.656 9.512 9.352 9.183 9.01 8.877 8.741 8.536 8.387 8.236 8.158 8.001 7.838 7.652 7.547 7.294 7.218 7.104 6.981 6.694 6.532 6.363 6.174 5.918 5.633 5.294 4.147 -5 ,25963 ,TETRA ,17601289,Sun Nov 28 14:34:39 CET,Sun Nov 28 16:27:41 CET,0.0 0.9 1.324 1.667 1.944 2.197 2.417 2.605 2.95 3.111 3.253 3.364 3.643 3.76 3.988 4.212 4.416 4.508 4.692 4.87 5.113 5.28 5.437 5.659 5.862 6.047 6.249 6.452 6.698 6.919 7.123 7.367 7.625 7.884 8.169 8.49 8.79 9.116 9.463 9.82 10.178 10.548 10.944 11.331 11.809 12.314 12.831 13.373 13.977 14.516 14.852 14.796 14.546 14.247 13.919 13.597 13.288 12.975 12.68 12.37 12.097 11.838 11.575 11.321 11.09 10.875 10.632 10.426 10.25 10.045 9.818 9.633 9.46 9.279 9.133 8.984 8.821 8.642 8.459 8.338 8.211 8.015 7.872 7.72 7.645 7.492 7.34 7.174 7.066 6.791 6.675 6.542 6.402 6.085 5.884 5.661 5.416 5.138 4.775 4.258 2.604 -6 ,6958 ,TETRA ,17601290,Sun Nov 28 14:34:39 CET,Sun Nov 28 16:25:05 CET,0.0 1.096 1.5 1.769 1.995 2.216 2.423 2.605 2.933 3.074 3.203 3.308 3.587 3.705 3.937 4.154 4.352 4.45 4.637 4.803 5.042 5.193 5.334 5.554 5.747 5.926 6.109 6.285 6.522 6.747 6.963 7.221 7.463 7.705 7.974 8.247 8.507 8.8 9.11 9.441 9.774 10.15 10.58 10.976 11.412 11.884 12.388 12.882 13.427 13.96 14.352 14.295 14.011 13.72 13.379 13.007 12.669 12.359 12.075 11.747 11.441 11.169 10.908 10.665 10.44 10.223 9.989 9.786 9.61 9.415 9.208 9.027 8.841 8.653 8.503 8.338 8.148 7.951 7.762 7.643 7.517 7.333 7.2 7.035 6.947 6.769 6.571 6.36 6.25 5.998 5.955 5.86 5.754 5.487 5.313 5.157 4.992 4.766 4.514 4.124 2.881 -7 ,30676 ,TETRA ,17601291,Sun Nov 28 14:34:42 CET,Sun Nov 28 16:25:05 CET,0.0 1.675 2.248 2.629 2.906 3.151 3.369 3.583 3.964 4.108 4.245 4.37 4.643 4.761 5.005 5.216 5.406 5.507 5.708 5.893 6.144 6.309 6.467 6.694 6.91 7.112 7.301 7.475 7.702 7.913 8.12 8.375 8.61 8.845 9.117 9.412 9.683 9.956 10.253 10.58 10.916 11.288 11.712 12.123 12.58 13.079 13.604 14.106 14.651 15.215 15.639 15.604 15.344 15.029 14.705 14.365 14.03 13.692 13.387 13.081 12.792 12.535 12.285 12.03 11.787 11.574 11.347 11.124 10.925 10.719 10.506 10.325 10.14 9.943 9.784 9.612 9.418 9.231 9.062 8.95 8.829 8.635 8.502 8.362 8.29 8.132 7.964 7.795 7.706 7.458 7.393 7.284 7.161 6.926 6.803 6.634 6.431 6.179 5.859 5.457 4.285 -8 ,193 ,TETRA ,17601292,Sun Nov 28 14:34:40 CET,Sun Nov 28 16:24:55 CET,0.0 1.09 1.562 1.928 2.206 2.483 2.752 2.996 3.444 3.646 3.833 3.998 4.278 4.394 4.6 4.798 4.987 5.083 5.28 5.455 5.675 5.829 5.976 6.176 6.376 6.576 6.769 6.953 7.191 7.416 7.636 7.904 8.154 8.389 8.651 8.939 9.219 9.513 9.821 10.138 10.477 10.849 11.255 11.664 12.108 12.587 13.124 13.643 14.191 14.768 15.119 15.117 14.948 14.704 14.392 14.053 13.725 13.379 13.064 12.742 12.446 12.167 11.905 11.671 11.453 11.237 11.002 10.795 10.6 10.378 10.16 9.978 9.787 9.593 9.433 9.269 9.113 8.955 8.783 8.647 8.497 8.28 8.133 7.976 7.891 7.71 7.515 7.308 7.199 6.942 6.867 6.752 6.624 6.317 6.146 5.964 5.775 5.577 5.321 4.913 3.588 -9 ,2555 ,TETRA ,17601293,Sun Nov 28 14:34:42 CET,Sun Nov 28 16:24:10 CET,0.0 2.771 3.382 3.786 4.119 4.429 4.687 4.907 5.309 5.476 5.64 5.796 6.078 6.207 6.465 6.689 6.913 7.023 7.216 7.395 7.653 7.814 7.963 8.181 8.381 8.572 8.758 8.928 9.152 9.376 9.603 9.881 10.135 10.372 10.636 10.928 11.215 11.528 11.849 12.182 12.525 12.89 13.316 13.733 14.18 14.66 15.198 15.733 16.308 16.866 17.241 17.232 16.976 16.639 16.277 15.928 15.603 15.307 15.041 14.73 14.441 14.182 13.938 13.688 13.464 13.253 13.018 12.815 12.633 12.435 12.232 12.068 11.888 11.709 11.579 11.436 11.276 11.112 10.939 10.819 10.681 10.448 10.28 10.102 10.011 9.814 9.59 9.334 9.208 8.946 8.84 8.695 8.542 8.244 8.086 7.875 7.601 7.31 6.999 6.586 5.393 -10 ,17034 ,TETRA ,17601294,Sun Nov 28 14:34:44 CET,Sun Nov 28 16:24:34 CET,0.0 1.505 2.131 2.613 2.968 3.25 3.496 3.718 4.103 4.281 4.454 4.649 4.969 5.128 5.428 5.709 5.976 6.097 6.328 6.566 6.889 7.056 7.201 7.424 7.636 7.829 8.013 8.192 8.447 8.689 8.908 9.174 9.415 9.646 9.916 10.223 10.514 10.83 11.155 11.473 11.81 12.179 12.591 12.99 13.421 13.889 14.401 14.918 15.465 15.986 16.375 16.336 16.088 15.796 15.447 15.075 14.711 14.359 14.072 13.794 13.528 13.279 13.037 12.796 12.569 12.35 12.106 11.899 11.72 11.529 11.328 11.149 10.974 10.79 10.627 10.458 10.297 10.141 9.962 9.827 9.696 9.507 9.368 9.204 9.118 8.946 8.766 8.575 8.479 8.24 8.201 8.095 7.985 7.732 7.572 7.388 7.207 7.002 6.77 6.439 5.138 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_42_51.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_42_51.txt deleted file mode 100644 index d95de9c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_42_51.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8049 ,TETRA ,17601295,Sun Nov 28 14:34:46 CET,Sun Nov 28 16:24:05 CET,0.0 2.453 3.002 3.385 3.758 4.093 4.346 4.573 4.982 5.169 5.357 5.544 5.855 6.01 6.287 6.555 6.83 6.959 7.195 7.415 7.716 7.915 8.116 8.4 8.657 8.898 9.136 9.367 9.653 9.927 10.19 10.501 10.816 11.136 11.506 11.887 12.221 12.594 12.997 13.402 13.829 14.313 14.867 15.384 15.96 16.556 17.186 17.893 18.647 19.381 19.999 20.222 20.115 19.878 19.575 19.246 18.945 18.631 18.339 18.04 17.772 17.529 17.286 17.042 16.8 16.57 16.331 16.124 15.945 15.761 15.564 15.402 15.229 15.043 14.895 14.741 14.59 14.443 14.275 14.149 14.015 13.79 13.626 13.464 13.382 13.194 12.983 12.767 12.663 12.41 12.293 12.132 11.979 11.673 11.494 11.315 11.134 10.927 10.677 10.253 8.853 -2 ,2107 ,TETRA ,17601296,Sun Nov 28 14:34:41 CET,Sun Nov 28 16:25:06 CET,0.0 1.908 2.385 2.744 3.059 3.335 3.54 3.712 4.048 4.216 4.381 4.508 4.784 4.913 5.175 5.429 5.669 5.79 6.02 6.237 6.548 6.746 6.947 7.235 7.517 7.791 8.037 8.269 8.571 8.867 9.135 9.447 9.747 10.024 10.334 10.662 10.973 11.32 11.692 12.076 12.465 12.897 13.4 13.895 14.444 15.055 15.745 16.508 17.312 18.033 18.616 18.788 18.656 18.39 18.063 17.706 17.372 17.034 16.702 16.38 16.085 15.78 15.497 15.272 15.065 14.86 14.643 14.439 14.269 14.089 13.887 13.723 13.54 13.353 13.206 13.044 12.886 12.721 12.523 12.38 12.242 12.027 11.885 11.741 11.665 11.502 11.333 11.167 11.086 10.844 10.723 10.587 10.442 10.089 9.9 9.706 9.43 9.045 8.594 8.118 4.349 -3 ,23029 ,TETRA ,17601297,Sun Nov 28 14:34:46 CET,Sun Nov 28 16:25:07 CET,0.0 1.806 2.225 2.561 2.873 3.157 3.404 3.625 3.973 4.148 4.331 4.501 4.799 4.951 5.236 5.479 5.714 5.834 6.076 6.307 6.632 6.833 7.018 7.274 7.521 7.765 7.991 8.211 8.489 8.765 9.063 9.41 9.717 10.002 10.328 10.69 11.03 11.401 11.806 12.211 12.616 13.078 13.617 14.141 14.691 15.282 15.968 16.711 17.473 18.234 18.945 19.181 19.086 18.817 18.483 18.127 17.793 17.495 17.241 16.951 16.648 16.329 16.033 15.795 15.576 15.365 15.139 14.938 14.748 14.508 14.242 14.038 13.814 13.571 13.389 13.206 13.024 12.83 12.606 12.46 12.323 12.108 11.955 11.775 11.679 11.49 11.281 11.039 10.923 10.669 10.57 10.44 10.307 10.036 9.864 9.674 9.456 9.196 8.9 8.492 6.451 -4 ,2795 ,TETRA ,17601298,Sun Nov 28 14:34:42 CET,Sun Nov 28 16:26:13 CET,0.0 3.47 4.194 4.664 4.97 5.218 5.452 5.686 6.1 6.28 6.449 6.632 6.944 7.092 7.367 7.614 7.847 7.963 8.181 8.385 8.694 8.895 9.074 9.335 9.589 9.825 10.048 10.274 10.58 10.877 11.144 11.448 11.763 12.067 12.41 12.79 13.135 13.521 13.927 14.355 14.816 15.288 15.806 16.31 16.852 17.461 18.173 18.918 19.666 20.389 21.057 21.314 21.235 20.967 20.659 20.306 19.957 19.686 19.436 19.151 18.901 18.656 18.366 18.075 17.837 17.636 17.414 17.202 17.022 16.828 16.629 16.479 16.316 16.133 15.994 15.848 15.681 15.506 15.338 15.227 15.113 14.911 14.76 14.605 14.517 14.313 14.117 13.936 13.843 13.596 13.517 13.409 13.276 12.969 12.82 12.665 12.474 12.217 11.915 11.519 10.052 -5 ,26029 ,TETRA ,17601299,Sun Nov 28 14:34:45 CET,Sun Nov 28 16:26:02 CET,0.0 3.521 4.072 4.463 4.794 5.079 5.336 5.584 6.004 6.195 6.385 6.572 6.887 7.038 7.294 7.543 7.784 7.898 8.094 8.268 8.53 8.708 8.89 9.165 9.407 9.61 9.816 10.014 10.259 10.497 10.733 11.01 11.272 11.53 11.807 12.115 12.415 12.722 13.058 13.424 13.794 14.207 14.699 15.178 15.71 16.26 16.883 17.569 18.31 19.081 19.747 19.976 19.863 19.648 19.404 19.139 18.858 18.554 18.267 17.963 17.699 17.436 17.176 16.953 16.742 16.532 16.289 16.073 15.895 15.712 15.523 15.367 15.18 14.966 14.796 14.609 14.408 14.205 13.993 13.842 13.696 13.477 13.314 13.141 13.053 12.853 12.634 12.402 12.282 12.025 11.939 11.796 11.641 11.335 11.177 11.008 10.828 10.638 10.383 10.012 7.72 -6 ,30042 ,TETRA ,17601300,Sun Nov 28 14:34:41 CET,Sun Nov 28 16:25:03 CET,0.0 2.169 2.703 3.051 3.339 3.568 3.769 3.951 4.258 4.409 4.573 4.715 4.999 5.128 5.377 5.612 5.835 5.937 6.12 6.307 6.585 6.764 6.948 7.215 7.454 7.677 7.888 8.086 8.358 8.626 8.872 9.162 9.458 9.748 10.087 10.474 10.834 11.202 11.603 12.037 12.457 12.944 13.5 13.983 14.53 15.131 15.783 16.44 17.18 17.976 18.708 19.018 18.95 18.72 18.429 18.111 17.752 17.356 17.041 16.759 16.493 16.254 16.022 15.787 15.542 15.28 14.999 14.791 14.625 14.432 14.218 14.059 13.901 13.706 13.551 13.394 13.234 13.064 12.886 12.763 12.63 12.418 12.276 12.119 12.025 11.831 11.66 11.485 11.388 11.153 11.082 10.957 10.807 10.474 10.301 10.084 9.84 9.555 9.198 8.742 6.389 -7 ,15918 ,TETRA ,17601301,Sun Nov 28 14:34:44 CET,Sun Nov 28 16:24:57 CET,0.0 1.364 1.755 2.114 2.433 2.702 2.925 3.124 3.542 3.736 3.903 4.085 4.405 4.557 4.824 5.092 5.349 5.478 5.721 5.937 6.234 6.426 6.629 6.914 7.166 7.414 7.657 7.898 8.2 8.48 8.746 9.068 9.37 9.653 9.995 10.37 10.718 11.093 11.489 11.894 12.319 12.816 13.357 13.876 14.44 14.988 15.576 16.221 16.947 17.702 18.336 18.467 18.323 18.092 17.796 17.486 17.19 16.884 16.585 16.255 15.951 15.675 15.39 15.145 14.939 14.726 14.504 14.307 14.126 13.94 13.746 13.57 13.366 13.153 12.997 12.829 12.654 12.487 12.306 12.157 11.992 11.767 11.623 11.464 11.381 11.209 11.033 10.836 10.724 10.465 10.379 10.248 10.115 9.828 9.652 9.458 9.231 8.984 8.691 8.336 6.93 -8 ,25644 ,TETRA ,17601302,Sun Nov 28 14:34:46 CET,Sun Nov 28 16:25:03 CET,0.0 2.9 3.673 4.103 4.454 4.735 4.999 5.267 5.723 5.923 6.102 6.27 6.578 6.732 7.032 7.307 7.548 7.665 7.888 8.095 8.388 8.578 8.76 9.028 9.286 9.525 9.764 9.999 10.275 10.539 10.801 11.096 11.369 11.654 11.994 12.345 12.689 13.071 13.48 13.926 14.373 14.855 15.393 15.89 16.446 17.044 17.731 18.475 19.209 19.944 20.544 20.719 20.631 20.461 20.196 19.867 19.549 19.212 18.91 18.615 18.345 18.093 17.868 17.632 17.378 17.16 16.951 16.768 16.598 16.409 16.227 16.069 15.897 15.711 15.555 15.399 15.244 15.067 14.886 14.773 14.655 14.467 14.338 14.197 14.122 13.956 13.786 13.618 13.529 13.288 13.211 13.1 12.988 12.71 12.539 12.344 12.143 11.935 11.646 11.281 9.356 -9 ,5418 ,TETRA ,17601303,Sun Nov 28 14:34:47 CET,Sun Nov 28 16:25:04 CET,0.0 3.674 4.091 4.409 4.7 4.994 5.272 5.523 5.953 6.126 6.282 6.453 6.749 6.875 7.119 7.361 7.612 7.731 7.974 8.216 8.542 8.757 8.97 9.268 9.529 9.766 9.998 10.22 10.497 10.762 11.015 11.32 11.6 11.856 12.149 12.474 12.791 13.146 13.517 13.902 14.338 14.804 15.342 15.892 16.5 17.116 17.74 18.426 19.188 19.946 20.589 20.802 20.689 20.455 20.149 19.802 19.464 19.149 18.856 18.539 18.256 18.002 17.748 17.471 17.218 17.01 16.793 16.599 16.429 16.246 16.047 15.879 15.702 15.513 15.359 15.213 15.066 14.904 14.719 14.58 14.44 14.231 14.082 13.921 13.841 13.677 13.495 13.291 13.18 12.922 12.852 12.741 12.594 12.297 12.152 11.982 11.788 11.568 11.285 10.851 9.827 -10 ,19547 ,TETRA ,17601304,Sun Nov 28 14:34:42 CET,Sun Nov 28 16:24:27 CET,0.0 1.595 2.046 2.424 2.792 3.089 3.333 3.568 4.011 4.201 4.378 4.549 4.836 4.956 5.186 5.421 5.64 5.758 6.003 6.228 6.532 6.716 6.888 7.131 7.373 7.61 7.838 8.057 8.347 8.628 8.893 9.21 9.514 9.811 10.153 10.544 10.902 11.265 11.666 12.084 12.491 12.953 13.497 14.014 14.588 15.187 15.869 16.593 17.317 18.077 18.737 19.004 18.893 18.647 18.375 18.051 17.693 17.357 17.059 16.74 16.48 16.231 15.978 15.711 15.435 15.205 14.958 14.715 14.5 14.28 14.057 13.868 13.68 13.509 13.378 13.229 13.055 12.872 12.696 12.578 12.45 12.245 12.119 11.991 11.91 11.742 11.592 11.411 11.289 11.022 10.92 10.783 10.66 10.393 10.266 10.134 9.948 9.698 9.396 8.996 7.671 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_42_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_42_54.txt deleted file mode 100644 index 2d189a23..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_42_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22892 ,TETRA ,17601305,Sun Nov 28 14:34:42 CET,Sun Nov 28 16:24:15 CET,0.0 1.236 1.715 2.024 2.259 2.463 2.646 2.807 3.072 3.197 3.317 3.397 3.652 3.745 3.931 4.135 4.347 4.444 4.614 4.767 4.975 5.118 5.251 5.431 5.607 5.773 5.919 6.05 6.223 6.401 6.579 6.789 6.977 7.135 7.302 7.515 7.717 7.913 8.127 8.348 8.57 8.801 9.05 9.276 9.506 9.718 9.931 10.125 10.213 10.126 9.603 8.659 7.798 7.011 6.285 5.596 5.006 4.496 4.044 3.591 3.202 2.833 2.48 2.149 1.842 1.56 1.247 0.967 0.736 0.505 0.264 0.054 -0.184 -0.445 -0.648 -0.867 -1.097 -1.334 -1.586 -1.758 -1.925 -2.191 -2.375 -2.566 -2.668 -2.89 -3.116 -3.341 -3.461 -3.744 -3.864 -4.005 -4.15 -4.478 -4.642 -4.817 -5.014 -5.249 -5.531 -5.881 -6.579 -2 ,17723 ,TETRA ,17601306,Sun Nov 28 14:34:43 CET,Sun Nov 28 16:25:53 CET,0.0 1.096 1.487 1.804 2.095 2.322 2.522 2.706 2.993 3.114 3.227 3.304 3.572 3.687 3.927 4.146 4.336 4.422 4.578 4.717 4.925 5.065 5.196 5.376 5.545 5.708 5.868 6.023 6.207 6.368 6.527 6.715 6.907 7.095 7.29 7.505 7.695 7.891 8.123 8.361 8.593 8.858 9.134 9.358 9.604 9.844 10.061 10.26 10.349 10.205 9.697 8.776 7.878 7.055 6.331 5.685 5.127 4.607 4.163 3.713 3.313 2.944 2.595 2.286 1.966 1.668 1.372 1.096 0.861 0.622 0.376 0.175 -0.037 -0.273 -0.455 -0.637 -0.841 -1.058 -1.268 -1.408 -1.552 -1.774 -1.928 -2.106 -2.202 -2.392 -2.588 -2.785 -2.883 -3.135 -3.193 -3.332 -3.472 -3.775 -3.963 -4.162 -4.377 -4.643 -4.918 -5.203 -5.706 -3 ,29235 ,TETRA ,17601307,Sun Nov 28 14:34:45 CET,Sun Nov 28 16:25:23 CET,0.0 1.12 1.543 1.857 2.111 2.311 2.497 2.667 2.973 3.104 3.233 3.323 3.574 3.675 3.874 4.073 4.253 4.332 4.488 4.648 4.863 4.997 5.137 5.326 5.5 5.673 5.835 5.989 6.183 6.365 6.531 6.727 6.923 7.107 7.3 7.515 7.72 7.938 8.165 8.396 8.632 8.896 9.174 9.404 9.653 9.874 10.056 10.217 10.3 10.227 9.783 8.884 7.998 7.184 6.454 5.804 5.225 4.684 4.222 3.752 3.339 2.972 2.62 2.287 1.981 1.703 1.397 1.114 0.865 0.624 0.383 0.178 -0.036 -0.269 -0.447 -0.628 -0.814 -1.022 -1.245 -1.391 -1.535 -1.758 -1.919 -2.068 -2.143 -2.316 -2.499 -2.702 -2.812 -3.074 -3.147 -3.282 -3.428 -3.714 -3.864 -4.02 -4.192 -4.406 -4.659 -4.961 -5.615 -4 ,32055 ,TETRA ,17601308,Sun Nov 28 14:34:43 CET,Sun Nov 28 16:24:17 CET,0.0 0.943 1.351 1.655 1.877 2.077 2.288 2.499 2.805 2.915 3.033 3.11 3.362 3.463 3.664 3.849 4.022 4.108 4.273 4.436 4.658 4.791 4.921 5.118 5.306 5.483 5.648 5.797 6.001 6.185 6.353 6.558 6.754 6.924 7.113 7.352 7.577 7.812 8.046 8.279 8.495 8.711 8.963 9.205 9.449 9.681 9.907 10.09 10.196 10.117 9.647 8.791 7.945 7.182 6.5 5.848 5.265 4.739 4.275 3.785 3.366 3.012 2.663 2.328 2.017 1.731 1.429 1.158 0.929 0.675 0.397 0.185 -0.018 -0.229 -0.402 -0.577 -0.742 -0.927 -1.13 -1.277 -1.428 -1.668 -1.843 -2.007 -2.087 -2.265 -2.445 -2.644 -2.759 -3.026 -3.095 -3.214 -3.342 -3.646 -3.813 -3.972 -4.176 -4.428 -4.727 -5.125 -5.892 -5 ,24302 ,TETRA ,17601309,Sun Nov 28 14:34:45 CET,Sun Nov 28 16:24:17 CET,0.0 0.928 1.291 1.542 1.758 1.955 2.138 2.306 2.579 2.71 2.835 2.91 3.166 3.262 3.437 3.601 3.762 3.847 4.01 4.156 4.371 4.501 4.62 4.795 4.98 5.155 5.312 5.47 5.669 5.847 6.015 6.209 6.387 6.566 6.773 6.99 7.176 7.388 7.618 7.834 8.045 8.276 8.536 8.776 9.033 9.292 9.52 9.69 9.789 9.698 9.249 8.359 7.453 6.661 5.959 5.315 4.74 4.208 3.742 3.269 2.846 2.464 2.097 1.742 1.414 1.109 0.794 0.531 0.298 0.046 -0.204 -0.4 -0.607 -0.829 -0.998 -1.174 -1.363 -1.565 -1.763 -1.894 -2.038 -2.273 -2.44 -2.614 -2.716 -2.926 -3.131 -3.349 -3.462 -3.743 -3.802 -3.904 -4.029 -4.295 -4.435 -4.596 -4.786 -5.015 -5.273 -5.571 -6.587 -6 ,13657 ,TETRA ,17601310,Sun Nov 28 14:34:47 CET,Sun Nov 28 16:24:42 CET,0.0 1.374 1.852 2.19 2.502 2.841 3.161 3.448 3.941 4.132 4.265 4.316 4.565 4.668 4.879 5.087 5.285 5.376 5.551 5.727 5.972 6.123 6.262 6.465 6.655 6.826 6.981 7.121 7.3 7.482 7.652 7.858 8.064 8.252 8.447 8.64 8.828 9.037 9.258 9.475 9.686 9.916 10.19 10.445 10.697 10.945 11.153 11.334 11.401 11.256 10.759 9.843 8.93 8.086 7.323 6.639 6.059 5.52 5.044 4.587 4.201 3.837 3.485 3.164 2.868 2.597 2.304 2.043 1.815 1.571 1.314 1.1 0.887 0.661 0.483 0.308 0.12 -0.076 -0.274 -0.413 -0.553 -0.768 -0.924 -1.095 -1.184 -1.353 -1.551 -1.769 -1.877 -2.145 -2.223 -2.349 -2.477 -2.743 -2.89 -3.053 -3.251 -3.466 -3.699 -3.985 -4.619 -7 ,14791 ,TETRA ,17601311,Sun Nov 28 14:34:49 CET,Sun Nov 28 16:24:37 CET,0.0 1.156 1.549 1.809 2.049 2.273 2.463 2.622 2.916 3.056 3.181 3.269 3.527 3.629 3.822 4.024 4.225 4.313 4.481 4.623 4.823 4.964 5.093 5.274 5.45 5.61 5.764 5.921 6.126 6.315 6.473 6.674 6.871 7.04 7.234 7.449 7.646 7.857 8.073 8.305 8.543 8.776 9.022 9.234 9.477 9.717 9.95 10.183 10.298 10.242 9.817 8.973 8.146 7.358 6.625 5.911 5.296 4.786 4.344 3.882 3.491 3.14 2.783 2.451 2.143 1.851 1.564 1.313 1.083 0.836 0.582 0.374 0.155 -0.075 -0.25 -0.433 -0.628 -0.831 -1.04 -1.182 -1.323 -1.534 -1.684 -1.844 -1.931 -2.124 -2.315 -2.504 -2.609 -2.879 -2.956 -3.087 -3.217 -3.486 -3.641 -3.813 -4.001 -4.224 -4.513 -4.889 -5.586 -8 ,32708 ,TETRA ,17601312,Sun Nov 28 14:35:09 CET,Sun Nov 28 16:26:01 CET,0.0 1.195 1.686 1.991 2.216 2.42 2.612 2.789 3.111 3.261 3.407 3.518 3.775 3.875 4.074 4.26 4.433 4.511 4.67 4.826 5.029 5.151 5.27 5.444 5.608 5.77 5.924 6.061 6.235 6.412 6.582 6.777 6.969 7.168 7.391 7.607 7.806 8.019 8.239 8.482 8.725 8.97 9.205 9.408 9.646 9.881 10.105 10.307 10.409 10.284 9.772 8.905 8.052 7.279 6.566 5.916 5.36 4.796 4.286 3.793 3.368 3.0 2.65 2.33 2.029 1.74 1.443 1.193 0.977 0.735 0.481 0.276 0.062 -0.169 -0.346 -0.527 -0.716 -0.919 -1.131 -1.266 -1.408 -1.638 -1.797 -1.959 -2.04 -2.211 -2.402 -2.607 -2.714 -2.985 -3.07 -3.198 -3.333 -3.623 -3.785 -3.95 -4.126 -4.358 -4.633 -5.011 -6.141 -9 ,15390 ,TETRA ,17601313,Sun Nov 28 14:35:09 CET,Sun Nov 28 16:26:00 CET,0.0 1.172 1.567 1.868 2.129 2.368 2.56 2.721 3.043 3.19 3.31 3.401 3.667 3.768 3.963 4.157 4.336 4.419 4.584 4.736 4.948 5.084 5.21 5.385 5.556 5.718 5.857 5.995 6.17 6.33 6.493 6.68 6.85 7.019 7.213 7.418 7.605 7.809 8.017 8.225 8.431 8.637 8.867 9.079 9.309 9.543 9.756 9.948 10.043 9.945 9.451 8.534 7.663 6.893 6.208 5.587 4.997 4.454 4.0 3.529 3.114 2.748 2.408 2.088 1.781 1.496 1.2 0.931 0.698 0.459 0.205 -0.005 -0.213 -0.428 -0.603 -0.786 -0.97 -1.156 -1.354 -1.493 -1.643 -1.866 -2.025 -2.204 -2.291 -2.471 -2.672 -2.89 -3.0 -3.28 -3.363 -3.481 -3.607 -3.859 -4.014 -4.194 -4.383 -4.589 -4.832 -5.224 -6.254 -10 ,8400 ,TETRA ,17601314,Sun Nov 28 14:35:10 CET,Sun Nov 28 16:26:01 CET,0.0 1.29 1.716 1.971 2.199 2.433 2.645 2.803 3.048 3.178 3.305 3.394 3.662 3.766 3.961 4.156 4.34 4.42 4.577 4.735 4.934 5.055 5.173 5.357 5.543 5.714 5.865 6.005 6.191 6.364 6.533 6.739 6.911 7.067 7.252 7.466 7.676 7.9 8.13 8.378 8.616 8.864 9.152 9.416 9.686 9.928 10.136 10.293 10.376 10.301 9.821 8.951 8.081 7.269 6.562 5.917 5.353 4.827 4.354 3.876 3.463 3.099 2.755 2.428 2.122 1.853 1.567 1.292 1.043 0.785 0.532 0.32 0.091 -0.143 -0.324 -0.514 -0.706 -0.898 -1.101 -1.251 -1.393 -1.605 -1.763 -1.926 -2.01 -2.203 -2.415 -2.654 -2.775 -3.041 -3.135 -3.29 -3.455 -3.785 -3.966 -4.149 -4.357 -4.598 -4.875 -5.224 -6.403 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_43_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_43_42.txt deleted file mode 100644 index ca37e004..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_43_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6651 ,KEBNE ,17027197,Wed Dec 22 16:21:25 CET,Wed Dec 22 17:55:52 CET,0.0 1.75 2.358 2.769 3.054 3.278 3.48 3.686 4.079 4.253 4.428 4.602 4.91 5.049 5.311 5.551 5.774 5.885 6.095 6.298 6.577 6.762 6.95 7.207 7.464 7.712 7.924 8.128 8.404 8.661 8.907 9.23 9.553 9.845 10.159 10.519 10.879 11.256 11.65 12.095 12.554 13.046 13.635 14.208 14.839 15.548 16.371 17.273 18.311 19.411 20.481 21.126 21.3 21.276 21.18 21.01 20.756 20.473 20.212 19.929 19.669 19.425 19.185 18.959 18.742 18.523 18.272 18.033 17.846 17.671 17.466 17.295 17.113 16.898 16.729 16.557 16.369 16.181 15.991 15.844 15.691 15.44 15.26 15.079 14.988 14.792 14.576 14.345 14.221 13.937 13.794 13.628 13.464 13.082 12.868 12.661 12.395 12.053 11.675 11.216 9.455 -2 ,3399 ,KEBNE ,17027198,Wed Dec 22 16:21:25 CET,Wed Dec 22 17:55:51 CET,0.0 1.928 2.489 2.831 3.085 3.336 3.556 3.777 4.203 4.372 4.52 4.638 4.924 5.049 5.317 5.554 5.776 5.885 6.088 6.285 6.57 6.755 6.935 7.185 7.427 7.655 7.866 8.076 8.352 8.616 8.869 9.176 9.469 9.751 10.072 10.426 10.784 11.181 11.58 12.01 12.453 12.946 13.533 14.114 14.768 15.47 16.265 17.112 18.067 19.124 20.147 20.795 21.036 20.998 20.885 20.736 20.552 20.352 20.125 19.867 19.638 19.432 19.212 18.98 18.755 18.532 18.29 18.07 17.858 17.641 17.442 17.279 17.076 16.843 16.671 16.5 16.317 16.126 15.936 15.796 15.649 15.421 15.25 15.072 14.984 14.794 14.603 14.415 14.296 14.009 13.879 13.73 13.576 13.206 12.966 12.711 12.453 12.162 11.846 11.414 9.58 -3 ,26426 ,KEBNE ,17027199,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:56:45 CET,0.0 1.928 2.446 2.781 3.043 3.274 3.492 3.696 4.085 4.254 4.411 4.55 4.854 4.986 5.231 5.468 5.687 5.8 6.013 6.202 6.479 6.65 6.828 7.094 7.335 7.577 7.809 8.033 8.311 8.588 8.864 9.159 9.445 9.748 10.094 10.456 10.794 11.156 11.54 11.945 12.384 12.886 13.45 14.024 14.685 15.39 16.18 17.066 18.033 19.042 20.042 20.673 20.924 20.928 20.805 20.659 20.452 20.19 19.943 19.667 19.386 19.108 18.841 18.577 18.342 18.135 17.894 17.677 17.493 17.295 17.073 16.889 16.697 16.49 16.33 16.149 15.953 15.732 15.479 15.304 15.136 14.885 14.704 14.503 14.394 14.181 13.961 13.725 13.601 13.319 13.174 13.021 12.863 12.449 12.21 11.944 11.624 11.278 10.864 10.31 8.54 -4 ,12023 ,KEBNE ,17027200,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:55:49 CET,0.0 1.684 2.254 2.699 3.058 3.378 3.673 3.937 4.396 4.612 4.815 5.038 5.391 5.568 5.893 6.214 6.504 6.641 6.916 7.166 7.505 7.721 7.933 8.229 8.508 8.758 8.987 9.205 9.477 9.737 9.98 10.295 10.598 10.884 11.21 11.561 11.909 12.284 12.665 13.088 13.518 13.974 14.528 15.106 15.773 16.496 17.291 18.16 19.117 20.147 21.252 21.875 22.071 22.094 21.951 21.721 21.4 21.01 20.661 20.267 19.926 19.626 19.323 19.043 18.773 18.524 18.28 18.04 17.807 17.555 17.273 17.023 16.762 16.492 16.268 16.049 15.817 15.551 15.268 15.076 14.884 14.56 14.35 14.131 13.999 13.757 13.531 13.259 13.103 12.797 12.636 12.463 12.282 11.86 11.596 11.309 10.975 10.59 10.115 9.504 7.479 -5 ,19017 ,KEBNE ,17027201,Wed Dec 22 16:21:26 CET,Wed Dec 22 17:57:19 CET,0.0 1.748 2.318 2.752 3.122 3.414 3.679 3.924 4.38 4.584 4.752 4.896 5.206 5.342 5.594 5.852 6.112 6.239 6.471 6.685 6.985 7.163 7.342 7.614 7.863 8.11 8.352 8.568 8.833 9.085 9.338 9.642 9.931 10.219 10.549 10.896 11.231 11.632 12.067 12.52 12.986 13.489 14.061 14.63 15.291 16.007 16.783 17.612 18.566 19.634 20.753 21.432 21.581 21.523 21.388 21.21 21.008 20.78 20.522 20.218 19.94 19.693 19.438 19.191 18.972 18.747 18.499 18.29 18.115 17.92 17.698 17.5 17.282 17.066 16.911 16.733 16.543 16.369 16.177 16.028 15.881 15.666 15.513 15.341 15.251 15.065 14.852 14.632 14.518 14.238 14.111 13.967 13.816 13.487 13.307 13.081 12.786 12.414 11.981 11.519 9.747 -6 ,7276 ,KEBNE ,17027202,Wed Dec 22 16:21:27 CET,Wed Dec 22 17:55:54 CET,0.0 2.129 2.622 2.983 3.28 3.534 3.755 3.956 4.322 4.477 4.621 4.751 5.056 5.203 5.469 5.698 5.928 6.038 6.25 6.463 6.759 6.941 7.115 7.361 7.603 7.85 8.081 8.289 8.553 8.822 9.077 9.373 9.669 9.947 10.269 10.629 10.979 11.347 11.732 12.169 12.63 13.127 13.68 14.212 14.837 15.563 16.391 17.294 18.299 19.37 20.499 21.239 21.457 21.431 21.294 21.08 20.834 20.6 20.374 20.113 19.833 19.581 19.351 19.113 18.888 18.687 18.473 18.266 18.074 17.88 17.679 17.498 17.288 17.062 16.899 16.742 16.575 16.382 16.161 16.001 15.83 15.54 15.351 15.164 15.063 14.862 14.651 14.42 14.296 14.005 13.868 13.727 13.584 13.274 13.076 12.862 12.635 12.355 12.014 11.451 9.505 -7 ,24063 ,KEBNE ,17027203,Wed Dec 22 16:21:25 CET,Wed Dec 22 17:56:58 CET,0.0 2.471 3.02 3.46 3.816 4.087 4.322 4.526 4.901 5.081 5.246 5.363 5.656 5.79 6.06 6.316 6.553 6.67 6.887 7.092 7.395 7.583 7.751 7.997 8.231 8.451 8.673 8.902 9.19 9.437 9.674 9.965 10.252 10.53 10.839 11.188 11.522 11.893 12.29 12.696 13.128 13.622 14.199 14.774 15.429 16.114 16.906 17.781 18.72 19.768 20.891 21.595 21.774 21.69 21.512 21.307 21.08 20.855 20.628 20.383 20.156 19.916 19.668 19.432 19.188 18.956 18.722 18.498 18.301 18.088 17.853 17.657 17.45 17.234 17.073 16.907 16.719 16.514 16.293 16.143 15.997 15.745 15.57 15.403 15.315 15.107 14.859 14.583 14.436 14.138 13.995 13.84 13.687 13.343 13.144 12.903 12.638 12.348 11.931 11.373 9.866 -8 ,7605 ,KEBNE ,17027204,Wed Dec 22 16:21:27 CET,Wed Dec 22 17:56:35 CET,0.0 1.945 2.442 2.836 3.132 3.364 3.572 3.78 4.185 4.363 4.51 4.627 4.923 5.064 5.326 5.578 5.82 5.92 6.108 6.293 6.575 6.778 6.973 7.24 7.491 7.722 7.935 8.14 8.417 8.683 8.942 9.249 9.548 9.831 10.139 10.498 10.839 11.203 11.602 12.022 12.44 12.913 13.515 14.118 14.762 15.477 16.293 17.108 17.976 19.005 20.148 20.777 20.957 20.928 20.794 20.633 20.412 20.14 19.872 19.599 19.365 19.143 18.917 18.701 18.465 18.232 17.99 17.778 17.604 17.415 17.22 17.056 16.882 16.688 16.523 16.349 16.169 15.974 15.772 15.632 15.489 15.266 15.096 14.922 14.833 14.63 14.426 14.219 14.101 13.824 13.7 13.544 13.377 13.029 12.839 12.65 12.397 12.088 11.727 11.206 9.497 -9 ,17954 ,KEBNE ,17027205,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:08:08 CET,0.0 1.821 2.381 2.779 3.154 3.495 3.759 3.985 4.409 4.59 4.75 4.882 5.187 5.33 5.59 5.826 6.048 6.156 6.374 6.581 6.86 7.039 7.21 7.455 7.698 7.931 8.157 8.368 8.645 8.924 9.174 9.471 9.774 10.057 10.369 10.724 11.063 11.415 11.816 12.253 12.681 13.171 13.748 14.292 14.922 15.622 16.411 17.274 18.192 19.231 20.302 20.896 21.093 21.082 20.956 20.73 20.44 20.136 19.871 19.616 19.363 19.104 18.845 18.586 18.354 18.152 17.919 17.703 17.524 17.322 17.111 16.927 16.716 16.502 16.341 16.16 15.955 15.757 15.562 15.412 15.258 15.015 14.842 14.661 14.566 14.375 14.183 13.957 13.842 13.573 13.444 13.306 13.154 12.771 12.563 12.359 12.124 11.864 11.554 11.138 9.282 -10 ,18073 ,KEBNE ,17027206,Wed Dec 22 16:32:47 CET,Wed Dec 22 18:08:58 CET,0.0 1.865 2.415 2.785 3.102 3.368 3.574 3.757 4.105 4.276 4.439 4.583 4.895 5.034 5.295 5.546 5.769 5.874 6.074 6.275 6.574 6.759 6.934 7.181 7.434 7.669 7.904 8.135 8.406 8.659 8.913 9.231 9.536 9.825 10.148 10.485 10.808 11.175 11.554 11.971 12.429 12.918 13.466 14.013 14.659 15.356 16.077 16.866 17.797 18.823 19.876 20.529 20.766 20.798 20.691 20.521 20.294 20.033 19.776 19.479 19.222 18.998 18.743 18.48 18.246 18.017 17.746 17.509 17.312 17.102 16.894 16.705 16.484 16.244 16.056 15.865 15.673 15.477 15.254 15.091 14.918 14.642 14.45 14.244 14.142 13.93 13.679 13.426 13.306 13.021 12.862 12.694 12.503 12.089 11.871 11.636 11.379 11.086 10.701 10.177 8.331 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_45_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_45_42.txt deleted file mode 100644 index dcfb0329..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_45_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8759 ,TETRA ,17601315,Sun Nov 28 14:35:12 CET,Sun Nov 28 16:26:18 CET,0.0 1.053 1.487 1.774 1.972 2.158 2.328 2.502 2.836 2.981 3.128 3.229 3.487 3.594 3.79 3.973 4.157 4.248 4.424 4.596 4.84 4.998 5.155 5.365 5.556 5.745 5.923 6.097 6.299 6.484 6.688 6.937 7.173 7.394 7.628 7.885 8.13 8.399 8.676 8.964 9.282 9.624 10.006 10.393 10.82 11.266 11.741 12.218 12.731 13.22 13.561 13.541 13.339 13.025 12.633 12.227 11.855 11.486 11.154 10.822 10.508 10.19 9.872 9.58 9.32 9.087 8.824 8.56 8.335 8.115 7.887 7.7 7.488 7.273 7.107 6.927 6.74 6.543 6.336 6.192 6.045 5.815 5.649 5.462 5.366 5.169 4.978 4.774 4.651 4.368 4.257 4.12 3.975 3.659 3.469 3.262 3.046 2.789 2.494 2.092 0.497 -2 ,14765 ,TETRA ,17601316,Sun Nov 28 14:35:09 CET,Sun Nov 28 16:26:59 CET,0.0 0.652 1.004 1.26 1.482 1.681 1.871 2.046 2.324 2.457 2.592 2.675 2.938 3.043 3.259 3.457 3.629 3.714 3.891 4.048 4.253 4.382 4.51 4.704 4.881 5.055 5.226 5.402 5.635 5.849 6.034 6.244 6.456 6.661 6.896 7.144 7.38 7.637 7.904 8.208 8.539 8.895 9.276 9.656 10.077 10.522 11.013 11.544 12.142 12.707 13.109 13.119 12.867 12.507 12.14 11.769 11.401 11.058 10.749 10.42 10.122 9.846 9.568 9.287 9.027 8.784 8.522 8.275 8.064 7.862 7.636 7.437 7.226 6.992 6.81 6.63 6.439 6.245 6.06 5.93 5.782 5.546 5.376 5.185 5.09 4.9 4.703 4.484 4.365 4.097 4.013 3.875 3.729 3.429 3.239 3.021 2.778 2.511 2.201 1.739 -0.698 -3 ,24794 ,TETRA ,17601317,Sun Nov 28 14:35:09 CET,Sun Nov 28 16:26:15 CET,0.0 1.154 1.596 1.894 2.135 2.328 2.489 2.644 2.93 3.062 3.18 3.245 3.503 3.613 3.823 4.014 4.19 4.273 4.434 4.601 4.843 4.996 5.141 5.35 5.546 5.728 5.902 6.081 6.309 6.506 6.693 6.911 7.115 7.329 7.566 7.809 8.056 8.327 8.6 8.888 9.199 9.527 9.895 10.253 10.649 11.101 11.606 12.097 12.605 13.135 13.511 13.453 13.187 12.85 12.457 12.076 11.705 11.33 10.989 10.654 10.365 10.078 9.8 9.518 9.227 8.988 8.757 8.535 8.33 8.121 7.904 7.723 7.525 7.302 7.126 6.945 6.751 6.555 6.369 6.241 6.094 5.858 5.699 5.528 5.44 5.257 5.068 4.874 4.766 4.496 4.372 4.236 4.097 3.785 3.611 3.417 3.212 2.948 2.592 2.103 0.246 -4 ,31631 ,TETRA ,17601318,Sun Nov 28 14:35:09 CET,Sun Nov 28 16:28:26 CET,0.0 0.667 1.069 1.363 1.607 1.823 2.014 2.171 2.445 2.582 2.71 2.789 3.049 3.146 3.333 3.52 3.698 3.78 3.934 4.096 4.333 4.482 4.618 4.805 4.995 5.178 5.339 5.488 5.694 5.901 6.101 6.333 6.542 6.736 6.954 7.204 7.449 7.708 7.97 8.248 8.546 8.881 9.261 9.615 10.009 10.452 10.935 11.412 11.917 12.444 12.809 12.789 12.516 12.178 11.819 11.44 11.071 10.711 10.382 10.029 9.71 9.399 9.103 8.834 8.575 8.334 8.067 7.822 7.607 7.396 7.18 6.981 6.781 6.576 6.403 6.214 6.016 5.822 5.636 5.499 5.346 5.117 4.949 4.779 4.693 4.503 4.289 4.064 3.953 3.685 3.598 3.466 3.322 3.022 2.852 2.659 2.452 2.217 1.911 1.467 0.182 -5 ,1324 ,TETRA ,17601319,Sun Nov 28 14:35:09 CET,Sun Nov 28 16:26:14 CET,0.0 1.233 1.599 1.91 2.164 2.371 2.557 2.748 3.083 3.241 3.386 3.493 3.769 3.884 4.12 4.341 4.531 4.613 4.773 4.925 5.151 5.302 5.445 5.647 5.844 6.016 6.177 6.337 6.546 6.752 6.94 7.164 7.373 7.572 7.793 8.048 8.316 8.603 8.899 9.203 9.518 9.849 10.224 10.605 11.029 11.471 11.945 12.433 12.951 13.45 13.808 13.802 13.548 13.161 12.753 12.354 11.942 11.558 11.208 10.832 10.523 10.234 9.957 9.69 9.417 9.176 8.913 8.674 8.473 8.252 8.013 7.819 7.62 7.402 7.224 7.035 6.84 6.645 6.462 6.333 6.181 5.926 5.755 5.569 5.46 5.266 5.083 4.866 4.742 4.462 4.357 4.228 4.09 3.774 3.607 3.423 3.196 2.931 2.644 2.251 0.693 -6 ,317 ,TETRA ,17601320,Sun Nov 28 14:35:11 CET,Sun Nov 28 16:25:34 CET,0.0 0.943 1.394 1.741 2.011 2.211 2.392 2.562 2.865 3.0 3.136 3.234 3.5 3.6 3.785 3.968 4.141 4.226 4.374 4.521 4.739 4.874 5.006 5.188 5.375 5.558 5.716 5.865 6.053 6.253 6.453 6.673 6.885 7.102 7.362 7.623 7.855 8.12 8.401 8.696 9.019 9.373 9.745 10.108 10.526 10.961 11.445 11.94 12.433 12.919 13.274 13.263 13.021 12.646 12.266 11.888 11.502 11.127 10.774 10.394 10.045 9.74 9.471 9.212 8.96 8.712 8.445 8.212 8.01 7.806 7.593 7.406 7.192 6.975 6.811 6.62 6.43 6.242 6.032 5.882 5.725 5.471 5.297 5.128 5.04 4.852 4.651 4.446 4.337 4.059 3.936 3.803 3.67 3.379 3.222 3.04 2.81 2.553 2.228 1.808 0.382 -7 ,7402 ,TETRA ,17601321,Sun Nov 28 14:35:13 CET,Sun Nov 28 16:25:57 CET,0.0 1.485 1.907 2.203 2.447 2.66 2.872 3.075 3.397 3.531 3.658 3.726 3.983 4.093 4.303 4.508 4.701 4.794 4.98 5.149 5.395 5.557 5.711 5.932 6.142 6.337 6.516 6.691 6.916 7.128 7.336 7.597 7.834 8.045 8.284 8.567 8.847 9.126 9.4 9.681 9.971 10.297 10.666 11.031 11.46 11.894 12.322 12.775 13.279 13.784 14.186 14.16 13.827 13.457 13.067 12.642 12.247 11.88 11.55 11.21 10.892 10.584 10.277 9.987 9.716 9.464 9.191 8.931 8.707 8.48 8.257 8.074 7.874 7.641 7.461 7.283 7.091 6.876 6.657 6.515 6.37 6.113 5.933 5.772 5.69 5.519 5.32 5.084 4.956 4.688 4.612 4.48 4.337 4.03 3.856 3.681 3.489 3.237 2.921 2.532 1.464 -8 ,21288 ,TETRA ,17601322,Sun Nov 28 14:35:11 CET,Sun Nov 28 16:25:34 CET,0.0 1.223 1.567 1.844 2.12 2.349 2.536 2.704 2.986 3.1 3.221 3.343 3.627 3.747 3.965 4.172 4.364 4.456 4.639 4.827 5.077 5.229 5.377 5.57 5.756 5.931 6.113 6.292 6.51 6.73 6.942 7.183 7.416 7.647 7.902 8.167 8.433 8.739 9.056 9.392 9.729 10.095 10.501 10.882 11.322 11.803 12.286 12.791 13.353 13.89 14.276 14.24 13.944 13.55 13.12 12.693 12.319 11.963 11.62 11.244 10.928 10.636 10.329 10.035 9.753 9.49 9.205 8.955 8.745 8.51 8.261 8.058 7.843 7.613 7.43 7.245 7.064 6.877 6.684 6.547 6.395 6.141 5.96 5.775 5.672 5.465 5.27 5.054 4.933 4.666 4.556 4.411 4.25 3.913 3.735 3.552 3.369 3.136 2.839 2.426 1.071 -9 ,6566 ,TETRA ,17601323,Sun Nov 28 14:35:10 CET,Sun Nov 28 16:26:22 CET,0.0 0.725 1.031 1.275 1.516 1.737 1.925 2.096 2.421 2.561 2.684 2.757 3.009 3.11 3.316 3.5 3.673 3.759 3.931 4.089 4.304 4.444 4.579 4.768 4.944 5.117 5.282 5.443 5.655 5.865 6.057 6.282 6.501 6.696 6.936 7.2 7.427 7.68 7.957 8.234 8.541 8.898 9.282 9.647 10.047 10.47 10.937 11.44 11.946 12.412 12.777 12.754 12.461 12.105 11.73 11.354 10.986 10.605 10.273 9.93 9.614 9.323 9.022 8.73 8.464 8.209 7.937 7.69 7.478 7.263 7.044 6.865 6.67 6.448 6.284 6.109 5.916 5.723 5.517 5.38 5.237 5.013 4.856 4.694 4.617 4.453 4.271 4.074 3.968 3.711 3.623 3.49 3.349 3.045 2.864 2.65 2.408 2.136 1.784 1.278 -0.228 -10 ,911 ,TETRA ,17601324,Sun Nov 28 14:35:10 CET,Sun Nov 28 16:29:43 CET,0.0 1.537 2.142 2.426 2.63 2.839 3.002 3.137 3.425 3.562 3.683 3.756 4.015 4.112 4.292 4.458 4.622 4.704 4.861 5.014 5.238 5.378 5.512 5.711 5.902 6.081 6.245 6.4 6.596 6.793 6.981 7.192 7.399 7.605 7.847 8.129 8.389 8.656 8.948 9.241 9.54 9.874 10.252 10.644 11.077 11.53 12.039 12.55 13.051 13.521 13.89 13.883 13.606 13.263 12.88 12.473 12.111 11.764 11.454 11.139 10.854 10.59 10.321 10.062 9.818 9.589 9.334 9.099 8.886 8.661 8.428 8.228 8.015 7.797 7.629 7.438 7.24 7.049 6.856 6.716 6.559 6.316 6.153 5.974 5.878 5.682 5.485 5.284 5.171 4.895 4.788 4.651 4.496 4.157 3.971 3.764 3.537 3.275 2.99 2.642 1.297 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_46_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_46_43.txt deleted file mode 100644 index ab7fa9ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_46_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19631 ,TETRA ,17601325,Sun Nov 28 14:35:10 CET,Sun Nov 28 16:25:01 CET,0.0 0.863 1.241 1.521 1.732 1.927 2.109 2.276 2.564 2.694 2.817 2.877 3.151 3.25 3.433 3.613 3.792 3.874 4.021 4.174 4.39 4.524 4.658 4.845 5.03 5.216 5.389 5.548 5.756 5.948 6.141 6.38 6.605 6.82 7.077 7.377 7.651 7.94 8.259 8.586 8.924 9.314 9.75 10.18 10.659 11.164 11.73 12.322 12.994 13.712 14.438 14.858 14.893 14.752 14.559 14.326 14.063 13.81 13.58 13.327 13.091 12.868 12.642 12.417 12.205 12.014 11.81 11.611 11.433 11.246 11.051 10.888 10.716 10.536 10.396 10.251 10.1 9.943 9.774 9.655 9.532 9.353 9.218 9.071 9.0 8.841 8.662 8.467 8.37 8.113 8.055 7.94 7.831 7.591 7.433 7.255 7.083 6.894 6.672 6.372 5.74 -2 ,23639 ,TETRA ,17601326,Sun Nov 28 14:35:13 CET,Sun Nov 28 16:25:51 CET,0.0 0.99 1.406 1.679 1.887 2.058 2.206 2.352 2.631 2.762 2.889 2.953 3.227 3.335 3.523 3.701 3.882 3.973 4.144 4.307 4.543 4.689 4.823 5.01 5.193 5.37 5.541 5.711 5.932 6.14 6.341 6.586 6.821 7.048 7.3 7.568 7.834 8.12 8.421 8.729 9.038 9.405 9.848 10.289 10.794 11.338 11.925 12.537 13.211 13.93 14.578 14.836 14.822 14.675 14.424 14.159 13.91 13.663 13.442 13.19 12.95 12.737 12.53 12.305 12.085 11.889 11.675 11.477 11.309 11.131 10.936 10.771 10.594 10.412 10.27 10.125 9.976 9.824 9.667 9.555 9.448 9.278 9.147 9.01 8.935 8.763 8.575 8.374 8.267 7.991 7.88 7.726 7.556 7.169 6.966 6.759 6.515 6.217 5.887 5.529 4.618 -3 ,13866 ,TETRA ,17601327,Sun Nov 28 14:35:15 CET,Sun Nov 28 16:25:00 CET,0.0 1.186 1.605 1.89 2.111 2.296 2.473 2.627 2.894 3.02 3.149 3.233 3.506 3.619 3.834 4.024 4.201 4.29 4.458 4.605 4.83 4.979 5.124 5.331 5.514 5.695 5.88 6.054 6.264 6.458 6.661 6.908 7.135 7.35 7.603 7.893 8.166 8.456 8.757 9.067 9.392 9.752 10.166 10.581 11.052 11.585 12.217 12.881 13.589 14.307 14.993 15.338 15.333 15.191 15.006 14.795 14.565 14.283 13.997 13.691 13.425 13.187 12.962 12.737 12.498 12.285 12.059 11.861 11.683 11.486 11.279 11.101 10.912 10.718 10.566 10.396 10.224 10.055 9.874 9.744 9.605 9.386 9.236 9.071 8.985 8.819 8.629 8.418 8.314 8.039 7.927 7.782 7.632 7.305 7.126 6.937 6.731 6.476 6.177 5.771 4.402 -4 ,24865 ,TETRA ,17601328,Sun Nov 28 14:35:11 CET,Sun Nov 28 16:26:11 CET,0.0 0.893 1.189 1.425 1.662 1.865 2.043 2.214 2.522 2.655 2.777 2.829 3.097 3.202 3.415 3.601 3.772 3.862 4.034 4.183 4.398 4.536 4.663 4.862 5.055 5.232 5.405 5.565 5.771 5.976 6.18 6.413 6.63 6.857 7.119 7.395 7.648 7.916 8.233 8.593 8.95 9.329 9.745 10.161 10.644 11.147 11.698 12.334 13.036 13.767 14.498 14.856 14.886 14.752 14.543 14.269 13.992 13.74 13.517 13.274 13.038 12.797 12.554 12.345 12.156 11.971 11.765 11.581 11.422 11.241 11.049 10.894 10.729 10.547 10.394 10.234 10.069 9.897 9.727 9.608 9.48 9.271 9.133 8.985 8.9 8.74 8.576 8.385 8.284 8.018 7.933 7.806 7.667 7.354 7.186 6.986 6.753 6.507 6.248 5.872 4.878 -5 ,11715 ,TETRA ,17601329,Sun Nov 28 14:35:11 CET,Sun Nov 28 16:26:11 CET,0.0 1.555 2.022 2.351 2.603 2.831 3.048 3.252 3.617 3.78 3.926 4.032 4.326 4.457 4.71 4.942 5.154 5.259 5.465 5.663 5.927 6.083 6.232 6.426 6.624 6.825 7.012 7.191 7.398 7.596 7.796 8.033 8.26 8.471 8.727 9.012 9.275 9.572 9.904 10.251 10.609 10.998 11.433 11.869 12.363 12.909 13.528 14.175 14.868 15.589 16.323 16.698 16.735 16.675 16.56 16.366 16.122 15.845 15.58 15.327 15.075 14.824 14.599 14.395 14.201 14.0 13.784 13.594 13.426 13.254 13.059 12.892 12.711 12.525 12.393 12.252 12.092 11.913 11.727 11.594 11.456 11.248 11.113 10.972 10.886 10.71 10.544 10.357 10.254 9.993 9.95 9.843 9.729 9.448 9.288 9.118 8.935 8.756 8.518 8.159 7.323 -6 ,16792 ,TETRA ,17601330,Sun Nov 28 14:35:13 CET,Sun Nov 28 16:26:17 CET,0.0 1.155 1.537 1.831 2.078 2.297 2.501 2.686 3.019 3.163 3.296 3.374 3.653 3.776 4.005 4.208 4.41 4.503 4.668 4.82 5.036 5.181 5.322 5.516 5.701 5.879 6.05 6.225 6.453 6.667 6.874 7.119 7.358 7.59 7.848 8.135 8.4 8.678 8.987 9.32 9.668 10.051 10.493 10.939 11.425 11.931 12.498 13.118 13.804 14.546 15.296 15.681 15.706 15.558 15.332 15.076 14.829 14.576 14.339 14.081 13.828 13.607 13.405 13.188 12.971 12.786 12.588 12.384 12.201 12.017 11.822 11.666 11.512 11.337 11.193 11.042 10.88 10.712 10.539 10.416 10.291 10.113 9.981 9.826 9.742 9.58 9.414 9.225 9.128 8.871 8.831 8.728 8.616 8.356 8.208 8.039 7.842 7.618 7.335 6.941 5.831 -7 ,21280 ,TETRA ,17601331,Sun Nov 28 14:35:15 CET,Sun Nov 28 16:26:11 CET,0.0 1.079 1.481 1.74 1.944 2.137 2.325 2.52 2.856 2.997 3.126 3.188 3.445 3.541 3.725 3.881 4.03 4.104 4.264 4.422 4.64 4.789 4.933 5.127 5.321 5.502 5.676 5.852 6.071 6.281 6.487 6.731 6.972 7.196 7.45 7.722 7.984 8.274 8.582 8.929 9.276 9.658 10.114 10.565 11.067 11.575 12.154 12.795 13.491 14.234 15.029 15.439 15.429 15.276 15.059 14.814 14.56 14.291 14.037 13.756 13.497 13.272 13.047 12.821 12.598 12.4 12.204 12.033 11.871 11.682 11.494 11.345 11.183 11.002 10.847 10.694 10.552 10.392 10.221 10.105 9.977 9.774 9.638 9.506 9.437 9.277 9.111 8.939 8.842 8.586 8.542 8.426 8.303 8.025 7.868 7.71 7.514 7.284 6.994 6.57 5.381 -8 ,1876 ,TETRA ,17601332,Sun Nov 28 14:35:11 CET,Sun Nov 28 16:25:17 CET,0.0 0.651 0.985 1.25 1.508 1.73 1.899 2.061 2.364 2.496 2.606 2.65 2.929 3.037 3.24 3.417 3.58 3.667 3.835 4.003 4.235 4.375 4.514 4.718 4.914 5.085 5.244 5.412 5.638 5.842 6.033 6.264 6.483 6.706 6.971 7.255 7.513 7.797 8.116 8.441 8.774 9.142 9.554 9.977 10.469 11.03 11.655 12.282 12.934 13.638 14.384 14.799 14.834 14.699 14.513 14.302 14.065 13.812 13.55 13.275 13.036 12.798 12.566 12.339 12.127 11.937 11.741 11.557 11.384 11.206 11.019 10.86 10.687 10.51 10.379 10.24 10.089 9.929 9.767 9.657 9.552 9.374 9.246 9.117 9.045 8.883 8.689 8.477 8.383 8.129 8.062 7.953 7.839 7.559 7.412 7.238 7.036 6.82 6.542 6.131 5.222 -9 ,8237 ,TETRA ,17601333,Sun Nov 28 14:35:11 CET,Sun Nov 28 16:25:05 CET,0.0 0.895 1.194 1.422 1.636 1.839 2.02 2.193 2.489 2.61 2.725 2.792 3.062 3.163 3.388 3.616 3.822 3.918 4.098 4.264 4.49 4.624 4.76 4.954 5.129 5.305 5.466 5.616 5.82 6.027 6.222 6.45 6.676 6.896 7.147 7.418 7.673 7.956 8.264 8.575 8.901 9.273 9.707 10.13 10.59 11.119 11.725 12.371 13.076 13.806 14.536 14.873 14.865 14.706 14.478 14.21 13.961 13.717 13.485 13.217 12.967 12.747 12.521 12.292 12.071 11.866 11.656 11.467 11.293 11.111 10.905 10.736 10.574 10.393 10.248 10.105 9.959 9.813 9.652 9.535 9.41 9.208 9.056 8.888 8.803 8.64 8.489 8.317 8.218 7.963 7.926 7.818 7.709 7.433 7.26 7.067 6.866 6.657 6.372 6.028 5.132 -10 ,19471 ,TETRA ,17601334,Sun Nov 28 14:35:13 CET,Sun Nov 28 16:25:03 CET,0.0 0.854 1.193 1.486 1.729 1.945 2.138 2.318 2.657 2.794 2.913 2.966 3.233 3.334 3.534 3.714 3.884 3.971 4.139 4.296 4.521 4.677 4.828 5.022 5.205 5.392 5.573 5.737 5.95 6.167 6.373 6.61 6.839 7.06 7.307 7.583 7.855 8.169 8.498 8.814 9.143 9.534 9.987 10.435 10.936 11.46 12.049 12.701 13.408 14.13 14.87 15.243 15.239 15.08 14.861 14.618 14.362 14.097 13.85 13.586 13.348 13.136 12.923 12.693 12.471 12.262 12.049 11.865 11.687 11.497 11.313 11.147 10.957 10.763 10.619 10.463 10.306 10.155 9.983 9.857 9.726 9.526 9.398 9.26 9.187 9.034 8.849 8.657 8.563 8.299 8.24 8.128 8.007 7.713 7.564 7.394 7.18 6.918 6.567 6.107 4.864 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_47_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_47_43.txt deleted file mode 100644 index 92621ffd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_47_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14185 ,TETRA ,17601335,Sun Nov 28 14:35:12 CET,Sun Nov 28 16:24:38 CET,0.0 1.125 1.607 1.96 2.232 2.467 2.666 2.835 3.169 3.346 3.515 3.629 3.949 4.101 4.385 4.648 4.91 5.037 5.289 5.533 5.847 6.036 6.214 6.469 6.722 6.987 7.237 7.449 7.727 8.0 8.268 8.584 8.881 9.169 9.5 9.872 10.222 10.602 11.023 11.478 11.95 12.464 13.014 13.583 14.259 14.979 15.812 16.734 17.701 18.711 19.857 20.615 20.859 20.875 20.689 20.464 20.321 20.163 19.966 19.757 19.593 19.402 19.178 18.973 18.779 18.603 18.402 18.208 18.063 17.914 17.739 17.587 17.437 17.281 17.145 16.976 16.791 16.602 16.406 16.294 16.195 16.011 15.87 15.728 15.65 15.465 15.275 15.077 14.964 14.688 14.632 14.515 14.395 14.113 13.951 13.784 13.606 13.385 13.091 12.695 11.746 -2 ,28603 ,TETRA ,17601336,Sun Nov 28 14:35:13 CET,Sun Nov 28 16:24:29 CET,0.0 1.08 1.528 1.803 2.05 2.262 2.452 2.642 3.017 3.19 3.345 3.512 3.843 3.977 4.236 4.478 4.707 4.813 5.01 5.214 5.522 5.697 5.85 6.079 6.302 6.526 6.744 6.947 7.205 7.46 7.712 8.002 8.294 8.581 8.897 9.228 9.554 9.928 10.31 10.712 11.141 11.617 12.17 12.713 13.317 13.976 14.709 15.523 16.453 17.46 18.52 19.215 19.498 19.535 19.446 19.313 19.146 18.969 18.792 18.602 18.434 18.269 18.106 17.921 17.705 17.526 17.356 17.193 17.053 16.892 16.719 16.57 16.419 16.262 16.136 16.01 15.865 15.709 15.555 15.447 15.326 15.12 14.978 14.829 14.749 14.602 14.449 14.287 14.197 13.935 13.905 13.783 13.639 13.36 13.205 13.042 12.88 12.68 12.422 11.964 10.553 -3 ,7963 ,TETRA ,17601337,Sun Nov 28 14:35:15 CET,Sun Nov 28 16:24:25 CET,0.0 1.136 1.548 1.874 2.163 2.419 2.642 2.823 3.149 3.308 3.473 3.606 3.918 4.048 4.276 4.484 4.7 4.805 4.994 5.189 5.472 5.649 5.816 6.045 6.242 6.443 6.661 6.865 7.123 7.397 7.683 8.024 8.313 8.569 8.884 9.239 9.596 9.987 10.384 10.804 11.243 11.729 12.277 12.823 13.441 14.112 14.877 15.718 16.672 17.734 18.824 19.567 19.849 19.89 19.838 19.718 19.572 19.396 19.184 18.968 18.779 18.593 18.417 18.247 18.073 17.916 17.763 17.605 17.465 17.328 17.167 17.006 16.84 16.683 16.554 16.418 16.28 16.124 15.948 15.828 15.709 15.524 15.377 15.225 15.156 15.005 14.857 14.711 14.627 14.358 14.302 14.194 14.075 13.801 13.651 13.474 13.26 13.033 12.763 12.343 11.138 -4 ,24705 ,TETRA ,17601338,Sun Nov 28 14:35:16 CET,Sun Nov 28 16:24:04 CET,0.0 0.656 1.027 1.34 1.606 1.828 2.023 2.208 2.547 2.699 2.838 2.922 3.226 3.355 3.631 3.898 4.129 4.24 4.464 4.689 5.02 5.22 5.403 5.655 5.887 6.13 6.374 6.596 6.887 7.171 7.448 7.771 8.063 8.339 8.663 9.031 9.386 9.772 10.197 10.665 11.156 11.675 12.268 12.881 13.576 14.305 15.137 16.063 17.065 18.168 19.312 19.928 20.058 20.006 19.88 19.667 19.391 19.092 18.811 18.527 18.291 18.073 17.849 17.645 17.448 17.247 17.013 16.795 16.606 16.409 16.203 16.028 15.841 15.634 15.474 15.301 15.117 14.94 14.759 14.631 14.489 14.253 14.1 13.969 13.899 13.732 13.549 13.36 13.261 12.998 12.963 12.869 12.761 12.516 12.378 12.221 12.059 11.865 11.627 11.289 9.995 -5 ,3329 ,TETRA ,17601339,Sun Nov 28 14:35:13 CET,Sun Nov 28 16:24:47 CET,0.0 0.991 1.439 1.739 1.991 2.217 2.418 2.584 2.889 3.071 3.254 3.391 3.713 3.859 4.118 4.36 4.595 4.712 4.948 5.173 5.471 5.646 5.815 6.069 6.325 6.558 6.757 6.954 7.237 7.534 7.81 8.116 8.397 8.664 8.97 9.32 9.665 10.059 10.501 10.97 11.458 12.008 12.635 13.231 13.892 14.639 15.472 16.374 17.349 18.28 19.211 19.755 19.85 19.765 19.607 19.388 19.133 18.847 18.53 18.2 17.925 17.673 17.441 17.212 16.98 16.755 16.517 16.304 16.11 15.911 15.709 15.533 15.341 15.136 14.966 14.797 14.621 14.435 14.24 14.091 13.936 13.689 13.511 13.317 13.216 13.01 12.799 12.574 12.452 12.176 12.088 11.95 11.8 11.438 11.242 11.03 10.774 10.478 10.14 9.726 8.316 -6 ,30757 ,TETRA ,17601340,Sun Nov 28 14:35:14 CET,Sun Nov 28 16:25:01 CET,0.0 0.681 1.061 1.374 1.629 1.873 2.116 2.35 2.721 2.867 3.007 3.088 3.398 3.535 3.789 4.009 4.209 4.301 4.477 4.668 4.955 5.129 5.308 5.59 5.856 6.108 6.361 6.613 6.917 7.193 7.444 7.733 8.012 8.266 8.557 8.913 9.27 9.65 10.051 10.466 10.913 11.404 11.941 12.505 13.156 13.806 14.541 15.394 16.355 17.401 18.49 19.197 19.339 19.276 19.16 18.959 18.727 18.476 18.226 17.963 17.7 17.42 17.136 16.874 16.619 16.379 16.137 15.916 15.731 15.529 15.309 15.124 14.943 14.76 14.596 14.41 14.209 14.005 13.799 13.658 13.514 13.289 13.125 12.956 12.866 12.67 12.466 12.247 12.129 11.849 11.767 11.622 11.455 11.113 10.927 10.724 10.492 10.239 9.924 9.424 8.445 -7 ,6874 ,TETRA ,17601341,Sun Nov 28 14:35:17 CET,Sun Nov 28 16:25:00 CET,0.0 1.01 1.45 1.791 2.072 2.325 2.536 2.735 3.125 3.314 3.495 3.626 3.93 4.059 4.295 4.551 4.812 4.926 5.137 5.326 5.598 5.777 5.944 6.192 6.433 6.673 6.906 7.125 7.409 7.689 7.973 8.298 8.587 8.859 9.18 9.54 9.896 10.304 10.732 11.172 11.635 12.183 12.845 13.459 14.136 14.863 15.629 16.503 17.501 18.581 19.757 20.432 20.56 20.493 20.388 20.19 19.939 19.677 19.408 19.111 18.845 18.604 18.355 18.112 17.888 17.666 17.425 17.205 16.997 16.785 16.56 16.362 16.159 15.961 15.798 15.617 15.427 15.246 15.056 14.905 14.754 14.529 14.374 14.213 14.126 13.938 13.743 13.529 13.403 13.12 13.043 12.912 12.771 12.451 12.281 12.088 11.88 11.676 11.407 10.994 9.815 -8 ,24744 ,TETRA ,17601342,Sun Nov 28 14:35:18 CET,Sun Nov 28 16:24:47 CET,0.0 1.202 1.713 2.036 2.336 2.596 2.842 3.085 3.509 3.699 3.872 4.005 4.317 4.44 4.683 4.909 5.109 5.199 5.373 5.561 5.837 6.005 6.172 6.418 6.651 6.87 7.092 7.306 7.569 7.826 8.091 8.427 8.736 9.02 9.351 9.727 10.077 10.451 10.858 11.294 11.736 12.25 12.867 13.423 14.065 14.828 15.649 16.523 17.548 18.623 19.661 20.222 20.338 20.261 20.054 19.831 19.62 19.353 19.092 18.828 18.577 18.338 18.074 17.817 17.579 17.343 17.102 16.884 16.685 16.479 16.263 16.075 15.871 15.655 15.48 15.296 15.105 14.89 14.664 14.519 14.378 14.156 13.999 13.837 13.755 13.568 13.367 13.162 13.052 12.769 12.673 12.544 12.401 12.05 11.857 11.669 11.437 11.152 10.84 10.521 9.883 -9 ,7483 ,TETRA ,17601343,Sun Nov 28 14:35:13 CET,Sun Nov 28 16:26:54 CET,0.0 0.878 1.282 1.604 1.87 2.103 2.325 2.532 2.882 3.03 3.179 3.295 3.613 3.742 3.965 4.176 4.372 4.465 4.652 4.827 5.073 5.242 5.404 5.625 5.847 6.066 6.283 6.494 6.757 7.008 7.253 7.535 7.807 8.082 8.394 8.776 9.164 9.555 9.955 10.38 10.82 11.31 11.884 12.465 13.113 13.794 14.581 15.486 16.478 17.483 18.549 19.24 19.468 19.494 19.434 19.331 19.204 19.038 18.875 18.694 18.502 18.307 18.089 17.87 17.646 17.438 17.227 17.039 16.887 16.724 16.533 16.366 16.201 16.023 15.881 15.741 15.586 15.418 15.227 15.085 14.931 14.696 14.556 14.422 14.355 14.211 14.05 13.863 13.764 13.502 13.44 13.319 13.18 12.879 12.725 12.555 12.371 12.168 11.907 11.539 10.764 -10 ,23664 ,TETRA ,17601344,Sun Nov 28 14:35:39 CET,Sun Nov 28 16:25:55 CET,0.0 0.952 1.342 1.627 1.872 2.113 2.362 2.591 2.98 3.145 3.292 3.398 3.714 3.857 4.128 4.364 4.584 4.691 4.897 5.095 5.387 5.585 5.774 6.038 6.286 6.511 6.749 6.987 7.275 7.543 7.794 8.108 8.422 8.735 9.089 9.46 9.805 10.189 10.608 11.038 11.495 12.003 12.565 13.132 13.794 14.506 15.278 16.145 17.15 18.224 19.389 20.103 20.23 20.141 19.994 19.78 19.527 19.282 19.062 18.834 18.592 18.331 18.056 17.775 17.513 17.273 17.007 16.745 16.527 16.314 16.087 15.907 15.721 15.518 15.361 15.197 15.023 14.846 14.652 14.511 14.364 14.136 13.985 13.811 13.72 13.544 13.341 13.118 13.006 12.745 12.683 12.549 12.405 12.092 11.92 11.739 11.522 11.242 10.869 10.413 9.249 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_48_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_48_42.txt deleted file mode 100644 index c54985e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_48_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31886 ,TETRA ,17601345,Sun Nov 28 14:35:40 CET,Sun Nov 28 16:25:34 CET,0.0 1.595 2.215 2.608 2.899 3.171 3.408 3.66 4.136 4.342 4.544 4.741 5.09 5.256 5.514 5.768 6.014 6.127 6.341 6.533 6.8 6.985 7.172 7.428 7.682 7.932 8.175 8.417 8.726 9.017 9.286 9.604 9.912 10.21 10.541 10.918 11.289 11.673 12.087 12.539 13.012 13.546 14.164 14.765 15.45 16.246 17.186 18.187 19.371 20.803 22.407 23.566 24.075 24.282 24.396 24.415 24.357 24.223 24.077 23.948 23.817 23.68 23.525 23.356 23.205 23.057 22.894 22.729 22.561 22.398 22.228 22.079 21.923 21.742 21.585 21.425 21.26 21.093 20.912 20.785 20.659 20.44 20.268 20.081 19.987 19.784 19.539 19.281 19.154 18.864 18.707 18.55 18.387 18.012 17.799 17.578 17.329 17.063 16.737 16.303 15.125 -2 ,16179 ,TETRA ,17601346,Sun Nov 28 14:35:40 CET,Sun Nov 28 16:26:00 CET,0.0 1.79 2.338 2.731 3.054 3.323 3.566 3.793 4.153 4.304 4.445 4.544 4.84 4.977 5.231 5.453 5.674 5.781 5.987 6.199 6.503 6.695 6.886 7.147 7.382 7.61 7.841 8.068 8.355 8.633 8.892 9.194 9.494 9.791 10.131 10.512 10.882 11.281 11.712 12.172 12.651 13.198 13.824 14.417 15.112 15.898 16.806 17.836 18.957 20.229 21.73 22.85 23.387 23.623 23.715 23.671 23.616 23.564 23.472 23.323 23.155 22.995 22.843 22.713 22.574 22.427 22.253 22.076 21.923 21.769 21.621 21.48 21.323 21.175 21.044 20.872 20.672 20.471 20.27 20.132 19.997 19.777 19.602 19.401 19.309 19.138 18.942 18.745 18.652 18.406 18.354 18.24 18.122 17.855 17.686 17.489 17.256 16.988 16.701 16.314 14.671 -3 ,27213 ,TETRA ,17601347,Sun Nov 28 14:35:40 CET,Sun Nov 28 16:27:46 CET,0.0 1.537 2.068 2.477 2.862 3.174 3.423 3.655 4.111 4.321 4.499 4.641 4.955 5.091 5.338 5.564 5.773 5.881 6.088 6.282 6.574 6.766 6.95 7.214 7.467 7.702 7.936 8.165 8.442 8.716 8.994 9.325 9.625 9.922 10.265 10.641 11.011 11.433 11.884 12.355 12.856 13.398 14.018 14.648 15.359 16.118 16.961 17.886 19.01 20.35 21.856 22.964 23.493 23.757 23.856 23.872 23.834 23.728 23.617 23.495 23.351 23.196 23.042 22.897 22.74 22.581 22.388 22.208 22.065 21.913 21.739 21.579 21.408 21.225 21.083 20.927 20.754 20.593 20.424 20.301 20.166 19.941 19.797 19.64 19.553 19.372 19.177 18.967 18.861 18.595 18.491 18.349 18.19 17.843 17.641 17.432 17.204 16.934 16.632 16.207 14.725 -4 ,1437 ,TETRA ,17601348,Sun Nov 28 14:35:40 CET,Sun Nov 28 16:25:00 CET,0.0 1.557 2.001 2.342 2.652 2.903 3.148 3.373 3.766 3.944 4.107 4.259 4.578 4.715 4.973 5.228 5.47 5.586 5.823 6.045 6.345 6.542 6.741 7.005 7.239 7.468 7.697 7.927 8.234 8.54 8.81 9.111 9.412 9.704 10.033 10.41 10.763 11.14 11.56 11.993 12.425 12.918 13.506 14.104 14.791 15.56 16.471 17.506 18.666 19.964 21.428 22.488 23.052 23.309 23.379 23.371 23.284 23.153 23.043 22.851 22.636 22.488 22.348 22.173 22.0 21.849 21.7 21.538 21.382 21.227 21.047 20.888 20.728 20.57 20.438 20.291 20.134 19.966 19.792 19.682 19.563 19.359 19.213 19.062 18.975 18.789 18.604 18.399 18.286 18.016 17.933 17.799 17.66 17.37 17.204 17.035 16.824 16.561 16.275 15.819 14.414 -5 ,29672 ,TETRA ,17601349,Sun Nov 28 14:35:40 CET,Sun Nov 28 16:27:00 CET,0.0 4.003 4.942 5.57 5.966 6.228 6.468 6.688 7.108 7.288 7.444 7.56 7.868 8.001 8.234 8.47 8.72 8.839 9.077 9.3 9.603 9.808 10.008 10.29 10.557 10.812 11.051 11.278 11.572 11.84 12.093 12.42 12.75 13.064 13.417 13.807 14.176 14.58 15.01 15.453 15.902 16.417 17.035 17.63 18.311 19.091 19.99 20.939 22.019 23.306 24.816 25.949 26.537 26.804 26.878 26.848 26.772 26.682 26.542 26.359 26.177 25.982 25.794 25.617 25.432 25.265 25.116 24.974 24.836 24.687 24.52 24.371 24.203 24.03 23.888 23.733 23.572 23.409 23.248 23.133 23.019 22.848 22.72 22.555 22.468 22.318 22.169 21.993 21.885 21.626 21.542 21.414 21.27 20.963 20.796 20.611 20.411 20.171 19.828 19.261 18.011 -6 ,22969 ,TETRA ,17601350,Sun Nov 28 14:35:41 CET,Sun Nov 28 16:27:30 CET,0.0 1.837 2.4 2.784 3.113 3.396 3.629 3.835 4.231 4.411 4.573 4.707 5.025 5.17 5.463 5.733 5.961 6.077 6.31 6.528 6.83 7.003 7.171 7.434 7.699 7.948 8.172 8.409 8.726 9.013 9.281 9.604 9.91 10.188 10.522 10.903 11.259 11.66 12.072 12.494 12.95 13.477 14.115 14.75 15.499 16.343 17.267 18.284 19.457 20.774 22.283 23.395 23.971 24.27 24.379 24.378 24.317 24.247 24.186 24.088 23.937 23.77 23.607 23.432 23.254 23.073 22.888 22.732 22.598 22.429 22.214 22.03 21.847 21.663 21.502 21.318 21.142 20.981 20.814 20.691 20.546 20.319 20.16 19.988 19.888 19.673 19.487 19.296 19.194 18.925 18.855 18.744 18.606 18.293 18.12 17.917 17.682 17.437 17.157 16.795 15.295 -7 ,27644 ,TETRA ,17601351,Sun Nov 28 14:35:42 CET,Sun Nov 28 16:25:00 CET,0.0 2.953 3.444 3.792 4.145 4.418 4.622 4.813 5.171 5.338 5.495 5.63 5.933 6.068 6.339 6.601 6.865 6.977 7.176 7.377 7.672 7.862 8.052 8.318 8.563 8.812 9.042 9.245 9.526 9.817 10.089 10.4 10.705 11.005 11.352 11.741 12.107 12.517 12.956 13.4 13.866 14.406 15.061 15.71 16.424 17.214 18.145 19.185 20.371 21.749 23.363 24.515 25.067 25.329 25.446 25.502 25.476 25.385 25.28 25.156 25.021 24.864 24.692 24.501 24.325 24.181 24.009 23.825 23.634 23.461 23.313 23.17 23.002 22.814 22.676 22.545 22.41 22.267 22.105 21.981 21.846 21.603 21.413 21.218 21.129 20.957 20.787 20.618 20.525 20.27 20.191 20.066 19.922 19.604 19.42 19.195 18.97 18.738 18.451 18.04 15.987 -8 ,10884 ,TETRA ,17601352,Sun Nov 28 14:35:41 CET,Sun Nov 28 16:25:08 CET,0.0 1.193 1.725 2.167 2.63 3.015 3.32 3.555 3.96 4.142 4.311 4.45 4.768 4.91 5.176 5.429 5.647 5.756 5.964 6.159 6.466 6.67 6.866 7.13 7.372 7.617 7.854 8.069 8.34 8.616 8.885 9.218 9.544 9.846 10.196 10.589 10.951 11.349 11.786 12.237 12.697 13.22 13.854 14.485 15.194 15.967 16.858 17.891 19.069 20.37 21.878 22.997 23.543 23.804 23.875 23.86 23.811 23.699 23.545 23.363 23.209 23.091 22.968 22.833 22.673 22.515 22.352 22.182 22.023 21.846 21.658 21.509 21.345 21.169 21.03 20.882 20.723 20.55 20.38 20.261 20.125 19.902 19.75 19.595 19.519 19.356 19.173 18.968 18.856 18.596 18.51 18.378 18.227 17.884 17.699 17.5 17.253 16.947 16.576 16.085 14.573 -9 ,3398 ,TETRA ,17601353,Sun Nov 28 14:35:43 CET,Sun Nov 28 16:25:00 CET,0.0 1.355 1.789 2.156 2.496 2.795 3.046 3.274 3.678 3.856 4.025 4.157 4.47 4.601 4.836 5.051 5.275 5.386 5.596 5.791 6.066 6.259 6.436 6.671 6.91 7.147 7.367 7.578 7.859 8.123 8.387 8.698 8.986 9.282 9.614 9.993 10.371 10.776 11.203 11.651 12.121 12.636 13.245 13.859 14.554 15.325 16.2 17.182 18.35 19.704 21.173 22.178 22.654 22.859 22.898 22.891 22.838 22.725 22.589 22.42 22.254 22.097 21.929 21.761 21.601 21.446 21.264 21.091 20.923 20.744 20.553 20.39 20.226 20.051 19.914 19.771 19.614 19.446 19.273 19.143 19.007 18.785 18.621 18.448 18.362 18.191 18.013 17.828 17.726 17.457 17.365 17.242 17.112 16.818 16.637 16.397 16.097 15.742 15.304 14.712 13.129 -10 ,26913 ,TETRA ,17601354,Sun Nov 28 14:35:45 CET,Sun Nov 28 16:25:19 CET,0.0 2.226 2.783 3.207 3.611 3.948 4.241 4.5 4.924 5.115 5.298 5.465 5.807 5.977 6.274 6.526 6.754 6.87 7.098 7.312 7.612 7.806 7.998 8.259 8.5 8.73 8.947 9.165 9.464 9.747 10.012 10.34 10.647 10.936 11.269 11.643 11.998 12.393 12.828 13.281 13.75 14.263 14.883 15.512 16.23 17.06 17.983 18.974 20.076 21.325 22.753 23.861 24.41 24.68 24.821 24.867 24.829 24.739 24.629 24.482 24.329 24.186 24.014 23.84 23.675 23.504 23.316 23.129 22.968 22.798 22.608 22.449 22.282 22.096 21.947 21.796 21.635 21.462 21.273 21.151 21.02 20.812 20.672 20.521 20.437 20.258 20.081 19.892 19.79 19.532 19.442 19.317 19.169 18.835 18.65 18.437 18.16 17.769 17.37 16.97 15.557 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_49_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_49_50.txt deleted file mode 100644 index d1c1e751..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_49_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9716 ,TETRA ,17601355,Sun Nov 28 14:35:46 CET,Sun Nov 28 16:24:46 CET,0.0 1.054 1.536 1.971 2.331 2.603 2.817 2.995 3.367 3.559 3.722 3.848 4.137 4.262 4.498 4.713 4.916 5.014 5.195 5.377 5.646 5.804 5.96 6.2 6.416 6.608 6.796 6.985 7.215 7.433 7.65 7.89 8.105 8.322 8.586 8.882 9.151 9.451 9.782 10.101 10.422 10.793 11.223 11.65 12.084 12.503 12.951 13.41 13.862 14.194 14.258 13.931 13.458 12.943 12.436 11.932 11.485 11.051 10.628 10.211 9.851 9.526 9.217 8.917 8.638 8.382 8.107 7.839 7.607 7.388 7.161 6.963 6.756 6.547 6.378 6.197 6.013 5.828 5.623 5.474 5.314 5.078 4.917 4.737 4.646 4.451 4.253 4.038 3.927 3.672 3.595 3.468 3.321 3.0 2.814 2.575 2.279 1.922 1.495 0.967 -0.129 -2 ,3000 ,TETRA ,17601356,Sun Nov 28 14:36:39 CET,Sun Nov 28 16:26:06 CET,0.0 1.083 1.656 1.957 2.24 2.476 2.682 2.875 3.185 3.318 3.457 3.591 3.873 3.99 4.211 4.417 4.606 4.7 4.881 5.055 5.309 5.466 5.616 5.842 6.058 6.249 6.436 6.632 6.88 7.111 7.33 7.601 7.855 8.096 8.364 8.641 8.917 9.221 9.525 9.823 10.141 10.491 10.874 11.244 11.643 12.061 12.498 12.92 13.312 13.605 13.692 13.314 12.776 12.285 11.793 11.301 10.824 10.384 10.01 9.6 9.238 8.912 8.585 8.267 7.973 7.691 7.391 7.137 6.922 6.684 6.438 6.244 6.035 5.808 5.632 5.459 5.271 5.078 4.875 4.737 4.595 4.364 4.205 4.024 3.929 3.732 3.513 3.275 3.15 2.874 2.761 2.611 2.462 2.148 1.974 1.793 1.585 1.358 1.086 0.719 -0.21 -3 ,4478 ,TETRA ,17601357,Sun Nov 28 14:36:39 CET,Sun Nov 28 16:25:46 CET,0.0 1.486 1.964 2.275 2.553 2.782 3.0 3.197 3.498 3.638 3.763 3.847 4.126 4.251 4.495 4.708 4.917 5.02 5.215 5.396 5.647 5.812 5.977 6.213 6.443 6.653 6.841 7.029 7.287 7.533 7.753 8.004 8.239 8.478 8.749 9.03 9.295 9.592 9.915 10.226 10.534 10.891 11.292 11.674 12.107 12.563 12.99 13.422 13.868 14.206 14.298 13.962 13.45 12.909 12.382 11.87 11.408 10.988 10.619 10.236 9.89 9.568 9.259 8.973 8.709 8.446 8.159 7.906 7.686 7.439 7.173 6.963 6.753 6.541 6.361 6.163 5.975 5.784 5.578 5.432 5.276 5.025 4.85 4.66 4.562 4.381 4.202 4.01 3.912 3.655 3.567 3.445 3.321 2.996 2.815 2.62 2.405 2.175 1.908 1.548 0.759 -4 ,32334 ,TETRA ,17601358,Sun Nov 28 14:36:39 CET,Sun Nov 28 16:29:02 CET,0.0 1.171 1.665 2.076 2.34 2.562 2.755 2.933 3.259 3.399 3.522 3.604 3.879 4.004 4.237 4.447 4.641 4.733 4.913 5.084 5.318 5.47 5.623 5.867 6.101 6.314 6.516 6.703 6.949 7.184 7.415 7.7 7.953 8.17 8.422 8.715 8.975 9.25 9.544 9.841 10.156 10.516 10.908 11.265 11.659 12.081 12.522 12.968 13.405 13.737 13.768 13.387 12.865 12.3 11.763 11.251 10.785 10.344 9.919 9.498 9.145 8.814 8.494 8.183 7.896 7.646 7.374 7.123 6.904 6.674 6.439 6.24 6.025 5.793 5.609 5.428 5.242 5.038 4.827 4.676 4.524 4.299 4.132 3.961 3.869 3.663 3.446 3.223 3.115 2.846 2.743 2.598 2.447 2.152 1.993 1.801 1.581 1.329 0.918 0.395 -0.757 -5 ,12763 ,TETRA ,17601359,Sun Nov 28 14:36:39 CET,Sun Nov 28 16:26:08 CET,0.0 0.955 1.379 1.678 1.932 2.165 2.39 2.581 2.924 3.094 3.263 3.405 3.692 3.831 4.089 4.318 4.526 4.623 4.811 4.992 5.248 5.416 5.583 5.805 6.023 6.235 6.425 6.614 6.86 7.092 7.314 7.579 7.819 8.04 8.312 8.617 8.884 9.179 9.492 9.793 10.104 10.46 10.857 11.246 11.667 12.082 12.513 12.979 13.462 13.809 13.911 13.584 13.037 12.449 11.894 11.374 10.88 10.397 9.968 9.521 9.144 8.825 8.503 8.17 7.863 7.584 7.293 7.041 6.814 6.575 6.315 6.092 5.861 5.626 5.446 5.258 5.069 4.864 4.644 4.49 4.325 4.088 3.925 3.738 3.642 3.456 3.284 3.112 3.016 2.758 2.678 2.549 2.426 2.171 2.023 1.864 1.654 1.429 1.204 0.847 -0.303 -6 ,7825 ,TETRA ,17601360,Sun Nov 28 14:36:41 CET,Sun Nov 28 16:26:01 CET,0.0 1.284 1.725 2.11 2.412 2.629 2.815 3.001 3.312 3.451 3.578 3.681 3.968 4.096 4.343 4.576 4.793 4.9 5.102 5.289 5.553 5.715 5.872 6.092 6.299 6.494 6.665 6.833 7.07 7.297 7.508 7.759 7.986 8.203 8.46 8.754 9.022 9.3 9.596 9.884 10.18 10.509 10.87 11.238 11.675 12.091 12.477 12.887 13.286 13.575 13.619 13.224 12.689 12.163 11.642 11.145 10.708 10.276 9.866 9.456 9.12 8.803 8.482 8.173 7.888 7.628 7.345 7.089 6.866 6.628 6.375 6.166 5.954 5.735 5.552 5.357 5.156 4.929 4.696 4.542 4.372 4.111 3.945 3.765 3.674 3.494 3.277 3.012 2.871 2.576 2.447 2.299 2.131 1.76 1.549 1.318 1.075 0.808 0.539 0.14 -0.838 -7 ,25121 ,TETRA ,17601361,Sun Nov 28 14:36:40 CET,Sun Nov 28 16:28:26 CET,0.0 1.709 2.181 2.468 2.71 2.985 3.208 3.391 3.747 3.925 4.095 4.231 4.513 4.638 4.88 5.111 5.332 5.437 5.634 5.823 6.104 6.274 6.436 6.666 6.88 7.076 7.269 7.47 7.73 7.964 8.186 8.461 8.716 8.949 9.217 9.524 9.818 10.128 10.442 10.758 11.085 11.426 11.794 12.169 12.612 13.071 13.546 14.009 14.41 14.707 14.862 14.609 14.123 13.581 13.077 12.614 12.154 11.705 11.296 10.868 10.504 10.156 9.789 9.449 9.143 8.872 8.595 8.33 8.094 7.842 7.584 7.377 7.165 6.94 6.745 6.543 6.35 6.155 5.945 5.799 5.647 5.41 5.25 5.078 4.991 4.823 4.644 4.428 4.296 4.017 3.935 3.814 3.69 3.39 3.194 3.007 2.818 2.576 2.225 1.763 0.619 -8 ,10171 ,TETRA ,17601362,Sun Nov 28 14:36:41 CET,Sun Nov 28 16:28:26 CET,0.0 1.2 1.639 1.988 2.279 2.531 2.748 2.949 3.316 3.47 3.611 3.711 3.98 4.099 4.321 4.544 4.773 4.876 5.045 5.205 5.451 5.625 5.807 6.073 6.333 6.573 6.8 7.023 7.298 7.558 7.78 8.042 8.301 8.546 8.838 9.142 9.421 9.729 10.051 10.365 10.682 11.043 11.461 11.869 12.302 12.745 13.23 13.679 14.047 14.335 14.437 14.071 13.514 12.933 12.393 11.905 11.464 11.042 10.663 10.275 9.912 9.576 9.258 8.957 8.66 8.394 8.133 7.897 7.682 7.437 7.189 6.998 6.793 6.57 6.403 6.237 6.06 5.868 5.666 5.529 5.386 5.161 5.002 4.818 4.714 4.513 4.299 4.071 3.961 3.689 3.586 3.449 3.283 2.878 2.66 2.428 2.185 1.92 1.602 1.151 -0.523 -9 ,30328 ,TETRA ,17601363,Sun Nov 28 14:36:39 CET,Sun Nov 28 16:26:03 CET,0.0 1.756 2.153 2.451 2.709 2.938 3.139 3.335 3.675 3.828 3.979 4.106 4.392 4.52 4.774 4.994 5.194 5.295 5.489 5.679 5.954 6.117 6.271 6.507 6.748 6.986 7.216 7.418 7.651 7.87 8.079 8.317 8.548 8.772 9.039 9.342 9.622 9.931 10.24 10.547 10.863 11.196 11.591 11.997 12.453 12.883 13.293 13.762 14.241 14.628 14.752 14.432 13.964 13.419 12.864 12.344 11.871 11.418 11.03 10.62 10.245 9.922 9.597 9.279 9.001 8.753 8.473 8.219 7.984 7.709 7.414 7.164 6.907 6.641 6.438 6.239 6.053 5.865 5.653 5.509 5.366 5.133 4.959 4.765 4.67 4.481 4.271 4.043 3.915 3.636 3.538 3.413 3.287 2.997 2.832 2.646 2.431 2.197 1.922 1.486 -0.317 -10 ,7764 ,TETRA ,17601364,Sun Nov 28 14:36:41 CET,Sun Nov 28 16:26:34 CET,0.0 1.306 1.716 2.006 2.231 2.436 2.621 2.79 3.089 3.245 3.399 3.512 3.789 3.915 4.146 4.356 4.56 4.66 4.854 5.036 5.296 5.452 5.597 5.824 6.058 6.272 6.462 6.641 6.886 7.125 7.34 7.6 7.84 8.069 8.34 8.631 8.895 9.175 9.463 9.772 10.075 10.393 10.77 11.135 11.539 11.954 12.375 12.812 13.239 13.553 13.612 13.275 12.771 12.226 11.7 11.186 10.737 10.314 9.923 9.522 9.177 8.872 8.569 8.277 7.994 7.734 7.459 7.204 6.978 6.734 6.494 6.311 6.122 5.92 5.755 5.577 5.404 5.221 5.015 4.874 4.726 4.497 4.337 4.17 4.082 3.916 3.747 3.562 3.461 3.204 3.136 3.01 2.861 2.538 2.348 2.141 1.932 1.675 1.375 0.942 -0.008 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_51_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_51_54.txt deleted file mode 100644 index 1fcf4c98..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_51_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9350 ,TETRA ,17601365,Sun Nov 28 14:36:44 CET,Sun Nov 28 16:28:20 CET,0.0 1.806 2.314 2.723 3.112 3.428 3.697 3.927 4.274 4.429 4.582 4.703 4.974 5.099 5.323 5.539 5.751 5.853 6.041 6.216 6.451 6.591 6.714 6.889 7.059 7.219 7.379 7.535 7.714 7.875 8.044 8.241 8.422 8.602 8.793 8.993 9.202 9.436 9.674 9.919 10.179 10.47 10.815 11.114 11.361 11.606 11.851 12.019 12.041 11.801 11.025 9.771 8.56 7.491 6.555 5.689 4.919 4.213 3.604 2.985 2.442 1.941 1.472 1.038 0.625 0.264 -0.112 -0.459 -0.743 -1.039 -1.359 -1.628 -1.914 -2.229 -2.471 -2.699 -2.94 -3.196 -3.465 -3.664 -3.868 -4.158 -4.356 -4.588 -4.717 -4.976 -5.246 -5.536 -5.682 -5.988 -6.172 -6.374 -6.578 -6.984 -7.197 -7.411 -7.658 -8.013 -8.591 -9.579 -13.808 -2 ,24799 ,TETRA ,17601366,Sun Nov 28 14:36:46 CET,Sun Nov 28 16:26:03 CET,0.0 2.081 2.531 2.92 3.235 3.504 3.744 3.962 4.346 4.531 4.694 4.83 5.107 5.234 5.473 5.678 5.867 5.956 6.121 6.295 6.553 6.708 6.849 7.04 7.232 7.43 7.612 7.778 7.991 8.192 8.362 8.538 8.711 8.882 9.061 9.243 9.422 9.626 9.855 10.072 10.281 10.553 10.829 11.04 11.25 11.423 11.574 11.695 11.705 11.473 10.729 9.532 8.393 7.357 6.437 5.604 4.834 4.141 3.545 2.925 2.406 1.933 1.457 1.013 0.6 0.24 -0.121 -0.457 -0.76 -1.066 -1.388 -1.665 -1.958 -2.27 -2.518 -2.78 -3.039 -3.299 -3.582 -3.779 -3.958 -4.249 -4.473 -4.7 -4.814 -5.05 -5.291 -5.543 -5.698 -6.017 -6.183 -6.37 -6.556 -6.942 -7.15 -7.377 -7.7 -8.083 -8.447 -8.985 -11.286 -3 ,30798 ,TETRA ,17601367,Sun Nov 28 14:37:40 CET,Sun Nov 28 16:34:20 CET,0.0 2.156 2.604 2.945 3.239 3.5 3.739 3.957 4.342 4.516 4.684 4.827 5.105 5.241 5.486 5.702 5.919 6.023 6.219 6.411 6.667 6.818 6.967 7.187 7.401 7.619 7.818 8.005 8.234 8.442 8.655 8.915 9.145 9.364 9.611 9.858 10.076 10.315 10.583 10.854 11.092 11.339 11.634 11.904 12.166 12.412 12.633 12.765 12.732 12.471 11.654 10.348 9.132 7.982 6.961 6.071 5.297 4.592 3.983 3.346 2.77 2.269 1.807 1.361 0.951 0.582 0.189 -0.16 -0.469 -0.795 -1.145 -1.453 -1.768 -2.082 -2.319 -2.553 -2.801 -3.085 -3.394 -3.608 -3.813 -4.11 -4.315 -4.552 -4.685 -4.952 -5.215 -5.474 -5.616 -5.93 -6.108 -6.283 -6.462 -6.884 -7.121 -7.378 -7.65 -7.925 -8.28 -8.852 -11.53 -4 ,19651 ,TETRA ,17601368,Sun Nov 28 14:37:38 CET,Sun Nov 28 16:27:46 CET,0.0 2.424 3.06 3.515 3.84 4.073 4.303 4.527 4.936 5.121 5.291 5.472 5.756 5.889 6.147 6.379 6.594 6.693 6.889 7.069 7.309 7.471 7.624 7.809 7.974 8.138 8.301 8.467 8.651 8.802 8.973 9.204 9.403 9.57 9.761 9.977 10.161 10.371 10.643 10.936 11.187 11.408 11.647 11.867 12.063 12.27 12.446 12.546 12.514 12.207 11.398 10.061 8.779 7.598 6.559 5.631 4.796 4.06 3.408 2.713 2.084 1.529 1.027 0.551 0.106 -0.31 -0.756 -1.149 -1.491 -1.854 -2.218 -2.516 -2.839 -3.17 -3.429 -3.713 -4.022 -4.344 -4.664 -4.869 -5.061 -5.358 -5.572 -5.809 -5.937 -6.201 -6.474 -6.76 -6.911 -7.226 -7.412 -7.596 -7.797 -8.245 -8.457 -8.674 -8.942 -9.227 -9.596 -10.142 -12.601 -5 ,12617 ,TETRA ,17601369,Sun Nov 28 14:37:39 CET,Sun Nov 28 16:29:47 CET,0.0 2.218 2.844 3.284 3.601 3.897 4.172 4.388 4.736 4.899 5.063 5.244 5.534 5.678 5.962 6.214 6.427 6.527 6.736 6.925 7.161 7.312 7.457 7.669 7.869 8.067 8.259 8.438 8.669 8.885 9.094 9.315 9.521 9.739 9.971 10.208 10.417 10.633 10.861 11.103 11.322 11.54 11.781 11.997 12.203 12.405 12.589 12.697 12.694 12.469 11.721 10.513 9.346 8.212 7.229 6.357 5.559 4.827 4.158 3.482 2.899 2.357 1.82 1.292 0.814 0.401 -0.039 -0.441 -0.791 -1.139 -1.496 -1.799 -2.114 -2.452 -2.711 -2.974 -3.251 -3.55 -3.875 -4.096 -4.312 -4.657 -4.895 -5.119 -5.243 -5.515 -5.796 -6.085 -6.229 -6.537 -6.717 -6.91 -7.114 -7.541 -7.789 -8.102 -8.422 -8.752 -9.161 -9.681 -12.059 -6 ,28604 ,TETRA ,17601370,Sun Nov 28 14:37:42 CET,Sun Nov 28 16:29:30 CET,0.0 2.016 2.606 3.021 3.324 3.602 3.841 4.047 4.42 4.588 4.75 4.902 5.173 5.293 5.535 5.766 5.977 6.073 6.254 6.431 6.677 6.84 6.996 7.217 7.427 7.623 7.809 7.988 8.218 8.431 8.633 8.859 9.055 9.235 9.447 9.68 9.895 10.116 10.333 10.554 10.794 11.051 11.292 11.517 11.746 11.941 12.117 12.235 12.25 11.943 11.034 9.73 8.53 7.408 6.372 5.384 4.523 3.74 3.049 2.359 1.773 1.256 0.728 0.216 -0.237 -0.657 -1.112 -1.519 -1.883 -2.252 -2.612 -2.932 -3.292 -3.638 -3.901 -4.193 -4.493 -4.801 -5.103 -5.294 -5.498 -5.835 -6.091 -6.375 -6.508 -6.763 -7.053 -7.37 -7.529 -7.846 -8.014 -8.198 -8.389 -8.811 -9.068 -9.366 -9.692 -10.058 -10.446 -10.967 -13.132 -7 ,3255 ,TETRA ,17601371,Sun Nov 28 14:37:40 CET,Sun Nov 28 16:30:39 CET,0.0 8.039 8.815 9.254 9.533 9.76 9.968 10.155 10.511 10.683 10.844 10.991 11.275 11.39 11.591 11.791 11.994 12.095 12.273 12.446 12.699 12.869 13.033 13.252 13.456 13.615 13.769 13.925 14.122 14.305 14.474 14.677 14.857 15.026 15.244 15.513 15.767 16.021 16.229 16.434 16.641 16.855 17.091 17.317 17.568 17.813 17.99 18.059 17.991 17.653 16.799 15.428 14.131 12.983 11.982 11.049 10.213 9.467 8.828 8.197 7.635 7.1 6.595 6.123 5.691 5.281 4.836 4.435 4.104 3.78 3.435 3.132 2.801 2.45 2.192 1.932 1.654 1.351 1.023 0.803 0.578 0.236 0.002 -0.245 -0.379 -0.654 -0.929 -1.214 -1.371 -1.7 -1.886 -2.065 -2.258 -2.692 -2.938 -3.206 -3.495 -3.794 -4.174 -4.691 -8.732 -8 ,23822 ,TETRA ,17601372,Sun Nov 28 14:37:39 CET,Sun Nov 28 16:27:43 CET,0.0 1.52 1.879 2.151 2.374 2.596 2.814 3.021 3.407 3.57 3.717 3.808 4.053 4.17 4.401 4.603 4.806 4.91 5.109 5.287 5.52 5.662 5.814 6.043 6.241 6.425 6.602 6.789 7.029 7.231 7.416 7.635 7.844 8.037 8.246 8.479 8.707 8.955 9.22 9.472 9.69 9.905 10.129 10.327 10.528 10.726 10.883 10.968 10.923 10.582 9.713 8.33 7.024 5.839 4.761 3.804 2.964 2.196 1.537 0.862 0.282 -0.24 -0.769 -1.257 -1.7 -2.13 -2.6 -3.019 -3.381 -3.742 -4.117 -4.432 -4.757 -5.099 -5.368 -5.644 -5.93 -6.218 -6.509 -6.716 -6.941 -7.283 -7.511 -7.753 -7.868 -8.096 -8.345 -8.603 -8.751 -9.076 -9.298 -9.494 -9.707 -10.163 -10.414 -10.694 -10.981 -11.362 -11.88 -12.492 -15.093 -9 ,1151 ,TETRA ,17601373,Sun Nov 28 14:37:40 CET,Sun Nov 28 16:30:58 CET,0.0 4.031 4.51 4.915 5.239 5.503 5.733 5.92 6.232 6.376 6.503 6.614 6.886 7.009 7.263 7.5 7.693 7.775 7.948 8.126 8.373 8.529 8.681 8.904 9.112 9.303 9.487 9.664 9.897 10.126 10.334 10.547 10.746 10.95 11.166 11.38 11.565 11.767 11.991 12.226 12.465 12.712 12.986 13.21 13.443 13.681 13.845 13.943 13.921 13.652 12.866 11.47 10.182 9.039 7.957 7.01 6.216 5.46 4.754 4.05 3.477 2.961 2.421 1.906 1.424 0.962 0.479 0.071 -0.277 -0.658 -1.052 -1.363 -1.682 -2.042 -2.328 -2.602 -2.88 -3.171 -3.489 -3.711 -3.937 -4.321 -4.571 -4.819 -4.945 -5.199 -5.49 -5.818 -5.983 -6.299 -6.49 -6.67 -6.872 -7.346 -7.582 -7.829 -8.103 -8.424 -8.855 -9.424 -11.147 -10 ,28673 ,TETRA ,17601374,Sun Nov 28 14:37:40 CET,Sun Nov 28 16:27:42 CET,0.0 2.727 3.244 3.632 3.952 4.22 4.441 4.645 5.021 5.183 5.341 5.499 5.772 5.897 6.137 6.35 6.542 6.637 6.832 7.011 7.266 7.434 7.59 7.823 8.046 8.238 8.412 8.582 8.806 9.02 9.218 9.449 9.677 9.884 10.102 10.339 10.57 10.826 11.07 11.317 11.6 11.881 12.161 12.424 12.668 12.908 13.099 13.151 13.081 12.78 11.962 10.651 9.387 8.264 7.248 6.315 5.496 4.737 4.053 3.357 2.79 2.311 1.86 1.438 1.043 0.681 0.297 -0.065 -0.381 -0.702 -1.024 -1.285 -1.574 -1.888 -2.124 -2.361 -2.611 -2.872 -3.123 -3.295 -3.481 -3.781 -4.002 -4.241 -4.36 -4.591 -4.833 -5.092 -5.242 -5.573 -5.781 -5.974 -6.171 -6.633 -6.918 -7.215 -7.507 -7.874 -8.35 -9.067 -13.075 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_52_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_52_53.txt deleted file mode 100644 index 438839ea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_52_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5958 ,TETRA ,17601375,Sun Nov 28 14:37:41 CET,Sun Nov 28 16:26:56 CET,0.0 1.709 2.233 2.577 2.854 3.104 3.352 3.581 3.975 4.152 4.313 4.454 4.767 4.919 5.21 5.458 5.665 5.768 5.965 6.144 6.395 6.56 6.722 6.942 7.166 7.387 7.58 7.766 8.004 8.225 8.437 8.701 8.963 9.205 9.474 9.777 10.053 10.335 10.637 10.953 11.265 11.613 12.003 12.378 12.79 13.205 13.654 14.128 14.557 14.848 14.978 14.676 14.133 13.553 12.981 12.442 11.953 11.474 11.061 10.627 10.235 9.908 9.587 9.261 8.953 8.671 8.364 8.088 7.857 7.608 7.341 7.112 6.869 6.622 6.433 6.238 6.023 5.789 5.541 5.364 5.197 4.953 4.76 4.56 4.461 4.252 4.009 3.737 3.591 3.273 3.078 2.911 2.729 2.352 2.182 2.003 1.783 1.498 1.221 0.846 -0.419 -2 ,29330 ,TETRA ,17601376,Sun Nov 28 14:37:42 CET,Sun Nov 28 16:26:38 CET,0.0 1.378 1.796 2.116 2.416 2.679 2.924 3.138 3.495 3.678 3.854 3.991 4.279 4.411 4.661 4.887 5.103 5.208 5.405 5.601 5.896 6.088 6.264 6.509 6.734 6.942 7.14 7.34 7.618 7.869 8.09 8.368 8.632 8.862 9.13 9.426 9.704 10.016 10.339 10.668 11.007 11.379 11.775 12.133 12.544 12.985 13.402 13.808 14.219 14.514 14.524 14.157 13.662 13.081 12.533 12.039 11.555 11.079 10.665 10.247 9.839 9.464 9.123 8.797 8.482 8.186 7.884 7.617 7.378 7.113 6.817 6.567 6.321 6.061 5.849 5.627 5.403 5.169 4.898 4.716 4.545 4.263 4.055 3.826 3.703 3.447 3.185 2.921 2.778 2.477 2.33 2.169 2.016 1.675 1.474 1.263 1.055 0.81 0.495 -0.04 -1.405 -3 ,32494 ,TETRA ,17601377,Sun Nov 28 14:37:44 CET,Sun Nov 28 16:26:38 CET,0.0 1.769 2.306 2.658 2.901 3.1 3.288 3.458 3.771 3.921 4.07 4.19 4.478 4.598 4.83 5.071 5.291 5.386 5.564 5.733 5.969 6.125 6.282 6.513 6.727 6.925 7.132 7.328 7.555 7.773 7.99 8.261 8.522 8.759 9.042 9.364 9.664 9.973 10.272 10.582 10.901 11.238 11.613 11.983 12.412 12.853 13.294 13.73 14.17 14.5 14.554 14.239 13.753 13.228 12.689 12.174 11.704 11.231 10.827 10.414 10.036 9.7 9.38 9.063 8.753 8.476 8.19 7.933 7.699 7.451 7.202 6.986 6.759 6.52 6.33 6.137 5.927 5.704 5.476 5.323 5.161 4.897 4.717 4.528 4.421 4.205 3.975 3.723 3.604 3.326 3.236 3.112 2.976 2.676 2.479 2.254 2.022 1.752 1.392 0.957 0.279 -4 ,31093 ,TETRA ,17601378,Sun Nov 28 14:38:39 CET,Sun Nov 28 16:28:36 CET,0.0 1.888 2.399 2.794 3.136 3.418 3.677 3.916 4.339 4.528 4.697 4.873 5.195 5.347 5.619 5.877 6.12 6.235 6.466 6.671 6.932 7.108 7.282 7.534 7.767 7.982 8.193 8.392 8.636 8.867 9.083 9.342 9.586 9.813 10.094 10.401 10.66 10.935 11.23 11.523 11.856 12.244 12.636 13.008 13.411 13.802 14.201 14.621 15.023 15.308 15.406 15.076 14.521 13.948 13.406 12.879 12.386 11.919 11.524 11.145 10.805 10.471 10.125 9.79 9.479 9.202 8.916 8.642 8.409 8.158 7.874 7.659 7.436 7.198 7.006 6.794 6.572 6.345 6.124 5.962 5.785 5.506 5.311 5.107 4.995 4.745 4.5 4.273 4.154 3.867 3.753 3.611 3.466 3.126 2.892 2.629 2.365 2.085 1.732 1.225 -0.341 -5 ,55 ,TETRA ,17601379,Sun Nov 28 14:38:39 CET,Sun Nov 28 16:30:07 CET,0.0 1.737 2.225 2.596 2.921 3.224 3.494 3.753 4.227 4.435 4.609 4.747 5.056 5.204 5.458 5.705 5.95 6.06 6.267 6.454 6.72 6.885 7.035 7.258 7.487 7.698 7.896 8.095 8.341 8.57 8.785 9.049 9.296 9.52 9.785 10.097 10.394 10.704 11.014 11.322 11.645 12.013 12.424 12.804 13.222 13.641 14.092 14.55 14.991 15.371 15.488 15.149 14.623 14.076 13.523 12.972 12.472 12.011 11.596 11.145 10.756 10.407 10.056 9.731 9.419 9.115 8.817 8.554 8.289 7.987 7.675 7.434 7.195 6.953 6.765 6.56 6.355 6.148 5.927 5.77 5.614 5.379 5.215 5.04 4.956 4.788 4.582 4.351 4.23 3.948 3.874 3.734 3.593 3.328 3.171 2.985 2.794 2.564 2.251 1.82 0.221 -6 ,7298 ,TETRA ,17601380,Sun Nov 28 14:38:38 CET,Sun Nov 28 16:28:52 CET,0.0 1.486 2.001 2.361 2.677 2.938 3.182 3.409 3.752 3.896 4.045 4.192 4.495 4.634 4.886 5.12 5.331 5.435 5.64 5.826 6.08 6.242 6.401 6.637 6.861 7.074 7.279 7.468 7.708 7.927 8.151 8.419 8.676 8.931 9.199 9.498 9.781 10.073 10.388 10.705 11.036 11.396 11.794 12.19 12.595 13.002 13.461 13.917 14.35 14.652 14.668 14.31 13.783 13.232 12.7 12.196 11.727 11.247 10.83 10.396 10.004 9.665 9.342 9.037 8.759 8.52 8.273 8.039 7.828 7.616 7.38 7.153 6.904 6.647 6.451 6.261 6.068 5.868 5.652 5.506 5.351 5.092 4.923 4.738 4.642 4.455 4.272 4.074 3.959 3.675 3.549 3.401 3.251 2.938 2.772 2.575 2.341 2.066 1.728 1.257 0.115 -7 ,9725 ,TETRA ,17601381,Sun Nov 28 14:38:41 CET,Sun Nov 28 16:28:54 CET,0.0 1.733 2.206 2.514 2.802 3.066 3.305 3.516 3.856 4.003 4.151 4.271 4.561 4.684 4.933 5.186 5.423 5.536 5.738 5.917 6.18 6.359 6.548 6.819 7.053 7.256 7.434 7.616 7.846 8.057 8.25 8.484 8.726 8.96 9.217 9.487 9.73 9.985 10.264 10.548 10.821 11.127 11.503 11.87 12.258 12.671 13.12 13.533 13.894 14.191 14.316 14.01 13.487 12.921 12.375 11.851 11.343 10.87 10.456 10.011 9.609 9.235 8.874 8.545 8.228 7.931 7.639 7.36 7.102 6.842 6.557 6.315 6.074 5.817 5.622 5.418 5.194 4.976 4.749 4.585 4.421 4.168 3.982 3.782 3.677 3.458 3.245 3.03 2.904 2.595 2.432 2.283 2.14 1.8 1.616 1.419 1.171 0.913 0.616 0.197 -1.256 -8 ,28663 ,TETRA ,17601382,Sun Nov 28 14:38:39 CET,Sun Nov 28 16:27:46 CET,0.0 1.402 1.958 2.372 2.634 2.857 3.087 3.317 3.698 3.867 4.026 4.178 4.489 4.635 4.909 5.19 5.426 5.534 5.755 5.948 6.228 6.406 6.572 6.81 7.027 7.228 7.413 7.595 7.846 8.089 8.318 8.578 8.804 9.025 9.288 9.575 9.855 10.167 10.495 10.819 11.148 11.519 11.933 12.333 12.771 13.218 13.697 14.145 14.55 14.863 14.959 14.707 14.235 13.668 13.159 12.659 12.175 11.712 11.269 10.814 10.427 10.077 9.726 9.399 9.096 8.806 8.496 8.208 7.958 7.696 7.424 7.199 6.957 6.7 6.499 6.292 6.082 5.87 5.644 5.487 5.328 5.074 4.898 4.719 4.622 4.407 4.175 3.927 3.796 3.496 3.326 3.165 3.011 2.654 2.434 2.162 1.89 1.62 1.285 0.842 -0.818 -9 ,19423 ,TETRA ,17601383,Sun Nov 28 14:38:39 CET,Sun Nov 28 16:27:34 CET,0.0 2.049 2.625 3.061 3.379 3.66 3.921 4.15 4.541 4.721 4.891 5.04 5.346 5.487 5.736 5.952 6.15 6.241 6.412 6.575 6.81 6.982 7.152 7.398 7.624 7.834 8.041 8.236 8.484 8.735 8.989 9.274 9.524 9.75 10.012 10.315 10.601 10.897 11.2 11.525 11.872 12.242 12.629 13.001 13.432 13.859 14.322 14.801 15.243 15.594 15.71 15.369 14.852 14.29 13.748 13.244 12.762 12.298 11.885 11.458 11.089 10.744 10.398 10.063 9.753 9.475 9.167 8.876 8.612 8.341 8.068 7.83 7.58 7.329 7.125 6.911 6.696 6.484 6.262 6.11 5.958 5.698 5.517 5.319 5.207 4.977 4.731 4.481 4.362 4.079 3.977 3.816 3.62 3.229 3.048 2.855 2.629 2.337 1.975 1.574 0.701 -10 ,16695 ,TETRA ,17601384,Sun Nov 28 14:38:42 CET,Sun Nov 28 16:27:50 CET,0.0 1.193 1.662 2.049 2.343 2.594 2.826 3.013 3.371 3.548 3.711 3.862 4.164 4.301 4.556 4.808 5.027 5.131 5.333 5.512 5.769 5.941 6.098 6.308 6.51 6.711 6.915 7.113 7.364 7.596 7.82 8.081 8.322 8.559 8.824 9.119 9.39 9.677 9.983 10.3 10.608 10.926 11.302 11.677 12.072 12.479 12.909 13.338 13.759 14.075 14.112 13.703 13.161 12.576 12.015 11.491 11.003 10.562 10.151 9.695 9.295 8.939 8.6 8.281 7.986 7.705 7.384 7.097 6.857 6.609 6.343 6.116 5.884 5.646 5.454 5.244 5.022 4.802 4.584 4.432 4.265 3.989 3.791 3.577 3.47 3.268 3.045 2.807 2.683 2.392 2.269 2.128 1.975 1.608 1.412 1.226 1.013 0.754 0.466 0.033 -1.489 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_53_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_53_54.txt deleted file mode 100644 index 53c32bb5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_53_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17227 ,TETRA ,17601385,Sun Nov 28 14:38:44 CET,Sun Nov 28 16:28:44 CET,0.0 1.562 2.003 2.31 2.555 2.78 2.961 3.134 3.466 3.611 3.761 3.871 4.144 4.253 4.466 4.664 4.862 4.963 5.163 5.341 5.598 5.773 5.937 6.166 6.386 6.601 6.82 7.048 7.334 7.591 7.834 8.118 8.381 8.64 8.946 9.294 9.62 9.971 10.363 10.788 11.23 11.719 12.273 12.814 13.436 14.109 14.842 15.676 16.616 17.589 18.621 19.222 19.379 19.34 19.152 18.858 18.562 18.275 18.011 17.751 17.513 17.289 17.068 16.845 16.631 16.421 16.188 15.977 15.791 15.593 15.378 15.193 14.993 14.789 14.631 14.451 14.263 14.065 13.848 13.699 13.537 13.284 13.114 12.927 12.829 12.641 12.446 12.23 12.116 11.826 11.695 11.539 11.377 10.978 10.763 10.565 10.333 10.048 9.69 9.249 7.872 -2 ,27313 ,TETRA ,17601386,Sun Nov 28 14:39:39 CET,Sun Nov 28 16:29:56 CET,0.0 1.086 1.395 1.639 1.871 2.076 2.271 2.444 2.733 2.867 2.998 3.093 3.365 3.479 3.699 3.917 4.121 4.221 4.409 4.581 4.816 4.972 5.135 5.364 5.576 5.783 5.996 6.21 6.465 6.691 6.917 7.197 7.461 7.719 8.014 8.333 8.636 8.971 9.343 9.729 10.127 10.584 11.11 11.638 12.282 12.999 13.792 14.642 15.557 16.521 17.542 18.182 18.374 18.281 18.082 17.865 17.599 17.301 17.055 16.788 16.507 16.243 15.991 15.744 15.504 15.266 14.989 14.725 14.505 14.28 14.052 13.865 13.661 13.44 13.253 13.053 12.847 12.645 12.417 12.255 12.114 11.882 11.71 11.542 11.456 11.279 11.085 10.867 10.747 10.458 10.325 10.18 10.032 9.709 9.53 9.326 9.077 8.799 8.432 7.977 6.56 -3 ,11741 ,TETRA ,17601387,Sun Nov 28 14:39:41 CET,Sun Nov 28 16:29:55 CET,0.0 1.089 1.407 1.662 1.882 2.077 2.259 2.413 2.69 2.825 2.953 3.045 3.322 3.429 3.62 3.798 3.983 4.08 4.265 4.438 4.683 4.835 4.984 5.202 5.42 5.629 5.824 6.011 6.255 6.502 6.745 7.029 7.3 7.573 7.89 8.217 8.528 8.875 9.236 9.618 10.031 10.508 11.053 11.58 12.163 12.805 13.546 14.41 15.423 16.47 17.461 18.03 18.176 18.134 17.983 17.753 17.509 17.239 16.974 16.678 16.409 16.167 15.915 15.664 15.424 15.186 14.931 14.709 14.496 14.267 14.027 13.821 13.61 13.392 13.233 13.068 12.882 12.689 12.487 12.346 12.199 11.963 11.79 11.61 11.514 11.305 11.085 10.852 10.723 10.429 10.299 10.144 9.976 9.637 9.454 9.256 9.013 8.751 8.41 7.921 6.987 -4 ,4853 ,TETRA ,17601388,Sun Nov 28 14:39:43 CET,Sun Nov 28 16:29:55 CET,0.0 0.841 1.214 1.439 1.64 1.843 2.025 2.195 2.506 2.649 2.797 2.913 3.194 3.316 3.567 3.806 4.016 4.111 4.296 4.48 4.727 4.879 5.022 5.236 5.454 5.663 5.865 6.055 6.288 6.522 6.752 7.029 7.316 7.595 7.907 8.243 8.539 8.882 9.261 9.634 10.049 10.505 11.014 11.535 12.126 12.79 13.573 14.402 15.29 16.282 17.307 17.869 17.995 17.934 17.753 17.509 17.25 16.98 16.73 16.462 16.197 15.946 15.688 15.436 15.204 14.976 14.73 14.511 14.305 14.074 13.831 13.631 13.431 13.231 13.065 12.888 12.704 12.493 12.278 12.135 11.98 11.748 11.575 11.381 11.28 11.051 10.803 10.531 10.383 10.08 9.937 9.782 9.625 9.255 9.066 8.871 8.647 8.38 8.04 7.55 6.105 -5 ,4635 ,TETRA ,17601389,Sun Nov 28 14:39:39 CET,Sun Nov 28 16:29:37 CET,0.0 0.749 1.128 1.486 1.794 2.001 2.193 2.378 2.715 2.863 3.007 3.125 3.411 3.536 3.772 3.988 4.197 4.297 4.481 4.663 4.932 5.1 5.262 5.496 5.726 5.943 6.142 6.322 6.552 6.774 6.991 7.267 7.538 7.796 8.089 8.427 8.752 9.099 9.464 9.852 10.264 10.743 11.302 11.818 12.396 13.042 13.778 14.61 15.536 16.553 17.62 18.221 18.361 18.263 18.056 17.84 17.589 17.326 17.089 16.812 16.571 16.345 16.095 15.839 15.595 15.377 15.141 14.924 14.722 14.51 14.277 14.074 13.866 13.651 13.491 13.324 13.135 12.922 12.704 12.553 12.396 12.159 11.997 11.826 11.733 11.536 11.331 11.096 10.96 10.672 10.57 10.424 10.273 9.949 9.761 9.543 9.28 8.972 8.608 8.137 7.03 -6 ,6280 ,TETRA ,17601390,Sun Nov 28 14:39:40 CET,Sun Nov 28 16:29:33 CET,0.0 3.541 4.378 4.837 5.149 5.413 5.652 5.876 6.264 6.426 6.581 6.714 7.004 7.13 7.369 7.593 7.817 7.925 8.129 8.327 8.612 8.791 8.96 9.209 9.444 9.657 9.855 10.047 10.291 10.513 10.751 11.044 11.301 11.555 11.872 12.23 12.549 12.897 13.272 13.665 14.083 14.574 15.152 15.699 16.301 16.976 17.756 18.589 19.535 20.541 21.591 22.252 22.417 22.341 22.192 21.974 21.711 21.454 21.196 20.889 20.571 20.261 19.985 19.72 19.425 19.115 18.804 18.529 18.257 17.982 17.746 17.561 17.372 17.144 16.953 16.776 16.584 16.378 16.156 15.992 15.819 15.556 15.386 15.203 15.095 14.862 14.624 14.367 14.228 13.929 13.785 13.626 13.445 13.024 12.805 12.573 12.337 12.064 11.707 11.276 9.759 -7 ,831 ,TETRA ,17601391,Sun Nov 28 14:39:41 CET,Sun Nov 28 16:29:35 CET,0.0 1.17 1.593 1.853 2.082 2.293 2.471 2.624 2.917 3.063 3.204 3.306 3.6 3.723 3.938 4.151 4.364 4.464 4.649 4.831 5.09 5.267 5.449 5.686 5.899 6.11 6.312 6.504 6.755 7.0 7.236 7.517 7.789 8.055 8.359 8.699 9.018 9.362 9.749 10.174 10.585 11.024 11.549 12.061 12.65 13.295 14.06 14.904 15.826 16.85 17.862 18.43 18.576 18.497 18.308 18.068 17.815 17.557 17.299 16.995 16.709 16.453 16.211 15.929 15.662 15.439 15.195 14.993 14.817 14.613 14.389 14.189 13.977 13.762 13.6 13.435 13.259 13.067 12.876 12.755 12.621 12.383 12.222 12.053 11.965 11.776 11.554 11.316 11.191 10.913 10.817 10.668 10.488 10.128 9.937 9.73 9.508 9.232 8.897 8.241 5.203 -8 ,3146 ,TETRA ,17601392,Sun Nov 28 14:39:43 CET,Sun Nov 28 16:29:32 CET,0.0 0.678 0.999 1.268 1.493 1.694 1.891 2.07 2.383 2.537 2.684 2.769 3.05 3.162 3.369 3.581 3.781 3.874 4.057 4.242 4.514 4.679 4.829 5.05 5.272 5.491 5.695 5.88 6.12 6.362 6.599 6.878 7.148 7.412 7.723 8.076 8.391 8.728 9.116 9.529 9.949 10.416 10.949 11.492 12.123 12.804 13.563 14.415 15.378 16.414 17.49 18.167 18.243 18.025 17.8 17.572 17.338 17.084 16.834 16.549 16.272 16.022 15.788 15.551 15.292 15.053 14.82 14.613 14.422 14.213 13.998 13.798 13.568 13.32 13.12 12.913 12.693 12.464 12.216 12.037 11.869 11.62 11.429 11.215 11.106 10.87 10.598 10.318 10.179 9.882 9.746 9.586 9.409 8.988 8.749 8.491 8.224 7.953 7.635 7.144 5.385 -9 ,22147 ,TETRA ,17601393,Sun Nov 28 14:40:38 CET,Sun Nov 28 16:29:53 CET,0.0 1.609 2.16 2.526 2.821 3.098 3.358 3.589 3.995 4.178 4.364 4.581 4.92 5.078 5.376 5.627 5.836 5.934 6.118 6.304 6.587 6.763 6.922 7.156 7.381 7.598 7.799 7.991 8.244 8.49 8.728 9.014 9.282 9.536 9.843 10.182 10.496 10.848 11.23 11.645 12.081 12.545 13.074 13.599 14.199 14.86 15.615 16.437 17.349 18.377 19.509 20.187 20.42 20.406 20.25 20.014 19.762 19.515 19.235 18.905 18.642 18.402 18.138 17.876 17.639 17.431 17.191 16.959 16.763 16.565 16.371 16.19 15.981 15.777 15.604 15.404 15.212 15.022 14.821 14.663 14.487 14.24 14.08 13.916 13.814 13.575 13.348 13.117 12.991 12.7 12.573 12.431 12.276 11.912 11.715 11.484 11.224 10.949 10.581 10.084 7.761 -10 ,30483 ,TETRA ,17601394,Sun Nov 28 14:40:41 CET,Sun Nov 28 16:29:52 CET,0.0 2.388 2.827 3.11 3.34 3.554 3.737 3.905 4.184 4.303 4.437 4.556 4.834 4.943 5.155 5.366 5.565 5.659 5.849 6.033 6.291 6.454 6.614 6.837 7.044 7.247 7.461 7.672 7.939 8.191 8.416 8.69 8.966 9.227 9.53 9.872 10.2 10.539 10.892 11.266 11.67 12.145 12.685 13.222 13.823 14.474 15.195 15.974 16.83 17.81 18.903 19.548 19.722 19.658 19.491 19.272 19.061 18.825 18.577 18.3 18.027 17.787 17.557 17.313 17.048 16.779 16.487 16.22 15.982 15.758 15.547 15.364 15.156 14.901 14.702 14.507 14.304 14.096 13.889 13.752 13.613 13.387 13.209 13.007 12.909 12.712 12.496 12.28 12.173 11.91 11.809 11.664 11.512 11.168 10.991 10.762 10.441 10.037 9.562 8.951 7.053 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_53_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_53_58.txt deleted file mode 100644 index 145df341..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_53_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5502 ,TETRA ,17601395,Sun Nov 28 14:40:38 CET,Sun Nov 28 16:31:12 CET,0.0 2.672 3.31 3.685 3.993 4.273 4.54 4.771 5.196 5.398 5.579 5.742 6.053 6.189 6.439 6.696 6.94 7.055 7.277 7.482 7.786 7.979 8.147 8.38 8.616 8.834 9.055 9.27 9.531 9.785 10.018 10.296 10.572 10.833 11.124 11.449 11.752 12.086 12.438 12.791 13.16 13.576 14.029 14.454 14.925 15.4 15.904 16.411 16.918 17.358 17.574 17.359 16.93 16.413 15.899 15.372 14.888 14.469 14.061 13.609 13.23 12.893 12.558 12.215 11.883 11.565 11.212 10.873 10.59 10.334 10.078 9.859 9.63 9.381 9.175 8.957 8.735 8.517 8.282 8.124 7.969 7.73 7.547 7.343 7.247 7.058 6.847 6.614 6.489 6.191 6.071 5.929 5.786 5.488 5.321 5.119 4.887 4.619 4.306 3.918 3.155 -2 ,27465 ,TETRA ,17601396,Sun Nov 28 14:41:39 CET,Sun Nov 28 16:35:59 CET,0.0 2.493 3.099 3.525 3.897 4.216 4.48 4.728 5.2 5.393 5.564 5.747 6.059 6.202 6.491 6.762 7.001 7.113 7.352 7.583 7.891 8.085 8.271 8.552 8.814 9.05 9.266 9.47 9.755 10.036 10.294 10.591 10.849 11.077 11.352 11.695 11.999 12.297 12.618 12.96 13.298 13.679 14.099 14.496 14.966 15.471 16.027 16.563 17.061 17.531 17.79 17.607 17.27 16.77 16.255 15.757 15.248 14.822 14.434 13.969 13.561 13.2 12.83 12.488 12.192 11.908 11.61 11.337 11.088 10.832 10.572 10.35 10.102 9.85 9.655 9.451 9.233 9.009 8.782 8.617 8.44 8.185 8.024 7.842 7.747 7.55 7.326 7.084 6.958 6.673 6.578 6.44 6.295 6.0 5.832 5.637 5.43 5.206 4.958 4.652 3.689 -3 ,2630 ,TETRA ,17601397,Sun Nov 28 14:41:38 CET,Sun Nov 28 16:31:48 CET,0.0 1.535 2.127 2.481 2.757 3.035 3.298 3.516 3.922 4.127 4.315 4.504 4.813 4.955 5.238 5.495 5.714 5.827 6.048 6.251 6.545 6.72 6.887 7.133 7.368 7.604 7.827 8.028 8.304 8.559 8.788 9.059 9.319 9.579 9.884 10.212 10.498 10.805 11.134 11.477 11.816 12.196 12.638 13.041 13.486 13.987 14.53 15.024 15.512 16.03 16.343 16.023 15.506 14.952 14.448 13.956 13.447 12.974 12.554 12.102 11.714 11.353 10.998 10.659 10.335 10.045 9.728 9.435 9.184 8.929 8.664 8.427 8.183 7.923 7.722 7.513 7.274 7.028 6.775 6.597 6.416 6.138 5.949 5.753 5.658 5.461 5.254 5.052 4.94 4.649 4.528 4.388 4.252 3.923 3.72 3.525 3.342 3.138 2.891 2.522 0.525 -4 ,11729 ,TETRA ,17601398,Sun Nov 28 14:41:41 CET,Sun Nov 28 16:31:47 CET,0.0 1.971 2.521 2.849 3.167 3.472 3.716 3.933 4.378 4.578 4.766 4.948 5.246 5.395 5.683 5.94 6.185 6.3 6.524 6.728 7.006 7.176 7.346 7.607 7.846 8.054 8.266 8.475 8.726 8.964 9.197 9.48 9.737 9.989 10.281 10.596 10.899 11.203 11.515 11.854 12.207 12.6 13.041 13.458 13.926 14.409 14.906 15.453 16.002 16.424 16.649 16.469 16.035 15.519 14.999 14.477 14.021 13.603 13.226 12.792 12.388 12.037 11.701 11.368 11.023 10.707 10.39 10.114 9.872 9.599 9.281 9.022 8.793 8.576 8.403 8.226 8.041 7.838 7.624 7.471 7.311 7.071 6.906 6.73 6.631 6.415 6.186 5.952 5.832 5.555 5.472 5.34 5.204 4.897 4.731 4.53 4.303 4.076 3.835 3.541 2.22 -5 ,7241 ,TETRA ,17601399,Sun Nov 28 14:42:38 CET,Sun Nov 28 16:33:33 CET,0.0 2.222 2.822 3.26 3.632 3.957 4.26 4.546 5.003 5.199 5.389 5.543 5.848 6.0 6.297 6.571 6.823 6.943 7.184 7.422 7.757 7.966 8.161 8.426 8.677 8.93 9.173 9.409 9.689 9.926 10.167 10.451 10.709 10.948 11.223 11.546 11.861 12.226 12.576 12.912 13.256 13.647 14.135 14.591 15.062 15.542 16.103 16.66 17.188 17.667 17.887 17.63 17.159 16.642 16.129 15.625 15.133 14.685 14.278 13.847 13.479 13.143 12.791 12.454 12.167 11.885 11.561 11.273 11.011 10.737 10.474 10.253 10.004 9.745 9.542 9.321 9.095 8.865 8.628 8.462 8.291 8.021 7.832 7.639 7.539 7.336 7.128 6.91 6.785 6.494 6.414 6.284 6.135 5.806 5.641 5.448 5.225 4.965 4.664 4.289 2.235 -6 ,17202 ,TETRA ,17601400,Sun Nov 28 14:42:41 CET,Sun Nov 28 16:32:43 CET,0.0 1.667 2.249 2.716 3.057 3.343 3.591 3.827 4.284 4.488 4.674 4.843 5.154 5.297 5.552 5.79 6.028 6.144 6.355 6.552 6.834 7.016 7.197 7.451 7.685 7.908 8.129 8.34 8.615 8.9 9.159 9.437 9.715 9.983 10.282 10.592 10.875 11.186 11.504 11.843 12.198 12.597 13.013 13.402 13.878 14.394 14.932 15.402 15.838 16.242 16.44 16.244 15.88 15.385 14.838 14.314 13.841 13.385 12.957 12.503 12.119 11.758 11.397 11.071 10.77 10.486 10.196 9.944 9.703 9.442 9.175 8.958 8.734 8.504 8.324 8.116 7.906 7.715 7.501 7.339 7.163 6.896 6.721 6.528 6.433 6.246 6.042 5.801 5.676 5.399 5.32 5.191 5.048 4.728 4.562 4.379 4.164 3.926 3.661 3.362 2.44 -7 ,9437 ,TETRA ,17601401,Sun Nov 28 14:42:39 CET,Sun Nov 28 16:34:38 CET,0.0 1.437 1.926 2.318 2.629 2.918 3.19 3.403 3.75 3.919 4.099 4.284 4.586 4.724 4.99 5.231 5.468 5.584 5.798 5.996 6.276 6.449 6.621 6.881 7.115 7.336 7.543 7.75 8.02 8.271 8.518 8.817 9.086 9.329 9.638 9.984 10.291 10.616 10.953 11.325 11.699 12.101 12.536 12.947 13.4 13.846 14.359 14.899 15.406 15.861 16.118 15.872 15.394 14.872 14.361 13.864 13.398 12.915 12.482 12.06 11.659 11.268 10.905 10.586 10.284 10.003 9.701 9.431 9.201 8.945 8.658 8.422 8.195 7.971 7.784 7.572 7.358 7.146 6.914 6.751 6.587 6.314 6.123 5.927 5.824 5.612 5.395 5.168 5.049 4.765 4.667 4.526 4.38 4.08 3.89 3.643 3.391 3.136 2.814 2.456 0.894 -8 ,20047 ,TETRA ,17601402,Sun Nov 28 14:42:38 CET,Sun Nov 28 16:32:45 CET,0.0 1.428 1.905 2.33 2.654 2.916 3.167 3.392 3.808 3.987 4.153 4.338 4.655 4.795 5.046 5.299 5.539 5.649 5.855 6.054 6.337 6.518 6.696 6.959 7.207 7.434 7.663 7.88 8.13 8.369 8.602 8.884 9.155 9.424 9.724 10.028 10.31 10.611 10.939 11.296 11.67 12.073 12.494 12.92 13.406 13.888 14.42 14.949 15.414 15.781 15.929 15.687 15.256 14.707 14.16 13.642 13.143 12.668 12.25 11.819 11.423 11.047 10.693 10.377 10.081 9.795 9.478 9.187 8.934 8.667 8.385 8.137 7.865 7.563 7.322 7.079 6.847 6.605 6.34 6.165 5.995 5.731 5.526 5.295 5.181 4.944 4.679 4.401 4.26 3.964 3.843 3.69 3.518 3.141 2.912 2.656 2.396 2.075 1.682 1.162 -1.019 -9 ,2500 ,TETRA ,17601403,Sun Nov 28 14:43:39 CET,Sun Nov 28 16:34:05 CET,0.0 1.662 2.335 2.891 3.309 3.606 3.846 4.075 4.471 4.647 4.828 5.013 5.319 5.448 5.709 5.954 6.176 6.286 6.505 6.711 6.992 7.18 7.35 7.588 7.828 8.041 8.253 8.461 8.724 8.974 9.209 9.496 9.773 10.031 10.333 10.669 10.985 11.313 11.654 12.019 12.375 12.771 13.23 13.652 14.121 14.584 15.081 15.601 16.064 16.477 16.62 16.307 15.848 15.34 14.82 14.263 13.772 13.313 12.891 12.451 12.047 11.666 11.275 10.894 10.573 10.301 9.984 9.703 9.465 9.194 8.9 8.679 8.454 8.208 8.023 7.816 7.595 7.377 7.154 6.998 6.827 6.567 6.395 6.211 6.113 5.886 5.637 5.356 5.205 4.899 4.745 4.581 4.407 4.077 3.911 3.722 3.514 3.256 2.944 2.524 0.455 -10 ,28502 ,TETRA ,17601404,Sun Nov 28 14:43:43 CET,Sun Nov 28 16:34:33 CET,0.0 1.674 2.194 2.544 2.85 3.143 3.374 3.56 3.901 4.069 4.216 4.359 4.678 4.829 5.108 5.371 5.605 5.712 5.942 6.159 6.439 6.612 6.78 7.026 7.264 7.487 7.687 7.868 8.116 8.374 8.619 8.882 9.132 9.387 9.654 9.954 10.245 10.555 10.895 11.239 11.592 11.975 12.404 12.824 13.272 13.736 14.259 14.82 15.344 15.777 15.988 15.726 15.308 14.841 14.342 13.821 13.353 12.918 12.502 12.068 11.696 11.327 10.942 10.599 10.29 10.012 9.719 9.442 9.184 8.919 8.647 8.42 8.194 7.964 7.774 7.557 7.341 7.123 6.895 6.751 6.599 6.328 6.144 5.958 5.853 5.637 5.437 5.219 5.098 4.805 4.69 4.544 4.387 4.057 3.853 3.617 3.374 3.128 2.805 2.394 0.366 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_54_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_54_37.txt deleted file mode 100644 index 863688b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_54_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15320 ,KEBNE ,17070637,Fri Dec 24 21:10:44 CET,Fri Dec 24 22:46:03 CET,0.0 1.172 1.694 2.04 2.311 2.592 2.831 3.03 3.382 3.527 3.686 3.851 4.152 4.284 4.527 4.763 4.977 5.074 5.256 5.433 5.704 5.903 6.103 6.372 6.625 6.859 7.085 7.305 7.579 7.845 8.091 8.377 8.659 8.93 9.221 9.538 9.85 10.169 10.497 10.843 11.191 11.574 11.97 12.333 12.75 13.176 13.609 14.003 14.367 14.573 14.419 13.819 13.093 12.347 11.651 10.979 10.381 9.824 9.325 8.807 8.349 7.939 7.531 7.156 6.811 6.49 6.147 5.835 5.561 5.276 4.99 4.752 4.496 4.231 4.033 3.828 3.606 3.374 3.126 2.948 2.768 2.476 2.275 2.056 1.937 1.703 1.45 1.181 1.057 0.755 0.598 0.445 0.278 -0.086 -0.294 -0.538 -0.808 -1.101 -1.462 -1.955 -3.088 -2 ,25061 ,KEBNE ,17070638,Fri Dec 24 21:11:49 CET,Fri Dec 24 22:45:57 CET,0.0 1.344 1.847 2.229 2.531 2.787 3.045 3.271 3.658 3.835 4.006 4.184 4.493 4.629 4.895 5.166 5.419 5.534 5.742 5.936 6.202 6.399 6.604 6.866 7.105 7.329 7.544 7.752 8.023 8.278 8.515 8.8 9.081 9.352 9.66 9.985 10.293 10.633 10.972 11.328 11.708 12.07 12.467 12.878 13.32 13.763 14.193 14.595 14.95 15.126 14.935 14.309 13.618 12.904 12.184 11.533 10.942 10.419 9.946 9.426 8.974 8.575 8.19 7.824 7.484 7.16 6.806 6.493 6.23 5.958 5.653 5.401 5.13 4.818 4.582 4.351 4.125 3.902 3.676 3.518 3.348 3.08 2.892 2.69 2.583 2.36 2.099 1.817 1.684 1.388 1.231 1.065 0.904 0.547 0.338 0.107 -0.17 -0.472 -0.814 -1.307 -2.845 -3 ,29991 ,KEBNE ,17070639,Fri Dec 24 21:27:45 CET,Fri Dec 24 23:03:59 CET,0.0 1.397 1.87 2.262 2.573 2.829 3.036 3.234 3.589 3.753 3.927 4.11 4.42 4.57 4.843 5.092 5.324 5.445 5.679 5.878 6.145 6.327 6.52 6.797 7.042 7.269 7.481 7.678 7.939 8.19 8.423 8.709 8.994 9.268 9.587 9.948 10.284 10.623 10.966 11.313 11.644 11.993 12.406 12.82 13.252 13.694 14.141 14.53 14.864 15.085 14.998 14.392 13.673 12.925 12.177 11.471 10.841 10.272 9.768 9.236 8.804 8.412 8.013 7.645 7.285 6.96 6.64 6.328 6.045 5.741 5.411 5.147 4.872 4.592 4.374 4.154 3.919 3.672 3.443 3.281 3.104 2.821 2.621 2.408 2.296 2.071 1.826 1.56 1.429 1.141 1.007 0.842 0.662 0.235 0.013 -0.193 -0.457 -0.756 -1.096 -1.643 -2.935 -4 ,21257 ,KEBNE ,17070640,Fri Dec 24 21:30:53 CET,Fri Dec 24 23:05:27 CET,0.0 1.76 2.295 2.712 3.036 3.314 3.564 3.79 4.198 4.381 4.556 4.75 5.055 5.209 5.522 5.808 6.047 6.162 6.379 6.576 6.882 7.066 7.231 7.483 7.729 7.978 8.234 8.467 8.762 9.029 9.275 9.587 9.888 10.164 10.475 10.831 11.138 11.436 11.786 12.16 12.506 12.898 13.371 13.788 14.214 14.667 15.125 15.584 15.998 16.261 16.112 15.5 14.81 14.085 13.394 12.744 12.142 11.58 11.101 10.606 10.171 9.761 9.359 9.003 8.676 8.343 7.978 7.665 7.381 7.072 6.774 6.54 6.284 6.021 5.817 5.583 5.341 5.09 4.816 4.63 4.447 4.157 3.932 3.702 3.593 3.353 3.09 2.809 2.67 2.362 2.185 2.011 1.82 1.437 1.235 0.996 0.711 0.403 0.047 -0.449 -1.877 -5 ,24168 ,KEBNE ,17070641,Fri Dec 24 21:39:23 CET,Fri Dec 24 23:12:57 CET,0.0 2.072 2.544 2.965 3.294 3.56 3.789 3.997 4.391 4.568 4.727 4.886 5.183 5.311 5.557 5.794 6.031 6.136 6.326 6.53 6.83 7.014 7.193 7.453 7.686 7.908 8.124 8.325 8.571 8.813 9.04 9.323 9.608 9.86 10.14 10.437 10.717 11.024 11.352 11.693 12.04 12.415 12.86 13.31 13.773 14.219 14.667 15.177 15.686 16.014 16.025 15.458 14.677 13.917 13.225 12.582 12.008 11.47 10.983 10.472 10.021 9.621 9.232 8.866 8.523 8.192 7.842 7.538 7.262 6.98 6.695 6.454 6.214 5.965 5.761 5.54 5.301 5.05 4.794 4.612 4.423 4.148 3.96 3.749 3.632 3.393 3.15 2.868 2.701 2.389 2.227 2.049 1.873 1.466 1.223 0.961 0.685 0.358 -0.067 -0.594 -1.852 -6 ,1210 ,KEBNE ,17070642,Fri Dec 24 21:55:14 CET,Fri Dec 24 23:30:49 CET,0.0 2.926 3.537 3.93 4.274 4.559 4.834 5.077 5.48 5.668 5.849 5.997 6.291 6.432 6.683 6.911 7.128 7.235 7.465 7.681 7.98 8.175 8.357 8.604 8.836 9.085 9.334 9.561 9.832 10.087 10.333 10.606 10.861 11.115 11.398 11.713 12.016 12.334 12.674 13.03 13.391 13.769 14.195 14.602 15.033 15.469 15.925 16.36 16.734 17.028 16.966 16.311 15.558 14.805 14.101 13.469 12.868 12.303 11.825 11.318 10.86 10.461 10.078 9.711 9.375 9.049 8.709 8.414 8.146 7.86 7.564 7.317 7.053 6.777 6.568 6.344 6.103 5.871 5.631 5.449 5.254 4.951 4.738 4.527 4.425 4.198 3.95 3.687 3.55 3.252 3.095 2.929 2.761 2.413 2.225 1.989 1.702 1.393 1.038 0.47 -1.463 -7 ,30445 ,KEBNE ,17070643,Fri Dec 24 21:56:19 CET,Fri Dec 24 23:30:16 CET,0.0 1.5 2.051 2.457 2.804 3.09 3.321 3.544 3.948 4.134 4.325 4.528 4.839 4.979 5.254 5.524 5.777 5.892 6.132 6.359 6.646 6.822 6.988 7.222 7.451 7.661 7.866 8.067 8.315 8.552 8.804 9.109 9.378 9.617 9.884 10.199 10.502 10.837 11.188 11.544 11.892 12.254 12.658 13.039 13.454 13.907 14.359 14.801 15.235 15.5 15.406 14.8 14.089 13.379 12.685 12.001 11.371 10.799 10.299 9.796 9.346 8.932 8.541 8.174 7.829 7.511 7.181 6.861 6.58 6.309 6.021 5.764 5.493 5.216 5.007 4.784 4.544 4.301 4.048 3.878 3.704 3.428 3.238 3.039 2.934 2.675 2.384 2.138 2.013 1.7 1.551 1.403 1.238 0.883 0.704 0.485 0.199 -0.138 -0.475 -0.972 -2.709 -8 ,3325 ,KEBNE ,17070644,Fri Dec 24 21:56:19 CET,Fri Dec 24 23:30:08 CET,0.0 1.848 2.409 2.79 3.077 3.304 3.528 3.749 4.189 4.397 4.579 4.748 5.048 5.179 5.448 5.71 5.947 6.064 6.275 6.452 6.724 6.911 7.095 7.352 7.592 7.811 8.02 8.227 8.482 8.724 8.967 9.256 9.53 9.78 10.051 10.37 10.679 11.007 11.336 11.667 12.032 12.43 12.867 13.281 13.718 14.156 14.609 15.061 15.46 15.67 15.553 14.969 14.274 13.557 12.874 12.207 11.562 10.953 10.412 9.847 9.343 8.906 8.497 8.102 7.73 7.403 7.06 6.761 6.511 6.25 5.976 5.724 5.442 5.159 4.941 4.721 4.509 4.281 4.036 3.853 3.652 3.348 3.13 2.912 2.803 2.594 2.391 2.154 2.024 1.731 1.6 1.442 1.282 0.935 0.71 0.468 0.229 -0.067 -0.412 -0.781 -2.137 -9 ,19062 ,KEBNE ,17070645,Fri Dec 24 21:57:24 CET,Fri Dec 24 23:33:00 CET,0.0 1.914 2.431 2.828 3.158 3.424 3.642 3.86 4.292 4.482 4.651 4.823 5.115 5.226 5.44 5.648 5.828 5.921 6.126 6.334 6.64 6.82 7.001 7.284 7.533 7.761 7.984 8.192 8.474 8.746 8.978 9.256 9.537 9.806 10.096 10.413 10.731 11.067 11.408 11.766 12.123 12.499 12.916 13.338 13.797 14.275 14.758 15.217 15.688 16.005 15.988 15.423 14.601 13.816 13.118 12.49 11.9 11.34 10.86 10.346 9.864 9.424 9.025 8.656 8.317 7.991 7.639 7.345 7.075 6.798 6.521 6.267 5.991 5.721 5.514 5.296 5.068 4.816 4.557 4.384 4.196 3.9 3.702 3.496 3.378 3.109 2.857 2.617 2.481 2.168 2.0 1.82 1.633 1.217 0.951 0.647 0.345 0.01 -0.436 -0.986 -2.431 -10 ,26235 ,KEBNE ,17070646,Fri Dec 24 21:57:24 CET,Fri Dec 24 23:31:37 CET,0.0 1.656 2.171 2.546 2.876 3.208 3.472 3.663 4.027 4.197 4.352 4.5 4.793 4.937 5.223 5.491 5.761 5.879 6.079 6.276 6.582 6.774 6.945 7.197 7.456 7.698 7.911 8.109 8.377 8.644 8.897 9.178 9.437 9.699 9.976 10.273 10.552 10.854 11.188 11.52 11.859 12.241 12.665 13.046 13.435 13.841 14.283 14.705 15.085 15.363 15.215 14.552 13.819 13.057 12.337 11.666 11.045 10.462 9.95 9.436 8.976 8.559 8.177 7.828 7.485 7.149 6.812 6.513 6.249 5.973 5.683 5.439 5.183 4.91 4.69 4.462 4.242 4.017 3.763 3.583 3.394 3.099 2.897 2.683 2.572 2.348 2.136 1.877 1.724 1.428 1.284 1.119 0.943 0.532 0.317 0.072 -0.218 -0.51 -0.895 -1.462 -3.002 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_56_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_56_43.txt deleted file mode 100644 index 4f690607..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_56_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18469 ,KEBNE ,17027207,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:07:33 CET,0.0 1.093 1.41 1.636 1.839 2.025 2.205 2.376 2.692 2.838 2.969 3.063 3.344 3.462 3.69 3.902 4.116 4.22 4.411 4.591 4.849 5.012 5.163 5.394 5.627 5.853 6.061 6.257 6.531 6.787 7.02 7.313 7.585 7.835 8.133 8.464 8.792 9.155 9.55 9.962 10.333 10.719 11.145 11.571 12.073 12.613 13.215 13.834 14.458 15.107 15.652 15.694 15.362 14.915 14.478 14.053 13.647 13.229 12.822 12.383 12.002 11.66 11.319 10.981 10.65 10.345 10.014 9.729 9.492 9.238 8.973 8.738 8.5 8.244 8.03 7.821 7.601 7.362 7.109 6.934 6.743 6.451 6.25 6.028 5.914 5.66 5.395 5.132 4.989 4.683 4.539 4.373 4.183 3.758 3.529 3.268 2.97 2.639 2.225 1.652 -0.37 -2 ,26419 ,KEBNE ,17027208,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:08:45 CET,0.0 1.166 1.618 1.928 2.182 2.386 2.577 2.75 3.077 3.226 3.364 3.452 3.724 3.841 4.083 4.314 4.525 4.622 4.801 4.981 5.258 5.424 5.578 5.807 6.032 6.239 6.436 6.628 6.875 7.123 7.366 7.654 7.919 8.175 8.474 8.806 9.136 9.483 9.835 10.221 10.635 11.063 11.549 12.023 12.503 13.036 13.652 14.291 14.972 15.644 16.144 16.163 15.895 15.481 15.005 14.514 14.042 13.575 13.156 12.722 12.327 11.985 11.647 11.295 10.968 10.695 10.401 10.119 9.877 9.616 9.34 9.103 8.85 8.573 8.36 8.141 7.898 7.636 7.383 7.203 7.006 6.704 6.495 6.277 6.163 5.928 5.655 5.371 5.223 4.917 4.752 4.569 4.387 3.965 3.709 3.434 3.142 2.804 2.352 1.672 -0.098 -3 ,13824 ,KEBNE ,17027209,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:08:52 CET,0.0 1.256 1.66 1.99 2.239 2.477 2.69 2.885 3.205 3.343 3.48 3.559 3.838 3.959 4.182 4.38 4.567 4.664 4.854 5.036 5.292 5.455 5.617 5.843 6.062 6.273 6.469 6.657 6.899 7.146 7.397 7.684 7.944 8.207 8.52 8.855 9.181 9.535 9.884 10.272 10.677 11.101 11.599 12.084 12.593 13.145 13.752 14.37 15.039 15.712 16.227 16.283 16.028 15.624 15.181 14.75 14.311 13.855 13.45 12.996 12.583 12.216 11.845 11.504 11.199 10.89 10.541 10.227 9.952 9.68 9.402 9.149 8.879 8.612 8.402 8.177 7.946 7.704 7.437 7.253 7.08 6.802 6.591 6.371 6.254 6.022 5.793 5.53 5.392 5.081 4.88 4.69 4.496 4.094 3.841 3.557 3.287 2.958 2.549 1.954 -0.144 -4 ,31351 ,KEBNE ,17027210,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:07:53 CET,0.0 1.184 1.558 1.853 2.096 2.324 2.542 2.746 3.116 3.274 3.423 3.559 3.847 3.95 4.173 4.408 4.614 4.711 4.894 5.066 5.325 5.486 5.64 5.86 6.081 6.292 6.501 6.706 6.95 7.18 7.397 7.644 7.902 8.173 8.5 8.859 9.157 9.476 9.84 10.223 10.604 11.021 11.54 12.054 12.58 13.165 13.824 14.49 15.14 15.69 16.063 15.997 15.602 15.124 14.663 14.165 13.691 13.257 12.827 12.373 11.975 11.632 11.329 11.003 10.691 10.4 10.083 9.788 9.541 9.29 9.01 8.773 8.524 8.255 8.037 7.816 7.585 7.356 7.115 6.933 6.749 6.451 6.227 6.003 5.896 5.677 5.435 5.165 5.018 4.704 4.564 4.398 4.22 3.823 3.579 3.309 2.991 2.613 2.184 1.59 -0.311 -5 ,13326 ,KEBNE ,17027211,Wed Dec 22 16:32:47 CET,Wed Dec 22 18:09:12 CET,0.0 1.066 1.376 1.668 1.934 2.112 2.271 2.431 2.741 2.886 3.025 3.137 3.426 3.542 3.756 3.968 4.18 4.28 4.472 4.654 4.908 5.073 5.233 5.453 5.67 5.89 6.108 6.315 6.559 6.809 7.065 7.371 7.67 7.938 8.223 8.534 8.844 9.195 9.55 9.887 10.254 10.688 11.163 11.597 12.049 12.585 13.241 13.884 14.539 15.216 15.761 15.847 15.557 15.108 14.622 14.138 13.716 13.283 12.876 12.452 12.062 11.703 11.347 11.004 10.684 10.395 10.086 9.79 9.529 9.259 8.977 8.739 8.483 8.226 8.026 7.807 7.57 7.333 7.085 6.894 6.692 6.389 6.167 5.935 5.817 5.567 5.337 5.1 4.945 4.628 4.489 4.314 4.115 3.653 3.37 3.069 2.76 2.407 1.982 1.274 -1.343 -6 ,21540 ,KEBNE ,17027212,Wed Dec 22 16:32:47 CET,Wed Dec 22 18:07:14 CET,0.0 0.865 1.24 1.517 1.75 1.958 2.137 2.287 2.585 2.724 2.861 2.974 3.264 3.38 3.601 3.821 4.01 4.101 4.286 4.461 4.724 4.892 5.047 5.269 5.497 5.724 5.945 6.153 6.398 6.628 6.862 7.147 7.423 7.687 7.986 8.326 8.641 8.984 9.352 9.714 10.07 10.458 10.918 11.385 11.892 12.414 12.971 13.532 14.147 14.819 15.382 15.455 15.239 14.884 14.44 13.976 13.515 13.076 12.679 12.268 11.882 11.5 11.135 10.801 10.482 10.169 9.855 9.593 9.353 9.094 8.823 8.593 8.344 8.087 7.887 7.678 7.473 7.242 7.005 6.838 6.646 6.352 6.14 5.915 5.804 5.567 5.295 5.021 4.884 4.573 4.41 4.227 4.025 3.619 3.405 3.159 2.871 2.533 2.092 1.482 -0.688 -7 ,9373 ,KEBNE ,17027213,Wed Dec 22 16:32:45 CET,Wed Dec 22 18:09:36 CET,0.0 0.984 1.268 1.508 1.754 1.974 2.177 2.358 2.658 2.795 2.927 3.018 3.299 3.407 3.62 3.828 4.022 4.113 4.291 4.475 4.737 4.898 5.05 5.282 5.5 5.702 5.902 6.097 6.344 6.574 6.803 7.074 7.325 7.584 7.896 8.252 8.584 8.922 9.293 9.675 10.03 10.4 10.831 11.28 11.778 12.263 12.845 13.5 14.174 14.794 15.352 15.503 15.215 14.836 14.419 13.979 13.524 13.088 12.74 12.329 11.939 11.6 11.275 10.94 10.611 10.3 9.972 9.696 9.448 9.175 8.894 8.662 8.412 8.137 7.921 7.702 7.475 7.229 6.955 6.763 6.564 6.236 5.993 5.73 5.594 5.323 5.057 4.776 4.617 4.295 4.124 3.925 3.713 3.256 2.992 2.709 2.365 1.951 1.449 0.866 -0.95 -8 ,16512 ,KEBNE ,17027214,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:07:33 CET,0.0 1.157 1.524 1.745 1.969 2.18 2.362 2.517 2.813 2.969 3.111 3.194 3.475 3.605 3.86 4.088 4.288 4.385 4.58 4.765 5.026 5.187 5.346 5.589 5.83 6.059 6.271 6.467 6.728 6.973 7.203 7.49 7.786 8.063 8.366 8.684 8.988 9.34 9.704 10.074 10.466 10.925 11.421 11.873 12.395 12.988 13.605 14.242 14.944 15.575 16.123 16.231 15.948 15.567 15.117 14.654 14.215 13.756 13.362 12.981 12.65 12.33 11.987 11.664 11.354 11.061 10.746 10.456 10.217 9.936 9.603 9.322 9.021 8.714 8.498 8.285 8.058 7.831 7.583 7.391 7.204 6.936 6.728 6.485 6.365 6.132 5.888 5.621 5.476 5.16 4.976 4.798 4.629 4.232 4.009 3.755 3.473 3.147 2.718 2.164 0.676 -9 ,6340 ,KEBNE ,17027215,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:08:59 CET,0.0 1.064 1.406 1.653 1.865 2.066 2.243 2.416 2.731 2.874 3.003 3.07 3.345 3.459 3.699 3.936 4.15 4.248 4.423 4.593 4.839 4.989 5.142 5.374 5.599 5.814 6.03 6.236 6.484 6.716 6.943 7.222 7.5 7.784 8.095 8.396 8.688 9.011 9.347 9.715 10.088 10.474 10.928 11.429 11.994 12.582 13.266 14.004 14.712 15.297 15.718 15.667 15.323 14.933 14.502 14.053 13.65 13.238 12.844 12.414 12.031 11.693 11.358 11.042 10.731 10.43 10.097 9.809 9.564 9.291 9.0 8.74 8.464 8.188 7.98 7.748 7.5 7.26 7.014 6.837 6.655 6.375 6.156 5.939 5.832 5.562 5.288 5.031 4.887 4.567 4.386 4.214 4.026 3.613 3.367 3.098 2.809 2.431 1.988 1.376 -0.766 -10 ,29261 ,KEBNE ,17027216,Wed Dec 22 16:32:47 CET,Wed Dec 22 18:08:50 CET,0.0 1.468 1.825 2.069 2.292 2.501 2.669 2.833 3.163 3.315 3.462 3.581 3.883 4.014 4.262 4.465 4.652 4.746 4.93 5.105 5.353 5.515 5.675 5.909 6.13 6.339 6.539 6.728 6.963 7.197 7.442 7.738 8.017 8.281 8.565 8.882 9.208 9.565 9.926 10.303 10.69 11.105 11.562 12.002 12.516 13.074 13.706 14.347 14.954 15.602 16.174 16.244 15.98 15.542 15.084 14.643 14.18 13.721 13.313 12.892 12.532 12.198 11.853 11.492 11.17 10.875 10.538 10.252 10.011 9.735 9.421 9.171 8.915 8.638 8.42 8.192 7.972 7.727 7.455 7.276 7.101 6.812 6.598 6.363 6.232 5.968 5.691 5.374 5.21 4.887 4.708 4.523 4.326 3.901 3.658 3.399 3.082 2.682 2.227 1.667 -0.066 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_56_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_56_57.txt deleted file mode 100644 index c879dd33..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_56_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21429 ,TETRA ,17601405,Sun Nov 28 14:43:40 CET,Sun Nov 28 16:34:46 CET,0.0 0.61 0.898 1.165 1.408 1.621 1.814 1.994 2.337 2.504 2.666 2.828 3.147 3.289 3.551 3.796 4.037 4.149 4.355 4.568 4.892 5.104 5.313 5.602 5.878 6.14 6.392 6.633 6.951 7.265 7.567 7.919 8.252 8.59 8.983 9.405 9.807 10.247 10.73 11.244 11.76 12.34 13.004 13.673 14.442 15.266 16.212 17.274 18.487 19.847 21.374 22.45 22.911 23.118 23.169 23.107 22.954 22.764 22.567 22.356 22.161 21.932 21.713 21.495 21.263 21.055 20.839 20.628 20.426 20.212 19.976 19.77 19.552 19.347 19.206 19.045 18.856 18.674 18.485 18.327 18.168 17.94 17.788 17.626 17.536 17.357 17.164 16.957 16.855 16.608 16.516 16.382 16.256 15.94 15.755 15.575 15.36 15.132 14.904 14.615 13.949 -2 ,26638 ,TETRA ,17601406,Sun Nov 28 14:43:41 CET,Sun Nov 28 16:34:38 CET,0.0 0.755 1.019 1.26 1.472 1.666 1.88 2.095 2.451 2.612 2.781 2.951 3.261 3.407 3.672 3.929 4.183 4.303 4.545 4.781 5.126 5.334 5.533 5.833 6.118 6.391 6.658 6.911 7.229 7.537 7.831 8.196 8.545 8.896 9.312 9.758 10.185 10.666 11.172 11.702 12.277 12.913 13.605 14.262 15.008 15.842 16.799 17.849 19.084 20.477 22.038 23.18 23.694 23.951 24.001 23.929 23.79 23.6 23.415 23.206 22.993 22.772 22.556 22.328 22.104 21.898 21.642 21.406 21.201 20.993 20.767 20.565 20.367 20.165 20.006 19.832 19.65 19.466 19.266 19.117 18.968 18.735 18.586 18.438 18.349 18.169 17.99 17.784 17.671 17.408 17.299 17.156 17.015 16.723 16.553 16.369 16.16 15.889 15.605 15.296 14.458 -3 ,63 ,TETRA ,17601407,Sun Nov 28 14:43:40 CET,Sun Nov 28 16:35:34 CET,0.0 0.715 1.111 1.43 1.7 1.957 2.191 2.387 2.751 2.931 3.111 3.284 3.597 3.74 4.009 4.248 4.456 4.561 4.789 5.004 5.306 5.511 5.705 5.978 6.239 6.497 6.744 6.978 7.279 7.585 7.876 8.202 8.534 8.852 9.211 9.633 10.033 10.463 10.937 11.441 11.96 12.556 13.254 13.937 14.716 15.582 16.58 17.663 18.88 20.269 21.799 22.887 23.374 23.528 23.543 23.414 23.216 23.0 22.772 22.522 22.271 22.013 21.748 21.484 21.205 20.944 20.701 20.494 20.315 20.123 19.909 19.718 19.517 19.307 19.131 18.948 18.772 18.59 18.4 18.269 18.124 17.873 17.697 17.521 17.432 17.247 17.054 16.852 16.742 16.483 16.383 16.245 16.099 15.746 15.543 15.34 15.13 14.888 14.613 14.312 13.521 -4 ,5031 ,TETRA ,17601408,Sun Nov 28 14:43:42 CET,Sun Nov 28 16:35:21 CET,0.0 1.111 1.489 1.793 2.069 2.322 2.561 2.785 3.146 3.314 3.501 3.671 3.967 4.092 4.335 4.574 4.798 4.913 5.151 5.372 5.683 5.873 6.056 6.327 6.614 6.888 7.126 7.362 7.674 7.97 8.25 8.601 8.946 9.267 9.639 10.048 10.439 10.876 11.351 11.864 12.398 12.989 13.671 14.349 15.115 15.954 16.946 18.055 19.278 20.659 22.244 23.331 23.84 24.027 24.01 23.922 23.796 23.611 23.404 23.187 22.968 22.754 22.529 22.305 22.094 21.885 21.66 21.437 21.229 21.026 20.805 20.608 20.423 20.234 20.071 19.894 19.704 19.503 19.286 19.13 18.97 18.733 18.567 18.384 18.292 18.086 17.874 17.673 17.57 17.308 17.206 17.072 16.932 16.613 16.417 16.194 15.938 15.685 15.439 15.115 14.624 -5 ,17519 ,TETRA ,17601409,Sun Nov 28 14:43:44 CET,Sun Nov 28 16:34:51 CET,0.0 1.009 1.52 1.838 2.107 2.372 2.608 2.81 3.169 3.33 3.486 3.626 3.948 4.093 4.349 4.59 4.823 4.939 5.164 5.378 5.685 5.879 6.061 6.315 6.562 6.815 7.072 7.324 7.649 7.962 8.262 8.629 8.978 9.298 9.678 10.105 10.524 10.977 11.442 11.956 12.506 13.108 13.8 14.486 15.256 16.099 17.026 18.057 19.249 20.593 22.105 23.178 23.663 23.848 23.829 23.714 23.54 23.337 23.138 22.896 22.671 22.442 22.208 21.95 21.68 21.433 21.15 20.889 20.661 20.405 20.14 19.932 19.693 19.44 19.24 19.034 18.828 18.609 18.378 18.211 18.038 17.77 17.585 17.395 17.305 17.109 16.882 16.633 16.505 16.229 16.137 16.005 15.853 15.512 15.305 15.088 14.821 14.523 14.183 13.662 12.152 -6 ,31300 ,TETRA ,17601410,Sun Nov 28 14:43:45 CET,Sun Nov 28 16:34:38 CET,0.0 0.716 1.042 1.295 1.528 1.74 1.933 2.124 2.495 2.675 2.839 2.963 3.265 3.409 3.689 3.964 4.208 4.317 4.532 4.742 5.042 5.237 5.426 5.681 5.927 6.196 6.451 6.679 6.963 7.235 7.503 7.834 8.171 8.516 8.903 9.316 9.704 10.132 10.597 11.079 11.573 12.1 12.701 13.315 14.058 14.838 15.707 16.736 17.935 19.245 20.635 21.615 22.012 22.125 22.09 21.959 21.762 21.555 21.354 21.102 20.833 20.577 20.333 20.095 19.846 19.591 19.319 19.077 18.863 18.632 18.404 18.22 18.006 17.783 17.609 17.427 17.237 17.035 16.835 16.69 16.524 16.262 16.091 15.916 15.825 15.634 15.437 15.225 15.115 14.854 14.739 14.591 14.437 14.135 13.965 13.77 13.552 13.301 12.979 12.554 11.503 -7 ,11328 ,TETRA ,17601411,Sun Nov 28 14:44:39 CET,Sun Nov 28 16:35:04 CET,0.0 0.964 1.458 1.764 2.018 2.243 2.456 2.665 3.049 3.225 3.395 3.575 3.895 4.032 4.272 4.508 4.748 4.858 5.082 5.314 5.635 5.835 6.021 6.284 6.553 6.809 7.064 7.326 7.635 7.931 8.237 8.601 8.939 9.263 9.635 10.037 10.437 10.866 11.317 11.823 12.357 12.936 13.602 14.29 15.074 15.907 16.873 17.926 19.099 20.514 22.121 23.179 23.649 23.804 23.768 23.667 23.525 23.357 23.16 22.909 22.667 22.438 22.225 22.0 21.762 21.547 21.335 21.131 20.946 20.748 20.537 20.364 20.176 19.974 19.805 19.629 19.464 19.286 19.094 18.96 18.808 18.569 18.406 18.242 18.153 17.96 17.763 17.556 17.448 17.198 17.14 17.022 16.898 16.619 16.468 16.325 16.175 15.984 15.766 15.496 14.91 -8 ,6521 ,TETRA ,17601412,Sun Nov 28 14:45:38 CET,Sun Nov 28 16:36:29 CET,0.0 0.829 1.195 1.502 1.778 2.001 2.203 2.388 2.711 2.878 3.041 3.186 3.499 3.637 3.883 4.116 4.344 4.459 4.688 4.899 5.203 5.402 5.59 5.877 6.155 6.419 6.684 6.935 7.244 7.553 7.854 8.209 8.552 8.87 9.227 9.635 10.023 10.463 10.947 11.471 12.032 12.619 13.282 13.94 14.713 15.568 16.521 17.573 18.776 20.135 21.695 22.836 23.326 23.516 23.518 23.421 23.27 23.071 22.867 22.631 22.416 22.203 21.969 21.746 21.525 21.318 21.098 20.889 20.698 20.484 20.25 20.068 19.891 19.681 19.504 19.32 19.142 18.974 18.792 18.651 18.499 18.247 18.062 17.868 17.77 17.562 17.339 17.102 16.974 16.689 16.571 16.44 16.289 15.933 15.725 15.498 15.249 14.939 14.551 14.031 12.378 -9 ,29125 ,TETRA ,17601413,Sun Nov 28 14:44:40 CET,Sun Nov 28 16:35:49 CET,0.0 0.706 1.031 1.264 1.493 1.722 1.926 2.109 2.47 2.644 2.819 2.973 3.285 3.434 3.714 3.986 4.238 4.357 4.579 4.785 5.103 5.316 5.521 5.82 6.105 6.389 6.661 6.918 7.249 7.565 7.87 8.239 8.584 8.912 9.303 9.735 10.141 10.598 11.09 11.619 12.178 12.779 13.478 14.16 14.899 15.727 16.701 17.753 18.942 20.294 21.766 22.832 23.27 23.402 23.41 23.319 23.191 23.035 22.852 22.622 22.404 22.175 21.928 21.703 21.499 21.301 21.053 20.819 20.626 20.414 20.175 19.973 19.782 19.593 19.438 19.272 19.083 18.886 18.696 18.567 18.422 18.176 18.015 17.841 17.732 17.517 17.317 17.108 17.007 16.744 16.623 16.47 16.304 15.99 15.806 15.594 15.394 15.154 14.867 14.56 13.758 -10 ,1854 ,TETRA ,17601414,Sun Nov 28 14:44:41 CET,Sun Nov 28 16:35:49 CET,0.0 0.608 0.863 1.125 1.393 1.641 1.862 2.065 2.436 2.598 2.745 2.868 3.155 3.282 3.543 3.781 4.004 4.11 4.32 4.529 4.839 5.037 5.223 5.503 5.772 6.02 6.268 6.507 6.797 7.093 7.388 7.745 8.099 8.435 8.814 9.231 9.605 10.017 10.485 10.986 11.494 12.044 12.694 13.373 14.185 15.063 16.026 17.107 18.349 19.745 21.297 22.391 22.875 23.042 23.073 23.0 22.858 22.69 22.497 22.225 21.963 21.718 21.456 21.203 20.95 20.697 20.413 20.143 19.917 19.682 19.432 19.228 19.014 18.783 18.583 18.371 18.172 17.96 17.728 17.573 17.409 17.128 16.937 16.752 16.655 16.455 16.236 15.992 15.868 15.579 15.414 15.245 15.055 14.632 14.391 14.132 13.861 13.576 13.253 12.816 11.841 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_56_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_56_58.txt deleted file mode 100644 index fd3d30f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_56_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1678 ,TETRA ,17601415,Sun Nov 28 14:44:40 CET,Sun Nov 28 16:39:36 CET,0.0 1.57 2.182 2.642 3.011 3.35 3.639 3.91 4.397 4.62 4.841 5.081 5.423 5.595 5.922 6.254 6.539 6.657 6.886 7.096 7.392 7.585 7.769 8.032 8.274 8.521 8.78 9.006 9.266 9.518 9.749 10.035 10.329 10.585 10.866 11.182 11.477 11.808 12.14 12.467 12.792 13.152 13.58 13.998 14.418 14.831 15.231 15.588 15.9 16.108 16.016 15.496 14.826 14.142 13.52 12.944 12.382 11.828 11.359 10.876 10.45 10.062 9.66 9.271 8.913 8.593 8.251 7.938 7.672 7.4 7.104 6.839 6.561 6.275 6.057 5.839 5.624 5.392 5.137 4.95 4.762 4.503 4.328 4.127 4.011 3.77 3.534 3.289 3.149 2.834 2.673 2.5 2.332 1.955 1.743 1.523 1.292 1.049 0.788 0.443 -2.017 -2 ,28826 ,TETRA ,17601416,Sun Nov 28 14:44:40 CET,Sun Nov 28 16:40:46 CET,0.0 1.065 1.433 1.719 1.976 2.235 2.463 2.686 3.101 3.272 3.446 3.603 3.919 4.054 4.296 4.552 4.796 4.912 5.12 5.316 5.595 5.765 5.934 6.192 6.432 6.647 6.861 7.066 7.356 7.643 7.895 8.205 8.508 8.779 9.057 9.371 9.684 10.012 10.338 10.677 11.016 11.393 11.825 12.22 12.631 13.036 13.499 13.946 14.273 14.459 14.304 13.675 12.993 12.293 11.63 11.032 10.469 9.913 9.43 8.941 8.504 8.108 7.721 7.349 6.995 6.666 6.319 5.992 5.711 5.438 5.15 4.908 4.656 4.386 4.17 3.946 3.724 3.497 3.255 3.084 2.906 2.633 2.434 2.221 2.108 1.858 1.6 1.332 1.191 0.888 0.778 0.639 0.484 0.116 -0.079 -0.267 -0.47 -0.72 -1.071 -1.552 -3.741 -3 ,25424 ,TETRA ,17601417,Sun Nov 28 14:45:40 CET,Sun Nov 28 16:37:37 CET,0.0 2.067 2.437 2.735 3.021 3.255 3.474 3.68 4.071 4.263 4.426 4.537 4.835 4.971 5.249 5.509 5.742 5.855 6.07 6.269 6.548 6.742 6.932 7.188 7.424 7.651 7.863 8.06 8.321 8.594 8.862 9.153 9.418 9.674 9.969 10.295 10.607 10.92 11.225 11.565 11.912 12.288 12.716 13.106 13.498 13.874 14.249 14.603 14.964 15.218 15.099 14.592 14.001 13.355 12.715 12.111 11.564 11.03 10.538 10.038 9.589 9.167 8.756 8.385 8.029 7.685 7.34 7.03 6.753 6.463 6.176 5.935 5.651 5.36 5.152 4.936 4.704 4.466 4.217 4.039 3.862 3.591 3.399 3.18 3.061 2.837 2.612 2.381 2.258 1.964 1.848 1.684 1.504 1.144 0.939 0.71 0.46 0.196 -0.09 -0.523 -1.873 -4 ,20724 ,TETRA ,17601418,Sun Nov 28 14:45:41 CET,Sun Nov 28 16:35:54 CET,0.0 1.529 1.986 2.333 2.648 2.949 3.197 3.417 3.845 4.016 4.161 4.29 4.592 4.734 5.019 5.279 5.52 5.631 5.839 6.049 6.338 6.511 6.682 6.918 7.145 7.378 7.604 7.828 8.108 8.382 8.635 8.935 9.24 9.532 9.865 10.21 10.518 10.83 11.162 11.517 11.854 12.213 12.614 12.999 13.379 13.738 14.185 14.616 14.958 15.199 15.057 14.492 13.835 13.147 12.511 11.893 11.338 10.831 10.372 9.889 9.431 9.018 8.626 8.223 7.852 7.523 7.18 6.872 6.6 6.318 6.008 5.748 5.488 5.228 5.027 4.81 4.584 4.354 4.111 3.938 3.758 3.463 3.259 3.023 2.89 2.613 2.347 2.099 1.967 1.649 1.446 1.261 1.08 0.719 0.527 0.328 0.098 -0.179 -0.517 -0.93 -2.394 -5 ,26082 ,TETRA ,17601419,Sun Nov 28 14:45:39 CET,Sun Nov 28 16:36:42 CET,0.0 2.39 2.956 3.468 3.88 4.179 4.423 4.634 5.02 5.2 5.379 5.555 5.882 6.03 6.277 6.51 6.728 6.836 7.052 7.261 7.549 7.723 7.893 8.147 8.394 8.627 8.837 9.024 9.277 9.539 9.791 10.082 10.352 10.618 10.902 11.174 11.447 11.762 12.083 12.424 12.774 13.143 13.527 13.871 14.232 14.583 14.962 15.327 15.644 15.895 15.865 15.39 14.765 14.147 13.554 12.958 12.416 11.893 11.428 10.955 10.548 10.198 9.847 9.466 9.094 8.788 8.478 8.184 7.931 7.677 7.397 7.151 6.893 6.609 6.38 6.151 5.919 5.673 5.418 5.241 5.046 4.734 4.522 4.312 4.208 3.97 3.718 3.466 3.337 3.043 2.907 2.746 2.584 2.234 2.031 1.811 1.541 1.22 0.842 0.462 -0.607 -6 ,5246 ,TETRA ,17601420,Sun Nov 28 14:45:39 CET,Sun Nov 28 16:36:32 CET,0.0 1.411 1.967 2.406 2.778 3.131 3.444 3.705 4.159 4.376 4.593 4.836 5.187 5.369 5.699 6.01 6.287 6.404 6.622 6.835 7.134 7.324 7.508 7.777 8.024 8.236 8.441 8.637 8.887 9.142 9.394 9.686 9.943 10.197 10.481 10.789 11.08 11.4 11.751 12.085 12.426 12.821 13.248 13.64 14.072 14.479 14.897 15.316 15.63 15.793 15.655 15.135 14.502 13.876 13.264 12.675 12.133 11.618 11.134 10.606 10.169 9.786 9.402 9.042 8.686 8.361 8.039 7.744 7.475 7.201 6.929 6.688 6.43 6.147 5.926 5.71 5.471 5.226 4.982 4.816 4.638 4.356 4.163 3.959 3.854 3.637 3.42 3.199 3.073 2.777 2.661 2.521 2.366 1.998 1.812 1.628 1.378 1.099 0.785 0.356 -0.994 -7 ,21682 ,TETRA ,17601421,Sun Nov 28 14:45:41 CET,Sun Nov 28 16:35:44 CET,0.0 1.864 2.285 2.614 2.928 3.203 3.444 3.663 4.04 4.202 4.362 4.532 4.853 4.999 5.285 5.534 5.755 5.862 6.079 6.294 6.584 6.77 6.952 7.194 7.422 7.639 7.846 8.056 8.311 8.557 8.806 9.091 9.349 9.604 9.907 10.221 10.512 10.836 11.161 11.49 11.834 12.201 12.613 12.996 13.425 13.886 14.302 14.674 15.007 15.205 15.098 14.587 13.941 13.267 12.636 12.032 11.447 10.882 10.406 9.914 9.47 9.085 8.707 8.327 7.985 7.669 7.333 7.022 6.753 6.49 6.192 5.93 5.659 5.38 5.169 4.951 4.713 4.472 4.214 4.032 3.85 3.571 3.376 3.155 3.037 2.798 2.572 2.357 2.236 1.944 1.817 1.654 1.481 1.136 0.954 0.756 0.543 0.313 0.016 -0.379 -2.218 -8 ,9528 ,TETRA ,17601422,Sun Nov 28 14:45:39 CET,Sun Nov 28 16:40:39 CET,0.0 1.078 1.494 1.808 2.042 2.252 2.471 2.689 3.085 3.257 3.432 3.619 3.937 4.078 4.341 4.579 4.815 4.929 5.129 5.319 5.601 5.783 5.962 6.22 6.456 6.688 6.931 7.155 7.419 7.664 7.898 8.185 8.464 8.723 9.014 9.353 9.679 9.999 10.327 10.677 11.019 11.373 11.755 12.113 12.514 12.926 13.365 13.798 14.193 14.46 14.33 13.78 13.126 12.464 11.8 11.154 10.573 10.031 9.554 9.055 8.629 8.23 7.832 7.442 7.075 6.749 6.418 6.118 5.845 5.561 5.254 5.003 4.741 4.461 4.239 4.019 3.813 3.585 3.327 3.145 2.967 2.697 2.511 2.325 2.223 2.015 1.788 1.542 1.423 1.13 0.981 0.808 0.631 0.265 0.06 -0.167 -0.414 -0.681 -0.974 -1.464 -3.562 -9 ,19805 ,TETRA ,17601423,Sun Nov 28 14:45:41 CET,Sun Nov 28 16:36:01 CET,0.0 1.725 2.232 2.572 2.853 3.133 3.392 3.6 3.984 4.159 4.314 4.453 4.756 4.89 5.147 5.377 5.602 5.72 5.945 6.154 6.446 6.633 6.812 7.074 7.315 7.537 7.76 7.985 8.261 8.515 8.752 9.026 9.297 9.551 9.828 10.128 10.419 10.749 11.085 11.434 11.778 12.128 12.522 12.888 13.269 13.665 14.067 14.449 14.784 15.004 15.01 14.515 13.842 13.2 12.609 12.031 11.487 10.978 10.504 9.988 9.529 9.11 8.696 8.296 7.943 7.622 7.276 6.965 6.683 6.395 6.1 5.858 5.611 5.353 5.145 4.922 4.693 4.447 4.192 4.008 3.801 3.486 3.28 3.07 2.956 2.715 2.463 2.193 2.058 1.761 1.657 1.508 1.335 0.982 0.8 0.6 0.332 0.042 -0.242 -0.627 -3.553 -10 ,20715 ,TETRA ,17601424,Sun Nov 28 14:45:41 CET,Sun Nov 28 16:36:31 CET,0.0 1.828 2.325 2.672 2.951 3.195 3.412 3.595 3.91 4.062 4.223 4.388 4.704 4.847 5.108 5.348 5.577 5.69 5.908 6.113 6.412 6.598 6.778 7.026 7.26 7.489 7.689 7.875 8.145 8.404 8.637 8.916 9.181 9.421 9.697 10.004 10.293 10.608 10.937 11.28 11.621 11.973 12.372 12.745 13.131 13.523 13.939 14.317 14.626 14.86 14.734 14.129 13.47 12.81 12.168 11.533 10.957 10.438 9.976 9.493 9.059 8.68 8.306 7.927 7.568 7.241 6.883 6.549 6.263 5.974 5.673 5.428 5.176 4.912 4.704 4.482 4.25 4.007 3.767 3.602 3.428 3.163 2.979 2.788 2.688 2.454 2.202 1.953 1.829 1.549 1.447 1.298 1.132 0.738 0.539 0.338 0.097 -0.151 -0.399 -0.712 -1.576 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_60_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_60_37.txt deleted file mode 100644 index 587abb30..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_60_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5701 ,KEBNE ,17027217,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:08:24 CET,0.0 1.024 1.473 1.821 2.116 2.355 2.534 2.698 3.031 3.201 3.353 3.459 3.736 3.852 4.095 4.323 4.523 4.619 4.8 4.968 5.217 5.38 5.528 5.728 5.911 6.087 6.257 6.428 6.654 6.862 7.071 7.321 7.542 7.739 7.969 8.233 8.478 8.75 9.042 9.334 9.619 9.948 10.356 10.754 11.172 11.572 11.99 12.428 12.845 13.169 13.356 13.106 12.693 12.235 11.719 11.207 10.72 10.26 9.865 9.45 9.073 8.724 8.382 8.049 7.739 7.458 7.152 6.865 6.639 6.39 6.081 5.832 5.59 5.35 5.171 4.974 4.744 4.504 4.273 4.114 3.95 3.687 3.504 3.318 3.218 3.012 2.8 2.574 2.461 2.182 2.058 1.914 1.757 1.404 1.218 1.021 0.769 0.438 0.062 -0.395 -1.548 -2 ,2605 ,KEBNE ,17027218,Wed Dec 22 16:32:47 CET,Wed Dec 22 18:08:06 CET,0.0 0.741 1.027 1.25 1.465 1.647 1.794 1.939 2.214 2.331 2.448 2.536 2.82 2.955 3.219 3.454 3.676 3.79 4.021 4.22 4.488 4.661 4.841 5.111 5.358 5.587 5.811 6.027 6.306 6.558 6.774 7.066 7.347 7.594 7.869 8.178 8.482 8.814 9.162 9.517 9.871 10.282 10.749 11.165 11.664 12.182 12.701 13.226 13.706 14.062 14.165 13.869 13.379 12.772 12.165 11.597 11.058 10.512 9.989 9.436 8.959 8.546 8.199 7.894 7.596 7.32 7.009 6.729 6.495 6.268 6.029 5.808 5.553 5.286 5.086 4.868 4.639 4.411 4.172 4.01 3.846 3.581 3.4 3.214 3.118 2.925 2.72 2.48 2.344 2.037 1.898 1.73 1.53 1.082 0.855 0.636 0.373 0.064 -0.284 -0.798 -2.143 -3 ,27739 ,KEBNE ,17027219,Wed Dec 22 16:32:45 CET,Wed Dec 22 18:06:38 CET,0.0 1.315 1.722 2.026 2.285 2.497 2.681 2.836 3.122 3.279 3.444 3.582 3.874 3.989 4.18 4.36 4.542 4.634 4.8 4.957 5.195 5.344 5.487 5.686 5.872 6.066 6.246 6.4 6.613 6.835 7.045 7.289 7.538 7.778 8.038 8.298 8.527 8.795 9.103 9.434 9.753 10.073 10.448 10.841 11.288 11.747 12.219 12.669 13.125 13.546 13.732 13.443 12.95 12.443 11.957 11.444 10.964 10.51 10.098 9.673 9.297 8.94 8.565 8.236 7.942 7.665 7.376 7.112 6.884 6.634 6.363 6.144 5.91 5.658 5.464 5.258 5.042 4.822 4.591 4.428 4.262 3.998 3.802 3.602 3.491 3.271 3.046 2.802 2.666 2.36 2.246 2.095 1.918 1.531 1.309 1.048 0.753 0.41 0.047 -0.313 -1.357 -4 ,14467 ,KEBNE ,17027220,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:07:53 CET,0.0 1.485 1.939 2.305 2.614 2.877 3.094 3.322 3.765 3.945 4.104 4.248 4.549 4.687 4.942 5.184 5.411 5.523 5.732 5.921 6.177 6.348 6.514 6.742 6.947 7.127 7.312 7.493 7.706 7.918 8.128 8.378 8.622 8.867 9.134 9.391 9.646 9.926 10.193 10.471 10.794 11.17 11.577 11.958 12.367 12.808 13.261 13.689 14.1 14.458 14.578 14.281 13.853 13.339 12.831 12.361 11.925 11.494 11.077 10.623 10.231 9.88 9.55 9.225 8.92 8.64 8.311 8.001 7.737 7.475 7.209 6.975 6.723 6.471 6.264 6.046 5.836 5.614 5.377 5.216 5.059 4.819 4.639 4.437 4.333 4.115 3.87 3.568 3.407 3.096 2.929 2.758 2.582 2.189 1.979 1.749 1.492 1.19 0.795 0.21 -1.262 -5 ,14003 ,KEBNE ,17027221,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:06:54 CET,0.0 0.814 1.19 1.48 1.753 1.993 2.181 2.36 2.713 2.88 3.041 3.149 3.416 3.528 3.748 3.956 4.14 4.226 4.41 4.587 4.827 4.965 5.099 5.31 5.513 5.691 5.854 6.013 6.228 6.447 6.652 6.883 7.102 7.336 7.603 7.862 8.098 8.365 8.643 8.927 9.231 9.588 9.971 10.312 10.706 11.144 11.628 12.11 12.591 13.015 13.209 12.898 12.403 11.834 11.297 10.816 10.362 9.906 9.459 8.996 8.616 8.259 7.904 7.587 7.29 7.001 6.691 6.41 6.152 5.886 5.61 5.379 5.147 4.903 4.696 4.465 4.233 4.007 3.79 3.633 3.461 3.183 2.987 2.786 2.676 2.461 2.244 2.018 1.898 1.613 1.506 1.359 1.212 0.9 0.712 0.504 0.285 0.018 -0.332 -0.784 -2.317 -6 ,25840 ,KEBNE ,17027222,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:08:08 CET,0.0 0.949 1.406 1.695 1.933 2.124 2.321 2.517 2.847 2.997 3.133 3.248 3.544 3.67 3.887 4.093 4.288 4.387 4.582 4.762 5.016 5.178 5.349 5.591 5.817 6.034 6.23 6.41 6.648 6.89 7.135 7.419 7.675 7.926 8.234 8.545 8.802 9.102 9.433 9.775 10.142 10.545 10.985 11.392 11.827 12.285 12.806 13.321 13.817 14.264 14.483 14.229 13.705 13.135 12.558 12.0 11.505 11.004 10.537 10.092 9.698 9.296 8.899 8.548 8.221 7.923 7.612 7.322 7.059 6.786 6.498 6.252 6.0 5.715 5.483 5.254 5.027 4.795 4.555 4.379 4.19 3.915 3.734 3.537 3.434 3.216 2.985 2.75 2.612 2.299 2.149 1.99 1.837 1.486 1.294 1.104 0.871 0.603 0.291 -0.118 -1.222 -7 ,15158 ,KEBNE ,17027223,Wed Dec 22 16:32:47 CET,Wed Dec 22 18:07:40 CET,0.0 1.341 1.736 2.054 2.306 2.508 2.711 2.914 3.255 3.424 3.575 3.662 3.945 4.065 4.303 4.502 4.674 4.763 4.952 5.125 5.355 5.505 5.642 5.835 6.032 6.222 6.399 6.571 6.814 7.051 7.28 7.568 7.836 8.096 8.397 8.71 8.989 9.279 9.595 9.933 10.299 10.71 11.16 11.575 12.007 12.508 13.043 13.545 14.051 14.439 14.555 14.193 13.647 13.083 12.487 11.913 11.409 10.898 10.413 9.924 9.517 9.143 8.766 8.395 8.027 7.681 7.315 6.972 6.674 6.362 6.049 5.81 5.561 5.288 5.06 4.823 4.59 4.357 4.123 3.966 3.812 3.561 3.379 3.198 3.093 2.865 2.629 2.373 2.246 1.955 1.859 1.721 1.569 1.262 1.065 0.817 0.537 0.24 -0.066 -0.49 -2.044 -8 ,28413 ,KEBNE ,17027224,Wed Dec 22 16:32:47 CET,Wed Dec 22 18:06:55 CET,0.0 0.952 1.224 1.43 1.649 1.858 2.047 2.199 2.447 2.569 2.699 2.79 3.054 3.155 3.358 3.563 3.742 3.82 3.982 4.133 4.35 4.489 4.626 4.83 5.032 5.227 5.402 5.574 5.784 5.998 6.228 6.483 6.72 6.949 7.203 7.486 7.76 8.039 8.313 8.609 8.92 9.256 9.644 10.03 10.458 10.926 11.452 11.983 12.463 12.891 13.111 12.892 12.45 11.87 11.248 10.654 10.135 9.627 9.151 8.661 8.229 7.832 7.461 7.107 6.757 6.439 6.108 5.802 5.531 5.241 4.943 4.718 4.465 4.185 3.972 3.758 3.539 3.305 3.054 2.876 2.694 2.405 2.201 1.99 1.877 1.651 1.438 1.211 1.09 0.801 0.656 0.482 0.289 -0.155 -0.382 -0.604 -0.836 -1.134 -1.493 -1.887 -3.058 -9 ,17843 ,KEBNE ,17027225,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:08:40 CET,0.0 0.913 1.348 1.657 1.912 2.13 2.306 2.466 2.784 2.936 3.075 3.145 3.401 3.514 3.729 3.914 4.116 4.209 4.379 4.562 4.829 4.991 5.146 5.353 5.549 5.732 5.894 6.064 6.286 6.502 6.716 6.954 7.177 7.404 7.659 7.92 8.178 8.461 8.753 9.054 9.348 9.682 10.058 10.402 10.82 11.262 11.723 12.185 12.617 13.076 13.335 12.992 12.476 11.901 11.323 10.784 10.295 9.837 9.408 8.941 8.522 8.158 7.818 7.48 7.162 6.875 6.567 6.26 5.998 5.75 5.472 5.22 4.977 4.736 4.543 4.343 4.124 3.895 3.672 3.512 3.336 3.07 2.88 2.689 2.584 2.318 2.035 1.78 1.661 1.371 1.264 1.124 0.966 0.578 0.353 0.118 -0.12 -0.404 -0.758 -1.345 -4.291 -10 ,5141 ,KEBNE ,17027226,Wed Dec 22 16:32:46 CET,Wed Dec 22 18:08:03 CET,0.0 0.776 1.129 1.364 1.544 1.726 1.893 2.042 2.309 2.435 2.557 2.636 2.914 3.024 3.229 3.446 3.64 3.724 3.877 4.024 4.244 4.392 4.529 4.712 4.904 5.091 5.242 5.392 5.612 5.815 6.001 6.224 6.445 6.667 6.922 7.199 7.464 7.743 8.008 8.299 8.618 8.949 9.34 9.71 10.118 10.583 11.063 11.516 11.951 12.306 12.482 12.237 11.79 11.256 10.706 10.192 9.712 9.228 8.802 8.382 7.986 7.622 7.265 6.927 6.604 6.3 5.992 5.702 5.448 5.184 4.9 4.665 4.421 4.163 3.959 3.746 3.534 3.313 3.075 2.92 2.762 2.485 2.283 2.081 1.975 1.748 1.521 1.25 1.099 0.776 0.535 0.313 0.09 -0.313 -0.537 -0.825 -1.155 -1.527 -1.974 -2.551 -4.232 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_60_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_60_61.txt deleted file mode 100644 index 7c5582f1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_60_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4594 ,TETRA ,17601425,Sun Nov 28 14:45:43 CET,Sun Nov 28 16:35:11 CET,0.0 3.191 3.864 4.364 4.756 5.089 5.379 5.663 6.173 6.387 6.587 6.809 7.141 7.319 7.67 8.004 8.321 8.471 8.742 8.988 9.348 9.595 9.841 10.211 10.555 10.853 11.133 11.416 11.77 12.133 12.49 12.878 13.253 13.62 14.04 14.514 14.973 15.455 15.937 16.409 16.889 17.433 18.032 18.631 19.319 20.027 20.765 21.491 22.265 23.057 23.673 23.743 23.457 23.078 22.635 22.156 21.707 21.286 20.913 20.504 20.118 19.756 19.41 19.088 18.777 18.477 18.165 17.893 17.66 17.404 17.126 16.9 16.672 16.428 16.229 16.016 15.797 15.573 15.328 15.164 14.991 14.706 14.511 14.32 14.219 14.01 13.79 13.538 13.397 13.09 12.926 12.782 12.615 12.164 11.909 11.68 11.475 11.227 10.871 10.29 8.202 -2 ,12805 ,TETRA ,17601426,Sun Nov 28 14:45:41 CET,Sun Nov 28 16:34:37 CET,0.0 3.557 4.216 4.706 5.073 5.405 5.697 5.958 6.401 6.609 6.822 7.051 7.374 7.535 7.856 8.153 8.423 8.549 8.797 9.029 9.358 9.581 9.801 10.112 10.399 10.694 10.986 11.238 11.558 11.867 12.146 12.469 12.776 13.062 13.387 13.762 14.112 14.48 14.883 15.312 15.742 16.224 16.781 17.291 17.84 18.409 19.037 19.69 20.372 21.059 21.556 21.59 21.374 21.038 20.634 20.226 19.821 19.425 19.064 18.661 18.305 17.96 17.638 17.374 17.093 16.82 16.557 16.328 16.11 15.872 15.632 15.413 15.165 14.917 14.711 14.498 14.284 14.058 13.817 13.646 13.48 13.216 13.021 12.809 12.701 12.484 12.258 12.039 11.917 11.622 11.435 11.27 11.111 10.752 10.562 10.336 10.057 9.736 9.366 8.836 7.052 -3 ,8384 ,TETRA ,17601427,Sun Nov 28 14:45:43 CET,Sun Nov 28 16:34:52 CET,0.0 2.019 2.571 2.972 3.31 3.639 3.949 4.214 4.665 4.871 5.079 5.331 5.676 5.856 6.201 6.523 6.826 6.981 7.271 7.511 7.856 8.084 8.301 8.642 8.986 9.308 9.621 9.931 10.307 10.66 11.022 11.443 11.827 12.187 12.59 13.036 13.443 13.878 14.33 14.802 15.273 15.776 16.352 16.924 17.591 18.295 19.042 19.79 20.547 21.28 21.863 21.894 21.594 21.239 20.832 20.403 19.981 19.527 19.131 18.736 18.389 18.067 17.71 17.364 17.047 16.751 16.428 16.11 15.83 15.558 15.264 15.014 14.757 14.485 14.284 14.085 13.871 13.644 13.412 13.244 13.062 12.78 12.598 12.411 12.305 12.079 11.845 11.612 11.483 11.191 11.073 10.911 10.731 10.328 10.1 9.856 9.597 9.326 8.941 8.369 6.449 -4 ,23120 ,TETRA ,17601428,Sun Nov 28 14:45:41 CET,Sun Nov 28 16:34:50 CET,0.0 2.275 3.001 3.473 3.868 4.235 4.54 4.81 5.287 5.508 5.721 5.941 6.28 6.462 6.807 7.134 7.45 7.606 7.907 8.181 8.555 8.786 9.007 9.34 9.639 9.924 10.223 10.516 10.875 11.228 11.586 11.984 12.348 12.715 13.152 13.607 14.024 14.481 14.924 15.381 15.878 16.398 16.981 17.566 18.211 18.924 19.697 20.448 21.212 21.911 22.463 22.569 22.279 21.912 21.51 21.064 20.638 20.22 19.824 19.423 19.068 18.73 18.405 18.08 17.76 17.467 17.148 16.848 16.572 16.296 16.025 15.785 15.55 15.312 15.109 14.885 14.664 14.446 14.222 14.08 13.938 13.692 13.52 13.351 13.265 13.074 12.842 12.621 12.513 12.223 12.085 11.954 11.799 11.39 11.129 10.843 10.529 10.216 9.902 9.35 6.92 -5 ,2912 ,TETRA ,17601429,Sun Nov 28 14:46:37 CET,Sun Nov 28 16:35:28 CET,0.0 2.74 3.452 3.9 4.267 4.599 4.919 5.208 5.67 5.875 6.077 6.317 6.663 6.851 7.204 7.526 7.836 7.981 8.252 8.516 8.91 9.167 9.403 9.717 10.01 10.298 10.582 10.851 11.188 11.517 11.834 12.212 12.572 12.908 13.274 13.682 14.092 14.546 15.008 15.452 15.926 16.456 17.032 17.611 18.241 18.88 19.602 20.351 21.084 21.77 22.324 22.379 22.111 21.724 21.28 20.829 20.384 19.948 19.562 19.136 18.787 18.471 18.153 17.846 17.528 17.24 16.959 16.706 16.479 16.238 15.962 15.734 15.511 15.259 15.029 14.812 14.614 14.399 14.179 14.026 13.867 13.629 13.459 13.271 13.168 12.947 12.718 12.471 12.336 12.036 11.857 11.672 11.498 11.127 10.939 10.742 10.514 10.216 9.79 9.215 7.37 -6 ,15825 ,TETRA ,17601430,Sun Nov 28 14:46:39 CET,Sun Nov 28 16:35:56 CET,0.0 2.95 3.516 3.962 4.308 4.6 4.866 5.11 5.55 5.748 5.946 6.152 6.476 6.642 6.95 7.258 7.565 7.71 7.971 8.201 8.532 8.758 8.985 9.3 9.588 9.878 10.138 10.384 10.724 11.057 11.373 11.721 12.049 12.372 12.758 13.173 13.55 13.989 14.451 14.902 15.366 15.86 16.409 16.971 17.596 18.262 19.021 19.804 20.606 21.39 21.983 22.021 21.734 21.306 20.809 20.334 19.893 19.463 19.107 18.73 18.38 18.061 17.742 17.436 17.134 16.845 16.524 16.236 16.003 15.751 15.476 15.249 15.011 14.758 14.564 14.362 14.131 13.858 13.57 13.392 13.18 12.842 12.632 12.418 12.307 12.068 11.833 11.595 11.472 11.195 11.041 10.867 10.683 10.273 10.039 9.802 9.548 9.231 8.882 8.424 6.979 -7 ,1350 ,TETRA ,17601431,Sun Nov 28 14:46:38 CET,Sun Nov 28 16:35:44 CET,0.0 2.728 3.324 3.741 4.119 4.456 4.768 5.045 5.509 5.708 5.893 6.067 6.382 6.537 6.836 7.148 7.459 7.609 7.901 8.164 8.513 8.727 8.922 9.205 9.49 9.747 9.992 10.243 10.565 10.867 11.153 11.484 11.786 12.096 12.457 12.82 13.159 13.54 13.947 14.367 14.805 15.268 15.762 16.253 16.831 17.456 18.14 18.836 19.534 20.208 20.721 20.803 20.571 20.212 19.815 19.392 19.0 18.611 18.255 17.892 17.565 17.284 17.002 16.694 16.4 16.139 15.851 15.583 15.356 15.109 14.851 14.65 14.429 14.186 14.0 13.811 13.63 13.432 13.202 13.037 12.869 12.599 12.377 12.138 12.032 11.843 11.632 11.395 11.268 10.988 10.875 10.73 10.576 10.234 10.044 9.841 9.619 9.337 8.914 8.36 6.392 -8 ,921 ,TETRA ,17601432,Sun Nov 28 14:46:41 CET,Sun Nov 28 16:35:53 CET,0.0 3.511 4.181 4.597 4.997 5.356 5.675 5.949 6.433 6.654 6.847 7.049 7.378 7.552 7.874 8.172 8.454 8.59 8.872 9.157 9.538 9.773 10.01 10.346 10.665 10.965 11.254 11.545 11.921 12.285 12.652 13.09 13.483 13.833 14.241 14.689 15.105 15.561 16.061 16.592 17.095 17.647 18.284 18.902 19.569 20.244 20.983 21.771 22.583 23.34 23.836 23.829 23.575 23.135 22.687 22.25 21.84 21.423 21.013 20.58 20.206 19.899 19.609 19.336 19.062 18.806 18.545 18.295 18.087 17.857 17.611 17.391 17.146 16.898 16.702 16.503 16.292 16.063 15.802 15.625 15.449 15.157 14.944 14.711 14.6 14.359 14.091 13.794 13.631 13.317 13.147 12.994 12.827 12.442 12.235 12.034 11.783 11.457 11.097 10.637 8.055 -9 ,16833 ,TETRA ,17601433,Sun Nov 28 14:46:42 CET,Sun Nov 28 16:35:19 CET,0.0 2.442 3.008 3.406 3.795 4.145 4.448 4.725 5.182 5.397 5.608 5.843 6.184 6.37 6.717 7.052 7.378 7.534 7.818 8.072 8.435 8.667 8.886 9.198 9.502 9.785 10.053 10.318 10.663 10.982 11.287 11.679 12.048 12.391 12.787 13.235 13.685 14.149 14.601 15.09 15.576 16.104 16.757 17.369 18.038 18.752 19.497 20.265 21.035 21.768 22.34 22.377 22.122 21.747 21.369 20.959 20.523 20.089 19.689 19.264 18.872 18.522 18.185 17.863 17.564 17.288 16.988 16.717 16.475 16.204 15.931 15.709 15.467 15.204 14.99 14.781 14.578 14.343 14.068 13.88 13.698 13.405 13.169 12.932 12.818 12.56 12.288 12.005 11.853 11.547 11.339 11.155 10.989 10.594 10.363 10.104 9.777 9.433 9.022 8.434 6.638 -10 ,26558 ,TETRA ,17601434,Sun Nov 28 14:46:38 CET,Sun Nov 28 16:36:04 CET,0.0 2.126 2.728 3.199 3.596 3.934 4.24 4.519 5.032 5.269 5.49 5.749 6.1 6.294 6.658 6.984 7.281 7.43 7.72 7.98 8.357 8.61 8.85 9.196 9.52 9.832 10.139 10.432 10.814 11.181 11.518 11.894 12.231 12.538 12.914 13.328 13.702 14.113 14.563 15.047 15.555 16.099 16.712 17.325 17.997 18.702 19.418 20.149 20.907 21.654 22.249 22.328 22.012 21.565 21.126 20.673 20.246 19.831 19.448 19.042 18.69 18.353 17.989 17.639 17.319 17.035 16.702 16.384 16.132 15.883 15.628 15.411 15.179 14.933 14.737 14.537 14.337 14.109 13.844 13.656 13.465 13.184 12.995 12.801 12.7 12.492 12.282 12.072 11.966 11.695 11.598 11.453 11.294 10.947 10.752 10.549 10.262 9.824 9.375 8.926 7.332 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_60_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_60_63.txt deleted file mode 100644 index ea8da853..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_60_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20325 ,TETRA ,17601435,Sun Nov 28 14:46:41 CET,Sun Nov 28 16:38:04 CET,0.0 1.127 1.572 1.885 2.113 2.324 2.535 2.744 3.07 3.209 3.354 3.48 3.78 3.908 4.132 4.35 4.558 4.659 4.854 5.034 5.297 5.458 5.612 5.834 6.043 6.238 6.423 6.599 6.813 7.011 7.204 7.46 7.712 7.939 8.196 8.486 8.759 9.05 9.345 9.634 9.914 10.227 10.584 10.925 11.284 11.616 11.925 12.209 12.463 12.508 12.147 11.446 10.716 9.992 9.285 8.618 8.015 7.463 6.969 6.471 6.053 5.685 5.339 5.015 4.695 4.374 4.037 3.739 3.481 3.216 2.947 2.716 2.465 2.207 2.008 1.814 1.618 1.407 1.181 1.013 0.845 0.587 0.394 0.194 0.098 -0.105 -0.321 -0.529 -0.634 -0.914 -1.014 -1.155 -1.309 -1.633 -1.798 -1.968 -2.159 -2.368 -2.632 -2.989 -4.033 -2 ,2789 ,TETRA ,17601436,Sun Nov 28 14:46:38 CET,Sun Nov 28 16:38:04 CET,0.0 1.337 1.733 2.014 2.263 2.497 2.737 2.95 3.311 3.475 3.62 3.735 4.021 4.149 4.371 4.579 4.787 4.882 5.067 5.25 5.5 5.654 5.804 6.031 6.261 6.478 6.664 6.842 7.081 7.311 7.526 7.789 8.042 8.272 8.518 8.784 9.029 9.291 9.587 9.886 10.177 10.482 10.828 11.159 11.486 11.803 12.136 12.452 12.709 12.83 12.617 11.888 11.066 10.341 9.671 8.999 8.388 7.811 7.307 6.828 6.403 6.017 5.645 5.3 4.972 4.67 4.364 4.069 3.802 3.54 3.273 3.046 2.803 2.551 2.355 2.149 1.95 1.737 1.509 1.355 1.191 0.943 0.778 0.602 0.505 0.295 0.052 -0.196 -0.313 -0.588 -0.664 -0.787 -0.934 -1.246 -1.392 -1.551 -1.742 -1.942 -2.181 -2.519 -3.268 -3 ,30020 ,TETRA ,17601437,Sun Nov 28 14:47:39 CET,Sun Nov 28 16:37:19 CET,0.0 0.89 1.328 1.669 1.951 2.166 2.36 2.549 2.888 3.04 3.18 3.277 3.557 3.681 3.906 4.107 4.301 4.396 4.573 4.745 4.987 5.137 5.281 5.491 5.682 5.868 6.066 6.257 6.496 6.725 6.95 7.215 7.447 7.666 7.907 8.177 8.42 8.669 8.942 9.228 9.527 9.842 10.18 10.499 10.85 11.189 11.508 11.808 12.044 12.116 11.864 11.234 10.482 9.738 9.083 8.478 7.903 7.365 6.911 6.466 6.051 5.65 5.255 4.888 4.552 4.231 3.904 3.606 3.331 3.052 2.774 2.538 2.283 2.014 1.81 1.615 1.405 1.187 0.974 0.825 0.666 0.41 0.228 0.045 -0.05 -0.253 -0.483 -0.728 -0.847 -1.13 -1.236 -1.38 -1.523 -1.862 -2.073 -2.322 -2.581 -2.858 -3.176 -3.513 -4.093 -4 ,12886 ,TETRA ,17601438,Sun Nov 28 14:46:38 CET,Sun Nov 28 16:36:37 CET,0.0 0.818 1.224 1.522 1.806 2.064 2.268 2.455 2.824 2.984 3.14 3.276 3.557 3.676 3.887 4.09 4.307 4.412 4.6 4.77 5.019 5.17 5.314 5.534 5.738 5.939 6.145 6.328 6.538 6.749 6.949 7.188 7.415 7.621 7.875 8.156 8.397 8.654 8.922 9.202 9.486 9.802 10.133 10.436 10.775 11.09 11.41 11.731 11.985 12.074 11.839 11.235 10.5 9.74 9.032 8.371 7.784 7.248 6.784 6.274 5.814 5.431 5.079 4.756 4.446 4.152 3.848 3.578 3.324 3.061 2.81 2.586 2.339 2.104 1.926 1.735 1.531 1.314 1.08 0.905 0.727 0.467 0.274 0.069 -0.03 -0.237 -0.461 -0.698 -0.829 -1.136 -1.289 -1.452 -1.618 -1.985 -2.182 -2.38 -2.581 -2.787 -3.01 -3.358 -4.105 -5 ,7178 ,TETRA ,17601439,Sun Nov 28 14:46:41 CET,Sun Nov 28 16:36:28 CET,0.0 1.153 1.758 2.16 2.454 2.729 2.984 3.204 3.573 3.745 3.902 4.033 4.329 4.458 4.686 4.892 5.085 5.179 5.355 5.525 5.776 5.929 6.083 6.314 6.528 6.713 6.884 7.06 7.279 7.491 7.69 7.923 8.159 8.379 8.614 8.87 9.11 9.377 9.652 9.932 10.228 10.545 10.851 11.133 11.471 11.803 12.146 12.449 12.654 12.715 12.44 11.733 10.951 10.207 9.515 8.872 8.296 7.744 7.252 6.753 6.317 5.934 5.568 5.212 4.875 4.564 4.244 3.955 3.699 3.441 3.164 2.931 2.688 2.422 2.216 2.002 1.792 1.576 1.333 1.166 1.006 0.758 0.574 0.387 0.285 0.048 -0.207 -0.452 -0.577 -0.868 -0.954 -1.086 -1.242 -1.586 -1.763 -1.963 -2.165 -2.367 -2.614 -2.919 -3.601 -6 ,5937 ,TETRA ,17601440,Sun Nov 28 14:47:41 CET,Sun Nov 28 16:37:32 CET,0.0 0.936 1.475 1.839 2.132 2.375 2.589 2.794 3.143 3.3 3.446 3.565 3.846 3.961 4.18 4.378 4.57 4.669 4.857 5.046 5.302 5.468 5.632 5.853 6.062 6.261 6.446 6.621 6.848 7.064 7.271 7.519 7.75 7.973 8.228 8.504 8.764 9.032 9.299 9.571 9.853 10.132 10.442 10.771 11.129 11.465 11.79 12.099 12.315 12.366 12.08 11.339 10.528 9.761 9.067 8.392 7.761 7.202 6.695 6.18 5.763 5.382 5.017 4.668 4.341 4.049 3.729 3.428 3.179 2.922 2.616 2.353 2.106 1.844 1.636 1.428 1.201 0.979 0.759 0.601 0.443 0.191 0.003 -0.187 -0.282 -0.482 -0.693 -0.914 -1.028 -1.304 -1.37 -1.501 -1.642 -1.934 -2.111 -2.3 -2.486 -2.712 -2.986 -3.402 -4.104 -7 ,20697 ,TETRA ,17601441,Sun Nov 28 14:47:39 CET,Sun Nov 28 16:37:37 CET,0.0 1.077 1.501 1.846 2.107 2.314 2.5 2.7 3.067 3.223 3.372 3.481 3.758 3.875 4.085 4.286 4.486 4.579 4.756 4.934 5.192 5.344 5.498 5.731 5.951 6.156 6.346 6.529 6.758 6.969 7.167 7.399 7.616 7.824 8.058 8.33 8.591 8.857 9.109 9.366 9.644 9.944 10.274 10.587 10.935 11.297 11.656 11.926 12.105 12.146 11.81 11.088 10.337 9.592 8.859 8.188 7.582 7.016 6.543 6.067 5.657 5.274 4.876 4.508 4.17 3.847 3.487 3.144 2.833 2.512 2.176 1.899 1.616 1.315 1.078 0.835 0.593 0.342 0.072 -0.117 -0.306 -0.58 -0.766 -0.97 -1.08 -1.308 -1.536 -1.788 -1.93 -2.233 -2.384 -2.55 -2.715 -3.054 -3.251 -3.448 -3.659 -3.915 -4.233 -4.605 -5.146 -8 ,995 ,TETRA ,17601442,Sun Nov 28 14:47:39 CET,Sun Nov 28 16:37:53 CET,0.0 0.883 1.334 1.666 1.912 2.148 2.369 2.566 2.892 3.046 3.22 3.363 3.646 3.763 3.967 4.18 4.388 4.485 4.668 4.838 5.08 5.231 5.374 5.6 5.835 6.049 6.247 6.442 6.691 6.921 7.129 7.369 7.607 7.84 8.106 8.386 8.63 8.891 9.163 9.443 9.739 10.057 10.387 10.691 11.025 11.331 11.643 11.94 12.173 12.311 12.079 11.353 10.557 9.801 9.127 8.472 7.862 7.298 6.829 6.369 5.94 5.541 5.163 4.811 4.485 4.181 3.857 3.556 3.294 3.032 2.763 2.538 2.293 2.031 1.823 1.618 1.416 1.204 0.987 0.839 0.675 0.4 0.219 0.039 -0.059 -0.271 -0.488 -0.721 -0.849 -1.135 -1.249 -1.38 -1.514 -1.813 -1.973 -2.169 -2.386 -2.631 -2.884 -3.187 -4.048 -9 ,10805 ,TETRA ,17601443,Sun Nov 28 14:47:39 CET,Sun Nov 28 16:37:47 CET,0.0 0.995 1.435 1.775 2.035 2.25 2.452 2.636 2.971 3.124 3.271 3.4 3.688 3.82 4.05 4.256 4.489 4.602 4.79 4.963 5.219 5.39 5.548 5.78 6.01 6.215 6.395 6.578 6.818 7.03 7.251 7.519 7.759 7.981 8.248 8.539 8.776 9.029 9.286 9.565 9.884 10.232 10.587 10.881 11.187 11.505 11.805 12.062 12.265 12.306 12.044 11.364 10.594 9.853 9.193 8.549 7.925 7.354 6.875 6.383 5.932 5.531 5.158 4.806 4.475 4.166 3.838 3.546 3.309 3.057 2.782 2.55 2.305 2.054 1.865 1.67 1.453 1.224 0.997 0.833 0.668 0.41 0.228 0.041 -0.058 -0.279 -0.533 -0.797 -0.927 -1.213 -1.287 -1.41 -1.548 -1.855 -2.029 -2.233 -2.533 -2.9 -3.312 -3.889 -5.365 -10 ,1474 ,TETRA ,17601444,Sun Nov 28 14:47:39 CET,Sun Nov 28 16:37:31 CET,0.0 1.032 1.397 1.656 1.897 2.13 2.348 2.551 2.913 3.074 3.224 3.325 3.601 3.734 3.981 4.191 4.402 4.505 4.694 4.878 5.131 5.286 5.44 5.658 5.859 6.053 6.237 6.413 6.641 6.851 7.05 7.289 7.53 7.771 8.023 8.293 8.557 8.846 9.136 9.412 9.695 10.002 10.36 10.712 11.081 11.441 11.765 12.057 12.3 12.405 12.176 11.523 10.765 10.024 9.344 8.685 8.069 7.497 6.988 6.477 6.06 5.681 5.308 4.962 4.641 4.349 4.03 3.733 3.475 3.211 2.946 2.725 2.496 2.258 2.065 1.867 1.654 1.442 1.229 1.068 0.902 0.636 0.448 0.258 0.154 -0.055 -0.256 -0.475 -0.586 -0.865 -0.983 -1.121 -1.27 -1.566 -1.727 -1.916 -2.101 -2.318 -2.607 -2.943 -3.441 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_60_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_60_65.txt deleted file mode 100644 index 93fbbae3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_60_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19260 ,TETRA ,17601445,Sun Nov 28 14:48:39 CET,Sun Nov 28 16:37:52 CET,0.0 1.442 2.063 2.521 2.828 3.064 3.276 3.478 3.845 4.002 4.144 4.257 4.547 4.675 4.941 5.18 5.378 5.487 5.714 5.928 6.213 6.406 6.585 6.79 6.996 7.212 7.421 7.615 7.851 8.069 8.274 8.541 8.809 9.05 9.319 9.626 9.905 10.171 10.443 10.736 11.032 11.331 11.673 12.008 12.367 12.731 13.078 13.394 13.674 13.787 13.54 12.899 12.19 11.488 10.802 10.148 9.575 9.055 8.581 8.104 7.69 7.315 6.957 6.608 6.253 5.937 5.624 5.33 5.085 4.845 4.578 4.348 4.11 3.859 3.663 3.456 3.237 3.017 2.776 2.589 2.401 2.119 1.924 1.722 1.617 1.4 1.18 0.936 0.797 0.495 0.369 0.225 0.07 -0.276 -0.471 -0.695 -0.952 -1.214 -1.539 -1.966 -3.622 -2 ,23205 ,TETRA ,17601446,Sun Nov 28 14:47:39 CET,Sun Nov 28 16:39:56 CET,0.0 0.97 1.408 1.788 2.091 2.347 2.57 2.784 3.156 3.312 3.461 3.583 3.871 4.004 4.264 4.503 4.726 4.833 5.048 5.246 5.488 5.636 5.784 5.987 6.179 6.369 6.552 6.728 6.943 7.138 7.325 7.573 7.8 8.005 8.239 8.477 8.702 8.947 9.195 9.439 9.705 10.019 10.358 10.663 10.994 11.338 11.721 12.078 12.341 12.442 12.254 11.677 10.934 10.2 9.52 8.871 8.252 7.702 7.24 6.76 6.355 5.992 5.636 5.289 4.976 4.703 4.38 4.065 3.795 3.527 3.247 3.027 2.808 2.569 2.388 2.2 1.996 1.784 1.564 1.404 1.23 0.97 0.798 0.616 0.518 0.313 0.106 -0.127 -0.246 -0.51 -0.585 -0.716 -0.862 -1.223 -1.424 -1.629 -1.84 -2.086 -2.358 -2.675 -3.632 -3 ,22835 ,TETRA ,17601447,Sun Nov 28 14:47:41 CET,Sun Nov 28 16:40:35 CET,0.0 1.019 1.415 1.717 2.015 2.274 2.466 2.67 3.035 3.173 3.305 3.391 3.667 3.789 4.011 4.232 4.457 4.562 4.752 4.924 5.16 5.316 5.474 5.707 5.932 6.141 6.334 6.516 6.74 6.955 7.178 7.456 7.7 7.914 8.154 8.42 8.666 8.951 9.254 9.557 9.85 10.155 10.5 10.793 11.124 11.483 11.855 12.212 12.493 12.618 12.402 11.735 11.017 10.321 9.675 9.062 8.501 7.986 7.535 7.055 6.639 6.285 5.938 5.6 5.286 4.992 4.683 4.408 4.167 3.914 3.64 3.418 3.187 2.943 2.747 2.542 2.326 2.107 1.868 1.696 1.527 1.277 1.106 0.925 0.834 0.639 0.433 0.203 0.081 -0.193 -0.277 -0.4 -0.538 -0.856 -1.029 -1.213 -1.423 -1.704 -2.008 -2.357 -3.163 -4 ,23538 ,TETRA ,17601448,Sun Nov 28 14:48:42 CET,Sun Nov 28 16:37:49 CET,0.0 1.477 1.892 2.205 2.461 2.664 2.841 3.014 3.328 3.49 3.653 3.773 4.053 4.168 4.386 4.603 4.827 4.932 5.122 5.295 5.536 5.704 5.866 6.098 6.325 6.549 6.765 6.956 7.17 7.375 7.589 7.858 8.105 8.332 8.587 8.857 9.103 9.359 9.64 9.937 10.229 10.538 10.869 11.198 11.555 11.893 12.246 12.597 12.853 12.951 12.755 12.132 11.402 10.683 10.0 9.361 8.802 8.305 7.861 7.38 6.965 6.579 6.203 5.868 5.574 5.288 4.955 4.67 4.432 4.173 3.908 3.691 3.46 3.229 3.04 2.827 2.6 2.364 2.137 1.993 1.838 1.586 1.402 1.202 1.103 0.9 0.68 0.438 0.308 0.019 -0.092 -0.242 -0.408 -0.795 -0.988 -1.164 -1.36 -1.589 -1.85 -2.199 -3.172 -5 ,5527 ,TETRA ,17601449,Sun Nov 28 14:48:44 CET,Sun Nov 28 16:38:13 CET,0.0 1.084 1.582 1.886 2.121 2.364 2.586 2.77 3.127 3.289 3.443 3.579 3.874 4.005 4.24 4.458 4.675 4.78 4.977 5.161 5.4 5.545 5.697 5.93 6.15 6.348 6.537 6.717 6.933 7.154 7.361 7.585 7.8 8.004 8.248 8.533 8.783 9.062 9.358 9.632 9.901 10.19 10.508 10.827 11.175 11.513 11.867 12.211 12.49 12.628 12.431 11.713 10.983 10.292 9.664 9.094 8.539 8.013 7.547 7.062 6.66 6.291 5.903 5.533 5.207 4.917 4.614 4.332 4.075 3.811 3.543 3.301 3.041 2.79 2.598 2.398 2.197 1.987 1.765 1.614 1.451 1.188 1.015 0.855 0.766 0.557 0.352 0.146 0.034 -0.233 -0.327 -0.453 -0.577 -0.863 -1.049 -1.24 -1.423 -1.643 -1.905 -2.246 -3.107 -6 ,29137 ,TETRA ,17601450,Sun Nov 28 14:48:40 CET,Sun Nov 28 16:37:44 CET,0.0 1.105 1.589 1.971 2.248 2.508 2.747 2.951 3.287 3.444 3.604 3.744 4.041 4.174 4.413 4.62 4.822 4.921 5.096 5.269 5.517 5.666 5.809 6.034 6.242 6.43 6.614 6.786 7.013 7.245 7.464 7.703 7.926 8.146 8.392 8.668 8.943 9.224 9.499 9.784 10.072 10.359 10.672 11.014 11.4 11.75 12.103 12.454 12.724 12.855 12.649 12.061 11.402 10.718 10.091 9.499 8.939 8.418 7.957 7.488 7.078 6.718 6.37 6.025 5.702 5.407 5.098 4.817 4.568 4.308 4.03 3.796 3.537 3.26 3.061 2.859 2.657 2.45 2.231 2.075 1.911 1.657 1.471 1.267 1.161 0.955 0.738 0.49 0.356 0.062 -0.053 -0.186 -0.333 -0.686 -0.873 -1.067 -1.298 -1.557 -1.834 -2.223 -3.375 -7 ,8490 ,TETRA ,17601451,Sun Nov 28 14:48:40 CET,Sun Nov 28 16:39:42 CET,0.0 1.183 1.641 1.943 2.189 2.416 2.628 2.804 3.128 3.29 3.429 3.541 3.817 3.926 4.145 4.355 4.543 4.638 4.834 5.011 5.271 5.437 5.592 5.812 6.025 6.234 6.422 6.596 6.83 7.04 7.236 7.485 7.714 7.917 8.142 8.395 8.629 8.888 9.181 9.477 9.77 10.083 10.423 10.737 11.091 11.465 11.776 12.042 12.283 12.379 12.138 11.517 10.82 10.13 9.484 8.844 8.264 7.752 7.287 6.818 6.411 6.038 5.687 5.336 5.0 4.704 4.408 4.139 3.907 3.664 3.39 3.16 2.925 2.678 2.492 2.304 2.102 1.88 1.648 1.486 1.321 1.065 0.884 0.708 0.618 0.422 0.203 -0.027 -0.145 -0.43 -0.551 -0.691 -0.828 -1.124 -1.295 -1.471 -1.671 -1.891 -2.139 -2.451 -3.359 -8 ,30073 ,TETRA ,17601452,Sun Nov 28 14:48:40 CET,Sun Nov 28 16:42:37 CET,0.0 0.873 1.279 1.565 1.783 1.987 2.185 2.377 2.722 2.88 3.032 3.159 3.433 3.546 3.779 4.003 4.212 4.309 4.491 4.67 4.928 5.081 5.232 5.462 5.668 5.868 6.069 6.262 6.505 6.726 6.927 7.176 7.432 7.658 7.891 8.164 8.412 8.684 8.988 9.271 9.557 9.885 10.257 10.608 10.974 11.324 11.675 11.983 12.228 12.362 12.139 11.487 10.747 10.048 9.411 8.807 8.255 7.756 7.317 6.85 6.431 6.038 5.666 5.328 5.011 4.712 4.398 4.111 3.863 3.619 3.35 3.118 2.874 2.622 2.435 2.25 2.066 1.866 1.649 1.493 1.335 1.088 0.903 0.709 0.618 0.431 0.216 0.005 -0.095 -0.375 -0.493 -0.636 -0.775 -1.056 -1.212 -1.432 -1.667 -1.874 -2.113 -2.452 -3.078 -9 ,11818 ,TETRA ,17601453,Sun Nov 28 14:48:42 CET,Sun Nov 28 16:42:24 CET,0.0 0.947 1.369 1.69 1.99 2.253 2.453 2.631 2.99 3.158 3.306 3.421 3.701 3.817 4.041 4.254 4.454 4.554 4.741 4.918 5.178 5.341 5.499 5.729 5.944 6.144 6.33 6.511 6.739 6.953 7.154 7.388 7.619 7.847 8.103 8.369 8.606 8.859 9.143 9.45 9.748 10.054 10.392 10.715 11.053 11.395 11.743 12.048 12.303 12.391 12.181 11.543 10.804 10.093 9.413 8.78 8.23 7.719 7.257 6.778 6.371 6.014 5.67 5.354 5.051 4.757 4.458 4.19 3.944 3.683 3.401 3.161 2.925 2.687 2.497 2.299 2.092 1.884 1.685 1.535 1.363 1.104 0.925 0.738 0.64 0.441 0.236 0.013 -0.1 -0.371 -0.459 -0.579 -0.699 -0.973 -1.128 -1.314 -1.524 -1.759 -2.014 -2.295 -3.17 -10 ,11000 ,TETRA ,17601454,Sun Nov 28 14:48:44 CET,Sun Nov 28 16:38:28 CET,0.0 0.988 1.37 1.696 2.008 2.281 2.501 2.687 3.036 3.196 3.333 3.44 3.721 3.839 4.075 4.282 4.481 4.578 4.755 4.93 5.179 5.331 5.474 5.684 5.89 6.089 6.276 6.448 6.664 6.877 7.087 7.325 7.548 7.772 8.018 8.276 8.52 8.792 9.083 9.379 9.679 10.009 10.354 10.636 10.953 11.305 11.662 11.993 12.244 12.318 12.056 11.37 10.614 9.932 9.288 8.677 8.134 7.627 7.164 6.669 6.248 5.888 5.542 5.197 4.862 4.563 4.235 3.94 3.696 3.439 3.166 2.93 2.696 2.458 2.262 2.051 1.82 1.575 1.325 1.155 0.983 0.712 0.527 0.337 0.238 0.03 -0.187 -0.408 -0.515 -0.781 -0.861 -0.993 -1.133 -1.439 -1.607 -1.78 -1.983 -2.214 -2.47 -2.835 -3.681 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_61_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_61_50.txt deleted file mode 100644 index c776ed87..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_61_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31658 ,KEBNE ,17027227,Wed Dec 22 16:32:47 CET,Wed Dec 22 18:07:36 CET,0.0 1.066 1.423 1.743 2.106 2.428 2.641 2.821 3.161 3.316 3.446 3.528 3.811 3.929 4.153 4.372 4.564 4.657 4.858 5.054 5.307 5.462 5.613 5.852 6.068 6.261 6.449 6.621 6.863 7.103 7.333 7.603 7.848 8.087 8.382 8.721 9.024 9.353 9.72 10.091 10.441 10.828 11.267 11.685 12.178 12.684 13.214 13.747 14.287 14.818 15.15 14.952 14.501 13.963 13.378 12.827 12.328 11.808 11.322 10.826 10.395 9.987 9.58 9.199 8.829 8.469 8.093 7.772 7.488 7.185 6.872 6.599 6.321 6.031 5.802 5.575 5.331 5.074 4.802 4.606 4.398 4.081 3.859 3.612 3.489 3.24 2.965 2.666 2.508 2.187 1.955 1.763 1.568 1.15 0.929 0.659 0.363 0.072 -0.307 -0.821 -2.743 -2 ,22295 ,KEBNE ,17027228,Wed Dec 22 16:32:47 CET,Wed Dec 22 18:07:55 CET,0.0 1.374 1.826 2.215 2.496 2.71 2.933 3.148 3.512 3.674 3.828 3.936 4.203 4.318 4.546 4.755 4.953 5.051 5.25 5.448 5.739 5.92 6.077 6.308 6.525 6.716 6.906 7.091 7.338 7.593 7.832 8.118 8.392 8.635 8.905 9.232 9.543 9.852 10.182 10.539 10.923 11.338 11.809 12.268 12.749 13.234 13.727 14.25 14.753 15.174 15.495 15.305 14.849 14.331 13.788 13.245 12.694 12.155 11.662 11.142 10.684 10.27 9.877 9.498 9.139 8.803 8.459 8.144 7.851 7.542 7.226 6.965 6.686 6.395 6.166 5.92 5.665 5.419 5.156 4.956 4.75 4.439 4.216 3.981 3.859 3.607 3.341 3.063 2.909 2.604 2.457 2.283 2.1 1.714 1.488 1.234 0.956 0.646 0.274 -0.274 -2.282 -3 ,4065 ,KEBNE ,17027229,Wed Dec 22 16:39:59 CET,Wed Dec 22 18:14:28 CET,0.0 2.025 2.419 2.723 2.981 3.198 3.448 3.72 4.111 4.26 4.408 4.539 4.81 4.932 5.19 5.432 5.658 5.768 5.997 6.237 6.579 6.792 6.988 7.257 7.5 7.738 7.955 8.135 8.365 8.613 8.884 9.182 9.442 9.69 9.962 10.25 10.53 10.841 11.181 11.524 11.866 12.265 12.709 13.146 13.657 14.169 14.675 15.228 15.8 16.235 16.454 16.168 15.657 15.111 14.572 14.035 13.515 13.01 12.547 12.052 11.594 11.179 10.785 10.406 10.038 9.708 9.357 9.036 8.758 8.468 8.159 7.88 7.601 7.324 7.088 6.835 6.555 6.262 5.992 5.812 5.617 5.299 5.065 4.821 4.701 4.458 4.21 3.932 3.771 3.452 3.251 3.054 2.862 2.46 2.225 1.954 1.655 1.33 0.949 0.391 -1.081 -4 ,501 ,KEBNE ,17027230,Wed Dec 22 16:39:58 CET,Wed Dec 22 18:14:34 CET,0.0 1.103 1.592 1.948 2.248 2.529 2.757 2.932 3.253 3.402 3.536 3.637 3.913 4.044 4.288 4.502 4.697 4.789 4.975 5.17 5.462 5.635 5.795 6.041 6.29 6.519 6.731 6.943 7.221 7.485 7.73 7.999 8.257 8.512 8.795 9.117 9.439 9.789 10.137 10.488 10.865 11.291 11.765 12.212 12.714 13.225 13.761 14.319 14.903 15.44 15.687 15.481 15.008 14.38 13.748 13.13 12.541 11.977 11.484 10.992 10.549 10.108 9.679 9.292 8.915 8.559 8.188 7.862 7.597 7.309 7.001 6.747 6.473 6.176 5.952 5.731 5.501 5.256 4.982 4.788 4.59 4.292 4.074 3.823 3.698 3.447 3.191 2.917 2.772 2.463 2.294 2.128 1.947 1.543 1.302 1.037 0.762 0.442 0.004 -0.61 -2.95 -5 ,62 ,KEBNE ,17027231,Wed Dec 22 16:39:59 CET,Wed Dec 22 18:15:34 CET,0.0 1.636 2.17 2.613 2.931 3.15 3.357 3.557 3.926 4.113 4.291 4.455 4.743 4.852 5.056 5.256 5.446 5.548 5.754 5.941 6.198 6.364 6.528 6.764 6.978 7.178 7.378 7.564 7.802 8.03 8.252 8.52 8.775 9.025 9.318 9.645 9.938 10.242 10.56 10.908 11.288 11.692 12.131 12.572 13.09 13.609 14.13 14.66 15.165 15.618 15.867 15.636 15.127 14.514 13.911 13.276 12.684 12.123 11.593 11.044 10.572 10.154 9.759 9.375 8.988 8.623 8.251 7.928 7.631 7.299 6.943 6.65 6.35 6.041 5.805 5.558 5.299 5.021 4.732 4.539 4.335 4.011 3.776 3.529 3.399 3.131 2.87 2.584 2.425 2.111 1.907 1.712 1.51 1.088 0.841 0.572 0.284 -0.03 -0.392 -0.859 -2.266 -6 ,3583 ,KEBNE ,17027232,Wed Dec 22 16:39:58 CET,Wed Dec 22 18:14:27 CET,0.0 2.503 2.991 3.391 3.707 3.951 4.167 4.359 4.706 4.862 5.012 5.129 5.402 5.532 5.786 6.005 6.229 6.339 6.523 6.697 6.963 7.133 7.286 7.504 7.715 7.899 8.079 8.269 8.51 8.751 8.984 9.257 9.514 9.752 10.036 10.349 10.658 11.024 11.388 11.74 12.109 12.503 12.92 13.319 13.796 14.297 14.837 15.438 16.029 16.499 16.705 16.374 15.807 15.208 14.64 14.072 13.527 12.992 12.515 12.027 11.571 11.151 10.76 10.373 9.982 9.627 9.266 8.943 8.652 8.345 8.032 7.769 7.498 7.21 6.976 6.722 6.45 6.179 5.901 5.702 5.502 5.212 4.996 4.757 4.632 4.376 4.106 3.818 3.656 3.331 3.167 3.002 2.811 2.405 2.189 1.947 1.645 1.298 0.942 0.496 -0.948 -7 ,15516 ,KEBNE ,17027233,Wed Dec 22 16:39:59 CET,Wed Dec 22 18:16:02 CET,0.0 2.206 2.813 3.136 3.431 3.701 3.938 4.149 4.482 4.632 4.776 4.885 5.159 5.283 5.513 5.742 5.956 6.047 6.229 6.41 6.674 6.857 7.041 7.295 7.52 7.732 7.943 8.138 8.376 8.602 8.838 9.119 9.366 9.596 9.872 10.185 10.472 10.803 11.151 11.514 11.877 12.269 12.709 13.12 13.587 14.087 14.626 15.167 15.706 16.246 16.596 16.402 15.915 15.341 14.739 14.155 13.612 13.072 12.591 12.128 11.712 11.321 10.931 10.54 10.19 9.857 9.476 9.123 8.824 8.519 8.177 7.89 7.603 7.3 7.059 6.809 6.55 6.298 6.029 5.835 5.642 5.336 5.126 4.915 4.8 4.547 4.287 4.0 3.834 3.507 3.324 3.144 2.95 2.525 2.292 2.042 1.754 1.444 1.086 0.576 -1.174 -8 ,16315 ,KEBNE ,17027234,Wed Dec 22 16:39:58 CET,Wed Dec 22 18:14:20 CET,0.0 1.313 1.738 2.025 2.283 2.531 2.744 2.934 3.26 3.423 3.584 3.73 4.012 4.14 4.392 4.618 4.828 4.93 5.116 5.277 5.515 5.675 5.836 6.095 6.326 6.543 6.772 6.986 7.251 7.498 7.742 8.048 8.341 8.605 8.882 9.177 9.465 9.798 10.16 10.553 10.952 11.389 11.897 12.376 12.885 13.395 13.971 14.552 15.136 15.62 15.865 15.657 15.185 14.639 14.054 13.428 12.848 12.284 11.785 11.288 10.838 10.439 10.047 9.642 9.238 8.878 8.522 8.185 7.87 7.546 7.224 6.948 6.648 6.316 6.061 5.8 5.529 5.248 4.936 4.723 4.508 4.183 3.948 3.704 3.582 3.312 3.02 2.71 2.556 2.238 2.042 1.86 1.674 1.289 1.059 0.821 0.558 0.269 -0.062 -0.528 -1.446 -9 ,25263 ,KEBNE ,17027235,Wed Dec 22 16:39:58 CET,Wed Dec 22 18:15:54 CET,0.0 2.138 2.609 2.919 3.196 3.464 3.656 3.825 4.146 4.304 4.457 4.587 4.864 4.971 5.182 5.388 5.592 5.693 5.884 6.071 6.335 6.494 6.65 6.883 7.108 7.319 7.533 7.737 7.986 8.228 8.465 8.764 9.05 9.32 9.605 9.918 10.24 10.581 10.946 11.319 11.678 12.117 12.624 13.043 13.514 14.027 14.597 15.21 15.809 16.382 16.758 16.628 16.198 15.615 15.049 14.476 13.903 13.368 12.897 12.405 11.968 11.567 11.17 10.778 10.4 10.065 9.716 9.396 9.111 8.8 8.477 8.214 7.939 7.633 7.397 7.17 6.929 6.667 6.394 6.205 6.004 5.676 5.441 5.206 5.086 4.833 4.576 4.292 4.136 3.819 3.623 3.449 3.267 2.88 2.678 2.446 2.152 1.817 1.435 1.008 -0.153 -10 ,22551 ,KEBNE ,17027236,Wed Dec 22 16:39:59 CET,Wed Dec 22 18:14:02 CET,0.0 1.036 1.513 1.866 2.089 2.289 2.5 2.701 3.025 3.173 3.311 3.415 3.698 3.823 4.067 4.296 4.507 4.611 4.797 4.977 5.241 5.403 5.566 5.814 6.044 6.268 6.482 6.685 6.938 7.169 7.397 7.676 7.949 8.212 8.509 8.847 9.186 9.535 9.888 10.245 10.582 10.978 11.473 11.929 12.426 12.958 13.508 14.073 14.657 15.169 15.4 15.108 14.605 14.034 13.476 12.895 12.345 11.841 11.395 10.931 10.48 10.06 9.657 9.265 8.909 8.591 8.236 7.901 7.612 7.297 6.959 6.67 6.373 6.063 5.808 5.548 5.277 4.986 4.694 4.495 4.288 3.95 3.719 3.487 3.365 3.104 2.837 2.568 2.422 2.12 1.971 1.79 1.59 1.198 0.998 0.76 0.495 0.178 -0.255 -0.819 -2.844 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_61_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_61_65.txt deleted file mode 100644 index c7c19093..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_61_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24335 ,TETRA ,17601455,Sun Nov 28 14:48:45 CET,Sun Nov 28 16:37:54 CET,0.0 1.875 2.542 3.074 3.461 3.765 4.059 4.33 4.764 4.954 5.127 5.263 5.548 5.69 5.957 6.19 6.416 6.526 6.718 6.888 7.152 7.33 7.504 7.758 7.99 8.191 8.375 8.562 8.814 9.054 9.275 9.538 9.776 9.987 10.222 10.495 10.765 11.071 11.403 11.746 12.097 12.465 12.873 13.245 13.614 13.98 14.368 14.717 14.947 14.981 14.593 13.66 12.652 11.65 10.694 9.792 8.96 8.191 7.529 6.865 6.28 5.719 5.165 4.668 4.218 3.777 3.284 2.865 2.519 2.147 1.752 1.424 1.073 0.714 0.446 0.159 -0.16 -0.496 -0.848 -1.102 -1.356 -1.752 -2.036 -2.322 -2.467 -2.777 -3.113 -3.473 -3.654 -3.992 -4.263 -4.49 -4.718 -5.203 -5.473 -5.783 -6.168 -6.586 -7.039 -7.663 -10.243 -2 ,19661 ,TETRA ,17601456,Sun Nov 28 14:48:40 CET,Sun Nov 28 16:38:38 CET,0.0 2.068 2.629 3.048 3.353 3.596 3.83 4.049 4.413 4.575 4.734 4.881 5.161 5.283 5.519 5.738 5.95 6.053 6.25 6.445 6.748 6.931 7.093 7.338 7.571 7.779 7.973 8.171 8.429 8.667 8.886 9.149 9.41 9.656 9.94 10.244 10.527 10.837 11.166 11.492 11.837 12.215 12.594 12.966 13.377 13.749 14.122 14.461 14.677 14.611 14.014 13.0 11.935 10.902 9.953 9.044 8.166 7.315 6.582 5.887 5.29 4.739 4.204 3.681 3.197 2.764 2.308 1.891 1.52 1.121 0.7 0.357 0.002 -0.368 -0.661 -0.971 -1.289 -1.613 -1.947 -2.176 -2.421 -2.829 -3.119 -3.421 -3.577 -3.907 -4.254 -4.605 -4.79 -5.147 -5.423 -5.652 -5.897 -6.452 -6.724 -7.009 -7.333 -7.71 -8.192 -8.927 -12.227 -3 ,19675 ,TETRA ,17601457,Sun Nov 28 14:48:40 CET,Sun Nov 28 16:39:30 CET,0.0 2.848 3.534 3.997 4.341 4.624 4.855 5.054 5.411 5.584 5.754 5.915 6.204 6.333 6.605 6.881 7.126 7.234 7.441 7.637 7.92 8.116 8.303 8.566 8.832 9.088 9.315 9.516 9.782 10.03 10.268 10.548 10.812 11.063 11.325 11.602 11.864 12.166 12.487 12.786 13.074 13.383 13.734 14.091 14.499 14.892 15.277 15.629 15.871 15.835 15.325 14.245 13.118 12.067 11.088 10.156 9.341 8.587 7.888 7.149 6.521 5.989 5.472 4.956 4.466 4.024 3.557 3.101 2.701 2.317 1.907 1.551 1.192 0.817 0.528 0.248 -0.044 -0.359 -0.691 -0.918 -1.156 -1.568 -1.855 -2.147 -2.303 -2.621 -2.944 -3.292 -3.473 -3.811 -4.04 -4.238 -4.451 -4.91 -5.167 -5.471 -5.801 -6.175 -6.624 -7.283 -10.164 -4 ,27434 ,TETRA ,17601458,Sun Nov 28 14:48:40 CET,Sun Nov 28 16:39:27 CET,0.0 4.007 4.606 5.038 5.395 5.705 6.012 6.323 6.808 7.0 7.189 7.407 7.732 7.891 8.179 8.434 8.694 8.822 9.058 9.28 9.595 9.804 10.016 10.31 10.576 10.837 11.094 11.34 11.627 11.878 12.133 12.439 12.727 13.008 13.322 13.64 13.92 14.225 14.576 14.956 15.304 15.658 16.064 16.412 16.756 17.117 17.524 17.869 18.119 18.201 17.695 16.667 15.623 14.551 13.563 12.682 11.844 11.018 10.305 9.595 8.993 8.463 7.918 7.404 6.924 6.471 6.011 5.595 5.227 4.845 4.436 4.082 3.732 3.379 3.09 2.781 2.465 2.138 1.785 1.553 1.307 0.894 0.613 0.317 0.168 -0.146 -0.478 -0.837 -1.035 -1.386 -1.621 -1.848 -2.091 -2.611 -2.891 -3.179 -3.497 -3.88 -4.362 -5.03 -7.672 -5 ,21246 ,TETRA ,17601459,Sun Nov 28 14:48:41 CET,Sun Nov 28 16:39:14 CET,0.0 1.991 2.562 3.02 3.435 3.799 4.148 4.48 5.024 5.273 5.515 5.79 6.114 6.267 6.562 6.83 7.077 7.197 7.42 7.637 7.956 8.132 8.291 8.539 8.791 9.018 9.227 9.438 9.701 9.94 10.178 10.479 10.758 11.015 11.286 11.567 11.829 12.117 12.407 12.694 12.996 13.338 13.728 14.111 14.5 14.872 15.258 15.579 15.816 15.869 15.451 14.482 13.405 12.362 11.393 10.456 9.605 8.818 8.09 7.353 6.72 6.151 5.593 5.042 4.547 4.078 3.566 3.113 2.705 2.265 1.815 1.449 1.051 0.639 0.314 -0.017 -0.341 -0.683 -1.04 -1.294 -1.574 -2.016 -2.314 -2.614 -2.77 -3.102 -3.453 -3.809 -3.987 -4.333 -4.599 -4.834 -5.078 -5.585 -5.877 -6.204 -6.554 -6.968 -7.481 -8.154 -11.133 -6 ,26765 ,TETRA ,17601460,Sun Nov 28 14:50:39 CET,Sun Nov 28 16:41:27 CET,0.0 2.488 3.212 3.747 4.103 4.357 4.579 4.797 5.175 5.339 5.488 5.631 5.932 6.07 6.313 6.543 6.763 6.872 7.088 7.294 7.58 7.76 7.938 8.204 8.467 8.701 8.904 9.108 9.372 9.649 9.926 10.223 10.519 10.81 11.108 11.408 11.686 11.985 12.289 12.624 12.987 13.368 13.77 14.116 14.485 14.854 15.216 15.568 15.841 15.875 15.414 14.473 13.476 12.504 11.602 10.718 9.898 9.125 8.449 7.738 7.111 6.526 5.928 5.367 4.841 4.367 3.879 3.437 3.057 2.657 2.223 1.855 1.49 1.115 0.815 0.496 0.169 -0.159 -0.507 -0.746 -0.998 -1.4 -1.674 -1.969 -2.123 -2.433 -2.748 -3.095 -3.289 -3.644 -3.913 -4.123 -4.325 -4.839 -5.147 -5.462 -5.819 -6.206 -6.676 -7.372 -10.283 -7 ,18570 ,TETRA ,17601461,Sun Nov 28 14:50:40 CET,Sun Nov 28 16:41:23 CET,0.0 2.485 3.183 3.593 3.927 4.233 4.52 4.779 5.233 5.425 5.606 5.819 6.151 6.309 6.59 6.858 7.112 7.237 7.456 7.644 7.928 8.114 8.291 8.556 8.805 9.046 9.28 9.495 9.766 10.024 10.279 10.576 10.836 11.08 11.354 11.668 11.97 12.283 12.609 12.927 13.243 13.584 13.948 14.29 14.692 15.097 15.458 15.783 16.044 16.079 15.548 14.515 13.447 12.414 11.472 10.561 9.74 9.005 8.363 7.701 7.115 6.567 6.035 5.538 5.052 4.601 4.128 3.718 3.366 2.986 2.589 2.257 1.901 1.529 1.237 0.912 0.583 0.24 -0.133 -0.385 -0.655 -1.09 -1.393 -1.705 -1.859 -2.174 -2.508 -2.883 -3.077 -3.431 -3.687 -3.89 -4.109 -4.624 -4.9 -5.194 -5.545 -5.964 -6.423 -7.065 -9.823 -8 ,11780 ,TETRA ,17601462,Sun Nov 28 14:50:39 CET,Sun Nov 28 16:42:47 CET,0.0 3.207 3.889 4.361 4.691 4.991 5.251 5.493 5.943 6.147 6.339 6.543 6.864 7.035 7.339 7.601 7.846 7.967 8.198 8.415 8.715 8.904 9.091 9.356 9.589 9.817 10.042 10.263 10.548 10.807 11.059 11.371 11.66 11.925 12.237 12.563 12.859 13.167 13.471 13.784 14.108 14.48 14.904 15.273 15.644 15.977 16.288 16.591 16.788 16.723 16.251 15.237 14.158 13.116 12.175 11.298 10.467 9.73 9.108 8.451 7.844 7.268 6.671 6.091 5.579 5.107 4.601 4.156 3.755 3.327 2.891 2.529 2.148 1.741 1.43 1.115 0.771 0.392 0.004 -0.244 -0.496 -0.891 -1.17 -1.463 -1.61 -1.931 -2.281 -2.651 -2.841 -3.197 -3.46 -3.67 -3.894 -4.405 -4.671 -4.952 -5.257 -5.614 -6.072 -6.742 -11.678 -9 ,30226 ,TETRA ,17601463,Sun Nov 28 14:50:39 CET,Sun Nov 28 16:40:29 CET,0.0 3.177 3.841 4.251 4.553 4.803 5.02 5.208 5.566 5.738 5.914 6.094 6.397 6.534 6.777 7.024 7.266 7.379 7.585 7.787 8.082 8.261 8.436 8.672 8.894 9.107 9.304 9.499 9.741 9.987 10.228 10.509 10.781 11.039 11.349 11.673 11.962 12.291 12.629 12.96 13.318 13.716 14.111 14.462 14.845 15.221 15.619 15.969 16.189 16.24 15.867 14.9 13.872 12.845 11.881 10.974 10.151 9.37 8.659 7.949 7.349 6.825 6.319 5.839 5.389 4.977 4.544 4.144 3.79 3.416 3.023 2.702 2.369 2.015 1.733 1.443 1.146 0.825 0.506 0.288 0.059 -0.283 -0.525 -0.794 -0.934 -1.207 -1.504 -1.82 -1.991 -2.329 -2.543 -2.752 -2.964 -3.406 -3.68 -3.98 -4.304 -4.659 -5.076 -5.639 -7.056 -10 ,17592 ,TETRA ,17601464,Sun Nov 28 14:50:39 CET,Sun Nov 28 16:40:39 CET,0.0 2.078 2.532 2.933 3.311 3.628 3.928 4.217 4.716 4.919 5.099 5.333 5.674 5.845 6.102 6.327 6.546 6.656 6.869 7.063 7.385 7.593 7.752 7.978 8.198 8.406 8.61 8.817 9.083 9.337 9.575 9.858 10.127 10.379 10.669 10.965 11.224 11.525 11.848 12.168 12.516 12.936 13.408 13.825 14.245 14.657 15.081 15.403 15.632 15.688 15.217 14.226 13.147 12.079 11.118 10.225 9.41 8.668 8.003 7.33 6.746 6.204 5.684 5.17 4.655 4.188 3.73 3.316 2.94 2.525 2.078 1.717 1.342 0.947 0.645 0.323 0.002 -0.31 -0.659 -0.911 -1.18 -1.605 -1.889 -2.185 -2.335 -2.636 -2.966 -3.328 -3.525 -3.886 -4.14 -4.334 -4.525 -4.968 -5.234 -5.556 -5.902 -6.264 -6.716 -7.314 -10.119 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_63_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_63_53.txt deleted file mode 100644 index be116303..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_63_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13453 ,TETRA ,17601465,Sun Nov 28 14:51:39 CET,Sun Nov 28 16:40:45 CET,0.0 1.213 1.51 1.774 1.996 2.174 2.356 2.524 2.798 2.925 3.045 3.123 3.393 3.496 3.699 3.897 4.096 4.191 4.362 4.532 4.775 4.92 5.069 5.299 5.498 5.682 5.866 6.047 6.273 6.476 6.675 6.936 7.199 7.447 7.713 7.979 8.245 8.542 8.851 9.198 9.541 9.882 10.269 10.662 11.109 11.573 12.072 12.574 13.045 13.424 13.606 13.37 12.925 12.416 11.907 11.407 10.936 10.447 10.013 9.585 9.187 8.84 8.507 8.189 7.885 7.605 7.305 7.023 6.767 6.5 6.238 6.015 5.777 5.537 5.349 5.149 4.939 4.726 4.502 4.336 4.153 3.872 3.687 3.495 3.399 3.2 2.981 2.75 2.625 2.328 2.21 2.074 1.935 1.582 1.371 1.152 0.916 0.662 0.342 -0.116 -1.318 -2 ,19840 ,TETRA ,17601466,Sun Nov 28 14:51:39 CET,Sun Nov 28 16:44:32 CET,0.0 0.607 0.877 1.104 1.317 1.51 1.682 1.848 2.141 2.276 2.408 2.473 2.74 2.85 3.057 3.24 3.418 3.51 3.687 3.859 4.099 4.247 4.387 4.594 4.798 4.999 5.2 5.378 5.585 5.794 6.014 6.277 6.516 6.744 6.997 7.285 7.565 7.871 8.213 8.578 8.943 9.305 9.723 10.128 10.547 11.01 11.516 12.026 12.537 13.017 13.322 13.125 12.713 12.217 11.66 11.099 10.59 10.109 9.68 9.218 8.807 8.438 8.083 7.742 7.424 7.145 6.841 6.563 6.325 6.067 5.788 5.556 5.313 5.051 4.843 4.625 4.4 4.157 3.906 3.752 3.594 3.324 3.132 2.935 2.835 2.623 2.402 2.159 2.034 1.747 1.633 1.488 1.326 0.968 0.768 0.552 0.336 0.085 -0.246 -0.655 -1.866 -3 ,212 ,TETRA ,17601467,Sun Nov 28 14:51:39 CET,Sun Nov 28 16:41:25 CET,0.0 0.891 1.22 1.491 1.729 1.93 2.128 2.298 2.569 2.692 2.799 2.844 3.114 3.208 3.391 3.567 3.743 3.835 4.008 4.173 4.404 4.561 4.722 4.952 5.156 5.348 5.541 5.725 5.955 6.186 6.4 6.642 6.885 7.12 7.383 7.666 7.927 8.224 8.539 8.881 9.239 9.613 10.046 10.444 10.887 11.357 11.835 12.357 12.887 13.308 13.527 13.236 12.791 12.32 11.806 11.314 10.84 10.334 9.899 9.479 9.099 8.76 8.436 8.096 7.768 7.497 7.219 6.955 6.719 6.486 6.234 6.019 5.794 5.533 5.324 5.109 4.891 4.662 4.408 4.234 4.056 3.783 3.593 3.381 3.271 3.053 2.84 2.609 2.48 2.175 1.995 1.813 1.634 1.292 1.094 0.864 0.636 0.394 0.08 -0.356 -1.997 -4 ,32632 ,TETRA ,17601468,Sun Nov 28 14:51:41 CET,Sun Nov 28 16:41:25 CET,0.0 0.866 1.221 1.508 1.725 1.908 2.09 2.27 2.584 2.723 2.856 2.932 3.203 3.306 3.518 3.733 3.925 4.015 4.182 4.338 4.574 4.731 4.884 5.104 5.319 5.516 5.705 5.892 6.122 6.347 6.556 6.793 7.039 7.284 7.544 7.847 8.121 8.401 8.699 9.018 9.374 9.772 10.196 10.58 11.002 11.473 11.966 12.44 12.951 13.376 13.568 13.319 12.847 12.32 11.789 11.252 10.728 10.25 9.822 9.353 8.955 8.613 8.275 7.936 7.622 7.348 7.045 6.758 6.494 6.214 5.94 5.714 5.452 5.169 4.964 4.762 4.553 4.327 4.097 3.935 3.755 3.475 3.285 3.073 2.965 2.764 2.538 2.298 2.179 1.884 1.753 1.596 1.439 1.094 0.892 0.691 0.5 0.265 -0.07 -0.501 -1.636 -5 ,7272 ,TETRA ,17601469,Sun Nov 28 14:51:41 CET,Sun Nov 28 16:41:23 CET,0.0 1.261 1.707 2.013 2.267 2.47 2.659 2.831 3.119 3.243 3.366 3.455 3.729 3.838 4.052 4.253 4.431 4.515 4.683 4.843 5.065 5.211 5.361 5.567 5.754 5.933 6.116 6.304 6.521 6.718 6.915 7.13 7.343 7.578 7.835 8.13 8.413 8.699 9.018 9.357 9.701 10.062 10.485 10.904 11.33 11.782 12.289 12.772 13.247 13.661 13.854 13.627 13.166 12.659 12.146 11.645 11.186 10.714 10.27 9.819 9.423 9.044 8.67 8.324 8.013 7.728 7.421 7.131 6.874 6.616 6.343 6.113 5.88 5.628 5.415 5.194 4.98 4.771 4.535 4.368 4.208 3.947 3.746 3.54 3.436 3.223 3.0 2.749 2.62 2.329 2.195 2.04 1.88 1.537 1.34 1.127 0.897 0.642 0.293 -0.143 -1.126 -6 ,1269 ,TETRA ,17601470,Sun Nov 28 14:51:39 CET,Sun Nov 28 16:41:15 CET,0.0 0.588 0.895 1.184 1.395 1.585 1.762 1.93 2.236 2.366 2.491 2.59 2.865 2.964 3.156 3.354 3.542 3.635 3.815 3.972 4.202 4.347 4.491 4.719 4.933 5.127 5.314 5.488 5.717 5.939 6.145 6.396 6.632 6.846 7.091 7.354 7.629 7.964 8.319 8.656 8.991 9.374 9.813 10.211 10.63 11.086 11.588 12.074 12.533 12.963 13.157 12.881 12.445 11.966 11.477 10.964 10.455 9.974 9.553 9.11 8.714 8.364 8.024 7.679 7.336 7.025 6.713 6.432 6.179 5.911 5.616 5.361 5.113 4.859 4.654 4.445 4.226 3.99 3.746 3.587 3.417 3.151 2.961 2.761 2.665 2.472 2.263 2.024 1.902 1.615 1.499 1.344 1.182 0.862 0.696 0.498 0.246 -0.025 -0.351 -0.787 -2.752 -7 ,23567 ,TETRA ,17601471,Sun Nov 28 14:52:39 CET,Sun Nov 28 16:42:10 CET,0.0 1.842 2.131 2.411 2.629 2.807 2.985 3.15 3.441 3.566 3.68 3.752 4.037 4.155 4.377 4.562 4.736 4.829 5.023 5.211 5.46 5.611 5.759 5.979 6.195 6.399 6.585 6.753 6.969 7.196 7.411 7.66 7.896 8.121 8.388 8.676 8.948 9.234 9.532 9.842 10.161 10.501 10.882 11.276 11.717 12.146 12.613 13.117 13.596 14.003 14.206 13.953 13.499 12.987 12.423 11.855 11.367 10.897 10.47 10.04 9.66 9.301 8.947 8.625 8.322 8.03 7.716 7.431 7.187 6.917 6.637 6.421 6.181 5.912 5.7 5.484 5.264 5.025 4.775 4.596 4.414 4.141 3.942 3.75 3.657 3.462 3.24 2.999 2.874 2.583 2.454 2.294 2.134 1.763 1.547 1.322 1.095 0.857 0.513 0.068 -1.13 -8 ,21750 ,TETRA ,17601472,Sun Nov 28 14:51:39 CET,Sun Nov 28 16:41:15 CET,0.0 1.544 2.035 2.38 2.673 2.883 3.032 3.179 3.481 3.627 3.759 3.832 4.101 4.199 4.389 4.57 4.755 4.851 5.03 5.188 5.415 5.561 5.709 5.932 6.122 6.296 6.48 6.664 6.891 7.103 7.309 7.552 7.779 7.999 8.27 8.579 8.88 9.199 9.511 9.828 10.163 10.546 10.959 11.337 11.744 12.19 12.694 13.18 13.682 14.155 14.416 14.23 13.789 13.214 12.652 12.155 11.686 11.21 10.779 10.351 9.945 9.555 9.198 8.873 8.566 8.273 7.959 7.676 7.427 7.16 6.869 6.635 6.394 6.127 5.902 5.659 5.428 5.203 4.982 4.826 4.649 4.377 4.179 3.975 3.878 3.663 3.434 3.203 3.083 2.791 2.659 2.515 2.362 2.009 1.795 1.557 1.295 1.013 0.719 0.321 -0.654 -9 ,16225 ,TETRA ,17601473,Sun Nov 28 14:51:41 CET,Sun Nov 28 16:41:15 CET,0.0 1.296 1.711 2.009 2.247 2.468 2.669 2.844 3.134 3.281 3.435 3.561 3.858 3.992 4.244 4.471 4.685 4.799 5.018 5.209 5.457 5.612 5.771 5.978 6.17 6.354 6.527 6.704 6.914 7.095 7.273 7.501 7.766 8.045 8.351 8.694 8.997 9.315 9.63 9.929 10.266 10.644 11.076 11.498 11.968 12.459 12.964 13.487 13.983 14.396 14.625 14.385 13.886 13.365 12.849 12.342 11.859 11.354 10.887 10.431 10.045 9.686 9.315 8.959 8.648 8.344 7.998 7.688 7.423 7.154 6.87 6.588 6.247 5.908 5.684 5.465 5.217 4.958 4.697 4.525 4.355 4.078 3.878 3.663 3.553 3.314 3.06 2.794 2.653 2.34 2.166 1.989 1.807 1.418 1.224 1.027 0.781 0.485 0.12 -0.441 -2.015 -10 ,1165 ,TETRA ,17601474,Sun Nov 28 14:51:39 CET,Sun Nov 28 16:41:36 CET,0.0 0.714 1.089 1.357 1.58 1.767 1.952 2.132 2.4 2.517 2.63 2.689 2.967 3.081 3.302 3.52 3.725 3.814 3.979 4.156 4.431 4.603 4.756 4.963 5.156 5.356 5.546 5.714 5.949 6.196 6.429 6.708 6.961 7.177 7.429 7.721 7.991 8.285 8.615 8.971 9.324 9.687 10.067 10.415 10.822 11.271 11.734 12.193 12.673 13.1 13.324 13.127 12.693 12.171 11.603 11.069 10.563 10.065 9.638 9.182 8.792 8.444 8.096 7.778 7.484 7.193 6.877 6.594 6.345 6.093 5.835 5.614 5.385 5.144 4.951 4.754 4.551 4.334 4.101 3.931 3.76 3.505 3.313 3.107 3.006 2.785 2.548 2.308 2.189 1.902 1.775 1.62 1.441 1.095 0.922 0.706 0.471 0.164 -0.226 -0.68 -1.511 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_63_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_63_58.txt deleted file mode 100644 index e026c25e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_63_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28278 ,TETRA ,17601475,Sun Nov 28 14:51:43 CET,Sun Nov 28 16:42:17 CET,0.0 0.522 0.864 1.15 1.376 1.585 1.776 1.943 2.271 2.429 2.571 2.666 2.954 3.084 3.328 3.556 3.769 3.875 4.081 4.273 4.545 4.722 4.895 5.139 5.369 5.586 5.79 5.986 6.239 6.475 6.706 6.998 7.278 7.549 7.845 8.156 8.451 8.762 9.094 9.434 9.782 10.178 10.638 11.076 11.545 12.047 12.616 13.233 13.819 14.241 14.501 14.355 13.968 13.515 13.017 12.507 12.032 11.593 11.2 10.791 10.43 10.094 9.773 9.465 9.159 8.871 8.574 8.303 8.055 7.814 7.556 7.326 7.092 6.854 6.665 6.465 6.254 6.037 5.816 5.665 5.502 5.248 5.07 4.882 4.779 4.549 4.305 4.061 3.936 3.638 3.552 3.426 3.284 2.996 2.849 2.683 2.48 2.233 1.945 1.59 0.77 -2 ,2211 ,TETRA ,17601476,Sun Nov 28 14:51:45 CET,Sun Nov 28 16:42:17 CET,0.0 0.89 1.394 1.715 1.957 2.185 2.425 2.624 2.976 3.155 3.323 3.456 3.739 3.857 4.105 4.341 4.57 4.678 4.879 5.064 5.333 5.509 5.673 5.906 6.128 6.341 6.548 6.747 7.002 7.24 7.468 7.749 8.022 8.279 8.564 8.863 9.137 9.441 9.791 10.155 10.507 10.92 11.411 11.876 12.381 12.923 13.496 14.039 14.569 15.038 15.335 15.233 14.865 14.403 13.942 13.483 13.046 12.602 12.203 11.823 11.487 11.169 10.84 10.505 10.188 9.908 9.609 9.335 9.084 8.826 8.568 8.332 8.084 7.848 7.656 7.449 7.237 6.999 6.752 6.582 6.4 6.123 5.938 5.737 5.629 5.405 5.167 4.914 4.788 4.5 4.364 4.214 4.061 3.735 3.533 3.305 3.094 2.846 2.568 2.198 1.314 -3 ,11092 ,TETRA ,17601477,Sun Nov 28 14:51:41 CET,Sun Nov 28 16:42:17 CET,0.0 0.492 0.818 1.106 1.384 1.631 1.823 1.977 2.259 2.386 2.521 2.635 2.925 3.041 3.271 3.494 3.709 3.815 4.017 4.203 4.463 4.631 4.793 5.032 5.251 5.455 5.647 5.829 6.08 6.328 6.567 6.851 7.124 7.4 7.702 8.012 8.31 8.643 8.991 9.324 9.655 10.037 10.499 10.924 11.362 11.863 12.414 12.953 13.484 13.944 14.267 14.165 13.794 13.324 12.824 12.323 11.87 11.422 11.029 10.644 10.289 9.961 9.643 9.323 9.027 8.745 8.44 8.174 7.941 7.7 7.438 7.21 6.983 6.752 6.558 6.37 6.175 5.957 5.72 5.555 5.389 5.131 4.946 4.757 4.663 4.476 4.274 4.047 3.92 3.628 3.52 3.377 3.229 2.899 2.723 2.524 2.292 2.034 1.727 1.367 0.719 -4 ,13617 ,TETRA ,17601478,Sun Nov 28 14:51:39 CET,Sun Nov 28 16:44:05 CET,0.0 1.063 1.476 1.774 2.092 2.39 2.612 2.809 3.161 3.308 3.447 3.549 3.826 3.94 4.157 4.363 4.57 4.671 4.868 5.065 5.35 5.533 5.712 5.968 6.21 6.427 6.615 6.806 7.056 7.302 7.54 7.813 8.076 8.335 8.621 8.926 9.227 9.555 9.902 10.277 10.673 11.121 11.632 12.109 12.599 13.088 13.65 14.202 14.73 15.231 15.529 15.396 15.006 14.515 14.023 13.558 13.128 12.693 12.297 11.894 11.493 11.121 10.77 10.423 10.111 9.827 9.519 9.245 9.019 8.776 8.507 8.272 8.023 7.773 7.58 7.382 7.174 6.956 6.739 6.595 6.44 6.194 6.014 5.829 5.736 5.543 5.339 5.119 4.997 4.713 4.608 4.45 4.277 3.916 3.743 3.561 3.338 3.078 2.785 2.361 1.317 -5 ,7849 ,TETRA ,17601479,Sun Nov 28 14:51:41 CET,Sun Nov 28 16:41:58 CET,0.0 0.549 0.94 1.259 1.505 1.722 1.908 2.074 2.425 2.571 2.692 2.781 3.071 3.192 3.436 3.654 3.854 3.957 4.166 4.371 4.643 4.801 4.949 5.179 5.408 5.634 5.84 6.034 6.296 6.541 6.783 7.091 7.381 7.649 7.938 8.247 8.544 8.844 9.16 9.516 9.882 10.266 10.701 11.112 11.581 12.109 12.625 13.132 13.683 14.238 14.587 14.401 13.98 13.505 13.035 12.579 12.133 11.705 11.331 10.939 10.58 10.245 9.916 9.605 9.313 9.033 8.729 8.463 8.241 7.997 7.728 7.495 7.251 7.014 6.827 6.623 6.411 6.197 5.981 5.827 5.663 5.398 5.218 5.019 4.922 4.73 4.52 4.295 4.163 3.862 3.74 3.597 3.455 3.134 2.956 2.772 2.56 2.304 1.987 1.566 0.358 -6 ,29483 ,TETRA ,17601480,Sun Nov 28 14:52:41 CET,Sun Nov 28 16:42:36 CET,0.0 0.873 1.276 1.618 1.894 2.141 2.374 2.56 2.922 3.107 3.271 3.4 3.699 3.826 4.081 4.326 4.56 4.674 4.886 5.081 5.365 5.55 5.718 5.956 6.198 6.429 6.663 6.908 7.216 7.512 7.801 8.132 8.445 8.752 9.086 9.44 9.795 10.189 10.58 10.971 11.361 11.773 12.245 12.737 13.272 13.774 14.305 14.866 15.447 15.911 16.122 15.995 15.643 15.174 14.724 14.273 13.819 13.387 13.003 12.6 12.218 11.867 11.527 11.194 10.905 10.623 10.296 10.005 9.754 9.493 9.227 9.019 8.794 8.526 8.308 8.096 7.893 7.691 7.477 7.316 7.152 6.9 6.714 6.519 6.413 6.197 5.989 5.757 5.622 5.321 5.176 5.013 4.861 4.537 4.352 4.131 3.865 3.578 3.268 2.898 1.928 -7 ,580 ,TETRA ,17601481,Sun Nov 28 14:52:39 CET,Sun Nov 28 16:43:13 CET,0.0 1.141 1.554 1.816 2.048 2.268 2.462 2.644 2.986 3.13 3.263 3.343 3.621 3.748 3.988 4.197 4.395 4.485 4.646 4.813 5.066 5.235 5.4 5.641 5.869 6.073 6.258 6.431 6.673 6.93 7.177 7.468 7.731 7.983 8.283 8.608 8.915 9.248 9.587 9.945 10.325 10.745 11.207 11.649 12.175 12.708 13.193 13.682 14.225 14.736 14.988 14.755 14.37 13.944 13.5 13.037 12.598 12.183 11.793 11.396 11.024 10.67 10.338 9.987 9.665 9.395 9.088 8.799 8.568 8.324 8.057 7.841 7.609 7.34 7.11 6.876 6.645 6.433 6.22 6.065 5.915 5.669 5.486 5.289 5.192 5.001 4.787 4.548 4.413 4.109 3.984 3.845 3.687 3.34 3.163 2.945 2.699 2.453 2.159 1.778 1.009 -8 ,6008 ,TETRA ,17601482,Sun Nov 28 14:52:39 CET,Sun Nov 28 16:43:00 CET,0.0 0.592 0.9 1.199 1.497 1.738 1.963 2.156 2.46 2.6 2.743 2.849 3.135 3.255 3.474 3.689 3.914 4.019 4.211 4.4 4.708 4.948 5.201 5.542 5.82 6.059 6.29 6.513 6.787 7.038 7.277 7.548 7.804 8.064 8.355 8.668 8.957 9.265 9.603 9.966 10.345 10.751 11.198 11.626 12.088 12.582 13.141 13.723 14.297 14.775 15.098 15.004 14.61 14.135 13.632 13.153 12.725 12.294 11.912 11.481 11.086 10.745 10.4 10.068 9.777 9.52 9.221 8.934 8.688 8.432 8.166 7.946 7.706 7.446 7.243 7.034 6.833 6.631 6.387 6.206 6.018 5.727 5.53 5.317 5.206 5.002 4.796 4.556 4.431 4.154 4.047 3.891 3.737 3.413 3.227 3.047 2.863 2.627 2.345 1.991 1.238 -9 ,4925 ,TETRA ,17601483,Sun Nov 28 14:52:39 CET,Sun Nov 28 16:42:42 CET,0.0 0.779 1.188 1.482 1.698 1.893 2.1 2.299 2.617 2.768 2.914 3.016 3.295 3.412 3.638 3.852 4.055 4.151 4.335 4.517 4.767 4.923 5.086 5.333 5.575 5.795 5.995 6.179 6.416 6.663 6.91 7.193 7.44 7.674 7.957 8.272 8.549 8.868 9.223 9.588 9.947 10.319 10.741 11.167 11.652 12.136 12.671 13.224 13.767 14.263 14.559 14.363 13.886 13.395 12.939 12.488 12.056 11.621 11.205 10.777 10.405 10.071 9.747 9.424 9.127 8.852 8.564 8.306 8.064 7.793 7.514 7.289 7.042 6.79 6.609 6.415 6.212 6.003 5.775 5.619 5.46 5.206 5.027 4.836 4.741 4.543 4.326 4.091 3.968 3.681 3.589 3.452 3.297 2.949 2.764 2.577 2.355 2.087 1.791 1.383 0.442 -10 ,6886 ,TETRA ,17601484,Sun Nov 28 14:52:39 CET,Sun Nov 28 16:43:06 CET,0.0 1.082 1.492 1.793 2.033 2.258 2.448 2.611 2.921 3.065 3.195 3.252 3.518 3.632 3.865 4.073 4.255 4.347 4.535 4.72 4.979 5.137 5.306 5.547 5.754 5.962 6.161 6.344 6.579 6.803 7.025 7.297 7.538 7.769 8.055 8.37 8.652 8.955 9.299 9.671 10.038 10.43 10.874 11.305 11.809 12.316 12.857 13.415 13.95 14.5 14.933 14.83 14.422 13.948 13.5 13.075 12.644 12.229 11.831 11.396 11.028 10.708 10.401 10.095 9.805 9.533 9.248 9.0 8.79 8.56 8.31 8.107 7.885 7.64 7.446 7.251 7.042 6.827 6.603 6.433 6.264 5.987 5.797 5.616 5.523 5.328 5.128 4.921 4.8 4.509 4.426 4.299 4.173 3.878 3.697 3.503 3.286 3.048 2.758 2.353 1.393 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_63_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_63_64.txt deleted file mode 100644 index 37e67a21..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_63_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20838 ,TETRA ,17601485,Sun Nov 28 14:52:39 CET,Sun Nov 28 16:42:03 CET,0.0 0.73 1.058 1.333 1.566 1.758 1.935 2.108 2.436 2.597 2.744 2.837 3.129 3.272 3.538 3.767 3.961 4.049 4.237 4.408 4.641 4.804 4.965 5.186 5.384 5.586 5.798 6.004 6.266 6.509 6.738 7.015 7.29 7.551 7.845 8.192 8.516 8.862 9.234 9.6 9.981 10.407 10.858 11.314 11.836 12.353 12.905 13.543 14.252 14.905 15.28 15.11 14.672 14.163 13.652 13.154 12.692 12.216 11.786 11.34 10.947 10.598 10.242 9.904 9.585 9.254 8.895 8.596 8.357 8.117 7.842 7.594 7.338 7.073 6.858 6.624 6.386 6.133 5.851 5.665 5.49 5.195 4.982 4.76 4.651 4.424 4.159 3.856 3.691 3.356 3.166 2.988 2.786 2.334 2.1 1.845 1.563 1.238 0.883 0.382 -1.319 -2 ,3630 ,TETRA ,17601486,Sun Nov 28 14:52:43 CET,Sun Nov 28 16:42:04 CET,0.0 0.761 1.162 1.48 1.708 1.899 2.095 2.282 2.639 2.812 2.955 3.051 3.341 3.465 3.691 3.914 4.123 4.227 4.427 4.629 4.938 5.112 5.275 5.508 5.723 5.939 6.145 6.33 6.569 6.807 7.061 7.355 7.628 7.903 8.197 8.512 8.832 9.184 9.531 9.904 10.295 10.697 11.125 11.578 12.114 12.67 13.246 13.819 14.378 14.839 15.176 15.046 14.618 14.083 13.55 13.033 12.539 12.056 11.623 11.195 10.82 10.476 10.137 9.814 9.502 9.203 8.903 8.629 8.384 8.14 7.878 7.639 7.392 7.127 6.905 6.679 6.453 6.219 5.968 5.794 5.608 5.306 5.099 4.89 4.781 4.54 4.28 4.031 3.903 3.591 3.414 3.232 3.044 2.647 2.409 2.14 1.861 1.543 1.167 0.658 -0.39 -3 ,9953 ,TETRA ,17601487,Sun Nov 28 14:52:43 CET,Sun Nov 28 16:41:33 CET,0.0 0.945 1.434 1.76 1.994 2.22 2.42 2.605 2.948 3.093 3.224 3.296 3.563 3.671 3.894 4.107 4.313 4.416 4.586 4.746 4.988 5.142 5.29 5.508 5.719 5.905 6.081 6.26 6.509 6.757 6.982 7.258 7.534 7.797 8.081 8.387 8.666 8.957 9.285 9.633 10.002 10.4 10.841 11.268 11.729 12.248 12.792 13.312 13.906 14.479 14.855 14.742 14.402 13.979 13.486 12.995 12.535 12.087 11.683 11.277 10.928 10.595 10.261 9.934 9.624 9.34 9.048 8.777 8.543 8.301 8.027 7.786 7.541 7.291 7.088 6.878 6.661 6.427 6.163 5.972 5.787 5.472 5.228 4.989 4.867 4.62 4.393 4.143 4.008 3.711 3.569 3.403 3.238 2.892 2.704 2.502 2.27 2.024 1.754 1.3 -0.214 -4 ,9785 ,TETRA ,17601488,Sun Nov 28 14:52:39 CET,Sun Nov 28 16:42:14 CET,0.0 1.047 1.437 1.708 1.962 2.205 2.415 2.595 2.891 3.029 3.166 3.276 3.562 3.677 3.891 4.103 4.313 4.415 4.615 4.802 5.058 5.225 5.395 5.638 5.874 6.102 6.311 6.517 6.794 7.052 7.287 7.553 7.818 8.067 8.336 8.647 8.959 9.297 9.646 10.003 10.38 10.804 11.261 11.706 12.215 12.767 13.35 13.926 14.533 15.116 15.519 15.396 14.99 14.514 14.046 13.544 13.05 12.592 12.18 11.752 11.365 11.013 10.656 10.306 9.979 9.661 9.335 9.047 8.79 8.521 8.241 8.002 7.75 7.496 7.3 7.094 6.869 6.631 6.371 6.167 5.958 5.65 5.435 5.204 5.078 4.804 4.515 4.22 4.065 3.742 3.591 3.417 3.198 2.712 2.463 2.212 1.918 1.535 1.032 0.485 -1.252 -5 ,23805 ,TETRA ,17601489,Sun Nov 28 14:53:39 CET,Sun Nov 28 16:44:12 CET,0.0 1.088 1.578 1.951 2.261 2.567 2.846 3.094 3.547 3.752 3.958 4.189 4.528 4.697 5.006 5.287 5.552 5.673 5.888 6.081 6.334 6.498 6.663 6.893 7.113 7.333 7.54 7.744 8.015 8.271 8.517 8.811 9.096 9.374 9.672 9.977 10.26 10.579 10.917 11.277 11.679 12.102 12.543 12.983 13.484 14.027 14.626 15.228 15.816 16.328 16.711 16.585 16.203 15.77 15.255 14.74 14.279 13.818 13.409 12.978 12.564 12.191 11.84 11.496 11.178 10.892 10.583 10.31 10.073 9.799 9.496 9.244 8.992 8.734 8.531 8.326 8.112 7.883 7.641 7.475 7.302 7.027 6.835 6.628 6.524 6.305 6.077 5.83 5.697 5.399 5.255 5.091 4.921 4.558 4.358 4.128 3.883 3.621 3.271 2.764 1.223 -6 ,31821 ,TETRA ,17601490,Sun Nov 28 14:53:42 CET,Sun Nov 28 16:44:10 CET,0.0 0.664 0.984 1.25 1.485 1.725 1.925 2.089 2.454 2.623 2.769 2.875 3.16 3.274 3.506 3.72 3.923 4.026 4.217 4.397 4.668 4.848 5.015 5.252 5.484 5.704 5.917 6.131 6.417 6.683 6.928 7.212 7.491 7.771 8.077 8.406 8.714 9.043 9.391 9.766 10.155 10.564 11.049 11.509 11.989 12.523 13.131 13.748 14.4 15.017 15.447 15.427 15.064 14.568 14.05 13.51 13.008 12.535 12.108 11.671 11.289 10.942 10.589 10.246 9.912 9.611 9.304 8.996 8.715 8.434 8.154 7.915 7.667 7.422 7.232 7.011 6.781 6.566 6.337 6.183 6.02 5.738 5.547 5.338 5.229 5.012 4.77 4.524 4.401 4.104 3.966 3.816 3.647 3.275 3.09 2.883 2.643 2.375 2.062 1.654 0.213 -7 ,18580 ,TETRA ,17601491,Sun Nov 28 14:53:43 CET,Sun Nov 28 16:43:25 CET,0.0 1.1 1.489 1.804 2.075 2.311 2.535 2.726 3.029 3.16 3.293 3.384 3.657 3.773 4.017 4.249 4.451 4.541 4.726 4.914 5.164 5.327 5.49 5.74 5.973 6.182 6.385 6.569 6.822 7.09 7.344 7.643 7.928 8.187 8.465 8.771 9.079 9.41 9.752 10.11 10.497 10.919 11.352 11.777 12.297 12.861 13.431 13.998 14.568 15.091 15.431 15.318 14.93 14.453 13.944 13.43 12.922 12.427 12.004 11.571 11.177 10.811 10.457 10.116 9.792 9.49 9.153 8.848 8.606 8.342 8.037 7.794 7.552 7.29 7.081 6.855 6.62 6.39 6.151 5.964 5.763 5.471 5.277 5.067 4.954 4.732 4.479 4.194 4.057 3.76 3.617 3.449 3.263 2.813 2.543 2.212 1.84 1.43 0.947 0.365 -1.261 -8 ,8746 ,TETRA ,17601492,Sun Nov 28 14:53:45 CET,Sun Nov 28 16:43:11 CET,0.0 0.839 1.231 1.537 1.797 2.005 2.201 2.376 2.693 2.846 2.985 3.098 3.384 3.506 3.754 3.989 4.224 4.334 4.53 4.708 4.957 5.121 5.278 5.507 5.736 5.952 6.153 6.351 6.606 6.84 7.06 7.325 7.597 7.855 8.125 8.44 8.751 9.08 9.418 9.788 10.188 10.604 11.074 11.54 12.065 12.627 13.241 13.855 14.474 15.094 15.556 15.474 15.091 14.607 14.085 13.585 13.099 12.616 12.217 11.784 11.391 11.055 10.704 10.363 10.06 9.776 9.464 9.18 8.933 8.642 8.321 8.074 7.833 7.57 7.358 7.142 6.906 6.658 6.4 6.235 6.08 5.81 5.607 5.396 5.285 5.06 4.826 4.558 4.413 4.094 3.914 3.742 3.571 3.17 2.955 2.724 2.461 2.112 1.711 1.182 -0.123 -9 ,22997 ,TETRA ,17601493,Sun Nov 28 14:53:40 CET,Sun Nov 28 16:43:26 CET,0.0 1.029 1.444 1.744 1.981 2.179 2.383 2.575 2.915 3.076 3.233 3.351 3.631 3.747 3.976 4.194 4.392 4.484 4.662 4.846 5.113 5.272 5.435 5.691 5.928 6.154 6.363 6.559 6.802 7.033 7.265 7.557 7.831 8.09 8.387 8.712 9.026 9.345 9.683 10.069 10.464 10.873 11.336 11.785 12.275 12.789 13.369 13.994 14.605 15.155 15.545 15.42 14.988 14.488 13.999 13.488 13.0 12.523 12.094 11.675 11.281 10.908 10.552 10.205 9.873 9.567 9.251 8.977 8.741 8.484 8.192 7.938 7.678 7.414 7.193 6.954 6.72 6.47 6.201 6.016 5.818 5.507 5.31 5.115 5.014 4.797 4.551 4.296 4.168 3.867 3.714 3.544 3.377 3.011 2.802 2.572 2.339 2.107 1.831 1.436 0.38 -10 ,28159 ,TETRA ,17601494,Sun Nov 28 14:53:40 CET,Sun Nov 28 16:43:38 CET,0.0 1.014 1.308 1.523 1.726 1.929 2.107 2.266 2.575 2.718 2.857 2.959 3.239 3.361 3.614 3.852 4.07 4.17 4.356 4.536 4.801 4.966 5.125 5.351 5.565 5.771 5.977 6.183 6.448 6.716 6.972 7.263 7.521 7.761 8.043 8.362 8.668 8.992 9.33 9.682 10.054 10.467 10.912 11.337 11.819 12.338 12.909 13.5 14.074 14.577 14.916 14.846 14.453 13.944 13.453 12.95 12.475 12.011 11.558 11.085 10.7 10.351 9.998 9.657 9.316 8.984 8.647 8.35 8.089 7.807 7.511 7.277 7.03 6.757 6.545 6.334 6.123 5.905 5.671 5.51 5.347 5.089 4.902 4.695 4.581 4.348 4.113 3.849 3.713 3.399 3.222 3.04 2.862 2.485 2.27 2.048 1.803 1.53 1.231 0.819 -0.409 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_63_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_63_65.txt deleted file mode 100644 index b07ad373..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_63_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2934 ,TETRA ,17601495,Sun Nov 28 14:53:40 CET,Sun Nov 28 16:44:06 CET,0.0 1.111 1.568 1.897 2.164 2.386 2.583 2.76 3.097 3.264 3.419 3.537 3.841 3.971 4.211 4.429 4.636 4.737 4.926 5.112 5.379 5.549 5.722 5.972 6.198 6.412 6.623 6.816 7.057 7.294 7.528 7.807 8.063 8.315 8.619 8.939 9.239 9.562 9.897 10.247 10.6 11.008 11.473 11.912 12.39 12.879 13.401 13.916 14.455 14.942 15.181 15.008 14.631 14.175 13.709 13.229 12.773 12.369 11.977 11.539 11.166 10.824 10.493 10.174 9.861 9.58 9.268 8.975 8.738 8.484 8.213 7.986 7.747 7.498 7.301 7.089 6.865 6.648 6.396 6.21 6.028 5.751 5.559 5.367 5.276 5.082 4.868 4.629 4.494 4.21 4.1 3.951 3.791 3.431 3.237 3.049 2.833 2.573 2.293 1.97 0.679 -2 ,14266 ,TETRA ,17601496,Sun Nov 28 14:53:40 CET,Sun Nov 28 16:43:55 CET,0.0 1.107 1.521 1.863 2.136 2.362 2.589 2.811 3.155 3.314 3.471 3.609 3.905 4.031 4.271 4.501 4.723 4.823 5.012 5.194 5.455 5.625 5.797 6.036 6.259 6.479 6.682 6.871 7.12 7.37 7.608 7.888 8.154 8.412 8.701 9.016 9.312 9.63 9.985 10.353 10.718 11.137 11.605 12.037 12.537 13.048 13.585 14.141 14.657 15.112 15.421 15.311 14.925 14.467 14.008 13.526 13.075 12.641 12.242 11.842 11.48 11.165 10.861 10.548 10.25 9.97 9.659 9.381 9.141 8.898 8.642 8.426 8.189 7.935 7.748 7.546 7.337 7.124 6.893 6.723 6.551 6.28 6.09 5.902 5.809 5.604 5.386 5.168 5.045 4.751 4.636 4.502 4.354 4.018 3.815 3.596 3.365 3.095 2.787 2.41 1.362 -3 ,9309 ,TETRA ,17601497,Sun Nov 28 14:53:40 CET,Sun Nov 28 16:44:03 CET,0.0 0.691 1.089 1.374 1.59 1.786 1.989 2.198 2.57 2.738 2.895 3.019 3.31 3.437 3.693 3.932 4.16 4.277 4.503 4.71 5.008 5.204 5.385 5.645 5.893 6.113 6.317 6.508 6.755 6.995 7.223 7.506 7.775 8.021 8.301 8.602 8.871 9.177 9.519 9.868 10.222 10.597 11.042 11.507 12.008 12.501 13.03 13.55 14.063 14.559 14.884 14.707 14.297 13.815 13.322 12.842 12.399 11.953 11.514 11.065 10.677 10.327 10.005 9.697 9.385 9.087 8.78 8.513 8.274 8.011 7.742 7.523 7.284 7.022 6.83 6.641 6.45 6.256 6.021 5.856 5.691 5.414 5.222 5.037 4.936 4.72 4.486 4.225 4.086 3.798 3.713 3.58 3.435 3.102 2.916 2.689 2.435 2.179 1.9 1.556 0.517 -4 ,18699 ,TETRA ,17601498,Sun Nov 28 14:53:43 CET,Sun Nov 28 16:44:03 CET,0.0 0.973 1.35 1.663 1.914 2.131 2.325 2.507 2.859 3.017 3.152 3.257 3.557 3.68 3.914 4.143 4.352 4.45 4.653 4.853 5.146 5.326 5.491 5.734 5.954 6.162 6.366 6.552 6.81 7.088 7.342 7.611 7.865 8.116 8.395 8.714 9.04 9.372 9.691 10.042 10.419 10.837 11.301 11.715 12.166 12.653 13.186 13.719 14.255 14.771 15.102 15.045 14.733 14.283 13.786 13.319 12.89 12.46 12.052 11.641 11.257 10.857 10.45 10.059 9.683 9.337 8.985 8.676 8.407 8.102 7.774 7.509 7.236 6.953 6.725 6.489 6.242 5.976 5.706 5.533 5.36 5.086 4.889 4.686 4.58 4.363 4.138 3.904 3.789 3.508 3.397 3.261 3.115 2.772 2.586 2.382 2.176 1.919 1.56 1.115 0.032 -5 ,13056 ,TETRA ,17601499,Sun Nov 28 14:53:40 CET,Sun Nov 28 16:44:03 CET,0.0 1.245 1.617 1.926 2.198 2.434 2.642 2.816 3.13 3.292 3.44 3.536 3.819 3.939 4.18 4.419 4.641 4.744 4.944 5.135 5.395 5.555 5.709 5.935 6.173 6.398 6.603 6.804 7.076 7.341 7.581 7.88 8.18 8.446 8.73 9.071 9.395 9.706 10.035 10.396 10.79 11.213 11.652 12.062 12.509 12.986 13.504 14.058 14.646 15.168 15.447 15.252 14.872 14.411 13.896 13.394 12.945 12.51 12.113 11.712 11.357 11.014 10.67 10.352 10.06 9.779 9.463 9.182 8.957 8.725 8.474 8.256 8.017 7.77 7.589 7.395 7.183 6.974 6.753 6.595 6.437 6.163 5.961 5.743 5.628 5.395 5.143 4.871 4.727 4.439 4.329 4.171 3.994 3.628 3.434 3.205 2.956 2.704 2.393 1.997 1.148 -6 ,561 ,TETRA ,17601500,Sun Nov 28 14:54:41 CET,Sun Nov 28 16:44:06 CET,0.0 0.902 1.347 1.685 1.948 2.17 2.375 2.588 2.975 3.131 3.266 3.377 3.672 3.79 4.021 4.252 4.471 4.58 4.787 4.982 5.248 5.407 5.57 5.806 6.023 6.227 6.42 6.612 6.877 7.133 7.362 7.627 7.877 8.117 8.389 8.686 8.973 9.28 9.6 9.959 10.327 10.713 11.152 11.583 12.049 12.502 13.022 13.597 14.122 14.536 14.751 14.58 14.204 13.752 13.263 12.764 12.291 11.822 11.413 11.002 10.633 10.283 9.944 9.63 9.323 9.043 8.75 8.486 8.255 8.004 7.734 7.505 7.264 7.022 6.841 6.643 6.42 6.195 5.969 5.807 5.638 5.361 5.168 4.97 4.866 4.649 4.434 4.19 4.057 3.777 3.658 3.509 3.357 3.011 2.835 2.644 2.412 2.14 1.834 1.416 0.212 -7 ,8825 ,TETRA ,17601501,Sun Nov 28 14:54:42 CET,Sun Nov 28 16:44:19 CET,0.0 0.635 1.024 1.367 1.689 1.989 2.234 2.447 2.827 2.991 3.143 3.262 3.56 3.688 3.923 4.169 4.397 4.498 4.699 4.898 5.179 5.343 5.487 5.706 5.932 6.158 6.377 6.579 6.833 7.077 7.319 7.603 7.847 8.066 8.324 8.64 8.942 9.253 9.572 9.899 10.249 10.634 11.065 11.473 11.921 12.395 12.907 13.444 13.972 14.448 14.746 14.57 14.155 13.726 13.274 12.788 12.319 11.884 11.48 11.038 10.668 10.346 10.034 9.718 9.408 9.129 8.841 8.573 8.327 8.07 7.815 7.591 7.339 7.085 6.902 6.711 6.499 6.276 6.038 5.865 5.685 5.406 5.209 5.002 4.894 4.654 4.399 4.146 4.021 3.736 3.614 3.466 3.313 2.974 2.754 2.51 2.253 1.996 1.73 1.334 0.21 -8 ,22646 ,TETRA ,17601502,Sun Nov 28 14:54:44 CET,Sun Nov 28 16:46:17 CET,0.0 0.904 1.33 1.64 1.931 2.204 2.445 2.65 3.003 3.157 3.301 3.418 3.71 3.833 4.09 4.308 4.516 4.621 4.807 4.987 5.274 5.473 5.655 5.906 6.161 6.415 6.647 6.869 7.148 7.409 7.672 7.985 8.262 8.534 8.882 9.265 9.607 9.98 10.366 10.728 11.07 11.432 11.857 12.258 12.708 13.215 13.743 14.27 14.789 15.26 15.537 15.417 15.007 14.485 13.982 13.505 13.071 12.647 12.251 11.833 11.458 11.108 10.78 10.457 10.153 9.873 9.564 9.281 9.051 8.824 8.573 8.357 8.128 7.881 7.689 7.493 7.288 7.065 6.817 6.653 6.474 6.183 5.993 5.789 5.685 5.483 5.265 5.031 4.912 4.634 4.54 4.406 4.262 3.928 3.718 3.494 3.263 3.002 2.697 2.319 1.336 -9 ,23657 ,TETRA ,17601503,Sun Nov 28 14:54:46 CET,Sun Nov 28 16:44:06 CET,0.0 1.169 1.605 1.911 2.179 2.425 2.64 2.802 3.118 3.284 3.433 3.528 3.807 3.931 4.175 4.412 4.627 4.725 4.916 5.106 5.386 5.548 5.706 5.931 6.133 6.332 6.53 6.721 6.958 7.182 7.397 7.66 7.91 8.163 8.467 8.782 9.093 9.454 9.821 10.199 10.589 11.001 11.449 11.892 12.359 12.837 13.362 13.897 14.426 14.888 15.157 15.005 14.602 14.135 13.677 13.23 12.803 12.377 11.976 11.551 11.174 10.842 10.514 10.173 9.861 9.594 9.304 9.019 8.769 8.515 8.245 8.012 7.765 7.52 7.325 7.118 6.914 6.694 6.465 6.31 6.148 5.907 5.73 5.532 5.433 5.234 5.037 4.817 4.686 4.396 4.287 4.148 3.993 3.662 3.49 3.304 3.088 2.863 2.6 2.167 0.844 -10 ,29453 ,TETRA ,17601504,Sun Nov 28 14:54:40 CET,Sun Nov 28 16:45:59 CET,0.0 0.774 1.181 1.538 1.844 2.097 2.325 2.547 2.923 3.075 3.223 3.34 3.628 3.743 3.96 4.187 4.402 4.5 4.681 4.852 5.11 5.28 5.447 5.693 5.931 6.153 6.362 6.565 6.819 7.058 7.292 7.584 7.865 8.119 8.399 8.704 9.002 9.331 9.687 10.055 10.412 10.786 11.235 11.678 12.147 12.666 13.219 13.765 14.306 14.814 15.136 14.981 14.579 14.093 13.602 13.104 12.648 12.202 11.81 11.404 11.036 10.696 10.343 10.005 9.702 9.43 9.121 8.841 8.597 8.336 8.078 7.858 7.647 7.439 7.257 7.059 6.845 6.589 6.316 6.138 5.955 5.651 5.424 5.197 5.083 4.838 4.56 4.275 4.134 3.831 3.679 3.503 3.309 2.912 2.71 2.494 2.252 1.952 1.551 1.055 0.091 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_64_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_64_54.txt deleted file mode 100644 index 411b74ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_64_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11400 ,TETRA ,17601505,Sun Nov 28 14:54:41 CET,Sun Nov 28 16:45:59 CET,0.0 0.843 1.191 1.417 1.611 1.808 1.997 2.159 2.461 2.603 2.741 2.85 3.145 3.268 3.499 3.734 3.947 4.05 4.26 4.453 4.726 4.899 5.052 5.264 5.459 5.646 5.842 6.026 6.256 6.491 6.722 6.991 7.248 7.514 7.819 8.147 8.461 8.791 9.134 9.501 9.899 10.345 10.848 11.33 11.875 12.466 13.152 13.9 14.721 15.623 16.491 17.002 17.106 16.991 16.805 16.555 16.282 15.991 15.722 15.442 15.165 14.898 14.647 14.413 14.19 13.971 13.715 13.488 13.282 13.054 12.82 12.625 12.409 12.181 12.003 11.805 11.595 11.384 11.16 11.006 10.867 10.652 10.493 10.316 10.207 9.984 9.774 9.553 9.44 9.162 9.06 8.927 8.771 8.442 8.261 8.057 7.825 7.552 7.257 6.91 6.102 -2 ,19928 ,TETRA ,17601506,Sun Nov 28 14:54:40 CET,Sun Nov 28 16:45:00 CET,0.0 1.403 1.835 2.148 2.398 2.598 2.774 2.94 3.243 3.389 3.525 3.603 3.883 4.001 4.219 4.436 4.638 4.734 4.935 5.116 5.367 5.524 5.674 5.905 6.122 6.323 6.532 6.743 7.012 7.25 7.473 7.757 8.031 8.281 8.555 8.868 9.165 9.467 9.808 10.182 10.568 10.992 11.47 11.951 12.518 13.155 13.87 14.597 15.382 16.253 17.172 17.728 17.802 17.696 17.498 17.23 16.955 16.687 16.431 16.137 15.835 15.524 15.221 14.945 14.699 14.478 14.24 14.021 13.814 13.569 13.319 13.114 12.895 12.683 12.509 12.321 12.14 11.947 11.732 11.581 11.416 11.146 10.981 10.821 10.726 10.517 10.303 10.07 9.946 9.666 9.568 9.428 9.274 8.927 8.734 8.531 8.303 8.021 7.645 7.185 5.939 -3 ,4604 ,TETRA ,17601507,Sun Nov 28 14:55:37 CET,Sun Nov 28 16:51:20 CET,0.0 0.831 1.155 1.461 1.695 1.885 2.074 2.218 2.488 2.634 2.768 2.866 3.153 3.263 3.464 3.661 3.86 3.953 4.137 4.304 4.527 4.678 4.831 5.062 5.284 5.492 5.702 5.899 6.14 6.375 6.608 6.888 7.13 7.361 7.636 7.954 8.279 8.639 9.012 9.394 9.805 10.257 10.78 11.333 11.967 12.628 13.33 14.095 14.978 15.94 16.858 17.354 17.447 17.292 17.071 16.841 16.572 16.281 16.027 15.738 15.462 15.184 14.902 14.634 14.374 14.122 13.846 13.602 13.384 13.16 12.919 12.712 12.494 12.28 12.117 11.924 11.714 11.492 11.26 11.107 10.947 10.713 10.555 10.381 10.29 10.088 9.884 9.675 9.56 9.284 9.167 9.016 8.85 8.489 8.278 8.058 7.823 7.559 7.252 6.79 5.641 -4 ,12534 ,TETRA ,17601508,Sun Nov 28 14:55:38 CET,Sun Nov 28 16:45:32 CET,0.0 0.964 1.251 1.461 1.679 1.883 2.068 2.243 2.536 2.673 2.81 2.91 3.193 3.307 3.531 3.745 3.944 4.035 4.215 4.383 4.628 4.798 4.969 5.205 5.422 5.625 5.818 6.01 6.25 6.492 6.735 7.009 7.271 7.531 7.828 8.153 8.474 8.824 9.185 9.538 9.911 10.338 10.837 11.349 11.903 12.514 13.206 13.9 14.694 15.621 16.534 17.011 17.121 17.049 16.84 16.569 16.303 16.028 15.774 15.502 15.241 14.979 14.704 14.43 14.167 13.936 13.687 13.431 13.21 12.995 12.774 12.58 12.361 12.12 11.923 11.731 11.549 11.356 11.15 10.997 10.834 10.585 10.405 10.217 10.122 9.914 9.7 9.464 9.329 9.041 8.918 8.764 8.599 8.26 8.091 7.921 7.703 7.438 7.141 6.757 5.053 -5 ,3212 ,TETRA ,17601509,Sun Nov 28 14:55:40 CET,Sun Nov 28 16:45:49 CET,0.0 0.899 1.258 1.553 1.805 2.065 2.306 2.514 2.863 3.026 3.18 3.306 3.599 3.727 4.011 4.265 4.503 4.619 4.836 5.026 5.273 5.424 5.574 5.789 5.992 6.203 6.413 6.61 6.863 7.108 7.34 7.608 7.878 8.15 8.439 8.743 9.014 9.32 9.662 10.023 10.409 10.832 11.356 11.916 12.534 13.165 13.86 14.628 15.521 16.487 17.436 17.944 18.024 17.93 17.734 17.488 17.227 16.932 16.655 16.358 16.059 15.784 15.527 15.281 15.037 14.784 14.519 14.289 14.089 13.885 13.654 13.442 13.22 13.007 12.844 12.667 12.489 12.295 12.075 11.927 11.768 11.496 11.297 11.104 11.009 10.809 10.6 10.366 10.242 9.953 9.826 9.677 9.526 9.201 9.005 8.761 8.446 8.048 7.563 6.895 4.929 -6 ,27891 ,TETRA ,17601510,Sun Nov 28 14:55:43 CET,Sun Nov 28 16:45:21 CET,0.0 1.8 2.201 2.493 2.73 2.942 3.123 3.288 3.595 3.733 3.864 3.934 4.211 4.321 4.538 4.749 4.952 5.052 5.246 5.421 5.679 5.847 6.015 6.255 6.46 6.653 6.852 7.049 7.28 7.506 7.744 8.019 8.271 8.522 8.806 9.115 9.429 9.759 10.099 10.488 10.904 11.35 11.858 12.366 12.916 13.521 14.239 15.028 15.892 16.812 17.738 18.229 18.295 18.145 17.911 17.68 17.425 17.138 16.855 16.547 16.274 16.023 15.754 15.481 15.238 15.009 14.743 14.501 14.297 14.084 13.857 13.663 13.464 13.251 13.078 12.903 12.726 12.535 12.313 12.167 12.015 11.752 11.56 11.362 11.262 11.061 10.843 10.618 10.504 10.223 10.1 9.946 9.779 9.431 9.271 9.083 8.806 8.495 8.125 7.627 6.02 -7 ,16986 ,TETRA ,17601511,Sun Nov 28 14:56:39 CET,Sun Nov 28 16:46:27 CET,0.0 1.447 1.866 2.157 2.405 2.642 2.84 2.995 3.288 3.441 3.583 3.695 3.985 4.108 4.344 4.57 4.777 4.873 5.049 5.21 5.43 5.582 5.749 6.0 6.226 6.43 6.629 6.819 7.062 7.293 7.526 7.813 8.088 8.345 8.656 9.013 9.332 9.668 10.001 10.346 10.707 11.128 11.647 12.166 12.746 13.339 14.013 14.752 15.583 16.483 17.392 17.931 17.996 17.858 17.632 17.361 17.109 16.843 16.588 16.308 16.041 15.775 15.519 15.285 15.044 14.805 14.557 14.337 14.145 13.954 13.748 13.556 13.34 13.108 12.928 12.73 12.525 12.328 12.117 11.963 11.804 11.549 11.369 11.196 11.104 10.896 10.682 10.447 10.315 10.013 9.833 9.66 9.495 9.082 8.822 8.543 8.27 8.009 7.725 7.316 5.19 -8 ,16757 ,TETRA ,17601512,Sun Nov 28 14:56:40 CET,Sun Nov 28 16:46:50 CET,0.0 1.275 1.681 1.956 2.199 2.396 2.571 2.755 3.068 3.197 3.321 3.431 3.724 3.844 4.079 4.303 4.507 4.599 4.775 4.945 5.19 5.347 5.488 5.694 5.91 6.12 6.313 6.504 6.764 7.011 7.234 7.5 7.757 8.009 8.292 8.597 8.89 9.213 9.568 9.947 10.331 10.772 11.285 11.777 12.348 12.986 13.684 14.45 15.343 16.238 17.046 17.497 17.516 17.353 17.158 16.913 16.638 16.362 16.105 15.815 15.554 15.321 15.077 14.812 14.563 14.323 14.056 13.804 13.578 13.367 13.154 12.966 12.751 12.523 12.358 12.194 12.009 11.802 11.598 11.451 11.286 11.028 10.851 10.667 10.568 10.362 10.149 9.913 9.786 9.501 9.407 9.278 9.144 8.836 8.654 8.441 8.208 7.972 7.678 7.242 5.357 -9 ,14456 ,TETRA ,17601513,Sun Nov 28 14:56:42 CET,Sun Nov 28 16:46:44 CET,0.0 0.785 1.096 1.364 1.597 1.799 1.98 2.154 2.457 2.593 2.73 2.81 3.089 3.214 3.447 3.652 3.846 3.937 4.129 4.302 4.52 4.677 4.837 5.06 5.281 5.498 5.7 5.891 6.141 6.378 6.596 6.872 7.148 7.411 7.689 8.015 8.362 8.719 9.08 9.455 9.853 10.306 10.813 11.293 11.827 12.436 13.131 13.873 14.721 15.675 16.586 17.097 17.166 17.051 16.844 16.578 16.323 16.047 15.768 15.479 15.218 14.953 14.687 14.437 14.192 13.973 13.751 13.52 13.313 13.078 12.813 12.606 12.395 12.181 12.011 11.825 11.634 11.441 11.241 11.099 10.949 10.698 10.504 10.308 10.212 10.007 9.785 9.559 9.437 9.154 9.064 8.934 8.776 8.434 8.256 8.031 7.786 7.521 7.165 6.741 5.033 -10 ,21308 ,TETRA ,17601514,Sun Nov 28 14:56:43 CET,Sun Nov 28 16:46:33 CET,0.0 1.071 1.436 1.714 1.931 2.116 2.287 2.462 2.769 2.907 3.034 3.101 3.38 3.497 3.719 3.917 4.114 4.222 4.419 4.595 4.862 5.038 5.196 5.407 5.61 5.827 6.038 6.235 6.481 6.726 6.968 7.241 7.504 7.751 8.035 8.37 8.691 9.034 9.405 9.796 10.194 10.645 11.159 11.638 12.195 12.832 13.552 14.327 15.158 15.989 16.872 17.39 17.439 17.258 16.994 16.706 16.392 16.075 15.795 15.487 15.202 14.923 14.614 14.309 14.025 13.774 13.508 13.258 13.035 12.801 12.556 12.347 12.132 11.897 11.711 11.535 11.348 11.135 10.923 10.777 10.621 10.372 10.198 10.014 9.914 9.706 9.498 9.282 9.161 8.872 8.743 8.589 8.427 8.076 7.881 7.664 7.418 7.123 6.781 6.294 5.182 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_65_66.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_65_66.txt deleted file mode 100644 index 2adb8b89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_65_66.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30765 ,TETRA ,17601515,Sun Nov 28 14:56:40 CET,Sun Nov 28 16:52:40 CET,0.0 1.252 1.636 1.907 2.185 2.464 2.71 2.917 3.259 3.422 3.582 3.731 4.028 4.158 4.404 4.625 4.844 4.955 5.158 5.351 5.623 5.796 5.97 6.23 6.479 6.711 6.938 7.153 7.421 7.69 7.953 8.253 8.547 8.84 9.173 9.551 9.907 10.288 10.712 11.166 11.62 12.104 12.68 13.274 13.952 14.711 15.55 16.478 17.559 18.731 19.917 20.635 20.909 20.931 20.781 20.57 20.345 20.095 19.838 19.55 19.297 19.06 18.812 18.57 18.347 18.141 17.925 17.721 17.521 17.295 17.058 16.861 16.658 16.451 16.283 16.11 15.931 15.734 15.516 15.371 15.222 14.98 14.802 14.611 14.516 14.316 14.093 13.842 13.723 13.459 13.353 13.218 13.066 12.712 12.505 12.295 12.049 11.759 11.475 11.042 9.605 -2 ,13020 ,TETRA ,17601516,Sun Nov 28 14:56:39 CET,Sun Nov 28 16:46:58 CET,0.0 0.559 0.874 1.156 1.442 1.706 1.931 2.131 2.491 2.653 2.802 2.923 3.215 3.356 3.615 3.844 4.075 4.187 4.386 4.582 4.867 5.053 5.238 5.522 5.796 6.039 6.27 6.489 6.763 7.028 7.295 7.616 7.908 8.194 8.542 8.939 9.323 9.718 10.142 10.597 11.063 11.604 12.218 12.817 13.488 14.219 15.061 15.977 17.001 18.16 19.379 20.133 20.416 20.436 20.331 20.148 19.899 19.641 19.38 19.097 18.852 18.625 18.384 18.137 17.898 17.672 17.434 17.213 17.011 16.8 16.582 16.396 16.195 15.97 15.79 15.616 15.441 15.245 15.043 14.899 14.74 14.487 14.309 14.129 14.031 13.831 13.619 13.374 13.24 12.95 12.809 12.652 12.492 12.171 11.964 11.713 11.471 11.211 10.86 10.413 9.25 -3 ,13638 ,TETRA ,17601517,Sun Nov 28 14:57:39 CET,Sun Nov 28 16:48:02 CET,0.0 1.436 1.879 2.184 2.455 2.712 2.926 3.104 3.423 3.574 3.718 3.844 4.148 4.29 4.556 4.795 5.014 5.122 5.338 5.544 5.835 6.024 6.204 6.459 6.705 6.943 7.165 7.377 7.669 7.965 8.247 8.556 8.848 9.13 9.459 9.846 10.206 10.599 11.02 11.452 11.897 12.403 12.997 13.585 14.25 14.984 15.842 16.779 17.79 18.892 20.08 20.803 21.01 21.008 20.913 20.735 20.499 20.241 19.98 19.709 19.491 19.279 19.037 18.787 18.556 18.354 18.104 17.863 17.662 17.455 17.237 17.05 16.857 16.635 16.455 16.272 16.084 15.892 15.687 15.547 15.401 15.155 14.98 14.776 14.665 14.462 14.267 14.053 13.936 13.651 13.484 13.318 13.16 12.803 12.607 12.374 12.123 11.839 11.462 10.955 9.586 -4 ,30067 ,TETRA ,17601518,Sun Nov 28 14:58:39 CET,Sun Nov 28 16:48:04 CET,0.0 1.159 1.56 1.874 2.15 2.402 2.624 2.818 3.163 3.33 3.486 3.606 3.908 4.043 4.284 4.512 4.743 4.855 5.066 5.28 5.581 5.758 5.927 6.186 6.436 6.679 6.924 7.157 7.438 7.72 8.001 8.332 8.646 8.935 9.256 9.636 10.001 10.383 10.805 11.259 11.724 12.242 12.855 13.45 14.13 14.862 15.686 16.607 17.614 18.712 19.917 20.626 20.778 20.744 20.635 20.451 20.249 20.014 19.769 19.511 19.273 19.033 18.794 18.577 18.361 18.147 17.904 17.678 17.481 17.276 17.066 16.882 16.675 16.451 16.287 16.113 15.914 15.724 15.518 15.365 15.196 14.933 14.764 14.576 14.476 14.258 14.031 13.803 13.682 13.41 13.291 13.131 12.951 12.549 12.343 12.149 11.945 11.686 11.352 10.898 9.826 -5 ,23293 ,TETRA ,17601519,Sun Nov 28 14:58:40 CET,Sun Nov 28 16:48:24 CET,0.0 0.823 1.188 1.478 1.714 1.942 2.163 2.366 2.761 2.929 3.075 3.204 3.495 3.622 3.862 4.098 4.319 4.419 4.622 4.832 5.153 5.353 5.536 5.802 6.051 6.285 6.516 6.748 7.044 7.329 7.605 7.916 8.187 8.458 8.794 9.156 9.515 9.933 10.375 10.823 11.28 11.802 12.413 13.016 13.692 14.422 15.295 16.225 17.214 18.33 19.525 20.293 20.518 20.472 20.324 20.125 19.905 19.66 19.429 19.158 18.888 18.652 18.414 18.175 17.951 17.728 17.485 17.261 17.057 16.837 16.607 16.421 16.232 16.029 15.863 15.687 15.5 15.298 15.087 14.937 14.782 14.537 14.356 14.185 14.093 13.876 13.651 13.418 13.282 12.982 12.85 12.709 12.548 12.151 11.922 11.676 11.405 11.104 10.739 10.152 8.685 -6 ,3082 ,TETRA ,17601520,Sun Nov 28 14:58:41 CET,Sun Nov 28 16:48:36 CET,0.0 0.935 1.257 1.55 1.799 2.05 2.296 2.502 2.827 2.984 3.142 3.307 3.625 3.77 4.028 4.283 4.531 4.648 4.879 5.104 5.406 5.587 5.767 6.026 6.275 6.518 6.744 6.959 7.238 7.495 7.74 8.043 8.341 8.635 8.976 9.352 9.711 10.117 10.555 11.01 11.48 11.998 12.614 13.241 13.936 14.68 15.508 16.445 17.512 18.635 19.811 20.571 20.83 20.84 20.722 20.51 20.289 20.06 19.818 19.552 19.309 19.084 18.843 18.598 18.383 18.181 17.961 17.756 17.554 17.342 17.127 16.926 16.707 16.467 16.257 16.046 15.842 15.617 15.37 15.202 15.024 14.741 14.544 14.344 14.241 14.019 13.768 13.506 13.39 13.121 12.986 12.841 12.69 12.338 12.149 11.951 11.727 11.454 11.146 10.687 8.445 -7 ,12701 ,TETRA ,17601521,Sun Nov 28 14:58:43 CET,Sun Nov 28 16:48:37 CET,0.0 1.291 1.784 2.11 2.384 2.646 2.877 3.085 3.495 3.68 3.837 3.981 4.283 4.426 4.689 4.932 5.172 5.295 5.528 5.737 6.026 6.211 6.401 6.685 6.952 7.202 7.435 7.67 7.975 8.254 8.528 8.857 9.174 9.492 9.867 10.264 10.632 11.024 11.45 11.904 12.35 12.846 13.431 14.021 14.699 15.406 16.229 17.194 18.242 19.321 20.54 21.341 21.57 21.582 21.479 21.285 21.015 20.747 20.514 20.244 19.984 19.733 19.484 19.249 19.02 18.796 18.56 18.349 18.144 17.919 17.688 17.493 17.268 17.016 16.822 16.637 16.435 16.221 15.996 15.834 15.676 15.428 15.239 15.041 14.945 14.728 14.484 14.214 14.074 13.792 13.691 13.56 13.422 13.109 12.919 12.709 12.479 12.232 11.943 11.588 10.47 -8 ,8098 ,TETRA ,17601522,Sun Nov 28 14:58:40 CET,Sun Nov 28 16:48:54 CET,0.0 1.148 1.598 1.941 2.199 2.433 2.642 2.83 3.173 3.334 3.497 3.63 3.918 4.05 4.301 4.539 4.756 4.861 5.069 5.269 5.564 5.751 5.928 6.191 6.435 6.668 6.908 7.152 7.457 7.722 7.968 8.276 8.591 8.893 9.231 9.619 10.001 10.407 10.832 11.274 11.726 12.258 12.881 13.465 14.12 14.857 15.737 16.699 17.699 18.779 20.015 20.816 21.074 21.055 20.917 20.702 20.445 20.208 19.983 19.72 19.467 19.216 18.959 18.705 18.462 18.242 17.992 17.753 17.544 17.335 17.132 16.937 16.725 16.507 16.334 16.158 15.967 15.755 15.538 15.394 15.243 15.011 14.838 14.654 14.543 14.293 14.025 13.716 13.552 13.228 13.017 12.81 12.604 12.237 12.049 11.81 11.512 11.189 10.759 10.133 8.764 -9 ,28690 ,TETRA ,17601523,Sun Nov 28 14:58:42 CET,Sun Nov 28 16:48:51 CET,0.0 0.761 1.134 1.456 1.741 1.979 2.189 2.402 2.78 2.941 3.084 3.194 3.482 3.609 3.848 4.073 4.288 4.397 4.609 4.804 5.097 5.29 5.477 5.752 6.008 6.24 6.459 6.681 6.971 7.251 7.521 7.845 8.157 8.461 8.817 9.195 9.535 9.923 10.351 10.796 11.262 11.782 12.403 13.007 13.679 14.417 15.224 16.095 17.113 18.258 19.507 20.331 20.575 20.596 20.506 20.279 20.039 19.789 19.538 19.286 19.038 18.792 18.543 18.301 18.079 17.868 17.639 17.425 17.223 16.996 16.77 16.577 16.37 16.153 15.974 15.787 15.601 15.421 15.227 15.088 14.943 14.716 14.558 14.379 14.287 14.084 13.862 13.64 13.523 13.258 13.165 13.032 12.879 12.518 12.324 12.141 11.934 11.658 11.335 10.931 9.672 -10 ,11019 ,TETRA ,17601524,Sun Nov 28 14:58:44 CET,Sun Nov 28 16:48:36 CET,0.0 0.971 1.362 1.644 1.897 2.143 2.348 2.538 2.913 3.083 3.243 3.395 3.689 3.823 4.07 4.299 4.526 4.631 4.836 5.056 5.364 5.543 5.716 5.973 6.223 6.452 6.683 6.914 7.197 7.46 7.714 8.027 8.323 8.607 8.937 9.312 9.674 10.064 10.477 10.899 11.345 11.851 12.439 13.022 13.69 14.437 15.275 16.197 17.22 18.373 19.596 20.318 20.582 20.641 20.553 20.322 20.06 19.821 19.576 19.282 19.024 18.792 18.547 18.296 18.053 17.833 17.605 17.382 17.192 16.994 16.781 16.612 16.426 16.211 16.041 15.862 15.674 15.478 15.279 15.14 15.002 14.784 14.619 14.433 14.339 14.151 13.959 13.747 13.623 13.345 13.241 13.092 12.939 12.643 12.455 12.235 12.003 11.732 11.425 11.093 9.943 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_66_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_66_62.txt deleted file mode 100644 index c74a5fc3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_66_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,175 ,TETRA ,17601525,Sun Nov 28 14:58:41 CET,Sun Nov 28 16:48:07 CET,0.0 2.198 2.935 3.448 3.826 4.175 4.479 4.738 5.209 5.437 5.637 5.841 6.174 6.344 6.646 6.941 7.229 7.371 7.655 7.926 8.302 8.524 8.731 9.043 9.341 9.627 9.898 10.156 10.501 10.833 11.146 11.53 11.879 12.209 12.597 13.005 13.385 13.803 14.251 14.727 15.216 15.734 16.329 16.938 17.625 18.337 19.107 19.917 20.734 21.513 22.177 22.345 22.206 21.903 21.486 21.059 20.684 20.28 19.892 19.53 19.206 18.884 18.571 18.263 17.983 17.748 17.482 17.235 17.031 16.81 16.58 16.384 16.174 15.952 15.761 15.562 15.373 15.177 14.961 14.81 14.661 14.413 14.238 14.047 13.943 13.729 13.514 13.276 13.147 12.872 12.772 12.642 12.499 12.154 11.951 11.722 11.453 11.19 10.878 10.386 8.671 -2 ,30726 ,TETRA ,17601526,Sun Nov 28 14:58:40 CET,Sun Nov 28 16:48:32 CET,0.0 2.818 3.422 3.842 4.223 4.545 4.814 5.063 5.488 5.686 5.883 6.066 6.369 6.524 6.832 7.127 7.417 7.562 7.84 8.102 8.473 8.702 8.925 9.241 9.543 9.827 10.104 10.382 10.717 11.029 11.342 11.721 12.066 12.404 12.798 13.231 13.635 14.057 14.505 14.992 15.504 16.055 16.681 17.295 17.943 18.605 19.352 20.101 20.875 21.685 22.364 22.52 22.327 21.983 21.579 21.155 20.767 20.406 20.051 19.663 19.312 18.984 18.648 18.319 18.003 17.679 17.36 17.106 16.881 16.639 16.407 16.227 16.03 15.827 15.657 15.453 15.245 15.033 14.811 14.645 14.478 14.248 14.077 13.896 13.808 13.629 13.422 13.19 13.066 12.785 12.637 12.466 12.295 11.94 11.735 11.525 11.299 11.009 10.673 10.242 8.581 -3 ,23841 ,TETRA ,17601527,Sun Nov 28 14:58:42 CET,Sun Nov 28 16:48:04 CET,0.0 2.054 2.608 2.993 3.284 3.547 3.797 4.032 4.488 4.697 4.9 5.124 5.437 5.598 5.911 6.201 6.477 6.617 6.882 7.128 7.511 7.777 8.034 8.384 8.721 9.06 9.377 9.674 10.035 10.353 10.66 11.034 11.382 11.717 12.089 12.491 12.877 13.282 13.744 14.25 14.757 15.287 15.9 16.494 17.201 17.935 18.684 19.504 20.366 21.205 21.843 21.988 21.779 21.411 20.972 20.53 20.148 19.791 19.458 19.095 18.771 18.489 18.213 17.937 17.641 17.376 17.107 16.859 16.649 16.42 16.157 15.933 15.686 15.409 15.22 15.047 14.859 14.655 14.429 14.267 14.108 13.848 13.669 13.487 13.386 13.182 12.958 12.72 12.602 12.329 12.199 12.042 11.885 11.504 11.289 11.077 10.841 10.54 10.129 9.607 7.834 -4 ,8537 ,TETRA ,17601528,Sun Nov 28 14:58:43 CET,Sun Nov 28 16:48:05 CET,0.0 2.061 2.558 2.922 3.261 3.56 3.857 4.136 4.623 4.84 5.044 5.315 5.662 5.826 6.12 6.432 6.75 6.885 7.138 7.387 7.751 7.989 8.219 8.536 8.838 9.135 9.409 9.659 9.976 10.273 10.566 10.921 11.24 11.557 11.926 12.327 12.699 13.1 13.532 13.976 14.423 14.919 15.519 16.092 16.756 17.532 18.386 19.256 20.122 20.925 21.563 21.71 21.355 20.912 20.556 20.174 19.792 19.416 19.064 18.722 18.427 18.134 17.831 17.531 17.257 17.001 16.716 16.468 16.262 16.05 15.824 15.617 15.39 15.157 14.976 14.774 14.558 14.323 14.088 13.94 13.777 13.515 13.311 13.077 12.956 12.686 12.394 12.111 11.964 11.635 11.412 11.23 11.02 10.57 10.343 10.097 9.84 9.552 9.213 8.767 7.268 -5 ,20832 ,TETRA ,17601529,Sun Nov 28 14:58:45 CET,Sun Nov 28 16:48:09 CET,0.0 2.192 2.75 3.159 3.497 3.79 4.035 4.28 4.745 4.951 5.138 5.329 5.65 5.819 6.118 6.402 6.678 6.81 7.066 7.32 7.69 7.927 8.164 8.488 8.794 9.078 9.339 9.596 9.936 10.255 10.556 10.928 11.274 11.603 11.999 12.437 12.835 13.26 13.712 14.173 14.63 15.156 15.752 16.313 16.99 17.69 18.408 19.198 20.05 20.935 21.638 21.825 21.617 21.261 20.897 20.492 20.095 19.723 19.351 18.962 18.63 18.307 17.957 17.638 17.347 17.06 16.744 16.45 16.201 15.929 15.641 15.405 15.16 14.91 14.714 14.516 14.308 14.089 13.87 13.716 13.563 13.331 13.162 12.957 12.846 12.645 12.445 12.233 12.125 11.86 11.717 11.559 11.395 11.038 10.842 10.628 10.36 10.003 9.524 8.89 7.863 -6 ,22487 ,TETRA ,17601530,Sun Nov 28 14:58:41 CET,Sun Nov 28 16:50:07 CET,0.0 1.817 2.343 2.739 3.091 3.401 3.659 3.909 4.324 4.516 4.701 4.856 5.161 5.328 5.654 5.949 6.211 6.328 6.557 6.794 7.125 7.337 7.54 7.812 8.082 8.357 8.623 8.866 9.174 9.466 9.737 10.067 10.392 10.697 11.04 11.436 11.835 12.266 12.699 13.152 13.597 14.089 14.672 15.211 15.819 16.533 17.359 18.161 18.943 19.732 20.328 20.41 20.182 19.863 19.458 19.01 18.588 18.2 17.877 17.538 17.207 16.909 16.65 16.39 16.122 15.876 15.619 15.372 15.154 14.926 14.668 14.428 14.173 13.897 13.688 13.489 13.263 13.031 12.82 12.674 12.515 12.269 12.108 11.922 11.812 11.604 11.395 11.148 11.013 10.729 10.596 10.451 10.302 9.999 9.793 9.533 9.262 8.969 8.598 8.144 6.667 -7 ,22535 ,TETRA ,17601531,Sun Nov 28 14:58:45 CET,Sun Nov 28 16:50:06 CET,0.0 1.824 2.333 2.746 3.092 3.42 3.684 3.922 4.375 4.569 4.757 4.99 5.326 5.495 5.802 6.113 6.431 6.58 6.851 7.109 7.479 7.708 7.926 8.233 8.533 8.837 9.118 9.378 9.72 10.051 10.363 10.736 11.092 11.449 11.876 12.31 12.703 13.143 13.608 14.102 14.582 15.076 15.674 16.28 16.954 17.652 18.406 19.243 20.152 21.008 21.693 21.832 21.591 21.218 20.781 20.341 19.938 19.538 19.183 18.801 18.445 18.123 17.821 17.531 17.25 16.977 16.66 16.361 16.112 15.884 15.662 15.449 15.221 14.987 14.799 14.608 14.414 14.229 14.015 13.857 13.713 13.485 13.311 13.141 13.051 12.822 12.563 12.306 12.166 11.873 11.701 11.521 11.326 10.942 10.745 10.553 10.307 9.98 9.584 9.095 7.499 -8 ,11695 ,TETRA ,17601532,Sun Nov 28 14:58:42 CET,Sun Nov 28 16:49:02 CET,0.0 1.667 2.142 2.49 2.795 3.052 3.296 3.523 3.902 4.093 4.298 4.528 4.853 5.011 5.302 5.558 5.805 5.932 6.17 6.385 6.691 6.882 7.061 7.331 7.588 7.822 8.043 8.266 8.547 8.814 9.078 9.384 9.667 9.936 10.258 10.629 10.973 11.332 11.699 12.084 12.501 12.958 13.468 13.97 14.514 15.1 15.769 16.441 17.118 17.806 18.336 18.46 18.32 18.0 17.616 17.246 16.883 16.523 16.178 15.803 15.471 15.151 14.851 14.584 14.311 14.062 13.771 13.48 13.21 12.938 12.705 12.523 12.318 12.081 11.898 11.721 11.532 11.319 11.086 10.92 10.756 10.477 10.275 10.068 9.965 9.752 9.523 9.284 9.152 8.867 8.699 8.528 8.362 7.954 7.718 7.463 7.197 6.88 6.528 6.119 4.663 -9 ,4509 ,TETRA ,17601533,Sun Nov 28 14:58:43 CET,Sun Nov 28 16:49:00 CET,0.0 1.969 2.398 2.702 2.963 3.198 3.433 3.641 3.995 4.18 4.367 4.552 4.871 5.032 5.334 5.635 5.9 6.028 6.281 6.513 6.853 7.076 7.284 7.575 7.833 8.081 8.338 8.59 8.924 9.227 9.508 9.861 10.194 10.511 10.887 11.296 11.677 12.084 12.498 12.935 13.4 13.929 14.522 15.089 15.688 16.315 17.036 17.782 18.54 19.302 19.977 20.061 19.753 19.393 19.021 18.612 18.22 17.771 17.358 16.953 16.597 16.278 15.944 15.624 15.298 14.962 14.595 14.294 14.068 13.804 13.532 13.301 13.04 12.787 12.604 12.42 12.228 11.982 11.702 11.544 11.396 11.142 10.948 10.72 10.608 10.389 10.126 9.86 9.735 9.459 9.345 9.221 9.082 8.739 8.548 8.333 8.093 7.854 7.548 7.085 5.626 -10 ,16086 ,TETRA ,17601534,Sun Nov 28 14:58:43 CET,Sun Nov 28 16:48:34 CET,0.0 1.529 1.975 2.351 2.665 2.916 3.151 3.376 3.765 3.94 4.108 4.281 4.585 4.727 4.991 5.264 5.524 5.639 5.868 6.079 6.362 6.551 6.736 6.998 7.253 7.504 7.741 7.965 8.247 8.509 8.766 9.089 9.397 9.676 10.002 10.374 10.72 11.099 11.51 11.945 12.378 12.834 13.346 13.854 14.42 15.026 15.685 16.365 17.09 17.799 18.339 18.443 18.209 17.871 17.489 17.095 16.721 16.345 15.995 15.63 15.305 15.022 14.736 14.436 14.141 13.87 13.6 13.357 13.15 12.936 12.698 12.491 12.276 12.035 11.845 11.66 11.449 11.218 11.003 10.858 10.703 10.466 10.263 10.018 9.896 9.667 9.431 9.147 9.001 8.717 8.556 8.393 8.227 7.863 7.667 7.457 7.225 6.968 6.674 6.18 4.945 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_66_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_66_64.txt deleted file mode 100644 index 8448b9b5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_66_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19915 ,TETRA ,17601535,Sun Nov 28 14:58:44 CET,Sun Nov 28 16:48:08 CET,0.0 4.147 4.835 5.335 5.702 5.977 6.228 6.454 6.844 7.012 7.161 7.275 7.555 7.681 7.934 8.166 8.381 8.483 8.673 8.852 9.111 9.269 9.423 9.645 9.857 10.061 10.255 10.433 10.654 10.864 11.06 11.301 11.523 11.717 11.934 12.178 12.389 12.623 12.895 13.175 13.436 13.698 13.958 14.187 14.446 14.706 14.947 15.107 15.11 14.869 14.215 13.077 11.989 11.026 10.156 9.321 8.549 7.857 7.25 6.623 6.098 5.643 5.209 4.795 4.361 3.956 3.566 3.191 2.862 2.513 2.143 1.841 1.525 1.205 0.941 0.652 0.361 0.068 -0.234 -0.453 -0.682 -1.017 -1.26 -1.522 -1.65 -1.919 -2.233 -2.556 -2.714 -3.031 -3.175 -3.348 -3.533 -3.946 -4.173 -4.432 -4.742 -5.088 -5.481 -5.982 -7.912 -2 ,19541 ,TETRA ,17601536,Sun Nov 28 14:58:48 CET,Sun Nov 28 16:48:10 CET,0.0 2.024 2.565 2.958 3.243 3.521 3.795 4.005 4.371 4.545 4.711 4.854 5.136 5.254 5.475 5.7 5.921 6.019 6.206 6.392 6.647 6.798 6.95 7.183 7.394 7.58 7.768 7.943 8.155 8.366 8.571 8.812 9.024 9.231 9.468 9.715 9.965 10.226 10.484 10.723 10.946 11.199 11.471 11.734 12.013 12.247 12.475 12.628 12.659 12.497 11.812 10.593 9.461 8.471 7.596 6.776 6.029 5.362 4.766 4.162 3.635 3.139 2.675 2.24 1.821 1.425 1.013 0.665 0.35 -0.01 -0.376 -0.663 -0.981 -1.303 -1.53 -1.766 -2.018 -2.277 -2.547 -2.745 -2.955 -3.272 -3.489 -3.723 -3.844 -4.104 -4.375 -4.644 -4.794 -5.104 -5.252 -5.424 -5.614 -6.052 -6.29 -6.556 -6.845 -7.172 -7.57 -8.076 -10.188 -3 ,31963 ,TETRA ,17601537,Sun Nov 28 14:58:46 CET,Sun Nov 28 16:48:34 CET,0.0 2.061 2.591 2.972 3.276 3.512 3.737 3.983 4.38 4.529 4.685 4.856 5.156 5.289 5.563 5.813 6.019 6.117 6.314 6.521 6.822 6.994 7.159 7.39 7.598 7.8 7.991 8.176 8.412 8.626 8.837 9.093 9.337 9.551 9.769 10.014 10.265 10.545 10.817 11.077 11.342 11.63 11.935 12.191 12.434 12.67 12.871 13.014 13.06 12.898 12.261 11.133 10.059 9.081 8.202 7.414 6.708 6.021 5.366 4.704 4.142 3.624 3.147 2.731 2.337 1.96 1.575 1.201 0.875 0.564 0.215 -0.093 -0.415 -0.738 -0.992 -1.266 -1.547 -1.837 -2.141 -2.354 -2.566 -2.884 -3.121 -3.386 -3.518 -3.774 -4.061 -4.381 -4.549 -4.88 -5.057 -5.245 -5.452 -5.92 -6.179 -6.468 -6.801 -7.176 -7.601 -8.152 -10.407 -4 ,30488 ,TETRA ,17601538,Sun Nov 28 14:58:45 CET,Sun Nov 28 16:48:34 CET,0.0 2.416 3.036 3.493 3.913 4.263 4.521 4.728 5.11 5.299 5.468 5.605 5.9 6.036 6.277 6.498 6.724 6.827 7.008 7.197 7.459 7.619 7.787 8.024 8.25 8.479 8.689 8.867 9.086 9.296 9.511 9.781 10.01 10.227 10.475 10.711 10.916 11.146 11.384 11.611 11.82 12.084 12.413 12.684 12.937 13.145 13.355 13.485 13.467 13.27 12.6 11.519 10.448 9.482 8.614 7.825 7.112 6.449 5.884 5.3 4.795 4.332 3.819 3.298 2.839 2.446 2.06 1.707 1.363 0.973 0.582 0.3 0.018 -0.291 -0.529 -0.789 -1.056 -1.314 -1.599 -1.805 -2.012 -2.323 -2.547 -2.787 -2.913 -3.158 -3.421 -3.709 -3.863 -4.189 -4.377 -4.573 -4.777 -5.247 -5.492 -5.727 -6.022 -6.354 -6.75 -7.314 -9.845 -5 ,155 ,TETRA ,17601539,Sun Nov 28 14:58:42 CET,Sun Nov 28 16:48:12 CET,0.0 2.762 3.264 3.614 3.916 4.174 4.422 4.65 5.04 5.199 5.341 5.467 5.744 5.872 6.118 6.336 6.537 6.636 6.846 7.04 7.295 7.472 7.625 7.834 8.048 8.244 8.43 8.606 8.821 9.015 9.208 9.455 9.698 9.93 10.208 10.495 10.737 10.976 11.203 11.449 11.686 11.95 12.242 12.504 12.774 13.051 13.295 13.439 13.488 13.297 12.643 11.555 10.486 9.511 8.623 7.794 7.044 6.38 5.821 5.201 4.611 4.115 3.657 3.215 2.808 2.438 2.038 1.668 1.372 1.07 0.753 0.489 0.2 -0.087 -0.314 -0.564 -0.832 -1.132 -1.459 -1.675 -1.889 -2.217 -2.445 -2.681 -2.805 -3.069 -3.341 -3.633 -3.797 -4.127 -4.308 -4.503 -4.718 -5.169 -5.408 -5.679 -6.01 -6.389 -6.806 -7.366 -10.742 -6 ,366 ,TETRA ,17601540,Sun Nov 28 14:58:47 CET,Sun Nov 28 16:48:08 CET,0.0 2.337 2.886 3.252 3.516 3.747 3.962 4.171 4.574 4.762 4.936 5.102 5.399 5.533 5.785 6.018 6.237 6.333 6.515 6.701 6.974 7.136 7.289 7.519 7.725 7.918 8.118 8.311 8.562 8.798 8.993 9.223 9.428 9.618 9.871 10.143 10.361 10.584 10.83 11.089 11.331 11.589 11.866 12.099 12.334 12.577 12.797 12.942 12.953 12.697 12.038 10.97 9.938 8.983 8.07 7.257 6.558 5.883 5.281 4.671 4.135 3.661 3.229 2.822 2.406 2.018 1.625 1.277 0.965 0.639 0.294 0.0 -0.31 -0.625 -0.864 -1.105 -1.356 -1.626 -1.909 -2.112 -2.319 -2.635 -2.863 -3.102 -3.227 -3.487 -3.765 -4.08 -4.243 -4.56 -4.728 -4.908 -5.1 -5.554 -5.816 -6.098 -6.405 -6.771 -7.209 -7.739 -10.506 -7 ,27966 ,TETRA ,17601541,Sun Nov 28 14:58:44 CET,Sun Nov 28 16:48:34 CET,0.0 2.779 3.242 3.541 3.823 4.097 4.343 4.567 4.97 5.137 5.295 5.47 5.764 5.885 6.116 6.347 6.568 6.663 6.835 7.02 7.303 7.477 7.643 7.888 8.11 8.299 8.482 8.671 8.904 9.114 9.314 9.55 9.766 9.986 10.234 10.471 10.71 11.018 11.314 11.562 11.799 12.052 12.324 12.564 12.82 13.074 13.323 13.516 13.576 13.362 12.68 11.566 10.497 9.5 8.642 7.834 7.055 6.369 5.806 5.228 4.715 4.244 3.804 3.386 2.977 2.609 2.232 1.891 1.584 1.25 0.909 0.656 0.39 0.075 -0.178 -0.442 -0.724 -1.004 -1.308 -1.544 -1.78 -2.099 -2.309 -2.541 -2.665 -2.904 -3.159 -3.445 -3.604 -3.939 -4.154 -4.359 -4.559 -4.985 -5.207 -5.462 -5.737 -6.039 -6.478 -7.085 -9.278 -8 ,32673 ,TETRA ,17601542,Sun Nov 28 14:58:44 CET,Sun Nov 28 16:47:50 CET,0.0 2.026 2.644 3.118 3.457 3.715 3.945 4.154 4.532 4.701 4.856 4.975 5.257 5.381 5.624 5.871 6.112 6.222 6.415 6.603 6.882 7.045 7.191 7.395 7.597 7.802 7.986 8.159 8.393 8.612 8.824 9.085 9.329 9.562 9.804 10.064 10.311 10.55 10.806 11.059 11.305 11.573 11.857 12.111 12.406 12.7 12.903 13.023 13.052 12.858 12.199 11.147 10.107 9.125 8.222 7.362 6.611 5.939 5.348 4.742 4.212 3.744 3.303 2.879 2.483 2.124 1.745 1.397 1.087 0.76 0.421 0.134 -0.166 -0.472 -0.709 -0.963 -1.233 -1.517 -1.8 -1.995 -2.216 -2.565 -2.789 -3.024 -3.15 -3.409 -3.69 -4.004 -4.163 -4.475 -4.685 -4.906 -5.133 -5.601 -5.852 -6.152 -6.494 -6.838 -7.188 -7.772 -11.334 -9 ,11182 ,TETRA ,17601543,Sun Nov 28 14:58:44 CET,Sun Nov 28 16:47:50 CET,0.0 2.158 2.762 3.202 3.535 3.808 4.046 4.266 4.669 4.871 5.073 5.273 5.599 5.776 6.099 6.347 6.579 6.689 6.871 7.047 7.315 7.468 7.608 7.831 8.036 8.231 8.423 8.608 8.852 9.072 9.276 9.5 9.71 9.913 10.126 10.361 10.59 10.831 11.078 11.317 11.54 11.782 12.038 12.269 12.538 12.789 12.962 13.052 13.041 12.854 12.227 11.086 10.007 9.023 8.121 7.3 6.563 5.882 5.279 4.701 4.173 3.663 3.199 2.773 2.379 2.016 1.606 1.21 0.862 0.506 0.143 -0.159 -0.465 -0.769 -1.003 -1.244 -1.504 -1.779 -2.047 -2.243 -2.466 -2.814 -3.06 -3.319 -3.449 -3.728 -4.021 -4.345 -4.508 -4.827 -5.016 -5.199 -5.379 -5.821 -6.122 -6.491 -6.902 -7.333 -7.894 -8.724 -12.15 -10 ,20370 ,TETRA ,17601544,Sun Nov 28 14:58:47 CET,Sun Nov 28 16:48:10 CET,0.0 3.881 4.589 4.984 5.29 5.56 5.804 6.05 6.453 6.629 6.811 6.995 7.299 7.443 7.688 7.914 8.154 8.267 8.473 8.678 8.97 9.141 9.302 9.524 9.726 9.919 10.106 10.284 10.513 10.737 10.946 11.179 11.394 11.599 11.845 12.104 12.332 12.583 12.824 13.065 13.331 13.62 13.899 14.135 14.396 14.638 14.856 15.028 15.057 14.821 14.151 13.054 11.979 10.982 10.097 9.258 8.511 7.84 7.24 6.616 6.072 5.562 5.037 4.534 4.103 3.735 3.315 2.932 2.626 2.331 2.018 1.722 1.398 1.085 0.84 0.567 0.284 -0.007 -0.287 -0.507 -0.751 -1.086 -1.309 -1.539 -1.665 -1.923 -2.195 -2.501 -2.664 -2.997 -3.241 -3.475 -3.699 -4.152 -4.398 -4.66 -4.993 -5.408 -5.958 -6.707 -9.173 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_67_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_67_26.txt deleted file mode 100644 index 71eb6a62..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_67_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24033 ,TETRA ,17601545,Sun Nov 28 14:58:49 CET,Sun Nov 28 16:48:34 CET,0.0 1.815 2.3 2.668 2.972 3.243 3.466 3.665 4.041 4.216 4.38 4.55 4.82 4.956 5.197 5.411 5.625 5.731 5.936 6.137 6.415 6.595 6.775 7.024 7.256 7.478 7.694 7.912 8.199 8.469 8.727 9.023 9.301 9.573 9.878 10.238 10.595 10.967 11.344 11.75 12.198 12.69 13.263 13.848 14.529 15.265 16.105 17.067 18.15 19.335 20.604 21.456 21.762 21.816 21.735 21.599 21.432 21.226 21.007 20.742 20.511 20.253 19.942 19.66 19.41 19.157 18.882 18.654 18.469 18.282 18.066 17.876 17.689 17.5 17.344 17.16 16.979 16.784 16.578 16.434 16.277 16.012 15.809 15.606 15.508 15.323 15.107 14.861 14.744 14.505 14.383 14.261 14.119 13.752 13.554 13.32 13.049 12.77 12.387 11.842 9.245 -2 ,17333 ,TETRA ,17601546,Sun Nov 28 14:58:43 CET,Sun Nov 28 16:48:48 CET,0.0 2.046 2.575 2.974 3.297 3.542 3.765 3.975 4.32 4.477 4.636 4.788 5.037 5.153 5.399 5.625 5.825 5.924 6.123 6.327 6.605 6.766 6.928 7.165 7.393 7.621 7.834 8.027 8.287 8.547 8.793 9.093 9.387 9.656 9.965 10.327 10.679 11.067 11.474 11.899 12.336 12.825 13.396 13.964 14.627 15.363 16.231 17.194 18.214 19.304 20.52 21.299 21.589 21.685 21.661 21.55 21.391 21.207 21.011 20.785 20.577 20.373 20.164 19.973 19.783 19.575 19.345 19.143 18.96 18.766 18.571 18.393 18.198 17.984 17.809 17.638 17.462 17.274 17.09 16.955 16.812 16.587 16.432 16.268 16.18 15.993 15.794 15.586 15.462 15.21 15.081 14.945 14.793 14.443 14.239 14.021 13.785 13.522 13.166 12.631 10.636 -3 ,11656 ,TETRA ,17601547,Sun Nov 28 14:58:45 CET,Sun Nov 28 16:49:01 CET,0.0 1.841 2.318 2.682 3.004 3.292 3.533 3.739 4.105 4.265 4.418 4.569 4.826 4.947 5.182 5.409 5.623 5.723 5.928 6.126 6.405 6.579 6.741 6.969 7.18 7.388 7.602 7.811 8.07 8.319 8.567 8.862 9.145 9.419 9.734 10.085 10.415 10.77 11.169 11.612 12.079 12.591 13.167 13.744 14.395 15.128 15.945 16.865 17.949 19.129 20.44 21.382 21.748 21.847 21.841 21.735 21.533 21.287 21.05 20.811 20.603 20.398 20.164 19.93 19.708 19.497 19.263 19.044 18.852 18.649 18.438 18.262 18.051 17.814 17.641 17.459 17.254 17.062 16.883 16.753 16.604 16.361 16.201 16.036 15.941 15.739 15.535 15.321 15.203 14.954 14.81 14.659 14.474 14.079 13.855 13.59 13.288 12.935 12.488 11.872 9.893 -4 ,5603 ,TETRA ,17601548,Sun Nov 28 14:58:44 CET,Sun Nov 28 16:48:36 CET,0.0 2.1 2.535 2.866 3.11 3.337 3.549 3.726 4.059 4.218 4.363 4.515 4.787 4.919 5.169 5.4 5.619 5.728 5.935 6.141 6.457 6.649 6.843 7.141 7.419 7.687 7.927 8.162 8.473 8.747 9.012 9.346 9.681 10.007 10.373 10.768 11.134 11.537 11.937 12.35 12.804 13.312 13.881 14.45 15.124 15.863 16.712 17.639 18.68 19.861 21.147 21.973 22.262 22.29 22.194 22.05 21.864 21.658 21.442 21.2 20.981 20.761 20.547 20.345 20.147 19.963 19.762 19.558 19.372 19.157 18.944 18.78 18.597 18.413 18.265 18.108 17.95 17.775 17.583 17.445 17.297 17.051 16.884 16.712 16.622 16.43 16.217 15.998 15.88 15.627 15.48 15.343 15.207 14.93 14.773 14.585 14.362 14.102 13.762 13.315 11.819 -5 ,2932 ,TETRA ,17601549,Sun Nov 28 14:59:09 CET,Sun Nov 28 16:48:36 CET,0.0 1.89 2.341 2.691 2.975 3.205 3.401 3.57 3.878 4.016 4.156 4.324 4.608 4.766 5.06 5.317 5.54 5.635 5.842 6.051 6.322 6.481 6.643 6.887 7.111 7.342 7.566 7.77 8.031 8.282 8.524 8.821 9.113 9.377 9.68 10.026 10.357 10.73 11.125 11.538 11.976 12.466 13.042 13.613 14.271 15.014 15.847 16.692 17.55 18.572 19.881 20.825 21.176 21.239 21.176 21.044 20.866 20.649 20.446 20.219 19.991 19.77 19.531 19.311 19.124 18.917 18.686 18.484 18.304 18.115 17.898 17.708 17.521 17.331 17.183 17.02 16.841 16.652 16.46 16.327 16.185 15.968 15.801 15.626 15.533 15.317 15.1 14.883 14.762 14.51 14.35 14.196 14.037 13.693 13.512 13.304 13.08 12.82 12.473 12.032 10.848 -6 ,9986 ,TETRA ,17601550,Sun Nov 28 14:59:09 CET,Sun Nov 28 16:48:42 CET,0.0 1.001 1.387 1.666 1.954 2.232 2.46 2.661 3.03 3.199 3.362 3.558 3.833 3.97 4.252 4.513 4.74 4.849 5.064 5.271 5.585 5.795 5.989 6.245 6.494 6.751 6.995 7.226 7.531 7.818 8.09 8.415 8.73 9.044 9.392 9.771 10.143 10.566 11.023 11.504 12.023 12.592 13.225 13.88 14.653 15.462 16.369 17.393 18.564 19.878 21.297 22.198 22.567 22.714 22.701 22.557 22.347 22.12 21.915 21.68 21.439 21.213 21.008 20.806 20.591 20.388 20.169 19.948 19.74 19.515 19.281 19.086 18.898 18.705 18.55 18.383 18.205 18.016 17.794 17.636 17.473 17.23 17.056 16.869 16.78 16.599 16.412 16.192 16.069 15.818 15.641 15.482 15.324 14.981 14.771 14.544 14.3 13.989 13.62 13.083 10.453 -7 ,2955 ,TETRA ,17601551,Sun Nov 28 14:59:10 CET,Sun Nov 28 16:49:01 CET,0.0 1.73 2.321 2.811 3.152 3.405 3.621 3.796 4.09 4.227 4.374 4.512 4.77 4.893 5.11 5.325 5.533 5.632 5.832 6.029 6.301 6.462 6.619 6.849 7.084 7.31 7.52 7.724 7.978 8.219 8.459 8.766 9.062 9.345 9.66 10.017 10.374 10.76 11.155 11.567 12.029 12.543 13.108 13.684 14.37 15.118 15.99 16.964 18.02 19.229 20.565 21.394 21.732 21.807 21.725 21.565 21.381 21.178 20.987 20.743 20.491 20.269 20.039 19.813 19.619 19.442 19.243 19.057 18.883 18.668 18.452 18.293 18.107 17.907 17.767 17.627 17.471 17.303 17.123 16.996 16.856 16.627 16.463 16.298 16.216 16.034 15.835 15.63 15.521 15.292 15.184 15.056 14.916 14.59 14.382 14.158 13.879 13.57 13.209 12.738 10.44 -8 ,2071 ,TETRA ,17601552,Sun Nov 28 14:59:13 CET,Sun Nov 28 16:50:02 CET,0.0 0.984 1.447 1.757 2.018 2.25 2.465 2.655 2.975 3.121 3.266 3.385 3.64 3.775 4.039 4.264 4.462 4.558 4.751 4.959 5.258 5.442 5.616 5.86 6.083 6.294 6.507 6.718 6.973 7.22 7.468 7.767 8.048 8.329 8.675 9.05 9.412 9.824 10.245 10.683 11.132 11.614 12.186 12.754 13.418 14.169 15.017 15.962 17.014 18.183 19.492 20.285 20.607 20.732 20.699 20.568 20.409 20.169 19.877 19.576 19.347 19.148 18.933 18.712 18.5 18.316 18.125 17.938 17.762 17.578 17.362 17.157 16.957 16.749 16.582 16.407 16.198 15.968 15.733 15.564 15.382 15.106 14.917 14.712 14.606 14.382 14.137 13.886 13.745 13.469 13.287 13.121 12.951 12.584 12.364 12.118 11.847 11.531 11.114 10.537 8.799 -9 ,3205 ,TETRA ,17601553,Sun Nov 28 14:59:14 CET,Sun Nov 28 16:49:50 CET,0.0 1.97 2.66 3.038 3.332 3.595 3.86 4.124 4.608 4.825 5.026 5.227 5.497 5.638 5.92 6.199 6.439 6.549 6.761 6.967 7.272 7.467 7.655 7.926 8.197 8.449 8.677 8.905 9.2 9.487 9.761 10.086 10.405 10.719 11.089 11.497 11.872 12.277 12.706 13.178 13.682 14.237 14.894 15.553 16.281 17.047 17.937 18.932 20.061 21.368 22.8 23.724 24.044 24.078 23.979 23.836 23.673 23.474 23.245 22.961 22.709 22.473 22.226 21.988 21.744 21.501 21.23 20.968 20.736 20.508 20.271 20.064 19.849 19.628 19.453 19.26 19.054 18.839 18.611 18.457 18.298 18.051 17.87 17.685 17.594 17.383 17.155 16.878 16.718 16.426 16.198 16.028 15.857 15.486 15.287 15.087 14.841 14.557 14.206 13.721 12.151 -10 ,17033 ,TETRA ,17601554,Sun Nov 28 14:59:10 CET,Sun Nov 28 16:48:44 CET,0.0 1.577 2.034 2.407 2.708 2.958 3.214 3.439 3.844 4.029 4.19 4.388 4.672 4.821 5.089 5.318 5.541 5.659 5.89 6.092 6.381 6.574 6.756 7.011 7.249 7.478 7.703 7.916 8.18 8.436 8.679 8.981 9.28 9.559 9.879 10.229 10.557 10.928 11.32 11.725 12.174 12.679 13.241 13.808 14.491 15.254 16.103 17.022 18.108 19.384 20.733 21.573 21.895 21.977 21.938 21.831 21.686 21.497 21.279 21.041 20.816 20.579 20.353 20.151 19.959 19.759 19.523 19.315 19.126 18.92 18.717 18.546 18.358 18.169 18.029 17.878 17.693 17.471 17.274 17.161 17.03 16.785 16.609 16.444 16.357 16.175 15.983 15.76 15.644 15.418 15.309 15.192 15.061 14.726 14.536 14.321 14.105 13.854 13.493 12.996 11.061 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_67_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_67_37.txt deleted file mode 100644 index 65286f32..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_67_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26352 ,TETRA ,17601555,Sun Nov 28 14:59:13 CET,Sun Nov 28 16:48:36 CET,0.0 1.518 1.951 2.284 2.567 2.805 3.014 3.193 3.523 3.696 3.857 3.984 4.208 4.306 4.506 4.728 4.943 5.026 5.179 5.324 5.531 5.679 5.823 6.015 6.175 6.309 6.438 6.581 6.777 6.941 7.085 7.255 7.427 7.592 7.744 7.881 8.006 8.144 8.297 8.392 8.422 8.438 8.407 8.313 8.132 7.855 7.428 6.834 5.908 4.424 1.972 -0.897 -3.222 -5.153 -6.745 -8.145 -9.381 -10.481 -11.382 -12.239 -12.96 -13.595 -14.183 -14.741 -15.268 -15.742 -16.227 -16.648 -17.016 -17.399 -17.786 -18.127 -18.484 -18.837 -19.109 -19.383 -19.665 -19.961 -20.241 -20.424 -20.631 -20.948 -21.157 -21.373 -21.487 -21.748 -22.013 -22.285 -22.433 -22.737 -22.908 -23.091 -23.265 -23.646 -23.871 -24.136 -24.439 -24.751 -25.115 -25.692 -27.216 -2 ,11114 ,TETRA ,17601556,Sun Nov 28 14:59:14 CET,Sun Nov 28 16:49:00 CET,0.0 1.287 1.624 1.884 2.134 2.363 2.542 2.7 2.989 3.122 3.246 3.325 3.569 3.66 3.832 3.994 4.134 4.205 4.345 4.473 4.654 4.758 4.841 4.968 5.084 5.191 5.313 5.437 5.594 5.736 5.859 6.007 6.137 6.244 6.36 6.479 6.578 6.694 6.815 6.908 6.976 7.042 7.069 7.033 6.968 6.807 6.479 5.919 5.055 3.68 1.269 -1.596 -3.934 -5.866 -7.483 -8.896 -10.097 -11.164 -12.075 -12.957 -13.727 -14.4 -15.03 -15.614 -16.13 -16.599 -17.081 -17.511 -17.893 -18.305 -18.727 -19.066 -19.435 -19.823 -20.104 -20.401 -20.703 -21.003 -21.306 -21.512 -21.747 -22.148 -22.42 -22.694 -22.833 -23.109 -23.399 -23.708 -23.863 -24.175 -24.345 -24.531 -24.712 -25.099 -25.312 -25.554 -25.81 -26.081 -26.474 -27.004 -28.535 -3 ,15807 ,TETRA ,17601557,Sun Nov 28 14:59:11 CET,Sun Nov 28 16:48:44 CET,0.0 0.623 0.953 1.217 1.404 1.579 1.739 1.879 2.144 2.256 2.355 2.407 2.627 2.715 2.893 3.055 3.204 3.272 3.398 3.532 3.727 3.85 3.967 4.112 4.235 4.356 4.456 4.525 4.617 4.71 4.806 4.918 5.007 5.074 5.169 5.305 5.4 5.486 5.56 5.622 5.694 5.762 5.823 5.826 5.724 5.503 5.139 4.617 3.82 2.501 0.156 -2.659 -4.961 -6.858 -8.439 -9.858 -11.094 -12.162 -13.059 -13.972 -14.735 -15.39 -16.011 -16.587 -17.115 -17.576 -18.065 -18.509 -18.879 -19.263 -19.651 -19.972 -20.322 -20.688 -20.978 -21.303 -21.622 -21.909 -22.199 -22.391 -22.584 -22.899 -23.121 -23.35 -23.468 -23.714 -23.976 -24.243 -24.367 -24.66 -24.829 -25.011 -25.203 -25.592 -25.788 -26.015 -26.263 -26.533 -26.873 -27.254 -28.022 -4 ,19884 ,TETRA ,17601558,Sun Nov 28 14:59:11 CET,Sun Nov 28 16:48:48 CET,0.0 0.66 1.009 1.275 1.485 1.651 1.821 1.994 2.299 2.438 2.56 2.646 2.884 2.981 3.142 3.285 3.43 3.518 3.681 3.811 4.002 4.107 4.202 4.341 4.446 4.537 4.622 4.705 4.819 4.941 5.046 5.139 5.211 5.284 5.355 5.415 5.462 5.496 5.547 5.624 5.677 5.672 5.614 5.495 5.325 5.067 4.619 3.964 3.014 1.542 -0.953 -3.812 -6.068 -7.919 -9.491 -10.859 -12.011 -13.03 -13.904 -14.749 -15.451 -16.075 -16.666 -17.219 -17.714 -18.158 -18.641 -19.06 -19.427 -19.826 -20.237 -20.573 -20.909 -21.247 -21.506 -21.772 -22.057 -22.363 -22.692 -22.92 -23.137 -23.461 -23.695 -23.943 -24.067 -24.328 -24.594 -24.874 -25.03 -25.338 -25.506 -25.67 -25.813 -26.135 -26.323 -26.518 -26.735 -26.998 -27.31 -27.698 -28.628 -5 ,7849 ,TETRA ,17601559,Sun Nov 28 14:59:13 CET,Sun Nov 28 16:48:40 CET,0.0 1.26 1.637 1.923 2.169 2.355 2.496 2.619 2.844 2.943 3.028 3.045 3.245 3.32 3.475 3.612 3.724 3.778 3.887 3.992 4.143 4.227 4.3 4.401 4.508 4.618 4.711 4.793 4.894 4.987 5.073 5.172 5.251 5.316 5.383 5.462 5.569 5.699 5.837 5.935 6.005 6.062 6.063 6.017 5.904 5.716 5.386 4.816 3.932 2.539 0.072 -2.804 -5.099 -7.029 -8.67 -10.102 -11.325 -12.408 -13.332 -14.228 -14.986 -15.684 -16.337 -16.92 -17.449 -17.918 -18.417 -18.864 -19.245 -19.647 -20.061 -20.415 -20.787 -21.168 -21.46 -21.761 -22.078 -22.402 -22.735 -22.962 -23.192 -23.552 -23.798 -24.052 -24.184 -24.456 -24.741 -25.04 -25.194 -25.499 -25.638 -25.801 -25.968 -26.334 -26.527 -26.726 -26.959 -27.239 -27.57 -27.98 -28.898 -6 ,4890 ,TETRA ,17601560,Sun Nov 28 14:59:15 CET,Sun Nov 28 16:48:46 CET,0.0 0.917 1.305 1.58 1.796 1.984 2.168 2.348 2.651 2.772 2.894 3.008 3.241 3.334 3.517 3.67 3.806 3.874 4.001 4.123 4.304 4.423 4.514 4.633 4.756 4.862 4.955 5.044 5.17 5.291 5.396 5.504 5.592 5.677 5.775 5.866 5.933 5.99 6.031 6.079 6.106 6.103 6.057 5.96 5.807 5.561 5.155 4.524 3.572 2.145 -0.257 -3.137 -5.417 -7.297 -8.883 -10.265 -11.455 -12.526 -13.445 -14.336 -15.084 -15.747 -16.389 -16.987 -17.522 -17.994 -18.487 -18.932 -19.312 -19.719 -20.155 -20.509 -20.87 -21.238 -21.523 -21.811 -22.111 -22.424 -22.738 -22.955 -23.186 -23.522 -23.736 -23.967 -24.092 -24.353 -24.627 -24.925 -25.079 -25.395 -25.558 -25.726 -25.922 -26.366 -26.595 -26.833 -27.099 -27.427 -27.751 -28.168 -29.167 -7 ,31724 ,TETRA ,17601561,Sun Nov 28 14:59:17 CET,Sun Nov 28 16:48:39 CET,0.0 0.7 1.099 1.433 1.647 1.842 2.034 2.217 2.539 2.667 2.78 2.866 3.108 3.207 3.398 3.588 3.755 3.834 3.977 4.095 4.259 4.365 4.46 4.582 4.694 4.802 4.898 4.985 5.095 5.21 5.32 5.425 5.504 5.581 5.684 5.786 5.856 5.907 5.952 5.996 6.016 5.972 5.9 5.892 5.812 5.548 5.124 4.551 3.756 2.431 0.071 -2.717 -4.949 -6.864 -8.49 -9.936 -11.182 -12.222 -13.105 -13.987 -14.717 -15.379 -16.013 -16.575 -17.097 -17.583 -18.07 -18.501 -18.874 -19.249 -19.629 -19.936 -20.258 -20.605 -20.868 -21.128 -21.399 -21.687 -21.984 -22.195 -22.412 -22.737 -22.955 -23.184 -23.314 -23.6 -23.893 -24.2 -24.357 -24.672 -24.811 -24.967 -25.137 -25.458 -25.626 -25.823 -26.032 -26.278 -26.605 -27.008 -27.998 -8 ,18294 ,TETRA ,17601562,Sun Nov 28 14:59:11 CET,Sun Nov 28 16:48:37 CET,0.0 1.06 1.387 1.64 1.833 1.971 2.079 2.18 2.369 2.468 2.568 2.62 2.832 2.919 3.099 3.231 3.339 3.404 3.545 3.661 3.821 3.922 4.012 4.148 4.267 4.362 4.452 4.537 4.642 4.731 4.82 4.913 4.987 5.069 5.15 5.226 5.326 5.437 5.544 5.624 5.681 5.724 5.716 5.666 5.545 5.346 4.997 4.447 3.61 2.257 -0.124 -2.996 -5.283 -7.21 -8.864 -10.278 -11.469 -12.554 -13.481 -14.4 -15.186 -15.876 -16.509 -17.084 -17.632 -18.144 -18.672 -19.115 -19.489 -19.89 -20.306 -20.646 -20.986 -21.346 -21.626 -21.903 -22.192 -22.493 -22.794 -23.009 -23.252 -23.632 -23.877 -24.123 -24.255 -24.537 -24.829 -25.152 -25.314 -25.639 -25.812 -25.977 -26.152 -26.542 -26.754 -26.978 -27.219 -27.499 -27.85 -28.27 -29.125 -9 ,30339 ,TETRA ,17601563,Sun Nov 28 14:59:12 CET,Sun Nov 28 16:48:40 CET,0.0 0.819 1.143 1.381 1.581 1.765 1.947 2.104 2.35 2.469 2.591 2.674 2.923 3.032 3.241 3.438 3.606 3.682 3.814 3.922 4.074 4.173 4.27 4.422 4.563 4.678 4.769 4.853 4.955 5.047 5.128 5.209 5.274 5.356 5.463 5.55 5.607 5.65 5.704 5.768 5.828 5.867 5.857 5.774 5.598 5.345 4.995 4.436 3.505 2.057 -0.291 -3.092 -5.403 -7.328 -8.926 -10.31 -11.493 -12.52 -13.39 -14.246 -14.968 -15.586 -16.166 -16.716 -17.229 -17.706 -18.183 -18.601 -18.983 -19.39 -19.805 -20.156 -20.521 -20.896 -21.182 -21.479 -21.77 -22.037 -22.321 -22.518 -22.725 -23.071 -23.299 -23.541 -23.671 -23.925 -24.182 -24.448 -24.591 -24.906 -25.066 -25.24 -25.418 -25.79 -26.001 -26.246 -26.541 -26.876 -27.283 -27.694 -28.556 -10 ,15669 ,TETRA ,17601564,Sun Nov 28 14:59:13 CET,Sun Nov 28 16:48:59 CET,0.0 1.244 1.528 1.793 1.985 2.127 2.269 2.426 2.726 2.85 2.961 3.057 3.294 3.392 3.586 3.762 3.918 3.991 4.123 4.248 4.418 4.528 4.636 4.78 4.912 5.023 5.12 5.211 5.313 5.405 5.496 5.594 5.66 5.721 5.798 5.867 5.91 5.961 6.015 6.035 6.03 6.0 5.939 5.834 5.664 5.449 5.116 4.624 3.846 2.484 0.111 -2.768 -5.089 -6.974 -8.57 -9.964 -11.152 -12.214 -13.125 -14.049 -14.818 -15.477 -16.11 -16.684 -17.211 -17.691 -18.191 -18.633 -19.022 -19.432 -19.857 -20.209 -20.556 -20.888 -21.143 -21.416 -21.706 -22.007 -22.3 -22.497 -22.703 -23.028 -23.248 -23.466 -23.577 -23.816 -24.092 -24.373 -24.507 -24.806 -24.956 -25.135 -25.324 -25.73 -25.946 -26.179 -26.423 -26.685 -26.995 -27.408 -28.33 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_67_60.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_67_60.txt deleted file mode 100644 index 337111fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_67_60.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24979 ,KEBNE ,17027237,Wed Dec 22 16:39:59 CET,Wed Dec 22 18:15:13 CET,0.0 0.78 1.093 1.358 1.582 1.764 1.931 2.087 2.375 2.513 2.632 2.69 2.893 2.973 3.137 3.275 3.401 3.466 3.603 3.725 3.875 3.973 4.061 4.174 4.292 4.4 4.503 4.606 4.723 4.814 4.906 5.016 5.104 5.184 5.284 5.384 5.463 5.54 5.616 5.7 5.765 5.811 5.826 5.756 5.613 5.403 5.057 4.536 3.711 2.365 0.071 -2.608 -4.795 -6.655 -8.167 -9.457 -10.57 -11.544 -12.364 -13.161 -13.845 -14.444 -15.004 -15.538 -16.048 -16.52 -16.991 -17.418 -17.787 -18.143 -18.527 -18.843 -19.144 -19.458 -19.71 -19.966 -20.234 -20.523 -20.815 -21.015 -21.226 -21.54 -21.751 -21.964 -22.076 -22.308 -22.554 -22.826 -22.963 -23.253 -23.39 -23.555 -23.735 -24.095 -24.283 -24.475 -24.71 -24.991 -25.3 -25.703 -26.617 -2 ,21895 ,KEBNE ,17027238,Wed Dec 22 16:39:59 CET,Wed Dec 22 18:14:02 CET,0.0 1.225 1.75 2.117 2.38 2.583 2.75 2.922 3.263 3.413 3.54 3.63 3.85 3.939 4.114 4.276 4.427 4.498 4.63 4.753 4.926 5.025 5.116 5.251 5.37 5.488 5.604 5.708 5.834 5.95 6.051 6.143 6.23 6.323 6.417 6.515 6.593 6.663 6.725 6.783 6.847 6.862 6.807 6.722 6.57 6.327 5.929 5.338 4.462 3.103 0.783 -1.988 -4.213 -6.069 -7.614 -8.933 -10.055 -11.062 -11.893 -12.695 -13.413 -14.035 -14.584 -15.123 -15.652 -16.128 -16.623 -17.062 -17.407 -17.758 -18.151 -18.477 -18.807 -19.134 -19.382 -19.654 -19.93 -20.201 -20.499 -20.717 -20.934 -21.247 -21.467 -21.708 -21.83 -22.076 -22.334 -22.602 -22.741 -23.048 -23.198 -23.343 -23.489 -23.812 -23.985 -24.169 -24.394 -24.669 -25.019 -25.449 -26.487 -3 ,20073 ,KEBNE ,17027239,Wed Dec 22 16:39:58 CET,Wed Dec 22 18:14:20 CET,0.0 0.807 1.149 1.399 1.639 1.867 2.037 2.158 2.422 2.556 2.683 2.764 2.972 3.054 3.225 3.364 3.483 3.548 3.672 3.791 3.963 4.068 4.175 4.318 4.435 4.542 4.641 4.74 4.847 4.929 5.022 5.15 5.261 5.349 5.431 5.521 5.615 5.701 5.786 5.852 5.902 5.937 5.923 5.862 5.724 5.488 5.1 4.54 3.709 2.353 -0.001 -2.738 -4.966 -6.766 -8.255 -9.563 -10.667 -11.644 -12.475 -13.289 -13.97 -14.572 -15.134 -15.667 -16.179 -16.644 -17.113 -17.533 -17.897 -18.264 -18.645 -18.958 -19.277 -19.613 -19.89 -20.161 -20.417 -20.683 -20.964 -21.167 -21.372 -21.684 -21.915 -22.154 -22.267 -22.505 -22.774 -23.059 -23.204 -23.497 -23.614 -23.757 -23.907 -24.224 -24.405 -24.61 -24.833 -25.058 -25.289 -25.657 -26.452 -4 ,20799 ,KEBNE ,17027240,Wed Dec 22 16:39:59 CET,Wed Dec 22 18:13:35 CET,0.0 0.939 1.348 1.615 1.836 2.045 2.219 2.381 2.66 2.779 2.906 3.019 3.248 3.345 3.529 3.687 3.817 3.876 4.001 4.125 4.283 4.377 4.476 4.614 4.734 4.845 4.956 5.066 5.187 5.287 5.384 5.5 5.606 5.695 5.778 5.851 5.902 5.959 6.031 6.097 6.126 6.115 6.072 6.013 5.943 5.748 5.382 4.851 3.977 2.64 0.362 -2.289 -4.422 -6.276 -7.794 -9.11 -10.225 -11.181 -12.004 -12.837 -13.531 -14.128 -14.713 -15.267 -15.757 -16.199 -16.674 -17.101 -17.452 -17.819 -18.204 -18.52 -18.852 -19.208 -19.488 -19.76 -20.042 -20.335 -20.648 -20.871 -21.097 -21.44 -21.68 -21.925 -22.04 -22.268 -22.527 -22.806 -22.945 -23.247 -23.405 -23.57 -23.751 -24.15 -24.365 -24.611 -24.896 -25.202 -25.585 -26.048 -27.073 -5 ,18635 ,KEBNE ,17027241,Wed Dec 22 16:40:00 CET,Wed Dec 22 18:13:51 CET,0.0 0.921 1.234 1.454 1.661 1.866 2.025 2.172 2.468 2.597 2.712 2.791 3.014 3.101 3.273 3.434 3.566 3.629 3.761 3.889 4.047 4.15 4.253 4.387 4.513 4.629 4.744 4.847 4.961 5.067 5.167 5.275 5.378 5.488 5.591 5.68 5.755 5.825 5.892 5.94 5.966 5.964 5.925 5.832 5.685 5.443 5.053 4.496 3.623 2.242 -0.087 -2.779 -5.01 -6.886 -8.392 -9.724 -10.852 -11.82 -12.688 -13.552 -14.248 -14.854 -15.426 -15.974 -16.517 -17.02 -17.546 -18.01 -18.381 -18.757 -19.146 -19.461 -19.797 -20.139 -20.388 -20.654 -20.947 -21.26 -21.568 -21.77 -21.983 -22.304 -22.515 -22.744 -22.867 -23.115 -23.377 -23.648 -23.78 -24.063 -24.189 -24.339 -24.487 -24.803 -24.99 -25.221 -25.462 -25.708 -26.013 -26.366 -27.287 -6 ,2047 ,KEBNE ,17027242,Wed Dec 22 16:39:59 CET,Wed Dec 22 18:13:54 CET,0.0 0.856 1.263 1.552 1.783 1.966 2.138 2.29 2.538 2.65 2.768 2.856 3.078 3.173 3.362 3.529 3.677 3.749 3.895 4.018 4.177 4.286 4.383 4.519 4.65 4.769 4.877 4.974 5.087 5.18 5.273 5.394 5.506 5.596 5.688 5.79 5.858 5.902 5.946 5.989 6.025 6.042 5.986 5.883 5.711 5.466 5.094 4.495 3.588 2.201 -0.091 -2.795 -4.967 -6.782 -8.285 -9.623 -10.766 -11.761 -12.609 -13.465 -14.184 -14.811 -15.394 -15.929 -16.436 -16.893 -17.357 -17.773 -18.138 -18.511 -18.894 -19.212 -19.529 -19.85 -20.104 -20.366 -20.638 -20.924 -21.217 -21.418 -21.62 -21.916 -22.126 -22.35 -22.47 -22.722 -22.969 -23.209 -23.342 -23.647 -23.8 -23.97 -24.132 -24.473 -24.653 -24.838 -25.055 -25.316 -25.641 -26.044 -27.375 -7 ,14093 ,KEBNE ,17027243,Wed Dec 22 16:39:58 CET,Wed Dec 22 18:13:33 CET,0.0 1.01 1.409 1.693 1.926 2.089 2.233 2.37 2.611 2.727 2.836 2.899 3.112 3.197 3.354 3.502 3.637 3.699 3.813 3.909 4.048 4.141 4.231 4.348 4.458 4.591 4.721 4.845 4.997 5.112 5.213 5.333 5.442 5.531 5.624 5.725 5.803 5.864 5.931 5.991 6.008 5.992 5.927 5.809 5.617 5.355 4.972 4.384 3.534 2.207 -0.051 -2.646 -4.799 -6.64 -8.151 -9.447 -10.548 -11.54 -12.393 -13.219 -13.971 -14.634 -15.197 -15.696 -16.153 -16.586 -17.032 -17.424 -17.775 -18.131 -18.483 -18.779 -19.097 -19.442 -19.699 -19.955 -20.22 -20.498 -20.789 -20.976 -21.176 -21.509 -21.74 -21.974 -22.093 -22.355 -22.633 -22.925 -23.072 -23.385 -23.557 -23.729 -23.913 -24.265 -24.453 -24.673 -24.928 -25.186 -25.464 -25.853 -26.586 -8 ,22159 ,KEBNE ,17027244,Wed Dec 22 16:40:00 CET,Wed Dec 22 18:13:57 CET,0.0 1.507 2.002 2.318 2.589 2.801 2.984 3.167 3.493 3.646 3.79 3.91 4.165 4.291 4.518 4.731 4.92 5.0 5.148 5.286 5.488 5.621 5.751 5.943 6.121 6.282 6.436 6.582 6.75 6.9 7.038 7.19 7.332 7.47 7.617 7.762 7.891 8.01 8.103 8.159 8.184 8.185 8.132 8.046 7.935 7.733 7.342 6.776 5.945 4.557 2.194 -0.518 -2.669 -4.454 -5.95 -7.253 -8.364 -9.367 -10.214 -11.026 -11.724 -12.35 -12.943 -13.481 -13.985 -14.446 -14.914 -15.333 -15.685 -16.047 -16.425 -16.733 -17.062 -17.4 -17.65 -17.906 -18.175 -18.466 -18.762 -18.956 -19.156 -19.472 -19.697 -19.933 -20.052 -20.292 -20.542 -20.808 -20.942 -21.231 -21.342 -21.498 -21.67 -22.05 -22.258 -22.464 -22.687 -22.932 -23.252 -23.661 -24.683 -9 ,4648 ,KEBNE ,17027245,Wed Dec 22 16:39:59 CET,Wed Dec 22 18:15:15 CET,0.0 0.875 1.223 1.489 1.686 1.863 2.017 2.157 2.428 2.56 2.682 2.743 2.969 3.065 3.253 3.422 3.567 3.639 3.767 3.872 4.026 4.121 4.206 4.342 4.475 4.591 4.688 4.771 4.891 5.002 5.103 5.219 5.316 5.416 5.518 5.601 5.671 5.738 5.797 5.85 5.881 5.877 5.828 5.748 5.603 5.331 4.898 4.324 3.452 2.052 -0.231 -2.917 -5.059 -6.865 -8.402 -9.743 -10.851 -11.798 -12.605 -13.416 -14.125 -14.738 -15.301 -15.846 -16.357 -16.821 -17.288 -17.682 -18.023 -18.381 -18.752 -19.061 -19.386 -19.72 -19.975 -20.232 -20.497 -20.772 -21.053 -21.244 -21.439 -21.725 -21.921 -22.143 -22.262 -22.492 -22.746 -23.026 -23.153 -23.439 -23.558 -23.695 -23.845 -24.183 -24.378 -24.591 -24.816 -25.064 -25.353 -25.722 -26.451 -10 ,16658 ,KEBNE ,17027246,Wed Dec 22 16:39:58 CET,Wed Dec 22 18:13:55 CET,0.0 0.793 1.158 1.458 1.707 1.931 2.116 2.27 2.559 2.69 2.816 2.915 3.141 3.23 3.409 3.582 3.726 3.795 3.938 4.07 4.229 4.321 4.419 4.584 4.754 4.888 4.987 5.082 5.207 5.312 5.416 5.542 5.635 5.712 5.801 5.906 5.989 6.057 6.138 6.192 6.225 6.243 6.2 6.097 5.946 5.736 5.381 4.824 3.939 2.557 0.267 -2.408 -4.556 -6.34 -7.832 -9.14 -10.268 -11.27 -12.099 -12.927 -13.688 -14.359 -14.96 -15.499 -16.014 -16.483 -16.937 -17.343 -17.701 -18.073 -18.457 -18.776 -19.121 -19.467 -19.718 -19.99 -20.271 -20.56 -20.868 -21.069 -21.262 -21.573 -21.805 -22.04 -22.152 -22.384 -22.639 -22.901 -23.033 -23.325 -23.464 -23.623 -23.779 -24.117 -24.307 -24.514 -24.723 -24.949 -25.262 -25.688 -26.823 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_68_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_68_54.txt deleted file mode 100644 index 289fd0d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_68_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9737 ,TETRA ,17601565,Sun Nov 28 14:59:15 CET,Sun Nov 28 16:48:45 CET,0.0 1.131 1.517 1.775 1.976 2.146 2.305 2.438 2.689 2.809 2.916 2.993 3.216 3.307 3.472 3.645 3.803 3.871 3.987 4.097 4.253 4.348 4.453 4.595 4.712 4.829 4.939 5.034 5.136 5.247 5.348 5.447 5.541 5.614 5.681 5.748 5.8 5.846 5.882 5.906 5.886 5.831 5.746 5.605 5.393 5.075 4.599 3.892 2.82 1.156 -1.608 -4.85 -7.438 -9.546 -11.281 -12.796 -14.111 -15.269 -16.262 -17.223 -18.034 -18.749 -19.415 -20.035 -20.602 -21.117 -21.638 -22.103 -22.528 -22.947 -23.363 -23.709 -24.067 -24.448 -24.731 -25.028 -25.339 -25.658 -25.995 -26.216 -26.435 -26.776 -27.027 -27.317 -27.463 -27.751 -28.052 -28.379 -28.541 -28.855 -29.033 -29.207 -29.395 -29.81 -30.034 -30.29 -30.597 -30.938 -31.295 -31.791 -33.695 -2 ,2307 ,TETRA ,17601566,Sun Nov 28 14:59:12 CET,Sun Nov 28 16:49:11 CET,0.0 2.266 2.701 3.022 3.294 3.528 3.71 3.857 4.156 4.307 4.448 4.556 4.779 4.88 5.082 5.262 5.395 5.456 5.587 5.705 5.864 5.956 6.039 6.177 6.301 6.397 6.488 6.577 6.686 6.774 6.861 6.968 7.045 7.105 7.19 7.266 7.308 7.347 7.382 7.396 7.365 7.322 7.251 7.148 6.951 6.621 6.145 5.469 4.429 2.773 -0.025 -3.32 -5.915 -8.02 -9.798 -11.373 -12.716 -13.866 -14.815 -15.751 -16.548 -17.257 -17.941 -18.581 -19.159 -19.682 -20.214 -20.678 -21.089 -21.516 -21.943 -22.286 -22.639 -23.004 -23.292 -23.597 -23.909 -24.25 -24.606 -24.829 -25.048 -25.39 -25.639 -25.898 -26.025 -26.284 -26.563 -26.873 -27.038 -27.364 -27.572 -27.756 -27.96 -28.429 -28.671 -28.925 -29.212 -29.541 -29.906 -30.409 -33.117 -3 ,15589 ,TETRA ,17601567,Sun Nov 28 14:59:14 CET,Sun Nov 28 16:49:09 CET,0.0 1.955 2.438 2.777 3.042 3.287 3.503 3.707 4.062 4.206 4.333 4.427 4.635 4.713 4.88 5.051 5.2 5.272 5.417 5.551 5.717 5.808 5.889 6.011 6.132 6.233 6.325 6.413 6.519 6.619 6.71 6.803 6.877 6.939 7.011 7.08 7.146 7.206 7.241 7.259 7.255 7.223 7.137 7.02 6.828 6.491 6.0 5.313 4.287 2.709 0.024 -3.115 -5.617 -7.734 -9.496 -10.991 -12.272 -13.435 -14.408 -15.362 -16.176 -16.902 -17.585 -18.215 -18.788 -19.307 -19.846 -20.3 -20.698 -21.118 -21.533 -21.879 -22.234 -22.619 -22.93 -23.227 -23.528 -23.846 -24.172 -24.403 -24.645 -25.002 -25.247 -25.493 -25.616 -25.888 -26.16 -26.456 -26.617 -26.937 -27.111 -27.284 -27.464 -27.86 -28.094 -28.354 -28.638 -28.948 -29.342 -29.893 -33.906 -4 ,24330 ,TETRA ,17601568,Sun Nov 28 14:59:16 CET,Sun Nov 28 16:49:29 CET,0.0 1.739 2.122 2.415 2.689 2.944 3.177 3.374 3.734 3.893 4.048 4.244 4.486 4.59 4.786 4.949 5.106 5.185 5.341 5.489 5.675 5.792 5.901 6.043 6.162 6.269 6.388 6.495 6.593 6.673 6.763 6.889 7.003 7.098 7.185 7.259 7.317 7.373 7.411 7.422 7.419 7.411 7.339 7.197 6.974 6.639 6.174 5.51 4.453 2.793 0.02 -3.224 -5.829 -7.975 -9.737 -11.253 -12.561 -13.74 -14.718 -15.662 -16.466 -17.161 -17.812 -18.423 -18.986 -19.493 -20.03 -20.497 -20.89 -21.295 -21.7 -22.033 -22.391 -22.771 -23.066 -23.364 -23.662 -23.988 -24.327 -24.549 -24.77 -25.126 -25.378 -25.629 -25.765 -26.055 -26.36 -26.687 -26.845 -27.164 -27.353 -27.536 -27.731 -28.17 -28.433 -28.719 -29.023 -29.325 -29.717 -30.286 -32.026 -5 ,31243 ,TETRA ,17601569,Sun Nov 28 14:59:18 CET,Sun Nov 28 16:49:07 CET,0.0 1.922 2.341 2.611 2.852 3.037 3.194 3.358 3.659 3.802 3.945 4.091 4.318 4.418 4.606 4.781 4.949 5.026 5.175 5.306 5.479 5.589 5.689 5.815 5.942 6.077 6.188 6.28 6.4 6.507 6.612 6.716 6.795 6.871 6.946 7.016 7.07 7.131 7.197 7.238 7.244 7.207 7.108 6.972 6.746 6.408 5.939 5.245 4.213 2.677 -0.045 -3.319 -5.964 -8.084 -9.842 -11.382 -12.67 -13.825 -14.802 -15.759 -16.574 -17.267 -17.918 -18.525 -19.07 -19.567 -20.083 -20.551 -20.964 -21.384 -21.814 -22.173 -22.553 -22.956 -23.26 -23.565 -23.899 -24.243 -24.572 -24.805 -25.051 -25.444 -25.733 -26.02 -26.158 -26.444 -26.748 -27.056 -27.214 -27.543 -27.719 -27.903 -28.116 -28.569 -28.827 -29.103 -29.383 -29.756 -30.203 -30.759 -33.237 -6 ,16102 ,TETRA ,17601570,Sun Nov 28 14:59:12 CET,Sun Nov 28 16:49:01 CET,0.0 1.934 2.304 2.532 2.753 2.98 3.158 3.319 3.615 3.758 3.893 3.99 4.208 4.293 4.474 4.643 4.793 4.864 4.996 5.12 5.3 5.413 5.506 5.639 5.772 5.884 5.988 6.094 6.225 6.327 6.402 6.481 6.552 6.638 6.747 6.823 6.874 6.927 6.956 6.962 6.941 6.888 6.801 6.661 6.426 6.085 5.596 4.886 3.747 2.02 -0.682 -3.868 -6.438 -8.51 -10.246 -11.72 -12.951 -14.103 -15.083 -16.021 -16.825 -17.528 -18.191 -18.8 -19.357 -19.864 -20.384 -20.846 -21.244 -21.667 -22.109 -22.467 -22.832 -23.212 -23.513 -23.817 -24.124 -24.43 -24.743 -24.969 -25.202 -25.548 -25.793 -26.05 -26.184 -26.477 -26.767 -27.075 -27.246 -27.566 -27.773 -27.997 -28.244 -28.775 -29.043 -29.326 -29.636 -29.987 -30.463 -31.062 -34.494 -7 ,30590 ,TETRA ,17601571,Sun Nov 28 14:59:13 CET,Sun Nov 28 16:48:38 CET,0.0 1.864 2.298 2.623 2.907 3.132 3.302 3.464 3.753 3.862 3.959 4.052 4.27 4.353 4.507 4.673 4.83 4.899 5.018 5.128 5.31 5.417 5.509 5.647 5.77 5.862 5.945 6.024 6.115 6.203 6.286 6.381 6.463 6.551 6.657 6.734 6.782 6.842 6.884 6.898 6.916 6.9 6.807 6.686 6.485 6.147 5.638 4.934 3.86 2.202 -0.505 -3.737 -6.348 -8.483 -10.264 -11.755 -13.012 -14.143 -15.111 -16.068 -16.868 -17.574 -18.251 -18.887 -19.463 -19.99 -20.566 -21.086 -21.526 -21.951 -22.36 -22.704 -23.071 -23.444 -23.724 -24.022 -24.342 -24.665 -24.99 -25.215 -25.443 -25.772 -26.013 -26.282 -26.42 -26.706 -27.001 -27.301 -27.469 -27.806 -27.993 -28.176 -28.388 -28.852 -29.104 -29.442 -29.824 -30.181 -30.6 -31.159 -33.2 -8 ,2022 ,TETRA ,17601572,Sun Nov 28 14:59:15 CET,Sun Nov 28 16:48:57 CET,0.0 2.484 2.994 3.387 3.694 3.939 4.156 4.362 4.713 4.86 4.988 5.077 5.281 5.365 5.529 5.695 5.883 5.969 6.102 6.222 6.398 6.513 6.622 6.753 6.866 6.971 7.074 7.172 7.285 7.388 7.477 7.58 7.674 7.747 7.817 7.907 7.98 8.023 8.074 8.111 8.111 8.084 7.982 7.822 7.599 7.264 6.734 6.01 4.948 3.306 0.527 -2.693 -5.23 -7.332 -9.069 -10.6 -11.893 -13.035 -14.014 -14.964 -15.757 -16.476 -17.147 -17.764 -18.348 -18.877 -19.431 -19.913 -20.315 -20.716 -21.114 -21.456 -21.836 -22.237 -22.544 -22.843 -23.163 -23.5 -23.823 -24.045 -24.279 -24.647 -24.903 -25.168 -25.303 -25.592 -25.895 -26.191 -26.342 -26.668 -26.887 -27.085 -27.279 -27.664 -27.88 -28.143 -28.418 -28.719 -29.146 -29.67 -31.351 -9 ,26284 ,TETRA ,17601573,Sun Nov 28 14:59:17 CET,Sun Nov 28 16:48:38 CET,0.0 1.966 2.464 2.784 3.023 3.257 3.458 3.637 3.952 4.09 4.226 4.335 4.554 4.651 4.844 5.021 5.179 5.251 5.378 5.489 5.627 5.717 5.81 5.94 6.057 6.151 6.231 6.309 6.422 6.534 6.636 6.758 6.862 6.956 7.058 7.146 7.186 7.202 7.224 7.243 7.227 7.183 7.091 6.961 6.742 6.401 5.89 5.133 4.053 2.388 -0.411 -3.62 -6.148 -8.25 -10.064 -11.623 -12.926 -14.072 -15.03 -15.998 -16.807 -17.505 -18.18 -18.812 -19.4 -19.928 -20.48 -20.973 -21.395 -21.828 -22.262 -22.62 -22.991 -23.364 -23.658 -23.955 -24.254 -24.573 -24.931 -25.174 -25.408 -25.771 -26.032 -26.295 -26.425 -26.694 -26.975 -27.277 -27.43 -27.746 -27.947 -28.134 -28.33 -28.782 -29.021 -29.279 -29.573 -29.906 -30.292 -30.763 -32.267 -10 ,21121 ,TETRA ,17601574,Sun Nov 28 14:59:13 CET,Sun Nov 28 16:48:36 CET,0.0 2.016 2.503 2.815 3.076 3.321 3.537 3.719 4.078 4.233 4.369 4.493 4.719 4.819 5.008 5.178 5.322 5.386 5.523 5.648 5.814 5.922 6.02 6.131 6.232 6.344 6.448 6.54 6.645 6.733 6.817 6.923 7.013 7.09 7.171 7.247 7.3 7.337 7.366 7.388 7.382 7.316 7.22 7.085 6.858 6.532 6.042 5.331 4.25 2.604 -0.17 -3.395 -5.937 -8.102 -9.871 -11.395 -12.729 -13.861 -14.843 -15.85 -16.683 -17.403 -18.085 -18.72 -19.29 -19.805 -20.331 -20.792 -21.193 -21.608 -22.036 -22.374 -22.715 -23.084 -23.371 -23.672 -23.988 -24.311 -24.633 -24.85 -25.072 -25.431 -25.692 -25.96 -26.093 -26.376 -26.662 -26.958 -27.118 -27.44 -27.632 -27.813 -28.005 -28.425 -28.667 -28.935 -29.216 -29.506 -29.868 -30.389 -32.767 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_68_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_68_64.txt deleted file mode 100644 index e7dd4de9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/MCL1/water/Summary_FEP_68_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31225 ,TETRA ,17601575,Sun Nov 28 14:59:15 CET,Sun Nov 28 16:48:45 CET,0.0 2.094 2.534 2.874 3.142 3.388 3.599 3.783 4.087 4.224 4.358 4.482 4.707 4.797 4.965 5.12 5.26 5.326 5.45 5.568 5.741 5.83 5.895 6.001 6.11 6.204 6.302 6.402 6.497 6.574 6.646 6.715 6.761 6.823 6.879 6.899 6.916 6.906 6.877 6.839 6.773 6.652 6.468 6.23 5.876 5.368 4.655 3.659 2.197 0.054 -3.374 -7.209 -10.156 -12.527 -14.48 -16.174 -17.61 -18.877 -19.954 -21.001 -21.892 -22.653 -23.343 -23.982 -24.575 -25.124 -25.676 -26.158 -26.583 -27.023 -27.487 -27.869 -28.246 -28.627 -28.928 -29.245 -29.57 -29.906 -30.242 -30.47 -30.707 -31.075 -31.341 -31.606 -31.736 -32.004 -32.284 -32.585 -32.745 -33.088 -33.323 -33.514 -33.705 -34.07 -34.27 -34.527 -34.83 -35.174 -35.579 -36.111 -38.458 -2 ,18786 ,TETRA ,17601576,Sun Nov 28 14:59:17 CET,Sun Nov 28 16:49:07 CET,0.0 2.809 3.271 3.543 3.775 3.973 4.181 4.363 4.643 4.767 4.871 4.949 5.158 5.242 5.395 5.536 5.675 5.737 5.865 5.991 6.152 6.243 6.32 6.427 6.53 6.625 6.707 6.787 6.888 6.97 7.038 7.126 7.193 7.238 7.288 7.332 7.363 7.358 7.328 7.296 7.226 7.094 6.879 6.602 6.206 5.666 4.951 3.995 2.577 0.448 -2.975 -6.798 -9.698 -12.083 -14.083 -15.774 -17.203 -18.443 -19.469 -20.468 -21.305 -22.05 -22.742 -23.386 -23.982 -24.525 -25.098 -25.599 -26.015 -26.447 -26.902 -27.278 -27.663 -28.061 -28.367 -28.665 -28.975 -29.313 -29.646 -29.872 -30.098 -30.459 -30.713 -30.951 -31.074 -31.34 -31.613 -31.888 -32.034 -32.349 -32.511 -32.707 -32.898 -33.301 -33.556 -33.81 -34.067 -34.368 -34.75 -35.365 -37.18 -3 ,30123 ,TETRA ,17601577,Sun Nov 28 14:59:19 CET,Sun Nov 28 16:48:41 CET,0.0 1.373 1.827 2.126 2.375 2.615 2.823 3.012 3.339 3.471 3.588 3.664 3.876 3.959 4.111 4.27 4.408 4.469 4.592 4.711 4.889 4.999 5.099 5.222 5.328 5.435 5.527 5.616 5.724 5.809 5.889 5.965 6.018 6.07 6.118 6.147 6.164 6.173 6.156 6.108 6.023 5.89 5.696 5.445 5.056 4.522 3.802 2.816 1.368 -0.746 -4.024 -7.794 -10.78 -13.204 -15.168 -16.844 -18.279 -19.532 -20.572 -21.594 -22.461 -23.229 -23.946 -24.586 -25.183 -25.743 -26.327 -26.843 -27.285 -27.739 -28.2 -28.571 -28.954 -29.333 -29.629 -29.959 -30.298 -30.633 -30.978 -31.204 -31.43 -31.793 -32.047 -32.316 -32.456 -32.741 -33.037 -33.34 -33.493 -33.831 -34.055 -34.255 -34.466 -34.889 -35.136 -35.43 -35.715 -36.022 -36.403 -36.933 -38.596 -4 ,8172 ,TETRA ,17601578,Sun Nov 28 14:59:13 CET,Sun Nov 28 16:49:02 CET,0.0 2.152 2.625 3.011 3.294 3.519 3.725 3.917 4.239 4.412 4.566 4.667 4.881 4.976 5.152 5.3 5.448 5.522 5.656 5.767 5.919 6.022 6.118 6.234 6.319 6.412 6.511 6.601 6.695 6.769 6.836 6.896 6.951 6.996 7.048 7.114 7.147 7.145 7.112 7.042 6.953 6.821 6.595 6.327 5.943 5.385 4.64 3.653 2.217 0.067 -3.277 -7.031 -9.961 -12.325 -14.285 -15.972 -17.376 -18.6 -19.634 -20.654 -21.527 -22.273 -22.944 -23.579 -24.195 -24.734 -25.269 -25.75 -26.168 -26.609 -27.068 -27.429 -27.785 -28.157 -28.453 -28.763 -29.092 -29.429 -29.782 -30.022 -30.259 -30.625 -30.868 -31.12 -31.255 -31.535 -31.821 -32.122 -32.277 -32.598 -32.77 -32.94 -33.118 -33.534 -33.768 -33.987 -34.274 -34.637 -35.005 -35.431 -37.038 -5 ,30452 ,TETRA ,17601579,Sun Nov 28 14:59:14 CET,Sun Nov 28 16:49:06 CET,0.0 1.754 2.122 2.439 2.693 2.907 3.097 3.262 3.585 3.723 3.841 3.953 4.171 4.262 4.434 4.587 4.731 4.794 4.915 5.026 5.157 5.246 5.343 5.468 5.579 5.689 5.782 5.858 5.944 6.015 6.09 6.185 6.252 6.298 6.339 6.362 6.368 6.351 6.314 6.244 6.154 6.048 5.875 5.631 5.24 4.73 4.034 3.068 1.66 -0.515 -3.938 -7.714 -10.683 -13.086 -15.032 -16.717 -18.147 -19.4 -20.463 -21.51 -22.403 -23.175 -23.888 -24.541 -25.137 -25.676 -26.236 -26.726 -27.151 -27.587 -28.03 -28.405 -28.798 -29.209 -29.52 -29.829 -30.143 -30.49 -30.837 -31.069 -31.315 -31.709 -31.99 -32.256 -32.39 -32.673 -32.961 -33.268 -33.422 -33.723 -33.885 -34.064 -34.253 -34.669 -34.881 -35.11 -35.35 -35.609 -35.944 -36.386 -38.51 -6 ,25516 ,TETRA ,17601580,Sun Nov 28 14:59:17 CET,Sun Nov 28 16:49:28 CET,0.0 2.705 3.132 3.499 3.789 4.004 4.19 4.386 4.704 4.838 4.969 5.066 5.284 5.381 5.555 5.721 5.865 5.924 6.033 6.155 6.329 6.427 6.513 6.631 6.748 6.842 6.925 7.007 7.108 7.185 7.248 7.318 7.36 7.394 7.423 7.435 7.452 7.452 7.401 7.325 7.229 7.09 6.896 6.654 6.287 5.772 5.057 4.084 2.64 0.507 -2.874 -6.683 -9.636 -12.047 -14.0 -15.661 -17.097 -18.379 -19.451 -20.465 -21.327 -22.089 -22.796 -23.441 -24.021 -24.567 -25.134 -25.625 -26.054 -26.491 -26.932 -27.297 -27.675 -28.059 -28.36 -28.665 -28.964 -29.279 -29.6 -29.821 -30.063 -30.439 -30.695 -30.955 -31.087 -31.367 -31.655 -31.948 -32.103 -32.428 -32.622 -32.809 -32.996 -33.408 -33.64 -33.861 -34.095 -34.372 -34.723 -35.179 -37.224 -7 ,1912 ,TETRA ,17601581,Sun Nov 28 14:59:39 CET,Sun Nov 28 16:48:49 CET,0.0 2.494 2.957 3.307 3.596 3.84 4.054 4.25 4.574 4.71 4.846 4.997 5.241 5.345 5.541 5.739 5.919 5.998 6.142 6.286 6.471 6.582 6.685 6.819 6.948 7.062 7.165 7.255 7.37 7.471 7.547 7.627 7.692 7.76 7.827 7.891 7.923 7.917 7.894 7.828 7.73 7.605 7.409 7.154 6.799 6.293 5.56 4.574 3.176 1.093 -2.263 -6.1 -9.067 -11.449 -13.427 -15.125 -16.54 -17.777 -18.831 -19.87 -20.75 -21.517 -22.239 -22.921 -23.548 -24.104 -24.685 -25.198 -25.641 -26.111 -26.593 -26.99 -27.389 -27.787 -28.107 -28.439 -28.782 -29.14 -29.508 -29.759 -30.002 -30.372 -30.64 -30.923 -31.065 -31.355 -31.67 -32.008 -32.185 -32.522 -32.695 -32.871 -33.079 -33.537 -33.782 -34.062 -34.348 -34.673 -35.028 -35.457 -37.659 -8 ,9969 ,TETRA ,17601582,Sun Nov 28 14:59:40 CET,Sun Nov 28 16:49:02 CET,0.0 1.578 2.083 2.416 2.687 2.925 3.122 3.295 3.588 3.724 3.867 4.005 4.225 4.315 4.493 4.67 4.836 4.915 5.058 5.183 5.355 5.462 5.57 5.719 5.847 5.95 6.035 6.104 6.19 6.275 6.329 6.382 6.437 6.489 6.543 6.583 6.591 6.583 6.563 6.525 6.456 6.322 6.105 5.844 5.477 4.993 4.291 3.296 1.892 -0.236 -3.661 -7.473 -10.417 -12.78 -14.755 -16.475 -17.911 -19.164 -20.216 -21.21 -22.042 -22.788 -23.488 -24.136 -24.723 -25.254 -25.828 -26.34 -26.765 -27.2 -27.651 -28.019 -28.406 -28.812 -29.115 -29.422 -29.722 -30.018 -30.341 -30.576 -30.811 -31.166 -31.415 -31.687 -31.829 -32.116 -32.419 -32.735 -32.9 -33.248 -33.463 -33.668 -33.888 -34.336 -34.58 -34.85 -35.153 -35.5 -35.938 -36.488 -38.185 -9 ,3903 ,TETRA ,17601583,Sun Nov 28 14:59:44 CET,Sun Nov 28 16:48:49 CET,0.0 2.024 2.473 2.782 3.02 3.218 3.44 3.648 3.947 4.077 4.204 4.318 4.537 4.613 4.76 4.902 5.031 5.098 5.234 5.351 5.501 5.6 5.701 5.829 5.942 6.047 6.13 6.216 6.319 6.389 6.461 6.547 6.629 6.699 6.74 6.765 6.778 6.763 6.726 6.678 6.604 6.47 6.248 5.985 5.617 5.097 4.388 3.416 2.008 -0.09 -3.515 -7.383 -10.325 -12.709 -14.7 -16.422 -17.85 -19.08 -20.131 -21.168 -22.032 -22.779 -23.478 -24.122 -24.717 -25.264 -25.804 -26.293 -26.736 -27.176 -27.6 -27.954 -28.348 -28.775 -29.087 -29.384 -29.692 -30.014 -30.354 -30.588 -30.823 -31.189 -31.435 -31.672 -31.798 -32.074 -32.355 -32.644 -32.793 -33.119 -33.309 -33.492 -33.683 -34.082 -34.331 -34.641 -35.039 -35.456 -35.866 -36.448 -37.904 -10 ,24084 ,TETRA ,17601584,Sun Nov 28 14:59:41 CET,Sun Nov 28 16:46:50 CET,0.0 2.021 2.472 2.854 3.183 3.442 3.679 3.889 4.225 4.372 4.527 4.706 4.945 5.048 5.261 5.471 5.657 5.738 5.9 6.06 6.254 6.362 6.469 6.603 6.733 6.851 6.943 7.02 7.1 7.175 7.251 7.339 7.4 7.445 7.479 7.496 7.499 7.493 7.484 7.436 7.341 7.221 7.027 6.743 6.362 5.855 5.114 4.089 2.645 0.508 -2.904 -6.725 -9.707 -12.103 -14.049 -15.745 -17.195 -18.453 -19.511 -20.538 -21.395 -22.14 -22.833 -23.487 -24.088 -24.628 -25.187 -25.668 -26.082 -26.52 -26.972 -27.327 -27.685 -28.056 -28.35 -28.664 -28.994 -29.323 -29.644 -29.871 -30.101 -30.442 -30.686 -30.949 -31.079 -31.342 -31.632 -31.944 -32.101 -32.423 -32.599 -32.78 -32.982 -33.393 -33.624 -33.882 -34.137 -34.469 -34.892 -35.505 -37.929 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt deleted file mode 100644 index c705be6d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25847 ,TETRA ,17604738,Sun Nov 28 18:18:38 CET,Sun Nov 28 20:45:20 CET,0.0 2.082 3.056 3.815 4.416 4.946 5.412 5.845 6.628 6.971 7.299 7.286 8.207 8.465 8.962 9.43 9.881 10.105 10.535 10.909 11.392 11.704 11.994 12.411 12.817 13.206 13.566 13.893 14.313 14.72 15.119 15.583 16.017 16.424 16.88 17.386 17.856 18.367 18.908 19.47 20.056 20.702 21.449 22.2 23.075 23.95 24.845 25.815 26.794 27.722 28.325 28.23 27.74 27.067 26.321 25.567 24.851 24.112 23.479 22.869 22.324 21.79 21.205 20.669 20.161 19.598 19.01 18.485 17.969 17.448 16.945 16.503 16.02 15.528 15.12 14.693 14.277 13.807 13.302 12.982 12.64 12.065 11.685 11.285 11.07 10.604 10.086 9.51 9.204 8.267 8.228 7.849 7.43 6.539 6.018 5.459 4.848 4.093 3.141 1.911 -3.867 -2 ,32515 ,TETRA ,17604739,Sun Nov 28 18:18:39 CET,Sun Nov 28 20:45:44 CET,0.0 2.057 2.951 3.592 4.126 4.572 4.996 5.411 6.138 6.469 6.787 6.729 7.652 7.926 8.453 8.923 9.362 9.576 10.01 10.427 10.964 11.288 11.608 12.075 12.501 12.858 13.219 13.614 14.12 14.608 15.071 15.623 16.104 16.532 17.007 17.475 17.94 18.459 18.975 19.495 20.016 20.595 21.228 21.81 22.439 23.084 23.854 24.7 25.502 26.356 26.92 26.607 25.88 25.004 24.193 23.418 22.663 21.94 21.28 20.607 19.998 19.407 18.801 18.207 17.644 17.091 16.474 15.897 15.384 14.837 14.239 13.715 13.171 12.607 12.172 11.736 11.268 10.763 10.244 9.891 9.507 8.854 8.395 7.922 7.656 7.06 6.465 5.868 5.549 4.576 4.51 4.122 3.667 2.606 2.02 1.399 0.748 -0.005 -1.023 -2.469 -10.85 -5 ,24749 ,TETRA ,17604742,Sun Nov 28 18:18:39 CET,Sun Nov 28 20:43:29 CET,0.0 1.917 2.815 3.476 4.059 4.57 5.028 5.436 6.158 6.495 6.818 6.76 7.7 7.97 8.475 8.951 9.4 9.613 10.005 10.351 10.867 11.208 11.527 11.97 12.415 12.877 13.321 13.754 14.3 14.804 15.293 15.833 16.302 16.761 17.294 17.875 18.427 19.043 19.707 20.385 21.055 21.789 22.615 23.369 24.173 25.035 25.931 26.786 27.629 28.329 28.739 28.614 28.099 27.355 26.473 25.53 24.591 23.674 22.833 21.93 21.146 20.471 19.83 19.209 18.599 18.007 17.387 16.801 16.274 15.748 15.208 14.733 14.221 13.71 13.284 12.835 12.369 11.867 11.337 10.982 10.628 10.046 9.616 9.15 8.902 8.398 7.895 7.354 7.073 6.139 6.122 5.752 5.324 4.36 3.858 3.355 2.742 2.029 1.236 0.041 -11.421 -6 ,30133 ,TETRA ,17604743,Sun Nov 28 18:18:42 CET,Sun Nov 28 20:44:20 CET,0.0 2.287 3.277 4.024 4.622 5.141 5.623 6.07 6.846 7.186 7.515 7.483 8.409 8.667 9.151 9.605 10.043 10.257 10.64 11.007 11.575 11.937 12.273 12.749 13.191 13.586 13.968 14.346 14.827 15.307 15.777 16.362 16.925 17.417 17.95 18.534 19.082 19.686 20.314 20.983 21.687 22.426 23.222 23.896 24.619 25.44 26.318 27.207 28.121 28.959 29.589 29.557 29.099 28.356 27.341 26.27 25.315 24.46 23.715 22.894 22.146 21.488 20.825 20.152 19.502 18.879 18.221 17.617 17.065 16.491 15.942 15.497 14.994 14.446 14.001 13.525 13.023 12.488 11.942 11.548 11.126 10.502 10.109 9.706 9.479 8.985 8.459 7.845 7.513 6.532 6.448 6.059 5.66 4.769 4.27 3.745 3.152 2.39 1.414 -0.017 -6.11 -8 ,28169 ,TETRA ,17604745,Sun Nov 28 18:18:39 CET,Sun Nov 28 20:44:36 CET,0.0 2.026 2.958 3.71 4.316 4.827 5.276 5.69 6.444 6.795 7.124 7.089 8.035 8.319 8.862 9.369 9.835 10.054 10.461 10.842 11.343 11.64 11.958 12.463 12.933 13.393 13.807 14.161 14.605 15.017 15.399 15.818 16.219 16.598 17.033 17.558 18.043 18.537 19.061 19.607 20.169 20.792 21.497 22.164 22.912 23.699 24.535 25.402 26.283 27.079 27.682 27.559 26.999 26.366 25.673 24.968 24.283 23.614 23.009 22.357 21.727 21.117 20.551 20.004 19.455 18.931 18.405 17.954 17.541 17.068 16.58 16.167 15.731 15.249 14.847 14.454 14.073 13.614 13.068 12.68 12.276 11.665 11.225 10.766 10.557 10.162 9.657 9.01 8.67 7.688 7.61 7.242 6.886 6.104 5.634 5.073 4.451 3.758 2.951 1.695 -3.661 -9 ,32643 ,TETRA ,17604746,Sun Nov 28 18:18:41 CET,Sun Nov 28 20:44:35 CET,0.0 2.482 3.371 4.006 4.55 5.039 5.474 5.891 6.632 6.95 7.261 7.178 8.097 8.368 8.84 9.272 9.683 9.88 10.237 10.55 11.013 11.324 11.617 12.041 12.424 12.779 13.111 13.423 13.887 14.309 14.652 15.034 15.391 15.766 16.197 16.671 17.101 17.532 18.002 18.485 19.001 19.577 20.212 20.838 21.507 22.217 23.042 23.856 24.658 25.478 26.152 26.224 25.841 25.265 24.574 23.812 23.047 22.278 21.574 20.884 20.34 19.841 19.34 18.884 18.413 17.934 17.401 16.891 16.426 15.931 15.423 15.006 14.552 14.043 13.639 13.233 12.809 12.35 11.831 11.466 11.067 10.396 9.969 9.527 9.274 8.74 8.18 7.604 7.301 6.349 6.287 5.906 5.498 4.619 4.094 3.508 2.821 1.936 0.827 -0.803 -11.507 -10 ,31668 ,TETRA ,17604747,Sun Nov 28 18:18:39 CET,Sun Nov 28 20:44:07 CET,0.0 2.062 2.928 3.607 4.195 4.695 5.14 5.551 6.284 6.612 6.927 6.864 7.798 8.067 8.577 9.046 9.5 9.712 10.104 10.508 11.067 11.384 11.672 12.068 12.482 12.943 13.353 13.723 14.193 14.591 14.96 15.418 15.855 16.265 16.729 17.237 17.708 18.208 18.739 19.284 19.84 20.45 21.124 21.794 22.553 23.31 24.125 24.983 25.851 26.59 26.901 26.592 26.005 25.289 24.552 23.774 23.011 22.223 21.461 20.655 19.958 19.369 18.788 18.213 17.662 17.139 16.596 16.104 15.673 15.226 14.762 14.378 13.956 13.495 13.144 12.763 12.321 11.848 11.385 11.033 10.648 10.053 9.613 9.115 8.844 8.295 7.74 7.169 6.861 5.898 5.901 5.532 5.097 4.101 3.565 2.964 2.235 1.372 0.2 -1.515 -5.567 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt deleted file mode 100644 index e76936ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20594 ,TETRA ,17604748,Sun Nov 28 18:18:41 CET,Sun Nov 28 20:46:13 CET,0.0 2.13 2.999 3.653 4.233 4.74 5.181 5.592 6.358 6.704 7.033 6.991 7.949 8.238 8.791 9.32 9.82 10.049 10.49 10.931 11.559 11.949 12.327 12.87 13.369 13.837 14.302 14.749 15.345 15.937 16.474 17.113 17.719 18.265 18.893 19.599 20.221 20.895 21.641 22.394 23.194 24.12 25.12 26.074 27.255 28.593 30.074 31.707 33.516 35.454 37.578 39.045 39.673 39.827 39.725 39.467 39.154 38.824 38.481 38.025 37.617 37.28 36.905 36.515 36.18 35.855 35.479 35.087 34.683 34.217 33.708 33.311 32.9 32.467 32.137 31.803 31.462 31.104 30.703 30.398 30.076 29.547 29.169 28.807 28.613 28.184 27.733 27.261 27.016 26.119 26.16 25.854 25.513 24.698 24.261 23.796 23.238 22.572 21.797 20.711 18.01 -2 ,2670 ,TETRA ,17604749,Sun Nov 28 18:18:43 CET,Sun Nov 28 20:47:05 CET,0.0 3.04 3.966 4.673 5.273 5.796 6.282 6.746 7.541 7.899 8.243 8.231 9.161 9.452 9.983 10.436 10.848 11.046 11.454 11.847 12.359 12.681 12.992 13.442 13.886 14.316 14.747 15.14 15.619 16.093 16.571 17.137 17.667 18.183 18.778 19.436 20.047 20.748 21.518 22.315 23.132 24.055 25.152 26.234 27.471 28.804 30.355 32.143 34.146 36.482 39.323 41.288 41.973 42.082 41.95 41.715 41.347 40.929 40.525 40.054 39.613 39.187 38.774 38.381 38.002 37.665 37.307 36.944 36.575 36.201 35.832 35.527 35.223 34.877 34.569 34.21 33.843 33.443 33.009 32.696 32.37 31.853 31.454 31.02 30.797 30.353 29.876 29.353 29.079 28.173 28.178 27.827 27.447 26.668 26.233 25.743 25.195 24.532 23.708 22.537 19.731 -3 ,18620 ,TETRA ,17604750,Sun Nov 28 18:18:46 CET,Sun Nov 28 20:46:24 CET,0.0 2.82 3.82 4.571 5.189 5.734 6.261 6.741 7.579 7.966 8.322 8.31 9.282 9.58 10.155 10.709 11.246 11.507 12.007 12.477 13.111 13.498 13.865 14.401 14.902 15.36 15.829 16.306 16.936 17.577 18.169 18.864 19.58 20.278 21.032 21.864 22.649 23.425 24.253 25.115 25.99 26.969 28.084 29.196 30.416 31.735 33.238 34.892 36.736 38.788 40.94 42.373 42.944 42.995 42.862 42.604 42.186 41.688 41.116 40.564 40.138 39.723 39.342 38.971 38.622 38.311 37.952 37.612 37.3 36.882 36.397 35.996 35.569 35.112 34.743 34.366 33.987 33.595 33.177 32.89 32.578 32.048 31.672 31.255 31.033 30.574 30.1 29.605 29.332 28.383 28.37 28.043 27.697 26.93 26.533 26.087 25.543 24.899 24.173 23.217 20.327 -4 ,26897 ,TETRA ,17604751,Sun Nov 28 18:18:40 CET,Sun Nov 28 20:46:43 CET,0.0 2.51 3.44 4.181 4.845 5.374 5.831 6.271 7.057 7.403 7.742 7.755 8.711 9.017 9.571 10.082 10.561 10.785 11.243 11.676 12.263 12.655 13.029 13.513 13.973 14.432 14.856 15.243 15.755 16.24 16.689 17.222 17.735 18.274 18.918 19.586 20.191 20.821 21.518 22.293 23.054 23.95 25.066 26.144 27.383 28.814 30.47 32.288 34.394 36.79 39.44 41.266 42.091 42.358 42.222 41.927 41.603 41.21 40.832 40.439 40.048 39.593 39.096 38.581 38.043 37.546 37.04 36.585 36.169 35.714 35.228 34.851 34.462 34.016 33.654 33.293 32.911 32.508 32.075 31.756 31.431 30.925 30.565 30.178 29.971 29.522 29.056 28.593 28.338 27.428 27.495 27.175 26.848 26.092 25.648 25.161 24.61 24.029 23.357 22.459 19.76 -5 ,2967 ,TETRA ,17604752,Sun Nov 28 18:18:41 CET,Sun Nov 28 20:46:57 CET,0.0 2.996 4.005 4.791 5.508 6.123 6.636 7.097 7.913 8.286 8.645 8.629 9.581 9.871 10.429 10.962 11.467 11.697 12.14 12.572 13.21 13.631 14.035 14.592 15.116 15.607 16.087 16.562 17.163 17.736 18.244 18.795 19.306 19.809 20.406 21.063 21.703 22.435 23.231 24.073 24.92 25.809 26.837 27.875 29.054 30.375 31.868 33.497 35.405 37.447 39.508 40.851 41.347 41.429 41.298 41.036 40.613 40.091 39.59 39.053 38.562 38.107 37.645 37.166 36.71 36.294 35.829 35.386 34.97 34.486 34.008 33.624 33.156 32.644 32.267 31.874 31.463 31.021 30.545 30.212 29.871 29.339 28.959 28.545 28.335 27.892 27.399 26.892 26.622 25.697 25.693 25.354 24.991 24.199 23.772 23.266 22.622 21.908 21.178 20.227 17.082 -6 ,5955 ,TETRA ,17604753,Sun Nov 28 18:18:43 CET,Sun Nov 28 20:46:48 CET,0.0 2.08 3.055 3.777 4.342 4.821 5.256 5.655 6.411 6.761 7.081 7.017 7.949 8.232 8.783 9.287 9.748 9.959 10.342 10.708 11.29 11.686 12.054 12.537 13.002 13.471 13.888 14.267 14.758 15.253 15.732 16.345 16.946 17.474 18.088 18.79 19.428 20.109 20.842 21.642 22.487 23.424 24.483 25.542 26.79 28.197 29.775 31.508 33.544 35.861 38.357 40.042 40.787 40.98 40.925 40.77 40.493 40.15 39.799 39.373 39.003 38.656 38.31 37.941 37.579 37.26 36.897 36.59 36.316 35.99 35.626 35.316 35.01 34.679 34.385 34.068 33.752 33.418 33.042 32.782 32.504 32.014 31.639 31.248 31.068 30.722 30.329 29.892 29.647 28.734 28.757 28.42 28.052 27.274 26.871 26.43 25.872 25.248 24.557 23.505 19.68 -7 ,3433 ,TETRA ,17604754,Sun Nov 28 18:18:46 CET,Sun Nov 28 20:46:27 CET,0.0 2.725 3.727 4.534 5.189 5.754 6.236 6.673 7.434 7.776 8.126 8.087 9.028 9.313 9.872 10.4 10.908 11.152 11.629 12.049 12.615 12.994 13.369 13.903 14.425 14.894 15.314 15.755 16.298 16.776 17.281 17.937 18.555 19.103 19.692 20.357 20.994 21.7 22.443 23.224 24.032 24.949 26.026 27.09 28.345 29.732 31.243 32.882 34.793 36.888 38.956 40.18 40.619 40.729 40.591 40.291 39.93 39.546 39.197 38.758 38.335 37.966 37.599 37.244 36.896 36.55 36.196 35.84 35.49 35.119 34.737 34.415 34.071 33.638 33.296 32.99 32.662 32.3 31.919 31.639 31.299 30.749 30.398 30.036 29.83 29.364 28.882 28.365 28.093 27.171 27.186 26.863 26.504 25.682 25.238 24.768 24.196 23.548 22.757 21.777 18.822 -8 ,4767 ,TETRA ,17604755,Sun Nov 28 18:18:43 CET,Sun Nov 28 20:47:58 CET,0.0 1.868 2.783 3.55 4.215 4.773 5.291 5.738 6.492 6.84 7.178 7.181 8.155 8.489 9.084 9.613 10.114 10.358 10.829 11.278 11.913 12.301 12.652 13.13 13.589 14.042 14.469 14.866 15.397 15.919 16.387 16.94 17.445 17.929 18.51 19.165 19.79 20.454 21.191 22.01 22.849 23.784 24.898 25.996 27.208 28.571 30.124 31.761 33.679 35.776 37.788 39.033 39.536 39.6 39.366 39.037 38.643 38.19 37.781 37.297 36.736 36.23 35.83 35.42 34.988 34.577 34.147 33.686 33.223 32.776 32.358 32.001 31.603 31.178 30.841 30.478 30.076 29.627 29.148 28.824 28.489 27.969 27.61 27.22 27.0 26.538 26.085 25.611 25.339 24.414 24.469 24.141 23.776 23.003 22.589 22.12 21.581 20.928 20.141 19.204 16.442 -9 ,7209 ,TETRA ,17604756,Sun Nov 28 18:18:41 CET,Sun Nov 28 20:48:18 CET,0.0 2.106 3.029 3.784 4.393 4.901 5.387 5.841 6.672 7.062 7.415 7.416 8.383 8.667 9.232 9.763 10.259 10.495 10.951 11.387 11.986 12.357 12.729 13.283 13.832 14.353 14.821 15.285 15.892 16.458 17.01 17.709 18.327 18.848 19.495 20.214 20.874 21.626 22.48 23.379 24.266 25.27 26.402 27.491 28.72 30.066 31.546 33.167 35.005 37.035 39.04 40.144 40.456 40.441 40.313 40.15 39.925 39.589 39.198 38.728 38.302 37.908 37.508 37.088 36.659 36.227 35.781 35.401 35.062 34.711 34.338 33.982 33.544 33.091 32.73 32.343 31.954 31.541 31.074 30.744 30.422 29.918 29.545 29.139 28.923 28.473 28.012 27.521 27.257 26.337 26.367 26.046 25.702 24.863 24.423 23.98 23.471 22.852 22.104 21.004 17.475 -10 ,7913 ,TETRA ,17604757,Sun Nov 28 18:18:41 CET,Sun Nov 28 20:48:24 CET,0.0 3.907 5.0 5.76 6.418 7.029 7.579 8.051 8.814 9.153 9.495 9.52 10.476 10.776 11.318 11.824 12.316 12.549 12.989 13.415 14.013 14.407 14.773 15.266 15.755 16.219 16.654 17.129 17.721 18.235 18.707 19.285 19.86 20.396 21.031 21.739 22.382 23.054 23.799 24.593 25.441 26.4 27.464 28.499 29.647 30.951 32.512 34.281 36.302 38.392 40.706 42.488 43.161 43.364 43.318 43.143 42.947 42.701 42.393 42.019 41.642 41.228 40.794 40.361 39.985 39.646 39.259 38.911 38.582 38.213 37.818 37.477 37.139 36.746 36.371 36.009 35.676 35.333 34.974 34.707 34.434 34.018 33.709 33.355 33.16 32.702 32.17 31.623 31.357 30.474 30.476 30.12 29.745 28.943 28.492 27.953 27.31 26.587 25.732 24.52 21.308 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt deleted file mode 100644 index 4a89fa13..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10829 ,TETRA ,17604758,Sun Nov 28 18:18:42 CET,Sun Nov 28 20:51:06 CET,0.0 0.568 0.908 1.209 1.478 1.734 1.982 2.204 2.589 2.769 2.949 2.675 3.483 3.651 3.95 4.235 4.537 4.682 4.954 5.234 5.65 5.915 6.177 6.553 6.901 7.229 7.564 7.908 8.341 8.748 9.155 9.672 10.167 10.629 11.165 11.758 12.336 12.98 13.651 14.364 15.129 16.001 17.037 18.082 19.344 20.804 22.47 24.34 26.539 29.059 32.043 34.474 35.749 36.417 36.724 36.806 36.736 36.547 36.29 35.989 35.688 35.374 34.947 34.531 34.195 33.885 33.546 33.203 32.873 32.531 32.2 31.93 31.635 31.286 30.965 30.58 30.176 29.79 29.411 29.157 28.885 28.411 28.061 27.696 27.518 27.156 26.749 26.3 26.065 25.19 25.267 24.982 24.678 24.013 23.629 23.221 22.771 22.218 21.608 20.844 19.07 -2 ,24754 ,TETRA ,17604759,Sun Nov 28 18:18:41 CET,Sun Nov 28 20:50:37 CET,0.0 0.565 0.877 1.147 1.407 1.647 1.868 2.087 2.49 2.679 2.863 2.57 3.393 3.565 3.901 4.215 4.496 4.635 4.922 5.195 5.592 5.846 6.092 6.462 6.821 7.172 7.511 7.832 8.251 8.673 9.086 9.585 10.066 10.53 11.069 11.668 12.246 12.882 13.584 14.339 15.143 16.059 17.128 18.251 19.548 20.949 22.631 24.573 26.864 29.554 32.801 35.391 36.649 37.283 37.561 37.629 37.63 37.608 37.476 37.174 36.814 36.43 36.019 35.628 35.242 34.863 34.46 34.078 33.704 33.32 32.937 32.615 32.291 31.942 31.665 31.361 31.041 30.692 30.293 30.022 29.735 29.268 28.946 28.597 28.404 27.988 27.559 27.09 26.82 25.912 25.981 25.684 25.379 24.678 24.281 23.844 23.345 22.782 22.1 21.186 19.444 -3 ,15769 ,TETRA ,17604760,Sun Nov 28 18:18:43 CET,Sun Nov 28 20:50:42 CET,0.0 0.604 0.95 1.254 1.541 1.79 2.018 2.231 2.67 2.874 3.054 2.768 3.576 3.739 4.056 4.381 4.689 4.833 5.111 5.378 5.778 6.029 6.29 6.686 7.045 7.361 7.678 8.021 8.479 8.919 9.341 9.841 10.336 10.809 11.336 11.922 12.492 13.113 13.79 14.548 15.349 16.237 17.272 18.339 19.588 20.969 22.615 24.516 26.681 29.195 32.247 34.802 36.179 36.9 37.284 37.467 37.463 37.322 37.154 36.935 36.656 36.343 35.983 35.596 35.184 34.791 34.381 33.959 33.59 33.233 32.869 32.519 32.134 31.753 31.439 31.112 30.766 30.391 29.986 29.705 29.421 28.974 28.668 28.344 28.177 27.807 27.383 26.935 26.701 25.85 25.981 25.715 25.432 24.835 24.51 24.154 23.762 23.294 22.68 21.959 20.345 -4 ,1849 ,TETRA ,17604761,Sun Nov 28 18:18:46 CET,Sun Nov 28 20:48:32 CET,0.0 0.651 0.979 1.272 1.544 1.786 1.988 2.186 2.603 2.807 2.999 2.721 3.529 3.706 4.042 4.345 4.634 4.78 5.069 5.337 5.707 5.946 6.18 6.518 6.871 7.223 7.548 7.878 8.317 8.737 9.14 9.605 10.054 10.5 11.015 11.596 12.169 12.816 13.515 14.274 15.071 15.954 17.015 18.11 19.404 20.824 22.447 24.384 26.706 29.43 32.598 35.068 36.309 36.877 37.111 37.133 37.054 36.902 36.669 36.349 36.021 35.707 35.39 35.041 34.675 34.334 33.955 33.579 33.244 32.859 32.434 32.079 31.69 31.279 30.944 30.611 30.297 29.975 29.616 29.36 29.097 28.665 28.31 27.892 27.676 27.234 26.773 26.243 25.97 25.073 25.191 24.892 24.578 23.905 23.499 23.036 22.538 22.006 21.363 20.509 18.834 -5 ,16085 ,TETRA ,17604762,Sun Nov 28 18:18:47 CET,Sun Nov 28 20:48:58 CET,0.0 0.784 1.14 1.465 1.756 1.998 2.229 2.472 2.943 3.157 3.352 3.069 3.897 4.06 4.383 4.686 4.989 5.148 5.456 5.724 6.093 6.346 6.6 6.96 7.309 7.647 7.985 8.316 8.751 9.178 9.589 10.068 10.525 10.983 11.503 12.108 12.709 13.349 14.04 14.781 15.555 16.464 17.558 18.637 19.902 21.341 22.999 24.907 27.205 29.9 33.102 35.611 36.991 37.814 38.227 38.336 38.274 38.15 37.973 37.749 37.503 37.218 36.87 36.472 36.111 35.786 35.376 34.926 34.54 34.139 33.709 33.359 32.996 32.585 32.224 31.845 31.481 31.113 30.716 30.438 30.144 29.67 29.316 28.937 28.745 28.358 27.939 27.479 27.244 26.364 26.459 26.165 25.85 25.147 24.725 24.262 23.761 23.201 22.521 21.601 19.569 -6 ,1771 ,TETRA ,17604763,Sun Nov 28 18:18:42 CET,Sun Nov 28 20:48:45 CET,0.0 0.819 1.179 1.458 1.724 1.986 2.215 2.441 2.87 3.056 3.242 2.98 3.8 3.974 4.296 4.61 4.915 5.06 5.354 5.64 6.058 6.326 6.585 6.955 7.306 7.648 8.004 8.358 8.805 9.223 9.608 10.094 10.584 11.055 11.612 12.237 12.826 13.471 14.176 14.943 15.761 16.684 17.744 18.829 20.143 21.629 23.358 25.293 27.594 30.381 33.592 36.064 37.333 38.015 38.41 38.569 38.567 38.483 38.298 37.991 37.698 37.385 37.038 36.714 36.36 35.969 35.567 35.233 34.941 34.624 34.224 33.874 33.52 33.115 32.817 32.505 32.135 31.742 31.312 30.995 30.669 30.156 29.789 29.388 29.177 28.74 28.281 27.781 27.517 26.636 26.694 26.414 26.123 25.435 25.05 24.63 24.16 23.634 23.013 22.125 20.396 -7 ,7483 ,TETRA ,17604764,Sun Nov 28 18:18:43 CET,Sun Nov 28 20:49:17 CET,0.0 0.692 1.14 1.513 1.805 2.079 2.321 2.531 2.944 3.144 3.34 3.089 3.888 4.06 4.407 4.719 5.026 5.18 5.48 5.772 6.211 6.497 6.761 7.138 7.509 7.883 8.249 8.604 9.072 9.524 9.949 10.447 10.928 11.379 11.897 12.515 13.108 13.732 14.427 15.192 15.974 16.858 17.926 19.023 20.33 21.809 23.482 25.338 27.568 30.248 33.385 35.812 37.131 37.842 38.183 38.283 38.242 38.144 37.973 37.754 37.545 37.321 37.06 36.753 36.482 36.24 35.887 35.559 35.323 35.07 34.764 34.504 34.228 33.885 33.602 33.32 32.976 32.597 32.229 31.964 31.661 31.161 30.827 30.504 30.338 29.975 29.564 29.105 28.86 28.009 28.137 27.882 27.591 26.908 26.549 26.175 25.762 25.289 24.725 23.973 22.548 -8 ,24536 ,TETRA ,17604765,Sun Nov 28 18:18:45 CET,Sun Nov 28 20:51:56 CET,0.0 0.632 1.003 1.366 1.675 1.918 2.141 2.35 2.747 2.94 3.138 2.865 3.684 3.857 4.19 4.499 4.795 4.939 5.203 5.462 5.848 6.094 6.338 6.717 7.084 7.416 7.733 8.057 8.497 8.925 9.317 9.797 10.281 10.753 11.317 11.935 12.51 13.15 13.864 14.626 15.423 16.349 17.429 18.487 19.719 21.135 22.807 24.731 26.999 29.581 32.674 35.045 36.205 36.864 37.206 37.285 37.228 37.11 36.949 36.75 36.505 36.213 35.908 35.526 35.037 34.558 34.03 33.584 33.198 32.748 32.307 31.981 31.635 31.253 30.964 30.677 30.383 30.069 29.736 29.487 29.221 28.808 28.503 28.177 27.994 27.586 27.163 26.725 26.491 25.601 25.679 25.385 25.07 24.363 23.968 23.545 23.079 22.536 21.896 20.982 18.801 -9 ,25951 ,TETRA ,17604766,Sun Nov 28 18:18:46 CET,Sun Nov 28 20:51:05 CET,0.0 0.642 1.036 1.367 1.668 1.939 2.204 2.45 2.868 3.075 3.285 3.032 3.85 4.01 4.318 4.616 4.91 5.047 5.348 5.664 6.083 6.343 6.597 6.972 7.34 7.699 8.06 8.416 8.847 9.255 9.66 10.164 10.646 11.101 11.619 12.218 12.804 13.44 14.137 14.892 15.699 16.614 17.708 18.833 20.148 21.591 23.232 25.106 27.3 29.793 32.634 34.664 35.589 36.001 36.073 35.922 35.669 35.372 35.008 34.565 34.133 33.71 33.289 32.857 32.467 32.143 31.784 31.377 31.016 30.624 30.167 29.764 29.322 28.904 28.583 28.209 27.805 27.398 26.976 26.665 26.331 25.804 25.432 25.059 24.873 24.479 24.036 23.53 23.271 22.367 22.423 22.126 21.816 21.159 20.793 20.387 19.949 19.409 18.689 17.793 15.883 -10 ,26665 ,TETRA ,17604767,Sun Nov 28 18:18:43 CET,Sun Nov 28 20:49:13 CET,0.0 0.835 1.271 1.61 1.909 2.177 2.446 2.686 3.138 3.357 3.571 3.345 4.163 4.325 4.654 4.984 5.298 5.44 5.72 6.015 6.44 6.696 6.94 7.28 7.601 7.929 8.266 8.583 8.976 9.361 9.734 10.2 10.672 11.126 11.665 12.285 12.886 13.536 14.24 15.006 15.815 16.737 17.836 18.963 20.265 21.693 23.343 25.234 27.462 30.105 33.241 35.667 36.872 37.485 37.8 37.923 37.898 37.81 37.69 37.464 37.221 36.979 36.71 36.426 36.135 35.858 35.537 35.178 34.809 34.452 34.095 33.799 33.459 33.034 32.722 32.369 31.983 31.576 31.167 30.914 30.615 30.14 29.79 29.394 29.186 28.762 28.349 27.892 27.632 26.725 26.735 26.427 26.069 25.261 24.844 24.366 23.83 23.256 22.48 21.468 19.422 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt deleted file mode 100644 index 216d9190..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15214 ,TETRA ,17604768,Sun Nov 28 18:18:45 CET,Sun Nov 28 20:48:48 CET,0.0 2.115 2.873 3.45 3.925 4.312 4.683 5.042 5.663 5.944 6.193 6.017 6.891 7.115 7.538 7.918 8.275 8.437 8.751 9.078 9.519 9.784 10.048 10.428 10.775 11.086 11.392 11.696 12.084 12.447 12.795 13.228 13.666 14.087 14.553 15.031 15.487 15.958 16.407 16.881 17.364 17.894 18.52 19.149 19.839 20.575 21.405 22.318 23.237 24.12 24.889 25.09 24.85 24.481 24.029 23.479 22.946 22.44 21.986 21.525 21.078 20.649 20.249 19.835 19.43 19.067 18.685 18.324 18.008 17.672 17.237 16.824 16.392 15.953 15.618 15.286 14.943 14.544 14.106 13.814 13.517 13.033 12.684 12.341 12.164 11.796 11.434 11.045 10.828 9.949 10.111 9.84 9.555 8.952 8.621 8.249 7.8 7.302 6.747 6.01 4.679 -2 ,26708 ,TETRA ,17604769,Sun Nov 28 18:18:46 CET,Sun Nov 28 20:48:31 CET,0.0 2.216 2.959 3.519 3.984 4.372 4.718 5.046 5.659 5.946 6.224 6.086 6.94 7.157 7.556 7.894 8.2 8.358 8.677 8.972 9.398 9.664 9.937 10.33 10.679 11.025 11.35 11.661 12.044 12.382 12.695 13.078 13.452 13.817 14.244 14.72 15.175 15.646 16.115 16.606 17.133 17.685 18.29 18.901 19.599 20.385 21.228 22.076 23.001 23.856 24.508 24.582 24.297 23.906 23.472 22.964 22.461 21.954 21.477 20.957 20.472 20.001 19.553 19.147 18.756 18.372 17.965 17.62 17.309 16.963 16.61 16.283 15.936 15.573 15.266 14.965 14.645 14.256 13.811 13.527 13.255 12.83 12.481 12.095 11.912 11.537 11.139 10.703 10.471 9.596 9.719 9.456 9.175 8.529 8.165 7.773 7.328 6.819 6.233 5.485 3.815 -3 ,22213 ,TETRA ,17604770,Sun Nov 28 18:19:08 CET,Sun Nov 28 20:51:20 CET,0.0 2.426 3.217 3.784 4.253 4.663 5.027 5.387 6.014 6.296 6.582 6.467 7.35 7.578 8.001 8.394 8.731 8.887 9.2 9.502 9.907 10.148 10.382 10.719 11.053 11.382 11.688 11.985 12.385 12.77 13.11 13.501 13.865 14.234 14.677 15.134 15.574 16.057 16.577 17.115 17.666 18.283 18.993 19.667 20.364 21.116 21.988 22.892 23.794 24.697 25.421 25.603 25.326 24.864 24.386 23.889 23.44 23.0 22.584 22.132 21.696 21.267 20.814 20.36 19.941 19.576 19.185 18.814 18.504 18.187 17.826 17.523 17.203 16.856 16.592 16.315 16.012 15.705 15.381 15.132 14.865 14.437 14.107 13.74 13.547 13.126 12.68 12.214 11.963 11.049 11.167 10.883 10.587 9.909 9.517 9.078 8.614 8.088 7.453 6.636 4.855 -4 ,1561 ,TETRA ,17604771,Sun Nov 28 18:19:09 CET,Sun Nov 28 20:47:47 CET,0.0 2.714 3.472 4.015 4.477 4.896 5.28 5.618 6.215 6.491 6.769 6.601 7.461 7.678 8.099 8.482 8.823 8.989 9.31 9.612 10.029 10.29 10.535 10.876 11.199 11.512 11.815 12.106 12.49 12.843 13.147 13.522 13.886 14.217 14.592 15.022 15.445 15.897 16.353 16.832 17.349 17.914 18.527 19.124 19.817 20.593 21.438 22.299 23.211 24.151 25.023 25.3 25.174 24.798 24.312 23.845 23.389 22.934 22.48 21.976 21.556 21.176 20.809 20.463 20.106 19.744 19.366 19.027 18.665 18.27 17.92 17.585 17.225 16.858 16.554 16.272 15.952 15.616 15.267 14.999 14.743 14.335 14.01 13.679 13.51 13.141 12.738 12.304 12.074 11.175 11.288 11.005 10.715 10.035 9.666 9.267 8.811 8.324 7.744 6.956 5.455 -5 ,742 ,TETRA ,17604772,Sun Nov 28 18:19:08 CET,Sun Nov 28 20:57:41 CET,0.0 2.555 3.323 3.946 4.466 4.857 5.202 5.528 6.11 6.388 6.652 6.453 7.322 7.533 7.922 8.263 8.574 8.733 9.047 9.339 9.752 10.009 10.26 10.623 10.955 11.268 11.561 11.862 12.27 12.623 12.946 13.358 13.729 14.075 14.481 14.907 15.292 15.73 16.209 16.697 17.184 17.74 18.375 18.984 19.712 20.51 21.399 22.362 23.402 24.42 25.218 25.381 25.138 24.796 24.297 23.764 23.282 22.771 22.277 21.748 21.299 20.894 20.482 20.087 19.704 19.337 18.954 18.626 18.317 17.994 17.672 17.386 17.083 16.761 16.462 16.094 15.715 15.35 14.946 14.65 14.348 13.856 13.503 13.146 12.964 12.585 12.163 11.687 11.443 10.525 10.636 10.348 10.044 9.384 9.025 8.63 8.21 7.78 7.265 6.578 5.321 -6 ,20718 ,TETRA ,17604773,Sun Nov 28 18:19:10 CET,Sun Nov 28 20:56:44 CET,0.0 2.566 3.344 3.967 4.492 4.919 5.276 5.619 6.229 6.502 6.777 6.618 7.467 7.675 8.078 8.453 8.809 8.984 9.311 9.623 10.052 10.317 10.573 10.944 11.307 11.663 11.974 12.271 12.657 12.997 13.327 13.721 14.1 14.457 14.886 15.358 15.772 16.215 16.686 17.163 17.665 18.254 18.932 19.612 20.395 21.185 21.987 22.883 23.86 24.784 25.503 25.507 25.03 24.361 23.7 23.089 22.45 21.764 21.131 20.527 19.941 19.372 18.86 18.369 17.902 17.446 16.909 16.409 15.988 15.522 15.032 14.652 14.265 13.872 13.571 13.246 12.868 12.446 12.018 11.726 11.418 10.933 10.598 10.244 10.063 9.677 9.286 8.879 8.647 7.751 7.892 7.602 7.319 6.711 6.362 5.975 5.533 5.008 4.42 3.63 2.005 -7 ,9688 ,TETRA ,17604774,Sun Nov 28 18:19:09 CET,Sun Nov 28 20:48:43 CET,0.0 2.584 3.358 3.984 4.504 4.941 5.335 5.672 6.263 6.535 6.789 6.6 7.452 7.648 8.052 8.447 8.787 8.95 9.274 9.576 10.018 10.28 10.516 10.857 11.186 11.505 11.819 12.124 12.529 12.922 13.306 13.77 14.202 14.595 15.05 15.583 16.05 16.556 17.131 17.709 18.276 18.923 19.681 20.413 21.217 22.049 22.968 23.934 24.869 25.766 26.47 26.481 26.081 25.593 25.065 24.484 23.94 23.434 22.956 22.434 21.955 21.506 21.084 20.666 20.257 19.91 19.47 19.007 18.615 18.182 17.674 17.23 16.781 16.31 15.938 15.559 15.168 14.76 14.335 14.03 13.709 13.216 12.87 12.504 12.319 11.94 11.514 11.07 10.846 9.955 10.101 9.829 9.545 8.9 8.523 8.114 7.685 7.215 6.65 5.95 4.644 -8 ,16008 ,TETRA ,17604775,Sun Nov 28 18:19:13 CET,Sun Nov 28 20:48:40 CET,0.0 2.33 3.112 3.677 4.186 4.616 4.939 5.236 5.812 6.058 6.279 6.095 6.973 7.201 7.576 7.9 8.219 8.372 8.668 8.968 9.421 9.705 9.97 10.359 10.735 11.079 11.389 11.686 12.064 12.418 12.766 13.197 13.611 13.984 14.388 14.852 15.293 15.762 16.252 16.759 17.277 17.843 18.501 19.161 19.917 20.679 21.487 22.363 23.338 24.321 25.099 25.365 25.222 24.862 24.422 23.913 23.395 22.918 22.479 21.989 21.513 21.073 20.661 20.202 19.762 19.42 19.069 18.743 18.423 18.076 17.723 17.408 17.083 16.709 16.385 16.055 15.702 15.329 14.97 14.746 14.506 14.071 13.743 13.398 13.222 12.837 12.407 11.963 11.735 10.861 11.035 10.762 10.47 9.837 9.469 9.064 8.617 8.121 7.566 6.938 5.869 -9 ,7541 ,TETRA ,17604776,Sun Nov 28 18:19:10 CET,Sun Nov 28 20:48:41 CET,0.0 2.184 2.936 3.542 3.996 4.416 4.804 5.122 5.675 5.932 6.17 5.993 6.834 7.018 7.347 7.654 7.954 8.112 8.433 8.718 9.123 9.382 9.632 10.02 10.376 10.69 10.997 11.277 11.624 11.941 12.234 12.604 12.956 13.281 13.659 14.107 14.52 14.928 15.396 15.909 16.423 16.977 17.572 18.153 18.847 19.588 20.384 21.224 22.122 23.01 23.792 24.074 23.88 23.459 22.992 22.534 22.111 21.675 21.243 20.781 20.337 19.937 19.551 19.148 18.773 18.436 18.026 17.648 17.357 17.06 16.723 16.425 16.119 15.794 15.53 15.228 14.896 14.562 14.211 13.968 13.718 13.311 13.027 12.733 12.587 12.287 11.964 11.606 11.409 10.565 10.796 10.564 10.297 9.704 9.38 9.021 8.627 8.211 7.761 7.146 5.593 -10 ,21962 ,TETRA ,17604777,Sun Nov 28 18:19:12 CET,Sun Nov 28 20:47:56 CET,0.0 2.33 3.061 3.596 4.066 4.492 4.868 5.204 5.812 6.087 6.351 6.165 7.038 7.26 7.653 8.008 8.354 8.516 8.824 9.112 9.501 9.764 10.036 10.405 10.765 11.131 11.467 11.79 12.189 12.544 12.87 13.25 13.629 14.009 14.419 14.85 15.265 15.708 16.167 16.65 17.146 17.673 18.288 18.899 19.597 20.369 21.165 22.02 22.963 23.888 24.65 24.756 24.418 23.94 23.453 22.966 22.488 22.011 21.563 21.102 20.702 20.322 19.922 19.534 19.152 18.796 18.418 18.073 17.779 17.475 17.139 16.792 16.402 16.041 15.775 15.495 15.191 14.854 14.464 14.175 13.878 13.4 13.06 12.705 12.519 12.13 11.737 11.329 11.116 10.222 10.369 10.104 9.807 9.182 8.853 8.483 8.07 7.615 7.105 6.43 5.002 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt deleted file mode 100644 index 718ec27e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6441 ,TETRA ,17604778,Sun Nov 28 18:19:09 CET,Sun Nov 28 20:48:46 CET,0.0 0.922 1.458 1.897 2.284 2.626 2.927 3.215 3.745 3.996 4.244 4.053 4.895 5.1 5.493 5.857 6.201 6.367 6.695 7.006 7.449 7.738 8.01 8.39 8.753 9.107 9.446 9.774 10.21 10.623 11.01 11.488 11.938 12.373 12.895 13.462 14.012 14.625 15.288 16.008 16.753 17.557 18.487 19.414 20.446 21.519 22.671 23.908 25.17 26.463 27.715 28.374 28.556 28.497 28.286 28.014 27.736 27.417 27.068 26.701 26.366 26.047 25.721 25.392 25.092 24.801 24.477 24.166 23.854 23.531 23.182 22.853 22.545 22.203 21.892 21.575 21.275 20.941 20.558 20.287 19.995 19.533 19.21 18.897 18.734 18.373 17.989 17.569 17.346 16.483 16.644 16.388 16.118 15.531 15.189 14.807 14.385 13.897 13.33 12.576 10.978 -2 ,13840 ,TETRA ,17604779,Sun Nov 28 18:19:11 CET,Sun Nov 28 20:49:58 CET,0.0 1.201 1.864 2.378 2.791 3.129 3.44 3.761 4.359 4.612 4.845 4.651 5.509 5.707 6.071 6.43 6.768 6.924 7.243 7.559 8.013 8.315 8.615 9.022 9.402 9.765 10.122 10.477 10.921 11.332 11.71 12.161 12.622 13.066 13.582 14.137 14.622 15.183 15.777 16.382 17.032 17.72 18.524 19.323 20.191 21.152 22.199 23.294 24.487 25.78 27.166 28.021 28.245 28.172 27.968 27.668 27.32 26.925 26.561 26.167 25.781 25.424 25.075 24.752 24.405 24.042 23.654 23.307 23.019 22.731 22.418 22.113 21.779 21.43 21.155 20.854 20.557 20.259 19.892 19.625 19.357 18.916 18.616 18.288 18.106 17.772 17.432 17.049 16.849 16.018 16.214 15.971 15.716 15.155 14.822 14.458 14.059 13.586 13.027 12.284 10.697 -3 ,24680 ,TETRA ,17604780,Sun Nov 28 18:19:14 CET,Sun Nov 28 20:46:16 CET,0.0 1.202 1.814 2.274 2.684 3.038 3.367 3.676 4.239 4.492 4.737 4.564 5.428 5.64 6.046 6.434 6.815 6.997 7.329 7.645 8.1 8.393 8.67 9.038 9.391 9.764 10.136 10.482 10.901 11.284 11.658 12.121 12.56 12.972 13.402 13.856 14.284 14.769 15.302 15.875 16.515 17.191 17.936 18.677 19.517 20.455 21.461 22.517 23.718 25.011 26.353 27.182 27.432 27.395 27.189 26.894 26.568 26.226 25.897 25.552 25.226 24.903 24.589 24.29 23.999 23.713 23.378 23.075 22.815 22.46 22.086 21.83 21.536 21.223 20.969 20.674 20.375 20.044 19.713 19.511 19.297 18.95 18.708 18.397 18.208 17.85 17.471 17.032 16.798 15.947 16.075 15.803 15.519 14.914 14.601 14.253 13.849 13.354 12.719 11.995 10.688 -4 ,2413 ,TETRA ,17604781,Sun Nov 28 18:19:10 CET,Sun Nov 28 20:49:39 CET,0.0 1.008 1.534 1.96 2.301 2.587 2.852 3.108 3.619 3.869 4.109 3.899 4.776 4.977 5.371 5.759 6.131 6.307 6.635 6.959 7.431 7.72 7.999 8.408 8.811 9.211 9.572 9.91 10.353 10.767 11.172 11.66 12.109 12.541 13.066 13.651 14.169 14.756 15.384 15.991 16.655 17.42 18.245 19.009 19.841 20.758 21.747 22.8 24.017 25.342 26.738 27.612 27.875 27.859 27.732 27.527 27.256 26.963 26.661 26.295 25.962 25.651 25.345 25.038 24.642 24.267 23.952 23.684 23.429 23.141 22.83 22.575 22.304 22.012 21.767 21.472 21.164 20.815 20.463 20.242 20.002 19.591 19.297 19.021 18.878 18.572 18.222 17.825 17.615 16.767 16.888 16.607 16.314 15.626 15.22 14.793 14.33 13.833 13.28 12.552 10.989 -5 ,3621 ,TETRA ,17604782,Sun Nov 28 18:19:10 CET,Sun Nov 28 20:49:43 CET,0.0 1.275 1.856 2.326 2.729 3.08 3.393 3.687 4.222 4.471 4.723 4.558 5.415 5.617 6.003 6.406 6.794 6.978 7.317 7.628 8.073 8.354 8.645 9.059 9.439 9.805 10.162 10.499 10.922 11.329 11.703 12.155 12.62 13.091 13.637 14.199 14.706 15.256 15.8 16.33 16.918 17.588 18.345 19.08 19.897 20.774 21.744 22.843 24.051 25.365 26.779 27.624 27.819 27.757 27.533 27.245 26.963 26.648 26.339 26.014 25.703 25.386 25.05 24.728 24.44 24.157 23.783 23.437 23.123 22.784 22.47 22.214 21.921 21.603 21.374 21.096 20.792 20.447 20.051 19.803 19.529 19.069 18.753 18.427 18.263 17.929 17.544 17.108 16.89 16.044 16.217 15.955 15.668 15.06 14.724 14.345 13.923 13.466 12.851 12.022 10.543 -6 ,12446 ,TETRA ,17604783,Sun Nov 28 18:19:12 CET,Sun Nov 28 20:50:22 CET,0.0 1.525 2.217 2.743 3.179 3.569 3.943 4.287 4.923 5.213 5.459 5.303 6.181 6.393 6.784 7.144 7.487 7.658 8.012 8.344 8.799 9.094 9.364 9.758 10.135 10.486 10.824 11.155 11.582 11.974 12.327 12.743 13.14 13.557 14.033 14.492 14.956 15.475 16.036 16.613 17.163 17.765 18.472 19.185 19.994 20.876 21.861 22.937 24.139 25.518 26.94 27.783 28.066 28.02 27.819 27.551 27.243 26.891 26.557 26.188 25.846 25.561 25.243 24.902 24.594 24.31 23.986 23.651 23.355 23.02 22.653 22.368 22.054 21.691 21.425 21.174 20.907 20.606 20.251 19.97 19.692 19.255 18.943 18.664 18.531 18.208 17.795 17.392 17.201 16.338 16.422 16.118 15.814 15.176 14.815 14.437 14.039 13.57 12.97 12.123 10.486 -7 ,5355 ,TETRA ,17604784,Sun Nov 28 18:19:13 CET,Sun Nov 28 20:49:41 CET,0.0 1.074 1.672 2.097 2.441 2.765 3.069 3.353 3.868 4.096 4.322 4.093 4.943 5.133 5.505 5.861 6.202 6.373 6.703 7.004 7.43 7.71 7.985 8.383 8.76 9.102 9.427 9.758 10.194 10.604 10.998 11.462 11.904 12.331 12.83 13.386 13.878 14.382 14.935 15.542 16.146 16.786 17.568 18.33 19.143 20.031 21.026 22.145 23.362 24.626 25.928 26.686 26.91 26.852 26.668 26.41 26.094 25.728 25.345 24.935 24.603 24.305 23.991 23.66 23.359 23.085 22.776 22.472 22.152 21.82 21.481 21.196 20.912 20.583 20.274 19.923 19.558 19.164 18.743 18.447 18.141 17.642 17.278 16.933 16.763 16.388 15.945 15.484 15.264 14.398 14.549 14.28 13.973 13.276 12.914 12.537 12.13 11.653 11.086 10.332 8.903 -8 ,31316 ,TETRA ,17604785,Sun Nov 28 18:19:10 CET,Sun Nov 28 20:49:02 CET,0.0 1.111 1.555 1.925 2.282 2.612 2.94 3.252 3.81 4.067 4.312 4.142 4.974 5.181 5.569 5.927 6.269 6.439 6.764 7.063 7.523 7.826 8.097 8.492 8.896 9.266 9.602 9.946 10.396 10.825 11.232 11.69 12.111 12.544 13.057 13.576 14.045 14.536 15.046 15.618 16.26 16.982 17.749 18.472 19.302 20.186 21.192 22.295 23.461 24.693 26.023 26.793 26.96 26.92 26.75 26.459 26.138 25.799 25.46 25.103 24.751 24.378 24.034 23.736 23.439 23.144 22.806 22.493 22.184 21.83 21.48 21.187 20.867 20.504 20.196 19.905 19.585 19.222 18.869 18.604 18.302 17.843 17.526 17.19 17.019 16.656 16.271 15.865 15.652 14.79 14.922 14.663 14.391 13.817 13.497 13.131 12.728 12.282 11.751 11.085 9.909 -9 ,21103 ,TETRA ,17604786,Sun Nov 28 18:19:12 CET,Sun Nov 28 20:49:02 CET,0.0 1.078 1.71 2.216 2.627 2.987 3.3 3.584 4.136 4.4 4.655 4.467 5.32 5.518 5.903 6.29 6.656 6.821 7.141 7.459 7.923 8.199 8.459 8.841 9.195 9.522 9.849 10.19 10.614 11.029 11.418 11.865 12.312 12.731 13.237 13.844 14.397 14.98 15.569 16.152 16.76 17.421 18.189 18.943 19.799 20.773 21.885 23.065 24.294 25.542 26.851 27.669 27.993 28.053 27.977 27.794 27.559 27.301 26.998 26.635 26.291 25.973 25.671 25.377 25.105 24.842 24.539 24.246 23.979 23.672 23.336 23.044 22.67 22.225 21.861 21.494 21.125 20.732 20.32 20.035 19.745 19.306 19.0 18.671 18.497 18.13 17.739 17.343 17.127 16.252 16.406 16.13 15.846 15.206 14.866 14.491 14.069 13.607 13.08 12.372 10.8 -10 ,1901 ,TETRA ,17604787,Sun Nov 28 18:19:14 CET,Sun Nov 28 20:50:03 CET,0.0 1.061 1.598 2.04 2.437 2.78 3.071 3.359 3.897 4.149 4.396 4.217 5.081 5.291 5.701 6.095 6.463 6.639 6.984 7.303 7.738 8.014 8.295 8.666 8.998 9.335 9.656 9.988 10.416 10.827 11.256 11.723 12.112 12.522 12.987 13.499 14.024 14.562 15.109 15.69 16.296 16.921 17.654 18.415 19.271 20.188 21.177 22.282 23.514 24.792 26.09 26.935 27.19 27.121 26.904 26.583 26.25 25.902 25.575 25.23 24.908 24.593 24.274 23.969 23.658 23.334 22.979 22.647 22.336 22.018 21.692 21.405 21.089 20.779 20.56 20.318 20.026 19.7 19.367 19.098 18.827 18.481 18.225 17.939 17.78 17.4 16.973 16.527 16.293 15.393 15.549 15.269 14.963 14.29 13.935 13.561 13.135 12.649 12.107 11.446 10.063 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt deleted file mode 100644 index 48ef6065..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3911 ,TETRA ,17604788,Sun Nov 28 18:19:17 CET,Sun Nov 28 20:37:40 CET,0.0 1.476 2.125 2.619 3.037 3.414 3.754 4.062 4.636 4.891 5.135 5.127 5.819 6.019 6.375 6.701 7.005 7.155 7.453 7.723 8.103 8.349 8.589 8.941 9.266 9.584 9.892 10.168 10.517 10.873 11.222 11.634 12.026 12.417 12.877 13.364 13.839 14.372 14.929 15.488 16.068 16.738 17.508 18.262 19.111 20.02 21.036 22.164 23.475 24.949 26.396 27.334 27.688 27.765 27.736 27.617 27.473 27.261 27.019 26.757 26.478 26.165 25.876 25.623 25.372 25.128 24.85 24.599 24.375 24.148 23.918 23.696 23.455 23.217 23.009 22.785 22.563 22.313 22.051 21.879 21.694 21.382 21.153 20.921 20.804 20.553 20.281 20.004 19.855 19.22 19.31 19.093 18.876 18.417 18.16 17.88 17.559 17.182 16.71 15.991 13.898 -2 ,26599 ,TETRA ,17604789,Sun Nov 28 18:19:10 CET,Sun Nov 28 20:39:21 CET,0.0 1.335 2.003 2.556 2.974 3.348 3.677 3.988 4.567 4.833 5.089 5.068 5.757 5.969 6.349 6.698 7.033 7.185 7.481 7.761 8.151 8.405 8.662 9.038 9.393 9.733 10.052 10.347 10.728 11.108 11.457 11.866 12.276 12.666 13.102 13.577 14.026 14.513 15.041 15.602 16.183 16.818 17.526 18.206 18.992 19.901 20.958 22.134 23.407 24.757 26.277 27.415 27.943 28.114 28.061 27.878 27.65 27.404 27.165 26.887 26.622 26.382 26.142 25.914 25.684 25.452 25.199 24.967 24.757 24.541 24.321 24.107 23.873 23.612 23.398 23.192 22.969 22.726 22.47 22.284 22.098 21.801 21.585 21.362 21.25 21.016 20.737 20.433 20.284 19.657 19.751 19.552 19.355 18.889 18.63 18.357 18.028 17.642 17.162 16.45 14.549 -3 ,2612 ,TETRA ,17604790,Sun Nov 28 18:19:11 CET,Sun Nov 28 20:39:20 CET,0.0 1.485 2.213 2.776 3.247 3.635 3.976 4.297 4.854 5.1 5.339 5.29 5.975 6.181 6.553 6.895 7.218 7.378 7.692 8.0 8.425 8.682 8.939 9.322 9.682 10.024 10.352 10.658 11.035 11.381 11.711 12.115 12.51 12.895 13.331 13.821 14.313 14.846 15.393 15.944 16.511 17.12 17.824 18.565 19.397 20.271 21.239 22.309 23.511 24.814 26.188 27.1 27.441 27.521 27.45 27.265 27.015 26.761 26.528 26.255 25.987 25.734 25.496 25.264 25.024 24.775 24.506 24.258 24.023 23.768 23.491 23.244 22.989 22.684 22.449 22.258 22.063 21.825 21.565 21.393 21.209 20.912 20.695 20.467 20.357 20.135 19.881 19.59 19.425 18.798 18.908 18.71 18.498 17.991 17.707 17.406 17.059 16.649 16.131 15.405 13.56 -4 ,17340 ,TETRA ,17604791,Sun Nov 28 18:19:14 CET,Sun Nov 28 20:36:34 CET,0.0 3.048 3.775 4.305 4.753 5.154 5.546 5.913 6.527 6.783 7.012 6.958 7.651 7.856 8.234 8.582 8.904 9.057 9.357 9.642 10.053 10.308 10.555 10.908 11.241 11.567 11.879 12.177 12.573 12.963 13.33 13.755 14.159 14.565 15.018 15.505 15.965 16.448 16.966 17.515 18.068 18.71 19.472 20.2 21.047 21.964 22.971 24.061 25.279 26.62 28.08 29.085 29.469 29.487 29.351 29.202 28.951 28.659 28.374 28.022 27.722 27.456 27.184 26.924 26.68 26.438 26.154 25.896 25.66 25.387 25.105 24.877 24.629 24.354 24.133 23.898 23.654 23.377 23.08 22.884 22.674 22.32 22.072 21.814 21.673 21.394 21.113 20.797 20.632 19.996 20.11 19.892 19.655 19.149 18.865 18.538 18.172 17.749 17.206 16.445 14.548 -5 ,3931 ,TETRA ,17604792,Sun Nov 28 18:19:15 CET,Sun Nov 28 20:36:15 CET,0.0 1.54 2.298 2.903 3.367 3.769 4.159 4.489 5.029 5.275 5.509 5.462 6.166 6.386 6.8 7.207 7.59 7.763 8.099 8.427 8.902 9.2 9.485 9.877 10.248 10.601 10.914 11.212 11.605 11.97 12.311 12.716 13.111 13.495 13.926 14.393 14.839 15.328 15.834 16.394 16.999 17.635 18.391 19.163 20.023 20.944 21.954 23.069 24.304 25.634 27.072 27.973 28.313 28.408 28.326 28.15 27.92 27.676 27.459 27.196 26.96 26.735 26.507 26.283 26.032 25.8 25.533 25.27 25.049 24.842 24.62 24.404 24.162 23.901 23.703 23.5 23.282 23.037 22.753 22.558 22.367 22.072 21.872 21.656 21.534 21.262 20.967 20.665 20.505 19.864 19.991 19.791 19.547 18.984 18.667 18.318 17.956 17.521 16.95 16.17 14.647 -6 ,20548 ,TETRA ,17604793,Sun Nov 28 18:19:12 CET,Sun Nov 28 20:36:55 CET,0.0 1.876 2.554 3.074 3.492 3.855 4.198 4.494 5.02 5.264 5.477 5.403 6.078 6.269 6.637 6.991 7.31 7.461 7.751 8.027 8.421 8.672 8.915 9.27 9.613 9.945 10.267 10.574 10.96 11.31 11.645 12.075 12.484 12.874 13.32 13.792 14.253 14.758 15.296 15.901 16.517 17.165 17.893 18.601 19.426 20.322 21.309 22.408 23.694 25.112 26.624 27.574 27.915 27.998 27.95 27.759 27.51 27.233 26.976 26.68 26.339 26.019 25.737 25.472 25.209 24.931 24.611 24.327 24.071 23.801 23.521 23.271 22.998 22.714 22.493 22.268 22.037 21.795 21.553 21.374 21.169 20.862 20.645 20.39 20.253 19.96 19.626 19.271 19.095 18.466 18.563 18.354 18.13 17.644 17.381 17.066 16.715 16.34 15.868 15.132 13.486 -7 ,22395 ,TETRA ,17604794,Sun Nov 28 18:19:15 CET,Sun Nov 28 20:36:25 CET,0.0 2.157 2.942 3.479 3.938 4.324 4.643 4.954 5.496 5.738 5.972 5.914 6.602 6.803 7.174 7.532 7.88 8.039 8.334 8.613 9.01 9.259 9.508 9.859 10.176 10.5 10.826 11.117 11.484 11.833 12.155 12.555 12.95 13.325 13.742 14.199 14.651 15.175 15.746 16.319 16.915 17.586 18.339 19.091 19.967 20.964 22.079 23.269 24.556 25.905 27.339 28.243 28.567 28.61 28.48 28.276 28.09 27.9 27.672 27.374 27.073 26.783 26.48 26.151 25.828 25.538 25.244 24.978 24.731 24.467 24.194 23.961 23.713 23.453 23.249 23.028 22.784 22.53 22.254 22.057 21.857 21.525 21.287 21.046 20.923 20.657 20.37 20.035 19.848 19.211 19.329 19.134 18.921 18.457 18.187 17.884 17.55 17.173 16.732 16.104 14.644 -8 ,28515 ,TETRA ,17604795,Sun Nov 28 18:19:17 CET,Sun Nov 28 20:37:46 CET,0.0 1.709 2.413 2.962 3.432 3.854 4.236 4.578 5.2 5.478 5.74 5.751 6.457 6.68 7.11 7.503 7.876 8.056 8.414 8.736 9.174 9.466 9.741 10.135 10.522 10.88 11.201 11.511 11.907 12.269 12.599 12.993 13.391 13.78 14.216 14.684 15.143 15.651 16.179 16.728 17.286 17.917 18.635 19.343 20.182 21.071 22.076 23.232 24.584 26.137 27.765 28.887 29.404 29.587 29.578 29.434 29.25 29.023 28.775 28.495 28.207 27.946 27.65 27.332 27.013 26.729 26.445 26.165 25.888 25.59 25.288 25.034 24.789 24.528 24.323 24.119 23.889 23.64 23.374 23.179 22.981 22.686 22.48 22.265 22.15 21.89 21.569 21.221 21.048 20.382 20.395 20.164 19.929 19.392 19.07 18.691 18.273 17.812 17.258 16.523 14.893 -9 ,4669 ,TETRA ,17604796,Sun Nov 28 18:19:13 CET,Sun Nov 28 20:37:12 CET,0.0 1.406 2.061 2.555 2.99 3.367 3.69 3.991 4.569 4.836 5.082 5.064 5.75 5.95 6.316 6.665 7.001 7.162 7.466 7.765 8.197 8.476 8.75 9.122 9.458 9.788 10.137 10.47 10.911 11.34 11.748 12.241 12.654 13.022 13.477 14.016 14.481 14.991 15.556 16.123 16.672 17.275 17.989 18.724 19.598 20.535 21.552 22.643 23.91 25.374 27.001 28.106 28.515 28.613 28.542 28.36 28.154 27.96 27.758 27.498 27.219 26.909 26.592 26.279 25.958 25.645 25.331 25.053 24.802 24.515 24.172 23.876 23.584 23.28 23.031 22.761 22.457 22.132 21.843 21.619 21.339 20.912 20.615 20.293 20.119 19.774 19.422 19.024 18.814 18.143 18.151 17.894 17.618 17.06 16.761 16.404 15.969 15.477 14.936 14.221 12.718 -10 ,30772 ,TETRA ,17604797,Sun Nov 28 18:19:12 CET,Sun Nov 28 20:43:51 CET,0.0 1.56 2.233 2.678 3.061 3.416 3.75 4.064 4.634 4.88 5.101 5.045 5.726 5.918 6.297 6.636 6.959 7.117 7.417 7.699 8.09 8.339 8.582 8.932 9.269 9.584 9.887 10.178 10.542 10.902 11.242 11.641 12.025 12.399 12.83 13.311 13.77 14.246 14.751 15.296 15.851 16.451 17.145 17.864 18.704 19.632 20.678 21.819 23.087 24.501 26.09 27.164 27.541 27.587 27.51 27.372 27.197 26.985 26.753 26.505 26.257 26.0 25.745 25.495 25.225 24.962 24.691 24.435 24.204 23.945 23.641 23.388 23.156 22.918 22.72 22.517 22.316 22.108 21.873 21.701 21.516 21.211 20.993 20.765 20.646 20.394 20.128 19.843 19.686 19.056 19.173 18.966 18.762 18.344 18.115 17.859 17.535 17.108 16.585 15.915 14.371 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt deleted file mode 100644 index f0e092a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26506 ,TETRA ,17604798,Sun Nov 28 18:19:14 CET,Sun Nov 28 20:44:28 CET,0.0 3.419 4.14 4.584 4.953 5.274 5.56 5.83 6.334 6.552 6.754 6.65 7.321 7.5 7.851 8.181 8.488 8.643 8.939 9.23 9.663 9.929 10.179 10.53 10.833 11.122 11.416 11.686 12.019 12.348 12.661 13.019 13.332 13.621 13.967 14.335 14.679 15.047 15.463 15.887 16.274 16.659 17.102 17.564 18.062 18.567 19.108 19.682 20.242 20.737 20.989 20.824 20.438 19.943 19.413 18.845 18.299 17.81 17.379 16.927 16.523 16.161 15.793 15.435 15.109 14.796 14.453 14.139 13.845 13.535 13.212 12.93 12.639 12.342 12.096 11.82 11.502 11.166 10.832 10.563 10.302 9.94 9.655 9.339 9.172 8.829 8.506 8.136 7.906 7.178 7.176 6.906 6.621 6.021 5.694 5.337 4.898 4.393 3.814 3.088 1.336 -2 ,29929 ,TETRA ,17604799,Sun Nov 28 18:19:16 CET,Sun Nov 28 20:38:05 CET,0.0 1.077 1.653 2.114 2.517 2.882 3.222 3.53 4.062 4.303 4.54 4.489 5.162 5.367 5.745 6.093 6.421 6.578 6.852 7.107 7.477 7.7 7.913 8.183 8.445 8.73 9.039 9.324 9.658 10.035 10.378 10.709 10.99 11.248 11.58 11.962 12.347 12.735 13.084 13.476 13.887 14.31 14.789 15.25 15.747 16.315 16.925 17.503 18.108 18.638 18.843 18.649 18.219 17.694 17.148 16.609 16.097 15.593 15.148 14.668 14.249 13.891 13.483 13.069 12.71 12.379 12.026 11.678 11.368 11.047 10.713 10.426 10.093 9.715 9.415 9.123 8.842 8.547 8.243 8.035 7.768 7.305 7.022 6.734 6.568 6.212 5.819 5.435 5.24 4.517 4.509 4.257 3.988 3.344 2.991 2.611 2.192 1.718 1.162 0.44 -1.164 -3 ,19500 ,TETRA ,17604800,Sun Nov 28 18:19:18 CET,Sun Nov 28 20:37:43 CET,0.0 1.131 1.727 2.202 2.609 2.993 3.346 3.645 4.175 4.426 4.652 4.599 5.29 5.487 5.859 6.224 6.544 6.7 7.023 7.328 7.78 8.063 8.338 8.682 8.982 9.298 9.597 9.869 10.17 10.443 10.724 11.066 11.399 11.702 12.023 12.386 12.729 13.071 13.434 13.837 14.238 14.675 15.159 15.61 16.115 16.638 17.212 17.784 18.31 18.825 19.203 19.099 18.66 18.118 17.623 17.123 16.628 16.163 15.737 15.289 14.882 14.477 14.064 13.694 13.326 12.99 12.665 12.332 12.038 11.728 11.389 11.119 10.833 10.528 10.31 10.029 9.682 9.373 9.029 8.771 8.517 8.111 7.81 7.495 7.332 6.982 6.607 6.199 5.985 5.278 5.3 5.047 4.779 4.211 3.876 3.496 3.093 2.649 2.108 1.35 -0.299 -4 ,26381 ,TETRA ,17604801,Sun Nov 28 18:19:12 CET,Sun Nov 28 20:37:39 CET,0.0 1.433 2.1 2.567 2.999 3.41 3.74 4.038 4.577 4.817 5.051 4.977 5.64 5.817 6.175 6.528 6.87 7.024 7.299 7.574 7.98 8.227 8.473 8.824 9.104 9.396 9.693 9.949 10.282 10.576 10.852 11.186 11.467 11.73 12.048 12.382 12.696 13.032 13.38 13.741 14.119 14.559 15.048 15.5 15.992 16.504 17.044 17.578 18.126 18.624 18.961 18.868 18.458 17.942 17.445 16.937 16.435 15.946 15.529 15.115 14.712 14.345 13.991 13.616 13.28 12.984 12.632 12.285 11.988 11.673 11.324 11.05 10.751 10.429 10.185 9.903 9.613 9.318 8.989 8.741 8.487 8.049 7.698 7.352 7.178 6.804 6.429 6.032 5.828 5.132 5.17 4.931 4.666 4.086 3.77 3.405 2.989 2.505 1.951 1.264 -0.066 -5 ,9093 ,TETRA ,17604802,Sun Nov 28 18:19:39 CET,Sun Nov 28 20:39:32 CET,0.0 1.427 2.003 2.422 2.783 3.088 3.37 3.639 4.107 4.319 4.518 4.395 5.044 5.216 5.549 5.844 6.118 6.25 6.512 6.765 7.11 7.323 7.544 7.879 8.197 8.491 8.785 9.084 9.41 9.695 9.963 10.255 10.563 10.865 11.195 11.565 11.93 12.341 12.745 13.134 13.53 13.929 14.362 14.821 15.322 15.833 16.392 16.943 17.469 17.921 18.197 18.03 17.578 17.051 16.53 15.971 15.415 14.913 14.517 14.11 13.713 13.318 12.929 12.57 12.23 11.895 11.511 11.166 10.885 10.606 10.317 10.042 9.704 9.339 9.081 8.797 8.504 8.197 7.844 7.58 7.292 6.862 6.565 6.248 6.08 5.74 5.384 4.978 4.762 4.069 4.126 3.885 3.613 3.013 2.675 2.302 1.881 1.372 0.807 0.111 -1.324 -6 ,24610 ,TETRA ,17604803,Sun Nov 28 18:19:39 CET,Sun Nov 28 20:42:21 CET,0.0 1.279 1.927 2.399 2.821 3.2 3.532 3.843 4.41 4.668 4.914 4.907 5.621 5.803 6.135 6.459 6.789 6.958 7.252 7.522 7.939 8.205 8.425 8.733 9.023 9.266 9.538 9.801 10.075 10.357 10.624 10.909 11.192 11.495 11.84 12.184 12.498 12.833 13.193 13.548 13.886 14.258 14.693 15.117 15.578 16.037 16.515 16.996 17.488 17.917 18.079 17.829 17.425 16.971 16.466 15.95 15.494 15.07 14.67 14.25 13.872 13.497 13.115 12.76 12.419 12.085 11.715 11.371 11.071 10.764 10.449 10.167 9.882 9.581 9.322 9.034 8.745 8.486 8.229 8.027 7.76 7.297 6.98 6.646 6.481 6.176 5.87 5.52 5.311 4.603 4.581 4.282 3.997 3.406 3.055 2.67 2.252 1.762 1.151 0.413 -1.327 -7 ,23287 ,TETRA ,17604804,Sun Nov 28 18:19:39 CET,Sun Nov 28 20:38:25 CET,0.0 1.302 1.931 2.41 2.792 3.168 3.523 3.836 4.392 4.638 4.876 4.821 5.516 5.718 6.1 6.451 6.758 6.896 7.183 7.472 7.869 8.097 8.315 8.617 8.934 9.279 9.577 9.848 10.226 10.598 10.925 11.26 11.572 11.855 12.148 12.47 12.789 13.161 13.541 13.932 14.34 14.748 15.206 15.693 16.26 16.868 17.491 18.106 18.692 19.178 19.516 19.335 18.815 18.286 17.772 17.238 16.731 16.259 15.794 15.281 14.821 14.398 14.007 13.637 13.283 12.952 12.545 12.18 11.898 11.56 11.125 10.795 10.484 10.143 9.86 9.52 9.162 8.85 8.518 8.249 7.983 7.566 7.266 6.956 6.782 6.398 5.982 5.549 5.337 4.62 4.566 4.295 4.057 3.52 3.182 2.8 2.367 1.927 1.399 0.658 -0.677 -8 ,24540 ,TETRA ,17604805,Sun Nov 28 18:19:42 CET,Sun Nov 28 20:37:25 CET,0.0 1.494 2.136 2.667 3.094 3.464 3.799 4.101 4.614 4.866 5.113 5.062 5.751 5.941 6.298 6.65 6.959 7.09 7.358 7.608 8.0 8.258 8.475 8.829 9.188 9.511 9.778 9.995 10.265 10.559 10.874 11.219 11.485 11.731 12.019 12.341 12.647 12.992 13.365 13.734 14.115 14.518 14.968 15.412 15.87 16.332 16.857 17.39 17.913 18.362 18.565 18.325 17.861 17.324 16.79 16.267 15.762 15.294 14.859 14.428 14.043 13.656 13.293 12.941 12.603 12.286 11.952 11.645 11.359 11.059 10.74 10.467 10.152 9.824 9.577 9.31 9.049 8.761 8.425 8.195 7.969 7.589 7.273 6.938 6.769 6.389 5.98 5.6 5.401 4.693 4.718 4.45 4.174 3.543 3.187 2.805 2.393 1.94 1.397 0.74 -0.505 -9 ,12193 ,TETRA ,17604806,Sun Nov 28 18:19:40 CET,Sun Nov 28 20:37:30 CET,0.0 1.143 1.839 2.36 2.77 3.127 3.439 3.726 4.242 4.484 4.715 4.637 5.323 5.517 5.896 6.255 6.594 6.76 7.07 7.339 7.733 7.955 8.165 8.501 8.831 9.121 9.348 9.613 10.015 10.372 10.672 11.046 11.388 11.663 11.964 12.302 12.609 12.928 13.275 13.637 14.003 14.406 14.866 15.339 15.857 16.357 16.902 17.463 17.987 18.413 18.658 18.492 18.088 17.586 17.082 16.564 16.059 15.576 15.107 14.608 14.2 13.838 13.448 13.075 12.732 12.39 12.04 11.72 11.433 11.139 10.829 10.579 10.315 10.013 9.714 9.399 9.084 8.765 8.423 8.135 7.838 7.413 7.151 6.868 6.707 6.367 6.041 5.718 5.525 4.819 4.862 4.614 4.337 3.722 3.385 3.001 2.585 2.152 1.623 0.906 -0.825 -10 ,12463 ,TETRA ,17604807,Sun Nov 28 18:19:39 CET,Sun Nov 28 20:38:06 CET,0.0 1.396 2.105 2.642 3.067 3.418 3.726 4.044 4.646 4.903 5.144 5.097 5.799 6.001 6.382 6.749 7.089 7.245 7.549 7.844 8.248 8.514 8.804 9.206 9.54 9.821 10.119 10.406 10.725 11.02 11.273 11.559 11.843 12.115 12.402 12.768 13.119 13.457 13.825 14.191 14.549 14.981 15.467 15.892 16.359 16.854 17.41 17.993 18.587 19.12 19.365 19.137 18.72 18.251 17.773 17.229 16.697 16.225 15.817 15.384 14.965 14.568 14.21 13.87 13.559 13.274 12.944 12.633 12.355 12.041 11.709 11.45 11.177 10.874 10.613 10.319 10.017 9.738 9.46 9.251 9.006 8.623 8.373 8.106 7.945 7.574 7.189 6.778 6.556 5.847 5.866 5.61 5.332 4.708 4.376 4.005 3.58 3.084 2.512 1.903 0.52 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt deleted file mode 100644 index 6729771f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10256 ,TETRA ,17604808,Sun Nov 28 18:19:42 CET,Sun Nov 28 20:38:27 CET,0.0 1.433 2.17 2.727 3.192 3.638 4.058 4.424 5.076 5.395 5.689 5.693 6.421 6.652 7.081 7.486 7.849 8.02 8.342 8.631 9.013 9.283 9.561 9.946 10.3 10.615 10.899 11.177 11.559 11.906 12.212 12.587 12.93 13.241 13.573 13.923 14.246 14.58 14.96 15.331 15.695 16.115 16.536 16.916 17.323 17.717 18.087 18.403 18.529 18.352 17.505 16.159 14.953 13.744 12.646 11.633 10.707 9.89 9.143 8.359 7.698 7.106 6.545 6.001 5.482 5.01 4.519 4.072 3.655 3.185 2.694 2.326 1.94 1.507 1.167 0.819 0.458 0.068 -0.36 -0.659 -0.952 -1.418 -1.756 -2.087 -2.247 -2.624 -3.047 -3.449 -3.649 -4.386 -4.404 -4.67 -4.946 -5.56 -5.9 -6.282 -6.724 -7.19 -7.687 -8.257 -9.485 -2 ,16973 ,TETRA ,17604809,Sun Nov 28 18:19:43 CET,Sun Nov 28 20:36:36 CET,0.0 1.926 2.713 3.345 3.87 4.328 4.742 5.102 5.738 6.017 6.279 6.321 7.068 7.299 7.735 8.133 8.502 8.679 9.005 9.32 9.77 10.036 10.279 10.656 11.029 11.335 11.608 11.911 12.263 12.529 12.811 13.153 13.439 13.708 14.031 14.38 14.684 15.009 15.339 15.653 15.966 16.273 16.595 16.928 17.248 17.528 17.806 17.985 18.017 17.768 16.825 15.304 13.977 12.785 11.666 10.578 9.572 8.681 7.937 7.203 6.551 5.998 5.475 4.946 4.459 4.026 3.576 3.161 2.778 2.371 1.89 1.47 1.046 0.6 0.262 -0.088 -0.455 -0.859 -1.299 -1.587 -1.892 -2.386 -2.722 -3.087 -3.276 -3.637 -4.023 -4.451 -4.682 -5.424 -5.407 -5.675 -5.956 -6.544 -6.852 -7.211 -7.629 -8.061 -8.549 -9.143 -10.324 -3 ,24061 ,TETRA ,17604810,Sun Nov 28 18:19:39 CET,Sun Nov 28 20:39:46 CET,0.0 2.148 3.028 3.667 4.231 4.704 5.111 5.49 6.174 6.497 6.8 6.835 7.57 7.81 8.257 8.664 9.059 9.235 9.537 9.815 10.229 10.501 10.73 11.077 11.454 11.81 12.119 12.38 12.673 12.95 13.25 13.614 13.903 14.169 14.483 14.826 15.149 15.479 15.811 16.151 16.469 16.805 17.176 17.511 17.855 18.175 18.421 18.554 18.613 18.362 17.317 15.778 14.306 12.925 11.797 10.782 9.847 8.999 8.233 7.476 6.83 6.218 5.634 5.108 4.617 4.165 3.671 3.203 2.813 2.411 1.927 1.524 1.108 0.637 0.268 -0.128 -0.553 -0.997 -1.44 -1.739 -2.042 -2.536 -2.886 -3.258 -3.455 -3.836 -4.215 -4.649 -4.891 -5.638 -5.669 -5.948 -6.239 -6.833 -7.168 -7.547 -7.966 -8.394 -8.872 -9.535 -10.857 -4 ,28389 ,TETRA ,17604811,Sun Nov 28 18:19:40 CET,Sun Nov 28 20:45:07 CET,0.0 2.183 3.058 3.768 4.305 4.77 5.178 5.566 6.291 6.621 6.93 6.994 7.731 7.947 8.383 8.792 9.124 9.291 9.599 9.873 10.265 10.518 10.738 11.028 11.33 11.663 11.984 12.257 12.573 12.864 13.127 13.428 13.727 14.004 14.32 14.66 14.968 15.285 15.603 15.934 16.255 16.574 16.894 17.216 17.551 17.819 18.042 18.175 18.219 17.919 16.878 15.354 13.945 12.697 11.558 10.475 9.536 8.708 7.964 7.187 6.485 5.867 5.29 4.733 4.212 3.724 3.184 2.692 2.285 1.856 1.429 1.091 0.713 0.292 -0.03 -0.378 -0.752 -1.125 -1.503 -1.778 -2.105 -2.632 -2.98 -3.337 -3.51 -3.861 -4.256 -4.681 -4.905 -5.642 -5.656 -5.925 -6.214 -6.833 -7.175 -7.529 -7.927 -8.396 -8.916 -9.523 -10.818 -5 ,1467 ,TETRA ,17604812,Sun Nov 28 18:19:41 CET,Sun Nov 28 20:44:22 CET,0.0 2.284 3.14 3.78 4.288 4.73 5.134 5.515 6.218 6.528 6.797 6.825 7.561 7.797 8.252 8.642 8.99 9.164 9.494 9.781 10.196 10.457 10.683 11.001 11.286 11.544 11.811 12.069 12.367 12.649 12.924 13.242 13.532 13.793 14.09 14.427 14.753 15.093 15.434 15.776 16.109 16.464 16.852 17.183 17.508 17.796 18.031 18.209 18.245 18.05 17.237 15.829 14.499 13.228 12.037 10.956 10.04 9.219 8.483 7.722 7.05 6.48 5.947 5.411 4.9 4.382 3.816 3.356 2.958 2.516 2.065 1.703 1.339 0.96 0.633 0.295 -0.067 -0.492 -0.914 -1.196 -1.504 -1.995 -2.313 -2.653 -2.841 -3.23 -3.66 -4.125 -4.362 -5.085 -5.073 -5.345 -5.633 -6.249 -6.562 -6.912 -7.31 -7.748 -8.236 -8.857 -9.955 -6 ,10991 ,TETRA ,17604813,Sun Nov 28 18:19:42 CET,Sun Nov 28 20:37:25 CET,0.0 2.204 3.11 3.77 4.303 4.784 5.227 5.599 6.256 6.564 6.867 6.912 7.629 7.853 8.298 8.698 9.034 9.185 9.497 9.802 10.239 10.545 10.824 11.163 11.449 11.738 12.034 12.282 12.566 12.887 13.188 13.464 13.715 13.966 14.266 14.583 14.863 15.164 15.465 15.776 16.091 16.444 16.819 17.16 17.528 17.86 18.137 18.312 18.362 18.151 17.469 16.224 14.914 13.725 12.633 11.611 10.669 9.79 9.006 8.224 7.559 6.97 6.42 5.885 5.391 4.924 4.422 3.979 3.594 3.204 2.806 2.463 2.101 1.717 1.382 1.024 0.668 0.318 -0.026 -0.288 -0.566 -1.0 -1.346 -1.716 -1.901 -2.288 -2.716 -3.162 -3.384 -4.131 -4.121 -4.372 -4.651 -5.282 -5.621 -6.001 -6.402 -6.819 -7.297 -7.916 -9.247 -7 ,10012 ,TETRA ,17604814,Sun Nov 28 18:19:40 CET,Sun Nov 28 20:38:49 CET,0.0 2.046 2.963 3.629 4.149 4.594 5.002 5.392 6.095 6.399 6.677 6.691 7.421 7.654 8.114 8.515 8.845 9.003 9.297 9.557 9.927 10.173 10.404 10.768 11.199 11.548 11.794 12.026 12.353 12.66 12.925 13.247 13.543 13.811 14.157 14.54 14.842 15.178 15.524 15.871 16.225 16.562 16.913 17.269 17.639 17.992 18.295 18.446 18.429 18.217 17.358 15.863 14.411 13.115 12.006 10.978 10.039 9.21 8.543 7.824 7.177 6.583 5.991 5.461 4.975 4.52 4.038 3.599 3.224 2.781 2.287 1.92 1.51 1.021 0.663 0.338 0.011 -0.345 -0.737 -1.033 -1.352 -1.832 -2.163 -2.487 -2.656 -3.052 -3.466 -3.877 -4.091 -4.829 -4.804 -5.062 -5.342 -5.963 -6.298 -6.665 -7.074 -7.52 -8.004 -8.613 -9.683 -8 ,10849 ,TETRA ,17604815,Sun Nov 28 18:19:42 CET,Sun Nov 28 20:39:09 CET,0.0 2.194 3.047 3.723 4.251 4.712 5.129 5.501 6.194 6.528 6.814 6.803 7.547 7.773 8.189 8.622 9.043 9.214 9.519 9.854 10.342 10.604 10.823 11.154 11.504 11.827 12.141 12.45 12.819 13.168 13.456 13.809 14.165 14.517 14.898 15.304 15.68 16.023 16.368 16.684 17.009 17.379 17.764 18.117 18.489 18.832 19.173 19.429 19.48 19.292 18.581 17.298 16.061 14.913 13.84 12.837 11.979 11.208 10.526 9.815 9.18 8.608 8.059 7.52 6.988 6.515 5.953 5.391 4.961 4.545 4.105 3.751 3.402 3.052 2.735 2.396 2.071 1.729 1.379 1.116 0.813 0.303 -0.049 -0.412 -0.605 -0.999 -1.395 -1.786 -2.009 -2.756 -2.761 -3.032 -3.298 -3.913 -4.282 -4.668 -5.068 -5.515 -6.024 -6.621 -7.776 -9 ,8107 ,TETRA ,17604816,Sun Nov 28 18:19:44 CET,Sun Nov 28 20:39:16 CET,0.0 2.339 3.181 3.806 4.348 4.799 5.197 5.568 6.274 6.596 6.895 6.917 7.636 7.859 8.283 8.706 9.101 9.265 9.54 9.834 10.285 10.565 10.822 11.201 11.581 11.89 12.171 12.437 12.747 13.017 13.272 13.579 13.853 14.095 14.347 14.646 14.929 15.222 15.529 15.853 16.172 16.494 16.856 17.175 17.524 17.887 18.203 18.372 18.374 18.129 17.262 15.748 14.353 13.149 11.983 10.904 9.966 9.048 8.212 7.375 6.674 6.038 5.421 4.835 4.287 3.803 3.29 2.831 2.435 2.032 1.605 1.241 0.869 0.473 0.164 -0.173 -0.526 -0.88 -1.236 -1.47 -1.716 -2.108 -2.39 -2.683 -2.834 -3.162 -3.497 -3.845 -4.036 -4.739 -4.696 -4.948 -5.201 -5.821 -6.197 -6.613 -7.105 -7.707 -8.447 -9.467 -13.284 -10 ,31076 ,TETRA ,17604817,Sun Nov 28 18:19:46 CET,Sun Nov 28 20:38:41 CET,0.0 2.326 3.178 3.735 4.227 4.681 5.067 5.415 6.041 6.345 6.661 6.727 7.457 7.69 8.141 8.579 8.969 9.151 9.515 9.849 10.288 10.553 10.792 11.107 11.434 11.786 12.097 12.362 12.709 13.038 13.34 13.671 13.985 14.299 14.627 14.956 15.266 15.61 15.986 16.373 16.743 17.119 17.549 17.937 18.287 18.606 18.892 19.055 19.134 18.965 18.289 17.102 15.834 14.683 13.643 12.639 11.739 10.919 10.211 9.47 8.833 8.292 7.753 7.217 6.699 6.222 5.728 5.294 4.931 4.561 4.148 3.77 3.392 3.03 2.72 2.396 2.036 1.631 1.214 0.91 0.603 0.116 -0.229 -0.595 -0.765 -1.088 -1.491 -1.948 -2.171 -2.899 -2.913 -3.196 -3.489 -4.134 -4.486 -4.872 -5.286 -5.746 -6.274 -6.987 -8.377 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt deleted file mode 100644 index 08f93c60..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1680 ,TETRA ,17604818,Sun Nov 28 18:19:44 CET,Sun Nov 28 20:35:31 CET,0.0 1.282 1.905 2.44 2.884 3.25 3.568 3.88 4.464 4.72 4.956 4.894 5.611 5.822 6.226 6.612 6.984 7.158 7.495 7.83 8.316 8.629 8.905 9.288 9.647 9.962 10.243 10.497 10.849 11.197 11.498 11.858 12.288 12.766 13.226 13.646 14.055 14.5 15.017 15.536 16.024 16.581 17.242 17.911 18.667 19.468 20.333 21.254 22.226 23.298 24.346 24.775 24.759 24.57 24.25 23.855 23.438 22.979 22.557 22.11 21.663 21.236 20.813 20.388 19.928 19.488 19.03 18.628 18.268 17.856 17.389 17.0 16.546 16.025 15.647 15.237 14.815 14.409 13.948 13.606 13.251 12.711 12.302 11.851 11.63 11.141 10.556 9.879 9.541 8.734 8.553 8.192 7.765 6.801 6.252 5.605 4.883 4.037 3.031 1.733 -2.945 -2 ,23722 ,TETRA ,17604819,Sun Nov 28 18:19:40 CET,Sun Nov 28 20:37:47 CET,0.0 1.238 1.811 2.245 2.674 3.053 3.401 3.729 4.33 4.617 4.869 4.827 5.549 5.758 6.168 6.533 6.875 7.059 7.414 7.721 8.086 8.302 8.549 8.963 9.339 9.638 9.932 10.262 10.662 10.98 11.294 11.673 12.008 12.328 12.695 13.128 13.542 13.971 14.449 14.943 15.433 15.994 16.619 17.222 17.926 18.718 19.629 20.55 21.526 22.624 23.791 24.445 24.474 24.247 23.867 23.435 23.0 22.532 22.072 21.58 21.142 20.701 20.248 19.807 19.397 19.031 18.643 18.28 17.941 17.589 17.135 16.681 16.25 15.827 15.439 15.003 14.575 14.151 13.738 13.452 13.144 12.634 12.243 11.854 11.649 11.204 10.74 10.206 9.901 9.084 8.887 8.514 8.104 7.132 6.588 6.042 5.408 4.63 3.713 2.463 -1.173 -3 ,2765 ,TETRA ,17604820,Sun Nov 28 18:19:42 CET,Sun Nov 28 20:35:03 CET,0.0 2.339 3.063 3.56 3.969 4.335 4.671 4.976 5.537 5.79 6.019 5.974 6.693 6.898 7.3 7.692 8.048 8.22 8.573 8.914 9.371 9.654 9.926 10.279 10.633 11.023 11.386 11.723 12.105 12.406 12.704 13.094 13.456 13.807 14.212 14.631 15.007 15.439 15.918 16.397 16.924 17.507 18.152 18.787 19.501 20.259 21.088 22.023 23.05 24.07 25.183 25.843 25.872 25.659 25.324 24.853 24.408 23.971 23.524 23.03 22.577 22.137 21.656 21.195 20.787 20.406 19.979 19.587 19.239 18.857 18.428 18.047 17.658 17.242 16.844 16.438 16.071 15.676 15.25 14.948 14.622 14.036 13.579 13.117 12.883 12.389 11.907 11.366 11.057 10.243 10.029 9.654 9.25 8.344 7.791 7.169 6.53 5.72 4.682 3.447 -0.458 -4 ,24452 ,TETRA ,17604821,Sun Nov 28 18:19:44 CET,Sun Nov 28 20:35:33 CET,0.0 1.487 2.161 2.67 3.09 3.469 3.807 4.099 4.649 4.917 5.166 5.105 5.807 6.009 6.402 6.769 7.118 7.278 7.591 7.898 8.344 8.63 8.902 9.289 9.65 10.02 10.384 10.726 11.149 11.558 11.947 12.364 12.798 13.253 13.749 14.309 14.813 15.264 15.691 16.16 16.635 17.149 17.789 18.45 19.144 19.903 20.765 21.664 22.687 23.758 24.808 25.402 25.464 25.214 24.876 24.469 24.06 23.623 23.133 22.61 22.16 21.724 21.307 20.91 20.532 20.162 19.702 19.256 18.892 18.535 18.059 17.636 17.261 16.87 16.557 16.219 15.856 15.44 14.995 14.699 14.371 13.793 13.361 12.913 12.67 12.113 11.523 10.928 10.612 9.772 9.491 9.11 8.723 7.868 7.386 6.847 6.211 5.418 4.441 3.143 -0.792 -5 ,13917 ,TETRA ,17604822,Sun Nov 28 18:19:46 CET,Sun Nov 28 20:35:10 CET,0.0 1.324 1.966 2.48 2.931 3.309 3.645 3.952 4.488 4.744 4.995 4.96 5.687 5.912 6.323 6.686 7.042 7.215 7.556 7.898 8.345 8.623 8.914 9.32 9.701 10.061 10.436 10.778 11.155 11.558 11.948 12.418 12.831 13.142 13.506 13.93 14.346 14.797 15.24 15.7 16.187 16.758 17.42 18.052 18.79 19.609 20.478 21.414 22.444 23.517 24.622 25.165 25.196 24.986 24.651 24.268 23.868 23.352 22.815 22.296 21.85 21.444 21.03 20.603 20.189 19.795 19.364 18.957 18.576 18.157 17.733 17.385 17.002 16.609 16.304 15.955 15.48 14.91 14.334 13.94 13.576 13.062 12.679 12.232 11.985 11.478 10.904 10.263 9.937 9.099 8.805 8.398 7.993 7.081 6.511 5.864 5.164 4.331 3.332 2.086 -1.935 -6 ,5799 ,TETRA ,17604823,Sun Nov 28 18:19:48 CET,Sun Nov 28 20:34:36 CET,0.0 1.548 2.238 2.795 3.256 3.635 3.975 4.274 4.811 5.07 5.315 5.297 6.011 6.217 6.62 6.999 7.355 7.522 7.849 8.16 8.59 8.869 9.128 9.491 9.833 10.153 10.434 10.71 11.127 11.493 11.804 12.169 12.513 12.835 13.214 13.629 14.038 14.503 14.988 15.466 15.951 16.49 17.083 17.682 18.369 19.125 19.984 20.93 21.953 23.081 24.246 24.835 24.85 24.614 24.266 23.863 23.432 22.98 22.533 22.057 21.585 21.107 20.656 20.198 19.727 19.273 18.786 18.332 17.922 17.519 17.106 16.751 16.374 15.882 15.488 15.106 14.698 14.271 13.815 13.47 13.101 12.552 12.177 11.723 11.468 10.982 10.478 9.906 9.592 8.783 8.572 8.219 7.83 6.899 6.344 5.711 5.01 4.205 3.286 2.069 -1.961 -7 ,32410 ,TETRA ,17604824,Sun Nov 28 18:19:42 CET,Sun Nov 28 20:37:36 CET,0.0 1.245 1.822 2.299 2.707 3.082 3.449 3.782 4.344 4.61 4.866 4.83 5.565 5.798 6.224 6.6 6.946 7.12 7.469 7.799 8.272 8.562 8.835 9.22 9.596 9.978 10.347 10.698 11.148 11.535 11.84 12.192 12.538 12.872 13.237 13.653 14.06 14.494 14.959 15.437 15.945 16.532 17.201 17.851 18.539 19.276 20.159 21.135 22.172 23.241 24.37 24.953 24.872 24.517 24.076 23.592 23.079 22.582 22.109 21.555 21.061 20.562 20.056 19.569 19.078 18.615 18.126 17.677 17.217 16.725 16.285 15.911 15.517 15.142 14.83 14.475 14.102 13.708 13.272 12.953 12.615 12.028 11.588 11.16 10.946 10.456 9.915 9.313 8.996 8.164 7.851 7.415 6.977 6.07 5.539 4.929 4.277 3.533 2.612 1.341 -2.418 -8 ,32650 ,TETRA ,17604825,Sun Nov 28 18:19:44 CET,Sun Nov 28 20:38:17 CET,0.0 1.675 2.375 2.906 3.338 3.719 4.073 4.39 4.957 5.213 5.458 5.411 6.12 6.324 6.72 7.106 7.478 7.65 7.982 8.301 8.755 9.053 9.348 9.779 10.173 10.544 10.888 11.2 11.626 11.995 12.273 12.593 12.918 13.253 13.644 14.053 14.475 14.926 15.373 15.877 16.367 16.891 17.519 18.135 18.857 19.649 20.494 21.389 22.332 23.31 24.369 24.885 24.872 24.624 24.227 23.788 23.277 22.788 22.361 21.871 21.436 21.023 20.606 20.164 19.712 19.315 18.903 18.508 18.113 17.702 17.307 16.977 16.595 16.184 15.868 15.525 15.164 14.783 14.375 14.049 13.658 13.035 12.578 12.092 11.861 11.382 10.859 10.296 9.985 9.155 8.876 8.457 8.009 6.986 6.407 5.777 5.054 4.211 3.167 1.718 -2.44 -9 ,22157 ,TETRA ,17604826,Sun Nov 28 18:19:42 CET,Sun Nov 28 20:35:35 CET,0.0 1.322 1.938 2.413 2.817 3.191 3.545 3.863 4.419 4.674 4.918 4.892 5.593 5.783 6.151 6.516 6.858 7.036 7.399 7.734 8.162 8.431 8.686 9.048 9.41 9.769 10.154 10.491 10.897 11.328 11.721 12.139 12.533 12.932 13.377 13.802 14.212 14.674 15.213 15.804 16.392 17.05 17.807 18.572 19.395 20.232 21.14 22.1 23.179 24.296 25.403 26.026 26.074 25.879 25.538 25.087 24.609 24.119 23.648 23.071 22.487 22.013 21.631 21.254 20.872 20.479 20.06 19.679 19.325 18.9 18.346 17.853 17.407 16.949 16.54 16.062 15.558 15.066 14.58 14.27 13.933 13.355 12.944 12.504 12.268 11.786 11.27 10.708 10.408 9.593 9.377 9.003 8.612 7.765 7.297 6.774 6.137 5.368 4.416 3.055 -1.249 -10 ,3380 ,TETRA ,17604827,Sun Nov 28 18:19:42 CET,Sun Nov 28 20:34:37 CET,0.0 1.354 1.971 2.463 2.92 3.334 3.688 4.017 4.601 4.858 5.087 5.011 5.725 5.945 6.367 6.757 7.112 7.284 7.621 7.945 8.41 8.682 8.936 9.287 9.612 9.931 10.219 10.521 10.935 11.341 11.727 12.141 12.543 12.909 13.281 13.686 14.06 14.485 14.946 15.443 15.962 16.527 17.163 17.794 18.499 19.25 20.107 21.01 21.994 23.02 24.016 24.535 24.532 24.314 23.949 23.487 23.025 22.583 22.154 21.669 21.218 20.786 20.346 19.902 19.44 19.001 18.524 18.066 17.697 17.325 16.847 16.401 15.912 15.412 15.075 14.745 14.403 13.979 13.465 13.094 12.702 12.057 11.605 11.15 10.905 10.391 9.83 9.218 8.896 8.07 7.808 7.399 6.944 5.914 5.316 4.645 3.912 3.078 2.073 0.646 -5.356 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt deleted file mode 100644 index 5a6d071e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29859 ,TETRA ,17604828,Sun Nov 28 18:19:44 CET,Sun Nov 28 20:36:46 CET,0.0 1.477 2.075 2.57 2.997 3.374 3.737 4.071 4.668 4.949 5.22 5.182 5.914 6.164 6.61 7.02 7.419 7.602 7.915 8.229 8.726 9.026 9.321 9.78 10.217 10.569 10.858 11.142 11.512 11.926 12.323 12.722 13.112 13.492 13.919 14.391 14.839 15.311 15.796 16.312 16.841 17.435 18.156 18.848 19.582 20.39 21.314 22.275 23.309 24.465 25.657 26.276 26.419 26.229 25.852 25.446 25.02 24.592 24.158 23.688 23.264 22.816 22.381 21.955 21.543 21.169 20.728 20.318 19.974 19.579 19.132 18.766 18.356 17.86 17.513 17.217 16.882 16.517 16.138 15.866 15.566 15.083 14.708 14.271 14.033 13.552 13.069 12.56 12.277 11.481 11.333 10.983 10.595 9.702 9.235 8.743 8.208 7.573 6.739 5.518 0.829 -2 ,17160 ,TETRA ,17604829,Sun Nov 28 18:19:46 CET,Sun Nov 28 20:37:09 CET,0.0 1.362 2.034 2.623 3.088 3.486 3.857 4.221 4.875 5.177 5.456 5.453 6.184 6.419 6.88 7.322 7.733 7.914 8.266 8.619 9.098 9.391 9.671 10.071 10.489 10.879 11.227 11.538 11.902 12.297 12.669 13.034 13.372 13.71 14.126 14.601 15.016 15.46 15.942 16.444 16.977 17.588 18.282 18.993 19.81 20.62 21.505 22.485 23.573 24.74 25.866 26.29 26.286 26.072 25.681 25.238 24.795 24.344 23.869 23.35 22.911 22.475 22.008 21.559 21.155 20.787 20.372 19.979 19.623 19.246 18.841 18.476 18.053 17.592 17.25 16.879 16.473 16.062 15.607 15.258 14.877 14.304 13.916 13.487 13.257 12.778 12.252 11.676 11.372 10.564 10.347 9.984 9.605 8.742 8.244 7.671 7.03 6.276 5.352 4.171 -0.443 -3 ,27239 ,TETRA ,17604830,Sun Nov 28 18:19:42 CET,Sun Nov 28 20:36:52 CET,0.0 1.422 2.165 2.715 3.195 3.632 4.011 4.366 5.03 5.333 5.613 5.638 6.373 6.6 7.025 7.446 7.857 8.063 8.452 8.818 9.369 9.697 9.978 10.352 10.728 11.076 11.409 11.731 12.094 12.45 12.813 13.264 13.659 14.015 14.428 14.872 15.291 15.747 16.226 16.733 17.279 17.896 18.566 19.203 19.954 20.772 21.626 22.561 23.613 24.702 25.732 26.133 26.029 25.817 25.525 25.107 24.653 24.199 23.74 23.217 22.741 22.305 21.843 21.402 21.004 20.633 20.218 19.828 19.49 19.095 18.662 18.307 17.947 17.536 17.211 16.84 16.401 15.961 15.489 15.156 14.791 14.149 13.691 13.225 12.989 12.498 11.965 11.408 11.125 10.336 10.199 9.863 9.513 8.692 8.244 7.751 7.171 6.49 5.625 4.491 0.9 -4 ,22964 ,TETRA ,17604831,Sun Nov 28 18:19:46 CET,Sun Nov 28 20:38:23 CET,0.0 1.718 2.419 2.961 3.411 3.818 4.206 4.55 5.165 5.454 5.733 5.701 6.416 6.634 7.064 7.487 7.887 8.078 8.457 8.831 9.355 9.67 9.945 10.339 10.765 11.157 11.524 11.869 12.286 12.729 13.138 13.582 14.03 14.422 14.821 15.294 15.739 16.194 16.676 17.173 17.691 18.286 19.015 19.718 20.488 21.34 22.268 23.244 24.326 25.498 26.551 26.998 26.981 26.72 26.349 25.905 25.45 24.986 24.53 24.057 23.622 23.211 22.802 22.411 21.987 21.55 21.137 20.784 20.461 20.105 19.707 19.372 19.021 18.624 18.28 17.867 17.407 16.9 16.346 15.983 15.606 14.997 14.575 14.135 13.908 13.438 12.905 12.327 12.037 11.242 11.086 10.747 10.387 9.542 9.061 8.512 7.861 7.181 6.327 5.077 0.733 -5 ,104 ,TETRA ,17604832,Sun Nov 28 18:19:44 CET,Sun Nov 28 20:37:56 CET,0.0 1.862 2.551 3.096 3.577 3.991 4.356 4.697 5.316 5.595 5.863 5.863 6.594 6.818 7.242 7.651 8.022 8.193 8.556 8.92 9.442 9.765 10.063 10.5 10.896 11.242 11.571 11.931 12.419 12.819 13.158 13.576 14.018 14.417 14.831 15.277 15.718 16.211 16.69 17.196 17.741 18.332 18.982 19.649 20.396 21.203 22.1 23.081 24.166 25.194 26.129 26.538 26.447 26.191 25.851 25.398 24.918 24.432 23.968 23.477 23.026 22.587 22.134 21.66 21.206 20.803 20.39 19.982 19.608 19.175 18.691 18.341 17.967 17.531 17.146 16.716 16.268 15.776 15.267 14.917 14.546 13.949 13.531 13.081 12.839 12.354 11.836 11.256 10.962 10.175 10.089 9.75 9.374 8.54 8.095 7.617 7.053 6.392 5.591 4.415 -0.496 -6 ,23422 ,TETRA ,17604833,Sun Nov 28 18:20:09 CET,Sun Nov 28 20:40:02 CET,0.0 3.772 4.701 5.283 5.75 6.175 6.55 6.869 7.479 7.763 8.026 8.037 8.781 9.002 9.406 9.801 10.171 10.355 10.712 11.051 11.547 11.83 12.1 12.526 12.941 13.338 13.711 14.059 14.477 14.857 15.207 15.602 15.976 16.347 16.81 17.382 17.859 18.284 18.741 19.231 19.759 20.34 21.018 21.677 22.392 23.197 24.128 25.147 26.265 27.381 28.434 28.917 28.928 28.749 28.467 28.146 27.752 27.301 26.884 26.404 25.938 25.471 25.003 24.586 24.17 23.718 23.195 22.752 22.406 22.021 21.606 21.292 20.946 20.532 20.208 19.868 19.496 19.06 18.565 18.267 17.936 17.332 16.908 16.462 16.255 15.826 15.307 14.745 14.449 13.635 13.437 13.088 12.739 11.887 11.394 10.853 10.207 9.509 8.689 7.607 4.092 -7 ,19466 ,TETRA ,17604834,Sun Nov 28 18:20:11 CET,Sun Nov 28 20:40:31 CET,0.0 1.701 2.33 2.891 3.336 3.712 4.056 4.384 5.049 5.359 5.618 5.591 6.322 6.554 7.006 7.41 7.786 7.96 8.303 8.64 9.07 9.351 9.651 10.079 10.469 10.847 11.234 11.598 12.064 12.498 12.931 13.436 13.86 14.24 14.653 15.136 15.598 16.073 16.572 17.098 17.634 18.203 18.874 19.549 20.308 21.139 22.058 23.112 24.271 25.402 26.579 27.199 27.258 27.089 26.735 26.296 25.851 25.396 24.97 24.491 24.017 23.535 23.066 22.641 22.234 21.818 21.383 21.014 20.672 20.314 19.95 19.635 19.265 18.87 18.523 18.1 17.7 17.341 16.919 16.584 16.219 15.689 15.33 14.925 14.696 14.2 13.698 13.139 12.838 12.032 11.846 11.469 11.064 10.18 9.662 9.077 8.449 7.778 6.95 5.762 0.403 -8 ,2324 ,TETRA ,17604835,Sun Nov 28 18:20:12 CET,Sun Nov 28 20:38:25 CET,0.0 1.436 2.09 2.606 3.052 3.452 3.844 4.206 4.832 5.113 5.384 5.409 6.144 6.38 6.819 7.224 7.612 7.802 8.18 8.533 9.033 9.353 9.659 10.067 10.467 10.853 11.162 11.439 11.816 12.197 12.567 12.994 13.372 13.737 14.156 14.604 15.054 15.535 16.027 16.565 17.101 17.716 18.459 19.168 19.947 20.791 21.702 22.667 23.74 24.847 26.031 26.625 26.518 26.26 25.875 25.386 24.912 24.412 23.928 23.418 22.918 22.459 22.035 21.589 21.077 20.591 20.135 19.737 19.34 18.924 18.513 18.101 17.684 17.306 16.959 16.533 16.079 15.667 15.236 14.901 14.565 13.991 13.577 13.188 12.99 12.556 12.104 11.618 11.34 10.543 10.384 10.012 9.63 8.817 8.351 7.834 7.22 6.525 5.654 4.475 1.055 -9 ,13563 ,TETRA ,17604836,Sun Nov 28 18:20:15 CET,Sun Nov 28 20:38:03 CET,0.0 2.082 2.716 3.199 3.624 4.008 4.359 4.693 5.31 5.589 5.855 5.887 6.635 6.868 7.308 7.719 8.123 8.323 8.694 9.044 9.521 9.824 10.133 10.533 10.908 11.304 11.675 12.029 12.475 12.859 13.209 13.652 14.061 14.437 14.874 15.35 15.807 16.295 16.814 17.355 17.889 18.484 19.166 19.829 20.585 21.373 22.292 23.298 24.412 25.572 26.579 27.047 26.967 26.668 26.304 25.895 25.446 24.978 24.534 24.03 23.587 23.167 22.729 22.323 21.801 21.294 20.861 20.478 20.083 19.662 19.291 18.956 18.583 18.184 17.85 17.471 17.071 16.693 16.249 15.91 15.588 15.069 14.694 14.277 14.047 13.578 13.097 12.559 12.258 11.447 11.298 10.966 10.592 9.718 9.258 8.775 8.182 7.464 6.621 5.523 1.361 -10 ,5223 ,TETRA ,17604837,Sun Nov 28 18:20:09 CET,Sun Nov 28 20:34:56 CET,0.0 2.452 3.149 3.661 4.108 4.503 4.871 5.201 5.805 6.088 6.359 6.376 7.106 7.324 7.761 8.18 8.544 8.717 9.065 9.384 9.859 10.162 10.438 10.842 11.211 11.55 11.867 12.197 12.62 13.028 13.467 13.944 14.321 14.667 15.07 15.513 15.94 16.42 16.928 17.447 18.011 18.654 19.359 20.041 20.817 21.66 22.585 23.534 24.554 25.707 26.826 27.266 27.179 26.854 26.496 26.097 25.6 25.067 24.595 24.076 23.579 23.12 22.673 22.252 21.846 21.433 20.964 20.559 20.227 19.86 19.433 19.028 18.579 18.105 17.712 17.31 16.923 16.536 16.085 15.744 15.392 14.828 14.428 13.994 13.763 13.287 12.802 12.283 12.0 11.223 11.096 10.751 10.393 9.623 9.185 8.662 8.081 7.415 6.536 5.461 1.763 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23467_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23467_23466.txt deleted file mode 100644 index c78a1030..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23467_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23379 ,TETRA ,17604838,Sun Nov 28 18:20:11 CET,Sun Nov 28 20:22:37 CET,0.0 2.402 3.249 3.814 4.26 4.653 4.991 5.288 5.788 5.977 6.151 6.022 6.615 6.755 7.017 7.253 7.482 7.588 7.773 7.947 8.189 8.34 8.483 8.695 8.892 9.068 9.234 9.401 9.608 9.787 9.965 10.186 10.376 10.53 10.693 10.891 11.083 11.265 11.446 11.632 11.793 11.927 12.046 12.141 12.2 12.207 12.16 11.943 11.496 10.681 9.054 6.917 5.029 3.368 1.882 0.541 -0.639 -1.691 -2.601 -3.508 -4.277 -4.957 -5.596 -6.206 -6.784 -7.324 -7.881 -8.378 -8.807 -9.247 -9.723 -10.123 -10.535 -10.96 -11.289 -11.636 -12.005 -12.372 -12.75 -13.021 -13.303 -13.751 -14.072 -14.408 -14.586 -14.96 -15.344 -15.756 -15.985 -16.699 -16.687 -16.939 -17.215 -17.843 -18.218 -18.63 -19.06 -19.572 -20.17 -20.896 -23.102 -2 ,3726 ,TETRA ,17604839,Sun Nov 28 18:20:10 CET,Sun Nov 28 20:29:19 CET,0.0 1.8 2.384 2.841 3.245 3.556 3.804 4.028 4.442 4.629 4.788 4.619 5.207 5.336 5.586 5.81 6.028 6.135 6.338 6.561 6.869 7.028 7.169 7.376 7.569 7.743 7.922 8.079 8.267 8.449 8.606 8.794 8.968 9.121 9.301 9.498 9.676 9.855 10.008 10.164 10.311 10.434 10.576 10.711 10.81 10.831 10.759 10.599 10.205 9.327 7.703 5.605 3.779 2.247 0.93 -0.285 -1.384 -2.357 -3.175 -4.006 -4.744 -5.402 -6.027 -6.628 -7.173 -7.669 -8.198 -8.681 -9.116 -9.576 -10.051 -10.445 -10.84 -11.255 -11.606 -11.959 -12.309 -12.67 -13.055 -13.331 -13.608 -14.062 -14.407 -14.778 -14.963 -15.336 -15.741 -16.16 -16.383 -17.1 -17.134 -17.4 -17.676 -18.298 -18.637 -19.013 -19.445 -19.95 -20.579 -21.504 -24.171 -3 ,16122 ,TETRA ,17604840,Sun Nov 28 18:20:12 CET,Sun Nov 28 20:29:49 CET,0.0 1.278 1.88 2.312 2.663 2.971 3.243 3.487 3.921 4.108 4.27 4.115 4.711 4.841 5.074 5.296 5.51 5.608 5.789 5.981 6.254 6.403 6.538 6.743 6.943 7.137 7.324 7.493 7.715 7.923 8.109 8.33 8.538 8.723 8.915 9.141 9.341 9.52 9.693 9.847 9.995 10.136 10.261 10.353 10.402 10.434 10.467 10.376 10.04 9.291 7.677 5.547 3.745 2.161 0.776 -0.443 -1.538 -2.554 -3.418 -4.288 -5.053 -5.736 -6.389 -6.984 -7.515 -8.025 -8.575 -9.075 -9.509 -9.955 -10.432 -10.825 -11.236 -11.687 -12.05 -12.412 -12.779 -13.172 -13.58 -13.871 -14.184 -14.664 -14.994 -15.347 -15.525 -15.896 -16.283 -16.692 -16.914 -17.616 -17.61 -17.878 -18.171 -18.823 -19.187 -19.592 -20.048 -20.56 -21.117 -21.869 -23.868 -4 ,9589 ,TETRA ,17604841,Sun Nov 28 18:20:09 CET,Sun Nov 28 20:28:36 CET,0.0 1.198 1.787 2.226 2.627 2.952 3.212 3.442 3.829 4.001 4.171 4.032 4.636 4.782 5.046 5.277 5.496 5.603 5.797 5.978 6.232 6.392 6.544 6.754 6.943 7.122 7.283 7.428 7.617 7.803 7.984 8.185 8.374 8.553 8.744 8.939 9.113 9.304 9.493 9.663 9.838 10.033 10.189 10.316 10.437 10.48 10.43 10.259 9.859 9.077 7.545 5.482 3.685 2.084 0.668 -0.596 -1.672 -2.663 -3.523 -4.337 -5.054 -5.736 -6.372 -6.956 -7.518 -8.032 -8.559 -9.042 -9.469 -9.913 -10.385 -10.781 -11.205 -11.646 -11.97 -12.304 -12.651 -13.03 -13.433 -13.703 -13.991 -14.45 -14.773 -15.105 -15.267 -15.614 -16.005 -16.427 -16.648 -17.374 -17.399 -17.677 -17.995 -18.659 -19.012 -19.408 -19.842 -20.355 -21.024 -21.939 -23.984 -5 ,7316 ,TETRA ,17604842,Sun Nov 28 18:20:13 CET,Sun Nov 28 20:28:54 CET,0.0 1.13 1.666 2.069 2.397 2.702 2.975 3.225 3.7 3.91 4.085 3.917 4.517 4.654 4.913 5.149 5.356 5.458 5.665 5.857 6.115 6.266 6.41 6.619 6.817 7.0 7.16 7.313 7.514 7.699 7.869 8.064 8.245 8.409 8.582 8.774 8.934 9.1 9.266 9.41 9.543 9.652 9.765 9.881 9.931 9.91 9.82 9.571 9.1 8.261 6.712 4.738 3.012 1.505 0.207 -0.981 -2.068 -3.032 -3.831 -4.657 -5.38 -6.031 -6.664 -7.253 -7.819 -8.331 -8.854 -9.333 -9.748 -10.174 -10.621 -11.0 -11.402 -11.82 -12.141 -12.489 -12.862 -13.244 -13.634 -13.9 -14.175 -14.623 -14.937 -15.264 -15.434 -15.79 -16.185 -16.612 -16.824 -17.509 -17.494 -17.748 -18.03 -18.675 -19.044 -19.437 -19.839 -20.306 -20.9 -21.658 -23.767 -6 ,3290 ,TETRA ,17604843,Sun Nov 28 18:20:15 CET,Sun Nov 28 20:28:18 CET,0.0 1.537 2.113 2.584 2.95 3.265 3.521 3.756 4.167 4.336 4.507 4.392 5.005 5.144 5.403 5.639 5.845 5.949 6.153 6.345 6.617 6.788 6.94 7.147 7.345 7.526 7.701 7.86 8.043 8.215 8.387 8.585 8.754 8.915 9.11 9.317 9.493 9.669 9.845 10.02 10.204 10.379 10.509 10.614 10.694 10.707 10.644 10.474 10.067 9.322 7.852 5.825 4.067 2.457 1.024 -0.212 -1.244 -2.18 -3.017 -3.864 -4.609 -5.267 -5.886 -6.493 -7.049 -7.542 -8.075 -8.57 -8.993 -9.432 -9.894 -10.271 -10.671 -11.081 -11.398 -11.737 -12.082 -12.459 -12.868 -13.147 -13.434 -13.883 -14.209 -14.556 -14.739 -15.137 -15.552 -15.979 -16.206 -16.928 -16.99 -17.286 -17.584 -18.205 -18.595 -19.041 -19.488 -19.973 -20.581 -21.467 -24.093 -7 ,12233 ,TETRA ,17604844,Sun Nov 28 18:20:11 CET,Sun Nov 28 20:28:55 CET,0.0 1.379 1.943 2.343 2.699 3.015 3.278 3.524 3.974 4.172 4.353 4.239 4.838 4.98 5.239 5.462 5.678 5.78 5.971 6.153 6.409 6.578 6.735 6.954 7.152 7.32 7.474 7.613 7.784 7.958 8.14 8.356 8.554 8.741 8.931 9.137 9.328 9.519 9.71 9.89 10.065 10.241 10.401 10.514 10.61 10.64 10.602 10.46 10.066 9.22 7.573 5.466 3.624 2.026 0.599 -0.642 -1.699 -2.674 -3.496 -4.321 -5.027 -5.669 -6.302 -6.894 -7.443 -7.949 -8.468 -8.946 -9.368 -9.789 -10.238 -10.639 -11.058 -11.471 -11.794 -12.129 -12.482 -12.859 -13.25 -13.516 -13.793 -14.237 -14.558 -14.941 -15.137 -15.513 -15.924 -16.387 -16.627 -17.339 -17.349 -17.623 -17.908 -18.504 -18.846 -19.233 -19.676 -20.191 -20.861 -21.788 -23.89 -8 ,15692 ,TETRA ,17604845,Sun Nov 28 18:20:10 CET,Sun Nov 28 20:29:43 CET,0.0 1.721 2.362 2.839 3.206 3.511 3.777 4.021 4.459 4.64 4.805 4.656 5.275 5.408 5.647 5.858 6.052 6.153 6.355 6.535 6.779 6.935 7.08 7.28 7.474 7.652 7.818 7.976 8.177 8.367 8.548 8.754 8.937 9.109 9.292 9.464 9.641 9.842 10.017 10.19 10.346 10.475 10.606 10.727 10.816 10.83 10.779 10.621 10.232 9.457 7.83 5.732 3.918 2.345 1.048 -0.093 -1.131 -2.096 -2.94 -3.783 -4.508 -5.183 -5.83 -6.431 -6.987 -7.5 -8.045 -8.523 -8.933 -9.36 -9.835 -10.231 -10.639 -11.069 -11.393 -11.731 -12.072 -12.443 -12.854 -13.146 -13.444 -13.874 -14.188 -14.523 -14.691 -15.057 -15.441 -15.864 -16.097 -16.816 -16.817 -17.07 -17.341 -17.962 -18.309 -18.7 -19.134 -19.641 -20.276 -21.109 -23.007 -9 ,11937 ,TETRA ,17604846,Sun Nov 28 18:20:12 CET,Sun Nov 28 20:30:19 CET,0.0 1.903 2.547 2.96 3.299 3.624 3.904 4.163 4.616 4.794 4.972 4.842 5.462 5.607 5.876 6.114 6.331 6.434 6.619 6.786 7.024 7.176 7.321 7.527 7.721 7.91 8.079 8.22 8.405 8.58 8.744 8.935 9.095 9.257 9.451 9.661 9.842 10.009 10.162 10.31 10.462 10.61 10.741 10.853 10.955 10.996 10.947 10.757 10.345 9.553 7.929 5.805 4.006 2.438 1.1 -0.114 -1.219 -2.222 -3.078 -3.944 -4.695 -5.339 -5.94 -6.547 -7.141 -7.664 -8.199 -8.701 -9.151 -9.618 -10.103 -10.492 -10.889 -11.304 -11.624 -11.964 -12.332 -12.704 -13.093 -13.368 -13.663 -14.126 -14.441 -14.772 -14.949 -15.329 -15.729 -16.142 -16.364 -17.075 -17.08 -17.35 -17.652 -18.312 -18.67 -19.054 -19.475 -19.971 -20.558 -21.342 -23.426 -10 ,27913 ,TETRA ,17604847,Sun Nov 28 18:20:15 CET,Sun Nov 28 20:31:14 CET,0.0 1.703 2.311 2.761 3.147 3.464 3.732 3.986 4.415 4.599 4.771 4.652 5.26 5.403 5.663 5.898 6.115 6.219 6.422 6.623 6.911 7.078 7.239 7.477 7.685 7.876 8.06 8.231 8.44 8.634 8.813 9.004 9.178 9.347 9.522 9.726 9.916 10.087 10.269 10.444 10.603 10.785 10.958 11.101 11.206 11.227 11.167 10.994 10.63 9.868 8.323 6.203 4.397 2.842 1.452 0.193 -0.954 -1.977 -2.815 -3.649 -4.391 -5.037 -5.63 -6.217 -6.78 -7.294 -7.832 -8.326 -8.757 -9.204 -9.67 -10.063 -10.472 -10.92 -11.274 -11.626 -11.983 -12.362 -12.774 -13.067 -13.382 -13.859 -14.19 -14.544 -14.73 -15.108 -15.499 -15.925 -16.151 -16.862 -16.882 -17.153 -17.437 -18.055 -18.421 -18.826 -19.266 -19.797 -20.464 -21.297 -23.459 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23466.txt deleted file mode 100644 index 13c16738..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,108 ,KEBNE ,17027250,Wed Dec 22 16:40:00 CET,Wed Dec 22 18:33:14 CET,0.0 1.213 1.829 2.294 2.683 3.058 3.412 3.726 4.291 4.554 4.81 4.773 5.491 5.715 6.146 6.526 6.884 7.06 7.387 7.699 8.166 8.477 8.772 9.16 9.526 9.918 10.305 10.654 11.08 11.481 11.87 12.383 12.897 13.39 13.932 14.5 15.039 15.613 16.269 16.937 17.562 18.235 19.061 19.914 20.897 21.968 23.167 24.466 25.926 27.625 29.268 30.341 30.775 30.802 30.662 30.451 30.146 29.753 29.385 29.004 28.657 28.339 28.026 27.71 27.388 27.082 26.73 26.372 26.05 25.701 25.292 24.942 24.589 24.229 23.951 23.659 23.339 22.979 22.599 22.333 22.062 21.622 21.31 20.999 20.83 20.448 20.021 19.556 19.314 18.59 18.536 18.224 17.875 17.059 16.624 16.149 15.556 14.855 13.947 12.63 6.99 -2 ,30220 ,KEBNE ,17027251,Wed Dec 22 16:40:00 CET,Wed Dec 22 18:34:00 CET,0.0 1.225 1.881 2.346 2.778 3.179 3.524 3.849 4.425 4.684 4.939 4.915 5.647 5.865 6.264 6.628 6.972 7.128 7.436 7.768 8.243 8.545 8.833 9.232 9.612 10.007 10.382 10.702 11.095 11.529 11.936 12.398 12.87 13.31 13.785 14.271 14.728 15.246 15.812 16.414 17.036 17.734 18.544 19.36 20.319 21.354 22.527 23.828 25.325 27.08 28.982 30.084 30.456 30.482 30.276 29.986 29.689 29.379 29.042 28.663 28.331 27.991 27.607 27.198 26.798 26.424 26.03 25.661 25.332 24.991 24.627 24.32 24.007 23.637 23.337 23.052 22.728 22.353 21.97 21.708 21.417 20.954 20.633 20.283 20.107 19.742 19.32 18.883 18.652 17.898 17.79 17.473 17.16 16.466 16.037 15.532 14.923 14.239 13.36 12.062 6.458 -3 ,27939 ,KEBNE ,17027252,Wed Dec 22 16:39:59 CET,Wed Dec 22 18:33:10 CET,0.0 1.107 1.68 2.143 2.557 2.937 3.271 3.576 4.136 4.402 4.657 4.626 5.339 5.553 5.962 6.345 6.722 6.899 7.241 7.574 8.031 8.322 8.625 9.068 9.484 9.879 10.239 10.555 10.969 11.383 11.768 12.195 12.593 13.042 13.555 14.075 14.551 15.053 15.592 16.171 16.805 17.538 18.372 19.21 20.205 21.289 22.485 23.711 25.126 26.821 28.648 29.917 30.266 30.182 30.022 29.816 29.536 29.192 28.83 28.442 28.091 27.761 27.413 27.045 26.701 26.359 25.994 25.65 25.345 25.053 24.689 24.344 23.955 23.532 23.248 22.977 22.678 22.314 21.904 21.607 21.296 20.822 20.488 20.138 19.961 19.572 19.15 18.661 18.377 17.621 17.511 17.184 16.856 16.106 15.639 15.104 14.522 13.893 13.064 11.809 3.452 -4 ,15012 ,KEBNE ,17027253,Wed Dec 22 16:39:58 CET,Wed Dec 22 18:33:50 CET,0.0 1.514 2.191 2.754 3.206 3.595 3.951 4.277 4.858 5.131 5.39 5.38 6.119 6.341 6.756 7.134 7.498 7.676 8.024 8.35 8.817 9.139 9.443 9.87 10.243 10.552 10.849 11.138 11.541 11.906 12.221 12.623 13.018 13.387 13.814 14.341 14.9 15.469 16.022 16.613 17.226 17.92 18.731 19.535 20.451 21.453 22.548 23.783 25.281 26.949 28.555 29.507 29.824 29.773 29.581 29.367 29.099 28.784 28.465 28.111 27.769 27.432 27.097 26.752 26.425 26.135 25.804 25.477 25.187 24.819 24.404 24.075 23.735 23.349 22.998 22.676 22.379 22.015 21.612 21.339 21.053 20.573 20.209 19.83 19.634 19.217 18.788 18.306 18.037 17.277 17.158 16.822 16.482 15.783 15.389 14.944 14.449 13.861 13.08 11.983 7.732 -5 ,29585 ,KEBNE ,17027254,Wed Dec 22 16:39:59 CET,Wed Dec 22 18:33:41 CET,0.0 1.345 1.994 2.497 2.96 3.334 3.668 3.987 4.561 4.826 5.082 5.078 5.819 6.052 6.488 6.889 7.244 7.411 7.746 8.08 8.532 8.803 9.084 9.507 9.929 10.337 10.73 11.11 11.596 12.027 12.382 12.839 13.322 13.735 14.164 14.638 15.096 15.612 16.174 16.777 17.392 18.079 18.884 19.649 20.522 21.507 22.697 24.03 25.517 27.247 29.031 30.006 30.368 30.484 30.371 30.102 29.797 29.43 29.072 28.664 28.259 27.909 27.537 27.165 26.826 26.51 26.159 25.815 25.478 25.108 24.723 24.423 24.073 23.647 23.342 22.995 22.634 22.267 21.86 21.572 21.263 20.761 20.391 20.015 19.819 19.404 18.958 18.45 18.181 17.441 17.372 17.061 16.717 15.941 15.505 15.055 14.546 13.894 13.166 12.086 8.063 -6 ,4923 ,KEBNE ,17027255,Wed Dec 22 16:40:00 CET,Wed Dec 22 18:33:44 CET,0.0 3.337 4.215 4.858 5.404 5.847 6.195 6.492 6.986 7.209 7.431 7.35 8.069 8.268 8.635 8.997 9.377 9.57 9.918 10.215 10.63 10.888 11.132 11.498 11.854 12.181 12.493 12.808 13.222 13.621 13.977 14.398 14.814 15.218 15.697 16.239 16.782 17.366 17.987 18.654 19.356 20.161 21.093 22.037 23.108 24.204 25.373 26.628 28.101 29.865 31.743 32.847 33.251 33.291 33.024 32.598 32.175 31.789 31.38 30.884 30.494 30.125 29.723 29.332 28.943 28.578 28.166 27.789 27.474 27.121 26.749 26.45 26.104 25.722 25.434 25.137 24.82 24.467 24.074 23.785 23.466 22.972 22.658 22.331 22.148 21.754 21.34 20.87 20.614 19.868 19.766 19.446 19.112 18.358 17.926 17.421 16.819 16.11 15.253 13.975 9.13 -7 ,1236 ,KEBNE ,17027256,Wed Dec 22 16:39:58 CET,Wed Dec 22 18:33:47 CET,0.0 1.305 1.986 2.507 2.924 3.284 3.634 3.951 4.49 4.744 4.996 4.958 5.693 5.931 6.373 6.793 7.177 7.351 7.716 8.068 8.564 8.885 9.195 9.641 10.066 10.458 10.842 11.227 11.684 12.114 12.522 12.976 13.396 13.761 14.17 14.697 15.239 15.791 16.327 16.907 17.541 18.24 19.062 19.867 20.772 21.814 22.989 24.377 26.06 27.878 29.863 31.142 31.548 31.626 31.492 31.232 30.925 30.551 30.205 29.845 29.469 29.114 28.765 28.401 28.035 27.596 27.147 26.817 26.517 26.207 25.87 25.546 25.184 24.827 24.558 24.25 23.933 23.61 23.236 22.934 22.575 22.033 21.669 21.28 21.081 20.666 20.216 19.737 19.496 18.752 18.641 18.303 17.939 17.144 16.697 16.234 15.72 15.028 14.162 12.999 8.401 -8 ,3880 ,KEBNE ,17027257,Wed Dec 22 16:39:59 CET,Wed Dec 22 18:33:17 CET,0.0 1.237 1.915 2.465 2.891 3.26 3.605 3.916 4.473 4.743 5.01 4.999 5.718 5.929 6.327 6.687 7.04 7.218 7.566 7.901 8.361 8.629 8.887 9.293 9.678 10.017 10.306 10.578 11.006 11.484 11.876 12.273 12.659 13.025 13.449 13.926 14.374 14.871 15.411 15.984 16.572 17.247 18.0 18.746 19.661 20.685 21.839 23.084 24.524 26.061 27.839 29.197 29.668 29.732 29.603 29.354 29.074 28.777 28.513 28.166 27.784 27.416 27.004 26.605 26.244 25.895 25.503 25.132 24.795 24.439 24.067 23.735 23.376 22.995 22.698 22.403 22.087 21.735 21.354 21.088 20.806 20.307 19.979 19.65 19.459 19.039 18.569 18.093 17.844 17.103 17.013 16.719 16.391 15.611 15.154 14.63 14.05 13.384 12.539 11.318 6.751 -9 ,9543 ,KEBNE ,17027258,Wed Dec 22 16:40:00 CET,Wed Dec 22 18:33:10 CET,0.0 1.338 1.97 2.433 2.847 3.232 3.595 3.916 4.504 4.766 5.005 4.94 5.666 5.885 6.299 6.681 7.028 7.199 7.535 7.866 8.356 8.663 8.93 9.282 9.665 10.073 10.458 10.833 11.317 11.745 12.105 12.512 12.887 13.258 13.705 14.191 14.66 15.178 15.719 16.274 16.855 17.52 18.293 19.067 19.976 20.986 22.151 23.416 24.686 26.139 27.945 29.243 29.798 29.939 29.869 29.698 29.442 29.118 28.808 28.44 28.063 27.712 27.398 27.079 26.762 26.467 26.133 25.812 25.515 25.202 24.888 24.63 24.327 23.991 23.716 23.423 23.097 22.698 22.313 22.052 21.765 21.34 21.055 20.714 20.52 20.132 19.715 19.228 18.967 18.212 18.071 17.756 17.437 16.676 16.245 15.778 15.271 14.678 13.96 12.99 9.708 -10 ,29428 ,KEBNE ,17027259,Wed Dec 22 16:39:58 CET,Wed Dec 22 18:33:19 CET,0.0 1.325 1.934 2.513 2.996 3.401 3.776 4.127 4.746 5.018 5.271 5.255 5.992 6.211 6.64 7.048 7.433 7.614 7.961 8.284 8.7 8.961 9.228 9.639 10.042 10.409 10.766 11.095 11.49 11.879 12.251 12.744 13.235 13.685 14.177 14.698 15.186 15.68 16.217 16.823 17.469 18.213 19.037 19.791 20.714 21.748 22.863 24.138 25.662 27.308 29.055 30.096 30.433 30.427 30.191 29.883 29.52 29.088 28.671 28.243 27.858 27.481 27.091 26.683 26.28 25.907 25.508 25.151 24.837 24.495 24.117 23.776 23.398 23.015 22.701 22.361 22.01 21.64 21.246 20.968 20.686 20.189 19.822 19.445 19.25 18.865 18.424 17.947 17.703 16.967 16.888 16.575 16.234 15.489 15.064 14.521 13.857 13.11 12.235 10.967 6.248 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23467.txt deleted file mode 100644 index 60d203dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18719 ,KEBNE ,17070648,Fri Dec 24 21:57:24 CET,Fri Dec 24 23:52:42 CET,0.0 1.604 2.324 2.894 3.408 3.866 4.279 4.664 5.363 5.678 5.983 6.061 6.821 7.067 7.549 8.02 8.477 8.695 9.122 9.539 10.117 10.478 10.815 11.298 11.771 12.242 12.68 13.1 13.631 14.108 14.57 15.131 15.7 16.284 16.948 17.661 18.368 19.119 19.903 20.749 21.638 22.648 23.837 25.055 26.478 28.077 30.01 32.149 34.595 37.58 41.237 44.112 45.593 46.474 47.022 47.31 47.469 47.508 47.48 47.428 47.34 47.219 47.06 46.876 46.648 46.421 46.194 45.985 45.762 45.52 45.205 44.893 44.573 44.269 44.058 43.779 43.455 43.118 42.74 42.487 42.225 41.763 41.432 41.076 40.886 40.497 40.118 39.717 39.498 38.812 38.767 38.495 38.203 37.537 37.152 36.733 36.227 35.571 34.745 33.737 30.354 -2 ,19971 ,KEBNE ,17070649,Fri Dec 24 22:01:44 CET,Fri Dec 24 23:56:26 CET,0.0 1.477 2.189 2.721 3.164 3.582 3.975 4.343 5.021 5.341 5.647 5.713 6.482 6.734 7.201 7.665 8.109 8.311 8.697 9.068 9.554 9.873 10.207 10.7 11.142 11.554 11.951 12.342 12.874 13.38 13.842 14.402 14.968 15.502 16.097 16.796 17.464 18.183 18.97 19.832 20.741 21.756 22.969 24.239 25.689 27.261 29.06 31.141 33.661 36.57 39.952 42.619 44.133 45.096 45.644 45.958 46.127 46.167 46.142 46.081 45.969 45.779 45.552 45.359 45.162 44.956 44.739 44.503 44.28 44.063 43.809 43.578 43.297 42.949 42.675 42.413 42.132 41.795 41.466 41.25 41.024 40.668 40.398 40.102 39.934 39.572 39.215 38.818 38.567 37.845 37.779 37.503 37.188 36.413 36.002 35.583 35.114 34.557 33.838 32.847 29.681 -3 ,20006 ,KEBNE ,17070650,Fri Dec 24 22:02:50 CET,Fri Dec 24 23:57:53 CET,0.0 1.579 2.393 3.029 3.523 3.958 4.388 4.77 5.444 5.758 6.063 6.131 6.904 7.151 7.645 8.149 8.638 8.874 9.324 9.708 10.217 10.553 10.894 11.413 11.91 12.418 12.902 13.357 13.899 14.385 14.873 15.434 15.96 16.466 17.061 17.768 18.434 19.147 19.919 20.729 21.612 22.64 23.88 25.15 26.625 28.283 30.2 32.323 34.8 37.824 41.536 44.46 46.03 46.922 47.407 47.64 47.727 47.74 47.703 47.612 47.494 47.337 47.157 46.966 46.772 46.564 46.317 46.112 45.933 45.652 45.327 45.113 44.866 44.565 44.328 44.066 43.772 43.479 43.164 42.933 42.687 42.274 41.967 41.649 41.495 41.157 40.768 40.324 40.09 39.395 39.399 39.127 38.827 38.139 37.733 37.27 36.773 36.208 35.464 34.455 31.495 -4 ,13237 ,KEBNE ,17070651,Fri Dec 24 22:23:53 CET,Sat Dec 25 00:12:45 CET,0.0 1.386 2.09 2.658 3.153 3.602 4.002 4.367 5.023 5.33 5.637 5.681 6.453 6.715 7.228 7.711 8.167 8.381 8.778 9.168 9.756 10.145 10.512 11.007 11.497 11.992 12.461 12.889 13.424 13.974 14.522 15.142 15.711 16.256 16.908 17.668 18.414 19.225 20.071 20.97 21.918 22.979 24.233 25.514 26.977 28.57 30.453 32.653 35.193 38.2 41.802 44.609 46.179 47.011 47.457 47.702 47.804 47.8 47.729 47.615 47.48 47.356 47.171 46.949 46.748 46.546 46.286 45.976 45.701 45.447 45.147 44.872 44.594 44.257 43.985 43.749 43.488 43.168 42.829 42.601 42.347 41.934 41.647 41.341 41.165 40.787 40.416 39.995 39.763 39.062 39.027 38.735 38.401 37.662 37.237 36.767 36.257 35.711 35.062 34.118 30.524 -5 ,13319 ,KEBNE ,17070652,Fri Dec 24 22:26:59 CET,Sat Dec 25 00:21:25 CET,0.0 1.704 2.549 3.145 3.639 4.123 4.549 4.928 5.637 5.954 6.248 6.298 7.06 7.314 7.828 8.314 8.764 8.983 9.4 9.805 10.417 10.809 11.152 11.614 12.057 12.507 12.953 13.367 13.943 14.51 15.017 15.603 16.193 16.787 17.461 18.217 18.943 19.717 20.529 21.41 22.338 23.393 24.65 25.917 27.383 29.006 30.933 33.134 35.69 38.736 42.411 45.357 46.974 47.884 48.334 48.575 48.626 48.578 48.509 48.362 48.18 47.993 47.775 47.547 47.276 47.001 46.745 46.519 46.294 46.035 45.759 45.497 45.151 44.731 44.45 44.197 43.912 43.582 43.2 42.92 42.617 42.157 41.849 41.51 41.333 40.967 40.541 40.068 39.82 39.095 39.028 38.745 38.438 37.766 37.388 36.942 36.416 35.854 35.218 34.369 32.252 -6 ,21850 ,KEBNE ,17070653,Fri Dec 24 22:26:58 CET,Sat Dec 25 00:21:16 CET,0.0 1.637 2.352 2.902 3.382 3.817 4.218 4.587 5.258 5.576 5.862 5.921 6.71 6.966 7.434 7.904 8.374 8.585 8.977 9.341 9.85 10.189 10.538 11.067 11.568 12.044 12.492 12.909 13.431 13.915 14.404 15.039 15.643 16.199 16.839 17.538 18.203 18.924 19.711 20.568 21.462 22.492 23.733 24.967 26.378 27.994 29.896 32.061 34.635 37.713 41.335 44.056 45.465 46.304 46.784 47.086 47.253 47.279 47.242 47.169 47.062 46.932 46.751 46.549 46.336 46.111 45.842 45.616 45.396 45.114 44.826 44.554 44.291 44.018 43.748 43.45 43.147 42.839 42.507 42.272 42.035 41.668 41.387 41.071 40.907 40.557 40.18 39.768 39.551 38.854 38.865 38.612 38.322 37.627 37.248 36.886 36.483 35.984 35.301 34.41 31.519 -7 ,26200 ,KEBNE ,17070654,Fri Dec 24 22:29:03 CET,Sat Dec 25 00:23:48 CET,0.0 1.642 2.45 3.08 3.586 4.042 4.46 4.837 5.502 5.805 6.091 6.148 6.901 7.125 7.568 7.974 8.351 8.534 8.889 9.236 9.735 10.06 10.373 10.838 11.283 11.688 12.084 12.48 12.991 13.467 13.94 14.507 15.05 15.586 16.207 16.923 17.614 18.338 19.116 20.009 20.962 22.0 23.194 24.395 25.825 27.467 29.35 31.432 33.948 36.96 40.406 43.149 44.633 45.503 45.988 46.226 46.333 46.308 46.182 46.011 45.83 45.617 45.394 45.159 44.916 44.697 44.415 44.133 43.9 43.637 43.344 43.11 42.851 42.542 42.301 42.053 41.769 41.468 41.151 40.931 40.707 40.326 40.026 39.717 39.567 39.232 38.838 38.402 38.158 37.477 37.426 37.147 36.863 36.258 35.877 35.412 34.881 34.219 33.437 32.467 29.764 -8 ,2522 ,KEBNE ,17070655,Fri Dec 24 22:29:03 CET,Sat Dec 25 00:23:03 CET,0.0 1.683 2.415 2.988 3.481 3.906 4.299 4.668 5.324 5.623 5.896 5.898 6.67 6.928 7.422 7.9 8.348 8.556 8.966 9.351 9.883 10.204 10.527 11.017 11.496 11.973 12.425 12.846 13.339 13.801 14.27 14.865 15.409 15.944 16.573 17.246 17.893 18.614 19.411 20.274 21.2 22.203 23.378 24.626 26.131 27.837 29.738 31.882 34.468 37.537 41.093 43.807 45.333 46.252 46.758 47.04 47.171 47.182 47.102 46.961 46.822 46.695 46.558 46.374 46.138 45.883 45.552 45.238 44.989 44.723 44.423 44.167 43.897 43.603 43.362 43.087 42.798 42.5 42.177 41.959 41.728 41.319 41.03 40.736 40.58 40.237 39.872 39.437 39.209 38.538 38.554 38.295 37.984 37.258 36.836 36.38 35.867 35.331 34.643 33.62 30.448 -9 ,19760 ,KEBNE ,17070656,Fri Dec 24 22:29:07 CET,Sat Dec 25 00:14:55 CET,0.0 1.707 2.49 3.082 3.586 4.033 4.447 4.847 5.574 5.893 6.19 6.25 7.01 7.256 7.747 8.21 8.649 8.871 9.288 9.644 10.158 10.517 10.853 11.343 11.809 12.282 12.766 13.164 13.657 14.176 14.675 15.232 15.793 16.342 16.992 17.721 18.386 19.13 19.954 20.835 21.762 22.83 24.068 25.272 26.664 28.246 30.029 32.126 34.687 37.744 41.445 44.456 46.095 46.977 47.465 47.742 47.817 47.771 47.674 47.535 47.379 47.214 47.045 46.811 46.575 46.384 46.171 45.947 45.671 45.395 45.155 44.941 44.723 44.465 44.222 43.95 43.667 43.346 43.011 42.766 42.468 42.028 41.729 41.396 41.221 40.826 40.407 39.977 39.749 39.067 39.025 38.757 38.481 37.856 37.506 37.08 36.578 36.012 35.299 34.31 30.889 -10 ,17498 ,KEBNE ,17070657,Fri Dec 24 22:31:11 CET,Sat Dec 25 00:25:24 CET,0.0 1.45 2.204 2.768 3.289 3.761 4.187 4.579 5.266 5.576 5.872 5.916 6.675 6.935 7.431 7.866 8.291 8.514 8.934 9.303 9.87 10.231 10.547 11.024 11.515 12.002 12.447 12.875 13.448 13.989 14.543 15.19 15.724 16.258 16.87 17.537 18.19 18.901 19.689 20.556 21.467 22.497 23.752 25.0 26.422 27.985 29.847 32.02 34.561 37.587 41.175 44.008 45.682 46.659 47.114 47.327 47.429 47.48 47.409 47.25 47.081 46.877 46.675 46.466 46.189 45.912 45.632 45.358 45.12 44.844 44.513 44.241 43.965 43.672 43.454 43.231 42.984 42.702 42.392 42.178 41.932 41.526 41.249 40.95 40.797 40.473 40.11 39.705 39.468 38.783 38.791 38.535 38.24 37.553 37.158 36.704 36.224 35.665 34.95 33.873 30.216 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index fa12714c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19394 ,TETRA ,17604848,Sun Nov 28 18:20:16 CET,Sun Nov 28 20:40:30 CET,0.0 1.339 1.975 2.515 2.967 3.334 3.635 3.898 4.394 4.631 4.837 4.72 5.387 5.55 5.882 6.211 6.511 6.65 6.919 7.174 7.53 7.766 7.999 8.339 8.665 8.971 9.251 9.519 9.873 10.211 10.542 10.93 11.304 11.661 12.063 12.516 12.944 13.413 13.921 14.453 14.992 15.583 16.31 17.02 17.716 18.382 19.109 19.898 20.675 21.363 21.666 21.135 20.291 19.407 18.496 17.623 16.874 16.155 15.507 14.854 14.258 13.707 13.179 12.671 12.202 11.769 11.307 10.894 10.539 10.171 9.772 9.426 9.049 8.634 8.313 8.0 7.681 7.341 6.986 6.748 6.487 6.026 5.703 5.382 5.223 4.893 4.538 4.169 3.966 3.274 3.336 3.112 2.858 2.231 1.867 1.524 1.157 0.719 0.2 -0.439 -1.544 -2 ,9153 ,TETRA ,17604849,Sun Nov 28 18:20:10 CET,Sun Nov 28 20:33:55 CET,0.0 1.599 2.152 2.519 2.82 3.109 3.385 3.62 4.037 4.239 4.42 4.299 4.967 5.117 5.402 5.677 5.948 6.082 6.374 6.672 7.059 7.281 7.492 7.791 8.073 8.35 8.621 8.884 9.227 9.548 9.848 10.212 10.557 10.901 11.296 11.727 12.135 12.565 13.025 13.522 14.028 14.588 15.28 15.953 16.633 17.389 18.273 19.197 20.134 20.9 21.183 20.696 19.971 19.178 18.358 17.538 16.782 16.049 15.425 14.777 14.175 13.645 13.136 12.659 12.202 11.753 11.292 10.896 10.544 10.164 9.762 9.42 9.06 8.684 8.395 8.084 7.734 7.375 7.016 6.776 6.523 6.122 5.842 5.548 5.399 5.094 4.759 4.399 4.209 3.525 3.613 3.39 3.161 2.669 2.396 2.08 1.723 1.323 0.848 0.205 -1.094 -3 ,28576 ,TETRA ,17604850,Sun Nov 28 18:20:10 CET,Sun Nov 28 20:37:34 CET,0.0 1.687 2.405 2.964 3.467 3.879 4.222 4.549 5.132 5.394 5.648 5.639 6.358 6.571 6.987 7.374 7.739 7.92 8.27 8.6 9.082 9.379 9.669 10.098 10.503 10.905 11.284 11.631 12.068 12.485 12.882 13.346 13.761 14.141 14.585 15.075 15.554 16.088 16.635 17.196 17.768 18.401 19.173 19.946 20.78 21.655 22.669 23.767 24.915 26.089 27.273 27.763 27.714 27.403 26.991 26.564 26.137 25.685 25.254 24.822 24.422 24.039 23.651 23.267 22.895 22.557 22.195 21.855 21.53 21.158 20.743 20.395 20.052 19.689 19.39 19.069 18.734 18.378 17.973 17.675 17.372 16.934 16.631 16.316 16.155 15.79 15.411 15.003 14.776 14.069 14.073 13.8 13.502 12.869 12.533 12.134 11.653 11.115 10.39 9.313 5.589 -4 ,14112 ,TETRA ,17604851,Sun Nov 28 18:20:12 CET,Sun Nov 28 20:37:50 CET,0.0 1.354 1.91 2.377 2.799 3.162 3.478 3.754 4.24 4.458 4.672 4.582 5.256 5.436 5.779 6.11 6.418 6.564 6.861 7.146 7.54 7.791 8.033 8.385 8.722 9.041 9.343 9.616 9.971 10.318 10.644 11.055 11.439 11.82 12.275 12.742 13.159 13.6 14.072 14.553 15.036 15.558 16.125 16.681 17.375 18.076 18.792 19.564 20.36 21.153 21.65 21.328 20.598 19.755 18.981 18.251 17.572 16.906 16.26 15.564 14.942 14.373 13.851 13.281 12.693 12.208 11.707 11.266 10.877 10.425 9.912 9.484 9.057 8.613 8.26 7.898 7.518 7.131 6.714 6.412 6.099 5.611 5.274 4.892 4.691 4.272 3.844 3.43 3.207 2.472 2.415 2.126 1.813 1.14 0.774 0.364 -0.097 -0.639 -1.289 -2.081 -3.395 -5 ,6678 ,TETRA ,17604852,Sun Nov 28 18:20:14 CET,Sun Nov 28 20:38:29 CET,0.0 1.203 1.868 2.36 2.743 3.1 3.397 3.639 4.102 4.354 4.624 4.649 5.358 5.535 5.836 6.128 6.429 6.58 6.874 7.156 7.549 7.803 8.039 8.365 8.687 9.002 9.296 9.562 9.911 10.267 10.601 10.994 11.369 11.708 12.086 12.527 12.955 13.434 13.958 14.482 15.014 15.604 16.251 16.871 17.587 18.363 19.165 19.979 20.853 21.503 21.745 21.418 20.772 19.989 19.192 18.377 17.582 16.833 16.158 15.471 14.879 14.339 13.836 13.349 12.887 12.466 12.002 11.581 11.23 10.857 10.47 10.154 9.811 9.435 9.147 8.842 8.506 8.169 7.792 7.511 7.224 6.76 6.437 6.118 5.956 5.613 5.244 4.842 4.629 3.923 3.909 3.657 3.41 2.839 2.498 2.132 1.735 1.246 0.613 -0.113 -1.713 -6 ,21501 ,TETRA ,17604853,Sun Nov 28 18:20:16 CET,Sun Nov 28 20:38:39 CET,0.0 1.519 2.026 2.455 2.828 3.133 3.423 3.696 4.158 4.36 4.566 4.476 5.159 5.339 5.672 5.998 6.293 6.436 6.714 6.972 7.346 7.595 7.829 8.131 8.428 8.718 8.996 9.271 9.634 9.988 10.318 10.703 11.066 11.417 11.815 12.239 12.652 13.133 13.658 14.192 14.734 15.326 15.999 16.689 17.459 18.22 18.999 19.829 20.721 21.473 21.85 21.419 20.643 19.745 18.834 17.975 17.203 16.498 15.854 15.187 14.593 14.037 13.482 12.969 12.489 11.996 11.488 11.075 10.723 10.34 9.927 9.578 9.225 8.862 8.569 8.266 7.945 7.616 7.267 7.007 6.735 6.333 6.061 5.762 5.606 5.3 4.974 4.607 4.42 3.755 3.85 3.639 3.389 2.854 2.581 2.28 1.87 1.314 0.618 -0.38 -3.528 -7 ,31728 ,TETRA ,17604854,Sun Nov 28 18:20:12 CET,Sun Nov 28 20:40:11 CET,0.0 1.442 2.099 2.602 3.038 3.437 3.803 4.127 4.729 5.008 5.267 5.256 5.993 6.223 6.651 7.043 7.409 7.587 7.921 8.255 8.728 9.02 9.307 9.735 10.145 10.518 10.861 11.177 11.573 11.975 12.365 12.843 13.303 13.699 14.121 14.619 15.099 15.61 16.162 16.733 17.306 17.929 18.638 19.323 20.088 20.957 21.937 22.992 24.113 25.299 26.471 27.01 26.908 26.588 26.217 25.786 25.353 24.862 24.379 23.879 23.457 23.069 22.646 22.256 21.885 21.508 21.109 20.759 20.43 20.071 19.719 19.414 19.084 18.734 18.444 18.088 17.733 17.411 17.018 16.743 16.452 15.94 15.592 15.249 15.062 14.634 14.187 13.736 13.497 12.77 12.716 12.421 12.112 11.42 11.012 10.557 10.036 9.412 8.654 7.593 4.253 -8 ,18267 ,TETRA ,17604855,Sun Nov 28 18:20:16 CET,Sun Nov 28 20:40:04 CET,0.0 4.473 5.412 6.077 6.615 7.06 7.47 7.831 8.379 8.616 8.846 8.77 9.433 9.608 9.948 10.288 10.627 10.787 11.09 11.375 11.798 12.08 12.336 12.694 13.05 13.405 13.758 14.101 14.525 14.901 15.283 15.715 16.058 16.39 16.803 17.231 17.602 18.057 18.562 19.079 19.59 20.11 20.698 21.298 21.985 22.699 23.492 24.357 25.245 26.111 26.677 26.619 26.246 25.726 25.131 24.511 23.912 23.305 22.736 22.161 21.65 21.135 20.581 20.059 19.567 19.082 18.563 18.093 17.671 17.217 16.727 16.313 15.904 15.477 15.132 14.795 14.461 14.107 13.728 13.464 13.18 12.723 12.378 11.99 11.803 11.447 11.07 10.668 10.456 9.761 9.783 9.531 9.262 8.628 8.289 7.937 7.531 7.051 6.483 5.722 3.795 -9 ,19244 ,TETRA ,17604856,Sun Nov 28 18:20:14 CET,Sun Nov 28 20:39:14 CET,0.0 4.106 5.062 5.742 6.31 6.764 7.125 7.441 7.996 8.242 8.471 8.427 9.134 9.326 9.678 10.005 10.319 10.471 10.762 11.049 11.463 11.716 11.952 12.292 12.608 12.92 13.224 13.494 13.837 14.194 14.553 14.987 15.387 15.744 16.159 16.636 17.079 17.557 18.105 18.703 19.263 19.857 20.548 21.184 21.877 22.566 23.276 24.04 24.779 25.461 25.775 25.273 24.479 23.641 22.903 22.189 21.431 20.678 20.054 19.442 18.89 18.372 17.887 17.418 16.956 16.528 16.053 15.599 15.199 14.779 14.313 13.908 13.484 13.047 12.711 12.381 12.061 11.695 11.269 10.964 10.674 10.282 10.012 9.725 9.574 9.269 8.943 8.581 8.38 7.681 7.68 7.428 7.15 6.566 6.257 5.915 5.503 5.012 4.466 3.79 2.2 -10 ,12337 ,TETRA ,17604857,Sun Nov 28 18:20:14 CET,Sun Nov 28 20:39:32 CET,0.0 1.986 2.644 3.168 3.621 4.008 4.366 4.684 5.248 5.525 5.789 5.752 6.453 6.662 7.054 7.422 7.77 7.943 8.271 8.567 9.008 9.289 9.546 9.913 10.265 10.605 10.938 11.257 11.662 12.055 12.455 12.939 13.38 13.828 14.346 14.869 15.365 15.914 16.499 17.119 17.758 18.475 19.278 20.002 20.834 21.841 22.93 24.023 25.208 26.394 27.49 28.023 28.01 27.728 27.355 26.914 26.416 25.918 25.456 24.971 24.531 24.144 23.802 23.454 23.109 22.771 22.399 22.054 21.738 21.403 20.996 20.603 20.204 19.814 19.488 19.167 18.819 18.402 17.978 17.677 17.347 16.844 16.498 16.146 15.962 15.552 15.12 14.674 14.444 13.717 13.659 13.359 13.039 12.336 11.935 11.467 10.952 10.375 9.637 8.576 5.406 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23468.txt deleted file mode 100644 index efc6df1d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,19406 ,KEBNE ,17027261,Wed Dec 22 16:40:00 CET,Wed Dec 22 18:37:06 CET,0.0 3.198 4.187 4.862 5.389 5.777 6.101 6.406 6.99 7.259 7.49 7.417 8.106 8.295 8.645 8.958 9.267 9.423 9.705 9.955 10.312 10.535 10.741 11.042 11.332 11.607 11.873 12.128 12.454 12.759 13.025 13.32 13.602 13.871 14.196 14.55 14.858 15.187 15.562 15.944 16.288 16.612 16.956 17.312 17.64 17.918 18.221 18.481 18.546 18.251 17.163 15.431 13.892 12.448 11.147 9.978 8.916 7.924 7.047 6.164 5.399 4.685 3.969 3.278 2.657 2.097 1.482 0.931 0.474 -0.021 -0.556 -1.004 -1.462 -1.932 -2.31 -2.715 -3.13 -3.55 -3.987 -4.296 -4.626 -5.166 -5.546 -5.933 -6.128 -6.513 -6.938 -7.407 -7.646 -8.384 -8.427 -8.749 -9.11 -9.91 -10.32 -10.743 -11.271 -11.894 -12.638 -13.621 -16.31 -3 ,11878 ,KEBNE ,17027262,Wed Dec 22 16:40:00 CET,Wed Dec 22 18:36:34 CET,0.0 2.268 2.956 3.463 3.907 4.314 4.689 5.005 5.551 5.804 6.035 5.949 6.655 6.852 7.203 7.519 7.822 7.971 8.25 8.524 8.918 9.148 9.363 9.69 9.996 10.272 10.539 10.787 11.109 11.405 11.679 11.991 12.26 12.517 12.829 13.169 13.474 13.793 14.102 14.408 14.736 15.099 15.477 15.836 16.217 16.546 16.807 16.953 16.84 16.393 15.281 13.449 11.673 10.125 8.714 7.395 6.294 5.337 4.487 3.588 2.805 2.118 1.449 0.777 0.147 -0.434 -1.04 -1.582 -2.06 -2.551 -3.078 -3.532 -4.005 -4.49 -4.869 -5.268 -5.678 -6.129 -6.66 -7.049 -7.439 -7.986 -8.352 -8.745 -8.947 -9.358 -9.814 -10.342 -10.611 -11.387 -11.48 -11.802 -12.14 -12.869 -13.297 -13.751 -14.253 -14.846 -15.569 -16.579 -19.548 -4 ,8035 ,KEBNE ,17027263,Wed Dec 22 16:40:00 CET,Wed Dec 22 18:36:22 CET,0.0 1.424 2.187 2.829 3.361 3.83 4.232 4.609 5.332 5.646 5.913 5.919 6.648 6.88 7.345 7.774 8.175 8.365 8.726 9.09 9.638 9.957 10.253 10.675 11.037 11.384 11.721 12.042 12.471 12.855 13.24 13.709 14.113 14.513 14.932 15.374 15.811 16.282 16.775 17.271 17.759 18.265 18.829 19.38 19.952 20.489 21.113 21.856 22.425 22.677 22.364 21.037 19.603 18.219 16.95 15.731 14.637 13.691 12.83 11.926 11.117 10.376 9.65 8.969 8.375 7.816 7.164 6.589 6.114 5.611 5.043 4.544 4.046 3.558 3.166 2.688 2.182 1.67 1.098 0.684 0.248 -0.38 -0.816 -1.308 -1.57 -2.123 -2.724 -3.366 -3.709 -4.587 -4.886 -5.318 -5.791 -6.89 -7.503 -8.15 -8.895 -9.823 -10.897 -12.355 -25.631 -5 ,21468 ,KEBNE ,17027264,Wed Dec 22 16:40:00 CET,Wed Dec 22 18:38:07 CET,0.0 1.992 2.757 3.321 3.801 4.231 4.624 4.987 5.655 5.953 6.236 6.28 7.019 7.243 7.669 8.084 8.483 8.673 9.023 9.353 9.832 10.138 10.44 10.869 11.28 11.664 12.021 12.398 12.873 13.298 13.712 14.202 14.661 15.092 15.565 16.076 16.55 17.066 17.623 18.192 18.776 19.39 20.082 20.79 21.595 22.417 23.268 24.18 24.977 25.458 25.223 24.069 22.784 21.497 20.286 19.097 17.97 16.92 16.002 15.066 14.214 13.449 12.719 12.006 11.323 10.725 10.118 9.544 9.042 8.498 7.884 7.386 6.893 6.354 5.933 5.496 5.035 4.573 4.087 3.738 3.369 2.765 2.321 1.865 1.633 1.135 0.571 -0.01 -0.312 -1.145 -1.376 -1.762 -2.198 -3.252 -3.845 -4.497 -5.203 -6.067 -7.173 -8.726 -20.252 -6 ,15128 ,KEBNE ,17027265,Wed Dec 22 16:40:03 CET,Wed Dec 22 18:32:22 CET,0.0 3.483 4.426 5.126 5.628 5.987 6.297 6.605 7.188 7.441 7.668 7.594 8.284 8.482 8.855 9.18 9.476 9.635 9.934 10.188 10.562 10.803 11.023 11.333 11.644 11.937 12.209 12.474 12.799 13.096 13.389 13.73 14.029 14.304 14.623 14.964 15.262 15.578 15.914 16.247 16.566 16.908 17.221 17.451 17.667 17.916 18.191 18.303 18.124 17.575 16.225 14.305 12.672 11.204 9.844 8.61 7.523 6.53 5.675 4.705 3.853 3.117 2.388 1.725 1.116 0.502 -0.139 -0.725 -1.32 -1.92 -2.475 -2.967 -3.512 -4.034 -4.447 -4.894 -5.362 -5.867 -6.392 -6.743 -7.104 -7.708 -8.141 -8.611 -8.86 -9.366 -9.925 -10.506 -10.802 -11.638 -11.841 -12.248 -12.66 -13.49 -13.954 -14.465 -15.008 -15.642 -16.41 -17.441 -20.152 -7 ,12963 ,KEBNE ,17027266,Wed Dec 22 16:40:02 CET,Wed Dec 22 18:31:58 CET,0.0 1.718 2.386 2.903 3.314 3.665 3.995 4.291 4.808 5.04 5.265 5.224 5.91 6.09 6.43 6.748 7.058 7.212 7.517 7.804 8.192 8.453 8.709 9.055 9.387 9.711 10.009 10.282 10.634 10.971 11.291 11.668 12.004 12.311 12.654 13.011 13.335 13.664 13.987 14.332 14.686 15.054 15.434 15.749 16.065 16.342 16.546 16.639 16.544 16.174 15.201 13.575 11.978 10.544 9.254 8.031 6.901 5.907 5.027 4.111 3.364 2.703 2.047 1.42 0.81 0.223 -0.404 -0.957 -1.432 -1.942 -2.461 -2.905 -3.391 -3.912 -4.311 -4.708 -5.119 -5.549 -6.04 -6.372 -6.682 -7.199 -7.567 -7.939 -8.131 -8.527 -8.965 -9.453 -9.705 -10.474 -10.52 -10.826 -11.146 -11.852 -12.258 -12.713 -13.194 -13.726 -14.366 -15.266 -17.878 -8 ,5361 ,KEBNE ,17027267,Wed Dec 22 16:40:06 CET,Wed Dec 22 18:31:24 CET,0.0 2.328 3.052 3.602 4.1 4.53 4.903 5.241 5.858 6.131 6.38 6.379 7.096 7.327 7.712 8.065 8.423 8.586 8.886 9.177 9.612 9.893 10.15 10.504 10.83 11.141 11.445 11.712 12.016 12.312 12.579 12.876 13.177 13.467 13.788 14.126 14.429 14.76 15.113 15.46 15.789 16.135 16.514 16.835 17.15 17.428 17.627 17.733 17.674 17.27 16.203 14.571 12.957 11.465 10.097 8.791 7.652 6.608 5.695 4.773 3.951 3.212 2.509 1.823 1.199 0.636 0.033 -0.505 -0.963 -1.448 -1.986 -2.45 -2.934 -3.44 -3.83 -4.21 -4.639 -5.144 -5.625 -5.919 -6.229 -6.744 -7.11 -7.505 -7.718 -8.152 -8.597 -9.053 -9.304 -10.074 -10.138 -10.441 -10.757 -11.467 -11.879 -12.355 -12.888 -13.471 -14.188 -15.148 -17.661 -9 ,1832 ,KEBNE ,17027268,Wed Dec 22 16:40:03 CET,Wed Dec 22 18:34:36 CET,0.0 1.827 2.473 2.947 3.343 3.693 4.014 4.317 4.882 5.14 5.392 5.361 6.056 6.245 6.61 6.959 7.301 7.465 7.761 8.039 8.44 8.689 8.919 9.25 9.566 9.848 10.132 10.421 10.748 11.032 11.293 11.599 11.895 12.16 12.452 12.765 13.044 13.323 13.62 13.924 14.225 14.556 14.921 15.237 15.546 15.839 16.056 16.11 16.055 15.633 14.322 12.45 10.658 9.037 7.583 6.225 4.994 3.834 2.797 1.794 0.949 0.195 -0.508 -1.193 -1.84 -2.413 -3.049 -3.641 -4.231 -4.862 -5.422 -5.866 -6.398 -7.008 -7.464 -7.924 -8.397 -8.911 -9.465 -9.841 -10.216 -10.846 -11.309 -11.766 -12.01 -12.534 -13.08 -13.677 -13.985 -14.802 -14.978 -15.337 -15.723 -16.658 -17.161 -17.685 -18.247 -18.864 -19.669 -20.728 -23.583 -10 ,22359 ,KEBNE ,17027269,Wed Dec 22 16:40:02 CET,Wed Dec 22 18:34:49 CET,0.0 1.323 1.982 2.484 2.904 3.275 3.63 3.947 4.508 4.767 4.993 4.961 5.677 5.882 6.262 6.632 6.99 7.156 7.464 7.758 8.19 8.463 8.721 9.106 9.453 9.773 10.076 10.341 10.707 11.086 11.438 11.837 12.225 12.599 13.012 13.474 13.852 14.176 14.483 14.778 15.081 15.407 15.785 16.151 16.508 16.799 17.037 17.112 16.977 16.526 15.286 13.432 11.658 10.011 8.668 7.444 6.354 5.329 4.364 3.383 2.536 1.781 1.056 0.364 -0.286 -0.883 -1.502 -2.06 -2.557 -3.081 -3.637 -4.108 -4.589 -5.094 -5.486 -5.879 -6.282 -6.7 -7.166 -7.504 -7.845 -8.385 -8.77 -9.164 -9.369 -9.803 -10.256 -10.746 -11.013 -11.795 -11.922 -12.244 -12.576 -13.311 -13.732 -14.213 -14.755 -15.341 -16.067 -17.04 -19.556 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23471.txt deleted file mode 100644 index 3482d500..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18255 ,TETRA ,17604858,Sun Nov 28 18:20:12 CET,Sun Nov 28 20:38:29 CET,0.0 2.037 2.815 3.381 3.839 4.253 4.612 4.915 5.45 5.7 5.94 5.877 6.582 6.779 7.152 7.495 7.813 7.957 8.226 8.489 8.852 9.076 9.284 9.574 9.847 10.109 10.36 10.593 10.882 11.146 11.382 11.661 11.924 12.164 12.437 12.743 13.004 13.258 13.525 13.784 14.015 14.206 14.373 14.524 14.637 14.694 14.592 14.209 13.517 12.294 9.909 6.855 4.26 1.98 0.054 -1.646 -3.159 -4.524 -5.736 -6.992 -8.067 -9.023 -9.963 -10.855 -11.675 -12.41 -13.164 -13.837 -14.431 -15.059 -15.71 -16.253 -16.794 -17.34 -17.797 -18.261 -18.721 -19.215 -19.721 -20.072 -20.454 -21.055 -21.484 -21.954 -22.197 -22.686 -23.196 -23.758 -24.058 -24.885 -25.052 -25.419 -25.769 -26.574 -27.022 -27.483 -28.021 -28.612 -29.318 -30.317 -32.766 -2 ,29530 ,TETRA ,17604859,Sun Nov 28 18:20:14 CET,Sun Nov 28 20:38:24 CET,0.0 3.771 4.795 5.503 6.108 6.629 7.078 7.469 8.078 8.324 8.56 8.509 9.203 9.396 9.761 10.086 10.384 10.537 10.827 11.079 11.432 11.646 11.84 12.113 12.377 12.629 12.87 13.101 13.392 13.656 13.893 14.165 14.404 14.643 14.92 15.198 15.451 15.705 15.977 16.238 16.45 16.647 16.824 16.93 16.965 16.923 16.73 16.348 15.687 14.486 12.247 9.345 6.812 4.672 2.769 0.978 -0.572 -1.935 -3.11 -4.287 -5.31 -6.264 -7.156 -7.965 -8.732 -9.42 -10.143 -10.802 -11.351 -11.926 -12.543 -13.068 -13.638 -14.228 -14.671 -15.128 -15.607 -16.09 -16.588 -16.944 -17.337 -17.961 -18.387 -18.832 -19.058 -19.528 -20.046 -20.627 -20.961 -21.835 -22.006 -22.348 -22.699 -23.48 -23.935 -24.468 -25.061 -25.768 -26.711 -27.968 -32.431 -3 ,4820 ,TETRA ,17604860,Sun Nov 28 18:20:16 CET,Sun Nov 28 20:36:58 CET,0.0 1.324 1.906 2.378 2.791 3.196 3.628 3.986 4.596 4.927 5.239 5.298 6.035 6.247 6.592 6.915 7.21 7.341 7.597 7.854 8.208 8.419 8.616 8.915 9.205 9.464 9.694 9.917 10.209 10.474 10.712 10.991 11.266 11.528 11.826 12.124 12.389 12.681 12.963 13.215 13.426 13.605 13.765 13.893 13.95 13.92 13.757 13.407 12.716 11.437 9.136 6.229 3.743 1.556 -0.353 -2.049 -3.561 -4.939 -6.188 -7.467 -8.545 -9.537 -10.508 -11.4 -12.194 -12.968 -13.809 -14.507 -15.142 -15.818 -16.537 -17.143 -17.753 -18.399 -18.924 -19.479 -20.056 -20.678 -21.322 -21.742 -22.17 -22.853 -23.345 -23.866 -24.131 -24.673 -25.263 -25.915 -26.255 -27.122 -27.367 -27.767 -28.193 -29.162 -29.663 -30.207 -30.869 -31.631 -32.452 -33.536 -37.688 -4 ,9107 ,TETRA ,17604861,Sun Nov 28 18:20:18 CET,Sun Nov 28 20:36:14 CET,0.0 2.01 2.696 3.191 3.637 4.02 4.329 4.617 5.126 5.344 5.542 5.414 6.071 6.235 6.532 6.805 7.067 7.192 7.423 7.653 7.974 8.175 8.37 8.638 8.891 9.118 9.33 9.543 9.802 10.045 10.261 10.492 10.708 10.907 11.14 11.38 11.572 11.748 11.915 12.071 12.217 12.367 12.473 12.471 12.398 12.235 11.935 11.403 10.403 8.768 5.948 2.453 -0.35 -2.7 -4.767 -6.63 -8.206 -9.578 -10.805 -12.034 -13.041 -13.961 -14.859 -15.7 -16.48 -17.198 -17.951 -18.633 -19.238 -19.855 -20.487 -21.003 -21.528 -22.081 -22.522 -22.978 -23.455 -23.976 -24.515 -24.89 -25.284 -25.874 -26.278 -26.705 -26.928 -27.404 -27.903 -28.439 -28.723 -29.522 -29.626 -29.949 -30.276 -31.005 -31.436 -31.92 -32.449 -33.05 -33.791 -34.864 -38.039 -5 ,3782 ,TETRA ,17604862,Sun Nov 28 18:20:12 CET,Sun Nov 28 20:36:32 CET,0.0 2.052 2.728 3.261 3.737 4.184 4.562 4.907 5.491 5.708 5.925 5.874 6.545 6.727 7.053 7.34 7.616 7.747 7.983 8.222 8.642 8.897 9.095 9.397 9.683 9.924 10.147 10.376 10.653 10.89 11.123 11.397 11.651 11.871 12.157 12.489 12.72 12.951 13.178 13.388 13.579 13.768 13.97 14.117 14.209 14.21 14.122 13.86 13.227 12.019 9.75 6.739 4.114 1.883 -0.097 -1.937 -3.555 -5.001 -6.226 -7.465 -8.518 -9.438 -10.348 -11.209 -12.0 -12.71 -13.453 -14.117 -14.707 -15.342 -15.982 -16.482 -16.994 -17.55 -17.999 -18.458 -18.918 -19.396 -19.911 -20.267 -20.624 -21.223 -21.65 -22.094 -22.332 -22.824 -23.324 -23.837 -24.118 -24.927 -25.023 -25.371 -25.741 -26.57 -27.036 -27.506 -28.017 -28.63 -29.43 -30.526 -33.933 -6 ,6435 ,TETRA ,17604863,Sun Nov 28 18:20:13 CET,Sun Nov 28 20:36:40 CET,0.0 1.436 2.067 2.576 3.019 3.389 3.694 3.97 4.475 4.697 4.908 4.796 5.478 5.645 5.951 6.227 6.517 6.658 6.902 7.13 7.453 7.659 7.852 8.106 8.34 8.556 8.739 8.918 9.145 9.333 9.517 9.746 9.945 10.119 10.324 10.534 10.706 10.868 11.025 11.205 11.368 11.485 11.567 11.585 11.558 11.465 11.185 10.642 9.746 8.28 5.594 2.18 -0.691 -3.038 -5.001 -6.757 -8.343 -9.801 -11.011 -12.232 -13.287 -14.225 -15.133 -15.989 -16.794 -17.526 -18.303 -19.009 -19.624 -20.252 -20.908 -21.442 -21.972 -22.522 -22.962 -23.422 -23.889 -24.386 -24.921 -25.288 -25.664 -26.261 -26.673 -27.092 -27.313 -27.793 -28.304 -28.862 -29.154 -29.981 -30.105 -30.446 -30.817 -31.591 -32.022 -32.53 -33.083 -33.721 -34.49 -35.443 -38.822 -7 ,29293 ,TETRA ,17604864,Sun Nov 28 18:20:15 CET,Sun Nov 28 20:36:33 CET,0.0 1.21 1.916 2.481 2.951 3.362 3.735 4.058 4.663 4.939 5.196 5.203 5.924 6.136 6.541 6.928 7.273 7.443 7.769 8.074 8.515 8.781 9.022 9.367 9.703 10.01 10.295 10.584 10.922 11.219 11.487 11.78 12.091 12.366 12.619 12.896 13.137 13.406 13.703 13.966 14.224 14.454 14.626 14.742 14.803 14.776 14.578 14.212 13.551 12.322 10.0 7.016 4.437 2.218 0.358 -1.345 -2.852 -4.161 -5.349 -6.586 -7.641 -8.591 -9.502 -10.37 -11.188 -11.938 -12.707 -13.376 -13.988 -14.625 -15.287 -15.873 -16.521 -17.194 -17.691 -18.241 -18.815 -19.414 -20.067 -20.503 -20.943 -21.666 -22.171 -22.68 -22.955 -23.535 -24.117 -24.743 -25.091 -25.984 -26.218 -26.604 -27.01 -27.909 -28.412 -28.956 -29.569 -30.288 -31.11 -32.168 -35.335 -8 ,10915 ,TETRA ,17604865,Sun Nov 28 18:20:41 CET,Sun Nov 28 20:37:11 CET,0.0 1.779 2.484 3.019 3.459 3.824 4.129 4.407 4.922 5.158 5.378 5.268 5.929 6.09 6.398 6.694 6.968 7.089 7.329 7.552 7.843 8.026 8.216 8.481 8.719 8.935 9.141 9.342 9.579 9.796 9.987 10.2 10.419 10.618 10.798 10.995 11.207 11.404 11.55 11.687 11.808 11.917 12.012 12.04 12.015 11.904 11.646 11.183 10.341 8.774 5.922 2.44 -0.379 -2.735 -4.788 -6.643 -8.312 -9.813 -11.081 -12.355 -13.452 -14.413 -15.314 -16.136 -16.898 -17.613 -18.37 -19.033 -19.598 -20.205 -20.875 -21.478 -22.101 -22.697 -23.16 -23.643 -24.14 -24.656 -25.162 -25.509 -25.878 -26.454 -26.864 -27.301 -27.52 -27.965 -28.425 -28.901 -29.169 -29.982 -30.081 -30.435 -30.861 -31.855 -32.387 -32.992 -33.696 -34.441 -35.35 -36.684 -41.894 -9 ,25571 ,TETRA ,17604866,Sun Nov 28 18:20:43 CET,Sun Nov 28 20:37:16 CET,0.0 2.354 3.202 3.818 4.281 4.679 5.034 5.342 5.89 6.149 6.4 6.365 7.07 7.271 7.65 7.995 8.301 8.438 8.696 8.956 9.322 9.541 9.754 10.059 10.345 10.612 10.859 11.084 11.361 11.622 11.861 12.138 12.403 12.656 12.944 13.244 13.506 13.76 13.983 14.202 14.441 14.668 14.872 15.005 15.043 14.979 14.774 14.351 13.614 12.398 10.103 7.087 4.491 2.29 0.339 -1.422 -2.964 -4.346 -5.535 -6.766 -7.865 -8.855 -9.753 -10.592 -11.392 -12.12 -12.859 -13.507 -14.064 -14.634 -15.232 -15.746 -16.283 -16.83 -17.253 -17.699 -18.165 -18.645 -19.159 -19.526 -19.917 -20.541 -20.965 -21.405 -21.639 -22.103 -22.588 -23.152 -23.445 -24.281 -24.458 -24.792 -25.127 -25.956 -26.437 -26.945 -27.522 -28.188 -28.986 -30.175 -34.152 -10 ,12226 ,TETRA ,17604867,Sun Nov 28 18:20:39 CET,Sun Nov 28 20:37:31 CET,0.0 2.209 3.068 3.732 4.265 4.691 5.051 5.361 5.93 6.21 6.462 6.379 7.059 7.241 7.623 7.969 8.226 8.35 8.592 8.811 9.12 9.316 9.503 9.767 10.016 10.264 10.492 10.688 10.929 11.18 11.419 11.657 11.869 12.062 12.301 12.54 12.704 12.873 13.021 13.158 13.258 13.309 13.345 13.325 13.223 13.023 12.688 12.125 11.21 9.682 6.959 3.715 1.038 -1.271 -3.267 -5.081 -6.626 -7.986 -9.161 -10.348 -11.371 -12.282 -13.171 -14.025 -14.823 -15.546 -16.321 -17.002 -17.574 -18.16 -18.765 -19.287 -19.828 -20.385 -20.802 -21.235 -21.707 -22.2 -22.745 -23.139 -23.537 -24.126 -24.527 -24.945 -25.159 -25.609 -26.092 -26.602 -26.852 -27.647 -27.738 -28.065 -28.409 -29.159 -29.589 -30.066 -30.587 -31.17 -31.845 -32.77 -36.39 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23468.txt deleted file mode 100644 index 78b96a50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10374 ,TETRA ,17604868,Sun Nov 28 18:20:40 CET,Sun Nov 28 20:36:22 CET,0.0 1.944 2.69 3.279 3.752 4.182 4.6 5.001 5.738 6.066 6.362 6.394 7.186 7.434 7.915 8.372 8.797 9.006 9.428 9.837 10.423 10.789 11.137 11.629 12.096 12.566 13.03 13.464 14.029 14.584 15.123 15.769 16.388 16.982 17.655 18.396 19.123 19.923 20.762 21.699 22.73 23.874 25.166 26.492 28.084 29.87 31.942 34.274 37.056 40.468 44.81 48.594 50.876 52.327 53.25 53.933 54.444 54.788 55.025 55.188 55.213 55.163 55.121 55.05 54.925 54.803 54.658 54.49 54.304 54.104 53.893 53.699 53.498 53.275 53.096 52.916 52.713 52.47 52.205 52.015 51.79 51.427 51.175 50.907 50.77 50.482 50.148 49.757 49.546 48.838 48.873 48.617 48.339 47.697 47.328 46.928 46.482 46.014 45.428 44.612 42.161 -2 ,11914 ,TETRA ,17604869,Sun Nov 28 18:20:42 CET,Sun Nov 28 20:35:50 CET,0.0 1.483 2.208 2.804 3.35 3.854 4.298 4.7 5.438 5.772 6.097 6.183 7.031 7.321 7.882 8.373 8.818 9.05 9.51 9.939 10.575 10.966 11.303 11.792 12.283 12.751 13.184 13.599 14.133 14.645 15.138 15.761 16.367 16.937 17.6 18.339 19.043 19.84 20.699 21.606 22.569 23.666 24.96 26.285 27.821 29.54 31.596 33.918 36.656 39.964 44.194 47.919 50.206 51.748 52.715 53.379 53.88 54.196 54.344 54.436 54.47 54.435 54.332 54.211 54.074 53.886 53.683 53.51 53.33 53.138 52.947 52.747 52.521 52.276 52.047 51.812 51.601 51.368 51.094 50.88 50.637 50.25 49.935 49.59 49.428 49.07 48.687 48.27 48.032 47.274 47.223 46.926 46.615 45.95 45.573 45.139 44.618 44.023 43.282 42.3 40.042 -3 ,25072 ,TETRA ,17604870,Sun Nov 28 18:20:45 CET,Sun Nov 28 20:36:35 CET,0.0 1.859 2.68 3.344 3.904 4.4 4.87 5.306 6.068 6.423 6.759 6.847 7.706 7.982 8.52 9.021 9.494 9.73 10.191 10.609 11.199 11.602 11.986 12.54 13.081 13.593 14.083 14.549 15.132 15.689 16.193 16.776 17.348 17.901 18.624 19.441 20.148 20.941 21.797 22.696 23.654 24.741 26.056 27.422 29.005 30.785 32.89 35.27 38.044 41.467 45.83 49.578 51.879 53.348 54.298 54.934 55.37 55.663 55.808 55.888 55.916 55.895 55.818 55.733 55.616 55.436 55.246 55.09 54.949 54.785 54.591 54.425 54.226 53.971 53.76 53.547 53.317 53.021 52.672 52.441 52.191 51.783 51.508 51.229 51.084 50.747 50.362 49.93 49.688 48.932 48.923 48.649 48.338 47.637 47.257 46.807 46.3 45.691 44.957 43.975 41.563 -4 ,28317 ,TETRA ,17604871,Sun Nov 28 18:20:40 CET,Sun Nov 28 20:36:39 CET,0.0 1.657 2.372 2.94 3.458 3.931 4.37 4.784 5.539 5.887 6.225 6.317 7.177 7.475 8.046 8.56 9.043 9.28 9.725 10.142 10.763 11.171 11.562 12.135 12.658 13.146 13.656 14.139 14.747 15.352 15.881 16.481 17.071 17.626 18.274 19.013 19.725 20.513 21.349 22.265 23.245 24.357 25.666 26.977 28.546 30.325 32.366 34.697 37.51 41.0 45.464 49.278 51.556 53.01 53.945 54.591 55.001 55.245 55.363 55.438 55.472 55.45 55.391 55.301 55.177 55.03 54.885 54.735 54.546 54.353 54.161 53.992 53.813 53.534 53.234 52.93 52.636 52.27 51.914 51.686 51.467 51.099 50.819 50.543 50.377 49.993 49.602 49.168 48.943 48.231 48.235 47.937 47.606 46.867 46.45 46.005 45.506 44.911 44.189 43.22 40.619 -5 ,12589 ,TETRA ,17604872,Sun Nov 28 18:20:40 CET,Sun Nov 28 20:36:13 CET,0.0 2.22 3.056 3.701 4.249 4.738 5.195 5.618 6.397 6.763 7.11 7.202 8.042 8.318 8.867 9.391 9.849 10.052 10.439 10.853 11.484 11.889 12.304 12.882 13.394 13.867 14.363 14.843 15.487 16.155 16.717 17.354 17.956 18.52 19.186 19.911 20.604 21.382 22.223 23.078 23.967 24.994 26.206 27.469 28.951 30.609 32.614 34.902 37.645 41.004 45.229 48.963 51.244 52.753 53.791 54.487 54.913 55.171 55.306 55.376 55.416 55.408 55.345 55.284 55.188 55.043 54.886 54.759 54.637 54.423 54.175 53.975 53.732 53.462 53.247 52.994 52.698 52.376 52.034 51.798 51.552 51.127 50.814 50.493 50.323 49.97 49.597 49.182 48.964 48.218 48.222 47.962 47.679 47.015 46.649 46.249 45.798 45.245 44.5 43.508 41.078 -6 ,8922 ,TETRA ,17604873,Sun Nov 28 18:20:42 CET,Sun Nov 28 20:35:23 CET,0.0 1.69 2.421 3.027 3.556 4.002 4.428 4.821 5.5 5.814 6.126 6.195 7.039 7.319 7.857 8.367 8.838 9.061 9.516 9.967 10.612 10.997 11.335 11.808 12.284 12.738 13.167 13.639 14.238 14.776 15.305 15.907 16.489 17.066 17.719 18.454 19.175 19.965 20.82 21.729 22.673 23.718 24.961 26.239 27.731 29.474 31.56 33.942 36.811 40.311 44.738 48.539 50.783 52.289 53.278 53.928 54.335 54.564 54.711 54.806 54.814 54.774 54.708 54.627 54.542 54.407 54.215 54.016 53.801 53.589 53.373 53.17 52.944 52.664 52.457 52.24 51.969 51.698 51.464 51.302 51.103 50.711 50.383 50.058 49.89 49.518 49.126 48.72 48.491 47.728 47.673 47.369 47.048 46.356 45.98 45.532 44.994 44.399 43.674 42.725 40.53 -7 ,26348 ,TETRA ,17604874,Sun Nov 28 18:20:45 CET,Sun Nov 28 20:35:46 CET,0.0 1.839 2.632 3.257 3.805 4.287 4.732 5.159 5.922 6.277 6.623 6.723 7.578 7.86 8.399 8.894 9.35 9.58 10.064 10.526 11.168 11.576 11.939 12.465 13.015 13.512 14.0 14.484 15.047 15.566 16.05 16.625 17.18 17.703 18.314 19.001 19.661 20.395 21.197 22.076 23.015 24.055 25.298 26.646 28.239 30.002 32.052 34.399 37.216 40.645 45.02 48.837 51.126 52.623 53.618 54.252 54.629 54.878 55.04 55.168 55.222 55.191 55.107 54.967 54.826 54.69 54.488 54.295 54.123 53.924 53.707 53.519 53.294 53.026 52.809 52.593 52.314 51.964 51.618 51.392 51.172 50.816 50.528 50.219 50.063 49.752 49.406 48.985 48.76 48.004 47.997 47.723 47.439 46.837 46.48 46.053 45.547 44.899 44.089 43.07 41.006 -8 ,28211 ,TETRA ,17604875,Sun Nov 28 18:20:41 CET,Sun Nov 28 20:36:35 CET,0.0 2.042 2.869 3.526 4.061 4.527 4.941 5.311 5.964 6.263 6.558 6.571 7.372 7.616 8.085 8.536 8.959 9.165 9.556 9.922 10.461 10.818 11.173 11.685 12.172 12.649 13.109 13.547 14.134 14.692 15.238 15.888 16.493 17.093 17.756 18.465 19.141 19.901 20.741 21.626 22.562 23.65 24.947 26.261 27.808 29.543 31.568 33.884 36.648 39.994 44.243 47.932 50.212 51.748 52.721 53.33 53.728 53.986 54.143 54.196 54.145 54.058 53.96 53.848 53.704 53.535 53.326 53.115 52.944 52.722 52.465 52.257 51.995 51.689 51.429 51.143 50.854 50.572 50.283 50.087 49.878 49.55 49.318 49.052 48.916 48.627 48.294 47.914 47.711 47.011 47.045 46.774 46.479 45.825 45.459 45.05 44.582 43.983 43.24 42.224 38.15 -9 ,31399 ,TETRA ,17604876,Sun Nov 28 18:20:43 CET,Sun Nov 28 20:35:59 CET,0.0 1.322 2.029 2.59 3.109 3.584 4.02 4.444 5.234 5.586 5.924 6.005 6.856 7.145 7.685 8.23 8.723 8.932 9.331 9.739 10.377 10.768 11.125 11.694 12.244 12.735 13.175 13.597 14.205 14.825 15.398 16.07 16.712 17.33 18.013 18.751 19.467 20.27 21.156 22.084 23.077 24.263 25.657 27.028 28.643 30.479 32.624 35.058 37.939 41.471 45.915 49.693 51.974 53.472 54.442 55.099 55.496 55.733 55.847 55.86 55.807 55.721 55.636 55.543 55.419 55.286 55.097 54.919 54.771 54.593 54.394 54.204 53.98 53.742 53.54 53.305 53.064 52.827 52.561 52.372 52.19 51.858 51.591 51.307 51.168 50.871 50.526 50.169 49.979 49.28 49.321 49.067 48.804 48.232 47.874 47.459 46.976 46.439 45.809 44.969 42.91 -10 ,16983 ,TETRA ,17604877,Sun Nov 28 18:20:45 CET,Sun Nov 28 20:39:34 CET,0.0 1.517 2.268 2.883 3.406 3.864 4.28 4.65 5.315 5.627 5.938 5.961 6.758 7.007 7.513 7.987 8.422 8.636 9.053 9.454 10.014 10.371 10.719 11.208 11.676 12.134 12.582 13.009 13.572 14.148 14.686 15.308 15.908 16.473 17.138 17.897 18.624 19.431 20.285 21.192 22.164 23.25 24.557 25.897 27.428 29.133 31.129 33.459 36.23 39.597 43.909 47.631 49.868 51.302 52.251 52.914 53.376 53.654 53.806 53.915 53.976 53.992 53.951 53.855 53.749 53.642 53.49 53.31 53.118 52.889 52.656 52.441 52.189 51.94 51.735 51.502 51.265 51.029 50.76 50.557 50.338 49.96 49.689 49.413 49.279 48.989 48.634 48.23 48.02 47.3 47.413 47.173 46.916 46.321 45.969 45.578 45.134 44.614 43.946 43.061 40.353 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23471.txt deleted file mode 100644 index 9a5260b1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29942 ,TETRA ,17604878,Sun Nov 28 18:20:42 CET,Sun Nov 28 20:37:44 CET,0.0 1.447 2.243 2.868 3.388 3.855 4.276 4.664 5.39 5.72 6.03 6.077 6.911 7.174 7.679 8.153 8.598 8.82 9.25 9.653 10.221 10.592 10.957 11.443 11.923 12.404 12.815 13.192 13.728 14.308 14.801 15.317 15.819 16.288 16.826 17.431 18.002 18.624 19.311 20.051 20.832 21.684 22.657 23.635 24.752 25.994 27.436 29.07 30.999 33.297 36.016 38.17 39.206 39.719 39.974 40.035 40.019 39.95 39.801 39.596 39.373 39.12 38.844 38.583 38.337 38.088 37.788 37.49 37.211 36.9 36.537 36.244 35.964 35.652 35.397 35.112 34.796 34.48 34.104 33.806 33.531 33.063 32.693 32.34 32.155 31.728 31.274 30.795 30.54 29.761 29.705 29.394 29.052 28.282 27.862 27.391 26.861 26.225 25.488 24.501 21.127 -2 ,1528 ,TETRA ,17604879,Sun Nov 28 18:20:42 CET,Sun Nov 28 20:35:20 CET,0.0 1.538 2.295 2.889 3.408 3.868 4.304 4.718 5.49 5.815 6.126 6.172 6.998 7.261 7.781 8.269 8.719 8.943 9.351 9.729 10.288 10.645 10.982 11.458 11.897 12.295 12.727 13.166 13.688 14.139 14.586 15.148 15.725 16.278 16.87 17.541 18.152 18.801 19.501 20.253 21.073 22.027 23.096 24.124 25.298 26.628 28.184 29.945 32.017 34.421 37.281 39.53 40.817 41.558 41.92 42.093 42.155 42.099 41.953 41.74 41.517 41.301 41.058 40.799 40.563 40.343 40.084 39.842 39.621 39.373 39.12 38.906 38.648 38.347 38.096 37.835 37.563 37.227 36.823 36.553 36.259 35.769 35.437 35.076 34.88 34.493 34.087 33.635 33.382 32.6 32.541 32.187 31.788 31.01 30.599 30.127 29.599 28.954 28.221 27.258 23.894 -3 ,154 ,TETRA ,17604880,Sun Nov 28 18:20:43 CET,Sun Nov 28 20:34:45 CET,0.0 1.268 1.921 2.441 2.883 3.295 3.716 4.117 4.771 5.057 5.341 5.379 6.194 6.432 6.885 7.312 7.713 7.903 8.284 8.647 9.164 9.508 9.843 10.303 10.722 11.142 11.568 11.97 12.473 12.936 13.375 13.924 14.46 14.966 15.559 16.214 16.823 17.506 18.233 18.993 19.791 20.665 21.673 22.719 23.963 25.338 26.924 28.68 30.751 33.2 36.097 38.503 39.814 40.548 40.975 41.146 41.164 41.128 41.027 40.877 40.716 40.528 40.301 40.037 39.748 39.457 39.117 38.802 38.527 38.224 37.899 37.595 37.257 36.911 36.653 36.39 36.1 35.776 35.423 35.176 34.904 34.447 34.129 33.794 33.618 33.23 32.812 32.375 32.139 31.388 31.416 31.129 30.812 30.146 29.762 29.325 28.848 28.247 27.547 26.684 24.391 -4 ,9754 ,TETRA ,17604881,Sun Nov 28 18:20:45 CET,Sun Nov 28 20:36:00 CET,0.0 1.336 2.038 2.606 3.115 3.592 4.038 4.423 5.105 5.423 5.726 5.752 6.561 6.811 7.339 7.817 8.275 8.5 8.92 9.328 9.938 10.31 10.644 11.125 11.567 11.96 12.344 12.775 13.366 13.879 14.311 14.88 15.445 15.946 16.524 17.152 17.772 18.473 19.239 20.052 20.886 21.829 22.931 24.023 25.258 26.6 28.141 29.833 31.753 34.012 36.661 38.701 39.719 40.268 40.586 40.692 40.672 40.571 40.41 40.203 39.995 39.796 39.573 39.314 39.079 38.84 38.549 38.29 38.056 37.817 37.54 37.291 37.014 36.71 36.477 36.221 35.938 35.619 35.272 34.988 34.683 34.23 33.897 33.531 33.337 32.941 32.518 32.062 31.809 31.031 31.007 30.708 30.378 29.622 29.223 28.773 28.238 27.663 26.959 25.963 23.756 -5 ,9916 ,TETRA ,17604882,Sun Nov 28 18:20:47 CET,Sun Nov 28 20:36:28 CET,0.0 1.748 2.533 3.111 3.6 4.037 4.437 4.824 5.545 5.858 6.164 6.217 7.043 7.297 7.8 8.28 8.72 8.942 9.386 9.803 10.397 10.763 11.103 11.597 12.026 12.392 12.773 13.167 13.691 14.192 14.667 15.225 15.723 16.217 16.772 17.361 17.937 18.568 19.286 20.057 20.826 21.667 22.648 23.675 24.871 26.175 27.659 29.375 31.461 33.911 36.731 38.76 39.777 40.362 40.718 40.898 40.93 40.86 40.721 40.553 40.376 40.185 39.979 39.736 39.488 39.252 38.971 38.701 38.46 38.194 37.893 37.617 37.333 37.025 36.704 36.369 36.059 35.725 35.385 35.137 34.858 34.358 33.996 33.628 33.416 32.978 32.533 32.023 31.774 31.016 30.944 30.596 30.242 29.456 29.004 28.511 27.943 27.251 26.425 25.367 22.939 -6 ,15956 ,TETRA ,17604883,Sun Nov 28 18:20:42 CET,Sun Nov 28 20:35:26 CET,0.0 1.508 2.23 2.825 3.322 3.761 4.189 4.582 5.308 5.646 5.97 6.05 6.891 7.18 7.717 8.21 8.676 8.878 9.223 9.559 10.045 10.389 10.728 11.211 11.688 12.101 12.505 12.94 13.442 13.863 14.291 14.797 15.262 15.716 16.264 16.906 17.51 18.142 18.816 19.537 20.302 21.149 22.129 23.102 24.234 25.555 27.076 28.756 30.692 32.952 35.788 38.03 39.072 39.57 39.802 39.861 39.816 39.686 39.489 39.232 38.944 38.641 38.333 38.033 37.768 37.505 37.192 36.936 36.676 36.375 36.077 35.791 35.483 35.143 34.853 34.56 34.256 33.936 33.577 33.3 33.01 32.569 32.275 31.958 31.798 31.472 31.097 30.707 30.502 29.758 29.756 29.463 29.15 28.462 28.094 27.706 27.208 26.617 25.925 25.003 22.509 -7 ,733 ,TETRA ,17604884,Sun Nov 28 18:20:47 CET,Sun Nov 28 20:35:23 CET,0.0 1.436 2.263 2.898 3.424 3.896 4.308 4.696 5.396 5.721 6.045 6.099 6.914 7.178 7.692 8.176 8.644 8.859 9.225 9.585 10.173 10.574 10.927 11.359 11.746 12.109 12.457 12.856 13.397 13.834 14.266 14.79 15.284 15.782 16.328 16.905 17.497 18.159 18.836 19.551 20.326 21.217 22.233 23.207 24.316 25.567 27.081 28.813 30.778 33.072 35.836 38.005 39.114 39.738 40.05 40.126 40.07 40.018 39.952 39.808 39.637 39.423 39.183 38.944 38.71 38.47 38.183 37.923 37.699 37.456 37.177 36.921 36.645 36.343 36.087 35.818 35.525 35.217 34.903 34.682 34.439 34.033 33.721 33.356 33.174 32.813 32.404 31.926 31.676 30.898 30.821 30.519 30.211 29.455 28.963 28.435 27.872 27.224 26.454 25.476 23.385 -8 ,14679 ,TETRA ,17604885,Sun Nov 28 18:20:42 CET,Sun Nov 28 20:35:28 CET,0.0 2.459 3.285 3.934 4.504 5.014 5.474 5.871 6.592 6.93 7.25 7.299 8.123 8.423 9.035 9.55 9.997 10.218 10.65 11.046 11.612 11.981 12.34 12.869 13.371 13.84 14.293 14.723 15.283 15.827 16.325 16.913 17.498 18.063 18.706 19.427 20.117 20.861 21.659 22.498 23.393 24.427 25.633 26.834 28.242 29.816 31.665 33.717 36.02 38.745 42.035 44.688 46.147 47.052 47.584 47.812 47.835 47.768 47.678 47.536 47.334 47.101 46.835 46.53 46.236 45.972 45.678 45.409 45.155 44.865 44.551 44.268 43.962 43.631 43.377 43.114 42.824 42.51 42.164 41.921 41.678 41.288 41.001 40.679 40.507 40.15 39.757 39.325 39.102 38.355 38.356 38.068 37.766 37.14 36.788 36.348 35.835 35.281 34.642 33.806 31.305 -9 ,19628 ,TETRA ,17604886,Sun Nov 28 18:20:45 CET,Sun Nov 28 20:35:30 CET,0.0 1.385 2.133 2.726 3.245 3.737 4.182 4.565 5.263 5.582 5.88 5.911 6.753 7.03 7.534 7.975 8.394 8.612 9.004 9.381 9.973 10.335 10.686 11.173 11.603 12.042 12.454 12.836 13.314 13.743 14.184 14.777 15.369 15.881 16.432 17.059 17.663 18.329 19.045 19.811 20.608 21.466 22.463 23.519 24.761 26.188 27.777 29.455 31.463 33.815 36.513 38.587 39.627 40.179 40.453 40.469 40.328 40.142 39.952 39.695 39.433 39.186 38.913 38.632 38.361 38.092 37.777 37.468 37.201 36.904 36.556 36.23 35.86 35.489 35.211 34.916 34.609 34.288 33.923 33.638 33.319 32.842 32.511 32.15 31.952 31.526 31.091 30.603 30.334 29.532 29.436 29.093 28.737 27.963 27.517 27.039 26.498 25.874 25.169 24.273 22.055 -10 ,1713 ,TETRA ,17604887,Sun Nov 28 18:20:42 CET,Sun Nov 28 20:35:29 CET,0.0 1.451 2.179 2.718 3.163 3.573 3.95 4.289 4.923 5.237 5.55 5.559 6.347 6.556 7.027 7.546 8.03 8.241 8.652 9.059 9.636 10.006 10.366 10.881 11.386 11.858 12.259 12.645 13.135 13.572 13.98 14.47 14.948 15.424 15.976 16.566 17.139 17.781 18.467 19.216 19.982 20.815 21.769 22.714 23.85 25.143 26.589 28.211 30.156 32.406 35.128 37.286 38.445 39.083 39.387 39.511 39.515 39.434 39.303 39.142 39.001 38.826 38.623 38.415 38.177 37.914 37.619 37.349 37.101 36.846 36.566 36.32 36.066 35.786 35.534 35.218 34.894 34.541 34.145 33.91 33.677 33.215 32.83 32.468 32.284 31.861 31.427 30.976 30.726 29.925 29.848 29.532 29.209 28.503 28.1 27.649 27.129 26.544 25.857 24.804 21.367 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23466.txt deleted file mode 100644 index ce1cfdb2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28953 ,TETRA ,17604888,Sun Nov 28 18:20:42 CET,Sun Nov 28 20:30:05 CET,0.0 1.584 2.19 2.692 3.122 3.484 3.824 4.156 4.761 5.041 5.305 5.29 6.049 6.29 6.741 7.168 7.592 7.78 8.142 8.513 9.038 9.384 9.696 10.11 10.559 10.975 11.376 11.812 12.354 12.881 13.378 13.894 14.352 14.814 15.368 15.988 16.61 17.311 18.017 18.777 19.591 20.514 21.605 22.688 23.96 25.471 27.224 29.153 31.466 34.31 37.791 40.762 42.64 43.712 44.284 44.639 44.803 44.785 44.66 44.511 44.365 44.179 43.972 43.756 43.52 43.297 43.036 42.798 42.6 42.351 42.057 41.823 41.588 41.302 41.072 40.834 40.564 40.27 39.958 39.735 39.495 39.107 38.814 38.488 38.321 37.984 37.625 37.202 36.966 36.24 36.135 35.819 35.503 34.807 34.408 33.952 33.443 32.835 32.116 31.01 25.946 -2 ,21746 ,TETRA ,17604889,Sun Nov 28 18:20:45 CET,Sun Nov 28 20:29:52 CET,0.0 1.48 2.065 2.526 2.902 3.242 3.565 3.862 4.386 4.627 4.852 4.745 5.466 5.659 6.021 6.376 6.721 6.891 7.222 7.542 8.009 8.302 8.577 8.973 9.35 9.72 10.084 10.447 10.92 11.364 11.795 12.303 12.808 13.316 13.893 14.516 15.115 15.798 16.548 17.354 18.206 19.184 20.323 21.47 22.841 24.382 26.132 28.174 30.649 33.465 36.774 39.477 40.949 41.771 42.25 42.498 42.568 42.495 42.368 42.24 42.099 41.937 41.735 41.506 41.269 41.02 40.74 40.482 40.252 40.001 39.733 39.485 39.202 38.899 38.671 38.42 38.15 37.867 37.545 37.306 37.058 36.69 36.392 36.027 35.846 35.498 35.134 34.716 34.498 33.791 33.772 33.526 33.247 32.5 32.09 31.655 31.131 30.509 29.768 28.762 25.425 -3 ,29949 ,TETRA ,17604890,Sun Nov 28 18:20:47 CET,Sun Nov 28 20:34:55 CET,0.0 1.259 1.985 2.526 2.988 3.393 3.731 4.079 4.738 5.028 5.293 5.277 6.041 6.277 6.729 7.16 7.565 7.763 8.147 8.517 9.06 9.416 9.76 10.257 10.707 11.143 11.576 11.958 12.407 12.82 13.203 13.664 14.122 14.573 15.093 15.689 16.286 16.947 17.671 18.455 19.28 20.199 21.301 22.445 23.762 25.196 26.896 28.858 31.18 34.107 37.836 40.951 42.756 43.709 44.216 44.558 44.733 44.839 44.851 44.777 44.673 44.568 44.431 44.257 44.067 43.861 43.624 43.39 43.176 42.922 42.607 42.326 42.017 41.665 41.389 41.127 40.858 40.562 40.233 39.986 39.732 39.355 39.087 38.789 38.625 38.285 37.916 37.492 37.266 36.572 36.537 36.262 35.972 35.333 34.994 34.611 34.154 33.567 32.776 31.495 22.032 -4 ,25402 ,TETRA ,17604891,Sun Nov 28 18:20:43 CET,Sun Nov 28 20:34:46 CET,0.0 1.575 2.293 2.854 3.309 3.772 4.166 4.475 5.052 5.343 5.595 5.48 6.192 6.393 6.784 7.155 7.51 7.668 7.968 8.26 8.691 8.977 9.256 9.649 10.026 10.392 10.755 11.119 11.57 11.989 12.401 12.911 13.415 13.903 14.48 15.133 15.752 16.442 17.192 17.999 18.875 19.843 20.93 22.05 23.381 24.88 26.611 28.58 30.901 33.618 36.747 39.17 40.316 40.79 40.888 40.849 40.71 40.46 40.238 39.975 39.642 39.324 39.026 38.715 38.41 38.125 37.817 37.484 37.17 36.831 36.474 36.192 35.878 35.523 35.25 34.972 34.668 34.346 33.996 33.737 33.457 33.023 32.735 32.406 32.235 31.882 31.459 31.002 30.773 30.061 29.973 29.657 29.337 28.661 28.272 27.8 27.235 26.599 25.878 24.929 16.844 -5 ,19253 ,TETRA ,17604892,Sun Nov 28 18:20:44 CET,Sun Nov 28 20:30:39 CET,0.0 1.345 1.968 2.485 2.92 3.3 3.634 3.94 4.493 4.741 4.982 4.946 5.694 5.909 6.296 6.658 7.008 7.179 7.512 7.832 8.275 8.555 8.837 9.251 9.65 10.045 10.41 10.76 11.218 11.651 12.077 12.59 13.089 13.59 14.193 14.867 15.503 16.183 16.911 17.683 18.504 19.43 20.495 21.598 22.924 24.428 26.186 28.195 30.57 33.369 36.766 39.406 40.809 41.619 42.004 42.169 42.208 42.196 42.091 41.888 41.694 41.477 41.259 41.013 40.735 40.453 40.152 39.869 39.595 39.332 39.075 38.829 38.572 38.292 38.061 37.816 37.544 37.272 36.961 36.732 36.496 36.114 35.832 35.529 35.38 35.078 34.725 34.3 34.058 33.356 33.347 33.073 32.779 32.073 31.674 31.248 30.765 30.215 29.518 28.433 24.439 -6 ,6315 ,TETRA ,17604893,Sun Nov 28 18:20:45 CET,Sun Nov 28 20:30:23 CET,0.0 1.416 2.091 2.63 3.078 3.478 3.855 4.21 4.85 5.14 5.41 5.388 6.151 6.381 6.844 7.263 7.656 7.852 8.226 8.562 9.007 9.299 9.588 9.979 10.403 10.87 11.326 11.764 12.246 12.652 13.048 13.533 14.012 14.463 14.981 15.581 16.199 16.896 17.591 18.335 19.149 20.061 21.19 22.347 23.672 25.174 26.939 28.939 31.287 34.15 37.548 40.258 41.887 42.926 43.543 43.879 44.101 44.216 44.218 44.17 44.103 43.997 43.832 43.634 43.437 43.261 43.025 42.783 42.567 42.325 42.085 41.889 41.662 41.409 41.204 40.984 40.752 40.492 40.179 39.907 39.593 39.155 38.861 38.531 38.358 37.999 37.614 37.166 36.914 36.159 36.011 35.655 35.291 34.511 34.082 33.628 33.082 32.458 31.756 30.763 27.274 -7 ,30996 ,TETRA ,17604894,Sun Nov 28 18:20:47 CET,Sun Nov 28 20:30:21 CET,0.0 1.189 1.819 2.376 2.842 3.223 3.568 3.903 4.531 4.805 5.077 5.059 5.814 6.042 6.506 6.949 7.338 7.514 7.885 8.271 8.826 9.157 9.486 9.974 10.403 10.823 11.258 11.643 12.075 12.482 12.874 13.387 13.896 14.365 14.904 15.501 16.08 16.74 17.459 18.224 19.036 19.949 21.014 22.122 23.507 25.072 26.822 28.794 31.179 34.045 37.532 40.385 41.969 42.862 43.335 43.667 43.864 43.896 43.841 43.745 43.623 43.495 43.362 43.212 43.061 42.89 42.665 42.452 42.258 42.041 41.784 41.541 41.295 40.96 40.663 40.384 40.079 39.76 39.437 39.198 38.928 38.523 38.222 37.877 37.7 37.321 36.907 36.454 36.215 35.499 35.436 35.135 34.806 34.094 33.68 33.22 32.63 31.841 30.853 29.462 22.706 -8 ,29479 ,TETRA ,17604895,Sun Nov 28 18:20:50 CET,Sun Nov 28 20:30:28 CET,0.0 1.323 2.012 2.529 2.967 3.371 3.745 4.079 4.683 4.964 5.23 5.206 5.967 6.194 6.625 7.026 7.408 7.601 7.986 8.363 8.831 9.112 9.426 9.925 10.359 10.768 11.173 11.569 12.117 12.59 13.034 13.568 14.037 14.51 15.081 15.683 16.239 16.866 17.576 18.329 19.129 20.039 21.096 22.175 23.461 24.902 26.624 28.575 30.871 33.676 37.061 39.869 41.538 42.572 43.254 43.69 43.906 44.007 44.025 43.98 43.902 43.793 43.627 43.45 43.271 42.993 42.694 42.5 42.327 42.134 41.905 41.701 41.467 41.123 40.828 40.553 40.237 39.916 39.591 39.349 39.101 38.662 38.337 37.999 37.822 37.445 37.028 36.608 36.376 35.654 35.655 35.392 35.082 34.398 34.045 33.632 33.136 32.481 31.685 30.649 26.417 -9 ,19859 ,TETRA ,17604896,Sun Nov 28 18:21:09 CET,Sun Nov 28 20:32:37 CET,0.0 2.098 2.775 3.264 3.659 4.015 4.38 4.733 5.349 5.637 5.908 5.914 6.656 6.88 7.355 7.809 8.238 8.448 8.844 9.217 9.725 10.042 10.357 10.789 11.184 11.563 11.919 12.26 12.684 13.137 13.612 14.144 14.621 15.073 15.621 16.249 16.85 17.507 18.213 18.974 19.754 20.629 21.703 22.837 24.146 25.58 27.284 29.267 31.619 34.437 37.947 40.778 42.322 43.252 43.794 44.129 44.284 44.327 44.306 44.239 44.154 44.046 43.893 43.711 43.509 43.336 43.145 42.904 42.668 42.441 42.198 41.968 41.708 41.423 41.197 40.951 40.706 40.463 40.165 39.944 39.705 39.285 38.978 38.665 38.505 38.153 37.772 37.348 37.122 36.408 36.331 36.029 35.726 35.058 34.66 34.208 33.647 32.963 32.158 31.03 27.208 -10 ,2026 ,TETRA ,17604897,Sun Nov 28 18:21:09 CET,Sun Nov 28 20:29:41 CET,0.0 1.356 1.968 2.478 2.938 3.351 3.706 4.044 4.689 4.971 5.245 5.25 6.01 6.241 6.7 7.131 7.495 7.669 8.039 8.406 8.945 9.297 9.624 10.101 10.539 10.931 11.312 11.664 12.114 12.555 13.036 13.613 14.103 14.591 15.152 15.74 16.317 16.962 17.706 18.508 19.311 20.26 21.357 22.446 23.779 25.247 26.931 28.903 31.307 34.257 37.906 40.889 42.469 43.379 43.974 44.288 44.427 44.508 44.525 44.479 44.397 44.283 44.135 43.974 43.777 43.553 43.305 43.077 42.859 42.6 42.337 42.134 41.896 41.578 41.29 41.023 40.76 40.473 40.199 40.011 39.765 39.315 38.976 38.609 38.447 38.133 37.733 37.283 37.06 36.357 36.367 36.052 35.691 34.973 34.508 33.972 33.445 32.822 32.002 30.863 25.585 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23467.txt deleted file mode 100644 index f947f9b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13468 ,TETRA ,17604898,Sun Nov 28 18:21:09 CET,Sun Nov 28 20:31:22 CET,0.0 1.711 2.503 3.091 3.587 4.03 4.428 4.803 5.464 5.763 6.06 6.092 6.878 7.113 7.559 8.014 8.454 8.655 9.05 9.438 9.989 10.343 10.686 11.196 11.688 12.147 12.592 13.021 13.577 14.121 14.652 15.304 15.93 16.535 17.253 18.081 18.877 19.729 20.659 21.689 22.79 24.036 25.512 27.007 28.784 30.805 33.139 35.821 39.164 43.343 48.515 53.001 55.753 57.554 58.792 59.606 60.131 60.463 60.66 60.795 60.866 60.884 60.857 60.805 60.727 60.636 60.505 60.366 60.234 60.067 59.879 59.714 59.514 59.309 59.144 58.942 58.71 58.481 58.237 58.038 57.822 57.477 57.23 56.982 56.859 56.586 56.276 55.953 55.783 55.137 55.16 54.924 54.674 54.066 53.717 53.339 52.905 52.359 51.694 50.837 48.333 -2 ,12617 ,TETRA ,17604899,Sun Nov 28 18:21:11 CET,Sun Nov 28 20:30:58 CET,0.0 1.809 2.557 3.123 3.579 4.006 4.418 4.802 5.49 5.793 6.082 6.119 6.891 7.146 7.634 8.09 8.526 8.741 9.154 9.55 10.123 10.494 10.847 11.368 11.877 12.364 12.837 13.289 13.869 14.451 15.01 15.679 16.33 16.955 17.684 18.511 19.298 20.171 21.147 22.196 23.311 24.591 26.111 27.666 29.466 31.485 33.915 36.746 40.109 44.064 48.79 52.713 55.062 56.523 57.357 57.867 58.198 58.39 58.484 58.485 58.374 58.2 58.013 57.825 57.561 57.284 57.045 56.842 56.645 56.413 56.151 55.903 55.625 55.353 55.142 54.909 54.668 54.396 54.079 53.857 53.625 53.265 53.011 52.73 52.576 52.26 51.931 51.561 51.355 50.667 50.638 50.379 50.109 49.507 49.126 48.683 48.196 47.614 46.926 46.073 42.587 -3 ,7511 ,TETRA ,17604900,Sun Nov 28 18:21:12 CET,Sun Nov 28 20:31:05 CET,0.0 1.381 2.103 2.724 3.234 3.694 4.125 4.508 5.194 5.499 5.802 5.896 6.705 6.984 7.545 8.066 8.54 8.758 9.16 9.57 10.137 10.49 10.833 11.317 11.822 12.36 12.855 13.292 13.884 14.453 14.982 15.637 16.267 16.861 17.55 18.35 19.117 19.967 20.912 21.926 23.0 24.245 25.717 27.199 28.936 30.9 33.215 35.979 39.366 43.446 48.687 53.24 55.936 57.653 58.732 59.491 60.039 60.418 60.675 60.839 60.925 60.948 60.927 60.89 60.818 60.734 60.627 60.481 60.332 60.189 60.02 59.855 59.667 59.438 59.242 59.04 58.828 58.618 58.391 58.2 57.994 57.678 57.46 57.202 57.065 56.768 56.396 56.007 55.813 55.166 55.194 54.945 54.649 53.943 53.537 53.073 52.559 51.991 51.393 50.523 48.097 -4 ,12858 ,TETRA ,17604901,Sun Nov 28 18:21:14 CET,Sun Nov 28 20:30:58 CET,0.0 1.563 2.329 2.851 3.3 3.692 4.053 4.4 5.03 5.33 5.605 5.59 6.35 6.59 7.063 7.504 7.915 8.114 8.497 8.868 9.407 9.754 10.091 10.579 11.043 11.501 11.947 12.382 12.943 13.486 14.023 14.668 15.288 15.903 16.619 17.425 18.204 19.058 19.994 21.024 22.131 23.384 24.891 26.392 28.12 30.192 32.682 35.459 38.752 42.599 47.306 51.347 53.644 55.05 55.929 56.517 56.817 56.928 56.964 56.927 56.858 56.746 56.574 56.407 56.244 56.04 55.773 55.522 55.302 55.056 54.796 54.578 54.341 54.088 53.887 53.657 53.399 53.133 52.866 52.664 52.439 52.084 51.816 51.523 51.375 51.072 50.734 50.38 50.189 49.506 49.502 49.248 48.993 48.355 47.99 47.569 47.072 46.542 45.932 45.024 42.208 -5 ,22171 ,TETRA ,17604902,Sun Nov 28 18:21:09 CET,Sun Nov 28 20:31:15 CET,0.0 1.374 2.117 2.695 3.205 3.681 4.111 4.5 5.217 5.554 5.862 5.956 6.779 7.046 7.539 8.032 8.508 8.745 9.203 9.622 10.216 10.612 10.994 11.578 12.136 12.619 13.097 13.567 14.144 14.697 15.228 15.861 16.475 17.068 17.763 18.585 19.393 20.276 21.218 22.223 23.304 24.563 26.071 27.592 29.441 31.568 34.008 36.841 40.375 44.749 50.312 55.032 57.91 59.814 61.007 61.831 62.448 62.896 63.183 63.401 63.516 63.562 63.582 63.579 63.547 63.483 63.378 63.245 63.111 62.966 62.804 62.665 62.487 62.287 62.124 61.934 61.724 61.492 61.244 61.071 60.891 60.578 60.338 60.083 59.949 59.663 59.356 58.995 58.793 58.129 58.173 57.955 57.713 57.133 56.803 56.43 55.986 55.468 54.863 54.033 51.189 -6 ,5873 ,TETRA ,17604903,Sun Nov 28 18:21:11 CET,Sun Nov 28 20:32:02 CET,0.0 1.65 2.334 2.875 3.346 3.755 4.118 4.461 5.086 5.369 5.632 5.621 6.385 6.61 7.064 7.5 7.914 8.124 8.522 8.899 9.438 9.786 10.127 10.61 11.08 11.536 11.974 12.402 12.966 13.535 14.082 14.727 15.352 15.959 16.684 17.545 18.38 19.271 20.22 21.248 22.375 23.665 25.162 26.692 28.525 30.617 33.042 35.81 39.152 43.133 47.999 51.978 54.143 55.42 56.302 56.901 57.22 57.426 57.531 57.545 57.471 57.357 57.193 57.01 56.834 56.653 56.391 56.126 55.907 55.658 55.366 55.09 54.816 54.524 54.256 53.974 53.698 53.398 53.077 52.833 52.557 52.123 51.797 51.441 51.267 50.934 50.586 50.207 49.998 49.308 49.305 49.068 48.823 48.208 47.834 47.444 47.037 46.508 45.849 44.94 42.374 -7 ,25052 ,TETRA ,17604904,Sun Nov 28 18:21:09 CET,Sun Nov 28 20:36:15 CET,0.0 1.983 2.731 3.28 3.738 4.143 4.527 4.886 5.536 5.844 6.143 6.157 6.936 7.17 7.613 8.042 8.46 8.66 9.039 9.412 9.974 10.323 10.659 11.155 11.657 12.152 12.611 13.053 13.616 14.173 14.733 15.401 16.036 16.654 17.385 18.204 18.984 19.86 20.845 21.911 23.004 24.239 25.752 27.332 29.212 31.34 33.866 36.737 40.147 44.288 49.297 53.365 55.705 57.077 57.862 58.343 58.597 58.705 58.78 58.766 58.645 58.508 58.349 58.181 58.01 57.832 57.626 57.418 57.222 56.988 56.715 56.49 56.26 56.005 55.783 55.523 55.219 54.899 54.58 54.365 54.141 53.778 53.522 53.252 53.11 52.799 52.443 52.018 51.804 51.135 51.112 50.831 50.525 49.834 49.452 49.06 48.601 48.06 47.413 46.543 43.273 -8 ,1663 ,TETRA ,17604905,Sun Nov 28 18:21:09 CET,Sun Nov 28 20:31:16 CET,0.0 1.69 2.485 3.1 3.612 4.078 4.522 4.905 5.589 5.901 6.205 6.233 7.022 7.296 7.827 8.307 8.758 8.992 9.441 9.872 10.496 10.878 11.257 11.817 12.327 12.821 13.299 13.74 14.305 14.861 15.386 16.01 16.615 17.219 17.933 18.731 19.502 20.371 21.325 22.341 23.422 24.672 26.158 27.683 29.512 31.604 34.048 36.832 40.046 43.835 48.706 52.665 54.828 56.147 56.956 57.415 57.72 57.911 57.93 57.897 57.824 57.698 57.516 57.32 57.151 56.955 56.684 56.431 56.221 56.006 55.762 55.541 55.304 55.038 54.811 54.567 54.321 54.065 53.773 53.56 53.336 52.967 52.707 52.421 52.264 51.947 51.616 51.252 51.054 50.389 50.367 50.124 49.865 49.248 48.87 48.449 47.969 47.427 46.752 45.85 43.442 -9 ,1012 ,TETRA ,17604906,Sun Nov 28 18:21:11 CET,Sun Nov 28 20:31:29 CET,0.0 1.348 2.003 2.542 2.989 3.386 3.757 4.109 4.762 5.08 5.407 5.5 6.307 6.564 7.048 7.521 7.974 8.195 8.627 9.034 9.599 9.965 10.323 10.861 11.37 11.85 12.334 12.821 13.456 14.061 14.646 15.354 16.041 16.698 17.45 18.302 19.13 20.034 21.016 22.089 23.255 24.596 26.204 27.81 29.644 31.735 34.16 36.863 40.025 43.784 48.436 52.258 54.459 55.857 56.726 57.281 57.571 57.705 57.772 57.764 57.675 57.558 57.419 57.237 57.027 56.818 56.579 56.308 56.059 55.817 55.539 55.282 55.008 54.735 54.526 54.29 54.026 53.756 53.475 53.265 53.049 52.704 52.439 52.167 52.024 51.703 51.368 50.996 50.79 50.117 50.084 49.823 49.526 48.799 48.366 47.872 47.329 46.699 45.983 45.113 43.252 -10 ,14257 ,TETRA ,17604907,Sun Nov 28 18:21:13 CET,Sun Nov 28 20:31:34 CET,0.0 1.531 2.342 2.989 3.548 4.053 4.517 4.935 5.65 5.97 6.297 6.41 7.247 7.536 8.048 8.585 9.112 9.352 9.817 10.237 10.822 11.243 11.666 12.223 12.745 13.275 13.775 14.247 14.843 15.401 15.973 16.67 17.314 17.951 18.742 19.643 20.451 21.316 22.271 23.296 24.373 25.64 27.132 28.632 30.461 32.558 34.992 37.861 41.319 45.561 50.951 55.635 58.59 60.582 61.903 62.751 63.289 63.693 63.956 64.106 64.18 64.218 64.181 64.107 64.041 63.973 63.853 63.696 63.531 63.352 63.172 62.998 62.796 62.594 62.422 62.223 62.013 61.784 61.524 61.328 61.14 60.826 60.573 60.314 60.176 59.9 59.603 59.257 59.069 58.416 58.434 58.207 57.951 57.324 56.947 56.501 55.968 55.32 54.516 53.343 48.083 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23468.txt deleted file mode 100644 index 422175d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24082 ,TETRA ,17604908,Sun Nov 28 18:21:16 CET,Sun Nov 28 20:33:32 CET,0.0 1.927 2.783 3.436 3.986 4.476 4.921 5.315 6.024 6.346 6.662 6.714 7.485 7.745 8.232 8.691 9.127 9.337 9.761 10.151 10.669 11.006 11.341 11.809 12.207 12.558 12.932 13.291 13.722 14.133 14.511 14.984 15.439 15.867 16.36 16.914 17.453 18.053 18.673 19.283 19.928 20.65 21.493 22.357 23.317 24.339 25.498 26.797 28.3 30.072 32.066 33.534 34.259 34.54 34.607 34.55 34.426 34.279 34.082 33.81 33.519 33.25 32.991 32.715 32.432 32.172 31.895 31.628 31.367 31.076 30.748 30.393 29.994 29.599 29.285 28.991 28.705 28.416 28.114 27.889 27.621 27.216 26.927 26.569 26.381 26.011 25.623 25.217 25.007 24.268 24.27 23.995 23.72 23.104 22.733 22.336 21.876 21.329 20.655 19.801 17.872 -2 ,17540 ,TETRA ,17604909,Sun Nov 28 18:21:10 CET,Sun Nov 28 20:34:59 CET,0.0 1.626 2.41 3.037 3.578 4.046 4.461 4.834 5.56 5.911 6.227 6.29 7.061 7.309 7.793 8.228 8.661 8.86 9.257 9.637 10.11 10.389 10.683 11.165 11.627 12.038 12.428 12.792 13.215 13.611 13.981 14.449 14.893 15.289 15.756 16.281 16.785 17.341 17.918 18.531 19.178 19.884 20.723 21.599 22.579 23.633 24.803 26.081 27.514 28.995 30.431 31.24 31.432 31.404 31.199 30.842 30.49 30.139 29.75 29.326 28.931 28.526 28.109 27.694 27.295 26.891 26.447 26.061 25.728 25.362 24.982 24.666 24.318 23.934 23.63 23.309 22.966 22.605 22.226 21.98 21.733 21.33 21.042 20.733 20.573 20.236 19.882 19.511 19.315 18.6 18.649 18.401 18.138 17.552 17.229 16.878 16.47 15.988 15.381 14.571 11.991 -3 ,13917 ,TETRA ,17604910,Sun Nov 28 18:21:16 CET,Sun Nov 28 20:34:23 CET,0.0 2.669 3.473 4.07 4.561 4.987 5.381 5.747 6.41 6.721 7.02 7.059 7.803 8.034 8.481 8.9 9.29 9.478 9.846 10.195 10.7 11.011 11.314 11.764 12.182 12.596 13.008 13.396 13.881 14.318 14.728 15.217 15.666 16.1 16.597 17.16 17.695 18.29 18.948 19.605 20.28 21.052 21.915 22.738 23.681 24.736 25.953 27.276 28.768 30.437 32.342 33.74 34.393 34.63 34.635 34.571 34.423 34.189 33.985 33.754 33.443 33.132 32.837 32.559 32.307 32.076 31.784 31.5 31.274 31.018 30.739 30.521 30.246 29.892 29.642 29.385 29.098 28.767 28.406 28.157 27.877 27.421 27.1 26.765 26.586 26.216 25.853 25.457 25.235 24.502 24.481 24.193 23.908 23.286 22.944 22.568 22.121 21.594 20.969 20.091 18.313 -4 ,11995 ,TETRA ,17604911,Sun Nov 28 18:21:12 CET,Sun Nov 28 20:34:56 CET,0.0 3.655 4.586 5.204 5.726 6.186 6.593 6.969 7.646 7.948 8.246 8.305 9.07 9.312 9.782 10.225 10.629 10.815 11.168 11.522 12.048 12.383 12.686 13.12 13.568 14.0 14.405 14.784 15.255 15.705 16.132 16.639 17.137 17.613 18.151 18.745 19.297 19.9 20.546 21.219 21.917 22.7 23.641 24.575 25.606 26.712 27.923 29.268 30.693 32.142 33.746 34.721 35.037 35.017 34.754 34.392 34.017 33.644 33.255 32.813 32.404 32.003 31.588 31.184 30.808 30.412 29.964 29.543 29.168 28.785 28.375 28.022 27.644 27.236 26.928 26.631 26.306 25.962 25.605 25.348 25.072 24.626 24.312 23.976 23.794 23.397 22.964 22.527 22.312 21.571 21.586 21.311 21.015 20.358 19.998 19.607 19.086 18.423 17.642 16.58 12.742 -5 ,23046 ,TETRA ,17604912,Sun Nov 28 18:21:14 CET,Sun Nov 28 20:35:07 CET,0.0 2.087 2.957 3.577 4.068 4.509 4.919 5.282 5.941 6.246 6.52 6.511 7.269 7.5 7.994 8.469 8.881 9.074 9.456 9.819 10.33 10.654 10.96 11.407 11.84 12.249 12.652 13.03 13.486 13.928 14.375 14.911 15.397 15.861 16.383 16.941 17.49 18.113 18.755 19.413 20.082 20.817 21.664 22.49 23.438 24.515 25.714 27.0 28.509 30.242 32.203 33.581 34.227 34.506 34.579 34.541 34.426 34.259 34.037 33.718 33.426 33.198 32.98 32.754 32.514 32.224 31.897 31.602 31.328 31.007 30.631 30.31 29.972 29.63 29.381 29.125 28.851 28.574 28.278 28.062 27.833 27.46 27.178 26.886 26.736 26.418 26.081 25.691 25.482 24.758 24.825 24.597 24.356 23.794 23.467 23.108 22.697 22.214 21.652 20.889 18.759 -6 ,9366 ,TETRA ,17604913,Sun Nov 28 18:21:11 CET,Sun Nov 28 20:36:46 CET,0.0 1.993 2.773 3.4 3.979 4.455 4.86 5.247 5.973 6.29 6.577 6.627 7.403 7.646 8.104 8.512 8.896 9.088 9.475 9.857 10.387 10.724 11.042 11.47 11.867 12.241 12.604 12.948 13.362 13.761 14.174 14.681 15.15 15.599 16.105 16.638 17.115 17.651 18.22 18.825 19.488 20.227 21.062 21.904 22.85 23.874 25.066 26.403 27.935 29.714 31.731 33.139 33.81 34.112 34.199 34.146 33.994 33.806 33.616 33.334 33.027 32.764 32.491 32.213 31.936 31.676 31.386 31.105 30.835 30.487 30.115 29.793 29.421 29.024 28.73 28.436 28.139 27.848 27.539 27.303 27.066 26.673 26.368 26.05 25.877 25.514 25.119 24.686 24.449 23.702 23.702 23.432 23.163 22.577 22.24 21.873 21.457 20.94 20.297 19.496 17.399 -7 ,22259 ,TETRA ,17604914,Sun Nov 28 18:21:13 CET,Sun Nov 28 20:36:08 CET,0.0 1.608 2.5 3.181 3.734 4.187 4.598 4.99 5.708 6.046 6.357 6.388 7.172 7.431 7.928 8.397 8.843 9.055 9.447 9.815 10.337 10.651 10.979 11.449 11.854 12.298 12.713 13.091 13.647 14.147 14.561 15.028 15.441 15.876 16.392 16.935 17.425 17.966 18.558 19.182 19.841 20.583 21.433 22.272 23.237 24.283 25.515 26.912 28.441 30.137 32.073 33.485 34.113 34.397 34.529 34.506 34.382 34.19 33.941 33.613 33.252 32.905 32.572 32.266 32.001 31.733 31.421 31.109 30.829 30.561 30.265 29.981 29.672 29.351 29.103 28.835 28.552 28.259 27.955 27.743 27.521 27.169 26.907 26.636 26.496 26.194 25.869 25.508 25.305 24.599 24.655 24.413 24.173 23.624 23.303 22.963 22.565 22.055 21.401 20.575 18.547 -8 ,185 ,TETRA ,17604915,Sun Nov 28 18:21:16 CET,Sun Nov 28 20:33:35 CET,0.0 3.605 4.484 5.119 5.655 6.169 6.676 7.112 7.806 8.111 8.407 8.473 9.259 9.493 9.909 10.297 10.682 10.866 11.214 11.547 12.029 12.329 12.613 13.029 13.445 13.852 14.235 14.602 15.085 15.543 15.975 16.504 16.964 17.376 17.851 18.381 18.895 19.448 20.052 20.681 21.32 22.021 22.838 23.67 24.624 25.68 26.927 28.344 29.907 31.673 33.708 35.2 35.934 36.246 36.278 36.157 36.021 35.866 35.656 35.423 35.201 34.968 34.705 34.433 34.179 33.95 33.7 33.445 33.207 32.958 32.706 32.477 32.184 31.831 31.577 31.298 30.957 30.584 30.198 29.962 29.716 29.279 28.98 28.696 28.554 28.242 27.881 27.48 27.266 26.533 26.533 26.271 25.987 25.359 24.981 24.546 24.096 23.608 23.019 22.275 20.675 -9 ,3308 ,TETRA ,17604916,Sun Nov 28 18:21:18 CET,Sun Nov 28 20:33:55 CET,0.0 2.383 3.344 3.99 4.487 4.951 5.38 5.754 6.441 6.748 7.042 7.055 7.849 8.103 8.596 9.063 9.49 9.697 10.106 10.502 11.068 11.431 11.757 12.214 12.674 13.095 13.494 13.885 14.352 14.771 15.162 15.636 16.09 16.522 17.019 17.571 18.141 18.82 19.609 20.399 21.085 21.819 22.698 23.539 24.499 25.606 26.834 28.137 29.582 31.231 33.166 34.66 35.361 35.658 35.732 35.678 35.539 35.355 35.168 34.962 34.733 34.469 34.183 33.915 33.65 33.395 33.037 32.672 32.423 32.162 31.882 31.589 31.24 30.876 30.592 30.34 30.068 29.746 29.433 29.205 28.93 28.509 28.23 27.94 27.8 27.49 27.132 26.75 26.547 25.838 25.859 25.596 25.328 24.766 24.451 24.091 23.686 23.219 22.633 21.846 19.965 -10 ,5368 ,TETRA ,17604917,Sun Nov 28 18:21:11 CET,Sun Nov 28 20:36:11 CET,0.0 2.117 2.841 3.381 3.868 4.302 4.673 5.016 5.648 5.943 6.228 6.24 7.022 7.283 7.796 8.256 8.677 8.87 9.249 9.622 10.162 10.476 10.767 11.249 11.739 12.157 12.533 12.886 13.319 13.733 14.112 14.572 15.02 15.448 15.945 16.486 16.999 17.561 18.162 18.779 19.419 20.158 21.003 21.806 22.707 23.738 24.964 26.309 27.819 29.572 31.476 32.81 33.445 33.721 33.768 33.629 33.453 33.24 32.962 32.641 32.338 32.061 31.788 31.473 31.061 30.656 30.277 29.899 29.543 29.162 28.769 28.438 28.057 27.668 27.38 27.049 26.684 26.299 25.896 25.618 25.332 24.879 24.555 24.219 24.04 23.661 23.26 22.849 22.633 21.873 21.897 21.642 21.374 20.78 20.433 20.056 19.642 19.169 18.586 17.836 15.956 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index ec4874b5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31412 ,TETRA ,17604918,Sun Nov 28 18:21:11 CET,Sun Nov 28 20:37:27 CET,0.0 1.533 2.3 2.92 3.47 3.987 4.456 4.898 5.719 6.093 6.453 6.573 7.531 7.881 8.559 9.191 9.791 10.087 10.636 11.129 11.882 12.415 12.918 13.626 14.334 15.01 15.649 16.318 17.208 18.047 18.856 19.848 20.815 21.723 22.795 24.026 25.223 26.587 28.131 29.789 31.54 33.572 36.037 38.593 41.655 45.251 49.568 54.656 61.034 69.228 80.146 90.107 96.658 101.286 104.649 107.238 109.18 110.717 111.915 112.964 113.756 114.362 114.851 115.26 115.616 115.907 116.169 116.356 116.453 116.539 116.617 116.662 116.667 116.647 116.635 116.591 116.536 116.47 116.372 116.295 116.193 116.018 115.913 115.828 115.778 115.652 115.504 115.318 115.214 114.622 114.838 114.684 114.525 114.137 113.893 113.611 113.266 112.877 112.391 111.704 110.116 -2 ,14994 ,TETRA ,17604919,Sun Nov 28 18:21:13 CET,Sun Nov 28 20:37:34 CET,0.0 1.646 2.397 3.032 3.6 4.144 4.639 5.076 5.894 6.298 6.689 6.813 7.758 8.078 8.703 9.328 9.92 10.195 10.749 11.31 12.126 12.651 13.142 13.865 14.595 15.285 15.924 16.547 17.354 18.119 18.915 19.922 20.851 21.785 22.936 24.207 25.461 26.874 28.388 30.07 31.886 33.904 36.354 38.927 41.962 45.482 49.756 54.825 61.098 69.099 79.921 90.038 96.69 101.364 104.778 107.475 109.574 111.224 112.502 113.657 114.512 115.181 115.77 116.272 116.696 117.055 117.382 117.625 117.8 117.966 118.085 118.119 118.166 118.213 118.199 118.157 118.129 118.095 118.011 117.934 117.85 117.679 117.544 117.407 117.335 117.196 117.031 116.805 116.687 116.095 116.248 116.062 115.865 115.405 115.119 114.793 114.428 114.01 113.458 112.692 110.398 -3 ,22620 ,TETRA ,17604920,Sun Nov 28 18:21:15 CET,Sun Nov 28 20:37:34 CET,0.0 2.168 3.07 3.835 4.469 5.022 5.538 6.05 7.003 7.437 7.851 8.013 8.96 9.29 9.93 10.565 11.183 11.471 12.019 12.576 13.365 13.86 14.36 15.083 15.777 16.465 17.154 17.843 18.729 19.565 20.375 21.366 22.328 23.274 24.373 25.632 26.878 28.255 29.755 31.389 33.157 35.18 37.588 40.089 43.117 46.709 51.063 56.131 62.466 70.631 81.533 91.486 98.028 102.663 106.064 108.717 110.775 112.395 113.642 114.783 115.638 116.285 116.823 117.289 117.634 117.855 118.079 118.262 118.377 118.511 118.637 118.704 118.725 118.698 118.669 118.596 118.495 118.407 118.29 118.2 118.098 117.906 117.773 117.634 117.549 117.329 117.089 116.851 116.716 116.092 116.244 116.074 115.884 115.408 115.118 114.789 114.393 113.936 113.357 112.552 109.706 -4 ,12732 ,TETRA ,17604921,Sun Nov 28 18:21:13 CET,Sun Nov 28 20:41:24 CET,0.0 1.839 2.662 3.352 3.963 4.523 5.014 5.448 6.289 6.697 7.078 7.19 8.129 8.456 9.086 9.699 10.299 10.595 11.155 11.685 12.429 12.929 13.427 14.128 14.843 15.562 16.239 16.896 17.791 18.647 19.439 20.39 21.29 22.174 23.263 24.545 25.767 27.108 28.628 30.28 32.055 34.121 36.597 39.193 42.295 45.858 50.157 55.26 61.683 69.856 80.736 90.891 97.556 102.372 105.966 108.709 110.82 112.544 113.859 115.011 115.921 116.631 117.212 117.732 118.162 118.499 118.797 119.021 119.179 119.325 119.451 119.535 119.6 119.579 119.542 119.514 119.462 119.399 119.339 119.297 119.246 119.119 119.017 118.916 118.854 118.717 118.554 118.37 118.281 117.703 117.925 117.771 117.615 117.269 117.036 116.768 116.46 116.059 115.589 115.005 112.997 -5 ,18154 ,TETRA ,17604922,Sun Nov 28 18:21:15 CET,Sun Nov 28 20:41:40 CET,0.0 1.688 2.511 3.234 3.837 4.354 4.847 5.298 6.101 6.475 6.84 6.955 7.894 8.207 8.817 9.426 10.021 10.309 10.873 11.419 12.206 12.719 13.224 13.943 14.633 15.311 15.994 16.662 17.465 18.215 18.976 19.94 20.887 21.795 22.84 24.083 25.319 26.655 28.127 29.735 31.468 33.486 35.924 38.439 41.513 45.067 49.33 54.422 60.752 68.776 79.548 89.567 96.138 100.833 104.272 106.981 109.093 110.751 112.015 113.147 114.01 114.694 115.285 115.798 116.25 116.585 116.826 117.012 117.161 117.292 117.363 117.384 117.397 117.368 117.334 117.304 117.244 117.154 117.04 116.96 116.884 116.746 116.641 116.532 116.461 116.294 116.125 115.922 115.803 115.201 115.411 115.267 115.097 114.698 114.466 114.185 113.842 113.441 112.944 112.196 110.056 -6 ,21600 ,TETRA ,17604923,Sun Nov 28 18:21:12 CET,Sun Nov 28 20:41:25 CET,0.0 1.887 2.713 3.361 3.934 4.46 4.951 5.432 6.297 6.68 7.06 7.193 8.147 8.491 9.127 9.738 10.326 10.609 11.184 11.757 12.587 13.118 13.644 14.412 15.159 15.903 16.624 17.306 18.15 18.94 19.764 20.804 21.783 22.715 23.795 25.027 26.225 27.593 29.11 30.753 32.507 34.53 37.022 39.647 42.817 46.467 50.843 56.019 62.42 70.461 80.997 90.93 97.574 102.337 105.839 108.515 110.527 112.137 113.394 114.517 115.384 116.076 116.652 117.165 117.575 117.881 118.193 118.442 118.621 118.769 118.909 118.989 119.027 119.043 119.024 118.997 118.964 118.904 118.826 118.752 118.648 118.496 118.379 118.227 118.147 117.987 117.795 117.573 117.459 116.858 117.05 116.889 116.733 116.345 116.125 115.859 115.515 115.078 114.541 113.865 111.577 -7 ,12475 ,TETRA ,17604924,Sun Nov 28 18:21:15 CET,Sun Nov 28 20:40:59 CET,0.0 2.087 3.006 3.763 4.368 4.881 5.373 5.837 6.704 7.115 7.499 7.605 8.536 8.872 9.525 10.131 10.709 10.986 11.542 12.096 12.895 13.413 13.918 14.677 15.418 16.114 16.791 17.444 18.306 19.159 19.982 20.991 21.991 22.979 24.146 25.458 26.755 28.243 29.851 31.571 33.416 35.538 38.089 40.77 44.003 47.708 52.09 57.286 63.855 72.104 82.739 92.488 99.113 103.933 107.47 110.225 112.332 114.03 115.334 116.468 117.341 118.025 118.595 119.094 119.515 119.857 120.156 120.304 120.423 120.567 120.664 120.746 120.795 120.792 120.759 120.731 120.714 120.672 120.566 120.455 120.348 120.175 120.023 119.844 119.742 119.53 119.295 119.003 118.85 118.215 118.371 118.163 117.904 117.392 117.115 116.794 116.429 115.981 115.396 114.544 112.313 -8 ,3028 ,TETRA ,17604925,Sun Nov 28 18:21:13 CET,Sun Nov 28 20:36:31 CET,0.0 2.25 3.14 3.804 4.409 4.924 5.395 5.847 6.679 7.054 7.399 7.459 8.367 8.667 9.262 9.851 10.426 10.698 11.22 11.713 12.428 12.903 13.372 14.071 14.788 15.487 16.158 16.821 17.688 18.523 19.336 20.335 21.299 22.26 23.382 24.629 25.851 27.229 28.751 30.378 32.137 34.154 36.559 39.077 42.154 45.767 50.117 55.317 61.781 69.895 80.583 90.585 97.213 101.898 105.371 108.102 110.204 111.902 113.236 114.397 115.289 116.01 116.617 117.153 117.615 117.994 118.353 118.623 118.811 118.981 119.158 119.283 119.373 119.457 119.445 119.371 119.341 119.326 119.237 119.143 119.068 118.908 118.748 118.588 118.503 118.304 118.068 117.779 117.608 116.937 117.05 116.863 116.654 116.185 115.897 115.566 115.223 114.808 114.28 113.528 111.633 -9 ,486 ,TETRA ,17604926,Sun Nov 28 18:21:13 CET,Sun Nov 28 20:38:13 CET,0.0 1.53 2.303 2.964 3.554 4.099 4.586 5.024 5.826 6.23 6.634 6.791 7.728 8.072 8.713 9.3 9.896 10.184 10.738 11.304 12.096 12.596 13.103 13.861 14.589 15.246 15.87 16.533 17.393 18.18 18.97 19.95 20.889 21.82 22.939 24.203 25.471 26.886 28.389 30.018 31.785 33.85 36.304 38.874 42.012 45.629 49.985 55.078 61.36 69.416 80.195 90.214 96.819 101.511 105.011 107.697 109.728 111.313 112.477 113.482 114.235 114.826 115.338 115.748 116.044 116.269 116.459 116.621 116.753 116.858 116.948 117.007 117.048 117.067 117.055 117.018 116.975 116.93 116.854 116.793 116.736 116.616 116.531 116.436 116.376 116.246 116.093 115.902 115.789 115.195 115.422 115.266 115.091 114.654 114.401 114.133 113.843 113.527 113.078 112.36 110.561 -10 ,12639 ,TETRA ,17604927,Sun Nov 28 18:21:16 CET,Sun Nov 28 20:37:46 CET,0.0 2.841 3.81 4.524 5.145 5.705 6.213 6.679 7.541 7.951 8.335 8.445 9.386 9.723 10.381 11.02 11.641 11.943 12.527 13.075 13.854 14.369 14.854 15.532 16.191 16.831 17.462 18.085 18.891 19.671 20.435 21.439 22.419 23.371 24.532 25.805 27.045 28.422 29.903 31.522 33.305 35.347 37.746 40.26 43.363 46.982 51.351 56.541 62.885 70.904 81.747 91.792 98.401 103.133 106.596 109.294 111.346 112.976 114.277 115.445 116.325 117.022 117.624 118.147 118.574 118.903 119.209 119.455 119.663 119.857 120.006 120.125 120.219 120.238 120.211 120.141 120.041 119.921 119.808 119.727 119.624 119.439 119.28 119.128 119.044 118.815 118.566 118.294 118.146 117.491 117.597 117.408 117.204 116.713 116.442 116.174 115.853 115.431 114.89 114.1 111.85 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23469.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23469.txt deleted file mode 100644 index 0759a6ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23469.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29837 ,KEBNE ,17027270,Wed Dec 22 16:42:00 CET,Wed Dec 22 18:39:12 CET,0.0 13.18 14.889 15.942 16.676 17.291 17.841 18.361 19.281 19.696 20.117 20.332 21.314 21.678 22.394 23.063 23.71 24.036 24.636 25.245 26.151 26.691 27.208 27.963 28.681 29.358 30.018 30.662 31.486 32.29 33.065 34.0 34.933 35.845 36.888 38.071 39.217 40.483 41.904 43.456 45.116 47.054 49.413 51.837 54.752 58.175 62.214 66.969 72.92 80.449 90.464 99.693 105.681 109.863 112.936 115.327 117.147 118.596 119.687 120.619 121.33 121.918 122.417 122.798 123.061 123.277 123.512 123.691 123.79 123.854 123.898 123.929 123.934 123.895 123.843 123.778 123.713 123.63 123.515 123.424 123.318 123.143 122.994 122.828 122.751 122.58 122.361 122.105 121.973 121.337 121.431 121.225 121.025 120.541 120.251 119.906 119.501 119.039 118.508 117.76 114.612 -2 ,32555 ,KEBNE ,17027271,Wed Dec 22 16:42:01 CET,Wed Dec 22 18:38:33 CET,0.0 3.399 4.455 5.221 5.87 6.453 6.983 7.477 8.392 8.808 9.199 9.344 10.305 10.642 11.303 11.954 12.567 12.862 13.433 13.977 14.765 15.291 15.819 16.611 17.387 18.129 18.853 19.548 20.419 21.229 22.021 23.016 23.95 24.838 25.914 27.201 28.439 29.825 31.333 32.883 34.548 36.463 38.743 41.126 44.031 47.366 51.347 56.1 62.037 69.539 79.538 88.897 94.99 99.358 102.606 105.094 106.995 108.507 109.672 110.72 111.535 112.159 112.662 113.095 113.474 113.752 113.935 114.071 114.183 114.261 114.312 114.339 114.315 114.277 114.241 114.183 114.117 114.018 113.911 113.829 113.733 113.578 113.454 113.298 113.204 112.981 112.736 112.498 112.361 111.716 111.845 111.632 111.393 110.891 110.607 110.264 109.865 109.386 108.811 108.029 105.232 -3 ,2143 ,KEBNE ,17027272,Wed Dec 22 16:42:01 CET,Wed Dec 22 18:39:42 CET,0.0 5.513 6.613 7.458 8.192 8.821 9.406 9.946 10.903 11.341 11.756 11.926 12.903 13.278 13.993 14.669 15.303 15.604 16.197 16.77 17.595 18.117 18.628 19.371 20.085 20.792 21.483 22.147 23.015 23.846 24.63 25.579 26.526 27.452 28.501 29.7 30.865 32.165 33.602 35.151 36.821 38.721 40.991 43.359 46.23 49.584 53.602 58.424 64.439 71.99 81.975 91.261 97.497 101.957 105.232 107.714 109.576 111.074 112.257 113.337 114.111 114.735 115.277 115.715 116.095 116.408 116.643 116.791 116.889 116.971 117.053 117.052 117.023 117.001 116.991 116.959 116.902 116.835 116.723 116.629 116.521 116.339 116.193 116.012 115.911 115.695 115.464 115.204 115.05 114.382 114.53 114.345 114.131 113.664 113.397 113.088 112.722 112.274 111.738 111.025 108.682 -4 ,25426 ,KEBNE ,17027273,Wed Dec 22 16:42:01 CET,Wed Dec 22 18:38:27 CET,0.0 5.34 6.604 7.499 8.26 8.901 9.451 9.949 10.835 11.254 11.668 11.851 12.812 13.173 13.863 14.524 15.171 15.483 16.086 16.652 17.444 17.965 18.489 19.245 19.961 20.635 21.292 21.927 22.734 23.559 24.366 25.318 26.249 27.148 28.178 29.369 30.525 31.799 33.206 34.779 36.497 38.445 40.779 43.167 46.038 49.371 53.385 58.146 64.055 71.557 81.501 90.721 96.902 101.316 104.58 107.107 109.019 110.555 111.725 112.771 113.566 114.199 114.755 115.226 115.592 115.819 115.946 116.03 116.065 116.043 116.009 115.987 115.942 115.846 115.768 115.685 115.571 115.448 115.314 115.196 115.053 114.827 114.663 114.494 114.404 114.198 113.971 113.692 113.539 112.87 112.982 112.789 112.593 112.159 111.899 111.543 111.108 110.669 110.151 109.366 106.687 -5 ,11764 ,KEBNE ,17027274,Wed Dec 22 16:44:06 CET,Wed Dec 22 18:40:00 CET,0.0 2.121 3.081 3.907 4.619 5.23 5.815 6.345 7.297 7.759 8.211 8.45 9.439 9.829 10.583 11.281 11.952 12.292 12.948 13.573 14.473 15.052 15.646 16.507 17.329 18.079 18.768 19.481 20.373 21.245 22.125 23.177 24.212 25.227 26.405 27.715 28.994 30.43 32.01 33.718 35.585 37.757 40.284 42.873 46.004 49.659 54.036 59.109 65.405 73.45 84.136 94.093 100.688 105.346 108.791 111.429 113.493 115.147 116.351 117.426 118.259 118.943 119.528 119.983 120.328 120.599 120.865 121.065 121.185 121.265 121.312 121.317 121.307 121.257 121.209 121.168 121.085 120.965 120.807 120.687 120.556 120.318 120.161 119.987 119.899 119.735 119.528 119.29 119.158 118.54 118.74 118.566 118.374 117.948 117.699 117.447 117.177 116.835 116.343 115.446 111.165 -6 ,8067 ,KEBNE ,17027275,Wed Dec 22 16:44:06 CET,Wed Dec 22 18:40:19 CET,0.0 2.029 3.013 3.749 4.335 4.887 5.423 5.911 6.812 7.221 7.595 7.728 8.683 9.023 9.677 10.301 10.885 11.182 11.773 12.327 13.112 13.611 14.106 14.857 15.576 16.268 16.94 17.61 18.477 19.302 20.128 21.132 22.105 23.069 24.184 25.484 26.758 28.146 29.666 31.309 33.097 35.174 37.652 40.221 43.289 46.838 51.126 56.201 62.491 70.306 80.49 89.85 96.08 100.536 103.778 106.301 108.272 109.812 110.971 112.026 112.83 113.476 114.035 114.471 114.833 115.14 115.401 115.596 115.744 115.875 116.007 116.102 116.154 116.18 116.179 116.164 116.123 116.067 116.007 115.968 115.938 115.844 115.731 115.61 115.546 115.398 115.231 115.034 114.914 114.284 114.498 114.349 114.169 113.737 113.488 113.193 112.853 112.437 111.909 111.158 109.083 -7 ,14390 ,KEBNE ,17027276,Wed Dec 22 16:44:06 CET,Wed Dec 22 18:39:51 CET,0.0 4.354 5.72 6.579 7.295 7.957 8.509 8.994 9.851 10.256 10.647 10.774 11.7 12.018 12.651 13.286 13.913 14.21 14.774 15.329 16.123 16.622 17.111 17.827 18.529 19.215 19.886 20.55 21.409 22.239 23.072 24.081 25.033 25.95 27.034 28.275 29.498 30.892 32.429 34.092 35.887 37.944 40.418 42.958 45.959 49.46 53.731 58.75 64.981 72.86 83.188 92.882 99.274 103.774 107.052 109.564 111.474 112.994 114.165 115.208 115.984 116.583 117.13 117.583 117.942 118.264 118.554 118.768 118.906 119.016 119.116 119.188 119.255 119.316 119.335 119.324 119.277 119.2 119.13 119.083 119.012 118.86 118.733 118.589 118.505 118.32 118.128 117.958 117.874 117.278 117.435 117.233 117.002 116.509 116.238 115.922 115.578 115.22 114.803 114.186 111.911 -8 ,6233 ,KEBNE ,17027277,Wed Dec 22 16:44:06 CET,Wed Dec 22 18:41:17 CET,0.0 5.361 6.574 7.439 8.198 8.863 9.426 9.923 10.842 11.292 11.709 11.888 12.846 13.199 13.873 14.504 15.117 15.414 15.989 16.545 17.352 17.873 18.387 19.133 19.837 20.52 21.19 21.848 22.7 23.483 24.265 25.253 26.188 27.09 28.154 29.403 30.608 31.916 33.368 34.935 36.615 38.578 40.904 43.284 46.15 49.523 53.593 58.331 64.197 71.694 81.61 90.852 97.053 101.48 104.664 107.076 108.966 110.467 111.582 112.511 113.224 113.804 114.302 114.758 115.134 115.431 115.698 115.912 116.074 116.196 116.277 116.308 116.292 116.285 116.277 116.216 116.134 116.039 115.906 115.809 115.704 115.512 115.363 115.162 115.047 114.817 114.592 114.355 114.218 113.594 113.735 113.547 113.358 112.89 112.591 112.268 111.854 111.36 110.829 110.161 107.672 -9 ,6497 ,KEBNE ,17027278,Wed Dec 22 16:44:06 CET,Wed Dec 22 18:40:47 CET,0.0 2.344 3.435 4.297 5.034 5.691 6.286 6.816 7.804 8.272 8.706 8.904 9.89 10.279 11.027 11.73 12.421 12.758 13.407 14.031 14.922 15.51 16.09 16.947 17.767 18.532 19.269 19.957 20.87 21.77 22.643 23.694 24.69 25.673 26.836 28.219 29.557 30.999 32.58 34.269 36.069 38.174 40.718 43.33 46.449 50.063 54.398 59.466 65.795 73.826 84.446 94.506 101.121 105.773 109.237 111.844 113.796 115.426 116.678 117.711 118.538 119.226 119.772 120.243 120.618 120.873 121.067 121.166 121.185 121.205 121.269 121.316 121.356 121.375 121.356 121.322 121.289 121.236 121.16 121.103 121.012 120.836 120.715 120.546 120.444 120.251 120.041 119.802 119.679 119.04 119.182 118.985 118.766 118.306 118.054 117.769 117.445 117.043 116.552 115.772 113.641 -10 ,3450 ,KEBNE ,17027279,Wed Dec 22 16:44:06 CET,Wed Dec 22 18:41:35 CET,0.0 1.815 2.73 3.479 4.148 4.756 5.302 5.803 6.717 7.15 7.568 7.777 8.747 9.108 9.817 10.505 11.159 11.474 12.099 12.717 13.596 14.165 14.73 15.539 16.311 17.086 17.88 18.67 19.631 20.492 21.368 22.48 23.556 24.56 25.727 27.052 28.313 29.729 31.308 33.025 34.861 37.015 39.657 42.342 45.453 49.046 53.321 58.338 64.514 72.346 83.01 92.967 99.512 104.179 107.629 110.279 112.306 113.912 115.119 116.175 116.986 117.653 118.197 118.609 118.987 119.296 119.57 119.791 119.944 120.071 120.149 120.206 120.222 120.182 120.144 120.094 120.048 120.001 119.941 119.902 119.86 119.763 119.657 119.535 119.477 119.357 119.217 119.038 118.932 118.309 118.497 118.344 118.167 117.735 117.499 117.2 116.822 116.399 115.911 115.196 112.503 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23471.txt deleted file mode 100644 index 4cbcb0a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,21724 ,TETRA ,17604930,Sun Nov 28 18:21:39 CET,Sun Nov 28 20:38:29 CET,0.0 4.165 5.381 6.292 7.025 7.633 8.155 8.609 9.433 9.794 10.156 10.265 11.175 11.476 12.049 12.596 13.133 13.403 13.933 14.433 15.159 15.618 16.063 16.716 17.346 17.967 18.558 19.133 19.893 20.636 21.333 22.168 22.99 23.791 24.735 25.802 26.841 27.972 29.184 30.505 31.918 33.534 35.478 37.495 39.945 42.748 46.051 49.922 54.656 60.538 68.073 74.939 79.477 82.585 84.744 86.326 87.485 88.335 88.961 89.517 89.902 90.148 90.339 90.521 90.628 90.681 90.741 90.795 90.799 90.752 90.682 90.601 90.501 90.362 90.245 90.111 89.935 89.753 89.545 89.402 89.268 88.997 88.791 88.563 88.438 88.188 87.913 87.578 87.382 86.667 86.709 86.433 86.092 85.269 84.79 84.268 83.685 82.998 82.194 81.152 77.035 -4 ,9982 ,TETRA ,17604931,Sun Nov 28 18:21:42 CET,Sun Nov 28 20:38:22 CET,0.0 1.915 2.8 3.534 4.182 4.714 5.188 5.651 6.511 6.91 7.296 7.373 8.295 8.623 9.265 9.86 10.388 10.636 11.11 11.559 12.261 12.757 13.227 13.893 14.553 15.181 15.768 16.358 17.113 17.842 18.554 19.384 20.175 20.943 21.866 22.935 23.93 25.0 26.196 27.495 28.88 30.473 32.377 34.344 36.625 39.172 42.212 45.822 50.303 55.931 63.196 69.806 74.053 76.987 79.119 80.695 81.819 82.697 83.387 83.993 84.424 84.729 84.971 85.146 85.254 85.333 85.433 85.476 85.438 85.323 85.198 85.137 85.051 84.931 84.83 84.728 84.61 84.476 84.29 84.114 83.895 83.555 83.328 83.093 82.956 82.584 82.166 81.712 81.466 80.706 80.658 80.348 80.012 79.283 78.859 78.342 77.733 77.024 76.103 74.769 69.871 -6 ,1046 ,TETRA ,17604933,Sun Nov 28 18:21:40 CET,Sun Nov 28 20:36:10 CET,0.0 1.484 2.283 2.902 3.474 4.026 4.524 4.984 5.859 6.254 6.64 6.774 7.704 8.02 8.619 9.197 9.762 10.039 10.573 11.086 11.841 12.331 12.805 13.489 14.144 14.787 15.413 16.021 16.822 17.614 18.391 19.338 20.241 21.104 22.13 23.302 24.435 25.687 27.05 28.533 30.134 31.966 34.114 36.299 38.948 41.979 45.558 49.756 54.899 61.252 69.361 76.662 81.191 84.14 86.199 87.755 88.876 89.709 90.338 90.877 91.286 91.561 91.715 91.849 91.971 92.042 92.092 92.117 92.105 92.044 91.951 91.864 91.744 91.607 91.508 91.376 91.215 91.039 90.832 90.699 90.551 90.284 90.078 89.847 89.726 89.475 89.219 88.889 88.695 87.985 88.121 87.899 87.633 86.964 86.57 86.159 85.664 85.024 84.257 83.137 72.234 -7 ,17062 ,TETRA ,17604934,Sun Nov 28 18:21:42 CET,Sun Nov 28 20:36:58 CET,0.0 2.3 3.247 4.005 4.671 5.262 5.767 6.245 7.141 7.551 7.933 8.032 8.986 9.321 9.938 10.512 11.067 11.339 11.862 12.372 13.108 13.578 14.05 14.758 15.429 16.088 16.735 17.351 18.148 18.923 19.684 20.607 21.492 22.356 23.368 24.526 25.642 26.871 28.223 29.693 31.26 33.06 35.205 37.408 40.058 43.066 46.536 50.531 55.441 61.577 69.701 77.145 81.905 85.174 87.465 89.154 90.394 91.355 92.05 92.609 93.006 93.292 93.525 93.714 93.843 93.926 93.978 93.994 93.985 93.955 93.883 93.789 93.66 93.499 93.366 93.244 93.104 92.928 92.744 92.611 92.463 92.203 92.007 91.812 91.702 91.418 91.114 90.812 90.632 89.897 89.942 89.682 89.419 88.844 88.501 88.062 87.571 86.964 86.173 85.232 74.585 -8 ,11181 ,TETRA ,17604935,Sun Nov 28 18:21:40 CET,Sun Nov 28 20:36:47 CET,0.0 1.981 2.856 3.568 4.145 4.679 5.171 5.613 6.44 6.819 7.168 7.236 8.169 8.482 9.09 9.705 10.274 10.531 11.016 11.473 12.138 12.576 13.04 13.753 14.442 15.09 15.686 16.239 16.946 17.646 18.314 19.138 19.952 20.729 21.601 22.583 23.576 24.7 25.916 27.22 28.604 30.167 32.055 34.061 36.479 39.156 42.256 45.937 50.49 56.263 63.939 70.832 75.239 78.287 80.475 82.099 83.295 84.208 84.855 85.395 85.768 86.049 86.274 86.414 86.483 86.542 86.57 86.576 86.555 86.468 86.363 86.279 86.189 86.078 85.983 85.849 85.669 85.494 85.302 85.15 84.977 84.704 84.492 84.254 84.131 83.867 83.55 83.192 83.029 82.338 82.428 82.175 81.883 81.248 80.891 80.477 79.979 79.334 78.499 77.298 67.441 -9 ,32205 ,TETRA ,17604936,Sun Nov 28 18:21:41 CET,Sun Nov 28 20:37:41 CET,0.0 4.416 5.699 6.59 7.345 7.998 8.561 9.073 9.996 10.422 10.807 10.903 11.835 12.155 12.769 13.343 13.885 14.149 14.673 15.185 15.911 16.385 16.841 17.485 18.145 18.803 19.405 20.006 20.797 21.555 22.294 23.14 23.942 24.72 25.667 26.726 27.73 28.843 30.041 31.319 32.646 34.175 36.079 38.067 40.369 43.068 46.219 49.813 54.265 59.877 67.285 73.947 78.218 81.228 83.403 85.032 86.242 87.163 87.835 88.413 88.815 89.118 89.356 89.537 89.674 89.749 89.781 89.783 89.785 89.793 89.759 89.681 89.565 89.434 89.343 89.253 89.127 88.942 88.719 88.55 88.339 88.01 87.818 87.611 87.493 87.229 86.94 86.584 86.385 85.673 85.761 85.525 85.258 84.652 84.272 83.848 83.391 82.831 82.118 81.104 76.857 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23473_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23473_23467.txt deleted file mode 100644 index 4e3a1f51..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23473_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23432 ,TETRA ,17604938,Sun Nov 28 18:21:42 CET,Sun Nov 28 20:36:58 CET,0.0 1.536 2.189 2.709 3.13 3.498 3.824 4.103 4.618 4.866 5.096 5.06 5.729 5.918 6.285 6.625 6.938 7.091 7.378 7.638 8.008 8.254 8.499 8.835 9.137 9.424 9.7 9.986 10.36 10.702 11.031 11.422 11.802 12.151 12.533 12.98 13.404 13.836 14.281 14.748 15.264 15.844 16.478 17.077 17.758 18.497 19.317 20.266 21.343 22.383 23.218 23.519 23.373 22.972 22.543 22.081 21.571 21.051 20.568 20.062 19.612 19.183 18.738 18.31 17.914 17.524 17.109 16.754 16.42 16.058 15.683 15.357 15.02 14.668 14.389 14.1 13.785 13.432 13.052 12.794 12.525 12.094 11.789 11.464 11.294 10.936 10.563 10.138 9.913 9.222 9.167 8.892 8.592 7.9 7.483 7.012 6.464 5.879 5.168 3.937 -1.143 -2 ,1547 ,TETRA ,17604939,Sun Nov 28 18:21:40 CET,Sun Nov 28 20:37:00 CET,0.0 1.782 2.414 2.893 3.284 3.618 3.916 4.201 4.74 4.982 5.208 5.138 5.791 5.965 6.288 6.592 6.899 7.05 7.341 7.617 7.981 8.208 8.425 8.732 9.031 9.318 9.583 9.841 10.171 10.473 10.772 11.133 11.475 11.808 12.204 12.636 13.019 13.435 13.912 14.418 14.936 15.505 16.132 16.751 17.448 18.182 18.975 19.765 20.506 21.227 21.942 22.155 21.856 21.379 20.891 20.412 19.951 19.449 18.98 18.474 17.98 17.544 17.136 16.706 16.27 15.888 15.453 15.046 14.694 14.315 13.906 13.54 13.141 12.71 12.373 12.026 11.662 11.243 10.792 10.496 10.204 9.757 9.41 9.026 8.822 8.382 7.898 7.367 7.1 6.369 6.254 5.95 5.625 4.865 4.398 3.887 3.374 2.781 2.055 0.996 -5.716 -3 ,32525 ,TETRA ,17604940,Sun Nov 28 18:21:43 CET,Sun Nov 28 20:37:05 CET,0.0 1.565 2.188 2.676 3.071 3.424 3.777 4.11 4.666 4.909 5.126 5.046 5.706 5.89 6.222 6.519 6.798 6.932 7.186 7.427 7.769 7.987 8.2 8.513 8.804 9.067 9.321 9.572 9.909 10.24 10.553 10.916 11.269 11.597 11.978 12.411 12.822 13.282 13.752 14.239 14.749 15.305 15.946 16.558 17.248 18.015 18.837 19.645 20.472 21.317 22.047 22.212 21.964 21.584 21.177 20.684 20.145 19.609 19.108 18.581 18.109 17.673 17.244 16.818 16.389 16.005 15.609 15.239 14.903 14.552 14.164 13.836 13.495 13.125 12.853 12.571 12.258 11.911 11.523 11.256 10.968 10.515 10.193 9.846 9.677 9.322 8.942 8.534 8.312 7.621 7.512 7.209 6.874 6.08 5.656 5.221 4.755 4.171 3.331 2.16 -2.028 -4 ,3449 ,TETRA ,17604941,Sun Nov 28 18:21:45 CET,Sun Nov 28 20:37:04 CET,0.0 1.667 2.348 2.818 3.209 3.58 3.932 4.236 4.766 5.013 5.242 5.205 5.875 6.07 6.428 6.768 7.087 7.238 7.533 7.814 8.196 8.432 8.652 8.988 9.325 9.635 9.917 10.199 10.585 10.937 11.264 11.656 12.013 12.348 12.737 13.152 13.542 13.985 14.474 14.992 15.506 16.051 16.671 17.273 17.94 18.646 19.441 20.304 21.262 22.283 23.086 23.261 23.097 22.796 22.39 21.906 21.396 20.844 20.356 19.875 19.405 18.961 18.543 18.135 17.726 17.339 16.925 16.544 16.221 15.814 15.33 14.946 14.568 14.178 13.873 13.57 13.223 12.851 12.468 12.198 11.907 11.438 11.093 10.718 10.537 10.167 9.771 9.339 9.086 8.331 8.143 7.829 7.507 6.772 6.337 5.851 5.295 4.613 3.769 2.636 -3.44 -5 ,8197 ,TETRA ,17604942,Sun Nov 28 18:21:41 CET,Sun Nov 28 20:37:08 CET,0.0 1.475 2.106 2.569 2.987 3.354 3.657 3.923 4.419 4.65 4.868 4.815 5.47 5.672 6.054 6.384 6.691 6.836 7.111 7.376 7.74 7.978 8.221 8.56 8.874 9.174 9.461 9.739 10.11 10.468 10.813 11.224 11.614 11.977 12.379 12.812 13.218 13.669 14.158 14.686 15.26 15.878 16.531 17.169 17.926 18.726 19.591 20.568 21.616 22.667 23.599 23.858 23.613 23.185 22.702 22.235 21.78 21.287 20.82 20.309 19.85 19.442 19.035 18.619 18.204 17.826 17.436 17.083 16.763 16.417 16.052 15.742 15.391 14.999 14.698 14.396 14.061 13.69 13.316 13.072 12.802 12.354 12.051 11.721 11.543 11.175 10.79 10.357 10.104 9.383 9.276 8.975 8.659 7.952 7.546 7.102 6.611 6.04 5.37 4.216 -1.276 -6 ,10049 ,TETRA ,17604943,Sun Nov 28 18:21:41 CET,Sun Nov 28 20:39:36 CET,0.0 1.699 2.362 2.84 3.222 3.548 3.832 4.103 4.609 4.839 5.052 4.965 5.622 5.798 6.126 6.448 6.76 6.909 7.209 7.5 7.896 8.139 8.37 8.713 9.043 9.356 9.655 9.94 10.308 10.656 10.985 11.376 11.734 12.087 12.499 12.942 13.368 13.825 14.3 14.808 15.341 15.915 16.566 17.208 17.954 18.8 19.708 20.617 21.647 22.801 23.814 24.206 24.093 23.683 23.208 22.762 22.332 21.891 21.471 21.004 20.525 20.064 19.636 19.211 18.795 18.426 18.063 17.72 17.399 17.038 16.633 16.281 15.904 15.519 15.232 14.937 14.588 14.216 13.845 13.59 13.318 12.861 12.521 12.149 11.947 11.511 11.076 10.645 10.394 9.63 9.476 9.184 8.884 8.206 7.822 7.369 6.863 6.243 5.499 4.638 0.489 -7 ,20259 ,TETRA ,17604944,Sun Nov 28 18:21:43 CET,Sun Nov 28 20:39:23 CET,0.0 1.694 2.305 2.783 3.192 3.536 3.844 4.112 4.583 4.795 4.995 4.903 5.547 5.726 6.074 6.394 6.698 6.853 7.156 7.441 7.841 8.097 8.346 8.695 9.032 9.349 9.64 9.917 10.28 10.628 10.948 11.322 11.69 12.048 12.453 12.878 13.263 13.677 14.109 14.604 15.151 15.738 16.425 17.079 17.775 18.525 19.325 20.171 21.078 21.991 22.848 23.176 23.104 22.843 22.433 21.966 21.522 21.06 20.598 20.045 19.525 19.058 18.63 18.224 17.802 17.408 17.0 16.605 16.232 15.843 15.462 15.134 14.792 14.444 14.14 13.808 13.471 13.13 12.781 12.532 12.267 11.834 11.505 11.164 10.998 10.637 10.238 9.786 9.56 8.879 8.809 8.516 8.206 7.507 7.123 6.675 6.157 5.515 4.653 3.577 -2.738 -8 ,14907 ,TETRA ,17604945,Sun Nov 28 18:21:45 CET,Sun Nov 28 20:37:12 CET,0.0 1.709 2.334 2.823 3.215 3.553 3.876 4.181 4.711 4.955 5.186 5.138 5.825 6.033 6.397 6.724 7.026 7.177 7.465 7.736 8.131 8.374 8.606 8.932 9.24 9.547 9.838 10.108 10.462 10.796 11.106 11.479 11.848 12.2 12.597 13.051 13.492 13.952 14.439 14.97 15.503 16.061 16.716 17.33 17.941 18.606 19.364 20.165 21.014 21.849 22.49 22.572 22.388 22.124 21.777 21.336 20.881 20.431 19.995 19.519 19.059 18.629 18.181 17.746 17.31 16.882 16.454 16.069 15.676 15.255 14.8 14.403 13.999 13.564 13.221 12.859 12.452 12.007 11.562 11.272 10.971 10.485 10.156 9.776 9.559 9.135 8.665 8.124 7.852 7.127 7.025 6.697 6.349 5.609 5.188 4.688 4.1 3.398 2.559 1.465 -10.923 -9 ,3883 ,TETRA ,17604946,Sun Nov 28 18:21:47 CET,Sun Nov 28 20:37:50 CET,0.0 1.614 2.244 2.704 3.097 3.462 3.771 4.051 4.546 4.769 4.985 4.919 5.565 5.735 6.069 6.384 6.667 6.801 7.069 7.33 7.711 7.963 8.201 8.542 8.864 9.165 9.442 9.717 10.085 10.439 10.754 11.094 11.42 11.745 12.12 12.526 12.914 13.333 13.765 14.234 14.741 15.306 15.962 16.603 17.317 18.087 18.899 19.769 20.748 21.702 22.408 22.515 22.352 22.032 21.608 21.108 20.584 20.047 19.511 18.959 18.496 18.055 17.61 17.187 16.792 16.415 16.009 15.653 15.326 14.964 14.582 14.253 13.892 13.532 13.248 12.927 12.598 12.252 11.888 11.633 11.359 10.925 10.624 10.303 10.128 9.765 9.389 8.942 8.691 7.989 7.925 7.642 7.339 6.623 6.197 5.692 5.136 4.524 3.724 2.481 -4.57 -10 ,26723 ,TETRA ,17604947,Sun Nov 28 18:21:42 CET,Sun Nov 28 20:45:41 CET,0.0 3.421 4.321 4.859 5.281 5.624 5.955 6.275 6.808 7.045 7.276 7.254 7.916 8.1 8.451 8.775 9.076 9.225 9.504 9.755 10.122 10.365 10.609 10.951 11.264 11.557 11.842 12.139 12.498 12.82 13.13 13.496 13.857 14.211 14.606 15.037 15.458 15.925 16.418 16.947 17.486 18.035 18.671 19.329 20.059 20.85 21.742 22.709 23.728 24.763 25.814 26.238 26.208 26.002 25.617 25.111 24.608 24.124 23.664 23.166 22.724 22.312 21.908 21.523 21.128 20.744 20.302 19.899 19.562 19.211 18.851 18.523 18.162 17.806 17.522 17.202 16.838 16.474 16.136 15.903 15.653 15.244 14.939 14.616 14.448 14.105 13.735 13.308 13.077 12.379 12.312 12.014 11.687 11.007 10.604 10.147 9.629 8.983 8.143 7.04 1.341 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index c959e689..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32418 ,TETRA ,17604948,Sun Nov 28 18:21:43 CET,Sun Nov 28 20:47:07 CET,0.0 1.487 2.086 2.603 3.029 3.417 3.778 4.109 4.683 4.942 5.184 5.159 5.866 6.08 6.5 6.872 7.221 7.392 7.721 8.024 8.422 8.671 8.928 9.333 9.703 10.06 10.422 10.746 11.124 11.461 11.759 12.101 12.46 12.816 13.196 13.599 13.954 14.319 14.755 15.237 15.718 16.254 16.835 17.375 18.002 18.69 19.44 20.192 20.917 21.634 22.274 22.408 22.133 21.743 21.326 20.853 20.373 19.903 19.477 19.04 18.606 18.188 17.819 17.45 17.066 16.681 16.296 15.954 15.617 15.254 14.881 14.565 14.235 13.882 13.591 13.292 12.984 12.669 12.317 12.055 11.789 11.392 11.128 10.826 10.659 10.316 9.95 9.569 9.361 8.664 8.664 8.4 8.128 7.514 7.187 6.81 6.351 5.856 5.314 4.537 2.625 -2 ,24286 ,TETRA ,17604949,Sun Nov 28 18:21:43 CET,Sun Nov 28 20:38:51 CET,0.0 1.029 1.622 2.107 2.491 2.846 3.175 3.472 4.029 4.277 4.498 4.42 5.129 5.342 5.736 6.09 6.421 6.596 6.927 7.23 7.666 7.946 8.216 8.586 8.935 9.285 9.626 9.95 10.364 10.771 11.151 11.608 12.045 12.438 12.883 13.334 13.701 14.068 14.471 14.887 15.318 15.806 16.355 16.893 17.497 18.132 18.824 19.54 20.278 21.023 21.594 21.653 21.35 20.893 20.315 19.688 19.086 18.501 18.01 17.478 16.988 16.555 16.12 15.636 15.119 14.617 14.128 13.684 13.287 12.91 12.517 12.174 11.797 11.383 11.069 10.75 10.391 10.02 9.635 9.357 9.072 8.642 8.341 8.017 7.845 7.47 7.061 6.637 6.421 5.715 5.738 5.494 5.203 4.531 4.173 3.804 3.419 2.926 2.292 1.487 -0.495 -3 ,16412 ,TETRA ,17604950,Sun Nov 28 18:21:45 CET,Sun Nov 28 20:39:09 CET,0.0 1.461 2.139 2.662 3.08 3.47 3.811 4.123 4.709 4.987 5.245 5.226 5.935 6.154 6.55 6.927 7.272 7.434 7.764 8.086 8.529 8.804 9.062 9.444 9.787 10.065 10.326 10.574 10.898 11.218 11.564 12.015 12.416 12.76 13.132 13.542 13.925 14.361 14.81 15.256 15.712 16.197 16.747 17.273 17.864 18.514 19.233 19.966 20.747 21.505 22.043 22.033 21.657 21.106 20.466 19.841 19.272 18.689 18.167 17.631 17.14 16.69 16.271 15.865 15.45 15.041 14.603 14.21 13.869 13.508 13.106 12.791 12.491 12.162 11.898 11.62 11.331 11.021 10.679 10.439 10.187 9.783 9.507 9.2 9.018 8.649 8.294 7.913 7.714 7.01 6.974 6.701 6.435 5.874 5.558 5.172 4.716 4.198 3.522 2.585 0.189 -4 ,14495 ,TETRA ,17604951,Sun Nov 28 18:21:43 CET,Sun Nov 28 20:38:05 CET,0.0 2.018 2.82 3.369 3.816 4.24 4.643 4.987 5.564 5.809 6.045 6.042 6.761 6.975 7.344 7.713 8.052 8.21 8.525 8.82 9.231 9.496 9.755 10.106 10.423 10.73 11.015 11.28 11.6 11.91 12.226 12.605 12.98 13.325 13.708 14.121 14.505 14.918 15.336 15.767 16.202 16.66 17.173 17.697 18.307 18.97 19.704 20.467 21.196 21.848 22.435 22.489 22.188 21.815 21.408 20.969 20.532 20.11 19.712 19.267 18.834 18.44 18.045 17.631 17.227 16.839 16.354 15.919 15.581 15.239 14.874 14.556 14.226 13.842 13.519 13.215 12.879 12.467 12.012 11.694 11.382 10.899 10.553 10.195 10.007 9.618 9.234 8.843 8.61 7.888 7.864 7.586 7.295 6.654 6.315 5.972 5.574 5.029 4.309 3.435 1.407 -5 ,1456 ,TETRA ,17604952,Sun Nov 28 18:21:43 CET,Sun Nov 28 20:44:17 CET,0.0 1.534 2.147 2.631 3.046 3.44 3.805 4.141 4.732 5.002 5.263 5.273 5.987 6.203 6.597 6.939 7.257 7.398 7.676 7.985 8.435 8.718 8.99 9.395 9.77 10.075 10.359 10.634 10.958 11.327 11.686 12.041 12.368 12.733 13.128 13.509 13.923 14.372 14.843 15.298 15.743 16.232 16.76 17.278 17.915 18.598 19.304 20.022 20.677 21.303 21.938 22.064 21.794 21.451 21.124 20.726 20.279 19.836 19.442 19.031 18.621 18.215 17.815 17.411 17.048 16.669 16.222 15.821 15.474 15.109 14.697 14.36 14.007 13.616 13.312 12.994 12.644 12.275 11.902 11.656 11.388 10.944 10.641 10.317 10.143 9.76 9.341 8.903 8.676 7.953 7.933 7.671 7.402 6.786 6.417 5.97 5.449 4.92 4.312 3.524 1.794 -6 ,13950 ,TETRA ,17604953,Sun Nov 28 18:21:43 CET,Sun Nov 28 20:45:09 CET,0.0 1.9 2.594 3.088 3.511 3.9 4.248 4.561 5.127 5.385 5.629 5.575 6.255 6.458 6.832 7.163 7.503 7.673 7.987 8.278 8.675 8.929 9.172 9.517 9.853 10.168 10.461 10.738 11.077 11.42 11.753 12.119 12.463 12.808 13.215 13.666 14.065 14.473 14.885 15.282 15.713 16.196 16.745 17.283 17.86 18.451 19.086 19.758 20.478 21.177 21.749 21.832 21.552 21.13 20.643 20.134 19.645 19.137 18.683 18.241 17.82 17.414 17.0 16.591 16.223 15.893 15.5 15.11 14.78 14.437 14.069 13.768 13.445 13.097 12.817 12.51 12.185 11.832 11.434 11.169 10.923 10.473 10.11 9.763 9.582 9.192 8.796 8.369 8.142 7.44 7.426 7.152 6.857 6.258 5.937 5.578 5.191 4.735 4.21 3.547 1.577 -7 ,2482 ,TETRA ,17604954,Sun Nov 28 18:21:45 CET,Sun Nov 28 20:45:05 CET,0.0 1.363 2.005 2.478 2.871 3.225 3.555 3.858 4.421 4.688 4.956 4.973 5.684 5.896 6.285 6.656 7.0 7.155 7.463 7.764 8.195 8.461 8.707 9.071 9.438 9.792 10.145 10.483 10.898 11.275 11.572 11.891 12.227 12.548 12.953 13.417 13.791 14.218 14.68 15.146 15.626 16.154 16.729 17.267 17.885 18.529 19.226 19.929 20.619 21.348 21.985 22.03 21.688 21.259 20.76 20.197 19.679 19.157 18.639 18.094 17.612 17.185 16.784 16.351 15.898 15.459 15.001 14.596 14.245 13.877 13.448 13.087 12.729 12.329 12.013 11.686 11.355 11.032 10.657 10.375 10.095 9.644 9.339 9.019 8.844 8.497 8.108 7.685 7.478 6.784 6.78 6.512 6.229 5.63 5.285 4.889 4.43 3.853 3.186 2.362 0.272 -8 ,31192 ,TETRA ,17604955,Sun Nov 28 18:21:42 CET,Sun Nov 28 20:39:11 CET,0.0 1.449 2.092 2.591 3.026 3.381 3.706 4.012 4.566 4.816 5.055 5.017 5.718 5.907 6.257 6.6 6.943 7.108 7.429 7.743 8.195 8.478 8.738 9.089 9.431 9.782 10.132 10.426 10.768 11.104 11.454 11.901 12.285 12.635 13.037 13.467 13.86 14.282 14.735 15.201 15.679 16.21 16.777 17.293 17.873 18.516 19.205 19.962 20.781 21.481 21.992 22.008 21.754 21.244 20.64 20.071 19.552 19.017 18.513 17.983 17.477 17.01 16.552 16.089 15.629 15.2 14.774 14.406 14.077 13.724 13.335 13.01 12.666 12.316 12.038 11.73 11.405 11.042 10.641 10.373 10.097 9.639 9.304 8.977 8.815 8.468 8.078 7.652 7.432 6.73 6.679 6.383 6.082 5.462 5.128 4.778 4.396 3.935 3.305 2.429 -0.14 -9 ,19984 ,TETRA ,17604956,Sun Nov 28 18:21:43 CET,Sun Nov 28 20:38:14 CET,0.0 1.923 2.692 3.257 3.739 4.185 4.558 4.875 5.426 5.69 5.951 5.934 6.627 6.833 7.225 7.592 7.916 8.072 8.362 8.64 9.031 9.268 9.514 9.881 10.209 10.504 10.784 11.05 11.378 11.691 11.989 12.343 12.692 13.018 13.368 13.762 14.147 14.57 14.996 15.426 15.861 16.336 16.885 17.409 17.998 18.622 19.297 20.04 20.818 21.549 22.124 22.149 21.808 21.409 20.914 20.352 19.848 19.404 19.019 18.614 18.249 17.896 17.545 17.213 16.867 16.508 16.139 15.839 15.579 15.321 15.046 14.734 14.386 14.023 13.725 13.4 13.04 12.679 12.3 12.064 11.823 11.373 11.056 10.726 10.544 10.168 9.783 9.386 9.173 8.468 8.478 8.228 7.947 7.308 6.946 6.539 6.09 5.613 5.042 4.275 2.065 -10 ,16130 ,TETRA ,17604957,Sun Nov 28 18:21:45 CET,Sun Nov 28 20:38:15 CET,0.0 1.696 2.396 2.933 3.401 3.779 4.114 4.427 4.996 5.256 5.494 5.47 6.171 6.373 6.753 7.107 7.443 7.613 7.943 8.239 8.644 8.9 9.137 9.473 9.783 10.081 10.396 10.694 11.051 11.387 11.726 12.123 12.509 12.894 13.309 13.746 14.171 14.636 15.117 15.615 16.13 16.695 17.327 17.926 18.553 19.197 19.928 20.716 21.55 22.289 22.793 22.791 22.427 21.951 21.48 21.015 20.531 20.001 19.494 18.937 18.405 17.926 17.462 17.003 16.551 16.138 15.714 15.324 15.001 14.656 14.278 13.95 13.597 13.24 12.976 12.703 12.39 12.062 11.727 11.487 11.233 10.825 10.54 10.238 10.079 9.724 9.341 8.972 8.767 8.057 8.072 7.799 7.493 6.784 6.388 5.97 5.539 5.036 4.359 3.522 1.448 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_23475.txt deleted file mode 100644 index 8694857a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17498 ,KEBNE ,17027280,Wed Dec 22 16:44:06 CET,Wed Dec 22 18:39:32 CET,0.0 2.113 2.877 3.422 3.88 4.258 4.605 4.933 5.498 5.752 5.998 5.988 6.688 6.895 7.303 7.689 8.059 8.242 8.603 8.923 9.334 9.585 9.837 10.208 10.517 10.784 11.04 11.297 11.625 11.955 12.269 12.596 12.904 13.189 13.523 13.919 14.306 14.692 15.069 15.448 15.807 16.178 16.574 16.963 17.383 17.836 18.315 18.769 19.193 19.366 19.175 18.576 17.831 17.103 16.37 15.593 14.857 14.169 13.561 12.945 12.403 11.863 11.356 10.875 10.396 9.948 9.48 8.992 8.531 8.112 7.686 7.286 6.87 6.447 6.1 5.726 5.36 4.985 4.554 4.251 3.933 3.444 3.11 2.743 2.54 2.12 1.695 1.213 0.954 0.206 0.115 -0.202 -0.517 -1.193 -1.578 -1.991 -2.442 -2.961 -3.619 -4.493 -7.326 -2 ,19253 ,KEBNE ,17027281,Wed Dec 22 16:44:06 CET,Wed Dec 22 18:40:46 CET,0.0 2.289 2.957 3.458 3.879 4.253 4.603 4.934 5.526 5.792 6.032 5.989 6.688 6.898 7.304 7.659 7.994 8.154 8.453 8.741 9.135 9.39 9.646 10.0 10.311 10.617 10.918 11.185 11.493 11.77 12.057 12.44 12.807 13.112 13.459 13.849 14.186 14.52 14.845 15.174 15.502 15.844 16.237 16.611 17.033 17.481 17.902 18.325 18.727 18.97 18.904 18.33 17.566 16.779 15.985 15.183 14.412 13.643 12.946 12.271 11.697 11.173 10.683 10.26 9.821 9.304 8.76 8.31 7.903 7.481 7.067 6.68 6.208 5.719 5.355 4.952 4.531 4.141 3.688 3.345 3.029 2.544 2.212 1.867 1.683 1.307 0.909 0.471 0.23 -0.507 -0.557 -0.849 -1.186 -1.934 -2.315 -2.723 -3.192 -3.694 -4.255 -5.027 -7.441 -3 ,21375 ,KEBNE ,17027282,Wed Dec 22 16:48:15 CET,Wed Dec 22 18:44:25 CET,0.0 1.775 2.494 3.046 3.481 3.855 4.207 4.528 5.082 5.335 5.574 5.533 6.2 6.395 6.778 7.143 7.485 7.641 7.944 8.253 8.659 8.908 9.169 9.535 9.863 10.168 10.438 10.665 10.979 11.279 11.536 11.84 12.124 12.392 12.68 12.989 13.285 13.614 13.988 14.363 14.718 15.113 15.557 15.967 16.419 16.881 17.337 17.749 18.098 18.273 18.13 17.513 16.714 15.882 15.1 14.384 13.736 13.114 12.557 11.928 11.372 10.909 10.476 10.071 9.69 9.326 8.919 8.528 8.169 7.777 7.346 6.999 6.634 6.171 5.793 5.41 4.971 4.53 4.103 3.79 3.448 2.919 2.539 2.143 1.936 1.502 1.041 0.54 0.283 -0.479 -0.572 -0.904 -1.257 -2.015 -2.435 -2.903 -3.459 -4.053 -4.723 -5.665 -7.778 -4 ,19609 ,KEBNE ,17027283,Wed Dec 22 16:48:15 CET,Wed Dec 22 18:45:38 CET,0.0 1.43 2.07 2.558 2.992 3.379 3.727 4.029 4.56 4.813 5.06 5.01 5.714 5.931 6.328 6.685 6.999 7.148 7.453 7.745 8.169 8.442 8.707 9.046 9.347 9.628 9.862 10.087 10.375 10.65 10.957 11.304 11.572 11.835 12.127 12.435 12.741 13.114 13.479 13.829 14.188 14.569 15.001 15.409 15.85 16.308 16.761 17.17 17.584 17.893 17.757 17.059 16.27 15.49 14.765 14.065 13.392 12.722 12.098 11.461 10.924 10.449 9.967 9.496 9.016 8.557 8.084 7.662 7.288 6.829 6.314 5.921 5.489 5.026 4.659 4.249 3.833 3.422 2.977 2.662 2.304 1.711 1.324 0.911 0.702 0.282 -0.187 -0.682 -0.939 -1.704 -1.806 -2.123 -2.458 -3.192 -3.6 -4.05 -4.544 -5.111 -5.731 -6.559 -8.849 -5 ,9467 ,KEBNE ,17027284,Wed Dec 22 16:48:17 CET,Wed Dec 22 18:44:58 CET,0.0 1.449 2.131 2.642 3.08 3.464 3.827 4.15 4.694 4.952 5.197 5.185 5.864 6.05 6.438 6.792 7.111 7.266 7.588 7.875 8.263 8.528 8.772 9.123 9.461 9.777 10.051 10.274 10.595 10.945 11.29 11.706 12.067 12.382 12.725 13.082 13.417 13.748 14.061 14.388 14.712 15.053 15.443 15.839 16.269 16.698 17.163 17.599 17.931 18.136 17.921 17.213 16.372 15.495 14.65 13.867 13.144 12.408 11.781 11.144 10.567 10.062 9.563 9.085 8.596 8.139 7.676 7.245 6.875 6.503 6.108 5.763 5.41 5.036 4.734 4.41 4.066 3.708 3.338 3.091 2.833 2.391 2.087 1.772 1.593 1.198 0.784 0.349 0.137 -0.56 -0.583 -0.821 -1.053 -1.646 -2.021 -2.416 -2.842 -3.331 -3.915 -4.864 -7.792 -6 ,22889 ,KEBNE ,17027285,Wed Dec 22 16:48:15 CET,Wed Dec 22 18:45:25 CET,0.0 1.5 2.12 2.627 3.068 3.442 3.785 4.106 4.678 4.922 5.14 5.089 5.786 5.975 6.354 6.743 7.077 7.233 7.532 7.81 8.205 8.45 8.693 9.067 9.428 9.761 10.06 10.35 10.711 11.036 11.361 11.724 12.075 12.396 12.739 13.149 13.512 13.872 14.245 14.615 14.967 15.336 15.73 16.106 16.517 16.918 17.38 17.89 18.281 18.445 18.26 17.622 16.811 16.026 15.312 14.586 13.898 13.233 12.62 11.997 11.433 10.929 10.468 9.991 9.52 9.097 8.628 8.198 7.844 7.465 7.006 6.611 6.199 5.738 5.383 5.018 4.608 4.158 3.716 3.407 3.06 2.529 2.166 1.802 1.612 1.182 0.745 0.274 0.024 -0.727 -0.793 -1.078 -1.388 -2.073 -2.438 -2.844 -3.31 -3.852 -4.508 -5.315 -7.461 -7 ,26176 ,KEBNE ,17027286,Wed Dec 22 16:48:14 CET,Wed Dec 22 18:45:09 CET,0.0 1.5 2.161 2.698 3.155 3.519 3.855 4.179 4.77 5.034 5.289 5.299 6.002 6.2 6.575 6.927 7.263 7.414 7.717 8.015 8.433 8.707 8.944 9.255 9.585 9.906 10.187 10.431 10.711 10.998 11.268 11.58 11.894 12.183 12.508 12.869 13.211 13.595 13.988 14.383 14.761 15.128 15.569 16.003 16.482 16.97 17.436 17.839 18.2 18.434 18.27 17.668 16.977 16.181 15.359 14.603 13.912 13.252 12.629 12.013 11.487 10.993 10.506 10.031 9.565 9.124 8.612 8.129 7.75 7.356 6.915 6.554 6.143 5.678 5.313 4.976 4.64 4.207 3.736 3.424 3.102 2.598 2.252 1.888 1.692 1.267 0.83 0.366 0.108 -0.642 -0.65 -0.936 -1.238 -1.961 -2.347 -2.739 -3.191 -3.737 -4.405 -5.321 -8.931 -8 ,4538 ,KEBNE ,17027287,Wed Dec 22 16:48:15 CET,Wed Dec 22 18:45:16 CET,0.0 2.368 3.127 3.749 4.239 4.668 5.049 5.366 5.924 6.18 6.418 6.409 7.115 7.314 7.689 8.057 8.4 8.555 8.842 9.097 9.472 9.724 9.981 10.341 10.686 11.022 11.317 11.578 11.891 12.158 12.409 12.754 13.067 13.338 13.683 14.101 14.479 14.843 15.218 15.622 16.019 16.389 16.805 17.197 17.629 18.118 18.591 18.989 19.312 19.477 19.272 18.632 17.861 17.049 16.236 15.411 14.661 13.967 13.341 12.709 12.135 11.622 11.153 10.696 10.238 9.818 9.388 8.984 8.599 8.182 7.785 7.462 7.055 6.648 6.368 6.051 5.67 5.222 4.755 4.461 4.15 3.64 3.316 2.952 2.738 2.31 1.884 1.437 1.192 0.427 0.365 0.08 -0.231 -0.926 -1.324 -1.753 -2.229 -2.762 -3.387 -4.266 -6.921 -9 ,15752 ,KEBNE ,17027288,Wed Dec 22 16:48:14 CET,Wed Dec 22 18:45:05 CET,0.0 2.508 3.326 3.918 4.362 4.733 5.061 5.369 5.927 6.172 6.41 6.398 7.101 7.303 7.673 8.007 8.32 8.47 8.764 9.047 9.44 9.694 9.944 10.31 10.644 10.948 11.241 11.496 11.783 12.05 12.319 12.706 13.078 13.379 13.697 14.012 14.306 14.633 14.97 15.341 15.706 16.066 16.501 16.954 17.451 17.947 18.447 18.894 19.271 19.485 19.345 18.735 17.97 17.139 16.378 15.659 14.966 14.285 13.662 13.017 12.421 11.83 11.267 10.735 10.258 9.846 9.405 9.002 8.631 8.256 7.85 7.489 7.135 6.742 6.426 6.067 5.627 5.17 4.728 4.411 4.073 3.592 3.245 2.862 2.661 2.224 1.753 1.256 1.015 0.289 0.238 -0.06 -0.373 -1.07 -1.489 -1.916 -2.381 -2.946 -3.668 -4.598 -6.713 -10 ,17262 ,KEBNE ,17027289,Wed Dec 22 16:48:15 CET,Wed Dec 22 18:44:26 CET,0.0 1.971 2.643 3.172 3.637 4.054 4.4 4.714 5.33 5.614 5.861 5.834 6.533 6.726 7.103 7.467 7.8 7.96 8.267 8.555 8.93 9.173 9.417 9.758 10.038 10.295 10.57 10.81 11.096 11.373 11.67 12.021 12.312 12.595 12.895 13.21 13.499 13.799 14.136 14.547 14.974 15.382 15.804 16.188 16.611 17.074 17.519 17.923 18.322 18.583 18.523 17.943 17.226 16.474 15.718 15.002 14.306 13.627 13.037 12.418 11.874 11.38 10.893 10.401 9.944 9.542 9.066 8.576 8.116 7.624 7.151 6.754 6.333 5.895 5.54 5.178 4.821 4.446 4.008 3.69 3.387 2.923 2.577 2.22 2.037 1.652 1.235 0.773 0.54 -0.177 -0.216 -0.518 -0.842 -1.536 -1.941 -2.42 -2.952 -3.499 -4.117 -5.042 -7.499 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23475_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23475_23468.txt deleted file mode 100644 index d637c479..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23475_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5717 ,KEBNE ,17027290,Wed Dec 22 16:48:14 CET,Wed Dec 22 18:44:48 CET,0.0 1.286 1.948 2.478 2.92 3.292 3.635 3.959 4.563 4.83 5.083 5.079 5.788 6.001 6.41 6.789 7.154 7.326 7.655 7.976 8.442 8.708 8.945 9.305 9.654 9.965 10.253 10.549 10.901 11.248 11.577 11.924 12.248 12.553 12.891 13.236 13.552 13.895 14.277 14.665 15.067 15.483 15.916 16.328 16.766 17.238 17.697 18.044 18.303 18.422 17.944 16.719 15.527 14.459 13.356 12.314 11.424 10.574 9.82 9.07 8.416 7.785 7.185 6.671 6.177 5.666 5.114 4.608 4.164 3.696 3.194 2.785 2.355 1.892 1.527 1.151 0.77 0.374 -0.055 -0.368 -0.688 -1.201 -1.567 -1.938 -2.125 -2.521 -2.929 -3.343 -3.575 -4.327 -4.326 -4.595 -4.885 -5.56 -5.953 -6.366 -6.814 -7.356 -8.01 -8.845 -11.759 -2 ,23605 ,KEBNE ,17027291,Wed Dec 22 16:48:15 CET,Wed Dec 22 18:45:00 CET,0.0 1.43 2.184 2.732 3.191 3.61 3.989 4.335 4.965 5.258 5.545 5.579 6.295 6.528 6.947 7.334 7.708 7.878 8.207 8.519 8.97 9.273 9.548 9.879 10.203 10.544 10.842 11.122 11.512 11.873 12.171 12.523 12.855 13.154 13.497 13.85 14.172 14.516 14.888 15.264 15.614 16.016 16.492 16.934 17.377 17.815 18.264 18.675 19.022 19.169 18.793 17.805 16.603 15.36 14.242 13.218 12.304 11.474 10.725 9.936 9.233 8.579 7.967 7.405 6.864 6.365 5.85 5.402 5.013 4.593 4.156 3.785 3.375 2.949 2.614 2.242 1.829 1.382 0.947 0.65 0.327 -0.172 -0.534 -0.9 -1.077 -1.468 -1.91 -2.39 -2.644 -3.403 -3.409 -3.697 -4.007 -4.696 -5.089 -5.504 -5.952 -6.466 -7.052 -7.764 -9.508 -3 ,2107 ,KEBNE ,17027292,Wed Dec 22 16:48:14 CET,Wed Dec 22 18:44:56 CET,0.0 1.325 2.06 2.616 3.037 3.424 3.789 4.11 4.676 4.947 5.209 5.192 5.897 6.111 6.525 6.917 7.287 7.461 7.801 8.129 8.576 8.848 9.1 9.419 9.751 10.117 10.445 10.735 11.076 11.376 11.649 11.965 12.274 12.571 12.899 13.244 13.55 13.88 14.259 14.646 14.994 15.371 15.833 16.301 16.766 17.195 17.593 17.962 18.273 18.263 17.628 16.523 15.342 14.188 13.162 12.126 11.215 10.403 9.664 8.91 8.261 7.652 7.073 6.557 6.1 5.657 5.152 4.713 4.332 3.895 3.427 3.044 2.614 2.152 1.807 1.466 1.103 0.699 0.251 -0.049 -0.334 -0.808 -1.179 -1.561 -1.755 -2.187 -2.659 -3.167 -3.413 -4.157 -4.175 -4.451 -4.75 -5.417 -5.768 -6.182 -6.657 -7.153 -7.756 -8.603 -10.645 -4 ,32615 ,KEBNE ,17027293,Wed Dec 22 16:48:14 CET,Wed Dec 22 18:45:30 CET,0.0 1.105 1.748 2.243 2.661 3.027 3.365 3.67 4.203 4.46 4.701 4.648 5.354 5.57 5.973 6.35 6.694 6.85 7.155 7.456 7.848 8.1 8.362 8.724 9.092 9.443 9.745 9.994 10.3 10.607 10.88 11.221 11.57 11.882 12.219 12.596 12.956 13.31 13.669 14.049 14.43 14.829 15.271 15.714 16.198 16.659 17.109 17.505 17.78 17.763 17.22 15.981 14.702 13.568 12.461 11.417 10.45 9.578 8.823 8.054 7.401 6.84 6.315 5.777 5.255 4.801 4.358 3.926 3.539 3.143 2.71 2.318 1.913 1.51 1.173 0.818 0.442 0.012 -0.457 -0.771 -1.091 -1.572 -1.884 -2.242 -2.44 -2.842 -3.257 -3.674 -3.893 -4.621 -4.647 -4.92 -5.209 -5.874 -6.257 -6.658 -7.102 -7.658 -8.343 -9.191 -11.135 -5 ,15963 ,KEBNE ,17027294,Wed Dec 22 16:48:15 CET,Wed Dec 22 18:44:18 CET,0.0 1.087 1.741 2.265 2.721 3.126 3.479 3.805 4.381 4.655 4.915 4.883 5.623 5.841 6.252 6.647 7.024 7.196 7.519 7.825 8.265 8.555 8.828 9.212 9.595 9.93 10.202 10.473 10.804 11.11 11.406 11.745 12.079 12.41 12.765 13.147 13.497 13.887 14.295 14.681 15.072 15.473 15.945 16.398 16.863 17.393 17.937 18.383 18.646 18.636 18.178 17.078 15.894 14.749 13.627 12.607 11.661 10.753 10.009 9.256 8.576 7.972 7.383 6.832 6.34 5.84 5.293 4.817 4.411 4.003 3.582 3.202 2.809 2.402 2.07 1.709 1.347 0.986 0.545 0.214 -0.108 -0.599 -0.926 -1.276 -1.473 -1.884 -2.303 -2.758 -3.002 -3.773 -3.871 -4.179 -4.484 -5.184 -5.573 -5.99 -6.48 -7.031 -7.626 -8.371 -10.037 -6 ,5294 ,KEBNE ,17027295,Wed Dec 22 16:48:14 CET,Wed Dec 22 18:44:28 CET,0.0 1.27 1.981 2.516 2.944 3.337 3.705 4.037 4.639 4.912 5.167 5.135 5.843 6.063 6.469 6.836 7.19 7.359 7.68 7.98 8.386 8.645 8.873 9.198 9.528 9.853 10.144 10.384 10.751 11.102 11.371 11.707 12.025 12.314 12.676 13.084 13.453 13.836 14.224 14.627 15.036 15.474 15.965 16.408 16.87 17.337 17.779 18.167 18.465 18.577 18.241 17.204 15.99 14.841 13.795 12.815 11.938 11.093 10.312 9.521 8.831 8.227 7.679 7.158 6.634 6.134 5.596 5.118 4.731 4.347 3.938 3.583 3.205 2.808 2.489 2.163 1.839 1.443 0.985 0.683 0.349 -0.169 -0.515 -0.89 -1.083 -1.475 -1.916 -2.39 -2.643 -3.43 -3.495 -3.8 -4.095 -4.673 -5.017 -5.422 -5.872 -6.335 -6.858 -7.607 -9.806 -7 ,24401 ,KEBNE ,17027296,Wed Dec 22 16:50:18 CET,Wed Dec 22 18:48:28 CET,0.0 1.129 1.723 2.222 2.659 3.051 3.41 3.752 4.345 4.617 4.868 4.862 5.6 5.816 6.212 6.572 6.908 7.08 7.415 7.726 8.175 8.464 8.745 9.145 9.489 9.823 10.17 10.486 10.848 11.167 11.46 11.783 12.077 12.364 12.672 13.037 13.402 13.748 14.11 14.502 14.884 15.297 15.754 16.195 16.658 17.093 17.522 17.848 18.066 18.077 17.589 16.507 15.306 14.087 12.938 11.889 11.03 10.209 9.451 8.738 8.132 7.559 6.964 6.412 5.915 5.425 4.897 4.39 3.942 3.503 3.061 2.695 2.271 1.794 1.456 1.135 0.783 0.366 -0.111 -0.438 -0.737 -1.196 -1.542 -1.908 -2.102 -2.506 -2.929 -3.384 -3.616 -4.368 -4.335 -4.608 -4.903 -5.506 -5.836 -6.202 -6.627 -7.075 -7.579 -8.315 -10.17 -8 ,27016 ,KEBNE ,17027297,Wed Dec 22 16:50:19 CET,Wed Dec 22 18:48:01 CET,0.0 1.414 2.131 2.703 3.189 3.591 3.975 4.341 4.984 5.283 5.552 5.553 6.276 6.497 6.935 7.331 7.687 7.841 8.113 8.384 8.784 9.064 9.343 9.712 10.07 10.403 10.696 10.966 11.297 11.594 11.872 12.222 12.557 12.857 13.208 13.612 13.964 14.326 14.708 15.097 15.518 15.97 16.438 16.873 17.391 17.959 18.445 18.868 19.294 19.433 18.913 17.724 16.365 15.025 13.861 12.817 11.886 11.05 10.307 9.521 8.855 8.264 7.712 7.208 6.707 6.227 5.708 5.249 4.862 4.434 3.993 3.622 3.226 2.775 2.366 1.955 1.584 1.207 0.78 0.484 0.163 -0.357 -0.707 -1.055 -1.236 -1.616 -2.02 -2.444 -2.669 -3.429 -3.467 -3.746 -4.032 -4.659 -5.009 -5.388 -5.835 -6.358 -6.964 -7.67 -9.315 -9 ,22595 ,KEBNE ,17027298,Wed Dec 22 16:50:19 CET,Wed Dec 22 18:46:34 CET,0.0 1.282 1.964 2.485 2.931 3.305 3.649 3.976 4.562 4.842 5.109 5.11 5.836 6.046 6.444 6.811 7.162 7.331 7.648 7.955 8.447 8.746 9.016 9.408 9.763 10.086 10.396 10.709 11.094 11.42 11.704 12.062 12.428 12.759 13.109 13.474 13.814 14.186 14.592 15.025 15.431 15.827 16.259 16.706 17.184 17.654 18.118 18.501 18.805 18.884 18.303 17.045 15.746 14.589 13.599 12.639 11.781 10.948 10.178 9.435 8.799 8.2 7.643 7.108 6.55 6.046 5.556 5.1 4.653 4.127 3.556 3.105 2.67 2.209 1.827 1.412 0.992 0.575 0.155 -0.133 -0.432 -0.931 -1.291 -1.648 -1.84 -2.24 -2.662 -3.126 -3.369 -4.137 -4.146 -4.433 -4.741 -5.43 -5.833 -6.278 -6.753 -7.273 -7.903 -8.688 -10.472 -10 ,11200 ,KEBNE ,17027299,Wed Dec 22 16:50:19 CET,Wed Dec 22 18:47:44 CET,0.0 1.494 2.259 2.784 3.24 3.636 3.974 4.285 4.869 5.135 5.382 5.363 6.08 6.29 6.67 7.035 7.386 7.549 7.853 8.121 8.512 8.745 8.974 9.351 9.687 9.992 10.29 10.561 10.866 11.182 11.478 11.796 12.106 12.399 12.737 13.094 13.42 13.752 14.094 14.47 14.833 15.219 15.674 16.08 16.513 16.963 17.474 18.031 18.511 18.776 18.488 17.397 16.152 14.967 13.851 12.788 11.868 11.068 10.336 9.563 8.878 8.271 7.707 7.165 6.676 6.225 5.717 5.244 4.84 4.433 4.003 3.644 3.255 2.844 2.504 2.127 1.732 1.302 0.887 0.616 0.317 -0.163 -0.519 -0.906 -1.095 -1.476 -1.915 -2.394 -2.643 -3.404 -3.446 -3.751 -4.056 -4.728 -5.121 -5.542 -5.984 -6.444 -6.976 -7.751 -9.707 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt deleted file mode 100644 index 7fb24732..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10455 ,TETRA ,17604958,Sun Nov 28 18:21:47 CET,Sun Nov 28 20:37:52 CET,0.0 1.725 2.365 2.879 3.312 3.703 4.06 4.402 4.962 5.206 5.461 5.446 6.158 6.358 6.724 7.082 7.425 7.593 7.926 8.26 8.712 8.97 9.212 9.558 9.867 10.164 10.489 10.775 11.079 11.392 11.722 12.077 12.372 12.682 13.049 13.393 13.719 14.067 14.413 14.771 15.152 15.59 16.04 16.491 17.026 17.549 18.106 18.674 19.201 19.665 19.872 19.571 19.029 18.467 17.848 17.232 16.652 16.097 15.597 15.045 14.547 14.092 13.675 13.275 12.893 12.551 12.157 11.782 11.46 11.134 10.793 10.477 10.142 9.796 9.52 9.191 8.813 8.463 8.12 7.872 7.612 7.184 6.864 6.529 6.349 5.959 5.553 5.111 4.884 4.162 4.134 3.844 3.54 2.895 2.52 2.107 1.664 1.161 0.566 -0.195 -1.662 -2 ,25734 ,TETRA ,17604959,Sun Nov 28 18:21:43 CET,Sun Nov 28 20:38:01 CET,0.0 1.604 2.228 2.687 3.093 3.489 3.867 4.2 4.742 4.992 5.254 5.251 5.953 6.171 6.529 6.835 7.14 7.286 7.586 7.897 8.29 8.495 8.714 9.032 9.325 9.614 9.896 10.154 10.468 10.761 11.014 11.295 11.571 11.832 12.129 12.469 12.78 13.095 13.44 13.807 14.163 14.546 14.968 15.402 15.89 16.388 16.939 17.508 18.085 18.532 18.717 18.453 17.955 17.387 16.819 16.218 15.617 15.07 14.564 14.027 13.571 13.12 12.66 12.21 11.788 11.406 10.997 10.624 10.283 9.926 9.5 9.153 8.837 8.494 8.235 7.962 7.65 7.288 6.914 6.633 6.323 5.854 5.519 5.161 4.974 4.584 4.183 3.768 3.54 2.811 2.79 2.52 2.233 1.58 1.221 0.827 0.399 -0.067 -0.643 -1.367 -2.974 -3 ,12096 ,TETRA ,17604960,Sun Nov 28 18:22:09 CET,Sun Nov 28 20:39:03 CET,0.0 1.561 2.19 2.716 3.179 3.571 3.907 4.234 4.814 5.074 5.321 5.303 6.019 6.24 6.609 6.956 7.288 7.436 7.704 7.935 8.285 8.497 8.699 8.999 9.328 9.64 9.896 10.139 10.429 10.701 10.971 11.286 11.578 11.841 12.134 12.472 12.794 13.136 13.477 13.823 14.191 14.593 15.037 15.499 16.011 16.522 17.086 17.661 18.18 18.612 18.851 18.568 18.026 17.462 16.876 16.244 15.667 15.103 14.573 14.021 13.555 13.138 12.711 12.294 11.891 11.495 11.082 10.718 10.361 9.966 9.609 9.332 9.027 8.7 8.417 8.08 7.707 7.321 6.928 6.666 6.415 5.985 5.659 5.339 5.164 4.768 4.339 3.875 3.627 2.884 2.832 2.556 2.287 1.711 1.358 0.936 0.462 -0.049 -0.627 -1.342 -3.156 -4 ,30370 ,TETRA ,17604961,Sun Nov 28 18:22:09 CET,Sun Nov 28 20:39:35 CET,0.0 0.994 1.578 2.038 2.431 2.765 3.073 3.374 3.932 4.183 4.417 4.383 5.073 5.269 5.669 6.036 6.376 6.532 6.836 7.123 7.525 7.777 7.998 8.286 8.565 8.846 9.118 9.419 9.811 10.166 10.509 10.855 11.132 11.411 11.732 12.074 12.406 12.784 13.168 13.548 13.943 14.426 14.993 15.466 15.973 16.533 17.17 17.777 18.322 18.778 18.931 18.588 18.006 17.34 16.678 16.057 15.483 14.92 14.413 13.914 13.478 13.065 12.644 12.24 11.845 11.464 11.066 10.719 10.416 10.093 9.756 9.471 9.178 8.866 8.595 8.283 7.917 7.55 7.179 6.891 6.585 6.101 5.754 5.403 5.227 4.849 4.443 4.01 3.778 3.05 2.998 2.704 2.402 1.777 1.435 1.048 0.602 0.101 -0.46 -1.123 -2.791 -5 ,27604 ,TETRA ,17604962,Sun Nov 28 18:22:10 CET,Sun Nov 28 20:39:26 CET,0.0 1.385 2.025 2.539 2.958 3.301 3.623 3.928 4.471 4.714 4.953 4.925 5.621 5.822 6.212 6.581 6.911 7.06 7.325 7.568 7.952 8.217 8.463 8.79 9.063 9.337 9.643 9.915 10.207 10.472 10.75 11.094 11.377 11.637 11.934 12.27 12.586 12.923 13.28 13.671 14.053 14.453 14.901 15.312 15.751 16.235 16.754 17.268 17.771 18.203 18.463 18.23 17.727 17.114 16.518 15.91 15.31 14.737 14.243 13.767 13.338 12.912 12.498 12.087 11.682 11.299 10.802 10.358 10.0 9.589 9.151 8.782 8.348 7.901 7.558 7.179 6.778 6.357 5.913 5.613 5.309 4.815 4.464 4.111 3.918 3.503 3.087 2.634 2.395 1.66 1.661 1.39 1.106 0.439 0.066 -0.329 -0.774 -1.264 -1.855 -2.587 -4.664 -6 ,2237 ,TETRA ,17604963,Sun Nov 28 18:22:13 CET,Sun Nov 28 20:39:17 CET,0.0 2.044 2.739 3.283 3.768 4.18 4.549 4.894 5.468 5.704 5.94 5.923 6.607 6.788 7.15 7.474 7.756 7.89 8.142 8.389 8.75 8.948 9.138 9.452 9.736 9.986 10.228 10.456 10.74 11.083 11.446 11.801 12.113 12.393 12.692 13.032 13.381 13.761 14.136 14.529 14.934 15.344 15.778 16.241 16.781 17.292 17.832 18.397 18.93 19.392 19.619 19.252 18.651 17.966 17.326 16.693 16.101 15.549 15.028 14.498 14.039 13.61 13.182 12.765 12.363 11.984 11.594 11.229 10.901 10.544 10.162 9.855 9.543 9.217 8.948 8.641 8.323 8.011 7.688 7.454 7.19 6.746 6.431 6.124 5.956 5.565 5.158 4.715 4.466 3.725 3.673 3.386 3.089 2.424 2.063 1.683 1.285 0.819 0.245 -0.477 -1.805 -7 ,24235 ,TETRA ,17604964,Sun Nov 28 18:22:14 CET,Sun Nov 28 20:37:46 CET,0.0 1.853 2.506 3.015 3.425 3.781 4.092 4.376 4.9 5.134 5.35 5.292 6.004 6.228 6.647 7.0 7.313 7.484 7.814 8.096 8.496 8.727 8.95 9.307 9.642 9.948 10.222 10.446 10.734 11.016 11.275 11.624 11.962 12.256 12.575 12.914 13.234 13.586 13.965 14.347 14.733 15.157 15.632 16.048 16.484 16.965 17.496 18.049 18.565 18.973 19.161 18.89 18.375 17.785 17.166 16.528 15.938 15.354 14.791 14.194 13.685 13.235 12.795 12.384 11.994 11.612 11.213 10.841 10.473 10.111 9.774 9.478 9.147 8.808 8.558 8.284 7.991 7.679 7.304 7.04 6.772 6.326 6.005 5.662 5.482 5.117 4.73 4.317 4.098 3.361 3.347 3.069 2.78 2.166 1.832 1.472 1.079 0.625 0.062 -0.716 -2.3 -8 ,31654 ,TETRA ,17604965,Sun Nov 28 18:22:09 CET,Sun Nov 28 20:38:03 CET,0.0 1.328 1.93 2.411 2.829 3.204 3.543 3.843 4.408 4.664 4.896 4.839 5.53 5.739 6.112 6.464 6.807 6.968 7.28 7.57 7.965 8.227 8.481 8.823 9.144 9.41 9.686 9.959 10.269 10.551 10.826 11.157 11.429 11.713 12.029 12.391 12.776 13.144 13.516 13.901 14.271 14.684 15.126 15.55 16.023 16.496 16.99 17.479 17.997 18.407 18.583 18.282 17.697 17.082 16.433 15.742 15.117 14.545 14.034 13.521 13.062 12.611 12.17 11.759 11.374 10.995 10.558 10.17 9.855 9.506 9.116 8.807 8.488 8.099 7.806 7.491 7.09 6.675 6.3 6.056 5.79 5.366 5.074 4.755 4.578 4.193 3.773 3.346 3.14 2.449 2.51 2.262 1.983 1.407 1.07 0.666 0.222 -0.236 -0.738 -1.362 -2.863 -9 ,2624 ,TETRA ,17604966,Sun Nov 28 18:22:10 CET,Sun Nov 28 20:40:01 CET,0.0 1.423 2.005 2.502 2.905 3.281 3.629 3.957 4.543 4.797 5.03 4.989 5.698 5.884 6.244 6.631 6.954 7.1 7.42 7.731 8.169 8.428 8.672 9.0 9.27 9.521 9.811 10.134 10.51 10.801 11.052 11.392 11.71 11.989 12.313 12.654 12.968 13.3 13.642 14.008 14.395 14.775 15.203 15.627 16.071 16.538 17.064 17.613 18.157 18.634 18.819 18.534 18.027 17.401 16.811 16.228 15.612 15.051 14.569 14.015 13.533 13.112 12.696 12.285 11.879 11.486 11.076 10.709 10.374 10.042 9.72 9.432 9.089 8.665 8.346 8.065 7.768 7.463 7.108 6.856 6.585 6.098 5.763 5.418 5.231 4.821 4.404 4.0 3.781 3.076 3.116 2.852 2.552 1.899 1.526 1.122 0.685 0.166 -0.45 -1.207 -2.931 -10 ,15328 ,TETRA ,17604967,Sun Nov 28 18:22:10 CET,Sun Nov 28 20:39:12 CET,0.0 2.162 2.777 3.246 3.657 4.06 4.407 4.707 5.257 5.519 5.765 5.712 6.408 6.606 6.994 7.334 7.637 7.789 8.09 8.366 8.738 8.994 9.259 9.634 9.983 10.284 10.535 10.783 11.131 11.48 11.784 12.083 12.353 12.62 12.945 13.301 13.683 14.106 14.476 14.855 15.242 15.657 16.134 16.571 17.048 17.543 18.063 18.597 19.106 19.542 19.785 19.519 18.972 18.384 17.778 17.166 16.577 16.015 15.521 15.034 14.566 14.112 13.681 13.271 12.887 12.518 12.128 11.766 11.453 11.102 10.691 10.372 10.06 9.725 9.464 9.197 8.908 8.567 8.208 7.983 7.742 7.327 7.014 6.696 6.523 6.134 5.716 5.261 5.021 4.297 4.335 4.096 3.814 3.154 2.776 2.358 1.88 1.342 0.711 -0.077 -2.189 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23474.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23474.txt deleted file mode 100644 index dcd91a8c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23474.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2606 ,TETRA ,17604968,Sun Nov 28 18:22:13 CET,Sun Nov 28 20:46:09 CET,0.0 1.889 2.55 3.095 3.562 3.989 4.384 4.73 5.306 5.59 5.866 5.884 6.627 6.853 7.308 7.738 8.109 8.288 8.627 8.956 9.433 9.73 10.026 10.456 10.855 11.239 11.61 11.94 12.375 12.808 13.23 13.73 14.224 14.727 15.256 15.837 16.408 17.017 17.62 18.162 18.668 19.195 19.816 20.414 21.06 21.807 22.564 23.37 24.367 25.298 25.996 26.096 25.797 25.354 24.86 24.337 23.839 23.358 22.904 22.4 21.927 21.504 21.076 20.653 20.247 19.847 19.418 19.024 18.669 18.314 17.925 17.592 17.268 16.901 16.62 16.277 15.882 15.485 15.061 14.769 14.462 13.989 13.65 13.286 13.106 12.718 12.278 11.81 11.576 10.832 10.761 10.478 10.175 9.483 9.08 8.628 8.121 7.575 6.919 5.991 2.533 -2 ,2651 ,TETRA ,17604969,Sun Nov 28 18:22:15 CET,Sun Nov 28 20:45:10 CET,0.0 1.649 2.359 2.928 3.405 3.836 4.223 4.568 5.184 5.456 5.719 5.754 6.464 6.668 7.058 7.423 7.789 7.954 8.25 8.567 9.051 9.351 9.608 9.97 10.341 10.693 11.046 11.397 11.852 12.272 12.624 13.02 13.376 13.721 14.098 14.487 14.862 15.293 15.75 16.214 16.701 17.299 18.011 18.643 19.354 20.127 20.932 21.769 22.666 23.525 24.192 24.306 24.076 23.671 23.236 22.762 22.256 21.741 21.228 20.712 20.266 19.84 19.411 18.982 18.589 18.207 17.794 17.438 17.113 16.762 16.371 16.046 15.713 15.334 15.022 14.691 14.354 13.991 13.578 13.281 12.982 12.494 12.133 11.775 11.594 11.207 10.79 10.319 10.068 9.343 9.298 9.006 8.712 8.06 7.687 7.272 6.848 6.382 5.77 4.878 1.932 -3 ,28261 ,TETRA ,17604970,Sun Nov 28 18:22:10 CET,Sun Nov 28 20:39:48 CET,0.0 1.475 2.178 2.752 3.252 3.685 4.073 4.422 5.081 5.383 5.647 5.665 6.399 6.636 7.088 7.492 7.866 8.057 8.424 8.768 9.254 9.561 9.838 10.184 10.487 10.832 11.215 11.535 11.87 12.174 12.46 12.803 13.182 13.545 13.94 14.441 14.889 15.316 15.788 16.269 16.785 17.383 18.048 18.675 19.362 20.078 20.847 21.651 22.481 23.283 23.874 23.911 23.56 23.092 22.64 22.168 21.674 21.173 20.701 20.213 19.769 19.359 18.961 18.557 18.173 17.826 17.463 17.128 16.83 16.498 16.133 15.83 15.506 15.125 14.83 14.54 14.183 13.826 13.476 13.192 12.872 12.36 12.05 11.722 11.529 11.171 10.778 10.315 10.087 9.372 9.356 9.067 8.764 8.123 7.779 7.396 6.957 6.431 5.774 4.867 1.514 -4 ,10079 ,TETRA ,17604971,Sun Nov 28 18:22:12 CET,Sun Nov 28 20:39:50 CET,0.0 3.132 3.984 4.579 5.055 5.486 5.885 6.246 6.88 7.176 7.452 7.47 8.198 8.429 8.879 9.323 9.741 9.932 10.286 10.617 11.088 11.369 11.642 12.064 12.431 12.778 13.142 13.454 13.849 14.278 14.648 15.085 15.523 15.896 16.318 16.782 17.185 17.599 18.076 18.623 19.152 19.67 20.259 20.85 21.518 22.218 23.011 23.825 24.604 25.347 25.926 25.984 25.716 25.302 24.841 24.354 23.914 23.476 23.034 22.567 22.104 21.655 21.242 20.814 20.383 19.997 19.575 19.217 18.933 18.644 18.264 17.936 17.616 17.219 16.896 16.584 16.253 15.888 15.516 15.253 14.964 14.462 14.119 13.784 13.619 13.269 12.855 12.389 12.154 11.452 11.42 11.121 10.799 10.125 9.763 9.366 8.923 8.412 7.791 7.025 4.864 -5 ,680 ,TETRA ,17604972,Sun Nov 28 18:22:15 CET,Sun Nov 28 20:43:20 CET,0.0 2.339 3.081 3.658 4.171 4.651 5.074 5.429 6.036 6.323 6.601 6.628 7.363 7.591 8.026 8.416 8.752 8.927 9.279 9.594 10.043 10.343 10.645 11.062 11.441 11.819 12.17 12.468 12.904 13.39 13.81 14.246 14.637 15.022 15.46 15.917 16.355 16.787 17.22 17.74 18.283 18.884 19.57 20.181 20.854 21.542 22.279 23.057 23.883 24.738 25.469 25.595 25.345 24.966 24.533 24.087 23.656 23.199 22.773 22.294 21.827 21.414 21.003 20.591 20.229 19.804 19.349 19.007 18.69 18.37 17.994 17.665 17.3 16.89 16.613 16.352 16.076 15.746 15.349 15.049 14.733 14.269 13.945 13.601 13.42 13.037 12.642 12.219 11.989 11.268 11.266 11.006 10.719 10.092 9.752 9.389 8.966 8.443 7.833 7.002 4.066 -6 ,10179 ,TETRA ,17604973,Sun Nov 28 18:22:13 CET,Sun Nov 28 20:42:55 CET,0.0 2.529 3.265 3.839 4.327 4.766 5.16 5.528 6.177 6.464 6.737 6.75 7.477 7.715 8.176 8.635 9.057 9.249 9.607 9.93 10.399 10.712 11.008 11.406 11.755 12.104 12.456 12.791 13.212 13.624 14.003 14.443 14.853 15.201 15.584 16.026 16.439 16.88 17.329 17.805 18.304 18.847 19.469 20.055 20.698 21.402 22.182 23.017 23.915 24.785 25.497 25.657 25.458 25.084 24.62 24.121 23.655 23.193 22.712 22.219 21.787 21.363 20.938 20.545 20.158 19.796 19.449 19.138 18.843 18.512 18.15 17.822 17.494 17.148 16.832 16.47 16.09 15.693 15.28 14.992 14.683 14.204 13.882 13.528 13.34 12.959 12.557 12.137 11.917 11.192 11.128 10.838 10.547 9.923 9.565 9.161 8.718 8.19 7.592 6.796 4.605 -7 ,20210 ,TETRA ,17604974,Sun Nov 28 18:22:10 CET,Sun Nov 28 20:39:11 CET,0.0 2.673 3.54 4.201 4.688 5.105 5.505 5.862 6.494 6.792 7.071 7.108 7.832 8.058 8.515 8.942 9.318 9.502 9.867 10.198 10.641 10.902 11.168 11.583 11.977 12.345 12.655 12.952 13.377 13.748 14.071 14.474 14.864 15.243 15.707 16.215 16.651 17.1 17.589 18.093 18.597 19.174 19.813 20.41 21.077 21.795 22.561 23.345 24.177 25.001 25.653 25.764 25.469 25.074 24.668 24.244 23.8 23.312 22.859 22.407 22.003 21.597 21.173 20.73 20.288 19.863 19.385 18.956 18.573 18.16 17.712 17.332 16.943 16.522 16.197 15.858 15.491 15.112 14.708 14.427 14.135 13.667 13.347 12.993 12.8 12.425 12.032 11.58 11.328 10.577 10.525 10.251 9.948 9.265 8.9 8.529 8.109 7.604 6.994 6.164 3.095 -8 ,23700 ,TETRA ,17604975,Sun Nov 28 18:22:11 CET,Sun Nov 28 20:42:40 CET,0.0 1.468 2.087 2.619 3.101 3.503 3.877 4.227 4.875 5.158 5.435 5.454 6.177 6.417 6.87 7.298 7.704 7.896 8.246 8.569 9.083 9.42 9.723 10.135 10.526 10.954 11.329 11.624 12.004 12.406 12.792 13.196 13.563 13.924 14.351 14.836 15.315 15.808 16.298 16.822 17.348 17.943 18.636 19.265 19.944 20.662 21.436 22.248 23.139 24.066 24.741 24.77 24.482 24.03 23.521 23.035 22.583 22.118 21.678 21.178 20.736 20.37 19.972 19.557 19.165 18.805 18.443 18.116 17.788 17.443 17.104 16.809 16.495 16.157 15.869 15.549 15.234 14.912 14.557 14.278 13.963 13.465 13.127 12.782 12.596 12.195 11.777 11.298 11.045 10.308 10.262 9.972 9.657 8.975 8.621 8.228 7.768 7.263 6.656 5.829 3.126 -9 ,24884 ,TETRA ,17604976,Sun Nov 28 18:22:13 CET,Sun Nov 28 20:42:01 CET,0.0 1.694 2.359 2.911 3.409 3.816 4.194 4.561 5.224 5.525 5.807 5.837 6.568 6.803 7.252 7.677 8.072 8.252 8.598 8.943 9.422 9.702 9.945 10.295 10.631 10.937 11.257 11.574 11.961 12.34 12.734 13.209 13.582 13.911 14.286 14.715 15.141 15.562 16.049 16.559 17.044 17.593 18.2 18.775 19.416 20.136 20.895 21.663 22.445 23.185 23.769 23.801 23.53 23.096 22.606 22.107 21.603 21.108 20.676 20.208 19.765 19.348 18.94 18.513 18.07 17.634 17.186 16.76 16.345 15.92 15.473 15.096 14.7 14.284 13.959 13.611 13.245 12.849 12.426 12.14 11.845 11.357 10.994 10.604 10.408 10.014 9.602 9.15 8.912 8.182 8.095 7.812 7.528 6.881 6.502 6.107 5.688 5.193 4.574 3.761 1.036 -10 ,7541 ,TETRA ,17604977,Sun Nov 28 18:22:12 CET,Sun Nov 28 20:40:34 CET,0.0 2.291 3.082 3.677 4.186 4.642 5.057 5.448 6.154 6.477 6.78 6.825 7.563 7.784 8.191 8.584 8.962 9.143 9.488 9.826 10.293 10.577 10.868 11.296 11.692 12.055 12.379 12.694 13.051 13.395 13.748 14.156 14.539 14.882 15.302 15.782 16.204 16.644 17.116 17.607 18.089 18.601 19.206 19.847 20.585 21.393 22.186 22.936 23.76 24.496 24.995 25.054 24.839 24.462 23.975 23.455 22.937 22.434 21.932 21.389 20.964 20.565 20.153 19.758 19.373 18.993 18.57 18.169 17.81 17.419 16.976 16.592 16.184 15.756 15.447 15.13 14.782 14.423 14.047 13.776 13.495 13.033 12.693 12.358 12.179 11.779 11.353 10.91 10.673 9.938 9.892 9.604 9.297 8.63 8.259 7.822 7.356 6.815 6.092 5.145 0.795 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23475.txt deleted file mode 100644 index 71690a9c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14453 ,TETRA ,17604978,Sun Nov 28 18:22:14 CET,Sun Nov 28 20:38:28 CET,0.0 1.434 2.093 2.595 2.973 3.316 3.61 3.861 4.326 4.553 4.78 4.721 5.4 5.586 5.94 6.252 6.558 6.713 6.98 7.245 7.633 7.865 8.09 8.411 8.722 9.024 9.304 9.568 9.912 10.248 10.548 10.886 11.218 11.538 11.914 12.307 12.643 13.032 13.454 13.882 14.314 14.729 15.159 15.55 15.983 16.479 17.031 17.606 18.201 18.707 18.976 18.736 18.233 17.655 17.054 16.443 15.863 15.295 14.762 14.171 13.646 13.202 12.762 12.312 11.873 11.48 11.017 10.578 10.246 9.906 9.555 9.268 8.954 8.601 8.279 7.966 7.68 7.301 6.867 6.603 6.346 5.908 5.558 5.164 4.961 4.581 4.203 3.781 3.545 2.814 2.762 2.475 2.184 1.485 1.084 0.68 0.245 -0.264 -0.908 -1.739 -3.613 -2 ,25302 ,TETRA ,17604979,Sun Nov 28 18:22:16 CET,Sun Nov 28 20:37:56 CET,0.0 1.229 1.801 2.261 2.683 3.03 3.339 3.644 4.203 4.452 4.691 4.649 5.352 5.543 5.911 6.257 6.59 6.752 7.06 7.358 7.789 8.072 8.329 8.65 8.941 9.199 9.49 9.834 10.211 10.51 10.783 11.093 11.383 11.667 12.004 12.413 12.77 13.092 13.449 13.816 14.17 14.584 15.049 15.474 15.957 16.527 17.158 17.749 18.332 18.838 19.113 18.897 18.397 17.805 17.224 16.626 16.061 15.503 14.962 14.402 13.92 13.507 13.112 12.704 12.298 11.906 11.475 11.063 10.71 10.349 9.954 9.621 9.276 8.933 8.645 8.303 7.963 7.596 7.168 6.869 6.591 6.154 5.794 5.405 5.215 4.812 4.387 3.934 3.698 2.993 2.997 2.718 2.417 1.782 1.416 1.009 0.566 0.022 -0.633 -1.439 -3.292 -3 ,9821 ,TETRA ,17604980,Sun Nov 28 18:22:13 CET,Sun Nov 28 20:37:41 CET,0.0 1.318 2.014 2.493 2.87 3.211 3.535 3.818 4.327 4.559 4.78 4.75 5.457 5.661 6.033 6.376 6.697 6.846 7.144 7.427 7.821 8.079 8.318 8.649 8.963 9.286 9.576 9.856 10.24 10.613 10.924 11.209 11.486 11.751 12.041 12.363 12.691 13.08 13.471 13.883 14.289 14.713 15.185 15.602 16.062 16.558 17.1 17.649 18.158 18.622 18.91 18.583 17.96 17.323 16.699 16.059 15.442 14.856 14.329 13.797 13.325 12.836 12.364 11.899 11.412 11.005 10.594 10.202 9.807 9.345 8.917 8.552 8.117 7.687 7.374 7.042 6.703 6.372 5.988 5.705 5.411 4.911 4.555 4.194 3.994 3.562 3.103 2.617 2.37 1.63 1.56 1.257 0.934 0.248 -0.139 -0.572 -1.043 -1.627 -2.286 -3.035 -4.569 -4 ,10305 ,TETRA ,17604981,Sun Nov 28 18:22:13 CET,Sun Nov 28 20:40:34 CET,0.0 1.203 1.858 2.339 2.73 3.08 3.398 3.682 4.229 4.49 4.721 4.654 5.335 5.522 5.912 6.284 6.618 6.78 7.098 7.402 7.796 8.036 8.297 8.674 8.997 9.272 9.571 9.887 10.22 10.496 10.783 11.198 11.566 11.866 12.229 12.611 12.932 13.27 13.644 14.026 14.398 14.778 15.195 15.637 16.157 16.7 17.297 17.88 18.448 18.906 19.077 18.773 18.263 17.673 17.062 16.447 15.886 15.298 14.752 14.21 13.711 13.247 12.805 12.398 11.988 11.589 11.167 10.787 10.454 10.104 9.705 9.33 8.93 8.478 8.098 7.709 7.348 7.008 6.628 6.363 6.09 5.64 5.33 5.001 4.807 4.373 3.924 3.445 3.183 2.429 2.361 2.075 1.78 1.11 0.72 0.281 -0.177 -0.683 -1.31 -2.113 -3.715 -5 ,5084 ,TETRA ,17604982,Sun Nov 28 18:22:12 CET,Sun Nov 28 20:38:47 CET,0.0 1.67 2.328 2.831 3.255 3.638 3.988 4.312 4.88 5.133 5.382 5.363 6.053 6.246 6.635 6.996 7.337 7.489 7.776 8.076 8.516 8.796 9.049 9.373 9.723 10.074 10.358 10.62 10.94 11.218 11.493 11.847 12.183 12.483 12.798 13.138 13.448 13.775 14.111 14.474 14.845 15.253 15.729 16.144 16.6 17.097 17.59 18.119 18.713 19.222 19.452 19.18 18.594 17.832 17.113 16.468 15.884 15.349 14.831 14.285 13.811 13.367 12.923 12.499 12.109 11.723 11.289 10.892 10.53 10.165 9.798 9.483 9.136 8.724 8.403 8.081 7.712 7.34 6.971 6.675 6.342 5.888 5.587 5.23 5.027 4.623 4.202 3.772 3.546 2.802 2.755 2.474 2.175 1.516 1.152 0.72 0.234 -0.263 -0.862 -1.666 -4.401 -6 ,9047 ,TETRA ,17604983,Sun Nov 28 18:22:15 CET,Sun Nov 28 20:39:36 CET,0.0 1.14 1.681 2.123 2.488 2.815 3.124 3.429 3.979 4.222 4.458 4.43 5.114 5.315 5.711 6.07 6.4 6.567 6.886 7.153 7.547 7.795 8.005 8.283 8.554 8.846 9.109 9.342 9.649 9.932 10.191 10.566 10.915 11.17 11.47 11.811 12.125 12.478 12.861 13.248 13.626 14.033 14.476 14.931 15.464 16.008 16.553 17.081 17.656 18.166 18.457 18.271 17.783 17.235 16.634 16.018 15.435 14.881 14.39 13.858 13.367 12.919 12.511 12.091 11.673 11.31 10.912 10.536 10.187 9.81 9.383 9.038 8.727 8.383 8.091 7.796 7.476 7.081 6.658 6.34 5.975 5.376 4.953 4.55 4.347 3.909 3.449 2.936 2.657 1.882 1.758 1.425 1.078 0.323 -0.108 -0.597 -1.14 -1.74 -2.491 -3.443 -5.373 -7 ,18523 ,TETRA ,17604984,Sun Nov 28 18:22:17 CET,Sun Nov 28 20:34:48 CET,0.0 1.665 2.328 2.838 3.249 3.601 3.918 4.193 4.669 4.881 5.092 5.003 5.683 5.852 6.169 6.463 6.738 6.868 7.123 7.372 7.697 7.898 8.089 8.339 8.588 8.851 9.091 9.316 9.614 9.888 10.15 10.496 10.842 11.147 11.483 11.848 12.189 12.559 12.977 13.419 13.857 14.31 14.777 15.217 15.687 16.19 16.758 17.321 17.874 18.379 18.672 18.438 17.898 17.327 16.718 16.094 15.516 14.972 14.479 13.96 13.511 13.108 12.691 12.268 11.862 11.42 10.946 10.581 10.271 9.908 9.457 9.083 8.714 8.335 8.069 7.765 7.388 6.981 6.594 6.327 6.019 5.556 5.236 4.908 4.738 4.363 3.988 3.565 3.307 2.551 2.515 2.234 1.927 1.262 0.897 0.472 -0.009 -0.524 -1.181 -2.015 -3.729 -8 ,6058 ,TETRA ,17604985,Sun Nov 28 18:22:13 CET,Sun Nov 28 20:39:19 CET,0.0 1.248 1.921 2.415 2.793 3.138 3.472 3.785 4.326 4.574 4.806 4.757 5.449 5.643 5.987 6.297 6.625 6.789 7.09 7.381 7.776 7.998 8.206 8.54 8.853 9.111 9.346 9.603 9.924 10.186 10.44 10.732 11.017 11.284 11.592 11.951 12.27 12.571 12.887 13.23 13.599 13.999 14.438 14.888 15.396 15.93 16.492 17.03 17.56 18.04 18.349 18.224 17.743 17.167 16.579 15.949 15.325 14.747 14.232 13.65 13.129 12.657 12.222 11.811 11.411 11.019 10.554 10.152 9.814 9.459 9.086 8.716 8.335 7.983 7.701 7.393 7.068 6.733 6.382 6.134 5.867 5.404 5.057 4.707 4.535 4.162 3.744 3.287 3.041 2.292 2.215 1.917 1.599 0.928 0.553 0.139 -0.324 -0.853 -1.523 -2.422 -4.598 -9 ,31378 ,TETRA ,17604986,Sun Nov 28 18:22:13 CET,Sun Nov 28 20:38:24 CET,0.0 1.131 1.784 2.287 2.73 3.118 3.457 3.749 4.288 4.55 4.801 4.736 5.414 5.622 6.016 6.372 6.711 6.877 7.165 7.425 7.858 8.139 8.392 8.752 9.098 9.411 9.683 9.92 10.209 10.504 10.801 11.136 11.432 11.691 11.978 12.312 12.618 12.932 13.284 13.65 14.025 14.446 14.943 15.421 15.9 16.412 16.991 17.543 18.059 18.548 18.819 18.613 18.147 17.594 16.998 16.419 15.872 15.303 14.766 14.224 13.75 13.307 12.863 12.444 12.057 11.672 11.259 10.894 10.576 10.253 9.881 9.522 9.089 8.621 8.305 8.019 7.702 7.334 6.91 6.616 6.347 5.905 5.571 5.218 5.031 4.654 4.243 3.797 3.565 2.819 2.825 2.565 2.298 1.722 1.374 0.982 0.536 0.033 -0.51 -1.143 -2.566 -10 ,6003 ,TETRA ,17604987,Sun Nov 28 18:22:15 CET,Sun Nov 28 20:37:41 CET,0.0 1.209 1.844 2.353 2.761 3.112 3.442 3.743 4.279 4.521 4.755 4.723 5.396 5.592 5.991 6.36 6.675 6.82 7.107 7.403 7.84 8.086 8.295 8.634 9.016 9.315 9.575 9.827 10.133 10.456 10.742 11.064 11.377 11.661 11.976 12.347 12.695 13.04 13.407 13.796 14.188 14.593 15.035 15.467 15.962 16.533 17.131 17.723 18.333 18.869 19.263 19.094 18.558 17.923 17.269 16.666 16.12 15.593 15.083 14.513 14.012 13.55 13.088 12.66 12.265 11.897 11.491 11.097 10.75 10.421 10.079 9.763 9.421 9.055 8.761 8.443 8.111 7.781 7.42 7.138 6.826 6.388 6.118 5.823 5.658 5.273 4.836 4.384 4.163 3.455 3.395 3.119 2.834 2.177 1.795 1.37 0.901 0.377 -0.203 -0.936 -2.66 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23477.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23477.txt deleted file mode 100644 index 2a22f0a0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23477.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19923 ,KEBNE ,17070658,Fri Dec 24 22:31:11 CET,Sat Dec 25 00:28:39 CET,0.0 2.439 3.17 3.692 4.105 4.46 4.765 5.049 5.563 5.809 6.038 5.964 6.668 6.912 7.349 7.721 8.069 8.241 8.556 8.834 9.255 9.533 9.803 10.171 10.472 10.748 11.036 11.294 11.585 11.866 12.135 12.436 12.742 13.037 13.363 13.701 13.999 14.328 14.661 14.986 15.298 15.643 16.012 16.337 16.675 16.98 17.226 17.377 17.354 17.053 16.113 14.508 13.038 11.756 10.598 9.569 8.653 7.779 6.996 6.176 5.446 4.79 4.15 3.535 2.964 2.455 1.921 1.423 1.009 0.588 0.121 -0.283 -0.711 -1.169 -1.571 -1.995 -2.41 -2.841 -3.319 -3.664 -4.002 -4.506 -4.881 -5.297 -5.505 -5.924 -6.374 -6.868 -7.133 -7.918 -7.986 -8.299 -8.632 -9.317 -9.691 -10.117 -10.596 -11.124 -11.789 -12.673 -14.997 -2 ,1075 ,KEBNE ,17070659,Fri Dec 24 22:35:26 CET,Sat Dec 25 00:30:15 CET,0.0 1.873 2.565 3.084 3.482 3.854 4.228 4.585 5.22 5.508 5.802 5.857 6.59 6.838 7.262 7.602 7.936 8.119 8.501 8.861 9.301 9.54 9.8 10.2 10.533 10.811 11.083 11.346 11.716 12.074 12.342 12.639 12.933 13.214 13.541 13.899 14.25 14.603 14.916 15.241 15.569 15.921 16.324 16.689 17.027 17.333 17.608 17.812 17.834 17.522 16.584 15.027 13.552 12.281 11.057 9.857 8.858 7.996 7.222 6.399 5.712 5.114 4.517 3.939 3.375 2.852 2.32 1.848 1.414 0.97 0.497 0.074 -0.382 -0.855 -1.242 -1.636 -1.998 -2.384 -2.801 -3.111 -3.439 -3.926 -4.288 -4.69 -4.875 -5.244 -5.683 -6.169 -6.433 -7.218 -7.329 -7.653 -7.966 -8.672 -9.07 -9.478 -9.962 -10.521 -11.158 -12.063 -14.04 -3 ,29018 ,KEBNE ,17070660,Fri Dec 24 22:35:27 CET,Sat Dec 25 00:30:40 CET,0.0 2.334 3.046 3.536 3.95 4.332 4.671 4.962 5.525 5.782 6.002 5.898 6.577 6.749 7.088 7.406 7.703 7.846 8.122 8.398 8.792 9.033 9.234 9.501 9.779 10.024 10.272 10.52 10.812 11.08 11.291 11.535 11.782 12.023 12.282 12.541 12.78 13.032 13.282 13.539 13.786 14.021 14.271 14.571 14.937 15.27 15.528 15.69 15.767 15.572 14.644 13.085 11.67 10.367 9.189 8.04 7.009 6.103 5.283 4.458 3.737 3.104 2.509 1.944 1.409 0.905 0.388 -0.088 -0.49 -0.931 -1.428 -1.815 -2.205 -2.607 -2.942 -3.336 -3.759 -4.182 -4.592 -4.887 -5.25 -5.872 -6.256 -6.606 -6.807 -7.234 -7.656 -8.095 -8.323 -9.067 -9.149 -9.462 -9.783 -10.515 -10.928 -11.338 -11.789 -12.326 -12.948 -13.669 -15.762 -4 ,25809 ,KEBNE ,17070661,Fri Dec 24 22:37:34 CET,Sat Dec 25 00:32:45 CET,0.0 2.334 3.031 3.531 3.95 4.318 4.663 4.994 5.566 5.824 6.081 6.059 6.752 6.938 7.298 7.613 7.896 8.038 8.311 8.587 8.948 9.164 9.386 9.682 9.972 10.238 10.477 10.728 11.011 11.247 11.462 11.746 12.039 12.311 12.612 12.93 13.234 13.578 13.911 14.229 14.554 14.908 15.266 15.582 15.91 16.23 16.52 16.708 16.769 16.541 15.759 14.422 13.011 11.654 10.458 9.402 8.448 7.539 6.721 5.882 5.151 4.486 3.821 3.191 2.64 2.139 1.582 1.075 0.626 0.173 -0.28 -0.668 -1.113 -1.589 -1.947 -2.343 -2.771 -3.228 -3.67 -3.969 -4.326 -4.92 -5.321 -5.725 -5.937 -6.376 -6.847 -7.362 -7.63 -8.406 -8.486 -8.785 -9.103 -9.792 -10.171 -10.598 -11.064 -11.596 -12.256 -13.124 -14.988 -5 ,29855 ,KEBNE ,17070662,Fri Dec 24 22:36:29 CET,Sat Dec 25 00:32:16 CET,0.0 1.822 2.462 2.969 3.396 3.778 4.115 4.418 5.01 5.278 5.524 5.503 6.205 6.39 6.754 7.11 7.457 7.646 7.982 8.306 8.81 9.099 9.382 9.788 10.115 10.416 10.744 11.075 11.451 11.79 12.097 12.432 12.741 13.05 13.405 13.773 14.109 14.467 14.833 15.186 15.533 15.917 16.328 16.711 17.17 17.566 17.9 18.217 18.364 18.163 17.369 15.975 14.544 13.18 11.948 10.77 9.665 8.689 7.881 7.047 6.301 5.648 5.013 4.415 3.794 3.2 2.642 2.152 1.714 1.257 0.773 0.352 -0.116 -0.645 -1.067 -1.521 -1.988 -2.451 -2.935 -3.261 -3.596 -4.108 -4.473 -4.875 -5.085 -5.53 -6.011 -6.516 -6.776 -7.55 -7.608 -7.915 -8.255 -8.954 -9.305 -9.704 -10.177 -10.698 -11.297 -12.068 -14.518 -6 ,6405 ,KEBNE ,17070663,Fri Dec 24 22:36:29 CET,Sat Dec 25 00:31:53 CET,0.0 2.293 3.118 3.623 4.04 4.43 4.795 5.128 5.698 5.96 6.225 6.197 6.872 7.041 7.398 7.78 8.091 8.226 8.527 8.808 9.176 9.408 9.643 9.965 10.275 10.597 10.852 11.058 11.315 11.586 11.845 12.085 12.312 12.518 12.748 13.013 13.255 13.487 13.713 13.98 14.246 14.47 14.68 14.874 15.169 15.505 15.752 15.904 15.96 15.667 14.593 12.985 11.483 10.128 8.941 7.858 6.85 5.89 5.047 4.159 3.326 2.607 1.953 1.316 0.724 0.163 -0.446 -0.993 -1.443 -1.907 -2.408 -2.833 -3.277 -3.725 -4.078 -4.459 -4.854 -5.254 -5.658 -5.945 -6.258 -6.744 -7.085 -7.437 -7.642 -8.079 -8.502 -8.943 -9.174 -9.91 -9.898 -10.157 -10.434 -11.095 -11.461 -11.865 -12.318 -12.827 -13.458 -14.293 -17.067 -7 ,31311 ,KEBNE ,17070664,Fri Dec 24 22:37:34 CET,Sat Dec 25 00:32:02 CET,0.0 1.715 2.344 2.845 3.298 3.684 4.023 4.36 4.984 5.26 5.518 5.513 6.232 6.44 6.795 7.132 7.475 7.637 7.954 8.269 8.673 8.893 9.1 9.421 9.754 10.065 10.339 10.613 10.952 11.243 11.537 11.873 12.153 12.386 12.666 12.998 13.306 13.639 14.001 14.377 14.751 15.138 15.564 15.945 16.36 16.765 17.102 17.38 17.61 17.523 16.743 15.424 14.117 12.832 11.642 10.534 9.529 8.589 7.754 6.914 6.192 5.558 4.941 4.371 3.828 3.303 2.782 2.322 1.895 1.414 0.915 0.507 0.099 -0.308 -0.658 -1.065 -1.502 -1.965 -2.465 -2.818 -3.166 -3.708 -4.1 -4.503 -4.713 -5.146 -5.588 -6.043 -6.291 -7.053 -7.131 -7.441 -7.765 -8.471 -8.858 -9.295 -9.812 -10.354 -10.915 -11.645 -13.437 -8 ,12974 ,KEBNE ,17070665,Fri Dec 24 22:38:38 CET,Sat Dec 25 00:35:04 CET,0.0 1.541 2.193 2.676 3.076 3.458 3.811 4.125 4.702 4.959 5.187 5.157 5.869 6.069 6.448 6.821 7.179 7.343 7.638 7.937 8.368 8.638 8.898 9.277 9.64 9.962 10.249 10.518 10.872 11.191 11.462 11.782 12.093 12.369 12.694 13.05 13.367 13.681 13.991 14.334 14.688 15.104 15.546 15.919 16.317 16.662 16.935 17.135 17.276 17.187 16.505 15.192 13.769 12.516 11.446 10.445 9.566 8.728 7.947 7.169 6.442 5.765 5.155 4.568 4.013 3.515 3.009 2.548 2.122 1.668 1.204 0.821 0.393 -0.093 -0.468 -0.85 -1.275 -1.755 -2.284 -2.661 -3.005 -3.485 -3.828 -4.215 -4.439 -4.921 -5.443 -5.984 -6.244 -7.012 -7.102 -7.422 -7.754 -8.477 -8.874 -9.299 -9.767 -10.31 -10.939 -11.758 -14.419 -9 ,16301 ,KEBNE ,17070666,Fri Dec 24 22:39:41 CET,Sat Dec 25 00:34:57 CET,0.0 1.936 2.627 3.187 3.721 4.208 4.623 4.977 5.61 5.904 6.179 6.185 6.892 7.1 7.508 7.901 8.248 8.413 8.74 9.055 9.501 9.787 10.087 10.457 10.736 10.994 11.227 11.457 11.763 12.049 12.327 12.648 12.928 13.184 13.494 13.85 14.17 14.485 14.815 15.153 15.474 15.797 16.154 16.509 16.852 17.148 17.416 17.585 17.582 17.328 16.546 15.081 13.565 12.193 11.008 9.946 8.959 8.033 7.188 6.349 5.663 5.027 4.399 3.77 3.19 2.672 2.096 1.614 1.227 0.827 0.408 0.037 -0.387 -0.823 -1.173 -1.552 -1.925 -2.347 -2.82 -3.15 -3.504 -4.064 -4.445 -4.865 -5.09 -5.532 -5.989 -6.464 -6.726 -7.51 -7.574 -7.876 -8.191 -8.87 -9.249 -9.66 -10.106 -10.586 -11.148 -11.876 -13.614 -10 ,6060 ,KEBNE ,17070667,Fri Dec 24 22:39:41 CET,Sat Dec 25 00:35:04 CET,0.0 1.962 2.671 3.324 3.834 4.258 4.649 5.007 5.658 5.954 6.238 6.287 7.02 7.239 7.645 8.044 8.404 8.587 8.916 9.195 9.593 9.859 10.13 10.488 10.813 11.088 11.343 11.617 11.949 12.291 12.61 12.941 13.283 13.595 13.928 14.286 14.607 14.93 15.266 15.624 15.965 16.327 16.704 17.02 17.336 17.61 17.885 18.137 18.214 17.917 17.043 15.651 14.227 12.903 11.758 10.686 9.587 8.557 7.692 6.815 6.077 5.419 4.785 4.21 3.65 3.114 2.509 1.959 1.475 0.924 0.342 -0.148 -0.657 -1.163 -1.531 -1.891 -2.267 -2.671 -3.1 -3.398 -3.691 -4.114 -4.435 -4.809 -5.001 -5.399 -5.848 -6.333 -6.595 -7.391 -7.478 -7.802 -8.13 -8.792 -9.175 -9.612 -10.105 -10.658 -11.293 -12.103 -14.377 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23477_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23477_23475.txt deleted file mode 100644 index cae388b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23477_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23060 ,TETRA ,17604988,Sun Nov 28 18:22:16 CET,Sun Nov 28 20:40:37 CET,0.0 1.789 2.645 3.306 3.813 4.226 4.571 4.904 5.564 5.866 6.144 6.167 6.922 7.153 7.601 8.028 8.421 8.614 8.974 9.29 9.775 10.105 10.386 10.747 11.097 11.424 11.752 12.056 12.417 12.771 13.115 13.524 13.905 14.264 14.686 15.175 15.627 16.092 16.606 17.177 17.769 18.407 19.124 19.836 20.629 21.477 22.464 23.552 24.758 26.034 27.334 28.285 28.637 28.648 28.495 28.225 27.889 27.558 27.235 26.87 26.563 26.273 25.956 25.636 25.353 25.076 24.701 24.38 24.109 23.793 23.49 23.22 22.934 22.641 22.404 22.136 21.859 21.583 21.272 21.017 20.741 20.315 19.986 19.645 19.476 19.117 18.753 18.367 18.152 17.44 17.442 17.17 16.899 16.344 16.016 15.659 15.274 14.829 14.312 13.649 11.715 -2 ,9204 ,TETRA ,17604989,Sun Nov 28 18:22:13 CET,Sun Nov 28 20:40:53 CET,0.0 1.187 1.806 2.316 2.772 3.18 3.531 3.845 4.414 4.667 4.915 4.881 5.638 5.854 6.26 6.661 7.044 7.221 7.576 7.926 8.423 8.735 9.038 9.473 9.889 10.291 10.689 11.061 11.535 12.017 12.48 13.012 13.496 13.945 14.468 15.036 15.615 16.265 16.856 17.438 18.03 18.67 19.379 20.118 21.001 21.958 23.035 24.18 25.487 26.92 28.358 29.258 29.517 29.419 29.205 28.949 28.659 28.329 27.989 27.622 27.251 26.895 26.515 26.114 25.746 25.427 25.091 24.769 24.463 24.15 23.788 23.46 23.104 22.691 22.359 22.008 21.631 21.247 20.894 20.659 20.406 20.021 19.752 19.47 19.322 19.001 18.637 18.248 18.05 17.356 17.37 17.108 16.825 16.208 15.873 15.514 15.117 14.7 14.193 13.503 11.669 -3 ,7986 ,TETRA ,17604990,Sun Nov 28 18:22:15 CET,Sun Nov 28 20:41:15 CET,0.0 1.523 2.105 2.589 3.033 3.398 3.745 4.084 4.713 4.991 5.241 5.21 5.945 6.153 6.545 6.94 7.29 7.465 7.829 8.168 8.635 8.9 9.143 9.514 9.877 10.254 10.632 10.932 11.293 11.671 12.031 12.432 12.815 13.19 13.619 14.073 14.499 14.965 15.464 15.99 16.51 17.106 17.83 18.567 19.414 20.33 21.381 22.469 23.615 24.901 26.272 27.089 27.259 27.142 26.867 26.532 26.165 25.757 25.356 24.943 24.562 24.192 23.863 23.551 23.217 22.881 22.529 22.206 21.9 21.578 21.23 20.945 20.633 20.196 19.819 19.466 19.137 18.798 18.377 18.096 17.828 17.363 17.014 16.633 16.452 16.058 15.609 15.16 14.915 14.18 14.199 13.961 13.694 13.099 12.781 12.426 12.042 11.615 11.099 10.466 8.917 -4 ,2377 ,TETRA ,17604991,Sun Nov 28 18:22:14 CET,Sun Nov 28 20:41:10 CET,0.0 3.851 4.612 5.062 5.449 5.858 6.224 6.547 7.135 7.387 7.619 7.537 8.248 8.453 8.848 9.224 9.595 9.778 10.12 10.433 10.88 11.155 11.429 11.847 12.258 12.641 12.982 13.313 13.738 14.128 14.487 14.915 15.309 15.685 16.138 16.643 17.127 17.649 18.186 18.746 19.328 19.973 20.703 21.427 22.272 23.231 24.345 25.52 26.776 28.201 29.824 30.92 31.203 31.133 30.864 30.495 30.21 29.973 29.709 29.42 29.165 28.889 28.565 28.235 27.926 27.624 27.282 26.976 26.722 26.423 26.097 25.824 25.522 25.204 24.94 24.653 24.361 24.069 23.764 23.558 23.336 22.971 22.716 22.44 22.284 21.935 21.564 21.207 21.028 20.351 20.389 20.135 19.854 19.249 18.947 18.641 18.303 17.9 17.396 16.745 15.014 -5 ,24039 ,TETRA ,17604992,Sun Nov 28 18:22:41 CET,Sun Nov 28 20:42:20 CET,0.0 1.107 1.752 2.286 2.702 3.078 3.442 3.78 4.373 4.642 4.902 4.881 5.613 5.828 6.231 6.617 6.965 7.139 7.474 7.777 8.222 8.5 8.77 9.147 9.517 9.888 10.219 10.499 10.881 11.31 11.713 12.159 12.582 12.953 13.374 13.863 14.32 14.796 15.302 15.841 16.413 17.051 17.773 18.488 19.303 20.176 21.16 22.282 23.608 25.094 26.645 27.668 27.979 27.957 27.857 27.694 27.453 27.169 26.881 26.577 26.29 26.007 25.732 25.442 25.155 24.873 24.566 24.271 24.009 23.72 23.401 23.163 22.936 22.682 22.432 22.136 21.84 21.536 21.197 20.955 20.717 20.333 20.068 19.819 19.673 19.349 18.977 18.565 18.38 17.691 17.726 17.48 17.21 16.625 16.259 15.827 15.338 14.783 14.207 13.583 11.893 -6 ,18274 ,TETRA ,17604993,Sun Nov 28 18:22:41 CET,Sun Nov 28 20:42:08 CET,0.0 1.974 2.704 3.223 3.634 3.998 4.329 4.647 5.23 5.494 5.74 5.7 6.418 6.627 7.043 7.417 7.763 7.932 8.26 8.574 9.029 9.322 9.603 9.988 10.349 10.697 11.04 11.369 11.784 12.195 12.554 12.938 13.31 13.673 14.086 14.545 15.012 15.543 16.057 16.571 17.128 17.734 18.434 19.125 19.88 20.696 21.618 22.614 23.779 25.12 26.455 27.216 27.427 27.322 27.094 26.811 26.492 26.158 25.81 25.411 25.021 24.653 24.34 24.049 23.741 23.444 23.135 22.855 22.591 22.267 21.923 21.64 21.357 21.062 20.826 20.572 20.264 19.899 19.506 19.252 18.968 18.523 18.251 17.971 17.83 17.503 17.119 16.72 16.514 15.814 15.835 15.568 15.292 14.649 14.288 13.942 13.556 13.103 12.528 11.837 10.019 -7 ,14558 ,TETRA ,17604994,Sun Nov 28 18:22:43 CET,Sun Nov 28 20:42:28 CET,0.0 1.962 2.856 3.447 3.863 4.245 4.613 4.949 5.518 5.785 6.058 6.057 6.824 7.047 7.473 7.864 8.251 8.444 8.805 9.146 9.637 9.947 10.237 10.642 11.035 11.426 11.81 12.205 12.706 13.126 13.51 13.962 14.377 14.796 15.237 15.714 16.2 16.705 17.231 17.784 18.373 19.071 19.855 20.614 21.485 22.418 23.495 24.622 25.868 27.304 28.717 29.486 29.635 29.581 29.437 29.205 28.915 28.565 28.234 27.893 27.578 27.271 26.971 26.68 26.411 26.157 25.851 25.567 25.318 25.014 24.669 24.406 24.16 23.89 23.662 23.399 23.079 22.738 22.392 22.136 21.878 21.48 21.171 20.845 20.683 20.332 19.966 19.557 19.329 18.614 18.643 18.405 18.149 17.565 17.254 16.906 16.513 16.102 15.61 14.964 13.118 -8 ,25342 ,TETRA ,17604995,Sun Nov 28 18:22:41 CET,Sun Nov 28 20:38:51 CET,0.0 1.569 2.206 2.696 3.118 3.506 3.841 4.147 4.737 5.022 5.304 5.318 6.029 6.24 6.651 7.017 7.354 7.52 7.873 8.22 8.685 8.973 9.248 9.628 10.0 10.339 10.68 11.028 11.454 11.826 12.148 12.575 13.011 13.435 13.928 14.518 15.058 15.54 16.039 16.587 17.131 17.703 18.388 19.075 19.828 20.69 21.683 22.71 23.865 25.187 26.544 27.367 27.651 27.588 27.376 27.15 26.863 26.512 26.157 25.766 25.395 25.052 24.733 24.424 24.129 23.865 23.563 23.265 23.016 22.749 22.45 22.201 21.935 21.662 21.45 21.219 20.975 20.682 20.331 20.079 19.806 19.368 19.043 18.71 18.541 18.186 17.83 17.433 17.219 16.509 16.538 16.288 16.007 15.382 15.054 14.689 14.278 13.81 13.297 12.679 10.888 -9 ,28104 ,TETRA ,17604996,Sun Nov 28 18:22:41 CET,Sun Nov 28 20:40:54 CET,0.0 2.375 3.076 3.561 3.997 4.388 4.742 5.076 5.676 5.951 6.203 6.154 6.904 7.142 7.578 7.949 8.297 8.482 8.834 9.161 9.648 9.973 10.278 10.723 11.163 11.593 12.006 12.396 12.895 13.358 13.783 14.248 14.667 15.076 15.546 16.097 16.602 17.118 17.714 18.326 18.927 19.583 20.279 21.005 21.902 22.819 23.822 24.977 26.337 27.894 29.59 30.704 31.066 31.206 31.227 31.112 30.93 30.756 30.57 30.337 30.095 29.848 29.601 29.355 29.121 28.898 28.641 28.374 28.111 27.853 27.615 27.393 27.126 26.86 26.618 26.353 26.093 25.803 25.511 25.296 25.052 24.666 24.383 24.071 23.908 23.557 23.187 22.793 22.581 21.875 21.908 21.663 21.406 20.789 20.453 20.104 19.713 19.289 18.728 18.007 15.772 -10 ,24153 ,TETRA ,17604997,Sun Nov 28 18:22:41 CET,Sun Nov 28 20:41:44 CET,0.0 1.58 2.288 2.788 3.209 3.587 3.948 4.287 4.845 5.095 5.353 5.34 6.096 6.315 6.735 7.127 7.5 7.674 7.965 8.258 8.718 8.989 9.227 9.59 9.999 10.382 10.708 11.013 11.415 11.835 12.253 12.69 13.071 13.453 13.914 14.455 14.917 15.399 15.948 16.507 17.084 17.73 18.485 19.241 20.037 20.916 21.926 23.04 24.318 25.724 27.16 27.926 28.202 28.211 28.053 27.804 27.522 27.212 26.907 26.592 26.27 25.936 25.528 25.13 24.78 24.447 24.105 23.776 23.497 23.215 22.864 22.552 22.263 21.956 21.705 21.406 21.02 20.643 20.311 20.079 19.861 19.51 19.242 18.955 18.807 18.501 18.156 17.773 17.56 16.85 16.894 16.663 16.403 15.814 15.488 15.132 14.747 14.319 13.829 13.184 11.291 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23475.txt deleted file mode 100644 index 1423649d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31241 ,TETRA ,17604998,Sun Nov 28 18:22:41 CET,Sun Nov 28 20:41:41 CET,0.0 1.388 2.034 2.53 2.991 3.427 3.82 4.195 4.883 5.198 5.506 5.529 6.346 6.608 7.112 7.583 8.03 8.235 8.63 9.035 9.622 9.997 10.343 10.836 11.341 11.821 12.304 12.767 13.312 13.845 14.354 14.955 15.579 16.189 16.866 17.655 18.404 19.21 20.111 21.112 22.158 23.336 24.773 26.249 28.003 30.014 32.387 35.142 38.539 42.772 48.014 52.54 55.349 57.261 58.55 59.414 60.009 60.435 60.689 60.845 60.892 60.85 60.812 60.744 60.6 60.477 60.37 60.239 60.104 59.966 59.805 59.637 59.454 59.262 59.086 58.865 58.619 58.376 58.121 57.93 57.746 57.449 57.2 56.873 56.697 56.354 55.965 55.549 55.334 54.606 54.56 54.285 53.957 53.224 52.807 52.291 51.739 51.118 50.335 49.236 46.083 -2 ,18933 ,TETRA ,17604999,Sun Nov 28 18:22:42 CET,Sun Nov 28 20:42:07 CET,0.0 1.28 1.972 2.498 2.934 3.337 3.728 4.094 4.756 5.07 5.369 5.384 6.183 6.435 6.923 7.386 7.843 8.061 8.474 8.865 9.397 9.774 10.151 10.68 11.233 11.76 12.247 12.746 13.35 13.869 14.387 15.048 15.721 16.378 17.117 17.912 18.684 19.523 20.422 21.421 22.482 23.688 25.155 26.662 28.412 30.402 32.767 35.584 39.069 43.288 48.539 53.053 55.675 57.38 58.52 59.249 59.776 60.204 60.474 60.67 60.802 60.84 60.804 60.719 60.607 60.508 60.375 60.238 60.117 59.982 59.793 59.596 59.391 59.172 58.99 58.79 58.569 58.313 58.046 57.854 57.649 57.341 57.11 56.791 56.607 56.209 55.754 55.279 55.043 54.324 54.243 53.927 53.625 52.976 52.575 52.106 51.571 50.955 50.263 49.284 45.268 -3 ,7790 ,TETRA ,17605000,Sun Nov 28 18:22:41 CET,Sun Nov 28 20:42:12 CET,0.0 1.261 1.92 2.461 2.957 3.403 3.789 4.156 4.848 5.167 5.481 5.513 6.329 6.581 7.061 7.512 7.918 8.134 8.587 8.996 9.574 9.945 10.287 10.81 11.315 11.759 12.181 12.611 13.202 13.796 14.35 14.998 15.635 16.227 16.927 17.715 18.466 19.306 20.221 21.239 22.356 23.599 25.022 26.466 28.176 30.114 32.404 35.093 38.374 42.483 47.67 52.153 54.862 56.59 57.8 58.678 59.286 59.716 59.977 60.179 60.27 60.269 60.252 60.232 60.214 60.155 60.055 59.954 59.861 59.742 59.547 59.372 59.225 59.041 58.873 58.654 58.425 58.191 57.917 57.729 57.512 57.148 56.894 56.624 56.48 56.17 55.791 55.36 55.152 54.446 54.45 54.171 53.886 53.254 52.838 52.414 51.947 51.346 50.584 49.542 46.127 -4 ,19677 ,TETRA ,17605001,Sun Nov 28 18:22:43 CET,Sun Nov 28 20:42:40 CET,0.0 1.745 2.566 3.189 3.692 4.142 4.554 4.92 5.601 5.928 6.239 6.284 7.121 7.39 7.875 8.33 8.774 8.99 9.417 9.842 10.446 10.836 11.187 11.648 12.102 12.571 13.021 13.429 14.013 14.586 15.119 15.75 16.34 16.955 17.681 18.474 19.212 20.03 20.972 21.948 22.982 24.205 25.655 27.154 28.918 30.923 33.28 35.989 39.35 43.398 48.485 52.907 55.555 57.284 58.451 59.274 59.832 60.235 60.495 60.664 60.737 60.729 60.675 60.608 60.508 60.367 60.209 60.068 59.941 59.801 59.626 59.453 59.263 59.037 58.773 58.45 58.117 57.764 57.391 57.145 56.899 56.455 56.137 55.831 55.67 55.318 54.93 54.501 54.263 53.526 53.48 53.224 52.937 52.234 51.846 51.433 50.971 50.42 49.781 48.875 45.236 -5 ,2584 ,TETRA ,17605002,Sun Nov 28 18:22:46 CET,Sun Nov 28 20:42:41 CET,0.0 2.089 2.872 3.529 4.065 4.509 4.902 5.259 5.946 6.253 6.551 6.591 7.4 7.663 8.167 8.589 9.03 9.267 9.714 10.144 10.746 11.131 11.491 11.992 12.499 12.983 13.433 13.867 14.436 14.988 15.531 16.205 16.842 17.449 18.16 18.996 19.802 20.66 21.597 22.599 23.654 24.852 26.27 27.746 29.508 31.523 33.949 36.724 40.12 44.362 49.595 54.089 56.874 58.701 59.897 60.74 61.31 61.687 61.922 62.089 62.159 62.155 62.139 62.115 62.072 61.999 61.88 61.764 61.641 61.467 61.284 61.121 60.914 60.653 60.443 60.2 59.904 59.607 59.294 59.068 58.847 58.471 58.137 57.779 57.604 57.203 56.738 56.223 55.952 55.172 55.043 54.703 54.331 53.525 53.069 52.599 52.101 51.535 50.818 49.781 44.565 -6 ,2397 ,TETRA ,17605003,Sun Nov 28 18:22:41 CET,Sun Nov 28 20:42:20 CET,0.0 1.569 2.262 2.799 3.27 3.679 4.059 4.435 5.113 5.419 5.715 5.722 6.519 6.777 7.279 7.756 8.228 8.455 8.892 9.33 9.928 10.271 10.612 11.142 11.682 12.18 12.62 13.038 13.611 14.171 14.696 15.325 15.949 16.575 17.26 18.012 18.747 19.567 20.487 21.497 22.558 23.757 25.177 26.654 28.406 30.409 32.756 35.467 38.783 42.802 47.938 52.409 55.154 56.949 58.084 58.874 59.424 59.786 60.036 60.25 60.362 60.378 60.368 60.347 60.272 60.145 59.991 59.867 59.747 59.584 59.384 59.203 59.012 58.809 58.634 58.432 58.203 57.941 57.654 57.449 57.228 56.827 56.522 56.16 55.957 55.56 55.093 54.584 54.327 53.578 53.534 53.272 52.961 52.25 51.845 51.39 50.886 50.269 49.496 48.54 44.257 -7 ,13456 ,TETRA ,17605004,Sun Nov 28 18:22:41 CET,Sun Nov 28 20:43:29 CET,0.0 1.091 1.729 2.273 2.756 3.189 3.576 3.925 4.576 4.89 5.192 5.237 6.064 6.334 6.838 7.341 7.815 8.037 8.474 8.918 9.547 9.917 10.261 10.735 11.175 11.657 12.166 12.663 13.314 13.932 14.539 15.236 15.835 16.432 17.134 17.901 18.681 19.56 20.48 21.452 22.511 23.758 25.239 26.724 28.499 30.52 32.844 35.53 38.794 42.77 47.658 51.874 54.538 56.29 57.49 58.326 58.902 59.324 59.581 59.745 59.787 59.754 59.715 59.66 59.572 59.449 59.29 59.137 58.993 58.831 58.646 58.444 58.207 57.987 57.804 57.605 57.396 57.131 56.765 56.475 56.212 55.853 55.603 55.333 55.175 54.802 54.404 53.993 53.771 53.033 52.939 52.653 52.366 51.597 51.169 50.742 50.246 49.709 49.082 48.174 43.436 -8 ,13370 ,TETRA ,17605005,Sun Nov 28 18:22:42 CET,Sun Nov 28 20:43:33 CET,0.0 1.386 2.018 2.532 3.02 3.476 3.869 4.221 4.883 5.192 5.483 5.53 6.357 6.619 7.125 7.637 8.109 8.336 8.784 9.202 9.785 10.131 10.455 10.935 11.428 11.969 12.499 12.964 13.514 14.026 14.529 15.167 15.772 16.347 17.041 17.845 18.648 19.546 20.539 21.6 22.692 23.945 25.441 26.975 28.794 30.844 33.205 35.937 39.264 43.241 48.36 52.76 55.386 57.139 58.254 59.084 59.617 59.91 60.08 60.185 60.199 60.168 60.112 60.02 59.897 59.751 59.58 59.407 59.254 59.091 58.894 58.696 58.462 58.211 58.01 57.799 57.544 57.231 56.909 56.691 56.428 55.982 55.701 55.349 55.146 54.744 54.327 53.875 53.632 52.891 52.759 52.453 52.126 51.341 50.869 50.333 49.782 49.117 48.188 47.054 42.622 -9 ,4932 ,TETRA ,17605006,Sun Nov 28 18:22:41 CET,Sun Nov 28 20:37:15 CET,0.0 1.235 1.919 2.485 2.948 3.366 3.744 4.096 4.736 5.042 5.339 5.325 6.133 6.382 6.862 7.313 7.767 7.993 8.428 8.859 9.48 9.847 10.183 10.658 11.1 11.563 12.05 12.489 13.016 13.563 14.122 14.759 15.358 15.96 16.649 17.43 18.206 19.054 19.983 20.983 22.041 23.263 24.752 26.266 27.987 29.921 32.232 34.932 38.216 42.289 47.659 52.291 55.07 56.924 58.165 59.031 59.562 59.898 60.1 60.239 60.327 60.358 60.322 60.218 60.111 60.001 59.859 59.717 59.565 59.39 59.213 59.04 58.812 58.589 58.395 58.144 57.873 57.596 57.304 57.057 56.777 56.326 56.009 55.691 55.523 55.207 54.866 54.429 54.211 53.501 53.501 53.259 52.962 52.259 51.875 51.455 50.964 50.388 49.626 48.604 44.937 -10 ,2204 ,TETRA ,17605007,Sun Nov 28 18:22:43 CET,Sun Nov 28 20:36:00 CET,0.0 1.297 1.97 2.501 2.981 3.41 3.81 4.179 4.839 5.15 5.455 5.488 6.307 6.575 7.092 7.551 7.982 8.193 8.6 9.004 9.589 9.948 10.314 10.842 11.354 11.884 12.359 12.776 13.325 13.875 14.383 15.002 15.612 16.186 16.873 17.659 18.4 19.242 20.174 21.151 22.19 23.39 24.83 26.334 28.125 30.162 32.546 35.278 38.642 42.804 47.954 52.372 55.135 56.919 58.113 59.023 59.657 60.045 60.28 60.459 60.533 60.529 60.445 60.348 60.258 60.118 59.93 59.761 59.605 59.403 59.171 58.993 58.805 58.589 58.401 58.184 57.976 57.766 57.505 57.296 57.084 56.729 56.441 56.135 55.957 55.526 55.085 54.677 54.47 53.749 53.674 53.373 53.078 52.386 51.996 51.584 51.095 50.546 49.836 48.716 44.132 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23476.txt deleted file mode 100644 index 64d8c450..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15819 ,TETRA ,17605008,Sun Nov 28 18:22:41 CET,Sun Nov 28 20:44:55 CET,0.0 2.239 3.166 3.888 4.472 4.952 5.384 5.795 6.554 6.904 7.255 7.368 8.232 8.523 9.076 9.597 10.109 10.362 10.834 11.291 11.957 12.396 12.831 13.452 14.015 14.547 15.041 15.537 16.244 16.9 17.529 18.329 19.052 19.727 20.537 21.454 22.33 23.236 24.217 25.277 26.387 27.691 29.209 30.717 32.556 34.658 37.082 39.847 43.134 47.14 52.247 56.736 59.404 61.083 62.231 62.985 63.445 63.77 63.985 64.122 64.132 64.022 63.889 63.779 63.657 63.542 63.341 63.122 62.972 62.72 62.407 62.209 62.008 61.758 61.541 61.319 61.095 60.795 60.459 60.241 59.99 59.562 59.249 58.931 58.786 58.501 58.182 57.801 57.582 56.867 56.896 56.645 56.363 55.708 55.352 54.974 54.555 54.063 53.444 52.571 48.242 -2 ,5892 ,TETRA ,17605009,Sun Nov 28 18:22:42 CET,Sun Nov 28 20:44:26 CET,0.0 1.762 2.49 3.064 3.602 4.121 4.599 5.052 5.865 6.235 6.577 6.675 7.517 7.797 8.376 8.931 9.441 9.678 10.146 10.635 11.338 11.796 12.217 12.767 13.263 13.735 14.191 14.648 15.229 15.75 16.301 16.993 17.61 18.283 19.175 20.123 20.947 21.842 22.835 23.89 24.986 26.245 27.714 29.245 31.087 33.18 35.637 38.459 41.912 45.95 50.931 55.351 58.09 59.863 61.016 61.838 62.394 62.785 63.016 63.159 63.222 63.213 63.166 63.092 62.997 62.871 62.68 62.487 62.313 62.129 61.922 61.744 61.542 61.284 61.085 60.878 60.642 60.415 60.162 59.931 59.69 59.326 59.037 58.729 58.584 58.257 57.867 57.441 57.216 56.513 56.577 56.366 56.123 55.547 55.21 54.829 54.417 53.883 53.249 52.397 48.992 -3 ,2051 ,TETRA ,17605010,Sun Nov 28 18:22:44 CET,Sun Nov 28 20:43:29 CET,0.0 1.763 2.559 3.218 3.77 4.219 4.647 5.056 5.815 6.159 6.477 6.556 7.391 7.687 8.291 8.861 9.379 9.633 10.137 10.6 11.208 11.583 11.984 12.582 13.124 13.658 14.192 14.721 15.394 15.972 16.509 17.164 17.876 18.605 19.372 20.208 21.015 21.918 22.91 23.986 25.118 26.372 27.859 29.372 31.152 33.222 35.619 38.391 41.781 45.712 50.61 55.124 57.924 59.626 60.754 61.559 62.121 62.475 62.662 62.81 62.881 62.875 62.765 62.651 62.592 62.484 62.322 62.172 62.052 61.922 61.764 61.63 61.449 61.245 61.046 60.805 60.573 60.324 60.054 59.863 59.641 59.283 59.046 58.761 58.604 58.291 57.971 57.613 57.417 56.737 56.78 56.531 56.266 55.641 55.286 54.902 54.481 53.98 53.363 52.462 47.328 -4 ,29133 ,TETRA ,17605011,Sun Nov 28 18:22:42 CET,Sun Nov 28 20:45:01 CET,0.0 3.013 3.981 4.742 5.391 5.946 6.433 6.863 7.665 8.052 8.412 8.542 9.433 9.75 10.365 10.959 11.526 11.795 12.312 12.815 13.554 14.01 14.464 15.161 15.742 16.227 16.713 17.211 17.839 18.421 19.006 19.794 20.522 21.222 22.054 22.906 23.736 24.644 25.614 26.686 27.822 29.095 30.613 32.159 33.997 36.093 38.599 41.595 45.187 49.445 54.767 59.323 62.117 63.891 65.073 65.893 66.402 66.721 66.935 67.105 67.208 67.224 67.164 67.099 67.035 66.881 66.678 66.539 66.404 66.182 65.953 65.822 65.682 65.444 65.223 64.98 64.694 64.405 64.094 63.859 63.588 63.159 62.879 62.581 62.421 62.105 61.743 61.321 61.104 60.384 60.422 60.18 59.899 59.255 58.894 58.498 58.034 57.509 56.854 55.881 51.616 -5 ,649 ,TETRA ,17605012,Sun Nov 28 18:22:48 CET,Sun Nov 28 20:45:12 CET,0.0 2.576 3.391 4.024 4.568 5.048 5.493 5.922 6.716 7.071 7.409 7.543 8.414 8.711 9.272 9.798 10.298 10.552 11.037 11.499 12.188 12.596 12.99 13.608 14.179 14.689 15.208 15.701 16.325 16.956 17.584 18.367 19.129 19.827 20.587 21.422 22.19 23.045 23.986 24.997 26.111 27.426 28.939 30.461 32.301 34.379 36.8 39.557 42.809 46.862 51.936 56.147 58.668 60.364 61.499 62.266 62.765 63.102 63.294 63.42 63.463 63.442 63.391 63.299 63.184 63.077 62.947 62.775 62.603 62.433 62.254 62.075 61.867 61.595 61.335 61.039 60.732 60.411 60.047 59.821 59.582 59.126 58.782 58.454 58.3 57.972 57.619 57.215 56.983 56.25 56.228 55.963 55.713 55.163 54.848 54.5 54.086 53.592 53.027 52.214 47.923 -6 ,7522 ,TETRA ,17605013,Sun Nov 28 18:22:44 CET,Sun Nov 28 20:43:57 CET,0.0 2.382 3.217 3.878 4.447 4.946 5.399 5.822 6.621 6.989 7.326 7.411 8.273 8.584 9.164 9.692 10.216 10.47 10.933 11.373 12.015 12.398 12.776 13.38 13.978 14.532 15.054 15.568 16.208 16.784 17.374 18.125 18.819 19.466 20.203 21.047 21.912 22.898 23.933 25.027 26.166 27.418 28.876 30.346 32.107 34.111 36.441 39.175 42.518 46.622 51.834 56.199 58.764 60.537 61.734 62.549 63.093 63.428 63.647 63.759 63.801 63.828 63.808 63.746 63.645 63.539 63.409 63.273 63.114 62.907 62.693 62.519 62.311 62.099 61.94 61.75 61.527 61.285 61.003 60.787 60.525 60.129 59.898 59.617 59.443 59.052 58.645 58.218 57.985 57.271 57.272 57.005 56.718 56.078 55.721 55.342 54.925 54.444 53.904 53.152 50.255 -7 ,9319 ,TETRA ,17605014,Sun Nov 28 18:22:47 CET,Sun Nov 28 20:44:02 CET,0.0 1.587 2.363 3.039 3.651 4.159 4.611 5.04 5.792 6.128 6.451 6.53 7.386 7.674 8.238 8.765 9.269 9.524 10.024 10.501 11.15 11.568 12.004 12.636 13.231 13.813 14.39 14.902 15.505 16.144 16.768 17.435 18.085 18.759 19.548 20.394 21.19 22.085 23.054 24.099 25.188 26.43 27.937 29.521 31.387 33.437 35.838 38.608 42.017 46.276 51.654 56.388 59.195 61.055 62.355 63.228 63.774 64.121 64.355 64.505 64.549 64.544 64.507 64.432 64.345 64.223 64.038 63.872 63.738 63.582 63.377 63.202 63.03 62.801 62.608 62.4 62.163 61.892 61.548 61.281 61.003 60.547 60.207 59.862 59.682 59.286 58.873 58.399 58.139 57.374 57.306 57.02 56.697 55.919 55.52 55.118 54.628 54.048 53.355 52.476 49.277 -8 ,10305 ,TETRA ,17605015,Sun Nov 28 18:22:45 CET,Sun Nov 28 20:43:43 CET,0.0 2.114 2.986 3.705 4.264 4.737 5.167 5.575 6.33 6.673 7.0 7.062 7.913 8.196 8.741 9.278 9.808 10.074 10.57 11.035 11.701 12.123 12.543 13.161 13.757 14.36 14.931 15.433 16.088 16.75 17.369 18.089 18.741 19.364 20.118 21.002 21.874 22.857 23.914 24.994 26.101 27.338 28.774 30.259 32.051 34.123 36.669 39.592 43.038 47.284 52.689 57.242 59.828 61.483 62.561 63.284 63.751 64.049 64.249 64.388 64.437 64.429 64.367 64.262 64.141 63.959 63.726 63.524 63.351 63.18 62.981 62.793 62.523 62.189 61.971 61.764 61.523 61.271 60.976 60.72 60.431 60.013 59.742 59.411 59.237 58.886 58.504 58.103 57.89 57.173 57.171 56.914 56.622 55.986 55.659 55.272 54.801 54.266 53.496 52.331 48.137 -9 ,20571 ,TETRA ,17605016,Sun Nov 28 18:22:47 CET,Sun Nov 28 20:44:14 CET,0.0 3.939 4.929 5.661 6.267 6.777 7.239 7.668 8.419 8.754 9.083 9.186 10.029 10.288 10.811 11.364 11.897 12.15 12.624 13.069 13.726 14.195 14.637 15.221 15.767 16.279 16.792 17.309 17.946 18.557 19.141 19.822 20.499 21.155 21.906 22.75 23.556 24.424 25.385 26.455 27.593 28.909 30.461 32.069 33.943 36.073 38.565 41.334 44.713 48.883 54.031 58.341 60.972 62.72 63.871 64.652 65.182 65.521 65.72 65.876 65.95 65.968 65.965 65.837 65.655 65.517 65.376 65.238 65.092 64.909 64.647 64.428 64.229 64.001 63.802 63.559 63.311 63.017 62.659 62.405 62.123 61.694 61.427 61.1 60.913 60.532 60.111 59.646 59.406 58.67 58.606 58.318 57.998 57.274 56.875 56.405 55.872 55.275 54.449 53.148 49.545 -10 ,10609 ,TETRA ,17605017,Sun Nov 28 18:22:46 CET,Sun Nov 28 20:43:25 CET,0.0 1.685 2.574 3.211 3.736 4.208 4.649 5.08 5.853 6.188 6.505 6.587 7.45 7.752 8.322 8.867 9.373 9.612 10.096 10.538 11.14 11.545 11.972 12.615 13.212 13.791 14.353 14.893 15.591 16.264 16.93 17.668 18.384 19.104 19.868 20.741 21.578 22.494 23.503 24.558 25.667 26.921 28.395 29.935 31.74 33.81 36.231 38.99 42.431 46.629 51.726 55.971 58.664 60.424 61.516 62.247 62.729 63.075 63.284 63.42 63.502 63.527 63.488 63.392 63.28 63.163 63.023 62.881 62.674 62.371 62.12 61.957 61.746 61.515 61.338 61.115 60.834 60.544 60.228 59.978 59.74 59.403 59.139 58.832 58.678 58.354 57.981 57.577 57.365 56.648 56.637 56.372 56.063 55.314 54.915 54.491 54.04 53.535 52.925 52.121 48.97 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23479.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23479.txt deleted file mode 100644 index af35e67a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23479.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12154 ,TETRA ,17605018,Sun Nov 28 18:22:44 CET,Sun Nov 28 20:47:20 CET,0.0 2.035 2.808 3.404 3.899 4.341 4.727 5.084 5.773 6.091 6.373 6.332 7.121 7.344 7.763 8.163 8.55 8.727 9.077 9.414 9.895 10.202 10.494 10.908 11.304 11.664 11.952 12.232 12.647 13.013 13.313 13.669 14.006 14.324 14.654 15.006 15.367 15.745 16.102 16.484 16.883 17.315 17.772 18.198 18.655 19.076 19.442 19.771 20.01 20.044 19.524 18.282 17.013 15.864 14.861 13.914 12.995 12.119 11.367 10.64 9.998 9.38 8.786 8.24 7.73 7.236 6.7 6.206 5.745 5.263 4.782 4.404 4.024 3.581 3.183 2.786 2.419 2.047 1.585 1.225 0.872 0.375 0.024 -0.38 -0.598 -1.065 -1.541 -2.019 -2.282 -3.13 -3.182 -3.487 -3.802 -4.506 -4.903 -5.349 -5.864 -6.429 -7.091 -7.942 -10.113 -2 ,12391 ,TETRA ,17605019,Sun Nov 28 18:22:47 CET,Sun Nov 28 20:47:05 CET,0.0 2.404 3.264 3.881 4.44 4.922 5.354 5.759 6.444 6.744 7.022 6.994 7.78 8.018 8.452 8.83 9.198 9.398 9.766 10.083 10.51 10.775 11.046 11.466 11.85 12.171 12.445 12.709 13.073 13.405 13.722 14.108 14.443 14.745 15.1 15.498 15.86 16.228 16.589 16.95 17.321 17.758 18.227 18.619 19.037 19.44 19.833 20.189 20.394 20.349 19.767 18.612 17.399 16.193 15.061 13.992 13.011 12.09 11.303 10.563 9.912 9.308 8.732 8.171 7.658 7.183 6.632 6.13 5.67 5.194 4.744 4.328 3.858 3.393 3.004 2.581 2.145 1.672 1.178 0.845 0.492 -0.066 -0.432 -0.82 -1.029 -1.476 -1.958 -2.46 -2.734 -3.568 -3.597 -3.909 -4.238 -4.982 -5.413 -5.876 -6.396 -7.005 -7.697 -8.639 -11.614 -3 ,31180 ,TETRA ,17605020,Sun Nov 28 18:22:48 CET,Sun Nov 28 20:47:16 CET,0.0 2.461 3.323 3.983 4.51 4.948 5.341 5.693 6.323 6.617 6.906 6.89 7.687 7.922 8.361 8.79 9.183 9.356 9.689 10.02 10.48 10.783 11.081 11.513 11.895 12.247 12.581 12.874 13.245 13.609 13.928 14.295 14.62 14.931 15.286 15.631 16.009 16.418 16.816 17.224 17.586 17.987 18.431 18.85 19.278 19.668 20.034 20.376 20.618 20.553 19.881 18.691 17.527 16.402 15.332 14.355 13.466 12.604 11.83 11.059 10.401 9.791 9.195 8.631 8.093 7.584 7.057 6.615 6.234 5.806 5.344 4.957 4.543 4.108 3.766 3.373 2.961 2.562 2.12 1.806 1.478 0.943 0.601 0.251 0.06 -0.36 -0.818 -1.285 -1.538 -2.354 -2.358 -2.682 -3.03 -3.738 -4.107 -4.552 -5.045 -5.554 -6.183 -7.017 -9.596 -4 ,23244 ,TETRA ,17605021,Sun Nov 28 18:22:50 CET,Sun Nov 28 20:46:51 CET,0.0 1.965 2.804 3.469 4.005 4.473 4.883 5.237 5.867 6.177 6.477 6.472 7.263 7.516 7.981 8.374 8.747 8.936 9.295 9.629 10.081 10.352 10.608 11.018 11.432 11.779 12.071 12.366 12.723 13.026 13.373 13.792 14.155 14.511 14.907 15.355 15.749 16.138 16.528 16.919 17.332 17.761 18.202 18.638 19.098 19.504 19.913 20.285 20.535 20.533 19.899 18.665 17.459 16.348 15.315 14.286 13.363 12.532 11.797 11.037 10.365 9.784 9.194 8.586 8.037 7.512 6.943 6.458 6.036 5.592 5.134 4.744 4.332 3.885 3.507 3.138 2.798 2.403 1.944 1.653 1.335 0.846 0.531 0.126 -0.08 -0.461 -0.908 -1.382 -1.624 -2.453 -2.517 -2.857 -3.223 -4.018 -4.447 -4.901 -5.413 -6.01 -6.7 -7.606 -10.307 -5 ,3682 ,TETRA ,17605022,Sun Nov 28 18:22:46 CET,Sun Nov 28 20:46:04 CET,0.0 2.076 2.967 3.641 4.172 4.628 5.039 5.434 6.12 6.434 6.735 6.739 7.508 7.746 8.175 8.593 8.981 9.152 9.481 9.805 10.291 10.604 10.871 11.197 11.537 11.865 12.144 12.418 12.75 13.041 13.321 13.655 14.048 14.458 14.876 15.404 15.876 16.299 16.725 17.124 17.52 17.955 18.411 18.824 19.29 19.716 20.123 20.518 20.794 20.819 20.24 19.063 17.859 16.72 15.664 14.644 13.734 12.945 12.229 11.474 10.82 10.226 9.651 9.089 8.571 8.1 7.597 7.152 6.746 6.318 5.82 5.394 4.993 4.577 4.228 3.859 3.502 3.076 2.575 2.229 1.895 1.413 1.045 0.653 0.463 0.05 -0.421 -0.928 -1.188 -2.007 -2.036 -2.35 -2.682 -3.414 -3.828 -4.257 -4.737 -5.283 -5.952 -6.882 -9.568 -6 ,30302 ,TETRA ,17605023,Sun Nov 28 18:23:15 CET,Sun Nov 28 20:47:09 CET,0.0 2.146 2.947 3.579 4.135 4.619 5.043 5.432 6.129 6.429 6.698 6.689 7.477 7.724 8.205 8.614 8.984 9.168 9.518 9.855 10.332 10.607 10.847 11.223 11.598 11.936 12.223 12.494 12.838 13.149 13.441 13.794 14.134 14.439 14.849 15.319 15.661 16.054 16.511 16.935 17.323 17.73 18.167 18.585 19.008 19.392 19.743 20.036 20.213 20.137 19.513 18.298 17.093 15.903 14.776 13.728 12.797 11.933 11.184 10.449 9.805 9.217 8.634 8.073 7.558 7.087 6.574 6.093 5.658 5.204 4.737 4.339 3.928 3.493 3.151 2.809 2.462 2.09 1.614 1.237 0.865 0.35 -0.012 -0.416 -0.607 -1.015 -1.517 -2.051 -2.304 -3.106 -3.128 -3.431 -3.757 -4.453 -4.84 -5.284 -5.792 -6.348 -7.006 -7.894 -10.258 -7 ,15157 ,TETRA ,17605024,Sun Nov 28 18:23:14 CET,Sun Nov 28 20:47:15 CET,0.0 2.128 2.995 3.646 4.187 4.677 5.112 5.495 6.15 6.447 6.744 6.771 7.57 7.828 8.303 8.707 9.095 9.283 9.639 9.961 10.388 10.681 10.977 11.381 11.753 12.113 12.452 12.777 13.158 13.49 13.824 14.217 14.599 14.961 15.344 15.782 16.193 16.581 16.969 17.378 17.799 18.268 18.768 19.231 19.767 20.291 20.781 21.207 21.501 21.563 21.151 20.036 18.816 17.636 16.535 15.532 14.671 13.88 13.14 12.366 11.713 11.134 10.56 10.016 9.499 9.007 8.484 7.997 7.576 7.14 6.679 6.298 5.89 5.455 5.121 4.777 4.418 4.032 3.608 3.32 3.034 2.58 2.258 1.871 1.673 1.268 0.798 0.302 0.038 -0.789 -0.819 -1.141 -1.484 -2.193 -2.58 -3.008 -3.499 -4.059 -4.683 -5.489 -7.9 -8 ,2628 ,TETRA ,17605025,Sun Nov 28 18:23:16 CET,Sun Nov 28 20:48:47 CET,0.0 2.733 3.622 4.293 4.841 5.338 5.749 6.106 6.738 7.026 7.302 7.304 8.074 8.296 8.708 9.069 9.387 9.54 9.849 10.155 10.598 10.878 11.137 11.492 11.835 12.159 12.471 12.781 13.162 13.509 13.85 14.255 14.602 14.904 15.243 15.604 15.938 16.3 16.683 17.088 17.495 17.909 18.369 18.777 19.198 19.645 20.08 20.415 20.631 20.599 20.016 18.844 17.626 16.503 15.462 14.443 13.524 12.724 11.989 11.214 10.542 9.944 9.363 8.788 8.223 7.706 7.178 6.716 6.335 5.927 5.477 5.093 4.631 4.103 3.723 3.318 2.906 2.49 2.016 1.703 1.409 0.921 0.563 0.189 -0.008 -0.421 -0.863 -1.362 -1.622 -2.425 -2.44 -2.736 -3.039 -3.751 -4.152 -4.563 -4.983 -5.486 -6.166 -7.11 -10.52 -9 ,32351 ,TETRA ,17605026,Sun Nov 28 18:23:14 CET,Sun Nov 28 20:39:50 CET,0.0 1.871 2.724 3.369 3.891 4.38 4.817 5.215 5.92 6.235 6.535 6.548 7.343 7.594 8.031 8.388 8.748 8.945 9.301 9.598 10.039 10.356 10.64 10.983 11.317 11.619 11.903 12.188 12.533 12.861 13.194 13.586 13.939 14.246 14.569 14.941 15.318 15.7 16.077 16.47 16.862 17.266 17.698 18.134 18.597 19.043 19.466 19.784 19.99 19.948 19.299 18.199 17.075 15.937 14.892 13.922 13.01 12.15 11.4 10.614 9.913 9.286 8.703 8.158 7.641 7.162 6.632 6.158 5.754 5.322 4.859 4.465 4.051 3.632 3.294 2.867 2.416 1.997 1.547 1.219 0.874 0.362 -0.007 -0.435 -0.655 -1.103 -1.576 -2.07 -2.334 -3.153 -3.16 -3.469 -3.79 -4.502 -4.894 -5.313 -5.785 -6.347 -7.012 -7.841 -10.059 -10 ,30507 ,TETRA ,17605027,Sun Nov 28 18:23:15 CET,Sun Nov 28 20:45:06 CET,0.0 2.1 2.932 3.531 4.067 4.544 4.952 5.334 6.03 6.344 6.656 6.705 7.495 7.728 8.177 8.574 8.953 9.139 9.493 9.836 10.318 10.605 10.859 11.201 11.515 11.849 12.168 12.46 12.84 13.16 13.447 13.83 14.217 14.528 14.863 15.236 15.58 15.952 16.352 16.763 17.167 17.576 17.992 18.396 18.837 19.27 19.664 20.006 20.222 20.153 19.545 18.339 17.144 16.017 14.951 13.961 13.095 12.301 11.585 10.852 10.201 9.6 9.031 8.5 7.995 7.527 7.04 6.572 6.151 5.714 5.234 4.829 4.397 3.943 3.613 3.277 2.929 2.565 2.14 1.836 1.528 1.044 0.717 0.334 0.116 -0.327 -0.763 -1.236 -1.489 -2.289 -2.351 -2.686 -3.033 -3.773 -4.177 -4.631 -5.122 -5.671 -6.341 -7.236 -9.822 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23482.txt deleted file mode 100644 index e87c6dd1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5199 ,TETRA ,17605028,Sun Nov 28 18:23:15 CET,Sun Nov 28 20:47:08 CET,0.0 2.706 3.565 4.17 4.69 5.165 5.582 5.954 6.56 6.816 7.058 6.937 7.67 7.859 8.2 8.5 8.774 8.908 9.152 9.344 9.596 9.772 9.948 10.184 10.389 10.581 10.738 10.822 10.883 10.9 10.928 11.027 11.062 11.007 10.922 10.774 10.597 10.404 10.162 9.842 9.421 8.858 8.113 7.253 6.066 4.547 2.574 -0.076 -3.748 -8.913 -17.002 -25.794 -32.475 -37.869 -42.235 -45.952 -49.095 -51.867 -54.173 -56.409 -58.283 -59.892 -61.391 -62.768 -64.042 -65.198 -66.366 -67.39 -68.284 -69.227 -70.213 -71.1 -72.032 -72.895 -73.558 -74.277 -75.001 -75.721 -76.421 -76.885 -77.387 -78.205 -78.789 -79.414 -79.727 -80.348 -81.011 -81.683 -82.032 -83.047 -83.142 -83.532 -83.968 -84.933 -85.464 -86.049 -86.697 -87.381 -88.158 -89.169 -91.307 -2 ,7755 ,TETRA ,17605029,Sun Nov 28 18:23:15 CET,Sun Nov 28 20:46:21 CET,0.0 1.8 2.578 3.226 3.738 4.154 4.516 4.85 5.45 5.718 5.976 5.876 6.625 6.83 7.172 7.471 7.722 7.82 8.018 8.188 8.446 8.654 8.861 9.092 9.236 9.368 9.522 9.694 9.8 9.838 9.922 10.052 10.138 10.121 10.02 9.881 9.741 9.525 9.241 8.914 8.501 7.948 7.181 6.33 5.207 3.715 1.696 -0.967 -4.665 -9.955 -18.09 -27.151 -34.003 -39.43 -43.895 -47.669 -50.77 -53.449 -55.692 -57.847 -59.656 -61.243 -62.715 -64.115 -65.444 -66.634 -67.875 -68.964 -69.874 -70.823 -71.859 -72.698 -73.563 -74.419 -75.06 -75.74 -76.379 -77.058 -77.84 -78.375 -78.904 -79.708 -80.266 -80.86 -81.155 -81.745 -82.399 -83.094 -83.448 -84.468 -84.651 -85.088 -85.551 -86.526 -87.074 -87.673 -88.284 -88.996 -89.869 -91.015 -94.055 -3 ,21545 ,TETRA ,17605030,Sun Nov 28 18:23:17 CET,Sun Nov 28 20:47:21 CET,0.0 3.588 4.488 5.091 5.605 6.036 6.423 6.776 7.352 7.581 7.772 7.652 8.391 8.567 8.895 9.209 9.5 9.634 9.854 10.055 10.34 10.509 10.681 10.887 11.012 11.112 11.186 11.223 11.332 11.421 11.422 11.389 11.346 11.37 11.375 11.247 11.077 10.861 10.602 10.242 9.745 9.111 8.261 7.274 6.013 4.437 2.342 -0.427 -4.301 -9.771 -18.147 -27.299 -34.212 -39.649 -44.017 -47.718 -50.835 -53.537 -55.758 -57.9 -59.7 -61.272 -62.739 -64.093 -65.33 -66.422 -67.547 -68.58 -69.45 -70.303 -71.199 -71.96 -72.721 -73.556 -74.209 -74.81 -75.409 -76.046 -76.701 -77.174 -77.703 -78.517 -79.053 -79.629 -79.947 -80.586 -81.228 -81.918 -82.268 -83.27 -83.412 -83.821 -84.255 -85.221 -85.748 -86.312 -86.923 -87.615 -88.47 -89.599 -92.206 -4 ,25690 ,TETRA ,17605031,Sun Nov 28 18:23:15 CET,Sun Nov 28 20:47:36 CET,0.0 2.87 3.764 4.403 4.906 5.348 5.724 6.077 6.74 7.015 7.256 7.1 7.826 8.002 8.356 8.697 9.035 9.178 9.425 9.68 10.011 10.201 10.385 10.632 10.832 11.018 11.153 11.255 11.421 11.549 11.6 11.565 11.506 11.434 11.315 11.128 10.936 10.733 10.431 10.003 9.508 8.906 8.111 7.184 5.935 4.348 2.263 -0.481 -4.31 -9.775 -18.04 -26.942 -33.749 -39.23 -43.684 -47.416 -50.552 -53.305 -55.577 -57.787 -59.659 -61.316 -62.856 -64.268 -65.557 -66.69 -67.852 -68.876 -69.754 -70.656 -71.572 -72.327 -73.123 -73.981 -74.652 -75.3 -75.944 -76.601 -77.306 -77.808 -78.323 -79.141 -79.703 -80.322 -80.636 -81.23 -81.869 -82.587 -82.966 -83.985 -84.151 -84.579 -85.033 -86.047 -86.584 -87.132 -87.732 -88.436 -89.272 -90.328 -93.175 -5 ,17594 ,TETRA ,17605032,Sun Nov 28 18:23:16 CET,Sun Nov 28 20:48:22 CET,0.0 2.547 3.471 4.119 4.601 5.047 5.475 5.862 6.502 6.764 7.005 6.898 7.615 7.808 8.19 8.527 8.804 8.928 9.18 9.413 9.71 9.875 10.007 10.222 10.46 10.611 10.678 10.762 10.91 11.038 11.111 11.101 11.046 10.976 10.93 10.977 10.91 10.676 10.416 10.166 9.841 9.354 8.624 7.721 6.495 4.892 2.787 0.012 -3.807 -9.212 -17.57 -26.701 -33.686 -39.303 -43.872 -47.716 -50.909 -53.684 -56.031 -58.331 -60.258 -61.927 -63.497 -64.956 -66.29 -67.493 -68.754 -69.88 -70.825 -71.781 -72.769 -73.56 -74.335 -75.138 -75.751 -76.371 -77.014 -77.68 -78.365 -78.834 -79.303 -80.042 -80.555 -81.067 -81.335 -81.886 -82.438 -82.995 -83.291 -84.25 -84.262 -84.599 -84.96 -85.73 -86.14 -86.588 -87.078 -87.631 -88.3 -89.179 -91.501 -6 ,15082 ,TETRA ,17605033,Sun Nov 28 18:23:16 CET,Sun Nov 28 20:49:39 CET,0.0 2.047 2.747 3.282 3.712 4.12 4.486 4.792 5.349 5.6 5.818 5.64 6.327 6.467 6.717 6.963 7.196 7.299 7.49 7.672 7.92 8.071 8.209 8.329 8.438 8.586 8.714 8.791 8.866 8.952 9.031 9.076 9.018 8.897 8.725 8.514 8.279 7.987 7.599 7.111 6.569 5.888 4.983 3.98 2.693 1.069 -1.09 -3.901 -7.754 -13.167 -21.475 -30.516 -37.26 -42.581 -46.893 -50.551 -53.564 -56.176 -58.395 -60.568 -62.385 -63.967 -65.438 -66.772 -68.02 -69.13 -70.212 -71.178 -72.054 -72.949 -73.84 -74.552 -75.304 -76.085 -76.633 -77.192 -77.791 -78.4 -79.052 -79.546 -80.074 -80.896 -81.456 -82.001 -82.265 -82.835 -83.474 -84.154 -84.506 -85.514 -85.648 -86.036 -86.44 -87.33 -87.81 -88.319 -88.857 -89.414 -90.043 -90.824 -92.286 -7 ,11882 ,TETRA ,17605034,Sun Nov 28 18:23:18 CET,Sun Nov 28 20:49:41 CET,0.0 2.419 3.301 3.941 4.456 4.871 5.242 5.616 6.276 6.545 6.782 6.67 7.406 7.589 7.92 8.219 8.5 8.633 8.875 9.096 9.378 9.543 9.714 9.94 10.122 10.276 10.408 10.531 10.631 10.688 10.739 10.812 10.864 10.857 10.813 10.723 10.574 10.37 10.102 9.774 9.379 8.829 8.122 7.269 6.04 4.499 2.443 -0.337 -4.132 -9.525 -17.886 -26.982 -33.94 -39.506 -43.989 -47.852 -51.118 -53.928 -56.26 -58.478 -60.303 -61.873 -63.334 -64.693 -65.913 -67.0 -68.127 -69.107 -69.936 -70.799 -71.693 -72.42 -73.155 -73.946 -74.562 -75.192 -75.836 -76.477 -77.156 -77.638 -78.149 -78.984 -79.539 -80.121 -80.438 -81.079 -81.715 -82.37 -82.707 -83.689 -83.836 -84.265 -84.724 -85.704 -86.212 -86.721 -87.283 -87.949 -88.721 -89.791 -92.761 -8 ,18081 ,TETRA ,17605035,Sun Nov 28 18:23:20 CET,Sun Nov 28 20:51:34 CET,0.0 2.411 3.29 3.892 4.409 4.851 5.249 5.591 6.149 6.404 6.626 6.466 7.199 7.363 7.684 7.988 8.257 8.372 8.587 8.795 9.075 9.256 9.416 9.62 9.813 9.984 10.127 10.249 10.42 10.541 10.546 10.495 10.436 10.355 10.217 10.009 9.766 9.488 9.206 8.837 8.324 7.701 6.878 5.908 4.627 2.991 0.813 -2.05 -5.91 -11.366 -19.788 -28.823 -35.64 -41.12 -45.479 -49.148 -52.268 -54.962 -57.208 -59.395 -61.222 -62.793 -64.263 -65.634 -66.891 -68.018 -69.178 -70.192 -71.066 -71.974 -72.877 -73.602 -74.354 -75.126 -75.717 -76.358 -77.048 -77.777 -78.535 -79.03 -79.528 -80.275 -80.791 -81.365 -81.664 -82.277 -82.928 -83.625 -83.984 -84.966 -85.12 -85.528 -85.937 -86.818 -87.304 -87.834 -88.452 -89.192 -90.035 -91.117 -93.613 -9 ,10265 ,TETRA ,17605036,Sun Nov 28 18:23:22 CET,Sun Nov 28 20:51:06 CET,0.0 3.251 4.097 4.736 5.281 5.76 6.178 6.539 7.154 7.443 7.708 7.624 8.38 8.584 8.949 9.258 9.549 9.697 9.969 10.208 10.553 10.767 10.973 11.24 11.42 11.547 11.66 11.775 11.927 12.033 12.099 12.239 12.317 12.247 12.136 11.988 11.823 11.619 11.36 11.008 10.562 10.002 9.281 8.449 7.33 5.86 3.855 1.234 -2.332 -7.492 -15.615 -24.371 -31.095 -36.587 -40.992 -44.692 -47.851 -50.638 -52.95 -55.206 -57.115 -58.749 -60.262 -61.66 -62.973 -64.168 -65.38 -66.447 -67.343 -68.242 -69.196 -69.997 -70.806 -71.635 -72.274 -72.94 -73.654 -74.356 -75.039 -75.562 -76.122 -77.008 -77.617 -78.167 -78.443 -79.053 -79.703 -80.392 -80.743 -81.733 -81.872 -82.289 -82.716 -83.624 -84.101 -84.624 -85.213 -85.887 -86.707 -87.715 -90.054 -10 ,12298 ,TETRA ,17605037,Sun Nov 28 18:23:17 CET,Sun Nov 28 20:48:40 CET,0.0 2.698 3.63 4.327 4.958 5.492 5.926 6.332 7.055 7.355 7.614 7.513 8.274 8.486 8.876 9.215 9.518 9.664 9.944 10.224 10.597 10.79 10.95 11.163 11.391 11.583 11.746 11.843 11.947 12.065 12.107 12.11 12.054 11.948 11.777 11.543 11.286 10.968 10.577 10.089 9.52 8.808 7.894 6.858 5.472 3.719 1.436 -1.48 -5.435 -10.998 -19.432 -28.454 -35.138 -40.388 -44.653 -48.275 -51.296 -53.926 -56.1 -58.198 -59.969 -61.494 -62.911 -64.22 -65.425 -66.486 -67.549 -68.483 -69.299 -70.145 -71.02 -71.735 -72.451 -73.235 -73.849 -74.476 -75.123 -75.751 -76.384 -76.847 -77.322 -78.059 -78.597 -79.155 -79.442 -80.038 -80.65 -81.276 -81.595 -82.564 -82.662 -83.042 -83.436 -84.313 -84.794 -85.297 -85.842 -86.436 -87.133 -88.029 -89.75 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23475.txt deleted file mode 100644 index 7b820a68..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18869 ,KEBNE ,17027300,Wed Dec 22 16:50:19 CET,Wed Dec 22 18:49:43 CET,0.0 1.643 2.423 3.052 3.619 4.127 4.601 5.072 5.981 6.41 6.816 6.944 7.942 8.298 8.962 9.624 10.252 10.55 11.155 11.763 12.625 13.149 13.69 14.493 15.274 16.074 16.83 17.549 18.547 19.5 20.36 21.449 22.516 23.552 24.822 26.285 27.681 29.261 31.054 32.995 35.077 37.445 40.307 43.314 46.909 51.023 56.027 62.078 69.551 79.159 92.042 103.983 111.868 117.57 121.878 125.207 127.765 129.807 131.388 132.818 133.922 134.821 135.613 136.29 136.85 137.308 137.737 138.068 138.307 138.514 138.673 138.778 138.831 138.817 138.763 138.688 138.605 138.503 138.376 138.262 138.14 137.941 137.79 137.624 137.529 137.302 137.038 136.738 136.579 135.923 136.026 135.81 135.557 134.979 134.643 134.207 133.67 133.052 132.304 131.271 127.416 -2 ,26615 ,KEBNE ,17027301,Wed Dec 22 16:50:19 CET,Wed Dec 22 18:49:44 CET,0.0 1.742 2.592 3.271 3.872 4.389 4.855 5.313 6.183 6.598 7.006 7.133 8.123 8.48 9.155 9.82 10.486 10.79 11.395 12.002 12.891 13.473 13.998 14.72 15.454 16.199 16.91 17.588 18.496 19.43 20.367 21.542 22.667 23.714 24.937 26.326 27.69 29.215 30.918 32.784 34.8 37.171 40.04 42.989 46.527 50.682 55.724 61.756 69.298 78.874 91.727 103.779 111.759 117.443 121.671 124.975 127.559 129.695 131.324 132.748 133.857 134.771 135.546 136.184 136.706 137.105 137.489 137.784 137.988 138.206 138.393 138.493 138.582 138.65 138.669 138.641 138.592 138.544 138.436 138.315 138.17 137.885 137.663 137.422 137.295 137.012 136.685 136.339 136.135 135.431 135.475 135.196 134.874 134.169 133.716 133.168 132.574 131.905 131.056 129.706 124.497 -3 ,18698 ,KEBNE ,17027302,Wed Dec 22 16:50:23 CET,Wed Dec 22 18:41:26 CET,0.0 2.445 3.297 4.045 4.664 5.221 5.747 6.216 7.099 7.528 7.945 8.086 9.062 9.41 10.087 10.713 11.318 11.631 12.258 12.848 13.699 14.269 14.802 15.549 16.304 17.09 17.861 18.574 19.489 20.406 21.336 22.479 23.541 24.55 25.763 27.173 28.574 30.141 31.873 33.788 35.866 38.228 41.036 43.981 47.528 51.66 56.671 62.653 70.117 79.651 92.462 104.42 112.389 118.084 122.338 125.646 128.158 130.189 131.768 133.185 134.275 135.147 135.911 136.575 137.126 137.577 137.992 138.322 138.57 138.779 138.983 139.11 139.195 139.275 139.305 139.305 139.298 139.289 139.241 139.173 139.071 138.816 138.608 138.412 138.32 138.103 137.833 137.542 137.377 136.708 136.773 136.533 136.252 135.584 135.198 134.677 134.067 133.417 132.581 131.405 125.475 -4 ,25905 ,KEBNE ,17027303,Wed Dec 22 16:50:19 CET,Wed Dec 22 18:49:51 CET,0.0 1.773 2.554 3.215 3.779 4.294 4.814 5.3 6.179 6.593 6.989 7.097 8.103 8.464 9.166 9.865 10.533 10.854 11.489 12.104 12.999 13.587 14.134 14.92 15.701 16.456 17.227 17.986 18.989 19.986 20.952 22.105 23.195 24.272 25.544 27.001 28.399 29.931 31.64 33.547 35.605 37.988 40.839 43.758 47.318 51.491 56.586 62.709 70.297 79.934 92.982 105.252 113.386 119.164 123.381 126.64 129.16 131.212 132.787 134.165 135.22 136.076 136.808 137.459 138.019 138.472 138.894 139.224 139.484 139.71 139.906 140.055 140.195 140.315 140.375 140.432 140.462 140.425 140.327 140.217 140.078 139.83 139.624 139.386 139.282 139.06 138.762 138.408 138.219 137.549 137.6 137.35 137.082 136.43 136.025 135.557 135.028 134.475 133.802 132.792 125.292 -5 ,22705 ,KEBNE ,17027304,Wed Dec 22 16:50:19 CET,Wed Dec 22 18:49:49 CET,0.0 1.812 2.669 3.339 3.945 4.478 4.982 5.476 6.387 6.817 7.232 7.396 8.414 8.783 9.486 10.166 10.824 11.143 11.787 12.429 13.349 13.946 14.54 15.405 16.245 17.05 17.834 18.607 19.62 20.607 21.555 22.722 23.872 24.996 26.337 27.881 29.411 31.103 32.924 34.908 37.073 39.59 42.585 45.67 49.382 53.729 59.086 65.391 73.069 82.825 96.07 108.657 116.913 122.829 127.321 130.75 133.316 135.417 137.035 138.419 139.464 140.326 141.066 141.681 142.197 142.604 142.949 143.201 143.362 143.472 143.565 143.635 143.695 143.74 143.75 143.744 143.711 143.643 143.546 143.482 143.405 143.239 143.111 142.966 142.884 142.698 142.491 142.226 142.084 141.469 141.589 141.388 141.167 140.64 140.324 139.942 139.466 138.869 138.053 136.949 131.844 -6 ,5501 ,KEBNE ,17027305,Wed Dec 22 16:50:19 CET,Wed Dec 22 18:50:20 CET,0.0 2.273 3.293 4.079 4.684 5.279 5.869 6.41 7.423 7.896 8.329 8.498 9.505 9.875 10.587 11.261 11.922 12.246 12.872 13.465 14.354 14.941 15.497 16.315 17.123 17.905 18.666 19.425 20.422 21.38 22.292 23.379 24.433 25.478 26.706 28.086 29.412 30.909 32.595 34.461 36.5 38.876 41.704 44.648 48.248 52.453 57.513 63.467 70.943 80.578 93.415 105.341 113.309 119.042 123.298 126.591 129.101 131.134 132.739 134.164 135.221 136.053 136.834 137.543 138.119 138.569 138.982 139.303 139.511 139.624 139.746 139.865 139.96 140.017 140.023 140.043 140.047 140.001 139.881 139.776 139.657 139.433 139.272 139.1 138.999 138.759 138.475 138.157 137.998 137.357 137.474 137.272 137.008 136.303 135.937 135.546 135.066 134.505 133.763 132.559 128.302 -7 ,22930 ,KEBNE ,17027306,Wed Dec 22 16:50:19 CET,Wed Dec 22 18:50:23 CET,0.0 3.515 4.55 5.269 5.868 6.432 6.966 7.437 8.322 8.738 9.139 9.274 10.269 10.635 11.353 12.039 12.695 13.003 13.619 14.246 15.102 15.627 16.186 16.987 17.76 18.553 19.31 20.041 20.993 21.957 22.908 24.025 25.095 26.147 27.353 28.733 30.141 31.728 33.442 35.32 37.338 39.683 42.541 45.519 49.134 53.308 58.245 64.033 71.411 81.042 94.012 106.273 114.466 120.253 124.436 127.693 130.285 132.365 133.931 135.347 136.486 137.419 138.191 138.81 139.331 139.673 139.939 140.096 140.104 140.103 140.078 140.045 140.029 140.012 139.988 139.977 139.987 139.932 139.792 139.682 139.55 139.293 139.106 138.914 138.816 138.601 138.354 138.057 137.881 137.207 137.304 137.068 136.794 136.139 135.763 135.383 134.948 134.416 133.608 132.298 127.491 -8 ,5659 ,KEBNE ,17027307,Wed Dec 22 16:56:32 CET,Wed Dec 22 18:55:33 CET,0.0 2.28 3.136 3.842 4.456 5.005 5.518 5.989 6.858 7.27 7.674 7.806 8.814 9.181 9.904 10.592 11.227 11.54 12.18 12.814 13.716 14.295 14.874 15.722 16.542 17.352 18.117 18.829 19.749 20.663 21.589 22.703 23.79 24.882 26.168 27.635 29.081 30.675 32.398 34.263 36.289 38.673 41.521 44.466 48.003 52.104 57.146 63.202 70.838 80.65 93.63 105.658 113.728 119.499 123.687 126.983 129.449 131.399 132.985 134.393 135.475 136.334 137.059 137.684 138.206 138.626 138.98 139.262 139.451 139.614 139.757 139.845 139.88 139.829 139.776 139.728 139.697 139.653 139.564 139.47 139.349 139.118 138.933 138.759 138.696 138.516 138.249 138.007 137.868 137.194 137.279 137.061 136.806 136.204 135.863 135.428 134.897 134.291 133.514 132.443 129.17 -9 ,30661 ,KEBNE ,17027308,Wed Dec 22 16:56:32 CET,Wed Dec 22 18:56:13 CET,0.0 1.817 2.658 3.341 3.906 4.408 4.882 5.331 6.203 6.618 7.015 7.12 8.135 8.492 9.191 9.853 10.474 10.775 11.388 12.035 12.989 13.58 14.118 14.928 15.732 16.469 17.18 17.898 18.854 19.763 20.632 21.707 22.765 23.804 25.11 26.693 28.194 29.767 31.449 33.321 35.343 37.67 40.492 43.426 46.972 51.133 56.208 62.21 69.657 79.24 92.135 104.272 112.355 118.193 122.558 125.981 128.652 130.806 132.457 133.895 134.987 135.866 136.618 137.268 137.81 138.249 138.655 138.947 139.152 139.34 139.512 139.66 139.793 139.894 139.941 139.956 139.932 139.809 139.618 139.485 139.331 139.082 138.925 138.784 138.694 138.459 138.235 138.006 137.863 137.205 137.297 137.066 136.818 136.271 135.959 135.577 135.105 134.545 133.846 132.775 128.873 -10 ,22062 ,KEBNE ,17027309,Wed Dec 22 16:56:32 CET,Wed Dec 22 18:55:08 CET,0.0 1.592 2.324 2.964 3.537 4.082 4.613 5.108 6.014 6.436 6.841 6.988 7.99 8.359 9.06 9.706 10.299 10.608 11.227 11.791 12.633 13.199 13.764 14.639 15.448 16.165 16.859 17.535 18.429 19.345 20.253 21.325 22.384 23.459 24.691 26.117 27.522 29.049 30.77 32.657 34.647 36.962 39.813 42.788 46.346 50.492 55.578 61.67 69.115 78.539 91.318 103.353 111.417 117.197 121.424 124.7 127.26 129.286 130.868 132.319 133.392 134.242 134.999 135.633 136.177 136.634 137.028 137.343 137.598 137.75 137.838 137.924 137.974 137.982 137.955 137.947 137.945 137.899 137.792 137.658 137.53 137.361 137.249 137.129 137.05 136.859 136.623 136.349 136.199 135.573 135.664 135.421 135.144 134.503 134.111 133.705 133.294 132.777 132.051 131.061 127.144 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23476.txt deleted file mode 100644 index 6ebfe448..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28732 ,TETRA ,17605038,Sun Nov 28 18:23:21 CET,Sun Nov 28 20:46:09 CET,0.0 2.237 3.269 4.061 4.707 5.28 5.793 6.296 7.285 7.728 8.154 8.341 9.372 9.777 10.558 11.294 11.973 12.302 12.964 13.602 14.475 15.045 15.621 16.477 17.344 18.165 18.908 19.623 20.561 21.479 22.415 23.566 24.668 25.749 27.038 28.525 29.953 31.544 33.327 35.284 37.367 39.772 42.637 45.615 49.21 53.348 58.43 64.472 71.916 81.513 94.553 106.755 114.885 120.707 124.997 128.328 130.888 132.926 134.487 135.896 137.004 137.907 138.675 139.328 139.863 140.258 140.628 140.942 141.096 141.183 141.276 141.356 141.41 141.385 141.358 141.312 141.238 141.198 141.119 141.045 140.972 140.843 140.707 140.504 140.401 140.173 139.917 139.626 139.451 138.763 138.779 138.536 138.29 137.701 137.317 136.885 136.41 135.811 135.056 134.018 129.811 -2 ,20328 ,TETRA ,17605039,Sun Nov 28 18:23:17 CET,Sun Nov 28 20:47:17 CET,0.0 1.402 2.167 2.86 3.502 4.083 4.616 5.13 6.1 6.547 6.985 7.176 8.216 8.588 9.324 10.047 10.726 11.051 11.711 12.378 13.336 13.936 14.505 15.34 16.145 16.908 17.652 18.424 19.431 20.351 21.254 22.389 23.5 24.567 25.819 27.282 28.707 30.279 32.007 33.895 35.948 38.357 41.258 44.283 47.95 52.22 57.41 63.535 71.159 80.942 94.089 106.336 114.515 120.42 124.814 128.25 130.912 133.064 134.697 136.155 137.3 138.23 139.021 139.708 140.312 140.802 141.248 141.516 141.702 141.908 142.082 142.144 142.153 142.219 142.247 142.243 142.232 142.167 142.037 141.92 141.806 141.615 141.446 141.232 141.109 140.861 140.566 140.235 140.078 139.411 139.498 139.265 139.003 138.396 138.056 137.674 137.192 136.592 135.868 134.852 130.698 -3 ,26323 ,TETRA ,17605040,Sun Nov 28 18:23:19 CET,Sun Nov 28 20:47:03 CET,0.0 4.624 5.657 6.451 7.138 7.771 8.399 8.992 9.998 10.477 10.948 11.186 12.238 12.648 13.437 14.172 14.879 15.234 15.915 16.562 17.498 18.076 18.615 19.414 20.208 20.982 21.755 22.516 23.498 24.446 25.39 26.552 27.669 28.753 30.016 31.49 32.923 34.502 36.237 38.107 40.138 42.482 45.328 48.35 52.052 56.402 61.616 67.781 75.441 85.076 97.958 110.126 118.267 124.033 128.273 131.644 134.294 136.404 138.041 139.538 140.67 141.593 142.395 143.062 143.633 144.112 144.563 144.916 145.185 145.425 145.586 145.635 145.704 145.784 145.818 145.84 145.815 145.756 145.687 145.603 145.494 145.291 145.114 144.918 144.834 144.664 144.409 144.092 143.924 143.261 143.318 143.055 142.746 142.014 141.603 141.166 140.658 140.029 139.298 138.166 131.695 -4 ,22623 ,TETRA ,17605041,Sun Nov 28 18:23:17 CET,Sun Nov 28 20:44:27 CET,0.0 2.378 3.279 4.059 4.738 5.36 5.924 6.429 7.358 7.82 8.279 8.477 9.502 9.887 10.591 11.246 11.889 12.216 12.885 13.526 14.394 14.952 15.518 16.333 17.138 17.938 18.705 19.485 20.506 21.457 22.38 23.49 24.564 25.616 26.905 28.402 29.846 31.457 33.218 35.134 37.203 39.58 42.498 45.523 49.144 53.382 58.503 64.563 72.119 81.655 94.373 106.373 114.312 120.115 124.408 127.672 130.16 132.17 133.738 135.136 136.237 137.137 137.87 138.466 138.969 139.375 139.762 140.076 140.304 140.499 140.682 140.808 140.918 141.021 141.037 141.003 140.966 140.92 140.828 140.71 140.56 140.306 140.109 139.895 139.792 139.555 139.272 138.974 138.812 138.124 138.083 137.799 137.514 136.827 136.424 135.979 135.484 134.871 134.031 133.02 130.173 -5 ,11453 ,TETRA ,17605042,Sun Nov 28 18:23:19 CET,Sun Nov 28 20:45:11 CET,0.0 2.324 3.328 4.127 4.801 5.397 5.95 6.472 7.405 7.841 8.272 8.457 9.492 9.88 10.631 11.372 12.081 12.417 13.084 13.733 14.66 15.255 15.832 16.686 17.529 18.373 19.197 19.98 21.024 22.02 22.952 24.085 25.183 26.262 27.537 28.991 30.409 31.988 33.733 35.644 37.68 40.042 42.929 45.927 49.554 53.775 58.822 64.794 72.285 81.811 94.709 106.966 115.105 120.901 125.108 128.374 130.925 133.003 134.594 135.961 137.03 137.928 138.697 139.336 139.842 140.239 140.624 140.922 141.146 141.353 141.539 141.597 141.56 141.539 141.546 141.55 141.532 141.456 141.333 141.225 141.085 140.854 140.674 140.47 140.367 140.125 139.821 139.506 139.358 138.699 138.734 138.477 138.217 137.651 137.309 136.938 136.539 136.067 135.454 134.522 131.464 -6 ,3679 ,TETRA ,17605043,Sun Nov 28 18:23:18 CET,Sun Nov 28 20:46:10 CET,0.0 2.412 3.35 4.084 4.754 5.373 5.911 6.424 7.393 7.845 8.282 8.457 9.487 9.872 10.61 11.337 12.007 12.335 12.993 13.602 14.443 14.989 15.515 16.318 17.172 18.016 18.795 19.511 20.449 21.407 22.392 23.542 24.612 25.683 26.963 28.431 29.854 31.433 33.171 35.054 37.107 39.469 42.287 45.252 48.855 53.031 58.102 64.132 71.663 81.234 94.016 106.091 114.012 119.692 123.975 127.318 129.859 131.868 133.415 134.818 135.921 136.783 137.512 138.145 138.67 139.091 139.486 139.796 140.036 140.181 140.211 140.202 140.223 140.285 140.304 140.292 140.274 140.203 140.127 140.094 140.032 139.933 139.814 139.576 139.44 139.232 139.04 138.773 138.599 137.952 138.11 137.891 137.652 137.079 136.712 136.319 135.875 135.318 134.647 133.744 128.455 -7 ,1845 ,TETRA ,17605044,Sun Nov 28 18:23:23 CET,Sun Nov 28 20:46:21 CET,0.0 2.554 3.492 4.242 4.902 5.511 6.057 6.575 7.528 7.975 8.414 8.597 9.628 10.01 10.754 11.464 12.146 12.473 13.1 13.693 14.56 15.122 15.66 16.458 17.237 18.009 18.811 19.598 20.58 21.524 22.458 23.632 24.741 25.802 27.051 28.477 29.883 31.472 33.21 35.14 37.264 39.683 42.578 45.578 49.192 53.447 58.572 64.628 72.213 81.725 94.465 106.628 114.843 120.836 125.327 128.797 131.467 133.618 135.263 136.741 137.918 138.847 139.627 140.321 140.93 141.427 141.844 142.149 142.418 142.704 142.962 143.138 143.303 143.442 143.522 143.546 143.504 143.442 143.371 143.319 143.256 143.094 142.977 142.833 142.74 142.567 142.414 142.189 142.018 141.334 141.43 141.213 140.979 140.442 140.105 139.706 139.285 138.746 137.992 137.045 133.276 -9 ,31491 ,TETRA ,17605046,Sun Nov 28 18:23:21 CET,Sun Nov 28 20:47:16 CET,0.0 2.744 3.797 4.605 5.27 5.869 6.442 6.97 7.93 8.386 8.84 9.063 10.108 10.51 11.278 12.008 12.72 13.064 13.745 14.416 15.364 15.95 16.528 17.406 18.257 19.027 19.772 20.535 21.51 22.469 23.406 24.541 25.674 26.755 28.035 29.506 30.934 32.537 34.287 36.192 38.22 40.591 43.471 46.429 50.01 54.229 59.352 65.445 73.009 82.489 95.205 107.046 114.821 120.404 124.53 127.779 130.287 132.308 133.864 135.237 136.297 137.091 137.773 138.402 138.915 139.337 139.759 140.092 140.324 140.505 140.677 140.791 140.861 140.907 140.935 140.964 140.981 140.964 140.902 140.819 140.69 140.448 140.278 140.095 140.002 139.773 139.469 139.12 138.928 138.253 138.328 138.1 137.84 137.257 136.928 136.517 136.021 135.446 134.785 133.842 129.933 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23479.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23479.txt deleted file mode 100644 index 243b1919..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23479.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9279 ,TETRA ,17605048,Sun Nov 28 18:23:19 CET,Sun Nov 28 20:50:31 CET,0.0 2.555 3.559 4.309 4.97 5.538 6.028 6.508 7.419 7.834 8.248 8.358 9.347 9.722 10.463 11.132 11.746 12.045 12.605 13.131 13.936 14.436 14.899 15.587 16.248 16.883 17.54 18.202 19.003 19.74 20.483 21.39 22.221 23.047 24.022 25.111 26.165 27.349 28.646 30.038 31.54 33.28 35.379 37.518 40.048 42.925 46.312 50.327 55.242 61.351 69.299 76.506 81.142 84.285 86.438 88.078 89.326 90.276 90.964 91.547 91.966 92.279 92.535 92.736 92.883 92.987 93.066 93.089 93.061 92.974 92.898 92.841 92.753 92.604 92.393 92.179 92.03 91.873 91.634 91.414 91.193 90.893 90.651 90.367 90.241 90.004 89.732 89.43 89.25 88.503 88.587 88.308 88.012 87.345 86.988 86.583 86.099 85.501 84.805 83.985 81.522 -2 ,18777 ,TETRA ,17605049,Sun Nov 28 18:23:22 CET,Sun Nov 28 20:50:54 CET,0.0 2.53 3.5 4.26 4.894 5.491 6.053 6.552 7.431 7.841 8.23 8.283 9.261 9.609 10.297 10.949 11.561 11.855 12.405 12.939 13.754 14.266 14.765 15.486 16.139 16.769 17.368 17.946 18.745 19.511 20.234 21.122 22.004 22.86 23.805 24.874 25.905 27.029 28.292 29.665 31.123 32.814 34.841 36.953 39.493 42.371 45.762 49.711 54.553 60.652 68.682 75.807 80.341 83.496 85.687 87.301 88.493 89.419 90.073 90.563 90.94 91.247 91.486 91.605 91.66 91.732 91.781 91.816 91.835 91.791 91.648 91.496 91.311 91.088 90.925 90.73 90.524 90.311 90.079 89.928 89.784 89.539 89.312 89.046 88.907 88.639 88.344 87.983 87.773 87.014 87.105 86.858 86.583 85.978 85.646 85.259 84.787 84.231 83.585 82.588 80.04 -3 ,16640 ,TETRA ,17605050,Sun Nov 28 18:23:24 CET,Sun Nov 28 20:47:58 CET,0.0 3.089 4.089 4.835 5.503 6.1 6.647 7.163 8.082 8.494 8.876 8.948 9.944 10.297 10.969 11.613 12.244 12.545 13.144 13.724 14.536 15.058 15.566 16.319 17.016 17.644 18.293 18.933 19.73 20.487 21.203 22.117 23.012 23.881 24.895 26.048 27.153 28.35 29.668 31.073 32.541 34.236 36.244 38.393 41.009 43.904 47.335 51.33 56.268 62.431 70.409 77.624 82.24 85.504 87.813 89.502 90.715 91.619 92.254 92.759 93.176 93.519 93.778 93.961 94.086 94.169 94.23 94.283 94.314 94.294 94.25 94.211 94.089 93.88 93.688 93.502 93.33 93.135 92.9 92.716 92.541 92.232 91.967 91.671 91.51 91.183 90.875 90.507 90.284 89.519 89.547 89.266 88.973 88.351 87.991 87.593 87.172 86.698 86.132 85.236 82.315 -4 ,31506 ,TETRA ,17605051,Sun Nov 28 18:23:19 CET,Sun Nov 28 20:47:39 CET,0.0 1.932 2.813 3.513 4.165 4.761 5.29 5.769 6.695 7.117 7.506 7.592 8.572 8.92 9.591 10.218 10.809 11.109 11.729 12.336 13.177 13.704 14.219 14.952 15.671 16.356 17.026 17.711 18.604 19.425 20.17 21.09 21.987 22.865 23.941 25.12 26.178 27.371 28.727 30.161 31.675 33.412 35.442 37.548 40.134 43.124 46.699 50.908 55.975 62.194 70.067 77.055 81.595 84.72 86.897 88.518 89.686 90.553 91.218 91.792 92.214 92.524 92.737 92.889 92.958 92.918 92.847 92.804 92.76 92.638 92.499 92.427 92.348 92.22 92.081 91.921 91.751 91.536 91.239 91.022 90.798 90.423 90.154 89.879 89.723 89.425 89.138 88.795 88.619 87.886 88.018 87.77 87.496 86.884 86.544 86.171 85.736 85.219 84.57 83.747 80.905 -5 ,24202 ,TETRA ,17605052,Sun Nov 28 18:23:19 CET,Sun Nov 28 20:49:08 CET,0.0 1.99 2.743 3.359 3.89 4.344 4.764 5.153 5.833 6.156 6.472 6.422 7.359 7.649 8.191 8.706 9.2 9.439 9.919 10.398 11.104 11.558 11.983 12.58 13.164 13.738 14.286 14.82 15.511 16.18 16.84 17.713 18.608 19.463 20.458 21.549 22.589 23.78 25.078 26.439 27.9 29.586 31.615 33.736 36.261 39.186 42.705 46.816 51.887 58.293 66.677 74.345 79.343 82.865 85.379 87.298 88.825 90.026 90.921 91.686 92.253 92.724 93.109 93.4 93.637 93.833 93.998 94.126 94.217 94.281 94.301 94.295 94.297 94.286 94.26 94.232 94.207 94.16 94.044 93.946 93.842 93.645 93.517 93.375 93.296 93.119 92.911 92.667 92.529 91.83 91.957 91.727 91.538 91.123 90.877 90.607 90.243 89.827 89.32 88.5 85.109 -6 ,11969 ,TETRA ,17605053,Sun Nov 28 18:23:21 CET,Sun Nov 28 20:48:58 CET,0.0 2.766 3.782 4.569 5.273 5.896 6.468 7.025 8.008 8.445 8.876 9.081 10.117 10.482 11.141 11.744 12.351 12.636 13.191 13.745 14.526 15.044 15.54 16.186 16.826 17.498 18.157 18.788 19.571 20.316 21.058 21.941 22.808 23.671 24.644 25.739 26.811 27.978 29.235 30.61 32.101 33.808 35.844 37.927 40.428 43.32 46.744 50.79 55.725 61.773 69.554 76.635 81.225 84.418 86.713 88.422 89.688 90.673 91.409 92.053 92.517 92.863 93.151 93.383 93.553 93.655 93.719 93.746 93.706 93.642 93.603 93.538 93.399 93.265 93.181 93.042 92.834 92.574 92.346 92.183 91.957 91.577 91.326 91.085 90.947 90.628 90.284 89.903 89.689 88.928 89.014 88.743 88.46 87.805 87.432 87.045 86.631 86.17 85.606 84.732 82.205 -7 ,27334 ,TETRA ,17605054,Sun Nov 28 18:23:45 CET,Sun Nov 28 20:49:45 CET,0.0 3.304 4.46 5.266 5.908 6.483 7.011 7.504 8.424 8.86 9.262 9.365 10.349 10.711 11.426 12.073 12.694 12.998 13.547 14.09 14.917 15.454 15.954 16.682 17.381 18.062 18.752 19.385 20.209 21.027 21.866 22.863 23.816 24.719 25.672 26.786 27.912 29.148 30.486 31.938 33.473 35.216 37.29 39.4 41.968 44.897 48.277 52.31 57.316 63.505 71.525 78.673 83.19 86.269 88.441 90.11 91.371 92.332 93.02 93.624 94.051 94.318 94.504 94.656 94.799 94.906 94.965 94.983 94.995 94.99 94.953 94.912 94.851 94.767 94.691 94.594 94.49 94.351 94.154 94.013 93.83 93.449 93.173 92.929 92.798 92.491 92.176 91.807 91.616 90.859 90.938 90.701 90.413 89.723 89.35 88.941 88.465 87.897 87.231 86.375 84.079 -8 ,30750 ,TETRA ,17605055,Sun Nov 28 18:23:46 CET,Sun Nov 28 20:50:16 CET,0.0 2.345 3.213 3.917 4.538 5.117 5.673 6.189 7.103 7.511 7.884 7.935 8.923 9.265 9.892 10.495 11.119 11.407 11.933 12.452 13.224 13.735 14.228 14.935 15.583 16.221 16.875 17.471 18.227 18.971 19.675 20.501 21.311 22.116 23.077 24.174 25.2 26.331 27.581 28.965 30.459 32.165 34.18 36.223 38.691 41.56 44.933 48.878 53.834 60.084 68.294 75.887 80.834 84.247 86.702 88.592 90.03 91.158 92.008 92.728 93.241 93.643 93.974 94.219 94.406 94.552 94.679 94.775 94.816 94.759 94.633 94.537 94.455 94.353 94.237 94.064 93.882 93.707 93.533 93.407 93.233 92.972 92.773 92.513 92.37 92.07 91.751 91.385 91.186 90.435 90.528 90.268 89.988 89.348 88.992 88.614 88.159 87.618 87.032 86.299 83.891 -9 ,19640 ,TETRA ,17605056,Sun Nov 28 18:23:45 CET,Sun Nov 28 20:48:54 CET,0.0 3.373 4.43 5.257 6.051 6.739 7.303 7.815 8.767 9.189 9.604 9.789 10.805 11.184 11.906 12.564 13.177 13.473 14.068 14.632 15.424 15.92 16.423 17.151 17.85 18.493 19.091 19.711 20.493 21.232 21.953 22.86 23.799 24.692 25.704 26.839 27.922 29.137 30.456 31.869 33.383 35.115 37.128 39.196 41.674 44.527 47.928 51.946 56.87 62.921 70.974 78.247 82.815 85.947 88.172 89.889 91.149 92.071 92.756 93.352 93.791 94.099 94.349 94.551 94.665 94.722 94.768 94.786 94.786 94.71 94.613 94.564 94.436 94.249 94.107 93.958 93.762 93.529 93.272 93.081 92.871 92.527 92.286 92.026 91.908 91.698 91.463 91.154 90.97 90.215 90.265 89.987 89.691 89.045 88.677 88.292 87.878 87.354 86.685 85.7 82.517 -10 ,6141 ,TETRA ,17605057,Sun Nov 28 18:23:45 CET,Sun Nov 28 20:48:54 CET,0.0 3.608 4.674 5.439 6.089 6.62 7.047 7.449 8.178 8.514 8.848 8.855 9.792 10.096 10.679 11.229 11.736 11.979 12.464 12.94 13.644 14.112 14.569 15.233 15.873 16.483 17.087 17.688 18.466 19.217 19.951 20.879 21.789 22.651 23.671 24.833 25.937 27.153 28.508 29.976 31.542 33.329 35.436 37.649 40.329 43.391 47.081 51.454 56.711 63.201 71.587 79.235 84.17 87.505 89.89 91.696 93.066 94.128 94.918 95.609 96.105 96.443 96.639 96.788 96.944 97.036 97.069 97.062 97.038 97.012 96.958 96.896 96.807 96.684 96.58 96.47 96.352 96.22 96.066 95.939 95.804 95.616 95.475 95.306 95.21 95.018 94.821 94.576 94.427 93.716 93.9 93.708 93.495 92.98 92.704 92.414 92.059 91.658 91.165 90.54 88.708 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23483_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23483_23482.txt deleted file mode 100644 index e4be0533..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23483_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5279 ,TETRA ,17605058,Sun Nov 28 18:23:45 CET,Sun Nov 28 20:46:04 CET,0.0 2.068 2.979 3.647 4.183 4.63 5.053 5.461 6.191 6.511 6.815 6.758 7.663 7.921 8.346 8.745 9.158 9.348 9.695 10.026 10.492 10.778 11.04 11.387 11.707 12.011 12.308 12.59 12.914 13.238 13.555 13.919 14.265 14.558 14.889 15.264 15.61 15.973 16.354 16.747 17.133 17.553 17.961 18.269 18.567 18.875 19.103 19.125 18.925 18.266 16.588 14.11 11.965 10.244 8.752 7.326 6.053 4.871 3.82 2.77 1.867 1.049 0.28 -0.441 -1.119 -1.778 -2.469 -3.063 -3.58 -4.114 -4.676 -5.133 -5.654 -6.225 -6.668 -7.158 -7.665 -8.172 -8.763 -9.172 -9.558 -10.194 -10.684 -11.208 -11.475 -11.992 -12.523 -13.134 -13.451 -14.414 -14.512 -14.911 -15.315 -16.213 -16.723 -17.277 -17.928 -18.646 -19.481 -20.73 -24.692 -2 ,113 ,TETRA ,17605059,Sun Nov 28 18:23:47 CET,Sun Nov 28 20:43:50 CET,0.0 2.498 3.428 4.143 4.76 5.283 5.748 6.188 6.909 7.22 7.529 7.479 8.372 8.611 9.012 9.377 9.775 9.979 10.341 10.656 11.077 11.335 11.588 11.943 12.263 12.555 12.824 13.094 13.446 13.758 14.056 14.424 14.743 15.044 15.399 15.761 16.088 16.439 16.799 17.168 17.525 17.917 18.363 18.773 19.161 19.468 19.744 19.85 19.658 19.093 17.655 15.472 13.547 11.812 10.218 8.774 7.492 6.33 5.317 4.271 3.385 2.612 1.841 1.082 0.372 -0.313 -1.034 -1.663 -2.2 -2.755 -3.385 -3.893 -4.389 -4.959 -5.45 -5.971 -6.534 -7.117 -7.702 -8.122 -8.556 -9.198 -9.645 -10.11 -10.344 -10.875 -11.473 -12.074 -12.394 -13.376 -13.461 -13.851 -14.262 -15.107 -15.566 -16.059 -16.643 -17.333 -18.123 -19.123 -22.066 -4 ,477 ,TETRA ,17605061,Sun Nov 28 18:23:47 CET,Sun Nov 28 20:35:23 CET,0.0 2.252 3.146 3.855 4.419 4.905 5.357 5.766 6.479 6.788 7.072 7.011 7.92 8.175 8.652 9.08 9.465 9.663 10.052 10.422 10.949 11.295 11.641 12.106 12.478 12.797 13.098 13.375 13.71 14.012 14.315 14.703 15.082 15.455 15.887 16.33 16.681 17.037 17.413 17.774 18.115 18.499 18.932 19.279 19.604 19.9 20.14 20.268 20.129 19.474 17.957 15.719 13.682 11.953 10.366 8.885 7.575 6.23 4.981 3.731 2.674 1.697 0.748 -0.127 -0.946 -1.686 -2.473 -3.181 -3.821 -4.487 -5.146 -5.713 -6.305 -6.931 -7.434 -7.946 -8.49 -9.056 -9.647 -10.09 -10.553 -11.257 -11.741 -12.269 -12.543 -13.095 -13.665 -14.264 -14.564 -15.513 -15.566 -15.966 -16.364 -17.321 -17.905 -18.502 -19.144 -19.943 -20.918 -22.255 -26.748 -5 ,31140 ,TETRA ,17605062,Sun Nov 28 18:23:45 CET,Sun Nov 28 20:49:31 CET,0.0 1.993 2.9 3.559 4.144 4.646 5.073 5.451 6.12 6.436 6.757 6.709 7.594 7.836 8.304 8.752 9.145 9.326 9.691 10.044 10.546 10.85 11.146 11.59 12.012 12.396 12.72 13.018 13.448 13.883 14.254 14.618 14.945 15.243 15.578 15.948 16.286 16.646 17.034 17.427 17.794 18.184 18.645 19.106 19.567 19.92 20.141 20.22 20.097 19.586 18.105 15.76 13.627 11.761 10.161 8.757 7.483 6.249 5.164 4.123 3.275 2.477 1.67 0.956 0.287 -0.38 -1.063 -1.675 -2.237 -2.811 -3.399 -3.887 -4.434 -5.02 -5.449 -5.911 -6.371 -6.826 -7.346 -7.716 -8.117 -8.803 -9.267 -9.729 -9.982 -10.523 -11.068 -11.605 -11.925 -12.895 -12.98 -13.381 -13.806 -14.701 -15.199 -15.7 -16.288 -17.004 -17.862 -19.126 -25.939 -6 ,10344 ,TETRA ,17605063,Sun Nov 28 18:23:47 CET,Sun Nov 28 20:49:36 CET,0.0 1.871 2.756 3.415 3.95 4.418 4.856 5.27 6.006 6.329 6.624 6.549 7.452 7.695 8.138 8.559 8.972 9.169 9.559 9.94 10.455 10.767 11.062 11.485 11.897 12.27 12.604 12.923 13.334 13.704 14.078 14.486 14.804 15.11 15.434 15.867 16.275 16.604 16.956 17.311 17.633 17.962 18.323 18.65 18.97 19.23 19.383 19.325 19.011 18.342 16.769 14.419 12.123 10.025 8.127 6.391 4.938 3.671 2.584 1.481 0.476 -0.444 -1.317 -2.158 -2.962 -3.743 -4.566 -5.304 -5.971 -6.681 -7.39 -7.948 -8.521 -9.13 -9.624 -10.123 -10.646 -11.221 -11.807 -12.193 -12.596 -13.232 -13.67 -14.143 -14.4 -14.934 -15.479 -16.059 -16.378 -17.359 -17.459 -17.845 -18.252 -19.164 -19.693 -20.277 -20.902 -21.574 -22.367 -23.543 -27.997 -7 ,14703 ,TETRA ,17605064,Sun Nov 28 18:23:47 CET,Sun Nov 28 20:48:49 CET,0.0 1.741 2.61 3.321 3.915 4.391 4.82 5.194 5.891 6.216 6.501 6.366 7.237 7.479 7.947 8.338 8.686 8.846 9.15 9.433 9.824 10.07 10.333 10.744 11.089 11.393 11.685 11.999 12.451 12.898 13.274 13.632 13.952 14.248 14.58 14.94 15.257 15.607 15.973 16.309 16.649 17.018 17.407 17.781 18.141 18.455 18.722 18.869 18.742 18.127 16.712 14.465 12.491 10.732 9.134 7.698 6.404 5.218 4.159 3.07 2.079 1.181 0.308 -0.487 -1.2 -1.866 -2.554 -3.186 -3.723 -4.286 -4.891 -5.395 -5.917 -6.449 -6.866 -7.302 -7.764 -8.259 -8.792 -9.163 -9.539 -10.129 -10.558 -11.01 -11.247 -11.778 -12.356 -12.963 -13.271 -14.23 -14.287 -14.637 -15.024 -15.915 -16.42 -16.956 -17.534 -18.185 -19.085 -20.582 -28.259 -8 ,25729 ,TETRA ,17605065,Sun Nov 28 18:23:49 CET,Sun Nov 28 20:48:54 CET,0.0 1.993 2.808 3.422 3.953 4.407 4.822 5.213 5.895 6.179 6.447 6.355 7.232 7.453 7.859 8.265 8.623 8.785 9.141 9.493 9.894 10.11 10.355 10.738 11.085 11.374 11.607 11.842 12.158 12.455 12.744 13.082 13.39 13.685 14.003 14.3 14.584 14.885 15.188 15.515 15.787 16.036 16.3 16.559 16.81 17.049 17.204 17.15 16.787 15.932 14.199 11.862 9.732 7.945 6.421 4.948 3.642 2.443 1.414 0.408 -0.481 -1.308 -2.102 -2.802 -3.45 -4.085 -4.771 -5.39 -5.921 -6.495 -7.102 -7.569 -8.086 -8.697 -9.182 -9.682 -10.197 -10.721 -11.257 -11.627 -12.039 -12.728 -13.201 -13.671 -13.923 -14.465 -15.018 -15.611 -15.933 -16.902 -16.964 -17.337 -17.743 -18.654 -19.169 -19.739 -20.349 -21.05 -21.917 -23.06 -26.986 -9 ,9255 ,TETRA ,17605066,Sun Nov 28 18:23:51 CET,Sun Nov 28 20:49:50 CET,0.0 2.473 3.337 3.995 4.519 4.955 5.38 5.779 6.451 6.744 7.017 6.91 7.769 7.985 8.398 8.795 9.162 9.336 9.67 9.972 10.381 10.654 10.922 11.29 11.615 11.926 12.236 12.532 12.859 13.171 13.479 13.789 14.07 14.322 14.615 14.914 15.172 15.45 15.759 16.068 16.324 16.566 16.833 17.042 17.223 17.374 17.425 17.304 16.954 16.196 14.483 12.12 9.959 7.994 6.278 4.741 3.382 2.162 1.076 -0.069 -1.074 -1.988 -2.84 -3.611 -4.329 -4.991 -5.697 -6.348 -6.93 -7.519 -8.116 -8.664 -9.278 -9.936 -10.431 -10.925 -11.443 -11.986 -12.543 -12.938 -13.36 -14.014 -14.459 -14.942 -15.204 -15.731 -16.302 -16.889 -17.202 -18.156 -18.194 -18.576 -18.977 -19.834 -20.308 -20.827 -21.43 -22.155 -22.973 -23.969 -27.653 -10 ,3849 ,TETRA ,17605067,Sun Nov 28 18:23:52 CET,Sun Nov 28 20:49:07 CET,0.0 4.819 5.905 6.693 7.376 7.932 8.427 8.874 9.703 10.032 10.281 10.129 10.971 11.196 11.666 12.104 12.479 12.636 12.905 13.156 13.469 13.675 13.893 14.191 14.468 14.749 15.062 15.353 15.684 15.981 16.242 16.619 17.011 17.365 17.752 18.142 18.529 18.997 19.384 19.697 20.048 20.379 20.677 20.943 21.168 21.269 21.268 21.13 20.538 19.322 17.074 14.202 11.765 9.525 7.576 5.858 4.343 2.987 1.835 0.683 -0.336 -1.277 -2.188 -3.016 -3.783 -4.494 -5.228 -5.894 -6.503 -7.131 -7.775 -8.316 -8.857 -9.427 -9.881 -10.359 -10.883 -11.454 -12.046 -12.449 -12.872 -13.544 -14.016 -14.522 -14.786 -15.327 -15.917 -16.538 -16.852 -17.85 -17.952 -18.352 -18.777 -19.666 -20.174 -20.738 -21.363 -22.039 -22.85 -24.047 -28.253 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23484.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23484.txt deleted file mode 100644 index 012e2e62..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23484.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9881 ,TETRA ,17605068,Sun Nov 28 18:23:46 CET,Sun Nov 28 20:58:25 CET,0.0 0.571 0.934 1.248 1.521 1.779 2.015 2.222 2.603 2.781 2.94 2.618 3.395 3.532 3.81 4.112 4.406 4.547 4.802 5.047 5.436 5.681 5.905 6.242 6.563 6.869 7.167 7.454 7.82 8.176 8.53 8.953 9.361 9.754 10.192 10.671 11.134 11.641 12.181 12.778 13.417 14.123 14.914 15.726 16.709 17.812 19.054 20.399 21.925 23.683 25.608 26.846 27.316 27.434 27.331 27.021 26.678 26.374 26.0 25.502 24.962 24.402 23.852 23.4 22.991 22.564 22.136 21.717 21.327 20.933 20.532 20.197 19.844 19.484 19.2 18.883 18.539 18.197 17.859 17.629 17.392 17.025 16.743 16.446 16.295 15.962 15.634 15.299 15.125 14.332 14.586 14.366 14.121 13.625 13.354 13.043 12.713 12.355 11.913 11.349 10.204 -2 ,30438 ,TETRA ,17605069,Sun Nov 28 18:23:48 CET,Sun Nov 28 20:57:44 CET,0.0 0.822 1.215 1.567 1.847 2.1 2.327 2.529 2.918 3.102 3.273 2.959 3.744 3.902 4.188 4.458 4.715 4.84 5.101 5.36 5.71 5.931 6.15 6.481 6.811 7.118 7.418 7.71 8.097 8.491 8.864 9.293 9.689 10.078 10.551 11.099 11.629 12.197 12.77 13.357 14.0 14.75 15.625 16.49 17.45 18.469 19.629 20.929 22.367 23.959 25.711 26.711 26.892 26.721 26.395 25.992 25.569 25.125 24.689 24.153 23.647 23.215 22.798 22.379 21.956 21.536 21.039 20.581 20.177 19.785 19.404 19.052 18.681 18.294 17.982 17.663 17.356 17.028 16.643 16.381 16.112 15.668 15.362 15.043 14.875 14.51 14.137 13.728 13.505 12.672 12.836 12.573 12.302 11.721 11.394 11.04 10.679 10.255 9.78 9.235 7.554 -3 ,4490 ,TETRA ,17605070,Sun Nov 28 18:23:46 CET,Sun Nov 28 20:55:23 CET,0.0 0.612 1.025 1.304 1.562 1.802 1.997 2.195 2.58 2.76 2.937 2.652 3.465 3.636 3.974 4.292 4.572 4.704 4.964 5.214 5.585 5.822 6.049 6.379 6.716 7.039 7.341 7.658 8.077 8.457 8.815 9.244 9.645 10.038 10.512 11.063 11.593 12.154 12.741 13.347 13.998 14.759 15.638 16.506 17.493 18.576 19.793 21.147 22.734 24.562 26.514 27.771 28.193 28.145 27.852 27.479 27.14 26.808 26.457 26.005 25.564 25.13 24.686 24.26 23.798 23.345 22.887 22.458 22.09 21.735 21.393 21.096 20.748 20.35 20.025 19.707 19.391 19.06 18.709 18.472 18.232 17.814 17.498 17.175 17.002 16.638 16.267 15.851 15.637 14.792 14.924 14.659 14.379 13.738 13.368 12.997 12.636 12.212 11.725 11.126 9.693 -4 ,16837 ,TETRA ,17605071,Sun Nov 28 18:23:48 CET,Sun Nov 28 20:57:05 CET,0.0 0.854 1.222 1.562 1.88 2.138 2.381 2.602 3.018 3.214 3.4 3.12 3.927 4.091 4.394 4.682 4.968 5.111 5.381 5.632 5.996 6.238 6.488 6.836 7.155 7.469 7.765 8.049 8.425 8.766 9.099 9.505 9.895 10.271 10.71 11.212 11.7 12.251 12.83 13.428 14.066 14.78 15.617 16.445 17.398 18.427 19.6 20.967 22.521 24.271 26.087 27.211 27.568 27.511 27.325 27.106 26.776 26.343 25.889 25.388 24.93 24.522 24.095 23.672 23.312 22.96 22.562 22.187 21.828 21.432 21.018 20.664 20.286 19.904 19.6 19.274 18.945 18.619 18.288 18.057 17.815 17.41 17.107 16.783 16.617 16.277 15.906 15.523 15.33 14.508 14.708 14.475 14.228 13.7 13.41 13.1 12.751 12.331 11.851 11.176 9.539 -5 ,6637 ,TETRA ,17605072,Sun Nov 28 18:23:48 CET,Sun Nov 28 20:43:26 CET,0.0 0.525 0.906 1.196 1.45 1.704 1.903 2.083 2.428 2.594 2.765 2.464 3.245 3.411 3.715 3.99 4.268 4.406 4.667 4.914 5.261 5.475 5.685 6.016 6.33 6.626 6.942 7.248 7.626 8.005 8.362 8.777 9.177 9.545 9.984 10.473 10.927 11.457 12.038 12.658 13.325 14.066 14.939 15.832 16.872 18.004 19.253 20.618 22.204 24.011 26.042 27.446 27.998 28.112 28.008 27.806 27.56 27.278 26.902 26.425 25.996 25.613 25.249 24.869 24.486 24.123 23.712 23.321 22.958 22.554 22.132 21.799 21.447 21.077 20.784 20.468 20.15 19.82 19.461 19.208 18.943 18.495 18.174 17.858 17.691 17.334 16.962 16.55 16.339 15.484 15.652 15.392 15.121 14.536 14.215 13.829 13.381 12.897 12.347 11.665 10.1 -6 ,4039 ,TETRA ,17605073,Sun Nov 28 18:23:48 CET,Sun Nov 28 20:45:20 CET,0.0 0.797 1.14 1.431 1.673 1.902 2.13 2.338 2.732 2.928 3.114 2.841 3.643 3.81 4.111 4.407 4.698 4.837 5.123 5.395 5.757 5.976 6.195 6.511 6.816 7.133 7.443 7.748 8.151 8.513 8.873 9.325 9.743 10.124 10.588 11.137 11.637 12.178 12.756 13.369 14.022 14.751 15.615 16.499 17.536 18.665 19.975 21.45 23.059 24.783 26.667 27.896 28.269 28.253 28.022 27.656 27.261 26.828 26.412 25.944 25.471 25.036 24.575 24.118 23.687 23.252 22.77 22.34 21.988 21.652 21.265 20.884 20.467 20.052 19.749 19.436 19.107 18.739 18.342 18.073 17.799 17.366 17.044 16.703 16.526 16.147 15.753 15.349 15.141 14.3 14.462 14.208 13.941 13.376 13.068 12.733 12.374 11.978 11.52 10.875 9.094 -7 ,14584 ,TETRA ,17605074,Sun Nov 28 18:23:48 CET,Sun Nov 28 20:45:10 CET,0.0 0.771 1.182 1.542 1.865 2.128 2.369 2.601 2.989 3.163 3.345 3.07 3.848 3.992 4.299 4.62 4.915 5.044 5.296 5.531 5.865 6.089 6.305 6.624 6.935 7.22 7.492 7.76 8.113 8.441 8.758 9.148 9.533 9.919 10.363 10.863 11.363 11.903 12.452 13.055 13.723 14.465 15.345 16.217 17.198 18.252 19.399 20.673 22.116 23.718 25.402 26.3 26.505 26.414 26.09 25.664 25.249 24.81 24.368 23.849 23.365 22.923 22.446 21.928 21.47 21.06 20.591 20.167 19.801 19.419 19.017 18.654 18.264 17.872 17.563 17.243 16.916 16.567 16.201 15.927 15.629 15.19 14.875 14.55 14.376 14.009 13.632 13.21 12.983 12.13 12.304 12.049 11.79 11.197 10.844 10.454 10.012 9.517 8.944 8.223 6.752 -8 ,3196 ,TETRA ,17605075,Sun Nov 28 18:23:50 CET,Sun Nov 28 20:40:53 CET,0.0 0.875 1.274 1.563 1.816 2.063 2.313 2.552 3.022 3.227 3.409 3.094 3.917 4.08 4.381 4.668 4.953 5.099 5.384 5.664 6.05 6.297 6.542 6.888 7.224 7.536 7.821 8.1 8.467 8.827 9.186 9.605 10.005 10.408 10.876 11.385 11.871 12.403 12.982 13.599 14.213 14.884 15.679 16.473 17.394 18.402 19.504 20.706 22.085 23.594 25.087 25.871 26.01 25.852 25.488 25.033 24.581 24.145 23.719 23.21 22.7 22.226 21.753 21.289 20.875 20.479 20.042 19.648 19.304 18.958 18.626 18.311 17.961 17.596 17.312 17.02 16.681 16.311 15.922 15.645 15.36 14.928 14.61 14.279 14.119 13.785 13.425 13.048 12.854 12.006 12.169 11.902 11.621 11.059 10.762 10.428 10.057 9.652 9.172 8.549 7.465 -9 ,5745 ,TETRA ,17605076,Sun Nov 28 18:23:47 CET,Sun Nov 28 20:54:49 CET,0.0 0.528 0.811 1.043 1.257 1.477 1.695 1.901 2.27 2.46 2.642 2.333 3.103 3.244 3.508 3.747 4.014 4.145 4.381 4.612 4.94 5.15 5.368 5.676 5.979 6.286 6.569 6.825 7.173 7.544 7.913 8.351 8.768 9.19 9.67 10.172 10.647 11.161 11.743 12.392 13.054 13.755 14.583 15.457 16.444 17.495 18.683 19.962 21.305 22.867 24.68 25.67 25.785 25.538 25.23 24.835 24.381 23.882 23.409 22.946 22.485 22.014 21.525 21.04 20.6 20.209 19.786 19.415 19.084 18.706 18.293 17.949 17.59 17.195 16.889 16.574 16.237 15.893 15.524 15.26 15.003 14.589 14.29 13.981 13.814 13.429 13.004 12.572 12.342 11.482 11.667 11.432 11.176 10.64 10.337 9.993 9.608 9.152 8.62 7.962 6.795 -10 ,1587 ,TETRA ,17605077,Sun Nov 28 18:23:48 CET,Sun Nov 28 20:54:26 CET,0.0 0.699 1.015 1.267 1.487 1.701 1.93 2.165 2.571 2.763 2.954 2.67 3.47 3.614 3.893 4.159 4.426 4.559 4.812 5.045 5.386 5.618 5.839 6.151 6.471 6.787 7.073 7.362 7.735 8.082 8.427 8.851 9.277 9.685 10.149 10.672 11.188 11.75 12.358 13.015 13.707 14.489 15.338 16.165 17.166 18.288 19.498 20.792 22.258 23.838 25.544 26.611 26.845 26.755 26.561 26.236 25.846 25.438 25.039 24.563 24.107 23.676 23.214 22.739 22.246 21.771 21.292 20.888 20.539 20.167 19.783 19.457 19.115 18.758 18.473 18.177 17.859 17.524 17.182 16.931 16.653 16.244 15.964 15.662 15.512 15.196 14.865 14.506 14.306 13.481 13.65 13.417 13.184 12.666 12.385 12.086 11.732 11.331 10.852 10.277 9.037 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23485.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23485.txt deleted file mode 100644 index 0cd997b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23485.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30829 ,TETRA ,17605078,Sun Nov 28 18:23:48 CET,Sun Nov 28 20:50:29 CET,0.0 2.324 3.079 3.616 4.08 4.516 4.903 5.247 5.829 6.09 6.336 6.163 7.008 7.189 7.561 7.932 8.292 8.463 8.779 9.075 9.49 9.734 9.974 10.36 10.712 11.01 11.285 11.559 11.922 12.266 12.595 12.984 13.316 13.62 13.955 14.314 14.657 15.002 15.365 15.754 16.145 16.559 17.006 17.411 17.834 18.247 18.688 19.115 19.408 19.484 19.213 18.43 17.468 16.517 15.64 14.769 13.95 13.182 12.487 11.809 11.247 10.728 10.216 9.726 9.211 8.718 8.218 7.759 7.345 6.89 6.416 6.037 5.643 5.229 4.907 4.56 4.182 3.802 3.416 3.147 2.874 2.416 2.089 1.778 1.62 1.269 0.885 0.501 0.295 -0.568 -0.41 -0.66 -0.904 -1.419 -1.715 -2.03 -2.359 -2.737 -3.143 -3.612 -4.506 -2 ,5581 ,TETRA ,17605079,Sun Nov 28 18:23:50 CET,Sun Nov 28 20:55:41 CET,0.0 2.201 2.956 3.543 4.049 4.481 4.853 5.206 5.802 6.065 6.313 6.092 6.937 7.142 7.532 7.885 8.212 8.366 8.674 8.988 9.414 9.679 9.931 10.297 10.635 10.939 11.218 11.46 11.779 12.085 12.372 12.741 13.086 13.391 13.714 14.072 14.424 14.779 15.148 15.528 15.906 16.335 16.811 17.23 17.664 18.094 18.553 18.96 19.21 19.332 19.041 18.144 17.15 16.143 15.166 14.275 13.503 12.772 12.135 11.485 10.879 10.307 9.785 9.286 8.78 8.296 7.782 7.347 6.963 6.53 6.096 5.738 5.34 4.942 4.651 4.323 3.955 3.583 3.218 2.957 2.675 2.241 1.932 1.607 1.442 1.118 0.771 0.377 0.166 -0.691 -0.515 -0.782 -1.05 -1.61 -1.923 -2.253 -2.618 -3.028 -3.475 -3.982 -5.027 -3 ,31787 ,TETRA ,17605080,Sun Nov 28 18:23:52 CET,Sun Nov 28 20:55:19 CET,0.0 2.382 3.251 3.871 4.328 4.778 5.204 5.551 6.149 6.401 6.633 6.424 7.294 7.491 7.857 8.218 8.55 8.711 9.024 9.307 9.701 9.959 10.202 10.54 10.855 11.15 11.459 11.755 12.101 12.43 12.752 13.139 13.505 13.845 14.204 14.561 14.919 15.314 15.711 16.106 16.48 16.906 17.385 17.807 18.228 18.638 19.082 19.506 19.842 19.947 19.526 18.63 17.65 16.592 15.526 14.529 13.641 12.81 12.016 11.136 10.38 9.722 9.091 8.504 7.963 7.437 6.88 6.384 5.95 5.488 4.989 4.586 4.185 3.758 3.408 3.044 2.656 2.246 1.837 1.559 1.263 0.789 0.452 0.104 -0.076 -0.453 -0.831 -1.228 -1.436 -2.321 -2.131 -2.381 -2.637 -3.173 -3.474 -3.809 -4.155 -4.538 -4.978 -5.568 -6.574 -4 ,13826 ,TETRA ,17605081,Sun Nov 28 18:23:48 CET,Sun Nov 28 20:55:00 CET,0.0 1.967 2.579 3.064 3.494 3.879 4.238 4.551 5.1 5.379 5.64 5.488 6.31 6.498 6.864 7.22 7.567 7.737 8.055 8.354 8.743 8.982 9.234 9.587 9.924 10.247 10.529 10.796 11.141 11.463 11.793 12.161 12.494 12.826 13.174 13.559 13.939 14.335 14.737 15.15 15.55 15.993 16.471 16.888 17.342 17.806 18.262 18.652 18.997 19.139 18.736 17.761 16.758 15.736 14.61 13.436 12.423 11.587 10.908 10.214 9.586 9.013 8.483 8.011 7.548 7.079 6.55 6.057 5.642 5.24 4.812 4.429 4.049 3.646 3.291 2.924 2.58 2.245 1.875 1.607 1.33 0.886 0.573 0.243 0.076 -0.277 -0.67 -1.064 -1.269 -2.146 -1.955 -2.199 -2.456 -2.996 -3.278 -3.595 -3.97 -4.393 -4.872 -5.421 -6.359 -5 ,29227 ,TETRA ,17605082,Sun Nov 28 18:23:52 CET,Sun Nov 28 20:54:26 CET,0.0 2.511 3.238 3.755 4.198 4.578 4.949 5.304 5.909 6.167 6.413 6.238 7.079 7.282 7.641 7.967 8.278 8.427 8.702 8.954 9.33 9.557 9.764 10.065 10.354 10.627 10.88 11.127 11.428 11.718 12.016 12.365 12.69 12.986 13.318 13.673 13.983 14.329 14.706 15.092 15.477 15.887 16.335 16.756 17.219 17.667 18.097 18.511 18.851 18.996 18.705 17.868 16.916 15.952 15.034 14.17 13.336 12.54 11.815 11.068 10.43 9.854 9.326 8.783 8.243 7.793 7.337 6.92 6.555 6.16 5.711 5.33 4.944 4.518 4.183 3.849 3.511 3.143 2.748 2.464 2.165 1.689 1.348 1.002 0.827 0.461 0.085 -0.287 -0.48 -1.33 -1.108 -1.339 -1.579 -2.066 -2.341 -2.644 -2.96 -3.305 -3.706 -4.189 -5.213 -6 ,1135 ,TETRA ,17605083,Sun Nov 28 18:23:50 CET,Sun Nov 28 20:48:54 CET,0.0 1.906 2.641 3.23 3.698 4.127 4.492 4.82 5.401 5.661 5.907 5.734 6.573 6.752 7.097 7.422 7.733 7.881 8.152 8.411 8.809 9.076 9.321 9.655 9.976 10.29 10.565 10.827 11.174 11.472 11.766 12.142 12.485 12.785 13.109 13.501 13.878 14.239 14.604 14.981 15.378 15.812 16.293 16.746 17.214 17.691 18.178 18.639 19.044 19.212 18.896 18.061 17.114 16.144 15.217 14.312 13.494 12.754 12.108 11.422 10.814 10.275 9.734 9.224 8.76 8.303 7.787 7.336 6.962 6.559 6.135 5.759 5.357 4.931 4.592 4.251 3.91 3.54 3.125 2.842 2.549 2.087 1.769 1.436 1.257 0.893 0.494 0.051 -0.169 -1.045 -0.872 -1.127 -1.389 -1.939 -2.251 -2.599 -2.985 -3.424 -3.941 -4.609 -5.694 -7 ,14920 ,TETRA ,17605084,Sun Nov 28 18:23:49 CET,Sun Nov 28 20:54:39 CET,0.0 2.793 3.598 4.2 4.677 5.073 5.443 5.786 6.443 6.745 7.008 6.832 7.712 7.944 8.438 8.869 9.243 9.42 9.745 10.044 10.478 10.762 11.028 11.397 11.747 12.062 12.335 12.591 12.915 13.235 13.548 13.908 14.252 14.558 14.901 15.277 15.605 15.951 16.304 16.685 17.085 17.476 17.919 18.346 18.806 19.267 19.683 20.05 20.363 20.53 20.244 19.33 18.388 17.425 16.533 15.727 14.958 14.229 13.546 12.843 12.255 11.71 11.139 10.618 10.178 9.756 9.293 8.865 8.492 8.095 7.661 7.273 6.861 6.464 6.165 5.852 5.526 5.189 4.842 4.601 4.353 3.952 3.631 3.265 3.081 2.703 2.312 1.911 1.705 0.85 0.95 0.694 0.42 -0.183 -0.512 -0.887 -1.312 -1.786 -2.33 -2.954 -4.262 -8 ,10586 ,TETRA ,17605085,Sun Nov 28 18:23:52 CET,Sun Nov 28 20:53:59 CET,0.0 2.475 3.225 3.764 4.236 4.623 4.962 5.284 5.934 6.237 6.496 6.306 7.137 7.348 7.729 8.076 8.411 8.565 8.874 9.185 9.605 9.86 10.102 10.446 10.779 11.092 11.377 11.648 12.027 12.371 12.667 13.011 13.337 13.647 13.992 14.377 14.723 15.114 15.529 15.949 16.375 16.806 17.253 17.673 18.149 18.613 19.078 19.542 19.922 20.05 19.703 18.823 17.888 16.915 15.995 15.098 14.229 13.435 12.756 12.079 11.497 10.914 10.309 9.747 9.253 8.804 8.276 7.799 7.405 6.982 6.549 6.182 5.772 5.34 5.003 4.655 4.285 3.91 3.535 3.275 3.011 2.604 2.308 1.964 1.792 1.451 1.076 0.696 0.495 -0.356 -0.166 -0.403 -0.645 -1.153 -1.441 -1.769 -2.126 -2.499 -2.923 -3.466 -4.677 -9 ,29122 ,TETRA ,17605086,Sun Nov 28 18:24:14 CET,Sun Nov 28 20:55:21 CET,0.0 2.336 3.119 3.701 4.168 4.54 4.865 5.205 5.825 6.093 6.342 6.147 6.97 7.169 7.54 7.888 8.2 8.348 8.627 8.904 9.283 9.495 9.718 10.049 10.343 10.616 10.863 11.11 11.418 11.686 11.938 12.248 12.545 12.812 13.139 13.519 13.843 14.172 14.536 14.925 15.29 15.694 16.153 16.584 17.049 17.497 17.935 18.319 18.634 18.755 18.447 17.555 16.52 15.576 14.749 13.953 13.203 12.467 11.853 11.194 10.552 10.005 9.478 8.938 8.472 8.032 7.531 7.074 6.664 6.234 5.759 5.348 4.928 4.504 4.163 3.798 3.429 3.051 2.656 2.382 2.089 1.624 1.299 0.957 0.778 0.424 0.059 -0.328 -0.529 -1.414 -1.22 -1.472 -1.73 -2.287 -2.606 -2.941 -3.312 -3.728 -4.17 -4.769 -5.933 -10 ,16920 ,TETRA ,17605087,Sun Nov 28 18:24:17 CET,Sun Nov 28 20:55:20 CET,0.0 2.458 3.239 3.792 4.253 4.682 5.055 5.364 5.931 6.199 6.446 6.271 7.115 7.314 7.658 7.968 8.278 8.424 8.72 9.016 9.424 9.673 9.912 10.271 10.602 10.91 11.191 11.451 11.778 12.095 12.399 12.733 13.051 13.345 13.681 14.058 14.408 14.793 15.183 15.579 16.003 16.445 16.909 17.357 17.856 18.332 18.775 19.162 19.435 19.524 19.219 18.367 17.355 16.376 15.49 14.651 13.877 13.149 12.509 11.858 11.284 10.744 10.205 9.722 9.271 8.834 8.371 7.941 7.55 7.126 6.694 6.347 5.964 5.545 5.232 4.926 4.581 4.209 3.838 3.578 3.316 2.898 2.59 2.257 2.092 1.767 1.421 1.07 0.884 0.047 0.26 0.041 -0.195 -0.701 -0.969 -1.264 -1.581 -1.926 -2.325 -2.874 -4.004 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt deleted file mode 100644 index 67186b11..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31086 ,TETRA ,17605088,Sun Nov 28 18:24:19 CET,Sun Nov 28 20:13:53 CET,0.0 1.535 2.239 2.788 3.243 3.667 4.053 4.404 5.042 5.316 5.572 5.611 6.36 6.592 7.016 7.432 7.832 8.027 8.379 8.694 9.135 9.43 9.712 10.102 10.469 10.837 11.194 11.527 11.984 12.398 12.762 13.187 13.666 14.249 14.879 15.418 15.884 16.357 16.842 17.377 17.942 18.558 19.196 19.781 20.469 21.156 21.818 22.454 23.014 23.407 23.35 22.599 21.569 20.436 19.401 18.428 17.534 16.569 15.643 14.733 13.935 13.247 12.595 11.92 11.236 10.58 9.895 9.266 8.706 8.13 7.516 6.985 6.378 5.735 5.266 4.774 4.234 3.664 3.063 2.626 2.168 1.469 0.983 0.458 0.175 -0.382 -0.978 -1.659 -2.007 -2.863 -3.19 -3.635 -4.092 -5.117 -5.711 -6.37 -7.145 -8.038 -9.115 -10.559 -19.258 -2 ,14367 ,TETRA ,17605089,Sun Nov 28 18:24:15 CET,Sun Nov 28 20:18:20 CET,0.0 2.22 2.985 3.571 4.031 4.436 4.829 5.188 5.841 6.148 6.448 6.54 7.311 7.584 8.077 8.53 8.939 9.131 9.566 9.998 10.54 10.88 11.208 11.668 12.126 12.568 13.001 13.404 13.887 14.337 14.744 15.234 15.725 16.182 16.674 17.205 17.723 18.284 18.851 19.432 20.009 20.623 21.289 21.913 22.623 23.324 24.001 24.66 25.318 25.825 25.745 25.017 24.057 23.075 22.141 21.183 20.276 19.423 18.673 17.9 17.162 16.458 15.786 15.134 14.496 13.909 13.302 12.764 12.279 11.721 11.091 10.539 9.969 9.385 8.945 8.48 7.971 7.449 6.917 6.55 6.161 5.543 5.12 4.652 4.394 3.874 3.336 2.763 2.449 1.633 1.476 1.117 0.728 -0.159 -0.681 -1.268 -1.919 -2.667 -3.529 -4.707 -13.966 -3 ,19846 ,TETRA ,17605090,Sun Nov 28 18:24:18 CET,Sun Nov 28 20:18:24 CET,0.0 1.929 2.644 3.244 3.815 4.309 4.772 5.183 5.922 6.257 6.565 6.634 7.407 7.677 8.161 8.615 9.065 9.282 9.682 10.052 10.579 10.922 11.248 11.672 12.07 12.478 12.846 13.216 13.726 14.17 14.602 15.135 15.588 15.98 16.459 17.004 17.521 18.052 18.57 19.148 19.747 20.369 21.066 21.701 22.343 23.014 23.71 24.314 24.837 25.237 25.198 24.333 23.292 22.264 21.302 20.36 19.426 18.531 17.747 16.95 16.192 15.448 14.743 14.094 13.454 12.859 12.221 11.657 11.167 10.6 9.965 9.434 8.883 8.282 7.809 7.327 6.831 6.297 5.728 5.344 4.916 4.247 3.793 3.274 3.014 2.495 1.926 1.325 1.01 0.164 -0.096 -0.492 -0.937 -1.916 -2.45 -3.014 -3.681 -4.462 -5.462 -6.928 -13.447 -4 ,20690 ,TETRA ,17605091,Sun Nov 28 18:24:20 CET,Sun Nov 28 20:18:13 CET,0.0 1.985 2.824 3.474 3.965 4.404 4.796 5.146 5.812 6.127 6.417 6.454 7.198 7.429 7.896 8.334 8.749 8.954 9.355 9.737 10.281 10.642 10.982 11.435 11.85 12.229 12.596 12.986 13.489 13.944 14.405 14.951 15.442 15.88 16.359 16.921 17.468 18.054 18.611 19.139 19.689 20.271 20.867 21.464 22.151 22.839 23.527 24.211 24.907 25.438 25.466 24.751 23.777 22.771 21.793 20.854 20.0 19.166 18.418 17.654 16.968 16.309 15.635 14.997 14.41 13.869 13.248 12.667 12.163 11.634 11.05 10.547 10.015 9.417 8.972 8.511 8.002 7.466 6.931 6.561 6.152 5.511 5.06 4.58 4.333 3.818 3.256 2.655 2.334 1.508 1.296 0.927 0.545 -0.336 -0.868 -1.485 -2.134 -2.825 -3.744 -5.166 -12.084 -5 ,14062 ,TETRA ,17605092,Sun Nov 28 18:24:16 CET,Sun Nov 28 20:18:11 CET,0.0 2.39 3.214 3.804 4.278 4.733 5.193 5.594 6.281 6.576 6.852 6.883 7.626 7.864 8.312 8.741 9.153 9.34 9.715 10.084 10.581 10.914 11.258 11.711 12.126 12.579 12.995 13.357 13.841 14.309 14.751 15.275 15.759 16.191 16.669 17.171 17.602 18.097 18.661 19.211 19.732 20.326 21.021 21.679 22.4 23.083 23.715 24.356 24.958 25.35 25.206 24.304 23.187 22.117 21.119 20.092 19.103 18.17 17.284 16.375 15.599 14.881 14.183 13.508 12.856 12.224 11.54 10.928 10.395 9.827 9.233 8.756 8.266 7.719 7.28 6.812 6.317 5.793 5.218 4.834 4.42 3.76 3.323 2.872 2.638 2.154 1.608 0.955 0.607 -0.249 -0.548 -0.94 -1.345 -2.258 -2.775 -3.347 -4.042 -4.871 -5.873 -7.208 -13.821 -6 ,10696 ,TETRA ,17605093,Sun Nov 28 18:24:17 CET,Sun Nov 28 20:17:45 CET,0.0 2.133 2.848 3.441 3.968 4.418 4.816 5.168 5.847 6.189 6.489 6.536 7.289 7.533 7.984 8.397 8.797 8.982 9.325 9.68 10.214 10.54 10.854 11.337 11.837 12.299 12.72 13.126 13.617 14.082 14.505 14.99 15.49 15.963 16.477 17.042 17.594 18.183 18.759 19.325 19.852 20.387 21.024 21.659 22.318 22.966 23.622 24.24 24.782 25.214 25.23 24.559 23.633 22.548 21.459 20.408 19.409 18.434 17.509 16.567 15.785 15.058 14.285 13.545 12.907 12.321 11.687 11.105 10.577 9.982 9.349 8.841 8.302 7.741 7.302 6.825 6.321 5.769 5.17 4.754 4.331 3.675 3.221 2.748 2.495 1.978 1.426 0.749 0.378 -0.46 -0.704 -1.106 -1.539 -2.455 -2.949 -3.481 -4.076 -4.743 -5.627 -6.979 -13.506 -7 ,31395 ,TETRA ,17605094,Sun Nov 28 18:24:19 CET,Sun Nov 28 20:18:16 CET,0.0 2.32 3.297 4.035 4.682 5.209 5.653 6.072 6.812 7.14 7.457 7.593 8.38 8.658 9.191 9.685 10.144 10.351 10.773 11.195 11.78 12.144 12.501 12.992 13.431 13.874 14.283 14.655 15.159 15.622 16.062 16.661 17.217 17.7 18.237 18.788 19.256 19.739 20.253 20.788 21.31 21.871 22.526 23.15 23.796 24.458 25.123 25.745 26.313 26.729 26.746 25.962 25.026 24.087 23.146 22.194 21.273 20.389 19.559 18.688 17.938 17.263 16.579 15.946 15.354 14.784 14.186 13.605 13.073 12.529 11.949 11.456 10.942 10.397 9.982 9.538 9.055 8.557 8.04 7.675 7.254 6.517 6.028 5.553 5.307 4.792 4.225 3.645 3.346 2.534 2.369 1.996 1.607 0.721 0.177 -0.416 -1.082 -1.828 -2.715 -3.965 -14.912 -8 ,19370 ,TETRA ,17605095,Sun Nov 28 18:24:21 CET,Sun Nov 28 20:17:58 CET,0.0 4.09 5.185 5.894 6.52 7.109 7.617 8.042 8.764 9.085 9.405 9.541 10.331 10.641 11.227 11.737 12.177 12.397 12.827 13.203 13.737 14.072 14.401 14.876 15.304 15.7 16.086 16.496 16.996 17.457 17.931 18.461 18.941 19.401 19.891 20.415 20.949 21.507 22.031 22.568 23.158 23.828 24.509 25.135 25.816 26.527 27.325 28.038 28.607 28.991 28.97 28.308 27.321 26.291 25.373 24.445 23.511 22.632 21.867 21.088 20.385 19.686 18.998 18.406 17.832 17.27 16.633 16.063 15.59 15.053 14.462 13.973 13.458 12.917 12.486 12.045 11.583 11.098 10.562 10.159 9.749 9.113 8.656 8.182 7.935 7.425 6.891 6.315 6.003 5.182 4.941 4.534 4.116 3.238 2.727 2.155 1.507 0.69 -0.309 -1.727 -12.312 -9 ,14649 ,TETRA ,17605096,Sun Nov 28 18:24:17 CET,Sun Nov 28 20:17:52 CET,0.0 1.511 2.188 2.761 3.283 3.736 4.121 4.5 5.23 5.536 5.826 5.905 6.672 6.939 7.469 7.966 8.407 8.62 9.03 9.406 9.928 10.26 10.596 11.097 11.564 12.005 12.408 12.791 13.322 13.782 14.179 14.674 15.142 15.596 16.138 16.708 17.209 17.775 18.346 18.925 19.527 20.102 20.739 21.349 21.976 22.628 23.3 23.939 24.542 25.037 25.169 24.594 23.731 22.743 21.766 20.824 19.944 19.112 18.311 17.368 16.502 15.806 15.202 14.585 13.93 13.331 12.751 12.225 11.714 11.165 10.604 10.148 9.665 9.094 8.64 8.162 7.638 7.088 6.528 6.142 5.742 5.081 4.607 4.092 3.819 3.292 2.719 2.089 1.745 0.898 0.672 0.29 -0.126 -1.038 -1.599 -2.216 -2.836 -3.557 -4.474 -5.823 -11.893 -10 ,10911 ,TETRA ,17605097,Sun Nov 28 18:24:20 CET,Sun Nov 28 20:18:10 CET,0.0 1.801 2.532 3.166 3.702 4.217 4.715 5.161 5.942 6.285 6.618 6.73 7.495 7.753 8.27 8.76 9.216 9.438 9.868 10.269 10.854 11.24 11.591 12.059 12.48 12.913 13.341 13.716 14.188 14.668 15.104 15.583 16.058 16.515 17.039 17.586 18.087 18.617 19.136 19.671 20.196 20.787 21.477 22.082 22.731 23.411 24.078 24.699 25.285 25.654 25.611 24.897 23.899 22.888 21.924 20.979 20.114 19.249 18.492 17.729 17.045 16.425 15.779 15.138 14.533 13.992 13.425 12.869 12.358 11.798 11.178 10.655 10.108 9.54 9.093 8.623 8.158 7.674 7.152 6.791 6.401 5.737 5.291 4.83 4.586 4.081 3.524 2.92 2.601 1.778 1.558 1.165 0.754 -0.136 -0.63 -1.171 -1.779 -2.455 -3.278 -4.524 -9.13 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt deleted file mode 100644 index cbb3b499..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28760 ,TETRA ,17605098,Sun Nov 28 18:24:22 CET,Sun Nov 28 20:19:48 CET,0.0 2.816 3.928 4.789 5.458 6.004 6.484 6.928 7.762 8.158 8.532 8.726 9.559 9.878 10.431 10.96 11.469 11.704 12.16 12.604 13.22 13.606 13.979 14.496 14.998 15.497 15.996 16.475 17.025 17.553 18.08 18.735 19.395 19.99 20.596 21.266 21.907 22.623 23.416 24.234 25.062 25.953 27.0 28.039 29.177 30.44 31.863 33.415 35.232 37.198 39.326 40.768 41.315 41.467 41.34 41.054 40.726 40.367 39.97 39.503 39.072 38.644 38.204 37.717 37.218 36.758 36.242 35.788 35.405 34.989 34.565 34.178 33.739 33.29 32.942 32.578 32.179 31.752 31.318 31.013 30.672 30.121 29.753 29.378 29.169 28.731 28.288 27.801 27.519 26.739 26.613 26.279 25.929 25.123 24.679 24.201 23.649 23.004 22.222 21.226 18.057 -2 ,17238 ,TETRA ,17605099,Sun Nov 28 18:24:18 CET,Sun Nov 28 20:19:28 CET,0.0 2.879 3.929 4.746 5.392 5.917 6.349 6.746 7.492 7.846 8.221 8.448 9.256 9.549 10.059 10.569 11.077 11.313 11.769 12.199 12.827 13.229 13.611 14.136 14.631 15.109 15.546 15.956 16.508 17.059 17.607 18.276 18.914 19.488 20.128 20.881 21.602 22.353 23.151 23.959 24.762 25.668 26.733 27.779 28.951 30.235 31.696 33.314 35.062 37.007 39.151 40.604 41.165 41.244 41.147 40.925 40.591 40.189 39.79 39.345 38.935 38.558 38.178 37.768 37.318 36.862 36.416 36.002 35.594 35.207 34.78 34.419 34.039 33.597 33.232 32.841 32.429 32.028 31.621 31.303 30.94 30.396 30.04 29.636 29.421 28.968 28.471 27.933 27.65 26.883 26.754 26.396 26.029 25.264 24.823 24.337 23.781 23.144 22.391 21.461 19.076 -3 ,32099 ,TETRA ,17605100,Sun Nov 28 18:26:15 CET,Sun Nov 28 20:21:36 CET,0.0 2.658 3.708 4.449 5.106 5.686 6.168 6.614 7.424 7.79 8.122 8.274 9.084 9.365 9.888 10.401 10.904 11.136 11.563 11.973 12.56 12.948 13.327 13.855 14.365 14.856 15.303 15.718 16.262 16.798 17.302 17.878 18.441 19.028 19.717 20.453 21.148 21.911 22.701 23.488 24.294 25.198 26.233 27.288 28.474 29.789 31.312 32.896 34.679 36.685 38.793 40.095 40.551 40.605 40.452 40.223 39.936 39.556 39.153 38.69 38.237 37.762 37.257 36.761 36.255 35.782 35.304 34.868 34.5 34.092 33.638 33.277 32.892 32.478 32.126 31.759 31.383 30.975 30.526 30.209 29.873 29.352 29.012 28.628 28.412 27.963 27.483 26.963 26.69 25.916 25.811 25.482 25.115 24.372 23.967 23.512 22.966 22.333 21.582 20.473 16.333 -4 ,9567 ,TETRA ,17605101,Sun Nov 28 18:26:17 CET,Sun Nov 28 20:21:28 CET,0.0 2.023 2.945 3.643 4.243 4.741 5.187 5.638 6.528 6.921 7.297 7.524 8.336 8.627 9.175 9.677 10.146 10.371 10.806 11.216 11.816 12.196 12.546 13.054 13.545 14.016 14.446 14.83 15.36 15.921 16.462 17.081 17.636 18.162 18.806 19.517 20.154 20.849 21.575 22.348 23.158 24.043 25.098 26.116 27.284 28.579 30.002 31.563 33.338 35.268 37.415 38.889 39.455 39.579 39.449 39.187 38.883 38.52 38.113 37.649 37.235 36.82 36.37 35.912 35.477 35.108 34.68 34.263 33.887 33.449 32.991 32.602 32.158 31.695 31.329 30.94 30.543 30.11 29.626 29.302 28.99 28.479 28.108 27.702 27.479 27.027 26.537 26.0 25.721 24.954 24.785 24.421 24.064 23.352 22.962 22.515 21.968 21.3 20.513 19.467 15.924 -5 ,19172 ,TETRA ,17605102,Sun Nov 28 18:26:19 CET,Sun Nov 28 20:21:46 CET,0.0 2.602 3.581 4.376 5.083 5.681 6.193 6.646 7.436 7.787 8.117 8.233 9.025 9.333 9.901 10.419 10.893 11.122 11.573 12.001 12.605 12.988 13.36 13.892 14.389 14.887 15.363 15.802 16.364 16.881 17.385 17.995 18.576 19.122 19.741 20.476 21.162 21.872 22.603 23.373 24.209 25.121 26.143 27.15 28.293 29.547 30.897 32.398 34.151 36.064 38.152 39.482 39.967 40.096 40.005 39.811 39.53 39.196 38.827 38.372 37.947 37.535 37.114 36.696 36.273 35.871 35.434 35.024 34.674 34.269 33.851 33.526 33.171 32.759 32.416 32.038 31.627 31.229 30.81 30.491 30.148 29.642 29.278 28.839 28.643 28.272 27.833 27.35 27.073 26.309 26.179 25.85 25.507 24.699 24.268 23.776 23.197 22.574 21.845 20.77 16.973 -6 ,9932 ,TETRA ,17605103,Sun Nov 28 18:26:21 CET,Sun Nov 28 20:21:16 CET,0.0 2.302 3.326 4.099 4.743 5.311 5.786 6.22 7.029 7.382 7.719 7.926 8.749 9.066 9.648 10.177 10.662 10.897 11.363 11.799 12.418 12.801 13.175 13.715 14.221 14.71 15.194 15.626 16.161 16.736 17.263 17.878 18.477 19.009 19.631 20.326 20.973 21.704 22.468 23.23 24.055 24.978 26.033 27.082 28.298 29.649 31.088 32.682 34.519 36.554 38.747 40.158 40.738 40.945 40.928 40.746 40.413 40.022 39.689 39.306 38.926 38.545 38.16 37.78 37.364 36.96 36.527 36.08 35.67 35.26 34.804 34.423 34.024 33.576 33.208 32.814 32.406 31.974 31.525 31.22 30.901 30.351 29.942 29.529 29.335 28.91 28.419 27.903 27.627 26.864 26.749 26.411 26.049 25.23 24.764 24.255 23.699 23.088 22.353 21.35 18.507 -7 ,11427 ,TETRA ,17605104,Sun Nov 28 18:28:15 CET,Sun Nov 28 20:25:45 CET,0.0 2.297 3.222 3.917 4.484 5.02 5.498 5.929 6.697 7.052 7.394 7.561 8.358 8.65 9.208 9.706 10.18 10.414 10.85 11.277 11.905 12.284 12.645 13.171 13.673 14.169 14.65 15.114 15.699 16.249 16.762 17.387 18.011 18.574 19.206 19.933 20.591 21.283 22.035 22.806 23.639 24.608 25.641 26.603 27.718 28.934 30.347 31.992 33.832 35.779 37.865 39.218 39.706 39.743 39.56 39.288 38.957 38.568 38.162 37.736 37.336 36.949 36.537 36.097 35.692 35.301 34.855 34.457 34.088 33.689 33.264 32.896 32.508 32.085 31.725 31.323 30.912 30.473 30.019 29.701 29.353 28.785 28.385 27.968 27.748 27.316 26.88 26.391 26.127 25.361 25.218 24.883 24.541 23.756 23.323 22.822 22.256 21.655 20.971 19.961 17.288 -8 ,25023 ,TETRA ,17605105,Sun Nov 28 18:28:16 CET,Sun Nov 28 20:23:34 CET,0.0 2.751 3.775 4.542 5.16 5.712 6.168 6.574 7.321 7.657 7.992 8.124 8.919 9.213 9.772 10.272 10.734 10.95 11.363 11.757 12.347 12.741 13.112 13.66 14.193 14.694 15.156 15.582 16.113 16.596 17.056 17.635 18.197 18.736 19.373 20.078 20.751 21.453 22.178 22.947 23.744 24.638 25.647 26.64 27.812 29.108 30.537 32.091 33.909 35.956 38.163 39.639 40.168 40.241 40.116 39.9 39.623 39.27 38.829 38.312 37.864 37.463 37.068 36.655 36.242 35.86 35.459 35.093 34.739 34.334 33.875 33.459 33.032 32.563 32.164 31.745 31.319 30.885 30.424 30.101 29.783 29.254 28.86 28.454 28.245 27.81 27.32 26.789 26.53 25.769 25.596 25.266 24.923 24.151 23.728 23.246 22.709 22.11 21.396 20.361 17.034 -9 ,8213 ,TETRA ,17605106,Sun Nov 28 18:29:15 CET,Sun Nov 28 20:24:56 CET,0.0 2.403 3.353 4.102 4.721 5.279 5.772 6.209 6.958 7.297 7.638 7.808 8.602 8.876 9.403 9.902 10.379 10.607 11.073 11.53 12.143 12.528 12.903 13.425 13.92 14.437 14.923 15.379 15.968 16.504 17.016 17.637 18.221 18.768 19.41 20.146 20.848 21.607 22.472 23.356 24.183 25.121 26.231 27.332 28.582 29.873 31.317 32.955 34.775 36.772 38.943 40.349 40.902 41.004 40.833 40.466 39.989 39.508 39.096 38.622 38.123 37.633 37.165 36.702 36.25 35.795 35.26 34.771 34.336 33.842 33.334 32.934 32.483 31.971 31.576 31.183 30.755 30.305 29.845 29.524 29.187 28.645 28.267 27.867 27.648 27.201 26.722 26.207 25.925 25.148 25.046 24.716 24.37 23.582 23.152 22.683 22.155 21.551 20.785 19.647 14.809 -10 ,7108 ,TETRA ,17605107,Sun Nov 28 18:29:17 CET,Sun Nov 28 20:24:46 CET,0.0 2.731 3.773 4.511 5.082 5.607 6.129 6.59 7.462 7.854 8.191 8.327 9.118 9.418 9.975 10.48 10.992 11.257 11.759 12.19 12.758 13.134 13.506 14.047 14.578 15.078 15.556 16.006 16.594 17.139 17.617 18.217 18.819 19.391 20.01 20.689 21.354 22.09 22.893 23.723 24.536 25.429 26.502 27.555 28.719 30.018 31.502 33.019 34.694 36.605 38.731 40.239 40.763 40.847 40.674 40.359 40.011 39.642 39.289 38.876 38.441 37.949 37.499 37.084 36.678 36.321 35.93 35.522 35.167 34.816 34.403 34.014 33.555 33.089 32.74 32.365 31.985 31.569 31.112 30.777 30.419 29.897 29.54 29.138 28.93 28.503 27.992 27.416 27.132 26.364 26.233 25.888 25.514 24.745 24.33 23.864 23.312 22.676 21.934 20.969 18.132 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt deleted file mode 100644 index 4248c04b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,515 ,TETRA ,17605108,Sun Nov 28 18:29:19 CET,Sun Nov 28 20:25:41 CET,0.0 1.026 1.45 1.809 2.129 2.405 2.66 2.914 3.397 3.61 3.827 3.743 4.435 4.633 5.039 5.46 5.83 5.993 6.328 6.657 7.096 7.386 7.67 8.063 8.447 8.82 9.174 9.535 10.008 10.455 10.887 11.418 11.927 12.391 12.937 13.582 14.196 14.847 15.558 16.327 17.163 18.088 19.119 20.168 21.448 22.879 24.518 26.378 28.43 30.845 33.786 36.035 37.185 37.624 37.69 37.581 37.359 37.08 36.775 36.397 36.035 35.678 35.315 34.962 34.617 34.276 33.888 33.539 33.216 32.848 32.439 32.092 31.724 31.331 31.016 30.677 30.315 29.917 29.503 29.226 28.92 28.416 28.067 27.685 27.48 27.06 26.607 26.116 25.867 25.13 25.061 24.772 24.448 23.703 23.278 22.821 22.332 21.765 21.071 20.156 18.081 -2 ,23620 ,TETRA ,17605109,Sun Nov 28 18:29:21 CET,Sun Nov 28 20:25:41 CET,0.0 0.858 1.331 1.689 2.005 2.315 2.606 2.865 3.336 3.553 3.78 3.723 4.413 4.609 5.014 5.398 5.74 5.906 6.232 6.53 6.982 7.267 7.527 7.937 8.352 8.757 9.147 9.507 9.964 10.415 10.841 11.353 11.856 12.33 12.878 13.51 14.135 14.833 15.573 16.344 17.156 18.071 19.141 20.237 21.508 22.933 24.59 26.404 28.469 30.822 33.568 35.751 36.807 37.275 37.433 37.403 37.333 37.194 36.953 36.666 36.385 36.073 35.711 35.31 34.907 34.543 34.132 33.731 33.389 33.052 32.672 32.321 31.936 31.529 31.213 30.853 30.477 30.11 29.718 29.416 29.095 28.626 28.296 27.938 27.748 27.337 26.905 26.453 26.208 25.477 25.42 25.128 24.787 24.036 23.642 23.177 22.645 22.08 21.4 20.446 18.453 -3 ,26730 ,TETRA ,17605110,Sun Nov 28 18:31:15 CET,Sun Nov 28 20:28:08 CET,0.0 1.302 1.855 2.272 2.595 2.892 3.167 3.428 3.941 4.172 4.382 4.284 4.962 5.142 5.522 5.907 6.274 6.445 6.758 7.067 7.527 7.812 8.091 8.497 8.895 9.287 9.664 10.012 10.461 10.903 11.323 11.853 12.355 12.825 13.382 14.041 14.658 15.301 16.004 16.763 17.574 18.512 19.606 20.655 21.906 23.337 24.974 26.858 29.05 31.549 34.47 36.77 37.907 38.411 38.548 38.51 38.363 38.097 37.817 37.512 37.195 36.881 36.531 36.165 35.812 35.484 35.114 34.729 34.379 34.001 33.611 33.283 32.917 32.541 32.231 31.89 31.546 31.17 30.791 30.534 30.25 29.795 29.465 29.097 28.901 28.483 28.035 27.548 27.292 26.537 26.378 26.078 25.774 25.078 24.667 24.21 23.719 23.158 22.52 21.667 19.506 -4 ,15372 ,TETRA ,17605111,Sun Nov 28 18:31:17 CET,Sun Nov 28 20:28:33 CET,0.0 0.843 1.34 1.754 2.093 2.397 2.673 2.943 3.485 3.722 3.955 3.904 4.603 4.797 5.166 5.516 5.855 6.033 6.366 6.677 7.122 7.413 7.701 8.11 8.515 8.921 9.303 9.656 10.119 10.585 11.029 11.554 12.052 12.533 13.111 13.764 14.389 15.087 15.832 16.621 17.447 18.387 19.506 20.613 21.877 23.295 24.94 26.763 28.924 31.442 34.34 36.577 37.604 38.038 38.299 38.415 38.369 38.229 38.018 37.749 37.472 37.138 36.759 36.381 35.994 35.625 35.213 34.809 34.458 34.082 33.687 33.344 32.992 32.613 32.305 31.986 31.636 31.26 30.879 30.598 30.297 29.825 29.482 29.121 28.933 28.541 28.122 27.681 27.443 26.714 26.642 26.335 26.001 25.265 24.844 24.367 23.845 23.264 22.602 21.739 20.174 -5 ,11696 ,TETRA ,17605112,Sun Nov 28 18:31:19 CET,Sun Nov 28 20:27:06 CET,0.0 0.913 1.361 1.743 2.073 2.362 2.638 2.917 3.435 3.676 3.897 3.81 4.508 4.7 5.061 5.414 5.749 5.916 6.262 6.601 7.069 7.345 7.612 8.005 8.391 8.794 9.189 9.583 10.088 10.534 10.962 11.497 11.999 12.468 13.03 13.68 14.29 14.938 15.64 16.419 17.24 18.146 19.235 20.359 21.661 23.111 24.737 26.542 28.648 30.986 33.604 35.544 36.594 37.152 37.351 37.352 37.216 36.998 36.74 36.408 36.089 35.759 35.389 35.032 34.691 34.324 33.898 33.495 33.161 32.822 32.447 32.132 31.79 31.406 31.087 30.741 30.389 30.037 29.657 29.373 29.074 28.596 28.246 27.877 27.689 27.309 26.904 26.467 26.236 25.501 25.393 25.079 24.762 24.133 23.757 23.296 22.751 22.119 21.382 20.408 18.44 -6 ,14121 ,TETRA ,17605113,Sun Nov 28 18:31:21 CET,Sun Nov 28 20:27:08 CET,0.0 0.847 1.311 1.709 2.051 2.34 2.603 2.868 3.328 3.538 3.754 3.691 4.388 4.581 4.953 5.327 5.689 5.865 6.182 6.489 6.961 7.256 7.543 7.949 8.356 8.756 9.122 9.488 9.966 10.398 10.836 11.353 11.815 12.299 12.868 13.497 14.093 14.721 15.437 16.263 17.115 18.004 19.036 20.086 21.335 22.793 24.455 26.277 28.413 30.799 33.412 35.388 36.439 36.99 37.239 37.269 37.149 36.903 36.624 36.305 35.981 35.655 35.327 34.942 34.565 34.233 33.849 33.48 33.133 32.763 32.379 32.04 31.675 31.28 30.956 30.637 30.324 29.96 29.532 29.24 28.937 28.452 28.121 27.753 27.556 27.147 26.715 26.304 26.069 25.337 25.25 24.924 24.597 23.877 23.456 22.985 22.467 21.876 21.163 20.246 18.354 -7 ,23065 ,TETRA ,17605114,Sun Nov 28 18:31:16 CET,Sun Nov 28 20:27:40 CET,0.0 1.149 1.685 2.092 2.43 2.724 3.021 3.308 3.806 4.038 4.257 4.169 4.872 5.062 5.412 5.747 6.089 6.259 6.57 6.881 7.352 7.633 7.901 8.308 8.707 9.11 9.496 9.861 10.353 10.821 11.262 11.806 12.329 12.829 13.393 14.015 14.625 15.318 16.056 16.837 17.648 18.56 19.633 20.711 21.976 23.379 24.969 26.793 28.903 31.338 34.225 36.376 37.441 37.837 37.892 37.831 37.68 37.408 37.117 36.806 36.504 36.217 35.916 35.548 35.195 34.875 34.466 34.085 33.724 33.338 32.949 32.613 32.261 31.867 31.553 31.209 30.833 30.463 30.093 29.821 29.521 29.076 28.775 28.434 28.242 27.828 27.374 26.894 26.654 25.929 25.844 25.536 25.204 24.428 24.006 23.585 23.11 22.582 21.975 21.094 18.899 -8 ,22083 ,TETRA ,17605115,Sun Nov 28 18:31:21 CET,Sun Nov 28 20:27:42 CET,0.0 0.851 1.331 1.719 2.055 2.371 2.691 2.991 3.509 3.725 3.926 3.814 4.491 4.682 5.031 5.369 5.711 5.88 6.205 6.524 6.979 7.272 7.574 8.012 8.432 8.832 9.193 9.524 9.953 10.361 10.776 11.296 11.785 12.247 12.765 13.372 13.984 14.655 15.387 16.176 17.017 17.961 19.041 20.111 21.334 22.725 24.352 26.196 28.325 30.687 33.423 35.648 36.693 37.132 37.322 37.289 37.124 36.841 36.504 36.156 35.843 35.535 35.187 34.825 34.472 34.135 33.755 33.388 33.071 32.723 32.331 31.99 31.618 31.251 30.952 30.613 30.279 29.932 29.534 29.251 28.975 28.51 28.173 27.832 27.635 27.206 26.783 26.337 26.094 25.367 25.274 24.974 24.671 23.988 23.588 23.157 22.719 22.254 21.67 20.878 18.849 -9 ,16367 ,TETRA ,17605116,Sun Nov 28 18:31:16 CET,Sun Nov 28 20:27:35 CET,0.0 0.854 1.316 1.663 1.958 2.25 2.518 2.772 3.278 3.513 3.733 3.65 4.329 4.515 4.889 5.235 5.58 5.748 6.044 6.326 6.759 7.028 7.287 7.705 8.121 8.522 8.902 9.26 9.719 10.162 10.594 11.115 11.603 12.063 12.635 13.294 13.926 14.621 15.341 16.114 16.958 17.901 18.969 20.051 21.319 22.756 24.463 26.316 28.422 30.87 33.704 35.828 36.83 37.272 37.393 37.361 37.246 37.054 36.784 36.463 36.137 35.78 35.445 35.096 34.743 34.426 34.074 33.713 33.367 33.013 32.614 32.264 31.922 31.558 31.257 30.918 30.551 30.193 29.807 29.541 29.257 28.794 28.473 28.128 27.948 27.565 27.143 26.664 26.41 25.673 25.6 25.32 25.023 24.326 23.924 23.487 23.005 22.432 21.686 20.702 18.745 -10 ,15490 ,TETRA ,17605117,Sun Nov 28 18:31:19 CET,Sun Nov 28 20:26:57 CET,0.0 1.061 1.547 1.92 2.245 2.538 2.82 3.094 3.589 3.817 4.033 3.921 4.598 4.774 5.138 5.512 5.872 6.037 6.348 6.642 7.074 7.369 7.651 8.051 8.445 8.826 9.191 9.549 10.03 10.499 10.95 11.485 11.99 12.465 13.012 13.625 14.234 14.936 15.715 16.558 17.397 18.321 19.402 20.49 21.744 23.088 24.667 26.503 28.604 30.954 33.749 35.889 36.85 37.201 37.28 37.244 37.107 36.862 36.518 36.084 35.699 35.345 34.991 34.645 34.294 33.939 33.539 33.184 32.864 32.487 32.069 31.692 31.29 30.906 30.61 30.277 29.935 29.565 29.156 28.868 28.56 28.055 27.696 27.345 27.165 26.781 26.351 25.882 25.632 24.899 24.836 24.543 24.236 23.55 23.158 22.718 22.244 21.737 21.082 20.193 18.254 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt deleted file mode 100644 index 094619fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7348 ,TETRA ,17605118,Sun Nov 28 18:31:17 CET,Sun Nov 28 20:29:17 CET,0.0 2.225 3.058 3.623 4.101 4.506 4.861 5.186 5.798 6.084 6.341 6.331 7.066 7.3 7.727 8.128 8.508 8.693 9.043 9.372 9.847 10.136 10.404 10.813 11.194 11.55 11.893 12.222 12.633 12.997 13.36 13.808 14.212 14.602 15.032 15.508 15.994 16.512 17.058 17.6 18.145 18.748 19.409 20.049 20.759 21.465 22.202 22.988 23.866 24.71 25.339 25.359 24.97 24.474 23.94 23.348 22.769 22.237 21.748 21.154 20.608 20.093 19.602 19.148 18.675 18.228 17.746 17.305 16.917 16.501 16.055 15.668 15.266 14.852 14.514 14.157 13.774 13.358 12.945 12.658 12.334 11.826 11.456 11.075 10.881 10.467 10.038 9.568 9.329 8.581 8.548 8.242 7.908 7.174 6.765 6.333 5.883 5.357 4.745 3.833 1.804 -2 ,736 ,TETRA ,17605119,Sun Nov 28 18:31:19 CET,Sun Nov 28 20:29:08 CET,0.0 2.33 3.172 3.771 4.263 4.694 5.077 5.429 6.072 6.356 6.627 6.649 7.388 7.611 8.04 8.45 8.834 9.015 9.363 9.7 10.197 10.505 10.789 11.198 11.567 11.918 12.254 12.583 13.001 13.378 13.731 14.181 14.61 15.024 15.496 15.975 16.416 16.899 17.407 17.937 18.475 19.041 19.662 20.271 20.952 21.636 22.395 23.208 24.049 24.844 25.396 25.343 24.944 24.422 23.898 23.35 22.744 22.138 21.577 20.966 20.43 19.932 19.44 18.988 18.569 18.168 17.719 17.263 16.844 16.421 15.936 15.517 15.077 14.605 14.26 13.896 13.536 13.175 12.751 12.447 12.126 11.595 11.214 10.825 10.625 10.212 9.783 9.326 9.083 8.328 8.326 8.028 7.701 6.976 6.568 6.139 5.67 5.101 4.384 3.511 1.825 -3 ,1186 ,TETRA ,17605120,Sun Nov 28 18:31:21 CET,Sun Nov 28 20:28:43 CET,0.0 2.61 3.47 4.108 4.627 5.078 5.483 5.867 6.541 6.827 7.096 7.109 7.853 8.098 8.543 8.944 9.329 9.516 9.86 10.179 10.65 10.93 11.201 11.615 12.0 12.367 12.718 13.047 13.464 13.862 14.263 14.741 15.186 15.606 16.051 16.53 16.98 17.465 17.987 18.528 19.082 19.704 20.404 21.036 21.731 22.49 23.295 24.118 24.973 25.764 26.384 26.397 25.926 25.317 24.752 24.181 23.563 22.908 22.33 21.745 21.175 20.652 20.132 19.618 19.15 18.702 18.182 17.73 17.338 16.873 16.388 15.973 15.541 15.113 14.773 14.408 14.023 13.622 13.2 12.898 12.564 12.075 11.723 11.309 11.1 10.684 10.228 9.729 9.469 8.713 8.689 8.383 8.053 7.337 6.93 6.494 5.974 5.36 4.674 3.808 1.801 -4 ,9100 ,TETRA ,17605121,Sun Nov 28 18:31:23 CET,Sun Nov 28 20:28:39 CET,0.0 2.192 3.02 3.614 4.118 4.558 4.933 5.271 5.902 6.201 6.479 6.482 7.22 7.455 7.853 8.228 8.59 8.77 9.119 9.437 9.895 10.198 10.489 10.886 11.274 11.64 11.992 12.34 12.766 13.164 13.549 14.054 14.521 14.917 15.383 15.91 16.389 16.917 17.468 17.987 18.514 19.1 19.754 20.378 21.08 21.832 22.615 23.403 24.237 25.069 25.627 25.613 25.288 24.777 24.153 23.489 22.841 22.216 21.663 21.029 20.461 19.98 19.497 19.033 18.573 18.106 17.619 17.206 16.86 16.5 16.087 15.719 15.309 14.842 14.475 14.117 13.763 13.372 12.941 12.646 12.357 11.902 11.569 11.202 10.995 10.562 10.134 9.678 9.438 8.676 8.587 8.283 7.98 7.337 6.95 6.509 6.056 5.511 4.832 3.976 1.631 -5 ,9353 ,TETRA ,17605122,Sun Nov 28 18:31:17 CET,Sun Nov 28 20:28:12 CET,0.0 2.831 3.736 4.429 5.017 5.486 5.889 6.248 6.84 7.127 7.418 7.431 8.161 8.379 8.795 9.197 9.577 9.754 10.089 10.421 10.886 11.179 11.474 11.87 12.226 12.581 12.911 13.23 13.65 14.047 14.449 14.925 15.354 15.744 16.182 16.691 17.149 17.615 18.099 18.617 19.127 19.664 20.294 20.917 21.644 22.411 23.216 24.045 24.892 25.725 26.419 26.452 25.991 25.446 24.91 24.353 23.828 23.302 22.723 22.114 21.579 21.049 20.534 20.032 19.579 19.127 18.629 18.191 17.802 17.377 16.94 16.572 16.138 15.672 15.315 14.956 14.596 14.215 13.811 13.531 13.236 12.777 12.429 12.04 11.844 11.448 11.017 10.534 10.291 9.538 9.501 9.206 8.885 8.193 7.816 7.405 6.963 6.469 5.884 4.974 1.642 -6 ,23085 ,TETRA ,17605123,Sun Nov 28 18:31:18 CET,Sun Nov 28 20:27:41 CET,0.0 3.301 4.241 4.896 5.442 5.914 6.323 6.68 7.335 7.625 7.894 7.897 8.612 8.817 9.269 9.73 10.151 10.34 10.702 11.041 11.531 11.834 12.097 12.479 12.847 13.204 13.55 13.878 14.289 14.68 15.052 15.497 15.919 16.31 16.762 17.284 17.756 18.236 18.736 19.24 19.758 20.356 21.058 21.708 22.372 23.105 23.913 24.739 25.622 26.462 27.108 27.142 26.743 26.201 25.638 25.034 24.458 23.928 23.428 22.797 22.18 21.623 21.104 20.565 20.048 19.613 19.149 18.693 18.278 17.86 17.432 17.061 16.658 16.221 15.889 15.547 15.147 14.722 14.3 13.99 13.653 13.122 12.749 12.359 12.156 11.742 11.3 10.843 10.608 9.844 9.809 9.509 9.172 8.44 8.058 7.665 7.206 6.664 6.003 5.075 3.012 -7 ,20175 ,TETRA ,17605124,Sun Nov 28 18:31:19 CET,Sun Nov 28 20:27:33 CET,0.0 2.226 3.039 3.692 4.203 4.65 5.032 5.381 6.017 6.31 6.582 6.544 7.265 7.484 7.887 8.277 8.648 8.826 9.174 9.515 9.982 10.254 10.517 10.913 11.306 11.673 12.041 12.397 12.827 13.237 13.617 14.041 14.443 14.839 15.28 15.737 16.191 16.688 17.182 17.699 18.243 18.826 19.466 20.107 20.826 21.566 22.346 23.129 23.949 24.771 25.437 25.466 25.078 24.578 24.023 23.446 22.879 22.284 21.663 21.014 20.499 20.024 19.534 19.049 18.604 18.189 17.725 17.303 16.927 16.522 16.098 15.72 15.312 14.876 14.498 14.107 13.701 13.262 12.82 12.524 12.201 11.673 11.318 10.966 10.786 10.421 10.023 9.572 9.329 8.563 8.559 8.276 7.95 7.257 6.892 6.449 5.962 5.399 4.678 3.76 1.948 -8 ,32228 ,TETRA ,17605125,Sun Nov 28 18:31:22 CET,Sun Nov 28 20:27:53 CET,0.0 2.179 2.98 3.564 4.023 4.419 4.795 5.158 5.805 6.086 6.354 6.381 7.114 7.332 7.75 8.161 8.528 8.703 9.056 9.388 9.871 10.178 10.474 10.903 11.299 11.673 12.033 12.395 12.838 13.22 13.592 14.04 14.444 14.81 15.216 15.721 16.239 16.769 17.266 17.779 18.332 18.915 19.58 20.224 20.922 21.683 22.491 23.299 24.162 24.986 25.633 25.569 25.016 24.36 23.708 23.033 22.412 21.815 21.25 20.663 20.158 19.68 19.136 18.62 18.165 17.727 17.2 16.709 16.322 15.908 15.435 15.034 14.619 14.177 13.837 13.494 13.13 12.74 12.321 12.019 11.691 11.185 10.838 10.472 10.288 9.907 9.505 9.071 8.824 8.068 8.046 7.755 7.427 6.711 6.34 5.941 5.522 5.045 4.442 3.645 1.915 -9 ,434 ,TETRA ,17605126,Sun Nov 28 18:31:18 CET,Sun Nov 28 20:28:59 CET,0.0 2.605 3.432 4.009 4.478 4.875 5.248 5.614 6.249 6.535 6.816 6.883 7.644 7.869 8.285 8.727 9.159 9.338 9.674 9.999 10.478 10.781 11.056 11.483 11.892 12.262 12.617 12.943 13.351 13.755 14.134 14.58 14.999 15.387 15.836 16.34 16.846 17.39 17.956 18.523 19.032 19.582 20.26 20.911 21.624 22.415 23.26 24.138 24.997 25.82 26.43 26.452 26.099 25.602 25.024 24.384 23.745 23.132 22.537 21.854 21.249 20.735 20.227 19.73 19.256 18.793 18.295 17.875 17.505 17.083 16.655 16.283 15.851 15.361 14.971 14.59 14.198 13.795 13.384 13.089 12.768 12.251 11.865 11.458 11.258 10.874 10.472 10.005 9.761 9.003 8.984 8.698 8.408 7.764 7.393 6.976 6.507 5.989 5.381 4.486 2.754 -10 ,13489 ,TETRA ,17605127,Sun Nov 28 18:31:20 CET,Sun Nov 28 20:28:52 CET,0.0 3.348 4.265 4.891 5.387 5.822 6.237 6.634 7.316 7.596 7.851 7.859 8.604 8.861 9.328 9.769 10.17 10.351 10.694 11.027 11.507 11.801 12.09 12.527 12.927 13.303 13.659 13.983 14.385 14.759 15.125 15.574 15.988 16.387 16.834 17.324 17.796 18.288 18.795 19.353 19.943 20.552 21.233 21.87 22.528 23.265 24.07 24.863 25.708 26.532 27.129 27.06 26.641 26.149 25.58 24.985 24.395 23.791 23.224 22.616 22.066 21.543 21.009 20.513 20.051 19.624 19.144 18.708 18.325 17.854 17.358 16.966 16.547 16.124 15.802 15.472 15.114 14.722 14.302 14.002 13.696 13.176 12.781 12.368 12.17 11.767 11.336 10.897 10.662 9.892 9.803 9.511 9.213 8.551 8.17 7.718 7.191 6.601 5.893 4.982 3.012 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt deleted file mode 100644 index 0136f3a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6283 ,TETRA ,17605128,Sun Nov 28 18:31:22 CET,Sun Nov 28 20:27:27 CET,0.0 1.589 2.314 2.866 3.302 3.726 4.113 4.439 5.037 5.32 5.582 5.539 6.252 6.475 6.895 7.314 7.712 7.888 8.219 8.545 9.013 9.307 9.6 10.017 10.401 10.783 11.15 11.507 11.983 12.427 12.857 13.382 13.855 14.282 14.775 15.384 15.98 16.596 17.198 17.868 18.612 19.382 20.234 21.058 22.006 22.99 24.036 25.18 26.521 27.989 29.472 30.324 30.563 30.532 30.312 29.971 29.619 29.293 28.889 28.421 28.039 27.692 27.314 26.895 26.543 26.226 25.866 25.541 25.245 24.887 24.491 24.186 23.847 23.442 23.15 22.851 22.493 22.123 21.73 21.449 21.166 20.738 20.423 20.076 19.898 19.536 19.155 18.751 18.562 17.87 17.871 17.614 17.338 16.698 16.318 15.882 15.4 14.872 14.256 13.486 12.071 -2 ,1242 ,TETRA ,17605129,Sun Nov 28 18:31:19 CET,Sun Nov 28 20:26:56 CET,0.0 1.426 2.051 2.51 2.904 3.252 3.578 3.904 4.518 4.789 5.038 5.015 5.742 5.961 6.381 6.795 7.195 7.389 7.742 8.083 8.604 8.952 9.285 9.731 10.144 10.544 10.935 11.311 11.783 12.249 12.712 13.262 13.763 14.251 14.821 15.453 16.059 16.682 17.286 17.93 18.636 19.408 20.323 21.163 22.015 22.97 24.027 25.174 26.463 27.868 29.399 30.387 30.679 30.648 30.439 30.15 29.805 29.407 29.048 28.66 28.289 27.919 27.509 27.124 26.756 26.371 25.899 25.439 25.082 24.741 24.387 24.086 23.725 23.313 23.008 22.712 22.388 22.022 21.637 21.381 21.105 20.64 20.308 19.958 19.782 19.413 19.032 18.626 18.416 17.706 17.648 17.356 17.048 16.4 16.035 15.601 15.094 14.514 13.865 13.096 11.427 -3 ,29034 ,TETRA ,17605130,Sun Nov 28 18:33:15 CET,Sun Nov 28 20:29:42 CET,0.0 1.659 2.325 2.839 3.314 3.721 4.074 4.409 5.053 5.348 5.638 5.683 6.408 6.625 7.03 7.423 7.804 7.987 8.348 8.683 9.141 9.441 9.735 10.182 10.632 11.061 11.45 11.819 12.302 12.748 13.168 13.69 14.185 14.654 15.207 15.829 16.392 16.975 17.605 18.27 18.928 19.649 20.501 21.347 22.292 23.306 24.418 25.597 26.904 28.332 29.885 30.812 31.049 31.04 30.85 30.578 30.317 30.029 29.682 29.254 28.832 28.428 28.065 27.705 27.34 27.016 26.612 26.198 25.863 25.541 25.207 24.917 24.618 24.271 23.961 23.655 23.331 22.979 22.614 22.344 22.059 21.616 21.314 20.995 20.816 20.443 20.058 19.62 19.379 18.646 18.615 18.34 18.029 17.355 17.006 16.628 16.205 15.722 15.161 14.457 12.93 -4 ,14807 ,TETRA ,17605131,Sun Nov 28 18:33:17 CET,Sun Nov 28 20:29:44 CET,0.0 1.382 2.084 2.61 3.071 3.502 3.902 4.24 4.824 5.099 5.373 5.396 6.15 6.397 6.834 7.217 7.582 7.765 8.127 8.479 8.977 9.298 9.606 10.041 10.465 10.866 11.234 11.598 12.081 12.535 12.95 13.429 13.882 14.322 14.865 15.489 16.031 16.572 17.15 17.745 18.376 19.114 19.988 20.843 21.763 22.744 23.818 24.989 26.311 27.727 29.264 30.28 30.641 30.679 30.5 30.19 29.868 29.545 29.22 28.851 28.492 28.147 27.82 27.491 27.155 26.818 26.414 26.032 25.708 25.355 24.959 24.604 24.249 23.884 23.574 23.244 22.919 22.545 22.128 21.848 21.573 21.157 20.85 20.481 20.278 19.907 19.523 19.104 18.866 18.132 18.088 17.815 17.516 16.87 16.514 16.126 15.705 15.203 14.574 13.828 12.443 -5 ,3558 ,TETRA ,17605132,Sun Nov 28 18:33:19 CET,Sun Nov 28 20:29:09 CET,0.0 1.837 2.604 3.202 3.706 4.133 4.51 4.871 5.52 5.82 6.105 6.146 6.88 7.123 7.587 7.992 8.371 8.556 8.918 9.253 9.743 10.058 10.356 10.791 11.203 11.597 11.983 12.353 12.824 13.276 13.688 14.18 14.667 15.098 15.635 16.291 16.857 17.425 18.079 18.815 19.493 20.188 21.023 21.869 22.791 23.807 24.952 26.132 27.466 28.944 30.45 31.39 31.724 31.791 31.65 31.368 31.064 30.726 30.377 29.983 29.631 29.281 28.916 28.573 28.255 27.937 27.565 27.188 26.83 26.461 26.111 25.796 25.472 25.153 24.865 24.56 24.24 23.882 23.515 23.252 22.971 22.528 22.22 21.913 21.746 21.384 21.003 20.582 20.348 19.63 19.632 19.348 19.02 18.258 17.847 17.414 16.916 16.365 15.714 14.779 12.881 -6 ,7364 ,TETRA ,17605133,Sun Nov 28 18:33:21 CET,Sun Nov 28 20:28:54 CET,0.0 1.21 1.904 2.454 2.937 3.333 3.678 3.999 4.561 4.832 5.103 5.115 5.851 6.083 6.53 6.93 7.294 7.476 7.84 8.203 8.723 9.044 9.357 9.831 10.298 10.747 11.147 11.514 11.99 12.444 12.876 13.387 13.856 14.347 14.925 15.516 16.121 16.76 17.381 18.027 18.713 19.475 20.281 21.071 22.019 23.065 24.202 25.38 26.671 28.087 29.597 30.552 30.845 30.831 30.66 30.369 30.046 29.696 29.359 28.963 28.574 28.199 27.826 27.472 27.108 26.739 26.346 25.979 25.649 25.279 24.889 24.58 24.242 23.889 23.621 23.332 23.016 22.648 22.244 21.987 21.714 21.286 20.997 20.672 20.5 20.129 19.744 19.346 19.121 18.385 18.313 18.04 17.768 17.168 16.822 16.423 15.971 15.408 14.714 13.869 11.497 -7 ,2048 ,TETRA ,17605134,Sun Nov 28 18:37:15 CET,Sun Nov 28 20:34:11 CET,0.0 2.348 3.04 3.551 3.992 4.368 4.708 5.039 5.639 5.891 6.13 6.086 6.802 7.016 7.417 7.791 8.169 8.36 8.71 9.041 9.521 9.831 10.136 10.561 10.964 11.35 11.717 12.081 12.525 12.927 13.318 13.807 14.289 14.772 15.34 15.919 16.44 17.027 17.663 18.342 19.039 19.78 20.592 21.379 22.272 23.216 24.268 25.456 26.838 28.346 29.893 30.757 30.988 30.937 30.756 30.473 30.102 29.676 29.289 28.954 28.657 28.324 27.996 27.652 27.297 26.954 26.57 26.21 25.875 25.525 25.134 24.794 24.464 24.11 23.821 23.515 23.181 22.81 22.435 22.19 21.912 21.438 21.122 20.81 20.628 20.243 19.852 19.407 19.169 18.44 18.424 18.145 17.841 17.201 16.833 16.435 16.005 15.494 14.903 14.149 12.524 -8 ,14915 ,TETRA ,17605135,Sun Nov 28 18:38:15 CET,Sun Nov 28 20:34:36 CET,0.0 1.267 1.914 2.412 2.847 3.226 3.565 3.875 4.478 4.756 5.026 5.064 5.803 6.026 6.47 6.885 7.259 7.438 7.777 8.107 8.589 8.901 9.208 9.651 10.076 10.472 10.857 11.231 11.714 12.162 12.588 13.091 13.568 14.048 14.566 15.109 15.613 16.169 16.797 17.484 18.179 18.89 19.727 20.56 21.502 22.529 23.611 24.784 26.127 27.56 29.121 30.078 30.348 30.3 30.093 29.867 29.569 29.208 28.859 28.441 28.066 27.711 27.319 26.933 26.578 26.211 25.779 25.402 25.081 24.742 24.378 24.048 23.708 23.351 23.06 22.744 22.413 22.07 21.691 21.415 21.135 20.698 20.356 19.989 19.797 19.381 18.929 18.456 18.213 17.477 17.451 17.203 16.938 16.315 15.954 15.5 14.994 14.517 13.941 13.09 10.693 -9 ,16129 ,TETRA ,17605136,Sun Nov 28 18:38:16 CET,Sun Nov 28 20:34:11 CET,0.0 1.358 2.035 2.582 3.071 3.483 3.849 4.209 4.812 5.082 5.357 5.41 6.155 6.382 6.79 7.173 7.549 7.731 8.07 8.398 8.884 9.19 9.487 9.922 10.361 10.793 11.198 11.586 12.063 12.501 12.902 13.399 13.888 14.341 14.86 15.457 16.017 16.604 17.261 17.96 18.662 19.434 20.309 21.165 22.107 23.071 24.128 25.266 26.554 27.98 29.475 30.483 30.832 30.845 30.638 30.339 30.038 29.669 29.28 28.848 28.415 28.024 27.634 27.24 26.864 26.512 26.129 25.734 25.397 25.065 24.69 24.381 24.058 23.702 23.414 23.101 22.764 22.404 22.026 21.76 21.479 21.016 20.648 20.251 20.077 19.738 19.365 18.936 18.71 18.005 17.964 17.678 17.388 16.773 16.433 16.057 15.645 15.156 14.494 13.632 11.736 -10 ,28473 ,TETRA ,17605137,Sun Nov 28 18:38:18 CET,Sun Nov 28 20:35:41 CET,0.0 1.155 1.744 2.247 2.649 3.034 3.396 3.738 4.364 4.641 4.895 4.841 5.557 5.789 6.217 6.61 6.985 7.166 7.523 7.856 8.325 8.625 8.923 9.38 9.827 10.224 10.59 10.973 11.471 11.923 12.354 12.874 13.37 13.827 14.32 14.846 15.364 15.931 16.522 17.127 17.774 18.52 19.391 20.249 21.181 22.203 23.345 24.593 25.984 27.466 28.987 29.875 30.117 30.081 29.911 29.625 29.296 28.971 28.621 28.198 27.81 27.437 27.077 26.729 26.367 26.031 25.706 25.378 25.058 24.725 24.35 24.022 23.676 23.291 22.984 22.649 22.295 21.945 21.56 21.282 20.994 20.496 20.131 19.75 19.559 19.132 18.676 18.232 18.0 17.27 17.222 16.952 16.671 16.03 15.647 15.219 14.747 14.223 13.637 12.785 10.329 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt deleted file mode 100644 index c3a9dfd2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3734 ,TETRA ,17605138,Sun Nov 28 18:38:21 CET,Sun Nov 28 20:28:15 CET,0.0 2.228 3.031 3.655 4.191 4.655 5.099 5.52 6.213 6.53 6.838 7.042 7.62 7.854 8.326 8.77 9.185 9.382 9.757 10.113 10.616 10.938 11.262 11.73 12.203 12.681 13.096 13.467 13.929 14.373 14.86 15.479 16.023 16.485 16.99 17.548 18.05 18.605 19.233 19.881 20.532 21.224 22.0 22.776 23.649 24.617 25.717 26.941 28.332 29.853 31.483 32.545 33.005 33.157 33.133 33.016 32.813 32.564 32.306 31.983 31.708 31.46 31.171 30.869 30.549 30.199 29.823 29.503 29.2 28.901 28.598 28.293 27.956 27.617 27.332 27.031 26.721 26.383 26.023 25.785 25.556 25.158 24.864 24.552 24.393 24.065 23.69 23.264 23.05 22.525 22.407 22.165 21.916 21.357 21.054 20.722 20.357 19.912 19.306 18.532 17.046 -2 ,19092 ,TETRA ,17605139,Sun Nov 28 18:38:15 CET,Sun Nov 28 20:27:47 CET,0.0 1.651 2.519 3.235 3.787 4.246 4.679 5.105 5.868 6.179 6.47 6.704 7.31 7.566 8.048 8.488 8.906 9.103 9.48 9.843 10.336 10.645 10.965 11.441 11.882 12.318 12.713 13.072 13.549 14.006 14.458 14.998 15.49 15.951 16.501 17.123 17.672 18.256 18.85 19.497 20.18 20.855 21.625 22.396 23.277 24.228 25.345 26.603 27.986 29.533 31.207 32.242 32.578 32.652 32.583 32.413 32.228 31.986 31.715 31.403 31.111 30.848 30.593 30.318 30.039 29.758 29.438 29.133 28.823 28.497 28.156 27.866 27.544 27.177 26.914 26.648 26.345 26.019 25.676 25.432 25.184 24.797 24.532 24.248 24.09 23.756 23.387 22.962 22.729 22.171 22.03 21.767 21.495 20.934 20.621 20.28 19.893 19.427 18.855 18.147 16.596 -3 ,6817 ,TETRA ,17605140,Sun Nov 28 18:38:17 CET,Sun Nov 28 20:28:12 CET,0.0 2.377 3.221 3.876 4.391 4.871 5.307 5.661 6.291 6.588 6.866 7.036 7.634 7.878 8.33 8.77 9.178 9.379 9.752 10.094 10.609 10.928 11.233 11.69 12.114 12.536 12.928 13.261 13.694 14.141 14.585 15.102 15.599 16.056 16.522 17.047 17.601 18.217 18.853 19.491 20.103 20.812 21.628 22.387 23.28 24.249 25.325 26.552 27.954 29.475 31.154 32.29 32.798 32.925 32.796 32.576 32.357 32.124 31.854 31.568 31.271 30.951 30.661 30.389 30.092 29.779 29.442 29.107 28.8 28.47 28.128 27.809 27.47 27.126 26.841 26.528 26.187 25.839 25.476 25.236 24.991 24.599 24.335 24.045 23.89 23.557 23.184 22.803 22.608 22.073 21.95 21.702 21.433 20.863 20.545 20.18 19.767 19.308 18.747 17.992 16.677 -4 ,12938 ,TETRA ,17605141,Sun Nov 28 18:38:18 CET,Sun Nov 28 20:27:29 CET,0.0 1.533 2.269 2.868 3.371 3.812 4.235 4.609 5.275 5.585 5.883 6.1 6.705 6.958 7.446 7.887 8.295 8.5 8.897 9.258 9.783 10.126 10.448 10.917 11.368 11.786 12.213 12.617 13.049 13.435 13.82 14.313 14.793 15.248 15.759 16.343 16.93 17.532 18.124 18.729 19.384 20.145 20.978 21.761 22.651 23.637 24.748 25.988 27.326 28.752 30.407 31.476 31.845 31.96 31.907 31.76 31.555 31.326 31.112 30.82 30.503 30.182 29.859 29.51 29.132 28.804 28.452 28.124 27.83 27.512 27.176 26.873 26.542 26.185 25.909 25.617 25.328 25.031 24.69 24.439 24.174 23.771 23.489 23.189 23.039 22.697 22.313 21.91 21.681 21.122 20.932 20.653 20.363 19.688 19.316 18.954 18.569 18.063 17.415 16.644 15.219 -5 ,30685 ,TETRA ,17605142,Sun Nov 28 18:38:21 CET,Sun Nov 28 20:26:59 CET,0.0 2.522 3.422 4.074 4.6 5.081 5.543 5.948 6.621 6.939 7.251 7.492 8.104 8.369 8.852 9.292 9.705 9.895 10.257 10.601 11.126 11.466 11.79 12.254 12.68 13.105 13.521 13.906 14.39 14.847 15.275 15.81 16.312 16.762 17.272 17.82 18.349 18.932 19.538 20.146 20.813 21.58 22.39 23.149 24.032 25.002 26.09 27.291 28.628 30.149 31.799 32.852 33.264 33.401 33.391 33.241 33.018 32.783 32.537 32.211 31.875 31.574 31.241 30.915 30.583 30.235 29.851 29.521 29.261 28.952 28.609 28.308 27.975 27.635 27.384 27.13 26.831 26.496 26.174 25.952 25.704 25.31 25.039 24.759 24.602 24.251 23.896 23.526 23.323 22.782 22.643 22.395 22.129 21.553 21.218 20.813 20.36 19.842 19.27 18.521 16.787 -6 ,6212 ,TETRA ,17605143,Sun Nov 28 18:39:15 CET,Sun Nov 28 20:29:58 CET,0.0 1.612 2.399 3.016 3.53 4.015 4.476 4.879 5.558 5.885 6.206 6.457 7.075 7.322 7.797 8.245 8.67 8.872 9.265 9.668 10.256 10.584 10.888 11.356 11.786 12.205 12.63 13.016 13.475 13.925 14.364 14.877 15.378 15.861 16.373 16.91 17.447 18.05 18.693 19.373 20.06 20.782 21.62 22.464 23.378 24.349 25.459 26.649 28.006 29.542 31.193 32.31 32.71 32.816 32.776 32.636 32.466 32.218 31.943 31.629 31.301 30.971 30.638 30.304 29.967 29.654 29.329 28.999 28.721 28.43 28.091 27.801 27.491 27.156 26.872 26.571 26.249 25.913 25.552 25.289 25.019 24.58 24.276 23.974 23.816 23.49 23.152 22.768 22.538 21.965 21.802 21.545 21.26 20.666 20.357 20.001 19.597 19.134 18.525 17.648 14.75 -7 ,2315 ,TETRA ,17605144,Sun Nov 28 18:39:15 CET,Sun Nov 28 20:27:18 CET,0.0 2.001 2.802 3.41 3.947 4.42 4.842 5.219 5.887 6.197 6.486 6.69 7.292 7.533 7.98 8.4 8.812 9.013 9.399 9.775 10.303 10.628 10.946 11.405 11.844 12.281 12.696 13.081 13.595 14.081 14.508 15.02 15.516 15.979 16.495 17.047 17.554 18.116 18.711 19.313 19.947 20.666 21.452 22.186 23.064 24.044 25.127 26.31 27.704 29.245 30.857 31.942 32.305 32.42 32.428 32.308 32.109 31.852 31.619 31.358 31.085 30.809 30.519 30.208 29.904 29.618 29.26 28.911 28.63 28.314 27.938 27.621 27.317 27.001 26.73 26.424 26.093 25.764 25.426 25.189 24.938 24.55 24.265 23.957 23.795 23.437 23.073 22.691 22.48 21.927 21.743 21.456 21.172 20.603 20.304 19.984 19.611 19.134 18.517 17.565 14.291 -8 ,3427 ,TETRA ,17605145,Sun Nov 28 18:40:16 CET,Sun Nov 28 20:30:08 CET,0.0 1.841 2.727 3.366 3.938 4.451 4.859 5.238 5.937 6.258 6.57 6.781 7.383 7.629 8.083 8.524 8.953 9.148 9.501 9.852 10.336 10.63 10.932 11.4 11.846 12.273 12.652 13.004 13.478 13.902 14.304 14.818 15.313 15.807 16.384 17.002 17.548 18.107 18.704 19.326 19.99 20.704 21.48 22.272 23.184 24.164 25.271 26.501 27.888 29.394 31.031 32.096 32.531 32.669 32.597 32.438 32.251 32.002 31.711 31.399 31.098 30.74 30.351 30.013 29.7 29.4 29.07 28.713 28.354 27.988 27.636 27.362 27.071 26.727 26.459 26.17 25.804 25.438 25.105 24.864 24.605 24.191 23.897 23.597 23.441 23.092 22.717 22.33 22.129 21.585 21.454 21.217 20.956 20.354 20.034 19.69 19.281 18.826 18.272 17.537 15.939 -9 ,17774 ,TETRA ,17605146,Sun Nov 28 18:40:18 CET,Sun Nov 28 20:30:10 CET,0.0 1.855 2.674 3.338 3.864 4.324 4.76 5.157 5.85 6.178 6.487 6.696 7.289 7.525 7.991 8.488 8.997 9.218 9.609 9.992 10.527 10.868 11.189 11.627 12.053 12.475 12.866 13.238 13.711 14.145 14.581 15.054 15.482 15.96 16.486 17.046 17.581 18.129 18.728 19.386 20.077 20.824 21.664 22.461 23.329 24.26 25.324 26.499 27.871 29.466 31.159 32.208 32.644 32.787 32.731 32.539 32.322 32.086 31.838 31.559 31.293 31.056 30.81 30.522 30.225 29.948 29.636 29.318 28.987 28.608 28.243 27.982 27.713 27.414 27.156 26.862 26.557 26.248 25.917 25.684 25.439 25.058 24.765 24.417 24.232 23.889 23.54 23.122 22.914 22.374 22.261 22.01 21.727 21.096 20.746 20.389 19.991 19.524 18.942 18.146 16.471 -10 ,22194 ,TETRA ,17605147,Sun Nov 28 18:40:20 CET,Sun Nov 28 20:29:29 CET,0.0 1.985 2.865 3.472 4.002 4.466 4.888 5.292 6.023 6.344 6.641 6.859 7.469 7.723 8.2 8.659 9.109 9.318 9.701 10.066 10.582 10.905 11.229 11.691 12.129 12.546 12.947 13.356 13.857 14.342 14.788 15.26 15.716 16.188 16.723 17.287 17.811 18.369 19.027 19.715 20.358 21.071 21.886 22.657 23.557 24.536 25.6 26.773 28.124 29.643 31.317 32.364 32.732 32.823 32.751 32.618 32.416 32.137 31.854 31.579 31.331 31.048 30.692 30.337 30.028 29.726 29.399 29.123 28.898 28.642 28.298 27.99 27.684 27.386 27.142 26.877 26.607 26.288 25.933 25.702 25.469 25.061 24.753 24.432 24.258 23.89 23.534 23.151 22.941 22.4 22.185 21.908 21.65 21.089 20.766 20.396 19.972 19.47 18.856 17.956 16.116 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt deleted file mode 100644 index f7f75005..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25192 ,TETRA ,17605148,Sun Nov 28 18:40:21 CET,Sun Nov 28 20:29:53 CET,0.0 1.767 2.508 3.09 3.578 3.98 4.329 4.655 5.28 5.548 5.796 5.936 6.512 6.731 7.124 7.499 7.875 8.048 8.377 8.698 9.123 9.389 9.642 10.021 10.397 10.745 11.067 11.397 11.821 12.179 12.522 12.95 13.351 13.724 14.145 14.579 14.951 15.331 15.76 16.193 16.597 17.057 17.57 18.034 18.55 19.122 19.712 20.253 20.796 21.298 21.502 21.244 20.76 20.171 19.583 18.999 18.446 17.909 17.402 16.88 16.423 15.962 15.494 15.033 14.591 14.17 13.709 13.271 12.907 12.538 12.114 11.751 11.385 10.989 10.676 10.367 10.052 9.744 9.383 9.106 8.838 8.429 8.14 7.819 7.657 7.334 6.964 6.562 6.348 5.779 5.651 5.38 5.093 4.486 4.132 3.74 3.327 2.854 2.276 1.496 -0.582 -2 ,24872 ,TETRA ,17605149,Sun Nov 28 18:40:16 CET,Sun Nov 28 20:28:59 CET,0.0 1.757 2.543 3.122 3.602 4.033 4.395 4.699 5.256 5.541 5.811 5.94 6.51 6.723 7.142 7.541 7.902 8.065 8.39 8.702 9.165 9.473 9.758 10.164 10.55 10.917 11.249 11.545 11.898 12.244 12.603 13.009 13.353 13.697 14.105 14.551 14.976 15.44 15.898 16.308 16.7 17.152 17.675 18.173 18.721 19.241 19.775 20.329 20.891 21.388 21.675 21.445 20.937 20.357 19.746 19.125 18.547 17.987 17.419 16.827 16.351 15.889 15.408 14.969 14.569 14.185 13.75 13.344 12.966 12.574 12.184 11.841 11.483 11.119 10.821 10.494 10.148 9.787 9.414 9.14 8.849 8.4 8.064 7.71 7.533 7.164 6.766 6.322 6.075 5.47 5.255 4.962 4.662 3.988 3.623 3.234 2.754 2.156 1.459 0.614 -1.336 -3 ,365 ,TETRA ,17605150,Sun Nov 28 18:41:15 CET,Sun Nov 28 20:24:32 CET,0.0 1.438 2.132 2.68 3.124 3.527 3.912 4.255 4.847 5.107 5.359 5.503 6.076 6.283 6.672 7.036 7.39 7.57 7.911 8.22 8.659 8.939 9.191 9.524 9.861 10.188 10.476 10.738 11.055 11.393 11.768 12.198 12.569 12.923 13.297 13.715 14.12 14.521 14.925 15.359 15.833 16.337 16.86 17.348 17.865 18.36 18.87 19.41 19.948 20.417 20.664 20.447 20.004 19.449 18.87 18.326 17.816 17.272 16.772 16.256 15.754 15.312 14.877 14.449 14.066 13.696 13.263 12.838 12.44 12.006 11.564 11.185 10.781 10.381 10.062 9.739 9.424 9.058 8.657 8.374 8.08 7.597 7.233 6.867 6.689 6.322 5.908 5.455 5.219 4.632 4.476 4.177 3.862 3.208 2.843 2.442 2.008 1.497 0.835 0.037 -2.201 -4 ,31852 ,TETRA ,17605151,Sun Nov 28 18:41:16 CET,Sun Nov 28 20:31:46 CET,0.0 1.787 2.537 3.079 3.54 3.954 4.334 4.666 5.263 5.556 5.825 5.956 6.548 6.796 7.243 7.662 8.064 8.242 8.567 8.862 9.277 9.553 9.826 10.225 10.59 10.913 11.217 11.525 11.935 12.315 12.626 12.994 13.383 13.72 14.1 14.529 14.911 15.303 15.7 16.094 16.508 16.98 17.455 17.906 18.449 19.0 19.549 20.121 20.703 21.177 21.408 21.157 20.656 20.057 19.436 18.844 18.296 17.763 17.261 16.737 16.281 15.811 15.341 14.899 14.448 14.001 13.526 13.141 12.788 12.4 12.009 11.651 11.264 10.848 10.52 10.18 9.836 9.478 9.074 8.804 8.532 8.068 7.733 7.378 7.197 6.849 6.47 6.032 5.802 5.217 4.999 4.695 4.398 3.789 3.433 3.024 2.582 2.099 1.474 0.57 -1.656 -5 ,11049 ,TETRA ,17605152,Sun Nov 28 18:42:15 CET,Sun Nov 28 20:30:12 CET,0.0 2.306 3.111 3.707 4.14 4.522 4.852 5.137 5.713 5.98 6.238 6.427 7.022 7.268 7.699 8.081 8.447 8.626 8.963 9.258 9.683 9.955 10.201 10.536 10.876 11.215 11.524 11.832 12.23 12.59 12.932 13.309 13.629 13.964 14.351 14.776 15.189 15.605 16.078 16.59 17.054 17.505 18.011 18.478 18.976 19.483 20.014 20.592 21.148 21.619 21.848 21.611 21.13 20.53 19.953 19.362 18.782 18.272 17.836 17.364 16.877 16.414 15.979 15.545 15.157 14.783 14.356 13.955 13.577 13.192 12.792 12.417 12.027 11.625 11.296 10.959 10.601 10.233 9.841 9.565 9.289 8.852 8.528 8.188 8.015 7.638 7.225 6.78 6.556 5.974 5.79 5.503 5.222 4.596 4.236 3.87 3.473 2.966 2.329 1.502 -0.268 -6 ,13913 ,TETRA ,17605153,Sun Nov 28 18:42:15 CET,Sun Nov 28 20:31:29 CET,0.0 1.817 2.649 3.24 3.717 4.129 4.494 4.801 5.35 5.614 5.88 6.019 6.588 6.81 7.249 7.646 8.014 8.185 8.511 8.81 9.224 9.514 9.806 10.207 10.584 10.955 11.291 11.588 11.941 12.271 12.587 12.948 13.264 13.592 13.989 14.389 14.757 15.171 15.597 16.01 16.443 16.912 17.449 17.98 18.486 18.984 19.552 20.086 20.563 20.984 21.156 20.889 20.413 19.841 19.197 18.566 17.969 17.384 16.847 16.266 15.747 15.307 14.899 14.494 14.067 13.665 13.26 12.863 12.503 12.11 11.678 11.298 10.904 10.522 10.227 9.897 9.546 9.213 8.837 8.543 8.246 7.789 7.438 7.072 6.898 6.531 6.149 5.713 5.472 4.881 4.712 4.435 4.134 3.464 3.098 2.707 2.284 1.829 1.216 0.431 -1.468 -7 ,5447 ,TETRA ,17605154,Sun Nov 28 18:43:14 CET,Sun Nov 28 20:32:33 CET,0.0 3.45 4.3 4.879 5.369 5.802 6.175 6.501 7.094 7.377 7.649 7.789 8.362 8.574 8.979 9.345 9.686 9.856 10.175 10.475 10.935 11.229 11.51 11.901 12.242 12.577 12.898 13.197 13.619 13.999 14.32 14.726 15.099 15.443 15.855 16.26 16.596 17.015 17.494 17.948 18.358 18.805 19.322 19.853 20.407 20.901 21.393 21.927 22.509 23.013 23.267 23.047 22.554 21.991 21.4 20.775 20.172 19.615 19.143 18.623 18.101 17.605 17.154 16.741 16.324 15.853 15.329 14.917 14.544 14.112 13.664 13.293 12.92 12.54 12.237 11.906 11.557 11.191 10.782 10.499 10.193 9.719 9.405 9.063 8.888 8.514 8.104 7.651 7.41 6.823 6.669 6.397 6.123 5.448 5.04 4.637 4.177 3.645 3.021 2.215 0.164 -8 ,1178 ,TETRA ,17605155,Sun Nov 28 18:43:14 CET,Sun Nov 28 20:32:17 CET,0.0 1.665 2.479 3.085 3.53 3.921 4.283 4.615 5.215 5.496 5.759 5.896 6.465 6.674 7.074 7.442 7.806 7.978 8.277 8.571 9.013 9.293 9.552 9.906 10.223 10.515 10.826 11.14 11.534 11.937 12.311 12.693 13.044 13.405 13.833 14.293 14.698 15.136 15.597 16.071 16.549 17.046 17.574 18.032 18.541 19.078 19.602 20.151 20.727 21.21 21.456 21.193 20.663 20.085 19.518 18.938 18.375 17.85 17.39 16.871 16.37 15.921 15.487 15.035 14.624 14.269 13.879 13.495 13.167 12.811 12.381 12.034 11.679 11.281 10.951 10.616 10.29 9.927 9.53 9.242 8.945 8.503 8.157 7.786 7.603 7.226 6.814 6.371 6.151 5.558 5.349 5.06 4.762 4.14 3.778 3.352 2.897 2.389 1.806 0.913 -1.526 -9 ,20357 ,TETRA ,17605156,Sun Nov 28 18:43:16 CET,Sun Nov 28 20:32:57 CET,0.0 1.701 2.373 2.866 3.319 3.724 4.064 4.382 4.986 5.26 5.527 5.69 6.271 6.493 6.934 7.344 7.702 7.861 8.171 8.478 8.914 9.194 9.449 9.825 10.187 10.516 10.824 11.121 11.497 11.859 12.205 12.614 12.993 13.352 13.772 14.216 14.593 15.015 15.455 15.864 16.281 16.736 17.232 17.716 18.298 18.877 19.414 19.919 20.412 20.835 21.029 20.71 20.183 19.633 19.057 18.435 17.83 17.214 16.655 16.102 15.61 15.144 14.699 14.237 13.755 13.326 12.855 12.434 12.069 11.675 11.265 10.926 10.591 10.22 9.885 9.551 9.224 8.858 8.479 8.205 7.919 7.469 7.13 6.778 6.598 6.213 5.79 5.322 5.083 4.501 4.38 4.105 3.804 3.171 2.789 2.375 1.926 1.418 0.813 0.04 -2.042 -10 ,14852 ,TETRA ,17605157,Sun Nov 28 18:43:15 CET,Sun Nov 28 20:28:47 CET,0.0 1.865 2.687 3.354 3.854 4.249 4.601 4.928 5.532 5.796 6.043 6.174 6.757 6.985 7.408 7.781 8.146 8.333 8.674 9.002 9.481 9.755 10.013 10.38 10.715 11.047 11.36 11.666 12.053 12.429 12.791 13.141 13.441 13.779 14.184 14.612 15.005 15.411 15.844 16.277 16.692 17.151 17.648 18.126 18.654 19.184 19.756 20.34 20.902 21.351 21.584 21.308 20.771 20.199 19.632 19.08 18.562 18.043 17.535 16.992 16.442 15.927 15.498 15.092 14.689 14.3 13.894 13.509 13.15 12.74 12.284 11.924 11.537 11.129 10.824 10.497 10.165 9.803 9.396 9.125 8.847 8.383 8.065 7.746 7.566 7.162 6.73 6.305 6.096 5.518 5.382 5.118 4.828 4.179 3.827 3.44 2.962 2.409 1.794 0.944 -1.203 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt deleted file mode 100644 index 1034e686..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15562 ,TETRA ,17605158,Sun Nov 28 18:44:18 CET,Sun Nov 28 20:34:12 CET,0.0 2.98 3.939 4.596 5.17 5.673 6.079 6.445 7.133 7.442 7.71 7.869 8.476 8.726 9.195 9.618 10.017 10.212 10.584 10.912 11.362 11.658 11.936 12.326 12.71 13.045 13.328 13.591 13.918 14.275 14.592 14.891 15.199 15.504 15.846 16.252 16.62 17.003 17.391 17.749 18.107 18.492 18.896 19.244 19.589 19.884 20.116 20.243 20.24 19.883 18.851 17.284 15.744 14.292 13.042 11.95 10.985 10.077 9.225 8.338 7.606 6.956 6.34 5.776 5.194 4.607 4.05 3.584 3.172 2.773 2.322 1.923 1.51 1.054 0.697 0.321 -0.07 -0.493 -0.934 -1.215 -1.52 -2.032 -2.383 -2.756 -2.961 -3.406 -3.859 -4.321 -4.566 -5.177 -5.327 -5.606 -5.907 -6.574 -6.972 -7.466 -8.044 -8.699 -9.496 -10.585 -13.224 -2 ,25968 ,TETRA ,17605159,Sun Nov 28 18:44:19 CET,Sun Nov 28 20:35:07 CET,0.0 2.757 3.675 4.381 4.941 5.404 5.814 6.202 6.917 7.253 7.57 7.774 8.375 8.621 9.038 9.423 9.782 9.953 10.304 10.642 11.093 11.363 11.647 12.061 12.439 12.799 13.132 13.44 13.791 14.112 14.451 14.839 15.177 15.484 15.844 16.25 16.613 17.018 17.393 17.707 18.012 18.315 18.637 18.905 19.192 19.469 19.669 19.817 19.863 19.648 18.851 17.484 16.018 14.627 13.445 12.306 11.253 10.332 9.551 8.722 7.95 7.228 6.511 5.869 5.325 4.792 4.209 3.675 3.194 2.712 2.185 1.743 1.288 0.81 0.451 0.071 -0.311 -0.733 -1.196 -1.52 -1.872 -2.413 -2.774 -3.157 -3.357 -3.737 -4.144 -4.627 -4.891 -5.52 -5.697 -5.993 -6.302 -6.997 -7.408 -7.849 -8.316 -8.832 -9.408 -10.246 -12.839 -3 ,6661 ,TETRA ,17605160,Sun Nov 28 18:44:20 CET,Sun Nov 28 20:33:55 CET,0.0 2.497 3.401 4.065 4.589 5.06 5.496 5.879 6.561 6.866 7.141 7.311 7.897 8.117 8.546 8.966 9.343 9.518 9.85 10.182 10.659 10.935 11.192 11.562 11.905 12.211 12.485 12.772 13.139 13.426 13.693 14.05 14.373 14.68 15.022 15.394 15.796 16.215 16.602 16.959 17.292 17.63 17.994 18.339 18.678 19.009 19.266 19.384 19.29 18.855 17.737 16.112 14.62 13.236 11.994 10.839 9.811 8.846 7.971 7.119 6.358 5.667 5.016 4.391 3.813 3.269 2.69 2.147 1.643 1.127 0.594 0.145 -0.345 -0.885 -1.3 -1.715 -2.167 -2.667 -3.179 -3.541 -3.917 -4.492 -4.903 -5.348 -5.586 -6.065 -6.549 -7.056 -7.337 -7.989 -8.221 -8.573 -8.94 -9.684 -10.101 -10.577 -11.121 -11.74 -12.499 -13.569 -17.262 -4 ,24496 ,TETRA ,17605161,Sun Nov 28 18:45:15 CET,Sun Nov 28 20:37:56 CET,0.0 2.785 3.773 4.465 4.999 5.468 5.889 6.289 6.992 7.295 7.579 7.742 8.324 8.557 8.984 9.367 9.749 9.928 10.237 10.545 10.986 11.257 11.523 11.958 12.407 12.783 13.117 13.445 13.856 14.207 14.531 14.921 15.279 15.593 15.938 16.313 16.648 17.028 17.44 17.849 18.23 18.608 18.994 19.34 19.668 19.94 20.178 20.305 20.243 19.854 18.757 17.117 15.574 14.134 12.902 11.781 10.754 9.8 8.981 8.189 7.467 6.776 6.097 5.456 4.853 4.29 3.701 3.159 2.694 2.182 1.64 1.214 0.754 0.264 -0.129 -0.547 -0.978 -1.421 -1.879 -2.2 -2.518 -2.995 -3.348 -3.734 -3.941 -4.381 -4.834 -5.303 -5.542 -6.166 -6.312 -6.592 -6.908 -7.619 -8.008 -8.416 -8.874 -9.404 -9.97 -10.699 -12.094 -5 ,28628 ,TETRA ,17605162,Sun Nov 28 18:45:15 CET,Sun Nov 28 20:34:23 CET,0.0 2.65 3.613 4.28 4.836 5.304 5.727 6.111 6.797 7.102 7.369 7.516 8.086 8.299 8.703 9.101 9.486 9.691 10.088 10.432 10.903 11.195 11.484 11.88 12.246 12.605 12.943 13.269 13.631 13.933 14.239 14.601 14.95 15.289 15.681 16.122 16.497 16.853 17.218 17.582 17.95 18.337 18.71 19.013 19.299 19.584 19.808 19.892 19.81 19.416 18.309 16.686 15.173 13.771 12.523 11.384 10.393 9.454 8.645 7.834 7.068 6.383 5.737 5.118 4.545 3.971 3.357 2.826 2.329 1.8 1.276 0.827 0.346 -0.175 -0.641 -1.125 -1.574 -2.019 -2.494 -2.833 -3.195 -3.804 -4.244 -4.692 -4.913 -5.382 -5.895 -6.406 -6.662 -7.327 -7.63 -7.973 -8.336 -9.135 -9.587 -10.093 -10.644 -11.25 -11.932 -12.902 -15.832 -6 ,9523 ,TETRA ,17605163,Sun Nov 28 18:45:15 CET,Sun Nov 28 20:34:53 CET,0.0 2.853 3.756 4.346 4.864 5.329 5.77 6.169 6.811 7.109 7.403 7.588 8.182 8.422 8.824 9.156 9.49 9.66 10.004 10.321 10.757 11.036 11.275 11.608 11.967 12.288 12.548 12.795 13.131 13.473 13.796 14.143 14.442 14.751 15.108 15.463 15.791 16.124 16.461 16.823 17.208 17.616 18.01 18.332 18.635 18.923 19.167 19.327 19.36 18.991 17.883 16.253 14.662 13.191 11.938 10.812 9.847 8.952 8.147 7.321 6.568 5.893 5.248 4.618 4.034 3.461 2.839 2.324 1.87 1.403 0.934 0.516 0.062 -0.423 -0.798 -1.182 -1.594 -2.047 -2.545 -2.867 -3.165 -3.654 -4.014 -4.383 -4.575 -4.987 -5.432 -5.917 -6.159 -6.765 -6.917 -7.206 -7.513 -8.207 -8.592 -9.02 -9.494 -10.007 -10.601 -11.429 -14.173 -7 ,16319 ,TETRA ,17605164,Sun Nov 28 18:45:16 CET,Sun Nov 28 20:35:34 CET,0.0 2.725 3.739 4.432 4.994 5.473 5.96 6.431 7.201 7.524 7.822 8.005 8.58 8.791 9.204 9.61 9.998 10.178 10.504 10.811 11.257 11.548 11.837 12.247 12.629 12.996 13.319 13.59 13.959 14.351 14.711 15.09 15.4 15.689 16.077 16.47 16.773 17.119 17.462 17.755 18.052 18.396 18.713 18.957 19.219 19.498 19.754 19.886 19.883 19.49 18.364 16.679 15.072 13.666 12.471 11.378 10.421 9.45 8.556 7.677 6.929 6.267 5.592 4.923 4.309 3.734 3.115 2.558 2.071 1.573 1.057 0.616 0.146 -0.352 -0.756 -1.188 -1.614 -2.041 -2.495 -2.811 -3.148 -3.699 -4.09 -4.469 -4.666 -5.104 -5.525 -5.959 -6.198 -6.828 -7.036 -7.337 -7.635 -8.267 -8.614 -9.002 -9.501 -10.104 -10.801 -11.706 -13.538 -8 ,9873 ,TETRA ,17605165,Sun Nov 28 18:45:17 CET,Sun Nov 28 20:37:27 CET,0.0 2.361 3.258 3.933 4.522 5.011 5.45 5.849 6.541 6.832 7.111 7.303 7.895 8.129 8.598 9.036 9.418 9.594 9.944 10.268 10.724 10.994 11.239 11.603 11.934 12.228 12.512 12.801 13.207 13.574 13.871 14.231 14.606 14.965 15.354 15.746 16.137 16.591 17.007 17.378 17.74 18.136 18.586 18.951 19.276 19.551 19.757 19.883 19.825 19.452 18.424 16.82 15.32 13.95 12.734 11.598 10.562 9.622 8.779 7.936 7.243 6.615 5.99 5.396 4.838 4.292 3.694 3.148 2.683 2.197 1.685 1.24 0.754 0.258 -0.132 -0.526 -0.931 -1.388 -1.867 -2.175 -2.497 -3.007 -3.358 -3.749 -3.959 -4.398 -4.826 -5.268 -5.519 -6.137 -6.325 -6.642 -6.963 -7.621 -7.962 -8.374 -8.848 -9.39 -10.112 -11.185 -14.396 -9 ,11449 ,TETRA ,17605166,Sun Nov 28 18:46:16 CET,Sun Nov 28 20:36:06 CET,0.0 2.655 3.65 4.333 4.861 5.345 5.791 6.156 6.765 7.043 7.319 7.493 8.084 8.328 8.782 9.194 9.591 9.778 10.137 10.482 10.971 11.278 11.557 11.941 12.301 12.647 12.951 13.243 13.616 13.983 14.347 14.7 15.005 15.283 15.616 15.975 16.272 16.582 16.912 17.248 17.593 17.978 18.363 18.689 19.051 19.415 19.71 19.891 19.844 19.419 18.356 16.726 15.179 13.791 12.567 11.426 10.432 9.519 8.693 7.862 7.093 6.396 5.736 5.106 4.532 3.985 3.422 2.938 2.498 1.999 1.466 1.005 0.537 0.097 -0.278 -0.705 -1.116 -1.575 -2.098 -2.432 -2.767 -3.277 -3.642 -4.039 -4.237 -4.65 -5.119 -5.618 -5.876 -6.503 -6.655 -6.935 -7.239 -7.924 -8.306 -8.719 -9.162 -9.683 -10.346 -11.185 -13.339 -10 ,15996 ,TETRA ,17605167,Sun Nov 28 18:46:17 CET,Sun Nov 28 20:35:49 CET,0.0 2.522 3.501 4.211 4.783 5.288 5.729 6.126 6.819 7.12 7.415 7.607 8.21 8.458 8.936 9.382 9.751 9.911 10.222 10.537 10.981 11.237 11.474 11.835 12.217 12.587 12.933 13.251 13.673 14.052 14.386 14.786 15.136 15.444 15.777 16.139 16.454 16.803 17.177 17.514 17.828 18.195 18.644 19.032 19.394 19.693 19.928 20.078 20.044 19.683 18.68 17.086 15.564 14.151 12.83 11.657 10.65 9.73 8.911 8.062 7.349 6.702 6.031 5.333 4.685 4.155 3.59 3.031 2.544 2.058 1.552 1.101 0.618 0.135 -0.244 -0.645 -1.031 -1.422 -1.863 -2.181 -2.507 -3.019 -3.404 -3.805 -4.001 -4.419 -4.88 -5.359 -5.607 -6.23 -6.396 -6.701 -7.029 -7.77 -8.162 -8.571 -9.095 -9.659 -10.277 -11.02 -12.924 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt deleted file mode 100644 index 8645b287..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28228 ,TETRA ,17605168,Sun Nov 28 18:46:16 CET,Sun Nov 28 20:38:07 CET,0.0 3.486 4.288 4.864 5.367 5.794 6.17 6.542 7.197 7.469 7.739 7.899 8.478 8.689 9.126 9.546 9.917 10.102 10.456 10.8 11.302 11.607 11.897 12.299 12.682 13.051 13.404 13.761 14.217 14.634 15.026 15.497 15.98 16.416 16.862 17.337 17.84 18.395 18.931 19.462 19.97 20.53 21.15 21.786 22.497 23.242 24.069 24.899 25.771 26.719 27.642 27.918 27.71 27.309 26.789 26.212 25.64 25.052 24.458 23.83 23.283 22.788 22.285 21.743 21.22 20.717 20.142 19.634 19.17 18.645 18.086 17.595 17.067 16.545 16.119 15.639 15.13 14.605 14.05 13.645 13.228 12.592 12.127 11.622 11.363 10.818 10.23 9.578 9.22 8.518 8.11 7.676 7.222 6.265 5.716 5.127 4.409 3.518 2.447 0.98 -3.39 -2 ,14596 ,TETRA ,17605169,Sun Nov 28 18:46:18 CET,Sun Nov 28 20:38:20 CET,0.0 2.091 2.873 3.505 3.995 4.433 4.847 5.201 5.821 6.129 6.435 6.659 7.273 7.523 7.993 8.416 8.818 9.01 9.362 9.695 10.174 10.468 10.739 11.143 11.53 11.906 12.264 12.584 13.002 13.454 13.878 14.337 14.773 15.174 15.617 16.093 16.551 17.035 17.522 18.012 18.517 19.124 19.802 20.425 21.108 21.83 22.636 23.493 24.426 25.352 26.178 26.472 26.283 25.879 25.379 24.816 24.244 23.685 23.119 22.454 21.871 21.327 20.768 20.271 19.798 19.288 18.691 18.133 17.658 17.161 16.593 16.122 15.675 15.163 14.716 14.269 13.803 13.263 12.677 12.282 11.884 11.246 10.793 10.332 10.088 9.575 9.011 8.379 8.045 7.349 6.976 6.576 6.141 5.157 4.575 3.959 3.293 2.472 1.474 0.149 -4.75 -3 ,15982 ,TETRA ,17605170,Sun Nov 28 18:46:18 CET,Sun Nov 28 20:37:46 CET,0.0 2.435 3.244 3.807 4.274 4.685 5.052 5.411 6.071 6.377 6.667 6.825 7.407 7.629 8.079 8.495 8.875 9.056 9.414 9.766 10.257 10.556 10.843 11.238 11.612 11.995 12.355 12.685 13.087 13.512 13.937 14.394 14.812 15.21 15.642 16.092 16.56 17.093 17.606 18.124 18.646 19.181 19.777 20.372 21.065 21.807 22.613 23.483 24.404 25.402 26.264 26.481 26.217 25.737 25.198 24.593 23.947 23.348 22.846 22.259 21.675 21.101 20.552 20.05 19.57 19.108 18.577 18.065 17.603 17.11 16.517 15.973 15.453 14.968 14.592 14.182 13.715 13.154 12.519 12.118 11.721 11.092 10.656 10.201 9.972 9.479 8.933 8.317 7.988 7.299 6.889 6.481 6.027 5.006 4.454 3.841 3.148 2.353 1.4 0.024 -5.487 -4 ,19756 ,TETRA ,17605171,Sun Nov 28 18:46:17 CET,Sun Nov 28 20:39:15 CET,0.0 1.598 2.456 3.086 3.571 3.967 4.315 4.646 5.289 5.602 5.895 6.06 6.646 6.861 7.274 7.659 8.028 8.214 8.591 8.939 9.443 9.765 10.043 10.447 10.833 11.191 11.582 11.977 12.438 12.818 13.167 13.631 14.053 14.446 14.926 15.395 15.812 16.3 16.811 17.302 17.812 18.404 19.101 19.773 20.48 21.229 22.012 22.824 23.711 24.625 25.431 25.657 25.399 24.982 24.494 23.91 23.331 22.762 22.207 21.563 20.997 20.486 19.95 19.433 18.946 18.424 17.791 17.228 16.749 16.253 15.726 15.27 14.774 14.262 13.858 13.43 12.967 12.42 11.838 11.47 11.071 10.427 9.958 9.447 9.186 8.633 8.053 7.439 7.115 6.438 6.058 5.629 5.165 4.116 3.527 2.921 2.217 1.376 0.293 -1.12 -5.481 -5 ,31438 ,TETRA ,17605172,Sun Nov 28 18:47:16 CET,Sun Nov 28 20:38:46 CET,0.0 2.019 2.883 3.504 3.998 4.442 4.835 5.206 5.919 6.223 6.496 6.674 7.28 7.513 7.952 8.38 8.795 8.991 9.354 9.717 10.231 10.534 10.819 11.237 11.642 12.027 12.375 12.708 13.177 13.617 14.004 14.429 14.814 15.216 15.69 16.192 16.628 17.085 17.594 18.114 18.615 19.173 19.816 20.431 21.155 21.935 22.817 23.746 24.71 25.685 26.463 26.608 26.333 25.883 25.379 24.857 24.321 23.79 23.287 22.711 22.139 21.568 21.003 20.454 19.932 19.412 18.832 18.315 17.871 17.417 16.908 16.423 15.939 15.423 14.982 14.533 14.03 13.506 12.959 12.539 12.082 11.421 10.961 10.47 10.233 9.706 9.145 8.567 8.234 7.537 7.122 6.711 6.284 5.236 4.643 4.017 3.304 2.433 1.361 -0.084 -6.125 -6 ,1901 ,TETRA ,17605173,Sun Nov 28 18:47:16 CET,Sun Nov 28 20:39:25 CET,0.0 1.819 2.562 3.131 3.607 4.051 4.488 4.877 5.519 5.813 6.092 6.21 6.785 7.018 7.459 7.86 8.259 8.448 8.796 9.149 9.643 9.929 10.215 10.652 11.081 11.512 11.95 12.325 12.736 13.131 13.531 14.014 14.444 14.837 15.266 15.72 16.142 16.607 17.137 17.674 18.18 18.739 19.42 20.121 20.909 21.665 22.452 23.32 24.222 25.133 25.945 26.223 26.001 25.522 25.03 24.449 23.857 23.305 22.741 22.065 21.444 20.92 20.421 19.887 19.335 18.82 18.284 17.788 17.345 16.868 16.358 15.903 15.383 14.833 14.407 14.0 13.575 13.094 12.57 12.18 11.746 11.056 10.604 10.133 9.879 9.344 8.777 8.171 7.847 7.153 6.747 6.345 5.936 4.978 4.391 3.771 3.081 2.226 1.143 -0.36 -5.194 -7 ,27473 ,TETRA ,17605174,Sun Nov 28 18:48:15 CET,Sun Nov 28 20:39:47 CET,0.0 2.184 2.942 3.527 3.981 4.368 4.75 5.099 5.699 5.981 6.242 6.426 7.034 7.257 7.68 8.062 8.424 8.595 8.925 9.238 9.66 9.928 10.198 10.614 11.023 11.412 11.771 12.103 12.521 12.908 13.302 13.76 14.169 14.58 15.046 15.547 16.009 16.504 17.017 17.52 18.048 18.627 19.263 19.875 20.555 21.258 22.05 22.908 23.837 24.773 25.492 25.689 25.512 25.111 24.584 23.964 23.388 22.808 22.234 21.597 21.036 20.502 19.925 19.373 18.842 18.278 17.651 17.132 16.692 16.235 15.711 15.269 14.8 14.259 13.845 13.38 12.859 12.335 11.793 11.405 10.991 10.336 9.86 9.346 9.085 8.56 7.991 7.383 7.061 6.355 5.887 5.474 5.054 4.031 3.447 2.805 2.087 1.268 0.265 -1.015 -6.234 -8 ,20655 ,TETRA ,17605175,Sun Nov 28 18:47:16 CET,Sun Nov 28 20:39:10 CET,0.0 2.638 3.386 3.953 4.434 4.874 5.254 5.599 6.23 6.518 6.794 6.942 7.539 7.773 8.2 8.602 8.981 9.159 9.512 9.863 10.349 10.656 10.95 11.359 11.729 12.096 12.468 12.824 13.265 13.704 14.13 14.611 15.026 15.387 15.778 16.23 16.7 17.208 17.699 18.174 18.68 19.249 19.877 20.503 21.226 21.976 22.77 23.61 24.492 25.429 26.285 26.468 26.264 25.866 25.35 24.808 24.246 23.674 23.13 22.521 21.966 21.447 20.925 20.42 19.919 19.376 18.769 18.24 17.772 17.286 16.747 16.286 15.807 15.296 14.883 14.421 13.91 13.389 12.891 12.518 12.107 11.471 11.037 10.595 10.348 9.782 9.185 8.579 8.25 7.56 7.182 6.793 6.354 5.328 4.777 4.201 3.514 2.682 1.692 0.27 -5.053 -9 ,20545 ,TETRA ,17605176,Sun Nov 28 18:47:16 CET,Sun Nov 28 20:38:53 CET,0.0 1.71 2.405 2.966 3.451 3.848 4.211 4.55 5.153 5.44 5.706 5.813 6.401 6.639 7.088 7.482 7.852 8.033 8.376 8.709 9.172 9.453 9.732 10.119 10.461 10.797 11.14 11.45 11.855 12.281 12.697 13.221 13.67 14.042 14.474 14.945 15.397 15.876 16.351 16.845 17.365 17.976 18.69 19.332 20.028 20.851 21.794 22.71 23.636 24.605 25.4 25.549 25.331 24.963 24.503 23.95 23.363 22.791 22.206 21.56 20.989 20.459 19.932 19.334 18.763 18.299 17.77 17.225 16.718 16.162 15.599 15.164 14.699 14.162 13.736 13.324 12.879 12.394 11.868 11.491 11.107 10.481 10.023 9.554 9.302 8.761 8.162 7.468 7.106 6.398 6.005 5.64 5.241 4.268 3.696 3.059 2.311 1.479 0.488 -1.037 -6.043 -10 ,2987 ,TETRA ,17605177,Sun Nov 28 18:47:16 CET,Sun Nov 28 20:38:15 CET,0.0 2.083 2.785 3.334 3.824 4.243 4.628 4.988 5.622 5.897 6.143 6.248 6.84 7.069 7.482 7.876 8.256 8.434 8.779 9.12 9.601 9.889 10.166 10.589 10.997 11.36 11.682 11.985 12.392 12.786 13.155 13.586 14.001 14.415 14.859 15.317 15.751 16.252 16.787 17.29 17.791 18.338 18.942 19.54 20.238 20.996 21.795 22.612 23.511 24.488 25.37 25.635 25.476 25.149 24.71 24.187 23.656 23.097 22.539 21.92 21.316 20.75 20.214 19.712 19.228 18.765 18.252 17.752 17.286 16.824 16.351 15.912 15.443 14.915 14.483 14.008 13.504 13.004 12.494 12.139 11.75 11.083 10.596 10.119 9.874 9.33 8.745 8.129 7.823 7.146 6.778 6.397 5.983 5.057 4.529 3.904 3.199 2.405 1.467 0.099 -5.196 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt deleted file mode 100644 index a3173ed4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8605 ,TETRA ,17605178,Sun Nov 28 18:47:16 CET,Sun Nov 28 20:40:14 CET,0.0 3.511 4.425 5.074 5.623 6.098 6.544 6.947 7.64 7.946 8.25 8.482 9.106 9.356 9.817 10.264 10.69 10.894 11.299 11.669 12.158 12.468 12.775 13.251 13.702 14.098 14.484 14.856 15.324 15.777 16.244 16.815 17.281 17.676 18.149 18.667 19.144 19.701 20.291 20.886 21.478 22.119 22.826 23.467 24.192 24.984 25.892 26.866 27.88 28.951 29.922 30.205 30.014 29.629 29.107 28.501 27.933 27.392 26.836 26.207 25.648 25.141 24.652 24.158 23.646 23.159 22.601 22.063 21.618 21.171 20.669 20.2 19.71 19.2 18.824 18.435 17.976 17.493 16.981 16.617 16.251 15.653 15.211 14.739 14.496 14.004 13.461 12.879 12.572 11.895 11.574 11.208 10.824 9.952 9.443 8.871 8.207 7.425 6.451 5.149 1.237 -2 ,545 ,TETRA ,17605179,Sun Nov 28 18:47:16 CET,Sun Nov 28 20:40:11 CET,0.0 2.159 3.006 3.614 4.126 4.586 5.007 5.395 6.1 6.423 6.73 6.965 7.584 7.848 8.337 8.79 9.227 9.433 9.829 10.19 10.719 11.084 11.425 11.891 12.331 12.746 13.114 13.461 13.923 14.355 14.764 15.242 15.701 16.13 16.585 17.109 17.626 18.188 18.77 19.334 19.898 20.545 21.276 21.974 22.789 23.652 24.522 25.399 26.372 27.418 28.383 28.713 28.503 28.105 27.635 27.115 26.511 25.883 25.326 24.716 24.172 23.668 23.171 22.687 22.21 21.729 21.177 20.66 20.218 19.734 19.239 18.8 18.335 17.846 17.437 17.026 16.586 16.104 15.56 15.184 14.819 14.229 13.783 13.311 13.069 12.555 12.0 11.411 11.093 10.42 10.105 9.728 9.307 8.349 7.805 7.189 6.535 5.821 4.944 3.747 -0.49 -3 ,5676 ,TETRA ,17605180,Sun Nov 28 18:47:16 CET,Sun Nov 28 20:39:03 CET,0.0 3.048 3.938 4.622 5.168 5.64 6.051 6.422 7.079 7.382 7.672 7.855 8.468 8.714 9.186 9.617 10.035 10.251 10.653 11.022 11.557 11.885 12.19 12.637 13.081 13.503 13.896 14.282 14.768 15.227 15.69 16.26 16.752 17.208 17.732 18.25 18.744 19.28 19.879 20.489 21.081 21.763 22.497 23.172 23.918 24.725 25.619 26.571 27.604 28.66 29.697 30.058 29.835 29.444 29.001 28.456 27.857 27.28 26.765 26.172 25.577 25.039 24.499 23.911 23.328 22.794 22.274 21.782 21.332 20.887 20.382 19.914 19.418 18.929 18.532 18.078 17.617 17.132 16.607 16.248 15.862 15.267 14.852 14.39 14.143 13.65 13.118 12.525 12.228 11.561 11.193 10.818 10.428 9.579 9.106 8.563 7.954 7.274 6.462 5.301 1.73 -4 ,8412 ,TETRA ,17605181,Sun Nov 28 18:48:15 CET,Sun Nov 28 20:41:04 CET,0.0 2.251 3.094 3.73 4.247 4.677 5.071 5.434 6.084 6.387 6.667 6.846 7.459 7.705 8.164 8.605 9.023 9.214 9.582 9.952 10.459 10.761 11.064 11.521 11.964 12.395 12.804 13.178 13.629 14.062 14.466 14.951 15.457 15.932 16.439 17.009 17.543 18.087 18.616 19.145 19.698 20.299 21.001 21.727 22.495 23.306 24.206 25.102 26.079 27.144 28.121 28.424 28.241 27.871 27.345 26.759 26.176 25.563 24.984 24.391 23.881 23.391 22.873 22.347 21.822 21.306 20.76 20.264 19.8 19.301 18.77 18.329 17.865 17.354 16.953 16.529 16.072 15.609 15.128 14.782 14.415 13.817 13.405 12.978 12.747 12.271 11.762 11.19 10.889 10.245 9.943 9.573 9.156 8.232 7.724 7.146 6.518 5.832 4.986 3.691 -1.853 -5 ,4031 ,TETRA ,17605182,Sun Nov 28 18:48:15 CET,Sun Nov 28 20:41:18 CET,0.0 1.992 2.814 3.432 3.955 4.422 4.825 5.168 5.798 6.088 6.36 6.556 7.18 7.419 7.869 8.307 8.725 8.92 9.303 9.645 10.122 10.444 10.751 11.211 11.663 12.089 12.505 12.914 13.423 13.847 14.197 14.628 15.087 15.515 15.982 16.504 17.025 17.608 18.142 18.66 19.253 19.916 20.647 21.343 22.111 22.91 23.76 24.692 25.727 26.796 27.726 28.025 27.868 27.491 26.967 26.393 25.803 25.23 24.654 23.983 23.381 22.833 22.247 21.668 21.163 20.658 20.043 19.517 19.104 18.644 18.093 17.605 17.103 16.579 16.166 15.745 15.341 14.914 14.405 14.035 13.665 13.093 12.677 12.204 11.958 11.462 10.914 10.33 10.029 9.367 9.002 8.628 8.254 7.42 6.926 6.351 5.703 4.951 4.017 2.712 -1.045 -6 ,30520 ,TETRA ,17605183,Sun Nov 28 18:48:17 CET,Sun Nov 28 20:40:49 CET,0.0 2.368 3.328 4.054 4.649 5.122 5.55 5.938 6.599 6.897 7.181 7.359 7.966 8.221 8.715 9.156 9.555 9.751 10.15 10.511 11.021 11.369 11.691 12.162 12.618 13.02 13.392 13.743 14.209 14.646 15.073 15.601 16.085 16.554 17.086 17.636 18.116 18.592 19.085 19.624 20.19 20.825 21.57 22.29 23.067 23.9 24.834 25.805 26.794 27.828 28.769 29.059 28.841 28.395 27.849 27.245 26.672 26.134 25.609 25.034 24.503 23.96 23.429 22.948 22.425 21.906 21.37 20.866 20.405 19.888 19.344 18.924 18.504 18.042 17.657 17.223 16.771 16.293 15.758 15.408 15.067 14.495 14.069 13.575 13.305 12.781 12.263 11.698 11.381 10.703 10.352 9.991 9.613 8.723 8.195 7.598 6.932 6.161 5.233 3.883 -6.919 -7 ,8654 ,TETRA ,17605184,Sun Nov 28 18:48:16 CET,Sun Nov 28 20:41:10 CET,0.0 3.628 4.509 5.138 5.668 6.16 6.613 7.007 7.636 7.934 8.227 8.397 9.005 9.254 9.734 10.187 10.585 10.768 11.132 11.504 12.025 12.318 12.613 13.035 13.449 13.862 14.255 14.644 15.098 15.493 15.883 16.394 16.872 17.334 17.876 18.396 18.866 19.42 20.022 20.624 21.227 21.884 22.61 23.277 24.03 24.866 25.785 26.749 27.783 28.875 29.814 30.085 29.912 29.581 29.123 28.578 28.02 27.477 26.927 26.319 25.778 25.258 24.766 24.301 23.782 23.278 22.79 22.354 21.957 21.482 20.954 20.531 20.134 19.69 19.27 18.832 18.41 17.942 17.393 17.002 16.619 16.026 15.599 15.136 14.891 14.375 13.828 13.25 12.943 12.282 11.886 11.492 11.086 10.192 9.717 9.185 8.52 7.731 6.858 5.622 0.869 -8 ,2397 ,TETRA ,17605185,Sun Nov 28 18:48:17 CET,Sun Nov 28 20:40:48 CET,0.0 2.793 3.807 4.598 5.247 5.767 6.192 6.586 7.328 7.669 7.999 8.271 8.927 9.226 9.771 10.292 10.778 10.999 11.422 11.835 12.445 12.818 13.162 13.679 14.195 14.688 15.153 15.582 16.094 16.575 17.033 17.602 18.134 18.606 19.191 19.859 20.436 21.008 21.617 22.245 22.856 23.541 24.329 25.102 25.992 26.969 28.0 29.1 30.327 31.563 32.619 32.905 32.748 32.366 31.877 31.306 30.734 30.194 29.665 29.061 28.492 27.959 27.422 26.898 26.396 25.899 25.356 24.819 24.362 23.901 23.354 22.893 22.42 21.908 21.51 21.091 20.671 20.24 19.762 19.415 19.043 18.444 18.006 17.517 17.255 16.737 16.219 15.654 15.344 14.674 14.376 14.007 13.595 12.718 12.235 11.696 11.087 10.36 9.5 8.373 4.226 -9 ,7004 ,TETRA ,17605186,Sun Nov 28 18:48:17 CET,Sun Nov 28 20:40:44 CET,0.0 2.189 2.99 3.61 4.135 4.593 4.993 5.379 6.091 6.401 6.692 6.866 7.47 7.71 8.165 8.571 8.967 9.165 9.544 9.919 10.453 10.775 11.073 11.513 11.953 12.366 12.754 13.122 13.582 14.033 14.472 15.003 15.507 15.976 16.495 17.032 17.526 18.059 18.621 19.227 19.872 20.564 21.301 21.992 22.764 23.59 24.493 25.512 26.554 27.558 28.56 28.814 28.549 28.148 27.663 27.12 26.542 25.987 25.458 24.882 24.33 23.783 23.268 22.775 22.253 21.721 21.143 20.573 20.07 19.574 19.063 18.636 18.156 17.62 17.22 16.822 16.413 15.999 15.518 15.15 14.764 14.136 13.693 13.256 13.027 12.495 11.887 11.247 10.918 10.237 9.884 9.51 9.108 8.247 7.779 7.254 6.636 5.93 5.094 3.973 0.395 -10 ,11010 ,TETRA ,17605187,Sun Nov 28 18:48:17 CET,Sun Nov 28 20:41:03 CET,0.0 2.396 3.246 3.902 4.444 4.895 5.317 5.727 6.489 6.817 7.11 7.298 7.915 8.167 8.64 9.103 9.543 9.744 10.116 10.473 10.988 11.338 11.668 12.108 12.527 12.927 13.313 13.68 14.139 14.549 14.955 15.476 15.978 16.447 16.962 17.555 18.125 18.731 19.329 19.926 20.508 21.092 21.769 22.439 23.179 23.987 24.892 25.834 26.815 27.836 28.844 29.193 29.057 28.721 28.201 27.624 27.103 26.554 26.006 25.433 24.866 24.311 23.758 23.259 22.761 22.28 21.812 21.355 20.93 20.476 19.984 19.565 19.092 18.574 18.172 17.739 17.291 16.831 16.321 15.962 15.576 14.945 14.503 14.05 13.816 13.287 12.722 12.15 11.856 11.194 10.864 10.499 10.089 9.212 8.734 8.18 7.546 6.818 5.876 4.662 1.26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23467_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23467_23466.txt deleted file mode 100644 index d750be97..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23467_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6967 ,TETRA ,17605188,Sun Nov 28 18:48:16 CET,Sun Nov 28 20:32:18 CET,0.0 1.563 2.334 2.913 3.375 3.764 4.088 4.389 4.912 5.136 5.354 5.413 5.912 6.098 6.449 6.769 7.095 7.25 7.522 7.773 8.124 8.331 8.537 8.873 9.174 9.45 9.713 9.93 10.164 10.408 10.681 10.969 11.196 11.431 11.718 12.002 12.223 12.438 12.661 12.877 13.082 13.285 13.479 13.644 13.76 13.809 13.75 13.562 13.144 12.282 10.561 8.358 6.515 4.941 3.584 2.331 1.205 0.205 -0.701 -1.672 -2.47 -3.145 -3.84 -4.496 -5.058 -5.588 -6.183 -6.771 -7.293 -7.809 -8.353 -8.822 -9.314 -9.806 -10.179 -10.596 -11.037 -11.475 -11.958 -12.314 -12.67 -13.238 -13.65 -14.073 -14.288 -14.729 -15.181 -15.674 -15.955 -16.584 -16.801 -17.114 -17.445 -18.176 -18.591 -19.051 -19.564 -20.16 -20.893 -21.849 -24.227 -2 ,2231 ,TETRA ,17605189,Sun Nov 28 18:48:17 CET,Sun Nov 28 20:31:53 CET,0.0 2.538 3.34 3.883 4.318 4.693 5.041 5.346 5.916 6.182 6.403 6.474 6.982 7.166 7.536 7.879 8.179 8.32 8.617 8.914 9.287 9.51 9.727 10.04 10.325 10.567 10.797 11.009 11.274 11.552 11.847 12.152 12.382 12.595 12.855 13.152 13.39 13.633 13.88 14.137 14.378 14.561 14.717 14.853 14.984 15.049 15.008 14.828 14.431 13.649 12.039 9.869 8.017 6.454 5.084 3.824 2.711 1.724 0.867 -0.043 -0.84 -1.567 -2.258 -2.888 -3.481 -4.063 -4.673 -5.201 -5.689 -6.245 -6.85 -7.354 -7.865 -8.399 -8.822 -9.244 -9.682 -10.179 -10.713 -11.057 -11.385 -11.918 -12.307 -12.729 -12.946 -13.401 -13.89 -14.388 -14.657 -15.287 -15.558 -15.879 -16.215 -16.951 -17.354 -17.83 -18.38 -19.01 -19.753 -20.753 -23.094 -3 ,8801 ,TETRA ,17605190,Sun Nov 28 18:48:17 CET,Sun Nov 28 20:32:32 CET,0.0 1.525 2.155 2.668 3.123 3.508 3.846 4.172 4.739 4.993 5.233 5.342 5.861 6.052 6.388 6.686 6.965 7.101 7.361 7.605 7.962 8.182 8.384 8.688 8.989 9.273 9.531 9.765 10.034 10.302 10.562 10.826 11.084 11.332 11.583 11.841 12.069 12.303 12.554 12.77 12.936 13.147 13.415 13.606 13.741 13.791 13.755 13.588 13.162 12.329 10.703 8.613 6.824 5.282 3.916 2.661 1.575 0.592 -0.302 -1.2 -1.963 -2.653 -3.299 -4.001 -4.682 -5.261 -5.899 -6.485 -7.003 -7.55 -8.127 -8.595 -9.068 -9.558 -9.95 -10.367 -10.8 -11.251 -11.735 -12.082 -12.43 -12.991 -13.387 -13.805 -14.032 -14.474 -14.923 -15.422 -15.692 -16.31 -16.566 -16.889 -17.223 -17.958 -18.359 -18.804 -19.311 -19.885 -20.545 -21.463 -24.05 -4 ,24031 ,TETRA ,17605191,Sun Nov 28 18:48:18 CET,Sun Nov 28 20:33:06 CET,0.0 1.764 2.484 3.013 3.445 3.801 4.13 4.442 5.029 5.282 5.511 5.65 6.157 6.332 6.7 7.042 7.354 7.505 7.801 8.076 8.439 8.657 8.87 9.176 9.456 9.727 9.992 10.233 10.537 10.839 11.116 11.417 11.691 11.922 12.187 12.482 12.715 12.953 13.196 13.449 13.7 13.913 14.137 14.349 14.484 14.541 14.485 14.285 13.929 13.108 11.451 9.384 7.649 6.112 4.739 3.519 2.449 1.471 0.579 -0.342 -1.124 -1.819 -2.516 -3.207 -3.828 -4.363 -4.925 -5.457 -5.916 -6.376 -6.863 -7.296 -7.775 -8.308 -8.705 -9.097 -9.526 -9.976 -10.447 -10.782 -11.145 -11.731 -12.154 -12.588 -12.795 -13.213 -13.67 -14.156 -14.41 -15.028 -15.288 -15.595 -15.933 -16.704 -17.101 -17.555 -18.098 -18.682 -19.382 -20.408 -22.986 -5 ,30805 ,TETRA ,17605192,Sun Nov 28 18:48:20 CET,Sun Nov 28 20:33:09 CET,0.0 1.812 2.544 3.066 3.499 3.882 4.193 4.487 5.01 5.243 5.463 5.534 6.041 6.234 6.605 6.932 7.226 7.373 7.642 7.875 8.234 8.457 8.661 8.956 9.239 9.507 9.752 9.949 10.2 10.487 10.765 11.068 11.326 11.57 11.82 12.062 12.29 12.52 12.741 12.936 13.114 13.305 13.52 13.67 13.761 13.799 13.748 13.539 13.142 12.383 10.825 8.726 6.827 5.151 3.71 2.46 1.376 0.372 -0.533 -1.524 -2.4 -3.148 -3.869 -4.544 -5.139 -5.683 -6.315 -6.891 -7.354 -7.846 -8.372 -8.818 -9.302 -9.832 -10.243 -10.666 -11.103 -11.557 -12.047 -12.387 -12.738 -13.301 -13.699 -14.107 -14.33 -14.794 -15.255 -15.744 -16.016 -16.653 -16.924 -17.266 -17.62 -18.363 -18.785 -19.252 -19.763 -20.343 -21.024 -21.944 -24.657 -6 ,29077 ,TETRA ,17605193,Sun Nov 28 18:48:22 CET,Sun Nov 28 20:32:29 CET,0.0 1.712 2.445 3.022 3.506 3.907 4.24 4.524 5.033 5.265 5.482 5.604 6.132 6.325 6.677 6.984 7.274 7.413 7.681 7.939 8.268 8.48 8.703 8.999 9.281 9.561 9.829 10.083 10.356 10.602 10.853 11.136 11.405 11.651 11.902 12.158 12.364 12.579 12.818 13.029 13.257 13.487 13.674 13.823 13.938 14.042 14.077 13.923 13.503 12.737 11.153 9.008 7.206 5.634 4.243 2.99 1.908 0.915 0.017 -0.902 -1.738 -2.524 -3.283 -3.982 -4.63 -5.234 -5.876 -6.446 -6.951 -7.489 -7.998 -8.41 -8.863 -9.364 -9.774 -10.184 -10.612 -11.086 -11.583 -11.932 -12.286 -12.842 -13.238 -13.655 -13.869 -14.296 -14.749 -15.257 -15.548 -16.169 -16.392 -16.711 -17.031 -17.718 -18.122 -18.564 -19.059 -19.647 -20.372 -21.342 -23.873 -7 ,9074 ,TETRA ,17605194,Sun Nov 28 18:48:23 CET,Sun Nov 28 20:32:45 CET,0.0 1.575 2.256 2.821 3.263 3.634 3.981 4.285 4.83 5.078 5.313 5.444 5.965 6.156 6.523 6.868 7.196 7.339 7.57 7.794 8.136 8.351 8.554 8.843 9.122 9.406 9.679 9.926 10.266 10.577 10.832 11.13 11.418 11.674 11.951 12.259 12.544 12.84 13.108 13.345 13.597 13.837 14.028 14.194 14.33 14.36 14.311 14.154 13.807 13.057 11.491 9.336 7.505 5.954 4.617 3.441 2.346 1.245 0.33 -0.533 -1.28 -1.993 -2.74 -3.408 -4.04 -4.622 -5.21 -5.803 -6.302 -6.786 -7.321 -7.781 -8.265 -8.782 -9.184 -9.611 -10.049 -10.507 -10.986 -11.312 -11.66 -12.194 -12.567 -12.967 -13.183 -13.625 -14.081 -14.571 -14.831 -15.459 -15.765 -16.118 -16.476 -17.208 -17.6 -18.038 -18.558 -19.17 -19.887 -20.816 -22.931 -8 ,15902 ,TETRA ,17605195,Sun Nov 28 18:48:17 CET,Sun Nov 28 20:32:15 CET,0.0 1.598 2.276 2.838 3.288 3.659 3.993 4.299 4.842 5.094 5.33 5.441 5.951 6.136 6.482 6.804 7.12 7.27 7.554 7.814 8.168 8.39 8.599 8.898 9.183 9.44 9.686 9.934 10.235 10.495 10.736 10.994 11.208 11.427 11.67 11.911 12.148 12.371 12.559 12.744 12.929 13.123 13.341 13.513 13.634 13.708 13.692 13.541 13.124 12.346 10.847 8.734 6.876 5.277 3.854 2.542 1.433 0.448 -0.423 -1.294 -2.049 -2.722 -3.396 -4.037 -4.637 -5.217 -5.807 -6.321 -6.76 -7.236 -7.79 -8.275 -8.769 -9.272 -9.66 -10.075 -10.5 -10.946 -11.434 -11.798 -12.166 -12.699 -13.09 -13.504 -13.719 -14.184 -14.673 -15.167 -15.434 -16.066 -16.327 -16.654 -16.986 -17.745 -18.168 -18.622 -19.141 -19.75 -20.508 -21.471 -24.172 -9 ,31438 ,TETRA ,17605196,Sun Nov 28 18:48:18 CET,Sun Nov 28 20:32:33 CET,0.0 1.479 2.394 3.007 3.428 3.801 4.152 4.451 4.972 5.206 5.424 5.515 6.026 6.211 6.552 6.881 7.176 7.317 7.602 7.873 8.228 8.452 8.66 8.937 9.196 9.43 9.643 9.835 10.099 10.395 10.661 10.945 11.221 11.465 11.709 11.963 12.203 12.443 12.683 12.932 13.16 13.385 13.579 13.719 13.839 13.882 13.833 13.682 13.356 12.625 11.038 8.968 7.197 5.624 4.257 3.019 1.933 0.963 0.103 -0.778 -1.507 -2.2 -2.918 -3.592 -4.228 -4.796 -5.378 -5.915 -6.372 -6.847 -7.368 -7.82 -8.291 -8.769 -9.192 -9.658 -10.112 -10.584 -11.084 -11.418 -11.756 -12.315 -12.71 -13.109 -13.314 -13.746 -14.197 -14.704 -14.993 -15.636 -15.934 -16.282 -16.645 -17.44 -17.885 -18.337 -18.825 -19.357 -20.014 -20.929 -23.142 -10 ,5481 ,TETRA ,17605197,Sun Nov 28 18:48:20 CET,Sun Nov 28 20:32:14 CET,0.0 2.236 2.907 3.45 3.944 4.348 4.663 4.952 5.454 5.671 5.872 5.955 6.482 6.68 7.054 7.392 7.699 7.837 8.101 8.357 8.704 8.919 9.143 9.478 9.774 10.038 10.28 10.519 10.825 11.1 11.345 11.621 11.889 12.14 12.411 12.709 12.998 13.287 13.551 13.803 14.015 14.192 14.352 14.47 14.572 14.612 14.583 14.445 14.043 13.234 11.693 9.617 7.817 6.268 4.903 3.657 2.558 1.546 0.643 -0.268 -1.027 -1.689 -2.346 -2.976 -3.54 -4.048 -4.614 -5.143 -5.641 -6.2 -6.754 -7.199 -7.672 -8.176 -8.576 -8.989 -9.438 -9.919 -10.423 -10.762 -11.104 -11.677 -12.083 -12.485 -12.69 -13.126 -13.618 -14.146 -14.417 -15.048 -15.297 -15.631 -15.97 -16.745 -17.2 -17.65 -18.133 -18.708 -19.398 -20.301 -23.342 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23466.txt deleted file mode 100644 index 467b1a34..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30519 ,KEBNE ,17027310,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:26:56 CET,0.0 1.96 2.756 3.339 3.842 4.28 4.662 5.035 5.686 5.974 6.258 6.441 7.059 7.288 7.746 8.19 8.607 8.793 9.169 9.535 10.043 10.398 10.736 11.174 11.59 12.009 12.409 12.814 13.339 13.848 14.328 14.829 15.307 15.808 16.359 16.921 17.498 18.127 18.73 19.359 20.058 20.849 21.747 22.603 23.605 24.748 25.976 27.3 28.797 30.53 32.388 33.43 33.715 33.692 33.486 33.196 32.854 32.43 32.006 31.563 31.16 30.763 30.304 29.845 29.393 28.94 28.5 28.128 27.771 27.361 26.954 26.62 26.266 25.892 25.55 25.173 24.773 24.352 23.919 23.619 23.318 22.828 22.444 22.02 21.81 21.402 20.962 20.45 20.174 19.543 19.308 18.989 18.621 17.763 17.288 16.757 16.174 15.509 14.658 13.47 8.535 -2 ,21105 ,KEBNE ,17027311,Wed Dec 22 16:56:36 CET,Wed Dec 22 18:22:21 CET,0.0 1.708 2.545 3.174 3.703 4.141 4.545 4.911 5.57 5.865 6.147 6.321 6.93 7.166 7.598 7.998 8.393 8.58 8.94 9.268 9.721 10.061 10.409 10.874 11.304 11.715 12.116 12.509 13.014 13.476 13.909 14.48 15.002 15.443 15.95 16.517 17.071 17.662 18.276 18.949 19.655 20.395 21.24 22.1 23.087 24.15 25.35 26.731 28.349 30.09 31.924 33.043 33.451 33.487 33.252 32.925 32.552 32.123 31.709 31.245 30.8 30.353 29.913 29.53 29.169 28.79 28.388 28.042 27.669 27.193 26.689 26.302 25.873 25.386 25.0 24.591 24.171 23.733 23.273 22.949 22.599 22.049 21.68 21.297 21.09 20.647 20.181 19.697 19.44 18.797 18.448 18.074 17.694 16.874 16.41 15.91 15.318 14.573 13.702 12.598 8.408 -3 ,26576 ,KEBNE ,17027312,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:26:56 CET,0.0 1.56 2.286 2.86 3.353 3.785 4.194 4.536 5.108 5.389 5.652 5.759 6.358 6.59 7.039 7.467 7.881 8.072 8.413 8.77 9.289 9.603 9.909 10.363 10.801 11.19 11.574 11.987 12.499 13.002 13.459 13.937 14.457 14.983 15.529 16.103 16.657 17.24 17.857 18.536 19.227 19.973 20.799 21.645 22.691 23.806 25.067 26.511 28.135 29.892 31.731 32.847 33.15 33.146 32.936 32.597 32.219 31.81 31.44 31.025 30.605 30.17 29.717 29.263 28.831 28.414 27.925 27.461 27.029 26.568 26.087 25.69 25.263 24.782 24.413 24.054 23.663 23.224 22.785 22.478 22.139 21.615 21.232 20.811 20.592 20.127 19.645 19.093 18.791 18.154 17.855 17.512 17.151 16.319 15.86 15.361 14.782 14.092 13.236 12.105 7.731 -4 ,24053 ,KEBNE ,17027313,Wed Dec 22 16:56:31 CET,Wed Dec 22 18:27:06 CET,0.0 1.711 2.471 3.057 3.552 3.972 4.323 4.633 5.207 5.487 5.761 5.867 6.456 6.678 7.123 7.544 7.921 8.097 8.449 8.804 9.319 9.654 9.983 10.399 10.767 11.146 11.559 11.945 12.383 12.797 13.191 13.707 14.244 14.727 15.295 15.976 16.611 17.241 17.849 18.498 19.196 19.985 20.879 21.745 22.703 23.719 24.93 26.269 27.777 29.502 31.345 32.541 32.89 32.847 32.669 32.376 32.016 31.619 31.193 30.707 30.28 29.839 29.339 28.843 28.358 27.879 27.351 26.872 26.451 26.001 25.546 25.205 24.804 24.338 23.976 23.573 23.147 22.714 22.219 21.867 21.533 21.006 20.633 20.227 20.002 19.55 19.092 18.6 18.326 17.688 17.381 17.025 16.647 15.794 15.306 14.743 14.08 13.359 12.491 11.173 6.15 -5 ,23131 ,KEBNE ,17027314,Wed Dec 22 16:56:32 CET,Wed Dec 22 18:27:03 CET,0.0 1.789 2.67 3.296 3.794 4.247 4.642 5.008 5.675 5.971 6.248 6.393 6.987 7.207 7.645 8.054 8.469 8.669 9.042 9.404 9.915 10.228 10.532 10.975 11.427 11.866 12.246 12.621 13.091 13.519 13.928 14.392 14.845 15.294 15.794 16.339 16.855 17.445 18.11 18.793 19.501 20.274 21.145 21.999 23.007 24.108 25.314 26.68 28.212 29.857 31.618 32.615 32.953 32.956 32.763 32.489 32.106 31.638 31.166 30.67 30.254 29.857 29.406 28.976 28.584 28.146 27.619 27.187 26.806 26.37 25.944 25.588 25.181 24.751 24.398 24.013 23.598 23.157 22.682 22.346 21.997 21.427 21.014 20.554 20.31 19.81 19.316 18.81 18.526 17.886 17.577 17.215 16.827 15.956 15.489 14.976 14.368 13.68 12.823 11.576 6.672 -6 ,23912 ,KEBNE ,17027315,Wed Dec 22 16:56:32 CET,Wed Dec 22 18:28:19 CET,0.0 1.644 2.344 2.906 3.405 3.852 4.245 4.611 5.295 5.59 5.862 6.015 6.619 6.852 7.329 7.761 8.152 8.341 8.722 9.093 9.607 9.95 10.262 10.68 11.099 11.514 11.908 12.282 12.756 13.207 13.682 14.23 14.695 15.175 15.738 16.317 16.847 17.434 18.093 18.796 19.501 20.27 21.172 22.119 23.215 24.351 25.579 26.919 28.417 29.999 31.729 32.805 33.131 33.127 32.893 32.532 32.147 31.755 31.364 30.944 30.55 30.14 29.67 29.19 28.752 28.338 27.87 27.408 26.991 26.621 26.229 25.852 25.462 25.073 24.755 24.373 23.95 23.505 23.038 22.721 22.387 21.805 21.381 20.963 20.73 20.197 19.697 19.197 18.919 18.268 17.919 17.561 17.192 16.358 15.895 15.382 14.792 14.103 13.242 11.978 6.709 -7 ,18238 ,KEBNE ,17027316,Wed Dec 22 16:56:32 CET,Wed Dec 22 18:27:07 CET,0.0 2.368 3.16 3.711 4.152 4.556 4.936 5.27 5.856 6.142 6.418 6.576 7.198 7.435 7.868 8.279 8.643 8.825 9.202 9.566 10.094 10.396 10.671 11.1 11.527 11.931 12.309 12.675 13.167 13.634 14.062 14.581 15.083 15.567 16.103 16.662 17.176 17.737 18.405 19.13 19.841 20.587 21.446 22.312 23.318 24.445 25.716 27.072 28.548 30.256 32.131 33.19 33.5 33.478 33.25 32.943 32.587 32.162 31.717 31.24 30.782 30.331 29.856 29.381 28.923 28.511 28.067 27.638 27.255 26.821 26.356 25.994 25.622 25.201 24.856 24.464 24.034 23.603 23.143 22.822 22.485 21.954 21.572 21.12 20.886 20.44 19.983 19.466 19.167 18.519 18.181 17.801 17.414 16.623 16.166 15.651 15.072 14.399 13.541 12.365 7.354 -8 ,30275 ,KEBNE ,17027317,Wed Dec 22 16:56:32 CET,Wed Dec 22 18:27:02 CET,0.0 1.793 2.672 3.279 3.75 4.164 4.543 4.93 5.653 5.953 6.237 6.399 7.0 7.229 7.664 8.069 8.454 8.64 9.011 9.375 9.917 10.254 10.557 10.987 11.411 11.833 12.237 12.607 13.097 13.6 14.045 14.559 15.058 15.53 16.069 16.647 17.236 17.891 18.52 19.156 19.842 20.618 21.514 22.413 23.477 24.611 25.838 27.214 28.828 30.562 32.373 33.539 33.912 33.902 33.691 33.407 33.045 32.623 32.224 31.756 31.307 30.884 30.437 29.929 29.409 28.935 28.464 28.047 27.658 27.221 26.753 26.37 25.956 25.477 25.092 24.713 24.33 23.921 23.47 23.156 22.809 22.239 21.869 21.474 21.257 20.803 20.286 19.777 19.514 18.887 18.61 18.27 17.897 17.048 16.579 16.042 15.442 14.769 13.894 12.642 8.594 -9 ,4386 ,KEBNE ,17027318,Wed Dec 22 16:56:31 CET,Wed Dec 22 18:27:00 CET,0.0 2.052 2.877 3.429 3.919 4.366 4.786 5.157 5.803 6.098 6.385 6.556 7.164 7.394 7.838 8.272 8.672 8.861 9.223 9.567 10.084 10.425 10.747 11.193 11.623 12.052 12.453 12.836 13.339 13.818 14.26 14.764 15.246 15.708 16.206 16.727 17.25 17.813 18.419 19.091 19.78 20.562 21.472 22.378 23.404 24.509 25.746 27.085 28.585 30.256 32.129 33.303 33.677 33.67 33.404 33.067 32.715 32.302 31.896 31.478 31.07 30.622 30.143 29.655 29.205 28.801 28.373 27.955 27.531 27.075 26.587 26.164 25.719 25.245 24.887 24.502 24.086 23.638 23.144 22.801 22.45 21.897 21.508 21.113 20.897 20.43 19.924 19.369 19.084 18.451 18.153 17.802 17.442 16.661 16.204 15.697 15.096 14.37 13.497 12.256 6.033 -10 ,15790 ,KEBNE ,17027319,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:28:48 CET,0.0 1.824 2.576 3.163 3.669 4.107 4.47 4.823 5.484 5.777 6.038 6.161 6.766 6.989 7.417 7.812 8.201 8.392 8.746 9.088 9.595 9.935 10.256 10.687 11.107 11.538 11.927 12.294 12.751 13.188 13.639 14.18 14.694 15.218 15.813 16.409 16.956 17.545 18.17 18.817 19.499 20.268 21.173 22.044 23.013 24.075 25.255 26.586 28.151 29.866 31.821 33.105 33.426 33.334 33.046 32.623 32.189 31.75 31.303 30.854 30.444 30.009 29.566 29.147 28.726 28.301 27.795 27.346 27.001 26.584 26.097 25.681 25.231 24.787 24.453 24.101 23.712 23.266 22.815 22.508 22.174 21.62 21.218 20.815 20.604 20.157 19.693 19.199 18.932 18.294 17.997 17.654 17.29 16.447 15.956 15.379 14.722 14.051 13.169 11.963 7.13 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23467.txt deleted file mode 100644 index 2276d0c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17229 ,KEBNE ,17070668,Fri Dec 24 22:40:45 CET,Sat Dec 25 00:12:35 CET,0.0 2.078 2.978 3.645 4.23 4.757 5.206 5.597 6.358 6.694 7.009 7.259 7.915 8.183 8.71 9.193 9.671 9.917 10.385 10.828 11.454 11.849 12.237 12.798 13.323 13.801 14.245 14.673 15.263 15.867 16.455 17.173 17.847 18.48 19.204 19.951 20.646 21.446 22.302 23.16 24.094 25.22 26.521 27.784 29.311 31.001 32.846 34.965 37.491 40.486 44.082 46.872 48.427 49.424 49.954 50.144 50.179 50.168 50.079 49.881 49.638 49.376 49.063 48.717 48.399 48.118 47.824 47.531 47.227 46.859 46.464 46.136 45.778 45.391 45.07 44.735 44.395 44.027 43.64 43.373 43.086 42.609 42.266 41.913 41.715 41.29 40.856 40.375 40.116 39.532 39.271 38.977 38.664 37.907 37.471 37.015 36.521 35.912 35.195 34.253 30.352 -2 ,32176 ,KEBNE ,17070669,Fri Dec 24 22:39:41 CET,Sat Dec 25 00:10:06 CET,0.0 2.107 3.021 3.675 4.234 4.73 5.181 5.608 6.386 6.741 7.078 7.333 7.983 8.255 8.784 9.273 9.751 9.998 10.472 10.905 11.53 11.94 12.321 12.866 13.396 13.906 14.388 14.845 15.463 16.089 16.664 17.305 17.904 18.493 19.185 19.933 20.659 21.483 22.358 23.288 24.312 25.431 26.714 28.035 29.523 31.161 33.089 35.248 37.786 40.782 44.408 47.311 48.916 49.756 50.176 50.415 50.483 50.479 50.41 50.288 50.122 49.863 49.597 49.319 48.987 48.647 48.292 47.995 47.676 47.285 46.895 46.571 46.229 45.86 45.546 45.211 44.881 44.525 44.118 43.828 43.529 43.046 42.712 42.36 42.163 41.756 41.312 40.799 40.533 39.96 39.746 39.457 39.139 38.39 37.975 37.523 37.025 36.458 35.723 34.664 30.407 -3 ,23165 ,KEBNE ,17070670,Fri Dec 24 22:39:45 CET,Sat Dec 25 00:06:02 CET,0.0 1.999 2.882 3.59 4.186 4.691 5.144 5.566 6.297 6.629 6.942 7.15 7.801 8.081 8.619 9.154 9.658 9.89 10.345 10.778 11.402 11.834 12.249 12.794 13.319 13.85 14.338 14.801 15.409 16.012 16.587 17.265 17.925 18.551 19.294 20.095 20.85 21.689 22.532 23.399 24.328 25.411 26.698 28.0 29.521 31.21 33.112 35.241 37.793 40.908 44.725 47.669 49.148 50.022 50.55 50.836 50.941 50.929 50.8 50.597 50.369 50.067 49.709 49.363 49.049 48.739 48.391 48.024 47.697 47.369 46.995 46.657 46.284 45.888 45.568 45.221 44.863 44.49 44.072 43.775 43.48 43.039 42.7 42.323 42.127 41.699 41.271 40.811 40.55 39.953 39.667 39.326 38.98 38.286 37.9 37.468 36.966 36.34 35.586 34.603 31.225 -4 ,24280 ,KEBNE ,17070671,Fri Dec 24 22:40:45 CET,Sat Dec 25 00:12:06 CET,0.0 2.009 2.831 3.488 4.058 4.567 5.011 5.393 6.089 6.433 6.772 7.03 7.664 7.918 8.428 8.953 9.451 9.677 10.131 10.572 11.206 11.615 12.004 12.556 13.072 13.562 14.05 14.529 15.109 15.689 16.275 16.951 17.624 18.294 19.023 19.801 20.562 21.424 22.328 23.241 24.221 25.365 26.712 28.044 29.538 31.213 33.183 35.416 38.013 41.077 44.866 47.764 49.351 50.29 50.745 50.903 50.873 50.816 50.716 50.527 50.349 50.124 49.862 49.586 49.285 48.99 48.694 48.398 48.071 47.731 47.38 47.089 46.809 46.474 46.172 45.834 45.485 45.125 44.719 44.431 44.143 43.699 43.366 42.992 42.799 42.402 41.967 41.489 41.234 40.655 40.442 40.142 39.796 39.058 38.668 38.192 37.643 36.991 36.233 35.185 32.083 -5 ,5904 ,KEBNE ,17070672,Fri Dec 24 22:40:45 CET,Sat Dec 25 00:07:56 CET,0.0 1.911 2.822 3.546 4.137 4.631 5.085 5.511 6.252 6.579 6.909 7.188 7.846 8.118 8.653 9.153 9.618 9.844 10.286 10.713 11.304 11.689 12.079 12.625 13.148 13.656 14.123 14.586 15.219 15.823 16.397 17.111 17.787 18.399 19.106 19.896 20.657 21.515 22.419 23.36 24.319 25.387 26.669 27.982 29.485 31.103 32.961 35.123 37.697 40.696 44.331 47.24 48.811 49.795 50.407 50.67 50.745 50.776 50.659 50.403 50.213 50.022 49.797 49.577 49.313 48.987 48.647 48.326 47.983 47.633 47.291 46.991 46.656 46.298 46.035 45.746 45.421 45.067 44.65 44.325 44.001 43.508 43.158 42.813 42.624 42.245 41.813 41.302 41.039 40.44 40.159 39.814 39.463 38.767 38.351 37.866 37.305 36.637 35.842 34.754 31.375 -6 ,24691 ,KEBNE ,17070673,Fri Dec 24 22:41:47 CET,Sat Dec 25 00:13:58 CET,0.0 2.314 3.205 3.889 4.465 4.977 5.428 5.844 6.635 7.003 7.346 7.624 8.288 8.566 9.087 9.584 10.067 10.299 10.758 11.196 11.81 12.187 12.556 13.109 13.644 14.143 14.633 15.12 15.723 16.281 16.802 17.434 18.038 18.597 19.256 20.009 20.726 21.565 22.48 23.4 24.352 25.427 26.662 27.902 29.339 30.937 32.862 35.062 37.533 40.49 44.182 47.231 48.85 49.718 50.196 50.459 50.547 50.485 50.34 50.129 49.912 49.706 49.469 49.193 48.926 48.671 48.344 48.012 47.727 47.416 47.089 46.805 46.454 46.038 45.714 45.39 45.046 44.669 44.266 43.979 43.672 43.187 42.867 42.517 42.318 41.869 41.362 40.851 40.592 40.001 39.74 39.42 39.075 38.287 37.858 37.384 36.823 36.16 35.349 34.276 31.19 -7 ,16300 ,KEBNE ,17070674,Fri Dec 24 22:43:54 CET,Sat Dec 25 00:15:11 CET,0.0 2.369 3.243 3.914 4.499 5.036 5.479 5.875 6.592 6.923 7.242 7.501 8.182 8.475 9.032 9.557 10.051 10.28 10.727 11.196 11.876 12.273 12.653 13.211 13.744 14.252 14.741 15.233 15.842 16.381 16.938 17.612 18.233 18.843 19.56 20.391 21.179 22.028 22.976 23.945 24.92 26.036 27.377 28.688 30.098 31.741 33.675 35.783 38.2 41.096 44.658 47.5 49.043 49.942 50.438 50.734 50.847 50.826 50.726 50.554 50.354 50.09 49.787 49.501 49.219 48.963 48.687 48.412 48.118 47.81 47.488 47.141 46.777 46.428 46.141 45.811 45.448 45.044 44.626 44.334 44.014 43.515 43.157 42.741 42.536 42.152 41.737 41.282 41.029 40.44 40.167 39.836 39.496 38.727 38.282 37.795 37.259 36.647 35.944 34.954 31.871 -8 ,18492 ,KEBNE ,17070675,Fri Dec 24 22:44:58 CET,Sat Dec 25 00:17:19 CET,0.0 2.015 2.833 3.491 4.059 4.588 5.077 5.489 6.21 6.547 6.884 7.129 7.792 8.076 8.605 9.103 9.592 9.826 10.255 10.661 11.298 11.708 12.083 12.654 13.206 13.708 14.184 14.653 15.271 15.845 16.393 17.072 17.729 18.365 19.112 19.92 20.654 21.456 22.298 23.195 24.155 25.255 26.552 27.84 29.333 31.034 32.965 35.095 37.661 40.692 44.42 47.302 48.761 49.64 50.16 50.382 50.447 50.447 50.389 50.255 50.059 49.851 49.613 49.348 49.082 48.796 48.471 48.169 47.886 47.573 47.207 46.881 46.527 46.171 45.884 45.546 45.207 44.87 44.49 44.21 43.915 43.421 43.072 42.71 42.516 42.112 41.672 41.182 40.939 40.363 40.095 39.776 39.448 38.694 38.271 37.805 37.225 36.572 35.834 34.711 29.952 -9 ,19863 ,KEBNE ,17070676,Fri Dec 24 22:44:58 CET,Sat Dec 25 00:17:00 CET,0.0 1.798 2.647 3.305 3.866 4.372 4.834 5.261 6.008 6.342 6.658 6.884 7.55 7.831 8.362 8.872 9.334 9.55 9.988 10.418 11.004 11.399 11.795 12.346 12.864 13.357 13.85 14.325 14.91 15.466 16.008 16.662 17.301 17.914 18.623 19.439 20.214 21.02 21.864 22.76 23.709 24.793 26.061 27.321 28.868 30.614 32.589 34.837 37.372 40.288 43.921 46.855 48.517 49.402 49.773 49.983 50.081 50.036 49.924 49.783 49.592 49.389 49.19 48.958 48.699 48.387 48.005 47.652 47.364 47.05 46.648 46.311 45.947 45.539 45.225 44.904 44.561 44.194 43.804 43.503 43.188 42.672 42.295 41.915 41.722 41.326 40.916 40.458 40.193 39.608 39.374 39.056 38.708 37.91 37.462 36.989 36.44 35.813 35.092 34.098 30.839 -10 ,29613 ,KEBNE ,17070677,Fri Dec 24 22:45:02 CET,Sat Dec 25 00:13:40 CET,0.0 1.894 2.721 3.392 3.939 4.424 4.867 5.289 6.045 6.395 6.727 6.971 7.633 7.917 8.49 9.035 9.528 9.759 10.217 10.665 11.288 11.68 12.055 12.624 13.184 13.697 14.174 14.642 15.251 15.824 16.37 17.054 17.704 18.309 19.011 19.793 20.536 21.339 22.2 23.105 24.063 25.162 26.405 27.699 29.263 30.904 32.821 35.114 37.699 40.691 44.344 47.164 48.779 49.737 50.191 50.397 50.438 50.373 50.245 50.052 49.839 49.579 49.286 48.997 48.714 48.384 47.977 47.657 47.369 47.022 46.654 46.308 45.944 45.541 45.198 44.862 44.506 44.14 43.749 43.452 43.131 42.626 42.28 41.921 41.734 41.33 40.908 40.425 40.166 39.59 39.346 39.035 38.705 37.939 37.507 37.035 36.477 35.875 35.16 34.162 31.357 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index 42d0594a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26000 ,TETRA ,17605198,Sun Nov 28 18:49:17 CET,Sun Nov 28 20:37:37 CET,0.0 1.944 2.806 3.423 3.951 4.423 4.815 5.169 5.829 6.122 6.394 6.55 7.147 7.377 7.788 8.179 8.584 8.772 9.123 9.465 9.966 10.302 10.617 11.037 11.436 11.839 12.197 12.501 12.915 13.326 13.702 14.151 14.558 14.946 15.4 15.899 16.386 16.893 17.417 17.997 18.589 19.258 20.035 20.772 21.578 22.375 23.223 24.098 24.977 25.883 26.581 26.467 25.917 25.243 24.51 23.732 23.045 22.425 21.836 21.183 20.595 20.057 19.513 18.997 18.521 18.051 17.528 17.055 16.64 16.196 15.696 15.25 14.784 14.289 13.902 13.521 13.117 12.695 12.247 11.921 11.587 11.07 10.703 10.298 10.084 9.652 9.204 8.723 8.466 7.861 7.649 7.344 6.993 6.232 5.842 5.431 4.968 4.362 3.607 2.677 0.287 -2 ,21099 ,TETRA ,17605199,Sun Nov 28 18:49:17 CET,Sun Nov 28 20:33:14 CET,0.0 2.99 3.82 4.474 5.006 5.46 5.874 6.256 6.909 7.19 7.47 7.635 8.236 8.474 8.914 9.307 9.679 9.867 10.245 10.595 11.081 11.395 11.693 12.125 12.524 12.886 13.241 13.592 14.037 14.449 14.841 15.291 15.714 16.134 16.619 17.157 17.636 18.14 18.708 19.287 19.857 20.528 21.292 21.972 22.687 23.435 24.285 25.214 26.147 26.982 27.637 27.637 27.139 26.438 25.744 25.043 24.305 23.567 22.9 22.249 21.672 21.123 20.559 20.005 19.485 18.965 18.423 17.97 17.556 17.108 16.646 16.247 15.827 15.38 15.014 14.632 14.242 13.828 13.383 13.079 12.763 12.251 11.886 11.496 11.29 10.857 10.407 9.909 9.641 9.017 8.77 8.465 8.149 7.422 7.035 6.645 6.168 5.615 4.974 4.108 2.106 -3 ,21768 ,TETRA ,17605200,Sun Nov 28 18:49:17 CET,Sun Nov 28 20:37:19 CET,0.0 1.407 2.081 2.636 3.125 3.582 3.968 4.322 4.963 5.254 5.538 5.689 6.265 6.495 6.955 7.382 7.779 7.972 8.344 8.683 9.145 9.444 9.743 10.183 10.605 11.01 11.401 11.768 12.236 12.687 13.093 13.567 14.008 14.444 14.98 15.532 16.014 16.544 17.097 17.652 18.223 18.834 19.508 20.153 20.892 21.725 22.633 23.588 24.587 25.508 26.125 25.991 25.485 24.841 24.129 23.421 22.766 22.112 21.516 20.835 20.226 19.68 19.122 18.588 18.087 17.618 17.098 16.621 16.194 15.749 15.261 14.829 14.383 13.915 13.56 13.199 12.807 12.391 11.971 11.672 11.354 10.869 10.511 10.127 9.936 9.535 9.083 8.604 8.355 7.751 7.556 7.265 6.948 6.215 5.826 5.4 4.869 4.264 3.586 2.759 1.224 -4 ,27476 ,TETRA ,17605201,Sun Nov 28 18:49:19 CET,Sun Nov 28 20:38:20 CET,0.0 2.221 3.02 3.628 4.125 4.535 4.914 5.275 5.895 6.182 6.449 6.588 7.181 7.412 7.834 8.239 8.636 8.814 9.14 9.484 9.968 10.259 10.557 10.985 11.374 11.719 12.085 12.458 12.899 13.328 13.741 14.224 14.692 15.142 15.665 16.219 16.725 17.306 17.914 18.5 19.106 19.853 20.739 21.537 22.381 23.301 24.364 25.471 26.752 28.137 29.365 29.818 29.646 29.241 28.632 27.894 27.194 26.523 25.92 25.306 24.751 24.24 23.709 23.192 22.69 22.216 21.736 21.304 20.927 20.513 20.06 19.684 19.282 18.861 18.537 18.197 17.838 17.461 17.01 16.699 16.402 15.918 15.573 15.203 15.006 14.61 14.19 13.711 13.464 12.867 12.682 12.403 12.075 11.314 10.886 10.44 10.006 9.537 8.981 8.172 5.471 -5 ,24563 ,TETRA ,17605202,Sun Nov 28 18:49:18 CET,Sun Nov 28 20:39:27 CET,0.0 1.698 2.477 3.008 3.455 3.874 4.264 4.625 5.267 5.555 5.829 5.966 6.559 6.805 7.277 7.722 8.141 8.341 8.713 9.053 9.536 9.852 10.163 10.628 11.041 11.401 11.781 12.149 12.601 13.036 13.441 13.912 14.353 14.808 15.355 15.886 16.38 16.912 17.468 18.037 18.607 19.226 19.929 20.639 21.454 22.294 23.172 24.047 24.919 25.801 26.45 26.392 25.911 25.298 24.602 23.825 23.056 22.346 21.74 21.098 20.514 19.969 19.422 18.927 18.475 18.016 17.534 17.096 16.697 16.26 15.773 15.377 14.94 14.466 14.109 13.742 13.353 12.931 12.489 12.176 11.842 11.322 10.935 10.506 10.287 9.839 9.387 8.927 8.679 8.067 7.796 7.476 7.146 6.362 5.919 5.438 4.924 4.317 3.559 2.632 0.764 -6 ,6088 ,TETRA ,17605203,Sun Nov 28 18:49:18 CET,Sun Nov 28 20:37:32 CET,0.0 1.833 2.554 3.15 3.66 4.097 4.485 4.841 5.469 5.754 6.031 6.17 6.75 6.99 7.454 7.872 8.264 8.456 8.823 9.164 9.664 9.981 10.279 10.693 11.068 11.413 11.73 12.049 12.474 12.865 13.256 13.732 14.173 14.633 15.163 15.741 16.244 16.777 17.373 17.951 18.527 19.163 19.872 20.568 21.408 22.277 23.149 24.083 25.08 26.0 26.638 26.59 25.997 25.184 24.368 23.609 22.889 22.191 21.569 20.908 20.3 19.75 19.182 18.633 18.121 17.626 17.093 16.618 16.201 15.772 15.325 14.93 14.507 14.058 13.69 13.321 12.942 12.517 12.063 11.747 11.403 10.847 10.469 10.078 9.875 9.459 9.024 8.586 8.352 7.763 7.563 7.261 6.946 6.239 5.843 5.43 4.98 4.45 3.796 2.9 0.799 -7 ,4400 ,TETRA ,17605204,Sun Nov 28 18:49:20 CET,Sun Nov 28 20:37:46 CET,0.0 1.822 2.637 3.258 3.821 4.31 4.739 5.125 5.787 6.101 6.405 6.626 7.246 7.515 8.018 8.45 8.831 9.025 9.409 9.771 10.321 10.673 11.006 11.464 11.898 12.317 12.7 13.06 13.516 13.952 14.385 14.908 15.386 15.832 16.355 16.966 17.572 18.209 18.852 19.529 20.238 21.0 21.843 22.635 23.539 24.566 25.693 26.896 28.202 29.647 31.125 31.757 31.696 31.344 30.858 30.362 29.884 29.346 28.85 28.317 27.829 27.374 26.89 26.382 25.875 25.428 24.971 24.518 24.096 23.668 23.212 22.8 22.381 21.95 21.59 21.198 20.798 20.381 19.907 19.576 19.249 18.713 18.321 17.899 17.679 17.252 16.821 16.382 16.138 15.51 15.179 14.843 14.494 13.739 13.323 12.853 12.339 11.722 10.914 9.839 6.224 -8 ,27954 ,TETRA ,17605205,Sun Nov 28 18:49:18 CET,Sun Nov 28 20:37:52 CET,0.0 1.754 2.474 2.991 3.451 3.865 4.257 4.617 5.25 5.536 5.825 6.047 6.654 6.889 7.339 7.763 8.169 8.359 8.719 9.075 9.553 9.844 10.132 10.561 10.984 11.386 11.765 12.11 12.538 12.969 13.394 13.893 14.335 14.732 15.213 15.737 16.227 16.769 17.295 17.849 18.474 19.187 19.972 20.705 21.52 22.364 23.212 24.054 24.921 25.732 26.224 25.885 25.225 24.514 23.76 22.971 22.217 21.507 20.876 20.16 19.502 18.894 18.267 17.664 17.096 16.612 16.112 15.661 15.273 14.818 14.325 13.92 13.467 12.976 12.62 12.249 11.824 11.373 10.927 10.625 10.309 9.828 9.479 9.111 8.92 8.502 8.045 7.557 7.305 6.71 6.512 6.214 5.899 5.192 4.773 4.313 3.787 3.159 2.461 1.605 -0.301 -9 ,28277 ,TETRA ,17605206,Sun Nov 28 18:49:18 CET,Sun Nov 28 20:38:12 CET,0.0 1.787 2.537 3.051 3.517 3.937 4.326 4.688 5.359 5.675 5.956 6.094 6.691 6.921 7.335 7.724 8.097 8.281 8.638 8.97 9.444 9.756 10.063 10.494 10.898 11.302 11.692 12.035 12.456 12.892 13.316 13.791 14.245 14.699 15.234 15.802 16.286 16.787 17.354 17.927 18.473 19.105 19.821 20.488 21.234 22.055 22.99 23.952 24.857 25.745 26.449 26.343 25.848 25.25 24.556 23.816 23.087 22.363 21.735 21.09 20.527 19.987 19.437 18.934 18.464 17.987 17.465 16.987 16.574 16.138 15.607 15.156 14.7 14.227 13.88 13.517 13.127 12.708 12.261 11.952 11.633 11.136 10.777 10.378 10.168 9.761 9.328 8.844 8.584 7.966 7.766 7.472 7.153 6.462 6.072 5.638 5.138 4.564 3.889 2.904 0.679 -10 ,3784 ,TETRA ,17605207,Sun Nov 28 18:49:18 CET,Sun Nov 28 20:38:10 CET,0.0 1.899 2.706 3.299 3.771 4.199 4.592 4.954 5.583 5.871 6.155 6.341 6.947 7.193 7.655 8.078 8.488 8.687 9.077 9.452 9.964 10.289 10.604 11.062 11.513 11.932 12.322 12.684 13.146 13.599 14.033 14.566 15.061 15.518 16.033 16.622 17.181 17.76 18.417 19.132 19.858 20.686 21.553 22.321 23.273 24.324 25.409 26.565 27.894 29.373 30.654 31.122 31.049 30.724 30.324 29.83 29.294 28.782 28.266 27.643 27.107 26.674 26.248 25.796 25.358 24.925 24.447 24.049 23.696 23.314 22.881 22.485 22.083 21.675 21.344 20.967 20.579 20.184 19.748 19.438 19.111 18.62 18.268 17.895 17.701 17.269 16.779 16.257 15.991 15.379 15.164 14.845 14.503 13.763 13.352 12.888 12.306 11.634 10.854 9.756 6.001 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23468.txt deleted file mode 100644 index 7e9ebe82..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6136 ,KEBNE ,17027320,Wed Dec 22 16:56:35 CET,Wed Dec 22 18:31:00 CET,0.0 2.492 3.403 4.045 4.588 5.065 5.466 5.82 6.456 6.77 7.085 7.283 7.888 8.143 8.612 9.047 9.436 9.61 9.953 10.293 10.777 11.084 11.37 11.769 12.139 12.47 12.785 13.123 13.558 13.944 14.282 14.674 15.068 15.43 15.81 16.224 16.588 16.937 17.332 17.773 18.18 18.563 18.946 19.276 19.617 19.897 20.082 20.158 20.106 19.713 18.48 16.613 14.917 13.36 11.975 10.732 9.59 8.473 7.508 6.557 5.708 4.911 4.136 3.438 2.82 2.201 1.548 0.973 0.445 -0.119 -0.754 -1.325 -1.913 -2.5 -2.956 -3.44 -3.937 -4.449 -4.979 -5.344 -5.725 -6.343 -6.78 -7.245 -7.496 -8.0 -8.559 -9.147 -9.447 -10.137 -10.467 -10.821 -11.179 -12.005 -12.48 -12.977 -13.526 -14.157 -14.927 -16.051 -19.249 -2 ,27319 ,KEBNE ,17027321,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:28:45 CET,0.0 2.437 3.322 3.977 4.517 4.998 5.405 5.771 6.47 6.775 7.056 7.254 7.851 8.092 8.583 9.019 9.417 9.598 9.937 10.284 10.768 11.065 11.355 11.766 12.158 12.535 12.876 13.19 13.59 13.975 14.308 14.68 15.021 15.337 15.721 16.122 16.465 16.813 17.167 17.51 17.882 18.33 18.764 19.094 19.407 19.696 19.922 20.064 20.026 19.584 18.448 16.72 15.048 13.496 12.158 10.876 9.724 8.676 7.727 6.768 5.94 5.212 4.509 3.801 3.117 2.472 1.807 1.221 0.697 0.128 -0.481 -0.981 -1.514 -2.072 -2.506 -2.969 -3.461 -3.99 -4.534 -4.906 -5.312 -5.967 -6.43 -6.903 -7.141 -7.646 -8.2 -8.79 -9.096 -9.801 -10.131 -10.467 -10.841 -11.733 -12.231 -12.771 -13.394 -14.097 -15.008 -16.214 -19.152 -3 ,26012 ,KEBNE ,17027322,Wed Dec 22 16:56:30 CET,Wed Dec 22 18:28:51 CET,0.0 2.571 3.513 4.172 4.684 5.148 5.58 5.964 6.631 6.933 7.227 7.384 7.965 8.221 8.716 9.186 9.627 9.831 10.183 10.521 11.014 11.308 11.583 11.979 12.354 12.69 13.022 13.345 13.733 14.097 14.444 14.819 15.163 15.485 15.834 16.18 16.478 16.816 17.155 17.53 17.915 18.303 18.709 19.049 19.385 19.71 20.036 20.224 20.164 19.701 18.52 16.673 14.928 13.343 11.901 10.579 9.358 8.209 7.273 6.338 5.507 4.758 4.0 3.25 2.574 1.962 1.272 0.671 0.13 -0.469 -1.084 -1.628 -2.201 -2.779 -3.225 -3.694 -4.17 -4.661 -5.2 -5.581 -5.991 -6.587 -6.978 -7.399 -7.616 -8.107 -8.66 -9.244 -9.552 -10.245 -10.553 -10.907 -11.292 -12.134 -12.6 -13.109 -13.699 -14.358 -15.118 -16.146 -19.25 -4 ,29644 ,KEBNE ,17027323,Wed Dec 22 16:56:29 CET,Wed Dec 22 18:30:18 CET,0.0 1.904 2.819 3.463 3.971 4.43 4.85 5.23 5.92 6.231 6.515 6.666 7.262 7.502 7.97 8.391 8.791 8.985 9.347 9.656 10.116 10.426 10.716 11.132 11.501 11.856 12.21 12.538 12.958 13.344 13.704 14.127 14.5 14.869 15.28 15.686 16.034 16.409 16.792 17.176 17.539 17.866 18.215 18.587 18.988 19.3 19.485 19.542 19.444 18.948 17.705 15.906 14.291 12.797 11.394 10.092 8.935 7.881 6.974 6.041 5.21 4.43 3.687 3.005 2.335 1.698 1.043 0.455 -0.075 -0.649 -1.247 -1.761 -2.286 -2.829 -3.285 -3.751 -4.228 -4.745 -5.27 -5.631 -6.005 -6.615 -7.072 -7.548 -7.797 -8.291 -8.805 -9.37 -9.671 -10.353 -10.656 -11.019 -11.398 -12.26 -12.738 -13.266 -13.844 -14.491 -15.256 -16.297 -19.253 -5 ,32746 ,KEBNE ,17027324,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:30:46 CET,0.0 2.38 3.326 4.019 4.599 5.108 5.57 6.005 6.78 7.111 7.421 7.637 8.259 8.531 9.042 9.508 9.964 10.187 10.605 10.995 11.547 11.898 12.25 12.742 13.198 13.597 13.954 14.306 14.768 15.225 15.693 16.274 16.789 17.255 17.758 18.296 18.828 19.377 19.924 20.501 21.065 21.702 22.473 23.18 23.904 24.641 25.377 26.035 26.647 27.052 26.623 25.251 23.766 22.227 20.757 19.431 18.207 17.031 15.934 14.811 13.864 13.021 12.178 11.362 10.591 9.854 9.078 8.376 7.791 7.204 6.583 6.055 5.492 4.9 4.418 3.89 3.343 2.769 2.165 1.739 1.305 0.622 0.137 -0.379 -0.644 -1.174 -1.831 -2.569 -2.938 -3.69 -4.14 -4.564 -5.009 -6.042 -6.661 -7.299 -8.078 -9.098 -10.299 -12.122 -18.496 -6 ,16389 ,KEBNE ,17027325,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:28:42 CET,0.0 2.143 3.061 3.824 4.411 4.868 5.274 5.634 6.282 6.583 6.871 7.059 7.655 7.881 8.33 8.752 9.152 9.346 9.699 10.028 10.488 10.791 11.085 11.495 11.872 12.215 12.542 12.854 13.237 13.598 13.948 14.35 14.707 15.012 15.372 15.809 16.228 16.646 17.068 17.489 17.864 18.228 18.613 18.991 19.343 19.615 19.801 19.88 19.801 19.317 18.082 16.253 14.565 13.031 11.605 10.279 9.14 8.128 7.208 6.248 5.382 4.549 3.759 3.016 2.284 1.587 0.856 0.215 -0.347 -0.928 -1.511 -1.988 -2.479 -3.007 -3.44 -3.913 -4.42 -4.94 -5.477 -5.849 -6.229 -6.825 -7.258 -7.712 -7.937 -8.433 -8.991 -9.559 -9.864 -10.56 -10.848 -11.208 -11.591 -12.408 -12.861 -13.364 -13.958 -14.675 -15.511 -16.639 -20.049 -7 ,7712 ,KEBNE ,17027326,Wed Dec 22 16:56:32 CET,Wed Dec 22 18:29:17 CET,0.0 2.632 3.56 4.187 4.717 5.194 5.628 6.029 6.693 6.986 7.277 7.481 8.087 8.32 8.765 9.196 9.604 9.797 10.146 10.465 10.937 11.23 11.494 11.841 12.172 12.504 12.83 13.163 13.556 13.923 14.29 14.73 15.148 15.527 15.92 16.31 16.663 17.031 17.411 17.799 18.191 18.596 18.967 19.279 19.613 19.916 20.139 20.252 20.185 19.783 18.617 16.845 15.252 13.763 12.356 11.07 9.936 8.838 7.859 6.876 6.005 5.211 4.452 3.761 3.121 2.494 1.839 1.258 0.717 0.125 -0.488 -1.006 -1.547 -2.123 -2.578 -3.047 -3.558 -4.104 -4.651 -5.019 -5.412 -6.056 -6.486 -6.914 -7.134 -7.604 -8.124 -8.68 -8.974 -9.651 -9.968 -10.34 -10.716 -11.561 -12.054 -12.575 -13.143 -13.823 -14.627 -15.656 -18.77 -8 ,22402 ,KEBNE ,17027327,Wed Dec 22 16:56:31 CET,Wed Dec 22 18:28:41 CET,0.0 1.792 2.788 3.496 4.0 4.493 4.964 5.364 6.013 6.299 6.582 6.767 7.367 7.593 8.036 8.468 8.874 9.07 9.429 9.757 10.205 10.493 10.774 11.163 11.523 11.854 12.188 12.518 12.895 13.241 13.603 14.03 14.415 14.761 15.173 15.621 15.976 16.362 16.77 17.187 17.578 17.947 18.319 18.657 18.993 19.254 19.44 19.53 19.423 18.91 17.669 15.873 14.194 12.653 11.246 9.957 8.811 7.769 6.85 5.884 5.032 4.266 3.518 2.782 2.086 1.443 0.761 0.131 -0.412 -0.966 -1.57 -2.099 -2.644 -3.216 -3.677 -4.129 -4.605 -5.118 -5.648 -6.013 -6.395 -7.03 -7.478 -7.95 -8.197 -8.714 -9.261 -9.84 -10.159 -10.865 -11.223 -11.61 -12.026 -12.884 -13.356 -13.903 -14.517 -15.223 -16.07 -17.224 -20.563 -9 ,11825 ,KEBNE ,17027328,Wed Dec 22 16:56:34 CET,Wed Dec 22 18:28:45 CET,0.0 1.848 2.706 3.378 3.924 4.393 4.795 5.16 5.809 6.118 6.412 6.566 7.162 7.408 7.874 8.298 8.688 8.868 9.21 9.528 9.976 10.26 10.552 10.993 11.383 11.737 12.084 12.405 12.761 13.068 13.38 13.781 14.163 14.508 14.884 15.266 15.601 15.965 16.325 16.667 16.998 17.358 17.752 18.075 18.341 18.592 18.844 18.957 18.819 18.362 17.21 15.369 13.626 12.08 10.755 9.52 8.308 7.186 6.248 5.289 4.456 3.735 3.011 2.283 1.595 0.951 0.266 -0.334 -0.861 -1.423 -1.984 -2.442 -2.936 -3.476 -3.892 -4.332 -4.826 -5.347 -5.908 -6.283 -6.656 -7.305 -7.771 -8.265 -8.526 -9.034 -9.546 -10.099 -10.401 -11.094 -11.422 -11.803 -12.182 -12.995 -13.453 -13.995 -14.605 -15.287 -16.172 -17.258 -20.077 -10 ,6840 ,KEBNE ,17027329,Wed Dec 22 16:56:32 CET,Wed Dec 22 18:30:08 CET,0.0 2.122 2.988 3.633 4.14 4.608 5.037 5.422 6.107 6.424 6.722 6.932 7.554 7.793 8.235 8.663 9.068 9.259 9.617 9.963 10.463 10.769 11.043 11.455 11.857 12.222 12.546 12.835 13.221 13.599 13.937 14.322 14.716 15.097 15.477 15.864 16.238 16.615 16.992 17.373 17.792 18.23 18.652 19.046 19.412 19.688 19.884 20.037 20.085 19.74 18.605 16.872 15.217 13.671 12.259 10.941 9.796 8.77 7.843 6.903 6.056 5.264 4.513 3.809 3.181 2.604 1.979 1.379 0.835 0.282 -0.321 -0.841 -1.378 -1.948 -2.411 -2.897 -3.389 -3.89 -4.416 -4.789 -5.196 -5.829 -6.255 -6.717 -6.964 -7.475 -8.027 -8.633 -8.942 -9.632 -9.951 -10.293 -10.667 -11.571 -12.057 -12.569 -13.153 -13.813 -14.653 -15.761 -18.888 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23471.txt deleted file mode 100644 index 7b4e51c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7121 ,TETRA ,17605208,Sun Nov 28 18:49:18 CET,Sun Nov 28 20:36:00 CET,0.0 1.911 2.696 3.325 3.888 4.359 4.774 5.165 5.844 6.147 6.44 6.631 7.228 7.452 7.902 8.327 8.715 8.896 9.228 9.561 10.025 10.3 10.568 10.968 11.334 11.669 12.008 12.34 12.756 13.134 13.458 13.825 14.171 14.492 14.844 15.179 15.47 15.781 16.071 16.336 16.591 16.836 17.056 17.212 17.297 17.309 17.221 16.88 16.18 14.985 12.688 9.739 7.253 5.13 3.277 1.6 0.095 -1.266 -2.404 -3.531 -4.527 -5.463 -6.362 -7.237 -8.061 -8.795 -9.603 -10.347 -10.978 -11.67 -12.353 -12.929 -13.571 -14.224 -14.754 -15.301 -15.836 -16.388 -16.972 -17.367 -17.815 -18.612 -19.17 -19.714 -19.978 -20.531 -21.131 -21.767 -22.111 -22.849 -23.188 -23.569 -23.99 -24.895 -25.391 -25.937 -26.54 -27.247 -28.119 -29.27 -32.572 -2 ,22019 ,TETRA ,17605209,Sun Nov 28 18:49:19 CET,Sun Nov 28 20:36:08 CET,0.0 2.199 3.098 3.76 4.337 4.825 5.236 5.623 6.349 6.688 6.989 7.164 7.775 8.023 8.487 8.907 9.291 9.471 9.81 10.119 10.57 10.87 11.152 11.521 11.854 12.198 12.518 12.785 13.13 13.473 13.814 14.175 14.468 14.747 15.089 15.475 15.798 16.091 16.406 16.747 17.06 17.341 17.559 17.714 17.829 17.864 17.814 17.56 16.923 15.686 13.4 10.463 7.926 5.805 3.964 2.29 0.86 -0.43 -1.561 -2.744 -3.798 -4.738 -5.624 -6.444 -7.213 -7.966 -8.748 -9.44 -10.07 -10.753 -11.494 -12.099 -12.685 -13.293 -13.789 -14.31 -14.871 -15.457 -16.069 -16.483 -16.911 -17.609 -18.096 -18.592 -18.846 -19.391 -19.958 -20.545 -20.867 -21.58 -21.896 -22.269 -22.672 -23.555 -24.04 -24.584 -25.188 -25.91 -26.764 -27.879 -31.331 -3 ,24414 ,TETRA ,17605210,Sun Nov 28 18:49:22 CET,Sun Nov 28 20:36:07 CET,0.0 2.43 3.38 4.054 4.573 5.031 5.452 5.836 6.499 6.805 7.1 7.28 7.875 8.114 8.557 8.957 9.309 9.475 9.831 10.179 10.643 10.929 11.205 11.609 11.976 12.306 12.623 12.936 13.317 13.648 13.985 14.388 14.728 15.052 15.404 15.719 16.015 16.366 16.676 16.945 17.213 17.467 17.734 17.968 18.117 18.148 18.025 17.716 17.105 15.934 13.683 10.702 8.183 5.975 3.998 2.207 0.615 -0.829 -2.037 -3.228 -4.286 -5.253 -6.161 -7.011 -7.818 -8.566 -9.373 -10.11 -10.752 -11.437 -12.119 -12.668 -13.283 -13.957 -14.471 -15.0 -15.559 -16.146 -16.763 -17.181 -17.612 -18.285 -18.745 -19.242 -19.506 -20.053 -20.634 -21.297 -21.641 -22.366 -22.722 -23.113 -23.518 -24.398 -24.903 -25.458 -26.061 -26.843 -27.856 -29.14 -32.72 -4 ,24024 ,TETRA ,17605211,Sun Nov 28 18:49:23 CET,Sun Nov 28 20:36:39 CET,0.0 1.875 2.755 3.46 4.058 4.532 4.949 5.344 6.038 6.346 6.639 6.831 7.438 7.679 8.124 8.564 8.957 9.14 9.506 9.839 10.293 10.588 10.866 11.282 11.68 12.016 12.326 12.619 12.959 13.266 13.566 13.932 14.268 14.559 14.888 15.241 15.569 15.894 16.182 16.459 16.693 16.933 17.186 17.354 17.475 17.512 17.42 17.133 16.507 15.272 12.914 9.849 7.294 5.199 3.373 1.713 0.227 -1.183 -2.445 -3.713 -4.798 -5.743 -6.686 -7.609 -8.502 -9.33 -10.144 -10.879 -11.501 -12.137 -12.81 -13.36 -13.954 -14.618 -15.102 -15.63 -16.229 -16.795 -17.375 -17.801 -18.236 -18.911 -19.377 -19.851 -20.112 -20.668 -21.248 -21.847 -22.176 -22.908 -23.261 -23.655 -24.06 -24.936 -25.427 -25.947 -26.528 -27.237 -28.107 -29.224 -32.559 -5 ,14656 ,TETRA ,17605212,Sun Nov 28 18:49:20 CET,Sun Nov 28 20:35:38 CET,0.0 1.911 2.821 3.513 4.067 4.533 4.964 5.362 6.01 6.309 6.598 6.777 7.389 7.642 8.11 8.525 8.915 9.108 9.467 9.818 10.317 10.627 10.933 11.358 11.76 12.138 12.482 12.798 13.171 13.522 13.864 14.269 14.635 14.951 15.284 15.628 15.936 16.205 16.447 16.703 16.945 17.214 17.475 17.657 17.837 17.926 17.804 17.449 16.74 15.467 13.176 10.229 7.696 5.547 3.633 1.868 0.333 -1.051 -2.268 -3.515 -4.638 -5.633 -6.531 -7.391 -8.235 -8.986 -9.763 -10.46 -11.036 -11.646 -12.343 -12.936 -13.541 -14.16 -14.658 -15.196 -15.754 -16.341 -16.922 -17.312 -17.733 -18.405 -18.868 -19.341 -19.594 -20.141 -20.706 -21.323 -21.657 -22.375 -22.704 -23.092 -23.531 -24.489 -24.977 -25.549 -26.211 -26.943 -27.766 -28.851 -32.06 -6 ,23974 ,TETRA ,17605213,Sun Nov 28 18:49:20 CET,Sun Nov 28 20:36:25 CET,0.0 1.636 2.425 3.043 3.532 3.948 4.331 4.676 5.279 5.563 5.821 5.918 6.485 6.671 7.027 7.364 7.662 7.8 8.07 8.338 8.738 8.997 9.237 9.557 9.863 10.171 10.456 10.702 11.028 11.335 11.589 11.885 12.167 12.407 12.663 12.934 13.191 13.475 13.72 13.946 14.149 14.309 14.475 14.577 14.533 14.387 14.086 13.54 12.662 11.2 8.489 5.035 2.175 -0.206 -2.22 -4.013 -5.615 -7.097 -8.341 -9.549 -10.583 -11.525 -12.484 -13.387 -14.207 -14.975 -15.794 -16.523 -17.188 -17.874 -18.569 -19.161 -19.766 -20.377 -20.873 -21.413 -21.971 -22.533 -23.111 -23.552 -24.022 -24.709 -25.181 -25.686 -25.939 -26.471 -27.056 -27.673 -27.997 -28.705 -29.012 -29.417 -29.847 -30.702 -31.163 -31.695 -32.333 -33.073 -34.014 -35.336 -38.573 -7 ,15250 ,TETRA ,17605214,Sun Nov 28 18:49:22 CET,Sun Nov 28 20:36:30 CET,0.0 2.02 2.885 3.59 4.166 4.66 5.103 5.506 6.229 6.545 6.836 7.043 7.649 7.87 8.29 8.707 9.109 9.308 9.684 10.028 10.508 10.797 11.064 11.427 11.772 12.117 12.463 12.792 13.179 13.511 13.813 14.15 14.485 14.795 15.095 15.413 15.71 16.042 16.346 16.581 16.796 17.007 17.239 17.407 17.492 17.519 17.408 17.135 16.54 15.322 13.009 9.97 7.417 5.231 3.373 1.757 0.261 -1.188 -2.429 -3.632 -4.663 -5.605 -6.527 -7.444 -8.312 -9.141 -10.064 -10.848 -11.502 -12.181 -12.876 -13.452 -14.064 -14.723 -15.22 -15.721 -16.257 -16.812 -17.401 -17.822 -18.262 -18.952 -19.449 -19.982 -20.257 -20.832 -21.411 -21.997 -22.31 -23.029 -23.404 -23.814 -24.236 -25.12 -25.612 -26.157 -26.758 -27.467 -28.304 -29.416 -32.855 -8 ,27009 ,TETRA ,17605215,Sun Nov 28 18:49:23 CET,Sun Nov 28 20:36:03 CET,0.0 1.861 2.731 3.387 3.956 4.464 4.903 5.305 5.976 6.283 6.576 6.762 7.366 7.603 8.039 8.46 8.874 9.065 9.434 9.78 10.276 10.569 10.828 11.22 11.585 11.914 12.212 12.491 12.868 13.189 13.489 13.865 14.184 14.484 14.811 15.166 15.463 15.74 16.044 16.368 16.652 16.904 17.134 17.282 17.364 17.322 17.177 16.88 16.226 14.948 12.598 9.631 7.044 4.699 2.664 0.871 -0.702 -2.091 -3.265 -4.47 -5.537 -6.491 -7.414 -8.292 -9.107 -9.871 -10.719 -11.48 -12.097 -12.755 -13.484 -14.056 -14.641 -15.264 -15.775 -16.325 -16.862 -17.42 -18.014 -18.451 -18.879 -19.529 -20.005 -20.494 -20.763 -21.317 -21.894 -22.509 -22.828 -23.534 -23.85 -24.232 -24.642 -25.546 -26.05 -26.615 -27.245 -27.931 -28.783 -30.047 -33.125 -9 ,8547 ,TETRA ,17605216,Sun Nov 28 18:49:26 CET,Sun Nov 28 20:36:06 CET,0.0 1.855 2.679 3.329 3.854 4.301 4.745 5.16 5.867 6.174 6.455 6.626 7.229 7.464 7.913 8.34 8.733 8.917 9.268 9.589 10.059 10.365 10.648 11.025 11.38 11.734 12.055 12.354 12.751 13.102 13.421 13.829 14.234 14.56 14.851 15.137 15.397 15.693 16.003 16.297 16.559 16.811 17.019 17.15 17.263 17.311 17.201 16.89 16.234 14.978 12.663 9.595 6.994 4.868 2.973 1.192 -0.364 -1.741 -2.924 -4.127 -5.171 -6.119 -7.084 -8.028 -8.882 -9.643 -10.46 -11.173 -11.795 -12.458 -13.136 -13.721 -14.361 -14.994 -15.459 -15.966 -16.494 -17.05 -17.64 -18.061 -18.501 -19.178 -19.664 -20.189 -20.469 -21.04 -21.62 -22.257 -22.591 -23.306 -23.648 -24.029 -24.426 -25.289 -25.795 -26.395 -27.022 -27.712 -28.591 -29.745 -33.741 -10 ,24959 ,TETRA ,17605217,Sun Nov 28 18:49:20 CET,Sun Nov 28 20:36:25 CET,0.0 2.594 3.483 4.213 4.809 5.3 5.742 6.151 6.877 7.182 7.471 7.685 8.312 8.572 9.021 9.448 9.849 10.033 10.386 10.719 11.171 11.449 11.715 12.1 12.475 12.827 13.174 13.51 13.907 14.254 14.575 14.938 15.257 15.572 15.89 16.208 16.518 16.851 17.169 17.463 17.707 17.907 18.114 18.268 18.36 18.382 18.267 17.947 17.308 16.095 13.808 10.8 8.097 5.697 3.603 1.766 0.209 -1.223 -2.472 -3.705 -4.772 -5.734 -6.667 -7.542 -8.35 -9.112 -9.883 -10.569 -11.191 -11.863 -12.58 -13.184 -13.82 -14.466 -14.981 -15.516 -16.051 -16.613 -17.203 -17.618 -18.075 -18.79 -19.274 -19.786 -20.054 -20.617 -21.205 -21.803 -22.116 -22.838 -23.226 -23.618 -23.993 -24.837 -25.327 -25.87 -26.47 -27.167 -28.005 -29.069 -32.699 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23468.txt deleted file mode 100644 index 060db1f9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20714 ,TETRA ,17605218,Sun Nov 28 18:49:24 CET,Sun Nov 28 20:36:39 CET,0.0 3.158 4.191 4.893 5.468 5.973 6.452 6.896 7.732 8.12 8.467 8.684 9.39 9.701 10.328 10.853 11.328 11.574 12.06 12.513 13.135 13.558 13.973 14.536 15.093 15.659 16.191 16.689 17.316 17.927 18.525 19.215 19.855 20.454 21.165 21.955 22.686 23.511 24.419 25.36 26.327 27.439 28.735 30.09 31.697 33.459 35.525 37.867 40.687 44.063 48.218 51.776 53.943 55.36 56.263 56.932 57.401 57.695 57.884 57.917 57.852 57.801 57.739 57.609 57.414 57.197 56.976 56.739 56.488 56.221 55.917 55.682 55.456 55.176 54.934 54.664 54.362 54.048 53.706 53.46 53.192 52.755 52.451 52.114 51.93 51.553 51.151 50.719 50.478 49.854 49.661 49.358 49.031 48.321 47.906 47.423 46.894 46.312 45.622 44.699 42.042 -2 ,20563 ,TETRA ,17605219,Sun Nov 28 18:49:21 CET,Sun Nov 28 20:37:18 CET,0.0 1.69 2.547 3.227 3.818 4.342 4.821 5.282 6.134 6.513 6.863 7.101 7.809 8.1 8.656 9.189 9.712 9.962 10.423 10.87 11.508 11.941 12.377 12.959 13.491 14.018 14.54 15.04 15.691 16.307 16.855 17.5 18.139 18.74 19.448 20.247 21.04 21.948 22.87 23.82 24.822 25.947 27.255 28.569 30.118 31.889 33.97 36.347 39.182 42.646 47.068 50.907 53.253 54.781 55.784 56.502 56.964 57.256 57.448 57.546 57.552 57.479 57.333 57.204 57.033 56.816 56.6 56.389 56.169 55.951 55.731 55.459 55.175 54.882 54.613 54.34 54.046 53.726 53.38 53.149 52.916 52.488 52.151 51.809 51.638 51.268 50.851 50.413 50.179 49.56 49.387 49.092 48.77 48.063 47.688 47.224 46.683 46.075 45.323 44.333 41.665 -3 ,29872 ,TETRA ,17605220,Sun Nov 28 18:49:22 CET,Sun Nov 28 20:36:52 CET,0.0 2.108 2.97 3.649 4.201 4.701 5.167 5.575 6.314 6.674 7.022 7.246 7.951 8.241 8.792 9.293 9.77 10.012 10.492 10.946 11.578 12.009 12.425 12.985 13.541 14.057 14.52 14.973 15.571 16.175 16.775 17.491 18.175 18.825 19.568 20.377 21.17 22.051 22.968 23.958 25.022 26.178 27.51 28.876 30.447 32.215 34.28 36.627 39.487 43.002 47.4 51.189 53.517 55.062 56.082 56.739 57.153 57.433 57.614 57.717 57.722 57.672 57.574 57.433 57.23 56.986 56.748 56.534 56.333 56.11 55.845 55.606 55.329 55.017 54.756 54.471 54.177 53.864 53.521 53.276 53.022 52.592 52.257 51.888 51.704 51.329 50.907 50.443 50.197 49.578 49.382 49.046 48.685 47.91 47.496 47.038 46.516 45.916 45.208 44.295 41.365 -4 ,26540 ,TETRA ,17605221,Sun Nov 28 18:49:21 CET,Sun Nov 28 20:36:51 CET,0.0 1.92 2.807 3.5 4.068 4.574 5.057 5.503 6.252 6.604 6.93 7.156 7.878 8.163 8.722 9.259 9.764 10.006 10.483 10.937 11.54 11.917 12.302 12.867 13.393 13.897 14.385 14.872 15.531 16.154 16.739 17.454 18.118 18.713 19.418 20.242 21.008 21.821 22.725 23.68 24.646 25.743 27.034 28.34 29.891 31.666 33.743 36.126 38.954 42.354 46.603 50.194 52.29 53.648 54.533 55.086 55.5 55.788 55.906 55.959 55.956 55.917 55.812 55.603 55.322 55.041 54.765 54.526 54.317 54.059 53.75 53.472 53.181 52.898 52.689 52.478 52.234 51.941 51.629 51.39 51.108 50.676 50.373 50.038 49.859 49.472 49.07 48.64 48.388 47.752 47.574 47.273 46.945 46.206 45.787 45.317 44.778 44.181 43.464 42.539 40.225 -5 ,14244 ,TETRA ,17605222,Sun Nov 28 18:49:22 CET,Sun Nov 28 20:36:51 CET,0.0 1.852 2.669 3.326 3.901 4.414 4.862 5.275 6.03 6.383 6.718 6.944 7.649 7.934 8.49 9.028 9.544 9.799 10.293 10.737 11.357 11.77 12.154 12.722 13.291 13.816 14.321 14.817 15.479 16.129 16.735 17.423 18.091 18.728 19.425 20.238 21.068 21.936 22.832 23.817 24.856 26.029 27.373 28.706 30.261 32.005 34.04 36.37 39.149 42.536 46.769 50.299 52.398 53.82 54.84 55.551 55.963 56.214 56.336 56.401 56.395 56.308 56.222 56.137 55.999 55.842 55.656 55.425 55.184 54.925 54.644 54.361 54.039 53.701 53.429 53.146 52.838 52.495 52.099 51.809 51.516 51.087 50.811 50.502 50.324 49.956 49.58 49.151 48.914 48.308 48.132 47.831 47.511 46.797 46.39 45.932 45.422 44.829 44.092 43.114 40.19 -6 ,19648 ,TETRA ,17605223,Sun Nov 28 18:49:25 CET,Sun Nov 28 20:37:03 CET,0.0 2.737 3.749 4.494 5.088 5.586 6.056 6.502 7.296 7.658 8.009 8.28 9.01 9.319 9.887 10.397 10.876 11.12 11.605 12.057 12.7 13.112 13.504 14.058 14.596 15.145 15.662 16.128 16.773 17.438 18.056 18.745 19.364 19.973 20.68 21.468 22.242 23.081 23.983 24.913 25.903 27.057 28.384 29.717 31.32 33.095 35.108 37.405 40.153 43.519 47.746 51.366 53.621 55.139 56.118 56.766 57.184 57.433 57.571 57.658 57.665 57.561 57.416 57.251 57.08 56.913 56.683 56.478 56.287 56.025 55.744 55.52 55.257 54.947 54.69 54.428 54.145 53.813 53.465 53.219 52.945 52.473 52.094 51.687 51.49 51.128 50.74 50.287 50.049 49.421 49.273 49.0 48.681 47.942 47.527 47.068 46.564 45.997 45.261 44.228 41.422 -7 ,19188 ,TETRA ,17605224,Sun Nov 28 18:49:26 CET,Sun Nov 28 20:36:53 CET,0.0 2.696 3.709 4.424 4.981 5.488 5.965 6.397 7.187 7.55 7.875 8.09 8.808 9.089 9.622 10.141 10.645 10.888 11.335 11.755 12.36 12.746 13.134 13.698 14.234 14.759 15.278 15.781 16.411 16.993 17.523 18.166 18.799 19.436 20.19 21.022 21.78 22.583 23.499 24.487 25.504 26.62 27.924 29.279 30.853 32.625 34.744 37.141 39.938 43.322 47.578 51.212 53.36 54.823 55.854 56.544 56.95 57.234 57.424 57.517 57.513 57.461 57.307 57.1 56.945 56.811 56.66 56.477 56.253 55.993 55.704 55.45 55.196 54.894 54.644 54.394 54.126 53.79 53.412 53.161 52.879 52.441 52.132 51.788 51.602 51.219 50.855 50.423 50.165 49.536 49.342 49.046 48.726 47.966 47.522 47.0 46.41 45.743 44.919 43.897 40.445 -8 ,22911 ,TETRA ,17605225,Sun Nov 28 18:49:21 CET,Sun Nov 28 20:36:50 CET,0.0 1.768 2.64 3.331 3.916 4.447 4.947 5.404 6.2 6.548 6.881 7.092 7.814 8.126 8.686 9.184 9.672 9.923 10.414 10.866 11.506 11.931 12.344 12.902 13.423 13.935 14.439 14.917 15.516 16.127 16.71 17.396 18.088 18.728 19.463 20.279 21.035 21.912 22.902 23.911 24.917 26.054 27.417 28.799 30.418 32.223 34.284 36.641 39.492 42.987 47.433 51.285 53.577 55.077 56.126 56.81 57.215 57.492 57.657 57.734 57.682 57.581 57.404 57.161 56.961 56.775 56.495 56.207 55.964 55.71 55.444 55.22 54.953 54.632 54.392 54.151 53.896 53.574 53.21 52.963 52.695 52.234 51.902 51.567 51.395 51.021 50.6 50.133 49.879 49.246 49.039 48.747 48.44 47.695 47.285 46.839 46.314 45.706 44.93 43.891 40.889 -9 ,4940 ,TETRA ,17605226,Sun Nov 28 18:49:22 CET,Sun Nov 28 20:37:11 CET,0.0 1.886 2.761 3.424 3.964 4.462 4.932 5.385 6.211 6.576 6.936 7.21 7.929 8.227 8.764 9.271 9.755 9.999 10.493 10.965 11.615 12.022 12.428 13.008 13.539 14.073 14.608 15.103 15.712 16.283 16.832 17.502 18.166 18.83 19.602 20.401 21.134 21.975 22.884 23.923 25.016 26.129 27.452 28.798 30.378 32.222 34.312 36.665 39.538 43.023 47.422 51.164 53.447 54.953 55.922 56.561 56.941 57.139 57.249 57.316 57.325 57.252 57.094 56.911 56.71 56.515 56.334 56.13 55.904 55.66 55.383 55.118 54.813 54.519 54.302 54.034 53.737 53.411 53.047 52.796 52.544 52.107 51.779 51.439 51.25 50.845 50.42 49.949 49.7 49.077 48.932 48.646 48.325 47.602 47.193 46.738 46.204 45.591 44.853 43.896 41.455 -10 ,5998 ,TETRA ,17605227,Sun Nov 28 18:49:24 CET,Sun Nov 28 20:37:05 CET,0.0 1.998 2.867 3.555 4.117 4.611 5.067 5.508 6.307 6.657 7.001 7.263 7.976 8.273 8.858 9.391 9.924 10.185 10.642 11.072 11.721 12.141 12.55 13.141 13.711 14.245 14.74 15.207 15.823 16.439 17.036 17.76 18.434 19.039 19.734 20.582 21.419 22.331 23.341 24.378 25.411 26.546 27.881 29.242 30.818 32.575 34.629 37.039 39.962 43.496 47.995 51.855 54.152 55.648 56.636 57.287 57.708 57.98 58.134 58.196 58.193 58.121 57.987 57.829 57.672 57.517 57.318 57.08 56.87 56.641 56.321 56.046 55.782 55.487 55.235 54.958 54.663 54.35 53.991 53.731 53.464 52.998 52.665 52.314 52.128 51.749 51.335 50.91 50.684 50.075 49.901 49.591 49.268 48.575 48.19 47.76 47.256 46.69 46.006 45.011 42.046 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23471.txt deleted file mode 100644 index f515572d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29630 ,TETRA ,17605228,Sun Nov 28 18:49:27 CET,Sun Nov 28 20:36:37 CET,0.0 1.951 2.796 3.404 3.901 4.329 4.729 5.114 5.807 6.124 6.426 6.583 7.266 7.519 8.006 8.482 8.936 9.146 9.545 9.947 10.563 10.959 11.307 11.789 12.306 12.81 13.273 13.714 14.276 14.816 15.347 15.995 16.583 17.168 17.818 18.494 19.182 19.951 20.77 21.598 22.396 23.301 24.396 25.462 26.699 28.121 29.711 31.435 33.448 35.762 38.426 40.424 41.39 41.854 42.031 42.029 41.906 41.664 41.444 41.187 40.892 40.608 40.318 40.032 39.72 39.383 38.992 38.649 38.295 37.882 37.461 37.106 36.735 36.298 35.945 35.602 35.253 34.859 34.412 34.083 33.738 33.186 32.788 32.394 32.194 31.772 31.318 30.813 30.548 29.88 29.639 29.33 28.991 28.194 27.743 27.256 26.722 26.091 25.326 24.316 21.326 -2 ,17355 ,TETRA ,17605229,Sun Nov 28 18:50:15 CET,Sun Nov 28 20:37:49 CET,0.0 1.47 2.201 2.778 3.244 3.666 4.067 4.436 5.12 5.451 5.765 5.914 6.584 6.84 7.321 7.771 8.192 8.396 8.804 9.188 9.741 10.107 10.457 10.952 11.439 11.917 12.392 12.86 13.422 13.93 14.44 15.071 15.64 16.166 16.772 17.46 18.137 18.855 19.62 20.449 21.301 22.225 23.294 24.351 25.569 26.927 28.448 30.136 32.12 34.43 37.176 39.237 40.249 40.718 40.878 40.926 40.885 40.717 40.464 40.18 39.893 39.604 39.343 39.076 38.783 38.495 38.179 37.885 37.619 37.276 36.828 36.444 36.063 35.646 35.346 35.049 34.708 34.33 33.904 33.596 33.281 32.777 32.425 32.053 31.853 31.412 30.945 30.467 30.204 29.542 29.335 28.992 28.605 27.746 27.272 26.776 26.203 25.548 24.806 23.745 20.198 -3 ,22762 ,TETRA ,17605230,Sun Nov 28 18:50:15 CET,Sun Nov 28 20:37:34 CET,0.0 1.619 2.374 2.955 3.457 3.908 4.315 4.696 5.394 5.719 6.034 6.235 6.926 7.177 7.66 8.125 8.598 8.838 9.317 9.781 10.421 10.819 11.194 11.722 12.222 12.699 13.168 13.618 14.187 14.706 15.191 15.782 16.371 16.966 17.645 18.356 19.007 19.752 20.532 21.316 22.132 23.071 24.204 25.31 26.545 27.884 29.471 31.283 33.361 35.735 38.56 40.824 42.016 42.63 42.916 43.029 42.979 42.853 42.696 42.436 42.126 41.819 41.532 41.241 40.949 40.647 40.267 39.936 39.654 39.336 39.005 38.66 38.286 37.905 37.563 37.216 36.856 36.472 36.079 35.8 35.475 34.927 34.561 34.196 34.002 33.568 33.116 32.65 32.388 31.734 31.557 31.245 30.909 30.193 29.786 29.298 28.755 28.129 27.37 26.343 23.682 -4 ,13987 ,TETRA ,17605231,Sun Nov 28 18:50:16 CET,Sun Nov 28 20:37:43 CET,0.0 1.592 2.342 2.933 3.427 3.852 4.245 4.618 5.305 5.617 5.922 6.106 6.79 7.049 7.553 8.06 8.541 8.759 9.165 9.56 10.144 10.517 10.858 11.349 11.857 12.346 12.801 13.244 13.826 14.401 14.947 15.557 16.125 16.689 17.358 18.106 18.791 19.542 20.349 21.173 22.038 22.971 24.049 25.139 26.418 27.852 29.49 31.309 33.37 35.72 38.501 40.712 41.87 42.488 42.783 42.91 42.888 42.728 42.535 42.294 42.042 41.803 41.505 41.146 40.808 40.497 40.159 39.843 39.526 39.173 38.836 38.524 38.145 37.726 37.406 37.077 36.698 36.267 35.816 35.512 35.2 34.726 34.39 33.997 33.79 33.366 32.883 32.361 32.088 31.403 31.14 30.802 30.459 29.698 29.248 28.782 28.278 27.64 26.775 25.631 22.947 -5 ,30963 ,TETRA ,17605232,Sun Nov 28 18:50:16 CET,Sun Nov 28 20:37:45 CET,0.0 1.353 2.078 2.653 3.144 3.598 4.016 4.401 5.092 5.428 5.744 5.888 6.562 6.806 7.3 7.78 8.222 8.43 8.842 9.225 9.745 10.095 10.467 11.004 11.491 11.949 12.425 12.909 13.461 13.955 14.452 15.079 15.65 16.188 16.834 17.564 18.248 18.941 19.675 20.473 21.319 22.271 23.334 24.383 25.614 26.959 28.487 30.167 32.106 34.374 37.011 39.033 40.01 40.481 40.645 40.627 40.498 40.314 40.079 39.808 39.565 39.328 39.054 38.72 38.386 38.055 37.675 37.314 36.969 36.62 36.23 35.879 35.534 35.14 34.794 34.445 34.102 33.727 33.293 32.985 32.653 32.113 31.724 31.319 31.11 30.666 30.22 29.77 29.512 28.831 28.535 28.179 27.827 27.065 26.621 26.114 25.565 24.955 24.18 23.121 20.336 -6 ,19472 ,TETRA ,17605233,Sun Nov 28 18:51:16 CET,Sun Nov 28 20:29:04 CET,0.0 1.982 2.815 3.376 3.85 4.292 4.698 5.07 5.718 6.021 6.322 6.436 7.102 7.351 7.835 8.301 8.764 8.986 9.403 9.817 10.418 10.808 11.194 11.718 12.196 12.656 13.101 13.521 14.051 14.574 15.068 15.683 16.299 16.873 17.51 18.196 18.864 19.592 20.339 21.128 21.955 22.871 23.93 24.982 26.186 27.514 29.06 30.785 32.748 34.971 37.55 39.498 40.397 40.792 40.939 40.926 40.813 40.632 40.449 40.247 39.968 39.641 39.287 38.917 38.543 38.195 37.824 37.477 37.189 36.893 36.523 36.148 35.754 35.339 35.019 34.681 34.289 33.892 33.472 33.151 32.847 32.396 32.027 31.633 31.442 31.034 30.572 30.114 29.861 29.201 28.994 28.673 28.336 27.593 27.154 26.642 26.063 25.399 24.615 23.575 20.076 -7 ,2330 ,TETRA ,17605234,Sun Nov 28 18:50:16 CET,Sun Nov 28 20:37:04 CET,0.0 1.916 2.812 3.431 3.985 4.495 4.948 5.362 6.122 6.471 6.79 6.965 7.642 7.902 8.432 8.938 9.409 9.634 10.093 10.561 11.229 11.64 12.032 12.606 13.153 13.682 14.223 14.745 15.373 15.947 16.487 17.16 17.81 18.434 19.146 19.926 20.657 21.414 22.2 23.003 23.834 24.753 25.811 26.877 28.093 29.45 31.037 32.813 34.849 37.172 39.96 42.233 43.47 44.126 44.429 44.524 44.489 44.366 44.152 43.864 43.613 43.352 43.038 42.727 42.416 42.137 41.825 41.477 41.141 40.798 40.45 40.114 39.753 39.398 39.104 38.773 38.424 38.027 37.576 37.257 36.926 36.418 36.036 35.636 35.442 35.025 34.566 34.052 33.769 33.106 32.875 32.528 32.138 31.336 30.904 30.439 29.887 29.191 28.355 27.286 23.906 -8 ,2437 ,TETRA ,17605235,Sun Nov 28 18:50:16 CET,Sun Nov 28 20:37:10 CET,0.0 1.825 2.848 3.623 4.274 4.851 5.356 5.811 6.623 6.998 7.364 7.651 8.394 8.705 9.253 9.783 10.3 10.544 11.009 11.475 12.13 12.526 12.919 13.501 14.054 14.564 15.06 15.572 16.233 16.827 17.387 18.071 18.747 19.387 20.127 20.936 21.671 22.499 23.395 24.305 25.225 26.269 27.504 28.75 30.204 31.771 33.52 35.518 37.826 40.487 43.726 46.109 47.236 47.875 48.199 48.335 48.345 48.26 48.113 47.894 47.649 47.414 47.151 46.85 46.521 46.206 45.814 45.397 45.058 44.717 44.345 43.991 43.592 43.214 42.93 42.599 42.229 41.862 41.469 41.187 40.884 40.383 39.99 39.55 39.336 38.926 38.499 38.01 37.743 37.076 36.888 36.584 36.235 35.469 35.037 34.541 33.978 33.326 32.527 31.388 28.414 -9 ,30766 ,TETRA ,17605236,Sun Nov 28 18:50:16 CET,Sun Nov 28 20:37:47 CET,0.0 1.673 2.443 3.056 3.54 3.954 4.352 4.723 5.406 5.73 6.056 6.251 6.932 7.19 7.676 8.139 8.586 8.814 9.277 9.704 10.303 10.681 11.052 11.599 12.119 12.619 13.09 13.515 14.039 14.564 15.087 15.718 16.313 16.893 17.553 18.263 18.967 19.749 20.527 21.29 22.077 22.986 24.104 25.213 26.443 27.82 29.466 31.261 33.259 35.619 38.418 40.605 41.807 42.452 42.743 42.837 42.793 42.702 42.57 42.355 42.112 41.855 41.559 41.182 40.79 40.452 40.072 39.69 39.373 39.022 38.634 38.306 37.928 37.494 37.15 36.793 36.406 36.009 35.595 35.298 34.985 34.511 34.159 33.758 33.549 33.135 32.69 32.206 31.954 31.296 31.05 30.717 30.37 29.566 29.1 28.62 28.107 27.478 26.72 25.749 22.522 -10 ,19092 ,TETRA ,17605237,Sun Nov 28 18:50:17 CET,Sun Nov 28 20:37:42 CET,0.0 1.406 2.18 2.795 3.356 3.874 4.331 4.74 5.468 5.807 6.139 6.356 7.061 7.335 7.847 8.342 8.836 9.068 9.477 9.884 10.49 10.858 11.208 11.706 12.2 12.704 13.18 13.607 14.144 14.667 15.164 15.788 16.429 17.046 17.729 18.483 19.199 19.969 20.752 21.543 22.409 23.392 24.498 25.577 26.824 28.213 29.796 31.556 33.591 35.979 38.856 41.118 42.275 42.822 43.002 42.995 42.944 42.825 42.592 42.232 41.893 41.544 41.135 40.72 40.355 40.044 39.699 39.354 39.006 38.638 38.277 37.945 37.571 37.194 36.88 36.547 36.195 35.798 35.388 35.094 34.774 34.275 33.94 33.581 33.375 32.937 32.471 31.986 31.729 31.061 30.822 30.488 30.14 29.387 28.92 28.362 27.741 27.056 26.222 25.145 22.693 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23466.txt deleted file mode 100644 index 3c0c1ac1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4691 ,TETRA ,17605238,Sun Nov 28 18:50:16 CET,Sun Nov 28 20:40:21 CET,0.0 1.805 2.525 3.131 3.668 4.123 4.527 4.894 5.524 5.829 6.132 6.293 6.936 7.192 7.681 8.13 8.548 8.76 9.189 9.568 10.087 10.433 10.764 11.25 11.735 12.191 12.618 13.047 13.568 14.048 14.531 15.125 15.687 16.214 16.823 17.495 18.16 18.94 19.794 20.646 21.512 22.509 23.677 24.821 26.186 27.745 29.533 31.529 33.781 36.46 39.609 42.027 43.221 43.726 43.916 43.91 43.7 43.404 43.121 42.733 42.386 42.054 41.65 41.198 40.761 40.371 39.959 39.606 39.289 38.889 38.425 38.021 37.587 37.125 36.76 36.39 35.979 35.54 35.104 34.789 34.454 33.922 33.519 33.086 32.871 32.426 31.945 31.433 31.165 30.522 30.214 29.865 29.475 28.617 28.128 27.601 27.019 26.306 25.427 24.126 19.383 -2 ,20780 ,TETRA ,17605239,Sun Nov 28 18:50:16 CET,Sun Nov 28 20:35:19 CET,0.0 1.578 2.373 2.989 3.497 3.942 4.381 4.773 5.405 5.697 5.985 6.149 6.785 7.026 7.491 7.953 8.387 8.595 9.006 9.4 9.966 10.314 10.657 11.149 11.591 12.058 12.487 12.862 13.417 13.959 14.455 15.085 15.662 16.208 16.847 17.6 18.333 19.057 19.825 20.674 21.544 22.489 23.656 24.863 26.265 27.836 29.668 31.744 34.11 36.926 40.296 42.948 44.453 45.311 45.782 46.005 46.049 46.022 45.922 45.776 45.591 45.374 45.139 44.87 44.563 44.254 43.92 43.613 43.351 43.064 42.748 42.441 42.102 41.743 41.434 41.117 40.769 40.396 40.02 39.745 39.447 38.993 38.688 38.343 38.154 37.71 37.24 36.768 36.52 35.916 35.683 35.352 34.979 34.189 33.747 33.251 32.657 31.956 31.144 30.023 24.54 -3 ,28510 ,TETRA ,17605240,Sun Nov 28 18:50:18 CET,Sun Nov 28 20:34:48 CET,0.0 1.856 2.6 3.236 3.755 4.178 4.566 4.934 5.584 5.889 6.179 6.335 6.984 7.232 7.698 8.132 8.554 8.774 9.215 9.614 10.171 10.52 10.848 11.319 11.766 12.235 12.711 13.16 13.732 14.255 14.741 15.32 15.901 16.486 17.167 17.9 18.584 19.363 20.172 20.991 21.853 22.825 23.954 25.095 26.452 27.947 29.668 31.647 33.977 36.744 39.896 42.154 43.224 43.704 43.831 43.799 43.658 43.407 43.156 42.809 42.433 42.09 41.713 41.32 40.912 40.463 39.991 39.572 39.203 38.797 38.337 37.966 37.59 37.188 36.853 36.492 36.084 35.635 35.156 34.82 34.479 33.937 33.525 33.079 32.855 32.371 31.863 31.329 31.042 30.398 30.08 29.729 29.366 28.539 28.037 27.481 26.88 26.189 25.316 24.009 19.384 -4 ,15982 ,TETRA ,17605241,Sun Nov 28 18:50:19 CET,Sun Nov 28 20:34:34 CET,0.0 1.565 2.379 3.001 3.517 3.985 4.422 4.81 5.471 5.771 6.069 6.248 6.88 7.13 7.612 8.052 8.472 8.673 9.057 9.444 10.01 10.368 10.702 11.199 11.698 12.152 12.596 13.04 13.589 14.099 14.585 15.185 15.746 16.282 16.943 17.654 18.329 19.074 19.847 20.656 21.538 22.555 23.701 24.841 26.207 27.74 29.523 31.559 33.875 36.554 39.66 41.989 43.042 43.414 43.594 43.581 43.4 43.149 42.843 42.467 42.092 41.742 41.392 41.017 40.639 40.274 39.883 39.522 39.188 38.768 38.268 37.877 37.476 37.05 36.712 36.334 35.92 35.505 35.086 34.784 34.451 33.882 33.472 33.061 32.849 32.402 31.938 31.425 31.151 30.517 30.219 29.862 29.465 28.572 28.082 27.504 26.838 26.102 25.23 24.018 20.571 -5 ,2400 ,TETRA ,17605242,Sun Nov 28 18:50:18 CET,Sun Nov 28 20:34:47 CET,0.0 1.541 2.337 2.956 3.477 3.914 4.297 4.668 5.365 5.684 5.987 6.146 6.774 7.016 7.482 7.935 8.363 8.557 8.944 9.353 9.93 10.264 10.58 11.052 11.519 11.973 12.411 12.83 13.37 13.883 14.388 15.032 15.617 16.151 16.798 17.544 18.251 19.02 19.851 20.711 21.585 22.579 23.719 24.87 26.245 27.814 29.577 31.487 33.764 36.455 39.674 42.163 43.327 43.83 43.974 43.902 43.712 43.466 43.167 42.786 42.435 42.12 41.783 41.374 40.946 40.555 40.117 39.732 39.393 39.037 38.652 38.298 37.888 37.456 37.105 36.717 36.309 35.898 35.502 35.202 34.862 34.307 33.899 33.483 33.258 32.771 32.263 31.725 31.453 30.822 30.53 30.19 29.821 28.971 28.49 27.941 27.337 26.653 25.811 24.519 18.885 -6 ,8866 ,TETRA ,17605243,Sun Nov 28 18:50:20 CET,Sun Nov 28 20:34:55 CET,0.0 1.571 2.342 2.965 3.461 3.899 4.313 4.691 5.348 5.639 5.945 6.193 6.853 7.107 7.611 8.114 8.581 8.799 9.237 9.656 10.222 10.563 10.883 11.37 11.856 12.32 12.751 13.169 13.71 14.231 14.723 15.341 15.962 16.505 17.129 17.85 18.554 19.35 20.167 21.022 21.891 22.836 24.016 25.2 26.514 28.042 29.843 31.917 34.393 37.316 40.751 43.387 44.847 45.683 46.121 46.346 46.412 46.366 46.263 46.12 45.882 45.601 45.315 44.971 44.672 44.431 44.138 43.82 43.532 43.248 42.936 42.641 42.303 41.904 41.567 41.225 40.887 40.518 40.105 39.819 39.503 38.999 38.67 38.306 38.098 37.67 37.215 36.741 36.479 35.858 35.64 35.315 34.963 34.196 33.762 33.254 32.669 31.977 31.167 30.07 25.774 -7 ,13677 ,TETRA ,17605244,Sun Nov 28 18:50:22 CET,Sun Nov 28 20:34:40 CET,0.0 1.84 2.568 3.093 3.553 3.965 4.353 4.735 5.42 5.741 6.045 6.215 6.865 7.11 7.581 8.043 8.5 8.722 9.13 9.52 10.064 10.393 10.717 11.198 11.671 12.137 12.586 13.028 13.59 14.131 14.635 15.254 15.869 16.424 17.06 17.772 18.43 19.171 19.983 20.833 21.726 22.701 23.829 24.983 26.372 27.985 29.793 31.776 34.152 36.946 40.242 42.985 44.46 45.248 45.675 45.878 45.926 45.855 45.719 45.583 45.406 45.159 44.864 44.565 44.287 44.013 43.689 43.378 43.104 42.788 42.433 42.153 41.846 41.488 41.181 40.852 40.515 40.152 39.751 39.465 39.176 38.735 38.409 38.042 37.86 37.475 37.049 36.604 36.357 35.737 35.51 35.205 34.876 34.12 33.656 33.122 32.566 31.93 31.135 29.961 25.773 -8 ,3374 ,TETRA ,17605245,Sun Nov 28 18:51:16 CET,Sun Nov 28 20:35:44 CET,0.0 1.859 2.559 3.157 3.684 4.127 4.537 4.935 5.632 5.924 6.194 6.335 6.978 7.232 7.705 8.147 8.567 8.769 9.169 9.547 10.05 10.386 10.716 11.176 11.633 12.093 12.537 12.932 13.42 13.91 14.41 15.043 15.664 16.225 16.833 17.562 18.285 19.058 19.867 20.705 21.617 22.617 23.748 24.898 26.267 27.787 29.545 31.595 34.033 36.834 40.145 42.827 44.281 45.126 45.593 45.825 45.916 45.909 45.846 45.68 45.474 45.303 45.076 44.793 44.508 44.221 43.905 43.589 43.278 42.942 42.61 42.311 41.946 41.555 41.254 40.923 40.565 40.191 39.799 39.516 39.223 38.769 38.431 38.068 37.876 37.444 36.957 36.458 36.193 35.561 35.314 35.011 34.67 33.881 33.442 32.971 32.409 31.721 30.848 29.574 26.349 -9 ,19967 ,TETRA ,17605246,Sun Nov 28 18:51:16 CET,Sun Nov 28 20:35:46 CET,0.0 2.023 2.769 3.347 3.855 4.307 4.697 5.047 5.695 6.011 6.315 6.507 7.154 7.394 7.84 8.235 8.624 8.815 9.214 9.624 10.16 10.488 10.833 11.359 11.824 12.242 12.668 13.097 13.626 14.141 14.67 15.297 15.876 16.414 17.052 17.78 18.45 19.192 19.974 20.776 21.636 22.601 23.712 24.848 26.244 27.835 29.668 31.77 34.129 36.804 39.943 42.268 43.437 44.009 44.238 44.233 44.088 43.896 43.657 43.32 42.966 42.607 42.249 41.882 41.534 41.203 40.796 40.405 40.041 39.63 39.177 38.765 38.325 37.88 37.526 37.147 36.757 36.344 35.889 35.588 35.264 34.701 34.3 33.889 33.667 33.183 32.7 32.198 31.914 31.249 30.876 30.497 30.099 29.225 28.749 28.211 27.591 26.845 25.925 24.714 20.08 -10 ,14228 ,TETRA ,17605247,Sun Nov 28 18:51:17 CET,Sun Nov 28 20:36:47 CET,0.0 1.662 2.458 3.054 3.559 4.006 4.4 4.761 5.424 5.72 6.006 6.185 6.821 7.068 7.543 8.014 8.477 8.692 9.077 9.441 9.988 10.354 10.692 11.16 11.642 12.132 12.594 13.017 13.567 14.092 14.569 15.156 15.748 16.317 16.963 17.688 18.361 19.088 19.882 20.709 21.527 22.483 23.687 24.873 26.213 27.78 29.631 31.664 34.002 36.825 40.062 42.358 43.538 44.105 44.297 44.256 44.097 43.885 43.639 43.332 43.015 42.675 42.343 42.011 41.647 41.249 40.796 40.387 40.034 39.66 39.255 38.892 38.46 38.005 37.636 37.239 36.84 36.443 36.016 35.7 35.372 34.829 34.422 33.999 33.784 33.325 32.812 32.221 31.92 31.281 31.0 30.639 30.245 29.4 28.922 28.386 27.793 27.109 26.18 24.769 16.664 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23467.txt deleted file mode 100644 index 05889703..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21864 ,TETRA ,17605248,Sun Nov 28 18:51:17 CET,Sun Nov 28 20:36:15 CET,0.0 1.738 2.634 3.289 3.854 4.373 4.849 5.266 6.017 6.381 6.746 7.004 7.658 7.94 8.5 9.04 9.556 9.804 10.268 10.721 11.383 11.823 12.245 12.802 13.357 13.919 14.456 14.998 15.688 16.301 16.886 17.678 18.449 19.122 19.915 20.83 21.689 22.626 23.681 24.814 25.973 27.278 28.857 30.521 32.453 34.546 36.974 39.754 43.062 47.16 52.344 56.869 59.59 61.397 62.604 63.362 63.86 64.191 64.364 64.452 64.474 64.423 64.285 64.103 63.941 63.763 63.548 63.35 63.144 62.878 62.58 62.353 62.114 61.846 61.606 61.335 61.057 60.76 60.44 60.207 59.96 59.572 59.296 59.011 58.867 58.565 58.205 57.769 57.536 56.979 56.796 56.519 56.216 55.485 55.07 54.623 54.125 53.558 52.842 51.865 48.993 -2 ,21465 ,TETRA ,17605249,Sun Nov 28 18:51:17 CET,Sun Nov 28 20:37:21 CET,0.0 1.985 2.879 3.566 4.16 4.695 5.162 5.59 6.371 6.713 7.032 7.278 7.958 8.254 8.847 9.449 9.978 10.227 10.726 11.188 11.869 12.301 12.712 13.293 13.84 14.381 14.94 15.476 16.173 16.856 17.486 18.235 18.949 19.605 20.395 21.362 22.278 23.249 24.266 25.369 26.535 27.823 29.404 30.986 32.773 34.848 37.355 40.241 43.7 47.905 53.183 57.773 60.555 62.271 63.377 64.162 64.721 65.117 65.354 65.432 65.398 65.355 65.254 65.068 64.866 64.667 64.469 64.267 64.054 63.817 63.571 63.337 63.052 62.751 62.52 62.277 62.028 61.747 61.424 61.186 60.918 60.473 60.148 59.826 59.666 59.329 58.934 58.484 58.26 57.718 57.497 57.206 56.92 56.293 55.903 55.459 54.963 54.376 53.66 52.746 48.805 -3 ,28451 ,TETRA ,17605250,Sun Nov 28 18:51:17 CET,Sun Nov 28 20:36:51 CET,0.0 1.889 2.808 3.534 4.142 4.672 5.154 5.584 6.368 6.731 7.076 7.344 8.032 8.318 8.881 9.425 9.92 10.163 10.63 11.055 11.674 12.094 12.526 13.175 13.785 14.35 14.895 15.438 16.118 16.753 17.377 18.136 18.872 19.533 20.341 21.268 22.13 23.104 24.176 25.333 26.496 27.771 29.267 30.824 32.692 34.84 37.296 39.958 43.118 47.05 51.93 55.981 58.284 59.692 60.584 61.118 61.415 61.578 61.619 61.59 61.501 61.365 61.204 60.989 60.691 60.362 60.018 59.706 59.428 59.115 58.743 58.433 58.097 57.719 57.416 57.063 56.686 56.328 55.945 55.7 55.46 55.025 54.701 54.362 54.183 53.81 53.404 52.926 52.657 52.059 51.789 51.464 51.112 50.34 49.903 49.409 48.877 48.255 47.486 46.482 44.001 -4 ,11738 ,TETRA ,17605251,Sun Nov 28 18:51:17 CET,Sun Nov 28 20:37:49 CET,0.0 1.699 2.534 3.161 3.744 4.253 4.685 5.096 5.843 6.191 6.532 6.779 7.457 7.761 8.351 8.896 9.413 9.653 10.104 10.546 11.209 11.64 12.062 12.676 13.241 13.783 14.334 14.877 15.549 16.181 16.807 17.546 18.228 18.929 19.768 20.677 21.523 22.452 23.52 24.652 25.812 27.198 28.816 30.412 32.299 34.389 36.833 39.649 43.01 46.937 51.694 55.759 58.096 59.532 60.387 60.874 61.171 61.332 61.365 61.333 61.196 60.996 60.746 60.446 60.145 59.853 59.568 59.33 59.102 58.847 58.543 58.238 57.88 57.515 57.238 56.935 56.614 56.282 55.928 55.672 55.399 54.955 54.637 54.296 54.114 53.733 53.308 52.869 52.645 52.066 51.789 51.487 51.189 50.502 50.116 49.666 49.146 48.539 47.732 46.621 43.146 -5 ,3234 ,TETRA ,17605252,Sun Nov 28 18:51:18 CET,Sun Nov 28 20:37:54 CET,0.0 1.821 2.677 3.346 3.918 4.409 4.856 5.281 6.067 6.421 6.742 6.97 7.659 7.957 8.527 9.055 9.543 9.785 10.262 10.716 11.376 11.798 12.233 12.905 13.536 14.106 14.649 15.188 15.882 16.545 17.177 17.924 18.651 19.375 20.183 21.076 21.909 22.798 23.767 24.835 26.005 27.319 28.868 30.457 32.334 34.448 36.923 39.796 43.18 47.041 51.777 55.937 58.33 59.762 60.677 61.265 61.576 61.709 61.742 61.706 61.604 61.423 61.202 60.992 60.765 60.525 60.246 59.985 59.744 59.447 59.101 58.774 58.407 58.038 57.765 57.455 57.104 56.745 56.358 56.076 55.791 55.331 55.001 54.653 54.469 54.087 53.674 53.232 52.995 52.416 52.143 51.836 51.527 50.826 50.409 49.969 49.492 48.876 48.103 47.205 45.057 -6 ,3937 ,TETRA ,17605253,Sun Nov 28 18:51:18 CET,Sun Nov 28 20:36:48 CET,0.0 2.134 2.967 3.603 4.168 4.671 5.122 5.528 6.279 6.633 6.953 7.19 7.88 8.194 8.79 9.341 9.842 10.086 10.557 11.013 11.661 12.072 12.479 13.071 13.651 14.217 14.751 15.247 15.878 16.497 17.099 17.818 18.523 19.213 20.011 20.906 21.748 22.67 23.675 24.73 25.869 27.186 28.71 30.248 32.056 34.164 36.627 39.45 42.778 46.681 51.554 55.637 57.972 59.408 60.235 60.739 61.085 61.224 61.25 61.215 61.099 60.948 60.76 60.577 60.39 60.164 59.904 59.648 59.409 59.106 58.762 58.47 58.128 57.755 57.436 57.087 56.718 56.327 55.929 55.659 55.373 54.902 54.541 54.158 53.971 53.575 53.14 52.702 52.463 51.873 51.607 51.293 50.965 50.233 49.837 49.382 48.835 48.24 47.425 46.374 43.673 -7 ,7017 ,TETRA ,17605254,Sun Nov 28 18:51:18 CET,Sun Nov 28 20:36:05 CET,0.0 2.984 3.858 4.519 5.085 5.584 6.045 6.484 7.271 7.623 7.962 8.265 8.96 9.262 9.841 10.398 10.923 11.167 11.664 12.15 12.809 13.25 13.694 14.28 14.834 15.368 15.883 16.409 17.073 17.729 18.372 19.104 19.807 20.512 21.337 22.273 23.171 24.114 25.137 26.264 27.453 28.782 30.326 31.896 33.735 35.839 38.323 41.132 44.534 48.762 53.977 58.405 61.104 62.871 64.043 64.831 65.303 65.624 65.848 65.962 65.966 65.952 65.897 65.781 65.635 65.451 65.268 65.09 64.856 64.591 64.327 64.093 63.832 63.54 63.29 63.03 62.776 62.5 62.186 61.952 61.703 61.307 60.993 60.646 60.471 60.106 59.72 59.296 59.077 58.53 58.317 58.021 57.735 57.104 56.728 56.292 55.79 55.244 54.491 53.392 50.772 -8 ,26997 ,TETRA ,17605255,Sun Nov 28 18:51:20 CET,Sun Nov 28 20:36:13 CET,0.0 1.921 2.773 3.468 4.074 4.595 5.051 5.484 6.264 6.607 6.938 7.193 7.873 8.161 8.706 9.216 9.721 9.993 10.536 10.994 11.603 11.996 12.376 12.954 13.521 14.074 14.591 15.079 15.747 16.422 17.046 17.781 18.536 19.245 20.032 20.946 21.858 22.826 23.84 24.952 26.123 27.434 28.972 30.568 32.438 34.556 36.97 39.633 42.858 46.829 51.88 56.025 58.356 59.815 60.746 61.317 61.634 61.823 61.862 61.761 61.653 61.518 61.324 61.098 60.852 60.598 60.272 59.971 59.718 59.415 59.093 58.813 58.484 58.146 57.892 57.616 57.275 56.883 56.481 56.202 55.925 55.494 55.17 54.801 54.605 54.209 53.788 53.334 53.089 52.508 52.272 51.939 51.574 50.827 50.407 49.941 49.434 48.848 48.088 46.978 44.769 -9 ,21471 ,TETRA ,17605256,Sun Nov 28 18:51:18 CET,Sun Nov 28 20:36:09 CET,0.0 1.994 2.838 3.494 4.046 4.53 4.978 5.383 6.093 6.428 6.741 6.958 7.632 7.927 8.489 9.0 9.5 9.75 10.213 10.66 11.331 11.75 12.162 12.779 13.364 13.921 14.47 14.998 15.667 16.309 16.926 17.721 18.499 19.218 20.025 20.931 21.841 22.803 23.805 24.886 26.05 27.405 29.007 30.591 32.403 34.457 36.948 39.845 43.204 47.147 52.004 56.048 58.409 59.891 60.811 61.381 61.682 61.788 61.814 61.762 61.616 61.444 61.202 60.882 60.606 60.355 60.059 59.8 59.551 59.261 58.906 58.591 58.271 57.927 57.658 57.347 56.983 56.615 56.228 55.949 55.682 55.241 54.891 54.525 54.344 53.937 53.483 53.006 52.753 52.168 51.894 51.582 51.276 50.569 50.151 49.675 49.127 48.462 47.649 46.691 43.775 -10 ,26408 ,TETRA ,17605257,Sun Nov 28 18:51:21 CET,Sun Nov 28 20:36:11 CET,0.0 2.512 3.348 4.026 4.597 5.125 5.609 6.022 6.788 7.143 7.464 7.69 8.374 8.662 9.246 9.799 10.306 10.562 11.066 11.54 12.216 12.642 13.043 13.615 14.158 14.695 15.223 15.732 16.368 16.961 17.554 18.298 19.028 19.742 20.569 21.495 22.398 23.388 24.433 25.553 26.73 28.044 29.599 31.185 33.04 35.123 37.534 40.327 43.713 47.923 53.216 57.739 60.433 62.127 63.256 64.06 64.612 64.988 65.178 65.271 65.298 65.279 65.177 65.047 64.916 64.761 64.603 64.429 64.237 63.992 63.719 63.514 63.282 62.987 62.749 62.476 62.157 61.84 61.515 61.272 61.014 60.611 60.31 59.998 59.836 59.462 59.063 58.609 58.362 57.797 57.595 57.31 57.01 56.354 55.97 55.521 55.022 54.468 53.777 52.76 49.605 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23468.txt deleted file mode 100644 index c983fd5c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28831 ,TETRA ,17605258,Sun Nov 28 18:51:20 CET,Sun Nov 28 20:36:56 CET,0.0 2.663 3.548 4.212 4.784 5.308 5.778 6.196 6.922 7.265 7.6 7.84 8.522 8.816 9.349 9.836 10.295 10.51 10.916 11.32 11.922 12.308 12.675 13.172 13.66 14.124 14.575 15.056 15.645 16.14 16.607 17.158 17.681 18.196 18.821 19.522 20.117 20.707 21.335 22.01 22.702 23.507 24.471 25.417 26.46 27.591 28.89 30.278 31.82 33.582 35.559 36.882 37.413 37.553 37.496 37.356 37.122 36.801 36.445 36.056 35.699 35.365 35.028 34.657 34.277 33.908 33.524 33.171 32.833 32.478 32.076 31.729 31.369 30.967 30.652 30.314 29.932 29.542 29.154 28.878 28.572 28.066 27.728 27.381 27.196 26.799 26.38 25.947 25.711 25.081 24.84 24.519 24.19 23.494 23.121 22.696 22.218 21.687 21.045 20.134 17.676 -2 ,21299 ,TETRA ,17605259,Sun Nov 28 18:51:18 CET,Sun Nov 28 20:36:44 CET,0.0 1.881 2.82 3.564 4.165 4.66 5.123 5.58 6.402 6.766 7.117 7.371 8.037 8.319 8.828 9.293 9.761 9.986 10.395 10.817 11.441 11.808 12.154 12.671 13.146 13.587 14.019 14.443 15.02 15.56 16.043 16.627 17.212 17.76 18.357 19.015 19.61 20.244 20.936 21.639 22.353 23.155 24.059 24.946 25.987 27.148 28.424 29.776 31.272 32.98 34.936 36.265 36.819 36.946 36.873 36.698 36.415 36.091 35.797 35.46 35.128 34.79 34.398 34.031 33.701 33.37 32.956 32.57 32.246 31.872 31.475 31.141 30.762 30.357 30.063 29.736 29.383 29.01 28.587 28.287 27.979 27.507 27.177 26.831 26.653 26.266 25.837 25.384 25.147 24.526 24.372 24.089 23.781 23.101 22.709 22.276 21.749 21.112 20.405 19.434 16.519 -3 ,24160 ,TETRA ,17605260,Sun Nov 28 18:51:19 CET,Sun Nov 28 20:37:42 CET,0.0 2.537 3.483 4.223 4.809 5.336 5.819 6.235 6.965 7.328 7.677 7.914 8.57 8.837 9.319 9.761 10.212 10.442 10.883 11.289 11.851 12.215 12.552 13.019 13.496 13.979 14.428 14.856 15.417 15.948 16.465 17.059 17.614 18.14 18.679 19.284 19.894 20.587 21.361 22.121 22.894 23.773 24.746 25.675 26.707 27.808 29.007 30.227 31.552 33.048 34.631 35.544 35.774 35.644 35.378 35.041 34.591 34.13 33.693 33.225 32.787 32.372 31.959 31.54 31.121 30.699 30.254 29.856 29.478 29.047 28.59 28.203 27.807 27.382 27.033 26.674 26.286 25.85 25.382 25.049 24.711 24.208 23.852 23.451 23.243 22.811 22.352 21.853 21.585 20.942 20.74 20.434 20.1 19.338 18.901 18.427 17.881 17.251 16.549 15.629 13.673 -4 ,30178 ,TETRA ,17605261,Sun Nov 28 18:51:19 CET,Sun Nov 28 20:36:45 CET,0.0 3.689 4.666 5.394 6.014 6.557 7.052 7.484 8.225 8.562 8.896 9.154 9.825 10.108 10.658 11.161 11.613 11.821 12.203 12.584 13.159 13.53 13.877 14.369 14.847 15.301 15.719 16.122 16.647 17.162 17.653 18.204 18.743 19.282 19.873 20.53 21.158 21.778 22.442 23.196 23.971 24.788 25.695 26.61 27.639 28.7 29.9 31.206 32.662 34.23 35.755 36.553 36.717 36.612 36.337 35.972 35.558 35.102 34.661 34.177 33.742 33.298 32.833 32.368 31.925 31.49 30.987 30.535 30.126 29.704 29.25 28.845 28.407 27.932 27.557 27.162 26.74 26.286 25.794 25.467 25.14 24.606 24.241 23.872 23.673 23.241 22.766 22.261 22.008 21.372 21.142 20.806 20.456 19.716 19.314 18.862 18.361 17.795 17.114 16.223 14.033 -5 ,27223 ,TETRA ,17605262,Sun Nov 28 18:51:19 CET,Sun Nov 28 20:37:40 CET,0.0 3.161 3.985 4.641 5.205 5.708 6.163 6.562 7.266 7.604 7.934 8.16 8.838 9.124 9.653 10.16 10.629 10.858 11.308 11.733 12.314 12.683 13.041 13.552 14.05 14.516 14.947 15.354 15.896 16.412 16.94 17.562 18.085 18.601 19.209 19.876 20.502 21.153 21.843 22.594 23.355 24.186 25.109 26.009 27.046 28.19 29.47 30.815 32.309 33.865 35.343 36.106 36.258 36.149 35.874 35.489 35.068 34.576 34.037 33.476 32.996 32.474 31.95 31.493 31.059 30.643 30.142 29.666 29.276 28.841 28.326 27.918 27.529 27.115 26.771 26.391 25.99 25.583 25.139 24.812 24.485 23.983 23.614 23.224 23.02 22.578 22.12 21.613 21.335 20.693 20.497 20.187 19.857 19.132 18.721 18.277 17.718 17.063 16.316 15.301 12.961 -6 ,8710 ,TETRA ,17605263,Sun Nov 28 18:51:22 CET,Sun Nov 28 20:36:56 CET,0.0 2.548 3.473 4.179 4.798 5.347 5.809 6.247 7.037 7.379 7.713 7.946 8.612 8.896 9.447 9.957 10.421 10.651 11.082 11.499 12.154 12.553 12.902 13.401 13.865 14.317 14.768 15.204 15.77 16.307 16.845 17.449 17.946 18.427 19.027 19.704 20.294 20.899 21.591 22.353 23.116 23.923 24.852 25.774 26.818 27.943 29.166 30.466 31.88 33.447 35.015 35.879 36.102 35.993 35.693 35.282 34.854 34.382 33.911 33.433 33.005 32.561 32.088 31.646 31.202 30.732 30.232 29.8 29.417 28.991 28.523 28.128 27.688 27.212 26.841 26.469 26.09 25.664 25.207 24.886 24.556 24.038 23.651 23.247 23.042 22.61 22.147 21.664 21.404 20.763 20.516 20.164 19.805 19.072 18.655 18.183 17.651 17.015 16.248 15.255 11.648 -7 ,23085 ,TETRA ,17605264,Sun Nov 28 18:51:19 CET,Sun Nov 28 20:38:39 CET,0.0 2.276 3.185 3.891 4.46 4.949 5.398 5.829 6.583 6.911 7.239 7.506 8.185 8.462 8.988 9.489 9.958 10.182 10.613 11.023 11.613 11.989 12.359 12.885 13.366 13.828 14.279 14.713 15.279 15.816 16.33 16.923 17.487 18.063 18.69 19.34 19.967 20.625 21.285 22.0 22.774 23.651 24.638 25.598 26.686 27.794 29.012 30.362 31.908 33.64 35.531 36.788 37.285 37.438 37.401 37.193 36.907 36.618 36.318 35.955 35.624 35.302 34.95 34.609 34.287 33.921 33.475 33.068 32.711 32.347 31.981 31.666 31.318 30.945 30.635 30.312 29.962 29.562 29.159 28.885 28.589 28.078 27.708 27.333 27.135 26.72 26.302 25.854 25.61 24.984 24.805 24.506 24.19 23.487 23.102 22.694 22.189 21.616 21.032 20.306 18.589 -8 ,6088 ,TETRA ,17605265,Sun Nov 28 18:51:19 CET,Sun Nov 28 20:37:01 CET,0.0 3.026 4.023 4.751 5.333 5.824 6.264 6.691 7.479 7.829 8.164 8.434 9.115 9.412 9.95 10.426 10.866 11.084 11.529 11.948 12.521 12.884 13.233 13.748 14.238 14.693 15.128 15.558 16.091 16.583 17.054 17.604 18.115 18.605 19.177 19.813 20.426 21.108 21.813 22.551 23.327 24.209 25.185 26.095 27.158 28.311 29.59 30.962 32.43 33.946 35.476 36.365 36.55 36.441 36.197 35.827 35.407 34.99 34.571 34.076 33.634 33.203 32.759 32.328 31.905 31.488 31.02 30.563 30.153 29.709 29.242 28.852 28.43 27.95 27.578 27.218 26.828 26.379 25.916 25.588 25.245 24.745 24.386 24.018 23.835 23.442 23.008 22.53 22.256 21.602 21.368 21.045 20.718 19.952 19.521 19.068 18.584 18.021 17.315 16.333 13.762 -9 ,12077 ,TETRA ,17605266,Sun Nov 28 18:51:20 CET,Sun Nov 28 20:35:26 CET,0.0 2.744 3.653 4.326 4.913 5.425 5.894 6.338 7.11 7.457 7.782 7.998 8.665 8.964 9.505 9.982 10.455 10.691 11.133 11.528 12.112 12.479 12.83 13.356 13.816 14.261 14.724 15.158 15.717 16.247 16.732 17.306 17.826 18.33 18.942 19.6 20.201 20.86 21.57 22.296 23.042 23.867 24.811 25.76 26.809 27.954 29.261 30.632 32.21 33.969 35.777 37.013 37.596 37.765 37.73 37.565 37.329 37.053 36.761 36.413 36.035 35.66 35.289 34.913 34.544 34.199 33.794 33.413 33.074 32.703 32.299 31.954 31.587 31.183 30.886 30.597 30.263 29.891 29.501 29.207 28.897 28.414 28.059 27.693 27.519 27.157 26.772 26.361 26.118 25.497 25.331 25.056 24.758 24.089 23.734 23.358 22.919 22.351 21.643 20.687 17.845 -10 ,31440 ,TETRA ,17605267,Sun Nov 28 18:52:15 CET,Sun Nov 28 20:38:08 CET,0.0 3.265 4.309 5.061 5.694 6.21 6.664 7.076 7.863 8.242 8.584 8.806 9.467 9.745 10.287 10.778 11.25 11.474 11.89 12.306 12.919 13.283 13.62 14.106 14.586 15.074 15.532 15.979 16.572 17.104 17.591 18.197 18.768 19.281 19.827 20.448 21.098 21.78 22.444 23.136 23.89 24.714 25.639 26.555 27.619 28.784 30.07 31.47 32.948 34.427 35.894 36.753 36.958 36.857 36.579 36.195 35.795 35.367 34.95 34.489 34.01 33.517 33.017 32.514 32.041 31.602 31.13 30.717 30.339 29.933 29.493 29.102 28.699 28.271 27.918 27.539 27.148 26.731 26.265 25.944 25.62 25.103 24.741 24.344 24.141 23.717 23.239 22.721 22.45 21.801 21.552 21.223 20.884 20.161 19.745 19.276 18.758 18.207 17.461 16.282 12.268 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index 8207e5e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,276 ,TETRA ,17605268,Sun Nov 28 18:52:16 CET,Sun Nov 28 20:40:43 CET,0.0 1.725 2.607 3.359 4.002 4.551 5.071 5.55 6.399 6.802 7.198 7.491 8.312 8.671 9.369 10.021 10.643 10.96 11.58 12.169 13.033 13.587 14.123 14.912 15.648 16.353 17.065 17.798 18.767 19.701 20.594 21.678 22.733 23.741 24.925 26.301 27.658 29.161 30.809 32.596 34.503 36.697 39.318 41.993 45.192 48.903 53.349 58.581 65.037 73.227 84.104 94.043 100.464 104.853 108.001 110.519 112.439 113.883 114.937 115.856 116.572 117.142 117.589 117.93 118.212 118.417 118.602 118.77 118.844 118.833 118.826 118.814 118.803 118.8 118.774 118.713 118.62 118.482 118.318 118.204 118.075 117.893 117.752 117.57 117.475 117.269 117.024 116.736 116.575 116.069 116.044 115.814 115.557 115.004 114.689 114.32 113.874 113.403 112.836 111.972 108.304 -2 ,126 ,TETRA ,17605269,Sun Nov 28 18:52:16 CET,Sun Nov 28 20:40:38 CET,0.0 2.513 3.501 4.292 4.975 5.547 6.079 6.567 7.447 7.855 8.247 8.541 9.355 9.706 10.388 11.067 11.716 12.02 12.629 13.244 14.118 14.653 15.165 15.937 16.703 17.462 18.204 18.887 19.757 20.639 21.551 22.694 23.767 24.771 25.918 27.195 28.473 29.914 31.498 33.199 35.03 37.172 39.71 42.29 45.411 49.04 53.431 58.59 64.829 72.765 83.378 93.02 99.264 103.673 106.932 109.434 111.307 112.815 113.974 114.983 115.74 116.336 116.792 117.163 117.487 117.729 117.915 118.024 118.084 118.128 118.14 118.108 118.057 118.007 117.947 117.861 117.766 117.645 117.52 117.405 117.24 116.99 116.829 116.647 116.543 116.305 116.028 115.694 115.514 114.999 114.952 114.737 114.519 114.016 113.698 113.334 112.953 112.496 111.881 110.975 109.082 -3 ,12666 ,TETRA ,17605270,Sun Nov 28 18:52:18 CET,Sun Nov 28 20:40:16 CET,0.0 3.463 4.426 5.105 5.734 6.325 6.865 7.365 8.27 8.681 9.088 9.419 10.246 10.606 11.294 11.94 12.555 12.856 13.44 13.996 14.825 15.371 15.903 16.689 17.459 18.213 18.934 19.632 20.559 21.441 22.279 23.328 24.377 25.376 26.528 27.873 29.214 30.702 32.284 34.002 35.891 38.084 40.634 43.237 46.392 50.027 54.366 59.452 65.776 73.828 84.403 94.055 100.332 104.774 108.038 110.53 112.39 113.876 115.023 116.007 116.757 117.356 117.865 118.301 118.642 118.891 119.121 119.259 119.32 119.337 119.342 119.362 119.358 119.316 119.251 119.153 119.046 118.933 118.808 118.701 118.576 118.399 118.242 118.049 117.961 117.777 117.541 117.245 117.088 116.582 116.541 116.325 116.106 115.565 115.256 114.933 114.518 114.002 113.335 112.535 110.429 -4 ,4681 ,TETRA ,17605271,Sun Nov 28 18:52:16 CET,Sun Nov 28 20:40:44 CET,0.0 2.112 3.011 3.723 4.355 4.908 5.394 5.845 6.7 7.124 7.516 7.769 8.582 8.931 9.609 10.282 10.937 11.24 11.823 12.413 13.271 13.824 14.375 15.164 15.917 16.664 17.406 18.1 18.981 19.887 20.796 21.869 22.898 23.921 25.116 26.506 27.841 29.267 30.847 32.569 34.415 36.513 39.004 41.602 44.719 48.321 52.649 57.726 64.02 71.96 82.465 92.139 98.474 102.927 106.131 108.639 110.56 112.094 113.272 114.243 114.988 115.615 116.09 116.451 116.782 117.056 117.31 117.484 117.576 117.656 117.693 117.672 117.608 117.507 117.43 117.354 117.248 117.141 117.012 116.885 116.747 116.525 116.369 116.203 116.114 115.899 115.642 115.369 115.221 114.709 114.667 114.445 114.203 113.642 113.3 112.911 112.473 112.008 111.43 110.512 107.998 -5 ,3247 ,TETRA ,17605272,Sun Nov 28 18:52:16 CET,Sun Nov 28 20:45:30 CET,0.0 1.767 2.599 3.285 3.877 4.429 4.963 5.451 6.31 6.713 7.109 7.424 8.245 8.606 9.298 9.961 10.616 10.932 11.533 12.104 12.93 13.477 14.017 14.799 15.556 16.296 17.029 17.734 18.646 19.538 20.4 21.465 22.493 23.486 24.656 25.985 27.311 28.785 30.345 32.034 33.855 35.949 38.503 41.197 44.42 48.126 52.589 57.825 64.329 72.414 82.998 92.736 99.067 103.57 106.814 109.309 111.223 112.703 113.797 114.744 115.482 116.082 116.566 116.924 117.22 117.46 117.661 117.802 117.909 117.981 118.006 118.024 118.001 117.953 117.919 117.854 117.759 117.666 117.553 117.45 117.325 117.119 116.962 116.782 116.686 116.479 116.231 115.942 115.782 115.262 115.225 115.018 114.799 114.302 113.982 113.6 113.162 112.661 112.066 111.122 107.588 -6 ,3940 ,TETRA ,17605273,Sun Nov 28 18:52:16 CET,Sun Nov 28 20:40:57 CET,0.0 1.939 2.794 3.52 4.177 4.772 5.311 5.806 6.737 7.16 7.561 7.891 8.736 9.119 9.834 10.501 11.14 11.45 12.061 12.672 13.552 14.1 14.624 15.401 16.13 16.812 17.525 18.227 19.138 20.035 20.894 21.976 23.043 24.1 25.302 26.608 27.92 29.377 30.94 32.647 34.48 36.561 39.114 41.784 44.984 48.648 52.989 58.195 64.546 72.452 83.085 92.815 99.083 103.569 106.884 109.366 111.23 112.716 113.846 114.875 115.634 116.183 116.621 116.972 117.251 117.443 117.559 117.623 117.708 117.826 117.889 117.914 117.943 117.924 117.876 117.8 117.72 117.609 117.469 117.369 117.25 117.042 116.894 116.711 116.595 116.349 116.111 115.852 115.705 115.198 115.153 114.928 114.679 114.136 113.826 113.462 113.046 112.545 111.899 111.045 109.363 -7 ,18123 ,TETRA ,17605274,Sun Nov 28 18:52:18 CET,Sun Nov 28 20:41:10 CET,0.0 2.208 3.162 3.877 4.482 5.049 5.558 6.028 6.914 7.322 7.718 8.028 8.849 9.208 9.905 10.57 11.216 11.532 12.148 12.736 13.562 14.102 14.644 15.422 16.165 16.89 17.606 18.316 19.264 20.183 21.09 22.198 23.222 24.188 25.349 26.71 28.048 29.51 31.078 32.785 34.623 36.772 39.329 41.934 45.068 48.723 53.092 58.169 64.387 72.256 82.83 92.623 98.975 103.425 106.687 109.216 111.119 112.626 113.773 114.756 115.497 116.054 116.51 116.881 117.163 117.383 117.577 117.701 117.785 117.865 117.934 117.944 117.902 117.841 117.787 117.732 117.655 117.529 117.351 117.233 117.093 116.83 116.657 116.497 116.418 116.201 115.926 115.613 115.449 114.942 114.93 114.727 114.471 113.865 113.529 113.155 112.729 112.213 111.56 110.697 108.374 -8 ,10646 ,TETRA ,17605275,Sun Nov 28 18:52:17 CET,Sun Nov 28 20:41:28 CET,0.0 1.966 2.938 3.75 4.412 4.982 5.499 6.001 6.918 7.353 7.765 8.069 8.903 9.268 9.969 10.632 11.269 11.578 12.168 12.732 13.577 14.143 14.688 15.44 16.177 16.922 17.642 18.35 19.264 20.125 20.947 21.945 22.912 23.858 24.984 26.264 27.524 28.934 30.46 32.129 33.959 36.087 38.659 41.347 44.554 48.223 52.742 58.069 64.525 72.706 83.48 93.545 100.114 104.642 107.871 110.352 112.23 113.682 114.848 115.928 116.694 117.237 117.686 118.096 118.437 118.666 118.88 119.071 119.193 119.282 119.324 119.309 119.282 119.218 119.148 119.081 118.995 118.907 118.782 118.672 118.559 118.354 118.204 118.031 117.929 117.705 117.437 117.112 116.944 116.441 116.414 116.214 116.014 115.519 115.226 114.888 114.484 113.983 113.331 112.489 110.267 -9 ,28112 ,TETRA ,17605276,Sun Nov 28 18:52:17 CET,Sun Nov 28 20:40:20 CET,0.0 1.982 2.929 3.662 4.315 4.877 5.398 5.921 6.893 7.299 7.702 8.05 8.872 9.231 9.891 10.502 11.113 11.417 12.02 12.613 13.462 14.003 14.538 15.334 16.114 16.872 17.604 18.322 19.253 20.128 20.98 22.052 23.075 24.079 25.31 26.671 27.992 29.497 31.142 32.921 34.786 36.93 39.485 42.095 45.237 48.871 53.22 58.318 64.594 72.527 83.008 92.617 98.944 103.419 106.603 109.088 110.99 112.454 113.555 114.566 115.329 115.914 116.423 116.806 117.085 117.317 117.525 117.636 117.7 117.738 117.74 117.742 117.748 117.721 117.678 117.638 117.562 117.438 117.262 117.133 117.017 116.804 116.625 116.44 116.345 116.106 115.814 115.52 115.369 114.853 114.806 114.572 114.321 113.787 113.49 113.16 112.791 112.346 111.796 110.832 107.303 -10 ,31669 ,TETRA ,17605277,Sun Nov 28 18:52:16 CET,Sun Nov 28 20:40:53 CET,0.0 2.235 3.184 3.924 4.535 5.081 5.592 6.081 7.01 7.437 7.836 8.13 8.95 9.298 9.963 10.612 11.256 11.564 12.148 12.721 13.563 14.117 14.654 15.408 16.148 16.869 17.569 18.257 19.156 20.051 20.946 22.027 23.062 24.045 25.199 26.553 27.862 29.3 30.868 32.551 34.384 36.498 39.013 41.636 44.755 48.309 52.604 57.694 63.983 71.934 82.497 92.158 98.451 102.875 106.048 108.449 110.288 111.763 112.902 113.93 114.693 115.299 115.78 116.15 116.415 116.609 116.786 116.914 116.997 117.041 117.073 117.097 117.088 117.046 116.983 116.886 116.777 116.65 116.496 116.383 116.264 116.026 115.851 115.67 115.568 115.351 115.099 114.798 114.638 114.129 114.113 113.918 113.699 113.178 112.875 112.513 112.066 111.522 110.895 109.989 107.41 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23469.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23469.txt deleted file mode 100644 index 77e32809..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23469.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3033 ,KEBNE ,17027330,Wed Dec 22 16:56:31 CET,Wed Dec 22 18:29:52 CET,0.0 4.267 5.468 6.413 7.234 7.991 8.664 9.271 10.357 10.858 11.318 11.7 12.543 12.916 13.64 14.324 14.961 15.263 15.876 16.495 17.373 17.937 18.499 19.321 20.078 20.81 21.555 22.269 23.16 24.029 24.89 25.929 26.924 27.879 29.015 30.374 31.69 33.086 34.607 36.256 38.01 40.018 42.425 44.919 47.886 51.304 55.422 60.264 66.283 73.858 83.79 92.98 99.0 103.308 106.45 108.829 110.65 112.136 113.252 114.176 114.834 115.336 115.752 116.071 116.356 116.595 116.755 116.845 116.909 116.951 116.935 116.883 116.824 116.767 116.691 116.585 116.465 116.326 116.167 116.044 115.921 115.709 115.515 115.285 115.171 114.903 114.556 114.172 113.978 113.435 113.409 113.184 112.926 112.381 112.049 111.645 111.213 110.721 110.092 109.223 106.761 -2 ,8124 ,KEBNE ,17027331,Wed Dec 22 16:56:37 CET,Wed Dec 22 18:22:21 CET,0.0 2.566 3.651 4.445 5.127 5.756 6.336 6.865 7.85 8.314 8.742 9.065 9.911 10.294 11.014 11.696 12.353 12.666 13.279 13.875 14.703 15.229 15.762 16.56 17.328 18.062 18.78 19.496 20.445 21.372 22.291 23.375 24.39 25.387 26.561 27.934 29.27 30.705 32.242 33.875 35.633 37.664 40.13 42.69 45.736 49.231 53.397 58.333 64.484 72.285 82.559 92.077 98.358 102.77 106.017 108.589 110.582 112.147 113.335 114.402 115.202 115.831 116.344 116.73 117.012 117.233 117.421 117.572 117.668 117.704 117.761 117.785 117.759 117.728 117.702 117.637 117.529 117.423 117.32 117.249 117.144 116.953 116.829 116.687 116.597 116.4 116.193 115.911 115.742 115.219 115.178 114.968 114.754 114.264 113.952 113.577 113.151 112.642 112.022 111.193 108.7 -3 ,27281 ,KEBNE ,17027332,Wed Dec 22 16:56:36 CET,Wed Dec 22 18:26:41 CET,0.0 2.758 3.761 4.532 5.228 5.838 6.407 6.933 7.894 8.343 8.773 9.136 9.968 10.361 11.133 11.825 12.473 12.795 13.426 14.041 14.926 15.502 16.079 16.919 17.705 18.443 19.161 19.861 20.767 21.652 22.521 23.565 24.595 25.603 26.746 28.097 29.409 30.783 32.261 33.893 35.644 37.679 40.194 42.781 45.86 49.372 53.566 58.548 64.685 72.446 82.771 92.275 98.541 103.075 106.411 108.947 110.85 112.362 113.512 114.554 115.355 115.939 116.432 116.865 117.226 117.48 117.672 117.835 117.956 118.033 118.076 118.072 118.011 117.942 117.898 117.842 117.727 117.585 117.44 117.313 117.177 116.974 116.825 116.642 116.537 116.318 116.082 115.806 115.655 115.141 115.126 114.917 114.69 114.155 113.834 113.496 113.146 112.677 112.05 111.188 109.028 -4 ,7434 ,KEBNE ,17027333,Wed Dec 22 16:56:37 CET,Wed Dec 22 18:25:39 CET,0.0 2.195 3.207 4.043 4.76 5.385 5.948 6.466 7.393 7.818 8.233 8.578 9.425 9.802 10.534 11.226 11.887 12.222 12.865 13.461 14.337 14.888 15.418 16.208 16.972 17.727 18.481 19.203 20.122 21.014 21.843 22.833 23.839 24.831 25.963 27.252 28.499 29.88 31.42 33.081 34.858 36.901 39.326 41.87 44.932 48.398 52.578 57.503 63.546 71.171 81.347 90.848 97.11 101.56 104.834 107.355 109.251 110.794 111.985 112.999 113.732 114.322 114.795 115.166 115.48 115.703 115.901 116.015 116.072 116.116 116.141 116.147 116.123 116.05 115.973 115.905 115.818 115.686 115.517 115.401 115.267 115.001 114.818 114.63 114.532 114.31 114.052 113.799 113.645 113.125 113.146 112.949 112.72 112.182 111.862 111.53 111.159 110.685 110.101 109.281 106.847 -5 ,9804 ,KEBNE ,17027334,Wed Dec 22 16:56:32 CET,Wed Dec 22 18:29:42 CET,0.0 2.082 3.231 4.138 4.903 5.553 6.117 6.635 7.569 8.003 8.427 8.767 9.608 9.988 10.701 11.365 12.016 12.332 12.933 13.532 14.402 14.971 15.517 16.3 17.084 17.844 18.586 19.307 20.217 21.081 21.937 22.978 23.961 24.937 26.102 27.397 28.661 30.061 31.576 33.226 34.971 37.007 39.462 41.958 44.962 48.435 52.579 57.524 63.688 71.384 81.644 91.218 97.481 101.912 105.183 107.691 109.578 111.097 112.259 113.295 114.091 114.702 115.231 115.699 116.071 116.352 116.599 116.788 116.921 117.001 117.036 117.051 117.024 116.967 116.929 116.869 116.781 116.67 116.523 116.408 116.288 116.065 115.901 115.709 115.601 115.376 115.138 114.877 114.721 114.206 114.197 113.988 113.781 113.3 113.017 112.69 112.301 111.78 111.092 110.16 107.791 -6 ,25527 ,KEBNE ,17027335,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:30:48 CET,0.0 2.401 3.474 4.295 4.98 5.606 6.195 6.745 7.705 8.139 8.563 8.923 9.767 10.129 10.828 11.498 12.142 12.465 13.093 13.689 14.571 15.152 15.706 16.531 17.334 18.078 18.773 19.442 20.335 21.238 22.134 23.196 24.214 25.23 26.43 27.766 29.036 30.422 31.934 33.582 35.391 37.493 39.98 42.481 45.472 48.994 53.194 58.054 64.128 71.914 82.188 91.677 97.86 102.295 105.584 108.1 110.025 111.547 112.702 113.728 114.518 115.155 115.68 116.08 116.39 116.631 116.861 117.019 117.124 117.222 117.284 117.285 117.235 117.173 117.124 117.071 116.995 116.854 116.687 116.575 116.44 116.215 116.052 115.861 115.746 115.491 115.207 114.91 114.753 114.215 114.184 113.985 113.744 113.197 112.893 112.565 112.155 111.583 110.876 109.873 107.05 -7 ,18285 ,KEBNE ,17027336,Wed Dec 22 16:56:31 CET,Wed Dec 22 18:29:40 CET,0.0 2.389 3.416 4.279 4.997 5.589 6.162 6.705 7.697 8.148 8.571 8.907 9.746 10.119 10.824 11.521 12.217 12.54 13.141 13.75 14.624 15.163 15.701 16.507 17.291 18.033 18.746 19.442 20.346 21.224 22.098 23.178 24.205 25.207 26.374 27.7 29.009 30.474 32.067 33.75 35.542 37.61 40.087 42.655 45.752 49.334 53.603 58.599 64.789 72.649 82.997 92.426 98.694 103.186 106.469 109.036 110.989 112.511 113.625 114.553 115.294 115.9 116.384 116.786 117.11 117.36 117.571 117.716 117.793 117.851 117.867 117.848 117.833 117.815 117.795 117.74 117.628 117.497 117.373 117.258 117.113 116.909 116.744 116.521 116.405 116.181 115.947 115.693 115.534 115.006 115.007 114.787 114.541 114.002 113.699 113.347 112.96 112.507 111.93 111.103 108.751 -8 ,23360 ,KEBNE ,17027337,Wed Dec 22 16:56:31 CET,Wed Dec 22 18:30:50 CET,0.0 2.044 3.038 3.858 4.553 5.185 5.784 6.291 7.195 7.661 8.118 8.46 9.293 9.673 10.414 11.112 11.758 12.068 12.687 13.28 14.131 14.662 15.182 15.983 16.802 17.595 18.338 19.052 19.96 20.817 21.648 22.715 23.789 24.847 26.059 27.367 28.638 30.057 31.581 33.222 35.013 37.096 39.58 42.121 45.185 48.711 52.896 57.876 64.052 71.832 82.103 91.611 97.88 102.346 105.622 108.183 110.149 111.707 112.881 113.909 114.702 115.331 115.827 116.25 116.517 116.676 116.85 116.954 117.074 117.148 117.137 117.146 117.112 117.046 117.016 116.974 116.886 116.748 116.586 116.49 116.391 116.197 116.043 115.855 115.735 115.477 115.229 114.957 114.812 114.296 114.286 114.074 113.846 113.317 112.993 112.609 112.184 111.68 111.044 110.138 106.977 -9 ,25173 ,KEBNE ,17027338,Wed Dec 22 16:56:34 CET,Wed Dec 22 18:29:49 CET,0.0 2.283 3.318 4.102 4.773 5.383 5.929 6.452 7.445 7.893 8.303 8.63 9.478 9.86 10.604 11.304 11.956 12.269 12.864 13.453 14.295 14.84 15.389 16.178 16.937 17.681 18.412 19.114 20.0 20.857 21.719 22.778 23.78 24.749 25.906 27.236 28.515 29.912 31.433 33.043 34.784 36.793 39.197 41.75 44.763 48.173 52.294 57.195 63.327 71.032 81.233 90.815 97.123 101.599 104.879 107.394 109.337 110.897 112.068 113.106 113.895 114.479 114.99 115.456 115.788 116.012 116.226 116.368 116.435 116.467 116.482 116.484 116.47 116.434 116.394 116.327 116.218 116.119 116.012 115.927 115.814 115.579 115.406 115.208 115.1 114.87 114.619 114.34 114.187 113.672 113.666 113.464 113.233 112.738 112.459 112.103 111.682 111.203 110.651 109.926 107.888 -10 ,12541 ,KEBNE ,17027339,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:30:49 CET,0.0 2.124 3.261 4.223 5.037 5.706 6.25 6.752 7.693 8.141 8.566 8.909 9.752 10.126 10.846 11.53 12.179 12.495 13.114 13.709 14.569 15.121 15.662 16.438 17.188 17.954 18.701 19.414 20.345 21.246 22.105 23.163 24.223 25.256 26.448 27.777 29.014 30.366 31.898 33.602 35.428 37.508 39.954 42.475 45.544 49.061 53.267 58.248 64.372 72.034 82.244 91.854 98.162 102.599 105.823 108.293 110.194 111.711 112.866 113.882 114.663 115.28 115.766 116.171 116.532 116.794 116.961 117.057 117.151 117.195 117.195 117.194 117.177 117.141 117.09 117.023 116.94 116.818 116.685 116.597 116.497 116.325 116.159 115.943 115.815 115.543 115.264 114.953 114.785 114.268 114.272 114.08 113.882 113.412 113.11 112.756 112.33 111.841 111.208 110.364 107.999 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23471.txt deleted file mode 100644 index 6ac3d36a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17599 ,TETRA ,17605278,Sun Nov 28 18:52:19 CET,Sun Nov 28 20:39:41 CET,0.0 2.081 3.093 3.851 4.491 5.096 5.634 6.124 7.048 7.482 7.882 8.21 9.044 9.399 10.088 10.768 11.438 11.762 12.373 12.954 13.79 14.336 14.883 15.687 16.463 17.195 17.858 18.505 19.332 20.142 20.994 22.036 23.031 23.967 25.034 26.253 27.436 28.731 30.099 31.563 33.178 34.993 37.058 39.191 41.77 44.693 48.109 52.017 56.824 62.941 70.672 77.483 81.989 85.068 87.159 88.699 89.837 90.663 91.177 91.613 91.908 92.096 92.186 92.236 92.278 92.259 92.163 92.074 91.96 91.782 91.643 91.541 91.412 91.22 91.03 90.822 90.592 90.34 90.051 89.831 89.59 89.194 88.916 88.63 88.468 88.116 87.753 87.339 87.123 86.521 86.392 86.087 85.724 84.9 84.468 83.986 83.38 82.643 81.772 80.533 72.137 -2 ,18270 ,TETRA ,17605279,Sun Nov 28 18:52:21 CET,Sun Nov 28 20:39:34 CET,0.0 2.861 4.035 4.93 5.597 6.189 6.728 7.239 8.211 8.646 9.039 9.324 10.153 10.505 11.147 11.735 12.291 12.567 13.099 13.607 14.351 14.834 15.304 15.981 16.645 17.286 17.888 18.486 19.286 20.041 20.748 21.595 22.424 23.232 24.231 25.35 26.342 27.459 28.686 29.996 31.427 33.077 35.012 36.997 39.368 42.054 45.222 48.951 53.52 59.156 66.43 73.072 77.346 80.23 82.234 83.734 84.789 85.555 86.146 86.602 86.844 87.007 87.123 87.158 87.157 87.149 87.108 87.026 86.92 86.806 86.668 86.528 86.354 86.11 85.93 85.739 85.497 85.255 85.011 84.837 84.637 84.261 83.979 83.685 83.522 83.174 82.806 82.418 82.224 81.638 81.52 81.232 80.927 80.207 79.749 79.225 78.686 78.072 77.208 76.049 70.517 -3 ,3416 ,TETRA ,17605280,Sun Nov 28 18:52:16 CET,Sun Nov 28 20:40:16 CET,0.0 2.148 3.296 4.099 4.729 5.323 5.91 6.454 7.422 7.853 8.25 8.548 9.369 9.731 10.414 11.05 11.654 11.946 12.539 13.128 13.928 14.389 14.825 15.482 16.146 16.807 17.45 18.076 18.899 19.704 20.454 21.361 22.286 23.168 24.139 25.238 26.314 27.488 28.798 30.196 31.648 33.344 35.344 37.362 39.755 42.518 45.748 49.536 54.157 59.768 67.081 73.755 77.982 80.806 82.806 84.221 85.263 86.132 86.759 87.267 87.566 87.757 87.931 88.043 88.079 88.085 88.048 87.974 87.893 87.768 87.609 87.437 87.23 86.989 86.762 86.542 86.343 86.11 85.832 85.645 85.435 85.052 84.767 84.46 84.314 84.014 83.638 83.196 82.943 82.287 82.102 81.819 81.524 80.798 80.358 79.878 79.301 78.643 77.84 76.703 70.356 -4 ,15345 ,TETRA ,17605281,Sun Nov 28 18:52:16 CET,Sun Nov 28 20:40:17 CET,0.0 2.187 3.304 4.196 4.926 5.539 6.09 6.59 7.486 7.906 8.313 8.648 9.478 9.817 10.485 11.133 11.748 12.046 12.635 13.199 13.992 14.512 15.014 15.746 16.462 17.149 17.813 18.469 19.302 20.048 20.763 21.672 22.567 23.442 24.438 25.511 26.544 27.71 28.992 30.367 31.823 33.506 35.539 37.594 40.051 42.859 46.146 50.045 54.803 60.676 68.133 74.773 79.016 81.837 83.822 85.298 86.366 87.152 87.731 88.233 88.584 88.825 88.953 89.01 89.049 89.067 89.022 88.896 88.76 88.625 88.474 88.319 88.16 87.985 87.797 87.578 87.316 87.037 86.739 86.509 86.27 85.885 85.574 85.24 85.073 84.739 84.402 84.017 83.795 83.183 83.086 82.786 82.427 81.638 81.215 80.758 80.244 79.558 78.694 77.608 73.898 -5 ,20328 ,TETRA ,17605282,Sun Nov 28 18:52:18 CET,Sun Nov 28 20:40:07 CET,0.0 2.087 3.138 3.994 4.675 5.257 5.803 6.325 7.247 7.673 8.104 8.469 9.296 9.655 10.347 10.995 11.618 11.908 12.437 12.94 13.672 14.166 14.649 15.323 15.976 16.634 17.266 17.873 18.652 19.386 20.094 20.973 21.833 22.686 23.701 24.795 25.824 26.973 28.262 29.636 31.086 32.748 34.669 36.638 39.015 41.797 45.101 48.944 53.633 59.302 66.539 73.189 77.4 80.243 82.233 83.725 84.828 85.656 86.23 86.702 87.015 87.223 87.362 87.443 87.482 87.443 87.356 87.277 87.154 87.015 86.871 86.692 86.491 86.313 86.165 85.988 85.776 85.515 85.23 85.026 84.816 84.477 84.233 83.978 83.822 83.467 83.085 82.665 82.447 81.85 81.756 81.5 81.209 80.49 80.061 79.576 79.036 78.422 77.55 76.366 67.573 -6 ,2445 ,TETRA ,17605283,Sun Nov 28 18:52:17 CET,Sun Nov 28 20:39:50 CET,0.0 2.444 3.475 4.259 4.92 5.522 6.08 6.592 7.522 7.969 8.396 8.698 9.51 9.861 10.531 11.175 11.796 12.089 12.664 13.215 13.995 14.515 15.021 15.75 16.456 17.13 17.806 18.433 19.217 20.026 20.839 21.775 22.664 23.545 24.566 25.73 26.865 28.103 29.381 30.745 32.2 33.81 35.702 37.663 40.002 42.665 45.898 49.629 54.075 59.662 66.946 73.495 77.76 80.669 82.667 84.163 85.265 86.03 86.579 87.044 87.322 87.485 87.593 87.671 87.699 87.685 87.577 87.395 87.27 87.178 87.062 86.916 86.701 86.473 86.304 86.112 85.892 85.662 85.397 85.177 84.936 84.56 84.267 83.946 83.79 83.482 83.132 82.698 82.468 81.876 81.79 81.514 81.211 80.532 80.133 79.631 79.063 78.388 77.532 76.366 71.822 -7 ,24427 ,TETRA ,17605284,Sun Nov 28 18:52:18 CET,Sun Nov 28 20:39:11 CET,0.0 1.969 2.954 3.779 4.488 5.088 5.634 6.144 7.074 7.518 7.95 8.294 9.137 9.504 10.195 10.876 11.506 11.798 12.356 12.906 13.705 14.205 14.709 15.452 16.157 16.826 17.47 18.098 18.897 19.679 20.442 21.377 22.294 23.189 24.226 25.351 26.436 27.662 29.008 30.426 31.915 33.634 35.67 37.752 40.234 43.051 46.407 50.401 55.277 61.281 69.066 76.011 80.451 83.481 85.573 87.139 88.265 89.07 89.673 90.205 90.585 90.826 90.991 91.093 91.128 91.083 90.961 90.847 90.72 90.58 90.476 90.369 90.205 89.988 89.788 89.565 89.336 89.098 88.817 88.592 88.37 88.006 87.731 87.443 87.292 86.948 86.592 86.213 85.997 85.396 85.31 85.055 84.764 84.115 83.723 83.258 82.728 82.079 81.248 80.015 75.547 -8 ,27139 ,TETRA ,17605285,Sun Nov 28 18:52:18 CET,Sun Nov 28 20:40:55 CET,0.0 2.478 3.516 4.3 4.993 5.596 6.157 6.677 7.597 8.019 8.423 8.721 9.548 9.911 10.607 11.265 11.897 12.196 12.765 13.317 14.11 14.613 15.106 15.846 16.566 17.281 17.971 18.624 19.448 20.279 21.084 22.029 22.955 23.822 24.829 25.958 27.064 28.28 29.566 30.954 32.453 34.173 36.214 38.297 40.738 43.543 46.823 50.593 55.291 61.058 68.386 74.907 79.073 81.876 83.866 85.403 86.521 87.346 87.926 88.415 88.737 88.909 89.029 89.14 89.179 89.129 89.062 88.985 88.83 88.611 88.382 88.162 87.937 87.717 87.498 87.257 87.03 86.771 86.444 86.204 85.963 85.579 85.297 84.982 84.809 84.44 84.059 83.663 83.447 82.83 82.693 82.42 82.111 81.343 80.907 80.432 79.875 79.216 78.382 77.187 70.456 -9 ,30580 ,TETRA ,17605286,Sun Nov 28 18:52:18 CET,Sun Nov 28 20:39:18 CET,0.0 2.512 3.512 4.252 4.906 5.538 6.096 6.562 7.444 7.873 8.291 8.617 9.447 9.787 10.412 11.02 11.612 11.896 12.439 12.956 13.735 14.242 14.744 15.499 16.208 16.876 17.523 18.159 18.943 19.723 20.515 21.47 22.378 23.273 24.354 25.507 26.545 27.698 28.952 30.31 31.789 33.403 35.277 37.237 39.595 42.305 45.565 49.39 53.973 59.644 67.051 73.65 77.854 80.728 82.737 84.198 85.24 85.998 86.495 86.963 87.341 87.538 87.679 87.801 87.8 87.722 87.651 87.564 87.478 87.38 87.199 87.046 86.912 86.718 86.536 86.328 86.093 85.842 85.563 85.356 85.134 84.772 84.509 84.192 84.008 83.645 83.287 82.907 82.685 82.058 81.904 81.627 81.33 80.593 80.157 79.683 79.126 78.473 77.611 76.208 68.884 -10 ,11327 ,TETRA ,17605287,Sun Nov 28 18:52:18 CET,Sun Nov 28 20:39:33 CET,0.0 1.514 2.376 3.063 3.665 4.215 4.729 5.199 6.067 6.472 6.845 7.07 7.863 8.195 8.848 9.465 10.055 10.357 10.967 11.555 12.383 12.894 13.383 14.093 14.779 15.463 16.122 16.748 17.586 18.408 19.188 20.113 21.007 21.857 22.812 23.939 25.052 26.259 27.584 28.978 30.439 32.099 34.017 35.959 38.292 40.939 44.057 47.748 52.333 57.996 65.358 71.94 76.13 79.057 81.153 82.7 83.785 84.605 85.19 85.64 85.911 86.06 86.141 86.172 86.159 86.15 86.115 86.022 85.884 85.722 85.59 85.458 85.254 85.018 84.819 84.606 84.38 84.111 83.812 83.584 83.349 82.994 82.72 82.403 82.23 81.848 81.448 81.029 80.785 80.148 79.978 79.656 79.32 78.589 78.155 77.689 77.162 76.49 75.664 74.359 61.895 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23473_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23473_23467.txt deleted file mode 100644 index 87e3934e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23473_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7550 ,TETRA ,17605288,Sun Nov 28 18:52:18 CET,Sun Nov 28 20:38:23 CET,0.0 2.046 2.976 3.609 4.1 4.551 4.952 5.306 6.026 6.351 6.627 6.788 7.339 7.56 7.978 8.364 8.717 8.888 9.227 9.557 10.015 10.294 10.561 10.94 11.304 11.655 12.0 12.334 12.744 13.122 13.513 13.975 14.372 14.777 15.228 15.674 16.101 16.556 17.029 17.563 18.13 18.732 19.44 20.096 20.759 21.447 22.18 22.976 23.826 24.579 25.166 25.225 24.807 24.234 23.624 22.976 22.373 21.776 21.236 20.691 20.137 19.643 19.146 18.625 18.15 17.663 17.128 16.658 16.26 15.808 15.314 14.933 14.499 13.985 13.568 13.128 12.69 12.254 11.784 11.45 11.11 10.578 10.2 9.825 9.613 9.122 8.624 8.109 7.834 7.236 6.94 6.573 6.197 5.412 4.975 4.479 3.898 3.186 2.321 1.116 -4.819 -2 ,24729 ,TETRA ,17605289,Sun Nov 28 18:52:18 CET,Sun Nov 28 20:38:05 CET,0.0 3.127 4.071 4.643 5.143 5.574 5.928 6.23 6.81 7.104 7.36 7.47 8.017 8.235 8.644 9.021 9.377 9.552 9.895 10.235 10.709 11.003 11.29 11.684 12.049 12.413 12.787 13.115 13.526 13.928 14.309 14.805 15.248 15.646 16.107 16.566 16.948 17.391 17.878 18.387 18.899 19.426 20.044 20.652 21.323 22.023 22.796 23.603 24.401 25.131 25.696 25.719 25.392 24.917 24.356 23.743 23.171 22.596 22.069 21.482 20.95 20.433 19.873 19.333 18.85 18.45 18.031 17.604 17.16 16.692 16.218 15.816 15.389 14.925 14.558 14.181 13.784 13.362 12.871 12.516 12.177 11.618 11.216 10.809 10.582 10.099 9.604 9.1 8.834 8.235 7.948 7.617 7.286 6.51 6.045 5.526 4.926 4.271 3.472 2.187 -6.686 -3 ,17267 ,TETRA ,17605290,Sun Nov 28 18:52:18 CET,Sun Nov 28 20:37:47 CET,0.0 1.758 2.583 3.179 3.67 4.119 4.521 4.883 5.565 5.87 6.133 6.27 6.822 7.042 7.47 7.859 8.212 8.389 8.749 9.09 9.538 9.827 10.117 10.531 10.903 11.24 11.555 11.862 12.276 12.65 12.998 13.435 13.844 14.234 14.658 15.071 15.457 15.907 16.422 16.915 17.379 17.934 18.575 19.185 19.866 20.549 21.269 21.981 22.73 23.501 24.077 24.053 23.715 23.227 22.656 22.058 21.49 20.929 20.351 19.757 19.261 18.797 18.277 17.724 17.183 16.687 16.197 15.744 15.28 14.809 14.377 13.982 13.549 13.125 12.812 12.445 12.033 11.638 11.21 10.889 10.558 10.026 9.63 9.189 8.968 8.55 8.102 7.608 7.353 6.749 6.416 6.095 5.74 4.882 4.391 3.851 3.285 2.578 1.729 0.667 -6.137 -4 ,29136 ,TETRA ,17605291,Sun Nov 28 18:52:20 CET,Sun Nov 28 20:38:02 CET,0.0 2.486 3.261 3.822 4.309 4.75 5.148 5.494 6.114 6.423 6.711 6.873 7.417 7.635 8.05 8.434 8.794 8.972 9.316 9.644 10.109 10.376 10.628 11.004 11.394 11.757 12.068 12.371 12.759 13.124 13.478 13.897 14.292 14.685 15.143 15.618 16.039 16.493 16.975 17.478 18.009 18.571 19.158 19.741 20.428 21.139 21.866 22.59 23.357 24.118 24.657 24.719 24.412 23.939 23.408 22.8 22.124 21.471 20.929 20.356 19.824 19.285 18.768 18.29 17.78 17.315 16.814 16.323 15.9 15.459 14.974 14.572 14.169 13.747 13.386 12.987 12.591 12.198 11.743 11.396 11.047 10.51 10.141 9.743 9.534 9.103 8.62 8.096 7.827 7.22 6.915 6.574 6.2 5.397 4.951 4.458 3.908 3.267 2.473 1.326 -4.562 -5 ,1208 ,TETRA ,17605292,Sun Nov 28 18:52:22 CET,Sun Nov 28 20:38:47 CET,0.0 1.517 2.321 2.927 3.379 3.763 4.119 4.448 5.076 5.374 5.64 5.817 6.394 6.628 7.048 7.455 7.857 8.037 8.373 8.697 9.158 9.459 9.747 10.16 10.561 10.954 11.302 11.618 12.017 12.386 12.742 13.143 13.511 13.866 14.293 14.783 15.22 15.661 16.112 16.582 17.094 17.659 18.284 18.875 19.501 20.158 20.887 21.667 22.428 23.064 23.53 23.422 23.004 22.5 21.929 21.286 20.645 20.046 19.467 18.852 18.327 17.842 17.346 16.803 16.291 15.827 15.315 14.869 14.493 14.088 13.629 13.197 12.749 12.274 11.883 11.488 11.067 10.606 10.133 9.816 9.498 9.02 8.664 8.277 8.075 7.639 7.182 6.681 6.413 5.817 5.555 5.222 4.865 4.061 3.58 3.044 2.457 1.758 0.866 -0.332 -5.153 -6 ,15692 ,TETRA ,17605293,Sun Nov 28 18:52:18 CET,Sun Nov 28 20:38:17 CET,0.0 1.458 2.25 2.81 3.255 3.694 4.102 4.479 5.138 5.424 5.694 5.86 6.422 6.648 7.076 7.47 7.839 8.019 8.367 8.688 9.116 9.387 9.68 10.115 10.49 10.854 11.218 11.57 12.008 12.41 12.789 13.257 13.686 14.047 14.44 14.892 15.312 15.752 16.253 16.78 17.268 17.819 18.472 19.036 19.674 20.354 21.07 21.842 22.639 23.359 23.914 23.871 23.439 22.889 22.311 21.756 21.202 20.614 20.066 19.484 18.959 18.455 17.976 17.483 16.961 16.503 16.036 15.589 15.174 14.734 14.234 13.803 13.385 12.917 12.548 12.206 11.811 11.324 10.813 10.473 10.13 9.599 9.206 8.785 8.571 8.129 7.655 7.137 6.862 6.258 5.981 5.627 5.234 4.392 3.936 3.452 2.875 2.206 1.398 0.208 -3.695 -7 ,16881 ,TETRA ,17605294,Sun Nov 28 18:52:19 CET,Sun Nov 28 20:39:18 CET,0.0 1.479 2.187 2.743 3.21 3.629 4.014 4.37 5.015 5.297 5.551 5.723 6.294 6.528 6.94 7.312 7.68 7.856 8.196 8.515 8.956 9.223 9.495 9.892 10.253 10.625 10.996 11.334 11.757 12.154 12.525 12.96 13.365 13.741 14.174 14.639 15.046 15.497 16.0 16.486 16.958 17.508 18.123 18.704 19.327 19.972 20.715 21.473 22.249 22.98 23.458 23.424 23.03 22.448 21.805 21.176 20.577 20.01 19.479 18.848 18.285 17.818 17.329 16.777 16.276 15.859 15.419 15.013 14.624 14.202 13.762 13.37 12.946 12.481 12.08 11.661 11.24 10.82 10.377 10.049 9.711 9.194 8.826 8.426 8.213 7.762 7.283 6.747 6.452 5.836 5.5 5.134 4.761 3.975 3.532 2.99 2.348 1.632 0.793 -0.363 -7.819 -8 ,1762 ,TETRA ,17605295,Sun Nov 28 18:52:19 CET,Sun Nov 28 20:38:45 CET,0.0 1.704 2.508 3.083 3.55 3.966 4.335 4.67 5.276 5.548 5.798 5.935 6.493 6.712 7.138 7.532 7.921 8.105 8.418 8.718 9.17 9.458 9.735 10.14 10.519 10.885 11.234 11.544 11.929 12.307 12.653 13.046 13.461 13.894 14.369 14.823 15.257 15.751 16.264 16.783 17.288 17.819 18.453 19.093 19.737 20.411 21.143 21.895 22.699 23.522 24.065 23.953 23.531 22.96 22.359 21.745 21.143 20.502 19.887 19.3 18.765 18.27 17.796 17.303 16.841 16.402 15.918 15.494 15.088 14.644 14.156 13.74 13.314 12.858 12.507 12.142 11.757 11.336 10.864 10.54 10.202 9.668 9.304 8.913 8.693 8.225 7.745 7.221 6.931 6.307 5.971 5.626 5.269 4.424 3.934 3.403 2.779 2.05 1.223 0.043 -4.207 -9 ,5638 ,TETRA ,17605296,Sun Nov 28 18:52:19 CET,Sun Nov 28 20:38:51 CET,0.0 1.46 2.107 2.614 3.065 3.473 3.838 4.167 4.776 5.048 5.3 5.44 5.991 6.22 6.638 7.016 7.369 7.532 7.844 8.145 8.562 8.819 9.072 9.443 9.824 10.188 10.508 10.84 11.245 11.588 11.911 12.285 12.659 13.052 13.488 13.916 14.318 14.794 15.342 15.859 16.333 16.905 17.599 18.233 18.882 19.556 20.3 21.083 21.867 22.606 23.182 23.118 22.725 22.233 21.677 21.11 20.517 19.905 19.368 18.786 18.266 17.742 17.207 16.719 16.218 15.777 15.325 14.9 14.514 14.104 13.665 13.256 12.834 12.368 11.999 11.628 11.2 10.727 10.259 9.947 9.613 9.075 8.675 8.258 8.05 7.603 7.111 6.604 6.338 5.743 5.44 5.11 4.773 3.988 3.539 3.002 2.385 1.734 0.928 -0.269 -4.404 -10 ,20553 ,TETRA ,17605297,Sun Nov 28 18:52:21 CET,Sun Nov 28 20:37:55 CET,0.0 1.488 2.238 2.786 3.261 3.67 4.043 4.389 4.993 5.27 5.522 5.681 6.242 6.46 6.871 7.274 7.661 7.842 8.187 8.507 8.964 9.254 9.528 9.94 10.337 10.69 11.015 11.34 11.758 12.157 12.53 12.976 13.397 13.794 14.241 14.702 15.143 15.615 16.124 16.66 17.176 17.758 18.406 19.003 19.653 20.309 21.009 21.751 22.517 23.24 23.77 23.696 23.325 22.831 22.209 21.569 20.921 20.244 19.674 19.073 18.546 18.097 17.637 17.169 16.73 16.311 15.827 15.398 15.016 14.604 14.185 13.832 13.45 13.068 12.742 12.369 11.982 11.554 11.087 10.761 10.409 9.804 9.392 8.967 8.745 8.305 7.825 7.285 6.991 6.362 6.049 5.735 5.38 4.536 4.036 3.486 2.863 2.169 1.378 0.171 -4.966 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index 3d0f9c2e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25205 ,TETRA ,17605298,Sun Nov 28 18:52:20 CET,Sun Nov 28 20:42:10 CET,0.0 1.641 2.415 2.975 3.453 3.874 4.24 4.567 5.13 5.388 5.646 5.762 6.321 6.55 6.975 7.362 7.744 7.92 8.253 8.581 9.022 9.277 9.525 9.89 10.244 10.591 10.924 11.251 11.666 12.058 12.438 12.872 13.24 13.594 14.039 14.55 14.995 15.422 15.881 16.349 16.8 17.269 17.781 18.276 18.861 19.481 20.107 20.732 21.362 21.977 22.346 22.105 21.598 21.001 20.391 19.79 19.202 18.633 18.098 17.513 16.966 16.443 15.92 15.404 14.925 14.503 14.058 13.62 13.222 12.825 12.404 12.013 11.607 11.202 10.843 10.446 10.057 9.653 9.226 8.921 8.589 8.089 7.742 7.371 7.179 6.786 6.37 5.912 5.666 5.062 4.847 4.548 4.261 3.594 3.186 2.745 2.271 1.675 0.917 -0.034 -2.339 -2 ,3311 ,TETRA ,17605299,Sun Nov 28 18:52:48 CET,Sun Nov 28 20:41:22 CET,0.0 3.182 4.029 4.544 5.011 5.456 5.83 6.151 6.75 7.052 7.333 7.502 8.078 8.302 8.738 9.154 9.528 9.7 10.033 10.359 10.817 11.098 11.367 11.74 12.096 12.431 12.745 13.035 13.403 13.767 14.113 14.538 14.95 15.311 15.698 16.122 16.523 16.974 17.402 17.807 18.228 18.673 19.171 19.658 20.22 20.809 21.45 22.081 22.706 23.269 23.589 23.349 22.815 22.226 21.602 20.959 20.328 19.725 19.178 18.599 18.043 17.506 16.95 16.417 15.942 15.486 14.959 14.468 14.075 13.685 13.233 12.839 12.415 11.967 11.626 11.273 10.89 10.463 10.006 9.69 9.365 8.857 8.477 8.086 7.895 7.485 7.039 6.577 6.333 5.728 5.56 5.288 4.984 4.311 3.936 3.512 2.994 2.404 1.719 0.871 -1.129 -3 ,5881 ,TETRA ,17605300,Sun Nov 28 18:53:46 CET,Sun Nov 28 20:43:35 CET,0.0 1.45 2.271 2.891 3.414 3.875 4.277 4.634 5.279 5.549 5.796 5.912 6.475 6.7 7.131 7.524 7.885 8.06 8.378 8.683 9.152 9.427 9.683 10.062 10.407 10.767 11.111 11.413 11.836 12.238 12.578 12.93 13.28 13.657 14.092 14.565 14.974 15.385 15.815 16.276 16.742 17.255 17.827 18.345 18.904 19.544 20.215 20.832 21.464 22.004 22.345 22.159 21.659 21.097 20.45 19.751 19.114 18.464 17.874 17.281 16.707 16.176 15.675 15.142 14.636 14.201 13.731 13.287 12.903 12.502 12.038 11.633 11.189 10.724 10.364 9.973 9.573 9.172 8.777 8.505 8.205 7.687 7.331 6.965 6.77 6.382 5.958 5.495 5.248 4.627 4.378 4.065 3.73 3.022 2.636 2.202 1.723 1.149 0.477 -0.479 -2.93 -4 ,6958 ,TETRA ,17605301,Sun Nov 28 18:52:48 CET,Sun Nov 28 20:41:18 CET,0.0 1.525 2.229 2.779 3.285 3.719 4.092 4.429 5.0 5.267 5.551 5.765 6.349 6.573 6.977 7.377 7.773 7.945 8.272 8.575 9.008 9.298 9.598 10.064 10.498 10.892 11.24 11.561 11.955 12.314 12.671 13.085 13.449 13.792 14.194 14.633 15.031 15.453 15.912 16.371 16.82 17.331 17.888 18.397 18.942 19.498 20.081 20.649 21.248 21.867 22.278 22.111 21.595 20.955 20.299 19.614 18.964 18.344 17.749 17.139 16.616 16.158 15.693 15.176 14.668 14.218 13.718 13.256 12.857 12.437 11.966 11.574 11.177 10.738 10.401 10.04 9.659 9.264 8.846 8.559 8.251 7.753 7.392 7.012 6.818 6.399 5.969 5.51 5.266 4.677 4.452 4.142 3.829 3.108 2.713 2.28 1.806 1.265 0.614 -0.233 -2.802 -5 ,32665 ,TETRA ,17605302,Sun Nov 28 18:52:48 CET,Sun Nov 28 20:42:54 CET,0.0 1.569 2.301 2.914 3.411 3.828 4.204 4.546 5.154 5.435 5.729 5.904 6.455 6.666 7.076 7.458 7.79 7.954 8.258 8.559 9.023 9.297 9.547 9.924 10.292 10.661 11.013 11.323 11.697 12.032 12.36 12.757 13.115 13.465 13.87 14.299 14.693 15.106 15.551 16.0 16.435 16.897 17.433 17.939 18.504 19.104 19.752 20.432 21.093 21.636 22.01 21.836 21.324 20.752 20.192 19.584 18.955 18.398 17.904 17.341 16.853 16.392 15.904 15.471 15.05 14.593 14.087 13.659 13.296 12.888 12.458 12.083 11.697 11.304 10.972 10.62 10.258 9.869 9.454 9.17 8.874 8.377 8.026 7.667 7.477 7.08 6.65 6.168 5.925 5.343 5.145 4.848 4.537 3.867 3.499 3.097 2.645 2.121 1.433 0.36 -2.095 -6 ,22554 ,TETRA ,17605303,Sun Nov 28 18:52:48 CET,Sun Nov 28 20:42:58 CET,0.0 1.763 2.551 3.136 3.613 4.045 4.454 4.808 5.42 5.742 6.05 6.202 6.777 7.012 7.452 7.85 8.223 8.412 8.776 9.109 9.595 9.901 10.201 10.631 11.002 11.315 11.604 11.885 12.297 12.697 13.022 13.383 13.761 14.167 14.609 15.108 15.544 15.952 16.382 16.786 17.194 17.658 18.17 18.709 19.311 19.893 20.523 21.155 21.747 22.289 22.64 22.421 21.867 21.227 20.639 20.036 19.445 18.825 18.225 17.627 17.099 16.61 16.105 15.622 15.164 14.734 14.264 13.806 13.389 12.974 12.571 12.23 11.84 11.423 11.12 10.796 10.421 10.036 9.626 9.321 9.032 8.592 8.25 7.871 7.692 7.343 6.928 6.47 6.239 5.658 5.467 5.187 4.88 4.18 3.808 3.428 3.031 2.547 1.961 1.122 -1.986 -7 ,22748 ,TETRA ,17605304,Sun Nov 28 18:52:48 CET,Sun Nov 28 20:44:02 CET,0.0 1.499 2.265 2.839 3.336 3.788 4.183 4.529 5.126 5.414 5.694 5.851 6.429 6.67 7.108 7.493 7.838 8.003 8.331 8.67 9.147 9.43 9.697 10.083 10.442 10.762 11.079 11.385 11.758 12.097 12.397 12.746 13.095 13.436 13.834 14.285 14.709 15.158 15.64 16.098 16.541 17.061 17.637 18.156 18.709 19.299 19.962 20.608 21.235 21.745 21.981 21.781 21.297 20.748 20.144 19.483 18.899 18.326 17.766 17.198 16.686 16.199 15.718 15.228 14.778 14.378 13.857 13.381 12.992 12.56 12.095 11.684 11.269 10.871 10.546 10.188 9.808 9.415 9.015 8.725 8.378 7.848 7.505 7.129 6.939 6.548 6.132 5.689 5.448 4.832 4.609 4.305 3.969 3.228 2.786 2.29 1.772 1.167 0.403 -0.515 -2.616 -8 ,2864 ,TETRA ,17605305,Sun Nov 28 18:52:48 CET,Sun Nov 28 20:43:00 CET,0.0 1.938 2.716 3.262 3.744 4.164 4.536 4.874 5.439 5.703 5.967 6.145 6.719 6.937 7.364 7.765 8.132 8.3 8.627 8.938 9.406 9.696 9.967 10.371 10.735 11.056 11.372 11.684 12.066 12.443 12.815 13.238 13.63 14.0 14.418 14.913 15.38 15.812 16.234 16.657 17.091 17.587 18.19 18.786 19.395 20.016 20.644 21.296 21.996 22.637 23.041 22.852 22.366 21.789 21.152 20.488 19.809 19.185 18.655 18.077 17.522 17.019 16.551 16.065 15.564 15.12 14.691 14.29 13.932 13.562 13.134 12.735 12.336 11.927 11.591 11.229 10.863 10.499 10.082 9.787 9.487 8.998 8.666 8.313 8.117 7.731 7.32 6.865 6.632 6.046 5.861 5.568 5.258 4.474 4.031 3.593 3.1 2.519 1.869 0.962 -1.939 -9 ,5475 ,TETRA ,17605306,Sun Nov 28 18:52:50 CET,Sun Nov 28 20:42:23 CET,0.0 1.771 2.536 3.115 3.613 4.046 4.433 4.786 5.386 5.663 5.932 6.092 6.67 6.898 7.333 7.751 8.147 8.328 8.683 9.024 9.487 9.775 10.052 10.444 10.824 11.206 11.567 11.89 12.288 12.658 12.995 13.401 13.769 14.117 14.528 14.977 15.383 15.817 16.292 16.771 17.21 17.687 18.238 18.743 19.281 19.806 20.368 20.956 21.525 22.082 22.438 22.237 21.77 21.178 20.532 19.898 19.322 18.756 18.231 17.663 17.115 16.609 16.124 15.629 15.154 14.739 14.268 13.817 13.45 13.068 12.633 12.27 11.905 11.504 11.165 10.786 10.373 9.969 9.558 9.273 8.981 8.497 8.135 7.743 7.55 7.165 6.743 6.265 6.015 5.419 5.234 4.938 4.601 3.844 3.426 3.006 2.541 1.973 1.305 0.424 -1.439 -10 ,21678 ,TETRA ,17605307,Sun Nov 28 18:52:48 CET,Sun Nov 28 20:42:24 CET,0.0 1.558 2.245 2.829 3.351 3.788 4.172 4.516 5.126 5.406 5.666 5.832 6.406 6.624 7.046 7.434 7.797 7.964 8.279 8.573 8.997 9.278 9.553 9.942 10.301 10.618 10.913 11.228 11.639 12.012 12.367 12.797 13.168 13.488 13.861 14.27 14.645 15.058 15.476 15.904 16.361 16.824 17.354 17.876 18.443 19.057 19.715 20.347 20.966 21.481 21.795 21.66 21.2 20.611 19.976 19.305 18.691 18.096 17.545 16.98 16.476 15.987 15.503 15.066 14.631 14.174 13.703 13.304 12.934 12.511 12.041 11.634 11.191 10.73 10.391 10.02 9.611 9.205 8.784 8.49 8.18 7.668 7.317 6.944 6.746 6.352 5.927 5.434 5.176 4.573 4.364 4.058 3.715 2.975 2.556 2.117 1.639 1.056 0.356 -0.562 -2.656 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_23475.txt deleted file mode 100644 index e28e643a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13629 ,KEBNE ,17027340,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:31:07 CET,0.0 2.843 3.553 4.151 4.649 5.097 5.508 5.853 6.451 6.73 6.999 7.149 7.717 7.936 8.335 8.717 9.087 9.266 9.606 9.935 10.395 10.67 10.939 11.331 11.679 12.019 12.338 12.615 12.977 13.343 13.711 14.12 14.51 14.887 15.276 15.682 16.045 16.393 16.743 17.115 17.524 17.936 18.344 18.735 19.207 19.649 20.054 20.476 20.802 20.957 20.68 19.918 19.012 18.092 17.233 16.46 15.732 14.995 14.34 13.66 13.103 12.619 12.082 11.548 11.05 10.576 10.088 9.624 9.178 8.713 8.235 7.826 7.371 6.9 6.559 6.178 5.745 5.308 4.856 4.531 4.189 3.659 3.282 2.871 2.657 2.194 1.704 1.208 0.954 0.334 0.05 -0.275 -0.61 -1.344 -1.747 -2.193 -2.703 -3.29 -3.969 -4.934 -7.557 -2 ,812 ,KEBNE ,17027341,Wed Dec 22 16:56:32 CET,Wed Dec 22 18:31:05 CET,0.0 2.695 3.472 4.043 4.492 4.916 5.314 5.665 6.293 6.578 6.837 6.993 7.572 7.79 8.205 8.612 8.966 9.131 9.467 9.793 10.264 10.563 10.822 11.162 11.505 11.847 12.179 12.507 12.909 13.257 13.572 13.912 14.233 14.556 14.898 15.262 15.61 15.966 16.333 16.73 17.138 17.558 17.974 18.346 18.749 19.154 19.541 19.877 20.163 20.238 19.837 18.949 17.992 17.033 16.154 15.332 14.511 13.727 13.055 12.285 11.567 10.96 10.325 9.697 9.145 8.657 8.093 7.57 7.16 6.729 6.243 5.795 5.323 4.861 4.494 4.109 3.7 3.23 2.741 2.421 2.087 1.563 1.167 0.748 0.546 0.12 -0.34 -0.856 -1.132 -1.747 -1.981 -2.276 -2.573 -3.307 -3.735 -4.171 -4.67 -5.263 -5.971 -6.923 -10.247 -3 ,15855 ,KEBNE ,17027342,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:31:03 CET,0.0 2.614 3.577 4.274 4.841 5.331 5.745 6.111 6.717 6.983 7.232 7.376 7.972 8.233 8.712 9.112 9.492 9.686 10.051 10.395 10.862 11.153 11.43 11.861 12.253 12.574 12.893 13.212 13.637 13.999 14.302 14.685 15.057 15.428 15.83 16.221 16.588 16.998 17.405 17.825 18.265 18.692 19.121 19.49 19.885 20.274 20.646 21.045 21.386 21.523 21.277 20.49 19.569 18.623 17.69 16.795 15.944 15.161 14.518 13.843 13.243 12.715 12.167 11.583 11.026 10.509 9.986 9.542 9.16 8.761 8.323 7.906 7.447 6.977 6.592 6.21 5.832 5.434 5.035 4.736 4.4 3.88 3.511 3.104 2.894 2.476 2.029 1.536 1.273 0.645 0.37 0.06 -0.258 -0.978 -1.394 -1.887 -2.442 -3.034 -3.745 -4.602 -6.71 -4 ,7008 ,KEBNE ,17027343,Wed Dec 22 16:56:34 CET,Wed Dec 22 18:30:53 CET,0.0 2.535 3.395 4.058 4.556 4.977 5.369 5.737 6.377 6.671 6.969 7.175 7.763 7.996 8.411 8.799 9.153 9.316 9.634 9.932 10.353 10.631 10.904 11.282 11.621 11.949 12.262 12.542 12.888 13.211 13.508 13.868 14.195 14.481 14.854 15.278 15.663 16.066 16.432 16.817 17.217 17.645 18.135 18.576 19.037 19.488 19.887 20.237 20.523 20.664 20.452 19.708 18.775 17.848 16.979 16.137 15.357 14.621 13.97 13.254 12.599 11.986 11.397 10.869 10.352 9.841 9.278 8.77 8.329 7.843 7.336 6.912 6.468 6.011 5.637 5.221 4.777 4.322 3.849 3.518 3.192 2.651 2.257 1.836 1.615 1.201 0.774 0.278 0.004 -0.619 -0.877 -1.211 -1.553 -2.281 -2.709 -3.21 -3.75 -4.33 -5.073 -6.057 -10.282 -5 ,4899 ,KEBNE ,17027344,Wed Dec 22 16:56:34 CET,Wed Dec 22 18:30:41 CET,0.0 1.642 2.421 3.026 3.52 3.944 4.313 4.655 5.275 5.574 5.845 5.952 6.514 6.729 7.113 7.505 7.885 8.055 8.366 8.65 9.057 9.301 9.547 9.954 10.353 10.707 11.008 11.308 11.683 12.016 12.351 12.732 13.079 13.43 13.8 14.156 14.502 14.891 15.284 15.654 16.036 16.485 16.982 17.45 17.897 18.285 18.667 19.042 19.345 19.391 19.03 18.229 17.29 16.338 15.443 14.571 13.778 13.024 12.362 11.686 11.088 10.557 10.039 9.511 9.003 8.563 8.081 7.6 7.15 6.674 6.201 5.786 5.341 4.881 4.501 4.096 3.678 3.253 2.815 2.501 2.147 1.58 1.195 0.791 0.589 0.162 -0.31 -0.809 -1.069 -1.693 -1.939 -2.244 -2.568 -3.279 -3.66 -4.093 -4.602 -5.227 -6.022 -7.039 -10.388 -6 ,26753 ,KEBNE ,17027345,Wed Dec 22 16:56:34 CET,Wed Dec 22 18:30:38 CET,0.0 2.138 2.879 3.472 3.945 4.341 4.692 5.005 5.595 5.869 6.15 6.306 6.841 7.053 7.46 7.82 8.168 8.342 8.691 9.003 9.428 9.702 9.96 10.335 10.672 10.974 11.271 11.554 11.882 12.231 12.581 12.991 13.355 13.658 14.017 14.396 14.753 15.15 15.558 15.974 16.393 16.828 17.28 17.672 18.127 18.566 18.938 19.291 19.576 19.668 19.4 18.645 17.725 16.786 15.903 15.069 14.295 13.554 12.891 12.172 11.557 11.003 10.417 9.869 9.344 8.831 8.274 7.774 7.334 6.889 6.411 5.975 5.513 5.015 4.617 4.216 3.819 3.4 2.936 2.614 2.278 1.754 1.403 1.036 0.846 0.424 -0.039 -0.542 -0.802 -1.408 -1.658 -1.991 -2.343 -3.117 -3.541 -3.974 -4.43 -4.999 -5.777 -6.818 -10.23 -7 ,8291 ,KEBNE ,17027346,Wed Dec 22 16:56:34 CET,Wed Dec 22 18:32:46 CET,0.0 2.615 3.603 4.374 4.941 5.387 5.769 6.121 6.757 7.04 7.323 7.512 8.084 8.317 8.785 9.212 9.576 9.741 10.059 10.381 10.824 11.077 11.321 11.694 12.047 12.37 12.692 12.976 13.324 13.663 13.985 14.411 14.796 15.108 15.446 15.805 16.171 16.588 17.017 17.445 17.822 18.188 18.623 19.066 19.545 19.98 20.389 20.764 21.057 21.178 20.894 20.078 19.145 18.259 17.477 16.67 15.865 15.104 14.443 13.736 13.063 12.472 11.904 11.373 10.878 10.37 9.839 9.397 9.025 8.58 8.059 7.637 7.197 6.743 6.395 6.006 5.63 5.233 4.748 4.429 4.116 3.561 3.16 2.765 2.571 2.15 1.668 1.165 0.904 0.287 0.071 -0.241 -0.594 -1.328 -1.74 -2.213 -2.739 -3.324 -4.038 -5.053 -7.787 -8 ,18176 ,KEBNE ,17027347,Wed Dec 22 16:56:34 CET,Wed Dec 22 18:30:37 CET,0.0 3.145 3.968 4.539 5.031 5.46 5.85 6.201 6.809 7.094 7.37 7.523 8.085 8.292 8.68 9.055 9.408 9.585 9.936 10.236 10.654 10.938 11.201 11.576 11.933 12.269 12.59 12.895 13.287 13.631 13.978 14.416 14.806 15.121 15.445 15.818 16.157 16.549 16.96 17.333 17.706 18.115 18.535 18.923 19.388 19.822 20.177 20.507 20.772 20.866 20.538 19.692 18.779 17.885 16.993 16.125 15.316 14.576 13.897 13.152 12.511 11.953 11.428 10.939 10.464 9.969 9.421 8.941 8.551 8.137 7.689 7.293 6.84 6.365 5.989 5.571 5.118 4.666 4.246 3.93 3.576 3.032 2.656 2.262 2.056 1.633 1.165 0.665 0.408 -0.204 -0.422 -0.722 -1.041 -1.744 -2.135 -2.568 -3.048 -3.62 -4.34 -5.347 -8.761 -9 ,19943 ,KEBNE ,17027348,Wed Dec 22 16:56:34 CET,Wed Dec 22 18:30:43 CET,0.0 2.934 3.812 4.444 4.971 5.443 5.835 6.177 6.822 7.116 7.378 7.509 8.061 8.269 8.686 9.085 9.456 9.631 9.961 10.282 10.76 11.047 11.302 11.676 12.031 12.349 12.656 12.963 13.339 13.677 14.001 14.375 14.725 15.079 15.479 15.9 16.292 16.675 17.076 17.494 17.877 18.275 18.698 19.097 19.488 19.871 20.258 20.585 20.898 21.084 20.767 19.883 18.949 18.014 17.108 16.205 15.399 14.67 14.014 13.367 12.774 12.198 11.636 11.091 10.567 10.047 9.452 8.942 8.518 8.038 7.532 7.144 6.761 6.358 6.01 5.635 5.23 4.786 4.325 4.004 3.677 3.149 2.762 2.353 2.142 1.7 1.23 0.722 0.45 -0.177 -0.449 -0.777 -1.107 -1.794 -2.189 -2.653 -3.16 -3.728 -4.426 -5.502 -8.934 -10 ,20604 ,KEBNE ,17027349,Wed Dec 22 16:56:34 CET,Wed Dec 22 18:30:49 CET,0.0 2.379 3.146 3.73 4.219 4.634 5.028 5.398 6.033 6.304 6.562 6.701 7.267 7.484 7.901 8.263 8.587 8.737 9.031 9.308 9.702 9.982 10.268 10.643 10.998 11.337 11.634 11.915 12.286 12.644 12.963 13.318 13.638 13.935 14.279 14.648 14.985 15.323 15.71 16.124 16.53 17.001 17.482 17.881 18.302 18.721 19.166 19.538 19.77 19.816 19.505 18.728 17.779 16.873 16.001 15.138 14.363 13.651 12.987 12.219 11.484 10.815 10.23 9.729 9.247 8.76 8.23 7.742 7.308 6.82 6.322 5.925 5.469 5.002 4.655 4.285 3.892 3.483 3.064 2.769 2.473 2.004 1.646 1.259 1.062 0.646 0.18 -0.321 -0.595 -1.23 -1.485 -1.806 -2.156 -2.902 -3.304 -3.738 -4.246 -4.855 -5.592 -6.519 -9.443 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23475_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23475_23468.txt deleted file mode 100644 index 35b7fbd7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23475_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7392 ,KEBNE ,17027350,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:29:13 CET,0.0 1.469 2.165 2.741 3.251 3.673 4.055 4.406 5.047 5.349 5.637 5.803 6.389 6.613 7.036 7.442 7.841 8.031 8.363 8.671 9.135 9.424 9.714 10.134 10.513 10.886 11.234 11.532 11.93 12.335 12.695 13.158 13.592 13.943 14.315 14.723 15.113 15.556 16.026 16.45 16.874 17.332 17.821 18.27 18.728 19.133 19.501 19.878 20.073 19.928 19.157 17.625 16.113 14.748 13.539 12.351 11.254 10.267 9.433 8.58 7.815 7.092 6.395 5.714 5.044 4.45 3.871 3.335 2.82 2.308 1.792 1.359 0.894 0.406 0.02 -0.381 -0.776 -1.219 -1.69 -2.01 -2.347 -2.873 -3.237 -3.62 -3.825 -4.259 -4.719 -5.216 -5.484 -6.125 -6.317 -6.62 -6.933 -7.664 -8.08 -8.532 -9.01 -9.546 -10.239 -11.144 -13.124 -2 ,19762 ,KEBNE ,17027351,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:30:18 CET,0.0 3.125 3.926 4.54 5.097 5.528 5.876 6.217 6.869 7.179 7.482 7.685 8.27 8.504 8.943 9.347 9.718 9.892 10.235 10.579 11.055 11.346 11.632 12.022 12.385 12.741 13.077 13.396 13.799 14.166 14.509 14.929 15.319 15.694 16.098 16.497 16.854 17.266 17.768 18.267 18.703 19.147 19.601 20.01 20.437 20.897 21.338 21.635 21.833 21.779 21.122 19.67 18.212 16.867 15.63 14.459 13.421 12.482 11.633 10.756 9.93 9.215 8.568 7.896 7.243 6.678 6.074 5.51 5.017 4.503 3.971 3.498 2.987 2.494 2.084 1.64 1.214 0.761 0.26 -0.097 -0.453 -1.009 -1.402 -1.804 -2.007 -2.448 -2.909 -3.369 -3.615 -4.256 -4.496 -4.815 -5.135 -5.837 -6.228 -6.667 -7.159 -7.707 -8.358 -9.203 -11.53 -3 ,11288 ,KEBNE ,17027352,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:29:28 CET,0.0 1.751 2.525 3.127 3.657 4.093 4.481 4.832 5.433 5.717 5.982 6.113 6.683 6.906 7.335 7.748 8.106 8.254 8.565 8.882 9.333 9.607 9.851 10.223 10.568 10.895 11.213 11.479 11.807 12.147 12.481 12.869 13.266 13.656 14.054 14.481 14.874 15.291 15.709 16.136 16.578 17.062 17.584 18.035 18.5 18.944 19.352 19.729 19.984 19.927 19.28 17.947 16.519 15.116 13.879 12.729 11.665 10.715 9.877 8.98 8.197 7.482 6.79 6.149 5.548 4.989 4.388 3.86 3.4 2.858 2.283 1.816 1.304 0.768 0.371 -0.028 -0.442 -0.852 -1.32 -1.666 -2.016 -2.572 -2.954 -3.345 -3.554 -3.995 -4.477 -4.99 -5.244 -5.884 -6.093 -6.395 -6.727 -7.43 -7.813 -8.261 -8.766 -9.324 -9.986 -10.833 -12.906 -4 ,2065 ,KEBNE ,17027353,Wed Dec 22 16:56:33 CET,Wed Dec 22 18:29:22 CET,0.0 1.552 2.371 3.012 3.539 3.967 4.334 4.671 5.304 5.587 5.856 6.033 6.627 6.853 7.28 7.68 8.069 8.256 8.62 8.959 9.41 9.702 9.987 10.392 10.777 11.145 11.479 11.783 12.17 12.552 12.918 13.354 13.789 14.177 14.584 15.032 15.471 15.926 16.346 16.778 17.203 17.659 18.14 18.538 18.986 19.487 19.986 20.339 20.567 20.632 20.104 18.77 17.423 16.094 14.821 13.656 12.629 11.669 10.813 9.951 9.222 8.555 7.87 7.216 6.595 5.951 5.25 4.64 4.123 3.621 3.086 2.635 2.132 1.583 1.204 0.811 0.376 -0.111 -0.59 -0.896 -1.235 -1.77 -2.169 -2.614 -2.83 -3.273 -3.733 -4.208 -4.459 -5.093 -5.342 -5.673 -6.006 -6.717 -7.1 -7.527 -8.022 -8.589 -9.264 -10.157 -12.427 -5 ,10190 ,KEBNE ,17027354,Wed Dec 22 16:56:32 CET,Wed Dec 22 18:29:22 CET,0.0 1.567 2.369 2.976 3.439 3.86 4.28 4.703 5.433 5.73 6.012 6.175 6.766 7.002 7.44 7.846 8.219 8.393 8.739 9.066 9.54 9.848 10.129 10.526 10.89 11.23 11.591 11.956 12.397 12.813 13.198 13.625 14.004 14.399 14.849 15.254 15.638 16.066 16.497 16.897 17.306 17.739 18.183 18.623 19.099 19.572 20.039 20.405 20.642 20.661 20.031 18.62 17.175 15.84 14.634 13.497 12.423 11.421 10.586 9.711 8.953 8.25 7.529 6.869 6.269 5.69 5.068 4.525 4.069 3.604 3.1 2.663 2.208 1.71 1.297 0.876 0.435 -0.017 -0.472 -0.791 -1.133 -1.668 -2.045 -2.453 -2.669 -3.116 -3.59 -4.092 -4.344 -4.963 -5.149 -5.473 -5.803 -6.531 -6.959 -7.442 -7.994 -8.588 -9.294 -10.361 -13.186 -6 ,22351 ,KEBNE ,17027355,Wed Dec 22 16:56:31 CET,Wed Dec 22 18:29:11 CET,0.0 1.794 2.634 3.258 3.777 4.241 4.637 4.992 5.654 5.951 6.229 6.409 6.996 7.226 7.655 8.049 8.416 8.591 8.926 9.25 9.707 9.985 10.258 10.666 11.049 11.401 11.733 12.045 12.435 12.837 13.226 13.664 14.075 14.462 14.872 15.321 15.766 16.192 16.628 17.083 17.487 17.902 18.393 18.843 19.285 19.755 20.186 20.497 20.757 20.796 20.076 18.582 17.129 15.744 14.505 13.377 12.338 11.361 10.529 9.668 8.874 8.154 7.439 6.76 6.156 5.601 5.029 4.526 4.048 3.517 2.98 2.514 2.039 1.574 1.195 0.797 0.371 -0.094 -0.574 -0.922 -1.29 -1.838 -2.246 -2.671 -2.877 -3.327 -3.805 -4.286 -4.549 -5.198 -5.419 -5.724 -6.038 -6.766 -7.167 -7.592 -8.103 -8.66 -9.272 -10.154 -12.452 -7 ,14463 ,KEBNE ,17027356,Wed Dec 22 16:56:35 CET,Wed Dec 22 18:29:21 CET,0.0 1.775 2.618 3.22 3.716 4.171 4.586 4.958 5.613 5.902 6.171 6.314 6.896 7.121 7.574 8.016 8.407 8.586 8.951 9.305 9.768 10.067 10.355 10.757 11.154 11.516 11.848 12.171 12.6 12.993 13.323 13.738 14.164 14.536 14.911 15.297 15.644 16.025 16.442 16.848 17.244 17.67 18.133 18.576 19.017 19.418 19.831 20.176 20.341 20.209 19.549 18.182 16.738 15.329 14.021 12.865 11.822 10.849 10.029 9.181 8.406 7.695 7.007 6.355 5.716 5.099 4.475 3.927 3.425 2.88 2.317 1.835 1.363 0.872 0.442 0.007 -0.428 -0.903 -1.398 -1.748 -2.109 -2.661 -3.052 -3.467 -3.674 -4.102 -4.576 -5.063 -5.319 -5.97 -6.195 -6.507 -6.833 -7.544 -7.953 -8.39 -8.855 -9.385 -10.075 -11.039 -13.404 -8 ,19629 ,KEBNE ,17027357,Wed Dec 22 16:57:30 CET,Wed Dec 22 18:29:58 CET,0.0 1.931 2.78 3.37 3.832 4.257 4.645 5.0 5.649 5.943 6.222 6.393 6.978 7.201 7.623 8.018 8.397 8.579 8.938 9.278 9.743 10.053 10.335 10.723 11.106 11.462 11.812 12.136 12.524 12.886 13.228 13.673 14.095 14.435 14.807 15.224 15.579 16.0 16.49 16.949 17.357 17.786 18.296 18.742 19.168 19.612 20.026 20.341 20.584 20.628 19.981 18.528 17.065 15.717 14.471 13.33 12.348 11.445 10.634 9.735 8.949 8.265 7.579 6.935 6.311 5.711 5.073 4.49 3.965 3.408 2.826 2.317 1.793 1.253 0.823 0.4 -0.015 -0.476 -0.958 -1.27 -1.598 -2.149 -2.544 -2.939 -3.146 -3.597 -4.062 -4.543 -4.795 -5.432 -5.634 -5.963 -6.322 -7.071 -7.481 -7.925 -8.449 -9.063 -9.814 -10.826 -13.056 -9 ,24366 ,KEBNE ,17027358,Wed Dec 22 16:57:30 CET,Wed Dec 22 18:31:29 CET,0.0 2.652 3.511 4.091 4.604 5.05 5.459 5.829 6.476 6.766 7.033 7.208 7.799 8.027 8.468 8.889 9.274 9.448 9.798 10.12 10.562 10.866 11.146 11.522 11.884 12.221 12.529 12.832 13.258 13.663 14.033 14.453 14.851 15.225 15.611 16.01 16.374 16.763 17.164 17.578 18.005 18.462 18.968 19.426 19.845 20.273 20.741 21.104 21.317 21.241 20.458 18.977 17.527 16.171 14.95 13.835 12.818 11.898 11.051 10.152 9.372 8.66 7.951 7.256 6.627 6.086 5.492 4.922 4.424 3.92 3.378 2.9 2.412 1.937 1.574 1.162 0.712 0.237 -0.255 -0.599 -0.952 -1.485 -1.884 -2.325 -2.539 -2.963 -3.414 -3.906 -4.174 -4.812 -4.995 -5.291 -5.609 -6.314 -6.699 -7.113 -7.622 -8.22 -8.889 -9.729 -12.361 -10 ,10041 ,KEBNE ,17027359,Wed Dec 22 16:57:31 CET,Wed Dec 22 18:29:44 CET,0.0 1.85 2.579 3.137 3.627 4.098 4.502 4.851 5.515 5.812 6.078 6.215 6.797 7.035 7.494 7.929 8.328 8.52 8.883 9.22 9.726 10.042 10.331 10.741 11.112 11.438 11.772 12.118 12.531 12.912 13.283 13.704 14.088 14.444 14.824 15.235 15.615 15.992 16.372 16.749 17.164 17.652 18.146 18.598 19.051 19.456 19.883 20.223 20.431 20.339 19.511 18.116 16.66 15.267 14.068 12.962 11.898 10.844 9.974 9.146 8.42 7.732 7.027 6.357 5.755 5.188 4.574 4.019 3.515 2.968 2.4 1.936 1.428 0.924 0.568 0.166 -0.295 -0.783 -1.277 -1.619 -1.978 -2.532 -2.924 -3.341 -3.543 -3.963 -4.427 -4.908 -5.159 -5.786 -5.996 -6.306 -6.626 -7.338 -7.732 -8.177 -8.686 -9.254 -9.922 -10.778 -13.027 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt deleted file mode 100644 index 5fae3ad1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30987 ,TETRA ,17605308,Sun Nov 28 18:52:48 CET,Sun Nov 28 20:43:29 CET,0.0 1.511 2.544 3.361 3.955 4.428 4.865 5.25 5.896 6.172 6.426 6.574 7.143 7.359 7.789 8.178 8.532 8.713 9.061 9.379 9.817 10.088 10.345 10.702 11.032 11.355 11.677 11.989 12.375 12.741 13.105 13.513 13.897 14.252 14.623 15.026 15.394 15.788 16.217 16.657 17.116 17.594 18.084 18.573 19.125 19.663 20.23 20.778 21.275 21.74 21.899 21.546 20.926 20.224 19.534 18.883 18.287 17.692 17.142 16.579 16.071 15.591 15.119 14.638 14.137 13.642 13.139 12.702 12.332 11.924 11.494 11.105 10.689 10.297 9.962 9.576 9.139 8.689 8.238 7.924 7.6 7.09 6.73 6.345 6.147 5.777 5.392 4.966 4.749 4.156 3.948 3.667 3.373 2.7 2.321 1.896 1.41 0.876 0.218 -0.724 -4.338 -2 ,18974 ,TETRA ,17605309,Sun Nov 28 18:52:48 CET,Sun Nov 28 20:42:07 CET,0.0 1.936 2.683 3.257 3.726 4.135 4.543 4.929 5.565 5.838 6.108 6.25 6.823 7.043 7.469 7.858 8.216 8.395 8.74 9.053 9.498 9.773 10.047 10.448 10.823 11.17 11.491 11.777 12.153 12.536 12.862 13.221 13.584 13.939 14.303 14.673 15.052 15.464 15.875 16.287 16.697 17.155 17.664 18.146 18.682 19.227 19.782 20.327 20.871 21.323 21.449 21.112 20.604 19.994 19.328 18.612 17.922 17.224 16.587 15.995 15.488 14.953 14.449 13.998 13.532 13.091 12.628 12.207 11.822 11.381 10.889 10.478 10.076 9.648 9.283 8.925 8.536 8.093 7.648 7.328 7.013 6.544 6.2 5.834 5.641 5.249 4.848 4.417 4.184 3.598 3.412 3.115 2.808 2.123 1.725 1.283 0.813 0.286 -0.379 -1.257 -3.417 -3 ,23346 ,TETRA ,17605310,Sun Nov 28 18:52:50 CET,Sun Nov 28 20:43:28 CET,0.0 1.6 2.423 3.032 3.513 3.944 4.339 4.691 5.333 5.636 5.924 6.087 6.652 6.862 7.281 7.667 8.027 8.199 8.521 8.831 9.284 9.593 9.885 10.246 10.572 10.898 11.223 11.531 11.916 12.283 12.637 13.038 13.424 13.808 14.227 14.683 15.113 15.536 15.97 16.425 16.901 17.437 18.044 18.587 19.157 19.741 20.297 20.82 21.325 21.768 21.931 21.565 20.919 20.171 19.452 18.766 18.149 17.543 16.997 16.422 15.866 15.324 14.782 14.292 13.844 13.412 12.935 12.518 12.176 11.782 11.324 10.967 10.613 10.2 9.874 9.559 9.192 8.777 8.355 8.066 7.763 7.272 6.925 6.552 6.355 5.96 5.532 5.067 4.821 4.22 4.047 3.76 3.459 2.781 2.407 2.003 1.562 1.058 0.434 -0.428 -3.1 -4 ,21766 ,TETRA ,17605311,Sun Nov 28 18:52:49 CET,Sun Nov 28 20:42:30 CET,0.0 1.582 2.314 2.856 3.341 3.773 4.173 4.543 5.13 5.392 5.652 5.789 6.362 6.582 7.012 7.41 7.764 7.945 8.312 8.65 9.123 9.417 9.697 10.094 10.456 10.798 11.13 11.432 11.809 12.156 12.472 12.867 13.242 13.595 13.979 14.382 14.766 15.177 15.563 15.955 16.387 16.856 17.367 17.844 18.362 18.886 19.412 19.939 20.45 20.817 20.928 20.578 19.983 19.288 18.608 17.972 17.318 16.595 15.95 15.313 14.739 14.22 13.71 13.179 12.668 12.195 11.681 11.197 10.781 10.391 9.985 9.611 9.2 8.778 8.43 8.07 7.702 7.291 6.86 6.57 6.253 5.755 5.409 5.044 4.847 4.422 3.994 3.54 3.292 2.683 2.494 2.196 1.872 1.174 0.794 0.363 -0.088 -0.604 -1.223 -1.99 -4.761 -5 ,10263 ,TETRA ,17605312,Sun Nov 28 18:52:49 CET,Sun Nov 28 20:42:40 CET,0.0 2.237 3.011 3.639 4.16 4.584 4.944 5.301 5.962 6.247 6.515 6.658 7.229 7.448 7.84 8.226 8.617 8.807 9.157 9.485 9.954 10.234 10.507 10.914 11.28 11.617 11.915 12.181 12.539 12.89 13.222 13.604 13.942 14.269 14.674 15.118 15.513 15.924 16.364 16.833 17.273 17.716 18.219 18.725 19.292 19.846 20.406 20.982 21.523 22.003 22.198 21.822 21.216 20.558 19.895 19.267 18.68 18.099 17.554 16.961 16.432 15.932 15.433 14.959 14.509 14.067 13.594 13.144 12.737 12.303 11.839 11.461 11.055 10.614 10.258 9.886 9.487 9.065 8.624 8.323 8.02 7.534 7.2 6.862 6.682 6.298 5.88 5.415 5.159 4.55 4.38 4.092 3.784 3.156 2.791 2.39 1.968 1.474 0.79 -0.12 -2.382 -6 ,6411 ,TETRA ,17605313,Sun Nov 28 18:52:49 CET,Sun Nov 28 20:43:24 CET,0.0 2.269 3.001 3.58 4.049 4.419 4.752 5.1 5.761 6.062 6.328 6.445 7.018 7.235 7.633 8.013 8.393 8.582 8.937 9.255 9.685 9.983 10.293 10.686 11.02 11.343 11.653 11.947 12.313 12.668 13.015 13.383 13.706 14.026 14.419 14.848 15.223 15.609 16.01 16.406 16.804 17.256 17.785 18.274 18.778 19.301 19.865 20.44 20.961 21.392 21.567 21.204 20.626 19.945 19.203 18.496 17.869 17.236 16.643 16.031 15.476 14.968 14.476 13.989 13.516 13.079 12.588 12.111 11.676 11.244 10.806 10.395 9.948 9.501 9.133 8.747 8.38 8.006 7.59 7.301 6.992 6.484 6.127 5.74 5.531 5.104 4.645 4.114 3.836 3.2 2.946 2.62 2.281 1.513 1.074 0.605 0.071 -0.561 -1.322 -2.314 -5.275 -7 ,28807 ,TETRA ,17605314,Sun Nov 28 18:52:50 CET,Sun Nov 28 20:43:34 CET,0.0 2.558 3.461 4.002 4.464 4.851 5.203 5.538 6.103 6.357 6.609 6.731 7.287 7.495 7.921 8.306 8.649 8.819 9.162 9.496 9.965 10.251 10.529 10.919 11.274 11.624 11.954 12.263 12.663 13.024 13.385 13.837 14.213 14.558 14.967 15.442 15.899 16.332 16.747 17.163 17.564 17.996 18.499 19.005 19.567 20.151 20.765 21.321 21.872 22.361 22.537 22.17 21.543 20.873 20.147 19.385 18.725 18.129 17.58 17.031 16.547 16.092 15.637 15.157 14.679 14.236 13.766 13.328 12.952 12.553 12.122 11.759 11.359 10.891 10.523 10.164 9.781 9.369 8.927 8.625 8.313 7.808 7.439 7.047 6.848 6.422 5.967 5.486 5.237 4.638 4.452 4.164 3.877 3.229 2.83 2.402 1.937 1.404 0.776 -0.08 -1.906 -8 ,5255 ,TETRA ,17605315,Sun Nov 28 18:52:51 CET,Sun Nov 28 20:43:33 CET,0.0 2.055 2.765 3.377 3.914 4.361 4.744 5.085 5.739 6.034 6.305 6.445 7.028 7.26 7.675 8.047 8.416 8.588 8.923 9.244 9.687 9.975 10.25 10.637 10.989 11.325 11.65 11.964 12.357 12.736 13.08 13.446 13.821 14.178 14.575 15.026 15.412 15.818 16.247 16.702 17.16 17.622 18.128 18.59 19.108 19.671 20.218 20.757 21.278 21.705 21.887 21.597 21.066 20.415 19.759 19.104 18.472 17.838 17.256 16.646 16.133 15.665 15.182 14.726 14.293 13.835 13.336 12.898 12.49 12.061 11.602 11.196 10.753 10.301 9.964 9.606 9.205 8.783 8.374 8.09 7.797 7.328 6.986 6.63 6.442 6.05 5.624 5.145 4.884 4.273 4.081 3.771 3.448 2.731 2.313 1.836 1.297 0.742 0.142 -0.794 -5.041 -9 ,29804 ,TETRA ,17605316,Sun Nov 28 18:52:50 CET,Sun Nov 28 20:43:17 CET,0.0 2.55 3.231 3.769 4.253 4.678 5.041 5.388 6.026 6.309 6.57 6.668 7.21 7.403 7.782 8.154 8.503 8.668 8.966 9.256 9.668 9.931 10.173 10.524 10.87 11.183 11.476 11.76 12.134 12.484 12.794 13.176 13.538 13.846 14.207 14.648 15.045 15.456 15.885 16.299 16.696 17.124 17.644 18.142 18.654 19.192 19.748 20.324 20.912 21.362 21.548 21.238 20.658 20.014 19.378 18.71 18.016 17.354 16.767 16.139 15.591 15.094 14.582 14.063 13.578 13.151 12.665 12.216 11.82 11.374 10.916 10.529 10.115 9.685 9.338 8.954 8.547 8.148 7.741 7.452 7.126 6.612 6.258 5.878 5.687 5.286 4.846 4.339 4.077 3.468 3.291 3.016 2.706 1.995 1.606 1.164 0.666 0.09 -0.589 -1.442 -3.27 -10 ,31042 ,TETRA ,17605317,Sun Nov 28 18:52:50 CET,Sun Nov 28 20:42:31 CET,0.0 2.302 3.115 3.716 4.202 4.608 4.951 5.29 5.894 6.158 6.434 6.577 7.128 7.334 7.741 8.149 8.554 8.733 9.065 9.379 9.829 10.105 10.37 10.761 11.133 11.523 11.889 12.212 12.621 12.993 13.343 13.737 14.087 14.452 14.868 15.342 15.788 16.194 16.556 16.939 17.352 17.789 18.286 18.78 19.326 19.921 20.549 21.152 21.722 22.207 22.454 22.083 21.483 20.849 20.181 19.529 18.93 18.336 17.739 17.118 16.58 16.107 15.618 15.112 14.638 14.201 13.716 13.225 12.808 12.373 11.934 11.574 11.151 10.677 10.304 9.924 9.554 9.179 8.755 8.453 8.143 7.618 7.232 6.857 6.667 6.246 5.793 5.313 5.081 4.505 4.313 4.031 3.726 3.052 2.679 2.262 1.756 1.194 0.59 -0.177 -1.906 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23474.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23474.txt deleted file mode 100644 index 60d6dd99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23474.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26881 ,TETRA ,17605318,Sun Nov 28 18:52:52 CET,Sun Nov 28 20:43:55 CET,0.0 2.535 3.351 4.015 4.549 4.997 5.401 5.771 6.45 6.761 7.061 7.284 7.905 8.154 8.604 9.031 9.439 9.631 9.991 10.33 10.813 11.144 11.455 11.887 12.32 12.748 13.13 13.47 13.904 14.289 14.652 15.068 15.473 15.893 16.352 16.844 17.32 17.846 18.393 18.924 19.446 20.01 20.628 21.286 22.079 22.877 23.723 24.572 25.491 26.442 27.289 27.619 27.485 27.137 26.689 26.162 25.64 25.135 24.654 24.149 23.681 23.235 22.811 22.377 21.953 21.504 20.993 20.577 20.211 19.805 19.355 18.955 18.5 18.022 17.663 17.287 16.899 16.488 16.052 15.754 15.463 15.036 14.721 14.374 14.184 13.775 13.342 12.838 12.575 11.981 11.777 11.49 11.176 10.458 10.085 9.659 9.142 8.562 7.808 6.703 3.484 -2 ,18155 ,TETRA ,17605319,Sun Nov 28 18:52:50 CET,Sun Nov 28 20:44:13 CET,0.0 3.008 3.914 4.6 5.157 5.672 6.119 6.495 7.155 7.466 7.773 7.954 8.545 8.779 9.242 9.697 10.102 10.274 10.594 10.913 11.397 11.717 12.032 12.466 12.866 13.263 13.632 13.976 14.427 14.839 15.246 15.734 16.2 16.641 17.078 17.561 18.064 18.583 19.109 19.658 20.191 20.768 21.413 22.037 22.71 23.433 24.246 25.128 26.068 27.03 27.863 28.08 27.862 27.474 27.021 26.509 26.002 25.509 25.029 24.538 24.079 23.61 23.141 22.624 22.125 21.62 21.108 20.685 20.287 19.894 19.491 19.15 18.788 18.382 18.047 17.695 17.297 16.843 16.372 16.054 15.721 15.166 14.757 14.343 14.141 13.737 13.327 12.861 12.6 12.002 11.806 11.505 11.197 10.559 10.178 9.721 9.246 8.716 8.048 7.209 3.715 -3 ,5093 ,TETRA ,17605320,Sun Nov 28 18:52:53 CET,Sun Nov 28 20:44:09 CET,0.0 2.457 3.372 4.02 4.557 5.036 5.46 5.841 6.509 6.823 7.124 7.322 7.912 8.144 8.591 9.005 9.401 9.604 10.004 10.38 10.909 11.258 11.599 12.068 12.514 12.923 13.285 13.644 14.129 14.586 14.994 15.463 15.913 16.334 16.792 17.297 17.807 18.354 18.956 19.609 20.21 20.764 21.426 22.089 22.784 23.55 24.371 25.208 26.094 26.961 27.674 27.841 27.598 27.218 26.746 26.233 25.707 25.195 24.675 24.073 23.557 23.096 22.626 22.165 21.698 21.239 20.757 20.307 19.909 19.465 18.976 18.577 18.186 17.76 17.418 17.063 16.665 16.258 15.849 15.567 15.26 14.771 14.446 14.097 13.904 13.485 13.044 12.57 12.318 11.715 11.505 11.209 10.884 10.167 9.776 9.327 8.797 8.206 7.479 6.541 3.809 -4 ,19390 ,TETRA ,17605321,Sun Nov 28 18:52:55 CET,Sun Nov 28 20:44:10 CET,0.0 2.59 3.44 4.072 4.59 5.059 5.478 5.838 6.474 6.764 7.042 7.215 7.81 8.053 8.534 8.99 9.387 9.573 9.955 10.317 10.833 11.164 11.474 11.907 12.318 12.735 13.136 13.489 13.906 14.283 14.636 15.066 15.496 15.902 16.37 16.881 17.353 17.822 18.292 18.843 19.42 20.008 20.681 21.314 22.044 22.868 23.726 24.584 25.492 26.44 27.329 27.604 27.375 26.934 26.408 25.851 25.295 24.756 24.252 23.695 23.222 22.811 22.387 21.956 21.542 21.155 20.73 20.313 19.927 19.502 19.038 18.664 18.285 17.887 17.581 17.247 16.89 16.527 16.145 15.874 15.593 15.137 14.794 14.42 14.221 13.792 13.338 12.854 12.595 11.987 11.808 11.523 11.198 10.445 10.001 9.516 9.005 8.406 7.626 6.643 3.96 -5 ,25731 ,TETRA ,17605322,Sun Nov 28 18:52:50 CET,Sun Nov 28 20:44:12 CET,0.0 2.182 2.998 3.61 4.107 4.564 5.002 5.396 6.07 6.388 6.669 6.812 7.402 7.632 8.079 8.494 8.904 9.114 9.51 9.886 10.413 10.726 11.027 11.451 11.83 12.219 12.605 12.946 13.409 13.899 14.339 14.782 15.204 15.648 16.137 16.683 17.193 17.724 18.292 18.862 19.436 20.063 20.727 21.332 22.008 22.719 23.521 24.36 25.193 26.029 26.81 27.041 26.837 26.425 25.964 25.466 24.952 24.425 23.928 23.431 22.976 22.508 22.021 21.589 21.156 20.697 20.195 19.759 19.396 19.012 18.606 18.247 17.849 17.409 17.05 16.675 16.304 15.942 15.519 15.213 14.913 14.423 14.071 13.713 13.522 13.1 12.662 12.232 12.002 11.395 11.117 10.806 10.497 9.796 9.415 9.005 8.535 7.997 7.367 6.493 4.375 -6 ,27393 ,TETRA ,17605323,Sun Nov 28 18:52:51 CET,Sun Nov 28 20:44:02 CET,0.0 2.591 3.543 4.209 4.777 5.257 5.656 6.034 6.762 7.097 7.396 7.58 8.178 8.432 8.905 9.347 9.775 9.965 10.293 10.605 11.083 11.413 11.73 12.168 12.6 12.989 13.348 13.712 14.151 14.568 14.995 15.519 15.997 16.39 16.804 17.312 17.81 18.329 18.86 19.376 19.917 20.529 21.207 21.846 22.536 23.302 24.161 25.006 25.843 26.712 27.519 27.724 27.517 27.146 26.695 26.171 25.646 25.066 24.463 23.833 23.287 22.793 22.295 21.822 21.403 21.002 20.578 20.163 19.765 19.375 18.955 18.582 18.183 17.741 17.391 17.035 16.657 16.251 15.844 15.552 15.246 14.77 14.434 14.066 13.876 13.49 13.056 12.575 12.329 11.739 11.509 11.198 10.884 10.236 9.881 9.467 8.959 8.373 7.679 6.751 4.012 -7 ,10583 ,TETRA ,17605324,Sun Nov 28 18:52:51 CET,Sun Nov 28 20:43:55 CET,0.0 1.998 2.895 3.557 4.122 4.592 4.999 5.388 6.154 6.508 6.824 7.031 7.633 7.863 8.293 8.701 9.09 9.277 9.639 9.998 10.507 10.83 11.145 11.568 11.937 12.292 12.651 12.997 13.439 13.87 14.284 14.741 15.193 15.671 16.171 16.678 17.165 17.696 18.26 18.862 19.44 20.037 20.71 21.347 22.053 22.803 23.624 24.478 25.403 26.337 27.195 27.464 27.228 26.795 26.334 25.882 25.419 24.915 24.441 23.926 23.443 23.017 22.598 22.188 21.794 21.414 20.982 20.554 20.168 19.77 19.32 18.938 18.561 18.14 17.81 17.474 17.116 16.715 16.254 15.931 15.611 15.089 14.733 14.395 14.208 13.792 13.354 12.912 12.683 12.111 11.942 11.657 11.36 10.725 10.35 9.927 9.424 8.84 8.125 7.028 2.594 -8 ,26908 ,TETRA ,17605325,Sun Nov 28 18:52:54 CET,Sun Nov 28 20:43:31 CET,0.0 2.491 3.43 4.076 4.599 5.074 5.47 5.82 6.484 6.804 7.109 7.299 7.889 8.121 8.582 9.016 9.414 9.595 9.939 10.275 10.767 11.079 11.384 11.831 12.231 12.605 12.954 13.28 13.723 14.115 14.473 14.932 15.333 15.704 16.137 16.614 17.064 17.528 18.061 18.649 19.198 19.806 20.524 21.189 21.927 22.706 23.559 24.444 25.401 26.326 27.018 27.23 26.973 26.539 26.024 25.446 24.897 24.368 23.868 23.323 22.848 22.393 21.936 21.462 20.97 20.495 20.012 19.581 19.19 18.777 18.298 17.878 17.449 17.02 16.69 16.341 15.972 15.581 15.147 14.82 14.493 14.007 13.667 13.311 13.129 12.732 12.301 11.858 11.622 11.029 10.781 10.471 10.162 9.473 9.084 8.645 8.15 7.561 6.831 5.892 1.633 -9 ,30749 ,TETRA ,17605326,Sun Nov 28 18:52:51 CET,Sun Nov 28 20:35:34 CET,0.0 2.469 3.316 3.993 4.533 5.011 5.485 5.918 6.626 6.95 7.259 7.445 8.032 8.275 8.727 9.141 9.547 9.736 10.094 10.464 10.969 11.264 11.565 12.01 12.441 12.843 13.193 13.53 13.963 14.376 14.786 15.267 15.718 16.174 16.677 17.228 17.771 18.328 18.898 19.487 20.08 20.687 21.382 22.038 22.75 23.501 24.324 25.245 26.233 27.171 28.078 28.438 28.308 27.967 27.51 27.001 26.486 25.961 25.495 25.041 24.585 24.151 23.726 23.256 22.781 22.361 21.894 21.423 21.06 20.671 20.233 19.902 19.508 19.031 18.648 18.243 17.852 17.494 17.12 16.829 16.524 16.063 15.691 15.274 15.06 14.644 14.214 13.762 13.543 12.964 12.754 12.426 12.069 11.321 10.948 10.56 10.094 9.528 8.85 7.984 5.043 -10 ,29406 ,TETRA ,17605327,Sun Nov 28 18:52:54 CET,Sun Nov 28 20:43:55 CET,0.0 2.06 2.968 3.718 4.29 4.804 5.239 5.613 6.333 6.67 6.988 7.194 7.803 8.055 8.511 8.935 9.335 9.526 9.896 10.244 10.733 11.053 11.383 11.853 12.261 12.639 13.007 13.353 13.81 14.248 14.641 15.112 15.609 16.064 16.518 17.031 17.488 17.975 18.516 19.042 19.598 20.195 20.833 21.483 22.213 22.944 23.738 24.628 25.583 26.507 27.323 27.623 27.432 27.037 26.539 25.989 25.432 24.905 24.424 23.906 23.406 22.91 22.402 21.903 21.441 21.011 20.55 20.129 19.738 19.295 18.839 18.498 18.16 17.714 17.344 16.983 16.594 16.197 15.768 15.46 15.143 14.644 14.286 13.903 13.709 13.333 12.907 12.42 12.173 11.585 11.4 11.111 10.804 10.097 9.707 9.273 8.808 8.317 7.665 6.763 4.792 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23475.txt deleted file mode 100644 index e97cc242..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29267 ,TETRA ,17605328,Sun Nov 28 18:52:52 CET,Sun Nov 28 20:42:29 CET,0.0 1.675 2.361 2.932 3.468 3.914 4.272 4.593 5.229 5.532 5.812 5.997 6.573 6.789 7.208 7.602 7.975 8.153 8.48 8.798 9.246 9.522 9.777 10.144 10.52 10.862 11.156 11.428 11.791 12.157 12.464 12.846 13.215 13.58 14.025 14.45 14.846 15.25 15.659 16.121 16.672 17.25 17.774 18.223 18.714 19.252 19.822 20.377 20.924 21.382 21.534 21.156 20.572 19.918 19.218 18.458 17.729 17.028 16.394 15.758 15.169 14.603 14.071 13.538 12.992 12.5 12.022 11.593 11.2 10.769 10.311 9.915 9.498 9.076 8.738 8.366 7.976 7.575 7.158 6.885 6.565 5.99 5.604 5.207 4.996 4.528 4.026 3.5 3.237 2.625 2.403 2.099 1.791 1.098 0.682 0.237 -0.235 -0.791 -1.486 -2.393 -5.121 -2 ,28280 ,TETRA ,17605329,Sun Nov 28 18:53:46 CET,Sun Nov 28 20:44:03 CET,0.0 1.627 2.446 3.071 3.563 3.944 4.275 4.598 5.211 5.495 5.752 5.873 6.453 6.673 7.075 7.459 7.817 7.988 8.313 8.617 9.046 9.343 9.636 10.017 10.355 10.686 10.986 11.263 11.66 12.054 12.425 12.844 13.227 13.601 14.015 14.428 14.804 15.234 15.681 16.127 16.552 16.998 17.514 18.002 18.541 19.101 19.691 20.29 20.853 21.306 21.49 21.183 20.64 19.991 19.346 18.676 18.035 17.45 16.916 16.317 15.718 15.168 14.662 14.18 13.705 13.267 12.794 12.32 11.905 11.476 11.021 10.654 10.249 9.827 9.52 9.18 8.793 8.379 7.958 7.663 7.355 6.876 6.529 6.156 5.971 5.559 5.091 4.589 4.306 3.676 3.474 3.183 2.847 2.075 1.65 1.212 0.736 0.183 -0.435 -1.285 -4.052 -3 ,3752 ,TETRA ,17605330,Sun Nov 28 18:53:46 CET,Sun Nov 28 20:43:32 CET,0.0 1.874 2.651 3.196 3.671 4.111 4.494 4.862 5.495 5.774 6.037 6.162 6.719 6.939 7.368 7.752 8.109 8.276 8.587 8.881 9.337 9.64 9.907 10.239 10.545 10.866 11.165 11.463 11.865 12.214 12.551 12.999 13.397 13.754 14.162 14.584 14.971 15.397 15.898 16.39 16.828 17.28 17.803 18.324 18.885 19.493 20.125 20.747 21.26 21.616 21.732 21.272 20.576 19.875 19.184 18.486 17.791 17.16 16.598 15.998 15.464 14.955 14.46 13.944 13.429 12.962 12.448 11.967 11.528 11.025 10.491 10.086 9.686 9.246 8.891 8.515 8.111 7.702 7.272 6.954 6.635 6.143 5.789 5.413 5.22 4.788 4.312 3.805 3.538 2.919 2.685 2.372 2.016 1.222 0.739 0.187 -0.438 -1.142 -1.895 -2.85 -5.71 -4 ,11811 ,TETRA ,17605331,Sun Nov 28 18:53:47 CET,Sun Nov 28 20:38:30 CET,0.0 1.579 2.341 2.919 3.402 3.846 4.245 4.612 5.28 5.569 5.823 5.935 6.505 6.723 7.145 7.557 7.927 8.087 8.404 8.7 9.126 9.397 9.641 9.987 10.314 10.653 11.017 11.345 11.739 12.11 12.467 12.896 13.321 13.708 14.097 14.518 14.909 15.321 15.761 16.207 16.629 17.082 17.607 18.101 18.604 19.15 19.765 20.394 20.969 21.378 21.486 21.106 20.52 19.832 19.149 18.499 17.814 17.119 16.503 15.883 15.322 14.797 14.294 13.81 13.337 12.891 12.387 11.915 11.515 11.049 10.515 10.103 9.677 9.201 8.817 8.387 7.98 7.595 7.169 6.863 6.529 5.986 5.621 5.24 5.034 4.619 4.167 3.613 3.304 2.644 2.348 2.004 1.63 0.772 0.292 -0.212 -0.785 -1.459 -2.265 -3.253 -5.936 -5 ,19336 ,TETRA ,17605332,Sun Nov 28 18:53:46 CET,Sun Nov 28 20:43:33 CET,0.0 2.061 2.814 3.369 3.81 4.244 4.634 4.951 5.533 5.811 6.065 6.166 6.746 6.979 7.407 7.812 8.185 8.355 8.681 8.981 9.394 9.673 9.958 10.346 10.688 11.022 11.343 11.655 12.069 12.451 12.814 13.227 13.582 13.91 14.296 14.706 15.081 15.52 15.965 16.392 16.826 17.295 17.836 18.351 18.893 19.427 20.01 20.624 21.156 21.533 21.714 21.46 20.88 20.203 19.529 18.825 18.137 17.449 16.858 16.253 15.701 15.215 14.724 14.225 13.692 13.203 12.736 12.293 11.889 11.475 11.048 10.682 10.263 9.814 9.441 9.056 8.688 8.318 7.94 7.656 7.344 6.819 6.434 6.052 5.855 5.43 4.958 4.46 4.21 3.586 3.354 3.039 2.683 1.881 1.448 1.004 0.52 -0.039 -0.697 -1.541 -3.22 -6 ,21453 ,TETRA ,17605333,Sun Nov 28 18:53:47 CET,Sun Nov 28 20:41:24 CET,0.0 2.591 3.383 3.934 4.381 4.763 5.11 5.432 6.006 6.277 6.543 6.661 7.231 7.447 7.853 8.224 8.559 8.722 9.041 9.352 9.786 10.054 10.316 10.677 11.016 11.359 11.717 12.046 12.455 12.84 13.195 13.603 13.99 14.359 14.744 15.148 15.537 15.96 16.376 16.792 17.222 17.685 18.18 18.674 19.233 19.78 20.318 20.824 21.332 21.753 21.93 21.601 20.951 20.244 19.604 18.979 18.359 17.723 17.125 16.499 15.939 15.419 14.914 14.428 13.96 13.501 12.983 12.533 12.157 11.75 11.323 10.944 10.504 10.023 9.644 9.261 8.884 8.465 7.994 7.668 7.33 6.825 6.466 6.068 5.867 5.47 5.044 4.585 4.333 3.708 3.488 3.186 2.853 2.089 1.661 1.214 0.705 0.111 -0.595 -1.542 -4.829 -7 ,2571 ,TETRA ,17605334,Sun Nov 28 18:53:46 CET,Sun Nov 28 20:43:32 CET,0.0 1.527 2.296 2.831 3.295 3.724 4.09 4.416 5.032 5.319 5.586 5.733 6.3 6.506 6.896 7.285 7.7 7.892 8.226 8.534 8.963 9.228 9.485 9.859 10.227 10.591 10.92 11.219 11.568 11.899 12.208 12.556 12.892 13.22 13.614 14.018 14.373 14.771 15.214 15.664 16.115 16.579 17.096 17.575 18.106 18.663 19.19 19.725 20.284 20.781 21.02 20.64 20.001 19.35 18.68 17.999 17.384 16.795 16.252 15.665 15.126 14.626 14.13 13.649 13.2 12.779 12.287 11.784 11.3 10.777 10.219 9.759 9.278 8.771 8.359 7.91 7.449 6.95 6.418 6.054 5.667 5.103 4.702 4.25 4.016 3.523 3.001 2.447 2.153 1.499 1.205 0.855 0.48 -0.365 -0.837 -1.34 -1.901 -2.541 -3.349 -4.519 -8.619 -8 ,4713 ,TETRA ,17605335,Sun Nov 28 18:53:46 CET,Sun Nov 28 20:44:03 CET,0.0 2.06 2.841 3.357 3.846 4.295 4.678 5.03 5.62 5.88 6.133 6.297 6.878 7.087 7.464 7.812 8.154 8.323 8.677 9.021 9.483 9.76 10.027 10.422 10.78 11.137 11.475 11.768 12.128 12.451 12.754 13.158 13.538 13.853 14.211 14.633 15.027 15.443 15.875 16.281 16.68 17.164 17.716 18.182 18.689 19.196 19.725 20.253 20.784 21.226 21.384 21.08 20.496 19.799 19.115 18.435 17.798 17.182 16.61 16.002 15.465 14.942 14.407 13.916 13.445 12.982 12.492 12.043 11.645 11.216 10.754 10.343 9.866 9.372 8.998 8.62 8.228 7.81 7.396 7.102 6.785 6.306 5.959 5.569 5.358 4.906 4.45 3.996 3.745 3.129 2.89 2.573 2.23 1.452 1.049 0.601 0.06 -0.55 -1.303 -2.352 -4.924 -9 ,15420 ,TETRA ,17605336,Sun Nov 28 18:53:47 CET,Sun Nov 28 20:44:04 CET,0.0 2.081 2.964 3.589 4.071 4.496 4.869 5.202 5.818 6.095 6.352 6.466 7.035 7.242 7.633 8.003 8.361 8.534 8.876 9.218 9.667 9.959 10.248 10.633 10.969 11.26 11.541 11.821 12.182 12.549 12.915 13.341 13.731 14.098 14.497 14.887 15.254 15.655 16.05 16.455 16.876 17.327 17.832 18.303 18.849 19.421 19.976 20.536 21.048 21.464 21.621 21.237 20.662 20.05 19.383 18.725 18.111 17.483 16.896 16.299 15.733 15.216 14.684 14.156 13.66 13.198 12.725 12.304 11.923 11.504 11.039 10.64 10.216 9.737 9.34 8.921 8.506 8.091 7.657 7.343 7.012 6.475 6.095 5.699 5.486 5.047 4.608 4.155 3.917 3.302 3.035 2.709 2.372 1.664 1.254 0.813 0.348 -0.229 -0.943 -1.948 -5.664 -10 ,9427 ,TETRA ,17605337,Sun Nov 28 18:53:49 CET,Sun Nov 28 20:43:21 CET,0.0 2.013 2.714 3.293 3.759 4.172 4.542 4.875 5.458 5.718 5.974 6.098 6.681 6.903 7.289 7.647 7.997 8.168 8.485 8.787 9.198 9.461 9.74 10.151 10.511 10.83 11.139 11.448 11.835 12.194 12.548 12.982 13.364 13.693 14.07 14.469 14.861 15.253 15.632 16.067 16.545 17.053 17.566 18.024 18.529 19.092 19.671 20.234 20.832 21.31 21.473 21.12 20.493 19.777 19.097 18.423 17.762 17.14 16.553 15.943 15.431 14.945 14.413 13.908 13.415 12.952 12.475 12.0 11.562 11.11 10.678 10.314 9.89 9.434 9.063 8.658 8.238 7.785 7.334 7.051 6.736 6.219 5.855 5.489 5.3 4.88 4.427 3.949 3.697 3.096 2.909 2.614 2.304 1.6 1.194 0.755 0.285 -0.287 -0.955 -1.874 -4.936 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23477.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23477.txt deleted file mode 100644 index 89730e9b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23477.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,583 ,KEBNE ,17070678,Fri Dec 24 22:44:58 CET,Sat Dec 25 00:20:07 CET,0.0 2.145 2.913 3.483 3.974 4.431 4.864 5.24 5.883 6.166 6.439 6.581 7.159 7.38 7.802 8.206 8.595 8.779 9.107 9.418 9.856 10.14 10.404 10.764 11.096 11.414 11.709 11.983 12.363 12.729 13.081 13.541 13.943 14.281 14.704 15.242 15.723 16.109 16.471 16.847 17.208 17.585 17.994 18.387 18.857 19.293 19.637 19.902 20.003 19.844 19.034 17.602 16.101 14.603 13.254 11.996 10.876 9.846 8.897 7.917 7.08 6.341 5.642 4.976 4.285 3.631 2.985 2.397 1.904 1.392 0.817 0.326 -0.178 -0.729 -1.166 -1.576 -1.989 -2.451 -2.974 -3.324 -3.669 -4.266 -4.688 -5.132 -5.373 -5.872 -6.404 -6.971 -7.257 -7.925 -8.204 -8.533 -8.877 -9.638 -10.064 -10.546 -11.079 -11.667 -12.365 -13.272 -15.763 -2 ,16004 ,KEBNE ,17070679,Fri Dec 24 22:44:58 CET,Sat Dec 25 00:20:08 CET,0.0 2.177 2.942 3.6 4.158 4.573 4.934 5.274 5.897 6.176 6.458 6.617 7.181 7.416 7.842 8.238 8.613 8.79 9.111 9.396 9.795 10.081 10.358 10.718 11.084 11.423 11.764 12.109 12.536 12.948 13.323 13.75 14.123 14.43 14.805 15.271 15.683 16.069 16.465 16.87 17.27 17.702 18.166 18.552 18.937 19.305 19.646 19.894 19.966 19.74 18.886 17.437 15.999 14.609 13.334 12.138 11.028 9.99 9.103 8.205 7.382 6.677 5.984 5.305 4.688 4.087 3.451 2.86 2.295 1.722 1.129 0.637 0.133 -0.412 -0.85 -1.285 -1.729 -2.23 -2.76 -3.119 -3.497 -4.11 -4.537 -4.965 -5.181 -5.6 -6.069 -6.607 -6.889 -7.559 -7.836 -8.181 -8.536 -9.328 -9.758 -10.236 -10.767 -11.367 -12.086 -12.969 -15.802 -3 ,20417 ,KEBNE ,17070680,Fri Dec 24 22:46:01 CET,Sat Dec 25 00:22:57 CET,0.0 2.206 3.007 3.605 4.092 4.551 4.939 5.279 5.91 6.224 6.53 6.708 7.283 7.492 7.881 8.24 8.584 8.758 9.098 9.425 9.889 10.183 10.471 10.869 11.231 11.578 11.918 12.233 12.643 13.028 13.373 13.789 14.167 14.496 14.835 15.22 15.601 15.99 16.409 16.835 17.214 17.589 17.998 18.36 18.733 19.055 19.296 19.465 19.452 19.115 18.069 16.413 14.839 13.333 11.974 10.726 9.614 8.612 7.694 6.728 5.898 5.175 4.487 3.753 3.05 2.445 1.787 1.174 0.624 0.027 -0.564 -1.054 -1.578 -2.114 -2.537 -2.99 -3.462 -3.945 -4.43 -4.778 -5.158 -5.765 -6.187 -6.627 -6.85 -7.295 -7.787 -8.311 -8.584 -9.235 -9.496 -9.838 -10.188 -10.942 -11.35 -11.794 -12.278 -12.835 -13.476 -14.342 -17.867 -4 ,30546 ,KEBNE ,17070681,Fri Dec 24 22:47:04 CET,Sat Dec 25 00:21:23 CET,0.0 2.132 2.986 3.574 4.068 4.503 4.882 5.232 5.859 6.134 6.389 6.551 7.127 7.332 7.718 8.069 8.403 8.572 8.892 9.184 9.598 9.839 10.076 10.434 10.776 11.119 11.419 11.691 12.035 12.373 12.7 13.056 13.364 13.638 13.969 14.317 14.636 14.976 15.326 15.702 16.047 16.349 16.624 16.872 17.148 17.407 17.606 17.694 17.669 17.341 16.196 14.259 12.554 11.089 9.755 8.538 7.458 6.454 5.58 4.626 3.772 3.041 2.338 1.661 1.044 0.494 -0.093 -0.674 -1.192 -1.715 -2.323 -2.853 -3.405 -3.984 -4.424 -4.885 -5.366 -5.879 -6.414 -6.775 -7.146 -7.754 -8.178 -8.601 -8.833 -9.358 -9.92 -10.471 -10.751 -11.398 -11.624 -11.964 -12.326 -13.124 -13.579 -14.057 -14.568 -15.176 -15.906 -16.796 -19.663 -5 ,19320 ,KEBNE ,17070682,Fri Dec 24 22:47:05 CET,Sat Dec 25 00:21:43 CET,0.0 2.857 3.686 4.277 4.791 5.227 5.604 5.943 6.507 6.763 7.01 7.121 7.683 7.888 8.28 8.664 9.061 9.242 9.547 9.827 10.243 10.506 10.749 11.101 11.433 11.752 12.052 12.327 12.698 13.045 13.355 13.737 14.127 14.448 14.783 15.167 15.499 15.846 16.188 16.534 16.93 17.342 17.755 18.143 18.481 18.79 19.023 19.108 19.059 18.66 17.552 15.848 14.248 12.831 11.537 10.343 9.223 8.145 7.195 6.243 5.453 4.724 3.983 3.268 2.595 1.979 1.316 0.69 0.146 -0.382 -0.956 -1.449 -1.94 -2.445 -2.836 -3.261 -3.725 -4.217 -4.733 -5.105 -5.498 -6.099 -6.527 -6.984 -7.215 -7.69 -8.205 -8.756 -9.047 -9.704 -9.965 -10.323 -10.703 -11.5 -11.927 -12.391 -12.931 -13.567 -14.329 -15.304 -18.125 -6 ,14293 ,KEBNE ,17070683,Fri Dec 24 22:47:04 CET,Sat Dec 25 00:23:51 CET,0.0 1.988 2.673 3.238 3.732 4.153 4.56 4.932 5.558 5.821 6.079 6.205 6.771 6.982 7.412 7.801 8.14 8.323 8.694 9.032 9.517 9.827 10.116 10.507 10.84 11.135 11.421 11.711 12.056 12.343 12.619 12.926 13.195 13.426 13.702 14.037 14.319 14.593 14.889 15.238 15.58 15.896 16.215 16.478 16.728 16.94 17.105 17.148 16.99 16.527 15.439 13.757 12.125 10.662 9.374 8.135 6.919 5.826 4.95 4.059 3.273 2.57 1.867 1.18 0.551 0.008 -0.596 -1.177 -1.681 -2.229 -2.809 -3.276 -3.771 -4.297 -4.704 -5.133 -5.581 -6.06 -6.598 -6.968 -7.322 -7.885 -8.298 -8.714 -8.924 -9.368 -9.826 -10.335 -10.622 -11.293 -11.58 -11.958 -12.38 -13.26 -13.737 -14.283 -14.884 -15.509 -16.282 -17.331 -20.164 -7 ,32548 ,KEBNE ,17070684,Fri Dec 24 22:47:04 CET,Sat Dec 25 00:22:42 CET,0.0 3.582 4.557 5.253 5.801 6.216 6.594 6.952 7.564 7.836 8.097 8.223 8.799 9.027 9.43 9.778 10.111 10.273 10.609 10.914 11.321 11.594 11.848 12.2 12.533 12.845 13.134 13.411 13.746 14.038 14.286 14.596 14.941 15.257 15.588 15.925 16.207 16.518 16.872 17.258 17.658 18.071 18.475 18.806 19.108 19.427 19.733 19.874 19.846 19.482 18.376 16.645 15.061 13.635 12.365 11.169 10.037 8.974 8.082 7.212 6.44 5.733 5.029 4.326 3.659 3.05 2.369 1.744 1.238 0.693 0.114 -0.365 -0.885 -1.434 -1.865 -2.313 -2.789 -3.285 -3.8 -4.169 -4.55 -5.104 -5.495 -5.917 -6.133 -6.588 -7.079 -7.619 -7.898 -8.549 -8.824 -9.16 -9.496 -10.291 -10.748 -11.23 -11.749 -12.35 -13.073 -14.021 -16.876 -8 ,8168 ,KEBNE ,17070685,Fri Dec 24 22:51:16 CET,Sat Dec 25 00:27:18 CET,0.0 2.422 3.289 3.912 4.431 4.897 5.289 5.628 6.192 6.453 6.705 6.821 7.389 7.593 7.967 8.327 8.688 8.858 9.202 9.562 10.003 10.246 10.502 10.85 11.155 11.474 11.788 12.064 12.389 12.71 13.013 13.392 13.752 14.049 14.374 14.713 15.018 15.36 15.683 16.022 16.393 16.714 17.012 17.295 17.578 17.776 17.938 18.02 17.857 17.335 16.178 14.435 12.727 11.165 9.768 8.498 7.372 6.363 5.502 4.613 3.815 3.082 2.364 1.674 1.018 0.421 -0.209 -0.786 -1.307 -1.868 -2.442 -2.921 -3.423 -3.947 -4.369 -4.828 -5.291 -5.772 -6.284 -6.616 -6.972 -7.567 -7.971 -8.398 -8.625 -9.112 -9.659 -10.27 -10.597 -11.299 -11.673 -12.079 -12.501 -13.435 -13.988 -14.615 -15.285 -16.052 -16.968 -18.152 -21.615 -9 ,23755 ,KEBNE ,17070686,Fri Dec 24 22:52:20 CET,Sat Dec 25 00:26:45 CET,0.0 2.299 3.113 3.699 4.182 4.619 4.983 5.318 5.95 6.23 6.487 6.621 7.196 7.395 7.768 8.138 8.488 8.657 8.988 9.308 9.739 9.978 10.218 10.584 10.946 11.283 11.579 11.878 12.263 12.608 12.935 13.317 13.637 13.907 14.237 14.609 14.938 15.282 15.637 16.001 16.355 16.757 17.212 17.572 17.895 18.182 18.429 18.598 18.578 18.231 17.144 15.467 13.854 12.404 11.125 9.934 8.851 7.829 6.923 5.987 5.154 4.418 3.72 3.025 2.345 1.726 1.057 0.462 -0.061 -0.635 -1.22 -1.723 -2.288 -2.91 -3.389 -3.884 -4.418 -4.937 -5.448 -5.816 -6.187 -6.754 -7.174 -7.611 -7.829 -8.289 -8.778 -9.31 -9.6 -10.279 -10.577 -10.91 -11.248 -12.016 -12.445 -12.939 -13.518 -14.165 -14.899 -15.99 -19.702 -10 ,30529 ,KEBNE ,17070687,Fri Dec 24 22:52:19 CET,Sat Dec 25 00:26:46 CET,0.0 2.107 3.009 3.659 4.179 4.611 4.995 5.343 5.998 6.296 6.546 6.681 7.259 7.469 7.847 8.203 8.534 8.692 8.999 9.284 9.697 9.947 10.177 10.537 10.879 11.182 11.471 11.742 12.061 12.353 12.662 13.046 13.378 13.661 13.954 14.272 14.559 14.852 15.154 15.456 15.749 16.085 16.462 16.767 17.122 17.443 17.661 17.811 17.757 17.409 16.405 14.724 13.112 11.617 10.261 9.019 7.922 6.926 6.052 5.172 4.383 3.617 2.874 2.184 1.516 0.905 0.279 -0.319 -0.844 -1.357 -1.927 -2.443 -2.968 -3.498 -3.914 -4.35 -4.809 -5.303 -5.806 -6.149 -6.519 -7.11 -7.512 -7.917 -8.122 -8.589 -9.109 -9.652 -9.945 -10.614 -10.836 -11.159 -11.495 -12.252 -12.688 -13.158 -13.694 -14.299 -15.008 -15.932 -18.868 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23477_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23477_23475.txt deleted file mode 100644 index 02ead849..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23477_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,162 ,TETRA ,17605338,Sun Nov 28 18:53:48 CET,Sun Nov 28 20:42:36 CET,0.0 2.196 2.99 3.57 4.068 4.506 4.916 5.285 5.912 6.21 6.501 6.694 7.331 7.59 8.078 8.526 8.949 9.152 9.528 9.863 10.335 10.644 10.949 11.394 11.825 12.222 12.582 12.947 13.418 13.827 14.213 14.676 15.122 15.559 16.061 16.596 17.109 17.665 18.257 18.929 19.628 20.362 21.155 21.904 22.787 23.807 24.948 26.16 27.556 29.143 30.889 32.168 32.755 32.977 32.958 32.835 32.643 32.39 32.109 31.747 31.419 31.131 30.819 30.491 30.186 29.891 29.574 29.243 28.923 28.547 28.147 27.85 27.508 27.108 26.812 26.528 26.22 25.886 25.539 25.304 25.05 24.605 24.271 23.949 23.781 23.393 22.983 22.566 22.35 21.773 21.622 21.337 21.031 20.409 20.079 19.683 19.218 18.676 18.025 17.189 15.17 -2 ,6897 ,TETRA ,17605339,Sun Nov 28 18:53:47 CET,Sun Nov 28 20:42:07 CET,0.0 1.994 2.851 3.529 4.074 4.538 4.97 5.354 6.04 6.344 6.629 6.855 7.493 7.746 8.203 8.591 8.977 9.171 9.541 9.88 10.362 10.691 11.018 11.489 11.917 12.293 12.639 12.986 13.456 13.916 14.355 14.853 15.329 15.796 16.325 16.942 17.543 18.165 18.798 19.414 20.071 20.845 21.708 22.544 23.466 24.468 25.577 26.792 28.191 29.74 31.441 32.518 32.845 32.9 32.737 32.466 32.214 31.889 31.557 31.203 30.848 30.539 30.244 29.924 29.584 29.237 28.89 28.549 28.253 27.947 27.59 27.308 26.998 26.634 26.354 26.085 25.793 25.482 25.143 24.898 24.638 24.205 23.874 23.536 23.375 23.028 22.63 22.197 21.977 21.416 21.31 21.034 20.72 20.066 19.71 19.325 18.89 18.394 17.773 16.898 14.835 -3 ,22098 ,TETRA ,17605340,Sun Nov 28 18:53:48 CET,Sun Nov 28 20:42:32 CET,0.0 2.228 3.058 3.691 4.241 4.718 5.15 5.539 6.207 6.508 6.784 6.924 7.549 7.807 8.252 8.651 9.049 9.244 9.649 10.04 10.558 10.9 11.24 11.697 12.14 12.569 12.952 13.302 13.731 14.156 14.591 15.091 15.531 15.982 16.552 17.196 17.755 18.313 18.92 19.551 20.207 20.942 21.777 22.609 23.586 24.6 25.669 26.901 28.378 29.996 31.758 32.984 33.484 33.643 33.598 33.45 33.252 32.926 32.591 32.29 32.006 31.725 31.443 31.143 30.842 30.519 30.143 29.816 29.536 29.259 28.961 28.689 28.392 28.057 27.791 27.508 27.196 26.873 26.511 26.24 25.981 25.588 25.296 24.985 24.813 24.453 24.086 23.692 23.481 22.908 22.793 22.554 22.29 21.65 21.295 20.89 20.404 19.869 19.274 18.526 16.26 -4 ,23235 ,TETRA ,17605341,Sun Nov 28 18:53:50 CET,Sun Nov 28 20:42:33 CET,0.0 2.074 2.809 3.391 3.932 4.396 4.792 5.164 5.827 6.128 6.431 6.612 7.216 7.446 7.925 8.376 8.787 8.976 9.32 9.651 10.163 10.489 10.8 11.245 11.659 12.047 12.416 12.754 13.188 13.641 14.092 14.622 15.114 15.61 16.179 16.778 17.32 17.925 18.581 19.222 19.923 20.695 21.518 22.335 23.261 24.285 25.402 26.589 27.987 29.602 31.337 32.366 32.652 32.722 32.615 32.373 32.096 31.788 31.533 31.277 31.022 30.753 30.44 30.095 29.779 29.517 29.221 28.918 28.626 28.326 28.023 27.752 27.459 27.134 26.862 26.561 26.237 25.926 25.593 25.352 25.104 24.703 24.397 24.062 23.888 23.531 23.165 22.773 22.56 21.999 21.889 21.62 21.329 20.716 20.367 19.964 19.497 18.955 18.335 17.596 15.484 -5 ,20776 ,TETRA ,17605342,Sun Nov 28 18:53:48 CET,Sun Nov 28 20:45:58 CET,0.0 2.33 3.13 3.773 4.334 4.84 5.267 5.664 6.402 6.748 7.07 7.258 7.869 8.117 8.607 9.044 9.471 9.68 10.059 10.409 10.907 11.218 11.5 11.924 12.358 12.775 13.173 13.537 13.978 14.42 14.861 15.38 15.872 16.318 16.811 17.353 17.87 18.459 19.089 19.777 20.484 21.19 22.017 22.847 23.757 24.75 25.914 27.168 28.526 30.106 31.809 32.956 33.433 33.539 33.519 33.373 33.13 32.876 32.607 32.27 31.941 31.656 31.374 31.07 30.754 30.438 30.087 29.775 29.497 29.174 28.835 28.553 28.242 27.871 27.556 27.244 26.924 26.543 26.151 25.899 25.629 25.225 24.919 24.572 24.401 24.041 23.652 23.223 22.995 22.427 22.305 22.049 21.774 21.141 20.772 20.363 19.902 19.318 18.578 17.705 15.566 -6 ,4845 ,TETRA ,17605343,Sun Nov 28 18:53:49 CET,Sun Nov 28 20:42:31 CET,0.0 2.318 3.219 3.902 4.489 5.012 5.475 5.875 6.545 6.844 7.121 7.249 7.853 8.083 8.54 8.981 9.359 9.535 9.902 10.266 10.741 11.03 11.318 11.738 12.158 12.56 12.938 13.304 13.775 14.228 14.671 15.172 15.626 16.073 16.585 17.126 17.638 18.216 18.82 19.449 20.111 20.88 21.749 22.544 23.441 24.465 25.634 26.877 28.23 29.77 31.443 32.485 32.895 32.957 32.805 32.568 32.295 31.933 31.551 31.164 30.813 30.477 30.117 29.718 29.316 28.951 28.558 28.213 27.949 27.642 27.328 27.065 26.723 26.341 26.053 25.79 25.505 25.19 24.865 24.614 24.345 23.932 23.632 23.305 23.138 22.801 22.441 22.042 21.826 21.255 21.112 20.853 20.585 19.976 19.63 19.28 18.9 18.436 17.856 17.089 14.928 -7 ,8621 ,TETRA ,17605344,Sun Nov 28 18:53:49 CET,Sun Nov 28 20:44:04 CET,0.0 1.884 2.649 3.214 3.74 4.189 4.556 4.891 5.531 5.835 6.134 6.323 6.943 7.178 7.632 8.067 8.481 8.674 9.029 9.388 9.933 10.269 10.575 10.976 11.336 11.692 12.034 12.375 12.83 13.285 13.748 14.279 14.774 15.214 15.688 16.248 16.786 17.348 17.957 18.594 19.235 19.964 20.811 21.646 22.669 23.763 24.922 26.195 27.554 29.013 30.532 31.41 31.652 31.613 31.408 31.08 30.72 30.328 29.941 29.518 29.115 28.722 28.334 27.954 27.522 27.073 26.62 26.213 25.853 25.485 25.035 24.662 24.334 23.989 23.703 23.389 23.062 22.673 22.265 22.019 21.727 21.214 20.874 20.534 20.349 19.965 19.581 19.17 18.946 18.374 18.23 17.954 17.665 17.048 16.703 16.333 15.937 15.476 14.78 13.728 11.294 -8 ,16144 ,TETRA ,17605345,Sun Nov 28 18:53:48 CET,Sun Nov 28 20:42:32 CET,0.0 2.208 3.235 3.976 4.571 5.083 5.557 5.942 6.628 6.96 7.251 7.419 8.035 8.275 8.737 9.158 9.57 9.761 10.123 10.492 10.993 11.31 11.62 12.062 12.482 12.876 13.262 13.639 14.115 14.575 15.034 15.543 15.985 16.417 16.924 17.469 17.973 18.511 19.081 19.7 20.363 21.142 22.028 22.826 23.745 24.775 25.888 27.096 28.452 29.945 31.504 32.541 32.994 33.074 32.976 32.802 32.567 32.25 31.919 31.577 31.228 30.897 30.598 30.253 29.892 29.566 29.186 28.786 28.448 28.138 27.76 27.421 27.085 26.726 26.429 26.109 25.78 25.441 25.098 24.86 24.602 24.195 23.91 23.591 23.425 23.095 22.738 22.344 22.132 21.57 21.468 21.215 20.936 20.296 19.951 19.571 19.133 18.638 18.04 17.086 13.723 -9 ,15473 ,TETRA ,17605346,Sun Nov 28 18:53:51 CET,Sun Nov 28 20:42:31 CET,0.0 1.763 2.55 3.167 3.67 4.086 4.465 4.815 5.452 5.741 6.01 6.179 6.814 7.069 7.516 7.93 8.311 8.493 8.879 9.253 9.765 10.096 10.432 10.929 11.389 11.815 12.201 12.555 13.02 13.469 13.899 14.428 14.944 15.421 15.936 16.539 17.125 17.727 18.327 18.978 19.674 20.411 21.218 22.018 22.979 24.016 25.13 26.342 27.66 29.051 30.471 31.299 31.523 31.46 31.244 30.964 30.632 30.227 29.828 29.415 29.012 28.631 28.266 27.882 27.473 27.101 26.689 26.305 25.998 25.675 25.28 24.95 24.611 24.227 23.934 23.611 23.269 22.931 22.597 22.337 22.045 21.628 21.323 20.992 20.825 20.484 20.1 19.681 19.466 18.897 18.774 18.52 18.24 17.638 17.298 16.915 16.506 16.033 15.429 14.565 12.363 -10 ,30929 ,TETRA ,17605347,Sun Nov 28 18:53:52 CET,Sun Nov 28 20:43:00 CET,0.0 2.178 3.205 3.939 4.563 5.086 5.545 5.949 6.632 6.955 7.251 7.413 8.039 8.31 8.817 9.252 9.657 9.853 10.226 10.591 11.1 11.424 11.753 12.237 12.69 13.088 13.488 13.891 14.373 14.803 15.189 15.67 16.127 16.54 17.017 17.554 18.098 18.692 19.286 19.901 20.524 21.231 22.091 22.93 23.863 24.857 25.977 27.222 28.643 30.253 32.01 33.236 33.764 33.912 33.898 33.772 33.552 33.272 32.994 32.683 32.384 32.075 31.78 31.518 31.236 30.928 30.565 30.226 29.943 29.668 29.356 29.084 28.795 28.46 28.196 27.905 27.575 27.231 26.846 26.572 26.31 25.894 25.572 25.226 25.048 24.668 24.26 23.786 23.526 22.915 22.724 22.442 22.164 21.587 21.247 20.85 20.405 19.926 19.359 18.59 16.408 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23475.txt deleted file mode 100644 index e28348e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6028 ,TETRA ,17605348,Sun Nov 28 18:53:48 CET,Sun Nov 28 20:44:19 CET,0.0 2.018 2.939 3.639 4.238 4.773 5.239 5.63 6.318 6.639 6.957 7.178 7.879 8.162 8.711 9.236 9.706 9.926 10.377 10.835 11.519 11.936 12.314 12.868 13.414 13.948 14.475 14.976 15.579 16.16 16.763 17.528 18.245 18.898 19.666 20.547 21.362 22.25 23.249 24.312 25.433 26.68 28.132 29.644 31.462 33.531 35.989 38.846 42.264 46.411 51.606 56.095 58.783 60.514 61.626 62.391 62.928 63.269 63.44 63.503 63.49 63.428 63.304 63.167 62.982 62.76 62.507 62.222 61.986 61.766 61.488 61.227 60.943 60.629 60.366 60.078 59.738 59.374 59.008 58.732 58.44 57.983 57.657 57.302 57.109 56.711 56.247 55.744 55.496 54.876 54.637 54.354 54.041 53.274 52.832 52.344 51.773 51.139 50.418 49.459 45.227 -2 ,12416 ,TETRA ,17605349,Sun Nov 28 18:54:47 CET,Sun Nov 28 20:48:07 CET,0.0 2.812 3.624 4.213 4.714 5.171 5.608 6.028 6.789 7.125 7.444 7.629 8.326 8.611 9.146 9.668 10.177 10.417 10.872 11.304 11.926 12.342 12.747 13.321 13.882 14.403 14.896 15.386 16.022 16.647 17.264 18.004 18.708 19.377 20.153 21.019 21.875 22.831 23.814 24.897 26.053 27.369 28.907 30.424 32.261 34.328 36.762 39.645 43.061 47.23 52.639 57.161 59.8 61.579 62.788 63.499 63.937 64.274 64.471 64.58 64.61 64.583 64.48 64.327 64.15 63.981 63.803 63.598 63.39 63.15 62.834 62.565 62.32 62.045 61.815 61.589 61.348 61.044 60.703 60.465 60.216 59.819 59.548 59.264 59.1 58.759 58.386 57.945 57.715 57.142 56.959 56.659 56.343 55.598 55.182 54.739 54.224 53.636 52.899 51.786 45.191 -3 ,6624 ,TETRA ,17605350,Sun Nov 28 18:54:48 CET,Sun Nov 28 20:44:06 CET,0.0 1.974 2.797 3.436 3.964 4.454 4.907 5.298 5.981 6.311 6.641 6.844 7.543 7.823 8.374 8.907 9.396 9.627 10.069 10.512 11.146 11.533 11.924 12.503 13.066 13.579 14.051 14.536 15.179 15.806 16.428 17.166 17.895 18.614 19.4 20.263 21.147 22.172 23.188 24.223 25.368 26.652 28.179 29.779 31.642 33.722 36.142 38.928 42.346 46.441 51.612 56.101 58.775 60.564 61.779 62.614 63.149 63.456 63.64 63.731 63.714 63.645 63.549 63.406 63.209 63.015 62.783 62.546 62.316 62.046 61.764 61.533 61.289 61.01 60.771 60.52 60.266 59.977 59.669 59.443 59.179 58.77 58.5 58.228 58.08 57.736 57.342 56.92 56.684 56.097 55.946 55.661 55.332 54.569 54.162 53.727 53.25 52.68 51.97 50.987 44.427 -4 ,23144 ,TETRA ,17605351,Sun Nov 28 18:53:48 CET,Sun Nov 28 20:44:05 CET,0.0 2.114 2.96 3.629 4.259 4.789 5.236 5.648 6.4 6.755 7.089 7.305 8.004 8.275 8.775 9.276 9.773 10.017 10.473 10.902 11.529 11.932 12.306 12.834 13.381 13.926 14.449 14.948 15.593 16.225 16.832 17.582 18.282 18.922 19.646 20.461 21.255 22.128 23.129 24.251 25.407 26.697 28.225 29.729 31.509 33.554 35.968 38.73 42.089 46.402 51.873 56.368 59.062 60.774 61.866 62.632 63.123 63.426 63.594 63.678 63.694 63.695 63.65 63.535 63.399 63.242 63.012 62.761 62.517 62.236 61.932 61.661 61.36 61.039 60.785 60.491 60.167 59.82 59.448 59.212 58.969 58.567 58.285 57.996 57.843 57.481 57.089 56.69 56.465 55.878 55.684 55.387 55.086 54.432 54.026 53.577 53.096 52.509 51.701 50.466 46.23 -5 ,9557 ,TETRA ,17605352,Sun Nov 28 18:53:48 CET,Sun Nov 28 20:44:03 CET,0.0 2.213 3.038 3.683 4.226 4.69 5.122 5.54 6.328 6.667 6.999 7.234 7.936 8.219 8.754 9.259 9.758 10.005 10.47 10.918 11.567 11.958 12.347 12.909 13.438 13.96 14.46 14.955 15.618 16.253 16.819 17.488 18.177 18.858 19.663 20.563 21.38 22.299 23.319 24.378 25.504 26.794 28.27 29.79 31.65 33.746 36.181 39.003 42.464 46.68 51.831 56.19 58.849 60.643 61.82 62.617 63.072 63.328 63.518 63.619 63.618 63.561 63.461 63.345 63.186 62.98 62.704 62.435 62.223 61.983 61.647 61.353 61.074 60.721 60.423 60.118 59.783 59.422 59.045 58.777 58.485 58.048 57.711 57.327 57.145 56.802 56.43 56.007 55.778 55.198 55.003 54.683 54.314 53.485 53.042 52.552 52.033 51.458 50.789 49.803 46.283 -6 ,21423 ,TETRA ,17605353,Sun Nov 28 18:53:49 CET,Sun Nov 28 20:44:02 CET,0.0 2.593 3.499 4.168 4.724 5.198 5.617 6.006 6.739 7.095 7.429 7.637 8.342 8.624 9.141 9.652 10.146 10.384 10.845 11.276 11.889 12.3 12.71 13.318 13.9 14.443 14.971 15.48 16.104 16.73 17.359 18.112 18.815 19.456 20.205 21.052 21.87 22.797 23.78 24.815 25.907 27.175 28.707 30.258 32.069 34.151 36.638 39.425 42.799 46.976 52.202 56.682 59.339 61.079 62.304 63.142 63.659 63.993 64.175 64.184 64.123 64.074 63.995 63.85 63.667 63.462 63.229 63.034 62.859 62.648 62.395 62.167 61.926 61.664 61.435 61.185 60.909 60.61 60.305 60.096 59.861 59.442 59.145 58.849 58.689 58.318 57.94 57.536 57.318 56.752 56.594 56.33 56.06 55.415 55.008 54.528 53.958 53.323 52.556 51.596 48.542 -7 ,21157 ,TETRA ,17605354,Sun Nov 28 18:53:49 CET,Sun Nov 28 20:44:02 CET,0.0 1.946 2.798 3.423 3.933 4.424 4.876 5.261 5.934 6.256 6.56 6.729 7.429 7.708 8.249 8.772 9.27 9.52 9.982 10.393 10.977 11.375 11.789 12.377 12.945 13.518 14.074 14.573 15.17 15.769 16.348 17.029 17.713 18.414 19.233 20.14 21.024 22.003 23.036 24.095 25.212 26.516 28.064 29.578 31.386 33.492 35.957 38.813 42.277 46.511 51.842 56.406 59.096 60.823 61.885 62.565 63.024 63.316 63.453 63.494 63.478 63.426 63.33 63.216 63.032 62.816 62.621 62.429 62.224 62.025 61.795 61.56 61.335 61.097 60.879 60.638 60.396 60.119 59.787 59.55 59.321 58.977 58.719 58.435 58.27 57.898 57.523 57.095 56.861 56.281 56.108 55.823 55.505 54.752 54.322 53.795 53.191 52.547 51.769 50.733 47.45 -8 ,32656 ,TETRA ,17605355,Sun Nov 28 18:53:49 CET,Sun Nov 28 20:44:18 CET,0.0 1.615 2.418 3.019 3.529 4.006 4.441 4.84 5.564 5.902 6.216 6.408 7.113 7.387 7.932 8.461 8.96 9.219 9.726 10.188 10.822 11.213 11.61 12.169 12.675 13.168 13.661 14.144 14.773 15.392 15.99 16.707 17.387 18.072 18.899 19.815 20.66 21.601 22.658 23.749 24.855 26.143 27.671 29.222 31.105 33.253 35.73 38.542 41.935 46.096 51.371 55.929 58.608 60.296 61.42 62.145 62.577 62.863 63.018 63.093 63.094 63.025 62.875 62.711 62.551 62.361 62.095 61.825 61.594 61.352 61.056 60.823 60.598 60.318 60.111 59.88 59.569 59.247 58.945 58.714 58.456 58.064 57.773 57.438 57.262 56.906 56.54 56.138 55.91 55.308 55.096 54.796 54.472 53.709 53.281 52.82 52.281 51.667 50.89 49.775 45.523 -9 ,11820 ,TETRA ,17605356,Sun Nov 28 18:53:49 CET,Sun Nov 28 20:44:02 CET,0.0 2.371 3.239 3.878 4.415 4.905 5.369 5.805 6.567 6.923 7.275 7.512 8.225 8.534 9.086 9.598 10.114 10.348 10.793 11.228 11.852 12.25 12.642 13.219 13.771 14.308 14.806 15.286 15.928 16.541 17.134 17.836 18.533 19.242 20.041 20.884 21.69 22.594 23.601 24.709 25.848 27.144 28.692 30.244 32.006 34.01 36.485 39.312 42.733 46.913 52.109 56.657 59.481 61.322 62.556 63.429 63.984 64.337 64.534 64.683 64.767 64.748 64.669 64.593 64.496 64.351 64.148 63.958 63.779 63.581 63.341 63.124 62.9 62.619 62.373 62.122 61.871 61.608 61.332 61.124 60.869 60.421 60.104 59.774 59.604 59.241 58.866 58.443 58.204 57.629 57.47 57.182 56.868 56.198 55.813 55.309 54.752 54.159 53.456 52.422 48.924 -10 ,14024 ,TETRA ,17605357,Sun Nov 28 18:54:48 CET,Sun Nov 28 20:43:41 CET,0.0 1.872 2.693 3.377 3.902 4.363 4.801 5.175 5.85 6.163 6.465 6.645 7.338 7.603 8.118 8.631 9.116 9.352 9.794 10.2 10.781 11.187 11.601 12.189 12.756 13.315 13.849 14.343 14.991 15.627 16.221 16.924 17.64 18.348 19.133 20.022 20.877 21.778 22.748 23.781 24.885 26.159 27.691 29.253 31.097 33.214 35.675 38.5 41.987 46.137 51.231 55.649 58.35 60.112 61.292 62.101 62.648 62.993 63.162 63.255 63.282 63.273 63.227 63.151 63.028 62.866 62.699 62.493 62.272 62.047 61.792 61.558 61.275 60.947 60.682 60.384 60.083 59.774 59.388 59.096 58.859 58.505 58.21 57.906 57.73 57.326 56.896 56.388 56.112 55.489 55.209 54.881 54.568 53.895 53.519 53.083 52.554 51.955 51.164 49.985 45.894 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23476.txt deleted file mode 100644 index 1dd3c9ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15032 ,TETRA ,17605358,Sun Nov 28 18:54:47 CET,Sun Nov 28 20:46:14 CET,0.0 3.311 4.349 5.064 5.716 6.288 6.787 7.262 8.139 8.532 8.914 9.211 9.951 10.279 10.88 11.484 12.053 12.317 12.827 13.32 14.024 14.466 14.893 15.499 16.108 16.695 17.261 17.821 18.504 19.166 19.822 20.588 21.334 22.079 22.88 23.754 24.618 25.561 26.563 27.653 28.843 30.211 31.831 33.456 35.381 37.58 40.094 42.939 46.329 50.469 55.778 60.453 63.279 65.085 66.254 67.079 67.591 67.982 68.263 68.408 68.462 68.45 68.384 68.295 68.216 68.118 67.939 67.697 67.478 67.267 67.036 66.81 66.569 66.327 66.109 65.873 65.646 65.384 65.088 64.863 64.609 64.219 63.938 63.628 63.468 63.153 62.812 62.41 62.192 61.612 61.452 61.178 60.872 60.176 59.782 59.347 58.853 58.299 57.616 56.602 53.025 -2 ,32078 ,TETRA ,17605359,Sun Nov 28 18:54:48 CET,Sun Nov 28 20:46:06 CET,0.0 2.685 3.666 4.376 4.993 5.566 6.086 6.559 7.412 7.794 8.16 8.466 9.203 9.512 10.112 10.697 11.269 11.542 12.047 12.523 13.236 13.689 14.128 14.775 15.38 15.968 16.552 17.127 17.87 18.569 19.236 20.05 20.809 21.565 22.446 23.377 24.269 25.25 26.331 27.52 28.741 30.143 31.809 33.441 35.368 37.542 40.116 43.065 46.557 50.822 56.041 60.551 63.31 65.028 66.14 66.836 67.254 67.52 67.653 67.678 67.651 67.56 67.434 67.3 67.168 67.075 66.921 66.701 66.529 66.378 66.118 65.878 65.636 65.343 65.105 64.84 64.572 64.311 64.024 63.808 63.583 63.192 62.89 62.55 62.358 61.966 61.563 61.136 60.914 60.338 60.209 59.951 59.663 59.015 58.656 58.262 57.806 57.24 56.505 55.469 51.762 -3 ,29341 ,TETRA ,17605360,Sun Nov 28 18:54:47 CET,Sun Nov 28 20:45:50 CET,0.0 2.903 3.881 4.592 5.22 5.786 6.308 6.799 7.644 8.03 8.398 8.653 9.382 9.691 10.269 10.824 11.374 11.638 12.141 12.611 13.276 13.724 14.18 14.807 15.386 15.984 16.576 17.143 17.853 18.551 19.212 19.96 20.689 21.399 22.255 23.211 24.093 25.096 26.166 27.305 28.548 29.918 31.544 33.226 35.166 37.302 39.853 42.834 46.329 50.563 55.953 60.506 63.192 64.909 66.033 66.793 67.314 67.685 67.905 68.034 68.068 68.015 67.915 67.789 67.623 67.454 67.224 66.947 66.717 66.477 66.171 65.914 65.621 65.278 64.996 64.716 64.436 64.097 63.72 63.444 63.157 62.738 62.432 62.093 61.924 61.589 61.234 60.857 60.661 60.094 59.939 59.654 59.36 58.684 58.311 57.921 57.457 56.877 56.198 55.256 51.96 -4 ,24230 ,TETRA ,17605361,Sun Nov 28 18:54:47 CET,Sun Nov 28 20:44:16 CET,0.0 3.812 4.952 5.875 6.662 7.322 7.894 8.416 9.347 9.743 10.109 10.409 11.155 11.481 12.125 12.719 13.245 13.503 14.021 14.516 15.229 15.677 16.107 16.753 17.404 18.032 18.61 19.166 19.853 20.519 21.188 22.006 22.792 23.525 24.354 25.259 26.133 27.129 28.18 29.307 30.516 31.876 33.446 35.017 36.895 39.052 41.64 44.612 48.134 52.435 57.818 62.496 65.299 67.107 68.38 69.218 69.749 70.125 70.366 70.54 70.57 70.541 70.456 70.334 70.208 70.068 69.881 69.678 69.496 69.26 68.981 68.748 68.473 68.165 67.934 67.699 67.459 67.167 66.846 66.617 66.355 65.952 65.64 65.309 65.143 64.769 64.358 63.937 63.71 63.118 62.935 62.655 62.369 61.717 61.341 60.904 60.408 59.844 59.131 58.132 53.977 -5 ,21128 ,TETRA ,17605362,Sun Nov 28 18:54:48 CET,Sun Nov 28 20:45:10 CET,0.0 2.993 3.911 4.606 5.201 5.75 6.271 6.746 7.578 7.964 8.326 8.605 9.329 9.64 10.247 10.844 11.433 11.723 12.249 12.712 13.385 13.844 14.289 14.933 15.569 16.168 16.756 17.327 18.079 18.78 19.41 20.154 20.874 21.615 22.499 23.464 24.361 25.321 26.373 27.518 28.711 30.083 31.733 33.366 35.269 37.441 40.009 42.978 46.509 50.792 56.06 60.528 63.205 64.893 65.986 66.73 67.227 67.553 67.747 67.846 67.876 67.848 67.811 67.705 67.493 67.241 66.969 66.771 66.583 66.374 66.178 65.996 65.758 65.482 65.247 64.993 64.746 64.471 64.162 63.926 63.641 63.192 62.902 62.591 62.416 62.015 61.601 61.187 60.965 60.369 60.158 59.872 59.561 58.825 58.413 57.971 57.461 56.865 56.115 54.98 49.36 -6 ,27037 ,TETRA ,17605363,Sun Nov 28 18:54:47 CET,Sun Nov 28 20:45:36 CET,0.0 3.427 4.436 5.175 5.831 6.408 6.914 7.394 8.303 8.695 9.051 9.336 10.077 10.387 10.996 11.573 12.108 12.366 12.865 13.338 14.019 14.47 14.903 15.533 16.183 16.802 17.355 17.895 18.6 19.247 19.879 20.633 21.368 22.115 22.961 23.867 24.754 25.763 26.868 28.038 29.261 30.627 32.24 33.88 35.81 38.035 40.613 43.54 47.047 51.266 56.617 61.174 63.853 65.562 66.628 67.333 67.805 68.092 68.234 68.27 68.258 68.227 68.141 68.017 67.886 67.741 67.541 67.289 67.044 66.801 66.519 66.244 65.941 65.654 65.441 65.183 64.922 64.648 64.311 64.092 63.865 63.465 63.176 62.878 62.725 62.357 61.965 61.559 61.342 60.775 60.637 60.351 60.031 59.364 59.011 58.596 58.123 57.573 56.877 55.783 51.88 -7 ,29588 ,TETRA ,17605364,Sun Nov 28 18:54:48 CET,Sun Nov 28 20:46:35 CET,0.0 3.175 4.131 4.872 5.492 6.028 6.519 6.994 7.853 8.227 8.566 8.813 9.546 9.863 10.468 11.043 11.584 11.838 12.335 12.821 13.543 13.995 14.416 15.049 15.677 16.291 16.873 17.412 18.091 18.748 19.42 20.236 20.999 21.7 22.478 23.357 24.27 25.306 26.379 27.521 28.718 30.089 31.704 33.311 35.259 37.481 40.016 42.982 46.56 50.775 55.953 60.337 62.982 64.641 65.722 66.505 67.034 67.39 67.597 67.691 67.725 67.72 67.689 67.595 67.433 67.27 67.108 66.948 66.736 66.482 66.216 65.956 65.695 65.423 65.196 64.933 64.636 64.345 64.019 63.787 63.555 63.181 62.907 62.604 62.443 62.095 61.73 61.326 61.103 60.513 60.298 59.997 59.692 59.03 58.667 58.248 57.767 57.239 56.637 55.802 52.825 -8 ,2928 ,TETRA ,17605365,Sun Nov 28 18:54:47 CET,Sun Nov 28 20:46:05 CET,0.0 3.361 4.4 5.177 5.842 6.42 6.94 7.416 8.293 8.68 9.047 9.353 10.097 10.409 11.008 11.594 12.152 12.421 12.945 13.438 14.146 14.606 15.046 15.69 16.309 16.891 17.456 18.016 18.723 19.417 20.094 20.914 21.691 22.411 23.239 24.169 25.107 26.146 27.252 28.395 29.588 30.954 32.598 34.252 36.141 38.26 40.75 43.664 47.143 51.37 56.659 61.177 63.943 65.806 67.104 67.961 68.487 68.767 68.909 69.023 69.057 69.041 68.974 68.872 68.761 68.555 68.232 68.004 67.848 67.624 67.322 67.039 66.766 66.521 66.306 66.055 65.767 65.413 65.015 64.736 64.469 64.074 63.775 63.447 63.284 62.939 62.547 62.105 61.858 61.259 61.078 60.816 60.545 59.89 59.468 58.983 58.496 57.972 57.329 56.43 52.665 -9 ,27381 ,TETRA ,17605366,Sun Nov 28 18:54:47 CET,Sun Nov 28 20:44:51 CET,0.0 2.507 3.543 4.295 4.921 5.486 6.0 6.466 7.326 7.741 8.118 8.421 9.152 9.47 10.125 10.741 11.36 11.646 12.142 12.674 13.474 13.949 14.407 15.073 15.697 16.284 16.86 17.417 18.127 18.828 19.506 20.332 21.161 21.962 22.799 23.692 24.565 25.524 26.58 27.718 28.937 30.324 31.935 33.523 35.411 37.577 40.112 42.975 46.372 50.601 55.944 60.422 63.111 64.86 66.021 66.855 67.457 67.886 68.114 68.255 68.319 68.321 68.257 68.125 67.971 67.848 67.72 67.557 67.389 67.153 66.894 66.684 66.422 66.134 65.909 65.666 65.395 65.091 64.743 64.519 64.283 63.858 63.572 63.279 63.116 62.794 62.457 62.025 61.779 61.204 61.061 60.79 60.511 59.885 59.501 59.046 58.544 57.992 57.336 56.322 51.287 -10 ,16672 ,TETRA ,17605367,Sun Nov 28 18:54:47 CET,Sun Nov 28 20:44:00 CET,0.0 3.427 4.411 5.204 5.853 6.391 6.873 7.318 8.184 8.598 8.974 9.26 10.005 10.335 10.96 11.549 12.124 12.397 12.917 13.43 14.16 14.612 15.03 15.637 16.257 16.861 17.435 17.978 18.678 19.344 19.965 20.715 21.458 22.21 23.076 24.008 24.917 25.893 26.93 28.068 29.275 30.619 32.167 33.724 35.575 37.696 40.203 43.13 46.608 50.838 56.164 60.765 63.584 65.45 66.75 67.651 68.238 68.635 68.89 69.067 69.151 69.154 69.124 69.051 68.903 68.717 68.537 68.391 68.25 68.065 67.836 67.581 67.29 66.986 66.736 66.468 66.177 65.867 65.534 65.302 65.063 64.675 64.394 64.078 63.911 63.562 63.163 62.741 62.509 61.912 61.753 61.48 61.178 60.553 60.166 59.731 59.284 58.731 58.066 57.146 54.411 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23479.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23479.txt deleted file mode 100644 index e18dfbcb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23479.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18523 ,TETRA ,17605368,Sun Nov 28 18:54:48 CET,Sun Nov 28 20:46:08 CET,0.0 1.63 2.428 3.065 3.567 4.017 4.411 4.761 5.408 5.713 5.982 6.068 6.705 6.931 7.362 7.771 8.18 8.365 8.69 8.996 9.436 9.729 10.025 10.437 10.8 11.145 11.486 11.789 12.136 12.456 12.776 13.184 13.555 13.878 14.241 14.689 15.132 15.54 15.948 16.395 16.812 17.234 17.734 18.211 18.705 19.147 19.575 19.951 20.11 20.031 19.416 18.233 17.014 15.878 14.797 13.779 12.903 12.059 11.266 10.476 9.808 9.195 8.565 7.947 7.379 6.821 6.209 5.657 5.188 4.716 4.206 3.779 3.342 2.832 2.416 2.009 1.613 1.238 0.828 0.531 0.205 -0.319 -0.655 -1.02 -1.227 -1.667 -2.164 -2.69 -2.951 -3.624 -3.751 -4.07 -4.415 -5.111 -5.514 -5.975 -6.487 -7.051 -7.728 -8.583 -10.526 -2 ,30663 ,TETRA ,17605369,Sun Nov 28 18:54:48 CET,Sun Nov 28 20:46:25 CET,0.0 1.847 2.641 3.256 3.781 4.258 4.673 5.036 5.668 5.97 6.258 6.365 6.997 7.231 7.667 8.056 8.439 8.618 8.939 9.257 9.72 10.01 10.315 10.757 11.13 11.481 11.812 12.136 12.538 12.892 13.235 13.661 14.034 14.344 14.705 15.108 15.504 15.946 16.399 16.828 17.247 17.726 18.237 18.653 19.039 19.444 19.849 20.216 20.456 20.405 19.779 18.524 17.294 16.153 15.11 14.133 13.222 12.351 11.595 10.858 10.195 9.553 8.898 8.263 7.674 7.148 6.604 6.099 5.644 5.166 4.642 4.199 3.754 3.282 2.913 2.535 2.125 1.683 1.23 0.908 0.575 0.056 -0.318 -0.691 -0.883 -1.286 -1.72 -2.211 -2.474 -3.155 -3.3 -3.588 -3.893 -4.541 -4.903 -5.305 -5.752 -6.272 -6.943 -7.837 -9.673 -3 ,32203 ,TETRA ,17605370,Sun Nov 28 18:54:49 CET,Sun Nov 28 20:46:11 CET,0.0 1.747 2.501 3.102 3.604 4.016 4.372 4.703 5.313 5.579 5.834 5.921 6.546 6.776 7.218 7.612 8.001 8.179 8.486 8.774 9.194 9.471 9.731 10.101 10.471 10.823 11.152 11.478 11.874 12.266 12.639 13.021 13.369 13.704 14.087 14.518 14.909 15.279 15.68 16.098 16.525 17.005 17.477 17.902 18.35 18.775 19.153 19.495 19.734 19.688 19.154 17.938 16.706 15.526 14.404 13.391 12.467 11.589 10.821 10.028 9.317 8.659 8.024 7.413 6.845 6.341 5.784 5.277 4.842 4.397 3.928 3.499 3.049 2.564 2.179 1.817 1.435 0.991 0.491 0.13 -0.247 -0.846 -1.264 -1.674 -1.872 -2.269 -2.701 -3.166 -3.422 -4.103 -4.23 -4.512 -4.834 -5.542 -5.929 -6.35 -6.773 -7.251 -7.875 -8.715 -10.844 -4 ,526 ,TETRA ,17605371,Sun Nov 28 18:55:48 CET,Sun Nov 28 20:47:06 CET,0.0 1.821 2.611 3.209 3.704 4.139 4.529 4.882 5.534 5.856 6.156 6.269 6.904 7.122 7.55 7.963 8.349 8.533 8.911 9.273 9.729 9.99 10.26 10.656 10.999 11.339 11.674 12.005 12.425 12.798 13.141 13.517 13.882 14.223 14.59 14.983 15.333 15.752 16.214 16.627 17.007 17.418 17.907 18.363 18.808 19.245 19.658 19.96 20.142 20.14 19.58 18.316 17.046 15.881 14.82 13.786 12.838 11.99 11.25 10.451 9.715 9.096 8.504 7.892 7.311 6.792 6.232 5.691 5.22 4.745 4.225 3.786 3.357 2.925 2.585 2.197 1.78 1.35 0.895 0.583 0.29 -0.172 -0.521 -0.868 -1.057 -1.48 -1.941 -2.462 -2.736 -3.41 -3.582 -3.887 -4.209 -4.879 -5.225 -5.601 -6.024 -6.504 -7.055 -7.756 -9.206 -5 ,23797 ,TETRA ,17605372,Sun Nov 28 18:55:47 CET,Sun Nov 28 20:47:35 CET,0.0 2.704 3.519 4.163 4.699 5.148 5.536 5.913 6.569 6.855 7.134 7.248 7.861 8.061 8.48 8.876 9.261 9.459 9.823 10.163 10.667 10.972 11.232 11.635 12.019 12.35 12.678 12.991 13.369 13.73 14.053 14.439 14.826 15.188 15.593 16.041 16.47 16.925 17.371 17.747 18.135 18.582 19.051 19.455 19.886 20.325 20.741 21.074 21.266 21.241 20.642 19.422 18.162 17.009 15.982 15.026 14.132 13.271 12.529 11.776 11.116 10.523 9.914 9.309 8.728 8.197 7.656 7.171 6.744 6.269 5.761 5.337 4.883 4.391 4.019 3.65 3.275 2.855 2.376 2.067 1.776 1.325 0.985 0.632 0.453 0.064 -0.33 -0.748 -0.976 -1.619 -1.71 -1.974 -2.23 -2.771 -3.074 -3.4 -3.756 -4.169 -4.646 -5.275 -6.997 -6 ,17893 ,TETRA ,17605373,Sun Nov 28 18:54:48 CET,Sun Nov 28 20:45:38 CET,0.0 2.498 3.415 4.116 4.74 5.27 5.704 6.118 6.886 7.21 7.527 7.731 8.395 8.658 9.145 9.614 10.063 10.267 10.664 11.047 11.615 11.971 12.287 12.748 13.198 13.611 14.0 14.349 14.794 15.214 15.581 16.023 16.424 16.775 17.182 17.662 18.101 18.52 18.964 19.421 19.865 20.316 20.835 21.362 21.899 22.403 22.887 23.318 23.641 23.66 23.057 21.783 20.461 19.244 18.105 17.0 16.009 15.098 14.283 13.461 12.731 12.061 11.397 10.757 10.189 9.616 8.979 8.439 7.938 7.419 6.892 6.436 5.966 5.453 5.057 4.669 4.282 3.868 3.392 3.054 2.709 2.132 1.737 1.339 1.124 0.662 0.189 -0.288 -0.542 -1.223 -1.389 -1.701 -2.018 -2.726 -3.15 -3.623 -4.146 -4.724 -5.392 -6.237 -8.997 -7 ,6219 ,TETRA ,17605374,Sun Nov 28 18:54:48 CET,Sun Nov 28 20:46:04 CET,0.0 2.432 3.295 3.922 4.476 4.993 5.463 5.871 6.558 6.877 7.198 7.389 8.052 8.291 8.763 9.224 9.653 9.855 10.258 10.642 11.156 11.485 11.81 12.27 12.696 13.068 13.396 13.698 14.097 14.554 14.996 15.475 15.91 16.285 16.732 17.223 17.636 18.077 18.559 19.071 19.553 20.019 20.565 21.035 21.518 22.008 22.448 22.807 23.071 23.159 22.665 21.458 20.175 18.924 17.753 16.655 15.649 14.742 13.952 13.098 12.37 11.74 11.106 10.427 9.774 9.166 8.523 7.97 7.51 7.011 6.483 6.041 5.531 5.02 4.615 4.165 3.695 3.21 2.718 2.386 2.047 1.48 1.084 0.683 0.465 0.016 -0.437 -0.918 -1.182 -1.874 -2.096 -2.416 -2.738 -3.448 -3.849 -4.307 -4.82 -5.398 -6.106 -7.164 -10.501 -8 ,4256 ,TETRA ,17605375,Sun Nov 28 18:54:49 CET,Sun Nov 28 20:49:06 CET,0.0 2.314 3.164 3.779 4.295 4.731 5.118 5.483 6.12 6.414 6.695 6.847 7.521 7.772 8.217 8.615 8.996 9.169 9.489 9.818 10.273 10.554 10.826 11.234 11.607 11.965 12.329 12.668 13.057 13.4 13.745 14.155 14.548 14.899 15.28 15.734 16.148 16.614 17.082 17.476 17.915 18.39 18.863 19.295 19.721 20.122 20.527 20.885 21.146 21.158 20.587 19.443 18.231 17.054 15.966 14.981 14.098 13.223 12.424 11.6 10.88 10.226 9.553 8.891 8.309 7.809 7.302 6.819 6.363 5.893 5.389 4.969 4.537 4.078 3.737 3.367 2.948 2.503 2.018 1.698 1.374 0.84 0.455 0.026 -0.2 -0.625 -1.056 -1.518 -1.757 -2.429 -2.588 -2.891 -3.214 -3.939 -4.336 -4.772 -5.261 -5.789 -6.413 -7.199 -8.801 -9 ,26044 ,TETRA ,17605376,Sun Nov 28 18:54:51 CET,Sun Nov 28 20:49:03 CET,0.0 2.825 3.626 4.171 4.581 4.945 5.287 5.595 6.128 6.361 6.585 6.604 7.203 7.399 7.758 8.096 8.429 8.604 8.945 9.257 9.7 9.961 10.212 10.577 10.914 11.228 11.523 11.82 12.199 12.544 12.864 13.207 13.521 13.843 14.21 14.587 14.919 15.289 15.662 16.029 16.401 16.78 17.182 17.537 17.907 18.294 18.7 19.0 19.161 19.124 18.523 17.245 15.974 14.887 13.848 12.843 11.941 11.104 10.365 9.557 8.833 8.197 7.573 6.963 6.353 5.794 5.198 4.688 4.283 3.847 3.314 2.823 2.363 1.936 1.604 1.23 0.802 0.356 -0.101 -0.42 -0.759 -1.291 -1.66 -2.034 -2.217 -2.6 -3.023 -3.471 -3.702 -4.348 -4.451 -4.734 -5.017 -5.611 -5.926 -6.243 -6.581 -6.988 -7.493 -8.16 -9.394 -10 ,13238 ,TETRA ,17605377,Sun Nov 28 18:54:49 CET,Sun Nov 28 20:49:16 CET,0.0 1.539 2.281 2.907 3.431 3.905 4.34 4.693 5.323 5.619 5.877 5.956 6.577 6.788 7.207 7.617 7.998 8.167 8.497 8.829 9.296 9.579 9.858 10.237 10.586 10.903 11.19 11.504 11.933 12.324 12.659 13.061 13.446 13.778 14.158 14.572 14.93 15.295 15.688 16.111 16.528 16.956 17.425 17.849 18.281 18.71 19.137 19.522 19.798 19.851 19.299 18.083 16.834 15.655 14.609 13.623 12.701 11.868 11.122 10.339 9.671 9.06 8.443 7.845 7.295 6.76 6.176 5.645 5.165 4.71 4.236 3.809 3.351 2.849 2.459 2.047 1.624 1.187 0.729 0.399 0.044 -0.51 -0.909 -1.315 -1.517 -1.941 -2.39 -2.862 -3.116 -3.778 -3.935 -4.237 -4.536 -5.242 -5.665 -6.119 -6.595 -7.173 -7.804 -8.51 -10.129 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23482.txt deleted file mode 100644 index 66947c38..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21983 ,TETRA ,17605378,Sun Nov 28 18:54:49 CET,Sun Nov 28 20:46:19 CET,0.0 2.336 3.162 3.785 4.257 4.636 4.958 5.27 5.82 6.043 6.253 6.251 6.839 7.026 7.378 7.666 7.919 8.045 8.289 8.52 8.809 8.974 9.109 9.289 9.475 9.624 9.73 9.835 10.001 10.13 10.201 10.278 10.337 10.374 10.429 10.441 10.343 10.205 10.002 9.686 9.321 8.865 8.217 7.449 6.391 5.004 3.133 0.583 -2.976 -8.076 -15.892 -24.713 -31.625 -37.126 -41.572 -45.377 -48.556 -51.277 -53.541 -55.778 -57.716 -59.365 -60.896 -62.329 -63.598 -64.742 -65.906 -66.971 -67.902 -68.832 -69.836 -70.687 -71.57 -72.453 -73.109 -73.8 -74.511 -75.231 -76.001 -76.525 -77.054 -77.885 -78.46 -79.069 -79.38 -80.0 -80.634 -81.325 -81.693 -82.546 -82.794 -83.197 -83.617 -84.494 -84.991 -85.507 -86.045 -86.661 -87.429 -88.453 -90.255 -2 ,10413 ,TETRA ,17605379,Sun Nov 28 18:54:49 CET,Sun Nov 28 20:46:06 CET,0.0 2.37 3.251 3.89 4.372 4.774 5.125 5.432 5.963 6.194 6.434 6.496 7.08 7.25 7.58 7.914 8.187 8.304 8.583 8.819 9.096 9.29 9.464 9.674 9.86 10.023 10.184 10.32 10.463 10.579 10.672 10.74 10.772 10.844 10.938 10.949 10.909 10.816 10.609 10.3 9.909 9.388 8.659 7.804 6.645 5.173 3.231 0.627 -2.933 -8.063 -16.072 -24.928 -31.63 -36.878 -41.152 -44.836 -47.928 -50.666 -52.991 -55.224 -57.058 -58.658 -60.169 -61.554 -62.829 -64.068 -65.348 -66.439 -67.387 -68.379 -69.4 -70.225 -71.068 -71.904 -72.541 -73.205 -73.891 -74.604 -75.352 -75.855 -76.359 -77.18 -77.752 -78.329 -78.629 -79.227 -79.835 -80.5 -80.854 -81.704 -81.963 -82.355 -82.754 -83.609 -84.113 -84.684 -85.293 -85.969 -86.744 -87.812 -90.192 -3 ,14849 ,TETRA ,17605380,Sun Nov 28 18:55:47 CET,Sun Nov 28 20:47:24 CET,0.0 2.083 2.822 3.415 3.9 4.299 4.658 4.959 5.472 5.693 5.911 5.966 6.544 6.713 7.038 7.315 7.561 7.676 7.899 8.101 8.356 8.524 8.682 8.875 9.016 9.118 9.205 9.276 9.373 9.436 9.464 9.506 9.509 9.477 9.427 9.296 9.108 8.848 8.515 8.112 7.637 7.053 6.234 5.238 3.95 2.293 0.078 -2.768 -6.673 -12.232 -20.569 -29.556 -36.377 -41.818 -46.267 -50.067 -53.221 -55.971 -58.289 -60.525 -62.375 -64.01 -65.555 -67.017 -68.335 -69.491 -70.73 -71.829 -72.791 -73.753 -74.706 -75.511 -76.353 -77.238 -77.92 -78.594 -79.282 -80.036 -80.807 -81.321 -81.848 -82.659 -83.22 -83.804 -84.12 -84.764 -85.423 -86.14 -86.497 -87.347 -87.605 -87.995 -88.413 -89.338 -89.851 -90.413 -91.031 -91.702 -92.411 -93.233 -95.679 -4 ,2984 ,TETRA ,17605381,Sun Nov 28 18:55:49 CET,Sun Nov 28 20:47:10 CET,0.0 2.136 2.9 3.483 3.986 4.413 4.796 5.131 5.682 5.913 6.134 6.147 6.729 6.92 7.274 7.555 7.804 7.919 8.124 8.303 8.568 8.733 8.88 9.098 9.27 9.417 9.584 9.725 9.902 10.066 10.146 10.232 10.289 10.289 10.287 10.255 10.16 10.006 9.778 9.494 9.138 8.638 7.944 7.14 6.044 4.582 2.636 0.016 -3.626 -8.749 -16.601 -25.22 -31.973 -37.416 -41.784 -45.529 -48.699 -51.413 -53.698 -55.913 -57.748 -59.354 -60.846 -62.26 -63.597 -64.78 -65.946 -66.978 -67.886 -68.839 -69.81 -70.596 -71.392 -72.225 -72.882 -73.543 -74.204 -74.885 -75.628 -76.142 -76.666 -77.528 -78.133 -78.743 -79.066 -79.734 -80.378 -81.046 -81.404 -82.255 -82.511 -82.915 -83.341 -84.243 -84.741 -85.277 -85.857 -86.496 -87.221 -88.167 -90.12 -5 ,4482 ,TETRA ,17605382,Sun Nov 28 18:55:48 CET,Sun Nov 28 20:47:41 CET,0.0 2.919 3.817 4.488 5.011 5.473 5.884 6.263 6.957 7.244 7.492 7.545 8.147 8.353 8.74 9.061 9.362 9.504 9.764 10.023 10.412 10.628 10.825 11.113 11.365 11.567 11.757 11.942 12.167 12.368 12.499 12.634 12.693 12.751 12.837 12.871 12.819 12.718 12.559 12.305 11.977 11.503 10.853 10.108 9.101 7.7 5.756 3.175 -0.426 -5.609 -13.628 -22.453 -29.255 -34.765 -39.206 -42.974 -46.146 -48.886 -51.177 -53.472 -55.405 -57.081 -58.674 -60.149 -61.468 -62.642 -63.874 -64.945 -65.852 -66.811 -67.814 -68.641 -69.519 -70.491 -71.258 -72.021 -72.775 -73.528 -74.29 -74.833 -75.394 -76.265 -76.9 -77.549 -77.866 -78.52 -79.209 -79.916 -80.297 -81.2 -81.558 -82.008 -82.476 -83.499 -84.072 -84.68 -85.361 -86.14 -86.986 -88.01 -90.457 -6 ,13666 ,TETRA ,17605383,Sun Nov 28 18:55:48 CET,Sun Nov 28 20:47:10 CET,0.0 3.034 4.002 4.664 5.168 5.604 5.984 6.322 6.921 7.18 7.435 7.537 8.162 8.374 8.775 9.13 9.444 9.594 9.868 10.121 10.47 10.662 10.846 11.118 11.376 11.594 11.756 11.893 12.043 12.172 12.276 12.333 12.371 12.389 12.377 12.355 12.264 12.104 11.872 11.527 11.092 10.533 9.779 8.884 7.716 6.188 4.089 1.375 -2.403 -7.885 -16.243 -25.339 -32.249 -37.718 -42.111 -45.876 -49.074 -51.844 -54.126 -56.341 -58.224 -59.875 -61.451 -62.917 -64.233 -65.417 -66.646 -67.755 -68.717 -69.69 -70.715 -71.557 -72.424 -73.338 -74.034 -74.768 -75.547 -76.337 -77.125 -77.652 -78.213 -79.125 -79.744 -80.387 -80.728 -81.407 -82.086 -82.801 -83.168 -84.039 -84.359 -84.8 -85.277 -86.326 -86.881 -87.471 -88.107 -88.809 -89.666 -90.739 -93.643 -7 ,30091 ,TETRA ,17605384,Sun Nov 28 18:55:48 CET,Sun Nov 28 20:48:03 CET,0.0 2.862 3.89 4.673 5.294 5.819 6.276 6.661 7.31 7.593 7.852 7.921 8.558 8.793 9.214 9.561 9.85 9.994 10.28 10.551 10.956 11.202 11.422 11.718 11.963 12.154 12.309 12.45 12.621 12.787 12.936 13.08 13.177 13.246 13.327 13.347 13.316 13.223 13.021 12.745 12.447 12.046 11.426 10.683 9.638 8.253 6.382 3.896 0.349 -4.867 -13.031 -21.902 -28.69 -34.085 -38.431 -42.168 -45.311 -48.081 -50.408 -52.637 -54.503 -56.178 -57.762 -59.209 -60.501 -61.687 -62.94 -64.114 -65.137 -66.167 -67.252 -68.129 -69.003 -69.911 -70.611 -71.3 -72.026 -72.817 -73.615 -74.144 -74.705 -75.573 -76.175 -76.792 -77.103 -77.737 -78.385 -79.082 -79.45 -80.327 -80.666 -81.093 -81.542 -82.537 -83.079 -83.699 -84.362 -85.079 -85.891 -86.936 -89.445 -8 ,18712 ,TETRA ,17605385,Sun Nov 28 18:55:48 CET,Sun Nov 28 20:46:55 CET,0.0 2.472 3.43 4.124 4.672 5.149 5.589 5.964 6.63 6.917 7.176 7.247 7.863 8.061 8.428 8.772 9.087 9.231 9.485 9.735 10.072 10.267 10.463 10.765 11.068 11.325 11.538 11.714 11.896 12.048 12.181 12.273 12.322 12.373 12.436 12.496 12.463 12.337 12.137 11.843 11.485 10.966 10.213 9.352 8.222 6.76 4.773 2.193 -1.39 -6.641 -14.742 -23.656 -30.497 -35.991 -40.415 -44.169 -47.369 -50.156 -52.469 -54.703 -56.592 -58.301 -59.929 -61.425 -62.766 -63.957 -65.247 -66.407 -67.387 -68.412 -69.455 -70.289 -71.125 -72.006 -72.707 -73.418 -74.164 -74.951 -75.731 -76.261 -76.815 -77.661 -78.244 -78.858 -79.182 -79.846 -80.515 -81.219 -81.571 -82.428 -82.76 -83.191 -83.631 -84.568 -85.115 -85.713 -86.345 -87.038 -87.86 -88.934 -91.708 -9 ,4323 ,TETRA ,17605386,Sun Nov 28 18:55:49 CET,Sun Nov 28 20:42:40 CET,0.0 2.697 3.59 4.211 4.755 5.235 5.654 5.992 6.526 6.781 7.026 7.072 7.675 7.883 8.226 8.498 8.746 8.861 9.089 9.308 9.607 9.795 9.967 10.205 10.44 10.651 10.821 10.973 11.149 11.264 11.341 11.414 11.512 11.575 11.578 11.547 11.448 11.279 11.046 10.724 10.388 9.96 9.285 8.516 7.431 6.008 4.058 1.434 -2.156 -7.276 -15.266 -24.013 -30.615 -35.837 -40.107 -43.776 -46.853 -49.559 -51.847 -54.062 -55.921 -57.547 -59.057 -60.431 -61.718 -62.878 -64.071 -65.121 -66.003 -66.936 -67.931 -68.755 -69.599 -70.482 -71.17 -71.862 -72.578 -73.35 -74.139 -74.644 -75.156 -75.987 -76.569 -77.145 -77.44 -78.069 -78.735 -79.408 -79.751 -80.617 -80.906 -81.321 -81.734 -82.578 -83.039 -83.561 -84.16 -84.802 -85.559 -86.506 -88.134 -10 ,12357 ,TETRA ,17605387,Sun Nov 28 18:55:48 CET,Sun Nov 28 20:46:23 CET,0.0 2.534 3.439 4.153 4.713 5.14 5.493 5.802 6.357 6.618 6.852 6.896 7.501 7.692 8.05 8.371 8.681 8.83 9.078 9.295 9.598 9.773 9.931 10.15 10.324 10.495 10.638 10.769 10.935 11.048 11.157 11.25 11.314 11.334 11.291 11.209 11.105 10.965 10.775 10.562 10.282 9.83 9.145 8.287 7.113 5.651 3.654 0.974 -2.693 -7.901 -16.059 -25.047 -31.744 -37.048 -41.36 -45.003 -48.126 -50.878 -53.14 -55.323 -57.212 -58.872 -60.403 -61.83 -63.173 -64.362 -65.604 -66.721 -67.657 -68.632 -69.607 -70.414 -71.267 -72.16 -72.846 -73.522 -74.215 -74.952 -75.699 -76.22 -76.759 -77.558 -78.11 -78.667 -78.957 -79.582 -80.229 -80.903 -81.255 -82.114 -82.367 -82.752 -83.147 -84.004 -84.485 -85.035 -85.628 -86.283 -87.076 -88.007 -89.639 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23475.txt deleted file mode 100644 index bbbfdd8b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18432 ,KEBNE ,17027360,Wed Dec 22 16:57:31 CET,Wed Dec 22 18:32:03 CET,0.0 2.044 2.93 3.684 4.325 4.905 5.448 5.946 6.857 7.274 7.7 8.019 8.887 9.272 10.04 10.746 11.422 11.757 12.399 13.026 13.991 14.627 15.213 16.066 16.913 17.721 18.534 19.343 20.383 21.386 22.364 23.591 24.758 25.856 27.195 28.708 30.138 31.752 33.538 35.46 37.526 39.911 42.768 45.77 49.402 53.576 58.614 64.636 72.171 81.768 94.666 106.761 114.728 120.319 124.45 127.64 130.056 132.015 133.529 134.875 135.912 136.752 137.444 137.976 138.373 138.728 139.086 139.349 139.534 139.67 139.76 139.807 139.844 139.85 139.798 139.707 139.61 139.495 139.35 139.206 139.042 138.781 138.566 138.319 138.18 137.91 137.644 137.356 137.174 136.617 136.478 136.159 135.84 135.249 134.867 134.412 133.888 133.237 132.422 131.345 126.477 -2 ,1941 ,KEBNE ,17027361,Wed Dec 22 16:57:30 CET,Wed Dec 22 18:31:55 CET,0.0 2.537 3.466 4.182 4.78 5.337 5.878 6.4 7.357 7.784 8.2 8.501 9.383 9.773 10.521 11.253 11.987 12.347 13.023 13.652 14.569 15.161 15.748 16.628 17.493 18.371 19.208 19.974 20.997 22.003 22.994 24.217 25.392 26.56 27.905 29.411 30.873 32.467 34.249 36.188 38.262 40.691 43.625 46.68 50.357 54.605 59.706 65.786 73.418 83.164 96.226 108.511 116.742 122.627 126.978 130.39 133.017 135.1 136.672 138.084 139.184 140.029 140.731 141.316 141.808 142.199 142.554 142.802 142.965 143.116 143.185 143.177 143.195 143.195 143.139 143.064 142.956 142.799 142.606 142.471 142.331 142.105 141.912 141.684 141.572 141.328 141.028 140.652 140.456 139.912 139.765 139.463 139.149 138.389 137.92 137.402 136.837 136.165 135.266 133.899 128.814 -3 ,2110 ,KEBNE ,17027362,Wed Dec 22 16:57:30 CET,Wed Dec 22 18:33:29 CET,0.0 2.687 3.631 4.315 4.923 5.509 6.033 6.525 7.474 7.916 8.361 8.711 9.604 9.983 10.688 11.382 12.066 12.406 13.057 13.669 14.616 15.236 15.813 16.672 17.545 18.365 19.149 19.931 20.962 21.999 22.996 24.189 25.348 26.465 27.769 29.268 30.785 32.454 34.235 36.19 38.278 40.661 43.546 46.559 50.202 54.429 59.536 65.665 73.273 82.985 96.134 108.452 116.686 122.59 126.935 130.38 133.078 135.245 136.91 138.411 139.522 140.382 141.168 141.806 142.337 142.823 143.284 143.641 143.859 144.002 144.154 144.289 144.398 144.454 144.442 144.396 144.306 144.17 144.013 143.873 143.704 143.452 143.262 143.044 142.913 142.607 142.278 141.915 141.708 141.165 141.056 140.78 140.489 139.869 139.498 139.046 138.574 138.036 137.334 136.289 132.704 -4 ,28308 ,KEBNE ,17027363,Wed Dec 22 16:57:34 CET,Wed Dec 22 18:29:20 CET,0.0 2.127 3.1 3.836 4.515 5.1 5.625 6.122 7.055 7.501 7.924 8.24 9.111 9.485 10.22 10.93 11.602 11.928 12.572 13.22 14.191 14.79 15.361 16.222 17.112 17.986 18.819 19.628 20.668 21.641 22.58 23.742 24.887 26.044 27.377 28.852 30.312 31.953 33.74 35.703 37.851 40.305 43.199 46.205 49.86 54.116 59.262 65.383 73.018 82.799 95.869 108.003 116.158 122.032 126.374 129.715 132.225 134.253 135.829 137.279 138.394 139.271 140.027 140.659 141.187 141.603 141.983 142.284 142.502 142.671 142.829 142.954 143.05 143.119 143.129 143.083 142.992 142.874 142.728 142.627 142.521 142.352 142.224 142.049 141.951 141.739 141.492 141.223 141.074 140.57 140.549 140.335 140.102 139.559 139.213 138.802 138.316 137.774 137.068 135.979 131.912 -5 ,9704 ,KEBNE ,17027364,Wed Dec 22 16:57:30 CET,Wed Dec 22 18:33:58 CET,0.0 2.432 3.36 4.078 4.717 5.29 5.812 6.302 7.332 7.862 8.345 8.708 9.603 9.985 10.747 11.506 12.234 12.586 13.255 13.884 14.826 15.464 16.066 16.902 17.716 18.54 19.338 20.092 21.105 22.124 23.135 24.342 25.487 26.584 27.862 29.354 30.844 32.521 34.334 36.281 38.371 40.795 43.701 46.697 50.341 54.588 59.763 65.939 73.559 83.252 96.323 108.733 117.047 122.976 127.376 130.864 133.55 135.691 137.356 138.839 139.996 140.953 141.744 142.392 142.911 143.348 143.796 144.157 144.423 144.62 144.728 144.765 144.761 144.713 144.648 144.567 144.47 144.354 144.219 144.098 143.923 143.648 143.477 143.257 143.134 142.892 142.609 142.273 142.089 141.556 141.499 141.27 140.996 140.379 140.055 139.693 139.246 138.632 137.781 136.493 132.201 -6 ,4823 ,KEBNE ,17027365,Wed Dec 22 16:57:31 CET,Wed Dec 22 18:34:18 CET,0.0 2.437 3.399 4.142 4.793 5.402 5.993 6.542 7.521 7.977 8.408 8.723 9.593 9.957 10.663 11.366 12.056 12.386 13.03 13.657 14.555 15.15 15.748 16.621 17.455 18.277 19.092 19.871 20.872 21.889 22.907 24.123 25.288 26.431 27.764 29.281 30.75 32.391 34.178 36.096 38.159 40.533 43.421 46.431 50.044 54.273 59.408 65.471 73.061 82.634 95.471 107.54 115.477 121.179 125.379 128.581 131.059 133.046 134.581 135.916 136.887 137.678 138.366 138.938 139.39 139.715 140.003 140.239 140.421 140.572 140.647 140.674 140.683 140.635 140.6 140.577 140.539 140.471 140.333 140.225 140.123 139.884 139.674 139.445 139.32 139.023 138.68 138.328 138.148 137.62 137.541 137.319 137.08 136.443 136.074 135.699 135.222 134.642 133.949 132.92 129.182 -7 ,10404 ,KEBNE ,17027366,Wed Dec 22 16:57:31 CET,Wed Dec 22 18:34:00 CET,0.0 2.381 3.323 4.065 4.784 5.398 5.917 6.411 7.328 7.744 8.161 8.502 9.386 9.767 10.51 11.217 11.888 12.211 12.851 13.494 14.458 15.087 15.669 16.508 17.359 18.203 19.018 19.804 20.811 21.794 22.792 24.01 25.161 26.257 27.597 29.136 30.586 32.19 33.953 35.879 37.954 40.387 43.332 46.377 50.099 54.401 59.509 65.617 73.256 82.941 96.074 108.44 116.586 122.42 126.786 130.218 132.832 134.929 136.553 137.98 139.059 139.94 140.675 141.266 141.743 142.131 142.508 142.844 143.095 143.287 143.447 143.492 143.494 143.547 143.592 143.587 143.55 143.481 143.399 143.337 143.248 143.103 142.991 142.833 142.736 142.521 142.275 141.989 141.836 141.327 141.278 141.044 140.802 140.262 139.919 139.51 139.015 138.393 137.533 136.322 131.997 -8 ,27082 ,KEBNE ,17027367,Wed Dec 22 16:57:31 CET,Wed Dec 22 18:33:21 CET,0.0 2.451 3.432 4.186 4.793 5.367 5.895 6.38 7.273 7.699 8.135 8.485 9.372 9.755 10.474 11.186 11.881 12.208 12.849 13.5 14.449 15.064 15.676 16.554 17.381 18.176 18.945 19.679 20.635 21.577 22.496 23.663 24.858 25.998 27.306 28.761 30.178 31.819 33.602 35.535 37.656 40.096 43.006 46.023 49.657 53.879 58.978 65.063 72.631 82.249 95.207 107.348 115.332 120.996 125.167 128.413 130.915 132.879 134.373 135.732 136.79 137.59 138.259 138.842 139.317 139.688 140.03 140.282 140.442 140.555 140.591 140.623 140.682 140.701 140.651 140.566 140.485 140.363 140.184 140.052 139.908 139.636 139.421 139.185 139.057 138.778 138.476 138.141 137.952 137.405 137.302 137.065 136.822 136.233 135.873 135.46 134.977 134.397 133.614 132.531 128.355 -9 ,29259 ,KEBNE ,17027368,Wed Dec 22 16:57:30 CET,Wed Dec 22 18:32:33 CET,0.0 2.364 3.428 4.21 4.82 5.4 5.952 6.454 7.356 7.793 8.224 8.54 9.421 9.796 10.523 11.233 11.923 12.242 12.867 13.506 14.432 15.036 15.628 16.498 17.343 18.152 18.938 19.685 20.694 21.725 22.733 23.962 25.141 26.285 27.652 29.224 30.739 32.411 34.235 36.183 38.292 40.735 43.623 46.611 50.25 54.51 59.672 65.835 73.518 83.288 96.356 108.611 116.836 122.711 127.035 130.37 132.886 134.845 136.345 137.685 138.706 139.51 140.222 140.807 141.272 141.669 142.041 142.359 142.632 142.877 142.981 142.986 142.965 142.932 142.926 142.904 142.88 142.831 142.719 142.635 142.557 142.393 142.255 142.105 142.008 141.791 141.571 141.314 141.154 140.617 140.531 140.299 140.052 139.508 139.172 138.781 138.307 137.678 136.868 135.676 130.038 -10 ,29544 ,KEBNE ,17027369,Wed Dec 22 16:57:31 CET,Wed Dec 22 18:33:17 CET,0.0 2.061 3.013 3.835 4.537 5.137 5.677 6.175 7.101 7.551 7.993 8.354 9.232 9.608 10.347 11.05 11.725 12.053 12.698 13.347 14.285 14.882 15.465 16.322 17.18 18.016 18.836 19.627 20.649 21.655 22.642 23.815 24.932 26.045 27.371 28.862 30.294 31.88 33.613 35.545 37.663 40.104 43.056 46.076 49.697 53.914 59.048 65.084 72.525 82.067 94.76 106.704 114.631 120.218 124.35 127.603 130.097 132.06 133.549 134.883 135.891 136.702 137.386 137.943 138.418 138.809 139.139 139.356 139.528 139.679 139.813 139.891 139.907 139.911 139.901 139.872 139.781 139.621 139.485 139.413 139.299 139.052 138.873 138.675 138.567 138.302 137.992 137.705 137.562 137.025 136.888 136.637 136.356 135.748 135.418 135.035 134.558 133.998 133.337 132.305 127.734 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23476.txt deleted file mode 100644 index 88f1827b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21636 ,TETRA ,17605388,Sun Nov 28 18:55:48 CET,Sun Nov 28 20:47:14 CET,0.0 3.313 4.372 5.223 5.935 6.584 7.194 7.778 8.857 9.345 9.814 10.21 11.132 11.529 12.332 13.125 13.888 14.256 14.969 15.65 16.602 17.232 17.871 18.78 19.628 20.452 21.306 22.147 23.198 24.222 25.23 26.489 27.746 29.0 30.455 32.069 33.635 35.344 37.174 39.147 41.275 43.72 46.682 49.793 53.529 57.837 63.057 69.256 76.981 86.875 100.227 112.738 121.066 127.033 131.406 134.817 137.486 139.622 141.238 142.655 143.743 144.643 145.429 146.056 146.539 146.91 147.304 147.604 147.816 148.057 148.27 148.406 148.495 148.544 148.533 148.508 148.489 148.459 148.375 148.265 148.131 147.931 147.778 147.609 147.528 147.349 147.139 146.898 146.757 146.255 146.229 146.008 145.771 145.217 144.918 144.574 144.14 143.642 142.927 141.719 138.089 -2 ,9357 ,TETRA ,17605389,Sun Nov 28 18:55:50 CET,Sun Nov 28 20:48:18 CET,0.0 4.219 5.481 6.424 7.159 7.795 8.383 8.932 9.934 10.405 10.877 11.285 12.208 12.627 13.392 14.124 14.85 15.222 15.962 16.647 17.625 18.272 18.902 19.818 20.693 21.542 22.378 23.203 24.286 25.347 26.375 27.607 28.812 29.977 31.315 32.865 34.389 36.063 37.883 39.858 42.004 44.475 47.456 50.564 54.325 58.665 63.813 69.89 77.484 87.26 100.368 112.484 120.503 126.217 130.361 133.577 136.059 138.011 139.472 140.775 141.784 142.555 143.181 143.707 144.091 144.381 144.641 144.826 144.974 145.126 145.233 145.251 145.243 145.185 145.111 145.047 144.983 144.884 144.792 144.709 144.589 144.408 144.243 144.045 143.952 143.736 143.441 143.084 142.894 142.369 142.295 142.051 141.798 141.243 140.894 140.511 140.065 139.502 138.773 137.838 133.675 -3 ,20717 ,TETRA ,17605390,Sun Nov 28 18:55:50 CET,Sun Nov 28 20:46:06 CET,0.0 2.803 3.928 4.746 5.456 6.134 6.775 7.36 8.4 8.89 9.36 9.741 10.657 11.075 11.863 12.615 13.353 13.71 14.409 15.078 16.052 16.686 17.318 18.246 19.141 20.03 20.87 21.663 22.726 23.764 24.756 25.942 27.102 28.263 29.678 31.298 32.814 34.479 36.324 38.353 40.539 43.018 45.958 48.99 52.692 57.003 62.217 68.371 75.986 85.746 98.839 111.104 119.277 125.175 129.553 132.991 135.618 137.669 139.23 140.633 141.749 142.647 143.361 143.961 144.483 144.851 145.171 145.465 145.697 145.891 146.028 146.088 146.115 146.124 146.098 146.058 146.018 145.945 145.817 145.682 145.509 145.242 145.077 144.89 144.793 144.577 144.319 144.016 143.858 143.346 143.267 143.034 142.798 142.251 141.884 141.461 140.977 140.388 139.666 138.698 135.681 -4 ,30511 ,TETRA ,17605391,Sun Nov 28 18:55:50 CET,Sun Nov 28 20:47:06 CET,0.0 3.198 4.46 5.419 6.181 6.843 7.432 7.975 9.043 9.553 10.024 10.41 11.334 11.73 12.484 13.221 13.934 14.289 14.982 15.66 16.651 17.291 17.911 18.789 19.635 20.489 21.326 22.143 23.201 24.232 25.273 26.513 27.702 28.881 30.248 31.795 33.309 35.034 36.902 38.893 41.036 43.52 46.502 49.554 53.234 57.509 62.672 68.864 76.56 86.33 99.498 111.857 120.049 125.869 130.163 133.534 136.143 138.234 139.834 141.261 142.343 143.225 143.989 144.591 145.032 145.346 145.663 145.9 146.053 146.166 146.254 146.332 146.383 146.415 146.425 146.417 146.393 146.348 146.267 146.184 146.088 145.893 145.73 145.565 145.483 145.301 145.084 144.836 144.67 144.132 144.066 143.828 143.577 143.029 142.718 142.381 141.952 141.37 140.612 139.662 135.649 -5 ,26687 ,TETRA ,17605392,Sun Nov 28 18:55:51 CET,Sun Nov 28 20:47:27 CET,0.0 4.273 5.541 6.467 7.186 7.82 8.435 9.015 10.082 10.572 11.039 11.451 12.372 12.787 13.613 14.38 15.122 15.495 16.202 16.87 17.852 18.504 19.143 20.066 20.963 21.826 22.668 23.48 24.515 25.521 26.542 27.822 29.054 30.267 31.674 33.248 34.782 36.483 38.326 40.33 42.512 45.025 48.021 51.093 54.819 59.161 64.362 70.636 78.478 88.346 101.363 113.382 121.305 126.91 131.043 134.319 136.902 138.973 140.558 141.958 143.054 143.943 144.673 145.286 145.792 146.182 146.52 146.754 146.909 147.068 147.227 147.33 147.385 147.413 147.419 147.381 147.321 147.245 147.17 147.117 147.033 146.84 146.672 146.497 146.409 146.208 145.959 145.665 145.506 144.986 144.944 144.728 144.493 143.929 143.587 143.197 142.714 142.178 141.564 140.595 136.754 -6 ,24170 ,TETRA ,17605393,Sun Nov 28 18:55:53 CET,Sun Nov 28 20:47:26 CET,0.0 3.318 4.576 5.506 6.353 7.116 7.764 8.361 9.5 10.016 10.513 10.964 11.923 12.359 13.158 13.928 14.655 15.011 15.706 16.38 17.367 17.991 18.601 19.523 20.423 21.298 22.147 22.989 24.082 25.118 26.138 27.388 28.576 29.736 31.092 32.638 34.218 36.009 37.914 39.946 42.121 44.618 47.603 50.692 54.426 58.753 63.985 70.156 77.802 87.563 100.676 113.045 121.377 127.251 131.596 135.064 137.746 139.898 141.545 143.018 144.135 145.044 145.851 146.545 147.109 147.561 147.967 148.263 148.495 148.712 148.87 148.954 149.045 149.084 149.05 148.975 148.877 148.746 148.584 148.479 148.362 148.086 147.843 147.603 147.484 147.222 146.922 146.579 146.379 145.824 145.736 145.476 145.187 144.588 144.235 143.791 143.22 142.544 141.774 140.617 135.692 -7 ,28533 ,TETRA ,17605394,Sun Nov 28 18:55:50 CET,Sun Nov 28 20:46:57 CET,0.0 3.337 4.362 5.185 5.886 6.527 7.138 7.719 8.761 9.236 9.7 10.066 10.986 11.401 12.197 12.962 13.714 14.088 14.82 15.517 16.488 17.103 17.721 18.655 19.591 20.492 21.33 22.132 23.195 24.246 25.286 26.528 27.706 28.871 30.247 31.826 33.341 35.014 36.889 38.926 41.1 43.63 46.612 49.691 53.417 57.698 62.871 69.034 76.681 86.354 99.243 111.31 119.333 125.002 129.15 132.38 134.876 136.885 138.4 139.746 140.795 141.581 142.145 142.609 143.082 143.503 143.896 144.155 144.313 144.439 144.54 144.595 144.64 144.689 144.685 144.63 144.552 144.478 144.349 144.222 144.095 143.914 143.767 143.605 143.526 143.325 143.099 142.866 142.734 142.234 142.166 141.924 141.659 141.076 140.758 140.4 139.962 139.404 138.759 137.873 133.75 -8 ,30558 ,TETRA ,17605395,Sun Nov 28 18:55:51 CET,Sun Nov 28 20:47:24 CET,0.0 2.798 3.817 4.629 5.317 5.947 6.509 7.035 8.047 8.52 8.974 9.332 10.238 10.637 11.399 12.148 12.878 13.233 13.915 14.578 15.566 16.217 16.865 17.832 18.755 19.611 20.436 21.246 22.318 23.345 24.354 25.622 26.853 28.03 29.362 30.896 32.421 34.119 35.995 38.033 40.199 42.685 45.698 48.844 52.616 56.933 62.025 68.039 75.623 85.218 98.025 110.049 117.931 123.527 127.623 130.796 133.219 135.132 136.591 137.896 138.885 139.617 140.194 140.71 141.166 141.52 141.854 142.105 142.298 142.469 142.579 142.639 142.664 142.669 142.679 142.667 142.616 142.528 142.423 142.338 142.225 142.057 141.907 141.721 141.621 141.401 141.158 140.865 140.701 140.178 140.107 139.864 139.599 139.023 138.694 138.298 137.854 137.345 136.699 135.753 131.888 -9 ,5013 ,TETRA ,17605396,Sun Nov 28 18:55:54 CET,Sun Nov 28 20:47:16 CET,0.0 2.828 3.829 4.634 5.359 6.001 6.573 7.11 8.138 8.62 9.081 9.493 10.427 10.842 11.629 12.397 13.127 13.477 14.172 14.839 15.805 16.422 17.016 17.896 18.76 19.624 20.468 21.277 22.322 23.346 24.34 25.549 26.752 27.934 29.32 30.869 32.345 34.009 35.848 37.867 40.027 42.495 45.423 48.473 52.209 56.543 61.756 67.872 75.512 85.354 98.503 110.804 119.047 124.946 129.333 132.769 135.393 137.469 139.075 140.529 141.656 142.516 143.248 143.865 144.318 144.679 145.024 145.319 145.539 145.746 145.974 146.106 146.202 146.305 146.368 146.426 146.43 146.369 146.291 146.215 146.136 145.975 145.787 145.555 145.437 145.172 144.856 144.498 144.31 143.768 143.649 143.394 143.134 142.507 142.122 141.71 141.247 140.658 139.876 138.746 126.281 -10 ,9657 ,TETRA ,17605397,Sun Nov 28 18:55:50 CET,Sun Nov 28 20:46:17 CET,0.0 2.277 3.288 4.111 4.833 5.481 6.088 6.646 7.661 8.132 8.584 8.944 9.857 10.263 11.043 11.779 12.471 12.811 13.487 14.149 15.169 15.839 16.45 17.348 18.248 19.092 19.921 20.743 21.823 22.856 23.818 25.039 26.238 27.375 28.712 30.259 31.808 33.518 35.35 37.375 39.557 42.038 45.007 48.089 51.796 56.111 61.34 67.493 75.112 84.721 97.611 109.73 117.76 123.484 127.704 130.95 133.405 135.381 136.906 138.254 139.286 140.128 140.798 141.345 141.765 142.09 142.378 142.564 142.729 142.884 143.01 143.071 143.079 143.061 143.032 142.978 142.925 142.877 142.795 142.71 142.58 142.331 142.152 141.962 141.869 141.658 141.424 141.156 141.0 140.48 140.411 140.177 139.944 139.443 139.13 138.777 138.344 137.761 137.036 136.131 133.041 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23479.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23479.txt deleted file mode 100644 index a9de9872..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23479.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17624 ,TETRA ,17605398,Sun Nov 28 18:55:50 CET,Sun Nov 28 20:46:24 CET,0.0 2.591 3.619 4.433 5.127 5.749 6.323 6.833 7.755 8.19 8.602 8.884 9.742 10.104 10.807 11.448 12.085 12.401 13.008 13.603 14.472 15.02 15.522 16.229 16.922 17.592 18.228 18.86 19.725 20.585 21.401 22.375 23.32 24.223 25.284 26.495 27.646 28.921 30.314 31.791 33.348 35.127 37.234 39.384 41.957 44.892 48.353 52.426 57.4 63.554 71.474 78.538 83.049 86.118 88.254 89.813 90.963 91.851 92.484 92.96 93.248 93.441 93.614 93.736 93.796 93.837 93.822 93.725 93.612 93.518 93.377 93.226 93.06 92.82 92.631 92.436 92.214 91.947 91.648 91.44 91.206 90.853 90.595 90.268 90.089 89.71 89.312 88.911 88.695 88.053 87.958 87.657 87.332 86.687 86.315 85.889 85.407 84.816 84.047 83.026 79.576 -2 ,21727 ,TETRA ,17605399,Sun Nov 28 18:55:51 CET,Sun Nov 28 20:46:15 CET,0.0 2.933 4.056 4.908 5.63 6.268 6.848 7.37 8.319 8.774 9.22 9.554 10.425 10.788 11.505 12.213 12.87 13.201 13.866 14.479 15.346 15.907 16.439 17.218 17.977 18.685 19.372 20.052 20.941 21.792 22.578 23.517 24.45 25.346 26.358 27.556 28.748 30.031 31.486 33.027 34.59 36.375 38.515 40.744 43.348 46.273 49.677 53.72 58.758 64.968 72.949 80.045 84.506 87.566 89.744 91.4 92.58 93.421 94.011 94.482 94.821 95.048 95.197 95.249 95.244 95.222 95.16 95.034 94.91 94.781 94.613 94.447 94.223 93.995 93.827 93.619 93.403 93.175 92.898 92.679 92.428 92.023 91.746 91.448 91.279 90.934 90.549 90.107 89.887 89.248 89.175 88.918 88.634 87.954 87.567 87.148 86.676 86.127 85.386 84.277 80.998 -3 ,8428 ,TETRA ,17605400,Sun Nov 28 18:55:50 CET,Sun Nov 28 20:47:45 CET,0.0 1.798 2.629 3.341 3.967 4.504 4.991 5.432 6.216 6.597 6.973 7.168 8.009 8.34 8.985 9.598 10.184 10.468 11.023 11.574 12.384 12.886 13.368 14.084 14.751 15.411 16.065 16.694 17.522 18.295 19.067 20.011 20.873 21.727 22.734 23.863 25.002 26.225 27.556 29.031 30.583 32.354 34.465 36.616 39.151 42.065 45.509 49.553 54.552 60.833 69.02 76.469 81.292 84.709 87.169 89.018 90.448 91.562 92.307 92.896 93.367 93.77 94.05 94.207 94.34 94.466 94.549 94.599 94.605 94.539 94.441 94.329 94.21 94.123 94.029 93.861 93.656 93.428 93.185 93.01 92.817 92.512 92.274 92.002 91.843 91.472 91.09 90.701 90.49 89.853 89.763 89.49 89.182 88.494 88.098 87.612 87.092 86.532 85.826 84.899 81.648 -4 ,22583 ,TETRA ,17605401,Sun Nov 28 18:55:52 CET,Sun Nov 28 20:47:52 CET,0.0 2.03 2.933 3.648 4.245 4.791 5.313 5.796 6.681 7.095 7.489 7.711 8.531 8.86 9.53 10.159 10.765 11.071 11.677 12.24 13.005 13.515 14.013 14.697 15.378 16.063 16.717 17.346 18.151 18.901 19.612 20.494 21.371 22.244 23.237 24.307 25.378 26.58 27.869 29.254 30.762 32.521 34.616 36.751 39.302 42.236 45.722 49.811 54.82 61.097 69.392 76.969 81.851 85.232 87.682 89.536 90.918 92.004 92.827 93.545 94.03 94.384 94.667 94.872 95.04 95.152 95.201 95.226 95.249 95.233 95.161 95.056 94.933 94.814 94.716 94.594 94.433 94.243 94.02 93.858 93.687 93.327 93.037 92.73 92.56 92.238 91.905 91.497 91.272 90.62 90.452 90.149 89.832 89.165 88.796 88.341 87.775 87.091 86.26 85.183 81.92 -5 ,2066 ,TETRA ,17605402,Sun Nov 28 18:55:54 CET,Sun Nov 28 20:47:38 CET,0.0 1.793 2.723 3.479 4.095 4.644 5.15 5.612 6.457 6.88 7.281 7.51 8.344 8.668 9.31 9.921 10.514 10.817 11.406 12.003 12.839 13.304 13.771 14.472 15.148 15.839 16.51 17.126 17.924 18.722 19.494 20.409 21.289 22.175 23.209 24.352 25.478 26.72 28.078 29.541 31.082 32.826 34.855 36.933 39.445 42.377 45.872 49.973 54.954 61.167 69.472 77.052 81.996 85.448 87.853 89.684 91.124 92.223 93.022 93.768 94.324 94.734 95.045 95.243 95.405 95.512 95.576 95.618 95.612 95.592 95.539 95.457 95.362 95.223 95.098 94.958 94.761 94.557 94.357 94.199 94.036 93.77 93.572 93.343 93.195 92.836 92.433 92.037 91.841 91.217 91.136 90.867 90.574 89.909 89.535 89.109 88.626 88.016 87.22 86.19 83.224 -6 ,19361 ,TETRA ,17605403,Sun Nov 28 18:55:51 CET,Sun Nov 28 20:47:47 CET,0.0 2.669 3.732 4.561 5.285 5.901 6.457 7.015 8.023 8.474 8.906 9.193 10.054 10.41 11.091 11.747 12.378 12.683 13.273 13.837 14.642 15.166 15.669 16.398 17.124 17.828 18.495 19.17 20.045 20.859 21.644 22.617 23.597 24.51 25.514 26.647 27.767 29.013 30.382 31.863 33.416 35.189 37.301 39.457 42.016 44.949 48.464 52.585 57.602 63.849 72.035 79.463 84.2 87.577 89.988 91.72 93.015 94.009 94.713 95.27 95.668 95.989 96.206 96.327 96.418 96.455 96.44 96.4 96.329 96.202 96.033 95.912 95.779 95.598 95.403 95.157 94.902 94.631 94.344 94.126 93.88 93.504 93.223 92.929 92.772 92.407 91.994 91.565 91.331 90.685 90.579 90.298 90.02 89.395 89.024 88.61 88.105 87.486 86.746 85.806 82.475 -7 ,31162 ,TETRA ,17605404,Sun Nov 28 18:55:54 CET,Sun Nov 28 20:47:30 CET,0.0 1.566 2.495 3.231 3.846 4.394 4.897 5.377 6.254 6.666 7.065 7.297 8.144 8.48 9.138 9.753 10.323 10.608 11.174 11.724 12.494 12.986 13.483 14.204 14.901 15.583 16.244 16.879 17.701 18.502 19.267 20.2 21.104 21.987 23.023 24.176 25.292 26.56 27.909 29.362 30.937 32.712 34.828 36.987 39.526 42.457 45.937 49.964 54.968 61.21 69.351 76.794 81.618 85.05 87.548 89.461 90.894 92.019 92.87 93.534 94.007 94.384 94.678 94.923 95.109 95.219 95.244 95.215 95.165 95.081 94.987 94.866 94.715 94.556 94.404 94.241 94.086 93.914 93.68 93.51 93.325 92.989 92.759 92.521 92.378 92.095 91.784 91.418 91.23 90.624 90.58 90.323 90.029 89.364 89.017 88.626 88.205 87.698 87.054 86.181 83.308 -8 ,20018 ,TETRA ,17605405,Sun Nov 28 18:55:51 CET,Sun Nov 28 20:47:21 CET,0.0 3.04 4.155 4.932 5.585 6.201 6.755 7.262 8.23 8.686 9.13 9.46 10.337 10.71 11.43 12.094 12.715 13.039 13.694 14.293 15.125 15.674 16.201 16.962 17.703 18.413 19.124 19.806 20.664 21.505 22.328 23.373 24.399 25.379 26.503 27.704 28.868 30.228 31.706 33.242 34.812 36.576 38.73 40.957 43.583 46.547 50.046 54.167 59.227 65.498 73.638 80.923 85.516 88.541 90.639 92.245 93.427 94.302 94.942 95.446 95.8 96.051 96.198 96.29 96.336 96.346 96.314 96.225 96.108 95.978 95.858 95.737 95.551 95.305 95.086 94.815 94.509 94.169 93.819 93.596 93.349 92.968 92.701 92.401 92.234 91.864 91.479 91.078 90.866 90.238 90.104 89.792 89.47 88.744 88.337 87.901 87.38 86.784 86.059 85.009 81.633 -9 ,30405 ,TETRA ,17605406,Sun Nov 28 18:55:51 CET,Sun Nov 28 20:47:39 CET,0.0 1.802 2.763 3.576 4.24 4.818 5.361 5.879 6.837 7.27 7.68 7.99 8.857 9.206 9.896 10.56 11.193 11.497 12.081 12.643 13.453 13.973 14.494 15.259 15.996 16.709 17.396 18.046 18.92 19.783 20.575 21.526 22.458 23.365 24.411 25.575 26.733 28.0 29.347 30.805 32.369 34.179 36.322 38.537 41.159 44.119 47.602 51.624 56.608 62.85 71.001 78.413 83.18 86.522 88.938 90.756 92.109 93.139 93.897 94.54 95.005 95.363 95.649 95.827 95.938 96.017 96.025 96.002 95.925 95.816 95.695 95.566 95.424 95.235 95.07 94.896 94.707 94.487 94.246 94.072 93.85 93.471 93.212 92.932 92.786 92.48 92.15 91.787 91.572 90.944 90.865 90.587 90.301 89.733 89.401 89.034 88.618 88.118 87.514 86.673 83.792 -10 ,372 ,TETRA ,17605407,Sun Nov 28 18:56:35 CET,Sun Nov 28 20:42:02 CET,0.0 2.531 3.677 4.567 5.396 6.134 6.756 7.324 8.35 8.807 9.238 9.542 10.409 10.768 11.46 12.123 12.758 13.071 13.715 14.353 15.245 15.789 16.299 17.035 17.757 18.487 19.205 19.892 20.774 21.63 22.435 23.395 24.32 25.223 26.318 27.559 28.755 30.068 31.476 32.985 34.566 36.35 38.478 40.677 43.264 46.181 49.619 53.647 58.605 64.761 72.789 79.978 84.509 87.656 89.919 91.597 92.799 93.667 94.302 94.855 95.189 95.422 95.603 95.693 95.704 95.682 95.654 95.612 95.563 95.471 95.315 95.172 95.028 94.869 94.73 94.546 94.309 94.05 93.765 93.571 93.378 93.047 92.807 92.524 92.367 92.027 91.656 91.271 91.046 90.398 90.278 89.989 89.693 89.011 88.587 88.113 87.605 86.997 86.255 85.27 82.127 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23483_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23483_23482.txt deleted file mode 100644 index f1c54755..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23483_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22102 ,TETRA ,17605408,Sun Nov 28 18:56:18 CET,Sun Nov 28 20:48:56 CET,0.0 1.881 2.552 3.086 3.537 3.942 4.312 4.664 5.331 5.629 5.901 5.926 6.647 6.881 7.335 7.752 8.119 8.286 8.613 8.937 9.393 9.693 9.991 10.404 10.798 11.155 11.475 11.788 12.19 12.603 12.956 13.301 13.656 14.032 14.462 14.877 15.25 15.679 16.12 16.507 16.871 17.25 17.608 17.911 18.195 18.411 18.561 18.558 18.267 17.496 15.721 13.189 10.916 8.89 7.132 5.543 4.097 2.798 1.701 0.59 -0.383 -1.249 -2.06 -2.826 -3.591 -4.349 -5.135 -5.809 -6.388 -6.977 -7.595 -8.124 -8.693 -9.294 -9.762 -10.258 -10.782 -11.321 -11.936 -12.384 -12.806 -13.459 -13.914 -14.378 -14.624 -15.18 -15.774 -16.383 -16.709 -17.536 -17.725 -18.108 -18.536 -19.453 -19.952 -20.482 -21.085 -21.772 -22.652 -23.896 -28.455 -2 ,26909 ,TETRA ,17605409,Sun Nov 28 18:56:20 CET,Sun Nov 28 20:49:47 CET,0.0 1.844 2.581 3.208 3.738 4.162 4.541 4.886 5.493 5.76 6.016 5.999 6.706 6.93 7.374 7.771 8.143 8.324 8.652 8.96 9.391 9.676 9.972 10.39 10.781 11.138 11.465 11.819 12.265 12.654 13.04 13.466 13.818 14.171 14.589 15.029 15.438 15.845 16.236 16.633 17.01 17.354 17.704 17.993 18.302 18.591 18.745 18.685 18.355 17.568 15.843 13.361 11.146 9.237 7.513 5.966 4.632 3.366 2.232 1.169 0.24 -0.635 -1.499 -2.344 -3.096 -3.768 -4.489 -5.148 -5.702 -6.305 -6.978 -7.529 -8.098 -8.721 -9.233 -9.734 -10.256 -10.818 -11.404 -11.834 -12.268 -12.922 -13.379 -13.871 -14.138 -14.687 -15.239 -15.832 -16.157 -16.995 -17.211 -17.597 -18.002 -18.871 -19.399 -19.997 -20.656 -21.382 -22.211 -23.293 -26.939 -3 ,27924 ,TETRA ,17605410,Sun Nov 28 18:56:21 CET,Sun Nov 28 20:49:13 CET,0.0 2.469 3.328 3.891 4.374 4.768 5.124 5.476 6.077 6.355 6.632 6.679 7.407 7.64 8.075 8.507 8.943 9.143 9.502 9.834 10.328 10.646 10.937 11.349 11.73 12.086 12.439 12.77 13.156 13.516 13.845 14.23 14.583 14.908 15.295 15.711 16.093 16.47 16.841 17.184 17.448 17.726 18.026 18.254 18.476 18.676 18.768 18.658 18.252 17.266 15.261 12.522 10.047 7.918 6.061 4.404 2.946 1.556 0.374 -0.807 -1.864 -2.781 -3.656 -4.483 -5.248 -5.961 -6.689 -7.358 -7.967 -8.628 -9.33 -9.916 -10.524 -11.134 -11.612 -12.114 -12.644 -13.215 -13.828 -14.263 -14.709 -15.427 -15.923 -16.438 -16.697 -17.229 -17.806 -18.449 -18.793 -19.62 -19.839 -20.236 -20.648 -21.557 -22.071 -22.63 -23.312 -24.069 -24.886 -26.053 -31.274 -4 ,28781 ,TETRA ,17605411,Sun Nov 28 18:56:20 CET,Sun Nov 28 20:49:11 CET,0.0 1.465 2.167 2.712 3.17 3.543 3.888 4.211 4.812 5.101 5.372 5.385 6.104 6.338 6.833 7.313 7.732 7.925 8.299 8.625 9.071 9.371 9.679 10.108 10.499 10.873 11.223 11.54 11.924 12.301 12.627 12.998 13.375 13.752 14.203 14.66 15.008 15.343 15.713 16.149 16.551 16.87 17.2 17.546 17.897 18.12 18.217 18.144 17.797 16.9 15.103 12.727 10.593 8.655 6.881 5.287 3.924 2.693 1.611 0.475 -0.51 -1.409 -2.29 -3.096 -3.894 -4.638 -5.403 -6.112 -6.704 -7.331 -8.023 -8.628 -9.279 -9.924 -10.428 -11.0 -11.604 -12.218 -12.863 -13.317 -13.785 -14.5 -15.004 -15.542 -15.823 -16.399 -17.032 -17.74 -18.116 -18.992 -19.344 -19.801 -20.253 -21.321 -21.915 -22.568 -23.328 -24.175 -25.165 -26.574 -31.748 -5 ,15532 ,TETRA ,17605412,Sun Nov 28 18:56:20 CET,Sun Nov 28 20:48:49 CET,0.0 1.691 2.365 2.88 3.324 3.716 4.099 4.475 5.121 5.407 5.674 5.672 6.401 6.617 7.029 7.426 7.807 7.991 8.336 8.646 9.075 9.346 9.608 9.989 10.329 10.657 10.969 11.269 11.644 11.954 12.239 12.579 12.937 13.263 13.623 14.038 14.369 14.682 15.026 15.385 15.748 16.143 16.535 16.85 17.094 17.269 17.38 17.324 16.976 16.212 14.343 11.744 9.503 7.499 5.763 4.142 2.72 1.465 0.351 -0.769 -1.743 -2.617 -3.457 -4.26 -5.03 -5.794 -6.643 -7.396 -8.053 -8.73 -9.405 -9.97 -10.543 -11.15 -11.656 -12.217 -12.805 -13.405 -14.094 -14.581 -15.073 -15.843 -16.358 -16.906 -17.196 -17.795 -18.454 -19.133 -19.466 -20.323 -20.623 -21.075 -21.577 -22.649 -23.269 -23.95 -24.697 -25.549 -26.632 -28.038 -35.771 -6 ,31614 ,TETRA ,17605413,Sun Nov 28 18:56:20 CET,Sun Nov 28 20:49:10 CET,0.0 2.061 2.757 3.238 3.626 4.001 4.338 4.632 5.149 5.377 5.604 5.545 6.218 6.401 6.756 7.109 7.444 7.595 7.893 8.218 8.678 8.916 9.148 9.485 9.84 10.202 10.509 10.814 11.204 11.555 11.912 12.323 12.703 13.067 13.441 13.821 14.161 14.56 14.965 15.364 15.767 16.155 16.531 16.824 17.074 17.216 17.267 17.141 16.716 15.738 13.613 10.758 8.242 6.005 4.137 2.478 0.962 -0.464 -1.647 -2.796 -3.815 -4.756 -5.659 -6.507 -7.362 -8.143 -8.952 -9.685 -10.296 -10.922 -11.616 -12.253 -12.87 -13.497 -13.999 -14.508 -15.048 -15.586 -16.162 -16.57 -16.997 -17.701 -18.184 -18.659 -18.906 -19.482 -20.119 -20.793 -21.14 -21.99 -22.273 -22.669 -23.077 -23.959 -24.462 -25.025 -25.647 -26.314 -27.132 -28.337 -33.648 -7 ,30932 ,TETRA ,17605414,Sun Nov 28 18:56:19 CET,Sun Nov 28 20:50:09 CET,0.0 1.879 2.641 3.217 3.694 4.143 4.537 4.906 5.588 5.885 6.174 6.241 6.978 7.244 7.796 8.294 8.736 8.937 9.303 9.637 10.095 10.393 10.682 11.104 11.522 11.901 12.255 12.629 13.11 13.522 13.883 14.288 14.637 14.961 15.335 15.751 16.136 16.52 16.903 17.283 17.598 17.848 18.138 18.407 18.611 18.781 18.846 18.716 18.224 17.199 15.16 12.24 9.675 7.536 5.678 3.98 2.506 1.139 -0.083 -1.297 -2.319 -3.227 -4.098 -4.92 -5.706 -6.436 -7.218 -7.945 -8.575 -9.194 -9.87 -10.466 -11.059 -11.692 -12.214 -12.768 -13.339 -13.931 -14.568 -14.993 -15.431 -16.169 -16.679 -17.178 -17.446 -18.026 -18.624 -19.281 -19.621 -20.472 -20.738 -21.117 -21.531 -22.468 -22.99 -23.546 -24.15 -24.926 -25.819 -26.975 -30.94 -8 ,11946 ,TETRA ,17605415,Sun Nov 28 18:57:19 CET,Sun Nov 28 20:57:37 CET,0.0 2.189 3.049 3.701 4.243 4.701 5.124 5.475 6.056 6.339 6.632 6.693 7.427 7.658 8.121 8.549 8.898 9.063 9.379 9.695 10.151 10.423 10.682 11.046 11.388 11.732 12.058 12.366 12.766 13.131 13.477 13.89 14.261 14.619 15.013 15.422 15.799 16.155 16.527 16.927 17.288 17.614 17.95 18.267 18.585 18.814 18.972 18.965 18.639 17.854 16.107 13.669 11.443 9.516 7.824 6.25 4.799 3.461 2.306 1.194 0.278 -0.589 -1.437 -2.25 -3.041 -3.757 -4.49 -5.147 -5.762 -6.44 -7.121 -7.652 -8.209 -8.828 -9.33 -9.862 -10.425 -10.999 -11.571 -11.989 -12.438 -13.11 -13.562 -14.051 -14.325 -14.894 -15.477 -16.073 -16.387 -17.22 -17.431 -17.823 -18.236 -19.131 -19.663 -20.243 -20.869 -21.624 -22.509 -23.539 -28.033 -9 ,5429 ,TETRA ,17605416,Sun Nov 28 18:57:19 CET,Sun Nov 28 20:53:36 CET,0.0 2.125 2.991 3.652 4.199 4.655 5.057 5.419 6.037 6.308 6.575 6.599 7.316 7.549 8.001 8.413 8.8 8.982 9.325 9.643 10.085 10.368 10.635 11.025 11.406 11.743 12.093 12.411 12.734 13.055 13.362 13.77 14.185 14.543 14.926 15.365 15.78 16.187 16.613 17.015 17.358 17.701 18.081 18.412 18.67 18.866 18.999 18.995 18.702 17.865 16.127 13.741 11.555 9.623 7.886 6.28 4.873 3.597 2.474 1.37 0.424 -0.437 -1.276 -2.109 -2.881 -3.562 -4.28 -4.944 -5.539 -6.193 -6.893 -7.408 -7.955 -8.571 -9.021 -9.533 -10.094 -10.654 -11.26 -11.667 -12.062 -12.683 -13.134 -13.647 -13.922 -14.478 -15.034 -15.599 -15.907 -16.749 -17.031 -17.439 -17.872 -18.808 -19.344 -19.94 -20.59 -21.311 -22.19 -23.373 -26.572 -10 ,10698 ,TETRA ,17605417,Sun Nov 28 18:57:20 CET,Sun Nov 28 20:51:43 CET,0.0 2.085 2.811 3.359 3.82 4.23 4.605 4.947 5.552 5.837 6.123 6.177 6.913 7.145 7.559 7.931 8.291 8.468 8.809 9.139 9.611 9.914 10.204 10.647 11.065 11.429 11.766 12.115 12.573 12.984 13.329 13.709 14.1 14.498 14.929 15.336 15.713 16.091 16.434 16.786 17.158 17.517 17.822 18.08 18.313 18.495 18.576 18.403 17.911 16.969 14.859 12.017 9.652 7.602 5.847 4.239 2.812 1.558 0.453 -0.708 -1.713 -2.593 -3.451 -4.373 -5.203 -5.889 -6.646 -7.343 -7.928 -8.57 -9.284 -9.846 -10.407 -11.017 -11.486 -11.963 -12.474 -13.037 -13.638 -14.038 -14.449 -15.13 -15.619 -16.112 -16.373 -16.93 -17.513 -18.106 -18.409 -19.227 -19.411 -19.79 -20.206 -21.105 -21.606 -22.136 -22.698 -23.317 -24.105 -25.157 -28.64 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23484.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23484.txt deleted file mode 100644 index c47d56f2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23484.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24214 ,TETRA ,17605418,Sun Nov 28 18:57:20 CET,Sun Nov 28 20:47:34 CET,0.0 0.708 1.159 1.546 1.896 2.192 2.437 2.685 3.188 3.42 3.633 3.566 4.23 4.403 4.749 5.069 5.363 5.508 5.806 6.11 6.567 6.829 7.07 7.449 7.801 8.125 8.443 8.791 9.289 9.723 10.11 10.578 11.022 11.442 11.92 12.454 12.956 13.506 14.113 14.753 15.381 16.065 16.855 17.632 18.589 19.643 20.755 21.985 23.396 24.937 26.367 27.237 27.413 27.2 26.864 26.397 25.893 25.402 24.959 24.481 23.992 23.514 23.052 22.6 22.178 21.778 21.358 20.968 20.611 20.249 19.863 19.534 19.165 18.761 18.453 18.138 17.799 17.447 17.093 16.831 16.552 16.12 15.818 15.524 15.365 15.014 14.654 14.253 14.029 13.316 13.271 12.996 12.714 12.1 11.786 11.467 11.086 10.659 10.158 9.486 7.862 -2 ,26843 ,TETRA ,17605419,Sun Nov 28 18:57:20 CET,Sun Nov 28 20:52:21 CET,0.0 0.951 1.397 1.791 2.146 2.441 2.701 2.951 3.446 3.688 3.907 3.824 4.49 4.66 4.985 5.303 5.608 5.758 6.054 6.345 6.753 6.999 7.255 7.646 8.021 8.368 8.686 8.98 9.368 9.764 10.146 10.595 11.023 11.458 11.949 12.459 12.971 13.531 14.092 14.691 15.327 16.018 16.825 17.638 18.546 19.519 20.602 21.839 23.178 24.483 25.756 26.422 26.545 26.35 25.958 25.441 24.935 24.472 24.015 23.504 23.014 22.551 22.086 21.627 21.185 20.762 20.323 19.92 19.584 19.235 18.833 18.499 18.124 17.732 17.423 17.087 16.751 16.394 16.01 15.731 15.439 14.962 14.641 14.315 14.144 13.797 13.411 12.995 12.777 12.07 12.057 11.808 11.55 11.006 10.69 10.327 9.92 9.45 8.889 8.147 6.591 -3 ,27285 ,TETRA ,17605420,Sun Nov 28 18:57:20 CET,Sun Nov 28 20:50:35 CET,0.0 1.109 1.564 1.941 2.265 2.552 2.791 3.001 3.413 3.619 3.818 3.695 4.358 4.537 4.901 5.232 5.533 5.696 6.014 6.323 6.761 7.021 7.262 7.606 7.969 8.312 8.601 8.898 9.304 9.674 10.029 10.46 10.873 11.282 11.755 12.27 12.768 13.299 13.859 14.462 15.091 15.815 16.607 17.36 18.252 19.258 20.384 21.602 23.004 24.533 26.03 26.721 26.767 26.569 26.199 25.747 25.251 24.741 24.239 23.703 23.228 22.795 22.367 21.946 21.554 21.155 20.712 20.317 19.969 19.593 19.181 18.852 18.521 18.154 17.86 17.542 17.196 16.832 16.449 16.179 15.886 15.429 15.126 14.803 14.633 14.274 13.88 13.465 13.257 12.562 12.552 12.283 12.021 11.49 11.179 10.833 10.433 9.955 9.414 8.712 7.324 -4 ,32155 ,TETRA ,17605421,Sun Nov 28 18:57:21 CET,Sun Nov 28 20:53:07 CET,0.0 0.949 1.375 1.724 2.049 2.364 2.652 2.906 3.367 3.583 3.778 3.662 4.315 4.48 4.816 5.099 5.379 5.525 5.819 6.117 6.534 6.795 7.079 7.49 7.831 8.143 8.449 8.785 9.232 9.629 9.992 10.438 10.85 11.236 11.709 12.243 12.733 13.269 13.887 14.502 15.099 15.795 16.622 17.444 18.364 19.334 20.401 21.582 22.913 24.339 25.695 26.391 26.439 26.206 25.86 25.373 24.824 24.294 23.871 23.364 22.866 22.421 21.971 21.533 21.101 20.693 20.267 19.878 19.519 19.148 18.759 18.418 18.072 17.716 17.406 17.068 16.697 16.306 15.931 15.659 15.364 14.905 14.599 14.274 14.097 13.749 13.384 12.985 12.771 12.074 12.084 11.841 11.58 10.97 10.642 10.28 9.872 9.435 8.905 8.149 6.51 -5 ,10759 ,TETRA ,17605422,Sun Nov 28 18:57:24 CET,Sun Nov 28 20:53:07 CET,0.0 0.738 1.197 1.587 1.927 2.226 2.503 2.749 3.195 3.409 3.608 3.501 4.156 4.333 4.662 5.02 5.377 5.525 5.8 6.069 6.435 6.689 6.957 7.312 7.639 7.943 8.244 8.576 9.029 9.431 9.786 10.236 10.676 11.089 11.565 12.105 12.618 13.162 13.723 14.343 15.007 15.728 16.539 17.317 18.21 19.169 20.213 21.375 22.767 24.31 25.796 26.488 26.557 26.433 26.108 25.666 25.202 24.701 24.244 23.726 23.226 22.78 22.332 21.902 21.513 21.133 20.687 20.259 19.897 19.525 19.099 18.732 18.358 17.985 17.702 17.396 17.057 16.698 16.328 16.052 15.755 15.315 15.008 14.69 14.53 14.182 13.784 13.344 13.112 12.404 12.355 12.078 11.804 11.172 10.814 10.431 10.01 9.526 8.926 8.172 6.858 -6 ,1176 ,TETRA ,17605423,Sun Nov 28 18:57:25 CET,Sun Nov 28 20:53:22 CET,0.0 0.728 1.201 1.586 1.924 2.227 2.492 2.729 3.16 3.363 3.573 3.513 4.181 4.369 4.744 5.068 5.385 5.544 5.851 6.153 6.548 6.799 7.037 7.39 7.746 8.088 8.416 8.726 9.129 9.499 9.85 10.276 10.679 11.087 11.579 12.112 12.595 13.116 13.69 14.302 14.925 15.616 16.45 17.26 18.161 19.145 20.264 21.504 22.855 24.237 25.621 26.365 26.442 26.22 25.879 25.489 25.043 24.546 24.068 23.54 23.053 22.612 22.131 21.639 21.169 20.7 20.195 19.781 19.433 19.04 18.611 18.265 17.91 17.521 17.209 16.88 16.549 16.19 15.81 15.561 15.298 14.865 14.556 14.243 14.08 13.74 13.375 12.991 12.788 12.093 12.12 11.891 11.636 11.031 10.7 10.344 9.903 9.396 8.804 8.088 6.369 -7 ,23875 ,TETRA ,17605424,Sun Nov 28 18:57:22 CET,Sun Nov 28 20:47:21 CET,0.0 0.743 1.199 1.577 1.874 2.14 2.388 2.614 3.045 3.247 3.45 3.356 4.018 4.187 4.526 4.845 5.134 5.279 5.556 5.837 6.245 6.49 6.729 7.079 7.405 7.726 8.028 8.312 8.697 9.07 9.46 9.963 10.407 10.826 11.31 11.826 12.323 12.872 13.473 14.075 14.692 15.41 16.266 17.065 17.922 18.892 20.047 21.338 22.675 24.188 25.812 26.657 26.882 26.767 26.443 25.956 25.423 24.892 24.375 23.809 23.331 22.89 22.433 21.996 21.576 21.167 20.709 20.287 19.941 19.599 19.221 18.882 18.527 18.154 17.852 17.521 17.169 16.794 16.405 16.154 15.899 15.476 15.16 14.818 14.646 14.291 13.914 13.523 13.309 12.6 12.593 12.333 12.053 11.406 11.048 10.66 10.201 9.662 9.048 8.327 6.669 -8 ,15474 ,TETRA ,17605425,Sun Nov 28 18:57:24 CET,Sun Nov 28 20:46:15 CET,0.0 0.772 1.209 1.548 1.882 2.174 2.415 2.65 3.089 3.291 3.487 3.385 4.042 4.229 4.58 4.895 5.183 5.322 5.608 5.885 6.267 6.537 6.819 7.202 7.548 7.875 8.175 8.475 8.893 9.312 9.71 10.151 10.581 11.004 11.469 11.961 12.437 12.966 13.532 14.133 14.785 15.512 16.331 17.148 18.095 19.131 20.234 21.465 22.926 24.497 26.129 27.038 27.183 26.942 26.569 26.18 25.742 25.234 24.736 24.188 23.685 23.234 22.764 22.292 21.838 21.401 20.961 20.57 20.221 19.853 19.45 19.107 18.757 18.384 18.093 17.778 17.439 17.075 16.675 16.398 16.118 15.708 15.431 15.101 14.915 14.544 14.173 13.782 13.562 12.861 12.895 12.651 12.395 11.788 11.432 11.049 10.618 10.129 9.493 8.615 6.408 -9 ,17041 ,TETRA ,17605426,Sun Nov 28 18:57:21 CET,Sun Nov 28 20:51:14 CET,0.0 1.088 1.585 1.967 2.306 2.606 2.875 3.118 3.578 3.798 3.992 3.883 4.555 4.731 5.084 5.448 5.773 5.915 6.197 6.465 6.873 7.147 7.395 7.726 8.025 8.33 8.642 8.936 9.323 9.728 10.109 10.531 10.933 11.322 11.777 12.291 12.772 13.286 13.828 14.416 15.032 15.688 16.457 17.221 18.063 19.053 20.214 21.417 22.72 24.139 25.605 26.401 26.593 26.444 26.094 25.634 25.125 24.609 24.152 23.665 23.238 22.814 22.361 21.938 21.518 21.084 20.634 20.237 19.878 19.498 19.096 18.761 18.394 18.011 17.719 17.413 17.095 16.741 16.365 16.113 15.842 15.411 15.112 14.811 14.649 14.284 13.907 13.518 13.311 12.616 12.633 12.389 12.137 11.582 11.277 10.941 10.561 10.123 9.639 9.03 7.848 -10 ,25662 ,TETRA ,17605427,Sun Nov 28 18:58:19 CET,Sun Nov 28 20:55:38 CET,0.0 0.979 1.402 1.721 1.989 2.244 2.49 2.741 3.228 3.449 3.669 3.607 4.271 4.446 4.758 5.047 5.344 5.495 5.787 6.072 6.486 6.753 6.995 7.328 7.674 8.027 8.348 8.644 9.022 9.387 9.749 10.192 10.622 11.032 11.49 11.986 12.448 12.967 13.559 14.151 14.738 15.417 16.221 17.037 17.925 18.894 20.005 21.213 22.593 24.118 25.596 26.274 26.36 26.188 25.867 25.421 24.913 24.424 23.986 23.471 22.978 22.534 22.085 21.62 21.155 20.702 20.226 19.801 19.427 19.016 18.584 18.24 17.879 17.51 17.224 16.9 16.533 16.17 15.821 15.574 15.306 14.86 14.529 14.174 13.995 13.635 13.267 12.876 12.67 11.981 11.994 11.736 11.466 10.874 10.559 10.233 9.868 9.441 8.918 8.22 6.744 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23485.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23485.txt deleted file mode 100644 index 6a588ebb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23485.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,686 ,TETRA ,17605428,Sun Nov 28 18:58:22 CET,Sun Nov 28 20:56:12 CET,0.0 2.522 3.469 4.104 4.634 5.101 5.488 5.811 6.393 6.661 6.922 6.924 7.639 7.86 8.255 8.642 8.987 9.14 9.429 9.712 10.118 10.378 10.63 10.984 11.334 11.66 11.96 12.251 12.616 12.921 13.195 13.534 13.871 14.191 14.549 14.933 15.297 15.683 16.094 16.511 16.897 17.324 17.763 18.167 18.631 19.044 19.405 19.708 19.899 19.832 19.229 18.022 16.741 15.513 14.363 13.314 12.367 11.495 10.718 9.891 9.197 8.605 7.984 7.381 6.811 6.235 5.626 5.105 4.652 4.177 3.698 3.295 2.854 2.38 2.018 1.637 1.241 0.82 0.377 0.087 -0.217 -0.715 -1.074 -1.454 -1.646 -2.038 -2.451 -2.863 -3.088 -3.846 -3.877 -4.139 -4.402 -5.0 -5.354 -5.774 -6.254 -6.774 -7.308 -7.983 -9.401 -2 ,29239 ,TETRA ,17605429,Sun Nov 28 18:57:22 CET,Sun Nov 28 20:53:07 CET,0.0 2.198 2.974 3.574 4.075 4.502 4.884 5.258 5.872 6.133 6.385 6.347 7.049 7.243 7.629 7.999 8.336 8.506 8.845 9.158 9.586 9.852 10.103 10.448 10.772 11.097 11.426 11.726 12.078 12.424 12.754 13.124 13.456 13.78 14.172 14.583 14.953 15.332 15.726 16.131 16.515 16.929 17.394 17.82 18.239 18.638 19.062 19.434 19.621 19.517 18.907 17.628 16.328 15.071 13.948 13.019 12.162 11.337 10.601 9.833 9.139 8.457 7.79 7.181 6.595 6.047 5.442 4.89 4.453 3.992 3.488 3.081 2.653 2.214 1.878 1.496 1.1 0.699 0.271 -0.011 -0.302 -0.78 -1.109 -1.456 -1.638 -2.045 -2.485 -2.944 -3.195 -3.933 -3.899 -4.166 -4.442 -5.034 -5.373 -5.742 -6.132 -6.557 -7.05 -7.667 -9.004 -3 ,13673 ,TETRA ,17605430,Sun Nov 28 18:57:22 CET,Sun Nov 28 20:54:13 CET,0.0 2.407 3.255 3.874 4.364 4.813 5.235 5.595 6.185 6.466 6.741 6.722 7.424 7.641 8.074 8.488 8.85 9.019 9.328 9.62 10.037 10.282 10.533 10.902 11.215 11.494 11.754 11.989 12.281 12.555 12.821 13.149 13.512 13.876 14.22 14.589 14.936 15.304 15.685 16.037 16.387 16.792 17.23 17.625 18.056 18.485 18.901 19.205 19.372 19.331 18.777 17.55 16.285 15.076 13.976 12.942 11.969 11.07 10.27 9.481 8.762 8.074 7.412 6.775 6.165 5.614 5.055 4.547 4.083 3.592 3.113 2.706 2.261 1.794 1.411 1.022 0.654 0.275 -0.135 -0.425 -0.73 -1.219 -1.569 -1.935 -2.115 -2.497 -2.911 -3.319 -3.53 -4.273 -4.253 -4.515 -4.809 -5.433 -5.789 -6.197 -6.622 -7.092 -7.646 -8.375 -9.845 -4 ,28827 ,TETRA ,17605431,Sun Nov 28 18:57:24 CET,Sun Nov 28 20:53:41 CET,0.0 1.954 2.72 3.345 3.852 4.273 4.633 4.948 5.517 5.785 6.03 6.001 6.698 6.899 7.271 7.613 7.943 8.104 8.437 8.741 9.187 9.465 9.755 10.172 10.497 10.815 11.095 11.359 11.719 12.044 12.34 12.696 13.057 13.403 13.765 14.145 14.511 14.887 15.264 15.644 16.014 16.417 16.86 17.29 17.712 18.086 18.417 18.65 18.817 18.781 18.135 16.858 15.626 14.498 13.438 12.388 11.44 10.568 9.741 8.893 8.197 7.547 6.92 6.357 5.815 5.3 4.751 4.227 3.773 3.3 2.771 2.325 1.873 1.406 1.048 0.688 0.302 -0.115 -0.547 -0.856 -1.18 -1.672 -2.009 -2.37 -2.566 -2.965 -3.377 -3.806 -4.032 -4.774 -4.754 -5.017 -5.305 -5.946 -6.311 -6.713 -7.16 -7.653 -8.178 -8.822 -9.971 -5 ,15740 ,TETRA ,17605432,Sun Nov 28 18:57:22 CET,Sun Nov 28 20:54:15 CET,0.0 2.293 3.102 3.753 4.285 4.715 5.094 5.423 6.008 6.284 6.545 6.54 7.246 7.465 7.874 8.246 8.583 8.742 9.058 9.367 9.781 10.042 10.316 10.673 11.005 11.313 11.589 11.863 12.205 12.537 12.864 13.229 13.572 13.902 14.267 14.651 14.999 15.377 15.778 16.172 16.545 16.948 17.387 17.776 18.188 18.601 19.017 19.353 19.569 19.565 18.987 17.756 16.478 15.265 14.138 13.035 12.007 11.085 10.325 9.59 8.895 8.237 7.597 6.982 6.394 5.838 5.245 4.716 4.286 3.841 3.339 2.931 2.513 2.075 1.731 1.356 0.965 0.553 0.111 -0.207 -0.527 -1.032 -1.378 -1.726 -1.908 -2.28 -2.684 -3.116 -3.344 -4.096 -4.104 -4.354 -4.622 -5.223 -5.559 -5.952 -6.38 -6.869 -7.414 -8.039 -9.174 -6 ,8739 ,TETRA ,17605433,Sun Nov 28 18:57:25 CET,Sun Nov 28 20:54:16 CET,0.0 2.469 3.306 3.922 4.443 4.877 5.252 5.618 6.246 6.524 6.788 6.767 7.457 7.668 8.054 8.393 8.711 8.877 9.206 9.507 9.913 10.163 10.401 10.795 11.185 11.504 11.817 12.103 12.45 12.799 13.137 13.544 13.892 14.214 14.579 14.964 15.321 15.682 16.061 16.44 16.824 17.233 17.664 18.087 18.524 18.934 19.321 19.603 19.793 19.711 19.033 17.803 16.543 15.311 14.138 13.061 12.103 11.212 10.422 9.632 8.944 8.285 7.645 7.029 6.418 5.869 5.307 4.811 4.369 3.874 3.359 2.947 2.514 2.051 1.684 1.313 0.915 0.488 0.069 -0.217 -0.524 -1.042 -1.395 -1.735 -1.912 -2.302 -2.724 -3.172 -3.399 -4.143 -4.142 -4.413 -4.704 -5.345 -5.68 -6.041 -6.46 -6.946 -7.537 -8.257 -9.618 -7 ,18427 ,TETRA ,17605434,Sun Nov 28 18:57:26 CET,Sun Nov 28 20:52:05 CET,0.0 2.479 3.337 3.971 4.458 4.862 5.244 5.592 6.199 6.479 6.744 6.773 7.497 7.716 8.095 8.445 8.802 8.972 9.286 9.585 10.005 10.264 10.509 10.873 11.197 11.49 11.778 12.052 12.415 12.773 13.099 13.481 13.829 14.135 14.47 14.835 15.183 15.564 15.951 16.353 16.756 17.182 17.638 18.028 18.433 18.81 19.174 19.512 19.73 19.691 19.103 17.92 16.655 15.42 14.272 13.203 12.256 11.368 10.555 9.728 9.041 8.433 7.817 7.213 6.653 6.125 5.53 4.996 4.542 4.068 3.586 3.173 2.715 2.209 1.816 1.419 1.029 0.624 0.182 -0.123 -0.435 -0.942 -1.294 -1.649 -1.841 -2.224 -2.604 -3.007 -3.226 -3.975 -3.958 -4.212 -4.5 -5.186 -5.557 -5.927 -6.312 -6.755 -7.284 -7.958 -9.467 -8 ,3507 ,TETRA ,17605435,Sun Nov 28 18:58:19 CET,Sun Nov 28 20:54:40 CET,0.0 2.648 3.477 4.078 4.592 5.056 5.461 5.832 6.501 6.781 7.026 7.002 7.7 7.905 8.289 8.636 8.968 9.134 9.438 9.748 10.187 10.446 10.706 11.076 11.411 11.733 12.047 12.346 12.713 13.05 13.371 13.74 14.13 14.499 14.873 15.278 15.664 16.064 16.449 16.829 17.22 17.632 18.061 18.469 18.91 19.325 19.659 19.952 20.168 20.109 19.458 18.174 16.911 15.774 14.675 13.554 12.601 11.717 10.915 10.173 9.526 8.872 8.203 7.579 7.01 6.46 5.854 5.328 4.883 4.42 3.932 3.508 3.057 2.578 2.191 1.803 1.41 0.999 0.574 0.288 -0.031 -0.532 -0.872 -1.23 -1.404 -1.775 -2.165 -2.571 -2.795 -3.54 -3.555 -3.827 -4.113 -4.703 -5.032 -5.41 -5.837 -6.343 -6.912 -7.629 -9.34 -9 ,825 ,TETRA ,17605436,Sun Nov 28 18:58:22 CET,Sun Nov 28 20:54:36 CET,0.0 2.635 3.379 3.938 4.464 4.923 5.302 5.631 6.236 6.519 6.786 6.794 7.495 7.7 8.1 8.472 8.809 8.97 9.276 9.563 9.959 10.223 10.491 10.853 11.182 11.504 11.804 12.084 12.437 12.777 13.102 13.48 13.828 14.144 14.481 14.833 15.16 15.542 15.958 16.372 16.792 17.212 17.642 18.061 18.483 18.871 19.245 19.542 19.697 19.576 18.907 17.671 16.395 15.194 14.106 13.071 12.111 11.176 10.342 9.482 8.737 8.066 7.404 6.795 6.218 5.673 5.132 4.659 4.236 3.781 3.271 2.835 2.379 1.912 1.561 1.188 0.774 0.314 -0.139 -0.445 -0.756 -1.25 -1.629 -2.038 -2.257 -2.684 -3.077 -3.497 -3.725 -4.464 -4.468 -4.745 -5.042 -5.705 -6.068 -6.431 -6.799 -7.257 -7.807 -8.516 -10.447 -10 ,21044 ,TETRA ,17605437,Sun Nov 28 18:58:19 CET,Sun Nov 28 20:55:26 CET,0.0 2.576 3.378 3.988 4.485 4.911 5.29 5.614 6.214 6.488 6.755 6.799 7.503 7.707 8.127 8.53 8.902 9.078 9.41 9.725 10.175 10.459 10.727 11.086 11.411 11.709 11.999 12.287 12.633 12.949 13.283 13.679 14.026 14.347 14.696 15.112 15.484 15.824 16.19 16.585 17.004 17.437 17.882 18.282 18.712 19.199 19.656 20.01 20.234 20.161 19.55 18.416 17.204 15.989 14.887 13.861 12.927 12.042 11.244 10.411 9.706 9.093 8.481 7.874 7.29 6.754 6.193 5.686 5.244 4.778 4.278 3.855 3.409 2.951 2.603 2.24 1.844 1.4 0.945 0.649 0.336 -0.158 -0.508 -0.867 -1.049 -1.421 -1.813 -2.245 -2.475 -3.227 -3.238 -3.506 -3.777 -4.388 -4.709 -5.045 -5.444 -5.9 -6.437 -7.186 -8.695 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1a_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1a_5.txt deleted file mode 100644 index 9656df13..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1a_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6732 ,TETRA ,17602287,Sun Nov 28 15:24:31 CET,Sun Nov 28 17:48:20 CET,0.0 0.472 0.719 0.922 1.119 1.329 1.516 1.661 1.899 2.009 2.126 2.23 2.432 2.527 2.719 2.895 3.055 3.134 3.286 3.433 3.655 3.789 3.915 4.098 4.295 4.498 4.685 4.865 5.096 5.306 5.514 5.771 6.002 6.212 6.445 6.703 6.95 7.223 7.531 7.86 8.197 8.568 8.997 9.431 9.928 10.474 11.07 11.721 12.473 13.267 14.082 14.578 14.746 14.743 14.678 14.522 14.253 13.957 13.666 13.415 13.219 13.033 12.865 12.71 12.55 12.377 12.193 12.031 11.891 11.739 11.58 11.46 11.335 11.193 11.089 10.975 10.852 10.727 10.594 10.499 10.389 10.223 10.102 9.962 9.896 9.762 9.627 9.466 9.376 9.18 9.071 8.961 8.86 8.649 8.533 8.427 8.311 8.145 7.963 7.74 6.982 -2 ,30771 ,TETRA ,17602288,Sun Nov 28 15:24:31 CET,Sun Nov 28 17:48:10 CET,0.0 0.402 0.616 0.849 1.078 1.242 1.397 1.549 1.819 1.93 2.035 2.12 2.318 2.407 2.572 2.728 2.87 2.941 3.104 3.254 3.451 3.596 3.744 3.946 4.135 4.325 4.508 4.661 4.861 5.075 5.258 5.469 5.686 5.882 6.123 6.415 6.693 6.991 7.321 7.671 8.018 8.405 8.831 9.255 9.757 10.302 10.932 11.621 12.393 13.227 14.036 14.525 14.658 14.649 14.553 14.384 14.201 14.034 13.866 13.658 13.47 13.277 13.061 12.835 12.631 12.453 12.282 12.135 11.995 11.842 11.671 11.533 11.396 11.246 11.126 11.005 10.88 10.738 10.599 10.505 10.394 10.208 10.09 9.972 9.909 9.778 9.64 9.494 9.411 9.217 9.132 9.044 8.94 8.662 8.497 8.348 8.195 7.995 7.781 7.541 6.814 -3 ,4989 ,TETRA ,17602289,Sun Nov 28 15:24:32 CET,Sun Nov 28 17:49:13 CET,0.0 0.668 0.948 1.149 1.316 1.468 1.622 1.777 2.09 2.226 2.334 2.436 2.651 2.74 2.899 3.057 3.208 3.287 3.448 3.598 3.811 3.957 4.089 4.268 4.475 4.679 4.853 5.017 5.244 5.459 5.662 5.912 6.145 6.363 6.602 6.874 7.145 7.454 7.791 8.135 8.466 8.813 9.227 9.66 10.17 10.746 11.37 12.042 12.817 13.691 14.579 15.135 15.342 15.323 15.226 15.113 14.941 14.736 14.537 14.336 14.163 13.981 13.789 13.607 13.437 13.288 13.14 12.987 12.846 12.704 12.553 12.421 12.275 12.113 11.997 11.895 11.76 11.612 11.471 11.359 11.247 11.085 10.974 10.851 10.785 10.65 10.502 10.34 10.248 10.032 9.923 9.798 9.662 9.411 9.273 9.115 8.92 8.695 8.441 8.133 7.603 -4 ,30669 ,TETRA ,17602290,Sun Nov 28 15:24:30 CET,Sun Nov 28 17:48:01 CET,0.0 0.762 1.075 1.296 1.473 1.641 1.796 1.928 2.149 2.262 2.376 2.468 2.682 2.788 2.992 3.175 3.338 3.414 3.566 3.715 3.937 4.065 4.169 4.331 4.508 4.68 4.837 4.988 5.184 5.374 5.564 5.799 6.023 6.242 6.491 6.77 7.036 7.33 7.644 7.971 8.331 8.739 9.224 9.689 10.192 10.768 11.412 12.106 12.889 13.701 14.517 15.009 15.136 15.089 14.961 14.811 14.615 14.418 14.267 14.072 13.888 13.724 13.559 13.389 13.219 13.064 12.89 12.727 12.575 12.408 12.254 12.127 11.977 11.808 11.676 11.534 11.398 11.276 11.138 11.038 10.932 10.737 10.601 10.481 10.421 10.292 10.15 10.007 9.929 9.73 9.64 9.541 9.434 9.18 9.012 8.832 8.679 8.516 8.328 8.008 7.354 -5 ,32673 ,TETRA ,17602291,Sun Nov 28 15:24:32 CET,Sun Nov 28 17:47:34 CET,0.0 0.548 0.815 1.068 1.31 1.511 1.687 1.846 2.107 2.217 2.316 2.408 2.613 2.709 2.908 3.086 3.277 3.369 3.525 3.682 3.886 4.006 4.134 4.322 4.5 4.672 4.837 4.996 5.192 5.378 5.568 5.804 6.019 6.214 6.441 6.702 6.965 7.254 7.552 7.842 8.135 8.467 8.842 9.213 9.67 10.214 10.822 11.451 12.13 12.878 13.689 14.141 14.166 14.095 13.996 13.842 13.628 13.409 13.232 13.004 12.797 12.628 12.459 12.28 12.111 11.962 11.787 11.617 11.476 11.322 11.152 11.012 10.864 10.708 10.596 10.488 10.372 10.236 10.093 9.998 9.895 9.747 9.633 9.508 9.448 9.328 9.194 9.046 8.969 8.775 8.672 8.571 8.475 8.271 8.152 8.026 7.88 7.702 7.441 7.118 6.508 -6 ,30551 ,TETRA ,17602292,Sun Nov 28 15:25:01 CET,Sun Nov 28 17:48:29 CET,0.0 0.658 0.934 1.121 1.262 1.396 1.542 1.708 1.995 2.1 2.207 2.317 2.543 2.64 2.791 2.951 3.101 3.17 3.308 3.444 3.642 3.767 3.895 4.081 4.265 4.433 4.595 4.759 4.948 5.125 5.311 5.557 5.798 6.007 6.245 6.498 6.741 7.032 7.327 7.658 8.031 8.444 8.917 9.386 9.983 10.635 11.3 12.047 12.881 13.798 14.736 15.284 15.51 15.524 15.375 15.141 14.931 14.679 14.414 14.162 13.947 13.741 13.513 13.296 13.089 12.898 12.707 12.543 12.395 12.23 12.05 11.904 11.751 11.579 11.453 11.348 11.235 11.099 10.959 10.867 10.779 10.625 10.503 10.381 10.316 10.186 10.055 9.919 9.851 9.674 9.6 9.51 9.42 9.201 9.071 8.916 8.746 8.557 8.345 8.051 7.065 -7 ,18850 ,TETRA ,17602293,Sun Nov 28 15:25:01 CET,Sun Nov 28 17:48:33 CET,0.0 0.549 0.827 1.047 1.232 1.382 1.521 1.666 1.94 2.065 2.187 2.298 2.529 2.641 2.846 3.028 3.207 3.291 3.433 3.574 3.793 3.927 4.051 4.244 4.432 4.611 4.777 4.945 5.169 5.377 5.594 5.869 6.118 6.347 6.602 6.88 7.167 7.488 7.815 8.16 8.519 8.944 9.418 9.875 10.415 11.002 11.707 12.433 13.198 14.085 15.041 15.621 15.767 15.702 15.551 15.374 15.195 14.99 14.778 14.557 14.363 14.182 14.008 13.854 13.672 13.493 13.307 13.115 12.97 12.839 12.697 12.573 12.421 12.249 12.123 12.009 11.899 11.763 11.617 11.524 11.433 11.287 11.183 11.069 10.991 10.821 10.67 10.523 10.453 10.269 10.2 10.116 10.013 9.793 9.683 9.575 9.443 9.25 9.032 8.819 8.022 -8 ,25449 ,TETRA ,17602294,Sun Nov 28 15:25:00 CET,Sun Nov 28 17:48:24 CET,0.0 0.401 0.537 0.673 0.827 0.994 1.17 1.321 1.573 1.685 1.786 1.859 2.081 2.183 2.379 2.565 2.732 2.81 2.963 3.105 3.301 3.433 3.568 3.759 3.93 4.1 4.274 4.442 4.664 4.867 5.064 5.311 5.556 5.781 6.031 6.318 6.587 6.874 7.192 7.547 7.907 8.309 8.753 9.165 9.675 10.244 10.862 11.531 12.264 13.085 13.894 14.391 14.519 14.443 14.341 14.218 14.051 13.856 13.646 13.4 13.187 12.982 12.791 12.616 12.42 12.236 12.07 11.914 11.774 11.627 11.477 11.351 11.205 11.049 10.938 10.805 10.657 10.519 10.366 10.25 10.134 9.969 9.847 9.724 9.669 9.552 9.416 9.257 9.171 8.983 8.925 8.835 8.72 8.501 8.4 8.261 8.087 7.911 7.675 7.346 6.741 -9 ,4365 ,TETRA ,17602295,Sun Nov 28 15:25:03 CET,Sun Nov 28 17:48:33 CET,0.0 0.442 0.717 0.923 1.13 1.316 1.472 1.634 1.952 2.085 2.222 2.374 2.602 2.7 2.881 3.053 3.222 3.305 3.462 3.609 3.816 3.957 4.097 4.29 4.469 4.662 4.867 5.043 5.252 5.459 5.668 5.928 6.16 6.382 6.665 7.009 7.354 7.704 8.063 8.458 8.882 9.35 9.878 10.372 10.91 11.462 12.075 12.776 13.561 14.482 15.506 16.161 16.395 16.403 16.306 16.147 15.926 15.688 15.449 15.2 15.012 14.833 14.641 14.444 14.229 14.027 13.825 13.634 13.46 13.274 13.078 12.917 12.753 12.575 12.435 12.291 12.126 11.951 11.767 11.64 11.52 11.312 11.172 11.04 10.964 10.8 10.622 10.415 10.304 10.097 9.999 9.88 9.753 9.485 9.354 9.195 9.001 8.81 8.589 8.232 7.312 -10 ,24459 ,TETRA ,17602296,Sun Nov 28 15:25:05 CET,Sun Nov 28 17:47:41 CET,0.0 0.373 0.587 0.753 0.923 1.072 1.214 1.359 1.607 1.712 1.816 1.9 2.122 2.219 2.39 2.561 2.73 2.814 2.975 3.128 3.361 3.5 3.629 3.834 4.045 4.248 4.423 4.576 4.778 4.975 5.183 5.443 5.68 5.897 6.137 6.42 6.685 6.966 7.293 7.642 8.008 8.418 8.862 9.289 9.762 10.291 10.894 11.554 12.292 13.113 13.956 14.397 14.497 14.459 14.326 14.106 13.852 13.618 13.404 13.164 12.991 12.827 12.643 12.476 12.303 12.148 12.006 11.855 11.703 11.554 11.404 11.282 11.139 10.972 10.838 10.689 10.54 10.4 10.255 10.154 10.056 9.897 9.784 9.662 9.597 9.491 9.381 9.254 9.182 8.994 8.932 8.86 8.769 8.524 8.394 8.255 8.1 7.938 7.74 7.51 7.126 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt deleted file mode 100644 index 49e98e08..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5027 ,TETRA ,17602297,Sun Nov 28 15:25:06 CET,Sun Nov 28 17:47:51 CET,0.0 0.629 0.88 1.076 1.254 1.408 1.537 1.656 1.898 2.014 2.117 2.203 2.41 2.492 2.66 2.817 2.957 3.03 3.166 3.287 3.486 3.616 3.721 3.862 4.0 4.135 4.275 4.415 4.586 4.746 4.914 5.115 5.295 5.47 5.677 5.877 6.069 6.296 6.527 6.755 7.012 7.328 7.672 7.995 8.357 8.726 9.124 9.548 9.999 10.476 10.859 10.779 10.509 10.22 9.854 9.461 9.11 8.761 8.456 8.175 7.88 7.582 7.332 7.109 6.891 6.686 6.456 6.244 6.054 5.869 5.688 5.525 5.33 5.111 4.949 4.792 4.635 4.472 4.285 4.156 4.03 3.83 3.693 3.553 3.479 3.321 3.155 2.984 2.89 2.672 2.569 2.457 2.336 2.098 1.966 1.805 1.626 1.435 1.22 0.987 0.569 -2 ,23928 ,TETRA ,17602298,Sun Nov 28 15:25:00 CET,Sun Nov 28 17:48:06 CET,0.0 0.537 0.797 1.004 1.177 1.328 1.479 1.616 1.902 2.044 2.158 2.266 2.495 2.588 2.751 2.909 3.052 3.12 3.251 3.386 3.572 3.682 3.802 3.985 4.144 4.294 4.428 4.544 4.707 4.878 5.035 5.225 5.398 5.56 5.77 6.011 6.227 6.453 6.713 6.988 7.247 7.545 7.896 8.227 8.6 8.973 9.375 9.858 10.398 10.881 11.144 11.004 10.666 10.268 9.908 9.535 9.167 8.852 8.557 8.237 7.948 7.691 7.46 7.236 7.011 6.796 6.557 6.36 6.201 6.02 5.824 5.647 5.451 5.257 5.12 4.978 4.827 4.649 4.434 4.301 4.18 3.985 3.835 3.651 3.564 3.398 3.215 3.028 2.93 2.714 2.626 2.518 2.387 2.075 1.91 1.742 1.567 1.39 1.172 0.876 0.035 -3 ,4425 ,TETRA ,17602299,Sun Nov 28 15:25:00 CET,Sun Nov 28 17:48:31 CET,0.0 0.422 0.692 0.893 1.025 1.147 1.277 1.398 1.593 1.687 1.784 1.863 2.066 2.147 2.303 2.441 2.587 2.655 2.792 2.944 3.135 3.244 3.359 3.521 3.669 3.815 3.959 4.107 4.296 4.478 4.668 4.902 5.121 5.323 5.557 5.808 6.039 6.282 6.525 6.782 7.053 7.371 7.72 8.012 8.354 8.738 9.133 9.574 10.03 10.429 10.656 10.541 10.267 9.931 9.545 9.181 8.846 8.517 8.228 7.9 7.579 7.288 7.01 6.752 6.524 6.318 6.084 5.858 5.669 5.481 5.284 5.099 4.896 4.688 4.53 4.374 4.212 4.036 3.86 3.741 3.619 3.422 3.271 3.11 3.024 2.845 2.667 2.481 2.385 2.176 2.071 1.96 1.843 1.581 1.443 1.304 1.161 0.994 0.71 0.306 -0.905 -4 ,9991 ,TETRA ,17602300,Sun Nov 28 15:25:02 CET,Sun Nov 28 17:48:18 CET,0.0 0.555 0.773 0.94 1.104 1.267 1.424 1.558 1.794 1.914 2.03 2.127 2.35 2.461 2.649 2.804 2.95 3.025 3.176 3.351 3.589 3.721 3.847 4.013 4.177 4.338 4.492 4.644 4.843 5.037 5.217 5.426 5.635 5.818 6.018 6.239 6.436 6.665 6.928 7.199 7.465 7.786 8.16 8.521 8.93 9.354 9.8 10.23 10.676 11.081 11.312 11.176 10.898 10.564 10.171 9.792 9.473 9.179 8.93 8.638 8.371 8.131 7.867 7.635 7.406 7.169 6.93 6.723 6.534 6.336 6.132 5.957 5.78 5.602 5.464 5.308 5.15 4.998 4.835 4.724 4.607 4.433 4.321 4.184 4.113 3.963 3.808 3.655 3.563 3.359 3.28 3.168 3.05 2.81 2.686 2.545 2.363 2.155 1.922 1.619 0.876 -5 ,11936 ,TETRA ,17602301,Sun Nov 28 15:25:05 CET,Sun Nov 28 17:50:30 CET,0.0 1.124 1.489 1.755 1.915 2.069 2.211 2.35 2.618 2.745 2.871 2.981 3.191 3.288 3.494 3.673 3.823 3.902 4.046 4.175 4.368 4.501 4.617 4.767 4.924 5.075 5.222 5.37 5.572 5.76 5.924 6.11 6.3 6.485 6.679 6.908 7.141 7.379 7.627 7.879 8.141 8.455 8.806 9.105 9.442 9.811 10.173 10.53 10.92 11.32 11.643 11.603 11.328 10.964 10.559 10.166 9.82 9.482 9.157 8.825 8.571 8.339 8.091 7.861 7.65 7.429 7.19 6.992 6.827 6.649 6.444 6.266 6.075 5.878 5.722 5.564 5.407 5.241 5.063 4.943 4.815 4.617 4.49 4.35 4.277 4.142 4.0 3.818 3.713 3.5 3.398 3.277 3.149 2.873 2.746 2.614 2.432 2.218 1.951 1.564 0.946 -6 ,23325 ,TETRA ,17602302,Sun Nov 28 15:25:06 CET,Sun Nov 28 17:50:17 CET,0.0 0.634 0.976 1.18 1.343 1.505 1.663 1.803 2.058 2.188 2.309 2.403 2.603 2.691 2.873 3.037 3.184 3.255 3.39 3.522 3.714 3.824 3.95 4.149 4.322 4.479 4.63 4.773 4.952 5.113 5.248 5.41 5.585 5.764 5.975 6.208 6.426 6.65 6.901 7.173 7.439 7.727 8.046 8.342 8.685 9.081 9.494 9.899 10.328 10.785 11.119 11.049 10.764 10.363 10.001 9.646 9.289 8.972 8.681 8.378 8.108 7.869 7.64 7.404 7.167 6.95 6.727 6.524 6.332 6.127 5.942 5.797 5.644 5.478 5.335 5.18 5.005 4.83 4.668 4.545 4.428 4.252 4.126 4.004 3.927 3.756 3.568 3.368 3.271 3.052 2.95 2.854 2.754 2.517 2.39 2.246 2.051 1.834 1.612 1.325 0.854 -7 ,4503 ,TETRA ,17602303,Sun Nov 28 15:25:01 CET,Sun Nov 28 18:00:09 CET,0.0 0.775 1.016 1.214 1.406 1.577 1.719 1.852 2.115 2.225 2.328 2.436 2.647 2.734 2.891 3.058 3.226 3.301 3.429 3.563 3.766 3.88 3.99 4.152 4.315 4.465 4.596 4.722 4.903 5.077 5.233 5.417 5.605 5.786 5.989 6.212 6.425 6.674 6.957 7.223 7.471 7.757 8.076 8.38 8.717 9.105 9.56 9.984 10.4 10.826 11.103 11.018 10.759 10.449 10.065 9.639 9.284 8.945 8.63 8.315 8.023 7.757 7.511 7.265 7.03 6.822 6.598 6.382 6.193 6.005 5.806 5.648 5.495 5.313 5.162 5.018 4.867 4.689 4.497 4.379 4.256 4.063 3.932 3.788 3.707 3.535 3.372 3.183 3.083 2.886 2.819 2.71 2.585 2.337 2.203 2.042 1.839 1.606 1.347 1.053 0.383 -8 ,1429 ,TETRA ,17602304,Sun Nov 28 15:25:01 CET,Sun Nov 28 17:48:27 CET,0.0 0.496 0.744 0.955 1.121 1.269 1.426 1.559 1.758 1.859 1.96 2.038 2.243 2.339 2.517 2.681 2.836 2.907 3.046 3.175 3.345 3.452 3.555 3.714 3.865 4.014 4.182 4.355 4.557 4.733 4.906 5.137 5.35 5.528 5.725 5.93 6.134 6.368 6.6 6.857 7.125 7.404 7.737 8.071 8.433 8.855 9.295 9.669 10.031 10.398 10.716 10.68 10.373 10.005 9.625 9.242 8.879 8.545 8.273 7.98 7.7 7.457 7.225 6.99 6.737 6.503 6.269 6.038 5.844 5.674 5.493 5.322 5.148 4.972 4.827 4.669 4.526 4.38 4.206 4.094 3.979 3.795 3.667 3.527 3.455 3.291 3.121 2.961 2.867 2.654 2.581 2.468 2.343 2.098 1.967 1.809 1.621 1.451 1.247 0.89 -0.171 -9 ,28526 ,TETRA ,17602305,Sun Nov 28 15:25:01 CET,Sun Nov 28 17:48:55 CET,0.0 0.445 0.735 0.913 1.086 1.268 1.439 1.59 1.889 2.023 2.146 2.275 2.492 2.593 2.778 2.929 3.078 3.15 3.291 3.425 3.622 3.755 3.883 4.073 4.257 4.413 4.552 4.693 4.874 5.057 5.24 5.452 5.642 5.825 6.034 6.279 6.506 6.734 6.976 7.231 7.511 7.813 8.153 8.502 8.899 9.313 9.723 10.123 10.584 11.033 11.361 11.349 11.116 10.803 10.448 10.095 9.762 9.384 9.035 8.699 8.41 8.144 7.888 7.62 7.344 7.134 6.933 6.738 6.572 6.401 6.22 6.051 5.86 5.668 5.535 5.401 5.234 5.048 4.85 4.711 4.576 4.37 4.241 4.095 4.009 3.822 3.636 3.451 3.361 3.153 3.072 2.962 2.848 2.58 2.421 2.26 2.088 1.908 1.681 1.35 0.595 -10 ,19978 ,TETRA ,17602306,Sun Nov 28 15:25:02 CET,Sun Nov 28 17:50:08 CET,0.0 0.739 0.982 1.157 1.304 1.423 1.531 1.643 1.876 1.994 2.102 2.197 2.409 2.511 2.711 2.876 3.027 3.102 3.253 3.407 3.606 3.721 3.847 4.018 4.183 4.348 4.494 4.64 4.826 4.993 5.149 5.344 5.534 5.704 5.891 6.096 6.301 6.551 6.799 7.038 7.328 7.638 7.938 8.235 8.611 8.994 9.377 9.801 10.221 10.562 10.887 10.855 10.539 10.181 9.809 9.443 9.108 8.796 8.517 8.232 7.991 7.774 7.543 7.316 7.11 6.911 6.7 6.515 6.362 6.215 6.041 5.89 5.732 5.554 5.405 5.238 5.072 4.914 4.75 4.639 4.517 4.331 4.203 4.049 3.976 3.824 3.669 3.517 3.42 3.203 3.091 2.984 2.879 2.655 2.506 2.328 2.148 1.969 1.744 1.432 0.924 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1c.txt deleted file mode 100644 index 59158899..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5238 ,TETRA ,17602307,Sun Nov 28 15:25:03 CET,Sun Nov 28 17:50:33 CET,0.0 1.231 1.52 1.725 1.907 2.088 2.264 2.422 2.663 2.769 2.883 2.975 3.179 3.264 3.428 3.576 3.728 3.802 3.933 4.07 4.265 4.384 4.515 4.698 4.855 5.003 5.138 5.281 5.502 5.722 5.93 6.172 6.379 6.589 6.835 7.073 7.31 7.57 7.843 8.138 8.436 8.757 9.153 9.537 9.923 10.326 10.71 11.113 11.529 11.827 12.012 11.929 11.593 11.157 10.77 10.364 9.992 9.691 9.428 9.115 8.845 8.603 8.335 8.066 7.822 7.636 7.446 7.257 7.087 6.9 6.711 6.553 6.382 6.201 6.061 5.917 5.765 5.614 5.45 5.341 5.229 5.044 4.911 4.77 4.703 4.566 4.419 4.263 4.173 3.956 3.838 3.715 3.6 3.379 3.262 3.118 2.931 2.701 2.484 2.28 1.831 -2 ,9330 ,TETRA ,17602308,Sun Nov 28 15:25:05 CET,Sun Nov 28 17:48:39 CET,0.0 0.77 1.056 1.243 1.376 1.527 1.668 1.789 2.049 2.194 2.321 2.437 2.674 2.79 3.006 3.191 3.353 3.438 3.621 3.786 4.012 4.155 4.288 4.473 4.632 4.787 4.941 5.092 5.288 5.474 5.654 5.86 6.04 6.218 6.429 6.677 6.92 7.177 7.449 7.714 7.962 8.238 8.577 8.913 9.279 9.674 10.122 10.561 10.923 11.266 11.483 11.298 10.883 10.419 10.039 9.663 9.298 8.937 8.583 8.219 7.922 7.66 7.406 7.163 6.91 6.688 6.469 6.269 6.094 5.9 5.711 5.563 5.401 5.226 5.076 4.922 4.777 4.627 4.466 4.35 4.232 4.059 3.924 3.785 3.722 3.581 3.397 3.184 3.084 2.878 2.801 2.692 2.577 2.327 2.197 2.034 1.845 1.654 1.442 1.181 0.696 -3 ,20208 ,TETRA ,17602309,Sun Nov 28 15:25:07 CET,Sun Nov 28 17:48:27 CET,0.0 1.366 1.712 1.941 2.112 2.254 2.383 2.521 2.775 2.898 3.014 3.094 3.294 3.386 3.576 3.752 3.919 4.005 4.159 4.289 4.496 4.633 4.754 4.929 5.099 5.251 5.386 5.518 5.718 5.908 6.078 6.294 6.493 6.689 6.918 7.182 7.434 7.686 7.933 8.185 8.444 8.74 9.055 9.342 9.716 10.116 10.528 10.913 11.198 11.484 11.717 11.477 11.096 10.683 10.271 9.862 9.476 9.145 8.84 8.502 8.204 7.943 7.693 7.466 7.229 7.001 6.779 6.584 6.407 6.209 6.006 5.846 5.691 5.531 5.399 5.254 5.109 4.974 4.818 4.691 4.557 4.356 4.201 4.048 3.979 3.84 3.697 3.537 3.451 3.239 3.145 3.043 2.948 2.739 2.615 2.485 2.342 2.165 1.961 1.735 1.29 -4 ,2842 ,TETRA ,17602310,Sun Nov 28 15:26:00 CET,Sun Nov 28 17:48:32 CET,0.0 0.7 0.997 1.251 1.458 1.61 1.744 1.885 2.11 2.196 2.301 2.399 2.601 2.683 2.843 2.982 3.099 3.158 3.293 3.437 3.647 3.795 3.948 4.138 4.306 4.48 4.649 4.796 4.975 5.157 5.335 5.544 5.758 5.968 6.206 6.45 6.659 6.879 7.121 7.372 7.649 7.96 8.303 8.638 8.991 9.373 9.798 10.246 10.683 11.016 11.06 10.732 10.338 9.913 9.458 9.006 8.6 8.23 7.892 7.527 7.231 6.989 6.733 6.467 6.215 5.976 5.735 5.536 5.36 5.169 4.961 4.778 4.597 4.412 4.274 4.141 4.001 3.852 3.696 3.589 3.472 3.271 3.135 2.991 2.915 2.759 2.606 2.448 2.358 2.145 2.022 1.903 1.8 1.551 1.394 1.219 1.031 0.847 0.656 0.395 -0.338 -5 ,27318 ,TETRA ,17602311,Sun Nov 28 15:26:03 CET,Sun Nov 28 17:49:12 CET,0.0 0.774 1.008 1.226 1.43 1.607 1.77 1.913 2.157 2.293 2.417 2.528 2.76 2.867 3.051 3.231 3.415 3.493 3.624 3.763 3.955 4.068 4.188 4.364 4.531 4.694 4.85 5.015 5.219 5.401 5.585 5.787 5.977 6.168 6.378 6.59 6.778 7.011 7.288 7.554 7.838 8.172 8.525 8.873 9.256 9.617 10.01 10.456 10.887 11.195 11.273 11.074 10.777 10.358 9.874 9.435 9.08 8.736 8.421 8.079 7.783 7.53 7.28 7.044 6.821 6.613 6.402 6.199 6.023 5.857 5.686 5.528 5.341 5.145 4.987 4.823 4.659 4.481 4.297 4.174 4.054 3.877 3.745 3.604 3.528 3.385 3.236 3.063 2.97 2.777 2.734 2.643 2.548 2.355 2.231 2.084 1.916 1.698 1.479 1.249 0.323 -6 ,26009 ,TETRA ,17602312,Sun Nov 28 15:26:05 CET,Sun Nov 28 17:49:16 CET,0.0 0.669 0.958 1.189 1.374 1.553 1.754 1.953 2.256 2.378 2.497 2.62 2.844 2.946 3.128 3.294 3.476 3.557 3.69 3.826 4.038 4.173 4.301 4.507 4.695 4.838 4.969 5.108 5.293 5.47 5.632 5.816 5.997 6.171 6.372 6.584 6.802 7.04 7.28 7.552 7.845 8.153 8.503 8.857 9.24 9.643 10.058 10.476 10.961 11.405 11.691 11.593 11.263 10.893 10.52 10.111 9.737 9.421 9.112 8.787 8.505 8.247 7.989 7.743 7.52 7.315 7.097 6.9 6.727 6.554 6.376 6.219 6.066 5.91 5.778 5.637 5.481 5.313 5.136 5.021 4.902 4.719 4.594 4.452 4.375 4.225 4.064 3.892 3.813 3.62 3.533 3.419 3.303 3.066 2.947 2.827 2.686 2.5 2.268 1.93 0.957 -7 ,3030 ,TETRA ,17602313,Sun Nov 28 15:26:07 CET,Sun Nov 28 17:49:39 CET,0.0 0.707 0.997 1.187 1.393 1.591 1.769 1.93 2.201 2.344 2.479 2.593 2.83 2.937 3.123 3.307 3.464 3.537 3.688 3.823 4.032 4.175 4.307 4.504 4.691 4.876 5.054 5.226 5.447 5.647 5.832 6.036 6.238 6.436 6.662 6.91 7.123 7.358 7.619 7.888 8.152 8.46 8.82 9.14 9.489 9.875 10.268 10.613 10.953 11.254 11.383 11.261 10.949 10.562 10.194 9.844 9.498 9.133 8.803 8.479 8.165 7.869 7.597 7.334 7.072 6.842 6.61 6.407 6.234 6.041 5.849 5.698 5.535 5.365 5.232 5.085 4.92 4.747 4.583 4.469 4.354 4.185 4.062 3.925 3.85 3.669 3.477 3.296 3.208 2.993 2.899 2.786 2.679 2.444 2.304 2.147 1.969 1.733 1.496 1.235 0.537 -8 ,19123 ,TETRA ,17602314,Sun Nov 28 15:26:00 CET,Sun Nov 28 17:53:56 CET,0.0 0.694 0.997 1.254 1.458 1.649 1.812 1.953 2.231 2.373 2.503 2.611 2.841 2.952 3.16 3.346 3.508 3.587 3.751 3.901 4.099 4.231 4.357 4.531 4.698 4.857 5.007 5.156 5.361 5.545 5.726 5.954 6.162 6.353 6.572 6.819 7.033 7.258 7.511 7.787 8.068 8.378 8.746 9.112 9.532 10.013 10.514 10.958 11.365 11.748 11.967 11.809 11.504 11.186 10.816 10.413 10.049 9.691 9.375 9.022 8.707 8.436 8.166 7.891 7.633 7.401 7.172 6.959 6.761 6.555 6.339 6.179 6.008 5.805 5.647 5.492 5.335 5.17 5.016 4.907 4.789 4.602 4.47 4.343 4.279 4.146 3.991 3.813 3.727 3.517 3.408 3.291 3.182 2.967 2.849 2.736 2.588 2.389 2.154 1.784 1.242 -9 ,32079 ,TETRA ,17602315,Sun Nov 28 15:26:01 CET,Sun Nov 28 17:53:37 CET,0.0 0.543 0.879 1.147 1.36 1.549 1.689 1.835 2.149 2.279 2.377 2.443 2.644 2.728 2.9 3.062 3.211 3.293 3.472 3.642 3.86 3.992 4.125 4.309 4.487 4.664 4.811 4.943 5.13 5.323 5.521 5.747 5.949 6.145 6.344 6.57 6.798 7.033 7.28 7.532 7.819 8.148 8.483 8.783 9.134 9.536 9.951 10.363 10.746 11.068 11.228 11.034 10.685 10.286 9.861 9.46 9.101 8.74 8.406 8.081 7.782 7.473 7.17 6.888 6.612 6.356 6.101 5.862 5.624 5.374 5.155 4.999 4.828 4.643 4.509 4.361 4.205 4.055 3.878 3.746 3.621 3.444 3.313 3.159 3.082 2.95 2.817 2.655 2.56 2.334 2.254 2.15 2.029 1.788 1.645 1.478 1.294 1.101 0.874 0.551 -0.517 -10 ,12934 ,TETRA ,17602316,Sun Nov 28 15:26:04 CET,Sun Nov 28 17:49:26 CET,0.0 0.854 1.144 1.421 1.627 1.772 1.907 2.041 2.306 2.437 2.555 2.666 2.889 2.98 3.151 3.32 3.487 3.57 3.722 3.857 4.038 4.16 4.291 4.481 4.654 4.811 4.97 5.131 5.328 5.507 5.677 5.894 6.09 6.264 6.469 6.698 6.917 7.168 7.453 7.753 8.046 8.351 8.698 9.041 9.419 9.802 10.199 10.606 11.017 11.422 11.715 11.559 11.194 10.777 10.375 10.006 9.672 9.32 8.972 8.615 8.312 8.037 7.757 7.504 7.257 7.005 6.75 6.542 6.353 6.149 5.951 5.793 5.618 5.426 5.276 5.128 4.975 4.805 4.639 4.531 4.419 4.239 4.112 3.978 3.896 3.71 3.532 3.356 3.262 3.047 2.949 2.842 2.721 2.505 2.396 2.232 2.043 1.868 1.671 1.354 0.683 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1d.txt deleted file mode 100644 index de72976a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5992 ,TETRA ,17602317,Sun Nov 28 15:26:05 CET,Sun Nov 28 17:48:48 CET,0.0 0.799 1.192 1.407 1.607 1.797 1.984 2.167 2.463 2.586 2.696 2.812 3.045 3.16 3.353 3.527 3.694 3.776 3.948 4.107 4.31 4.444 4.578 4.76 4.928 5.087 5.253 5.412 5.599 5.791 5.978 6.198 6.422 6.657 6.936 7.212 7.45 7.731 8.006 8.291 8.641 9.01 9.391 9.759 10.172 10.606 11.058 11.523 12.057 12.614 12.936 12.827 12.521 12.162 11.757 11.3 10.911 10.564 10.244 9.902 9.592 9.301 9.049 8.816 8.588 8.383 8.165 7.969 7.805 7.623 7.417 7.243 7.065 6.882 6.742 6.611 6.479 6.34 6.185 6.066 5.922 5.69 5.551 5.407 5.33 5.184 5.041 4.892 4.813 4.598 4.5 4.394 4.289 4.045 3.905 3.774 3.6 3.394 3.187 2.93 2.281 -2 ,235 ,TETRA ,17602318,Sun Nov 28 15:26:01 CET,Sun Nov 28 17:53:00 CET,0.0 0.514 0.767 1.032 1.313 1.556 1.751 1.917 2.177 2.287 2.409 2.513 2.712 2.8 2.963 3.123 3.301 3.385 3.539 3.672 3.876 4.03 4.172 4.368 4.568 4.76 4.935 5.109 5.344 5.562 5.759 5.976 6.182 6.383 6.6 6.843 7.079 7.326 7.602 7.93 8.262 8.603 8.993 9.356 9.741 10.14 10.585 11.053 11.494 11.881 12.075 11.917 11.611 11.219 10.851 10.508 10.177 9.851 9.522 9.163 8.857 8.604 8.359 8.114 7.887 7.679 7.458 7.262 7.093 6.915 6.716 6.538 6.361 6.177 6.039 5.895 5.738 5.569 5.384 5.264 5.147 4.956 4.826 4.685 4.599 4.437 4.292 4.142 4.063 3.871 3.81 3.704 3.602 3.379 3.243 3.11 2.971 2.808 2.613 2.388 1.899 -3 ,339 ,TETRA ,17602319,Sun Nov 28 15:26:04 CET,Sun Nov 28 17:53:16 CET,0.0 1.293 1.653 1.915 2.128 2.352 2.548 2.72 3.006 3.131 3.267 3.435 3.669 3.78 3.996 4.212 4.41 4.496 4.654 4.813 5.053 5.192 5.318 5.506 5.686 5.859 6.035 6.207 6.424 6.636 6.836 7.063 7.284 7.491 7.716 7.965 8.207 8.473 8.751 9.009 9.286 9.622 10.01 10.434 10.96 11.492 12.012 12.56 13.099 13.559 13.91 13.899 13.609 13.207 12.746 12.254 11.776 11.363 11.01 10.638 10.335 10.045 9.758 9.513 9.29 9.071 8.84 8.641 8.458 8.259 8.067 7.913 7.74 7.555 7.412 7.259 7.096 6.924 6.744 6.622 6.495 6.274 6.124 5.983 5.915 5.785 5.623 5.427 5.327 5.12 5.052 4.944 4.837 4.607 4.472 4.325 4.168 4.018 3.85 3.603 3.161 -4 ,10777 ,TETRA ,17602320,Sun Nov 28 15:26:06 CET,Sun Nov 28 17:49:42 CET,0.0 0.814 1.118 1.324 1.518 1.693 1.872 2.044 2.307 2.412 2.52 2.64 2.866 2.969 3.169 3.355 3.528 3.615 3.773 3.92 4.138 4.276 4.406 4.589 4.775 4.955 5.119 5.281 5.482 5.677 5.866 6.083 6.298 6.513 6.772 7.042 7.285 7.553 7.865 8.184 8.5 8.85 9.205 9.568 9.964 10.351 10.802 11.276 11.817 12.337 12.59 12.395 11.942 11.428 10.971 10.537 10.144 9.778 9.468 9.159 8.858 8.581 8.317 8.078 7.859 7.641 7.404 7.202 7.032 6.835 6.624 6.452 6.268 6.068 5.898 5.727 5.562 5.4 5.224 5.101 4.978 4.78 4.635 4.493 4.425 4.277 4.106 3.903 3.798 3.586 3.506 3.402 3.305 3.109 2.989 2.843 2.66 2.445 2.233 1.976 1.378 -5 ,21035 ,TETRA ,17602321,Sun Nov 28 15:26:07 CET,Sun Nov 28 17:49:27 CET,0.0 1.18 1.519 1.76 1.96 2.127 2.295 2.454 2.767 2.915 3.04 3.155 3.389 3.49 3.671 3.848 4.019 4.093 4.232 4.371 4.585 4.714 4.849 5.063 5.27 5.464 5.627 5.793 6.023 6.244 6.454 6.685 6.892 7.096 7.343 7.641 7.91 8.165 8.457 8.776 9.076 9.427 9.818 10.156 10.541 10.974 11.445 11.92 12.374 12.802 13.064 12.895 12.481 12.083 11.712 11.331 10.957 10.555 10.187 9.846 9.538 9.256 9.016 8.799 8.601 8.403 8.179 7.975 7.798 7.621 7.426 7.268 7.106 6.938 6.816 6.682 6.527 6.367 6.206 6.091 5.974 5.793 5.677 5.558 5.488 5.344 5.206 5.064 4.989 4.785 4.683 4.574 4.468 4.235 4.098 3.95 3.808 3.649 3.412 3.135 2.41 -6 ,6946 ,TETRA ,17602322,Sun Nov 28 15:26:01 CET,Sun Nov 28 17:53:02 CET,0.0 0.729 1.032 1.268 1.457 1.662 1.872 2.051 2.339 2.477 2.612 2.742 2.969 3.079 3.271 3.46 3.647 3.734 3.901 4.072 4.305 4.427 4.555 4.76 4.944 5.105 5.26 5.425 5.642 5.833 6.034 6.294 6.519 6.715 6.928 7.185 7.432 7.702 7.969 8.21 8.5 8.835 9.199 9.562 9.929 10.269 10.689 11.106 11.477 11.809 11.923 11.664 11.263 10.848 10.432 10.019 9.622 9.275 8.999 8.667 8.378 8.122 7.866 7.617 7.369 7.162 6.964 6.765 6.581 6.398 6.196 6.018 5.828 5.64 5.505 5.35 5.2 5.061 4.913 4.809 4.693 4.511 4.384 4.262 4.204 4.07 3.924 3.77 3.69 3.487 3.412 3.306 3.183 2.948 2.84 2.693 2.543 2.417 2.228 1.963 1.36 -7 ,31268 ,TETRA ,17602323,Sun Nov 28 15:26:04 CET,Sun Nov 28 17:52:42 CET,0.0 0.87 1.188 1.436 1.651 1.848 2.021 2.192 2.494 2.625 2.759 2.876 3.11 3.206 3.396 3.589 3.77 3.857 4.032 4.205 4.45 4.607 4.752 4.97 5.185 5.387 5.585 5.771 5.98 6.174 6.369 6.596 6.81 7.047 7.334 7.632 7.911 8.193 8.492 8.821 9.164 9.513 9.911 10.313 10.712 11.114 11.568 11.998 12.487 12.932 13.135 13.004 12.65 12.233 11.814 11.422 11.083 10.746 10.4 10.023 9.728 9.489 9.253 9.011 8.777 8.563 8.333 8.104 7.914 7.737 7.532 7.37 7.219 7.056 6.912 6.764 6.634 6.497 6.341 6.227 6.116 5.925 5.777 5.63 5.558 5.41 5.259 5.088 4.988 4.775 4.698 4.604 4.513 4.307 4.166 4.021 3.881 3.717 3.547 3.304 2.486 -8 ,10262 ,TETRA ,17602324,Sun Nov 28 15:26:05 CET,Sun Nov 28 17:49:18 CET,0.0 1.121 1.46 1.741 1.96 2.135 2.287 2.416 2.666 2.8 2.932 3.052 3.271 3.361 3.521 3.691 3.873 3.967 4.14 4.275 4.453 4.578 4.706 4.888 5.053 5.216 5.384 5.543 5.753 5.954 6.134 6.36 6.587 6.803 7.045 7.325 7.581 7.83 8.103 8.374 8.654 8.999 9.398 9.775 10.185 10.601 11.067 11.574 12.091 12.57 12.928 12.955 12.721 12.322 11.909 11.469 11.062 10.708 10.407 10.09 9.797 9.513 9.227 8.977 8.761 8.529 8.285 8.092 7.914 7.721 7.51 7.343 7.18 6.988 6.828 6.684 6.523 6.34 6.167 6.042 5.909 5.722 5.595 5.446 5.365 5.191 5.019 4.838 4.737 4.521 4.428 4.303 4.191 3.971 3.845 3.718 3.584 3.44 3.272 3.066 2.676 -9 ,19524 ,TETRA ,17602325,Sun Nov 28 15:26:08 CET,Sun Nov 28 17:48:44 CET,0.0 0.632 0.946 1.151 1.323 1.465 1.611 1.762 2.021 2.137 2.252 2.354 2.573 2.681 2.873 3.038 3.201 3.283 3.429 3.559 3.765 3.901 4.021 4.173 4.323 4.491 4.657 4.821 5.036 5.237 5.423 5.635 5.832 6.023 6.236 6.467 6.689 6.926 7.183 7.459 7.753 8.101 8.484 8.838 9.248 9.678 10.135 10.584 11.023 11.437 11.73 11.617 11.275 10.885 10.489 10.105 9.712 9.326 8.958 8.59 8.276 7.964 7.688 7.441 7.205 6.97 6.729 6.533 6.345 6.15 5.949 5.792 5.647 5.472 5.322 5.169 5.014 4.851 4.675 4.556 4.433 4.244 4.114 3.953 3.866 3.707 3.557 3.378 3.281 3.077 3.022 2.936 2.838 2.601 2.481 2.342 2.172 2.008 1.783 1.516 0.854 -10 ,3890 ,TETRA ,17602326,Sun Nov 28 15:26:02 CET,Sun Nov 28 18:07:55 CET,0.0 0.92 1.311 1.575 1.787 1.975 2.175 2.339 2.574 2.677 2.784 2.894 3.12 3.213 3.416 3.625 3.816 3.899 4.07 4.25 4.477 4.605 4.742 4.95 5.145 5.321 5.496 5.665 5.862 6.048 6.218 6.434 6.641 6.834 7.086 7.375 7.632 7.897 8.192 8.486 8.776 9.105 9.483 9.864 10.284 10.73 11.219 11.689 12.152 12.553 12.85 12.703 12.29 11.872 11.442 11.009 10.63 10.28 9.949 9.61 9.317 9.053 8.792 8.554 8.321 8.088 7.833 7.61 7.425 7.226 7.015 6.839 6.669 6.507 6.37 6.216 6.065 5.896 5.713 5.595 5.478 5.294 5.173 5.064 4.999 4.837 4.657 4.484 4.399 4.198 4.133 4.037 3.932 3.693 3.569 3.439 3.284 3.088 2.864 2.615 1.87 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_5.txt deleted file mode 100644 index 819903a7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18157 ,TETRA ,17602327,Sun Nov 28 15:26:02 CET,Sun Nov 28 17:48:50 CET,0.0 0.691 1.007 1.251 1.454 1.614 1.75 1.903 2.241 2.369 2.475 2.57 2.782 2.877 3.059 3.226 3.393 3.477 3.639 3.806 4.054 4.197 4.333 4.527 4.717 4.899 5.063 5.232 5.467 5.68 5.886 6.144 6.389 6.631 6.909 7.208 7.483 7.782 8.111 8.49 8.887 9.318 9.813 10.314 10.884 11.463 12.131 12.9 13.763 14.687 15.724 16.351 16.49 16.523 16.465 16.28 16.107 15.95 15.779 15.576 15.372 15.165 14.942 14.71 14.51 14.342 14.157 13.975 13.814 13.638 13.437 13.271 13.113 12.966 12.851 12.715 12.562 12.402 12.229 12.102 11.976 11.778 11.646 11.529 11.454 11.274 11.09 10.91 10.816 10.598 10.462 10.347 10.225 9.937 9.765 9.576 9.373 9.116 8.823 8.49 7.252 -2 ,16554 ,TETRA ,17602328,Sun Nov 28 15:26:05 CET,Sun Nov 28 17:49:01 CET,0.0 0.847 1.131 1.342 1.512 1.676 1.821 1.931 2.174 2.311 2.445 2.584 2.811 2.918 3.117 3.3 3.481 3.565 3.714 3.871 4.082 4.22 4.361 4.565 4.788 5.031 5.261 5.453 5.66 5.848 6.037 6.278 6.517 6.754 7.034 7.339 7.606 7.913 8.257 8.592 8.934 9.339 9.804 10.236 10.746 11.301 11.948 12.72 13.558 14.346 15.215 15.783 15.941 15.963 15.877 15.758 15.583 15.346 15.136 14.95 14.78 14.596 14.408 14.216 14.021 13.845 13.66 13.482 13.318 13.149 12.962 12.808 12.644 12.475 12.356 12.231 12.093 11.942 11.783 11.662 11.545 11.385 11.267 11.111 11.027 10.879 10.727 10.56 10.467 10.256 10.121 10.0 9.883 9.642 9.513 9.355 9.172 8.994 8.736 8.405 7.654 -3 ,22364 ,TETRA ,17602329,Sun Nov 28 15:26:03 CET,Sun Nov 28 17:48:55 CET,0.0 0.953 1.269 1.533 1.737 1.919 2.082 2.226 2.49 2.613 2.729 2.842 3.076 3.197 3.428 3.645 3.862 3.963 4.126 4.284 4.53 4.669 4.807 5.013 5.205 5.395 5.577 5.756 5.989 6.214 6.422 6.664 6.91 7.135 7.396 7.714 8.021 8.338 8.66 9.008 9.37 9.771 10.228 10.703 11.283 11.889 12.584 13.396 14.308 15.302 16.378 17.102 17.41 17.506 17.433 17.265 17.072 16.85 16.627 16.417 16.226 16.048 15.865 15.673 15.498 15.339 15.163 14.999 14.851 14.704 14.564 14.442 14.297 14.132 13.993 13.846 13.697 13.537 13.379 13.268 13.144 12.942 12.801 12.66 12.591 12.445 12.282 12.093 11.988 11.774 11.676 11.576 11.466 11.217 11.067 10.888 10.693 10.448 10.187 9.886 8.889 -4 ,7757 ,TETRA ,17602330,Sun Nov 28 15:26:03 CET,Sun Nov 28 17:48:41 CET,0.0 0.802 1.084 1.299 1.49 1.665 1.83 1.983 2.269 2.399 2.513 2.595 2.809 2.923 3.13 3.304 3.469 3.55 3.706 3.859 4.094 4.257 4.432 4.659 4.847 5.024 5.207 5.389 5.599 5.808 6.016 6.238 6.458 6.691 6.956 7.237 7.507 7.794 8.094 8.419 8.75 9.14 9.61 10.083 10.627 11.22 11.895 12.632 13.483 14.39 15.381 15.964 16.086 16.068 15.985 15.843 15.676 15.491 15.319 15.119 14.915 14.74 14.571 14.411 14.243 14.077 13.913 13.76 13.617 13.451 13.249 13.084 12.929 12.765 12.64 12.505 12.365 12.223 12.066 11.965 11.863 11.7 11.581 11.447 11.381 11.233 11.079 10.918 10.828 10.632 10.551 10.433 10.303 10.067 9.931 9.777 9.579 9.329 9.055 8.767 7.795 -5 ,26698 ,TETRA ,17602331,Sun Nov 28 15:26:05 CET,Sun Nov 28 17:49:40 CET,0.0 0.541 0.799 1.033 1.222 1.387 1.565 1.721 1.972 2.09 2.201 2.315 2.529 2.629 2.805 2.969 3.134 3.215 3.377 3.534 3.749 3.893 4.029 4.197 4.374 4.562 4.733 4.898 5.12 5.33 5.521 5.756 5.997 6.219 6.465 6.746 7.007 7.303 7.635 7.964 8.304 8.695 9.165 9.627 10.161 10.758 11.419 12.157 12.989 13.903 14.886 15.519 15.789 15.857 15.844 15.732 15.529 15.316 15.143 14.998 14.858 14.68 14.493 14.314 14.146 13.998 13.812 13.641 13.503 13.359 13.204 13.065 12.929 12.781 12.656 12.527 12.397 12.264 12.093 11.962 11.837 11.664 11.535 11.399 11.335 11.186 11.002 10.794 10.689 10.483 10.352 10.245 10.124 9.856 9.725 9.572 9.398 9.191 8.911 8.529 7.5 -6 ,130 ,TETRA ,17602332,Sun Nov 28 15:26:07 CET,Sun Nov 28 17:49:49 CET,0.0 0.658 1.045 1.303 1.515 1.711 1.889 2.038 2.313 2.437 2.568 2.713 2.924 3.011 3.188 3.378 3.561 3.649 3.814 3.963 4.187 4.325 4.472 4.688 4.886 5.086 5.285 5.477 5.709 5.928 6.139 6.397 6.638 6.87 7.131 7.404 7.668 7.97 8.3 8.624 8.946 9.295 9.724 10.177 10.695 11.257 11.883 12.565 13.36 14.292 15.309 15.917 16.044 15.994 15.819 15.599 15.398 15.223 15.064 14.88 14.706 14.508 14.303 14.133 13.978 13.815 13.627 13.457 13.316 13.171 13.004 12.852 12.67 12.459 12.3 12.155 11.989 11.81 11.649 11.544 11.429 11.248 11.129 10.995 10.92 10.781 10.635 10.466 10.378 10.186 10.086 9.969 9.854 9.618 9.469 9.286 9.101 8.88 8.593 8.249 7.18 -7 ,5696 ,TETRA ,17602333,Sun Nov 28 15:26:03 CET,Sun Nov 28 17:49:25 CET,0.0 0.808 1.148 1.395 1.583 1.776 1.96 2.108 2.394 2.53 2.647 2.73 2.933 3.021 3.22 3.413 3.574 3.656 3.823 3.983 4.221 4.367 4.496 4.701 4.895 5.069 5.236 5.398 5.602 5.791 5.988 6.229 6.448 6.66 6.908 7.181 7.439 7.732 8.066 8.413 8.759 9.153 9.622 10.103 10.657 11.298 12.021 12.805 13.697 14.65 15.639 16.238 16.417 16.438 16.382 16.24 16.059 15.844 15.641 15.442 15.255 15.078 14.873 14.66 14.471 14.297 14.11 13.933 13.791 13.665 13.524 13.379 13.231 13.091 12.978 12.853 12.73 12.607 12.458 12.349 12.233 12.029 11.872 11.725 11.659 11.511 11.348 11.187 11.108 10.907 10.796 10.693 10.586 10.313 10.173 10.033 9.858 9.664 9.429 9.11 8.048 -8 ,14114 ,TETRA ,17602334,Sun Nov 28 15:26:06 CET,Sun Nov 28 17:49:36 CET,0.0 0.854 1.24 1.484 1.681 1.847 2.004 2.15 2.419 2.548 2.669 2.775 2.994 3.102 3.299 3.48 3.681 3.778 3.945 4.091 4.312 4.453 4.578 4.781 4.978 5.159 5.342 5.522 5.755 5.963 6.173 6.455 6.713 6.952 7.212 7.496 7.772 8.08 8.414 8.757 9.122 9.538 10.031 10.504 10.999 11.548 12.213 12.918 13.686 14.593 15.548 16.131 16.323 16.283 16.193 16.036 15.883 15.773 15.63 15.443 15.263 15.09 14.905 14.712 14.544 14.381 14.196 14.026 13.859 13.688 13.514 13.374 13.24 13.078 12.948 12.825 12.679 12.509 12.336 12.224 12.108 11.942 11.829 11.689 11.616 11.473 11.324 11.175 11.09 10.892 10.779 10.679 10.568 10.318 10.157 9.97 9.808 9.638 9.418 9.071 7.799 -9 ,31632 ,TETRA ,17602335,Sun Nov 28 15:26:08 CET,Sun Nov 28 17:49:18 CET,0.0 0.587 0.82 1.05 1.247 1.409 1.554 1.688 1.93 2.056 2.176 2.277 2.487 2.582 2.764 2.949 3.146 3.237 3.401 3.55 3.767 3.911 4.047 4.243 4.424 4.599 4.785 4.965 5.184 5.385 5.575 5.812 6.039 6.251 6.498 6.782 7.064 7.38 7.705 8.044 8.387 8.763 9.213 9.668 10.199 10.811 11.489 12.221 13.05 13.964 14.942 15.509 15.686 15.653 15.498 15.313 15.148 14.927 14.693 14.484 14.307 14.109 13.905 13.722 13.549 13.389 13.21 13.025 12.866 12.714 12.52 12.366 12.217 12.051 11.916 11.771 11.608 11.437 11.299 11.204 11.084 10.893 10.761 10.629 10.557 10.389 10.225 10.073 9.994 9.813 9.72 9.603 9.488 9.218 9.064 8.895 8.691 8.455 8.198 7.874 6.962 -10 ,27103 ,TETRA ,17602336,Sun Nov 28 15:26:09 CET,Sun Nov 28 17:49:31 CET,0.0 0.923 1.251 1.505 1.694 1.868 2.015 2.154 2.43 2.551 2.655 2.739 2.956 3.049 3.241 3.432 3.614 3.698 3.845 3.995 4.215 4.349 4.475 4.667 4.858 5.048 5.24 5.428 5.672 5.903 6.122 6.381 6.62 6.833 7.082 7.366 7.643 7.962 8.295 8.654 9.028 9.43 9.887 10.337 10.892 11.489 12.114 12.771 13.542 14.442 15.408 16.04 16.234 16.223 16.115 15.974 15.808 15.636 15.473 15.27 15.069 14.882 14.701 14.51 14.31 14.129 13.956 13.81 13.68 13.514 13.337 13.185 13.019 12.842 12.709 12.584 12.455 12.312 12.142 12.022 11.905 11.717 11.576 11.439 11.371 11.225 11.056 10.857 10.759 10.571 10.472 10.368 10.264 10.014 9.874 9.719 9.557 9.355 9.088 8.658 7.486 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1c_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1c_5.txt deleted file mode 100644 index ee52c450..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1c_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30408 ,TETRA ,17602337,Sun Nov 28 15:26:03 CET,Sun Nov 28 17:48:42 CET,0.0 0.926 1.17 1.407 1.612 1.788 1.944 2.086 2.31 2.413 2.518 2.617 2.833 2.929 3.13 3.332 3.532 3.629 3.806 3.972 4.221 4.385 4.536 4.739 4.936 5.124 5.298 5.462 5.694 5.927 6.133 6.375 6.61 6.845 7.133 7.458 7.74 8.05 8.387 8.729 9.076 9.484 9.974 10.464 11.05 11.694 12.426 13.236 14.165 15.181 16.247 16.944 17.212 17.259 17.164 17.01 16.851 16.695 16.528 16.327 16.145 15.973 15.793 15.593 15.357 15.146 14.944 14.734 14.554 14.373 14.175 14.009 13.843 13.67 13.543 13.409 13.264 13.104 12.921 12.81 12.701 12.514 12.375 12.204 12.113 11.951 11.772 11.565 11.456 11.253 11.144 11.019 10.889 10.58 10.389 10.189 9.995 9.733 9.401 8.987 7.658 -2 ,4588 ,TETRA ,17602338,Sun Nov 28 15:26:06 CET,Sun Nov 28 17:48:44 CET,0.0 1.16 1.591 1.937 2.146 2.349 2.545 2.708 2.968 3.089 3.21 3.308 3.526 3.625 3.825 4.005 4.176 4.256 4.403 4.555 4.805 4.963 5.108 5.313 5.501 5.675 5.847 6.029 6.262 6.481 6.693 6.946 7.182 7.401 7.685 8.014 8.307 8.621 8.962 9.324 9.689 10.115 10.611 11.079 11.625 12.231 12.898 13.638 14.544 15.503 16.379 16.871 16.992 16.947 16.818 16.651 16.497 16.369 16.204 16.008 15.817 15.61 15.409 15.223 15.059 14.88 14.671 14.486 14.324 14.175 14.011 13.856 13.704 13.549 13.424 13.291 13.152 12.998 12.812 12.677 12.556 12.36 12.215 12.069 11.993 11.845 11.686 11.502 11.398 11.191 11.103 10.994 10.875 10.594 10.443 10.292 10.1 9.843 9.521 9.112 7.525 -3 ,3036 ,TETRA ,17602339,Sun Nov 28 15:26:07 CET,Sun Nov 28 17:51:07 CET,0.0 0.874 1.229 1.538 1.803 2.005 2.156 2.311 2.615 2.738 2.845 2.953 3.182 3.285 3.467 3.633 3.809 3.897 4.058 4.217 4.435 4.581 4.728 4.931 5.142 5.347 5.539 5.724 5.941 6.153 6.361 6.6 6.826 7.041 7.295 7.582 7.862 8.168 8.484 8.833 9.191 9.586 10.074 10.544 11.054 11.623 12.293 13.028 13.858 14.835 15.84 16.476 16.714 16.736 16.652 16.492 16.323 16.177 16.026 15.812 15.605 15.405 15.178 14.945 14.759 14.602 14.403 14.226 14.087 13.908 13.703 13.546 13.372 13.204 13.062 12.881 12.706 12.554 12.39 12.273 12.149 11.941 11.799 11.66 11.592 11.433 11.261 11.071 10.974 10.784 10.665 10.522 10.363 10.062 9.89 9.692 9.482 9.272 8.985 8.484 6.45 -4 ,10123 ,TETRA ,17602340,Sun Nov 28 15:26:30 CET,Sun Nov 28 17:50:28 CET,0.0 1.349 1.746 2.08 2.318 2.532 2.706 2.853 3.136 3.274 3.395 3.49 3.707 3.817 4.023 4.2 4.373 4.465 4.63 4.786 5.024 5.17 5.309 5.523 5.738 5.926 6.104 6.284 6.517 6.727 6.907 7.128 7.365 7.601 7.873 8.169 8.45 8.76 9.08 9.423 9.779 10.172 10.633 11.114 11.676 12.299 12.993 13.7 14.531 15.481 16.498 17.221 17.537 17.617 17.53 17.392 17.233 17.025 16.855 16.676 16.437 16.207 15.998 15.791 15.589 15.408 15.227 15.042 14.87 14.695 14.509 14.364 14.198 14.024 13.887 13.734 13.583 13.415 13.241 13.121 12.991 12.803 12.665 12.507 12.427 12.232 12.027 11.841 11.748 11.544 11.408 11.282 11.146 10.848 10.692 10.523 10.3 9.984 9.638 9.198 7.879 -5 ,17011 ,TETRA ,17602341,Sun Nov 28 15:26:30 CET,Sun Nov 28 17:51:39 CET,0.0 0.9 1.223 1.461 1.698 1.934 2.139 2.307 2.583 2.713 2.83 2.935 3.156 3.264 3.468 3.658 3.828 3.908 4.073 4.228 4.454 4.593 4.731 4.945 5.13 5.311 5.51 5.69 5.896 6.109 6.326 6.597 6.86 7.097 7.379 7.699 8.01 8.361 8.728 9.089 9.443 9.861 10.395 10.928 11.525 12.2 12.978 13.789 14.678 15.743 16.894 17.58 17.849 17.879 17.831 17.744 17.516 17.213 16.994 16.817 16.62 16.404 16.189 15.982 15.788 15.603 15.408 15.209 15.014 14.818 14.624 14.479 14.323 14.15 14.013 13.866 13.72 13.573 13.416 13.3 13.177 12.991 12.862 12.726 12.657 12.496 12.286 12.062 11.96 11.744 11.608 11.489 11.361 11.065 10.879 10.682 10.486 10.229 9.918 9.498 7.551 -6 ,14041 ,TETRA ,17602342,Sun Nov 28 15:26:32 CET,Sun Nov 28 17:51:28 CET,0.0 1.28 1.59 1.848 2.059 2.233 2.407 2.567 2.835 2.956 3.083 3.225 3.463 3.575 3.778 3.971 4.153 4.241 4.422 4.586 4.801 4.943 5.084 5.289 5.47 5.642 5.813 5.988 6.224 6.465 6.688 6.911 7.144 7.395 7.666 7.959 8.248 8.552 8.885 9.249 9.618 10.021 10.477 10.939 11.503 12.151 12.884 13.663 14.509 15.519 16.69 17.439 17.646 17.608 17.521 17.376 17.2 17.006 16.798 16.566 16.365 16.177 15.979 15.791 15.613 15.445 15.244 15.028 14.836 14.642 14.454 14.3 14.135 13.971 13.837 13.693 13.553 13.403 13.231 13.106 12.972 12.764 12.608 12.439 12.353 12.17 11.989 11.793 11.687 11.479 11.36 11.218 11.052 10.734 10.566 10.369 10.117 9.809 9.503 9.12 7.953 -7 ,31805 ,TETRA ,17602343,Sun Nov 28 15:26:31 CET,Sun Nov 28 17:50:17 CET,0.0 1.358 1.678 1.913 2.173 2.396 2.585 2.779 3.121 3.271 3.426 3.596 3.823 3.929 4.148 4.341 4.499 4.577 4.725 4.875 5.093 5.23 5.362 5.556 5.747 5.934 6.118 6.291 6.514 6.742 6.954 7.201 7.444 7.697 7.982 8.255 8.53 8.839 9.161 9.514 9.881 10.268 10.725 11.185 11.748 12.355 13.009 13.749 14.614 15.588 16.592 17.231 17.43 17.427 17.326 17.188 17.044 16.871 16.691 16.496 16.321 16.145 15.938 15.71 15.491 15.294 15.098 14.926 14.78 14.639 14.463 14.299 14.129 13.965 13.833 13.673 13.524 13.366 13.183 13.061 12.943 12.776 12.668 12.546 12.476 12.318 12.149 11.956 11.852 11.647 11.549 11.43 11.3 11.001 10.841 10.662 10.461 10.213 9.93 9.588 7.88 -8 ,16410 ,TETRA ,17602344,Sun Nov 28 15:26:31 CET,Sun Nov 28 17:48:44 CET,0.0 1.352 1.671 1.989 2.279 2.461 2.612 2.764 3.007 3.127 3.255 3.362 3.587 3.698 3.914 4.119 4.307 4.398 4.574 4.728 4.945 5.089 5.233 5.444 5.638 5.822 6.004 6.183 6.418 6.645 6.854 7.11 7.347 7.576 7.856 8.159 8.435 8.738 9.086 9.451 9.794 10.186 10.673 11.143 11.684 12.287 12.955 13.697 14.567 15.491 16.284 16.692 16.776 16.694 16.563 16.412 16.23 16.024 15.837 15.62 15.394 15.15 14.9 14.671 14.461 14.257 14.042 13.84 13.674 13.519 13.325 13.151 12.974 12.78 12.635 12.483 12.32 12.16 11.968 11.826 11.695 11.504 11.359 11.2 11.118 10.957 10.792 10.597 10.49 10.26 10.101 9.973 9.836 9.551 9.4 9.235 9.032 8.784 8.473 8.05 5.702 -9 ,21332 ,TETRA ,17602345,Sun Nov 28 15:26:30 CET,Sun Nov 28 17:50:54 CET,0.0 0.905 1.131 1.371 1.607 1.787 1.969 2.159 2.461 2.601 2.74 2.838 3.046 3.147 3.347 3.536 3.711 3.793 3.955 4.112 4.335 4.493 4.638 4.835 5.037 5.216 5.38 5.549 5.767 5.969 6.166 6.391 6.607 6.828 7.083 7.364 7.652 7.975 8.29 8.647 9.037 9.437 9.888 10.354 10.87 11.447 12.139 12.871 13.696 14.64 15.592 16.151 16.34 16.405 16.373 16.231 16.062 15.891 15.691 15.456 15.26 15.058 14.858 14.664 14.483 14.321 14.128 13.95 13.795 13.626 13.414 13.227 13.052 12.869 12.736 12.588 12.426 12.254 12.07 11.943 11.796 11.57 11.431 11.278 11.186 10.971 10.775 10.572 10.464 10.256 10.126 10.001 9.87 9.561 9.396 9.222 9.044 8.79 8.513 8.223 6.173 -10 ,25797 ,TETRA ,17602346,Sun Nov 28 15:26:31 CET,Sun Nov 28 17:51:18 CET,0.0 0.971 1.34 1.614 1.833 2.012 2.19 2.37 2.708 2.849 2.969 3.072 3.3 3.411 3.625 3.829 4.026 4.12 4.304 4.485 4.723 4.872 5.026 5.241 5.456 5.658 5.848 6.039 6.277 6.508 6.73 6.981 7.202 7.42 7.693 8.001 8.284 8.587 8.91 9.254 9.644 10.079 10.55 11.0 11.53 12.162 12.87 13.641 14.508 15.439 16.426 17.018 17.225 17.243 17.128 16.929 16.711 16.507 16.297 16.052 15.83 15.631 15.421 15.199 14.995 14.811 14.602 14.404 14.228 14.04 13.818 13.616 13.394 13.165 12.99 12.802 12.602 12.407 12.23 12.125 12.016 11.825 11.694 11.55 11.464 11.274 11.075 10.869 10.772 10.577 10.443 10.308 10.176 9.877 9.722 9.556 9.344 9.076 8.701 8.282 6.837 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1d_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1d_5.txt deleted file mode 100644 index ea0d2d4a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_1d_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27655 ,TETRA ,17602347,Sun Nov 28 15:26:33 CET,Sun Nov 28 17:50:21 CET,0.0 1.105 1.485 1.7 1.895 2.074 2.234 2.379 2.643 2.767 2.888 3.008 3.234 3.335 3.523 3.698 3.857 3.936 4.093 4.252 4.471 4.617 4.765 4.962 5.14 5.313 5.499 5.677 5.89 6.097 6.314 6.574 6.812 7.054 7.321 7.606 7.877 8.175 8.497 8.857 9.239 9.655 10.13 10.594 11.141 11.752 12.479 13.312 14.25 15.215 16.217 16.805 16.872 16.769 16.592 16.307 16.021 15.715 15.393 15.05 14.743 14.47 14.207 13.938 13.639 13.366 13.11 12.856 12.612 12.373 12.125 11.928 11.727 11.499 11.318 11.137 10.941 10.732 10.51 10.349 10.198 9.957 9.766 9.569 9.473 9.264 9.048 8.827 8.702 8.475 8.313 8.169 8.025 7.7 7.527 7.348 7.131 6.835 6.505 6.092 4.335 -2 ,3034 ,TETRA ,17602348,Sun Nov 28 15:26:35 CET,Sun Nov 28 17:49:33 CET,0.0 0.776 1.062 1.286 1.483 1.64 1.785 1.943 2.242 2.373 2.481 2.57 2.801 2.905 3.106 3.299 3.473 3.556 3.709 3.863 4.091 4.236 4.378 4.59 4.785 4.971 5.153 5.316 5.529 5.742 5.951 6.206 6.436 6.648 6.905 7.21 7.496 7.802 8.12 8.443 8.81 9.23 9.696 10.162 10.733 11.354 11.998 12.68 13.485 14.448 15.415 15.965 16.151 16.165 16.108 15.984 15.841 15.685 15.497 15.25 15.0 14.777 14.56 14.35 14.158 13.953 13.721 13.545 13.379 13.198 13.007 12.821 12.639 12.452 12.297 12.141 11.989 11.823 11.644 11.517 11.382 11.162 11.008 10.841 10.743 10.555 10.369 10.163 10.058 9.846 9.718 9.583 9.436 9.133 8.964 8.771 8.56 8.331 8.065 7.681 6.214 -3 ,2478 ,TETRA ,17602349,Sun Nov 28 15:26:32 CET,Sun Nov 28 17:57:03 CET,0.0 1.166 1.461 1.7 1.905 2.073 2.247 2.413 2.663 2.776 2.894 3.012 3.237 3.344 3.548 3.727 3.884 3.98 4.165 4.311 4.517 4.648 4.785 4.985 5.17 5.362 5.566 5.753 5.989 6.213 6.413 6.653 6.883 7.104 7.386 7.727 8.021 8.304 8.616 8.969 9.335 9.764 10.28 10.785 11.394 12.058 12.781 13.594 14.503 15.475 16.532 17.196 17.42 17.403 17.278 17.112 16.911 16.673 16.428 16.134 15.831 15.584 15.383 15.193 14.998 14.81 14.614 14.411 14.224 14.03 13.824 13.66 13.477 13.265 13.107 12.946 12.778 12.605 12.418 12.297 12.173 11.973 11.831 11.682 11.598 11.436 11.266 11.076 10.974 10.755 10.648 10.533 10.403 10.128 9.934 9.733 9.549 9.307 9.025 8.611 5.86 -4 ,9980 ,TETRA ,17602350,Sun Nov 28 15:26:32 CET,Sun Nov 28 17:49:35 CET,0.0 0.967 1.343 1.612 1.799 1.973 2.148 2.291 2.532 2.649 2.774 2.908 3.125 3.232 3.467 3.668 3.852 3.938 4.095 4.243 4.455 4.601 4.744 4.943 5.129 5.309 5.499 5.69 5.932 6.148 6.341 6.596 6.847 7.074 7.34 7.636 7.924 8.26 8.618 8.989 9.371 9.767 10.225 10.691 11.211 11.775 12.436 13.125 13.904 14.856 15.887 16.467 16.57 16.501 16.356 16.123 15.87 15.625 15.349 15.065 14.85 14.658 14.452 14.239 14.038 13.85 13.633 13.435 13.264 13.073 12.849 12.645 12.414 12.181 12.019 11.843 11.668 11.477 11.274 11.137 10.978 10.738 10.577 10.401 10.305 10.111 9.922 9.719 9.617 9.405 9.262 9.116 8.973 8.689 8.517 8.322 8.083 7.808 7.509 7.054 4.64 -5 ,12796 ,TETRA ,17602351,Sun Nov 28 15:26:34 CET,Sun Nov 28 17:50:04 CET,0.0 1.208 1.552 1.801 2.011 2.192 2.342 2.489 2.75 2.859 2.979 3.093 3.308 3.412 3.605 3.794 3.987 4.073 4.234 4.383 4.591 4.739 4.885 5.117 5.354 5.568 5.761 5.946 6.198 6.43 6.636 6.875 7.095 7.314 7.579 7.853 8.134 8.467 8.824 9.182 9.562 10.016 10.494 10.944 11.51 12.168 12.912 13.681 14.517 15.517 16.572 17.21 17.377 17.335 17.193 17.009 16.791 16.532 16.289 16.037 15.835 15.646 15.431 15.215 15.013 14.817 14.602 14.405 14.231 14.016 13.788 13.631 13.462 13.278 13.134 12.992 12.843 12.681 12.515 12.387 12.262 12.059 11.914 11.768 11.683 11.485 11.285 11.072 10.96 10.76 10.652 10.543 10.426 10.168 10.027 9.849 9.635 9.415 9.183 8.875 7.06 -6 ,26622 ,TETRA ,17602352,Sun Nov 28 15:26:35 CET,Sun Nov 28 17:49:35 CET,0.0 1.481 1.786 1.984 2.197 2.399 2.541 2.68 2.957 3.073 3.184 3.266 3.476 3.574 3.744 3.907 4.077 4.163 4.335 4.503 4.747 4.903 5.042 5.24 5.446 5.645 5.826 5.999 6.239 6.463 6.673 6.949 7.219 7.456 7.717 7.997 8.266 8.574 8.92 9.269 9.622 10.039 10.523 10.996 11.548 12.184 12.9 13.667 14.519 15.451 16.408 17.002 17.145 17.118 16.975 16.798 16.588 16.304 16.04 15.767 15.527 15.309 15.078 14.836 14.621 14.438 14.232 14.027 13.836 13.615 13.383 13.208 13.025 12.833 12.692 12.547 12.388 12.202 12.013 11.883 11.742 11.52 11.358 11.195 11.113 10.938 10.759 10.577 10.464 10.248 10.138 10.024 9.884 9.596 9.44 9.217 8.978 8.747 8.425 7.964 6.299 -7 ,20839 ,TETRA ,17602353,Sun Nov 28 15:26:32 CET,Sun Nov 28 17:49:36 CET,0.0 1.032 1.341 1.582 1.805 1.987 2.13 2.247 2.462 2.576 2.691 2.812 3.048 3.152 3.345 3.537 3.716 3.801 3.957 4.108 4.303 4.429 4.567 4.767 4.952 5.122 5.278 5.428 5.637 5.844 6.035 6.262 6.476 6.697 6.98 7.29 7.59 7.914 8.248 8.611 9.003 9.476 10.011 10.514 11.098 11.726 12.409 13.162 14.039 15.029 16.053 16.664 16.844 16.786 16.586 16.356 16.097 15.807 15.527 15.228 14.966 14.71 14.481 14.282 14.079 13.868 13.625 13.397 13.207 13.0 12.774 12.608 12.43 12.238 12.086 11.909 11.719 11.515 11.284 11.134 10.98 10.722 10.555 10.373 10.282 10.113 9.915 9.666 9.539 9.32 9.169 9.033 8.885 8.568 8.418 8.253 8.036 7.789 7.481 7.013 4.521 -8 ,31237 ,TETRA ,17602354,Sun Nov 28 15:26:32 CET,Sun Nov 28 17:49:00 CET,0.0 1.19 1.62 1.879 2.07 2.256 2.402 2.54 2.824 2.971 3.111 3.238 3.47 3.585 3.799 3.987 4.152 4.231 4.389 4.544 4.757 4.901 5.042 5.226 5.416 5.621 5.81 5.977 6.197 6.411 6.614 6.891 7.159 7.401 7.676 7.964 8.237 8.558 8.898 9.236 9.587 9.969 10.411 10.85 11.404 12.056 12.764 13.552 14.463 15.45 16.405 16.897 16.919 16.747 16.459 16.155 15.927 15.695 15.42 15.154 14.91 14.661 14.43 14.192 13.966 13.754 13.501 13.27 13.081 12.889 12.685 12.514 12.34 12.165 12.012 11.83 11.633 11.421 11.224 11.103 10.964 10.733 10.573 10.406 10.311 10.117 9.922 9.676 9.541 9.31 9.135 8.988 8.855 8.537 8.333 8.126 7.912 7.64 7.291 6.842 4.29 -9 ,15455 ,TETRA ,17602355,Sun Nov 28 15:26:34 CET,Sun Nov 28 17:50:09 CET,0.0 0.699 0.99 1.237 1.442 1.613 1.77 1.92 2.223 2.374 2.506 2.608 2.815 2.901 3.067 3.241 3.428 3.51 3.649 3.783 3.989 4.13 4.272 4.492 4.704 4.894 5.065 5.238 5.474 5.703 5.942 6.239 6.507 6.748 7.005 7.316 7.631 7.941 8.251 8.604 9.011 9.461 9.951 10.43 10.975 11.568 12.252 13.01 13.878 14.84 15.813 16.413 16.514 16.466 16.346 16.158 15.982 15.773 15.526 15.271 15.056 14.851 14.642 14.422 14.187 13.976 13.762 13.552 13.368 13.192 12.998 12.827 12.659 12.475 12.337 12.188 12.017 11.841 11.662 11.537 11.404 11.19 11.041 10.886 10.795 10.61 10.42 10.207 10.11 9.913 9.796 9.666 9.536 9.252 9.076 8.869 8.653 8.396 8.045 7.57 5.567 -10 ,12832 ,TETRA ,17602356,Sun Nov 28 15:26:36 CET,Sun Nov 28 17:49:46 CET,0.0 0.549 0.932 1.181 1.377 1.586 1.771 1.907 2.157 2.295 2.43 2.559 2.768 2.857 3.047 3.227 3.405 3.492 3.65 3.807 4.019 4.166 4.316 4.529 4.732 4.912 5.086 5.26 5.483 5.687 5.901 6.178 6.426 6.664 6.932 7.212 7.488 7.788 8.106 8.461 8.856 9.278 9.737 10.24 10.809 11.392 12.058 12.753 13.559 14.511 15.535 16.211 16.388 16.343 16.217 16.018 15.78 15.515 15.253 14.96 14.711 14.499 14.27 14.034 13.815 13.63 13.421 13.222 13.077 12.921 12.726 12.561 12.378 12.188 12.06 11.919 11.755 11.585 11.411 11.287 11.145 10.949 10.821 10.678 10.597 10.421 10.24 10.052 9.944 9.728 9.598 9.469 9.338 9.069 8.914 8.742 8.531 8.278 8.011 7.664 5.361 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_3a_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_3a_5.txt deleted file mode 100644 index 3d32a99f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_3a_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25643 ,TETRA ,17602357,Sun Nov 28 15:26:32 CET,Sun Nov 28 17:50:54 CET,0.0 0.41 0.633 0.809 0.984 1.126 1.26 1.394 1.638 1.747 1.841 1.899 2.107 2.201 2.373 2.522 2.669 2.747 2.901 3.058 3.294 3.428 3.548 3.733 3.914 4.089 4.263 4.434 4.63 4.83 5.037 5.271 5.492 5.699 5.945 6.239 6.517 6.805 7.131 7.491 7.86 8.253 8.715 9.204 9.746 10.325 11.04 11.876 12.814 13.822 14.957 15.791 16.055 16.067 16.035 15.977 15.855 15.734 15.566 15.303 15.054 14.838 14.642 14.462 14.306 14.147 13.947 13.772 13.617 13.464 13.307 13.15 12.989 12.82 12.691 12.569 12.429 12.277 12.138 12.04 11.922 11.718 11.567 11.407 11.328 11.164 10.997 10.81 10.713 10.503 10.383 10.265 10.136 9.836 9.684 9.515 9.339 9.098 8.757 8.355 6.98 -2 ,16960 ,TETRA ,17602358,Sun Nov 28 15:26:34 CET,Sun Nov 28 17:51:38 CET,0.0 0.854 1.078 1.276 1.448 1.605 1.78 1.941 2.239 2.372 2.477 2.561 2.769 2.858 3.039 3.212 3.362 3.434 3.573 3.708 3.911 4.042 4.169 4.378 4.591 4.779 4.966 5.143 5.35 5.546 5.739 5.972 6.187 6.401 6.655 6.929 7.191 7.49 7.819 8.172 8.555 9.028 9.588 10.116 10.721 11.364 12.096 12.889 13.76 14.763 15.847 16.592 16.882 16.89 16.768 16.638 16.503 16.355 16.214 16.035 15.859 15.681 15.481 15.297 15.105 14.905 14.718 14.56 14.408 14.254 14.105 13.971 13.844 13.711 13.589 13.451 13.299 13.143 12.976 12.858 12.733 12.513 12.349 12.179 12.096 11.92 11.731 11.544 11.448 11.244 11.133 11.041 10.943 10.701 10.56 10.383 10.184 9.969 9.718 9.404 8.026 -3 ,4261 ,TETRA ,17602359,Sun Nov 28 15:26:36 CET,Sun Nov 28 17:51:11 CET,0.0 0.849 1.168 1.394 1.516 1.658 1.819 1.966 2.192 2.291 2.389 2.486 2.705 2.807 2.965 3.131 3.31 3.387 3.532 3.684 3.901 4.038 4.18 4.389 4.582 4.758 4.932 5.103 5.321 5.525 5.722 5.952 6.176 6.391 6.646 6.936 7.207 7.506 7.843 8.202 8.563 8.973 9.489 9.996 10.57 11.207 11.908 12.716 13.577 14.485 15.48 16.079 16.245 16.291 16.268 16.132 15.903 15.651 15.404 15.131 14.87 14.647 14.453 14.263 14.091 13.928 13.74 13.549 13.381 13.202 13.005 12.86 12.704 12.528 12.385 12.223 12.047 11.875 11.699 11.571 11.442 11.243 11.108 10.962 10.883 10.706 10.497 10.291 10.183 9.957 9.832 9.703 9.552 9.232 9.062 8.878 8.657 8.418 8.133 7.693 6.522 -4 ,6143 ,TETRA ,17602360,Sun Nov 28 15:26:32 CET,Sun Nov 28 17:51:43 CET,0.0 0.415 0.638 0.819 0.977 1.138 1.283 1.417 1.634 1.741 1.849 1.938 2.151 2.245 2.437 2.635 2.81 2.893 3.059 3.217 3.449 3.607 3.749 3.935 4.124 4.305 4.479 4.638 4.833 5.027 5.22 5.458 5.685 5.909 6.166 6.458 6.742 7.041 7.362 7.703 8.098 8.534 9.006 9.484 10.023 10.64 11.352 12.183 13.166 14.245 15.438 16.219 16.511 16.594 16.558 16.447 16.301 16.149 16.013 15.832 15.636 15.453 15.273 15.085 14.9 14.734 14.543 14.355 14.189 14.029 13.864 13.719 13.566 13.399 13.261 13.092 12.907 12.731 12.549 12.415 12.26 12.032 11.88 11.712 11.632 11.469 11.297 11.113 11.005 10.791 10.663 10.537 10.4 10.111 9.956 9.79 9.587 9.357 9.11 8.804 7.661 -5 ,30346 ,TETRA ,17602361,Sun Nov 28 15:26:34 CET,Sun Nov 28 17:52:07 CET,0.0 0.561 0.783 0.96 1.115 1.28 1.452 1.607 1.875 1.977 2.072 2.148 2.336 2.419 2.602 2.797 2.975 3.058 3.221 3.382 3.615 3.752 3.876 4.056 4.244 4.422 4.593 4.759 4.959 5.151 5.336 5.573 5.831 6.07 6.337 6.631 6.918 7.217 7.527 7.88 8.253 8.657 9.115 9.595 10.15 10.746 11.448 12.27 13.176 14.154 15.239 15.909 16.186 16.311 16.267 16.108 15.919 15.701 15.484 15.254 15.044 14.864 14.66 14.436 14.238 14.062 13.859 13.67 13.502 13.325 13.155 13.014 12.853 12.672 12.539 12.405 12.25 12.091 11.922 11.804 11.678 11.467 11.328 11.188 11.11 10.942 10.771 10.574 10.478 10.293 10.218 10.116 9.988 9.711 9.57 9.42 9.257 9.065 8.859 8.533 7.333 -6 ,20328 ,TETRA ,17602362,Sun Nov 28 15:26:36 CET,Sun Nov 28 17:51:27 CET,0.0 0.57 0.813 1.01 1.201 1.382 1.548 1.706 1.96 2.078 2.201 2.293 2.504 2.599 2.785 2.968 3.14 3.219 3.373 3.524 3.738 3.873 4.007 4.201 4.379 4.551 4.724 4.886 5.083 5.29 5.497 5.737 5.954 6.166 6.428 6.71 6.962 7.244 7.56 7.899 8.243 8.62 9.082 9.564 10.132 10.771 11.499 12.276 13.152 14.167 15.284 16.034 16.347 16.444 16.397 16.286 16.17 16.061 15.935 15.778 15.628 15.493 15.367 15.24 15.081 14.923 14.765 14.61 14.473 14.316 14.14 13.988 13.824 13.641 13.488 13.327 13.156 12.985 12.809 12.691 12.572 12.383 12.243 12.104 12.041 11.901 11.731 11.529 11.424 11.214 11.089 10.97 10.84 10.545 10.411 10.273 10.106 9.908 9.602 9.146 7.977 -7 ,32499 ,TETRA ,17602363,Sun Nov 28 15:26:37 CET,Sun Nov 28 17:51:29 CET,0.0 0.303 0.565 0.774 0.926 1.072 1.212 1.364 1.652 1.772 1.895 2.022 2.251 2.349 2.532 2.707 2.865 2.94 3.093 3.234 3.449 3.609 3.765 3.974 4.193 4.422 4.615 4.78 4.997 5.227 5.458 5.723 5.963 6.195 6.482 6.8 7.097 7.439 7.829 8.222 8.606 9.04 9.548 10.042 10.604 11.225 11.928 12.703 13.64 14.715 15.859 16.56 16.785 16.878 16.897 16.824 16.7 16.514 16.33 16.14 15.937 15.734 15.561 15.412 15.253 15.102 14.926 14.741 14.554 14.35 14.146 13.982 13.827 13.66 13.526 13.393 13.248 13.096 12.927 12.802 12.674 12.477 12.326 12.178 12.106 11.959 11.817 11.654 11.564 11.355 11.205 11.075 10.954 10.667 10.494 10.329 10.174 9.993 9.781 9.421 8.168 -8 ,30984 ,TETRA ,17602364,Sun Nov 28 15:26:33 CET,Sun Nov 28 17:52:32 CET,0.0 0.458 0.757 0.981 1.192 1.36 1.516 1.67 1.932 2.062 2.19 2.302 2.517 2.618 2.79 2.947 3.114 3.198 3.35 3.489 3.694 3.84 3.99 4.186 4.352 4.518 4.693 4.858 5.073 5.299 5.519 5.772 5.997 6.224 6.502 6.807 7.097 7.428 7.779 8.15 8.55 9.009 9.523 10.013 10.59 11.212 11.927 12.738 13.653 14.699 15.792 16.442 16.695 16.741 16.694 16.596 16.446 16.267 16.086 15.892 15.721 15.525 15.315 15.122 14.937 14.771 14.597 14.435 14.292 14.138 13.969 13.813 13.642 13.461 13.319 13.175 13.015 12.851 12.663 12.514 12.367 12.139 11.982 11.83 11.753 11.584 11.387 11.175 11.051 10.814 10.676 10.535 10.394 10.095 9.931 9.756 9.542 9.341 9.118 8.77 7.463 -9 ,16515 ,TETRA ,17602365,Sun Nov 28 15:26:36 CET,Sun Nov 28 17:50:11 CET,0.0 0.473 0.767 1.009 1.169 1.327 1.497 1.655 1.938 2.056 2.162 2.246 2.457 2.557 2.744 2.935 3.117 3.199 3.344 3.492 3.72 3.855 3.985 4.174 4.362 4.544 4.714 4.888 5.112 5.323 5.534 5.794 6.042 6.28 6.56 6.88 7.185 7.503 7.843 8.207 8.572 8.968 9.45 9.941 10.526 11.165 11.872 12.689 13.614 14.639 15.837 16.639 16.955 17.011 16.939 16.803 16.585 16.336 16.118 15.915 15.749 15.565 15.361 15.172 14.995 14.818 14.637 14.469 14.303 14.133 13.94 13.775 13.607 13.417 13.266 13.102 12.925 12.757 12.581 12.438 12.287 12.091 11.959 11.811 11.731 11.529 11.321 11.141 11.043 10.836 10.731 10.612 10.472 10.158 9.985 9.803 9.58 9.298 8.962 8.563 7.3 -10 ,28593 ,TETRA ,17602366,Sun Nov 28 15:26:33 CET,Sun Nov 28 17:52:59 CET,0.0 0.621 0.899 1.118 1.314 1.468 1.608 1.739 1.954 2.051 2.152 2.254 2.455 2.558 2.755 2.934 3.102 3.174 3.316 3.45 3.643 3.774 3.903 4.093 4.279 4.456 4.629 4.824 5.07 5.275 5.471 5.694 5.92 6.15 6.397 6.687 6.98 7.285 7.601 7.947 8.339 8.81 9.355 9.854 10.418 11.029 11.721 12.529 13.472 14.486 15.563 16.273 16.638 16.765 16.768 16.741 16.63 16.466 16.295 16.067 15.833 15.631 15.463 15.278 15.076 14.906 14.756 14.61 14.462 14.301 14.118 13.964 13.801 13.646 13.522 13.39 13.261 13.123 12.97 12.848 12.695 12.467 12.328 12.185 12.114 11.959 11.788 11.61 11.51 11.297 11.186 11.064 10.924 10.615 10.438 10.236 10.032 9.821 9.549 9.127 8.115 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt deleted file mode 100644 index 0c4ede99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11977 ,TETRA ,17602367,Sun Nov 28 15:26:35 CET,Sun Nov 28 17:56:47 CET,0.0 0.758 0.981 1.171 1.357 1.511 1.656 1.788 2.028 2.133 2.235 2.319 2.524 2.617 2.784 2.941 3.084 3.144 3.272 3.408 3.591 3.707 3.828 4.005 4.175 4.328 4.464 4.594 4.765 4.93 5.082 5.266 5.434 5.604 5.804 6.026 6.242 6.475 6.74 6.99 7.246 7.542 7.871 8.177 8.516 8.844 9.147 9.461 9.783 10.125 10.301 10.141 9.789 9.369 8.942 8.469 8.018 7.62 7.225 6.811 6.454 6.104 5.77 5.48 5.193 4.896 4.571 4.291 4.064 3.825 3.561 3.331 3.107 2.893 2.719 2.542 2.371 2.181 1.966 1.812 1.645 1.391 1.224 1.048 0.953 0.732 0.521 0.316 0.204 -0.016 -0.145 -0.291 -0.446 -0.746 -0.908 -1.089 -1.296 -1.536 -1.823 -2.122 -3.445 -2 ,22541 ,TETRA ,17602368,Sun Nov 28 15:26:36 CET,Sun Nov 28 17:55:40 CET,0.0 0.669 0.909 1.095 1.253 1.384 1.507 1.647 1.882 1.987 2.088 2.18 2.375 2.46 2.631 2.771 2.927 3.011 3.155 3.293 3.492 3.625 3.757 3.926 4.074 4.231 4.366 4.49 4.678 4.84 4.986 5.171 5.355 5.535 5.734 5.936 6.13 6.35 6.599 6.859 7.105 7.366 7.676 7.974 8.284 8.613 8.968 9.356 9.758 10.1 10.234 9.946 9.436 8.905 8.357 7.813 7.342 6.92 6.543 6.147 5.774 5.414 5.067 4.749 4.439 4.153 3.872 3.627 3.416 3.205 2.977 2.748 2.505 2.271 2.08 1.877 1.671 1.453 1.211 1.059 0.912 0.659 0.455 0.255 0.158 -0.056 -0.285 -0.532 -0.654 -0.885 -1.004 -1.144 -1.289 -1.567 -1.728 -1.925 -2.168 -2.455 -2.747 -3.119 -4.301 -3 ,7841 ,TETRA ,17602369,Sun Nov 28 15:26:35 CET,Sun Nov 28 17:55:36 CET,0.0 0.507 0.768 0.99 1.146 1.285 1.413 1.531 1.769 1.873 1.959 2.001 2.19 2.272 2.433 2.572 2.705 2.771 2.9 3.019 3.2 3.322 3.43 3.583 3.731 3.884 4.057 4.215 4.4 4.593 4.767 4.963 5.157 5.345 5.546 5.76 5.972 6.194 6.447 6.724 7.008 7.32 7.664 7.956 8.251 8.596 8.956 9.329 9.726 10.043 10.104 9.802 9.389 8.935 8.41 7.928 7.545 7.148 6.792 6.433 6.113 5.824 5.504 5.206 4.938 4.646 4.341 4.097 3.874 3.642 3.409 3.197 2.951 2.698 2.504 2.296 2.085 1.861 1.617 1.442 1.268 0.999 0.803 0.599 0.492 0.266 0.024 -0.227 -0.355 -0.591 -0.726 -0.855 -0.986 -1.267 -1.422 -1.591 -1.779 -2.017 -2.325 -2.761 -3.558 -4 ,31107 ,TETRA ,17602370,Sun Nov 28 15:26:34 CET,Sun Nov 28 17:56:31 CET,0.0 0.37 0.593 0.76 0.909 1.041 1.161 1.276 1.503 1.609 1.707 1.793 1.992 2.074 2.229 2.375 2.51 2.581 2.721 2.852 3.04 3.155 3.273 3.441 3.596 3.749 3.886 4.013 4.18 4.343 4.503 4.679 4.846 5.018 5.218 5.443 5.657 5.913 6.164 6.395 6.635 6.887 7.174 7.452 7.779 8.112 8.436 8.798 9.126 9.349 9.314 8.935 8.498 8.022 7.531 7.054 6.621 6.204 5.848 5.482 5.132 4.788 4.453 4.133 3.808 3.52 3.235 2.986 2.751 2.494 2.24 2.018 1.774 1.497 1.283 1.078 0.855 0.61 0.361 0.202 0.047 -0.192 -0.361 -0.552 -0.655 -0.861 -1.077 -1.307 -1.426 -1.659 -1.824 -1.98 -2.135 -2.457 -2.638 -2.839 -3.065 -3.333 -3.629 -3.951 -5.343 -5 ,15227 ,TETRA ,17602371,Sun Nov 28 15:26:37 CET,Sun Nov 28 17:56:51 CET,0.0 0.388 0.592 0.779 0.954 1.092 1.238 1.361 1.556 1.654 1.744 1.804 2.011 2.098 2.25 2.393 2.539 2.607 2.727 2.844 3.024 3.142 3.247 3.389 3.531 3.684 3.83 3.972 4.163 4.33 4.492 4.685 4.85 4.997 5.189 5.402 5.599 5.84 6.086 6.331 6.601 6.873 7.146 7.429 7.762 8.115 8.454 8.785 9.139 9.409 9.484 9.27 8.845 8.354 7.895 7.467 7.062 6.685 6.341 5.983 5.65 5.339 5.028 4.722 4.415 4.152 3.907 3.659 3.425 3.19 2.946 2.731 2.498 2.257 2.069 1.868 1.661 1.443 1.211 1.049 0.889 0.648 0.494 0.337 0.244 0.044 -0.164 -0.388 -0.511 -0.757 -0.919 -1.071 -1.208 -1.525 -1.721 -1.92 -2.125 -2.349 -2.625 -3.009 -3.988 -6 ,32521 ,TETRA ,17602372,Sun Nov 28 15:28:01 CET,Sun Nov 28 17:58:43 CET,0.0 0.726 0.974 1.201 1.381 1.524 1.655 1.783 2.016 2.104 2.181 2.225 2.424 2.511 2.667 2.818 2.973 3.041 3.163 3.288 3.473 3.595 3.709 3.872 4.023 4.152 4.275 4.392 4.545 4.709 4.869 5.053 5.229 5.406 5.617 5.835 6.032 6.233 6.447 6.679 6.899 7.151 7.439 7.68 7.982 8.331 8.698 9.069 9.449 9.739 9.788 9.463 8.925 8.412 7.934 7.434 6.986 6.573 6.201 5.773 5.388 5.024 4.659 4.315 3.99 3.711 3.409 3.151 2.939 2.71 2.454 2.232 2.003 1.754 1.567 1.384 1.184 0.975 0.755 0.599 0.437 0.171 -0.003 -0.195 -0.293 -0.474 -0.672 -0.875 -0.983 -1.215 -1.343 -1.475 -1.611 -1.926 -2.096 -2.279 -2.488 -2.724 -3.056 -3.534 -5.837 -7 ,3392 ,TETRA ,17602373,Sun Nov 28 15:28:04 CET,Sun Nov 28 17:59:07 CET,0.0 0.702 0.996 1.215 1.393 1.575 1.762 1.919 2.16 2.28 2.393 2.502 2.729 2.839 3.029 3.215 3.394 3.471 3.626 3.777 3.983 4.116 4.237 4.395 4.541 4.688 4.833 4.968 5.141 5.311 5.459 5.644 5.843 6.035 6.254 6.495 6.706 6.906 7.114 7.331 7.577 7.92 8.263 8.543 8.895 9.291 9.692 10.116 10.527 10.815 10.896 10.607 10.199 9.753 9.293 8.845 8.452 8.085 7.734 7.353 7.031 6.751 6.463 6.177 5.902 5.665 5.423 5.193 5.004 4.801 4.575 4.365 4.116 3.875 3.694 3.499 3.289 3.076 2.848 2.679 2.511 2.239 2.042 1.833 1.715 1.49 1.278 1.035 0.901 0.646 0.477 0.314 0.133 -0.241 -0.421 -0.62 -0.887 -1.164 -1.468 -1.813 -2.347 -8 ,20580 ,TETRA ,17602374,Sun Nov 28 15:28:03 CET,Sun Nov 28 17:58:26 CET,0.0 0.468 0.715 0.898 1.069 1.246 1.399 1.544 1.818 1.935 2.06 2.2 2.434 2.543 2.743 2.927 3.074 3.15 3.307 3.465 3.69 3.814 3.927 4.105 4.282 4.443 4.61 4.764 4.947 5.142 5.329 5.547 5.764 5.967 6.181 6.416 6.637 6.856 7.082 7.326 7.592 7.907 8.22 8.498 8.839 9.231 9.694 10.121 10.492 10.797 10.842 10.48 10.041 9.564 9.146 8.717 8.262 7.809 7.395 6.99 6.642 6.279 5.942 5.665 5.417 5.192 4.95 4.725 4.528 4.311 4.053 3.856 3.661 3.447 3.28 3.097 2.919 2.737 2.526 2.376 2.224 1.999 1.832 1.666 1.585 1.394 1.159 0.876 0.745 0.503 0.333 0.202 0.059 -0.269 -0.445 -0.632 -0.831 -1.073 -1.401 -1.827 -3.011 -9 ,24386 ,TETRA ,17602375,Sun Nov 28 15:28:01 CET,Sun Nov 28 17:58:22 CET,0.0 0.558 0.812 0.989 1.143 1.312 1.458 1.592 1.84 1.948 2.058 2.148 2.343 2.431 2.599 2.763 2.907 2.975 3.108 3.232 3.418 3.539 3.655 3.806 3.947 4.099 4.249 4.39 4.572 4.759 4.942 5.159 5.354 5.544 5.776 6.024 6.25 6.494 6.744 6.989 7.26 7.574 7.921 8.238 8.579 8.912 9.282 9.624 9.929 10.19 10.173 9.808 9.346 8.86 8.337 7.82 7.365 6.912 6.524 6.148 5.795 5.458 5.121 4.808 4.536 4.277 3.98 3.699 3.454 3.211 2.939 2.71 2.493 2.265 2.09 1.909 1.709 1.501 1.279 1.12 0.959 0.712 0.541 0.36 0.263 0.055 -0.161 -0.383 -0.507 -0.75 -0.901 -1.046 -1.182 -1.463 -1.638 -1.823 -2.026 -2.262 -2.536 -2.877 -4.037 -10 ,10294 ,TETRA ,17602376,Sun Nov 28 15:28:02 CET,Sun Nov 28 17:58:51 CET,0.0 0.638 0.88 1.061 1.219 1.364 1.5 1.628 1.858 1.966 2.063 2.107 2.298 2.383 2.531 2.682 2.828 2.899 3.046 3.176 3.361 3.485 3.611 3.783 3.942 4.091 4.229 4.358 4.515 4.666 4.831 5.041 5.239 5.421 5.624 5.839 6.037 6.292 6.554 6.794 7.053 7.332 7.634 7.949 8.297 8.647 9.011 9.383 9.786 10.102 10.212 10.043 9.695 9.259 8.828 8.414 7.956 7.467 7.031 6.587 6.229 5.92 5.614 5.297 4.965 4.657 4.354 4.089 3.848 3.597 3.33 3.104 2.876 2.655 2.486 2.303 2.108 1.891 1.645 1.477 1.314 1.049 0.869 0.691 0.599 0.397 0.193 -0.014 -0.114 -0.333 -0.458 -0.587 -0.716 -1.01 -1.2 -1.39 -1.58 -1.801 -2.089 -2.5 -3.662 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_5.txt deleted file mode 100644 index d5b4197b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7734 ,TETRA ,17602377,Sun Nov 28 15:31:01 CET,Sun Nov 28 18:02:25 CET,0.0 0.7 1.005 1.219 1.392 1.542 1.689 1.832 2.116 2.242 2.346 2.445 2.661 2.76 2.983 3.194 3.386 3.474 3.632 3.806 4.054 4.196 4.325 4.511 4.697 4.881 5.055 5.217 5.422 5.608 5.798 6.031 6.26 6.474 6.733 7.044 7.348 7.668 8.005 8.371 8.726 9.131 9.611 10.097 10.668 11.257 11.93 12.755 13.708 14.752 15.916 16.574 16.773 16.853 16.826 16.701 16.554 16.381 16.189 15.977 15.801 15.614 15.402 15.17 14.925 14.718 14.495 14.277 14.09 13.905 13.7 13.517 13.333 13.156 13.019 12.858 12.696 12.53 12.341 12.214 12.081 11.87 11.711 11.545 11.477 11.342 11.188 11.024 10.935 10.746 10.619 10.482 10.356 10.083 9.91 9.716 9.524 9.259 8.87 8.382 7.224 -2 ,20169 ,TETRA ,17602378,Sun Nov 28 15:31:03 CET,Sun Nov 28 18:02:23 CET,0.0 0.542 0.762 0.955 1.119 1.274 1.427 1.555 1.779 1.895 2.005 2.11 2.326 2.414 2.583 2.752 2.928 3.016 3.182 3.338 3.564 3.705 3.828 4.005 4.18 4.357 4.521 4.678 4.907 5.131 5.34 5.576 5.792 6.005 6.267 6.545 6.8 7.088 7.386 7.729 8.111 8.517 8.987 9.481 10.039 10.629 11.326 12.127 13.02 13.987 15.002 15.653 15.865 15.851 15.682 15.442 15.197 14.963 14.76 14.54 14.332 14.141 13.957 13.784 13.614 13.44 13.221 12.992 12.812 12.617 12.389 12.212 12.016 11.795 11.613 11.427 11.238 11.039 10.84 10.7 10.556 10.347 10.187 10.025 9.944 9.755 9.543 9.304 9.175 8.944 8.784 8.635 8.473 8.136 7.931 7.699 7.454 7.171 6.788 6.255 4.258 -3 ,25175 ,TETRA ,17602379,Sun Nov 28 15:31:05 CET,Sun Nov 28 17:58:47 CET,0.0 0.346 0.513 0.667 0.825 0.964 1.095 1.214 1.41 1.498 1.597 1.666 1.874 1.98 2.186 2.386 2.549 2.625 2.791 2.958 3.184 3.324 3.465 3.665 3.863 4.054 4.222 4.385 4.604 4.808 5.002 5.269 5.532 5.759 6.027 6.335 6.626 6.934 7.262 7.648 8.046 8.461 8.949 9.472 10.066 10.679 11.428 12.283 13.263 14.379 15.556 16.35 16.627 16.646 16.538 16.356 16.196 16.012 15.804 15.585 15.392 15.191 14.976 14.777 14.588 14.398 14.184 13.973 13.797 13.641 13.456 13.271 13.058 12.83 12.658 12.504 12.357 12.165 11.926 11.752 11.587 11.345 11.174 11.008 10.913 10.689 10.467 10.225 10.093 9.847 9.62 9.459 9.303 8.944 8.742 8.518 8.255 7.943 7.542 6.973 4.377 -4 ,2220 ,TETRA ,17602380,Sun Nov 28 15:31:07 CET,Sun Nov 28 17:59:24 CET,0.0 0.749 0.981 1.184 1.348 1.506 1.674 1.821 2.062 2.17 2.287 2.411 2.635 2.742 2.927 3.096 3.254 3.334 3.484 3.621 3.845 3.991 4.135 4.339 4.536 4.724 4.89 5.058 5.288 5.492 5.676 5.916 6.159 6.395 6.672 6.968 7.235 7.546 7.893 8.249 8.632 9.052 9.523 9.99 10.565 11.213 11.912 12.689 13.513 14.428 15.453 15.948 16.01 15.922 15.72 15.456 15.182 14.877 14.572 14.263 14.027 13.848 13.656 13.456 13.252 13.021 12.782 12.589 12.411 12.233 12.058 11.889 11.687 11.477 11.317 11.159 10.99 10.808 10.628 10.495 10.339 10.11 9.964 9.808 9.728 9.521 9.298 9.077 8.96 8.751 8.623 8.515 8.379 8.035 7.855 7.648 7.423 7.17 6.892 6.542 5.08 -5 ,14933 ,TETRA ,17602381,Sun Nov 28 15:32:00 CET,Sun Nov 28 17:40:06 CET,0.0 0.829 1.233 1.472 1.638 1.785 1.913 2.048 2.309 2.429 2.549 2.673 2.89 2.972 3.155 3.36 3.545 3.633 3.815 3.982 4.189 4.327 4.47 4.669 4.854 5.039 5.214 5.378 5.605 5.821 6.038 6.287 6.513 6.741 6.995 7.279 7.541 7.834 8.165 8.512 8.893 9.317 9.804 10.289 10.873 11.535 12.268 13.065 13.96 14.988 16.084 16.725 16.955 16.972 16.874 16.714 16.52 16.318 16.116 15.909 15.685 15.464 15.245 15.019 14.829 14.662 14.463 14.283 14.121 13.953 13.779 13.631 13.468 13.287 13.134 12.957 12.795 12.627 12.427 12.281 12.137 11.925 11.754 11.556 11.459 11.262 11.038 10.796 10.669 10.43 10.248 10.1 9.952 9.62 9.469 9.304 9.098 8.883 8.586 8.152 6.208 -6 ,16199 ,TETRA ,17602382,Sun Nov 28 15:34:00 CET,Sun Nov 28 17:42:27 CET,0.0 0.711 1.004 1.168 1.331 1.511 1.669 1.795 2.023 2.13 2.223 2.301 2.503 2.589 2.769 2.938 3.093 3.173 3.329 3.477 3.669 3.789 3.919 4.106 4.278 4.454 4.628 4.794 5.004 5.213 5.424 5.666 5.9 6.126 6.375 6.658 6.928 7.235 7.578 7.943 8.301 8.694 9.153 9.595 10.131 10.76 11.47 12.271 13.238 14.31 15.47 16.199 16.472 16.545 16.416 16.202 15.985 15.781 15.632 15.447 15.237 15.019 14.79 14.56 14.341 14.151 13.951 13.773 13.605 13.425 13.229 13.058 12.873 12.664 12.502 12.325 12.131 11.944 11.772 11.639 11.498 11.266 11.083 10.907 10.816 10.607 10.402 10.21 10.105 9.878 9.698 9.549 9.424 9.132 8.952 8.737 8.501 8.271 7.941 7.518 6.014 -7 ,24761 ,TETRA ,17602383,Sun Nov 28 15:36:00 CET,Sun Nov 28 18:03:50 CET,0.0 0.781 1.034 1.218 1.39 1.557 1.7 1.832 2.057 2.161 2.272 2.384 2.59 2.674 2.836 3.009 3.178 3.255 3.401 3.53 3.731 3.872 4.003 4.181 4.355 4.528 4.704 4.874 5.094 5.31 5.517 5.771 6.007 6.234 6.498 6.785 7.049 7.343 7.682 8.05 8.416 8.806 9.27 9.756 10.322 10.928 11.638 12.428 13.271 14.275 15.45 16.185 16.363 16.353 16.273 16.113 15.949 15.753 15.512 15.229 14.992 14.809 14.626 14.434 14.247 14.052 13.857 13.679 13.508 13.337 13.155 12.988 12.794 12.579 12.404 12.243 12.094 11.921 11.72 11.562 11.393 11.121 10.931 10.747 10.653 10.479 10.295 10.079 9.966 9.738 9.561 9.412 9.28 9.001 8.829 8.61 8.328 8.053 7.783 7.378 5.415 -8 ,22677 ,TETRA ,17602384,Sun Nov 28 15:36:01 CET,Sun Nov 28 18:03:23 CET,0.0 0.707 0.943 1.116 1.285 1.458 1.615 1.757 1.995 2.107 2.223 2.32 2.529 2.632 2.835 3.017 3.186 3.274 3.438 3.581 3.786 3.915 4.039 4.228 4.409 4.583 4.747 4.921 5.144 5.356 5.572 5.815 6.046 6.294 6.593 6.905 7.196 7.521 7.864 8.239 8.623 9.034 9.537 10.039 10.622 11.265 11.98 12.764 13.685 14.681 15.723 16.337 16.453 16.336 16.16 16.023 15.817 15.511 15.247 14.978 14.726 14.493 14.219 13.95 13.723 13.497 13.256 13.05 12.867 12.662 12.433 12.238 12.016 11.779 11.608 11.437 11.248 11.038 10.826 10.675 10.52 10.273 10.094 9.921 9.832 9.625 9.394 9.166 9.051 8.82 8.662 8.501 8.329 7.971 7.789 7.608 7.412 7.134 6.769 6.342 4.853 -9 ,30697 ,TETRA ,17602385,Sun Nov 28 15:36:00 CET,Sun Nov 28 18:03:47 CET,0.0 0.424 0.712 0.89 1.033 1.177 1.304 1.422 1.665 1.782 1.879 1.95 2.157 2.262 2.464 2.66 2.859 2.941 3.075 3.215 3.431 3.566 3.699 3.886 4.075 4.259 4.432 4.612 4.838 5.033 5.225 5.469 5.698 5.923 6.185 6.475 6.757 7.051 7.367 7.711 8.083 8.498 8.966 9.435 9.983 10.584 11.247 12.005 12.908 13.897 14.932 15.67 15.942 15.981 15.891 15.769 15.644 15.453 15.257 15.03 14.831 14.671 14.509 14.35 14.191 14.012 13.798 13.614 13.449 13.25 13.049 12.901 12.731 12.539 12.395 12.255 12.108 11.941 11.766 11.637 11.497 11.283 11.136 10.978 10.897 10.708 10.489 10.276 10.159 9.924 9.769 9.622 9.485 9.171 8.978 8.782 8.568 8.322 8.039 7.644 5.736 -10 ,3657 ,TETRA ,17602386,Sun Nov 28 15:38:02 CET,Sun Nov 28 18:07:14 CET,0.0 0.893 1.264 1.485 1.647 1.806 1.951 2.087 2.352 2.476 2.579 2.662 2.87 2.969 3.154 3.317 3.482 3.561 3.702 3.836 4.04 4.183 4.318 4.506 4.688 4.865 5.04 5.198 5.405 5.617 5.825 6.08 6.341 6.591 6.878 7.211 7.507 7.809 8.149 8.513 8.89 9.308 9.78 10.246 10.775 11.387 12.11 12.851 13.735 14.817 15.93 16.637 16.887 16.878 16.787 16.657 16.495 16.319 16.128 15.893 15.673 15.46 15.244 15.014 14.767 14.546 14.331 14.14 13.967 13.78 13.594 13.439 13.264 13.051 12.886 12.734 12.558 12.364 12.177 12.045 11.9 11.674 11.511 11.348 11.259 11.067 10.869 10.664 10.549 10.323 10.158 10.007 9.857 9.576 9.428 9.257 9.033 8.774 8.455 7.959 6.296 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_1b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_1b.txt deleted file mode 100644 index 2f025b96..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_1b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17955 ,TETRA ,17602387,Sun Nov 28 15:37:00 CET,Sun Nov 28 17:59:16 CET,0.0 0.378 0.631 0.83 0.985 1.156 1.327 1.488 1.771 1.889 2.0 2.078 2.31 2.417 2.616 2.807 2.993 3.081 3.251 3.423 3.673 3.828 3.987 4.21 4.41 4.595 4.763 4.924 5.129 5.324 5.523 5.757 5.983 6.217 6.503 6.796 7.059 7.389 7.77 8.177 8.61 9.08 9.625 10.155 10.759 11.41 12.13 12.923 13.799 14.831 15.985 16.706 16.939 16.931 16.774 16.565 16.37 16.16 15.968 15.751 15.526 15.311 15.082 14.87 14.669 14.465 14.262 14.064 13.868 13.653 13.452 13.301 13.128 12.927 12.774 12.595 12.396 12.205 12.02 11.89 11.733 11.475 11.31 11.138 11.049 10.869 10.686 10.496 10.377 10.127 9.971 9.817 9.657 9.326 9.146 8.958 8.746 8.48 8.128 7.639 6.451 -2 ,4727 ,TETRA ,17602388,Sun Nov 28 15:37:02 CET,Sun Nov 28 18:00:10 CET,0.0 0.667 1.0 1.242 1.425 1.571 1.709 1.859 2.126 2.237 2.344 2.439 2.668 2.77 2.959 3.132 3.304 3.391 3.569 3.735 3.978 4.142 4.287 4.506 4.708 4.884 5.065 5.246 5.475 5.689 5.898 6.161 6.425 6.68 6.963 7.258 7.532 7.866 8.247 8.609 8.998 9.457 9.955 10.452 11.015 11.596 12.246 12.967 13.812 14.75 15.714 16.285 16.41 16.304 16.109 15.9 15.672 15.419 15.14 14.862 14.664 14.476 14.287 14.118 13.914 13.697 13.463 13.244 13.056 12.857 12.657 12.504 12.354 12.181 12.033 11.871 11.707 11.543 11.357 11.223 11.09 10.878 10.74 10.59 10.512 10.352 10.153 9.935 9.826 9.602 9.497 9.36 9.191 8.844 8.681 8.509 8.33 8.119 7.875 7.593 6.904 -3 ,19956 ,TETRA ,17602389,Sun Nov 28 15:37:01 CET,Sun Nov 28 18:00:18 CET,0.0 0.982 1.311 1.512 1.689 1.84 1.97 2.097 2.346 2.471 2.589 2.68 2.909 3.014 3.2 3.381 3.562 3.642 3.799 3.956 4.183 4.33 4.464 4.668 4.876 5.072 5.246 5.412 5.64 5.854 6.057 6.303 6.55 6.791 7.063 7.371 7.678 8.009 8.337 8.679 9.06 9.495 9.976 10.455 11.011 11.622 12.321 13.069 13.904 14.833 15.763 16.227 16.292 16.219 16.027 15.763 15.49 15.2 14.928 14.632 14.354 14.112 13.892 13.647 13.421 13.23 12.988 12.77 12.585 12.378 12.146 11.941 11.733 11.527 11.364 11.194 10.998 10.807 10.625 10.489 10.342 10.098 9.934 9.762 9.675 9.499 9.311 9.129 9.029 8.807 8.663 8.526 8.402 8.141 7.974 7.787 7.581 7.311 6.982 6.571 5.68 -4 ,25192 ,TETRA ,17602390,Sun Nov 28 15:37:03 CET,Sun Nov 28 17:59:47 CET,0.0 0.617 0.909 1.127 1.323 1.504 1.668 1.793 2.043 2.165 2.276 2.376 2.612 2.727 2.946 3.14 3.319 3.401 3.559 3.71 3.919 4.058 4.195 4.386 4.577 4.764 4.939 5.117 5.351 5.561 5.767 6.033 6.294 6.534 6.805 7.126 7.445 7.778 8.136 8.519 8.897 9.299 9.751 10.215 10.764 11.374 12.083 12.872 13.733 14.618 15.467 15.829 15.868 15.765 15.576 15.327 15.063 14.796 14.533 14.264 14.009 13.759 13.505 13.245 12.989 12.774 12.564 12.352 12.164 11.958 11.727 11.534 11.341 11.16 11.028 10.885 10.723 10.544 10.352 10.218 10.074 9.847 9.676 9.489 9.398 9.201 8.993 8.761 8.64 8.409 8.319 8.192 8.047 7.731 7.569 7.403 7.228 7.012 6.738 6.378 5.76 -5 ,25423 ,TETRA ,17602391,Sun Nov 28 15:37:06 CET,Sun Nov 28 18:00:10 CET,0.0 0.416 0.601 0.754 0.929 1.089 1.238 1.381 1.64 1.782 1.918 2.032 2.269 2.373 2.57 2.765 2.957 3.05 3.209 3.353 3.587 3.747 3.881 4.067 4.273 4.481 4.671 4.859 5.098 5.326 5.552 5.825 6.085 6.322 6.599 6.923 7.218 7.543 7.932 8.357 8.787 9.235 9.716 10.206 10.826 11.489 12.19 12.969 13.892 14.882 15.822 16.396 16.6 16.582 16.462 16.275 16.042 15.771 15.519 15.284 15.077 14.859 14.632 14.415 14.2 13.999 13.771 13.544 13.365 13.195 13.004 12.828 12.635 12.438 12.285 12.11 11.925 11.752 11.587 11.475 11.346 11.124 10.98 10.825 10.742 10.58 10.4 10.195 10.099 9.891 9.782 9.652 9.525 9.209 9.015 8.81 8.586 8.34 8.074 7.665 6.471 -6 ,28104 ,TETRA ,17602392,Sun Nov 28 15:37:02 CET,Sun Nov 28 18:00:08 CET,0.0 0.717 1.013 1.215 1.381 1.546 1.694 1.831 2.11 2.231 2.356 2.494 2.751 2.858 3.039 3.216 3.389 3.475 3.638 3.79 4.009 4.149 4.286 4.488 4.685 4.879 5.071 5.251 5.478 5.683 5.887 6.153 6.42 6.675 6.966 7.291 7.578 7.903 8.265 8.641 9.011 9.422 9.91 10.401 10.973 11.583 12.278 13.024 13.871 14.818 15.685 16.034 16.06 15.997 15.876 15.674 15.413 15.118 14.889 14.658 14.418 14.198 13.945 13.67 13.434 13.231 12.981 12.725 12.517 12.326 12.124 11.95 11.765 11.586 11.452 11.301 11.138 10.97 10.798 10.678 10.54 10.308 10.137 9.959 9.871 9.681 9.477 9.255 9.142 8.913 8.789 8.642 8.476 8.147 7.981 7.804 7.591 7.341 7.064 6.748 5.686 -7 ,15662 ,TETRA ,17602393,Sun Nov 28 15:37:01 CET,Sun Nov 28 17:59:57 CET,0.0 0.721 1.016 1.23 1.429 1.593 1.742 1.889 2.158 2.304 2.443 2.537 2.774 2.886 3.094 3.29 3.471 3.56 3.733 3.89 4.124 4.281 4.423 4.623 4.823 5.028 5.22 5.396 5.627 5.848 6.071 6.34 6.576 6.809 7.092 7.39 7.668 7.986 8.319 8.695 9.123 9.571 10.068 10.547 11.127 11.776 12.454 13.196 14.075 15.033 15.969 16.569 16.783 16.745 16.64 16.479 16.249 15.992 15.732 15.46 15.238 15.029 14.806 14.578 14.366 14.175 13.958 13.76 13.586 13.388 13.189 13.042 12.87 12.662 12.493 12.323 12.144 11.956 11.763 11.625 11.473 11.19 10.999 10.819 10.719 10.499 10.265 10.04 9.927 9.678 9.503 9.349 9.182 8.837 8.675 8.469 8.248 8.007 7.711 7.288 5.912 -8 ,11027 ,TETRA ,17602394,Sun Nov 28 15:38:03 CET,Sun Nov 28 18:02:36 CET,0.0 0.401 0.614 0.799 0.999 1.173 1.317 1.462 1.753 1.897 2.013 2.114 2.35 2.448 2.633 2.813 2.994 3.081 3.24 3.39 3.619 3.76 3.908 4.139 4.34 4.521 4.694 4.868 5.088 5.295 5.49 5.733 5.98 6.204 6.478 6.798 7.087 7.416 7.773 8.128 8.518 8.967 9.477 9.986 10.559 11.211 11.968 12.804 13.784 14.829 15.829 16.382 16.479 16.431 16.332 16.134 15.869 15.612 15.37 15.096 14.86 14.629 14.386 14.168 13.971 13.784 13.54 13.304 13.108 12.892 12.666 12.489 12.3 12.097 11.945 11.782 11.613 11.425 11.213 11.074 10.929 10.7 10.542 10.377 10.287 10.104 9.897 9.675 9.564 9.332 9.247 9.132 8.98 8.629 8.438 8.243 8.032 7.823 7.58 7.223 6.242 -9 ,32183 ,TETRA ,17602395,Sun Nov 28 15:38:05 CET,Sun Nov 28 18:02:34 CET,0.0 0.363 0.571 0.774 0.947 1.097 1.218 1.361 1.624 1.731 1.833 1.888 2.1 2.189 2.378 2.584 2.773 2.864 3.038 3.198 3.42 3.562 3.703 3.909 4.116 4.313 4.502 4.695 4.968 5.219 5.447 5.728 6.004 6.272 6.559 6.874 7.197 7.538 7.862 8.219 8.606 9.029 9.51 10.001 10.556 11.143 11.823 12.542 13.33 14.256 15.294 15.918 16.119 16.124 16.026 15.865 15.661 15.402 15.134 14.806 14.503 14.236 13.97 13.724 13.482 13.25 13.003 12.786 12.578 12.347 12.116 11.914 11.699 11.477 11.299 11.119 10.927 10.721 10.508 10.35 10.185 9.942 9.77 9.586 9.49 9.28 9.075 8.863 8.742 8.508 8.365 8.238 8.117 7.813 7.619 7.407 7.201 6.979 6.706 6.304 4.856 -10 ,22308 ,TETRA ,17602396,Sun Nov 28 15:38:02 CET,Sun Nov 28 18:00:39 CET,0.0 0.724 0.997 1.206 1.37 1.542 1.694 1.843 2.099 2.208 2.314 2.395 2.634 2.758 3.002 3.207 3.376 3.459 3.633 3.805 4.034 4.191 4.347 4.557 4.763 4.96 5.138 5.311 5.548 5.776 6.005 6.295 6.577 6.853 7.16 7.484 7.789 8.116 8.467 8.857 9.258 9.68 10.161 10.653 11.212 11.811 12.47 13.171 13.93 14.815 15.821 16.419 16.616 16.607 16.426 16.169 15.876 15.579 15.293 14.975 14.701 14.456 14.222 14.003 13.774 13.538 13.261 13.0 12.779 12.556 12.348 12.191 12.016 11.805 11.636 11.44 11.23 11.03 10.813 10.661 10.52 10.305 10.131 9.945 9.856 9.669 9.462 9.229 9.11 8.869 8.734 8.618 8.471 8.113 7.903 7.654 7.392 7.123 6.769 6.324 4.742 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_6b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_6b.txt deleted file mode 100644 index 2585076b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_6b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10445 ,TETRA ,17602397,Sun Nov 28 15:38:02 CET,Sun Nov 28 18:01:41 CET,0.0 0.572 0.858 1.087 1.272 1.442 1.613 1.777 2.062 2.189 2.319 2.438 2.672 2.785 3.021 3.236 3.426 3.518 3.704 3.875 4.117 4.272 4.419 4.639 4.842 5.039 5.238 5.426 5.65 5.889 6.126 6.392 6.645 6.88 7.149 7.453 7.748 8.075 8.415 8.771 9.156 9.606 10.133 10.616 11.157 11.758 12.468 13.243 13.986 14.737 15.454 15.678 15.58 15.386 15.119 14.798 14.465 14.148 13.856 13.556 13.284 13.032 12.801 12.59 12.378 12.16 11.916 11.705 11.532 11.357 11.169 11.003 10.825 10.645 10.509 10.359 10.217 10.049 9.834 9.698 9.566 9.357 9.211 9.063 8.989 8.834 8.669 8.498 8.405 8.178 8.077 7.953 7.832 7.562 7.405 7.238 7.057 6.858 6.637 6.342 5.571 -2 ,24294 ,TETRA ,17602398,Sun Nov 28 15:38:05 CET,Sun Nov 28 18:01:57 CET,0.0 0.612 0.911 1.158 1.365 1.522 1.676 1.847 2.161 2.289 2.409 2.524 2.758 2.875 3.096 3.27 3.446 3.54 3.726 3.9 4.147 4.303 4.453 4.676 4.884 5.082 5.28 5.462 5.681 5.901 6.116 6.376 6.632 6.865 7.124 7.432 7.733 8.058 8.409 8.769 9.136 9.554 10.057 10.52 11.036 11.634 12.25 12.858 13.53 14.286 15.035 15.335 15.263 15.106 14.892 14.59 14.282 13.98 13.692 13.409 13.163 12.918 12.655 12.392 12.132 11.899 11.681 11.494 11.335 11.154 10.97 10.814 10.624 10.424 10.272 10.117 9.966 9.817 9.651 9.536 9.422 9.217 9.062 8.901 8.814 8.647 8.479 8.289 8.192 7.975 7.858 7.742 7.629 7.365 7.22 7.074 6.918 6.744 6.549 6.274 5.603 -3 ,20704 ,TETRA ,17602399,Sun Nov 28 15:38:02 CET,Sun Nov 28 18:02:24 CET,0.0 0.858 1.197 1.438 1.627 1.798 1.957 2.104 2.371 2.519 2.665 2.795 3.041 3.155 3.366 3.59 3.82 3.925 4.118 4.3 4.57 4.738 4.893 5.112 5.32 5.517 5.689 5.849 6.075 6.295 6.501 6.754 7.007 7.252 7.53 7.843 8.149 8.475 8.803 9.143 9.496 9.921 10.427 10.895 11.408 11.958 12.565 13.255 14.002 14.721 15.402 15.649 15.486 15.244 14.992 14.713 14.437 14.157 13.902 13.632 13.37 13.111 12.855 12.622 12.405 12.215 12.008 11.812 11.635 11.425 11.204 11.038 10.86 10.661 10.506 10.342 10.183 10.028 9.86 9.732 9.587 9.371 9.216 9.045 8.961 8.791 8.615 8.418 8.304 8.076 7.984 7.863 7.743 7.495 7.362 7.225 7.066 6.88 6.653 6.362 5.463 -4 ,16381 ,TETRA ,17602400,Sun Nov 28 15:38:03 CET,Sun Nov 28 18:02:26 CET,0.0 1.337 1.699 1.907 2.103 2.307 2.493 2.676 2.999 3.139 3.279 3.426 3.684 3.805 4.019 4.218 4.402 4.493 4.678 4.847 5.089 5.252 5.408 5.627 5.834 6.033 6.233 6.418 6.636 6.85 7.057 7.305 7.563 7.825 8.12 8.416 8.688 9.021 9.396 9.798 10.215 10.657 11.181 11.668 12.197 12.775 13.368 13.993 14.695 15.454 16.15 16.434 16.411 16.252 16.011 15.729 15.444 15.119 14.798 14.495 14.216 13.945 13.694 13.427 13.166 12.961 12.766 12.577 12.406 12.24 12.056 11.887 11.703 11.519 11.367 11.202 11.041 10.873 10.708 10.592 10.466 10.27 10.138 9.996 9.917 9.745 9.561 9.364 9.263 9.03 8.953 8.849 8.72 8.447 8.304 8.158 8.0 7.819 7.63 7.38 6.862 -5 ,3060 ,TETRA ,17602401,Sun Nov 28 15:39:01 CET,Sun Nov 28 18:04:53 CET,0.0 0.757 1.112 1.374 1.639 1.898 2.119 2.319 2.696 2.848 2.972 3.097 3.35 3.468 3.669 3.845 4.021 4.112 4.297 4.476 4.722 4.887 5.047 5.243 5.437 5.639 5.842 6.05 6.298 6.529 6.743 6.988 7.225 7.46 7.732 8.034 8.315 8.607 8.921 9.254 9.594 9.988 10.471 10.944 11.461 12.018 12.621 13.224 13.92 14.629 15.218 15.395 15.227 14.962 14.66 14.329 13.967 13.628 13.302 12.96 12.677 12.404 12.155 11.919 11.688 11.48 11.253 11.045 10.857 10.655 10.453 10.288 10.111 9.937 9.791 9.629 9.462 9.293 9.141 9.022 8.885 8.676 8.523 8.368 8.288 8.113 7.937 7.756 7.668 7.438 7.325 7.215 7.094 6.821 6.661 6.506 6.36 6.167 5.93 5.716 4.972 -6 ,3908 ,TETRA ,17602402,Sun Nov 28 15:39:02 CET,Sun Nov 28 18:03:39 CET,0.0 0.484 0.835 1.127 1.385 1.618 1.789 1.94 2.219 2.353 2.477 2.601 2.862 2.981 3.182 3.382 3.576 3.664 3.832 3.99 4.224 4.378 4.529 4.737 4.929 5.12 5.3 5.484 5.749 5.998 6.235 6.511 6.739 6.961 7.229 7.513 7.777 8.099 8.445 8.79 9.149 9.542 9.974 10.384 10.87 11.39 11.971 12.633 13.362 14.138 14.9 15.25 15.274 15.109 14.848 14.572 14.291 14.001 13.729 13.458 13.225 12.998 12.772 12.548 12.325 12.124 11.911 11.728 11.569 11.393 11.207 11.049 10.87 10.673 10.515 10.363 10.207 10.025 9.838 9.696 9.552 9.352 9.21 9.053 8.975 8.816 8.646 8.468 8.361 8.127 8.03 7.9 7.77 7.525 7.39 7.233 7.057 6.843 6.607 6.302 5.597 -7 ,21847 ,TETRA ,17602403,Sun Nov 28 15:39:05 CET,Sun Nov 28 18:03:49 CET,0.0 0.561 0.863 1.102 1.298 1.495 1.679 1.835 2.12 2.249 2.362 2.459 2.701 2.81 2.998 3.185 3.365 3.461 3.643 3.812 4.056 4.2 4.342 4.576 4.81 5.018 5.217 5.408 5.648 5.883 6.097 6.347 6.584 6.814 7.084 7.392 7.678 7.978 8.303 8.644 8.997 9.402 9.897 10.381 10.884 11.427 12.062 12.748 13.431 14.008 14.523 14.748 14.655 14.42 14.133 13.812 13.513 13.217 12.914 12.608 12.34 12.096 11.854 11.619 11.39 11.177 10.954 10.735 10.55 10.362 10.163 10.001 9.826 9.65 9.51 9.353 9.192 9.025 8.846 8.723 8.595 8.371 8.219 8.057 7.972 7.807 7.618 7.407 7.305 7.083 7.005 6.913 6.809 6.571 6.416 6.244 6.049 5.824 5.583 5.225 4.515 -8 ,4620 ,TETRA ,17602404,Sun Nov 28 15:40:02 CET,Sun Nov 28 18:03:23 CET,0.0 0.749 1.142 1.399 1.605 1.792 1.959 2.122 2.433 2.571 2.695 2.795 3.014 3.121 3.338 3.528 3.72 3.819 3.993 4.151 4.4 4.557 4.695 4.902 5.129 5.336 5.53 5.736 5.984 6.206 6.416 6.658 6.908 7.167 7.453 7.753 8.04 8.375 8.717 9.061 9.431 9.82 10.247 10.706 11.216 11.695 12.251 12.872 13.526 14.155 14.665 14.822 14.699 14.485 14.244 13.928 13.604 13.296 13.01 12.693 12.391 12.137 11.894 11.646 11.398 11.155 10.905 10.694 10.494 10.29 10.104 9.941 9.756 9.556 9.389 9.218 9.046 8.856 8.659 8.535 8.398 8.173 8.025 7.846 7.753 7.583 7.395 7.198 7.092 6.854 6.726 6.598 6.456 6.101 5.934 5.785 5.618 5.462 5.276 5.017 4.387 -9 ,13606 ,TETRA ,17602405,Sun Nov 28 15:40:02 CET,Sun Nov 28 18:00:12 CET,0.0 1.323 1.671 1.892 2.094 2.291 2.471 2.647 2.963 3.106 3.236 3.359 3.596 3.708 3.931 4.139 4.34 4.428 4.595 4.77 5.004 5.156 5.301 5.502 5.703 5.908 6.096 6.273 6.509 6.723 6.933 7.204 7.451 7.678 7.934 8.228 8.502 8.803 9.132 9.479 9.859 10.257 10.69 11.123 11.63 12.172 12.77 13.39 14.017 14.716 15.297 15.409 15.305 15.057 14.714 14.34 13.99 13.682 13.412 13.103 12.806 12.539 12.29 12.043 11.8 11.575 11.324 11.092 10.896 10.691 10.476 10.287 10.096 9.918 9.751 9.565 9.392 9.216 9.038 8.898 8.751 8.542 8.389 8.222 8.134 7.948 7.751 7.555 7.446 7.201 7.084 6.953 6.825 6.574 6.434 6.264 6.042 5.771 5.533 5.262 4.594 -10 ,24241 ,TETRA ,17602406,Sun Nov 28 15:40:02 CET,Sun Nov 28 18:06:05 CET,0.0 0.824 1.198 1.464 1.705 1.902 2.087 2.251 2.57 2.738 2.89 3.032 3.278 3.389 3.613 3.836 4.044 4.14 4.343 4.55 4.83 5.0 5.162 5.387 5.595 5.797 5.995 6.196 6.444 6.669 6.881 7.128 7.372 7.598 7.863 8.158 8.433 8.739 9.057 9.415 9.779 10.171 10.651 11.154 11.761 12.381 13.047 13.783 14.579 15.353 16.013 16.246 16.138 15.903 15.633 15.351 15.052 14.753 14.485 14.203 13.959 13.735 13.476 13.212 12.962 12.723 12.472 12.243 12.05 11.852 11.659 11.498 11.322 11.129 10.97 10.804 10.641 10.481 10.305 10.184 10.063 9.869 9.736 9.597 9.525 9.379 9.207 9.026 8.937 8.717 8.638 8.54 8.44 8.218 8.094 7.975 7.834 7.66 7.464 7.183 6.276 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_7a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_7a.txt deleted file mode 100644 index ada1ecff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_7a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7947 ,TETRA ,17602407,Sun Nov 28 15:40:02 CET,Sun Nov 28 17:47:43 CET,0.0 1.425 1.863 2.185 2.44 2.68 2.885 3.066 3.415 3.583 3.737 3.888 4.156 4.299 4.57 4.813 5.027 5.138 5.364 5.564 5.824 5.985 6.142 6.384 6.599 6.794 6.999 7.204 7.473 7.723 7.953 8.228 8.502 8.753 9.022 9.321 9.605 9.906 10.224 10.57 10.925 11.316 11.756 12.212 12.699 13.15 13.67 14.183 14.667 15.096 15.29 15.029 14.56 13.991 13.382 12.852 12.378 11.923 11.537 11.128 10.745 10.4 10.09 9.802 9.5 9.213 8.947 8.71 8.488 8.27 8.055 7.852 7.615 7.379 7.196 7.002 6.813 6.611 6.396 6.258 6.103 5.842 5.666 5.493 5.403 5.207 4.997 4.778 4.662 4.405 4.253 4.111 3.968 3.663 3.48 3.28 3.059 2.802 2.477 2.034 1.024 -2 ,15183 ,TETRA ,17602408,Sun Nov 28 15:40:02 CET,Sun Nov 28 17:50:53 CET,0.0 1.922 2.381 2.729 3.029 3.29 3.516 3.697 3.988 4.129 4.273 4.423 4.666 4.793 5.045 5.272 5.488 5.6 5.823 6.024 6.292 6.458 6.622 6.86 7.092 7.32 7.531 7.74 8.004 8.238 8.454 8.715 8.96 9.202 9.475 9.758 10.034 10.368 10.718 11.055 11.393 11.751 12.169 12.588 13.045 13.522 14.033 14.525 15.018 15.538 15.875 15.699 15.32 14.861 14.417 13.977 13.51 13.07 12.672 12.222 11.838 11.505 11.181 10.871 10.573 10.318 10.051 9.798 9.582 9.348 9.099 8.901 8.702 8.486 8.305 8.118 7.921 7.708 7.487 7.326 7.161 6.91 6.744 6.581 6.491 6.301 6.106 5.903 5.79 5.545 5.405 5.269 5.132 4.844 4.673 4.464 4.246 4.017 3.742 3.341 1.718 -3 ,25538 ,TETRA ,17602409,Sun Nov 28 15:41:02 CET,Sun Nov 28 18:07:00 CET,0.0 1.235 1.684 2.016 2.284 2.513 2.749 2.985 3.385 3.561 3.721 3.929 4.215 4.365 4.638 4.896 5.14 5.254 5.474 5.684 5.965 6.146 6.322 6.544 6.752 6.952 7.148 7.353 7.62 7.871 8.115 8.412 8.712 8.983 9.274 9.606 9.918 10.231 10.573 10.932 11.298 11.7 12.142 12.559 13.025 13.528 14.044 14.587 15.134 15.578 15.809 15.661 15.2 14.573 13.971 13.413 12.916 12.49 12.129 11.759 11.419 11.092 10.776 10.483 10.212 9.947 9.653 9.387 9.161 8.918 8.653 8.432 8.204 7.97 7.78 7.569 7.359 7.159 6.939 6.777 6.605 6.323 6.132 5.942 5.851 5.664 5.437 5.207 5.083 4.827 4.683 4.547 4.408 4.093 3.925 3.736 3.515 3.273 2.983 2.539 1.452 -4 ,6431 ,TETRA ,17602410,Sun Nov 28 15:41:03 CET,Sun Nov 28 18:07:15 CET,0.0 1.358 1.878 2.264 2.52 2.741 2.945 3.147 3.535 3.702 3.846 3.996 4.255 4.392 4.655 4.904 5.118 5.212 5.406 5.601 5.87 6.041 6.196 6.417 6.627 6.837 7.046 7.241 7.497 7.753 7.983 8.235 8.477 8.701 8.957 9.231 9.488 9.773 10.09 10.42 10.747 11.099 11.495 11.862 12.275 12.776 13.32 13.855 14.384 14.816 15.029 14.844 14.458 13.983 13.416 12.871 12.419 11.983 11.623 11.268 10.934 10.627 10.337 10.049 9.771 9.52 9.247 9.002 8.784 8.549 8.302 8.086 7.873 7.65 7.465 7.281 7.103 6.916 6.687 6.521 6.359 6.101 5.919 5.724 5.619 5.415 5.215 4.998 4.887 4.655 4.537 4.409 4.277 3.938 3.742 3.561 3.347 3.09 2.801 2.289 0.519 -5 ,17193 ,TETRA ,17602411,Sun Nov 28 15:40:02 CET,Sun Nov 28 18:07:18 CET,0.0 1.598 1.97 2.262 2.511 2.726 2.938 3.134 3.473 3.641 3.795 3.946 4.186 4.303 4.542 4.783 5.016 5.121 5.318 5.507 5.79 5.965 6.123 6.357 6.564 6.752 6.945 7.124 7.356 7.577 7.785 8.023 8.259 8.513 8.788 9.08 9.374 9.7 10.047 10.404 10.728 11.075 11.472 11.847 12.268 12.74 13.261 13.726 14.13 14.548 14.732 14.505 14.19 13.807 13.406 12.98 12.54 12.103 11.69 11.279 10.949 10.652 10.362 10.086 9.819 9.572 9.305 9.051 8.835 8.6 8.342 8.126 7.903 7.655 7.46 7.269 7.063 6.852 6.645 6.501 6.338 6.078 5.908 5.73 5.642 5.448 5.208 4.955 4.837 4.595 4.464 4.329 4.191 3.884 3.693 3.486 3.282 3.051 2.764 2.355 0.754 -6 ,25991 ,TETRA ,17602412,Sun Nov 28 15:40:04 CET,Sun Nov 28 18:07:27 CET,0.0 1.651 2.172 2.531 2.802 3.03 3.228 3.429 3.805 3.995 4.176 4.332 4.582 4.703 4.928 5.167 5.397 5.503 5.695 5.873 6.127 6.29 6.447 6.675 6.888 7.081 7.281 7.486 7.725 7.929 8.116 8.347 8.584 8.828 9.094 9.386 9.676 9.981 10.286 10.578 10.87 11.216 11.637 12.041 12.474 12.933 13.433 13.951 14.473 14.962 15.212 15.061 14.696 14.212 13.689 13.192 12.747 12.33 11.954 11.546 11.171 10.85 10.55 10.26 9.989 9.726 9.435 9.174 8.956 8.729 8.478 8.271 8.061 7.835 7.659 7.473 7.284 7.082 6.859 6.703 6.54 6.288 6.109 5.924 5.829 5.639 5.43 5.222 5.117 4.884 4.749 4.617 4.473 4.147 3.993 3.836 3.649 3.448 3.213 2.826 1.525 -7 ,13804 ,TETRA ,17602413,Sun Nov 28 15:41:06 CET,Sun Nov 28 18:06:52 CET,0.0 1.268 1.759 2.117 2.424 2.702 2.919 3.122 3.543 3.717 3.861 4.018 4.275 4.402 4.645 4.875 5.085 5.191 5.407 5.607 5.861 6.021 6.197 6.458 6.696 6.932 7.166 7.377 7.631 7.894 8.144 8.417 8.697 8.965 9.256 9.575 9.867 10.191 10.534 10.856 11.193 11.583 12.039 12.465 12.897 13.348 13.837 14.334 14.846 15.323 15.514 15.195 14.725 14.258 13.804 13.367 12.924 12.515 12.149 11.751 11.413 11.094 10.778 10.48 10.178 9.895 9.629 9.383 9.144 8.89 8.632 8.416 8.199 7.983 7.804 7.604 7.397 7.18 6.947 6.797 6.632 6.354 6.172 5.99 5.9 5.71 5.503 5.273 5.142 4.887 4.754 4.621 4.471 4.105 3.915 3.734 3.534 3.275 2.974 2.578 1.386 -8 ,23202 ,TETRA ,17602414,Sun Nov 28 15:41:07 CET,Sun Nov 28 18:07:14 CET,0.0 2.36 2.773 3.127 3.428 3.65 3.843 4.025 4.359 4.519 4.673 4.819 5.068 5.207 5.467 5.679 5.879 5.981 6.178 6.368 6.637 6.797 6.945 7.167 7.382 7.581 7.795 8.02 8.298 8.542 8.75 8.995 9.242 9.486 9.764 10.066 10.369 10.709 11.054 11.399 11.749 12.156 12.607 13.03 13.543 14.095 14.65 15.213 15.794 16.275 16.517 16.296 15.857 15.412 14.91 14.376 13.914 13.484 13.092 12.687 12.345 12.027 11.725 11.441 11.155 10.877 10.57 10.316 10.106 9.869 9.613 9.4 9.182 8.955 8.79 8.626 8.439 8.236 8.027 7.877 7.713 7.468 7.301 7.123 7.029 6.828 6.618 6.408 6.29 6.038 5.896 5.767 5.612 5.24 5.036 4.815 4.585 4.326 4.019 3.604 2.599 -9 ,10671 ,TETRA ,17602415,Sun Nov 28 15:41:02 CET,Sun Nov 28 18:09:44 CET,0.0 1.35 1.826 2.194 2.452 2.691 2.925 3.151 3.521 3.68 3.836 4.002 4.261 4.385 4.614 4.855 5.084 5.19 5.398 5.589 5.857 6.035 6.205 6.435 6.652 6.858 7.05 7.233 7.473 7.701 7.926 8.21 8.473 8.723 8.996 9.28 9.539 9.838 10.179 10.543 10.928 11.33 11.743 12.145 12.613 13.105 13.589 14.057 14.561 15.006 15.247 15.097 14.75 14.343 13.893 13.432 12.984 12.565 12.215 11.854 11.509 11.202 10.898 10.598 10.329 10.093 9.851 9.625 9.415 9.193 8.974 8.778 8.554 8.326 8.147 7.963 7.767 7.546 7.324 7.173 7.011 6.769 6.595 6.407 6.305 6.106 5.903 5.655 5.513 5.253 5.109 4.966 4.818 4.5 4.309 4.101 3.861 3.603 3.305 2.849 1.641 -10 ,17503 ,TETRA ,17602416,Sun Nov 28 15:41:03 CET,Sun Nov 28 18:09:27 CET,0.0 2.122 2.644 2.972 3.228 3.465 3.687 3.882 4.236 4.411 4.562 4.706 4.963 5.097 5.324 5.558 5.781 5.884 6.083 6.276 6.535 6.677 6.816 7.032 7.24 7.441 7.659 7.854 8.079 8.327 8.571 8.872 9.144 9.385 9.673 9.993 10.279 10.581 10.901 11.232 11.601 12.009 12.422 12.806 13.23 13.684 14.17 14.633 15.122 15.57 15.773 15.504 15.075 14.591 14.067 13.544 13.051 12.609 12.2 11.783 11.424 11.09 10.779 10.475 10.193 9.933 9.656 9.406 9.178 8.933 8.665 8.44 8.201 7.964 7.785 7.588 7.382 7.161 6.944 6.794 6.632 6.372 6.187 5.976 5.864 5.669 5.473 5.254 5.132 4.879 4.714 4.562 4.411 4.079 3.908 3.718 3.486 3.224 2.902 2.518 0.929 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6a.txt deleted file mode 100644 index 102d8ca1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24063 ,TETRA ,17602417,Sun Nov 28 15:41:05 CET,Sun Nov 28 18:04:26 CET,0.0 0.529 0.834 1.07 1.283 1.507 1.718 1.886 2.179 2.308 2.415 2.497 2.729 2.839 3.044 3.259 3.47 3.558 3.718 3.856 4.042 4.18 4.312 4.493 4.694 4.896 5.068 5.236 5.47 5.671 5.852 6.072 6.279 6.503 6.752 6.999 7.254 7.541 7.821 8.107 8.398 8.705 9.067 9.432 9.822 10.195 10.578 10.946 11.229 11.387 11.305 10.819 10.254 9.666 9.101 8.61 8.159 7.739 7.366 6.991 6.677 6.351 6.016 5.714 5.437 5.187 4.917 4.679 4.472 4.26 4.037 3.85 3.666 3.471 3.325 3.173 2.996 2.809 2.622 2.489 2.348 2.142 1.999 1.842 1.759 1.579 1.389 1.202 1.106 0.883 0.812 0.695 0.576 0.329 0.202 0.083 -0.066 -0.259 -0.497 -0.738 -1.381 -2 ,11550 ,TETRA ,17602418,Sun Nov 28 15:41:06 CET,Sun Nov 28 18:03:56 CET,0.0 0.418 0.699 0.942 1.128 1.314 1.495 1.641 1.927 2.058 2.202 2.352 2.595 2.721 2.96 3.178 3.375 3.467 3.646 3.82 4.063 4.204 4.339 4.549 4.768 4.979 5.153 5.322 5.543 5.748 5.958 6.226 6.487 6.705 6.952 7.241 7.503 7.783 8.083 8.399 8.717 9.043 9.382 9.706 10.039 10.359 10.733 11.129 11.455 11.691 11.74 11.267 10.684 10.111 9.59 9.089 8.609 8.175 7.786 7.349 6.994 6.683 6.345 5.999 5.686 5.412 5.14 4.913 4.697 4.457 4.219 4.034 3.829 3.617 3.463 3.293 3.123 2.968 2.793 2.655 2.522 2.321 2.176 2.029 1.95 1.788 1.629 1.446 1.353 1.135 1.068 0.956 0.824 0.55 0.384 0.183 -0.002 -0.183 -0.374 -0.6 -1.179 -3 ,3877 ,TETRA ,17602419,Sun Nov 28 15:44:00 CET,Sun Nov 28 18:06:51 CET,0.0 0.908 1.258 1.499 1.747 1.968 2.147 2.305 2.576 2.704 2.82 2.917 3.146 3.255 3.471 3.666 3.84 3.922 4.085 4.247 4.462 4.589 4.726 4.937 5.132 5.307 5.487 5.669 5.881 6.071 6.275 6.512 6.702 6.882 7.098 7.356 7.603 7.851 8.084 8.335 8.607 8.904 9.247 9.567 9.935 10.332 10.719 11.091 11.483 11.79 11.798 11.411 10.927 10.401 9.827 9.269 8.749 8.252 7.813 7.402 7.056 6.746 6.449 6.152 5.858 5.592 5.321 5.085 4.883 4.665 4.415 4.199 3.987 3.771 3.606 3.443 3.277 3.088 2.882 2.729 2.576 2.369 2.219 2.064 1.985 1.804 1.61 1.427 1.328 1.103 1.024 0.913 0.79 0.477 0.312 0.157 -0.019 -0.227 -0.459 -0.722 -1.229 -4 ,10198 ,TETRA ,17602420,Sun Nov 28 15:44:03 CET,Sun Nov 28 18:06:50 CET,0.0 0.939 1.296 1.499 1.681 1.856 2.019 2.158 2.425 2.557 2.687 2.808 3.047 3.148 3.338 3.535 3.721 3.799 3.959 4.117 4.372 4.535 4.683 4.902 5.096 5.275 5.455 5.64 5.886 6.114 6.302 6.541 6.779 6.978 7.211 7.478 7.734 8.005 8.271 8.568 8.873 9.198 9.573 9.915 10.317 10.752 11.153 11.476 11.751 11.933 11.936 11.585 11.108 10.57 10.018 9.501 9.025 8.566 8.181 7.795 7.451 7.162 6.885 6.6 6.335 6.101 5.852 5.626 5.417 5.197 4.988 4.823 4.646 4.462 4.303 4.131 3.96 3.775 3.58 3.449 3.314 3.089 2.936 2.79 2.718 2.559 2.39 2.214 2.123 1.903 1.842 1.749 1.643 1.387 1.259 1.132 0.98 0.802 0.6 0.4 -0.207 -5 ,15974 ,TETRA ,17602421,Sun Nov 28 15:46:00 CET,Sun Nov 28 18:09:23 CET,0.0 0.655 0.923 1.139 1.352 1.548 1.706 1.845 2.11 2.236 2.365 2.487 2.721 2.823 3.022 3.206 3.371 3.453 3.627 3.782 3.994 4.13 4.274 4.493 4.705 4.912 5.122 5.33 5.585 5.815 6.027 6.264 6.495 6.73 6.998 7.3 7.589 7.888 8.18 8.459 8.734 9.035 9.353 9.666 10.036 10.408 10.75 11.074 11.361 11.53 11.508 11.103 10.501 9.943 9.424 8.896 8.426 8.01 7.63 7.224 6.857 6.511 6.164 5.83 5.517 5.238 4.969 4.732 4.532 4.314 4.064 3.863 3.648 3.431 3.274 3.102 2.914 2.729 2.532 2.376 2.231 2.023 1.865 1.697 1.615 1.454 1.278 1.098 1.011 0.793 0.736 0.618 0.481 0.224 0.092 -0.064 -0.245 -0.474 -0.756 -1.067 -1.716 -6 ,30286 ,TETRA ,17602422,Sun Nov 28 15:45:00 CET,Sun Nov 28 18:14:53 CET,0.0 0.8 1.073 1.324 1.551 1.733 1.903 2.07 2.324 2.436 2.557 2.643 2.864 2.963 3.151 3.336 3.504 3.58 3.74 3.897 4.105 4.234 4.366 4.575 4.772 4.947 5.106 5.267 5.483 5.678 5.869 6.087 6.283 6.495 6.728 6.969 7.209 7.463 7.736 8.033 8.323 8.645 8.999 9.278 9.581 9.932 10.291 10.615 10.892 11.028 10.885 10.397 9.81 9.236 8.67 8.14 7.686 7.245 6.876 6.502 6.158 5.855 5.555 5.267 5.001 4.744 4.484 4.257 4.056 3.843 3.622 3.441 3.243 3.037 2.882 2.705 2.515 2.326 2.139 2.015 1.887 1.673 1.519 1.381 1.305 1.121 0.92 0.728 0.631 0.403 0.321 0.224 0.115 -0.132 -0.262 -0.424 -0.612 -0.829 -1.061 -1.334 -1.8 -7 ,18329 ,TETRA ,17602423,Sun Nov 28 15:46:03 CET,Sun Nov 28 18:08:30 CET,0.0 0.907 1.232 1.444 1.651 1.833 1.995 2.171 2.482 2.6 2.714 2.823 3.055 3.152 3.359 3.558 3.728 3.804 3.961 4.119 4.329 4.47 4.617 4.816 4.995 5.155 5.316 5.48 5.677 5.859 6.033 6.221 6.402 6.582 6.768 6.994 7.224 7.456 7.699 7.929 8.175 8.445 8.728 9.04 9.413 9.79 10.199 10.596 10.941 11.237 11.296 10.828 10.19 9.586 9.019 8.489 8.013 7.563 7.166 6.764 6.435 6.134 5.813 5.514 5.237 4.976 4.705 4.447 4.22 4.004 3.791 3.613 3.406 3.188 3.03 2.857 2.67 2.483 2.295 2.163 2.025 1.818 1.679 1.537 1.461 1.303 1.149 0.984 0.893 0.678 0.6 0.493 0.386 0.182 0.065 -0.079 -0.234 -0.401 -0.599 -0.876 -1.601 -8 ,26197 ,TETRA ,17602424,Sun Nov 28 15:46:03 CET,Sun Nov 28 17:54:50 CET,0.0 0.962 1.462 1.816 2.076 2.251 2.406 2.548 2.787 2.902 3.016 3.124 3.362 3.47 3.668 3.857 4.029 4.107 4.252 4.395 4.599 4.753 4.901 5.086 5.272 5.454 5.629 5.794 5.994 6.188 6.377 6.595 6.812 7.021 7.247 7.477 7.687 7.947 8.228 8.511 8.806 9.119 9.459 9.762 10.108 10.492 10.906 11.324 11.744 12.055 12.012 11.466 10.818 10.223 9.665 9.115 8.621 8.111 7.624 7.193 6.863 6.564 6.252 5.972 5.734 5.492 5.228 4.986 4.77 4.54 4.313 4.128 3.928 3.726 3.559 3.392 3.223 3.04 2.847 2.718 2.591 2.391 2.246 2.092 2.014 1.85 1.679 1.485 1.377 1.15 1.09 0.991 0.886 0.6 0.444 0.288 0.134 -0.025 -0.249 -0.538 -1.098 -9 ,18163 ,TETRA ,17602425,Sun Nov 28 15:47:01 CET,Sun Nov 28 17:57:49 CET,0.0 0.897 1.204 1.471 1.675 1.876 2.077 2.25 2.513 2.627 2.747 2.879 3.123 3.235 3.408 3.575 3.747 3.829 3.985 4.132 4.332 4.456 4.582 4.772 4.949 5.125 5.3 5.465 5.679 5.893 6.095 6.322 6.545 6.756 7.007 7.276 7.528 7.808 8.093 8.397 8.71 9.026 9.386 9.762 10.165 10.568 10.993 11.375 11.75 12.002 12.007 11.667 11.087 10.496 9.954 9.469 9.045 8.629 8.239 7.843 7.498 7.18 6.863 6.56 6.288 6.022 5.732 5.482 5.273 5.057 4.814 4.596 4.385 4.181 4.022 3.87 3.696 3.489 3.27 3.113 2.947 2.706 2.553 2.395 2.321 2.178 2.014 1.834 1.746 1.515 1.413 1.302 1.169 0.908 0.777 0.614 0.454 0.305 0.109 -0.186 -0.686 -10 ,32438 ,TETRA ,17602426,Sun Nov 28 15:47:01 CET,Sun Nov 28 18:16:05 CET,0.0 0.658 0.948 1.202 1.422 1.639 1.84 2.006 2.273 2.389 2.519 2.666 2.9 2.993 3.183 3.365 3.547 3.64 3.808 3.958 4.175 4.32 4.453 4.628 4.807 4.985 5.144 5.292 5.495 5.695 5.889 6.118 6.316 6.511 6.741 6.996 7.225 7.487 7.775 8.072 8.398 8.727 9.053 9.36 9.739 10.162 10.55 10.863 11.229 11.527 11.384 10.847 10.207 9.627 9.118 8.619 8.153 7.682 7.274 6.869 6.521 6.205 5.895 5.605 5.339 5.11 4.875 4.646 4.452 4.254 4.029 3.835 3.631 3.422 3.251 3.08 2.91 2.727 2.539 2.406 2.277 2.071 1.908 1.744 1.663 1.494 1.324 1.118 1.006 0.772 0.656 0.542 0.429 0.196 0.07 -0.073 -0.231 -0.395 -0.578 -0.872 -1.522 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6b.txt deleted file mode 100644 index b3d61052..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30432 ,TETRA ,17602427,Sun Nov 28 15:48:00 CET,Sun Nov 28 17:59:10 CET,0.0 0.659 1.064 1.39 1.647 1.854 2.047 2.241 2.558 2.705 2.861 3.019 3.268 3.4 3.633 3.839 4.056 4.157 4.351 4.54 4.801 4.97 5.15 5.411 5.642 5.861 6.074 6.286 6.555 6.808 7.054 7.342 7.605 7.856 8.152 8.46 8.749 9.075 9.428 9.754 10.066 10.447 10.901 11.356 11.855 12.408 13.02 13.638 14.272 14.873 15.333 15.32 15.098 14.761 14.357 13.954 13.594 13.242 12.916 12.583 12.281 12.007 11.745 11.495 11.235 10.983 10.733 10.512 10.329 10.145 9.961 9.806 9.655 9.491 9.344 9.181 9.006 8.826 8.639 8.513 8.387 8.182 8.043 7.904 7.823 7.667 7.509 7.315 7.218 7.002 6.901 6.779 6.658 6.415 6.29 6.15 5.998 5.822 5.615 5.366 5.067 -2 ,21686 ,TETRA ,17602428,Sun Nov 28 15:49:00 CET,Sun Nov 28 18:00:03 CET,0.0 0.694 1.03 1.331 1.569 1.764 1.96 2.135 2.476 2.655 2.832 3.014 3.265 3.392 3.641 3.869 4.105 4.212 4.394 4.58 4.84 5.003 5.164 5.396 5.614 5.837 6.042 6.229 6.471 6.709 6.97 7.273 7.54 7.78 8.047 8.364 8.65 8.953 9.256 9.559 9.902 10.277 10.681 11.073 11.522 11.98 12.445 12.932 13.438 13.923 14.314 14.332 13.972 13.513 13.073 12.643 12.221 11.796 11.426 11.069 10.769 10.501 10.247 10.01 9.779 9.571 9.359 9.164 8.977 8.776 8.576 8.41 8.242 8.075 7.944 7.807 7.66 7.497 7.324 7.199 7.072 6.877 6.74 6.606 6.537 6.38 6.211 6.025 5.921 5.706 5.654 5.562 5.465 5.227 5.088 4.92 4.728 4.535 4.328 4.047 3.679 -3 ,15779 ,TETRA ,17602429,Sun Nov 28 15:49:00 CET,Sun Nov 28 17:59:58 CET,0.0 1.0 1.343 1.622 1.855 2.077 2.274 2.439 2.729 2.884 3.038 3.178 3.419 3.529 3.749 3.971 4.164 4.256 4.436 4.605 4.858 5.038 5.207 5.444 5.665 5.863 6.051 6.231 6.487 6.73 6.956 7.229 7.484 7.709 7.961 8.254 8.516 8.809 9.139 9.475 9.818 10.2 10.617 10.997 11.424 11.883 12.369 12.859 13.361 13.875 14.324 14.349 14.07 13.672 13.306 12.925 12.545 12.185 11.85 11.491 11.178 10.888 10.604 10.358 10.133 9.911 9.663 9.416 9.194 8.991 8.781 8.612 8.448 8.275 8.141 7.992 7.831 7.67 7.496 7.367 7.242 7.05 6.905 6.754 6.677 6.5 6.308 6.124 6.016 5.779 5.695 5.594 5.469 5.186 5.054 4.905 4.751 4.596 4.405 4.113 3.244 -4 ,25459 ,TETRA ,17602430,Sun Nov 28 15:49:02 CET,Sun Nov 28 17:59:51 CET,0.0 1.239 1.554 1.782 2.007 2.236 2.459 2.652 2.981 3.123 3.236 3.348 3.601 3.734 3.957 4.16 4.37 4.478 4.689 4.892 5.171 5.329 5.476 5.685 5.885 6.086 6.285 6.498 6.78 7.031 7.273 7.557 7.818 8.066 8.357 8.673 8.963 9.276 9.596 9.911 10.242 10.617 11.036 11.444 11.865 12.325 12.877 13.418 13.969 14.508 14.824 14.791 14.539 14.109 13.637 13.195 12.799 12.432 12.105 11.758 11.449 11.159 10.849 10.559 10.3 10.048 9.779 9.537 9.336 9.136 8.921 8.741 8.551 8.356 8.204 8.029 7.852 7.691 7.53 7.39 7.247 7.055 6.927 6.798 6.718 6.545 6.384 6.212 6.122 5.911 5.826 5.705 5.579 5.299 5.147 5.008 4.869 4.692 4.459 4.142 3.651 -5 ,17781 ,TETRA ,17602431,Sun Nov 28 15:49:59 CET,Sun Nov 28 18:01:01 CET,0.0 0.768 1.082 1.313 1.575 1.831 2.046 2.243 2.579 2.725 2.875 3.044 3.3 3.43 3.653 3.865 4.077 4.187 4.383 4.549 4.784 4.93 5.091 5.332 5.538 5.733 5.914 6.092 6.336 6.592 6.823 7.094 7.374 7.621 7.904 8.221 8.534 8.872 9.212 9.569 9.925 10.272 10.66 11.065 11.485 11.966 12.497 12.993 13.522 13.932 14.055 13.773 13.386 12.902 12.411 11.993 11.598 11.212 10.891 10.543 10.204 9.912 9.634 9.377 9.134 8.909 8.681 8.466 8.27 8.064 7.863 7.7 7.503 7.293 7.138 6.952 6.762 6.581 6.393 6.257 6.118 5.904 5.758 5.615 5.537 5.369 5.195 5.009 4.912 4.685 4.581 4.466 4.344 4.065 3.919 3.772 3.609 3.398 3.103 2.757 2.104 -6 ,25585 ,TETRA ,17602432,Sun Nov 28 15:50:00 CET,Sun Nov 28 18:02:25 CET,0.0 0.634 0.987 1.273 1.493 1.704 1.93 2.145 2.499 2.638 2.78 2.932 3.18 3.287 3.488 3.689 3.885 3.985 4.173 4.355 4.618 4.783 4.944 5.154 5.377 5.614 5.836 6.041 6.287 6.512 6.729 6.986 7.225 7.463 7.75 8.053 8.314 8.613 8.955 9.329 9.707 10.099 10.545 10.989 11.485 12.032 12.607 13.142 13.708 14.232 14.562 14.411 14.106 13.781 13.416 13.024 12.642 12.262 11.905 11.535 11.223 10.938 10.66 10.381 10.12 9.882 9.627 9.393 9.173 8.934 8.674 8.475 8.29 8.098 7.942 7.774 7.609 7.434 7.256 7.139 7.014 6.813 6.671 6.51 6.428 6.271 6.109 5.936 5.843 5.626 5.552 5.459 5.367 5.125 4.976 4.82 4.645 4.46 4.251 4.027 3.397 -7 ,23307 ,TETRA ,17602433,Sun Nov 28 15:50:00 CET,Sun Nov 28 18:03:07 CET,0.0 1.093 1.425 1.717 1.959 2.173 2.34 2.509 2.876 3.034 3.169 3.309 3.552 3.663 3.881 4.077 4.256 4.346 4.536 4.718 4.962 5.114 5.255 5.466 5.678 5.874 6.064 6.255 6.505 6.74 6.951 7.191 7.422 7.653 7.918 8.201 8.467 8.765 9.076 9.403 9.742 10.137 10.606 11.061 11.562 12.042 12.537 13.054 13.62 14.103 14.327 14.159 13.854 13.502 13.091 12.691 12.305 11.916 11.578 11.229 10.912 10.603 10.297 10.008 9.756 9.53 9.27 9.056 8.891 8.713 8.518 8.342 8.157 7.978 7.832 7.68 7.52 7.344 7.145 6.995 6.857 6.666 6.525 6.372 6.293 6.141 5.991 5.827 5.735 5.516 5.445 5.35 5.246 5.016 4.897 4.746 4.584 4.432 4.207 3.953 3.518 -8 ,16141 ,TETRA ,17602434,Sun Nov 28 15:51:02 CET,Sun Nov 28 18:15:39 CET,0.0 0.911 1.23 1.476 1.744 2.006 2.21 2.371 2.676 2.82 2.958 3.064 3.3 3.414 3.651 3.895 4.122 4.235 4.444 4.631 4.903 5.083 5.253 5.493 5.728 5.94 6.129 6.313 6.544 6.749 6.959 7.224 7.465 7.711 8.028 8.404 8.728 9.034 9.379 9.739 10.077 10.453 10.876 11.254 11.704 12.214 12.737 13.317 13.995 14.715 15.314 15.377 15.153 14.841 14.505 14.146 13.782 13.423 13.107 12.808 12.531 12.257 11.995 11.732 11.476 11.246 11.0 10.777 10.572 10.359 10.155 9.972 9.775 9.589 9.444 9.292 9.133 8.969 8.79 8.661 8.527 8.317 8.158 7.981 7.897 7.739 7.571 7.384 7.285 7.067 7.007 6.92 6.792 6.482 6.347 6.198 6.022 5.825 5.601 5.368 4.975 -9 ,29961 ,TETRA ,17602435,Sun Nov 28 15:51:04 CET,Sun Nov 28 18:14:56 CET,0.0 0.602 0.975 1.255 1.462 1.637 1.807 2.004 2.376 2.535 2.692 2.889 3.14 3.26 3.49 3.687 3.883 3.981 4.158 4.337 4.589 4.743 4.894 5.111 5.31 5.496 5.698 5.899 6.132 6.351 6.56 6.808 7.052 7.288 7.557 7.858 8.141 8.451 8.785 9.126 9.472 9.85 10.313 10.767 11.247 11.744 12.257 12.787 13.369 13.916 14.251 14.206 13.988 13.688 13.31 12.897 12.502 12.121 11.79 11.467 11.186 10.913 10.66 10.429 10.187 9.963 9.735 9.532 9.357 9.165 8.944 8.768 8.601 8.438 8.314 8.178 8.03 7.884 7.743 7.642 7.532 7.346 7.207 7.041 6.955 6.799 6.633 6.466 6.38 6.169 6.097 5.997 5.881 5.624 5.483 5.333 5.185 5.021 4.829 4.564 3.671 -10 ,27269 ,TETRA ,17602436,Sun Nov 28 15:51:06 CET,Sun Nov 28 18:15:40 CET,0.0 1.178 1.511 1.806 2.049 2.271 2.489 2.683 3.036 3.197 3.337 3.464 3.696 3.811 4.035 4.234 4.423 4.51 4.675 4.845 5.1 5.263 5.419 5.639 5.843 6.049 6.253 6.445 6.683 6.907 7.134 7.423 7.703 7.966 8.257 8.578 8.879 9.194 9.522 9.851 10.194 10.56 10.946 11.347 11.821 12.328 12.837 13.344 13.854 14.298 14.608 14.589 14.275 13.837 13.433 13.029 12.611 12.236 11.928 11.565 11.225 10.921 10.616 10.331 10.075 9.843 9.587 9.353 9.153 8.943 8.728 8.554 8.368 8.172 8.023 7.881 7.731 7.545 7.347 7.22 7.084 6.861 6.723 6.577 6.5 6.34 6.147 5.96 5.879 5.674 5.611 5.498 5.376 5.096 4.943 4.785 4.616 4.459 4.288 4.032 3.466 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_7a_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_7a_3a.txt deleted file mode 100644 index 9dfb57a0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/protein/Summary_FEP_7a_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2761 ,TETRA ,17602437,Sun Nov 28 15:51:07 CET,Sun Nov 28 18:18:12 CET,0.0 0.43 0.64 0.818 0.983 1.134 1.266 1.386 1.618 1.731 1.826 1.899 2.104 2.196 2.37 2.518 2.65 2.711 2.851 2.991 3.176 3.294 3.4 3.55 3.703 3.848 3.993 4.143 4.332 4.52 4.696 4.911 5.127 5.332 5.56 5.797 6.012 6.226 6.472 6.743 7.046 7.394 7.779 8.141 8.524 8.971 9.482 10.023 10.595 11.041 11.243 11.075 10.666 10.183 9.726 9.306 8.899 8.506 8.166 7.81 7.452 7.12 6.809 6.515 6.249 6.009 5.762 5.519 5.293 5.045 4.754 4.512 4.262 4.008 3.819 3.618 3.414 3.199 2.983 2.846 2.708 2.478 2.313 2.163 2.093 1.939 1.755 1.522 1.395 1.157 1.009 0.86 0.702 0.333 0.132 -0.079 -0.307 -0.58 -0.916 -1.334 -2.606 -2 ,29049 ,TETRA ,17602438,Sun Nov 28 15:52:02 CET,Sun Nov 28 18:11:04 CET,0.0 0.207 0.439 0.689 0.891 1.069 1.211 1.325 1.574 1.7 1.803 1.868 2.084 2.182 2.355 2.513 2.654 2.721 2.867 3.014 3.223 3.356 3.491 3.681 3.853 4.018 4.18 4.332 4.518 4.692 4.853 5.046 5.238 5.427 5.637 5.863 6.074 6.314 6.585 6.863 7.134 7.433 7.784 8.115 8.504 8.923 9.362 9.816 10.243 10.655 10.923 10.793 10.541 10.252 9.91 9.494 9.104 8.751 8.43 8.083 7.751 7.463 7.182 6.901 6.629 6.369 6.121 5.895 5.667 5.43 5.168 4.936 4.693 4.426 4.197 3.968 3.751 3.529 3.307 3.159 3.012 2.769 2.587 2.393 2.286 2.059 1.83 1.579 1.451 1.206 1.044 0.894 0.738 0.421 0.232 0.026 -0.215 -0.524 -0.884 -1.289 -2.347 -3 ,2234 ,TETRA ,17602439,Sun Nov 28 15:52:02 CET,Sun Nov 28 18:06:38 CET,0.0 0.363 0.578 0.756 0.914 1.055 1.17 1.284 1.49 1.589 1.694 1.76 1.959 2.043 2.205 2.365 2.511 2.586 2.738 2.875 3.065 3.185 3.307 3.472 3.625 3.773 3.916 4.057 4.241 4.409 4.581 4.792 4.983 5.162 5.368 5.62 5.885 6.159 6.439 6.74 7.039 7.346 7.682 8.045 8.433 8.848 9.388 9.941 10.479 10.953 11.208 11.036 10.702 10.344 9.971 9.595 9.206 8.807 8.443 8.033 7.673 7.392 7.131 6.87 6.594 6.321 6.054 5.824 5.62 5.4 5.191 5.004 4.785 4.568 4.41 4.257 4.098 3.912 3.713 3.591 3.452 3.231 3.072 2.897 2.815 2.641 2.461 2.273 2.173 1.959 1.847 1.719 1.59 1.302 1.126 0.938 0.735 0.516 0.263 -0.105 -0.938 -4 ,2054 ,TETRA ,17602440,Sun Nov 28 15:53:02 CET,Sun Nov 28 18:07:47 CET,0.0 0.615 0.832 1.007 1.145 1.268 1.394 1.536 1.831 1.951 2.05 2.12 2.32 2.392 2.543 2.701 2.842 2.91 3.055 3.194 3.394 3.52 3.637 3.813 3.975 4.126 4.277 4.429 4.635 4.82 4.984 5.18 5.375 5.566 5.779 6.02 6.242 6.479 6.73 6.986 7.251 7.552 7.903 8.266 8.693 9.144 9.642 10.146 10.676 11.208 11.662 11.705 11.473 11.165 10.767 10.329 9.95 9.603 9.275 8.905 8.568 8.254 7.963 7.691 7.41 7.157 6.884 6.621 6.39 6.138 5.881 5.693 5.488 5.261 5.091 4.912 4.705 4.473 4.212 4.032 3.867 3.639 3.491 3.314 3.208 3.007 2.808 2.582 2.464 2.23 2.092 1.951 1.799 1.415 1.186 0.969 0.745 0.472 0.118 -0.374 -1.458 -5 ,12205 ,TETRA ,17602441,Sun Nov 28 15:53:02 CET,Sun Nov 28 18:07:20 CET,0.0 0.476 0.757 0.926 1.062 1.195 1.323 1.444 1.666 1.779 1.896 1.992 2.21 2.298 2.467 2.645 2.8 2.87 3.009 3.127 3.302 3.427 3.543 3.71 3.877 4.032 4.174 4.31 4.466 4.612 4.772 4.972 5.162 5.35 5.565 5.795 6.011 6.256 6.522 6.812 7.111 7.418 7.77 8.139 8.551 8.957 9.383 9.846 10.328 10.8 11.133 10.966 10.627 10.232 9.841 9.326 8.76 8.313 7.96 7.607 7.306 7.029 6.74 6.455 6.191 5.951 5.683 5.434 5.215 4.985 4.737 4.521 4.308 4.096 3.903 3.675 3.446 3.241 3.044 2.892 2.739 2.54 2.393 2.204 2.108 1.916 1.694 1.449 1.308 1.051 0.911 0.756 0.583 0.209 0.012 -0.224 -0.493 -0.791 -1.16 -1.61 -2.619 -6 ,16241 ,TETRA ,17602442,Sun Nov 28 15:53:02 CET,Sun Nov 28 18:07:39 CET,0.0 0.505 0.74 0.932 1.096 1.249 1.421 1.572 1.78 1.863 1.943 1.99 2.189 2.274 2.416 2.556 2.715 2.792 2.931 3.078 3.301 3.431 3.548 3.712 3.875 4.033 4.185 4.334 4.513 4.69 4.872 5.074 5.266 5.458 5.679 5.922 6.156 6.423 6.707 7.006 7.31 7.641 8.021 8.402 8.855 9.345 9.83 10.286 10.757 11.221 11.588 11.566 11.286 10.919 10.54 10.164 9.795 9.428 9.1 8.752 8.443 8.151 7.868 7.604 7.318 7.044 6.768 6.517 6.304 6.083 5.86 5.667 5.456 5.251 5.094 4.922 4.746 4.561 4.366 4.236 4.093 3.869 3.716 3.555 3.471 3.295 3.1 2.892 2.793 2.582 2.511 2.416 2.303 2.024 1.875 1.711 1.523 1.286 1.0 0.678 0.122 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1a_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1a_5.txt deleted file mode 100644 index a5bce6dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1a_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6772 ,TETRA ,17602447,Sun Nov 28 15:54:02 CET,Sun Nov 28 17:38:14 CET,0.0 0.373 0.62 0.796 0.971 1.12 1.24 1.348 1.554 1.662 1.767 1.822 2.041 2.138 2.301 2.461 2.611 2.677 2.816 2.959 3.167 3.3 3.425 3.599 3.768 3.929 4.084 4.233 4.436 4.646 4.837 5.051 5.262 5.471 5.712 5.988 6.246 6.528 6.835 7.159 7.503 7.879 8.306 8.745 9.273 9.834 10.458 11.142 11.886 12.693 13.537 13.97 13.966 13.786 13.582 13.385 13.148 12.888 12.652 12.402 12.163 11.936 11.702 11.481 11.273 11.071 10.859 10.673 10.515 10.351 10.156 9.991 9.837 9.673 9.541 9.393 9.242 9.077 8.889 8.765 8.648 8.469 8.342 8.209 8.145 8.004 7.849 7.69 7.592 7.368 7.275 7.154 7.035 6.773 6.644 6.525 6.392 6.249 6.068 5.844 5.143 -2 ,28851 ,TETRA ,17602448,Sun Nov 28 15:57:03 CET,Sun Nov 28 17:42:27 CET,0.0 1.165 1.55 1.822 2.043 2.228 2.387 2.532 2.781 2.901 3.019 3.107 3.325 3.416 3.595 3.767 3.922 3.991 4.126 4.262 4.466 4.596 4.728 4.917 5.085 5.249 5.416 5.591 5.81 5.994 6.176 6.414 6.628 6.831 7.073 7.351 7.62 7.921 8.248 8.587 8.957 9.361 9.797 10.228 10.755 11.349 11.968 12.618 13.362 14.103 14.826 15.2 15.207 15.077 14.894 14.702 14.486 14.235 14.002 13.76 13.541 13.345 13.142 12.93 12.732 12.551 12.351 12.155 11.985 11.819 11.638 11.488 11.338 11.186 11.067 10.93 10.765 10.597 10.437 10.322 10.2 10.014 9.895 9.765 9.691 9.552 9.42 9.285 9.216 9.023 8.961 8.87 8.784 8.6 8.501 8.394 8.263 8.086 7.918 7.741 7.304 -3 ,14841 ,TETRA ,17602449,Sun Nov 28 15:58:03 CET,Sun Nov 28 17:51:37 CET,0.0 0.596 0.814 0.969 1.102 1.233 1.354 1.477 1.697 1.805 1.916 1.963 2.169 2.253 2.407 2.553 2.696 2.765 2.899 3.029 3.221 3.341 3.461 3.642 3.806 3.957 4.112 4.261 4.454 4.652 4.854 5.107 5.337 5.539 5.762 6.023 6.297 6.609 6.933 7.266 7.618 8.009 8.459 8.875 9.324 9.851 10.49 11.151 11.84 12.573 13.32 13.76 13.847 13.724 13.516 13.33 13.127 12.86 12.601 12.334 12.102 11.892 11.676 11.469 11.261 11.063 10.872 10.7 10.54 10.375 10.195 10.038 9.876 9.713 9.591 9.467 9.319 9.161 9.015 8.915 8.809 8.644 8.523 8.385 8.317 8.17 8.002 7.824 7.734 7.522 7.442 7.333 7.213 6.962 6.823 6.664 6.477 6.259 5.994 5.606 4.747 -4 ,13943 ,TETRA ,17602450,Sun Nov 28 15:59:01 CET,Sun Nov 28 17:52:28 CET,0.0 0.94 1.223 1.44 1.645 1.847 2.032 2.17 2.437 2.557 2.658 2.731 2.947 3.051 3.254 3.421 3.573 3.648 3.802 3.941 4.139 4.268 4.389 4.564 4.748 4.932 5.099 5.259 5.473 5.682 5.879 6.112 6.334 6.547 6.804 7.105 7.375 7.646 7.941 8.255 8.604 8.997 9.433 9.865 10.33 10.824 11.384 12.023 12.765 13.569 14.349 14.723 14.686 14.53 14.323 14.058 13.807 13.564 13.326 13.081 12.859 12.661 12.479 12.281 12.083 11.9 11.679 11.479 11.326 11.172 10.999 10.855 10.704 10.545 10.434 10.314 10.185 10.048 9.907 9.808 9.694 9.514 9.379 9.235 9.163 9.001 8.827 8.661 8.577 8.361 8.261 8.149 8.028 7.749 7.608 7.468 7.275 7.035 6.751 6.419 5.84 -5 ,103 ,TETRA ,17602451,Sun Nov 28 16:00:02 CET,Sun Nov 28 17:46:58 CET,0.0 0.875 1.189 1.405 1.574 1.733 1.875 2.0 2.248 2.357 2.45 2.525 2.746 2.836 3.02 3.199 3.378 3.464 3.626 3.77 3.956 4.082 4.217 4.414 4.589 4.757 4.915 5.073 5.286 5.487 5.689 5.941 6.173 6.4 6.673 6.955 7.205 7.478 7.781 8.121 8.479 8.873 9.333 9.788 10.321 10.894 11.497 12.156 12.877 13.598 14.341 14.724 14.759 14.646 14.435 14.199 13.959 13.733 13.514 13.237 12.982 12.775 12.566 12.363 12.188 12.01 11.807 11.627 11.463 11.284 11.105 10.959 10.79 10.626 10.505 10.36 10.215 10.068 9.911 9.802 9.691 9.502 9.357 9.214 9.142 8.975 8.808 8.649 8.564 8.367 8.294 8.191 8.089 7.857 7.716 7.565 7.379 7.153 6.932 6.612 5.654 -6 ,20151 ,TETRA ,17602452,Sun Nov 28 16:00:01 CET,Sun Nov 28 17:47:19 CET,0.0 1.105 1.428 1.678 1.865 2.02 2.164 2.304 2.534 2.645 2.762 2.847 3.061 3.15 3.318 3.47 3.62 3.7 3.86 4.0 4.217 4.353 4.479 4.67 4.845 5.025 5.199 5.366 5.588 5.798 5.992 6.225 6.446 6.653 6.901 7.174 7.439 7.732 8.045 8.378 8.724 9.114 9.559 9.985 10.453 10.979 11.613 12.312 13.042 13.82 14.566 14.836 14.825 14.707 14.501 14.261 14.016 13.756 13.52 13.287 13.085 12.896 12.689 12.462 12.251 12.053 11.85 11.676 11.518 11.351 11.174 11.022 10.855 10.672 10.54 10.416 10.286 10.138 9.985 9.873 9.752 9.573 9.443 9.304 9.236 9.104 8.949 8.774 8.688 8.489 8.427 8.324 8.21 7.975 7.85 7.706 7.562 7.423 7.259 7.063 6.574 -7 ,16333 ,TETRA ,17602453,Sun Nov 28 16:02:02 CET,Sun Nov 28 17:49:13 CET,0.0 0.682 1.012 1.238 1.425 1.611 1.787 1.931 2.181 2.294 2.411 2.493 2.709 2.814 3.0 3.17 3.33 3.406 3.56 3.708 3.939 4.082 4.21 4.395 4.57 4.728 4.876 5.019 5.201 5.392 5.585 5.807 6.023 6.241 6.483 6.748 6.992 7.253 7.554 7.883 8.199 8.553 8.999 9.445 9.936 10.497 11.119 11.782 12.52 13.288 14.056 14.413 14.402 14.319 14.134 13.887 13.676 13.466 13.249 12.982 12.744 12.545 12.345 12.156 11.981 11.812 11.625 11.45 11.294 11.13 10.96 10.811 10.654 10.497 10.369 10.232 10.098 9.964 9.825 9.729 9.622 9.462 9.353 9.237 9.179 9.045 8.911 8.781 8.707 8.502 8.428 8.333 8.236 8.033 7.923 7.813 7.713 7.566 7.369 7.116 6.122 -8 ,32639 ,TETRA ,17602454,Sun Nov 28 16:02:02 CET,Sun Nov 28 17:57:57 CET,0.0 1.062 1.298 1.518 1.728 1.897 2.052 2.195 2.457 2.572 2.664 2.724 2.953 3.048 3.217 3.389 3.568 3.653 3.807 3.95 4.158 4.292 4.415 4.591 4.758 4.919 5.09 5.266 5.482 5.668 5.838 6.065 6.306 6.527 6.765 7.035 7.291 7.565 7.856 8.182 8.523 8.902 9.363 9.807 10.32 10.876 11.456 12.073 12.787 13.627 14.442 14.767 14.818 14.733 14.549 14.319 14.078 13.829 13.577 13.341 13.119 12.859 12.62 12.429 12.247 12.068 11.874 11.71 11.569 11.412 11.23 11.077 10.92 10.757 10.628 10.489 10.343 10.194 10.044 9.944 9.833 9.647 9.512 9.364 9.295 9.15 8.981 8.803 8.709 8.49 8.388 8.272 8.15 7.902 7.797 7.689 7.57 7.439 7.236 7.004 6.597 -9 ,26776 ,TETRA ,17602455,Sun Nov 28 16:02:03 CET,Sun Nov 28 17:49:10 CET,0.0 0.822 1.159 1.385 1.554 1.71 1.863 1.997 2.246 2.375 2.498 2.581 2.811 2.909 3.072 3.237 3.398 3.479 3.63 3.764 3.969 4.099 4.22 4.395 4.574 4.751 4.906 5.055 5.251 5.438 5.627 5.859 6.074 6.274 6.521 6.799 7.05 7.312 7.606 7.934 8.267 8.627 9.056 9.491 10.007 10.566 11.171 11.819 12.526 13.274 14.035 14.449 14.516 14.444 14.26 14.056 13.866 13.639 13.403 13.148 12.921 12.716 12.516 12.323 12.132 11.949 11.762 11.594 11.445 11.276 11.093 10.94 10.787 10.628 10.494 10.352 10.209 10.069 9.914 9.796 9.665 9.459 9.328 9.187 9.107 8.946 8.797 8.658 8.579 8.369 8.281 8.163 8.043 7.807 7.669 7.507 7.325 7.103 6.856 6.54 5.479 -10 ,29010 ,TETRA ,17602456,Sun Nov 28 16:02:03 CET,Sun Nov 28 17:49:12 CET,0.0 0.714 0.941 1.12 1.275 1.427 1.581 1.719 1.932 2.023 2.123 2.189 2.39 2.467 2.639 2.811 2.97 3.041 3.168 3.289 3.464 3.574 3.679 3.846 4.016 4.168 4.325 4.482 4.682 4.877 5.071 5.312 5.544 5.772 6.024 6.298 6.569 6.891 7.219 7.54 7.892 8.294 8.736 9.155 9.668 10.231 10.853 11.548 12.341 13.213 14.057 14.509 14.568 14.435 14.221 13.972 13.709 13.462 13.224 12.98 12.773 12.56 12.351 12.158 11.952 11.757 11.568 11.395 11.247 11.095 10.923 10.78 10.643 10.495 10.376 10.257 10.136 10.0 9.835 9.724 9.614 9.442 9.318 9.18 9.104 8.956 8.819 8.651 8.561 8.352 8.273 8.164 8.065 7.872 7.755 7.609 7.457 7.308 7.132 6.876 6.082 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1a.txt deleted file mode 100644 index 250fc3ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14730 ,TETRA ,17602457,Sun Nov 28 16:02:03 CET,Sun Nov 28 17:49:25 CET,0.0 0.683 0.987 1.205 1.384 1.552 1.697 1.825 2.073 2.183 2.284 2.352 2.561 2.651 2.821 2.979 3.141 3.217 3.355 3.493 3.694 3.822 3.942 4.114 4.279 4.428 4.584 4.742 4.929 5.097 5.257 5.442 5.62 5.783 5.979 6.214 6.428 6.657 6.921 7.192 7.432 7.7 8.028 8.361 8.724 9.1 9.532 9.949 10.328 10.663 10.842 10.586 10.158 9.72 9.256 8.8 8.383 8.002 7.691 7.357 7.034 6.743 6.462 6.2 5.959 5.725 5.47 5.252 5.068 4.879 4.68 4.505 4.324 4.132 3.982 3.824 3.656 3.492 3.329 3.213 3.079 2.873 2.735 2.581 2.502 2.338 2.154 1.967 1.872 1.648 1.525 1.396 1.28 0.991 0.825 0.665 0.473 0.263 0.018 -0.323 -1.374 -2 ,29017 ,TETRA ,17602458,Sun Nov 28 16:04:03 CET,Sun Nov 28 17:59:29 CET,0.0 0.343 0.545 0.705 0.846 0.961 1.073 1.188 1.389 1.482 1.571 1.605 1.813 1.882 2.011 2.148 2.285 2.347 2.46 2.57 2.741 2.848 2.949 3.109 3.246 3.36 3.477 3.609 3.78 3.933 4.092 4.284 4.448 4.606 4.791 4.985 5.175 5.391 5.634 5.889 6.148 6.451 6.789 7.127 7.508 7.912 8.35 8.757 9.089 9.345 9.432 9.177 8.817 8.367 7.902 7.423 6.991 6.644 6.342 5.995 5.679 5.376 5.094 4.849 4.607 4.378 4.133 3.899 3.698 3.489 3.267 3.088 2.895 2.694 2.545 2.398 2.245 2.077 1.908 1.803 1.695 1.52 1.4 1.271 1.199 1.055 0.922 0.781 0.71 0.505 0.434 0.33 0.218 -0.022 -0.149 -0.286 -0.444 -0.647 -0.875 -1.157 -1.8 -3 ,28540 ,TETRA ,17602459,Sun Nov 28 16:04:05 CET,Sun Nov 28 17:59:21 CET,0.0 0.3 0.477 0.646 0.803 0.94 1.063 1.164 1.352 1.447 1.533 1.588 1.8 1.879 2.043 2.198 2.344 2.414 2.549 2.683 2.874 2.983 3.092 3.243 3.373 3.536 3.707 3.849 4.021 4.189 4.355 4.561 4.75 4.914 5.102 5.305 5.491 5.695 5.941 6.223 6.512 6.83 7.171 7.466 7.796 8.197 8.586 8.929 9.282 9.569 9.652 9.393 8.997 8.565 8.105 7.633 7.226 6.836 6.493 6.143 5.817 5.521 5.242 4.992 4.756 4.531 4.296 4.088 3.903 3.709 3.504 3.325 3.146 2.962 2.801 2.619 2.436 2.269 2.097 1.972 1.847 1.657 1.511 1.36 1.291 1.143 0.986 0.822 0.717 0.477 0.375 0.254 0.135 -0.121 -0.259 -0.417 -0.602 -0.814 -1.085 -1.472 -2.36 -4 ,29450 ,TETRA ,17602460,Sun Nov 28 16:04:08 CET,Sun Nov 28 17:58:10 CET,0.0 1.037 1.372 1.581 1.753 1.913 2.066 2.215 2.476 2.592 2.699 2.753 2.962 3.053 3.22 3.377 3.544 3.619 3.743 3.857 4.042 4.163 4.269 4.421 4.574 4.731 4.882 5.026 5.202 5.365 5.518 5.689 5.862 6.024 6.218 6.45 6.669 6.887 7.109 7.338 7.579 7.854 8.172 8.498 8.843 9.198 9.583 9.988 10.411 10.734 10.813 10.535 10.15 9.746 9.332 8.923 8.537 8.157 7.83 7.516 7.233 6.959 6.69 6.438 6.206 5.994 5.74 5.516 5.336 5.135 4.929 4.758 4.574 4.379 4.238 4.082 3.904 3.738 3.564 3.443 3.317 3.112 2.969 2.822 2.745 2.577 2.407 2.233 2.137 1.914 1.802 1.673 1.533 1.248 1.103 0.938 0.763 0.605 0.454 0.231 -0.452 -5 ,24656 ,TETRA ,17602461,Sun Nov 28 16:04:06 CET,Sun Nov 28 17:58:05 CET,0.0 0.568 0.774 0.944 1.089 1.211 1.321 1.434 1.649 1.741 1.818 1.846 2.045 2.109 2.247 2.387 2.521 2.588 2.712 2.82 2.98 3.085 3.193 3.351 3.508 3.66 3.807 3.948 4.12 4.284 4.435 4.601 4.761 4.929 5.139 5.389 5.603 5.822 6.073 6.342 6.585 6.838 7.132 7.416 7.757 8.133 8.519 8.916 9.303 9.602 9.676 9.373 8.985 8.557 8.124 7.69 7.306 6.949 6.604 6.246 5.929 5.648 5.387 5.133 4.901 4.691 4.466 4.26 4.079 3.902 3.699 3.522 3.349 3.156 3.007 2.855 2.698 2.541 2.37 2.242 2.113 1.91 1.76 1.604 1.526 1.359 1.182 1.004 0.91 0.69 0.628 0.531 0.428 0.205 0.078 -0.068 -0.23 -0.407 -0.609 -0.909 -1.685 -6 ,3416 ,TETRA ,17602462,Sun Nov 28 16:05:05 CET,Sun Nov 28 17:53:21 CET,0.0 1.206 1.474 1.681 1.892 2.067 2.205 2.347 2.584 2.696 2.803 2.857 3.08 3.174 3.341 3.511 3.666 3.744 3.891 4.013 4.192 4.314 4.442 4.626 4.795 4.957 5.103 5.245 5.436 5.613 5.772 5.966 6.137 6.304 6.518 6.738 6.939 7.171 7.426 7.687 7.942 8.22 8.546 8.85 9.172 9.535 9.925 10.29 10.651 10.952 11.041 10.753 10.385 9.983 9.568 9.159 8.779 8.41 8.061 7.705 7.41 7.133 6.869 6.635 6.406 6.201 5.968 5.734 5.542 5.34 5.12 4.946 4.762 4.561 4.412 4.264 4.11 3.954 3.791 3.684 3.571 3.399 3.273 3.131 3.064 2.938 2.803 2.637 2.541 2.321 2.232 2.125 2.034 1.802 1.665 1.529 1.381 1.222 1.032 0.751 0.326 -7 ,26373 ,TETRA ,17602463,Sun Nov 28 16:05:05 CET,Sun Nov 28 17:53:01 CET,0.0 0.905 1.195 1.398 1.566 1.75 1.928 2.073 2.308 2.418 2.528 2.608 2.825 2.914 3.071 3.222 3.364 3.433 3.57 3.698 3.868 3.984 4.099 4.258 4.412 4.555 4.696 4.829 5.004 5.17 5.326 5.521 5.703 5.872 6.067 6.288 6.498 6.728 6.985 7.248 7.506 7.768 8.073 8.375 8.712 9.073 9.456 9.831 10.193 10.51 10.599 10.334 9.942 9.539 9.142 8.741 8.352 7.978 7.661 7.336 7.035 6.746 6.468 6.22 5.982 5.746 5.488 5.254 5.056 4.855 4.652 4.488 4.313 4.127 3.977 3.797 3.603 3.424 3.25 3.124 2.979 2.742 2.591 2.434 2.344 2.159 1.983 1.812 1.719 1.484 1.384 1.26 1.13 0.863 0.725 0.575 0.386 0.176 -0.105 -0.534 -2.097 -8 ,1872 ,TETRA ,17602464,Sun Nov 28 16:06:02 CET,Sun Nov 28 18:00:01 CET,0.0 0.386 0.677 0.886 1.046 1.211 1.356 1.477 1.715 1.827 1.93 1.995 2.206 2.291 2.467 2.649 2.827 2.907 3.041 3.174 3.375 3.499 3.614 3.779 3.936 4.089 4.233 4.365 4.55 4.734 4.909 5.092 5.257 5.434 5.647 5.878 6.096 6.327 6.555 6.781 7.028 7.323 7.653 7.958 8.327 8.706 9.081 9.462 9.808 10.055 10.125 9.913 9.592 9.218 8.798 8.355 7.933 7.566 7.253 6.918 6.624 6.362 6.117 5.878 5.651 5.439 5.208 4.982 4.778 4.574 4.357 4.181 4.013 3.832 3.682 3.536 3.385 3.221 3.036 2.909 2.792 2.596 2.453 2.316 2.247 2.088 1.914 1.733 1.636 1.415 1.306 1.178 1.05 0.764 0.612 0.449 0.271 0.039 -0.23 -0.579 -1.686 -9 ,14397 ,TETRA ,17602465,Sun Nov 28 16:06:04 CET,Sun Nov 28 18:03:19 CET,0.0 0.354 0.574 0.728 0.869 1.009 1.133 1.241 1.433 1.519 1.608 1.655 1.858 1.932 2.079 2.213 2.329 2.391 2.505 2.616 2.797 2.906 3.003 3.157 3.314 3.456 3.609 3.77 3.956 4.113 4.262 4.455 4.653 4.832 5.008 5.193 5.384 5.611 5.839 6.078 6.347 6.663 6.996 7.291 7.651 8.026 8.437 8.863 9.258 9.563 9.649 9.454 9.101 8.667 8.216 7.768 7.339 6.943 6.598 6.232 5.917 5.648 5.393 5.138 4.89 4.654 4.4 4.167 3.971 3.772 3.548 3.371 3.193 3.011 2.871 2.72 2.553 2.378 2.22 2.109 1.977 1.761 1.615 1.478 1.406 1.243 1.072 0.873 0.768 0.539 0.446 0.337 0.226 -0.038 -0.192 -0.355 -0.554 -0.804 -1.116 -1.558 -2.558 -10 ,1876 ,TETRA ,17602466,Sun Nov 28 16:08:02 CET,Sun Nov 28 17:57:36 CET,0.0 0.55 0.87 1.092 1.284 1.451 1.6 1.73 1.96 2.065 2.156 2.214 2.425 2.512 2.681 2.842 2.985 3.053 3.185 3.311 3.494 3.623 3.761 3.939 4.103 4.261 4.408 4.545 4.707 4.87 5.037 5.229 5.407 5.567 5.759 5.979 6.183 6.417 6.669 6.933 7.207 7.487 7.789 8.072 8.408 8.78 9.153 9.532 9.93 10.246 10.396 10.168 9.749 9.264 8.809 8.39 7.974 7.596 7.276 6.939 6.639 6.37 6.111 5.84 5.586 5.369 5.137 4.915 4.71 4.503 4.282 4.103 3.911 3.703 3.554 3.403 3.256 3.099 2.927 2.82 2.717 2.529 2.374 2.208 2.127 1.97 1.811 1.643 1.55 1.327 1.242 1.126 1.008 0.763 0.641 0.495 0.337 0.163 -0.064 -0.383 -1.352 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1c.txt deleted file mode 100644 index 020dbdc5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26236 ,TETRA ,17602467,Sun Nov 28 16:08:02 CET,Sun Nov 28 18:02:22 CET,0.0 1.158 1.522 1.809 2.042 2.245 2.441 2.622 2.957 3.094 3.199 3.266 3.483 3.591 3.807 3.976 4.134 4.205 4.329 4.469 4.673 4.8 4.931 5.108 5.281 5.452 5.615 5.774 5.962 6.147 6.333 6.558 6.774 6.977 7.219 7.472 7.687 7.925 8.199 8.474 8.738 9.03 9.365 9.697 10.072 10.451 10.841 11.276 11.671 11.974 12.156 12.018 11.687 11.306 10.897 10.439 10.015 9.656 9.368 9.045 8.732 8.48 8.224 7.955 7.702 7.477 7.258 7.054 6.859 6.658 6.46 6.293 6.123 5.952 5.813 5.666 5.518 5.355 5.176 5.049 4.932 4.765 4.636 4.507 4.443 4.302 4.148 3.982 3.904 3.694 3.645 3.56 3.479 3.299 3.191 3.076 2.931 2.759 2.586 2.355 1.682 -2 ,12234 ,TETRA ,17602468,Sun Nov 28 16:10:04 CET,Sun Nov 28 18:04:18 CET,0.0 1.352 1.777 2.088 2.329 2.531 2.69 2.828 3.124 3.251 3.366 3.488 3.723 3.814 3.995 4.17 4.333 4.415 4.569 4.714 4.933 5.061 5.19 5.384 5.566 5.734 5.888 6.034 6.226 6.419 6.595 6.803 7.005 7.192 7.417 7.653 7.862 8.09 8.332 8.598 8.885 9.18 9.525 9.862 10.224 10.626 11.033 11.428 11.833 12.186 12.361 12.219 11.894 11.501 11.085 10.64 10.203 9.823 9.494 9.165 8.867 8.571 8.298 8.053 7.808 7.585 7.362 7.164 6.99 6.801 6.606 6.447 6.272 6.088 5.948 5.795 5.63 5.452 5.275 5.159 5.027 4.824 4.68 4.529 4.457 4.305 4.144 3.992 3.908 3.695 3.635 3.521 3.407 3.174 3.034 2.867 2.66 2.425 2.172 1.857 0.901 -3 ,7766 ,TETRA ,17602469,Sun Nov 28 16:11:03 CET,Sun Nov 28 17:51:11 CET,0.0 0.948 1.284 1.548 1.74 1.921 2.113 2.276 2.531 2.641 2.748 2.833 3.05 3.152 3.358 3.548 3.741 3.821 3.959 4.093 4.301 4.45 4.587 4.776 4.949 5.119 5.286 5.443 5.653 5.855 6.034 6.245 6.447 6.642 6.865 7.118 7.364 7.616 7.883 8.163 8.436 8.734 9.091 9.432 9.817 10.212 10.623 11.039 11.45 11.777 11.871 11.577 11.156 10.724 10.27 9.806 9.376 8.982 8.666 8.34 8.037 7.753 7.484 7.24 7.016 6.817 6.601 6.389 6.203 6.012 5.814 5.654 5.488 5.327 5.199 5.053 4.889 4.713 4.541 4.419 4.29 4.098 3.963 3.815 3.742 3.598 3.452 3.291 3.204 2.992 2.911 2.795 2.673 2.423 2.291 2.148 1.98 1.784 1.53 1.162 0.119 -4 ,30622 ,TETRA ,17602470,Sun Nov 28 16:11:03 CET,Sun Nov 28 18:04:05 CET,0.0 1.448 1.838 2.108 2.336 2.538 2.712 2.845 3.08 3.203 3.322 3.427 3.658 3.747 3.905 4.075 4.233 4.306 4.453 4.601 4.812 4.939 5.057 5.222 5.4 5.574 5.734 5.889 6.082 6.267 6.444 6.668 6.881 7.078 7.31 7.543 7.745 7.965 8.203 8.459 8.733 9.027 9.378 9.743 10.147 10.549 10.976 11.396 11.792 12.164 12.351 12.113 11.699 11.275 10.85 10.429 10.05 9.688 9.353 9.009 8.716 8.456 8.206 7.96 7.727 7.51 7.285 7.095 6.92 6.723 6.517 6.353 6.182 5.991 5.859 5.729 5.568 5.396 5.24 5.128 5.009 4.818 4.677 4.542 4.475 4.301 4.104 3.919 3.822 3.603 3.542 3.424 3.304 3.04 2.887 2.749 2.617 2.464 2.283 2.034 1.18 -5 ,6814 ,TETRA ,17602471,Sun Nov 28 16:12:04 CET,Sun Nov 28 18:04:28 CET,0.0 1.308 1.763 2.076 2.292 2.461 2.609 2.759 3.027 3.163 3.3 3.401 3.623 3.718 3.908 4.082 4.254 4.341 4.496 4.644 4.857 4.987 5.11 5.287 5.458 5.621 5.772 5.93 6.128 6.317 6.503 6.729 6.939 7.136 7.363 7.609 7.844 8.103 8.364 8.622 8.918 9.258 9.626 10.005 10.419 10.847 11.291 11.706 12.093 12.382 12.496 12.26 11.892 11.481 11.069 10.625 10.194 9.825 9.486 9.135 8.833 8.556 8.298 8.052 7.815 7.606 7.381 7.17 6.989 6.794 6.586 6.422 6.242 6.045 5.906 5.77 5.612 5.431 5.242 5.12 5.01 4.829 4.674 4.503 4.428 4.287 4.123 3.95 3.854 3.635 3.561 3.45 3.342 3.09 2.931 2.77 2.608 2.383 2.154 1.888 1.018 -6 ,13172 ,TETRA ,17602472,Sun Nov 28 16:12:02 CET,Sun Nov 28 18:04:53 CET,0.0 0.746 1.047 1.26 1.438 1.609 1.759 1.893 2.149 2.265 2.365 2.412 2.633 2.725 2.884 3.04 3.188 3.25 3.364 3.497 3.717 3.851 3.965 4.128 4.302 4.467 4.604 4.741 4.926 5.101 5.261 5.447 5.63 5.804 6.011 6.243 6.464 6.712 6.969 7.235 7.515 7.83 8.191 8.538 8.918 9.279 9.661 10.062 10.452 10.816 10.978 10.775 10.403 9.968 9.574 9.175 8.761 8.378 8.061 7.723 7.401 7.124 6.871 6.611 6.363 6.133 5.889 5.669 5.479 5.299 5.123 4.971 4.797 4.611 4.468 4.321 4.174 4.022 3.851 3.724 3.593 3.392 3.26 3.125 3.05 2.886 2.726 2.562 2.472 2.26 2.21 2.107 1.988 1.727 1.594 1.47 1.333 1.156 0.908 0.588 -0.161 -7 ,15568 ,TETRA ,17602473,Sun Nov 28 16:13:03 CET,Sun Nov 28 18:06:58 CET,0.0 0.619 0.873 1.056 1.224 1.382 1.535 1.687 1.965 2.087 2.199 2.298 2.53 2.622 2.786 2.947 3.091 3.164 3.318 3.45 3.631 3.766 3.903 4.08 4.246 4.416 4.582 4.734 4.909 5.077 5.254 5.467 5.687 5.891 6.111 6.354 6.565 6.791 7.05 7.32 7.592 7.885 8.212 8.544 8.923 9.328 9.742 10.176 10.622 10.944 11.081 10.923 10.563 10.114 9.682 9.236 8.802 8.419 8.11 7.777 7.467 7.195 6.922 6.675 6.446 6.22 5.966 5.723 5.531 5.347 5.134 4.957 4.786 4.595 4.437 4.29 4.138 3.974 3.791 3.656 3.527 3.34 3.209 3.07 3.007 2.873 2.722 2.545 2.446 2.22 2.131 2.015 1.907 1.682 1.546 1.386 1.215 1.017 0.773 0.405 -0.389 -8 ,17007 ,TETRA ,17602474,Sun Nov 28 16:13:03 CET,Sun Nov 28 18:04:22 CET,0.0 1.252 1.476 1.686 1.848 1.983 2.127 2.257 2.496 2.605 2.706 2.774 2.999 3.093 3.263 3.41 3.545 3.619 3.764 3.896 4.093 4.211 4.322 4.511 4.702 4.883 5.054 5.212 5.398 5.574 5.751 5.957 6.14 6.315 6.532 6.784 7.012 7.26 7.533 7.814 8.107 8.433 8.775 9.077 9.426 9.802 10.188 10.596 11.003 11.374 11.549 11.334 11.009 10.619 10.188 9.782 9.417 9.077 8.771 8.429 8.126 7.875 7.636 7.379 7.12 6.893 6.658 6.449 6.271 6.08 5.867 5.685 5.529 5.376 5.238 5.097 4.943 4.772 4.582 4.445 4.311 4.114 3.983 3.834 3.753 3.602 3.425 3.222 3.119 2.887 2.777 2.667 2.557 2.295 2.152 2.014 1.88 1.688 1.416 1.046 -0.212 -9 ,4496 ,TETRA ,17602475,Sun Nov 28 16:14:02 CET,Sun Nov 28 18:04:01 CET,0.0 1.25 1.607 1.917 2.186 2.38 2.544 2.692 2.962 3.094 3.234 3.346 3.566 3.663 3.854 4.036 4.217 4.301 4.457 4.601 4.799 4.92 5.042 5.228 5.403 5.578 5.751 5.92 6.128 6.313 6.488 6.699 6.885 7.067 7.302 7.557 7.774 8.014 8.274 8.543 8.819 9.123 9.456 9.79 10.153 10.498 10.886 11.315 11.756 12.124 12.256 11.969 11.608 11.239 10.823 10.388 9.99 9.611 9.281 8.952 8.666 8.401 8.133 7.871 7.632 7.422 7.172 6.957 6.784 6.593 6.402 6.232 6.054 5.878 5.738 5.592 5.444 5.299 5.136 5.015 4.886 4.687 4.564 4.424 4.348 4.199 4.034 3.846 3.753 3.538 3.446 3.342 3.243 2.99 2.839 2.688 2.523 2.337 2.096 1.747 0.632 -10 ,31378 ,TETRA ,17602476,Sun Nov 28 16:15:03 CET,Sun Nov 28 18:09:21 CET,0.0 0.783 1.06 1.286 1.429 1.56 1.683 1.796 2.015 2.124 2.233 2.329 2.547 2.626 2.784 2.935 3.075 3.136 3.256 3.384 3.566 3.68 3.794 3.959 4.136 4.307 4.466 4.618 4.806 4.979 5.146 5.365 5.567 5.749 5.952 6.181 6.413 6.68 6.953 7.223 7.511 7.834 8.193 8.515 8.888 9.289 9.678 10.1 10.51 10.8 10.986 10.883 10.533 10.131 9.729 9.329 8.962 8.59 8.256 7.916 7.625 7.366 7.112 6.87 6.643 6.433 6.2 5.98 5.794 5.608 5.41 5.25 5.093 4.918 4.776 4.633 4.48 4.319 4.156 4.042 3.931 3.753 3.619 3.482 3.416 3.269 3.109 2.948 2.865 2.649 2.582 2.486 2.373 2.11 1.962 1.795 1.587 1.373 1.103 0.721 -0.276 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1d.txt deleted file mode 100644 index b955a982..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30256 ,TETRA ,17602477,Sun Nov 28 16:16:03 CET,Sun Nov 28 18:09:30 CET,0.0 2.027 2.356 2.626 2.871 3.072 3.258 3.417 3.709 3.846 3.978 4.111 4.351 4.47 4.703 4.907 5.092 5.169 5.329 5.492 5.721 5.877 6.025 6.232 6.429 6.615 6.784 6.942 7.145 7.334 7.513 7.728 7.924 8.112 8.32 8.574 8.814 9.049 9.307 9.584 9.883 10.223 10.6 10.953 11.327 11.709 12.134 12.549 12.945 13.241 13.315 13.041 12.65 12.229 11.797 11.379 10.959 10.533 10.171 9.836 9.535 9.234 8.936 8.662 8.418 8.184 7.915 7.674 7.484 7.295 7.094 6.919 6.73 6.525 6.369 6.225 6.075 5.909 5.74 5.626 5.504 5.308 5.178 5.048 4.979 4.817 4.642 4.48 4.395 4.18 4.117 4.003 3.881 3.635 3.504 3.365 3.199 2.98 2.739 2.426 1.793 -2 ,22417 ,TETRA ,17602478,Sun Nov 28 16:16:07 CET,Sun Nov 28 18:09:39 CET,0.0 1.439 1.849 2.174 2.438 2.654 2.85 3.045 3.38 3.516 3.636 3.716 3.943 4.049 4.242 4.417 4.594 4.682 4.837 5.0 5.243 5.379 5.507 5.702 5.879 6.048 6.233 6.41 6.625 6.821 7.002 7.235 7.458 7.658 7.889 8.132 8.351 8.599 8.865 9.148 9.444 9.758 10.103 10.457 10.856 11.244 11.618 12.016 12.414 12.66 12.664 12.326 11.856 11.336 10.827 10.356 9.938 9.517 9.135 8.739 8.384 8.092 7.818 7.552 7.286 7.047 6.809 6.583 6.391 6.218 6.035 5.865 5.696 5.519 5.374 5.219 5.062 4.904 4.726 4.606 4.481 4.277 4.131 3.985 3.916 3.764 3.599 3.418 3.325 3.112 3.039 2.918 2.797 2.56 2.425 2.287 2.134 1.932 1.686 1.384 0.076 -3 ,27581 ,TETRA ,17602479,Sun Nov 28 16:16:03 CET,Sun Nov 28 18:09:17 CET,0.0 0.892 1.276 1.515 1.727 1.968 2.186 2.364 2.684 2.825 2.958 3.05 3.29 3.397 3.589 3.781 3.971 4.064 4.233 4.396 4.62 4.764 4.905 5.112 5.303 5.465 5.615 5.756 5.944 6.15 6.346 6.571 6.793 7.001 7.22 7.46 7.703 7.959 8.218 8.507 8.803 9.12 9.472 9.819 10.211 10.622 11.037 11.437 11.821 12.135 12.302 12.031 11.547 11.042 10.584 10.182 9.803 9.426 9.091 8.765 8.467 8.183 7.921 7.659 7.392 7.158 6.931 6.715 6.519 6.319 6.105 5.929 5.756 5.587 5.449 5.303 5.153 4.996 4.812 4.678 4.551 4.348 4.2 4.047 3.97 3.805 3.638 3.474 3.395 3.18 3.113 3.0 2.868 2.609 2.467 2.312 2.17 2.0 1.718 1.336 0.729 -4 ,10210 ,TETRA ,17602480,Sun Nov 28 16:16:06 CET,Sun Nov 28 18:08:37 CET,0.0 0.779 1.105 1.362 1.588 1.779 1.936 2.081 2.33 2.434 2.535 2.596 2.808 2.898 3.084 3.262 3.439 3.514 3.649 3.797 4.024 4.167 4.3 4.488 4.676 4.855 5.023 5.186 5.403 5.608 5.805 6.049 6.266 6.462 6.684 6.919 7.142 7.384 7.663 7.956 8.215 8.495 8.85 9.21 9.61 10.021 10.441 10.86 11.231 11.531 11.601 11.304 10.811 10.287 9.775 9.284 8.88 8.505 8.164 7.831 7.531 7.248 6.976 6.729 6.502 6.274 6.029 5.808 5.61 5.412 5.209 5.035 4.856 4.673 4.529 4.368 4.204 4.026 3.837 3.714 3.594 3.406 3.258 3.107 3.031 2.871 2.705 2.532 2.441 2.219 2.133 2.015 1.882 1.602 1.446 1.267 1.083 0.894 0.685 0.405 -0.059 -5 ,3476 ,TETRA ,17602481,Sun Nov 28 16:16:04 CET,Sun Nov 28 18:09:35 CET,0.0 1.106 1.504 1.808 2.09 2.319 2.478 2.627 2.938 3.085 3.204 3.304 3.548 3.662 3.862 4.051 4.223 4.311 4.486 4.641 4.856 4.991 5.121 5.317 5.505 5.686 5.869 6.036 6.239 6.426 6.614 6.837 7.032 7.227 7.449 7.692 7.946 8.217 8.469 8.729 9.015 9.323 9.68 10.03 10.414 10.84 11.297 11.73 12.107 12.404 12.555 12.262 11.801 11.365 10.9 10.413 9.984 9.595 9.22 8.822 8.473 8.162 7.852 7.568 7.334 7.098 6.842 6.636 6.459 6.271 6.067 5.877 5.677 5.498 5.357 5.199 5.033 4.866 4.69 4.561 4.433 4.245 4.105 3.945 3.864 3.71 3.556 3.392 3.293 3.054 2.978 2.873 2.758 2.479 2.338 2.192 2.02 1.818 1.573 1.256 0.212 -6 ,20091 ,TETRA ,17602482,Sun Nov 28 16:16:06 CET,Sun Nov 28 18:09:49 CET,0.0 1.061 1.464 1.764 2.0 2.215 2.41 2.588 2.911 3.053 3.196 3.348 3.588 3.694 3.902 4.11 4.301 4.393 4.563 4.716 4.932 5.066 5.197 5.375 5.552 5.731 5.906 6.075 6.269 6.46 6.658 6.89 7.108 7.298 7.495 7.742 7.986 8.244 8.515 8.793 9.098 9.462 9.846 10.177 10.542 10.936 11.399 11.887 12.301 12.636 12.781 12.453 12.007 11.544 11.076 10.626 10.2 9.807 9.481 9.151 8.833 8.556 8.295 8.041 7.798 7.573 7.338 7.114 6.916 6.705 6.484 6.296 6.1 5.916 5.774 5.61 5.443 5.292 5.126 5.009 4.895 4.703 4.562 4.416 4.344 4.188 4.03 3.866 3.772 3.553 3.465 3.354 3.241 2.966 2.807 2.645 2.485 2.296 2.07 1.764 0.825 -7 ,4764 ,TETRA ,17602483,Sun Nov 28 16:16:08 CET,Sun Nov 28 18:09:00 CET,0.0 1.394 1.798 2.134 2.382 2.589 2.82 3.012 3.301 3.444 3.58 3.702 3.945 4.052 4.268 4.461 4.653 4.749 4.922 5.077 5.305 5.462 5.614 5.825 6.014 6.192 6.365 6.532 6.749 6.951 7.136 7.351 7.557 7.765 8.018 8.285 8.512 8.753 9.019 9.289 9.584 9.892 10.194 10.507 10.869 11.222 11.629 12.029 12.364 12.654 12.736 12.52 12.093 11.569 11.076 10.634 10.23 9.838 9.501 9.172 8.882 8.607 8.323 8.05 7.814 7.589 7.346 7.125 6.93 6.743 6.548 6.384 6.205 6.005 5.861 5.718 5.563 5.407 5.252 5.136 4.997 4.777 4.633 4.49 4.417 4.263 4.092 3.91 3.809 3.583 3.497 3.38 3.272 3.06 2.912 2.731 2.54 2.323 2.061 1.66 0.484 -8 ,32263 ,TETRA ,17602484,Sun Nov 28 16:16:10 CET,Sun Nov 28 18:11:10 CET,0.0 1.544 1.895 2.226 2.482 2.689 2.881 3.04 3.322 3.457 3.607 3.764 4.003 4.107 4.313 4.507 4.693 4.78 4.946 5.107 5.334 5.484 5.629 5.83 6.015 6.183 6.345 6.508 6.704 6.893 7.085 7.303 7.505 7.716 7.972 8.249 8.504 8.781 9.046 9.319 9.62 9.929 10.282 10.635 11.022 11.461 11.953 12.391 12.769 13.04 13.091 12.735 12.273 11.85 11.435 11.003 10.545 10.107 9.766 9.414 9.093 8.79 8.504 8.261 8.038 7.816 7.563 7.346 7.159 6.957 6.758 6.59 6.403 6.207 6.05 5.901 5.765 5.618 5.458 5.354 5.24 5.055 4.931 4.81 4.754 4.617 4.473 4.324 4.243 4.038 4.003 3.914 3.821 3.632 3.52 3.389 3.269 3.159 2.993 2.768 2.355 -9 ,29327 ,TETRA ,17602485,Sun Nov 28 16:16:04 CET,Sun Nov 28 18:10:11 CET,0.0 1.034 1.456 1.735 1.976 2.214 2.402 2.552 2.813 2.928 3.045 3.169 3.411 3.526 3.745 3.951 4.126 4.203 4.369 4.531 4.748 4.89 5.031 5.231 5.41 5.585 5.757 5.912 6.118 6.315 6.486 6.706 6.916 7.112 7.336 7.595 7.862 8.126 8.395 8.661 8.939 9.279 9.678 10.039 10.439 10.859 11.241 11.589 11.919 12.21 12.341 12.048 11.532 11.016 10.529 10.064 9.67 9.279 8.933 8.588 8.261 7.958 7.68 7.418 7.185 6.97 6.739 6.525 6.336 6.157 5.974 5.795 5.592 5.399 5.253 5.099 4.932 4.755 4.577 4.451 4.32 4.11 3.967 3.815 3.733 3.586 3.449 3.288 3.204 2.99 2.899 2.789 2.674 2.409 2.256 2.095 1.928 1.717 1.443 1.163 0.553 -10 ,15612 ,TETRA ,17602486,Sun Nov 28 16:16:04 CET,Sun Nov 28 18:09:54 CET,0.0 1.758 2.248 2.621 2.899 3.114 3.319 3.5 3.806 3.942 4.066 4.169 4.394 4.505 4.726 4.916 5.097 5.182 5.348 5.504 5.738 5.882 6.012 6.195 6.374 6.555 6.721 6.878 7.084 7.28 7.477 7.693 7.875 8.056 8.279 8.533 8.752 8.978 9.231 9.509 9.813 10.139 10.484 10.812 11.175 11.56 11.973 12.377 12.765 13.09 13.153 12.83 12.368 11.895 11.458 11.024 10.62 10.223 9.847 9.483 9.162 8.862 8.587 8.323 8.074 7.847 7.61 7.403 7.205 6.984 6.77 6.587 6.395 6.221 6.081 5.933 5.794 5.642 5.485 5.365 5.233 5.037 4.892 4.735 4.664 4.529 4.383 4.232 4.158 3.958 3.91 3.819 3.729 3.53 3.416 3.297 3.168 3.025 2.834 2.585 1.849 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_5.txt deleted file mode 100644 index a6beb4e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15841 ,TETRA ,17602487,Sun Nov 28 16:16:06 CET,Sun Nov 28 18:09:39 CET,0.0 0.956 1.4 1.66 1.892 2.082 2.253 2.408 2.699 2.831 2.961 3.088 3.333 3.447 3.65 3.833 4.01 4.098 4.258 4.401 4.617 4.764 4.892 5.088 5.272 5.435 5.609 5.776 5.993 6.213 6.419 6.654 6.872 7.083 7.337 7.628 7.892 8.182 8.491 8.807 9.137 9.512 9.935 10.364 10.875 11.43 12.042 12.706 13.439 14.21 14.989 15.406 15.478 15.38 15.186 14.941 14.723 14.498 14.255 13.981 13.706 13.446 13.195 12.956 12.75 12.568 12.361 12.143 11.964 11.801 11.62 11.461 11.302 11.124 10.972 10.818 10.657 10.464 10.265 10.139 10.021 9.842 9.721 9.597 9.525 9.375 9.227 9.058 8.965 8.747 8.67 8.569 8.441 8.169 8.018 7.836 7.646 7.439 7.192 6.863 5.883 -2 ,8431 ,TETRA ,17602488,Sun Nov 28 16:16:08 CET,Sun Nov 28 18:09:27 CET,0.0 0.849 1.169 1.407 1.615 1.806 1.979 2.117 2.405 2.549 2.682 2.796 3.033 3.145 3.349 3.531 3.694 3.78 3.953 4.114 4.341 4.476 4.599 4.772 4.943 5.104 5.265 5.443 5.681 5.888 6.085 6.346 6.589 6.803 7.029 7.281 7.535 7.818 8.118 8.436 8.774 9.151 9.585 10.031 10.535 11.073 11.702 12.367 13.105 13.898 14.633 14.957 14.952 14.837 14.635 14.38 14.158 13.932 13.69 13.422 13.163 12.918 12.692 12.464 12.241 12.038 11.822 11.628 11.459 11.286 11.099 10.941 10.781 10.618 10.488 10.339 10.179 10.031 9.858 9.722 9.579 9.344 9.174 9.014 8.931 8.762 8.58 8.374 8.268 8.05 7.935 7.796 7.646 7.343 7.167 6.962 6.718 6.43 6.062 5.565 3.331 -3 ,5737 ,TETRA ,17602489,Sun Nov 28 16:16:04 CET,Sun Nov 28 18:09:45 CET,0.0 0.762 1.031 1.236 1.393 1.534 1.671 1.797 2.036 2.154 2.266 2.334 2.549 2.633 2.798 2.97 3.122 3.196 3.355 3.506 3.706 3.834 3.962 4.152 4.335 4.505 4.674 4.849 5.078 5.295 5.503 5.74 5.966 6.192 6.434 6.696 6.965 7.274 7.601 7.95 8.326 8.719 9.168 9.63 10.182 10.737 11.302 11.961 12.712 13.486 14.255 14.651 14.677 14.496 14.258 14.003 13.714 13.431 13.188 12.945 12.715 12.473 12.233 12.004 11.781 11.579 11.367 11.182 11.01 10.797 10.571 10.4 10.236 10.082 9.946 9.789 9.633 9.466 9.298 9.181 9.051 8.845 8.695 8.528 8.443 8.28 8.111 7.919 7.817 7.592 7.452 7.312 7.168 6.884 6.723 6.535 6.325 6.083 5.777 5.272 3.355 -4 ,6904 ,TETRA ,17602490,Sun Nov 28 16:16:05 CET,Sun Nov 28 18:09:43 CET,0.0 0.553 0.798 0.962 1.11 1.238 1.371 1.509 1.74 1.85 1.96 2.029 2.24 2.325 2.482 2.651 2.817 2.893 3.06 3.223 3.45 3.596 3.742 3.947 4.137 4.316 4.479 4.65 4.882 5.105 5.323 5.58 5.828 6.056 6.303 6.595 6.888 7.2 7.549 7.905 8.251 8.642 9.087 9.514 9.99 10.505 11.102 11.772 12.508 13.285 14.028 14.341 14.298 14.106 13.849 13.571 13.302 13.037 12.772 12.494 12.243 11.987 11.731 11.496 11.279 11.063 10.822 10.615 10.449 10.284 10.11 9.939 9.766 9.595 9.455 9.306 9.146 8.981 8.807 8.693 8.569 8.369 8.204 8.019 7.934 7.762 7.587 7.39 7.286 7.063 6.937 6.808 6.674 6.345 6.155 5.958 5.754 5.505 5.217 4.785 2.896 -5 ,22932 ,TETRA ,17602491,Sun Nov 28 16:16:08 CET,Sun Nov 28 18:10:15 CET,0.0 1.038 1.327 1.542 1.739 1.919 2.106 2.262 2.541 2.675 2.79 2.854 3.093 3.195 3.399 3.589 3.761 3.843 3.998 4.144 4.374 4.524 4.662 4.849 5.03 5.206 5.363 5.514 5.719 5.914 6.102 6.347 6.578 6.794 7.05 7.322 7.581 7.871 8.202 8.571 8.939 9.33 9.763 10.193 10.697 11.247 11.865 12.547 13.269 14.044 14.826 15.209 15.235 15.099 14.893 14.657 14.424 14.131 13.848 13.543 13.274 13.026 12.777 12.557 12.335 12.128 11.911 11.717 11.557 11.378 11.182 11.018 10.859 10.68 10.526 10.367 10.202 10.039 9.883 9.759 9.632 9.451 9.309 9.162 9.086 8.908 8.71 8.499 8.399 8.19 8.104 7.992 7.869 7.608 7.457 7.291 7.119 6.906 6.654 6.324 5.093 -6 ,23460 ,TETRA ,17602492,Sun Nov 28 16:16:10 CET,Sun Nov 28 18:10:14 CET,0.0 0.797 1.087 1.3 1.475 1.626 1.778 1.916 2.155 2.267 2.384 2.502 2.739 2.847 3.05 3.235 3.415 3.499 3.651 3.796 3.996 4.128 4.254 4.446 4.633 4.796 4.956 5.12 5.32 5.512 5.712 5.954 6.183 6.416 6.68 6.952 7.219 7.529 7.868 8.223 8.588 8.974 9.407 9.849 10.382 10.952 11.581 12.277 13.019 13.813 14.626 15.05 15.066 14.908 14.711 14.478 14.204 13.916 13.673 13.441 13.221 12.995 12.755 12.494 12.26 12.07 11.868 11.683 11.51 11.336 11.146 10.968 10.785 10.61 10.485 10.343 10.182 10.012 9.819 9.682 9.557 9.356 9.198 9.038 8.954 8.762 8.544 8.315 8.205 7.986 7.874 7.741 7.586 7.256 7.096 6.945 6.76 6.55 6.327 6.015 4.775 -7 ,19094 ,TETRA ,17602493,Sun Nov 28 16:16:06 CET,Sun Nov 28 18:09:45 CET,0.0 1.374 1.753 2.046 2.271 2.475 2.653 2.806 3.078 3.221 3.354 3.453 3.672 3.764 3.958 4.167 4.379 4.473 4.642 4.803 5.034 5.18 5.316 5.498 5.669 5.848 6.023 6.182 6.378 6.568 6.755 6.99 7.227 7.443 7.685 7.958 8.227 8.526 8.836 9.167 9.52 9.909 10.362 10.816 11.31 11.842 12.463 13.153 13.895 14.687 15.508 15.905 15.95 15.803 15.55 15.297 15.048 14.753 14.47 14.202 13.942 13.696 13.45 13.218 13.012 12.804 12.588 12.394 12.216 12.026 11.828 11.678 11.523 11.345 11.209 11.066 10.906 10.735 10.554 10.43 10.299 10.078 9.923 9.767 9.684 9.519 9.343 9.122 9.012 8.784 8.654 8.522 8.38 8.045 7.858 7.64 7.375 7.088 6.728 6.179 4.444 -8 ,13673 ,TETRA ,17602494,Sun Nov 28 16:16:04 CET,Sun Nov 28 18:09:12 CET,0.0 1.022 1.374 1.621 1.834 2.026 2.18 2.305 2.558 2.686 2.822 2.947 3.174 3.274 3.47 3.659 3.833 3.912 4.069 4.228 4.453 4.593 4.735 4.955 5.148 5.322 5.496 5.659 5.874 6.082 6.279 6.516 6.739 6.95 7.21 7.501 7.762 8.047 8.361 8.699 9.045 9.415 9.828 10.249 10.777 11.329 11.891 12.55 13.319 14.11 14.835 15.209 15.265 15.115 14.868 14.604 14.357 14.093 13.839 13.579 13.33 13.09 12.863 12.655 12.444 12.247 12.017 11.804 11.616 11.41 11.209 11.036 10.85 10.65 10.491 10.327 10.162 9.992 9.813 9.687 9.548 9.34 9.192 9.025 8.944 8.769 8.563 8.359 8.263 8.043 7.936 7.816 7.672 7.364 7.188 6.981 6.771 6.533 6.274 5.959 4.501 -9 ,22422 ,TETRA ,17602495,Sun Nov 28 16:16:06 CET,Sun Nov 28 18:09:53 CET,0.0 0.762 0.993 1.157 1.308 1.484 1.631 1.742 1.978 2.097 2.212 2.286 2.498 2.591 2.775 2.937 3.089 3.166 3.304 3.44 3.646 3.781 3.908 4.081 4.25 4.427 4.605 4.761 4.951 5.141 5.325 5.563 5.801 6.029 6.277 6.557 6.843 7.145 7.46 7.805 8.172 8.586 9.056 9.497 9.984 10.517 11.142 11.844 12.607 13.356 14.04 14.344 14.335 14.224 14.027 13.79 13.55 13.29 13.01 12.711 12.479 12.263 12.034 11.809 11.593 11.383 11.162 10.974 10.815 10.635 10.429 10.26 10.066 9.854 9.69 9.524 9.356 9.186 9.018 8.902 8.774 8.569 8.426 8.281 8.208 8.05 7.866 7.664 7.564 7.339 7.213 7.084 6.948 6.634 6.457 6.265 6.056 5.771 5.373 4.815 2.462 -10 ,18194 ,TETRA ,17602496,Sun Nov 28 16:17:03 CET,Sun Nov 28 18:11:16 CET,0.0 0.651 0.915 1.095 1.234 1.365 1.489 1.603 1.815 1.926 2.036 2.109 2.324 2.412 2.572 2.717 2.865 2.939 3.083 3.222 3.429 3.578 3.73 3.941 4.137 4.311 4.468 4.632 4.851 5.067 5.282 5.521 5.732 5.934 6.163 6.442 6.728 6.997 7.267 7.596 7.976 8.389 8.827 9.236 9.708 10.253 10.822 11.416 12.182 13.036 13.866 14.265 14.326 14.222 14.02 13.75 13.474 13.202 12.94 12.674 12.421 12.187 11.953 11.714 11.495 11.296 11.093 10.895 10.714 10.525 10.313 10.137 9.954 9.752 9.599 9.464 9.323 9.151 8.976 8.861 8.734 8.53 8.374 8.209 8.124 7.934 7.748 7.551 7.44 7.209 7.099 6.985 6.859 6.558 6.383 6.178 5.949 5.654 5.258 4.755 2.973 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1c_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1c_5.txt deleted file mode 100644 index 74c63357..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1c_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6930 ,TETRA ,17602497,Sun Nov 28 16:17:05 CET,Sun Nov 28 18:11:15 CET,0.0 0.791 1.041 1.223 1.402 1.595 1.76 1.894 2.152 2.271 2.369 2.416 2.629 2.711 2.865 3.015 3.166 3.241 3.391 3.53 3.749 3.898 4.034 4.223 4.421 4.631 4.826 5.001 5.22 5.422 5.617 5.868 6.118 6.345 6.603 6.888 7.163 7.478 7.807 8.144 8.492 8.871 9.317 9.759 10.245 10.795 11.475 12.284 13.147 13.962 14.753 15.24 15.323 15.182 14.961 14.696 14.398 14.112 13.856 13.584 13.337 13.098 12.85 12.611 12.391 12.185 11.986 11.806 11.627 11.427 11.217 11.038 10.851 10.647 10.479 10.308 10.13 9.936 9.731 9.592 9.446 9.217 9.055 8.892 8.806 8.605 8.388 8.169 8.054 7.812 7.651 7.512 7.374 7.027 6.816 6.592 6.328 6.031 5.636 5.04 2.667 -2 ,18983 ,TETRA ,17602498,Sun Nov 28 16:17:07 CET,Sun Nov 28 18:11:08 CET,0.0 0.746 1.044 1.286 1.514 1.722 1.892 2.041 2.301 2.41 2.529 2.635 2.858 2.951 3.12 3.291 3.48 3.565 3.711 3.852 4.055 4.193 4.332 4.533 4.726 4.909 5.087 5.257 5.484 5.701 5.892 6.126 6.371 6.607 6.87 7.156 7.427 7.739 8.074 8.406 8.746 9.137 9.595 10.053 10.577 11.141 11.763 12.458 13.219 13.989 14.81 15.265 15.319 15.199 14.982 14.707 14.425 14.147 13.893 13.617 13.375 13.154 12.922 12.695 12.481 12.285 12.085 11.897 11.72 11.515 11.295 11.116 10.913 10.696 10.523 10.345 10.167 9.97 9.758 9.619 9.478 9.239 9.069 8.891 8.795 8.589 8.368 8.115 7.985 7.74 7.571 7.422 7.262 6.909 6.717 6.515 6.275 5.989 5.628 5.128 3.13 -3 ,13082 ,TETRA ,17602499,Sun Nov 28 16:17:09 CET,Sun Nov 28 18:10:20 CET,0.0 0.537 0.804 1.021 1.211 1.365 1.498 1.634 1.883 1.994 2.091 2.144 2.359 2.448 2.628 2.799 2.963 3.05 3.222 3.377 3.595 3.738 3.868 4.054 4.243 4.434 4.618 4.787 4.989 5.174 5.356 5.591 5.817 6.037 6.297 6.58 6.846 7.137 7.453 7.788 8.15 8.556 9.022 9.479 10.013 10.585 11.21 11.992 12.883 13.722 14.491 14.841 14.838 14.697 14.452 14.168 13.898 13.642 13.378 13.052 12.794 12.572 12.329 12.099 11.867 11.643 11.43 11.248 11.076 10.879 10.671 10.498 10.318 10.13 9.968 9.782 9.606 9.428 9.238 9.108 8.965 8.724 8.541 8.333 8.232 8.038 7.808 7.555 7.437 7.198 7.051 6.909 6.75 6.423 6.25 6.053 5.833 5.572 5.289 4.888 2.565 -4 ,15352 ,TETRA ,17602500,Sun Nov 28 16:17:04 CET,Sun Nov 28 18:10:24 CET,0.0 0.688 0.998 1.22 1.409 1.581 1.735 1.884 2.157 2.281 2.393 2.494 2.724 2.821 3.009 3.191 3.372 3.46 3.631 3.79 4.035 4.197 4.349 4.561 4.75 4.926 5.103 5.285 5.506 5.691 5.884 6.13 6.349 6.568 6.837 7.109 7.361 7.655 7.967 8.294 8.629 8.993 9.429 9.884 10.398 10.957 11.592 12.28 13.033 13.85 14.68 15.033 15.059 14.982 14.808 14.593 14.357 14.14 13.945 13.69 13.434 13.202 12.944 12.687 12.472 12.271 12.037 11.819 11.633 11.443 11.235 11.048 10.856 10.659 10.508 10.355 10.191 10.021 9.855 9.734 9.598 9.379 9.225 9.049 8.952 8.765 8.551 8.321 8.218 7.988 7.846 7.712 7.548 7.161 6.929 6.674 6.403 6.127 5.824 5.4 3.994 -5 ,3754 ,TETRA ,17602502,Sun Nov 28 16:17:07 CET,Sun Nov 28 18:10:23 CET,0.0 0.818 1.189 1.47 1.657 1.834 1.997 2.139 2.399 2.529 2.655 2.746 2.965 3.062 3.269 3.465 3.643 3.725 3.877 4.017 4.233 4.374 4.499 4.705 4.912 5.089 5.258 5.425 5.638 5.845 6.042 6.287 6.53 6.769 7.035 7.325 7.619 7.929 8.253 8.604 8.956 9.357 9.823 10.272 10.778 11.329 11.983 12.719 13.528 14.392 15.247 15.667 15.661 15.506 15.28 14.983 14.711 14.463 14.215 13.926 13.671 13.419 13.147 12.903 12.678 12.472 12.253 12.062 11.891 11.696 11.498 11.334 11.159 10.974 10.816 10.642 10.468 10.291 10.113 9.997 9.872 9.656 9.495 9.317 9.227 9.038 8.83 8.625 8.521 8.294 8.191 8.059 7.905 7.579 7.405 7.202 6.96 6.693 6.411 6.006 3.901 -6 ,25373 ,TETRA ,17602503,Sun Nov 28 16:17:04 CET,Sun Nov 28 18:14:36 CET,0.0 0.68 0.926 1.12 1.29 1.444 1.592 1.739 1.978 2.087 2.196 2.257 2.477 2.579 2.758 2.943 3.136 3.224 3.394 3.558 3.782 3.922 4.058 4.265 4.465 4.652 4.83 4.993 5.205 5.421 5.629 5.865 6.095 6.326 6.589 6.889 7.189 7.516 7.846 8.19 8.572 8.971 9.415 9.869 10.384 10.952 11.591 12.289 13.087 13.939 14.789 15.203 15.202 15.054 14.814 14.504 14.217 13.965 13.714 13.42 13.156 12.9 12.634 12.393 12.179 11.981 11.757 11.559 11.382 11.165 10.937 10.765 10.58 10.393 10.246 10.076 9.884 9.678 9.496 9.368 9.226 9.002 8.84 8.683 8.607 8.446 8.278 8.095 7.997 7.78 7.68 7.555 7.426 7.122 6.951 6.766 6.553 6.321 6.034 5.592 3.801 -7 ,29479 ,TETRA ,17602504,Sun Nov 28 16:17:05 CET,Sun Nov 28 18:14:16 CET,0.0 0.7 1.004 1.24 1.457 1.649 1.822 1.981 2.249 2.365 2.476 2.578 2.816 2.93 3.147 3.324 3.475 3.551 3.7 3.846 4.058 4.204 4.337 4.524 4.721 4.911 5.091 5.272 5.485 5.669 5.861 6.107 6.345 6.574 6.837 7.124 7.406 7.711 8.02 8.346 8.693 9.093 9.536 9.979 10.497 11.068 11.707 12.397 13.192 14.024 14.84 15.28 15.327 15.239 15.062 14.778 14.503 14.253 13.993 13.71 13.463 13.217 12.973 12.744 12.531 12.334 12.115 11.891 11.686 11.477 11.255 11.069 10.868 10.67 10.524 10.368 10.194 10.028 9.849 9.713 9.571 9.343 9.183 9.016 8.93 8.746 8.529 8.28 8.147 7.911 7.801 7.668 7.511 7.129 6.883 6.608 6.339 6.054 5.719 5.248 3.198 -8 ,3490 ,TETRA ,17602505,Sun Nov 28 16:17:04 CET,Sun Nov 28 18:14:29 CET,0.0 1.17 1.671 2.007 2.248 2.45 2.611 2.765 3.035 3.155 3.28 3.383 3.623 3.741 3.951 4.128 4.291 4.376 4.539 4.693 4.907 5.037 5.16 5.337 5.513 5.687 5.853 6.015 6.23 6.436 6.642 6.919 7.176 7.392 7.645 7.928 8.209 8.531 8.88 9.232 9.583 9.992 10.456 10.911 11.456 12.065 12.715 13.391 14.16 14.996 15.838 16.29 16.354 16.237 16.02 15.767 15.507 15.227 14.932 14.625 14.344 14.085 13.859 13.63 13.393 13.193 12.995 12.792 12.601 12.404 12.228 12.082 11.902 11.708 11.553 11.389 11.222 11.03 10.797 10.645 10.508 10.279 10.107 9.928 9.837 9.658 9.457 9.218 9.086 8.831 8.708 8.587 8.447 8.171 8.018 7.838 7.625 7.351 7.034 6.533 4.922 -9 ,22290 ,TETRA ,17602506,Sun Nov 28 16:17:05 CET,Sun Nov 28 18:14:48 CET,0.0 0.992 1.332 1.617 1.853 2.061 2.24 2.384 2.665 2.795 2.91 3.01 3.258 3.375 3.579 3.759 3.943 4.035 4.2 4.353 4.574 4.716 4.848 5.037 5.228 5.408 5.574 5.742 5.961 6.162 6.339 6.563 6.783 6.991 7.223 7.492 7.761 8.041 8.361 8.71 9.057 9.435 9.858 10.291 10.789 11.351 12.006 12.725 13.511 14.302 15.098 15.501 15.548 15.478 15.307 15.034 14.753 14.502 14.245 13.97 13.71 13.448 13.207 12.973 12.737 12.526 12.307 12.089 11.894 11.694 11.471 11.283 11.091 10.888 10.732 10.569 10.4 10.235 10.023 9.857 9.702 9.459 9.302 9.146 9.057 8.85 8.642 8.441 8.334 8.106 7.946 7.795 7.655 7.347 7.152 6.948 6.705 6.427 6.084 5.554 3.513 -10 ,23365 ,TETRA ,17602507,Sun Nov 28 16:17:07 CET,Sun Nov 28 18:10:36 CET,0.0 0.821 1.174 1.471 1.689 1.853 2.005 2.15 2.404 2.531 2.652 2.754 2.987 3.088 3.279 3.46 3.642 3.734 3.889 4.028 4.23 4.361 4.492 4.693 4.878 5.051 5.215 5.374 5.589 5.804 6.022 6.28 6.512 6.734 6.994 7.273 7.537 7.835 8.177 8.549 8.91 9.297 9.744 10.178 10.696 11.275 11.894 12.557 13.3 14.119 14.915 15.284 15.294 15.15 14.956 14.709 14.439 14.181 13.946 13.693 13.472 13.26 13.038 12.809 12.583 12.362 12.124 11.908 11.722 11.538 11.329 11.149 10.97 10.77 10.593 10.405 10.211 10.013 9.821 9.69 9.554 9.312 9.137 8.96 8.867 8.684 8.489 8.256 8.129 7.89 7.738 7.586 7.443 7.104 6.895 6.693 6.484 6.236 5.918 5.489 4.278 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1d_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1d_5.txt deleted file mode 100644 index 918c659e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_1d_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29497 ,TETRA ,17602508,Sun Nov 28 16:17:09 CET,Sun Nov 28 18:10:24 CET,0.0 0.483 0.737 0.93 1.104 1.247 1.388 1.518 1.746 1.851 1.95 2.0 2.216 2.307 2.5 2.665 2.838 2.924 3.084 3.248 3.488 3.632 3.769 3.955 4.144 4.332 4.513 4.703 4.938 5.149 5.354 5.613 5.88 6.137 6.412 6.699 6.971 7.279 7.615 7.996 8.401 8.827 9.294 9.764 10.335 10.965 11.672 12.462 13.326 14.186 15.062 15.554 15.6 15.476 15.277 15.05 14.811 14.508 14.219 13.946 13.692 13.437 13.18 12.941 12.721 12.501 12.27 12.069 11.873 11.659 11.443 11.255 11.037 10.815 10.647 10.47 10.297 10.108 9.897 9.75 9.608 9.382 9.2 9.0 8.892 8.671 8.429 8.136 7.994 7.751 7.648 7.504 7.322 6.968 6.782 6.57 6.307 5.946 5.463 4.846 2.913 -2 ,15836 ,TETRA ,17602509,Sun Nov 28 16:17:04 CET,Sun Nov 28 18:10:37 CET,0.0 0.852 1.166 1.402 1.576 1.737 1.888 2.02 2.253 2.358 2.463 2.545 2.773 2.861 3.032 3.201 3.363 3.446 3.603 3.76 3.992 4.139 4.287 4.501 4.707 4.9 5.087 5.272 5.502 5.724 5.943 6.194 6.428 6.657 6.934 7.248 7.54 7.844 8.177 8.541 8.918 9.334 9.808 10.291 10.849 11.45 12.116 12.82 13.662 14.629 15.626 16.238 16.384 16.318 16.149 15.914 15.668 15.426 15.193 14.917 14.618 14.346 14.098 13.847 13.6 13.379 13.153 12.95 12.77 12.563 12.345 12.162 11.956 11.741 11.579 11.419 11.238 11.041 10.853 10.722 10.583 10.346 10.164 9.967 9.868 9.659 9.443 9.189 9.05 8.8 8.611 8.442 8.245 7.81 7.58 7.312 6.988 6.603 6.177 5.656 3.451 -3 ,3888 ,TETRA ,17602510,Sun Nov 28 16:17:05 CET,Sun Nov 28 18:10:37 CET,0.0 1.182 1.591 1.88 2.082 2.257 2.435 2.601 2.899 3.025 3.137 3.231 3.47 3.573 3.774 3.983 4.172 4.255 4.413 4.563 4.779 4.932 5.075 5.28 5.479 5.664 5.835 6.002 6.229 6.436 6.636 6.885 7.122 7.351 7.608 7.888 8.148 8.438 8.774 9.123 9.483 9.912 10.416 10.921 11.506 12.143 12.851 13.616 14.495 15.44 16.322 16.825 16.946 16.855 16.648 16.402 16.165 15.892 15.626 15.373 15.13 14.874 14.623 14.39 14.155 13.935 13.718 13.506 13.318 13.134 12.946 12.775 12.594 12.408 12.247 12.059 11.863 11.673 11.459 11.314 11.18 10.944 10.776 10.615 10.53 10.326 10.102 9.877 9.751 9.514 9.37 9.217 9.049 8.634 8.4 8.153 7.9 7.583 7.157 6.537 4.293 -4 ,31299 ,TETRA ,17602511,Sun Nov 28 16:17:05 CET,Sun Nov 28 18:11:07 CET,0.0 0.95 1.194 1.366 1.514 1.662 1.784 1.896 2.111 2.218 2.324 2.401 2.62 2.709 2.883 3.037 3.182 3.259 3.416 3.556 3.756 3.88 4.001 4.187 4.368 4.535 4.695 4.868 5.093 5.3 5.496 5.754 6.012 6.239 6.503 6.806 7.076 7.378 7.724 8.079 8.444 8.853 9.315 9.774 10.299 10.87 11.543 12.277 13.103 14.031 14.947 15.39 15.423 15.319 15.078 14.82 14.604 14.341 14.079 13.796 13.531 13.278 13.032 12.783 12.554 12.343 12.114 11.911 11.721 11.52 11.319 11.152 10.97 10.753 10.586 10.43 10.262 10.09 9.913 9.777 9.628 9.4 9.236 9.053 8.947 8.715 8.491 8.259 8.137 7.882 7.704 7.554 7.393 7.028 6.836 6.589 6.29 5.961 5.475 4.698 1.762 -5 ,29082 ,TETRA ,17602512,Sun Nov 28 16:17:07 CET,Sun Nov 28 18:10:29 CET,0.0 0.786 1.095 1.321 1.536 1.688 1.824 1.95 2.162 2.277 2.405 2.533 2.765 2.867 3.069 3.246 3.409 3.496 3.673 3.83 4.045 4.188 4.322 4.519 4.714 4.902 5.084 5.259 5.478 5.69 5.896 6.15 6.398 6.645 6.934 7.239 7.516 7.829 8.194 8.587 8.981 9.397 9.872 10.354 10.925 11.538 12.214 12.937 13.748 14.749 15.782 16.293 16.396 16.286 16.127 15.954 15.724 15.453 15.201 14.966 14.735 14.497 14.268 14.04 13.823 13.631 13.403 13.177 12.986 12.775 12.551 12.366 12.169 11.963 11.802 11.623 11.434 11.227 11.003 10.853 10.701 10.458 10.273 10.09 9.993 9.775 9.557 9.329 9.204 8.959 8.8 8.638 8.456 8.057 7.817 7.53 7.226 6.909 6.504 5.857 3.458 -6 ,19506 ,TETRA ,17602513,Sun Nov 28 16:17:05 CET,Sun Nov 28 18:09:55 CET,0.0 0.702 1.052 1.333 1.514 1.667 1.843 2.013 2.311 2.453 2.583 2.671 2.89 2.994 3.207 3.396 3.563 3.64 3.795 3.965 4.208 4.355 4.502 4.71 4.899 5.094 5.288 5.473 5.703 5.917 6.123 6.378 6.624 6.86 7.139 7.456 7.773 8.107 8.464 8.84 9.208 9.618 10.098 10.594 11.183 11.803 12.491 13.277 14.168 15.1 15.971 16.388 16.473 16.412 16.235 15.98 15.702 15.439 15.176 14.872 14.594 14.34 14.1 13.874 13.651 13.433 13.216 13.009 12.816 12.605 12.372 12.191 12.008 11.817 11.681 11.523 11.345 11.148 10.929 10.78 10.629 10.396 10.224 10.033 9.936 9.744 9.539 9.304 9.161 8.899 8.725 8.568 8.402 7.999 7.779 7.552 7.274 6.971 6.583 5.908 3.341 -7 ,21800 ,TETRA ,17602514,Sun Nov 28 16:17:06 CET,Sun Nov 28 18:10:30 CET,0.0 0.628 0.916 1.119 1.275 1.411 1.554 1.682 1.911 2.018 2.115 2.2 2.441 2.546 2.746 2.924 3.087 3.174 3.343 3.491 3.712 3.851 3.985 4.184 4.379 4.57 4.763 4.949 5.186 5.414 5.611 5.843 6.083 6.307 6.566 6.869 7.165 7.486 7.831 8.195 8.553 8.951 9.42 9.892 10.444 11.065 11.763 12.525 13.379 14.346 15.327 15.84 15.952 15.891 15.758 15.563 15.312 15.036 14.773 14.49 14.24 13.983 13.73 13.478 13.233 13.028 12.798 12.559 12.352 12.136 11.911 11.726 11.52 11.286 11.104 10.92 10.721 10.52 10.323 10.188 10.046 9.797 9.602 9.409 9.311 9.106 8.892 8.651 8.515 8.262 8.092 7.934 7.761 7.334 7.076 6.83 6.548 6.204 5.801 5.331 3.016 -8 ,24210 ,TETRA ,17602515,Sun Nov 28 16:17:09 CET,Sun Nov 28 18:10:52 CET,0.0 0.505 0.811 1.039 1.241 1.416 1.553 1.681 1.938 2.056 2.158 2.252 2.498 2.608 2.813 3.01 3.184 3.26 3.41 3.557 3.757 3.889 4.025 4.224 4.419 4.6 4.773 4.947 5.169 5.392 5.604 5.842 6.083 6.312 6.578 6.889 7.206 7.539 7.876 8.255 8.634 9.045 9.532 10.029 10.608 11.203 11.849 12.578 13.38 14.261 15.268 15.846 15.931 15.783 15.538 15.268 14.998 14.745 14.475 14.178 13.914 13.655 13.402 13.152 12.916 12.69 12.451 12.234 12.032 11.823 11.592 11.392 11.2 10.993 10.832 10.683 10.506 10.298 10.082 9.931 9.79 9.545 9.36 9.166 9.059 8.843 8.637 8.421 8.297 8.05 7.88 7.706 7.528 7.17 6.967 6.73 6.463 6.148 5.687 5.047 2.006 -9 ,31649 ,TETRA ,17602516,Sun Nov 28 16:17:11 CET,Sun Nov 28 18:11:08 CET,0.0 0.818 1.103 1.305 1.507 1.701 1.842 1.974 2.224 2.333 2.435 2.52 2.758 2.862 3.047 3.231 3.419 3.502 3.655 3.823 4.065 4.214 4.357 4.554 4.75 4.933 5.112 5.279 5.498 5.727 5.947 6.205 6.449 6.685 6.956 7.244 7.508 7.811 8.155 8.504 8.865 9.284 9.757 10.24 10.794 11.402 12.095 12.844 13.658 14.552 15.508 16.002 16.123 16.063 15.904 15.712 15.455 15.148 14.883 14.585 14.319 14.104 13.875 13.633 13.393 13.178 12.949 12.739 12.547 12.331 12.1 11.903 11.705 11.49 11.318 11.146 10.967 10.759 10.542 10.397 10.244 9.988 9.808 9.625 9.528 9.338 9.119 8.878 8.748 8.487 8.293 8.131 7.945 7.487 7.231 6.969 6.679 6.365 5.951 5.397 3.699 -10 ,18525 ,TETRA ,17602517,Sun Nov 28 16:17:05 CET,Sun Nov 28 18:11:21 CET,0.0 0.7 0.93 1.113 1.288 1.43 1.554 1.673 1.89 1.994 2.1 2.168 2.391 2.48 2.646 2.807 2.956 3.028 3.187 3.342 3.556 3.693 3.827 4.017 4.19 4.359 4.53 4.707 4.933 5.129 5.323 5.568 5.812 6.065 6.347 6.64 6.934 7.265 7.61 7.966 8.338 8.758 9.246 9.727 10.259 10.859 11.556 12.283 13.047 13.866 14.773 15.361 15.438 15.318 15.138 14.903 14.645 14.36 14.091 13.782 13.507 13.281 13.043 12.787 12.551 12.331 12.063 11.822 11.632 11.434 11.221 11.04 10.852 10.652 10.481 10.293 10.107 9.917 9.723 9.585 9.428 9.174 8.999 8.815 8.725 8.533 8.306 8.077 7.958 7.708 7.525 7.356 7.189 6.835 6.621 6.364 6.029 5.656 5.264 4.601 1.46 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_3a_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_3a_5.txt deleted file mode 100644 index 2c377369..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_3a_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23440 ,TETRA ,17602518,Sun Nov 28 16:17:06 CET,Sun Nov 28 18:11:56 CET,0.0 0.711 1.013 1.216 1.41 1.602 1.768 1.92 2.202 2.325 2.455 2.575 2.808 2.91 3.114 3.302 3.484 3.572 3.735 3.887 4.103 4.243 4.383 4.586 4.779 4.96 5.123 5.292 5.519 5.732 5.941 6.177 6.39 6.616 6.891 7.199 7.502 7.807 8.121 8.481 8.865 9.304 9.842 10.388 10.964 11.565 12.252 13.016 13.879 14.846 15.917 16.616 16.896 16.96 16.928 16.829 16.685 16.523 16.362 16.203 16.05 15.866 15.675 15.493 15.305 15.128 14.95 14.784 14.627 14.463 14.297 14.152 13.99 13.813 13.683 13.557 13.413 13.259 13.102 12.997 12.892 12.734 12.613 12.48 12.412 12.27 12.124 11.931 11.827 11.622 11.522 11.399 11.286 11.054 10.924 10.768 10.57 10.367 10.157 9.866 8.442 -2 ,22695 ,TETRA ,17602519,Sun Nov 28 16:17:07 CET,Sun Nov 28 18:11:23 CET,0.0 0.501 0.741 1.017 1.295 1.533 1.733 1.892 2.189 2.318 2.434 2.531 2.769 2.874 3.073 3.276 3.471 3.553 3.699 3.855 4.088 4.238 4.376 4.559 4.747 4.936 5.12 5.287 5.498 5.711 5.928 6.187 6.418 6.652 6.95 7.267 7.552 7.85 8.162 8.511 8.876 9.28 9.743 10.232 10.805 11.41 12.111 12.959 13.965 15.03 16.131 16.837 17.086 17.121 17.057 16.953 16.81 16.645 16.482 16.296 16.088 15.883 15.701 15.522 15.35 15.198 15.044 14.887 14.746 14.596 14.425 14.285 14.143 13.992 13.874 13.726 13.566 13.421 13.248 13.133 13.028 12.838 12.694 12.543 12.461 12.308 12.145 11.96 11.871 11.652 11.537 11.425 11.299 11.019 10.876 10.721 10.554 10.354 10.062 9.673 9.025 -3 ,32720 ,TETRA ,17602520,Sun Nov 28 16:17:09 CET,Sun Nov 28 18:10:55 CET,0.0 1.081 1.463 1.716 1.921 2.096 2.253 2.41 2.685 2.808 2.918 3.002 3.236 3.339 3.541 3.731 3.902 3.977 4.136 4.285 4.483 4.618 4.757 4.95 5.14 5.321 5.488 5.647 5.855 6.064 6.277 6.541 6.776 6.99 7.247 7.531 7.8 8.101 8.428 8.786 9.156 9.584 10.087 10.565 11.119 11.777 12.557 13.407 14.367 15.406 16.548 17.392 17.713 17.735 17.673 17.582 17.435 17.262 17.088 16.893 16.715 16.528 16.344 16.165 15.988 15.825 15.641 15.479 15.319 15.138 14.973 14.842 14.697 14.525 14.393 14.266 14.125 13.971 13.795 13.677 13.554 13.359 13.233 13.099 13.028 12.877 12.727 12.573 12.494 12.3 12.241 12.136 12.038 11.789 11.637 11.492 11.34 11.159 10.951 10.71 10.184 -4 ,19757 ,TETRA ,17602521,Sun Nov 28 16:17:06 CET,Sun Nov 28 18:13:20 CET,0.0 1.119 1.441 1.651 1.846 2.039 2.205 2.351 2.621 2.743 2.851 2.923 3.159 3.262 3.455 3.654 3.834 3.909 4.05 4.19 4.409 4.55 4.686 4.882 5.078 5.266 5.437 5.596 5.801 6.004 6.192 6.425 6.668 6.907 7.182 7.481 7.755 8.06 8.401 8.759 9.142 9.566 10.072 10.598 11.171 11.811 12.56 13.399 14.354 15.408 16.544 17.305 17.625 17.759 17.732 17.614 17.471 17.304 17.137 16.938 16.76 16.587 16.414 16.262 16.121 15.965 15.77 15.591 15.439 15.284 15.12 14.982 14.835 14.679 14.561 14.435 14.299 14.16 14.018 13.92 13.82 13.652 13.537 13.435 13.379 13.243 13.106 12.963 12.887 12.689 12.623 12.52 12.423 12.208 12.071 11.91 11.733 11.535 11.31 11.025 10.272 -5 ,26203 ,TETRA ,17602522,Sun Nov 28 16:17:08 CET,Sun Nov 28 18:12:47 CET,0.0 1.075 1.515 1.84 2.121 2.325 2.497 2.637 2.892 3.022 3.151 3.236 3.46 3.562 3.741 3.898 4.045 4.12 4.268 4.42 4.668 4.817 4.952 5.156 5.358 5.549 5.724 5.891 6.111 6.329 6.537 6.778 7.012 7.227 7.49 7.801 8.098 8.434 8.793 9.165 9.541 9.964 10.465 10.943 11.474 12.097 12.846 13.64 14.504 15.511 16.638 17.413 17.718 17.803 17.775 17.698 17.562 17.367 17.186 16.996 16.83 16.674 16.51 16.363 16.203 16.031 15.839 15.664 15.515 15.358 15.184 15.021 14.856 14.686 14.547 14.406 14.268 14.122 13.961 13.851 13.742 13.57 13.445 13.323 13.264 13.155 13.038 12.902 12.823 12.623 12.556 12.454 12.352 12.123 11.998 11.863 11.71 11.546 11.384 11.117 10.455 -6 ,30065 ,TETRA ,17602523,Sun Nov 28 16:17:10 CET,Sun Nov 28 18:11:19 CET,0.0 0.782 1.05 1.252 1.458 1.641 1.787 1.933 2.208 2.331 2.452 2.549 2.774 2.86 3.04 3.216 3.382 3.462 3.608 3.755 3.964 4.106 4.244 4.434 4.62 4.796 4.965 5.127 5.332 5.54 5.756 6.007 6.245 6.474 6.735 7.034 7.337 7.681 8.031 8.391 8.769 9.19 9.675 10.162 10.725 11.336 12.069 12.902 13.839 14.909 16.02 16.667 16.919 16.975 16.918 16.812 16.715 16.619 16.485 16.325 16.168 16.002 15.828 15.651 15.468 15.3 15.116 14.943 14.814 14.689 14.547 14.414 14.265 14.099 13.968 13.836 13.688 13.532 13.38 13.281 13.169 12.993 12.882 12.757 12.69 12.541 12.371 12.199 12.109 11.893 11.818 11.723 11.619 11.4 11.289 11.161 10.991 10.788 10.584 10.314 9.487 -7 ,3274 ,TETRA ,17602524,Sun Nov 28 16:17:07 CET,Sun Nov 28 18:11:22 CET,0.0 0.656 0.997 1.254 1.443 1.63 1.804 1.955 2.203 2.313 2.424 2.509 2.743 2.838 3.012 3.175 3.316 3.394 3.559 3.706 3.933 4.088 4.233 4.436 4.628 4.812 4.985 5.15 5.368 5.578 5.776 6.019 6.258 6.498 6.787 7.095 7.4 7.724 8.048 8.39 8.761 9.186 9.665 10.149 10.698 11.308 12.053 12.887 13.802 14.816 15.937 16.677 16.979 17.07 17.049 16.952 16.772 16.601 16.448 16.239 16.04 15.854 15.682 15.5 15.318 15.153 14.98 14.82 14.673 14.53 14.378 14.233 14.078 13.935 13.821 13.688 13.547 13.397 13.237 13.124 13.006 12.816 12.681 12.549 12.478 12.32 12.163 12.002 11.914 11.7 11.613 11.505 11.4 11.155 10.998 10.841 10.682 10.51 10.326 10.099 9.491 -8 ,19720 ,TETRA ,17602525,Sun Nov 28 16:17:07 CET,Sun Nov 28 18:10:57 CET,0.0 0.926 1.355 1.63 1.838 2.018 2.194 2.351 2.591 2.692 2.794 2.862 3.094 3.2 3.383 3.555 3.726 3.809 3.965 4.121 4.357 4.507 4.643 4.842 5.045 5.238 5.416 5.592 5.819 6.038 6.251 6.511 6.746 6.958 7.215 7.502 7.763 8.062 8.417 8.782 9.138 9.564 10.08 10.593 11.174 11.789 12.505 13.305 14.217 15.267 16.443 17.239 17.535 17.577 17.51 17.406 17.254 17.085 16.937 16.762 16.608 16.467 16.301 16.13 15.963 15.809 15.626 15.452 15.298 15.137 14.98 14.84 14.676 14.51 14.385 14.258 14.12 13.971 13.821 13.711 13.6 13.446 13.336 13.212 13.149 13.011 12.856 12.688 12.604 12.396 12.334 12.242 12.146 11.939 11.821 11.692 11.561 11.411 11.221 10.893 9.961 -9 ,15467 ,TETRA ,17602526,Sun Nov 28 16:17:08 CET,Sun Nov 28 18:10:54 CET,0.0 0.875 1.197 1.443 1.638 1.803 1.965 2.115 2.369 2.476 2.577 2.642 2.867 2.951 3.114 3.292 3.455 3.533 3.694 3.854 4.071 4.203 4.335 4.526 4.713 4.898 5.083 5.253 5.455 5.644 5.827 6.057 6.273 6.491 6.753 7.038 7.316 7.632 7.968 8.336 8.723 9.132 9.611 10.092 10.654 11.32 12.074 12.855 13.755 14.8 15.956 16.674 16.969 17.062 17.016 16.931 16.816 16.672 16.518 16.343 16.176 15.987 15.798 15.628 15.447 15.273 15.094 14.922 14.772 14.616 14.446 14.297 14.143 13.982 13.856 13.724 13.586 13.452 13.308 13.198 13.084 12.902 12.769 12.622 12.547 12.406 12.251 12.076 11.98 11.765 11.652 11.517 11.389 11.138 10.984 10.812 10.637 10.443 10.211 9.878 9.103 -10 ,12492 ,TETRA ,17602527,Sun Nov 28 16:17:10 CET,Sun Nov 28 18:13:16 CET,0.0 0.566 0.844 1.077 1.296 1.488 1.665 1.834 2.102 2.212 2.321 2.417 2.652 2.756 2.962 3.154 3.319 3.394 3.535 3.676 3.9 4.038 4.167 4.357 4.545 4.734 4.915 5.078 5.279 5.483 5.68 5.925 6.158 6.383 6.658 6.946 7.215 7.53 7.871 8.223 8.607 9.042 9.517 9.971 10.51 11.148 11.87 12.652 13.559 14.619 15.742 16.494 16.811 16.916 16.901 16.814 16.645 16.419 16.246 16.058 15.854 15.673 15.491 15.315 15.145 14.976 14.811 14.639 14.471 14.301 14.111 13.951 13.795 13.623 13.49 13.355 13.197 13.04 12.883 12.767 12.636 12.439 12.311 12.182 12.114 11.968 11.81 11.636 11.545 11.322 11.213 11.089 10.954 10.68 10.528 10.375 10.223 10.048 9.812 9.492 8.609 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_3a.txt deleted file mode 100644 index 9f3c9b1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11681 ,TETRA ,17602528,Sun Nov 28 16:18:05 CET,Sun Nov 28 18:15:17 CET,0.0 1.065 1.341 1.577 1.774 1.925 2.058 2.18 2.421 2.534 2.631 2.676 2.88 2.965 3.105 3.225 3.355 3.424 3.565 3.698 3.869 3.965 4.059 4.214 4.365 4.51 4.66 4.802 4.982 5.144 5.287 5.464 5.649 5.812 5.985 6.2 6.413 6.629 6.84 7.065 7.304 7.542 7.803 8.068 8.344 8.607 8.89 9.152 9.347 9.427 9.259 8.745 8.146 7.547 6.974 6.421 5.914 5.443 5.036 4.628 4.255 3.912 3.573 3.256 2.971 2.712 2.437 2.195 1.985 1.752 1.493 1.286 1.08 0.854 0.683 0.526 0.365 0.174 -0.037 -0.18 -0.342 -0.599 -0.768 -0.936 -1.029 -1.233 -1.435 -1.65 -1.768 -2.022 -2.159 -2.312 -2.469 -2.794 -2.963 -3.149 -3.364 -3.57 -3.751 -4.047 -4.798 -2 ,6915 ,TETRA ,17602529,Sun Nov 28 16:17:33 CET,Sun Nov 28 18:12:17 CET,0.0 0.758 1.105 1.345 1.532 1.668 1.79 1.918 2.143 2.249 2.352 2.426 2.637 2.717 2.878 3.031 3.171 3.235 3.352 3.47 3.647 3.756 3.866 4.034 4.178 4.308 4.437 4.572 4.737 4.886 5.031 5.197 5.369 5.543 5.736 5.939 6.131 6.349 6.578 6.793 7.007 7.241 7.514 7.772 8.063 8.357 8.628 8.881 9.092 9.206 9.08 8.646 8.067 7.472 6.914 6.345 5.777 5.26 4.827 4.373 3.992 3.637 3.3 2.981 2.67 2.395 2.105 1.841 1.606 1.361 1.122 0.913 0.675 0.43 0.25 0.063 -0.122 -0.308 -0.51 -0.644 -0.777 -0.982 -1.128 -1.29 -1.381 -1.571 -1.774 -1.992 -2.104 -2.351 -2.489 -2.624 -2.757 -3.081 -3.256 -3.439 -3.652 -3.887 -4.135 -4.478 -5.254 -3 ,32034 ,TETRA ,17602530,Sun Nov 28 16:17:33 CET,Sun Nov 28 18:12:46 CET,0.0 0.59 0.746 0.87 0.987 1.094 1.188 1.279 1.478 1.555 1.621 1.648 1.847 1.922 2.065 2.191 2.308 2.367 2.485 2.591 2.752 2.848 2.933 3.071 3.211 3.343 3.477 3.611 3.767 3.922 4.065 4.237 4.4 4.558 4.733 4.928 5.121 5.315 5.531 5.767 6.027 6.314 6.586 6.8 7.051 7.325 7.578 7.842 8.081 8.16 7.842 7.243 6.642 6.041 5.455 4.871 4.347 3.869 3.444 3.015 2.647 2.287 1.931 1.623 1.345 1.073 0.775 0.519 0.304 0.064 -0.185 -0.376 -0.578 -0.795 -0.969 -1.144 -1.332 -1.529 -1.722 -1.864 -2.007 -2.238 -2.41 -2.582 -2.672 -2.873 -3.09 -3.31 -3.423 -3.675 -3.809 -3.952 -4.097 -4.423 -4.624 -4.824 -5.054 -5.329 -5.616 -6.039 -7.239 -4 ,5354 ,TETRA ,17602531,Sun Nov 28 16:17:34 CET,Sun Nov 28 18:12:40 CET,0.0 0.494 0.722 0.892 1.029 1.131 1.221 1.321 1.495 1.574 1.655 1.688 1.876 1.946 2.088 2.237 2.378 2.444 2.565 2.675 2.845 2.952 3.06 3.218 3.361 3.501 3.625 3.743 3.898 4.055 4.205 4.371 4.526 4.688 4.885 5.089 5.282 5.51 5.734 5.944 6.162 6.406 6.692 6.954 7.234 7.558 7.91 8.163 8.341 8.454 8.286 7.758 7.128 6.467 5.872 5.338 4.839 4.347 3.894 3.446 3.057 2.727 2.42 2.111 1.809 1.523 1.229 0.965 0.728 0.488 0.249 0.046 -0.178 -0.41 -0.579 -0.77 -0.987 -1.21 -1.426 -1.568 -1.719 -1.973 -2.156 -2.33 -2.412 -2.576 -2.771 -2.978 -3.08 -3.319 -3.409 -3.527 -3.666 -3.966 -4.126 -4.32 -4.543 -4.783 -5.059 -5.503 -6.996 -5 ,5009 ,TETRA ,17602532,Sun Nov 28 16:17:37 CET,Sun Nov 28 18:13:02 CET,0.0 0.603 0.821 0.993 1.109 1.215 1.321 1.423 1.621 1.707 1.788 1.822 2.015 2.079 2.199 2.309 2.415 2.468 2.569 2.663 2.811 2.915 3.01 3.148 3.285 3.417 3.541 3.654 3.791 3.932 4.077 4.253 4.421 4.583 4.768 4.959 5.136 5.337 5.556 5.781 5.996 6.219 6.504 6.797 7.088 7.356 7.632 7.925 8.168 8.269 8.035 7.363 6.668 6.022 5.426 4.863 4.336 3.857 3.423 2.966 2.574 2.216 1.866 1.54 1.236 0.958 0.654 0.375 0.148 -0.074 -0.309 -0.519 -0.731 -0.939 -1.119 -1.322 -1.529 -1.738 -1.953 -2.1 -2.239 -2.446 -2.608 -2.784 -2.864 -3.032 -3.218 -3.417 -3.528 -3.763 -3.847 -3.971 -4.089 -4.328 -4.458 -4.616 -4.791 -4.986 -5.216 -5.505 -6.349 -6 ,2479 ,TETRA ,17602533,Sun Nov 28 16:17:38 CET,Sun Nov 28 18:12:53 CET,0.0 1.044 1.354 1.588 1.78 1.917 2.064 2.204 2.462 2.586 2.701 2.797 3.01 3.096 3.263 3.403 3.525 3.582 3.704 3.815 3.979 4.091 4.2 4.37 4.527 4.679 4.812 4.933 5.104 5.259 5.413 5.611 5.783 5.948 6.134 6.316 6.484 6.681 6.909 7.144 7.375 7.613 7.857 8.093 8.382 8.668 8.958 9.241 9.454 9.554 9.382 8.843 8.236 7.628 7.018 6.443 5.92 5.425 4.949 4.463 4.074 3.741 3.41 3.066 2.743 2.457 2.172 1.925 1.708 1.463 1.201 0.998 0.781 0.54 0.362 0.182 -0.013 -0.211 -0.415 -0.554 -0.696 -0.921 -1.078 -1.243 -1.322 -1.484 -1.663 -1.84 -1.932 -2.169 -2.261 -2.392 -2.526 -2.782 -2.928 -3.087 -3.246 -3.424 -3.66 -3.989 -4.945 -7 ,13567 ,TETRA ,17602534,Sun Nov 28 16:17:35 CET,Sun Nov 28 18:11:56 CET,0.0 0.885 1.25 1.47 1.651 1.847 2.013 2.143 2.376 2.483 2.572 2.618 2.828 2.908 3.056 3.194 3.329 3.4 3.533 3.653 3.816 3.906 3.999 4.16 4.301 4.432 4.564 4.688 4.841 4.986 5.133 5.309 5.471 5.622 5.809 6.03 6.243 6.462 6.684 6.908 7.122 7.348 7.613 7.883 8.157 8.426 8.719 9.015 9.27 9.36 9.143 8.591 7.947 7.337 6.793 6.247 5.708 5.208 4.776 4.334 3.955 3.619 3.301 2.998 2.688 2.399 2.109 1.845 1.612 1.375 1.148 0.955 0.739 0.512 0.331 0.137 -0.065 -0.263 -0.449 -0.588 -0.746 -0.974 -1.14 -1.323 -1.418 -1.614 -1.809 -2.0 -2.107 -2.344 -2.408 -2.528 -2.676 -2.954 -3.088 -3.249 -3.436 -3.631 -3.839 -4.105 -4.728 -8 ,2345 ,TETRA ,17602535,Sun Nov 28 16:17:35 CET,Sun Nov 28 18:12:23 CET,0.0 0.801 1.084 1.298 1.507 1.67 1.805 1.939 2.183 2.29 2.384 2.444 2.658 2.737 2.878 3.01 3.14 3.206 3.334 3.454 3.623 3.734 3.842 3.998 4.136 4.265 4.397 4.516 4.655 4.798 4.951 5.127 5.294 5.466 5.657 5.852 6.048 6.26 6.472 6.698 6.923 7.166 7.449 7.725 8.009 8.292 8.617 8.931 9.183 9.348 9.221 8.651 8.004 7.359 6.784 6.248 5.726 5.228 4.794 4.376 4.006 3.653 3.321 3.016 2.726 2.447 2.155 1.897 1.668 1.438 1.192 0.98 0.767 0.539 0.368 0.205 0.026 -0.175 -0.403 -0.558 -0.711 -0.954 -1.127 -1.306 -1.396 -1.582 -1.762 -1.942 -2.039 -2.278 -2.376 -2.498 -2.612 -2.844 -3.001 -3.178 -3.354 -3.537 -3.742 -4.015 -4.851 -9 ,30703 ,TETRA ,17602536,Sun Nov 28 16:17:32 CET,Sun Nov 28 18:14:07 CET,0.0 0.293 0.469 0.623 0.762 0.866 0.972 1.089 1.314 1.412 1.512 1.577 1.784 1.864 2.041 2.205 2.343 2.411 2.548 2.676 2.847 2.95 3.049 3.213 3.367 3.495 3.619 3.745 3.914 4.068 4.205 4.382 4.574 4.754 4.947 5.164 5.372 5.588 5.813 6.051 6.271 6.482 6.738 6.987 7.238 7.524 7.827 8.077 8.307 8.473 8.373 7.81 7.176 6.524 5.915 5.362 4.821 4.3 3.868 3.471 3.119 2.77 2.444 2.145 1.86 1.591 1.312 1.066 0.846 0.607 0.351 0.147 -0.058 -0.264 -0.431 -0.612 -0.795 -0.985 -1.198 -1.354 -1.516 -1.757 -1.911 -2.084 -2.177 -2.386 -2.608 -2.829 -2.947 -3.203 -3.305 -3.428 -3.574 -3.896 -4.083 -4.294 -4.498 -4.741 -5.053 -5.512 -6.858 -10 ,2725 ,TETRA ,17602537,Sun Nov 28 16:17:34 CET,Sun Nov 28 18:12:38 CET,0.0 0.903 1.197 1.385 1.532 1.674 1.802 1.91 2.116 2.211 2.3 2.336 2.537 2.619 2.77 2.907 3.039 3.099 3.212 3.334 3.517 3.637 3.765 3.941 4.101 4.259 4.398 4.533 4.708 4.867 5.027 5.216 5.39 5.547 5.723 5.923 6.106 6.31 6.534 6.777 7.024 7.257 7.507 7.749 8.034 8.332 8.615 8.841 8.992 9.069 8.895 8.321 7.644 6.996 6.354 5.724 5.195 4.709 4.284 3.837 3.432 3.086 2.764 2.458 2.17 1.902 1.604 1.35 1.144 0.914 0.655 0.433 0.214 -0.002 -0.181 -0.377 -0.578 -0.787 -1.016 -1.169 -1.31 -1.532 -1.695 -1.873 -1.958 -2.134 -2.34 -2.556 -2.671 -2.914 -3.012 -3.135 -3.266 -3.58 -3.786 -3.982 -4.158 -4.349 -4.558 -4.836 -5.651 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_5.txt deleted file mode 100644 index e9028bff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30723 ,TETRA ,17602538,Sun Nov 28 16:17:35 CET,Sun Nov 28 18:12:23 CET,0.0 0.682 0.936 1.134 1.329 1.492 1.624 1.75 1.965 2.062 2.164 2.217 2.427 2.514 2.681 2.835 2.977 3.047 3.183 3.322 3.52 3.643 3.774 3.963 4.139 4.314 4.471 4.625 4.837 5.04 5.23 5.463 5.699 5.918 6.157 6.439 6.725 7.035 7.338 7.645 7.969 8.322 8.746 9.182 9.694 10.27 10.91 11.628 12.394 13.191 14.056 14.52 14.524 14.398 14.212 13.967 13.693 13.414 13.157 12.885 12.653 12.404 12.139 11.91 11.715 11.518 11.285 11.081 10.896 10.688 10.472 10.298 10.103 9.882 9.721 9.567 9.405 9.227 9.022 8.882 8.743 8.503 8.339 8.188 8.105 7.902 7.687 7.47 7.36 7.125 6.991 6.84 6.668 6.319 6.132 5.929 5.693 5.419 5.098 4.584 2.712 -2 ,12264 ,TETRA ,17602539,Sun Nov 28 16:17:38 CET,Sun Nov 28 18:12:21 CET,0.0 0.581 0.871 1.136 1.355 1.522 1.679 1.827 2.088 2.219 2.336 2.408 2.618 2.71 2.901 3.078 3.239 3.318 3.466 3.603 3.796 3.928 4.071 4.28 4.472 4.648 4.822 5.003 5.227 5.413 5.586 5.818 6.04 6.267 6.528 6.799 7.083 7.393 7.687 8.005 8.355 8.719 9.143 9.579 10.073 10.628 11.244 11.907 12.64 13.458 14.277 14.632 14.647 14.523 14.283 13.997 13.767 13.536 13.28 12.985 12.7 12.445 12.199 11.96 11.723 11.503 11.269 11.062 10.894 10.721 10.524 10.36 10.193 9.993 9.825 9.654 9.488 9.329 9.157 9.016 8.865 8.633 8.474 8.309 8.217 8.021 7.821 7.632 7.525 7.291 7.172 7.05 6.926 6.633 6.457 6.258 6.054 5.815 5.517 5.162 3.607 -3 ,32293 ,TETRA ,17602540,Sun Nov 28 16:17:39 CET,Sun Nov 28 18:12:17 CET,0.0 0.481 0.654 0.809 0.943 1.073 1.217 1.366 1.612 1.716 1.821 1.891 2.102 2.206 2.429 2.619 2.782 2.863 3.022 3.172 3.386 3.521 3.643 3.82 3.992 4.148 4.301 4.455 4.664 4.87 5.082 5.327 5.538 5.744 5.987 6.271 6.536 6.824 7.145 7.48 7.843 8.23 8.626 9.056 9.583 10.134 10.72 11.338 12.07 12.898 13.74 14.208 14.244 14.082 13.853 13.558 13.28 13.035 12.783 12.486 12.207 11.962 11.73 11.509 11.273 11.04 10.805 10.598 10.412 10.206 9.998 9.806 9.617 9.443 9.282 9.11 8.954 8.787 8.603 8.481 8.352 8.124 7.953 7.755 7.648 7.438 7.229 7.002 6.885 6.634 6.477 6.326 6.161 5.812 5.622 5.403 5.159 4.908 4.579 4.082 2.039 -4 ,14761 ,TETRA ,17602541,Sun Nov 28 16:17:34 CET,Sun Nov 28 18:12:11 CET,0.0 0.678 1.011 1.264 1.465 1.65 1.813 1.954 2.207 2.319 2.419 2.496 2.714 2.809 2.996 3.168 3.323 3.4 3.547 3.683 3.881 4.012 4.137 4.321 4.506 4.677 4.84 4.995 5.186 5.365 5.553 5.781 5.997 6.215 6.472 6.745 7.009 7.309 7.626 7.966 8.296 8.651 9.071 9.475 9.952 10.493 11.101 11.755 12.458 13.235 14.089 14.577 14.641 14.565 14.347 14.065 13.801 13.568 13.332 13.058 12.803 12.563 12.331 12.102 11.881 11.678 11.454 11.245 11.061 10.864 10.656 10.473 10.286 10.09 9.927 9.758 9.597 9.442 9.274 9.157 9.025 8.822 8.678 8.505 8.413 8.227 8.021 7.828 7.731 7.505 7.409 7.281 7.139 6.84 6.66 6.467 6.247 6.006 5.763 5.392 3.819 -5 ,27473 ,TETRA ,17602542,Sun Nov 28 16:17:38 CET,Sun Nov 28 18:12:14 CET,0.0 0.479 0.719 0.924 1.061 1.179 1.299 1.419 1.652 1.757 1.851 1.899 2.105 2.199 2.38 2.545 2.707 2.784 2.929 3.063 3.247 3.368 3.495 3.683 3.877 4.065 4.234 4.402 4.618 4.814 5.005 5.24 5.47 5.687 5.939 6.231 6.506 6.805 7.119 7.445 7.774 8.13 8.559 8.986 9.497 10.062 10.681 11.339 12.079 12.881 13.59 13.974 14.01 13.833 13.58 13.326 13.086 12.821 12.563 12.267 11.974 11.693 11.443 11.208 10.963 10.744 10.531 10.332 10.148 9.94 9.705 9.519 9.33 9.134 8.976 8.8 8.619 8.43 8.21 8.056 7.91 7.67 7.493 7.309 7.221 7.049 6.872 6.65 6.531 6.293 6.15 6.013 5.871 5.59 5.426 5.202 4.93 4.626 4.274 3.888 2.409 -6 ,14252 ,TETRA ,17602543,Sun Nov 28 16:17:34 CET,Sun Nov 28 18:12:59 CET,0.0 0.349 0.66 0.911 1.143 1.312 1.465 1.593 1.79 1.891 2.0 2.092 2.316 2.406 2.565 2.721 2.879 2.956 3.098 3.238 3.431 3.549 3.674 3.866 4.045 4.206 4.364 4.51 4.71 4.916 5.103 5.318 5.518 5.709 5.942 6.213 6.461 6.738 7.047 7.361 7.681 8.056 8.482 8.895 9.381 9.901 10.484 11.133 11.866 12.657 13.425 13.752 13.692 13.487 13.263 13.018 12.765 12.52 12.298 12.054 11.815 11.599 11.369 11.134 10.924 10.71 10.461 10.238 10.036 9.823 9.605 9.416 9.212 9.01 8.848 8.684 8.512 8.32 8.116 7.964 7.81 7.568 7.394 7.218 7.131 6.951 6.752 6.546 6.434 6.192 6.064 5.929 5.79 5.457 5.269 5.069 4.839 4.555 4.184 3.656 1.556 -7 ,4563 ,TETRA ,17602544,Sun Nov 28 16:17:36 CET,Sun Nov 28 18:12:40 CET,0.0 1.081 1.41 1.683 1.879 2.023 2.161 2.284 2.492 2.607 2.73 2.847 3.073 3.162 3.315 3.468 3.626 3.706 3.858 4.006 4.213 4.331 4.449 4.624 4.799 4.97 5.128 5.289 5.5 5.702 5.895 6.129 6.353 6.565 6.788 7.022 7.272 7.57 7.872 8.189 8.526 8.892 9.321 9.76 10.259 10.803 11.448 12.148 12.912 13.733 14.496 14.891 14.969 14.874 14.649 14.325 14.012 13.73 13.472 13.228 12.996 12.773 12.55 12.307 12.069 11.836 11.58 11.35 11.149 10.943 10.721 10.524 10.323 10.127 9.969 9.793 9.612 9.421 9.238 9.105 8.968 8.762 8.599 8.423 8.331 8.129 7.915 7.689 7.57 7.34 7.206 7.073 6.92 6.548 6.366 6.188 6.002 5.788 5.508 5.135 3.813 -8 ,26363 ,TETRA ,17602545,Sun Nov 28 16:17:35 CET,Sun Nov 28 18:15:38 CET,0.0 0.333 0.633 0.853 1.006 1.125 1.221 1.313 1.481 1.557 1.641 1.692 1.898 1.98 2.146 2.3 2.446 2.524 2.689 2.841 3.039 3.165 3.287 3.461 3.633 3.8 3.953 4.101 4.302 4.504 4.68 4.888 5.115 5.338 5.584 5.863 6.132 6.412 6.704 7.013 7.339 7.716 8.141 8.539 9.012 9.54 10.15 10.836 11.585 12.392 13.143 13.474 13.505 13.388 13.195 12.946 12.669 12.364 12.091 11.8 11.517 11.271 11.026 10.761 10.5 10.26 10.028 9.828 9.637 9.429 9.211 9.028 8.835 8.655 8.519 8.365 8.198 8.021 7.84 7.723 7.599 7.373 7.206 7.04 6.959 6.789 6.599 6.392 6.284 6.061 5.971 5.85 5.724 5.448 5.27 5.072 4.86 4.614 4.312 3.882 1.988 -9 ,14193 ,TETRA ,17602546,Sun Nov 28 16:17:37 CET,Sun Nov 28 18:15:56 CET,0.0 0.477 0.791 1.008 1.181 1.325 1.433 1.54 1.751 1.849 1.949 2.012 2.225 2.32 2.506 2.686 2.848 2.927 3.092 3.244 3.443 3.563 3.683 3.868 4.046 4.216 4.382 4.54 4.741 4.936 5.115 5.324 5.54 5.75 5.993 6.269 6.523 6.795 7.101 7.435 7.769 8.152 8.617 9.073 9.569 10.098 10.72 11.437 12.214 12.945 13.65 14.032 14.026 13.889 13.718 13.477 13.199 12.908 12.655 12.394 12.132 11.877 11.65 11.434 11.215 11.017 10.8 10.595 10.426 10.24 10.025 9.848 9.653 9.439 9.265 9.102 8.945 8.777 8.591 8.444 8.293 8.057 7.89 7.719 7.625 7.431 7.226 7.012 6.913 6.674 6.5 6.351 6.199 5.911 5.753 5.553 5.297 5.03 4.721 4.294 2.343 -10 ,2369 ,TETRA ,17602547,Sun Nov 28 16:17:39 CET,Sun Nov 28 18:12:32 CET,0.0 0.434 0.665 0.841 0.984 1.12 1.242 1.351 1.55 1.643 1.743 1.817 2.028 2.119 2.31 2.494 2.665 2.745 2.885 3.018 3.223 3.358 3.488 3.677 3.85 4.012 4.176 4.345 4.571 4.779 4.967 5.196 5.42 5.632 5.871 6.145 6.409 6.695 6.998 7.332 7.664 8.013 8.421 8.823 9.309 9.846 10.429 11.093 11.875 12.672 13.429 13.858 13.883 13.669 13.408 13.151 12.87 12.592 12.334 12.043 11.776 11.54 11.308 11.076 10.838 10.608 10.348 10.116 9.926 9.718 9.489 9.304 9.122 8.919 8.753 8.587 8.414 8.224 8.02 7.879 7.737 7.494 7.311 7.131 7.038 6.842 6.651 6.44 6.329 6.088 5.922 5.771 5.628 5.323 5.132 4.912 4.663 4.37 3.984 3.413 1.207 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_1b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_1b.txt deleted file mode 100644 index 0b00841c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_1b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9727 ,TETRA ,17602548,Sun Nov 28 16:17:40 CET,Sun Nov 28 18:10:54 CET,0.0 0.571 0.848 1.091 1.289 1.457 1.604 1.736 2.002 2.126 2.24 2.318 2.548 2.649 2.828 2.993 3.159 3.234 3.391 3.541 3.737 3.866 4.001 4.201 4.388 4.565 4.729 4.889 5.111 5.318 5.53 5.804 6.051 6.276 6.529 6.807 7.084 7.392 7.716 8.033 8.351 8.738 9.203 9.639 10.118 10.665 11.27 11.886 12.542 13.255 14.007 14.372 14.466 14.4 14.232 14.012 13.762 13.482 13.233 12.965 12.706 12.48 12.267 12.049 11.823 11.62 11.414 11.225 11.047 10.857 10.664 10.496 10.314 10.129 9.983 9.843 9.707 9.542 9.356 9.225 9.085 8.874 8.728 8.571 8.491 8.319 8.155 7.986 7.897 7.684 7.626 7.537 7.426 7.172 7.028 6.859 6.686 6.508 6.279 6.007 5.449 -2 ,4165 ,TETRA ,17602549,Sun Nov 28 16:17:34 CET,Sun Nov 28 18:11:17 CET,0.0 0.669 0.98 1.243 1.473 1.669 1.832 1.973 2.244 2.369 2.485 2.579 2.813 2.91 3.091 3.264 3.433 3.517 3.676 3.819 4.004 4.135 4.278 4.471 4.662 4.861 5.037 5.203 5.41 5.603 5.787 6.029 6.27 6.492 6.76 7.06 7.32 7.608 7.933 8.275 8.632 9.038 9.49 9.914 10.423 10.991 11.631 12.328 13.068 13.928 14.812 15.162 15.181 15.106 14.951 14.704 14.429 14.173 13.929 13.652 13.407 13.179 12.955 12.749 12.544 12.342 12.127 11.926 11.728 11.52 11.312 11.146 10.969 10.764 10.603 10.448 10.294 10.116 9.93 9.809 9.686 9.483 9.341 9.194 9.11 8.934 8.77 8.602 8.505 8.276 8.173 8.054 7.928 7.674 7.522 7.345 7.16 6.952 6.755 6.496 5.574 -3 ,17036 ,TETRA ,17602550,Sun Nov 28 16:17:36 CET,Sun Nov 28 18:11:17 CET,0.0 0.501 0.745 0.917 1.059 1.202 1.34 1.476 1.728 1.85 1.968 2.06 2.294 2.397 2.578 2.749 2.913 2.992 3.145 3.297 3.509 3.64 3.766 3.949 4.124 4.3 4.478 4.652 4.87 5.078 5.278 5.508 5.723 5.924 6.168 6.446 6.713 7.005 7.314 7.639 7.963 8.336 8.775 9.207 9.71 10.252 10.874 11.534 12.214 12.943 13.729 14.113 14.13 13.993 13.8 13.577 13.325 13.088 12.871 12.6 12.341 12.116 11.866 11.608 11.382 11.181 10.962 10.761 10.588 10.403 10.212 10.055 9.894 9.725 9.588 9.432 9.28 9.132 8.973 8.87 8.759 8.558 8.414 8.266 8.178 7.995 7.831 7.65 7.559 7.353 7.303 7.202 7.091 6.846 6.714 6.558 6.38 6.183 5.967 5.706 4.971 -4 ,8586 ,TETRA ,17602551,Sun Nov 28 16:17:37 CET,Sun Nov 28 18:11:12 CET,0.0 1.055 1.402 1.654 1.858 2.044 2.208 2.354 2.623 2.744 2.86 2.952 3.183 3.278 3.461 3.649 3.828 3.917 4.094 4.251 4.467 4.595 4.719 4.888 5.055 5.239 5.405 5.56 5.768 5.963 6.165 6.418 6.649 6.869 7.11 7.375 7.634 7.931 8.247 8.579 8.937 9.34 9.799 10.232 10.728 11.277 11.909 12.598 13.362 14.179 14.954 15.38 15.468 15.351 15.144 14.897 14.664 14.45 14.229 13.963 13.703 13.443 13.19 12.956 12.733 12.541 12.333 12.118 11.923 11.739 11.571 11.414 11.229 11.024 10.864 10.713 10.556 10.391 10.211 10.075 9.931 9.724 9.592 9.456 9.378 9.207 9.036 8.85 8.748 8.522 8.419 8.291 8.162 7.897 7.738 7.548 7.343 7.139 6.873 6.445 4.794 -5 ,25373 ,TETRA ,17602552,Sun Nov 28 16:17:38 CET,Sun Nov 28 18:10:21 CET,0.0 0.929 1.292 1.539 1.725 1.909 2.071 2.228 2.518 2.639 2.762 2.856 3.098 3.201 3.374 3.549 3.725 3.803 3.954 4.095 4.319 4.466 4.585 4.762 4.955 5.135 5.297 5.455 5.662 5.854 6.043 6.28 6.502 6.707 6.95 7.212 7.451 7.727 8.028 8.362 8.725 9.128 9.588 10.01 10.488 11.044 11.663 12.319 13.072 13.95 14.765 15.174 15.242 15.094 14.895 14.665 14.42 14.172 13.936 13.664 13.412 13.165 12.923 12.695 12.456 12.247 12.033 11.841 11.68 11.501 11.293 11.123 10.956 10.784 10.64 10.469 10.291 10.129 9.97 9.851 9.726 9.536 9.403 9.262 9.189 9.049 8.91 8.733 8.641 8.429 8.367 8.264 8.136 7.86 7.725 7.581 7.399 7.197 6.976 6.695 6.047 -6 ,32355 ,TETRA ,17602553,Sun Nov 28 16:17:36 CET,Sun Nov 28 18:10:22 CET,0.0 0.515 0.777 1.013 1.248 1.423 1.57 1.721 1.984 2.093 2.197 2.263 2.489 2.586 2.765 2.926 3.075 3.156 3.315 3.463 3.696 3.835 3.95 4.126 4.309 4.48 4.645 4.804 5.015 5.222 5.416 5.66 5.914 6.149 6.395 6.67 6.942 7.233 7.548 7.881 8.23 8.617 9.06 9.496 10.006 10.587 11.218 11.89 12.614 13.406 14.259 14.64 14.665 14.534 14.332 14.135 13.93 13.697 13.464 13.21 12.969 12.731 12.489 12.258 12.049 11.866 11.674 11.468 11.281 11.094 10.897 10.736 10.549 10.352 10.209 10.057 9.891 9.731 9.564 9.441 9.307 9.076 8.909 8.745 8.664 8.498 8.325 8.135 8.035 7.816 7.736 7.62 7.472 7.141 6.959 6.739 6.526 6.298 6.023 5.682 4.408 -7 ,5808 ,TETRA ,17602554,Sun Nov 28 16:17:38 CET,Sun Nov 28 18:10:26 CET,0.0 0.453 0.68 0.854 1.01 1.147 1.257 1.361 1.578 1.683 1.771 1.826 2.061 2.155 2.332 2.508 2.681 2.764 2.914 3.051 3.253 3.394 3.531 3.731 3.909 4.077 4.255 4.423 4.634 4.83 5.026 5.266 5.503 5.731 5.981 6.268 6.549 6.838 7.131 7.438 7.785 8.177 8.629 9.08 9.582 10.128 10.738 11.41 12.184 12.992 13.77 14.161 14.141 13.999 13.834 13.598 13.322 13.046 12.799 12.504 12.232 12.003 11.774 11.556 11.364 11.176 10.959 10.76 10.589 10.411 10.221 10.058 9.885 9.699 9.543 9.396 9.251 9.089 8.917 8.805 8.694 8.505 8.352 8.192 8.115 7.95 7.781 7.617 7.531 7.315 7.249 7.158 7.049 6.802 6.682 6.559 6.406 6.206 5.935 5.612 4.837 -8 ,8968 ,TETRA ,17602555,Sun Nov 28 16:17:39 CET,Sun Nov 28 18:11:04 CET,0.0 0.515 0.728 0.881 1.015 1.14 1.257 1.363 1.573 1.694 1.817 1.89 2.109 2.196 2.384 2.576 2.755 2.834 2.971 3.105 3.317 3.462 3.606 3.811 4.007 4.203 4.384 4.547 4.756 4.952 5.138 5.358 5.576 5.788 6.041 6.32 6.583 6.881 7.197 7.505 7.83 8.205 8.618 9.048 9.58 10.163 10.794 11.462 12.235 13.056 13.847 14.259 14.274 14.119 13.897 13.659 13.411 13.163 12.956 12.729 12.497 12.246 11.989 11.764 11.566 11.379 11.162 10.964 10.786 10.587 10.389 10.243 10.081 9.893 9.738 9.568 9.398 9.254 9.112 9.006 8.894 8.714 8.596 8.474 8.403 8.267 8.138 7.987 7.904 7.69 7.624 7.52 7.419 7.209 7.077 6.925 6.745 6.541 6.298 5.972 5.244 -9 ,28275 ,TETRA ,17602556,Sun Nov 28 16:17:42 CET,Sun Nov 28 18:10:21 CET,0.0 0.679 0.994 1.25 1.467 1.639 1.797 1.956 2.236 2.354 2.459 2.518 2.742 2.834 3.012 3.174 3.332 3.414 3.556 3.676 3.878 4.017 4.152 4.367 4.566 4.748 4.925 5.074 5.269 5.462 5.65 5.886 6.106 6.337 6.616 6.903 7.176 7.484 7.809 8.156 8.518 8.909 9.357 9.842 10.397 10.967 11.611 12.306 13.056 13.879 14.708 15.081 15.095 14.969 14.758 14.466 14.202 13.965 13.723 13.44 13.194 12.982 12.771 12.558 12.331 12.135 11.935 11.728 11.544 11.359 11.17 11.02 10.854 10.671 10.529 10.395 10.262 10.128 9.978 9.866 9.762 9.593 9.462 9.333 9.264 9.113 8.971 8.822 8.733 8.509 8.462 8.369 8.262 8.028 7.897 7.758 7.606 7.443 7.249 7.02 6.333 -10 ,20347 ,TETRA ,17602557,Sun Nov 28 16:17:36 CET,Sun Nov 28 18:10:53 CET,0.0 0.417 0.575 0.717 0.859 0.98 1.087 1.194 1.396 1.489 1.587 1.631 1.839 1.912 2.062 2.212 2.376 2.455 2.588 2.713 2.899 3.013 3.12 3.278 3.43 3.594 3.761 3.913 4.109 4.3 4.482 4.704 4.917 5.14 5.421 5.702 5.954 6.259 6.579 6.906 7.242 7.633 8.083 8.542 9.093 9.646 10.231 10.867 11.583 12.388 13.234 13.716 13.77 13.648 13.464 13.247 13.032 12.788 12.535 12.239 11.976 11.763 11.548 11.321 11.104 10.909 10.689 10.483 10.308 10.135 9.959 9.817 9.66 9.478 9.341 9.192 9.026 8.854 8.668 8.547 8.426 8.225 8.092 7.959 7.889 7.731 7.545 7.335 7.228 7.007 6.92 6.805 6.677 6.419 6.278 6.111 5.894 5.654 5.39 5.031 4.327 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_6b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_6b.txt deleted file mode 100644 index d479f102..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_6b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16246 ,TETRA ,17602558,Sun Nov 28 16:17:36 CET,Sun Nov 28 18:11:42 CET,0.0 0.619 0.841 1.043 1.178 1.298 1.428 1.563 1.814 1.927 2.035 2.102 2.327 2.411 2.567 2.714 2.86 2.928 3.061 3.198 3.398 3.521 3.635 3.805 3.964 4.123 4.292 4.46 4.664 4.85 5.04 5.282 5.529 5.757 6.0 6.26 6.514 6.811 7.111 7.409 7.733 8.112 8.535 8.955 9.445 9.987 10.561 11.131 11.759 12.379 12.946 13.178 13.058 12.798 12.468 12.091 11.743 11.445 11.186 10.908 10.657 10.438 10.221 10.008 9.799 9.598 9.381 9.182 9.006 8.826 8.642 8.478 8.284 8.089 7.96 7.828 7.687 7.536 7.363 7.233 7.106 6.915 6.793 6.67 6.597 6.443 6.285 6.109 6.016 5.798 5.713 5.603 5.494 5.26 5.136 5.004 4.822 4.582 4.315 3.967 2.761 -2 ,28551 ,TETRA ,17602559,Sun Nov 28 16:17:39 CET,Sun Nov 28 18:11:42 CET,0.0 1.472 1.889 2.136 2.333 2.489 2.655 2.814 3.056 3.181 3.309 3.39 3.61 3.696 3.895 4.088 4.248 4.327 4.484 4.632 4.84 4.98 5.123 5.31 5.485 5.667 5.848 6.018 6.24 6.46 6.658 6.897 7.125 7.34 7.603 7.906 8.169 8.441 8.733 9.051 9.387 9.742 10.155 10.556 11.014 11.511 12.06 12.669 13.314 13.995 14.612 14.785 14.691 14.498 14.28 14.024 13.774 13.536 13.278 12.962 12.707 12.482 12.256 12.055 11.844 11.644 11.437 11.247 11.068 10.878 10.69 10.536 10.371 10.191 10.041 9.89 9.751 9.603 9.429 9.315 9.207 9.031 8.921 8.81 8.749 8.622 8.475 8.316 8.24 8.04 8.0 7.902 7.796 7.58 7.474 7.355 7.205 7.03 6.84 6.659 6.393 -3 ,15825 ,TETRA ,17602560,Sun Nov 28 16:17:41 CET,Sun Nov 28 18:10:52 CET,0.0 0.605 0.779 0.947 1.106 1.257 1.41 1.535 1.783 1.903 2.003 2.069 2.292 2.378 2.559 2.741 2.917 3.001 3.17 3.329 3.57 3.725 3.866 4.063 4.253 4.438 4.623 4.793 5.0 5.203 5.395 5.615 5.837 6.053 6.278 6.547 6.833 7.127 7.422 7.744 8.083 8.444 8.871 9.328 9.838 10.343 10.875 11.456 12.134 12.81 13.399 13.545 13.393 13.114 12.784 12.466 12.154 11.856 11.569 11.249 10.977 10.726 10.48 10.262 10.058 9.863 9.66 9.476 9.308 9.145 8.965 8.801 8.65 8.47 8.323 8.183 8.028 7.88 7.727 7.608 7.493 7.31 7.179 7.042 6.971 6.825 6.635 6.458 6.378 6.156 6.084 5.975 5.857 5.597 5.463 5.317 5.136 4.911 4.629 4.218 3.472 -4 ,14133 ,TETRA ,17602561,Sun Nov 28 16:18:02 CET,Sun Nov 28 18:11:21 CET,0.0 1.024 1.415 1.706 1.947 2.128 2.287 2.431 2.703 2.844 2.971 3.051 3.286 3.382 3.584 3.789 3.974 4.063 4.23 4.393 4.634 4.792 4.949 5.164 5.366 5.557 5.734 5.916 6.156 6.365 6.551 6.769 6.985 7.184 7.426 7.723 7.985 8.282 8.619 8.959 9.311 9.692 10.119 10.554 11.04 11.561 12.145 12.784 13.399 13.965 14.483 14.619 14.523 14.257 13.932 13.613 13.289 12.983 12.715 12.434 12.17 11.92 11.671 11.427 11.214 11.025 10.818 10.639 10.486 10.315 10.132 9.977 9.807 9.616 9.483 9.347 9.184 9.011 8.837 8.722 8.6 8.408 8.278 8.133 8.054 7.9 7.745 7.564 7.467 7.235 7.147 7.037 6.917 6.666 6.528 6.381 6.215 6.037 5.803 5.501 4.908 -5 ,23431 ,TETRA ,17602562,Sun Nov 28 16:18:04 CET,Sun Nov 28 18:11:38 CET,0.0 1.111 1.458 1.651 1.809 1.964 2.132 2.293 2.563 2.691 2.813 2.915 3.157 3.266 3.467 3.654 3.838 3.922 4.086 4.253 4.487 4.635 4.778 4.974 5.152 5.332 5.516 5.683 5.882 6.076 6.269 6.495 6.712 6.92 7.15 7.426 7.696 7.97 8.277 8.622 8.978 9.391 9.839 10.251 10.749 11.261 11.785 12.347 12.976 13.661 14.276 14.413 14.253 14.011 13.728 13.417 13.089 12.751 12.485 12.212 11.955 11.722 11.475 11.233 11.019 10.814 10.595 10.372 10.171 9.971 9.757 9.594 9.431 9.258 9.118 8.975 8.823 8.67 8.514 8.4 8.289 8.122 8.002 7.864 7.787 7.628 7.475 7.318 7.228 7.002 6.936 6.837 6.727 6.491 6.357 6.196 6.005 5.745 5.416 5.052 4.301 -6 ,4606 ,TETRA ,17602563,Sun Nov 28 16:18:02 CET,Sun Nov 28 18:12:48 CET,0.0 1.05 1.446 1.706 1.909 2.074 2.224 2.372 2.654 2.776 2.89 2.982 3.23 3.341 3.531 3.701 3.888 3.985 4.158 4.315 4.545 4.68 4.802 4.986 5.167 5.359 5.542 5.715 5.945 6.166 6.374 6.614 6.85 7.081 7.337 7.614 7.866 8.153 8.468 8.776 9.078 9.445 9.888 10.321 10.816 11.323 11.842 12.411 13.08 13.739 14.237 14.321 14.217 13.956 13.588 13.214 12.904 12.599 12.303 12.009 11.743 11.497 11.263 11.042 10.819 10.61 10.401 10.196 9.999 9.823 9.658 9.499 9.326 9.157 9.02 8.883 8.742 8.583 8.411 8.293 8.174 7.965 7.822 7.674 7.598 7.446 7.273 7.079 6.974 6.75 6.669 6.569 6.48 6.293 6.176 6.04 5.898 5.775 5.64 5.428 4.973 -7 ,10561 ,TETRA ,17602564,Sun Nov 28 16:18:03 CET,Sun Nov 28 18:14:02 CET,0.0 0.639 0.953 1.204 1.408 1.608 1.79 1.951 2.261 2.397 2.532 2.672 2.93 3.048 3.262 3.46 3.639 3.726 3.908 4.064 4.26 4.402 4.537 4.721 4.906 5.081 5.259 5.433 5.636 5.834 6.028 6.276 6.513 6.738 6.997 7.27 7.523 7.8 8.105 8.426 8.767 9.153 9.596 10.007 10.452 10.939 11.483 12.043 12.65 13.291 13.845 13.971 13.844 13.655 13.444 13.192 12.898 12.595 12.324 12.052 11.792 11.528 11.267 11.032 10.805 10.582 10.356 10.173 10.01 9.832 9.645 9.479 9.304 9.124 8.986 8.845 8.698 8.54 8.372 8.254 8.141 7.962 7.814 7.658 7.583 7.43 7.285 7.133 7.052 6.847 6.782 6.673 6.552 6.3 6.195 6.104 6.008 5.894 5.73 5.516 4.973 -8 ,2934 ,TETRA ,17602565,Sun Nov 28 16:18:32 CET,Sun Nov 28 18:12:13 CET,0.0 0.298 0.486 0.656 0.834 1.0 1.157 1.303 1.553 1.66 1.76 1.822 2.049 2.131 2.288 2.45 2.614 2.684 2.814 2.954 3.148 3.268 3.401 3.617 3.819 4.006 4.202 4.39 4.606 4.817 5.024 5.252 5.48 5.701 5.95 6.214 6.462 6.746 7.06 7.384 7.706 8.071 8.503 8.926 9.395 9.892 10.429 11.001 11.664 12.36 12.932 13.087 12.991 12.759 12.452 12.104 11.791 11.473 11.151 10.812 10.518 10.272 10.03 9.801 9.578 9.344 9.107 8.915 8.739 8.555 8.366 8.207 8.042 7.888 7.76 7.618 7.479 7.34 7.211 7.111 6.996 6.823 6.703 6.574 6.509 6.384 6.258 6.121 6.047 5.836 5.788 5.693 5.596 5.406 5.302 5.165 5.008 4.874 4.715 4.427 3.599 -9 ,5647 ,TETRA ,17602566,Sun Nov 28 16:18:03 CET,Sun Nov 28 18:11:41 CET,0.0 0.76 1.107 1.359 1.583 1.775 1.926 2.055 2.316 2.43 2.541 2.637 2.872 2.973 3.184 3.382 3.552 3.635 3.802 3.955 4.156 4.294 4.432 4.618 4.796 4.972 5.142 5.31 5.536 5.752 5.945 6.175 6.4 6.632 6.891 7.148 7.399 7.692 8.003 8.302 8.621 8.975 9.372 9.777 10.263 10.797 11.335 11.906 12.603 13.298 13.834 13.972 13.841 13.589 13.298 12.988 12.711 12.447 12.199 11.914 11.632 11.399 11.185 10.969 10.768 10.582 10.38 10.194 10.032 9.859 9.671 9.515 9.346 9.154 9.006 8.861 8.709 8.552 8.396 8.286 8.167 7.985 7.853 7.702 7.628 7.48 7.308 7.129 7.052 6.847 6.788 6.686 6.57 6.321 6.187 6.035 5.877 5.694 5.487 5.256 4.765 -10 ,27916 ,TETRA ,17602567,Sun Nov 28 16:18:04 CET,Sun Nov 28 18:11:35 CET,0.0 0.425 0.681 0.881 1.036 1.155 1.262 1.382 1.62 1.719 1.813 1.884 2.111 2.205 2.408 2.599 2.766 2.844 2.993 3.141 3.361 3.501 3.627 3.826 4.025 4.201 4.366 4.526 4.74 4.942 5.138 5.369 5.598 5.829 6.081 6.36 6.623 6.904 7.191 7.522 7.888 8.267 8.716 9.162 9.65 10.186 10.773 11.405 12.075 12.755 13.38 13.561 13.426 13.155 12.865 12.579 12.294 12.042 11.813 11.546 11.295 11.042 10.785 10.542 10.308 10.071 9.827 9.632 9.467 9.272 9.059 8.896 8.723 8.543 8.415 8.294 8.162 8.021 7.876 7.779 7.673 7.489 7.363 7.239 7.175 7.044 6.916 6.784 6.716 6.51 6.47 6.391 6.316 6.138 6.032 5.925 5.805 5.67 5.507 5.285 4.812 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_7a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_7a.txt deleted file mode 100644 index 7a29dca2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_7a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30160 ,TETRA ,17602568,Sun Nov 28 16:18:07 CET,Sun Nov 28 18:13:25 CET,0.0 1.391 1.786 2.113 2.389 2.625 2.824 2.991 3.283 3.421 3.557 3.645 3.872 3.976 4.188 4.389 4.555 4.635 4.803 4.965 5.186 5.328 5.47 5.686 5.903 6.095 6.263 6.415 6.61 6.81 6.999 7.217 7.437 7.651 7.878 8.145 8.387 8.632 8.901 9.191 9.479 9.782 10.14 10.477 10.852 11.224 11.616 12.028 12.4 12.722 12.822 12.459 11.981 11.45 10.926 10.433 9.985 9.559 9.155 8.767 8.423 8.082 7.747 7.428 7.137 6.884 6.625 6.387 6.172 5.944 5.711 5.511 5.315 5.126 4.971 4.8 4.602 4.391 4.178 4.041 3.909 3.702 3.547 3.383 3.3 3.139 2.972 2.77 2.661 2.426 2.348 2.247 2.135 1.874 1.749 1.604 1.418 1.22 0.991 0.703 -0.719 -2 ,28272 ,TETRA ,17602569,Sun Nov 28 16:18:08 CET,Sun Nov 28 18:12:55 CET,0.0 1.191 1.522 1.8 2.017 2.194 2.354 2.498 2.761 2.894 3.03 3.141 3.373 3.474 3.651 3.817 3.976 4.059 4.226 4.389 4.612 4.744 4.877 5.077 5.255 5.418 5.585 5.743 5.936 6.119 6.307 6.535 6.742 6.943 7.171 7.415 7.649 7.909 8.164 8.436 8.758 9.121 9.521 9.908 10.302 10.699 11.15 11.586 11.985 12.297 12.325 11.953 11.483 10.978 10.458 9.897 9.401 8.99 8.626 8.207 7.819 7.48 7.17 6.88 6.595 6.327 6.053 5.804 5.575 5.341 5.113 4.926 4.718 4.497 4.33 4.148 3.941 3.751 3.571 3.431 3.29 3.077 2.932 2.78 2.7 2.549 2.378 2.194 2.099 1.877 1.837 1.744 1.626 1.343 1.197 1.052 0.878 0.677 0.46 0.174 -1.103 -3 ,20661 ,TETRA ,17602570,Sun Nov 28 16:18:04 CET,Sun Nov 28 18:13:15 CET,0.0 0.674 0.937 1.172 1.37 1.542 1.713 1.868 2.14 2.274 2.396 2.483 2.721 2.833 3.05 3.25 3.429 3.518 3.699 3.86 4.073 4.209 4.354 4.568 4.758 4.928 5.09 5.245 5.456 5.671 5.873 6.09 6.291 6.488 6.709 6.97 7.234 7.526 7.816 8.11 8.429 8.767 9.117 9.451 9.843 10.241 10.642 11.08 11.495 11.796 11.839 11.395 10.864 10.358 9.871 9.368 8.888 8.436 8.051 7.635 7.258 6.954 6.657 6.366 6.089 5.825 5.551 5.313 5.111 4.898 4.671 4.48 4.274 4.042 3.871 3.7 3.517 3.326 3.133 3.002 2.855 2.616 2.445 2.274 2.196 2.033 1.858 1.679 1.589 1.369 1.283 1.172 1.068 0.839 0.712 0.581 0.437 0.257 0.053 -0.181 -1.091 -4 ,25130 ,TETRA ,17602571,Sun Nov 28 16:18:03 CET,Sun Nov 28 18:14:27 CET,0.0 1.67 2.058 2.397 2.676 2.892 3.074 3.229 3.495 3.61 3.724 3.811 4.035 4.144 4.358 4.557 4.738 4.82 4.976 5.118 5.325 5.456 5.583 5.767 5.937 6.099 6.255 6.419 6.619 6.809 7.005 7.241 7.453 7.653 7.893 8.172 8.431 8.703 8.999 9.292 9.573 9.905 10.285 10.618 10.972 11.357 11.765 12.153 12.539 12.934 13.099 12.759 12.266 11.71 11.176 10.69 10.224 9.766 9.335 8.879 8.496 8.175 7.874 7.574 7.29 7.04 6.765 6.501 6.268 6.032 5.797 5.597 5.391 5.185 5.026 4.862 4.679 4.483 4.268 4.117 3.974 3.736 3.553 3.386 3.315 3.151 2.968 2.788 2.69 2.461 2.372 2.253 2.14 1.891 1.749 1.581 1.385 1.155 0.892 0.508 -0.456 -5 ,15235 ,TETRA ,17602572,Sun Nov 28 16:18:04 CET,Sun Nov 28 18:13:09 CET,0.0 1.017 1.322 1.561 1.749 1.933 2.145 2.348 2.684 2.829 2.968 3.094 3.328 3.428 3.627 3.816 3.992 4.073 4.226 4.371 4.575 4.712 4.848 5.043 5.23 5.419 5.586 5.729 5.934 6.143 6.337 6.562 6.771 6.982 7.248 7.534 7.787 8.037 8.276 8.535 8.8 9.105 9.471 9.807 10.174 10.534 10.946 11.401 11.838 12.191 12.245 11.838 11.353 10.857 10.358 9.848 9.344 8.903 8.534 8.151 7.818 7.516 7.217 6.933 6.678 6.443 6.18 5.923 5.703 5.485 5.254 5.056 4.851 4.638 4.462 4.279 4.091 3.893 3.69 3.545 3.396 3.175 3.023 2.854 2.76 2.569 2.366 2.143 2.03 1.783 1.671 1.541 1.384 1.047 0.851 0.631 0.421 0.198 -0.068 -0.512 -2.014 -6 ,9486 ,TETRA ,17602573,Sun Nov 28 16:18:04 CET,Sun Nov 28 18:12:31 CET,0.0 0.797 1.237 1.506 1.776 2.014 2.193 2.349 2.646 2.788 2.919 3.046 3.292 3.394 3.594 3.78 3.933 4.014 4.186 4.344 4.57 4.711 4.839 5.025 5.204 5.375 5.548 5.719 5.927 6.116 6.289 6.486 6.683 6.888 7.123 7.38 7.61 7.843 8.121 8.422 8.699 9.01 9.382 9.716 10.062 10.465 10.916 11.296 11.657 12.019 12.084 11.73 11.227 10.675 10.149 9.642 9.19 8.775 8.387 7.995 7.667 7.36 7.063 6.772 6.491 6.238 5.966 5.721 5.507 5.296 5.07 4.863 4.647 4.429 4.262 4.089 3.903 3.711 3.51 3.366 3.225 3.009 2.849 2.676 2.587 2.399 2.197 1.982 1.868 1.634 1.536 1.404 1.249 0.932 0.773 0.601 0.397 0.098 -0.249 -0.619 -1.978 -7 ,1070 ,TETRA ,17602574,Sun Nov 28 16:18:06 CET,Sun Nov 28 18:12:51 CET,0.0 0.928 1.242 1.455 1.652 1.825 1.974 2.114 2.396 2.53 2.648 2.748 2.983 3.09 3.308 3.498 3.662 3.751 3.929 4.09 4.318 4.46 4.593 4.775 4.932 5.08 5.231 5.384 5.587 5.788 5.987 6.221 6.427 6.63 6.868 7.126 7.368 7.629 7.899 8.185 8.488 8.804 9.17 9.53 9.906 10.32 10.757 11.168 11.565 11.853 11.886 11.52 11.024 10.477 9.991 9.555 9.103 8.638 8.239 7.831 7.479 7.176 6.875 6.581 6.315 6.075 5.822 5.572 5.342 5.121 4.892 4.694 4.487 4.274 4.118 3.962 3.796 3.614 3.404 3.262 3.128 2.906 2.75 2.592 2.51 2.318 2.107 1.91 1.805 1.563 1.432 1.302 1.169 0.861 0.672 0.447 0.247 0.029 -0.247 -0.568 -1.391 -8 ,3684 ,TETRA ,17602575,Sun Nov 28 16:18:08 CET,Sun Nov 28 18:13:01 CET,0.0 0.427 0.697 0.921 1.121 1.29 1.431 1.575 1.847 1.966 2.091 2.208 2.449 2.558 2.758 2.953 3.142 3.228 3.388 3.533 3.751 3.9 4.041 4.234 4.408 4.573 4.732 4.878 5.077 5.281 5.478 5.713 5.925 6.123 6.357 6.62 6.856 7.118 7.383 7.65 7.943 8.272 8.647 8.976 9.324 9.713 10.132 10.571 10.993 11.293 11.367 11.042 10.458 9.873 9.383 8.935 8.507 8.095 7.708 7.302 6.944 6.613 6.304 6.005 5.728 5.467 5.193 4.941 4.716 4.494 4.256 4.059 3.84 3.609 3.438 3.261 3.074 2.883 2.695 2.564 2.426 2.194 2.022 1.844 1.755 1.588 1.416 1.214 1.11 0.885 0.805 0.688 0.564 0.276 0.118 -0.043 -0.214 -0.416 -0.651 -0.928 -2.126 -9 ,30857 ,TETRA ,17602576,Sun Nov 28 16:18:04 CET,Sun Nov 28 18:12:48 CET,0.0 1.354 1.652 1.897 2.102 2.28 2.472 2.653 2.948 3.083 3.211 3.306 3.534 3.635 3.824 4.012 4.196 4.282 4.453 4.613 4.835 4.981 5.118 5.311 5.491 5.663 5.835 5.997 6.213 6.419 6.6 6.818 7.028 7.235 7.47 7.725 7.985 8.246 8.505 8.78 9.041 9.33 9.672 10.005 10.361 10.743 11.192 11.623 11.975 12.259 12.405 12.133 11.669 11.163 10.618 10.089 9.619 9.163 8.794 8.457 8.15 7.857 7.547 7.236 6.943 6.684 6.423 6.186 5.98 5.762 5.53 5.334 5.127 4.913 4.757 4.594 4.412 4.223 4.026 3.89 3.733 3.495 3.343 3.182 3.107 2.954 2.794 2.62 2.526 2.296 2.213 2.1 1.979 1.73 1.605 1.468 1.298 1.098 0.893 0.642 -0.145 -10 ,10215 ,TETRA ,17602577,Sun Nov 28 16:18:05 CET,Sun Nov 28 18:12:45 CET,0.0 0.8 1.126 1.421 1.677 1.865 2.041 2.204 2.507 2.646 2.773 2.897 3.131 3.234 3.444 3.638 3.809 3.89 4.037 4.189 4.424 4.568 4.709 4.907 5.093 5.276 5.459 5.633 5.84 6.038 6.22 6.449 6.674 6.87 7.095 7.35 7.577 7.825 8.111 8.405 8.711 9.055 9.462 9.817 10.17 10.541 10.909 11.25 11.61 11.956 12.007 11.574 11.025 10.488 9.959 9.41 8.922 8.498 8.125 7.74 7.392 7.081 6.787 6.502 6.227 5.975 5.721 5.472 5.246 5.02 4.774 4.57 4.364 4.145 3.964 3.774 3.581 3.391 3.201 3.069 2.93 2.717 2.557 2.385 2.298 2.105 1.888 1.657 1.539 1.301 1.207 1.086 0.952 0.646 0.496 0.35 0.186 -0.01 -0.26 -0.609 -1.803 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6a.txt deleted file mode 100644 index b6f292aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4741 ,TETRA ,17602578,Sun Nov 28 16:18:08 CET,Sun Nov 28 18:11:36 CET,0.0 0.83 1.155 1.411 1.616 1.791 1.984 2.166 2.456 2.576 2.692 2.8 3.033 3.133 3.336 3.532 3.698 3.773 3.921 4.044 4.225 4.348 4.457 4.617 4.788 4.955 5.117 5.27 5.474 5.671 5.842 6.044 6.233 6.404 6.618 6.847 7.059 7.309 7.57 7.855 8.157 8.454 8.767 9.099 9.468 9.825 10.219 10.585 10.914 11.202 11.242 10.819 10.291 9.735 9.214 8.763 8.353 7.931 7.551 7.199 6.898 6.616 6.343 6.093 5.871 5.654 5.4 5.17 4.979 4.777 4.571 4.406 4.232 4.04 3.884 3.728 3.576 3.424 3.273 3.156 3.036 2.84 2.696 2.547 2.472 2.312 2.129 1.944 1.852 1.627 1.556 1.45 1.336 1.092 0.955 0.815 0.649 0.424 0.19 -0.097 -1.309 -2 ,15068 ,TETRA ,17602579,Sun Nov 28 16:18:08 CET,Sun Nov 28 18:11:38 CET,0.0 0.815 1.123 1.369 1.581 1.792 1.971 2.109 2.362 2.478 2.583 2.654 2.889 2.99 3.164 3.327 3.478 3.554 3.699 3.848 4.081 4.208 4.319 4.495 4.675 4.85 5.023 5.197 5.397 5.567 5.736 5.944 6.148 6.345 6.556 6.783 6.994 7.234 7.492 7.741 8.003 8.304 8.633 8.948 9.304 9.667 10.048 10.433 10.791 11.034 10.969 10.477 9.947 9.418 8.901 8.399 7.985 7.641 7.326 6.983 6.661 6.361 6.073 5.82 5.582 5.354 5.11 4.887 4.698 4.486 4.264 4.107 3.95 3.779 3.645 3.504 3.363 3.223 3.079 2.966 2.843 2.668 2.548 2.42 2.352 2.219 2.069 1.906 1.83 1.617 1.567 1.467 1.359 1.151 1.037 0.905 0.753 0.589 0.392 0.151 -0.356 -3 ,480 ,TETRA ,17602580,Sun Nov 28 16:18:06 CET,Sun Nov 28 18:11:26 CET,0.0 0.791 1.064 1.296 1.474 1.656 1.809 1.935 2.179 2.287 2.395 2.477 2.706 2.801 2.971 3.14 3.309 3.384 3.531 3.679 3.869 3.982 4.101 4.276 4.431 4.585 4.731 4.881 5.079 5.258 5.411 5.6 5.8 5.973 6.173 6.405 6.628 6.865 7.105 7.353 7.599 7.867 8.183 8.503 8.866 9.222 9.555 9.891 10.276 10.614 10.66 10.243 9.741 9.238 8.742 8.267 7.809 7.387 7.042 6.686 6.353 6.064 5.779 5.498 5.246 5.01 4.758 4.546 4.363 4.17 3.97 3.804 3.618 3.408 3.25 3.094 2.939 2.776 2.598 2.478 2.356 2.159 2.027 1.89 1.816 1.664 1.504 1.347 1.26 1.024 0.949 0.84 0.72 0.451 0.305 0.169 0.013 -0.174 -0.408 -0.77 -1.525 -4 ,8192 ,TETRA ,17602581,Sun Nov 28 16:18:06 CET,Sun Nov 28 18:11:26 CET,0.0 0.88 1.262 1.499 1.682 1.856 2.032 2.201 2.523 2.674 2.797 2.883 3.114 3.208 3.382 3.558 3.724 3.804 3.958 4.097 4.298 4.427 4.552 4.727 4.894 5.061 5.21 5.353 5.543 5.715 5.875 6.081 6.288 6.475 6.678 6.911 7.127 7.366 7.616 7.856 8.111 8.406 8.733 9.036 9.374 9.725 10.108 10.499 10.867 11.105 11.119 10.765 10.239 9.698 9.196 8.7 8.246 7.833 7.47 7.1 6.757 6.448 6.154 5.887 5.653 5.435 5.221 5.024 4.833 4.618 4.398 4.216 4.026 3.841 3.7 3.555 3.396 3.219 3.039 2.92 2.794 2.575 2.428 2.29 2.219 2.071 1.917 1.75 1.657 1.435 1.375 1.265 1.142 0.901 0.785 0.677 0.562 0.432 0.272 0.034 -0.613 -5 ,8681 ,TETRA ,17602582,Sun Nov 28 16:18:08 CET,Sun Nov 28 18:10:54 CET,0.0 1.378 1.714 1.988 2.22 2.417 2.574 2.724 2.971 3.081 3.191 3.273 3.508 3.607 3.792 3.983 4.159 4.233 4.369 4.508 4.707 4.832 4.96 5.129 5.286 5.443 5.594 5.744 5.937 6.121 6.3 6.507 6.688 6.853 7.055 7.308 7.54 7.774 8.02 8.258 8.515 8.795 9.09 9.383 9.693 10.006 10.36 10.711 11.042 11.295 11.244 10.755 10.19 9.661 9.156 8.672 8.25 7.854 7.502 7.146 6.8 6.47 6.177 5.916 5.677 5.463 5.231 5.027 4.86 4.681 4.483 4.316 4.138 3.933 3.771 3.606 3.448 3.305 3.146 3.025 2.891 2.7 2.576 2.447 2.38 2.235 2.094 1.938 1.859 1.64 1.585 1.486 1.368 1.086 0.921 0.766 0.593 0.377 0.149 -0.193 -1.158 -6 ,21265 ,TETRA ,17602583,Sun Nov 28 16:18:06 CET,Sun Nov 28 18:12:40 CET,0.0 0.749 1.158 1.502 1.758 1.96 2.138 2.277 2.509 2.63 2.742 2.828 3.056 3.151 3.327 3.48 3.63 3.707 3.857 4.009 4.218 4.345 4.458 4.617 4.787 4.941 5.086 5.229 5.41 5.588 5.755 5.97 6.171 6.356 6.568 6.802 7.026 7.264 7.518 7.775 8.027 8.323 8.668 8.983 9.313 9.657 10.041 10.4 10.706 10.913 10.874 10.482 9.988 9.482 9.016 8.552 8.119 7.708 7.327 6.947 6.634 6.368 6.089 5.8 5.547 5.318 5.059 4.819 4.618 4.416 4.205 4.027 3.837 3.634 3.472 3.319 3.154 2.981 2.814 2.696 2.564 2.34 2.184 2.022 1.95 1.801 1.623 1.432 1.332 1.094 1.007 0.903 0.798 0.547 0.408 0.252 0.071 -0.12 -0.312 -0.535 -1.681 -7 ,24013 ,TETRA ,17602584,Sun Nov 28 16:18:08 CET,Sun Nov 28 18:12:36 CET,0.0 1.309 1.665 1.942 2.169 2.368 2.539 2.69 2.954 3.083 3.194 3.252 3.488 3.588 3.763 3.945 4.126 4.207 4.356 4.495 4.703 4.826 4.941 5.117 5.29 5.458 5.604 5.74 5.934 6.1 6.255 6.453 6.639 6.829 7.038 7.254 7.473 7.713 7.95 8.195 8.447 8.709 9.032 9.354 9.674 10.002 10.341 10.691 11.065 11.299 11.268 10.857 10.369 9.899 9.402 8.922 8.499 8.075 7.697 7.356 7.063 6.769 6.476 6.214 5.959 5.72 5.482 5.27 5.096 4.916 4.714 4.553 4.384 4.197 4.052 3.896 3.736 3.571 3.392 3.273 3.147 2.962 2.85 2.734 2.676 2.557 2.413 2.251 2.181 1.975 1.915 1.805 1.71 1.491 1.371 1.259 1.123 0.978 0.809 0.581 0.318 -8 ,12451 ,TETRA ,17602585,Sun Nov 28 16:18:10 CET,Sun Nov 28 18:11:29 CET,0.0 0.405 0.615 0.807 0.995 1.16 1.318 1.472 1.747 1.877 1.998 2.083 2.31 2.412 2.599 2.781 2.96 3.039 3.196 3.341 3.542 3.677 3.801 3.987 4.158 4.304 4.442 4.578 4.769 4.969 5.149 5.358 5.58 5.781 5.996 6.24 6.461 6.694 6.938 7.198 7.467 7.762 8.11 8.425 8.765 9.117 9.462 9.799 10.1 10.325 10.31 9.884 9.371 8.845 8.354 7.903 7.485 7.106 6.743 6.357 6.04 5.744 5.458 5.176 4.901 4.667 4.43 4.212 4.022 3.82 3.609 3.441 3.257 3.06 2.907 2.751 2.592 2.438 2.278 2.171 2.07 1.893 1.77 1.647 1.578 1.433 1.291 1.144 1.07 0.852 0.807 0.714 0.611 0.411 0.301 0.187 0.061 -0.123 -0.389 -0.773 -1.379 -9 ,14216 ,TETRA ,17602586,Sun Nov 28 16:18:11 CET,Sun Nov 28 18:11:08 CET,0.0 0.706 1.004 1.224 1.409 1.563 1.708 1.829 2.022 2.114 2.202 2.237 2.458 2.55 2.719 2.872 3.012 3.079 3.21 3.337 3.516 3.629 3.735 3.887 4.035 4.176 4.317 4.457 4.633 4.811 4.985 5.19 5.384 5.562 5.779 6.027 6.235 6.448 6.678 6.919 7.195 7.488 7.803 8.111 8.443 8.813 9.179 9.532 9.903 10.144 10.034 9.641 9.13 8.517 7.929 7.397 6.951 6.523 6.171 5.836 5.518 5.231 4.938 4.668 4.451 4.241 4.007 3.81 3.629 3.427 3.223 3.057 2.892 2.709 2.554 2.397 2.234 2.064 1.883 1.759 1.64 1.463 1.349 1.216 1.144 0.99 0.818 0.627 0.527 0.293 0.196 0.078 -0.045 -0.314 -0.453 -0.62 -0.78 -0.923 -1.066 -1.231 -1.526 -10 ,26417 ,TETRA ,17602587,Sun Nov 28 16:18:06 CET,Sun Nov 28 18:11:41 CET,0.0 1.183 1.521 1.798 2.032 2.219 2.393 2.541 2.798 2.914 3.016 3.089 3.323 3.421 3.585 3.735 3.901 3.983 4.128 4.274 4.479 4.605 4.721 4.879 5.049 5.214 5.366 5.514 5.697 5.871 6.048 6.262 6.466 6.65 6.859 7.099 7.339 7.585 7.831 8.087 8.348 8.649 8.991 9.3 9.653 10.037 10.442 10.823 11.17 11.438 11.42 11.024 10.517 9.992 9.534 9.062 8.595 8.164 7.771 7.39 7.083 6.804 6.53 6.28 6.036 5.8 5.561 5.341 5.149 4.951 4.735 4.565 4.393 4.2 4.057 3.912 3.758 3.601 3.42 3.292 3.166 2.954 2.806 2.667 2.6 2.456 2.289 2.112 2.019 1.79 1.742 1.641 1.517 1.253 1.143 1.024 0.883 0.743 0.591 0.381 -0.421 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6b.txt deleted file mode 100644 index 99dc52c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4077 ,TETRA ,17602588,Sun Nov 28 16:18:07 CET,Sun Nov 28 18:11:53 CET,0.0 1.078 1.518 1.855 2.113 2.331 2.508 2.664 2.942 3.074 3.208 3.327 3.573 3.685 3.885 4.064 4.23 4.321 4.509 4.682 4.893 5.031 5.178 5.376 5.555 5.734 5.904 6.073 6.303 6.523 6.718 6.943 7.183 7.422 7.698 7.985 8.242 8.521 8.814 9.099 9.403 9.792 10.235 10.639 11.089 11.568 12.05 12.554 13.093 13.597 13.948 13.876 13.62 13.304 12.933 12.554 12.234 11.899 11.566 11.239 10.96 10.688 10.426 10.18 9.929 9.7 9.483 9.288 9.106 8.904 8.7 8.537 8.372 8.21 8.068 7.907 7.752 7.586 7.407 7.289 7.163 6.969 6.84 6.703 6.629 6.471 6.315 6.159 6.067 5.832 5.759 5.66 5.551 5.321 5.193 5.055 4.906 4.679 4.378 4.008 2.807 -2 ,11108 ,TETRA ,17602589,Sun Nov 28 16:18:10 CET,Sun Nov 28 18:12:37 CET,0.0 1.051 1.348 1.535 1.699 1.858 1.993 2.11 2.351 2.476 2.588 2.65 2.884 2.987 3.172 3.348 3.504 3.575 3.724 3.876 4.089 4.228 4.366 4.559 4.746 4.922 5.083 5.256 5.496 5.711 5.899 6.127 6.349 6.546 6.779 7.039 7.277 7.545 7.84 8.194 8.556 8.905 9.317 9.716 10.153 10.62 11.103 11.6 12.146 12.703 13.075 12.993 12.652 12.279 11.93 11.558 11.19 10.827 10.513 10.199 9.929 9.676 9.411 9.153 8.912 8.694 8.468 8.26 8.072 7.877 7.669 7.493 7.314 7.133 6.996 6.861 6.722 6.573 6.4 6.269 6.131 5.916 5.788 5.679 5.617 5.453 5.276 5.114 5.028 4.811 4.768 4.68 4.577 4.333 4.184 4.022 3.852 3.678 3.482 3.214 2.419 -3 ,4703 ,TETRA ,17602590,Sun Nov 28 16:18:11 CET,Sun Nov 28 18:11:52 CET,0.0 0.673 0.907 1.081 1.242 1.401 1.554 1.685 1.924 2.031 2.133 2.206 2.43 2.517 2.678 2.839 2.994 3.068 3.211 3.332 3.503 3.621 3.729 3.896 4.076 4.258 4.449 4.639 4.861 5.068 5.267 5.513 5.752 5.967 6.209 6.483 6.745 7.059 7.41 7.733 8.05 8.409 8.83 9.233 9.68 10.119 10.561 11.082 11.664 12.207 12.531 12.519 12.348 12.045 11.683 11.313 10.977 10.638 10.327 10.024 9.776 9.529 9.266 9.03 8.803 8.591 8.387 8.21 8.039 7.845 7.624 7.448 7.27 7.085 6.945 6.803 6.666 6.513 6.335 6.217 6.094 5.916 5.791 5.638 5.564 5.423 5.275 5.116 5.031 4.806 4.717 4.615 4.513 4.274 4.13 3.97 3.767 3.549 3.349 3.092 2.16 -4 ,10773 ,TETRA ,17602591,Sun Nov 28 16:18:07 CET,Sun Nov 28 18:13:26 CET,0.0 1.37 1.685 1.912 2.117 2.311 2.486 2.648 2.925 3.056 3.182 3.279 3.522 3.631 3.831 4.02 4.198 4.279 4.439 4.593 4.822 4.981 5.124 5.323 5.525 5.711 5.883 6.052 6.267 6.481 6.702 6.965 7.215 7.448 7.711 7.988 8.243 8.524 8.816 9.124 9.454 9.818 10.254 10.691 11.157 11.628 12.136 12.661 13.219 13.808 14.257 14.268 13.97 13.586 13.234 12.868 12.519 12.198 11.902 11.595 11.3 11.015 10.736 10.467 10.224 10.004 9.77 9.571 9.399 9.205 9.002 8.837 8.657 8.462 8.309 8.151 7.985 7.819 7.66 7.557 7.455 7.305 7.196 7.079 7.018 6.882 6.736 6.583 6.507 6.301 6.257 6.174 6.087 5.92 5.824 5.711 5.582 5.436 5.275 5.058 4.562 -5 ,28042 ,TETRA ,17602592,Sun Nov 28 16:18:08 CET,Sun Nov 28 18:13:26 CET,0.0 0.827 1.15 1.393 1.599 1.776 1.922 2.059 2.311 2.43 2.541 2.626 2.867 2.962 3.143 3.317 3.48 3.565 3.735 3.904 4.152 4.308 4.458 4.671 4.868 5.059 5.257 5.441 5.652 5.863 6.076 6.333 6.577 6.806 7.058 7.348 7.639 7.929 8.219 8.519 8.824 9.157 9.527 9.915 10.384 10.895 11.474 12.085 12.672 13.159 13.498 13.473 13.207 12.837 12.44 12.035 11.683 11.356 11.047 10.719 10.419 10.163 9.923 9.681 9.447 9.239 9.014 8.812 8.632 8.442 8.25 8.082 7.895 7.703 7.564 7.432 7.297 7.141 6.979 6.863 6.742 6.553 6.413 6.261 6.183 6.028 5.867 5.691 5.602 5.387 5.317 5.216 5.107 4.888 4.785 4.668 4.523 4.38 4.221 4.004 3.444 -6 ,18387 ,TETRA ,17602593,Sun Nov 28 16:18:33 CET,Sun Nov 28 18:12:33 CET,0.0 0.933 1.305 1.59 1.812 2.017 2.192 2.351 2.656 2.798 2.925 3.053 3.301 3.407 3.607 3.781 3.944 4.026 4.179 4.321 4.513 4.649 4.797 5.011 5.216 5.401 5.577 5.755 5.965 6.168 6.362 6.585 6.813 7.038 7.288 7.55 7.802 8.082 8.373 8.654 8.967 9.372 9.807 10.188 10.617 11.082 11.598 12.118 12.648 13.149 13.546 13.549 13.248 12.888 12.515 12.112 11.742 11.414 11.117 10.798 10.524 10.271 10.005 9.762 9.523 9.281 9.03 8.807 8.617 8.441 8.271 8.116 7.947 7.786 7.657 7.513 7.373 7.228 7.058 6.933 6.805 6.626 6.506 6.371 6.298 6.14 5.979 5.811 5.716 5.504 5.47 5.371 5.271 5.051 4.912 4.745 4.537 4.306 4.049 3.787 2.955 -7 ,25888 ,TETRA ,17602594,Sun Nov 28 16:18:36 CET,Sun Nov 28 18:12:51 CET,0.0 0.961 1.386 1.662 1.909 2.122 2.292 2.449 2.754 2.9 3.032 3.132 3.363 3.454 3.659 3.882 4.081 4.166 4.333 4.495 4.721 4.869 5.027 5.241 5.409 5.581 5.755 5.93 6.153 6.361 6.567 6.813 7.039 7.254 7.497 7.781 8.057 8.328 8.609 8.904 9.219 9.593 10.01 10.395 10.82 11.293 11.801 12.314 12.871 13.379 13.73 13.778 13.555 13.194 12.796 12.392 12.014 11.691 11.412 11.099 10.803 10.526 10.251 9.977 9.698 9.459 9.227 9.019 8.846 8.665 8.483 8.327 8.16 7.977 7.842 7.707 7.554 7.399 7.245 7.132 7.02 6.859 6.742 6.622 6.564 6.436 6.298 6.155 6.076 5.869 5.824 5.726 5.643 5.463 5.346 5.221 5.103 4.955 4.756 4.507 4.074 -8 ,7362 ,TETRA ,17602595,Sun Nov 28 16:18:35 CET,Sun Nov 28 18:12:50 CET,0.0 1.874 2.486 2.93 3.319 3.642 3.898 4.092 4.388 4.527 4.684 4.821 5.067 5.188 5.403 5.594 5.773 5.858 6.024 6.188 6.408 6.548 6.693 6.896 7.088 7.278 7.458 7.629 7.842 8.038 8.235 8.466 8.67 8.887 9.165 9.459 9.709 9.96 10.247 10.577 10.914 11.26 11.661 12.07 12.504 12.973 13.494 14.004 14.53 15.052 15.33 15.24 14.976 14.6 14.211 13.853 13.516 13.205 12.918 12.604 12.33 12.063 11.804 11.569 11.337 11.118 10.897 10.694 10.518 10.331 10.13 9.966 9.787 9.603 9.468 9.321 9.162 9.009 8.841 8.714 8.576 8.366 8.234 8.103 8.034 7.884 7.712 7.525 7.429 7.209 7.125 7.023 6.923 6.662 6.523 6.401 6.279 6.119 5.922 5.705 4.769 -9 ,629 ,TETRA ,17602596,Sun Nov 28 16:18:38 CET,Sun Nov 28 18:13:07 CET,0.0 1.054 1.352 1.574 1.768 1.924 2.064 2.204 2.486 2.625 2.751 2.86 3.099 3.205 3.424 3.638 3.831 3.921 4.09 4.263 4.501 4.65 4.799 4.994 5.175 5.353 5.522 5.686 5.902 6.111 6.312 6.549 6.772 6.997 7.253 7.533 7.802 8.109 8.428 8.745 9.075 9.407 9.795 10.205 10.676 11.174 11.71 12.262 12.789 13.243 13.532 13.508 13.262 12.877 12.509 12.165 11.8 11.446 11.154 10.838 10.562 10.326 10.079 9.839 9.613 9.393 9.163 8.969 8.803 8.622 8.433 8.282 8.127 7.956 7.808 7.644 7.478 7.31 7.146 7.037 6.921 6.734 6.6 6.47 6.401 6.252 6.092 5.922 5.839 5.615 5.524 5.415 5.29 5.018 4.882 4.75 4.591 4.395 4.192 3.98 3.505 -10 ,1009 ,TETRA ,17602597,Sun Nov 28 16:18:33 CET,Sun Nov 28 18:13:10 CET,0.0 0.807 1.227 1.486 1.703 1.927 2.134 2.31 2.626 2.763 2.884 2.973 3.207 3.309 3.514 3.716 3.902 3.983 4.131 4.276 4.495 4.64 4.776 4.985 5.182 5.371 5.559 5.741 5.97 6.183 6.381 6.609 6.84 7.071 7.326 7.614 7.885 8.168 8.484 8.815 9.121 9.452 9.843 10.209 10.637 11.091 11.596 12.128 12.67 13.206 13.539 13.479 13.181 12.805 12.452 12.112 11.756 11.412 11.127 10.831 10.567 10.29 10.001 9.753 9.536 9.312 9.058 8.864 8.718 8.545 8.339 8.18 8.03 7.863 7.717 7.568 7.412 7.243 7.07 6.95 6.823 6.637 6.528 6.414 6.35 6.215 6.079 5.938 5.861 5.655 5.621 5.538 5.452 5.279 5.193 5.086 4.963 4.804 4.626 4.418 4.079 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_7a_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_7a_3a.txt deleted file mode 100644 index 6b2a7c02..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Thrombin/water/Summary_FEP_7a_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3770 ,TETRA ,17602598,Sun Nov 28 16:18:32 CET,Sun Nov 28 18:14:16 CET,0.0 1.274 1.569 1.765 1.928 2.092 2.256 2.401 2.641 2.75 2.852 2.927 3.142 3.216 3.375 3.53 3.68 3.755 3.891 4.022 4.22 4.343 4.449 4.602 4.754 4.9 5.041 5.186 5.381 5.56 5.723 5.925 6.108 6.275 6.473 6.705 6.926 7.161 7.414 7.674 7.941 8.232 8.602 8.979 9.377 9.785 10.196 10.634 11.099 11.485 11.713 11.588 11.168 10.677 10.197 9.727 9.269 8.82 8.42 8.031 7.704 7.399 7.094 6.806 6.539 6.297 6.042 5.798 5.57 5.323 5.082 4.887 4.687 4.475 4.302 4.12 3.934 3.75 3.557 3.424 3.295 3.1 2.944 2.781 2.7 2.532 2.37 2.188 2.085 1.856 1.771 1.66 1.538 1.257 1.113 0.958 0.784 0.575 0.32 -0.013 -1.521 -2 ,16796 ,TETRA ,17602599,Sun Nov 28 16:18:34 CET,Sun Nov 28 18:14:12 CET,0.0 0.608 0.869 1.096 1.297 1.461 1.616 1.759 2.03 2.146 2.239 2.292 2.51 2.595 2.747 2.898 3.067 3.146 3.292 3.436 3.635 3.748 3.851 4.015 4.176 4.313 4.439 4.565 4.733 4.909 5.09 5.314 5.522 5.718 5.94 6.19 6.408 6.624 6.856 7.117 7.414 7.727 8.064 8.39 8.765 9.193 9.648 10.073 10.483 10.838 10.984 10.767 10.428 10.016 9.526 9.004 8.529 8.099 7.734 7.344 6.981 6.667 6.379 6.094 5.811 5.544 5.273 5.032 4.802 4.564 4.328 4.125 3.908 3.678 3.495 3.306 3.117 2.933 2.742 2.605 2.466 2.257 2.102 1.928 1.841 1.674 1.499 1.295 1.186 0.956 0.854 0.727 0.602 0.303 0.116 -0.086 -0.3 -0.552 -0.816 -1.179 -2.402 -3 ,6267 ,TETRA ,17602600,Sun Nov 28 16:18:35 CET,Sun Nov 28 18:14:25 CET,0.0 0.459 0.644 0.805 0.949 1.076 1.197 1.318 1.543 1.639 1.725 1.763 1.97 2.056 2.235 2.397 2.557 2.64 2.792 2.923 3.111 3.235 3.35 3.504 3.663 3.831 3.976 4.116 4.308 4.483 4.642 4.829 5.019 5.2 5.399 5.625 5.845 6.086 6.335 6.587 6.863 7.178 7.526 7.862 8.223 8.6 9.007 9.443 9.917 10.311 10.502 10.242 9.831 9.43 9.006 8.532 8.043 7.599 7.213 6.826 6.488 6.192 5.899 5.595 5.323 5.091 4.838 4.584 4.365 4.139 3.904 3.705 3.494 3.266 3.078 2.882 2.698 2.512 2.309 2.163 2.006 1.747 1.577 1.411 1.32 1.132 0.939 0.751 0.648 0.408 0.295 0.164 0.029 -0.239 -0.395 -0.58 -0.786 -1.035 -1.359 -1.789 -2.808 -4 ,17935 ,TETRA ,17602601,Sun Nov 28 16:18:34 CET,Sun Nov 28 18:15:28 CET,0.0 1.316 1.613 1.84 2.051 2.237 2.393 2.547 2.828 2.941 3.051 3.119 3.332 3.422 3.593 3.76 3.912 3.977 4.112 4.252 4.473 4.607 4.732 4.934 5.124 5.279 5.424 5.568 5.765 5.943 6.091 6.284 6.48 6.657 6.854 7.08 7.289 7.525 7.79 8.064 8.329 8.615 8.974 9.323 9.698 10.065 10.445 10.842 11.261 11.679 11.87 11.637 11.242 10.78 10.317 9.863 9.433 9.024 8.626 8.241 7.918 7.605 7.302 6.998 6.708 6.467 6.211 5.963 5.751 5.527 5.29 5.083 4.866 4.649 4.467 4.276 4.089 3.9 3.701 3.561 3.415 3.159 2.981 2.811 2.724 2.525 2.299 2.062 1.937 1.687 1.554 1.397 1.246 0.972 0.828 0.674 0.499 0.291 0.051 -0.258 -0.99 -5 ,27141 ,TETRA ,17602602,Sun Nov 28 16:18:33 CET,Sun Nov 28 18:14:13 CET,0.0 0.35 0.561 0.705 0.838 0.969 1.111 1.239 1.46 1.553 1.64 1.678 1.885 1.959 2.103 2.243 2.38 2.447 2.564 2.672 2.844 2.96 3.072 3.243 3.404 3.555 3.697 3.821 3.986 4.156 4.31 4.503 4.703 4.896 5.12 5.357 5.587 5.836 6.087 6.341 6.587 6.854 7.182 7.533 7.909 8.26 8.655 9.077 9.495 9.901 10.133 10.0 9.644 9.216 8.77 8.294 7.828 7.399 7.019 6.63 6.271 5.934 5.629 5.348 5.074 4.821 4.547 4.291 4.072 3.832 3.588 3.381 3.162 2.947 2.782 2.599 2.399 2.207 2.021 1.889 1.744 1.513 1.343 1.165 1.079 0.892 0.687 0.457 0.338 0.093 -0.043 -0.191 -0.326 -0.617 -0.785 -0.976 -1.202 -1.434 -1.655 -1.959 -3.095 -6 ,704 ,TETRA ,17602603,Sun Nov 28 16:18:33 CET,Sun Nov 28 18:14:26 CET,0.0 0.743 1.069 1.305 1.542 1.738 1.892 2.034 2.295 2.425 2.529 2.565 2.78 2.864 3.022 3.172 3.298 3.356 3.483 3.618 3.826 3.95 4.065 4.216 4.376 4.538 4.678 4.825 5.017 5.195 5.36 5.552 5.741 5.921 6.146 6.407 6.634 6.855 7.095 7.362 7.637 7.939 8.261 8.584 8.993 9.436 9.864 10.288 10.766 11.155 11.338 11.175 10.805 10.368 9.966 9.578 9.142 8.711 8.354 7.979 7.62 7.314 7.034 6.747 6.463 6.203 5.914 5.653 5.438 5.223 4.989 4.764 4.53 4.307 4.136 3.963 3.784 3.599 3.417 3.289 3.145 2.889 2.715 2.55 2.463 2.268 2.054 1.838 1.729 1.485 1.364 1.229 1.072 0.724 0.544 0.319 0.071 -0.178 -0.464 -0.782 -1.755 -7 ,26408 ,TETRA ,17602604,Sun Nov 28 16:18:35 CET,Sun Nov 28 18:14:23 CET,0.0 0.559 0.884 1.107 1.279 1.441 1.585 1.72 1.983 2.095 2.191 2.248 2.463 2.546 2.698 2.85 3.006 3.083 3.237 3.381 3.559 3.674 3.786 3.94 4.099 4.256 4.406 4.55 4.736 4.914 5.082 5.292 5.494 5.679 5.898 6.162 6.414 6.683 6.949 7.199 7.451 7.742 8.087 8.427 8.792 9.174 9.614 10.063 10.482 10.843 11.089 10.912 10.465 9.995 9.533 9.06 8.614 8.202 7.835 7.467 7.163 6.875 6.595 6.331 6.055 5.781 5.503 5.249 5.03 4.822 4.595 4.403 4.207 3.985 3.81 3.632 3.44 3.241 3.019 2.865 2.715 2.461 2.286 2.13 2.05 1.873 1.685 1.472 1.353 1.106 0.987 0.838 0.685 0.395 0.232 0.053 -0.159 -0.415 -0.752 -1.244 -2.346 -8 ,23955 ,TETRA ,17602605,Sun Nov 28 16:18:34 CET,Sun Nov 28 18:14:08 CET,0.0 0.765 1.171 1.442 1.603 1.722 1.851 1.972 2.193 2.31 2.42 2.481 2.694 2.776 2.949 3.126 3.299 3.374 3.504 3.631 3.825 3.944 4.058 4.239 4.396 4.536 4.68 4.822 5.006 5.189 5.36 5.555 5.746 5.931 6.136 6.372 6.602 6.843 7.111 7.384 7.643 7.937 8.291 8.629 8.966 9.332 9.746 10.196 10.647 11.002 11.152 10.912 10.542 10.091 9.573 9.091 8.68 8.277 7.902 7.523 7.198 6.89 6.578 6.265 5.959 5.697 5.446 5.219 5.026 4.808 4.574 4.384 4.179 3.971 3.8 3.619 3.445 3.256 3.063 2.929 2.779 2.561 2.403 2.227 2.136 1.936 1.713 1.475 1.357 1.108 0.998 0.879 0.741 0.441 0.267 0.074 -0.136 -0.439 -0.778 -1.15 -3.152 -9 ,27870 ,TETRA ,17602606,Sun Nov 28 16:18:35 CET,Sun Nov 28 18:14:13 CET,0.0 0.63 0.847 1.033 1.228 1.397 1.544 1.68 1.93 2.051 2.158 2.216 2.437 2.517 2.683 2.849 2.99 3.058 3.196 3.329 3.526 3.647 3.76 3.918 4.066 4.227 4.371 4.499 4.677 4.842 5.0 5.205 5.401 5.578 5.776 6.011 6.234 6.479 6.744 7.021 7.321 7.634 7.965 8.321 8.727 9.152 9.611 10.029 10.486 10.93 11.128 10.899 10.503 10.064 9.641 9.247 8.862 8.458 8.103 7.752 7.416 7.084 6.756 6.456 6.183 5.921 5.644 5.394 5.181 4.971 4.748 4.549 4.347 4.147 3.988 3.814 3.616 3.414 3.195 3.034 2.872 2.617 2.446 2.27 2.169 1.98 1.776 1.543 1.426 1.164 1.045 0.904 0.749 0.427 0.234 0.043 -0.18 -0.467 -0.801 -1.314 -3.278 -10 ,31049 ,TETRA ,17602607,Sun Nov 28 16:18:36 CET,Sun Nov 28 18:14:44 CET,0.0 1.266 1.618 1.846 2.064 2.266 2.448 2.608 2.873 2.987 3.095 3.155 3.375 3.47 3.624 3.771 3.932 4.006 4.142 4.277 4.458 4.564 4.683 4.865 5.029 5.18 5.316 5.457 5.645 5.819 5.981 6.171 6.354 6.533 6.758 7.022 7.267 7.524 7.785 8.051 8.326 8.63 8.971 9.303 9.661 10.054 10.488 10.87 11.247 11.57 11.751 11.609 11.181 10.71 10.262 9.814 9.353 8.918 8.581 8.236 7.898 7.566 7.231 6.926 6.642 6.363 6.073 5.809 5.593 5.385 5.168 4.969 4.758 4.541 4.366 4.174 3.983 3.792 3.571 3.416 3.263 3.021 2.837 2.648 2.552 2.348 2.14 1.932 1.834 1.605 1.489 1.348 1.204 0.89 0.702 0.514 0.319 0.087 -0.152 -0.472 -1.173 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 6e3a4790..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3130 ,TETRA ,17608671,Sun Nov 28 22:11:37 CET,Mon Nov 29 00:16:14 CET,0.0 0.684 1.048 1.362 1.614 1.85 2.074 2.269 2.633 2.796 2.954 2.992 3.4 3.547 3.832 4.084 4.313 4.421 4.636 4.848 5.131 5.305 5.469 5.708 5.937 6.153 6.362 6.569 6.844 7.096 7.322 7.592 7.859 8.095 8.346 8.633 8.918 9.23 9.543 9.842 10.124 10.408 10.727 11.019 11.313 11.564 11.797 12.009 12.081 11.843 11.031 9.797 8.629 7.555 6.575 5.644 4.806 4.035 3.368 2.705 2.116 1.574 1.06 0.542 0.046 -0.386 -0.828 -1.232 -1.586 -1.954 -2.353 -2.691 -3.041 -3.403 -3.681 -3.98 -4.304 -4.638 -4.981 -5.212 -5.456 -5.861 -6.136 -6.417 -6.555 -6.833 -7.133 -7.45 -7.623 -8.09 -8.227 -8.431 -8.647 -9.115 -9.375 -9.658 -9.963 -10.301 -10.684 -11.199 -12.327 -2 ,6553 ,TETRA ,17608672,Sun Nov 28 22:11:38 CET,Mon Nov 29 00:16:21 CET,0.0 0.563 0.931 1.218 1.472 1.695 1.896 2.08 2.422 2.599 2.77 2.813 3.204 3.331 3.579 3.831 4.082 4.206 4.44 4.651 4.953 5.133 5.302 5.547 5.78 5.998 6.2 6.392 6.64 6.871 7.09 7.349 7.597 7.838 8.112 8.401 8.665 8.945 9.225 9.504 9.776 10.076 10.436 10.766 11.095 11.44 11.723 11.904 12.024 11.875 11.091 9.772 8.568 7.456 6.452 5.55 4.689 3.867 3.137 2.393 1.75 1.162 0.6 0.062 -0.435 -0.876 -1.351 -1.799 -2.19 -2.605 -3.046 -3.406 -3.77 -4.151 -4.447 -4.748 -5.066 -5.397 -5.74 -5.986 -6.246 -6.638 -6.917 -7.211 -7.362 -7.688 -8.03 -8.377 -8.558 -9.027 -9.149 -9.358 -9.582 -10.09 -10.364 -10.659 -10.988 -11.356 -11.792 -12.298 -13.613 -3 ,12407 ,TETRA ,17608673,Sun Nov 28 22:11:38 CET,Mon Nov 29 00:15:22 CET,0.0 0.504 0.865 1.147 1.399 1.617 1.812 1.989 2.33 2.494 2.648 2.676 3.084 3.231 3.498 3.743 3.964 4.073 4.287 4.483 4.759 4.93 5.094 5.339 5.566 5.774 5.976 6.173 6.427 6.669 6.898 7.161 7.405 7.633 7.896 8.189 8.457 8.728 8.997 9.27 9.549 9.858 10.195 10.485 10.769 11.057 11.289 11.414 11.421 11.21 10.482 9.228 7.992 6.848 5.819 4.871 4.017 3.224 2.56 1.904 1.286 0.722 0.185 -0.347 -0.838 -1.269 -1.732 -2.174 -2.565 -2.977 -3.403 -3.753 -4.116 -4.499 -4.795 -5.101 -5.429 -5.763 -6.129 -6.393 -6.663 -7.076 -7.363 -7.676 -7.828 -8.132 -8.459 -8.815 -8.994 -9.446 -9.582 -9.797 -10.021 -10.485 -10.746 -11.022 -11.292 -11.597 -11.957 -12.435 -13.536 -4 ,14619 ,TETRA ,17608674,Sun Nov 28 22:12:07 CET,Mon Nov 29 00:15:35 CET,0.0 0.576 0.93 1.203 1.463 1.696 1.903 2.093 2.429 2.587 2.745 2.774 3.172 3.298 3.535 3.757 3.973 4.078 4.278 4.469 4.743 4.921 5.094 5.347 5.582 5.791 5.997 6.196 6.446 6.692 6.925 7.201 7.464 7.706 7.959 8.242 8.518 8.804 9.107 9.422 9.708 10.011 10.349 10.647 10.949 11.22 11.491 11.709 11.767 11.553 10.795 9.59 8.414 7.256 6.21 5.263 4.39 3.58 2.875 2.159 1.525 0.961 0.417 -0.111 -0.613 -1.083 -1.558 -1.966 -2.327 -2.718 -3.13 -3.465 -3.822 -4.203 -4.488 -4.775 -5.085 -5.417 -5.763 -6.005 -6.253 -6.637 -6.902 -7.18 -7.327 -7.624 -7.954 -8.317 -8.5 -8.946 -9.058 -9.257 -9.457 -9.894 -10.135 -10.421 -10.744 -11.105 -11.556 -12.135 -13.47 -5 ,21517 ,TETRA ,17608675,Sun Nov 28 22:11:38 CET,Mon Nov 29 00:18:59 CET,0.0 0.594 0.968 1.247 1.498 1.753 1.976 2.174 2.534 2.692 2.845 2.871 3.278 3.414 3.665 3.909 4.145 4.255 4.466 4.669 4.951 5.135 5.311 5.553 5.78 6.004 6.223 6.423 6.669 6.896 7.117 7.383 7.634 7.866 8.132 8.424 8.68 8.945 9.221 9.503 9.778 10.09 10.424 10.693 10.955 11.208 11.45 11.613 11.646 11.46 10.773 9.657 8.58 7.509 6.492 5.573 4.769 4.006 3.32 2.614 1.996 1.435 0.901 0.402 -0.063 -0.488 -0.942 -1.358 -1.711 -2.095 -2.513 -2.851 -3.195 -3.557 -3.85 -4.148 -4.451 -4.784 -5.146 -5.389 -5.634 -6.018 -6.279 -6.549 -6.696 -7.004 -7.317 -7.645 -7.832 -8.295 -8.416 -8.634 -8.857 -9.355 -9.648 -9.954 -10.258 -10.629 -11.081 -11.603 -13.031 -6 ,10143 ,TETRA ,17608676,Sun Nov 28 22:11:38 CET,Mon Nov 29 00:17:25 CET,0.0 0.744 1.133 1.416 1.669 1.901 2.109 2.292 2.644 2.818 2.978 3.012 3.416 3.543 3.78 4.009 4.236 4.346 4.563 4.772 5.063 5.243 5.42 5.669 5.899 6.124 6.341 6.541 6.79 7.031 7.26 7.522 7.77 8.007 8.275 8.565 8.836 9.12 9.417 9.74 10.053 10.372 10.703 10.998 11.312 11.605 11.859 12.046 12.132 11.988 11.259 10.012 8.891 7.82 6.789 5.814 4.929 4.105 3.375 2.637 2.006 1.433 0.876 0.356 -0.144 -0.596 -1.052 -1.468 -1.833 -2.227 -2.648 -2.998 -3.371 -3.772 -4.083 -4.384 -4.692 -5.022 -5.374 -5.621 -5.865 -6.235 -6.506 -6.79 -6.932 -7.23 -7.559 -7.904 -8.074 -8.532 -8.668 -8.888 -9.112 -9.573 -9.827 -10.091 -10.375 -10.72 -11.135 -11.645 -12.955 -7 ,26977 ,TETRA ,17608677,Sun Nov 28 22:11:42 CET,Mon Nov 29 00:16:33 CET,0.0 0.56 0.907 1.201 1.47 1.719 1.944 2.139 2.493 2.652 2.809 2.838 3.236 3.379 3.653 3.896 4.122 4.231 4.45 4.656 4.935 5.107 5.278 5.524 5.75 5.965 6.174 6.373 6.623 6.868 7.101 7.37 7.616 7.853 8.12 8.394 8.647 8.916 9.193 9.484 9.763 10.04 10.344 10.619 10.908 11.167 11.385 11.522 11.508 11.253 10.486 9.261 8.054 6.947 5.981 5.061 4.217 3.432 2.727 2.021 1.398 0.837 0.29 -0.23 -0.702 -1.146 -1.628 -2.072 -2.452 -2.837 -3.256 -3.61 -3.969 -4.334 -4.611 -4.908 -5.227 -5.555 -5.891 -6.117 -6.354 -6.744 -7.02 -7.308 -7.459 -7.766 -8.073 -8.385 -8.548 -8.995 -9.126 -9.336 -9.548 -10.013 -10.289 -10.61 -10.937 -11.274 -11.662 -12.19 -13.518 -8 ,32120 ,TETRA ,17608678,Sun Nov 28 22:11:39 CET,Mon Nov 29 00:16:20 CET,0.0 0.823 1.223 1.527 1.782 2.007 2.205 2.392 2.752 2.921 3.093 3.148 3.551 3.688 3.942 4.177 4.411 4.525 4.738 4.941 5.222 5.395 5.565 5.814 6.048 6.271 6.492 6.69 6.937 7.188 7.427 7.705 7.958 8.186 8.447 8.729 8.983 9.259 9.544 9.821 10.092 10.38 10.7 10.995 11.267 11.522 11.776 11.92 11.899 11.621 10.821 9.558 8.314 7.133 6.112 5.169 4.333 3.564 2.882 2.193 1.593 1.047 0.52 0.022 -0.461 -0.916 -1.378 -1.788 -2.151 -2.527 -2.915 -3.245 -3.587 -3.95 -4.254 -4.571 -4.909 -5.261 -5.604 -5.842 -6.102 -6.518 -6.801 -7.091 -7.241 -7.558 -7.892 -8.247 -8.435 -8.907 -9.033 -9.245 -9.475 -9.966 -10.238 -10.541 -10.862 -11.226 -11.638 -12.185 -13.557 -9 ,8935 ,TETRA ,17608679,Sun Nov 28 22:11:39 CET,Mon Nov 29 00:17:26 CET,0.0 0.457 0.81 1.1 1.354 1.573 1.769 1.962 2.326 2.498 2.662 2.69 3.092 3.228 3.48 3.721 3.947 4.059 4.278 4.478 4.752 4.923 5.088 5.32 5.543 5.766 5.981 6.188 6.451 6.694 6.921 7.186 7.426 7.655 7.922 8.21 8.479 8.768 9.059 9.356 9.654 9.966 10.282 10.55 10.838 11.109 11.309 11.422 11.456 11.258 10.49 9.174 7.92 6.798 5.754 4.761 3.897 3.13 2.461 1.755 1.126 0.571 0.04 -0.499 -1.033 -1.517 -2.016 -2.469 -2.865 -3.286 -3.74 -4.119 -4.506 -4.903 -5.206 -5.508 -5.82 -6.148 -6.503 -6.752 -7.008 -7.41 -7.689 -7.976 -8.122 -8.426 -8.743 -9.066 -9.238 -9.693 -9.798 -10.0 -10.221 -10.689 -10.94 -11.209 -11.494 -11.809 -12.181 -12.636 -13.882 -10 ,632 ,TETRA ,17608680,Sun Nov 28 22:11:39 CET,Mon Nov 29 00:12:51 CET,0.0 0.531 0.874 1.165 1.436 1.663 1.864 2.054 2.404 2.55 2.695 2.714 3.112 3.248 3.515 3.764 3.993 4.102 4.303 4.487 4.749 4.918 5.087 5.337 5.571 5.786 5.992 6.191 6.448 6.699 6.925 7.187 7.444 7.682 7.949 8.236 8.501 8.796 9.106 9.428 9.735 10.054 10.401 10.711 11.042 11.353 11.597 11.776 11.877 11.71 10.962 9.673 8.431 7.314 6.274 5.302 4.448 3.673 2.995 2.269 1.613 1.022 0.454 -0.072 -0.565 -1.024 -1.514 -1.942 -2.315 -2.728 -3.166 -3.534 -3.922 -4.321 -4.613 -4.898 -5.201 -5.526 -5.863 -6.092 -6.328 -6.703 -6.97 -7.258 -7.41 -7.725 -8.039 -8.364 -8.536 -8.993 -9.151 -9.367 -9.591 -10.085 -10.361 -10.642 -10.93 -11.278 -11.708 -12.316 -13.688 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index fc72269a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11672 ,TETRA ,17608681,Sun Nov 28 22:11:39 CET,Mon Nov 29 00:16:59 CET,0.0 1.029 1.43 1.723 1.968 2.194 2.405 2.603 2.945 3.096 3.242 3.249 3.648 3.778 4.01 4.232 4.452 4.555 4.747 4.934 5.2 5.359 5.513 5.734 5.935 6.125 6.304 6.475 6.699 6.909 7.102 7.333 7.549 7.747 7.966 8.202 8.406 8.595 8.783 8.97 9.141 9.276 9.409 9.517 9.564 9.549 9.455 9.2 8.622 7.517 5.454 2.929 0.827 -1.014 -2.607 -4.03 -5.225 -6.266 -7.165 -8.101 -8.93 -9.642 -10.323 -10.977 -11.586 -12.134 -12.705 -13.22 -13.67 -14.126 -14.587 -14.979 -15.389 -15.809 -16.132 -16.47 -16.825 -17.202 -17.599 -17.865 -18.128 -18.541 -18.839 -19.151 -19.311 -19.647 -20.016 -20.403 -20.595 -21.087 -21.186 -21.399 -21.638 -22.147 -22.408 -22.686 -22.993 -23.35 -23.747 -24.236 -25.41 -2 ,25902 ,TETRA ,17608682,Sun Nov 28 22:11:42 CET,Mon Nov 29 00:16:47 CET,0.0 0.755 1.149 1.465 1.744 1.981 2.202 2.399 2.764 2.939 3.093 3.111 3.515 3.643 3.887 4.121 4.351 4.457 4.657 4.857 5.142 5.32 5.486 5.721 5.939 6.145 6.34 6.517 6.731 6.936 7.131 7.348 7.551 7.745 7.952 8.164 8.358 8.559 8.765 8.956 9.133 9.308 9.453 9.539 9.581 9.539 9.382 9.067 8.473 7.373 5.285 2.733 0.6 -1.232 -2.828 -4.252 -5.493 -6.624 -7.62 -8.646 -9.495 -10.222 -10.919 -11.569 -12.172 -12.732 -13.326 -13.855 -14.309 -14.787 -15.283 -15.69 -16.119 -16.56 -16.901 -17.25 -17.614 -18.008 -18.416 -18.688 -18.959 -19.383 -19.678 -19.997 -20.163 -20.511 -20.885 -21.262 -21.457 -21.956 -22.082 -22.306 -22.533 -23.006 -23.267 -23.554 -23.871 -24.221 -24.629 -25.133 -26.322 -3 ,16131 ,TETRA ,17608683,Sun Nov 28 22:11:39 CET,Mon Nov 29 00:17:48 CET,0.0 0.972 1.429 1.776 2.07 2.317 2.553 2.76 3.092 3.249 3.407 3.435 3.819 3.939 4.18 4.412 4.63 4.733 4.927 5.105 5.355 5.522 5.676 5.892 6.094 6.281 6.465 6.636 6.843 7.056 7.258 7.462 7.653 7.839 8.044 8.248 8.422 8.599 8.77 8.942 9.104 9.262 9.395 9.489 9.548 9.539 9.418 9.11 8.508 7.387 5.321 2.757 0.625 -1.183 -2.75 -4.149 -5.38 -6.481 -7.426 -8.378 -9.204 -9.935 -10.613 -11.25 -11.844 -12.387 -12.96 -13.473 -13.925 -14.393 -14.865 -15.253 -15.655 -16.084 -16.418 -16.764 -17.127 -17.487 -17.859 -18.114 -18.368 -18.779 -19.075 -19.389 -19.553 -19.878 -20.222 -20.598 -20.792 -21.28 -21.39 -21.61 -21.848 -22.336 -22.614 -22.921 -23.262 -23.651 -24.101 -24.667 -25.764 -4 ,28976 ,TETRA ,17608684,Sun Nov 28 22:11:39 CET,Mon Nov 29 00:16:25 CET,0.0 0.672 1.054 1.368 1.63 1.87 2.086 2.29 2.65 2.805 2.96 2.987 3.383 3.51 3.761 3.988 4.199 4.305 4.503 4.681 4.944 5.11 5.27 5.505 5.717 5.904 6.077 6.241 6.452 6.658 6.848 7.057 7.242 7.417 7.612 7.821 8.005 8.185 8.359 8.522 8.674 8.8 8.926 9.025 9.069 9.041 8.871 8.506 7.877 6.759 4.691 2.067 -0.165 -2.073 -3.687 -5.109 -6.368 -7.497 -8.471 -9.467 -10.295 -11.026 -11.73 -12.395 -12.995 -13.504 -14.059 -14.59 -15.051 -15.513 -15.976 -16.384 -16.828 -17.279 -17.628 -17.98 -18.329 -18.685 -19.066 -19.334 -19.617 -20.061 -20.353 -20.658 -20.821 -21.141 -21.467 -21.824 -22.012 -22.496 -22.614 -22.822 -23.038 -23.508 -23.762 -24.035 -24.33 -24.649 -25.058 -25.544 -26.374 -5 ,15541 ,TETRA ,17608685,Sun Nov 28 22:11:41 CET,Mon Nov 29 00:16:23 CET,0.0 0.903 1.402 1.757 2.03 2.281 2.519 2.739 3.126 3.305 3.472 3.502 3.907 4.044 4.294 4.521 4.734 4.835 5.038 5.234 5.514 5.689 5.849 6.076 6.293 6.493 6.679 6.854 7.068 7.273 7.464 7.692 7.895 8.086 8.312 8.538 8.737 8.939 9.132 9.315 9.483 9.643 9.774 9.855 9.922 9.925 9.814 9.509 8.867 7.761 5.732 3.174 0.998 -0.885 -2.503 -3.911 -5.091 -6.173 -7.142 -8.103 -8.915 -9.622 -10.298 -10.953 -11.566 -12.134 -12.731 -13.254 -13.703 -14.165 -14.645 -15.041 -15.445 -15.885 -16.236 -16.589 -16.959 -17.341 -17.735 -18.008 -18.289 -18.731 -19.044 -19.378 -19.55 -19.895 -20.252 -20.63 -20.838 -21.352 -21.485 -21.725 -21.979 -22.482 -22.757 -23.065 -23.396 -23.75 -24.158 -24.675 -25.929 -6 ,20488 ,TETRA ,17608686,Sun Nov 28 22:11:41 CET,Mon Nov 29 00:15:24 CET,0.0 0.556 0.917 1.223 1.502 1.741 1.961 2.167 2.547 2.723 2.88 2.907 3.304 3.435 3.688 3.918 4.13 4.23 4.427 4.62 4.889 5.054 5.209 5.426 5.631 5.823 6.002 6.178 6.405 6.61 6.79 6.997 7.195 7.384 7.593 7.808 7.997 8.188 8.375 8.56 8.73 8.882 8.995 9.064 9.098 9.04 8.852 8.496 7.849 6.687 4.532 1.866 -0.313 -2.181 -3.796 -5.21 -6.435 -7.529 -8.488 -9.459 -10.303 -11.065 -11.764 -12.419 -13.042 -13.605 -14.191 -14.708 -15.152 -15.622 -16.118 -16.524 -16.935 -17.358 -17.687 -18.028 -18.384 -18.762 -19.139 -19.387 -19.649 -20.074 -20.376 -20.691 -20.855 -21.184 -21.526 -21.897 -22.088 -22.567 -22.672 -22.881 -23.1 -23.567 -23.82 -24.104 -24.409 -24.753 -25.188 -25.71 -26.559 -7 ,19701 ,TETRA ,17608687,Sun Nov 28 22:11:41 CET,Mon Nov 29 00:15:46 CET,0.0 0.648 1.083 1.423 1.711 1.967 2.199 2.416 2.823 3.019 3.198 3.229 3.629 3.758 4.007 4.241 4.46 4.565 4.763 4.948 5.214 5.38 5.531 5.751 5.962 6.154 6.332 6.504 6.724 6.921 7.104 7.326 7.524 7.696 7.888 8.087 8.26 8.455 8.665 8.863 9.045 9.22 9.364 9.435 9.458 9.417 9.288 9.01 8.435 7.337 5.262 2.708 0.584 -1.231 -2.762 -4.143 -5.358 -6.446 -7.378 -8.313 -9.111 -9.826 -10.512 -11.155 -11.757 -12.31 -12.903 -13.419 -13.853 -14.315 -14.806 -15.21 -15.63 -16.069 -16.406 -16.752 -17.107 -17.47 -17.844 -18.107 -18.38 -18.803 -19.098 -19.407 -19.574 -19.921 -20.272 -20.646 -20.839 -21.325 -21.442 -21.65 -21.864 -22.349 -22.62 -22.908 -23.216 -23.588 -24.014 -24.479 -25.537 -8 ,21874 ,TETRA ,17608688,Sun Nov 28 22:11:41 CET,Mon Nov 29 00:15:30 CET,0.0 0.75 1.143 1.485 1.793 2.078 2.337 2.569 2.98 3.155 3.31 3.333 3.739 3.869 4.125 4.363 4.575 4.675 4.874 5.07 5.352 5.522 5.678 5.893 6.088 6.276 6.466 6.655 6.887 7.091 7.272 7.481 7.675 7.861 8.073 8.291 8.481 8.691 8.906 9.087 9.243 9.383 9.502 9.578 9.615 9.574 9.403 9.109 8.518 7.398 5.405 2.88 0.762 -1.035 -2.585 -3.961 -5.186 -6.279 -7.224 -8.179 -8.969 -9.68 -10.378 -11.024 -11.627 -12.184 -12.752 -13.255 -13.696 -14.161 -14.631 -15.017 -15.423 -15.831 -16.143 -16.474 -16.823 -17.19 -17.575 -17.843 -18.133 -18.578 -18.877 -19.187 -19.338 -19.642 -19.969 -20.322 -20.513 -21.008 -21.125 -21.336 -21.563 -22.075 -22.352 -22.628 -22.913 -23.218 -23.574 -24.096 -25.261 -9 ,26426 ,TETRA ,17608689,Sun Nov 28 22:11:42 CET,Mon Nov 29 00:15:46 CET,0.0 0.749 1.12 1.416 1.665 1.879 2.069 2.259 2.625 2.785 2.938 2.954 3.346 3.472 3.715 3.946 4.161 4.262 4.461 4.653 4.927 5.096 5.251 5.471 5.679 5.874 6.055 6.228 6.449 6.638 6.814 7.038 7.247 7.444 7.66 7.889 8.072 8.241 8.436 8.651 8.838 8.994 9.126 9.208 9.275 9.262 9.143 8.847 8.23 7.127 5.018 2.364 0.12 -1.797 -3.429 -4.862 -6.102 -7.235 -8.2 -9.136 -9.938 -10.652 -11.323 -11.965 -12.578 -13.146 -13.731 -14.238 -14.671 -15.125 -15.612 -16.022 -16.446 -16.885 -17.223 -17.565 -17.912 -18.275 -18.654 -18.926 -19.207 -19.65 -19.967 -20.293 -20.457 -20.787 -21.131 -21.505 -21.701 -22.198 -22.334 -22.554 -22.79 -23.311 -23.594 -23.901 -24.212 -24.53 -24.884 -25.306 -26.142 -10 ,8143 ,TETRA ,17608690,Sun Nov 28 22:11:40 CET,Mon Nov 29 00:16:04 CET,0.0 0.466 0.865 1.182 1.446 1.68 1.876 2.054 2.388 2.544 2.696 2.729 3.123 3.254 3.495 3.732 3.954 4.058 4.253 4.435 4.694 4.858 5.013 5.229 5.434 5.628 5.819 6.008 6.251 6.469 6.67 6.922 7.149 7.352 7.586 7.834 8.048 8.263 8.491 8.724 8.938 9.126 9.304 9.426 9.482 9.487 9.385 9.057 8.422 7.333 5.3 2.724 0.62 -1.157 -2.733 -4.11 -5.307 -6.424 -7.366 -8.303 -9.124 -9.853 -10.541 -11.188 -11.789 -12.332 -12.893 -13.394 -13.842 -14.326 -14.819 -15.216 -15.632 -16.06 -16.386 -16.718 -17.057 -17.401 -17.758 -18.004 -18.263 -18.671 -18.961 -19.274 -19.432 -19.747 -20.069 -20.412 -20.593 -21.067 -21.166 -21.381 -21.623 -22.143 -22.428 -22.732 -23.077 -23.448 -23.824 -24.28 -25.172 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 5b379dc3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16244 ,TETRA ,17608691,Sun Nov 28 22:11:40 CET,Mon Nov 29 00:14:33 CET,0.0 0.525 0.854 1.14 1.39 1.596 1.793 1.977 2.316 2.478 2.638 2.676 3.068 3.202 3.458 3.703 3.931 4.038 4.244 4.445 4.732 4.905 5.076 5.316 5.532 5.736 5.931 6.119 6.357 6.58 6.787 7.029 7.257 7.475 7.742 8.041 8.295 8.555 8.827 9.095 9.356 9.614 9.873 10.092 10.257 10.337 10.364 10.253 9.907 9.22 7.733 5.654 3.837 2.306 0.964 -0.279 -1.386 -2.372 -3.213 -4.105 -4.911 -5.626 -6.303 -6.936 -7.536 -8.121 -8.721 -9.254 -9.736 -10.216 -10.694 -11.088 -11.523 -11.985 -12.323 -12.672 -13.038 -13.426 -13.828 -14.105 -14.386 -14.813 -15.114 -15.455 -15.647 -16.035 -16.414 -16.812 -17.023 -17.505 -17.666 -17.905 -18.173 -18.765 -19.094 -19.449 -19.788 -20.192 -20.719 -21.453 -23.04 -2 ,27490 ,TETRA ,17608692,Sun Nov 28 22:12:07 CET,Mon Nov 29 00:14:48 CET,0.0 0.76 1.18 1.479 1.743 1.972 2.179 2.385 2.758 2.92 3.067 3.086 3.476 3.603 3.843 4.076 4.294 4.396 4.597 4.796 5.08 5.257 5.427 5.664 5.879 6.089 6.297 6.49 6.734 6.958 7.164 7.416 7.647 7.862 8.108 8.384 8.642 8.9 9.166 9.435 9.696 9.944 10.196 10.411 10.596 10.75 10.813 10.72 10.415 9.719 8.279 6.312 4.575 3.048 1.724 0.505 -0.597 -1.602 -2.488 -3.384 -4.15 -4.83 -5.491 -6.108 -6.69 -7.223 -7.758 -8.254 -8.703 -9.159 -9.616 -9.994 -10.394 -10.819 -11.145 -11.467 -11.822 -12.221 -12.633 -12.908 -13.183 -13.639 -13.971 -14.301 -14.467 -14.817 -15.187 -15.592 -15.805 -16.275 -16.402 -16.611 -16.833 -17.356 -17.677 -18.039 -18.427 -18.86 -19.376 -20.049 -21.997 -3 ,30469 ,TETRA ,17608693,Sun Nov 28 22:13:08 CET,Mon Nov 29 00:17:38 CET,0.0 0.566 0.936 1.26 1.541 1.785 2.023 2.227 2.561 2.706 2.842 2.869 3.258 3.387 3.636 3.862 4.071 4.171 4.362 4.549 4.82 4.989 5.147 5.366 5.588 5.806 5.995 6.168 6.379 6.577 6.767 6.988 7.194 7.382 7.584 7.817 8.022 8.215 8.424 8.626 8.815 9.024 9.242 9.394 9.533 9.619 9.562 9.348 8.926 8.197 6.766 4.788 3.038 1.461 0.019 -1.287 -2.437 -3.483 -4.392 -5.293 -6.045 -6.689 -7.315 -7.936 -8.517 -9.061 -9.639 -10.156 -10.605 -11.084 -11.597 -12.021 -12.457 -12.898 -13.227 -13.561 -13.905 -14.282 -14.704 -15.019 -15.332 -15.786 -16.095 -16.414 -16.579 -16.907 -17.279 -17.688 -17.904 -18.416 -18.642 -18.911 -19.194 -19.821 -20.189 -20.578 -20.993 -21.48 -22.035 -22.708 -24.958 -4 ,28615 ,TETRA ,17608694,Sun Nov 28 22:12:08 CET,Mon Nov 29 00:16:28 CET,0.0 0.546 0.881 1.186 1.455 1.672 1.869 2.055 2.391 2.556 2.711 2.711 3.093 3.214 3.443 3.656 3.845 3.937 4.112 4.276 4.52 4.676 4.826 5.047 5.25 5.438 5.618 5.796 6.023 6.235 6.431 6.662 6.882 7.09 7.322 7.565 7.789 8.02 8.254 8.461 8.642 8.834 9.051 9.252 9.422 9.537 9.551 9.424 9.118 8.451 6.989 4.958 3.143 1.49 0.066 -1.197 -2.312 -3.329 -4.242 -5.172 -5.963 -6.671 -7.358 -8.016 -8.633 -9.193 -9.761 -10.27 -10.751 -11.277 -11.824 -12.28 -12.733 -13.182 -13.534 -13.913 -14.321 -14.748 -15.184 -15.479 -15.785 -16.272 -16.609 -16.967 -17.152 -17.526 -17.916 -18.322 -18.546 -19.05 -19.247 -19.508 -19.773 -20.339 -20.65 -20.963 -21.35 -21.843 -22.39 -23.042 -24.791 -5 ,15246 ,TETRA ,17608695,Sun Nov 28 22:12:08 CET,Mon Nov 29 00:18:40 CET,0.0 0.526 0.864 1.155 1.406 1.616 1.796 1.972 2.289 2.439 2.586 2.598 2.981 3.107 3.344 3.561 3.769 3.867 4.054 4.232 4.484 4.64 4.79 5.005 5.209 5.4 5.569 5.739 5.953 6.15 6.343 6.565 6.77 6.967 7.184 7.406 7.611 7.833 8.047 8.267 8.497 8.73 8.951 9.091 9.19 9.239 9.196 9.027 8.659 7.92 6.44 4.433 2.606 0.984 -0.412 -1.628 -2.738 -3.789 -4.692 -5.578 -6.306 -6.959 -7.627 -8.268 -8.862 -9.415 -10.009 -10.527 -10.971 -11.454 -11.967 -12.394 -12.829 -13.266 -13.621 -14.0 -14.389 -14.806 -15.246 -15.547 -15.848 -16.31 -16.658 -17.042 -17.23 -17.619 -18.042 -18.451 -18.647 -19.121 -19.306 -19.539 -19.792 -20.378 -20.692 -21.017 -21.359 -21.761 -22.213 -22.796 -24.318 -6 ,9948 ,TETRA ,17608696,Sun Nov 28 22:12:08 CET,Mon Nov 29 00:15:36 CET,0.0 0.647 0.996 1.286 1.546 1.768 1.961 2.141 2.476 2.63 2.777 2.807 3.19 3.313 3.555 3.784 3.999 4.102 4.303 4.485 4.74 4.91 5.071 5.305 5.521 5.716 5.906 6.088 6.313 6.529 6.73 6.961 7.18 7.379 7.608 7.869 8.09 8.307 8.518 8.718 8.933 9.139 9.341 9.529 9.683 9.772 9.785 9.637 9.255 8.525 7.008 4.935 3.036 1.387 0.053 -1.113 -2.176 -3.179 -4.032 -4.866 -5.585 -6.251 -6.894 -7.516 -8.116 -8.661 -9.227 -9.743 -10.204 -10.681 -11.159 -11.553 -11.993 -12.446 -12.786 -13.142 -13.501 -13.869 -14.263 -14.538 -14.822 -15.278 -15.602 -15.928 -16.103 -16.462 -16.806 -17.18 -17.396 -17.905 -18.116 -18.393 -18.695 -19.271 -19.576 -19.892 -20.217 -20.625 -21.119 -21.75 -23.141 -7 ,6166 ,TETRA ,17608697,Sun Nov 28 22:12:08 CET,Mon Nov 29 00:16:19 CET,0.0 0.503 0.829 1.102 1.335 1.547 1.742 1.927 2.256 2.407 2.545 2.554 2.925 3.048 3.286 3.5 3.698 3.798 3.998 4.18 4.425 4.581 4.741 4.972 5.192 5.398 5.591 5.779 6.019 6.241 6.445 6.69 6.913 7.12 7.362 7.621 7.851 8.101 8.365 8.611 8.845 9.089 9.343 9.565 9.761 9.91 9.962 9.88 9.608 8.948 7.477 5.4 3.638 2.159 0.85 -0.351 -1.412 -2.412 -3.307 -4.211 -4.963 -5.62 -6.27 -6.878 -7.453 -8.018 -8.616 -9.13 -9.579 -10.04 -10.516 -10.924 -11.343 -11.775 -12.129 -12.493 -12.868 -13.292 -13.718 -13.996 -14.285 -14.721 -15.016 -15.323 -15.49 -15.842 -16.22 -16.636 -16.845 -17.335 -17.559 -17.836 -18.123 -18.753 -19.119 -19.527 -19.93 -20.322 -20.783 -21.401 -22.807 -8 ,32091 ,TETRA ,17608698,Sun Nov 28 22:13:10 CET,Mon Nov 29 00:16:08 CET,0.0 0.6 0.916 1.169 1.41 1.638 1.843 2.03 2.347 2.493 2.64 2.673 3.056 3.179 3.417 3.648 3.857 3.959 4.161 4.359 4.638 4.803 4.964 5.204 5.425 5.625 5.816 6.003 6.24 6.47 6.689 6.938 7.16 7.373 7.625 7.878 8.104 8.354 8.632 8.895 9.11 9.318 9.525 9.708 9.881 9.996 10.024 9.902 9.544 8.806 7.244 5.122 3.35 1.855 0.49 -0.793 -1.911 -2.927 -3.789 -4.641 -5.376 -6.054 -6.763 -7.422 -8.009 -8.542 -9.092 -9.587 -10.025 -10.473 -10.937 -11.327 -11.744 -12.2 -12.554 -12.917 -13.315 -13.75 -14.181 -14.468 -14.766 -15.247 -15.579 -15.909 -16.075 -16.441 -16.84 -17.24 -17.444 -17.928 -18.102 -18.344 -18.606 -19.144 -19.44 -19.782 -20.16 -20.582 -21.071 -21.684 -22.901 -9 ,27707 ,TETRA ,17608699,Sun Nov 28 22:12:08 CET,Mon Nov 29 00:13:30 CET,0.0 0.637 0.962 1.235 1.489 1.719 1.922 2.115 2.466 2.632 2.79 2.824 3.215 3.338 3.578 3.819 4.04 4.14 4.332 4.519 4.798 4.973 5.135 5.374 5.602 5.81 6.005 6.192 6.432 6.657 6.866 7.105 7.327 7.537 7.763 8.0 8.222 8.461 8.692 8.909 9.125 9.338 9.544 9.723 9.874 9.965 9.993 9.879 9.536 8.818 7.376 5.404 3.671 2.159 0.841 -0.367 -1.493 -2.547 -3.418 -4.292 -5.075 -5.778 -6.452 -7.095 -7.706 -8.247 -8.787 -9.274 -9.719 -10.197 -10.685 -11.082 -11.493 -11.927 -12.279 -12.65 -13.044 -13.479 -13.928 -14.237 -14.563 -15.071 -15.413 -15.762 -15.943 -16.309 -16.691 -17.092 -17.3 -17.797 -17.99 -18.249 -18.539 -19.121 -19.404 -19.724 -20.071 -20.433 -20.868 -21.475 -23.036 -10 ,3980 ,TETRA ,17608700,Sun Nov 28 22:12:08 CET,Mon Nov 29 00:14:33 CET,0.0 0.804 1.166 1.451 1.68 1.908 2.126 2.314 2.645 2.796 2.945 2.965 3.351 3.48 3.729 3.966 4.194 4.302 4.51 4.703 4.963 5.128 5.29 5.524 5.745 5.947 6.134 6.309 6.525 6.727 6.916 7.136 7.341 7.539 7.76 7.987 8.208 8.451 8.688 8.908 9.097 9.277 9.491 9.694 9.869 9.967 9.964 9.856 9.563 8.909 7.563 5.664 3.881 2.242 0.773 -0.532 -1.67 -2.693 -3.568 -4.47 -5.265 -6.014 -6.763 -7.425 -8.026 -8.592 -9.193 -9.716 -10.153 -10.621 -11.111 -11.509 -11.935 -12.398 -12.756 -13.127 -13.503 -13.89 -14.289 -14.566 -14.864 -15.33 -15.661 -16.034 -16.225 -16.581 -16.943 -17.333 -17.545 -18.038 -18.27 -18.536 -18.782 -19.296 -19.585 -19.914 -20.279 -20.661 -21.132 -21.763 -23.067 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index 769fd55e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29693 ,TETRA ,17608702,Sun Nov 28 22:12:10 CET,Mon Nov 29 00:15:37 CET,0.0 0.51 0.817 1.077 1.325 1.54 1.737 1.923 2.242 2.388 2.534 2.566 2.959 3.086 3.317 3.527 3.717 3.808 3.998 4.177 4.415 4.567 4.712 4.913 5.105 5.281 5.449 5.609 5.801 5.967 6.12 6.316 6.508 6.672 6.844 7.025 7.179 7.328 7.465 7.569 7.652 7.719 7.732 7.705 7.599 7.374 7.032 6.485 5.585 4.055 1.296 -1.965 -4.638 -6.922 -8.882 -10.597 -12.059 -13.373 -14.514 -15.65 -16.625 -17.477 -18.286 -19.066 -19.797 -20.456 -21.119 -21.704 -22.2 -22.711 -23.245 -23.683 -24.154 -24.659 -25.043 -25.445 -25.858 -26.272 -26.692 -26.975 -27.273 -27.744 -28.067 -28.402 -28.58 -28.953 -29.355 -29.781 -29.996 -30.512 -30.714 -30.979 -31.241 -31.775 -32.08 -32.424 -32.787 -33.217 -33.708 -34.299 -36.009 -2 ,1173 ,TETRA ,17608703,Sun Nov 28 22:12:08 CET,Mon Nov 29 00:14:32 CET,0.0 0.573 0.898 1.177 1.433 1.665 1.883 2.076 2.409 2.564 2.701 2.7 3.077 3.194 3.417 3.621 3.81 3.902 4.083 4.25 4.488 4.646 4.793 4.996 5.186 5.353 5.508 5.655 5.831 5.994 6.149 6.327 6.487 6.629 6.789 6.95 7.095 7.244 7.378 7.493 7.587 7.665 7.7 7.67 7.541 7.3 6.919 6.342 5.379 3.762 0.955 -2.416 -5.136 -7.41 -9.375 -11.149 -12.651 -13.976 -15.126 -16.272 -17.236 -18.111 -18.949 -19.734 -20.461 -21.136 -21.876 -22.506 -23.026 -23.586 -24.191 -24.701 -25.235 -25.766 -26.169 -26.601 -27.049 -27.521 -28.005 -28.336 -28.67 -29.189 -29.572 -29.975 -30.175 -30.58 -31.011 -31.47 -31.714 -32.262 -32.497 -32.765 -33.045 -33.691 -34.042 -34.388 -34.754 -35.209 -35.745 -36.358 -37.643 -3 ,2935 ,TETRA ,17608704,Sun Nov 28 22:12:08 CET,Mon Nov 29 00:12:58 CET,0.0 0.614 0.983 1.285 1.544 1.793 2.037 2.247 2.594 2.747 2.883 2.877 3.245 3.356 3.568 3.774 3.972 4.069 4.255 4.423 4.655 4.798 4.937 5.131 5.302 5.458 5.603 5.741 5.921 6.094 6.242 6.407 6.565 6.707 6.87 7.033 7.159 7.286 7.401 7.504 7.585 7.635 7.665 7.649 7.54 7.333 7.002 6.437 5.474 3.946 1.302 -1.944 -4.599 -6.839 -8.749 -10.421 -11.827 -13.045 -14.104 -15.202 -16.143 -16.958 -17.725 -18.435 -19.106 -19.731 -20.376 -20.947 -21.45 -21.969 -22.5 -22.936 -23.394 -23.882 -24.252 -24.621 -25.003 -25.404 -25.824 -26.116 -26.419 -26.891 -27.227 -27.578 -27.764 -28.157 -28.57 -28.993 -29.213 -29.736 -29.929 -30.201 -30.469 -31.051 -31.374 -31.705 -32.079 -32.529 -33.033 -33.675 -34.891 -4 ,3362 ,TETRA ,17608705,Sun Nov 28 22:12:08 CET,Mon Nov 29 00:15:05 CET,0.0 0.634 0.997 1.307 1.573 1.797 1.999 2.182 2.506 2.659 2.806 2.825 3.203 3.319 3.539 3.751 3.95 4.045 4.229 4.394 4.623 4.773 4.911 5.095 5.268 5.428 5.578 5.723 5.893 6.059 6.214 6.387 6.545 6.684 6.838 7.005 7.156 7.307 7.435 7.535 7.611 7.672 7.703 7.681 7.584 7.352 6.954 6.359 5.367 3.742 0.974 -2.383 -5.145 -7.486 -9.467 -11.168 -12.652 -14.024 -15.207 -16.368 -17.36 -18.241 -19.066 -19.834 -20.547 -21.207 -21.904 -22.523 -23.065 -23.615 -24.177 -24.648 -25.144 -25.66 -26.062 -26.486 -26.924 -27.372 -27.832 -28.142 -28.46 -28.956 -29.299 -29.682 -29.894 -30.322 -30.764 -31.217 -31.447 -31.976 -32.175 -32.431 -32.705 -33.318 -33.644 -33.968 -34.341 -34.763 -35.234 -35.801 -37.272 -5 ,30853 ,TETRA ,17608706,Sun Nov 28 22:12:11 CET,Mon Nov 29 00:15:23 CET,0.0 0.485 0.835 1.124 1.375 1.602 1.793 1.978 2.343 2.499 2.646 2.664 3.047 3.176 3.429 3.656 3.868 3.964 4.148 4.325 4.571 4.722 4.866 5.072 5.271 5.463 5.643 5.814 6.021 6.205 6.386 6.604 6.797 6.975 7.173 7.377 7.546 7.71 7.862 8.007 8.133 8.23 8.313 8.332 8.254 8.062 7.688 7.054 6.049 4.436 1.68 -1.717 -4.499 -6.74 -8.62 -10.327 -11.819 -13.149 -14.298 -15.443 -16.402 -17.246 -18.068 -18.844 -19.567 -20.237 -20.937 -21.561 -22.098 -22.662 -23.249 -23.74 -24.263 -24.8 -25.194 -25.598 -26.015 -26.443 -26.893 -27.203 -27.521 -28.016 -28.366 -28.733 -28.916 -29.288 -29.687 -30.117 -30.348 -30.87 -31.053 -31.306 -31.574 -32.152 -32.461 -32.766 -33.086 -33.437 -33.848 -34.404 -35.349 -6 ,31614 ,TETRA ,17608707,Sun Nov 28 22:12:08 CET,Mon Nov 29 00:20:33 CET,0.0 0.684 0.997 1.255 1.483 1.691 1.891 2.072 2.395 2.543 2.68 2.694 3.069 3.19 3.429 3.653 3.857 3.952 4.132 4.297 4.524 4.669 4.806 5.001 5.191 5.372 5.544 5.705 5.906 6.096 6.268 6.466 6.639 6.795 6.96 7.114 7.245 7.385 7.509 7.605 7.701 7.781 7.807 7.768 7.639 7.396 7.005 6.389 5.4 3.871 1.255 -1.863 -4.439 -6.662 -8.568 -10.226 -11.647 -12.946 -14.068 -15.175 -16.109 -16.94 -17.74 -18.481 -19.168 -19.797 -20.445 -21.031 -21.539 -22.072 -22.655 -23.132 -23.623 -24.144 -24.541 -24.957 -25.38 -25.818 -26.292 -26.619 -26.96 -27.492 -27.853 -28.225 -28.419 -28.813 -29.23 -29.676 -29.907 -30.428 -30.645 -30.905 -31.184 -31.777 -32.085 -32.438 -32.824 -33.247 -33.736 -34.349 -36.156 -7 ,17820 ,TETRA ,17608708,Sun Nov 28 22:12:10 CET,Mon Nov 29 00:20:12 CET,0.0 0.592 0.966 1.26 1.513 1.732 1.917 2.079 2.398 2.561 2.709 2.713 3.095 3.206 3.412 3.612 3.799 3.89 4.065 4.227 4.453 4.597 4.736 4.931 5.108 5.264 5.406 5.545 5.726 5.895 6.051 6.226 6.382 6.532 6.697 6.856 6.977 7.096 7.207 7.301 7.375 7.426 7.448 7.422 7.301 7.054 6.638 6.011 5.028 3.397 0.619 -2.689 -5.398 -7.636 -9.514 -11.193 -12.649 -13.943 -15.056 -16.193 -17.15 -17.979 -18.767 -19.513 -20.212 -20.871 -21.57 -22.18 -22.695 -23.226 -23.778 -24.234 -24.71 -25.204 -25.592 -25.993 -26.408 -26.843 -27.302 -27.611 -27.928 -28.442 -28.8 -29.16 -29.343 -29.731 -30.13 -30.559 -30.793 -31.324 -31.51 -31.76 -32.019 -32.537 -32.814 -33.148 -33.529 -33.963 -34.453 -35.005 -36.206 -8 ,17907 ,TETRA ,17608709,Sun Nov 28 22:12:09 CET,Mon Nov 29 00:17:25 CET,0.0 0.596 0.993 1.281 1.515 1.732 1.939 2.126 2.478 2.631 2.763 2.775 3.156 3.27 3.487 3.695 3.895 3.986 4.16 4.326 4.563 4.701 4.838 5.041 5.221 5.389 5.543 5.69 5.876 6.039 6.187 6.36 6.528 6.68 6.833 6.986 7.122 7.244 7.342 7.427 7.491 7.525 7.535 7.503 7.371 7.121 6.717 6.099 5.081 3.396 0.497 -2.947 -5.665 -7.964 -9.968 -11.757 -13.308 -14.669 -15.806 -16.963 -17.934 -18.786 -19.605 -20.403 -21.15 -21.816 -22.51 -23.124 -23.656 -24.203 -24.79 -25.284 -25.807 -26.356 -26.78 -27.202 -27.64 -28.131 -28.63 -28.939 -29.253 -29.794 -30.176 -30.564 -30.771 -31.21 -31.654 -32.116 -32.367 -32.925 -33.179 -33.462 -33.766 -34.439 -34.795 -35.162 -35.575 -36.09 -36.683 -37.407 -39.295 -9 ,20744 ,TETRA ,17608710,Sun Nov 28 22:12:11 CET,Mon Nov 29 00:17:25 CET,0.0 0.494 0.845 1.142 1.387 1.593 1.781 1.947 2.249 2.399 2.55 2.57 2.946 3.072 3.299 3.509 3.714 3.816 4.016 4.19 4.421 4.573 4.722 4.926 5.115 5.296 5.475 5.64 5.835 6.017 6.186 6.386 6.567 6.715 6.878 7.057 7.211 7.371 7.524 7.66 7.783 7.885 7.947 7.941 7.821 7.58 7.181 6.593 5.663 4.092 1.246 -2.222 -4.979 -7.273 -9.243 -10.982 -12.462 -13.801 -14.973 -16.172 -17.236 -18.185 -19.077 -19.867 -20.581 -21.246 -21.933 -22.559 -23.097 -23.656 -24.261 -24.75 -25.255 -25.775 -26.177 -26.604 -27.051 -27.509 -27.978 -28.307 -28.65 -29.196 -29.572 -29.951 -30.142 -30.534 -30.947 -31.382 -31.611 -32.137 -32.347 -32.611 -32.869 -33.428 -33.735 -34.068 -34.43 -34.803 -35.238 -35.897 -37.877 -10 ,6193 ,TETRA ,17608711,Sun Nov 28 22:12:10 CET,Mon Nov 29 00:03:00 CET,0.0 0.634 0.976 1.254 1.491 1.696 1.884 2.055 2.347 2.485 2.625 2.618 2.983 3.094 3.304 3.499 3.685 3.774 3.945 4.11 4.333 4.477 4.617 4.806 4.987 5.152 5.304 5.445 5.624 5.787 5.929 6.096 6.253 6.394 6.554 6.722 6.862 6.992 7.101 7.187 7.258 7.314 7.341 7.304 7.199 6.973 6.563 5.935 4.923 3.314 0.511 -2.918 -5.676 -8.015 -9.999 -11.73 -13.236 -14.577 -15.719 -16.891 -17.916 -18.791 -19.61 -20.382 -21.095 -21.761 -22.455 -23.065 -23.598 -24.155 -24.726 -25.202 -25.709 -26.241 -26.657 -27.083 -27.52 -27.967 -28.415 -28.72 -29.044 -29.564 -29.921 -30.295 -30.491 -30.889 -31.304 -31.729 -31.953 -32.462 -32.644 -32.909 -33.188 -33.777 -34.085 -34.414 -34.779 -35.182 -35.621 -36.191 -37.717 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index e0f84e2e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30176 ,TETRA ,17608712,Sun Nov 28 22:12:09 CET,Mon Nov 29 00:12:21 CET,0.0 0.663 1.063 1.348 1.606 1.823 2.031 2.226 2.571 2.731 2.883 2.913 3.305 3.435 3.676 3.894 4.089 4.179 4.359 4.538 4.791 4.951 5.101 5.312 5.513 5.708 5.892 6.06 6.266 6.456 6.634 6.845 7.041 7.225 7.432 7.639 7.828 8.047 8.272 8.473 8.661 8.855 9.023 9.155 9.266 9.311 9.277 9.099 8.676 7.837 6.164 3.836 1.742 0.012 -1.462 -2.891 -4.147 -5.263 -6.266 -7.309 -8.191 -8.954 -9.728 -10.492 -11.192 -11.832 -12.505 -13.109 -13.615 -14.136 -14.698 -15.166 -15.654 -16.155 -16.553 -16.959 -17.371 -17.811 -18.268 -18.602 -18.96 -19.542 -19.931 -20.309 -20.507 -20.906 -21.358 -21.879 -22.137 -22.681 -22.95 -23.227 -23.53 -24.212 -24.573 -24.967 -25.444 -25.981 -26.59 -27.374 -29.113 -2 ,10030 ,TETRA ,17608713,Sun Nov 28 22:12:09 CET,Sun Nov 28 23:59:35 CET,0.0 0.57 0.885 1.133 1.372 1.602 1.815 2.013 2.364 2.523 2.673 2.688 3.072 3.205 3.455 3.679 3.896 3.997 4.194 4.374 4.624 4.779 4.927 5.137 5.328 5.512 5.699 5.88 6.104 6.315 6.511 6.731 6.922 7.092 7.293 7.517 7.72 7.93 8.134 8.324 8.502 8.692 8.884 9.026 9.129 9.173 9.126 8.935 8.502 7.624 5.915 3.724 1.794 0.061 -1.448 -2.789 -3.997 -5.12 -6.083 -7.024 -7.835 -8.584 -9.331 -10.038 -10.68 -11.282 -11.931 -12.511 -13.004 -13.512 -14.042 -14.484 -14.924 -15.397 -15.781 -16.168 -16.572 -17.007 -17.461 -17.767 -18.084 -18.584 -18.948 -19.317 -19.497 -19.878 -20.28 -20.708 -20.943 -21.471 -21.701 -21.969 -22.264 -22.949 -23.355 -23.789 -24.264 -24.796 -25.36 -26.046 -27.899 -3 ,11981 ,TETRA ,17608714,Sun Nov 28 22:12:09 CET,Mon Nov 29 00:14:03 CET,0.0 0.417 0.741 0.994 1.211 1.427 1.622 1.8 2.136 2.287 2.421 2.427 2.801 2.922 3.154 3.374 3.582 3.681 3.868 4.046 4.306 4.478 4.642 4.868 5.082 5.283 5.474 5.649 5.871 6.082 6.282 6.514 6.731 6.944 7.186 7.421 7.616 7.82 8.036 8.239 8.421 8.612 8.814 8.985 9.107 9.157 9.148 9.01 8.615 7.823 6.104 3.803 1.861 0.157 -1.413 -2.854 -4.104 -5.205 -6.164 -7.133 -7.97 -8.748 -9.514 -10.226 -10.862 -11.435 -12.05 -12.608 -13.108 -13.671 -14.239 -14.709 -15.219 -15.73 -16.111 -16.494 -16.896 -17.335 -17.808 -18.144 -18.489 -19.015 -19.408 -19.828 -20.04 -20.484 -20.927 -21.41 -21.671 -22.216 -22.458 -22.735 -23.05 -23.735 -24.128 -24.586 -25.05 -25.572 -26.268 -27.188 -29.604 -4 ,27603 ,TETRA ,17608715,Sun Nov 28 22:12:12 CET,Mon Nov 29 00:13:58 CET,0.0 0.682 1.12 1.436 1.703 1.947 2.171 2.382 2.748 2.905 3.058 3.089 3.481 3.608 3.846 4.063 4.267 4.366 4.553 4.728 4.986 5.144 5.284 5.495 5.699 5.897 6.097 6.27 6.464 6.659 6.854 7.088 7.315 7.53 7.772 8.029 8.263 8.489 8.7 8.915 9.124 9.333 9.544 9.713 9.85 9.923 9.913 9.759 9.381 8.575 6.916 4.692 2.767 1.042 -0.473 -1.786 -2.972 -4.052 -4.985 -5.942 -6.767 -7.504 -8.22 -8.917 -9.61 -10.224 -10.829 -11.388 -11.873 -12.379 -12.91 -13.373 -13.882 -14.414 -14.821 -15.235 -15.656 -16.112 -16.626 -16.983 -17.344 -17.907 -18.323 -18.755 -18.961 -19.401 -19.883 -20.393 -20.64 -21.155 -21.418 -21.714 -22.025 -22.658 -22.983 -23.335 -23.743 -24.222 -24.796 -25.557 -28.1 -5 ,25703 ,TETRA ,17608716,Sun Nov 28 22:12:11 CET,Mon Nov 29 00:15:09 CET,0.0 0.558 0.934 1.214 1.441 1.664 1.871 2.061 2.398 2.547 2.692 2.705 3.078 3.192 3.426 3.641 3.838 3.935 4.121 4.294 4.532 4.683 4.837 5.052 5.254 5.45 5.631 5.791 5.985 6.172 6.359 6.577 6.77 6.948 7.145 7.355 7.544 7.737 7.936 8.133 8.306 8.473 8.649 8.782 8.89 8.943 8.878 8.694 8.317 7.53 5.935 3.679 1.62 -0.142 -1.668 -3.023 -4.174 -5.242 -6.21 -7.221 -8.106 -8.912 -9.697 -10.432 -11.102 -11.711 -12.385 -12.99 -13.495 -14.039 -14.604 -15.057 -15.531 -16.031 -16.412 -16.811 -17.24 -17.706 -18.215 -18.555 -18.89 -19.399 -19.759 -20.141 -20.34 -20.747 -21.189 -21.681 -21.932 -22.474 -22.791 -23.097 -23.414 -24.111 -24.492 -24.931 -25.415 -25.876 -26.454 -27.237 -29.26 -6 ,26512 ,TETRA ,17608717,Sun Nov 28 22:12:14 CET,Mon Nov 29 00:15:33 CET,0.0 0.513 0.855 1.135 1.397 1.629 1.829 2.021 2.4 2.561 2.703 2.736 3.128 3.255 3.497 3.726 3.941 4.04 4.235 4.429 4.699 4.869 5.031 5.258 5.472 5.669 5.856 6.035 6.259 6.465 6.651 6.873 7.101 7.305 7.521 7.769 7.992 8.22 8.444 8.662 8.87 9.083 9.318 9.516 9.678 9.779 9.835 9.742 9.397 8.673 7.088 4.899 2.949 1.231 -0.273 -1.659 -2.848 -3.916 -4.91 -5.924 -6.765 -7.515 -8.262 -8.973 -9.623 -10.23 -10.891 -11.476 -11.987 -12.528 -13.084 -13.542 -14.006 -14.488 -14.89 -15.308 -15.726 -16.173 -16.631 -16.934 -17.237 -17.734 -18.091 -18.453 -18.637 -19.021 -19.422 -19.863 -20.104 -20.63 -20.926 -21.244 -21.573 -22.262 -22.662 -23.11 -23.594 -24.122 -24.792 -25.819 -28.951 -7 ,24462 ,TETRA ,17608718,Sun Nov 28 22:12:16 CET,Mon Nov 29 00:17:30 CET,0.0 0.534 0.863 1.133 1.363 1.565 1.746 1.918 2.232 2.375 2.509 2.511 2.891 3.014 3.253 3.468 3.668 3.764 3.937 4.104 4.357 4.514 4.659 4.869 5.068 5.252 5.429 5.601 5.817 6.02 6.21 6.429 6.631 6.822 7.04 7.268 7.477 7.7 7.911 8.108 8.298 8.492 8.687 8.816 8.893 8.931 8.894 8.721 8.352 7.543 5.874 3.702 1.774 0.056 -1.451 -2.794 -3.985 -5.097 -6.096 -7.137 -8.019 -8.804 -9.544 -10.226 -10.876 -11.499 -12.173 -12.773 -13.281 -13.8 -14.34 -14.813 -15.325 -15.837 -16.22 -16.621 -17.048 -17.506 -17.98 -18.313 -18.667 -19.201 -19.579 -19.986 -20.197 -20.625 -21.045 -21.508 -21.756 -22.27 -22.496 -22.755 -23.03 -23.603 -23.921 -24.271 -24.648 -25.105 -25.65 -26.397 -28.652 -8 ,7311 ,TETRA ,17608719,Sun Nov 28 22:12:12 CET,Mon Nov 29 00:17:11 CET,0.0 0.839 1.199 1.468 1.719 1.944 2.151 2.332 2.674 2.834 2.979 2.995 3.378 3.503 3.739 3.952 4.153 4.25 4.443 4.626 4.877 5.033 5.185 5.412 5.629 5.831 6.018 6.202 6.434 6.635 6.818 7.033 7.233 7.421 7.642 7.886 8.11 8.339 8.562 8.768 8.966 9.142 9.306 9.453 9.582 9.631 9.557 9.356 8.933 8.123 6.409 4.046 2.076 0.408 -1.084 -2.479 -3.746 -4.884 -5.882 -6.899 -7.743 -8.497 -9.249 -9.976 -10.645 -11.264 -11.938 -12.528 -13.025 -13.533 -14.06 -14.521 -15.016 -15.538 -15.938 -16.372 -16.814 -17.255 -17.735 -18.054 -18.371 -18.904 -19.3 -19.71 -19.923 -20.359 -20.81 -21.305 -21.572 -22.134 -22.443 -22.738 -23.058 -23.804 -24.209 -24.647 -25.127 -25.695 -26.413 -27.416 -30.691 -9 ,7032 ,TETRA ,17608720,Sun Nov 28 22:13:09 CET,Mon Nov 29 00:16:12 CET,0.0 0.926 1.291 1.572 1.822 2.052 2.264 2.451 2.782 2.934 3.073 3.07 3.438 3.557 3.781 4.0 4.202 4.295 4.479 4.66 4.912 5.065 5.208 5.405 5.595 5.775 5.944 6.111 6.318 6.519 6.707 6.918 7.127 7.332 7.565 7.819 8.043 8.265 8.481 8.689 8.894 9.111 9.344 9.548 9.735 9.865 9.914 9.812 9.437 8.636 7.029 4.806 2.766 1.053 -0.41 -1.741 -2.907 -3.996 -4.97 -5.948 -6.825 -7.618 -8.362 -9.064 -9.726 -10.344 -10.997 -11.595 -12.095 -12.6 -13.13 -13.563 -14.01 -14.496 -14.873 -15.268 -15.679 -16.095 -16.544 -16.859 -17.195 -17.727 -18.084 -18.452 -18.65 -19.04 -19.419 -19.829 -20.04 -20.539 -20.802 -21.075 -21.352 -21.99 -22.327 -22.664 -23.077 -23.567 -24.115 -24.818 -26.171 -10 ,25116 ,TETRA ,17608721,Sun Nov 28 22:13:11 CET,Mon Nov 29 00:16:15 CET,0.0 0.659 1.001 1.292 1.549 1.775 1.971 2.152 2.484 2.637 2.783 2.798 3.185 3.307 3.532 3.748 3.956 4.057 4.251 4.431 4.683 4.843 4.995 5.219 5.429 5.623 5.807 5.986 6.226 6.446 6.645 6.874 7.088 7.28 7.486 7.717 7.952 8.202 8.447 8.674 8.888 9.118 9.347 9.513 9.657 9.768 9.754 9.603 9.188 8.329 6.759 4.645 2.713 1.012 -0.485 -1.877 -3.092 -4.198 -5.17 -6.146 -6.991 -7.748 -8.469 -9.164 -9.8 -10.359 -10.963 -11.511 -11.983 -12.474 -12.991 -13.423 -13.859 -14.326 -14.69 -15.052 -15.439 -15.854 -16.273 -16.555 -16.858 -17.347 -17.694 -18.056 -18.24 -18.615 -19.013 -19.439 -19.667 -20.171 -20.404 -20.671 -20.942 -21.524 -21.848 -22.195 -22.571 -23.0 -23.529 -24.32 -26.541 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt deleted file mode 100644 index 6dff74df..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7380 ,KEBNE ,17027381,Wed Dec 22 16:57:31 CET,Wed Dec 22 18:42:35 CET,0.0 0.705 1.067 1.359 1.631 1.886 2.124 2.35 2.761 2.945 3.114 3.178 3.586 3.735 4.024 4.295 4.548 4.673 4.913 5.138 5.463 5.673 5.882 6.182 6.466 6.736 6.989 7.233 7.542 7.833 8.114 8.449 8.773 9.091 9.45 9.857 10.238 10.643 11.07 11.524 11.982 12.459 13.007 13.542 14.09 14.606 15.134 15.641 16.128 16.523 16.585 16.115 15.367 14.506 13.68 12.914 12.231 11.584 10.981 10.358 9.811 9.322 8.839 8.362 7.903 7.471 7.026 6.605 6.233 5.869 5.488 5.155 4.791 4.41 4.125 3.842 3.531 3.193 2.845 2.607 2.36 1.979 1.718 1.421 1.265 0.951 0.61 0.243 0.053 -0.382 -0.515 -0.733 -0.965 -1.488 -1.769 -2.065 -2.389 -2.75 -3.149 -3.653 -4.548 -2 ,8771 ,KEBNE ,17027382,Wed Dec 22 16:57:31 CET,Wed Dec 22 18:44:09 CET,0.0 0.742 1.127 1.456 1.778 2.053 2.277 2.489 2.895 3.091 3.275 3.349 3.761 3.914 4.204 4.487 4.762 4.888 5.125 5.35 5.671 5.878 6.08 6.373 6.652 6.924 7.187 7.433 7.75 8.061 8.354 8.694 9.029 9.361 9.733 10.136 10.52 10.944 11.383 11.821 12.271 12.762 13.325 13.874 14.461 15.064 15.684 16.319 16.928 17.386 17.517 17.108 16.456 15.635 14.81 14.027 13.327 12.659 12.052 11.446 10.912 10.411 9.91 9.44 9.002 8.592 8.155 7.745 7.382 7.01 6.618 6.29 5.95 5.591 5.313 5.026 4.726 4.415 4.091 3.862 3.621 3.239 2.969 2.693 2.548 2.247 1.94 1.601 1.418 0.975 0.846 0.638 0.422 -0.045 -0.303 -0.591 -0.896 -1.228 -1.615 -2.122 -3.015 -3 ,6012 ,KEBNE ,17027383,Wed Dec 22 16:57:31 CET,Wed Dec 22 18:44:12 CET,0.0 0.763 1.188 1.503 1.778 2.026 2.243 2.446 2.822 3.001 3.184 3.268 3.679 3.829 4.106 4.375 4.632 4.752 4.976 5.2 5.524 5.721 5.913 6.203 6.473 6.728 6.972 7.202 7.499 7.781 8.052 8.374 8.678 8.97 9.292 9.654 10.012 10.375 10.726 11.108 11.518 11.967 12.477 12.985 13.53 14.063 14.622 15.162 15.69 16.117 16.216 15.792 15.078 14.288 13.486 12.682 11.974 11.313 10.707 10.086 9.537 9.023 8.532 8.076 7.621 7.187 6.709 6.296 5.957 5.592 5.215 4.894 4.545 4.189 3.924 3.641 3.343 3.04 2.725 2.497 2.248 1.855 1.569 1.271 1.121 0.808 0.494 0.173 -0.002 -0.457 -0.618 -0.845 -1.08 -1.579 -1.868 -2.18 -2.526 -2.917 -3.338 -3.856 -5.103 -4 ,7042 ,KEBNE ,17027384,Wed Dec 22 16:57:31 CET,Wed Dec 22 18:42:34 CET,0.0 0.709 1.062 1.358 1.641 1.901 2.132 2.339 2.696 2.868 3.038 3.111 3.519 3.668 3.947 4.217 4.488 4.614 4.852 5.074 5.392 5.6 5.794 6.07 6.349 6.615 6.862 7.098 7.4 7.68 7.946 8.266 8.568 8.844 9.147 9.483 9.814 10.184 10.564 10.957 11.355 11.763 12.23 12.676 13.16 13.661 14.181 14.727 15.226 15.554 15.547 15.092 14.422 13.655 12.897 12.143 11.451 10.815 10.233 9.605 9.038 8.519 8.012 7.512 7.018 6.564 6.093 5.673 5.322 4.952 4.554 4.228 3.881 3.495 3.194 2.887 2.575 2.242 1.883 1.646 1.405 0.999 0.721 0.446 0.306 0.02 -0.278 -0.588 -0.752 -1.165 -1.286 -1.491 -1.701 -2.145 -2.377 -2.628 -2.915 -3.229 -3.586 -4.008 -4.662 -5 ,20085 ,KEBNE ,17027385,Wed Dec 22 16:58:34 CET,Wed Dec 22 18:44:56 CET,0.0 0.522 0.85 1.135 1.411 1.657 1.87 2.085 2.462 2.632 2.798 2.871 3.264 3.401 3.664 3.911 4.146 4.268 4.511 4.74 5.058 5.26 5.46 5.747 6.028 6.293 6.545 6.787 7.097 7.403 7.698 8.05 8.393 8.72 9.082 9.486 9.872 10.275 10.699 11.149 11.602 12.095 12.648 13.174 13.77 14.371 14.96 15.514 16.02 16.401 16.391 15.869 15.182 14.446 13.706 12.967 12.275 11.614 11.012 10.358 9.792 9.281 8.747 8.254 7.799 7.364 6.888 6.471 6.129 5.768 5.377 5.047 4.707 4.357 4.083 3.791 3.491 3.179 2.841 2.601 2.344 1.953 1.69 1.42 1.277 0.969 0.651 0.319 0.143 -0.297 -0.422 -0.617 -0.812 -1.252 -1.494 -1.751 -2.025 -2.325 -2.677 -3.089 -3.784 -6 ,806 ,KEBNE ,17027386,Wed Dec 22 16:57:30 CET,Wed Dec 22 18:43:56 CET,0.0 0.554 0.928 1.239 1.508 1.756 1.986 2.209 2.614 2.797 2.971 3.035 3.447 3.597 3.883 4.151 4.398 4.521 4.767 5.006 5.331 5.533 5.73 6.024 6.307 6.584 6.862 7.121 7.432 7.715 7.989 8.318 8.623 8.912 9.251 9.625 9.976 10.357 10.766 11.172 11.582 12.037 12.531 12.985 13.48 14.005 14.548 15.1 15.703 16.237 16.442 16.037 15.356 14.597 13.892 13.222 12.549 11.909 11.351 10.77 10.244 9.75 9.266 8.777 8.306 7.885 7.445 7.028 6.667 6.301 5.913 5.602 5.289 4.958 4.697 4.419 4.112 3.784 3.435 3.197 2.959 2.588 2.322 2.034 1.888 1.582 1.249 0.901 0.721 0.285 0.142 -0.061 -0.265 -0.731 -0.992 -1.269 -1.588 -1.941 -2.355 -2.932 -3.981 -7 ,19312 ,KEBNE ,17027387,Wed Dec 22 16:57:31 CET,Wed Dec 22 18:43:12 CET,0.0 0.959 1.407 1.759 2.043 2.287 2.519 2.731 3.116 3.299 3.475 3.547 3.956 4.103 4.395 4.667 4.926 5.05 5.286 5.513 5.826 6.028 6.224 6.5 6.769 7.023 7.266 7.502 7.8 8.08 8.351 8.689 9.012 9.308 9.628 9.998 10.364 10.749 11.148 11.549 11.96 12.41 12.925 13.416 13.924 14.451 15.02 15.585 16.06 16.343 16.285 15.681 14.864 14.056 13.301 12.563 11.834 11.148 10.573 9.964 9.404 8.89 8.408 7.943 7.491 7.08 6.658 6.29 5.936 5.548 5.161 4.83 4.475 4.087 3.78 3.474 3.163 2.844 2.504 2.269 2.032 1.661 1.397 1.101 0.948 0.628 0.296 -0.041 -0.217 -0.652 -0.8 -1.006 -1.211 -1.657 -1.91 -2.193 -2.501 -2.83 -3.223 -3.783 -4.884 -8 ,28322 ,KEBNE ,17027388,Wed Dec 22 16:57:31 CET,Wed Dec 22 18:42:05 CET,0.0 0.604 1.011 1.34 1.621 1.874 2.119 2.344 2.731 2.91 3.082 3.15 3.572 3.731 4.009 4.275 4.535 4.658 4.897 5.131 5.474 5.687 5.885 6.176 6.448 6.695 6.932 7.156 7.444 7.726 7.995 8.328 8.642 8.935 9.26 9.617 9.963 10.346 10.747 11.141 11.535 11.983 12.491 12.998 13.556 14.106 14.665 15.15 15.601 15.963 15.864 15.221 14.489 13.744 12.973 12.196 11.474 10.786 10.158 9.488 8.896 8.359 7.814 7.285 6.811 6.381 5.917 5.493 5.121 4.728 4.312 3.97 3.614 3.245 2.957 2.656 2.348 2.034 1.713 1.493 1.265 0.916 0.674 0.403 0.263 -0.021 -0.316 -0.622 -0.784 -1.215 -1.335 -1.525 -1.716 -2.13 -2.36 -2.613 -2.899 -3.229 -3.624 -4.107 -4.863 -9 ,29981 ,KEBNE ,17027389,Wed Dec 22 16:57:32 CET,Wed Dec 22 18:42:57 CET,0.0 0.982 1.421 1.757 2.039 2.266 2.472 2.684 3.078 3.261 3.44 3.526 3.926 4.07 4.35 4.597 4.835 4.956 5.195 5.419 5.737 5.94 6.132 6.406 6.671 6.92 7.16 7.398 7.715 8.023 8.306 8.654 8.985 9.284 9.631 10.005 10.347 10.722 11.101 11.488 11.886 12.32 12.815 13.272 13.772 14.32 14.871 15.372 15.849 16.188 16.187 15.646 14.91 14.139 13.364 12.598 11.876 11.175 10.559 9.946 9.406 8.907 8.389 7.871 7.4 6.952 6.464 6.019 5.622 5.219 4.822 4.503 4.157 3.77 3.469 3.162 2.841 2.493 2.136 1.891 1.637 1.252 0.984 0.706 0.569 0.285 -0.037 -0.367 -0.533 -0.964 -1.089 -1.286 -1.497 -1.996 -2.27 -2.558 -2.862 -3.192 -3.59 -4.073 -4.941 -10 ,10636 ,KEBNE ,17027390,Wed Dec 22 16:57:32 CET,Wed Dec 22 18:42:56 CET,0.0 0.596 1.035 1.383 1.666 1.922 2.156 2.376 2.767 2.948 3.125 3.211 3.616 3.76 4.047 4.321 4.575 4.701 4.939 5.16 5.478 5.681 5.877 6.162 6.426 6.684 6.936 7.169 7.473 7.759 8.041 8.386 8.702 8.996 9.328 9.701 10.058 10.437 10.825 11.229 11.642 12.09 12.609 13.113 13.656 14.233 14.824 15.346 15.816 16.156 16.18 15.654 14.864 14.001 13.177 12.414 11.717 11.021 10.377 9.711 9.14 8.614 8.085 7.586 7.1 6.656 6.203 5.777 5.396 5.006 4.592 4.245 3.9 3.538 3.251 2.94 2.614 2.282 1.92 1.668 1.415 1.019 0.729 0.423 0.27 -0.035 -0.36 -0.703 -0.882 -1.323 -1.441 -1.64 -1.846 -2.275 -2.534 -2.826 -3.127 -3.452 -3.814 -4.256 -5.151 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index f72c46a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8088 ,TETRA ,17608722,Sun Nov 28 22:13:14 CET,Mon Nov 29 00:15:42 CET,0.0 0.564 0.922 1.204 1.437 1.647 1.833 2.005 2.353 2.511 2.648 2.669 3.052 3.178 3.405 3.626 3.842 3.942 4.126 4.304 4.553 4.706 4.844 5.044 5.239 5.407 5.557 5.695 5.873 6.042 6.203 6.385 6.543 6.691 6.845 7.001 7.134 7.252 7.348 7.447 7.551 7.626 7.649 7.602 7.457 7.196 6.764 6.071 4.999 3.295 0.386 -3.05 -5.939 -8.392 -10.47 -12.318 -13.878 -15.28 -16.51 -17.728 -18.77 -19.699 -20.595 -21.461 -22.269 -23.001 -23.765 -24.458 -25.069 -25.703 -26.35 -26.875 -27.42 -27.987 -28.429 -28.882 -29.336 -29.811 -30.32 -30.677 -31.05 -31.651 -32.072 -32.501 -32.726 -33.209 -33.723 -34.246 -34.516 -35.083 -35.378 -35.683 -35.992 -36.688 -37.086 -37.504 -37.95 -38.479 -39.095 -39.867 -41.547 -2 ,9583 ,TETRA ,17608723,Sun Nov 28 22:13:08 CET,Mon Nov 29 00:19:10 CET,0.0 0.681 1.048 1.334 1.578 1.79 1.977 2.155 2.484 2.644 2.79 2.809 3.193 3.314 3.554 3.775 3.973 4.065 4.241 4.414 4.681 4.855 5.009 5.215 5.402 5.578 5.759 5.933 6.131 6.318 6.494 6.685 6.863 7.021 7.191 7.363 7.502 7.633 7.737 7.836 7.934 8.022 8.076 8.07 8.019 7.86 7.531 6.952 5.947 4.295 1.328 -2.249 -5.132 -7.559 -9.637 -11.478 -13.07 -14.486 -15.723 -17.011 -18.151 -19.171 -20.122 -21.028 -21.862 -22.616 -23.402 -24.087 -24.687 -25.313 -25.968 -26.511 -27.055 -27.604 -28.032 -28.482 -28.968 -29.477 -29.975 -30.306 -30.631 -31.122 -31.474 -31.834 -32.013 -32.392 -32.829 -33.307 -33.541 -34.076 -34.319 -34.597 -34.884 -35.455 -35.758 -36.105 -36.499 -36.976 -37.548 -38.17 -39.76 -3 ,32635 ,TETRA ,17608724,Sun Nov 28 22:13:09 CET,Mon Nov 29 00:19:00 CET,0.0 0.518 0.841 1.088 1.314 1.52 1.71 1.89 2.218 2.366 2.502 2.525 2.902 3.024 3.24 3.446 3.651 3.739 3.913 4.088 4.325 4.462 4.59 4.781 4.968 5.144 5.303 5.449 5.633 5.8 5.95 6.125 6.295 6.447 6.606 6.762 6.877 6.994 7.111 7.199 7.246 7.268 7.283 7.247 7.123 6.875 6.432 5.756 4.719 3.035 0.092 -3.421 -6.334 -8.826 -10.923 -12.73 -14.281 -15.695 -16.908 -18.104 -19.136 -20.084 -21.002 -21.844 -22.589 -23.275 -23.996 -24.645 -25.227 -25.817 -26.416 -26.934 -27.481 -28.033 -28.448 -28.874 -29.322 -29.789 -30.264 -30.582 -30.919 -31.471 -31.867 -32.28 -32.486 -32.903 -33.339 -33.813 -34.067 -34.623 -34.896 -35.181 -35.491 -36.16 -36.535 -36.935 -37.384 -37.914 -38.5 -39.251 -41.238 -4 ,3951 ,TETRA ,17608725,Sun Nov 28 22:13:10 CET,Mon Nov 29 00:13:31 CET,0.0 0.452 0.775 1.052 1.309 1.548 1.772 1.968 2.313 2.474 2.621 2.643 3.025 3.159 3.404 3.615 3.816 3.913 4.107 4.288 4.534 4.688 4.829 5.028 5.22 5.4 5.572 5.737 5.936 6.111 6.265 6.431 6.595 6.744 6.897 7.058 7.193 7.326 7.453 7.559 7.639 7.721 7.769 7.739 7.646 7.46 7.099 6.477 5.426 3.78 1.006 -2.333 -5.051 -7.373 -9.385 -11.151 -12.682 -14.043 -15.196 -16.393 -17.434 -18.355 -19.256 -20.099 -20.872 -21.583 -22.311 -22.96 -23.54 -24.161 -24.828 -25.381 -25.928 -26.488 -26.914 -27.357 -27.833 -28.317 -28.801 -29.144 -29.505 -30.075 -30.477 -30.88 -31.088 -31.529 -32.023 -32.553 -32.82 -33.379 -33.625 -33.906 -34.19 -34.783 -35.122 -35.523 -35.974 -36.438 -36.993 -37.807 -39.858 -5 ,8884 ,TETRA ,17608726,Sun Nov 28 22:13:10 CET,Mon Nov 29 00:18:13 CET,0.0 0.792 1.219 1.567 1.852 2.096 2.311 2.495 2.816 2.97 3.12 3.138 3.524 3.648 3.872 4.072 4.254 4.343 4.515 4.669 4.892 5.046 5.187 5.362 5.538 5.718 5.889 6.048 6.241 6.418 6.575 6.752 6.909 7.047 7.197 7.343 7.455 7.559 7.665 7.753 7.81 7.839 7.808 7.732 7.587 7.342 6.951 6.301 5.22 3.456 0.425 -3.12 -5.95 -8.339 -10.382 -12.174 -13.721 -15.132 -16.347 -17.568 -18.636 -19.573 -20.456 -21.289 -22.078 -22.821 -23.602 -24.308 -24.917 -25.53 -26.142 -26.644 -27.16 -27.71 -28.148 -28.585 -29.044 -29.559 -30.085 -30.441 -30.81 -31.403 -31.828 -32.25 -32.475 -32.959 -33.449 -33.948 -34.209 -34.779 -35.125 -35.464 -35.809 -36.53 -36.891 -37.27 -37.695 -38.223 -38.941 -39.903 -42.863 -6 ,31729 ,TETRA ,17608727,Sun Nov 28 22:13:11 CET,Mon Nov 29 00:18:44 CET,0.0 0.608 0.977 1.267 1.52 1.751 1.943 2.122 2.465 2.623 2.771 2.789 3.176 3.296 3.531 3.755 3.959 4.057 4.254 4.44 4.679 4.822 4.959 5.155 5.337 5.509 5.676 5.827 6.011 6.171 6.32 6.51 6.691 6.851 7.018 7.202 7.366 7.519 7.664 7.787 7.886 7.973 8.024 8.022 7.932 7.74 7.378 6.769 5.811 4.182 1.31 -2.192 -5.119 -7.577 -9.666 -11.502 -13.092 -14.534 -15.761 -17.005 -18.075 -19.015 -19.912 -20.76 -21.546 -22.257 -23.009 -23.685 -24.275 -24.879 -25.491 -26.013 -26.57 -27.139 -27.556 -27.982 -28.427 -28.898 -29.414 -29.772 -30.126 -30.66 -31.044 -31.452 -31.658 -32.096 -32.56 -33.047 -33.3 -33.847 -34.139 -34.434 -34.742 -35.442 -35.828 -36.225 -36.633 -37.102 -37.659 -38.381 -40.076 -7 ,7268 ,TETRA ,17608728,Sun Nov 28 22:13:10 CET,Mon Nov 29 00:15:09 CET,0.0 0.749 1.107 1.396 1.658 1.901 2.102 2.282 2.615 2.768 2.911 2.912 3.284 3.4 3.61 3.798 3.989 4.082 4.25 4.407 4.629 4.764 4.891 5.072 5.236 5.39 5.538 5.679 5.853 6.003 6.135 6.283 6.411 6.524 6.643 6.763 6.867 6.967 7.05 7.118 7.165 7.188 7.158 7.058 6.88 6.603 6.156 5.458 4.33 2.542 -0.429 -3.992 -6.95 -9.438 -11.539 -13.401 -15.021 -16.484 -17.742 -19.009 -20.085 -21.021 -21.914 -22.782 -23.649 -24.439 -25.228 -25.924 -26.519 -27.134 -27.761 -28.265 -28.782 -29.328 -29.756 -30.194 -30.658 -31.149 -31.657 -32.009 -32.374 -32.94 -33.332 -33.74 -33.949 -34.373 -34.819 -35.304 -35.558 -36.101 -36.336 -36.626 -36.955 -37.67 -38.052 -38.461 -38.896 -39.399 -40.011 -40.843 -43.014 -8 ,20195 ,TETRA ,17608729,Sun Nov 28 22:13:10 CET,Mon Nov 29 00:17:26 CET,0.0 0.685 1.066 1.368 1.626 1.855 2.058 2.254 2.61 2.767 2.912 2.936 3.316 3.43 3.646 3.846 4.036 4.125 4.292 4.453 4.683 4.825 4.955 5.147 5.327 5.496 5.654 5.803 5.992 6.172 6.341 6.53 6.7 6.848 7.011 7.196 7.358 7.51 7.655 7.781 7.859 7.905 7.93 7.913 7.806 7.572 7.157 6.546 5.593 3.961 1.118 -2.214 -4.901 -7.176 -9.148 -10.907 -12.422 -13.778 -14.937 -16.116 -17.138 -18.059 -18.937 -19.765 -20.54 -21.229 -21.952 -22.604 -23.168 -23.738 -24.33 -24.841 -25.369 -25.923 -26.349 -26.78 -27.241 -27.726 -28.23 -28.574 -28.909 -29.427 -29.795 -30.185 -30.393 -30.805 -31.224 -31.7 -31.952 -32.498 -32.789 -33.098 -33.4 -34.046 -34.407 -34.8 -35.226 -35.664 -36.219 -36.975 -38.658 -9 ,17789 ,TETRA ,17608730,Sun Nov 28 22:13:10 CET,Mon Nov 29 00:16:07 CET,0.0 0.613 0.992 1.279 1.514 1.722 1.919 2.099 2.428 2.587 2.732 2.747 3.122 3.238 3.466 3.672 3.864 3.957 4.14 4.312 4.543 4.687 4.821 5.011 5.191 5.356 5.515 5.667 5.851 6.015 6.165 6.334 6.486 6.628 6.778 6.922 7.046 7.171 7.264 7.333 7.395 7.439 7.43 7.375 7.241 6.979 6.54 5.873 4.813 3.087 0.2 -3.323 -6.208 -8.612 -10.612 -12.33 -13.826 -15.164 -16.297 -17.459 -18.472 -19.363 -20.21 -21.018 -21.779 -22.491 -23.241 -23.875 -24.412 -24.988 -25.586 -26.069 -26.575 -27.121 -27.536 -27.948 -28.386 -28.845 -29.334 -29.685 -30.044 -30.614 -31.0 -31.399 -31.61 -32.034 -32.458 -32.898 -33.128 -33.641 -33.862 -34.133 -34.412 -35.054 -35.411 -35.779 -36.209 -36.676 -37.142 -37.837 -39.465 -10 ,24278 ,TETRA ,17608731,Sun Nov 28 22:13:10 CET,Mon Nov 29 00:16:54 CET,0.0 0.679 1.02 1.305 1.563 1.797 2.004 2.195 2.529 2.683 2.831 2.827 3.2 3.326 3.575 3.794 4.002 4.098 4.275 4.446 4.694 4.845 4.981 5.175 5.364 5.545 5.71 5.868 6.077 6.259 6.411 6.586 6.756 6.908 7.063 7.234 7.391 7.547 7.685 7.794 7.895 7.971 8.006 7.986 7.883 7.668 7.29 6.711 5.734 4.063 1.214 -2.211 -5.003 -7.373 -9.414 -11.222 -12.79 -14.183 -15.383 -16.566 -17.591 -18.529 -19.431 -20.275 -21.036 -21.73 -22.466 -23.111 -23.666 -24.235 -24.812 -25.316 -25.84 -26.369 -26.786 -27.212 -27.641 -28.068 -28.525 -28.85 -29.185 -29.726 -30.091 -30.447 -30.629 -31.006 -31.411 -31.849 -32.081 -32.605 -32.786 -33.025 -33.297 -33.965 -34.329 -34.725 -35.2 -35.761 -36.359 -37.046 -39.073 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index e7d19cfe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4399 ,KEBNE ,17027391,Wed Dec 22 16:58:34 CET,Wed Dec 22 18:43:10 CET,0.0 0.871 1.289 1.63 1.944 2.24 2.497 2.734 3.175 3.371 3.555 3.628 4.056 4.211 4.511 4.792 5.065 5.193 5.443 5.697 6.068 6.298 6.514 6.839 7.164 7.455 7.722 7.985 8.324 8.662 8.991 9.374 9.737 10.092 10.498 10.948 11.377 11.84 12.342 12.871 13.412 14.003 14.689 15.388 16.17 17.001 17.936 18.929 20.013 21.199 22.387 23.087 23.159 22.981 22.72 22.381 21.997 21.62 21.283 20.867 20.492 20.154 19.81 19.478 19.141 18.824 18.492 18.175 17.892 17.589 17.274 17.01 16.726 16.405 16.154 15.9 15.627 15.34 15.034 14.822 14.593 14.21 13.942 13.67 13.531 13.213 12.874 12.532 12.36 11.924 11.806 11.596 11.385 10.92 10.652 10.369 10.088 9.786 9.396 8.849 7.025 -2 ,27621 ,KEBNE ,17027392,Wed Dec 22 16:58:34 CET,Wed Dec 22 18:43:15 CET,0.0 1.022 1.428 1.772 2.06 2.321 2.594 2.845 3.254 3.447 3.636 3.708 4.152 4.311 4.616 4.899 5.162 5.292 5.55 5.799 6.142 6.359 6.57 6.882 7.192 7.497 7.778 8.038 8.369 8.688 9.001 9.384 9.748 10.095 10.496 10.95 11.389 11.865 12.368 12.888 13.434 14.045 14.739 15.414 16.176 17.02 17.949 18.958 20.126 21.345 22.561 23.24 23.375 23.249 22.937 22.531 22.124 21.714 21.323 20.914 20.546 20.205 19.852 19.479 19.124 18.802 18.459 18.155 17.859 17.544 17.237 16.964 16.667 16.353 16.11 15.867 15.614 15.334 15.019 14.798 14.571 14.222 13.97 13.691 13.547 13.24 12.911 12.575 12.409 11.985 11.912 11.704 11.473 10.955 10.666 10.337 9.965 9.54 9.037 8.409 7.101 -3 ,1599 ,KEBNE ,17027393,Wed Dec 22 16:58:34 CET,Wed Dec 22 18:44:26 CET,0.0 0.848 1.279 1.612 1.887 2.145 2.39 2.617 3.046 3.254 3.441 3.499 3.935 4.093 4.397 4.685 4.953 5.076 5.318 5.56 5.904 6.12 6.334 6.65 6.943 7.223 7.501 7.761 8.108 8.448 8.767 9.14 9.492 9.836 10.229 10.652 11.056 11.501 11.981 12.483 13.007 13.595 14.267 14.944 15.699 16.513 17.457 18.454 19.546 20.722 21.831 22.342 22.421 22.295 22.029 21.718 21.38 21.004 20.636 20.215 19.807 19.439 19.097 18.766 18.442 18.126 17.77 17.44 17.136 16.817 16.493 16.191 15.864 15.539 15.288 15.023 14.735 14.435 14.122 13.909 13.693 13.35 13.076 12.789 12.647 12.347 12.062 11.755 11.59 11.143 10.975 10.756 10.522 9.998 9.722 9.408 9.091 8.733 8.299 7.74 6.336 -4 ,20142 ,KEBNE ,17027394,Wed Dec 22 16:58:35 CET,Wed Dec 22 18:44:25 CET,0.0 0.677 1.097 1.416 1.677 1.93 2.168 2.396 2.812 3.001 3.192 3.27 3.722 3.885 4.191 4.476 4.744 4.874 5.13 5.385 5.738 5.963 6.186 6.511 6.822 7.114 7.392 7.652 7.993 8.328 8.646 9.019 9.373 9.715 10.11 10.558 10.974 11.409 11.887 12.399 12.94 13.546 14.225 14.9 15.684 16.501 17.384 18.316 19.394 20.604 21.849 22.618 22.843 22.789 22.572 22.244 21.885 21.546 21.226 20.869 20.518 20.155 19.813 19.486 19.147 18.821 18.469 18.135 17.838 17.532 17.208 16.944 16.673 16.385 16.16 15.929 15.683 15.399 15.077 14.862 14.657 14.331 14.091 13.835 13.706 13.43 13.131 12.811 12.643 12.207 12.095 11.891 11.65 11.092 10.797 10.477 10.139 9.766 9.298 8.653 7.252 -5 ,29678 ,KEBNE ,17027395,Wed Dec 22 16:58:38 CET,Wed Dec 22 18:38:21 CET,0.0 0.695 1.053 1.358 1.63 1.891 2.127 2.357 2.809 2.998 3.16 3.221 3.652 3.81 4.106 4.382 4.659 4.794 5.046 5.285 5.638 5.862 6.075 6.382 6.673 6.957 7.238 7.516 7.88 8.217 8.526 8.904 9.279 9.644 10.066 10.524 10.954 11.423 11.931 12.477 13.05 13.679 14.388 15.11 15.939 16.825 17.832 18.892 20.008 21.174 22.35 22.923 22.918 22.733 22.448 22.078 21.675 21.256 20.891 20.495 20.116 19.752 19.395 19.054 18.693 18.35 18.003 17.693 17.42 17.131 16.815 16.531 16.241 15.939 15.703 15.455 15.188 14.905 14.61 14.413 14.199 13.833 13.576 13.312 13.173 12.872 12.558 12.227 12.057 11.614 11.419 11.19 10.981 10.524 10.272 9.985 9.674 9.317 8.822 8.175 6.66 -6 ,26932 ,KEBNE ,17027396,Wed Dec 22 16:58:34 CET,Wed Dec 22 18:43:54 CET,0.0 0.941 1.402 1.767 2.072 2.355 2.607 2.831 3.265 3.461 3.641 3.71 4.156 4.321 4.629 4.923 5.208 5.342 5.602 5.854 6.197 6.421 6.645 6.963 7.272 7.567 7.835 8.093 8.426 8.755 9.087 9.468 9.829 10.175 10.571 11.017 11.444 11.926 12.431 12.946 13.496 14.103 14.789 15.476 16.248 17.058 17.94 18.911 19.988 21.167 22.354 23.019 23.147 22.99 22.679 22.25 21.873 21.475 21.083 20.675 20.279 19.93 19.587 19.242 18.895 18.541 18.145 17.785 17.472 17.159 16.826 16.541 16.242 15.915 15.656 15.393 15.134 14.862 14.547 14.321 14.094 13.731 13.469 13.196 13.053 12.742 12.409 12.07 11.887 11.426 11.298 11.094 10.868 10.355 10.057 9.735 9.401 9.002 8.491 7.799 6.249 -7 ,11570 ,KEBNE ,17027397,Wed Dec 22 16:58:34 CET,Wed Dec 22 18:43:17 CET,0.0 0.879 1.256 1.59 1.902 2.192 2.439 2.673 3.111 3.311 3.496 3.552 4.007 4.17 4.475 4.763 5.031 5.164 5.426 5.679 6.031 6.25 6.468 6.776 7.071 7.355 7.629 7.892 8.224 8.555 8.867 9.24 9.603 9.937 10.318 10.755 11.191 11.679 12.181 12.696 13.243 13.855 14.539 15.204 15.975 16.812 17.738 18.742 19.814 20.924 22.07 22.728 22.82 22.642 22.363 22.023 21.627 21.236 20.869 20.468 20.108 19.774 19.446 19.112 18.786 18.457 18.086 17.761 17.479 17.169 16.839 16.562 16.268 15.948 15.696 15.442 15.172 14.887 14.581 14.365 14.136 13.773 13.521 13.244 13.102 12.811 12.503 12.179 12.008 11.565 11.445 11.251 11.043 10.582 10.327 10.02 9.681 9.298 8.847 8.312 6.626 -8 ,12781 ,KEBNE ,17027398,Wed Dec 22 16:58:34 CET,Wed Dec 22 18:44:23 CET,0.0 0.675 1.091 1.419 1.693 1.942 2.182 2.413 2.855 3.051 3.23 3.302 3.749 3.909 4.212 4.496 4.776 4.916 5.182 5.425 5.757 5.974 6.187 6.504 6.817 7.118 7.405 7.673 8.023 8.36 8.675 9.058 9.439 9.802 10.211 10.662 11.092 11.56 12.051 12.576 13.13 13.741 14.446 15.114 15.845 16.647 17.572 18.608 19.74 20.905 22.137 22.815 22.838 22.655 22.434 22.115 21.744 21.37 20.981 20.529 20.127 19.752 19.357 18.968 18.61 18.285 17.92 17.574 17.271 16.953 16.636 16.385 16.112 15.8 15.563 15.32 15.051 14.766 14.444 14.227 14.014 13.656 13.409 13.149 13.013 12.735 12.444 12.127 11.954 11.513 11.359 11.14 10.921 10.418 10.151 9.848 9.477 9.053 8.597 8.032 6.273 -9 ,24085 ,KEBNE ,17027399,Wed Dec 22 16:58:35 CET,Wed Dec 22 18:44:52 CET,0.0 0.749 1.183 1.506 1.794 2.065 2.321 2.553 2.982 3.182 3.377 3.466 3.904 4.058 4.356 4.645 4.937 5.078 5.338 5.59 5.954 6.187 6.406 6.719 7.029 7.329 7.606 7.87 8.216 8.546 8.862 9.25 9.627 9.983 10.375 10.813 11.237 11.696 12.189 12.707 13.249 13.853 14.537 15.221 16.001 16.825 17.735 18.719 19.799 20.936 22.119 22.751 22.832 22.681 22.393 22.075 21.735 21.344 20.938 20.506 20.114 19.739 19.382 19.022 18.669 18.35 18.011 17.694 17.417 17.133 16.811 16.505 16.197 15.901 15.645 15.368 15.082 14.775 14.463 14.255 14.04 13.687 13.438 13.172 13.034 12.754 12.456 12.123 11.942 11.505 11.401 11.201 10.983 10.51 10.249 9.953 9.628 9.265 8.878 8.404 6.934 -10 ,2197 ,KEBNE ,17027400,Wed Dec 22 16:58:34 CET,Wed Dec 22 18:43:14 CET,0.0 0.806 1.267 1.607 1.9 2.168 2.414 2.653 3.095 3.291 3.476 3.568 4.018 4.184 4.518 4.822 5.097 5.238 5.512 5.769 6.149 6.385 6.606 6.934 7.248 7.535 7.812 8.081 8.424 8.751 9.062 9.436 9.793 10.131 10.519 10.958 11.383 11.831 12.302 12.815 13.353 13.938 14.592 15.245 16.027 16.881 17.802 18.788 19.848 20.945 22.089 22.769 22.92 22.799 22.509 22.1 21.678 21.265 20.842 20.398 20.02 19.677 19.314 18.943 18.589 18.259 17.901 17.538 17.212 16.902 16.568 16.251 15.906 15.546 15.261 14.982 14.703 14.395 14.074 13.861 13.629 13.228 12.948 12.667 12.521 12.205 11.859 11.514 11.336 10.883 10.748 10.523 10.285 9.827 9.578 9.267 8.922 8.576 8.184 7.617 6.017 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 6a8a669a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2623 ,TETRA ,17608732,Sun Nov 28 22:13:10 CET,Mon Nov 29 00:16:37 CET,0.0 0.787 1.185 1.498 1.787 2.068 2.323 2.557 3.026 3.256 3.464 3.571 4.041 4.224 4.571 4.884 5.19 5.339 5.634 5.922 6.327 6.588 6.837 7.187 7.516 7.835 8.145 8.45 8.834 9.195 9.547 9.973 10.379 10.769 11.228 11.737 12.207 12.717 13.268 13.864 14.492 15.182 15.967 16.76 17.719 18.785 19.987 21.292 22.758 24.444 26.381 27.801 28.437 28.717 28.796 28.727 28.601 28.417 28.197 27.944 27.687 27.426 27.173 26.922 26.663 26.418 26.142 25.896 25.692 25.449 25.174 24.945 24.686 24.398 24.168 23.925 23.667 23.397 23.107 22.911 22.715 22.37 22.126 21.892 21.774 21.511 21.218 20.913 20.742 20.292 20.185 20.007 19.811 19.386 19.138 18.867 18.562 18.216 17.825 17.336 16.053 -2 ,16169 ,TETRA ,17608733,Sun Nov 28 22:13:10 CET,Mon Nov 29 00:17:51 CET,0.0 0.908 1.383 1.764 2.099 2.396 2.679 2.937 3.382 3.598 3.803 3.905 4.357 4.534 4.875 5.198 5.499 5.646 5.945 6.221 6.622 6.89 7.152 7.515 7.852 8.17 8.487 8.794 9.169 9.535 9.892 10.328 10.759 11.173 11.641 12.162 12.665 13.204 13.765 14.361 14.996 15.71 16.554 17.385 18.313 19.359 20.567 21.881 23.368 25.047 27.003 28.438 29.052 29.257 29.237 29.117 28.955 28.743 28.54 28.305 28.028 27.771 27.508 27.225 26.946 26.681 26.403 26.143 25.882 25.589 25.29 25.053 24.797 24.505 24.283 24.06 23.819 23.561 23.288 23.099 22.908 22.587 22.358 22.127 22.009 21.771 21.517 21.225 21.053 20.62 20.529 20.343 20.14 19.715 19.504 19.267 18.989 18.675 18.291 17.762 16.75 -3 ,29353 ,TETRA ,17608734,Sun Nov 28 22:13:14 CET,Mon Nov 29 00:17:48 CET,0.0 0.682 1.088 1.448 1.765 2.058 2.327 2.57 3.018 3.235 3.441 3.571 4.046 4.231 4.574 4.904 5.223 5.37 5.654 5.94 6.349 6.602 6.852 7.218 7.58 7.928 8.244 8.548 8.957 9.348 9.711 10.163 10.615 11.042 11.505 12.023 12.512 13.04 13.62 14.226 14.845 15.557 16.397 17.22 18.166 19.209 20.412 21.724 23.182 24.831 26.642 27.925 28.55 28.825 28.895 28.854 28.71 28.51 28.295 28.001 27.702 27.428 27.142 26.843 26.547 26.278 25.981 25.719 25.495 25.244 24.963 24.701 24.423 24.164 23.951 23.719 23.487 23.234 22.972 22.798 22.61 22.281 22.054 21.818 21.68 21.392 21.105 20.791 20.627 20.21 20.145 19.98 19.789 19.293 19.025 18.756 18.45 18.113 17.733 17.17 16.065 -4 ,12349 ,TETRA ,17608735,Sun Nov 28 22:13:11 CET,Mon Nov 29 00:23:35 CET,0.0 0.774 1.192 1.514 1.827 2.104 2.342 2.573 3.037 3.263 3.474 3.585 4.044 4.221 4.562 4.883 5.196 5.351 5.657 5.962 6.387 6.651 6.903 7.259 7.611 7.956 8.281 8.585 8.99 9.396 9.792 10.253 10.681 11.102 11.595 12.135 12.646 13.223 13.853 14.509 15.203 15.979 16.854 17.718 18.722 19.818 21.047 22.368 23.853 25.591 27.58 29.058 29.749 30.014 30.062 30.004 29.852 29.662 29.457 29.19 28.93 28.685 28.427 28.163 27.903 27.642 27.357 27.103 26.869 26.601 26.315 26.089 25.853 25.599 25.394 25.168 24.936 24.68 24.396 24.197 23.988 23.649 23.408 23.161 23.033 22.771 22.503 22.225 22.072 21.653 21.546 21.361 21.179 20.738 20.484 20.239 19.986 19.701 19.348 18.928 18.044 -5 ,20975 ,TETRA ,17608736,Sun Nov 28 22:13:12 CET,Mon Nov 29 00:22:51 CET,0.0 0.768 1.199 1.545 1.881 2.188 2.452 2.694 3.115 3.323 3.539 3.649 4.101 4.279 4.628 4.953 5.261 5.41 5.702 5.988 6.391 6.627 6.854 7.19 7.516 7.828 8.141 8.451 8.84 9.215 9.571 10.003 10.419 10.807 11.258 11.781 12.278 12.818 13.412 14.023 14.652 15.387 16.259 17.118 18.095 19.17 20.36 21.652 23.164 24.943 26.942 28.406 29.118 29.411 29.484 29.409 29.245 29.045 28.796 28.475 28.173 27.919 27.667 27.404 27.156 26.9 26.601 26.332 26.099 25.861 25.611 25.378 25.13 24.871 24.663 24.439 24.202 23.959 23.703 23.52 23.318 22.988 22.755 22.515 22.392 22.133 21.858 21.561 21.403 20.974 20.852 20.641 20.401 19.905 19.637 19.338 19.032 18.673 18.252 17.694 16.533 -6 ,10454 ,TETRA ,17608737,Sun Nov 28 22:13:11 CET,Mon Nov 29 00:16:45 CET,0.0 0.789 1.183 1.516 1.805 2.079 2.341 2.583 3.013 3.214 3.412 3.496 3.939 4.102 4.421 4.723 5.021 5.17 5.456 5.728 6.131 6.394 6.648 7.007 7.334 7.652 7.968 8.27 8.657 9.028 9.385 9.822 10.248 10.654 11.113 11.631 12.141 12.698 13.294 13.917 14.572 15.33 16.198 17.051 18.043 19.136 20.363 21.707 23.238 24.932 26.829 28.231 28.884 29.165 29.196 29.057 28.889 28.669 28.395 28.093 27.817 27.555 27.287 27.021 26.755 26.495 26.211 25.957 25.73 25.468 25.185 24.951 24.695 24.4 24.171 23.956 23.713 23.439 23.151 22.955 22.76 22.449 22.22 21.97 21.84 21.561 21.249 20.942 20.788 20.354 20.237 20.047 19.849 19.433 19.202 18.952 18.673 18.348 17.992 17.586 16.687 -7 ,9707 ,TETRA ,17608738,Sun Nov 28 22:13:12 CET,Mon Nov 29 00:16:24 CET,0.0 0.65 1.05 1.381 1.682 1.951 2.21 2.455 2.892 3.088 3.273 3.344 3.788 3.953 4.273 4.576 4.866 5.003 5.274 5.545 5.936 6.196 6.456 6.826 7.173 7.504 7.816 8.121 8.52 8.893 9.252 9.698 10.124 10.525 10.993 11.508 12.0 12.54 13.129 13.754 14.393 15.113 15.937 16.752 17.738 18.827 20.034 21.374 22.909 24.654 26.551 27.882 28.53 28.782 28.8 28.707 28.521 28.256 27.942 27.561 27.212 26.884 26.564 26.246 25.916 25.617 25.321 25.046 24.768 24.461 24.154 23.917 23.659 23.38 23.158 22.912 22.658 22.392 22.109 21.905 21.675 21.33 21.104 20.856 20.728 20.453 20.16 19.871 19.707 19.267 19.144 18.934 18.725 18.265 18.018 17.752 17.444 17.095 16.659 16.085 14.69 -8 ,11442 ,TETRA ,17608739,Sun Nov 28 22:13:15 CET,Mon Nov 29 00:17:16 CET,0.0 0.868 1.307 1.667 2.01 2.309 2.577 2.854 3.34 3.541 3.734 3.829 4.278 4.453 4.785 5.109 5.425 5.575 5.871 6.155 6.558 6.818 7.065 7.416 7.758 8.09 8.415 8.729 9.128 9.532 9.927 10.378 10.804 11.22 11.699 12.228 12.72 13.258 13.847 14.467 15.133 15.889 16.749 17.566 18.495 19.526 20.699 22.015 23.517 25.213 27.126 28.457 29.033 29.301 29.349 29.198 28.964 28.708 28.43 28.1 27.8 27.528 27.247 26.977 26.711 26.434 26.123 25.846 25.587 25.32 25.037 24.788 24.522 24.248 24.035 23.795 23.551 23.307 23.029 22.833 22.635 22.32 22.094 21.855 21.734 21.474 21.18 20.861 20.697 20.273 20.191 20.005 19.819 19.433 19.211 18.97 18.677 18.332 17.916 17.342 16.042 -9 ,24409 ,TETRA ,17608740,Sun Nov 28 22:13:17 CET,Mon Nov 29 00:17:26 CET,0.0 0.804 1.224 1.584 1.891 2.174 2.442 2.707 3.188 3.408 3.619 3.719 4.18 4.358 4.688 4.993 5.294 5.441 5.73 6.011 6.401 6.639 6.877 7.244 7.608 7.955 8.266 8.562 8.949 9.329 9.698 10.127 10.524 10.909 11.365 11.867 12.342 12.869 13.441 14.046 14.685 15.391 16.21 17.031 17.947 18.954 20.143 21.446 22.909 24.638 26.616 28.018 28.69 28.983 29.03 28.982 28.844 28.635 28.422 28.163 27.89 27.606 27.328 27.052 26.774 26.519 26.253 25.997 25.741 25.452 25.147 24.91 24.662 24.378 24.16 23.956 23.72 23.458 23.202 23.019 22.816 22.507 22.294 22.064 21.942 21.684 21.411 21.11 20.949 20.533 20.455 20.268 20.065 19.595 19.334 19.064 18.773 18.448 18.019 17.467 16.542 -10 ,25590 ,TETRA ,17608741,Sun Nov 28 22:13:11 CET,Mon Nov 29 00:16:38 CET,0.0 0.762 1.148 1.461 1.772 2.059 2.322 2.569 3.025 3.24 3.441 3.543 3.996 4.171 4.507 4.824 5.134 5.285 5.573 5.858 6.278 6.54 6.785 7.141 7.486 7.819 8.143 8.459 8.864 9.246 9.613 10.045 10.451 10.839 11.292 11.796 12.281 12.83 13.423 14.036 14.675 15.419 16.295 17.123 18.065 19.135 20.325 21.627 23.128 24.847 26.821 28.193 28.82 29.06 29.097 29.027 28.87 28.647 28.379 28.055 27.746 27.465 27.183 26.889 26.599 26.351 26.084 25.806 25.57 25.335 25.077 24.842 24.581 24.309 24.085 23.846 23.614 23.375 23.108 22.908 22.702 22.381 22.144 21.901 21.78 21.522 21.234 20.938 20.789 20.367 20.265 20.061 19.843 19.395 19.133 18.853 18.572 18.272 17.906 17.433 16.535 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt deleted file mode 100644 index 7319fa91..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16246 ,TETRA ,17608742,Sun Nov 28 22:13:11 CET,Mon Nov 29 00:15:54 CET,0.0 0.564 1.016 1.411 1.723 2.03 2.333 2.608 3.098 3.328 3.558 3.723 4.216 4.426 4.804 5.163 5.504 5.672 6.006 6.333 6.805 7.11 7.404 7.841 8.271 8.678 9.072 9.453 9.952 10.445 10.922 11.506 12.073 12.62 13.256 13.978 14.686 15.46 16.3 17.199 18.147 19.244 20.561 21.931 23.561 25.397 27.54 30.006 32.996 36.66 41.437 45.605 47.998 49.634 50.806 51.584 52.043 52.321 52.479 52.544 52.545 52.516 52.486 52.399 52.277 52.155 51.995 51.835 51.68 51.5 51.294 51.095 50.87 50.631 50.449 50.262 50.072 49.877 49.64 49.461 49.283 48.981 48.749 48.493 48.367 48.092 47.777 47.438 47.244 46.82 46.666 46.452 46.204 45.629 45.289 44.967 44.603 44.117 43.549 42.807 39.165 -2 ,17198 ,TETRA ,17608743,Sun Nov 28 22:13:14 CET,Mon Nov 29 00:13:00 CET,0.0 0.854 1.287 1.653 1.982 2.264 2.546 2.817 3.307 3.546 3.776 3.922 4.407 4.614 5.022 5.396 5.752 5.922 6.238 6.549 7.008 7.308 7.602 8.034 8.463 8.882 9.284 9.675 10.178 10.666 11.14 11.717 12.283 12.84 13.49 14.222 14.923 15.697 16.563 17.518 18.525 19.651 20.978 22.334 23.954 25.765 27.882 30.392 33.477 37.215 41.906 46.004 48.479 50.128 51.259 52.026 52.519 52.883 53.139 53.285 53.324 53.292 53.22 53.16 53.037 52.874 52.724 52.586 52.458 52.299 52.077 51.887 51.712 51.518 51.341 51.128 50.887 50.648 50.417 50.251 50.087 49.821 49.612 49.387 49.275 49.019 48.744 48.474 48.324 47.922 47.765 47.561 47.317 46.737 46.402 46.014 45.607 45.179 44.634 43.83 40.746 -4 ,31428 ,TETRA ,17608745,Sun Nov 28 22:13:12 CET,Mon Nov 29 00:16:11 CET,0.0 0.786 1.246 1.605 1.916 2.221 2.514 2.791 3.317 3.555 3.777 3.935 4.422 4.616 4.99 5.366 5.73 5.902 6.228 6.547 7.017 7.329 7.629 8.053 8.46 8.865 9.278 9.688 10.218 10.729 11.217 11.797 12.364 12.921 13.56 14.269 14.97 15.777 16.654 17.581 18.561 19.662 20.977 22.352 23.954 25.775 27.938 30.422 33.467 37.273 42.105 46.22 48.67 50.366 51.583 52.423 52.965 53.304 53.501 53.64 53.719 53.744 53.724 53.647 53.562 53.45 53.282 53.119 52.941 52.756 52.606 52.471 52.296 52.101 51.931 51.727 51.517 51.298 51.049 50.884 50.724 50.418 50.186 49.956 49.842 49.591 49.286 48.95 48.783 48.396 48.299 48.105 47.879 47.363 47.102 46.808 46.475 46.12 45.679 45.061 42.437 -5 ,5973 ,TETRA ,17608746,Sun Nov 28 22:13:13 CET,Mon Nov 29 00:16:07 CET,0.0 0.851 1.313 1.696 2.025 2.327 2.61 2.873 3.365 3.605 3.833 3.975 4.454 4.648 5.032 5.408 5.755 5.922 6.247 6.569 7.047 7.359 7.657 8.085 8.502 8.912 9.303 9.68 10.181 10.663 11.129 11.706 12.271 12.826 13.469 14.193 14.908 15.707 16.583 17.513 18.497 19.652 21.029 22.41 24.055 25.938 28.143 30.69 33.742 37.434 42.154 46.386 48.952 50.625 51.743 52.521 53.068 53.403 53.579 53.719 53.756 53.747 53.712 53.611 53.5 53.389 53.269 53.156 53.005 52.815 52.632 52.454 52.228 51.997 51.837 51.681 51.515 51.288 51.033 50.88 50.717 50.448 50.256 50.02 49.887 49.608 49.299 48.96 48.789 48.388 48.264 48.077 47.866 47.367 47.058 46.695 46.29 45.851 45.351 44.667 41.651 -6 ,13574 ,TETRA ,17608747,Sun Nov 28 22:13:39 CET,Mon Nov 29 00:20:58 CET,0.0 0.698 1.16 1.539 1.867 2.155 2.437 2.708 3.215 3.455 3.681 3.817 4.299 4.505 4.886 5.246 5.594 5.771 6.121 6.459 6.959 7.277 7.582 8.028 8.466 8.883 9.282 9.676 10.186 10.683 11.178 11.781 12.356 12.917 13.574 14.305 15.018 15.804 16.662 17.591 18.563 19.672 20.99 22.338 23.933 25.75 27.875 30.333 33.321 36.978 41.685 45.777 48.19 49.693 50.624 51.239 51.637 51.867 52.017 52.055 52.032 51.998 51.949 51.897 51.798 51.679 51.508 51.315 51.139 50.945 50.715 50.514 50.32 50.122 49.964 49.78 49.559 49.306 49.037 48.833 48.602 48.244 48.005 47.771 47.647 47.37 47.059 46.682 46.462 46.014 45.821 45.579 45.327 44.724 44.398 44.081 43.735 43.31 42.788 42.139 39.649 -7 ,3524 ,TETRA ,17608748,Sun Nov 28 22:13:39 CET,Mon Nov 29 00:20:47 CET,0.0 0.924 1.384 1.771 2.125 2.443 2.72 2.977 3.46 3.695 3.921 4.068 4.561 4.765 5.176 5.576 5.939 6.113 6.468 6.805 7.276 7.587 7.892 8.332 8.755 9.175 9.583 9.975 10.487 10.988 11.477 12.064 12.637 13.19 13.835 14.579 15.303 16.101 16.97 17.887 18.854 19.969 21.298 22.656 24.245 26.058 28.249 30.817 33.892 37.689 42.406 46.394 48.949 50.633 51.705 52.455 52.962 53.262 53.451 53.598 53.684 53.693 53.636 53.542 53.436 53.336 53.216 53.104 52.971 52.779 52.561 52.376 52.177 51.981 51.809 51.601 51.397 51.178 50.928 50.753 50.558 50.234 50.012 49.78 49.657 49.397 49.118 48.795 48.608 48.18 47.965 47.679 47.398 46.843 46.513 46.164 45.749 45.235 44.617 43.798 40.806 -8 ,13948 ,TETRA ,17608749,Sun Nov 28 22:13:39 CET,Mon Nov 29 00:16:47 CET,0.0 0.829 1.347 1.714 2.025 2.315 2.587 2.851 3.346 3.572 3.79 3.932 4.411 4.609 4.986 5.344 5.691 5.863 6.2 6.519 6.989 7.3 7.601 8.038 8.461 8.868 9.258 9.635 10.13 10.621 11.096 11.677 12.246 12.79 13.427 14.156 14.863 15.639 16.479 17.395 18.395 19.533 20.865 22.212 23.798 25.614 27.77 30.277 33.316 37.075 41.855 45.965 48.388 49.893 50.957 51.705 52.115 52.352 52.506 52.652 52.749 52.784 52.74 52.632 52.523 52.395 52.235 52.074 51.91 51.74 51.547 51.368 51.167 50.921 50.721 50.521 50.334 50.14 49.896 49.717 49.53 49.239 49.019 48.734 48.579 48.277 47.981 47.667 47.467 47.026 46.876 46.653 46.401 45.878 45.582 45.249 44.914 44.493 43.919 43.17 40.525 -9 ,22970 ,TETRA ,17608750,Sun Nov 28 22:13:42 CET,Mon Nov 29 00:17:22 CET,0.0 0.725 1.208 1.604 1.95 2.268 2.562 2.847 3.37 3.609 3.838 3.984 4.467 4.663 5.03 5.391 5.74 5.905 6.233 6.553 7.008 7.305 7.601 8.049 8.479 8.884 9.284 9.676 10.175 10.655 11.133 11.72 12.279 12.824 13.456 14.167 14.872 15.653 16.496 17.416 18.414 19.545 20.879 22.229 23.825 25.655 27.809 30.34 33.419 37.132 41.843 46.021 48.614 50.314 51.47 52.217 52.638 52.948 53.136 53.221 53.303 53.372 53.394 53.337 53.248 53.171 53.071 52.963 52.834 52.685 52.528 52.362 52.168 51.972 51.812 51.647 51.491 51.322 51.111 50.936 50.758 50.488 50.288 50.048 49.919 49.673 49.418 49.161 49.017 48.611 48.445 48.234 48.01 47.497 47.219 46.896 46.512 46.051 45.487 44.708 42.113 -10 ,26368 ,TETRA ,17608751,Sun Nov 28 22:13:39 CET,Mon Nov 29 00:20:23 CET,0.0 0.827 1.359 1.776 2.12 2.434 2.74 3.024 3.553 3.8 4.031 4.195 4.682 4.874 5.248 5.614 5.955 6.12 6.44 6.753 7.212 7.515 7.811 8.245 8.663 9.066 9.466 9.853 10.344 10.822 11.287 11.857 12.422 12.977 13.633 14.374 15.085 15.872 16.728 17.65 18.631 19.748 21.048 22.371 23.962 25.794 27.959 30.44 33.463 37.19 41.926 46.093 48.608 50.23 51.379 52.158 52.656 53.012 53.241 53.398 53.449 53.446 53.414 53.324 53.191 53.041 52.888 52.756 52.621 52.472 52.305 52.13 51.936 51.741 51.582 51.422 51.246 51.041 50.825 50.673 50.498 50.193 49.972 49.729 49.603 49.32 49.007 48.66 48.476 48.05 47.877 47.65 47.408 46.884 46.593 46.223 45.784 45.314 44.725 43.916 41.311 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 852db581..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24743 ,KEBNE ,17027401,Wed Dec 22 16:58:35 CET,Wed Dec 22 18:46:01 CET,0.0 0.632 1.008 1.324 1.605 1.864 2.089 2.286 2.655 2.832 2.992 3.034 3.443 3.581 3.848 4.103 4.348 4.464 4.685 4.899 5.201 5.388 5.566 5.824 6.067 6.299 6.528 6.752 7.031 7.291 7.541 7.823 8.085 8.34 8.625 8.955 9.256 9.564 9.904 10.254 10.591 10.944 11.341 11.696 12.056 12.413 12.748 13.048 13.248 13.261 12.861 11.872 10.819 9.83 8.93 8.082 7.295 6.569 5.954 5.311 4.731 4.198 3.683 3.202 2.756 2.355 1.931 1.532 1.174 0.799 0.395 0.066 -0.272 -0.636 -0.917 -1.199 -1.488 -1.804 -2.142 -2.372 -2.607 -2.966 -3.219 -3.495 -3.635 -3.925 -4.225 -4.555 -4.741 -5.188 -5.297 -5.493 -5.707 -6.181 -6.429 -6.694 -6.989 -7.307 -7.677 -8.167 -9.074 -2 ,1031 ,KEBNE ,17027402,Wed Dec 22 17:00:39 CET,Wed Dec 22 18:48:22 CET,0.0 0.635 1.002 1.288 1.541 1.777 1.995 2.197 2.577 2.751 2.917 2.964 3.365 3.503 3.76 4.003 4.245 4.363 4.58 4.787 5.09 5.278 5.45 5.699 5.951 6.205 6.451 6.681 6.959 7.22 7.458 7.726 7.988 8.242 8.538 8.855 9.146 9.459 9.797 10.141 10.469 10.812 11.204 11.578 11.961 12.309 12.611 12.877 13.03 12.969 12.479 11.49 10.522 9.603 8.682 7.831 7.09 6.362 5.697 5.025 4.412 3.867 3.366 2.877 2.405 1.96 1.499 1.089 0.74 0.386 0.012 -0.317 -0.658 -1.022 -1.306 -1.596 -1.901 -2.207 -2.527 -2.751 -2.984 -3.361 -3.618 -3.891 -4.04 -4.331 -4.624 -4.955 -5.13 -5.582 -5.711 -5.909 -6.125 -6.612 -6.864 -7.118 -7.399 -7.711 -8.049 -8.497 -9.06 -3 ,3354 ,KEBNE ,17027403,Wed Dec 22 17:00:39 CET,Wed Dec 22 18:47:40 CET,0.0 0.927 1.329 1.64 1.924 2.176 2.401 2.614 2.993 3.163 3.329 3.379 3.779 3.917 4.189 4.44 4.67 4.783 5.007 5.22 5.521 5.709 5.888 6.142 6.393 6.637 6.863 7.07 7.329 7.596 7.855 8.148 8.422 8.673 8.973 9.3 9.595 9.911 10.235 10.564 10.87 11.202 11.588 11.936 12.297 12.626 12.946 13.22 13.391 13.351 12.829 11.798 10.714 9.641 8.611 7.665 6.823 6.061 5.422 4.757 4.18 3.659 3.159 2.693 2.226 1.781 1.323 0.892 0.535 0.187 -0.199 -0.525 -0.865 -1.228 -1.501 -1.787 -2.095 -2.398 -2.715 -2.957 -3.2 -3.579 -3.86 -4.137 -4.275 -4.568 -4.877 -5.193 -5.357 -5.797 -5.908 -6.124 -6.347 -6.803 -7.049 -7.308 -7.602 -7.949 -8.342 -8.781 -9.44 -4 ,21056 ,KEBNE ,17027404,Wed Dec 22 17:00:39 CET,Wed Dec 22 18:48:48 CET,0.0 0.741 1.161 1.507 1.787 2.039 2.285 2.516 2.914 3.098 3.271 3.33 3.732 3.877 4.146 4.401 4.641 4.754 4.973 5.182 5.482 5.674 5.857 6.109 6.347 6.577 6.792 6.998 7.26 7.517 7.765 8.043 8.299 8.557 8.863 9.195 9.509 9.844 10.162 10.472 10.802 11.151 11.497 11.805 12.148 12.491 12.84 13.125 13.277 13.248 12.768 11.732 10.667 9.676 8.774 7.927 7.147 6.432 5.815 5.178 4.611 4.094 3.598 3.11 2.63 2.183 1.727 1.322 0.965 0.59 0.204 -0.111 -0.438 -0.796 -1.078 -1.361 -1.651 -1.969 -2.307 -2.533 -2.768 -3.14 -3.396 -3.671 -3.819 -4.131 -4.464 -4.806 -4.977 -5.422 -5.523 -5.728 -5.949 -6.414 -6.65 -6.899 -7.195 -7.54 -7.934 -8.422 -9.253 -5 ,3773 ,KEBNE ,17027405,Wed Dec 22 17:00:39 CET,Wed Dec 22 18:48:39 CET,0.0 0.723 1.074 1.337 1.579 1.817 2.026 2.214 2.558 2.72 2.873 2.903 3.302 3.445 3.718 3.962 4.191 4.303 4.521 4.73 5.026 5.208 5.384 5.64 5.884 6.117 6.332 6.539 6.807 7.064 7.313 7.599 7.874 8.132 8.421 8.743 9.039 9.345 9.676 10.027 10.358 10.7 11.06 11.395 11.773 12.13 12.449 12.72 12.892 12.909 12.494 11.548 10.503 9.488 8.589 7.73 6.973 6.262 5.62 4.985 4.429 3.936 3.449 2.986 2.554 2.129 1.674 1.268 0.913 0.53 0.137 -0.179 -0.523 -0.887 -1.172 -1.473 -1.784 -2.108 -2.463 -2.7 -2.946 -3.324 -3.57 -3.84 -3.986 -4.284 -4.599 -4.922 -5.093 -5.534 -5.651 -5.861 -6.075 -6.528 -6.78 -7.055 -7.356 -7.691 -8.074 -8.551 -9.584 -6 ,32425 ,KEBNE ,17027406,Wed Dec 22 17:00:39 CET,Wed Dec 22 18:49:02 CET,0.0 0.756 1.162 1.514 1.827 2.086 2.304 2.519 2.912 3.09 3.267 3.336 3.753 3.907 4.179 4.425 4.656 4.775 5.006 5.217 5.524 5.714 5.893 6.153 6.395 6.631 6.857 7.068 7.325 7.573 7.823 8.119 8.394 8.655 8.945 9.261 9.56 9.886 10.233 10.582 10.922 11.287 11.688 12.051 12.432 12.811 13.155 13.448 13.688 13.765 13.329 12.349 11.338 10.341 9.45 8.637 7.869 7.141 6.497 5.82 5.214 4.686 4.194 3.704 3.249 2.834 2.378 1.973 1.633 1.274 0.884 0.553 0.209 -0.148 -0.415 -0.696 -0.991 -1.286 -1.607 -1.839 -2.08 -2.461 -2.72 -2.995 -3.138 -3.405 -3.696 -4.033 -4.204 -4.634 -4.726 -4.921 -5.125 -5.566 -5.82 -6.087 -6.354 -6.643 -6.988 -7.442 -8.424 -7 ,15518 ,KEBNE ,17027407,Wed Dec 22 17:00:40 CET,Wed Dec 22 18:49:03 CET,0.0 0.455 0.816 1.126 1.38 1.602 1.816 2.01 2.364 2.54 2.71 2.773 3.169 3.295 3.541 3.792 4.034 4.144 4.355 4.56 4.861 5.049 5.227 5.482 5.726 5.955 6.174 6.388 6.655 6.915 7.174 7.484 7.775 8.043 8.342 8.672 8.975 9.288 9.624 9.964 10.298 10.658 11.045 11.413 11.783 12.122 12.478 12.805 12.98 12.943 12.457 11.434 10.372 9.382 8.487 7.618 6.812 6.084 5.46 4.817 4.231 3.685 3.164 2.676 2.216 1.781 1.325 0.915 0.558 0.19 -0.197 -0.518 -0.853 -1.22 -1.509 -1.806 -2.124 -2.445 -2.763 -2.979 -3.205 -3.562 -3.818 -4.092 -4.233 -4.515 -4.797 -5.097 -5.258 -5.685 -5.771 -5.967 -6.168 -6.604 -6.858 -7.13 -7.434 -7.764 -8.11 -8.558 -9.355 -8 ,6733 ,KEBNE ,17027408,Wed Dec 22 17:00:43 CET,Wed Dec 22 18:43:12 CET,0.0 0.591 0.966 1.268 1.51 1.735 1.955 2.159 2.536 2.714 2.89 2.957 3.355 3.496 3.761 4.023 4.277 4.394 4.613 4.817 5.105 5.289 5.469 5.729 5.972 6.206 6.434 6.649 6.922 7.186 7.428 7.71 7.974 8.221 8.5 8.803 9.094 9.408 9.733 10.058 10.381 10.734 11.131 11.49 11.843 12.167 12.501 12.79 12.985 12.984 12.565 11.621 10.561 9.545 8.65 7.823 7.053 6.33 5.702 5.047 4.434 3.888 3.369 2.863 2.38 1.918 1.445 1.041 0.694 0.313 -0.111 -0.463 -0.82 -1.191 -1.484 -1.788 -2.084 -2.386 -2.722 -2.967 -3.217 -3.595 -3.856 -4.134 -4.276 -4.558 -4.847 -5.15 -5.314 -5.761 -5.892 -6.091 -6.302 -6.774 -7.043 -7.331 -7.64 -7.974 -8.356 -8.823 -9.644 -9 ,3595 ,KEBNE ,17027409,Wed Dec 22 17:00:39 CET,Wed Dec 22 18:48:16 CET,0.0 0.543 0.937 1.252 1.51 1.749 1.985 2.206 2.594 2.76 2.926 3.005 3.405 3.55 3.826 4.086 4.336 4.452 4.665 4.87 5.162 5.346 5.529 5.788 6.032 6.26 6.481 6.704 6.98 7.24 7.493 7.786 8.066 8.325 8.616 8.935 9.231 9.551 9.867 10.199 10.545 10.893 11.28 11.64 11.99 12.33 12.662 12.954 13.16 13.115 12.576 11.543 10.518 9.563 8.643 7.76 6.971 6.264 5.644 5.002 4.435 3.901 3.38 2.896 2.442 1.995 1.52 1.116 0.755 0.378 -0.01 -0.326 -0.659 -1.015 -1.284 -1.558 -1.848 -2.161 -2.482 -2.697 -2.916 -3.263 -3.511 -3.795 -3.941 -4.225 -4.524 -4.843 -5.012 -5.459 -5.588 -5.803 -6.036 -6.522 -6.772 -7.032 -7.321 -7.63 -8.004 -8.474 -9.408 -10 ,10466 ,KEBNE ,17027410,Wed Dec 22 17:00:39 CET,Wed Dec 22 18:48:47 CET,0.0 0.518 0.855 1.144 1.395 1.621 1.839 2.036 2.408 2.582 2.746 2.788 3.189 3.333 3.606 3.867 4.108 4.221 4.438 4.653 4.964 5.162 5.351 5.614 5.858 6.083 6.302 6.515 6.786 7.051 7.295 7.569 7.837 8.09 8.364 8.664 8.948 9.273 9.624 9.964 10.316 10.713 11.139 11.513 11.907 12.311 12.713 13.086 13.384 13.452 13.023 12.088 11.072 10.049 9.079 8.157 7.318 6.542 5.847 5.132 4.52 3.963 3.428 2.922 2.437 1.984 1.515 1.104 0.738 0.365 -0.027 -0.357 -0.692 -1.04 -1.298 -1.568 -1.873 -2.197 -2.524 -2.742 -2.962 -3.327 -3.588 -3.865 -4.006 -4.283 -4.574 -4.9 -5.069 -5.503 -5.591 -5.776 -5.978 -6.425 -6.675 -6.947 -7.238 -7.557 -7.955 -8.459 -9.54 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 040c7fe4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3047 ,TETRA ,17608752,Sun Nov 28 22:13:40 CET,Mon Nov 29 00:21:32 CET,0.0 0.523 0.896 1.217 1.489 1.733 1.99 2.234 2.644 2.833 3.012 3.091 3.52 3.687 4.01 4.315 4.605 4.753 5.054 5.331 5.706 5.945 6.175 6.508 6.827 7.129 7.413 7.684 8.042 8.382 8.716 9.122 9.507 9.876 10.309 10.799 11.251 11.732 12.258 12.825 13.417 14.055 14.779 15.499 16.301 17.153 18.089 19.042 20.03 21.105 22.149 22.782 22.927 22.784 22.528 22.241 21.927 21.58 21.24 20.869 20.53 20.19 19.849 19.52 19.197 18.902 18.567 18.254 17.983 17.693 17.395 17.147 16.886 16.601 16.37 16.125 15.86 15.574 15.273 15.073 14.872 14.558 14.327 14.067 13.942 13.707 13.441 13.149 12.993 12.568 12.487 12.305 12.101 11.661 11.432 11.182 10.906 10.604 10.275 9.886 9.024 -2 ,24486 ,TETRA ,17608753,Sun Nov 28 22:13:39 CET,Mon Nov 29 00:15:50 CET,0.0 0.784 1.211 1.564 1.877 2.143 2.379 2.606 3.044 3.24 3.42 3.505 3.948 4.113 4.424 4.719 4.991 5.117 5.357 5.591 5.927 6.144 6.359 6.676 6.987 7.286 7.567 7.84 8.185 8.502 8.818 9.201 9.555 9.901 10.298 10.731 11.15 11.604 12.09 12.601 13.115 13.678 14.327 14.976 15.733 16.542 17.414 18.347 19.43 20.628 21.822 22.461 22.559 22.436 22.173 21.848 21.538 21.207 20.872 20.523 20.195 19.859 19.513 19.179 18.848 18.552 18.243 17.941 17.689 17.431 17.145 16.905 16.645 16.364 16.149 15.917 15.673 15.416 15.146 14.962 14.763 14.43 14.201 13.964 13.835 13.578 13.314 13.021 12.87 12.461 12.396 12.23 12.043 11.613 11.379 11.14 10.887 10.604 10.284 9.866 9.037 -4 ,18033 ,TETRA ,17608755,Sun Nov 28 22:13:39 CET,Mon Nov 29 00:18:23 CET,0.0 0.908 1.364 1.727 2.028 2.287 2.523 2.743 3.169 3.377 3.575 3.667 4.095 4.249 4.55 4.836 5.132 5.272 5.516 5.753 6.101 6.317 6.527 6.845 7.152 7.445 7.732 8.016 8.38 8.726 9.055 9.448 9.834 10.192 10.584 11.005 11.42 11.882 12.365 12.876 13.42 14.031 14.707 15.349 16.069 16.872 17.772 18.733 19.759 20.859 22.042 22.684 22.811 22.695 22.485 22.202 21.869 21.52 21.167 20.761 20.391 20.062 19.754 19.448 19.132 18.814 18.467 18.157 17.882 17.589 17.273 17.01 16.746 16.444 16.2 15.962 15.723 15.452 15.152 14.956 14.757 14.445 14.224 13.978 13.848 13.575 13.273 12.956 12.797 12.378 12.306 12.125 11.937 11.524 11.3 11.055 10.778 10.481 10.121 9.724 9.087 -5 ,26505 ,TETRA ,17608756,Sun Nov 28 22:13:39 CET,Mon Nov 29 00:17:35 CET,0.0 0.915 1.346 1.673 1.95 2.189 2.413 2.625 3.014 3.198 3.377 3.451 3.884 4.045 4.351 4.637 4.902 5.031 5.282 5.529 5.875 6.1 6.325 6.646 6.958 7.255 7.548 7.825 8.16 8.486 8.804 9.186 9.548 9.896 10.297 10.727 11.135 11.59 12.071 12.573 13.094 13.666 14.306 14.933 15.632 16.37 17.216 18.132 19.117 20.177 21.246 21.815 21.946 21.86 21.593 21.228 20.862 20.495 20.141 19.766 19.43 19.108 18.779 18.442 18.123 17.833 17.509 17.201 16.929 16.643 16.32 16.045 15.77 15.481 15.26 15.025 14.776 14.519 14.241 14.044 13.849 13.553 13.34 13.113 12.99 12.733 12.466 12.175 12.022 11.605 11.495 11.31 11.115 10.684 10.449 10.205 9.935 9.615 9.218 8.739 7.777 -6 ,31609 ,TETRA ,17608757,Sun Nov 28 22:13:39 CET,Mon Nov 29 00:17:45 CET,0.0 0.488 0.821 1.127 1.415 1.674 1.911 2.135 2.55 2.744 2.93 3.018 3.459 3.62 3.929 4.225 4.504 4.634 4.89 5.133 5.469 5.691 5.911 6.231 6.541 6.833 7.11 7.371 7.709 8.047 8.366 8.741 9.102 9.438 9.83 10.28 10.709 11.169 11.657 12.184 12.719 13.276 13.908 14.535 15.256 16.037 16.894 17.792 18.762 19.836 20.896 21.459 21.517 21.329 21.053 20.705 20.361 20.037 19.713 19.334 18.978 18.645 18.284 17.913 17.552 17.223 16.874 16.543 16.26 15.958 15.626 15.358 15.084 14.769 14.505 14.239 13.978 13.702 13.382 13.162 12.949 12.602 12.353 12.095 11.962 11.692 11.412 11.122 10.964 10.536 10.448 10.261 10.066 9.666 9.43 9.172 8.914 8.59 8.193 7.726 7.011 -7 ,20686 ,TETRA ,17608758,Sun Nov 28 22:13:42 CET,Mon Nov 29 00:17:34 CET,0.0 0.604 0.971 1.281 1.57 1.83 2.065 2.29 2.732 2.938 3.119 3.184 3.619 3.779 4.08 4.364 4.632 4.767 5.039 5.286 5.629 5.861 6.087 6.401 6.705 7.002 7.28 7.556 7.907 8.23 8.544 8.912 9.266 9.616 10.023 10.469 10.892 11.346 11.827 12.335 12.87 13.468 14.131 14.79 15.532 16.325 17.221 18.188 19.22 20.325 21.408 21.942 22.001 21.859 21.627 21.312 20.949 20.563 20.211 19.843 19.498 19.149 18.804 18.482 18.158 17.824 17.452 17.11 16.823 16.533 16.2 15.909 15.601 15.281 15.032 14.773 14.507 14.238 13.951 13.748 13.531 13.179 12.942 12.695 12.563 12.302 12.015 11.692 11.531 11.118 11.017 10.831 10.656 10.269 10.042 9.794 9.528 9.239 8.92 8.545 7.746 -8 ,3885 ,TETRA ,17608759,Sun Nov 28 22:13:44 CET,Mon Nov 29 00:18:01 CET,0.0 0.607 1.005 1.336 1.613 1.868 2.113 2.34 2.743 2.934 3.128 3.225 3.663 3.822 4.127 4.428 4.708 4.839 5.095 5.336 5.674 5.893 6.104 6.404 6.698 6.985 7.26 7.529 7.882 8.213 8.518 8.886 9.237 9.576 9.974 10.409 10.817 11.264 11.749 12.245 12.769 13.386 14.077 14.726 15.459 16.248 17.11 18.036 19.032 20.104 21.256 21.947 22.074 21.968 21.776 21.526 21.237 20.924 20.592 20.208 19.863 19.54 19.2 18.859 18.526 18.208 17.876 17.564 17.273 16.982 16.695 16.447 16.185 15.904 15.676 15.438 15.192 14.931 14.646 14.444 14.231 13.892 13.654 13.403 13.278 13.017 12.719 12.391 12.216 11.785 11.714 11.541 11.346 10.926 10.713 10.477 10.193 9.843 9.427 8.915 7.659 -9 ,26122 ,TETRA ,17608760,Sun Nov 28 22:13:39 CET,Mon Nov 29 00:17:47 CET,0.0 0.588 1.007 1.338 1.615 1.87 2.111 2.338 2.771 2.972 3.164 3.262 3.702 3.87 4.197 4.504 4.789 4.925 5.196 5.452 5.801 6.02 6.229 6.529 6.817 7.097 7.373 7.645 8.003 8.347 8.672 9.065 9.448 9.807 10.232 10.715 11.155 11.62 12.112 12.633 13.181 13.784 14.468 15.128 15.876 16.716 17.67 18.679 19.744 20.865 21.928 22.508 22.6 22.417 22.075 21.646 21.199 20.733 20.306 19.861 19.445 19.027 18.601 18.209 17.827 17.459 17.087 16.761 16.462 16.136 15.801 15.522 15.234 14.92 14.667 14.407 14.137 13.842 13.527 13.323 13.107 12.758 12.524 12.282 12.152 11.871 11.582 11.281 11.12 10.693 10.597 10.417 10.216 9.772 9.528 9.251 8.967 8.655 8.294 7.872 7.082 -10 ,4890 ,TETRA ,17608761,Sun Nov 28 22:13:40 CET,Mon Nov 29 00:18:36 CET,0.0 0.852 1.284 1.654 1.99 2.298 2.553 2.783 3.222 3.419 3.605 3.694 4.139 4.301 4.607 4.902 5.174 5.305 5.565 5.811 6.161 6.381 6.598 6.919 7.234 7.538 7.83 8.107 8.444 8.769 9.081 9.448 9.816 10.176 10.581 11.028 11.447 11.906 12.397 12.893 13.4 13.964 14.614 15.242 15.939 16.708 17.594 18.551 19.569 20.664 21.82 22.517 22.646 22.503 22.269 21.982 21.664 21.314 20.973 20.612 20.272 19.942 19.603 19.276 18.962 18.647 18.305 17.992 17.718 17.415 17.078 16.807 16.522 16.212 15.964 15.702 15.446 15.188 14.908 14.715 14.51 14.178 13.943 13.696 13.571 13.325 13.067 12.773 12.606 12.183 12.095 11.912 11.718 11.296 11.072 10.833 10.579 10.282 9.917 9.507 8.706 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt deleted file mode 100644 index 53eff8ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2713 ,TETRA ,17608762,Sun Nov 28 22:13:39 CET,Mon Nov 29 00:17:24 CET,0.0 0.972 1.435 1.802 2.113 2.387 2.637 2.88 3.335 3.539 3.727 3.801 4.239 4.41 4.736 5.036 5.327 5.473 5.742 6.0 6.363 6.576 6.787 7.121 7.428 7.699 7.976 8.239 8.568 8.882 9.167 9.51 9.846 10.167 10.537 10.942 11.299 11.69 12.126 12.569 13.013 13.5 14.041 14.57 15.141 15.68 16.252 16.855 17.413 17.806 17.869 17.49 16.888 16.227 15.61 15.005 14.403 13.796 13.24 12.691 12.216 11.776 11.342 10.929 10.551 10.197 9.802 9.429 9.109 8.779 8.432 8.141 7.833 7.5 7.235 6.961 6.683 6.389 6.074 5.859 5.639 5.287 5.049 4.809 4.682 4.405 4.109 3.805 3.651 3.221 3.137 2.94 2.747 2.342 2.126 1.889 1.629 1.333 0.978 0.538 -0.22 -2 ,4605 ,TETRA ,17608763,Sun Nov 28 22:13:41 CET,Mon Nov 29 00:18:02 CET,0.0 0.829 1.351 1.771 2.103 2.394 2.659 2.924 3.408 3.621 3.811 3.893 4.331 4.492 4.814 5.118 5.391 5.52 5.765 6.005 6.362 6.594 6.818 7.129 7.42 7.697 7.952 8.204 8.533 8.835 9.119 9.465 9.799 10.104 10.449 10.849 11.233 11.624 12.002 12.403 12.838 13.315 13.852 14.37 14.928 15.491 16.104 16.742 17.379 17.867 18.007 17.601 16.978 16.293 15.601 14.934 14.339 13.759 13.217 12.666 12.18 11.721 11.274 10.855 10.435 10.011 9.568 9.188 8.871 8.536 8.168 7.861 7.535 7.191 6.933 6.668 6.384 6.087 5.759 5.535 5.319 4.974 4.736 4.496 4.368 4.087 3.792 3.493 3.331 2.897 2.821 2.625 2.41 1.963 1.721 1.473 1.211 0.917 0.603 0.216 -0.721 -3 ,6119 ,TETRA ,17608764,Sun Nov 28 22:13:41 CET,Mon Nov 29 00:18:53 CET,0.0 1.18 1.567 1.904 2.214 2.49 2.754 2.999 3.416 3.607 3.796 3.875 4.309 4.475 4.778 5.072 5.353 5.486 5.743 5.986 6.323 6.548 6.771 7.086 7.403 7.703 7.975 8.232 8.551 8.846 9.137 9.491 9.826 10.154 10.525 10.936 11.316 11.72 12.162 12.607 13.056 13.549 14.088 14.623 15.219 15.833 16.458 17.065 17.65 18.173 18.466 18.204 17.641 16.97 16.358 15.742 15.097 14.491 13.929 13.335 12.836 12.385 11.937 11.506 11.096 10.706 10.291 9.916 9.585 9.242 8.882 8.579 8.254 7.913 7.651 7.372 7.084 6.784 6.471 6.256 6.035 5.692 5.436 5.155 5.012 4.72 4.419 4.104 3.944 3.514 3.432 3.244 3.055 2.651 2.425 2.181 1.923 1.63 1.289 0.901 0.087 -4 ,1332 ,TETRA ,17608765,Sun Nov 28 22:13:43 CET,Mon Nov 29 00:18:07 CET,0.0 1.125 1.598 1.972 2.315 2.64 2.932 3.203 3.681 3.88 4.07 4.16 4.597 4.768 5.084 5.381 5.654 5.785 6.037 6.285 6.65 6.869 7.077 7.381 7.678 7.963 8.229 8.489 8.822 9.133 9.433 9.787 10.125 10.46 10.816 11.196 11.557 11.94 12.348 12.775 13.221 13.702 14.232 14.755 15.352 15.974 16.634 17.322 18.023 18.589 18.793 18.513 17.952 17.269 16.599 15.93 15.305 14.717 14.196 13.638 13.141 12.704 12.297 11.903 11.502 11.113 10.699 10.337 10.012 9.676 9.341 9.059 8.757 8.433 8.179 7.917 7.639 7.341 7.038 6.83 6.618 6.273 6.024 5.772 5.643 5.377 5.095 4.802 4.65 4.22 4.143 3.956 3.751 3.279 3.034 2.784 2.497 2.178 1.842 1.397 0.532 -5 ,22584 ,TETRA ,17608766,Sun Nov 28 22:13:44 CET,Mon Nov 29 00:19:22 CET,0.0 1.093 1.556 1.914 2.211 2.484 2.76 3.022 3.488 3.701 3.914 4.045 4.491 4.67 5.028 5.346 5.637 5.771 6.041 6.302 6.663 6.889 7.1 7.407 7.704 7.992 8.261 8.515 8.849 9.166 9.472 9.838 10.168 10.479 10.85 11.262 11.658 12.088 12.514 12.939 13.368 13.826 14.347 14.857 15.464 16.117 16.731 17.293 17.856 18.323 18.474 18.089 17.471 16.81 16.117 15.392 14.745 14.139 13.592 13.014 12.491 12.009 11.524 11.061 10.621 10.204 9.765 9.379 9.032 8.657 8.259 7.928 7.594 7.25 6.977 6.684 6.368 6.044 5.716 5.478 5.228 4.859 4.607 4.323 4.172 3.889 3.605 3.29 3.124 2.7 2.619 2.428 2.222 1.769 1.523 1.257 0.955 0.628 0.257 -0.212 -0.955 -6 ,30209 ,TETRA ,17608767,Sun Nov 28 22:13:46 CET,Mon Nov 29 00:19:11 CET,0.0 1.218 1.789 2.259 2.635 2.921 3.178 3.411 3.83 4.027 4.226 4.329 4.768 4.94 5.275 5.573 5.842 5.971 6.216 6.461 6.814 7.027 7.232 7.524 7.814 8.093 8.356 8.62 8.957 9.275 9.575 9.942 10.314 10.667 11.066 11.513 11.929 12.382 12.837 13.278 13.722 14.215 14.795 15.333 15.886 16.48 17.115 17.745 18.38 18.822 18.925 18.523 17.917 17.258 16.539 15.836 15.233 14.674 14.133 13.551 13.048 12.576 12.112 11.695 11.309 10.941 10.55 10.194 9.861 9.484 9.082 8.757 8.411 8.053 7.781 7.503 7.224 6.942 6.652 6.446 6.227 5.881 5.641 5.389 5.255 4.983 4.696 4.396 4.237 3.806 3.703 3.504 3.295 2.847 2.625 2.388 2.087 1.766 1.425 0.983 0.129 -7 ,12520 ,TETRA ,17608769,Sun Nov 28 22:13:42 CET,Mon Nov 29 00:18:29 CET,0.0 0.863 1.296 1.632 1.925 2.193 2.439 2.678 3.115 3.308 3.487 3.576 4.011 4.168 4.456 4.737 5.008 5.135 5.389 5.632 5.959 6.17 6.377 6.681 6.973 7.242 7.505 7.767 8.088 8.388 8.671 9.0 9.321 9.639 10.001 10.405 10.788 11.199 11.656 12.124 12.583 13.091 13.661 14.205 14.828 15.49 16.147 16.761 17.333 17.8 18.003 17.671 17.081 16.415 15.724 15.038 14.392 13.757 13.175 12.575 12.041 11.567 11.112 10.667 10.242 9.849 9.44 9.082 8.763 8.416 8.053 7.747 7.43 7.101 6.833 6.544 6.248 5.952 5.64 5.423 5.203 4.852 4.601 4.34 4.206 3.921 3.616 3.295 3.133 2.698 2.598 2.414 2.23 1.825 1.601 1.364 1.087 0.765 0.411 0.032 -0.603 -8 ,26764 ,TETRA ,17608770,Sun Nov 28 22:13:44 CET,Mon Nov 29 00:18:23 CET,0.0 1.217 1.716 2.082 2.401 2.698 2.954 3.189 3.648 3.852 4.037 4.127 4.578 4.754 5.081 5.396 5.683 5.819 6.088 6.345 6.702 6.923 7.139 7.453 7.762 8.054 8.329 8.587 8.916 9.243 9.558 9.929 10.276 10.619 11.015 11.438 11.834 12.246 12.664 13.1 13.538 13.999 14.516 15.036 15.65 16.264 16.877 17.528 18.176 18.667 18.837 18.546 17.965 17.3 16.628 15.938 15.271 14.632 14.073 13.496 12.984 12.514 12.061 11.634 11.22 10.824 10.397 10.013 9.681 9.327 8.963 8.662 8.333 7.989 7.729 7.463 7.186 6.896 6.565 6.33 6.1 5.727 5.466 5.208 5.079 4.806 4.531 4.241 4.081 3.641 3.552 3.367 3.179 2.782 2.559 2.309 2.034 1.717 1.368 0.972 0.073 -9 ,11856 ,TETRA ,17608771,Sun Nov 28 22:13:42 CET,Mon Nov 29 00:17:48 CET,0.0 1.219 1.67 2.013 2.319 2.596 2.851 3.092 3.533 3.741 3.937 4.023 4.471 4.634 4.951 5.253 5.53 5.669 5.941 6.202 6.559 6.775 6.99 7.306 7.604 7.896 8.184 8.457 8.782 9.092 9.394 9.745 10.088 10.407 10.762 11.142 11.503 11.893 12.292 12.724 13.177 13.657 14.192 14.703 15.261 15.825 16.441 17.066 17.665 18.223 18.438 18.031 17.43 16.743 16.025 15.284 14.615 13.986 13.423 12.836 12.317 11.858 11.394 10.938 10.513 10.119 9.717 9.367 9.057 8.721 8.355 8.042 7.729 7.411 7.157 6.893 6.612 6.306 5.997 5.791 5.572 5.213 4.969 4.723 4.595 4.338 4.062 3.754 3.593 3.162 3.093 2.917 2.739 2.359 2.135 1.892 1.626 1.309 0.955 0.525 -0.264 -10 ,4128 ,TETRA ,17608772,Sun Nov 28 22:13:46 CET,Mon Nov 29 00:18:47 CET,0.0 0.928 1.363 1.722 2.037 2.327 2.598 2.85 3.288 3.479 3.675 3.781 4.213 4.38 4.709 4.998 5.262 5.392 5.644 5.883 6.226 6.448 6.662 6.968 7.264 7.544 7.805 8.059 8.394 8.698 8.976 9.315 9.645 9.966 10.334 10.733 11.097 11.49 11.907 12.352 12.806 13.277 13.813 14.323 14.906 15.513 16.071 16.635 17.236 17.721 17.856 17.419 16.839 16.133 15.37 14.649 14.0 13.392 12.865 12.333 11.84 11.389 10.95 10.525 10.139 9.785 9.406 9.067 8.762 8.443 8.111 7.828 7.52 7.19 6.941 6.681 6.413 6.138 5.836 5.627 5.418 5.083 4.848 4.601 4.476 4.211 3.929 3.636 3.485 3.061 2.999 2.819 2.635 2.24 2.017 1.763 1.47 1.152 0.801 0.405 -0.212 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 960f9e9e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18694 ,TETRA ,17608773,Sun Nov 28 22:13:42 CET,Mon Nov 29 00:14:23 CET,0.0 0.624 0.969 1.259 1.539 1.808 2.057 2.288 2.712 2.907 3.103 3.2 3.646 3.81 4.136 4.452 4.748 4.893 5.17 5.433 5.809 6.05 6.286 6.633 6.969 7.285 7.594 7.905 8.293 8.66 9.016 9.45 9.863 10.259 10.712 11.195 11.651 12.148 12.678 13.254 13.869 14.551 15.326 16.097 16.998 18.003 19.159 20.472 21.986 23.661 25.489 26.805 27.35 27.515 27.505 27.365 27.144 26.86 26.55 26.187 25.875 25.584 25.263 24.927 24.565 24.221 23.889 23.591 23.313 23.011 22.682 22.396 22.092 21.774 21.522 21.249 20.957 20.664 20.355 20.13 19.894 19.512 19.239 18.969 18.836 18.548 18.241 17.923 17.76 17.336 17.24 17.041 16.826 16.377 16.125 15.843 15.522 15.154 14.753 14.278 13.151 -2 ,8845 ,TETRA ,17608774,Sun Nov 28 22:13:42 CET,Mon Nov 29 00:15:37 CET,0.0 0.533 0.928 1.266 1.551 1.819 2.069 2.296 2.718 2.918 3.108 3.2 3.643 3.803 4.115 4.417 4.711 4.853 5.127 5.385 5.749 5.983 6.211 6.551 6.886 7.208 7.509 7.802 8.189 8.57 8.93 9.356 9.767 10.173 10.646 11.161 11.653 12.183 12.752 13.355 13.984 14.692 15.512 16.329 17.258 18.291 19.496 20.868 22.402 24.072 25.955 27.299 27.881 28.154 28.187 28.013 27.781 27.518 27.175 26.784 26.424 26.077 25.709 25.34 24.988 24.644 24.273 23.924 23.628 23.303 22.932 22.633 22.332 21.985 21.7 21.429 21.139 20.836 20.558 20.366 20.147 19.792 19.548 19.291 19.153 18.869 18.576 18.232 18.04 17.582 17.404 17.175 16.933 16.424 16.146 15.833 15.497 15.123 14.655 14.099 12.871 -3 ,16720 ,TETRA ,17608775,Sun Nov 28 22:13:44 CET,Mon Nov 29 00:15:27 CET,0.0 0.585 0.951 1.261 1.539 1.804 2.06 2.295 2.705 2.897 3.086 3.166 3.615 3.784 4.099 4.399 4.682 4.814 5.07 5.327 5.703 5.947 6.179 6.506 6.818 7.122 7.428 7.722 8.09 8.442 8.796 9.231 9.632 10.006 10.441 10.93 11.395 11.909 12.463 13.044 13.652 14.346 15.146 15.929 16.831 17.85 18.989 20.236 21.692 23.358 25.199 26.494 27.081 27.326 27.321 27.156 26.962 26.729 26.476 26.194 25.912 25.613 25.311 25.001 24.699 24.428 24.121 23.841 23.577 23.282 22.991 22.743 22.46 22.146 21.9 21.642 21.358 21.07 20.759 20.523 20.264 19.863 19.584 19.301 19.152 18.824 18.479 18.127 17.948 17.516 17.44 17.246 17.026 16.536 16.25 15.952 15.632 15.237 14.766 14.232 13.165 -4 ,15072 ,TETRA ,17608776,Sun Nov 28 22:13:42 CET,Sun Nov 28 23:59:47 CET,0.0 0.884 1.29 1.627 1.923 2.174 2.409 2.634 3.053 3.246 3.433 3.525 3.974 4.14 4.45 4.746 5.035 5.175 5.449 5.706 6.076 6.317 6.551 6.888 7.22 7.546 7.853 8.144 8.52 8.89 9.242 9.659 10.063 10.455 10.903 11.406 11.88 12.393 12.955 13.551 14.172 14.883 15.709 16.526 17.462 18.49 19.689 21.041 22.558 24.214 26.12 27.507 28.139 28.36 28.333 28.185 27.987 27.735 27.429 27.06 26.715 26.391 26.054 25.729 25.413 25.098 24.742 24.415 24.117 23.802 23.47 23.178 22.882 22.584 22.352 22.106 21.85 21.56 21.239 21.026 20.797 20.443 20.203 19.949 19.823 19.572 19.303 19.001 18.838 18.42 18.341 18.16 17.959 17.505 17.273 17.039 16.767 16.437 16.032 15.548 14.564 -5 ,5119 ,TETRA ,17608777,Sun Nov 28 22:13:43 CET,Mon Nov 29 00:14:36 CET,0.0 0.807 1.23 1.582 1.855 2.108 2.342 2.565 2.98 3.176 3.376 3.475 3.931 4.101 4.416 4.722 5.013 5.154 5.423 5.677 6.045 6.284 6.517 6.853 7.177 7.485 7.785 8.082 8.462 8.829 9.182 9.597 9.996 10.387 10.844 11.341 11.81 12.334 12.903 13.515 14.157 14.87 15.696 16.511 17.441 18.459 19.618 20.921 22.395 24.038 25.953 27.34 27.939 28.137 28.107 27.959 27.759 27.528 27.251 26.931 26.633 26.329 25.999 25.666 25.352 25.073 24.789 24.514 24.24 23.933 23.607 23.339 23.071 22.793 22.564 22.313 22.049 21.767 21.459 21.238 21.012 20.666 20.423 20.174 20.044 19.755 19.451 19.136 18.972 18.546 18.436 18.221 17.997 17.52 17.248 16.964 16.635 16.3 15.956 15.449 13.842 -6 ,16603 ,TETRA ,17608778,Sun Nov 28 22:13:44 CET,Mon Nov 29 00:15:45 CET,0.0 0.726 1.136 1.438 1.706 1.955 2.211 2.453 2.885 3.088 3.278 3.356 3.792 3.952 4.263 4.561 4.851 4.988 5.248 5.509 5.88 6.108 6.344 6.686 7.001 7.308 7.609 7.905 8.279 8.633 8.98 9.4 9.812 10.208 10.668 11.184 11.667 12.187 12.758 13.379 14.019 14.739 15.578 16.377 17.279 18.301 19.446 20.732 22.209 23.871 25.726 27.054 27.715 27.96 27.963 27.858 27.7 27.509 27.274 26.961 26.647 26.333 25.998 25.688 25.411 25.128 24.809 24.513 24.249 23.966 23.666 23.408 23.117 22.789 22.531 22.285 22.013 21.719 21.409 21.184 20.959 20.609 20.365 20.093 19.946 19.662 19.358 19.034 18.873 18.432 18.31 18.095 17.858 17.38 17.127 16.851 16.538 16.184 15.754 15.225 14.15 -7 ,13160 ,TETRA ,17608779,Sun Nov 28 22:13:47 CET,Mon Nov 29 00:14:57 CET,0.0 0.638 1.084 1.42 1.703 1.969 2.224 2.465 2.918 3.12 3.327 3.453 3.907 4.075 4.399 4.706 5.009 5.148 5.403 5.66 6.034 6.278 6.519 6.862 7.188 7.494 7.781 8.054 8.412 8.761 9.101 9.517 9.914 10.288 10.718 11.213 11.704 12.244 12.819 13.425 14.049 14.73 15.51 16.306 17.232 18.236 19.353 20.572 21.983 23.621 25.455 26.79 27.43 27.709 27.762 27.684 27.54 27.331 27.091 26.802 26.526 26.24 25.924 25.628 25.357 25.072 24.75 24.46 24.195 23.913 23.614 23.354 23.088 22.809 22.574 22.309 22.043 21.779 21.486 21.281 21.064 20.711 20.469 20.215 20.071 19.778 19.473 19.132 18.95 18.483 18.317 18.107 17.881 17.365 17.066 16.721 16.381 16.021 15.57 14.963 13.307 -8 ,13170 ,TETRA ,17608780,Sun Nov 28 22:14:12 CET,Mon Nov 29 00:15:38 CET,0.0 0.609 1.015 1.346 1.645 1.928 2.18 2.408 2.804 2.989 3.169 3.237 3.677 3.843 4.16 4.463 4.752 4.889 5.159 5.418 5.787 6.024 6.256 6.593 6.908 7.21 7.504 7.788 8.156 8.514 8.849 9.253 9.649 10.029 10.468 10.961 11.424 11.925 12.482 13.076 13.683 14.366 15.178 15.974 16.893 17.921 19.057 20.289 21.722 23.348 25.171 26.525 27.107 27.288 27.259 27.102 26.883 26.623 26.337 26.014 25.685 25.338 24.998 24.673 24.368 24.068 23.737 23.437 23.166 22.877 22.549 22.269 22.002 21.711 21.472 21.242 20.998 20.731 20.448 20.248 20.043 19.715 19.484 19.231 19.104 18.84 18.542 18.217 18.042 17.612 17.504 17.315 17.121 16.711 16.482 16.229 15.939 15.609 15.232 14.674 13.522 -9 ,8231 ,TETRA ,17608781,Sun Nov 28 22:14:12 CET,Mon Nov 29 00:17:25 CET,0.0 0.793 1.226 1.561 1.839 2.084 2.338 2.589 3.039 3.247 3.443 3.518 3.976 4.144 4.465 4.779 5.087 5.235 5.509 5.765 6.137 6.378 6.615 6.959 7.278 7.584 7.882 8.177 8.554 8.905 9.248 9.67 10.071 10.455 10.902 11.438 11.981 12.566 13.183 13.836 14.533 15.312 16.177 17.01 17.965 19.009 20.188 21.524 23.065 24.756 26.576 27.876 28.511 28.735 28.699 28.564 28.364 28.102 27.826 27.5 27.186 26.887 26.561 26.218 25.895 25.597 25.259 24.94 24.661 24.377 24.068 23.802 23.53 23.239 22.99 22.717 22.439 22.144 21.843 21.626 21.393 21.035 20.783 20.521 20.379 20.082 19.766 19.437 19.256 18.802 18.655 18.433 18.192 17.655 17.361 17.026 16.632 16.198 15.733 15.105 13.339 -10 ,23504 ,TETRA ,17608782,Sun Nov 28 22:14:12 CET,Mon Nov 29 00:17:15 CET,0.0 0.79 1.246 1.595 1.883 2.174 2.454 2.691 3.11 3.307 3.505 3.6 4.041 4.204 4.527 4.839 5.127 5.264 5.538 5.807 6.183 6.425 6.658 6.99 7.317 7.625 7.905 8.183 8.545 8.896 9.242 9.65 10.048 10.433 10.888 11.389 11.852 12.372 12.934 13.52 14.133 14.815 15.596 16.371 17.281 18.293 19.43 20.707 22.196 23.882 25.721 26.967 27.47 27.674 27.708 27.588 27.343 27.043 26.772 26.462 26.159 25.854 25.527 25.2 24.898 24.616 24.291 23.985 23.716 23.405 23.083 22.831 22.564 22.277 22.042 21.791 21.525 21.243 20.939 20.727 20.516 20.159 19.9 19.649 19.513 19.228 18.947 18.638 18.471 18.041 17.923 17.715 17.5 17.013 16.75 16.473 16.184 15.826 15.371 14.799 13.324 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt deleted file mode 100644 index a93f8d2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19947 ,TETRA ,17608783,Sun Nov 28 22:14:14 CET,Mon Nov 29 00:17:15 CET,0.0 0.757 1.152 1.488 1.774 2.023 2.269 2.502 2.915 3.102 3.285 3.356 3.804 3.962 4.263 4.532 4.788 4.918 5.159 5.389 5.737 5.963 6.186 6.505 6.787 7.058 7.321 7.579 7.917 8.238 8.548 8.919 9.269 9.608 9.997 10.423 10.846 11.297 11.776 12.276 12.781 13.353 14.007 14.623 15.327 16.104 16.926 17.81 18.774 19.731 20.716 21.172 21.081 20.821 20.448 20.024 19.624 19.217 18.814 18.361 17.947 17.559 17.174 16.804 16.464 16.144 15.783 15.443 15.15 14.849 14.522 14.254 13.973 13.657 13.407 13.16 12.909 12.65 12.368 12.165 11.957 11.626 11.389 11.136 11.003 10.733 10.455 10.158 10.006 9.57 9.473 9.289 9.102 8.662 8.425 8.174 7.88 7.561 7.183 6.708 5.848 -2 ,31650 ,TETRA ,17608784,Sun Nov 28 22:14:16 CET,Mon Nov 29 00:16:39 CET,0.0 0.737 1.185 1.527 1.824 2.088 2.32 2.538 2.937 3.113 3.292 3.361 3.788 3.937 4.223 4.508 4.774 4.895 5.127 5.352 5.68 5.886 6.079 6.354 6.635 6.912 7.169 7.421 7.748 8.06 8.365 8.75 9.112 9.442 9.825 10.245 10.636 11.06 11.52 11.993 12.482 13.038 13.655 14.255 14.939 15.668 16.491 17.386 18.343 19.317 20.209 20.608 20.544 20.26 19.884 19.466 19.038 18.603 18.204 17.765 17.369 16.996 16.594 16.216 15.88 15.569 15.226 14.913 14.634 14.344 14.054 13.806 13.53 13.225 12.985 12.736 12.462 12.169 11.884 11.686 11.468 11.117 10.874 10.633 10.514 10.271 10.003 9.717 9.563 9.127 9.03 8.836 8.641 8.212 7.954 7.695 7.429 7.115 6.74 6.218 4.817 -3 ,8646 ,TETRA ,17608785,Sun Nov 28 22:14:13 CET,Mon Nov 29 00:16:09 CET,0.0 0.862 1.277 1.626 1.92 2.185 2.434 2.659 3.078 3.274 3.458 3.524 3.965 4.118 4.408 4.678 4.938 5.071 5.332 5.581 5.931 6.152 6.373 6.682 6.973 7.255 7.523 7.79 8.143 8.474 8.781 9.149 9.493 9.819 10.2 10.63 11.042 11.493 11.96 12.437 12.951 13.52 14.156 14.772 15.458 16.192 17.029 17.913 18.846 19.879 20.898 21.338 21.305 21.058 20.71 20.315 19.888 19.459 19.084 18.697 18.333 17.981 17.616 17.262 16.908 16.569 16.232 15.935 15.663 15.357 15.035 14.775 14.497 14.205 13.977 13.723 13.451 13.177 12.897 12.701 12.498 12.171 11.938 11.696 11.563 11.263 10.949 10.633 10.469 10.028 9.932 9.731 9.532 9.108 8.871 8.617 8.334 8.016 7.637 7.154 6.242 -4 ,25632 ,TETRA ,17608786,Sun Nov 28 22:14:14 CET,Mon Nov 29 00:19:38 CET,0.0 0.659 1.073 1.392 1.685 1.95 2.185 2.409 2.812 2.999 3.18 3.231 3.669 3.831 4.136 4.426 4.699 4.833 5.089 5.341 5.705 5.926 6.144 6.457 6.75 7.03 7.309 7.577 7.909 8.235 8.535 8.883 9.217 9.542 9.928 10.358 10.748 11.176 11.651 12.141 12.637 13.184 13.817 14.447 15.14 15.889 16.719 17.568 18.462 19.417 20.383 20.774 20.696 20.364 19.909 19.434 18.929 18.411 17.941 17.466 17.044 16.641 16.247 15.872 15.503 15.157 14.782 14.442 14.13 13.779 13.43 13.158 12.864 12.55 12.296 12.03 11.773 11.492 11.172 10.957 10.744 10.401 10.164 9.917 9.791 9.531 9.246 8.931 8.765 8.331 8.253 8.071 7.866 7.425 7.194 6.955 6.695 6.408 6.079 5.685 5.083 -5 ,13097 ,TETRA ,17608787,Sun Nov 28 22:14:13 CET,Mon Nov 29 00:02:00 CET,0.0 0.929 1.358 1.733 2.046 2.31 2.548 2.771 3.177 3.377 3.578 3.651 4.094 4.257 4.555 4.84 5.119 5.252 5.497 5.736 6.089 6.311 6.527 6.835 7.131 7.416 7.69 7.958 8.303 8.631 8.947 9.324 9.691 10.038 10.418 10.836 11.231 11.667 12.134 12.638 13.156 13.72 14.365 14.986 15.702 16.468 17.304 18.172 19.084 20.071 21.014 21.37 21.227 20.957 20.638 20.252 19.849 19.415 18.992 18.515 18.083 17.699 17.315 16.951 16.609 16.278 15.938 15.633 15.363 15.069 14.733 14.457 14.156 13.822 13.571 13.321 13.059 12.786 12.502 12.288 12.06 11.719 11.471 11.212 11.085 10.817 10.531 10.221 10.056 9.622 9.508 9.322 9.126 8.688 8.461 8.231 7.977 7.675 7.308 6.874 5.975 -6 ,2563 ,TETRA ,17608788,Sun Nov 28 22:14:13 CET,Mon Nov 29 00:17:43 CET,0.0 0.548 0.928 1.238 1.491 1.721 1.947 2.168 2.57 2.765 2.949 2.991 3.413 3.56 3.836 4.102 4.358 4.482 4.724 4.953 5.282 5.49 5.698 6.006 6.3 6.581 6.848 7.104 7.435 7.75 8.043 8.396 8.74 9.077 9.466 9.877 10.265 10.687 11.138 11.614 12.1 12.651 13.271 13.882 14.6 15.325 16.112 16.977 17.936 18.976 19.999 20.502 20.486 20.238 19.878 19.474 19.067 18.639 18.225 17.805 17.433 17.082 16.721 16.349 15.982 15.649 15.294 14.977 14.706 14.42 14.114 13.844 13.574 13.291 13.053 12.805 12.538 12.251 11.948 11.74 11.523 11.168 10.908 10.632 10.492 10.2 9.902 9.597 9.442 9.019 8.946 8.767 8.589 8.187 7.949 7.697 7.407 7.08 6.716 6.261 5.193 -7 ,10639 ,TETRA ,17608789,Sun Nov 28 22:14:16 CET,Mon Nov 29 00:17:59 CET,0.0 0.543 0.904 1.221 1.505 1.74 1.963 2.179 2.555 2.729 2.907 2.977 3.41 3.562 3.846 4.109 4.364 4.493 4.744 4.975 5.309 5.533 5.748 6.054 6.351 6.623 6.875 7.121 7.452 7.776 8.096 8.469 8.81 9.141 9.516 9.924 10.314 10.759 11.227 11.721 12.246 12.808 13.434 14.045 14.724 15.443 16.258 17.124 18.048 19.0 19.881 20.258 20.194 19.906 19.511 19.066 18.622 18.193 17.797 17.358 16.949 16.579 16.223 15.861 15.492 15.134 14.749 14.389 14.061 13.732 13.404 13.125 12.823 12.498 12.245 11.986 11.722 11.451 11.151 10.932 10.704 10.354 10.107 9.838 9.697 9.426 9.15 8.832 8.666 8.227 8.131 7.932 7.723 7.293 7.067 6.815 6.539 6.248 5.879 5.42 4.721 -8 ,7214 ,TETRA ,17608790,Sun Nov 28 22:14:16 CET,Mon Nov 29 00:17:30 CET,0.0 0.66 1.069 1.386 1.656 1.916 2.157 2.381 2.793 2.982 3.171 3.235 3.676 3.833 4.121 4.397 4.657 4.784 5.043 5.288 5.626 5.834 6.036 6.333 6.614 6.878 7.131 7.385 7.711 8.026 8.327 8.671 9.012 9.353 9.732 10.137 10.513 10.921 11.373 11.855 12.352 12.914 13.56 14.177 14.86 15.594 16.393 17.236 18.165 19.161 20.151 20.54 20.419 20.178 19.863 19.484 19.089 18.682 18.319 17.893 17.471 17.072 16.68 16.283 15.918 15.594 15.246 14.941 14.679 14.388 14.066 13.811 13.562 13.275 13.033 12.796 12.548 12.283 12.005 11.812 11.603 11.271 11.047 10.813 10.692 10.428 10.141 9.851 9.706 9.284 9.227 9.045 8.841 8.383 8.119 7.848 7.573 7.258 6.865 6.324 5.346 -9 ,10248 ,TETRA ,17608791,Sun Nov 28 22:14:13 CET,Mon Nov 29 00:17:09 CET,0.0 0.563 0.957 1.307 1.599 1.835 2.061 2.279 2.686 2.869 3.042 3.107 3.553 3.715 4.004 4.277 4.55 4.683 4.941 5.186 5.529 5.748 5.957 6.249 6.527 6.799 7.063 7.325 7.67 8.002 8.327 8.708 9.065 9.401 9.778 10.209 10.618 11.044 11.504 12.007 12.537 13.14 13.819 14.473 15.194 15.989 16.903 17.843 18.845 19.854 20.742 21.11 21.053 20.773 20.406 19.966 19.525 19.088 18.687 18.25 17.82 17.426 17.049 16.673 16.308 15.962 15.593 15.253 14.953 14.655 14.331 14.061 13.794 13.511 13.277 13.029 12.775 12.495 12.198 12.006 11.803 11.468 11.233 10.984 10.856 10.589 10.3 9.992 9.838 9.41 9.316 9.128 8.936 8.518 8.286 8.03 7.766 7.48 7.113 6.675 5.853 -10 ,21252 ,TETRA ,17608792,Sun Nov 28 22:14:14 CET,Mon Nov 29 00:17:23 CET,0.0 0.81 1.211 1.555 1.853 2.118 2.365 2.585 2.98 3.169 3.351 3.417 3.855 4.003 4.286 4.567 4.843 4.971 5.215 5.453 5.781 5.983 6.186 6.485 6.771 7.039 7.293 7.546 7.871 8.176 8.475 8.83 9.17 9.506 9.882 10.293 10.706 11.162 11.638 12.133 12.627 13.185 13.826 14.435 15.141 15.887 16.703 17.601 18.566 19.528 20.49 20.971 20.929 20.653 20.269 19.851 19.403 18.938 18.543 18.142 17.769 17.408 17.032 16.67 16.326 15.993 15.635 15.31 15.017 14.702 14.371 14.107 13.831 13.524 13.287 13.044 12.787 12.528 12.252 12.044 11.834 11.509 11.273 11.02 10.884 10.607 10.325 10.018 9.855 9.431 9.346 9.168 8.981 8.542 8.294 8.023 7.741 7.439 7.074 6.587 5.772 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index c7d6ac02..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3110 ,TETRA ,17608793,Sun Nov 28 22:14:13 CET,Mon Nov 29 00:15:23 CET,0.0 0.696 1.05 1.37 1.675 1.935 2.15 2.344 2.685 2.838 2.99 3.02 3.405 3.531 3.782 4.012 4.23 4.337 4.529 4.707 4.957 5.118 5.269 5.481 5.686 5.88 6.066 6.232 6.438 6.645 6.833 7.044 7.238 7.422 7.636 7.861 8.063 8.257 8.43 8.599 8.753 8.898 9.043 9.138 9.198 9.21 9.088 8.807 8.287 7.267 5.334 2.748 0.511 -1.384 -3.02 -4.45 -5.679 -6.845 -7.847 -8.827 -9.688 -10.448 -11.182 -11.873 -12.508 -13.089 -13.699 -14.264 -14.759 -15.278 -15.828 -16.279 -16.74 -17.222 -17.599 -17.987 -18.409 -18.846 -19.29 -19.601 -19.927 -20.457 -20.827 -21.217 -21.415 -21.847 -22.316 -22.781 -23.039 -23.604 -23.917 -24.225 -24.551 -25.24 -25.605 -26.002 -26.457 -26.99 -27.634 -28.534 -32.321 -2 ,30648 ,TETRA ,17608794,Sun Nov 28 22:14:13 CET,Mon Nov 29 00:15:43 CET,0.0 0.814 1.189 1.487 1.747 1.972 2.182 2.383 2.747 2.911 3.068 3.102 3.484 3.605 3.844 4.068 4.272 4.369 4.559 4.739 5.001 5.168 5.322 5.534 5.732 5.918 6.093 6.257 6.467 6.651 6.82 7.025 7.223 7.401 7.591 7.795 7.976 8.163 8.35 8.546 8.727 8.887 9.025 9.099 9.156 9.196 9.139 8.914 8.415 7.409 5.477 3.049 0.933 -0.969 -2.664 -4.209 -5.506 -6.63 -7.662 -8.704 -9.574 -10.35 -11.094 -11.8 -12.467 -13.083 -13.727 -14.302 -14.789 -15.301 -15.832 -16.266 -16.708 -17.172 -17.553 -17.955 -18.388 -18.855 -19.32 -19.629 -19.956 -20.472 -20.828 -21.209 -21.405 -21.806 -22.263 -22.772 -23.033 -23.569 -23.836 -24.127 -24.446 -25.171 -25.561 -26.004 -26.507 -27.083 -27.712 -28.492 -31.036 -3 ,806 ,TETRA ,17608795,Sun Nov 28 22:14:16 CET,Mon Nov 29 00:14:04 CET,0.0 0.603 0.955 1.228 1.475 1.7 1.911 2.101 2.419 2.561 2.698 2.699 3.068 3.195 3.444 3.673 3.872 3.965 4.155 4.346 4.616 4.776 4.929 5.149 5.345 5.523 5.695 5.877 6.101 6.31 6.516 6.748 6.956 7.151 7.367 7.579 7.775 7.986 8.193 8.394 8.576 8.746 8.906 9.023 9.083 9.046 8.908 8.597 7.992 6.897 4.913 2.369 0.116 -1.831 -3.522 -5.032 -6.402 -7.68 -8.769 -9.816 -10.711 -11.516 -12.27 -12.979 -13.661 -14.285 -14.95 -15.565 -16.07 -16.585 -17.129 -17.589 -18.079 -18.582 -18.971 -19.364 -19.762 -20.179 -20.618 -20.926 -21.244 -21.751 -22.112 -22.513 -22.726 -23.151 -23.588 -24.059 -24.303 -24.81 -25.082 -25.403 -25.742 -26.469 -26.864 -27.348 -27.96 -28.651 -29.366 -30.314 -34.326 -4 ,29921 ,TETRA ,17608796,Sun Nov 28 22:14:14 CET,Mon Nov 29 00:16:04 CET,0.0 0.605 1.019 1.307 1.546 1.782 1.992 2.16 2.475 2.633 2.785 2.802 3.178 3.3 3.527 3.746 3.957 4.056 4.244 4.415 4.667 4.84 5.003 5.23 5.44 5.625 5.796 5.961 6.169 6.361 6.543 6.758 6.944 7.112 7.31 7.525 7.722 7.916 8.091 8.242 8.383 8.523 8.633 8.694 8.687 8.615 8.467 8.137 7.536 6.467 4.502 1.985 -0.268 -2.158 -3.759 -5.232 -6.516 -7.67 -8.675 -9.687 -10.572 -11.352 -12.097 -12.826 -13.515 -14.146 -14.796 -15.376 -15.878 -16.401 -16.948 -17.417 -17.909 -18.406 -18.793 -19.186 -19.589 -20.008 -20.447 -20.771 -21.109 -21.634 -22.012 -22.433 -22.637 -23.026 -23.45 -23.935 -24.21 -24.763 -25.086 -25.405 -25.733 -26.467 -26.869 -27.282 -27.72 -28.254 -28.988 -29.932 -33.308 -5 ,9987 ,TETRA ,17608797,Sun Nov 28 22:14:14 CET,Mon Nov 29 00:15:44 CET,0.0 0.84 1.24 1.548 1.818 2.046 2.249 2.432 2.757 2.907 3.059 3.098 3.472 3.591 3.828 4.046 4.244 4.338 4.519 4.697 4.968 5.134 5.279 5.491 5.686 5.862 6.027 6.184 6.388 6.586 6.763 6.972 7.176 7.357 7.549 7.752 7.926 8.107 8.291 8.466 8.628 8.767 8.892 8.982 9.022 8.995 8.821 8.454 7.884 6.93 5.027 2.582 0.488 -1.372 -2.983 -4.43 -5.698 -6.842 -7.808 -8.798 -9.69 -10.503 -11.272 -12.0 -12.689 -13.328 -13.988 -14.567 -15.071 -15.584 -16.126 -16.59 -17.076 -17.551 -17.92 -18.337 -18.75 -19.158 -19.592 -19.89 -20.202 -20.688 -21.031 -21.401 -21.6 -22.03 -22.477 -22.957 -23.207 -23.726 -23.97 -24.259 -24.563 -25.222 -25.595 -25.991 -26.384 -26.84 -27.454 -28.251 -30.917 -6 ,7250 ,TETRA ,17608798,Sun Nov 28 22:14:17 CET,Mon Nov 29 00:18:15 CET,0.0 0.782 1.19 1.503 1.766 1.999 2.211 2.403 2.743 2.899 3.045 3.047 3.429 3.546 3.776 4.011 4.227 4.322 4.509 4.686 4.935 5.101 5.252 5.454 5.646 5.822 5.992 6.163 6.373 6.566 6.742 6.937 7.124 7.293 7.475 7.684 7.875 8.064 8.245 8.403 8.545 8.679 8.796 8.872 8.912 8.912 8.782 8.457 7.902 6.932 4.969 2.382 0.197 -1.701 -3.342 -4.816 -6.119 -7.319 -8.368 -9.437 -10.369 -11.168 -11.906 -12.619 -13.292 -13.897 -14.559 -15.162 -15.669 -16.209 -16.748 -17.188 -17.656 -18.138 -18.523 -18.935 -19.365 -19.813 -20.305 -20.644 -20.963 -21.456 -21.835 -22.245 -22.455 -22.913 -23.422 -23.971 -24.256 -24.838 -25.139 -25.432 -25.78 -26.581 -26.985 -27.418 -27.957 -28.582 -29.278 -30.166 -33.576 -7 ,21312 ,TETRA ,17608799,Sun Nov 28 22:14:19 CET,Mon Nov 29 00:17:45 CET,0.0 0.613 0.948 1.24 1.497 1.712 1.897 2.082 2.432 2.588 2.746 2.792 3.184 3.322 3.587 3.818 4.013 4.11 4.299 4.472 4.726 4.885 5.036 5.26 5.461 5.64 5.804 5.964 6.179 6.386 6.588 6.812 7.008 7.198 7.405 7.621 7.811 7.999 8.192 8.377 8.55 8.718 8.862 8.968 9.04 9.041 8.941 8.691 8.153 7.09 5.176 2.714 0.573 -1.256 -2.837 -4.315 -5.608 -6.726 -7.703 -8.701 -9.561 -10.332 -11.06 -11.767 -12.427 -13.021 -13.662 -14.214 -14.683 -15.191 -15.733 -16.193 -16.665 -17.137 -17.503 -17.899 -18.309 -18.736 -19.2 -19.513 -19.824 -20.327 -20.694 -21.082 -21.289 -21.71 -22.107 -22.516 -22.753 -23.277 -23.547 -23.829 -24.122 -24.841 -25.214 -25.613 -26.096 -26.645 -27.322 -28.137 -30.954 -8 ,13392 ,TETRA ,17608800,Sun Nov 28 22:14:41 CET,Mon Nov 29 00:15:41 CET,0.0 0.539 0.891 1.169 1.43 1.677 1.889 2.067 2.382 2.544 2.699 2.723 3.106 3.23 3.449 3.651 3.85 3.954 4.16 4.361 4.645 4.815 4.976 5.188 5.385 5.577 5.755 5.918 6.128 6.326 6.511 6.718 6.89 7.056 7.248 7.45 7.626 7.801 7.975 8.134 8.277 8.427 8.575 8.678 8.715 8.652 8.512 8.251 7.693 6.64 4.627 1.964 -0.255 -2.138 -3.775 -5.255 -6.54 -7.693 -8.711 -9.769 -10.712 -11.517 -12.286 -13.049 -13.76 -14.378 -15.021 -15.617 -16.151 -16.719 -17.291 -17.751 -18.228 -18.761 -19.179 -19.595 -20.023 -20.452 -20.904 -21.238 -21.587 -22.097 -22.443 -22.816 -23.012 -23.423 -23.869 -24.342 -24.573 -25.095 -25.359 -25.666 -26.001 -26.656 -27.014 -27.398 -27.85 -28.419 -29.097 -29.954 -33.647 -9 ,7843 ,TETRA ,17608801,Sun Nov 28 22:14:14 CET,Mon Nov 29 00:16:23 CET,0.0 0.558 0.856 1.087 1.299 1.49 1.669 1.845 2.161 2.304 2.448 2.497 2.869 2.988 3.224 3.447 3.657 3.754 3.938 4.114 4.361 4.521 4.669 4.871 5.059 5.236 5.404 5.564 5.772 5.961 6.128 6.342 6.548 6.721 6.908 7.116 7.312 7.516 7.724 7.928 8.095 8.238 8.382 8.466 8.497 8.439 8.257 7.909 7.288 6.196 4.047 1.403 -0.773 -2.632 -4.23 -5.693 -7.01 -8.212 -9.256 -10.358 -11.291 -12.065 -12.842 -13.621 -14.341 -14.983 -15.63 -16.225 -16.772 -17.325 -17.883 -18.353 -18.849 -19.372 -19.784 -20.21 -20.652 -21.126 -21.621 -21.944 -22.286 -22.833 -23.203 -23.614 -23.833 -24.283 -24.748 -25.255 -25.52 -26.068 -26.361 -26.651 -26.951 -27.632 -28.011 -28.394 -28.822 -29.35 -29.991 -30.831 -33.691 -10 ,15195 ,TETRA ,17608802,Sun Nov 28 22:14:16 CET,Mon Nov 29 00:16:35 CET,0.0 0.626 0.954 1.246 1.513 1.743 1.953 2.153 2.48 2.629 2.776 2.809 3.191 3.313 3.546 3.777 3.984 4.08 4.262 4.434 4.683 4.838 4.993 5.223 5.431 5.627 5.827 6.013 6.239 6.446 6.629 6.843 7.058 7.264 7.486 7.717 7.921 8.132 8.344 8.533 8.728 8.946 9.121 9.223 9.282 9.243 9.093 8.805 8.224 7.15 5.168 2.542 0.214 -1.758 -3.389 -4.839 -6.182 -7.408 -8.426 -9.448 -10.347 -11.154 -11.923 -12.67 -13.386 -14.032 -14.682 -15.269 -15.784 -16.306 -16.844 -17.297 -17.795 -18.312 -18.707 -19.147 -19.615 -20.094 -20.595 -20.949 -21.3 -21.874 -22.275 -22.661 -22.872 -23.321 -23.795 -24.264 -24.493 -25.006 -25.284 -25.615 -25.966 -26.712 -27.136 -27.637 -28.142 -28.686 -29.403 -30.361 -33.068 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt deleted file mode 100644 index eba377ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28158 ,KEBNE ,17027411,Wed Dec 22 17:00:39 CET,Wed Dec 22 18:45:41 CET,0.0 1.111 1.57 1.95 2.274 2.554 2.801 3.013 3.414 3.609 3.808 3.949 4.37 4.537 4.856 5.163 5.449 5.582 5.843 6.085 6.429 6.651 6.852 7.134 7.401 7.665 7.919 8.172 8.513 8.831 9.121 9.452 9.76 10.065 10.417 10.808 11.188 11.581 11.994 12.433 12.886 13.38 13.913 14.407 14.904 15.408 15.889 16.308 16.707 16.883 16.526 15.618 14.585 13.462 12.406 11.425 10.553 9.727 8.981 8.234 7.588 7.013 6.467 5.928 5.423 4.965 4.485 4.05 3.647 3.215 2.774 2.413 2.036 1.643 1.343 1.029 0.692 0.343 -0.016 -0.27 -0.541 -0.963 -1.255 -1.566 -1.725 -2.061 -2.404 -2.752 -2.952 -3.421 -3.614 -3.855 -4.092 -4.594 -4.888 -5.211 -5.556 -5.958 -6.46 -7.104 -9.108 -2 ,3151 ,KEBNE ,17027412,Wed Dec 22 17:00:40 CET,Wed Dec 22 18:46:24 CET,0.0 1.211 1.706 2.115 2.443 2.736 3.024 3.288 3.768 3.98 4.175 4.291 4.712 4.881 5.19 5.46 5.711 5.839 6.088 6.317 6.642 6.847 7.044 7.338 7.625 7.908 8.188 8.457 8.792 9.097 9.388 9.743 10.081 10.392 10.744 11.141 11.512 11.898 12.305 12.727 13.149 13.595 14.076 14.523 15.024 15.55 16.057 16.474 16.82 17.036 16.934 16.301 15.356 14.386 13.491 12.624 11.815 11.011 10.289 9.557 8.917 8.369 7.839 7.298 6.779 6.315 5.822 5.358 4.953 4.538 4.104 3.748 3.38 2.997 2.692 2.371 2.037 1.686 1.328 1.074 0.808 0.399 0.12 -0.172 -0.335 -0.679 -1.024 -1.367 -1.549 -2.003 -2.177 -2.403 -2.63 -3.135 -3.436 -3.76 -4.092 -4.446 -4.867 -5.427 -6.735 -3 ,29127 ,KEBNE ,17027413,Wed Dec 22 17:00:39 CET,Wed Dec 22 18:46:01 CET,0.0 0.891 1.305 1.634 1.937 2.214 2.465 2.701 3.152 3.369 3.559 3.647 4.052 4.203 4.492 4.761 5.01 5.135 5.385 5.624 5.965 6.172 6.358 6.626 6.892 7.145 7.395 7.632 7.93 8.224 8.494 8.805 9.105 9.401 9.732 10.083 10.409 10.753 11.128 11.536 11.939 12.349 12.812 13.265 13.749 14.229 14.706 15.105 15.381 15.491 15.091 14.024 12.916 11.866 10.926 10.033 9.187 8.366 7.616 6.843 6.187 5.602 5.028 4.478 3.964 3.506 3.015 2.549 2.138 1.723 1.292 0.924 0.542 0.159 -0.145 -0.467 -0.809 -1.174 -1.549 -1.817 -2.093 -2.532 -2.86 -3.191 -3.353 -3.679 -4.025 -4.396 -4.588 -5.045 -5.21 -5.432 -5.669 -6.174 -6.46 -6.775 -7.101 -7.466 -7.907 -8.538 -10.392 -4 ,28691 ,KEBNE ,17027414,Wed Dec 22 17:06:52 CET,Wed Dec 22 18:52:23 CET,0.0 1.021 1.472 1.868 2.22 2.547 2.828 3.067 3.485 3.673 3.878 4.031 4.453 4.619 4.942 5.248 5.518 5.633 5.861 6.095 6.434 6.649 6.859 7.16 7.439 7.708 7.967 8.217 8.554 8.88 9.179 9.539 9.866 10.159 10.479 10.83 11.167 11.52 11.905 12.301 12.676 13.081 13.555 13.978 14.364 14.721 15.083 15.409 15.614 15.546 15.074 14.094 12.966 11.81 10.723 9.784 8.963 8.171 7.487 6.781 6.156 5.58 5.005 4.458 3.934 3.435 2.92 2.472 2.073 1.654 1.22 0.864 0.497 0.121 -0.175 -0.5 -0.837 -1.192 -1.567 -1.83 -2.102 -2.515 -2.808 -3.122 -3.287 -3.627 -3.969 -4.32 -4.503 -4.955 -5.136 -5.375 -5.63 -6.179 -6.495 -6.842 -7.206 -7.617 -8.103 -8.717 -10.413 -5 ,29128 ,KEBNE ,17027415,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:50:27 CET,0.0 1.205 1.736 2.169 2.541 2.849 3.11 3.35 3.802 4.008 4.205 4.314 4.738 4.905 5.235 5.547 5.822 5.944 6.191 6.433 6.765 6.975 7.182 7.48 7.757 8.014 8.275 8.544 8.862 9.14 9.413 9.742 10.057 10.359 10.701 11.07 11.395 11.735 12.082 12.46 12.85 13.248 13.691 14.096 14.53 14.959 15.404 15.79 16.01 16.054 15.684 14.556 13.328 12.216 11.222 10.308 9.469 8.671 7.953 7.211 6.548 5.962 5.412 4.869 4.344 3.861 3.349 2.885 2.484 2.066 1.638 1.282 0.901 0.493 0.169 -0.155 -0.489 -0.851 -1.225 -1.469 -1.726 -2.158 -2.449 -2.742 -2.902 -3.24 -3.607 -4.004 -4.208 -4.673 -4.84 -5.058 -5.284 -5.798 -6.097 -6.431 -6.778 -7.142 -7.55 -8.068 -9.121 -6 ,9476 ,KEBNE ,17027416,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:52:05 CET,0.0 0.942 1.419 1.776 2.086 2.351 2.608 2.853 3.285 3.478 3.666 3.793 4.22 4.377 4.673 4.957 5.225 5.356 5.612 5.846 6.167 6.373 6.58 6.88 7.165 7.444 7.703 7.952 8.27 8.562 8.836 9.164 9.475 9.763 10.102 10.491 10.864 11.259 11.669 12.103 12.555 13.051 13.59 14.076 14.598 15.126 15.63 16.083 16.417 16.557 16.226 15.286 14.17 13.066 12.09 11.188 10.331 9.505 8.768 8.014 7.373 6.785 6.219 5.684 5.169 4.685 4.175 3.737 3.345 2.918 2.469 2.081 1.675 1.269 0.943 0.601 0.271 -0.065 -0.42 -0.666 -0.927 -1.335 -1.627 -1.949 -2.112 -2.453 -2.822 -3.211 -3.411 -3.862 -4.01 -4.244 -4.5 -5.056 -5.383 -5.737 -6.108 -6.527 -6.991 -7.574 -9.399 -7 ,23294 ,KEBNE ,17027417,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:51:14 CET,0.0 1.153 1.645 2.043 2.388 2.681 2.969 3.244 3.729 3.929 4.12 4.239 4.66 4.829 5.153 5.46 5.749 5.885 6.155 6.418 6.786 7.018 7.246 7.574 7.879 8.165 8.443 8.7 9.026 9.336 9.637 9.998 10.333 10.65 11.008 11.395 11.725 12.052 12.41 12.815 13.229 13.684 14.204 14.68 15.164 15.653 16.155 16.585 16.933 17.108 16.81 15.841 14.796 13.818 12.876 11.991 11.165 10.363 9.658 8.964 8.356 7.774 7.209 6.668 6.156 5.7 5.216 4.763 4.371 3.963 3.528 3.165 2.805 2.435 2.137 1.816 1.472 1.107 0.711 0.45 0.196 -0.214 -0.504 -0.811 -0.972 -1.292 -1.629 -2.0 -2.196 -2.659 -2.831 -3.056 -3.283 -3.795 -4.104 -4.426 -4.787 -5.183 -5.619 -6.253 -8.147 -8 ,23635 ,KEBNE ,17027418,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:52:05 CET,0.0 1.576 2.117 2.534 2.882 3.193 3.472 3.708 4.112 4.304 4.501 4.642 5.079 5.257 5.598 5.913 6.215 6.364 6.641 6.913 7.306 7.541 7.756 8.069 8.363 8.631 8.892 9.144 9.465 9.76 10.043 10.388 10.707 11.005 11.346 11.727 12.096 12.494 12.893 13.317 13.759 14.208 14.694 15.166 15.672 16.175 16.62 16.973 17.318 17.499 17.115 16.088 15.073 14.093 13.093 12.125 11.262 10.461 9.743 8.976 8.301 7.707 7.118 6.571 6.073 5.597 5.088 4.635 4.237 3.832 3.408 3.048 2.669 2.255 1.938 1.608 1.265 0.911 0.533 0.281 0.029 -0.396 -0.7 -1.017 -1.187 -1.533 -1.879 -2.245 -2.442 -2.903 -3.08 -3.303 -3.536 -4.06 -4.356 -4.676 -5.007 -5.376 -5.84 -6.5 -8.272 -9 ,27912 ,KEBNE ,17027419,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:51:11 CET,0.0 0.935 1.44 1.873 2.22 2.513 2.782 3.026 3.474 3.676 3.874 4.009 4.455 4.648 4.984 5.278 5.559 5.699 5.961 6.191 6.523 6.733 6.929 7.217 7.494 7.764 8.026 8.278 8.599 8.894 9.154 9.448 9.747 10.05 10.405 10.794 11.159 11.562 11.99 12.41 12.819 13.238 13.678 14.124 14.569 15.009 15.51 15.985 16.358 16.558 16.274 15.341 14.268 13.203 12.234 11.321 10.47 9.645 8.938 8.22 7.578 7.003 6.447 5.928 5.438 4.968 4.46 4.008 3.609 3.2 2.792 2.453 2.073 1.66 1.354 1.031 0.69 0.35 0.006 -0.225 -0.466 -0.877 -1.184 -1.511 -1.67 -1.974 -2.315 -2.683 -2.867 -3.307 -3.482 -3.708 -3.945 -4.448 -4.714 -5.026 -5.364 -5.717 -6.112 -6.666 -8.001 -10 ,29934 ,KEBNE ,17027420,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:51:32 CET,0.0 0.668 1.08 1.398 1.683 1.947 2.197 2.452 2.945 3.155 3.351 3.495 3.922 4.093 4.398 4.676 4.96 5.098 5.352 5.597 5.956 6.183 6.393 6.692 6.989 7.268 7.528 7.783 8.116 8.426 8.714 9.04 9.353 9.653 9.979 10.35 10.707 11.084 11.489 11.883 12.267 12.735 13.266 13.73 14.22 14.738 15.23 15.615 15.893 15.986 15.721 14.888 13.819 12.812 11.876 10.936 10.065 9.25 8.538 7.795 7.152 6.594 6.04 5.491 4.972 4.49 3.983 3.516 3.093 2.654 2.212 1.835 1.446 1.054 0.74 0.414 0.06 -0.306 -0.672 -0.923 -1.191 -1.605 -1.89 -2.209 -2.381 -2.733 -3.099 -3.504 -3.724 -4.192 -4.374 -4.613 -4.843 -5.304 -5.568 -5.867 -6.223 -6.646 -7.111 -7.715 -9.512 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 11f97d7b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27484 ,TETRA ,17608803,Sun Nov 28 22:14:14 CET,Mon Nov 29 00:16:28 CET,0.0 0.833 1.356 1.753 2.075 2.346 2.588 2.813 3.25 3.463 3.662 3.763 4.183 4.351 4.667 4.962 5.24 5.375 5.638 5.896 6.264 6.488 6.701 7.009 7.299 7.572 7.835 8.073 8.377 8.67 8.936 9.263 9.578 9.864 10.181 10.525 10.852 11.205 11.577 11.944 12.309 12.714 13.158 13.567 13.995 14.431 14.868 15.251 15.552 15.679 15.394 14.534 13.597 12.668 11.742 10.825 9.993 9.21 8.522 7.824 7.204 6.64 6.098 5.587 5.096 4.635 4.14 3.696 3.315 2.921 2.524 2.183 1.805 1.385 1.055 0.716 0.368 0.014 -0.355 -0.612 -0.888 -1.331 -1.636 -1.937 -2.086 -2.402 -2.735 -3.104 -3.316 -3.787 -3.95 -4.175 -4.414 -4.97 -5.301 -5.661 -6.015 -6.353 -6.823 -7.523 -9.464 -2 ,3901 ,TETRA ,17608804,Sun Nov 28 22:14:16 CET,Mon Nov 29 00:17:10 CET,0.0 0.995 1.539 1.962 2.303 2.6 2.872 3.111 3.537 3.73 3.907 3.985 4.388 4.542 4.837 5.114 5.387 5.52 5.769 6.004 6.331 6.535 6.741 7.039 7.319 7.595 7.844 8.066 8.357 8.632 8.894 9.219 9.534 9.822 10.144 10.496 10.81 11.143 11.486 11.843 12.221 12.619 13.058 13.472 13.88 14.304 14.743 15.12 15.363 15.437 15.088 14.216 13.264 12.248 11.289 10.402 9.575 8.749 8.0 7.255 6.617 6.047 5.479 4.933 4.427 3.953 3.451 2.994 2.589 2.159 1.696 1.298 0.891 0.494 0.184 -0.16 -0.515 -0.872 -1.243 -1.508 -1.796 -2.241 -2.537 -2.854 -3.029 -3.441 -3.861 -4.252 -4.457 -4.924 -5.146 -5.387 -5.647 -6.241 -6.574 -6.933 -7.311 -7.708 -8.193 -8.829 -10.263 -3 ,29060 ,TETRA ,17608805,Sun Nov 28 22:14:17 CET,Mon Nov 29 00:17:00 CET,0.0 1.19 1.679 2.081 2.426 2.734 3.001 3.244 3.671 3.884 4.096 4.221 4.647 4.805 5.114 5.414 5.687 5.813 6.048 6.282 6.634 6.856 7.075 7.392 7.688 7.956 8.211 8.458 8.761 9.038 9.306 9.649 9.991 10.295 10.627 11.006 11.343 11.689 12.044 12.414 12.801 13.246 13.763 14.231 14.738 15.274 15.822 16.311 16.697 16.892 16.588 15.603 14.574 13.532 12.554 11.626 10.73 9.883 9.139 8.347 7.646 7.018 6.412 5.842 5.305 4.807 4.282 3.81 3.394 2.961 2.512 2.123 1.709 1.27 0.93 0.59 0.242 -0.115 -0.487 -0.742 -0.999 -1.411 -1.705 -2.007 -2.163 -2.497 -2.866 -3.255 -3.464 -3.951 -4.167 -4.402 -4.653 -5.202 -5.53 -5.916 -6.31 -6.725 -7.205 -7.794 -9.504 -4 ,25597 ,TETRA ,17608806,Sun Nov 28 22:14:15 CET,Mon Nov 29 00:19:55 CET,0.0 0.965 1.377 1.734 2.032 2.285 2.534 2.769 3.191 3.376 3.551 3.626 4.027 4.176 4.46 4.742 5.005 5.125 5.355 5.584 5.911 6.116 6.319 6.623 6.924 7.215 7.479 7.717 8.022 8.295 8.558 8.885 9.179 9.46 9.794 10.158 10.489 10.835 11.196 11.579 11.96 12.349 12.777 13.177 13.608 14.034 14.432 14.761 14.985 15.059 14.718 13.821 12.844 11.879 10.968 10.064 9.216 8.4 7.641 6.86 6.188 5.588 5.013 4.46 3.942 3.48 2.984 2.526 2.138 1.727 1.273 0.896 0.516 0.113 -0.224 -0.572 -0.92 -1.275 -1.662 -1.945 -2.231 -2.675 -2.99 -3.321 -3.495 -3.859 -4.245 -4.651 -4.871 -5.363 -5.569 -5.813 -6.082 -6.668 -6.96 -7.282 -7.645 -8.057 -8.592 -9.353 -11.634 -5 ,7893 ,TETRA ,17608807,Sun Nov 28 22:14:17 CET,Mon Nov 29 00:19:54 CET,0.0 0.966 1.355 1.688 1.982 2.234 2.462 2.679 3.101 3.292 3.479 3.58 3.99 4.144 4.44 4.72 4.985 5.116 5.365 5.592 5.924 6.133 6.339 6.638 6.911 7.159 7.411 7.662 7.974 8.284 8.587 8.932 9.249 9.544 9.868 10.229 10.568 10.917 11.275 11.642 12.017 12.426 12.875 13.3 13.788 14.262 14.706 15.11 15.439 15.643 15.351 14.51 13.604 12.639 11.738 10.872 10.04 9.273 8.604 7.895 7.255 6.692 6.175 5.671 5.182 4.739 4.255 3.807 3.415 2.997 2.572 2.205 1.819 1.436 1.128 0.783 0.42 0.052 -0.332 -0.602 -0.885 -1.329 -1.633 -1.951 -2.118 -2.463 -2.826 -3.218 -3.425 -3.897 -4.1 -4.348 -4.602 -5.157 -5.462 -5.788 -6.155 -6.584 -7.15 -7.844 -9.5 -6 ,17076 ,TETRA ,17608808,Sun Nov 28 22:14:16 CET,Mon Nov 29 00:17:58 CET,0.0 0.929 1.407 1.794 2.081 2.343 2.582 2.804 3.223 3.41 3.599 3.713 4.133 4.29 4.602 4.898 5.162 5.287 5.541 5.784 6.099 6.29 6.477 6.76 7.034 7.31 7.574 7.817 8.144 8.448 8.724 9.05 9.359 9.65 9.979 10.337 10.677 11.051 11.458 11.876 12.297 12.741 13.183 13.614 14.14 14.621 15.046 15.459 15.833 16.029 15.719 14.826 13.865 12.853 11.94 11.113 10.299 9.512 8.844 8.162 7.506 6.902 6.359 5.832 5.316 4.839 4.332 3.894 3.51 3.088 2.648 2.291 1.909 1.488 1.174 0.846 0.504 0.162 -0.191 -0.459 -0.743 -1.168 -1.462 -1.786 -1.961 -2.301 -2.669 -3.061 -3.267 -3.742 -3.94 -4.178 -4.41 -4.935 -5.236 -5.568 -5.969 -6.424 -6.936 -7.558 -9.113 -7 ,15442 ,TETRA ,17608809,Sun Nov 28 22:14:19 CET,Mon Nov 29 00:17:32 CET,0.0 1.162 1.633 1.99 2.323 2.656 2.924 3.15 3.557 3.748 3.929 4.017 4.413 4.557 4.852 5.144 5.431 5.562 5.815 6.059 6.405 6.624 6.829 7.131 7.432 7.719 7.995 8.246 8.538 8.814 9.08 9.39 9.69 9.992 10.331 10.694 11.021 11.371 11.758 12.167 12.57 13.018 13.5 13.92 14.373 14.822 15.298 15.728 16.05 16.235 15.996 15.132 14.181 13.2 12.264 11.383 10.54 9.74 9.045 8.328 7.651 7.037 6.452 5.89 5.375 4.899 4.397 3.948 3.552 3.126 2.687 2.325 1.933 1.508 1.174 0.818 0.435 0.04 -0.357 -0.626 -0.907 -1.36 -1.669 -1.99 -2.155 -2.492 -2.877 -3.304 -3.518 -3.987 -4.194 -4.428 -4.656 -5.173 -5.475 -5.811 -6.172 -6.604 -7.132 -7.828 -9.485 -8 ,1460 ,TETRA ,17608810,Sun Nov 28 22:14:16 CET,Mon Nov 29 00:16:47 CET,0.0 1.034 1.479 1.822 2.123 2.395 2.65 2.891 3.329 3.526 3.704 3.785 4.206 4.368 4.676 4.982 5.268 5.406 5.674 5.909 6.244 6.464 6.679 6.976 7.252 7.518 7.761 7.995 8.291 8.563 8.824 9.135 9.437 9.725 10.036 10.372 10.697 11.055 11.439 11.846 12.259 12.69 13.152 13.574 14.044 14.508 14.933 15.294 15.635 15.901 15.727 14.937 13.949 12.943 12.01 11.136 10.324 9.523 8.804 8.107 7.517 6.956 6.395 5.85 5.317 4.822 4.296 3.798 3.372 2.925 2.453 2.077 1.675 1.253 0.914 0.548 0.192 -0.177 -0.559 -0.816 -1.1 -1.554 -1.874 -2.215 -2.399 -2.78 -3.163 -3.578 -3.803 -4.279 -4.497 -4.753 -5.028 -5.637 -5.968 -6.323 -6.704 -7.149 -7.733 -8.528 -10.797 -9 ,8908 ,TETRA ,17608811,Sun Nov 28 22:14:16 CET,Mon Nov 29 00:17:08 CET,0.0 0.982 1.36 1.678 1.978 2.227 2.45 2.669 3.059 3.236 3.416 3.509 3.914 4.062 4.344 4.615 4.872 5.001 5.25 5.475 5.798 6.015 6.225 6.512 6.773 7.024 7.267 7.508 7.816 8.11 8.391 8.718 9.022 9.318 9.658 10.018 10.343 10.7 11.092 11.488 11.897 12.336 12.789 13.212 13.67 14.12 14.558 14.956 15.235 15.288 14.843 13.817 12.717 11.631 10.606 9.652 8.798 8.002 7.289 6.553 5.895 5.298 4.716 4.12 3.556 3.065 2.545 2.088 1.69 1.24 0.754 0.347 -0.067 -0.491 -0.833 -1.199 -1.582 -1.982 -2.376 -2.648 -2.936 -3.385 -3.714 -4.051 -4.222 -4.6 -5.012 -5.431 -5.65 -6.148 -6.384 -6.642 -6.903 -7.479 -7.812 -8.17 -8.54 -8.922 -9.363 -9.917 -11.413 -10 ,14315 ,TETRA ,17608812,Sun Nov 28 22:14:17 CET,Mon Nov 29 00:19:03 CET,0.0 1.01 1.435 1.796 2.097 2.37 2.63 2.849 3.24 3.419 3.593 3.68 4.089 4.239 4.535 4.814 5.078 5.204 5.431 5.65 5.967 6.163 6.353 6.638 6.904 7.147 7.384 7.613 7.918 8.212 8.473 8.784 9.076 9.348 9.663 10.007 10.328 10.677 11.048 11.412 11.782 12.195 12.658 13.086 13.503 13.892 14.309 14.685 14.956 15.071 14.714 13.79 12.775 11.735 10.805 9.947 9.124 8.334 7.636 6.92 6.276 5.69 5.123 4.577 4.067 3.612 3.133 2.698 2.306 1.88 1.434 1.077 0.704 0.296 -0.008 -0.302 -0.621 -0.978 -1.356 -1.614 -1.89 -2.334 -2.65 -2.978 -3.139 -3.469 -3.813 -4.189 -4.39 -4.855 -5.025 -5.245 -5.477 -6.026 -6.33 -6.645 -7.01 -7.447 -7.987 -8.755 -10.764 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index dc64dac8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18035 ,KEBNE ,17027421,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:54:16 CET,0.0 0.794 1.189 1.515 1.805 2.029 2.227 2.414 2.756 2.903 3.038 3.067 3.429 3.538 3.744 3.934 4.127 4.214 4.369 4.518 4.723 4.841 4.949 5.095 5.227 5.349 5.461 5.559 5.678 5.794 5.899 6.012 6.1 6.174 6.262 6.327 6.362 6.374 6.36 6.336 6.273 6.178 6.037 5.821 5.447 4.871 4.054 2.947 1.289 -1.259 -5.374 -9.908 -13.388 -16.269 -18.681 -20.75 -22.503 -24.078 -25.428 -26.74 -27.819 -28.772 -29.691 -30.537 -31.298 -31.98 -32.688 -33.316 -33.857 -34.42 -34.999 -35.469 -35.957 -36.46 -36.84 -37.223 -37.618 -38.037 -38.473 -38.773 -39.09 -39.572 -39.889 -40.215 -40.39 -40.757 -41.131 -41.516 -41.72 -42.202 -42.376 -42.614 -42.857 -43.377 -43.658 -43.954 -44.292 -44.674 -45.094 -45.651 -46.616 -2 ,7209 ,KEBNE ,17027422,Wed Dec 22 17:06:52 CET,Wed Dec 22 18:54:37 CET,0.0 0.703 1.069 1.325 1.546 1.757 1.939 2.095 2.377 2.505 2.629 2.631 2.971 3.075 3.268 3.447 3.613 3.692 3.843 3.981 4.175 4.292 4.402 4.562 4.703 4.828 4.942 5.041 5.16 5.277 5.383 5.496 5.598 5.685 5.766 5.841 5.91 5.975 6.001 5.993 5.957 5.885 5.741 5.508 5.166 4.666 3.891 2.785 1.178 -1.263 -5.162 -9.646 -13.245 -16.169 -18.582 -20.687 -22.488 -24.079 -25.429 -26.757 -27.865 -28.831 -29.751 -30.622 -31.414 -32.11 -32.835 -33.49 -34.043 -34.611 -35.201 -35.681 -36.167 -36.672 -37.073 -37.478 -37.894 -38.325 -38.774 -39.082 -39.394 -39.875 -40.215 -40.574 -40.753 -41.108 -41.47 -41.846 -42.043 -42.52 -42.658 -42.87 -43.098 -43.588 -43.85 -44.122 -44.419 -44.746 -45.112 -45.57 -46.348 -3 ,11342 ,KEBNE ,17027423,Wed Dec 22 17:06:52 CET,Wed Dec 22 18:53:48 CET,0.0 0.905 1.28 1.576 1.819 2.029 2.225 2.41 2.736 2.881 3.03 3.065 3.416 3.526 3.746 3.948 4.133 4.22 4.38 4.535 4.741 4.857 4.966 5.12 5.26 5.391 5.51 5.613 5.755 5.887 5.991 6.11 6.216 6.307 6.408 6.494 6.564 6.628 6.656 6.65 6.605 6.53 6.397 6.182 5.853 5.318 4.466 3.348 1.805 -0.585 -4.585 -9.151 -12.674 -15.551 -17.973 -20.05 -21.808 -23.372 -24.706 -26.002 -27.092 -28.051 -28.943 -29.776 -30.546 -31.234 -31.947 -32.582 -33.133 -33.709 -34.297 -34.773 -35.257 -35.757 -36.145 -36.542 -36.952 -37.365 -37.786 -38.087 -38.404 -38.892 -39.228 -39.575 -39.748 -40.101 -40.481 -40.885 -41.093 -41.575 -41.747 -41.988 -42.233 -42.759 -43.054 -43.373 -43.707 -44.07 -44.475 -44.985 -46.19 -4 ,26876 ,KEBNE ,17027424,Wed Dec 22 17:06:52 CET,Wed Dec 22 18:53:31 CET,0.0 0.924 1.38 1.688 1.944 2.173 2.384 2.567 2.902 3.054 3.188 3.198 3.536 3.638 3.843 4.037 4.209 4.285 4.43 4.575 4.765 4.884 4.997 5.145 5.274 5.386 5.492 5.602 5.749 5.871 5.972 6.078 6.164 6.24 6.307 6.352 6.383 6.407 6.396 6.345 6.256 6.136 5.943 5.661 5.247 4.707 3.941 2.828 1.12 -1.449 -5.485 -10.115 -13.673 -16.611 -19.074 -21.175 -22.953 -24.5 -25.798 -27.079 -28.174 -29.126 -30.019 -30.851 -31.618 -32.323 -33.053 -33.689 -34.229 -34.785 -35.353 -35.826 -36.318 -36.834 -37.238 -37.648 -38.059 -38.475 -38.911 -39.219 -39.532 -39.998 -40.321 -40.661 -40.835 -41.191 -41.557 -41.953 -42.164 -42.651 -42.802 -43.032 -43.274 -43.782 -44.056 -44.365 -44.689 -45.047 -45.475 -45.989 -46.988 -5 ,10250 ,KEBNE ,17027425,Wed Dec 22 17:06:52 CET,Wed Dec 22 18:53:46 CET,0.0 0.659 1.064 1.364 1.606 1.809 2.0 2.173 2.504 2.647 2.779 2.792 3.133 3.234 3.408 3.561 3.714 3.789 3.934 4.068 4.264 4.394 4.508 4.657 4.794 4.911 5.012 5.103 5.218 5.333 5.441 5.557 5.663 5.751 5.826 5.889 5.936 5.963 5.958 5.928 5.879 5.803 5.644 5.394 4.99 4.417 3.618 2.546 0.96 -1.501 -5.404 -9.875 -13.407 -16.327 -18.777 -20.891 -22.685 -24.242 -25.555 -26.855 -27.952 -28.903 -29.798 -30.659 -31.441 -32.123 -32.824 -33.444 -33.98 -34.55 -35.145 -35.632 -36.126 -36.636 -37.029 -37.439 -37.864 -38.296 -38.741 -39.046 -39.36 -39.843 -40.185 -40.546 -40.728 -41.098 -41.479 -41.871 -42.07 -42.55 -42.696 -42.908 -43.135 -43.623 -43.899 -44.194 -44.495 -44.841 -45.243 -45.741 -46.673 -6 ,32750 ,KEBNE ,17027426,Wed Dec 22 17:06:52 CET,Wed Dec 22 18:53:22 CET,0.0 0.676 1.067 1.338 1.552 1.749 1.935 2.112 2.442 2.598 2.737 2.735 3.082 3.194 3.408 3.598 3.767 3.85 4.006 4.147 4.339 4.461 4.584 4.753 4.896 5.025 5.146 5.253 5.386 5.507 5.622 5.763 5.892 6.012 6.135 6.222 6.277 6.329 6.356 6.357 6.327 6.253 6.067 5.825 5.481 4.947 4.176 3.091 1.445 -1.059 -5.105 -9.677 -13.229 -16.102 -18.521 -20.617 -22.386 -23.963 -25.28 -26.555 -27.643 -28.623 -29.552 -30.404 -31.187 -31.892 -32.626 -33.276 -33.827 -34.387 -34.963 -35.446 -35.958 -36.491 -36.895 -37.313 -37.739 -38.179 -38.637 -38.947 -39.268 -39.766 -40.099 -40.449 -40.627 -40.984 -41.368 -41.772 -41.978 -42.453 -42.612 -42.844 -43.081 -43.615 -43.902 -44.188 -44.483 -44.828 -45.24 -45.703 -46.511 -7 ,7979 ,KEBNE ,17027427,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:54:14 CET,0.0 0.561 0.886 1.173 1.428 1.666 1.875 2.06 2.387 2.527 2.655 2.656 3.002 3.109 3.305 3.482 3.651 3.731 3.883 4.026 4.223 4.347 4.463 4.62 4.761 4.894 5.013 5.118 5.249 5.372 5.484 5.609 5.714 5.788 5.851 5.919 5.98 6.008 6.008 5.982 5.901 5.774 5.567 5.295 4.913 4.411 3.705 2.679 1.095 -1.423 -5.442 -9.981 -13.595 -16.579 -19.037 -21.149 -22.913 -24.465 -25.79 -27.072 -28.149 -29.082 -29.981 -30.841 -31.617 -32.314 -33.035 -33.676 -34.227 -34.789 -35.364 -35.843 -36.338 -36.852 -37.254 -37.661 -38.082 -38.513 -38.967 -39.277 -39.588 -40.072 -40.405 -40.749 -40.922 -41.275 -41.654 -42.055 -42.257 -42.742 -42.908 -43.135 -43.373 -43.905 -44.177 -44.46 -44.785 -45.13 -45.512 -45.958 -46.736 -8 ,14739 ,KEBNE ,17027428,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:53:12 CET,0.0 0.682 1.054 1.336 1.546 1.73 1.921 2.101 2.371 2.497 2.619 2.604 2.95 3.054 3.238 3.41 3.563 3.64 3.8 3.944 4.14 4.264 4.38 4.538 4.689 4.828 4.951 5.062 5.199 5.317 5.415 5.526 5.624 5.7 5.773 5.84 5.871 5.884 5.893 5.868 5.808 5.696 5.52 5.268 4.882 4.358 3.539 2.37 0.691 -1.713 -5.588 -10.057 -13.624 -16.568 -19.003 -21.154 -22.942 -24.464 -25.774 -27.076 -28.186 -29.173 -30.088 -30.928 -31.707 -32.413 -33.128 -33.766 -34.319 -34.898 -35.491 -35.966 -36.461 -36.979 -37.379 -37.791 -38.208 -38.635 -39.081 -39.384 -39.692 -40.172 -40.506 -40.842 -41.011 -41.36 -41.734 -42.136 -42.345 -42.821 -42.983 -43.204 -43.438 -43.947 -44.221 -44.518 -44.835 -45.167 -45.539 -45.955 -46.62 -9 ,15246 ,KEBNE ,17027429,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:55:04 CET,0.0 0.45 0.759 0.981 1.18 1.38 1.564 1.736 2.032 2.163 2.288 2.295 2.637 2.742 2.93 3.108 3.281 3.36 3.511 3.66 3.865 3.992 4.106 4.263 4.408 4.534 4.657 4.769 4.905 5.026 5.124 5.248 5.365 5.45 5.533 5.63 5.713 5.766 5.8 5.812 5.759 5.64 5.444 5.147 4.706 4.186 3.413 2.285 0.725 -1.625 -5.615 -10.222 -13.797 -16.731 -19.168 -21.302 -23.119 -24.675 -25.993 -27.307 -28.414 -29.401 -30.321 -31.16 -31.938 -32.642 -33.37 -34.024 -34.58 -35.155 -35.767 -36.258 -36.745 -37.247 -37.643 -38.054 -38.482 -38.931 -39.4 -39.725 -40.052 -40.545 -40.887 -41.251 -41.437 -41.808 -42.183 -42.591 -42.81 -43.29 -43.464 -43.703 -43.945 -44.442 -44.704 -44.981 -45.27 -45.594 -45.948 -46.387 -46.988 -10 ,1883 ,KEBNE ,17027430,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:54:00 CET,0.0 0.637 0.951 1.199 1.427 1.645 1.849 2.028 2.319 2.456 2.587 2.58 2.925 3.031 3.223 3.399 3.564 3.639 3.774 3.901 4.08 4.199 4.315 4.465 4.605 4.738 4.85 4.95 5.083 5.198 5.295 5.399 5.488 5.558 5.614 5.67 5.702 5.723 5.736 5.698 5.618 5.482 5.261 4.992 4.588 4.006 3.156 1.991 0.362 -2.07 -6.052 -10.607 -14.216 -17.13 -19.538 -21.617 -23.373 -24.951 -26.3 -27.592 -28.675 -29.636 -30.541 -31.39 -32.173 -32.867 -33.57 -34.192 -34.732 -35.294 -35.876 -36.352 -36.837 -37.334 -37.719 -38.116 -38.534 -38.976 -39.424 -39.731 -40.046 -40.526 -40.851 -41.197 -41.378 -41.747 -42.133 -42.534 -42.735 -43.217 -43.385 -43.617 -43.848 -44.336 -44.612 -44.906 -45.205 -45.532 -45.922 -46.424 -47.385 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index d3bd5b35..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13920 ,TETRA ,17608813,Sun Nov 28 22:14:41 CET,Mon Nov 29 00:16:14 CET,0.0 1.308 1.814 2.176 2.494 2.796 3.049 3.277 3.686 3.883 4.06 4.128 4.494 4.624 4.888 5.112 5.316 5.421 5.62 5.797 6.072 6.262 6.431 6.673 6.906 7.12 7.314 7.487 7.693 7.87 8.039 8.241 8.417 8.576 8.747 8.921 9.074 9.211 9.322 9.429 9.494 9.52 9.517 9.46 9.336 9.086 8.605 7.845 6.725 4.991 1.893 -1.872 -4.881 -7.309 -9.334 -11.126 -12.66 -14.04 -15.189 -16.31 -17.253 -18.068 -18.863 -19.606 -20.287 -20.914 -21.56 -22.131 -22.624 -23.134 -23.661 -24.096 -24.54 -25.007 -25.367 -25.741 -26.128 -26.514 -26.92 -27.204 -27.488 -27.917 -28.218 -28.531 -28.692 -29.018 -29.355 -29.713 -29.905 -30.37 -30.535 -30.766 -31.001 -31.484 -31.744 -32.025 -32.333 -32.687 -33.107 -33.597 -34.531 -2 ,31639 ,TETRA ,17608814,Sun Nov 28 22:14:42 CET,Mon Nov 29 00:20:59 CET,0.0 0.742 1.176 1.516 1.811 2.066 2.3 2.511 2.897 3.064 3.215 3.278 3.655 3.797 4.048 4.277 4.49 4.591 4.784 4.97 5.239 5.401 5.56 5.772 5.95 6.122 6.301 6.473 6.667 6.836 7.0 7.195 7.38 7.539 7.691 7.839 7.963 8.095 8.235 8.343 8.428 8.48 8.468 8.43 8.317 8.037 7.554 6.808 5.609 3.717 0.657 -2.927 -5.843 -8.274 -10.335 -12.123 -13.633 -14.975 -16.132 -17.265 -18.227 -19.075 -19.882 -20.637 -21.323 -21.941 -22.609 -23.221 -23.745 -24.282 -24.822 -25.261 -25.716 -26.188 -26.549 -26.92 -27.309 -27.715 -28.127 -28.403 -28.691 -29.135 -29.438 -29.755 -29.923 -30.27 -30.628 -31.003 -31.194 -31.65 -31.803 -32.012 -32.229 -32.68 -32.918 -33.168 -33.437 -33.736 -34.088 -34.54 -35.121 -3 ,27998 ,TETRA ,17608815,Sun Nov 28 22:14:41 CET,Mon Nov 29 00:20:17 CET,0.0 1.158 1.649 2.045 2.39 2.695 2.971 3.22 3.678 3.879 4.049 4.142 4.533 4.689 4.983 5.245 5.482 5.599 5.832 6.034 6.303 6.479 6.657 6.923 7.16 7.37 7.568 7.75 7.968 8.168 8.367 8.591 8.787 8.979 9.189 9.379 9.521 9.653 9.778 9.902 10.016 10.089 10.131 10.135 10.044 9.824 9.439 8.827 7.806 6.075 3.066 -0.636 -3.647 -6.096 -8.141 -9.921 -11.424 -12.749 -13.883 -15.001 -15.935 -16.766 -17.556 -18.301 -18.99 -19.614 -20.267 -20.839 -21.33 -21.825 -22.334 -22.764 -23.204 -23.659 -24.011 -24.377 -24.751 -25.137 -25.547 -25.833 -26.124 -26.565 -26.867 -27.173 -27.327 -27.651 -27.988 -28.341 -28.527 -28.981 -29.105 -29.313 -29.528 -29.989 -30.252 -30.531 -30.824 -31.158 -31.534 -31.954 -32.449 -4 ,28657 ,TETRA ,17608816,Sun Nov 28 22:14:43 CET,Mon Nov 29 00:22:22 CET,0.0 0.747 1.224 1.583 1.89 2.193 2.466 2.709 3.142 3.337 3.517 3.585 3.964 4.107 4.367 4.607 4.833 4.938 5.14 5.348 5.65 5.831 5.998 6.242 6.462 6.654 6.833 7.001 7.206 7.409 7.614 7.839 8.037 8.214 8.392 8.578 8.727 8.859 9.002 9.124 9.2 9.254 9.281 9.241 9.117 8.88 8.427 7.736 6.682 4.893 1.703 -2.064 -5.044 -7.467 -9.478 -11.229 -12.747 -14.081 -15.196 -16.302 -17.25 -18.087 -18.872 -19.599 -20.257 -20.854 -21.484 -22.049 -22.536 -23.046 -23.583 -24.014 -24.448 -24.895 -25.241 -25.606 -25.981 -26.365 -26.768 -27.047 -27.329 -27.754 -28.044 -28.349 -28.509 -28.858 -29.22 -29.577 -29.763 -30.222 -30.356 -30.569 -30.785 -31.228 -31.476 -31.744 -32.026 -32.333 -32.676 -33.106 -34.137 -5 ,26186 ,TETRA ,17608817,Sun Nov 28 22:14:42 CET,Mon Nov 29 00:07:48 CET,0.0 1.021 1.533 1.93 2.266 2.566 2.819 3.044 3.469 3.663 3.835 3.908 4.298 4.446 4.723 4.984 5.228 5.342 5.549 5.739 6.016 6.18 6.324 6.52 6.703 6.88 7.05 7.216 7.434 7.633 7.818 8.04 8.231 8.407 8.624 8.861 9.065 9.251 9.438 9.644 9.804 9.913 10.015 10.084 10.078 9.963 9.676 9.089 8.057 6.388 3.499 -0.006 -2.908 -5.324 -7.358 -9.127 -10.635 -11.962 -13.072 -14.185 -15.158 -16.013 -16.81 -17.571 -18.276 -18.897 -19.545 -20.122 -20.611 -21.117 -21.644 -22.079 -22.527 -22.985 -23.334 -23.692 -24.072 -24.466 -24.878 -25.165 -25.458 -25.911 -26.216 -26.529 -26.69 -27.023 -27.375 -27.743 -27.934 -28.388 -28.523 -28.734 -28.955 -29.423 -29.659 -29.9 -30.164 -30.45 -30.794 -31.23 -31.944 -6 ,31940 ,TETRA ,17608818,Sun Nov 28 22:14:43 CET,Mon Nov 29 00:21:48 CET,0.0 1.317 1.823 2.193 2.519 2.802 3.055 3.297 3.714 3.904 4.086 4.176 4.557 4.704 4.982 5.213 5.422 5.52 5.719 5.924 6.219 6.385 6.539 6.769 6.98 7.186 7.389 7.569 7.794 8.018 8.219 8.454 8.674 8.856 9.05 9.261 9.446 9.623 9.809 9.983 10.122 10.256 10.372 10.437 10.36 10.118 9.738 9.152 8.163 6.46 3.456 -0.179 -3.037 -5.422 -7.441 -9.176 -10.667 -11.995 -13.11 -14.218 -15.186 -16.051 -16.863 -17.617 -18.303 -18.917 -19.558 -20.141 -20.65 -21.168 -21.693 -22.118 -22.548 -22.998 -23.359 -23.736 -24.115 -24.502 -24.914 -25.198 -25.491 -25.95 -26.26 -26.576 -26.74 -27.084 -27.448 -27.84 -28.048 -28.521 -28.669 -28.886 -29.115 -29.611 -29.883 -30.159 -30.457 -30.783 -31.117 -31.493 -32.123 -7 ,25278 ,TETRA ,17608819,Sun Nov 28 22:14:42 CET,Mon Nov 29 00:21:56 CET,0.0 1.442 1.966 2.339 2.638 2.907 3.168 3.408 3.833 4.008 4.164 4.252 4.647 4.783 5.04 5.294 5.546 5.66 5.859 6.05 6.328 6.504 6.677 6.914 7.129 7.341 7.534 7.707 7.918 8.109 8.294 8.499 8.674 8.835 9.016 9.201 9.358 9.512 9.637 9.754 9.841 9.869 9.852 9.819 9.722 9.507 9.119 8.487 7.486 5.727 2.667 -0.867 -3.752 -6.172 -8.226 -10.007 -11.518 -12.873 -14.012 -15.108 -16.034 -16.84 -17.609 -18.359 -19.06 -19.692 -20.34 -20.917 -21.42 -21.936 -22.475 -22.926 -23.374 -23.826 -24.18 -24.552 -24.937 -25.337 -25.74 -26.01 -26.292 -26.723 -27.025 -27.346 -27.513 -27.858 -28.207 -28.573 -28.764 -29.22 -29.398 -29.634 -29.879 -30.391 -30.666 -30.948 -31.237 -31.549 -31.881 -32.259 -32.799 -8 ,5701 ,TETRA ,17608820,Sun Nov 28 22:14:45 CET,Mon Nov 29 00:21:21 CET,0.0 1.523 2.086 2.543 2.906 3.212 3.492 3.749 4.197 4.391 4.568 4.675 5.075 5.217 5.472 5.711 5.932 6.039 6.237 6.423 6.688 6.852 7.028 7.278 7.504 7.719 7.911 8.087 8.294 8.484 8.651 8.821 8.982 9.141 9.295 9.441 9.6 9.774 9.924 10.04 10.117 10.172 10.201 10.173 10.025 9.725 9.19 8.391 7.271 5.618 2.68 -0.881 -3.775 -6.217 -8.269 -10.091 -11.623 -12.954 -14.098 -15.21 -16.156 -17.022 -17.848 -18.589 -19.264 -19.906 -20.578 -21.162 -21.662 -22.188 -22.73 -23.184 -23.649 -24.11 -24.468 -24.84 -25.216 -25.603 -26.018 -26.296 -26.583 -27.047 -27.353 -27.662 -27.828 -28.182 -28.548 -28.93 -29.128 -29.603 -29.771 -30.009 -30.242 -30.714 -30.973 -31.251 -31.563 -31.909 -32.305 -32.761 -33.561 -9 ,14237 ,TETRA ,17608821,Sun Nov 28 22:14:44 CET,Mon Nov 29 00:24:00 CET,0.0 1.219 1.687 2.042 2.38 2.679 2.934 3.182 3.617 3.808 3.987 4.079 4.473 4.625 4.908 5.154 5.384 5.495 5.7 5.899 6.184 6.37 6.552 6.812 7.047 7.261 7.464 7.643 7.857 8.047 8.218 8.422 8.614 8.794 8.977 9.169 9.369 9.566 9.731 9.864 9.966 10.041 10.068 9.999 9.828 9.557 9.092 8.376 7.255 5.404 2.342 -1.269 -4.226 -6.635 -8.689 -10.537 -12.105 -13.474 -14.65 -15.805 -16.779 -17.655 -18.481 -19.264 -20.01 -20.676 -21.349 -21.941 -22.449 -22.975 -23.513 -23.955 -24.415 -24.886 -25.245 -25.611 -25.989 -26.392 -26.814 -27.1 -27.392 -27.835 -28.145 -28.462 -28.619 -28.952 -29.3 -29.651 -29.831 -30.287 -30.436 -30.652 -30.875 -31.369 -31.645 -31.927 -32.206 -32.498 -32.853 -33.297 -34.092 -10 ,17858 ,TETRA ,17608822,Sun Nov 28 22:14:43 CET,Mon Nov 29 00:22:43 CET,0.0 1.035 1.466 1.85 2.194 2.48 2.736 2.966 3.363 3.551 3.723 3.81 4.185 4.325 4.595 4.852 5.092 5.207 5.411 5.6 5.881 6.068 6.238 6.47 6.69 6.899 7.11 7.311 7.544 7.754 7.957 8.165 8.331 8.495 8.679 8.883 9.066 9.212 9.335 9.457 9.569 9.653 9.686 9.645 9.537 9.332 8.905 8.238 7.136 5.311 2.305 -1.265 -4.176 -6.573 -8.597 -10.367 -11.896 -13.251 -14.391 -15.52 -16.471 -17.312 -18.121 -18.87 -19.552 -20.187 -20.837 -21.418 -21.932 -22.456 -22.986 -23.416 -23.865 -24.33 -24.699 -25.085 -25.471 -25.866 -26.263 -26.533 -26.817 -27.267 -27.587 -27.909 -28.071 -28.41 -28.765 -29.153 -29.361 -29.823 -29.987 -30.207 -30.436 -30.926 -31.18 -31.446 -31.73 -32.054 -32.445 -32.909 -33.6 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 77f9ba34..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13694 ,TETRA ,17608823,Sun Nov 28 22:14:46 CET,Mon Nov 29 00:17:48 CET,0.0 0.585 0.999 1.348 1.666 1.952 2.199 2.437 2.895 3.111 3.318 3.4 3.894 4.077 4.422 4.744 5.046 5.191 5.478 5.765 6.168 6.419 6.668 7.031 7.379 7.722 8.056 8.371 8.776 9.166 9.539 9.991 10.421 10.838 11.344 11.9 12.419 12.997 13.614 14.253 14.928 15.699 16.608 17.515 18.594 19.805 21.177 22.69 24.425 26.52 28.997 30.999 32.124 32.758 33.077 33.181 33.196 33.1 32.906 32.68 32.465 32.256 32.024 31.797 31.565 31.294 31.022 30.79 30.539 30.273 30.021 29.792 29.532 29.261 29.054 28.831 28.582 28.313 28.05 27.875 27.687 27.389 27.169 26.918 26.78 26.489 26.177 25.855 25.691 25.243 25.143 24.943 24.742 24.344 24.102 23.813 23.519 23.19 22.836 22.394 20.623 -2 ,5212 ,TETRA ,17608824,Sun Nov 28 22:14:43 CET,Mon Nov 29 00:17:36 CET,0.0 0.911 1.318 1.661 1.98 2.265 2.505 2.729 3.165 3.371 3.57 3.645 4.125 4.301 4.636 4.945 5.251 5.399 5.679 5.951 6.352 6.611 6.856 7.224 7.592 7.945 8.286 8.612 9.035 9.436 9.807 10.253 10.686 11.109 11.603 12.146 12.656 13.228 13.841 14.499 15.199 15.992 16.918 17.835 18.872 20.023 21.367 22.892 24.686 26.791 29.262 31.24 32.304 32.854 33.149 33.292 33.369 33.371 33.276 33.122 32.95 32.753 32.534 32.318 32.088 31.856 31.604 31.374 31.18 30.963 30.73 30.533 30.32 30.089 29.895 29.692 29.47 29.225 28.983 28.805 28.606 28.299 28.074 27.839 27.712 27.435 27.159 26.854 26.686 26.243 26.168 25.98 25.783 25.343 25.088 24.814 24.505 24.123 23.662 23.031 21.288 -3 ,21840 ,TETRA ,17608825,Sun Nov 28 22:14:43 CET,Mon Nov 29 00:16:33 CET,0.0 1.048 1.49 1.849 2.181 2.483 2.771 3.029 3.498 3.713 3.911 3.995 4.487 4.668 5.011 5.342 5.659 5.803 6.089 6.368 6.77 7.024 7.263 7.613 7.945 8.271 8.606 8.935 9.346 9.73 10.099 10.54 10.972 11.39 11.888 12.45 12.985 13.569 14.18 14.83 15.523 16.301 17.185 18.082 19.147 20.325 21.689 23.225 24.97 27.0 29.365 31.27 32.348 32.975 33.31 33.42 33.424 33.401 33.312 33.121 32.935 32.76 32.543 32.304 32.078 31.85 31.602 31.382 31.17 30.946 30.705 30.483 30.255 30.023 29.813 29.579 29.315 29.033 28.747 28.545 28.322 27.964 27.727 27.475 27.341 27.058 26.773 26.48 26.323 25.888 25.759 25.53 25.309 24.857 24.6 24.303 23.988 23.643 23.222 22.718 21.03 -4 ,5743 ,TETRA ,17608826,Sun Nov 28 22:14:45 CET,Mon Nov 29 00:16:37 CET,0.0 1.049 1.495 1.844 2.153 2.444 2.702 2.947 3.397 3.612 3.815 3.893 4.387 4.572 4.916 5.239 5.554 5.707 6.005 6.286 6.677 6.927 7.175 7.537 7.89 8.234 8.57 8.904 9.335 9.734 10.106 10.562 11.0 11.417 11.911 12.481 13.032 13.627 14.248 14.897 15.59 16.386 17.307 18.235 19.328 20.534 21.89 23.396 25.15 27.276 29.834 31.894 33.057 33.682 34.009 34.166 34.177 34.111 34.0 33.841 33.659 33.444 33.223 32.997 32.76 32.519 32.246 31.994 31.762 31.509 31.259 31.05 30.811 30.547 30.326 30.096 29.86 29.609 29.34 29.149 28.957 28.639 28.406 28.168 28.041 27.766 27.471 27.163 27.001 26.542 26.409 26.187 25.96 25.501 25.264 24.984 24.687 24.35 23.898 23.33 21.861 -5 ,27759 ,TETRA ,17608827,Sun Nov 28 22:14:43 CET,Mon Nov 29 00:16:01 CET,0.0 0.906 1.417 1.812 2.141 2.433 2.681 2.923 3.399 3.616 3.829 3.942 4.443 4.629 4.982 5.306 5.61 5.757 6.051 6.341 6.748 6.997 7.238 7.604 7.957 8.29 8.607 8.915 9.317 9.7 10.079 10.534 10.972 11.403 11.888 12.418 12.938 13.533 14.167 14.822 15.507 16.276 17.18 18.07 19.122 20.33 21.663 23.153 24.921 27.005 29.47 31.394 32.466 33.039 33.303 33.389 33.383 33.294 33.166 33.015 32.844 32.649 32.43 32.218 32.005 31.765 31.508 31.285 31.077 30.837 30.576 30.365 30.119 29.841 29.615 29.369 29.121 28.874 28.589 28.363 28.121 27.771 27.542 27.299 27.169 26.889 26.585 26.262 26.098 25.647 25.564 25.364 25.131 24.625 24.358 24.065 23.736 23.348 22.867 22.315 20.646 -6 ,25554 ,TETRA ,17608828,Sun Nov 28 22:14:45 CET,Mon Nov 29 00:16:05 CET,0.0 1.064 1.528 1.907 2.244 2.542 2.824 3.082 3.536 3.752 3.96 4.039 4.526 4.704 5.043 5.356 5.654 5.803 6.095 6.378 6.779 7.035 7.288 7.65 8.004 8.345 8.67 8.982 9.379 9.768 10.147 10.598 11.03 11.444 11.924 12.461 12.98 13.549 14.164 14.818 15.485 16.217 17.077 17.965 19.014 20.184 21.541 23.024 24.728 26.745 29.169 31.04 32.035 32.615 32.909 33.016 33.003 32.964 32.879 32.703 32.493 32.286 32.064 31.833 31.611 31.389 31.154 30.909 30.672 30.422 30.145 29.908 29.659 29.415 29.217 28.985 28.737 28.482 28.203 28.001 27.79 27.452 27.228 26.997 26.871 26.587 26.291 25.978 25.804 25.346 25.216 24.998 24.765 24.285 24.021 23.709 23.357 22.942 22.501 21.955 19.648 -7 ,27145 ,TETRA ,17608829,Sun Nov 28 22:14:44 CET,Mon Nov 29 00:20:04 CET,0.0 1.272 1.771 2.198 2.574 2.889 3.162 3.407 3.861 4.081 4.284 4.36 4.859 5.046 5.385 5.709 6.02 6.18 6.5 6.794 7.197 7.452 7.7 8.05 8.382 8.709 9.031 9.345 9.745 10.132 10.52 10.979 11.401 11.814 12.302 12.85 13.379 13.95 14.555 15.203 15.905 16.686 17.574 18.473 19.539 20.736 22.121 23.629 25.345 27.352 29.755 31.685 32.757 33.355 33.63 33.773 33.846 33.799 33.699 33.587 33.438 33.242 33.045 32.864 32.671 32.458 32.205 31.965 31.751 31.52 31.267 31.042 30.814 30.573 30.371 30.164 29.959 29.734 29.475 29.289 29.093 28.781 28.548 28.307 28.182 27.904 27.635 27.356 27.202 26.756 26.671 26.481 26.277 25.815 25.544 25.254 24.933 24.551 24.103 23.541 22.193 -8 ,1872 ,TETRA ,17608830,Sun Nov 28 22:14:47 CET,Mon Nov 29 00:20:13 CET,0.0 0.839 1.256 1.615 1.919 2.196 2.462 2.716 3.181 3.396 3.597 3.663 4.147 4.323 4.659 4.982 5.298 5.452 5.748 6.031 6.431 6.687 6.932 7.282 7.636 7.987 8.322 8.636 9.036 9.434 9.822 10.285 10.716 11.129 11.608 12.145 12.67 13.256 13.879 14.536 15.239 16.023 16.923 17.797 18.83 20.019 21.372 22.856 24.562 26.604 29.117 31.079 32.103 32.666 32.943 33.027 32.998 32.89 32.776 32.63 32.419 32.182 31.936 31.71 31.484 31.255 31.014 30.778 30.563 30.358 30.123 29.899 29.662 29.402 29.189 28.958 28.707 28.43 28.141 27.943 27.732 27.39 27.149 26.897 26.767 26.501 26.223 25.928 25.776 25.328 25.218 25.011 24.795 24.348 24.102 23.825 23.532 23.209 22.838 22.294 20.198 -9 ,5976 ,TETRA ,17608831,Sun Nov 28 22:14:48 CET,Mon Nov 29 00:18:41 CET,0.0 0.924 1.401 1.802 2.155 2.469 2.745 3.0 3.471 3.685 3.889 3.976 4.466 4.643 4.978 5.302 5.611 5.763 6.062 6.358 6.77 7.038 7.303 7.664 8.012 8.361 8.701 9.026 9.437 9.828 10.209 10.673 11.108 11.529 12.019 12.564 13.085 13.663 14.283 14.935 15.618 16.379 17.274 18.205 19.277 20.428 21.773 23.328 25.184 27.348 29.878 31.837 32.829 33.358 33.58 33.638 33.626 33.536 33.413 33.24 33.036 32.84 32.643 32.408 32.155 31.922 31.66 31.397 31.159 30.919 30.634 30.374 30.118 29.854 29.648 29.438 29.192 28.928 28.66 28.468 28.271 27.932 27.688 27.451 27.332 27.095 26.824 26.514 26.362 25.924 25.808 25.609 25.41 24.967 24.737 24.479 24.172 23.83 23.379 22.791 21.032 -10 ,28478 ,TETRA ,17608832,Sun Nov 28 22:14:51 CET,Mon Nov 29 00:17:54 CET,0.0 0.947 1.392 1.772 2.106 2.401 2.685 2.958 3.439 3.658 3.864 3.933 4.425 4.602 4.933 5.248 5.563 5.721 6.024 6.315 6.744 7.016 7.263 7.62 7.975 8.31 8.631 8.943 9.344 9.726 10.095 10.553 10.999 11.421 11.897 12.43 12.956 13.546 14.188 14.859 15.546 16.316 17.205 18.091 19.127 20.297 21.638 23.135 24.918 26.972 29.386 31.373 32.404 32.959 33.238 33.315 33.274 33.174 33.055 32.901 32.725 32.521 32.296 32.052 31.801 31.567 31.329 31.113 30.892 30.623 30.335 30.108 29.873 29.619 29.416 29.191 28.961 28.704 28.404 28.189 27.969 27.646 27.417 27.156 27.018 26.73 26.427 26.107 25.935 25.478 25.368 25.17 24.953 24.456 24.2 23.923 23.589 23.198 22.722 22.097 19.425 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 80d09234..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2057 ,TETRA ,17608833,Sun Nov 28 22:15:42 CET,Mon Nov 29 00:17:55 CET,0.0 0.836 1.245 1.625 1.966 2.268 2.553 2.824 3.306 3.518 3.72 3.81 4.299 4.485 4.849 5.187 5.509 5.668 5.989 6.293 6.721 7.001 7.27 7.668 8.058 8.435 8.798 9.149 9.61 10.063 10.512 11.061 11.578 12.063 12.643 13.313 13.959 14.668 15.426 16.213 17.022 17.953 19.045 20.142 21.436 22.885 24.583 26.527 28.833 31.576 34.904 37.664 39.264 40.259 40.868 41.236 41.419 41.503 41.547 41.549 41.522 41.494 41.437 41.329 41.196 41.059 40.899 40.726 40.545 40.345 40.129 39.95 39.764 39.557 39.394 39.222 39.034 38.824 38.599 38.444 38.269 37.999 37.812 37.609 37.502 37.282 37.047 36.779 36.636 36.228 36.187 36.019 35.844 35.458 35.239 34.969 34.668 34.361 34.01 33.59 32.629 -2 ,10817 ,TETRA ,17608834,Sun Nov 28 22:14:45 CET,Mon Nov 29 00:02:43 CET,0.0 0.767 1.302 1.742 2.1 2.421 2.721 2.991 3.469 3.694 3.922 4.057 4.572 4.768 5.147 5.496 5.831 5.997 6.312 6.623 7.084 7.382 7.673 8.092 8.486 8.862 9.234 9.596 10.053 10.491 10.922 11.433 11.925 12.416 12.987 13.625 14.234 14.888 15.587 16.345 17.159 18.081 19.155 20.243 21.544 22.989 24.621 26.489 28.77 31.548 34.965 37.86 39.551 40.621 41.34 41.822 42.101 42.248 42.312 42.343 42.32 42.254 42.16 42.032 41.879 41.732 41.574 41.411 41.268 41.11 40.926 40.756 40.571 40.378 40.213 40.03 39.841 39.646 39.424 39.253 39.078 38.82 38.646 38.454 38.349 38.126 37.882 37.639 37.503 37.085 37.058 36.904 36.733 36.36 36.138 35.894 35.622 35.322 34.964 34.511 33.137 -3 ,30695 ,TETRA ,17608835,Sun Nov 28 22:15:42 CET,Mon Nov 29 00:18:09 CET,0.0 0.807 1.3 1.696 2.041 2.354 2.649 2.928 3.405 3.622 3.833 3.927 4.424 4.615 4.986 5.325 5.653 5.817 6.136 6.452 6.916 7.205 7.485 7.895 8.284 8.663 9.034 9.397 9.851 10.281 10.715 11.252 11.764 12.248 12.804 13.44 14.056 14.746 15.508 16.303 17.108 18.022 19.103 20.18 21.438 22.886 24.574 26.471 28.761 31.526 34.856 37.638 39.288 40.246 40.816 41.213 41.476 41.592 41.575 41.515 41.455 41.373 41.274 41.164 41.023 40.871 40.719 40.581 40.431 40.261 40.088 39.929 39.738 39.534 39.372 39.189 39.0 38.802 38.581 38.433 38.275 38.008 37.826 37.625 37.52 37.311 37.088 36.844 36.71 36.306 36.263 36.094 35.917 35.54 35.333 35.093 34.81 34.516 34.186 33.734 32.695 -4 ,14875 ,TETRA ,17608836,Sun Nov 28 22:15:43 CET,Mon Nov 29 00:18:21 CET,0.0 0.85 1.312 1.695 2.041 2.359 2.659 2.943 3.454 3.689 3.912 4.046 4.567 4.767 5.137 5.493 5.832 5.999 6.335 6.658 7.127 7.429 7.712 8.111 8.508 8.903 9.282 9.639 10.089 10.528 10.965 11.495 12.001 12.489 13.063 13.7 14.298 14.965 15.701 16.491 17.33 18.279 19.391 20.489 21.794 23.287 24.986 26.917 29.209 31.93 35.316 38.231 39.96 41.067 41.765 42.232 42.525 42.677 42.732 42.721 42.68 42.586 42.485 42.384 42.23 42.069 41.897 41.732 41.58 41.413 41.239 41.089 40.92 40.716 40.56 40.409 40.237 40.048 39.843 39.694 39.539 39.285 39.099 38.899 38.792 38.584 38.369 38.126 37.997 37.599 37.564 37.399 37.224 36.854 36.655 36.434 36.168 35.866 35.529 35.083 34.086 -5 ,10732 ,TETRA ,17608837,Sun Nov 28 22:15:44 CET,Mon Nov 29 00:17:41 CET,0.0 0.835 1.276 1.681 2.041 2.348 2.634 2.907 3.425 3.664 3.889 4.014 4.528 4.73 5.1 5.443 5.784 5.951 6.267 6.58 7.037 7.323 7.6 8.005 8.394 8.773 9.141 9.496 9.951 10.384 10.808 11.325 11.815 12.286 12.836 13.465 14.085 14.766 15.501 16.287 17.12 18.063 19.161 20.257 21.535 23.0 24.686 26.577 28.864 31.616 35.006 37.9 39.594 40.629 41.28 41.734 42.02 42.169 42.206 42.17 42.096 42.013 41.919 41.785 41.635 41.49 41.313 41.129 40.971 40.801 40.608 40.439 40.262 40.07 39.912 39.747 39.575 39.387 39.176 39.025 38.862 38.58 38.369 38.164 38.063 37.841 37.588 37.328 37.196 36.788 36.761 36.608 36.44 36.053 35.819 35.565 35.304 35.004 34.654 34.21 33.174 -6 ,13851 ,TETRA ,17608838,Sun Nov 28 22:15:46 CET,Mon Nov 29 00:19:24 CET,0.0 0.643 1.122 1.516 1.847 2.156 2.438 2.693 3.172 3.401 3.613 3.703 4.196 4.392 4.772 5.128 5.467 5.635 5.961 6.276 6.742 7.039 7.323 7.73 8.123 8.504 8.871 9.247 9.744 10.21 10.648 11.175 11.682 12.165 12.73 13.361 13.965 14.633 15.36 16.141 16.957 17.875 18.957 20.054 21.356 22.785 24.443 26.385 28.711 31.505 34.963 37.928 39.676 40.767 41.461 41.903 42.17 42.335 42.417 42.424 42.389 42.331 42.256 42.173 42.057 41.924 41.783 41.64 41.497 41.344 41.164 41.01 40.846 40.653 40.501 40.341 40.165 39.978 39.762 39.607 39.453 39.196 39.01 38.815 38.71 38.482 38.234 37.963 37.816 37.397 37.36 37.192 37.007 36.594 36.364 36.113 35.823 35.498 35.125 34.603 32.988 -7 ,9996 ,TETRA ,17608839,Sun Nov 28 22:15:48 CET,Mon Nov 29 00:19:50 CET,0.0 0.954 1.424 1.808 2.123 2.423 2.722 3.014 3.533 3.76 3.969 4.074 4.581 4.772 5.132 5.474 5.79 5.944 6.246 6.545 6.992 7.282 7.557 7.944 8.312 8.671 9.026 9.373 9.827 10.274 10.707 11.241 11.742 12.22 12.79 13.428 14.043 14.705 15.426 16.217 17.041 17.956 19.044 20.163 21.465 22.927 24.624 26.57 28.89 31.665 35.113 37.991 39.695 40.781 41.481 41.955 42.214 42.33 42.4 42.41 42.39 42.341 42.24 42.128 42.009 41.863 41.694 41.548 41.407 41.235 41.045 40.886 40.714 40.531 40.387 40.226 40.051 39.858 39.647 39.497 39.337 39.068 38.871 38.67 38.573 38.378 38.168 37.938 37.809 37.417 37.401 37.254 37.092 36.732 36.525 36.29 36.017 35.727 35.419 34.99 33.875 -8 ,11321 ,TETRA ,17608840,Sun Nov 28 22:15:44 CET,Mon Nov 29 00:18:17 CET,0.0 0.781 1.267 1.619 1.934 2.238 2.52 2.785 3.283 3.516 3.742 3.859 4.366 4.561 4.944 5.307 5.64 5.809 6.144 6.462 6.929 7.228 7.517 7.939 8.329 8.701 9.07 9.434 9.905 10.35 10.783 11.316 11.822 12.307 12.873 13.503 14.114 14.799 15.564 16.364 17.196 18.162 19.276 20.396 21.741 23.206 24.872 26.8 29.087 31.871 35.351 38.238 39.951 41.084 41.788 42.222 42.478 42.602 42.63 42.619 42.594 42.533 42.416 42.261 42.1 41.939 41.768 41.61 41.455 41.283 41.096 40.934 40.754 40.546 40.372 40.194 40.014 39.822 39.613 39.464 39.303 39.029 38.835 38.633 38.527 38.318 38.094 37.844 37.713 37.316 37.307 37.145 36.974 36.6 36.374 36.141 35.902 35.617 35.248 34.8 33.898 -9 ,28868 ,TETRA ,17608841,Sun Nov 28 22:15:47 CET,Mon Nov 29 00:18:16 CET,0.0 1.031 1.528 1.925 2.265 2.57 2.846 3.101 3.588 3.813 4.031 4.153 4.651 4.831 5.188 5.53 5.86 6.021 6.334 6.648 7.099 7.376 7.639 8.029 8.415 8.79 9.155 9.514 9.972 10.416 10.852 11.373 11.887 12.38 12.949 13.594 14.205 14.885 15.61 16.373 17.19 18.125 19.227 20.366 21.713 23.175 24.879 26.861 29.224 32.029 35.47 38.34 39.994 40.977 41.58 41.956 42.129 42.181 42.177 42.119 42.043 41.957 41.833 41.675 41.496 41.306 41.11 40.924 40.754 40.559 40.343 40.161 39.974 39.789 39.63 39.459 39.279 39.088 38.889 38.752 38.611 38.393 38.235 38.066 37.977 37.771 37.542 37.301 37.181 36.795 36.778 36.627 36.459 36.088 35.882 35.638 35.37 35.071 34.699 34.239 33.127 -10 ,5627 ,TETRA ,17608842,Sun Nov 28 22:15:49 CET,Mon Nov 29 00:18:31 CET,0.0 1.064 1.553 1.941 2.294 2.611 2.875 3.129 3.625 3.851 4.069 4.172 4.667 4.863 5.234 5.58 5.921 6.086 6.399 6.701 7.155 7.444 7.723 8.124 8.509 8.883 9.234 9.578 10.045 10.501 10.936 11.451 11.947 12.436 13.006 13.64 14.248 14.922 15.659 16.45 17.273 18.21 19.307 20.391 21.669 23.116 24.817 26.773 29.062 31.798 35.207 38.118 39.842 40.912 41.642 42.116 42.396 42.555 42.595 42.564 42.535 42.475 42.365 42.254 42.125 41.983 41.832 41.677 41.522 41.348 41.146 40.974 40.8 40.601 40.435 40.265 40.092 39.905 39.699 39.554 39.401 39.141 38.941 38.734 38.633 38.413 38.181 37.921 37.784 37.38 37.359 37.204 37.032 36.639 36.404 36.12 35.808 35.463 35.063 34.575 33.221 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 6d88e05f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16053 ,TETRA ,17608843,Sun Nov 28 22:15:44 CET,Mon Nov 29 00:17:49 CET,0.0 0.646 1.081 1.433 1.734 2.021 2.27 2.49 2.905 3.106 3.301 3.385 3.858 4.022 4.343 4.654 4.943 5.08 5.34 5.593 5.953 6.183 6.406 6.724 7.027 7.323 7.613 7.893 8.253 8.605 8.944 9.349 9.73 10.098 10.531 11.019 11.481 11.978 12.514 13.073 13.654 14.32 15.099 15.871 16.749 17.709 18.811 19.971 21.254 22.699 24.307 25.352 25.717 25.753 25.638 25.445 25.208 24.95 24.671 24.354 24.051 23.756 23.48 23.211 22.924 22.654 22.356 22.076 21.835 21.56 21.255 21.008 20.754 20.468 20.243 20.012 19.771 19.519 19.248 19.06 18.867 18.564 18.346 18.109 17.986 17.725 17.451 17.16 17.001 16.562 16.498 16.318 16.136 15.736 15.509 15.27 15.014 14.718 14.365 13.92 12.992 -2 ,6895 ,TETRA ,17608844,Sun Nov 28 22:15:45 CET,Mon Nov 29 00:18:16 CET,0.0 1.01 1.463 1.84 2.167 2.466 2.734 2.981 3.419 3.621 3.823 3.923 4.394 4.567 4.892 5.191 5.484 5.631 5.904 6.158 6.533 6.775 7.005 7.325 7.65 7.973 8.268 8.551 8.909 9.258 9.61 10.017 10.393 10.763 11.194 11.663 12.103 12.589 13.122 13.684 14.266 14.903 15.633 16.364 17.203 18.126 19.154 20.264 21.503 22.903 24.472 25.499 25.885 25.972 25.842 25.634 25.404 25.138 24.841 24.504 24.206 23.91 23.618 23.308 22.994 22.722 22.432 22.148 21.889 21.621 21.342 21.095 20.83 20.555 20.335 20.094 19.841 19.577 19.31 19.126 18.929 18.615 18.399 18.173 18.052 17.797 17.524 17.233 17.077 16.634 16.564 16.371 16.166 15.743 15.53 15.29 15.009 14.705 14.341 13.818 12.54 -3 ,20893 ,TETRA ,17608845,Sun Nov 28 22:15:45 CET,Mon Nov 29 00:18:58 CET,0.0 0.847 1.262 1.611 1.941 2.228 2.475 2.715 3.169 3.373 3.57 3.655 4.123 4.289 4.613 4.926 5.226 5.367 5.639 5.902 6.277 6.516 6.746 7.083 7.392 7.696 7.996 8.273 8.62 8.956 9.292 9.699 10.089 10.462 10.891 11.383 11.853 12.348 12.878 13.436 14.006 14.645 15.385 16.109 16.913 17.784 18.827 19.998 21.269 22.716 24.357 25.445 25.892 26.005 25.886 25.656 25.4 25.125 24.855 24.543 24.248 23.962 23.663 23.366 23.082 22.821 22.55 22.283 22.027 21.76 21.48 21.24 20.985 20.719 20.506 20.279 20.03 19.754 19.455 19.249 19.047 18.726 18.49 18.244 18.118 17.841 17.555 17.282 17.139 16.71 16.645 16.472 16.275 15.821 15.59 15.341 15.074 14.783 14.418 13.971 13.005 -4 ,26765 ,TETRA ,17608846,Sun Nov 28 22:15:47 CET,Mon Nov 29 00:18:00 CET,0.0 1.029 1.517 1.9 2.218 2.513 2.79 3.029 3.476 3.682 3.874 3.952 4.419 4.586 4.899 5.191 5.472 5.612 5.881 6.131 6.497 6.728 6.956 7.301 7.63 7.935 8.229 8.517 8.892 9.262 9.611 10.018 10.411 10.789 11.219 11.704 12.17 12.672 13.21 13.757 14.325 14.962 15.684 16.419 17.267 18.191 19.219 20.325 21.653 23.174 24.816 25.958 26.385 26.47 26.426 26.277 26.047 25.808 25.555 25.24 24.941 24.65 24.358 24.08 23.801 23.526 23.232 22.956 22.711 22.447 22.152 21.901 21.642 21.373 21.167 20.944 20.712 20.466 20.197 20.001 19.794 19.49 19.287 19.072 18.959 18.718 18.461 18.182 18.032 17.611 17.563 17.389 17.207 16.804 16.58 16.332 16.062 15.753 15.376 14.904 13.824 -5 ,12129 ,TETRA ,17608847,Sun Nov 28 22:15:45 CET,Mon Nov 29 00:21:04 CET,0.0 0.918 1.407 1.773 2.091 2.374 2.625 2.864 3.295 3.491 3.682 3.759 4.22 4.385 4.703 5.011 5.296 5.426 5.681 5.928 6.302 6.533 6.762 7.098 7.401 7.688 7.968 8.246 8.608 8.954 9.294 9.703 10.097 10.456 10.853 11.306 11.741 12.228 12.762 13.322 13.896 14.527 15.262 15.991 16.817 17.722 18.726 19.84 21.098 22.47 23.974 24.917 25.281 25.407 25.344 25.166 24.956 24.695 24.424 24.119 23.799 23.481 23.168 22.87 22.572 22.287 21.986 21.695 21.432 21.159 20.875 20.635 20.366 20.078 19.863 19.643 19.401 19.138 18.88 18.697 18.494 18.165 17.93 17.685 17.557 17.289 17.01 16.723 16.568 16.118 16.035 15.849 15.653 15.228 14.994 14.727 14.435 14.111 13.691 13.163 12.196 -6 ,21730 ,TETRA ,17608848,Sun Nov 28 22:15:47 CET,Mon Nov 29 00:21:09 CET,0.0 1.219 1.664 2.006 2.298 2.574 2.836 3.091 3.523 3.711 3.896 3.969 4.44 4.601 4.908 5.205 5.485 5.622 5.89 6.145 6.503 6.727 6.949 7.268 7.582 7.891 8.183 8.466 8.835 9.201 9.55 9.963 10.355 10.736 11.177 11.667 12.129 12.613 13.161 13.745 14.311 14.938 15.681 16.437 17.307 18.252 19.326 20.489 21.769 23.145 24.678 25.738 26.085 26.146 26.083 25.915 25.685 25.417 25.125 24.817 24.556 24.288 23.99 23.699 23.406 23.113 22.803 22.525 22.282 22.029 21.752 21.505 21.249 20.978 20.752 20.507 20.256 20.004 19.729 19.536 19.336 19.018 18.799 18.567 18.444 18.19 17.923 17.629 17.468 17.027 16.969 16.778 16.578 16.132 15.888 15.622 15.313 14.97 14.583 14.078 12.877 -7 ,20399 ,TETRA ,17608849,Sun Nov 28 22:15:45 CET,Mon Nov 29 00:22:34 CET,0.0 0.851 1.254 1.581 1.866 2.136 2.387 2.63 3.063 3.253 3.431 3.489 3.945 4.107 4.419 4.708 4.987 5.13 5.411 5.682 6.07 6.308 6.543 6.892 7.217 7.529 7.831 8.131 8.53 8.911 9.275 9.717 10.138 10.538 10.997 11.508 11.994 12.531 13.104 13.69 14.274 14.902 15.622 16.339 17.17 18.076 19.103 20.257 21.543 22.926 24.416 25.423 25.835 25.934 25.884 25.746 25.548 25.318 25.051 24.717 24.414 24.142 23.866 23.574 23.281 23.007 22.71 22.439 22.192 21.928 21.658 21.415 21.151 20.88 20.663 20.429 20.191 19.938 19.665 19.471 19.268 18.946 18.722 18.495 18.381 18.134 17.858 17.568 17.415 16.98 16.927 16.754 16.569 16.146 15.906 15.636 15.331 15.002 14.63 14.165 13.014 -8 ,1820 ,TETRA ,17608850,Sun Nov 28 22:15:46 CET,Mon Nov 29 00:18:58 CET,0.0 0.738 1.185 1.543 1.847 2.127 2.4 2.653 3.087 3.284 3.466 3.511 3.968 4.126 4.438 4.735 5.014 5.151 5.424 5.689 6.061 6.293 6.523 6.863 7.193 7.502 7.799 8.089 8.462 8.816 9.149 9.553 9.942 10.316 10.744 11.219 11.675 12.166 12.701 13.265 13.852 14.51 15.268 16.041 16.912 17.851 18.915 20.088 21.454 22.969 24.564 25.611 26.036 26.141 26.056 25.853 25.604 25.327 25.05 24.741 24.431 24.111 23.788 23.494 23.202 22.905 22.584 22.296 22.041 21.761 21.462 21.21 20.946 20.679 20.471 20.244 20.006 19.752 19.482 19.295 19.098 18.778 18.557 18.325 18.204 17.956 17.682 17.391 17.241 16.818 16.757 16.579 16.394 15.986 15.76 15.532 15.287 15.002 14.664 14.212 13.162 -9 ,29619 ,TETRA ,17608851,Sun Nov 28 22:15:48 CET,Mon Nov 29 00:19:21 CET,0.0 0.691 1.156 1.504 1.813 2.092 2.331 2.565 3.015 3.224 3.423 3.498 3.964 4.137 4.457 4.755 5.052 5.201 5.481 5.733 6.099 6.336 6.57 6.904 7.217 7.523 7.816 8.102 8.476 8.827 9.173 9.594 9.985 10.361 10.795 11.283 11.754 12.267 12.809 13.393 13.993 14.649 15.402 16.134 16.997 17.949 18.997 20.14 21.42 22.897 24.527 25.593 26.027 26.147 26.052 25.805 25.532 25.24 24.952 24.632 24.329 24.038 23.741 23.443 23.151 22.872 22.569 22.288 22.037 21.781 21.507 21.273 21.033 20.771 20.551 20.315 20.076 19.819 19.546 19.364 19.167 18.862 18.658 18.432 18.31 18.068 17.805 17.512 17.355 16.913 16.848 16.663 16.465 16.04 15.806 15.558 15.279 14.955 14.564 14.029 12.576 -10 ,7595 ,TETRA ,17608852,Sun Nov 28 22:15:50 CET,Mon Nov 29 00:19:24 CET,0.0 1.276 1.735 2.075 2.384 2.678 2.946 3.191 3.652 3.866 4.063 4.145 4.611 4.777 5.101 5.405 5.699 5.84 6.115 6.375 6.731 6.958 7.18 7.514 7.844 8.157 8.452 8.747 9.134 9.489 9.835 10.246 10.636 11.027 11.473 11.957 12.422 12.942 13.481 14.032 14.628 15.292 16.052 16.812 17.69 18.632 19.678 20.831 22.108 23.491 25.033 26.079 26.493 26.597 26.521 26.365 26.157 25.898 25.615 25.272 24.949 24.643 24.314 23.982 23.671 23.385 23.074 22.787 22.538 22.264 21.966 21.715 21.457 21.185 20.966 20.737 20.486 20.221 19.947 19.756 19.563 19.253 19.031 18.808 18.691 18.434 18.166 17.88 17.729 17.295 17.238 17.057 16.866 16.463 16.231 15.974 15.685 15.351 14.976 14.479 13.439 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index f14c419d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28789 ,TETRA ,17608853,Sun Nov 28 22:15:51 CET,Mon Nov 29 00:21:41 CET,0.0 0.717 1.118 1.448 1.721 1.954 2.167 2.387 2.824 3.019 3.202 3.288 3.719 3.88 4.186 4.478 4.756 4.884 5.14 5.4 5.773 6.002 6.213 6.528 6.844 7.147 7.445 7.73 8.088 8.431 8.764 9.166 9.549 9.919 10.344 10.814 11.263 11.745 12.261 12.829 13.421 14.074 14.811 15.527 16.335 17.212 18.178 19.211 20.393 21.667 22.901 23.559 23.707 23.582 23.311 22.977 22.611 22.235 21.882 21.505 21.136 20.763 20.405 20.088 19.778 19.456 19.081 18.763 18.502 18.211 17.895 17.621 17.33 17.014 16.772 16.537 16.298 16.036 15.752 15.553 15.346 15.015 14.773 14.523 14.394 14.133 13.863 13.57 13.411 12.974 12.85 12.662 12.461 12.01 11.776 11.54 11.28 10.997 10.663 10.251 9.153 -2 ,20802 ,TETRA ,17608854,Sun Nov 28 22:15:45 CET,Mon Nov 29 00:23:58 CET,0.0 0.801 1.219 1.58 1.886 2.159 2.401 2.623 3.041 3.237 3.422 3.502 3.935 4.094 4.392 4.671 4.946 5.083 5.346 5.597 5.964 6.195 6.419 6.758 7.091 7.399 7.696 7.99 8.351 8.696 9.041 9.459 9.86 10.239 10.678 11.178 11.646 12.142 12.654 13.185 13.737 14.357 15.072 15.798 16.599 17.399 18.303 19.257 20.334 21.547 22.747 23.47 23.682 23.591 23.305 22.934 22.594 22.306 22.032 21.661 21.299 20.968 20.65 20.337 20.007 19.693 19.367 19.07 18.786 18.477 18.161 17.897 17.598 17.271 17.018 16.768 16.516 16.256 15.965 15.739 15.522 15.206 14.962 14.707 14.572 14.264 13.947 13.637 13.485 13.061 12.939 12.737 12.513 12.002 11.734 11.463 11.168 10.854 10.489 9.971 8.904 -3 ,23510 ,TETRA ,17608855,Sun Nov 28 22:15:45 CET,Mon Nov 29 00:23:47 CET,0.0 0.842 1.306 1.649 1.953 2.241 2.481 2.7 3.122 3.317 3.5 3.572 4.001 4.158 4.479 4.782 5.056 5.191 5.451 5.703 6.057 6.281 6.494 6.795 7.097 7.398 7.691 7.968 8.323 8.662 8.984 9.373 9.736 10.074 10.472 10.913 11.319 11.788 12.296 12.801 13.332 13.942 14.64 15.329 16.139 17.016 17.946 18.946 20.057 21.22 22.375 23.006 23.13 22.969 22.675 22.335 21.984 21.622 21.271 20.898 20.513 20.147 19.792 19.417 19.063 18.741 18.373 18.033 17.744 17.458 17.176 16.931 16.663 16.374 16.147 15.908 15.644 15.373 15.098 14.901 14.691 14.355 14.13 13.886 13.749 13.469 13.178 12.871 12.704 12.266 12.175 11.979 11.764 11.3 11.035 10.759 10.474 10.129 9.726 9.205 7.85 -4 ,3052 ,TETRA ,17608856,Sun Nov 28 22:15:47 CET,Mon Nov 29 00:23:13 CET,0.0 0.58 0.961 1.282 1.542 1.782 2.021 2.242 2.64 2.845 3.053 3.153 3.592 3.754 4.068 4.37 4.656 4.799 5.073 5.331 5.701 5.94 6.172 6.491 6.795 7.089 7.363 7.625 7.966 8.298 8.62 9.001 9.355 9.708 10.128 10.574 10.994 11.466 11.974 12.503 13.041 13.631 14.317 14.997 15.771 16.638 17.648 18.734 19.917 21.205 22.507 23.289 23.514 23.455 23.218 22.852 22.489 22.15 21.797 21.4 21.024 20.668 20.311 19.932 19.562 19.214 18.857 18.542 18.254 17.951 17.633 17.365 17.088 16.8 16.556 16.296 16.046 15.786 15.495 15.286 15.067 14.724 14.493 14.244 14.106 13.821 13.522 13.212 13.057 12.629 12.504 12.293 12.072 11.606 11.357 11.099 10.816 10.505 10.155 9.709 8.216 -5 ,8427 ,TETRA ,17608857,Sun Nov 28 22:16:43 CET,Mon Nov 29 00:22:59 CET,0.0 0.751 1.172 1.505 1.785 2.044 2.287 2.515 2.927 3.117 3.296 3.365 3.802 3.973 4.298 4.581 4.836 4.965 5.224 5.464 5.807 6.034 6.251 6.564 6.864 7.151 7.426 7.697 8.064 8.411 8.738 9.149 9.547 9.918 10.342 10.813 11.264 11.756 12.287 12.834 13.376 13.973 14.66 15.348 16.148 17.007 17.962 19.036 20.226 21.464 22.757 23.446 23.574 23.453 23.194 22.843 22.434 22.029 21.667 21.273 20.908 20.577 20.221 19.823 19.445 19.107 18.728 18.366 18.064 17.753 17.422 17.14 16.845 16.536 16.298 16.056 15.802 15.516 15.221 15.008 14.774 14.427 14.189 13.938 13.805 13.519 13.207 12.859 12.672 12.224 12.095 11.893 11.671 11.183 10.922 10.656 10.356 10.016 9.62 9.099 8.08 -6 ,29897 ,TETRA ,17608858,Sun Nov 28 22:16:44 CET,Mon Nov 29 00:23:15 CET,0.0 0.781 1.124 1.414 1.699 1.956 2.192 2.42 2.844 3.037 3.222 3.297 3.727 3.886 4.194 4.488 4.759 4.888 5.139 5.39 5.749 5.972 6.198 6.524 6.819 7.107 7.385 7.647 7.985 8.315 8.636 9.03 9.403 9.743 10.135 10.589 11.01 11.45 11.935 12.467 13.018 13.627 14.312 14.972 15.742 16.593 17.529 18.51 19.579 20.75 21.934 22.626 22.768 22.625 22.348 21.993 21.62 21.267 20.907 20.488 20.111 19.751 19.389 19.041 18.72 18.392 18.024 17.695 17.413 17.122 16.807 16.554 16.291 15.989 15.748 15.481 15.194 14.907 14.602 14.4 14.192 13.849 13.612 13.378 13.254 12.99 12.693 12.353 12.175 11.743 11.653 11.462 11.257 10.802 10.532 10.239 9.93 9.522 9.047 8.471 7.338 -7 ,23332 ,TETRA ,17608859,Sun Nov 28 22:16:44 CET,Mon Nov 29 00:21:36 CET,0.0 0.947 1.415 1.756 2.027 2.277 2.514 2.744 3.152 3.336 3.512 3.58 4.014 4.171 4.46 4.722 4.989 5.124 5.387 5.639 6.0 6.233 6.459 6.782 7.082 7.371 7.646 7.91 8.247 8.567 8.879 9.259 9.62 9.963 10.36 10.806 11.221 11.665 12.15 12.667 13.211 13.802 14.497 15.206 15.99 16.8 17.71 18.751 19.912 21.161 22.423 23.123 23.234 23.107 22.906 22.613 22.28 21.922 21.591 21.244 20.896 20.573 20.256 19.937 19.64 19.36 19.027 18.705 18.437 18.153 17.843 17.59 17.328 17.037 16.796 16.539 16.27 15.989 15.696 15.498 15.285 14.949 14.714 14.461 14.328 14.043 13.738 13.424 13.265 12.847 12.766 12.573 12.363 11.894 11.644 11.382 11.103 10.792 10.429 9.92 8.945 -8 ,27478 ,TETRA ,17608860,Sun Nov 28 22:16:44 CET,Mon Nov 29 00:22:17 CET,0.0 0.982 1.352 1.669 1.998 2.284 2.532 2.768 3.196 3.401 3.597 3.682 4.116 4.273 4.582 4.87 5.149 5.282 5.536 5.789 6.153 6.383 6.597 6.904 7.201 7.489 7.767 8.034 8.372 8.689 8.991 9.351 9.709 10.055 10.447 10.889 11.319 11.79 12.28 12.8 13.371 13.997 14.688 15.369 16.127 16.949 17.877 18.874 19.995 21.218 22.42 22.994 23.016 22.835 22.604 22.313 21.986 21.642 21.267 20.856 20.478 20.121 19.774 19.412 19.058 18.741 18.388 18.062 17.784 17.484 17.158 16.888 16.618 16.32 16.075 15.804 15.527 15.257 14.975 14.773 14.552 14.2 13.959 13.71 13.579 13.292 12.978 12.665 12.498 12.062 11.941 11.735 11.529 11.066 10.817 10.541 10.229 9.909 9.541 9.058 8.265 -9 ,21627 ,TETRA ,17608861,Sun Nov 28 22:16:44 CET,Mon Nov 29 00:24:34 CET,0.0 0.811 1.207 1.541 1.844 2.095 2.325 2.556 3.007 3.208 3.392 3.482 3.929 4.11 4.45 4.774 5.083 5.229 5.506 5.771 6.155 6.417 6.671 7.013 7.343 7.665 7.98 8.285 8.659 9.016 9.368 9.792 10.2 10.588 11.037 11.535 11.991 12.486 13.023 13.59 14.177 14.853 15.633 16.396 17.253 18.18 19.185 20.194 21.319 22.539 23.779 24.508 24.667 24.505 24.145 23.749 23.36 22.937 22.53 22.114 21.724 21.35 20.997 20.64 20.286 19.963 19.611 19.281 18.984 18.658 18.322 18.032 17.715 17.386 17.133 16.868 16.586 16.299 16.004 15.781 15.547 15.186 14.928 14.659 14.521 14.248 13.953 13.608 13.41 12.944 12.824 12.638 12.434 11.913 11.622 11.354 11.074 10.775 10.41 9.955 9.257 -10 ,3658 ,TETRA ,17608862,Sun Nov 28 22:16:45 CET,Mon Nov 29 00:24:27 CET,0.0 0.539 0.908 1.232 1.537 1.813 2.054 2.284 2.721 2.925 3.119 3.226 3.664 3.836 4.156 4.452 4.746 4.884 5.146 5.395 5.745 5.985 6.224 6.556 6.887 7.198 7.494 7.788 8.168 8.534 8.885 9.305 9.696 10.061 10.489 10.97 11.443 11.948 12.468 13.016 13.575 14.207 14.916 15.6 16.425 17.341 18.329 19.359 20.466 21.619 22.791 23.501 23.645 23.507 23.251 22.951 22.627 22.268 21.918 21.534 21.164 20.822 20.497 20.181 19.874 19.561 19.209 18.914 18.657 18.365 18.046 17.775 17.493 17.194 16.946 16.683 16.409 16.12 15.811 15.592 15.377 15.033 14.783 14.529 14.399 14.12 13.829 13.513 13.351 12.934 12.824 12.63 12.42 11.955 11.721 11.467 11.182 10.846 10.414 9.911 9.019 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt deleted file mode 100644 index 0a5a4e26..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24474 ,TETRA ,17608863,Sun Nov 28 22:16:44 CET,Mon Nov 29 00:29:06 CET,0.0 0.623 1.037 1.366 1.67 1.928 2.162 2.383 2.761 2.934 3.106 3.163 3.586 3.725 3.991 4.247 4.484 4.591 4.794 4.995 5.289 5.472 5.648 5.904 6.146 6.377 6.608 6.826 7.064 7.288 7.518 7.797 8.048 8.286 8.556 8.848 9.113 9.403 9.715 10.027 10.34 10.65 10.98 11.297 11.605 11.873 12.112 12.292 12.355 12.187 11.551 10.421 9.303 8.248 7.248 6.292 5.463 4.702 4.012 3.308 2.684 2.132 1.593 1.078 0.598 0.164 -0.294 -0.719 -1.088 -1.472 -1.875 -2.213 -2.561 -2.93 -3.223 -3.53 -3.843 -4.162 -4.497 -4.734 -4.98 -5.35 -5.618 -5.9 -6.042 -6.337 -6.657 -7.029 -7.216 -7.683 -7.811 -8.023 -8.257 -8.749 -9.012 -9.302 -9.633 -10.011 -10.498 -11.164 -12.272 -2 ,25655 ,TETRA ,17608864,Sun Nov 28 22:16:45 CET,Mon Nov 29 00:10:19 CET,0.0 0.722 1.1 1.406 1.663 1.895 2.105 2.296 2.671 2.849 3.013 3.061 3.47 3.614 3.908 4.192 4.438 4.556 4.795 5.033 5.343 5.53 5.716 5.964 6.202 6.44 6.671 6.881 7.156 7.43 7.673 7.938 8.192 8.446 8.733 9.022 9.296 9.59 9.884 10.175 10.475 10.803 11.141 11.45 11.766 12.074 12.37 12.565 12.607 12.454 11.797 10.659 9.523 8.404 7.394 6.46 5.607 4.822 4.115 3.391 2.763 2.192 1.64 1.114 0.639 0.22 -0.248 -0.69 -1.067 -1.45 -1.853 -2.203 -2.563 -2.927 -3.214 -3.524 -3.85 -4.174 -4.523 -4.764 -5.0 -5.374 -5.644 -5.934 -6.087 -6.402 -6.723 -7.059 -7.23 -7.695 -7.793 -7.99 -8.202 -8.656 -8.924 -9.22 -9.53 -9.855 -10.229 -10.802 -11.859 -3 ,13266 ,TETRA ,17608865,Sun Nov 28 22:16:45 CET,Mon Nov 29 00:26:02 CET,0.0 0.669 1.086 1.39 1.655 1.901 2.125 2.328 2.694 2.869 3.044 3.117 3.524 3.658 3.926 4.177 4.408 4.526 4.76 4.969 5.259 5.444 5.629 5.905 6.155 6.389 6.611 6.818 7.076 7.315 7.541 7.808 8.066 8.31 8.585 8.892 9.175 9.472 9.78 10.09 10.375 10.687 11.026 11.322 11.613 11.887 12.158 12.339 12.364 12.123 11.368 10.138 8.864 7.669 6.615 5.656 4.797 3.993 3.305 2.619 1.996 1.402 0.832 0.315 -0.163 -0.615 -1.09 -1.505 -1.874 -2.257 -2.642 -2.971 -3.329 -3.698 -3.98 -4.272 -4.578 -4.911 -5.282 -5.526 -5.757 -6.122 -6.394 -6.686 -6.839 -7.14 -7.443 -7.758 -7.926 -8.386 -8.525 -8.761 -8.995 -9.489 -9.786 -10.09 -10.391 -10.708 -11.053 -11.508 -12.473 -4 ,15624 ,TETRA ,17608866,Sun Nov 28 22:16:45 CET,Mon Nov 29 00:28:59 CET,0.0 0.493 0.815 1.113 1.399 1.654 1.868 2.066 2.457 2.645 2.815 2.845 3.257 3.397 3.666 3.906 4.148 4.273 4.508 4.731 5.037 5.23 5.419 5.688 5.941 6.177 6.405 6.636 6.934 7.205 7.441 7.702 7.941 8.173 8.442 8.747 9.039 9.334 9.634 9.942 10.247 10.564 10.933 11.279 11.606 11.912 12.179 12.368 12.414 12.182 11.41 10.175 9.011 7.913 6.878 5.912 5.059 4.24 3.517 2.792 2.156 1.595 1.053 0.522 0.021 -0.432 -0.9 -1.308 -1.677 -2.072 -2.469 -2.815 -3.178 -3.566 -3.862 -4.142 -4.437 -4.749 -5.079 -5.307 -5.54 -5.916 -6.183 -6.455 -6.595 -6.896 -7.217 -7.563 -7.74 -8.204 -8.338 -8.552 -8.763 -9.233 -9.5 -9.779 -10.092 -10.444 -10.814 -11.272 -12.38 -5 ,9319 ,TETRA ,17608867,Sun Nov 28 22:16:45 CET,Mon Nov 29 00:25:26 CET,0.0 0.771 1.143 1.427 1.703 1.954 2.165 2.377 2.767 2.942 3.11 3.154 3.568 3.712 3.98 4.235 4.482 4.599 4.819 5.023 5.327 5.53 5.713 5.963 6.201 6.428 6.653 6.866 7.128 7.377 7.613 7.878 8.13 8.376 8.638 8.942 9.234 9.534 9.85 10.158 10.464 10.783 11.136 11.481 11.823 12.112 12.366 12.55 12.604 12.44 11.784 10.618 9.461 8.36 7.388 6.512 5.716 4.983 4.327 3.661 3.079 2.55 2.031 1.541 1.094 0.669 0.197 -0.221 -0.568 -0.931 -1.317 -1.651 -1.995 -2.36 -2.651 -2.934 -3.232 -3.559 -3.893 -4.116 -4.35 -4.723 -4.979 -5.243 -5.379 -5.684 -6.006 -6.325 -6.497 -6.955 -7.074 -7.281 -7.493 -7.936 -8.192 -8.478 -8.765 -9.056 -9.39 -9.847 -10.902 -6 ,4596 ,TETRA ,17608868,Sun Nov 28 22:16:50 CET,Mon Nov 29 00:25:01 CET,0.0 0.907 1.278 1.573 1.846 2.084 2.302 2.512 2.885 3.06 3.218 3.248 3.648 3.78 4.048 4.29 4.508 4.618 4.83 5.032 5.322 5.506 5.685 5.935 6.16 6.372 6.586 6.802 7.069 7.306 7.531 7.819 8.093 8.33 8.601 8.905 9.175 9.461 9.757 10.069 10.392 10.725 11.11 11.478 11.841 12.165 12.459 12.699 12.824 12.691 12.03 10.845 9.628 8.501 7.528 6.598 5.726 4.913 4.181 3.444 2.804 2.227 1.654 1.12 0.646 0.206 -0.278 -0.727 -1.117 -1.51 -1.916 -2.26 -2.598 -2.943 -3.232 -3.541 -3.854 -4.175 -4.511 -4.744 -4.982 -5.363 -5.641 -5.933 -6.086 -6.408 -6.743 -7.104 -7.301 -7.784 -7.942 -8.159 -8.374 -8.841 -9.095 -9.374 -9.682 -10.018 -10.424 -10.93 -12.666 -7 ,18742 ,TETRA ,17608869,Sun Nov 28 22:16:46 CET,Mon Nov 29 00:24:01 CET,0.0 0.989 1.464 1.789 2.089 2.363 2.611 2.828 3.204 3.384 3.56 3.597 4.003 4.144 4.415 4.659 4.892 5.001 5.21 5.421 5.725 5.905 6.081 6.325 6.558 6.799 7.028 7.248 7.536 7.8 8.048 8.341 8.616 8.875 9.161 9.481 9.777 10.093 10.413 10.717 11.033 11.365 11.728 12.065 12.398 12.698 12.935 13.098 13.178 13.025 12.336 11.134 9.908 8.782 7.778 6.803 5.928 5.148 4.429 3.683 3.043 2.461 1.9 1.366 0.863 0.418 -0.045 -0.47 -0.844 -1.25 -1.679 -2.037 -2.408 -2.787 -3.094 -3.423 -3.754 -4.094 -4.441 -4.686 -4.942 -5.336 -5.617 -5.911 -6.059 -6.361 -6.681 -7.026 -7.209 -7.675 -7.763 -7.966 -8.177 -8.634 -8.9 -9.189 -9.507 -9.865 -10.245 -10.711 -11.67 -8 ,8678 ,TETRA ,17608870,Sun Nov 28 22:16:48 CET,Mon Nov 29 00:23:35 CET,0.0 0.561 0.904 1.198 1.445 1.671 1.884 2.083 2.459 2.639 2.81 2.848 3.255 3.39 3.645 3.894 4.141 4.259 4.492 4.713 5.01 5.196 5.379 5.635 5.884 6.144 6.397 6.619 6.89 7.159 7.412 7.714 8.009 8.284 8.591 8.922 9.232 9.57 9.922 10.268 10.598 10.935 11.298 11.608 11.95 12.291 12.517 12.633 12.652 12.413 11.597 10.289 9.065 7.947 6.956 6.061 5.253 4.477 3.783 3.072 2.457 1.908 1.39 0.882 0.372 -0.093 -0.573 -0.996 -1.378 -1.803 -2.236 -2.58 -2.945 -3.323 -3.625 -3.947 -4.279 -4.624 -4.958 -5.183 -5.431 -5.828 -6.108 -6.392 -6.542 -6.853 -7.181 -7.526 -7.699 -8.151 -8.258 -8.453 -8.649 -9.088 -9.338 -9.625 -9.947 -10.299 -10.706 -11.202 -12.096 -9 ,14857 ,TETRA ,17608871,Sun Nov 28 22:16:46 CET,Mon Nov 29 00:23:01 CET,0.0 0.584 0.966 1.281 1.554 1.805 2.033 2.234 2.596 2.769 2.935 2.979 3.395 3.533 3.803 4.071 4.33 4.451 4.673 4.891 5.209 5.401 5.584 5.855 6.107 6.354 6.58 6.784 7.043 7.3 7.542 7.831 8.114 8.37 8.64 8.926 9.21 9.52 9.839 10.162 10.478 10.82 11.188 11.516 11.846 12.147 12.416 12.625 12.739 12.639 11.979 10.702 9.44 8.325 7.281 6.213 5.185 4.289 3.585 2.869 2.234 1.66 1.112 0.601 0.109 -0.34 -0.807 -1.247 -1.63 -2.033 -2.454 -2.785 -3.139 -3.511 -3.792 -4.089 -4.391 -4.706 -5.04 -5.276 -5.532 -5.905 -6.155 -6.433 -6.576 -6.875 -7.186 -7.507 -7.685 -8.162 -8.305 -8.509 -8.725 -9.254 -9.556 -9.86 -10.167 -10.498 -10.913 -11.423 -12.371 -10 ,27008 ,TETRA ,17608872,Sun Nov 28 22:16:48 CET,Mon Nov 29 00:22:57 CET,0.0 0.932 1.396 1.726 1.981 2.216 2.447 2.669 3.074 3.256 3.422 3.466 3.886 4.045 4.343 4.593 4.833 4.952 5.192 5.421 5.741 5.952 6.151 6.428 6.685 6.92 7.153 7.376 7.66 7.929 8.184 8.49 8.769 9.019 9.308 9.62 9.893 10.175 10.472 10.789 11.113 11.444 11.784 12.089 12.403 12.687 12.96 13.162 13.205 12.996 12.252 10.974 9.7 8.563 7.561 6.615 5.774 4.962 4.221 3.466 2.821 2.259 1.72 1.198 0.703 0.25 -0.229 -0.66 -1.044 -1.434 -1.826 -2.162 -2.521 -2.893 -3.182 -3.485 -3.803 -4.124 -4.453 -4.693 -4.95 -5.344 -5.614 -5.909 -6.067 -6.396 -6.734 -7.077 -7.259 -7.743 -7.863 -8.059 -8.27 -8.738 -8.99 -9.265 -9.561 -9.887 -10.267 -10.754 -11.759 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt deleted file mode 100644 index 2e3049bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25294 ,TETRA ,17608873,Sun Nov 28 22:16:50 CET,Mon Nov 29 00:23:17 CET,0.0 1.41 1.889 2.239 2.528 2.808 3.108 3.376 3.836 4.049 4.239 4.322 4.765 4.937 5.259 5.554 5.83 5.968 6.24 6.494 6.847 7.074 7.307 7.632 7.916 8.193 8.468 8.731 9.058 9.367 9.648 9.974 10.302 10.609 10.957 11.357 11.724 12.098 12.492 12.913 13.339 13.795 14.31 14.821 15.359 15.843 16.307 16.729 17.119 17.333 17.101 16.295 15.346 14.478 13.702 12.915 12.17 11.489 10.874 10.243 9.683 9.166 8.678 8.208 7.749 7.342 6.92 6.543 6.209 5.841 5.461 5.145 4.825 4.497 4.232 3.954 3.675 3.377 3.054 2.829 2.595 2.218 1.965 1.719 1.592 1.318 1.008 0.686 0.53 0.096 0.005 -0.207 -0.414 -0.831 -1.065 -1.33 -1.617 -1.908 -2.237 -2.704 -3.516 -2 ,18537 ,TETRA ,17608874,Sun Nov 28 22:16:51 CET,Mon Nov 29 00:22:40 CET,0.0 0.922 1.403 1.788 2.108 2.404 2.714 2.984 3.447 3.654 3.845 3.957 4.404 4.567 4.857 5.13 5.397 5.525 5.762 5.987 6.322 6.534 6.734 7.029 7.32 7.606 7.868 8.118 8.44 8.734 9.013 9.332 9.625 9.903 10.225 10.588 10.936 11.306 11.693 12.095 12.508 12.964 13.459 13.931 14.437 14.948 15.479 15.942 16.373 16.716 16.661 16.095 15.308 14.46 13.672 12.929 12.218 11.5 10.841 10.181 9.605 9.07 8.551 8.067 7.612 7.195 6.745 6.325 5.968 5.601 5.213 4.869 4.508 4.135 3.84 3.544 3.238 2.911 2.566 2.331 2.099 1.743 1.493 1.227 1.086 0.78 0.461 0.147 -0.014 -0.451 -0.541 -0.733 -0.925 -1.325 -1.549 -1.79 -2.062 -2.383 -2.732 -3.12 -4.135 -3 ,28191 ,TETRA ,17608875,Sun Nov 28 22:16:45 CET,Mon Nov 29 00:26:06 CET,0.0 1.291 1.785 2.167 2.469 2.743 3.009 3.25 3.66 3.848 4.032 4.094 4.525 4.688 4.999 5.28 5.551 5.676 5.911 6.15 6.499 6.71 6.904 7.202 7.494 7.761 8.011 8.26 8.585 8.885 9.162 9.492 9.815 10.131 10.474 10.843 11.205 11.596 11.995 12.398 12.797 13.227 13.717 14.177 14.661 15.164 15.673 16.144 16.554 16.81 16.671 16.024 15.252 14.453 13.679 12.945 12.248 11.584 11.035 10.466 9.943 9.471 9.008 8.56 8.129 7.727 7.296 6.908 6.59 6.26 5.893 5.588 5.263 4.906 4.628 4.343 4.053 3.743 3.414 3.186 2.953 2.589 2.346 2.099 1.966 1.673 1.373 1.065 0.897 0.459 0.369 0.174 -0.027 -0.456 -0.7 -0.959 -1.237 -1.529 -1.891 -2.324 -2.984 -4 ,18976 ,TETRA ,17608876,Sun Nov 28 22:16:47 CET,Mon Nov 29 00:25:56 CET,0.0 1.179 1.714 2.122 2.486 2.826 3.085 3.329 3.786 3.994 4.189 4.267 4.692 4.846 5.144 5.422 5.681 5.811 6.067 6.305 6.651 6.876 7.088 7.39 7.683 7.969 8.235 8.494 8.839 9.165 9.472 9.801 10.113 10.417 10.745 11.092 11.424 11.804 12.21 12.625 13.048 13.507 13.989 14.438 14.933 15.413 15.897 16.344 16.692 16.891 16.727 16.028 15.236 14.402 13.546 12.741 12.031 11.38 10.802 10.205 9.688 9.223 8.763 8.311 7.877 7.467 7.036 6.661 6.329 5.968 5.591 5.279 4.957 4.62 4.357 4.078 3.785 3.49 3.179 2.967 2.747 2.397 2.15 1.866 1.717 1.416 1.101 0.781 0.617 0.169 0.08 -0.098 -0.296 -0.751 -0.994 -1.238 -1.52 -1.847 -2.203 -2.581 -3.125 -5 ,21261 ,TETRA ,17608877,Sun Nov 28 22:17:42 CET,Mon Nov 29 00:25:27 CET,0.0 0.975 1.443 1.829 2.173 2.458 2.711 2.947 3.384 3.587 3.79 3.899 4.34 4.494 4.781 5.053 5.316 5.442 5.684 5.917 6.243 6.454 6.658 6.956 7.25 7.523 7.771 8.006 8.308 8.591 8.859 9.185 9.492 9.782 10.119 10.497 10.848 11.216 11.607 12.005 12.409 12.843 13.298 13.731 14.218 14.699 15.134 15.52 15.854 16.042 15.876 15.148 14.329 13.525 12.746 11.988 11.269 10.589 9.995 9.395 8.866 8.367 7.87 7.411 6.984 6.583 6.168 5.796 5.46 5.085 4.683 4.36 4.026 3.678 3.405 3.124 2.845 2.547 2.223 1.991 1.753 1.398 1.147 0.878 0.736 0.437 0.132 -0.184 -0.358 -0.81 -0.891 -1.088 -1.296 -1.728 -1.966 -2.234 -2.53 -2.858 -3.224 -3.69 -4.66 -6 ,32448 ,TETRA ,17608878,Sun Nov 28 22:17:43 CET,Mon Nov 29 00:27:15 CET,0.0 1.166 1.627 1.994 2.316 2.606 2.876 3.127 3.586 3.794 3.981 4.044 4.483 4.649 4.957 5.239 5.503 5.629 5.881 6.128 6.475 6.694 6.907 7.2 7.475 7.745 8.001 8.247 8.548 8.832 9.103 9.415 9.718 10.025 10.375 10.73 11.053 11.417 11.819 12.236 12.63 13.034 13.478 13.896 14.38 14.892 15.403 15.877 16.274 16.481 16.27 15.548 14.718 13.862 13.022 12.216 11.502 10.859 10.296 9.712 9.182 8.683 8.217 7.778 7.353 6.953 6.526 6.156 5.83 5.48 5.111 4.807 4.484 4.143 3.882 3.605 3.317 3.018 2.696 2.472 2.249 1.903 1.662 1.414 1.284 1.005 0.706 0.392 0.225 -0.233 -0.33 -0.521 -0.727 -1.167 -1.406 -1.666 -1.935 -2.226 -2.575 -3.015 -3.929 -7 ,15560 ,TETRA ,17608879,Sun Nov 28 22:17:48 CET,Mon Nov 29 00:27:23 CET,0.0 0.929 1.404 1.778 2.1 2.398 2.672 2.912 3.363 3.56 3.75 3.822 4.253 4.409 4.707 4.992 5.258 5.382 5.625 5.87 6.218 6.426 6.628 6.934 7.223 7.491 7.746 7.978 8.271 8.572 8.858 9.186 9.511 9.824 10.163 10.537 10.888 11.278 11.698 12.127 12.548 12.979 13.451 13.904 14.397 14.881 15.35 15.8 16.187 16.402 16.26 15.592 14.79 14.0 13.262 12.533 11.802 11.098 10.491 9.869 9.304 8.8 8.331 7.885 7.458 7.048 6.607 6.209 5.871 5.524 5.16 4.841 4.497 4.155 3.899 3.637 3.354 3.054 2.739 2.529 2.309 1.95 1.697 1.427 1.289 0.994 0.683 0.365 0.202 -0.245 -0.346 -0.545 -0.759 -1.242 -1.494 -1.773 -2.085 -2.424 -2.83 -3.351 -4.597 -8 ,22651 ,TETRA ,17608880,Sun Nov 28 22:17:44 CET,Mon Nov 29 00:26:12 CET,0.0 1.313 1.8 2.166 2.506 2.799 3.061 3.307 3.749 3.946 4.143 4.252 4.688 4.843 5.162 5.462 5.726 5.853 6.104 6.333 6.65 6.851 7.052 7.346 7.62 7.884 8.138 8.393 8.725 9.023 9.287 9.598 9.894 10.168 10.488 10.859 11.217 11.609 12.014 12.421 12.814 13.248 13.739 14.203 14.717 15.221 15.701 16.16 16.572 16.812 16.712 16.042 15.198 14.313 13.485 12.737 12.045 11.376 10.773 10.162 9.618 9.109 8.626 8.16 7.714 7.303 6.863 6.461 6.113 5.751 5.365 5.037 4.703 4.36 4.092 3.816 3.526 3.214 2.886 2.653 2.412 2.053 1.806 1.557 1.429 1.154 0.863 0.559 0.398 -0.052 -0.137 -0.321 -0.519 -0.975 -1.22 -1.467 -1.751 -2.114 -2.506 -2.925 -3.502 -9 ,2213 ,TETRA ,17608881,Sun Nov 28 22:17:46 CET,Mon Nov 29 00:25:51 CET,0.0 1.105 1.591 1.952 2.282 2.595 2.879 3.15 3.641 3.853 4.043 4.124 4.552 4.703 5.0 5.298 5.591 5.728 5.987 6.24 6.61 6.838 7.051 7.354 7.653 7.949 8.22 8.482 8.823 9.145 9.438 9.771 10.08 10.37 10.698 11.058 11.422 11.818 12.22 12.637 13.032 13.45 13.922 14.353 14.814 15.321 15.872 16.36 16.751 16.963 16.77 16.05 15.254 14.41 13.587 12.823 12.112 11.454 10.879 10.29 9.771 9.293 8.831 8.374 7.932 7.538 7.124 6.745 6.413 6.069 5.7 5.377 5.046 4.707 4.44 4.163 3.877 3.58 3.272 3.061 2.838 2.476 2.23 1.952 1.805 1.515 1.206 0.882 0.71 0.25 0.159 -0.04 -0.245 -0.681 -0.92 -1.177 -1.462 -1.767 -2.138 -2.583 -3.536 -10 ,16629 ,TETRA ,17608882,Sun Nov 28 22:17:44 CET,Mon Nov 29 00:26:46 CET,0.0 1.133 1.586 1.959 2.268 2.579 2.891 3.152 3.569 3.77 3.975 4.082 4.52 4.686 5.003 5.311 5.58 5.713 5.977 6.222 6.586 6.816 7.026 7.319 7.6 7.88 8.145 8.389 8.708 9.011 9.294 9.629 9.955 10.257 10.601 11.005 11.378 11.769 12.181 12.594 12.996 13.415 13.918 14.407 14.901 15.367 15.825 16.259 16.612 16.769 16.549 15.883 15.104 14.283 13.497 12.757 12.083 11.427 10.818 10.165 9.601 9.121 8.643 8.157 7.701 7.287 6.851 6.459 6.117 5.765 5.396 5.075 4.741 4.405 4.14 3.86 3.572 3.272 2.966 2.746 2.507 2.132 1.871 1.605 1.465 1.183 0.884 0.562 0.395 -0.057 -0.139 -0.326 -0.515 -0.91 -1.134 -1.4 -1.688 -1.99 -2.346 -2.821 -3.745 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 38f42e6d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21906 ,KEBNE ,17027431,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:52:08 CET,0.0 0.866 1.267 1.611 1.915 2.169 2.407 2.644 3.08 3.287 3.484 3.585 4.043 4.216 4.547 4.848 5.128 5.265 5.529 5.799 6.193 6.442 6.686 7.029 7.347 7.651 7.952 8.258 8.654 9.014 9.353 9.765 10.164 10.553 11.003 11.514 12.015 12.554 13.107 13.679 14.273 14.93 15.679 16.431 17.313 18.295 19.396 20.586 21.94 23.465 25.128 26.254 26.644 26.651 26.484 26.264 25.981 25.681 25.414 25.067 24.735 24.416 24.072 23.751 23.446 23.137 22.786 22.473 22.203 21.921 21.632 21.373 21.09 20.791 20.547 20.291 20.019 19.729 19.429 19.217 18.998 18.649 18.386 18.129 18.0 17.721 17.431 17.129 16.963 16.525 16.39 16.19 15.992 15.559 15.32 15.045 14.708 14.325 13.921 13.449 12.382 -2 ,30178 ,KEBNE ,17027432,Wed Dec 22 17:06:51 CET,Wed Dec 22 18:52:08 CET,0.0 0.924 1.344 1.676 1.974 2.245 2.485 2.709 3.131 3.328 3.512 3.586 4.027 4.189 4.498 4.792 5.062 5.193 5.453 5.7 6.05 6.279 6.508 6.833 7.139 7.431 7.708 7.974 8.316 8.645 8.961 9.339 9.714 10.084 10.506 10.973 11.423 11.927 12.462 13.011 13.577 14.187 14.893 15.617 16.442 17.365 18.407 19.523 20.77 22.162 23.766 24.858 25.249 25.287 25.157 24.949 24.706 24.424 24.137 23.811 23.478 23.188 22.884 22.559 22.252 21.946 21.626 21.348 21.077 20.789 20.496 20.232 19.968 19.689 19.463 19.208 18.934 18.672 18.405 18.218 18.015 17.68 17.44 17.186 17.05 16.745 16.444 16.159 16.007 15.585 15.47 15.276 15.072 14.624 14.385 14.125 13.836 13.547 13.162 12.635 11.868 -3 ,11921 ,KEBNE ,17027433,Wed Dec 22 17:07:52 CET,Wed Dec 22 18:53:35 CET,0.0 0.668 1.101 1.445 1.741 2.009 2.257 2.498 2.943 3.15 3.351 3.466 3.919 4.079 4.388 4.682 4.977 5.118 5.388 5.651 6.021 6.26 6.491 6.818 7.128 7.428 7.715 7.998 8.364 8.723 9.08 9.504 9.905 10.293 10.75 11.268 11.767 12.291 12.82 13.37 13.981 14.668 15.454 16.211 17.085 18.079 19.186 20.408 21.794 23.347 24.993 26.187 26.711 26.838 26.801 26.669 26.465 26.219 25.963 25.685 25.405 25.127 24.81 24.498 24.234 23.972 23.677 23.404 23.145 22.867 22.578 22.328 22.073 21.798 21.579 21.352 21.121 20.877 20.597 20.401 20.201 19.868 19.631 19.389 19.268 19.011 18.735 18.453 18.304 17.87 17.73 17.523 17.312 16.837 16.569 16.285 15.97 15.608 15.191 14.618 13.172 -5 ,4294 ,KEBNE ,17027435,Wed Dec 22 17:07:52 CET,Wed Dec 22 18:52:39 CET,0.0 0.746 1.152 1.491 1.798 2.067 2.309 2.53 2.957 3.157 3.339 3.416 3.855 4.016 4.328 4.623 4.912 5.054 5.325 5.585 5.961 6.202 6.44 6.783 7.11 7.422 7.725 8.013 8.384 8.741 9.086 9.497 9.884 10.263 10.698 11.18 11.659 12.206 12.782 13.349 13.909 14.545 15.279 16.006 16.876 17.846 18.957 20.179 21.531 23.032 24.726 25.927 26.448 26.571 26.509 26.4 26.225 25.977 25.706 25.385 25.08 24.779 24.458 24.128 23.805 23.509 23.197 22.915 22.671 22.412 22.139 21.907 21.647 21.368 21.151 20.934 20.698 20.438 20.168 19.969 19.75 19.415 19.177 18.923 18.795 18.525 18.227 17.918 17.763 17.331 17.202 16.997 16.786 16.328 16.072 15.782 15.471 15.14 14.743 14.229 13.1 -6 ,325 ,KEBNE ,17027436,Wed Dec 22 17:07:52 CET,Wed Dec 22 18:53:56 CET,0.0 0.671 1.076 1.376 1.627 1.886 2.143 2.373 2.808 3.008 3.201 3.288 3.733 3.892 4.206 4.502 4.778 4.913 5.174 5.419 5.765 5.998 6.227 6.552 6.874 7.182 7.47 7.751 8.111 8.46 8.802 9.218 9.602 9.981 10.432 10.908 11.356 11.843 12.368 12.932 13.522 14.171 14.917 15.662 16.506 17.457 18.556 19.76 21.123 22.626 24.287 25.407 25.8 25.821 25.696 25.539 25.345 25.081 24.779 24.446 24.128 23.806 23.468 23.125 22.814 22.512 22.17 21.866 21.607 21.34 21.039 20.767 20.482 20.197 19.965 19.72 19.485 19.24 18.97 18.777 18.578 18.25 18.019 17.782 17.661 17.403 17.118 16.82 16.662 16.235 16.12 15.922 15.716 15.25 14.988 14.7 14.394 14.042 13.593 13.038 11.832 -7 ,16762 ,KEBNE ,17027437,Wed Dec 22 17:07:52 CET,Wed Dec 22 18:53:45 CET,0.0 0.818 1.211 1.555 1.855 2.122 2.372 2.61 3.048 3.261 3.464 3.552 4.001 4.167 4.489 4.793 5.081 5.217 5.482 5.747 6.115 6.353 6.581 6.898 7.207 7.497 7.77 8.034 8.376 8.71 9.042 9.449 9.833 10.199 10.629 11.118 11.564 12.048 12.592 13.156 13.729 14.37 15.114 15.842 16.706 17.69 18.78 19.946 21.261 22.778 24.429 25.583 26.102 26.243 26.186 26.023 25.811 25.57 25.32 25.021 24.721 24.434 24.148 23.844 23.539 23.259 22.944 22.642 22.378 22.106 21.812 21.55 21.277 21.002 20.777 20.544 20.295 20.022 19.751 19.567 19.369 19.048 18.819 18.569 18.443 18.179 17.881 17.557 17.389 16.968 16.85 16.654 16.446 15.967 15.68 15.4 15.139 14.848 14.492 14.046 13.19 -8 ,4412 ,KEBNE ,17027438,Wed Dec 22 17:08:54 CET,Wed Dec 22 18:54:46 CET,0.0 0.726 1.133 1.492 1.82 2.106 2.356 2.58 3.014 3.22 3.411 3.503 3.961 4.139 4.472 4.767 5.047 5.188 5.462 5.722 6.087 6.325 6.56 6.898 7.221 7.53 7.83 8.116 8.478 8.83 9.179 9.593 9.981 10.364 10.812 11.308 11.788 12.294 12.813 13.364 13.942 14.597 15.371 16.148 17.014 17.96 19.036 20.196 21.541 23.059 24.743 25.923 26.458 26.639 26.622 26.532 26.366 26.12 25.873 25.603 25.323 25.021 24.702 24.388 24.081 23.797 23.494 23.213 22.977 22.713 22.42 22.183 21.903 21.595 21.357 21.106 20.862 20.594 20.299 20.095 19.88 19.518 19.262 19.004 18.866 18.582 18.284 17.958 17.784 17.333 17.182 16.963 16.733 16.282 16.029 15.746 15.433 15.049 14.597 14.061 12.846 -9 ,30730 ,KEBNE ,17027439,Wed Dec 22 17:08:54 CET,Wed Dec 22 18:54:37 CET,0.0 0.702 1.063 1.374 1.676 1.94 2.178 2.428 2.884 3.085 3.277 3.371 3.814 3.977 4.302 4.616 4.904 5.04 5.308 5.577 5.958 6.199 6.436 6.777 7.098 7.397 7.699 7.987 8.347 8.708 9.067 9.502 9.903 10.288 10.744 11.226 11.679 12.182 12.707 13.244 13.829 14.502 15.259 16.012 16.895 17.904 19.025 20.256 21.646 23.138 24.787 25.985 26.477 26.618 26.543 26.349 26.122 25.846 25.56 25.246 24.947 24.658 24.358 24.04 23.71 23.41 23.08 22.763 22.5 22.228 21.924 21.667 21.398 21.113 20.889 20.652 20.391 20.116 19.822 19.608 19.388 19.05 18.814 18.558 18.428 18.146 17.835 17.529 17.371 16.942 16.826 16.625 16.404 15.919 15.662 15.376 15.046 14.674 14.198 13.561 12.225 -10 ,26764 ,KEBNE ,17027440,Wed Dec 22 17:08:55 CET,Wed Dec 22 18:54:00 CET,0.0 0.607 1.014 1.349 1.62 1.885 2.158 2.404 2.838 3.034 3.222 3.315 3.753 3.92 4.251 4.569 4.866 5.003 5.272 5.545 5.929 6.174 6.416 6.769 7.107 7.43 7.733 8.021 8.399 8.774 9.129 9.539 9.936 10.324 10.775 11.293 11.776 12.278 12.812 13.39 14.012 14.694 15.475 16.257 17.169 18.166 19.263 20.448 21.803 23.344 25.02 26.176 26.655 26.786 26.752 26.604 26.406 26.153 25.867 25.57 25.281 24.987 24.705 24.408 24.115 23.849 23.562 23.274 23.005 22.72 22.406 22.148 21.882 21.604 21.383 21.159 20.924 20.653 20.353 20.149 19.931 19.582 19.354 19.111 18.982 18.712 18.409 18.075 17.893 17.443 17.34 17.156 16.945 16.455 16.189 15.883 15.545 15.184 14.748 14.179 12.92 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt deleted file mode 100644 index 7e9a3ddd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2376 ,TETRA ,17608883,Sun Nov 28 22:17:44 CET,Mon Nov 29 00:22:06 CET,0.0 1.065 1.511 1.866 2.161 2.402 2.62 2.818 3.183 3.362 3.53 3.545 3.965 4.107 4.373 4.629 4.878 4.994 5.216 5.429 5.737 5.937 6.129 6.396 6.656 6.913 7.156 7.387 7.682 7.972 8.249 8.567 8.869 9.146 9.451 9.781 10.085 10.426 10.796 11.169 11.534 11.928 12.355 12.755 13.2 13.644 14.085 14.515 14.903 15.114 14.909 14.121 13.234 12.356 11.512 10.695 9.957 9.262 8.623 7.948 7.37 6.86 6.363 5.885 5.416 4.989 4.536 4.107 3.73 3.348 2.952 2.626 2.284 1.914 1.62 1.296 0.943 0.585 0.23 -0.011 -0.263 -0.656 -0.929 -1.229 -1.382 -1.7 -2.025 -2.376 -2.569 -3.047 -3.185 -3.403 -3.626 -4.135 -4.408 -4.678 -4.988 -5.334 -5.714 -6.275 -7.512 -2 ,3729 ,TETRA ,17608884,Sun Nov 28 22:17:46 CET,Mon Nov 29 00:21:45 CET,0.0 0.743 1.124 1.462 1.747 2.001 2.247 2.478 2.888 3.089 3.293 3.381 3.834 3.994 4.28 4.553 4.801 4.921 5.159 5.375 5.692 5.898 6.084 6.354 6.621 6.869 7.097 7.316 7.593 7.872 8.141 8.445 8.742 9.017 9.33 9.673 9.992 10.338 10.697 11.052 11.407 11.8 12.229 12.667 13.15 13.598 14.028 14.421 14.77 14.986 14.816 14.116 13.251 12.372 11.518 10.697 9.933 9.208 8.557 7.875 7.303 6.816 6.332 5.849 5.375 4.932 4.477 4.052 3.678 3.291 2.866 2.506 2.132 1.743 1.443 1.124 0.799 0.461 0.104 -0.143 -0.404 -0.806 -1.082 -1.367 -1.514 -1.824 -2.154 -2.515 -2.705 -3.173 -3.261 -3.465 -3.688 -4.167 -4.42 -4.687 -4.979 -5.315 -5.705 -6.199 -7.484 -3 ,570 ,TETRA ,17608885,Sun Nov 28 22:17:48 CET,Mon Nov 29 00:21:03 CET,0.0 0.707 1.109 1.411 1.698 1.974 2.249 2.526 2.986 3.178 3.372 3.477 3.924 4.073 4.364 4.627 4.872 4.995 5.237 5.459 5.763 5.954 6.143 6.424 6.687 6.937 7.195 7.435 7.715 7.983 8.238 8.544 8.83 9.1 9.412 9.75 10.076 10.421 10.785 11.168 11.553 11.979 12.431 12.829 13.258 13.704 14.138 14.5 14.774 14.871 14.563 13.664 12.595 11.548 10.627 9.781 8.994 8.213 7.503 6.791 6.174 5.609 5.067 4.55 4.043 3.565 3.069 2.634 2.253 1.848 1.434 1.098 0.747 0.364 0.062 -0.251 -0.571 -0.902 -1.248 -1.483 -1.728 -2.114 -2.382 -2.666 -2.816 -3.124 -3.451 -3.801 -3.982 -4.449 -4.547 -4.751 -4.97 -5.452 -5.721 -6.017 -6.343 -6.712 -7.138 -7.681 -9.051 -4 ,13269 ,TETRA ,17608886,Sun Nov 28 22:17:45 CET,Mon Nov 29 00:21:12 CET,0.0 1.184 1.635 1.99 2.293 2.578 2.833 3.051 3.451 3.631 3.802 3.838 4.273 4.421 4.71 5.013 5.297 5.42 5.657 5.882 6.198 6.401 6.599 6.881 7.14 7.383 7.628 7.858 8.139 8.416 8.673 8.974 9.263 9.542 9.861 10.204 10.511 10.829 11.162 11.504 11.845 12.218 12.641 13.062 13.519 13.938 14.363 14.77 15.126 15.309 14.939 14.058 13.168 12.268 11.437 10.641 9.885 9.165 8.525 7.889 7.332 6.82 6.304 5.795 5.321 4.887 4.431 3.984 3.587 3.215 2.805 2.447 2.099 1.727 1.431 1.139 0.83 0.503 0.167 -0.069 -0.323 -0.74 -1.03 -1.321 -1.469 -1.777 -2.116 -2.472 -2.653 -3.141 -3.286 -3.506 -3.731 -4.203 -4.471 -4.774 -5.086 -5.442 -5.881 -6.421 -7.69 -5 ,9169 ,TETRA ,17608887,Sun Nov 28 22:17:45 CET,Mon Nov 29 00:27:38 CET,0.0 1.016 1.477 1.832 2.109 2.361 2.612 2.848 3.259 3.452 3.645 3.722 4.132 4.265 4.532 4.796 5.043 5.157 5.38 5.607 5.925 6.117 6.303 6.573 6.834 7.081 7.317 7.542 7.833 8.117 8.393 8.717 9.007 9.276 9.593 9.946 10.276 10.634 11.016 11.405 11.796 12.226 12.678 13.098 13.549 13.999 14.455 14.888 15.294 15.521 15.288 14.543 13.693 12.825 11.976 11.142 10.388 9.701 9.084 8.454 7.879 7.337 6.81 6.301 5.859 5.471 5.026 4.582 4.189 3.792 3.385 3.055 2.71 2.333 2.035 1.733 1.401 1.048 0.701 0.465 0.21 -0.21 -0.511 -0.825 -0.981 -1.295 -1.621 -1.956 -2.132 -2.593 -2.712 -2.931 -3.156 -3.618 -3.869 -4.169 -4.488 -4.849 -5.349 -5.895 -6.676 -6 ,1656 ,TETRA ,17608888,Sun Nov 28 22:17:45 CET,Mon Nov 29 00:24:00 CET,0.0 0.43 0.78 1.07 1.328 1.584 1.83 2.059 2.48 2.668 2.836 2.872 3.299 3.442 3.715 3.979 4.247 4.374 4.616 4.85 5.167 5.38 5.583 5.853 6.113 6.361 6.594 6.833 7.144 7.426 7.686 7.995 8.289 8.57 8.899 9.255 9.589 9.951 10.317 10.685 11.067 11.478 11.907 12.335 12.84 13.3 13.714 14.098 14.434 14.622 14.36 13.537 12.615 11.707 10.848 9.998 9.226 8.47 7.792 7.126 6.541 5.996 5.444 4.924 4.45 4.025 3.576 3.143 2.762 2.376 1.965 1.62 1.276 0.91 0.614 0.318 0.01 -0.323 -0.676 -0.91 -1.166 -1.576 -1.844 -2.131 -2.281 -2.573 -2.875 -3.204 -3.379 -3.836 -3.93 -4.147 -4.385 -4.848 -5.094 -5.378 -5.691 -6.057 -6.48 -7.016 -8.411 -7 ,28953 ,TETRA ,17608889,Sun Nov 28 22:17:47 CET,Mon Nov 29 00:24:36 CET,0.0 0.778 1.236 1.596 1.878 2.116 2.339 2.543 2.915 3.098 3.282 3.341 3.762 3.911 4.186 4.442 4.685 4.799 5.028 5.241 5.541 5.742 5.94 6.219 6.477 6.721 6.958 7.194 7.499 7.785 8.074 8.418 8.722 9.006 9.336 9.69 10.005 10.329 10.679 11.039 11.395 11.793 12.241 12.665 13.102 13.556 14.03 14.466 14.86 15.08 14.836 13.998 13.102 12.234 11.41 10.588 9.828 9.131 8.492 7.839 7.272 6.746 6.245 5.768 5.321 4.928 4.511 4.124 3.784 3.422 3.038 2.714 2.371 2.013 1.741 1.446 1.124 0.795 0.467 0.241 0.003 -0.361 -0.622 -0.9 -1.04 -1.335 -1.647 -1.979 -2.153 -2.609 -2.73 -2.938 -3.153 -3.635 -3.902 -4.195 -4.535 -4.925 -5.357 -5.859 -7.043 -8 ,24182 ,TETRA ,17608890,Sun Nov 28 22:17:49 CET,Mon Nov 29 00:21:35 CET,0.0 0.644 1.053 1.417 1.715 1.972 2.211 2.432 2.853 3.045 3.213 3.271 3.716 3.869 4.148 4.423 4.688 4.811 5.045 5.263 5.581 5.785 5.978 6.253 6.506 6.743 6.966 7.184 7.461 7.718 7.968 8.268 8.548 8.807 9.094 9.423 9.732 10.053 10.41 10.79 11.162 11.547 11.966 12.359 12.817 13.283 13.719 14.116 14.386 14.451 13.984 12.938 11.966 11.061 10.168 9.289 8.485 7.752 7.11 6.431 5.847 5.325 4.805 4.302 3.836 3.41 2.962 2.55 2.197 1.827 1.434 1.109 0.778 0.426 0.148 -0.143 -0.464 -0.79 -1.122 -1.355 -1.596 -1.982 -2.254 -2.549 -2.694 -2.994 -3.334 -3.694 -3.88 -4.357 -4.491 -4.7 -4.934 -5.45 -5.732 -6.04 -6.372 -6.73 -7.128 -7.649 -8.83 -9 ,4250 ,TETRA ,17608891,Sun Nov 28 22:17:51 CET,Mon Nov 29 00:20:45 CET,0.0 0.675 1.052 1.365 1.617 1.851 2.073 2.274 2.644 2.809 2.972 3.02 3.443 3.584 3.858 4.124 4.376 4.498 4.738 4.964 5.273 5.47 5.667 5.949 6.207 6.457 6.696 6.923 7.212 7.479 7.739 8.046 8.32 8.584 8.903 9.256 9.577 9.915 10.287 10.686 11.071 11.465 11.882 12.286 12.741 13.175 13.588 13.973 14.3 14.472 14.305 13.637 12.843 12.074 11.339 10.615 9.93 9.276 8.686 8.077 7.556 7.075 6.567 6.088 5.64 5.219 4.785 4.388 4.042 3.674 3.283 2.963 2.63 2.279 2.006 1.721 1.422 1.116 0.785 0.555 0.304 -0.104 -0.375 -0.644 -0.783 -1.084 -1.415 -1.761 -1.941 -2.419 -2.533 -2.76 -3.006 -3.529 -3.807 -4.091 -4.411 -4.801 -5.281 -5.903 -7.232 -10 ,19824 ,TETRA ,17608892,Sun Nov 28 22:17:44 CET,Mon Nov 29 00:24:37 CET,0.0 1.048 1.485 1.822 2.12 2.383 2.625 2.853 3.254 3.424 3.593 3.634 4.061 4.209 4.482 4.74 4.987 5.106 5.34 5.561 5.875 6.082 6.284 6.569 6.828 7.078 7.327 7.56 7.842 8.108 8.368 8.688 8.985 9.256 9.561 9.899 10.221 10.568 10.94 11.318 11.69 12.098 12.547 12.957 13.402 13.849 14.27 14.647 15.004 15.179 14.938 14.161 13.294 12.433 11.61 10.828 10.098 9.403 8.785 8.143 7.571 7.047 6.527 6.032 5.554 5.117 4.672 4.245 3.866 3.477 3.073 2.734 2.389 2.028 1.733 1.43 1.116 0.778 0.429 0.191 -0.052 -0.433 -0.71 -0.993 -1.138 -1.45 -1.781 -2.141 -2.331 -2.803 -2.929 -3.154 -3.383 -3.862 -4.117 -4.4 -4.727 -5.085 -5.487 -6.01 -7.638 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt deleted file mode 100644 index c20b24f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14337 ,TETRA ,17608893,Sun Nov 28 22:17:47 CET,Mon Nov 29 00:25:07 CET,0.0 0.958 1.415 1.798 2.107 2.389 2.644 2.875 3.302 3.514 3.713 3.791 4.231 4.397 4.698 4.973 5.228 5.356 5.599 5.823 6.168 6.394 6.606 6.906 7.186 7.449 7.706 7.95 8.258 8.558 8.839 9.184 9.531 9.85 10.2 10.591 10.961 11.348 11.757 12.177 12.588 13.046 13.568 14.075 14.621 15.17 15.772 16.387 16.975 17.453 17.664 17.357 16.786 16.123 15.434 14.793 14.209 13.616 13.076 12.526 12.023 11.58 11.143 10.695 10.264 9.879 9.478 9.104 8.77 8.42 8.073 7.787 7.47 7.143 6.897 6.636 6.361 6.073 5.76 5.532 5.303 4.958 4.713 4.446 4.308 4.019 3.703 3.371 3.199 2.758 2.606 2.391 2.188 1.736 1.487 1.225 0.922 0.578 0.198 -0.331 -1.401 -2 ,25429 ,TETRA ,17608894,Sun Nov 28 22:17:48 CET,Mon Nov 29 00:22:24 CET,0.0 1.069 1.541 1.897 2.203 2.506 2.785 3.037 3.512 3.72 3.914 4.011 4.445 4.601 4.904 5.198 5.477 5.613 5.871 6.109 6.454 6.685 6.9 7.2 7.491 7.764 8.028 8.28 8.599 8.922 9.231 9.575 9.91 10.23 10.579 10.957 11.312 11.707 12.146 12.586 13.02 13.499 14.037 14.552 15.096 15.655 16.241 16.832 17.387 17.793 17.898 17.487 16.897 16.273 15.638 14.99 14.362 13.77 13.24 12.674 12.176 11.702 11.251 10.834 10.423 10.033 9.627 9.259 8.934 8.599 8.249 7.957 7.657 7.346 7.092 6.823 6.546 6.257 5.933 5.71 5.492 5.153 4.904 4.641 4.511 4.242 3.949 3.652 3.496 3.059 2.983 2.793 2.585 2.162 1.929 1.668 1.376 1.075 0.723 0.214 -1.286 -3 ,16154 ,TETRA ,17608895,Sun Nov 28 22:17:51 CET,Mon Nov 29 00:21:55 CET,0.0 0.8 1.298 1.714 2.043 2.328 2.601 2.833 3.262 3.471 3.667 3.746 4.181 4.338 4.627 4.906 5.175 5.304 5.554 5.784 6.119 6.347 6.563 6.876 7.181 7.474 7.753 8.009 8.33 8.648 8.95 9.3 9.645 9.966 10.327 10.719 11.075 11.458 11.884 12.331 12.765 13.233 13.757 14.286 14.905 15.531 16.166 16.756 17.278 17.688 17.869 17.559 16.95 16.27 15.597 14.916 14.287 13.692 13.159 12.592 12.081 11.615 11.157 10.719 10.28 9.86 9.436 9.066 8.742 8.395 8.029 7.725 7.402 7.068 6.814 6.547 6.26 5.953 5.638 5.419 5.196 4.849 4.602 4.338 4.202 3.93 3.652 3.346 3.185 2.751 2.665 2.467 2.26 1.832 1.584 1.321 1.015 0.665 0.285 -0.184 -1.282 -4 ,21557 ,TETRA ,17608896,Sun Nov 28 22:17:46 CET,Mon Nov 29 00:27:59 CET,0.0 1.137 1.678 2.12 2.525 2.843 3.113 3.363 3.822 4.027 4.215 4.308 4.754 4.92 5.244 5.558 5.831 5.961 6.217 6.47 6.821 7.034 7.245 7.543 7.831 8.112 8.398 8.659 8.967 9.265 9.553 9.895 10.216 10.523 10.873 11.262 11.621 11.994 12.382 12.788 13.206 13.652 14.156 14.663 15.211 15.763 16.369 16.986 17.568 18.045 18.267 17.968 17.415 16.78 16.143 15.536 14.985 14.44 13.909 13.343 12.831 12.363 11.923 11.488 11.043 10.63 10.222 9.854 9.524 9.173 8.777 8.427 8.059 7.683 7.385 7.083 6.789 6.477 6.145 5.914 5.675 5.29 5.02 4.723 4.562 4.256 3.959 3.635 3.461 3.022 2.927 2.73 2.529 2.088 1.849 1.591 1.29 0.954 0.573 0.115 -0.774 -5 ,1651 ,TETRA ,17608897,Sun Nov 28 22:17:46 CET,Mon Nov 29 00:22:09 CET,0.0 0.737 1.216 1.593 1.905 2.194 2.463 2.711 3.135 3.339 3.533 3.626 4.069 4.226 4.536 4.839 5.136 5.279 5.553 5.804 6.151 6.37 6.58 6.876 7.155 7.435 7.719 7.99 8.345 8.692 8.987 9.331 9.663 9.97 10.328 10.727 11.105 11.522 11.951 12.391 12.842 13.313 13.834 14.355 14.954 15.548 16.137 16.751 17.365 17.819 18.016 17.706 17.084 16.425 15.79 15.144 14.529 13.95 13.432 12.878 12.378 11.923 11.473 11.043 10.647 10.276 9.871 9.5 9.182 8.851 8.492 8.195 7.889 7.547 7.273 6.998 6.712 6.41 6.099 5.875 5.632 5.271 5.021 4.761 4.628 4.321 3.993 3.674 3.507 3.068 2.981 2.769 2.547 2.111 1.863 1.592 1.299 0.958 0.555 0.025 -0.878 -6 ,30810 ,TETRA ,17608898,Sun Nov 28 22:17:47 CET,Mon Nov 29 00:22:05 CET,0.0 1.04 1.49 1.825 2.117 2.387 2.657 2.905 3.341 3.545 3.732 3.814 4.264 4.44 4.742 5.023 5.302 5.438 5.692 5.931 6.279 6.497 6.703 6.999 7.287 7.563 7.82 8.077 8.415 8.736 9.035 9.376 9.701 10.016 10.358 10.726 11.083 11.471 11.886 12.312 12.759 13.258 13.798 14.313 14.888 15.5 16.161 16.834 17.476 17.936 18.116 17.83 17.287 16.654 16.009 15.38 14.766 14.154 13.615 13.073 12.579 12.119 11.68 11.254 10.843 10.47 10.08 9.722 9.401 9.063 8.706 8.403 8.087 7.758 7.503 7.241 6.971 6.683 6.38 6.171 5.949 5.595 5.344 5.077 4.941 4.647 4.295 3.937 3.773 3.328 3.191 2.97 2.749 2.293 2.033 1.744 1.445 1.105 0.723 0.245 -0.864 -7 ,1868 ,TETRA ,17608899,Sun Nov 28 22:17:49 CET,Mon Nov 29 00:21:53 CET,0.0 0.621 1.071 1.416 1.689 1.943 2.192 2.426 2.85 3.046 3.244 3.347 3.774 3.935 4.247 4.542 4.831 4.955 5.189 5.419 5.73 5.936 6.141 6.458 6.769 7.044 7.306 7.557 7.872 8.167 8.445 8.777 9.102 9.419 9.772 10.147 10.506 10.904 11.348 11.802 12.243 12.736 13.298 13.827 14.406 15.009 15.632 16.232 16.822 17.367 17.648 17.372 16.83 16.207 15.572 14.921 14.314 13.758 13.259 12.729 12.247 11.803 11.361 10.931 10.528 10.153 9.759 9.4 9.085 8.737 8.356 8.05 7.74 7.41 7.144 6.874 6.603 6.313 6.007 5.795 5.571 5.213 4.964 4.714 4.589 4.311 3.997 3.664 3.494 3.047 2.93 2.733 2.522 2.04 1.764 1.454 1.123 0.768 0.35 -0.186 -1.614 -8 ,4753 ,TETRA ,17608900,Sun Nov 28 22:17:51 CET,Mon Nov 29 00:21:42 CET,0.0 0.862 1.316 1.687 2.002 2.289 2.559 2.806 3.242 3.431 3.623 3.701 4.136 4.299 4.607 4.891 5.176 5.312 5.56 5.8 6.137 6.35 6.551 6.841 7.122 7.391 7.64 7.873 8.192 8.511 8.804 9.163 9.514 9.835 10.202 10.605 10.969 11.355 11.76 12.156 12.553 12.999 13.545 14.083 14.635 15.214 15.842 16.451 17.03 17.495 17.674 17.306 16.713 16.065 15.432 14.807 14.231 13.649 13.102 12.549 12.056 11.594 11.149 10.725 10.314 9.94 9.555 9.208 8.892 8.508 8.086 7.759 7.432 7.087 6.816 6.536 6.241 5.929 5.6 5.372 5.136 4.773 4.52 4.249 4.116 3.831 3.517 3.187 3.007 2.559 2.428 2.206 1.981 1.525 1.293 1.046 0.742 0.398 0.015 -0.455 -1.862 -9 ,32429 ,TETRA ,17608901,Sun Nov 28 22:18:43 CET,Mon Nov 29 00:04:47 CET,0.0 1.235 1.757 2.171 2.52 2.785 3.032 3.269 3.69 3.888 4.085 4.176 4.613 4.78 5.107 5.41 5.695 5.837 6.106 6.347 6.702 6.929 7.145 7.459 7.763 8.058 8.327 8.575 8.896 9.205 9.496 9.836 10.171 10.488 10.844 11.237 11.595 11.974 12.392 12.837 13.264 13.717 14.245 14.745 15.276 15.795 16.331 16.892 17.506 18.078 18.366 18.094 17.546 16.951 16.355 15.712 15.094 14.505 13.964 13.387 12.887 12.447 12.019 11.603 11.208 10.833 10.411 10.025 9.69 9.336 8.955 8.63 8.298 7.962 7.701 7.424 7.124 6.821 6.489 6.247 6.017 5.666 5.411 5.135 4.992 4.71 4.414 4.089 3.909 3.449 3.342 3.118 2.873 2.389 2.134 1.864 1.54 1.158 0.736 0.245 -0.975 -10 ,29973 ,TETRA ,17608902,Sun Nov 28 22:18:43 CET,Mon Nov 29 00:27:54 CET,0.0 0.905 1.342 1.722 2.068 2.377 2.635 2.863 3.32 3.541 3.743 3.842 4.289 4.48 4.841 5.138 5.418 5.549 5.802 6.052 6.396 6.611 6.816 7.114 7.401 7.674 7.935 8.177 8.487 8.796 9.089 9.428 9.74 10.05 10.429 10.851 11.244 11.664 12.09 12.512 12.953 13.445 13.993 14.521 15.117 15.75 16.389 16.965 17.539 18.081 18.386 18.085 17.524 16.917 16.281 15.631 15.027 14.472 13.978 13.43 12.933 12.481 12.043 11.604 11.189 10.822 10.437 10.085 9.77 9.442 9.089 8.785 8.47 8.142 7.875 7.593 7.302 7.007 6.709 6.498 6.276 5.932 5.678 5.409 5.274 4.997 4.709 4.394 4.223 3.774 3.692 3.508 3.303 2.854 2.597 2.312 2.01 1.666 1.262 0.753 -1.114 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt deleted file mode 100644 index 2b51df0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31229 ,TETRA ,17608903,Sun Nov 28 22:18:45 CET,Mon Nov 29 00:27:59 CET,0.0 0.775 1.199 1.565 1.862 2.13 2.388 2.6 2.981 3.161 3.344 3.415 3.837 3.989 4.278 4.556 4.814 4.937 5.174 5.408 5.742 5.942 6.13 6.41 6.683 6.947 7.198 7.433 7.73 8.018 8.304 8.656 8.999 9.33 9.698 10.095 10.453 10.82 11.232 11.662 12.093 12.565 13.062 13.513 14.001 14.485 14.986 15.419 15.748 15.942 15.74 14.922 13.934 13.001 12.115 11.28 10.531 9.78 9.107 8.447 7.864 7.341 6.847 6.375 5.929 5.51 5.078 4.687 4.322 3.942 3.554 3.226 2.873 2.494 2.216 1.935 1.631 1.324 1.002 0.775 0.544 0.187 -0.065 -0.34 -0.483 -0.781 -1.093 -1.415 -1.578 -2.018 -2.109 -2.312 -2.52 -2.982 -3.235 -3.512 -3.808 -4.125 -4.5 -4.955 -5.788 -2 ,21413 ,TETRA ,17608904,Sun Nov 28 22:18:47 CET,Mon Nov 29 00:24:55 CET,0.0 0.905 1.329 1.716 2.024 2.284 2.516 2.743 3.169 3.356 3.541 3.612 4.028 4.17 4.462 4.732 4.976 5.092 5.318 5.541 5.87 6.09 6.306 6.61 6.89 7.146 7.381 7.612 7.922 8.214 8.488 8.812 9.119 9.415 9.75 10.112 10.447 10.81 11.183 11.585 12.002 12.432 12.926 13.388 13.855 14.33 14.8 15.249 15.639 15.857 15.685 14.954 14.081 13.198 12.365 11.579 10.863 10.18 9.583 8.967 8.389 7.862 7.359 6.876 6.43 6.02 5.586 5.201 4.864 4.511 4.129 3.798 3.466 3.134 2.87 2.588 2.295 1.993 1.685 1.47 1.255 0.929 0.688 0.42 0.285 0.006 -0.297 -0.613 -0.774 -1.215 -1.281 -1.46 -1.647 -2.052 -2.28 -2.529 -2.79 -3.093 -3.451 -3.844 -4.692 -3 ,6277 ,TETRA ,17608905,Sun Nov 28 22:18:49 CET,Mon Nov 29 00:24:03 CET,0.0 0.628 1.025 1.339 1.593 1.832 2.067 2.298 2.725 2.916 3.087 3.147 3.565 3.718 4.013 4.281 4.544 4.671 4.913 5.142 5.492 5.731 5.952 6.259 6.547 6.823 7.076 7.319 7.639 7.939 8.234 8.575 8.884 9.172 9.503 9.887 10.244 10.612 10.993 11.392 11.804 12.242 12.722 13.168 13.637 14.112 14.583 14.992 15.299 15.47 15.291 14.519 13.609 12.705 11.907 11.17 10.473 9.81 9.198 8.568 8.002 7.477 6.967 6.473 6.011 5.591 5.144 4.743 4.412 4.064 3.674 3.344 3.01 2.663 2.391 2.102 1.784 1.455 1.12 0.894 0.667 0.308 0.058 -0.2 -0.338 -0.631 -0.924 -1.238 -1.405 -1.853 -1.945 -2.141 -2.362 -2.836 -3.08 -3.338 -3.634 -3.973 -4.367 -4.856 -5.909 -4 ,14621 ,TETRA ,17608906,Sun Nov 28 22:18:44 CET,Mon Nov 29 00:27:59 CET,0.0 1.003 1.398 1.741 2.06 2.328 2.57 2.804 3.251 3.452 3.625 3.691 4.128 4.288 4.595 4.887 5.165 5.297 5.557 5.811 6.163 6.375 6.575 6.859 7.137 7.403 7.65 7.894 8.217 8.515 8.795 9.122 9.428 9.723 10.057 10.437 10.789 11.137 11.51 11.913 12.306 12.724 13.201 13.648 14.111 14.573 15.026 15.443 15.822 16.06 15.886 15.185 14.321 13.448 12.624 11.842 11.113 10.426 9.822 9.186 8.64 8.146 7.648 7.166 6.705 6.295 5.859 5.455 5.104 4.739 4.371 4.066 3.742 3.403 3.13 2.847 2.56 2.262 1.945 1.721 1.498 1.148 0.895 0.63 0.495 0.217 -0.091 -0.409 -0.572 -1.023 -1.12 -1.314 -1.516 -1.975 -2.232 -2.497 -2.763 -3.064 -3.409 -3.821 -4.669 -5 ,3404 ,TETRA ,17608907,Sun Nov 28 22:18:47 CET,Mon Nov 29 00:28:28 CET,0.0 0.627 1.033 1.375 1.667 1.925 2.191 2.434 2.84 3.023 3.196 3.242 3.674 3.84 4.135 4.407 4.669 4.794 5.034 5.263 5.602 5.832 6.053 6.367 6.663 6.942 7.213 7.475 7.808 8.111 8.403 8.767 9.111 9.424 9.785 10.183 10.55 10.961 11.391 11.815 12.239 12.691 13.193 13.661 14.149 14.665 15.169 15.61 15.98 16.131 15.794 14.994 14.087 13.126 12.252 11.409 10.63 9.914 9.278 8.632 8.058 7.529 7.038 6.569 6.116 5.677 5.195 4.782 4.439 4.077 3.681 3.342 2.975 2.598 2.317 2.014 1.687 1.352 1.009 0.774 0.524 0.147 -0.105 -0.373 -0.511 -0.8 -1.115 -1.451 -1.623 -2.077 -2.204 -2.428 -2.64 -3.072 -3.304 -3.574 -3.895 -4.231 -4.616 -5.081 -6.052 -6 ,11571 ,TETRA ,17608908,Sun Nov 28 22:18:45 CET,Mon Nov 29 00:16:55 CET,0.0 1.045 1.503 1.892 2.22 2.496 2.757 2.999 3.454 3.67 3.876 3.986 4.427 4.586 4.891 5.184 5.459 5.589 5.835 6.064 6.398 6.617 6.829 7.144 7.434 7.705 7.964 8.2 8.496 8.785 9.059 9.368 9.677 9.991 10.331 10.687 11.024 11.379 11.755 12.133 12.506 12.913 13.364 13.77 14.199 14.662 15.132 15.56 15.926 16.103 15.796 14.98 14.073 13.126 12.243 11.398 10.632 9.931 9.301 8.64 8.038 7.518 7.036 6.551 6.086 5.652 5.186 4.764 4.4 4.031 3.643 3.319 2.991 2.655 2.389 2.11 1.818 1.514 1.2 0.982 0.752 0.38 0.12 -0.15 -0.291 -0.586 -0.888 -1.206 -1.379 -1.824 -1.949 -2.168 -2.385 -2.855 -3.116 -3.388 -3.659 -3.948 -4.331 -4.839 -5.586 -7 ,22678 ,TETRA ,17608909,Sun Nov 28 22:18:45 CET,Mon Nov 29 00:23:49 CET,0.0 1.013 1.437 1.786 2.072 2.318 2.559 2.789 3.197 3.382 3.564 3.649 4.084 4.239 4.523 4.787 5.048 5.179 5.427 5.651 5.974 6.184 6.389 6.688 6.971 7.239 7.502 7.757 8.064 8.35 8.626 8.945 9.239 9.514 9.835 10.199 10.541 10.891 11.249 11.609 11.988 12.392 12.837 13.272 13.726 14.191 14.644 15.036 15.407 15.561 15.194 14.351 13.389 12.47 11.631 10.827 10.094 9.398 8.765 8.124 7.574 7.075 6.593 6.113 5.655 5.252 4.831 4.448 4.103 3.743 3.376 3.074 2.753 2.415 2.147 1.869 1.574 1.257 0.928 0.703 0.48 0.13 -0.125 -0.395 -0.535 -0.82 -1.119 -1.438 -1.6 -2.043 -2.139 -2.328 -2.528 -2.98 -3.223 -3.472 -3.72 -3.986 -4.31 -4.745 -5.793 -8 ,5851 ,TETRA ,17608910,Sun Nov 28 22:18:47 CET,Mon Nov 29 00:23:08 CET,0.0 1.41 1.967 2.369 2.704 2.977 3.24 3.492 3.914 4.107 4.295 4.384 4.822 4.991 5.311 5.614 5.898 6.034 6.297 6.537 6.878 7.098 7.301 7.585 7.859 8.122 8.379 8.627 8.934 9.231 9.523 9.87 10.189 10.487 10.82 11.186 11.543 11.929 12.332 12.73 13.123 13.541 14.008 14.466 14.924 15.35 15.788 16.239 16.629 16.827 16.65 15.921 15.053 14.166 13.308 12.503 11.737 10.998 10.369 9.727 9.157 8.662 8.192 7.722 7.26 6.83 6.389 5.993 5.638 5.264 4.872 4.532 4.166 3.802 3.524 3.236 2.941 2.626 2.302 2.08 1.846 1.477 1.214 0.945 0.811 0.533 0.226 -0.115 -0.289 -0.731 -0.805 -0.999 -1.207 -1.664 -1.911 -2.164 -2.452 -2.761 -3.137 -3.652 -4.449 -9 ,28795 ,TETRA ,17608911,Sun Nov 28 22:18:49 CET,Mon Nov 29 00:23:54 CET,0.0 0.709 1.143 1.479 1.754 2.011 2.268 2.496 2.891 3.072 3.246 3.303 3.721 3.869 4.155 4.421 4.666 4.787 5.029 5.256 5.575 5.778 5.972 6.257 6.532 6.797 7.052 7.293 7.593 7.883 8.168 8.493 8.788 9.078 9.416 9.785 10.141 10.525 10.929 11.356 11.764 12.175 12.637 13.085 13.559 14.025 14.527 14.989 15.399 15.654 15.416 14.636 13.736 12.806 11.912 11.07 10.301 9.583 8.956 8.335 7.803 7.307 6.822 6.365 5.939 5.539 5.104 4.706 4.351 3.983 3.608 3.282 2.947 2.606 2.341 2.067 1.775 1.467 1.156 0.946 0.716 0.347 0.1 -0.16 -0.302 -0.599 -0.897 -1.218 -1.387 -1.835 -1.922 -2.118 -2.32 -2.753 -2.993 -3.26 -3.546 -3.868 -4.238 -4.709 -5.819 -10 ,9782 ,TETRA ,17608912,Sun Nov 28 22:18:51 CET,Mon Nov 29 00:23:32 CET,0.0 0.678 1.088 1.424 1.713 1.963 2.205 2.448 2.881 3.078 3.258 3.304 3.725 3.879 4.189 4.489 4.773 4.907 5.175 5.421 5.747 5.963 6.178 6.474 6.748 7.014 7.267 7.515 7.83 8.135 8.425 8.762 9.086 9.391 9.73 10.099 10.443 10.81 11.201 11.604 12.018 12.456 12.914 13.347 13.815 14.293 14.78 15.189 15.533 15.759 15.568 14.772 13.836 12.883 11.947 11.08 10.314 9.602 8.958 8.289 7.7 7.166 6.644 6.141 5.674 5.243 4.785 4.376 4.018 3.636 3.238 2.906 2.565 2.213 1.936 1.642 1.344 1.033 0.709 0.494 0.256 -0.116 -0.366 -0.629 -0.765 -1.038 -1.328 -1.638 -1.799 -2.23 -2.299 -2.483 -2.684 -3.116 -3.359 -3.626 -3.899 -4.184 -4.506 -4.936 -5.775 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index d8cd619a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9147 ,TETRA ,17602854,Sun Nov 28 16:23:14 CET,Sun Nov 28 18:08:43 CET,0.0 0.997 1.427 1.763 2.077 2.368 2.614 2.836 3.246 3.446 3.636 3.721 4.124 4.269 4.547 4.818 5.074 5.183 5.391 5.592 5.893 6.091 6.283 6.551 6.801 7.062 7.316 7.539 7.821 8.081 8.314 8.587 8.851 9.101 9.385 9.7 9.993 10.293 10.582 10.881 11.168 11.454 11.756 12.05 12.392 12.696 12.931 13.086 13.129 12.909 12.12 10.863 9.627 8.465 7.429 6.456 5.606 4.809 4.109 3.42 2.772 2.15 1.57 1.031 0.498 0.005 -0.517 -0.987 -1.38 -1.797 -2.231 -2.593 -2.98 -3.375 -3.686 -4.0 -4.321 -4.663 -5.0 -5.235 -5.497 -5.918 -6.211 -6.514 -6.665 -6.969 -7.292 -7.639 -7.823 -8.276 -8.413 -8.633 -8.874 -9.394 -9.682 -9.979 -10.309 -10.688 -11.125 -11.74 -12.929 -2 ,16926 ,TETRA ,17602855,Sun Nov 28 16:23:14 CET,Sun Nov 28 18:08:43 CET,0.0 0.908 1.411 1.786 2.106 2.394 2.654 2.88 3.283 3.466 3.65 3.737 4.145 4.294 4.57 4.817 5.054 5.173 5.398 5.616 5.943 6.139 6.318 6.574 6.819 7.072 7.308 7.531 7.816 8.067 8.297 8.567 8.841 9.097 9.374 9.679 9.977 10.289 10.622 10.978 11.303 11.612 11.882 12.145 12.443 12.648 12.794 12.914 12.923 12.684 11.941 10.721 9.546 8.45 7.416 6.441 5.587 4.794 4.076 3.342 2.677 2.073 1.499 0.982 0.5 0.044 -0.445 -0.911 -1.311 -1.73 -2.165 -2.512 -2.862 -3.236 -3.54 -3.854 -4.182 -4.527 -4.882 -5.14 -5.407 -5.813 -6.093 -6.375 -6.531 -6.868 -7.207 -7.576 -7.768 -8.229 -8.389 -8.611 -8.831 -9.293 -9.558 -9.862 -10.206 -10.6 -11.043 -11.566 -12.704 -3 ,1325 ,TETRA ,17602856,Sun Nov 28 16:23:14 CET,Sun Nov 28 18:08:32 CET,0.0 1.004 1.458 1.789 2.073 2.339 2.58 2.81 3.21 3.39 3.57 3.641 4.046 4.191 4.472 4.745 4.998 5.118 5.338 5.548 5.866 6.071 6.272 6.548 6.808 7.072 7.314 7.531 7.791 8.044 8.288 8.567 8.848 9.114 9.398 9.695 9.957 10.227 10.518 10.822 11.119 11.41 11.727 12.041 12.363 12.649 12.872 13.011 13.016 12.741 11.931 10.677 9.461 8.345 7.34 6.411 5.553 4.747 4.018 3.254 2.607 2.068 1.55 1.038 0.548 0.068 -0.446 -0.894 -1.286 -1.715 -2.16 -2.525 -2.914 -3.308 -3.61 -3.936 -4.279 -4.633 -5.002 -5.253 -5.516 -5.934 -6.215 -6.502 -6.658 -6.983 -7.327 -7.704 -7.891 -8.339 -8.472 -8.692 -8.926 -9.457 -9.74 -10.018 -10.331 -10.707 -11.13 -11.693 -12.83 -4 ,1942 ,TETRA ,17602857,Sun Nov 28 16:23:16 CET,Sun Nov 28 18:08:39 CET,0.0 0.985 1.41 1.754 2.059 2.329 2.569 2.791 3.186 3.363 3.538 3.616 4.027 4.173 4.44 4.689 4.931 5.05 5.278 5.501 5.831 6.033 6.219 6.487 6.746 6.997 7.225 7.437 7.716 7.978 8.235 8.548 8.841 9.117 9.425 9.728 9.992 10.296 10.625 10.963 11.299 11.651 12.021 12.329 12.604 12.857 13.104 13.263 13.254 12.998 12.23 10.928 9.674 8.551 7.529 6.577 5.733 4.94 4.221 3.476 2.825 2.257 1.713 1.186 0.708 0.276 -0.204 -0.655 -1.045 -1.46 -1.895 -2.249 -2.616 -2.993 -3.294 -3.606 -3.926 -4.272 -4.638 -4.881 -5.13 -5.532 -5.823 -6.132 -6.288 -6.606 -6.939 -7.301 -7.488 -7.94 -8.076 -8.294 -8.52 -9.02 -9.303 -9.595 -9.907 -10.262 -10.699 -11.268 -12.69 -5 ,13886 ,TETRA ,17602858,Sun Nov 28 16:23:18 CET,Sun Nov 28 18:08:54 CET,0.0 0.88 1.356 1.721 2.01 2.263 2.5 2.717 3.093 3.264 3.431 3.478 3.876 4.021 4.301 4.563 4.813 4.929 5.158 5.388 5.705 5.899 6.081 6.347 6.603 6.843 7.074 7.299 7.585 7.847 8.096 8.393 8.67 8.944 9.239 9.516 9.758 10.034 10.347 10.663 10.935 11.23 11.571 11.845 12.131 12.411 12.633 12.735 12.717 12.461 11.674 10.418 9.201 8.084 7.066 6.092 5.19 4.422 3.768 3.051 2.429 1.884 1.337 0.793 0.308 -0.128 -0.604 -1.041 -1.436 -1.866 -2.309 -2.656 -3.024 -3.4 -3.687 -3.99 -4.326 -4.681 -5.043 -5.299 -5.551 -5.942 -6.225 -6.527 -6.676 -6.97 -7.296 -7.651 -7.834 -8.295 -8.442 -8.652 -8.871 -9.359 -9.644 -9.939 -10.259 -10.636 -11.05 -11.552 -12.724 -6 ,521 ,TETRA ,17602859,Sun Nov 28 16:23:20 CET,Sun Nov 28 18:08:36 CET,0.0 0.837 1.269 1.613 1.908 2.181 2.447 2.682 3.084 3.271 3.44 3.506 3.913 4.058 4.328 4.579 4.815 4.931 5.167 5.388 5.705 5.911 6.108 6.377 6.62 6.85 7.073 7.298 7.582 7.834 8.073 8.369 8.647 8.894 9.161 9.453 9.738 10.035 10.334 10.648 10.961 11.26 11.56 11.844 12.155 12.463 12.693 12.804 12.851 12.678 11.924 10.646 9.431 8.31 7.271 6.344 5.508 4.73 4.048 3.345 2.72 2.141 1.591 1.089 0.623 0.156 -0.36 -0.804 -1.181 -1.596 -2.038 -2.4 -2.773 -3.151 -3.446 -3.759 -4.081 -4.417 -4.779 -5.032 -5.298 -5.717 -6.008 -6.309 -6.463 -6.785 -7.128 -7.49 -7.683 -8.147 -8.285 -8.503 -8.729 -9.191 -9.448 -9.726 -10.04 -10.42 -10.877 -11.47 -12.779 -7 ,10750 ,TETRA ,17602860,Sun Nov 28 16:23:14 CET,Sun Nov 28 18:08:48 CET,0.0 0.892 1.311 1.643 1.927 2.192 2.443 2.675 3.092 3.287 3.47 3.543 3.95 4.093 4.366 4.629 4.87 4.985 5.216 5.445 5.756 5.942 6.121 6.381 6.633 6.885 7.126 7.347 7.637 7.898 8.129 8.399 8.659 8.913 9.208 9.521 9.792 10.097 10.397 10.682 10.981 11.287 11.594 11.853 12.125 12.382 12.59 12.687 12.611 12.31 11.49 10.161 8.908 7.746 6.725 5.808 4.977 4.206 3.517 2.797 2.158 1.569 1.003 0.469 -0.011 -0.466 -0.993 -1.441 -1.825 -2.243 -2.668 -3.021 -3.384 -3.764 -4.075 -4.401 -4.736 -5.082 -5.443 -5.687 -5.94 -6.351 -6.635 -6.926 -7.078 -7.402 -7.739 -8.086 -8.278 -8.744 -8.891 -9.108 -9.337 -9.844 -10.123 -10.408 -10.721 -11.109 -11.563 -12.132 -13.624 -8 ,28140 ,TETRA ,17602861,Sun Nov 28 16:23:20 CET,Sun Nov 28 18:09:35 CET,0.0 0.753 1.198 1.585 1.911 2.167 2.388 2.602 3.001 3.189 3.366 3.425 3.838 3.991 4.277 4.552 4.8 4.921 5.161 5.372 5.658 5.852 6.052 6.327 6.572 6.81 7.049 7.285 7.584 7.866 8.119 8.433 8.74 9.001 9.296 9.616 9.898 10.182 10.455 10.758 11.081 11.428 11.745 12.001 12.294 12.562 12.776 12.875 12.847 12.598 11.85 10.645 9.496 8.441 7.471 6.559 5.717 4.905 4.189 3.468 2.844 2.277 1.721 1.194 0.693 0.232 -0.256 -0.73 -1.135 -1.545 -1.968 -2.308 -2.68 -3.086 -3.404 -3.732 -4.067 -4.39 -4.728 -4.975 -5.226 -5.623 -5.908 -6.203 -6.354 -6.679 -7.031 -7.402 -7.592 -8.051 -8.211 -8.437 -8.674 -9.191 -9.462 -9.77 -10.11 -10.472 -10.889 -11.424 -12.649 -9 ,18840 ,TETRA ,17602862,Sun Nov 28 16:23:15 CET,Sun Nov 28 18:09:35 CET,0.0 0.827 1.228 1.574 1.883 2.162 2.406 2.63 3.051 3.248 3.434 3.495 3.902 4.062 4.364 4.625 4.875 4.996 5.219 5.43 5.74 5.937 6.127 6.402 6.659 6.888 7.105 7.329 7.635 7.919 8.156 8.428 8.694 8.953 9.258 9.573 9.876 10.206 10.512 10.818 11.134 11.463 11.771 12.021 12.28 12.51 12.703 12.795 12.758 12.471 11.66 10.397 9.178 8.022 6.947 5.947 5.073 4.321 3.656 2.935 2.3 1.736 1.182 0.639 0.147 -0.3 -0.78 -1.209 -1.598 -1.999 -2.435 -2.805 -3.174 -3.553 -3.852 -4.167 -4.49 -4.836 -5.2 -5.45 -5.699 -6.098 -6.391 -6.697 -6.852 -7.163 -7.506 -7.88 -8.067 -8.517 -8.647 -8.858 -9.083 -9.58 -9.865 -10.168 -10.489 -10.856 -11.274 -11.846 -13.174 -10 ,20350 ,TETRA ,17602863,Sun Nov 28 16:23:17 CET,Sun Nov 28 18:08:48 CET,0.0 1.02 1.443 1.791 2.109 2.381 2.62 2.832 3.21 3.396 3.57 3.626 4.027 4.171 4.457 4.733 4.982 5.098 5.318 5.533 5.842 6.036 6.224 6.496 6.747 6.974 7.199 7.407 7.66 7.913 8.161 8.447 8.719 8.966 9.24 9.548 9.833 10.124 10.396 10.646 10.95 11.305 11.648 11.974 12.272 12.521 12.725 12.839 12.828 12.557 11.781 10.541 9.321 8.182 7.17 6.214 5.305 4.466 3.773 3.077 2.429 1.847 1.308 0.769 0.258 -0.194 -0.682 -1.127 -1.512 -1.911 -2.34 -2.714 -3.081 -3.439 -3.729 -4.046 -4.367 -4.714 -5.098 -5.359 -5.617 -6.013 -6.291 -6.579 -6.731 -7.051 -7.382 -7.731 -7.913 -8.367 -8.513 -8.732 -8.961 -9.461 -9.745 -10.057 -10.399 -10.786 -11.232 -11.76 -13.045 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index 45af1189..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21463 ,TETRA ,17602864,Sun Nov 28 16:23:15 CET,Sun Nov 28 18:08:52 CET,0.0 0.466 0.821 1.139 1.404 1.631 1.848 2.055 2.409 2.57 2.723 2.758 3.152 3.282 3.527 3.754 3.963 4.061 4.245 4.427 4.703 4.884 5.057 5.287 5.491 5.681 5.867 6.048 6.269 6.477 6.685 6.938 7.174 7.39 7.639 7.901 8.141 8.413 8.679 8.87 9.02 9.2 9.357 9.468 9.526 9.469 9.268 8.959 8.433 7.351 5.299 2.685 0.545 -1.24 -2.78 -4.146 -5.334 -6.404 -7.385 -8.378 -9.198 -9.969 -10.698 -11.358 -11.965 -12.531 -13.134 -13.649 -14.102 -14.584 -15.079 -15.485 -15.909 -16.345 -16.695 -17.062 -17.435 -17.807 -18.197 -18.476 -18.76 -19.209 -19.516 -19.835 -20.0 -20.344 -20.719 -21.113 -21.312 -21.792 -21.944 -22.166 -22.391 -22.895 -23.185 -23.503 -23.843 -24.218 -24.674 -25.232 -26.137 -2 ,1643 ,TETRA ,17602865,Sun Nov 28 16:23:17 CET,Sun Nov 28 18:08:59 CET,0.0 0.742 1.08 1.359 1.617 1.852 2.059 2.261 2.634 2.797 2.943 2.966 3.357 3.493 3.756 4.006 4.262 4.388 4.614 4.828 5.127 5.31 5.501 5.775 6.023 6.264 6.49 6.689 6.932 7.153 7.366 7.607 7.835 8.064 8.32 8.607 8.869 9.117 9.355 9.563 9.754 9.972 10.197 10.349 10.427 10.436 10.334 10.046 9.47 8.435 6.439 3.863 1.744 -0.056 -1.595 -2.986 -4.238 -5.391 -6.369 -7.321 -8.14 -8.879 -9.573 -10.204 -10.817 -11.395 -11.984 -12.509 -12.958 -13.412 -13.894 -14.298 -14.708 -15.154 -15.52 -15.879 -16.25 -16.651 -17.068 -17.344 -17.633 -18.114 -18.438 -18.773 -18.948 -19.291 -19.633 -20.002 -20.201 -20.686 -20.836 -21.061 -21.299 -21.837 -22.127 -22.442 -22.794 -23.188 -23.624 -24.182 -25.361 -3 ,14702 ,TETRA ,17602866,Sun Nov 28 16:23:51 CET,Sun Nov 28 18:11:42 CET,0.0 0.607 0.971 1.269 1.515 1.732 1.929 2.119 2.465 2.621 2.774 2.82 3.214 3.339 3.57 3.787 4.006 4.115 4.322 4.52 4.806 4.989 5.166 5.434 5.692 5.915 6.109 6.297 6.531 6.748 6.961 7.22 7.459 7.661 7.872 8.121 8.357 8.593 8.83 9.04 9.247 9.468 9.649 9.765 9.809 9.781 9.66 9.402 8.871 7.82 5.822 3.355 1.242 -0.639 -2.24 -3.609 -4.769 -5.845 -6.786 -7.734 -8.583 -9.358 -10.072 -10.721 -11.339 -11.915 -12.531 -13.064 -13.508 -13.985 -14.483 -14.895 -15.333 -15.785 -16.111 -16.449 -16.813 -17.199 -17.604 -17.876 -18.155 -18.59 -18.895 -19.217 -19.386 -19.755 -20.139 -20.501 -20.689 -21.176 -21.335 -21.571 -21.812 -22.323 -22.608 -22.91 -23.236 -23.613 -24.072 -24.67 -25.763 -4 ,277 ,TETRA ,17602867,Sun Nov 28 16:23:50 CET,Sun Nov 28 18:11:09 CET,0.0 0.699 1.046 1.332 1.579 1.801 2.003 2.186 2.528 2.688 2.838 2.863 3.254 3.383 3.637 3.88 4.118 4.239 4.462 4.662 4.941 5.116 5.295 5.547 5.781 6.012 6.217 6.416 6.687 6.936 7.156 7.394 7.622 7.841 8.067 8.304 8.526 8.768 9.011 9.247 9.455 9.629 9.775 9.854 9.922 9.926 9.809 9.535 8.933 7.883 5.95 3.47 1.377 -0.427 -1.986 -3.414 -4.661 -5.737 -6.628 -7.534 -8.352 -9.097 -9.799 -10.448 -11.057 -11.632 -12.235 -12.779 -13.235 -13.697 -14.19 -14.593 -15.006 -15.433 -15.763 -16.113 -16.482 -16.879 -17.29 -17.561 -17.843 -18.283 -18.59 -18.909 -19.08 -19.435 -19.798 -20.173 -20.372 -20.856 -21.007 -21.243 -21.494 -22.026 -22.309 -22.622 -22.969 -23.363 -23.803 -24.334 -25.371 -5 ,20272 ,TETRA ,17602868,Sun Nov 28 16:23:50 CET,Sun Nov 28 18:09:48 CET,0.0 0.614 0.968 1.26 1.51 1.747 1.959 2.141 2.485 2.654 2.815 2.856 3.248 3.386 3.657 3.919 4.164 4.279 4.495 4.702 5.005 5.19 5.367 5.62 5.859 6.083 6.296 6.502 6.766 7.012 7.232 7.492 7.723 7.92 8.154 8.403 8.615 8.822 9.037 9.257 9.438 9.575 9.7 9.809 9.87 9.883 9.747 9.396 8.797 7.757 5.806 3.294 1.17 -0.616 -2.124 -3.505 -4.693 -5.788 -6.733 -7.667 -8.495 -9.22 -9.922 -10.579 -11.171 -11.716 -12.315 -12.868 -13.319 -13.778 -14.264 -14.683 -15.125 -15.587 -15.951 -16.313 -16.672 -17.043 -17.443 -17.722 -18.011 -18.46 -18.766 -19.086 -19.25 -19.575 -19.925 -20.305 -20.508 -20.994 -21.137 -21.366 -21.602 -22.087 -22.359 -22.672 -23.017 -23.409 -23.83 -24.292 -25.517 -6 ,14780 ,TETRA ,17602869,Sun Nov 28 16:23:50 CET,Sun Nov 28 18:10:29 CET,0.0 0.527 0.872 1.157 1.401 1.617 1.813 1.998 2.355 2.517 2.666 2.687 3.07 3.192 3.431 3.659 3.885 3.997 4.197 4.379 4.628 4.789 4.957 5.21 5.453 5.691 5.902 6.088 6.339 6.579 6.812 7.095 7.36 7.598 7.857 8.121 8.361 8.591 8.786 8.982 9.186 9.411 9.585 9.658 9.682 9.642 9.514 9.252 8.72 7.713 5.823 3.409 1.302 -0.513 -2.068 -3.448 -4.633 -5.694 -6.632 -7.589 -8.45 -9.23 -9.966 -10.681 -11.334 -11.886 -12.456 -12.989 -13.452 -13.937 -14.456 -14.885 -15.313 -15.739 -16.083 -16.45 -16.823 -17.214 -17.598 -17.86 -18.148 -18.608 -18.927 -19.256 -19.427 -19.771 -20.127 -20.496 -20.684 -21.158 -21.316 -21.553 -21.791 -22.31 -22.606 -22.927 -23.269 -23.637 -24.052 -24.569 -25.446 -7 ,17017 ,TETRA ,17602870,Sun Nov 28 16:23:52 CET,Sun Nov 28 18:10:27 CET,0.0 0.476 0.803 1.089 1.332 1.552 1.769 1.973 2.33 2.494 2.646 2.662 3.047 3.18 3.437 3.666 3.878 3.984 4.199 4.402 4.69 4.875 5.057 5.318 5.543 5.744 5.94 6.133 6.396 6.653 6.887 7.147 7.394 7.632 7.89 8.15 8.387 8.645 8.894 9.105 9.278 9.441 9.598 9.688 9.729 9.69 9.555 9.276 8.673 7.622 5.674 3.15 1.09 -0.694 -2.286 -3.68 -4.884 -5.984 -6.921 -7.834 -8.586 -9.29 -9.994 -10.645 -11.283 -11.877 -12.477 -13.02 -13.485 -13.977 -14.517 -14.95 -15.38 -15.829 -16.169 -16.524 -16.914 -17.314 -17.723 -18.008 -18.289 -18.698 -18.991 -19.316 -19.485 -19.825 -20.179 -20.558 -20.754 -21.235 -21.396 -21.629 -21.861 -22.365 -22.645 -22.947 -23.272 -23.646 -24.089 -24.666 -26.206 -8 ,31728 ,TETRA ,17602871,Sun Nov 28 16:23:49 CET,Sun Nov 28 18:08:56 CET,0.0 0.558 0.898 1.175 1.423 1.653 1.871 2.064 2.395 2.551 2.697 2.712 3.097 3.23 3.482 3.706 3.921 4.027 4.237 4.448 4.745 4.922 5.096 5.352 5.598 5.829 6.042 6.244 6.5 6.736 6.96 7.232 7.481 7.711 7.954 8.212 8.457 8.692 8.907 9.104 9.272 9.467 9.68 9.803 9.879 9.858 9.692 9.382 8.798 7.717 5.745 3.286 1.196 -0.644 -2.248 -3.66 -4.911 -6.05 -7.021 -7.963 -8.783 -9.509 -10.237 -10.931 -11.542 -12.084 -12.64 -13.155 -13.612 -14.086 -14.572 -14.999 -15.452 -15.915 -16.27 -16.634 -17.005 -17.386 -17.785 -18.067 -18.356 -18.8 -19.113 -19.44 -19.614 -19.965 -20.317 -20.698 -20.898 -21.38 -21.53 -21.754 -21.988 -22.489 -22.773 -23.075 -23.402 -23.77 -24.182 -24.709 -25.82 -9 ,27582 ,TETRA ,17602872,Sun Nov 28 16:25:51 CET,Sun Nov 28 18:11:15 CET,0.0 0.47 0.807 1.096 1.367 1.599 1.802 1.991 2.332 2.488 2.64 2.667 3.056 3.186 3.435 3.681 3.922 4.039 4.273 4.489 4.784 4.964 5.125 5.378 5.623 5.854 6.08 6.295 6.554 6.779 6.988 7.238 7.475 7.687 7.93 8.199 8.434 8.677 8.899 9.111 9.3 9.462 9.65 9.777 9.837 9.822 9.691 9.377 8.732 7.626 5.6 3.127 1.016 -0.847 -2.427 -3.825 -5.037 -6.134 -7.117 -8.076 -8.898 -9.657 -10.374 -11.039 -11.615 -12.131 -12.706 -13.24 -13.694 -14.17 -14.673 -15.087 -15.514 -15.961 -16.309 -16.664 -17.049 -17.448 -17.853 -18.126 -18.411 -18.87 -19.185 -19.506 -19.673 -20.021 -20.391 -20.763 -20.962 -21.459 -21.632 -21.868 -22.115 -22.647 -22.934 -23.239 -23.569 -23.948 -24.404 -24.964 -26.058 -10 ,17983 ,TETRA ,17602873,Sun Nov 28 16:23:49 CET,Sun Nov 28 18:09:34 CET,0.0 0.549 0.91 1.2 1.45 1.665 1.864 2.055 2.395 2.554 2.706 2.737 3.128 3.257 3.499 3.725 3.946 4.054 4.27 4.486 4.782 4.964 5.134 5.37 5.598 5.819 6.016 6.199 6.447 6.686 6.918 7.191 7.436 7.656 7.888 8.126 8.345 8.583 8.832 9.082 9.292 9.474 9.627 9.726 9.82 9.85 9.759 9.452 8.843 7.776 5.754 3.234 1.081 -0.798 -2.365 -3.709 -4.902 -5.99 -6.895 -7.816 -8.665 -9.428 -10.149 -10.824 -11.439 -11.994 -12.548 -13.048 -13.517 -13.998 -14.497 -14.923 -15.346 -15.784 -16.121 -16.463 -16.827 -17.222 -17.631 -17.912 -18.205 -18.666 -18.987 -19.323 -19.499 -19.851 -20.2 -20.576 -20.777 -21.266 -21.422 -21.649 -21.895 -22.443 -22.747 -23.066 -23.389 -23.751 -24.192 -24.727 -25.544 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index e6694bbd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6044 ,TETRA ,17602874,Sun Nov 28 16:23:51 CET,Sun Nov 28 18:09:54 CET,0.0 0.845 1.281 1.652 1.953 2.196 2.4 2.604 3.003 3.176 3.331 3.39 3.791 3.944 4.209 4.453 4.684 4.793 5.008 5.212 5.505 5.687 5.86 6.108 6.332 6.556 6.77 6.964 7.218 7.451 7.644 7.874 8.109 8.334 8.578 8.826 9.057 9.312 9.565 9.783 9.994 10.227 10.399 10.508 10.637 10.738 10.696 10.469 10.026 9.199 7.635 5.612 3.889 2.344 0.963 -0.29 -1.446 -2.5 -3.405 -4.364 -5.196 -5.906 -6.604 -7.247 -7.843 -8.407 -8.965 -9.464 -9.918 -10.393 -10.885 -11.3 -11.731 -12.178 -12.528 -12.89 -13.27 -13.66 -14.054 -14.338 -14.644 -15.124 -15.455 -15.788 -15.965 -16.346 -16.733 -17.131 -17.341 -17.827 -18.038 -18.298 -18.564 -19.141 -19.463 -19.816 -20.194 -20.601 -21.105 -21.745 -23.504 -2 ,31101 ,TETRA ,17602875,Sun Nov 28 16:25:52 CET,Sun Nov 28 18:14:29 CET,0.0 1.021 1.428 1.76 2.046 2.3 2.547 2.773 3.16 3.333 3.495 3.549 3.937 4.071 4.327 4.574 4.803 4.909 5.112 5.311 5.595 5.785 5.969 6.213 6.424 6.627 6.838 7.04 7.287 7.502 7.691 7.93 8.157 8.37 8.629 8.895 9.106 9.349 9.603 9.831 10.059 10.267 10.425 10.565 10.702 10.743 10.658 10.46 10.091 9.364 7.884 5.885 4.058 2.405 0.97 -0.273 -1.398 -2.417 -3.298 -4.211 -4.99 -5.687 -6.356 -7.002 -7.601 -8.166 -8.768 -9.276 -9.703 -10.154 -10.626 -11.037 -11.482 -11.925 -12.262 -12.631 -13.015 -13.413 -13.845 -14.144 -14.44 -14.9 -15.227 -15.565 -15.736 -16.083 -16.459 -16.864 -17.072 -17.555 -17.747 -17.996 -18.27 -18.852 -19.161 -19.505 -19.893 -20.327 -20.81 -21.47 -23.102 -3 ,4878 ,TETRA ,17602876,Sun Nov 28 16:23:49 CET,Sun Nov 28 18:09:32 CET,0.0 0.817 1.263 1.593 1.861 2.127 2.372 2.602 2.994 3.152 3.304 3.358 3.744 3.888 4.161 4.393 4.605 4.715 4.933 5.136 5.42 5.601 5.779 6.034 6.274 6.498 6.708 6.896 7.12 7.336 7.555 7.811 8.042 8.26 8.494 8.747 8.987 9.195 9.382 9.585 9.804 10.067 10.32 10.51 10.661 10.738 10.73 10.562 10.157 9.369 7.823 5.778 3.999 2.412 1.052 -0.199 -1.297 -2.281 -3.158 -4.035 -4.795 -5.508 -6.197 -6.823 -7.416 -7.985 -8.594 -9.129 -9.593 -10.09 -10.612 -11.045 -11.486 -11.938 -12.289 -12.651 -13.035 -13.436 -13.854 -14.139 -14.441 -14.91 -15.228 -15.565 -15.735 -16.096 -16.483 -16.882 -17.089 -17.565 -17.754 -17.999 -18.254 -18.812 -19.124 -19.478 -19.873 -20.291 -20.766 -21.4 -23.065 -4 ,7480 ,TETRA ,17602877,Sun Nov 28 16:23:50 CET,Sun Nov 28 18:09:51 CET,0.0 0.91 1.369 1.725 2.023 2.28 2.501 2.695 3.052 3.226 3.393 3.435 3.819 3.96 4.222 4.451 4.663 4.763 4.965 5.164 5.429 5.599 5.774 6.027 6.26 6.467 6.655 6.852 7.107 7.324 7.521 7.739 7.938 8.135 8.377 8.64 8.887 9.113 9.331 9.582 9.805 9.988 10.153 10.284 10.358 10.376 10.337 10.163 9.798 9.037 7.435 5.295 3.387 1.756 0.362 -0.889 -1.984 -2.977 -3.835 -4.684 -5.432 -6.138 -6.798 -7.429 -8.051 -8.614 -9.178 -9.69 -10.16 -10.649 -11.153 -11.563 -11.986 -12.442 -12.792 -13.153 -13.541 -13.952 -14.37 -14.66 -14.953 -15.409 -15.73 -16.086 -16.272 -16.637 -17.016 -17.398 -17.603 -18.084 -18.273 -18.527 -18.806 -19.381 -19.694 -20.034 -20.418 -20.861 -21.382 -22.039 -23.56 -5 ,32357 ,TETRA ,17602878,Sun Nov 28 16:23:52 CET,Sun Nov 28 18:10:09 CET,0.0 0.938 1.418 1.799 2.113 2.372 2.627 2.85 3.213 3.372 3.526 3.582 3.966 4.099 4.35 4.593 4.827 4.937 5.152 5.349 5.611 5.778 5.949 6.219 6.462 6.675 6.882 7.085 7.337 7.565 7.775 8.03 8.266 8.483 8.735 9.002 9.236 9.45 9.625 9.8 9.973 10.155 10.361 10.505 10.584 10.586 10.537 10.434 10.102 9.329 7.761 5.649 3.813 2.259 0.899 -0.377 -1.532 -2.573 -3.432 -4.322 -5.12 -5.809 -6.454 -7.067 -7.648 -8.207 -8.789 -9.309 -9.766 -10.238 -10.734 -11.138 -11.544 -11.976 -12.325 -12.688 -13.05 -13.425 -13.836 -14.119 -14.413 -14.872 -15.194 -15.538 -15.715 -16.095 -16.494 -16.893 -17.102 -17.582 -17.781 -18.034 -18.297 -18.854 -19.168 -19.505 -19.86 -20.284 -20.785 -21.403 -23.009 -6 ,1525 ,TETRA ,17602879,Sun Nov 28 16:23:54 CET,Sun Nov 28 18:10:10 CET,0.0 0.702 1.1 1.42 1.697 1.935 2.151 2.369 2.766 2.94 3.104 3.162 3.543 3.684 3.95 4.183 4.407 4.521 4.744 4.961 5.251 5.414 5.575 5.826 6.051 6.246 6.435 6.629 6.883 7.123 7.339 7.58 7.801 8.013 8.266 8.512 8.723 8.96 9.197 9.422 9.622 9.825 10.02 10.16 10.286 10.382 10.358 10.135 9.673 8.859 7.292 5.187 3.33 1.745 0.379 -0.86 -1.98 -3.031 -3.964 -4.901 -5.695 -6.384 -7.06 -7.716 -8.325 -8.866 -9.398 -9.873 -10.314 -10.78 -11.267 -11.684 -12.124 -12.597 -12.959 -13.318 -13.7 -14.094 -14.502 -14.797 -15.098 -15.566 -15.894 -16.224 -16.394 -16.767 -17.161 -17.563 -17.774 -18.257 -18.455 -18.7 -18.959 -19.525 -19.823 -20.141 -20.521 -20.937 -21.424 -22.079 -23.761 -7 ,20929 ,TETRA ,17602880,Sun Nov 28 16:23:56 CET,Sun Nov 28 18:09:53 CET,0.0 0.862 1.318 1.649 1.929 2.188 2.417 2.616 2.969 3.137 3.297 3.357 3.741 3.873 4.117 4.35 4.569 4.675 4.886 5.09 5.368 5.542 5.71 5.941 6.148 6.347 6.552 6.746 6.995 7.22 7.418 7.66 7.901 8.098 8.279 8.487 8.693 8.924 9.184 9.433 9.646 9.862 10.099 10.288 10.41 10.459 10.422 10.207 9.744 8.93 7.408 5.351 3.504 1.913 0.541 -0.722 -1.811 -2.786 -3.656 -4.573 -5.341 -6.014 -6.668 -7.322 -7.96 -8.525 -9.098 -9.617 -10.07 -10.548 -11.043 -11.45 -11.88 -12.322 -12.664 -13.019 -13.391 -13.783 -14.202 -14.491 -14.78 -15.235 -15.552 -15.879 -16.049 -16.403 -16.777 -17.176 -17.38 -17.855 -18.042 -18.281 -18.527 -19.083 -19.396 -19.74 -20.135 -20.558 -21.044 -21.684 -23.203 -8 ,18752 ,TETRA ,17602881,Sun Nov 28 16:25:52 CET,Sun Nov 28 18:11:31 CET,0.0 1.018 1.496 1.886 2.203 2.451 2.66 2.856 3.226 3.404 3.573 3.631 4.026 4.176 4.439 4.673 4.894 5.001 5.219 5.429 5.714 5.896 6.068 6.318 6.551 6.762 6.967 7.16 7.391 7.608 7.794 8.008 8.228 8.419 8.621 8.843 9.057 9.259 9.477 9.703 9.898 10.112 10.345 10.529 10.634 10.639 10.568 10.377 9.96 9.19 7.694 5.647 3.852 2.266 0.891 -0.368 -1.464 -2.466 -3.375 -4.277 -5.049 -5.737 -6.394 -7.023 -7.609 -8.137 -8.674 -9.158 -9.605 -10.082 -10.586 -11.004 -11.434 -11.879 -12.222 -12.571 -12.924 -13.306 -13.722 -14.009 -14.31 -14.785 -15.11 -15.438 -15.605 -15.969 -16.357 -16.745 -16.947 -17.439 -17.653 -17.902 -18.167 -18.749 -19.065 -19.388 -19.761 -20.184 -20.679 -21.393 -22.98 -9 ,19400 ,TETRA ,17602882,Sun Nov 28 16:23:53 CET,Sun Nov 28 18:09:50 CET,0.0 0.843 1.284 1.601 1.87 2.104 2.344 2.56 2.918 3.09 3.255 3.315 3.7 3.834 4.098 4.342 4.567 4.672 4.871 5.07 5.354 5.535 5.695 5.924 6.161 6.378 6.574 6.762 6.993 7.201 7.379 7.596 7.826 8.036 8.278 8.563 8.808 9.031 9.249 9.491 9.715 9.904 10.081 10.231 10.382 10.452 10.382 10.174 9.804 9.075 7.512 5.424 3.598 1.99 0.569 -0.743 -1.901 -2.92 -3.807 -4.729 -5.545 -6.262 -6.935 -7.584 -8.191 -8.734 -9.313 -9.847 -10.301 -10.779 -11.301 -11.734 -12.173 -12.624 -12.975 -13.335 -13.703 -14.099 -14.513 -14.803 -15.103 -15.564 -15.899 -16.243 -16.418 -16.786 -17.176 -17.585 -17.804 -18.296 -18.482 -18.733 -19.009 -19.599 -19.91 -20.256 -20.635 -21.052 -21.546 -22.235 -24.058 -10 ,8852 ,TETRA ,17602883,Sun Nov 28 16:23:55 CET,Sun Nov 28 18:09:51 CET,0.0 1.036 1.45 1.784 2.081 2.328 2.555 2.778 3.176 3.344 3.509 3.588 3.984 4.12 4.375 4.631 4.869 4.973 5.161 5.354 5.633 5.804 5.971 6.224 6.471 6.702 6.904 7.084 7.325 7.554 7.767 8.02 8.266 8.476 8.699 8.951 9.192 9.43 9.652 9.859 10.033 10.212 10.376 10.495 10.578 10.62 10.603 10.465 10.118 9.374 7.808 5.659 3.8 2.19 0.759 -0.482 -1.576 -2.591 -3.477 -4.381 -5.153 -5.831 -6.474 -7.091 -7.698 -8.261 -8.859 -9.388 -9.837 -10.317 -10.794 -11.194 -11.634 -12.088 -12.433 -12.793 -13.164 -13.547 -13.946 -14.21 -14.492 -14.963 -15.307 -15.665 -15.84 -16.201 -16.584 -16.978 -17.195 -17.689 -17.906 -18.164 -18.431 -19.017 -19.355 -19.709 -20.081 -20.496 -20.973 -21.591 -23.056 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index 1ecf30eb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18458 ,TETRA ,17602884,Sun Nov 28 16:23:57 CET,Sun Nov 28 18:09:58 CET,0.0 0.534 0.841 1.118 1.368 1.587 1.776 1.952 2.273 2.42 2.562 2.579 2.95 3.066 3.29 3.501 3.7 3.795 3.97 4.139 4.388 4.555 4.717 4.944 5.16 5.359 5.549 5.725 5.937 6.122 6.301 6.517 6.689 6.855 7.058 7.249 7.41 7.572 7.724 7.862 7.984 8.075 8.112 8.104 8.043 7.858 7.461 6.844 5.881 4.296 1.521 -1.789 -4.413 -6.657 -8.557 -10.174 -11.601 -12.922 -14.04 -15.165 -16.143 -16.999 -17.807 -18.566 -19.3 -19.989 -20.716 -21.332 -21.851 -22.411 -22.98 -23.456 -23.946 -24.449 -24.844 -25.238 -25.64 -26.062 -26.503 -26.81 -27.143 -27.664 -28.032 -28.405 -28.589 -28.971 -29.371 -29.805 -30.03 -30.54 -30.764 -31.031 -31.303 -31.864 -32.17 -32.526 -32.908 -33.306 -33.772 -34.384 -36.108 -2 ,32593 ,TETRA ,17602885,Sun Nov 28 16:23:59 CET,Sun Nov 28 18:09:41 CET,0.0 0.707 1.049 1.309 1.524 1.723 1.912 2.087 2.413 2.572 2.72 2.736 3.098 3.21 3.425 3.634 3.834 3.928 4.112 4.291 4.545 4.696 4.834 5.033 5.226 5.388 5.538 5.695 5.889 6.066 6.244 6.446 6.611 6.768 6.953 7.155 7.332 7.512 7.668 7.781 7.841 7.873 7.884 7.873 7.796 7.564 7.174 6.577 5.607 4.026 1.282 -1.997 -4.727 -7.039 -8.932 -10.551 -11.936 -13.206 -14.3 -15.417 -16.395 -17.238 -18.062 -18.83 -19.525 -20.164 -20.845 -21.464 -21.986 -22.516 -23.068 -23.537 -24.019 -24.504 -24.881 -25.272 -25.686 -26.118 -26.56 -26.872 -27.2 -27.706 -28.058 -28.419 -28.61 -29.009 -29.405 -29.817 -30.041 -30.546 -30.752 -31.014 -31.282 -31.869 -32.181 -32.508 -32.875 -33.293 -33.821 -34.472 -35.944 -3 ,23511 ,TETRA ,17602886,Sun Nov 28 16:26:35 CET,Sun Nov 28 18:13:24 CET,0.0 0.604 0.92 1.188 1.409 1.604 1.789 1.967 2.288 2.433 2.57 2.579 2.939 3.053 3.274 3.477 3.669 3.761 3.949 4.129 4.376 4.52 4.659 4.858 5.047 5.228 5.395 5.552 5.755 5.945 6.13 6.343 6.52 6.687 6.872 7.046 7.203 7.383 7.532 7.664 7.784 7.839 7.842 7.771 7.618 7.398 7.024 6.424 5.456 3.842 1.047 -2.25 -4.883 -7.134 -9.062 -10.732 -12.2 -13.532 -14.658 -15.769 -16.717 -17.535 -18.311 -19.057 -19.76 -20.4 -21.06 -21.671 -22.202 -22.74 -23.311 -23.78 -24.247 -24.736 -25.14 -25.553 -25.971 -26.409 -26.863 -27.185 -27.513 -28.025 -28.375 -28.731 -28.92 -29.31 -29.712 -30.139 -30.362 -30.871 -31.089 -31.359 -31.649 -32.258 -32.583 -32.948 -33.347 -33.775 -34.258 -34.886 -36.627 -4 ,11958 ,TETRA ,17602887,Sun Nov 28 16:25:53 CET,Sun Nov 28 18:12:16 CET,0.0 0.568 0.885 1.153 1.387 1.596 1.792 1.97 2.296 2.451 2.596 2.63 3.014 3.142 3.382 3.612 3.827 3.933 4.134 4.324 4.601 4.772 4.93 5.147 5.358 5.565 5.747 5.918 6.136 6.333 6.526 6.747 6.936 7.11 7.293 7.47 7.632 7.78 7.913 8.015 8.078 8.152 8.205 8.211 8.146 7.958 7.582 6.986 6.01 4.396 1.621 -1.704 -4.399 -6.658 -8.538 -10.208 -11.69 -13.015 -14.12 -15.231 -16.223 -17.105 -17.912 -18.67 -19.377 -20.011 -20.691 -21.32 -21.849 -22.375 -22.92 -23.37 -23.849 -24.361 -24.742 -25.132 -25.552 -25.997 -26.476 -26.797 -27.11 -27.596 -27.939 -28.304 -28.495 -28.882 -29.282 -29.705 -29.928 -30.439 -30.644 -30.903 -31.188 -31.814 -32.158 -32.507 -32.865 -33.252 -33.737 -34.403 -36.077 -5 ,15863 ,TETRA ,17602888,Sun Nov 28 16:25:53 CET,Sun Nov 28 18:11:30 CET,0.0 0.439 0.758 1.017 1.25 1.472 1.667 1.84 2.151 2.293 2.427 2.426 2.786 2.897 3.107 3.315 3.521 3.613 3.783 3.954 4.191 4.345 4.511 4.752 4.972 5.17 5.346 5.51 5.71 5.891 6.071 6.289 6.487 6.661 6.836 7.011 7.166 7.315 7.437 7.539 7.642 7.688 7.678 7.665 7.594 7.379 6.998 6.407 5.414 3.819 1.104 -2.171 -4.841 -7.099 -8.976 -10.622 -12.06 -13.367 -14.492 -15.616 -16.597 -17.474 -18.308 -19.095 -19.822 -20.451 -21.098 -21.706 -22.217 -22.75 -23.337 -23.808 -24.292 -24.802 -25.194 -25.605 -26.016 -26.437 -26.896 -27.214 -27.529 -28.029 -28.384 -28.744 -28.938 -29.339 -29.74 -30.169 -30.396 -30.901 -31.091 -31.343 -31.612 -32.216 -32.541 -32.897 -33.3 -33.737 -34.203 -34.835 -36.225 -6 ,5085 ,TETRA ,17602889,Sun Nov 28 16:25:52 CET,Sun Nov 28 18:11:20 CET,0.0 0.547 0.851 1.108 1.323 1.525 1.713 1.885 2.215 2.375 2.524 2.539 2.904 3.017 3.254 3.49 3.717 3.828 4.022 4.197 4.446 4.603 4.765 4.993 5.187 5.363 5.526 5.682 5.895 6.111 6.307 6.497 6.666 6.839 7.031 7.196 7.329 7.496 7.631 7.718 7.802 7.876 7.898 7.853 7.736 7.538 7.166 6.507 5.483 3.899 1.205 -2.059 -4.764 -7.033 -8.899 -10.568 -12.087 -13.438 -14.543 -15.67 -16.645 -17.47 -18.277 -19.07 -19.791 -20.434 -21.116 -21.734 -22.268 -22.812 -23.387 -23.858 -24.334 -24.84 -25.228 -25.629 -26.053 -26.495 -26.944 -27.253 -27.571 -28.083 -28.45 -28.829 -29.022 -29.413 -29.825 -30.251 -30.466 -30.981 -31.206 -31.459 -31.732 -32.331 -32.651 -33.001 -33.411 -33.866 -34.352 -35.003 -36.668 -7 ,2733 ,TETRA ,17602890,Sun Nov 28 16:25:52 CET,Sun Nov 28 18:11:40 CET,0.0 0.584 0.915 1.183 1.428 1.636 1.823 2.003 2.341 2.491 2.629 2.648 3.023 3.143 3.366 3.57 3.757 3.848 4.022 4.206 4.491 4.668 4.832 5.049 5.255 5.446 5.613 5.766 5.983 6.185 6.359 6.542 6.701 6.867 7.044 7.208 7.344 7.493 7.653 7.795 7.898 7.961 7.992 7.99 7.916 7.718 7.36 6.733 5.716 4.107 1.307 -1.979 -4.636 -6.831 -8.658 -10.284 -11.717 -13.004 -14.1 -15.193 -16.116 -16.945 -17.741 -18.494 -19.189 -19.804 -20.47 -21.088 -21.61 -22.154 -22.708 -23.158 -23.637 -24.125 -24.504 -24.917 -25.351 -25.793 -26.246 -26.554 -26.86 -27.338 -27.673 -28.035 -28.226 -28.602 -28.985 -29.409 -29.628 -30.13 -30.352 -30.615 -30.879 -31.464 -31.783 -32.111 -32.477 -32.886 -33.367 -33.988 -35.388 -8 ,9641 ,TETRA ,17602891,Sun Nov 28 16:25:52 CET,Sun Nov 28 18:13:02 CET,0.0 0.546 0.878 1.138 1.366 1.563 1.755 1.942 2.275 2.422 2.563 2.58 2.951 3.068 3.278 3.469 3.662 3.757 3.936 4.121 4.396 4.555 4.7 4.907 5.099 5.297 5.481 5.64 5.86 6.066 6.244 6.446 6.637 6.81 6.984 7.164 7.333 7.48 7.597 7.67 7.723 7.797 7.824 7.817 7.716 7.456 7.038 6.399 5.384 3.796 1.119 -2.121 -4.771 -7.074 -9.075 -10.739 -12.117 -13.398 -14.498 -15.562 -16.486 -17.326 -18.12 -18.868 -19.579 -20.23 -20.905 -21.504 -22.038 -22.604 -23.183 -23.655 -24.135 -24.643 -25.045 -25.457 -25.884 -26.325 -26.787 -27.095 -27.407 -27.924 -28.286 -28.655 -28.848 -29.252 -29.666 -30.1 -30.327 -30.834 -31.047 -31.315 -31.598 -32.196 -32.52 -32.868 -33.24 -33.647 -34.123 -34.776 -36.451 -9 ,24202 ,TETRA ,17602892,Sun Nov 28 16:25:53 CET,Sun Nov 28 18:11:41 CET,0.0 0.64 1.004 1.299 1.55 1.764 1.963 2.148 2.476 2.624 2.765 2.784 3.159 3.282 3.5 3.702 3.898 3.999 4.194 4.382 4.667 4.841 4.998 5.209 5.415 5.614 5.794 5.968 6.18 6.365 6.535 6.737 6.936 7.12 7.308 7.5 7.645 7.767 7.902 8.047 8.169 8.238 8.265 8.27 8.188 7.966 7.575 6.962 5.979 4.376 1.646 -1.702 -4.422 -6.65 -8.523 -10.177 -11.607 -12.9 -14.036 -15.163 -16.125 -16.984 -17.819 -18.622 -19.35 -19.999 -20.675 -21.263 -21.775 -22.323 -22.888 -23.343 -23.825 -24.35 -24.753 -25.16 -25.58 -26.017 -26.482 -26.8 -27.127 -27.664 -28.034 -28.404 -28.599 -28.997 -29.401 -29.832 -30.057 -30.574 -30.783 -31.036 -31.311 -31.905 -32.238 -32.581 -32.964 -33.417 -33.945 -34.621 -36.227 -10 ,16436 ,TETRA ,17602893,Sun Nov 28 16:25:54 CET,Sun Nov 28 18:11:45 CET,0.0 0.528 0.868 1.147 1.384 1.593 1.783 1.954 2.252 2.396 2.54 2.567 2.94 3.075 3.334 3.549 3.761 3.871 4.06 4.23 4.474 4.616 4.751 4.962 5.176 5.367 5.552 5.726 5.936 6.137 6.309 6.517 6.732 6.918 7.09 7.279 7.447 7.595 7.749 7.867 7.957 8.057 8.098 8.075 8.023 7.881 7.54 6.949 5.963 4.343 1.608 -1.648 -4.282 -6.533 -8.463 -10.164 -11.617 -12.913 -14.048 -15.176 -16.142 -17.01 -17.822 -18.582 -19.291 -19.94 -20.623 -21.239 -21.773 -22.299 -22.85 -23.312 -23.799 -24.304 -24.681 -25.091 -25.521 -25.953 -26.387 -26.692 -27.02 -27.537 -27.904 -28.274 -28.455 -28.84 -29.25 -29.669 -29.889 -30.398 -30.616 -30.874 -31.142 -31.732 -32.048 -32.386 -32.77 -33.207 -33.702 -34.314 -36.061 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index faf2f77a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4631 ,TETRA ,17602894,Sun Nov 28 16:25:54 CET,Sun Nov 28 18:11:47 CET,0.0 0.693 1.113 1.437 1.711 1.956 2.188 2.396 2.767 2.944 3.111 3.173 3.553 3.683 3.939 4.186 4.415 4.52 4.723 4.927 5.212 5.384 5.548 5.769 5.973 6.176 6.367 6.533 6.76 6.999 7.224 7.483 7.723 7.935 8.155 8.378 8.588 8.808 9.02 9.24 9.465 9.683 9.899 10.033 10.098 10.104 9.958 9.667 9.223 8.343 6.559 4.338 2.421 0.728 -0.731 -2.034 -3.144 -4.154 -5.058 -6.012 -6.85 -7.575 -8.269 -8.938 -9.549 -10.122 -10.74 -11.27 -11.725 -12.227 -12.752 -13.202 -13.679 -14.167 -14.556 -14.932 -15.299 -15.712 -16.16 -16.471 -16.796 -17.302 -17.655 -18.016 -18.202 -18.608 -19.045 -19.504 -19.745 -20.261 -20.524 -20.801 -21.09 -21.751 -22.104 -22.479 -22.88 -23.366 -23.982 -24.784 -27.238 -2 ,2353 ,TETRA ,17602895,Sun Nov 28 16:25:54 CET,Sun Nov 28 18:11:32 CET,0.0 0.698 1.068 1.378 1.664 1.92 2.157 2.381 2.769 2.946 3.117 3.199 3.601 3.743 4.007 4.253 4.476 4.585 4.807 5.024 5.313 5.491 5.666 5.911 6.143 6.361 6.56 6.757 7.014 7.235 7.429 7.674 7.9 8.098 8.299 8.52 8.761 9.012 9.259 9.495 9.692 9.866 10.061 10.243 10.385 10.441 10.392 10.205 9.745 8.861 7.156 4.926 3.01 1.321 -0.168 -1.523 -2.727 -3.785 -4.701 -5.66 -6.5 -7.243 -7.961 -8.645 -9.288 -9.878 -10.499 -11.049 -11.527 -12.059 -12.61 -13.049 -13.51 -14.01 -14.4 -14.777 -15.169 -15.584 -16.017 -16.323 -16.643 -17.153 -17.49 -17.841 -18.029 -18.409 -18.812 -19.265 -19.504 -20.012 -20.254 -20.525 -20.815 -21.445 -21.805 -22.202 -22.625 -23.106 -23.68 -24.383 -26.141 -3 ,21437 ,TETRA ,17602896,Sun Nov 28 16:25:54 CET,Sun Nov 28 18:12:58 CET,0.0 0.788 1.214 1.507 1.761 2.015 2.244 2.461 2.845 3.01 3.18 3.247 3.634 3.772 4.031 4.281 4.514 4.628 4.845 5.039 5.312 5.492 5.662 5.921 6.165 6.38 6.581 6.766 7.008 7.227 7.42 7.67 7.902 8.119 8.379 8.639 8.873 9.106 9.33 9.576 9.808 10.004 10.17 10.298 10.41 10.467 10.418 10.242 9.819 8.939 7.208 4.93 2.986 1.249 -0.248 -1.584 -2.778 -3.852 -4.794 -5.743 -6.571 -7.341 -8.06 -8.75 -9.421 -10.007 -10.595 -11.133 -11.617 -12.114 -12.63 -13.078 -13.545 -14.05 -14.438 -14.821 -15.226 -15.654 -16.086 -16.389 -16.708 -17.215 -17.571 -17.928 -18.121 -18.529 -18.946 -19.393 -19.627 -20.133 -20.386 -20.671 -20.968 -21.601 -21.939 -22.296 -22.704 -23.179 -23.726 -24.432 -26.253 -4 ,26459 ,TETRA ,17602897,Sun Nov 28 16:26:36 CET,Sun Nov 28 18:14:14 CET,0.0 0.778 1.192 1.526 1.794 2.042 2.292 2.514 2.913 3.084 3.247 3.311 3.703 3.843 4.103 4.343 4.57 4.68 4.899 5.108 5.394 5.563 5.715 5.945 6.162 6.363 6.559 6.749 7.006 7.253 7.475 7.719 7.931 8.13 8.363 8.602 8.822 9.069 9.319 9.54 9.715 9.886 10.058 10.186 10.282 10.298 10.244 10.023 9.502 8.59 6.905 4.63 2.675 1.041 -0.414 -1.762 -2.928 -4.006 -4.975 -5.959 -6.806 -7.563 -8.309 -9.002 -9.614 -10.176 -10.774 -11.319 -11.799 -12.306 -12.808 -13.215 -13.665 -14.154 -14.547 -14.943 -15.343 -15.76 -16.192 -16.491 -16.794 -17.285 -17.637 -18.003 -18.206 -18.614 -19.019 -19.462 -19.699 -20.201 -20.434 -20.705 -20.996 -21.646 -21.983 -22.34 -22.739 -23.194 -23.72 -24.422 -26.313 -5 ,23090 ,TETRA ,17602898,Sun Nov 28 16:25:54 CET,Sun Nov 28 18:12:35 CET,0.0 0.803 1.166 1.5 1.798 2.049 2.277 2.494 2.88 3.059 3.221 3.294 3.681 3.82 4.093 4.347 4.577 4.681 4.889 5.094 5.364 5.528 5.69 5.917 6.14 6.361 6.561 6.747 6.984 7.183 7.387 7.642 7.874 8.119 8.388 8.671 8.928 9.149 9.358 9.567 9.742 9.909 10.052 10.154 10.247 10.282 10.241 10.05 9.572 8.713 7.077 4.903 3.044 1.355 -0.148 -1.536 -2.766 -3.862 -4.808 -5.743 -6.515 -7.18 -7.851 -8.517 -9.149 -9.745 -10.366 -10.894 -11.35 -11.863 -12.423 -12.871 -13.337 -13.817 -14.185 -14.57 -14.988 -15.427 -15.858 -16.157 -16.475 -16.987 -17.352 -17.726 -17.919 -18.329 -18.768 -19.218 -19.452 -19.969 -20.232 -20.51 -20.8 -21.44 -21.816 -22.207 -22.624 -23.105 -23.65 -24.355 -26.293 -6 ,31928 ,TETRA ,17602899,Sun Nov 28 16:25:55 CET,Sun Nov 28 18:13:17 CET,0.0 0.839 1.22 1.525 1.811 2.082 2.342 2.554 2.904 3.067 3.224 3.285 3.665 3.796 4.06 4.296 4.521 4.63 4.83 5.023 5.281 5.449 5.613 5.839 6.059 6.265 6.464 6.649 6.885 7.103 7.3 7.54 7.775 7.986 8.201 8.429 8.656 8.9 9.132 9.358 9.565 9.767 9.958 10.101 10.209 10.209 10.138 9.944 9.474 8.596 6.873 4.659 2.744 1.051 -0.428 -1.749 -2.908 -3.969 -4.906 -5.849 -6.652 -7.392 -8.144 -8.845 -9.508 -10.126 -10.744 -11.276 -11.748 -12.247 -12.775 -13.234 -13.715 -14.2 -14.577 -14.99 -15.428 -15.855 -16.277 -16.585 -16.917 -17.425 -17.778 -18.139 -18.332 -18.745 -19.161 -19.591 -19.817 -20.323 -20.561 -20.836 -21.134 -21.8 -22.165 -22.567 -22.988 -23.44 -24.026 -24.817 -26.785 -7 ,24353 ,TETRA ,17602900,Sun Nov 28 16:25:54 CET,Sun Nov 28 18:12:49 CET,0.0 0.856 1.335 1.695 1.984 2.25 2.497 2.713 3.089 3.256 3.41 3.449 3.831 3.969 4.231 4.48 4.711 4.813 5.008 5.198 5.466 5.635 5.795 6.032 6.257 6.472 6.683 6.887 7.136 7.364 7.585 7.844 8.085 8.319 8.551 8.792 9.011 9.218 9.442 9.669 9.879 10.108 10.343 10.497 10.617 10.66 10.541 10.282 9.837 8.996 7.341 5.122 3.183 1.428 -0.095 -1.434 -2.632 -3.715 -4.631 -5.546 -6.337 -7.069 -7.803 -8.5 -9.165 -9.785 -10.436 -11.031 -11.534 -12.043 -12.551 -12.965 -13.431 -13.944 -14.33 -14.727 -15.145 -15.587 -16.039 -16.331 -16.643 -17.157 -17.507 -17.871 -18.068 -18.489 -18.914 -19.345 -19.582 -20.1 -20.353 -20.629 -20.918 -21.54 -21.882 -22.263 -22.675 -23.153 -23.754 -24.487 -26.146 -8 ,10528 ,TETRA ,17602901,Sun Nov 28 16:25:54 CET,Sun Nov 28 18:13:33 CET,0.0 0.851 1.245 1.575 1.89 2.155 2.37 2.57 2.943 3.123 3.298 3.353 3.737 3.875 4.122 4.35 4.565 4.665 4.857 5.052 5.342 5.512 5.661 5.882 6.104 6.32 6.521 6.695 6.9 7.111 7.32 7.558 7.8 8.018 8.227 8.447 8.663 8.867 9.071 9.294 9.497 9.673 9.838 9.97 10.056 10.106 10.125 9.99 9.552 8.664 6.939 4.686 2.73 0.987 -0.494 -1.792 -2.967 -4.026 -4.963 -5.957 -6.804 -7.546 -8.253 -8.923 -9.547 -10.124 -10.741 -11.287 -11.777 -12.301 -12.834 -13.272 -13.739 -14.209 -14.577 -14.953 -15.329 -15.752 -16.209 -16.51 -16.815 -17.301 -17.654 -18.041 -18.246 -18.665 -19.085 -19.521 -19.753 -20.263 -20.543 -20.816 -21.077 -21.683 -22.038 -22.432 -22.878 -23.398 -23.989 -24.737 -26.488 -9 ,10843 ,TETRA ,17602902,Sun Nov 28 16:25:54 CET,Sun Nov 28 18:12:38 CET,0.0 0.858 1.287 1.621 1.891 2.137 2.375 2.601 2.997 3.172 3.333 3.375 3.759 3.901 4.175 4.425 4.654 4.76 4.96 5.156 5.424 5.591 5.755 5.975 6.176 6.388 6.596 6.781 6.999 7.215 7.425 7.644 7.856 8.067 8.301 8.563 8.823 9.072 9.274 9.472 9.656 9.819 9.994 10.152 10.26 10.259 10.156 9.917 9.421 8.561 6.942 4.749 2.804 1.083 -0.416 -1.733 -2.883 -3.936 -4.877 -5.876 -6.732 -7.449 -8.135 -8.799 -9.415 -9.998 -10.622 -11.173 -11.657 -12.156 -12.675 -13.125 -13.584 -14.071 -14.455 -14.829 -15.226 -15.653 -16.108 -16.416 -16.736 -17.236 -17.574 -17.945 -18.142 -18.557 -19.017 -19.5 -19.747 -20.267 -20.519 -20.803 -21.118 -21.813 -22.197 -22.582 -22.989 -23.452 -24.002 -24.759 -26.618 -10 ,13326 ,TETRA ,17602903,Sun Nov 28 16:25:56 CET,Sun Nov 28 18:13:29 CET,0.0 0.885 1.283 1.613 1.896 2.129 2.351 2.567 2.951 3.121 3.283 3.326 3.701 3.823 4.064 4.312 4.54 4.645 4.856 5.056 5.328 5.499 5.661 5.892 6.116 6.33 6.536 6.729 6.952 7.165 7.383 7.638 7.855 8.043 8.282 8.536 8.758 8.986 9.213 9.443 9.65 9.845 10.035 10.199 10.314 10.367 10.305 10.029 9.525 8.59 6.824 4.577 2.646 0.941 -0.527 -1.849 -3.077 -4.192 -5.125 -6.074 -6.93 -7.68 -8.35 -9.016 -9.672 -10.246 -10.859 -11.431 -11.928 -12.452 -12.982 -13.414 -13.882 -14.357 -14.722 -15.114 -15.51 -15.929 -16.366 -16.676 -17.005 -17.507 -17.857 -18.226 -18.414 -18.806 -19.233 -19.696 -19.935 -20.447 -20.689 -20.952 -21.225 -21.821 -22.185 -22.591 -23.029 -23.549 -24.136 -24.922 -26.563 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt deleted file mode 100644 index 6fd8210e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24495 ,KEBNE ,17027441,Wed Dec 22 17:09:56 CET,Wed Dec 22 18:42:33 CET,0.0 0.754 1.201 1.53 1.822 2.088 2.333 2.559 2.972 3.174 3.37 3.475 3.889 4.048 4.341 4.619 4.892 5.027 5.274 5.51 5.861 6.09 6.309 6.629 6.938 7.224 7.48 7.714 8.03 8.352 8.664 9.013 9.339 9.66 10.028 10.43 10.776 11.113 11.468 11.879 12.305 12.742 13.221 13.677 14.155 14.671 15.289 15.885 16.383 16.75 16.756 16.331 15.725 15.044 14.371 13.691 13.063 12.48 11.933 11.341 10.799 10.3 9.815 9.347 8.879 8.435 7.991 7.607 7.273 6.905 6.504 6.179 5.846 5.478 5.202 4.928 4.626 4.3 3.959 3.735 3.499 3.108 2.839 2.55 2.401 2.099 1.771 1.427 1.246 0.809 0.654 0.44 0.211 -0.279 -0.529 -0.801 -1.118 -1.476 -1.877 -2.418 -3.608 -2 ,15817 ,KEBNE ,17027442,Wed Dec 22 17:09:57 CET,Wed Dec 22 18:44:16 CET,0.0 1.077 1.534 1.894 2.196 2.475 2.746 2.989 3.42 3.621 3.821 3.954 4.375 4.545 4.855 5.159 5.442 5.58 5.853 6.108 6.467 6.694 6.925 7.258 7.561 7.837 8.098 8.35 8.666 8.963 9.249 9.586 9.92 10.261 10.646 11.051 11.417 11.811 12.249 12.713 13.174 13.655 14.153 14.594 15.06 15.557 16.088 16.63 17.166 17.531 17.566 17.078 16.365 15.655 14.941 14.215 13.547 12.958 12.415 11.825 11.342 10.888 10.402 9.896 9.443 9.027 8.567 8.185 7.846 7.482 7.106 6.786 6.429 6.052 5.769 5.477 5.169 4.847 4.506 4.259 4.011 3.629 3.358 3.083 2.931 2.598 2.262 1.916 1.738 1.31 1.169 0.964 0.748 0.271 -0.004 -0.311 -0.628 -0.995 -1.424 -1.909 -2.921 -3 ,10825 ,KEBNE ,17027443,Wed Dec 22 17:09:57 CET,Wed Dec 22 18:42:26 CET,0.0 0.682 1.116 1.461 1.79 2.079 2.329 2.554 2.978 3.187 3.374 3.487 3.905 4.068 4.386 4.677 4.943 5.078 5.34 5.584 5.938 6.166 6.382 6.693 6.988 7.267 7.522 7.76 8.096 8.421 8.719 9.088 9.426 9.729 10.078 10.474 10.832 11.196 11.584 12.014 12.474 12.932 13.404 13.872 14.436 15.006 15.571 16.146 16.649 17.02 17.085 16.623 16.0 15.268 14.554 13.92 13.273 12.628 12.067 11.497 10.994 10.53 10.081 9.647 9.203 8.797 8.376 7.946 7.564 7.195 6.816 6.483 6.127 5.757 5.487 5.215 4.911 4.588 4.263 4.042 3.799 3.411 3.141 2.843 2.692 2.379 2.034 1.67 1.484 1.058 0.923 0.711 0.488 0.026 -0.223 -0.498 -0.796 -1.134 -1.523 -2.034 -3.14 -4 ,13630 ,KEBNE ,17027444,Wed Dec 22 17:09:57 CET,Wed Dec 22 18:42:33 CET,0.0 0.778 1.206 1.566 1.891 2.167 2.405 2.629 3.052 3.245 3.432 3.538 3.952 4.114 4.414 4.704 4.981 5.111 5.363 5.608 5.954 6.175 6.389 6.684 6.957 7.228 7.497 7.757 8.076 8.372 8.65 8.988 9.336 9.657 10.008 10.399 10.781 11.189 11.585 11.98 12.424 12.932 13.444 13.896 14.354 14.824 15.386 15.974 16.54 16.995 17.164 16.737 16.079 15.379 14.696 13.98 13.271 12.622 12.02 11.375 10.833 10.335 9.84 9.352 8.86 8.412 7.95 7.517 7.136 6.748 6.349 6.018 5.649 5.277 5.007 4.712 4.395 4.068 3.707 3.46 3.219 2.852 2.596 2.316 2.174 1.877 1.561 1.219 1.033 0.599 0.451 0.251 0.033 -0.443 -0.695 -0.972 -1.276 -1.607 -1.993 -2.535 -3.887 -5 ,26723 ,KEBNE ,17027445,Wed Dec 22 17:11:02 CET,Wed Dec 22 18:46:12 CET,0.0 0.76 1.191 1.532 1.835 2.121 2.381 2.622 3.066 3.262 3.448 3.557 3.973 4.139 4.444 4.729 5.004 5.139 5.393 5.618 5.942 6.16 6.371 6.675 6.958 7.23 7.494 7.739 8.056 8.365 8.646 8.98 9.299 9.603 9.967 10.378 10.774 11.165 11.549 11.989 12.433 12.895 13.399 13.86 14.368 14.904 15.462 16.01 16.532 16.906 16.957 16.546 15.94 15.237 14.537 13.869 13.206 12.564 11.997 11.387 10.836 10.294 9.764 9.316 8.889 8.47 8.027 7.608 7.231 6.844 6.437 6.099 5.757 5.403 5.124 4.837 4.55 4.249 3.91 3.665 3.422 3.044 2.766 2.489 2.345 2.038 1.712 1.37 1.199 0.778 0.644 0.444 0.233 -0.244 -0.526 -0.828 -1.133 -1.487 -1.915 -2.468 -3.781 -6 ,11141 ,KEBNE ,17027446,Wed Dec 22 17:09:57 CET,Wed Dec 22 18:42:46 CET,0.0 0.828 1.259 1.623 1.957 2.252 2.513 2.737 3.167 3.371 3.57 3.69 4.095 4.249 4.552 4.837 5.111 5.246 5.511 5.76 6.104 6.316 6.526 6.849 7.163 7.452 7.729 7.994 8.328 8.659 8.975 9.34 9.675 9.981 10.323 10.685 11.036 11.435 11.84 12.268 12.713 13.182 13.687 14.195 14.79 15.381 15.981 16.563 17.116 17.539 17.682 17.237 16.572 15.856 15.122 14.442 13.822 13.204 12.595 11.957 11.41 10.909 10.43 9.978 9.555 9.155 8.704 8.294 7.921 7.517 7.116 6.79 6.452 6.087 5.796 5.497 5.185 4.858 4.524 4.286 4.032 3.649 3.391 3.123 2.984 2.702 2.395 2.056 1.883 1.453 1.304 1.094 0.869 0.374 0.091 -0.223 -0.556 -0.94 -1.384 -1.933 -2.914 -7 ,13355 ,KEBNE ,17027447,Wed Dec 22 17:09:57 CET,Wed Dec 22 18:43:45 CET,0.0 0.868 1.347 1.718 2.036 2.332 2.598 2.821 3.232 3.432 3.622 3.734 4.145 4.304 4.622 4.931 5.21 5.341 5.592 5.832 6.182 6.404 6.624 6.931 7.212 7.477 7.737 7.995 8.329 8.655 8.957 9.3 9.631 9.966 10.337 10.737 11.091 11.471 11.877 12.291 12.698 13.103 13.567 14.024 14.541 15.1 15.686 16.249 16.827 17.257 17.316 16.874 16.218 15.517 14.813 14.112 13.397 12.698 12.081 11.452 10.876 10.349 9.835 9.357 8.922 8.509 8.061 7.638 7.264 6.879 6.482 6.157 5.815 5.47 5.197 4.91 4.604 4.263 3.904 3.66 3.41 3.018 2.733 2.431 2.286 1.993 1.683 1.355 1.187 0.763 0.617 0.415 0.201 -0.27 -0.536 -0.831 -1.148 -1.503 -1.92 -2.439 -3.27 -8 ,10146 ,KEBNE ,17027448,Wed Dec 22 17:09:57 CET,Wed Dec 22 18:42:42 CET,0.0 0.701 1.085 1.415 1.71 1.978 2.227 2.465 2.911 3.117 3.31 3.424 3.845 4.014 4.322 4.605 4.87 4.998 5.247 5.484 5.819 6.033 6.239 6.53 6.813 7.098 7.37 7.612 7.921 8.245 8.552 8.882 9.182 9.497 9.878 10.269 10.626 11.031 11.478 11.929 12.358 12.806 13.287 13.755 14.284 14.809 15.383 15.956 16.437 16.808 16.9 16.491 15.845 15.116 14.412 13.742 13.069 12.417 11.842 11.257 10.773 10.323 9.851 9.375 8.921 8.501 8.056 7.666 7.315 6.919 6.511 6.188 5.837 5.473 5.196 4.903 4.595 4.283 3.964 3.729 3.478 3.103 2.841 2.55 2.394 2.083 1.781 1.465 1.29 0.855 0.7 0.488 0.268 -0.183 -0.439 -0.722 -1.011 -1.354 -1.772 -2.297 -3.611 -9 ,20973 ,KEBNE ,17027449,Wed Dec 22 17:09:57 CET,Wed Dec 22 18:42:43 CET,0.0 0.837 1.293 1.667 1.976 2.246 2.483 2.711 3.152 3.353 3.535 3.634 4.043 4.196 4.499 4.795 5.077 5.214 5.473 5.715 6.07 6.298 6.508 6.813 7.128 7.421 7.69 7.944 8.266 8.582 8.875 9.227 9.566 9.887 10.238 10.624 10.998 11.401 11.81 12.23 12.665 13.134 13.672 14.16 14.653 15.148 15.694 16.244 16.785 17.171 17.262 16.998 16.47 15.805 15.093 14.353 13.682 13.077 12.503 11.902 11.366 10.872 10.391 9.926 9.478 9.032 8.548 8.123 7.771 7.412 7.018 6.673 6.306 5.951 5.684 5.389 5.077 4.749 4.412 4.181 3.932 3.535 3.262 2.977 2.827 2.515 2.194 1.83 1.639 1.201 1.038 0.823 0.598 0.15 -0.099 -0.387 -0.691 -1.032 -1.435 -1.953 -2.9 -10 ,32550 ,KEBNE ,17027450,Wed Dec 22 17:11:02 CET,Wed Dec 22 18:43:51 CET,0.0 0.945 1.425 1.783 2.087 2.367 2.643 2.895 3.328 3.525 3.71 3.813 4.224 4.388 4.703 4.985 5.259 5.396 5.649 5.885 6.232 6.458 6.677 6.987 7.305 7.61 7.883 8.148 8.479 8.779 9.075 9.434 9.77 10.1 10.45 10.826 11.217 11.653 12.094 12.494 12.901 13.362 13.879 14.396 14.944 15.477 16.033 16.585 17.061 17.41 17.486 17.124 16.477 15.673 14.891 14.192 13.529 12.827 12.198 11.589 11.037 10.515 10.009 9.522 9.051 8.635 8.2 7.781 7.402 7.013 6.625 6.29 5.933 5.558 5.257 4.949 4.641 4.32 3.976 3.744 3.504 3.129 2.862 2.581 2.443 2.142 1.819 1.482 1.308 0.888 0.737 0.518 0.292 -0.179 -0.442 -0.734 -1.051 -1.407 -1.825 -2.328 -3.529 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index 521e8bc7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27891 ,TETRA ,17602904,Sun Nov 28 16:25:58 CET,Sun Nov 28 18:13:29 CET,0.0 0.511 0.818 1.087 1.331 1.536 1.72 1.896 2.218 2.368 2.511 2.524 2.892 3.008 3.221 3.416 3.609 3.701 3.871 4.025 4.228 4.359 4.485 4.671 4.862 5.052 5.233 5.393 5.603 5.811 5.98 6.156 6.303 6.45 6.642 6.828 6.965 7.085 7.21 7.358 7.457 7.496 7.484 7.426 7.341 7.131 6.705 6.029 4.952 3.237 0.315 -3.2 -6.04 -8.393 -10.374 -12.137 -13.681 -15.068 -16.255 -17.395 -18.379 -19.301 -20.17 -20.978 -21.724 -22.403 -23.109 -23.762 -24.336 -24.927 -25.546 -26.048 -26.568 -27.135 -27.568 -28.0 -28.442 -28.905 -29.396 -29.737 -30.083 -30.623 -31.008 -31.407 -31.612 -32.025 -32.467 -32.936 -33.181 -33.706 -33.945 -34.235 -34.531 -35.172 -35.542 -35.934 -36.356 -36.852 -37.436 -38.11 -40.463 -2 ,22642 ,TETRA ,17602905,Sun Nov 28 16:25:55 CET,Sun Nov 28 18:11:32 CET,0.0 0.661 1.004 1.277 1.512 1.724 1.93 2.125 2.459 2.606 2.741 2.755 3.128 3.246 3.471 3.677 3.872 3.965 4.144 4.31 4.544 4.699 4.856 5.085 5.299 5.493 5.674 5.847 6.048 6.236 6.425 6.632 6.819 6.976 7.137 7.298 7.445 7.625 7.781 7.909 8.028 8.095 8.104 8.02 7.82 7.554 7.136 6.477 5.427 3.731 0.83 -2.598 -5.372 -7.719 -9.749 -11.577 -13.148 -14.506 -15.669 -16.827 -17.814 -18.691 -19.508 -20.272 -21.032 -21.747 -22.486 -23.137 -23.687 -24.257 -24.85 -25.348 -25.869 -26.41 -26.832 -27.27 -27.717 -28.169 -28.632 -28.963 -29.304 -29.84 -30.213 -30.6 -30.805 -31.214 -31.637 -32.098 -32.347 -32.88 -33.133 -33.422 -33.728 -34.392 -34.743 -35.104 -35.511 -35.989 -36.597 -37.374 -39.7 -3 ,31267 ,TETRA ,17602906,Sun Nov 28 16:25:55 CET,Sun Nov 28 18:13:15 CET,0.0 0.447 0.751 1.015 1.244 1.456 1.663 1.858 2.199 2.353 2.497 2.502 2.865 2.974 3.19 3.399 3.596 3.692 3.871 4.042 4.288 4.438 4.592 4.817 5.014 5.208 5.394 5.57 5.785 5.964 6.123 6.318 6.509 6.683 6.867 7.047 7.179 7.305 7.43 7.579 7.695 7.726 7.726 7.69 7.54 7.269 6.837 6.129 4.996 3.226 0.273 -3.236 -6.026 -8.352 -10.33 -12.066 -13.591 -14.968 -16.142 -17.333 -18.369 -19.259 -20.109 -20.93 -21.683 -22.363 -23.07 -23.72 -24.299 -24.884 -25.492 -26.0 -26.502 -27.021 -27.434 -27.863 -28.298 -28.74 -29.222 -29.568 -29.92 -30.453 -30.815 -31.207 -31.412 -31.829 -32.277 -32.745 -32.981 -33.512 -33.793 -34.09 -34.399 -35.073 -35.443 -35.826 -36.224 -36.689 -37.26 -37.963 -39.685 -4 ,6723 ,TETRA ,17602907,Sun Nov 28 16:25:56 CET,Sun Nov 28 18:13:09 CET,0.0 0.58 0.93 1.202 1.419 1.626 1.82 1.996 2.303 2.44 2.582 2.604 2.973 3.091 3.318 3.519 3.704 3.797 3.98 4.156 4.419 4.58 4.733 4.968 5.169 5.34 5.509 5.67 5.858 6.036 6.219 6.406 6.563 6.717 6.896 7.092 7.262 7.42 7.527 7.599 7.657 7.713 7.765 7.76 7.643 7.375 6.951 6.293 5.157 3.399 0.57 -2.854 -5.633 -7.968 -9.946 -11.695 -13.191 -14.495 -15.655 -16.82 -17.822 -18.764 -19.645 -20.453 -21.212 -21.883 -22.571 -23.215 -23.777 -24.367 -24.974 -25.474 -25.99 -26.526 -26.961 -27.403 -27.871 -28.349 -28.811 -29.136 -29.479 -30.023 -30.402 -30.801 -31.009 -31.426 -31.873 -32.358 -32.603 -33.128 -33.379 -33.665 -33.972 -34.67 -35.029 -35.397 -35.836 -36.335 -36.886 -37.598 -39.513 -5 ,1495 ,TETRA ,17602908,Sun Nov 28 16:26:35 CET,Sun Nov 28 18:13:25 CET,0.0 0.489 0.799 1.052 1.293 1.501 1.691 1.873 2.204 2.361 2.506 2.511 2.873 2.989 3.21 3.416 3.609 3.707 3.913 4.101 4.344 4.486 4.623 4.814 4.996 5.18 5.351 5.513 5.717 5.906 6.073 6.246 6.403 6.559 6.728 6.883 7.025 7.169 7.303 7.426 7.511 7.553 7.573 7.547 7.41 7.162 6.705 5.972 4.855 3.122 0.19 -3.248 -6.013 -8.329 -10.335 -12.103 -13.61 -15.019 -16.218 -17.376 -18.382 -19.297 -20.179 -21.009 -21.775 -22.464 -23.186 -23.838 -24.39 -24.967 -25.558 -26.052 -26.553 -27.06 -27.473 -27.902 -28.361 -28.858 -29.362 -29.7 -30.056 -30.59 -30.947 -31.332 -31.538 -31.97 -32.402 -32.866 -33.122 -33.662 -33.918 -34.199 -34.499 -35.165 -35.52 -35.907 -36.348 -36.844 -37.441 -38.254 -40.32 -6 ,25624 ,TETRA ,17602909,Sun Nov 28 16:26:37 CET,Sun Nov 28 18:13:50 CET,0.0 0.474 0.79 1.058 1.321 1.55 1.739 1.91 2.237 2.387 2.524 2.514 2.876 2.997 3.224 3.428 3.625 3.723 3.925 4.122 4.386 4.536 4.68 4.893 5.093 5.28 5.461 5.637 5.853 6.046 6.227 6.439 6.636 6.829 7.017 7.181 7.322 7.473 7.612 7.753 7.849 7.857 7.821 7.744 7.593 7.313 6.833 6.104 5.011 3.308 0.392 -3.033 -5.79 -8.135 -10.151 -11.885 -13.381 -14.773 -15.967 -17.121 -18.104 -18.997 -19.861 -20.679 -21.444 -22.146 -22.9 -23.585 -24.155 -24.717 -25.296 -25.789 -26.311 -26.867 -27.293 -27.731 -28.189 -28.631 -29.094 -29.426 -29.775 -30.306 -30.659 -31.047 -31.252 -31.677 -32.119 -32.575 -32.823 -33.367 -33.622 -33.901 -34.188 -34.803 -35.153 -35.547 -35.988 -36.454 -36.987 -37.72 -39.538 -7 ,5118 ,TETRA ,17602910,Sun Nov 28 16:26:39 CET,Sun Nov 28 18:13:36 CET,0.0 0.554 0.87 1.153 1.398 1.604 1.793 1.973 2.294 2.437 2.574 2.571 2.929 3.034 3.245 3.458 3.654 3.746 3.924 4.091 4.311 4.442 4.569 4.749 4.926 5.102 5.259 5.402 5.574 5.714 5.86 6.052 6.239 6.435 6.642 6.824 6.99 7.144 7.251 7.344 7.419 7.482 7.528 7.499 7.34 7.06 6.675 6.073 5.008 3.227 0.299 -3.125 -5.921 -8.264 -10.296 -12.07 -13.599 -14.971 -16.084 -17.195 -18.203 -19.113 -19.974 -20.743 -21.428 -22.076 -22.769 -23.385 -23.935 -24.523 -25.121 -25.605 -26.094 -26.618 -27.052 -27.486 -27.914 -28.358 -28.824 -29.152 -29.502 -30.077 -30.467 -30.856 -31.058 -31.47 -31.895 -32.354 -32.595 -33.121 -33.354 -33.623 -33.922 -34.605 -34.989 -35.379 -35.809 -36.28 -36.829 -37.562 -39.155 -8 ,15636 ,TETRA ,17602911,Sun Nov 28 16:26:36 CET,Sun Nov 28 18:13:35 CET,0.0 0.771 1.118 1.409 1.645 1.848 2.03 2.199 2.505 2.642 2.777 2.797 3.172 3.3 3.561 3.796 4.012 4.124 4.322 4.493 4.755 4.928 5.104 5.364 5.583 5.767 5.949 6.128 6.343 6.526 6.693 6.906 7.098 7.243 7.39 7.569 7.736 7.87 7.965 8.069 8.158 8.175 8.156 8.117 7.991 7.758 7.352 6.687 5.624 3.951 1.086 -2.399 -5.268 -7.695 -9.732 -11.53 -13.06 -14.439 -15.63 -16.788 -17.778 -18.64 -19.469 -20.284 -21.05 -21.773 -22.552 -23.205 -23.753 -24.335 -24.938 -25.437 -25.953 -26.482 -26.893 -27.312 -27.753 -28.224 -28.72 -29.066 -29.411 -29.933 -30.314 -30.718 -30.926 -31.339 -31.764 -32.242 -32.492 -33.016 -33.265 -33.553 -33.846 -34.491 -34.848 -35.238 -35.669 -36.167 -36.753 -37.478 -39.343 -9 ,7304 ,TETRA ,17602912,Sun Nov 28 16:27:29 CET,Sun Nov 28 18:14:42 CET,0.0 0.436 0.739 0.992 1.222 1.444 1.638 1.813 2.127 2.273 2.408 2.412 2.785 2.909 3.154 3.389 3.616 3.723 3.925 4.119 4.389 4.554 4.709 4.93 5.135 5.338 5.518 5.673 5.875 6.071 6.245 6.417 6.57 6.73 6.908 7.063 7.191 7.356 7.497 7.581 7.629 7.669 7.722 7.689 7.57 7.389 7.002 6.285 5.169 3.455 0.577 -2.829 -5.586 -7.901 -9.904 -11.701 -13.253 -14.652 -15.849 -17.099 -18.169 -19.076 -19.941 -20.746 -21.486 -22.163 -22.872 -23.516 -24.077 -24.651 -25.239 -25.74 -26.269 -26.804 -27.218 -27.658 -28.106 -28.551 -29.039 -29.383 -29.727 -30.262 -30.644 -31.051 -31.25 -31.662 -32.111 -32.583 -32.833 -33.364 -33.619 -33.916 -34.217 -34.842 -35.181 -35.559 -35.99 -36.465 -36.99 -37.678 -39.524 -10 ,5970 ,TETRA ,17602913,Sun Nov 28 16:26:36 CET,Sun Nov 28 18:12:40 CET,0.0 0.53 0.837 1.103 1.348 1.576 1.775 1.95 2.265 2.414 2.555 2.574 2.943 3.06 3.287 3.498 3.701 3.797 3.976 4.15 4.395 4.547 4.68 4.858 5.031 5.189 5.336 5.486 5.671 5.834 5.988 6.172 6.352 6.516 6.693 6.872 7.018 7.163 7.29 7.387 7.477 7.525 7.518 7.475 7.313 7.041 6.633 5.95 4.901 3.208 0.287 -3.178 -6.026 -8.376 -10.29 -11.994 -13.508 -14.86 -15.987 -17.113 -18.13 -19.065 -19.934 -20.749 -21.497 -22.186 -22.914 -23.54 -24.082 -24.664 -25.297 -25.817 -26.329 -26.857 -27.279 -27.723 -28.164 -28.598 -29.055 -29.387 -29.725 -30.25 -30.627 -31.019 -31.217 -31.631 -32.064 -32.526 -32.781 -33.316 -33.564 -33.843 -34.13 -34.751 -35.114 -35.502 -35.931 -36.417 -36.978 -37.688 -39.885 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 175feaba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2905 ,KEBNE ,17027451,Wed Dec 22 17:11:01 CET,Wed Dec 22 18:43:04 CET,0.0 1.088 1.573 1.982 2.335 2.642 2.918 3.17 3.625 3.83 4.025 4.133 4.58 4.763 5.102 5.414 5.722 5.875 6.164 6.42 6.771 7.008 7.241 7.557 7.864 8.176 8.484 8.783 9.167 9.539 9.886 10.291 10.701 11.095 11.534 12.011 12.453 12.927 13.399 13.905 14.493 15.129 15.796 16.43 17.192 18.029 18.911 19.837 20.852 21.954 23.106 23.702 23.81 23.697 23.474 23.189 22.89 22.568 22.225 21.837 21.433 21.058 20.714 20.363 20.002 19.66 19.287 18.931 18.626 18.299 17.945 17.662 17.364 17.037 16.789 16.523 16.225 15.918 15.603 15.386 15.15 14.78 14.528 14.264 14.119 13.816 13.504 13.172 12.996 12.549 12.38 12.153 11.931 11.46 11.202 10.932 10.607 10.22 9.752 9.133 7.49 -2 ,31003 ,KEBNE ,17027452,Wed Dec 22 17:11:01 CET,Wed Dec 22 18:43:12 CET,0.0 0.907 1.387 1.793 2.142 2.432 2.689 2.933 3.388 3.604 3.811 3.944 4.393 4.557 4.877 5.191 5.488 5.632 5.915 6.18 6.555 6.801 7.043 7.388 7.717 8.029 8.332 8.619 8.988 9.338 9.676 10.091 10.486 10.857 11.267 11.74 12.226 12.757 13.28 13.83 14.397 14.998 15.692 16.356 17.136 17.988 18.908 19.902 20.981 22.12 23.258 23.93 24.075 23.909 23.627 23.325 22.982 22.586 22.181 21.727 21.323 20.935 20.542 20.174 19.806 19.457 19.096 18.779 18.502 18.193 17.846 17.56 17.289 16.985 16.72 16.445 16.168 15.868 15.552 15.339 15.11 14.744 14.506 14.243 14.094 13.796 13.483 13.143 12.954 12.508 12.376 12.174 11.953 11.45 11.188 10.903 10.557 10.16 9.705 9.131 7.702 -3 ,1682 ,KEBNE ,17027453,Wed Dec 22 17:11:02 CET,Wed Dec 22 18:42:48 CET,0.0 0.951 1.453 1.854 2.195 2.479 2.744 2.994 3.442 3.659 3.871 4.009 4.467 4.641 4.97 5.277 5.564 5.708 5.992 6.256 6.627 6.863 7.084 7.409 7.734 8.04 8.329 8.61 8.971 9.329 9.688 10.117 10.518 10.906 11.356 11.851 12.311 12.792 13.283 13.802 14.346 14.977 15.69 16.346 17.08 17.904 18.856 19.863 20.964 22.122 23.277 23.917 24.076 24.003 23.744 23.403 23.058 22.684 22.339 21.924 21.538 21.185 20.824 20.494 20.145 19.795 19.424 19.07 18.739 18.413 18.09 17.796 17.469 17.11 16.825 16.539 16.242 15.938 15.635 15.421 15.194 14.842 14.588 14.328 14.186 13.886 13.58 13.243 13.063 12.619 12.457 12.227 11.99 11.468 11.175 10.851 10.495 10.086 9.578 8.957 7.507 -4 ,9658 ,KEBNE ,17027454,Wed Dec 22 17:11:02 CET,Wed Dec 22 18:43:04 CET,0.0 1.035 1.542 1.938 2.28 2.58 2.852 3.127 3.629 3.85 4.064 4.176 4.621 4.797 5.124 5.435 5.734 5.882 6.171 6.441 6.829 7.075 7.306 7.637 7.962 8.276 8.568 8.831 9.177 9.516 9.829 10.227 10.615 10.99 11.426 11.917 12.385 12.864 13.374 13.908 14.45 15.026 15.676 16.318 17.046 17.894 18.859 19.884 21.016 22.213 23.419 24.019 24.094 23.965 23.733 23.367 22.94 22.505 22.132 21.761 21.387 21.036 20.68 20.32 19.989 19.681 19.355 19.039 18.759 18.465 18.113 17.826 17.529 17.185 16.914 16.638 16.341 16.032 15.703 15.472 15.228 14.85 14.595 14.323 14.183 13.866 13.521 13.17 12.985 12.533 12.377 12.163 11.931 11.443 11.18 10.885 10.566 10.179 9.731 9.202 8.024 -5 ,4588 ,KEBNE ,17027455,Wed Dec 22 17:11:01 CET,Wed Dec 22 18:42:51 CET,0.0 0.862 1.329 1.696 2.031 2.341 2.607 2.848 3.306 3.522 3.726 3.835 4.274 4.443 4.765 5.057 5.331 5.47 5.753 6.02 6.413 6.662 6.899 7.257 7.582 7.87 8.16 8.446 8.817 9.178 9.512 9.897 10.279 10.67 11.133 11.644 12.092 12.554 13.039 13.566 14.14 14.743 15.41 16.11 16.885 17.654 18.487 19.408 20.441 21.549 22.721 23.31 23.389 23.261 23.046 22.767 22.437 22.087 21.716 21.275 20.877 20.529 20.174 19.838 19.525 19.223 18.878 18.538 18.245 17.929 17.589 17.305 16.993 16.651 16.371 16.087 15.816 15.512 15.184 14.967 14.735 14.359 14.095 13.806 13.654 13.346 13.017 12.657 12.471 12.032 11.897 11.683 11.459 10.961 10.689 10.392 10.067 9.68 9.199 8.611 6.99 -6 ,16129 ,KEBNE ,17027456,Wed Dec 22 17:11:02 CET,Wed Dec 22 18:42:49 CET,0.0 1.083 1.61 1.998 2.322 2.617 2.881 3.111 3.551 3.752 3.94 4.052 4.507 4.691 5.036 5.341 5.62 5.759 6.031 6.294 6.671 6.911 7.142 7.485 7.813 8.108 8.382 8.655 9.022 9.385 9.735 10.153 10.561 10.959 11.386 11.838 12.273 12.758 13.285 13.836 14.397 15.009 15.727 16.404 17.175 18.07 18.994 19.96 21.07 22.259 23.443 24.095 24.242 24.15 23.952 23.705 23.358 22.977 22.624 22.212 21.821 21.448 21.073 20.683 20.322 19.983 19.59 19.247 18.958 18.634 18.288 18.005 17.71 17.401 17.13 16.829 16.526 16.226 15.909 15.681 15.448 15.078 14.81 14.522 14.375 14.079 13.745 13.39 13.213 12.776 12.616 12.385 12.155 11.652 11.359 11.045 10.699 10.28 9.799 9.228 7.732 -7 ,11848 ,KEBNE ,17027457,Wed Dec 22 17:11:02 CET,Wed Dec 22 18:42:38 CET,0.0 0.865 1.41 1.82 2.152 2.444 2.711 2.958 3.406 3.616 3.814 3.93 4.385 4.563 4.891 5.192 5.477 5.622 5.903 6.168 6.535 6.779 7.024 7.368 7.706 8.037 8.353 8.653 9.042 9.421 9.773 10.203 10.621 11.008 11.424 11.866 12.297 12.782 13.329 13.892 14.452 15.063 15.776 16.494 17.281 18.075 18.948 19.962 21.095 22.282 23.494 24.123 24.204 24.06 23.789 23.461 23.143 22.798 22.427 22.001 21.613 21.278 20.92 20.521 20.158 19.829 19.447 19.099 18.81 18.519 18.209 17.926 17.616 17.296 17.034 16.765 16.491 16.194 15.868 15.639 15.397 15.021 14.768 14.488 14.332 14.0 13.671 13.329 13.148 12.701 12.538 12.325 12.096 11.605 11.339 11.028 10.67 10.252 9.752 9.135 7.82 -8 ,14243 ,KEBNE ,17027458,Wed Dec 22 17:11:02 CET,Wed Dec 22 18:42:52 CET,0.0 0.992 1.476 1.88 2.243 2.553 2.833 3.103 3.604 3.828 4.033 4.142 4.587 4.753 5.078 5.395 5.689 5.826 6.094 6.365 6.752 6.998 7.239 7.583 7.918 8.233 8.524 8.813 9.184 9.521 9.85 10.254 10.63 10.987 11.402 11.876 12.313 12.779 13.288 13.824 14.373 14.986 15.675 16.389 17.223 18.068 19.003 19.994 21.051 22.212 23.412 24.129 24.323 24.234 23.985 23.682 23.373 23.003 22.612 22.18 21.771 21.378 20.987 20.613 20.275 19.977 19.64 19.303 18.984 18.654 18.313 18.01 17.699 17.374 17.11 16.832 16.547 16.248 15.939 15.724 15.494 15.122 14.865 14.595 14.446 14.144 13.843 13.518 13.345 12.901 12.749 12.545 12.335 11.862 11.587 11.292 10.959 10.556 10.066 9.478 7.769 -9 ,14384 ,KEBNE ,17027459,Wed Dec 22 17:11:02 CET,Wed Dec 22 18:42:32 CET,0.0 1.056 1.569 1.978 2.303 2.588 2.865 3.122 3.601 3.825 4.036 4.169 4.623 4.8 5.131 5.45 5.766 5.917 6.196 6.462 6.865 7.126 7.357 7.686 8.005 8.302 8.607 8.908 9.277 9.626 9.959 10.353 10.74 11.132 11.572 12.058 12.53 13.013 13.5 14.025 14.574 15.183 15.908 16.596 17.387 18.24 19.148 20.193 21.339 22.527 23.715 24.392 24.561 24.422 24.161 23.811 23.418 23.047 22.689 22.282 21.918 21.581 21.223 20.864 20.512 20.163 19.785 19.456 19.159 18.833 18.509 18.244 17.952 17.642 17.382 17.099 16.819 16.527 16.211 15.991 15.753 15.376 15.113 14.822 14.672 14.372 14.052 13.719 13.55 13.106 12.942 12.722 12.49 11.997 11.712 11.406 11.071 10.673 10.19 9.584 7.838 -10 ,30454 ,KEBNE ,17027460,Wed Dec 22 17:11:02 CET,Wed Dec 22 18:43:00 CET,0.0 1.061 1.575 1.974 2.31 2.618 2.905 3.166 3.628 3.848 4.056 4.163 4.605 4.775 5.105 5.412 5.7 5.84 6.117 6.384 6.766 7.006 7.237 7.586 7.927 8.253 8.568 8.863 9.235 9.597 9.952 10.371 10.761 11.129 11.549 12.027 12.484 12.95 13.466 14.027 14.595 15.2 15.851 16.549 17.359 18.162 19.037 20.015 21.133 22.343 23.565 24.254 24.362 24.185 23.927 23.658 23.343 22.986 22.614 22.166 21.786 21.451 21.1 20.738 20.378 20.03 19.668 19.362 19.083 18.777 18.447 18.154 17.849 17.513 17.246 16.975 16.673 16.368 16.053 15.826 15.598 15.225 14.95 14.68 14.543 14.241 13.92 13.596 13.422 12.98 12.822 12.609 12.386 11.884 11.606 11.29 10.948 10.573 10.116 9.514 8.366 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 8fbdee0c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17500 ,TETRA ,17602914,Sun Nov 28 16:26:38 CET,Sun Nov 28 18:13:54 CET,0.0 0.98 1.427 1.824 2.196 2.526 2.809 3.082 3.59 3.808 4.01 4.147 4.619 4.806 5.151 5.497 5.84 6.004 6.324 6.629 7.033 7.287 7.54 7.912 8.273 8.612 8.938 9.266 9.68 10.063 10.438 10.881 11.293 11.702 12.201 12.754 13.25 13.806 14.419 15.063 15.75 16.521 17.386 18.217 19.151 20.159 21.326 22.642 24.166 25.95 28.005 29.494 30.182 30.507 30.586 30.519 30.404 30.217 29.983 29.698 29.429 29.17 28.911 28.662 28.413 28.145 27.849 27.584 27.339 27.064 26.779 26.53 26.243 25.94 25.714 25.479 25.238 24.99 24.708 24.504 24.292 23.956 23.713 23.472 23.36 23.126 22.853 22.535 22.37 21.968 21.856 21.653 21.447 20.994 20.735 20.46 20.141 19.76 19.324 18.812 17.483 -2 ,3975 ,TETRA ,17602915,Sun Nov 28 16:26:39 CET,Sun Nov 28 18:13:34 CET,0.0 0.919 1.44 1.843 2.197 2.513 2.792 3.061 3.555 3.783 4.003 4.133 4.59 4.774 5.125 5.472 5.8 5.951 6.245 6.538 6.964 7.237 7.487 7.839 8.191 8.536 8.881 9.21 9.616 10.002 10.38 10.848 11.303 11.744 12.231 12.735 13.228 13.795 14.412 15.048 15.702 16.454 17.308 18.116 19.023 20.046 21.255 22.613 24.118 25.826 27.87 29.403 30.154 30.52 30.621 30.599 30.481 30.276 30.096 29.892 29.642 29.393 29.135 28.846 28.572 28.315 28.011 27.734 27.51 27.276 27.002 26.753 26.492 26.208 25.993 25.777 25.543 25.286 25.004 24.805 24.6 24.271 24.039 23.803 23.673 23.395 23.12 22.831 22.682 22.278 22.167 21.972 21.755 21.287 21.036 20.762 20.465 20.112 19.685 19.175 17.815 -3 ,1353 ,TETRA ,17602916,Sun Nov 28 16:26:36 CET,Sun Nov 28 18:13:10 CET,0.0 0.859 1.368 1.746 2.089 2.405 2.685 2.953 3.466 3.692 3.909 4.073 4.538 4.726 5.064 5.377 5.693 5.843 6.13 6.407 6.811 7.08 7.337 7.692 8.045 8.395 8.731 9.05 9.462 9.865 10.252 10.713 11.156 11.594 12.102 12.658 13.178 13.752 14.375 15.015 15.672 16.376 17.196 18.08 19.072 20.106 21.321 22.691 24.28 26.111 28.116 29.546 30.303 30.718 30.861 30.812 30.666 30.478 30.243 29.959 29.675 29.421 29.169 28.89 28.625 28.363 28.066 27.799 27.561 27.295 26.999 26.756 26.502 26.224 25.998 25.752 25.512 25.267 24.986 24.789 24.583 24.247 24.017 23.773 23.645 23.371 23.064 22.729 22.56 22.143 22.005 21.807 21.592 21.136 20.891 20.617 20.316 19.959 19.524 18.935 17.533 -4 ,10080 ,TETRA ,17602917,Sun Nov 28 16:26:36 CET,Sun Nov 28 18:14:36 CET,0.0 0.79 1.28 1.667 1.987 2.292 2.583 2.849 3.352 3.584 3.796 3.923 4.382 4.567 4.922 5.265 5.574 5.725 6.037 6.342 6.763 7.028 7.285 7.651 8.008 8.349 8.671 8.993 9.418 9.83 10.233 10.693 11.115 11.546 12.057 12.611 13.121 13.677 14.279 14.913 15.572 16.327 17.222 18.069 19.037 20.099 21.248 22.556 24.099 25.84 27.818 29.264 29.993 30.335 30.457 30.433 30.277 30.087 29.861 29.543 29.229 28.948 28.66 28.37 28.094 27.827 27.497 27.182 26.939 26.692 26.412 26.158 25.895 25.623 25.403 25.176 24.94 24.667 24.374 24.174 23.965 23.634 23.403 23.157 23.03 22.763 22.469 22.18 22.03 21.608 21.433 21.219 21.013 20.557 20.297 20.026 19.737 19.402 19.0 18.475 17.233 -5 ,3147 ,TETRA ,17602918,Sun Nov 28 16:26:36 CET,Sun Nov 28 18:14:24 CET,0.0 0.907 1.44 1.874 2.202 2.501 2.786 3.063 3.566 3.786 3.998 4.15 4.61 4.8 5.161 5.5 5.828 5.984 6.296 6.599 7.019 7.28 7.533 7.902 8.252 8.591 8.912 9.226 9.636 10.029 10.41 10.874 11.338 11.788 12.272 12.808 13.326 13.857 14.434 15.068 15.747 16.49 17.3 18.095 19.011 20.037 21.185 22.462 23.978 25.732 27.76 29.281 30.019 30.341 30.408 30.33 30.197 29.999 29.794 29.562 29.324 29.07 28.804 28.543 28.27 28.019 27.742 27.451 27.175 26.883 26.596 26.361 26.101 25.824 25.612 25.378 25.121 24.861 24.569 24.362 24.155 23.836 23.615 23.369 23.237 22.971 22.685 22.375 22.218 21.797 21.642 21.447 21.24 20.754 20.495 20.221 19.91 19.554 19.124 18.577 17.317 -6 ,32500 ,TETRA ,17602919,Sun Nov 28 16:26:37 CET,Sun Nov 28 18:13:40 CET,0.0 1.067 1.621 2.019 2.341 2.66 2.97 3.244 3.746 3.978 4.199 4.337 4.796 4.985 5.347 5.683 5.993 6.147 6.462 6.77 7.189 7.457 7.73 8.111 8.467 8.816 9.16 9.497 9.921 10.326 10.721 11.201 11.655 12.077 12.571 13.119 13.619 14.165 14.765 15.401 16.064 16.822 17.709 18.606 19.632 20.741 21.973 23.305 24.826 26.561 28.51 29.996 30.764 31.112 31.188 31.133 30.997 30.8 30.576 30.275 29.97 29.685 29.398 29.114 28.838 28.581 28.293 28.019 27.78 27.523 27.248 27.018 26.759 26.464 26.241 26.018 25.778 25.515 25.241 25.047 24.845 24.534 24.313 24.063 23.93 23.661 23.371 23.064 22.905 22.492 22.383 22.194 21.983 21.549 21.301 21.018 20.731 20.391 19.985 19.454 18.33 -7 ,27517 ,TETRA ,17602920,Sun Nov 28 16:26:37 CET,Sun Nov 28 18:13:10 CET,0.0 1.2 1.688 2.066 2.414 2.73 3.009 3.274 3.758 3.982 4.2 4.338 4.799 4.988 5.34 5.68 6.0 6.155 6.458 6.741 7.154 7.428 7.693 8.072 8.436 8.789 9.132 9.464 9.886 10.289 10.669 11.11 11.547 11.967 12.454 13.001 13.525 14.105 14.746 15.404 16.058 16.81 17.657 18.496 19.475 20.574 21.829 23.176 24.714 26.451 28.45 29.936 30.637 30.988 31.128 31.099 30.933 30.711 30.515 30.261 29.979 29.738 29.471 29.144 28.834 28.549 28.239 27.975 27.741 27.482 27.189 26.94 26.69 26.409 26.187 25.963 25.713 25.435 25.137 24.925 24.704 24.359 24.121 23.879 23.752 23.491 23.224 22.927 22.758 22.337 22.225 22.036 21.834 21.416 21.177 20.903 20.581 20.206 19.787 19.269 17.971 -8 ,29243 ,TETRA ,17602921,Sun Nov 28 16:26:37 CET,Sun Nov 28 18:13:17 CET,0.0 0.986 1.442 1.828 2.169 2.472 2.744 2.999 3.462 3.691 3.919 4.057 4.516 4.703 5.071 5.422 5.745 5.896 6.195 6.493 6.911 7.17 7.415 7.763 8.109 8.461 8.816 9.151 9.562 9.966 10.35 10.778 11.198 11.615 12.081 12.585 13.084 13.676 14.323 14.993 15.69 16.442 17.285 18.113 19.069 20.126 21.287 22.605 24.178 25.985 28.045 29.586 30.361 30.742 30.874 30.804 30.678 30.506 30.279 30.018 29.756 29.495 29.229 28.956 28.685 28.426 28.139 27.867 27.624 27.365 27.081 26.828 26.553 26.251 26.023 25.793 25.54 25.264 24.981 24.784 24.576 24.243 23.998 23.74 23.61 23.326 23.016 22.704 22.544 22.136 22.036 21.837 21.609 21.16 20.935 20.669 20.368 20.025 19.609 19.063 17.774 -9 ,310 ,TETRA ,17602922,Sun Nov 28 16:26:37 CET,Sun Nov 28 18:13:48 CET,0.0 1.078 1.575 1.981 2.339 2.639 2.922 3.186 3.677 3.913 4.132 4.272 4.739 4.932 5.276 5.598 5.924 6.082 6.38 6.669 7.087 7.353 7.61 7.988 8.342 8.67 8.993 9.303 9.698 10.092 10.475 10.923 11.353 11.782 12.276 12.821 13.353 13.952 14.607 15.272 15.918 16.628 17.47 18.371 19.398 20.465 21.671 22.974 24.478 26.232 28.25 29.739 30.413 30.697 30.788 30.737 30.542 30.286 30.042 29.789 29.553 29.308 29.052 28.78 28.502 28.219 27.919 27.634 27.386 27.124 26.826 26.572 26.306 26.031 25.813 25.581 25.333 25.061 24.777 24.577 24.358 24.004 23.771 23.539 23.416 23.156 22.873 22.561 22.399 21.983 21.858 21.665 21.457 21.002 20.746 20.456 20.146 19.778 19.339 18.781 17.497 -10 ,32409 ,TETRA ,17602923,Sun Nov 28 16:26:36 CET,Sun Nov 28 18:13:31 CET,0.0 0.844 1.302 1.706 2.045 2.335 2.604 2.862 3.361 3.599 3.815 3.942 4.402 4.584 4.922 5.249 5.555 5.701 5.994 6.275 6.679 6.944 7.207 7.589 7.956 8.298 8.618 8.92 9.314 9.703 10.079 10.533 10.971 11.406 11.913 12.466 12.97 13.503 14.09 14.696 15.356 16.134 17.059 17.963 18.936 20.002 21.218 22.594 24.114 25.787 27.747 29.204 29.917 30.192 30.215 30.139 30.02 29.841 29.625 29.348 29.06 28.809 28.549 28.252 27.97 27.714 27.442 27.205 26.979 26.735 26.463 26.197 25.92 25.641 25.427 25.208 24.965 24.701 24.436 24.25 24.041 23.708 23.475 23.217 23.08 22.797 22.507 22.205 22.032 21.607 21.484 21.277 21.056 20.585 20.318 20.024 19.714 19.359 18.971 18.472 17.217 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt deleted file mode 100644 index a0ad3cd7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11483 ,TETRA ,17602924,Sun Nov 28 16:26:36 CET,Sun Nov 28 18:12:38 CET,0.0 0.915 1.432 1.849 2.214 2.543 2.855 3.145 3.707 3.977 4.222 4.406 4.89 5.109 5.535 5.925 6.297 6.484 6.863 7.219 7.699 8.022 8.348 8.805 9.247 9.701 10.148 10.566 11.103 11.615 12.099 12.699 13.282 13.845 14.492 15.216 15.925 16.714 17.6 18.542 19.514 20.64 21.991 23.334 24.906 26.722 28.857 31.314 34.298 37.951 42.662 46.737 49.073 50.591 51.632 52.346 52.814 53.09 53.256 53.375 53.412 53.378 53.326 53.244 53.104 52.947 52.773 52.599 52.423 52.218 51.971 51.747 51.52 51.3 51.118 50.903 50.664 50.416 50.173 49.998 49.799 49.502 49.26 48.976 48.82 48.514 48.227 47.909 47.739 47.334 47.19 46.998 46.784 46.311 46.028 45.686 45.304 44.853 44.326 43.61 41.145 -2 ,19641 ,TETRA ,17602925,Sun Nov 28 16:26:38 CET,Sun Nov 28 18:14:37 CET,0.0 1.317 1.825 2.264 2.642 2.977 3.297 3.598 4.144 4.397 4.637 4.816 5.3 5.513 5.909 6.304 6.7 6.886 7.245 7.604 8.116 8.436 8.743 9.193 9.652 10.101 10.533 10.95 11.477 11.996 12.49 13.071 13.654 14.229 14.908 15.673 16.395 17.18 18.023 18.938 19.93 21.075 22.423 23.776 25.382 27.2 29.389 31.987 35.055 38.774 43.433 47.395 49.796 51.394 52.496 53.185 53.555 53.807 53.981 54.096 54.137 54.101 54.038 53.971 53.873 53.756 53.601 53.42 53.263 53.096 52.879 52.672 52.453 52.22 52.025 51.832 51.632 51.405 51.164 50.986 50.804 50.512 50.279 50.014 49.888 49.62 49.338 49.039 48.873 48.479 48.306 48.084 47.845 47.324 47.008 46.647 46.253 45.792 45.198 44.411 41.953 -3 ,2450 ,TETRA ,17602926,Sun Nov 28 16:26:40 CET,Sun Nov 28 18:14:36 CET,0.0 1.06 1.593 2.027 2.401 2.742 3.058 3.351 3.882 4.129 4.365 4.543 5.024 5.242 5.685 6.099 6.477 6.659 7.018 7.375 7.875 8.191 8.508 8.982 9.45 9.909 10.344 10.751 11.28 11.803 12.323 12.952 13.548 14.113 14.751 15.474 16.182 16.959 17.821 18.781 19.813 20.947 22.239 23.557 25.169 27.007 29.144 31.638 34.656 38.328 42.972 46.95 49.369 51.062 52.198 52.916 53.395 53.696 53.852 53.948 53.972 53.954 53.893 53.833 53.769 53.655 53.502 53.344 53.175 52.986 52.791 52.611 52.399 52.161 51.98 51.78 51.551 51.303 51.046 50.874 50.682 50.359 50.139 49.92 49.798 49.521 49.218 48.882 48.707 48.305 48.128 47.892 47.653 47.15 46.844 46.51 46.162 45.778 45.346 44.679 42.267 -4 ,28278 ,TETRA ,17602927,Sun Nov 28 16:26:38 CET,Sun Nov 28 18:13:55 CET,0.0 0.802 1.29 1.706 2.069 2.381 2.681 2.966 3.504 3.758 3.999 4.194 4.675 4.884 5.294 5.681 6.06 6.248 6.613 6.961 7.451 7.773 8.102 8.575 9.022 9.475 9.922 10.33 10.832 11.318 11.804 12.425 13.031 13.629 14.326 15.064 15.782 16.602 17.498 18.447 19.445 20.576 21.865 23.171 24.74 26.548 28.703 31.176 34.173 37.821 42.476 46.54 48.989 50.548 51.583 52.335 52.856 53.16 53.324 53.471 53.538 53.555 53.504 53.407 53.309 53.184 53.031 52.867 52.692 52.484 52.274 52.094 51.895 51.673 51.481 51.29 51.091 50.863 50.598 50.406 50.207 49.9 49.694 49.474 49.346 49.066 48.768 48.439 48.263 47.863 47.705 47.495 47.248 46.686 46.384 46.062 45.708 45.286 44.777 44.048 41.446 -5 ,19538 ,TETRA ,17602928,Sun Nov 28 16:26:38 CET,Sun Nov 28 18:12:43 CET,0.0 0.792 1.279 1.686 2.071 2.418 2.731 3.029 3.581 3.832 4.068 4.235 4.722 4.946 5.373 5.774 6.155 6.342 6.699 7.047 7.558 7.886 8.188 8.63 9.072 9.507 9.93 10.35 10.884 11.385 11.876 12.467 13.04 13.612 14.3 15.064 15.79 16.586 17.466 18.41 19.378 20.485 21.825 23.206 24.836 26.683 28.842 31.331 34.313 37.985 42.688 46.756 49.298 50.977 52.061 52.864 53.42 53.727 53.902 54.02 54.059 54.058 54.006 53.901 53.811 53.715 53.54 53.349 53.184 52.991 52.769 52.58 52.393 52.21 52.047 51.844 51.623 51.397 51.155 50.984 50.793 50.463 50.221 49.966 49.827 49.518 49.214 48.92 48.758 48.351 48.183 47.983 47.762 47.243 46.942 46.607 46.208 45.763 45.241 44.529 42.565 -6 ,14582 ,TETRA ,17602929,Sun Nov 28 16:26:38 CET,Sun Nov 28 18:13:52 CET,0.0 0.885 1.418 1.851 2.206 2.539 2.856 3.146 3.681 3.934 4.183 4.395 4.891 5.112 5.555 5.972 6.356 6.542 6.912 7.269 7.769 8.084 8.394 8.84 9.274 9.727 10.164 10.576 11.117 11.629 12.125 12.732 13.301 13.846 14.488 15.22 15.938 16.754 17.637 18.578 19.592 20.742 22.073 23.413 25.018 26.813 28.946 31.499 34.561 38.297 43.081 47.155 49.639 51.239 52.333 53.138 53.632 53.98 54.219 54.337 54.342 54.303 54.254 54.15 54.024 53.908 53.751 53.586 53.423 53.241 53.051 52.881 52.688 52.46 52.273 52.077 51.86 51.63 51.392 51.223 51.038 50.718 50.48 50.237 50.1 49.812 49.526 49.207 49.037 48.622 48.442 48.22 47.987 47.477 47.188 46.852 46.462 45.995 45.462 44.803 41.225 -7 ,24306 ,TETRA ,17602930,Sun Nov 28 16:26:38 CET,Sun Nov 28 18:12:55 CET,0.0 1.008 1.524 1.925 2.308 2.661 2.991 3.283 3.808 4.065 4.311 4.498 4.984 5.2 5.623 6.024 6.406 6.593 6.957 7.309 7.808 8.135 8.464 8.938 9.384 9.811 10.244 10.671 11.211 11.738 12.253 12.865 13.445 14.006 14.689 15.459 16.189 17.014 17.894 18.822 19.827 20.992 22.358 23.694 25.321 27.208 29.363 31.847 34.831 38.482 43.209 47.264 49.734 51.35 52.423 53.215 53.694 53.936 54.072 54.165 54.207 54.189 54.117 54.037 53.907 53.759 53.629 53.481 53.3 53.096 52.885 52.71 52.505 52.268 52.094 51.902 51.681 51.466 51.224 51.034 50.815 50.483 50.265 50.021 49.883 49.584 49.276 48.949 48.769 48.347 48.138 47.909 47.671 47.141 46.858 46.554 46.195 45.796 45.312 44.616 41.392 -8 ,20917 ,TETRA ,17602931,Sun Nov 28 16:26:38 CET,Sun Nov 28 18:12:35 CET,0.0 1.142 1.669 2.083 2.454 2.795 3.099 3.384 3.942 4.201 4.432 4.606 5.093 5.31 5.73 6.133 6.516 6.7 7.053 7.393 7.899 8.225 8.546 9.018 9.476 9.923 10.352 10.773 11.317 11.832 12.332 12.93 13.498 14.058 14.716 15.46 16.186 16.984 17.855 18.79 19.767 20.86 22.162 23.532 25.131 26.938 29.076 31.527 34.504 38.192 42.863 46.957 49.471 51.13 52.308 53.055 53.492 53.798 53.971 54.06 54.078 54.074 54.02 53.903 53.76 53.598 53.407 53.224 53.065 52.89 52.656 52.43 52.193 51.939 51.734 51.533 51.331 51.107 50.873 50.706 50.514 50.202 49.993 49.77 49.656 49.415 49.128 48.787 48.608 48.201 47.994 47.761 47.529 47.008 46.717 46.389 46.022 45.61 45.12 44.464 41.683 -9 ,30862 ,TETRA ,17602932,Sun Nov 28 16:26:38 CET,Sun Nov 28 18:12:26 CET,0.0 0.913 1.408 1.83 2.207 2.54 2.855 3.155 3.702 3.959 4.208 4.413 4.901 5.113 5.547 5.965 6.351 6.534 6.887 7.231 7.73 8.061 8.389 8.858 9.312 9.765 10.199 10.601 11.133 11.653 12.149 12.741 13.309 13.873 14.566 15.347 16.088 16.911 17.82 18.812 19.843 21.003 22.395 23.797 25.421 27.221 29.312 31.751 34.742 38.377 42.968 46.929 49.373 51.051 52.185 52.995 53.48 53.798 54.049 54.211 54.275 54.27 54.197 54.093 53.971 53.825 53.645 53.5 53.371 53.19 52.974 52.784 52.568 52.337 52.147 51.941 51.721 51.495 51.247 51.065 50.873 50.576 50.371 50.154 50.037 49.783 49.507 49.187 49.008 48.614 48.48 48.269 48.043 47.513 47.198 46.866 46.481 46.072 45.635 44.989 42.881 -10 ,31274 ,TETRA ,17602933,Sun Nov 28 16:26:38 CET,Sun Nov 28 18:13:32 CET,0.0 0.952 1.5 1.925 2.297 2.639 2.943 3.229 3.787 4.051 4.296 4.509 5.001 5.215 5.64 6.041 6.419 6.602 6.967 7.323 7.831 8.157 8.475 8.946 9.4 9.826 10.244 10.656 11.193 11.718 12.228 12.86 13.461 14.04 14.744 15.527 16.242 17.025 17.88 18.796 19.771 20.904 22.241 23.594 25.208 27.007 29.154 31.652 34.641 38.324 42.99 47.082 49.598 51.134 52.167 52.902 53.384 53.741 53.949 54.055 54.063 54.032 53.957 53.861 53.775 53.658 53.506 53.342 53.18 53.008 52.804 52.641 52.454 52.228 52.056 51.861 51.641 51.41 51.16 50.989 50.804 50.493 50.275 50.045 49.924 49.667 49.394 49.078 48.905 48.503 48.32 48.093 47.859 47.331 47.038 46.718 46.328 45.844 45.303 44.569 42.193 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 7b7245d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23928 ,KEBNE ,17027461,Wed Dec 22 17:15:08 CET,Wed Dec 22 18:47:53 CET,0.0 0.854 1.318 1.698 2.002 2.265 2.502 2.718 3.092 3.264 3.442 3.525 3.913 4.054 4.328 4.606 4.863 4.988 5.224 5.433 5.741 5.941 6.131 6.402 6.64 6.861 7.096 7.33 7.628 7.909 8.161 8.454 8.724 8.976 9.273 9.6 9.88 10.18 10.511 10.843 11.173 11.516 11.891 12.239 12.551 12.823 13.134 13.397 13.522 13.404 12.76 11.633 10.541 9.529 8.627 7.782 6.992 6.242 5.612 4.954 4.322 3.757 3.228 2.734 2.278 1.844 1.373 0.931 0.534 0.114 -0.316 -0.667 -1.023 -1.389 -1.689 -2.003 -2.328 -2.667 -2.995 -3.221 -3.47 -3.864 -4.143 -4.433 -4.58 -4.889 -5.206 -5.55 -5.738 -6.181 -6.299 -6.501 -6.721 -7.196 -7.451 -7.726 -8.019 -8.352 -8.776 -9.275 -10.227 -2 ,31209 ,KEBNE ,17027462,Wed Dec 22 17:15:08 CET,Wed Dec 22 18:48:29 CET,0.0 0.913 1.317 1.642 1.932 2.2 2.463 2.701 3.128 3.318 3.497 3.594 3.985 4.121 4.391 4.653 4.898 5.017 5.255 5.483 5.793 5.99 6.182 6.46 6.716 6.962 7.211 7.44 7.714 7.977 8.237 8.538 8.829 9.111 9.419 9.753 10.066 10.387 10.733 11.087 11.437 11.817 12.218 12.585 12.958 13.288 13.585 13.838 13.95 13.794 13.196 12.14 10.991 9.881 8.962 8.106 7.306 6.546 5.823 5.112 4.526 3.962 3.388 2.847 2.358 1.902 1.412 0.984 0.612 0.222 -0.177 -0.524 -0.896 -1.28 -1.573 -1.881 -2.203 -2.533 -2.86 -3.082 -3.328 -3.723 -3.991 -4.267 -4.415 -4.722 -5.029 -5.351 -5.526 -5.966 -6.107 -6.307 -6.516 -6.967 -7.213 -7.492 -7.806 -8.147 -8.56 -9.085 -9.959 -3 ,9680 ,KEBNE ,17027463,Wed Dec 22 17:15:08 CET,Wed Dec 22 18:47:54 CET,0.0 0.859 1.281 1.662 1.986 2.261 2.507 2.735 3.139 3.315 3.489 3.587 3.977 4.127 4.43 4.701 4.944 5.059 5.29 5.521 5.842 6.038 6.231 6.509 6.754 6.977 7.208 7.441 7.73 7.995 8.242 8.557 8.868 9.147 9.428 9.726 10.039 10.369 10.679 11.007 11.337 11.671 12.032 12.383 12.762 13.051 13.305 13.562 13.746 13.652 13.062 11.949 10.841 9.856 8.895 7.969 7.207 6.498 5.833 5.134 4.528 4.003 3.454 2.922 2.441 1.983 1.486 1.049 0.675 0.301 -0.094 -0.438 -0.798 -1.184 -1.468 -1.743 -2.042 -2.371 -2.736 -2.994 -3.252 -3.657 -3.951 -4.262 -4.417 -4.727 -5.053 -5.422 -5.615 -6.061 -6.206 -6.414 -6.632 -7.085 -7.329 -7.614 -7.921 -8.261 -8.676 -9.228 -10.47 -4 ,16150 ,KEBNE ,17027464,Wed Dec 22 17:15:08 CET,Wed Dec 22 18:47:41 CET,0.0 0.96 1.404 1.761 2.063 2.325 2.553 2.768 3.191 3.382 3.559 3.662 4.062 4.211 4.482 4.737 4.988 5.115 5.356 5.578 5.891 6.09 6.282 6.554 6.822 7.08 7.33 7.568 7.849 8.12 8.386 8.699 9.002 9.263 9.54 9.867 10.153 10.448 10.78 11.115 11.459 11.837 12.214 12.538 12.874 13.225 13.571 13.809 13.918 13.809 13.208 12.112 11.001 9.975 9.065 8.222 7.451 6.713 6.039 5.341 4.712 4.122 3.537 2.98 2.463 1.992 1.528 1.138 0.78 0.393 -0.014 -0.364 -0.736 -1.131 -1.446 -1.76 -2.081 -2.416 -2.767 -3.018 -3.268 -3.646 -3.914 -4.201 -4.353 -4.669 -4.991 -5.328 -5.503 -5.935 -6.066 -6.287 -6.509 -6.978 -7.232 -7.506 -7.814 -8.143 -8.527 -9.034 -9.96 -5 ,29371 ,KEBNE ,17027465,Wed Dec 22 17:15:08 CET,Wed Dec 22 18:48:23 CET,0.0 0.792 1.226 1.555 1.86 2.129 2.369 2.587 2.971 3.153 3.332 3.434 3.836 3.983 4.263 4.545 4.801 4.919 5.153 5.38 5.7 5.9 6.09 6.364 6.638 6.899 7.131 7.359 7.654 7.928 8.184 8.469 8.75 9.023 9.323 9.638 9.946 10.316 10.657 10.949 11.269 11.618 12.005 12.37 12.745 13.102 13.408 13.666 13.812 13.733 13.151 12.031 10.966 9.964 8.985 8.06 7.265 6.528 5.865 5.191 4.567 4.014 3.504 2.987 2.504 2.087 1.63 1.196 0.812 0.419 0.022 -0.317 -0.692 -1.093 -1.405 -1.711 -2.027 -2.375 -2.733 -2.978 -3.233 -3.63 -3.907 -4.195 -4.34 -4.647 -4.971 -5.307 -5.49 -5.934 -6.077 -6.291 -6.516 -6.969 -7.214 -7.494 -7.797 -8.142 -8.546 -9.034 -10.007 -6 ,3671 ,KEBNE ,17027466,Wed Dec 22 17:15:08 CET,Wed Dec 22 18:47:52 CET,0.0 0.806 1.243 1.59 1.882 2.127 2.346 2.561 2.971 3.158 3.329 3.405 3.801 3.943 4.204 4.467 4.725 4.844 5.084 5.305 5.618 5.823 6.01 6.286 6.559 6.817 7.049 7.269 7.554 7.826 8.073 8.363 8.646 8.897 9.153 9.441 9.741 10.08 10.422 10.764 11.118 11.445 11.796 12.14 12.478 12.81 13.102 13.373 13.524 13.384 12.771 11.7 10.617 9.6 8.69 7.832 7.054 6.322 5.69 5.0 4.356 3.792 3.244 2.714 2.212 1.748 1.275 0.858 0.493 0.121 -0.266 -0.591 -0.939 -1.321 -1.636 -1.961 -2.286 -2.61 -2.947 -3.193 -3.446 -3.83 -4.099 -4.373 -4.517 -4.829 -5.159 -5.513 -5.693 -6.128 -6.243 -6.436 -6.652 -7.153 -7.414 -7.68 -7.981 -8.34 -8.757 -9.245 -10.306 -7 ,1807 ,KEBNE ,17027467,Wed Dec 22 17:15:09 CET,Wed Dec 22 18:46:21 CET,0.0 0.92 1.442 1.786 2.08 2.365 2.624 2.868 3.275 3.448 3.614 3.681 4.074 4.229 4.531 4.812 5.068 5.188 5.418 5.641 5.962 6.161 6.353 6.629 6.888 7.125 7.342 7.558 7.851 8.118 8.365 8.667 8.956 9.236 9.554 9.888 10.178 10.504 10.857 11.176 11.493 11.818 12.149 12.471 12.761 13.036 13.304 13.498 13.562 13.404 12.801 11.682 10.564 9.546 8.657 7.807 7.021 6.245 5.506 4.792 4.19 3.638 3.113 2.617 2.135 1.691 1.219 0.781 0.408 0.031 -0.375 -0.71 -1.054 -1.444 -1.757 -2.081 -2.401 -2.736 -3.101 -3.343 -3.591 -3.98 -4.244 -4.523 -4.674 -4.985 -5.316 -5.673 -5.854 -6.291 -6.423 -6.626 -6.84 -7.356 -7.645 -7.925 -8.225 -8.549 -8.914 -9.397 -10.337 -8 ,6448 ,KEBNE ,17027468,Wed Dec 22 17:15:08 CET,Wed Dec 22 18:47:26 CET,0.0 0.87 1.31 1.667 1.988 2.256 2.491 2.703 3.113 3.319 3.501 3.58 3.973 4.119 4.385 4.644 4.89 5.003 5.236 5.461 5.778 5.98 6.169 6.445 6.712 6.957 7.183 7.417 7.74 8.034 8.287 8.59 8.89 9.175 9.484 9.784 10.066 10.377 10.676 11.011 11.339 11.653 12.03 12.384 12.735 13.065 13.376 13.57 13.653 13.575 12.99 11.862 10.772 9.763 8.828 7.947 7.115 6.34 5.676 5.009 4.443 3.919 3.337 2.808 2.344 1.882 1.424 1.01 0.645 0.292 -0.106 -0.455 -0.797 -1.158 -1.446 -1.752 -2.079 -2.412 -2.772 -3.022 -3.271 -3.656 -3.91 -4.178 -4.326 -4.632 -4.959 -5.297 -5.463 -5.891 -6.014 -6.212 -6.424 -6.887 -7.133 -7.405 -7.728 -8.071 -8.451 -8.929 -9.839 -9 ,14466 ,KEBNE ,17027469,Wed Dec 22 17:15:08 CET,Wed Dec 22 18:46:57 CET,0.0 0.665 1.075 1.423 1.722 1.977 2.196 2.411 2.822 3.003 3.18 3.286 3.693 3.842 4.124 4.395 4.655 4.783 5.014 5.231 5.546 5.735 5.917 6.194 6.479 6.74 6.969 7.2 7.506 7.789 8.057 8.382 8.69 8.989 9.329 9.694 9.997 10.274 10.591 10.939 11.284 11.64 11.976 12.27 12.604 12.889 13.151 13.373 13.44 13.272 12.624 11.492 10.392 9.4 8.506 7.625 6.808 6.067 5.392 4.669 4.057 3.525 2.992 2.473 1.973 1.516 1.059 0.634 0.243 -0.158 -0.565 -0.889 -1.221 -1.612 -1.934 -2.247 -2.563 -2.897 -3.25 -3.496 -3.75 -4.134 -4.408 -4.708 -4.861 -5.172 -5.501 -5.849 -6.029 -6.472 -6.604 -6.812 -7.035 -7.507 -7.761 -8.031 -8.346 -8.695 -9.09 -9.615 -10.59 -10 ,188 ,KEBNE ,17027470,Wed Dec 22 17:15:09 CET,Wed Dec 22 18:48:50 CET,0.0 0.689 1.168 1.551 1.855 2.115 2.347 2.561 2.972 3.161 3.336 3.419 3.819 3.969 4.256 4.533 4.805 4.931 5.16 5.381 5.695 5.893 6.088 6.358 6.612 6.856 7.092 7.326 7.614 7.89 8.159 8.459 8.742 8.999 9.287 9.617 9.892 10.204 10.543 10.861 11.19 11.538 11.896 12.238 12.597 12.904 13.153 13.371 13.505 13.427 12.881 11.78 10.709 9.718 8.756 7.836 7.001 6.216 5.543 4.853 4.253 3.708 3.167 2.642 2.139 1.675 1.203 0.786 0.401 -0.008 -0.425 -0.775 -1.127 -1.49 -1.783 -2.079 -2.38 -2.705 -3.053 -3.291 -3.542 -3.946 -4.227 -4.515 -4.662 -4.963 -5.268 -5.604 -5.79 -6.232 -6.381 -6.594 -6.817 -7.303 -7.573 -7.864 -8.177 -8.514 -8.897 -9.406 -10.403 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 9ff66151..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6821 ,TETRA ,17602934,Sun Nov 28 16:26:39 CET,Sun Nov 28 18:14:28 CET,0.0 0.91 1.414 1.813 2.159 2.482 2.756 3.006 3.468 3.675 3.876 3.992 4.415 4.582 4.9 5.205 5.492 5.632 5.923 6.205 6.595 6.836 7.068 7.417 7.759 8.084 8.399 8.697 9.066 9.42 9.764 10.151 10.513 10.867 11.288 11.768 12.215 12.709 13.221 13.729 14.25 14.845 15.514 16.159 16.932 17.772 18.647 19.523 20.52 21.626 22.681 23.251 23.333 23.172 22.909 22.561 22.212 21.827 21.404 20.962 20.591 20.237 19.886 19.538 19.214 18.926 18.607 18.29 17.997 17.684 17.355 17.096 16.817 16.504 16.257 16.003 15.737 15.466 15.196 15.002 14.785 14.44 14.194 13.934 13.806 13.542 13.254 12.94 12.778 12.371 12.28 12.086 11.88 11.448 11.211 10.945 10.647 10.307 9.903 9.389 8.311 -2 ,6032 ,TETRA ,17602935,Sun Nov 28 16:26:38 CET,Sun Nov 28 18:13:13 CET,0.0 0.758 1.279 1.671 1.993 2.304 2.576 2.817 3.279 3.49 3.688 3.817 4.26 4.435 4.761 5.077 5.386 5.525 5.78 6.025 6.381 6.611 6.836 7.169 7.495 7.811 8.108 8.404 8.774 9.118 9.458 9.857 10.24 10.627 11.052 11.508 11.957 12.443 12.955 13.486 14.012 14.585 15.28 15.933 16.622 17.425 18.327 19.275 20.291 21.343 22.36 22.872 22.924 22.711 22.4 22.095 21.774 21.439 21.135 20.741 20.339 19.971 19.632 19.312 18.964 18.622 18.267 17.935 17.638 17.339 17.021 16.742 16.452 16.148 15.898 15.633 15.373 15.102 14.81 14.607 14.395 14.056 13.827 13.587 13.461 13.195 12.896 12.569 12.395 11.981 11.882 11.698 11.494 11.041 10.799 10.527 10.214 9.858 9.439 8.937 7.875 -3 ,30914 ,TETRA ,17602936,Sun Nov 28 16:26:40 CET,Sun Nov 28 18:13:24 CET,0.0 0.981 1.465 1.828 2.158 2.452 2.708 2.956 3.403 3.603 3.805 3.941 4.377 4.542 4.859 5.159 5.442 5.582 5.849 6.103 6.477 6.713 6.941 7.263 7.563 7.863 8.152 8.43 8.806 9.167 9.501 9.885 10.252 10.617 11.038 11.502 11.927 12.401 12.911 13.413 13.947 14.53 15.182 15.843 16.603 17.397 18.244 19.153 20.173 21.236 22.305 22.885 22.974 22.854 22.642 22.344 21.955 21.546 21.18 20.833 20.525 20.198 19.862 19.52 19.179 18.849 18.511 18.213 17.949 17.654 17.308 17.022 16.744 16.441 16.183 15.928 15.663 15.383 15.092 14.889 14.678 14.335 14.09 13.841 13.71 13.421 13.133 12.849 12.695 12.283 12.164 11.97 11.769 11.327 11.084 10.815 10.528 10.204 9.808 9.302 8.302 -4 ,30945 ,TETRA ,17602937,Sun Nov 28 16:26:38 CET,Sun Nov 28 18:13:35 CET,0.0 0.905 1.358 1.716 2.021 2.281 2.53 2.771 3.219 3.417 3.604 3.724 4.162 4.329 4.651 4.964 5.26 5.401 5.672 5.931 6.298 6.534 6.764 7.096 7.415 7.727 8.024 8.296 8.647 8.983 9.28 9.657 10.046 10.416 10.841 11.3 11.729 12.187 12.681 13.219 13.768 14.363 15.045 15.744 16.546 17.36 18.259 19.241 20.234 21.287 22.451 23.132 23.247 23.11 22.826 22.479 22.15 21.826 21.513 21.142 20.774 20.41 20.035 19.672 19.298 18.946 18.617 18.309 18.03 17.741 17.413 17.137 16.857 16.552 16.308 16.058 15.789 15.519 15.257 15.062 14.849 14.511 14.273 14.023 13.896 13.619 13.317 12.989 12.814 12.391 12.264 12.073 11.871 11.453 11.224 10.957 10.668 10.324 9.946 9.503 8.669 -5 ,18906 ,TETRA ,17602938,Sun Nov 28 16:27:31 CET,Sun Nov 28 18:14:09 CET,0.0 0.905 1.361 1.713 2.032 2.326 2.584 2.815 3.245 3.455 3.664 3.792 4.227 4.401 4.741 5.061 5.35 5.494 5.774 6.03 6.414 6.669 6.922 7.281 7.611 7.931 8.242 8.536 8.899 9.241 9.574 9.978 10.355 10.71 11.106 11.523 11.945 12.434 12.943 13.479 14.025 14.621 15.319 15.985 16.705 17.489 18.345 19.281 20.326 21.396 22.491 23.099 23.24 23.112 22.856 22.558 22.192 21.826 21.477 21.064 20.656 20.267 19.902 19.551 19.216 18.882 18.534 18.24 17.971 17.658 17.31 17.017 16.713 16.384 16.132 15.883 15.624 15.354 15.064 14.868 14.661 14.318 14.077 13.822 13.69 13.419 13.129 12.816 12.65 12.239 12.143 11.962 11.763 11.319 11.073 10.813 10.519 10.173 9.794 9.308 8.293 -6 ,11638 ,TETRA ,17602939,Sun Nov 28 16:27:29 CET,Sun Nov 28 18:14:07 CET,0.0 0.823 1.31 1.69 2.005 2.283 2.542 2.786 3.26 3.496 3.714 3.861 4.303 4.481 4.809 5.116 5.412 5.553 5.827 6.086 6.466 6.724 6.963 7.287 7.593 7.892 8.188 8.481 8.862 9.219 9.566 9.963 10.306 10.64 11.03 11.478 11.921 12.406 12.912 13.444 13.982 14.576 15.23 15.853 16.591 17.366 18.224 19.191 20.288 21.455 22.592 23.189 23.28 23.169 22.965 22.67 22.304 21.91 21.519 21.108 20.759 20.385 20.01 19.66 19.305 18.977 18.622 18.279 17.964 17.621 17.267 16.987 16.698 16.392 16.16 15.927 15.671 15.387 15.081 14.859 14.632 14.284 14.048 13.818 13.693 13.417 13.121 12.812 12.657 12.247 12.131 11.936 11.734 11.299 11.066 10.814 10.531 10.223 9.856 9.382 8.401 -7 ,15403 ,TETRA ,17602940,Sun Nov 28 16:27:30 CET,Sun Nov 28 18:17:16 CET,0.0 0.683 1.107 1.511 1.858 2.147 2.41 2.661 3.125 3.34 3.547 3.671 4.095 4.26 4.588 4.901 5.2 5.344 5.625 5.889 6.27 6.5 6.718 7.063 7.405 7.717 8.018 8.307 8.657 8.99 9.321 9.73 10.131 10.513 10.92 11.353 11.776 12.259 12.743 13.234 13.778 14.389 15.074 15.718 16.439 17.227 18.107 19.087 20.116 21.189 22.31 22.862 22.926 22.818 22.565 22.215 21.843 21.445 21.056 20.64 20.262 19.884 19.482 19.106 18.775 18.457 18.095 17.759 17.46 17.163 16.846 16.557 16.249 15.922 15.67 15.429 15.181 14.915 14.629 14.421 14.211 13.853 13.591 13.336 13.21 12.939 12.656 12.376 12.223 11.809 11.689 11.494 11.293 10.869 10.629 10.37 10.079 9.749 9.342 8.815 7.742 -8 ,31775 ,TETRA ,17602941,Sun Nov 28 16:27:30 CET,Sun Nov 28 18:13:53 CET,0.0 0.708 1.2 1.592 1.907 2.175 2.443 2.694 3.143 3.352 3.561 3.701 4.126 4.284 4.607 4.921 5.213 5.355 5.632 5.889 6.259 6.499 6.731 7.062 7.377 7.684 7.981 8.274 8.655 9.023 9.365 9.769 10.155 10.537 10.985 11.485 11.945 12.421 12.919 13.44 13.996 14.61 15.296 15.961 16.731 17.545 18.401 19.339 20.361 21.408 22.48 23.125 23.306 23.225 22.989 22.686 22.346 21.928 21.546 21.175 20.823 20.497 20.164 19.829 19.49 19.146 18.766 18.433 18.15 17.858 17.553 17.284 16.993 16.692 16.451 16.182 15.901 15.618 15.323 15.115 14.907 14.575 14.338 14.085 13.949 13.667 13.376 13.062 12.897 12.486 12.379 12.187 11.978 11.516 11.272 11.018 10.724 10.392 10.006 9.489 8.514 -9 ,17478 ,TETRA ,17602942,Sun Nov 28 16:27:33 CET,Sun Nov 28 18:14:08 CET,0.0 0.88 1.347 1.729 2.059 2.344 2.602 2.858 3.317 3.529 3.736 3.844 4.268 4.43 4.731 5.037 5.344 5.487 5.763 6.037 6.423 6.666 6.903 7.239 7.559 7.864 8.165 8.452 8.809 9.152 9.487 9.882 10.255 10.612 11.031 11.51 11.958 12.424 12.91 13.41 13.93 14.514 15.212 15.882 16.628 17.459 18.38 19.334 20.324 21.38 22.434 23.028 23.135 23.015 22.744 22.4 22.062 21.716 21.391 21.002 20.606 20.23 19.86 19.507 19.17 18.863 18.542 18.234 17.947 17.644 17.333 17.059 16.763 16.462 16.226 15.966 15.696 15.422 15.131 14.922 14.702 14.365 14.121 13.853 13.717 13.437 13.14 12.824 12.655 12.239 12.13 11.943 11.747 11.32 11.076 10.8 10.512 10.174 9.752 9.281 8.154 -10 ,23549 ,TETRA ,17602943,Sun Nov 28 16:27:35 CET,Sun Nov 28 18:13:31 CET,0.0 0.978 1.445 1.803 2.129 2.434 2.706 2.954 3.384 3.58 3.779 3.915 4.352 4.533 4.864 5.169 5.458 5.599 5.879 6.146 6.526 6.772 7.011 7.344 7.659 7.965 8.263 8.55 8.927 9.3 9.643 10.03 10.383 10.735 11.162 11.658 12.126 12.603 13.112 13.632 14.138 14.723 15.423 16.112 16.892 17.711 18.595 19.55 20.62 21.724 22.817 23.443 23.514 23.352 23.094 22.785 22.436 22.092 21.758 21.332 20.976 20.664 20.303 19.928 19.573 19.237 18.876 18.524 18.219 17.92 17.589 17.312 17.029 16.726 16.479 16.21 15.936 15.656 15.363 15.168 14.964 14.639 14.402 14.148 14.02 13.755 13.468 13.156 12.994 12.58 12.476 12.288 12.077 11.598 11.347 11.096 10.812 10.482 10.067 9.508 8.448 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt deleted file mode 100644 index 4f37f290..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6555 ,TETRA ,17602944,Sun Nov 28 16:27:31 CET,Sun Nov 28 18:14:18 CET,0.0 1.114 1.677 2.116 2.483 2.824 3.124 3.396 3.881 4.108 4.326 4.477 4.919 5.101 5.451 5.775 6.084 6.231 6.518 6.801 7.206 7.465 7.713 8.062 8.403 8.722 9.023 9.302 9.639 9.979 10.309 10.693 11.047 11.376 11.739 12.131 12.516 12.956 13.423 13.91 14.404 14.922 15.504 16.042 16.579 17.149 17.84 18.53 19.101 19.516 19.72 19.523 19.052 18.468 17.809 17.135 16.496 15.872 15.274 14.653 14.152 13.678 13.209 12.766 12.366 11.997 11.579 11.202 10.856 10.495 10.122 9.791 9.447 9.098 8.834 8.556 8.261 7.957 7.646 7.432 7.195 6.811 6.548 6.272 6.131 5.848 5.536 5.194 5.021 4.587 4.45 4.252 4.05 3.607 3.37 3.101 2.795 2.468 2.074 1.589 0.567 -2 ,32736 ,TETRA ,17602945,Sun Nov 28 16:27:33 CET,Sun Nov 28 18:14:25 CET,0.0 1.203 1.785 2.249 2.655 2.995 3.301 3.577 4.063 4.281 4.49 4.652 5.1 5.282 5.627 5.953 6.259 6.4 6.668 6.942 7.337 7.581 7.82 8.161 8.473 8.773 9.085 9.386 9.761 10.105 10.414 10.802 11.182 11.524 11.891 12.313 12.727 13.15 13.598 14.075 14.564 15.074 15.632 16.148 16.693 17.296 17.943 18.564 19.138 19.626 19.89 19.644 19.117 18.494 17.861 17.266 16.672 16.035 15.48 14.92 14.381 13.886 13.428 12.996 12.608 12.236 11.812 11.426 11.068 10.691 10.333 10.03 9.698 9.347 9.074 8.792 8.502 8.205 7.898 7.673 7.434 7.078 6.831 6.569 6.431 6.144 5.847 5.532 5.364 4.937 4.817 4.623 4.417 3.963 3.708 3.427 3.113 2.763 2.365 1.903 1.127 -3 ,26165 ,TETRA ,17602946,Sun Nov 28 16:27:31 CET,Sun Nov 28 18:13:53 CET,0.0 1.164 1.787 2.237 2.605 2.934 3.23 3.509 4.005 4.231 4.457 4.624 5.071 5.245 5.576 5.885 6.186 6.334 6.617 6.888 7.28 7.527 7.767 8.111 8.434 8.741 9.037 9.32 9.68 10.042 10.387 10.784 11.16 11.513 11.894 12.324 12.755 13.193 13.637 14.111 14.608 15.132 15.725 16.295 16.891 17.494 18.124 18.723 19.281 19.803 20.069 19.765 19.22 18.6 17.977 17.36 16.802 16.259 15.729 15.129 14.602 14.16 13.694 13.212 12.779 12.395 12.003 11.632 11.293 10.947 10.606 10.304 9.957 9.589 9.307 9.02 8.726 8.408 8.063 7.818 7.568 7.211 6.967 6.698 6.562 6.278 5.973 5.644 5.475 5.054 4.944 4.751 4.547 4.096 3.86 3.601 3.312 2.985 2.607 2.114 1.087 -4 ,18143 ,TETRA ,17602947,Sun Nov 28 16:27:32 CET,Sun Nov 28 18:13:53 CET,0.0 1.34 1.886 2.274 2.646 3.025 3.343 3.6 4.057 4.276 4.488 4.629 5.07 5.253 5.6 5.917 6.222 6.374 6.653 6.916 7.296 7.534 7.772 8.109 8.427 8.722 8.995 9.267 9.634 9.974 10.286 10.699 11.104 11.463 11.851 12.266 12.67 13.1 13.527 13.976 14.455 14.965 15.523 16.05 16.618 17.201 17.84 18.459 19.028 19.509 19.732 19.436 18.909 18.295 17.686 17.084 16.511 15.979 15.481 14.948 14.445 14.018 13.608 13.182 12.783 12.38 11.963 11.596 11.255 10.919 10.599 10.318 10.003 9.651 9.376 9.1 8.82 8.523 8.193 7.956 7.714 7.333 7.072 6.818 6.679 6.372 6.064 5.747 5.579 5.153 5.026 4.823 4.607 4.147 3.89 3.606 3.292 2.949 2.565 2.089 1.293 -5 ,13740 ,TETRA ,17602948,Sun Nov 28 16:27:31 CET,Sun Nov 28 18:14:53 CET,0.0 1.05 1.557 1.991 2.355 2.65 2.922 3.177 3.627 3.847 4.069 4.209 4.656 4.851 5.218 5.549 5.859 6.011 6.315 6.6 6.988 7.233 7.466 7.795 8.124 8.444 8.731 9.003 9.349 9.684 10.003 10.378 10.75 11.114 11.517 11.969 12.401 12.848 13.316 13.782 14.268 14.827 15.427 15.963 16.552 17.145 17.761 18.436 19.051 19.563 19.851 19.541 18.933 18.288 17.651 17.017 16.401 15.804 15.3 14.76 14.297 13.88 13.422 12.971 12.555 12.135 11.684 11.298 10.962 10.621 10.27 9.948 9.598 9.261 9.016 8.764 8.479 8.172 7.859 7.648 7.438 7.08 6.816 6.547 6.415 6.133 5.811 5.475 5.307 4.883 4.762 4.563 4.358 3.901 3.641 3.36 3.067 2.743 2.363 1.887 0.853 -6 ,28462 ,TETRA ,17602949,Sun Nov 28 16:27:36 CET,Sun Nov 28 18:15:22 CET,0.0 1.001 1.618 2.099 2.492 2.838 3.15 3.437 3.938 4.159 4.371 4.51 4.953 5.132 5.474 5.791 6.086 6.234 6.518 6.776 7.157 7.412 7.649 7.971 8.29 8.594 8.886 9.174 9.531 9.865 10.191 10.589 10.956 11.306 11.72 12.188 12.633 13.1 13.54 13.979 14.472 15.015 15.614 16.194 16.812 17.421 18.019 18.633 19.263 19.786 20.025 19.68 19.057 18.375 17.685 16.982 16.334 15.742 15.193 14.613 14.102 13.628 13.167 12.739 12.34 11.966 11.573 11.203 10.862 10.501 10.112 9.791 9.462 9.118 8.849 8.567 8.288 7.993 7.671 7.443 7.208 6.849 6.588 6.313 6.176 5.892 5.586 5.265 5.094 4.651 4.518 4.317 4.101 3.645 3.407 3.151 2.839 2.468 2.053 1.561 0.766 -7 ,5419 ,TETRA ,17602950,Sun Nov 28 16:27:31 CET,Sun Nov 28 18:14:51 CET,0.0 1.136 1.662 2.08 2.443 2.761 3.06 3.339 3.825 4.047 4.261 4.406 4.849 5.036 5.393 5.713 6.019 6.167 6.454 6.733 7.122 7.378 7.64 8.005 8.328 8.64 8.938 9.228 9.61 9.972 10.314 10.711 11.08 11.424 11.827 12.291 12.716 13.149 13.623 14.129 14.646 15.175 15.703 16.241 16.815 17.391 18.022 18.616 19.174 19.694 19.978 19.69 19.199 18.621 17.981 17.292 16.67 16.115 15.593 15.027 14.54 14.124 13.682 13.215 12.782 12.397 11.989 11.625 11.304 10.943 10.546 10.223 9.894 9.538 9.262 8.983 8.708 8.427 8.108 7.886 7.673 7.333 7.08 6.805 6.668 6.388 6.088 5.768 5.6 5.174 5.051 4.852 4.649 4.187 3.926 3.655 3.353 3.013 2.619 2.128 1.178 -8 ,31758 ,TETRA ,17602951,Sun Nov 28 16:27:31 CET,Sun Nov 28 18:15:30 CET,0.0 0.97 1.542 1.968 2.329 2.647 2.938 3.233 3.762 3.982 4.187 4.322 4.763 4.94 5.28 5.605 5.914 6.066 6.354 6.633 7.028 7.276 7.517 7.853 8.174 8.483 8.771 9.048 9.402 9.739 10.083 10.5 10.875 11.221 11.613 12.046 12.45 12.872 13.319 13.776 14.233 14.72 15.254 15.785 16.416 17.061 17.709 18.363 19.036 19.651 19.961 19.691 19.12 18.493 17.89 17.283 16.702 16.121 15.603 15.059 14.554 14.082 13.641 13.214 12.793 12.386 11.962 11.609 11.297 10.97 10.618 10.302 9.964 9.605 9.33 9.05 8.761 8.46 8.135 7.912 7.691 7.331 7.072 6.803 6.665 6.38 6.078 5.768 5.607 5.183 5.072 4.879 4.679 4.238 3.982 3.714 3.427 3.102 2.733 2.276 1.495 -9 ,1842 ,TETRA ,17602952,Sun Nov 28 16:27:32 CET,Sun Nov 28 18:13:15 CET,0.0 1.317 1.862 2.262 2.629 2.953 3.25 3.532 4.018 4.244 4.46 4.606 5.052 5.231 5.579 5.908 6.218 6.375 6.669 6.942 7.337 7.587 7.83 8.173 8.489 8.793 9.099 9.391 9.749 10.088 10.413 10.791 11.148 11.483 11.878 12.329 12.74 13.178 13.649 14.135 14.599 15.092 15.664 16.227 16.84 17.455 18.06 18.668 19.292 19.817 20.03 19.707 19.182 18.548 17.88 17.252 16.695 16.161 15.659 15.12 14.622 14.152 13.722 13.288 12.842 12.452 12.029 11.635 11.288 10.912 10.524 10.207 9.865 9.502 9.221 8.932 8.639 8.333 8.007 7.777 7.542 7.188 6.944 6.684 6.55 6.27 5.963 5.636 5.462 5.027 4.901 4.698 4.495 4.061 3.818 3.558 3.256 2.906 2.5 1.991 1.069 -10 ,17559 ,TETRA ,17602953,Sun Nov 28 16:27:32 CET,Sun Nov 28 18:14:43 CET,0.0 1.198 1.716 2.144 2.517 2.84 3.138 3.429 3.938 4.158 4.372 4.517 4.958 5.142 5.516 5.855 6.148 6.291 6.576 6.844 7.221 7.46 7.693 8.029 8.352 8.666 8.953 9.217 9.555 9.87 10.184 10.556 10.913 11.281 11.696 12.157 12.582 13.006 13.444 13.902 14.378 14.889 15.478 16.052 16.646 17.267 17.939 18.594 19.22 19.799 20.071 19.729 19.158 18.553 17.948 17.338 16.73 16.139 15.589 14.995 14.478 14.006 13.534 13.064 12.625 12.234 11.802 11.399 11.05 10.698 10.324 10.0 9.675 9.331 9.061 8.786 8.497 8.194 7.875 7.646 7.411 7.052 6.787 6.505 6.366 6.089 5.789 5.464 5.301 4.883 4.794 4.612 4.419 3.995 3.749 3.481 3.192 2.848 2.437 1.929 1.055 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index b32e0f18..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15645 ,TETRA ,17602954,Sun Nov 28 16:27:33 CET,Sun Nov 28 18:14:06 CET,0.0 0.805 1.232 1.586 1.906 2.201 2.483 2.756 3.26 3.488 3.698 3.826 4.281 4.466 4.824 5.155 5.46 5.614 5.917 6.188 6.569 6.817 7.06 7.42 7.765 8.08 8.395 8.719 9.121 9.5 9.867 10.324 10.759 11.147 11.61 12.158 12.68 13.224 13.797 14.418 15.072 15.819 16.685 17.531 18.5 19.527 20.669 21.984 23.491 25.149 26.963 28.279 28.955 29.284 29.389 29.353 29.189 28.901 28.635 28.35 28.052 27.778 27.506 27.206 26.902 26.622 26.334 26.072 25.803 25.498 25.168 24.887 24.607 24.31 24.063 23.791 23.517 23.239 22.952 22.759 22.543 22.169 21.914 21.665 21.535 21.264 20.966 20.645 20.475 20.062 19.943 19.74 19.53 19.058 18.773 18.465 18.141 17.789 17.353 16.758 15.508 -3 ,3701 ,TETRA ,17602956,Sun Nov 28 16:27:33 CET,Sun Nov 28 18:14:38 CET,0.0 0.942 1.429 1.821 2.165 2.471 2.75 3.014 3.494 3.721 3.94 4.079 4.545 4.739 5.097 5.422 5.741 5.897 6.184 6.464 6.876 7.129 7.368 7.709 8.045 8.382 8.71 9.031 9.45 9.846 10.224 10.685 11.117 11.531 11.979 12.49 13.005 13.56 14.159 14.792 15.431 16.117 16.92 17.726 18.651 19.692 20.882 22.14 23.566 25.214 27.148 28.555 29.186 29.514 29.629 29.606 29.492 29.25 28.973 28.651 28.309 28.005 27.694 27.374 27.087 26.811 26.503 26.209 25.939 25.661 25.376 25.128 24.832 24.521 24.296 24.063 23.804 23.529 23.229 23.005 22.778 22.432 22.188 21.919 21.777 21.493 21.21 20.902 20.728 20.296 20.142 19.934 19.722 19.253 18.997 18.712 18.384 17.994 17.519 16.94 15.708 -4 ,23567 ,TETRA ,17602957,Sun Nov 28 16:27:33 CET,Sun Nov 28 18:15:59 CET,0.0 0.986 1.475 1.882 2.216 2.522 2.81 3.067 3.511 3.721 3.926 4.039 4.489 4.676 5.037 5.373 5.693 5.846 6.125 6.397 6.808 7.076 7.331 7.698 8.054 8.39 8.713 9.025 9.416 9.8 10.179 10.633 11.073 11.513 12.009 12.55 13.075 13.608 14.151 14.728 15.344 16.047 16.858 17.678 18.595 19.593 20.781 22.113 23.629 25.302 27.216 28.614 29.307 29.589 29.615 29.491 29.288 29.065 28.815 28.502 28.214 27.944 27.654 27.357 27.057 26.782 26.477 26.164 25.877 25.575 25.276 25.017 24.733 24.425 24.169 23.905 23.625 23.341 23.052 22.836 22.609 22.283 22.058 21.8 21.668 21.404 21.111 20.786 20.615 20.195 20.071 19.872 19.669 19.222 18.974 18.703 18.398 18.044 17.614 17.064 15.751 -5 ,31102 ,TETRA ,17602958,Sun Nov 28 16:27:33 CET,Sun Nov 28 18:15:25 CET,0.0 0.976 1.442 1.817 2.15 2.46 2.749 3.019 3.492 3.711 3.921 4.033 4.483 4.67 5.026 5.373 5.703 5.855 6.15 6.434 6.838 7.106 7.375 7.75 8.096 8.431 8.741 9.036 9.439 9.844 10.226 10.678 11.114 11.528 12.0 12.538 13.053 13.622 14.226 14.818 15.408 16.092 16.964 17.856 18.843 19.897 21.073 22.35 23.766 25.433 27.332 28.677 29.25 29.508 29.605 29.512 29.327 29.08 28.83 28.564 28.283 28.014 27.755 27.494 27.229 26.965 26.67 26.385 26.118 25.825 25.509 25.226 24.905 24.575 24.337 24.095 23.834 23.553 23.258 23.047 22.825 22.467 22.215 21.963 21.823 21.521 21.216 20.906 20.744 20.324 20.181 19.972 19.767 19.316 19.054 18.762 18.429 18.067 17.651 17.073 15.26 -6 ,15931 ,TETRA ,17602959,Sun Nov 28 16:27:33 CET,Sun Nov 28 18:14:54 CET,0.0 1.002 1.534 1.933 2.273 2.574 2.861 3.147 3.673 3.899 4.107 4.224 4.68 4.863 5.204 5.527 5.847 6.009 6.316 6.607 7.027 7.296 7.548 7.905 8.263 8.613 8.938 9.235 9.624 10.015 10.407 10.884 11.323 11.743 12.222 12.762 13.279 13.815 14.4 15.006 15.645 16.375 17.17 17.923 18.788 19.752 20.877 22.15 23.63 25.317 27.206 28.63 29.276 29.53 29.564 29.452 29.252 29.017 28.756 28.416 28.137 27.912 27.662 27.368 27.064 26.786 26.51 26.262 26.023 25.745 25.427 25.161 24.876 24.586 24.372 24.132 23.875 23.605 23.303 23.084 22.853 22.52 22.299 22.057 21.923 21.62 21.273 20.919 20.751 20.332 20.196 19.987 19.77 19.308 19.041 18.755 18.437 18.067 17.619 17.037 15.417 -7 ,5496 ,TETRA ,17602960,Sun Nov 28 16:27:32 CET,Sun Nov 28 18:14:48 CET,0.0 0.877 1.353 1.716 2.052 2.35 2.613 2.853 3.305 3.517 3.72 3.857 4.309 4.493 4.853 5.185 5.504 5.653 5.939 6.206 6.579 6.827 7.076 7.424 7.759 8.1 8.437 8.76 9.172 9.575 9.947 10.395 10.845 11.281 11.751 12.26 12.773 13.349 13.975 14.613 15.262 15.986 16.815 17.629 18.595 19.649 20.807 22.081 23.512 25.147 27.045 28.467 29.128 29.361 29.378 29.304 29.148 28.943 28.717 28.422 28.114 27.815 27.511 27.2 26.909 26.648 26.369 26.111 25.854 25.552 25.231 24.97 24.698 24.403 24.169 23.928 23.679 23.408 23.11 22.901 22.684 22.329 22.075 21.817 21.677 21.361 21.04 20.709 20.526 20.104 19.985 19.784 19.571 19.086 18.82 18.555 18.267 17.911 17.439 16.868 15.649 -8 ,18378 ,TETRA ,17602961,Sun Nov 28 16:27:33 CET,Sun Nov 28 18:14:32 CET,0.0 0.927 1.431 1.802 2.127 2.437 2.722 2.986 3.457 3.668 3.876 4.015 4.471 4.646 4.99 5.323 5.65 5.808 6.105 6.388 6.797 7.056 7.307 7.664 8.009 8.356 8.69 9.014 9.418 9.794 10.164 10.594 10.999 11.398 11.871 12.41 12.92 13.455 14.008 14.635 15.327 16.077 16.925 17.72 18.6 19.591 20.718 22.001 23.473 25.129 26.988 28.31 28.996 29.328 29.437 29.415 29.24 28.953 28.648 28.316 27.996 27.669 27.326 26.991 26.662 26.348 26.007 25.706 25.443 25.142 24.799 24.517 24.218 23.894 23.653 23.413 23.162 22.896 22.6 22.388 22.172 21.825 21.572 21.31 21.181 20.898 20.586 20.254 20.081 19.657 19.5 19.292 19.077 18.607 18.347 18.035 17.688 17.294 16.836 16.254 15.262 -9 ,23041 ,TETRA ,17602962,Sun Nov 28 16:27:33 CET,Sun Nov 28 18:14:40 CET,0.0 0.79 1.252 1.63 1.962 2.282 2.574 2.827 3.301 3.519 3.731 3.871 4.317 4.483 4.811 5.132 5.442 5.593 5.887 6.164 6.554 6.805 7.06 7.438 7.793 8.122 8.439 8.76 9.166 9.556 9.95 10.425 10.871 11.303 11.805 12.362 12.888 13.448 14.063 14.705 15.348 16.047 16.85 17.667 18.617 19.669 20.826 22.066 23.525 25.243 27.244 28.638 29.236 29.475 29.473 29.368 29.221 28.977 28.707 28.446 28.179 27.913 27.66 27.367 27.055 26.779 26.472 26.157 25.878 25.594 25.277 25.023 24.76 24.464 24.227 23.966 23.692 23.417 23.115 22.902 22.688 22.341 22.086 21.825 21.689 21.401 21.087 20.746 20.569 20.149 20.033 19.833 19.626 19.185 18.93 18.644 18.327 17.96 17.541 16.964 15.708 -10 ,20986 ,TETRA ,17602963,Sun Nov 28 16:27:34 CET,Sun Nov 28 18:15:58 CET,0.0 0.767 1.258 1.683 2.037 2.34 2.609 2.852 3.313 3.541 3.761 3.902 4.36 4.539 4.882 5.206 5.508 5.665 5.971 6.255 6.674 6.951 7.212 7.565 7.904 8.236 8.56 8.887 9.313 9.709 10.08 10.513 10.93 11.346 11.828 12.362 12.865 13.406 13.997 14.604 15.216 15.936 16.766 17.556 18.469 19.507 20.705 21.965 23.371 25.053 26.988 28.381 29.027 29.316 29.432 29.401 29.249 29.042 28.856 28.623 28.335 28.046 27.759 27.449 27.135 26.84 26.497 26.181 25.903 25.614 25.307 25.029 24.737 24.439 24.196 23.931 23.663 23.394 23.106 22.908 22.697 22.342 22.101 21.85 21.714 21.43 21.123 20.792 20.617 20.194 20.075 19.874 19.657 19.164 18.89 18.602 18.282 17.927 17.491 16.937 15.651 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt deleted file mode 100644 index 959c511f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15118 ,TETRA ,17602964,Sun Nov 28 16:27:36 CET,Sun Nov 28 18:16:52 CET,0.0 0.761 1.187 1.545 1.871 2.146 2.395 2.637 3.088 3.287 3.479 3.584 4.026 4.199 4.529 4.859 5.164 5.297 5.547 5.802 6.183 6.42 6.653 6.987 7.307 7.621 7.926 8.213 8.567 8.9 9.213 9.582 9.949 10.31 10.726 11.211 11.661 12.129 12.636 13.154 13.704 14.311 15.001 15.712 16.513 17.352 18.28 19.227 20.197 21.26 22.29 22.76 22.774 22.623 22.38 22.034 21.655 21.274 20.892 20.486 20.116 19.764 19.417 19.094 18.782 18.466 18.111 17.79 17.527 17.225 16.871 16.579 16.269 15.946 15.693 15.426 15.142 14.858 14.581 14.381 14.165 13.806 13.554 13.302 13.161 12.859 12.546 12.232 12.072 11.641 11.52 11.332 11.131 10.681 10.433 10.157 9.855 9.519 9.124 8.631 7.435 -2 ,16672 ,TETRA ,17602965,Sun Nov 28 16:27:33 CET,Sun Nov 28 18:17:52 CET,0.0 0.879 1.349 1.704 2.017 2.318 2.589 2.832 3.271 3.473 3.668 3.779 4.233 4.408 4.736 5.047 5.337 5.476 5.756 6.028 6.408 6.649 6.891 7.232 7.542 7.843 8.134 8.429 8.809 9.143 9.476 9.881 10.247 10.604 11.027 11.495 11.935 12.408 12.881 13.343 13.819 14.361 15.019 15.693 16.438 17.231 18.097 19.024 20.032 21.081 22.161 22.684 22.721 22.585 22.338 22.004 21.674 21.333 20.974 20.547 20.117 19.726 19.353 18.987 18.634 18.283 17.892 17.552 17.254 16.944 16.62 16.34 16.031 15.702 15.464 15.221 14.964 14.689 14.384 14.166 13.952 13.62 13.378 13.127 12.995 12.715 12.426 12.112 11.944 11.514 11.397 11.203 10.997 10.55 10.315 10.038 9.723 9.387 8.998 8.511 7.462 -3 ,25919 ,TETRA ,17602966,Sun Nov 28 16:27:52 CET,Sun Nov 28 18:18:36 CET,0.0 0.751 1.197 1.554 1.88 2.172 2.431 2.681 3.108 3.3 3.494 3.605 4.051 4.226 4.57 4.884 5.171 5.31 5.576 5.83 6.192 6.427 6.654 6.982 7.306 7.626 7.927 8.22 8.595 8.958 9.319 9.728 10.105 10.454 10.837 11.258 11.69 12.176 12.679 13.207 13.741 14.33 15.011 15.675 16.393 17.161 18.011 18.923 19.926 20.954 21.989 22.551 22.677 22.573 22.296 21.955 21.615 21.233 20.856 20.464 20.097 19.737 19.354 18.965 18.591 18.267 17.924 17.594 17.308 17.0 16.651 16.344 16.048 15.761 15.53 15.278 15.02 14.74 14.409 14.181 13.957 13.599 13.345 13.075 12.933 12.642 12.34 12.021 11.851 11.418 11.303 11.107 10.908 10.475 10.237 9.979 9.674 9.339 8.965 8.492 7.534 -4 ,27382 ,TETRA ,17602967,Sun Nov 28 16:27:33 CET,Sun Nov 28 18:16:18 CET,0.0 1.018 1.467 1.821 2.129 2.401 2.649 2.877 3.316 3.522 3.712 3.807 4.252 4.42 4.724 5.009 5.293 5.432 5.698 5.961 6.338 6.569 6.797 7.124 7.446 7.768 8.067 8.338 8.701 9.073 9.412 9.785 10.151 10.512 10.927 11.384 11.833 12.326 12.821 13.332 13.82 14.337 14.987 15.625 16.34 17.146 18.021 18.95 19.914 20.904 21.892 22.36 22.361 22.15 21.837 21.486 21.101 20.689 20.286 19.854 19.446 19.043 18.654 18.314 17.985 17.639 17.267 16.931 16.633 16.311 15.961 15.67 15.366 15.05 14.809 14.562 14.299 14.015 13.725 13.521 13.294 12.942 12.699 12.444 12.308 12.025 11.736 11.411 11.24 10.808 10.683 10.491 10.298 9.863 9.619 9.355 9.067 8.758 8.378 7.912 7.213 -5 ,3155 ,TETRA ,17602968,Sun Nov 28 16:28:08 CET,Sun Nov 28 18:16:51 CET,0.0 0.729 1.161 1.496 1.788 2.064 2.326 2.576 3.032 3.241 3.432 3.521 3.965 4.134 4.449 4.748 5.038 5.185 5.479 5.758 6.149 6.406 6.655 7.002 7.315 7.605 7.899 8.182 8.522 8.847 9.165 9.558 9.937 10.313 10.742 11.183 11.602 12.047 12.499 12.996 13.528 14.134 14.804 15.43 16.137 16.907 17.792 18.718 19.726 20.8 21.77 22.212 22.209 21.949 21.592 21.193 20.791 20.373 19.993 19.644 19.331 18.998 18.611 18.235 17.91 17.592 17.226 16.917 16.644 16.337 15.992 15.697 15.406 15.114 14.884 14.623 14.342 14.053 13.756 13.552 13.333 12.976 12.74 12.507 12.38 12.103 11.805 11.484 11.317 10.885 10.761 10.559 10.355 9.931 9.699 9.449 9.152 8.79 8.402 7.918 6.922 -6 ,1156 ,TETRA ,17602969,Sun Nov 28 16:28:09 CET,Sun Nov 28 18:16:41 CET,0.0 0.899 1.375 1.72 2.01 2.285 2.546 2.8 3.251 3.446 3.639 3.753 4.194 4.368 4.7 4.992 5.267 5.406 5.681 5.942 6.306 6.536 6.767 7.105 7.419 7.728 8.018 8.278 8.624 8.951 9.258 9.632 10.01 10.372 10.773 11.227 11.663 12.129 12.621 13.139 13.66 14.229 14.896 15.53 16.238 17.011 17.879 18.806 19.769 20.745 21.749 22.273 22.24 21.977 21.645 21.285 20.894 20.505 20.171 19.779 19.386 19.01 18.628 18.256 17.902 17.558 17.193 16.871 16.582 16.293 15.984 15.711 15.416 15.124 14.899 14.64 14.362 14.062 13.751 13.54 13.316 12.948 12.705 12.469 12.337 12.05 11.76 11.458 11.296 10.866 10.757 10.558 10.345 9.904 9.653 9.381 9.089 8.756 8.36 7.885 6.911 -7 ,24497 ,TETRA ,17602970,Sun Nov 28 16:28:09 CET,Sun Nov 28 18:15:52 CET,0.0 0.963 1.424 1.797 2.12 2.404 2.671 2.931 3.395 3.605 3.802 3.905 4.346 4.514 4.835 5.144 5.439 5.574 5.834 6.087 6.454 6.687 6.912 7.255 7.585 7.875 8.145 8.43 8.803 9.141 9.447 9.824 10.208 10.582 11.016 11.456 11.859 12.318 12.781 13.248 13.736 14.282 14.926 15.542 16.213 16.992 17.914 18.891 19.891 20.913 21.887 22.343 22.387 22.253 21.983 21.633 21.216 20.778 20.394 19.962 19.535 19.156 18.776 18.376 17.992 17.658 17.303 16.984 16.699 16.377 16.028 15.742 15.46 15.169 14.915 14.629 14.355 14.08 13.784 13.584 13.37 13.019 12.769 12.505 12.37 12.081 11.79 11.48 11.309 10.883 10.765 10.564 10.357 9.892 9.648 9.383 9.094 8.773 8.399 8.012 7.131 -8 ,17196 ,TETRA ,17602971,Sun Nov 28 16:28:09 CET,Sun Nov 28 18:16:45 CET,0.0 0.755 1.181 1.546 1.873 2.17 2.442 2.695 3.137 3.342 3.544 3.652 4.089 4.257 4.575 4.886 5.186 5.325 5.608 5.884 6.268 6.508 6.735 7.072 7.394 7.7 7.992 8.268 8.628 8.982 9.32 9.744 10.147 10.514 10.924 11.373 11.79 12.233 12.75 13.3 13.817 14.382 15.038 15.653 16.385 17.195 18.036 18.921 19.864 20.872 21.908 22.437 22.46 22.27 21.982 21.613 21.18 20.696 20.297 19.903 19.517 19.131 18.738 18.346 17.964 17.624 17.268 16.921 16.605 16.285 15.923 15.597 15.268 14.953 14.721 14.469 14.195 13.907 13.597 13.383 13.162 12.814 12.569 12.307 12.176 11.919 11.626 11.32 11.166 10.742 10.646 10.459 10.257 9.817 9.576 9.311 9.005 8.656 8.256 7.734 6.822 -9 ,6975 ,TETRA ,17602972,Sun Nov 28 16:28:09 CET,Sun Nov 28 18:16:02 CET,0.0 0.742 1.163 1.538 1.868 2.159 2.432 2.68 3.118 3.325 3.519 3.626 4.072 4.242 4.566 4.875 5.187 5.338 5.621 5.895 6.274 6.503 6.73 7.064 7.378 7.692 8.005 8.304 8.681 9.053 9.402 9.797 10.163 10.52 10.945 11.42 11.847 12.292 12.795 13.328 13.86 14.435 15.091 15.773 16.522 17.25 18.104 19.024 20.042 21.151 22.146 22.636 22.647 22.479 22.188 21.805 21.413 20.993 20.616 20.214 19.825 19.438 19.039 18.657 18.296 17.971 17.605 17.25 16.936 16.619 16.282 15.991 15.71 15.43 15.198 14.942 14.672 14.375 14.051 13.822 13.589 13.235 12.987 12.731 12.599 12.319 12.023 11.708 11.551 11.125 10.991 10.79 10.587 10.144 9.898 9.633 9.337 8.989 8.598 8.11 7.027 -10 ,28893 ,TETRA ,17602973,Sun Nov 28 16:28:11 CET,Sun Nov 28 18:16:33 CET,0.0 0.697 1.147 1.511 1.812 2.099 2.368 2.605 3.033 3.243 3.442 3.548 3.988 4.159 4.487 4.787 5.076 5.219 5.497 5.772 6.167 6.413 6.658 6.995 7.306 7.616 7.93 8.229 8.599 8.948 9.265 9.66 10.038 10.392 10.8 11.247 11.685 12.167 12.672 13.189 13.696 14.273 14.961 15.618 16.378 17.198 18.097 19.029 19.99 21.039 22.047 22.533 22.544 22.331 22.012 21.678 21.347 20.942 20.513 20.055 19.659 19.267 18.861 18.485 18.122 17.759 17.365 17.019 16.703 16.374 16.044 15.754 15.447 15.143 14.899 14.635 14.363 14.065 13.747 13.532 13.302 12.943 12.694 12.426 12.29 12.004 11.706 11.401 11.235 10.803 10.677 10.479 10.269 9.822 9.592 9.335 9.03 8.68 8.274 7.798 7.012 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 2614f876..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2047 ,TETRA ,17602974,Sun Nov 28 16:28:10 CET,Sun Nov 28 18:14:19 CET,0.0 0.686 1.114 1.45 1.731 1.991 2.225 2.417 2.762 2.935 3.105 3.175 3.553 3.695 3.953 4.179 4.4 4.507 4.715 4.907 5.164 5.344 5.514 5.739 5.944 6.141 6.34 6.524 6.755 6.966 7.163 7.386 7.576 7.76 7.973 8.2 8.402 8.587 8.727 8.854 9.007 9.171 9.283 9.333 9.338 9.273 9.119 8.735 7.981 6.76 4.561 1.759 -0.593 -2.611 -4.268 -5.754 -7.105 -8.285 -9.302 -10.343 -11.244 -12.037 -12.779 -13.519 -14.213 -14.82 -15.466 -16.043 -16.534 -17.06 -17.625 -18.101 -18.583 -19.098 -19.49 -19.879 -20.289 -20.724 -21.176 -21.483 -21.797 -22.297 -22.658 -23.034 -23.228 -23.626 -24.066 -24.531 -24.767 -25.273 -25.509 -25.767 -26.043 -26.653 -27.018 -27.419 -27.834 -28.346 -28.926 -29.72 -32.77 -2 ,16833 ,TETRA ,17602975,Sun Nov 28 16:28:10 CET,Sun Nov 28 18:17:38 CET,0.0 0.83 1.284 1.662 1.945 2.186 2.411 2.624 2.99 3.16 3.33 3.404 3.797 3.942 4.191 4.419 4.64 4.746 4.945 5.135 5.403 5.575 5.739 5.953 6.147 6.34 6.538 6.73 6.956 7.165 7.359 7.586 7.803 7.991 8.179 8.385 8.587 8.771 8.933 9.089 9.227 9.336 9.428 9.496 9.538 9.528 9.382 8.999 8.261 7.034 4.772 1.942 -0.382 -2.393 -4.148 -5.699 -7.001 -8.195 -9.232 -10.225 -11.082 -11.865 -12.605 -13.287 -13.932 -14.558 -15.215 -15.784 -16.295 -16.816 -17.34 -17.808 -18.303 -18.815 -19.2 -19.588 -20.002 -20.44 -20.89 -21.193 -21.512 -22.026 -22.385 -22.748 -22.928 -23.295 -23.701 -24.145 -24.373 -24.879 -25.127 -25.392 -25.681 -26.334 -26.684 -27.062 -27.482 -27.973 -28.59 -29.444 -31.857 -3 ,29748 ,TETRA ,17602976,Sun Nov 28 16:28:10 CET,Sun Nov 28 18:14:29 CET,0.0 0.994 1.433 1.745 2.027 2.286 2.524 2.746 3.126 3.295 3.45 3.495 3.871 4.005 4.255 4.479 4.695 4.804 5.012 5.206 5.484 5.652 5.805 6.008 6.212 6.436 6.644 6.834 7.077 7.295 7.499 7.755 7.984 8.184 8.413 8.665 8.881 9.061 9.219 9.385 9.552 9.693 9.815 9.878 9.868 9.789 9.553 9.152 8.503 7.292 4.989 2.177 -0.137 -2.096 -3.782 -5.296 -6.548 -7.66 -8.691 -9.752 -10.669 -11.475 -12.206 -12.904 -13.566 -14.164 -14.828 -15.437 -15.965 -16.521 -17.086 -17.556 -18.05 -18.553 -18.943 -19.366 -19.797 -20.225 -20.695 -21.011 -21.322 -21.828 -22.18 -22.539 -22.723 -23.102 -23.504 -23.949 -24.186 -24.689 -24.933 -25.213 -25.512 -26.163 -26.505 -26.878 -27.298 -27.806 -28.453 -29.309 -31.832 -4 ,4562 ,TETRA ,17602977,Sun Nov 28 16:28:12 CET,Sun Nov 28 18:14:46 CET,0.0 1.017 1.419 1.743 2.04 2.294 2.503 2.688 3.044 3.217 3.382 3.449 3.837 3.981 4.249 4.498 4.721 4.823 5.02 5.212 5.489 5.652 5.795 6.017 6.229 6.432 6.625 6.801 7.014 7.218 7.415 7.64 7.861 8.065 8.266 8.458 8.636 8.838 9.051 9.268 9.443 9.552 9.628 9.681 9.681 9.568 9.34 8.952 8.251 7.018 4.794 2.029 -0.27 -2.217 -3.892 -5.371 -6.663 -7.84 -8.871 -9.924 -10.831 -11.62 -12.368 -13.114 -13.816 -14.446 -15.114 -15.722 -16.244 -16.759 -17.293 -17.735 -18.196 -18.709 -19.093 -19.487 -19.918 -20.368 -20.825 -21.13 -21.449 -21.955 -22.311 -22.704 -22.903 -23.294 -23.699 -24.131 -24.369 -24.88 -25.136 -25.414 -25.696 -26.325 -26.682 -27.07 -27.523 -28.074 -28.711 -29.566 -32.911 -5 ,12502 ,TETRA ,17602978,Sun Nov 28 16:28:14 CET,Sun Nov 28 18:15:45 CET,0.0 0.867 1.318 1.654 1.95 2.206 2.441 2.652 3.016 3.186 3.352 3.432 3.819 3.953 4.194 4.418 4.623 4.725 4.927 5.125 5.42 5.603 5.769 6.007 6.235 6.449 6.642 6.826 7.064 7.278 7.474 7.692 7.885 8.064 8.28 8.525 8.742 8.95 9.132 9.288 9.434 9.574 9.695 9.807 9.834 9.735 9.483 9.031 8.348 7.131 4.927 2.168 -0.185 -2.204 -3.947 -5.466 -6.775 -7.944 -8.972 -10.006 -10.872 -11.665 -12.441 -13.152 -13.812 -14.423 -15.082 -15.685 -16.187 -16.699 -17.236 -17.711 -18.2 -18.687 -19.08 -19.497 -19.918 -20.344 -20.786 -21.102 -21.43 -21.936 -22.307 -22.689 -22.885 -23.286 -23.709 -24.159 -24.396 -24.915 -25.191 -25.491 -25.805 -26.47 -26.825 -27.189 -27.607 -28.109 -28.714 -29.544 -32.565 -6 ,24260 ,TETRA ,17602979,Sun Nov 28 16:28:10 CET,Sun Nov 28 18:15:15 CET,0.0 0.658 1.034 1.344 1.621 1.876 2.104 2.311 2.689 2.865 3.029 3.091 3.469 3.601 3.857 4.103 4.329 4.434 4.642 4.843 5.119 5.293 5.457 5.691 5.917 6.12 6.308 6.488 6.711 6.931 7.128 7.343 7.533 7.7 7.905 8.115 8.285 8.478 8.677 8.841 8.981 9.106 9.177 9.216 9.167 9.002 8.763 8.349 7.608 6.356 4.082 1.311 -0.984 -2.98 -4.676 -6.151 -7.466 -8.671 -9.74 -10.814 -11.71 -12.507 -13.297 -14.065 -14.773 -15.431 -16.097 -16.673 -17.18 -17.702 -18.255 -18.717 -19.188 -19.671 -20.046 -20.431 -20.835 -21.277 -21.735 -22.043 -22.36 -22.872 -23.225 -23.587 -23.774 -24.162 -24.579 -25.029 -25.265 -25.774 -26.024 -26.305 -26.591 -27.195 -27.533 -27.907 -28.342 -28.868 -29.509 -30.418 -33.337 -7 ,31571 ,TETRA ,17602980,Sun Nov 28 16:28:10 CET,Sun Nov 28 18:15:11 CET,0.0 0.854 1.33 1.687 1.995 2.263 2.481 2.687 3.082 3.265 3.431 3.477 3.853 3.993 4.251 4.479 4.69 4.796 5.003 5.192 5.463 5.65 5.82 6.043 6.252 6.456 6.655 6.842 7.074 7.294 7.491 7.706 7.93 8.139 8.321 8.498 8.681 8.871 9.065 9.26 9.418 9.555 9.648 9.678 9.667 9.57 9.365 8.998 8.324 7.142 4.989 2.217 -0.123 -2.169 -3.894 -5.375 -6.686 -7.897 -8.969 -10.018 -10.929 -11.743 -12.501 -13.232 -13.916 -14.535 -15.173 -15.739 -16.234 -16.799 -17.434 -17.964 -18.512 -19.097 -19.555 -19.995 -20.452 -20.947 -21.463 -21.813 -22.172 -22.745 -23.138 -23.547 -23.759 -24.197 -24.664 -25.147 -25.401 -25.936 -26.24 -26.543 -26.853 -27.536 -27.932 -28.373 -28.819 -29.33 -29.942 -30.803 -33.143 -8 ,15482 ,TETRA ,17602981,Sun Nov 28 16:28:39 CET,Sun Nov 28 18:14:00 CET,0.0 0.758 1.154 1.486 1.778 2.05 2.281 2.464 2.824 2.99 3.139 3.181 3.555 3.688 3.935 4.173 4.407 4.522 4.744 4.932 5.194 5.37 5.541 5.784 5.997 6.186 6.369 6.557 6.799 7.022 7.231 7.48 7.696 7.89 8.101 8.32 8.51 8.667 8.816 8.977 9.146 9.301 9.405 9.449 9.431 9.353 9.16 8.789 8.103 6.831 4.539 1.756 -0.544 -2.483 -4.12 -5.624 -7.001 -8.233 -9.279 -10.305 -11.179 -11.985 -12.762 -13.49 -14.167 -14.785 -15.427 -16.009 -16.522 -17.051 -17.589 -18.036 -18.502 -18.965 -19.331 -19.739 -20.166 -20.611 -21.073 -21.391 -21.713 -22.2 -22.547 -22.927 -23.127 -23.537 -23.962 -24.42 -24.663 -25.174 -25.435 -25.724 -26.02 -26.688 -27.065 -27.472 -27.931 -28.453 -29.071 -29.846 -32.536 -9 ,31233 ,TETRA ,17602982,Sun Nov 28 16:28:39 CET,Sun Nov 28 18:15:17 CET,0.0 0.901 1.376 1.753 2.053 2.304 2.529 2.745 3.133 3.301 3.456 3.529 3.921 4.059 4.305 4.55 4.799 4.913 5.114 5.295 5.551 5.72 5.881 6.105 6.322 6.516 6.682 6.842 7.066 7.277 7.467 7.699 7.927 8.147 8.383 8.618 8.814 8.999 9.175 9.316 9.435 9.549 9.622 9.677 9.712 9.637 9.389 8.98 8.299 7.084 4.863 2.117 -0.145 -2.096 -3.797 -5.319 -6.622 -7.777 -8.779 -9.786 -10.661 -11.449 -12.183 -12.871 -13.551 -14.154 -14.801 -15.425 -15.956 -16.496 -17.055 -17.518 -18.0 -18.498 -18.871 -19.254 -19.653 -20.053 -20.482 -20.793 -21.126 -21.653 -22.02 -22.402 -22.595 -22.999 -23.415 -23.864 -24.108 -24.618 -24.876 -25.153 -25.432 -26.094 -26.468 -26.843 -27.28 -27.783 -28.403 -29.181 -31.973 -10 ,10257 ,TETRA ,17602983,Sun Nov 28 16:28:39 CET,Sun Nov 28 18:15:09 CET,0.0 0.895 1.353 1.696 1.985 2.243 2.465 2.675 3.033 3.195 3.366 3.448 3.826 3.958 4.215 4.457 4.686 4.794 4.994 5.186 5.451 5.615 5.772 5.996 6.212 6.422 6.617 6.801 7.046 7.272 7.462 7.68 7.89 8.088 8.299 8.495 8.671 8.853 9.026 9.19 9.328 9.487 9.632 9.69 9.679 9.544 9.292 8.902 8.192 6.913 4.648 1.825 -0.618 -2.663 -4.399 -5.963 -7.362 -8.585 -9.578 -10.546 -11.424 -12.228 -12.986 -13.719 -14.413 -15.069 -15.762 -16.358 -16.855 -17.372 -17.924 -18.382 -18.867 -19.38 -19.768 -20.174 -20.59 -21.017 -21.48 -21.817 -22.16 -22.667 -23.017 -23.391 -23.586 -23.985 -24.399 -24.845 -25.083 -25.58 -25.811 -26.096 -26.408 -27.073 -27.421 -27.791 -28.205 -28.696 -29.302 -30.192 -33.198 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt deleted file mode 100644 index 9ed23650..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6388 ,KEBNE ,17027471,Wed Dec 22 17:15:09 CET,Wed Dec 22 18:49:27 CET,0.0 1.01 1.546 1.971 2.32 2.622 2.905 3.159 3.614 3.829 4.029 4.161 4.575 4.74 5.063 5.371 5.661 5.792 6.045 6.294 6.65 6.877 7.09 7.39 7.68 7.961 8.225 8.474 8.792 9.09 9.376 9.697 9.994 10.307 10.681 11.091 11.45 11.803 12.159 12.546 12.929 13.353 13.84 14.259 14.689 15.089 15.486 15.868 16.141 16.113 15.606 14.624 13.604 12.575 11.584 10.668 9.873 9.113 8.411 7.691 7.063 6.481 5.908 5.349 4.849 4.413 3.952 3.54 3.156 2.726 2.288 1.919 1.51 1.075 0.744 0.41 0.066 -0.295 -0.679 -0.947 -1.231 -1.677 -1.97 -2.282 -2.451 -2.798 -3.164 -3.54 -3.74 -4.196 -4.398 -4.633 -4.886 -5.424 -5.706 -6.01 -6.361 -6.771 -7.247 -7.894 -9.759 -2 ,29875 ,KEBNE ,17027472,Wed Dec 22 17:15:08 CET,Wed Dec 22 18:47:55 CET,0.0 1.665 2.198 2.618 2.959 3.266 3.55 3.804 4.278 4.494 4.709 4.867 5.282 5.444 5.748 6.046 6.327 6.457 6.715 6.966 7.319 7.534 7.735 8.024 8.313 8.604 8.895 9.179 9.518 9.831 10.144 10.505 10.834 11.153 11.506 11.865 12.218 12.598 12.972 13.358 13.769 14.233 14.695 15.079 15.497 15.934 16.363 16.727 17.041 17.16 16.763 15.856 14.855 13.819 12.847 11.921 11.061 10.268 9.577 8.888 8.267 7.669 7.096 6.557 6.046 5.582 5.079 4.624 4.251 3.849 3.4 3.043 2.693 2.312 1.991 1.648 1.302 0.939 0.563 0.313 0.048 -0.36 -0.639 -0.937 -1.091 -1.423 -1.767 -2.132 -2.323 -2.77 -2.958 -3.179 -3.419 -3.973 -4.288 -4.618 -4.973 -5.388 -5.893 -6.526 -7.981 -3 ,10786 ,KEBNE ,17027473,Wed Dec 22 17:15:09 CET,Wed Dec 22 18:47:28 CET,0.0 1.309 1.818 2.201 2.537 2.843 3.12 3.381 3.854 4.069 4.285 4.439 4.854 5.034 5.36 5.648 5.932 6.069 6.331 6.581 6.934 7.166 7.395 7.712 8.015 8.309 8.597 8.876 9.218 9.541 9.855 10.21 10.522 10.831 11.184 11.544 11.879 12.25 12.632 13.021 13.426 13.839 14.276 14.675 15.103 15.552 15.961 16.298 16.55 16.61 16.207 15.207 14.125 13.153 12.282 11.404 10.557 9.749 9.059 8.362 7.724 7.132 6.564 6.038 5.514 5.025 4.511 4.043 3.642 3.236 2.823 2.471 2.104 1.72 1.422 1.113 0.77 0.409 0.037 -0.227 -0.508 -0.943 -1.235 -1.53 -1.683 -2.006 -2.351 -2.72 -2.911 -3.353 -3.524 -3.762 -4.02 -4.573 -4.883 -5.221 -5.589 -6.003 -6.477 -7.137 -8.902 -4 ,26892 ,KEBNE ,17027474,Wed Dec 22 17:15:09 CET,Wed Dec 22 18:47:33 CET,0.0 0.883 1.373 1.776 2.142 2.456 2.744 3.01 3.468 3.675 3.866 3.997 4.414 4.584 4.907 5.207 5.496 5.633 5.89 6.135 6.482 6.708 6.922 7.217 7.507 7.782 8.041 8.296 8.627 8.934 9.22 9.568 9.899 10.216 10.574 10.958 11.312 11.671 12.047 12.424 12.787 13.193 13.675 14.127 14.572 14.993 15.449 15.831 16.048 16.096 15.641 14.673 13.614 12.589 11.633 10.683 9.828 9.02 8.287 7.58 6.951 6.36 5.799 5.282 4.805 4.365 3.886 3.454 3.077 2.665 2.218 1.844 1.461 1.058 0.734 0.388 0.033 -0.319 -0.694 -0.955 -1.218 -1.628 -1.919 -2.238 -2.399 -2.733 -3.102 -3.482 -3.683 -4.144 -4.347 -4.59 -4.847 -5.407 -5.702 -6.008 -6.367 -6.79 -7.295 -7.972 -9.417 -5 ,10069 ,KEBNE ,17027475,Wed Dec 22 17:15:09 CET,Wed Dec 22 18:47:38 CET,0.0 1.147 1.619 2.031 2.381 2.675 2.942 3.172 3.604 3.818 4.022 4.152 4.568 4.74 5.06 5.355 5.623 5.755 6.016 6.266 6.635 6.871 7.085 7.395 7.71 8.008 8.281 8.538 8.872 9.194 9.503 9.871 10.209 10.521 10.879 11.259 11.622 12.033 12.461 12.904 13.332 13.761 14.228 14.65 15.108 15.56 15.971 16.329 16.622 16.72 16.332 15.417 14.398 13.366 12.413 11.509 10.731 9.989 9.309 8.576 7.923 7.361 6.798 6.23 5.699 5.214 4.706 4.26 3.866 3.466 3.048 2.678 2.294 1.878 1.549 1.212 0.862 0.515 0.141 -0.12 -0.379 -0.798 -1.093 -1.398 -1.554 -1.877 -2.235 -2.627 -2.829 -3.279 -3.481 -3.723 -3.966 -4.49 -4.787 -5.112 -5.496 -5.91 -6.41 -7.021 -8.505 -6 ,15972 ,KEBNE ,17027476,Wed Dec 22 17:15:08 CET,Wed Dec 22 18:47:27 CET,0.0 0.923 1.397 1.816 2.154 2.45 2.736 3.008 3.484 3.691 3.888 4.025 4.443 4.618 4.93 5.22 5.503 5.641 5.915 6.177 6.542 6.771 6.993 7.323 7.645 7.928 8.186 8.452 8.783 9.088 9.388 9.748 10.072 10.382 10.762 11.175 11.531 11.899 12.291 12.685 13.069 13.493 13.944 14.335 14.751 15.171 15.618 16.018 16.294 16.353 15.92 14.967 13.973 12.94 11.92 10.987 10.207 9.49 8.836 8.124 7.493 6.933 6.355 5.806 5.281 4.814 4.304 3.82 3.422 3.016 2.58 2.204 1.805 1.383 1.058 0.728 0.384 0.03 -0.336 -0.599 -0.877 -1.316 -1.62 -1.944 -2.11 -2.443 -2.786 -3.149 -3.351 -3.812 -4.006 -4.246 -4.5 -5.058 -5.368 -5.686 -6.034 -6.473 -6.98 -7.655 -9.133 -7 ,8540 ,KEBNE ,17027477,Wed Dec 22 17:15:09 CET,Wed Dec 22 18:47:42 CET,0.0 1.302 1.81 2.222 2.571 2.86 3.137 3.407 3.868 4.071 4.276 4.433 4.851 5.019 5.33 5.633 5.922 6.062 6.334 6.58 6.898 7.107 7.335 7.661 7.957 8.236 8.501 8.757 9.099 9.422 9.723 10.076 10.404 10.713 11.073 11.484 11.848 12.226 12.629 13.038 13.424 13.81 14.3 14.747 15.17 15.603 16.004 16.344 16.591 16.638 16.227 15.233 14.179 13.177 12.224 11.269 10.403 9.618 8.903 8.183 7.574 7.028 6.49 5.975 5.471 4.979 4.459 4.005 3.62 3.207 2.772 2.42 2.034 1.605 1.273 0.944 0.6 0.23 -0.15 -0.413 -0.688 -1.122 -1.421 -1.731 -1.895 -2.231 -2.585 -2.942 -3.133 -3.591 -3.796 -4.035 -4.277 -4.796 -5.085 -5.409 -5.785 -6.203 -6.688 -7.315 -9.0 -8 ,3451 ,KEBNE ,17027478,Wed Dec 22 17:15:09 CET,Wed Dec 22 18:47:27 CET,0.0 1.034 1.557 1.962 2.294 2.6 2.883 3.136 3.578 3.785 3.989 4.129 4.539 4.706 5.03 5.32 5.588 5.722 5.982 6.223 6.575 6.806 7.019 7.333 7.64 7.931 8.203 8.46 8.79 9.082 9.353 9.686 9.997 10.304 10.667 11.052 11.391 11.744 12.156 12.589 12.981 13.418 13.906 14.37 14.854 15.29 15.746 16.137 16.425 16.522 16.102 15.146 14.12 13.132 12.212 11.349 10.564 9.804 9.15 8.464 7.836 7.246 6.668 6.131 5.638 5.201 4.727 4.262 3.853 3.441 3.03 2.679 2.289 1.886 1.572 1.245 0.906 0.549 0.174 -0.088 -0.352 -0.76 -1.052 -1.368 -1.535 -1.867 -2.224 -2.613 -2.811 -3.273 -3.486 -3.718 -3.969 -4.518 -4.837 -5.179 -5.539 -5.943 -6.425 -7.03 -8.454 -9 ,26735 ,KEBNE ,17027479,Wed Dec 22 17:15:09 CET,Wed Dec 22 18:49:26 CET,0.0 1.009 1.529 1.938 2.288 2.594 2.87 3.124 3.574 3.782 3.988 4.112 4.521 4.691 5.003 5.3 5.576 5.708 5.962 6.204 6.544 6.76 6.975 7.291 7.6 7.888 8.158 8.416 8.747 9.066 9.381 9.74 10.039 10.329 10.677 11.067 11.428 11.815 12.203 12.562 12.959 13.4 13.829 14.264 14.773 15.231 15.63 15.956 16.18 16.19 15.662 14.655 13.555 12.511 11.614 10.764 9.947 9.103 8.365 7.655 7.037 6.471 5.892 5.33 4.823 4.355 3.849 3.393 3.009 2.601 2.142 1.761 1.374 0.967 0.656 0.338 0.021 -0.319 -0.685 -0.939 -1.216 -1.662 -1.956 -2.25 -2.41 -2.755 -3.128 -3.512 -3.708 -4.155 -4.352 -4.593 -4.825 -5.342 -5.641 -5.956 -6.299 -6.683 -7.166 -7.791 -9.42 -10 ,1833 ,KEBNE ,17027480,Wed Dec 22 17:19:19 CET,Wed Dec 22 18:44:46 CET,0.0 1.651 2.163 2.526 2.866 3.174 3.445 3.694 4.171 4.39 4.589 4.718 5.126 5.286 5.593 5.893 6.177 6.315 6.582 6.83 7.16 7.378 7.598 7.9 8.18 8.443 8.701 8.953 9.262 9.545 9.812 10.146 10.483 10.804 11.16 11.554 11.941 12.37 12.785 13.18 13.603 14.037 14.455 14.806 15.2 15.587 15.903 16.226 16.559 16.666 16.26 15.317 14.25 13.22 12.308 11.467 10.657 9.873 9.158 8.393 7.742 7.164 6.618 6.103 5.585 5.108 4.616 4.167 3.758 3.31 2.858 2.484 2.095 1.699 1.391 1.066 0.716 0.358 -0.017 -0.291 -0.568 -1.001 -1.305 -1.624 -1.786 -2.106 -2.448 -2.827 -3.033 -3.487 -3.688 -3.926 -4.169 -4.692 -5.002 -5.349 -5.73 -6.194 -6.719 -7.375 -8.731 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 5e680c24..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29708 ,TETRA ,17602984,Sun Nov 28 16:28:39 CET,Sun Nov 28 18:16:08 CET,0.0 1.073 1.626 2.028 2.352 2.653 2.925 3.17 3.621 3.832 4.033 4.163 4.566 4.73 5.051 5.351 5.637 5.774 6.035 6.285 6.633 6.851 7.057 7.36 7.671 7.97 8.245 8.487 8.793 9.102 9.385 9.704 10.002 10.303 10.652 11.026 11.371 11.73 12.114 12.513 12.89 13.298 13.778 14.216 14.632 15.003 15.413 15.808 16.073 16.15 15.778 14.852 13.842 12.821 11.816 10.891 10.087 9.335 8.665 7.99 7.4 6.825 6.253 5.722 5.24 4.811 4.35 3.909 3.516 3.115 2.672 2.291 1.927 1.565 1.266 0.918 0.56 0.201 -0.171 -0.426 -0.716 -1.175 -1.461 -1.765 -1.936 -2.278 -2.636 -3.017 -3.215 -3.664 -3.865 -4.092 -4.325 -4.861 -5.156 -5.474 -5.825 -6.246 -6.729 -7.342 -9.085 -2 ,2659 ,TETRA ,17602985,Sun Nov 28 16:28:39 CET,Sun Nov 28 18:15:19 CET,0.0 0.949 1.442 1.814 2.134 2.436 2.724 2.969 3.404 3.613 3.811 3.945 4.367 4.542 4.853 5.153 5.44 5.573 5.845 6.104 6.458 6.678 6.89 7.191 7.463 7.723 7.981 8.251 8.597 8.913 9.204 9.543 9.863 10.157 10.494 10.868 11.203 11.549 11.905 12.284 12.687 13.132 13.614 14.024 14.43 14.861 15.297 15.685 15.958 15.973 15.551 14.611 13.585 12.554 11.582 10.665 9.82 8.994 8.273 7.575 6.971 6.42 5.85 5.281 4.76 4.306 3.841 3.41 3.02 2.621 2.216 1.884 1.522 1.127 0.823 0.505 0.177 -0.17 -0.539 -0.796 -1.064 -1.493 -1.805 -2.124 -2.277 -2.594 -2.933 -3.298 -3.505 -3.956 -4.122 -4.347 -4.587 -5.116 -5.413 -5.761 -6.145 -6.557 -7.044 -7.713 -9.726 -3 ,25874 ,TETRA ,17602986,Sun Nov 28 16:28:10 CET,Sun Nov 28 18:15:10 CET,0.0 0.952 1.426 1.817 2.142 2.432 2.716 2.972 3.429 3.637 3.824 3.928 4.335 4.497 4.812 5.133 5.428 5.564 5.819 6.065 6.407 6.604 6.813 7.132 7.422 7.705 7.977 8.224 8.545 8.853 9.142 9.479 9.783 10.07 10.399 10.766 11.118 11.495 11.848 12.204 12.606 13.04 13.493 13.913 14.398 14.88 15.293 15.604 15.799 15.815 15.39 14.43 13.389 12.399 11.5 10.606 9.763 8.972 8.259 7.553 6.934 6.371 5.836 5.299 4.766 4.27 3.776 3.345 2.946 2.536 2.115 1.744 1.35 0.954 0.646 0.303 -0.051 -0.416 -0.79 -1.041 -1.306 -1.722 -2.019 -2.342 -2.506 -2.838 -3.187 -3.564 -3.767 -4.213 -4.396 -4.629 -4.875 -5.415 -5.72 -6.047 -6.429 -6.868 -7.388 -8.063 -9.451 -4 ,15046 ,TETRA ,17602987,Sun Nov 28 16:28:13 CET,Sun Nov 28 18:14:58 CET,0.0 1.292 1.813 2.201 2.555 2.858 3.123 3.375 3.841 4.048 4.242 4.355 4.753 4.918 5.246 5.553 5.847 5.991 6.253 6.495 6.844 7.068 7.278 7.583 7.874 8.123 8.357 8.606 8.93 9.226 9.503 9.851 10.185 10.484 10.809 11.165 11.526 11.907 12.278 12.635 12.991 13.404 13.867 14.282 14.719 15.141 15.536 15.877 16.113 16.147 15.697 14.729 13.672 12.67 11.758 10.886 10.106 9.383 8.681 7.995 7.418 6.854 6.326 5.824 5.301 4.809 4.298 3.852 3.458 3.036 2.604 2.243 1.871 1.477 1.17 0.848 0.505 0.155 -0.211 -0.478 -0.755 -1.172 -1.468 -1.78 -1.936 -2.261 -2.615 -3.001 -3.205 -3.661 -3.862 -4.098 -4.334 -4.825 -5.116 -5.455 -5.829 -6.252 -6.724 -7.303 -8.594 -5 ,23273 ,TETRA ,17602988,Sun Nov 28 16:28:10 CET,Sun Nov 28 18:17:09 CET,0.0 1.001 1.493 1.909 2.254 2.564 2.843 3.086 3.527 3.737 3.933 4.046 4.443 4.606 4.92 5.205 5.48 5.61 5.859 6.105 6.457 6.677 6.89 7.186 7.469 7.753 8.026 8.293 8.626 8.923 9.204 9.545 9.882 10.219 10.596 10.99 11.346 11.739 12.156 12.564 12.973 13.39 13.835 14.253 14.645 15.005 15.452 15.861 16.066 16.071 15.633 14.649 13.599 12.547 11.596 10.705 9.875 9.084 8.382 7.691 7.076 6.538 6.005 5.494 5.019 4.528 3.993 3.524 3.115 2.69 2.271 1.941 1.581 1.189 0.882 0.556 0.217 -0.119 -0.486 -0.746 -1.012 -1.447 -1.742 -2.049 -2.204 -2.524 -2.868 -3.225 -3.412 -3.851 -4.055 -4.29 -4.528 -5.062 -5.361 -5.677 -6.005 -6.414 -6.909 -7.54 -9.315 -6 ,5733 ,TETRA ,17602989,Sun Nov 28 16:28:12 CET,Sun Nov 28 18:17:08 CET,0.0 1.186 1.719 2.133 2.489 2.787 3.04 3.278 3.726 3.928 4.121 4.253 4.671 4.845 5.15 5.429 5.712 5.849 6.1 6.343 6.708 6.936 7.14 7.441 7.728 7.993 8.259 8.508 8.829 9.13 9.4 9.719 9.993 10.27 10.626 11.019 11.397 11.76 12.109 12.484 12.862 13.277 13.739 14.14 14.548 14.996 15.427 15.789 16.069 16.168 15.793 14.834 13.803 12.803 11.864 11.001 10.196 9.427 8.718 7.953 7.322 6.763 6.204 5.67 5.152 4.665 4.168 3.757 3.39 2.976 2.531 2.157 1.779 1.381 1.076 0.755 0.411 0.043 -0.35 -0.616 -0.884 -1.294 -1.57 -1.876 -2.045 -2.386 -2.741 -3.112 -3.313 -3.756 -3.942 -4.181 -4.419 -4.958 -5.255 -5.571 -5.933 -6.337 -6.786 -7.37 -8.748 -7 ,15443 ,TETRA ,17602990,Sun Nov 28 16:28:10 CET,Sun Nov 28 18:15:55 CET,0.0 1.06 1.567 1.932 2.253 2.542 2.813 3.059 3.505 3.717 3.909 4.014 4.42 4.583 4.885 5.189 5.473 5.602 5.847 6.081 6.421 6.632 6.84 7.149 7.437 7.72 7.992 8.239 8.558 8.881 9.18 9.522 9.849 10.144 10.465 10.849 11.234 11.614 11.99 12.392 12.778 13.191 13.664 14.091 14.539 14.974 15.367 15.654 15.883 15.955 15.507 14.525 13.51 12.513 11.556 10.664 9.844 9.067 8.374 7.667 7.04 6.458 5.902 5.376 4.86 4.374 3.866 3.423 3.033 2.619 2.192 1.833 1.447 1.036 0.71 0.37 0.026 -0.337 -0.707 -0.963 -1.229 -1.642 -1.927 -2.228 -2.39 -2.73 -3.077 -3.436 -3.628 -4.076 -4.304 -4.554 -4.797 -5.323 -5.626 -5.959 -6.306 -6.703 -7.204 -7.771 -9.195 -8 ,21239 ,TETRA ,17602991,Sun Nov 28 16:28:10 CET,Sun Nov 28 18:14:34 CET,0.0 1.097 1.581 2.011 2.355 2.645 2.915 3.174 3.648 3.856 4.051 4.183 4.59 4.764 5.08 5.375 5.657 5.789 6.042 6.288 6.639 6.866 7.085 7.386 7.671 7.933 8.186 8.44 8.763 9.056 9.341 9.678 9.97 10.249 10.586 10.972 11.313 11.665 12.045 12.408 12.747 13.121 13.56 13.964 14.383 14.817 15.277 15.681 15.976 16.081 15.605 14.531 13.452 12.392 11.403 10.5 9.68 8.915 8.254 7.578 6.946 6.36 5.798 5.27 4.775 4.316 3.833 3.397 3.012 2.589 2.147 1.779 1.399 1.011 0.701 0.368 0.022 -0.352 -0.74 -0.992 -1.263 -1.716 -2.011 -2.318 -2.49 -2.827 -3.17 -3.528 -3.707 -4.145 -4.346 -4.589 -4.833 -5.364 -5.68 -6.008 -6.361 -6.766 -7.232 -7.832 -9.304 -9 ,19293 ,TETRA ,17602992,Sun Nov 28 16:28:11 CET,Sun Nov 28 18:14:49 CET,0.0 0.955 1.42 1.798 2.134 2.436 2.702 2.951 3.399 3.594 3.776 3.899 4.312 4.483 4.814 5.121 5.406 5.537 5.786 6.024 6.36 6.579 6.795 7.108 7.39 7.643 7.889 8.134 8.45 8.765 9.061 9.391 9.719 10.028 10.368 10.736 11.077 11.454 11.864 12.276 12.678 13.115 13.561 13.955 14.391 14.803 15.154 15.424 15.639 15.708 15.317 14.445 13.44 12.387 11.423 10.502 9.631 8.86 8.224 7.561 6.93 6.358 5.805 5.269 4.791 4.338 3.852 3.421 3.04 2.633 2.192 1.837 1.466 1.061 0.745 0.417 0.077 -0.287 -0.677 -0.946 -1.234 -1.682 -1.991 -2.313 -2.474 -2.813 -3.159 -3.52 -3.716 -4.157 -4.319 -4.536 -4.776 -5.327 -5.634 -5.94 -6.279 -6.671 -7.124 -7.784 -9.303 -10 ,6287 ,TETRA ,17602993,Sun Nov 28 16:28:13 CET,Sun Nov 28 18:14:59 CET,0.0 0.964 1.451 1.811 2.125 2.42 2.676 2.914 3.357 3.564 3.766 3.901 4.308 4.472 4.798 5.109 5.387 5.52 5.781 6.03 6.382 6.609 6.824 7.124 7.412 7.681 7.939 8.2 8.524 8.823 9.115 9.458 9.769 10.071 10.422 10.785 11.125 11.519 11.931 12.331 12.732 13.155 13.616 14.023 14.452 14.944 15.329 15.573 15.786 15.866 15.52 14.542 13.468 12.481 11.563 10.667 9.817 9.052 8.403 7.734 7.134 6.572 6.024 5.505 5.02 4.56 4.076 3.635 3.234 2.819 2.392 2.026 1.648 1.261 0.949 0.614 0.291 -0.037 -0.407 -0.675 -0.947 -1.366 -1.657 -1.955 -2.112 -2.435 -2.776 -3.138 -3.326 -3.772 -3.949 -4.17 -4.412 -4.96 -5.261 -5.563 -5.905 -6.327 -6.851 -7.533 -9.237 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 3a322499..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19428 ,KEBNE ,17027481,Wed Dec 22 17:19:19 CET,Wed Dec 22 18:42:11 CET,0.0 1.152 1.587 1.921 2.198 2.43 2.643 2.852 3.237 3.409 3.562 3.616 3.971 4.088 4.309 4.531 4.727 4.816 4.988 5.142 5.356 5.498 5.645 5.86 6.054 6.218 6.355 6.484 6.634 6.756 6.867 6.999 7.122 7.225 7.311 7.377 7.443 7.484 7.503 7.53 7.523 7.447 7.275 7.008 6.585 6.016 5.214 4.132 2.581 0.196 -3.804 -8.424 -12.101 -15.105 -17.558 -19.668 -21.454 -23.074 -24.466 -25.808 -26.956 -27.973 -28.905 -29.768 -30.574 -31.295 -32.061 -32.754 -33.316 -33.893 -34.513 -35.027 -35.55 -36.085 -36.5 -36.922 -37.361 -37.802 -38.245 -38.563 -38.892 -39.4 -39.749 -40.107 -40.294 -40.681 -41.091 -41.513 -41.731 -42.223 -42.427 -42.67 -42.931 -43.508 -43.819 -44.128 -44.44 -44.802 -45.21 -45.706 -46.769 -2 ,10917 ,KEBNE ,17027482,Wed Dec 22 17:19:17 CET,Wed Dec 22 18:42:27 CET,0.0 0.963 1.394 1.718 2.003 2.246 2.454 2.658 3.029 3.186 3.343 3.409 3.76 3.877 4.087 4.284 4.476 4.566 4.726 4.879 5.118 5.258 5.383 5.557 5.707 5.85 5.989 6.119 6.282 6.422 6.546 6.695 6.83 6.953 7.061 7.131 7.169 7.205 7.224 7.181 7.111 7.039 6.903 6.671 6.3 5.727 4.845 3.673 2.004 -0.508 -4.58 -9.211 -12.854 -15.849 -18.272 -20.335 -22.112 -23.696 -25.014 -26.307 -27.417 -28.406 -29.339 -30.207 -31.008 -31.716 -32.43 -33.079 -33.655 -34.248 -34.857 -35.357 -35.864 -36.398 -36.814 -37.244 -37.685 -38.138 -38.613 -38.939 -39.27 -39.783 -40.142 -40.512 -40.694 -41.068 -41.46 -41.863 -42.078 -42.575 -42.79 -43.033 -43.293 -43.865 -44.17 -44.515 -44.893 -45.298 -45.74 -46.241 -47.151 -3 ,11871 ,KEBNE ,17027483,Wed Dec 22 17:19:16 CET,Wed Dec 22 18:50:58 CET,0.0 0.781 1.193 1.496 1.785 2.051 2.272 2.462 2.802 2.963 3.114 3.163 3.513 3.633 3.86 4.06 4.243 4.33 4.494 4.643 4.83 4.947 5.059 5.237 5.422 5.591 5.741 5.865 6.003 6.141 6.274 6.408 6.508 6.57 6.624 6.687 6.76 6.791 6.788 6.796 6.761 6.667 6.467 6.165 5.72 5.192 4.445 3.312 1.63 -0.924 -4.948 -9.521 -13.174 -16.17 -18.678 -20.855 -22.646 -24.215 -25.606 -26.988 -28.122 -29.095 -30.043 -30.934 -31.748 -32.483 -33.222 -33.886 -34.468 -35.079 -35.701 -36.19 -36.707 -37.251 -37.672 -38.097 -38.528 -38.99 -39.463 -39.779 -40.107 -40.604 -40.953 -41.334 -41.524 -41.909 -42.318 -42.753 -42.972 -43.453 -43.653 -43.902 -44.156 -44.68 -44.964 -45.28 -45.626 -46.004 -46.428 -46.918 -47.651 -4 ,29217 ,KEBNE ,17027484,Wed Dec 22 17:19:16 CET,Wed Dec 22 18:52:01 CET,0.0 0.853 1.246 1.563 1.84 2.068 2.277 2.486 2.835 2.991 3.141 3.18 3.529 3.646 3.867 4.084 4.284 4.371 4.537 4.697 4.924 5.074 5.205 5.364 5.521 5.678 5.823 5.951 6.1 6.247 6.388 6.536 6.654 6.748 6.849 6.927 6.975 7.034 7.047 6.988 6.927 6.815 6.591 6.342 5.963 5.381 4.611 3.536 1.908 -0.499 -4.496 -9.133 -12.745 -15.66 -18.094 -20.2 -21.992 -23.577 -24.939 -26.273 -27.375 -28.332 -29.284 -30.18 -30.982 -31.733 -32.497 -33.165 -33.728 -34.322 -34.945 -35.448 -35.984 -36.518 -36.921 -37.339 -37.764 -38.222 -38.696 -39.01 -39.335 -39.831 -40.164 -40.522 -40.71 -41.092 -41.488 -41.903 -42.115 -42.596 -42.777 -43.014 -43.261 -43.824 -44.129 -44.432 -44.79 -45.189 -45.602 -46.144 -47.393 -5 ,20223 ,KEBNE ,17027485,Wed Dec 22 17:20:19 CET,Wed Dec 22 18:51:18 CET,0.0 0.58 0.995 1.333 1.621 1.863 2.073 2.266 2.617 2.771 2.919 2.974 3.332 3.459 3.679 3.887 4.081 4.174 4.36 4.533 4.763 4.905 5.032 5.205 5.375 5.526 5.659 5.782 5.929 6.064 6.193 6.34 6.472 6.598 6.715 6.81 6.862 6.899 6.964 7.013 6.997 6.889 6.698 6.445 6.057 5.493 4.685 3.625 2.067 -0.403 -4.497 -9.082 -12.629 -15.602 -18.088 -20.178 -21.973 -23.58 -24.897 -26.221 -27.347 -28.308 -29.22 -30.069 -30.862 -31.588 -32.35 -33.024 -33.606 -34.204 -34.828 -35.346 -35.857 -36.389 -36.802 -37.233 -37.682 -38.136 -38.602 -38.92 -39.244 -39.737 -40.087 -40.457 -40.641 -41.027 -41.432 -41.844 -42.063 -42.557 -42.777 -43.033 -43.288 -43.814 -44.11 -44.433 -44.79 -45.206 -45.663 -46.225 -47.567 -6 ,13952 ,KEBNE ,17027486,Wed Dec 22 17:20:23 CET,Wed Dec 22 18:47:11 CET,0.0 0.898 1.354 1.685 1.961 2.22 2.452 2.659 3.043 3.206 3.353 3.414 3.765 3.881 4.09 4.291 4.485 4.574 4.737 4.893 5.12 5.25 5.366 5.537 5.702 5.857 5.996 6.121 6.265 6.391 6.51 6.658 6.807 6.922 7.024 7.13 7.213 7.304 7.38 7.408 7.381 7.281 7.127 6.907 6.513 5.947 5.196 4.143 2.501 0.001 -3.979 -8.581 -12.239 -15.221 -17.65 -19.705 -21.471 -23.052 -24.404 -25.731 -26.854 -27.863 -28.824 -29.726 -30.553 -31.3 -32.086 -32.769 -33.321 -33.889 -34.498 -34.996 -35.493 -35.996 -36.394 -36.809 -37.239 -37.695 -38.161 -38.473 -38.798 -39.315 -39.669 -40.037 -40.23 -40.624 -41.037 -41.475 -41.7 -42.191 -42.397 -42.638 -42.894 -43.442 -43.74 -44.057 -44.398 -44.771 -45.184 -45.674 -46.736 -7 ,30935 ,KEBNE ,17027487,Wed Dec 22 17:23:31 CET,Wed Dec 22 18:49:19 CET,0.0 0.772 1.155 1.483 1.785 2.052 2.272 2.465 2.826 2.986 3.143 3.2 3.541 3.664 3.901 4.119 4.321 4.415 4.587 4.738 4.946 5.081 5.206 5.373 5.528 5.681 5.818 5.95 6.111 6.245 6.374 6.512 6.638 6.734 6.817 6.921 7.012 7.085 7.131 7.133 7.074 6.948 6.777 6.553 6.162 5.594 4.758 3.602 1.938 -0.526 -4.524 -9.036 -12.557 -15.48 -17.893 -19.988 -21.767 -23.324 -24.671 -26.018 -27.169 -28.199 -29.195 -30.106 -30.907 -31.639 -32.42 -33.123 -33.715 -34.289 -34.882 -35.382 -35.912 -36.471 -36.887 -37.306 -37.74 -38.188 -38.654 -38.98 -39.315 -39.827 -40.176 -40.53 -40.711 -41.083 -41.488 -41.905 -42.117 -42.609 -42.824 -43.072 -43.327 -43.867 -44.159 -44.488 -44.834 -45.2 -45.613 -46.151 -47.131 -8 ,29769 ,KEBNE ,17027488,Wed Dec 22 17:23:31 CET,Wed Dec 22 18:49:31 CET,0.0 0.877 1.315 1.684 1.989 2.224 2.449 2.661 3.012 3.164 3.32 3.394 3.738 3.856 4.084 4.287 4.48 4.564 4.729 4.893 5.12 5.259 5.389 5.57 5.735 5.892 6.029 6.159 6.319 6.461 6.606 6.78 6.931 7.043 7.162 7.254 7.312 7.356 7.347 7.336 7.291 7.194 7.058 6.857 6.533 6.016 5.214 4.061 2.372 -0.125 -4.208 -8.897 -12.574 -15.54 -17.973 -20.048 -21.842 -23.43 -24.788 -26.151 -27.3 -28.31 -29.264 -30.139 -30.956 -31.703 -32.457 -33.121 -33.699 -34.274 -34.869 -35.392 -35.942 -36.498 -36.913 -37.337 -37.774 -38.229 -38.693 -39.007 -39.342 -39.868 -40.223 -40.583 -40.769 -41.163 -41.575 -41.994 -42.218 -42.724 -42.952 -43.218 -43.5 -44.109 -44.426 -44.764 -45.142 -45.549 -46.013 -46.581 -47.452 -9 ,29156 ,KEBNE ,17027489,Wed Dec 22 17:23:31 CET,Wed Dec 22 18:49:03 CET,0.0 0.982 1.429 1.782 2.082 2.335 2.558 2.767 3.131 3.302 3.461 3.514 3.868 3.984 4.196 4.392 4.575 4.666 4.836 4.999 5.236 5.379 5.525 5.719 5.878 6.027 6.163 6.292 6.448 6.588 6.723 6.881 7.007 7.091 7.165 7.25 7.329 7.393 7.432 7.442 7.404 7.304 7.154 6.915 6.557 6.069 5.256 4.092 2.381 -0.199 -4.26 -8.908 -12.525 -15.5 -17.94 -20.031 -21.824 -23.378 -24.728 -26.097 -27.248 -28.224 -29.111 -29.946 -30.737 -31.487 -32.276 -32.959 -33.542 -34.14 -34.737 -35.23 -35.755 -36.305 -36.735 -37.167 -37.606 -38.053 -38.515 -38.839 -39.163 -39.661 -40.01 -40.371 -40.552 -40.927 -41.331 -41.753 -41.97 -42.459 -42.668 -42.915 -43.163 -43.714 -44.021 -44.341 -44.681 -45.044 -45.451 -45.985 -47.366 -10 ,31542 ,KEBNE ,17027490,Wed Dec 22 17:23:31 CET,Wed Dec 22 18:49:37 CET,0.0 0.742 1.145 1.457 1.719 1.947 2.163 2.365 2.732 2.901 3.052 3.108 3.46 3.574 3.803 4.025 4.225 4.316 4.481 4.631 4.83 4.951 5.082 5.272 5.446 5.604 5.752 5.893 6.053 6.198 6.33 6.471 6.578 6.663 6.74 6.819 6.904 6.979 7.017 7.025 6.992 6.922 6.794 6.563 6.211 5.707 4.934 3.788 2.097 -0.381 -4.454 -9.052 -12.659 -15.646 -18.129 -20.251 -22.049 -23.652 -24.998 -26.336 -27.516 -28.544 -29.451 -30.284 -31.087 -31.808 -32.544 -33.197 -33.767 -34.346 -34.933 -35.431 -35.939 -36.451 -36.852 -37.277 -37.734 -38.196 -38.654 -38.972 -39.301 -39.814 -40.176 -40.547 -40.736 -41.122 -41.511 -41.911 -42.119 -42.614 -42.83 -43.085 -43.355 -43.918 -44.219 -44.54 -44.874 -45.244 -45.675 -46.241 -47.17 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 3a25a073..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1072 ,TETRA ,17602994,Sun Nov 28 16:28:16 CET,Sun Nov 28 18:13:26 CET,0.0 1.228 1.768 2.176 2.53 2.84 3.113 3.367 3.8 3.985 4.161 4.273 4.661 4.824 5.126 5.396 5.638 5.749 5.954 6.152 6.44 6.617 6.781 7.012 7.249 7.48 7.691 7.886 8.114 8.31 8.507 8.746 8.937 9.108 9.301 9.49 9.644 9.84 10.029 10.162 10.276 10.371 10.405 10.386 10.307 10.097 9.702 9.0 7.851 6.047 3.007 -0.664 -3.597 -5.982 -7.999 -9.796 -11.33 -12.661 -13.809 -14.974 -15.941 -16.775 -17.597 -18.387 -19.105 -19.756 -20.435 -21.044 -21.568 -22.1 -22.654 -23.123 -23.617 -24.119 -24.496 -24.883 -25.278 -25.685 -26.122 -26.419 -26.717 -27.192 -27.522 -27.864 -28.038 -28.401 -28.781 -29.169 -29.377 -29.838 -30.01 -30.244 -30.48 -30.983 -31.259 -31.565 -31.9 -32.265 -32.695 -33.211 -34.178 -2 ,15390 ,TETRA ,17602995,Sun Nov 28 16:28:11 CET,Sun Nov 28 18:14:04 CET,0.0 1.451 1.992 2.38 2.709 2.995 3.252 3.497 3.931 4.118 4.292 4.389 4.772 4.919 5.186 5.44 5.679 5.788 5.994 6.186 6.454 6.636 6.818 7.058 7.266 7.465 7.663 7.86 8.092 8.297 8.484 8.71 8.923 9.106 9.312 9.511 9.687 9.846 9.984 10.105 10.189 10.258 10.299 10.28 10.16 9.902 9.528 8.919 7.785 6.032 3.098 -0.539 -3.536 -6.034 -8.127 -9.943 -11.518 -12.898 -14.031 -15.179 -16.172 -17.056 -17.914 -18.704 -19.42 -20.08 -20.766 -21.365 -21.884 -22.421 -22.962 -23.411 -23.886 -24.37 -24.75 -25.146 -25.548 -25.968 -26.414 -26.711 -27.004 -27.471 -27.799 -28.137 -28.311 -28.662 -29.036 -29.433 -29.634 -30.089 -30.257 -30.481 -30.716 -31.233 -31.509 -31.789 -32.084 -32.43 -32.876 -33.397 -34.417 -3 ,9694 ,TETRA ,17602996,Sun Nov 28 16:28:11 CET,Sun Nov 28 18:14:26 CET,0.0 1.08 1.595 2.007 2.349 2.633 2.885 3.106 3.488 3.662 3.832 3.937 4.322 4.475 4.752 5.01 5.258 5.379 5.609 5.824 6.108 6.278 6.442 6.68 6.9 7.119 7.325 7.5 7.727 7.949 8.136 8.352 8.568 8.76 8.958 9.159 9.34 9.513 9.68 9.829 9.93 10.013 10.065 10.045 9.935 9.68 9.295 8.678 7.518 5.682 2.57 -1.08 -3.976 -6.399 -8.439 -10.22 -11.771 -13.135 -14.31 -15.514 -16.488 -17.328 -18.135 -18.908 -19.652 -20.324 -21.011 -21.606 -22.111 -22.643 -23.203 -23.657 -24.13 -24.635 -25.029 -25.439 -25.848 -26.258 -26.687 -26.985 -27.287 -27.766 -28.095 -28.435 -28.606 -28.953 -29.327 -29.72 -29.922 -30.381 -30.539 -30.76 -30.999 -31.521 -31.802 -32.098 -32.423 -32.791 -33.174 -33.638 -34.559 -4 ,5542 ,TETRA ,17602997,Sun Nov 28 16:28:14 CET,Sun Nov 28 18:14:16 CET,0.0 1.407 1.912 2.289 2.607 2.893 3.152 3.371 3.762 3.953 4.146 4.29 4.683 4.833 5.11 5.385 5.643 5.759 5.97 6.165 6.45 6.631 6.801 7.047 7.27 7.482 7.682 7.87 8.113 8.325 8.526 8.774 8.991 9.168 9.373 9.598 9.793 9.975 10.132 10.258 10.362 10.464 10.521 10.497 10.363 10.106 9.658 8.941 7.803 5.969 3.001 -0.51 -3.499 -5.993 -8.085 -9.927 -11.521 -12.922 -14.08 -15.23 -16.201 -17.063 -17.92 -18.736 -19.472 -20.124 -20.777 -21.362 -21.865 -22.39 -22.973 -23.449 -23.91 -24.393 -24.773 -25.152 -25.535 -25.94 -26.371 -26.66 -26.963 -27.441 -27.767 -28.117 -28.303 -28.678 -29.06 -29.47 -29.683 -30.149 -30.337 -30.568 -30.803 -31.314 -31.591 -31.879 -32.202 -32.567 -32.987 -33.524 -34.507 -5 ,30236 ,TETRA ,17602998,Sun Nov 28 16:28:11 CET,Sun Nov 28 18:15:11 CET,0.0 1.006 1.532 1.932 2.269 2.569 2.848 3.095 3.513 3.714 3.897 4.013 4.396 4.544 4.832 5.092 5.339 5.457 5.678 5.889 6.16 6.33 6.512 6.766 6.988 7.196 7.397 7.578 7.808 8.029 8.246 8.503 8.714 8.892 9.098 9.317 9.49 9.657 9.794 9.9 10.004 10.045 10.047 10.052 9.949 9.713 9.274 8.582 7.551 5.821 2.83 -0.739 -3.692 -6.12 -8.136 -9.896 -11.418 -12.792 -13.979 -15.183 -16.191 -17.049 -17.9 -18.708 -19.439 -20.103 -20.769 -21.364 -21.894 -22.427 -22.963 -23.428 -23.908 -24.386 -24.748 -25.126 -25.527 -25.936 -26.365 -26.659 -26.961 -27.434 -27.762 -28.094 -28.268 -28.635 -29.014 -29.406 -29.607 -30.074 -30.262 -30.499 -30.752 -31.263 -31.544 -31.858 -32.191 -32.553 -32.957 -33.437 -34.237 -6 ,11908 ,TETRA ,17602999,Sun Nov 28 16:28:12 CET,Sun Nov 28 18:14:25 CET,0.0 1.164 1.663 2.094 2.437 2.707 2.952 3.187 3.62 3.814 3.991 4.088 4.455 4.587 4.833 5.084 5.325 5.44 5.662 5.858 6.147 6.332 6.504 6.754 6.98 7.19 7.382 7.558 7.79 8.004 8.196 8.415 8.605 8.783 8.992 9.199 9.38 9.563 9.716 9.837 9.94 9.997 10.009 10.0 9.892 9.665 9.286 8.624 7.508 5.783 2.814 -0.814 -3.72 -6.147 -8.172 -9.955 -11.491 -12.846 -13.964 -15.066 -16.075 -16.968 -17.773 -18.514 -19.2 -19.83 -20.503 -21.103 -21.613 -22.145 -22.699 -23.159 -23.639 -24.131 -24.504 -24.889 -25.298 -25.716 -26.134 -26.415 -26.712 -27.185 -27.505 -27.838 -28.014 -28.375 -28.739 -29.129 -29.33 -29.785 -29.953 -30.18 -30.423 -30.944 -31.21 -31.508 -31.842 -32.195 -32.582 -33.06 -33.957 -7 ,27268 ,TETRA ,17603000,Sun Nov 28 16:28:15 CET,Sun Nov 28 18:15:17 CET,0.0 1.116 1.661 2.072 2.395 2.691 2.967 3.199 3.597 3.788 3.977 4.096 4.477 4.619 4.901 5.172 5.41 5.52 5.747 5.97 6.258 6.428 6.602 6.838 7.046 7.249 7.45 7.637 7.861 8.065 8.257 8.497 8.714 8.916 9.142 9.338 9.496 9.691 9.884 10.008 10.118 10.235 10.247 10.202 10.097 9.836 9.377 8.668 7.569 5.774 2.669 -1.008 -3.959 -6.361 -8.378 -10.173 -11.72 -13.108 -14.272 -15.397 -16.384 -17.265 -18.08 -18.877 -19.604 -20.234 -20.9 -21.496 -22.007 -22.52 -23.044 -23.494 -23.96 -24.446 -24.833 -25.227 -25.632 -26.053 -26.487 -26.78 -27.082 -27.552 -27.873 -28.225 -28.412 -28.784 -29.157 -29.546 -29.755 -30.22 -30.409 -30.644 -30.88 -31.414 -31.71 -32.012 -32.339 -32.704 -33.119 -33.64 -34.693 -8 ,28727 ,TETRA ,17603001,Sun Nov 28 16:28:16 CET,Sun Nov 28 18:15:10 CET,0.0 1.065 1.572 1.964 2.296 2.582 2.843 3.091 3.529 3.713 3.887 3.99 4.36 4.513 4.81 5.069 5.316 5.432 5.66 5.877 6.172 6.358 6.532 6.766 6.987 7.198 7.396 7.593 7.843 8.058 8.249 8.473 8.677 8.859 9.071 9.292 9.467 9.632 9.768 9.889 9.98 10.051 10.106 10.084 9.973 9.75 9.287 8.525 7.394 5.697 2.71 -0.905 -3.802 -6.22 -8.266 -10.058 -11.568 -12.92 -14.058 -15.163 -16.147 -17.058 -17.891 -18.645 -19.341 -19.975 -20.651 -21.256 -21.779 -22.312 -22.849 -23.295 -23.762 -24.245 -24.628 -25.014 -25.395 -25.802 -26.239 -26.545 -26.855 -27.327 -27.653 -27.986 -28.159 -28.515 -28.891 -29.28 -29.48 -29.946 -30.143 -30.383 -30.627 -31.151 -31.444 -31.749 -32.062 -32.392 -32.775 -33.307 -34.39 -9 ,14988 ,TETRA ,17603002,Sun Nov 28 16:28:12 CET,Sun Nov 28 18:14:27 CET,0.0 1.623 2.144 2.546 2.9 3.203 3.457 3.679 4.061 4.243 4.429 4.554 4.932 5.094 5.39 5.638 5.863 5.979 6.206 6.417 6.716 6.896 7.067 7.313 7.545 7.768 7.977 8.152 8.374 8.591 8.781 9.007 9.221 9.403 9.585 9.788 9.982 10.165 10.333 10.483 10.599 10.683 10.736 10.751 10.662 10.43 10.019 9.313 8.178 6.395 3.302 -0.349 -3.258 -5.644 -7.643 -9.392 -10.893 -12.28 -13.439 -14.563 -15.558 -16.421 -17.227 -18.005 -18.753 -19.427 -20.091 -20.689 -21.203 -21.724 -22.27 -22.729 -23.198 -23.673 -24.044 -24.428 -24.819 -25.228 -25.66 -25.952 -26.251 -26.718 -27.035 -27.348 -27.517 -27.881 -28.262 -28.667 -28.881 -29.347 -29.514 -29.745 -29.994 -30.53 -30.825 -31.127 -31.447 -31.799 -32.201 -32.683 -33.894 -10 ,6361 ,TETRA ,17603003,Sun Nov 28 16:28:15 CET,Sun Nov 28 18:15:06 CET,0.0 1.119 1.659 2.074 2.41 2.717 3.001 3.254 3.707 3.909 4.093 4.201 4.582 4.733 5.016 5.295 5.552 5.666 5.88 6.097 6.401 6.586 6.762 7.002 7.227 7.443 7.641 7.813 8.032 8.247 8.448 8.674 8.878 9.075 9.296 9.493 9.641 9.797 9.965 10.125 10.219 10.301 10.392 10.414 10.342 10.116 9.691 9.019 7.944 6.15 3.005 -0.723 -3.727 -6.152 -8.142 -9.909 -11.429 -12.794 -13.968 -15.126 -16.129 -17.023 -17.868 -18.622 -19.326 -19.988 -20.666 -21.279 -21.813 -22.339 -22.874 -23.336 -23.813 -24.298 -24.676 -25.07 -25.469 -25.874 -26.292 -26.585 -26.891 -27.362 -27.676 -28.001 -28.171 -28.53 -28.91 -29.305 -29.508 -29.969 -30.154 -30.395 -30.651 -31.185 -31.469 -31.77 -32.098 -32.473 -32.928 -33.435 -34.305 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 7045a3f1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13237 ,TETRA ,17603004,Sun Nov 28 16:28:16 CET,Sun Nov 28 18:13:34 CET,0.0 1.065 1.563 1.916 2.229 2.538 2.838 3.111 3.601 3.825 4.046 4.193 4.691 4.881 5.246 5.599 5.931 6.089 6.393 6.696 7.137 7.408 7.684 8.078 8.439 8.793 9.122 9.441 9.868 10.284 10.672 11.153 11.625 12.069 12.587 13.152 13.688 14.28 14.89 15.529 16.211 17.013 17.961 18.882 19.915 21.078 22.434 23.901 25.597 27.584 29.904 31.599 32.501 33.001 33.192 33.205 33.15 33.024 32.87 32.711 32.512 32.26 31.964 31.675 31.407 31.142 30.857 30.581 30.334 30.062 29.77 29.519 29.237 28.945 28.727 28.501 28.243 27.975 27.71 27.516 27.295 26.934 26.682 26.429 26.295 26.008 25.71 25.373 25.196 24.761 24.651 24.446 24.227 23.717 23.437 23.15 22.81 22.416 21.964 21.317 19.429 -2 ,513 ,TETRA ,17603005,Sun Nov 28 16:28:41 CET,Sun Nov 28 18:14:52 CET,0.0 0.993 1.479 1.884 2.212 2.52 2.825 3.098 3.622 3.86 4.077 4.191 4.678 4.862 5.201 5.534 5.87 6.03 6.322 6.595 7.001 7.272 7.535 7.907 8.273 8.617 8.933 9.26 9.695 10.125 10.555 11.04 11.47 11.909 12.426 13.0 13.546 14.143 14.787 15.441 16.132 16.916 17.794 18.703 19.797 20.965 22.267 23.732 25.396 27.3 29.606 31.409 32.341 32.846 33.114 33.188 33.138 33.036 32.901 32.697 32.487 32.277 32.01 31.748 31.518 31.28 30.995 30.703 30.446 30.186 29.899 29.67 29.407 29.1 28.871 28.638 28.389 28.115 27.82 27.616 27.401 27.055 26.801 26.538 26.407 26.123 25.809 25.489 25.316 24.872 24.793 24.591 24.348 23.814 23.524 23.214 22.881 22.48 21.996 21.365 19.412 -3 ,6854 ,TETRA ,17603006,Sun Nov 28 16:28:44 CET,Sun Nov 28 18:14:46 CET,0.0 1.264 1.781 2.163 2.491 2.804 3.098 3.352 3.808 4.031 4.245 4.366 4.857 5.043 5.396 5.735 6.068 6.233 6.563 6.876 7.306 7.57 7.833 8.22 8.596 8.967 9.318 9.651 10.066 10.45 10.819 11.275 11.727 12.162 12.658 13.212 13.757 14.37 14.99 15.593 16.243 17.008 17.919 18.845 19.923 21.115 22.457 23.884 25.514 27.407 29.65 31.406 32.297 32.783 33.011 33.065 33.025 32.876 32.691 32.474 32.236 31.975 31.688 31.395 31.108 30.838 30.565 30.324 30.095 29.858 29.604 29.353 29.096 28.843 28.617 28.377 28.134 27.86 27.571 27.369 27.165 26.845 26.603 26.358 26.224 25.924 25.617 25.295 25.129 24.688 24.585 24.385 24.156 23.654 23.369 23.082 22.761 22.383 21.936 21.292 19.056 -4 ,20721 ,TETRA ,17603007,Sun Nov 28 16:28:46 CET,Sun Nov 28 18:14:25 CET,0.0 1.159 1.674 2.111 2.482 2.802 3.094 3.384 3.899 4.13 4.351 4.479 4.97 5.158 5.523 5.859 6.17 6.326 6.634 6.927 7.348 7.622 7.882 8.243 8.594 8.957 9.305 9.638 10.08 10.513 10.91 11.361 11.81 12.266 12.81 13.393 13.919 14.49 15.106 15.75 16.414 17.177 18.11 19.071 20.16 21.318 22.607 24.079 25.825 27.804 30.086 31.837 32.754 33.184 33.37 33.369 33.303 33.21 33.048 32.814 32.586 32.341 32.077 31.826 31.556 31.294 30.993 30.712 30.474 30.215 29.945 29.716 29.46 29.181 28.948 28.697 28.449 28.185 27.889 27.693 27.488 27.139 26.89 26.636 26.507 26.243 25.947 25.621 25.456 25.008 24.875 24.676 24.457 23.964 23.687 23.381 23.051 22.665 22.177 21.55 19.443 -5 ,3917 ,TETRA ,17603008,Sun Nov 28 16:28:39 CET,Sun Nov 28 18:14:21 CET,0.0 0.857 1.358 1.728 2.075 2.43 2.75 3.033 3.547 3.784 4.009 4.158 4.659 4.859 5.239 5.587 5.911 6.07 6.382 6.681 7.1 7.37 7.637 8.021 8.388 8.73 9.067 9.391 9.797 10.19 10.579 11.073 11.556 12.005 12.509 13.078 13.634 14.216 14.827 15.504 16.223 17.008 17.893 18.759 19.761 20.876 22.145 23.6 25.285 27.244 29.593 31.366 32.28 32.715 32.873 32.922 32.906 32.785 32.637 32.455 32.249 32.028 31.767 31.497 31.216 30.935 30.629 30.356 30.106 29.855 29.603 29.383 29.153 28.882 28.639 28.374 28.105 27.838 27.549 27.338 27.128 26.8 26.561 26.317 26.185 25.898 25.598 25.278 25.113 24.681 24.558 24.341 24.12 23.634 23.368 23.082 22.756 22.377 21.902 21.243 19.359 -6 ,21689 ,TETRA ,17603009,Sun Nov 28 16:29:25 CET,Sun Nov 28 18:14:57 CET,0.0 1.052 1.627 2.033 2.404 2.743 3.044 3.318 3.828 4.057 4.276 4.401 4.889 5.083 5.458 5.815 6.141 6.299 6.618 6.919 7.35 7.641 7.922 8.322 8.691 9.047 9.401 9.748 10.195 10.617 11.024 11.527 12.005 12.452 12.971 13.561 14.137 14.76 15.416 16.095 16.833 17.681 18.615 19.498 20.521 21.685 22.966 24.356 26.018 27.95 30.182 31.896 32.753 33.192 33.36 33.381 33.333 33.216 33.051 32.839 32.635 32.415 32.157 31.899 31.626 31.351 31.08 30.842 30.629 30.378 30.081 29.836 29.588 29.316 29.104 28.879 28.628 28.362 28.077 27.871 27.648 27.301 27.065 26.815 26.677 26.403 26.118 25.805 25.637 25.198 25.089 24.875 24.65 24.17 23.915 23.634 23.327 22.964 22.498 21.882 19.87 -7 ,10239 ,TETRA ,17603010,Sun Nov 28 16:28:39 CET,Sun Nov 28 18:15:00 CET,0.0 1.093 1.62 2.033 2.388 2.709 3.01 3.295 3.794 4.038 4.272 4.4 4.883 5.081 5.458 5.789 6.114 6.275 6.578 6.878 7.303 7.574 7.84 8.213 8.577 8.941 9.289 9.62 10.057 10.482 10.89 11.377 11.82 12.226 12.692 13.232 13.764 14.357 15.005 15.702 16.443 17.278 18.258 19.194 20.247 21.398 22.742 24.237 25.947 27.916 30.199 31.885 32.785 33.259 33.42 33.44 33.387 33.253 33.068 32.869 32.66 32.428 32.203 31.959 31.679 31.401 31.093 30.801 30.562 30.311 30.021 29.773 29.501 29.206 28.981 28.746 28.499 28.232 27.961 27.772 27.574 27.251 27.023 26.794 26.659 26.363 26.051 25.702 25.526 25.075 24.922 24.716 24.496 23.998 23.717 23.414 23.082 22.663 22.129 21.475 19.649 -8 ,7835 ,TETRA ,17603011,Sun Nov 28 16:28:40 CET,Sun Nov 28 18:13:38 CET,0.0 1.005 1.547 1.951 2.291 2.608 2.889 3.141 3.631 3.858 4.065 4.159 4.647 4.84 5.195 5.54 5.875 6.033 6.338 6.629 7.054 7.326 7.588 7.976 8.343 8.695 9.036 9.373 9.813 10.239 10.635 11.093 11.543 11.997 12.53 13.107 13.628 14.21 14.865 15.568 16.301 17.078 17.966 18.867 19.908 21.066 22.389 23.867 25.548 27.454 29.719 31.589 32.585 33.135 33.394 33.436 33.389 33.283 33.087 32.854 32.637 32.422 32.191 31.92 31.631 31.338 31.013 30.727 30.488 30.219 29.928 29.678 29.407 29.131 28.913 28.691 28.461 28.206 27.932 27.737 27.526 27.211 26.998 26.744 26.607 26.329 26.027 25.711 25.552 25.116 25.003 24.812 24.599 24.092 23.801 23.47 23.121 22.735 22.265 21.66 19.923 -9 ,29686 ,TETRA ,17603012,Sun Nov 28 16:28:41 CET,Sun Nov 28 18:14:02 CET,0.0 1.335 1.844 2.239 2.598 2.926 3.209 3.47 3.962 4.195 4.421 4.536 5.021 5.213 5.583 5.931 6.268 6.431 6.735 7.034 7.46 7.721 7.982 8.364 8.729 9.08 9.412 9.726 10.139 10.552 10.95 11.408 11.845 12.279 12.76 13.297 13.838 14.427 15.063 15.741 16.448 17.235 18.14 19.052 20.07 21.172 22.469 23.911 25.574 27.5 29.785 31.553 32.426 32.84 33.001 33.07 33.045 32.916 32.736 32.499 32.246 31.984 31.706 31.42 31.142 30.886 30.613 30.337 30.084 29.831 29.553 29.306 29.057 28.79 28.582 28.357 28.108 27.836 27.549 27.352 27.146 26.803 26.557 26.315 26.188 25.905 25.598 25.269 25.09 24.634 24.478 24.258 24.03 23.544 23.28 22.981 22.656 22.279 21.804 21.161 19.238 -10 ,16463 ,TETRA ,17603013,Sun Nov 28 16:28:43 CET,Sun Nov 28 18:13:52 CET,0.0 0.725 1.209 1.602 1.93 2.242 2.529 2.791 3.282 3.515 3.738 3.873 4.373 4.568 4.936 5.273 5.592 5.754 6.054 6.342 6.784 7.066 7.323 7.674 8.03 8.39 8.746 9.092 9.51 9.908 10.296 10.753 11.201 11.632 12.129 12.692 13.237 13.838 14.47 15.144 15.838 16.611 17.499 18.387 19.422 20.505 21.748 23.192 24.892 26.853 29.131 30.872 31.792 32.281 32.495 32.535 32.491 32.401 32.236 32.004 31.75 31.481 31.202 30.958 30.721 30.477 30.211 29.954 29.718 29.44 29.146 28.899 28.639 28.354 28.111 27.869 27.608 27.328 27.047 26.855 26.651 26.32 26.09 25.833 25.693 25.403 25.093 24.768 24.589 24.134 24.027 23.823 23.594 23.103 22.84 22.552 22.23 21.859 21.378 20.732 19.08 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index bfc968c6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16113 ,TETRA ,17603014,Sun Nov 28 16:28:40 CET,Sun Nov 28 18:16:51 CET,0.0 1.319 1.858 2.288 2.661 3.011 3.319 3.596 4.129 4.383 4.622 4.79 5.292 5.494 5.884 6.26 6.621 6.8 7.147 7.471 7.941 8.245 8.547 8.991 9.411 9.799 10.171 10.533 11.003 11.473 11.944 12.497 12.998 13.501 14.092 14.732 15.35 16.04 16.766 17.52 18.351 19.303 20.403 21.509 22.764 24.12 25.726 27.647 29.912 32.53 35.792 38.547 40.153 41.145 41.767 42.199 42.474 42.604 42.585 42.528 42.464 42.352 42.241 42.109 41.934 41.751 41.53 41.324 41.149 40.958 40.735 40.54 40.329 40.112 39.952 39.759 39.556 39.358 39.128 38.964 38.801 38.529 38.311 38.07 37.946 37.702 37.454 37.199 37.065 36.67 36.6 36.42 36.235 35.82 35.596 35.341 35.043 34.731 34.388 33.978 32.879 -2 ,25117 ,TETRA ,17603015,Sun Nov 28 16:28:41 CET,Sun Nov 28 18:14:12 CET,0.0 0.882 1.387 1.803 2.151 2.457 2.765 3.062 3.594 3.827 4.048 4.192 4.693 4.898 5.291 5.666 6.022 6.197 6.537 6.852 7.311 7.606 7.9 8.341 8.761 9.158 9.541 9.904 10.345 10.791 11.234 11.747 12.252 12.753 13.346 14.0 14.626 15.327 16.084 16.874 17.669 18.543 19.577 20.659 21.963 23.409 25.055 26.888 29.051 31.699 35.018 37.876 39.55 40.554 41.146 41.52 41.763 41.888 41.91 41.895 41.864 41.793 41.673 41.516 41.367 41.237 41.069 40.874 40.68 40.478 40.291 40.146 39.966 39.735 39.55 39.352 39.133 38.915 38.703 38.554 38.386 38.107 37.906 37.688 37.569 37.318 37.053 36.774 36.63 36.228 36.159 35.979 35.79 35.345 35.092 34.83 34.527 34.178 33.773 33.212 31.752 -3 ,18557 ,TETRA ,17603016,Sun Nov 28 16:28:41 CET,Sun Nov 28 18:13:53 CET,0.0 1.018 1.54 1.98 2.358 2.698 3.007 3.297 3.83 4.083 4.332 4.507 5.016 5.222 5.594 5.938 6.276 6.448 6.785 7.116 7.607 7.91 8.185 8.587 8.995 9.391 9.776 10.15 10.613 11.069 11.516 12.044 12.569 13.075 13.66 14.326 14.958 15.653 16.409 17.206 18.041 19.003 20.126 21.233 22.506 23.914 25.577 27.484 29.674 32.265 35.532 38.32 39.99 41.024 41.647 42.028 42.246 42.359 42.408 42.396 42.3 42.19 42.077 41.911 41.711 41.523 41.339 41.167 40.991 40.808 40.604 40.414 40.219 40.024 39.866 39.688 39.51 39.31 39.079 38.908 38.731 38.454 38.241 38.019 37.903 37.65 37.388 37.106 36.961 36.55 36.457 36.275 36.072 35.637 35.386 35.107 34.843 34.546 34.146 33.656 32.358 -4 ,19677 ,TETRA ,17603017,Sun Nov 28 16:28:40 CET,Sun Nov 28 18:14:47 CET,0.0 1.227 1.731 2.158 2.533 2.874 3.189 3.487 4.016 4.256 4.491 4.635 5.136 5.337 5.724 6.086 6.429 6.599 6.94 7.277 7.765 8.076 8.374 8.796 9.208 9.617 10.017 10.402 10.878 11.313 11.727 12.257 12.788 13.287 13.839 14.479 15.141 15.856 16.595 17.357 18.171 19.167 20.315 21.39 22.648 24.08 25.704 27.553 29.754 32.434 35.77 38.578 40.215 41.209 41.846 42.282 42.547 42.68 42.723 42.678 42.584 42.478 42.329 42.155 42.009 41.842 41.614 41.419 41.256 41.058 40.849 40.671 40.461 40.256 40.092 39.903 39.7 39.489 39.274 39.122 38.955 38.678 38.467 38.246 38.136 37.901 37.64 37.375 37.241 36.843 36.784 36.605 36.417 36.015 35.796 35.55 35.255 34.942 34.591 34.071 32.581 -5 ,14700 ,TETRA ,17603018,Sun Nov 28 16:28:42 CET,Sun Nov 28 18:14:47 CET,0.0 0.921 1.42 1.864 2.242 2.566 2.871 3.173 3.703 3.931 4.157 4.302 4.811 5.028 5.435 5.812 6.182 6.355 6.683 6.996 7.442 7.735 8.032 8.456 8.862 9.272 9.652 10.016 10.509 10.991 11.444 11.989 12.521 13.029 13.608 14.252 14.891 15.591 16.326 17.11 17.928 18.888 20.043 21.148 22.384 23.807 25.503 27.394 29.563 32.155 35.418 38.195 39.884 40.947 41.609 42.005 42.257 42.39 42.359 42.28 42.245 42.181 42.06 41.904 41.725 41.558 41.368 41.172 40.992 40.794 40.602 40.452 40.263 40.027 39.834 39.643 39.444 39.225 38.995 38.824 38.636 38.344 38.144 37.924 37.808 37.582 37.345 37.09 36.945 36.535 36.449 36.261 36.063 35.643 35.407 35.152 34.876 34.537 34.12 33.54 32.12 -6 ,23545 ,TETRA ,17603019,Sun Nov 28 16:28:41 CET,Sun Nov 28 18:15:19 CET,0.0 1.087 1.634 2.047 2.397 2.705 2.991 3.276 3.834 4.089 4.327 4.481 4.98 5.188 5.587 5.954 6.309 6.479 6.814 7.136 7.606 7.91 8.191 8.602 9.016 9.413 9.799 10.158 10.596 11.04 11.476 11.999 12.507 12.98 13.529 14.178 14.826 15.517 16.247 17.015 17.833 18.779 19.891 20.99 22.259 23.719 25.425 27.371 29.63 32.293 35.565 38.276 39.89 40.904 41.51 41.874 42.049 42.136 42.187 42.161 42.085 41.98 41.839 41.701 41.585 41.456 41.277 41.09 40.92 40.734 40.532 40.378 40.199 39.978 39.793 39.603 39.408 39.192 38.954 38.782 38.596 38.316 38.127 37.927 37.824 37.591 37.331 37.047 36.898 36.498 36.428 36.251 36.059 35.642 35.417 35.161 34.86 34.52 34.122 33.583 32.313 -7 ,14289 ,TETRA ,17603020,Sun Nov 28 16:28:44 CET,Sun Nov 28 18:15:16 CET,0.0 1.082 1.663 2.107 2.497 2.851 3.157 3.435 3.951 4.198 4.433 4.58 5.075 5.272 5.657 6.02 6.373 6.549 6.896 7.23 7.704 8.01 8.302 8.721 9.129 9.516 9.891 10.272 10.764 11.223 11.658 12.19 12.72 13.227 13.796 14.455 15.097 15.78 16.519 17.304 18.128 19.046 20.115 21.251 22.562 24.009 25.681 27.541 29.75 32.412 35.729 38.519 40.178 41.192 41.814 42.247 42.517 42.635 42.658 42.619 42.551 42.436 42.273 42.101 41.918 41.733 41.521 41.305 41.111 40.926 40.731 40.555 40.362 40.144 39.952 39.742 39.519 39.291 39.07 38.914 38.748 38.473 38.271 38.063 37.948 37.697 37.447 37.179 37.027 36.61 36.533 36.362 36.179 35.765 35.535 35.282 35.004 34.681 34.279 33.73 32.635 -8 ,32390 ,TETRA ,17603021,Sun Nov 28 16:28:46 CET,Sun Nov 28 18:15:16 CET,0.0 1.087 1.66 2.097 2.457 2.789 3.115 3.402 3.93 4.175 4.397 4.532 5.035 5.241 5.629 6.0 6.349 6.522 6.854 7.179 7.652 7.949 8.234 8.648 9.059 9.455 9.82 10.188 10.684 11.156 11.616 12.169 12.703 13.222 13.811 14.47 15.109 15.807 16.58 17.421 18.285 19.255 20.35 21.401 22.665 24.074 25.727 27.722 30.019 32.682 35.966 38.748 40.384 41.354 41.971 42.418 42.732 42.933 42.973 42.919 42.855 42.736 42.586 42.449 42.306 42.131 41.941 41.802 41.654 41.452 41.236 41.064 40.858 40.625 40.453 40.262 40.051 39.828 39.595 39.427 39.237 38.935 38.727 38.509 38.399 38.169 37.912 37.629 37.48 37.071 37.0 36.825 36.638 36.235 36.005 35.745 35.45 35.093 34.682 34.143 32.487 -9 ,4831 ,TETRA ,17603022,Sun Nov 28 16:28:41 CET,Sun Nov 28 18:15:11 CET,0.0 1.008 1.501 1.935 2.307 2.631 2.935 3.23 3.778 4.027 4.269 4.421 4.916 5.114 5.504 5.884 6.252 6.43 6.773 7.113 7.595 7.889 8.176 8.614 9.023 9.413 9.799 10.164 10.638 11.125 11.581 12.08 12.584 13.088 13.653 14.304 14.944 15.626 16.347 17.126 17.931 18.844 19.976 21.129 22.475 23.938 25.581 27.416 29.582 32.235 35.576 38.343 39.957 40.999 41.661 42.073 42.3 42.404 42.435 42.408 42.342 42.235 42.123 42.025 41.889 41.71 41.513 41.343 41.191 41.011 40.804 40.642 40.471 40.264 40.104 39.94 39.746 39.546 39.335 39.171 38.993 38.697 38.484 38.27 38.159 37.925 37.672 37.401 37.255 36.844 36.769 36.585 36.38 35.964 35.739 35.475 35.182 34.826 34.373 33.785 32.598 -10 ,29376 ,TETRA ,17603023,Sun Nov 28 16:28:42 CET,Sun Nov 28 18:14:27 CET,0.0 0.846 1.334 1.765 2.151 2.483 2.789 3.074 3.602 3.855 4.095 4.257 4.755 4.957 5.354 5.742 6.112 6.29 6.63 6.945 7.413 7.722 8.012 8.43 8.825 9.191 9.556 9.923 10.42 10.912 11.377 11.923 12.451 12.953 13.517 14.151 14.78 15.483 16.206 16.959 17.799 18.78 19.877 20.96 22.237 23.694 25.413 27.296 29.523 32.203 35.473 38.243 39.831 40.794 41.432 41.851 42.088 42.226 42.275 42.277 42.234 42.102 41.947 41.827 41.69 41.533 41.341 41.146 40.976 40.798 40.606 40.428 40.222 39.998 39.814 39.616 39.404 39.18 38.95 38.781 38.606 38.36 38.172 37.948 37.831 37.598 37.351 37.087 36.949 36.548 36.479 36.304 36.109 35.632 35.375 35.114 34.81 34.476 34.094 33.625 32.566 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 6f48ac26..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32508 ,TETRA ,17603024,Sun Nov 28 16:28:41 CET,Sun Nov 28 18:13:45 CET,0.0 1.146 1.638 2.038 2.392 2.7 2.961 3.211 3.704 3.922 4.126 4.238 4.702 4.88 5.213 5.522 5.824 5.972 6.266 6.557 6.957 7.207 7.456 7.827 8.182 8.525 8.861 9.178 9.568 9.929 10.275 10.697 11.108 11.484 11.908 12.412 12.901 13.415 13.968 14.57 15.19 15.883 16.668 17.398 18.21 19.1 20.111 21.255 22.545 23.957 25.465 26.382 26.655 26.666 26.54 26.244 25.916 25.592 25.233 24.857 24.501 24.129 23.776 23.462 23.179 22.891 22.57 22.288 22.009 21.689 21.355 21.066 20.769 20.47 20.231 19.979 19.695 19.389 19.095 18.9 18.69 18.347 18.098 17.84 17.71 17.42 17.105 16.79 16.631 16.199 16.091 15.883 15.674 15.215 14.955 14.689 14.382 14.028 13.631 13.143 12.249 -2 ,21978 ,TETRA ,17603025,Sun Nov 28 16:28:42 CET,Sun Nov 28 18:13:09 CET,0.0 1.415 1.961 2.397 2.758 3.082 3.368 3.629 4.109 4.333 4.546 4.658 5.117 5.291 5.633 5.964 6.273 6.419 6.692 6.956 7.352 7.607 7.854 8.215 8.559 8.884 9.19 9.484 9.874 10.263 10.626 11.041 11.428 11.785 12.206 12.707 13.207 13.74 14.291 14.864 15.434 16.047 16.753 17.463 18.295 19.205 20.231 21.381 22.6 23.922 25.401 26.303 26.592 26.566 26.396 26.153 25.833 25.509 25.195 24.821 24.457 24.114 23.791 23.482 23.166 22.872 22.563 22.25 21.963 21.658 21.313 21.042 20.765 20.454 20.208 19.956 19.698 19.421 19.127 18.918 18.693 18.339 18.095 17.84 17.714 17.452 17.163 16.849 16.684 16.249 16.151 15.96 15.76 15.317 15.068 14.793 14.494 14.172 13.77 13.239 12.039 -3 ,15189 ,TETRA ,17603026,Sun Nov 28 16:28:42 CET,Sun Nov 28 18:16:20 CET,0.0 1.075 1.592 1.981 2.31 2.606 2.897 3.171 3.665 3.889 4.097 4.222 4.687 4.861 5.195 5.531 5.859 6.014 6.317 6.589 6.967 7.218 7.472 7.854 8.219 8.557 8.87 9.172 9.571 9.947 10.309 10.735 11.138 11.535 11.981 12.493 12.987 13.488 14.013 14.57 15.158 15.83 16.632 17.419 18.285 19.267 20.352 21.457 22.627 23.908 25.32 26.263 26.552 26.528 26.376 26.1 25.795 25.509 25.219 24.854 24.485 24.134 23.81 23.491 23.176 22.887 22.586 22.282 21.998 21.708 21.398 21.128 20.834 20.538 20.301 20.052 19.798 19.519 19.201 18.969 18.732 18.377 18.145 17.9 17.766 17.479 17.174 16.839 16.66 16.216 16.116 15.924 15.713 15.258 15.004 14.713 14.414 14.089 13.669 13.09 11.908 -4 ,22421 ,TETRA ,17603027,Sun Nov 28 16:28:42 CET,Sun Nov 28 18:13:48 CET,0.0 1.082 1.545 1.925 2.27 2.581 2.871 3.142 3.627 3.845 4.06 4.191 4.661 4.847 5.197 5.509 5.796 5.947 6.258 6.547 6.954 7.213 7.46 7.823 8.171 8.513 8.844 9.142 9.51 9.868 10.229 10.668 11.083 11.488 11.957 12.477 12.977 13.515 14.068 14.614 15.188 15.877 16.661 17.396 18.224 19.111 20.128 21.257 22.455 23.771 25.227 26.203 26.552 26.56 26.364 26.052 25.726 25.349 24.963 24.541 24.18 23.868 23.532 23.186 22.843 22.534 22.198 21.887 21.616 21.314 20.986 20.714 20.424 20.113 19.879 19.647 19.403 19.134 18.851 18.651 18.44 18.098 17.846 17.587 17.453 17.171 16.885 16.569 16.404 15.96 15.841 15.641 15.437 15.006 14.75 14.467 14.17 13.837 13.428 12.865 11.674 -5 ,13966 ,TETRA ,17603028,Sun Nov 28 16:28:44 CET,Sun Nov 28 18:14:12 CET,0.0 1.074 1.567 1.956 2.297 2.617 2.901 3.159 3.625 3.846 4.055 4.165 4.629 4.806 5.148 5.475 5.795 5.945 6.219 6.501 6.916 7.161 7.403 7.763 8.102 8.438 8.757 9.036 9.411 9.786 10.145 10.602 11.024 11.411 11.863 12.378 12.862 13.359 13.905 14.477 15.044 15.705 16.503 17.265 18.1 19.003 20.02 21.149 22.395 23.801 25.278 26.195 26.479 26.481 26.36 26.118 25.769 25.397 25.062 24.683 24.325 23.977 23.619 23.289 23.01 22.737 22.411 22.093 21.791 21.485 21.177 20.91 20.627 20.332 20.083 19.814 19.543 19.274 18.987 18.778 18.57 18.237 17.987 17.732 17.599 17.309 17.007 16.702 16.543 16.112 16.015 15.814 15.601 15.13 14.856 14.557 14.242 13.893 13.454 12.901 11.536 -6 ,23767 ,TETRA ,17603029,Sun Nov 28 16:28:46 CET,Sun Nov 28 18:14:06 CET,0.0 1.245 1.755 2.166 2.503 2.805 3.076 3.327 3.785 4.004 4.216 4.324 4.79 4.968 5.293 5.616 5.929 6.079 6.375 6.671 7.1 7.354 7.587 7.931 8.266 8.607 8.943 9.258 9.659 10.046 10.421 10.87 11.284 11.675 12.146 12.643 13.101 13.62 14.158 14.723 15.295 15.907 16.651 17.393 18.196 19.064 20.059 21.144 22.372 23.79 25.309 26.2 26.43 26.408 26.295 26.058 25.733 25.382 25.033 24.647 24.329 24.003 23.63 23.278 22.927 22.588 22.256 21.955 21.683 21.4 21.116 20.872 20.594 20.293 20.056 19.812 19.54 19.251 18.952 18.746 18.541 18.22 17.987 17.724 17.591 17.311 17.008 16.698 16.532 16.09 15.969 15.763 15.549 15.108 14.873 14.612 14.308 13.957 13.533 13.0 11.676 -7 ,24582 ,TETRA ,17603030,Sun Nov 28 16:29:27 CET,Sun Nov 28 18:14:59 CET,0.0 0.814 1.236 1.598 1.923 2.221 2.501 2.76 3.229 3.443 3.646 3.762 4.23 4.409 4.742 5.06 5.362 5.506 5.78 6.046 6.439 6.685 6.915 7.25 7.576 7.912 8.242 8.552 8.926 9.273 9.623 10.032 10.428 10.85 11.332 11.822 12.263 12.755 13.314 13.903 14.512 15.206 15.977 16.703 17.543 18.451 19.488 20.6 21.854 23.231 24.734 25.729 26.046 26.094 25.972 25.758 25.504 25.223 24.918 24.582 24.225 23.843 23.477 23.143 22.824 22.519 22.191 21.873 21.579 21.265 20.931 20.644 20.341 20.04 19.813 19.572 19.313 19.028 18.727 18.526 18.311 17.959 17.719 17.47 17.339 17.069 16.785 16.467 16.302 15.871 15.76 15.557 15.348 14.884 14.628 14.351 14.041 13.697 13.296 12.789 11.723 -8 ,17518 ,TETRA ,17603031,Sun Nov 28 16:28:43 CET,Sun Nov 28 18:15:30 CET,0.0 0.896 1.348 1.715 2.048 2.364 2.651 2.914 3.393 3.611 3.819 3.925 4.383 4.56 4.897 5.22 5.533 5.681 5.973 6.255 6.657 6.914 7.159 7.514 7.857 8.187 8.504 8.818 9.213 9.583 9.95 10.39 10.796 11.162 11.592 12.106 12.585 13.105 13.677 14.248 14.792 15.416 16.165 16.894 17.725 18.635 19.648 20.763 22.017 23.391 24.877 25.866 26.203 26.195 26.03 25.782 25.478 25.107 24.754 24.377 24.025 23.677 23.324 22.992 22.646 22.297 21.921 21.589 21.292 20.977 20.65 20.389 20.111 19.81 19.569 19.317 19.064 18.8 18.518 18.311 18.094 17.754 17.507 17.259 17.128 16.854 16.563 16.235 16.059 15.622 15.542 15.351 15.143 14.701 14.469 14.213 13.926 13.588 13.167 12.677 11.645 -9 ,11546 ,TETRA ,17603032,Sun Nov 28 16:28:43 CET,Sun Nov 28 18:14:00 CET,0.0 1.122 1.65 2.037 2.378 2.697 2.979 3.244 3.736 3.974 4.196 4.316 4.791 4.974 5.326 5.654 5.956 6.105 6.399 6.676 7.076 7.335 7.577 7.917 8.252 8.585 8.909 9.209 9.575 9.949 10.324 10.768 11.189 11.581 12.014 12.513 13.006 13.525 14.035 14.589 15.216 15.91 16.635 17.358 18.238 19.156 20.183 21.317 22.575 23.93 25.411 26.382 26.704 26.717 26.581 26.34 26.055 25.771 25.454 25.092 24.757 24.415 24.074 23.736 23.422 23.098 22.745 22.428 22.134 21.835 21.514 21.235 20.964 20.681 20.439 20.182 19.923 19.641 19.329 19.112 18.891 18.54 18.294 18.04 17.908 17.635 17.341 17.028 16.862 16.417 16.301 16.097 15.888 15.429 15.178 14.914 14.599 14.249 13.869 13.363 12.143 -10 ,9201 ,TETRA ,17603033,Sun Nov 28 16:28:43 CET,Sun Nov 28 18:13:44 CET,0.0 0.951 1.477 1.935 2.297 2.585 2.849 3.112 3.598 3.81 4.017 4.142 4.612 4.797 5.153 5.495 5.814 5.962 6.249 6.523 6.913 7.167 7.417 7.778 8.128 8.465 8.779 9.078 9.443 9.786 10.132 10.554 10.963 11.365 11.826 12.328 12.804 13.299 13.818 14.379 14.962 15.609 16.343 17.083 17.953 18.889 19.909 21.026 22.265 23.611 25.067 26.061 26.392 26.398 26.256 25.984 25.679 25.365 25.079 24.73 24.357 23.996 23.639 23.313 23.011 22.711 22.377 22.055 21.781 21.505 21.186 20.924 20.65 20.345 20.09 19.825 19.566 19.297 18.993 18.778 18.572 18.248 18.013 17.757 17.627 17.361 17.075 16.783 16.63 16.208 16.14 15.95 15.751 15.333 15.1 14.855 14.581 14.241 13.836 13.3 12.276 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 7f18674f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27834 ,TETRA ,17603034,Sun Nov 28 16:29:28 CET,Sun Nov 28 18:15:38 CET,0.0 1.015 1.483 1.857 2.164 2.434 2.685 2.93 3.388 3.598 3.8 3.926 4.362 4.543 4.882 5.195 5.48 5.616 5.875 6.128 6.517 6.756 6.972 7.293 7.608 7.917 8.219 8.508 8.882 9.237 9.569 9.963 10.345 10.727 11.168 11.628 12.069 12.55 13.067 13.604 14.135 14.744 15.459 16.157 16.923 17.713 18.594 19.577 20.632 21.718 22.805 23.398 23.512 23.387 23.093 22.705 22.312 21.951 21.605 21.2 20.808 20.434 20.073 19.705 19.324 18.958 18.578 18.24 17.927 17.58 17.229 16.967 16.687 16.352 16.086 15.816 15.539 15.254 14.959 14.757 14.537 14.177 13.925 13.66 13.523 13.241 12.933 12.596 12.417 11.985 11.826 11.613 11.391 10.9 10.621 10.314 9.981 9.602 9.162 8.635 7.475 -2 ,6878 ,TETRA ,17603035,Sun Nov 28 16:30:10 CET,Sun Nov 28 18:18:58 CET,0.0 0.856 1.307 1.706 2.055 2.346 2.613 2.861 3.309 3.518 3.718 3.831 4.261 4.437 4.769 5.08 5.377 5.516 5.79 6.062 6.443 6.685 6.919 7.256 7.586 7.896 8.187 8.482 8.864 9.233 9.592 10.009 10.383 10.739 11.158 11.616 12.031 12.472 12.944 13.449 13.977 14.586 15.295 15.946 16.655 17.442 18.307 19.256 20.375 21.565 22.683 23.233 23.29 23.118 22.777 22.338 21.892 21.457 21.037 20.557 20.161 19.821 19.453 19.077 18.721 18.381 18.009 17.661 17.339 17.007 16.681 16.392 16.099 15.795 15.53 15.25 14.97 14.663 14.341 14.122 13.886 13.521 13.272 13.012 12.875 12.586 12.29 11.964 11.786 11.364 11.23 11.024 10.8 10.296 10.017 9.722 9.405 9.052 8.652 8.143 6.989 -3 ,13356 ,TETRA ,17603036,Sun Nov 28 16:30:11 CET,Sun Nov 28 18:15:42 CET,0.0 1.029 1.529 1.916 2.261 2.546 2.805 3.042 3.498 3.712 3.917 4.062 4.495 4.668 5.001 5.311 5.616 5.761 6.027 6.289 6.684 6.926 7.152 7.481 7.813 8.147 8.454 8.727 9.089 9.458 9.805 10.232 10.633 11.001 11.422 11.881 12.311 12.761 13.225 13.715 14.211 14.78 15.465 16.102 16.845 17.674 18.546 19.475 20.552 21.712 22.823 23.362 23.417 23.267 22.966 22.553 22.133 21.777 21.436 21.012 20.627 20.279 19.921 19.558 19.198 18.837 18.451 18.102 17.807 17.485 17.125 16.836 16.532 16.235 16.016 15.768 15.486 15.195 14.904 14.702 14.477 14.11 13.856 13.588 13.445 13.158 12.852 12.533 12.374 11.952 11.808 11.603 11.375 10.877 10.608 10.318 9.999 9.636 9.237 8.744 7.601 -4 ,5991 ,TETRA ,17603037,Sun Nov 28 16:29:26 CET,Sun Nov 28 18:15:41 CET,0.0 0.734 1.197 1.583 1.9 2.176 2.423 2.653 3.073 3.275 3.474 3.6 4.028 4.195 4.52 4.832 5.13 5.272 5.535 5.786 6.172 6.42 6.641 6.956 7.277 7.596 7.905 8.207 8.604 8.973 9.317 9.724 10.111 10.465 10.863 11.325 11.744 12.199 12.718 13.28 13.851 14.446 15.09 15.746 16.526 17.309 18.156 19.142 20.23 21.333 22.409 22.993 23.068 22.944 22.642 22.278 21.905 21.461 21.068 20.652 20.258 19.883 19.477 19.069 18.693 18.371 18.022 17.693 17.411 17.116 16.77 16.471 16.173 15.85 15.576 15.291 15.003 14.708 14.405 14.193 13.969 13.622 13.38 13.123 12.984 12.69 12.384 12.042 11.865 11.446 11.328 11.137 10.927 10.46 10.2 9.906 9.582 9.21 8.784 8.272 7.314 -5 ,29302 ,TETRA ,17603038,Sun Nov 28 16:29:28 CET,Sun Nov 28 18:17:49 CET,0.0 0.811 1.258 1.624 1.935 2.21 2.479 2.727 3.162 3.356 3.546 3.666 4.104 4.274 4.602 4.924 5.22 5.364 5.644 5.911 6.276 6.514 6.756 7.08 7.376 7.694 8.006 8.288 8.63 8.945 9.263 9.65 10.021 10.386 10.801 11.26 11.705 12.223 12.788 13.351 13.897 14.507 15.225 15.9 16.628 17.412 18.288 19.25 20.343 21.476 22.55 23.123 23.145 22.968 22.713 22.394 22.023 21.631 21.247 20.797 20.391 20.005 19.626 19.269 18.916 18.585 18.226 17.89 17.582 17.251 16.895 16.597 16.305 16.0 15.746 15.463 15.176 14.881 14.571 14.354 14.13 13.78 13.523 13.246 13.106 12.826 12.525 12.193 12.016 11.591 11.448 11.239 11.011 10.519 10.263 9.976 9.641 9.262 8.8 8.197 6.966 -6 ,4164 ,TETRA ,17603039,Sun Nov 28 16:29:27 CET,Sun Nov 28 18:16:11 CET,0.0 0.716 1.16 1.556 1.884 2.163 2.413 2.639 3.057 3.264 3.457 3.544 3.964 4.134 4.456 4.771 5.072 5.211 5.475 5.735 6.113 6.357 6.587 6.925 7.256 7.56 7.849 8.135 8.51 8.873 9.211 9.621 10.017 10.396 10.824 11.286 11.715 12.171 12.661 13.181 13.75 14.392 15.062 15.711 16.485 17.307 18.199 19.133 20.144 21.212 22.298 22.873 22.952 22.802 22.522 22.189 21.826 21.459 21.086 20.629 20.223 19.84 19.435 19.034 18.655 18.303 17.949 17.646 17.367 17.058 16.711 16.41 16.096 15.765 15.489 15.192 14.896 14.594 14.281 14.069 13.85 13.494 13.241 12.984 12.856 12.569 12.247 11.909 11.735 11.306 11.154 10.95 10.744 10.27 10.0 9.71 9.386 9.039 8.624 8.076 7.014 -7 ,2998 ,TETRA ,17603040,Sun Nov 28 16:29:28 CET,Sun Nov 28 18:16:10 CET,0.0 0.806 1.294 1.67 2.001 2.304 2.571 2.821 3.285 3.498 3.707 3.839 4.261 4.432 4.761 5.063 5.354 5.496 5.773 6.039 6.406 6.641 6.873 7.201 7.514 7.81 8.092 8.365 8.735 9.087 9.403 9.8 10.206 10.592 11.024 11.498 11.951 12.463 13.009 13.574 14.134 14.702 15.35 16.001 16.745 17.559 18.439 19.413 20.537 21.745 22.92 23.534 23.643 23.472 23.195 22.884 22.518 22.132 21.751 21.327 20.932 20.551 20.163 19.786 19.438 19.096 18.703 18.356 18.051 17.726 17.415 17.148 16.845 16.523 16.274 16.005 15.725 15.429 15.108 14.891 14.661 14.293 14.033 13.774 13.64 13.361 13.067 12.738 12.565 12.144 12.011 11.812 11.603 11.152 10.901 10.606 10.289 9.947 9.522 8.951 7.577 -8 ,24174 ,TETRA ,17603041,Sun Nov 28 16:30:09 CET,Sun Nov 28 18:15:56 CET,0.0 1.069 1.585 1.975 2.293 2.58 2.854 3.119 3.607 3.817 4.002 4.102 4.523 4.685 4.998 5.308 5.602 5.745 6.025 6.286 6.657 6.898 7.133 7.456 7.762 8.073 8.37 8.65 9.031 9.395 9.72 10.118 10.499 10.871 11.286 11.727 12.165 12.651 13.185 13.733 14.284 14.891 15.566 16.233 16.979 17.742 18.596 19.527 20.514 21.618 22.776 23.413 23.522 23.394 23.12 22.758 22.351 21.951 21.582 21.182 20.779 20.403 20.071 19.731 19.372 19.027 18.644 18.281 17.98 17.672 17.319 17.032 16.728 16.395 16.138 15.855 15.568 15.279 14.96 14.74 14.526 14.184 13.928 13.659 13.521 13.235 12.935 12.623 12.464 12.046 11.876 11.651 11.426 10.939 10.673 10.377 10.057 9.735 9.348 8.798 7.519 -9 ,19554 ,TETRA ,17603042,Sun Nov 28 16:30:11 CET,Sun Nov 28 18:16:04 CET,0.0 0.955 1.43 1.787 2.088 2.379 2.654 2.901 3.347 3.545 3.749 3.881 4.303 4.469 4.806 5.135 5.431 5.571 5.832 6.087 6.48 6.729 6.96 7.296 7.623 7.935 8.225 8.504 8.884 9.244 9.577 9.967 10.337 10.697 11.116 11.588 12.017 12.49 12.998 13.501 14.016 14.582 15.223 15.863 16.589 17.369 18.275 19.248 20.303 21.445 22.613 23.209 23.226 23.063 22.807 22.451 22.064 21.688 21.316 20.916 20.537 20.151 19.745 19.344 18.986 18.662 18.302 17.955 17.65 17.323 16.965 16.684 16.39 16.048 15.772 15.501 15.232 14.942 14.624 14.41 14.198 13.841 13.567 13.289 13.155 12.871 12.558 12.231 12.053 11.621 11.454 11.233 11.012 10.552 10.305 10.041 9.744 9.397 8.986 8.476 7.573 -10 ,16234 ,TETRA ,17603043,Sun Nov 28 16:29:33 CET,Sun Nov 28 18:16:00 CET,0.0 0.94 1.418 1.816 2.138 2.413 2.668 2.913 3.387 3.602 3.805 3.93 4.357 4.533 4.869 5.176 5.477 5.623 5.898 6.162 6.551 6.809 7.042 7.373 7.72 8.057 8.378 8.672 9.04 9.401 9.736 10.138 10.538 10.909 11.339 11.829 12.303 12.816 13.342 13.879 14.401 14.966 15.624 16.275 17.011 17.851 18.792 19.785 20.862 21.949 23.054 23.603 23.629 23.464 23.187 22.839 22.443 22.053 21.692 21.298 20.93 20.547 20.168 19.8 19.448 19.113 18.735 18.382 18.082 17.769 17.433 17.146 16.84 16.501 16.233 15.957 15.669 15.368 15.06 14.842 14.607 14.24 13.982 13.718 13.577 13.272 12.95 12.612 12.44 12.011 11.864 11.648 11.414 10.94 10.681 10.394 10.069 9.686 9.241 8.688 7.138 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt deleted file mode 100644 index 1de63697..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23657 ,TETRA ,17603044,Sun Nov 28 16:29:33 CET,Sun Nov 28 18:16:45 CET,0.0 0.766 1.213 1.59 1.909 2.178 2.414 2.635 3.046 3.236 3.414 3.5 3.912 4.058 4.358 4.641 4.904 5.032 5.276 5.505 5.836 6.047 6.24 6.515 6.778 7.02 7.253 7.491 7.792 8.076 8.339 8.644 8.946 9.22 9.517 9.835 10.127 10.442 10.771 11.116 11.452 11.783 12.155 12.527 12.881 13.162 13.361 13.471 13.5 13.255 12.447 11.108 9.765 8.571 7.536 6.596 5.771 5.002 4.268 3.462 2.789 2.235 1.676 1.105 0.57 0.106 -0.399 -0.86 -1.255 -1.675 -2.113 -2.474 -2.847 -3.238 -3.552 -3.885 -4.231 -4.59 -4.957 -5.211 -5.481 -5.907 -6.206 -6.514 -6.668 -6.986 -7.33 -7.707 -7.903 -8.37 -8.547 -8.778 -9.01 -9.528 -9.819 -10.118 -10.437 -10.814 -11.305 -11.918 -13.132 -2 ,16081 ,TETRA ,17603045,Sun Nov 28 16:30:09 CET,Sun Nov 28 18:18:40 CET,0.0 0.875 1.346 1.724 2.039 2.306 2.55 2.782 3.199 3.395 3.589 3.683 4.088 4.241 4.547 4.828 5.094 5.226 5.481 5.721 6.057 6.264 6.458 6.732 6.989 7.23 7.46 7.687 7.947 8.194 8.45 8.74 9.004 9.262 9.569 9.901 10.181 10.454 10.749 11.08 11.387 11.69 12.044 12.34 12.634 12.948 13.202 13.284 13.259 13.019 12.203 10.9 9.608 8.402 7.353 6.359 5.457 4.674 3.991 3.291 2.706 2.159 1.611 1.09 0.576 0.096 -0.419 -0.9 -1.299 -1.708 -2.158 -2.536 -2.91 -3.298 -3.623 -3.954 -4.286 -4.619 -4.972 -5.231 -5.48 -5.867 -6.162 -6.474 -6.638 -6.977 -7.318 -7.674 -7.865 -8.336 -8.487 -8.706 -8.943 -9.438 -9.698 -9.994 -10.344 -10.739 -11.2 -11.769 -12.806 -3 ,17323 ,TETRA ,17603046,Sun Nov 28 16:29:34 CET,Sun Nov 28 18:15:34 CET,0.0 0.885 1.35 1.702 1.986 2.267 2.53 2.747 3.153 3.341 3.519 3.611 4.022 4.175 4.469 4.737 4.994 5.125 5.382 5.619 5.951 6.155 6.345 6.611 6.859 7.097 7.33 7.567 7.868 8.141 8.41 8.71 8.977 9.228 9.515 9.847 10.152 10.481 10.814 11.125 11.43 11.76 12.102 12.388 12.659 12.901 13.137 13.29 13.27 12.972 12.091 10.763 9.558 8.45 7.42 6.452 5.545 4.716 4.023 3.333 2.733 2.182 1.626 1.085 0.575 0.098 -0.433 -0.9 -1.289 -1.705 -2.137 -2.488 -2.859 -3.249 -3.55 -3.876 -4.221 -4.59 -4.988 -5.256 -5.524 -5.936 -6.221 -6.534 -6.698 -7.039 -7.405 -7.783 -7.972 -8.428 -8.552 -8.767 -8.995 -9.471 -9.735 -10.035 -10.374 -10.775 -11.242 -11.751 -13.051 -4 ,10903 ,TETRA ,17603047,Sun Nov 28 16:29:36 CET,Sun Nov 28 18:15:13 CET,0.0 0.728 1.171 1.517 1.825 2.114 2.38 2.634 3.087 3.291 3.47 3.544 3.947 4.091 4.376 4.658 4.941 5.076 5.327 5.561 5.888 6.092 6.285 6.552 6.799 7.038 7.284 7.531 7.82 8.077 8.321 8.612 8.874 9.129 9.447 9.797 10.134 10.503 10.858 11.194 11.511 11.828 12.146 12.45 12.805 13.095 13.279 13.42 13.461 13.188 12.342 10.971 9.658 8.436 7.351 6.36 5.478 4.649 3.907 3.145 2.508 1.949 1.375 0.801 0.257 -0.235 -0.748 -1.226 -1.651 -2.08 -2.53 -2.921 -3.319 -3.718 -4.03 -4.369 -4.735 -5.116 -5.506 -5.768 -6.036 -6.469 -6.769 -7.072 -7.235 -7.593 -7.949 -8.298 -8.477 -8.941 -9.111 -9.341 -9.581 -10.125 -10.414 -10.703 -11.027 -11.403 -11.854 -12.418 -13.517 -5 ,19531 ,TETRA ,17603048,Sun Nov 28 16:29:36 CET,Sun Nov 28 18:16:00 CET,0.0 0.911 1.404 1.783 2.116 2.413 2.67 2.902 3.323 3.519 3.708 3.803 4.216 4.372 4.678 4.946 5.178 5.296 5.524 5.745 6.071 6.276 6.471 6.743 6.98 7.224 7.464 7.675 7.948 8.221 8.484 8.776 9.059 9.344 9.646 9.955 10.259 10.584 10.932 11.288 11.638 12.011 12.379 12.726 13.103 13.439 13.688 13.855 13.9 13.607 12.707 11.412 10.165 8.975 7.938 6.994 6.153 5.357 4.614 3.844 3.16 2.561 1.99 1.447 0.957 0.502 0.025 -0.419 -0.824 -1.25 -1.707 -2.095 -2.501 -2.905 -3.219 -3.562 -3.915 -4.278 -4.665 -4.925 -5.193 -5.618 -5.924 -6.251 -6.411 -6.733 -7.078 -7.471 -7.678 -8.143 -8.311 -8.557 -8.806 -9.328 -9.623 -9.945 -10.304 -10.685 -11.108 -11.66 -12.834 -6 ,31770 ,TETRA ,17603049,Sun Nov 28 16:29:36 CET,Sun Nov 28 18:16:00 CET,0.0 0.79 1.262 1.618 1.908 2.173 2.427 2.655 3.067 3.278 3.477 3.581 4.008 4.173 4.468 4.73 4.982 5.104 5.33 5.552 5.881 6.093 6.302 6.595 6.862 7.098 7.316 7.544 7.839 8.1 8.354 8.656 8.94 9.214 9.511 9.83 10.131 10.437 10.74 11.077 11.408 11.745 12.112 12.43 12.735 13.014 13.265 13.427 13.426 13.175 12.411 11.086 9.798 8.612 7.582 6.633 5.746 4.895 4.12 3.348 2.674 2.075 1.5 0.923 0.362 -0.147 -0.658 -1.115 -1.527 -1.958 -2.39 -2.751 -3.129 -3.511 -3.821 -4.144 -4.465 -4.815 -5.207 -5.473 -5.737 -6.156 -6.45 -6.757 -6.915 -7.237 -7.573 -7.93 -8.113 -8.562 -8.71 -8.945 -9.181 -9.703 -10.006 -10.327 -10.676 -11.055 -11.49 -12.053 -13.021 -7 ,11465 ,TETRA ,17603050,Sun Nov 28 16:29:37 CET,Sun Nov 28 18:16:06 CET,0.0 0.823 1.276 1.629 1.943 2.221 2.467 2.706 3.144 3.336 3.508 3.572 3.984 4.143 4.455 4.752 5.028 5.156 5.384 5.598 5.92 6.122 6.323 6.607 6.86 7.108 7.346 7.564 7.842 8.107 8.37 8.689 8.969 9.212 9.476 9.806 10.145 10.51 10.874 11.234 11.602 11.939 12.321 12.67 12.983 13.311 13.584 13.78 13.801 13.561 12.797 11.475 10.127 8.852 7.721 6.691 5.804 4.983 4.237 3.475 2.805 2.187 1.597 1.049 0.549 0.102 -0.376 -0.833 -1.24 -1.687 -2.165 -2.538 -2.908 -3.293 -3.595 -3.903 -4.231 -4.587 -4.964 -5.23 -5.5 -5.911 -6.207 -6.516 -6.675 -6.998 -7.346 -7.721 -7.912 -8.386 -8.57 -8.803 -9.042 -9.56 -9.841 -10.145 -10.475 -10.846 -11.29 -11.816 -12.938 -8 ,15920 ,TETRA ,17603051,Sun Nov 28 16:29:40 CET,Sun Nov 28 18:15:38 CET,0.0 0.805 1.235 1.589 1.88 2.156 2.416 2.646 3.067 3.256 3.432 3.518 3.94 4.107 4.416 4.683 4.926 5.049 5.287 5.513 5.823 6.018 6.215 6.497 6.762 7.013 7.252 7.476 7.764 8.044 8.293 8.594 8.892 9.172 9.489 9.819 10.103 10.413 10.75 11.064 11.364 11.687 12.039 12.373 12.735 13.07 13.348 13.52 13.506 13.197 12.347 11.046 9.741 8.564 7.51 6.517 5.607 4.727 3.993 3.262 2.593 1.978 1.386 0.826 0.296 -0.172 -0.662 -1.109 -1.509 -1.965 -2.438 -2.819 -3.222 -3.631 -3.927 -4.227 -4.555 -4.92 -5.312 -5.575 -5.84 -6.255 -6.546 -6.855 -7.012 -7.332 -7.667 -8.023 -8.218 -8.693 -8.847 -9.066 -9.31 -9.82 -10.082 -10.381 -10.731 -11.096 -11.497 -12.014 -13.14 -9 ,13070 ,TETRA ,17603052,Sun Nov 28 16:29:41 CET,Sun Nov 28 18:15:23 CET,0.0 0.766 1.234 1.605 1.938 2.226 2.469 2.698 3.11 3.293 3.462 3.541 3.952 4.102 4.387 4.66 4.918 5.042 5.279 5.511 5.839 6.041 6.235 6.517 6.802 7.082 7.33 7.56 7.862 8.141 8.39 8.683 8.976 9.251 9.548 9.853 10.118 10.441 10.784 11.085 11.394 11.735 12.105 12.411 12.706 13.0 13.218 13.382 13.416 13.151 12.342 11.016 9.752 8.629 7.559 6.511 5.592 4.717 3.95 3.192 2.523 1.965 1.433 0.873 0.332 -0.142 -0.628 -1.076 -1.476 -1.902 -2.35 -2.724 -3.105 -3.515 -3.85 -4.195 -4.546 -4.911 -5.287 -5.547 -5.815 -6.23 -6.529 -6.845 -7.007 -7.344 -7.706 -8.072 -8.262 -8.732 -8.891 -9.117 -9.356 -9.872 -10.145 -10.457 -10.791 -11.15 -11.563 -12.078 -13.069 -10 ,17880 ,TETRA ,17603053,Sun Nov 28 16:29:36 CET,Sun Nov 28 18:15:57 CET,0.0 0.812 1.261 1.629 1.929 2.209 2.479 2.71 3.12 3.317 3.507 3.612 4.036 4.189 4.468 4.732 4.98 5.1 5.334 5.558 5.875 6.075 6.273 6.565 6.835 7.093 7.335 7.554 7.834 8.107 8.35 8.634 8.924 9.211 9.511 9.837 10.133 10.432 10.762 11.068 11.384 11.726 12.054 12.341 12.658 12.983 13.271 13.455 13.489 13.257 12.415 11.103 9.88 8.738 7.705 6.75 5.854 5.028 4.312 3.539 2.856 2.247 1.678 1.153 0.628 0.128 -0.387 -0.836 -1.223 -1.622 -2.052 -2.415 -2.781 -3.18 -3.511 -3.848 -4.187 -4.549 -4.936 -5.2 -5.468 -5.878 -6.175 -6.484 -6.64 -6.968 -7.307 -7.657 -7.848 -8.329 -8.527 -8.757 -8.981 -9.455 -9.724 -10.028 -10.375 -10.761 -11.191 -11.724 -13.002 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt deleted file mode 100644 index d38ff7a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21198 ,TETRA ,17603054,Sun Nov 28 16:29:38 CET,Sun Nov 28 18:16:20 CET,0.0 1.349 1.838 2.234 2.548 2.832 3.115 3.372 3.857 4.076 4.278 4.402 4.839 5.02 5.345 5.651 5.946 6.079 6.325 6.574 6.931 7.149 7.366 7.682 7.978 8.264 8.54 8.804 9.136 9.451 9.749 10.094 10.408 10.721 11.084 11.477 11.852 12.235 12.605 12.975 13.346 13.724 14.133 14.547 15.017 15.465 15.907 16.337 16.621 16.751 16.499 15.62 14.634 13.646 12.752 11.959 11.205 10.451 9.772 9.075 8.471 7.941 7.415 6.917 6.445 5.996 5.507 5.082 4.733 4.345 3.94 3.607 3.247 2.869 2.564 2.249 1.93 1.596 1.234 0.981 0.725 0.321 0.03 -0.287 -0.443 -0.742 -1.062 -1.41 -1.587 -2.041 -2.19 -2.407 -2.634 -3.123 -3.393 -3.684 -3.995 -4.339 -4.785 -5.383 -6.87 -2 ,11402 ,TETRA ,17603055,Sun Nov 28 16:29:40 CET,Sun Nov 28 18:17:16 CET,0.0 1.111 1.614 2.031 2.379 2.678 2.96 3.229 3.708 3.909 4.095 4.205 4.639 4.816 5.155 5.461 5.749 5.883 6.139 6.396 6.758 6.993 7.224 7.547 7.846 8.123 8.401 8.667 8.975 9.264 9.545 9.885 10.223 10.566 10.949 11.349 11.72 12.098 12.51 12.949 13.334 13.741 14.225 14.654 15.08 15.48 15.891 16.244 16.489 16.599 16.308 15.506 14.564 13.611 12.75 11.951 11.243 10.565 9.96 9.305 8.702 8.175 7.636 7.125 6.662 6.221 5.77 5.358 4.985 4.579 4.145 3.795 3.445 3.09 2.812 2.528 2.215 1.896 1.576 1.332 1.066 0.654 0.375 0.097 -0.043 -0.335 -0.652 -0.994 -1.169 -1.625 -1.782 -2.003 -2.233 -2.706 -2.96 -3.256 -3.598 -3.991 -4.441 -4.988 -6.062 -3 ,14906 ,TETRA ,17603056,Sun Nov 28 16:29:41 CET,Sun Nov 28 18:17:02 CET,0.0 1.069 1.643 2.081 2.41 2.716 2.996 3.268 3.761 3.979 4.175 4.271 4.697 4.866 5.189 5.498 5.792 5.927 6.198 6.464 6.824 7.047 7.27 7.593 7.877 8.155 8.434 8.695 9.024 9.351 9.663 10.006 10.334 10.658 11.002 11.363 11.696 12.03 12.405 12.817 13.201 13.625 14.108 14.518 14.935 15.36 15.791 16.198 16.519 16.624 16.284 15.435 14.514 13.606 12.751 11.934 11.196 10.499 9.855 9.204 8.616 8.06 7.569 7.115 6.661 6.214 5.728 5.325 4.981 4.6 4.188 3.834 3.467 3.102 2.807 2.488 2.164 1.822 1.468 1.231 0.983 0.6 0.329 0.032 -0.119 -0.433 -0.761 -1.112 -1.298 -1.749 -1.894 -2.106 -2.329 -2.84 -3.111 -3.393 -3.684 -4.034 -4.452 -4.979 -5.989 -4 ,29738 ,TETRA ,17603057,Sun Nov 28 16:29:38 CET,Sun Nov 28 18:16:06 CET,0.0 1.278 1.778 2.152 2.48 2.793 3.093 3.34 3.787 4.003 4.217 4.369 4.798 4.959 5.279 5.606 5.917 6.054 6.318 6.567 6.921 7.158 7.379 7.68 7.99 8.296 8.59 8.862 9.177 9.471 9.732 10.05 10.402 10.738 11.095 11.486 11.843 12.227 12.644 13.066 13.488 13.925 14.397 14.839 15.293 15.745 16.186 16.566 16.802 16.849 16.525 15.638 14.687 13.793 12.913 12.088 11.373 10.662 10.022 9.4 8.831 8.283 7.743 7.214 6.713 6.265 5.776 5.322 4.941 4.557 4.161 3.825 3.464 3.075 2.764 2.438 2.102 1.751 1.385 1.132 0.879 0.488 0.221 -0.073 -0.232 -0.553 -0.886 -1.237 -1.426 -1.887 -2.039 -2.26 -2.488 -2.978 -3.251 -3.541 -3.868 -4.222 -4.609 -5.109 -6.192 -5 ,31594 ,TETRA ,17603058,Sun Nov 28 16:29:40 CET,Sun Nov 28 18:16:15 CET,0.0 1.32 1.849 2.258 2.608 2.928 3.219 3.491 3.993 4.212 4.411 4.518 4.934 5.094 5.414 5.71 6.008 6.156 6.425 6.682 7.056 7.294 7.522 7.841 8.138 8.422 8.686 8.935 9.264 9.567 9.871 10.237 10.558 10.861 11.211 11.585 11.93 12.299 12.665 13.063 13.48 13.915 14.361 14.75 15.167 15.575 15.985 16.348 16.669 16.851 16.552 15.725 14.822 13.902 13.015 12.159 11.412 10.708 10.034 9.326 8.713 8.17 7.621 7.092 6.614 6.146 5.648 5.226 4.863 4.475 4.076 3.747 3.382 3.003 2.698 2.363 2.029 1.708 1.376 1.129 0.864 0.468 0.197 -0.092 -0.239 -0.537 -0.866 -1.235 -1.432 -1.889 -2.027 -2.25 -2.478 -2.984 -3.26 -3.543 -3.875 -4.261 -4.711 -5.264 -6.459 -6 ,2187 ,TETRA ,17603059,Sun Nov 28 16:29:42 CET,Sun Nov 28 18:16:36 CET,0.0 1.12 1.669 2.056 2.397 2.703 2.98 3.235 3.71 3.933 4.146 4.283 4.706 4.87 5.176 5.47 5.764 5.902 6.164 6.428 6.798 7.02 7.232 7.534 7.83 8.108 8.367 8.619 8.949 9.258 9.541 9.883 10.208 10.514 10.859 11.232 11.586 11.966 12.362 12.764 13.162 13.583 14.031 14.427 14.836 15.235 15.617 15.999 16.306 16.406 16.036 15.133 14.183 13.277 12.403 11.57 10.866 10.211 9.581 8.864 8.234 7.686 7.132 6.612 6.128 5.674 5.194 4.744 4.358 3.973 3.559 3.23 2.901 2.536 2.261 1.972 1.67 1.357 1.008 0.761 0.515 0.128 -0.164 -0.473 -0.633 -0.953 -1.276 -1.632 -1.821 -2.281 -2.43 -2.652 -2.885 -3.382 -3.647 -3.947 -4.248 -4.578 -4.996 -5.495 -6.444 -7 ,1707 ,TETRA ,17603060,Sun Nov 28 16:29:38 CET,Sun Nov 28 18:16:07 CET,0.0 1.17 1.745 2.209 2.571 2.875 3.152 3.406 3.884 4.106 4.311 4.448 4.881 5.056 5.405 5.721 6.016 6.157 6.421 6.663 6.997 7.224 7.441 7.737 8.025 8.295 8.565 8.829 9.151 9.454 9.748 10.096 10.436 10.755 11.089 11.464 11.819 12.192 12.585 12.993 13.415 13.888 14.401 14.85 15.276 15.661 16.033 16.356 16.592 16.671 16.297 15.465 14.573 13.636 12.81 12.051 11.324 10.672 10.07 9.385 8.791 8.281 7.785 7.288 6.79 6.345 5.909 5.495 5.124 4.731 4.295 3.941 3.601 3.242 2.961 2.66 2.341 2.007 1.654 1.416 1.179 0.796 0.521 0.226 0.075 -0.222 -0.568 -0.942 -1.127 -1.569 -1.677 -1.884 -2.104 -2.614 -2.906 -3.233 -3.588 -3.958 -4.376 -4.886 -5.897 -8 ,20081 ,TETRA ,17603061,Sun Nov 28 16:29:38 CET,Sun Nov 28 18:17:12 CET,0.0 1.315 1.81 2.231 2.599 2.896 3.159 3.396 3.848 4.061 4.273 4.435 4.864 5.024 5.325 5.605 5.882 6.018 6.284 6.545 6.911 7.142 7.363 7.686 8.008 8.302 8.563 8.821 9.14 9.419 9.69 10.022 10.334 10.636 10.988 11.349 11.692 12.08 12.467 12.853 13.223 13.62 14.089 14.539 15.034 15.487 15.903 16.31 16.64 16.828 16.612 15.748 14.831 13.953 13.032 12.167 11.419 10.704 10.087 9.475 8.896 8.337 7.808 7.338 6.87 6.409 5.952 5.536 5.147 4.756 4.356 3.998 3.623 3.232 2.939 2.656 2.352 2.025 1.678 1.439 1.181 0.764 0.491 0.199 0.039 -0.289 -0.628 -0.974 -1.154 -1.61 -1.761 -1.972 -2.174 -2.648 -2.935 -3.216 -3.511 -3.856 -4.29 -4.831 -6.292 -9 ,4754 ,TETRA ,17603062,Sun Nov 28 16:29:38 CET,Sun Nov 28 18:17:07 CET,0.0 1.165 1.742 2.192 2.57 2.903 3.198 3.469 3.965 4.183 4.374 4.469 4.888 5.042 5.358 5.676 5.97 6.108 6.385 6.649 7.006 7.232 7.455 7.779 8.086 8.354 8.608 8.855 9.179 9.488 9.756 10.086 10.392 10.656 10.958 11.322 11.69 12.057 12.428 12.815 13.212 13.67 14.147 14.554 14.989 15.425 15.888 16.286 16.543 16.616 16.246 15.379 14.414 13.429 12.526 11.701 10.983 10.29 9.629 8.95 8.391 7.88 7.341 6.835 6.375 5.926 5.44 5.008 4.64 4.252 3.851 3.536 3.197 2.819 2.518 2.21 1.894 1.56 1.211 0.964 0.702 0.304 0.033 -0.254 -0.406 -0.715 -1.047 -1.413 -1.595 -2.047 -2.18 -2.384 -2.608 -3.091 -3.361 -3.675 -3.991 -4.313 -4.714 -5.247 -6.244 -10 ,1830 ,TETRA ,17603063,Sun Nov 28 16:29:40 CET,Sun Nov 28 18:17:02 CET,0.0 1.151 1.686 2.11 2.45 2.77 3.053 3.312 3.792 4.017 4.236 4.379 4.818 5.007 5.348 5.66 5.942 6.072 6.334 6.585 6.944 7.175 7.402 7.723 8.022 8.317 8.586 8.842 9.165 9.479 9.784 10.108 10.411 10.719 11.073 11.451 11.799 12.17 12.553 12.942 13.313 13.668 14.112 14.6 15.099 15.53 15.951 16.363 16.688 16.826 16.461 15.623 14.729 13.816 12.925 12.107 11.351 10.584 9.916 9.242 8.633 8.065 7.508 6.98 6.486 6.031 5.586 5.214 4.874 4.499 4.106 3.785 3.431 3.053 2.751 2.442 2.12 1.766 1.4 1.154 0.919 0.546 0.271 -0.029 -0.183 -0.493 -0.815 -1.148 -1.331 -1.784 -1.906 -2.115 -2.354 -2.866 -3.133 -3.44 -3.775 -4.127 -4.531 -5.057 -6.261 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 78a64e90..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23070 ,KEBNE ,17027491,Wed Dec 22 17:28:36 CET,Wed Dec 22 19:00:31 CET,0.0 1.042 1.516 1.895 2.223 2.525 2.797 3.047 3.507 3.729 3.946 4.076 4.528 4.709 5.056 5.393 5.718 5.875 6.179 6.467 6.876 7.136 7.382 7.738 8.078 8.406 8.728 9.035 9.425 9.796 10.154 10.598 11.036 11.455 11.914 12.405 12.887 13.407 13.95 14.528 15.141 15.823 16.594 17.364 18.191 19.087 20.151 21.342 22.689 24.206 25.908 27.064 27.519 27.621 27.554 27.43 27.253 26.995 26.711 26.35 26.011 25.69 25.358 25.046 24.723 24.41 24.088 23.785 23.51 23.217 22.884 22.595 22.313 22.019 21.775 21.515 21.245 20.952 20.638 20.41 20.17 19.805 19.551 19.288 19.153 18.865 18.553 18.216 18.043 17.622 17.487 17.288 17.076 16.605 16.348 16.071 15.761 15.403 14.988 14.47 13.253 -2 ,4877 ,KEBNE ,17027492,Wed Dec 22 17:28:37 CET,Wed Dec 22 19:00:27 CET,0.0 0.724 1.178 1.567 1.915 2.222 2.504 2.776 3.259 3.476 3.685 3.808 4.257 4.434 4.774 5.094 5.393 5.542 5.835 6.114 6.522 6.777 7.022 7.368 7.71 8.057 8.402 8.731 9.132 9.51 9.877 10.32 10.744 11.143 11.589 12.095 12.587 13.147 13.757 14.378 15.007 15.681 16.458 17.286 18.235 19.223 20.341 21.559 22.918 24.478 26.146 27.224 27.682 27.756 27.691 27.572 27.37 27.087 26.813 26.558 26.252 25.913 25.583 25.265 24.973 24.694 24.393 24.121 23.856 23.563 23.281 23.024 22.735 22.453 22.231 21.983 21.716 21.43 21.128 20.92 20.699 20.348 20.101 19.847 19.712 19.426 19.111 18.774 18.599 18.173 18.018 17.801 17.577 17.107 16.847 16.567 16.252 15.895 15.479 14.88 13.51 -3 ,28748 ,KEBNE ,17027493,Wed Dec 22 17:28:37 CET,Wed Dec 22 19:00:36 CET,0.0 0.913 1.46 1.862 2.182 2.465 2.715 2.947 3.397 3.611 3.818 3.953 4.4 4.575 4.914 5.236 5.548 5.695 5.989 6.272 6.658 6.907 7.151 7.503 7.846 8.188 8.505 8.803 9.206 9.603 9.988 10.442 10.864 11.271 11.747 12.288 12.817 13.354 13.89 14.477 15.09 15.796 16.621 17.397 18.308 19.274 20.292 21.427 22.73 24.246 25.932 27.148 27.668 27.837 27.82 27.655 27.42 27.196 26.96 26.63 26.289 25.974 25.661 25.345 25.04 24.752 24.421 24.103 23.808 23.501 23.182 22.916 22.641 22.338 22.105 21.859 21.586 21.296 20.992 20.78 20.555 20.213 19.973 19.715 19.58 19.305 19.012 18.704 18.548 18.131 17.995 17.782 17.565 17.14 16.876 16.554 16.205 15.832 15.398 14.85 13.611 -4 ,23827 ,KEBNE ,17027494,Wed Dec 22 17:28:37 CET,Wed Dec 22 19:00:28 CET,0.0 0.736 1.208 1.581 1.916 2.219 2.488 2.741 3.223 3.454 3.667 3.786 4.235 4.417 4.753 5.073 5.376 5.522 5.805 6.082 6.478 6.725 6.967 7.318 7.656 7.987 8.305 8.604 9.002 9.387 9.734 10.16 10.601 11.028 11.5 12.04 12.563 13.097 13.679 14.299 14.949 15.69 16.525 17.316 18.186 19.153 20.252 21.409 22.676 24.139 25.779 26.918 27.398 27.564 27.488 27.296 27.067 26.839 26.588 26.238 25.905 25.59 25.262 24.941 24.628 24.317 23.969 23.65 23.394 23.127 22.817 22.537 22.231 21.921 21.692 21.457 21.201 20.917 20.615 20.402 20.175 19.824 19.594 19.34 19.203 18.913 18.602 18.286 18.116 17.695 17.551 17.338 17.116 16.631 16.375 16.092 15.768 15.411 14.989 14.425 13.239 -5 ,28233 ,KEBNE ,17027495,Wed Dec 22 17:28:36 CET,Wed Dec 22 19:00:37 CET,0.0 1.07 1.561 1.948 2.293 2.603 2.884 3.147 3.634 3.855 4.068 4.198 4.645 4.821 5.15 5.47 5.779 5.936 6.242 6.53 6.951 7.224 7.479 7.837 8.18 8.504 8.821 9.132 9.522 9.915 10.292 10.705 11.104 11.494 11.948 12.457 12.913 13.414 13.989 14.583 15.197 15.907 16.707 17.487 18.369 19.296 20.35 21.576 22.951 24.447 26.107 27.248 27.695 27.84 27.804 27.637 27.397 27.108 26.816 26.522 26.222 25.906 25.594 25.275 24.954 24.658 24.332 24.022 23.737 23.435 23.119 22.836 22.534 22.211 21.957 21.701 21.438 21.169 20.875 20.663 20.455 20.124 19.885 19.629 19.49 19.189 18.859 18.507 18.328 17.903 17.758 17.562 17.347 16.852 16.573 16.279 15.975 15.609 15.129 14.55 13.267 -6 ,28256 ,KEBNE ,17027496,Wed Dec 22 17:28:36 CET,Wed Dec 22 19:00:23 CET,0.0 0.79 1.229 1.613 1.943 2.231 2.493 2.752 3.228 3.445 3.656 3.784 4.233 4.419 4.774 5.094 5.399 5.551 5.829 6.097 6.512 6.775 7.018 7.366 7.702 8.016 8.338 8.669 9.077 9.462 9.825 10.25 10.667 11.079 11.536 12.055 12.575 13.118 13.661 14.235 14.87 15.571 16.365 17.166 18.056 19.001 20.078 21.333 22.794 24.363 26.099 27.282 27.782 27.976 27.954 27.781 27.555 27.251 26.92 26.599 26.296 25.985 25.697 25.405 25.09 24.781 24.419 24.08 23.788 23.492 23.193 22.932 22.645 22.34 22.099 21.838 21.587 21.329 21.04 20.835 20.622 20.287 20.035 19.759 19.62 19.335 19.024 18.684 18.502 18.079 17.948 17.747 17.538 17.055 16.788 16.477 16.133 15.796 15.403 14.905 13.263 -7 ,20967 ,KEBNE ,17027497,Wed Dec 22 17:29:44 CET,Wed Dec 22 18:56:59 CET,0.0 1.219 1.745 2.126 2.463 2.766 3.034 3.285 3.786 4.006 4.203 4.325 4.76 4.931 5.273 5.594 5.905 6.054 6.356 6.651 7.055 7.309 7.553 7.908 8.256 8.602 8.942 9.266 9.675 10.049 10.41 10.856 11.272 11.689 12.177 12.691 13.156 13.658 14.196 14.779 15.399 16.097 16.913 17.703 18.58 19.544 20.638 21.866 23.258 24.819 26.531 27.683 28.131 28.29 28.267 28.069 27.808 27.56 27.294 26.922 26.571 26.277 26.017 25.723 25.414 25.124 24.803 24.491 24.221 23.943 23.621 23.347 23.05 22.744 22.516 22.27 22.007 21.733 21.44 21.228 21.009 20.626 20.335 20.044 19.91 19.647 19.36 19.052 18.884 18.463 18.317 18.106 17.885 17.375 17.084 16.776 16.453 16.102 15.676 15.118 13.804 -8 ,482 ,KEBNE ,17027498,Wed Dec 22 17:31:44 CET,Wed Dec 22 19:03:34 CET,0.0 1.033 1.519 1.91 2.248 2.549 2.814 3.065 3.546 3.769 3.978 4.104 4.547 4.725 5.069 5.382 5.677 5.822 6.111 6.388 6.778 7.029 7.278 7.642 7.996 8.329 8.653 8.973 9.368 9.737 10.105 10.562 10.993 11.411 11.899 12.414 12.881 13.4 13.99 14.615 15.224 15.864 16.585 17.299 18.128 19.094 20.26 21.511 22.858 24.356 26.039 27.243 27.773 27.949 27.907 27.765 27.572 27.342 27.11 26.81 26.48 26.152 25.829 25.491 25.172 24.869 24.542 24.263 24.007 23.725 23.431 23.175 22.889 22.585 22.348 22.091 21.823 21.547 21.233 21.008 20.784 20.453 20.215 19.94 19.797 19.498 19.18 18.853 18.676 18.247 18.094 17.881 17.644 17.153 16.886 16.604 16.291 15.923 15.484 14.879 13.47 -9 ,22053 ,KEBNE ,17027499,Wed Dec 22 17:29:40 CET,Wed Dec 22 19:02:56 CET,0.0 0.891 1.353 1.778 2.117 2.397 2.67 2.931 3.427 3.658 3.87 3.997 4.433 4.601 4.944 5.267 5.561 5.703 5.984 6.254 6.646 6.903 7.155 7.51 7.851 8.184 8.502 8.811 9.218 9.608 9.982 10.443 10.87 11.276 11.74 12.232 12.703 13.224 13.751 14.297 14.9 15.585 16.382 17.194 18.105 19.036 20.105 21.33 22.687 24.207 26.003 27.269 27.801 27.996 27.976 27.842 27.658 27.408 27.141 26.8 26.453 26.14 25.808 25.486 25.18 24.876 24.54 24.232 23.959 23.651 23.302 23.012 22.742 22.456 22.221 21.973 21.705 21.432 21.145 20.94 20.722 20.372 20.118 19.849 19.712 19.425 19.114 18.784 18.605 18.177 18.018 17.805 17.59 17.116 16.867 16.592 16.272 15.921 15.504 14.941 13.567 -10 ,24428 ,KEBNE ,17027500,Wed Dec 22 17:29:40 CET,Wed Dec 22 19:02:52 CET,0.0 1.122 1.623 2.006 2.315 2.62 2.902 3.155 3.609 3.823 4.038 4.191 4.642 4.814 5.138 5.445 5.745 5.893 6.182 6.473 6.891 7.146 7.383 7.747 8.096 8.414 8.714 9.008 9.408 9.794 10.155 10.594 11.024 11.425 11.88 12.405 12.916 13.462 14.064 14.691 15.337 16.05 16.853 17.627 18.494 19.455 20.54 21.74 23.053 24.542 26.245 27.381 27.8 27.892 27.848 27.703 27.499 27.291 27.077 26.801 26.492 26.159 25.823 25.51 25.216 24.928 24.632 24.347 24.073 23.781 23.465 23.189 22.901 22.588 22.343 22.088 21.812 21.538 21.266 21.063 20.841 20.483 20.22 19.944 19.799 19.506 19.205 18.875 18.696 18.265 18.115 17.907 17.696 17.253 16.998 16.698 16.379 16.008 15.521 14.95 13.748 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt deleted file mode 100644 index a2417d9e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20923 ,TETRA ,17603064,Sun Nov 28 16:29:43 CET,Sun Nov 28 18:16:25 CET,0.0 0.836 1.295 1.667 2.016 2.35 2.618 2.85 3.293 3.492 3.677 3.769 4.205 4.374 4.688 4.973 5.247 5.378 5.623 5.867 6.226 6.447 6.657 6.979 7.296 7.586 7.857 8.122 8.446 8.736 9.017 9.351 9.665 9.979 10.344 10.708 11.044 11.417 11.814 12.226 12.643 13.086 13.529 13.96 14.454 14.929 15.413 15.851 16.171 16.341 16.197 15.482 14.634 13.837 13.103 12.305 11.512 10.808 10.166 9.499 8.915 8.356 7.813 7.276 6.775 6.336 5.877 5.47 5.11 4.704 4.263 3.894 3.507 3.109 2.797 2.479 2.142 1.796 1.438 1.176 0.914 0.51 0.225 -0.068 -0.222 -0.548 -0.903 -1.283 -1.473 -1.942 -2.121 -2.349 -2.579 -3.098 -3.389 -3.7 -4.033 -4.406 -4.876 -5.392 -6.685 -2 ,10826 ,TETRA ,17603065,Sun Nov 28 16:29:38 CET,Sun Nov 28 18:17:11 CET,0.0 1.075 1.562 1.96 2.283 2.579 2.846 3.092 3.535 3.739 3.934 4.044 4.481 4.644 4.954 5.253 5.539 5.677 5.949 6.198 6.533 6.74 6.943 7.261 7.57 7.847 8.115 8.376 8.695 8.993 9.282 9.63 9.97 10.291 10.637 11.004 11.344 11.702 12.091 12.506 12.908 13.35 13.863 14.313 14.78 15.283 15.803 16.242 16.575 16.75 16.589 15.847 14.931 14.036 13.193 12.367 11.639 10.985 10.344 9.677 9.102 8.588 8.071 7.542 7.045 6.567 6.045 5.601 5.228 4.825 4.401 4.047 3.669 3.274 2.969 2.65 2.317 1.978 1.628 1.382 1.118 0.715 0.446 0.154 0.001 -0.323 -0.661 -1.006 -1.188 -1.647 -1.819 -2.055 -2.294 -2.803 -3.077 -3.374 -3.713 -4.098 -4.546 -5.107 -6.468 -3 ,3081 ,TETRA ,17603066,Sun Nov 28 16:29:43 CET,Sun Nov 28 18:17:17 CET,0.0 0.899 1.366 1.762 2.098 2.389 2.661 2.909 3.358 3.561 3.742 3.814 4.245 4.408 4.723 5.016 5.278 5.411 5.674 5.915 6.265 6.49 6.708 7.013 7.291 7.577 7.86 8.114 8.441 8.768 9.076 9.434 9.772 10.098 10.454 10.821 11.184 11.554 11.927 12.313 12.702 13.135 13.605 14.065 14.545 15.028 15.536 15.968 16.34 16.55 16.372 15.684 14.871 14.052 13.208 12.389 11.654 10.968 10.354 9.744 9.218 8.685 8.16 7.662 7.17 6.709 6.204 5.776 5.418 5.015 4.577 4.215 3.832 3.444 3.147 2.825 2.508 2.185 1.817 1.558 1.303 0.893 0.599 0.296 0.142 -0.18 -0.516 -0.878 -1.069 -1.525 -1.681 -1.917 -2.17 -2.701 -2.971 -3.273 -3.602 -3.955 -4.399 -5.027 -6.465 -4 ,6437 ,TETRA ,17603067,Sun Nov 28 16:29:39 CET,Sun Nov 28 18:17:32 CET,0.0 0.903 1.371 1.781 2.126 2.431 2.703 2.947 3.386 3.608 3.821 3.926 4.369 4.548 4.874 5.174 5.464 5.598 5.853 6.104 6.458 6.682 6.907 7.231 7.515 7.788 8.048 8.29 8.602 8.903 9.185 9.511 9.821 10.12 10.469 10.839 11.161 11.498 11.883 12.286 12.659 13.066 13.527 13.934 14.34 14.794 15.27 15.686 16.041 16.255 16.073 15.356 14.472 13.53 12.669 11.847 11.08 10.343 9.696 9.053 8.473 7.952 7.45 6.959 6.48 6.028 5.566 5.139 4.755 4.333 3.891 3.542 3.178 2.807 2.504 2.167 1.815 1.449 1.069 0.809 0.538 0.137 -0.136 -0.429 -0.583 -0.903 -1.233 -1.593 -1.788 -2.249 -2.404 -2.639 -2.882 -3.389 -3.659 -3.97 -4.327 -4.734 -5.22 -5.799 -7.047 -5 ,24521 ,TETRA ,17603068,Sun Nov 28 16:29:40 CET,Sun Nov 28 18:17:45 CET,0.0 0.891 1.384 1.733 2.055 2.351 2.601 2.832 3.273 3.478 3.672 3.765 4.19 4.344 4.64 4.924 5.195 5.324 5.573 5.807 6.169 6.402 6.606 6.909 7.207 7.492 7.765 8.025 8.37 8.703 9.004 9.347 9.66 9.956 10.292 10.673 11.033 11.385 11.75 12.152 12.572 13.011 13.459 13.846 14.249 14.685 15.14 15.581 15.95 16.14 15.94 15.213 14.28 13.274 12.402 11.584 10.819 10.13 9.542 8.909 8.309 7.75 7.214 6.696 6.193 5.727 5.231 4.793 4.44 4.057 3.659 3.334 2.975 2.594 2.291 1.979 1.65 1.298 0.932 0.695 0.441 0.02 -0.261 -0.557 -0.71 -1.035 -1.381 -1.741 -1.936 -2.398 -2.559 -2.805 -3.05 -3.557 -3.863 -4.192 -4.531 -4.914 -5.348 -5.928 -6.992 -6 ,24977 ,TETRA ,17603069,Sun Nov 28 16:30:11 CET,Sun Nov 28 18:19:11 CET,0.0 0.873 1.331 1.692 2.004 2.281 2.538 2.78 3.233 3.447 3.641 3.742 4.178 4.34 4.645 4.937 5.213 5.343 5.598 5.842 6.196 6.429 6.638 6.932 7.221 7.488 7.747 8.004 8.332 8.631 8.91 9.246 9.579 9.885 10.229 10.64 11.044 11.431 11.79 12.166 12.545 12.956 13.414 13.872 14.399 14.884 15.335 15.771 16.111 16.254 16.021 15.287 14.398 13.447 12.502 11.663 10.905 10.176 9.548 8.913 8.325 7.771 7.242 6.732 6.255 5.814 5.334 4.887 4.485 4.079 3.665 3.301 2.919 2.526 2.212 1.89 1.568 1.233 0.868 0.602 0.338 -0.058 -0.343 -0.648 -0.805 -1.123 -1.45 -1.801 -1.992 -2.463 -2.626 -2.859 -3.105 -3.619 -3.893 -4.202 -4.562 -4.959 -5.432 -6.023 -7.518 -7 ,414 ,TETRA ,17603070,Sun Nov 28 16:30:09 CET,Sun Nov 28 18:18:35 CET,0.0 0.796 1.276 1.658 1.994 2.282 2.553 2.801 3.228 3.42 3.617 3.735 4.167 4.33 4.65 4.946 5.221 5.349 5.601 5.84 6.177 6.399 6.61 6.913 7.196 7.468 7.75 8.023 8.341 8.647 8.954 9.32 9.657 9.963 10.303 10.652 10.986 11.358 11.776 12.194 12.584 12.996 13.436 13.844 14.288 14.722 15.167 15.586 15.903 16.102 15.875 15.063 14.189 13.341 12.55 11.812 11.118 10.457 9.837 9.197 8.624 8.048 7.504 6.989 6.493 6.029 5.51 5.052 4.654 4.227 3.785 3.428 3.071 2.688 2.39 2.081 1.746 1.392 1.016 0.765 0.509 0.105 -0.177 -0.485 -0.638 -0.957 -1.295 -1.653 -1.845 -2.315 -2.48 -2.708 -2.951 -3.474 -3.764 -4.069 -4.387 -4.769 -5.224 -5.776 -6.891 -8 ,789 ,TETRA ,17603071,Sun Nov 28 16:30:10 CET,Sun Nov 28 18:17:10 CET,0.0 0.971 1.449 1.858 2.209 2.506 2.757 2.99 3.431 3.626 3.813 3.915 4.356 4.528 4.833 5.126 5.399 5.531 5.793 6.048 6.402 6.619 6.836 7.14 7.428 7.713 7.978 8.22 8.54 8.869 9.175 9.513 9.823 10.134 10.488 10.862 11.198 11.56 11.965 12.356 12.745 13.197 13.696 14.143 14.612 15.033 15.435 15.862 16.213 16.385 16.207 15.508 14.634 13.695 12.828 11.993 11.232 10.557 9.95 9.307 8.726 8.191 7.66 7.129 6.622 6.175 5.714 5.283 4.894 4.479 4.026 3.646 3.269 2.895 2.597 2.283 1.961 1.607 1.242 1.004 0.753 0.342 0.046 -0.261 -0.42 -0.743 -1.091 -1.483 -1.687 -2.155 -2.305 -2.522 -2.747 -3.234 -3.517 -3.825 -4.139 -4.494 -4.926 -5.514 -6.922 -9 ,32683 ,TETRA ,17603072,Sun Nov 28 16:30:13 CET,Sun Nov 28 18:17:05 CET,0.0 0.831 1.272 1.622 1.927 2.206 2.469 2.714 3.145 3.347 3.556 3.678 4.116 4.283 4.602 4.901 5.171 5.303 5.56 5.791 6.134 6.364 6.582 6.884 7.171 7.461 7.73 7.967 8.271 8.574 8.864 9.201 9.501 9.79 10.136 10.5 10.849 11.252 11.657 12.05 12.457 12.908 13.409 13.858 14.306 14.773 15.237 15.612 15.931 16.101 15.879 15.164 14.328 13.479 12.62 11.826 11.085 10.348 9.651 8.914 8.307 7.768 7.235 6.72 6.25 5.818 5.338 4.881 4.476 4.055 3.626 3.267 2.878 2.468 2.15 1.812 1.472 1.144 0.803 0.556 0.287 -0.133 -0.412 -0.698 -0.85 -1.162 -1.506 -1.881 -2.072 -2.529 -2.669 -2.885 -3.125 -3.659 -3.947 -4.258 -4.586 -4.952 -5.386 -5.999 -7.021 -10 ,12912 ,TETRA ,17603073,Sun Nov 28 16:30:10 CET,Sun Nov 28 18:16:51 CET,0.0 0.812 1.275 1.644 1.956 2.228 2.476 2.724 3.164 3.362 3.561 3.664 4.096 4.25 4.551 4.848 5.135 5.274 5.53 5.761 6.087 6.305 6.508 6.803 7.101 7.383 7.661 7.933 8.263 8.558 8.817 9.123 9.438 9.761 10.139 10.524 10.865 11.231 11.599 11.955 12.343 12.792 13.272 13.7 14.148 14.598 15.017 15.45 15.849 16.036 15.821 15.103 14.293 13.408 12.56 11.773 11.039 10.313 9.657 9.007 8.445 7.887 7.338 6.823 6.29 5.813 5.335 4.895 4.503 4.092 3.661 3.293 2.917 2.527 2.207 1.882 1.545 1.191 0.825 0.565 0.29 -0.128 -0.407 -0.703 -0.863 -1.19 -1.522 -1.883 -2.075 -2.542 -2.689 -2.91 -3.152 -3.694 -3.993 -4.309 -4.674 -5.073 -5.514 -6.094 -7.461 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt deleted file mode 100644 index d012eaf3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20001 ,TETRA ,17603074,Sun Nov 28 16:30:11 CET,Sun Nov 28 18:17:09 CET,0.0 1.029 1.507 1.944 2.32 2.631 2.944 3.231 3.713 3.928 4.134 4.275 4.709 4.877 5.219 5.545 5.845 5.984 6.24 6.487 6.838 7.061 7.28 7.594 7.898 8.189 8.463 8.724 9.074 9.422 9.743 10.112 10.456 10.793 11.201 11.642 12.056 12.51 12.99 13.483 13.941 14.417 14.961 15.488 16.085 16.709 17.33 17.929 18.514 18.969 19.182 18.834 18.221 17.539 16.821 16.142 15.55 14.939 14.408 13.854 13.332 12.864 12.392 11.925 11.488 11.09 10.679 10.322 9.993 9.637 9.245 8.898 8.548 8.202 7.927 7.639 7.343 7.022 6.67 6.423 6.163 5.763 5.512 5.249 5.104 4.779 4.436 4.084 3.904 3.476 3.348 3.136 2.923 2.468 2.207 1.923 1.615 1.242 0.827 0.334 -0.884 -2 ,31482 ,TETRA ,17603075,Sun Nov 28 16:30:13 CET,Sun Nov 28 18:17:31 CET,0.0 0.829 1.392 1.846 2.223 2.544 2.822 3.091 3.611 3.837 4.034 4.157 4.598 4.78 5.133 5.465 5.775 5.917 6.17 6.417 6.78 7.015 7.242 7.578 7.904 8.208 8.487 8.763 9.142 9.497 9.814 10.186 10.536 10.858 11.235 11.677 12.083 12.531 13.02 13.511 13.993 14.508 15.078 15.596 16.128 16.673 17.302 17.921 18.492 18.985 19.178 18.826 18.264 17.674 16.993 16.284 15.638 15.028 14.486 13.916 13.421 12.949 12.459 11.995 11.577 11.193 10.791 10.428 10.09 9.716 9.335 9.013 8.665 8.318 8.053 7.767 7.462 7.147 6.81 6.565 6.321 5.957 5.692 5.387 5.23 4.927 4.611 4.266 4.084 3.646 3.488 3.269 3.046 2.552 2.297 2.021 1.705 1.37 0.98 0.487 -0.672 -3 ,11058 ,TETRA ,17603076,Sun Nov 28 16:30:15 CET,Sun Nov 28 18:16:27 CET,0.0 1.024 1.517 1.921 2.266 2.576 2.861 3.11 3.575 3.789 3.989 4.114 4.549 4.728 5.071 5.391 5.685 5.829 6.11 6.377 6.754 6.99 7.215 7.525 7.805 8.087 8.369 8.638 8.981 9.307 9.609 9.958 10.305 10.629 11.002 11.453 11.875 12.303 12.725 13.148 13.57 14.033 14.591 15.115 15.651 16.185 16.749 17.346 17.925 18.365 18.49 18.127 17.545 16.871 16.174 15.529 14.927 14.293 13.762 13.229 12.713 12.213 11.714 11.235 10.776 10.385 9.994 9.594 9.24 8.878 8.493 8.167 7.825 7.477 7.203 6.914 6.61 6.294 5.962 5.725 5.477 5.091 4.819 4.543 4.406 4.109 3.786 3.437 3.257 2.818 2.655 2.441 2.207 1.677 1.4 1.109 0.804 0.448 -0.002 -0.574 -1.823 -4 ,1777 ,TETRA ,17603077,Sun Nov 28 16:30:11 CET,Sun Nov 28 18:16:15 CET,0.0 1.214 1.713 2.152 2.528 2.851 3.138 3.405 3.898 4.11 4.311 4.432 4.865 5.047 5.404 5.727 6.025 6.171 6.451 6.714 7.072 7.303 7.53 7.857 8.174 8.473 8.752 9.017 9.373 9.721 10.027 10.383 10.727 11.047 11.413 11.815 12.207 12.631 13.072 13.518 13.944 14.395 14.946 15.482 16.04 16.644 17.292 17.876 18.426 18.939 19.137 18.721 18.077 17.374 16.665 15.954 15.257 14.626 14.111 13.55 13.052 12.586 12.101 11.632 11.203 10.797 10.364 9.993 9.664 9.302 8.92 8.605 8.289 7.964 7.699 7.41 7.107 6.808 6.491 6.261 6.015 5.631 5.368 5.085 4.938 4.631 4.308 3.974 3.801 3.365 3.219 3.007 2.784 2.294 2.034 1.744 1.427 1.093 0.7 0.195 -1.029 -5 ,17816 ,TETRA ,17603078,Sun Nov 28 16:30:11 CET,Sun Nov 28 18:16:17 CET,0.0 0.99 1.542 1.957 2.307 2.6 2.883 3.153 3.635 3.853 4.055 4.188 4.634 4.815 5.152 5.455 5.741 5.884 6.162 6.437 6.817 7.051 7.283 7.622 7.936 8.226 8.508 8.767 9.085 9.41 9.738 10.1 10.426 10.766 11.148 11.538 11.924 12.357 12.808 13.269 13.711 14.158 14.663 15.191 15.756 16.302 16.905 17.521 18.108 18.57 18.712 18.318 17.717 17.03 16.337 15.691 15.077 14.477 13.944 13.354 12.842 12.372 11.892 11.427 10.977 10.568 10.129 9.736 9.396 9.02 8.622 8.296 7.962 7.621 7.354 7.081 6.789 6.472 6.129 5.897 5.649 5.247 4.966 4.688 4.547 4.24 3.9 3.549 3.37 2.92 2.756 2.534 2.311 1.846 1.592 1.319 1.005 0.661 0.263 -0.259 -1.33 -6 ,17725 ,TETRA ,17603079,Sun Nov 28 16:30:13 CET,Sun Nov 28 18:16:21 CET,0.0 1.082 1.613 2.046 2.4 2.69 2.965 3.238 3.723 3.947 4.151 4.288 4.729 4.908 5.27 5.604 5.897 6.031 6.294 6.567 6.966 7.204 7.424 7.73 8.02 8.301 8.573 8.839 9.184 9.522 9.852 10.224 10.557 10.88 11.242 11.638 12.011 12.4 12.822 13.268 13.713 14.221 14.779 15.24 15.762 16.352 16.942 17.49 17.999 18.42 18.642 18.397 17.809 17.105 16.406 15.714 15.067 14.461 13.9 13.28 12.752 12.299 11.847 11.39 10.942 10.528 10.11 9.731 9.401 9.071 8.715 8.413 8.082 7.725 7.456 7.163 6.837 6.508 6.172 5.94 5.704 5.323 5.046 4.766 4.622 4.31 3.975 3.629 3.453 3.015 2.88 2.674 2.465 2.01 1.76 1.485 1.181 0.836 0.406 -0.115 -1.042 -7 ,15313 ,TETRA ,17603080,Sun Nov 28 16:30:14 CET,Sun Nov 28 18:16:44 CET,0.0 1.135 1.68 2.092 2.439 2.753 3.029 3.271 3.718 3.93 4.138 4.271 4.7 4.852 5.155 5.464 5.755 5.89 6.148 6.4 6.767 7.004 7.227 7.553 7.856 8.15 8.443 8.707 9.028 9.33 9.613 9.959 10.324 10.675 11.035 11.413 11.775 12.169 12.589 13.031 13.469 13.908 14.398 14.9 15.476 16.09 16.69 17.267 17.825 18.246 18.404 18.038 17.439 16.789 16.157 15.536 14.881 14.249 13.687 13.04 12.522 12.054 11.542 11.036 10.57 10.154 9.708 9.311 8.956 8.574 8.189 7.858 7.508 7.148 6.858 6.581 6.292 5.963 5.635 5.413 5.178 4.793 4.515 4.221 4.072 3.783 3.475 3.132 2.944 2.502 2.367 2.153 1.924 1.453 1.198 0.897 0.579 0.248 -0.136 -0.638 -2.119 -8 ,30068 ,TETRA ,17603081,Sun Nov 28 16:30:17 CET,Sun Nov 28 18:16:20 CET,0.0 1.085 1.599 1.991 2.311 2.621 2.916 3.189 3.691 3.907 4.101 4.217 4.664 4.846 5.197 5.508 5.796 5.948 6.237 6.492 6.836 7.07 7.299 7.616 7.94 8.239 8.511 8.791 9.161 9.506 9.822 10.208 10.58 10.928 11.301 11.697 12.064 12.457 12.903 13.373 13.84 14.346 14.95 15.514 16.078 16.683 17.307 17.91 18.513 18.959 19.013 18.605 17.959 17.228 16.549 15.934 15.315 14.666 14.084 13.501 12.982 12.521 12.055 11.584 11.147 10.726 10.278 9.885 9.548 9.2 8.844 8.537 8.203 7.85 7.574 7.283 6.965 6.623 6.285 6.064 5.829 5.441 5.171 4.893 4.749 4.444 4.117 3.765 3.577 3.14 3.013 2.8 2.57 2.087 1.835 1.562 1.25 0.904 0.48 -0.086 -1.34 -9 ,23092 ,TETRA ,17603082,Sun Nov 28 16:30:11 CET,Sun Nov 28 18:16:10 CET,0.0 1.261 1.767 2.176 2.547 2.867 3.149 3.401 3.864 4.074 4.267 4.382 4.82 5.007 5.354 5.658 5.951 6.098 6.396 6.657 7.027 7.272 7.505 7.824 8.137 8.453 8.74 9.014 9.369 9.693 9.994 10.349 10.7 11.062 11.482 11.922 12.346 12.808 13.265 13.711 14.157 14.67 15.248 15.754 16.325 16.966 17.597 18.14 18.616 19.066 19.25 18.867 18.231 17.556 16.921 16.254 15.58 14.948 14.374 13.781 13.277 12.804 12.317 11.844 11.416 11.038 10.628 10.235 9.886 9.53 9.153 8.823 8.483 8.123 7.83 7.534 7.228 6.901 6.565 6.327 6.069 5.671 5.403 5.129 4.975 4.651 4.346 4.017 3.834 3.4 3.269 3.057 2.832 2.33 2.072 1.793 1.47 1.117 0.71 0.198 -0.948 -10 ,30138 ,TETRA ,17603083,Sun Nov 28 16:30:12 CET,Sun Nov 28 18:16:15 CET,0.0 1.164 1.688 2.106 2.449 2.742 3.029 3.285 3.729 3.933 4.13 4.274 4.708 4.87 5.196 5.511 5.804 5.946 6.226 6.508 6.885 7.102 7.311 7.631 7.948 8.244 8.524 8.797 9.175 9.531 9.853 10.223 10.559 10.879 11.251 11.666 12.065 12.505 12.961 13.41 13.864 14.356 14.892 15.427 16.032 16.652 17.259 17.824 18.366 18.792 18.986 18.64 17.979 17.284 16.601 15.933 15.316 14.707 14.153 13.6 13.101 12.61 12.129 11.675 11.261 10.889 10.467 10.084 9.751 9.395 9.021 8.704 8.368 8.001 7.697 7.377 7.056 6.725 6.386 6.155 5.914 5.539 5.284 5.008 4.863 4.554 4.223 3.886 3.71 3.274 3.141 2.93 2.714 2.235 1.962 1.674 1.369 1.025 0.607 0.09 -1.092 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt deleted file mode 100644 index 11c2a8bf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27796 ,TETRA ,17603084,Sun Nov 28 16:30:13 CET,Sun Nov 28 18:16:57 CET,0.0 1.024 1.53 1.957 2.338 2.661 2.945 3.211 3.7 3.923 4.127 4.254 4.691 4.86 5.177 5.483 5.784 5.926 6.196 6.453 6.819 7.047 7.259 7.573 7.873 8.155 8.417 8.672 9.008 9.323 9.629 9.984 10.319 10.638 10.974 11.34 11.695 12.069 12.481 12.927 13.383 13.831 14.3 14.749 15.213 15.677 16.13 16.527 16.808 16.839 16.368 15.346 14.29 13.26 12.32 11.453 10.662 9.93 9.244 8.492 7.838 7.246 6.691 6.193 5.715 5.248 4.767 4.33 3.94 3.538 3.111 2.747 2.374 1.996 1.688 1.365 1.016 0.657 0.305 0.065 -0.178 -0.575 -0.86 -1.146 -1.296 -1.614 -1.946 -2.304 -2.501 -2.961 -3.102 -3.322 -3.555 -4.044 -4.314 -4.606 -4.939 -5.337 -5.768 -6.301 -7.699 -2 ,17964 ,TETRA ,17603085,Sun Nov 28 16:30:14 CET,Sun Nov 28 18:17:17 CET,0.0 1.1 1.555 1.968 2.347 2.654 2.931 3.191 3.654 3.863 4.052 4.141 4.581 4.764 5.101 5.404 5.684 5.821 6.082 6.331 6.686 6.913 7.129 7.438 7.743 8.039 8.324 8.594 8.904 9.188 9.463 9.805 10.157 10.497 10.888 11.304 11.68 12.105 12.528 12.929 13.357 13.809 14.291 14.724 15.161 15.618 16.054 16.45 16.793 16.919 16.539 15.563 14.587 13.61 12.668 11.81 10.97 10.129 9.397 8.675 8.033 7.459 6.92 6.41 5.93 5.471 4.967 4.53 4.174 3.787 3.366 3.024 2.667 2.294 2.004 1.702 1.382 1.042 0.68 0.436 0.182 -0.22 -0.496 -0.794 -0.945 -1.256 -1.581 -1.939 -2.124 -2.573 -2.701 -2.912 -3.146 -3.638 -3.888 -4.148 -4.44 -4.796 -5.237 -5.769 -7.008 -3 ,3470 ,TETRA ,17603086,Sun Nov 28 16:30:15 CET,Sun Nov 28 18:16:53 CET,0.0 0.912 1.414 1.774 2.095 2.398 2.666 2.92 3.388 3.609 3.818 3.932 4.359 4.518 4.831 5.147 5.441 5.57 5.82 6.079 6.431 6.646 6.855 7.158 7.456 7.744 8.015 8.262 8.572 8.87 9.145 9.459 9.771 10.077 10.421 10.796 11.149 11.537 11.915 12.293 12.707 13.137 13.6 14.047 14.54 15.032 15.509 15.9 16.127 16.134 15.692 14.78 13.745 12.681 11.732 10.818 9.946 9.189 8.521 7.781 7.155 6.592 6.042 5.517 4.994 4.513 4.007 3.566 3.168 2.736 2.306 1.946 1.583 1.213 0.913 0.602 0.276 -0.058 -0.391 -0.621 -0.857 -1.235 -1.514 -1.813 -1.97 -2.289 -2.613 -2.97 -3.152 -3.601 -3.754 -3.973 -4.195 -4.668 -4.923 -5.209 -5.528 -5.903 -6.366 -6.884 -8.042 -4 ,7931 ,TETRA ,17603087,Sun Nov 28 16:30:13 CET,Sun Nov 28 18:17:18 CET,0.0 0.996 1.521 1.962 2.343 2.656 2.922 3.159 3.599 3.806 4.009 4.132 4.563 4.742 5.079 5.385 5.672 5.813 6.08 6.316 6.657 6.876 7.097 7.422 7.723 8.003 8.264 8.51 8.834 9.165 9.475 9.815 10.129 10.426 10.766 11.166 11.522 11.89 12.3 12.711 13.107 13.55 14.054 14.494 14.945 15.381 15.801 16.151 16.393 16.477 16.15 15.228 14.132 13.083 12.137 11.222 10.411 9.67 9.001 8.302 7.66 7.054 6.483 5.948 5.464 5.02 4.533 4.097 3.713 3.318 2.923 2.581 2.226 1.856 1.557 1.253 0.933 0.604 0.262 0.008 -0.262 -0.665 -0.954 -1.257 -1.408 -1.724 -2.063 -2.428 -2.616 -3.067 -3.222 -3.437 -3.667 -4.2 -4.495 -4.792 -5.111 -5.485 -5.939 -6.503 -7.428 -5 ,20267 ,TETRA ,17603088,Sun Nov 28 16:30:13 CET,Sun Nov 28 18:18:02 CET,0.0 1.308 1.779 2.127 2.446 2.741 3.005 3.262 3.722 3.923 4.114 4.202 4.619 4.782 5.094 5.383 5.663 5.798 6.061 6.318 6.662 6.873 7.087 7.411 7.728 8.026 8.286 8.527 8.85 9.17 9.472 9.828 10.133 10.43 10.791 11.187 11.55 11.926 12.344 12.776 13.175 13.591 14.058 14.436 14.824 15.267 15.67 16.031 16.368 16.456 16.04 15.057 14.012 13.025 12.092 11.219 10.386 9.588 8.873 8.123 7.464 6.895 6.355 5.84 5.34 4.87 4.382 3.938 3.548 3.114 2.659 2.3 1.929 1.536 1.219 0.894 0.564 0.229 -0.118 -0.369 -0.636 -1.057 -1.356 -1.666 -1.827 -2.16 -2.508 -2.871 -3.052 -3.505 -3.641 -3.856 -4.091 -4.616 -4.89 -5.174 -5.497 -5.848 -6.254 -6.793 -7.814 -6 ,32594 ,TETRA ,17603089,Sun Nov 28 16:30:15 CET,Sun Nov 28 18:17:10 CET,0.0 0.955 1.456 1.84 2.177 2.498 2.794 3.051 3.515 3.726 3.93 4.074 4.518 4.692 5.024 5.34 5.636 5.779 6.044 6.293 6.663 6.905 7.137 7.471 7.786 8.089 8.385 8.656 8.979 9.286 9.582 9.939 10.295 10.625 10.986 11.362 11.695 12.051 12.453 12.887 13.317 13.788 14.266 14.667 15.096 15.554 15.982 16.352 16.676 16.852 16.537 15.591 14.482 13.454 12.536 11.642 10.837 10.095 9.407 8.668 8.026 7.455 6.891 6.329 5.797 5.325 4.85 4.409 3.996 3.554 3.096 2.734 2.368 1.978 1.676 1.362 1.034 0.684 0.315 0.068 -0.193 -0.611 -0.89 -1.18 -1.343 -1.697 -2.056 -2.415 -2.603 -3.06 -3.201 -3.42 -3.654 -4.15 -4.404 -4.673 -4.984 -5.326 -5.705 -6.177 -7.133 -7 ,27879 ,TETRA ,17603090,Sun Nov 28 16:30:13 CET,Sun Nov 28 18:18:15 CET,0.0 1.223 1.736 2.119 2.431 2.718 2.988 3.241 3.707 3.915 4.11 4.211 4.63 4.795 5.12 5.418 5.685 5.819 6.101 6.367 6.729 6.952 7.17 7.475 7.753 8.036 8.32 8.579 8.897 9.204 9.511 9.871 10.198 10.507 10.856 11.239 11.602 11.988 12.388 12.809 13.225 13.672 14.169 14.598 15.032 15.488 15.98 16.414 16.677 16.703 16.268 15.263 14.202 13.118 12.127 11.203 10.372 9.637 8.969 8.253 7.616 7.045 6.498 5.955 5.463 5.036 4.558 4.118 3.744 3.348 2.948 2.614 2.262 1.89 1.594 1.281 0.943 0.585 0.215 -0.033 -0.287 -0.701 -0.991 -1.279 -1.426 -1.742 -2.076 -2.415 -2.592 -3.05 -3.202 -3.421 -3.66 -4.175 -4.443 -4.722 -5.031 -5.385 -5.8 -6.31 -7.331 -8 ,26516 ,TETRA ,17603091,Sun Nov 28 16:30:16 CET,Sun Nov 28 18:18:16 CET,0.0 1.102 1.613 2.023 2.377 2.673 2.954 3.218 3.682 3.887 4.075 4.166 4.583 4.748 5.068 5.377 5.668 5.803 6.067 6.336 6.731 6.965 7.194 7.52 7.817 8.105 8.389 8.653 8.979 9.296 9.604 9.967 10.318 10.653 11.025 11.435 11.818 12.233 12.636 13.026 13.45 13.883 14.316 14.749 15.226 15.691 16.127 16.475 16.759 16.879 16.459 15.413 14.38 13.371 12.416 11.576 10.843 10.1 9.398 8.683 8.047 7.49 6.991 6.485 5.974 5.513 5.038 4.598 4.198 3.78 3.343 2.997 2.636 2.245 1.936 1.621 1.29 0.934 0.565 0.312 0.058 -0.339 -0.63 -0.948 -1.109 -1.427 -1.759 -2.125 -2.321 -2.777 -2.914 -3.129 -3.355 -3.857 -4.13 -4.421 -4.755 -5.124 -5.536 -6.071 -7.043 -9 ,10919 ,TETRA ,17603092,Sun Nov 28 16:30:14 CET,Sun Nov 28 18:17:46 CET,0.0 1.063 1.602 1.994 2.347 2.669 2.955 3.214 3.7 3.907 4.097 4.213 4.654 4.834 5.183 5.515 5.809 5.947 6.216 6.471 6.844 7.08 7.295 7.598 7.886 8.171 8.453 8.724 9.052 9.343 9.648 10.018 10.341 10.66 11.028 11.437 11.828 12.225 12.629 13.035 13.428 13.849 14.348 14.818 15.275 15.748 16.2 16.579 16.87 16.949 16.62 15.666 14.544 13.482 12.491 11.572 10.756 10.023 9.385 8.723 8.116 7.521 6.916 6.35 5.848 5.384 4.894 4.463 4.063 3.619 3.174 2.805 2.424 2.03 1.716 1.394 1.062 0.71 0.358 0.115 -0.148 -0.548 -0.81 -1.094 -1.249 -1.571 -1.906 -2.26 -2.448 -2.907 -3.049 -3.265 -3.491 -3.977 -4.246 -4.54 -4.859 -5.231 -5.668 -6.182 -7.021 -10 ,9978 ,TETRA ,17603093,Sun Nov 28 16:30:15 CET,Sun Nov 28 18:17:23 CET,0.0 1.178 1.694 2.078 2.393 2.685 2.962 3.225 3.702 3.927 4.137 4.254 4.684 4.853 5.178 5.491 5.778 5.91 6.16 6.403 6.763 6.993 7.215 7.537 7.844 8.133 8.422 8.68 8.995 9.305 9.597 9.952 10.286 10.588 10.94 11.333 11.675 12.031 12.395 12.793 13.232 13.681 14.14 14.573 15.06 15.542 15.981 16.351 16.593 16.616 16.229 15.245 14.209 13.215 12.276 11.376 10.575 9.836 9.164 8.492 7.887 7.345 6.807 6.273 5.778 5.313 4.808 4.347 3.95 3.529 3.088 2.733 2.366 1.985 1.689 1.377 1.043 0.679 0.299 0.051 -0.189 -0.558 -0.836 -1.143 -1.299 -1.621 -1.938 -2.275 -2.46 -2.912 -3.049 -3.258 -3.475 -3.944 -4.209 -4.516 -4.852 -5.205 -5.625 -6.158 -7.067 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_15_14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_15_14.txt deleted file mode 100644 index 58c1538e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_15_14.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18049 ,TETRA ,17605836,Sun Nov 28 19:49:09 CET,Sun Nov 28 21:54:19 CET,0.0 1.01 1.302 1.522 1.687 1.83 1.966 2.098 2.324 2.44 2.558 2.676 2.877 2.978 3.176 3.359 3.533 3.615 3.765 3.905 4.115 4.269 4.418 4.62 4.825 5.031 5.224 5.409 5.657 5.901 6.131 6.403 6.662 6.92 7.238 7.6 7.953 8.34 8.733 9.155 9.583 10.067 10.661 11.256 11.959 12.759 13.721 14.768 15.892 17.152 18.632 19.682 19.981 19.963 19.771 19.458 19.148 18.881 18.674 18.427 18.116 17.793 17.481 17.152 16.84 16.524 16.157 15.84 15.557 15.253 14.935 14.676 14.411 14.14 13.919 13.672 13.416 13.137 12.848 12.657 12.465 12.172 11.951 11.705 11.585 11.326 11.045 10.761 10.605 10.344 10.016 9.788 9.535 9.005 8.724 8.421 8.058 7.583 6.93 5.843 1.43 -3 ,25637 ,TETRA ,17605838,Sun Nov 28 19:49:10 CET,Sun Nov 28 21:55:55 CET,0.0 1.404 1.715 1.959 2.174 2.346 2.487 2.621 2.86 2.964 3.074 3.204 3.411 3.502 3.674 3.839 3.999 4.077 4.223 4.375 4.609 4.746 4.878 5.071 5.249 5.43 5.629 5.823 6.058 6.278 6.482 6.745 7.004 7.248 7.548 7.875 8.176 8.505 8.839 9.215 9.634 10.102 10.607 11.105 11.697 12.348 13.096 13.988 15.068 16.307 17.685 18.531 18.804 18.902 18.847 18.563 18.166 17.731 17.279 16.826 16.433 16.059 15.663 15.202 14.779 14.413 14.002 13.614 13.291 12.957 12.563 12.203 11.818 11.449 11.175 10.875 10.544 10.195 9.841 9.575 9.273 8.82 8.527 8.222 8.059 7.694 7.276 6.793 6.52 6.153 5.681 5.381 5.074 4.375 3.953 3.486 2.996 2.439 1.591 0.312 -8.786 -6 ,15313 ,TETRA ,17605841,Sun Nov 28 19:49:09 CET,Sun Nov 28 21:57:00 CET,0.0 0.999 1.367 1.607 1.776 1.936 2.091 2.221 2.482 2.597 2.689 2.774 2.966 3.054 3.22 3.386 3.546 3.628 3.784 3.919 4.108 4.231 4.358 4.543 4.724 4.902 5.078 5.246 5.47 5.685 5.888 6.133 6.371 6.611 6.892 7.224 7.556 7.892 8.239 8.631 9.053 9.531 10.115 10.706 11.38 12.14 13.065 14.053 15.158 16.448 17.761 18.75 19.213 19.355 19.265 18.967 18.637 18.295 17.961 17.587 17.229 16.891 16.534 16.191 15.888 15.562 15.166 14.783 14.425 14.047 13.656 13.327 12.945 12.569 12.313 12.047 11.773 11.458 11.083 10.853 10.617 10.189 9.83 9.432 9.245 8.857 8.46 8.035 7.802 7.486 7.09 6.85 6.599 6.016 5.67 5.277 4.838 4.309 3.594 2.491 -5.74 -9 ,21450 ,TETRA ,17605844,Sun Nov 28 19:49:14 CET,Sun Nov 28 22:02:56 CET,0.0 0.725 0.988 1.204 1.38 1.534 1.673 1.814 2.083 2.207 2.324 2.472 2.69 2.793 2.987 3.177 3.362 3.449 3.63 3.806 4.055 4.214 4.366 4.586 4.8 5.013 5.216 5.415 5.669 5.912 6.146 6.423 6.704 6.972 7.268 7.605 7.911 8.245 8.644 9.089 9.541 10.032 10.614 11.196 11.853 12.548 13.353 14.281 15.373 16.619 17.97 18.907 19.234 19.231 19.022 18.689 18.331 17.962 17.61 17.228 16.903 16.605 16.292 15.973 15.642 15.337 15.025 14.733 14.46 14.171 13.888 13.657 13.403 13.127 12.888 12.608 12.327 12.062 11.77 11.545 11.311 10.93 10.668 10.382 10.231 9.93 9.59 9.187 8.972 8.684 8.334 8.085 7.787 7.156 6.78 6.352 5.927 5.386 4.668 3.582 -9.187 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_15_16.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_15_16.txt deleted file mode 100644 index 016794fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_15_16.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11750 ,TETRA ,17605846,Sun Nov 28 19:49:13 CET,Sun Nov 28 21:58:35 CET,0.0 0.364 0.51 0.639 0.772 0.889 0.981 1.062 1.219 1.304 1.382 1.423 1.587 1.648 1.774 1.892 1.991 2.042 2.158 2.259 2.403 2.497 2.581 2.703 2.814 2.922 3.038 3.152 3.284 3.409 3.554 3.744 3.915 4.077 4.273 4.489 4.689 4.893 5.122 5.373 5.634 5.965 6.311 6.598 6.943 7.352 7.805 8.25 8.727 9.212 9.654 9.701 9.348 8.906 8.462 7.916 7.379 6.897 6.49 6.099 5.741 5.406 5.05 4.682 4.336 4.012 3.656 3.331 3.056 2.761 2.458 2.193 1.897 1.604 1.374 1.126 0.878 0.636 0.386 0.206 0.017 -0.278 -0.493 -0.723 -0.852 -1.123 -1.405 -1.733 -1.907 -2.169 -2.424 -2.613 -2.823 -3.275 -3.521 -3.785 -4.062 -4.396 -4.815 -5.373 -7.442 -2 ,24720 ,TETRA ,17605847,Sun Nov 28 19:49:15 CET,Sun Nov 28 21:58:08 CET,0.0 0.377 0.591 0.73 0.821 0.91 1.011 1.106 1.287 1.371 1.441 1.476 1.654 1.73 1.854 1.951 2.058 2.11 2.205 2.293 2.42 2.504 2.588 2.718 2.839 2.952 3.074 3.195 3.328 3.455 3.58 3.733 3.883 4.015 4.17 4.353 4.525 4.721 4.927 5.123 5.321 5.564 5.846 6.103 6.391 6.702 7.036 7.381 7.789 8.224 8.561 8.515 8.147 7.676 7.194 6.734 6.303 5.858 5.428 4.979 4.587 4.241 3.887 3.517 3.146 2.799 2.442 2.118 1.84 1.56 1.261 1.012 0.758 0.491 0.278 0.054 -0.169 -0.411 -0.686 -0.871 -1.064 -1.376 -1.619 -1.897 -2.033 -2.299 -2.583 -2.893 -3.049 -3.303 -3.545 -3.725 -3.916 -4.391 -4.68 -4.949 -5.211 -5.546 -5.978 -6.555 -8.557 -3 ,23371 ,TETRA ,17605849,Sun Nov 28 19:49:10 CET,Sun Nov 28 21:58:04 CET,0.0 0.538 0.725 0.903 1.065 1.192 1.298 1.406 1.583 1.65 1.731 1.796 1.958 2.019 2.154 2.272 2.364 2.415 2.534 2.641 2.789 2.873 2.945 3.073 3.207 3.33 3.441 3.551 3.687 3.818 3.953 4.102 4.245 4.387 4.545 4.711 4.872 5.058 5.263 5.489 5.732 5.99 6.285 6.568 6.876 7.217 7.555 7.864 8.244 8.697 9.041 8.9 8.503 8.012 7.465 6.903 6.388 5.859 5.344 4.852 4.452 4.087 3.734 3.418 3.107 2.793 2.453 2.148 1.892 1.622 1.338 1.1 0.821 0.515 0.294 0.061 -0.205 -0.494 -0.813 -1.038 -1.263 -1.613 -1.855 -2.116 -2.256 -2.54 -2.836 -3.166 -3.337 -3.619 -3.925 -4.141 -4.387 -4.942 -5.23 -5.531 -5.859 -6.214 -6.642 -7.255 -9.385 -4 ,10114 ,TETRA ,17605850,Sun Nov 28 19:49:10 CET,Sun Nov 28 21:49:19 CET,0.0 0.697 0.9 1.022 1.128 1.215 1.292 1.371 1.539 1.618 1.691 1.728 1.898 1.957 2.069 2.183 2.288 2.345 2.463 2.575 2.723 2.812 2.911 3.062 3.193 3.326 3.462 3.58 3.739 3.89 4.019 4.18 4.332 4.473 4.649 4.86 5.062 5.262 5.453 5.66 5.884 6.153 6.476 6.785 7.135 7.552 7.975 8.362 8.756 9.126 9.417 9.333 9.041 8.659 8.203 7.706 7.247 6.791 6.32 5.829 5.39 4.978 4.582 4.201 3.835 3.47 3.08 2.728 2.408 2.081 1.74 1.444 1.134 0.808 0.548 0.279 -0.001 -0.297 -0.605 -0.811 -1.032 -1.382 -1.619 -1.886 -2.028 -2.334 -2.637 -2.931 -3.083 -3.335 -3.596 -3.792 -3.995 -4.419 -4.65 -4.921 -5.238 -5.608 -6.064 -6.66 -8.395 -5 ,31871 ,TETRA ,17605851,Sun Nov 28 19:49:11 CET,Sun Nov 28 21:40:14 CET,0.0 0.563 0.682 0.802 0.911 1.009 1.101 1.19 1.319 1.383 1.44 1.437 1.584 1.632 1.736 1.844 1.939 1.981 2.055 2.122 2.228 2.304 2.385 2.491 2.592 2.702 2.813 2.921 3.054 3.173 3.288 3.424 3.545 3.674 3.825 3.991 4.166 4.365 4.59 4.809 5.018 5.26 5.541 5.799 6.097 6.417 6.755 7.109 7.456 7.77 7.852 7.496 7.058 6.609 6.145 5.681 5.207 4.727 4.262 3.756 3.314 2.939 2.573 2.204 1.86 1.565 1.258 0.954 0.676 0.405 0.116 -0.146 -0.406 -0.671 -0.867 -1.077 -1.323 -1.606 -1.924 -2.118 -2.303 -2.607 -2.823 -3.044 -3.154 -3.381 -3.621 -3.879 -4.014 -4.245 -4.462 -4.633 -4.825 -5.256 -5.493 -5.733 -5.987 -6.307 -6.715 -7.29 -10.237 -6 ,8313 ,TETRA ,17605852,Sun Nov 28 19:49:10 CET,Sun Nov 28 21:59:46 CET,0.0 0.578 0.779 0.954 1.076 1.184 1.276 1.347 1.502 1.574 1.649 1.695 1.861 1.922 2.049 2.16 2.265 2.314 2.404 2.502 2.649 2.739 2.827 2.962 3.108 3.237 3.357 3.49 3.643 3.78 3.92 4.095 4.257 4.397 4.559 4.741 4.912 5.122 5.357 5.581 5.814 6.081 6.397 6.722 7.074 7.458 7.908 8.389 8.922 9.457 9.824 9.773 9.538 9.235 8.871 8.457 8.027 7.578 7.147 6.711 6.3 5.856 5.445 5.085 4.733 4.418 4.09 3.8 3.551 3.291 3.014 2.779 2.529 2.255 2.05 1.836 1.62 1.398 1.151 0.96 0.74 0.393 0.154 -0.104 -0.235 -0.507 -0.807 -1.117 -1.28 -1.547 -1.824 -2.014 -2.191 -2.569 -2.807 -3.096 -3.416 -3.742 -4.101 -4.722 -6.583 -7 ,27044 ,TETRA ,17605853,Sun Nov 28 19:49:11 CET,Sun Nov 28 22:00:58 CET,0.0 0.492 0.623 0.751 0.879 0.992 1.086 1.177 1.358 1.445 1.524 1.557 1.714 1.773 1.903 2.03 2.146 2.195 2.282 2.362 2.485 2.568 2.654 2.773 2.897 3.016 3.126 3.245 3.391 3.53 3.677 3.848 4.004 4.161 4.349 4.567 4.763 4.975 5.209 5.444 5.696 5.976 6.287 6.581 6.896 7.241 7.646 8.076 8.501 8.928 9.216 9.089 8.773 8.329 7.842 7.347 6.874 6.399 5.937 5.463 5.058 4.706 4.351 3.989 3.643 3.315 2.968 2.654 2.371 2.067 1.744 1.445 1.095 0.731 0.471 0.216 -0.053 -0.338 -0.626 -0.829 -1.051 -1.386 -1.628 -1.89 -2.024 -2.301 -2.587 -2.88 -3.035 -3.305 -3.616 -3.831 -4.055 -4.513 -4.751 -5.012 -5.311 -5.659 -6.105 -6.746 -9.162 -8 ,27400 ,TETRA ,17605854,Sun Nov 28 19:49:12 CET,Sun Nov 28 22:00:41 CET,0.0 0.318 0.468 0.585 0.698 0.819 0.938 1.047 1.225 1.3 1.363 1.387 1.545 1.599 1.71 1.816 1.923 1.969 2.063 2.162 2.303 2.396 2.471 2.576 2.689 2.81 2.927 3.027 3.165 3.303 3.429 3.602 3.772 3.92 4.086 4.271 4.455 4.654 4.872 5.098 5.326 5.612 5.98 6.345 6.74 7.146 7.536 7.874 8.226 8.571 8.781 8.658 8.378 7.884 7.341 6.846 6.403 6.005 5.615 5.196 4.763 4.336 3.943 3.531 3.135 2.772 2.38 2.044 1.738 1.405 1.077 0.799 0.48 0.151 -0.098 -0.367 -0.668 -0.961 -1.243 -1.449 -1.667 -2.015 -2.251 -2.501 -2.641 -2.939 -3.26 -3.61 -3.784 -4.062 -4.361 -4.561 -4.781 -5.293 -5.588 -5.908 -6.238 -6.599 -7.07 -7.765 -10.34 -9 ,1389 ,TETRA ,17605855,Sun Nov 28 19:49:13 CET,Sun Nov 28 21:58:29 CET,0.0 0.349 0.505 0.625 0.732 0.833 0.932 1.021 1.201 1.284 1.355 1.388 1.558 1.62 1.724 1.805 1.892 1.935 2.021 2.112 2.231 2.311 2.389 2.487 2.573 2.671 2.777 2.867 2.971 3.061 3.177 3.332 3.468 3.595 3.749 3.923 4.079 4.26 4.449 4.652 4.896 5.138 5.406 5.706 6.049 6.46 6.924 7.398 7.864 8.257 8.565 8.454 7.992 7.427 6.823 6.231 5.756 5.313 4.888 4.447 4.077 3.735 3.389 3.06 2.744 2.426 2.075 1.775 1.512 1.219 0.886 0.609 0.321 0.045 -0.146 -0.357 -0.593 -0.85 -1.117 -1.303 -1.503 -1.812 -2.038 -2.27 -2.387 -2.647 -2.912 -3.177 -3.317 -3.562 -3.823 -4.003 -4.189 -4.665 -4.922 -5.177 -5.519 -5.941 -6.44 -7.107 -9.608 -10 ,24287 ,TETRA ,17605856,Sun Nov 28 19:49:15 CET,Sun Nov 28 21:58:46 CET,0.0 0.624 0.757 0.868 0.967 1.05 1.132 1.204 1.356 1.419 1.47 1.484 1.629 1.677 1.776 1.871 1.958 1.997 2.079 2.168 2.295 2.366 2.424 2.523 2.621 2.722 2.827 2.922 3.052 3.181 3.318 3.492 3.656 3.813 3.984 4.172 4.351 4.535 4.743 4.971 5.205 5.471 5.751 6.003 6.293 6.622 6.994 7.352 7.742 8.12 8.394 8.276 7.8 7.283 6.818 6.347 5.87 5.377 4.948 4.527 4.135 3.737 3.315 2.934 2.585 2.239 1.897 1.608 1.342 1.049 0.734 0.477 0.229 -0.043 -0.277 -0.524 -0.767 -1.014 -1.28 -1.471 -1.683 -2.028 -2.261 -2.493 -2.615 -2.88 -3.181 -3.504 -3.665 -3.921 -4.178 -4.379 -4.604 -5.077 -5.343 -5.652 -5.98 -6.344 -6.754 -7.345 -9.255 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_16_14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_16_14.txt deleted file mode 100644 index 87a995d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_16_14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20627 ,TETRA ,17605857,Sun Nov 28 19:49:12 CET,Sun Nov 28 21:53:25 CET,0.0 1.517 1.799 1.987 2.143 2.297 2.449 2.585 2.829 2.939 3.048 3.168 3.357 3.451 3.63 3.813 3.979 4.055 4.204 4.344 4.549 4.68 4.808 4.984 5.154 5.333 5.502 5.665 5.873 6.076 6.276 6.522 6.759 6.996 7.287 7.607 7.908 8.243 8.589 8.957 9.361 9.821 10.363 10.886 11.49 12.168 12.936 13.809 14.834 16.063 17.377 18.281 18.72 18.898 18.935 18.938 18.881 18.712 18.549 18.455 18.383 18.276 18.144 18.0 17.864 17.714 17.533 17.374 17.208 16.993 16.786 16.641 16.492 16.327 16.192 16.055 15.903 15.717 15.499 15.347 15.186 14.926 14.743 14.56 14.461 14.238 14.008 13.752 13.633 13.437 13.251 13.099 12.934 12.568 12.357 12.101 11.802 11.468 11.069 10.494 5.917 -2 ,30744 ,TETRA ,17605858,Sun Nov 28 19:49:13 CET,Sun Nov 28 21:53:23 CET,0.0 0.803 1.07 1.301 1.5 1.638 1.767 1.9 2.142 2.263 2.389 2.537 2.737 2.835 3.023 3.204 3.372 3.446 3.589 3.733 3.938 4.081 4.222 4.42 4.611 4.804 5.007 5.188 5.413 5.638 5.862 6.131 6.369 6.586 6.866 7.187 7.488 7.8 8.105 8.446 8.828 9.269 9.789 10.3 10.905 11.556 12.26 13.063 13.96 14.921 15.922 16.584 16.842 16.896 16.853 16.756 16.625 16.494 16.352 16.175 16.018 15.851 15.583 15.309 15.108 14.955 14.784 14.593 14.413 14.205 13.998 13.843 13.662 13.469 13.309 13.138 12.959 12.759 12.56 12.426 12.284 12.077 11.927 11.768 11.681 11.502 11.34 11.156 11.054 10.865 10.741 10.626 10.472 10.042 9.793 9.523 9.224 8.85 8.352 7.637 3.785 -3 ,20796 ,TETRA ,17605859,Sun Nov 28 19:49:15 CET,Sun Nov 28 21:53:34 CET,0.0 1.131 1.404 1.622 1.814 1.987 2.132 2.247 2.449 2.542 2.637 2.738 2.93 3.027 3.23 3.46 3.671 3.758 3.924 4.077 4.284 4.416 4.54 4.719 4.892 5.057 5.234 5.406 5.622 5.836 6.034 6.286 6.528 6.761 7.033 7.321 7.606 7.924 8.254 8.629 9.016 9.421 9.891 10.372 10.945 11.603 12.373 13.197 14.111 15.146 16.304 17.19 17.634 17.81 17.858 17.855 17.798 17.708 17.59 17.428 17.271 17.112 16.948 16.794 16.65 16.517 16.354 16.181 16.037 15.892 15.737 15.615 15.482 15.335 15.201 15.044 14.886 14.703 14.51 14.4 14.295 14.109 13.964 13.823 13.751 13.597 13.45 13.259 13.154 12.978 12.882 12.779 12.623 12.195 11.955 11.698 11.429 11.172 10.862 10.43 8.209 -4 ,14758 ,TETRA ,17605860,Sun Nov 28 19:49:17 CET,Sun Nov 28 21:53:42 CET,0.0 1.335 1.695 1.976 2.219 2.415 2.577 2.734 3.036 3.179 3.317 3.473 3.685 3.8 4.012 4.202 4.387 4.481 4.641 4.786 5.007 5.141 5.281 5.5 5.697 5.881 6.066 6.252 6.489 6.712 6.933 7.215 7.486 7.741 8.031 8.364 8.705 9.047 9.385 9.746 10.135 10.583 11.113 11.652 12.257 12.928 13.726 14.594 15.564 16.683 17.908 18.733 19.15 19.411 19.561 19.627 19.646 19.61 19.515 19.398 19.284 19.16 18.994 18.797 18.59 18.405 18.229 18.066 17.922 17.775 17.602 17.412 17.214 17.045 16.922 16.8 16.664 16.469 16.236 16.082 15.919 15.667 15.481 15.285 15.178 14.944 14.717 14.495 14.394 14.205 14.041 13.901 13.748 13.414 13.242 13.026 12.726 12.384 12.033 11.344 7.668 -5 ,4041 ,TETRA ,17605861,Sun Nov 28 19:49:11 CET,Sun Nov 28 21:52:54 CET,0.0 1.896 2.382 2.752 3.058 3.336 3.584 3.795 4.162 4.328 4.487 4.703 4.938 5.064 5.256 5.404 5.567 5.644 5.781 5.912 6.105 6.241 6.371 6.556 6.753 6.945 7.115 7.295 7.527 7.728 7.919 8.163 8.401 8.622 8.886 9.206 9.503 9.796 10.109 10.471 10.863 11.279 11.761 12.227 12.743 13.34 14.067 14.892 15.805 16.897 18.2 19.163 19.639 19.914 20.031 19.999 19.923 19.767 19.585 19.42 19.246 19.04 18.86 18.651 18.399 18.185 17.962 17.758 17.584 17.391 17.194 17.043 16.897 16.721 16.567 16.421 16.256 16.053 15.836 15.705 15.572 15.302 15.106 14.883 14.771 14.574 14.357 14.138 14.031 13.823 13.607 13.447 13.293 12.945 12.745 12.539 12.301 11.991 11.596 10.981 7.4 -6 ,29885 ,TETRA ,17605862,Sun Nov 28 19:49:13 CET,Sun Nov 28 21:53:35 CET,0.0 0.978 1.29 1.503 1.67 1.837 2.004 2.148 2.396 2.509 2.623 2.755 2.951 3.05 3.241 3.416 3.583 3.667 3.826 3.97 4.168 4.293 4.416 4.595 4.767 4.942 5.112 5.271 5.481 5.689 5.893 6.144 6.401 6.654 6.933 7.242 7.535 7.853 8.197 8.567 8.962 9.408 9.92 10.449 11.051 11.711 12.477 13.324 14.321 15.407 16.563 17.461 17.921 18.195 18.318 18.333 18.273 18.17 18.045 17.822 17.626 17.482 17.336 17.168 17.025 16.899 16.734 16.579 16.451 16.317 16.137 15.976 15.814 15.637 15.482 15.325 15.178 15.022 14.862 14.741 14.597 14.374 14.221 14.056 13.98 13.837 13.684 13.52 13.43 13.226 13.033 12.883 12.709 12.291 12.051 11.809 11.578 11.281 10.874 10.331 7.334 -7 ,27127 ,TETRA ,17605863,Sun Nov 28 19:49:13 CET,Sun Nov 28 21:52:46 CET,0.0 1.264 1.535 1.729 1.903 2.058 2.179 2.291 2.516 2.631 2.743 2.855 3.037 3.124 3.305 3.458 3.6 3.67 3.799 3.923 4.111 4.229 4.34 4.51 4.671 4.83 4.993 5.157 5.365 5.551 5.733 5.962 6.182 6.388 6.636 6.931 7.208 7.501 7.818 8.169 8.549 8.974 9.479 9.994 10.583 11.207 11.916 12.732 13.668 14.735 15.941 16.754 17.104 17.233 17.221 17.13 16.997 16.805 16.613 16.415 16.224 16.04 15.864 15.706 15.556 15.411 15.236 15.069 14.9 14.7 14.509 14.372 14.239 14.092 13.963 13.841 13.716 13.555 13.372 13.247 13.107 12.873 12.712 12.546 12.452 12.261 12.076 11.849 11.716 11.504 11.344 11.197 11.055 10.725 10.499 10.262 10.025 9.734 9.342 8.809 7.101 -8 ,14430 ,TETRA ,17605864,Sun Nov 28 19:49:15 CET,Sun Nov 28 21:53:22 CET,0.0 1.323 1.707 1.975 2.188 2.374 2.542 2.704 2.985 3.115 3.242 3.369 3.566 3.671 3.862 4.047 4.236 4.325 4.482 4.628 4.838 4.982 5.123 5.324 5.52 5.713 5.903 6.073 6.281 6.479 6.666 6.906 7.144 7.362 7.611 7.912 8.22 8.556 8.898 9.236 9.599 10.016 10.526 11.066 11.689 12.353 13.1 13.936 14.905 16.018 17.131 17.817 17.967 17.845 17.684 17.5 17.312 17.106 16.875 16.612 16.393 16.202 16.015 15.839 15.66 15.501 15.325 15.111 14.917 14.751 14.566 14.418 14.29 14.14 13.987 13.807 13.619 13.441 13.263 13.13 13.004 12.779 12.596 12.4 12.299 12.093 11.849 11.622 11.513 11.303 11.154 11.018 10.859 10.502 10.307 10.099 9.829 9.467 9.106 8.527 2.332 -9 ,17605 ,TETRA ,17605865,Sun Nov 28 19:49:13 CET,Sun Nov 28 21:55:58 CET,0.0 2.09 2.596 2.924 3.236 3.515 3.771 4.015 4.426 4.593 4.749 4.94 5.16 5.274 5.478 5.673 5.865 5.955 6.128 6.303 6.55 6.724 6.898 7.136 7.375 7.592 7.777 7.96 8.2 8.415 8.618 8.872 9.118 9.375 9.678 9.998 10.301 10.629 10.981 11.338 11.711 12.149 12.618 13.06 13.57 14.127 14.792 15.556 16.459 17.493 18.68 19.674 20.113 20.254 20.312 20.29 20.156 19.962 19.739 19.476 19.241 18.997 18.755 18.543 18.354 18.184 17.992 17.806 17.634 17.466 17.288 17.13 16.982 16.832 16.714 16.585 16.459 16.313 16.123 15.99 15.868 15.7 15.559 15.371 15.277 15.092 14.866 14.606 14.484 14.277 14.094 13.966 13.832 13.517 13.336 13.138 12.877 12.53 12.059 11.333 7.422 -10 ,28757 ,TETRA ,17605866,Sun Nov 28 19:49:17 CET,Sun Nov 28 21:55:54 CET,0.0 1.383 1.834 2.185 2.481 2.746 2.974 3.18 3.554 3.725 3.887 4.07 4.277 4.372 4.542 4.703 4.851 4.928 5.084 5.227 5.407 5.512 5.621 5.782 5.928 6.072 6.209 6.336 6.513 6.692 6.872 7.097 7.305 7.478 7.683 7.934 8.2 8.533 8.882 9.233 9.621 10.077 10.618 11.142 11.734 12.386 13.118 13.939 14.853 15.885 16.995 17.773 18.132 18.169 18.122 18.08 17.964 17.801 17.643 17.463 17.279 17.096 16.94 16.809 16.668 16.497 16.295 16.123 15.963 15.764 15.549 15.376 15.219 15.069 14.951 14.828 14.696 14.543 14.384 14.282 14.156 13.928 13.78 13.654 13.595 13.477 13.362 13.212 13.127 12.963 12.844 12.708 12.56 12.22 12.044 11.884 11.726 11.558 11.303 10.884 7.426 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_17_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_17_15.txt deleted file mode 100644 index ba1fc1b7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_17_15.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5686 ,TETRA ,17605867,Sun Nov 28 19:49:15 CET,Sun Nov 28 21:56:47 CET,0.0 1.198 1.679 2.114 2.439 2.705 2.953 3.166 3.557 3.741 3.915 4.13 4.396 4.543 4.819 5.09 5.343 5.457 5.685 5.914 6.223 6.413 6.603 6.882 7.139 7.39 7.636 7.868 8.175 8.453 8.705 9.009 9.302 9.592 9.93 10.311 10.696 11.136 11.603 12.097 12.616 13.206 13.921 14.622 15.401 16.24 17.19 18.163 19.182 20.431 21.789 22.683 23.067 23.158 23.175 23.135 23.038 22.916 22.795 22.621 22.418 22.249 22.097 21.948 21.803 21.661 21.515 21.392 21.275 21.162 21.036 20.904 20.771 20.623 20.496 20.375 20.249 20.126 20.014 19.93 19.845 19.707 19.601 19.491 19.428 19.285 19.143 19.008 18.935 18.754 18.701 18.626 18.536 18.297 18.169 18.056 17.923 17.767 17.596 17.359 16.674 -2 ,20849 ,TETRA ,17605868,Sun Nov 28 19:49:14 CET,Sun Nov 28 21:56:04 CET,0.0 1.973 2.493 2.868 3.199 3.49 3.733 3.949 4.362 4.558 4.736 4.961 5.227 5.372 5.646 5.918 6.182 6.298 6.516 6.749 7.075 7.274 7.462 7.722 7.971 8.209 8.441 8.683 9.0 9.288 9.56 9.89 10.204 10.504 10.857 11.252 11.63 12.043 12.471 12.929 13.432 13.972 14.564 15.162 15.869 16.676 17.58 18.542 19.608 20.755 22.057 22.971 23.256 23.237 23.205 23.173 23.015 22.809 22.626 22.416 22.246 22.076 21.899 21.748 21.614 21.498 21.365 21.221 21.093 20.957 20.82 20.707 20.581 20.435 20.316 20.206 20.097 19.987 19.867 19.783 19.7 19.571 19.47 19.352 19.298 19.191 19.084 18.955 18.885 18.714 18.67 18.588 18.501 18.309 18.208 18.098 17.976 17.837 17.648 17.376 16.245 -3 ,23248 ,TETRA ,17605869,Sun Nov 28 19:49:39 CET,Sun Nov 28 21:57:38 CET,0.0 1.535 2.087 2.542 2.884 3.192 3.457 3.683 4.095 4.299 4.5 4.748 5.021 5.171 5.472 5.767 6.021 6.148 6.404 6.633 6.957 7.153 7.344 7.628 7.889 8.142 8.391 8.629 8.933 9.232 9.51 9.845 10.182 10.497 10.87 11.298 11.692 12.111 12.583 13.115 13.646 14.221 14.879 15.514 16.241 17.026 17.906 18.912 20.005 21.092 22.264 23.002 23.192 23.173 23.077 22.897 22.719 22.567 22.408 22.215 22.026 21.852 21.707 21.562 21.414 21.27 21.093 20.941 20.808 20.664 20.51 20.377 20.24 20.1 19.991 19.868 19.741 19.612 19.472 19.371 19.273 19.128 19.018 18.888 18.824 18.702 18.556 18.407 18.337 18.153 18.064 17.961 17.866 17.686 17.586 17.478 17.319 17.136 16.964 16.727 16.005 -4 ,10419 ,TETRA ,17605870,Sun Nov 28 19:49:40 CET,Sun Nov 28 21:57:45 CET,0.0 1.872 2.339 2.69 2.993 3.277 3.537 3.754 4.141 4.322 4.494 4.695 4.946 5.089 5.354 5.631 5.905 6.031 6.281 6.515 6.821 7.01 7.193 7.454 7.696 7.928 8.162 8.4 8.709 9.01 9.294 9.629 9.946 10.246 10.612 11.024 11.415 11.855 12.317 12.79 13.274 13.778 14.389 15.003 15.692 16.478 17.392 18.429 19.634 20.939 22.334 23.357 23.789 24.017 24.142 24.119 23.973 23.82 23.672 23.486 23.336 23.209 23.066 22.91 22.743 22.59 22.437 22.286 22.16 22.032 21.888 21.762 21.629 21.496 21.389 21.271 21.157 21.04 20.915 20.824 20.728 20.591 20.495 20.388 20.328 20.218 20.12 19.998 19.924 19.749 19.668 19.576 19.473 19.228 19.077 18.908 18.745 18.573 18.35 18.08 17.155 -5 ,30539 ,TETRA ,17605871,Sun Nov 28 19:49:43 CET,Sun Nov 28 21:57:46 CET,0.0 1.638 2.18 2.535 2.851 3.137 3.365 3.572 4.009 4.209 4.387 4.586 4.839 4.985 5.261 5.524 5.774 5.897 6.147 6.382 6.723 6.947 7.155 7.462 7.748 8.021 8.289 8.541 8.866 9.178 9.487 9.852 10.187 10.501 10.853 11.258 11.668 12.123 12.592 13.072 13.586 14.166 14.825 15.462 16.179 16.964 17.79 18.673 19.799 21.059 22.374 23.274 23.634 23.758 23.739 23.621 23.434 23.212 23.016 22.804 22.599 22.408 22.23 22.067 21.911 21.756 21.578 21.423 21.307 21.194 21.075 20.982 20.88 20.759 20.67 20.575 20.478 20.39 20.294 20.219 20.132 19.991 19.898 19.799 19.747 19.632 19.514 19.389 19.321 19.142 19.048 18.956 18.881 18.718 18.616 18.497 18.347 18.168 17.996 17.814 17.078 -6 ,21419 ,TETRA ,17605872,Sun Nov 28 19:49:44 CET,Sun Nov 28 21:56:30 CET,0.0 1.589 2.115 2.527 2.841 3.111 3.368 3.625 4.069 4.262 4.44 4.675 4.964 5.128 5.449 5.759 6.039 6.17 6.431 6.676 7.022 7.249 7.456 7.733 8.009 8.29 8.556 8.813 9.15 9.459 9.745 10.085 10.417 10.755 11.149 11.563 11.943 12.399 12.912 13.401 13.892 14.449 15.067 15.68 16.405 17.189 18.045 18.979 20.041 21.267 22.63 23.604 24.005 24.133 24.125 24.04 23.936 23.816 23.697 23.56 23.444 23.335 23.221 23.103 22.975 22.85 22.711 22.588 22.465 22.314 22.171 22.068 21.954 21.83 21.737 21.641 21.536 21.415 21.279 21.189 21.099 20.95 20.851 20.746 20.69 20.582 20.447 20.29 20.216 20.046 19.992 19.911 19.83 19.653 19.543 19.41 19.267 19.114 18.866 18.513 17.489 -7 ,28456 ,TETRA ,17605873,Sun Nov 28 19:50:09 CET,Sun Nov 28 21:57:37 CET,0.0 1.601 2.005 2.322 2.566 2.778 3.001 3.228 3.592 3.739 3.878 4.047 4.295 4.423 4.638 4.845 5.046 5.143 5.355 5.567 5.869 6.069 6.264 6.535 6.809 7.078 7.335 7.587 7.907 8.199 8.483 8.838 9.181 9.518 9.886 10.295 10.707 11.133 11.596 12.142 12.733 13.349 14.017 14.639 15.344 16.125 16.985 17.98 19.107 20.265 21.475 22.267 22.585 22.636 22.565 22.438 22.272 22.094 21.918 21.694 21.486 21.312 21.142 20.961 20.783 20.617 20.413 20.235 20.103 19.973 19.829 19.7 19.567 19.435 19.339 19.235 19.124 19.011 18.894 18.794 18.68 18.526 18.422 18.314 18.26 18.139 18.023 17.905 17.831 17.656 17.613 17.528 17.418 17.195 17.067 16.928 16.793 16.615 16.401 16.179 15.371 -8 ,26221 ,TETRA ,17605874,Sun Nov 28 19:49:39 CET,Sun Nov 28 21:57:36 CET,0.0 1.293 1.772 2.146 2.481 2.759 3.008 3.246 3.679 3.869 4.055 4.298 4.584 4.752 5.049 5.335 5.615 5.747 6.0 6.23 6.556 6.768 6.975 7.272 7.553 7.826 8.083 8.335 8.658 8.968 9.284 9.662 10.019 10.36 10.726 11.14 11.557 11.996 12.456 12.927 13.402 13.971 14.657 15.291 16.009 16.791 17.616 18.584 19.76 20.98 22.117 22.791 23.062 23.115 23.056 22.916 22.765 22.616 22.47 22.329 22.189 22.048 21.9 21.75 21.602 21.45 21.279 21.12 20.989 20.845 20.687 20.556 20.421 20.29 20.189 20.084 19.975 19.86 19.733 19.637 19.545 19.413 19.308 19.185 19.118 18.999 18.885 18.753 18.677 18.497 18.429 18.343 18.246 18.034 17.924 17.792 17.638 17.471 17.268 16.976 16.206 -9 ,22963 ,TETRA ,17605875,Sun Nov 28 19:49:39 CET,Sun Nov 28 21:56:44 CET,0.0 2.289 2.796 3.187 3.537 3.856 4.133 4.354 4.718 4.89 5.054 5.242 5.516 5.673 5.954 6.24 6.51 6.633 6.863 7.085 7.415 7.629 7.841 8.159 8.446 8.705 8.954 9.19 9.508 9.813 10.102 10.463 10.834 11.187 11.561 11.969 12.361 12.776 13.206 13.695 14.24 14.855 15.529 16.201 16.998 17.831 18.799 19.815 20.897 22.119 23.352 24.115 24.297 24.274 24.192 24.054 23.892 23.732 23.59 23.4 23.192 23.007 22.822 22.649 22.502 22.366 22.219 22.078 21.956 21.836 21.713 21.599 21.466 21.317 21.211 21.103 20.976 20.85 20.731 20.652 20.568 20.429 20.345 20.263 20.215 20.116 20.001 19.877 19.811 19.645 19.607 19.532 19.447 19.243 19.119 18.975 18.835 18.659 18.436 18.195 17.189 -10 ,7253 ,TETRA ,17605876,Sun Nov 28 19:49:41 CET,Sun Nov 28 22:01:15 CET,0.0 1.772 2.27 2.651 2.992 3.289 3.575 3.837 4.279 4.474 4.658 4.88 5.14 5.282 5.561 5.839 6.109 6.242 6.494 6.727 7.072 7.291 7.497 7.805 8.106 8.397 8.67 8.926 9.234 9.516 9.798 10.157 10.528 10.887 11.292 11.741 12.135 12.544 12.997 13.495 14.018 14.593 15.247 15.895 16.675 17.546 18.517 19.525 20.605 21.843 23.195 24.175 24.655 24.839 24.809 24.698 24.588 24.43 24.243 24.068 23.937 23.807 23.662 23.532 23.412 23.293 23.168 23.043 22.899 22.741 22.589 22.454 22.326 22.206 22.111 22.003 21.882 21.753 21.616 21.514 21.412 21.254 21.145 21.039 20.985 20.862 20.712 20.553 20.467 20.287 20.23 20.147 20.057 19.867 19.748 19.602 19.456 19.32 19.122 18.88 18.149 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_18_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_18_15.txt deleted file mode 100644 index 7e824f90..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_18_15.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27508 ,KEBNE ,17027606,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:27:18 CET,0.0 1.399 1.855 2.24 2.578 2.861 3.101 3.303 3.68 3.868 4.056 4.292 4.55 4.707 5.01 5.283 5.536 5.654 5.884 6.106 6.428 6.629 6.82 7.101 7.372 7.638 7.886 8.126 8.451 8.784 9.096 9.436 9.757 10.085 10.45 10.824 11.171 11.556 11.989 12.425 12.885 13.411 13.979 14.504 15.072 15.728 16.483 17.303 18.246 19.214 20.194 20.8 21.019 21.076 20.992 20.855 20.733 20.593 20.432 20.253 20.1 19.953 19.798 19.645 19.508 19.397 19.28 19.161 19.056 18.937 18.809 18.717 18.614 18.504 18.419 18.317 18.211 18.108 17.996 17.919 17.838 17.715 17.636 17.546 17.494 17.384 17.262 17.13 17.064 16.891 16.849 16.759 16.656 16.47 16.368 16.238 16.079 15.897 15.701 15.463 14.588 -2 ,7861 ,KEBNE ,17027607,Wed Dec 22 17:40:00 CET,Wed Dec 22 19:28:32 CET,0.0 1.24 1.672 2.011 2.338 2.624 2.869 3.098 3.516 3.703 3.888 4.109 4.365 4.513 4.783 5.046 5.296 5.42 5.673 5.897 6.216 6.421 6.616 6.894 7.146 7.398 7.651 7.892 8.195 8.484 8.754 9.071 9.382 9.684 10.023 10.39 10.726 11.106 11.526 11.975 12.44 12.944 13.525 14.076 14.72 15.43 16.215 17.076 18.027 19.007 20.075 20.676 20.827 20.869 20.805 20.716 20.594 20.435 20.275 20.091 19.929 19.772 19.616 19.481 19.355 19.22 19.079 18.96 18.849 18.719 18.598 18.507 18.405 18.299 18.214 18.124 18.039 17.954 17.855 17.775 17.693 17.579 17.497 17.402 17.351 17.253 17.164 17.077 17.029 16.867 16.842 16.773 16.696 16.521 16.394 16.272 16.135 15.974 15.816 15.6 14.953 -3 ,7962 ,KEBNE ,17027608,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:29:03 CET,0.0 2.184 2.694 3.031 3.323 3.591 3.83 4.053 4.466 4.656 4.828 5.059 5.32 5.457 5.731 5.996 6.234 6.345 6.564 6.777 7.076 7.269 7.462 7.732 7.994 8.268 8.539 8.801 9.129 9.444 9.766 10.168 10.54 10.88 11.249 11.646 12.019 12.405 12.8 13.223 13.669 14.173 14.786 15.351 15.967 16.681 17.453 18.214 19.028 19.968 20.988 21.586 21.8 21.802 21.755 21.729 21.653 21.542 21.413 21.25 21.109 20.983 20.855 20.721 20.598 20.479 20.347 20.234 20.137 20.032 19.909 19.809 19.698 19.57 19.475 19.365 19.255 19.152 19.04 18.966 18.887 18.759 18.678 18.582 18.528 18.438 18.335 18.209 18.141 17.972 17.939 17.866 17.791 17.627 17.529 17.425 17.33 17.22 17.057 16.836 16.254 -4 ,16003 ,KEBNE ,17027609,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:27:22 CET,0.0 1.102 1.637 2.024 2.299 2.557 2.812 3.038 3.424 3.593 3.758 3.973 4.235 4.393 4.712 5.017 5.297 5.43 5.694 5.945 6.295 6.525 6.732 7.035 7.348 7.637 7.904 8.16 8.506 8.847 9.169 9.574 9.967 10.322 10.709 11.125 11.525 11.969 12.422 12.878 13.359 13.872 14.462 15.08 15.788 16.527 17.386 18.334 19.36 20.48 21.508 22.068 22.267 22.268 22.192 22.08 21.959 21.825 21.702 21.573 21.447 21.314 21.17 21.019 20.867 20.721 20.547 20.386 20.234 20.07 19.938 19.838 19.729 19.618 19.526 19.434 19.342 19.251 19.155 19.076 18.996 18.883 18.795 18.688 18.628 18.517 18.382 18.23 18.155 17.973 17.913 17.829 17.746 17.584 17.484 17.361 17.234 17.095 16.887 16.657 16.202 -5 ,1943 ,KEBNE ,17027610,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:27:48 CET,0.0 2.357 2.929 3.294 3.595 3.852 4.1 4.345 4.781 4.987 5.183 5.43 5.7 5.843 6.128 6.409 6.679 6.816 7.083 7.338 7.689 7.909 8.125 8.412 8.679 8.944 9.204 9.451 9.753 10.033 10.308 10.649 10.974 11.284 11.632 12.012 12.37 12.754 13.193 13.662 14.109 14.584 15.168 15.755 16.381 17.03 17.742 18.488 19.334 20.302 21.394 22.088 22.262 22.244 22.137 21.971 21.798 21.625 21.464 21.307 21.149 21.01 20.885 20.757 20.621 20.485 20.352 20.252 20.164 20.056 19.942 19.843 19.74 19.642 19.554 19.453 19.362 19.265 19.159 19.09 19.012 18.88 18.796 18.698 18.646 18.545 18.432 18.315 18.265 18.123 18.117 18.045 17.98 17.857 17.77 17.676 17.56 17.416 17.255 17.066 16.703 -6 ,30861 ,KEBNE ,17027611,Wed Dec 22 17:40:00 CET,Wed Dec 22 19:27:07 CET,0.0 1.859 2.364 2.721 2.999 3.252 3.493 3.703 4.044 4.211 4.375 4.555 4.802 4.953 5.223 5.466 5.709 5.827 6.06 6.274 6.576 6.787 6.98 7.242 7.508 7.751 7.981 8.224 8.527 8.81 9.096 9.443 9.774 10.1 10.471 10.865 11.235 11.637 12.075 12.525 12.996 13.529 14.104 14.667 15.352 16.139 16.97 17.777 18.657 19.678 20.734 21.325 21.514 21.53 21.47 21.368 21.218 21.053 20.88 20.668 20.478 20.319 20.166 20.007 19.879 19.757 19.608 19.485 19.389 19.289 19.172 19.069 18.958 18.846 18.763 18.665 18.554 18.444 18.346 18.279 18.203 18.086 17.999 17.894 17.841 17.745 17.63 17.508 17.45 17.288 17.256 17.192 17.13 16.944 16.843 16.751 16.659 16.553 16.414 16.282 15.529 -7 ,20319 ,KEBNE ,17027612,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:29:12 CET,0.0 1.844 2.381 2.783 3.144 3.473 3.767 4.029 4.521 4.743 4.938 5.183 5.48 5.662 5.981 6.281 6.581 6.719 6.998 7.279 7.673 7.916 8.146 8.481 8.803 9.116 9.409 9.675 10.028 10.38 10.718 11.11 11.482 11.836 12.213 12.646 13.075 13.537 14.028 14.512 15.001 15.565 16.181 16.75 17.419 18.119 18.874 19.732 20.629 21.579 22.64 23.302 23.562 23.661 23.642 23.565 23.463 23.328 23.188 23.034 22.902 22.757 22.6 22.438 22.269 22.118 21.965 21.833 21.717 21.609 21.521 21.447 21.36 21.266 21.182 21.082 20.978 20.873 20.763 20.686 20.596 20.447 20.346 20.24 20.186 20.086 19.972 19.843 19.785 19.625 19.601 19.528 19.442 19.253 19.145 19.028 18.896 18.756 18.637 18.46 17.816 -8 ,2508 ,KEBNE ,17027613,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:27:20 CET,0.0 1.461 1.999 2.384 2.676 2.94 3.205 3.437 3.824 3.993 4.156 4.366 4.635 4.796 5.099 5.374 5.634 5.759 5.989 6.203 6.532 6.748 6.964 7.283 7.584 7.858 8.1 8.328 8.617 8.897 9.179 9.516 9.827 10.131 10.49 10.889 11.273 11.71 12.171 12.647 13.138 13.692 14.298 14.872 15.556 16.279 17.058 17.851 18.722 19.742 20.791 21.469 21.722 21.768 21.703 21.559 21.387 21.216 21.065 20.873 20.694 20.54 20.357 20.168 19.993 19.839 19.69 19.554 19.43 19.301 19.172 19.073 18.966 18.83 18.732 18.642 18.538 18.42 18.284 18.195 18.109 17.965 17.869 17.778 17.731 17.636 17.526 17.394 17.325 17.164 17.129 17.062 16.999 16.849 16.77 16.687 16.589 16.483 16.361 16.185 15.815 -9 ,1478 ,KEBNE ,17027614,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:28:09 CET,0.0 1.386 1.891 2.319 2.679 2.977 3.262 3.534 4.029 4.238 4.426 4.664 4.921 5.07 5.365 5.64 5.9 6.021 6.251 6.48 6.809 7.02 7.233 7.533 7.813 8.095 8.374 8.64 8.971 9.29 9.598 9.946 10.265 10.565 10.928 11.33 11.707 12.11 12.547 13.025 13.519 14.073 14.719 15.309 15.904 16.566 17.304 18.043 18.826 19.681 20.589 21.073 21.165 21.167 21.089 20.974 20.839 20.671 20.509 20.343 20.195 20.034 19.868 19.729 19.594 19.465 19.34 19.233 19.136 19.03 18.915 18.823 18.708 18.59 18.51 18.414 18.309 18.192 18.073 18.004 17.933 17.812 17.722 17.642 17.603 17.496 17.382 17.278 17.227 17.08 17.047 16.974 16.921 16.814 16.741 16.647 16.55 16.425 16.277 16.1 15.791 -10 ,13160 ,KEBNE ,17027615,Wed Dec 22 17:40:00 CET,Wed Dec 22 19:27:44 CET,0.0 1.215 1.699 2.084 2.396 2.657 2.898 3.12 3.517 3.702 3.883 4.136 4.402 4.559 4.865 5.138 5.4 5.523 5.757 5.981 6.296 6.508 6.712 7.004 7.276 7.544 7.806 8.052 8.366 8.668 8.96 9.3 9.613 9.907 10.244 10.637 11.019 11.42 11.838 12.265 12.709 13.229 13.82 14.389 15.083 15.885 16.792 17.82 18.873 19.856 20.897 21.561 21.859 21.98 21.964 21.859 21.709 21.577 21.445 21.267 21.127 21.021 20.913 20.782 20.649 20.538 20.413 20.306 20.217 20.115 20.001 19.906 19.807 19.712 19.63 19.526 19.416 19.306 19.195 19.117 19.033 18.911 18.811 18.692 18.637 18.527 18.399 18.251 18.173 17.995 17.935 17.855 17.783 17.632 17.543 17.441 17.322 17.167 16.986 16.79 16.447 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_18_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_18_17.txt deleted file mode 100644 index aa7dd82a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_18_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15306 ,TETRA ,17605877,Sun Nov 28 19:49:44 CET,Sun Nov 28 22:02:52 CET,0.0 0.781 1.045 1.258 1.418 1.561 1.663 1.741 1.881 1.947 2.024 2.078 2.254 2.313 2.423 2.53 2.632 2.681 2.772 2.868 3.019 3.112 3.2 3.329 3.464 3.589 3.7 3.813 3.956 4.091 4.216 4.362 4.499 4.636 4.797 4.971 5.157 5.352 5.541 5.749 5.972 6.197 6.456 6.729 7.015 7.293 7.577 7.858 8.088 8.2 8.142 7.88 7.519 7.105 6.686 6.283 5.894 5.518 5.181 4.856 4.588 4.325 4.061 3.811 3.587 3.384 3.161 2.948 2.771 2.587 2.386 2.222 2.047 1.868 1.741 1.609 1.479 1.339 1.178 1.062 0.947 0.784 0.67 0.552 0.493 0.368 0.232 0.067 -0.015 -0.198 -0.252 -0.339 -0.443 -0.683 -0.794 -0.903 -1.034 -1.184 -1.356 -1.569 -2.255 -2 ,24106 ,TETRA ,17605878,Sun Nov 28 19:49:39 CET,Sun Nov 28 21:58:19 CET,0.0 0.981 1.281 1.502 1.678 1.822 1.973 2.13 2.393 2.511 2.605 2.654 2.859 2.942 3.089 3.232 3.364 3.424 3.539 3.659 3.832 3.939 4.033 4.166 4.288 4.403 4.523 4.623 4.745 4.89 5.043 5.226 5.387 5.534 5.714 5.906 6.068 6.257 6.465 6.664 6.875 7.115 7.359 7.582 7.828 8.092 8.371 8.642 8.947 9.229 9.273 8.886 8.366 7.898 7.523 7.141 6.75 6.403 6.105 5.789 5.537 5.329 5.119 4.907 4.714 4.547 4.37 4.209 4.066 3.909 3.741 3.601 3.456 3.314 3.204 3.089 2.969 2.842 2.711 2.624 2.541 2.406 2.289 2.168 2.118 2.02 1.919 1.807 1.745 1.573 1.518 1.433 1.357 1.191 1.099 0.998 0.88 0.698 0.5 0.296 -0.927 -3 ,1208 ,TETRA ,17605879,Sun Nov 28 19:49:42 CET,Sun Nov 28 21:58:54 CET,0.0 0.825 1.101 1.305 1.486 1.655 1.816 1.952 2.178 2.283 2.383 2.476 2.682 2.766 2.93 3.092 3.235 3.304 3.439 3.556 3.717 3.833 3.95 4.116 4.267 4.404 4.525 4.647 4.823 4.994 5.147 5.317 5.469 5.627 5.829 6.036 6.225 6.432 6.648 6.87 7.084 7.317 7.578 7.841 8.148 8.453 8.775 9.115 9.45 9.725 9.856 9.667 9.331 8.977 8.622 8.264 7.916 7.615 7.37 7.091 6.838 6.616 6.407 6.201 6.008 5.851 5.691 5.54 5.402 5.263 5.124 5.004 4.876 4.741 4.638 4.53 4.415 4.299 4.173 4.089 4.002 3.848 3.737 3.625 3.555 3.412 3.283 3.144 3.062 2.861 2.81 2.714 2.617 2.422 2.308 2.176 2.019 1.853 1.674 1.43 0.678 -4 ,8242 ,TETRA ,17605880,Sun Nov 28 19:49:43 CET,Sun Nov 28 21:58:26 CET,0.0 0.471 0.729 0.96 1.15 1.309 1.451 1.586 1.822 1.934 2.044 2.126 2.333 2.419 2.574 2.719 2.863 2.938 3.09 3.216 3.366 3.464 3.563 3.712 3.854 3.979 4.119 4.259 4.413 4.572 4.719 4.878 5.032 5.182 5.348 5.54 5.732 5.926 6.136 6.357 6.585 6.85 7.132 7.381 7.683 8.004 8.311 8.585 8.825 9.028 9.083 8.758 8.322 7.92 7.552 7.201 6.868 6.556 6.281 6.019 5.786 5.57 5.375 5.181 4.999 4.835 4.67 4.508 4.358 4.209 4.049 3.903 3.75 3.601 3.489 3.369 3.246 3.122 2.973 2.862 2.756 2.587 2.472 2.35 2.288 2.162 2.047 1.94 1.873 1.686 1.643 1.569 1.481 1.282 1.166 1.036 0.888 0.723 0.566 0.379 -0.206 -5 ,18976 ,TETRA ,17605881,Sun Nov 28 19:49:41 CET,Sun Nov 28 21:56:54 CET,0.0 1.255 1.513 1.674 1.785 1.9 2.022 2.141 2.341 2.427 2.502 2.522 2.696 2.767 2.903 3.031 3.154 3.213 3.332 3.442 3.585 3.666 3.745 3.869 3.982 4.084 4.182 4.275 4.393 4.507 4.627 4.771 4.902 5.021 5.161 5.335 5.501 5.68 5.895 6.129 6.355 6.596 6.865 7.113 7.362 7.614 7.879 8.121 8.316 8.443 8.357 7.996 7.574 7.119 6.689 6.271 5.901 5.606 5.336 5.029 4.767 4.534 4.312 4.121 3.948 3.779 3.597 3.435 3.289 3.134 2.97 2.829 2.675 2.511 2.388 2.271 2.141 2.001 1.853 1.744 1.632 1.452 1.327 1.199 1.134 0.991 0.833 0.687 0.616 0.422 0.362 0.277 0.178 -0.018 -0.108 -0.212 -0.335 -0.471 -0.624 -0.788 -1.353 -6 ,24555 ,TETRA ,17605882,Sun Nov 28 19:49:41 CET,Sun Nov 28 22:00:49 CET,0.0 1.455 1.713 1.897 2.044 2.173 2.292 2.406 2.618 2.724 2.826 2.911 3.101 3.18 3.327 3.469 3.607 3.674 3.799 3.924 4.088 4.189 4.286 4.442 4.591 4.719 4.836 4.944 5.095 5.247 5.393 5.552 5.7 5.845 6.015 6.216 6.399 6.59 6.773 6.958 7.176 7.417 7.676 7.917 8.19 8.463 8.733 9.022 9.272 9.447 9.435 9.163 8.762 8.325 7.879 7.415 7.021 6.679 6.367 6.027 5.719 5.458 5.233 5.008 4.788 4.596 4.394 4.219 4.083 3.922 3.725 3.555 3.379 3.206 3.076 2.926 2.77 2.618 2.452 2.34 2.234 2.059 1.933 1.808 1.748 1.627 1.497 1.361 1.291 1.117 1.096 1.023 0.935 0.727 0.633 0.546 0.438 0.3 0.118 -0.191 -1.081 -7 ,27524 ,TETRA ,17605883,Sun Nov 28 19:49:43 CET,Sun Nov 28 21:56:34 CET,0.0 0.602 0.843 1.034 1.198 1.321 1.434 1.542 1.77 1.885 1.985 2.057 2.255 2.33 2.483 2.619 2.74 2.799 2.912 3.018 3.166 3.254 3.334 3.446 3.551 3.659 3.777 3.889 4.041 4.187 4.307 4.445 4.571 4.687 4.826 5.002 5.175 5.353 5.535 5.735 5.967 6.215 6.473 6.724 6.975 7.21 7.461 7.709 7.932 8.023 7.867 7.443 6.973 6.488 6.026 5.574 5.189 4.864 4.572 4.278 4.024 3.78 3.54 3.302 3.088 2.919 2.741 2.574 2.431 2.282 2.117 1.963 1.795 1.633 1.496 1.344 1.214 1.086 0.954 0.867 0.766 0.603 0.487 0.366 0.307 0.183 0.053 -0.085 -0.156 -0.322 -0.349 -0.422 -0.499 -0.669 -0.758 -0.849 -0.964 -1.122 -1.298 -1.522 -2.121 -8 ,20670 ,TETRA ,17605884,Sun Nov 28 19:49:40 CET,Sun Nov 28 22:00:04 CET,0.0 0.976 1.199 1.354 1.487 1.61 1.753 1.89 2.096 2.193 2.287 2.338 2.507 2.573 2.706 2.826 2.951 3.015 3.144 3.262 3.412 3.504 3.591 3.721 3.854 3.98 4.1 4.219 4.372 4.516 4.652 4.798 4.941 5.097 5.262 5.428 5.587 5.761 5.956 6.17 6.365 6.562 6.795 7.034 7.282 7.507 7.743 7.952 8.132 8.215 8.105 7.752 7.267 6.818 6.431 6.072 5.752 5.452 5.187 4.918 4.67 4.452 4.243 4.044 3.868 3.705 3.536 3.383 3.238 3.086 2.937 2.823 2.705 2.591 2.509 2.415 2.308 2.196 2.085 2.01 1.93 1.802 1.711 1.62 1.571 1.462 1.353 1.242 1.179 0.999 0.95 0.859 0.772 0.587 0.491 0.381 0.25 0.094 -0.124 -0.426 -1.262 -9 ,14716 ,TETRA ,17605885,Sun Nov 28 19:49:43 CET,Sun Nov 28 22:00:28 CET,0.0 0.985 1.244 1.412 1.547 1.683 1.816 1.928 2.108 2.192 2.281 2.343 2.518 2.582 2.704 2.825 2.952 3.015 3.122 3.213 3.353 3.451 3.546 3.685 3.813 3.932 4.05 4.159 4.293 4.436 4.594 4.777 4.942 5.091 5.263 5.47 5.657 5.858 6.08 6.311 6.54 6.768 7.033 7.289 7.572 7.883 8.196 8.502 8.784 9.021 9.043 8.676 8.245 7.8 7.37 6.976 6.582 6.203 5.908 5.624 5.375 5.14 4.91 4.692 4.48 4.276 4.077 3.898 3.734 3.575 3.411 3.266 3.116 2.972 2.874 2.775 2.664 2.545 2.418 2.321 2.219 2.073 1.975 1.871 1.82 1.707 1.57 1.434 1.364 1.188 1.161 1.082 0.994 0.801 0.694 0.57 0.436 0.3 0.137 -0.156 -1.002 -10 ,25881 ,TETRA ,17605886,Sun Nov 28 19:49:45 CET,Sun Nov 28 21:58:18 CET,0.0 1.031 1.276 1.445 1.548 1.646 1.751 1.837 1.981 2.05 2.116 2.153 2.324 2.386 2.493 2.587 2.685 2.743 2.85 2.953 3.108 3.206 3.3 3.445 3.581 3.687 3.785 3.883 4.013 4.153 4.283 4.423 4.548 4.661 4.801 4.954 5.091 5.244 5.393 5.543 5.705 5.89 6.099 6.293 6.513 6.767 7.015 7.218 7.391 7.478 7.402 7.043 6.596 6.153 5.732 5.282 4.836 4.43 4.103 3.788 3.529 3.291 3.043 2.806 2.592 2.415 2.234 2.069 1.923 1.773 1.617 1.475 1.313 1.16 1.049 0.922 0.791 0.665 0.54 0.45 0.34 0.177 0.071 -0.047 -0.109 -0.229 -0.343 -0.452 -0.504 -0.671 -0.691 -0.767 -0.857 -1.053 -1.155 -1.273 -1.405 -1.522 -1.682 -1.923 -2.425 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_19_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_19_17.txt deleted file mode 100644 index 85ef6cfa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_19_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21856 ,TETRA ,17605887,Sun Nov 28 19:49:44 CET,Sun Nov 28 21:57:56 CET,0.0 1.783 2.186 2.489 2.751 2.96 3.15 3.321 3.584 3.694 3.804 3.913 4.131 4.231 4.432 4.632 4.822 4.908 5.072 5.218 5.412 5.546 5.689 5.882 6.055 6.234 6.419 6.594 6.827 7.042 7.233 7.471 7.703 7.918 8.173 8.475 8.773 9.077 9.384 9.734 10.108 10.524 11.007 11.492 12.063 12.675 13.349 14.083 14.954 15.983 17.096 17.777 17.959 17.897 17.716 17.514 17.341 17.153 16.99 16.823 16.626 16.42 16.212 16.001 15.788 15.595 15.402 15.241 15.086 14.914 14.738 14.572 14.383 14.178 14.023 13.879 13.719 13.542 13.367 13.25 13.124 12.924 12.778 12.612 12.528 12.348 12.135 11.903 11.784 11.56 11.464 11.346 11.217 10.907 10.731 10.553 10.351 10.113 9.816 9.371 7.4 -2 ,27180 ,TETRA ,17605888,Sun Nov 28 19:49:41 CET,Sun Nov 28 21:45:39 CET,0.0 1.744 2.092 2.325 2.561 2.793 2.981 3.143 3.46 3.615 3.752 3.844 4.069 4.178 4.384 4.575 4.754 4.84 4.999 5.155 5.396 5.567 5.743 5.972 6.181 6.377 6.559 6.73 6.951 7.161 7.376 7.644 7.886 8.116 8.386 8.693 8.99 9.305 9.637 10.015 10.458 10.94 11.469 11.986 12.576 13.271 14.051 14.899 15.827 16.801 17.899 18.701 19.134 19.305 19.286 19.187 19.013 18.827 18.664 18.485 18.342 18.189 18.007 17.815 17.62 17.46 17.299 17.142 17.008 16.852 16.693 16.58 16.425 16.242 16.097 15.921 15.714 15.494 15.303 15.188 15.053 14.81 14.66 14.533 14.454 14.262 14.079 13.902 13.805 13.596 13.498 13.359 13.219 12.969 12.818 12.632 12.433 12.212 11.966 11.641 9.778 -3 ,11211 ,TETRA ,17605889,Sun Nov 28 19:49:41 CET,Sun Nov 28 21:58:12 CET,0.0 1.651 1.996 2.258 2.519 2.74 2.908 3.066 3.374 3.513 3.643 3.752 3.982 4.088 4.294 4.518 4.732 4.819 4.963 5.095 5.291 5.424 5.561 5.757 5.949 6.145 6.324 6.485 6.691 6.896 7.101 7.343 7.567 7.782 8.043 8.338 8.617 8.921 9.232 9.569 9.944 10.367 10.865 11.352 11.884 12.494 13.212 13.978 14.869 15.95 17.146 17.973 18.325 18.406 18.34 18.165 17.965 17.768 17.582 17.374 17.167 16.96 16.763 16.578 16.385 16.194 15.966 15.733 15.557 15.404 15.242 15.094 14.903 14.697 14.546 14.367 14.17 13.999 13.85 13.724 13.568 13.329 13.178 13.012 12.917 12.728 12.537 12.348 12.226 11.977 11.786 11.624 11.442 11.001 10.78 10.585 10.383 10.145 9.812 9.287 7.441 -4 ,14301 ,TETRA ,17605890,Sun Nov 28 19:49:43 CET,Sun Nov 28 21:58:16 CET,0.0 1.707 2.168 2.501 2.779 2.998 3.188 3.357 3.62 3.736 3.85 3.953 4.186 4.295 4.493 4.684 4.86 4.942 5.106 5.267 5.501 5.654 5.799 6.007 6.21 6.392 6.563 6.734 6.964 7.177 7.395 7.66 7.914 8.173 8.469 8.799 9.108 9.434 9.784 10.149 10.521 10.956 11.5 12.047 12.674 13.371 14.137 14.949 15.858 16.892 17.975 18.726 19.093 19.175 19.172 19.137 19.038 18.89 18.74 18.605 18.45 18.269 18.109 17.969 17.829 17.684 17.497 17.331 17.205 17.06 16.884 16.743 16.595 16.424 16.288 16.164 16.025 15.86 15.669 15.52 15.361 15.098 14.921 14.736 14.646 14.485 14.268 14.047 13.933 13.679 13.503 13.363 13.205 12.783 12.564 12.372 12.183 11.986 11.661 10.991 6.602 -5 ,5491 ,TETRA ,17605891,Sun Nov 28 19:49:45 CET,Sun Nov 28 22:01:35 CET,0.0 1.372 1.773 2.079 2.285 2.446 2.61 2.777 3.095 3.229 3.348 3.464 3.693 3.791 3.984 4.178 4.363 4.449 4.618 4.779 5.011 5.17 5.321 5.535 5.734 5.917 6.097 6.266 6.487 6.704 6.914 7.17 7.411 7.646 7.922 8.238 8.535 8.849 9.202 9.594 9.991 10.404 10.89 11.382 11.932 12.535 13.233 14.004 14.846 15.818 16.873 17.544 17.763 17.747 17.654 17.461 17.291 17.179 17.046 16.87 16.703 16.55 16.404 16.237 16.082 15.941 15.755 15.589 15.442 15.301 15.18 15.058 14.923 14.771 14.643 14.537 14.424 14.274 14.093 13.962 13.836 13.639 13.494 13.335 13.258 13.107 12.946 12.78 12.698 12.517 12.462 12.367 12.252 11.978 11.84 11.685 11.477 11.205 10.858 10.316 8.645 -6 ,13275 ,TETRA ,17605892,Sun Nov 28 19:49:48 CET,Sun Nov 28 22:00:48 CET,0.0 1.91 2.45 2.787 3.029 3.244 3.47 3.669 3.972 4.117 4.251 4.348 4.583 4.704 4.942 5.154 5.348 5.446 5.631 5.804 6.03 6.163 6.294 6.468 6.633 6.812 6.982 7.141 7.353 7.563 7.77 8.013 8.231 8.437 8.698 8.998 9.292 9.618 9.96 10.302 10.675 11.125 11.627 12.125 12.742 13.427 14.151 14.899 15.738 16.758 17.962 18.68 18.924 18.95 18.83 18.607 18.418 18.282 18.144 17.92 17.651 17.41 17.192 16.978 16.754 16.544 16.326 16.106 15.92 15.73 15.508 15.325 15.132 14.924 14.763 14.608 14.447 14.262 14.07 13.939 13.817 13.629 13.473 13.297 13.207 13.041 12.851 12.637 12.525 12.299 12.194 12.078 11.961 11.688 11.525 11.364 11.177 10.94 10.669 10.262 9.168 -7 ,16981 ,TETRA ,17605893,Sun Nov 28 19:49:42 CET,Sun Nov 28 21:42:55 CET,0.0 1.842 2.191 2.495 2.763 2.972 3.171 3.373 3.742 3.898 4.03 4.144 4.372 4.484 4.68 4.855 5.027 5.114 5.279 5.431 5.655 5.799 5.944 6.163 6.354 6.524 6.701 6.878 7.097 7.316 7.524 7.786 8.043 8.27 8.537 8.84 9.138 9.468 9.826 10.208 10.602 11.05 11.561 12.062 12.624 13.251 13.965 14.723 15.568 16.525 17.607 18.209 18.415 18.522 18.46 18.257 18.059 17.904 17.729 17.508 17.31 17.093 16.853 16.622 16.405 16.237 16.074 15.897 15.725 15.552 15.345 15.173 15.007 14.829 14.688 14.524 14.363 14.204 14.026 13.898 13.766 13.576 13.453 13.338 13.282 13.157 13.03 12.867 12.761 12.533 12.382 12.236 12.085 11.701 11.479 11.256 10.998 10.722 10.397 9.922 8.323 -8 ,1441 ,TETRA ,17605894,Sun Nov 28 19:49:42 CET,Sun Nov 28 21:59:05 CET,0.0 1.131 1.504 1.794 2.052 2.274 2.448 2.592 2.845 2.953 3.054 3.132 3.344 3.443 3.617 3.788 3.952 4.019 4.145 4.264 4.436 4.555 4.679 4.86 5.028 5.206 5.373 5.515 5.704 5.894 6.067 6.276 6.493 6.7 6.929 7.179 7.433 7.725 8.049 8.401 8.782 9.201 9.677 10.166 10.744 11.401 12.125 12.9 13.803 14.769 15.809 16.535 16.826 16.937 16.943 16.849 16.691 16.47 16.237 15.995 15.779 15.571 15.347 15.146 14.965 14.768 14.553 14.367 14.196 14.019 13.843 13.693 13.532 13.354 13.206 13.051 12.884 12.714 12.542 12.403 12.253 12.029 11.867 11.693 11.599 11.403 11.202 11.003 10.914 10.71 10.619 10.52 10.383 10.041 9.886 9.706 9.469 9.204 8.907 8.458 5.232 -9 ,15793 ,TETRA ,17605895,Sun Nov 28 19:49:43 CET,Sun Nov 28 21:58:46 CET,0.0 1.266 1.686 1.968 2.212 2.426 2.63 2.819 3.139 3.281 3.41 3.544 3.775 3.865 4.047 4.25 4.453 4.546 4.716 4.88 5.108 5.252 5.392 5.602 5.803 5.986 6.145 6.289 6.489 6.682 6.869 7.128 7.38 7.604 7.86 8.147 8.435 8.767 9.118 9.486 9.865 10.279 10.758 11.222 11.763 12.422 13.198 14.012 14.92 15.811 16.686 17.262 17.398 17.406 17.374 17.266 17.03 16.776 16.579 16.386 16.213 16.036 15.844 15.656 15.449 15.225 15.012 14.814 14.638 14.466 14.271 14.114 13.967 13.799 13.67 13.543 13.406 13.268 13.096 12.961 12.837 12.634 12.484 12.317 12.231 12.059 11.867 11.661 11.558 11.325 11.196 11.079 10.948 10.616 10.428 10.221 10.016 9.804 9.502 9.089 7.885 -10 ,25204 ,TETRA ,17605896,Sun Nov 28 19:49:44 CET,Sun Nov 28 21:58:57 CET,0.0 1.551 2.004 2.312 2.577 2.788 2.946 3.094 3.385 3.526 3.664 3.793 4.024 4.141 4.348 4.533 4.71 4.801 4.975 5.137 5.372 5.52 5.666 5.885 6.091 6.282 6.466 6.63 6.846 7.073 7.287 7.544 7.807 8.063 8.331 8.613 8.893 9.205 9.555 9.936 10.305 10.74 11.275 11.799 12.423 13.068 13.792 14.634 15.574 16.667 17.907 18.8 19.147 19.166 19.11 18.992 18.825 18.68 18.535 18.349 18.173 18.014 17.841 17.639 17.432 17.227 17.012 16.833 16.694 16.564 16.421 16.286 16.141 16.004 15.889 15.78 15.669 15.518 15.353 15.242 15.132 14.956 14.813 14.661 14.572 14.369 14.173 13.953 13.842 13.623 13.487 13.344 13.2 12.884 12.707 12.541 12.381 12.168 11.843 11.374 9.521 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_19_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_19_24.txt deleted file mode 100644 index aebeecfc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_19_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2648 ,TETRA ,17605897,Sun Nov 28 19:49:47 CET,Sun Nov 28 21:59:42 CET,0.0 0.929 1.205 1.442 1.672 1.857 2.004 2.138 2.363 2.467 2.565 2.622 2.827 2.908 3.061 3.202 3.331 3.389 3.495 3.601 3.762 3.858 3.946 4.068 4.181 4.295 4.4 4.488 4.608 4.732 4.843 4.958 5.054 5.128 5.201 5.299 5.38 5.444 5.494 5.532 5.577 5.615 5.62 5.602 5.531 5.399 5.174 4.81 4.218 3.128 1.279 -0.922 -2.624 -3.958 -5.148 -6.211 -7.103 -7.875 -8.515 -9.15 -9.706 -10.188 -10.633 -11.042 -11.422 -11.769 -12.117 -12.427 -12.697 -12.974 -13.253 -13.477 -13.706 -13.952 -14.151 -14.354 -14.565 -14.786 -15.015 -15.167 -15.316 -15.554 -15.722 -15.882 -15.963 -16.134 -16.306 -16.478 -16.567 -16.816 -16.9 -17.006 -17.113 -17.34 -17.474 -17.635 -17.835 -18.063 -18.272 -18.548 -19.806 -2 ,8273 ,TETRA ,17605898,Sun Nov 28 19:49:43 CET,Sun Nov 28 22:01:12 CET,0.0 1.147 1.512 1.732 1.907 2.063 2.211 2.362 2.615 2.724 2.825 2.878 3.078 3.159 3.303 3.426 3.538 3.594 3.71 3.82 3.968 4.06 4.146 4.275 4.396 4.514 4.625 4.722 4.845 4.951 5.055 5.172 5.274 5.37 5.456 5.522 5.589 5.663 5.714 5.75 5.762 5.766 5.787 5.779 5.716 5.557 5.287 4.95 4.398 3.467 1.856 -0.157 -1.833 -3.247 -4.443 -5.49 -6.349 -7.071 -7.712 -8.37 -8.9 -9.346 -9.784 -10.214 -10.611 -10.959 -11.306 -11.6 -11.851 -12.125 -12.408 -12.638 -12.898 -13.175 -13.38 -13.588 -13.802 -14.025 -14.261 -14.42 -14.589 -14.866 -15.04 -15.214 -15.314 -15.531 -15.736 -15.942 -16.051 -16.307 -16.401 -16.533 -16.667 -16.95 -17.106 -17.287 -17.486 -17.737 -18.079 -18.515 -19.889 -3 ,19186 ,TETRA ,17605899,Sun Nov 28 19:49:48 CET,Sun Nov 28 22:01:05 CET,0.0 1.492 1.823 2.06 2.237 2.382 2.523 2.654 2.888 2.994 3.092 3.15 3.353 3.436 3.586 3.718 3.845 3.907 4.018 4.126 4.279 4.375 4.476 4.624 4.752 4.863 4.948 5.026 5.144 5.264 5.371 5.483 5.583 5.672 5.783 5.892 5.966 6.044 6.118 6.161 6.197 6.229 6.207 6.138 5.996 5.744 5.397 4.999 4.407 3.368 1.563 -0.646 -2.448 -3.937 -5.158 -6.188 -7.057 -7.838 -8.521 -9.182 -9.738 -10.232 -10.68 -11.085 -11.466 -11.818 -12.175 -12.498 -12.772 -13.045 -13.336 -13.574 -13.825 -14.085 -14.279 -14.485 -14.696 -14.912 -15.129 -15.279 -15.439 -15.703 -15.888 -16.071 -16.157 -16.334 -16.529 -16.734 -16.838 -17.082 -17.171 -17.294 -17.406 -17.642 -17.763 -17.906 -18.091 -18.297 -18.545 -18.868 -20.772 -4 ,27730 ,TETRA ,17605900,Sun Nov 28 19:49:43 CET,Sun Nov 28 22:00:01 CET,0.0 1.097 1.367 1.585 1.782 1.963 2.1 2.221 2.441 2.535 2.639 2.702 2.896 2.984 3.149 3.268 3.385 3.448 3.561 3.664 3.812 3.902 3.999 4.141 4.271 4.39 4.479 4.57 4.701 4.814 4.909 5.011 5.097 5.179 5.28 5.381 5.46 5.523 5.588 5.653 5.692 5.699 5.699 5.689 5.633 5.516 5.273 4.901 4.317 3.268 1.456 -0.625 -2.351 -3.801 -5.011 -6.032 -6.883 -7.661 -8.336 -8.997 -9.57 -10.066 -10.52 -10.939 -11.314 -11.651 -12.02 -12.356 -12.633 -12.915 -13.215 -13.457 -13.705 -13.962 -14.165 -14.371 -14.569 -14.768 -14.987 -15.136 -15.277 -15.497 -15.652 -15.818 -15.907 -16.096 -16.299 -16.501 -16.596 -16.848 -16.951 -17.077 -17.208 -17.482 -17.641 -17.834 -18.036 -18.25 -18.496 -18.817 -20.962 -5 ,19266 ,TETRA ,17605901,Sun Nov 28 19:49:46 CET,Sun Nov 28 22:00:50 CET,0.0 1.421 1.856 2.1 2.255 2.399 2.528 2.642 2.862 2.971 3.077 3.129 3.328 3.401 3.532 3.664 3.795 3.851 3.944 4.043 4.196 4.283 4.368 4.481 4.581 4.685 4.782 4.87 4.985 5.086 5.171 5.275 5.365 5.44 5.525 5.601 5.656 5.714 5.774 5.823 5.854 5.859 5.832 5.788 5.706 5.574 5.316 4.906 4.312 3.348 1.583 -0.53 -2.226 -3.692 -4.968 -6.034 -6.94 -7.756 -8.423 -9.068 -9.619 -10.113 -10.574 -10.99 -11.38 -11.739 -12.1 -12.435 -12.722 -12.997 -13.276 -13.507 -13.741 -13.974 -14.153 -14.336 -14.541 -14.758 -14.978 -15.132 -15.288 -15.534 -15.723 -15.929 -16.02 -16.199 -16.389 -16.576 -16.672 -16.922 -17.015 -17.147 -17.282 -17.581 -17.769 -17.963 -18.182 -18.44 -18.712 -19.077 -20.384 -6 ,31815 ,TETRA ,17605902,Sun Nov 28 19:50:11 CET,Sun Nov 28 22:00:45 CET,0.0 1.026 1.312 1.544 1.744 1.912 2.066 2.198 2.425 2.524 2.615 2.669 2.875 2.959 3.111 3.243 3.367 3.43 3.552 3.67 3.838 3.942 4.046 4.186 4.306 4.408 4.497 4.595 4.727 4.85 4.96 5.083 5.198 5.306 5.421 5.54 5.643 5.743 5.851 5.944 6.022 6.086 6.128 6.154 6.141 6.021 5.826 5.496 4.922 3.993 2.286 0.161 -1.547 -2.942 -4.125 -5.169 -6.053 -6.85 -7.512 -8.133 -8.67 -9.141 -9.587 -10.018 -10.41 -10.751 -11.093 -11.401 -11.672 -11.962 -12.255 -12.495 -12.753 -13.015 -13.218 -13.407 -13.602 -13.831 -14.065 -14.218 -14.37 -14.618 -14.787 -14.955 -15.047 -15.235 -15.428 -15.658 -15.775 -16.03 -16.13 -16.269 -16.4 -16.664 -16.808 -16.97 -17.157 -17.351 -17.599 -17.932 -19.567 -7 ,9345 ,TETRA ,17605903,Sun Nov 28 19:50:14 CET,Sun Nov 28 22:02:06 CET,0.0 0.79 1.15 1.443 1.691 1.907 2.077 2.237 2.543 2.676 2.788 2.866 3.091 3.189 3.355 3.509 3.669 3.745 3.872 3.984 4.138 4.24 4.338 4.48 4.615 4.726 4.83 4.933 5.054 5.176 5.296 5.416 5.523 5.619 5.715 5.836 5.94 6.037 6.135 6.204 6.248 6.277 6.274 6.246 6.164 6.012 5.772 5.404 4.855 3.878 2.094 -0.048 -1.81 -3.257 -4.463 -5.494 -6.366 -7.159 -7.838 -8.499 -9.035 -9.513 -9.978 -10.398 -10.791 -11.15 -11.515 -11.834 -12.115 -12.414 -12.73 -13.003 -13.282 -13.553 -13.749 -13.94 -14.138 -14.349 -14.577 -14.733 -14.891 -15.14 -15.306 -15.485 -15.58 -15.776 -15.99 -16.2 -16.307 -16.562 -16.651 -16.79 -16.921 -17.188 -17.344 -17.495 -17.668 -17.893 -18.169 -18.558 -20.366 -8 ,18456 ,TETRA ,17605904,Sun Nov 28 19:50:10 CET,Sun Nov 28 22:01:16 CET,0.0 1.195 1.534 1.785 2.021 2.183 2.313 2.431 2.652 2.753 2.845 2.911 3.12 3.2 3.325 3.435 3.542 3.595 3.694 3.795 3.924 4.003 4.08 4.178 4.275 4.376 4.475 4.561 4.665 4.767 4.874 4.998 5.093 5.189 5.301 5.394 5.462 5.529 5.582 5.621 5.673 5.706 5.689 5.634 5.572 5.448 5.167 4.722 4.039 2.956 1.151 -0.973 -2.71 -4.19 -5.426 -6.477 -7.397 -8.194 -8.844 -9.503 -10.081 -10.59 -11.058 -11.488 -11.897 -12.259 -12.6 -12.915 -13.207 -13.511 -13.806 -14.034 -14.273 -14.533 -14.733 -14.933 -15.131 -15.336 -15.552 -15.694 -15.841 -16.084 -16.255 -16.427 -16.52 -16.72 -16.927 -17.143 -17.253 -17.514 -17.622 -17.767 -17.91 -18.203 -18.369 -18.58 -18.805 -19.03 -19.36 -19.802 -21.227 -9 ,30784 ,TETRA ,17605905,Sun Nov 28 19:50:10 CET,Sun Nov 28 22:01:51 CET,0.0 1.113 1.523 1.833 2.08 2.289 2.461 2.611 2.851 2.962 3.072 3.139 3.348 3.427 3.569 3.7 3.828 3.892 4.009 4.115 4.248 4.327 4.41 4.533 4.649 4.751 4.854 4.947 5.057 5.167 5.256 5.345 5.436 5.521 5.601 5.677 5.748 5.824 5.903 5.973 6.029 6.067 6.069 6.048 5.941 5.772 5.558 5.175 4.538 3.557 1.812 -0.377 -2.134 -3.599 -4.821 -5.864 -6.77 -7.581 -8.242 -8.869 -9.412 -9.894 -10.334 -10.736 -11.111 -11.467 -11.843 -12.171 -12.438 -12.697 -12.973 -13.209 -13.447 -13.686 -13.876 -14.065 -14.266 -14.48 -14.689 -14.839 -15.001 -15.257 -15.434 -15.607 -15.69 -15.863 -16.047 -16.244 -16.343 -16.589 -16.669 -16.793 -16.929 -17.215 -17.373 -17.544 -17.762 -18.059 -18.359 -18.766 -20.182 -10 ,21348 ,TETRA ,17605906,Sun Nov 28 19:50:10 CET,Sun Nov 28 21:56:49 CET,0.0 1.229 1.528 1.758 1.97 2.144 2.301 2.44 2.67 2.784 2.89 2.992 3.216 3.302 3.443 3.561 3.679 3.74 3.866 3.997 4.165 4.269 4.372 4.496 4.612 4.735 4.841 4.931 5.042 5.136 5.224 5.326 5.433 5.529 5.643 5.772 5.872 5.96 6.031 6.106 6.189 6.259 6.285 6.308 6.313 6.251 6.101 5.767 5.215 4.292 2.568 0.451 -1.317 -2.767 -3.935 -4.929 -5.78 -6.532 -7.17 -7.821 -8.383 -8.88 -9.346 -9.76 -10.148 -10.51 -10.89 -11.224 -11.504 -11.783 -12.06 -12.287 -12.542 -12.818 -13.02 -13.231 -13.447 -13.667 -13.898 -14.048 -14.204 -14.441 -14.616 -14.804 -14.894 -15.083 -15.288 -15.515 -15.631 -15.893 -15.993 -16.123 -16.245 -16.509 -16.659 -16.829 -17.056 -17.318 -17.601 -17.977 -19.589 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_19_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_19_32.txt deleted file mode 100644 index 7faaf9a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_19_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30360 ,TETRA ,17605907,Sun Nov 28 19:50:10 CET,Sun Nov 28 22:00:14 CET,0.0 0.583 0.706 0.811 0.894 0.965 1.02 1.077 1.186 1.228 1.26 1.208 1.381 1.425 1.501 1.567 1.626 1.657 1.722 1.788 1.872 1.917 1.95 2.001 2.062 2.108 2.138 2.166 2.208 2.241 2.254 2.286 2.331 2.365 2.382 2.393 2.413 2.443 2.47 2.48 2.47 2.437 2.367 2.239 2.058 1.827 1.505 1.03 0.323 -0.762 -2.554 -4.656 -6.327 -7.671 -8.755 -9.646 -10.42 -11.117 -11.682 -12.234 -12.702 -13.116 -13.515 -13.894 -14.257 -14.579 -14.899 -15.185 -15.423 -15.659 -15.908 -16.112 -16.316 -16.535 -16.703 -16.878 -17.059 -17.254 -17.449 -17.572 -17.702 -17.918 -18.08 -18.245 -18.324 -18.494 -18.672 -18.857 -18.957 -19.196 -19.249 -19.363 -19.506 -19.824 -19.977 -20.131 -20.321 -20.523 -20.746 -21.048 -22.066 -2 ,23673 ,TETRA ,17605908,Sun Nov 28 19:50:11 CET,Sun Nov 28 21:59:39 CET,0.0 0.157 0.211 0.29 0.364 0.414 0.467 0.517 0.594 0.64 0.683 0.637 0.795 0.83 0.884 0.927 0.973 1.004 1.057 1.102 1.178 1.217 1.245 1.279 1.318 1.351 1.384 1.416 1.452 1.486 1.512 1.539 1.551 1.553 1.562 1.572 1.575 1.566 1.533 1.498 1.458 1.381 1.263 1.137 0.964 0.734 0.408 -0.075 -0.806 -1.882 -3.573 -5.536 -7.114 -8.383 -9.473 -10.427 -11.23 -11.945 -12.523 -13.078 -13.534 -13.942 -14.349 -14.721 -15.072 -15.397 -15.725 -16.013 -16.276 -16.556 -16.827 -17.046 -17.278 -17.528 -17.717 -17.908 -18.115 -18.33 -18.532 -18.655 -18.79 -19.005 -19.158 -19.334 -19.421 -19.596 -19.775 -19.963 -20.074 -20.331 -20.415 -20.535 -20.646 -20.879 -21.028 -21.178 -21.341 -21.525 -21.707 -22.002 -22.841 -3 ,6026 ,TETRA ,17605909,Sun Nov 28 19:50:13 CET,Sun Nov 28 21:59:39 CET,0.0 0.176 0.295 0.383 0.453 0.533 0.621 0.699 0.777 0.812 0.853 0.814 0.983 1.026 1.111 1.2 1.294 1.329 1.377 1.425 1.496 1.541 1.583 1.641 1.69 1.731 1.76 1.781 1.813 1.854 1.898 1.933 1.953 1.973 1.993 2.011 2.024 2.024 2.012 1.992 1.954 1.889 1.807 1.699 1.531 1.285 0.897 0.361 -0.417 -1.566 -3.397 -5.526 -7.208 -8.567 -9.679 -10.624 -11.445 -12.186 -12.797 -13.384 -13.909 -14.393 -14.838 -15.236 -15.599 -15.935 -16.281 -16.576 -16.815 -17.066 -17.345 -17.568 -17.79 -18.025 -18.209 -18.405 -18.601 -18.793 -18.975 -19.105 -19.246 -19.481 -19.649 -19.816 -19.897 -20.064 -20.241 -20.423 -20.52 -20.755 -20.798 -20.898 -21.008 -21.285 -21.433 -21.558 -21.689 -21.853 -22.099 -22.423 -23.251 -4 ,16376 ,TETRA ,17605910,Sun Nov 28 19:50:15 CET,Sun Nov 28 21:58:49 CET,0.0 0.281 0.371 0.463 0.528 0.593 0.667 0.729 0.82 0.862 0.91 0.876 1.04 1.078 1.14 1.197 1.249 1.274 1.319 1.355 1.405 1.438 1.466 1.511 1.564 1.61 1.647 1.681 1.715 1.736 1.766 1.794 1.806 1.818 1.838 1.847 1.834 1.819 1.813 1.794 1.753 1.711 1.624 1.476 1.271 1.026 0.681 0.208 -0.501 -1.574 -3.328 -5.414 -7.078 -8.454 -9.578 -10.521 -11.326 -12.05 -12.66 -13.261 -13.775 -14.225 -14.648 -15.04 -15.391 -15.708 -16.048 -16.343 -16.602 -16.875 -17.15 -17.383 -17.631 -17.878 -18.065 -18.265 -18.468 -18.668 -18.884 -19.036 -19.188 -19.417 -19.575 -19.727 -19.802 -19.962 -20.132 -20.332 -20.441 -20.691 -20.764 -20.873 -20.984 -21.242 -21.389 -21.538 -21.697 -21.852 -22.061 -22.393 -23.228 -5 ,18352 ,TETRA ,17605912,Sun Nov 28 19:50:10 CET,Sun Nov 28 21:59:39 CET,0.0 0.29 0.391 0.465 0.539 0.602 0.649 0.703 0.807 0.858 0.904 0.85 1.002 1.027 1.08 1.12 1.155 1.174 1.216 1.26 1.315 1.349 1.382 1.427 1.468 1.502 1.526 1.551 1.589 1.62 1.656 1.699 1.718 1.726 1.734 1.748 1.749 1.737 1.725 1.684 1.631 1.566 1.451 1.305 1.126 0.892 0.53 0.019 -0.727 -1.908 -3.859 -6.076 -7.778 -9.11 -10.202 -11.144 -11.944 -12.629 -13.22 -13.814 -14.295 -14.728 -15.166 -15.591 -15.967 -16.288 -16.626 -16.914 -17.157 -17.416 -17.688 -17.901 -18.12 -18.355 -18.534 -18.718 -18.901 -19.086 -19.288 -19.428 -19.564 -19.794 -19.952 -20.11 -20.188 -20.358 -20.535 -20.718 -20.817 -21.073 -21.165 -21.282 -21.398 -21.682 -21.84 -21.996 -22.139 -22.301 -22.537 -22.923 -24.197 -6 ,16521 ,TETRA ,17605913,Sun Nov 28 19:50:11 CET,Sun Nov 28 21:59:48 CET,0.0 0.382 0.536 0.647 0.729 0.815 0.882 0.939 1.072 1.127 1.169 1.123 1.291 1.328 1.391 1.455 1.503 1.526 1.58 1.632 1.683 1.706 1.735 1.779 1.816 1.851 1.887 1.929 1.982 2.028 2.059 2.098 2.134 2.148 2.162 2.173 2.186 2.201 2.205 2.185 2.14 2.085 1.988 1.859 1.667 1.409 1.062 0.6 -0.075 -1.138 -2.924 -5.004 -6.689 -8.119 -9.31 -10.317 -11.165 -11.91 -12.52 -13.122 -13.643 -14.072 -14.465 -14.858 -15.23 -15.554 -15.905 -16.234 -16.516 -16.809 -17.124 -17.371 -17.601 -17.837 -18.03 -18.217 -18.398 -18.588 -18.796 -18.946 -19.093 -19.317 -19.471 -19.64 -19.726 -19.9 -20.085 -20.274 -20.376 -20.624 -20.704 -20.827 -20.944 -21.182 -21.332 -21.493 -21.655 -21.864 -22.111 -22.389 -23.189 -7 ,22530 ,TETRA ,17605914,Sun Nov 28 19:50:14 CET,Sun Nov 28 22:00:50 CET,0.0 0.177 0.315 0.422 0.512 0.593 0.666 0.748 0.889 0.944 0.988 0.954 1.119 1.153 1.213 1.263 1.313 1.339 1.396 1.454 1.528 1.569 1.608 1.665 1.712 1.767 1.817 1.85 1.876 1.898 1.93 1.965 1.992 2.014 2.027 2.049 2.068 2.067 2.065 2.04 1.972 1.87 1.756 1.64 1.456 1.206 0.866 0.395 -0.292 -1.365 -3.153 -5.251 -6.907 -8.213 -9.316 -10.301 -11.123 -11.832 -12.449 -13.064 -13.593 -14.079 -14.514 -14.899 -15.248 -15.567 -15.896 -16.184 -16.462 -16.788 -17.124 -17.378 -17.63 -17.884 -18.067 -18.246 -18.43 -18.614 -18.81 -18.942 -19.069 -19.282 -19.449 -19.627 -19.716 -19.899 -20.09 -20.286 -20.382 -20.621 -20.73 -20.867 -21.0 -21.278 -21.433 -21.617 -21.793 -21.992 -22.236 -22.573 -23.553 -8 ,7253 ,TETRA ,17605915,Sun Nov 28 19:50:15 CET,Sun Nov 28 22:00:13 CET,0.0 0.247 0.381 0.517 0.607 0.681 0.75 0.808 0.925 0.973 1.019 1.001 1.156 1.191 1.26 1.325 1.378 1.4 1.451 1.509 1.593 1.637 1.667 1.71 1.756 1.793 1.823 1.845 1.876 1.92 1.96 1.989 2.004 2.024 2.054 2.074 2.072 2.062 2.038 2.009 1.983 1.94 1.846 1.723 1.542 1.285 0.939 0.457 -0.247 -1.285 -3.001 -5.042 -6.667 -8.017 -9.103 -10.034 -10.843 -11.516 -12.069 -12.653 -13.168 -13.609 -14.031 -14.413 -14.75 -15.061 -15.387 -15.679 -15.933 -16.196 -16.468 -16.686 -16.908 -17.145 -17.343 -17.542 -17.751 -17.966 -18.18 -18.327 -18.466 -18.674 -18.818 -18.983 -19.073 -19.258 -19.433 -19.609 -19.705 -19.947 -20.034 -20.154 -20.277 -20.557 -20.723 -20.897 -21.068 -21.272 -21.511 -21.817 -22.66 -9 ,27732 ,TETRA ,17605916,Sun Nov 28 19:50:10 CET,Sun Nov 28 21:58:06 CET,0.0 0.114 0.212 0.298 0.35 0.399 0.45 0.504 0.596 0.638 0.684 0.636 0.788 0.818 0.878 0.947 0.999 1.021 1.069 1.107 1.157 1.184 1.218 1.275 1.323 1.369 1.406 1.443 1.482 1.51 1.535 1.561 1.588 1.603 1.614 1.626 1.617 1.622 1.633 1.604 1.547 1.472 1.366 1.232 1.054 0.835 0.511 0.019 -0.702 -1.757 -3.47 -5.487 -7.092 -8.401 -9.491 -10.448 -11.274 -12.009 -12.631 -13.225 -13.729 -14.167 -14.575 -14.957 -15.302 -15.619 -15.964 -16.274 -16.539 -16.809 -17.083 -17.304 -17.527 -17.763 -17.945 -18.134 -18.323 -18.505 -18.702 -18.84 -18.97 -19.167 -19.314 -19.467 -19.541 -19.696 -19.862 -20.056 -20.162 -20.4 -20.437 -20.547 -20.662 -20.902 -21.067 -21.232 -21.378 -21.581 -21.83 -22.075 -22.749 -10 ,2730 ,TETRA ,17605917,Sun Nov 28 19:50:10 CET,Sun Nov 28 21:58:48 CET,0.0 0.178 0.297 0.395 0.485 0.57 0.631 0.684 0.772 0.809 0.845 0.79 0.95 0.986 1.051 1.105 1.148 1.168 1.206 1.239 1.298 1.341 1.376 1.427 1.484 1.535 1.581 1.62 1.669 1.723 1.762 1.801 1.836 1.85 1.866 1.882 1.891 1.892 1.872 1.846 1.82 1.76 1.655 1.516 1.334 1.12 0.815 0.354 -0.355 -1.427 -3.176 -5.203 -6.854 -8.177 -9.245 -10.166 -10.953 -11.648 -12.248 -12.84 -13.326 -13.756 -14.176 -14.575 -14.946 -15.296 -15.642 -15.941 -16.205 -16.468 -16.74 -16.959 -17.17 -17.383 -17.55 -17.734 -17.923 -18.108 -18.306 -18.443 -18.576 -18.799 -18.953 -19.103 -19.172 -19.321 -19.494 -19.672 -19.765 -20.015 -20.121 -20.259 -20.407 -20.729 -20.917 -21.139 -21.399 -21.676 -21.991 -22.49 -24.213 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_20_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_20_19.txt deleted file mode 100644 index b7606936..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_20_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8401 ,TETRA ,17605918,Sun Nov 28 19:50:11 CET,Sun Nov 28 22:00:11 CET,0.0 0.321 0.436 0.574 0.712 0.829 0.943 1.06 1.302 1.409 1.507 1.565 1.818 1.913 2.095 2.271 2.437 2.519 2.674 2.818 3.035 3.176 3.315 3.516 3.708 3.904 4.102 4.292 4.528 4.76 4.997 5.292 5.586 5.867 6.182 6.539 6.911 7.333 7.802 8.303 8.82 9.419 10.131 10.848 11.674 12.636 13.808 15.146 16.731 18.665 20.983 22.915 24.055 24.715 25.115 25.356 25.498 25.557 25.543 25.487 25.391 25.279 25.177 25.089 24.973 24.843 24.703 24.569 24.454 24.342 24.193 24.034 23.873 23.69 23.537 23.399 23.256 23.106 22.964 22.856 22.734 22.544 22.391 22.206 22.104 21.907 21.723 21.516 21.402 21.158 21.02 20.875 20.71 20.329 20.116 19.884 19.635 19.326 18.944 18.445 16.15 -2 ,7862 ,TETRA ,17605919,Sun Nov 28 19:50:14 CET,Sun Nov 28 22:00:32 CET,0.0 0.646 0.842 1.029 1.181 1.297 1.405 1.514 1.708 1.798 1.903 1.952 2.19 2.283 2.468 2.635 2.787 2.861 3.016 3.172 3.398 3.55 3.696 3.895 4.088 4.283 4.484 4.679 4.919 5.16 5.391 5.672 5.949 6.218 6.536 6.891 7.235 7.644 8.09 8.562 9.095 9.702 10.395 11.093 11.936 12.936 14.135 15.516 17.173 19.165 21.699 23.847 25.074 25.793 26.156 26.293 26.331 26.352 26.343 26.292 26.227 26.154 26.067 25.951 25.816 25.667 25.516 25.379 25.249 25.096 24.919 24.79 24.674 24.535 24.41 24.275 24.149 24.003 23.858 23.778 23.66 23.424 23.262 23.113 23.026 22.846 22.688 22.486 22.364 22.105 21.904 21.729 21.557 21.166 20.97 20.779 20.506 20.138 19.694 19.134 15.614 -3 ,17429 ,TETRA ,17605920,Sun Nov 28 19:50:15 CET,Sun Nov 28 22:00:03 CET,0.0 0.275 0.451 0.603 0.721 0.823 0.921 1.031 1.238 1.321 1.413 1.443 1.671 1.752 1.911 2.061 2.198 2.265 2.404 2.557 2.776 2.906 3.029 3.212 3.399 3.593 3.786 3.97 4.212 4.444 4.654 4.913 5.175 5.43 5.719 6.042 6.371 6.729 7.122 7.556 8.027 8.6 9.274 9.967 10.825 11.783 12.937 14.314 15.878 17.719 19.964 21.847 22.935 23.561 23.879 24.023 24.112 24.114 24.053 23.933 23.802 23.703 23.607 23.517 23.418 23.28 23.119 22.965 22.823 22.662 22.469 22.304 22.117 21.914 21.758 21.589 21.417 21.222 20.998 20.841 20.695 20.487 20.324 20.144 20.057 19.869 19.669 19.453 19.329 19.077 18.913 18.743 18.562 18.146 17.898 17.644 17.368 17.033 16.474 15.646 12.933 -4 ,12516 ,TETRA ,17605921,Sun Nov 28 19:50:12 CET,Sun Nov 28 21:56:09 CET,0.0 0.099 0.248 0.448 0.607 0.733 0.847 0.942 1.129 1.221 1.306 1.318 1.548 1.637 1.803 1.945 2.081 2.15 2.289 2.431 2.631 2.768 2.907 3.108 3.302 3.497 3.679 3.851 4.092 4.323 4.542 4.818 5.102 5.374 5.701 6.074 6.418 6.812 7.232 7.672 8.152 8.695 9.339 10.038 10.874 11.786 12.877 14.138 15.605 17.337 19.518 21.475 22.644 23.386 23.813 24.028 24.16 24.198 24.142 24.069 23.96 23.825 23.697 23.545 23.367 23.218 23.047 22.884 22.755 22.611 22.454 22.337 22.212 22.037 21.885 21.731 21.575 21.427 21.267 21.145 21.03 20.826 20.654 20.471 20.375 20.18 19.959 19.737 19.61 19.346 19.172 18.998 18.825 18.447 18.195 17.937 17.686 17.413 17.018 16.347 13.27 -5 ,9042 ,TETRA ,17605922,Sun Nov 28 19:50:11 CET,Sun Nov 28 21:59:19 CET,0.0 0.287 0.51 0.664 0.806 0.949 1.074 1.17 1.35 1.441 1.533 1.557 1.795 1.88 2.054 2.223 2.387 2.469 2.614 2.757 2.981 3.126 3.268 3.479 3.685 3.886 4.078 4.267 4.506 4.744 4.973 5.241 5.512 5.783 6.108 6.468 6.815 7.217 7.661 8.128 8.618 9.191 9.851 10.529 11.356 12.287 13.418 14.758 16.31 18.124 20.375 22.238 23.348 24.096 24.522 24.711 24.809 24.88 24.847 24.772 24.704 24.623 24.518 24.394 24.283 24.196 24.063 23.912 23.772 23.631 23.501 23.391 23.265 23.139 23.015 22.85 22.705 22.54 22.325 22.176 22.048 21.87 21.741 21.595 21.502 21.282 21.077 20.855 20.735 20.511 20.372 20.212 20.05 19.669 19.449 19.207 18.928 18.64 18.3 17.732 14.741 -6 ,6184 ,TETRA ,17605923,Sun Nov 28 19:50:15 CET,Sun Nov 28 21:59:44 CET,0.0 0.177 0.36 0.539 0.693 0.821 0.945 1.064 1.297 1.396 1.487 1.527 1.761 1.849 2.015 2.166 2.31 2.381 2.544 2.703 2.928 3.07 3.2 3.402 3.599 3.794 3.988 4.172 4.408 4.635 4.872 5.167 5.436 5.701 6.017 6.383 6.758 7.159 7.591 8.075 8.59 9.166 9.858 10.574 11.401 12.33 13.417 14.645 16.096 17.781 19.805 21.428 22.415 23.086 23.499 23.743 23.863 23.939 23.938 23.868 23.809 23.756 23.63 23.483 23.37 23.254 23.12 22.986 22.874 22.782 22.659 22.533 22.405 22.264 22.147 22.037 21.926 21.798 21.627 21.468 21.303 21.076 20.909 20.723 20.615 20.354 20.114 19.881 19.758 19.522 19.404 19.276 19.123 18.777 18.543 18.241 17.943 17.639 17.216 16.628 14.172 -7 ,11823 ,TETRA ,17605924,Sun Nov 28 19:50:12 CET,Sun Nov 28 21:58:21 CET,0.0 0.383 0.601 0.747 0.91 1.05 1.184 1.311 1.487 1.574 1.669 1.713 1.956 2.04 2.21 2.379 2.534 2.603 2.738 2.895 3.126 3.271 3.421 3.623 3.825 4.021 4.198 4.38 4.629 4.868 5.087 5.364 5.64 5.9 6.213 6.573 6.939 7.353 7.79 8.269 8.772 9.348 10.047 10.775 11.616 12.564 13.714 15.074 16.729 18.69 21.008 22.924 24.062 24.714 25.111 25.352 25.45 25.471 25.458 25.426 25.393 25.326 25.209 25.07 24.916 24.74 24.573 24.45 24.345 24.236 24.096 23.986 23.878 23.767 23.68 23.571 23.453 23.336 23.187 23.076 22.968 22.814 22.693 22.542 22.464 22.305 22.123 21.9 21.78 21.534 21.381 21.23 21.065 20.743 20.578 20.347 20.065 19.768 19.371 18.795 16.468 -8 ,7909 ,TETRA ,17605925,Sun Nov 28 19:50:12 CET,Sun Nov 28 21:59:28 CET,0.0 0.232 0.415 0.568 0.709 0.843 0.965 1.069 1.269 1.362 1.454 1.466 1.698 1.785 1.945 2.095 2.238 2.312 2.458 2.6 2.803 2.932 3.069 3.27 3.456 3.636 3.814 3.994 4.244 4.491 4.716 4.984 5.242 5.492 5.787 6.123 6.462 6.85 7.283 7.738 8.22 8.784 9.434 10.103 10.903 11.811 12.888 14.168 15.757 17.692 20.056 22.07 23.25 23.93 24.379 24.638 24.774 24.851 24.862 24.834 24.795 24.732 24.618 24.482 24.37 24.268 24.145 24.017 23.886 23.746 23.614 23.504 23.385 23.25 23.154 23.046 22.913 22.777 22.635 22.536 22.428 22.225 22.081 21.933 21.854 21.698 21.514 21.303 21.196 20.967 20.87 20.745 20.587 20.216 19.985 19.736 19.466 19.147 18.724 18.078 15.028 -9 ,12617 ,TETRA ,17605926,Sun Nov 28 19:50:13 CET,Sun Nov 28 22:09:07 CET,0.0 0.311 0.51 0.668 0.795 0.911 1.017 1.109 1.287 1.378 1.473 1.484 1.711 1.798 1.98 2.15 2.3 2.372 2.508 2.645 2.858 3.001 3.145 3.354 3.556 3.764 3.96 4.148 4.385 4.613 4.848 5.129 5.386 5.644 5.973 6.355 6.723 7.143 7.603 8.104 8.63 9.194 9.861 10.554 11.388 12.355 13.472 14.729 16.257 18.129 20.493 22.466 23.545 24.166 24.528 24.756 24.842 24.858 24.868 24.849 24.81 24.716 24.567 24.414 24.293 24.176 23.985 23.804 23.68 23.566 23.437 23.297 23.125 22.937 22.795 22.675 22.559 22.403 22.242 22.134 22.012 21.792 21.64 21.504 21.435 21.278 21.1 20.911 20.799 20.567 20.468 20.362 20.241 19.914 19.71 19.507 19.263 18.957 18.576 17.935 15.044 -10 ,6032 ,TETRA ,17605927,Sun Nov 28 19:50:15 CET,Sun Nov 28 22:09:22 CET,0.0 0.233 0.404 0.56 0.683 0.797 0.925 1.04 1.235 1.342 1.447 1.478 1.72 1.812 1.981 2.145 2.314 2.4 2.573 2.73 2.954 3.109 3.255 3.462 3.661 3.857 4.053 4.241 4.498 4.754 4.988 5.272 5.551 5.829 6.149 6.516 6.882 7.264 7.689 8.164 8.673 9.278 10.003 10.721 11.603 12.629 13.789 15.106 16.697 18.609 20.94 22.802 23.813 24.406 24.703 24.797 24.891 24.963 24.963 24.912 24.853 24.777 24.662 24.532 24.408 24.322 24.224 24.088 23.948 23.758 23.533 23.361 23.182 22.993 22.837 22.667 22.509 22.352 22.175 22.067 21.953 21.736 21.574 21.389 21.278 21.055 20.845 20.615 20.499 20.26 20.085 19.932 19.745 19.307 19.086 18.85 18.549 18.228 17.891 17.246 14.122 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_20_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_20_33.txt deleted file mode 100644 index 560fd123..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_20_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16166 ,TETRA ,17605928,Sun Nov 28 19:50:13 CET,Sun Nov 28 22:03:22 CET,0.0 0.764 1.154 1.516 1.867 2.174 2.443 2.677 3.091 3.281 3.458 3.669 3.979 4.113 4.387 4.677 4.96 5.101 5.357 5.565 5.832 5.998 6.157 6.382 6.599 6.812 7.015 7.21 7.446 7.693 7.941 8.232 8.499 8.74 9.029 9.364 9.694 10.044 10.433 10.879 11.33 11.805 12.356 12.932 13.613 14.379 15.313 16.348 17.523 18.882 20.326 21.499 22.171 22.417 22.456 22.442 22.369 22.25 22.122 21.947 21.741 21.51 21.244 20.982 20.786 20.657 20.509 20.336 20.15 19.958 19.77 19.6 19.433 19.267 19.111 18.929 18.752 18.558 18.346 18.213 18.077 17.844 17.67 17.506 17.421 17.224 17.012 16.789 16.66 16.381 16.213 16.058 15.881 15.43 15.17 14.892 14.617 14.351 13.99 13.443 10.314 -2 ,31645 ,TETRA ,17605929,Sun Nov 28 19:50:18 CET,Sun Nov 28 22:03:07 CET,0.0 1.003 1.468 1.814 2.092 2.362 2.592 2.765 3.072 3.235 3.409 3.579 3.855 3.987 4.276 4.556 4.787 4.884 5.072 5.279 5.576 5.749 5.919 6.169 6.408 6.628 6.83 7.017 7.28 7.551 7.807 8.117 8.417 8.708 9.036 9.412 9.79 10.201 10.635 11.1 11.607 12.175 12.806 13.427 14.158 14.993 15.946 16.991 18.219 19.603 21.186 22.341 22.91 23.23 23.347 23.34 23.253 23.148 23.026 22.882 22.742 22.557 22.341 22.102 21.863 21.666 21.454 21.264 21.095 20.878 20.663 20.501 20.325 20.126 19.961 19.795 19.615 19.43 19.242 19.095 18.945 18.698 18.507 18.317 18.228 18.021 17.809 17.599 17.463 17.18 16.996 16.854 16.693 16.299 16.099 15.901 15.682 15.366 14.965 14.425 11.396 -3 ,14652 ,TETRA ,17605930,Sun Nov 28 19:50:14 CET,Sun Nov 28 22:02:27 CET,0.0 1.235 1.613 1.885 2.132 2.348 2.551 2.75 3.096 3.26 3.413 3.536 3.799 3.908 4.122 4.339 4.544 4.647 4.85 5.035 5.295 5.464 5.637 5.891 6.127 6.347 6.556 6.766 7.052 7.341 7.628 7.951 8.25 8.528 8.831 9.173 9.5 9.847 10.221 10.634 11.057 11.533 12.105 12.686 13.374 14.127 14.997 15.956 17.008 18.225 19.492 20.189 20.456 20.531 20.501 20.426 20.265 20.083 19.923 19.729 19.524 19.322 19.135 18.951 18.76 18.558 18.374 18.214 18.028 17.837 17.627 17.441 17.282 17.122 16.971 16.791 16.624 16.459 16.256 16.123 15.989 15.735 15.56 15.37 15.259 15.039 14.837 14.652 14.556 14.339 14.245 14.098 13.949 13.628 13.44 13.216 12.962 12.712 12.403 11.951 9.975 -4 ,17011 ,TETRA ,17605931,Sun Nov 28 19:50:15 CET,Sun Nov 28 22:02:37 CET,0.0 1.067 1.453 1.732 1.953 2.181 2.392 2.573 2.945 3.111 3.263 3.406 3.684 3.814 4.063 4.305 4.556 4.671 4.886 5.105 5.415 5.592 5.761 6.021 6.289 6.547 6.785 7.019 7.308 7.584 7.857 8.197 8.524 8.826 9.194 9.599 9.971 10.409 10.902 11.424 11.971 12.584 13.268 13.952 14.719 15.537 16.468 17.471 18.616 19.894 21.345 22.392 22.809 23.009 23.001 22.831 22.624 22.426 22.257 22.077 21.903 21.727 21.561 21.385 21.184 20.997 20.797 20.618 20.464 20.284 20.101 19.952 19.758 19.526 19.365 19.216 19.05 18.862 18.668 18.539 18.415 18.234 18.067 17.856 17.759 17.565 17.326 17.088 16.974 16.73 16.613 16.479 16.331 16.015 15.802 15.526 15.239 14.94 14.578 14.035 11.641 -5 ,28649 ,TETRA ,17605932,Sun Nov 28 19:50:14 CET,Sun Nov 28 22:01:13 CET,0.0 1.16 1.539 1.832 2.096 2.339 2.556 2.745 3.077 3.234 3.384 3.543 3.843 3.998 4.285 4.547 4.81 4.937 5.177 5.406 5.722 5.914 6.115 6.429 6.702 6.936 7.153 7.358 7.615 7.841 8.056 8.334 8.61 8.886 9.229 9.601 9.923 10.271 10.671 11.1 11.544 12.061 12.693 13.305 13.992 14.79 15.705 16.742 17.953 19.323 20.927 22.08 22.658 22.964 23.054 23.066 23.039 22.975 22.839 22.609 22.404 22.212 21.988 21.779 21.613 21.466 21.292 21.108 20.943 20.786 20.62 20.469 20.306 20.144 20.011 19.864 19.709 19.529 19.332 19.201 19.066 18.853 18.69 18.499 18.403 18.21 17.996 17.755 17.637 17.385 17.233 17.073 16.913 16.592 16.401 16.19 15.949 15.69 15.323 14.798 13.311 -6 ,4098 ,TETRA ,17605933,Sun Nov 28 19:50:15 CET,Sun Nov 28 22:01:28 CET,0.0 1.655 2.179 2.548 2.84 3.113 3.376 3.602 3.971 4.125 4.271 4.443 4.738 4.868 5.12 5.374 5.622 5.735 5.945 6.133 6.397 6.558 6.725 6.969 7.194 7.408 7.607 7.801 8.043 8.259 8.473 8.768 9.077 9.359 9.67 10.03 10.364 10.722 11.116 11.527 11.968 12.473 13.069 13.677 14.371 15.107 15.99 17.0 18.165 19.519 21.019 22.125 22.585 22.611 22.528 22.518 22.465 22.315 22.158 21.977 21.802 21.637 21.454 21.263 21.057 20.848 20.668 20.53 20.39 20.225 20.048 19.903 19.736 19.567 19.438 19.294 19.129 18.962 18.82 18.726 18.605 18.395 18.261 18.1 18.009 17.834 17.638 17.406 17.303 17.069 16.936 16.778 16.602 16.24 16.024 15.809 15.553 15.202 14.72 13.973 11.166 -7 ,11291 ,TETRA ,17605934,Sun Nov 28 19:50:39 CET,Sun Nov 28 22:02:08 CET,0.0 1.121 1.472 1.76 1.99 2.175 2.341 2.507 2.851 2.995 3.109 3.227 3.52 3.666 3.941 4.16 4.38 4.488 4.69 4.892 5.199 5.401 5.593 5.88 6.14 6.384 6.622 6.851 7.134 7.386 7.624 7.924 8.214 8.501 8.823 9.169 9.504 9.892 10.333 10.777 11.224 11.712 12.275 12.874 13.586 14.343 15.165 16.082 17.174 18.516 20.031 21.063 21.566 21.774 21.799 21.754 21.652 21.487 21.29 21.062 20.866 20.691 20.521 20.322 20.095 19.881 19.656 19.468 19.319 19.141 18.934 18.775 18.606 18.433 18.31 18.171 18.029 17.88 17.704 17.585 17.475 17.295 17.126 16.917 16.817 16.617 16.402 16.161 16.025 15.761 15.553 15.372 15.187 14.782 14.544 14.248 13.923 13.55 13.115 12.533 10.311 -8 ,25365 ,TETRA ,17605935,Sun Nov 28 19:50:42 CET,Sun Nov 28 22:01:58 CET,0.0 1.134 1.458 1.742 1.999 2.232 2.421 2.595 2.947 3.109 3.261 3.396 3.671 3.802 4.057 4.293 4.543 4.661 4.873 5.089 5.399 5.593 5.785 6.052 6.298 6.54 6.787 7.04 7.366 7.664 7.972 8.351 8.713 9.063 9.435 9.83 10.21 10.638 11.096 11.572 12.055 12.589 13.243 13.902 14.628 15.409 16.289 17.279 18.485 19.968 21.722 22.994 23.601 23.868 23.94 23.917 23.862 23.733 23.51 23.243 23.042 22.885 22.723 22.562 22.418 22.259 22.066 21.906 21.776 21.615 21.408 21.236 21.062 20.881 20.73 20.564 20.396 20.204 20.004 19.87 19.735 19.516 19.358 19.197 19.104 18.883 18.642 18.402 18.289 18.05 17.927 17.785 17.644 17.347 17.158 16.939 16.687 16.391 16.057 15.566 12.715 -9 ,18137 ,TETRA ,17605936,Sun Nov 28 19:50:39 CET,Sun Nov 28 22:04:41 CET,0.0 1.357 1.775 2.077 2.352 2.605 2.803 2.976 3.332 3.5 3.67 3.81 4.075 4.194 4.423 4.665 4.903 5.007 5.214 5.429 5.747 5.949 6.149 6.44 6.719 6.989 7.254 7.499 7.799 8.096 8.408 8.788 9.131 9.459 9.85 10.287 10.711 11.162 11.646 12.158 12.683 13.255 13.902 14.558 15.301 16.159 17.167 18.245 19.46 20.769 22.158 23.108 23.485 23.66 23.751 23.772 23.729 23.635 23.486 23.297 23.093 22.886 22.7 22.515 22.332 22.15 21.948 21.76 21.59 21.414 21.221 21.048 20.878 20.726 20.613 20.483 20.338 20.189 20.029 19.902 19.772 19.584 19.454 19.292 19.196 19.021 18.844 18.652 18.541 18.289 18.1 17.919 17.743 17.368 17.144 16.87 16.551 16.231 15.846 15.302 12.54 -10 ,14955 ,TETRA ,17605937,Sun Nov 28 19:50:40 CET,Sun Nov 28 22:04:17 CET,0.0 1.178 1.578 1.888 2.16 2.385 2.585 2.768 3.105 3.267 3.427 3.57 3.861 4.004 4.265 4.503 4.738 4.848 5.031 5.204 5.452 5.605 5.757 6.0 6.249 6.494 6.729 6.955 7.259 7.549 7.816 8.144 8.465 8.794 9.15 9.497 9.827 10.195 10.623 11.09 11.597 12.195 12.862 13.506 14.251 15.069 15.971 16.972 18.14 19.483 21.034 22.218 22.851 23.226 23.366 23.375 23.339 23.22 23.062 22.898 22.748 22.597 22.424 22.237 22.055 21.885 21.699 21.522 21.369 21.192 21.012 20.873 20.702 20.521 20.396 20.281 20.156 20.006 19.84 19.717 19.579 19.361 19.207 19.036 18.953 18.755 18.519 18.282 18.157 17.906 17.756 17.615 17.467 17.103 16.896 16.678 16.434 16.162 15.883 15.432 12.585 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_21_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_21_22.txt deleted file mode 100644 index cb570613..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_21_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4052 ,TETRA ,17605938,Sun Nov 28 19:50:39 CET,Sun Nov 28 22:04:08 CET,0.0 0.657 0.947 1.172 1.354 1.505 1.645 1.772 1.971 2.062 2.157 2.225 2.403 2.483 2.638 2.769 2.899 2.971 3.111 3.239 3.411 3.514 3.613 3.762 3.914 4.06 4.191 4.312 4.475 4.634 4.788 4.971 5.15 5.321 5.51 5.736 5.966 6.21 6.45 6.713 6.978 7.272 7.63 7.968 8.32 8.692 9.136 9.581 9.988 10.38 10.686 10.697 10.51 10.285 10.028 9.727 9.446 9.164 8.894 8.635 8.429 8.244 8.052 7.872 7.717 7.565 7.403 7.256 7.112 6.947 6.779 6.645 6.501 6.353 6.244 6.115 5.95 5.78 5.621 5.515 5.398 5.218 5.086 4.936 4.86 4.701 4.529 4.35 4.26 4.07 4.003 3.91 3.796 3.525 3.363 3.198 3.039 2.834 2.593 2.33 1.261 -2 ,14802 ,TETRA ,17605939,Sun Nov 28 19:50:41 CET,Sun Nov 28 22:04:56 CET,0.0 1.141 1.483 1.749 1.96 2.15 2.32 2.468 2.735 2.843 2.949 3.071 3.274 3.373 3.572 3.756 3.93 4.01 4.157 4.294 4.492 4.623 4.752 4.934 5.099 5.272 5.438 5.576 5.746 5.924 6.093 6.29 6.482 6.662 6.88 7.143 7.376 7.605 7.875 8.148 8.401 8.693 9.051 9.417 9.824 10.252 10.685 11.122 11.612 12.093 12.493 12.573 12.409 12.141 11.829 11.501 11.175 10.898 10.678 10.401 10.152 9.932 9.704 9.488 9.298 9.13 8.945 8.759 8.593 8.425 8.262 8.121 7.965 7.802 7.672 7.535 7.394 7.245 7.082 6.975 6.865 6.695 6.578 6.444 6.376 6.219 6.025 5.848 5.768 5.584 5.517 5.427 5.329 5.096 4.948 4.77 4.591 4.421 4.21 3.91 3.051 -3 ,21745 ,TETRA ,17605940,Sun Nov 28 19:50:40 CET,Sun Nov 28 22:03:24 CET,0.0 0.975 1.274 1.531 1.749 1.918 2.082 2.23 2.498 2.628 2.75 2.866 3.076 3.185 3.375 3.541 3.707 3.785 3.931 4.085 4.317 4.459 4.589 4.774 4.944 5.116 5.295 5.456 5.65 5.838 6.019 6.25 6.457 6.643 6.864 7.106 7.332 7.597 7.883 8.175 8.47 8.772 9.113 9.426 9.752 10.12 10.559 11.0 11.419 11.808 12.124 12.116 11.92 11.719 11.473 11.178 10.897 10.634 10.378 10.096 9.85 9.631 9.414 9.214 9.031 8.859 8.684 8.522 8.379 8.219 8.04 7.905 7.768 7.606 7.472 7.339 7.209 7.072 6.919 6.812 6.707 6.537 6.405 6.253 6.176 6.012 5.841 5.671 5.585 5.391 5.282 5.162 5.034 4.775 4.637 4.481 4.302 4.094 3.853 3.554 2.835 -4 ,8368 ,TETRA ,17605941,Sun Nov 28 19:50:43 CET,Sun Nov 28 22:03:32 CET,0.0 0.898 1.183 1.414 1.609 1.79 1.947 2.071 2.286 2.39 2.489 2.568 2.756 2.837 2.99 3.129 3.262 3.332 3.467 3.605 3.8 3.912 4.014 4.167 4.312 4.435 4.555 4.686 4.865 5.036 5.19 5.384 5.57 5.752 5.968 6.184 6.38 6.587 6.81 7.034 7.271 7.541 7.836 8.129 8.458 8.79 9.144 9.499 9.858 10.197 10.404 10.279 9.974 9.684 9.435 9.178 8.92 8.681 8.435 8.159 7.921 7.702 7.494 7.288 7.093 6.915 6.717 6.531 6.372 6.197 6.017 5.869 5.696 5.523 5.395 5.255 5.108 4.949 4.776 4.652 4.518 4.307 4.161 4.016 3.941 3.787 3.61 3.399 3.292 3.09 2.964 2.835 2.692 2.404 2.275 2.137 1.959 1.735 1.483 1.173 0.038 -5 ,30054 ,TETRA ,17605942,Sun Nov 28 19:50:44 CET,Sun Nov 28 22:05:36 CET,0.0 1.135 1.474 1.693 1.868 2.038 2.215 2.388 2.676 2.796 2.906 3.028 3.234 3.334 3.525 3.701 3.862 3.941 4.094 4.227 4.402 4.513 4.629 4.795 4.936 5.083 5.242 5.391 5.57 5.725 5.876 6.06 6.223 6.379 6.563 6.768 6.951 7.151 7.389 7.64 7.877 8.122 8.402 8.673 8.987 9.355 9.765 10.183 10.615 10.984 11.206 11.151 10.918 10.656 10.443 10.226 9.963 9.695 9.461 9.221 8.998 8.76 8.525 8.302 8.086 7.887 7.684 7.51 7.362 7.212 7.05 6.911 6.774 6.64 6.537 6.422 6.303 6.182 6.051 5.959 5.843 5.648 5.517 5.388 5.325 5.172 4.984 4.788 4.69 4.48 4.349 4.235 4.125 3.873 3.722 3.555 3.354 3.111 2.806 2.371 0.753 -6 ,3580 ,TETRA ,17605943,Sun Nov 28 19:50:40 CET,Sun Nov 28 22:04:18 CET,0.0 1.03 1.343 1.578 1.788 1.964 2.118 2.251 2.492 2.609 2.718 2.812 3.011 3.101 3.271 3.433 3.588 3.663 3.8 3.937 4.148 4.285 4.419 4.607 4.765 4.92 5.085 5.251 5.455 5.639 5.811 6.005 6.182 6.351 6.549 6.771 6.987 7.227 7.487 7.749 8.014 8.298 8.61 8.934 9.295 9.687 10.135 10.594 11.074 11.541 11.909 11.985 11.886 11.653 11.377 11.106 10.837 10.551 10.281 10.005 9.767 9.54 9.306 9.086 8.889 8.71 8.515 8.333 8.182 8.04 7.896 7.771 7.622 7.462 7.336 7.18 7.033 6.899 6.74 6.622 6.496 6.306 6.17 6.027 5.953 5.797 5.639 5.466 5.373 5.17 5.031 4.895 4.763 4.499 4.372 4.217 4.025 3.824 3.606 3.309 2.338 -7 ,7751 ,TETRA ,17605944,Sun Nov 28 19:50:41 CET,Sun Nov 28 22:07:31 CET,0.0 0.699 1.012 1.234 1.412 1.599 1.772 1.922 2.225 2.358 2.481 2.608 2.826 2.937 3.119 3.288 3.459 3.543 3.708 3.854 4.033 4.14 4.263 4.438 4.586 4.742 4.896 5.038 5.212 5.38 5.543 5.738 5.938 6.139 6.358 6.59 6.806 7.043 7.307 7.57 7.84 8.15 8.501 8.846 9.218 9.603 10.028 10.448 10.845 11.241 11.688 11.828 11.674 11.505 11.281 10.996 10.758 10.528 10.294 10.043 9.793 9.555 9.343 9.162 8.988 8.822 8.626 8.439 8.279 8.117 7.951 7.8 7.639 7.465 7.331 7.21 7.088 6.957 6.807 6.682 6.571 6.418 6.302 6.179 6.117 5.993 5.839 5.666 5.577 5.381 5.285 5.186 5.088 4.845 4.694 4.544 4.378 4.184 3.947 3.627 2.471 -8 ,5632 ,TETRA ,17605945,Sun Nov 28 19:50:42 CET,Sun Nov 28 22:07:54 CET,0.0 0.7 0.955 1.167 1.374 1.536 1.665 1.784 1.992 2.082 2.173 2.259 2.455 2.548 2.725 2.888 3.022 3.089 3.227 3.348 3.532 3.657 3.769 3.919 4.049 4.18 4.309 4.443 4.617 4.783 4.945 5.131 5.3 5.46 5.653 5.869 6.082 6.319 6.554 6.779 7.016 7.281 7.586 7.877 8.209 8.572 8.944 9.371 9.849 10.266 10.613 10.65 10.437 10.115 9.793 9.506 9.244 8.98 8.736 8.49 8.276 8.078 7.888 7.703 7.518 7.335 7.128 6.948 6.797 6.643 6.491 6.367 6.234 6.089 5.966 5.834 5.7 5.551 5.396 5.294 5.184 5.006 4.882 4.758 4.697 4.569 4.421 4.261 4.189 4.011 3.902 3.794 3.689 3.463 3.344 3.216 3.072 2.886 2.652 2.304 0.995 -9 ,2541 ,TETRA ,17605946,Sun Nov 28 19:50:44 CET,Sun Nov 28 22:03:39 CET,0.0 0.938 1.266 1.499 1.686 1.865 2.058 2.254 2.611 2.776 2.926 3.094 3.316 3.434 3.655 3.859 4.067 4.166 4.356 4.533 4.78 4.942 5.105 5.344 5.57 5.77 5.963 6.149 6.381 6.608 6.814 7.046 7.261 7.465 7.712 7.998 8.253 8.5 8.778 9.098 9.403 9.731 10.099 10.448 10.859 11.279 11.702 12.153 12.625 13.071 13.408 13.441 13.279 13.049 12.785 12.524 12.262 12.003 11.786 11.574 11.376 11.184 11.0 10.823 10.645 10.461 10.256 10.064 9.882 9.672 9.443 9.265 9.089 8.916 8.793 8.678 8.549 8.405 8.278 8.192 8.092 7.924 7.811 7.694 7.635 7.525 7.403 7.264 7.184 6.993 6.884 6.779 6.669 6.423 6.274 6.108 5.934 5.74 5.486 5.135 3.721 -10 ,3735 ,TETRA ,17605947,Sun Nov 28 19:50:47 CET,Sun Nov 28 22:03:05 CET,0.0 1.005 1.352 1.597 1.779 1.949 2.12 2.289 2.612 2.75 2.856 2.953 3.154 3.239 3.409 3.558 3.694 3.769 3.905 4.026 4.206 4.319 4.419 4.58 4.738 4.874 5.006 5.134 5.306 5.478 5.638 5.829 6.01 6.182 6.359 6.554 6.772 6.998 7.229 7.483 7.748 8.024 8.327 8.627 8.986 9.356 9.747 10.159 10.566 11.011 11.444 11.608 11.554 11.381 11.151 10.913 10.665 10.407 10.182 9.956 9.748 9.524 9.29 9.079 8.882 8.703 8.515 8.336 8.182 8.021 7.853 7.724 7.576 7.418 7.299 7.173 7.048 6.927 6.794 6.681 6.552 6.369 6.246 6.12 6.057 5.928 5.787 5.631 5.547 5.363 5.273 5.175 5.069 4.788 4.631 4.474 4.307 4.131 3.91 3.615 2.522 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_21_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_21_32.txt deleted file mode 100644 index cb51550a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_21_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27275 ,KEBNE ,17027616,Wed Dec 22 17:40:00 CET,Wed Dec 22 19:28:47 CET,0.0 0.2 0.32 0.425 0.494 0.559 0.621 0.67 0.747 0.787 0.82 0.763 0.891 0.922 0.986 1.026 1.058 1.076 1.11 1.14 1.176 1.193 1.213 1.239 1.256 1.269 1.281 1.294 1.311 1.312 1.307 1.296 1.28 1.259 1.227 1.178 1.123 1.045 0.951 0.85 0.726 0.532 0.249 -0.039 -0.428 -0.971 -1.663 -2.605 -4.001 -5.942 -8.921 -12.252 -14.813 -16.949 -18.736 -20.215 -21.427 -22.487 -23.383 -24.247 -25.003 -25.706 -26.37 -26.943 -27.435 -27.878 -28.327 -28.723 -29.062 -29.401 -29.768 -30.091 -30.42 -30.767 -31.021 -31.286 -31.577 -31.876 -32.196 -32.42 -32.64 -32.946 -33.16 -33.404 -33.53 -33.783 -34.038 -34.346 -34.542 -34.924 -35.294 -35.536 -35.781 -36.293 -36.58 -36.929 -37.316 -37.746 -38.304 -39.263 -42.424 -2 ,11243 ,KEBNE ,17027617,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:30:22 CET,0.0 0.165 0.265 0.343 0.425 0.522 0.603 0.642 0.721 0.762 0.789 0.733 0.859 0.889 0.941 0.98 1.026 1.051 1.088 1.107 1.134 1.154 1.162 1.169 1.19 1.205 1.205 1.208 1.209 1.202 1.196 1.18 1.155 1.121 1.076 1.01 0.932 0.843 0.734 0.597 0.437 0.232 -0.032 -0.331 -0.756 -1.323 -2.116 -3.18 -4.59 -6.583 -9.818 -13.318 -15.921 -18.034 -19.784 -21.275 -22.553 -23.698 -24.635 -25.499 -26.202 -26.856 -27.51 -28.139 -28.718 -29.237 -29.775 -30.258 -30.678 -31.111 -31.563 -31.912 -32.258 -32.62 -32.901 -33.193 -33.509 -33.836 -34.166 -34.391 -34.612 -34.941 -35.179 -35.428 -35.552 -35.806 -36.056 -36.32 -36.467 -36.775 -37.018 -37.221 -37.446 -37.944 -38.22 -38.53 -38.893 -39.286 -39.757 -40.348 -43.136 -3 ,24766 ,KEBNE ,17027618,Wed Dec 22 17:40:03 CET,Wed Dec 22 19:30:15 CET,0.0 0.138 0.223 0.312 0.406 0.474 0.544 0.618 0.727 0.783 0.837 0.826 0.969 0.997 1.037 1.082 1.122 1.14 1.173 1.193 1.22 1.243 1.264 1.29 1.306 1.323 1.335 1.333 1.322 1.303 1.281 1.245 1.208 1.169 1.125 1.086 1.026 0.915 0.767 0.61 0.441 0.212 -0.098 -0.446 -0.909 -1.479 -2.221 -3.196 -4.524 -6.433 -9.317 -12.522 -15.059 -17.185 -18.889 -20.278 -21.456 -22.479 -23.317 -24.177 -24.975 -25.67 -26.303 -26.894 -27.425 -27.91 -28.432 -28.906 -29.313 -29.707 -30.097 -30.428 -30.778 -31.142 -31.429 -31.713 -31.99 -32.281 -32.609 -32.838 -33.059 -33.394 -33.637 -33.904 -34.039 -34.292 -34.551 -34.833 -34.977 -35.268 -35.46 -35.619 -35.792 -36.194 -36.403 -36.62 -36.859 -37.13 -37.424 -37.874 -39.747 -4 ,1996 ,KEBNE ,17027619,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:29:36 CET,0.0 0.495 0.67 0.802 0.91 1.004 1.081 1.133 1.226 1.273 1.329 1.329 1.466 1.495 1.537 1.577 1.62 1.638 1.674 1.707 1.755 1.781 1.794 1.811 1.828 1.831 1.834 1.828 1.805 1.786 1.765 1.738 1.699 1.653 1.602 1.543 1.491 1.412 1.311 1.226 1.096 0.881 0.588 0.266 -0.122 -0.623 -1.324 -2.228 -3.51 -5.46 -8.465 -11.85 -14.459 -16.52 -18.215 -19.715 -20.999 -22.131 -23.093 -24.021 -24.81 -25.534 -26.237 -26.87 -27.443 -27.966 -28.483 -28.941 -29.363 -29.8 -30.222 -30.586 -31.002 -31.431 -31.768 -32.105 -32.455 -32.856 -33.242 -33.461 -33.683 -34.065 -34.311 -34.538 -34.663 -34.921 -35.172 -35.429 -35.558 -35.842 -36.044 -36.227 -36.41 -36.751 -36.924 -37.121 -37.359 -37.695 -38.08 -38.815 -42.508 -5 ,16259 ,KEBNE ,17027620,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:30:57 CET,0.0 0.078 0.151 0.263 0.352 0.418 0.471 0.522 0.612 0.65 0.692 0.668 0.8 0.823 0.854 0.884 0.906 0.916 0.933 0.953 0.988 1.007 1.019 1.043 1.061 1.064 1.071 1.077 1.076 1.068 1.052 1.036 1.015 0.983 0.936 0.869 0.803 0.728 0.619 0.481 0.329 0.094 -0.234 -0.574 -1.022 -1.591 -2.322 -3.269 -4.592 -6.493 -9.505 -12.886 -15.508 -17.579 -19.265 -20.789 -22.086 -23.214 -24.173 -25.111 -25.909 -26.617 -27.279 -27.897 -28.48 -28.994 -29.509 -29.971 -30.365 -30.764 -31.175 -31.512 -31.849 -32.183 -32.436 -32.696 -32.957 -33.217 -33.486 -33.677 -33.873 -34.198 -34.42 -34.65 -34.765 -34.975 -35.215 -35.53 -35.699 -36.002 -36.16 -36.298 -36.446 -36.821 -37.05 -37.285 -37.526 -37.783 -38.11 -38.559 -39.644 -6 ,21893 ,KEBNE ,17027621,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:30:08 CET,0.0 0.31 0.517 0.618 0.686 0.749 0.798 0.854 0.943 0.969 0.999 0.952 1.068 1.086 1.129 1.163 1.196 1.214 1.244 1.272 1.305 1.325 1.342 1.354 1.367 1.368 1.371 1.378 1.364 1.354 1.357 1.354 1.338 1.317 1.276 1.21 1.145 1.068 0.963 0.813 0.629 0.418 0.134 -0.197 -0.643 -1.214 -1.978 -2.984 -4.324 -6.267 -9.374 -12.822 -15.444 -17.477 -19.129 -20.589 -21.9 -23.063 -24.013 -24.942 -25.702 -26.369 -27.009 -27.583 -28.093 -28.556 -29.035 -29.471 -29.838 -30.213 -30.591 -30.883 -31.208 -31.563 -31.834 -32.092 -32.339 -32.595 -32.846 -33.011 -33.203 -33.543 -33.791 -34.042 -34.158 -34.371 -34.589 -34.826 -34.96 -35.241 -35.369 -35.509 -35.662 -36.012 -36.198 -36.385 -36.624 -36.997 -37.5 -38.211 -39.806 -7 ,1723 ,KEBNE ,17027622,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:30:17 CET,0.0 0.157 0.248 0.305 0.367 0.413 0.451 0.5 0.583 0.611 0.637 0.58 0.699 0.719 0.774 0.82 0.856 0.876 0.914 0.944 0.985 1.014 1.031 1.041 1.067 1.088 1.097 1.095 1.082 1.073 1.06 1.045 1.031 1.005 0.957 0.88 0.804 0.729 0.638 0.507 0.343 0.145 -0.139 -0.471 -0.874 -1.399 -2.082 -3.005 -4.354 -6.286 -9.335 -12.733 -15.332 -17.419 -19.084 -20.501 -21.73 -22.812 -23.726 -24.616 -25.356 -26.024 -26.681 -27.312 -27.882 -28.383 -28.917 -29.397 -29.817 -30.239 -30.638 -30.974 -31.324 -31.665 -31.917 -32.192 -32.473 -32.746 -33.036 -33.247 -33.465 -33.819 -34.056 -34.275 -34.39 -34.62 -34.839 -35.082 -35.217 -35.492 -35.667 -35.832 -35.986 -36.337 -36.518 -36.716 -36.944 -37.188 -37.461 -37.823 -39.733 -8 ,2847 ,KEBNE ,17027623,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:29:51 CET,0.0 0.232 0.402 0.522 0.579 0.644 0.714 0.77 0.845 0.878 0.905 0.832 0.941 0.954 0.983 1.008 1.033 1.04 1.055 1.078 1.099 1.1 1.097 1.093 1.086 1.078 1.083 1.095 1.087 1.07 1.053 1.017 0.974 0.928 0.867 0.779 0.692 0.608 0.508 0.372 0.193 -0.02 -0.298 -0.626 -1.053 -1.611 -2.382 -3.442 -4.93 -7.01 -10.245 -13.995 -16.872 -19.157 -20.967 -22.49 -23.775 -24.89 -25.823 -26.786 -27.64 -28.378 -29.051 -29.661 -30.203 -30.687 -31.211 -31.701 -32.106 -32.489 -32.877 -33.191 -33.519 -33.853 -34.107 -34.366 -34.645 -34.955 -35.275 -35.488 -35.684 -35.982 -36.179 -36.397 -36.517 -36.748 -37.009 -37.304 -37.452 -37.745 -37.916 -38.058 -38.245 -38.733 -38.964 -39.187 -39.458 -39.804 -40.239 -40.798 -42.117 -9 ,7710 ,KEBNE ,17027624,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:29:00 CET,0.0 0.446 0.606 0.698 0.762 0.822 0.862 0.905 1.011 1.06 1.1 1.067 1.196 1.212 1.235 1.25 1.274 1.286 1.304 1.328 1.358 1.377 1.394 1.423 1.464 1.491 1.503 1.507 1.516 1.535 1.533 1.521 1.509 1.48 1.444 1.395 1.325 1.246 1.147 1.015 0.863 0.65 0.339 -0.023 -0.516 -1.14 -1.897 -2.909 -4.378 -6.426 -9.577 -13.063 -15.879 -18.085 -19.804 -21.282 -22.539 -23.707 -24.712 -25.712 -26.553 -27.305 -28.069 -28.757 -29.342 -29.844 -30.351 -30.831 -31.253 -31.714 -32.199 -32.548 -32.869 -33.191 -33.433 -33.683 -33.967 -34.269 -34.573 -34.781 -34.997 -35.344 -35.569 -35.794 -35.913 -36.156 -36.395 -36.629 -36.754 -37.019 -37.104 -37.208 -37.32 -37.601 -37.765 -37.914 -38.11 -38.394 -38.772 -39.229 -41.196 -10 ,17381 ,KEBNE ,17027625,Wed Dec 22 17:40:03 CET,Wed Dec 22 19:29:53 CET,0.0 0.356 0.474 0.57 0.63 0.692 0.766 0.83 0.915 0.962 1.002 0.955 1.085 1.116 1.165 1.21 1.26 1.276 1.297 1.315 1.36 1.394 1.409 1.41 1.414 1.421 1.423 1.42 1.418 1.409 1.398 1.39 1.36 1.323 1.285 1.23 1.16 1.077 0.977 0.848 0.692 0.469 0.153 -0.203 -0.631 -1.165 -1.923 -2.94 -4.338 -6.244 -9.161 -12.458 -14.993 -17.035 -18.713 -20.179 -21.457 -22.575 -23.519 -24.463 -25.246 -25.918 -26.587 -27.215 -27.76 -28.279 -28.804 -29.252 -29.648 -30.041 -30.445 -30.794 -31.158 -31.534 -31.826 -32.112 -32.375 -32.634 -32.919 -33.118 -33.325 -33.654 -33.878 -34.115 -34.234 -34.467 -34.722 -35.01 -35.171 -35.473 -35.618 -35.777 -35.952 -36.334 -36.564 -36.811 -37.081 -37.435 -37.86 -38.36 -40.42 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_22_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_22_19.txt deleted file mode 100644 index a22c0a62..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_22_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23034 ,TETRA ,17605948,Sun Nov 28 19:50:41 CET,Sun Nov 28 22:03:32 CET,0.0 0.346 0.497 0.619 0.719 0.808 0.881 0.94 1.046 1.105 1.154 1.149 1.291 1.33 1.419 1.511 1.596 1.631 1.693 1.755 1.842 1.901 1.957 2.032 2.103 2.179 2.246 2.3 2.372 2.441 2.5 2.562 2.626 2.693 2.761 2.837 2.902 2.955 3.02 3.082 3.124 3.148 3.118 3.068 3.022 2.915 2.712 2.415 1.952 1.228 -0.041 -1.695 -3.073 -4.245 -5.283 -6.196 -6.967 -7.647 -8.228 -8.828 -9.338 -9.779 -10.209 -10.622 -11.022 -11.384 -11.743 -12.07 -12.358 -12.638 -12.924 -13.18 -13.453 -13.729 -13.943 -14.179 -14.433 -14.693 -14.941 -15.105 -15.276 -15.541 -15.727 -15.93 -16.04 -16.255 -16.487 -16.758 -16.891 -17.135 -17.295 -17.448 -17.604 -17.943 -18.112 -18.311 -18.544 -18.805 -19.125 -19.549 -20.992 -2 ,21458 ,TETRA ,17605949,Sun Nov 28 19:50:45 CET,Sun Nov 28 22:03:49 CET,0.0 0.451 0.629 0.751 0.861 0.941 1.014 1.08 1.208 1.267 1.318 1.308 1.459 1.515 1.61 1.696 1.782 1.817 1.884 1.947 2.032 2.081 2.135 2.205 2.257 2.318 2.379 2.433 2.494 2.562 2.634 2.704 2.768 2.826 2.877 2.931 2.98 3.023 3.052 3.064 3.065 3.062 3.045 2.987 2.882 2.758 2.553 2.204 1.656 0.774 -0.629 -2.294 -3.72 -4.963 -6.015 -6.902 -7.658 -8.364 -8.967 -9.543 -10.046 -10.508 -10.961 -11.387 -11.781 -12.131 -12.478 -12.788 -13.065 -13.376 -13.688 -13.938 -14.197 -14.46 -14.674 -14.889 -15.106 -15.329 -15.557 -15.717 -15.893 -16.168 -16.357 -16.56 -16.658 -16.859 -17.078 -17.296 -17.414 -17.654 -17.788 -17.932 -18.089 -18.415 -18.579 -18.777 -19.003 -19.239 -19.503 -19.846 -21.134 -3 ,29184 ,TETRA ,17605950,Sun Nov 28 19:50:41 CET,Sun Nov 28 22:04:08 CET,0.0 0.172 0.333 0.469 0.547 0.632 0.717 0.795 0.931 0.988 1.056 1.07 1.219 1.271 1.367 1.447 1.517 1.555 1.621 1.682 1.783 1.842 1.89 1.951 2.024 2.102 2.171 2.235 2.309 2.382 2.464 2.541 2.592 2.641 2.702 2.777 2.835 2.894 2.956 2.996 3.03 3.047 3.034 3.007 2.96 2.873 2.717 2.415 1.875 1.047 -0.396 -2.182 -3.627 -4.846 -5.92 -6.928 -7.773 -8.476 -9.069 -9.65 -10.155 -10.647 -11.123 -11.557 -11.939 -12.285 -12.656 -12.98 -13.27 -13.563 -13.86 -14.111 -14.367 -14.622 -14.814 -15.025 -15.252 -15.484 -15.725 -15.891 -16.057 -16.298 -16.474 -16.666 -16.759 -16.959 -17.185 -17.45 -17.587 -17.831 -17.963 -18.099 -18.253 -18.586 -18.762 -18.959 -19.207 -19.468 -19.736 -20.101 -21.127 -4 ,1268 ,TETRA ,17605951,Sun Nov 28 19:50:44 CET,Sun Nov 28 22:02:31 CET,0.0 0.537 0.687 0.814 0.904 0.968 1.046 1.135 1.287 1.34 1.395 1.395 1.537 1.576 1.649 1.723 1.793 1.827 1.892 1.954 2.043 2.091 2.13 2.199 2.268 2.326 2.372 2.42 2.481 2.532 2.581 2.632 2.677 2.714 2.756 2.819 2.878 2.93 2.989 3.023 3.047 3.075 3.076 3.054 2.969 2.799 2.517 2.082 1.466 0.554 -0.961 -2.752 -4.243 -5.497 -6.527 -7.457 -8.309 -9.06 -9.674 -10.296 -10.84 -11.356 -11.838 -12.267 -12.669 -13.024 -13.4 -13.742 -14.035 -14.328 -14.624 -14.862 -15.134 -15.424 -15.629 -15.828 -16.028 -16.237 -16.459 -16.612 -16.765 -16.989 -17.141 -17.312 -17.399 -17.579 -17.772 -17.995 -18.117 -18.368 -18.53 -18.67 -18.816 -19.131 -19.329 -19.535 -19.722 -19.942 -20.209 -20.568 -21.851 -5 ,7258 ,TETRA ,17605952,Sun Nov 28 19:50:42 CET,Sun Nov 28 22:03:17 CET,0.0 0.274 0.412 0.545 0.671 0.784 0.875 0.963 1.118 1.182 1.248 1.285 1.448 1.503 1.6 1.683 1.752 1.792 1.877 1.951 2.048 2.104 2.151 2.228 2.311 2.386 2.456 2.515 2.585 2.644 2.709 2.784 2.847 2.911 2.974 3.047 3.105 3.164 3.225 3.272 3.299 3.313 3.322 3.317 3.266 3.165 3.0 2.723 2.266 1.439 -0.089 -1.99 -3.547 -4.795 -5.801 -6.692 -7.489 -8.198 -8.796 -9.394 -9.918 -10.391 -10.841 -11.279 -11.697 -12.077 -12.468 -12.804 -13.082 -13.367 -13.677 -13.928 -14.169 -14.431 -14.644 -14.863 -15.082 -15.304 -15.564 -15.756 -15.93 -16.165 -16.335 -16.528 -16.625 -16.835 -17.068 -17.303 -17.432 -17.68 -17.842 -17.995 -18.14 -18.422 -18.578 -18.755 -18.943 -19.18 -19.497 -19.938 -21.123 -6 ,3680 ,TETRA ,17605953,Sun Nov 28 19:50:44 CET,Sun Nov 28 22:03:17 CET,0.0 0.425 0.635 0.774 0.891 0.988 1.059 1.119 1.238 1.295 1.353 1.361 1.512 1.557 1.648 1.725 1.782 1.815 1.906 1.994 2.092 2.152 2.203 2.265 2.325 2.384 2.438 2.494 2.569 2.638 2.703 2.774 2.834 2.892 2.964 3.044 3.104 3.16 3.224 3.276 3.302 3.339 3.386 3.419 3.383 3.284 3.167 2.917 2.43 1.645 0.217 -1.579 -3.067 -4.299 -5.335 -6.267 -7.067 -7.761 -8.372 -8.977 -9.51 -10.033 -10.533 -10.967 -11.347 -11.693 -12.046 -12.347 -12.617 -12.908 -13.213 -13.466 -13.735 -14.014 -14.224 -14.44 -14.678 -14.924 -15.165 -15.322 -15.476 -15.734 -15.915 -16.093 -16.185 -16.381 -16.581 -16.797 -16.921 -17.167 -17.295 -17.432 -17.58 -17.844 -17.999 -18.193 -18.369 -18.591 -18.879 -19.22 -20.169 -7 ,29802 ,TETRA ,17605954,Sun Nov 28 19:50:47 CET,Sun Nov 28 22:02:33 CET,0.0 0.266 0.468 0.604 0.689 0.768 0.843 0.91 1.021 1.076 1.134 1.141 1.301 1.352 1.433 1.505 1.581 1.62 1.689 1.754 1.851 1.909 1.953 2.015 2.079 2.146 2.209 2.264 2.336 2.416 2.485 2.567 2.646 2.707 2.769 2.832 2.879 2.92 2.972 3.025 3.044 3.034 3.041 3.03 2.971 2.888 2.714 2.41 1.921 1.151 -0.194 -1.83 -3.164 -4.303 -5.288 -6.203 -6.994 -7.691 -8.32 -8.99 -9.543 -10.018 -10.481 -10.932 -11.351 -11.724 -12.105 -12.439 -12.73 -13.023 -13.338 -13.635 -13.933 -14.22 -14.435 -14.648 -14.872 -15.109 -15.37 -15.545 -15.718 -15.989 -16.174 -16.374 -16.487 -16.726 -16.97 -17.224 -17.357 -17.616 -17.77 -17.91 -18.062 -18.384 -18.542 -18.725 -18.986 -19.27 -19.593 -20.084 -22.085 -8 ,19519 ,TETRA ,17605955,Sun Nov 28 19:50:45 CET,Sun Nov 28 22:03:28 CET,0.0 0.27 0.411 0.532 0.654 0.756 0.837 0.904 1.032 1.086 1.133 1.132 1.287 1.344 1.438 1.516 1.588 1.617 1.681 1.761 1.866 1.922 1.977 2.055 2.122 2.185 2.248 2.303 2.366 2.436 2.502 2.581 2.664 2.719 2.765 2.817 2.873 2.927 2.968 2.999 3.014 3.026 3.024 2.977 2.902 2.783 2.569 2.273 1.758 0.883 -0.563 -2.358 -3.796 -4.964 -6.006 -6.991 -7.828 -8.515 -9.095 -9.706 -10.232 -10.689 -11.11 -11.499 -11.865 -12.193 -12.536 -12.855 -13.148 -13.445 -13.729 -13.97 -14.226 -14.489 -14.688 -14.895 -15.121 -15.364 -15.613 -15.781 -15.962 -16.239 -16.418 -16.617 -16.72 -16.923 -17.147 -17.386 -17.511 -17.757 -17.918 -18.086 -18.251 -18.552 -18.723 -18.922 -19.142 -19.39 -19.717 -20.17 -21.369 -9 ,15822 ,TETRA ,17605956,Sun Nov 28 19:50:42 CET,Sun Nov 28 22:03:35 CET,0.0 0.348 0.504 0.631 0.776 0.902 0.998 1.076 1.219 1.277 1.333 1.357 1.511 1.566 1.677 1.763 1.83 1.865 1.935 1.994 2.079 2.136 2.187 2.256 2.324 2.389 2.446 2.496 2.551 2.613 2.683 2.75 2.815 2.883 2.954 3.026 3.082 3.145 3.208 3.258 3.302 3.322 3.29 3.229 3.152 3.011 2.786 2.496 2.027 1.221 -0.055 -1.576 -2.905 -4.14 -5.283 -6.286 -7.085 -7.788 -8.411 -9.045 -9.604 -10.099 -10.578 -11.051 -11.478 -11.834 -12.193 -12.52 -12.802 -13.096 -13.416 -13.674 -13.939 -14.227 -14.447 -14.671 -14.902 -15.135 -15.385 -15.556 -15.724 -15.988 -16.176 -16.37 -16.469 -16.684 -16.912 -17.143 -17.264 -17.509 -17.677 -17.836 -18.002 -18.35 -18.519 -18.706 -18.909 -19.131 -19.431 -19.778 -21.099 -10 ,11009 ,TETRA ,17605957,Sun Nov 28 19:50:44 CET,Sun Nov 28 22:02:55 CET,0.0 0.306 0.422 0.527 0.638 0.751 0.84 0.923 1.083 1.152 1.202 1.195 1.355 1.418 1.519 1.598 1.673 1.706 1.77 1.835 1.923 1.968 2.002 2.051 2.104 2.17 2.242 2.302 2.371 2.435 2.493 2.554 2.611 2.673 2.748 2.822 2.875 2.912 2.958 3.001 3.022 3.031 3.022 3.0 2.909 2.737 2.534 2.234 1.732 0.982 -0.436 -2.236 -3.656 -4.877 -5.904 -6.812 -7.673 -8.451 -9.129 -9.811 -10.391 -10.901 -11.356 -11.782 -12.163 -12.506 -12.886 -13.244 -13.553 -13.886 -14.209 -14.433 -14.657 -14.889 -15.077 -15.277 -15.49 -15.716 -15.963 -16.136 -16.306 -16.558 -16.726 -16.899 -16.99 -17.196 -17.428 -17.671 -17.789 -18.032 -18.162 -18.282 -18.425 -18.737 -18.899 -19.077 -19.306 -19.563 -19.853 -20.293 -21.413 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_23_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_23_21.txt deleted file mode 100644 index 4c191efa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_23_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10906 ,TETRA ,17605958,Sun Nov 28 19:50:46 CET,Sun Nov 28 22:06:32 CET,0.0 0.941 1.294 1.573 1.807 2.034 2.272 2.502 2.925 3.115 3.298 3.47 3.845 4.024 4.363 4.686 4.998 5.152 5.452 5.743 6.191 6.485 6.769 7.206 7.633 8.059 8.473 8.864 9.396 9.927 10.44 11.076 11.717 12.363 13.109 13.948 14.776 15.689 16.696 17.818 19.047 20.469 22.201 24.021 26.229 28.806 31.954 35.697 40.397 46.486 54.753 62.636 67.931 71.844 74.78 77.003 78.744 80.224 81.41 82.462 83.283 83.961 84.552 85.079 85.557 85.947 86.326 86.667 86.936 87.189 87.429 87.601 87.764 87.907 88.008 88.119 88.226 88.324 88.413 88.464 88.515 88.598 88.654 88.704 88.73 88.785 88.838 88.863 88.856 88.755 88.854 88.852 88.858 88.836 88.806 88.754 88.679 88.604 88.524 88.391 87.086 -2 ,32014 ,TETRA ,17605959,Sun Nov 28 19:50:47 CET,Sun Nov 28 22:07:41 CET,0.0 0.993 1.402 1.66 1.887 2.129 2.356 2.553 2.928 3.118 3.302 3.457 3.807 3.972 4.311 4.626 4.925 5.066 5.341 5.624 6.052 6.328 6.61 7.048 7.471 7.875 8.272 8.656 9.157 9.644 10.135 10.737 11.324 11.901 12.586 13.374 14.163 15.071 16.056 17.12 18.281 19.661 21.379 23.166 25.308 27.861 31.031 34.827 39.507 45.445 53.561 61.349 66.628 70.442 73.282 75.555 77.378 78.878 80.038 81.091 81.938 82.637 83.25 83.781 84.241 84.641 85.037 85.365 85.627 85.89 86.154 86.344 86.539 86.73 86.865 86.997 87.111 87.221 87.335 87.411 87.478 87.564 87.619 87.673 87.701 87.746 87.79 87.814 87.813 87.719 87.833 87.835 87.82 87.776 87.747 87.711 87.679 87.634 87.547 87.373 87.096 -3 ,8954 ,TETRA ,17605960,Sun Nov 28 19:50:43 CET,Sun Nov 28 22:05:30 CET,0.0 0.756 1.088 1.366 1.636 1.91 2.151 2.372 2.813 3.038 3.254 3.443 3.812 3.991 4.345 4.674 5.008 5.169 5.479 5.797 6.255 6.542 6.823 7.244 7.661 8.091 8.52 8.935 9.476 9.993 10.508 11.152 11.779 12.404 13.142 13.97 14.802 15.756 16.81 17.974 19.213 20.636 22.378 24.194 26.42 29.043 32.218 36.006 40.727 46.761 54.978 62.752 68.009 71.869 74.783 77.114 78.944 80.442 81.601 82.64 83.461 84.142 84.74 85.264 85.703 86.069 86.434 86.741 86.988 87.237 87.478 87.656 87.825 87.991 88.127 88.269 88.405 88.53 88.632 88.685 88.741 88.834 88.891 88.931 88.946 88.965 88.978 88.979 88.97 88.864 88.975 88.968 88.951 88.935 88.934 88.916 88.852 88.788 88.692 88.525 87.963 -4 ,5257 ,TETRA ,17605961,Sun Nov 28 19:50:48 CET,Sun Nov 28 22:04:23 CET,0.0 0.833 1.205 1.519 1.799 2.055 2.284 2.508 2.938 3.14 3.334 3.544 3.939 4.122 4.465 4.812 5.158 5.325 5.646 5.964 6.43 6.729 7.035 7.488 7.918 8.342 8.766 9.186 9.739 10.282 10.812 11.459 12.087 12.723 13.469 14.295 15.099 16.017 17.043 18.169 19.374 20.745 22.439 24.241 26.459 29.067 32.223 35.92 40.549 46.555 54.73 62.652 68.034 71.96 74.904 77.21 78.991 80.442 81.613 82.706 83.58 84.296 84.9 85.424 85.875 86.239 86.59 86.884 87.124 87.367 87.594 87.775 87.962 88.133 88.251 88.357 88.448 88.542 88.649 88.718 88.779 88.875 88.916 88.946 88.966 89.004 89.017 89.012 89.017 88.917 89.005 89.003 88.983 88.876 88.81 88.742 88.675 88.622 88.539 88.362 87.764 -5 ,31176 ,TETRA ,17605962,Sun Nov 28 19:50:43 CET,Sun Nov 28 22:09:33 CET,0.0 1.082 1.449 1.751 2.043 2.329 2.575 2.807 3.25 3.453 3.66 3.864 4.251 4.429 4.779 5.131 5.464 5.629 5.95 6.255 6.711 7.012 7.306 7.74 8.171 8.597 9.017 9.425 9.953 10.484 11.024 11.692 12.347 12.986 13.748 14.627 15.473 16.421 17.488 18.666 19.949 21.422 23.171 24.973 27.186 29.809 32.996 36.809 41.599 47.818 56.217 64.088 69.405 73.226 76.036 78.242 79.978 81.382 82.49 83.532 84.37 85.053 85.659 86.181 86.631 87.025 87.4 87.696 87.92 88.148 88.39 88.572 88.742 88.913 89.035 89.153 89.274 89.383 89.473 89.524 89.57 89.644 89.701 89.745 89.762 89.803 89.836 89.854 89.848 89.732 89.793 89.776 89.76 89.702 89.667 89.598 89.488 89.389 89.272 89.123 88.828 -6 ,6952 ,TETRA ,17605963,Sun Nov 28 19:50:46 CET,Sun Nov 28 22:09:43 CET,0.0 1.18 1.562 1.874 2.125 2.369 2.601 2.815 3.246 3.437 3.602 3.743 4.093 4.259 4.601 4.932 5.254 5.418 5.733 6.033 6.477 6.767 7.062 7.509 7.931 8.342 8.762 9.174 9.695 10.201 10.695 11.316 11.953 12.594 13.349 14.211 15.057 15.992 17.013 18.134 19.337 20.742 22.445 24.245 26.427 28.964 32.094 35.818 40.495 46.55 54.741 62.589 67.869 71.638 74.423 76.644 78.41 79.837 80.964 81.994 82.79 83.447 84.024 84.528 84.967 85.35 85.725 86.035 86.289 86.526 86.745 86.91 87.072 87.224 87.34 87.453 87.554 87.651 87.735 87.777 87.83 87.916 87.97 88.024 88.043 88.066 88.09 88.1 88.092 87.984 88.072 88.051 88.032 87.988 87.948 87.912 87.849 87.778 87.706 87.59 87.142 -7 ,23354 ,TETRA ,17605964,Sun Nov 28 19:50:44 CET,Sun Nov 28 22:06:13 CET,0.0 0.584 0.865 1.08 1.263 1.453 1.639 1.817 2.175 2.349 2.522 2.68 3.017 3.168 3.475 3.775 4.065 4.205 4.474 4.749 5.163 5.434 5.7 6.078 6.457 6.837 7.223 7.608 8.104 8.585 9.053 9.641 10.229 10.818 11.541 12.387 13.212 14.15 15.215 16.396 17.648 19.086 20.865 22.733 24.965 27.578 30.738 34.462 39.104 45.012 53.076 60.906 66.255 70.106 72.995 75.305 77.101 78.553 79.719 80.805 81.65 82.359 82.985 83.53 84.015 84.439 84.858 85.2 85.485 85.772 86.037 86.23 86.426 86.635 86.786 86.931 87.075 87.205 87.32 87.401 87.482 87.595 87.66 87.705 87.726 87.775 87.812 87.841 87.857 87.766 87.882 87.893 87.899 87.862 87.841 87.797 87.725 87.645 87.527 87.382 86.771 -8 ,4418 ,TETRA ,17605965,Sun Nov 28 19:50:46 CET,Sun Nov 28 22:05:58 CET,0.0 0.667 1.061 1.364 1.617 1.876 2.114 2.328 2.746 2.946 3.137 3.305 3.685 3.867 4.222 4.554 4.875 5.035 5.344 5.648 6.115 6.417 6.717 7.16 7.599 8.034 8.439 8.83 9.353 9.878 10.392 11.014 11.648 12.289 13.03 13.882 14.738 15.683 16.719 17.868 19.115 20.552 22.276 24.071 26.286 28.9 32.088 35.888 40.523 46.382 54.422 62.217 67.446 71.221 74.054 76.309 78.107 79.562 80.706 81.758 82.582 83.261 83.847 84.36 84.826 85.221 85.612 85.944 86.206 86.456 86.699 86.893 87.094 87.278 87.408 87.543 87.658 87.753 87.851 87.921 87.99 88.091 88.153 88.204 88.229 88.279 88.319 88.341 88.346 88.253 88.347 88.346 88.351 88.313 88.295 88.276 88.243 88.198 88.138 88.062 87.886 -9 ,8420 ,TETRA ,17605966,Sun Nov 28 19:51:09 CET,Sun Nov 28 22:04:54 CET,0.0 1.13 1.439 1.699 1.972 2.209 2.421 2.641 3.036 3.215 3.394 3.546 3.905 4.07 4.4 4.705 5.012 5.172 5.472 5.758 6.182 6.464 6.745 7.153 7.553 7.952 8.344 8.749 9.296 9.822 10.335 10.958 11.572 12.199 12.937 13.773 14.605 15.541 16.573 17.711 18.963 20.436 22.211 24.059 26.312 28.935 32.133 35.967 40.717 46.791 55.032 62.895 68.219 72.093 74.983 77.291 79.108 80.592 81.775 82.848 83.699 84.387 84.978 85.506 85.962 86.322 86.668 86.965 87.198 87.425 87.652 87.824 87.974 88.117 88.239 88.372 88.503 88.626 88.747 88.824 88.89 88.976 89.024 89.053 89.068 89.114 89.143 89.149 89.152 89.056 89.156 89.134 89.084 88.966 88.901 88.829 88.762 88.695 88.588 88.402 87.803 -10 ,30722 ,TETRA ,17605967,Sun Nov 28 19:51:10 CET,Sun Nov 28 22:04:30 CET,0.0 0.976 1.341 1.65 1.924 2.189 2.444 2.679 3.115 3.321 3.508 3.673 4.051 4.236 4.584 4.917 5.247 5.419 5.755 6.074 6.521 6.803 7.096 7.534 7.958 8.378 8.789 9.19 9.723 10.255 10.786 11.436 12.072 12.708 13.474 14.332 15.174 16.134 17.203 18.393 19.687 21.195 22.96 24.754 26.935 29.464 32.47 36.019 40.517 46.328 54.27 61.778 66.828 70.549 73.416 75.708 77.455 78.837 79.895 80.846 81.65 82.369 83.002 83.543 83.982 84.351 84.72 85.027 85.276 85.515 85.724 85.876 86.023 86.157 86.262 86.371 86.463 86.537 86.607 86.641 86.662 86.702 86.733 86.732 86.722 86.715 86.709 86.697 86.672 86.526 86.56 86.518 86.472 86.362 86.292 86.187 86.053 85.927 85.774 85.484 84.648 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_23_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_23_22.txt deleted file mode 100644 index f94fcc49..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_23_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27047 ,TETRA ,17605968,Sun Nov 28 19:51:09 CET,Sun Nov 28 22:05:25 CET,0.0 1.403 1.902 2.254 2.57 2.844 3.122 3.394 3.848 4.059 4.258 4.44 4.823 5.021 5.395 5.758 6.121 6.3 6.667 7.03 7.542 7.87 8.188 8.65 9.111 9.577 10.036 10.484 11.06 11.609 12.146 12.823 13.495 14.157 14.927 15.796 16.65 17.617 18.682 19.842 21.085 22.53 24.277 26.103 28.348 30.951 34.102 37.907 42.655 48.784 57.145 65.049 70.315 74.116 76.989 79.259 81.051 82.498 83.591 84.58 85.374 86.027 86.602 87.113 87.561 87.935 88.298 88.601 88.839 89.061 89.27 89.442 89.611 89.773 89.892 90.004 90.114 90.223 90.319 90.366 90.405 90.472 90.508 90.536 90.545 90.55 90.552 90.551 90.558 90.477 90.566 90.554 90.541 90.502 90.467 90.411 90.323 90.207 90.086 89.903 88.982 -2 ,28396 ,TETRA ,17605969,Sun Nov 28 19:51:10 CET,Sun Nov 28 22:05:16 CET,0.0 0.867 1.308 1.631 1.904 2.134 2.353 2.576 2.997 3.197 3.401 3.631 4.004 4.194 4.548 4.88 5.203 5.361 5.678 5.987 6.432 6.724 7.017 7.45 7.884 8.32 8.743 9.156 9.704 10.223 10.732 11.363 11.966 12.574 13.297 14.126 14.947 15.878 16.909 18.034 19.249 20.66 22.371 24.145 26.3 28.822 31.84 35.449 40.052 46.004 54.123 61.904 67.14 70.928 73.807 76.087 77.846 79.276 80.43 81.497 82.34 83.022 83.618 84.138 84.604 85.031 85.448 85.788 86.057 86.309 86.535 86.705 86.879 87.042 87.153 87.263 87.384 87.494 87.589 87.651 87.713 87.79 87.824 87.844 87.843 87.849 87.885 87.92 87.93 87.841 87.95 87.945 87.938 87.908 87.891 87.87 87.817 87.741 87.652 87.472 86.996 -3 ,10679 ,TETRA ,17605970,Sun Nov 28 19:51:10 CET,Sun Nov 28 22:05:16 CET,0.0 1.237 1.728 2.082 2.381 2.651 2.901 3.142 3.583 3.798 4.013 4.242 4.639 4.829 5.188 5.545 5.902 6.076 6.402 6.732 7.229 7.556 7.87 8.323 8.773 9.224 9.67 10.105 10.678 11.239 11.794 12.49 13.162 13.813 14.582 15.459 16.329 17.315 18.412 19.614 20.889 22.351 24.194 26.166 28.501 31.21 34.494 38.357 43.226 49.516 57.983 66.078 71.519 75.485 78.521 80.94 82.813 84.317 85.52 86.629 87.49 88.199 88.841 89.392 89.855 90.255 90.622 90.917 91.147 91.34 91.508 91.667 91.839 91.978 92.067 92.136 92.204 92.296 92.381 92.423 92.462 92.535 92.591 92.646 92.661 92.674 92.701 92.714 92.716 92.615 92.685 92.67 92.65 92.606 92.571 92.519 92.465 92.39 92.226 92.0 90.951 -4 ,14309 ,TETRA ,17605971,Sun Nov 28 19:51:12 CET,Sun Nov 28 22:05:02 CET,0.0 1.115 1.526 1.859 2.163 2.444 2.706 2.944 3.408 3.642 3.866 4.081 4.476 4.669 5.062 5.452 5.814 5.99 6.332 6.669 7.163 7.484 7.804 8.279 8.742 9.18 9.607 10.039 10.609 11.172 11.728 12.407 13.069 13.723 14.488 15.352 16.218 17.192 18.259 19.442 20.728 22.213 24.02 25.892 28.103 30.684 33.885 37.742 42.533 48.785 57.296 65.344 70.783 74.687 77.647 80.013 81.865 83.364 84.542 85.631 86.497 87.192 87.79 88.314 88.772 89.167 89.547 89.864 90.119 90.352 90.57 90.737 90.91 91.072 91.181 91.291 91.395 91.481 91.535 91.569 91.62 91.701 91.737 91.743 91.739 91.746 91.755 91.745 91.742 91.639 91.702 91.675 91.641 91.581 91.542 91.477 91.389 91.258 91.053 90.765 89.841 -5 ,16609 ,TETRA ,17605972,Sun Nov 28 19:51:13 CET,Sun Nov 28 22:10:31 CET,0.0 0.758 1.16 1.538 1.855 2.134 2.407 2.654 3.099 3.308 3.506 3.707 4.097 4.285 4.635 4.984 5.329 5.497 5.83 6.146 6.606 6.912 7.21 7.644 8.067 8.493 8.919 9.328 9.863 10.393 10.915 11.556 12.186 12.816 13.566 14.429 15.269 16.22 17.276 18.427 19.677 21.118 22.864 24.707 26.95 29.562 32.668 36.373 41.097 47.254 55.678 63.72 69.2 73.24 76.279 78.696 80.586 82.108 83.305 84.4 85.251 85.914 86.487 86.985 87.415 87.793 88.18 88.505 88.773 89.03 89.255 89.424 89.583 89.731 89.843 89.948 90.058 90.178 90.279 90.342 90.408 90.487 90.519 90.547 90.563 90.599 90.628 90.64 90.644 90.531 90.595 90.578 90.545 90.457 90.395 90.337 90.27 90.181 90.052 89.845 89.051 -6 ,631 ,TETRA ,17605973,Sun Nov 28 19:51:15 CET,Sun Nov 28 22:09:19 CET,0.0 0.981 1.405 1.728 2.034 2.319 2.572 2.822 3.312 3.518 3.709 3.893 4.269 4.449 4.815 5.161 5.501 5.672 6.007 6.328 6.793 7.112 7.431 7.894 8.346 8.789 9.233 9.671 10.236 10.794 11.344 12.005 12.657 13.309 14.082 14.978 15.867 16.851 17.928 19.127 20.417 21.909 23.728 25.614 27.887 30.572 33.832 37.654 42.398 48.538 57.013 65.015 70.373 74.294 77.22 79.526 81.322 82.796 83.975 85.045 85.886 86.607 87.243 87.773 88.23 88.638 89.038 89.375 89.664 89.938 90.193 90.385 90.566 90.731 90.837 90.939 91.045 91.138 91.228 91.293 91.348 91.4 91.437 91.472 91.48 91.499 91.514 91.515 91.52 91.426 91.527 91.519 91.506 91.456 91.411 91.353 91.29 91.241 91.167 90.925 90.121 -7 ,15853 ,TETRA ,17605974,Sun Nov 28 19:51:10 CET,Sun Nov 28 22:07:21 CET,0.0 0.772 1.134 1.455 1.751 2.012 2.247 2.482 2.922 3.137 3.334 3.514 3.881 4.066 4.418 4.761 5.1 5.265 5.587 5.902 6.356 6.644 6.934 7.367 7.792 8.219 8.64 9.053 9.578 10.084 10.583 11.213 11.836 12.443 13.162 13.995 14.818 15.739 16.752 17.86 19.085 20.513 22.221 24.0 26.144 28.63 31.66 35.303 39.875 45.836 53.967 61.67 66.943 70.811 73.681 75.923 77.683 79.117 80.226 81.251 82.079 82.736 83.305 83.828 84.287 84.658 85.029 85.36 85.615 85.851 86.092 86.283 86.462 86.631 86.753 86.883 87.018 87.128 87.223 87.286 87.346 87.443 87.512 87.555 87.56 87.559 87.548 87.54 87.527 87.406 87.457 87.421 87.373 87.273 87.22 87.149 87.049 86.947 86.834 86.678 86.32 -8 ,17619 ,TETRA ,17605975,Sun Nov 28 19:51:11 CET,Sun Nov 28 22:05:50 CET,0.0 1.205 1.639 1.987 2.27 2.518 2.783 3.047 3.497 3.715 3.936 4.146 4.52 4.707 5.066 5.407 5.738 5.899 6.226 6.552 7.039 7.354 7.656 8.095 8.521 8.946 9.373 9.792 10.325 10.842 11.357 11.985 12.619 13.244 13.961 14.804 15.643 16.587 17.63 18.765 20.006 21.437 23.174 25.003 27.191 29.779 32.944 36.661 41.417 47.589 55.971 63.992 69.351 73.201 76.094 78.391 80.192 81.703 82.935 84.062 84.927 85.639 86.255 86.776 87.238 87.633 88.013 88.331 88.597 88.851 89.085 89.269 89.449 89.624 89.735 89.83 89.925 90.015 90.107 90.158 90.211 90.281 90.319 90.361 90.383 90.408 90.413 90.428 90.428 90.324 90.401 90.383 90.362 90.297 90.271 90.232 90.166 90.063 89.935 89.809 89.229 -9 ,32020 ,TETRA ,17605976,Sun Nov 28 19:51:10 CET,Sun Nov 28 21:59:25 CET,0.0 0.875 1.222 1.556 1.882 2.155 2.41 2.649 3.078 3.282 3.483 3.678 4.057 4.24 4.597 4.936 5.271 5.438 5.769 6.095 6.568 6.883 7.195 7.642 8.082 8.529 8.971 9.385 9.913 10.443 10.982 11.648 12.299 12.925 13.649 14.467 15.258 16.156 17.173 18.306 19.532 20.94 22.645 24.441 26.652 29.24 32.353 36.099 40.835 46.938 55.211 63.125 68.52 72.391 75.264 77.528 79.307 80.724 81.827 82.863 83.677 84.348 84.949 85.478 85.937 86.32 86.689 86.987 87.232 87.495 87.756 87.953 88.112 88.266 88.391 88.5 88.607 88.719 88.825 88.889 88.954 89.044 89.094 89.143 89.165 89.198 89.23 89.257 89.263 89.165 89.23 89.202 89.17 89.062 88.99 88.932 88.861 88.74 88.61 88.415 87.558 -10 ,12588 ,TETRA ,17605978,Sun Nov 28 19:51:11 CET,Sun Nov 28 22:10:23 CET,0.0 0.993 1.456 1.792 2.089 2.369 2.643 2.906 3.408 3.65 3.86 4.063 4.456 4.65 5.019 5.371 5.72 5.89 6.217 6.549 7.067 7.412 7.732 8.177 8.626 9.071 9.51 9.953 10.539 11.116 11.668 12.334 13.001 13.676 14.465 15.361 16.245 17.231 18.322 19.507 20.786 22.293 24.105 25.953 28.151 30.734 33.954 37.845 42.718 48.964 57.433 65.47 70.894 74.734 77.563 79.837 81.631 83.104 84.238 85.234 86.029 86.684 87.246 87.752 88.195 88.553 88.899 89.199 89.435 89.661 89.888 90.062 90.218 90.364 90.473 90.58 90.678 90.758 90.837 90.884 90.934 91.012 91.044 91.062 91.061 91.064 91.079 91.069 91.056 90.942 91.009 90.992 90.967 90.91 90.876 90.815 90.709 90.574 90.413 90.191 89.375 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_25_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_25_19.txt deleted file mode 100644 index 9ab92155..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_25_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21395 ,KEBNE ,17027626,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:30:30 CET,0.0 0.852 1.273 1.631 1.978 2.298 2.581 2.841 3.337 3.574 3.799 3.998 4.464 4.673 5.102 5.534 5.964 6.181 6.609 7.02 7.62 8.016 8.406 8.989 9.573 10.148 10.721 11.29 12.016 12.724 13.441 14.341 15.222 16.088 17.135 18.342 19.512 20.818 22.254 23.856 25.605 27.616 30.069 32.588 35.638 39.27 43.687 48.968 55.543 64.011 75.624 86.708 94.202 99.65 103.721 106.973 109.567 111.715 113.403 114.91 116.1 117.09 117.973 118.751 119.435 120.024 120.593 121.068 121.459 121.825 122.153 122.402 122.668 122.95 123.143 123.313 123.482 123.636 123.784 123.891 123.993 124.128 124.218 124.306 124.342 124.413 124.47 124.504 124.516 124.413 124.534 124.52 124.507 124.431 124.368 124.304 124.228 124.129 123.947 123.606 121.974 -2 ,29490 ,KEBNE ,17027627,Wed Dec 22 17:41:02 CET,Wed Dec 22 19:31:48 CET,0.0 0.579 0.992 1.357 1.687 1.989 2.268 2.538 3.069 3.318 3.568 3.797 4.264 4.486 4.913 5.329 5.744 5.944 6.351 6.77 7.381 7.779 8.175 8.759 9.316 9.869 10.423 10.969 11.693 12.399 13.096 13.97 14.859 15.745 16.782 17.988 19.173 20.467 21.88 23.439 25.134 27.125 29.557 32.089 35.166 38.888 43.404 48.536 54.774 62.725 73.617 84.139 91.213 96.336 100.264 103.408 105.843 107.808 109.368 110.788 111.862 112.715 113.482 114.178 114.789 115.303 115.802 116.232 116.601 116.968 117.31 117.577 117.832 118.051 118.21 118.371 118.53 118.694 118.853 118.932 119.003 119.141 119.227 119.294 119.318 119.354 119.382 119.403 119.412 119.301 119.426 119.413 119.401 119.345 119.277 119.198 119.131 119.025 118.862 118.61 117.928 -3 ,20310 ,KEBNE ,17027628,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:31:12 CET,0.0 0.828 1.156 1.483 1.788 2.069 2.326 2.564 3.042 3.273 3.502 3.722 4.208 4.451 4.936 5.384 5.794 5.996 6.4 6.793 7.375 7.762 8.138 8.707 9.274 9.828 10.365 10.906 11.63 12.332 13.029 13.896 14.754 15.598 16.59 17.756 18.925 20.228 21.678 23.289 25.037 27.077 29.576 32.195 35.318 38.933 43.341 48.658 55.284 63.838 75.327 86.112 93.443 98.768 102.77 105.916 108.405 110.455 112.066 113.508 114.641 115.591 116.434 117.168 117.796 118.336 118.87 119.318 119.695 120.082 120.47 120.769 121.048 121.31 121.501 121.686 121.865 122.033 122.187 122.276 122.357 122.479 122.555 122.621 122.653 122.711 122.762 122.82 122.848 122.743 122.84 122.82 122.793 122.708 122.653 122.585 122.5 122.405 122.244 121.947 121.011 -4 ,12546 ,KEBNE ,17027629,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:31:25 CET,0.0 1.901 2.395 2.787 3.158 3.493 3.819 4.114 4.645 4.898 5.145 5.359 5.851 6.088 6.552 6.994 7.415 7.623 8.027 8.414 9.008 9.407 9.787 10.35 10.911 11.462 12.004 12.535 13.239 13.939 14.622 15.47 16.331 17.191 18.212 19.381 20.535 21.824 23.229 24.77 26.472 28.448 30.807 33.276 36.292 39.877 44.22 49.34 55.773 64.056 75.246 86.013 93.316 98.556 102.466 105.605 108.117 110.15 111.718 113.199 114.405 115.427 116.325 117.095 117.773 118.356 118.932 119.4 119.762 120.086 120.373 120.588 120.795 121.011 121.175 121.342 121.508 121.649 121.789 121.883 121.959 122.05 122.101 122.156 122.172 122.181 122.19 122.2 122.203 122.069 122.135 122.114 122.089 122.02 121.977 121.925 121.853 121.725 121.519 121.187 119.668 -5 ,12566 ,KEBNE ,17027630,Wed Dec 22 17:41:02 CET,Wed Dec 22 19:30:17 CET,0.0 0.727 1.136 1.517 1.846 2.148 2.439 2.712 3.253 3.526 3.779 4.013 4.529 4.779 5.255 5.72 6.172 6.401 6.858 7.314 7.983 8.428 8.873 9.52 10.16 10.789 11.405 12.02 12.837 13.641 14.426 15.38 16.344 17.326 18.481 19.796 21.097 22.584 24.225 26.017 27.976 30.258 33.017 35.876 39.341 43.128 47.547 52.972 59.578 67.902 79.226 89.995 97.231 102.461 106.405 109.523 111.974 114.013 115.625 117.111 118.301 119.268 120.146 120.948 121.609 122.146 122.68 123.112 123.454 123.79 124.111 124.353 124.586 124.807 124.979 125.157 125.316 125.453 125.57 125.653 125.748 125.876 125.948 125.993 126.011 126.052 126.078 126.089 126.082 125.952 126.044 126.015 125.969 125.9 125.876 125.829 125.755 125.662 125.494 125.186 123.595 -6 ,26650 ,KEBNE ,17027631,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:32:06 CET,0.0 1.049 1.495 1.849 2.182 2.453 2.702 2.953 3.435 3.675 3.912 4.095 4.555 4.785 5.232 5.65 6.063 6.266 6.663 7.077 7.7 8.091 8.465 9.019 9.567 10.101 10.64 11.181 11.901 12.625 13.34 14.205 15.054 15.879 16.856 17.992 19.119 20.402 21.818 23.381 25.076 27.014 29.328 31.767 34.77 38.35 42.772 48.08 54.733 63.231 74.678 85.413 92.555 97.666 101.524 104.629 107.088 109.104 110.665 112.096 113.236 114.18 115.034 115.777 116.397 116.913 117.418 117.848 118.194 118.526 118.843 119.088 119.343 119.604 119.795 119.983 120.172 120.335 120.478 120.579 120.676 120.8 120.877 120.968 121.014 121.079 121.119 121.151 121.168 121.061 121.177 121.165 121.147 121.113 121.086 121.021 120.961 120.89 120.746 120.537 119.979 -7 ,6309 ,KEBNE ,17027632,Wed Dec 22 17:41:02 CET,Wed Dec 22 19:31:17 CET,0.0 0.882 1.266 1.576 1.841 2.106 2.375 2.634 3.091 3.307 3.55 3.781 4.246 4.452 4.869 5.279 5.68 5.877 6.265 6.651 7.222 7.599 7.968 8.528 9.101 9.659 10.211 10.769 11.491 12.187 12.891 13.767 14.623 15.476 16.497 17.674 18.842 20.152 21.591 23.181 24.916 26.924 29.382 31.986 35.112 38.758 43.082 48.139 54.49 62.761 73.967 84.554 91.927 97.234 101.124 104.223 106.676 108.664 110.228 111.657 112.757 113.632 114.393 115.103 115.733 116.258 116.757 117.159 117.493 117.818 118.134 118.391 118.639 118.875 119.047 119.221 119.387 119.534 119.676 119.767 119.863 120.005 120.086 120.155 120.181 120.205 120.212 120.236 120.248 120.133 120.232 120.214 120.19 120.12 120.078 120.001 119.912 119.808 119.662 119.471 118.743 -8 ,21156 ,KEBNE ,17027633,Wed Dec 22 17:41:05 CET,Wed Dec 22 19:31:21 CET,0.0 1.008 1.417 1.744 2.066 2.366 2.63 2.876 3.345 3.575 3.806 4.008 4.483 4.698 5.101 5.483 5.853 6.052 6.455 6.835 7.409 7.786 8.159 8.707 9.25 9.806 10.343 10.866 11.553 12.236 12.932 13.825 14.704 15.535 16.504 17.63 18.763 20.059 21.489 23.074 24.805 26.784 29.155 31.696 34.843 38.507 42.865 48.06 54.607 62.958 74.363 85.254 92.633 98.017 102.028 105.097 107.417 109.344 110.852 112.222 113.33 114.254 115.07 115.801 116.459 117.004 117.523 117.962 118.319 118.663 118.988 119.256 119.521 119.753 119.916 120.077 120.234 120.389 120.535 120.634 120.728 120.849 120.924 120.988 121.021 121.077 121.126 121.172 121.187 121.078 121.216 121.219 121.199 121.133 121.107 121.075 121.02 120.895 120.74 120.495 119.559 -9 ,14645 ,KEBNE ,17027634,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:31:33 CET,0.0 0.938 1.418 1.798 2.143 2.478 2.79 3.092 3.646 3.913 4.181 4.445 4.95 5.202 5.693 6.167 6.635 6.862 7.3 7.741 8.39 8.818 9.242 9.865 10.471 11.07 11.683 12.304 13.135 13.964 14.782 15.789 16.753 17.691 18.829 20.141 21.448 22.921 24.56 26.371 28.301 30.53 33.227 36.057 39.496 43.531 48.442 54.063 60.637 68.911 80.08 90.615 97.814 103.069 106.97 110.031 112.441 114.379 115.916 117.36 118.494 119.417 120.199 120.86 121.434 121.931 122.42 122.8 123.089 123.387 123.709 123.975 124.222 124.457 124.623 124.78 124.929 125.083 125.227 125.309 125.39 125.509 125.591 125.664 125.688 125.736 125.763 125.769 125.779 125.656 125.742 125.724 125.702 125.648 125.618 125.587 125.53 125.426 125.263 124.993 123.929 -10 ,24825 ,KEBNE ,17027635,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:31:16 CET,0.0 1.295 1.741 2.088 2.397 2.696 3.01 3.323 3.877 4.139 4.399 4.646 5.155 5.411 5.906 6.374 6.833 7.062 7.512 7.964 8.623 9.054 9.479 10.108 10.716 11.314 11.927 12.532 13.32 14.106 14.897 15.892 16.89 17.877 19.028 20.342 21.639 23.093 24.673 26.396 28.26 30.389 32.881 35.425 38.569 42.261 46.702 51.943 58.443 66.781 77.992 88.652 95.868 101.184 105.194 108.325 110.811 112.803 114.282 115.613 116.672 117.559 118.346 119.041 119.649 120.187 120.725 121.173 121.525 121.861 122.195 122.477 122.769 123.033 123.221 123.415 123.603 123.77 123.91 123.999 124.093 124.222 124.308 124.381 124.405 124.444 124.471 124.454 124.439 124.309 124.4 124.373 124.341 124.299 124.253 124.165 124.066 123.961 123.822 123.6 121.758 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_25_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_25_24.txt deleted file mode 100644 index 7b0765e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_25_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27244 ,TETRA ,17605979,Sun Nov 28 19:51:13 CET,Sun Nov 28 22:07:47 CET,0.0 1.273 1.779 2.23 2.641 3.024 3.371 3.687 4.264 4.546 4.837 5.14 5.627 5.853 6.278 6.701 7.141 7.361 7.785 8.192 8.796 9.184 9.568 10.146 10.702 11.24 11.781 12.307 12.982 13.642 14.286 15.103 15.913 16.687 17.63 18.751 19.841 21.068 22.438 23.916 25.484 27.299 29.393 31.505 34.109 37.164 40.838 45.196 50.666 57.672 67.241 76.27 82.347 86.825 90.159 92.766 94.727 96.244 97.424 98.503 99.343 100.039 100.648 101.165 101.602 101.952 102.295 102.593 102.828 103.054 103.266 103.431 103.569 103.671 103.754 103.812 103.833 103.872 103.946 103.998 104.05 104.131 104.152 104.131 104.128 104.128 104.115 104.088 104.064 103.893 103.949 103.899 103.843 103.679 103.575 103.421 103.229 103.013 102.765 102.356 100.085 -2 ,7431 ,TETRA ,17605981,Sun Nov 28 19:51:15 CET,Sun Nov 28 22:03:20 CET,0.0 1.787 2.409 2.863 3.26 3.61 3.957 4.278 4.854 5.141 5.408 5.668 6.164 6.406 6.877 7.321 7.738 7.946 8.373 8.79 9.4 9.796 10.175 10.744 11.317 11.874 12.415 12.933 13.609 14.284 14.95 15.773 16.594 17.42 18.432 19.592 20.684 21.886 23.237 24.741 26.393 28.323 30.632 32.997 35.807 39.078 43.103 47.916 53.807 61.131 70.787 79.596 85.3 89.348 92.347 94.672 96.444 97.842 98.917 99.925 100.737 101.395 101.993 102.556 103.028 103.426 103.814 104.07 104.266 104.491 104.714 104.88 105.041 105.193 105.294 105.4 105.51 105.605 105.695 105.748 105.769 105.78 105.797 105.784 105.757 105.689 105.63 105.586 105.566 105.401 105.474 105.432 105.36 105.124 104.982 104.839 104.654 104.42 104.127 103.66 101.039 -3 ,32250 ,TETRA ,17605982,Sun Nov 28 19:51:12 CET,Sun Nov 28 22:02:43 CET,0.0 1.373 1.831 2.185 2.512 2.84 3.151 3.441 3.988 4.24 4.464 4.681 5.152 5.375 5.827 6.25 6.642 6.838 7.234 7.619 8.168 8.522 8.866 9.365 9.885 10.411 10.932 11.462 12.135 12.771 13.412 14.202 14.965 15.715 16.612 17.633 18.626 19.749 21.001 22.357 23.794 25.477 27.538 29.681 32.272 35.304 39.004 43.393 48.799 55.678 64.946 73.813 79.736 83.98 87.123 89.563 91.487 93.07 94.298 95.399 96.291 97.048 97.65 98.161 98.61 98.976 99.332 99.628 99.851 100.036 100.187 100.291 100.398 100.491 100.549 100.595 100.634 100.672 100.715 100.756 100.79 100.822 100.842 100.838 100.818 100.764 100.736 100.709 100.686 100.518 100.57 100.519 100.458 100.291 100.186 100.062 99.859 99.536 99.044 98.346 94.518 -4 ,11186 ,TETRA ,17605983,Sun Nov 28 19:51:11 CET,Sun Nov 28 22:03:12 CET,0.0 0.718 1.168 1.572 1.926 2.244 2.542 2.822 3.375 3.64 3.893 4.098 4.571 4.78 5.171 5.552 5.922 6.1 6.462 6.815 7.333 7.676 8.013 8.511 9.005 9.495 9.982 10.455 11.068 11.679 12.28 13.012 13.735 14.449 15.303 16.28 17.236 18.332 19.563 20.916 22.394 24.125 26.199 28.33 30.874 33.828 37.447 41.938 47.577 54.576 63.97 72.79 78.62 82.749 85.844 88.235 90.05 91.576 92.822 93.966 94.858 95.614 96.298 96.862 97.31 97.666 98.011 98.316 98.569 98.81 99.045 99.233 99.416 99.587 99.71 99.827 99.918 99.996 100.068 100.106 100.14 100.182 100.201 100.214 100.226 100.246 100.253 100.262 100.232 100.043 100.11 100.076 100.025 99.882 99.792 99.594 99.302 99.065 98.751 98.12 94.31 -5 ,31075 ,TETRA ,17605984,Sun Nov 28 19:51:13 CET,Sun Nov 28 22:02:31 CET,0.0 1.618 2.257 2.752 3.213 3.63 4.021 4.412 5.12 5.433 5.746 6.109 6.67 6.957 7.514 8.043 8.548 8.803 9.319 9.803 10.422 10.795 11.153 11.664 12.166 12.668 13.166 13.646 14.288 14.932 15.562 16.347 17.114 17.872 18.789 19.82 20.845 22.031 23.335 24.714 26.177 27.9 29.942 32.062 34.723 37.767 41.327 45.597 50.978 57.789 66.916 75.537 81.266 85.429 88.458 90.745 92.464 93.878 95.085 96.221 97.111 97.838 98.482 99.011 99.437 99.787 100.102 100.35 100.533 100.712 100.916 101.066 101.186 101.325 101.429 101.516 101.588 101.63 101.651 101.65 101.635 101.588 101.541 101.483 101.469 101.46 101.407 101.342 101.301 101.091 101.083 100.988 100.888 100.687 100.548 100.37 100.168 99.921 99.555 98.947 95.074 -6 ,1390 ,TETRA ,17605985,Sun Nov 28 19:51:15 CET,Sun Nov 28 22:05:07 CET,0.0 1.298 1.965 2.492 2.919 3.287 3.652 3.995 4.601 4.89 5.181 5.492 6.011 6.276 6.798 7.311 7.808 8.054 8.517 8.971 9.658 10.103 10.54 11.181 11.808 12.418 13.008 13.591 14.381 15.164 15.926 16.852 17.744 18.627 19.657 20.812 21.942 23.234 24.674 26.243 27.967 29.944 32.238 34.628 37.496 40.747 44.62 49.058 54.504 61.366 70.448 78.875 84.47 88.652 91.941 94.415 96.229 97.754 98.969 100.067 100.931 101.643 102.24 102.765 103.228 103.627 104.017 104.334 104.578 104.798 105.013 105.181 105.319 105.401 105.462 105.549 105.605 105.626 105.652 105.679 105.708 105.732 105.706 105.657 105.634 105.574 105.493 105.383 105.319 105.112 105.098 104.998 104.878 104.611 104.463 104.292 104.07 103.769 103.355 102.812 99.79 -7 ,26266 ,TETRA ,17605986,Sun Nov 28 19:51:16 CET,Sun Nov 28 22:05:37 CET,0.0 1.82 2.45 2.94 3.354 3.731 4.075 4.394 4.973 5.248 5.525 5.801 6.316 6.579 7.074 7.556 8.011 8.23 8.69 9.142 9.788 10.22 10.65 11.269 11.858 12.42 12.972 13.529 14.265 15.007 15.738 16.611 17.442 18.265 19.28 20.418 21.498 22.708 24.049 25.539 27.165 29.002 31.187 33.476 36.22 39.396 43.173 47.589 53.047 60.04 69.442 78.21 84.084 88.354 91.509 93.942 95.818 97.388 98.674 99.843 100.727 101.448 102.097 102.64 103.095 103.471 103.799 104.063 104.293 104.516 104.735 104.916 105.087 105.231 105.322 105.408 105.484 105.552 105.624 105.669 105.707 105.745 105.755 105.759 105.757 105.729 105.701 105.679 105.658 105.487 105.539 105.492 105.446 105.292 105.187 105.064 104.918 104.749 104.5 104.108 101.113 -8 ,22729 ,TETRA ,17605987,Sun Nov 28 19:51:12 CET,Sun Nov 28 22:03:30 CET,0.0 1.518 2.093 2.568 2.989 3.375 3.728 4.035 4.605 4.886 5.15 5.41 5.912 6.171 6.67 7.157 7.643 7.874 8.319 8.749 9.406 9.84 10.256 10.873 11.479 12.073 12.656 13.241 14.021 14.783 15.527 16.439 17.319 18.182 19.212 20.392 21.553 22.854 24.306 25.828 27.4 29.228 31.443 33.736 36.433 39.478 43.157 47.56 53.079 60.136 69.455 78.162 84.126 88.442 91.59 94.057 96.001 97.583 98.788 99.868 100.719 101.434 102.097 102.642 103.055 103.418 103.795 104.101 104.332 104.531 104.699 104.817 104.939 105.054 105.137 105.195 105.187 105.14 105.084 105.067 105.076 105.109 105.146 105.174 105.168 105.144 105.089 104.981 104.907 104.664 104.575 104.447 104.313 104.053 103.904 103.681 103.411 103.113 102.703 102.117 97.858 -9 ,23952 ,TETRA ,17605988,Sun Nov 28 19:51:16 CET,Sun Nov 28 22:03:34 CET,0.0 1.813 2.322 2.705 3.041 3.351 3.647 3.934 4.475 4.734 4.999 5.304 5.807 6.036 6.493 6.964 7.442 7.662 8.073 8.476 9.074 9.471 9.868 10.437 10.988 11.529 12.075 12.616 13.309 14.001 14.683 15.515 16.348 17.154 18.081 19.155 20.22 21.423 22.731 24.119 25.636 27.448 29.608 31.81 34.474 37.668 41.539 45.966 51.342 58.048 66.999 75.41 80.983 84.972 87.916 90.268 92.183 93.762 94.995 96.157 97.076 97.832 98.503 99.091 99.586 99.99 100.397 100.732 101.013 101.282 101.521 101.713 101.896 102.068 102.185 102.289 102.373 102.442 102.517 102.574 102.623 102.677 102.701 102.711 102.707 102.677 102.629 102.579 102.552 102.395 102.485 102.459 102.425 102.272 102.19 102.07 101.854 101.561 101.232 100.736 97.569 -10 ,10757 ,TETRA ,17605989,Sun Nov 28 19:51:12 CET,Sun Nov 28 22:03:59 CET,0.0 1.637 2.175 2.635 3.063 3.449 3.781 4.092 4.719 5.019 5.306 5.623 6.14 6.396 6.903 7.368 7.819 8.039 8.459 8.876 9.48 9.877 10.278 10.876 11.446 11.998 12.547 13.09 13.788 14.484 15.202 16.096 16.977 17.818 18.794 19.918 21.024 22.29 23.727 25.271 26.893 28.726 30.865 33.099 35.84 39.121 43.122 47.832 53.663 60.9 70.485 79.493 85.532 89.933 93.199 95.749 97.679 99.239 100.475 101.598 102.482 103.202 103.852 104.412 104.885 105.295 105.676 105.98 106.234 106.488 106.738 106.91 107.06 107.219 107.337 107.442 107.544 107.633 107.707 107.761 107.803 107.84 107.859 107.879 107.887 107.887 107.863 107.829 107.817 107.66 107.707 107.64 107.585 107.454 107.334 107.184 106.993 106.725 106.373 105.928 102.152 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_27_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_27_24.txt deleted file mode 100644 index 7f0ff93a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_27_24.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,18546 ,TETRA ,17605991,Sun Nov 28 19:51:12 CET,Sun Nov 28 22:04:02 CET,0.0 1.602 2.123 2.52 2.894 3.216 3.461 3.679 4.113 4.327 4.527 4.768 5.1 5.241 5.5 5.746 5.987 6.101 6.315 6.518 6.821 7.005 7.184 7.457 7.716 7.97 8.219 8.457 8.752 9.034 9.315 9.659 9.992 10.308 10.668 11.056 11.401 11.772 12.194 12.634 13.087 13.603 14.195 14.808 15.53 16.272 17.058 17.895 18.925 20.183 21.546 22.369 22.303 21.9 21.485 20.987 20.499 20.026 19.612 19.202 18.816 18.438 18.064 17.71 17.397 17.136 16.861 16.631 16.446 16.251 16.061 15.897 15.719 15.524 15.369 15.221 15.06 14.838 14.579 14.421 14.266 14.012 13.828 13.641 13.54 13.307 13.069 12.798 12.649 12.363 12.162 11.961 11.743 11.244 10.966 10.652 10.272 9.761 9.101 8.295 4.006 -5 ,27879 ,TETRA ,17605994,Sun Nov 28 19:51:16 CET,Sun Nov 28 22:05:20 CET,0.0 2.114 2.706 3.138 3.507 3.824 4.114 4.382 4.787 4.936 5.073 5.19 5.458 5.576 5.803 6.024 6.234 6.341 6.549 6.732 7.002 7.195 7.38 7.618 7.834 8.058 8.28 8.476 8.725 8.973 9.212 9.503 9.786 10.073 10.407 10.768 11.118 11.514 11.929 12.345 12.8 13.303 13.852 14.396 15.008 15.661 16.322 17.04 17.845 18.719 19.65 19.858 19.546 19.121 18.587 18.027 17.599 17.268 16.981 16.627 16.304 16.025 15.736 15.447 15.173 14.942 14.699 14.48 14.268 14.032 13.787 13.541 13.254 12.936 12.684 12.444 12.189 11.913 11.593 11.356 11.128 10.795 10.555 10.283 10.143 9.854 9.552 9.23 9.036 8.671 8.293 7.996 7.702 7.12 6.759 6.309 5.806 5.233 4.496 3.409 -2.071 -6 ,25228 ,TETRA ,17605995,Sun Nov 28 19:51:19 CET,Sun Nov 28 22:05:29 CET,0.0 1.328 1.677 1.974 2.215 2.415 2.614 2.824 3.205 3.353 3.478 3.6 3.881 4.004 4.23 4.436 4.63 4.723 4.907 5.085 5.341 5.507 5.675 5.92 6.135 6.345 6.572 6.788 7.049 7.288 7.504 7.769 8.027 8.271 8.562 8.887 9.202 9.55 9.911 10.301 10.695 11.145 11.671 12.19 12.815 13.473 14.173 14.919 15.716 16.564 17.263 17.322 17.041 16.598 16.109 15.605 15.127 14.663 14.258 13.83 13.423 13.041 12.662 12.326 12.024 11.738 11.43 11.15 10.909 10.662 10.4 10.162 9.909 9.661 9.471 9.26 9.044 8.819 8.561 8.387 8.196 7.846 7.578 7.324 7.211 6.976 6.722 6.444 6.293 5.996 5.817 5.652 5.484 5.128 4.895 4.585 4.237 3.824 3.168 2.095 -10.133 -7 ,30345 ,TETRA ,17605996,Sun Nov 28 19:51:14 CET,Sun Nov 28 22:05:18 CET,0.0 0.763 1.083 1.349 1.604 1.818 1.993 2.161 2.482 2.638 2.783 2.912 3.208 3.342 3.58 3.801 4.027 4.137 4.352 4.563 4.857 5.057 5.26 5.55 5.82 6.067 6.303 6.544 6.874 7.196 7.511 7.903 8.277 8.633 9.052 9.497 9.887 10.314 10.765 11.22 11.683 12.167 12.669 13.143 13.642 14.19 14.863 15.627 16.492 17.317 18.142 18.472 18.198 17.767 17.224 16.683 16.248 15.862 15.507 15.153 14.865 14.628 14.39 14.142 13.92 13.7 13.447 13.232 13.058 12.869 12.651 12.473 12.294 12.097 11.936 11.743 11.534 11.344 11.149 11.011 10.871 10.622 10.423 10.182 10.042 9.745 9.419 9.075 8.899 8.563 8.305 8.083 7.848 7.349 7.081 6.763 6.337 5.859 5.318 4.484 -0.912 -8 ,13053 ,TETRA ,17605997,Sun Nov 28 19:51:15 CET,Sun Nov 28 22:05:56 CET,0.0 1.066 1.395 1.666 1.903 2.097 2.27 2.433 2.724 2.878 3.032 3.151 3.432 3.564 3.817 4.065 4.336 4.468 4.697 4.909 5.239 5.471 5.695 5.999 6.267 6.521 6.772 7.007 7.291 7.564 7.829 8.145 8.458 8.764 9.118 9.513 9.889 10.31 10.763 11.282 11.88 12.563 13.33 14.057 14.849 15.698 16.727 17.902 19.056 20.131 21.06 21.214 20.848 20.233 19.581 18.947 18.32 17.695 17.14 16.565 16.075 15.642 15.229 14.851 14.5 14.159 13.787 13.45 13.149 12.819 12.453 12.141 11.83 11.502 11.225 10.93 10.613 10.298 9.995 9.792 9.568 9.192 8.914 8.6 8.433 8.089 7.716 7.318 7.116 6.758 6.437 6.198 5.943 5.403 5.112 4.768 4.331 3.826 3.24 2.455 -3.686 -10 ,5126 ,TETRA ,17605999,Sun Nov 28 19:51:19 CET,Sun Nov 28 22:05:02 CET,0.0 1.406 1.753 2.031 2.29 2.503 2.681 2.838 3.123 3.278 3.432 3.558 3.833 3.962 4.198 4.445 4.671 4.768 4.968 5.155 5.429 5.6 5.767 6.018 6.253 6.477 6.7 6.921 7.203 7.478 7.735 8.04 8.341 8.644 8.99 9.369 9.725 10.113 10.558 11.034 11.505 11.999 12.558 13.127 13.801 14.569 15.487 16.56 17.723 18.923 19.985 20.347 20.353 20.283 20.226 20.066 19.796 19.509 19.234 18.905 18.617 18.36 18.086 17.833 17.572 17.33 17.101 16.893 16.687 16.47 16.285 16.14 15.979 15.815 15.689 15.558 15.426 15.284 15.12 15.001 14.871 14.662 14.525 14.369 14.285 14.115 13.956 13.783 13.673 13.418 13.222 12.979 12.722 12.147 11.804 11.42 10.971 10.394 9.68 8.778 -1.114 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_27_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_27_25.txt deleted file mode 100644 index 4a559f42..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_27_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27550 ,TETRA ,17606000,Sun Nov 28 19:51:39 CET,Sun Nov 28 22:07:27 CET,0.0 0.654 0.818 0.926 1.065 1.2 1.276 1.316 1.39 1.423 1.448 1.32 1.469 1.462 1.453 1.43 1.398 1.392 1.378 1.341 1.264 1.207 1.155 1.079 0.981 0.886 0.805 0.711 0.583 0.441 0.266 0.034 -0.178 -0.406 -0.703 -1.064 -1.458 -1.942 -2.507 -3.162 -3.904 -4.811 -5.97 -7.224 -8.821 -10.785 -13.246 -16.304 -20.392 -26.112 -34.781 -44.027 -50.86 -56.177 -60.362 -63.856 -66.798 -69.366 -71.483 -73.498 -75.178 -76.636 -78.004 -79.247 -80.354 -81.356 -82.405 -83.326 -84.07 -84.815 -85.616 -86.261 -86.925 -87.605 -88.118 -88.647 -89.197 -89.747 -90.29 -90.675 -91.057 -91.616 -92.011 -92.424 -92.636 -93.065 -93.492 -93.949 -94.2 -94.694 -94.89 -95.137 -95.4 -95.946 -96.241 -96.582 -96.958 -97.437 -98.12 -99.044 -105.643 -2 ,5157 ,TETRA ,17606001,Sun Nov 28 19:51:40 CET,Sun Nov 28 22:08:22 CET,0.0 0.538 0.694 0.817 0.921 1.012 1.105 1.184 1.323 1.362 1.376 1.271 1.455 1.475 1.517 1.543 1.548 1.545 1.523 1.489 1.424 1.376 1.33 1.257 1.19 1.1 0.988 0.868 0.711 0.552 0.382 0.175 -0.054 -0.307 -0.612 -0.957 -1.3 -1.716 -2.215 -2.789 -3.471 -4.311 -5.335 -6.502 -8.0 -9.835 -12.173 -15.109 -19.062 -24.536 -32.684 -41.324 -47.788 -52.834 -56.924 -60.449 -63.405 -65.962 -68.075 -70.121 -71.829 -73.277 -74.616 -75.849 -76.937 -77.894 -78.866 -79.709 -80.434 -81.168 -81.911 -82.525 -83.145 -83.773 -84.255 -84.735 -85.234 -85.745 -86.236 -86.59 -86.965 -87.523 -87.908 -88.289 -88.465 -88.855 -89.304 -89.754 -89.982 -90.454 -90.647 -90.888 -91.143 -91.758 -92.099 -92.444 -92.827 -93.33 -93.99 -94.857 -100.947 -3 ,21451 ,TETRA ,17606002,Sun Nov 28 19:51:39 CET,Sun Nov 28 22:09:03 CET,0.0 0.338 0.457 0.566 0.647 0.724 0.797 0.842 0.923 0.957 0.974 0.821 0.987 0.993 1.0 1.005 0.99 0.976 0.953 0.913 0.837 0.78 0.715 0.626 0.538 0.425 0.306 0.189 0.025 -0.15 -0.333 -0.583 -0.838 -1.09 -1.401 -1.777 -2.162 -2.607 -3.135 -3.74 -4.406 -5.246 -6.34 -7.545 -9.094 -10.945 -13.338 -16.422 -20.422 -25.981 -34.427 -43.619 -50.71 -56.308 -60.682 -64.336 -67.448 -70.173 -72.48 -74.709 -76.53 -78.101 -79.541 -80.859 -82.07 -83.104 -84.151 -85.078 -85.821 -86.589 -87.376 -88.005 -88.653 -89.318 -89.857 -90.422 -90.986 -91.537 -92.099 -92.509 -92.929 -93.596 -94.106 -94.598 -94.817 -95.258 -95.731 -96.216 -96.484 -97.018 -97.234 -97.473 -97.718 -98.253 -98.586 -98.921 -99.248 -99.633 -100.094 -100.698 -103.42 -4 ,25329 ,TETRA ,17606003,Sun Nov 28 19:51:44 CET,Sun Nov 28 22:05:41 CET,0.0 0.512 0.735 0.878 0.945 1.021 1.102 1.151 1.236 1.276 1.309 1.192 1.359 1.372 1.372 1.345 1.315 1.307 1.267 1.225 1.172 1.111 1.037 0.935 0.859 0.785 0.686 0.588 0.452 0.29 0.111 -0.107 -0.288 -0.502 -0.836 -1.237 -1.646 -2.118 -2.655 -3.29 -3.995 -4.842 -5.943 -7.192 -8.789 -10.695 -13.104 -16.146 -20.241 -25.841 -34.116 -43.115 -49.768 -54.984 -59.236 -62.761 -65.676 -68.182 -70.245 -72.243 -73.906 -75.354 -76.704 -77.929 -79.036 -80.029 -81.025 -81.902 -82.643 -83.369 -84.116 -84.726 -85.34 -85.981 -86.482 -87.022 -87.56 -88.079 -88.603 -88.958 -89.312 -89.879 -90.296 -90.721 -90.929 -91.344 -91.773 -92.196 -92.412 -92.891 -93.11 -93.359 -93.613 -94.192 -94.508 -94.848 -95.241 -95.716 -96.312 -97.217 -101.592 -5 ,22948 ,TETRA ,17606004,Sun Nov 28 19:51:40 CET,Sun Nov 28 22:07:00 CET,0.0 0.975 1.186 1.35 1.484 1.548 1.58 1.629 1.744 1.794 1.829 1.721 1.905 1.931 1.95 1.934 1.925 1.929 1.931 1.923 1.881 1.852 1.821 1.75 1.647 1.533 1.42 1.305 1.145 0.977 0.791 0.512 0.249 -0.006 -0.358 -0.76 -1.14 -1.611 -2.182 -2.814 -3.519 -4.371 -5.471 -6.7 -8.249 -10.118 -12.475 -15.543 -19.773 -25.692 -34.292 -43.352 -50.11 -55.382 -59.625 -63.141 -66.114 -68.733 -70.867 -72.873 -74.54 -75.976 -77.319 -78.545 -79.657 -80.644 -81.618 -82.484 -83.214 -83.934 -84.672 -85.291 -85.923 -86.555 -87.026 -87.482 -87.989 -88.569 -89.134 -89.507 -89.918 -90.534 -90.933 -91.374 -91.598 -92.048 -92.546 -93.074 -93.327 -93.835 -94.097 -94.361 -94.624 -95.168 -95.488 -95.837 -96.179 -96.54 -97.015 -97.93 -108.331 -6 ,26676 ,TETRA ,17606005,Sun Nov 28 19:51:41 CET,Sun Nov 28 22:06:29 CET,0.0 0.628 0.844 1.002 1.099 1.186 1.266 1.317 1.404 1.443 1.456 1.297 1.45 1.443 1.425 1.411 1.401 1.397 1.386 1.374 1.339 1.304 1.265 1.197 1.103 1.0 0.897 0.786 0.621 0.45 0.281 0.042 -0.223 -0.508 -0.881 -1.281 -1.646 -2.118 -2.727 -3.424 -4.177 -5.073 -6.245 -7.564 -9.217 -11.254 -13.908 -17.231 -21.59 -27.518 -36.251 -45.552 -52.417 -57.693 -61.869 -65.314 -68.227 -70.792 -72.879 -74.863 -76.52 -78.001 -79.406 -80.708 -81.849 -82.848 -83.87 -84.727 -85.465 -86.224 -86.983 -87.653 -88.359 -89.066 -89.602 -90.145 -90.69 -91.246 -91.814 -92.193 -92.588 -93.195 -93.62 -94.08 -94.299 -94.711 -95.147 -95.608 -95.84 -96.334 -96.621 -96.915 -97.204 -97.916 -98.34 -98.751 -99.182 -99.632 -100.111 -100.813 -104.22 -7 ,22794 ,TETRA ,17606006,Sun Nov 28 19:51:44 CET,Sun Nov 28 22:08:37 CET,0.0 0.474 0.612 0.731 0.849 0.941 0.993 1.07 1.206 1.242 1.28 1.18 1.356 1.382 1.415 1.409 1.38 1.365 1.33 1.288 1.231 1.198 1.165 1.108 1.017 0.911 0.806 0.695 0.529 0.346 0.155 -0.074 -0.317 -0.586 -0.893 -1.273 -1.689 -2.173 -2.719 -3.346 -4.068 -4.951 -6.069 -7.288 -8.839 -10.761 -13.243 -16.366 -20.51 -26.293 -35.072 -44.332 -51.174 -56.583 -60.893 -64.476 -67.432 -69.994 -72.1 -74.108 -75.799 -77.264 -78.614 -79.867 -81.026 -82.053 -83.068 -83.94 -84.67 -85.413 -86.186 -86.819 -87.489 -88.158 -88.652 -89.186 -89.746 -90.321 -90.905 -91.295 -91.693 -92.307 -92.728 -93.159 -93.38 -93.819 -94.25 -94.697 -94.946 -95.461 -95.721 -95.994 -96.26 -96.805 -97.107 -97.449 -97.851 -98.308 -98.846 -99.622 -107.835 -8 ,31452 ,TETRA ,17606007,Sun Nov 28 19:51:42 CET,Sun Nov 28 22:08:52 CET,0.0 0.552 0.733 0.819 0.886 0.975 1.044 1.108 1.244 1.29 1.335 1.224 1.387 1.392 1.388 1.369 1.354 1.358 1.354 1.333 1.293 1.255 1.21 1.131 1.047 0.944 0.829 0.716 0.583 0.446 0.289 0.077 -0.164 -0.391 -0.674 -1.075 -1.506 -2.011 -2.577 -3.218 -3.939 -4.749 -5.807 -7.055 -8.608 -10.517 -13.014 -16.187 -20.404 -26.268 -34.993 -44.197 -50.987 -56.388 -60.757 -64.366 -67.325 -69.894 -72.027 -74.07 -75.74 -77.155 -78.471 -79.701 -80.813 -81.775 -82.752 -83.593 -84.296 -85.038 -85.797 -86.437 -87.086 -87.709 -88.177 -88.66 -89.154 -89.667 -90.181 -90.512 -90.855 -91.397 -91.771 -92.201 -92.426 -92.856 -93.299 -93.75 -93.975 -94.459 -94.691 -94.931 -95.163 -95.656 -95.942 -96.22 -96.476 -96.762 -97.126 -97.696 -100.96 -9 ,24739 ,TETRA ,17606008,Sun Nov 28 19:51:39 CET,Sun Nov 28 22:06:55 CET,0.0 0.827 1.038 1.189 1.281 1.354 1.426 1.486 1.565 1.601 1.639 1.53 1.694 1.707 1.719 1.719 1.715 1.709 1.675 1.635 1.588 1.545 1.49 1.405 1.298 1.179 1.081 0.975 0.801 0.617 0.434 0.177 -0.097 -0.356 -0.67 -1.068 -1.492 -1.973 -2.54 -3.197 -3.923 -4.8 -5.909 -7.13 -8.688 -10.614 -13.084 -16.196 -20.31 -25.976 -34.444 -43.37 -49.917 -55.047 -59.165 -62.602 -65.481 -67.927 -69.927 -71.822 -73.386 -74.768 -76.065 -77.246 -78.318 -79.291 -80.271 -81.099 -81.822 -82.58 -83.319 -83.901 -84.493 -85.085 -85.545 -86.022 -86.498 -86.99 -87.502 -87.855 -88.214 -88.77 -89.154 -89.543 -89.741 -90.134 -90.537 -90.981 -91.219 -91.73 -91.999 -92.241 -92.493 -93.134 -93.484 -93.815 -94.187 -94.611 -95.139 -95.807 -99.357 -10 ,29806 ,TETRA ,17606009,Sun Nov 28 19:51:41 CET,Sun Nov 28 22:06:14 CET,0.0 0.866 1.004 1.084 1.174 1.278 1.355 1.398 1.455 1.477 1.505 1.394 1.556 1.562 1.572 1.588 1.575 1.559 1.519 1.47 1.402 1.367 1.321 1.235 1.139 1.047 0.948 0.825 0.642 0.465 0.309 0.107 -0.118 -0.344 -0.63 -0.999 -1.404 -1.889 -2.439 -3.079 -3.816 -4.707 -5.789 -6.957 -8.504 -10.404 -12.843 -15.94 -20.079 -25.921 -34.676 -43.893 -50.706 -56.091 -60.424 -63.999 -66.915 -69.406 -71.49 -73.479 -75.101 -76.512 -77.826 -79.001 -80.055 -81.016 -81.988 -82.833 -83.546 -84.27 -85.035 -85.657 -86.275 -86.905 -87.378 -87.858 -88.37 -88.902 -89.444 -89.822 -90.2 -90.774 -91.182 -91.6 -91.805 -92.218 -92.637 -93.102 -93.351 -93.849 -94.073 -94.331 -94.625 -95.22 -95.532 -95.905 -96.294 -96.73 -97.258 -97.896 -102.7 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_28_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_28_21.txt deleted file mode 100644 index aba0ea8b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_28_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31841 ,KEBNE ,17027636,Wed Dec 22 17:41:05 CET,Wed Dec 22 19:33:13 CET,0.0 1.232 1.504 1.676 1.847 2.01 2.159 2.278 2.475 2.545 2.612 2.675 2.801 2.86 2.98 3.063 3.143 3.183 3.256 3.334 3.435 3.497 3.558 3.625 3.684 3.748 3.811 3.864 3.922 3.973 4.02 4.091 4.166 4.208 4.229 4.255 4.264 4.245 4.209 4.137 4.07 4.051 3.934 3.7 3.357 2.895 2.229 1.354 0.201 -1.398 -4.099 -7.321 -9.806 -11.84 -13.486 -14.894 -16.145 -17.23 -18.122 -19.004 -19.725 -20.331 -20.927 -21.508 -22.044 -22.541 -23.061 -23.518 -23.904 -24.293 -24.692 -25.023 -25.368 -25.723 -26.005 -26.294 -26.57 -26.843 -27.124 -27.308 -27.498 -27.819 -28.039 -28.25 -28.358 -28.592 -28.843 -29.117 -29.254 -29.49 -29.673 -29.819 -29.961 -30.266 -30.438 -30.609 -30.813 -31.062 -31.321 -31.634 -32.385 -2 ,31584 ,KEBNE ,17027637,Wed Dec 22 17:41:04 CET,Wed Dec 22 19:34:17 CET,0.0 1.145 1.478 1.67 1.831 1.988 2.152 2.304 2.554 2.68 2.78 2.852 2.994 3.07 3.21 3.328 3.427 3.472 3.564 3.658 3.796 3.875 3.952 4.08 4.211 4.323 4.408 4.49 4.584 4.654 4.706 4.762 4.82 4.854 4.863 4.871 4.869 4.861 4.831 4.746 4.638 4.515 4.332 4.094 3.753 3.283 2.606 1.71 0.448 -1.473 -4.493 -7.702 -10.124 -12.17 -13.938 -15.466 -16.732 -17.859 -18.813 -19.722 -20.478 -21.156 -21.811 -22.411 -22.957 -23.451 -23.971 -24.437 -24.813 -25.189 -25.585 -25.894 -26.198 -26.532 -26.806 -27.074 -27.342 -27.622 -27.907 -28.103 -28.306 -28.619 -28.828 -29.039 -29.139 -29.351 -29.593 -29.867 -30.005 -30.23 -30.41 -30.551 -30.682 -30.985 -31.142 -31.281 -31.442 -31.668 -31.965 -32.315 -32.788 -3 ,9812 ,KEBNE ,17027638,Wed Dec 22 17:41:04 CET,Wed Dec 22 19:34:01 CET,0.0 1.104 1.441 1.678 1.863 2.032 2.182 2.338 2.617 2.733 2.824 2.897 3.034 3.101 3.218 3.317 3.411 3.458 3.555 3.667 3.848 3.949 4.039 4.16 4.257 4.344 4.407 4.462 4.541 4.614 4.699 4.797 4.868 4.927 4.988 5.042 5.069 5.077 5.069 5.005 4.918 4.79 4.581 4.347 4.026 3.667 3.126 2.288 1.153 -0.63 -3.554 -6.801 -9.317 -11.315 -12.912 -14.289 -15.468 -16.465 -17.341 -18.273 -19.058 -19.736 -20.366 -20.942 -21.456 -21.924 -22.418 -22.855 -23.236 -23.632 -24.055 -24.406 -24.767 -25.134 -25.415 -25.715 -26.023 -26.337 -26.665 -26.88 -27.089 -27.413 -27.634 -27.849 -27.967 -28.214 -28.469 -28.742 -28.875 -29.118 -29.3 -29.454 -29.621 -29.946 -30.111 -30.309 -30.533 -30.743 -30.97 -31.324 -32.373 -4 ,3508 ,KEBNE ,17027639,Wed Dec 22 17:41:04 CET,Wed Dec 22 19:32:26 CET,0.0 0.963 1.251 1.543 1.758 1.91 2.031 2.136 2.343 2.444 2.535 2.635 2.778 2.851 2.997 3.134 3.26 3.317 3.436 3.55 3.68 3.752 3.833 3.944 4.036 4.137 4.247 4.354 4.473 4.577 4.673 4.766 4.842 4.918 4.987 5.01 4.991 4.972 4.984 5.062 5.144 5.107 4.989 4.821 4.517 4.042 3.366 2.486 1.288 -0.499 -3.405 -6.614 -9.16 -11.259 -12.907 -14.316 -15.479 -16.465 -17.308 -18.118 -18.811 -19.471 -20.085 -20.618 -21.137 -21.624 -22.113 -22.52 -22.847 -23.182 -23.532 -23.828 -24.147 -24.491 -24.739 -24.975 -25.214 -25.472 -25.752 -25.937 -26.127 -26.42 -26.616 -26.798 -26.89 -27.086 -27.291 -27.524 -27.652 -27.889 -28.064 -28.208 -28.361 -28.648 -28.795 -28.949 -29.119 -29.33 -29.55 -29.787 -30.565 -5 ,1072 ,KEBNE ,17027640,Wed Dec 22 17:41:02 CET,Wed Dec 22 19:35:01 CET,0.0 1.126 1.408 1.628 1.845 2.034 2.187 2.332 2.595 2.703 2.803 2.939 3.109 3.198 3.361 3.513 3.637 3.694 3.808 3.898 4.03 4.118 4.189 4.291 4.395 4.481 4.543 4.602 4.684 4.75 4.813 4.886 4.942 5.002 5.067 5.132 5.194 5.223 5.262 5.319 5.312 5.319 5.361 5.329 5.141 4.743 4.157 3.462 2.448 0.972 -1.378 -4.404 -6.94 -8.908 -10.486 -11.905 -13.113 -14.152 -15.033 -15.896 -16.6 -17.232 -17.853 -18.412 -18.904 -19.372 -19.895 -20.374 -20.794 -21.188 -21.554 -21.85 -22.138 -22.432 -22.664 -22.908 -23.167 -23.445 -23.733 -23.923 -24.122 -24.464 -24.704 -24.934 -25.048 -25.273 -25.506 -25.731 -25.85 -26.081 -26.253 -26.388 -26.528 -26.836 -26.994 -27.155 -27.331 -27.538 -27.769 -28.03 -28.641 -6 ,7411 ,KEBNE ,17027641,Wed Dec 22 17:41:02 CET,Wed Dec 22 19:33:37 CET,0.0 0.903 1.237 1.556 1.81 1.994 2.134 2.232 2.38 2.467 2.558 2.662 2.812 2.876 3.004 3.159 3.291 3.327 3.386 3.446 3.533 3.59 3.644 3.716 3.773 3.828 3.892 3.957 4.034 4.093 4.132 4.17 4.21 4.241 4.269 4.286 4.299 4.317 4.327 4.325 4.287 4.193 4.079 3.935 3.668 3.281 2.694 1.877 0.727 -1.033 -3.857 -7.073 -9.566 -11.553 -13.156 -14.511 -15.685 -16.725 -17.598 -18.457 -19.183 -19.814 -20.397 -20.94 -21.434 -21.888 -22.378 -22.82 -23.186 -23.552 -23.955 -24.305 -24.665 -25.026 -25.297 -25.579 -25.871 -26.171 -26.487 -26.709 -26.93 -27.276 -27.522 -27.776 -27.911 -28.188 -28.459 -28.744 -28.892 -29.153 -29.387 -29.556 -29.725 -30.079 -30.274 -30.487 -30.711 -30.969 -31.245 -31.601 -32.843 -7 ,26927 ,KEBNE ,17027642,Wed Dec 22 17:41:04 CET,Wed Dec 22 19:33:19 CET,0.0 0.975 1.269 1.489 1.657 1.785 1.903 2.022 2.256 2.351 2.436 2.524 2.671 2.752 2.895 3.03 3.158 3.218 3.337 3.435 3.552 3.643 3.736 3.852 3.957 4.054 4.134 4.208 4.312 4.402 4.483 4.575 4.656 4.745 4.859 4.966 5.058 5.147 5.234 5.307 5.347 5.356 5.281 5.094 4.803 4.401 3.774 2.849 1.552 -0.299 -3.2 -6.509 -9.072 -11.1 -12.761 -14.176 -15.37 -16.409 -17.271 -18.106 -18.807 -19.414 -19.975 -20.495 -20.985 -21.414 -21.856 -22.275 -22.647 -23.031 -23.41 -23.702 -24.007 -24.334 -24.582 -24.827 -25.068 -25.314 -25.57 -25.748 -25.94 -26.223 -26.417 -26.638 -26.746 -26.958 -27.194 -27.443 -27.579 -27.817 -28.014 -28.162 -28.299 -28.595 -28.75 -28.922 -29.134 -29.345 -29.556 -29.861 -30.648 -8 ,11000 ,KEBNE ,17027643,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:32:52 CET,0.0 1.021 1.32 1.484 1.627 1.751 1.847 1.933 2.074 2.151 2.214 2.232 2.348 2.405 2.502 2.591 2.671 2.715 2.807 2.874 2.967 3.047 3.118 3.215 3.294 3.359 3.421 3.47 3.533 3.574 3.587 3.592 3.601 3.615 3.617 3.6 3.602 3.599 3.56 3.495 3.383 3.245 3.094 2.943 2.682 2.256 1.686 0.907 -0.237 -1.956 -4.687 -7.78 -10.24 -12.346 -14.121 -15.641 -16.911 -18.035 -18.985 -19.906 -20.695 -21.378 -22.014 -22.627 -23.201 -23.698 -24.206 -24.658 -25.029 -25.412 -25.817 -26.145 -26.483 -26.83 -27.1 -27.369 -27.635 -27.916 -28.203 -28.395 -28.597 -28.902 -29.11 -29.341 -29.456 -29.678 -29.907 -30.147 -30.271 -30.501 -30.69 -30.844 -31.002 -31.32 -31.493 -31.68 -31.89 -32.141 -32.409 -32.767 -33.959 -9 ,32514 ,KEBNE ,17027644,Wed Dec 22 17:41:02 CET,Wed Dec 22 19:33:56 CET,0.0 0.882 1.091 1.219 1.328 1.42 1.512 1.609 1.766 1.825 1.889 1.96 2.096 2.144 2.237 2.338 2.433 2.469 2.538 2.608 2.693 2.75 2.808 2.871 2.919 2.98 3.04 3.085 3.149 3.204 3.236 3.272 3.3 3.309 3.313 3.33 3.348 3.361 3.354 3.328 3.289 3.217 3.093 2.959 2.812 2.634 2.329 1.796 0.805 -0.895 -3.534 -6.508 -8.935 -10.919 -12.577 -14.019 -15.25 -16.33 -17.23 -18.101 -18.834 -19.473 -20.056 -20.606 -21.14 -21.646 -22.137 -22.537 -22.864 -23.187 -23.539 -23.838 -24.155 -24.471 -24.712 -24.966 -25.216 -25.481 -25.756 -25.953 -26.161 -26.485 -26.694 -26.902 -27.014 -27.243 -27.475 -27.728 -27.857 -28.087 -28.271 -28.42 -28.584 -28.954 -29.152 -29.347 -29.574 -29.794 -30.019 -30.319 -30.995 -10 ,28197 ,KEBNE ,17027645,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:33:15 CET,0.0 0.92 1.258 1.483 1.652 1.806 1.948 2.063 2.242 2.318 2.381 2.431 2.564 2.626 2.75 2.863 2.962 3.005 3.099 3.198 3.31 3.377 3.443 3.518 3.595 3.696 3.79 3.885 4.013 4.104 4.192 4.275 4.339 4.396 4.439 4.493 4.543 4.588 4.609 4.605 4.604 4.599 4.563 4.432 4.134 3.692 3.05 2.146 0.819 -1.093 -3.889 -7.117 -9.792 -11.978 -13.794 -15.347 -16.672 -17.865 -18.886 -19.876 -20.716 -21.456 -22.136 -22.761 -23.333 -23.852 -24.398 -24.87 -25.279 -25.694 -26.095 -26.427 -26.779 -27.144 -27.414 -27.686 -27.971 -28.259 -28.565 -28.772 -28.972 -29.27 -29.477 -29.7 -29.811 -30.035 -30.253 -30.471 -30.587 -30.81 -30.953 -31.084 -31.212 -31.457 -31.614 -31.78 -31.936 -32.095 -32.285 -32.539 -33.346 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_28_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_28_26.txt deleted file mode 100644 index 5c293b2e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_28_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13573 ,TETRA ,17606010,Sun Nov 28 19:51:43 CET,Sun Nov 28 22:08:31 CET,0.0 0.254 0.42 0.571 0.684 0.789 0.888 0.975 1.116 1.167 1.221 1.255 1.363 1.397 1.46 1.528 1.578 1.6 1.648 1.694 1.747 1.776 1.804 1.843 1.882 1.924 1.96 1.985 1.999 2.003 2.019 2.055 2.103 2.152 2.17 2.139 2.085 1.989 1.867 1.728 1.563 1.362 1.079 0.726 0.248 -0.354 -1.149 -2.313 -4.078 -6.559 -10.566 -15.273 -19.119 -22.296 -24.866 -27.024 -28.835 -30.409 -31.723 -32.985 -34.017 -34.918 -35.758 -36.524 -37.209 -37.825 -38.465 -39.016 -39.488 -39.97 -40.455 -40.847 -41.246 -41.654 -41.958 -42.27 -42.592 -42.923 -43.266 -43.496 -43.724 -44.063 -44.295 -44.542 -44.674 -44.945 -45.203 -45.467 -45.61 -45.876 -46.053 -46.196 -46.354 -46.712 -46.89 -47.051 -47.247 -47.485 -47.737 -48.043 -48.756 -2 ,20629 ,TETRA ,17606011,Sun Nov 28 19:51:45 CET,Sun Nov 28 22:08:02 CET,0.0 0.711 0.917 1.082 1.231 1.367 1.489 1.596 1.787 1.869 1.937 2.006 2.154 2.217 2.334 2.434 2.52 2.564 2.641 2.718 2.835 2.901 2.964 3.046 3.111 3.163 3.203 3.238 3.276 3.303 3.325 3.338 3.336 3.338 3.35 3.357 3.358 3.341 3.277 3.202 3.109 2.937 2.684 2.373 1.923 1.357 0.57 -0.498 -2.003 -4.367 -8.323 -12.935 -16.573 -19.538 -22.032 -24.164 -25.946 -27.47 -28.743 -29.984 -30.997 -31.864 -32.655 -33.382 -34.051 -34.647 -35.261 -35.813 -36.289 -36.766 -37.246 -37.644 -38.051 -38.458 -38.764 -39.064 -39.376 -39.701 -40.036 -40.271 -40.513 -40.887 -41.131 -41.372 -41.497 -41.749 -42.002 -42.264 -42.403 -42.66 -42.837 -42.993 -43.159 -43.514 -43.694 -43.878 -44.073 -44.296 -44.532 -44.765 -45.18 -3 ,7776 ,TETRA ,17606012,Sun Nov 28 19:51:41 CET,Sun Nov 28 22:06:50 CET,0.0 0.331 0.511 0.661 0.774 0.872 0.96 1.041 1.181 1.244 1.299 1.338 1.452 1.49 1.556 1.612 1.662 1.687 1.732 1.771 1.83 1.862 1.888 1.935 1.971 1.992 2.007 2.02 2.041 2.047 2.044 2.038 2.019 1.983 1.932 1.887 1.836 1.753 1.633 1.476 1.296 1.044 0.701 0.355 -0.125 -0.77 -1.663 -2.914 -4.723 -7.345 -11.334 -15.664 -19.042 -21.797 -24.128 -26.228 -28.003 -29.548 -30.848 -32.089 -33.127 -34.019 -34.841 -35.576 -36.233 -36.838 -37.456 -38.007 -38.485 -38.963 -39.444 -39.831 -40.222 -40.624 -40.938 -41.264 -41.589 -41.918 -42.263 -42.502 -42.741 -43.115 -43.371 -43.623 -43.744 -43.974 -44.211 -44.451 -44.573 -44.814 -44.97 -45.112 -45.253 -45.57 -45.747 -45.958 -46.179 -46.384 -46.61 -46.858 -47.277 -4 ,6204 ,TETRA ,17606013,Sun Nov 28 19:51:45 CET,Sun Nov 28 22:06:49 CET,0.0 0.482 0.737 0.909 1.037 1.16 1.277 1.37 1.528 1.6 1.667 1.719 1.843 1.892 1.985 2.078 2.163 2.201 2.267 2.323 2.398 2.444 2.481 2.522 2.557 2.586 2.611 2.638 2.674 2.692 2.701 2.722 2.737 2.753 2.747 2.704 2.672 2.627 2.517 2.372 2.217 1.952 1.591 1.225 0.713 0.047 -0.836 -2.041 -3.763 -6.303 -10.395 -15.018 -18.605 -21.487 -23.847 -25.881 -27.647 -29.187 -30.457 -31.707 -32.737 -33.617 -34.44 -35.214 -35.932 -36.567 -37.222 -37.803 -38.288 -38.796 -39.315 -39.734 -40.169 -40.61 -40.937 -41.26 -41.586 -41.931 -42.314 -42.572 -42.819 -43.199 -43.459 -43.738 -43.88 -44.15 -44.434 -44.734 -44.89 -45.175 -45.422 -45.616 -45.789 -46.151 -46.344 -46.547 -46.76 -47.006 -47.273 -47.539 -48.084 -5 ,21353 ,TETRA ,17606014,Sun Nov 28 19:51:41 CET,Sun Nov 28 22:06:35 CET,0.0 0.59 0.778 0.943 1.093 1.223 1.35 1.458 1.654 1.729 1.798 1.865 1.999 2.058 2.171 2.282 2.381 2.431 2.518 2.589 2.68 2.732 2.777 2.842 2.896 2.941 2.973 2.99 3.016 3.041 3.052 3.039 3.023 2.994 2.949 2.874 2.787 2.704 2.598 2.489 2.35 2.115 1.754 1.332 0.77 0.017 -0.997 -2.287 -4.077 -6.61 -10.515 -14.961 -18.423 -21.203 -23.556 -25.532 -27.173 -28.664 -29.901 -31.072 -32.047 -32.903 -33.723 -34.502 -35.198 -35.821 -36.464 -37.016 -37.483 -37.958 -38.445 -38.85 -39.259 -39.682 -40.016 -40.358 -40.707 -41.054 -41.415 -41.667 -41.915 -42.292 -42.553 -42.809 -42.942 -43.218 -43.489 -43.776 -43.936 -44.215 -44.422 -44.601 -44.781 -45.14 -45.328 -45.531 -45.775 -46.024 -46.273 -46.564 -47.348 -6 ,24204 ,TETRA ,17606015,Sun Nov 28 19:51:42 CET,Sun Nov 28 22:05:37 CET,0.0 0.554 0.719 0.867 1.017 1.148 1.263 1.36 1.523 1.599 1.659 1.697 1.817 1.867 1.951 2.023 2.091 2.131 2.198 2.238 2.317 2.371 2.41 2.456 2.504 2.553 2.584 2.62 2.648 2.651 2.658 2.649 2.63 2.603 2.543 2.468 2.406 2.321 2.204 2.058 1.886 1.634 1.278 0.893 0.426 -0.178 -1.062 -2.336 -4.166 -6.726 -10.667 -15.069 -18.455 -21.172 -23.375 -25.197 -26.75 -28.17 -29.397 -30.598 -31.575 -32.392 -33.141 -33.832 -34.457 -35.043 -35.662 -36.202 -36.664 -37.126 -37.599 -37.984 -38.383 -38.803 -39.118 -39.429 -39.753 -40.084 -40.414 -40.629 -40.849 -41.212 -41.445 -41.661 -41.773 -42.022 -42.293 -42.562 -42.693 -42.949 -43.105 -43.242 -43.384 -43.715 -43.89 -44.062 -44.256 -44.471 -44.716 -45.012 -45.519 -7 ,2027 ,TETRA ,17606016,Sun Nov 28 19:51:41 CET,Sun Nov 28 22:07:36 CET,0.0 0.771 1.003 1.156 1.294 1.46 1.603 1.704 1.865 1.936 2.013 2.085 2.214 2.263 2.349 2.425 2.499 2.537 2.607 2.685 2.794 2.854 2.907 2.969 3.013 3.046 3.075 3.095 3.132 3.169 3.179 3.192 3.203 3.2 3.206 3.191 3.162 3.128 3.072 3.01 2.928 2.772 2.509 2.16 1.635 0.944 0.028 -1.266 -3.154 -5.89 -10.247 -14.977 -18.516 -21.369 -23.782 -25.905 -27.652 -29.165 -30.45 -31.705 -32.745 -33.651 -34.493 -35.262 -35.958 -36.58 -37.211 -37.751 -38.21 -38.67 -39.134 -39.524 -39.938 -40.373 -40.7 -41.034 -41.385 -41.737 -42.1 -42.345 -42.588 -42.96 -43.217 -43.479 -43.599 -43.843 -44.1 -44.364 -44.492 -44.734 -44.88 -45.019 -45.159 -45.445 -45.603 -45.779 -45.988 -46.235 -46.459 -46.681 -47.073 -8 ,22940 ,TETRA ,17606017,Sun Nov 28 19:51:43 CET,Sun Nov 28 22:06:59 CET,0.0 0.927 1.169 1.326 1.459 1.583 1.698 1.808 1.997 2.088 2.181 2.258 2.39 2.45 2.569 2.672 2.762 2.803 2.881 2.95 3.027 3.081 3.141 3.224 3.279 3.319 3.367 3.402 3.443 3.479 3.499 3.505 3.528 3.563 3.581 3.562 3.51 3.436 3.323 3.16 2.959 2.703 2.363 1.991 1.545 0.967 0.102 -1.192 -3.074 -5.753 -9.904 -14.476 -18.041 -20.982 -23.418 -25.482 -27.196 -28.665 -29.897 -31.074 -32.041 -32.878 -33.642 -34.364 -35.048 -35.665 -36.28 -36.817 -37.281 -37.752 -38.247 -38.66 -39.077 -39.492 -39.811 -40.134 -40.461 -40.82 -41.19 -41.432 -41.687 -42.087 -42.363 -42.643 -42.778 -43.033 -43.279 -43.536 -43.673 -43.93 -44.104 -44.258 -44.413 -44.733 -44.898 -45.067 -45.244 -45.43 -45.645 -45.878 -46.139 -9 ,7628 ,TETRA ,17606018,Sun Nov 28 19:51:46 CET,Sun Nov 28 22:06:39 CET,0.0 0.291 0.441 0.558 0.657 0.755 0.845 0.921 1.068 1.147 1.207 1.231 1.339 1.378 1.454 1.521 1.586 1.618 1.666 1.704 1.77 1.82 1.866 1.917 1.957 1.987 2.014 2.034 2.05 2.055 2.054 2.066 2.071 2.058 2.031 1.993 1.953 1.924 1.897 1.861 1.759 1.557 1.292 0.972 0.502 -0.119 -0.967 -2.085 -3.706 -6.244 -10.614 -15.604 -19.401 -22.454 -24.902 -26.923 -28.585 -30.035 -31.256 -32.446 -33.424 -34.251 -35.013 -35.726 -36.391 -36.972 -37.561 -38.091 -38.537 -38.99 -39.447 -39.819 -40.196 -40.567 -40.848 -41.133 -41.419 -41.731 -42.041 -42.237 -42.452 -42.783 -43.006 -43.235 -43.348 -43.577 -43.829 -44.103 -44.25 -44.504 -44.663 -44.818 -44.973 -45.294 -45.466 -45.643 -45.841 -46.074 -46.304 -46.518 -46.915 -10 ,17414 ,TETRA ,17606020,Sun Nov 28 19:51:47 CET,Sun Nov 28 22:07:21 CET,0.0 0.476 0.69 0.832 0.937 1.019 1.103 1.169 1.302 1.365 1.426 1.488 1.605 1.644 1.726 1.798 1.856 1.89 1.953 2.008 2.079 2.112 2.146 2.202 2.244 2.27 2.289 2.305 2.333 2.358 2.363 2.365 2.375 2.381 2.37 2.336 2.293 2.227 2.118 1.978 1.827 1.623 1.35 1.037 0.565 -0.107 -1.075 -2.427 -4.273 -6.851 -10.961 -15.473 -18.952 -21.879 -24.275 -26.207 -27.827 -29.301 -30.539 -31.709 -32.669 -33.511 -34.308 -35.037 -35.698 -36.283 -36.866 -37.379 -37.83 -38.293 -38.767 -39.16 -39.564 -39.986 -40.307 -40.627 -40.943 -41.266 -41.613 -41.848 -42.088 -42.467 -42.72 -42.981 -43.116 -43.386 -43.658 -43.94 -44.086 -44.351 -44.556 -44.722 -44.891 -45.24 -45.43 -45.637 -45.854 -46.113 -46.405 -46.722 -47.382 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_29_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_29_25.txt deleted file mode 100644 index 4552333e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_29_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16643 ,TETRA ,17606021,Sun Nov 28 19:51:41 CET,Sun Nov 28 22:05:33 CET,0.0 0.873 1.167 1.388 1.616 1.813 1.973 2.123 2.382 2.506 2.624 2.583 2.892 2.977 3.137 3.29 3.448 3.52 3.667 3.818 4.017 4.143 4.27 4.44 4.592 4.744 4.891 5.039 5.234 5.429 5.626 5.873 6.102 6.302 6.54 6.792 7.016 7.262 7.541 7.831 8.112 8.406 8.721 9.055 9.425 9.736 10.08 10.415 10.549 10.331 9.518 8.372 7.227 6.011 4.94 4.035 3.225 2.487 1.881 1.267 0.71 0.224 -0.228 -0.658 -1.056 -1.423 -1.834 -2.201 -2.512 -2.842 -3.164 -3.417 -3.667 -3.926 -4.137 -4.359 -4.577 -4.788 -5.021 -5.17 -5.304 -5.531 -5.722 -5.951 -6.078 -6.342 -6.595 -6.846 -6.987 -7.395 -7.482 -7.657 -7.841 -8.15 -8.291 -8.456 -8.628 -8.91 -9.338 -9.919 -12.392 -2 ,6560 ,TETRA ,17606022,Sun Nov 28 19:51:43 CET,Sun Nov 28 22:05:17 CET,0.0 0.805 1.204 1.505 1.734 1.936 2.137 2.323 2.623 2.746 2.861 2.842 3.191 3.316 3.547 3.726 3.889 3.967 4.1 4.24 4.474 4.617 4.75 4.922 5.108 5.295 5.453 5.604 5.787 5.949 6.131 6.38 6.596 6.768 6.976 7.244 7.484 7.704 7.907 8.104 8.305 8.567 8.851 9.001 9.069 9.186 9.333 9.215 8.779 8.123 7.128 5.867 4.529 3.161 1.962 0.823 -0.193 -1.052 -1.795 -2.515 -3.149 -3.737 -4.261 -4.801 -5.336 -5.794 -6.275 -6.71 -7.071 -7.456 -7.879 -8.197 -8.542 -8.955 -9.278 -9.603 -9.937 -10.275 -10.618 -10.851 -11.073 -11.435 -11.697 -11.949 -12.09 -12.404 -12.736 -13.079 -13.249 -13.671 -13.794 -13.991 -14.204 -14.652 -14.891 -15.14 -15.449 -15.834 -16.273 -16.919 -20.198 -3 ,26386 ,TETRA ,17606023,Sun Nov 28 19:51:45 CET,Sun Nov 28 22:05:25 CET,0.0 0.569 0.87 1.093 1.297 1.479 1.645 1.786 2.023 2.131 2.245 2.258 2.609 2.725 2.935 3.122 3.305 3.389 3.545 3.678 3.855 3.98 4.094 4.255 4.423 4.577 4.735 4.884 5.061 5.235 5.402 5.61 5.824 6.041 6.281 6.524 6.745 6.97 7.2 7.411 7.617 7.858 8.091 8.298 8.502 8.676 8.856 8.961 8.888 8.557 7.608 6.145 4.871 3.688 2.601 1.614 0.725 -0.083 -0.772 -1.433 -2.014 -2.535 -3.02 -3.51 -3.962 -4.365 -4.76 -5.109 -5.424 -5.729 -6.032 -6.299 -6.576 -6.844 -7.051 -7.274 -7.513 -7.765 -8.011 -8.177 -8.359 -8.635 -8.816 -9.002 -9.102 -9.3 -9.498 -9.735 -9.856 -10.218 -10.216 -10.338 -10.486 -10.809 -11.002 -11.265 -11.54 -11.885 -12.311 -12.844 -15.006 -4 ,27854 ,TETRA ,17606024,Sun Nov 28 19:51:42 CET,Sun Nov 28 22:11:29 CET,0.0 0.809 1.137 1.395 1.598 1.79 1.968 2.114 2.382 2.525 2.663 2.689 3.034 3.139 3.355 3.543 3.699 3.772 3.907 4.043 4.257 4.39 4.525 4.721 4.894 5.056 5.207 5.369 5.601 5.831 6.072 6.331 6.523 6.687 6.864 7.057 7.249 7.46 7.62 7.751 7.92 8.089 8.224 8.342 8.489 8.613 8.666 8.635 8.42 7.852 6.744 5.313 4.0 2.732 1.608 0.653 -0.129 -0.833 -1.445 -2.069 -2.604 -3.065 -3.509 -3.914 -4.309 -4.678 -5.051 -5.377 -5.657 -5.943 -6.263 -6.567 -6.882 -7.21 -7.477 -7.765 -8.063 -8.337 -8.607 -8.807 -9.015 -9.397 -9.691 -9.974 -10.109 -10.362 -10.631 -10.883 -10.994 -11.362 -11.382 -11.563 -11.808 -12.317 -12.592 -12.859 -13.071 -13.291 -13.589 -13.976 -15.501 -5 ,31404 ,TETRA ,17606026,Sun Nov 28 19:51:45 CET,Sun Nov 28 22:10:38 CET,0.0 0.938 1.263 1.547 1.788 1.99 2.146 2.304 2.586 2.71 2.824 2.794 3.145 3.259 3.45 3.618 3.797 3.889 4.053 4.21 4.443 4.589 4.732 4.924 5.103 5.274 5.446 5.601 5.766 5.932 6.087 6.263 6.446 6.659 6.907 7.147 7.368 7.594 7.827 8.061 8.278 8.493 8.714 8.914 9.13 9.327 9.454 9.506 9.448 9.037 8.106 6.461 4.552 2.801 1.214 -0.232 -1.436 -2.508 -3.399 -4.261 -5.038 -5.725 -6.364 -6.975 -7.518 -8.004 -8.534 -8.991 -9.352 -9.737 -10.144 -10.458 -10.778 -11.148 -11.452 -11.78 -12.126 -12.468 -12.81 -13.036 -13.25 -13.574 -13.818 -14.09 -14.233 -14.53 -14.841 -15.15 -15.312 -15.752 -15.904 -16.105 -16.31 -16.746 -16.985 -17.257 -17.564 -17.918 -18.349 -19.054 -22.455 -6 ,11607 ,TETRA ,17606027,Sun Nov 28 19:51:43 CET,Sun Nov 28 22:03:06 CET,0.0 1.914 2.285 2.573 2.815 3.033 3.224 3.383 3.694 3.846 3.983 4.001 4.35 4.459 4.673 4.866 5.046 5.134 5.315 5.496 5.744 5.893 6.034 6.239 6.437 6.624 6.804 6.988 7.256 7.496 7.688 7.925 8.161 8.376 8.63 8.908 9.162 9.44 9.706 9.987 10.288 10.596 10.933 11.268 11.654 12.052 12.447 12.775 12.947 12.904 12.538 11.806 10.988 10.254 9.613 8.981 8.397 7.839 7.34 6.842 6.419 6.023 5.645 5.307 4.977 4.642 4.294 4.008 3.766 3.497 3.189 2.938 2.695 2.453 2.274 2.097 1.908 1.695 1.472 1.33 1.189 0.969 0.807 0.63 0.536 0.341 0.126 -0.108 -0.243 -0.64 -0.75 -0.944 -1.139 -1.569 -1.838 -2.189 -2.588 -3.049 -3.587 -4.336 -7.254 -7 ,2964 ,TETRA ,17606028,Sun Nov 28 19:51:45 CET,Sun Nov 28 22:05:15 CET,0.0 1.318 1.732 1.988 2.195 2.377 2.552 2.702 2.958 3.077 3.187 3.166 3.504 3.612 3.816 3.998 4.184 4.275 4.439 4.587 4.807 4.944 5.072 5.258 5.435 5.613 5.785 5.938 6.134 6.331 6.546 6.825 7.063 7.28 7.545 7.861 8.158 8.462 8.773 9.065 9.361 9.684 10.044 10.38 10.715 11.05 11.385 11.709 11.83 11.356 10.158 8.575 7.102 5.853 4.776 3.78 2.917 2.152 1.469 0.719 0.061 -0.527 -1.105 -1.605 -2.07 -2.464 -2.826 -3.157 -3.433 -3.725 -4.027 -4.264 -4.512 -4.804 -5.032 -5.245 -5.448 -5.664 -5.915 -6.091 -6.27 -6.536 -6.718 -6.918 -7.027 -7.237 -7.454 -7.684 -7.813 -8.207 -8.213 -8.354 -8.512 -8.815 -8.989 -9.199 -9.42 -9.645 -9.967 -10.54 -13.16 -8 ,20905 ,TETRA ,17606029,Sun Nov 28 19:51:44 CET,Sun Nov 28 22:04:59 CET,0.0 1.229 1.628 1.928 2.177 2.406 2.612 2.795 3.125 3.282 3.439 3.482 3.831 3.941 4.161 4.372 4.572 4.662 4.835 5.004 5.256 5.417 5.554 5.758 5.958 6.143 6.313 6.455 6.623 6.8 6.979 7.205 7.438 7.673 7.922 8.168 8.403 8.639 8.851 9.054 9.254 9.464 9.689 9.882 10.101 10.349 10.568 10.699 10.68 10.447 9.692 8.229 6.759 5.457 4.36 3.361 2.379 1.438 0.628 -0.16 -0.812 -1.385 -1.932 -2.452 -2.933 -3.367 -3.85 -4.298 -4.661 -5.026 -5.403 -5.712 -6.034 -6.355 -6.595 -6.847 -7.12 -7.412 -7.701 -7.906 -8.111 -8.429 -8.688 -8.987 -9.139 -9.412 -9.692 -10.022 -10.196 -10.609 -10.724 -10.934 -11.164 -11.702 -11.997 -12.292 -12.604 -12.969 -13.403 -13.924 -15.95 -9 ,29870 ,TETRA ,17606030,Sun Nov 28 19:51:43 CET,Sun Nov 28 22:05:15 CET,0.0 1.017 1.306 1.587 1.822 2.027 2.194 2.331 2.576 2.692 2.822 2.832 3.175 3.282 3.483 3.685 3.873 3.946 4.077 4.221 4.429 4.554 4.673 4.829 4.967 5.108 5.245 5.376 5.524 5.667 5.805 5.953 6.077 6.185 6.317 6.466 6.59 6.7 6.794 6.899 7.012 7.108 7.186 7.227 7.211 7.123 6.956 6.627 6.047 5.14 3.545 1.459 -0.304 -1.804 -3.155 -4.377 -5.399 -6.311 -7.092 -7.857 -8.499 -9.084 -9.634 -10.123 -10.567 -10.982 -11.432 -11.841 -12.194 -12.562 -12.935 -13.24 -13.553 -13.88 -14.134 -14.383 -14.637 -14.905 -15.238 -15.488 -15.727 -16.105 -16.357 -16.595 -16.716 -16.972 -17.235 -17.497 -17.646 -18.048 -18.092 -18.267 -18.472 -18.939 -19.202 -19.457 -19.75 -20.118 -20.56 -21.21 -23.026 -10 ,18098 ,TETRA ,17606031,Sun Nov 28 19:51:45 CET,Sun Nov 28 22:05:22 CET,0.0 1.056 1.416 1.7 1.932 2.138 2.332 2.514 2.843 2.986 3.118 3.134 3.5 3.629 3.855 4.072 4.272 4.361 4.525 4.691 4.944 5.106 5.256 5.466 5.661 5.844 6.001 6.145 6.347 6.553 6.754 6.992 7.212 7.412 7.631 7.885 8.109 8.305 8.488 8.703 8.941 9.188 9.448 9.701 10.001 10.279 10.542 10.707 10.645 10.26 9.125 7.421 5.922 4.597 3.413 2.298 1.377 0.574 -0.151 -0.858 -1.466 -2.006 -2.51 -2.997 -3.455 -3.861 -4.274 -4.644 -4.972 -5.306 -5.642 -5.962 -6.328 -6.665 -6.917 -7.176 -7.429 -7.702 -7.993 -8.208 -8.479 -8.875 -9.127 -9.448 -9.622 -9.947 -10.268 -10.598 -10.764 -11.183 -11.331 -11.524 -11.723 -12.246 -12.519 -12.777 -13.123 -13.487 -13.873 -14.41 -17.279 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_29_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_29_33.txt deleted file mode 100644 index 51714172..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_29_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26814 ,TETRA ,17606032,Sun Nov 28 19:51:44 CET,Sun Nov 28 22:10:03 CET,0.0 0.879 1.228 1.511 1.775 2.032 2.273 2.508 2.966 3.201 3.41 3.527 3.939 4.125 4.465 4.792 5.127 5.295 5.635 5.966 6.459 6.776 7.074 7.518 7.974 8.436 8.893 9.34 9.915 10.476 11.042 11.737 12.407 13.071 13.87 14.805 15.725 16.756 17.904 19.145 20.487 22.071 24.006 26.039 28.532 31.432 34.973 39.281 44.704 51.706 61.16 70.128 76.272 80.76 84.141 86.824 88.909 90.597 91.957 93.232 94.25 95.072 95.782 96.401 96.931 97.385 97.813 98.178 98.48 98.763 99.039 99.261 99.482 99.679 99.82 99.97 100.111 100.241 100.364 100.442 100.524 100.652 100.73 100.798 100.832 100.872 100.89 100.909 100.91 100.772 100.843 100.808 100.795 100.774 100.722 100.614 100.501 100.41 100.289 100.014 98.879 -2 ,20985 ,TETRA ,17606033,Sun Nov 28 19:51:46 CET,Sun Nov 28 22:10:04 CET,0.0 1.041 1.497 1.871 2.192 2.499 2.784 3.047 3.517 3.741 3.962 4.157 4.582 4.764 5.121 5.463 5.793 5.957 6.282 6.615 7.12 7.434 7.736 8.199 8.672 9.149 9.617 10.065 10.631 11.199 11.764 12.482 13.191 13.867 14.69 15.638 16.567 17.651 18.853 20.168 21.628 23.323 25.345 27.432 29.93 32.839 36.414 40.787 46.374 53.631 63.24 72.24 78.351 82.821 86.237 88.928 91.0 92.677 94.023 95.274 96.262 97.072 97.793 98.452 99.022 99.487 99.931 100.316 100.633 100.932 101.233 101.459 101.679 101.896 102.047 102.196 102.357 102.498 102.628 102.724 102.814 102.953 103.03 103.077 103.095 103.136 103.184 103.221 103.23 103.1 103.208 103.206 103.193 103.144 103.096 103.013 102.889 102.744 102.55 102.307 101.51 -3 ,11329 ,TETRA ,17606034,Sun Nov 28 19:52:09 CET,Sun Nov 28 22:09:29 CET,0.0 0.682 0.978 1.239 1.464 1.686 1.935 2.168 2.588 2.802 2.997 3.13 3.534 3.706 4.047 4.375 4.705 4.864 5.187 5.519 6.002 6.306 6.622 7.085 7.519 7.941 8.359 8.785 9.348 9.901 10.444 11.114 11.786 12.447 13.225 14.115 14.985 15.961 17.058 18.268 19.583 21.137 23.01 24.949 27.339 30.16 33.575 37.675 42.821 49.518 58.816 67.895 74.109 78.644 82.113 84.931 87.133 88.851 90.196 91.446 92.422 93.23 93.937 94.562 95.115 95.58 96.014 96.378 96.676 96.965 97.252 97.459 97.635 97.818 97.955 98.086 98.227 98.355 98.463 98.526 98.581 98.634 98.679 98.747 98.767 98.774 98.785 98.802 98.796 98.654 98.746 98.727 98.692 98.575 98.514 98.439 98.321 98.172 97.992 97.755 96.777 -4 ,19615 ,TETRA ,17606035,Sun Nov 28 19:52:09 CET,Sun Nov 28 22:05:34 CET,0.0 1.322 1.729 2.085 2.427 2.74 3.007 3.261 3.751 3.98 4.198 4.375 4.799 4.993 5.362 5.703 6.055 6.238 6.598 6.951 7.471 7.814 8.155 8.645 9.115 9.584 10.056 10.51 11.102 11.707 12.314 13.05 13.761 14.469 15.323 16.304 17.257 18.333 19.532 20.84 22.278 23.964 25.976 28.08 30.655 33.693 37.399 41.861 47.486 54.676 64.504 73.835 80.035 84.616 88.084 90.847 93.043 94.832 96.271 97.6 98.627 99.48 100.246 100.921 101.503 101.985 102.432 102.817 103.145 103.47 103.786 104.026 104.272 104.515 104.683 104.841 105.009 105.177 105.319 105.403 105.492 105.596 105.649 105.677 105.682 105.709 105.726 105.735 105.747 105.612 105.675 105.658 105.647 105.574 105.499 105.412 105.319 105.177 105.003 104.793 103.531 -5 ,13652 ,TETRA ,17606036,Sun Nov 28 19:52:09 CET,Sun Nov 28 22:09:03 CET,0.0 0.989 1.366 1.717 2.032 2.299 2.549 2.791 3.223 3.434 3.637 3.785 4.205 4.397 4.772 5.122 5.463 5.628 5.966 6.314 6.803 7.115 7.417 7.873 8.337 8.795 9.239 9.675 10.259 10.838 11.413 12.127 12.824 13.517 14.336 15.267 16.205 17.262 18.417 19.685 21.062 22.661 24.595 26.632 29.098 31.949 35.431 39.629 44.946 51.804 61.141 70.105 76.223 80.703 84.048 86.731 88.893 90.597 91.928 93.202 94.228 95.065 95.79 96.411 96.952 97.459 97.963 98.355 98.676 98.996 99.302 99.531 99.736 99.921 100.051 100.181 100.292 100.385 100.476 100.531 100.586 100.671 100.714 100.733 100.742 100.783 100.809 100.776 100.75 100.612 100.72 100.704 100.673 100.583 100.518 100.436 100.339 100.196 99.992 99.678 98.425 -6 ,30438 ,TETRA ,17606037,Sun Nov 28 19:52:11 CET,Sun Nov 28 22:08:49 CET,0.0 0.422 0.786 1.127 1.393 1.62 1.835 2.056 2.507 2.716 2.916 3.081 3.501 3.678 4.032 4.384 4.723 4.891 5.212 5.534 6.009 6.302 6.594 7.038 7.471 7.902 8.321 8.751 9.344 9.934 10.516 11.213 11.888 12.554 13.339 14.237 15.125 16.138 17.261 18.485 19.817 21.396 23.338 25.365 27.859 30.763 34.247 38.44 43.788 50.68 59.956 68.814 74.858 79.245 82.533 85.126 87.153 88.838 90.189 91.44 92.426 93.216 93.905 94.494 95.017 95.466 95.893 96.279 96.57 96.831 97.102 97.334 97.568 97.787 97.951 98.118 98.279 98.439 98.58 98.66 98.719 98.773 98.812 98.832 98.831 98.854 98.87 98.855 98.854 98.732 98.834 98.81 98.77 98.684 98.615 98.514 98.389 98.203 97.979 97.68 96.586 -7 ,9227 ,TETRA ,17606038,Sun Nov 28 19:52:09 CET,Sun Nov 28 22:08:03 CET,0.0 0.746 1.135 1.429 1.702 1.963 2.219 2.463 2.911 3.114 3.313 3.472 3.879 4.05 4.397 4.733 5.06 5.229 5.561 5.879 6.337 6.641 6.957 7.437 7.899 8.349 8.801 9.245 9.818 10.382 10.94 11.64 12.333 13.012 13.811 14.734 15.65 16.683 17.837 19.118 20.532 22.171 24.147 26.224 28.767 31.778 35.441 39.856 45.342 52.171 61.466 70.392 76.468 80.914 84.242 86.907 89.088 90.935 92.394 93.738 94.801 95.674 96.447 97.126 97.72 98.237 98.744 99.16 99.5 99.835 100.175 100.456 100.719 100.961 101.147 101.316 101.459 101.596 101.723 101.791 101.838 101.877 101.915 101.983 102.014 102.04 102.012 101.983 101.985 101.855 101.925 101.9 101.872 101.77 101.706 101.644 101.561 101.448 101.269 100.927 100.169 -8 ,28681 ,TETRA ,17606039,Sun Nov 28 19:52:10 CET,Sun Nov 28 22:08:49 CET,0.0 0.884 1.17 1.416 1.673 1.916 2.175 2.416 2.84 3.044 3.242 3.385 3.779 3.957 4.305 4.634 4.954 5.119 5.45 5.761 6.225 6.531 6.83 7.29 7.756 8.207 8.644 9.077 9.642 10.202 10.756 11.438 12.103 12.764 13.552 14.469 15.38 16.424 17.607 18.872 20.224 21.793 23.667 25.647 28.082 30.943 34.47 38.731 44.048 50.883 60.174 69.08 75.284 79.879 83.394 86.195 88.354 90.113 91.518 92.775 93.726 94.464 95.126 95.693 96.149 96.579 97.027 97.418 97.728 98.021 98.306 98.523 98.735 98.943 99.091 99.224 99.336 99.445 99.557 99.627 99.672 99.693 99.72 99.758 99.759 99.752 99.764 99.775 99.773 99.641 99.725 99.694 99.652 99.537 99.469 99.392 99.299 99.162 98.977 98.696 97.987 -9 ,8861 ,TETRA ,17606040,Sun Nov 28 19:52:10 CET,Sun Nov 28 22:04:56 CET,0.0 0.705 1.099 1.423 1.655 1.883 2.112 2.342 2.758 2.952 3.154 3.329 3.738 3.904 4.226 4.566 4.899 5.069 5.404 5.705 6.156 6.468 6.778 7.232 7.688 8.122 8.538 8.962 9.531 10.098 10.653 11.342 12.025 12.67 13.444 14.368 15.286 16.33 17.502 18.769 20.128 21.715 23.653 25.668 28.111 31.015 34.557 38.766 44.059 50.886 60.229 69.099 75.076 79.495 82.891 85.59 87.709 89.411 90.73 92.009 93.072 93.957 94.721 95.371 95.949 96.44 96.929 97.346 97.679 98.013 98.336 98.592 98.842 99.089 99.281 99.463 99.634 99.799 99.959 100.054 100.131 100.221 100.268 100.313 100.334 100.371 100.388 100.388 100.393 100.263 100.367 100.355 100.347 100.318 100.284 100.231 100.157 100.025 99.836 99.597 98.446 -10 ,5222 ,TETRA ,17606041,Sun Nov 28 19:52:10 CET,Sun Nov 28 22:09:02 CET,0.0 0.413 0.795 1.108 1.357 1.585 1.802 2.036 2.456 2.644 2.83 2.947 3.346 3.512 3.847 4.189 4.513 4.671 4.993 5.312 5.796 6.119 6.431 6.877 7.33 7.789 8.236 8.669 9.233 9.804 10.376 11.074 11.769 12.452 13.249 14.18 15.105 16.139 17.29 18.547 19.918 21.524 23.475 25.55 28.098 31.094 34.585 38.628 43.793 50.603 60.116 69.127 75.128 79.542 82.897 85.516 87.587 89.272 90.583 91.822 92.822 93.627 94.325 94.931 95.466 95.939 96.406 96.799 97.099 97.389 97.685 97.928 98.162 98.383 98.546 98.677 98.793 98.909 99.01 99.072 99.136 99.227 99.285 99.339 99.357 99.391 99.424 99.442 99.445 99.308 99.396 99.37 99.337 99.284 99.258 99.194 99.096 98.977 98.761 98.407 97.459 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_30_13.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_30_13.txt deleted file mode 100644 index ace2f526..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_30_13.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8081 ,TETRA ,17606042,Sun Nov 28 19:52:12 CET,Sun Nov 28 22:10:21 CET,0.0 0.911 1.197 1.398 1.584 1.753 1.926 2.098 2.423 2.561 2.676 2.795 3.028 3.128 3.311 3.486 3.654 3.737 3.894 4.043 4.236 4.345 4.455 4.617 4.766 4.9 5.029 5.146 5.286 5.436 5.577 5.75 5.943 6.117 6.268 6.401 6.552 6.729 6.906 7.092 7.281 7.453 7.583 7.687 7.77 7.823 7.853 7.745 7.401 6.754 5.548 3.819 2.204 0.899 -0.212 -1.197 -2.009 -2.733 -3.361 -4.014 -4.567 -5.049 -5.526 -5.974 -6.37 -6.735 -7.117 -7.471 -7.804 -8.142 -8.474 -8.738 -9.012 -9.32 -9.547 -9.77 -10.002 -10.235 -10.481 -10.658 -10.846 -11.126 -11.329 -11.542 -11.65 -11.888 -12.127 -12.372 -12.502 -12.776 -12.947 -13.107 -13.282 -13.697 -13.947 -14.21 -14.515 -14.868 -15.305 -15.977 -20.227 -2 ,9190 ,TETRA ,17606043,Sun Nov 28 19:52:15 CET,Sun Nov 28 22:08:59 CET,0.0 1.022 1.377 1.647 1.907 2.133 2.321 2.496 2.801 2.938 3.07 3.199 3.446 3.555 3.736 3.904 4.063 4.143 4.3 4.446 4.647 4.767 4.881 5.052 5.212 5.362 5.505 5.651 5.839 5.986 6.112 6.266 6.414 6.548 6.674 6.803 6.927 7.061 7.209 7.349 7.503 7.681 7.854 7.988 8.057 8.046 8.033 7.916 7.57 6.921 5.642 3.929 2.499 1.361 0.346 -0.564 -1.369 -2.139 -2.826 -3.533 -4.137 -4.651 -5.131 -5.591 -5.989 -6.359 -6.788 -7.161 -7.493 -7.843 -8.182 -8.456 -8.754 -9.072 -9.295 -9.518 -9.741 -9.951 -10.197 -10.388 -10.594 -10.886 -11.089 -11.327 -11.442 -11.673 -11.941 -12.24 -12.415 -12.737 -12.972 -13.171 -13.381 -13.839 -14.086 -14.359 -14.664 -15.041 -15.528 -16.306 -23.498 -3 ,3042 ,TETRA ,17606044,Sun Nov 28 19:52:17 CET,Sun Nov 28 22:08:15 CET,0.0 1.159 1.551 1.898 2.169 2.39 2.599 2.788 3.113 3.252 3.38 3.514 3.747 3.856 4.063 4.254 4.438 4.524 4.681 4.845 5.075 5.206 5.339 5.536 5.713 5.887 6.044 6.172 6.33 6.484 6.628 6.795 6.947 7.094 7.273 7.446 7.601 7.791 7.987 8.184 8.373 8.569 8.765 8.903 8.989 9.079 9.158 9.077 8.772 8.057 6.676 4.795 3.205 1.83 0.671 -0.306 -1.139 -1.85 -2.479 -3.133 -3.698 -4.227 -4.754 -5.226 -5.628 -6.001 -6.408 -6.758 -7.032 -7.307 -7.605 -7.856 -8.141 -8.452 -8.682 -8.919 -9.166 -9.427 -9.697 -9.877 -10.068 -10.391 -10.608 -10.816 -10.929 -11.179 -11.45 -11.75 -11.913 -12.208 -12.413 -12.572 -12.732 -13.117 -13.351 -13.589 -13.862 -14.207 -14.656 -15.351 -18.085 -4 ,30519 ,TETRA ,17606045,Sun Nov 28 19:52:10 CET,Sun Nov 28 22:07:36 CET,0.0 1.569 1.933 2.24 2.503 2.738 2.949 3.112 3.408 3.543 3.663 3.763 3.983 4.077 4.29 4.492 4.646 4.715 4.854 4.996 5.201 5.324 5.444 5.606 5.759 5.916 6.051 6.182 6.347 6.493 6.631 6.791 6.954 7.114 7.277 7.458 7.648 7.837 8.012 8.185 8.366 8.564 8.781 8.978 9.145 9.23 9.25 9.161 8.87 8.324 7.202 5.793 4.588 3.484 2.514 1.608 0.819 0.104 -0.524 -1.146 -1.662 -2.175 -2.661 -3.055 -3.439 -3.794 -4.145 -4.488 -4.797 -5.088 -5.381 -5.625 -5.912 -6.243 -6.493 -6.741 -7.008 -7.316 -7.641 -7.853 -8.069 -8.417 -8.681 -8.955 -9.08 -9.328 -9.64 -10.023 -10.223 -10.551 -10.812 -11.011 -11.231 -11.736 -12.018 -12.352 -12.753 -13.25 -13.873 -14.641 -18.673 -5 ,12425 ,TETRA ,17606046,Sun Nov 28 19:52:12 CET,Sun Nov 28 22:07:30 CET,0.0 1.054 1.356 1.618 1.872 2.087 2.287 2.47 2.799 2.952 3.09 3.221 3.458 3.554 3.743 3.936 4.102 4.18 4.333 4.48 4.696 4.84 4.987 5.196 5.36 5.492 5.631 5.762 5.922 6.087 6.232 6.373 6.5 6.625 6.763 6.899 7.039 7.202 7.353 7.523 7.693 7.855 8.024 8.176 8.293 8.362 8.379 8.269 7.928 7.252 5.984 4.31 2.851 1.564 0.498 -0.459 -1.295 -2.015 -2.619 -3.219 -3.719 -4.164 -4.63 -5.1 -5.534 -5.901 -6.304 -6.667 -6.965 -7.269 -7.583 -7.861 -8.144 -8.435 -8.658 -8.894 -9.166 -9.45 -9.726 -9.931 -10.147 -10.46 -10.683 -10.913 -11.027 -11.273 -11.54 -11.846 -12.022 -12.33 -12.562 -12.75 -12.935 -13.387 -13.666 -14.036 -14.488 -14.996 -15.687 -16.748 -23.81 -6 ,2378 ,TETRA ,17606047,Sun Nov 28 19:52:14 CET,Sun Nov 28 22:07:51 CET,0.0 0.983 1.365 1.644 1.859 2.05 2.206 2.345 2.604 2.721 2.834 2.917 3.12 3.206 3.374 3.529 3.667 3.737 3.872 4.01 4.207 4.321 4.428 4.567 4.687 4.82 4.963 5.102 5.268 5.419 5.554 5.711 5.866 6.008 6.163 6.328 6.486 6.646 6.8 6.96 7.088 7.197 7.321 7.399 7.409 7.363 7.31 7.214 6.896 6.346 5.421 3.992 2.651 1.431 0.263 -0.771 -1.64 -2.422 -3.081 -3.746 -4.331 -4.82 -5.239 -5.635 -6.008 -6.372 -6.782 -7.15 -7.457 -7.766 -8.085 -8.349 -8.631 -8.951 -9.211 -9.477 -9.74 -10.002 -10.276 -10.474 -10.68 -10.996 -11.221 -11.461 -11.58 -11.82 -12.068 -12.325 -12.48 -12.769 -12.968 -13.164 -13.383 -13.84 -14.098 -14.371 -14.637 -14.981 -15.434 -16.089 -22.085 -8 ,5020 ,TETRA ,17606049,Sun Nov 28 19:52:12 CET,Sun Nov 28 22:06:53 CET,0.0 1.173 1.535 1.783 1.993 2.167 2.344 2.525 2.859 3.003 3.133 3.267 3.508 3.62 3.825 3.999 4.165 4.245 4.403 4.555 4.762 4.888 5.007 5.202 5.397 5.569 5.714 5.854 6.055 6.244 6.403 6.591 6.766 6.909 7.061 7.232 7.405 7.59 7.78 7.976 8.151 8.353 8.573 8.755 8.952 9.123 9.203 9.179 9.043 8.635 7.608 6.164 4.883 3.736 2.769 1.857 1.022 0.282 -0.323 -0.916 -1.441 -1.923 -2.384 -2.838 -3.292 -3.704 -4.129 -4.5 -4.804 -5.125 -5.485 -5.783 -6.122 -6.489 -6.761 -7.044 -7.325 -7.622 -7.968 -8.206 -8.423 -8.786 -9.067 -9.37 -9.529 -9.828 -10.122 -10.467 -10.649 -10.959 -11.197 -11.389 -11.609 -12.161 -12.515 -12.875 -13.222 -13.634 -14.192 -14.992 -19.865 -9 ,14297 ,TETRA ,17606050,Sun Nov 28 19:52:12 CET,Sun Nov 28 22:08:19 CET,0.0 1.675 2.072 2.321 2.535 2.716 2.896 3.053 3.312 3.441 3.565 3.667 3.879 3.976 4.174 4.356 4.526 4.608 4.75 4.874 5.086 5.229 5.347 5.517 5.694 5.865 6.024 6.173 6.348 6.493 6.631 6.828 7.024 7.203 7.409 7.631 7.838 8.035 8.206 8.347 8.465 8.597 8.765 8.923 8.999 8.967 8.923 8.87 8.578 7.977 6.818 5.158 3.659 2.371 1.244 0.21 -0.636 -1.392 -2.062 -2.725 -3.272 -3.771 -4.258 -4.714 -5.118 -5.486 -5.907 -6.282 -6.611 -6.977 -7.345 -7.63 -7.932 -8.234 -8.455 -8.681 -8.902 -9.134 -9.398 -9.581 -9.773 -10.093 -10.309 -10.534 -10.66 -10.944 -11.234 -11.518 -11.669 -11.947 -12.116 -12.3 -12.569 -13.215 -13.577 -13.951 -14.288 -14.676 -15.232 -16.134 -19.738 -10 ,19463 ,TETRA ,17606051,Sun Nov 28 19:52:12 CET,Sun Nov 28 22:07:45 CET,0.0 1.32 1.761 2.073 2.306 2.51 2.688 2.852 3.161 3.307 3.443 3.556 3.786 3.895 4.102 4.291 4.458 4.544 4.705 4.843 5.034 5.166 5.296 5.465 5.628 5.773 5.921 6.069 6.237 6.397 6.561 6.755 6.926 7.084 7.268 7.456 7.631 7.827 8.024 8.243 8.472 8.7 8.925 9.112 9.238 9.243 9.208 9.151 8.928 8.382 7.133 5.342 3.81 2.527 1.418 0.389 -0.574 -1.43 -2.14 -2.86 -3.476 -3.997 -4.48 -4.912 -5.301 -5.676 -6.106 -6.494 -6.811 -7.152 -7.522 -7.819 -8.099 -8.38 -8.619 -8.862 -9.101 -9.353 -9.608 -9.787 -9.982 -10.295 -10.507 -10.732 -10.848 -11.094 -11.351 -11.6 -11.735 -12.005 -12.167 -12.343 -12.527 -12.928 -13.174 -13.486 -13.883 -14.389 -14.949 -15.578 -19.144 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_30_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_30_35.txt deleted file mode 100644 index 77437251..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_30_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23603 ,TETRA ,17606053,Sun Nov 28 19:52:15 CET,Sun Nov 28 22:08:04 CET,0.0 0.469 0.676 0.824 0.958 1.092 1.234 1.361 1.59 1.7 1.806 1.896 2.114 2.21 2.38 2.535 2.682 2.753 2.897 3.051 3.289 3.441 3.583 3.792 3.991 4.179 4.362 4.542 4.767 4.984 5.2 5.471 5.738 5.994 6.286 6.619 6.937 7.28 7.65 8.044 8.466 8.957 9.551 10.144 10.838 11.634 12.558 13.562 14.662 15.907 17.424 18.627 19.239 19.501 19.606 19.581 19.471 19.407 19.338 19.229 19.124 19.007 18.879 18.742 18.61 18.493 18.365 18.258 18.155 18.021 17.862 17.733 17.598 17.468 17.381 17.282 17.159 17.024 16.883 16.78 16.666 16.493 16.377 16.257 16.195 16.053 15.893 15.711 15.618 15.413 15.286 15.178 15.063 14.796 14.655 14.497 14.301 14.061 13.757 13.34 12.296 -2 ,7074 ,TETRA ,17606054,Sun Nov 28 19:52:12 CET,Sun Nov 28 22:13:07 CET,0.0 0.266 0.451 0.619 0.774 0.913 1.04 1.163 1.396 1.504 1.613 1.739 1.96 2.045 2.22 2.388 2.544 2.624 2.773 2.918 3.124 3.249 3.371 3.554 3.747 3.943 4.135 4.315 4.543 4.749 4.95 5.217 5.479 5.729 6.024 6.368 6.695 7.05 7.452 7.883 8.347 8.868 9.464 10.051 10.73 11.489 12.323 13.243 14.355 15.779 17.459 18.724 19.413 19.749 19.888 19.904 19.876 19.867 19.847 19.768 19.645 19.517 19.384 19.239 19.106 18.971 18.794 18.615 18.478 18.352 18.199 18.06 17.913 17.771 17.656 17.517 17.375 17.236 17.091 16.98 16.868 16.709 16.59 16.441 16.364 16.219 16.069 15.91 15.828 15.634 15.527 15.399 15.269 15.007 14.851 14.677 14.507 14.319 14.051 13.717 12.865 -3 ,17954 ,TETRA ,17606055,Sun Nov 28 19:52:15 CET,Sun Nov 28 22:13:07 CET,0.0 0.358 0.566 0.752 0.924 1.088 1.229 1.356 1.603 1.714 1.82 1.902 2.132 2.242 2.427 2.596 2.777 2.857 3.005 3.161 3.372 3.502 3.647 3.861 4.067 4.266 4.446 4.63 4.871 5.098 5.321 5.588 5.84 6.078 6.352 6.666 6.979 7.33 7.716 8.128 8.561 9.07 9.679 10.273 10.948 11.701 12.623 13.661 14.8 16.183 17.813 19.09 19.801 20.099 20.168 20.192 20.163 20.073 19.928 19.743 19.556 19.359 19.175 19.002 18.837 18.667 18.478 18.311 18.174 18.032 17.862 17.722 17.586 17.431 17.299 17.154 17.001 16.841 16.676 16.572 16.468 16.307 16.184 16.04 15.969 15.83 15.661 15.473 15.373 15.164 15.072 14.96 14.837 14.556 14.39 14.194 13.975 13.735 13.437 13.032 12.014 -4 ,25965 ,TETRA ,17606056,Sun Nov 28 19:52:12 CET,Sun Nov 28 22:07:50 CET,0.0 0.38 0.601 0.793 0.955 1.102 1.219 1.321 1.55 1.67 1.788 1.872 2.079 2.169 2.357 2.543 2.715 2.799 2.961 3.1 3.3 3.428 3.549 3.733 3.924 4.117 4.297 4.47 4.693 4.903 5.117 5.376 5.612 5.846 6.132 6.439 6.727 7.042 7.394 7.787 8.21 8.669 9.192 9.731 10.342 11.018 11.85 12.833 14.008 15.384 16.911 17.862 18.143 18.246 18.253 18.184 18.042 17.8 17.555 17.287 17.032 16.806 16.589 16.389 16.202 16.044 15.881 15.709 15.564 15.397 15.216 15.082 14.924 14.756 14.635 14.505 14.366 14.196 14.009 13.903 13.793 13.598 13.453 13.295 13.214 13.042 12.863 12.682 12.585 12.379 12.248 12.116 11.979 11.704 11.552 11.369 11.18 10.959 10.668 10.253 9.254 -5 ,3471 ,TETRA ,17606057,Sun Nov 28 19:52:14 CET,Sun Nov 28 22:06:36 CET,0.0 0.932 1.238 1.416 1.568 1.725 1.877 2.03 2.323 2.451 2.567 2.644 2.875 2.987 3.185 3.366 3.537 3.619 3.777 3.934 4.163 4.319 4.468 4.667 4.873 5.073 5.25 5.435 5.696 5.95 6.195 6.475 6.72 6.953 7.232 7.55 7.855 8.199 8.573 8.973 9.4 9.88 10.449 11.032 11.728 12.503 13.392 14.428 15.626 16.916 18.472 19.75 20.295 20.529 20.632 20.667 20.673 20.609 20.438 20.179 19.924 19.729 19.575 19.435 19.294 19.142 18.99 18.857 18.735 18.59 18.402 18.263 18.13 17.971 17.845 17.716 17.576 17.428 17.282 17.189 17.096 16.929 16.805 16.674 16.607 16.466 16.303 16.117 16.022 15.819 15.695 15.581 15.459 15.198 15.054 14.86 14.633 14.399 14.112 13.693 12.597 -6 ,16599 ,TETRA ,17606058,Sun Nov 28 19:52:13 CET,Sun Nov 28 22:10:37 CET,0.0 0.496 0.796 0.984 1.164 1.331 1.473 1.619 1.858 1.956 2.044 2.094 2.31 2.404 2.574 2.75 2.921 3.003 3.168 3.33 3.555 3.696 3.837 4.044 4.239 4.415 4.588 4.75 4.96 5.169 5.377 5.636 5.885 6.133 6.423 6.747 7.055 7.407 7.8 8.21 8.648 9.166 9.771 10.35 11.012 11.745 12.595 13.568 14.764 16.131 17.611 18.759 19.344 19.529 19.541 19.481 19.352 19.225 19.114 18.965 18.801 18.662 18.521 18.353 18.178 18.035 17.881 17.72 17.564 17.405 17.247 17.1 16.946 16.777 16.633 16.495 16.357 16.208 16.06 15.936 15.803 15.612 15.46 15.31 15.24 15.096 14.947 14.766 14.667 14.457 14.359 14.241 14.117 13.828 13.66 13.484 13.288 13.066 12.818 12.486 11.59 -7 ,16730 ,TETRA ,17606059,Sun Nov 28 19:52:17 CET,Sun Nov 28 22:10:50 CET,0.0 0.395 0.644 0.86 1.029 1.162 1.304 1.443 1.691 1.796 1.888 1.957 2.184 2.286 2.474 2.651 2.815 2.894 3.061 3.212 3.417 3.557 3.694 3.892 4.094 4.284 4.447 4.6 4.796 5.003 5.216 5.479 5.737 5.976 6.258 6.601 6.932 7.277 7.62 7.982 8.368 8.808 9.351 9.912 10.559 11.291 12.155 13.113 14.203 15.403 16.789 17.905 18.413 18.513 18.424 18.344 18.216 18.065 17.921 17.713 17.49 17.272 17.08 16.911 16.748 16.602 16.458 16.3 16.146 15.98 15.783 15.632 15.501 15.359 15.23 15.089 14.943 14.783 14.604 14.478 14.349 14.129 13.962 13.802 13.722 13.549 13.389 13.225 13.135 12.928 12.793 12.666 12.535 12.267 12.112 11.947 11.763 11.567 11.32 10.9 9.358 -8 ,15675 ,TETRA ,17606060,Sun Nov 28 19:52:14 CET,Sun Nov 28 22:08:25 CET,0.0 0.493 0.678 0.836 0.989 1.131 1.25 1.391 1.695 1.818 1.921 1.985 2.196 2.292 2.482 2.662 2.824 2.911 3.099 3.273 3.52 3.679 3.832 4.058 4.267 4.465 4.66 4.84 5.078 5.313 5.53 5.789 6.047 6.299 6.579 6.916 7.249 7.608 7.996 8.412 8.839 9.324 9.892 10.464 11.167 11.959 12.865 13.884 15.054 16.437 18.142 19.447 19.981 20.198 20.361 20.373 20.241 20.096 19.987 19.833 19.642 19.461 19.268 19.081 18.906 18.729 18.51 18.293 18.126 17.973 17.81 17.668 17.517 17.36 17.228 17.1 16.967 16.807 16.633 16.51 16.381 16.164 16.008 15.834 15.739 15.545 15.357 15.158 15.049 14.832 14.69 14.564 14.441 14.165 14.0 13.805 13.577 13.316 13.024 12.654 11.649 -9 ,19326 ,TETRA ,17606061,Sun Nov 28 19:52:15 CET,Sun Nov 28 22:07:57 CET,0.0 0.432 0.638 0.786 0.912 1.045 1.202 1.338 1.562 1.665 1.763 1.837 2.06 2.173 2.389 2.579 2.738 2.809 2.952 3.096 3.299 3.428 3.562 3.748 3.916 4.086 4.265 4.434 4.644 4.843 5.038 5.286 5.529 5.761 6.035 6.343 6.65 6.994 7.354 7.745 8.164 8.649 9.204 9.766 10.454 11.241 12.149 13.163 14.288 15.586 17.141 18.355 18.982 19.306 19.462 19.532 19.464 19.326 19.222 19.056 18.87 18.718 18.599 18.509 18.396 18.256 18.091 17.932 17.784 17.616 17.435 17.275 17.103 16.926 16.783 16.635 16.492 16.347 16.208 16.103 15.976 15.791 15.665 15.519 15.443 15.281 15.104 14.917 14.819 14.601 14.449 14.325 14.191 13.87 13.695 13.509 13.294 13.049 12.777 12.435 11.49 -10 ,28320 ,TETRA ,17606062,Sun Nov 28 19:52:13 CET,Sun Nov 28 22:07:24 CET,0.0 0.349 0.597 0.829 1.025 1.181 1.332 1.482 1.733 1.84 1.953 2.034 2.243 2.329 2.497 2.673 2.837 2.917 3.079 3.233 3.444 3.578 3.712 3.92 4.138 4.326 4.486 4.652 4.872 5.087 5.306 5.571 5.814 6.052 6.328 6.622 6.922 7.273 7.651 8.068 8.495 8.962 9.534 10.117 10.78 11.489 12.331 13.333 14.515 15.948 17.666 18.873 19.432 19.685 19.69 19.665 19.666 19.569 19.433 19.279 19.133 18.982 18.839 18.701 18.579 18.502 18.409 18.291 18.18 18.064 17.927 17.814 17.704 17.567 17.467 17.36 17.237 17.106 16.948 16.827 16.702 16.515 16.386 16.242 16.169 16.036 15.872 15.694 15.604 15.4 15.297 15.183 15.073 14.806 14.648 14.461 14.258 14.052 13.775 13.378 12.488 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_30_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_30_37.txt deleted file mode 100644 index 4d4a7756..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_30_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3666 ,TETRA ,17606063,Sun Nov 28 19:52:15 CET,Sun Nov 28 22:09:09 CET,0.0 0.637 0.946 1.153 1.342 1.512 1.667 1.808 2.046 2.157 2.257 2.325 2.552 2.659 2.86 3.039 3.201 3.279 3.438 3.589 3.796 3.931 4.063 4.246 4.409 4.572 4.732 4.892 5.106 5.313 5.497 5.703 5.915 6.118 6.334 6.575 6.819 7.091 7.369 7.644 7.943 8.288 8.681 9.093 9.565 10.065 10.658 11.317 12.03 12.789 13.524 13.938 13.995 13.902 13.739 13.523 13.292 13.042 12.812 12.56 12.338 12.141 11.947 11.775 11.618 11.451 11.271 11.123 10.993 10.85 10.695 10.579 10.452 10.294 10.159 10.018 9.89 9.762 9.631 9.532 9.421 9.245 9.114 8.985 8.921 8.795 8.664 8.527 8.453 8.264 8.168 8.049 7.925 7.645 7.5 7.369 7.235 7.078 6.861 6.531 5.882 -2 ,6562 ,TETRA ,17606064,Sun Nov 28 19:52:18 CET,Sun Nov 28 22:07:37 CET,0.0 0.673 0.948 1.188 1.395 1.566 1.721 1.868 2.145 2.257 2.355 2.448 2.677 2.78 2.972 3.153 3.314 3.392 3.55 3.705 3.922 4.059 4.199 4.397 4.567 4.711 4.857 5.018 5.218 5.409 5.596 5.822 6.047 6.258 6.513 6.805 7.071 7.357 7.633 7.903 8.191 8.521 8.903 9.268 9.671 10.093 10.57 11.125 11.758 12.434 13.203 13.649 13.771 13.803 13.712 13.561 13.393 13.217 13.048 12.864 12.7 12.535 12.363 12.197 12.046 11.901 11.719 11.556 11.417 11.259 11.097 10.976 10.85 10.71 10.599 10.471 10.328 10.175 10.018 9.921 9.824 9.669 9.567 9.457 9.396 9.245 9.076 8.908 8.822 8.621 8.536 8.434 8.332 8.097 7.969 7.831 7.662 7.472 7.272 7.035 6.613 -3 ,25689 ,TETRA ,17606065,Sun Nov 28 19:52:13 CET,Sun Nov 28 22:09:08 CET,0.0 0.767 1.051 1.277 1.471 1.646 1.812 1.966 2.217 2.34 2.469 2.567 2.779 2.871 3.05 3.227 3.399 3.474 3.623 3.78 3.977 4.105 4.232 4.4 4.572 4.727 4.877 5.026 5.216 5.417 5.612 5.828 6.032 6.22 6.432 6.68 6.907 7.152 7.431 7.739 8.042 8.367 8.739 9.102 9.508 9.927 10.384 10.896 11.443 12.047 12.734 13.147 13.272 13.216 13.05 12.844 12.661 12.489 12.282 12.073 11.911 11.742 11.561 11.383 11.223 11.08 10.913 10.749 10.608 10.458 10.297 10.169 10.037 9.892 9.775 9.654 9.533 9.4 9.265 9.164 9.06 8.901 8.783 8.664 8.596 8.445 8.288 8.108 8.01 7.809 7.709 7.59 7.454 7.155 6.993 6.804 6.599 6.379 6.092 5.701 4.66 -4 ,18047 ,TETRA ,17606066,Sun Nov 28 19:52:15 CET,Sun Nov 28 22:09:22 CET,0.0 0.793 1.094 1.314 1.52 1.696 1.843 2.01 2.313 2.433 2.555 2.652 2.864 2.946 3.118 3.29 3.449 3.524 3.67 3.818 4.028 4.169 4.314 4.51 4.687 4.857 5.023 5.18 5.379 5.564 5.742 5.965 6.173 6.369 6.603 6.868 7.116 7.388 7.691 8.025 8.368 8.75 9.198 9.654 10.205 10.793 11.451 12.132 12.894 13.694 14.333 14.664 14.704 14.597 14.412 14.215 14.018 13.795 13.547 13.307 13.127 12.961 12.794 12.625 12.453 12.281 12.109 11.967 11.846 11.705 11.532 11.398 11.253 11.084 10.964 10.85 10.741 10.622 10.491 10.401 10.294 10.126 10.003 9.871 9.808 9.685 9.545 9.393 9.317 9.12 9.041 8.929 8.806 8.54 8.393 8.239 8.079 7.885 7.654 7.371 6.516 -5 ,6861 ,TETRA ,17606067,Sun Nov 28 19:52:40 CET,Sun Nov 28 22:09:42 CET,0.0 0.747 1.087 1.364 1.597 1.785 1.964 2.121 2.364 2.478 2.58 2.644 2.862 2.958 3.127 3.293 3.474 3.559 3.718 3.875 4.083 4.211 4.335 4.53 4.737 4.922 5.094 5.268 5.473 5.654 5.826 6.033 6.228 6.411 6.633 6.902 7.169 7.433 7.69 7.986 8.335 8.688 9.032 9.377 9.801 10.259 10.738 11.259 11.842 12.523 13.239 13.632 13.72 13.654 13.528 13.375 13.217 13.056 12.9 12.737 12.566 12.39 12.232 12.067 11.888 11.724 11.56 11.42 11.29 11.152 11.024 10.904 10.768 10.638 10.538 10.42 10.286 10.139 9.978 9.87 9.762 9.585 9.457 9.32 9.249 9.117 8.984 8.841 8.766 8.579 8.526 8.429 8.319 8.089 7.966 7.825 7.66 7.469 7.259 6.997 6.377 -6 ,26709 ,TETRA ,17606068,Sun Nov 28 19:52:41 CET,Sun Nov 28 22:09:02 CET,0.0 0.56 0.83 1.086 1.279 1.438 1.601 1.763 2.057 2.189 2.309 2.411 2.634 2.735 2.922 3.086 3.242 3.321 3.479 3.631 3.848 3.986 4.117 4.313 4.505 4.692 4.871 5.038 5.249 5.452 5.645 5.875 6.106 6.319 6.562 6.834 7.091 7.38 7.693 8.02 8.346 8.731 9.186 9.613 10.051 10.511 11.067 11.678 12.419 13.283 14.061 14.415 14.491 14.344 14.122 13.886 13.646 13.407 13.17 12.95 12.778 12.61 12.424 12.228 12.052 11.895 11.736 11.58 11.435 11.288 11.125 10.988 10.845 10.703 10.587 10.464 10.342 10.217 10.082 9.971 9.856 9.693 9.581 9.466 9.402 9.263 9.126 8.968 8.887 8.693 8.616 8.525 8.429 8.208 8.089 7.959 7.807 7.631 7.395 7.071 6.303 -7 ,13748 ,TETRA ,17606069,Sun Nov 28 19:52:40 CET,Sun Nov 28 21:54:45 CET,0.0 0.945 1.322 1.586 1.781 1.947 2.108 2.248 2.496 2.608 2.711 2.794 3.016 3.11 3.29 3.465 3.636 3.719 3.867 4.012 4.217 4.345 4.47 4.649 4.839 5.022 5.19 5.347 5.53 5.704 5.883 6.104 6.306 6.484 6.685 6.912 7.141 7.417 7.711 8.018 8.35 8.717 9.126 9.505 9.938 10.407 10.89 11.414 12.041 12.735 13.433 13.821 13.881 13.839 13.696 13.472 13.272 13.088 12.888 12.662 12.462 12.291 12.118 11.945 11.761 11.573 11.396 11.251 11.115 10.968 10.816 10.675 10.527 10.384 10.264 10.142 10.015 9.877 9.739 9.637 9.515 9.315 9.197 9.076 9.011 8.889 8.742 8.572 8.486 8.288 8.197 8.093 7.991 7.76 7.625 7.449 7.253 7.057 6.794 6.443 5.718 -8 ,29232 ,TETRA ,17606070,Sun Nov 28 19:52:40 CET,Sun Nov 28 22:09:45 CET,0.0 1.049 1.418 1.672 1.881 2.067 2.226 2.37 2.631 2.755 2.876 2.993 3.222 3.325 3.517 3.697 3.884 3.971 4.131 4.281 4.482 4.607 4.737 4.931 5.121 5.299 5.463 5.614 5.804 5.991 6.163 6.354 6.531 6.72 6.944 7.187 7.421 7.665 7.923 8.212 8.526 8.852 9.205 9.571 9.976 10.419 10.925 11.467 12.101 12.796 13.56 14.102 14.233 14.213 14.095 13.908 13.718 13.52 13.344 13.148 12.949 12.76 12.579 12.406 12.221 12.049 11.892 11.748 11.609 11.466 11.325 11.187 11.036 10.885 10.765 10.637 10.507 10.368 10.22 10.121 10.013 9.85 9.738 9.618 9.556 9.423 9.279 9.1 9.011 8.814 8.734 8.642 8.531 8.279 8.145 7.994 7.836 7.662 7.439 7.137 6.544 -9 ,7929 ,TETRA ,17606071,Sun Nov 28 19:52:41 CET,Sun Nov 28 22:09:31 CET,0.0 0.631 0.908 1.139 1.334 1.5 1.66 1.809 2.068 2.181 2.296 2.409 2.633 2.737 2.926 3.108 3.285 3.368 3.527 3.677 3.884 4.012 4.152 4.349 4.536 4.722 4.882 5.039 5.256 5.461 5.649 5.865 6.069 6.28 6.522 6.79 7.059 7.354 7.669 7.995 8.34 8.721 9.131 9.55 10.044 10.601 11.188 11.774 12.491 13.286 14.083 14.602 14.758 14.771 14.685 14.506 14.355 14.231 14.106 13.932 13.757 13.595 13.433 13.282 13.147 13.014 12.849 12.7 12.575 12.425 12.266 12.152 12.021 11.864 11.744 11.626 11.512 11.387 11.245 11.154 11.066 10.915 10.797 10.666 10.598 10.465 10.322 10.153 10.069 9.879 9.807 9.707 9.614 9.4 9.266 9.125 8.959 8.763 8.539 8.217 7.502 -10 ,5564 ,TETRA ,17606072,Sun Nov 28 19:52:42 CET,Sun Nov 28 22:09:19 CET,0.0 0.627 0.934 1.171 1.362 1.537 1.685 1.833 2.098 2.214 2.332 2.438 2.654 2.756 2.963 3.15 3.317 3.399 3.559 3.704 3.913 4.044 4.16 4.321 4.476 4.621 4.766 4.922 5.121 5.299 5.461 5.661 5.86 6.053 6.296 6.56 6.802 7.065 7.348 7.646 7.942 8.277 8.667 9.045 9.471 9.953 10.541 11.26 12.082 12.859 13.54 13.836 13.811 13.702 13.534 13.293 13.079 12.878 12.677 12.465 12.27 12.074 11.86 11.64 11.42 11.23 11.063 10.903 10.755 10.597 10.42 10.271 10.113 9.959 9.845 9.73 9.616 9.487 9.333 9.228 9.119 8.933 8.806 8.676 8.608 8.473 8.323 8.152 8.066 7.868 7.772 7.662 7.56 7.333 7.206 7.07 6.917 6.74 6.542 6.3 5.6 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_30_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_30_42.txt deleted file mode 100644 index 60f37ef4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_30_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1855 ,TETRA ,17606073,Sun Nov 28 19:52:45 CET,Sun Nov 28 22:08:00 CET,0.0 1.184 1.529 1.822 2.078 2.284 2.448 2.617 2.939 3.076 3.204 3.314 3.55 3.658 3.846 4.035 4.21 4.296 4.465 4.639 4.894 5.049 5.192 5.404 5.621 5.829 6.022 6.208 6.461 6.702 6.941 7.229 7.506 7.775 8.068 8.395 8.712 9.08 9.486 9.909 10.346 10.832 11.437 12.047 12.703 13.401 14.227 15.273 16.558 17.911 19.353 20.502 21.074 21.352 21.463 21.498 21.441 21.332 21.245 21.106 20.964 20.85 20.715 20.571 20.398 20.199 19.995 19.821 19.695 19.569 19.416 19.294 19.16 19.017 18.893 18.746 18.575 18.408 18.228 18.095 17.959 17.733 17.572 17.408 17.328 17.142 16.922 16.66 16.522 16.29 16.12 15.966 15.785 15.405 15.213 14.977 14.722 14.459 14.075 13.582 11.073 -2 ,18261 ,TETRA ,17606074,Sun Nov 28 19:52:40 CET,Sun Nov 28 22:08:29 CET,0.0 1.191 1.544 1.815 2.032 2.207 2.383 2.572 2.894 3.032 3.169 3.318 3.572 3.704 3.961 4.187 4.397 4.504 4.699 4.867 5.116 5.284 5.445 5.67 5.885 6.091 6.293 6.493 6.754 7.007 7.254 7.568 7.852 8.11 8.456 8.863 9.252 9.676 10.111 10.594 11.112 11.679 12.35 13.051 13.854 14.666 15.57 16.708 18.001 19.282 20.743 21.806 22.272 22.371 22.236 22.067 21.923 21.772 21.608 21.441 21.226 20.974 20.714 20.435 20.201 20.017 19.821 19.641 19.475 19.309 19.133 18.979 18.816 18.629 18.477 18.322 18.149 17.958 17.757 17.615 17.473 17.255 17.095 16.934 16.847 16.651 16.463 16.285 16.182 15.969 15.835 15.705 15.58 15.294 15.115 14.879 14.609 14.323 13.967 13.478 10.613 -3 ,32538 ,TETRA ,17606075,Sun Nov 28 19:52:42 CET,Sun Nov 28 22:08:36 CET,0.0 0.896 1.28 1.581 1.823 2.044 2.258 2.457 2.803 2.951 3.096 3.247 3.494 3.621 3.832 4.032 4.244 4.35 4.555 4.76 5.043 5.212 5.378 5.627 5.869 6.115 6.356 6.585 6.889 7.176 7.436 7.732 8.016 8.292 8.615 8.98 9.338 9.746 10.176 10.598 11.053 11.583 12.169 12.762 13.462 14.24 15.13 16.125 17.274 18.562 20.088 21.123 21.55 21.729 21.684 21.485 21.23 20.961 20.705 20.442 20.181 19.916 19.669 19.408 19.155 18.931 18.688 18.466 18.27 18.059 17.842 17.669 17.464 17.26 17.115 16.968 16.792 16.581 16.379 16.242 16.073 15.825 15.673 15.495 15.398 15.179 14.94 14.708 14.589 14.376 14.245 14.098 13.937 13.591 13.396 13.141 12.89 12.63 12.321 11.758 9.145 -4 ,5993 ,TETRA ,17606076,Sun Nov 28 19:52:45 CET,Sun Nov 28 22:09:51 CET,0.0 1.275 1.692 1.965 2.2 2.404 2.579 2.731 3.033 3.165 3.292 3.422 3.666 3.792 4.027 4.231 4.433 4.538 4.726 4.902 5.156 5.323 5.478 5.708 5.952 6.191 6.434 6.664 6.939 7.206 7.482 7.816 8.11 8.387 8.712 9.063 9.396 9.754 10.143 10.579 11.062 11.616 12.232 12.82 13.546 14.379 15.274 16.264 17.509 18.865 20.281 21.297 21.724 21.939 21.992 21.899 21.749 21.538 21.34 21.166 20.985 20.793 20.604 20.419 20.226 20.053 19.865 19.663 19.5 19.331 19.155 19.006 18.817 18.614 18.479 18.339 18.161 17.951 17.747 17.618 17.479 17.227 17.041 16.872 16.785 16.596 16.416 16.228 16.115 15.881 15.725 15.575 15.403 15.038 14.863 14.645 14.383 14.09 13.723 13.296 10.699 -5 ,27242 ,TETRA ,17606077,Sun Nov 28 19:52:46 CET,Sun Nov 28 22:10:21 CET,0.0 1.129 1.463 1.716 1.957 2.17 2.35 2.498 2.771 2.918 3.055 3.198 3.452 3.567 3.785 3.999 4.2 4.294 4.466 4.623 4.861 5.018 5.178 5.412 5.624 5.827 6.031 6.233 6.49 6.745 6.991 7.285 7.564 7.838 8.173 8.542 8.888 9.258 9.656 10.078 10.513 11.0 11.553 12.137 12.823 13.589 14.467 15.439 16.603 17.905 19.336 20.487 21.134 21.446 21.534 21.542 21.44 21.281 21.139 20.987 20.846 20.662 20.43 20.22 20.021 19.835 19.622 19.409 19.23 19.057 18.865 18.674 18.481 18.285 18.131 17.975 17.794 17.594 17.395 17.251 17.094 16.873 16.725 16.564 16.477 16.282 16.085 15.885 15.778 15.551 15.388 15.241 15.068 14.693 14.487 14.281 14.064 13.794 13.423 12.861 9.447 -6 ,16678 ,TETRA ,17606078,Sun Nov 28 19:52:40 CET,Sun Nov 28 22:08:10 CET,0.0 0.909 1.213 1.468 1.703 1.894 2.08 2.26 2.582 2.711 2.84 2.964 3.204 3.317 3.528 3.746 3.949 4.042 4.224 4.408 4.663 4.815 4.975 5.222 5.44 5.648 5.851 6.04 6.274 6.5 6.734 7.044 7.36 7.657 7.978 8.325 8.656 9.018 9.44 9.887 10.343 10.841 11.386 11.966 12.628 13.357 14.281 15.354 16.55 17.8 19.172 20.188 20.606 20.784 20.88 20.866 20.738 20.582 20.457 20.318 20.163 19.956 19.702 19.468 19.305 19.151 18.958 18.787 18.627 18.462 18.302 18.161 17.984 17.771 17.612 17.46 17.293 17.12 16.945 16.825 16.689 16.461 16.299 16.12 16.026 15.815 15.596 15.356 15.219 14.979 14.794 14.631 14.477 14.15 13.947 13.738 13.46 13.138 12.778 12.165 5.963 -7 ,22604 ,TETRA ,17606079,Sun Nov 28 19:52:42 CET,Sun Nov 28 22:08:10 CET,0.0 1.362 1.777 2.07 2.304 2.532 2.729 2.908 3.251 3.406 3.562 3.745 4.005 4.12 4.34 4.553 4.767 4.875 5.06 5.221 5.461 5.625 5.784 6.016 6.243 6.469 6.681 6.879 7.13 7.371 7.607 7.91 8.235 8.556 8.914 9.269 9.59 9.964 10.376 10.781 11.191 11.684 12.315 12.982 13.726 14.478 15.307 16.276 17.393 18.637 20.083 21.136 21.49 21.606 21.637 21.577 21.472 21.331 21.185 21.029 20.867 20.69 20.506 20.328 20.154 19.99 19.803 19.62 19.459 19.282 19.111 18.972 18.825 18.652 18.504 18.348 18.181 18.029 17.868 17.751 17.626 17.418 17.266 17.1 17.005 16.789 16.592 16.398 16.272 16.035 15.872 15.727 15.582 15.253 15.065 14.872 14.623 14.334 13.995 13.518 11.335 -8 ,2645 ,TETRA ,17606080,Sun Nov 28 19:52:45 CET,Sun Nov 28 22:16:18 CET,0.0 0.883 1.27 1.544 1.736 1.924 2.12 2.291 2.607 2.763 2.898 3.027 3.269 3.39 3.631 3.855 4.073 4.182 4.393 4.586 4.865 5.045 5.212 5.462 5.722 5.969 6.209 6.441 6.726 6.998 7.263 7.57 7.866 8.16 8.511 8.907 9.271 9.692 10.129 10.561 11.015 11.537 12.171 12.828 13.607 14.493 15.518 16.642 17.901 19.195 20.604 21.629 22.101 22.323 22.318 22.15 21.942 21.764 21.613 21.438 21.265 21.115 20.956 20.783 20.604 20.398 20.148 19.936 19.773 19.601 19.41 19.252 19.092 18.933 18.785 18.624 18.47 18.292 18.084 17.919 17.762 17.559 17.411 17.236 17.137 16.92 16.676 16.413 16.289 16.069 15.908 15.766 15.615 15.225 14.983 14.689 14.377 14.057 13.644 13.054 10.416 -9 ,9502 ,TETRA ,17606081,Sun Nov 28 19:52:46 CET,Sun Nov 28 22:16:53 CET,0.0 0.743 1.06 1.32 1.532 1.712 1.896 2.07 2.371 2.517 2.65 2.767 3.008 3.123 3.353 3.561 3.755 3.851 4.025 4.195 4.456 4.615 4.764 5.003 5.225 5.427 5.621 5.811 6.076 6.335 6.587 6.898 7.198 7.488 7.83 8.205 8.558 8.934 9.346 9.801 10.279 10.792 11.382 11.989 12.682 13.486 14.421 15.452 16.632 17.967 19.484 20.623 21.229 21.48 21.578 21.565 21.469 21.319 21.148 20.953 20.738 20.502 20.251 20.011 19.753 19.485 19.23 19.015 18.824 18.625 18.425 18.268 18.104 17.919 17.767 17.606 17.433 17.251 17.039 16.893 16.756 16.545 16.386 16.2 16.102 15.89 15.66 15.407 15.29 15.073 14.925 14.802 14.642 14.245 14.04 13.81 13.55 13.252 12.872 12.279 9.191 -10 ,305 ,TETRA ,17606082,Sun Nov 28 19:52:42 CET,Sun Nov 28 22:08:05 CET,0.0 1.031 1.382 1.676 1.932 2.135 2.331 2.513 2.815 2.96 3.105 3.259 3.51 3.631 3.87 4.093 4.305 4.408 4.605 4.807 5.087 5.245 5.403 5.653 5.877 6.092 6.3 6.494 6.754 7.001 7.236 7.528 7.81 8.085 8.404 8.77 9.135 9.535 9.952 10.389 10.87 11.409 12.035 12.653 13.369 14.247 15.297 16.459 17.671 18.828 20.182 21.276 21.826 22.101 22.134 22.056 21.976 21.889 21.757 21.584 21.422 21.234 21.019 20.818 20.637 20.45 20.251 20.07 19.892 19.713 19.519 19.353 19.193 19.006 18.848 18.691 18.506 18.307 18.116 17.981 17.843 17.631 17.476 17.289 17.181 16.973 16.743 16.459 16.317 16.071 15.865 15.715 15.567 15.13 14.899 14.702 14.481 14.2 13.82 13.268 10.166 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_31_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_31_35.txt deleted file mode 100644 index 64bc9b2d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_31_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22986 ,TETRA ,17606083,Sun Nov 28 19:52:45 CET,Sun Nov 28 22:08:32 CET,0.0 0.479 0.72 0.94 1.118 1.291 1.447 1.588 1.89 2.04 2.167 2.26 2.493 2.598 2.795 2.98 3.145 3.222 3.364 3.509 3.711 3.844 3.993 4.205 4.404 4.6 4.797 5.007 5.272 5.516 5.763 6.069 6.349 6.607 6.92 7.263 7.587 7.966 8.394 8.829 9.242 9.716 10.309 10.938 11.657 12.4 13.253 14.223 15.368 16.604 17.841 18.59 18.851 18.945 18.926 18.813 18.661 18.428 18.205 17.996 17.762 17.56 17.386 17.2 17.0 16.807 16.602 16.42 16.262 16.103 15.929 15.767 15.591 15.405 15.268 15.134 14.985 14.822 14.647 14.515 14.379 14.17 14.023 13.878 13.806 13.656 13.48 13.274 13.153 12.925 12.784 12.655 12.517 12.171 11.984 11.796 11.595 11.368 11.091 10.683 9.275 -2 ,25600 ,TETRA ,17606084,Sun Nov 28 19:52:43 CET,Sun Nov 28 22:09:59 CET,0.0 0.417 0.613 0.769 0.909 1.039 1.158 1.266 1.472 1.578 1.681 1.745 1.954 2.04 2.208 2.363 2.512 2.581 2.718 2.854 3.057 3.195 3.329 3.525 3.715 3.905 4.093 4.263 4.483 4.695 4.901 5.162 5.421 5.67 5.969 6.299 6.605 6.947 7.327 7.735 8.166 8.677 9.285 9.896 10.612 11.419 12.35 13.4 14.657 15.897 17.188 18.394 19.036 19.44 19.581 19.46 19.29 19.111 18.954 18.812 18.658 18.472 18.288 18.116 17.955 17.814 17.651 17.503 17.365 17.203 17.044 16.906 16.743 16.562 16.426 16.292 16.142 15.976 15.809 15.695 15.572 15.369 15.222 15.064 14.985 14.824 14.659 14.48 14.384 14.17 14.056 13.945 13.818 13.529 13.366 13.184 12.981 12.77 12.521 12.19 11.409 -3 ,24236 ,TETRA ,17606085,Sun Nov 28 19:52:44 CET,Sun Nov 28 22:10:27 CET,0.0 0.288 0.449 0.621 0.809 0.986 1.132 1.27 1.544 1.664 1.775 1.849 2.059 2.149 2.327 2.498 2.659 2.738 2.892 3.039 3.262 3.407 3.547 3.75 3.939 4.125 4.318 4.509 4.75 4.983 5.214 5.483 5.733 5.982 6.264 6.58 6.888 7.229 7.6 7.966 8.343 8.785 9.31 9.85 10.488 11.2 12.045 13.003 14.099 15.36 16.819 17.878 18.367 18.451 18.321 18.211 18.081 17.892 17.67 17.432 17.21 16.996 16.784 16.543 16.312 16.095 15.857 15.644 15.456 15.263 15.049 14.871 14.689 14.492 14.328 14.152 13.972 13.8 13.632 13.519 13.394 13.184 13.036 12.872 12.786 12.616 12.422 12.214 12.109 11.899 11.764 11.641 11.504 11.174 11.007 10.82 10.608 10.369 10.051 9.642 8.891 -4 ,11459 ,TETRA ,17606086,Sun Nov 28 19:52:42 CET,Sun Nov 28 22:08:28 CET,0.0 0.477 0.71 0.898 1.068 1.225 1.366 1.496 1.731 1.836 1.94 2.027 2.249 2.355 2.546 2.736 2.924 3.003 3.152 3.313 3.535 3.669 3.799 3.978 4.147 4.322 4.494 4.66 4.873 5.077 5.278 5.528 5.775 6.016 6.289 6.581 6.866 7.174 7.509 7.876 8.273 8.719 9.222 9.761 10.382 11.069 11.96 13.052 14.29 15.663 17.083 18.012 18.43 18.546 18.546 18.476 18.33 18.119 17.87 17.563 17.296 17.054 16.845 16.673 16.508 16.354 16.18 16.004 15.856 15.713 15.554 15.399 15.24 15.086 14.951 14.806 14.65 14.475 14.304 14.194 14.071 13.863 13.71 13.548 13.467 13.301 13.133 12.942 12.843 12.641 12.508 12.389 12.268 11.983 11.828 11.658 11.443 11.169 10.845 10.464 9.312 -5 ,29832 ,TETRA ,17606087,Sun Nov 28 19:52:45 CET,Sun Nov 28 22:07:27 CET,0.0 0.341 0.551 0.711 0.856 1.027 1.191 1.335 1.587 1.697 1.803 1.887 2.11 2.205 2.388 2.563 2.714 2.781 2.924 3.068 3.267 3.383 3.503 3.693 3.87 4.042 4.215 4.378 4.594 4.8 4.997 5.235 5.457 5.677 5.952 6.263 6.572 6.927 7.301 7.692 8.115 8.611 9.197 9.757 10.392 11.131 11.996 12.973 14.038 15.244 16.604 17.433 17.737 17.718 17.467 17.221 17.036 16.826 16.573 16.28 16.023 15.771 15.537 15.341 15.167 15.005 14.822 14.661 14.505 14.302 14.084 13.902 13.725 13.568 13.447 13.311 13.159 12.982 12.79 12.66 12.527 12.319 12.181 12.032 11.949 11.801 11.661 11.483 11.384 11.186 11.074 10.961 10.838 10.562 10.392 10.211 10.013 9.768 9.504 9.155 8.237 -6 ,25796 ,TETRA ,17606089,Sun Nov 28 19:52:47 CET,Sun Nov 28 22:09:04 CET,0.0 0.587 0.873 1.03 1.17 1.331 1.471 1.591 1.809 1.906 2.009 2.085 2.304 2.4 2.587 2.755 2.923 3.004 3.167 3.319 3.52 3.653 3.787 3.995 4.189 4.367 4.542 4.715 4.95 5.172 5.38 5.635 5.889 6.129 6.403 6.731 7.04 7.365 7.74 8.166 8.605 9.106 9.721 10.337 11.056 11.873 12.763 13.783 15.033 16.517 18.252 19.535 20.11 20.278 20.25 20.164 20.052 19.889 19.703 19.478 19.241 19.0 18.766 18.541 18.317 18.097 17.852 17.635 17.449 17.258 17.061 16.9 16.735 16.545 16.399 16.251 16.08 15.903 15.728 15.611 15.486 15.261 15.102 14.936 14.846 14.673 14.507 14.32 14.204 13.968 13.83 13.692 13.51 13.116 12.921 12.71 12.48 12.203 11.894 11.533 10.647 -7 ,32540 ,TETRA ,17606090,Sun Nov 28 19:52:48 CET,Sun Nov 28 22:08:15 CET,0.0 0.285 0.534 0.742 0.901 1.034 1.147 1.261 1.49 1.599 1.716 1.806 2.022 2.112 2.29 2.467 2.643 2.72 2.868 3.021 3.24 3.373 3.492 3.673 3.87 4.06 4.247 4.428 4.656 4.877 5.098 5.376 5.64 5.897 6.191 6.515 6.826 7.175 7.557 7.943 8.367 8.887 9.514 10.126 10.822 11.616 12.512 13.546 14.748 16.056 17.46 18.366 18.678 18.677 18.499 18.268 18.089 17.929 17.764 17.513 17.262 17.04 16.809 16.576 16.345 16.143 15.93 15.734 15.557 15.357 15.122 14.933 14.751 14.552 14.392 14.228 14.046 13.847 13.665 13.537 13.4 13.19 13.042 12.866 12.767 12.576 12.381 12.175 12.071 11.859 11.702 11.569 11.428 11.104 10.926 10.724 10.492 10.253 9.944 9.503 8.574 -8 ,25091 ,TETRA ,17606091,Sun Nov 28 19:52:43 CET,Sun Nov 28 22:10:50 CET,0.0 0.461 0.714 0.928 1.092 1.238 1.373 1.511 1.774 1.891 2.012 2.107 2.321 2.411 2.589 2.753 2.906 2.982 3.137 3.286 3.487 3.617 3.751 3.981 4.199 4.386 4.56 4.724 4.942 5.156 5.354 5.601 5.858 6.11 6.395 6.739 7.079 7.437 7.823 8.247 8.694 9.201 9.819 10.443 11.167 11.982 12.909 13.944 15.208 16.63 18.05 18.897 19.16 19.166 19.005 18.781 18.551 18.355 18.209 18.026 17.844 17.71 17.558 17.377 17.218 17.064 16.877 16.702 16.548 16.397 16.235 16.091 15.937 15.779 15.658 15.525 15.378 15.211 15.028 14.896 14.756 14.555 14.418 14.258 14.17 13.993 13.799 13.572 13.455 13.229 13.094 12.974 12.848 12.573 12.418 12.246 12.047 11.81 11.48 11.037 9.961 -9 ,15053 ,TETRA ,17606092,Sun Nov 28 19:52:43 CET,Sun Nov 28 22:10:32 CET,0.0 0.36 0.534 0.708 0.864 1.008 1.125 1.236 1.477 1.589 1.695 1.788 2.006 2.09 2.249 2.403 2.556 2.637 2.802 2.953 3.168 3.306 3.437 3.633 3.821 3.998 4.171 4.343 4.574 4.795 5.0 5.252 5.501 5.735 6.006 6.332 6.653 7.002 7.384 7.789 8.224 8.724 9.289 9.829 10.476 11.257 12.125 13.017 14.009 15.156 16.52 17.419 17.638 17.633 17.511 17.303 17.083 16.866 16.645 16.423 16.257 16.096 15.893 15.704 15.536 15.361 15.18 15.022 14.88 14.726 14.561 14.406 14.216 14.008 13.847 13.68 13.505 13.334 13.164 13.048 12.926 12.694 12.514 12.344 12.261 12.095 11.927 11.754 11.647 11.42 11.264 11.14 11.014 10.742 10.59 10.411 10.218 9.999 9.709 9.247 7.884 -10 ,25124 ,TETRA ,17606093,Sun Nov 28 19:52:45 CET,Sun Nov 28 22:10:30 CET,0.0 0.544 0.788 1.013 1.207 1.376 1.544 1.702 1.967 2.084 2.187 2.268 2.489 2.588 2.772 2.939 3.094 3.167 3.322 3.463 3.655 3.788 3.926 4.117 4.297 4.477 4.65 4.818 5.034 5.261 5.482 5.753 6.031 6.288 6.569 6.889 7.202 7.547 7.908 8.315 8.783 9.288 9.835 10.379 11.058 11.844 12.725 13.719 14.945 16.416 18.128 19.457 20.108 20.456 20.656 20.732 20.727 20.693 20.616 20.486 20.348 20.201 20.052 19.902 19.692 19.465 19.224 19.017 18.843 18.633 18.411 18.221 18.015 17.813 17.658 17.487 17.305 17.14 16.977 16.854 16.724 16.526 16.396 16.25 16.164 15.98 15.805 15.626 15.54 15.339 15.203 15.067 14.931 14.622 14.442 14.258 14.067 13.846 13.554 13.17 12.224 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_31_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_31_37.txt deleted file mode 100644 index 5bfeba25..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_31_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9365 ,TETRA ,17606094,Sun Nov 28 19:52:47 CET,Sun Nov 28 22:09:47 CET,0.0 0.743 1.041 1.256 1.455 1.63 1.785 1.942 2.239 2.36 2.478 2.578 2.803 2.896 3.076 3.249 3.4 3.471 3.616 3.754 3.953 4.087 4.222 4.403 4.565 4.73 4.888 5.04 5.237 5.43 5.621 5.857 6.074 6.266 6.496 6.75 6.996 7.307 7.639 7.95 8.262 8.612 9.065 9.531 10.022 10.581 11.243 11.995 12.832 13.691 14.521 14.639 14.324 13.97 13.618 13.265 12.936 12.616 12.328 12.037 11.783 11.556 11.321 11.089 10.883 10.681 10.451 10.252 10.088 9.91 9.711 9.548 9.378 9.201 9.073 8.947 8.811 8.656 8.496 8.385 8.27 8.081 7.945 7.804 7.73 7.575 7.413 7.241 7.15 6.945 6.854 6.738 6.618 6.357 6.196 6.034 5.866 5.665 5.429 5.143 4.235 -2 ,28444 ,TETRA ,17606095,Sun Nov 28 19:52:44 CET,Sun Nov 28 22:12:36 CET,0.0 0.897 1.208 1.449 1.655 1.833 2.001 2.187 2.521 2.636 2.744 2.83 3.056 3.16 3.346 3.532 3.711 3.796 3.961 4.113 4.34 4.49 4.625 4.813 5.003 5.197 5.384 5.559 5.774 5.983 6.188 6.431 6.656 6.861 7.094 7.367 7.631 7.917 8.235 8.574 8.934 9.357 9.845 10.318 10.81 11.276 11.838 12.527 13.341 14.049 14.66 14.998 14.822 14.46 14.09 13.752 13.393 13.057 12.791 12.519 12.257 12.019 11.81 11.601 11.397 11.196 10.983 10.79 10.626 10.463 10.27 10.1 9.933 9.765 9.616 9.443 9.271 9.1 8.919 8.797 8.677 8.494 8.352 8.205 8.14 8.003 7.834 7.658 7.569 7.37 7.304 7.204 7.096 6.838 6.687 6.534 6.37 6.175 5.944 5.62 4.796 -3 ,921 ,TETRA ,17606096,Sun Nov 28 19:52:48 CET,Sun Nov 28 22:12:35 CET,0.0 0.706 0.981 1.242 1.464 1.641 1.794 1.919 2.157 2.274 2.38 2.461 2.683 2.779 2.957 3.123 3.279 3.356 3.505 3.641 3.851 3.99 4.118 4.313 4.504 4.681 4.847 5.013 5.217 5.41 5.605 5.841 6.069 6.296 6.555 6.864 7.163 7.464 7.78 8.1 8.431 8.821 9.293 9.77 10.285 10.856 11.549 12.333 13.177 14.017 14.812 15.308 15.249 14.912 14.564 14.203 13.851 13.525 13.247 12.978 12.729 12.468 12.212 11.962 11.702 11.448 11.194 10.98 10.768 10.523 10.252 10.039 9.829 9.612 9.447 9.253 9.057 8.879 8.684 8.559 8.442 8.254 8.132 7.989 7.903 7.717 7.527 7.331 7.229 7.002 6.855 6.71 6.56 6.251 6.08 5.895 5.677 5.435 5.151 4.809 3.965 -4 ,27527 ,TETRA ,17606097,Sun Nov 28 19:52:45 CET,Sun Nov 28 22:09:56 CET,0.0 0.722 1.003 1.25 1.471 1.647 1.797 1.937 2.209 2.337 2.458 2.563 2.801 2.908 3.119 3.314 3.497 3.595 3.775 3.934 4.165 4.313 4.444 4.62 4.793 4.962 5.126 5.284 5.497 5.704 5.89 6.121 6.342 6.545 6.788 7.074 7.349 7.639 7.938 8.264 8.6 8.973 9.392 9.812 10.29 10.756 11.271 11.81 12.374 13.028 13.544 13.62 13.56 13.33 12.981 12.598 12.267 11.95 11.662 11.37 11.103 10.862 10.6 10.338 10.101 9.886 9.671 9.451 9.27 9.093 8.89 8.718 8.542 8.36 8.206 8.046 7.882 7.709 7.541 7.424 7.29 7.067 6.916 6.776 6.701 6.537 6.373 6.193 6.098 5.902 5.819 5.709 5.598 5.363 5.227 5.085 4.936 4.744 4.511 4.229 3.514 -5 ,30349 ,TETRA ,17606098,Sun Nov 28 19:52:46 CET,Sun Nov 28 22:09:15 CET,0.0 0.588 0.914 1.151 1.345 1.515 1.668 1.808 2.032 2.136 2.244 2.337 2.569 2.666 2.842 3.021 3.194 3.272 3.421 3.566 3.771 3.891 4.004 4.177 4.349 4.507 4.659 4.81 5.007 5.2 5.383 5.606 5.824 6.033 6.263 6.517 6.779 7.069 7.382 7.719 8.063 8.46 8.873 9.199 9.567 10.018 10.554 11.101 11.723 12.291 12.653 12.796 12.637 12.328 12.006 11.673 11.377 11.101 10.82 10.52 10.26 10.007 9.759 9.528 9.309 9.1 8.884 8.685 8.507 8.328 8.148 7.993 7.83 7.664 7.528 7.389 7.255 7.107 6.944 6.829 6.711 6.531 6.401 6.259 6.185 6.024 5.85 5.678 5.593 5.39 5.299 5.186 5.074 4.839 4.693 4.513 4.325 4.138 3.911 3.619 2.826 -6 ,2993 ,TETRA ,17606099,Sun Nov 28 19:53:12 CET,Sun Nov 28 22:10:16 CET,0.0 0.665 0.95 1.177 1.37 1.542 1.708 1.866 2.162 2.298 2.436 2.589 2.821 2.934 3.138 3.319 3.491 3.575 3.747 3.906 4.123 4.271 4.411 4.592 4.765 4.944 5.123 5.296 5.517 5.71 5.886 6.116 6.345 6.557 6.801 7.069 7.335 7.631 7.942 8.266 8.582 8.931 9.344 9.744 10.216 10.758 11.335 11.953 12.715 13.538 14.25 14.55 14.548 14.378 14.079 13.704 13.349 13.008 12.683 12.365 12.091 11.839 11.609 11.381 11.152 10.952 10.75 10.569 10.398 10.209 10.012 9.842 9.67 9.49 9.354 9.214 9.061 8.907 8.728 8.599 8.48 8.299 8.168 8.021 7.943 7.77 7.595 7.403 7.292 7.08 6.98 6.857 6.728 6.436 6.273 6.12 5.959 5.759 5.49 5.15 4.264 -7 ,1833 ,TETRA ,17606100,Sun Nov 28 19:53:14 CET,Sun Nov 28 22:09:37 CET,0.0 0.605 0.895 1.115 1.297 1.459 1.593 1.715 1.983 2.105 2.214 2.295 2.511 2.61 2.799 2.969 3.126 3.201 3.344 3.486 3.687 3.813 3.941 4.136 4.331 4.508 4.672 4.834 5.055 5.265 5.457 5.678 5.892 6.111 6.351 6.615 6.882 7.173 7.465 7.758 8.071 8.438 8.859 9.293 9.783 10.276 10.853 11.485 12.193 12.933 13.439 13.381 13.084 12.764 12.463 12.146 11.801 11.417 11.067 10.75 10.454 10.154 9.873 9.601 9.341 9.089 8.825 8.627 8.457 8.254 8.019 7.838 7.666 7.486 7.35 7.198 7.048 6.892 6.724 6.606 6.475 6.262 6.111 5.961 5.886 5.721 5.549 5.373 5.281 5.082 4.994 4.867 4.729 4.461 4.307 4.127 3.936 3.695 3.398 3.033 2.053 -8 ,21017 ,TETRA ,17606101,Sun Nov 28 19:53:10 CET,Sun Nov 28 22:13:00 CET,0.0 0.629 0.929 1.151 1.34 1.509 1.656 1.799 2.044 2.153 2.257 2.324 2.533 2.629 2.817 2.993 3.166 3.248 3.397 3.537 3.728 3.858 3.984 4.156 4.332 4.512 4.675 4.825 5.022 5.206 5.386 5.614 5.826 6.026 6.25 6.49 6.724 6.986 7.271 7.571 7.874 8.229 8.679 9.145 9.704 10.304 10.93 11.518 12.03 12.536 12.91 12.933 12.763 12.483 12.22 11.962 11.68 11.399 11.141 10.862 10.616 10.386 10.155 9.934 9.71 9.492 9.271 9.06 8.877 8.698 8.502 8.339 8.164 7.966 7.819 7.669 7.519 7.367 7.194 7.071 6.952 6.754 6.609 6.464 6.389 6.232 6.064 5.875 5.777 5.569 5.464 5.335 5.204 4.897 4.715 4.51 4.281 4.041 3.73 3.327 2.381 -9 ,12273 ,TETRA ,17606102,Sun Nov 28 19:53:15 CET,Sun Nov 28 22:12:38 CET,0.0 0.842 1.131 1.379 1.567 1.725 1.875 2.027 2.291 2.392 2.5 2.585 2.798 2.893 3.078 3.249 3.41 3.485 3.625 3.764 3.963 4.099 4.245 4.449 4.633 4.809 4.976 5.137 5.345 5.543 5.729 5.943 6.152 6.366 6.612 6.875 7.128 7.4 7.688 7.998 8.324 8.684 9.103 9.522 9.913 10.285 10.731 11.199 11.695 12.232 12.803 13.039 12.945 12.664 12.308 11.925 11.58 11.284 11.032 10.785 10.564 10.363 10.141 9.908 9.688 9.473 9.243 9.049 8.869 8.666 8.467 8.306 8.148 7.985 7.846 7.697 7.551 7.399 7.239 7.128 7.008 6.803 6.659 6.515 6.44 6.282 6.114 5.929 5.831 5.619 5.503 5.371 5.231 4.944 4.772 4.583 4.385 4.145 3.864 3.484 2.086 -10 ,16383 ,TETRA ,17606103,Sun Nov 28 19:53:10 CET,Sun Nov 28 22:10:03 CET,0.0 0.915 1.286 1.539 1.772 1.99 2.171 2.328 2.584 2.703 2.832 2.955 3.182 3.286 3.492 3.698 3.896 3.988 4.139 4.271 4.476 4.613 4.745 4.926 5.097 5.267 5.434 5.601 5.814 6.011 6.206 6.454 6.692 6.928 7.21 7.5 7.758 8.034 8.329 8.652 9.001 9.393 9.828 10.267 10.768 11.34 12.014 12.661 13.198 13.632 13.877 13.771 13.451 13.08 12.701 12.322 11.968 11.622 11.317 10.98 10.681 10.42 10.159 9.908 9.664 9.438 9.199 8.983 8.804 8.612 8.387 8.202 8.034 7.864 7.728 7.591 7.44 7.271 7.105 6.995 6.859 6.629 6.486 6.35 6.28 6.125 5.945 5.74 5.628 5.395 5.253 5.133 4.998 4.692 4.537 4.371 4.176 3.966 3.721 3.359 2.34 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_33_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_33_19.txt deleted file mode 100644 index e10ed37a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_33_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5360 ,TETRA ,17606104,Sun Nov 28 19:53:12 CET,Sun Nov 28 22:06:50 CET,0.0 0.368 0.576 0.714 0.831 0.943 1.048 1.142 1.289 1.354 1.425 1.44 1.628 1.689 1.811 1.926 2.034 2.084 2.183 2.279 2.41 2.502 2.606 2.765 2.915 3.054 3.191 3.311 3.453 3.604 3.746 3.913 4.083 4.264 4.484 4.716 4.922 5.155 5.423 5.726 6.03 6.348 6.733 7.137 7.576 8.036 8.558 9.16 9.894 10.714 11.583 12.029 12.048 11.947 11.732 11.468 11.216 10.977 10.765 10.509 10.247 10.004 9.751 9.512 9.318 9.129 8.908 8.721 8.563 8.393 8.219 8.064 7.906 7.744 7.609 7.466 7.321 7.173 7.023 6.919 6.821 6.678 6.56 6.42 6.346 6.193 6.036 5.86 5.768 5.561 5.483 5.371 5.24 4.964 4.822 4.648 4.476 4.269 4.004 3.627 2.631 -2 ,7141 ,TETRA ,17606105,Sun Nov 28 19:53:10 CET,Sun Nov 28 22:05:17 CET,0.0 0.461 0.679 0.819 0.921 1.01 1.092 1.181 1.345 1.414 1.485 1.489 1.673 1.734 1.847 1.956 2.065 2.112 2.209 2.309 2.456 2.559 2.655 2.784 2.916 3.034 3.154 3.276 3.424 3.568 3.705 3.869 4.037 4.211 4.415 4.633 4.841 5.081 5.34 5.606 5.898 6.224 6.59 6.971 7.433 7.958 8.538 9.193 9.955 10.827 11.793 12.411 12.613 12.627 12.578 12.492 12.358 12.173 12.006 11.824 11.684 11.588 11.498 11.405 11.29 11.168 11.044 10.941 10.845 10.75 10.644 10.545 10.439 10.29 10.164 10.061 9.962 9.84 9.718 9.63 9.529 9.378 9.253 9.12 9.045 8.882 8.742 8.614 8.548 8.349 8.233 8.101 7.99 7.769 7.612 7.422 7.213 7.001 6.752 6.396 5.288 -3 ,24959 ,TETRA ,17606106,Sun Nov 28 19:53:11 CET,Sun Nov 28 22:05:34 CET,0.0 0.345 0.521 0.683 0.822 0.928 1.017 1.115 1.311 1.393 1.469 1.469 1.66 1.721 1.831 1.939 2.053 2.102 2.189 2.279 2.414 2.505 2.594 2.717 2.835 2.952 3.063 3.169 3.301 3.437 3.582 3.762 3.939 4.1 4.289 4.517 4.743 4.978 5.213 5.466 5.746 6.064 6.421 6.783 7.222 7.708 8.243 8.84 9.552 10.37 11.263 11.846 12.07 12.151 12.101 11.966 11.824 11.664 11.513 11.346 11.175 11.015 10.836 10.655 10.497 10.347 10.184 10.04 9.92 9.788 9.645 9.528 9.376 9.206 9.089 8.983 8.882 8.759 8.63 8.546 8.444 8.281 8.173 8.058 8.0 7.863 7.708 7.541 7.457 7.247 7.163 7.062 6.96 6.692 6.561 6.429 6.257 6.03 5.748 5.434 4.655 -4 ,5651 ,TETRA ,17606107,Sun Nov 28 19:53:14 CET,Sun Nov 28 22:05:03 CET,0.0 0.544 0.71 0.849 0.977 1.082 1.181 1.287 1.484 1.574 1.652 1.667 1.872 1.953 2.101 2.226 2.335 2.39 2.507 2.618 2.778 2.877 2.974 3.116 3.24 3.36 3.49 3.626 3.793 3.946 4.097 4.286 4.461 4.636 4.848 5.077 5.29 5.523 5.773 6.04 6.313 6.619 6.981 7.352 7.782 8.261 8.844 9.506 10.243 11.042 11.924 12.507 12.704 12.774 12.771 12.707 12.607 12.471 12.308 12.098 11.887 11.688 11.508 11.357 11.222 11.092 10.923 10.758 10.611 10.462 10.306 10.189 10.092 9.991 9.858 9.686 9.514 9.324 9.112 8.958 8.812 8.617 8.488 8.347 8.271 8.103 7.916 7.716 7.602 7.352 7.209 7.086 6.959 6.685 6.532 6.334 6.112 5.877 5.575 5.233 4.2 -5 ,6227 ,TETRA ,17606108,Sun Nov 28 19:53:16 CET,Sun Nov 28 22:05:44 CET,0.0 0.221 0.36 0.507 0.646 0.76 0.862 0.945 1.103 1.174 1.242 1.241 1.422 1.48 1.596 1.714 1.821 1.865 1.953 2.04 2.167 2.252 2.344 2.477 2.595 2.714 2.826 2.942 3.098 3.241 3.386 3.554 3.707 3.856 4.027 4.216 4.405 4.623 4.855 5.101 5.379 5.709 6.077 6.446 6.885 7.344 7.871 8.51 9.278 10.139 11.08 11.71 11.96 12.061 12.101 12.044 11.915 11.772 11.623 11.474 11.351 11.227 11.102 10.985 10.846 10.68 10.507 10.353 10.225 10.065 9.86 9.682 9.474 9.244 9.076 8.922 8.745 8.532 8.309 8.16 8.018 7.823 7.684 7.519 7.427 7.22 6.959 6.691 6.567 6.33 6.211 6.083 5.96 5.674 5.495 5.291 5.051 4.793 4.508 4.094 2.427 -6 ,10379 ,TETRA ,17606109,Sun Nov 28 19:53:11 CET,Sun Nov 28 22:05:24 CET,0.0 0.476 0.622 0.76 0.887 1.012 1.142 1.244 1.386 1.457 1.529 1.535 1.731 1.795 1.926 2.059 2.174 2.227 2.334 2.449 2.616 2.713 2.804 2.938 3.069 3.196 3.322 3.449 3.618 3.782 3.932 4.112 4.282 4.436 4.612 4.796 4.962 5.154 5.394 5.658 5.914 6.204 6.545 6.894 7.322 7.791 8.309 8.898 9.625 10.485 11.463 12.15 12.428 12.496 12.4 12.262 12.126 11.971 11.831 11.681 11.519 11.366 11.223 11.065 10.926 10.792 10.628 10.477 10.34 10.188 10.043 9.93 9.788 9.621 9.507 9.402 9.286 9.156 9.027 8.94 8.842 8.684 8.574 8.466 8.406 8.266 8.127 7.987 7.905 7.706 7.64 7.545 7.439 7.19 7.043 6.89 6.751 6.573 6.318 6.039 5.313 -7 ,22895 ,TETRA ,17606110,Sun Nov 28 19:53:10 CET,Sun Nov 28 22:11:24 CET,0.0 0.408 0.621 0.794 0.932 1.051 1.15 1.239 1.402 1.481 1.557 1.581 1.783 1.852 1.967 2.067 2.166 2.223 2.345 2.451 2.607 2.708 2.803 2.94 3.065 3.195 3.314 3.43 3.595 3.748 3.89 4.058 4.206 4.343 4.513 4.727 4.937 5.16 5.405 5.662 5.923 6.217 6.566 6.917 7.314 7.776 8.306 8.881 9.56 10.299 11.145 11.746 11.957 12.029 12.03 11.933 11.773 11.626 11.5 11.328 11.14 10.925 10.672 10.407 10.129 9.867 9.589 9.334 9.115 8.871 8.614 8.438 8.278 8.094 7.95 7.795 7.618 7.438 7.257 7.142 7.013 6.768 6.596 6.426 6.346 6.19 6.023 5.862 5.774 5.56 5.495 5.381 5.259 5.004 4.839 4.657 4.454 4.234 3.976 3.626 2.41 -8 ,18150 ,TETRA ,17606111,Sun Nov 28 19:53:13 CET,Sun Nov 28 22:11:41 CET,0.0 0.322 0.493 0.659 0.793 0.908 1.016 1.129 1.322 1.404 1.483 1.51 1.699 1.773 1.911 2.019 2.14 2.199 2.297 2.388 2.532 2.633 2.725 2.864 2.997 3.108 3.212 3.318 3.469 3.618 3.763 3.932 4.086 4.241 4.429 4.644 4.855 5.08 5.325 5.593 5.865 6.174 6.556 6.927 7.354 7.859 8.432 9.032 9.772 10.673 11.596 12.2 12.437 12.499 12.501 12.446 12.357 12.27 12.173 12.05 11.923 11.805 11.69 11.576 11.452 11.328 11.17 11.008 10.861 10.692 10.526 10.411 10.275 10.117 9.995 9.869 9.725 9.576 9.419 9.308 9.2 9.008 8.84 8.651 8.56 8.376 8.188 7.986 7.862 7.611 7.516 7.392 7.239 6.953 6.799 6.609 6.394 6.152 5.859 5.495 4.403 -9 ,273 ,TETRA ,17606112,Sun Nov 28 19:53:15 CET,Sun Nov 28 22:06:46 CET,0.0 0.453 0.647 0.769 0.887 0.99 1.081 1.177 1.336 1.412 1.49 1.507 1.705 1.774 1.904 2.021 2.127 2.176 2.282 2.383 2.517 2.605 2.692 2.822 2.948 3.069 3.184 3.289 3.433 3.586 3.742 3.918 4.071 4.227 4.417 4.635 4.853 5.098 5.375 5.674 5.972 6.298 6.676 7.069 7.533 8.047 8.635 9.281 10.05 10.967 12.07 12.93 13.323 13.481 13.524 13.493 13.404 13.27 13.128 12.984 12.844 12.697 12.567 12.445 12.315 12.174 12.027 11.878 11.732 11.578 11.406 11.273 11.135 10.975 10.842 10.698 10.553 10.396 10.232 10.126 10.001 9.802 9.691 9.565 9.478 9.283 9.076 8.879 8.776 8.531 8.399 8.262 8.107 7.801 7.639 7.452 7.22 6.95 6.692 6.368 4.891 -10 ,32181 ,TETRA ,17606113,Sun Nov 28 19:53:16 CET,Sun Nov 28 22:05:59 CET,0.0 0.426 0.571 0.697 0.825 0.943 1.054 1.162 1.334 1.404 1.474 1.489 1.688 1.753 1.876 2.01 2.135 2.195 2.304 2.402 2.55 2.652 2.754 2.882 3.002 3.129 3.248 3.364 3.527 3.697 3.864 4.054 4.244 4.431 4.644 4.874 5.097 5.353 5.632 5.934 6.233 6.563 6.949 7.327 7.768 8.272 8.866 9.508 10.253 11.144 12.128 12.819 13.146 13.275 13.259 13.194 13.074 12.915 12.791 12.677 12.555 12.423 12.291 12.159 12.023 11.882 11.688 11.493 11.356 11.229 11.045 10.86 10.671 10.509 10.393 10.243 10.078 9.916 9.747 9.617 9.467 9.215 9.053 8.889 8.809 8.65 8.467 8.276 8.188 7.976 7.888 7.771 7.638 7.373 7.22 7.041 6.823 6.536 6.217 5.831 4.533 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_34_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_34_37.txt deleted file mode 100644 index a28d9732..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_34_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8924 ,TETRA ,17606114,Sun Nov 28 19:53:12 CET,Sun Nov 28 22:07:49 CET,0.0 0.982 1.312 1.577 1.811 2.016 2.203 2.358 2.612 2.735 2.847 2.941 3.141 3.239 3.423 3.587 3.723 3.791 3.925 4.05 4.218 4.324 4.428 4.561 4.688 4.821 4.955 5.083 5.235 5.371 5.496 5.646 5.788 5.914 6.046 6.2 6.349 6.5 6.647 6.781 6.915 7.063 7.219 7.337 7.449 7.565 7.689 7.769 7.707 7.382 6.652 5.669 4.79 4.049 3.428 2.856 2.339 1.871 1.465 1.048 0.675 0.346 0.048 -0.222 -0.465 -0.689 -0.926 -1.137 -1.323 -1.525 -1.733 -1.911 -2.086 -2.27 -2.414 -2.551 -2.701 -2.871 -3.044 -3.154 -3.274 -3.487 -3.636 -3.782 -3.856 -4.01 -4.194 -4.405 -4.519 -4.735 -4.826 -4.93 -5.023 -5.242 -5.37 -5.522 -5.667 -5.823 -6.036 -6.321 -6.999 -2 ,31684 ,TETRA ,17606115,Sun Nov 28 19:53:16 CET,Sun Nov 28 22:08:07 CET,0.0 1.459 1.878 2.189 2.444 2.67 2.869 3.056 3.374 3.499 3.611 3.734 3.958 4.072 4.26 4.427 4.573 4.648 4.8 4.927 5.096 5.202 5.311 5.466 5.602 5.731 5.858 5.967 6.102 6.238 6.375 6.544 6.684 6.804 6.953 7.12 7.27 7.414 7.559 7.721 7.878 8.051 8.239 8.433 8.649 8.835 9.014 9.123 9.114 8.862 8.157 7.125 6.237 5.481 4.792 4.149 3.59 3.109 2.704 2.305 1.96 1.641 1.338 1.044 0.777 0.542 0.289 0.046 -0.158 -0.35 -0.556 -0.736 -0.925 -1.123 -1.27 -1.417 -1.589 -1.776 -1.959 -2.083 -2.209 -2.41 -2.547 -2.693 -2.773 -2.928 -3.085 -3.261 -3.352 -3.557 -3.637 -3.745 -3.856 -4.11 -4.249 -4.398 -4.559 -4.713 -4.93 -5.275 -6.322 -3 ,11135 ,TETRA ,17606116,Sun Nov 28 19:53:12 CET,Sun Nov 28 22:08:46 CET,0.0 1.413 1.817 2.12 2.367 2.586 2.776 2.938 3.218 3.341 3.451 3.546 3.749 3.847 4.03 4.218 4.402 4.482 4.616 4.736 4.898 5.009 5.118 5.265 5.405 5.538 5.654 5.769 5.921 6.046 6.159 6.301 6.451 6.617 6.811 6.997 7.147 7.303 7.458 7.617 7.786 7.957 8.138 8.274 8.406 8.538 8.621 8.644 8.562 8.284 7.557 6.494 5.483 4.576 3.795 3.084 2.499 1.983 1.519 1.057 0.649 0.295 -0.025 -0.319 -0.594 -0.87 -1.143 -1.373 -1.576 -1.784 -2.006 -2.187 -2.369 -2.55 -2.686 -2.833 -2.998 -3.16 -3.323 -3.457 -3.597 -3.786 -3.911 -4.052 -4.135 -4.302 -4.493 -4.719 -4.823 -5.032 -5.132 -5.231 -5.327 -5.541 -5.672 -5.823 -5.977 -6.154 -6.417 -6.801 -7.833 -4 ,30200 ,TETRA ,17606117,Sun Nov 28 19:53:15 CET,Sun Nov 28 22:08:08 CET,0.0 1.687 2.134 2.447 2.727 2.985 3.204 3.378 3.659 3.786 3.907 4.019 4.212 4.302 4.48 4.636 4.772 4.839 4.971 5.087 5.248 5.372 5.493 5.639 5.785 5.936 6.061 6.181 6.341 6.482 6.595 6.719 6.847 6.975 7.124 7.28 7.429 7.59 7.746 7.897 8.065 8.243 8.378 8.495 8.614 8.722 8.813 8.824 8.739 8.491 7.822 6.759 5.794 4.949 4.221 3.581 2.997 2.479 2.058 1.652 1.309 0.99 0.69 0.404 0.132 -0.116 -0.378 -0.618 -0.82 -1.023 -1.228 -1.399 -1.575 -1.765 -1.914 -2.064 -2.223 -2.377 -2.545 -2.67 -2.793 -2.999 -3.149 -3.295 -3.363 -3.506 -3.669 -3.838 -3.922 -4.113 -4.166 -4.253 -4.367 -4.671 -4.821 -4.953 -5.106 -5.277 -5.459 -5.739 -6.823 -5 ,8065 ,TETRA ,17606118,Sun Nov 28 19:53:13 CET,Sun Nov 28 22:08:41 CET,0.0 1.101 1.542 1.871 2.115 2.331 2.522 2.687 2.975 3.091 3.201 3.313 3.514 3.61 3.791 3.95 4.102 4.176 4.311 4.431 4.604 4.714 4.82 4.975 5.115 5.247 5.369 5.47 5.609 5.751 5.886 6.052 6.199 6.327 6.465 6.625 6.764 6.895 7.023 7.161 7.305 7.451 7.615 7.755 7.898 8.035 8.113 8.124 8.07 7.762 6.953 5.894 4.985 4.182 3.485 2.853 2.267 1.735 1.309 0.894 0.523 0.206 -0.091 -0.378 -0.63 -0.873 -1.132 -1.351 -1.543 -1.745 -1.944 -2.109 -2.301 -2.508 -2.654 -2.797 -2.941 -3.081 -3.246 -3.372 -3.493 -3.668 -3.799 -3.933 -3.998 -4.154 -4.32 -4.475 -4.55 -4.744 -4.827 -4.934 -5.034 -5.243 -5.367 -5.506 -5.646 -5.807 -6.045 -6.38 -7.047 -6 ,16017 ,TETRA ,17606119,Sun Nov 28 19:53:14 CET,Sun Nov 28 22:08:51 CET,0.0 1.665 2.109 2.468 2.753 2.983 3.17 3.334 3.642 3.786 3.93 4.065 4.269 4.373 4.56 4.714 4.84 4.895 5.015 5.147 5.321 5.424 5.509 5.625 5.751 5.874 5.989 6.09 6.215 6.345 6.472 6.608 6.73 6.845 6.972 7.119 7.273 7.43 7.558 7.713 7.887 8.045 8.195 8.295 8.373 8.442 8.485 8.463 8.306 7.989 7.327 6.341 5.452 4.618 3.882 3.25 2.702 2.208 1.767 1.296 0.912 0.587 0.282 0.001 -0.275 -0.526 -0.775 -1.002 -1.204 -1.418 -1.641 -1.82 -2.013 -2.216 -2.366 -2.506 -2.651 -2.809 -2.963 -3.067 -3.184 -3.394 -3.55 -3.702 -3.788 -3.959 -4.112 -4.278 -4.363 -4.56 -4.641 -4.745 -4.858 -5.119 -5.244 -5.363 -5.504 -5.708 -5.973 -6.286 -7.026 -7 ,7289 ,TETRA ,17606120,Sun Nov 28 19:53:16 CET,Sun Nov 28 22:09:26 CET,0.0 1.379 1.826 2.145 2.418 2.636 2.802 2.965 3.259 3.385 3.499 3.593 3.793 3.894 4.071 4.232 4.371 4.439 4.574 4.692 4.859 4.961 5.061 5.219 5.366 5.504 5.624 5.738 5.889 6.036 6.17 6.328 6.472 6.601 6.748 6.894 7.04 7.196 7.342 7.488 7.62 7.771 7.969 8.147 8.337 8.517 8.613 8.587 8.421 8.053 7.384 6.349 5.351 4.484 3.764 3.151 2.598 2.093 1.652 1.216 0.857 0.538 0.246 -0.02 -0.272 -0.504 -0.757 -0.988 -1.181 -1.394 -1.633 -1.814 -1.984 -2.165 -2.31 -2.454 -2.598 -2.759 -2.935 -3.052 -3.171 -3.365 -3.495 -3.635 -3.708 -3.874 -4.037 -4.177 -4.261 -4.464 -4.53 -4.622 -4.714 -4.944 -5.085 -5.229 -5.356 -5.49 -5.641 -5.812 -6.217 -8 ,13083 ,TETRA ,17606121,Sun Nov 28 19:53:18 CET,Sun Nov 28 22:10:15 CET,0.0 1.148 1.598 1.935 2.177 2.377 2.572 2.757 3.055 3.183 3.302 3.406 3.604 3.693 3.852 4.005 4.164 4.237 4.371 4.488 4.647 4.757 4.86 4.997 5.115 5.227 5.338 5.44 5.575 5.707 5.827 5.952 6.06 6.155 6.26 6.384 6.503 6.633 6.771 6.918 7.066 7.205 7.353 7.476 7.596 7.676 7.701 7.676 7.529 7.194 6.515 5.492 4.527 3.692 2.992 2.393 1.863 1.358 0.935 0.517 0.159 -0.166 -0.479 -0.767 -1.052 -1.321 -1.584 -1.809 -2.005 -2.213 -2.419 -2.593 -2.782 -2.973 -3.131 -3.321 -3.508 -3.68 -3.851 -3.973 -4.109 -4.32 -4.467 -4.632 -4.718 -4.883 -5.028 -5.168 -5.253 -5.463 -5.539 -5.652 -5.787 -6.043 -6.165 -6.299 -6.485 -6.696 -6.909 -7.135 -7.598 -9 ,15969 ,TETRA ,17606122,Sun Nov 28 19:53:13 CET,Sun Nov 28 22:08:58 CET,0.0 1.441 1.896 2.194 2.426 2.628 2.825 2.996 3.273 3.394 3.505 3.61 3.802 3.886 4.055 4.212 4.358 4.43 4.569 4.696 4.871 4.977 5.074 5.226 5.368 5.487 5.607 5.712 5.83 5.941 6.059 6.207 6.365 6.521 6.679 6.844 6.992 7.149 7.288 7.414 7.534 7.652 7.782 7.894 8.014 8.118 8.165 8.133 8.076 7.909 7.36 6.416 5.483 4.666 3.975 3.329 2.732 2.203 1.757 1.309 0.932 0.6 0.283 -0.004 -0.29 -0.564 -0.843 -1.101 -1.31 -1.513 -1.739 -1.926 -2.125 -2.344 -2.508 -2.68 -2.863 -3.044 -3.223 -3.354 -3.491 -3.708 -3.86 -4.006 -4.078 -4.237 -4.422 -4.612 -4.711 -4.927 -5.019 -5.148 -5.286 -5.506 -5.632 -5.763 -5.896 -6.039 -6.261 -6.575 -7.396 -10 ,21004 ,TETRA ,17606123,Sun Nov 28 19:53:14 CET,Sun Nov 28 22:07:39 CET,0.0 1.851 2.307 2.614 2.858 3.072 3.251 3.407 3.69 3.815 3.923 4.006 4.194 4.282 4.469 4.625 4.761 4.83 4.954 5.088 5.281 5.383 5.478 5.617 5.753 5.882 5.991 6.084 6.208 6.35 6.494 6.632 6.758 6.884 7.013 7.151 7.269 7.378 7.491 7.6 7.72 7.852 7.973 8.082 8.217 8.336 8.406 8.448 8.404 8.132 7.421 6.435 5.553 4.746 4.021 3.38 2.834 2.339 1.9 1.456 1.088 0.771 0.465 0.16 -0.122 -0.363 -0.603 -0.819 -1.005 -1.182 -1.364 -1.522 -1.695 -1.882 -2.025 -2.169 -2.314 -2.463 -2.632 -2.757 -2.88 -3.067 -3.198 -3.343 -3.426 -3.585 -3.745 -3.92 -4.017 -4.234 -4.323 -4.439 -4.554 -4.783 -4.946 -5.112 -5.284 -5.534 -5.803 -6.054 -6.575 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_35_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_35_19.txt deleted file mode 100644 index b3a01209..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_35_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15901 ,KEBNE ,17074165,Sat Dec 25 00:17:47 CET,Sat Dec 25 02:09:11 CET,0.0 0.357 0.476 0.561 0.634 0.703 0.788 0.865 0.997 1.064 1.121 1.143 1.314 1.366 1.467 1.567 1.655 1.698 1.784 1.855 1.922 1.973 2.039 2.129 2.215 2.297 2.374 2.455 2.543 2.607 2.674 2.751 2.818 2.887 2.969 3.064 3.148 3.243 3.346 3.438 3.512 3.594 3.696 3.762 3.775 3.685 3.527 3.329 2.961 2.239 0.923 -0.598 -1.899 -3.072 -4.069 -4.913 -5.671 -6.395 -7.06 -7.732 -8.295 -8.787 -9.236 -9.627 -9.978 -10.304 -10.653 -10.965 -11.219 -11.474 -11.745 -11.976 -12.209 -12.443 -12.618 -12.792 -12.985 -13.203 -13.433 -13.59 -13.751 -14.018 -14.226 -14.44 -14.538 -14.726 -14.93 -15.176 -15.329 -15.616 -15.84 -16.02 -16.192 -16.618 -16.851 -17.093 -17.346 -17.595 -17.902 -18.284 -20.244 -2 ,15215 ,KEBNE ,17076611,Sat Dec 25 00:31:30 CET,Sat Dec 25 02:02:54 CET,0.0 0.269 0.427 0.533 0.613 0.694 0.777 0.856 0.987 1.048 1.094 1.066 1.206 1.24 1.297 1.36 1.427 1.464 1.536 1.594 1.697 1.766 1.816 1.899 2.003 2.09 2.171 2.241 2.316 2.391 2.456 2.522 2.584 2.645 2.727 2.842 2.941 3.034 3.125 3.203 3.257 3.3 3.353 3.386 3.42 3.466 3.456 3.33 3.017 2.491 1.443 -0.209 -1.593 -2.758 -3.821 -4.841 -5.705 -6.421 -7.014 -7.583 -8.077 -8.539 -8.984 -9.404 -9.801 -10.157 -10.516 -10.823 -11.072 -11.331 -11.615 -11.847 -12.094 -12.367 -12.574 -12.781 -12.99 -13.207 -13.441 -13.602 -13.772 -14.04 -14.236 -14.453 -14.562 -14.781 -15.015 -15.262 -15.392 -15.654 -15.847 -15.988 -16.123 -16.469 -16.667 -16.896 -17.15 -17.411 -17.737 -18.184 -19.73 -3 ,1142 ,KEBNE ,17076612,Sat Dec 25 00:31:30 CET,Sat Dec 25 02:09:58 CET,0.0 0.223 0.345 0.455 0.549 0.627 0.697 0.76 0.875 0.926 0.977 0.972 1.13 1.177 1.262 1.338 1.413 1.45 1.515 1.584 1.698 1.765 1.821 1.911 2.003 2.079 2.145 2.216 2.291 2.344 2.399 2.471 2.54 2.601 2.668 2.742 2.805 2.882 2.987 3.104 3.211 3.301 3.375 3.459 3.538 3.573 3.567 3.474 3.202 2.626 1.452 -0.083 -1.376 -2.48 -3.42 -4.269 -5.041 -5.703 -6.257 -6.843 -7.337 -7.782 -8.216 -8.628 -8.995 -9.304 -9.627 -9.916 -10.166 -10.418 -10.687 -10.93 -11.167 -11.409 -11.602 -11.812 -12.031 -12.24 -12.483 -12.658 -12.833 -13.14 -13.356 -13.568 -13.686 -13.935 -14.192 -14.492 -14.648 -14.942 -15.182 -15.344 -15.508 -15.924 -16.177 -16.432 -16.695 -16.971 -17.326 -17.832 -19.536 -4 ,26989 ,KEBNE ,17076613,Sat Dec 25 00:31:29 CET,Sat Dec 25 02:10:19 CET,0.0 0.201 0.318 0.423 0.508 0.599 0.703 0.782 0.905 0.962 1.02 1.024 1.186 1.24 1.342 1.435 1.522 1.561 1.63 1.692 1.789 1.854 1.911 1.998 2.08 2.158 2.233 2.297 2.375 2.453 2.538 2.642 2.739 2.819 2.902 3.0 3.094 3.203 3.301 3.384 3.476 3.593 3.713 3.809 3.889 3.906 3.888 3.73 3.299 2.543 1.133 -0.689 -2.085 -3.181 -4.099 -4.946 -5.719 -6.38 -6.905 -7.442 -7.96 -8.432 -8.856 -9.27 -9.655 -9.972 -10.283 -10.57 -10.81 -11.052 -11.299 -11.519 -11.764 -12.003 -12.176 -12.351 -12.54 -12.751 -12.97 -13.122 -13.279 -13.511 -13.667 -13.816 -13.895 -14.09 -14.37 -14.72 -14.873 -15.123 -15.315 -15.511 -15.726 -16.157 -16.4 -16.652 -16.934 -17.244 -17.664 -18.282 -19.859 -5 ,16065 ,KEBNE ,17076614,Sat Dec 25 00:31:29 CET,Sat Dec 25 02:05:32 CET,0.0 0.247 0.336 0.429 0.516 0.589 0.654 0.722 0.841 0.895 0.954 0.952 1.108 1.159 1.259 1.354 1.439 1.474 1.544 1.621 1.734 1.793 1.843 1.924 1.996 2.057 2.121 2.177 2.239 2.302 2.356 2.418 2.479 2.524 2.584 2.655 2.716 2.782 2.833 2.876 2.908 2.917 2.943 2.941 2.909 2.88 2.795 2.58 2.128 1.403 0.134 -1.491 -2.924 -4.111 -5.054 -5.864 -6.588 -7.216 -7.745 -8.317 -8.803 -9.216 -9.597 -9.937 -10.258 -10.553 -10.872 -11.155 -11.398 -11.647 -11.908 -12.124 -12.335 -12.558 -12.736 -12.918 -13.103 -13.304 -13.533 -13.697 -13.869 -14.135 -14.319 -14.51 -14.607 -14.802 -15.024 -15.281 -15.418 -15.666 -15.799 -15.931 -16.098 -16.538 -16.791 -17.075 -17.344 -17.661 -18.1 -18.818 -20.948 -6 ,1700 ,KEBNE ,17074173,Sat Dec 25 00:17:49 CET,Sat Dec 25 02:05:19 CET,0.0 0.166 0.297 0.391 0.464 0.544 0.614 0.678 0.799 0.865 0.927 0.927 1.077 1.125 1.217 1.289 1.364 1.4 1.482 1.562 1.655 1.713 1.773 1.856 1.925 1.989 2.053 2.113 2.202 2.298 2.386 2.496 2.598 2.671 2.758 2.867 2.957 3.043 3.122 3.208 3.3 3.392 3.464 3.481 3.481 3.448 3.349 3.124 2.688 1.974 0.799 -0.716 -2.008 -3.043 -3.97 -4.857 -5.646 -6.353 -6.956 -7.519 -7.967 -8.37 -8.762 -9.134 -9.472 -9.773 -10.093 -10.381 -10.63 -10.914 -11.229 -11.482 -11.729 -11.982 -12.181 -12.389 -12.608 -12.83 -13.071 -13.236 -13.399 -13.675 -13.884 -14.105 -14.217 -14.449 -14.684 -14.928 -15.067 -15.328 -15.504 -15.662 -15.817 -16.216 -16.436 -16.656 -16.939 -17.251 -17.614 -18.2 -20.214 -7 ,15877 ,KEBNE ,17074175,Sat Dec 25 00:17:49 CET,Sat Dec 25 02:09:00 CET,0.0 0.117 0.264 0.429 0.539 0.621 0.714 0.798 0.946 1.006 1.053 1.042 1.204 1.258 1.361 1.446 1.52 1.558 1.635 1.713 1.833 1.904 1.971 2.073 2.163 2.249 2.334 2.406 2.487 2.567 2.649 2.74 2.822 2.902 2.989 3.073 3.152 3.249 3.328 3.404 3.485 3.545 3.583 3.568 3.523 3.449 3.345 3.192 2.868 2.243 0.956 -0.733 -2.124 -3.341 -4.392 -5.266 -6.011 -6.691 -7.274 -7.84 -8.331 -8.744 -9.111 -9.479 -9.834 -10.15 -10.479 -10.786 -11.047 -11.3 -11.566 -11.809 -12.065 -12.316 -12.509 -12.715 -12.919 -13.113 -13.34 -13.503 -13.67 -13.95 -14.157 -14.385 -14.502 -14.736 -14.998 -15.295 -15.443 -15.717 -15.905 -16.05 -16.226 -16.625 -16.82 -17.022 -17.255 -17.497 -17.76 -18.114 -19.238 -8 ,21465 ,KEBNE ,17076617,Sat Dec 25 00:31:29 CET,Sat Dec 25 02:11:04 CET,0.0 0.478 0.671 0.759 0.853 0.952 1.021 1.081 1.22 1.292 1.366 1.379 1.53 1.573 1.663 1.747 1.825 1.864 1.94 2.006 2.103 2.172 2.236 2.304 2.368 2.432 2.507 2.58 2.664 2.744 2.818 2.92 3.022 3.11 3.2 3.301 3.392 3.499 3.618 3.734 3.829 3.912 3.981 4.037 4.097 4.094 4.014 3.892 3.607 3.029 1.906 0.332 -1.026 -2.148 -3.068 -3.932 -4.686 -5.341 -5.897 -6.442 -6.929 -7.38 -7.818 -8.23 -8.61 -8.944 -9.286 -9.612 -9.878 -10.149 -10.439 -10.65 -10.861 -11.101 -11.312 -11.545 -11.763 -11.974 -12.209 -12.374 -12.554 -12.817 -12.983 -13.145 -13.225 -13.412 -13.622 -13.854 -13.982 -14.219 -14.335 -14.504 -14.707 -15.108 -15.296 -15.48 -15.711 -16.017 -16.326 -16.639 -17.678 -9 ,21482 ,KEBNE ,17074178,Sat Dec 25 00:17:47 CET,Sat Dec 25 02:09:49 CET,0.0 0.242 0.348 0.485 0.606 0.682 0.744 0.805 0.927 1.002 1.074 1.063 1.221 1.278 1.378 1.456 1.534 1.571 1.649 1.729 1.839 1.903 1.961 2.046 2.138 2.224 2.297 2.367 2.454 2.543 2.632 2.739 2.834 2.909 2.996 3.105 3.198 3.28 3.362 3.444 3.517 3.587 3.657 3.713 3.671 3.573 3.534 3.421 3.141 2.587 1.441 -0.043 -1.329 -2.527 -3.58 -4.501 -5.243 -5.891 -6.483 -7.083 -7.631 -8.101 -8.508 -8.903 -9.275 -9.599 -9.93 -10.24 -10.516 -10.8 -11.093 -11.325 -11.559 -11.804 -11.996 -12.192 -12.388 -12.599 -12.836 -13.008 -13.185 -13.454 -13.631 -13.804 -13.895 -14.1 -14.33 -14.568 -14.69 -14.941 -15.097 -15.251 -15.406 -15.72 -15.934 -16.173 -16.408 -16.727 -17.123 -17.573 -19.689 -10 ,15976 ,KEBNE ,17076619,Sat Dec 25 00:32:32 CET,Sat Dec 25 02:11:32 CET,0.0 0.211 0.341 0.424 0.487 0.557 0.64 0.712 0.827 0.879 0.935 0.966 1.139 1.192 1.278 1.356 1.432 1.472 1.541 1.599 1.689 1.745 1.802 1.886 1.957 2.025 2.095 2.164 2.254 2.334 2.399 2.481 2.566 2.642 2.734 2.831 2.904 2.991 3.105 3.226 3.349 3.463 3.565 3.64 3.678 3.687 3.676 3.619 3.329 2.626 1.425 -0.11 -1.541 -2.782 -3.756 -4.581 -5.324 -6.0 -6.564 -7.112 -7.589 -8.013 -8.438 -8.855 -9.23 -9.559 -9.891 -10.182 -10.443 -10.739 -11.063 -11.326 -11.564 -11.795 -11.969 -12.156 -12.373 -12.612 -12.869 -13.047 -13.235 -13.535 -13.791 -14.092 -14.24 -14.573 -14.923 -15.222 -15.367 -15.647 -15.889 -16.052 -16.229 -16.639 -16.868 -17.127 -17.387 -17.669 -18.058 -18.647 -20.343 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_35_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_35_44.txt deleted file mode 100644 index fc5e5ebe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_35_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,924 ,KEBNE ,17027646,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:32:14 CET,0.0 0.577 0.877 1.134 1.354 1.532 1.697 1.855 2.151 2.29 2.419 2.547 2.788 2.904 3.096 3.293 3.498 3.595 3.772 3.94 4.195 4.362 4.519 4.749 4.979 5.204 5.421 5.628 5.891 6.153 6.406 6.702 6.986 7.25 7.523 7.828 8.14 8.493 8.877 9.281 9.736 10.276 10.904 11.494 12.126 12.816 13.679 14.677 15.745 16.986 18.273 19.064 19.4 19.548 19.566 19.441 19.238 19.075 18.904 18.689 18.48 18.244 18.0 17.762 17.538 17.351 17.177 16.993 16.814 16.624 16.409 16.233 16.064 15.881 15.728 15.559 15.388 15.218 15.036 14.9 14.76 14.558 14.424 14.274 14.195 14.04 13.858 13.662 13.55 13.339 13.21 13.076 12.932 12.626 12.457 12.25 12.041 11.812 11.483 11.038 8.72 -2 ,5733 ,KEBNE ,17027647,Wed Dec 22 17:41:05 CET,Wed Dec 22 19:33:41 CET,0.0 1.47 1.831 2.1 2.353 2.553 2.732 2.911 3.228 3.362 3.495 3.644 3.869 3.981 4.188 4.39 4.577 4.66 4.818 4.982 5.229 5.391 5.552 5.788 6.006 6.211 6.416 6.616 6.873 7.133 7.379 7.663 7.94 8.21 8.524 8.873 9.197 9.544 9.916 10.297 10.718 11.216 11.813 12.429 13.115 13.895 14.794 15.667 16.561 17.682 19.085 20.063 20.461 20.556 20.505 20.389 20.253 20.119 19.932 19.694 19.496 19.307 19.094 18.887 18.647 18.415 18.203 17.997 17.826 17.614 17.361 17.177 17.001 16.812 16.643 16.467 16.31 16.171 16.013 15.884 15.737 15.508 15.37 15.21 15.125 14.937 14.728 14.53 14.43 14.225 14.068 13.931 13.787 13.404 13.174 12.915 12.663 12.404 12.093 11.551 9.109 -3 ,613 ,KEBNE ,17027648,Wed Dec 22 17:41:05 CET,Wed Dec 22 19:32:58 CET,0.0 0.967 1.292 1.572 1.81 2.002 2.171 2.324 2.62 2.762 2.899 3.07 3.317 3.445 3.669 3.883 4.116 4.229 4.423 4.595 4.852 5.04 5.221 5.478 5.717 5.947 6.186 6.423 6.712 6.979 7.23 7.516 7.801 8.103 8.438 8.76 9.081 9.456 9.853 10.293 10.778 11.302 11.849 12.391 13.03 13.76 14.644 15.581 16.601 17.775 19.064 19.993 20.473 20.6 20.556 20.422 20.215 19.949 19.674 19.399 19.148 18.907 18.672 18.442 18.225 18.022 17.795 17.579 17.368 17.157 16.949 16.777 16.611 16.43 16.264 16.077 15.889 15.692 15.481 15.327 15.165 14.934 14.78 14.607 14.51 14.305 14.114 13.932 13.829 13.611 13.417 13.249 13.063 12.671 12.451 12.251 12.04 11.739 11.353 10.869 7.867 -4 ,27711 ,KEBNE ,17027649,Wed Dec 22 17:41:04 CET,Wed Dec 22 19:32:45 CET,0.0 0.963 1.304 1.593 1.854 2.065 2.278 2.47 2.799 2.956 3.089 3.259 3.504 3.628 3.86 4.079 4.296 4.395 4.596 4.787 5.039 5.212 5.39 5.654 5.908 6.135 6.351 6.568 6.846 7.128 7.396 7.709 7.999 8.275 8.618 9.023 9.421 9.864 10.339 10.83 11.346 11.933 12.611 13.296 14.093 15.048 16.175 17.276 18.439 19.655 20.949 21.855 22.086 22.002 21.869 21.775 21.645 21.472 21.305 21.084 20.828 20.574 20.329 20.108 19.895 19.684 19.453 19.233 19.014 18.78 18.563 18.388 18.197 17.991 17.837 17.676 17.506 17.338 17.134 16.989 16.857 16.633 16.474 16.312 16.229 16.048 15.821 15.558 15.432 15.205 15.007 14.875 14.743 14.408 14.218 14.022 13.787 13.511 13.183 12.574 10.212 -5 ,30904 ,KEBNE ,17027650,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:33:09 CET,0.0 0.919 1.249 1.515 1.736 1.942 2.126 2.312 2.651 2.805 2.957 3.118 3.358 3.485 3.706 3.912 4.108 4.199 4.371 4.547 4.815 4.982 5.148 5.38 5.59 5.804 6.015 6.215 6.467 6.716 6.966 7.265 7.566 7.862 8.19 8.535 8.884 9.298 9.744 10.236 10.771 11.377 12.07 12.765 13.561 14.39 15.351 16.405 17.551 18.772 20.179 21.141 21.506 21.656 21.655 21.586 21.519 21.442 21.325 21.193 21.084 20.963 20.833 20.697 20.532 20.363 20.195 20.045 19.912 19.766 19.605 19.461 19.293 19.093 18.931 18.754 18.574 18.392 18.196 18.055 17.906 17.684 17.518 17.342 17.253 17.055 16.848 16.642 16.532 16.316 16.113 15.968 15.832 15.528 15.371 15.177 14.936 14.666 14.333 13.826 11.83 -6 ,23723 ,KEBNE ,17027651,Wed Dec 22 17:41:02 CET,Wed Dec 22 19:32:33 CET,0.0 0.847 1.195 1.448 1.671 1.89 2.089 2.258 2.58 2.738 2.893 3.068 3.302 3.421 3.674 3.925 4.158 4.268 4.469 4.651 4.918 5.101 5.272 5.516 5.756 5.991 6.208 6.423 6.72 7.001 7.259 7.557 7.814 8.072 8.39 8.743 9.074 9.443 9.877 10.336 10.812 11.347 11.951 12.549 13.233 13.975 14.901 15.989 17.167 18.423 19.727 20.594 20.973 21.136 21.123 21.013 20.815 20.6 20.452 20.232 19.971 19.708 19.479 19.268 19.068 18.903 18.716 18.528 18.352 18.149 17.93 17.751 17.566 17.361 17.193 17.022 16.853 16.67 16.472 16.351 16.223 15.992 15.836 15.685 15.605 15.411 15.212 15.005 14.886 14.662 14.467 14.332 14.2 13.898 13.727 13.526 13.26 12.938 12.545 12.074 8.606 -7 ,17149 ,KEBNE ,17027652,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:33:14 CET,0.0 1.054 1.419 1.689 1.896 2.094 2.289 2.463 2.777 2.928 3.067 3.213 3.453 3.579 3.812 4.026 4.236 4.336 4.53 4.721 4.987 5.159 5.321 5.549 5.778 6.0 6.218 6.43 6.693 6.946 7.183 7.465 7.745 8.022 8.35 8.725 9.076 9.46 9.869 10.303 10.792 11.354 12.009 12.641 13.372 14.163 15.041 16.022 17.152 18.399 19.812 20.766 21.204 21.371 21.351 21.237 21.055 20.832 20.627 20.455 20.289 20.08 19.868 19.693 19.503 19.31 19.112 18.939 18.793 18.626 18.44 18.28 18.102 17.909 17.764 17.605 17.441 17.287 17.105 16.978 16.838 16.601 16.441 16.287 16.205 16.002 15.811 15.609 15.498 15.281 15.11 14.97 14.81 14.431 14.218 13.984 13.715 13.435 13.122 12.741 10.641 -8 ,2217 ,KEBNE ,17027653,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:33:31 CET,0.0 1.426 1.846 2.113 2.34 2.523 2.705 2.883 3.206 3.343 3.47 3.604 3.821 3.925 4.123 4.32 4.502 4.586 4.748 4.914 5.167 5.327 5.476 5.684 5.893 6.099 6.292 6.492 6.767 7.022 7.254 7.532 7.784 8.016 8.3 8.634 8.954 9.307 9.724 10.189 10.642 11.146 11.733 12.301 12.946 13.666 14.574 15.588 16.721 18.005 19.462 20.372 20.674 20.751 20.625 20.453 20.335 20.207 20.07 19.864 19.653 19.483 19.302 19.111 18.918 18.711 18.495 18.321 18.158 17.996 17.824 17.65 17.481 17.311 17.167 17.025 16.876 16.725 16.577 16.454 16.315 16.101 15.944 15.782 15.695 15.51 15.312 15.114 15.016 14.809 14.643 14.508 14.366 14.065 13.895 13.709 13.47 13.183 12.873 12.361 9.603 -9 ,24367 ,KEBNE ,17027654,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:32:57 CET,0.0 1.246 1.628 1.96 2.217 2.409 2.578 2.738 3.039 3.177 3.307 3.43 3.63 3.733 3.943 4.134 4.312 4.399 4.56 4.718 4.976 5.141 5.291 5.505 5.71 5.91 6.115 6.316 6.574 6.813 7.034 7.312 7.582 7.839 8.144 8.476 8.791 9.155 9.562 9.973 10.369 10.809 11.313 11.852 12.539 13.301 14.125 15.036 16.051 17.123 18.196 18.853 19.083 19.045 18.961 18.834 18.686 18.544 18.373 18.111 17.809 17.588 17.39 17.14 16.892 16.657 16.41 16.198 16.024 15.857 15.681 15.506 15.312 15.13 15.002 14.863 14.71 14.553 14.382 14.252 14.112 13.914 13.763 13.605 13.537 13.352 13.128 12.89 12.769 12.567 12.435 12.318 12.198 11.889 11.7 11.526 11.296 10.94 10.493 9.902 7.069 -10 ,29197 ,KEBNE ,17027655,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:33:14 CET,0.0 1.08 1.495 1.807 2.065 2.29 2.476 2.639 2.942 3.082 3.209 3.32 3.531 3.626 3.822 4.015 4.201 4.293 4.47 4.655 4.933 5.111 5.285 5.538 5.763 5.956 6.153 6.353 6.598 6.842 7.098 7.4 7.688 7.973 8.272 8.591 8.917 9.281 9.667 10.097 10.58 11.119 11.684 12.239 12.89 13.6 14.482 15.469 16.531 17.724 19.044 19.873 20.12 20.149 20.138 20.035 19.838 19.634 19.433 19.176 18.91 18.645 18.368 18.125 17.913 17.724 17.551 17.39 17.212 17.019 16.833 16.682 16.517 16.326 16.176 16.033 15.891 15.746 15.579 15.459 15.327 15.118 14.969 14.794 14.713 14.566 14.408 14.242 14.147 13.942 13.826 13.717 13.574 13.268 13.111 12.912 12.684 12.413 12.094 11.674 9.282 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_36_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_36_35.txt deleted file mode 100644 index 705ff8bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_36_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22901 ,TETRA ,17606124,Sun Nov 28 19:53:17 CET,Sun Nov 28 22:12:33 CET,0.0 0.378 0.609 0.802 0.942 1.081 1.224 1.348 1.553 1.646 1.746 1.817 2.0 2.086 2.232 2.371 2.513 2.583 2.709 2.809 2.963 3.077 3.192 3.361 3.516 3.674 3.832 3.966 4.137 4.304 4.443 4.602 4.756 4.898 5.063 5.25 5.428 5.632 5.866 6.136 6.426 6.742 7.136 7.543 7.968 8.444 8.975 9.517 10.13 10.781 11.402 11.541 11.355 11.003 10.568 10.173 9.874 9.542 9.178 8.816 8.509 8.252 7.962 7.653 7.371 7.129 6.882 6.624 6.387 6.137 5.87 5.65 5.435 5.201 5.001 4.787 4.556 4.31 4.06 3.899 3.739 3.496 3.329 3.146 3.041 2.819 2.592 2.343 2.208 1.967 1.802 1.659 1.513 1.22 1.051 0.882 0.69 0.463 0.192 -0.219 -1.479 -2 ,17302 ,TETRA ,17606125,Sun Nov 28 19:53:18 CET,Sun Nov 28 22:12:15 CET,0.0 0.37 0.582 0.777 0.962 1.129 1.253 1.347 1.539 1.631 1.723 1.808 2.003 2.085 2.229 2.358 2.487 2.56 2.708 2.839 3.02 3.125 3.227 3.376 3.514 3.656 3.796 3.927 4.092 4.254 4.407 4.588 4.764 4.928 5.111 5.319 5.522 5.748 5.982 6.233 6.508 6.814 7.16 7.505 7.896 8.311 8.806 9.344 9.907 10.444 10.803 10.774 10.438 9.995 9.551 9.094 8.637 8.178 7.834 7.512 7.177 6.845 6.539 6.268 6.03 5.79 5.519 5.293 5.058 4.776 4.499 4.263 3.997 3.713 3.493 3.276 3.066 2.852 2.606 2.437 2.276 2.006 1.798 1.595 1.491 1.271 1.057 0.829 0.704 0.47 0.31 0.16 0.012 -0.306 -0.492 -0.685 -0.888 -1.139 -1.485 -1.896 -2.828 -3 ,21521 ,TETRA ,17606126,Sun Nov 28 19:53:14 CET,Sun Nov 28 22:10:47 CET,0.0 0.376 0.601 0.749 0.862 0.99 1.124 1.231 1.416 1.501 1.583 1.623 1.79 1.853 1.992 2.126 2.246 2.307 2.427 2.525 2.666 2.757 2.842 2.974 3.101 3.223 3.356 3.493 3.664 3.844 4.024 4.222 4.399 4.578 4.787 5.006 5.206 5.419 5.65 5.902 6.183 6.502 6.851 7.19 7.597 8.043 8.492 8.962 9.456 9.936 10.47 10.604 10.403 10.049 9.613 9.219 8.863 8.441 8.02 7.595 7.21 6.862 6.557 6.252 5.945 5.689 5.445 5.215 4.982 4.731 4.494 4.294 4.057 3.799 3.603 3.391 3.179 2.968 2.742 2.583 2.419 2.165 1.972 1.783 1.686 1.47 1.248 1.023 0.911 0.679 0.464 0.301 0.149 -0.17 -0.345 -0.526 -0.715 -0.903 -1.164 -1.556 -2.821 -4 ,12532 ,TETRA ,17606127,Sun Nov 28 19:53:18 CET,Sun Nov 28 22:10:27 CET,0.0 0.347 0.472 0.617 0.752 0.861 0.983 1.095 1.288 1.381 1.461 1.51 1.707 1.802 1.991 2.162 2.32 2.387 2.503 2.609 2.787 2.897 2.988 3.134 3.282 3.424 3.549 3.668 3.83 3.998 4.166 4.358 4.551 4.724 4.906 5.127 5.347 5.574 5.805 6.064 6.344 6.637 6.953 7.294 7.707 8.141 8.603 9.11 9.676 10.245 10.794 10.999 10.982 10.845 10.59 10.294 9.892 9.401 8.977 8.58 8.212 7.853 7.492 7.161 6.882 6.626 6.346 6.072 5.847 5.614 5.353 5.142 4.92 4.676 4.483 4.299 4.1 3.895 3.698 3.55 3.402 3.183 3.024 2.85 2.754 2.546 2.313 2.081 1.952 1.703 1.527 1.369 1.211 0.87 0.693 0.504 0.276 0.045 -0.223 -0.591 -1.837 -5 ,16399 ,TETRA ,17606128,Sun Nov 28 19:53:15 CET,Sun Nov 28 22:09:49 CET,0.0 0.389 0.67 0.855 0.998 1.097 1.197 1.301 1.511 1.607 1.698 1.773 1.957 2.034 2.181 2.318 2.454 2.523 2.66 2.8 3.001 3.118 3.23 3.399 3.574 3.744 3.898 4.042 4.222 4.407 4.591 4.791 4.99 5.182 5.393 5.626 5.858 6.118 6.406 6.731 7.056 7.359 7.671 8.006 8.39 8.79 9.218 9.69 10.215 10.751 11.208 11.363 11.159 10.806 10.38 9.876 9.369 8.931 8.57 8.166 7.816 7.51 7.234 6.965 6.701 6.462 6.202 5.973 5.788 5.594 5.359 5.153 4.953 4.742 4.552 4.347 4.136 3.907 3.659 3.483 3.303 3.019 2.829 2.63 2.522 2.311 2.108 1.902 1.783 1.545 1.36 1.225 1.078 0.759 0.588 0.374 0.137 -0.118 -0.416 -0.801 -1.796 -6 ,8283 ,TETRA ,17606129,Sun Nov 28 19:53:17 CET,Sun Nov 28 22:09:22 CET,0.0 0.6 0.784 0.938 1.089 1.232 1.35 1.465 1.67 1.757 1.841 1.887 2.065 2.136 2.284 2.422 2.54 2.593 2.698 2.809 2.97 3.082 3.193 3.35 3.504 3.646 3.778 3.898 4.065 4.232 4.392 4.585 4.779 4.988 5.231 5.475 5.696 5.95 6.21 6.482 6.76 7.059 7.416 7.806 8.285 8.762 9.25 9.798 10.422 11.017 11.463 11.485 11.326 11.041 10.702 10.386 10.021 9.619 9.214 8.745 8.319 7.935 7.565 7.213 6.883 6.597 6.305 6.031 5.783 5.515 5.248 5.044 4.836 4.613 4.437 4.255 4.066 3.842 3.603 3.446 3.27 3.002 2.808 2.595 2.485 2.252 2.005 1.758 1.64 1.416 1.258 1.117 0.96 0.607 0.403 0.173 -0.061 -0.342 -0.642 -1.067 -2.229 -7 ,212 ,TETRA ,17606130,Sun Nov 28 19:53:40 CET,Sun Nov 28 22:10:32 CET,0.0 0.474 0.687 0.844 0.966 1.091 1.214 1.337 1.554 1.655 1.747 1.804 1.991 2.08 2.239 2.366 2.493 2.554 2.676 2.803 2.978 3.083 3.185 3.328 3.457 3.592 3.725 3.853 4.03 4.196 4.344 4.524 4.689 4.854 5.048 5.252 5.46 5.703 5.942 6.194 6.467 6.749 7.063 7.362 7.703 8.113 8.62 9.164 9.719 10.188 10.509 10.577 10.4 10.066 9.704 9.359 9.005 8.59 8.201 7.804 7.47 7.179 6.892 6.612 6.286 5.972 5.664 5.375 5.122 4.863 4.58 4.325 4.045 3.772 3.567 3.353 3.134 2.91 2.659 2.479 2.293 2.005 1.817 1.607 1.504 1.295 1.057 0.814 0.688 0.461 0.287 0.13 -0.022 -0.327 -0.508 -0.719 -0.971 -1.235 -1.502 -1.858 -3.23 -8 ,31542 ,TETRA ,17606131,Sun Nov 28 19:53:42 CET,Sun Nov 28 22:10:03 CET,0.0 0.383 0.579 0.754 0.902 1.026 1.151 1.266 1.46 1.547 1.63 1.674 1.847 1.921 2.065 2.203 2.341 2.409 2.54 2.666 2.823 2.93 3.044 3.187 3.323 3.464 3.595 3.722 3.885 4.027 4.16 4.319 4.48 4.654 4.847 5.042 5.233 5.453 5.685 5.922 6.185 6.494 6.822 7.126 7.516 7.932 8.361 8.862 9.39 9.903 10.339 10.414 10.188 9.811 9.501 9.244 8.949 8.653 8.388 8.09 7.798 7.463 7.104 6.74 6.411 6.136 5.86 5.621 5.406 5.183 4.941 4.732 4.506 4.272 4.1 3.93 3.751 3.543 3.333 3.199 3.052 2.844 2.71 2.547 2.455 2.262 2.037 1.816 1.722 1.514 1.372 1.219 1.067 0.77 0.62 0.443 0.23 -0.021 -0.327 -0.71 -1.66 -9 ,19855 ,TETRA ,17606132,Sun Nov 28 19:53:44 CET,Sun Nov 28 22:10:54 CET,0.0 0.56 0.809 0.995 1.131 1.246 1.36 1.471 1.677 1.784 1.889 1.963 2.136 2.203 2.344 2.485 2.614 2.667 2.766 2.876 3.037 3.129 3.219 3.358 3.5 3.637 3.773 3.904 4.064 4.221 4.373 4.557 4.74 4.914 5.102 5.319 5.535 5.748 5.963 6.191 6.442 6.736 7.08 7.421 7.792 8.189 8.639 9.111 9.599 10.016 10.311 10.389 10.165 9.654 9.077 8.608 8.181 7.681 7.202 6.774 6.455 6.167 5.828 5.495 5.199 4.913 4.592 4.302 4.055 3.781 3.49 3.255 3.032 2.811 2.625 2.432 2.243 2.039 1.812 1.661 1.509 1.252 1.066 0.858 0.747 0.533 0.31 0.058 -0.072 -0.296 -0.451 -0.588 -0.732 -1.054 -1.248 -1.458 -1.685 -1.926 -2.23 -2.706 -4.451 -10 ,11194 ,TETRA ,17606133,Sun Nov 28 19:53:40 CET,Sun Nov 28 22:09:52 CET,0.0 0.324 0.463 0.625 0.793 0.914 1.0 1.095 1.296 1.385 1.472 1.538 1.722 1.794 1.946 2.097 2.235 2.297 2.407 2.531 2.711 2.813 2.918 3.08 3.227 3.352 3.47 3.594 3.763 3.926 4.078 4.245 4.413 4.585 4.781 4.99 5.193 5.414 5.666 5.946 6.224 6.548 6.925 7.285 7.679 8.12 8.571 8.998 9.487 9.972 10.376 10.233 9.966 9.812 9.618 9.368 9.114 8.867 8.559 8.136 7.753 7.427 7.108 6.79 6.512 6.295 6.053 5.798 5.571 5.343 5.097 4.886 4.674 4.453 4.267 4.073 3.905 3.726 3.524 3.386 3.246 3.022 2.85 2.684 2.604 2.417 2.221 2.028 1.921 1.701 1.569 1.443 1.295 0.939 0.741 0.529 0.278 -0.016 -0.327 -0.763 -2.182 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_36_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_36_37.txt deleted file mode 100644 index acea853f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_36_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17373 ,TETRA ,17606134,Sun Nov 28 19:53:40 CET,Sun Nov 28 22:13:46 CET,0.0 1.594 2.047 2.362 2.606 2.826 3.028 3.197 3.497 3.638 3.778 3.94 4.159 4.26 4.448 4.623 4.792 4.874 5.025 5.168 5.366 5.479 5.579 5.733 5.881 6.009 6.139 6.276 6.433 6.569 6.706 6.873 7.019 7.154 7.321 7.525 7.715 7.908 8.094 8.304 8.541 8.735 8.957 9.201 9.404 9.575 9.682 9.67 9.55 9.205 8.409 7.324 6.35 5.485 4.737 4.036 3.386 2.778 2.251 1.739 1.278 0.871 0.505 0.159 -0.173 -0.491 -0.806 -1.07 -1.303 -1.554 -1.818 -2.031 -2.246 -2.47 -2.652 -2.844 -3.042 -3.248 -3.482 -3.645 -3.789 -4.007 -4.159 -4.319 -4.405 -4.599 -4.808 -5.027 -5.143 -5.368 -5.485 -5.611 -5.748 -6.029 -6.192 -6.388 -6.579 -6.784 -7.036 -7.389 -8.532 -2 ,28690 ,TETRA ,17606135,Sun Nov 28 19:53:43 CET,Sun Nov 28 22:12:57 CET,0.0 1.359 1.847 2.174 2.458 2.704 2.909 3.1 3.451 3.605 3.749 3.908 4.135 4.248 4.444 4.627 4.784 4.857 5.008 5.152 5.352 5.469 5.578 5.742 5.915 6.081 6.219 6.337 6.5 6.659 6.806 6.98 7.139 7.29 7.47 7.668 7.842 8.03 8.228 8.436 8.634 8.842 9.076 9.294 9.534 9.737 9.865 9.908 9.857 9.66 9.207 8.404 7.645 6.927 6.225 5.599 5.052 4.518 4.044 3.593 3.194 2.817 2.462 2.14 1.844 1.542 1.199 0.925 0.686 0.404 0.109 -0.107 -0.327 -0.572 -0.764 -0.969 -1.187 -1.399 -1.607 -1.762 -1.924 -2.167 -2.349 -2.539 -2.639 -2.853 -3.071 -3.296 -3.411 -3.654 -3.807 -3.936 -4.075 -4.352 -4.501 -4.686 -4.902 -5.143 -5.418 -5.746 -7.512 -3 ,4508 ,TETRA ,17606136,Sun Nov 28 19:53:44 CET,Sun Nov 28 22:11:13 CET,0.0 1.278 1.708 2.034 2.271 2.49 2.681 2.855 3.159 3.287 3.412 3.558 3.764 3.849 4.038 4.214 4.367 4.443 4.593 4.728 4.907 5.029 5.145 5.296 5.437 5.575 5.711 5.851 6.047 6.227 6.384 6.587 6.79 6.975 7.168 7.381 7.585 7.806 8.045 8.263 8.452 8.654 8.911 9.17 9.435 9.68 9.868 9.997 10.052 9.952 9.531 8.741 7.936 7.195 6.547 5.946 5.416 4.959 4.593 4.183 3.789 3.456 3.152 2.863 2.588 2.338 2.064 1.813 1.582 1.321 1.049 0.842 0.623 0.39 0.216 0.027 -0.162 -0.347 -0.532 -0.664 -0.804 -1.022 -1.178 -1.326 -1.404 -1.572 -1.728 -1.902 -2.007 -2.23 -2.347 -2.463 -2.585 -2.877 -3.062 -3.268 -3.464 -3.669 -3.898 -4.192 -5.133 -4 ,10653 ,TETRA ,17606137,Sun Nov 28 19:53:47 CET,Sun Nov 28 22:11:59 CET,0.0 1.536 1.963 2.237 2.464 2.705 2.93 3.137 3.494 3.646 3.791 3.94 4.176 4.303 4.525 4.733 4.938 5.038 5.225 5.374 5.581 5.72 5.858 6.048 6.201 6.353 6.51 6.654 6.841 7.016 7.18 7.379 7.579 7.761 7.953 8.183 8.394 8.602 8.798 8.982 9.154 9.336 9.543 9.724 9.919 10.121 10.339 10.468 10.429 10.305 9.795 8.865 8.034 7.299 6.617 5.993 5.445 4.911 4.458 4.026 3.621 3.225 2.853 2.494 2.161 1.89 1.611 1.337 1.079 0.812 0.539 0.311 0.07 -0.185 -0.38 -0.578 -0.783 -1.012 -1.258 -1.416 -1.575 -1.811 -1.972 -2.149 -2.246 -2.449 -2.659 -2.869 -2.98 -3.206 -3.317 -3.44 -3.562 -3.801 -3.938 -4.109 -4.322 -4.559 -4.84 -5.173 -6.712 -5 ,28432 ,TETRA ,17606138,Sun Nov 28 19:53:41 CET,Sun Nov 28 22:10:55 CET,0.0 1.499 1.917 2.223 2.466 2.664 2.836 3.004 3.321 3.45 3.569 3.696 3.918 4.021 4.194 4.351 4.505 4.573 4.691 4.795 4.94 5.045 5.154 5.315 5.46 5.593 5.728 5.847 5.992 6.143 6.287 6.456 6.619 6.775 6.93 7.101 7.281 7.451 7.636 7.862 8.072 8.272 8.517 8.759 9.026 9.281 9.536 9.72 9.744 9.514 8.883 7.918 7.026 6.203 5.393 4.608 3.924 3.31 2.78 2.287 1.886 1.53 1.168 0.831 0.538 0.261 -0.053 -0.356 -0.608 -0.851 -1.109 -1.347 -1.594 -1.84 -2.018 -2.188 -2.365 -2.561 -2.777 -2.92 -3.061 -3.287 -3.444 -3.609 -3.694 -3.862 -4.055 -4.259 -4.358 -4.579 -4.715 -4.836 -4.962 -5.269 -5.445 -5.615 -5.791 -5.993 -6.236 -6.576 -8.786 -6 ,16077 ,TETRA ,17606139,Sun Nov 28 19:53:42 CET,Sun Nov 28 22:10:26 CET,0.0 1.334 1.844 2.187 2.434 2.644 2.826 3.0 3.325 3.466 3.577 3.677 3.894 3.996 4.166 4.32 4.465 4.539 4.682 4.821 5.019 5.137 5.257 5.427 5.573 5.723 5.867 6.012 6.197 6.36 6.512 6.678 6.83 6.993 7.177 7.361 7.54 7.717 7.901 8.124 8.364 8.592 8.79 8.966 9.167 9.333 9.461 9.548 9.561 9.398 8.895 8.012 7.18 6.414 5.731 5.125 4.582 4.098 3.677 3.217 2.811 2.476 2.173 1.895 1.638 1.398 1.157 0.915 0.674 0.427 0.18 -0.012 -0.231 -0.475 -0.653 -0.826 -0.998 -1.182 -1.374 -1.509 -1.647 -1.865 -2.039 -2.23 -2.317 -2.484 -2.669 -2.864 -2.968 -3.197 -3.348 -3.472 -3.591 -3.835 -3.964 -4.107 -4.289 -4.578 -4.912 -5.267 -7.126 -7 ,30363 ,TETRA ,17606140,Sun Nov 28 19:53:42 CET,Sun Nov 28 22:11:56 CET,0.0 1.732 2.251 2.596 2.836 3.057 3.243 3.41 3.737 3.889 4.023 4.14 4.351 4.455 4.648 4.822 4.981 5.057 5.206 5.349 5.544 5.667 5.786 5.957 6.12 6.268 6.399 6.523 6.697 6.86 7.003 7.182 7.355 7.508 7.666 7.848 8.047 8.247 8.429 8.627 8.83 9.046 9.284 9.522 9.776 9.992 10.165 10.307 10.371 10.266 9.854 9.033 8.19 7.432 6.745 6.115 5.611 5.183 4.78 4.351 3.969 3.624 3.303 2.985 2.684 2.437 2.183 1.903 1.653 1.421 1.169 0.953 0.733 0.483 0.283 0.085 -0.119 -0.311 -0.515 -0.662 -0.8 -1.023 -1.179 -1.336 -1.425 -1.617 -1.835 -2.052 -2.156 -2.385 -2.511 -2.631 -2.77 -3.082 -3.249 -3.435 -3.638 -3.844 -4.089 -4.439 -5.64 -8 ,3975 ,TETRA ,17606141,Sun Nov 28 19:53:44 CET,Sun Nov 28 22:12:35 CET,0.0 1.411 1.869 2.198 2.466 2.691 2.882 3.041 3.334 3.465 3.586 3.71 3.925 4.035 4.234 4.409 4.575 4.658 4.816 4.944 5.131 5.26 5.377 5.548 5.712 5.86 5.995 6.141 6.336 6.506 6.668 6.869 7.046 7.201 7.379 7.567 7.734 7.907 8.103 8.294 8.475 8.675 8.883 9.073 9.29 9.539 9.758 9.884 9.851 9.589 9.021 8.194 7.408 6.663 5.992 5.351 4.758 4.214 3.744 3.26 2.838 2.482 2.159 1.859 1.549 1.243 0.95 0.69 0.448 0.197 -0.064 -0.27 -0.477 -0.706 -0.883 -1.059 -1.251 -1.449 -1.639 -1.776 -1.926 -2.166 -2.351 -2.552 -2.644 -2.816 -3.005 -3.211 -3.319 -3.549 -3.697 -3.827 -3.972 -4.266 -4.396 -4.542 -4.732 -4.953 -5.204 -5.573 -7.594 -9 ,22388 ,TETRA ,17606142,Sun Nov 28 19:53:46 CET,Sun Nov 28 22:10:37 CET,0.0 1.319 1.734 2.039 2.296 2.52 2.731 2.915 3.189 3.315 3.445 3.59 3.811 3.917 4.121 4.302 4.48 4.566 4.73 4.882 5.088 5.231 5.364 5.545 5.726 5.882 6.015 6.148 6.331 6.502 6.656 6.837 7.008 7.169 7.345 7.535 7.702 7.87 8.066 8.272 8.462 8.652 8.861 9.059 9.243 9.399 9.549 9.705 9.771 9.626 9.144 8.309 7.442 6.639 5.951 5.356 4.813 4.317 3.845 3.328 2.921 2.612 2.307 1.984 1.663 1.371 1.081 0.797 0.538 0.304 0.058 -0.175 -0.401 -0.617 -0.784 -0.982 -1.191 -1.367 -1.548 -1.681 -1.839 -2.104 -2.276 -2.446 -2.538 -2.756 -2.991 -3.239 -3.357 -3.582 -3.733 -3.866 -3.994 -4.27 -4.437 -4.629 -4.826 -5.037 -5.342 -5.755 -6.989 -10 ,2487 ,TETRA ,17606143,Sun Nov 28 19:53:47 CET,Sun Nov 28 22:10:26 CET,0.0 1.31 1.761 2.066 2.305 2.526 2.71 2.878 3.199 3.334 3.453 3.579 3.789 3.894 4.095 4.27 4.447 4.535 4.689 4.818 4.998 5.108 5.215 5.381 5.536 5.678 5.811 5.929 6.082 6.231 6.366 6.523 6.681 6.828 6.976 7.12 7.247 7.393 7.562 7.751 7.937 8.125 8.331 8.508 8.705 8.909 9.081 9.242 9.361 9.203 8.612 7.656 6.64 5.714 4.994 4.384 3.806 3.296 2.84 2.331 1.89 1.517 1.19 0.867 0.517 0.218 -0.062 -0.322 -0.554 -0.794 -1.053 -1.263 -1.462 -1.673 -1.85 -2.035 -2.209 -2.38 -2.573 -2.713 -2.852 -3.068 -3.23 -3.4 -3.486 -3.651 -3.822 -4.027 -4.147 -4.373 -4.497 -4.632 -4.782 -5.074 -5.243 -5.43 -5.611 -5.807 -6.036 -6.354 -7.41 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_37_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_37_19.txt deleted file mode 100644 index 5f274250..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_37_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10585 ,TETRA ,17606144,Sun Nov 28 19:53:42 CET,Sun Nov 28 22:11:25 CET,0.0 0.25 0.354 0.475 0.602 0.687 0.764 0.843 0.973 1.029 1.09 1.109 1.28 1.341 1.464 1.577 1.674 1.718 1.8 1.877 1.979 2.051 2.126 2.213 2.289 2.363 2.432 2.5 2.591 2.685 2.777 2.88 2.965 3.042 3.144 3.253 3.351 3.46 3.572 3.678 3.788 3.906 4.019 4.126 4.245 4.365 4.451 4.466 4.415 4.204 3.622 2.748 1.934 1.179 0.501 -0.111 -0.643 -1.103 -1.499 -1.932 -2.323 -2.668 -2.984 -3.277 -3.569 -3.857 -4.169 -4.449 -4.7 -4.963 -5.219 -5.429 -5.664 -5.916 -6.102 -6.305 -6.534 -6.771 -7.011 -7.175 -7.339 -7.614 -7.806 -7.996 -8.106 -8.346 -8.59 -8.869 -9.028 -9.299 -9.491 -9.67 -9.875 -10.329 -10.577 -10.861 -11.191 -11.597 -12.125 -12.801 -14.674 -2 ,1768 ,TETRA ,17606145,Sun Nov 28 19:53:45 CET,Sun Nov 28 22:11:34 CET,0.0 0.21 0.327 0.426 0.505 0.568 0.642 0.714 0.836 0.893 0.939 0.909 1.059 1.101 1.19 1.258 1.321 1.356 1.425 1.492 1.586 1.654 1.718 1.805 1.889 1.967 2.036 2.113 2.217 2.305 2.387 2.493 2.585 2.669 2.772 2.885 2.989 3.102 3.219 3.323 3.429 3.558 3.688 3.784 3.903 4.036 4.151 4.229 4.21 4.014 3.481 2.683 1.973 1.295 0.597 -0.042 -0.579 -1.09 -1.578 -2.095 -2.505 -2.839 -3.173 -3.5 -3.8 -4.085 -4.392 -4.664 -4.907 -5.176 -5.468 -5.718 -5.964 -6.224 -6.457 -6.698 -6.923 -7.141 -7.387 -7.565 -7.749 -8.052 -8.277 -8.515 -8.632 -8.88 -9.13 -9.392 -9.534 -9.797 -10.003 -10.178 -10.359 -10.768 -10.994 -11.224 -11.471 -11.765 -12.105 -12.575 -14.629 -3 ,23281 ,TETRA ,17606146,Sun Nov 28 19:53:42 CET,Sun Nov 28 22:07:25 CET,0.0 0.355 0.554 0.67 0.765 0.874 0.965 1.024 1.117 1.17 1.221 1.196 1.348 1.387 1.461 1.54 1.618 1.659 1.737 1.799 1.884 1.947 2.009 2.08 2.151 2.229 2.303 2.37 2.452 2.531 2.61 2.708 2.805 2.904 3.02 3.143 3.248 3.386 3.547 3.697 3.838 3.98 4.119 4.246 4.394 4.52 4.624 4.709 4.757 4.612 4.135 3.421 2.706 2.034 1.434 0.883 0.384 -0.078 -0.492 -0.899 -1.253 -1.589 -1.919 -2.229 -2.502 -2.793 -3.155 -3.48 -3.731 -3.979 -4.244 -4.457 -4.674 -4.893 -5.08 -5.28 -5.478 -5.692 -5.928 -6.087 -6.246 -6.487 -6.665 -6.876 -6.985 -7.189 -7.403 -7.654 -7.794 -8.064 -8.261 -8.416 -8.59 -8.975 -9.181 -9.435 -9.74 -10.139 -10.571 -11.147 -12.477 -4 ,9600 ,TETRA ,17606147,Sun Nov 28 19:53:45 CET,Sun Nov 28 22:07:02 CET,0.0 0.452 0.581 0.704 0.801 0.884 0.961 1.028 1.16 1.213 1.268 1.265 1.413 1.451 1.536 1.633 1.716 1.758 1.843 1.915 2.014 2.083 2.143 2.232 2.325 2.406 2.484 2.561 2.666 2.766 2.85 2.953 3.07 3.189 3.323 3.466 3.591 3.712 3.828 3.94 4.048 4.174 4.317 4.448 4.588 4.685 4.748 4.798 4.745 4.521 3.955 3.11 2.336 1.588 0.917 0.318 -0.207 -0.681 -1.089 -1.506 -1.881 -2.197 -2.497 -2.796 -3.104 -3.384 -3.657 -3.914 -4.125 -4.338 -4.58 -4.815 -5.052 -5.268 -5.446 -5.681 -5.987 -6.303 -6.633 -6.868 -7.108 -7.478 -7.737 -8.017 -8.163 -8.483 -8.818 -9.17 -9.354 -9.661 -9.963 -10.178 -10.389 -10.862 -11.142 -11.456 -11.815 -12.194 -12.588 -13.148 -15.237 -5 ,17767 ,TETRA ,17606148,Sun Nov 28 19:53:42 CET,Sun Nov 28 22:07:33 CET,0.0 0.283 0.424 0.532 0.623 0.715 0.795 0.865 0.984 1.04 1.097 1.097 1.256 1.296 1.381 1.463 1.537 1.576 1.652 1.717 1.822 1.89 1.951 2.044 2.137 2.225 2.317 2.405 2.511 2.626 2.727 2.837 2.942 3.034 3.144 3.261 3.38 3.509 3.629 3.754 3.878 4.031 4.196 4.329 4.463 4.577 4.665 4.692 4.651 4.468 3.965 3.129 2.265 1.498 0.844 0.222 -0.374 -0.908 -1.358 -1.791 -2.17 -2.535 -2.892 -3.231 -3.547 -3.832 -4.13 -4.402 -4.637 -4.889 -5.169 -5.401 -5.647 -5.92 -6.157 -6.4 -6.645 -6.904 -7.145 -7.308 -7.485 -7.763 -7.959 -8.166 -8.27 -8.488 -8.723 -8.977 -9.11 -9.372 -9.614 -9.813 -9.999 -10.39 -10.629 -10.891 -11.184 -11.57 -12.08 -12.751 -15.364 -6 ,23297 ,TETRA ,17606149,Sun Nov 28 19:53:44 CET,Sun Nov 28 22:07:16 CET,0.0 0.156 0.313 0.455 0.553 0.627 0.69 0.743 0.841 0.896 0.954 0.959 1.116 1.153 1.22 1.294 1.382 1.425 1.503 1.578 1.683 1.752 1.822 1.924 2.021 2.107 2.189 2.271 2.37 2.458 2.54 2.656 2.781 2.901 3.017 3.132 3.243 3.355 3.475 3.609 3.747 3.877 4.003 4.122 4.274 4.41 4.512 4.613 4.633 4.521 4.198 3.503 2.845 2.268 1.657 1.068 0.575 0.105 -0.324 -0.771 -1.161 -1.508 -1.851 -2.177 -2.48 -2.754 -3.062 -3.389 -3.678 -3.967 -4.28 -4.533 -4.776 -5.02 -5.228 -5.465 -5.706 -5.938 -6.186 -6.366 -6.545 -6.827 -7.033 -7.263 -7.383 -7.634 -7.919 -8.23 -8.383 -8.664 -8.869 -9.035 -9.21 -9.591 -9.835 -10.125 -10.432 -10.795 -11.264 -11.848 -14.153 -7 ,21143 ,TETRA ,17606150,Sun Nov 28 19:53:47 CET,Sun Nov 28 22:07:00 CET,0.0 0.225 0.38 0.502 0.579 0.632 0.688 0.758 0.882 0.946 1.016 1.021 1.178 1.225 1.331 1.439 1.535 1.578 1.65 1.724 1.835 1.903 1.975 2.072 2.164 2.252 2.33 2.415 2.532 2.623 2.717 2.845 2.963 3.058 3.166 3.291 3.398 3.526 3.665 3.795 3.921 4.086 4.269 4.448 4.667 4.836 4.944 4.996 4.996 4.895 4.449 3.696 2.988 2.361 1.778 1.201 0.71 0.292 -0.07 -0.453 -0.797 -1.108 -1.435 -1.784 -2.164 -2.546 -2.918 -3.196 -3.421 -3.678 -3.968 -4.206 -4.443 -4.7 -4.902 -5.116 -5.351 -5.594 -5.848 -6.033 -6.229 -6.549 -6.762 -6.959 -7.058 -7.29 -7.585 -7.918 -8.081 -8.363 -8.628 -8.832 -9.04 -9.512 -9.768 -10.07 -10.458 -10.87 -11.318 -11.979 -14.357 -8 ,3514 ,TETRA ,17606151,Sun Nov 28 19:53:48 CET,Sun Nov 28 22:07:31 CET,0.0 0.38 0.534 0.642 0.73 0.819 0.899 0.974 1.127 1.192 1.243 1.225 1.387 1.434 1.529 1.625 1.711 1.752 1.833 1.912 2.019 2.084 2.143 2.226 2.302 2.373 2.454 2.541 2.656 2.761 2.845 2.934 3.023 3.114 3.218 3.332 3.454 3.582 3.71 3.845 3.975 4.106 4.243 4.368 4.5 4.629 4.735 4.831 4.865 4.748 4.396 3.686 2.934 2.302 1.762 1.256 0.79 0.279 -0.197 -0.641 -1.031 -1.394 -1.742 -2.077 -2.377 -2.662 -2.959 -3.214 -3.454 -3.704 -3.967 -4.194 -4.443 -4.713 -4.919 -5.134 -5.352 -5.587 -5.85 -6.032 -6.226 -6.516 -6.716 -6.921 -7.029 -7.271 -7.52 -7.803 -7.962 -8.247 -8.477 -8.664 -8.866 -9.289 -9.521 -9.798 -10.102 -10.442 -10.935 -11.629 -13.719 -9 ,19737 ,TETRA ,17606152,Sun Nov 28 19:53:42 CET,Sun Nov 28 22:10:26 CET,0.0 0.301 0.46 0.559 0.659 0.735 0.802 0.867 0.979 1.033 1.086 1.075 1.23 1.277 1.371 1.463 1.549 1.587 1.664 1.735 1.829 1.888 1.945 2.034 2.11 2.182 2.255 2.325 2.418 2.499 2.586 2.688 2.773 2.855 2.953 3.052 3.142 3.241 3.335 3.461 3.605 3.743 3.865 3.969 4.092 4.206 4.304 4.394 4.399 4.145 3.451 2.478 1.685 1.003 0.407 -0.121 -0.619 -1.094 -1.511 -1.939 -2.336 -2.689 -3.015 -3.334 -3.631 -3.91 -4.217 -4.493 -4.72 -4.934 -5.163 -5.372 -5.602 -5.843 -6.016 -6.198 -6.395 -6.605 -6.817 -6.959 -7.11 -7.373 -7.553 -7.735 -7.83 -8.027 -8.252 -8.5 -8.628 -8.88 -9.051 -9.217 -9.397 -9.775 -9.988 -10.209 -10.431 -10.782 -11.274 -11.881 -13.626 -10 ,27232 ,TETRA ,17606153,Sun Nov 28 19:53:45 CET,Sun Nov 28 22:10:39 CET,0.0 0.236 0.383 0.491 0.606 0.704 0.772 0.851 1.001 1.059 1.113 1.121 1.295 1.353 1.453 1.529 1.598 1.633 1.694 1.752 1.852 1.915 1.971 2.065 2.166 2.252 2.319 2.385 2.466 2.544 2.633 2.733 2.818 2.907 3.0 3.086 3.174 3.27 3.366 3.459 3.557 3.675 3.784 3.881 3.997 4.089 4.185 4.281 4.309 4.19 3.797 3.139 2.431 1.733 1.095 0.495 -0.062 -0.56 -0.995 -1.464 -1.89 -2.275 -2.655 -3.045 -3.402 -3.718 -4.066 -4.376 -4.642 -4.917 -5.212 -5.461 -5.733 -6.043 -6.27 -6.479 -6.712 -6.971 -7.235 -7.426 -7.634 -7.939 -8.154 -8.394 -8.512 -8.745 -8.973 -9.214 -9.344 -9.597 -9.773 -9.946 -10.146 -10.593 -10.839 -11.102 -11.406 -11.785 -12.267 -12.95 -14.659 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_37_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_37_26.txt deleted file mode 100644 index 61c49c08..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_37_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10685 ,TETRA ,17606154,Sun Nov 28 19:53:44 CET,Sun Nov 28 22:09:38 CET,0.0 0.602 0.876 1.093 1.263 1.395 1.514 1.627 1.825 1.923 2.022 2.109 2.316 2.4 2.539 2.682 2.832 2.904 3.038 3.17 3.362 3.472 3.583 3.764 3.94 4.089 4.225 4.359 4.533 4.71 4.877 5.073 5.265 5.444 5.636 5.836 6.018 6.21 6.414 6.642 6.87 7.08 7.334 7.592 7.847 8.107 8.388 8.607 8.792 8.862 8.546 7.901 7.272 6.632 6.037 5.467 4.916 4.405 3.944 3.491 3.126 2.789 2.453 2.13 1.814 1.53 1.234 0.962 0.721 0.462 0.187 -0.041 -0.273 -0.509 -0.693 -0.883 -1.087 -1.325 -1.567 -1.724 -1.89 -2.176 -2.386 -2.613 -2.733 -2.975 -3.238 -3.519 -3.656 -3.909 -4.107 -4.278 -4.462 -4.873 -5.09 -5.321 -5.581 -5.894 -6.302 -6.873 -8.961 -2 ,22051 ,TETRA ,17606155,Sun Nov 28 19:53:45 CET,Sun Nov 28 22:09:57 CET,0.0 0.674 0.921 1.117 1.291 1.45 1.596 1.735 1.972 2.071 2.175 2.258 2.451 2.526 2.654 2.777 2.909 2.977 3.102 3.217 3.383 3.504 3.626 3.788 3.944 4.097 4.245 4.386 4.56 4.719 4.867 5.052 5.231 5.386 5.575 5.802 6.005 6.197 6.38 6.571 6.757 6.935 7.123 7.295 7.498 7.741 7.999 8.234 8.393 8.431 8.117 7.455 6.768 6.107 5.488 4.896 4.363 3.894 3.491 3.062 2.708 2.396 2.094 1.81 1.51 1.184 0.844 0.561 0.304 0.028 -0.246 -0.46 -0.717 -1.027 -1.256 -1.492 -1.741 -1.994 -2.279 -2.48 -2.671 -2.945 -3.133 -3.328 -3.436 -3.668 -3.906 -4.176 -4.323 -4.583 -4.799 -4.991 -5.19 -5.609 -5.838 -6.087 -6.368 -6.695 -7.081 -7.641 -9.787 -3 ,12530 ,TETRA ,17606156,Sun Nov 28 19:53:48 CET,Sun Nov 28 22:10:40 CET,0.0 0.733 0.97 1.155 1.327 1.487 1.638 1.779 2.04 2.162 2.276 2.36 2.556 2.641 2.817 2.976 3.116 3.182 3.313 3.438 3.623 3.746 3.858 4.024 4.183 4.331 4.488 4.639 4.822 4.997 5.162 5.363 5.561 5.745 5.946 6.16 6.352 6.569 6.808 7.043 7.285 7.552 7.844 8.134 8.435 8.714 8.984 9.244 9.489 9.574 9.36 8.85 8.216 7.546 6.956 6.418 5.903 5.407 4.962 4.495 4.06 3.667 3.31 2.99 2.676 2.389 2.115 1.866 1.64 1.395 1.162 0.969 0.728 0.475 0.297 0.108 -0.106 -0.337 -0.587 -0.765 -0.948 -1.224 -1.413 -1.608 -1.715 -1.944 -2.175 -2.408 -2.545 -2.818 -3.024 -3.183 -3.351 -3.724 -3.936 -4.196 -4.491 -4.835 -5.257 -5.817 -7.865 -4 ,5101 ,TETRA ,17606157,Sun Nov 28 19:53:50 CET,Sun Nov 28 22:09:29 CET,0.0 0.608 0.858 1.04 1.182 1.312 1.443 1.568 1.749 1.845 1.958 2.06 2.277 2.373 2.535 2.681 2.834 2.907 3.033 3.159 3.338 3.465 3.597 3.762 3.9 4.03 4.164 4.298 4.475 4.652 4.815 5.012 5.212 5.393 5.595 5.834 6.053 6.272 6.5 6.732 6.953 7.203 7.508 7.796 8.095 8.351 8.544 8.761 9.01 9.109 8.849 8.223 7.507 6.838 6.237 5.656 5.143 4.693 4.29 3.881 3.519 3.168 2.801 2.453 2.138 1.837 1.521 1.239 0.986 0.701 0.377 0.101 -0.167 -0.425 -0.632 -0.858 -1.077 -1.294 -1.547 -1.727 -1.9 -2.158 -2.328 -2.503 -2.601 -2.826 -3.062 -3.313 -3.446 -3.698 -3.893 -4.072 -4.262 -4.681 -4.915 -5.176 -5.468 -5.797 -6.196 -6.75 -9.409 -5 ,8946 ,TETRA ,17606158,Sun Nov 28 19:53:43 CET,Sun Nov 28 22:12:01 CET,0.0 0.418 0.651 0.84 1.014 1.142 1.255 1.379 1.606 1.713 1.814 1.885 2.087 2.176 2.332 2.47 2.611 2.691 2.845 2.979 3.166 3.277 3.383 3.538 3.687 3.833 3.977 4.115 4.276 4.425 4.587 4.786 4.964 5.143 5.352 5.562 5.764 5.998 6.247 6.509 6.795 7.1 7.411 7.706 8.002 8.303 8.618 8.878 9.132 9.313 9.191 8.611 7.92 7.259 6.661 6.083 5.523 5.021 4.609 4.158 3.742 3.372 3.017 2.674 2.347 2.042 1.717 1.418 1.163 0.902 0.634 0.416 0.176 -0.075 -0.262 -0.462 -0.68 -0.919 -1.187 -1.365 -1.552 -1.842 -2.025 -2.231 -2.342 -2.578 -2.845 -3.123 -3.265 -3.526 -3.732 -3.908 -4.106 -4.567 -4.824 -5.09 -5.368 -5.685 -6.087 -6.647 -8.415 -6 ,26492 ,TETRA ,17606159,Sun Nov 28 19:53:45 CET,Sun Nov 28 22:11:43 CET,0.0 1.071 1.435 1.645 1.837 2.003 2.125 2.236 2.474 2.587 2.695 2.777 2.966 3.043 3.187 3.337 3.479 3.543 3.68 3.804 3.973 4.084 4.183 4.302 4.423 4.542 4.663 4.787 4.919 5.057 5.194 5.339 5.484 5.633 5.825 6.027 6.194 6.365 6.536 6.721 6.911 7.09 7.272 7.472 7.698 7.886 8.061 8.216 8.271 8.166 7.736 6.934 6.074 5.287 4.616 3.998 3.415 2.891 2.442 1.957 1.534 1.168 0.816 0.477 0.149 -0.158 -0.463 -0.723 -0.95 -1.196 -1.461 -1.66 -1.88 -2.135 -2.33 -2.537 -2.762 -3.01 -3.26 -3.428 -3.604 -3.88 -4.087 -4.301 -4.418 -4.688 -4.95 -5.209 -5.352 -5.633 -5.861 -6.045 -6.236 -6.636 -6.849 -7.104 -7.422 -7.818 -8.264 -8.818 -10.644 -7 ,14907 ,TETRA ,17606160,Sun Nov 28 19:53:47 CET,Sun Nov 28 22:09:20 CET,0.0 0.731 1.009 1.214 1.385 1.549 1.713 1.862 2.107 2.214 2.316 2.425 2.629 2.721 2.908 3.076 3.235 3.309 3.455 3.602 3.789 3.899 4.005 4.164 4.332 4.495 4.642 4.775 4.957 5.136 5.283 5.47 5.661 5.823 5.986 6.168 6.364 6.584 6.793 6.991 7.224 7.493 7.781 8.041 8.311 8.626 8.913 9.081 9.192 9.098 8.5 7.652 6.838 6.026 5.325 4.729 4.195 3.691 3.246 2.808 2.429 2.083 1.753 1.431 1.11 0.813 0.522 0.252 0.013 -0.229 -0.497 -0.722 -0.964 -1.227 -1.424 -1.622 -1.83 -2.047 -2.272 -2.447 -2.627 -2.899 -3.098 -3.302 -3.397 -3.596 -3.835 -4.11 -4.264 -4.534 -4.743 -4.925 -5.125 -5.558 -5.809 -6.088 -6.385 -6.728 -7.14 -7.645 -10.049 -8 ,15949 ,TETRA ,17606161,Sun Nov 28 19:53:44 CET,Sun Nov 28 22:20:03 CET,0.0 0.703 0.981 1.167 1.32 1.489 1.64 1.769 2.004 2.105 2.205 2.289 2.476 2.549 2.7 2.84 2.975 3.045 3.183 3.309 3.48 3.595 3.711 3.872 4.028 4.184 4.335 4.466 4.611 4.747 4.891 5.066 5.231 5.399 5.584 5.764 5.935 6.107 6.297 6.513 6.735 6.968 7.188 7.376 7.578 7.775 7.994 8.174 8.223 8.166 7.846 7.212 6.534 5.865 5.277 4.679 4.091 3.537 3.085 2.646 2.259 1.898 1.535 1.205 0.911 0.631 0.328 0.047 -0.21 -0.478 -0.758 -1.002 -1.264 -1.538 -1.753 -1.958 -2.159 -2.381 -2.632 -2.815 -3.002 -3.297 -3.501 -3.708 -3.824 -4.074 -4.337 -4.619 -4.761 -5.03 -5.249 -5.421 -5.596 -5.972 -6.195 -6.458 -6.744 -7.055 -7.451 -8.063 -10.751 -9 ,32027 ,TETRA ,17606162,Sun Nov 28 19:54:11 CET,Sun Nov 28 22:10:00 CET,0.0 0.874 1.171 1.373 1.529 1.67 1.801 1.919 2.125 2.224 2.317 2.393 2.601 2.688 2.842 2.998 3.146 3.21 3.333 3.45 3.622 3.728 3.836 4.02 4.201 4.352 4.489 4.618 4.779 4.937 5.102 5.306 5.496 5.664 5.854 6.087 6.311 6.545 6.778 7.0 7.215 7.467 7.772 8.059 8.328 8.586 8.849 9.085 9.261 9.278 9.031 8.354 7.579 6.849 6.178 5.501 4.889 4.35 3.891 3.444 3.059 2.686 2.334 1.995 1.665 1.389 1.078 0.784 0.533 0.255 -0.035 -0.257 -0.49 -0.739 -0.938 -1.147 -1.347 -1.566 -1.8 -1.962 -2.137 -2.422 -2.619 -2.82 -2.925 -3.143 -3.386 -3.664 -3.802 -4.054 -4.242 -4.411 -4.58 -4.964 -5.183 -5.415 -5.663 -5.951 -6.313 -6.827 -8.558 -10 ,4092 ,TETRA ,17606163,Sun Nov 28 19:54:47 CET,Sun Nov 28 22:12:45 CET,0.0 0.71 1.076 1.369 1.608 1.776 1.9 2.012 2.232 2.336 2.432 2.49 2.684 2.767 2.948 3.131 3.278 3.342 3.466 3.581 3.76 3.875 3.977 4.131 4.275 4.404 4.531 4.668 4.843 5.015 5.188 5.389 5.594 5.784 5.98 6.202 6.414 6.638 6.869 7.111 7.365 7.623 7.934 8.287 8.64 8.94 9.221 9.447 9.625 9.694 9.465 8.9 8.265 7.65 7.086 6.55 6.022 5.512 5.029 4.506 4.036 3.638 3.285 2.942 2.628 2.349 2.05 1.774 1.513 1.251 0.995 0.773 0.54 0.281 0.068 -0.173 -0.43 -0.681 -0.939 -1.134 -1.339 -1.653 -1.859 -2.056 -2.163 -2.397 -2.648 -2.926 -3.068 -3.318 -3.496 -3.672 -3.863 -4.272 -4.495 -4.734 -5.011 -5.333 -5.728 -6.263 -7.895 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_37_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_37_32.txt deleted file mode 100644 index 2b18a0de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_37_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8802 ,TETRA ,17606164,Sun Nov 28 19:54:11 CET,Sun Nov 28 22:18:47 CET,0.0 0.175 0.28 0.347 0.392 0.432 0.479 0.531 0.608 0.637 0.67 0.625 0.756 0.776 0.813 0.856 0.9 0.919 0.961 0.994 1.035 1.059 1.081 1.111 1.134 1.155 1.175 1.196 1.236 1.276 1.305 1.336 1.358 1.361 1.352 1.335 1.31 1.295 1.274 1.231 1.176 1.097 0.961 0.775 0.554 0.24 -0.246 -0.897 -1.785 -3.144 -5.416 -7.973 -9.954 -11.586 -12.947 -14.126 -15.146 -16.048 -16.81 -17.576 -18.244 -18.836 -19.394 -19.932 -20.454 -20.922 -21.391 -21.814 -22.181 -22.55 -22.937 -23.286 -23.659 -24.059 -24.364 -24.685 -25.028 -25.376 -25.724 -25.965 -26.216 -26.592 -26.844 -27.116 -27.277 -27.616 -27.965 -28.335 -28.532 -28.891 -29.213 -29.466 -29.737 -30.319 -30.635 -30.951 -31.278 -31.677 -32.342 -33.452 -36.899 -2 ,31259 ,TETRA ,17606165,Sun Nov 28 19:54:10 CET,Sun Nov 28 22:04:42 CET,0.0 0.198 0.33 0.412 0.481 0.549 0.61 0.663 0.75 0.79 0.83 0.791 0.923 0.94 0.989 1.047 1.098 1.116 1.154 1.187 1.221 1.241 1.259 1.274 1.289 1.315 1.336 1.346 1.352 1.359 1.355 1.348 1.348 1.338 1.303 1.247 1.189 1.126 1.049 0.947 0.835 0.688 0.475 0.232 -0.084 -0.454 -0.976 -1.714 -2.715 -4.169 -6.478 -9.101 -11.17 -12.865 -14.273 -15.507 -16.592 -17.515 -18.279 -19.058 -19.726 -20.303 -20.835 -21.33 -21.803 -22.233 -22.677 -23.075 -23.419 -23.764 -24.111 -24.408 -24.745 -25.105 -25.382 -25.671 -25.958 -26.251 -26.556 -26.757 -26.999 -27.47 -27.802 -28.112 -28.263 -28.564 -28.901 -29.269 -29.448 -29.768 -30.003 -30.206 -30.447 -30.969 -31.242 -31.589 -32.004 -32.506 -33.17 -33.911 -35.743 -3 ,8365 ,TETRA ,17606166,Sun Nov 28 19:54:12 CET,Sun Nov 28 22:06:24 CET,0.0 0.145 0.23 0.316 0.385 0.422 0.46 0.505 0.573 0.598 0.627 0.574 0.718 0.742 0.79 0.839 0.874 0.89 0.93 0.972 1.036 1.076 1.109 1.152 1.179 1.209 1.244 1.262 1.275 1.291 1.314 1.333 1.336 1.344 1.346 1.325 1.299 1.256 1.198 1.132 1.048 0.932 0.778 0.595 0.357 0.026 -0.44 -1.077 -2.03 -3.441 -5.678 -8.277 -10.306 -11.933 -13.293 -14.438 -15.406 -16.292 -17.04 -17.769 -18.43 -19.022 -19.56 -20.063 -20.539 -20.991 -21.483 -21.904 -22.255 -22.602 -22.96 -23.279 -23.592 -23.924 -24.19 -24.449 -24.721 -25.017 -25.325 -25.529 -25.737 -26.062 -26.3 -26.557 -26.689 -26.988 -27.348 -27.711 -27.894 -28.232 -28.541 -28.786 -29.026 -29.598 -29.922 -30.254 -30.684 -31.2 -31.788 -32.549 -35.12 -4 ,15082 ,TETRA ,17606167,Sun Nov 28 19:54:13 CET,Sun Nov 28 22:06:29 CET,0.0 0.216 0.354 0.443 0.52 0.586 0.643 0.695 0.794 0.84 0.884 0.867 1.02 1.054 1.11 1.168 1.221 1.247 1.3 1.347 1.413 1.447 1.466 1.5 1.53 1.555 1.584 1.607 1.623 1.63 1.647 1.657 1.643 1.632 1.624 1.597 1.554 1.503 1.448 1.363 1.245 1.098 0.903 0.676 0.415 0.061 -0.471 -1.158 -2.134 -3.618 -5.98 -8.633 -10.73 -12.405 -13.781 -14.984 -15.999 -16.89 -17.653 -18.401 -19.052 -19.619 -20.141 -20.629 -21.086 -21.512 -21.945 -22.331 -22.667 -23.023 -23.398 -23.706 -24.018 -24.337 -24.594 -24.866 -25.142 -25.418 -25.701 -25.908 -26.148 -26.546 -26.812 -27.105 -27.27 -27.63 -28.03 -28.45 -28.662 -29.005 -29.318 -29.589 -29.857 -30.385 -30.721 -31.124 -31.571 -32.078 -32.691 -33.451 -35.624 -5 ,5727 ,TETRA ,17606168,Sun Nov 28 19:54:10 CET,Sun Nov 28 22:06:48 CET,0.0 0.176 0.278 0.342 0.418 0.507 0.573 0.627 0.705 0.737 0.776 0.733 0.869 0.887 0.933 0.98 1.008 1.025 1.059 1.083 1.118 1.14 1.158 1.178 1.19 1.194 1.198 1.209 1.219 1.23 1.232 1.226 1.22 1.202 1.18 1.15 1.112 1.053 0.975 0.889 0.795 0.688 0.517 0.289 -0.026 -0.434 -0.986 -1.664 -2.618 -4.127 -6.588 -9.378 -11.501 -13.206 -14.631 -15.856 -16.937 -17.964 -18.815 -19.63 -20.324 -20.916 -21.477 -22.0 -22.487 -22.958 -23.465 -23.904 -24.275 -24.675 -25.111 -25.452 -25.802 -26.187 -26.466 -26.762 -27.1 -27.443 -27.758 -27.964 -28.196 -28.552 -28.834 -29.175 -29.343 -29.685 -30.046 -30.418 -30.624 -30.997 -31.413 -31.715 -32.031 -32.766 -33.149 -33.523 -33.914 -34.392 -35.051 -35.947 -38.702 -6 ,18954 ,TETRA ,17606169,Sun Nov 28 19:54:15 CET,Sun Nov 28 22:07:23 CET,0.0 0.115 0.217 0.316 0.382 0.428 0.464 0.508 0.598 0.627 0.649 0.596 0.727 0.742 0.77 0.806 0.849 0.863 0.878 0.895 0.934 0.951 0.965 0.99 1.003 1.004 1.012 1.026 1.041 1.044 1.04 1.034 1.017 1.002 0.989 0.954 0.893 0.817 0.739 0.648 0.539 0.395 0.186 -0.049 -0.345 -0.723 -1.247 -1.966 -2.983 -4.509 -6.936 -9.673 -11.845 -13.625 -15.068 -16.291 -17.335 -18.267 -19.068 -19.844 -20.502 -21.099 -21.673 -22.205 -22.7 -23.158 -23.637 -24.042 -24.388 -24.766 -25.195 -25.548 -25.881 -26.223 -26.487 -26.754 -27.036 -27.333 -27.64 -27.848 -28.062 -28.425 -28.683 -28.941 -29.071 -29.342 -29.675 -30.024 -30.2 -30.543 -30.835 -31.061 -31.297 -31.781 -32.075 -32.399 -32.733 -33.126 -33.719 -34.552 -37.389 -7 ,31391 ,TETRA ,17606170,Sun Nov 28 19:54:13 CET,Sun Nov 28 22:07:23 CET,0.0 0.233 0.361 0.447 0.51 0.56 0.595 0.645 0.757 0.79 0.815 0.767 0.907 0.933 0.968 0.986 1.021 1.042 1.082 1.118 1.162 1.204 1.241 1.261 1.273 1.299 1.326 1.34 1.343 1.343 1.343 1.338 1.331 1.318 1.295 1.266 1.229 1.183 1.124 1.041 0.944 0.822 0.643 0.433 0.151 -0.192 -0.659 -1.35 -2.35 -3.788 -6.092 -8.726 -10.773 -12.459 -13.9 -15.145 -16.158 -17.044 -17.806 -18.564 -19.182 -19.743 -20.328 -20.857 -21.324 -21.77 -22.226 -22.611 -22.94 -23.275 -23.636 -23.944 -24.26 -24.588 -24.845 -25.114 -25.391 -25.677 -25.972 -26.176 -26.414 -26.823 -27.105 -27.387 -27.536 -27.845 -28.16 -28.491 -28.697 -29.065 -29.337 -29.561 -29.826 -30.447 -30.797 -31.176 -31.631 -32.174 -32.819 -33.699 -36.109 -8 ,2159 ,TETRA ,17606171,Sun Nov 28 19:54:13 CET,Sun Nov 28 22:06:52 CET,0.0 0.177 0.283 0.373 0.419 0.454 0.501 0.547 0.598 0.615 0.64 0.577 0.713 0.735 0.778 0.817 0.848 0.867 0.906 0.936 0.985 1.008 1.021 1.031 1.033 1.039 1.047 1.063 1.084 1.088 1.077 1.073 1.082 1.069 1.043 0.998 0.933 0.861 0.795 0.723 0.621 0.488 0.308 0.091 -0.209 -0.626 -1.145 -1.789 -2.704 -4.047 -6.266 -8.824 -10.846 -12.491 -13.859 -15.062 -16.135 -17.116 -17.923 -18.691 -19.344 -19.925 -20.476 -20.999 -21.475 -21.914 -22.377 -22.763 -23.085 -23.428 -23.804 -24.104 -24.399 -24.719 -24.967 -25.225 -25.514 -25.835 -26.157 -26.378 -26.62 -26.996 -27.256 -27.527 -27.659 -27.949 -28.288 -28.651 -28.84 -29.171 -29.506 -29.791 -30.07 -30.626 -30.918 -31.22 -31.588 -32.016 -32.525 -33.204 -35.354 -9 ,28165 ,TETRA ,17606172,Sun Nov 28 19:54:13 CET,Sun Nov 28 22:08:28 CET,0.0 0.191 0.244 0.292 0.341 0.404 0.456 0.494 0.567 0.603 0.632 0.555 0.687 0.711 0.747 0.783 0.814 0.828 0.86 0.894 0.94 0.96 0.969 0.993 1.027 1.06 1.089 1.1 1.106 1.112 1.114 1.114 1.099 1.084 1.078 1.068 1.04 0.99 0.929 0.846 0.739 0.596 0.404 0.19 -0.093 -0.455 -0.927 -1.57 -2.518 -3.921 -6.176 -8.694 -10.669 -12.319 -13.702 -14.895 -15.884 -16.752 -17.513 -18.277 -18.926 -19.489 -20.027 -20.553 -21.041 -21.497 -21.979 -22.399 -22.753 -23.119 -23.519 -23.865 -24.236 -24.622 -24.901 -25.179 -25.474 -25.778 -26.089 -26.297 -26.516 -26.894 -27.192 -27.52 -27.672 -27.953 -28.257 -28.632 -28.833 -29.161 -29.405 -29.623 -29.88 -30.45 -30.768 -31.126 -31.539 -31.995 -32.568 -33.425 -36.297 -10 ,7245 ,TETRA ,17606173,Sun Nov 28 19:54:15 CET,Sun Nov 28 22:05:35 CET,0.0 0.158 0.279 0.364 0.426 0.477 0.539 0.612 0.723 0.759 0.791 0.752 0.912 0.951 0.996 1.024 1.046 1.059 1.093 1.126 1.168 1.194 1.216 1.248 1.271 1.292 1.325 1.354 1.371 1.369 1.366 1.359 1.342 1.33 1.306 1.255 1.21 1.163 1.1 1.028 0.955 0.833 0.635 0.42 0.143 -0.206 -0.715 -1.391 -2.332 -3.732 -5.956 -8.464 -10.412 -12.043 -13.397 -14.538 -15.501 -16.362 -17.091 -17.798 -18.434 -19.01 -19.556 -20.079 -20.563 -21.02 -21.507 -21.941 -22.351 -22.798 -23.242 -23.604 -23.964 -24.338 -24.634 -24.933 -25.247 -25.579 -25.917 -26.15 -26.392 -26.791 -27.097 -27.407 -27.553 -27.845 -28.153 -28.498 -28.697 -29.057 -29.385 -29.66 -29.981 -30.723 -31.147 -31.602 -32.132 -32.727 -33.381 -34.225 -36.872 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_37_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_37_35.txt deleted file mode 100644 index 35f8c16e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_37_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9441 ,TETRA ,17606174,Sun Nov 28 19:54:13 CET,Sun Nov 28 22:02:13 CET,0.0 0.455 0.68 0.864 1.016 1.17 1.317 1.428 1.638 1.746 1.853 1.932 2.126 2.213 2.377 2.541 2.695 2.76 2.895 3.025 3.203 3.33 3.45 3.622 3.791 3.954 4.101 4.238 4.424 4.61 4.791 4.995 5.18 5.363 5.579 5.827 6.077 6.353 6.663 7.006 7.358 7.745 8.186 8.625 9.136 9.714 10.39 11.104 11.897 12.749 13.647 14.275 14.414 14.388 14.331 14.18 13.993 13.822 13.626 13.362 13.144 12.94 12.721 12.525 12.342 12.149 11.945 11.748 11.568 11.38 11.187 11.024 10.833 10.644 10.509 10.358 10.193 10.028 9.857 9.733 9.606 9.407 9.257 9.103 9.026 8.869 8.68 8.479 8.379 8.161 8.032 7.908 7.784 7.55 7.408 7.217 7.02 6.785 6.503 6.193 5.186 -2 ,27529 ,TETRA ,17606176,Sun Nov 28 19:54:14 CET,Sun Nov 28 22:05:30 CET,0.0 0.41 0.677 0.872 1.041 1.189 1.316 1.443 1.668 1.769 1.86 1.914 2.103 2.182 2.335 2.495 2.655 2.728 2.871 3.005 3.191 3.315 3.436 3.598 3.766 3.93 4.087 4.239 4.438 4.629 4.807 5.009 5.204 5.409 5.645 5.893 6.125 6.399 6.7 6.996 7.307 7.681 8.141 8.623 9.159 9.711 10.355 11.084 11.906 12.841 13.826 14.42 14.642 14.69 14.654 14.572 14.44 14.271 14.079 13.843 13.62 13.392 13.142 12.909 12.684 12.477 12.264 12.079 11.915 11.731 11.55 11.413 11.274 11.109 10.964 10.821 10.682 10.548 10.396 10.282 10.181 9.992 9.836 9.678 9.604 9.447 9.266 9.07 8.977 8.779 8.691 8.582 8.47 8.225 8.077 7.902 7.708 7.493 7.247 6.94 6.16 -3 ,26093 ,TETRA ,17606177,Sun Nov 28 19:54:13 CET,Sun Nov 28 22:09:50 CET,0.0 0.372 0.557 0.709 0.859 0.996 1.121 1.242 1.46 1.572 1.675 1.728 1.923 2.015 2.179 2.324 2.455 2.52 2.664 2.795 2.972 3.097 3.217 3.385 3.548 3.708 3.861 4.001 4.184 4.368 4.551 4.777 4.986 5.189 5.431 5.696 5.937 6.193 6.464 6.736 7.043 7.438 7.927 8.42 8.996 9.639 10.347 11.102 11.995 12.996 14.07 14.703 14.783 14.611 14.412 14.24 14.061 13.869 13.661 13.42 13.206 13.002 12.799 12.604 12.395 12.194 12.005 11.844 11.69 11.529 11.363 11.223 11.083 10.916 10.773 10.621 10.459 10.293 10.118 10.002 9.883 9.7 9.569 9.433 9.36 9.184 9.007 8.811 8.703 8.503 8.405 8.294 8.179 7.916 7.765 7.597 7.402 7.162 6.894 6.582 5.838 -4 ,23586 ,TETRA ,17606178,Sun Nov 28 19:54:16 CET,Sun Nov 28 22:10:26 CET,0.0 0.312 0.498 0.67 0.808 0.918 1.019 1.127 1.332 1.438 1.549 1.611 1.798 1.88 2.038 2.18 2.309 2.377 2.514 2.64 2.829 2.957 3.086 3.277 3.456 3.612 3.751 3.887 4.058 4.23 4.403 4.614 4.82 5.03 5.282 5.543 5.783 6.06 6.367 6.693 7.027 7.421 7.887 8.321 8.816 9.382 10.018 10.706 11.529 12.503 13.612 14.353 14.602 14.726 14.752 14.663 14.543 14.378 14.168 13.916 13.718 13.557 13.384 13.197 13.021 12.851 12.649 12.472 12.323 12.166 12.007 11.87 11.729 11.574 11.446 11.315 11.163 10.997 10.824 10.702 10.578 10.384 10.248 10.099 10.018 9.856 9.696 9.533 9.452 9.262 9.186 9.073 8.935 8.634 8.469 8.294 8.105 7.882 7.623 7.313 6.557 -5 ,17939 ,TETRA ,17606179,Sun Nov 28 19:54:14 CET,Sun Nov 28 22:09:36 CET,0.0 0.336 0.561 0.779 0.956 1.103 1.244 1.366 1.603 1.707 1.807 1.876 2.072 2.16 2.322 2.466 2.61 2.68 2.822 2.954 3.153 3.286 3.406 3.586 3.769 3.935 4.078 4.218 4.404 4.576 4.756 4.989 5.216 5.434 5.682 5.945 6.211 6.505 6.811 7.139 7.472 7.843 8.286 8.755 9.307 9.924 10.611 11.386 12.324 13.407 14.588 15.264 15.378 15.367 15.369 15.32 15.213 15.062 14.902 14.735 14.553 14.356 14.139 13.954 13.809 13.653 13.462 13.279 13.13 12.994 12.83 12.684 12.537 12.375 12.249 12.113 11.969 11.825 11.665 11.551 11.441 11.271 11.141 11.003 10.93 10.772 10.611 10.439 10.34 10.139 10.047 9.937 9.806 9.511 9.362 9.181 8.973 8.771 8.541 8.183 6.875 -6 ,30706 ,TETRA ,17606180,Sun Nov 28 19:54:15 CET,Sun Nov 28 22:09:20 CET,0.0 0.436 0.676 0.858 0.994 1.128 1.263 1.378 1.575 1.661 1.743 1.793 1.986 2.074 2.237 2.381 2.514 2.586 2.729 2.853 3.031 3.148 3.263 3.423 3.575 3.729 3.868 3.997 4.179 4.359 4.538 4.759 4.969 5.169 5.408 5.679 5.926 6.204 6.5 6.798 7.103 7.466 7.903 8.326 8.823 9.382 10.021 10.761 11.609 12.561 13.671 14.48 14.814 14.836 14.718 14.581 14.407 14.228 14.059 13.859 13.694 13.531 13.341 13.164 13.009 12.861 12.689 12.542 12.424 12.273 12.095 11.94 11.775 11.604 11.471 11.345 11.209 11.057 10.904 10.787 10.656 10.458 10.332 10.213 10.15 10.011 9.845 9.67 9.583 9.38 9.257 9.146 9.035 8.768 8.6 8.416 8.228 8.035 7.815 7.501 6.544 -7 ,9056 ,TETRA ,17606181,Sun Nov 28 19:54:14 CET,Sun Nov 28 22:10:59 CET,0.0 0.464 0.686 0.865 1.033 1.164 1.272 1.374 1.574 1.674 1.769 1.83 2.014 2.091 2.265 2.409 2.525 2.593 2.725 2.841 3.019 3.13 3.249 3.433 3.595 3.746 3.89 4.035 4.221 4.401 4.583 4.798 4.99 5.183 5.412 5.672 5.931 6.213 6.516 6.829 7.15 7.509 7.934 8.359 8.843 9.405 10.03 10.658 11.395 12.231 13.091 13.598 13.631 13.446 13.168 12.845 12.516 12.199 11.881 11.527 11.187 10.882 10.647 10.427 10.213 10.023 9.813 9.621 9.445 9.254 9.044 8.877 8.724 8.581 8.456 8.315 8.175 8.024 7.865 7.757 7.642 7.451 7.315 7.174 7.101 6.927 6.742 6.558 6.458 6.239 6.105 5.974 5.842 5.552 5.384 5.213 5.013 4.775 4.475 4.061 3.167 -8 ,31780 ,TETRA ,17606182,Sun Nov 28 19:54:16 CET,Sun Nov 28 22:11:08 CET,0.0 0.546 0.749 0.904 1.046 1.182 1.322 1.455 1.684 1.798 1.904 1.971 2.168 2.252 2.411 2.554 2.691 2.763 2.899 3.019 3.209 3.337 3.455 3.628 3.797 3.952 4.109 4.27 4.461 4.647 4.841 5.066 5.274 5.473 5.719 6.015 6.296 6.589 6.904 7.242 7.583 7.979 8.449 8.89 9.398 9.988 10.659 11.405 12.198 13.035 13.914 14.403 14.591 14.611 14.576 14.488 14.324 14.111 13.906 13.664 13.443 13.249 13.04 12.846 12.668 12.481 12.277 12.106 11.939 11.748 11.568 11.428 11.287 11.137 11.008 10.865 10.72 10.571 10.414 10.301 10.189 10.027 9.911 9.78 9.707 9.558 9.411 9.264 9.18 8.976 8.864 8.736 8.605 8.352 8.211 8.032 7.813 7.561 7.282 6.952 6.115 -9 ,23087 ,TETRA ,17606183,Sun Nov 28 19:54:18 CET,Sun Nov 28 22:16:53 CET,0.0 0.713 0.993 1.211 1.368 1.507 1.659 1.79 2.002 2.104 2.203 2.275 2.476 2.576 2.772 2.942 3.092 3.16 3.287 3.427 3.638 3.759 3.87 4.023 4.174 4.331 4.479 4.617 4.814 5.003 5.175 5.381 5.571 5.751 5.98 6.256 6.519 6.806 7.105 7.421 7.76 8.138 8.568 8.99 9.499 10.078 10.74 11.503 12.4 13.382 14.46 15.277 15.656 15.789 15.822 15.784 15.686 15.521 15.323 15.094 14.887 14.677 14.45 14.222 14.007 13.807 13.599 13.438 13.289 13.103 12.908 12.75 12.592 12.422 12.274 12.125 11.988 11.856 11.689 11.549 11.397 11.182 11.051 10.916 10.851 10.722 10.564 10.387 10.296 10.093 9.991 9.885 9.767 9.476 9.316 9.135 8.921 8.677 8.362 7.959 6.979 -10 ,9658 ,TETRA ,17606184,Sun Nov 28 19:54:19 CET,Sun Nov 28 22:16:19 CET,0.0 0.572 0.822 0.989 1.144 1.27 1.38 1.495 1.697 1.776 1.858 1.909 2.095 2.174 2.34 2.492 2.632 2.7 2.832 2.965 3.16 3.283 3.396 3.557 3.721 3.884 4.04 4.189 4.389 4.573 4.739 4.957 5.168 5.364 5.595 5.844 6.079 6.343 6.628 6.911 7.216 7.565 7.953 8.353 8.808 9.325 9.983 10.698 11.445 12.293 13.308 14.079 14.488 14.653 14.608 14.428 14.191 13.975 13.793 13.59 13.402 13.222 13.049 12.874 12.693 12.529 12.367 12.214 12.068 11.92 11.764 11.627 11.479 11.317 11.182 11.046 10.9 10.724 10.525 10.385 10.249 10.047 9.903 9.754 9.676 9.521 9.37 9.198 9.101 8.89 8.768 8.652 8.531 8.274 8.122 7.925 7.703 7.493 7.238 6.89 5.853 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_38_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_38_34.txt deleted file mode 100644 index 4d0abf01..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_38_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30268 ,TETRA ,17606185,Sun Nov 28 19:54:14 CET,Sun Nov 28 22:11:36 CET,0.0 0.68 0.88 1.047 1.185 1.311 1.43 1.569 1.825 1.918 2.006 2.075 2.273 2.362 2.535 2.712 2.873 2.935 3.065 3.201 3.387 3.51 3.631 3.801 3.949 4.088 4.238 4.391 4.569 4.734 4.893 5.089 5.281 5.465 5.689 5.94 6.174 6.44 6.725 7.033 7.361 7.711 8.122 8.535 9.019 9.555 10.161 10.842 11.636 12.569 13.59 14.299 14.661 14.874 14.929 14.846 14.731 14.605 14.441 14.266 14.147 14.032 13.908 13.801 13.683 13.576 13.465 13.35 13.259 13.153 13.025 12.921 12.821 12.691 12.575 12.473 12.368 12.247 12.11 12.012 11.918 11.768 11.652 11.512 11.438 11.282 11.101 10.894 10.779 10.573 10.446 10.306 10.147 9.799 9.614 9.411 9.163 8.881 8.542 8.034 6.0 -2 ,19593 ,TETRA ,17606186,Sun Nov 28 19:54:14 CET,Sun Nov 28 22:09:47 CET,0.0 1.563 1.939 2.201 2.395 2.538 2.662 2.785 2.997 3.094 3.202 3.291 3.495 3.59 3.755 3.916 4.071 4.142 4.283 4.408 4.589 4.705 4.811 4.957 5.103 5.255 5.413 5.563 5.741 5.92 6.095 6.297 6.501 6.704 6.932 7.194 7.456 7.736 8.038 8.353 8.675 9.022 9.415 9.827 10.324 10.877 11.487 12.148 12.887 13.706 14.651 15.357 15.628 15.653 15.599 15.536 15.459 15.353 15.239 15.099 14.971 14.851 14.713 14.563 14.414 14.271 14.114 13.968 13.839 13.699 13.553 13.437 13.301 13.134 12.997 12.846 12.694 12.556 12.409 12.302 12.185 11.99 11.847 11.704 11.637 11.479 11.304 11.123 11.028 10.831 10.699 10.58 10.453 10.128 9.924 9.702 9.452 9.159 8.796 8.241 6.168 -3 ,17655 ,TETRA ,17606187,Sun Nov 28 19:54:17 CET,Sun Nov 28 22:10:10 CET,0.0 0.81 1.119 1.343 1.522 1.674 1.831 1.967 2.166 2.268 2.373 2.43 2.615 2.686 2.83 2.969 3.115 3.187 3.311 3.437 3.623 3.746 3.868 4.031 4.196 4.359 4.499 4.636 4.828 5.015 5.183 5.384 5.585 5.773 5.991 6.233 6.466 6.727 7.001 7.304 7.621 7.951 8.352 8.765 9.247 9.785 10.4 11.103 11.936 12.911 14.033 14.831 15.19 15.293 15.265 15.136 14.978 14.834 14.695 14.535 14.383 14.232 14.068 13.905 13.733 13.568 13.399 13.225 13.068 12.91 12.733 12.598 12.48 12.345 12.225 12.104 11.968 11.813 11.647 11.523 11.387 11.167 11.016 10.845 10.752 10.551 10.334 10.097 9.973 9.747 9.588 9.451 9.291 8.938 8.739 8.492 8.21 7.903 7.469 6.849 4.887 -4 ,17783 ,TETRA ,17606188,Sun Nov 28 19:54:18 CET,Sun Nov 28 22:10:17 CET,0.0 0.859 1.061 1.225 1.399 1.548 1.665 1.793 2.077 2.207 2.32 2.386 2.583 2.669 2.819 2.967 3.116 3.187 3.323 3.453 3.639 3.76 3.877 4.044 4.203 4.361 4.513 4.658 4.85 5.036 5.207 5.413 5.603 5.789 6.002 6.226 6.44 6.688 6.969 7.269 7.6 7.981 8.416 8.854 9.334 9.837 10.437 11.138 11.936 12.812 13.88 14.716 15.092 15.246 15.313 15.332 15.258 15.129 15.007 14.873 14.737 14.61 14.488 14.362 14.239 14.095 13.902 13.73 13.6 13.464 13.312 13.187 13.062 12.906 12.782 12.673 12.546 12.409 12.269 12.168 12.059 11.847 11.674 11.502 11.419 11.235 11.029 10.818 10.715 10.509 10.385 10.26 10.126 9.809 9.615 9.4 9.161 8.889 8.551 8.04 6.439 -5 ,26926 ,TETRA ,17606189,Sun Nov 28 19:54:20 CET,Sun Nov 28 22:09:26 CET,0.0 1.18 1.392 1.554 1.709 1.855 2.008 2.145 2.354 2.459 2.561 2.631 2.835 2.924 3.092 3.25 3.392 3.459 3.587 3.716 3.903 4.024 4.142 4.314 4.468 4.608 4.76 4.913 5.099 5.282 5.462 5.679 5.881 6.07 6.298 6.568 6.819 7.079 7.375 7.699 8.025 8.377 8.78 9.204 9.698 10.235 10.852 11.537 12.346 13.294 14.371 15.129 15.458 15.594 15.596 15.543 15.438 15.309 15.196 15.063 14.911 14.754 14.587 14.401 14.235 14.081 13.902 13.748 13.609 13.446 13.266 13.097 12.929 12.778 12.656 12.538 12.405 12.25 12.09 11.974 11.852 11.661 11.524 11.373 11.287 11.094 10.884 10.667 10.561 10.344 10.205 10.079 9.944 9.638 9.453 9.253 9.031 8.762 8.355 7.775 6.381 -6 ,9418 ,TETRA ,17606190,Sun Nov 28 19:54:12 CET,Sun Nov 28 22:15:07 CET,0.0 1.156 1.541 1.747 1.922 2.08 2.235 2.385 2.627 2.738 2.848 2.93 3.125 3.219 3.398 3.568 3.737 3.815 3.952 4.084 4.279 4.4 4.52 4.694 4.861 5.021 5.171 5.314 5.517 5.717 5.889 6.097 6.304 6.496 6.717 6.971 7.209 7.471 7.755 8.046 8.355 8.708 9.121 9.548 10.055 10.614 11.239 11.978 12.845 13.84 14.947 15.694 16.041 16.153 16.142 16.105 16.067 15.992 15.869 15.706 15.551 15.415 15.275 15.131 14.997 14.893 14.771 14.655 14.555 14.434 14.302 14.175 14.04 13.9 13.787 13.658 13.517 13.36 13.194 13.09 12.985 12.802 12.675 12.532 12.444 12.263 12.046 11.808 11.688 11.464 11.326 11.178 11.011 10.645 10.433 10.176 9.85 9.505 9.139 8.558 6.133 -7 ,24963 ,TETRA ,17606191,Sun Nov 28 19:54:16 CET,Sun Nov 28 22:16:10 CET,0.0 0.731 0.971 1.17 1.324 1.464 1.603 1.762 2.038 2.147 2.26 2.353 2.563 2.658 2.828 3.006 3.173 3.245 3.386 3.517 3.701 3.825 3.955 4.134 4.294 4.456 4.61 4.754 4.947 5.135 5.313 5.535 5.752 5.959 6.195 6.453 6.702 6.984 7.286 7.597 7.929 8.304 8.745 9.2 9.736 10.32 10.972 11.692 12.543 13.536 14.561 15.121 15.29 15.365 15.38 15.335 15.256 15.132 14.983 14.841 14.71 14.588 14.472 14.333 14.184 14.027 13.858 13.722 13.591 13.439 13.295 13.16 13.0 12.845 12.723 12.584 12.441 12.297 12.133 12.011 11.889 11.693 11.55 11.405 11.33 11.151 10.949 10.734 10.628 10.412 10.234 10.088 9.931 9.592 9.423 9.22 8.963 8.654 8.28 7.797 5.998 -8 ,12069 ,TETRA ,17606192,Sun Nov 28 19:54:18 CET,Sun Nov 28 22:10:30 CET,0.0 0.521 0.777 0.988 1.154 1.302 1.46 1.602 1.813 1.914 2.017 2.094 2.291 2.383 2.565 2.719 2.868 2.941 3.075 3.2 3.389 3.514 3.63 3.808 3.981 4.128 4.275 4.421 4.607 4.785 4.959 5.171 5.382 5.584 5.82 6.087 6.344 6.617 6.894 7.196 7.512 7.867 8.294 8.732 9.243 9.813 10.451 11.143 11.963 12.939 14.026 14.797 15.168 15.342 15.384 15.323 15.239 15.127 14.973 14.798 14.633 14.459 14.282 14.127 13.98 13.813 13.631 13.478 13.338 13.193 13.043 12.916 12.774 12.611 12.471 12.325 12.17 12.001 11.808 11.681 11.567 11.378 11.223 11.047 10.968 10.792 10.595 10.403 10.301 10.093 9.955 9.815 9.678 9.371 9.151 8.902 8.658 8.377 8.008 7.482 5.809 -9 ,19829 ,TETRA ,17606193,Sun Nov 28 19:54:19 CET,Sun Nov 28 22:10:23 CET,0.0 0.567 0.845 1.082 1.238 1.363 1.485 1.598 1.787 1.876 1.97 2.067 2.272 2.349 2.509 2.66 2.795 2.862 2.999 3.135 3.336 3.474 3.597 3.757 3.908 4.056 4.2 4.334 4.516 4.692 4.86 5.063 5.248 5.427 5.644 5.904 6.166 6.445 6.736 7.033 7.353 7.737 8.197 8.656 9.17 9.729 10.351 11.057 11.894 12.819 13.898 14.616 14.86 14.911 14.888 14.798 14.687 14.581 14.442 14.269 14.114 13.963 13.812 13.663 13.511 13.362 13.21 13.063 12.913 12.759 12.625 12.505 12.342 12.16 12.03 11.901 11.761 11.616 11.459 11.354 11.249 11.048 10.894 10.738 10.657 10.484 10.293 10.074 9.958 9.739 9.612 9.483 9.331 9.024 8.838 8.602 8.368 8.118 7.778 7.279 5.656 -10 ,20194 ,TETRA ,17606194,Sun Nov 28 19:54:16 CET,Sun Nov 28 22:10:08 CET,0.0 0.557 0.835 1.025 1.184 1.32 1.449 1.569 1.778 1.89 1.999 2.065 2.265 2.345 2.497 2.645 2.789 2.862 3.024 3.186 3.377 3.494 3.609 3.791 3.978 4.144 4.304 4.463 4.66 4.848 5.021 5.23 5.426 5.614 5.834 6.079 6.324 6.584 6.858 7.157 7.474 7.84 8.258 8.669 9.158 9.694 10.298 10.951 11.685 12.521 13.459 14.081 14.317 14.374 14.344 14.249 14.077 13.881 13.725 13.538 13.317 13.109 12.92 12.723 12.525 12.34 12.155 12.003 11.874 11.736 11.582 11.443 11.284 11.121 10.993 10.859 10.716 10.555 10.396 10.292 10.175 9.985 9.839 9.68 9.608 9.451 9.293 9.127 9.028 8.82 8.702 8.58 8.444 8.122 7.918 7.71 7.499 7.258 6.927 6.351 4.775 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_38_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_38_37.txt deleted file mode 100644 index 846fd67b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_38_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14326 ,TETRA ,17672813,Fri Dec 3 09:11:36 CET,Fri Dec 3 11:28:36 CET,0.0 0.696 1.008 1.278 1.488 1.663 1.819 1.951 2.186 2.304 2.419 2.508 2.712 2.794 2.964 3.132 3.281 3.346 3.477 3.599 3.768 3.885 3.994 4.136 4.276 4.415 4.547 4.668 4.837 5.016 5.18 5.365 5.524 5.679 5.868 6.076 6.266 6.468 6.689 6.916 7.147 7.407 7.697 7.952 8.219 8.514 8.813 9.113 9.45 9.729 9.861 9.705 9.42 9.072 8.72 8.365 8.038 7.746 7.48 7.177 6.896 6.65 6.417 6.194 5.985 5.798 5.594 5.401 5.222 5.045 4.871 4.706 4.524 4.331 4.182 4.028 3.875 3.724 3.554 3.432 3.312 3.121 2.967 2.813 2.744 2.598 2.438 2.271 2.185 1.988 1.908 1.791 1.655 1.358 1.208 1.05 0.865 0.657 0.404 0.112 -0.744 -2 ,32129 ,TETRA ,17672814,Fri Dec 3 09:11:38 CET,Fri Dec 3 11:29:39 CET,0.0 0.665 1.017 1.292 1.508 1.671 1.808 1.94 2.178 2.284 2.384 2.457 2.656 2.737 2.909 3.059 3.195 3.265 3.398 3.527 3.705 3.816 3.926 4.081 4.236 4.385 4.529 4.654 4.797 4.953 5.098 5.265 5.437 5.605 5.786 5.968 6.14 6.331 6.534 6.766 7.01 7.271 7.573 7.87 8.217 8.604 8.991 9.304 9.593 9.858 10.01 9.866 9.495 9.12 8.782 8.467 8.178 7.888 7.627 7.334 7.051 6.803 6.574 6.354 6.145 5.945 5.731 5.54 5.37 5.182 4.98 4.82 4.654 4.486 4.367 4.23 4.078 3.918 3.743 3.632 3.517 3.311 3.169 3.021 2.946 2.793 2.627 2.465 2.372 2.159 2.066 1.956 1.84 1.573 1.418 1.243 1.058 0.855 0.603 0.274 -0.483 -3 ,17392 ,TETRA ,17672815,Fri Dec 3 09:11:36 CET,Fri Dec 3 11:28:21 CET,0.0 0.449 0.729 0.964 1.122 1.238 1.352 1.468 1.697 1.816 1.926 2.007 2.2 2.279 2.434 2.571 2.692 2.756 2.887 3.0 3.155 3.268 3.371 3.518 3.661 3.79 3.922 4.044 4.199 4.358 4.508 4.683 4.848 5.0 5.171 5.372 5.572 5.788 6.012 6.249 6.501 6.755 7.028 7.313 7.635 7.943 8.271 8.604 8.885 9.102 9.209 9.095 8.788 8.425 8.097 7.8 7.517 7.258 7.03 6.79 6.572 6.349 6.121 5.908 5.708 5.521 5.326 5.147 4.993 4.828 4.642 4.49 4.342 4.191 4.07 3.944 3.805 3.661 3.516 3.4 3.27 3.076 2.951 2.82 2.749 2.576 2.39 2.2 2.099 1.893 1.773 1.655 1.539 1.3 1.17 1.029 0.868 0.678 0.463 0.176 -0.711 -4 ,29907 ,TETRA ,17672816,Fri Dec 3 09:11:38 CET,Fri Dec 3 11:26:17 CET,0.0 0.869 1.169 1.408 1.615 1.784 1.926 2.061 2.286 2.39 2.488 2.573 2.779 2.86 3.016 3.167 3.306 3.368 3.495 3.622 3.81 3.926 4.033 4.195 4.334 4.462 4.592 4.71 4.865 5.029 5.169 5.317 5.471 5.639 5.837 6.029 6.213 6.424 6.638 6.858 7.094 7.358 7.666 7.967 8.282 8.626 9.029 9.415 9.783 10.159 10.393 10.318 10.094 9.833 9.532 9.2 8.886 8.606 8.368 8.09 7.848 7.642 7.434 7.225 7.017 6.824 6.624 6.444 6.289 6.127 5.958 5.813 5.651 5.476 5.33 5.182 5.047 4.913 4.756 4.642 4.529 4.339 4.206 4.078 4.011 3.864 3.707 3.55 3.467 3.256 3.137 3.019 2.891 2.628 2.48 2.314 2.113 1.855 1.565 1.182 -0.289 -5 ,29480 ,TETRA ,17672817,Fri Dec 3 09:11:36 CET,Fri Dec 3 11:21:59 CET,0.0 0.566 0.858 1.095 1.307 1.462 1.593 1.724 1.97 2.085 2.194 2.285 2.485 2.564 2.723 2.872 2.998 3.066 3.214 3.344 3.52 3.64 3.755 3.916 4.059 4.197 4.337 4.47 4.636 4.796 4.944 5.119 5.284 5.442 5.632 5.842 6.022 6.204 6.406 6.631 6.874 7.136 7.413 7.657 7.938 8.242 8.57 8.909 9.227 9.513 9.691 9.624 9.349 9.007 8.66 8.303 7.951 7.616 7.31 6.987 6.71 6.468 6.235 6.012 5.803 5.606 5.392 5.192 5.013 4.836 4.666 4.516 4.355 4.183 4.044 3.898 3.75 3.6 3.428 3.311 3.195 2.991 2.839 2.68 2.595 2.423 2.247 2.056 1.959 1.75 1.661 1.543 1.41 1.158 1.016 0.839 0.631 0.406 0.111 -0.303 -1.324 -6 ,19778 ,TETRA ,17672818,Fri Dec 3 09:11:36 CET,Fri Dec 3 11:21:10 CET,0.0 0.772 1.079 1.324 1.531 1.704 1.856 1.979 2.213 2.325 2.418 2.467 2.664 2.75 2.926 3.096 3.253 3.323 3.445 3.561 3.743 3.857 3.958 4.096 4.224 4.364 4.498 4.622 4.781 4.926 5.064 5.237 5.404 5.553 5.728 5.935 6.134 6.339 6.54 6.745 6.967 7.218 7.5 7.767 8.066 8.391 8.724 9.053 9.405 9.753 10.023 9.917 9.599 9.277 8.96 8.645 8.334 8.028 7.767 7.477 7.212 6.991 6.776 6.563 6.362 6.189 5.995 5.784 5.607 5.433 5.253 5.105 4.929 4.743 4.604 4.447 4.29 4.136 3.969 3.849 3.731 3.539 3.401 3.253 3.169 3.0 2.828 2.635 2.527 2.299 2.197 2.074 1.944 1.65 1.458 1.241 1.017 0.768 0.492 0.165 -0.648 -7 ,11821 ,TETRA ,17672819,Fri Dec 3 09:11:35 CET,Fri Dec 3 11:17:14 CET,0.0 0.542 0.805 1.014 1.178 1.326 1.481 1.631 1.868 1.968 2.07 2.146 2.343 2.432 2.599 2.751 2.892 2.963 3.101 3.217 3.376 3.48 3.576 3.716 3.854 3.984 4.113 4.236 4.388 4.541 4.687 4.86 5.047 5.211 5.377 5.578 5.784 5.994 6.202 6.431 6.652 6.875 7.139 7.432 7.757 8.082 8.452 8.826 9.226 9.568 9.737 9.537 9.222 8.88 8.559 8.278 7.968 7.671 7.434 7.182 6.95 6.745 6.538 6.335 6.144 5.951 5.753 5.587 5.443 5.29 5.118 4.976 4.836 4.695 4.578 4.444 4.305 4.163 4.0 3.882 3.761 3.566 3.427 3.28 3.202 3.033 2.858 2.695 2.605 2.404 2.32 2.208 2.081 1.777 1.605 1.415 1.207 0.988 0.734 0.398 -0.619 -8 ,26229 ,TETRA ,17672820,Fri Dec 3 09:11:37 CET,Fri Dec 3 11:07:48 CET,0.0 0.899 1.259 1.507 1.726 1.916 2.09 2.247 2.506 2.629 2.746 2.813 3.004 3.085 3.251 3.417 3.585 3.667 3.807 3.925 4.104 4.219 4.325 4.486 4.631 4.756 4.888 5.015 5.172 5.332 5.477 5.634 5.79 5.951 6.132 6.322 6.493 6.691 6.917 7.138 7.363 7.636 7.949 8.263 8.601 8.927 9.258 9.584 9.919 10.21 10.409 10.348 10.081 9.727 9.379 9.049 8.741 8.45 8.191 7.92 7.662 7.419 7.181 6.94 6.708 6.498 6.285 6.089 5.918 5.738 5.547 5.386 5.224 5.066 4.939 4.796 4.646 4.483 4.302 4.173 4.047 3.86 3.724 3.581 3.508 3.357 3.195 3.021 2.926 2.718 2.639 2.526 2.408 2.158 2.005 1.836 1.645 1.424 1.183 0.819 -0.247 -9 ,2369 ,TETRA ,17672821,Fri Dec 3 09:11:37 CET,Fri Dec 3 11:25:19 CET,0.0 0.732 1.046 1.299 1.513 1.676 1.81 1.931 2.189 2.32 2.436 2.523 2.722 2.812 2.995 3.16 3.312 3.389 3.528 3.656 3.849 3.975 4.089 4.253 4.419 4.575 4.71 4.839 4.991 5.136 5.285 5.461 5.646 5.814 5.992 6.186 6.366 6.574 6.804 7.028 7.236 7.489 7.772 8.016 8.282 8.548 8.848 9.153 9.487 9.776 9.846 9.643 9.332 8.99 8.624 8.264 7.939 7.639 7.374 7.077 6.799 6.535 6.268 6.016 5.762 5.531 5.306 5.113 4.938 4.737 4.517 4.351 4.189 4.009 3.878 3.75 3.602 3.425 3.23 3.107 2.993 2.803 2.673 2.542 2.471 2.319 2.156 1.991 1.909 1.7 1.586 1.483 1.379 1.137 0.998 0.824 0.613 0.395 0.145 -0.196 -1.23 -10 ,29650 ,TETRA ,17672822,Fri Dec 3 09:11:39 CET,Fri Dec 3 11:24:21 CET,0.0 0.703 1.029 1.291 1.475 1.644 1.8 1.92 2.131 2.229 2.321 2.377 2.563 2.644 2.811 2.955 3.088 3.152 3.272 3.388 3.577 3.699 3.803 3.936 4.063 4.188 4.302 4.421 4.573 4.712 4.845 5.011 5.171 5.319 5.494 5.7 5.888 6.08 6.285 6.501 6.724 6.971 7.272 7.586 7.909 8.223 8.562 8.885 9.179 9.427 9.556 9.383 9.071 8.719 8.362 7.979 7.628 7.328 7.048 6.75 6.481 6.242 6.024 5.808 5.593 5.385 5.185 5.015 4.865 4.711 4.541 4.397 4.236 4.072 3.95 3.824 3.693 3.549 3.397 3.29 3.175 2.974 2.83 2.688 2.61 2.453 2.286 2.098 2.005 1.803 1.711 1.598 1.482 1.239 1.107 0.955 0.784 0.575 0.306 -0.039 -1.442 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_38_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_38_43.txt deleted file mode 100644 index 502e087c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_38_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23069 ,TETRA ,17606195,Sun Nov 28 19:54:19 CET,Sun Nov 28 22:09:59 CET,0.0 0.779 1.094 1.344 1.556 1.743 1.919 2.071 2.348 2.488 2.612 2.719 2.937 3.048 3.248 3.432 3.605 3.683 3.832 3.983 4.21 4.353 4.497 4.712 4.909 5.083 5.253 5.427 5.653 5.879 6.114 6.393 6.648 6.887 7.158 7.476 7.775 8.086 8.438 8.835 9.25 9.679 10.167 10.693 11.323 12.046 12.841 13.657 14.639 15.716 16.88 17.774 18.173 18.249 18.181 18.045 17.898 17.716 17.469 17.23 17.03 16.821 16.604 16.391 16.214 16.046 15.843 15.677 15.505 15.312 15.157 15.027 14.879 14.72 14.59 14.466 14.337 14.193 14.043 13.93 13.8 13.584 13.425 13.263 13.195 13.072 12.919 12.723 12.609 12.394 12.243 12.108 11.957 11.627 11.457 11.286 11.097 10.844 10.517 10.047 7.096 -2 ,14385 ,TETRA ,17606196,Sun Nov 28 19:54:47 CET,Sun Nov 28 22:10:49 CET,0.0 1.23 1.588 1.875 2.081 2.265 2.425 2.563 2.815 2.93 3.051 3.162 3.375 3.479 3.703 3.913 4.103 4.196 4.374 4.549 4.794 4.944 5.083 5.284 5.482 5.656 5.823 5.991 6.225 6.45 6.648 6.887 7.113 7.329 7.595 7.925 8.233 8.552 8.909 9.281 9.669 10.122 10.643 11.189 11.833 12.491 13.243 14.151 15.181 16.282 17.434 18.1 18.388 18.459 18.381 18.273 18.146 18.008 17.843 17.652 17.497 17.336 17.166 17.004 16.838 16.645 16.439 16.258 16.067 15.877 15.719 15.569 15.389 15.205 15.063 14.896 14.721 14.561 14.378 14.251 14.122 13.895 13.716 13.551 13.471 13.269 13.045 12.833 12.732 12.518 12.367 12.237 12.088 11.773 11.594 11.375 11.115 10.775 10.358 9.838 8.135 -3 ,22081 ,TETRA ,17606197,Sun Nov 28 19:54:49 CET,Sun Nov 28 22:10:21 CET,0.0 1.465 1.885 2.149 2.373 2.604 2.795 2.94 3.189 3.298 3.407 3.517 3.728 3.843 4.058 4.244 4.419 4.497 4.646 4.796 5.017 5.156 5.293 5.489 5.678 5.854 6.027 6.204 6.437 6.668 6.888 7.137 7.395 7.654 7.943 8.251 8.534 8.859 9.202 9.56 9.942 10.376 10.896 11.418 12.047 12.735 13.459 14.278 15.271 16.376 17.613 18.536 18.866 18.96 18.946 18.823 18.668 18.503 18.348 18.159 17.997 17.86 17.705 17.552 17.395 17.22 17.023 16.841 16.685 16.52 16.329 16.171 16.011 15.843 15.708 15.558 15.408 15.244 15.044 14.901 14.761 14.555 14.417 14.273 14.179 13.977 13.79 13.598 13.51 13.311 13.189 13.059 12.894 12.506 12.31 12.124 11.891 11.603 11.301 10.833 7.915 -4 ,16104 ,TETRA ,17606198,Sun Nov 28 19:54:47 CET,Sun Nov 28 22:19:11 CET,0.0 0.997 1.299 1.589 1.821 2.013 2.166 2.33 2.638 2.77 2.898 3.012 3.241 3.358 3.563 3.75 3.926 4.009 4.172 4.335 4.572 4.713 4.853 5.075 5.284 5.482 5.672 5.847 6.06 6.265 6.464 6.702 6.94 7.168 7.432 7.747 8.062 8.393 8.736 9.099 9.485 9.905 10.395 10.897 11.467 12.107 12.868 13.7 14.604 15.646 16.884 17.763 18.129 18.211 18.182 18.137 18.013 17.846 17.657 17.397 17.191 17.009 16.817 16.651 16.475 16.299 16.115 15.941 15.796 15.654 15.488 15.319 15.146 14.977 14.85 14.722 14.588 14.448 14.299 14.188 14.063 13.864 13.722 13.562 13.477 13.296 13.095 12.879 12.773 12.576 12.445 12.31 12.162 11.786 11.569 11.323 11.045 10.751 10.368 9.924 7.549 -5 ,3870 ,TETRA ,17606199,Sun Nov 28 19:54:49 CET,Sun Nov 28 22:18:45 CET,0.0 0.837 1.137 1.385 1.597 1.789 1.965 2.113 2.353 2.466 2.585 2.697 2.906 3.011 3.204 3.371 3.538 3.622 3.791 3.946 4.164 4.303 4.438 4.64 4.834 5.016 5.187 5.361 5.603 5.837 6.05 6.282 6.503 6.73 6.998 7.303 7.593 7.915 8.255 8.603 8.972 9.384 9.891 10.419 11.013 11.667 12.421 13.257 14.195 15.218 16.436 17.384 17.777 17.931 17.982 17.96 17.882 17.735 17.534 17.294 17.117 16.929 16.733 16.518 16.318 16.173 15.984 15.789 15.635 15.482 15.313 15.165 14.997 14.833 14.714 14.576 14.431 14.28 14.113 13.987 13.832 13.594 13.43 13.234 13.138 12.968 12.779 12.524 12.388 12.179 12.041 11.893 11.727 11.35 11.136 10.906 10.641 10.313 9.864 9.203 4.291 -6 ,15546 ,TETRA ,17606200,Sun Nov 28 19:54:47 CET,Sun Nov 28 22:09:35 CET,0.0 1.055 1.372 1.619 1.799 1.946 2.104 2.251 2.508 2.632 2.751 2.871 3.088 3.177 3.344 3.517 3.676 3.753 3.909 4.077 4.317 4.462 4.609 4.824 5.024 5.212 5.4 5.573 5.803 6.032 6.252 6.523 6.782 7.028 7.324 7.668 7.982 8.316 8.682 9.074 9.5 9.991 10.547 11.091 11.716 12.396 13.165 13.997 14.964 16.087 17.303 18.189 18.541 18.638 18.633 18.55 18.392 18.21 18.028 17.797 17.588 17.413 17.232 17.04 16.881 16.72 16.512 16.338 16.19 16.02 15.861 15.738 15.606 15.463 15.342 15.199 15.041 14.893 14.732 14.613 14.485 14.276 14.115 13.949 13.867 13.678 13.483 13.279 13.166 12.942 12.769 12.633 12.494 12.185 11.997 11.77 11.495 11.188 10.844 10.285 7.245 -7 ,22271 ,TETRA ,17606201,Sun Nov 28 19:54:50 CET,Sun Nov 28 22:09:40 CET,0.0 1.094 1.406 1.628 1.809 1.992 2.163 2.318 2.601 2.726 2.841 2.945 3.158 3.268 3.474 3.654 3.83 3.918 4.079 4.227 4.448 4.594 4.735 4.942 5.134 5.32 5.494 5.659 5.876 6.083 6.265 6.48 6.696 6.921 7.196 7.505 7.801 8.126 8.484 8.87 9.278 9.741 10.257 10.756 11.337 11.97 12.738 13.647 14.677 15.865 17.261 18.22 18.608 18.739 18.758 18.71 18.613 18.474 18.304 18.146 17.984 17.82 17.646 17.46 17.27 17.096 16.908 16.722 16.569 16.414 16.235 16.079 15.916 15.73 15.577 15.422 15.265 15.082 14.889 14.769 14.645 14.431 14.281 14.136 14.057 13.883 13.709 13.5 13.366 13.12 12.893 12.709 12.513 12.069 11.803 11.519 11.252 10.957 10.58 10.032 7.712 -8 ,30549 ,TETRA ,17606202,Sun Nov 28 19:54:47 CET,Sun Nov 28 22:11:01 CET,0.0 1.168 1.605 1.876 2.11 2.287 2.454 2.622 2.904 3.03 3.156 3.264 3.474 3.579 3.771 3.956 4.147 4.238 4.424 4.604 4.844 4.998 5.151 5.377 5.595 5.811 6.004 6.165 6.376 6.601 6.827 7.084 7.316 7.548 7.826 8.146 8.462 8.825 9.211 9.625 10.081 10.578 11.137 11.69 12.332 13.01 13.767 14.632 15.609 16.716 17.815 18.413 18.656 18.67 18.571 18.452 18.281 18.032 17.797 17.597 17.451 17.267 17.067 16.933 16.801 16.623 16.414 16.248 16.105 15.932 15.738 15.585 15.425 15.239 15.087 14.929 14.794 14.653 14.47 14.338 14.196 13.95 13.768 13.581 13.496 13.344 13.181 13.008 12.906 12.696 12.571 12.438 12.3 11.99 11.795 11.576 11.342 11.071 10.742 10.267 8.269 -9 ,2679 ,TETRA ,17606203,Sun Nov 28 19:54:49 CET,Sun Nov 28 22:11:01 CET,0.0 0.822 1.113 1.384 1.626 1.818 1.98 2.11 2.353 2.478 2.598 2.699 2.901 3.002 3.193 3.365 3.537 3.622 3.776 3.911 4.107 4.243 4.375 4.568 4.764 4.957 5.132 5.296 5.509 5.724 5.939 6.182 6.408 6.638 6.894 7.168 7.45 7.782 8.138 8.495 8.891 9.382 9.943 10.481 11.121 11.833 12.607 13.451 14.451 15.542 16.654 17.395 17.679 17.754 17.696 17.606 17.528 17.385 17.214 17.057 16.89 16.731 16.565 16.369 16.207 16.032 15.836 15.67 15.533 15.397 15.223 15.065 14.908 14.742 14.595 14.448 14.302 14.145 13.986 13.878 13.746 13.5 13.338 13.168 13.082 12.912 12.707 12.498 12.394 12.171 11.977 11.817 11.657 11.269 11.057 10.856 10.618 10.324 9.961 9.436 7.045 -10 ,22342 ,TETRA ,17606204,Sun Nov 28 19:54:49 CET,Sun Nov 28 22:10:20 CET,0.0 1.144 1.517 1.765 1.975 2.148 2.292 2.434 2.709 2.841 2.976 3.111 3.319 3.409 3.589 3.761 3.918 3.997 4.155 4.307 4.522 4.676 4.83 5.041 5.27 5.492 5.69 5.874 6.096 6.317 6.54 6.803 7.065 7.329 7.628 7.965 8.288 8.643 9.046 9.446 9.84 10.314 10.852 11.367 11.963 12.615 13.386 14.266 15.337 16.554 17.749 18.535 18.869 19.034 19.084 18.978 18.828 18.695 18.557 18.32 18.1 17.955 17.769 17.573 17.391 17.21 17.039 16.89 16.745 16.577 16.41 16.284 16.163 16.011 15.86 15.708 15.569 15.418 15.235 15.093 14.949 14.725 14.552 14.37 14.278 14.081 13.87 13.63 13.511 13.295 13.132 12.993 12.823 12.449 12.254 12.012 11.671 11.27 10.83 10.266 7.133 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_39_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_39_19.txt deleted file mode 100644 index f9d49508..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_39_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7157 ,KEBNE ,17027656,Wed Dec 22 17:41:04 CET,Wed Dec 22 19:33:27 CET,0.0 0.221 0.332 0.439 0.516 0.582 0.641 0.69 0.784 0.819 0.85 0.827 0.95 0.974 1.025 1.075 1.12 1.14 1.177 1.211 1.256 1.289 1.324 1.363 1.39 1.421 1.455 1.48 1.5 1.521 1.552 1.582 1.595 1.605 1.608 1.6 1.582 1.539 1.462 1.366 1.259 1.13 0.954 0.752 0.489 0.119 -0.4 -1.068 -1.992 -3.385 -5.695 -8.387 -10.455 -12.105 -13.509 -14.735 -15.806 -16.761 -17.566 -18.379 -19.07 -19.681 -20.268 -20.801 -21.273 -21.7 -22.148 -22.576 -22.952 -23.33 -23.732 -24.077 -24.423 -24.756 -25.02 -25.29 -25.601 -25.948 -26.266 -26.477 -26.699 -27.042 -27.3 -27.577 -27.719 -28.017 -28.307 -28.593 -28.747 -29.033 -29.292 -29.491 -29.718 -30.214 -30.496 -30.851 -31.272 -31.755 -32.364 -33.24 -36.573 -2 ,11300 ,KEBNE ,17027657,Wed Dec 22 17:41:02 CET,Wed Dec 22 19:34:34 CET,0.0 0.269 0.342 0.406 0.476 0.548 0.618 0.69 0.801 0.844 0.889 0.88 1.012 1.05 1.129 1.197 1.249 1.271 1.31 1.344 1.389 1.421 1.451 1.494 1.536 1.561 1.576 1.592 1.609 1.622 1.639 1.66 1.68 1.703 1.725 1.739 1.747 1.74 1.715 1.688 1.619 1.482 1.326 1.155 0.937 0.647 0.171 -0.46 -1.254 -2.484 -4.53 -6.97 -8.99 -10.664 -12.07 -13.305 -14.337 -15.22 -15.998 -16.813 -17.55 -18.215 -18.79 -19.298 -19.775 -20.237 -20.723 -21.134 -21.487 -21.858 -22.262 -22.598 -22.934 -23.306 -23.6 -23.883 -24.169 -24.478 -24.813 -25.059 -25.311 -25.668 -25.912 -26.171 -26.304 -26.591 -26.892 -27.194 -27.351 -27.631 -27.848 -28.027 -28.219 -28.661 -28.924 -29.219 -29.565 -29.946 -30.396 -30.992 -33.918 -3 ,23995 ,KEBNE ,17027658,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:33:46 CET,0.0 0.126 0.221 0.283 0.357 0.421 0.473 0.518 0.589 0.628 0.675 0.657 0.788 0.831 0.895 0.96 1.017 1.039 1.085 1.123 1.177 1.216 1.245 1.288 1.326 1.355 1.394 1.435 1.468 1.504 1.539 1.566 1.596 1.618 1.629 1.641 1.643 1.63 1.604 1.577 1.56 1.523 1.439 1.312 1.097 0.788 0.352 -0.236 -1.073 -2.368 -4.523 -7.072 -9.136 -10.879 -12.365 -13.606 -14.636 -15.544 -16.322 -17.109 -17.781 -18.381 -18.945 -19.447 -19.897 -20.336 -20.805 -21.186 -21.518 -21.902 -22.302 -22.626 -22.966 -23.328 -23.622 -23.897 -24.148 -24.412 -24.691 -24.883 -25.071 -25.368 -25.589 -25.814 -25.933 -26.179 -26.425 -26.686 -26.817 -27.066 -27.246 -27.419 -27.609 -28.057 -28.298 -28.529 -28.779 -29.058 -29.451 -29.98 -32.271 -4 ,3200 ,KEBNE ,17027659,Wed Dec 22 17:41:04 CET,Wed Dec 22 19:34:54 CET,0.0 0.225 0.311 0.384 0.465 0.55 0.635 0.696 0.792 0.837 0.88 0.858 0.983 1.005 1.053 1.103 1.144 1.167 1.213 1.259 1.319 1.357 1.392 1.448 1.502 1.532 1.551 1.583 1.633 1.661 1.687 1.728 1.762 1.788 1.799 1.795 1.795 1.793 1.784 1.755 1.716 1.657 1.546 1.407 1.206 0.933 0.561 0.01 -0.83 -2.175 -4.396 -6.867 -8.925 -10.702 -12.168 -13.42 -14.53 -15.545 -16.384 -17.221 -17.953 -18.608 -19.213 -19.776 -20.32 -20.823 -21.332 -21.77 -22.137 -22.497 -22.899 -23.244 -23.578 -23.932 -24.205 -24.49 -24.792 -25.083 -25.388 -25.603 -25.821 -26.181 -26.419 -26.667 -26.799 -27.084 -27.41 -27.76 -27.944 -28.255 -28.526 -28.724 -28.945 -29.438 -29.695 -29.993 -30.347 -30.742 -31.203 -31.886 -36.436 -5 ,16817 ,KEBNE ,17027660,Wed Dec 22 17:41:03 CET,Wed Dec 22 19:33:44 CET,0.0 0.381 0.532 0.652 0.766 0.84 0.893 0.946 1.03 1.069 1.105 1.071 1.194 1.225 1.266 1.298 1.351 1.375 1.407 1.437 1.496 1.537 1.568 1.601 1.632 1.667 1.693 1.715 1.75 1.787 1.812 1.831 1.853 1.872 1.892 1.917 1.93 1.92 1.886 1.847 1.797 1.725 1.609 1.458 1.241 0.945 0.5 -0.139 -1.056 -2.386 -4.554 -7.251 -9.453 -11.2 -12.646 -13.991 -15.193 -16.247 -17.095 -17.922 -18.651 -19.3 -19.869 -20.378 -20.873 -21.339 -21.814 -22.213 -22.583 -23.008 -23.448 -23.822 -24.207 -24.578 -24.859 -25.154 -25.449 -25.747 -26.078 -26.312 -26.55 -26.904 -27.161 -27.442 -27.592 -27.909 -28.244 -28.603 -28.786 -29.09 -29.345 -29.536 -29.74 -30.202 -30.463 -30.763 -31.123 -31.535 -32.081 -32.889 -38.706 -6 ,13280 ,KEBNE ,17027661,Wed Dec 22 17:41:04 CET,Wed Dec 22 19:34:12 CET,0.0 0.298 0.375 0.438 0.508 0.561 0.614 0.683 0.784 0.824 0.861 0.838 0.973 1.007 1.055 1.096 1.155 1.187 1.235 1.278 1.333 1.368 1.407 1.458 1.489 1.508 1.534 1.57 1.609 1.633 1.664 1.684 1.703 1.735 1.763 1.777 1.773 1.762 1.741 1.712 1.673 1.614 1.503 1.347 1.148 0.882 0.501 -0.06 -0.926 -2.242 -4.402 -6.881 -8.813 -10.415 -11.799 -13.007 -14.048 -14.964 -15.742 -16.516 -17.173 -17.773 -18.339 -18.839 -19.291 -19.724 -20.181 -20.588 -20.94 -21.299 -21.671 -21.977 -22.294 -22.612 -22.867 -23.127 -23.381 -23.65 -23.933 -24.13 -24.328 -24.653 -24.881 -25.126 -25.253 -25.498 -25.785 -26.139 -26.331 -26.65 -26.925 -27.119 -27.34 -27.833 -28.103 -28.396 -28.75 -29.145 -29.585 -30.149 -32.534 -7 ,7672 ,KEBNE ,17027662,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:36:45 CET,0.0 0.368 0.516 0.612 0.696 0.762 0.828 0.876 0.964 1.018 1.065 1.061 1.206 1.24 1.306 1.373 1.434 1.459 1.516 1.572 1.628 1.655 1.683 1.736 1.789 1.832 1.879 1.923 1.961 1.981 1.992 2.005 2.01 2.01 2.017 2.036 2.051 2.045 2.025 2.009 1.976 1.889 1.773 1.636 1.393 1.082 0.664 0.066 -0.755 -1.952 -4.048 -6.542 -8.542 -10.251 -11.649 -12.839 -13.858 -14.778 -15.591 -16.413 -17.129 -17.773 -18.375 -18.958 -19.495 -19.951 -20.431 -20.872 -21.258 -21.651 -22.044 -22.376 -22.727 -23.111 -23.408 -23.702 -23.992 -24.287 -24.607 -24.819 -25.029 -25.365 -25.616 -25.896 -26.029 -26.286 -26.584 -26.906 -27.068 -27.351 -27.597 -27.8 -28.027 -28.594 -28.929 -29.285 -29.684 -30.134 -30.71 -31.481 -34.698 -8 ,5183 ,KEBNE ,17027663,Wed Dec 22 17:44:08 CET,Wed Dec 22 19:36:16 CET,0.0 0.243 0.419 0.546 0.649 0.711 0.782 0.856 0.958 0.992 1.022 1.004 1.14 1.182 1.249 1.306 1.363 1.39 1.449 1.494 1.542 1.572 1.598 1.631 1.664 1.708 1.736 1.75 1.77 1.79 1.81 1.833 1.847 1.862 1.878 1.878 1.868 1.855 1.825 1.765 1.718 1.661 1.541 1.382 1.158 0.848 0.39 -0.221 -1.036 -2.244 -4.33 -6.867 -8.972 -10.69 -12.114 -13.382 -14.456 -15.385 -16.18 -16.994 -17.688 -18.284 -18.844 -19.355 -19.827 -20.281 -20.755 -21.173 -21.551 -21.962 -22.354 -22.645 -22.966 -23.301 -23.549 -23.811 -24.083 -24.372 -24.668 -24.862 -25.082 -25.463 -25.729 -25.975 -26.094 -26.335 -26.59 -26.871 -27.015 -27.278 -27.464 -27.63 -27.804 -28.198 -28.417 -28.656 -28.928 -29.246 -29.699 -30.353 -34.256 -9 ,32036 ,KEBNE ,17027664,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:36:30 CET,0.0 0.342 0.497 0.573 0.628 0.678 0.711 0.746 0.821 0.858 0.895 0.882 1.016 1.048 1.113 1.167 1.217 1.239 1.278 1.321 1.391 1.437 1.464 1.496 1.534 1.56 1.583 1.609 1.639 1.669 1.698 1.722 1.736 1.747 1.746 1.725 1.684 1.639 1.599 1.573 1.53 1.434 1.31 1.147 0.913 0.617 0.207 -0.333 -1.137 -2.416 -4.522 -6.998 -9.047 -10.762 -12.201 -13.51 -14.623 -15.569 -16.376 -17.164 -17.824 -18.41 -18.959 -19.504 -20.029 -20.493 -20.984 -21.424 -21.806 -22.195 -22.596 -22.931 -23.266 -23.605 -23.86 -24.129 -24.411 -24.707 -25.022 -25.235 -25.447 -25.788 -26.034 -26.284 -26.408 -26.657 -26.942 -27.264 -27.429 -27.703 -27.909 -28.075 -28.259 -28.7 -28.923 -29.205 -29.59 -30.034 -30.599 -31.438 -34.791 -10 ,8682 ,KEBNE ,17027665,Wed Dec 22 17:44:08 CET,Wed Dec 22 19:36:09 CET,0.0 0.532 0.668 0.736 0.81 0.871 0.92 0.974 1.089 1.146 1.189 1.172 1.32 1.363 1.426 1.473 1.53 1.557 1.6 1.641 1.704 1.749 1.783 1.838 1.886 1.921 1.952 1.981 2.026 2.068 2.118 2.168 2.191 2.208 2.208 2.187 2.164 2.15 2.138 2.111 2.076 2.007 1.888 1.741 1.523 1.208 0.797 0.275 -0.495 -1.741 -3.844 -6.285 -8.262 -9.908 -11.281 -12.485 -13.545 -14.485 -15.278 -16.052 -16.707 -17.294 -17.835 -18.352 -18.844 -19.359 -19.959 -20.467 -20.895 -21.348 -21.811 -22.172 -22.514 -22.864 -23.157 -23.466 -23.796 -24.138 -24.493 -24.748 -25.003 -25.392 -25.677 -25.986 -26.138 -26.451 -26.779 -27.117 -27.297 -27.597 -27.864 -28.076 -28.284 -28.764 -29.047 -29.363 -29.712 -30.099 -30.564 -31.184 -33.436 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_39_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_39_28.txt deleted file mode 100644 index 1d361c2a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_39_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23144 ,TETRA ,17606205,Sun Nov 28 19:54:50 CET,Sun Nov 28 22:11:05 CET,0.0 0.967 1.284 1.557 1.796 2.009 2.217 2.418 2.753 2.906 3.053 3.237 3.47 3.606 3.852 4.079 4.295 4.405 4.636 4.858 5.165 5.365 5.551 5.816 6.079 6.336 6.58 6.822 7.148 7.471 7.79 8.168 8.534 8.895 9.3 9.757 10.2 10.659 11.123 11.627 12.198 12.861 13.648 14.446 15.35 16.36 17.585 18.899 20.434 22.187 24.014 25.367 26.098 26.534 26.761 26.88 26.899 26.862 26.803 26.711 26.609 26.507 26.389 26.243 26.099 25.98 25.854 25.737 25.619 25.481 25.308 25.134 24.943 24.736 24.587 24.458 24.322 24.166 23.988 23.862 23.738 23.53 23.377 23.209 23.115 22.918 22.702 22.45 22.322 22.127 21.912 21.751 21.581 21.226 21.018 20.783 20.512 20.161 19.718 19.135 15.327 -2 ,21283 ,TETRA ,17606206,Sun Nov 28 19:54:52 CET,Sun Nov 28 22:12:00 CET,0.0 0.76 1.063 1.286 1.473 1.635 1.792 1.936 2.194 2.326 2.463 2.622 2.834 2.941 3.159 3.396 3.614 3.709 3.891 4.075 4.371 4.574 4.76 5.025 5.288 5.541 5.794 6.057 6.413 6.756 7.078 7.459 7.828 8.19 8.597 9.049 9.502 10.0 10.515 11.072 11.7 12.4 13.248 14.13 15.141 16.277 17.569 18.994 20.764 22.799 24.994 26.732 27.698 28.255 28.528 28.661 28.709 28.654 28.515 28.336 28.157 27.97 27.781 27.598 27.411 27.209 26.965 26.759 26.599 26.428 26.243 26.066 25.879 25.702 25.565 25.421 25.26 25.056 24.832 24.679 24.526 24.287 24.122 23.954 23.853 23.612 23.374 23.137 23.01 22.803 22.514 22.344 22.193 21.782 21.541 21.32 21.068 20.731 20.347 19.825 14.669 -3 ,31595 ,TETRA ,17606207,Sun Nov 28 19:54:54 CET,Sun Nov 28 22:10:53 CET,0.0 0.703 1.029 1.309 1.546 1.75 1.93 2.099 2.384 2.52 2.661 2.835 3.051 3.177 3.416 3.646 3.861 3.968 4.183 4.391 4.702 4.904 5.097 5.386 5.67 5.942 6.204 6.466 6.806 7.12 7.439 7.838 8.233 8.611 9.033 9.504 9.97 10.482 11.022 11.586 12.184 12.885 13.701 14.493 15.384 16.394 17.659 19.124 20.756 22.612 24.726 26.402 27.374 27.947 28.158 28.101 27.968 27.794 27.613 27.372 27.127 26.902 26.674 26.453 26.234 26.021 25.797 25.582 25.395 25.209 25.009 24.842 24.682 24.488 24.32 24.146 23.958 23.77 23.584 23.434 23.275 23.04 22.845 22.625 22.527 22.346 22.146 21.916 21.787 21.571 21.312 21.131 20.927 20.421 20.158 19.888 19.571 19.21 18.788 18.249 15.661 -4 ,11055 ,TETRA ,17606208,Sun Nov 28 19:54:49 CET,Sun Nov 28 22:14:11 CET,0.0 1.245 1.499 1.718 1.946 2.116 2.255 2.402 2.684 2.8 2.919 3.063 3.273 3.381 3.6 3.827 4.036 4.132 4.321 4.502 4.766 4.943 5.114 5.371 5.637 5.89 6.141 6.394 6.718 7.023 7.31 7.663 8.008 8.343 8.725 9.174 9.616 10.092 10.625 11.219 11.862 12.537 13.318 14.181 15.154 16.217 17.498 18.924 20.593 22.62 25.037 26.924 27.936 28.512 28.786 28.861 28.857 28.748 28.607 28.473 28.327 28.187 28.036 27.876 27.705 27.54 27.348 27.159 27.019 26.86 26.661 26.48 26.282 26.079 25.923 25.767 25.577 25.37 25.157 25.009 24.857 24.595 24.401 24.203 24.101 23.893 23.678 23.434 23.305 23.111 22.906 22.749 22.576 22.15 21.903 21.662 21.41 21.09 20.657 20.07 17.711 -5 ,16780 ,TETRA ,17606209,Sun Nov 28 19:54:50 CET,Sun Nov 28 22:13:46 CET,0.0 0.583 0.857 1.084 1.28 1.458 1.613 1.763 2.063 2.208 2.346 2.508 2.72 2.831 3.037 3.247 3.454 3.557 3.755 3.939 4.204 4.374 4.534 4.773 5.012 5.232 5.444 5.662 5.98 6.302 6.592 6.936 7.266 7.592 8.0 8.481 8.907 9.333 9.81 10.359 10.931 11.568 12.358 13.156 14.041 15.008 16.129 17.424 18.879 20.523 22.461 23.898 24.726 25.213 25.477 25.612 25.649 25.62 25.574 25.502 25.427 25.317 25.155 24.967 24.789 24.657 24.509 24.351 24.198 24.031 23.87 23.727 23.569 23.428 23.308 23.173 23.026 22.875 22.709 22.58 22.432 22.187 22.023 21.855 21.774 21.584 21.36 21.124 21.006 20.814 20.597 20.444 20.292 19.979 19.805 19.604 19.349 19.035 18.61 18.022 14.44 -6 ,14311 ,TETRA ,17606210,Sun Nov 28 19:54:52 CET,Sun Nov 28 22:11:50 CET,0.0 0.44 0.705 0.921 1.113 1.311 1.474 1.619 1.891 2.034 2.167 2.304 2.514 2.624 2.83 3.043 3.262 3.367 3.565 3.773 4.084 4.28 4.47 4.743 5.005 5.258 5.5 5.73 6.031 6.327 6.632 7.031 7.404 7.741 8.135 8.591 9.058 9.574 10.109 10.66 11.245 11.972 12.832 13.659 14.621 15.761 17.098 18.561 20.256 22.273 24.797 26.787 27.874 28.434 28.747 28.986 29.106 29.128 29.073 28.971 28.872 28.741 28.555 28.365 28.203 28.051 27.868 27.675 27.497 27.309 27.103 26.928 26.743 26.541 26.382 26.216 26.045 25.877 25.688 25.534 25.379 25.151 24.985 24.815 24.732 24.546 24.317 24.076 23.955 23.755 23.557 23.404 23.235 22.901 22.716 22.489 22.216 21.906 21.518 20.881 18.164 -7 ,16549 ,TETRA ,17606211,Sun Nov 28 19:54:54 CET,Sun Nov 28 22:10:57 CET,0.0 0.845 1.136 1.373 1.589 1.766 1.941 2.109 2.417 2.556 2.681 2.831 3.047 3.173 3.421 3.646 3.847 3.94 4.132 4.321 4.577 4.748 4.919 5.165 5.407 5.64 5.868 6.097 6.393 6.675 6.951 7.293 7.632 7.95 8.324 8.779 9.225 9.719 10.254 10.811 11.403 12.076 12.892 13.711 14.645 15.717 16.966 18.43 20.153 22.022 24.148 25.802 26.678 27.163 27.458 27.633 27.657 27.582 27.505 27.414 27.314 27.203 27.066 26.933 26.815 26.706 26.572 26.425 26.276 26.089 25.878 25.726 25.556 25.364 25.211 25.034 24.844 24.638 24.423 24.281 24.14 23.919 23.763 23.595 23.504 23.323 23.128 22.893 22.764 22.56 22.321 22.171 22.005 21.609 21.409 21.202 20.932 20.589 20.152 19.525 16.755 -8 ,25873 ,TETRA ,17606212,Sun Nov 28 19:54:50 CET,Sun Nov 28 22:18:14 CET,0.0 1.505 1.794 2.027 2.226 2.392 2.555 2.72 3.033 3.172 3.299 3.452 3.668 3.787 3.996 4.202 4.411 4.52 4.741 4.953 5.258 5.453 5.65 5.93 6.201 6.475 6.73 6.973 7.298 7.61 7.904 8.26 8.613 8.962 9.365 9.817 10.26 10.755 11.298 11.918 12.556 13.211 14.0 14.824 15.793 16.959 18.371 19.923 21.698 23.773 26.285 28.182 29.009 29.382 29.588 29.631 29.529 29.356 29.189 29.044 28.912 28.773 28.601 28.42 28.268 28.134 27.966 27.794 27.636 27.467 27.275 27.106 26.927 26.738 26.593 26.45 26.301 26.138 25.981 25.871 25.748 25.546 25.413 25.267 25.188 25.019 24.817 24.602 24.49 24.294 24.093 23.948 23.785 23.436 23.219 22.972 22.711 22.369 21.918 21.362 18.472 -9 ,28545 ,TETRA ,17606213,Sun Nov 28 19:54:51 CET,Sun Nov 28 22:18:13 CET,0.0 1.064 1.379 1.631 1.813 1.962 2.109 2.232 2.478 2.61 2.749 2.93 3.155 3.282 3.525 3.767 4.009 4.126 4.354 4.574 4.88 5.071 5.274 5.593 5.891 6.165 6.42 6.672 7.012 7.337 7.658 8.052 8.435 8.817 9.258 9.763 10.262 10.804 11.396 12.025 12.667 13.404 14.266 15.099 16.075 17.156 18.375 19.742 21.312 23.103 25.11 26.666 27.528 27.933 28.129 28.245 28.298 28.315 28.291 28.227 28.144 28.034 27.918 27.779 27.627 27.497 27.341 27.17 27.014 26.855 26.677 26.516 26.345 26.173 26.032 25.88 25.713 25.529 25.354 25.233 25.099 24.876 24.713 24.544 24.457 24.271 24.05 23.793 23.665 23.453 23.216 23.059 22.898 22.532 22.329 22.103 21.838 21.53 21.148 20.617 17.026 -10 ,17305 ,TETRA ,17606214,Sun Nov 28 19:54:54 CET,Sun Nov 28 22:12:34 CET,0.0 1.436 1.669 1.874 2.061 2.233 2.375 2.51 2.784 2.91 3.014 3.148 3.357 3.472 3.701 3.92 4.152 4.265 4.464 4.656 4.956 5.135 5.309 5.588 5.839 6.087 6.339 6.582 6.907 7.198 7.484 7.854 8.2 8.515 8.89 9.333 9.77 10.245 10.765 11.323 11.917 12.638 13.486 14.313 15.284 16.357 17.577 18.933 20.506 22.357 24.632 26.546 27.54 28.031 28.261 28.342 28.304 28.177 28.046 27.896 27.716 27.521 27.344 27.15 26.931 26.768 26.607 26.452 26.267 26.006 25.716 25.499 25.299 25.065 24.883 24.694 24.489 24.268 24.046 23.882 23.68 23.403 23.231 23.034 22.935 22.739 22.539 22.311 22.175 21.965 21.749 21.595 21.414 20.981 20.732 20.463 20.174 19.846 19.407 18.726 15.296 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_39_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_39_37.txt deleted file mode 100644 index 9e7668f1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_39_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18762 ,TETRA ,17606215,Sun Nov 28 19:54:55 CET,Sun Nov 28 22:12:44 CET,0.0 1.121 1.477 1.682 1.851 2.006 2.145 2.287 2.536 2.654 2.764 2.847 3.016 3.087 3.228 3.352 3.469 3.529 3.626 3.706 3.842 3.933 4.006 4.097 4.19 4.283 4.383 4.468 4.55 4.635 4.719 4.811 4.886 4.951 5.024 5.087 5.144 5.219 5.276 5.308 5.325 5.346 5.369 5.348 5.248 5.082 4.896 4.616 4.063 3.182 1.727 -0.14 -1.71 -3.057 -4.231 -5.227 -6.095 -6.885 -7.538 -8.189 -8.765 -9.282 -9.784 -10.238 -10.622 -10.963 -11.324 -11.654 -11.95 -12.273 -12.586 -12.837 -13.107 -13.378 -13.587 -13.811 -14.041 -14.273 -14.514 -14.687 -14.864 -15.128 -15.315 -15.507 -15.604 -15.82 -16.055 -16.31 -16.441 -16.682 -16.837 -16.98 -17.133 -17.441 -17.61 -17.81 -18.042 -18.301 -18.614 -19.063 -20.445 -2 ,31701 ,TETRA ,17606216,Sun Nov 28 19:54:49 CET,Sun Nov 28 22:13:04 CET,0.0 0.84 1.115 1.332 1.514 1.675 1.828 1.966 2.214 2.32 2.417 2.492 2.666 2.743 2.872 2.985 3.093 3.14 3.233 3.332 3.47 3.548 3.625 3.748 3.858 3.943 4.024 4.109 4.222 4.332 4.436 4.554 4.648 4.722 4.801 4.899 4.987 5.061 5.138 5.209 5.256 5.283 5.279 5.241 5.175 5.046 4.828 4.51 3.967 2.998 1.31 -0.701 -2.388 -3.765 -4.954 -6.012 -6.892 -7.679 -8.345 -9.011 -9.592 -10.07 -10.508 -10.928 -11.305 -11.64 -12.002 -12.34 -12.633 -12.925 -13.215 -13.449 -13.682 -13.935 -14.128 -14.324 -14.536 -14.749 -14.967 -15.117 -15.273 -15.521 -15.69 -15.875 -15.969 -16.169 -16.381 -16.593 -16.701 -16.918 -17.049 -17.173 -17.3 -17.604 -17.788 -17.989 -18.221 -18.49 -18.783 -19.161 -20.635 -3 ,18875 ,TETRA ,17606217,Sun Nov 28 19:54:50 CET,Sun Nov 28 22:18:56 CET,0.0 0.605 0.899 1.125 1.311 1.483 1.632 1.769 1.999 2.108 2.208 2.287 2.46 2.532 2.66 2.78 2.889 2.941 3.048 3.141 3.252 3.327 3.413 3.538 3.651 3.763 3.862 3.946 4.067 4.196 4.293 4.401 4.509 4.593 4.679 4.777 4.853 4.918 4.988 5.057 5.115 5.137 5.128 5.106 5.05 4.939 4.744 4.465 3.975 3.125 1.633 -0.2 -1.807 -3.2 -4.344 -5.381 -6.292 -7.067 -7.705 -8.335 -8.868 -9.343 -9.815 -10.273 -10.671 -11.034 -11.43 -11.774 -12.054 -12.34 -12.642 -12.899 -13.164 -13.434 -13.639 -13.855 -14.08 -14.304 -14.539 -14.696 -14.857 -15.119 -15.304 -15.495 -15.592 -15.79 -15.983 -16.19 -16.307 -16.543 -16.696 -16.835 -16.988 -17.338 -17.53 -17.734 -17.972 -18.249 -18.554 -18.95 -20.523 -4 ,20167 ,TETRA ,17606218,Sun Nov 28 19:54:52 CET,Sun Nov 28 22:18:13 CET,0.0 1.006 1.35 1.584 1.769 1.926 2.068 2.195 2.406 2.511 2.604 2.662 2.83 2.894 3.026 3.14 3.249 3.307 3.415 3.508 3.626 3.704 3.781 3.892 3.996 4.087 4.169 4.235 4.332 4.423 4.488 4.565 4.653 4.736 4.821 4.898 4.964 5.044 5.113 5.186 5.261 5.296 5.284 5.262 5.207 5.086 4.855 4.465 3.844 2.837 1.155 -0.823 -2.475 -3.897 -5.087 -6.152 -7.076 -7.884 -8.56 -9.202 -9.738 -10.231 -10.707 -11.161 -11.574 -11.929 -12.308 -12.652 -12.941 -13.22 -13.502 -13.749 -13.998 -14.246 -14.438 -14.636 -14.852 -15.075 -15.297 -15.457 -15.629 -15.893 -16.068 -16.24 -16.333 -16.536 -16.751 -16.974 -17.096 -17.342 -17.478 -17.591 -17.719 -17.995 -18.146 -18.311 -18.5 -18.731 -19.009 -19.384 -20.971 -5 ,31554 ,TETRA ,17606219,Sun Nov 28 19:54:50 CET,Sun Nov 28 22:12:06 CET,0.0 0.719 0.994 1.231 1.453 1.635 1.784 1.902 2.121 2.237 2.343 2.426 2.616 2.708 2.845 2.97 3.098 3.153 3.264 3.371 3.517 3.603 3.682 3.798 3.894 3.984 4.079 4.167 4.275 4.377 4.456 4.535 4.622 4.712 4.801 4.882 4.943 5.005 5.069 5.117 5.145 5.161 5.162 5.136 5.039 4.906 4.714 4.408 3.9 2.972 1.325 -0.68 -2.313 -3.657 -4.778 -5.792 -6.672 -7.463 -8.145 -8.828 -9.42 -9.934 -10.412 -10.875 -11.298 -11.676 -12.056 -12.375 -12.66 -12.959 -13.256 -13.494 -13.739 -14.007 -14.216 -14.415 -14.628 -14.861 -15.105 -15.275 -15.452 -15.736 -15.929 -16.134 -16.242 -16.45 -16.661 -16.885 -16.992 -17.213 -17.371 -17.517 -17.67 -18.009 -18.194 -18.372 -18.567 -18.794 -19.073 -19.52 -21.505 -6 ,10829 ,TETRA ,17606220,Sun Nov 28 19:54:54 CET,Sun Nov 28 22:11:22 CET,0.0 0.655 0.976 1.241 1.434 1.592 1.724 1.853 2.073 2.173 2.272 2.352 2.517 2.594 2.729 2.861 2.995 3.05 3.161 3.255 3.369 3.451 3.526 3.637 3.752 3.855 3.947 4.029 4.129 4.217 4.299 4.419 4.534 4.617 4.694 4.778 4.853 4.943 5.004 5.037 5.075 5.079 5.057 5.031 4.955 4.806 4.581 4.225 3.645 2.763 1.206 -0.774 -2.37 -3.727 -4.885 -5.888 -6.745 -7.508 -8.192 -8.898 -9.488 -9.993 -10.458 -10.888 -11.277 -11.614 -11.966 -12.298 -12.581 -12.861 -13.137 -13.361 -13.607 -13.862 -14.053 -14.251 -14.468 -14.707 -14.95 -15.108 -15.272 -15.531 -15.718 -15.912 -16.01 -16.213 -16.431 -16.655 -16.764 -16.986 -17.111 -17.238 -17.373 -17.677 -17.842 -18.023 -18.219 -18.421 -18.686 -19.047 -20.321 -7 ,3476 ,TETRA ,17606222,Sun Nov 28 19:54:56 CET,Sun Nov 28 22:10:45 CET,0.0 0.609 0.853 1.045 1.208 1.367 1.517 1.648 1.883 1.984 2.075 2.147 2.321 2.391 2.523 2.651 2.778 2.837 2.946 3.044 3.193 3.282 3.358 3.468 3.566 3.652 3.727 3.813 3.926 4.036 4.13 4.217 4.312 4.407 4.509 4.618 4.72 4.804 4.876 4.938 4.986 5.037 5.066 5.064 5.02 4.929 4.769 4.505 4.059 3.294 1.878 0.079 -1.444 -2.751 -3.843 -4.793 -5.635 -6.384 -7.006 -7.622 -8.15 -8.61 -9.058 -9.489 -9.886 -10.232 -10.588 -10.92 -11.193 -11.464 -11.745 -11.984 -12.244 -12.51 -12.714 -12.903 -13.099 -13.325 -13.553 -13.704 -13.851 -14.081 -14.26 -14.442 -14.529 -14.711 -14.939 -15.177 -15.283 -15.504 -15.657 -15.802 -15.952 -16.27 -16.442 -16.625 -16.822 -17.039 -17.305 -17.639 -19.066 -8 ,17522 ,TETRA ,17606223,Sun Nov 28 19:54:52 CET,Sun Nov 28 22:12:30 CET,0.0 0.8 1.118 1.399 1.599 1.753 1.902 2.047 2.3 2.405 2.495 2.56 2.733 2.808 2.946 3.063 3.166 3.212 3.309 3.408 3.535 3.622 3.705 3.808 3.903 3.986 4.065 4.147 4.238 4.31 4.384 4.488 4.59 4.663 4.73 4.814 4.888 4.948 5.025 5.107 5.149 5.164 5.153 5.113 5.026 4.881 4.66 4.284 3.7 2.786 1.173 -0.738 -2.291 -3.634 -4.79 -5.799 -6.64 -7.389 -8.039 -8.682 -9.234 -9.717 -10.178 -10.629 -11.052 -11.409 -11.781 -12.121 -12.407 -12.691 -12.979 -13.226 -13.479 -13.746 -13.946 -14.147 -14.361 -14.582 -14.816 -14.974 -15.14 -15.403 -15.583 -15.771 -15.868 -16.066 -16.268 -16.483 -16.594 -16.814 -16.945 -17.068 -17.197 -17.515 -17.688 -17.862 -18.05 -18.27 -18.547 -18.916 -20.323 -9 ,19360 ,TETRA ,17606224,Sun Nov 28 19:54:51 CET,Sun Nov 28 22:11:46 CET,0.0 0.974 1.318 1.59 1.768 1.917 2.058 2.181 2.409 2.521 2.622 2.695 2.862 2.933 3.07 3.191 3.302 3.357 3.466 3.56 3.685 3.765 3.843 3.957 4.07 4.158 4.233 4.323 4.434 4.522 4.6 4.699 4.787 4.863 4.947 5.022 5.091 5.171 5.241 5.292 5.333 5.359 5.367 5.352 5.282 5.148 4.91 4.552 4.026 3.144 1.534 -0.407 -2.05 -3.439 -4.588 -5.583 -6.439 -7.204 -7.825 -8.443 -8.976 -9.444 -9.889 -10.294 -10.684 -11.048 -11.411 -11.74 -12.034 -12.335 -12.635 -12.886 -13.136 -13.394 -13.609 -13.822 -14.036 -14.256 -14.487 -14.651 -14.822 -15.088 -15.262 -15.434 -15.527 -15.739 -15.963 -16.196 -16.319 -16.564 -16.741 -16.884 -17.031 -17.356 -17.554 -17.771 -17.995 -18.234 -18.53 -18.932 -20.561 -10 ,20653 ,TETRA ,17606225,Sun Nov 28 19:54:53 CET,Sun Nov 28 22:11:00 CET,0.0 0.962 1.254 1.454 1.614 1.755 1.886 2.005 2.214 2.312 2.409 2.514 2.681 2.761 2.917 3.027 3.128 3.177 3.269 3.35 3.471 3.543 3.604 3.701 3.8 3.903 3.994 4.061 4.153 4.26 4.342 4.43 4.515 4.587 4.676 4.779 4.851 4.917 4.981 5.027 5.046 5.051 5.06 5.021 4.908 4.725 4.428 4.024 3.501 2.701 1.093 -0.988 -2.644 -4.046 -5.217 -6.229 -7.113 -7.879 -8.501 -9.13 -9.681 -10.159 -10.6 -11.017 -11.425 -11.783 -12.141 -12.474 -12.76 -13.035 -13.321 -13.573 -13.835 -14.101 -14.304 -14.51 -14.721 -14.937 -15.17 -15.326 -15.475 -15.72 -15.892 -16.071 -16.162 -16.339 -16.527 -16.742 -16.861 -17.09 -17.244 -17.393 -17.537 -17.838 -18.02 -18.207 -18.417 -18.666 -19.003 -19.438 -20.776 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_40_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_40_37.txt deleted file mode 100644 index 33627912..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_40_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32194 ,TETRA ,17606226,Sun Nov 28 19:54:56 CET,Sun Nov 28 22:11:38 CET,0.0 1.069 1.388 1.595 1.766 1.923 2.066 2.188 2.397 2.493 2.586 2.672 2.835 2.9 3.024 3.156 3.29 3.345 3.443 3.538 3.652 3.721 3.797 3.906 3.998 4.089 4.168 4.226 4.288 4.34 4.384 4.46 4.528 4.576 4.616 4.639 4.647 4.632 4.594 4.553 4.5 4.384 4.204 4.01 3.74 3.377 2.837 2.068 0.928 -0.799 -3.449 -6.546 -9.055 -11.078 -12.745 -14.167 -15.385 -16.47 -17.339 -18.165 -18.87 -19.484 -20.054 -20.598 -21.107 -21.557 -22.031 -22.442 -22.798 -23.171 -23.532 -23.818 -24.13 -24.46 -24.713 -24.967 -25.235 -25.511 -25.778 -25.961 -26.158 -26.477 -26.7 -26.916 -27.025 -27.252 -27.487 -27.758 -27.908 -28.166 -28.347 -28.494 -28.653 -28.985 -29.174 -29.378 -29.591 -29.829 -30.115 -30.564 -32.636 -2 ,24067 ,TETRA ,17606227,Sun Nov 28 19:54:57 CET,Sun Nov 28 22:11:12 CET,0.0 0.796 1.101 1.336 1.527 1.694 1.85 2.007 2.265 2.371 2.476 2.578 2.741 2.805 2.933 3.051 3.159 3.211 3.311 3.403 3.515 3.582 3.655 3.752 3.822 3.896 3.972 4.037 4.11 4.181 4.253 4.328 4.387 4.428 4.446 4.457 4.478 4.488 4.484 4.453 4.385 4.281 4.1 3.886 3.617 3.278 2.786 2.085 1.065 -0.574 -3.256 -6.339 -8.807 -10.794 -12.433 -13.856 -15.053 -16.125 -17.032 -17.921 -18.665 -19.297 -19.886 -20.448 -20.966 -21.414 -21.864 -22.269 -22.624 -22.975 -23.332 -23.628 -23.932 -24.256 -24.505 -24.766 -25.037 -25.314 -25.615 -25.819 -26.025 -26.338 -26.548 -26.774 -26.892 -27.14 -27.389 -27.63 -27.758 -27.999 -28.172 -28.329 -28.499 -28.856 -29.052 -29.253 -29.472 -29.712 -29.995 -30.396 -31.998 -3 ,29854 ,TETRA ,17606228,Sun Nov 28 19:55:18 CET,Sun Nov 28 22:16:03 CET,0.0 0.867 1.204 1.438 1.629 1.784 1.919 2.061 2.325 2.449 2.562 2.64 2.809 2.884 3.009 3.133 3.249 3.304 3.421 3.519 3.626 3.692 3.759 3.862 3.958 4.05 4.137 4.202 4.266 4.332 4.394 4.459 4.519 4.581 4.644 4.679 4.699 4.726 4.728 4.682 4.624 4.551 4.447 4.319 4.102 3.753 3.177 2.399 1.303 -0.392 -3.046 -6.04 -8.37 -10.264 -11.835 -13.184 -14.338 -15.37 -16.234 -17.061 -17.744 -18.358 -18.944 -19.474 -19.966 -20.424 -20.883 -21.273 -21.608 -21.967 -22.337 -22.64 -22.954 -23.27 -23.515 -23.764 -24.021 -24.288 -24.552 -24.734 -24.932 -25.23 -25.44 -25.657 -25.764 -25.987 -26.231 -26.494 -26.635 -26.896 -27.079 -27.227 -27.397 -27.766 -27.94 -28.13 -28.359 -28.601 -28.881 -29.259 -30.768 -4 ,12466 ,TETRA ,17606229,Sun Nov 28 19:55:18 CET,Sun Nov 28 22:12:25 CET,0.0 0.819 1.135 1.361 1.528 1.661 1.783 1.896 2.106 2.199 2.288 2.361 2.52 2.585 2.717 2.85 2.96 3.004 3.086 3.17 3.281 3.34 3.409 3.526 3.625 3.691 3.748 3.811 3.88 3.937 3.988 4.028 4.074 4.131 4.202 4.256 4.249 4.233 4.213 4.146 4.058 3.933 3.71 3.465 3.166 2.699 1.987 1.115 -0.06 -1.776 -4.618 -7.903 -10.408 -12.457 -14.166 -15.644 -16.892 -17.969 -18.881 -19.775 -20.521 -21.176 -21.79 -22.35 -22.849 -23.289 -23.738 -24.143 -24.495 -24.859 -25.247 -25.566 -25.883 -26.211 -26.477 -26.754 -27.036 -27.331 -27.642 -27.863 -28.077 -28.375 -28.585 -28.814 -28.932 -29.166 -29.425 -29.702 -29.848 -30.098 -30.263 -30.425 -30.596 -30.958 -31.167 -31.392 -31.631 -31.905 -32.247 -32.73 -34.612 -5 ,19350 ,TETRA ,17606230,Sun Nov 28 19:55:19 CET,Sun Nov 28 22:12:40 CET,0.0 0.799 1.094 1.306 1.509 1.686 1.804 1.917 2.134 2.223 2.311 2.389 2.543 2.612 2.735 2.843 2.948 2.997 3.082 3.157 3.275 3.35 3.414 3.499 3.563 3.623 3.68 3.731 3.807 3.869 3.912 3.948 3.977 4.022 4.056 4.056 4.052 4.05 4.019 3.957 3.889 3.807 3.687 3.512 3.224 2.788 2.197 1.423 0.254 -1.514 -4.323 -7.497 -10.03 -12.117 -13.798 -15.207 -16.391 -17.43 -18.285 -19.114 -19.8 -20.406 -21.001 -21.548 -22.053 -22.513 -22.968 -23.358 -23.699 -24.059 -24.432 -24.729 -25.023 -25.337 -25.578 -25.82 -26.068 -26.319 -26.586 -26.772 -26.961 -27.248 -27.45 -27.672 -27.789 -28.024 -28.272 -28.527 -28.649 -28.889 -29.048 -29.188 -29.346 -29.698 -29.882 -30.077 -30.297 -30.537 -30.831 -31.245 -32.661 -6 ,20019 ,TETRA ,17606231,Sun Nov 28 19:55:21 CET,Sun Nov 28 22:15:24 CET,0.0 0.784 1.091 1.324 1.503 1.654 1.785 1.892 2.058 2.143 2.222 2.26 2.414 2.488 2.608 2.712 2.822 2.872 2.962 3.043 3.137 3.196 3.258 3.342 3.419 3.495 3.566 3.639 3.735 3.81 3.873 3.938 3.984 4.016 4.062 4.119 4.168 4.218 4.241 4.225 4.193 4.143 4.06 3.936 3.727 3.44 3.011 2.375 1.396 -0.245 -3.014 -6.133 -8.624 -10.652 -12.317 -13.759 -15.002 -16.09 -16.97 -17.836 -18.588 -19.241 -19.83 -20.362 -20.847 -21.289 -21.745 -22.144 -22.493 -22.85 -23.204 -23.49 -23.783 -24.097 -24.336 -24.592 -24.88 -25.165 -25.45 -25.647 -25.842 -26.144 -26.363 -26.6 -26.719 -26.946 -27.181 -27.443 -27.583 -27.832 -28.023 -28.184 -28.355 -28.714 -28.916 -29.122 -29.354 -29.621 -29.928 -30.351 -32.163 -7 ,9696 ,TETRA ,17606232,Sun Nov 28 19:55:24 CET,Sun Nov 28 22:14:05 CET,0.0 1.125 1.431 1.679 1.89 2.066 2.212 2.339 2.56 2.654 2.752 2.854 3.025 3.094 3.218 3.337 3.452 3.503 3.593 3.676 3.788 3.867 3.945 4.037 4.113 4.182 4.241 4.298 4.365 4.435 4.488 4.541 4.596 4.634 4.664 4.705 4.74 4.757 4.749 4.715 4.678 4.618 4.489 4.313 4.038 3.65 3.146 2.45 1.364 -0.293 -2.907 -5.976 -8.408 -10.358 -11.968 -13.363 -14.553 -15.605 -16.481 -17.326 -18.031 -18.644 -19.224 -19.756 -20.235 -20.66 -21.105 -21.501 -21.834 -22.186 -22.558 -22.854 -23.139 -23.428 -23.66 -23.903 -24.153 -24.409 -24.666 -24.837 -25.017 -25.299 -25.496 -25.717 -25.829 -26.059 -26.313 -26.568 -26.694 -26.93 -27.088 -27.229 -27.373 -27.727 -27.926 -28.145 -28.367 -28.583 -28.885 -29.288 -30.921 -8 ,14737 ,TETRA ,17606233,Sun Nov 28 19:55:18 CET,Sun Nov 28 22:13:18 CET,0.0 0.957 1.303 1.581 1.789 1.948 2.089 2.226 2.46 2.558 2.645 2.72 2.889 2.96 3.088 3.228 3.357 3.41 3.505 3.594 3.723 3.804 3.873 3.969 4.062 4.142 4.219 4.292 4.378 4.458 4.517 4.563 4.602 4.642 4.679 4.719 4.749 4.761 4.762 4.731 4.664 4.571 4.452 4.331 4.101 3.765 3.354 2.717 1.72 0.239 -2.327 -5.502 -8.04 -10.079 -11.732 -13.123 -14.273 -15.296 -16.182 -17.039 -17.757 -18.392 -18.999 -19.561 -20.059 -20.497 -20.956 -21.366 -21.71 -22.061 -22.421 -22.713 -23.015 -23.342 -23.593 -23.849 -24.109 -24.38 -24.664 -24.864 -25.073 -25.388 -25.617 -25.848 -25.964 -26.196 -26.432 -26.686 -26.818 -27.066 -27.242 -27.392 -27.544 -27.893 -28.094 -28.291 -28.495 -28.732 -29.044 -29.505 -31.649 -9 ,24275 ,TETRA ,17606234,Sun Nov 28 19:55:18 CET,Sun Nov 28 22:12:23 CET,0.0 0.876 1.21 1.479 1.659 1.795 1.925 2.067 2.289 2.37 2.448 2.523 2.688 2.762 2.891 3.005 3.108 3.153 3.229 3.3 3.42 3.494 3.554 3.628 3.707 3.794 3.865 3.919 3.99 4.049 4.092 4.132 4.15 4.159 4.173 4.179 4.174 4.161 4.135 4.088 4.03 3.937 3.766 3.548 3.261 2.903 2.396 1.644 0.485 -1.331 -4.229 -7.428 -9.899 -11.903 -13.523 -14.881 -16.054 -17.08 -17.931 -18.779 -19.481 -20.085 -20.648 -21.167 -21.638 -22.06 -22.516 -22.929 -23.276 -23.637 -24.013 -24.323 -24.639 -24.974 -25.225 -25.468 -25.714 -25.967 -26.234 -26.411 -26.599 -26.909 -27.116 -27.325 -27.435 -27.665 -27.898 -28.137 -28.266 -28.515 -28.695 -28.847 -29.01 -29.34 -29.512 -29.709 -29.925 -30.168 -30.503 -30.959 -32.69 -10 ,3774 ,TETRA ,17606235,Sun Nov 28 19:55:19 CET,Sun Nov 28 22:11:52 CET,0.0 1.289 1.647 1.9 2.117 2.292 2.421 2.52 2.714 2.803 2.893 2.955 3.116 3.197 3.346 3.479 3.601 3.653 3.749 3.842 3.957 4.016 4.074 4.167 4.255 4.325 4.387 4.45 4.527 4.594 4.655 4.714 4.763 4.817 4.874 4.928 4.953 4.957 4.946 4.931 4.891 4.813 4.699 4.54 4.277 3.911 3.364 2.633 1.677 0.179 -2.412 -5.554 -7.985 -9.96 -11.619 -13.062 -14.28 -15.305 -16.149 -16.986 -17.701 -18.313 -18.88 -19.422 -19.919 -20.361 -20.802 -21.195 -21.54 -21.887 -22.248 -22.535 -22.827 -23.139 -23.371 -23.598 -23.835 -24.095 -24.368 -24.556 -24.747 -25.042 -25.249 -25.458 -25.567 -25.799 -26.036 -26.287 -26.425 -26.673 -26.847 -27.004 -27.176 -27.544 -27.745 -27.962 -28.188 -28.457 -28.807 -29.293 -31.093 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_41_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_41_37.txt deleted file mode 100644 index 62a18444..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_41_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31959 ,TETRA ,17606236,Sun Nov 28 19:55:21 CET,Sun Nov 28 22:12:41 CET,0.0 0.836 1.191 1.416 1.61 1.772 1.908 2.047 2.304 2.408 2.498 2.555 2.744 2.824 2.988 3.139 3.279 3.347 3.478 3.599 3.771 3.876 3.97 4.113 4.248 4.378 4.5 4.619 4.764 4.896 5.03 5.177 5.313 5.458 5.625 5.805 5.967 6.13 6.298 6.487 6.667 6.839 7.037 7.233 7.462 7.706 7.951 8.182 8.386 8.519 8.389 7.921 7.396 6.864 6.376 5.931 5.492 5.049 4.619 4.157 3.784 3.455 3.142 2.856 2.57 2.294 2.026 1.8 1.595 1.378 1.14 0.937 0.726 0.504 0.335 0.164 -0.025 -0.226 -0.435 -0.59 -0.747 -0.969 -1.121 -1.282 -1.363 -1.542 -1.757 -1.989 -2.109 -2.336 -2.468 -2.589 -2.721 -3.022 -3.187 -3.37 -3.592 -3.845 -4.165 -4.634 -6.561 -2 ,21364 ,TETRA ,17606237,Sun Nov 28 19:55:22 CET,Sun Nov 28 22:12:25 CET,0.0 0.783 1.095 1.342 1.558 1.726 1.884 2.037 2.3 2.404 2.508 2.608 2.807 2.895 3.044 3.175 3.3 3.362 3.488 3.606 3.771 3.876 3.97 4.113 4.256 4.378 4.495 4.614 4.772 4.916 5.055 5.206 5.348 5.488 5.647 5.813 5.967 6.166 6.367 6.548 6.744 6.973 7.212 7.441 7.701 7.962 8.26 8.556 8.806 8.964 8.88 8.42 7.88 7.336 6.809 6.348 5.924 5.49 5.1 4.711 4.373 4.047 3.734 3.445 3.171 2.928 2.677 2.454 2.262 2.032 1.771 1.569 1.349 1.12 0.964 0.806 0.642 0.445 0.229 0.089 -0.047 -0.256 -0.409 -0.577 -0.666 -0.859 -1.067 -1.275 -1.384 -1.616 -1.754 -1.873 -2.007 -2.321 -2.488 -2.676 -2.875 -3.079 -3.318 -3.657 -5.643 -3 ,23641 ,TETRA ,17606238,Sun Nov 28 19:55:24 CET,Sun Nov 28 22:12:42 CET,0.0 1.106 1.412 1.646 1.858 2.051 2.228 2.379 2.64 2.759 2.862 2.935 3.136 3.215 3.371 3.527 3.669 3.732 3.85 3.959 4.119 4.223 4.327 4.47 4.597 4.718 4.831 4.948 5.102 5.248 5.382 5.548 5.71 5.869 6.039 6.205 6.383 6.578 6.765 6.957 7.151 7.356 7.583 7.805 8.053 8.349 8.629 8.848 9.081 9.248 9.121 8.578 7.961 7.396 6.879 6.398 5.994 5.616 5.256 4.853 4.501 4.196 3.887 3.605 3.351 3.096 2.816 2.568 2.354 2.134 1.903 1.69 1.466 1.234 1.058 0.892 0.721 0.539 0.353 0.226 0.089 -0.145 -0.322 -0.494 -0.58 -0.778 -0.985 -1.209 -1.328 -1.566 -1.722 -1.85 -1.979 -2.267 -2.436 -2.633 -2.855 -3.099 -3.396 -3.848 -6.137 -4 ,8451 ,TETRA ,17606239,Sun Nov 28 19:55:19 CET,Sun Nov 28 22:04:20 CET,0.0 0.899 1.242 1.494 1.686 1.84 1.98 2.11 2.348 2.458 2.564 2.641 2.834 2.909 3.061 3.204 3.337 3.405 3.538 3.662 3.827 3.931 4.027 4.169 4.312 4.431 4.546 4.668 4.823 4.963 5.091 5.244 5.39 5.52 5.665 5.835 6.002 6.202 6.409 6.61 6.811 7.018 7.267 7.512 7.784 8.067 8.338 8.6 8.831 8.945 8.819 8.405 7.906 7.369 6.852 6.334 5.904 5.553 5.23 4.877 4.561 4.276 3.993 3.731 3.494 3.276 3.024 2.794 2.599 2.387 2.163 1.989 1.794 1.59 1.448 1.29 1.106 0.913 0.715 0.583 0.45 0.221 0.059 -0.114 -0.205 -0.384 -0.584 -0.802 -0.912 -1.134 -1.268 -1.4 -1.535 -1.849 -2.019 -2.194 -2.416 -2.688 -2.988 -3.39 -5.215 -5 ,2473 ,TETRA ,17606240,Sun Nov 28 19:55:19 CET,Sun Nov 28 22:14:15 CET,0.0 0.652 0.937 1.124 1.281 1.447 1.599 1.725 1.963 2.08 2.19 2.276 2.475 2.561 2.715 2.848 2.979 3.041 3.155 3.267 3.429 3.535 3.643 3.783 3.903 4.019 4.133 4.247 4.4 4.538 4.665 4.824 4.98 5.121 5.282 5.461 5.622 5.796 5.984 6.167 6.345 6.533 6.753 6.964 7.182 7.417 7.632 7.832 8.021 8.139 8.051 7.596 7.051 6.493 5.979 5.498 5.019 4.548 4.14 3.76 3.426 3.102 2.794 2.506 2.239 1.993 1.739 1.503 1.292 1.079 0.86 0.674 0.473 0.269 0.11 -0.06 -0.239 -0.427 -0.616 -0.748 -0.886 -1.086 -1.237 -1.414 -1.503 -1.691 -1.885 -2.102 -2.225 -2.46 -2.636 -2.786 -2.929 -3.248 -3.419 -3.593 -3.784 -4.011 -4.28 -4.659 -6.19 -6 ,32211 ,TETRA ,17606241,Sun Nov 28 19:55:20 CET,Sun Nov 28 22:14:16 CET,0.0 1.143 1.54 1.795 2.001 2.172 2.315 2.444 2.657 2.754 2.843 2.89 3.072 3.15 3.304 3.455 3.602 3.673 3.801 3.925 4.109 4.217 4.321 4.476 4.621 4.754 4.882 4.995 5.144 5.289 5.429 5.601 5.768 5.925 6.089 6.271 6.442 6.638 6.849 7.06 7.273 7.482 7.69 7.893 8.128 8.378 8.664 8.928 9.141 9.277 9.157 8.736 8.248 7.763 7.29 6.811 6.374 5.955 5.573 5.197 4.881 4.581 4.274 3.988 3.726 3.478 3.213 2.97 2.759 2.527 2.275 2.067 1.847 1.62 1.454 1.273 1.077 0.884 0.675 0.534 0.396 0.164 -0.007 -0.193 -0.283 -0.461 -0.649 -0.858 -0.971 -1.19 -1.302 -1.432 -1.576 -1.906 -2.079 -2.267 -2.488 -2.706 -2.991 -3.399 -5.341 -7 ,26175 ,TETRA ,17606242,Sun Nov 28 19:55:22 CET,Sun Nov 28 22:13:02 CET,0.0 0.851 1.196 1.456 1.69 1.889 2.05 2.187 2.421 2.526 2.621 2.695 2.886 2.963 3.115 3.258 3.39 3.464 3.61 3.736 3.912 4.028 4.136 4.277 4.409 4.527 4.633 4.749 4.896 5.034 5.166 5.324 5.48 5.628 5.787 5.949 6.097 6.272 6.475 6.687 6.88 7.063 7.283 7.488 7.711 7.955 8.181 8.392 8.584 8.66 8.548 8.053 7.47 6.96 6.475 6.016 5.587 5.173 4.822 4.466 4.148 3.867 3.583 3.289 3.003 2.74 2.469 2.232 2.03 1.823 1.604 1.394 1.171 0.956 0.792 0.619 0.433 0.229 0.021 -0.116 -0.255 -0.47 -0.614 -0.764 -0.846 -1.031 -1.237 -1.444 -1.543 -1.765 -1.882 -1.994 -2.127 -2.449 -2.617 -2.805 -3.043 -3.302 -3.588 -4.001 -5.843 -8 ,12776 ,TETRA ,17606243,Sun Nov 28 19:55:23 CET,Sun Nov 28 22:13:03 CET,0.0 0.725 1.048 1.301 1.493 1.647 1.795 1.936 2.17 2.277 2.375 2.457 2.664 2.746 2.89 3.028 3.17 3.237 3.363 3.487 3.672 3.78 3.884 4.043 4.182 4.31 4.445 4.566 4.702 4.835 4.973 5.142 5.303 5.456 5.631 5.83 6.028 6.237 6.434 6.632 6.844 7.074 7.323 7.587 7.874 8.142 8.459 8.779 9.016 9.117 9.065 8.719 8.199 7.635 7.129 6.66 6.224 5.824 5.461 5.085 4.749 4.433 4.128 3.868 3.635 3.413 3.187 2.981 2.78 2.559 2.334 2.145 1.951 1.752 1.596 1.435 1.259 1.078 0.898 0.759 0.607 0.371 0.208 0.05 -0.033 -0.225 -0.417 -0.607 -0.714 -0.944 -1.064 -1.179 -1.292 -1.552 -1.712 -1.896 -2.111 -2.373 -2.683 -3.098 -4.703 -9 ,10994 ,TETRA ,17606244,Sun Nov 28 19:55:20 CET,Sun Nov 28 22:11:56 CET,0.0 0.77 1.113 1.361 1.575 1.765 1.936 2.077 2.309 2.41 2.498 2.545 2.726 2.799 2.937 3.065 3.188 3.25 3.381 3.507 3.686 3.797 3.891 4.024 4.152 4.272 4.397 4.527 4.692 4.845 4.979 5.128 5.263 5.394 5.541 5.702 5.859 6.016 6.188 6.373 6.543 6.734 6.958 7.151 7.348 7.564 7.819 8.06 8.192 8.203 8.021 7.495 6.954 6.428 5.914 5.435 5.004 4.585 4.209 3.795 3.41 3.093 2.797 2.497 2.221 1.991 1.753 1.519 1.312 1.097 0.875 0.704 0.527 0.339 0.191 0.02 -0.163 -0.347 -0.544 -0.684 -0.825 -1.043 -1.202 -1.374 -1.465 -1.642 -1.829 -2.059 -2.176 -2.408 -2.558 -2.696 -2.839 -3.119 -3.297 -3.536 -3.771 -4.011 -4.286 -4.647 -6.373 -10 ,18423 ,TETRA ,17606245,Sun Nov 28 19:55:23 CET,Sun Nov 28 22:11:40 CET,0.0 0.875 1.2 1.451 1.662 1.836 1.983 2.114 2.368 2.493 2.6 2.674 2.869 2.942 3.079 3.212 3.347 3.41 3.521 3.629 3.793 3.894 3.99 4.132 4.267 4.397 4.511 4.621 4.764 4.912 5.05 5.208 5.365 5.515 5.682 5.854 6.024 6.225 6.433 6.641 6.873 7.118 7.349 7.566 7.825 8.082 8.336 8.607 8.82 8.962 8.957 8.664 8.237 7.754 7.262 6.792 6.352 5.913 5.513 5.116 4.753 4.419 4.113 3.818 3.546 3.301 3.058 2.836 2.635 2.428 2.21 2.01 1.809 1.614 1.456 1.296 1.133 0.969 0.79 0.668 0.54 0.331 0.181 0.016 -0.06 -0.209 -0.4 -0.607 -0.71 -0.934 -1.071 -1.198 -1.329 -1.616 -1.772 -1.939 -2.124 -2.349 -2.633 -3.09 -4.97 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_41_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_41_40.txt deleted file mode 100644 index 75d3e427..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_41_40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31679 ,TETRA ,17606246,Sun Nov 28 19:55:24 CET,Sun Nov 28 22:13:14 CET,0.0 1.252 1.653 2.002 2.29 2.507 2.697 2.884 3.208 3.347 3.477 3.624 3.854 3.961 4.171 4.384 4.595 4.698 4.89 5.073 5.345 5.529 5.708 5.971 6.231 6.476 6.708 6.931 7.222 7.506 7.791 8.139 8.47 8.793 9.166 9.612 10.049 10.509 10.999 11.519 12.089 12.738 13.506 14.32 15.308 16.406 17.697 19.236 21.088 23.342 26.245 28.784 30.306 31.28 31.883 32.273 32.565 32.755 32.823 32.846 32.855 32.844 32.814 32.777 32.759 32.744 32.699 32.642 32.572 32.476 32.368 32.275 32.162 32.038 31.96 31.876 31.772 31.66 31.542 31.464 31.386 31.244 31.127 31.005 30.939 30.792 30.627 30.445 30.355 30.173 30.052 29.942 29.828 29.561 29.405 29.226 29.031 28.812 28.537 28.124 26.526 -2 ,18676 ,TETRA ,17606247,Sun Nov 28 19:55:20 CET,Sun Nov 28 22:12:13 CET,0.0 1.961 2.376 2.66 2.898 3.114 3.329 3.51 3.799 3.936 4.065 4.195 4.418 4.529 4.747 4.965 5.183 5.286 5.481 5.674 5.962 6.155 6.337 6.586 6.833 7.078 7.303 7.521 7.805 8.086 8.358 8.68 9.008 9.326 9.681 10.098 10.51 10.963 11.472 12.022 12.606 13.289 14.106 14.931 15.897 16.983 18.286 19.834 21.699 24.007 27.026 29.728 31.374 32.399 33.071 33.538 33.824 34.056 34.25 34.379 34.43 34.455 34.451 34.412 34.366 34.311 34.232 34.132 34.054 33.987 33.899 33.809 33.705 33.597 33.509 33.409 33.301 33.18 33.039 32.949 32.865 32.714 32.599 32.485 32.426 32.288 32.132 31.966 31.879 31.701 31.589 31.484 31.38 31.134 30.986 30.815 30.618 30.395 30.106 29.728 28.235 -3 ,20464 ,TETRA ,17606248,Sun Nov 28 19:55:21 CET,Sun Nov 28 22:12:51 CET,0.0 1.52 1.877 2.182 2.418 2.623 2.814 2.98 3.306 3.458 3.599 3.757 3.993 4.118 4.363 4.586 4.814 4.92 5.117 5.328 5.629 5.812 5.992 6.249 6.495 6.729 6.955 7.177 7.466 7.749 8.02 8.356 8.706 9.048 9.437 9.888 10.328 10.81 11.32 11.874 12.455 13.11 13.914 14.745 15.713 16.813 18.131 19.684 21.545 23.791 26.579 28.962 30.413 31.355 31.873 32.205 32.462 32.693 32.853 32.89 32.869 32.806 32.712 32.647 32.581 32.504 32.414 32.321 32.23 32.106 31.971 31.864 31.735 31.6 31.503 31.392 31.266 31.132 30.995 30.898 30.797 30.646 30.519 30.375 30.308 30.166 30.01 29.838 29.746 29.565 29.46 29.353 29.23 28.948 28.812 28.66 28.462 28.235 27.968 27.583 25.789 -4 ,25997 ,TETRA ,17606249,Sun Nov 28 19:55:22 CET,Sun Nov 28 22:13:20 CET,0.0 1.407 1.819 2.125 2.366 2.575 2.754 2.906 3.187 3.324 3.454 3.605 3.848 3.975 4.211 4.434 4.645 4.75 4.957 5.153 5.45 5.638 5.814 6.067 6.304 6.538 6.769 7.0 7.296 7.572 7.846 8.178 8.51 8.839 9.223 9.652 10.078 10.554 11.047 11.577 12.159 12.83 13.643 14.464 15.432 16.541 17.834 19.315 21.106 23.331 26.17 28.649 30.186 31.182 31.787 32.156 32.397 32.563 32.603 32.589 32.619 32.636 32.6 32.552 32.489 32.412 32.324 32.238 32.16 32.079 31.989 31.917 31.841 31.757 31.69 31.609 31.527 31.437 31.327 31.244 31.153 31.006 30.897 30.78 30.72 30.591 30.442 30.274 30.193 30.022 29.916 29.796 29.673 29.384 29.228 29.084 28.905 28.661 28.362 27.979 26.496 -5 ,10867 ,TETRA ,17606250,Sun Nov 28 19:55:24 CET,Sun Nov 28 22:15:16 CET,0.0 1.55 1.936 2.211 2.432 2.633 2.816 2.97 3.259 3.407 3.548 3.696 3.944 4.076 4.313 4.546 4.772 4.872 5.068 5.263 5.54 5.721 5.898 6.159 6.419 6.674 6.926 7.177 7.498 7.802 8.082 8.408 8.713 9.012 9.376 9.785 10.183 10.651 11.161 11.692 12.266 12.93 13.721 14.515 15.461 16.54 17.814 19.298 21.113 23.393 26.303 28.814 30.307 31.179 31.738 32.111 32.311 32.461 32.508 32.505 32.51 32.487 32.454 32.413 32.358 32.298 32.212 32.112 32.009 31.899 31.785 31.681 31.565 31.444 31.342 31.224 31.095 30.964 30.834 30.741 30.639 30.462 30.331 30.206 30.147 30.013 29.861 29.691 29.601 29.423 29.309 29.205 29.088 28.797 28.631 28.447 28.251 28.018 27.737 27.397 25.982 -6 ,21771 ,TETRA ,17606251,Sun Nov 28 19:55:26 CET,Sun Nov 28 22:14:58 CET,0.0 1.502 1.846 2.117 2.358 2.562 2.769 2.959 3.269 3.42 3.569 3.718 3.951 4.069 4.275 4.474 4.673 4.773 4.967 5.157 5.423 5.596 5.778 6.044 6.286 6.517 6.757 6.995 7.288 7.572 7.849 8.192 8.533 8.859 9.239 9.663 10.066 10.515 11.016 11.572 12.156 12.834 13.653 14.481 15.478 16.62 17.946 19.502 21.416 23.66 26.338 28.708 30.152 30.996 31.529 31.87 32.042 32.115 32.139 32.141 32.128 32.094 32.033 31.964 31.892 31.82 31.729 31.638 31.548 31.448 31.344 31.248 31.145 31.023 30.911 30.795 30.674 30.548 30.414 30.319 30.223 30.059 29.937 29.816 29.754 29.623 29.481 29.33 29.248 29.074 28.958 28.834 28.689 28.391 28.234 28.064 27.879 27.664 27.395 26.985 25.346 -7 ,22484 ,TETRA ,17606252,Sun Nov 28 19:55:21 CET,Sun Nov 28 22:13:22 CET,0.0 1.396 1.751 2.002 2.198 2.377 2.562 2.743 3.062 3.208 3.347 3.501 3.736 3.856 4.09 4.3 4.497 4.598 4.794 4.973 5.227 5.397 5.582 5.85 6.086 6.322 6.558 6.78 7.065 7.346 7.637 7.987 8.31 8.625 8.995 9.412 9.816 10.269 10.763 11.301 11.9 12.589 13.372 14.173 15.153 16.266 17.587 19.164 21.007 23.161 25.923 28.244 29.607 30.455 30.94 31.319 31.548 31.6 31.63 31.66 31.685 31.675 31.628 31.578 31.511 31.449 31.379 31.291 31.2 31.111 31.02 30.929 30.828 30.721 30.639 30.559 30.464 30.344 30.204 30.104 29.992 29.799 29.687 29.58 29.514 29.38 29.238 29.077 28.995 28.812 28.687 28.58 28.463 28.171 28.006 27.83 27.63 27.385 27.105 26.732 24.966 -8 ,26904 ,TETRA ,17606253,Sun Nov 28 19:55:25 CET,Sun Nov 28 22:13:14 CET,0.0 1.499 1.859 2.107 2.323 2.533 2.718 2.889 3.201 3.336 3.466 3.615 3.856 3.988 4.241 4.477 4.695 4.798 4.996 5.191 5.468 5.648 5.822 6.077 6.325 6.567 6.807 7.033 7.313 7.599 7.885 8.219 8.541 8.857 9.239 9.678 10.097 10.561 11.072 11.614 12.2 12.872 13.663 14.48 15.453 16.56 17.856 19.386 21.264 23.595 26.563 29.155 30.776 31.766 32.313 32.646 32.843 33.007 33.192 33.33 33.378 33.391 33.406 33.405 33.371 33.332 33.295 33.258 33.219 33.166 33.093 33.026 32.946 32.86 32.783 32.692 32.596 32.488 32.381 32.308 32.218 32.067 31.954 31.84 31.783 31.667 31.562 31.414 31.33 31.17 31.094 31.008 30.915 30.697 30.56 30.41 30.22 29.997 29.734 29.369 27.879 -9 ,9266 ,TETRA ,17606254,Sun Nov 28 19:55:21 CET,Sun Nov 28 22:16:11 CET,0.0 1.559 1.928 2.175 2.39 2.59 2.765 2.938 3.254 3.384 3.516 3.676 3.919 4.039 4.268 4.497 4.704 4.801 4.993 5.171 5.437 5.611 5.776 6.018 6.261 6.497 6.72 6.939 7.225 7.505 7.782 8.122 8.444 8.763 9.149 9.595 10.019 10.485 11.001 11.56 12.161 12.839 13.615 14.42 15.388 16.475 17.767 19.262 21.088 23.369 26.26 28.777 30.155 31.027 31.595 31.93 32.164 32.339 32.443 32.503 32.496 32.453 32.397 32.316 32.228 32.136 32.032 31.936 31.859 31.774 31.651 31.528 31.422 31.305 31.2 31.105 30.996 30.873 30.724 30.609 30.501 30.348 30.244 30.129 30.07 29.947 29.808 29.672 29.598 29.418 29.287 29.183 29.069 28.788 28.632 28.464 28.271 28.047 27.749 27.346 25.918 -10 ,7358 ,TETRA ,17606255,Sun Nov 28 19:55:24 CET,Sun Nov 28 22:15:46 CET,0.0 1.727 2.154 2.466 2.733 2.956 3.146 3.326 3.641 3.789 3.94 4.099 4.327 4.443 4.685 4.933 5.172 5.285 5.501 5.707 5.994 6.183 6.369 6.629 6.878 7.122 7.35 7.57 7.869 8.162 8.447 8.798 9.13 9.45 9.832 10.261 10.693 11.173 11.668 12.205 12.786 13.446 14.225 15.036 16.015 17.119 18.413 19.961 21.896 24.281 27.295 29.985 31.602 32.547 33.141 33.477 33.712 33.939 34.044 34.079 34.086 34.065 34.049 33.998 33.95 33.934 33.904 33.858 33.795 33.723 33.651 33.583 33.513 33.412 33.316 33.221 33.121 33.012 32.881 32.8 32.717 32.578 32.476 32.362 32.3 32.16 32.018 31.87 31.788 31.61 31.503 31.399 31.285 31.034 30.895 30.737 30.548 30.324 30.066 29.676 27.934 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_42_13.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_42_13.txt deleted file mode 100644 index 0519f575..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_42_13.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23875 ,TETRA ,17606256,Sun Nov 28 19:55:21 CET,Sun Nov 28 22:13:56 CET,0.0 0.938 1.257 1.49 1.679 1.853 2.013 2.147 2.384 2.488 2.579 2.655 2.851 2.925 3.069 3.206 3.338 3.4 3.502 3.593 3.731 3.804 3.863 3.949 4.027 4.095 4.154 4.216 4.297 4.373 4.45 4.527 4.592 4.643 4.695 4.76 4.815 4.854 4.864 4.825 4.756 4.661 4.486 4.276 4.035 3.691 3.135 2.362 1.3 -0.393 -3.209 -6.362 -8.817 -10.838 -12.545 -13.977 -15.188 -16.29 -17.242 -18.16 -18.913 -19.552 -20.152 -20.76 -21.351 -21.867 -22.356 -22.776 -23.152 -23.533 -23.927 -24.245 -24.569 -24.916 -25.191 -25.479 -25.787 -26.103 -26.414 -26.619 -26.817 -27.132 -27.359 -27.594 -27.709 -27.961 -28.229 -28.517 -28.691 -29.011 -29.268 -29.463 -29.65 -30.048 -30.279 -30.539 -30.846 -31.211 -31.582 -32.028 -33.599 -2 ,257 ,TETRA ,17606257,Sun Nov 28 19:55:24 CET,Sun Nov 28 22:14:19 CET,0.0 0.795 1.041 1.22 1.383 1.52 1.642 1.752 1.93 2.013 2.098 2.153 2.334 2.399 2.514 2.624 2.732 2.784 2.873 2.945 3.066 3.142 3.205 3.299 3.39 3.492 3.588 3.68 3.788 3.867 3.936 4.007 4.07 4.109 4.147 4.179 4.209 4.253 4.297 4.324 4.3 4.247 4.176 4.07 3.886 3.621 3.245 2.767 2.003 0.669 -1.763 -4.745 -7.095 -9.1 -10.825 -12.344 -13.644 -14.699 -15.568 -16.478 -17.25 -17.913 -18.546 -19.144 -19.676 -20.149 -20.648 -21.074 -21.437 -21.829 -22.229 -22.563 -22.921 -23.286 -23.555 -23.837 -24.138 -24.446 -24.76 -24.978 -25.198 -25.535 -25.764 -25.999 -26.133 -26.413 -26.699 -26.993 -27.14 -27.426 -27.65 -27.841 -28.038 -28.446 -28.69 -28.966 -29.263 -29.606 -30.016 -30.6 -32.354 -3 ,1591 ,TETRA ,17606258,Sun Nov 28 19:55:25 CET,Sun Nov 28 22:13:18 CET,0.0 1.177 1.537 1.787 1.965 2.108 2.236 2.364 2.639 2.754 2.852 2.917 3.108 3.201 3.364 3.52 3.662 3.718 3.816 3.914 4.058 4.151 4.223 4.311 4.392 4.471 4.546 4.616 4.706 4.794 4.891 5.023 5.152 5.245 5.322 5.388 5.426 5.447 5.452 5.437 5.392 5.311 5.165 4.96 4.71 4.401 3.918 3.15 2.016 0.394 -2.252 -5.315 -7.64 -9.513 -11.093 -12.467 -13.658 -14.773 -15.723 -16.643 -17.458 -18.184 -18.896 -19.594 -20.206 -20.707 -21.206 -21.652 -22.047 -22.473 -22.924 -23.304 -23.687 -24.072 -24.364 -24.646 -24.93 -25.238 -25.558 -25.78 -26.022 -26.395 -26.631 -26.87 -26.996 -27.255 -27.532 -27.845 -28.017 -28.325 -28.555 -28.76 -28.978 -29.401 -29.628 -29.882 -30.186 -30.556 -31.011 -31.619 -33.783 -4 ,17362 ,TETRA ,17606259,Sun Nov 28 19:55:27 CET,Sun Nov 28 22:12:52 CET,0.0 1.114 1.45 1.666 1.826 1.968 2.094 2.206 2.419 2.54 2.649 2.712 2.897 2.969 3.104 3.228 3.358 3.42 3.53 3.624 3.74 3.809 3.882 3.983 4.057 4.125 4.192 4.261 4.35 4.447 4.56 4.677 4.766 4.838 4.904 4.964 5.021 5.079 5.118 5.138 5.114 5.025 4.884 4.7 4.454 4.148 3.681 2.978 1.932 0.393 -2.086 -4.917 -7.215 -9.064 -10.596 -11.927 -13.041 -14.053 -14.916 -15.749 -16.454 -17.084 -17.684 -18.232 -18.754 -19.248 -19.752 -20.216 -20.612 -20.993 -21.38 -21.698 -22.022 -22.364 -22.63 -22.914 -23.234 -23.568 -23.9 -24.119 -24.339 -24.688 -24.931 -25.188 -25.327 -25.613 -25.912 -26.225 -26.383 -26.665 -26.855 -27.034 -27.231 -27.646 -27.859 -28.105 -28.409 -28.747 -29.15 -29.708 -32.354 -5 ,14764 ,TETRA ,17606260,Sun Nov 28 19:55:48 CET,Sun Nov 28 22:11:25 CET,0.0 0.867 1.17 1.401 1.587 1.744 1.881 1.995 2.214 2.302 2.387 2.45 2.634 2.711 2.852 2.983 3.094 3.137 3.218 3.296 3.402 3.475 3.538 3.605 3.671 3.74 3.798 3.855 3.927 3.987 4.045 4.103 4.147 4.198 4.256 4.292 4.317 4.331 4.307 4.257 4.187 4.106 3.986 3.83 3.639 3.332 2.833 2.149 1.021 -0.865 -3.841 -7.102 -9.676 -11.813 -13.589 -15.147 -16.435 -17.494 -18.414 -19.317 -20.073 -20.747 -21.352 -21.915 -22.444 -22.919 -23.409 -23.839 -24.204 -24.566 -24.939 -25.267 -25.607 -25.943 -26.212 -26.504 -26.822 -27.163 -27.509 -27.757 -28.024 -28.431 -28.708 -28.991 -29.145 -29.478 -29.819 -30.173 -30.354 -30.666 -30.914 -31.13 -31.338 -31.742 -31.977 -32.258 -32.574 -32.91 -33.319 -33.897 -35.481 -6 ,25124 ,TETRA ,17606261,Sun Nov 28 19:55:48 CET,Sun Nov 28 22:13:07 CET,0.0 0.759 1.072 1.303 1.47 1.626 1.777 1.918 2.177 2.294 2.393 2.459 2.647 2.722 2.841 2.937 3.038 3.091 3.213 3.335 3.476 3.558 3.635 3.734 3.819 3.913 4.002 4.071 4.158 4.233 4.288 4.348 4.401 4.466 4.537 4.598 4.638 4.652 4.65 4.626 4.566 4.503 4.424 4.256 3.99 3.637 3.141 2.443 1.359 -0.266 -2.904 -5.959 -8.323 -10.302 -11.998 -13.459 -14.672 -15.696 -16.544 -17.389 -18.102 -18.731 -19.344 -19.926 -20.471 -20.975 -21.483 -21.916 -22.315 -22.764 -23.225 -23.59 -23.979 -24.389 -24.701 -25.007 -25.304 -25.621 -25.951 -26.181 -26.423 -26.784 -27.028 -27.284 -27.429 -27.728 -28.01 -28.312 -28.484 -28.802 -29.038 -29.229 -29.43 -29.893 -30.139 -30.406 -30.694 -31.001 -31.361 -31.865 -33.435 -7 ,322 ,TETRA ,17606262,Sun Nov 28 19:55:48 CET,Sun Nov 28 22:05:16 CET,0.0 0.644 0.899 1.112 1.309 1.465 1.589 1.727 2.023 2.147 2.251 2.332 2.516 2.588 2.722 2.846 2.97 3.021 3.113 3.203 3.316 3.399 3.49 3.606 3.708 3.801 3.881 3.961 4.069 4.18 4.289 4.409 4.506 4.589 4.687 4.778 4.851 4.92 4.979 5.028 5.09 5.125 5.063 4.931 4.656 4.282 3.794 3.039 1.887 0.236 -2.501 -5.84 -8.506 -10.631 -12.27 -13.715 -14.984 -16.076 -16.959 -17.827 -18.581 -19.231 -19.836 -20.406 -20.948 -21.432 -21.942 -22.422 -22.842 -23.27 -23.684 -24.016 -24.362 -24.732 -25.031 -25.337 -25.649 -25.972 -26.324 -26.564 -26.803 -27.179 -27.431 -27.678 -27.8 -28.068 -28.351 -28.642 -28.812 -29.143 -29.393 -29.589 -29.802 -30.248 -30.498 -30.78 -31.071 -31.389 -31.799 -32.415 -34.411 -8 ,3231 ,TETRA ,17606263,Sun Nov 28 19:55:48 CET,Sun Nov 28 21:59:55 CET,0.0 0.731 0.984 1.182 1.351 1.508 1.642 1.755 1.959 2.052 2.133 2.172 2.341 2.401 2.512 2.618 2.719 2.767 2.849 2.925 3.039 3.109 3.177 3.276 3.378 3.471 3.555 3.654 3.79 3.9 3.99 4.079 4.139 4.183 4.235 4.29 4.336 4.379 4.382 4.361 4.342 4.323 4.282 4.192 3.985 3.637 3.137 2.444 1.42 -0.174 -2.889 -6.054 -8.534 -10.507 -12.133 -13.517 -14.677 -15.729 -16.621 -17.492 -18.238 -18.887 -19.495 -20.062 -20.59 -21.087 -21.602 -22.055 -22.441 -22.842 -23.258 -23.592 -23.938 -24.294 -24.566 -24.845 -25.15 -25.469 -25.792 -26.018 -26.248 -26.589 -26.844 -27.143 -27.296 -27.598 -27.891 -28.173 -28.33 -28.643 -28.875 -29.066 -29.266 -29.665 -29.894 -30.15 -30.452 -30.834 -31.302 -31.949 -34.407 -9 ,12888 ,TETRA ,17606264,Sun Nov 28 19:55:49 CET,Sun Nov 28 22:10:45 CET,0.0 0.893 1.159 1.366 1.553 1.72 1.862 1.985 2.173 2.267 2.358 2.403 2.571 2.64 2.762 2.853 2.948 2.993 3.073 3.156 3.262 3.333 3.406 3.503 3.596 3.674 3.741 3.809 3.913 4.0 4.064 4.144 4.208 4.269 4.329 4.377 4.41 4.419 4.418 4.392 4.345 4.296 4.218 4.072 3.844 3.557 3.097 2.375 1.337 -0.143 -2.431 -5.169 -7.459 -9.389 -10.962 -12.286 -13.477 -14.569 -15.494 -16.392 -17.104 -17.712 -18.318 -18.903 -19.435 -19.905 -20.385 -20.796 -21.146 -21.521 -21.917 -22.272 -22.661 -23.058 -23.368 -23.663 -23.956 -24.259 -24.558 -24.775 -25.015 -25.381 -25.645 -25.93 -26.069 -26.36 -26.64 -26.879 -27.01 -27.298 -27.532 -27.727 -27.932 -28.36 -28.605 -28.874 -29.138 -29.43 -29.821 -30.372 -32.119 -10 ,452 ,TETRA ,17606265,Sun Nov 28 19:55:48 CET,Sun Nov 28 22:09:14 CET,0.0 0.703 0.942 1.137 1.31 1.461 1.607 1.729 1.931 2.023 2.106 2.154 2.335 2.407 2.549 2.673 2.78 2.834 2.94 3.043 3.183 3.269 3.352 3.463 3.566 3.659 3.748 3.83 3.925 4.018 4.096 4.192 4.269 4.317 4.375 4.456 4.516 4.562 4.614 4.659 4.714 4.781 4.781 4.688 4.489 4.189 3.83 3.318 2.54 1.228 -1.136 -4.0 -6.383 -8.356 -10.022 -11.416 -12.627 -13.726 -14.635 -15.531 -16.241 -16.826 -17.375 -17.89 -18.392 -18.872 -19.358 -19.782 -20.16 -20.548 -20.954 -21.292 -21.627 -21.972 -22.249 -22.551 -22.856 -23.161 -23.483 -23.708 -23.958 -24.342 -24.591 -24.856 -24.995 -25.266 -25.56 -25.852 -25.998 -26.292 -26.511 -26.702 -26.909 -27.336 -27.577 -27.848 -28.135 -28.445 -28.803 -29.36 -31.471 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_42_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_42_44.txt deleted file mode 100644 index 587a5b52..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_42_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4656 ,TETRA ,17606266,Sun Nov 28 19:55:48 CET,Sun Nov 28 22:09:34 CET,0.0 1.343 1.684 1.918 2.116 2.303 2.477 2.614 2.841 2.957 3.063 3.15 3.343 3.427 3.591 3.736 3.88 3.951 4.094 4.244 4.463 4.603 4.731 4.914 5.088 5.243 5.407 5.576 5.773 5.959 6.147 6.368 6.572 6.776 7.035 7.329 7.597 7.899 8.232 8.565 8.895 9.28 9.736 10.168 10.713 11.358 12.129 13.014 13.967 15.056 16.324 17.28 17.677 17.882 17.986 17.99 17.933 17.812 17.644 17.475 17.364 17.255 17.121 16.989 16.863 16.716 16.519 16.32 16.166 16.02 15.859 15.723 15.579 15.42 15.297 15.167 15.032 14.9 14.743 14.632 14.513 14.31 14.179 14.031 13.949 13.776 13.575 13.365 13.258 13.052 12.891 12.744 12.602 12.262 12.061 11.858 11.647 11.387 11.065 10.659 9.36 -2 ,7576 ,TETRA ,17606267,Sun Nov 28 19:55:50 CET,Sun Nov 28 22:09:45 CET,0.0 0.755 1.067 1.311 1.505 1.656 1.808 1.948 2.189 2.3 2.412 2.507 2.701 2.791 2.974 3.15 3.312 3.391 3.549 3.702 3.916 4.063 4.207 4.416 4.609 4.787 4.967 5.149 5.387 5.592 5.79 6.033 6.254 6.457 6.709 7.002 7.283 7.613 7.956 8.325 8.717 9.173 9.708 10.2 10.741 11.353 12.086 12.937 13.993 15.286 16.735 17.742 18.181 18.325 18.355 18.338 18.223 18.059 17.912 17.754 17.598 17.431 17.275 17.132 16.995 16.868 16.731 16.59 16.453 16.307 16.146 15.998 15.821 15.632 15.479 15.313 15.154 14.987 14.809 14.684 14.548 14.331 14.177 14.007 13.914 13.734 13.56 13.361 13.254 13.049 12.908 12.758 12.6 12.32 12.167 11.979 11.753 11.48 11.186 10.825 9.091 -3 ,11714 ,TETRA ,17606268,Sun Nov 28 19:55:49 CET,Sun Nov 28 22:10:04 CET,0.0 0.483 0.712 0.915 1.067 1.191 1.316 1.454 1.74 1.861 1.969 2.059 2.254 2.345 2.52 2.691 2.872 2.956 3.103 3.239 3.441 3.574 3.706 3.92 4.142 4.361 4.56 4.743 4.96 5.164 5.388 5.671 5.93 6.158 6.406 6.708 7.003 7.313 7.651 7.996 8.362 8.79 9.315 9.872 10.529 11.229 11.973 12.747 13.656 14.738 15.974 16.885 17.36 17.578 17.621 17.57 17.487 17.373 17.232 17.061 16.905 16.772 16.629 16.478 16.324 16.183 16.015 15.861 15.748 15.618 15.468 15.336 15.178 15.015 14.894 14.759 14.606 14.433 14.24 14.102 13.958 13.72 13.568 13.404 13.312 13.144 12.963 12.768 12.665 12.452 12.309 12.182 12.043 11.725 11.554 11.367 11.142 10.873 10.578 10.173 8.623 -4 ,26692 ,TETRA ,17606269,Sun Nov 28 19:55:53 CET,Sun Nov 28 22:10:06 CET,0.0 0.373 0.576 0.773 0.929 1.062 1.185 1.301 1.542 1.652 1.747 1.837 2.028 2.113 2.274 2.427 2.579 2.651 2.797 2.937 3.135 3.269 3.395 3.577 3.778 3.977 4.159 4.33 4.545 4.753 4.954 5.199 5.43 5.641 5.886 6.161 6.441 6.76 7.109 7.499 7.909 8.385 8.96 9.519 10.132 10.806 11.579 12.425 13.388 14.485 15.895 16.968 17.451 17.645 17.72 17.735 17.688 17.597 17.458 17.304 17.18 17.038 16.887 16.751 16.622 16.503 16.339 16.173 16.036 15.866 15.665 15.488 15.306 15.116 14.969 14.811 14.636 14.447 14.269 14.156 14.02 13.794 13.648 13.496 13.415 13.25 13.056 12.814 12.688 12.475 12.33 12.192 12.045 11.714 11.527 11.311 11.067 10.781 10.428 9.956 8.507 -5 ,26322 ,TETRA ,17606270,Sun Nov 28 19:55:50 CET,Sun Nov 28 22:10:07 CET,0.0 0.593 0.84 1.102 1.297 1.459 1.616 1.74 1.938 2.059 2.183 2.277 2.481 2.574 2.734 2.887 3.049 3.136 3.289 3.433 3.644 3.776 3.905 4.088 4.263 4.43 4.599 4.774 4.996 5.206 5.411 5.648 5.863 6.073 6.331 6.632 6.92 7.235 7.593 7.984 8.384 8.842 9.374 9.915 10.59 11.314 12.106 13.008 13.959 14.943 16.16 16.967 17.188 17.234 17.173 17.03 16.828 16.584 16.339 16.086 15.849 15.616 15.388 15.159 14.913 14.685 14.472 14.277 14.097 13.912 13.729 13.557 13.373 13.202 13.063 12.911 12.759 12.594 12.409 12.272 12.144 11.946 11.786 11.613 11.523 11.347 11.171 11.002 10.909 10.7 10.595 10.482 10.345 10.068 9.909 9.723 9.529 9.289 8.963 8.517 6.738 -6 ,17226 ,TETRA ,17606271,Sun Nov 28 19:55:52 CET,Sun Nov 28 22:09:49 CET,0.0 0.921 1.213 1.434 1.621 1.759 1.886 2.021 2.284 2.394 2.488 2.562 2.766 2.854 3.005 3.165 3.337 3.418 3.567 3.704 3.913 4.054 4.188 4.382 4.575 4.75 4.91 5.074 5.301 5.525 5.738 5.988 6.22 6.454 6.719 6.989 7.248 7.533 7.868 8.232 8.638 9.096 9.59 10.119 10.754 11.452 12.248 13.128 14.195 15.334 16.463 17.365 17.79 17.949 18.018 17.961 17.824 17.71 17.605 17.46 17.305 17.166 17.018 16.835 16.637 16.438 16.221 16.018 15.833 15.663 15.504 15.342 15.171 15.021 14.912 14.781 14.619 14.455 14.289 14.16 14.03 13.828 13.675 13.517 13.435 13.253 13.066 12.857 12.751 12.558 12.424 12.311 12.195 11.924 11.762 11.585 11.386 11.132 10.773 10.304 8.753 -7 ,32082 ,TETRA ,17606272,Sun Nov 28 19:55:49 CET,Sun Nov 28 22:09:17 CET,0.0 0.551 0.734 0.89 1.057 1.233 1.395 1.522 1.753 1.855 1.955 2.074 2.288 2.379 2.536 2.694 2.845 2.918 3.08 3.227 3.412 3.528 3.65 3.827 3.987 4.15 4.311 4.461 4.673 4.89 5.105 5.385 5.639 5.871 6.138 6.438 6.735 7.056 7.402 7.764 8.151 8.573 9.053 9.549 10.076 10.632 11.303 12.11 13.08 14.199 15.456 16.282 16.559 16.654 16.69 16.666 16.577 16.429 16.299 16.173 16.028 15.886 15.75 15.612 15.478 15.347 15.199 15.053 14.924 14.788 14.646 14.523 14.377 14.2 14.054 13.905 13.746 13.588 13.424 13.315 13.19 12.976 12.836 12.685 12.608 12.441 12.242 12.029 11.926 11.726 11.562 11.41 11.255 10.931 10.755 10.577 10.379 10.14 9.847 9.417 7.643 -8 ,3216 ,TETRA ,17606273,Sun Nov 28 19:55:49 CET,Sun Nov 28 22:13:09 CET,0.0 0.56 0.904 1.123 1.31 1.485 1.63 1.755 1.962 2.056 2.156 2.249 2.448 2.534 2.7 2.876 3.055 3.147 3.314 3.463 3.666 3.795 3.925 4.102 4.274 4.454 4.629 4.8 5.024 5.221 5.4 5.635 5.863 6.076 6.342 6.645 6.927 7.234 7.551 7.874 8.243 8.673 9.138 9.593 10.123 10.741 11.453 12.195 13.077 14.186 15.453 16.348 16.812 17.064 17.118 17.076 17.027 16.945 16.85 16.767 16.655 16.506 16.344 16.198 16.063 15.93 15.802 15.669 15.534 15.386 15.222 15.073 14.913 14.745 14.619 14.489 14.361 14.23 14.081 13.969 13.839 13.644 13.516 13.382 13.302 13.116 12.933 12.751 12.663 12.478 12.349 12.219 12.086 11.812 11.653 11.49 11.319 11.111 10.798 10.334 8.997 -9 ,279 ,TETRA ,17606274,Sun Nov 28 19:56:48 CET,Sun Nov 28 22:10:37 CET,0.0 0.751 0.974 1.131 1.284 1.425 1.553 1.681 1.89 1.992 2.096 2.183 2.383 2.475 2.644 2.805 2.976 3.056 3.186 3.319 3.518 3.644 3.777 3.958 4.124 4.302 4.478 4.637 4.847 5.053 5.267 5.54 5.788 6.025 6.298 6.6 6.9 7.222 7.567 7.941 8.334 8.808 9.356 9.902 10.562 11.25 11.977 12.766 13.691 14.822 16.145 17.086 17.532 17.721 17.774 17.773 17.724 17.618 17.5 17.364 17.207 17.051 16.885 16.722 16.564 16.42 16.28 16.155 16.033 15.887 15.74 15.616 15.473 15.32 15.201 15.065 14.911 14.753 14.579 14.448 14.312 14.114 13.984 13.838 13.765 13.602 13.41 13.198 13.078 12.858 12.7 12.559 12.406 12.113 11.954 11.778 11.565 11.311 11.013 10.555 8.854 -10 ,28511 ,TETRA ,17606275,Sun Nov 28 19:57:48 CET,Sun Nov 28 22:11:20 CET,0.0 0.544 0.727 0.916 1.114 1.259 1.388 1.516 1.76 1.864 1.951 2.021 2.212 2.302 2.483 2.635 2.771 2.831 2.967 3.107 3.303 3.429 3.546 3.724 3.905 4.074 4.235 4.396 4.593 4.792 4.985 5.19 5.395 5.608 5.857 6.144 6.427 6.753 7.112 7.498 7.915 8.373 8.852 9.324 9.886 10.495 11.18 11.935 12.787 13.758 14.934 15.829 16.217 16.358 16.404 16.387 16.344 16.264 16.14 15.989 15.833 15.695 15.555 15.411 15.262 15.091 14.891 14.734 14.612 14.466 14.308 14.166 14.005 13.851 13.73 13.582 13.42 13.269 13.128 13.019 12.884 12.671 12.534 12.397 12.321 12.154 11.958 11.75 11.651 11.451 11.335 11.222 11.086 10.771 10.603 10.411 10.183 9.917 9.553 9.057 7.33 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_42_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_42_45.txt deleted file mode 100644 index de5fe1d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_42_45.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27518 ,TETRA ,17606276,Sun Nov 28 19:57:47 CET,Sun Nov 28 22:11:23 CET,0.0 1.762 2.095 2.358 2.584 2.775 2.98 3.178 3.507 3.649 3.786 3.969 4.216 4.338 4.545 4.753 4.96 5.065 5.264 5.443 5.677 5.818 5.967 6.184 6.372 6.551 6.75 6.943 7.192 7.434 7.641 7.896 8.167 8.432 8.761 9.108 9.407 9.722 10.051 10.412 10.764 11.145 11.628 12.132 12.717 13.336 13.99 14.783 15.912 17.128 18.109 18.606 18.753 18.795 18.721 18.558 18.412 18.256 18.09 17.88 17.677 17.482 17.285 17.098 16.907 16.717 16.505 16.317 16.157 15.979 15.802 15.673 15.544 15.405 15.287 15.162 15.03 14.888 14.721 14.605 14.497 14.319 14.189 14.054 13.987 13.839 13.658 13.483 13.405 13.229 13.121 13.018 12.906 12.634 12.473 12.29 12.102 11.874 11.603 11.284 10.213 -2 ,23356 ,TETRA ,17606277,Sun Nov 28 19:58:47 CET,Sun Nov 28 22:14:24 CET,0.0 2.92 3.347 3.646 3.901 4.1 4.264 4.401 4.694 4.857 5.005 5.174 5.399 5.507 5.711 5.916 6.106 6.188 6.342 6.496 6.724 6.867 6.995 7.173 7.346 7.525 7.708 7.88 8.089 8.302 8.525 8.792 9.044 9.281 9.556 9.861 10.142 10.449 10.782 11.125 11.481 11.91 12.441 12.994 13.598 14.212 14.924 15.72 16.625 17.643 18.726 19.354 19.563 19.577 19.496 19.374 19.21 19.034 18.878 18.712 18.574 18.457 18.333 18.216 18.091 17.941 17.787 17.667 17.559 17.432 17.297 17.19 17.058 16.905 16.788 16.666 16.537 16.399 16.248 16.129 15.992 15.764 15.613 15.471 15.397 15.245 15.074 14.897 14.802 14.602 14.456 14.319 14.188 13.904 13.702 13.483 13.275 13.046 12.77 12.401 10.901 -3 ,25713 ,TETRA ,17606278,Sun Nov 28 19:58:48 CET,Sun Nov 28 22:16:47 CET,0.0 1.796 2.231 2.581 2.837 3.065 3.285 3.477 3.812 3.96 4.099 4.271 4.502 4.626 4.855 5.073 5.292 5.397 5.585 5.764 6.017 6.182 6.354 6.597 6.817 7.025 7.223 7.417 7.685 7.948 8.191 8.472 8.712 8.951 9.238 9.539 9.834 10.165 10.512 10.918 11.352 11.804 12.319 12.808 13.374 13.996 14.65 15.421 16.419 17.532 18.777 19.688 20.08 20.154 20.061 19.91 19.736 19.565 19.418 19.252 19.086 18.933 18.781 18.634 18.496 18.367 18.212 18.062 17.928 17.777 17.608 17.449 17.288 17.115 16.969 16.83 16.688 16.531 16.366 16.248 16.127 15.934 15.796 15.644 15.564 15.402 15.229 15.05 14.96 14.778 14.653 14.52 14.388 14.097 13.927 13.752 13.532 13.254 12.958 12.596 11.105 -4 ,2860 ,TETRA ,17606279,Sun Nov 28 19:58:48 CET,Sun Nov 28 22:18:01 CET,0.0 1.079 1.47 1.799 2.028 2.231 2.442 2.643 2.985 3.138 3.284 3.436 3.654 3.757 3.98 4.196 4.38 4.464 4.64 4.81 5.047 5.216 5.376 5.585 5.805 6.052 6.286 6.468 6.683 6.897 7.101 7.349 7.601 7.869 8.191 8.54 8.849 9.155 9.486 9.848 10.223 10.673 11.177 11.659 12.225 12.84 13.566 14.377 15.27 16.26 17.394 18.229 18.535 18.629 18.649 18.611 18.52 18.397 18.253 18.063 17.897 17.724 17.538 17.354 17.176 17.01 16.828 16.667 16.52 16.36 16.195 16.056 15.895 15.722 15.602 15.465 15.316 15.149 14.954 14.833 14.717 14.539 14.408 14.275 14.212 14.072 13.922 13.759 13.672 13.47 13.328 13.212 13.099 12.834 12.681 12.515 12.33 12.116 11.841 11.432 10.049 -5 ,15142 ,TETRA ,17606280,Sun Nov 28 19:58:48 CET,Sun Nov 28 22:13:42 CET,0.0 1.128 1.45 1.746 1.985 2.193 2.376 2.529 2.778 2.883 2.986 3.091 3.299 3.394 3.578 3.761 3.945 4.029 4.188 4.346 4.587 4.738 4.877 5.082 5.275 5.46 5.647 5.836 6.075 6.297 6.495 6.712 6.925 7.139 7.401 7.717 8.041 8.409 8.795 9.197 9.61 10.07 10.589 11.135 11.8 12.517 13.353 14.243 15.231 16.365 17.631 18.595 18.993 19.084 19.048 18.982 18.883 18.749 18.606 18.442 18.304 18.199 18.081 17.927 17.78 17.633 17.455 17.307 17.182 17.054 16.913 16.778 16.64 16.495 16.37 16.241 16.116 15.979 15.823 15.716 15.617 15.441 15.305 15.163 15.088 14.935 14.762 14.569 14.461 14.252 14.086 13.946 13.806 13.478 13.288 13.075 12.83 12.576 12.277 11.878 10.319 -6 ,7695 ,TETRA ,17606281,Sun Nov 28 20:00:19 CET,Sun Nov 28 22:15:17 CET,0.0 1.418 1.791 2.108 2.347 2.539 2.711 2.865 3.155 3.304 3.433 3.556 3.77 3.878 4.109 4.327 4.525 4.615 4.788 4.947 5.177 5.33 5.483 5.697 5.887 6.074 6.25 6.426 6.665 6.891 7.125 7.425 7.709 7.97 8.255 8.571 8.861 9.18 9.532 9.911 10.323 10.775 11.28 11.786 12.392 13.077 13.833 14.678 15.698 16.893 18.327 19.275 19.645 19.752 19.698 19.591 19.467 19.333 19.219 19.075 18.921 18.783 18.653 18.511 18.362 18.224 18.064 17.919 17.789 17.639 17.484 17.361 17.226 17.089 16.974 16.844 16.722 16.586 16.451 16.366 16.27 16.106 15.991 15.876 15.807 15.638 15.465 15.306 15.221 15.033 14.917 14.778 14.638 14.355 14.198 14.029 13.849 13.628 13.354 13.014 12.249 -7 ,12081 ,TETRA ,17606282,Sun Nov 28 19:59:48 CET,Sun Nov 28 22:16:41 CET,0.0 1.242 1.635 1.92 2.155 2.361 2.559 2.733 3.044 3.189 3.336 3.507 3.731 3.837 4.05 4.265 4.472 4.567 4.742 4.914 5.167 5.32 5.454 5.653 5.858 6.052 6.238 6.417 6.637 6.854 7.078 7.346 7.574 7.782 8.036 8.328 8.616 8.957 9.349 9.739 10.104 10.518 11.019 11.491 12.032 12.683 13.427 14.27 15.279 16.446 17.715 18.517 18.827 18.916 18.873 18.746 18.572 18.398 18.223 18.021 17.856 17.706 17.556 17.41 17.262 17.111 16.939 16.78 16.64 16.484 16.315 16.192 16.062 15.909 15.794 15.675 15.55 15.4 15.226 15.11 14.995 14.818 14.69 14.55 14.479 14.329 14.173 14.02 13.932 13.743 13.637 13.522 13.405 13.149 12.991 12.803 12.59 12.36 12.093 11.754 10.701 -8 ,27849 ,TETRA ,17606283,Sun Nov 28 19:59:49 CET,Sun Nov 28 22:16:13 CET,0.0 0.992 1.347 1.623 1.852 2.05 2.23 2.393 2.668 2.794 2.904 3.022 3.241 3.342 3.552 3.757 3.927 4.012 4.212 4.404 4.644 4.796 4.946 5.164 5.38 5.587 5.777 5.96 6.2 6.44 6.667 6.943 7.218 7.471 7.756 8.065 8.361 8.696 9.049 9.423 9.836 10.281 10.753 11.212 11.777 12.399 13.081 13.858 14.801 15.849 16.903 17.575 17.698 17.614 17.49 17.316 17.157 16.997 16.837 16.653 16.458 16.256 16.062 15.885 15.72 15.574 15.415 15.252 15.089 14.929 14.76 14.607 14.438 14.253 14.113 13.969 13.82 13.667 13.506 13.392 13.27 13.078 12.943 12.787 12.707 12.542 12.364 12.182 12.093 11.906 11.802 11.699 11.582 11.307 11.156 10.972 10.766 10.523 10.211 9.77 8.168 -9 ,32745 ,TETRA ,17606284,Sun Nov 28 19:59:51 CET,Sun Nov 28 22:15:08 CET,0.0 1.803 2.175 2.5 2.789 2.99 3.178 3.35 3.674 3.813 3.944 4.099 4.325 4.441 4.653 4.845 5.028 5.123 5.311 5.493 5.744 5.897 6.039 6.238 6.427 6.612 6.797 6.977 7.206 7.434 7.652 7.908 8.136 8.338 8.581 8.882 9.198 9.522 9.823 10.144 10.489 10.918 11.456 12.001 12.654 13.38 14.183 15.057 15.991 16.911 17.861 18.451 18.673 18.727 18.688 18.615 18.508 18.367 18.199 17.998 17.819 17.67 17.497 17.273 17.059 16.877 16.692 16.529 16.381 16.226 16.06 15.917 15.761 15.595 15.472 15.332 15.19 15.048 14.889 14.781 14.675 14.524 14.41 14.268 14.194 14.043 13.887 13.724 13.637 13.444 13.335 13.229 13.12 12.902 12.779 12.634 12.449 12.23 11.991 11.639 10.532 -10 ,20042 ,TETRA ,17606285,Sun Nov 28 19:59:54 CET,Sun Nov 28 22:14:24 CET,0.0 1.279 1.649 1.934 2.146 2.337 2.522 2.681 2.942 3.068 3.191 3.328 3.559 3.674 3.874 4.072 4.265 4.348 4.501 4.647 4.866 5.026 5.202 5.466 5.707 5.912 6.092 6.265 6.499 6.742 6.98 7.263 7.512 7.729 7.997 8.309 8.61 8.941 9.267 9.591 9.956 10.383 10.873 11.36 11.916 12.534 13.251 14.049 15.005 16.105 17.339 18.244 18.697 18.962 19.085 19.09 19.045 18.927 18.775 18.61 18.422 18.258 18.123 17.964 17.816 17.683 17.52 17.364 17.228 17.103 16.955 16.82 16.689 16.535 16.414 16.3 16.171 16.039 15.912 15.815 15.713 15.547 15.438 15.335 15.276 15.144 14.992 14.821 14.73 14.545 14.437 14.332 14.217 13.945 13.796 13.636 13.424 13.193 12.946 12.618 11.501 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_43_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_43_42.txt deleted file mode 100644 index 08a25b39..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_43_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21986 ,TETRA ,17606286,Sun Nov 28 19:59:48 CET,Sun Nov 28 22:14:30 CET,0.0 0.772 1.055 1.267 1.461 1.621 1.755 1.889 2.116 2.216 2.312 2.393 2.579 2.654 2.796 2.946 3.086 3.142 3.248 3.354 3.502 3.597 3.693 3.821 3.946 4.068 4.188 4.319 4.478 4.616 4.752 4.907 5.065 5.231 5.398 5.55 5.696 5.879 6.073 6.259 6.462 6.692 6.943 7.184 7.452 7.758 8.078 8.324 8.544 8.701 8.61 8.152 7.605 7.064 6.571 6.12 5.683 5.28 4.932 4.561 4.243 3.971 3.712 3.475 3.242 3.017 2.769 2.537 2.332 2.127 1.928 1.767 1.609 1.436 1.293 1.151 0.997 0.826 0.646 0.515 0.384 0.204 0.078 -0.067 -0.141 -0.297 -0.461 -0.648 -0.753 -0.979 -1.117 -1.233 -1.367 -1.646 -1.786 -1.959 -2.158 -2.375 -2.641 -2.985 -4.197 -2 ,25875 ,TETRA ,17606287,Sun Nov 28 19:59:49 CET,Sun Nov 28 22:14:49 CET,0.0 0.6 0.847 1.042 1.206 1.339 1.471 1.605 1.844 1.949 2.039 2.135 2.331 2.409 2.552 2.684 2.803 2.864 2.984 3.104 3.288 3.403 3.511 3.66 3.79 3.911 4.031 4.152 4.309 4.449 4.585 4.757 4.919 5.066 5.226 5.387 5.548 5.731 5.919 6.111 6.297 6.506 6.769 7.022 7.282 7.54 7.788 8.068 8.349 8.447 8.343 7.989 7.477 6.922 6.443 5.999 5.568 5.185 4.835 4.467 4.144 3.862 3.592 3.318 3.05 2.82 2.593 2.391 2.23 2.048 1.839 1.664 1.487 1.297 1.147 0.998 0.853 0.706 0.547 0.431 0.313 0.127 -0.013 -0.16 -0.231 -0.397 -0.587 -0.797 -0.914 -1.143 -1.283 -1.399 -1.516 -1.795 -1.95 -2.111 -2.308 -2.534 -2.791 -3.168 -5.126 -3 ,8675 ,TETRA ,17606288,Sun Nov 28 19:59:50 CET,Sun Nov 28 22:19:21 CET,0.0 0.722 0.959 1.111 1.272 1.446 1.592 1.715 1.942 2.041 2.141 2.235 2.414 2.494 2.653 2.805 2.939 2.998 3.116 3.231 3.397 3.503 3.613 3.771 3.905 4.039 4.175 4.295 4.442 4.6 4.757 4.935 5.102 5.274 5.458 5.636 5.814 6.008 6.207 6.423 6.63 6.835 7.094 7.365 7.664 7.95 8.231 8.534 8.84 9.102 9.151 8.765 8.251 7.739 7.245 6.769 6.304 5.857 5.464 5.084 4.78 4.506 4.218 3.948 3.696 3.47 3.242 3.018 2.826 2.655 2.47 2.289 2.107 1.925 1.762 1.582 1.402 1.225 1.052 0.92 0.779 0.583 0.45 0.296 0.208 0.028 -0.145 -0.336 -0.439 -0.654 -0.774 -0.9 -1.025 -1.286 -1.438 -1.603 -1.801 -2.016 -2.253 -2.56 -3.679 -4 ,23805 ,TETRA ,17606289,Sun Nov 28 19:59:51 CET,Sun Nov 28 22:18:20 CET,0.0 0.865 1.127 1.313 1.501 1.679 1.82 1.928 2.111 2.197 2.287 2.374 2.557 2.631 2.763 2.885 3.016 3.082 3.196 3.299 3.443 3.531 3.619 3.756 3.884 4.017 4.142 4.248 4.392 4.533 4.666 4.842 5.012 5.158 5.32 5.494 5.668 5.877 6.091 6.286 6.484 6.706 6.968 7.231 7.509 7.794 8.066 8.325 8.584 8.788 8.8 8.438 7.925 7.329 6.79 6.345 5.956 5.573 5.239 4.922 4.631 4.337 4.059 3.81 3.572 3.357 3.138 2.926 2.735 2.546 2.339 2.156 1.965 1.771 1.619 1.46 1.297 1.113 0.917 0.787 0.644 0.423 0.284 0.139 0.057 -0.114 -0.296 -0.485 -0.587 -0.803 -0.948 -1.091 -1.223 -1.503 -1.661 -1.845 -2.056 -2.273 -2.523 -2.892 -4.272 -5 ,941 ,TETRA ,17606290,Sun Nov 28 19:59:49 CET,Sun Nov 28 22:15:33 CET,0.0 0.675 0.945 1.176 1.358 1.506 1.637 1.761 1.955 2.037 2.13 2.207 2.385 2.46 2.598 2.729 2.857 2.925 3.057 3.169 3.329 3.426 3.517 3.651 3.783 3.911 4.025 4.13 4.274 4.438 4.595 4.751 4.896 5.036 5.19 5.374 5.545 5.724 5.935 6.154 6.375 6.628 6.9 7.133 7.387 7.675 8.009 8.319 8.589 8.858 8.983 8.73 8.328 7.884 7.394 6.921 6.545 6.184 5.846 5.512 5.213 4.947 4.685 4.431 4.193 3.988 3.768 3.56 3.387 3.21 3.027 2.866 2.698 2.516 2.365 2.215 2.064 1.906 1.76 1.666 1.56 1.379 1.25 1.117 1.046 0.894 0.736 0.569 0.482 0.292 0.205 0.096 -0.032 -0.338 -0.495 -0.654 -0.825 -1.046 -1.32 -1.651 -2.756 -6 ,30278 ,TETRA ,17606291,Sun Nov 28 19:59:52 CET,Sun Nov 28 22:15:54 CET,0.0 0.529 0.761 0.954 1.135 1.293 1.424 1.555 1.809 1.919 2.017 2.098 2.289 2.382 2.539 2.686 2.833 2.904 3.03 3.15 3.321 3.43 3.541 3.693 3.844 3.993 4.129 4.256 4.409 4.564 4.725 4.917 5.094 5.261 5.447 5.645 5.822 6.023 6.267 6.489 6.68 6.911 7.187 7.434 7.694 7.994 8.35 8.67 8.913 9.103 9.193 8.965 8.561 8.107 7.71 7.309 6.878 6.474 6.13 5.787 5.504 5.242 4.963 4.69 4.424 4.177 3.945 3.741 3.568 3.384 3.177 3.023 2.87 2.695 2.56 2.411 2.25 2.078 1.899 1.774 1.644 1.452 1.322 1.186 1.114 0.957 0.776 0.573 0.473 0.274 0.154 0.035 -0.079 -0.349 -0.499 -0.654 -0.825 -1.033 -1.288 -1.61 -3.084 -7 ,7817 ,TETRA ,17606292,Sun Nov 28 19:59:53 CET,Sun Nov 28 22:15:06 CET,0.0 0.962 1.238 1.454 1.629 1.792 1.942 2.074 2.332 2.453 2.56 2.668 2.868 2.965 3.129 3.291 3.455 3.528 3.661 3.781 3.963 4.078 4.181 4.34 4.496 4.639 4.771 4.898 5.071 5.242 5.407 5.597 5.767 5.923 6.084 6.243 6.423 6.639 6.843 7.053 7.281 7.529 7.815 8.088 8.389 8.691 8.957 9.208 9.463 9.654 9.695 9.434 9.02 8.525 8.018 7.548 7.139 6.793 6.484 6.153 5.862 5.602 5.347 5.098 4.871 4.654 4.424 4.208 4.01 3.814 3.616 3.451 3.276 3.076 2.916 2.747 2.566 2.395 2.216 2.084 1.947 1.735 1.581 1.416 1.333 1.167 0.99 0.801 0.702 0.483 0.337 0.219 0.105 -0.159 -0.3 -0.455 -0.642 -0.838 -1.084 -1.417 -2.336 -8 ,23686 ,TETRA ,17606293,Sun Nov 28 19:59:49 CET,Sun Nov 28 22:14:24 CET,0.0 1.054 1.399 1.661 1.88 2.068 2.201 2.331 2.577 2.684 2.797 2.896 3.074 3.146 3.289 3.443 3.6 3.674 3.809 3.936 4.128 4.248 4.364 4.539 4.707 4.864 5.006 5.139 5.31 5.473 5.637 5.822 5.984 6.146 6.323 6.515 6.706 6.927 7.154 7.375 7.599 7.837 8.119 8.37 8.617 8.888 9.188 9.486 9.76 9.969 9.963 9.631 9.178 8.67 8.131 7.58 7.078 6.605 6.185 5.737 5.351 5.05 4.77 4.511 4.262 4.025 3.786 3.578 3.412 3.243 3.045 2.871 2.701 2.52 2.366 2.207 2.041 1.852 1.658 1.529 1.386 1.161 1.004 0.839 0.753 0.564 0.364 0.162 0.056 -0.161 -0.284 -0.408 -0.553 -0.889 -1.063 -1.248 -1.457 -1.691 -1.962 -2.315 -3.506 -9 ,3004 ,TETRA ,17606294,Sun Nov 28 19:59:50 CET,Sun Nov 28 22:16:03 CET,0.0 0.997 1.319 1.538 1.708 1.862 2.024 2.172 2.435 2.548 2.643 2.728 2.916 2.999 3.146 3.295 3.447 3.515 3.643 3.764 3.927 4.032 4.14 4.297 4.437 4.56 4.672 4.793 4.95 5.1 5.24 5.415 5.583 5.728 5.904 6.112 6.296 6.492 6.688 6.904 7.152 7.41 7.683 7.926 8.178 8.464 8.804 9.137 9.381 9.496 9.515 9.227 8.778 8.267 7.774 7.314 6.809 6.304 5.876 5.43 5.052 4.731 4.442 4.186 3.949 3.731 3.519 3.322 3.142 2.958 2.761 2.583 2.386 2.194 2.053 1.899 1.722 1.54 1.371 1.258 1.126 0.908 0.759 0.609 0.531 0.37 0.201 0.003 -0.106 -0.327 -0.46 -0.585 -0.711 -0.977 -1.145 -1.337 -1.539 -1.782 -2.094 -2.541 -3.96 -10 ,25402 ,TETRA ,17606295,Sun Nov 28 19:59:52 CET,Sun Nov 28 22:15:55 CET,0.0 0.776 1.102 1.345 1.55 1.717 1.854 1.987 2.213 2.305 2.394 2.478 2.672 2.755 2.898 3.036 3.17 3.234 3.358 3.483 3.646 3.733 3.817 3.952 4.082 4.203 4.325 4.441 4.579 4.721 4.859 5.02 5.171 5.321 5.492 5.664 5.837 6.024 6.214 6.426 6.638 6.865 7.115 7.356 7.618 7.864 8.118 8.359 8.577 8.755 8.717 8.373 8.005 7.539 7.037 6.61 6.263 5.938 5.648 5.349 5.063 4.785 4.486 4.19 3.917 3.665 3.408 3.181 2.991 2.804 2.603 2.435 2.27 2.095 1.951 1.805 1.648 1.486 1.317 1.194 1.083 0.906 0.775 0.645 0.574 0.414 0.246 0.058 -0.042 -0.243 -0.355 -0.476 -0.597 -0.892 -1.077 -1.298 -1.548 -1.799 -2.085 -2.486 -3.647 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_44_18.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_44_18.txt deleted file mode 100644 index 70c64bb9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_44_18.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27382 ,TETRA ,17606296,Sun Nov 28 19:59:55 CET,Sun Nov 28 22:11:22 CET,0.0 0.189 0.305 0.388 0.454 0.508 0.556 0.603 0.716 0.771 0.815 0.799 0.945 0.987 1.054 1.13 1.205 1.234 1.294 1.346 1.421 1.475 1.523 1.599 1.664 1.722 1.785 1.839 1.893 1.965 2.042 2.11 2.173 2.244 2.328 2.419 2.492 2.567 2.634 2.69 2.739 2.784 2.844 2.868 2.852 2.827 2.786 2.644 2.309 1.718 0.507 -1.087 -2.388 -3.458 -4.432 -5.376 -6.187 -6.908 -7.53 -8.177 -8.782 -9.341 -9.862 -10.329 -10.747 -11.121 -11.507 -11.847 -12.151 -12.462 -12.782 -13.059 -13.342 -13.605 -13.809 -14.039 -14.276 -14.519 -14.76 -14.928 -15.106 -15.384 -15.585 -15.788 -15.89 -16.113 -16.33 -16.555 -16.679 -16.918 -17.081 -17.23 -17.4 -17.781 -17.977 -18.187 -18.416 -18.708 -19.06 -19.495 -20.75 -2 ,30161 ,TETRA ,17606297,Sun Nov 28 19:59:53 CET,Sun Nov 28 22:10:53 CET,0.0 0.065 0.152 0.228 0.293 0.359 0.436 0.498 0.595 0.646 0.683 0.656 0.783 0.825 0.904 0.964 1.015 1.042 1.098 1.146 1.213 1.262 1.306 1.358 1.419 1.477 1.527 1.584 1.653 1.703 1.736 1.77 1.821 1.876 1.939 2.007 2.085 2.163 2.219 2.279 2.334 2.373 2.402 2.412 2.396 2.348 2.211 1.944 1.523 0.836 -0.413 -1.945 -3.187 -4.251 -5.189 -6.051 -6.828 -7.536 -8.129 -8.718 -9.237 -9.674 -10.084 -10.48 -10.845 -11.179 -11.525 -11.82 -12.087 -12.375 -12.656 -12.896 -13.146 -13.411 -13.623 -13.833 -14.055 -14.307 -14.55 -14.697 -14.843 -15.081 -15.265 -15.468 -15.572 -15.775 -16.0 -16.242 -16.363 -16.609 -16.82 -16.98 -17.143 -17.469 -17.63 -17.83 -18.046 -18.272 -18.556 -18.95 -20.271 -3 ,4937 ,TETRA ,17606298,Sun Nov 28 19:59:50 CET,Sun Nov 28 22:14:09 CET,0.0 0.142 0.249 0.334 0.403 0.452 0.521 0.601 0.71 0.752 0.796 0.794 0.925 0.961 1.039 1.116 1.184 1.214 1.277 1.33 1.393 1.434 1.48 1.541 1.595 1.652 1.708 1.761 1.824 1.874 1.914 1.964 2.017 2.077 2.138 2.191 2.244 2.305 2.368 2.394 2.417 2.467 2.5 2.522 2.478 2.367 2.207 1.981 1.635 0.903 -0.513 -2.214 -3.611 -4.768 -5.749 -6.628 -7.425 -8.177 -8.835 -9.483 -10.0 -10.414 -10.811 -11.205 -11.555 -11.872 -12.217 -12.528 -12.799 -13.069 -13.333 -13.566 -13.842 -14.141 -14.375 -14.623 -14.878 -15.14 -15.408 -15.585 -15.769 -16.055 -16.251 -16.47 -16.58 -16.797 -17.023 -17.252 -17.374 -17.604 -17.771 -17.913 -18.055 -18.37 -18.55 -18.749 -18.964 -19.228 -19.543 -19.966 -21.353 -4 ,29071 ,TETRA ,17606299,Sun Nov 28 19:59:54 CET,Sun Nov 28 22:13:50 CET,0.0 0.12 0.23 0.309 0.363 0.416 0.462 0.507 0.599 0.646 0.692 0.674 0.802 0.837 0.902 0.965 1.029 1.06 1.115 1.173 1.268 1.323 1.364 1.42 1.487 1.559 1.62 1.667 1.729 1.793 1.858 1.934 1.994 2.051 2.131 2.207 2.257 2.304 2.35 2.398 2.438 2.455 2.49 2.541 2.576 2.546 2.429 2.276 1.984 1.337 0.028 -1.66 -3.184 -4.554 -5.649 -6.533 -7.351 -8.111 -8.715 -9.333 -9.869 -10.319 -10.758 -11.175 -11.562 -11.942 -12.324 -12.652 -12.945 -13.238 -13.544 -13.799 -14.056 -14.337 -14.544 -14.735 -14.947 -15.162 -15.388 -15.555 -15.721 -15.954 -16.122 -16.324 -16.432 -16.653 -16.88 -17.104 -17.224 -17.46 -17.625 -17.766 -17.916 -18.271 -18.49 -18.705 -18.907 -19.139 -19.423 -19.853 -21.237 -5 ,8127 ,TETRA ,17606300,Sun Nov 28 19:59:51 CET,Sun Nov 28 22:10:02 CET,0.0 0.188 0.34 0.451 0.51 0.552 0.609 0.662 0.74 0.789 0.841 0.827 0.96 0.997 1.092 1.165 1.224 1.256 1.314 1.374 1.459 1.508 1.542 1.586 1.632 1.683 1.738 1.797 1.877 1.953 2.02 2.084 2.144 2.188 2.242 2.329 2.407 2.489 2.59 2.683 2.758 2.811 2.848 2.873 2.881 2.856 2.769 2.529 2.029 1.261 -0.138 -2.013 -3.544 -4.728 -5.727 -6.682 -7.516 -8.255 -8.875 -9.472 -10.0 -10.445 -10.832 -11.209 -11.561 -11.884 -12.23 -12.533 -12.791 -13.057 -13.325 -13.545 -13.789 -14.042 -14.231 -14.426 -14.618 -14.827 -15.062 -15.226 -15.404 -15.681 -15.858 -16.039 -16.132 -16.324 -16.538 -16.782 -16.913 -17.144 -17.326 -17.475 -17.627 -18.016 -18.241 -18.455 -18.652 -18.892 -19.23 -19.658 -20.804 -6 ,20750 ,TETRA ,17606301,Sun Nov 28 19:59:52 CET,Sun Nov 28 22:09:16 CET,0.0 0.292 0.44 0.525 0.588 0.659 0.708 0.763 0.872 0.919 0.968 0.96 1.086 1.111 1.15 1.19 1.252 1.28 1.318 1.367 1.441 1.485 1.517 1.56 1.622 1.695 1.756 1.811 1.894 1.968 2.032 2.107 2.173 2.224 2.281 2.348 2.417 2.487 2.553 2.622 2.693 2.769 2.809 2.807 2.815 2.796 2.733 2.643 2.448 2.004 0.937 -0.536 -1.735 -2.752 -3.691 -4.553 -5.312 -5.989 -6.538 -7.074 -7.527 -7.915 -8.284 -8.649 -8.99 -9.277 -9.573 -9.842 -10.078 -10.327 -10.612 -10.853 -11.093 -11.344 -11.529 -11.719 -11.919 -12.152 -12.385 -12.527 -12.673 -12.938 -13.152 -13.394 -13.515 -13.744 -13.994 -14.261 -14.396 -14.652 -14.863 -15.048 -15.261 -15.721 -15.955 -16.156 -16.353 -16.599 -16.907 -17.331 -19.151 -7 ,4270 ,TETRA ,17606302,Sun Nov 28 20:00:20 CET,Sun Nov 28 22:11:24 CET,0.0 0.105 0.186 0.244 0.307 0.37 0.427 0.483 0.586 0.628 0.67 0.665 0.814 0.87 0.963 1.035 1.104 1.138 1.197 1.247 1.31 1.351 1.395 1.454 1.512 1.568 1.632 1.702 1.779 1.858 1.931 2.008 2.075 2.126 2.195 2.281 2.356 2.416 2.493 2.597 2.675 2.724 2.743 2.765 2.754 2.732 2.689 2.489 2.094 1.353 0.038 -1.59 -2.986 -4.22 -5.241 -6.171 -7.021 -7.735 -8.344 -9.007 -9.588 -10.106 -10.577 -10.994 -11.405 -11.79 -12.169 -12.515 -12.832 -13.165 -13.511 -13.795 -14.092 -14.413 -14.678 -14.94 -15.195 -15.466 -15.751 -15.937 -16.104 -16.353 -16.519 -16.683 -16.777 -16.987 -17.207 -17.458 -17.581 -17.792 -17.914 -18.05 -18.199 -18.501 -18.67 -18.865 -19.108 -19.398 -19.709 -20.105 -21.238 -8 ,26509 ,TETRA ,17606303,Sun Nov 28 19:59:51 CET,Sun Nov 28 22:11:01 CET,0.0 0.258 0.375 0.423 0.491 0.56 0.62 0.672 0.744 0.782 0.825 0.817 0.949 0.988 1.061 1.126 1.189 1.215 1.26 1.307 1.372 1.412 1.455 1.529 1.594 1.637 1.676 1.725 1.794 1.858 1.917 1.973 2.024 2.071 2.126 2.18 2.218 2.255 2.283 2.313 2.344 2.367 2.391 2.416 2.431 2.41 2.323 2.154 1.87 1.223 -0.143 -1.972 -3.53 -4.769 -5.752 -6.644 -7.471 -8.209 -8.854 -9.478 -10.025 -10.512 -10.942 -11.336 -11.658 -11.928 -12.221 -12.495 -12.733 -12.98 -13.232 -13.436 -13.655 -13.885 -14.061 -14.252 -14.453 -14.667 -14.906 -15.08 -15.277 -15.543 -15.679 -15.823 -15.929 -16.177 -16.432 -16.706 -16.855 -17.113 -17.305 -17.473 -17.623 -17.944 -18.138 -18.334 -18.563 -18.825 -19.099 -19.452 -20.479 -9 ,15591 ,TETRA ,17606304,Sun Nov 28 19:59:53 CET,Sun Nov 28 22:11:01 CET,0.0 0.133 0.22 0.293 0.352 0.409 0.474 0.529 0.614 0.666 0.72 0.725 0.865 0.901 0.967 1.023 1.08 1.112 1.16 1.211 1.293 1.338 1.377 1.429 1.481 1.522 1.557 1.598 1.661 1.724 1.776 1.833 1.883 1.925 1.986 2.056 2.138 2.21 2.261 2.328 2.41 2.466 2.492 2.523 2.517 2.476 2.41 2.216 1.848 1.211 -0.042 -1.58 -2.812 -3.874 -4.791 -5.574 -6.321 -7.085 -7.765 -8.381 -8.865 -9.276 -9.659 -10.024 -10.403 -10.785 -11.151 -11.475 -11.775 -12.074 -12.37 -12.631 -12.905 -13.2 -13.431 -13.661 -13.901 -14.133 -14.37 -14.548 -14.74 -15.045 -15.251 -15.487 -15.612 -15.837 -16.079 -16.359 -16.507 -16.767 -16.939 -17.093 -17.267 -17.669 -17.922 -18.218 -18.51 -18.805 -19.261 -19.948 -24.364 -10 ,13056 ,TETRA ,17606305,Sun Nov 28 19:59:54 CET,Sun Nov 28 22:11:06 CET,0.0 0.087 0.147 0.229 0.299 0.344 0.393 0.448 0.546 0.589 0.631 0.61 0.741 0.772 0.827 0.881 0.939 0.97 1.026 1.081 1.157 1.209 1.259 1.329 1.396 1.445 1.486 1.529 1.596 1.664 1.721 1.775 1.831 1.891 1.948 1.999 2.047 2.09 2.126 2.174 2.227 2.255 2.284 2.323 2.321 2.283 2.181 1.984 1.612 0.951 -0.112 -1.461 -2.602 -3.666 -4.593 -5.398 -6.179 -6.909 -7.528 -8.17 -8.714 -9.177 -9.642 -10.08 -10.473 -10.835 -11.194 -11.525 -11.827 -12.124 -12.454 -12.764 -13.088 -13.416 -13.662 -13.877 -14.061 -14.264 -14.476 -14.609 -14.744 -14.983 -15.14 -15.293 -15.382 -15.562 -15.745 -15.939 -16.041 -16.25 -16.364 -16.489 -16.616 -16.864 -16.999 -17.181 -17.404 -17.641 -17.885 -18.233 -19.077 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_44_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_44_43.txt deleted file mode 100644 index 892eb227..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_44_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4559 ,TETRA ,17698048,Sat Dec 4 16:38:54 CET,Sat Dec 4 18:11:51 CET,0.0 1.978 2.515 2.865 3.145 3.409 3.638 3.843 4.216 4.374 4.513 4.664 4.875 4.989 5.246 5.478 5.664 5.761 5.941 6.099 6.333 6.475 6.601 6.797 6.991 7.157 7.317 7.46 7.622 7.796 7.957 8.144 8.341 8.528 8.744 8.969 9.151 9.335 9.518 9.727 9.955 10.204 10.52 10.767 10.988 11.205 11.302 11.314 11.217 10.961 10.323 9.221 8.244 7.412 6.685 6.028 5.465 4.951 4.507 4.074 3.693 3.364 3.064 2.771 2.494 2.253 2.011 1.797 1.624 1.442 1.23 1.048 0.867 0.693 0.563 0.425 0.275 0.128 -0.036 -0.155 -0.266 -0.434 -0.547 -0.665 -0.736 -0.9 -1.069 -1.241 -1.327 -1.519 -1.595 -1.691 -1.788 -2.012 -2.134 -2.261 -2.405 -2.56 -2.738 -2.964 -3.846 -2 ,30107 ,TETRA ,17675320,Sat Dec 4 16:18:48 CET,Sat Dec 4 18:15:54 CET,0.0 2.036 2.539 2.878 3.148 3.372 3.57 3.757 4.092 4.241 4.376 4.562 4.795 4.91 5.117 5.302 5.486 5.594 5.795 5.961 6.21 6.372 6.512 6.713 6.905 7.103 7.288 7.44 7.639 7.846 8.05 8.273 8.471 8.659 8.872 9.098 9.282 9.458 9.652 9.859 10.093 10.368 10.647 10.887 11.111 11.275 11.398 11.454 11.414 11.251 10.716 9.689 8.667 7.742 6.925 6.177 5.529 4.992 4.54 4.111 3.76 3.451 3.151 2.855 2.579 2.323 2.072 1.872 1.694 1.497 1.298 1.132 0.959 0.764 0.612 0.47 0.318 0.163 0.012 -0.094 -0.203 -0.384 -0.518 -0.67 -0.745 -0.89 -1.047 -1.211 -1.291 -1.468 -1.542 -1.629 -1.722 -1.965 -2.1 -2.221 -2.346 -2.485 -2.68 -3.038 -3.803 -3 ,30247 ,TETRA ,17698050,Sat Dec 4 16:38:55 CET,Sat Dec 4 18:20:58 CET,0.0 1.915 2.37 2.719 3.016 3.26 3.488 3.701 4.106 4.29 4.448 4.636 4.854 4.973 5.18 5.349 5.526 5.605 5.747 5.885 6.075 6.195 6.314 6.482 6.627 6.773 6.917 7.045 7.201 7.338 7.471 7.63 7.771 7.918 8.084 8.258 8.434 8.616 8.783 8.942 9.101 9.237 9.343 9.456 9.573 9.725 9.874 9.815 9.61 9.211 8.355 7.255 6.273 5.383 4.573 3.897 3.346 2.835 2.419 1.986 1.597 1.256 0.946 0.666 0.377 0.091 -0.181 -0.412 -0.623 -0.842 -1.058 -1.223 -1.4 -1.593 -1.739 -1.887 -2.037 -2.196 -2.366 -2.475 -2.581 -2.74 -2.848 -2.971 -3.042 -3.187 -3.344 -3.515 -3.6 -3.782 -3.869 -3.98 -4.088 -4.284 -4.41 -4.543 -4.663 -4.801 -4.961 -5.196 -6.03 -4 ,31349 ,TETRA ,17698051,Sat Dec 4 16:38:58 CET,Sat Dec 4 18:05:40 CET,0.0 1.695 2.161 2.515 2.794 3.026 3.215 3.389 3.734 3.885 4.011 4.158 4.358 4.454 4.649 4.839 5.019 5.102 5.267 5.43 5.65 5.778 5.895 6.063 6.224 6.363 6.493 6.613 6.775 6.928 7.07 7.249 7.414 7.568 7.735 7.898 8.05 8.206 8.365 8.533 8.695 8.862 9.056 9.251 9.433 9.569 9.625 9.603 9.495 9.193 8.431 7.264 6.242 5.36 4.573 3.889 3.339 2.862 2.442 1.995 1.592 1.241 0.911 0.597 0.303 0.043 -0.223 -0.456 -0.651 -0.861 -1.089 -1.277 -1.472 -1.667 -1.808 -1.95 -2.101 -2.261 -2.421 -2.527 -2.637 -2.811 -2.936 -3.076 -3.144 -3.277 -3.424 -3.574 -3.656 -3.838 -3.906 -3.999 -4.107 -4.381 -4.513 -4.64 -4.78 -4.948 -5.158 -5.441 -6.578 -5 ,13418 ,TETRA ,17675323,Sat Dec 4 16:24:51 CET,Sat Dec 4 18:18:03 CET,0.0 1.873 2.451 2.833 3.145 3.402 3.624 3.821 4.17 4.315 4.443 4.575 4.778 4.88 5.087 5.272 5.435 5.522 5.682 5.82 6.009 6.127 6.245 6.413 6.577 6.723 6.856 6.988 7.14 7.272 7.42 7.608 7.785 7.959 8.141 8.351 8.559 8.753 8.955 9.16 9.344 9.553 9.79 9.998 10.22 10.433 10.568 10.689 10.779 10.623 9.994 9.002 8.136 7.366 6.621 5.933 5.333 4.762 4.257 3.808 3.459 3.123 2.787 2.472 2.189 1.946 1.695 1.467 1.261 1.054 0.847 0.664 0.472 0.275 0.127 -0.025 -0.187 -0.346 -0.505 -0.613 -0.724 -0.897 -1.025 -1.158 -1.224 -1.371 -1.519 -1.668 -1.754 -1.945 -2.024 -2.123 -2.227 -2.463 -2.577 -2.681 -2.819 -2.982 -3.164 -3.393 -4.428 -6 ,1430 ,TETRA ,17675082,Sat Dec 4 16:04:53 CET,Sat Dec 4 18:00:02 CET,0.0 1.764 2.236 2.593 2.877 3.143 3.381 3.572 3.898 4.036 4.17 4.349 4.582 4.7 4.917 5.117 5.287 5.374 5.542 5.687 5.905 6.057 6.198 6.392 6.576 6.762 6.933 7.091 7.284 7.443 7.604 7.815 8.034 8.219 8.419 8.644 8.841 9.04 9.218 9.378 9.525 9.693 9.897 10.093 10.272 10.386 10.494 10.543 10.399 9.983 9.085 7.988 7.003 6.087 5.323 4.638 4.016 3.472 3.013 2.559 2.163 1.821 1.479 1.148 0.868 0.62 0.362 0.132 -0.071 -0.286 -0.51 -0.698 -0.907 -1.107 -1.251 -1.416 -1.584 -1.75 -1.92 -2.044 -2.174 -2.37 -2.505 -2.648 -2.726 -2.891 -3.039 -3.175 -3.256 -3.436 -3.522 -3.619 -3.71 -3.901 -4.003 -4.112 -4.239 -4.385 -4.582 -4.819 -5.191 -7 ,13542 ,TETRA ,17698054,Sat Dec 4 16:40:46 CET,Sat Dec 4 18:17:12 CET,0.0 1.963 2.471 2.811 3.09 3.33 3.531 3.725 4.078 4.231 4.384 4.552 4.763 4.891 5.123 5.328 5.522 5.617 5.802 5.96 6.151 6.279 6.406 6.592 6.76 6.899 7.051 7.211 7.426 7.628 7.8 8.009 8.209 8.372 8.539 8.716 8.894 9.093 9.282 9.463 9.632 9.79 9.961 10.121 10.274 10.389 10.491 10.465 10.254 9.812 8.893 7.667 6.584 5.636 4.836 4.189 3.618 3.096 2.641 2.16 1.745 1.382 1.039 0.706 0.411 0.154 -0.116 -0.354 -0.563 -0.776 -0.994 -1.167 -1.344 -1.54 -1.692 -1.846 -2.011 -2.178 -2.35 -2.47 -2.59 -2.775 -2.91 -3.051 -3.119 -3.253 -3.402 -3.57 -3.649 -3.82 -3.885 -3.974 -4.067 -4.266 -4.366 -4.494 -4.652 -4.811 -4.963 -5.12 -5.592 -8 ,4317 ,TETRA ,17675326,Sat Dec 4 16:24:51 CET,Sat Dec 4 18:05:51 CET,0.0 1.703 2.127 2.446 2.743 3.017 3.254 3.454 3.783 3.924 4.06 4.233 4.452 4.575 4.805 5.012 5.212 5.311 5.493 5.655 5.872 6.004 6.135 6.308 6.452 6.596 6.743 6.882 7.047 7.194 7.332 7.504 7.679 7.842 8.04 8.289 8.498 8.669 8.842 9.043 9.265 9.498 9.725 9.907 10.08 10.23 10.341 10.359 10.307 10.092 9.528 8.549 7.435 6.411 5.582 4.868 4.269 3.767 3.338 2.885 2.506 2.171 1.836 1.525 1.23 0.955 0.685 0.468 0.275 0.068 -0.141 -0.32 -0.5 -0.691 -0.834 -0.972 -1.118 -1.285 -1.469 -1.583 -1.7 -1.893 -2.018 -2.149 -2.217 -2.356 -2.496 -2.64 -2.717 -2.895 -2.964 -3.049 -3.134 -3.317 -3.423 -3.544 -3.675 -3.847 -4.046 -4.252 -4.784 -9 ,706 ,TETRA ,17698056,Sat Dec 4 16:40:00 CET,Sat Dec 4 18:17:28 CET,0.0 1.623 2.104 2.483 2.781 3.027 3.243 3.448 3.811 3.97 4.117 4.273 4.479 4.593 4.824 5.028 5.21 5.299 5.457 5.615 5.85 5.998 6.13 6.305 6.483 6.66 6.829 6.984 7.184 7.364 7.532 7.736 7.921 8.1 8.301 8.508 8.72 8.957 9.193 9.399 9.588 9.822 10.08 10.336 10.628 10.893 11.141 11.326 11.368 11.086 10.332 9.228 8.137 7.17 6.36 5.665 5.082 4.592 4.169 3.723 3.334 2.999 2.672 2.366 2.09 1.838 1.58 1.356 1.166 0.97 0.762 0.589 0.398 0.196 0.054 -0.104 -0.261 -0.408 -0.59 -0.719 -0.825 -0.999 -1.123 -1.243 -1.306 -1.444 -1.609 -1.765 -1.832 -2.019 -2.116 -2.2 -2.28 -2.463 -2.559 -2.657 -2.777 -2.933 -3.093 -3.309 -3.672 -10 ,17737 ,TETRA ,17675328,Sat Dec 4 16:24:56 CET,Sat Dec 4 18:06:24 CET,0.0 2.334 2.827 3.159 3.411 3.632 3.826 4.022 4.373 4.533 4.687 4.857 5.074 5.189 5.393 5.597 5.801 5.895 6.059 6.206 6.417 6.552 6.674 6.842 7.008 7.168 7.317 7.447 7.603 7.768 7.917 8.071 8.224 8.368 8.539 8.747 8.914 9.079 9.259 9.411 9.55 9.712 9.872 10.0 10.098 10.166 10.19 10.136 10.018 9.725 8.937 7.807 6.838 5.994 5.216 4.497 3.905 3.395 2.959 2.526 2.152 1.793 1.448 1.142 0.875 0.627 0.375 0.164 -0.023 -0.215 -0.421 -0.588 -0.772 -0.973 -1.131 -1.303 -1.48 -1.653 -1.829 -1.955 -2.076 -2.257 -2.398 -2.545 -2.618 -2.771 -2.943 -3.127 -3.232 -3.431 -3.516 -3.622 -3.739 -4.0 -4.139 -4.287 -4.454 -4.621 -4.837 -5.166 -6.158 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_45_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_45_44.txt deleted file mode 100644 index f46d2989..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/protein/Summary_FEP_45_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6753 ,TETRA ,17606306,Sun Nov 28 19:59:57 CET,Sun Nov 28 22:12:55 CET,0.0 0.588 0.821 0.979 1.11 1.225 1.332 1.451 1.701 1.812 1.917 2.017 2.187 2.264 2.399 2.526 2.648 2.709 2.828 2.939 3.106 3.206 3.303 3.444 3.578 3.712 3.851 3.977 4.133 4.29 4.44 4.611 4.776 4.946 5.138 5.351 5.567 5.8 6.056 6.333 6.616 6.923 7.239 7.511 7.796 8.068 8.337 8.666 9.046 9.444 9.772 9.71 9.469 9.117 8.729 8.335 7.887 7.434 7.081 6.718 6.362 6.044 5.743 5.455 5.185 4.947 4.699 4.472 4.272 4.078 3.878 3.684 3.485 3.286 3.123 2.959 2.788 2.609 2.419 2.276 2.128 1.902 1.738 1.559 1.469 1.277 1.061 0.825 0.706 0.488 0.285 0.134 0.005 -0.271 -0.439 -0.627 -0.814 -1.018 -1.294 -1.726 -3.282 -2 ,24832 ,TETRA ,17606308,Sun Nov 28 19:59:51 CET,Sun Nov 28 22:13:06 CET,0.0 0.312 0.524 0.665 0.782 0.878 0.973 1.077 1.314 1.424 1.524 1.606 1.781 1.865 2.022 2.153 2.296 2.371 2.512 2.644 2.82 2.938 3.051 3.207 3.358 3.496 3.638 3.775 3.945 4.105 4.247 4.424 4.591 4.74 4.918 5.112 5.311 5.54 5.756 5.966 6.177 6.406 6.695 7.014 7.396 7.794 8.2 8.621 9.115 9.646 10.121 10.273 10.025 9.528 9.022 8.574 8.145 7.7 7.306 6.944 6.657 6.393 6.104 5.827 5.587 5.38 5.144 4.909 4.709 4.499 4.254 4.039 3.813 3.609 3.446 3.238 3.027 2.829 2.621 2.474 2.327 2.094 1.933 1.761 1.673 1.487 1.278 1.047 0.928 0.714 0.551 0.407 0.265 -0.008 -0.172 -0.375 -0.587 -0.819 -1.13 -1.506 -2.951 -3 ,31772 ,TETRA ,17606309,Sun Nov 28 19:59:51 CET,Sun Nov 28 22:13:01 CET,0.0 0.256 0.429 0.569 0.698 0.805 0.919 1.025 1.228 1.324 1.409 1.477 1.643 1.724 1.886 2.033 2.177 2.248 2.37 2.483 2.653 2.761 2.864 3.015 3.167 3.319 3.454 3.576 3.74 3.901 4.064 4.268 4.458 4.65 4.873 5.104 5.308 5.522 5.754 5.991 6.26 6.57 6.909 7.249 7.645 8.045 8.47 8.931 9.368 9.823 10.109 9.955 9.669 9.322 8.943 8.528 8.163 7.844 7.539 7.222 6.951 6.705 6.458 6.213 5.974 5.771 5.551 5.343 5.178 4.995 4.775 4.594 4.418 4.23 4.08 3.93 3.781 3.624 3.448 3.326 3.207 3.025 2.894 2.751 2.672 2.509 2.323 2.075 1.943 1.724 1.544 1.381 1.229 0.954 0.808 0.649 0.449 0.248 0.075 -0.202 -1.782 -4 ,7169 ,TETRA ,17606310,Sun Nov 28 19:59:54 CET,Sun Nov 28 22:13:00 CET,0.0 0.58 0.784 0.948 1.098 1.23 1.347 1.456 1.659 1.749 1.845 1.945 2.114 2.187 2.33 2.484 2.63 2.691 2.812 2.932 3.106 3.221 3.328 3.478 3.625 3.771 3.921 4.063 4.251 4.445 4.621 4.819 5.018 5.211 5.435 5.672 5.892 6.154 6.441 6.7 6.954 7.227 7.51 7.798 8.134 8.495 8.894 9.353 9.88 10.286 10.211 9.716 9.14 8.539 8.039 7.543 7.033 6.538 6.109 5.699 5.334 5.0 4.678 4.37 4.09 3.834 3.57 3.299 3.03 2.747 2.478 2.275 2.065 1.844 1.647 1.43 1.237 1.053 0.833 0.675 0.503 0.226 0.052 -0.111 -0.196 -0.381 -0.566 -0.761 -0.867 -1.066 -1.206 -1.344 -1.5 -1.954 -2.18 -2.379 -2.596 -2.836 -3.119 -3.516 -5.663 -5 ,7334 ,TETRA ,17606311,Sun Nov 28 19:59:56 CET,Sun Nov 28 22:12:38 CET,0.0 0.316 0.505 0.652 0.79 0.917 1.05 1.183 1.375 1.459 1.551 1.617 1.78 1.836 1.959 2.102 2.237 2.301 2.438 2.567 2.746 2.863 2.968 3.116 3.266 3.404 3.538 3.668 3.843 4.026 4.205 4.423 4.629 4.82 5.046 5.3 5.542 5.812 6.104 6.406 6.706 7.031 7.406 7.801 8.261 8.685 9.075 9.486 9.947 10.432 10.769 10.788 10.626 10.308 9.943 9.561 9.19 8.82 8.455 8.069 7.791 7.58 7.359 7.092 6.828 6.598 6.343 6.109 5.892 5.68 5.476 5.305 5.126 4.937 4.789 4.633 4.464 4.291 4.127 4.019 3.894 3.692 3.553 3.386 3.298 3.12 2.916 2.707 2.6 2.383 2.217 2.093 1.959 1.663 1.48 1.245 1.008 0.781 0.506 0.126 -1.647 -6 ,13423 ,TETRA ,17606312,Sun Nov 28 19:59:52 CET,Sun Nov 28 22:12:28 CET,0.0 0.325 0.463 0.621 0.79 0.923 1.037 1.141 1.312 1.386 1.463 1.507 1.661 1.724 1.847 1.969 2.091 2.149 2.261 2.368 2.52 2.622 2.724 2.883 3.027 3.159 3.29 3.422 3.597 3.773 3.948 4.146 4.339 4.52 4.722 4.941 5.15 5.398 5.685 5.961 6.207 6.484 6.797 7.112 7.493 7.923 8.472 9.062 9.549 9.982 10.391 10.44 10.201 9.863 9.481 9.111 8.763 8.418 8.116 7.807 7.535 7.283 7.038 6.822 6.616 6.422 6.227 6.048 5.886 5.698 5.485 5.325 5.165 4.993 4.852 4.688 4.523 4.356 4.192 4.065 3.906 3.672 3.5 3.321 3.24 3.05 2.839 2.634 2.529 2.328 2.162 2.03 1.91 1.599 1.398 1.184 0.964 0.695 0.383 0.038 -1.624 -7 ,11494 ,TETRA ,17606313,Sun Nov 28 19:59:55 CET,Sun Nov 28 22:13:14 CET,0.0 0.209 0.384 0.512 0.647 0.805 0.928 1.03 1.217 1.304 1.384 1.443 1.616 1.696 1.836 1.951 2.064 2.116 2.215 2.32 2.481 2.581 2.67 2.79 2.916 3.04 3.151 3.271 3.434 3.588 3.741 3.909 4.057 4.207 4.4 4.628 4.843 5.054 5.281 5.543 5.807 6.102 6.443 6.771 7.127 7.511 7.934 8.323 8.708 9.06 9.185 8.951 8.502 8.003 7.552 7.126 6.77 6.452 6.161 5.803 5.478 5.221 4.953 4.684 4.427 4.218 4.02 3.844 3.698 3.544 3.375 3.225 3.065 2.884 2.741 2.595 2.434 2.261 2.055 1.91 1.791 1.617 1.475 1.317 1.239 1.099 0.959 0.82 0.75 0.559 0.386 0.248 0.098 -0.207 -0.359 -0.548 -0.764 -0.967 -1.231 -1.626 -2.78 -8 ,767 ,TETRA ,17606314,Sun Nov 28 19:59:57 CET,Sun Nov 28 22:15:26 CET,0.0 0.66 0.909 1.101 1.257 1.403 1.543 1.651 1.834 1.919 1.999 2.05 2.209 2.283 2.433 2.565 2.704 2.773 2.904 3.025 3.18 3.281 3.381 3.532 3.682 3.817 3.944 4.066 4.227 4.39 4.555 4.756 4.939 5.103 5.308 5.549 5.767 5.997 6.261 6.56 6.856 7.181 7.557 7.923 8.334 8.728 9.153 9.632 10.126 10.551 10.747 10.52 10.008 9.323 8.664 8.09 7.564 7.083 6.672 6.256 5.907 5.584 5.261 4.957 4.667 4.406 4.124 3.883 3.693 3.484 3.255 3.044 2.831 2.629 2.467 2.299 2.141 1.976 1.782 1.643 1.497 1.277 1.135 0.969 0.873 0.663 0.457 0.272 0.173 -0.034 -0.169 -0.291 -0.434 -0.753 -0.928 -1.103 -1.303 -1.543 -1.851 -2.346 -4.052 -9 ,12219 ,TETRA ,17606315,Sun Nov 28 19:59:52 CET,Sun Nov 28 22:14:41 CET,0.0 0.463 0.726 0.946 1.156 1.328 1.458 1.569 1.784 1.874 1.949 2.017 2.204 2.285 2.442 2.595 2.739 2.809 2.938 3.051 3.207 3.303 3.393 3.541 3.695 3.837 3.962 4.073 4.222 4.371 4.531 4.747 4.929 5.092 5.272 5.456 5.651 5.852 6.042 6.24 6.449 6.686 6.942 7.191 7.485 7.822 8.179 8.548 8.896 9.166 9.342 9.118 8.73 8.326 7.845 7.358 6.963 6.594 6.241 5.828 5.491 5.216 4.948 4.678 4.431 4.22 3.963 3.726 3.528 3.316 3.106 2.93 2.741 2.543 2.378 2.208 2.024 1.831 1.63 1.472 1.313 1.079 0.903 0.727 0.643 0.474 0.271 0.035 -0.082 -0.298 -0.464 -0.598 -0.762 -1.17 -1.372 -1.592 -1.835 -2.095 -2.387 -2.801 -4.327 -10 ,8446 ,TETRA ,17606316,Sun Nov 28 20:00:22 CET,Sun Nov 28 22:12:49 CET,0.0 0.215 0.38 0.496 0.605 0.703 0.805 0.912 1.099 1.184 1.267 1.313 1.47 1.545 1.686 1.799 1.897 1.946 2.05 2.151 2.293 2.385 2.481 2.617 2.745 2.862 2.974 3.092 3.233 3.378 3.535 3.695 3.838 3.993 4.17 4.365 4.562 4.799 5.051 5.295 5.533 5.794 6.116 6.442 6.793 7.118 7.467 7.882 8.345 8.861 9.261 9.434 9.422 9.228 8.928 8.555 8.162 7.778 7.429 7.073 6.77 6.483 6.184 5.891 5.627 5.389 5.151 4.95 4.76 4.564 4.34 4.141 3.946 3.741 3.577 3.41 3.243 3.076 2.898 2.76 2.616 2.401 2.258 2.098 2.006 1.815 1.621 1.42 1.306 1.089 0.929 0.795 0.649 0.324 0.145 -0.049 -0.273 -0.523 -0.829 -1.291 -3.192 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_15_14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_15_14.txt deleted file mode 100644 index f1e04e36..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_15_14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19799 ,TETRA ,17606317,Sun Nov 28 20:00:23 CET,Sun Nov 28 21:48:18 CET,0.0 0.563 0.802 0.969 1.127 1.254 1.358 1.461 1.66 1.77 1.872 1.943 2.105 2.186 2.35 2.497 2.629 2.694 2.835 2.969 3.135 3.237 3.334 3.484 3.633 3.759 3.88 4.004 4.161 4.316 4.473 4.659 4.833 5.008 5.219 5.442 5.651 5.894 6.151 6.427 6.722 7.059 7.452 7.833 8.275 8.744 9.256 9.821 10.421 11.04 11.51 11.44 11.119 10.768 10.343 9.888 9.468 9.05 8.661 8.261 7.908 7.593 7.283 6.98 6.67 6.361 6.053 5.789 5.558 5.307 5.028 4.768 4.488 4.213 4.001 3.784 3.564 3.334 3.088 2.912 2.728 2.428 2.205 1.971 1.851 1.567 1.242 0.914 0.747 0.489 0.187 -0.005 -0.21 -0.689 -0.964 -1.263 -1.626 -2.093 -2.641 -3.457 -7.453 -2 ,22127 ,TETRA ,17606318,Sun Nov 28 20:00:20 CET,Sun Nov 28 21:48:08 CET,0.0 0.605 0.848 1.049 1.229 1.377 1.499 1.609 1.807 1.896 1.977 2.046 2.206 2.277 2.429 2.557 2.671 2.727 2.832 2.936 3.085 3.183 3.282 3.429 3.564 3.699 3.828 3.946 4.112 4.275 4.425 4.617 4.815 5.004 5.215 5.428 5.64 5.885 6.134 6.401 6.673 6.972 7.36 7.755 8.17 8.598 9.109 9.698 10.328 10.954 11.452 11.516 11.268 10.841 10.402 9.98 9.549 9.102 8.691 8.273 7.891 7.55 7.233 6.909 6.589 6.278 5.952 5.664 5.398 5.118 4.838 4.605 4.346 4.06 3.848 3.64 3.423 3.204 2.971 2.797 2.61 2.309 2.079 1.811 1.673 1.387 1.087 0.754 0.571 0.315 0.006 -0.222 -0.495 -1.058 -1.364 -1.73 -2.147 -2.606 -3.175 -4.034 -9.009 -3 ,4269 ,TETRA ,17606319,Sun Nov 28 20:00:22 CET,Sun Nov 28 21:48:27 CET,0.0 0.89 1.204 1.368 1.512 1.667 1.795 1.906 2.113 2.2 2.283 2.364 2.531 2.613 2.766 2.897 3.025 3.085 3.196 3.311 3.48 3.585 3.687 3.829 3.958 4.095 4.236 4.366 4.539 4.705 4.855 5.022 5.188 5.37 5.588 5.82 6.026 6.251 6.497 6.768 7.059 7.383 7.751 8.109 8.511 8.943 9.445 9.992 10.56 11.131 11.631 11.801 11.566 11.183 10.784 10.353 9.961 9.593 9.215 8.823 8.479 8.125 7.776 7.439 7.128 6.841 6.525 6.248 5.981 5.679 5.38 5.126 4.88 4.641 4.447 4.225 3.979 3.728 3.464 3.267 3.062 2.756 2.536 2.321 2.209 1.957 1.683 1.375 1.213 0.968 0.657 0.44 0.208 -0.328 -0.63 -0.948 -1.318 -1.769 -2.374 -3.354 -7.551 -4 ,10346 ,TETRA ,17606320,Sun Nov 28 20:00:24 CET,Sun Nov 28 21:48:14 CET,0.0 0.536 0.766 0.954 1.131 1.29 1.415 1.513 1.688 1.769 1.85 1.913 2.069 2.134 2.268 2.394 2.517 2.583 2.715 2.838 3.008 3.115 3.226 3.391 3.533 3.666 3.8 3.93 4.085 4.248 4.421 4.612 4.789 4.973 5.211 5.479 5.716 5.966 6.238 6.513 6.805 7.152 7.557 7.959 8.414 8.894 9.435 10.029 10.664 11.308 11.846 11.92 11.688 11.347 10.992 10.579 10.19 9.808 9.447 9.061 8.693 8.358 8.043 7.738 7.442 7.169 6.868 6.584 6.341 6.08 5.804 5.572 5.306 5.023 4.812 4.59 4.368 4.149 3.91 3.724 3.517 3.184 2.945 2.697 2.573 2.309 2.013 1.694 1.524 1.273 0.963 0.746 0.499 -0.062 -0.376 -0.734 -1.157 -1.662 -2.307 -3.182 -6.89 -5 ,22737 ,TETRA ,17606321,Sun Nov 28 20:00:22 CET,Sun Nov 28 21:48:08 CET,0.0 0.52 0.735 0.922 1.07 1.186 1.297 1.415 1.632 1.722 1.805 1.867 2.024 2.094 2.227 2.359 2.496 2.56 2.682 2.804 2.981 3.094 3.196 3.336 3.479 3.624 3.78 3.922 4.086 4.246 4.406 4.609 4.801 4.974 5.175 5.398 5.612 5.86 6.112 6.391 6.697 7.016 7.392 7.773 8.195 8.636 9.127 9.709 10.386 11.039 11.518 11.495 11.158 10.712 10.264 9.824 9.398 8.974 8.593 8.22 7.881 7.543 7.199 6.879 6.583 6.308 6.014 5.746 5.51 5.241 4.947 4.718 4.491 4.234 4.028 3.803 3.548 3.278 3.0 2.815 2.617 2.299 2.079 1.862 1.751 1.504 1.236 0.929 0.761 0.507 0.193 -0.01 -0.21 -0.711 -1.004 -1.329 -1.701 -2.074 -2.57 -3.431 -7.626 -6 ,13554 ,TETRA ,17606322,Sun Nov 28 20:00:21 CET,Sun Nov 28 21:48:25 CET,0.0 0.49 0.698 0.854 0.992 1.104 1.192 1.273 1.425 1.506 1.59 1.642 1.801 1.874 2.027 2.169 2.298 2.356 2.458 2.563 2.711 2.8 2.886 3.011 3.132 3.248 3.366 3.481 3.624 3.764 3.904 4.07 4.227 4.388 4.579 4.788 4.993 5.207 5.437 5.706 5.993 6.32 6.717 7.086 7.508 7.98 8.489 9.025 9.623 10.222 10.6 10.584 10.258 9.843 9.469 9.032 8.563 8.13 7.742 7.337 6.971 6.646 6.317 5.984 5.69 5.42 5.119 4.85 4.609 4.357 4.103 3.883 3.654 3.423 3.235 3.04 2.846 2.631 2.392 2.214 2.024 1.737 1.539 1.325 1.208 0.971 0.739 0.476 0.33 0.111 -0.14 -0.319 -0.496 -0.913 -1.174 -1.46 -1.746 -2.114 -2.652 -3.331 -6.358 -7 ,28138 ,TETRA ,17606323,Sun Nov 28 20:00:22 CET,Sun Nov 28 21:48:07 CET,0.0 0.439 0.589 0.7 0.817 0.93 1.03 1.129 1.312 1.393 1.466 1.518 1.682 1.754 1.886 2.017 2.147 2.206 2.32 2.43 2.592 2.704 2.816 2.983 3.149 3.306 3.456 3.603 3.788 3.975 4.16 4.364 4.548 4.731 4.959 5.22 5.468 5.744 6.039 6.328 6.605 6.921 7.294 7.648 8.061 8.534 9.056 9.596 10.19 10.825 11.232 11.249 11.037 10.666 10.272 9.856 9.44 9.016 8.644 8.262 7.914 7.584 7.241 6.907 6.591 6.293 5.99 5.709 5.452 5.191 4.928 4.708 4.463 4.213 4.014 3.787 3.549 3.301 3.025 2.832 2.635 2.332 2.123 1.877 1.744 1.5 1.255 0.981 0.828 0.606 0.389 0.201 -0.003 -0.462 -0.729 -0.994 -1.253 -1.599 -2.039 -2.664 -4.846 -8 ,12416 ,TETRA ,17606324,Sun Nov 28 20:00:25 CET,Sun Nov 28 21:48:27 CET,0.0 0.559 0.843 1.105 1.302 1.469 1.613 1.756 2.052 2.178 2.279 2.363 2.53 2.614 2.777 2.931 3.076 3.139 3.262 3.393 3.579 3.688 3.794 3.94 4.086 4.235 4.37 4.499 4.673 4.834 4.977 5.15 5.32 5.475 5.66 5.88 6.096 6.348 6.623 6.901 7.168 7.462 7.816 8.176 8.598 9.047 9.547 10.084 10.63 11.215 11.698 11.724 11.477 11.086 10.63 10.159 9.725 9.315 8.951 8.584 8.236 7.908 7.571 7.252 6.964 6.672 6.354 6.086 5.857 5.595 5.299 5.049 4.8 4.529 4.305 4.084 3.857 3.627 3.385 3.22 3.055 2.778 2.589 2.395 2.281 2.04 1.806 1.556 1.417 1.191 0.949 0.775 0.588 0.155 -0.11 -0.402 -0.725 -1.134 -1.671 -2.383 -7.02 -9 ,5144 ,TETRA ,17606325,Sun Nov 28 20:00:27 CET,Sun Nov 28 21:48:08 CET,0.0 0.37 0.526 0.645 0.744 0.845 0.932 1.013 1.175 1.241 1.3 1.326 1.468 1.523 1.631 1.744 1.85 1.9 1.989 2.071 2.214 2.312 2.408 2.556 2.705 2.841 2.961 3.079 3.242 3.398 3.549 3.738 3.911 4.085 4.291 4.523 4.742 4.979 5.242 5.5 5.784 6.108 6.441 6.799 7.248 7.726 8.27 8.852 9.52 10.198 10.668 10.721 10.496 10.178 9.839 9.406 8.951 8.497 8.115 7.732 7.36 7.025 6.697 6.367 6.059 5.767 5.43 5.13 4.868 4.583 4.301 4.081 3.832 3.55 3.323 3.093 2.858 2.601 2.346 2.175 1.982 1.668 1.448 1.185 1.057 0.813 0.526 0.227 0.069 -0.181 -0.475 -0.674 -0.902 -1.452 -1.785 -2.131 -2.521 -2.992 -3.607 -4.543 -8.185 -10 ,16354 ,TETRA ,17606326,Sun Nov 28 20:00:21 CET,Sun Nov 28 21:47:49 CET,0.0 0.481 0.692 0.877 1.038 1.192 1.33 1.438 1.623 1.715 1.802 1.883 2.052 2.126 2.265 2.406 2.539 2.602 2.73 2.845 3.012 3.116 3.215 3.362 3.494 3.626 3.762 3.891 4.05 4.192 4.334 4.528 4.717 4.878 5.058 5.275 5.488 5.726 5.986 6.258 6.544 6.873 7.255 7.635 8.08 8.549 9.042 9.593 10.182 10.628 11.05 11.153 10.832 10.445 10.058 9.651 9.235 8.776 8.34 7.895 7.499 7.168 6.852 6.521 6.208 5.943 5.643 5.353 5.105 4.838 4.56 4.328 4.082 3.812 3.585 3.344 3.091 2.837 2.562 2.352 2.138 1.812 1.576 1.32 1.191 0.928 0.628 0.301 0.129 -0.12 -0.377 -0.546 -0.726 -1.169 -1.46 -1.817 -2.194 -2.643 -3.194 -3.963 -9.219 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_15_16.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_15_16.txt deleted file mode 100644 index ab07ffdd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_15_16.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14054 ,TETRA ,17606327,Sun Nov 28 20:00:24 CET,Sun Nov 28 21:49:12 CET,0.0 0.701 0.91 1.051 1.172 1.279 1.378 1.467 1.627 1.706 1.787 1.832 1.98 2.039 2.148 2.253 2.351 2.402 2.498 2.578 2.702 2.785 2.862 2.986 3.115 3.234 3.339 3.436 3.565 3.688 3.808 3.954 4.097 4.236 4.389 4.561 4.72 4.876 5.048 5.24 5.435 5.653 5.924 6.174 6.418 6.687 6.989 7.288 7.516 7.6 7.488 6.922 6.263 5.715 5.192 4.66 4.146 3.644 3.184 2.704 2.302 1.939 1.585 1.268 0.951 0.631 0.303 0.016 -0.231 -0.481 -0.747 -0.97 -1.202 -1.441 -1.64 -1.858 -2.071 -2.299 -2.533 -2.686 -2.851 -3.145 -3.368 -3.599 -3.71 -3.931 -4.181 -4.444 -4.58 -4.803 -5.005 -5.161 -5.326 -5.699 -5.919 -6.152 -6.41 -6.731 -7.107 -7.613 -9.56 -2 ,23541 ,TETRA ,17606328,Sun Nov 28 20:00:24 CET,Sun Nov 28 21:49:04 CET,0.0 0.923 1.25 1.469 1.626 1.738 1.831 1.924 2.08 2.156 2.235 2.283 2.431 2.496 2.625 2.743 2.847 2.891 2.975 3.066 3.204 3.291 3.372 3.486 3.593 3.697 3.798 3.897 4.034 4.166 4.281 4.418 4.561 4.702 4.849 4.999 5.144 5.322 5.518 5.691 5.86 6.065 6.303 6.536 6.77 7.017 7.304 7.618 7.917 8.053 7.924 7.405 6.824 6.218 5.57 4.965 4.413 3.876 3.404 2.937 2.532 2.157 1.787 1.436 1.119 0.831 0.51 0.226 -0.015 -0.277 -0.561 -0.805 -1.055 -1.315 -1.52 -1.724 -1.932 -2.152 -2.389 -2.553 -2.724 -2.988 -3.177 -3.378 -3.477 -3.684 -3.912 -4.155 -4.289 -4.519 -4.745 -4.9 -5.057 -5.439 -5.638 -5.857 -6.148 -6.5 -6.898 -7.402 -9.122 -3 ,26652 ,TETRA ,17606329,Sun Nov 28 20:00:22 CET,Sun Nov 28 21:48:36 CET,0.0 0.662 0.83 0.985 1.129 1.26 1.376 1.478 1.671 1.756 1.835 1.893 2.045 2.104 2.227 2.357 2.475 2.522 2.604 2.681 2.807 2.894 2.976 3.092 3.212 3.328 3.435 3.537 3.67 3.797 3.911 4.043 4.179 4.314 4.468 4.641 4.81 4.986 5.161 5.341 5.528 5.725 5.954 6.21 6.503 6.797 7.11 7.4 7.683 7.947 7.986 7.59 7.021 6.416 5.803 5.172 4.604 4.08 3.616 3.16 2.766 2.402 2.055 1.729 1.402 1.101 0.804 0.541 0.288 0.022 -0.242 -0.474 -0.705 -0.923 -1.091 -1.273 -1.469 -1.671 -1.865 -2.001 -2.158 -2.405 -2.575 -2.753 -2.846 -3.039 -3.262 -3.491 -3.601 -3.805 -3.979 -4.115 -4.259 -4.589 -4.775 -4.966 -5.153 -5.385 -5.686 -6.11 -7.609 -4 ,23142 ,TETRA ,17606330,Sun Nov 28 20:01:50 CET,Sun Nov 28 21:50:38 CET,0.0 0.623 0.873 1.053 1.195 1.312 1.418 1.522 1.688 1.767 1.842 1.886 2.043 2.101 2.202 2.303 2.406 2.454 2.55 2.65 2.788 2.868 2.942 3.046 3.145 3.242 3.346 3.451 3.592 3.728 3.849 3.996 4.14 4.272 4.421 4.586 4.736 4.9 5.081 5.281 5.473 5.673 5.915 6.146 6.39 6.641 6.919 7.201 7.477 7.673 7.578 7.055 6.45 5.882 5.333 4.755 4.205 3.722 3.286 2.813 2.414 2.063 1.728 1.401 1.084 0.79 0.478 0.203 -0.052 -0.326 -0.604 -0.839 -1.078 -1.333 -1.541 -1.745 -1.958 -2.203 -2.457 -2.615 -2.769 -3.044 -3.234 -3.421 -3.523 -3.716 -3.907 -4.121 -4.244 -4.457 -4.632 -4.768 -4.921 -5.267 -5.446 -5.657 -5.91 -6.183 -6.513 -6.956 -8.732 -5 ,17233 ,TETRA ,17606331,Sun Nov 28 20:00:22 CET,Sun Nov 28 21:51:46 CET,0.0 0.347 0.464 0.571 0.662 0.741 0.814 0.883 1.024 1.095 1.164 1.203 1.347 1.407 1.52 1.623 1.72 1.768 1.871 1.973 2.116 2.205 2.289 2.403 2.511 2.616 2.724 2.826 2.942 3.059 3.178 3.314 3.458 3.599 3.748 3.915 4.078 4.255 4.443 4.628 4.806 5.007 5.249 5.491 5.774 6.086 6.393 6.668 6.911 7.025 6.875 6.344 5.714 5.11 4.519 3.951 3.426 2.933 2.496 2.027 1.626 1.279 0.933 0.587 0.256 -0.052 -0.356 -0.62 -0.867 -1.136 -1.414 -1.637 -1.866 -2.108 -2.298 -2.505 -2.723 -2.945 -3.173 -3.345 -3.537 -3.833 -4.042 -4.253 -4.362 -4.593 -4.844 -5.101 -5.231 -5.458 -5.683 -5.859 -6.037 -6.432 -6.651 -6.883 -7.141 -7.426 -7.749 -8.211 -9.566 -6 ,32433 ,TETRA ,17606332,Sun Nov 28 20:01:53 CET,Sun Nov 28 21:50:58 CET,0.0 0.514 0.752 0.935 1.096 1.236 1.364 1.469 1.623 1.695 1.766 1.811 1.967 2.03 2.149 2.253 2.359 2.411 2.497 2.578 2.699 2.783 2.865 2.988 3.113 3.224 3.331 3.437 3.57 3.7 3.818 3.962 4.105 4.23 4.378 4.539 4.688 4.86 5.033 5.225 5.448 5.683 5.944 6.197 6.46 6.765 7.079 7.344 7.6 7.811 7.795 7.348 6.739 6.093 5.474 4.879 4.346 3.854 3.391 2.915 2.499 2.121 1.771 1.449 1.144 0.852 0.537 0.254 -0.009 -0.289 -0.57 -0.799 -1.033 -1.262 -1.433 -1.626 -1.817 -2.011 -2.213 -2.353 -2.502 -2.732 -2.896 -3.071 -3.166 -3.377 -3.599 -3.821 -3.937 -4.148 -4.323 -4.462 -4.607 -4.95 -5.143 -5.351 -5.578 -5.847 -6.198 -6.7 -8.489 -7 ,26058 ,TETRA ,17606333,Sun Nov 28 20:00:21 CET,Sun Nov 28 21:31:59 CET,0.0 0.457 0.655 0.848 0.988 1.095 1.181 1.274 1.474 1.559 1.636 1.687 1.84 1.904 2.019 2.128 2.228 2.277 2.379 2.474 2.607 2.689 2.773 2.896 3.012 3.123 3.227 3.332 3.462 3.583 3.707 3.852 3.972 4.102 4.267 4.432 4.579 4.742 4.926 5.116 5.316 5.523 5.745 5.968 6.225 6.495 6.797 7.1 7.364 7.523 7.433 6.982 6.433 5.824 5.216 4.649 4.107 3.601 3.159 2.705 2.321 1.966 1.611 1.272 0.96 0.672 0.362 0.078 -0.168 -0.414 -0.67 -0.891 -1.124 -1.394 -1.62 -1.854 -2.097 -2.346 -2.615 -2.799 -2.99 -3.295 -3.507 -3.717 -3.825 -4.053 -4.288 -4.558 -4.7 -4.912 -5.113 -5.275 -5.447 -5.856 -6.083 -6.334 -6.604 -6.93 -7.338 -7.818 -9.437 -8 ,8609 ,TETRA ,17606334,Sun Nov 28 20:00:22 CET,Sun Nov 28 21:49:00 CET,0.0 0.405 0.58 0.741 0.868 0.979 1.086 1.174 1.341 1.419 1.49 1.539 1.696 1.754 1.863 1.978 2.085 2.131 2.224 2.32 2.452 2.539 2.622 2.74 2.856 2.975 3.09 3.196 3.326 3.451 3.567 3.706 3.838 3.976 4.143 4.298 4.451 4.629 4.809 5.009 5.211 5.416 5.66 5.891 6.161 6.463 6.758 7.036 7.251 7.313 7.149 6.644 6.0 5.354 4.77 4.226 3.71 3.21 2.758 2.294 1.867 1.486 1.128 0.79 0.479 0.192 -0.112 -0.404 -0.656 -0.917 -1.198 -1.441 -1.698 -1.974 -2.197 -2.426 -2.672 -2.922 -3.195 -3.383 -3.565 -3.866 -4.077 -4.3 -4.425 -4.684 -4.953 -5.242 -5.39 -5.631 -5.913 -6.109 -6.314 -6.765 -7.0 -7.261 -7.577 -7.936 -8.367 -8.892 -10.909 -9 ,28710 ,TETRA ,17606335,Sun Nov 28 20:00:24 CET,Sun Nov 28 21:49:00 CET,0.0 0.296 0.445 0.544 0.632 0.708 0.782 0.852 0.967 1.022 1.075 1.077 1.208 1.251 1.339 1.428 1.515 1.561 1.644 1.713 1.826 1.899 1.962 2.06 2.156 2.244 2.331 2.421 2.548 2.665 2.763 2.885 3.004 3.115 3.258 3.422 3.585 3.767 3.947 4.133 4.312 4.512 4.749 4.977 5.229 5.519 5.833 6.103 6.352 6.494 6.369 5.868 5.217 4.56 3.954 3.383 2.884 2.423 1.984 1.527 1.12 0.754 0.396 0.034 -0.306 -0.616 -0.949 -1.242 -1.496 -1.767 -2.039 -2.267 -2.511 -2.787 -3.005 -3.225 -3.471 -3.735 -3.99 -4.171 -4.365 -4.649 -4.841 -5.049 -5.157 -5.372 -5.601 -5.84 -5.966 -6.185 -6.404 -6.566 -6.731 -7.077 -7.262 -7.439 -7.649 -7.95 -8.354 -8.828 -10.558 -10 ,27110 ,TETRA ,17606336,Sun Nov 28 20:00:27 CET,Sun Nov 28 21:49:24 CET,0.0 0.546 0.832 0.981 1.094 1.201 1.293 1.389 1.567 1.635 1.699 1.742 1.893 1.955 2.081 2.194 2.298 2.346 2.43 2.517 2.648 2.734 2.823 2.942 3.047 3.16 3.265 3.355 3.464 3.58 3.705 3.842 3.961 4.084 4.227 4.384 4.544 4.715 4.891 5.08 5.285 5.521 5.786 6.027 6.297 6.592 6.87 7.113 7.345 7.524 7.449 7.042 6.485 5.822 5.169 4.569 4.037 3.526 3.062 2.596 2.206 1.842 1.486 1.148 0.823 0.53 0.223 -0.038 -0.269 -0.528 -0.797 -1.026 -1.265 -1.515 -1.724 -1.955 -2.201 -2.463 -2.723 -2.887 -3.048 -3.321 -3.523 -3.734 -3.843 -4.064 -4.295 -4.546 -4.678 -4.9 -5.116 -5.273 -5.433 -5.811 -6.027 -6.264 -6.557 -6.891 -7.298 -7.867 -9.888 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_16_14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_16_14.txt deleted file mode 100644 index 3a767c44..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_16_14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1597 ,TETRA ,17606337,Sun Nov 28 20:00:23 CET,Sun Nov 28 21:47:31 CET,0.0 0.562 0.728 0.862 1.004 1.124 1.209 1.297 1.484 1.564 1.626 1.656 1.811 1.882 2.021 2.154 2.278 2.34 2.467 2.598 2.761 2.856 2.958 3.102 3.238 3.38 3.526 3.657 3.824 3.988 4.146 4.333 4.512 4.673 4.843 5.056 5.268 5.489 5.734 5.977 6.218 6.505 6.832 7.153 7.541 7.959 8.4 8.881 9.445 9.999 10.516 10.864 10.962 10.911 10.774 10.602 10.434 10.25 10.067 9.892 9.721 9.548 9.392 9.234 9.068 8.906 8.737 8.585 8.448 8.305 8.164 8.049 7.928 7.809 7.715 7.603 7.471 7.352 7.238 7.159 7.082 6.955 6.86 6.756 6.699 6.583 6.454 6.307 6.234 6.08 5.987 5.899 5.809 5.615 5.471 5.302 5.129 4.913 4.643 4.255 2.39 -2 ,31949 ,TETRA ,17606338,Sun Nov 28 20:01:19 CET,Sun Nov 28 21:48:23 CET,0.0 0.574 0.848 1.049 1.243 1.398 1.518 1.63 1.827 1.917 2.018 2.124 2.29 2.362 2.511 2.671 2.823 2.893 3.018 3.134 3.308 3.42 3.524 3.661 3.783 3.909 4.035 4.156 4.32 4.475 4.622 4.803 4.969 5.126 5.312 5.534 5.747 5.975 6.209 6.453 6.71 7.009 7.351 7.655 8.001 8.389 8.852 9.377 9.974 10.623 11.296 11.625 11.66 11.628 11.528 11.38 11.226 11.057 10.868 10.674 10.509 10.349 10.202 10.058 9.923 9.78 9.625 9.496 9.374 9.248 9.116 9.003 8.885 8.753 8.642 8.528 8.4 8.266 8.139 8.051 7.961 7.799 7.669 7.545 7.477 7.334 7.207 7.049 6.951 6.789 6.714 6.622 6.52 6.309 6.19 6.021 5.845 5.652 5.402 5.079 2.462 -3 ,32655 ,TETRA ,17606339,Sun Nov 28 20:01:20 CET,Sun Nov 28 21:48:10 CET,0.0 0.28 0.484 0.666 0.817 0.938 1.033 1.122 1.316 1.416 1.515 1.584 1.733 1.797 1.927 2.054 2.162 2.214 2.312 2.409 2.556 2.643 2.732 2.86 2.98 3.089 3.197 3.308 3.454 3.598 3.748 3.931 4.102 4.276 4.477 4.703 4.915 5.14 5.385 5.647 5.923 6.22 6.545 6.866 7.229 7.61 8.065 8.576 9.152 9.737 10.291 10.636 10.701 10.658 10.552 10.402 10.243 10.081 9.911 9.725 9.56 9.379 9.195 9.038 8.876 8.723 8.562 8.407 8.285 8.175 8.053 7.926 7.788 7.663 7.565 7.459 7.349 7.223 7.083 6.991 6.883 6.714 6.603 6.477 6.413 6.286 6.151 5.996 5.924 5.769 5.645 5.537 5.435 5.206 5.064 4.916 4.754 4.572 4.329 3.973 1.83 -4 ,23358 ,TETRA ,17606340,Sun Nov 28 20:00:23 CET,Sun Nov 28 21:47:06 CET,0.0 0.808 1.067 1.263 1.418 1.555 1.681 1.801 2.0 2.097 2.194 2.278 2.445 2.522 2.669 2.811 2.943 3.01 3.145 3.271 3.445 3.555 3.664 3.823 3.981 4.121 4.242 4.375 4.561 4.734 4.893 5.067 5.25 5.439 5.648 5.882 6.104 6.337 6.604 6.896 7.191 7.525 7.91 8.291 8.725 9.177 9.669 10.201 10.804 11.531 12.387 12.862 12.915 12.849 12.761 12.641 12.51 12.372 12.229 12.073 11.938 11.806 11.662 11.518 11.386 11.25 11.111 10.987 10.864 10.749 10.612 10.49 10.37 10.237 10.125 10.004 9.881 9.746 9.602 9.504 9.398 9.242 9.128 8.998 8.931 8.797 8.64 8.476 8.396 8.237 8.134 8.044 7.958 7.713 7.581 7.423 7.21 6.963 6.66 6.239 4.218 -5 ,14039 ,TETRA ,17606341,Sun Nov 28 20:00:24 CET,Sun Nov 28 21:47:09 CET,0.0 1.019 1.308 1.509 1.691 1.846 1.968 2.076 2.274 2.363 2.453 2.54 2.693 2.764 2.918 3.056 3.193 3.258 3.376 3.49 3.662 3.772 3.876 4.036 4.185 4.317 4.447 4.575 4.726 4.864 5.009 5.191 5.365 5.532 5.713 5.909 6.103 6.322 6.554 6.78 7.014 7.32 7.697 8.042 8.432 8.857 9.316 9.837 10.441 11.099 11.7 11.938 11.987 11.904 11.73 11.557 11.394 11.24 11.083 10.897 10.723 10.553 10.392 10.228 10.062 9.915 9.748 9.592 9.461 9.32 9.175 9.048 8.915 8.776 8.659 8.534 8.409 8.291 8.156 8.059 7.97 7.826 7.716 7.608 7.551 7.426 7.283 7.125 7.052 6.906 6.811 6.708 6.608 6.368 6.231 6.09 5.935 5.743 5.482 5.109 3.343 -6 ,4859 ,TETRA ,17606342,Sun Nov 28 20:00:27 CET,Sun Nov 28 21:47:09 CET,0.0 0.875 1.183 1.426 1.598 1.746 1.88 1.981 2.178 2.267 2.35 2.447 2.622 2.705 2.845 2.978 3.106 3.167 3.288 3.407 3.575 3.689 3.792 3.927 4.057 4.175 4.289 4.412 4.576 4.731 4.877 5.044 5.2 5.355 5.549 5.779 5.986 6.217 6.464 6.71 6.964 7.244 7.567 7.899 8.261 8.639 9.095 9.598 10.158 10.734 11.28 11.578 11.597 11.512 11.402 11.265 11.112 10.917 10.732 10.566 10.401 10.243 10.084 9.908 9.732 9.577 9.418 9.283 9.175 9.051 8.902 8.777 8.661 8.529 8.417 8.299 8.168 8.025 7.866 7.764 7.665 7.508 7.393 7.261 7.194 7.06 6.908 6.733 6.639 6.472 6.348 6.248 6.145 5.897 5.765 5.607 5.407 5.169 4.893 4.543 3.162 -7 ,25568 ,TETRA ,17606343,Sun Nov 28 20:00:29 CET,Sun Nov 28 21:47:06 CET,0.0 0.323 0.475 0.598 0.73 0.847 0.942 1.029 1.188 1.272 1.359 1.429 1.581 1.64 1.76 1.88 1.993 2.047 2.163 2.279 2.434 2.531 2.63 2.767 2.901 3.037 3.163 3.284 3.439 3.587 3.733 3.907 4.072 4.236 4.417 4.61 4.801 5.009 5.243 5.512 5.793 6.105 6.473 6.834 7.261 7.724 8.226 8.803 9.419 10.05 10.72 11.1 11.185 11.14 11.031 10.857 10.688 10.534 10.385 10.232 10.08 9.927 9.778 9.641 9.504 9.38 9.256 9.122 9.002 8.888 8.746 8.622 8.489 8.339 8.232 8.124 7.999 7.878 7.768 7.682 7.584 7.44 7.32 7.18 7.113 6.977 6.825 6.667 6.586 6.431 6.33 6.227 6.108 5.841 5.703 5.554 5.358 5.083 4.732 4.186 0.867 -8 ,12348 ,TETRA ,17606344,Sun Nov 28 20:00:23 CET,Sun Nov 28 21:49:03 CET,0.0 0.599 0.87 1.108 1.282 1.392 1.514 1.634 1.828 1.916 2.006 2.091 2.252 2.327 2.474 2.619 2.764 2.825 2.947 3.076 3.253 3.358 3.453 3.594 3.737 3.867 3.994 4.113 4.262 4.407 4.552 4.744 4.923 5.091 5.272 5.46 5.651 5.852 6.068 6.319 6.587 6.869 7.187 7.511 7.878 8.279 8.734 9.236 9.796 10.464 11.183 11.561 11.646 11.614 11.485 11.296 11.121 10.963 10.823 10.646 10.487 10.347 10.194 10.041 9.887 9.734 9.574 9.436 9.309 9.168 9.028 8.891 8.739 8.6 8.481 8.353 8.232 8.115 7.985 7.882 7.774 7.599 7.467 7.323 7.249 7.109 6.968 6.793 6.703 6.539 6.417 6.313 6.202 5.932 5.776 5.62 5.422 5.16 4.818 4.37 2.058 -9 ,4832 ,TETRA ,17606345,Sun Nov 28 20:01:19 CET,Sun Nov 28 21:48:32 CET,0.0 0.621 0.853 1.051 1.215 1.352 1.478 1.593 1.797 1.89 1.986 2.104 2.278 2.362 2.536 2.692 2.812 2.868 2.994 3.112 3.281 3.382 3.474 3.608 3.739 3.869 3.991 4.111 4.275 4.429 4.568 4.732 4.891 5.059 5.251 5.461 5.668 5.903 6.153 6.401 6.67 6.978 7.326 7.655 8.021 8.422 8.866 9.406 10.04 10.677 11.369 11.77 11.815 11.723 11.573 11.415 11.27 11.115 10.965 10.798 10.647 10.478 10.298 10.147 10.001 9.844 9.679 9.55 9.447 9.327 9.19 9.079 8.956 8.826 8.731 8.627 8.509 8.385 8.271 8.187 8.09 7.955 7.866 7.768 7.715 7.601 7.48 7.35 7.28 7.128 7.029 6.937 6.825 6.578 6.467 6.344 6.186 5.984 5.729 5.311 3.749 -10 ,10869 ,TETRA ,17606346,Sun Nov 28 20:01:22 CET,Sun Nov 28 21:48:10 CET,0.0 0.614 0.878 1.057 1.227 1.4 1.544 1.663 1.881 1.982 2.077 2.176 2.346 2.43 2.591 2.747 2.887 2.949 3.076 3.206 3.387 3.495 3.6 3.758 3.906 4.047 4.177 4.301 4.46 4.616 4.769 4.946 5.109 5.268 5.454 5.661 5.855 6.07 6.315 6.566 6.824 7.124 7.471 7.819 8.215 8.661 9.158 9.694 10.254 10.845 11.456 11.678 11.643 11.599 11.527 11.39 11.233 11.034 10.853 10.68 10.491 10.307 10.148 9.986 9.815 9.663 9.509 9.367 9.238 9.1 8.951 8.829 8.697 8.541 8.416 8.294 8.173 8.06 7.938 7.847 7.754 7.593 7.461 7.323 7.26 7.142 7.015 6.865 6.777 6.608 6.497 6.397 6.293 6.057 5.91 5.739 5.542 5.305 5.007 4.563 2.69 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_17_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_17_15.txt deleted file mode 100644 index 7c93404e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_17_15.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27346 ,TETRA ,17606347,Sun Nov 28 20:01:19 CET,Sun Nov 28 21:50:52 CET,0.0 1.306 1.731 2.059 2.34 2.57 2.757 2.923 3.227 3.375 3.515 3.662 3.893 4.013 4.233 4.449 4.653 4.749 4.939 5.119 5.363 5.523 5.69 5.936 6.164 6.377 6.587 6.795 7.054 7.314 7.568 7.865 8.147 8.411 8.732 9.103 9.458 9.842 10.264 10.723 11.207 11.765 12.434 13.085 13.839 14.687 15.657 16.75 17.981 19.372 20.951 22.143 22.848 23.25 23.473 23.588 23.628 23.632 23.596 23.533 23.463 23.385 23.301 23.213 23.13 23.044 22.946 22.86 22.789 22.712 22.62 22.532 22.438 22.356 22.295 22.238 22.184 22.12 22.05 21.996 21.94 21.845 21.778 21.719 21.686 21.605 21.52 21.44 21.396 21.259 21.264 21.21 21.137 20.934 20.818 20.696 20.549 20.405 20.242 20.002 19.21 -2 ,1592 ,TETRA ,17606348,Sun Nov 28 20:01:21 CET,Sun Nov 28 21:50:25 CET,0.0 1.363 1.754 2.024 2.253 2.476 2.666 2.837 3.157 3.304 3.45 3.617 3.851 3.965 4.181 4.404 4.617 4.715 4.9 5.078 5.345 5.524 5.701 5.946 6.18 6.419 6.644 6.86 7.149 7.418 7.667 7.994 8.326 8.629 8.97 9.348 9.694 10.088 10.545 11.019 11.504 12.046 12.674 13.288 13.999 14.806 15.732 16.765 17.97 19.379 21.048 22.388 23.035 23.382 23.546 23.602 23.641 23.634 23.607 23.562 23.509 23.463 23.395 23.298 23.191 23.101 23.015 22.929 22.845 22.765 22.68 22.601 22.523 22.444 22.387 22.333 22.264 22.196 22.126 22.079 22.029 21.933 21.863 21.783 21.747 21.683 21.604 21.521 21.477 21.337 21.329 21.278 21.223 21.11 21.044 20.961 20.851 20.745 20.616 20.445 19.992 -3 ,7898 ,TETRA ,17606349,Sun Nov 28 20:01:23 CET,Sun Nov 28 21:50:53 CET,0.0 1.873 2.406 2.802 3.142 3.434 3.706 3.944 4.339 4.511 4.691 4.948 5.21 5.364 5.674 5.96 6.231 6.363 6.614 6.855 7.2 7.416 7.623 7.908 8.153 8.38 8.601 8.803 9.066 9.32 9.568 9.882 10.188 10.491 10.843 11.23 11.606 12.016 12.446 12.919 13.414 13.956 14.591 15.23 15.967 16.777 17.745 18.854 20.12 21.541 23.11 24.263 24.902 25.214 25.343 25.385 25.382 25.35 25.301 25.254 25.187 25.106 25.044 24.985 24.913 24.848 24.777 24.695 24.613 24.529 24.435 24.346 24.245 24.131 24.044 23.951 23.847 23.75 23.654 23.589 23.521 23.405 23.325 23.246 23.205 23.111 23.002 22.881 22.828 22.694 22.679 22.604 22.52 22.324 22.214 22.114 22.015 21.883 21.702 21.443 20.546 -4 ,16894 ,TETRA ,17606350,Sun Nov 28 20:01:24 CET,Sun Nov 28 21:50:31 CET,0.0 1.14 1.589 1.954 2.251 2.495 2.712 2.91 3.275 3.445 3.613 3.821 4.07 4.205 4.465 4.719 4.948 5.059 5.278 5.485 5.771 5.958 6.138 6.396 6.637 6.866 7.094 7.32 7.621 7.899 8.156 8.472 8.794 9.117 9.482 9.869 10.232 10.63 11.061 11.527 12.02 12.583 13.236 13.878 14.616 15.433 16.4 17.474 18.676 20.096 21.76 23.012 23.599 23.924 24.125 24.235 24.265 24.231 24.177 24.101 24.033 23.955 23.86 23.772 23.686 23.597 23.494 23.394 23.304 23.203 23.102 23.024 22.939 22.858 22.788 22.712 22.632 22.536 22.432 22.365 22.298 22.2 22.13 22.047 22.003 21.921 21.842 21.767 21.724 21.579 21.531 21.462 21.401 21.237 21.143 21.055 20.949 20.838 20.719 20.55 20.045 -5 ,27699 ,TETRA ,17606351,Sun Nov 28 20:01:19 CET,Sun Nov 28 21:50:25 CET,0.0 1.017 1.407 1.677 1.909 2.116 2.307 2.491 2.83 2.975 3.105 3.261 3.489 3.604 3.825 4.032 4.241 4.345 4.537 4.72 4.989 5.169 5.351 5.606 5.835 6.063 6.283 6.502 6.787 7.056 7.323 7.645 7.959 8.268 8.616 8.997 9.363 9.773 10.221 10.689 11.162 11.696 12.339 12.992 13.755 14.576 15.524 16.606 17.859 19.286 20.912 22.247 22.963 23.316 23.505 23.567 23.554 23.528 23.503 23.449 23.378 23.314 23.229 23.133 23.049 22.975 22.884 22.808 22.753 22.679 22.594 22.524 22.442 22.344 22.266 22.188 22.107 22.015 21.915 21.852 21.792 21.697 21.625 21.543 21.503 21.425 21.334 21.23 21.171 21.026 21.001 20.938 20.866 20.667 20.551 20.442 20.324 20.171 19.984 19.703 18.749 -6 ,10818 ,TETRA ,17606352,Sun Nov 28 20:01:21 CET,Sun Nov 28 21:50:24 CET,0.0 1.333 1.824 2.181 2.48 2.741 2.98 3.193 3.565 3.728 3.877 4.042 4.288 4.433 4.705 4.958 5.192 5.306 5.521 5.722 6.019 6.204 6.383 6.653 6.902 7.135 7.366 7.592 7.882 8.153 8.41 8.728 9.062 9.383 9.728 10.12 10.481 10.871 11.301 11.774 12.266 12.805 13.44 14.078 14.799 15.607 16.556 17.604 18.837 20.219 21.787 23.036 23.729 24.155 24.431 24.551 24.589 24.574 24.53 24.461 24.38 24.309 24.238 24.168 24.085 24.006 23.923 23.855 23.785 23.698 23.616 23.552 23.484 23.407 23.345 23.265 23.167 23.058 22.943 22.874 22.805 22.684 22.592 22.506 22.465 22.382 22.288 22.183 22.128 21.99 21.986 21.936 21.875 21.725 21.647 21.561 21.467 21.351 21.21 21.006 20.387 -7 ,30000 ,TETRA ,17606353,Sun Nov 28 20:01:22 CET,Sun Nov 28 21:51:16 CET,0.0 1.496 2.069 2.514 2.847 3.108 3.331 3.523 3.878 4.048 4.207 4.397 4.651 4.82 5.145 5.422 5.659 5.775 6.011 6.231 6.525 6.709 6.882 7.137 7.394 7.651 7.907 8.143 8.422 8.702 8.97 9.294 9.63 9.939 10.28 10.659 11.039 11.47 11.904 12.345 12.803 13.346 14.007 14.655 15.397 16.215 17.15 18.197 19.422 20.863 22.619 24.025 24.73 25.079 25.263 25.367 25.433 25.473 25.472 25.436 25.367 25.277 25.202 25.15 25.092 25.021 24.93 24.857 24.798 24.723 24.656 24.599 24.531 24.444 24.368 24.299 24.236 24.168 24.096 24.044 23.984 23.89 23.821 23.751 23.717 23.641 23.565 23.479 23.427 23.288 23.273 23.218 23.152 22.988 22.916 22.836 22.74 22.623 22.476 22.327 21.624 -8 ,13701 ,TETRA ,17606354,Sun Nov 28 20:01:25 CET,Sun Nov 28 21:50:24 CET,0.0 1.287 1.814 2.238 2.57 2.824 3.077 3.327 3.745 3.93 4.105 4.343 4.605 4.744 5.025 5.281 5.493 5.593 5.797 5.999 6.305 6.501 6.679 6.929 7.179 7.439 7.691 7.92 8.204 8.488 8.758 9.079 9.397 9.712 10.084 10.487 10.86 11.27 11.71 12.168 12.643 13.173 13.797 14.455 15.219 16.032 16.979 18.068 19.31 20.731 22.444 23.813 24.488 24.896 25.193 25.324 25.362 25.352 25.313 25.276 25.215 25.144 25.074 25.008 24.948 24.875 24.773 24.686 24.616 24.539 24.467 24.404 24.327 24.25 24.194 24.136 24.075 24.012 23.943 23.892 23.833 23.736 23.673 23.606 23.571 23.497 23.403 23.301 23.254 23.113 23.104 23.048 22.992 22.879 22.801 22.715 22.623 22.505 22.359 22.115 21.456 -9 ,23735 ,TETRA ,17606355,Sun Nov 28 20:01:20 CET,Sun Nov 28 21:50:27 CET,0.0 1.358 1.785 2.109 2.398 2.686 2.965 3.21 3.643 3.853 4.042 4.241 4.485 4.628 4.895 5.144 5.384 5.499 5.709 5.908 6.192 6.38 6.567 6.823 7.062 7.305 7.562 7.798 8.088 8.365 8.629 8.939 9.259 9.579 9.921 10.297 10.646 11.028 11.457 11.926 12.42 12.957 13.59 14.213 14.925 15.749 16.729 17.816 19.091 20.567 22.279 23.577 24.222 24.561 24.769 24.893 24.929 24.921 24.913 24.85 24.754 24.694 24.623 24.547 24.486 24.413 24.337 24.274 24.212 24.138 24.052 23.983 23.908 23.824 23.751 23.676 23.608 23.529 23.427 23.351 23.27 23.151 23.078 22.995 22.95 22.856 22.753 22.651 22.598 22.444 22.402 22.326 22.239 22.043 21.943 21.837 21.706 21.565 21.371 21.135 20.433 -10 ,24691 ,TETRA ,17606356,Sun Nov 28 20:01:24 CET,Sun Nov 28 21:50:35 CET,0.0 1.566 2.044 2.387 2.666 2.9 3.112 3.308 3.656 3.823 3.99 4.185 4.434 4.573 4.837 5.089 5.322 5.436 5.657 5.868 6.17 6.369 6.566 6.855 7.133 7.398 7.662 7.908 8.202 8.474 8.748 9.078 9.386 9.684 10.026 10.401 10.761 11.16 11.582 12.031 12.501 13.019 13.654 14.312 15.043 15.863 16.826 17.895 19.135 20.574 22.215 23.532 24.244 24.621 24.831 24.966 25.021 25.004 24.974 24.949 24.91 24.845 24.757 24.667 24.591 24.516 24.423 24.342 24.274 24.193 24.085 23.996 23.905 23.8 23.719 23.642 23.557 23.467 23.38 23.314 23.242 23.134 23.059 22.979 22.931 22.831 22.738 22.634 22.572 22.423 22.384 22.308 22.221 22.023 21.906 21.776 21.621 21.448 21.252 21.001 20.206 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_18_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_18_15.txt deleted file mode 100644 index 87d8f2b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_18_15.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28975 ,KEBNE ,17027666,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:17:53 CET,0.0 1.311 1.755 2.106 2.419 2.695 2.949 3.185 3.602 3.8 3.988 4.205 4.45 4.593 4.862 5.123 5.373 5.481 5.673 5.859 6.145 6.335 6.505 6.742 6.968 7.195 7.432 7.67 7.968 8.256 8.53 8.822 9.097 9.365 9.669 10.015 10.346 10.71 11.102 11.499 11.93 12.434 12.999 13.548 14.189 14.912 15.736 16.655 17.684 18.859 20.201 21.168 21.633 21.829 21.871 21.85 21.803 21.718 21.618 21.51 21.405 21.297 21.199 21.107 21.005 20.897 20.764 20.634 20.523 20.418 20.315 20.227 20.134 20.041 19.963 19.873 19.781 19.686 19.588 19.517 19.432 19.289 19.198 19.113 19.069 18.963 18.844 18.726 18.667 18.509 18.44 18.362 18.279 18.1 17.998 17.885 17.758 17.601 17.396 17.135 16.667 -2 ,15162 ,KEBNE ,17027667,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:17:51 CET,0.0 1.811 2.323 2.708 3.032 3.303 3.559 3.804 4.235 4.428 4.616 4.874 5.134 5.269 5.515 5.755 5.975 6.087 6.306 6.497 6.761 6.936 7.108 7.348 7.571 7.781 7.986 8.19 8.442 8.691 8.949 9.284 9.605 9.911 10.267 10.643 10.978 11.343 11.733 12.151 12.601 13.085 13.637 14.194 14.859 15.597 16.416 17.327 18.365 19.537 20.877 21.77 22.154 22.305 22.363 22.369 22.323 22.257 22.184 22.058 21.933 21.821 21.707 21.607 21.496 21.383 21.266 21.154 21.058 20.97 20.873 20.793 20.705 20.599 20.514 20.426 20.347 20.271 20.184 20.118 20.047 19.935 19.853 19.773 19.731 19.638 19.534 19.422 19.357 19.207 19.154 19.085 19.028 18.879 18.787 18.695 18.599 18.48 18.335 18.192 17.618 -3 ,4458 ,KEBNE ,17027668,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:17:43 CET,0.0 1.524 2.05 2.436 2.763 3.038 3.29 3.53 3.96 4.138 4.309 4.553 4.815 4.974 5.261 5.516 5.751 5.868 6.114 6.333 6.603 6.779 6.946 7.185 7.423 7.647 7.868 8.083 8.36 8.634 8.897 9.195 9.47 9.741 10.048 10.394 10.758 11.147 11.526 11.936 12.357 12.841 13.416 13.975 14.619 15.338 16.168 17.069 18.075 19.244 20.565 21.508 21.998 22.209 22.247 22.243 22.211 22.145 22.064 21.955 21.828 21.698 21.584 21.484 21.385 21.297 21.198 21.106 21.015 20.912 20.81 20.715 20.614 20.509 20.424 20.336 20.244 20.148 20.044 19.968 19.883 19.757 19.685 19.607 19.561 19.456 19.357 19.261 19.21 19.072 19.072 19.024 18.97 18.843 18.763 18.659 18.551 18.445 18.337 18.193 17.739 -4 ,2329 ,KEBNE ,17027669,Wed Dec 22 17:44:11 CET,Wed Dec 22 19:17:42 CET,0.0 1.161 1.563 1.909 2.208 2.455 2.702 2.944 3.316 3.467 3.611 3.79 4.024 4.156 4.4 4.636 4.88 5.008 5.245 5.445 5.712 5.88 6.064 6.351 6.615 6.867 7.1 7.303 7.559 7.811 8.059 8.361 8.644 8.906 9.209 9.562 9.901 10.264 10.654 11.066 11.489 11.957 12.52 13.095 13.736 14.431 15.245 16.147 17.16 18.356 19.715 20.71 21.188 21.393 21.441 21.402 21.348 21.282 21.192 21.098 20.991 20.87 20.752 20.653 20.562 20.444 20.308 20.198 20.095 19.992 19.887 19.792 19.692 19.591 19.513 19.42 19.326 19.238 19.126 19.047 18.979 18.881 18.818 18.742 18.702 18.627 18.538 18.443 18.398 18.262 18.246 18.187 18.135 18.006 17.937 17.88 17.802 17.715 17.626 17.509 16.929 -5 ,24589 ,KEBNE ,17027670,Wed Dec 22 17:44:11 CET,Wed Dec 22 19:19:39 CET,0.0 1.846 2.366 2.735 3.017 3.257 3.464 3.64 3.969 4.139 4.302 4.531 4.795 4.948 5.222 5.482 5.74 5.863 6.088 6.303 6.607 6.792 6.963 7.211 7.45 7.671 7.875 8.08 8.369 8.643 8.894 9.19 9.47 9.744 10.06 10.403 10.722 11.073 11.459 11.867 12.285 12.756 13.316 13.878 14.528 15.241 16.042 16.957 17.99 19.164 20.509 21.414 21.827 22.008 22.063 22.086 22.039 21.935 21.836 21.732 21.638 21.539 21.435 21.339 21.239 21.142 21.045 20.935 20.824 20.718 20.605 20.508 20.409 20.313 20.241 20.162 20.076 19.991 19.896 19.819 19.74 19.628 19.547 19.46 19.412 19.314 19.207 19.089 19.04 18.909 18.888 18.816 18.746 18.619 18.547 18.456 18.353 18.244 18.093 17.935 17.673 -6 ,27071 ,KEBNE ,17027671,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:17:42 CET,0.0 1.876 2.39 2.811 3.154 3.439 3.691 3.931 4.355 4.541 4.719 4.953 5.209 5.351 5.598 5.825 6.04 6.142 6.34 6.524 6.787 6.96 7.123 7.365 7.598 7.829 8.069 8.308 8.61 8.9 9.194 9.529 9.82 10.097 10.417 10.773 11.103 11.477 11.883 12.293 12.725 13.205 13.756 14.303 14.928 15.615 16.397 17.262 18.248 19.378 20.67 21.565 21.967 22.228 22.382 22.411 22.382 22.328 22.281 22.225 22.139 22.047 21.964 21.881 21.8 21.714 21.62 21.53 21.451 21.375 21.289 21.224 21.15 21.072 21.008 20.928 20.852 20.769 20.683 20.629 20.567 20.471 20.406 20.33 20.292 20.218 20.137 20.043 19.995 19.859 19.855 19.807 19.753 19.636 19.562 19.485 19.411 19.318 19.164 18.948 18.575 -7 ,6107 ,KEBNE ,17027672,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:17:52 CET,0.0 1.325 1.737 2.054 2.319 2.544 2.764 2.969 3.314 3.476 3.637 3.84 4.075 4.192 4.427 4.668 4.902 5.014 5.223 5.417 5.702 5.881 6.039 6.276 6.52 6.745 6.958 7.168 7.426 7.674 7.918 8.202 8.472 8.738 9.049 9.399 9.731 10.093 10.481 10.891 11.339 11.842 12.387 12.925 13.54 14.229 15.049 15.947 16.971 18.13 19.358 20.212 20.633 20.85 20.934 20.948 20.914 20.847 20.773 20.681 20.62 20.558 20.476 20.386 20.293 20.212 20.126 20.046 19.968 19.886 19.784 19.698 19.621 19.542 19.48 19.41 19.327 19.242 19.156 19.103 19.043 18.932 18.861 18.79 18.754 18.677 18.588 18.494 18.442 18.302 18.292 18.23 18.163 18.024 17.951 17.879 17.797 17.693 17.538 17.325 16.694 -8 ,5612 ,KEBNE ,17027673,Wed Dec 22 17:44:11 CET,Wed Dec 22 19:19:12 CET,0.0 1.309 1.679 1.966 2.193 2.388 2.57 2.735 3.036 3.172 3.303 3.455 3.676 3.781 3.994 4.207 4.405 4.5 4.675 4.845 5.097 5.257 5.41 5.636 5.848 6.06 6.294 6.523 6.81 7.094 7.359 7.677 7.986 8.28 8.616 8.978 9.312 9.675 10.062 10.479 10.925 11.426 11.987 12.544 13.18 13.86 14.646 15.557 16.609 17.78 19.088 19.999 20.432 20.69 20.805 20.809 20.758 20.667 20.552 20.424 20.307 20.196 20.07 19.951 19.851 19.751 19.627 19.51 19.421 19.328 19.219 19.127 19.035 18.931 18.837 18.738 18.641 18.534 18.424 18.339 18.253 18.138 18.064 17.981 17.933 17.835 17.741 17.639 17.584 17.435 17.415 17.359 17.299 17.158 17.086 17.021 16.933 16.815 16.678 16.499 16.164 -9 ,11185 ,KEBNE ,17027674,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:17:49 CET,0.0 1.136 1.508 1.779 2.009 2.221 2.413 2.583 2.912 3.054 3.175 3.331 3.551 3.663 3.869 4.058 4.248 4.343 4.537 4.718 4.959 5.115 5.265 5.492 5.727 5.958 6.181 6.397 6.669 6.926 7.175 7.488 7.789 8.071 8.397 8.779 9.145 9.533 9.942 10.364 10.821 11.358 11.98 12.582 13.256 14.0 14.838 15.782 16.852 18.021 19.315 20.285 20.708 20.865 20.951 20.943 20.876 20.765 20.654 20.576 20.478 20.367 20.25 20.119 20.0 19.889 19.773 19.67 19.585 19.487 19.362 19.266 19.172 19.068 18.993 18.903 18.807 18.711 18.606 18.528 18.443 18.318 18.225 18.131 18.088 18.0 17.895 17.766 17.707 17.563 17.517 17.441 17.352 17.152 17.067 16.981 16.875 16.756 16.568 16.289 15.468 -10 ,12525 ,KEBNE ,17027675,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:17:48 CET,0.0 1.352 1.916 2.324 2.636 2.914 3.159 3.362 3.684 3.833 3.984 4.18 4.418 4.556 4.837 5.113 5.37 5.481 5.679 5.866 6.12 6.291 6.477 6.76 7.02 7.249 7.463 7.667 7.939 8.2 8.456 8.778 9.086 9.386 9.727 10.09 10.424 10.78 11.162 11.564 11.985 12.465 13.024 13.58 14.212 14.924 15.757 16.681 17.707 18.834 20.157 21.104 21.523 21.699 21.75 21.758 21.711 21.626 21.511 21.37 21.251 21.137 21.009 20.893 20.777 20.664 20.551 20.441 20.346 20.256 20.165 20.086 20.01 19.938 19.878 19.801 19.714 19.633 19.542 19.477 19.419 19.335 19.268 19.186 19.146 19.071 18.979 18.884 18.838 18.703 18.662 18.594 18.532 18.403 18.33 18.235 18.134 18.022 17.859 17.606 16.678 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_18_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_18_17.txt deleted file mode 100644 index b3fe6b37..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_18_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30293 ,TETRA ,17606357,Sun Nov 28 20:01:20 CET,Sun Nov 28 21:50:39 CET,0.0 0.387 0.545 0.69 0.812 0.92 1.023 1.12 1.271 1.332 1.394 1.413 1.568 1.613 1.696 1.784 1.878 1.925 2.009 2.089 2.187 2.251 2.315 2.418 2.52 2.596 2.661 2.746 2.877 2.984 3.092 3.235 3.352 3.451 3.561 3.691 3.821 3.958 4.096 4.242 4.389 4.537 4.695 4.839 5.007 5.214 5.421 5.596 5.723 5.724 5.512 5.046 4.545 4.078 3.642 3.234 2.876 2.543 2.25 1.96 1.722 1.493 1.258 1.047 0.854 0.677 0.481 0.298 0.148 -0.003 -0.157 -0.284 -0.419 -0.56 -0.677 -0.79 -0.906 -1.025 -1.151 -1.253 -1.356 -1.493 -1.617 -1.756 -1.818 -1.936 -2.054 -2.179 -2.256 -2.442 -2.527 -2.626 -2.73 -2.963 -3.096 -3.245 -3.4 -3.57 -3.785 -4.088 -5.079 -2 ,9933 ,TETRA ,17606358,Sun Nov 28 20:01:22 CET,Sun Nov 28 21:50:26 CET,0.0 0.612 0.821 0.939 1.048 1.139 1.214 1.295 1.454 1.521 1.576 1.583 1.733 1.785 1.895 2.011 2.123 2.179 2.29 2.389 2.523 2.614 2.694 2.802 2.923 3.031 3.134 3.24 3.36 3.474 3.58 3.702 3.824 3.936 4.054 4.197 4.33 4.466 4.608 4.756 4.93 5.121 5.32 5.5 5.681 5.846 6.01 6.134 6.192 6.158 5.891 5.421 4.928 4.399 3.935 3.53 3.172 2.837 2.555 2.255 1.986 1.747 1.518 1.295 1.092 0.913 0.708 0.525 0.374 0.209 0.038 -0.092 -0.24 -0.4 -0.521 -0.651 -0.786 -0.93 -1.083 -1.189 -1.297 -1.458 -1.569 -1.683 -1.743 -1.878 -2.007 -2.138 -2.21 -2.386 -2.437 -2.52 -2.623 -2.889 -3.035 -3.166 -3.309 -3.481 -3.691 -4.0 -4.966 -3 ,8954 ,TETRA ,17606359,Sun Nov 28 20:01:21 CET,Sun Nov 28 21:50:24 CET,0.0 0.867 1.039 1.166 1.277 1.375 1.46 1.53 1.665 1.731 1.795 1.819 1.975 2.025 2.118 2.216 2.309 2.351 2.444 2.542 2.683 2.761 2.833 2.952 3.079 3.199 3.3 3.395 3.514 3.63 3.748 3.884 4.019 4.15 4.278 4.403 4.522 4.664 4.813 4.957 5.108 5.281 5.465 5.626 5.788 5.963 6.139 6.283 6.417 6.483 6.249 5.715 5.197 4.719 4.273 3.83 3.428 3.061 2.719 2.356 2.065 1.813 1.576 1.367 1.167 0.97 0.765 0.586 0.422 0.249 0.081 -0.061 -0.219 -0.391 -0.517 -0.641 -0.77 -0.903 -1.043 -1.13 -1.223 -1.368 -1.467 -1.581 -1.64 -1.762 -1.882 -2.025 -2.112 -2.295 -2.361 -2.456 -2.566 -2.787 -2.891 -3.016 -3.163 -3.326 -3.512 -3.754 -4.481 -4 ,14376 ,TETRA ,17606360,Sun Nov 28 20:01:22 CET,Sun Nov 28 21:50:25 CET,0.0 1.216 1.533 1.746 1.918 2.056 2.174 2.292 2.503 2.589 2.682 2.771 2.953 3.025 3.152 3.269 3.372 3.421 3.512 3.602 3.731 3.811 3.9 4.04 4.166 4.281 4.384 4.482 4.608 4.721 4.827 4.957 5.078 5.195 5.332 5.478 5.613 5.752 5.89 6.027 6.177 6.339 6.508 6.68 6.864 7.06 7.253 7.412 7.526 7.513 7.282 6.857 6.417 5.975 5.558 5.161 4.796 4.464 4.176 3.872 3.617 3.387 3.158 2.93 2.709 2.515 2.314 2.143 1.999 1.841 1.673 1.544 1.412 1.265 1.153 1.039 0.915 0.78 0.638 0.546 0.453 0.297 0.19 0.07 0.008 -0.116 -0.248 -0.392 -0.473 -0.658 -0.727 -0.81 -0.897 -1.08 -1.173 -1.282 -1.398 -1.516 -1.665 -1.933 -2.475 -5 ,27634 ,TETRA ,17606361,Sun Nov 28 20:01:24 CET,Sun Nov 28 21:51:24 CET,0.0 0.512 0.672 0.818 0.918 1.008 1.113 1.203 1.35 1.422 1.495 1.512 1.664 1.715 1.828 1.942 2.038 2.078 2.156 2.232 2.347 2.432 2.513 2.625 2.732 2.83 2.93 3.031 3.141 3.234 3.344 3.47 3.576 3.687 3.805 3.94 4.081 4.232 4.393 4.544 4.677 4.827 5.007 5.169 5.327 5.472 5.597 5.714 5.819 5.862 5.712 5.258 4.751 4.277 3.834 3.415 3.063 2.734 2.429 2.11 1.813 1.573 1.364 1.143 0.949 0.774 0.56 0.369 0.211 0.045 -0.121 -0.247 -0.386 -0.539 -0.664 -0.794 -0.926 -1.065 -1.206 -1.304 -1.41 -1.571 -1.675 -1.792 -1.852 -1.972 -2.109 -2.246 -2.317 -2.494 -2.556 -2.646 -2.739 -2.939 -3.036 -3.149 -3.298 -3.454 -3.64 -3.948 -5.006 -6 ,14753 ,TETRA ,17606362,Sun Nov 28 20:01:26 CET,Sun Nov 28 21:51:01 CET,0.0 0.711 0.922 1.114 1.275 1.393 1.505 1.622 1.839 1.935 2.018 2.068 2.236 2.303 2.43 2.554 2.66 2.704 2.789 2.873 2.994 3.074 3.151 3.259 3.37 3.472 3.564 3.658 3.786 3.906 4.011 4.128 4.238 4.341 4.464 4.611 4.749 4.894 5.037 5.177 5.325 5.497 5.667 5.809 5.968 6.131 6.294 6.451 6.555 6.552 6.323 5.846 5.363 4.888 4.448 4.024 3.638 3.303 3.01 2.707 2.45 2.224 2.02 1.824 1.621 1.441 1.267 1.112 0.971 0.818 0.65 0.511 0.363 0.214 0.101 -0.022 -0.143 -0.268 -0.41 -0.51 -0.615 -0.787 -0.899 -1.02 -1.092 -1.242 -1.377 -1.518 -1.597 -1.769 -1.812 -1.9 -1.999 -2.203 -2.31 -2.427 -2.568 -2.727 -2.923 -3.234 -4.073 -7 ,30377 ,TETRA ,17606363,Sun Nov 28 20:01:21 CET,Sun Nov 28 21:50:24 CET,0.0 0.597 0.78 0.897 1.009 1.11 1.193 1.272 1.401 1.474 1.551 1.589 1.75 1.805 1.912 2.01 2.099 2.141 2.22 2.306 2.433 2.507 2.581 2.691 2.793 2.884 2.972 3.061 3.172 3.279 3.374 3.485 3.607 3.721 3.85 4.0 4.125 4.247 4.389 4.531 4.676 4.848 5.013 5.16 5.327 5.497 5.669 5.791 5.9 5.939 5.737 5.276 4.707 4.16 3.701 3.303 2.939 2.608 2.305 1.995 1.755 1.522 1.281 1.065 0.855 0.663 0.469 0.297 0.15 -0.016 -0.189 -0.325 -0.48 -0.643 -0.76 -0.883 -1.009 -1.134 -1.27 -1.369 -1.475 -1.641 -1.751 -1.863 -1.919 -2.04 -2.174 -2.315 -2.388 -2.573 -2.645 -2.732 -2.824 -3.027 -3.146 -3.283 -3.445 -3.648 -3.887 -4.139 -5.284 -8 ,11822 ,TETRA ,17606364,Sun Nov 28 20:01:22 CET,Sun Nov 28 21:50:40 CET,0.0 0.412 0.576 0.682 0.805 0.921 1.012 1.1 1.275 1.343 1.403 1.41 1.562 1.619 1.727 1.835 1.934 1.977 2.055 2.144 2.288 2.367 2.439 2.537 2.632 2.731 2.826 2.921 3.042 3.154 3.261 3.381 3.483 3.587 3.721 3.868 3.998 4.126 4.263 4.413 4.566 4.741 4.915 5.062 5.22 5.386 5.556 5.702 5.843 5.894 5.646 5.126 4.591 4.105 3.638 3.196 2.8 2.438 2.146 1.853 1.591 1.355 1.115 0.878 0.661 0.471 0.289 0.135 -0.008 -0.17 -0.343 -0.481 -0.622 -0.773 -0.89 -1.005 -1.127 -1.268 -1.419 -1.517 -1.617 -1.775 -1.885 -2.005 -2.07 -2.202 -2.337 -2.486 -2.559 -2.741 -2.823 -2.914 -3.013 -3.222 -3.329 -3.452 -3.596 -3.77 -3.997 -4.25 -4.855 -9 ,20825 ,TETRA ,17606365,Sun Nov 28 20:01:23 CET,Sun Nov 28 21:50:08 CET,0.0 0.459 0.649 0.776 0.868 0.967 1.064 1.14 1.284 1.354 1.419 1.439 1.597 1.651 1.755 1.853 1.951 1.991 2.064 2.141 2.26 2.34 2.414 2.514 2.62 2.731 2.84 2.935 3.04 3.148 3.252 3.37 3.477 3.577 3.693 3.831 3.973 4.109 4.241 4.394 4.555 4.715 4.876 5.054 5.267 5.468 5.684 5.885 5.986 5.982 5.785 5.237 4.665 4.157 3.711 3.32 2.933 2.568 2.269 1.981 1.736 1.513 1.285 1.068 0.875 0.699 0.507 0.324 0.173 0.021 -0.15 -0.289 -0.425 -0.568 -0.682 -0.809 -0.938 -1.072 -1.215 -1.307 -1.406 -1.567 -1.687 -1.81 -1.866 -1.985 -2.121 -2.287 -2.37 -2.545 -2.601 -2.689 -2.782 -3.008 -3.136 -3.272 -3.408 -3.531 -3.703 -4.017 -5.004 -10 ,7505 ,TETRA ,17606366,Sun Nov 28 20:01:25 CET,Sun Nov 28 21:49:55 CET,0.0 0.779 0.943 1.059 1.158 1.28 1.399 1.482 1.631 1.7 1.763 1.768 1.918 1.975 2.087 2.18 2.269 2.309 2.393 2.48 2.594 2.666 2.742 2.867 2.991 3.096 3.181 3.267 3.389 3.513 3.625 3.74 3.851 3.972 4.108 4.25 4.377 4.508 4.642 4.769 4.924 5.098 5.269 5.432 5.604 5.783 5.943 6.069 6.152 6.131 5.906 5.416 4.875 4.35 3.917 3.541 3.194 2.878 2.599 2.306 2.06 1.829 1.596 1.371 1.155 0.96 0.766 0.586 0.431 0.28 0.118 -0.018 -0.147 -0.297 -0.413 -0.52 -0.643 -0.779 -0.917 -1.012 -1.114 -1.267 -1.374 -1.493 -1.561 -1.703 -1.834 -1.963 -2.035 -2.213 -2.266 -2.346 -2.434 -2.634 -2.742 -2.851 -2.981 -3.16 -3.386 -3.622 -4.236 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_19_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_19_17.txt deleted file mode 100644 index 69b1b7c6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_19_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17381 ,TETRA ,17606368,Sun Nov 28 20:01:22 CET,Sun Nov 28 21:51:23 CET,0.0 1.389 1.777 2.037 2.235 2.426 2.589 2.74 3.01 3.127 3.232 3.321 3.515 3.596 3.772 3.932 4.068 4.134 4.262 4.382 4.574 4.697 4.806 4.967 5.132 5.287 5.426 5.566 5.733 5.892 6.064 6.278 6.481 6.685 6.924 7.194 7.444 7.697 7.973 8.273 8.566 8.898 9.306 9.719 10.182 10.691 11.259 11.867 12.576 13.357 14.059 14.42 14.456 14.378 14.251 14.025 13.813 13.58 13.359 13.137 12.893 12.664 12.428 12.189 11.971 11.766 11.564 11.393 11.231 11.043 10.852 10.708 10.553 10.38 10.257 10.134 9.993 9.829 9.651 9.538 9.416 9.208 9.059 8.918 8.842 8.671 8.487 8.303 8.217 8.021 7.898 7.778 7.655 7.355 7.193 7.024 6.818 6.52 6.185 5.756 3.668 -2 ,25035 ,TETRA ,17606369,Sun Nov 28 20:01:25 CET,Sun Nov 28 21:51:23 CET,0.0 1.033 1.334 1.524 1.673 1.803 1.919 2.014 2.206 2.305 2.395 2.447 2.636 2.714 2.854 2.986 3.117 3.184 3.314 3.453 3.658 3.785 3.906 4.068 4.233 4.398 4.539 4.671 4.849 5.028 5.198 5.391 5.595 5.791 6.008 6.273 6.518 6.776 7.054 7.338 7.651 8.001 8.378 8.764 9.243 9.787 10.4 11.071 11.805 12.625 13.44 13.811 13.916 13.85 13.679 13.473 13.259 13.049 12.843 12.609 12.378 12.157 11.93 11.712 11.508 11.309 11.11 10.934 10.775 10.62 10.439 10.282 10.112 9.92 9.775 9.634 9.493 9.33 9.145 9.024 8.909 8.728 8.597 8.452 8.373 8.211 8.034 7.845 7.751 7.551 7.423 7.285 7.133 6.824 6.648 6.467 6.247 5.985 5.66 5.15 2.797 -3 ,9808 ,TETRA ,17606370,Sun Nov 28 20:01:26 CET,Sun Nov 28 21:51:19 CET,0.0 1.541 1.84 2.049 2.26 2.441 2.578 2.693 2.916 3.027 3.141 3.232 3.429 3.51 3.666 3.817 3.976 4.049 4.182 4.311 4.488 4.605 4.717 4.875 5.038 5.194 5.337 5.479 5.666 5.836 5.99 6.183 6.39 6.59 6.82 7.07 7.29 7.534 7.796 8.072 8.374 8.722 9.131 9.527 9.977 10.488 11.046 11.666 12.371 13.12 13.951 14.343 14.303 14.162 13.969 13.714 13.485 13.277 13.024 12.732 12.507 12.305 12.082 11.865 11.669 11.49 11.286 11.097 10.946 10.794 10.619 10.472 10.32 10.149 10.009 9.856 9.697 9.54 9.376 9.258 9.139 8.957 8.81 8.642 8.56 8.387 8.207 8.016 7.902 7.672 7.5 7.362 7.23 6.925 6.762 6.565 6.334 6.084 5.736 5.156 2.284 -4 ,26059 ,TETRA ,17606371,Sun Nov 28 20:01:23 CET,Sun Nov 28 21:50:32 CET,0.0 0.861 1.165 1.391 1.576 1.753 1.922 2.075 2.334 2.435 2.534 2.622 2.819 2.91 3.085 3.235 3.376 3.455 3.604 3.737 3.93 4.052 4.167 4.324 4.477 4.625 4.769 4.913 5.092 5.261 5.437 5.652 5.848 6.046 6.283 6.544 6.784 7.041 7.311 7.618 7.958 8.335 8.767 9.188 9.677 10.227 10.835 11.474 12.162 12.935 13.709 14.133 14.21 14.069 13.895 13.671 13.422 13.145 12.868 12.614 12.396 12.179 11.964 11.751 11.555 11.377 11.191 11.012 10.837 10.657 10.476 10.333 10.185 10.025 9.896 9.75 9.581 9.399 9.225 9.108 8.981 8.771 8.617 8.455 8.365 8.178 7.99 7.795 7.695 7.483 7.335 7.211 7.063 6.724 6.549 6.336 6.085 5.835 5.543 5.118 3.105 -5 ,25427 ,TETRA ,17606372,Sun Nov 28 20:01:23 CET,Sun Nov 28 21:50:55 CET,0.0 1.163 1.436 1.658 1.827 1.974 2.096 2.205 2.402 2.5 2.598 2.672 2.869 2.952 3.097 3.233 3.366 3.427 3.538 3.65 3.816 3.927 4.028 4.174 4.319 4.461 4.605 4.741 4.911 5.06 5.205 5.38 5.551 5.73 5.958 6.216 6.456 6.724 7.008 7.306 7.615 7.955 8.354 8.757 9.208 9.705 10.313 10.982 11.727 12.55 13.347 13.714 13.733 13.545 13.259 12.937 12.657 12.434 12.198 11.891 11.59 11.321 11.058 10.822 10.622 10.427 10.204 9.994 9.812 9.633 9.441 9.284 9.124 8.946 8.8 8.65 8.489 8.314 8.142 8.012 7.865 7.647 7.507 7.367 7.291 7.122 6.94 6.757 6.657 6.44 6.312 6.186 6.049 5.747 5.58 5.381 5.11 4.763 4.385 3.891 1.515 -6 ,25755 ,TETRA ,17606374,Sun Nov 28 20:01:24 CET,Sun Nov 28 21:50:37 CET,0.0 1.142 1.427 1.61 1.763 1.902 2.029 2.163 2.415 2.529 2.63 2.715 2.906 2.982 3.145 3.305 3.461 3.533 3.686 3.835 4.02 4.143 4.265 4.432 4.581 4.729 4.886 5.031 5.22 5.407 5.585 5.798 5.999 6.181 6.392 6.629 6.862 7.12 7.395 7.702 8.022 8.368 8.765 9.142 9.595 10.122 10.658 11.252 11.981 12.76 13.544 13.936 14.013 13.894 13.65 13.394 13.169 12.966 12.75 12.494 12.277 12.069 11.846 11.638 11.446 11.252 11.032 10.825 10.654 10.495 10.324 10.165 9.991 9.817 9.681 9.542 9.399 9.245 9.079 8.959 8.837 8.65 8.516 8.372 8.297 8.134 7.953 7.749 7.635 7.418 7.264 7.124 6.98 6.615 6.417 6.24 6.06 5.825 5.463 5.001 1.696 -7 ,23460 ,TETRA ,17606375,Sun Nov 28 20:01:27 CET,Sun Nov 28 21:51:00 CET,0.0 1.7 2.035 2.255 2.456 2.616 2.738 2.849 3.081 3.197 3.297 3.393 3.589 3.679 3.861 4.025 4.174 4.243 4.382 4.525 4.718 4.846 4.965 5.128 5.295 5.46 5.628 5.776 5.96 6.153 6.331 6.557 6.783 6.992 7.239 7.521 7.775 8.042 8.346 8.67 8.998 9.371 9.788 10.189 10.657 11.163 11.759 12.416 13.132 13.912 14.694 15.101 15.132 15.024 14.848 14.604 14.311 13.986 13.716 13.456 13.212 12.992 12.771 12.553 12.328 12.124 11.928 11.757 11.601 11.425 11.236 11.071 10.902 10.72 10.575 10.439 10.294 10.117 9.934 9.812 9.677 9.472 9.333 9.18 9.097 8.909 8.701 8.462 8.341 8.125 7.978 7.852 7.709 7.391 7.222 7.025 6.78 6.498 6.131 5.548 3.606 -8 ,23518 ,TETRA ,17606376,Sun Nov 28 20:01:29 CET,Sun Nov 28 21:50:55 CET,0.0 1.483 1.773 2.026 2.246 2.422 2.586 2.722 2.95 3.064 3.176 3.274 3.466 3.541 3.699 3.857 4.008 4.074 4.2 4.327 4.507 4.618 4.719 4.865 5.018 5.176 5.32 5.466 5.665 5.844 6.006 6.198 6.393 6.578 6.798 7.049 7.292 7.557 7.834 8.14 8.481 8.824 9.197 9.606 10.101 10.652 11.241 11.854 12.57 13.406 14.276 14.699 14.794 14.697 14.476 14.258 14.015 13.783 13.587 13.362 13.165 12.956 12.745 12.539 12.341 12.182 12.017 11.839 11.666 11.496 11.323 11.177 11.011 10.832 10.692 10.538 10.386 10.237 10.085 9.974 9.841 9.622 9.463 9.291 9.213 9.062 8.891 8.686 8.569 8.346 8.186 8.057 7.918 7.572 7.393 7.209 6.996 6.748 6.446 5.9 2.923 -9 ,9330 ,TETRA ,17606377,Sun Nov 28 20:02:25 CET,Sun Nov 28 21:52:14 CET,0.0 0.977 1.17 1.349 1.505 1.634 1.758 1.862 2.048 2.145 2.241 2.325 2.539 2.629 2.795 2.969 3.116 3.182 3.317 3.445 3.653 3.79 3.902 4.065 4.229 4.382 4.526 4.665 4.839 5.012 5.178 5.366 5.553 5.738 5.948 6.196 6.438 6.7 6.974 7.252 7.55 7.881 8.264 8.671 9.14 9.653 10.248 10.885 11.588 12.396 13.181 13.555 13.647 13.526 13.279 12.994 12.696 12.425 12.165 11.904 11.684 11.463 11.238 11.01 10.796 10.599 10.357 10.149 9.987 9.818 9.622 9.464 9.328 9.176 9.046 8.908 8.77 8.616 8.459 8.357 8.246 8.081 7.968 7.834 7.761 7.621 7.464 7.27 7.172 6.973 6.871 6.74 6.607 6.358 6.204 6.015 5.789 5.514 5.145 4.622 2.319 -10 ,28589 ,TETRA ,17606378,Sun Nov 28 20:01:51 CET,Sun Nov 28 21:51:32 CET,0.0 1.455 1.839 2.098 2.28 2.435 2.583 2.697 2.902 3.011 3.124 3.214 3.404 3.486 3.654 3.8 3.942 4.012 4.14 4.261 4.431 4.544 4.659 4.817 4.962 5.111 5.271 5.423 5.602 5.772 5.932 6.128 6.312 6.493 6.717 6.963 7.193 7.471 7.767 8.044 8.329 8.661 9.061 9.464 9.95 10.5 11.127 11.803 12.51 13.285 14.118 14.579 14.685 14.595 14.435 14.21 13.991 13.77 13.525 13.249 12.995 12.782 12.586 12.392 12.188 12.004 11.83 11.654 11.48 11.296 11.107 10.935 10.75 10.576 10.452 10.32 10.18 10.022 9.846 9.721 9.604 9.439 9.31 9.163 9.083 8.925 8.77 8.592 8.492 8.28 8.148 8.012 7.863 7.567 7.407 7.229 7.03 6.783 6.448 5.981 3.479 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_19_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_19_24.txt deleted file mode 100644 index 0e3b8cf0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_19_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28654 ,TETRA ,17606379,Sun Nov 28 20:01:51 CET,Sun Nov 28 21:55:32 CET,0.0 0.878 1.208 1.422 1.605 1.77 1.925 2.063 2.287 2.384 2.476 2.531 2.722 2.804 2.945 3.064 3.178 3.235 3.339 3.43 3.568 3.655 3.737 3.854 3.962 4.053 4.125 4.195 4.279 4.352 4.427 4.506 4.568 4.632 4.711 4.784 4.844 4.898 4.95 5.002 5.029 5.018 4.961 4.871 4.714 4.471 4.111 3.611 2.847 1.652 -0.35 -2.71 -4.613 -6.168 -7.427 -8.516 -9.429 -10.233 -10.909 -11.541 -12.075 -12.552 -12.993 -13.402 -13.776 -14.108 -14.437 -14.716 -14.968 -15.235 -15.499 -15.715 -15.935 -16.162 -16.344 -16.53 -16.712 -16.898 -17.088 -17.214 -17.351 -17.569 -17.719 -17.87 -17.952 -18.124 -18.281 -18.44 -18.523 -18.748 -18.81 -18.909 -19.018 -19.268 -19.405 -19.551 -19.689 -19.81 -19.975 -20.21 -21.034 -2 ,9134 ,TETRA ,17606380,Sun Nov 28 20:01:51 CET,Sun Nov 28 21:53:23 CET,0.0 1.413 1.725 1.944 2.151 2.34 2.488 2.614 2.835 2.936 3.026 3.072 3.259 3.331 3.466 3.6 3.725 3.787 3.899 3.985 4.102 4.179 4.258 4.369 4.468 4.563 4.653 4.738 4.841 4.912 4.979 5.063 5.136 5.201 5.262 5.323 5.381 5.422 5.452 5.477 5.493 5.494 5.465 5.394 5.254 5.033 4.684 4.198 3.429 2.144 0.062 -2.329 -4.19 -5.727 -7.034 -8.142 -9.063 -9.878 -10.555 -11.206 -11.776 -12.277 -12.742 -13.171 -13.563 -13.923 -14.305 -14.635 -14.908 -15.196 -15.492 -15.73 -15.968 -16.213 -16.41 -16.617 -16.825 -17.048 -17.277 -17.429 -17.584 -17.827 -17.992 -18.148 -18.228 -18.381 -18.525 -18.695 -18.788 -19.014 -19.055 -19.143 -19.242 -19.453 -19.567 -19.699 -19.845 -19.998 -20.171 -20.391 -21.426 -3 ,17613 ,TETRA ,17606381,Sun Nov 28 20:01:53 CET,Sun Nov 28 21:53:39 CET,0.0 1.475 1.812 2.021 2.19 2.349 2.481 2.61 2.826 2.919 3.015 3.109 3.315 3.383 3.515 3.646 3.757 3.806 3.889 3.971 4.088 4.16 4.232 4.336 4.434 4.524 4.598 4.664 4.754 4.844 4.929 5.021 5.096 5.166 5.237 5.306 5.362 5.409 5.444 5.465 5.478 5.491 5.489 5.43 5.284 5.03 4.661 4.115 3.295 2.14 0.163 -2.163 -4.001 -5.524 -6.814 -7.941 -8.861 -9.662 -10.337 -11.015 -11.598 -12.09 -12.551 -12.987 -13.383 -13.736 -14.102 -14.414 -14.673 -14.942 -15.219 -15.455 -15.7 -15.938 -16.126 -16.323 -16.519 -16.71 -16.897 -17.025 -17.164 -17.389 -17.56 -17.74 -17.823 -17.993 -18.163 -18.349 -18.447 -18.684 -18.774 -18.887 -19.005 -19.267 -19.403 -19.545 -19.719 -19.914 -20.12 -20.346 -21.505 -4 ,19486 ,TETRA ,17606382,Sun Nov 28 20:02:25 CET,Sun Nov 28 21:53:29 CET,0.0 1.15 1.494 1.746 1.919 2.077 2.21 2.328 2.537 2.649 2.756 2.829 3.028 3.105 3.244 3.371 3.488 3.539 3.634 3.73 3.863 3.95 4.031 4.126 4.214 4.301 4.383 4.455 4.555 4.647 4.717 4.802 4.875 4.934 4.987 5.035 5.082 5.137 5.176 5.172 5.164 5.149 5.091 4.998 4.849 4.606 4.255 3.766 3.03 1.84 -0.101 -2.37 -4.23 -5.696 -6.923 -8.021 -8.939 -9.741 -10.428 -11.105 -11.671 -12.163 -12.633 -13.068 -13.463 -13.825 -14.182 -14.5 -14.77 -15.033 -15.324 -15.584 -15.831 -16.066 -16.257 -16.465 -16.678 -16.891 -17.112 -17.264 -17.419 -17.657 -17.825 -18.009 -18.102 -18.277 -18.458 -18.65 -18.745 -18.979 -19.06 -19.181 -19.311 -19.587 -19.738 -19.891 -20.046 -20.203 -20.375 -20.617 -21.327 -5 ,23151 ,TETRA ,17606383,Sun Nov 28 20:02:25 CET,Sun Nov 28 21:53:41 CET,0.0 1.093 1.435 1.659 1.852 2.025 2.168 2.309 2.561 2.663 2.761 2.834 3.029 3.102 3.243 3.377 3.487 3.537 3.635 3.724 3.842 3.927 4.014 4.129 4.228 4.311 4.387 4.457 4.545 4.629 4.71 4.801 4.875 4.934 5.004 5.065 5.113 5.166 5.196 5.214 5.227 5.217 5.16 5.06 4.888 4.632 4.282 3.766 2.957 1.729 -0.306 -2.701 -4.58 -6.11 -7.352 -8.4 -9.283 -10.084 -10.754 -11.4 -11.951 -12.417 -12.869 -13.316 -13.716 -14.064 -14.415 -14.719 -14.971 -15.219 -15.483 -15.71 -15.95 -16.198 -16.38 -16.56 -16.739 -16.919 -17.117 -17.254 -17.386 -17.588 -17.729 -17.874 -17.949 -18.106 -18.28 -18.45 -18.536 -18.765 -18.814 -18.901 -18.996 -19.215 -19.339 -19.479 -19.648 -19.837 -20.033 -20.258 -21.139 -6 ,10325 ,TETRA ,17606384,Sun Nov 28 20:01:50 CET,Sun Nov 28 21:54:04 CET,0.0 1.23 1.605 1.837 2.022 2.194 2.349 2.478 2.697 2.799 2.89 2.955 3.144 3.221 3.369 3.491 3.603 3.655 3.752 3.847 3.975 4.054 4.126 4.22 4.31 4.402 4.481 4.556 4.666 4.758 4.843 4.953 5.045 5.118 5.194 5.278 5.346 5.39 5.418 5.443 5.467 5.477 5.43 5.341 5.213 4.997 4.648 4.166 3.408 2.142 0.066 -2.254 -4.067 -5.587 -6.864 -7.957 -8.88 -9.674 -10.352 -11.05 -11.647 -12.171 -12.639 -13.057 -13.457 -13.824 -14.205 -14.533 -14.818 -15.122 -15.424 -15.673 -15.923 -16.17 -16.365 -16.577 -16.79 -17.001 -17.217 -17.364 -17.52 -17.76 -17.923 -18.084 -18.166 -18.344 -18.529 -18.732 -18.843 -19.087 -19.155 -19.264 -19.373 -19.587 -19.7 -19.829 -19.965 -20.111 -20.307 -20.561 -21.319 -7 ,1148 ,TETRA ,17606385,Sun Nov 28 20:02:48 CET,Sun Nov 28 21:55:02 CET,0.0 0.972 1.259 1.466 1.661 1.826 1.96 2.092 2.307 2.412 2.51 2.57 2.757 2.821 2.949 3.078 3.195 3.252 3.37 3.475 3.611 3.685 3.757 3.854 3.941 4.026 4.102 4.178 4.27 4.357 4.427 4.502 4.579 4.641 4.714 4.807 4.882 4.945 4.99 5.019 5.028 5.0 4.958 4.898 4.786 4.573 4.205 3.67 2.86 1.69 -0.291 -2.645 -4.467 -5.994 -7.29 -8.41 -9.356 -10.217 -10.936 -11.593 -12.148 -12.646 -13.11 -13.537 -13.922 -14.277 -14.647 -14.974 -15.258 -15.541 -15.827 -16.066 -16.313 -16.569 -16.752 -16.941 -17.143 -17.351 -17.567 -17.708 -17.857 -18.084 -18.238 -18.4 -18.488 -18.675 -18.867 -19.064 -19.167 -19.416 -19.499 -19.606 -19.726 -20.008 -20.154 -20.302 -20.456 -20.624 -20.802 -21.013 -21.637 -8 ,18539 ,TETRA ,17606386,Sun Nov 28 20:02:48 CET,Sun Nov 28 21:54:14 CET,0.0 1.58 1.903 2.141 2.335 2.501 2.641 2.767 3.003 3.117 3.224 3.288 3.471 3.544 3.679 3.803 3.926 3.984 4.095 4.195 4.332 4.412 4.488 4.605 4.709 4.815 4.908 4.98 5.058 5.129 5.201 5.282 5.356 5.426 5.492 5.566 5.628 5.664 5.685 5.698 5.7 5.681 5.621 5.514 5.34 5.086 4.705 4.172 3.335 2.017 -0.074 -2.432 -4.267 -5.787 -7.003 -8.042 -8.963 -9.753 -10.42 -11.092 -11.636 -12.098 -12.551 -12.953 -13.308 -13.635 -13.979 -14.287 -14.529 -14.783 -15.052 -15.276 -15.505 -15.734 -15.912 -16.092 -16.282 -16.47 -16.652 -16.782 -16.922 -17.143 -17.304 -17.464 -17.542 -17.695 -17.85 -18.012 -18.099 -18.323 -18.356 -18.453 -18.559 -18.771 -18.889 -19.028 -19.172 -19.346 -19.54 -19.766 -20.628 -9 ,5339 ,TETRA ,17606387,Sun Nov 28 20:02:47 CET,Sun Nov 28 21:53:17 CET,0.0 1.439 1.748 1.96 2.134 2.296 2.429 2.551 2.783 2.886 2.977 3.027 3.218 3.295 3.426 3.55 3.66 3.718 3.839 3.937 4.058 4.147 4.227 4.322 4.41 4.495 4.568 4.639 4.732 4.808 4.871 4.95 5.02 5.069 5.122 5.171 5.217 5.256 5.293 5.351 5.378 5.323 5.226 5.144 5.004 4.779 4.444 3.932 3.122 1.874 -0.11 -2.367 -4.16 -5.62 -6.889 -8.009 -8.934 -9.727 -10.392 -11.06 -11.626 -12.133 -12.613 -13.043 -13.422 -13.782 -14.153 -14.467 -14.743 -15.028 -15.318 -15.563 -15.818 -16.068 -16.26 -16.466 -16.674 -16.882 -17.101 -17.257 -17.417 -17.662 -17.826 -17.983 -18.058 -18.211 -18.373 -18.553 -18.648 -18.883 -18.94 -19.037 -19.145 -19.371 -19.487 -19.623 -19.774 -19.952 -20.156 -20.42 -21.218 -10 ,5675 ,TETRA ,17606388,Sun Nov 28 20:02:49 CET,Sun Nov 28 21:53:00 CET,0.0 1.235 1.58 1.845 2.045 2.216 2.367 2.492 2.738 2.856 2.959 3.017 3.197 3.269 3.416 3.556 3.684 3.739 3.825 3.911 4.055 4.134 4.208 4.309 4.399 4.488 4.56 4.621 4.701 4.787 4.865 4.944 5.02 5.083 5.157 5.237 5.288 5.351 5.416 5.457 5.48 5.468 5.412 5.319 5.189 4.99 4.638 4.117 3.349 2.143 0.084 -2.293 -4.173 -5.717 -6.976 -8.062 -8.992 -9.804 -10.5 -11.188 -11.744 -12.241 -12.727 -13.17 -13.582 -13.954 -14.338 -14.669 -14.946 -15.229 -15.502 -15.728 -15.973 -16.224 -16.419 -16.62 -16.83 -17.043 -17.276 -17.453 -17.64 -17.932 -18.127 -18.319 -18.418 -18.622 -18.833 -19.058 -19.176 -19.431 -19.555 -19.691 -19.815 -20.065 -20.199 -20.35 -20.533 -20.727 -20.928 -21.178 -21.566 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_19_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_19_32.txt deleted file mode 100644 index 5b360ce9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_19_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2919 ,TETRA ,17606389,Sun Nov 28 20:03:47 CET,Sun Nov 28 21:55:01 CET,0.0 0.21 0.333 0.437 0.52 0.583 0.651 0.715 0.83 0.875 0.911 0.88 1.019 1.046 1.09 1.136 1.177 1.198 1.244 1.279 1.319 1.342 1.365 1.396 1.423 1.448 1.461 1.47 1.486 1.495 1.5 1.506 1.504 1.495 1.477 1.453 1.434 1.425 1.408 1.373 1.318 1.225 1.1 0.96 0.76 0.483 0.094 -0.45 -1.24 -2.354 -4.145 -6.32 -8.043 -9.402 -10.517 -11.5 -12.328 -13.075 -13.71 -14.31 -14.824 -15.274 -15.668 -16.041 -16.392 -16.713 -17.052 -17.352 -17.605 -17.859 -18.107 -18.298 -18.499 -18.708 -18.874 -19.048 -19.231 -19.409 -19.585 -19.713 -19.84 -20.046 -20.192 -20.332 -20.407 -20.575 -20.746 -20.921 -21.02 -21.253 -21.332 -21.446 -21.564 -21.827 -21.967 -22.104 -22.263 -22.454 -22.677 -22.932 -24.005 -2 ,16405 ,TETRA ,17606390,Sun Nov 28 20:03:49 CET,Sun Nov 28 22:04:58 CET,0.0 0.244 0.337 0.416 0.478 0.53 0.572 0.605 0.669 0.694 0.711 0.649 0.79 0.817 0.858 0.887 0.913 0.931 0.969 0.993 1.024 1.044 1.06 1.086 1.114 1.135 1.152 1.169 1.188 1.217 1.252 1.291 1.314 1.323 1.326 1.321 1.309 1.284 1.239 1.18 1.109 1.026 0.906 0.769 0.571 0.28 -0.118 -0.704 -1.471 -2.558 -4.332 -6.346 -8.026 -9.433 -10.574 -11.556 -12.407 -13.149 -13.761 -14.376 -14.882 -15.319 -15.753 -16.156 -16.517 -16.845 -17.187 -17.484 -17.732 -17.988 -18.25 -18.47 -18.696 -18.931 -19.121 -19.306 -19.5 -19.696 -19.901 -20.052 -20.213 -20.479 -20.64 -20.794 -20.878 -21.058 -21.243 -21.432 -21.523 -21.738 -21.794 -21.9 -22.014 -22.268 -22.403 -22.529 -22.672 -22.861 -23.079 -23.349 -23.988 -3 ,6830 ,TETRA ,17606391,Sun Nov 28 20:04:49 CET,Sun Nov 28 21:56:27 CET,0.0 0.173 0.233 0.293 0.353 0.402 0.45 0.496 0.583 0.627 0.673 0.651 0.793 0.817 0.852 0.875 0.906 0.923 0.958 0.985 1.018 1.037 1.055 1.093 1.121 1.132 1.145 1.165 1.197 1.215 1.216 1.212 1.209 1.206 1.194 1.175 1.148 1.108 1.065 1.01 0.944 0.864 0.754 0.618 0.389 0.077 -0.328 -0.871 -1.657 -2.83 -4.672 -6.793 -8.465 -9.819 -10.939 -11.929 -12.76 -13.487 -14.102 -14.696 -15.188 -15.605 -15.993 -16.349 -16.675 -16.967 -17.282 -17.558 -17.774 -17.993 -18.238 -18.446 -18.66 -18.886 -19.059 -19.237 -19.426 -19.615 -19.814 -19.956 -20.094 -20.292 -20.428 -20.572 -20.644 -20.797 -20.962 -21.133 -21.225 -21.456 -21.516 -21.62 -21.737 -21.958 -22.081 -22.215 -22.344 -22.489 -22.665 -22.95 -23.729 -4 ,25017 ,TETRA ,17606392,Sun Nov 28 20:04:49 CET,Sun Nov 28 21:55:14 CET,0.0 0.199 0.312 0.375 0.427 0.471 0.524 0.576 0.646 0.677 0.706 0.646 0.779 0.8 0.848 0.901 0.943 0.959 0.998 1.04 1.099 1.136 1.167 1.203 1.235 1.264 1.293 1.338 1.381 1.397 1.416 1.433 1.453 1.461 1.473 1.483 1.474 1.454 1.425 1.386 1.335 1.251 1.123 0.979 0.783 0.505 0.103 -0.453 -1.246 -2.38 -4.197 -6.317 -8.013 -9.393 -10.546 -11.536 -12.36 -13.091 -13.723 -14.338 -14.852 -15.307 -15.747 -16.151 -16.525 -16.865 -17.208 -17.512 -17.783 -18.054 -18.317 -18.529 -18.74 -18.965 -19.139 -19.312 -19.493 -19.683 -19.873 -20.008 -20.151 -20.367 -20.509 -20.647 -20.719 -20.886 -21.055 -21.218 -21.302 -21.518 -21.563 -21.658 -21.757 -21.981 -22.115 -22.254 -22.415 -22.595 -22.78 -23.099 -24.095 -5 ,1868 ,TETRA ,17606393,Sun Nov 28 20:04:49 CET,Sun Nov 28 21:54:25 CET,0.0 0.09 0.162 0.231 0.285 0.336 0.396 0.445 0.514 0.552 0.586 0.531 0.667 0.694 0.738 0.772 0.801 0.816 0.84 0.869 0.912 0.932 0.949 0.973 0.999 1.03 1.061 1.083 1.105 1.122 1.134 1.149 1.158 1.166 1.178 1.193 1.196 1.177 1.156 1.135 1.122 1.091 0.997 0.866 0.683 0.44 0.058 -0.476 -1.199 -2.303 -4.133 -6.227 -7.866 -9.239 -10.389 -11.402 -12.257 -12.972 -13.58 -14.192 -14.72 -15.187 -15.619 -16.029 -16.401 -16.728 -17.07 -17.384 -17.646 -17.9 -18.167 -18.387 -18.618 -18.857 -19.033 -19.222 -19.412 -19.599 -19.802 -19.946 -20.093 -20.298 -20.434 -20.589 -20.673 -20.843 -21.013 -21.183 -21.269 -21.488 -21.546 -21.65 -21.767 -22.017 -22.146 -22.299 -22.475 -22.645 -22.834 -23.126 -23.93 -6 ,12914 ,TETRA ,17606394,Sun Nov 28 20:04:49 CET,Sun Nov 28 21:54:25 CET,0.0 0.158 0.261 0.332 0.386 0.428 0.468 0.51 0.597 0.637 0.669 0.609 0.751 0.786 0.848 0.898 0.938 0.953 0.978 1.013 1.064 1.098 1.133 1.185 1.233 1.267 1.292 1.315 1.358 1.405 1.433 1.456 1.46 1.462 1.469 1.478 1.484 1.474 1.443 1.397 1.356 1.289 1.158 0.994 0.785 0.5 0.091 -0.447 -1.221 -2.395 -4.236 -6.363 -8.08 -9.461 -10.583 -11.555 -12.381 -13.108 -13.732 -14.336 -14.842 -15.286 -15.7 -16.083 -16.431 -16.761 -17.1 -17.392 -17.649 -17.908 -18.165 -18.381 -18.609 -18.845 -19.031 -19.225 -19.429 -19.631 -19.843 -19.993 -20.142 -20.403 -20.582 -20.759 -20.848 -21.009 -21.183 -21.377 -21.486 -21.723 -21.786 -21.891 -22.004 -22.232 -22.348 -22.475 -22.638 -22.816 -23.011 -23.283 -24.017 -7 ,15011 ,TETRA ,17606395,Sun Nov 28 20:04:52 CET,Sun Nov 28 21:54:45 CET,0.0 0.133 0.238 0.316 0.375 0.432 0.476 0.512 0.585 0.618 0.651 0.595 0.729 0.749 0.795 0.84 0.884 0.908 0.944 0.97 1.014 1.035 1.05 1.07 1.087 1.11 1.133 1.147 1.162 1.169 1.176 1.193 1.2 1.197 1.198 1.19 1.17 1.143 1.102 1.031 0.95 0.874 0.773 0.648 0.457 0.169 -0.232 -0.764 -1.505 -2.623 -4.528 -6.683 -8.295 -9.62 -10.764 -11.768 -12.628 -13.388 -14.029 -14.645 -15.153 -15.599 -16.021 -16.414 -16.763 -17.075 -17.408 -17.716 -17.984 -18.261 -18.528 -18.735 -18.949 -19.182 -19.362 -19.528 -19.701 -19.895 -20.092 -20.222 -20.362 -20.576 -20.714 -20.863 -20.942 -21.097 -21.266 -21.461 -21.561 -21.785 -21.846 -21.971 -22.094 -22.327 -22.458 -22.601 -22.767 -22.955 -23.188 -23.495 -24.58 -8 ,28919 ,TETRA ,17606396,Sun Nov 28 20:04:54 CET,Sun Nov 28 21:54:19 CET,0.0 0.158 0.248 0.301 0.352 0.409 0.469 0.523 0.619 0.667 0.713 0.697 0.843 0.878 0.966 1.045 1.104 1.129 1.18 1.226 1.282 1.315 1.353 1.408 1.443 1.475 1.516 1.553 1.587 1.619 1.651 1.678 1.69 1.697 1.705 1.704 1.694 1.691 1.67 1.604 1.541 1.476 1.359 1.2 0.985 0.7 0.3 -0.231 -1.002 -2.166 -4.025 -6.169 -7.846 -9.237 -10.415 -11.399 -12.214 -12.934 -13.558 -14.166 -14.663 -15.102 -15.515 -15.882 -16.229 -16.547 -16.858 -17.126 -17.348 -17.58 -17.828 -18.033 -18.239 -18.452 -18.622 -18.798 -18.976 -19.17 -19.364 -19.492 -19.623 -19.833 -19.98 -20.128 -20.207 -20.376 -20.547 -20.713 -20.798 -21.022 -21.113 -21.235 -21.352 -21.597 -21.73 -21.873 -22.013 -22.159 -22.343 -22.633 -23.347 -9 ,22992 ,TETRA ,17606397,Sun Nov 28 20:04:50 CET,Sun Nov 28 21:54:26 CET,0.0 0.215 0.312 0.4 0.464 0.516 0.553 0.592 0.678 0.714 0.742 0.69 0.827 0.845 0.884 0.92 0.973 0.997 1.029 1.054 1.081 1.107 1.137 1.184 1.227 1.264 1.299 1.33 1.355 1.374 1.393 1.414 1.438 1.457 1.486 1.507 1.499 1.482 1.467 1.449 1.398 1.305 1.178 1.046 0.854 0.544 0.138 -0.381 -1.154 -2.315 -4.162 -6.246 -7.901 -9.264 -10.406 -11.398 -12.245 -12.99 -13.608 -14.192 -14.69 -15.129 -15.544 -15.931 -16.273 -16.57 -16.869 -17.136 -17.37 -17.621 -17.875 -18.079 -18.298 -18.521 -18.681 -18.844 -19.012 -19.185 -19.37 -19.496 -19.626 -19.828 -19.972 -20.132 -20.21 -20.364 -20.53 -20.702 -20.788 -21.005 -21.046 -21.151 -21.276 -21.52 -21.647 -21.79 -21.95 -22.115 -22.316 -22.566 -23.452 -10 ,11481 ,TETRA ,17606398,Sun Nov 28 20:04:52 CET,Sun Nov 28 21:54:45 CET,0.0 0.17 0.244 0.302 0.342 0.377 0.408 0.44 0.509 0.545 0.573 0.501 0.633 0.651 0.682 0.718 0.752 0.768 0.791 0.81 0.846 0.869 0.89 0.921 0.95 0.974 1.0 1.028 1.055 1.083 1.116 1.138 1.151 1.162 1.17 1.183 1.187 1.166 1.126 1.085 1.022 0.922 0.786 0.635 0.432 0.14 -0.262 -0.79 -1.539 -2.664 -4.517 -6.665 -8.353 -9.686 -10.789 -11.798 -12.658 -13.387 -14.019 -14.623 -15.112 -15.531 -15.926 -16.29 -16.611 -16.893 -17.184 -17.456 -17.684 -17.912 -18.142 -18.327 -18.523 -18.744 -18.911 -19.076 -19.253 -19.427 -19.617 -19.759 -19.894 -20.1 -20.246 -20.386 -20.462 -20.629 -20.807 -20.986 -21.073 -21.298 -21.363 -21.468 -21.577 -21.795 -21.921 -22.062 -22.214 -22.396 -22.618 -22.902 -23.804 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_20_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_20_19.txt deleted file mode 100644 index ab0d9297..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_20_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13149 ,TETRA ,17606399,Sun Nov 28 20:04:54 CET,Sun Nov 28 21:57:56 CET,0.0 0.228 0.379 0.507 0.619 0.722 0.825 0.914 1.078 1.155 1.238 1.259 1.471 1.548 1.689 1.824 1.967 2.033 2.161 2.288 2.475 2.592 2.707 2.883 3.057 3.231 3.397 3.558 3.772 3.988 4.196 4.44 4.686 4.928 5.216 5.55 5.878 6.237 6.629 7.058 7.518 8.041 8.652 9.27 9.99 10.814 11.818 12.975 14.366 16.043 18.079 19.734 20.623 21.143 21.514 21.754 21.854 21.915 21.913 21.864 21.828 21.771 21.686 21.584 21.48 21.394 21.313 21.24 21.169 21.074 20.94 20.821 20.702 20.582 20.478 20.361 20.234 20.091 19.938 19.836 19.735 19.574 19.453 19.319 19.247 19.072 18.894 18.735 18.654 18.456 18.36 18.249 18.129 17.825 17.627 17.401 17.134 16.809 16.414 15.798 13.177 -2 ,24446 ,TETRA ,17606400,Sun Nov 28 20:04:55 CET,Sun Nov 28 21:57:28 CET,0.0 0.221 0.373 0.487 0.598 0.711 0.809 0.894 1.064 1.148 1.226 1.241 1.45 1.518 1.657 1.788 1.921 1.987 2.107 2.223 2.398 2.522 2.649 2.835 3.001 3.159 3.321 3.49 3.71 3.916 4.121 4.37 4.607 4.84 5.115 5.433 5.746 6.086 6.481 6.911 7.338 7.824 8.42 9.028 9.767 10.676 11.714 12.882 14.342 16.068 18.114 19.764 20.664 21.186 21.523 21.751 21.887 21.959 21.969 21.917 21.869 21.816 21.731 21.647 21.548 21.45 21.357 21.272 21.187 21.093 20.98 20.872 20.767 20.655 20.565 20.467 20.359 20.246 20.127 20.033 19.926 19.77 19.664 19.542 19.47 19.303 19.119 18.927 18.827 18.62 18.525 18.402 18.262 17.941 17.753 17.532 17.299 17.06 16.789 16.377 13.753 -3 ,8064 ,TETRA ,17606401,Sun Nov 28 20:04:49 CET,Sun Nov 28 21:56:47 CET,0.0 0.338 0.551 0.7 0.803 0.891 0.983 1.074 1.235 1.317 1.396 1.403 1.61 1.682 1.832 1.967 2.091 2.155 2.287 2.41 2.593 2.713 2.825 2.988 3.148 3.306 3.468 3.627 3.841 4.046 4.248 4.49 4.706 4.915 5.182 5.502 5.801 6.131 6.501 6.893 7.335 7.853 8.465 9.109 9.862 10.722 11.739 12.867 14.201 15.868 17.826 19.321 20.181 20.742 21.116 21.326 21.408 21.443 21.453 21.423 21.382 21.348 21.31 21.272 21.209 21.123 21.028 20.944 20.868 20.786 20.688 20.599 20.496 20.378 20.286 20.18 20.067 19.953 19.832 19.751 19.659 19.493 19.367 19.227 19.154 19.005 18.845 18.662 18.561 18.346 18.211 18.071 17.934 17.612 17.423 17.223 17.0 16.74 16.435 16.023 13.675 -4 ,2752 ,TETRA ,17606402,Sun Nov 28 20:04:51 CET,Sun Nov 28 21:57:39 CET,0.0 0.218 0.368 0.485 0.574 0.665 0.765 0.874 1.062 1.132 1.206 1.237 1.455 1.527 1.659 1.785 1.913 1.974 2.085 2.204 2.379 2.489 2.605 2.784 2.957 3.123 3.284 3.44 3.64 3.837 4.041 4.301 4.551 4.779 5.055 5.374 5.676 5.998 6.365 6.776 7.208 7.707 8.315 8.931 9.64 10.481 11.488 12.671 14.108 15.732 17.669 19.306 20.292 20.892 21.227 21.454 21.58 21.654 21.684 21.657 21.634 21.596 21.534 21.45 21.357 21.261 21.133 20.998 20.876 20.75 20.634 20.54 20.428 20.306 20.214 20.121 20.014 19.876 19.711 19.608 19.522 19.382 19.269 19.139 19.058 18.88 18.717 18.535 18.42 18.195 18.081 17.964 17.837 17.511 17.307 17.096 16.851 16.555 16.23 15.711 12.875 -5 ,19724 ,TETRA ,17606403,Sun Nov 28 20:04:53 CET,Sun Nov 28 21:57:24 CET,0.0 0.187 0.318 0.439 0.552 0.653 0.751 0.847 1.04 1.126 1.205 1.224 1.44 1.514 1.671 1.816 1.953 2.023 2.164 2.295 2.487 2.613 2.733 2.913 3.086 3.25 3.417 3.577 3.784 3.989 4.183 4.434 4.671 4.901 5.187 5.51 5.82 6.166 6.552 6.974 7.411 7.891 8.471 9.115 9.885 10.758 11.787 12.918 14.313 16.026 18.128 19.831 20.781 21.37 21.758 21.983 22.062 22.071 22.054 22.019 21.972 21.918 21.843 21.754 21.66 21.559 21.449 21.331 21.239 21.141 21.002 20.893 20.775 20.646 20.552 20.44 20.313 20.177 20.014 19.901 19.79 19.587 19.435 19.302 19.229 19.057 18.883 18.704 18.607 18.383 18.243 18.093 17.915 17.525 17.324 17.102 16.82 16.473 16.057 15.448 13.052 -6 ,19826 ,TETRA ,17606404,Sun Nov 28 20:04:54 CET,Sun Nov 28 21:57:55 CET,0.0 0.317 0.449 0.556 0.658 0.752 0.846 0.941 1.114 1.194 1.279 1.317 1.538 1.621 1.781 1.923 2.056 2.121 2.245 2.361 2.54 2.661 2.776 2.94 3.105 3.27 3.433 3.597 3.809 4.012 4.211 4.447 4.677 4.906 5.174 5.485 5.792 6.133 6.501 6.893 7.311 7.807 8.423 9.061 9.811 10.665 11.678 12.857 14.274 16.009 18.134 19.787 20.703 21.281 21.643 21.86 21.951 21.967 21.96 21.916 21.859 21.795 21.723 21.634 21.531 21.449 21.348 21.225 21.117 21.005 20.861 20.72 20.589 20.445 20.332 20.228 20.109 19.982 19.849 19.75 19.637 19.448 19.316 19.171 19.099 18.938 18.749 18.565 18.466 18.254 18.139 18.01 17.871 17.596 17.425 17.231 17.014 16.744 16.42 15.917 13.347 -7 ,19219 ,TETRA ,17606405,Sun Nov 28 20:04:57 CET,Sun Nov 28 21:57:30 CET,0.0 0.213 0.368 0.484 0.599 0.716 0.823 0.92 1.107 1.198 1.282 1.304 1.506 1.575 1.708 1.84 1.975 2.041 2.171 2.301 2.497 2.626 2.751 2.942 3.127 3.3 3.474 3.64 3.844 4.051 4.26 4.511 4.752 4.988 5.284 5.615 5.924 6.256 6.634 7.077 7.528 8.022 8.626 9.238 9.976 10.827 11.821 12.96 14.344 16.044 18.092 19.854 20.906 21.507 21.853 22.062 22.174 22.229 22.231 22.189 22.16 22.111 22.041 21.975 21.91 21.844 21.754 21.64 21.535 21.426 21.295 21.184 21.073 20.942 20.822 20.705 20.596 20.487 20.367 20.272 20.16 19.963 19.82 19.683 19.62 19.49 19.326 19.141 19.056 18.839 18.69 18.558 18.414 18.072 17.888 17.683 17.47 17.213 16.857 16.31 14.24 -8 ,1777 ,TETRA ,17606406,Sun Nov 28 20:04:51 CET,Sun Nov 28 21:57:08 CET,0.0 0.25 0.394 0.483 0.587 0.683 0.778 0.873 1.035 1.105 1.181 1.19 1.395 1.463 1.594 1.736 1.872 1.935 2.057 2.177 2.368 2.495 2.613 2.776 2.941 3.108 3.271 3.418 3.614 3.821 4.022 4.276 4.512 4.723 4.977 5.295 5.622 5.974 6.352 6.753 7.187 7.709 8.314 8.916 9.662 10.509 11.483 12.622 13.998 15.687 17.731 19.453 20.44 21.026 21.412 21.656 21.781 21.855 21.893 21.866 21.825 21.777 21.708 21.623 21.528 21.435 21.315 21.187 21.075 20.982 20.885 20.78 20.661 20.525 20.415 20.295 20.172 20.058 19.924 19.826 19.713 19.539 19.429 19.299 19.223 19.056 18.869 18.686 18.595 18.391 18.303 18.175 18.037 17.755 17.571 17.333 17.079 16.829 16.479 15.916 13.706 -9 ,14365 ,TETRA ,17606407,Sun Nov 28 20:04:52 CET,Sun Nov 28 21:57:27 CET,0.0 0.232 0.371 0.5 0.62 0.723 0.818 0.895 1.05 1.131 1.21 1.217 1.43 1.509 1.66 1.807 1.952 2.019 2.149 2.283 2.484 2.607 2.721 2.892 3.066 3.23 3.387 3.544 3.751 3.956 4.158 4.403 4.646 4.887 5.171 5.498 5.815 6.171 6.565 6.999 7.459 7.979 8.603 9.256 10.028 10.902 11.92 13.104 14.554 16.302 18.54 20.399 21.438 22.044 22.368 22.57 22.641 22.651 22.666 22.642 22.594 22.53 22.434 22.326 22.236 22.142 22.026 21.897 21.767 21.643 21.507 21.385 21.25 21.097 20.979 20.866 20.748 20.619 20.478 20.379 20.278 20.099 19.967 19.839 19.774 19.629 19.473 19.305 19.21 18.991 18.849 18.712 18.574 18.255 18.073 17.897 17.68 17.379 17.043 16.524 14.456 -10 ,27206 ,TETRA ,17606408,Sun Nov 28 20:04:54 CET,Sun Nov 28 21:57:49 CET,0.0 0.367 0.477 0.58 0.678 0.783 0.894 1.002 1.2 1.281 1.358 1.372 1.584 1.654 1.791 1.929 2.062 2.122 2.238 2.359 2.548 2.668 2.79 2.957 3.122 3.295 3.463 3.619 3.815 4.011 4.207 4.453 4.685 4.911 5.188 5.5 5.798 6.141 6.527 6.942 7.367 7.857 8.458 9.087 9.856 10.709 11.687 12.841 14.231 15.943 18.044 19.762 20.721 21.298 21.689 21.956 22.106 22.18 22.199 22.176 22.125 22.041 21.943 21.865 21.787 21.687 21.579 21.493 21.415 21.303 21.184 21.076 20.944 20.818 20.716 20.603 20.483 20.349 20.202 20.096 19.987 19.81 19.676 19.529 19.451 19.293 19.124 18.936 18.848 18.65 18.539 18.422 18.289 17.939 17.721 17.485 17.24 16.999 16.725 16.269 13.842 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_20_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_20_33.txt deleted file mode 100644 index a0b73c1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_20_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24715 ,TETRA ,17606409,Sun Nov 28 20:04:55 CET,Sun Nov 28 21:57:47 CET,0.0 1.134 1.447 1.706 1.904 2.082 2.242 2.389 2.642 2.764 2.88 2.969 3.221 3.327 3.538 3.747 3.933 4.024 4.203 4.363 4.594 4.746 4.886 5.09 5.288 5.481 5.667 5.852 6.094 6.307 6.538 6.826 7.08 7.318 7.593 7.921 8.238 8.558 8.908 9.312 9.738 10.227 10.796 11.378 12.064 12.83 13.738 14.776 15.943 17.188 18.645 19.847 20.382 20.555 20.595 20.602 20.528 20.391 20.276 20.141 19.975 19.804 19.636 19.466 19.289 19.11 18.911 18.729 18.569 18.391 18.194 18.033 17.876 17.723 17.605 17.469 17.302 17.115 16.919 16.796 16.686 16.496 16.335 16.173 16.091 15.905 15.714 15.528 15.417 15.183 15.051 14.9 14.732 14.405 14.222 13.978 13.695 13.367 12.964 12.488 10.1 -2 ,616 ,TETRA ,17606410,Sun Nov 28 20:06:02 CET,Sun Nov 28 21:59:00 CET,0.0 0.739 1.02 1.244 1.434 1.605 1.77 1.943 2.222 2.332 2.439 2.518 2.759 2.863 3.078 3.266 3.442 3.536 3.73 3.922 4.184 4.328 4.454 4.65 4.854 5.048 5.239 5.446 5.722 5.965 6.206 6.503 6.763 7.009 7.295 7.627 7.958 8.353 8.788 9.206 9.624 10.112 10.7 11.302 12.014 12.8 13.67 14.642 15.75 17.008 18.45 19.491 20.032 20.258 20.302 20.275 20.192 20.092 19.994 19.869 19.72 19.541 19.362 19.199 19.031 18.851 18.676 18.524 18.381 18.247 18.103 17.977 17.842 17.7 17.593 17.477 17.338 17.176 16.986 16.858 16.745 16.573 16.463 16.327 16.244 16.076 15.887 15.679 15.579 15.359 15.234 15.124 15.005 14.654 14.429 14.2 13.987 13.752 13.433 12.911 10.922 -3 ,12781 ,TETRA ,17606411,Sun Nov 28 20:06:02 CET,Sun Nov 28 21:55:13 CET,0.0 0.824 1.135 1.385 1.578 1.747 1.914 2.051 2.306 2.434 2.56 2.671 2.924 3.026 3.226 3.409 3.573 3.656 3.832 4.005 4.244 4.384 4.529 4.748 4.946 5.143 5.339 5.52 5.737 5.956 6.173 6.436 6.708 6.972 7.26 7.576 7.864 8.192 8.556 8.933 9.348 9.84 10.416 10.979 11.628 12.325 13.172 14.173 15.266 16.465 17.798 18.782 19.24 19.364 19.348 19.244 19.108 18.945 18.777 18.591 18.427 18.264 18.087 17.899 17.707 17.525 17.327 17.154 17.012 16.854 16.666 16.512 16.351 16.167 16.008 15.851 15.693 15.517 15.325 15.191 15.064 14.865 14.711 14.543 14.455 14.278 14.085 13.856 13.751 13.532 13.411 13.286 13.153 12.869 12.687 12.478 12.22 11.936 11.602 11.114 9.09 -4 ,7939 ,TETRA ,17606412,Sun Nov 28 20:07:57 CET,Sun Nov 28 22:04:43 CET,0.0 0.969 1.283 1.524 1.725 1.903 2.074 2.233 2.501 2.631 2.753 2.851 3.097 3.196 3.4 3.594 3.758 3.838 4.014 4.198 4.448 4.598 4.741 4.938 5.128 5.319 5.518 5.72 5.978 6.217 6.425 6.688 6.943 7.181 7.473 7.795 8.098 8.437 8.813 9.239 9.699 10.193 10.765 11.342 12.01 12.756 13.571 14.438 15.502 16.716 18.043 18.997 19.392 19.551 19.615 19.594 19.512 19.427 19.331 19.185 19.035 18.892 18.73 18.582 18.442 18.282 18.129 17.991 17.851 17.71 17.574 17.452 17.315 17.161 17.039 16.906 16.76 16.608 16.446 16.341 16.235 16.067 15.94 15.781 15.698 15.549 15.381 15.21 15.108 14.867 14.708 14.571 14.437 14.119 13.917 13.694 13.461 13.168 12.729 12.118 9.884 -5 ,9041 ,TETRA ,17606413,Sun Nov 28 20:07:58 CET,Sun Nov 28 21:51:27 CET,0.0 0.747 1.049 1.27 1.467 1.635 1.789 1.942 2.226 2.348 2.459 2.52 2.742 2.848 3.053 3.229 3.396 3.471 3.631 3.801 4.051 4.201 4.346 4.549 4.723 4.897 5.076 5.251 5.466 5.702 5.95 6.208 6.456 6.708 6.983 7.293 7.613 7.979 8.372 8.779 9.188 9.654 10.212 10.784 11.459 12.205 13.03 13.95 15.059 16.394 17.815 18.682 19.064 19.141 19.133 19.086 18.955 18.815 18.672 18.502 18.338 18.161 17.985 17.798 17.6 17.426 17.225 17.022 16.85 16.687 16.53 16.392 16.23 16.045 15.891 15.725 15.556 15.367 15.164 15.04 14.916 14.719 14.576 14.412 14.329 14.165 13.984 13.769 13.648 13.419 13.263 13.108 12.941 12.564 12.342 12.082 11.789 11.467 11.052 10.434 7.528 -6 ,7883 ,TETRA ,17606414,Sun Nov 28 20:09:01 CET,Sun Nov 28 22:01:48 CET,0.0 0.836 1.111 1.314 1.501 1.689 1.873 2.031 2.303 2.433 2.552 2.64 2.89 3.003 3.202 3.378 3.548 3.637 3.812 3.961 4.186 4.336 4.48 4.692 4.89 5.09 5.305 5.509 5.731 5.928 6.129 6.387 6.645 6.902 7.197 7.517 7.814 8.147 8.524 8.926 9.365 9.841 10.384 10.95 11.612 12.346 13.201 14.197 15.308 16.549 17.972 18.937 19.439 19.725 19.823 19.794 19.713 19.596 19.477 19.326 19.182 19.06 18.916 18.784 18.66 18.538 18.389 18.234 18.103 17.975 17.833 17.705 17.565 17.42 17.304 17.166 17.028 16.897 16.751 16.644 16.517 16.32 16.194 16.051 15.972 15.808 15.647 15.476 15.375 15.147 15.021 14.9 14.776 14.492 14.3 14.072 13.836 13.567 13.223 12.704 10.665 -7 ,14275 ,TETRA ,17606415,Sun Nov 28 20:09:01 CET,Sun Nov 28 21:59:46 CET,0.0 0.94 1.274 1.538 1.743 1.922 2.084 2.236 2.502 2.617 2.741 2.852 3.096 3.194 3.402 3.598 3.787 3.871 4.022 4.168 4.386 4.52 4.64 4.83 5.02 5.214 5.402 5.578 5.819 6.053 6.273 6.529 6.776 7.021 7.318 7.663 7.99 8.341 8.71 9.094 9.499 9.976 10.549 11.103 11.737 12.48 13.348 14.287 15.399 16.708 18.163 19.289 19.835 20.061 20.163 20.173 20.098 19.988 19.887 19.771 19.655 19.537 19.398 19.252 19.102 18.97 18.817 18.673 18.55 18.417 18.27 18.141 18.006 17.863 17.752 17.623 17.478 17.31 17.131 17.014 16.892 16.693 16.566 16.436 16.36 16.195 16.035 15.862 15.77 15.56 15.442 15.316 15.183 14.892 14.732 14.541 14.318 14.026 13.661 13.2 10.069 -8 ,1222 ,TETRA ,17606416,Sun Nov 28 20:10:00 CET,Sun Nov 28 22:06:36 CET,0.0 1.035 1.372 1.609 1.806 2.004 2.182 2.332 2.618 2.742 2.847 2.936 3.19 3.292 3.498 3.702 3.893 3.978 4.136 4.301 4.546 4.691 4.834 5.041 5.227 5.417 5.611 5.801 6.041 6.271 6.502 6.776 7.044 7.3 7.58 7.903 8.229 8.58 8.956 9.358 9.781 10.274 10.851 11.437 12.128 12.9 13.836 14.84 15.949 17.227 18.693 19.761 20.256 20.515 20.615 20.616 20.543 20.431 20.322 20.231 20.154 20.038 19.916 19.804 19.651 19.495 19.347 19.218 19.107 18.975 18.81 18.669 18.541 18.389 18.251 18.124 18.0 17.856 17.681 17.542 17.41 17.234 17.104 16.961 16.886 16.727 16.556 16.349 16.244 16.025 15.891 15.762 15.641 15.335 15.148 14.938 14.686 14.374 13.976 13.386 11.249 -9 ,22257 ,TETRA ,17606417,Sun Nov 28 20:10:00 CET,Sun Nov 28 22:03:36 CET,0.0 0.76 1.091 1.348 1.561 1.771 1.938 2.078 2.353 2.48 2.582 2.636 2.856 2.953 3.15 3.344 3.522 3.605 3.776 3.932 4.135 4.266 4.394 4.591 4.777 4.966 5.161 5.333 5.55 5.763 5.971 6.23 6.485 6.719 6.98 7.306 7.62 7.949 8.298 8.665 9.096 9.573 10.076 10.587 11.187 11.903 12.776 13.753 14.864 16.119 17.556 18.502 18.904 19.024 19.013 18.949 18.831 18.672 18.507 18.317 18.146 17.989 17.818 17.644 17.478 17.324 17.144 16.975 16.822 16.662 16.494 16.356 16.214 16.058 15.941 15.804 15.657 15.51 15.341 15.215 15.096 14.9 14.744 14.58 14.489 14.319 14.157 13.975 13.874 13.648 13.519 13.402 13.275 12.971 12.801 12.608 12.387 12.147 11.843 11.412 9.375 -10 ,7313 ,TETRA ,17606418,Sun Nov 28 20:10:02 CET,Sun Nov 28 22:06:39 CET,0.0 0.897 1.194 1.427 1.633 1.804 1.966 2.132 2.421 2.544 2.669 2.769 3.016 3.113 3.282 3.448 3.619 3.698 3.851 4.008 4.232 4.368 4.495 4.681 4.866 5.046 5.241 5.442 5.685 5.928 6.163 6.426 6.669 6.902 7.183 7.513 7.834 8.207 8.591 8.968 9.399 9.89 10.465 11.061 11.753 12.512 13.369 14.339 15.409 16.617 17.957 18.801 19.145 19.192 19.134 19.032 18.894 18.762 18.615 18.411 18.214 18.046 17.864 17.671 17.477 17.285 17.087 16.896 16.732 16.57 16.392 16.24 16.074 15.875 15.722 15.583 15.435 15.267 15.095 14.975 14.846 14.633 14.463 14.271 14.179 14.005 13.835 13.651 13.546 13.328 13.2 13.046 12.884 12.532 12.306 12.052 11.762 11.435 11.014 10.409 8.269 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_21_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_21_22.txt deleted file mode 100644 index 0a5ebe98..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_21_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22407 ,TETRA ,17606419,Sun Nov 28 20:10:02 CET,Sun Nov 28 22:00:06 CET,0.0 1.054 1.359 1.559 1.724 1.872 2.014 2.152 2.389 2.491 2.598 2.707 2.886 2.974 3.151 3.319 3.47 3.539 3.668 3.791 3.972 4.088 4.193 4.331 4.458 4.592 4.73 4.863 5.042 5.209 5.362 5.561 5.751 5.935 6.162 6.42 6.659 6.918 7.187 7.451 7.716 8.014 8.365 8.706 9.083 9.484 9.927 10.416 10.94 11.464 11.869 12.038 12.033 11.855 11.644 11.461 11.285 11.078 10.878 10.698 10.558 10.423 10.267 10.107 9.962 9.835 9.701 9.582 9.47 9.351 9.233 9.121 8.995 8.864 8.762 8.659 8.56 8.452 8.328 8.242 8.148 7.99 7.89 7.791 7.738 7.624 7.506 7.392 7.33 7.177 7.13 7.056 6.977 6.809 6.72 6.622 6.524 6.404 6.215 5.989 5.308 -2 ,12273 ,TETRA ,17606420,Sun Nov 28 20:10:05 CET,Sun Nov 28 22:05:42 CET,0.0 0.815 1.081 1.29 1.47 1.633 1.768 1.889 2.107 2.211 2.313 2.419 2.607 2.691 2.845 3.002 3.157 3.231 3.362 3.485 3.666 3.774 3.874 4.026 4.185 4.341 4.49 4.63 4.8 4.96 5.116 5.302 5.484 5.665 5.885 6.121 6.33 6.55 6.801 7.092 7.388 7.691 8.028 8.343 8.689 9.068 9.499 9.916 10.355 10.863 11.28 11.443 11.41 11.233 11.038 10.844 10.644 10.446 10.267 10.085 9.911 9.763 9.632 9.509 9.39 9.259 9.112 8.98 8.867 8.749 8.616 8.505 8.404 8.297 8.213 8.125 8.021 7.904 7.783 7.703 7.627 7.513 7.423 7.33 7.284 7.19 7.092 6.981 6.914 6.76 6.708 6.629 6.541 6.371 6.28 6.164 6.05 5.938 5.755 5.473 4.433 -3 ,15824 ,TETRA ,17606421,Sun Nov 28 20:10:02 CET,Sun Nov 28 22:03:46 CET,0.0 0.89 1.152 1.357 1.528 1.69 1.836 1.969 2.214 2.324 2.428 2.523 2.697 2.773 2.925 3.078 3.219 3.29 3.426 3.557 3.765 3.904 4.026 4.193 4.359 4.52 4.675 4.828 5.02 5.197 5.365 5.564 5.753 5.942 6.162 6.406 6.624 6.855 7.112 7.375 7.644 7.942 8.288 8.642 9.023 9.412 9.852 10.315 10.783 11.322 11.815 11.97 11.948 11.856 11.734 11.589 11.42 11.252 11.087 10.899 10.731 10.575 10.42 10.254 10.104 9.977 9.831 9.705 9.605 9.495 9.37 9.252 9.136 9.026 8.94 8.849 8.748 8.637 8.519 8.442 8.367 8.249 8.164 8.075 8.03 7.935 7.824 7.71 7.645 7.48 7.414 7.332 7.249 7.06 6.951 6.842 6.708 6.562 6.427 6.253 5.558 -4 ,30700 ,TETRA ,17606422,Sun Nov 28 20:10:02 CET,Sun Nov 28 22:03:22 CET,0.0 0.994 1.258 1.467 1.649 1.793 1.915 2.032 2.246 2.355 2.46 2.564 2.744 2.825 2.982 3.137 3.288 3.363 3.504 3.626 3.809 3.933 4.056 4.231 4.387 4.532 4.669 4.798 4.963 5.129 5.291 5.476 5.645 5.828 6.054 6.302 6.536 6.787 7.054 7.331 7.611 7.906 8.265 8.641 9.039 9.428 9.852 10.333 10.89 11.414 11.758 11.775 11.605 11.427 11.249 11.008 10.751 10.497 10.271 10.031 9.821 9.644 9.474 9.321 9.173 9.024 8.872 8.738 8.61 8.467 8.321 8.207 8.091 7.955 7.843 7.729 7.607 7.48 7.355 7.264 7.153 6.977 6.854 6.737 6.677 6.54 6.405 6.254 6.174 6.009 5.94 5.867 5.793 5.63 5.533 5.43 5.32 5.191 5.0 4.729 3.772 -5 ,30437 ,TETRA ,17606423,Sun Nov 28 20:10:02 CET,Sun Nov 28 22:03:02 CET,0.0 1.083 1.328 1.515 1.687 1.841 1.978 2.108 2.343 2.448 2.55 2.645 2.833 2.933 3.101 3.249 3.4 3.471 3.599 3.716 3.893 4.013 4.135 4.308 4.481 4.649 4.81 4.96 5.147 5.316 5.47 5.665 5.854 6.055 6.289 6.533 6.766 7.003 7.256 7.529 7.805 8.111 8.449 8.788 9.175 9.576 10.02 10.508 11.01 11.501 11.977 12.139 12.1 11.946 11.769 11.592 11.422 11.251 11.073 10.901 10.755 10.62 10.493 10.358 10.22 10.099 9.969 9.843 9.733 9.616 9.488 9.383 9.281 9.178 9.097 8.999 8.892 8.794 8.692 8.613 8.524 8.399 8.308 8.209 8.159 8.061 7.949 7.819 7.755 7.597 7.542 7.472 7.396 7.229 7.143 7.026 6.902 6.794 6.642 6.427 5.768 -6 ,6947 ,TETRA ,17606424,Sun Nov 28 20:10:02 CET,Sun Nov 28 22:04:06 CET,0.0 1.001 1.3 1.529 1.7 1.841 1.986 2.119 2.344 2.457 2.557 2.647 2.826 2.907 3.062 3.2 3.334 3.404 3.553 3.691 3.88 4.003 4.119 4.281 4.427 4.568 4.699 4.823 4.993 5.148 5.302 5.486 5.656 5.83 6.028 6.242 6.456 6.676 6.916 7.202 7.488 7.771 8.094 8.444 8.84 9.257 9.709 10.19 10.772 11.371 11.907 12.128 12.069 11.922 11.767 11.578 11.386 11.227 11.062 10.876 10.705 10.537 10.373 10.213 10.058 9.904 9.744 9.602 9.478 9.342 9.178 9.05 8.928 8.8 8.692 8.587 8.481 8.34 8.187 8.081 7.967 7.781 7.649 7.527 7.469 7.338 7.206 7.07 7.003 6.852 6.802 6.736 6.661 6.494 6.389 6.279 6.151 5.979 5.784 5.542 4.778 -7 ,12956 ,TETRA ,17606425,Sun Nov 28 20:10:02 CET,Sun Nov 28 22:02:54 CET,0.0 0.895 1.113 1.301 1.472 1.619 1.763 1.884 2.094 2.199 2.303 2.403 2.586 2.684 2.88 3.06 3.228 3.311 3.467 3.621 3.841 3.97 4.093 4.265 4.437 4.619 4.793 4.948 5.138 5.321 5.506 5.714 5.901 6.085 6.3 6.546 6.779 7.018 7.279 7.565 7.861 8.183 8.518 8.86 9.281 9.698 10.13 10.576 11.057 11.549 11.896 11.972 11.905 11.759 11.54 11.316 11.13 10.956 10.793 10.622 10.479 10.336 10.179 10.008 9.852 9.732 9.61 9.485 9.358 9.227 9.098 8.986 8.865 8.755 8.682 8.593 8.488 8.38 8.262 8.179 8.103 7.986 7.903 7.806 7.758 7.658 7.544 7.431 7.377 7.23 7.197 7.133 7.064 6.911 6.82 6.709 6.595 6.484 6.334 6.103 5.406 -8 ,21547 ,TETRA ,17606426,Sun Nov 28 20:10:55 CET,Sun Nov 28 22:04:19 CET,0.0 0.959 1.251 1.507 1.715 1.882 2.027 2.143 2.357 2.462 2.56 2.656 2.843 2.934 3.094 3.242 3.395 3.465 3.594 3.724 3.905 4.017 4.126 4.278 4.427 4.574 4.717 4.862 5.061 5.244 5.421 5.632 5.826 6.027 6.25 6.473 6.69 6.925 7.186 7.472 7.75 8.04 8.373 8.715 9.111 9.513 9.932 10.385 10.878 11.385 11.821 12.0 11.972 11.879 11.705 11.467 11.233 11.014 10.812 10.592 10.403 10.238 10.074 9.925 9.772 9.621 9.465 9.326 9.203 9.069 8.926 8.817 8.712 8.596 8.507 8.419 8.316 8.209 8.106 8.029 7.939 7.799 7.693 7.579 7.527 7.426 7.311 7.192 7.132 6.978 6.923 6.848 6.768 6.603 6.516 6.405 6.287 6.171 6.0 5.777 5.334 -9 ,9557 ,TETRA ,17606427,Sun Nov 28 20:10:55 CET,Sun Nov 28 22:04:43 CET,0.0 0.952 1.241 1.457 1.633 1.789 1.924 2.044 2.289 2.4 2.496 2.575 2.755 2.84 2.997 3.133 3.269 3.339 3.456 3.566 3.747 3.874 3.994 4.172 4.335 4.477 4.613 4.749 4.93 5.105 5.268 5.453 5.631 5.802 5.988 6.192 6.4 6.625 6.854 7.107 7.386 7.689 8.02 8.364 8.772 9.211 9.687 10.172 10.659 11.19 11.704 11.861 11.765 11.532 11.277 11.005 10.74 10.506 10.3 10.075 9.873 9.688 9.504 9.337 9.173 9.003 8.832 8.678 8.538 8.387 8.232 8.11 7.975 7.834 7.723 7.604 7.477 7.349 7.207 7.102 7.004 6.835 6.713 6.587 6.523 6.39 6.246 6.095 6.015 5.853 5.775 5.684 5.588 5.387 5.276 5.156 5.043 4.92 4.741 4.528 3.716 -10 ,21301 ,TETRA ,17606428,Sun Nov 28 20:12:54 CET,Sun Nov 28 22:03:25 CET,0.0 0.996 1.264 1.478 1.676 1.831 1.975 2.11 2.375 2.499 2.61 2.718 2.899 2.98 3.131 3.28 3.422 3.489 3.617 3.745 3.928 4.041 4.152 4.302 4.44 4.577 4.707 4.833 4.989 5.141 5.29 5.462 5.63 5.791 5.975 6.17 6.357 6.574 6.799 7.041 7.307 7.592 7.911 8.228 8.6 9.02 9.489 9.994 10.513 10.955 11.37 11.483 11.316 11.121 10.877 10.6 10.341 10.08 9.85 9.631 9.434 9.238 9.062 8.906 8.743 8.576 8.4 8.252 8.122 7.984 7.839 7.72 7.604 7.478 7.373 7.263 7.151 7.038 6.913 6.82 6.733 6.609 6.518 6.42 6.371 6.268 6.153 6.033 5.966 5.804 5.752 5.675 5.584 5.407 5.314 5.219 5.109 4.968 4.793 4.579 3.817 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_21_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_21_32.txt deleted file mode 100644 index a55252ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_21_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5935 ,KEBNE ,17027676,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:20:09 CET,0.0 0.284 0.358 0.423 0.481 0.524 0.556 0.582 0.645 0.677 0.701 0.643 0.746 0.762 0.788 0.813 0.824 0.823 0.83 0.832 0.819 0.807 0.797 0.78 0.767 0.754 0.734 0.708 0.673 0.634 0.585 0.529 0.471 0.401 0.312 0.21 0.103 -0.034 -0.185 -0.369 -0.585 -0.846 -1.169 -1.522 -1.988 -2.605 -3.428 -4.477 -5.891 -7.898 -10.997 -14.401 -17.066 -19.139 -20.808 -22.275 -23.554 -24.676 -25.607 -26.504 -27.232 -27.881 -28.513 -29.089 -29.6 -30.06 -30.534 -30.933 -31.285 -31.658 -32.04 -32.362 -32.686 -33.021 -33.273 -33.518 -33.78 -34.057 -34.33 -34.52 -34.712 -34.991 -35.203 -35.439 -35.559 -35.803 -36.053 -36.327 -36.476 -36.758 -36.936 -37.103 -37.278 -37.665 -37.905 -38.186 -38.456 -38.724 -39.049 -39.528 -41.805 -2 ,18062 ,KEBNE ,17027677,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:18:54 CET,0.0 0.114 0.178 0.237 0.303 0.361 0.398 0.431 0.475 0.496 0.52 0.454 0.556 0.568 0.592 0.609 0.626 0.633 0.641 0.649 0.659 0.656 0.651 0.643 0.626 0.611 0.593 0.567 0.536 0.5 0.468 0.441 0.407 0.359 0.294 0.218 0.126 0.01 -0.137 -0.328 -0.521 -0.761 -1.082 -1.425 -1.879 -2.477 -3.258 -4.247 -5.657 -7.724 -10.909 -14.343 -16.93 -19.041 -20.753 -22.199 -23.446 -24.547 -25.469 -26.352 -27.086 -27.721 -28.317 -28.876 -29.376 -29.825 -30.319 -30.763 -31.129 -31.496 -31.875 -32.185 -32.517 -32.865 -33.119 -33.379 -33.648 -33.924 -34.216 -34.419 -34.628 -34.939 -35.148 -35.392 -35.531 -35.797 -36.078 -36.362 -36.506 -36.8 -36.984 -37.14 -37.305 -37.671 -37.888 -38.131 -38.381 -38.659 -39.017 -39.54 -41.777 -3 ,18755 ,KEBNE ,17027678,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:19:36 CET,0.0 0.083 0.168 0.23 0.289 0.334 0.364 0.401 0.462 0.482 0.503 0.445 0.548 0.558 0.583 0.607 0.609 0.61 0.616 0.615 0.601 0.592 0.582 0.564 0.537 0.506 0.482 0.465 0.437 0.405 0.378 0.337 0.282 0.221 0.142 0.048 -0.041 -0.142 -0.269 -0.435 -0.64 -0.889 -1.221 -1.589 -2.05 -2.649 -3.445 -4.486 -5.885 -7.876 -11.023 -14.519 -17.232 -19.394 -21.152 -22.692 -23.974 -25.046 -25.947 -26.819 -27.552 -28.214 -28.833 -29.391 -29.907 -30.362 -30.822 -31.249 -31.622 -31.994 -32.375 -32.705 -33.041 -33.367 -33.617 -33.868 -34.128 -34.406 -34.693 -34.891 -35.1 -35.439 -35.689 -35.921 -36.024 -36.264 -36.523 -36.77 -36.903 -37.173 -37.331 -37.498 -37.673 -38.064 -38.293 -38.511 -38.719 -38.963 -39.317 -39.893 -43.153 -4 ,889 ,KEBNE ,17027679,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:19:05 CET,0.0 0.222 0.306 0.369 0.409 0.433 0.466 0.501 0.546 0.563 0.578 0.505 0.609 0.617 0.629 0.635 0.637 0.645 0.667 0.67 0.66 0.656 0.65 0.638 0.62 0.593 0.564 0.541 0.508 0.464 0.418 0.354 0.276 0.202 0.115 0.004 -0.116 -0.269 -0.453 -0.649 -0.872 -1.145 -1.495 -1.891 -2.39 -3.019 -3.856 -4.909 -6.327 -8.356 -11.477 -14.904 -17.565 -19.685 -21.434 -22.931 -24.175 -25.258 -26.19 -27.072 -27.769 -28.401 -29.003 -29.549 -30.054 -30.522 -30.994 -31.414 -31.789 -32.178 -32.554 -32.855 -33.174 -33.513 -33.793 -34.065 -34.342 -34.641 -34.936 -35.134 -35.346 -35.662 -35.871 -36.115 -36.245 -36.502 -36.79 -37.082 -37.22 -37.49 -37.674 -37.852 -38.043 -38.429 -38.637 -38.878 -39.137 -39.416 -39.803 -40.448 -43.549 -5 ,16460 ,KEBNE ,17027680,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:20:58 CET,0.0 0.227 0.361 0.45 0.535 0.613 0.677 0.732 0.823 0.853 0.89 0.862 0.981 1.012 1.061 1.103 1.141 1.159 1.194 1.23 1.279 1.314 1.351 1.385 1.397 1.405 1.406 1.395 1.368 1.337 1.303 1.26 1.221 1.169 1.093 1.001 0.916 0.818 0.684 0.528 0.353 0.11 -0.221 -0.577 -1.051 -1.654 -2.443 -3.495 -4.965 -7.067 -10.325 -13.858 -16.464 -18.539 -20.237 -21.696 -22.918 -24.012 -24.923 -25.776 -26.509 -27.126 -27.694 -28.228 -28.717 -29.171 -29.631 -30.049 -30.416 -30.77 -31.133 -31.434 -31.757 -32.095 -32.342 -32.606 -32.881 -33.154 -33.438 -33.633 -33.829 -34.123 -34.327 -34.543 -34.657 -34.896 -35.135 -35.384 -35.519 -35.795 -35.965 -36.13 -36.308 -36.717 -36.933 -37.168 -37.438 -37.722 -38.09 -38.592 -41.019 -6 ,22920 ,KEBNE ,17027681,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:18:51 CET,0.0 0.28 0.4 0.481 0.525 0.564 0.593 0.619 0.665 0.684 0.692 0.615 0.721 0.733 0.754 0.773 0.785 0.785 0.777 0.772 0.772 0.77 0.765 0.748 0.722 0.701 0.684 0.664 0.635 0.603 0.57 0.529 0.481 0.428 0.369 0.285 0.185 0.063 -0.083 -0.25 -0.46 -0.709 -1.024 -1.398 -1.865 -2.447 -3.24 -4.297 -5.721 -7.738 -10.912 -14.443 -17.16 -19.297 -21.004 -22.508 -23.79 -24.901 -25.811 -26.689 -27.455 -28.116 -28.726 -29.295 -29.807 -30.272 -30.749 -31.177 -31.544 -31.92 -32.32 -32.64 -32.958 -33.281 -33.538 -33.806 -34.083 -34.364 -34.654 -34.842 -35.03 -35.314 -35.513 -35.727 -35.837 -36.081 -36.334 -36.6 -36.738 -37.002 -37.19 -37.365 -37.53 -37.904 -38.116 -38.346 -38.604 -38.917 -39.26 -39.729 -42.344 -7 ,27766 ,KEBNE ,17027682,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:20:10 CET,0.0 0.301 0.454 0.517 0.593 0.66 0.713 0.765 0.842 0.869 0.893 0.845 0.954 0.969 0.999 1.027 1.054 1.064 1.081 1.096 1.112 1.113 1.112 1.116 1.115 1.102 1.084 1.069 1.049 1.029 1.012 0.989 0.951 0.897 0.831 0.768 0.689 0.573 0.441 0.279 0.085 -0.148 -0.444 -0.784 -1.23 -1.79 -2.565 -3.582 -4.975 -7.006 -10.17 -13.627 -16.257 -18.404 -20.177 -21.674 -22.928 -24.013 -24.934 -25.834 -26.578 -27.239 -27.843 -28.383 -28.879 -29.318 -29.769 -30.169 -30.498 -30.847 -31.22 -31.512 -31.824 -32.146 -32.385 -32.634 -32.887 -33.162 -33.442 -33.632 -33.838 -34.147 -34.366 -34.591 -34.697 -34.929 -35.169 -35.399 -35.52 -35.787 -35.98 -36.153 -36.346 -36.778 -36.991 -37.221 -37.47 -37.729 -38.074 -38.555 -40.721 -8 ,24290 ,KEBNE ,17027683,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:19:38 CET,0.0 0.163 0.216 0.271 0.325 0.357 0.377 0.4 0.449 0.477 0.51 0.467 0.582 0.613 0.667 0.708 0.744 0.762 0.787 0.805 0.831 0.847 0.86 0.877 0.887 0.89 0.886 0.871 0.846 0.83 0.814 0.783 0.742 0.689 0.617 0.529 0.43 0.3 0.158 0.009 -0.17 -0.424 -0.75 -1.111 -1.584 -2.167 -2.963 -4.021 -5.451 -7.49 -10.634 -14.103 -16.832 -19.021 -20.803 -22.35 -23.652 -24.762 -25.656 -26.527 -27.259 -27.902 -28.513 -29.071 -29.581 -30.048 -30.537 -30.961 -31.316 -31.677 -32.026 -32.311 -32.609 -32.918 -33.153 -33.397 -33.657 -33.923 -34.202 -34.396 -34.587 -34.868 -35.077 -35.309 -35.426 -35.651 -35.887 -36.153 -36.287 -36.552 -36.709 -36.852 -37.009 -37.381 -37.591 -37.847 -38.159 -38.514 -38.934 -39.48 -41.941 -9 ,11191 ,KEBNE ,17027684,Wed Dec 22 17:44:08 CET,Wed Dec 22 19:20:40 CET,0.0 0.277 0.407 0.495 0.564 0.624 0.674 0.715 0.806 0.839 0.862 0.819 0.935 0.959 1.002 1.046 1.085 1.102 1.129 1.143 1.156 1.17 1.188 1.212 1.219 1.224 1.221 1.207 1.188 1.166 1.145 1.123 1.079 1.021 0.957 0.873 0.791 0.682 0.54 0.378 0.18 -0.069 -0.384 -0.745 -1.206 -1.785 -2.568 -3.623 -5.095 -7.128 -10.252 -13.78 -16.461 -18.588 -20.307 -21.797 -23.045 -24.122 -25.04 -25.928 -26.673 -27.329 -27.936 -28.483 -28.995 -29.487 -29.983 -30.403 -30.758 -31.135 -31.534 -31.844 -32.17 -32.519 -32.782 -33.05 -33.313 -33.603 -33.914 -34.113 -34.304 -34.596 -34.812 -35.033 -35.146 -35.379 -35.63 -35.902 -36.044 -36.324 -36.478 -36.627 -36.801 -37.204 -37.422 -37.633 -37.883 -38.196 -38.563 -39.006 -42.711 -10 ,23362 ,KEBNE ,17027685,Wed Dec 22 17:44:11 CET,Wed Dec 22 19:19:00 CET,0.0 0.114 0.187 0.237 0.271 0.311 0.353 0.393 0.465 0.49 0.51 0.454 0.563 0.579 0.606 0.637 0.663 0.671 0.68 0.68 0.673 0.665 0.653 0.639 0.627 0.605 0.578 0.558 0.537 0.504 0.469 0.419 0.357 0.281 0.192 0.102 0.021 -0.091 -0.226 -0.383 -0.584 -0.842 -1.172 -1.516 -1.973 -2.563 -3.337 -4.374 -5.809 -7.846 -10.952 -14.351 -16.976 -19.13 -20.883 -22.336 -23.596 -24.699 -25.59 -26.468 -27.22 -27.873 -28.475 -29.029 -29.538 -29.994 -30.459 -30.87 -31.216 -31.559 -31.922 -32.222 -32.526 -32.847 -33.094 -33.343 -33.608 -33.882 -34.178 -34.384 -34.584 -34.897 -35.106 -35.316 -35.427 -35.669 -35.914 -36.179 -36.329 -36.615 -36.784 -36.946 -37.141 -37.569 -37.768 -37.988 -38.268 -38.595 -38.977 -39.492 -41.958 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_22_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_22_19.txt deleted file mode 100644 index 2cb29ef7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_22_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2090 ,TETRA ,17606429,Sun Nov 28 20:12:54 CET,Sun Nov 28 22:06:05 CET,0.0 0.283 0.44 0.6 0.735 0.855 0.973 1.066 1.22 1.29 1.364 1.416 1.564 1.631 1.743 1.82 1.898 1.936 2.0 2.068 2.182 2.253 2.323 2.438 2.555 2.66 2.75 2.84 2.947 3.051 3.167 3.306 3.432 3.546 3.672 3.762 3.811 3.86 3.89 3.927 3.966 3.98 3.956 3.884 3.778 3.626 3.381 3.019 2.479 1.608 0.122 -1.655 -3.132 -4.398 -5.448 -6.357 -7.17 -7.914 -8.51 -9.092 -9.632 -10.111 -10.552 -10.973 -11.352 -11.682 -12.033 -12.36 -12.644 -12.926 -13.223 -13.486 -13.734 -13.987 -14.202 -14.412 -14.626 -14.851 -15.088 -15.27 -15.454 -15.73 -15.931 -16.134 -16.24 -16.458 -16.702 -16.961 -17.093 -17.344 -17.524 -17.675 -17.835 -18.193 -18.401 -18.621 -18.836 -19.046 -19.306 -19.781 -21.152 -2 ,20538 ,TETRA ,17606430,Sun Nov 28 20:12:55 CET,Sun Nov 28 22:00:59 CET,0.0 0.513 0.638 0.738 0.84 0.95 1.044 1.12 1.249 1.308 1.361 1.358 1.482 1.516 1.584 1.648 1.702 1.727 1.774 1.811 1.869 1.907 1.938 1.997 2.062 2.115 2.156 2.192 2.236 2.27 2.297 2.326 2.358 2.388 2.412 2.444 2.462 2.486 2.519 2.526 2.53 2.52 2.492 2.445 2.333 2.157 1.868 1.476 0.944 0.062 -1.429 -3.155 -4.627 -5.87 -6.92 -7.829 -8.589 -9.3 -9.907 -10.49 -11.002 -11.453 -11.882 -12.307 -12.701 -13.053 -13.407 -13.724 -14.005 -14.302 -14.617 -14.863 -15.117 -15.382 -15.597 -15.821 -16.04 -16.283 -16.534 -16.696 -16.875 -17.152 -17.347 -17.549 -17.648 -17.849 -18.066 -18.298 -18.423 -18.663 -18.841 -19.01 -19.185 -19.563 -19.767 -19.987 -20.247 -20.557 -20.907 -21.283 -22.552 -3 ,20066 ,TETRA ,17606431,Sun Nov 28 20:13:59 CET,Sun Nov 28 22:09:21 CET,0.0 0.283 0.383 0.452 0.519 0.586 0.653 0.705 0.783 0.827 0.871 0.863 0.989 1.03 1.105 1.18 1.247 1.273 1.319 1.361 1.429 1.472 1.507 1.557 1.607 1.648 1.688 1.748 1.834 1.911 1.997 2.083 2.145 2.211 2.283 2.353 2.411 2.467 2.52 2.573 2.631 2.666 2.65 2.595 2.506 2.363 2.154 1.851 1.331 0.477 -1.004 -2.816 -4.324 -5.595 -6.675 -7.604 -8.381 -9.1 -9.727 -10.35 -10.875 -11.338 -11.771 -12.164 -12.522 -12.869 -13.249 -13.566 -13.83 -14.118 -14.431 -14.673 -14.925 -15.19 -15.389 -15.609 -15.845 -16.084 -16.34 -16.524 -16.695 -16.962 -17.154 -17.346 -17.45 -17.674 -17.917 -18.192 -18.339 -18.584 -18.758 -18.914 -19.079 -19.433 -19.617 -19.835 -20.092 -20.375 -20.715 -21.189 -22.873 -4 ,12529 ,TETRA ,17606432,Sun Nov 28 20:14:01 CET,Sun Nov 28 22:06:43 CET,0.0 0.304 0.421 0.538 0.648 0.74 0.814 0.877 1.007 1.069 1.122 1.129 1.259 1.295 1.352 1.414 1.484 1.522 1.603 1.685 1.786 1.848 1.912 1.999 2.082 2.156 2.223 2.286 2.369 2.444 2.513 2.602 2.666 2.73 2.805 2.89 2.974 3.042 3.094 3.13 3.148 3.17 3.189 3.175 3.114 2.989 2.79 2.459 1.921 1.056 -0.384 -2.092 -3.469 -4.653 -5.663 -6.551 -7.312 -7.988 -8.611 -9.24 -9.755 -10.2 -10.639 -11.045 -11.405 -11.74 -12.092 -12.397 -12.675 -12.974 -13.281 -13.533 -13.781 -14.047 -14.26 -14.465 -14.678 -14.92 -15.179 -15.352 -15.526 -15.791 -15.976 -16.169 -16.271 -16.483 -16.702 -16.954 -17.085 -17.329 -17.511 -17.671 -17.848 -18.237 -18.438 -18.674 -18.943 -19.224 -19.559 -20.009 -21.627 -5 ,1739 ,TETRA ,17606433,Sun Nov 28 20:14:57 CET,Sun Nov 28 22:07:08 CET,0.0 0.497 0.798 0.989 1.121 1.251 1.366 1.456 1.604 1.667 1.734 1.775 1.917 1.971 2.072 2.158 2.245 2.289 2.362 2.438 2.539 2.595 2.646 2.725 2.805 2.874 2.951 3.024 3.105 3.178 3.246 3.33 3.402 3.464 3.539 3.628 3.695 3.748 3.809 3.87 3.916 3.956 3.996 4.01 3.967 3.886 3.735 3.49 3.049 2.303 0.922 -0.949 -2.437 -3.63 -4.622 -5.504 -6.29 -7.029 -7.668 -8.282 -8.813 -9.278 -9.729 -10.173 -10.576 -10.924 -11.285 -11.608 -11.892 -12.173 -12.432 -12.66 -12.94 -13.235 -13.451 -13.677 -13.906 -14.137 -14.37 -14.538 -14.719 -14.999 -15.2 -15.407 -15.51 -15.713 -15.931 -16.17 -16.3 -16.54 -16.669 -16.828 -17.019 -17.386 -17.583 -17.79 -18.045 -18.351 -18.698 -19.205 -21.026 -6 ,31251 ,TETRA ,17606434,Sun Nov 28 20:14:58 CET,Sun Nov 28 22:09:03 CET,0.0 0.222 0.326 0.43 0.524 0.607 0.672 0.714 0.813 0.868 0.92 0.922 1.051 1.087 1.163 1.233 1.287 1.317 1.39 1.458 1.546 1.587 1.627 1.697 1.762 1.818 1.87 1.929 2.001 2.062 2.128 2.213 2.279 2.334 2.391 2.435 2.479 2.519 2.56 2.592 2.609 2.633 2.631 2.595 2.528 2.413 2.212 1.932 1.476 0.725 -0.593 -2.251 -3.636 -4.842 -5.85 -6.797 -7.641 -8.364 -8.995 -9.629 -10.172 -10.651 -11.113 -11.536 -11.913 -12.256 -12.616 -12.955 -13.244 -13.533 -13.834 -14.098 -14.394 -14.683 -14.891 -15.116 -15.341 -15.583 -15.848 -16.024 -16.2 -16.494 -16.695 -16.886 -16.995 -17.23 -17.482 -17.742 -17.885 -18.148 -18.307 -18.458 -18.633 -19.022 -19.23 -19.444 -19.695 -19.965 -20.262 -20.675 -22.065 -7 ,15364 ,TETRA ,17606435,Sun Nov 28 20:14:59 CET,Sun Nov 28 22:11:11 CET,0.0 0.293 0.403 0.481 0.564 0.635 0.697 0.752 0.839 0.882 0.925 0.906 1.024 1.057 1.126 1.188 1.245 1.274 1.321 1.363 1.423 1.461 1.505 1.557 1.602 1.659 1.71 1.747 1.79 1.838 1.874 1.901 1.935 1.971 2.006 2.046 2.075 2.086 2.086 2.074 2.054 2.026 1.969 1.876 1.75 1.605 1.398 1.044 0.522 -0.303 -1.812 -3.574 -5.008 -6.232 -7.281 -8.221 -9.033 -9.759 -10.401 -11.041 -11.583 -12.058 -12.515 -12.946 -13.345 -13.715 -14.107 -14.458 -14.757 -15.061 -15.372 -15.635 -15.902 -16.194 -16.433 -16.677 -16.922 -17.157 -17.41 -17.6 -17.789 -18.096 -18.323 -18.551 -18.661 -18.895 -19.146 -19.394 -19.521 -19.765 -19.937 -20.087 -20.245 -20.589 -20.804 -21.052 -21.304 -21.621 -21.99 -22.428 -24.119 -8 ,922 ,TETRA ,17606436,Sun Nov 28 20:14:59 CET,Sun Nov 28 22:07:39 CET,0.0 0.421 0.61 0.76 0.894 1.006 1.099 1.196 1.364 1.435 1.516 1.589 1.75 1.821 1.931 2.021 2.11 2.153 2.244 2.339 2.475 2.559 2.634 2.753 2.864 2.954 3.039 3.126 3.253 3.375 3.488 3.627 3.755 3.862 3.988 4.14 4.284 4.438 4.589 4.748 4.887 4.966 4.971 4.926 4.847 4.723 4.494 4.144 3.674 2.908 1.433 -0.337 -1.739 -2.925 -3.95 -4.833 -5.63 -6.352 -6.954 -7.554 -8.074 -8.553 -8.996 -9.404 -9.785 -10.134 -10.492 -10.814 -11.1 -11.389 -11.684 -11.929 -12.185 -12.452 -12.654 -12.867 -13.097 -13.337 -13.575 -13.738 -13.911 -14.185 -14.383 -14.573 -14.674 -14.903 -15.135 -15.369 -15.489 -15.732 -15.922 -16.076 -16.244 -16.632 -16.829 -17.055 -17.305 -17.592 -17.979 -18.464 -20.31 -9 ,4083 ,TETRA ,17606437,Sun Nov 28 20:14:59 CET,Sun Nov 28 22:06:30 CET,0.0 0.463 0.559 0.644 0.74 0.83 0.902 0.966 1.112 1.171 1.212 1.205 1.328 1.359 1.429 1.489 1.546 1.575 1.626 1.676 1.759 1.814 1.866 1.941 2.001 2.047 2.101 2.161 2.232 2.29 2.339 2.393 2.434 2.471 2.521 2.573 2.602 2.616 2.638 2.667 2.686 2.692 2.678 2.669 2.647 2.56 2.371 2.064 1.576 0.772 -0.687 -2.463 -3.943 -5.201 -6.24 -7.172 -7.995 -8.72 -9.319 -9.894 -10.399 -10.856 -11.29 -11.703 -12.092 -12.45 -12.818 -13.146 -13.425 -13.706 -14.01 -14.27 -14.537 -14.811 -15.02 -15.228 -15.445 -15.683 -15.937 -16.108 -16.293 -16.584 -16.772 -16.976 -17.087 -17.322 -17.565 -17.798 -17.927 -18.173 -18.35 -18.505 -18.665 -19.04 -19.241 -19.447 -19.688 -19.98 -20.313 -20.741 -22.273 -10 ,12523 ,TETRA ,17606438,Sun Nov 28 20:16:02 CET,Sun Nov 28 22:07:04 CET,0.0 0.221 0.345 0.451 0.523 0.573 0.627 0.68 0.776 0.823 0.871 0.885 1.017 1.056 1.136 1.202 1.266 1.293 1.35 1.418 1.516 1.575 1.629 1.708 1.78 1.849 1.913 1.961 2.012 2.072 2.153 2.256 2.345 2.416 2.476 2.548 2.612 2.68 2.747 2.788 2.827 2.87 2.891 2.881 2.822 2.69 2.47 2.142 1.647 0.82 -0.594 -2.33 -3.765 -5.022 -6.091 -7.003 -7.79 -8.486 -9.083 -9.655 -10.152 -10.617 -11.039 -11.438 -11.83 -12.171 -12.532 -12.869 -13.148 -13.425 -13.717 -13.963 -14.216 -14.484 -14.692 -14.892 -15.104 -15.352 -15.616 -15.784 -15.943 -16.22 -16.424 -16.637 -16.744 -16.954 -17.193 -17.463 -17.608 -17.857 -18.014 -18.168 -18.34 -18.706 -18.911 -19.125 -19.382 -19.676 -20.002 -20.436 -22.45 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_23_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_23_21.txt deleted file mode 100644 index e7a0fbde..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_23_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22126 ,TETRA ,17606439,Sun Nov 28 20:16:02 CET,Sun Nov 28 22:08:37 CET,0.0 0.346 0.614 0.855 1.087 1.298 1.493 1.666 1.995 2.157 2.321 2.463 2.794 2.946 3.234 3.515 3.807 3.946 4.214 4.493 4.911 5.182 5.441 5.811 6.183 6.559 6.931 7.302 7.798 8.296 8.77 9.339 9.924 10.509 11.2 11.997 12.778 13.661 14.645 15.727 16.9 18.261 19.914 21.609 23.672 26.17 29.235 32.872 37.425 43.268 51.236 58.867 64.091 67.938 70.856 73.168 74.997 76.493 77.685 78.78 79.633 80.344 80.984 81.551 82.044 82.46 82.863 83.207 83.496 83.776 84.039 84.243 84.448 84.656 84.794 84.921 85.038 85.137 85.221 85.275 85.327 85.401 85.445 85.486 85.505 85.535 85.557 85.564 85.564 85.472 85.535 85.514 85.489 85.43 85.389 85.315 85.207 85.095 84.964 84.77 84.035 -2 ,28792 ,TETRA ,17606440,Sun Nov 28 20:16:58 CET,Sun Nov 28 22:09:59 CET,0.0 0.541 0.812 1.056 1.311 1.555 1.773 1.98 2.368 2.554 2.744 2.911 3.248 3.419 3.748 4.048 4.328 4.464 4.735 5.003 5.396 5.657 5.925 6.313 6.695 7.076 7.444 7.808 8.29 8.769 9.243 9.827 10.396 10.957 11.634 12.417 13.198 14.077 15.049 16.121 17.283 18.627 20.247 21.961 24.077 26.554 29.522 33.07 37.562 43.369 51.297 58.901 64.132 67.978 70.863 73.153 74.957 76.437 77.609 78.663 79.496 80.187 80.795 81.33 81.791 82.177 82.548 82.87 83.138 83.404 83.663 83.844 84.021 84.202 84.333 84.451 84.564 84.678 84.78 84.846 84.91 84.989 85.029 85.076 85.099 85.134 85.166 85.184 85.183 85.084 85.123 85.101 85.086 85.056 85.014 84.96 84.885 84.781 84.675 84.511 83.704 -3 ,32235 ,TETRA ,17606441,Sun Nov 28 20:16:59 CET,Sun Nov 28 22:10:36 CET,0.0 0.366 0.637 0.843 1.031 1.208 1.37 1.529 1.848 1.998 2.145 2.26 2.586 2.731 3.014 3.295 3.571 3.713 3.986 4.248 4.645 4.909 5.16 5.534 5.91 6.271 6.632 6.994 7.462 7.933 8.411 9.025 9.651 10.252 10.935 11.712 12.489 13.368 14.347 15.431 16.613 18.0 19.675 21.42 23.548 26.028 29.084 32.764 37.338 43.2 51.11 58.678 63.826 67.582 70.414 72.685 74.5 75.985 77.148 78.224 79.082 79.781 80.383 80.92 81.385 81.765 82.142 82.472 82.741 83.004 83.26 83.453 83.636 83.816 83.944 84.056 84.157 84.262 84.375 84.441 84.496 84.565 84.598 84.63 84.65 84.692 84.731 84.759 84.766 84.681 84.774 84.786 84.793 84.781 84.778 84.755 84.714 84.691 84.642 84.557 84.188 -4 ,12336 ,TETRA ,17606442,Sun Nov 28 20:16:58 CET,Sun Nov 28 22:11:11 CET,0.0 0.667 0.951 1.179 1.397 1.586 1.768 1.943 2.27 2.433 2.591 2.71 3.03 3.175 3.469 3.759 4.032 4.164 4.433 4.704 5.113 5.38 5.644 6.042 6.429 6.806 7.18 7.546 8.031 8.51 8.977 9.564 10.146 10.716 11.386 12.138 12.875 13.737 14.721 15.788 16.94 18.291 19.93 21.651 23.75 26.233 29.248 32.859 37.45 43.352 51.342 59.05 64.356 68.226 71.138 73.449 75.255 76.734 77.908 79.003 79.882 80.595 81.218 81.773 82.257 82.659 83.047 83.374 83.641 83.9 84.151 84.339 84.515 84.687 84.822 84.958 85.092 85.228 85.357 85.441 85.521 85.644 85.726 85.799 85.833 85.888 85.937 85.979 85.994 85.914 86.036 86.048 86.054 86.077 86.075 86.059 86.04 86.002 85.923 85.784 85.404 -5 ,25285 ,TETRA ,17606443,Sun Nov 28 20:22:30 CET,Sun Nov 28 22:14:10 CET,0.0 1.065 1.448 1.734 1.997 2.24 2.479 2.713 3.11 3.296 3.474 3.65 3.995 4.158 4.502 4.83 5.134 5.283 5.575 5.875 6.316 6.591 6.854 7.244 7.638 8.026 8.411 8.788 9.286 9.785 10.272 10.878 11.471 12.053 12.742 13.527 14.295 15.176 16.192 17.319 18.507 19.853 21.504 23.227 25.31 27.756 30.728 34.281 38.762 44.622 52.671 60.34 65.532 69.301 72.153 74.429 76.229 77.693 78.853 79.936 80.79 81.508 82.157 82.72 83.204 83.618 84.029 84.372 84.654 84.932 85.191 85.393 85.598 85.806 85.957 86.097 86.237 86.367 86.49 86.575 86.66 86.778 86.847 86.907 86.937 86.996 87.039 87.059 87.068 86.986 87.086 87.099 87.118 87.127 87.121 87.107 87.083 87.028 86.934 86.858 86.558 -6 ,18416 ,TETRA ,17606444,Sun Nov 28 20:22:30 CET,Sun Nov 28 22:13:44 CET,0.0 0.584 0.84 1.055 1.258 1.466 1.661 1.848 2.211 2.377 2.534 2.657 2.989 3.135 3.431 3.723 4.005 4.147 4.425 4.689 5.083 5.337 5.583 5.953 6.325 6.692 7.057 7.43 7.908 8.374 8.837 9.416 10.002 10.567 11.228 12.005 12.787 13.684 14.681 15.766 16.93 18.281 19.907 21.603 23.684 26.156 29.157 32.732 37.248 43.035 50.98 58.669 63.863 67.658 70.506 72.773 74.593 76.094 77.272 78.348 79.196 79.901 80.538 81.108 81.6 82.007 82.398 82.725 82.994 83.255 83.512 83.707 83.896 84.08 84.216 84.351 84.472 84.592 84.717 84.795 84.867 84.961 85.018 85.079 85.107 85.153 85.196 85.227 85.237 85.151 85.203 85.19 85.178 85.122 85.074 85.02 84.962 84.888 84.793 84.648 84.047 -7 ,20291 ,TETRA ,17606445,Sun Nov 28 20:22:30 CET,Sun Nov 28 22:16:12 CET,0.0 0.403 0.646 0.862 1.066 1.247 1.418 1.589 1.927 2.09 2.242 2.359 2.696 2.847 3.141 3.43 3.716 3.853 4.115 4.375 4.764 5.024 5.282 5.659 6.021 6.377 6.73 7.09 7.587 8.071 8.54 9.119 9.683 10.238 10.899 11.664 12.438 13.33 14.311 15.383 16.524 17.833 19.447 21.148 23.219 25.637 28.58 32.159 36.692 42.516 50.529 58.21 63.365 67.142 70.003 72.275 74.053 75.543 76.718 77.751 78.566 79.249 79.858 80.406 80.875 81.282 81.697 82.038 82.311 82.578 82.832 83.033 83.231 83.424 83.564 83.693 83.818 83.95 84.079 84.162 84.235 84.319 84.37 84.421 84.44 84.471 84.506 84.539 84.554 84.463 84.533 84.526 84.514 84.462 84.424 84.366 84.304 84.242 84.129 83.937 83.404 -8 ,4527 ,TETRA ,17606446,Sun Nov 28 20:30:09 CET,Sun Nov 28 22:21:35 CET,0.0 0.525 0.782 1.014 1.229 1.423 1.589 1.749 2.08 2.238 2.392 2.504 2.821 2.961 3.256 3.548 3.833 3.971 4.24 4.508 4.898 5.142 5.391 5.768 6.139 6.516 6.886 7.241 7.703 8.162 8.624 9.196 9.763 10.337 11.016 11.769 12.521 13.378 14.317 15.356 16.509 17.853 19.472 21.17 23.238 25.653 28.574 32.116 36.624 42.452 50.467 58.172 63.396 67.19 70.052 72.33 74.122 75.606 76.776 77.853 78.718 79.425 80.059 80.621 81.091 81.497 81.907 82.243 82.518 82.79 83.05 83.251 83.445 83.627 83.757 83.88 84.003 84.117 84.219 84.284 84.349 84.451 84.52 84.582 84.613 84.67 84.711 84.754 84.776 84.699 84.833 84.854 84.865 84.866 84.86 84.856 84.847 84.822 84.796 84.741 84.398 -9 ,3823 ,TETRA ,17606447,Sun Nov 28 20:30:10 CET,Sun Nov 28 22:24:06 CET,0.0 1.049 1.413 1.742 2.009 2.229 2.429 2.621 3.032 3.223 3.392 3.548 3.895 4.055 4.37 4.657 4.936 5.079 5.365 5.641 6.052 6.33 6.604 7.004 7.394 7.779 8.164 8.544 9.042 9.535 10.015 10.603 11.192 11.773 12.468 13.263 14.032 14.93 15.937 17.011 18.164 19.501 21.134 22.898 25.065 27.582 30.586 34.162 38.687 44.532 52.555 60.186 65.35 69.131 71.998 74.282 76.085 77.576 78.742 79.821 80.675 81.377 82.004 82.553 83.023 83.437 83.845 84.183 84.472 84.752 85.023 85.229 85.424 85.615 85.747 85.878 86.009 86.132 86.248 86.324 86.402 86.506 86.557 86.6 86.624 86.673 86.713 86.755 86.778 86.7 86.808 86.819 86.839 86.875 86.871 86.849 86.821 86.783 86.734 86.646 86.186 -10 ,14617 ,TETRA ,17606448,Sun Nov 28 20:30:10 CET,Sun Nov 28 22:21:11 CET,0.0 0.555 0.828 1.065 1.287 1.511 1.729 1.929 2.322 2.509 2.689 2.875 3.222 3.385 3.691 3.999 4.306 4.459 4.762 5.053 5.481 5.765 6.047 6.458 6.857 7.235 7.617 7.997 8.487 8.973 9.454 10.061 10.669 11.264 11.963 12.773 13.584 14.483 15.45 16.512 17.687 19.039 20.646 22.348 24.428 26.871 29.899 33.526 38.053 43.888 51.832 59.468 64.673 68.478 71.342 73.613 75.395 76.848 78.004 79.067 79.901 80.582 81.188 81.717 82.176 82.579 82.982 83.325 83.607 83.884 84.16 84.384 84.601 84.809 84.959 85.105 85.247 85.382 85.514 85.604 85.688 85.79 85.847 85.902 85.934 86.001 86.049 86.089 86.11 86.035 86.131 86.132 86.132 86.135 86.138 86.096 86.041 86.012 85.976 85.895 85.392 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_23_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_23_22.txt deleted file mode 100644 index 62d9a78d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_23_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2396 ,TETRA ,17606449,Sun Nov 28 20:30:09 CET,Sun Nov 28 22:21:12 CET,0.0 1.0 1.341 1.632 1.901 2.128 2.357 2.573 2.965 3.154 3.339 3.521 3.88 4.052 4.397 4.733 5.047 5.201 5.507 5.812 6.263 6.558 6.851 7.296 7.727 8.147 8.565 8.975 9.508 10.035 10.563 11.205 11.831 12.451 13.182 14.021 14.86 15.809 16.856 17.995 19.232 20.672 22.388 24.186 26.375 28.938 32.084 35.9 40.678 46.785 55.136 63.079 68.524 72.504 75.494 77.907 79.777 81.292 82.482 83.58 84.455 85.161 85.786 86.333 86.811 87.226 87.622 87.956 88.241 88.508 88.752 88.952 89.142 89.318 89.449 89.581 89.706 89.815 89.917 89.982 90.04 90.112 90.156 90.196 90.216 90.249 90.278 90.293 90.292 90.198 90.249 90.23 90.208 90.149 90.104 90.042 89.958 89.853 89.767 89.694 89.166 -2 ,3543 ,TETRA ,17606450,Sun Nov 28 20:30:11 CET,Sun Nov 28 22:22:56 CET,0.0 0.837 1.231 1.528 1.777 2.008 2.221 2.425 2.822 3.012 3.203 3.395 3.756 3.933 4.262 4.567 4.877 5.033 5.336 5.635 6.073 6.363 6.655 7.08 7.491 7.898 8.304 8.704 9.235 9.755 10.263 10.909 11.538 12.143 12.881 13.719 14.528 15.454 16.488 17.641 18.913 20.398 22.196 24.057 26.29 28.875 32.034 35.848 40.639 46.835 55.21 63.147 68.587 72.612 75.618 77.996 79.881 81.428 82.649 83.759 84.642 85.377 86.011 86.565 87.052 87.473 87.901 88.26 88.549 88.809 89.066 89.271 89.466 89.671 89.817 89.953 90.085 90.213 90.338 90.417 90.488 90.588 90.644 90.696 90.729 90.777 90.81 90.845 90.848 90.759 90.875 90.892 90.891 90.838 90.812 90.797 90.771 90.714 90.608 90.432 89.894 -3 ,2847 ,TETRA ,17606451,Sun Nov 28 20:31:06 CET,Sun Nov 28 22:24:57 CET,0.0 0.962 1.315 1.586 1.854 2.123 2.391 2.647 3.107 3.315 3.524 3.74 4.109 4.295 4.653 4.987 5.313 5.483 5.818 6.14 6.624 6.933 7.228 7.673 8.115 8.545 8.968 9.384 9.934 10.478 11.006 11.653 12.285 12.914 13.674 14.552 15.397 16.34 17.387 18.537 19.769 21.211 22.988 24.845 27.095 29.74 32.942 36.71 41.451 47.579 55.98 64.023 69.457 73.432 76.427 78.826 80.723 82.263 83.487 84.6 85.47 86.194 86.836 87.399 87.882 88.304 88.718 89.065 89.354 89.629 89.906 90.13 90.344 90.549 90.696 90.845 90.987 91.121 91.258 91.343 91.422 91.533 91.607 91.671 91.69 91.729 91.777 91.827 91.852 91.771 91.87 91.886 91.896 91.888 91.86 91.818 91.776 91.699 91.59 91.437 91.075 -4 ,29734 ,TETRA ,17606452,Sun Nov 28 20:31:06 CET,Sun Nov 28 22:24:18 CET,0.0 1.272 1.63 1.938 2.201 2.427 2.655 2.872 3.263 3.453 3.641 3.828 4.191 4.361 4.697 5.033 5.352 5.512 5.821 6.116 6.57 6.87 7.161 7.594 8.019 8.436 8.846 9.245 9.771 10.303 10.825 11.46 12.089 12.714 13.468 14.351 15.211 16.173 17.232 18.388 19.645 21.103 22.881 24.735 26.978 29.613 32.819 36.63 41.421 47.589 55.943 63.927 69.31 73.217 76.186 78.563 80.429 81.96 83.15 84.224 85.081 85.802 86.45 87.018 87.511 87.931 88.343 88.7 88.985 89.25 89.504 89.7 89.889 90.086 90.236 90.375 90.513 90.644 90.757 90.831 90.913 91.029 91.097 91.165 91.197 91.253 91.299 91.309 91.317 91.249 91.352 91.362 91.359 91.314 91.291 91.262 91.222 91.175 91.071 90.935 90.577 -5 ,3260 ,TETRA ,17606454,Sun Nov 28 20:31:07 CET,Sun Nov 28 22:24:59 CET,0.0 0.999 1.344 1.645 1.9 2.139 2.384 2.623 3.083 3.297 3.511 3.75 4.123 4.306 4.666 5.03 5.377 5.544 5.876 6.195 6.658 6.967 7.277 7.737 8.181 8.613 9.041 9.466 10.028 10.586 11.131 11.782 12.417 13.058 13.819 14.685 15.527 16.469 17.538 18.724 20.008 21.507 23.295 25.154 27.418 30.068 33.256 37.092 41.925 48.062 56.361 64.207 69.602 73.566 76.521 78.872 80.722 82.26 83.474 84.6 85.5 86.242 86.897 87.467 87.987 88.448 88.895 89.263 89.559 89.848 90.127 90.335 90.538 90.749 90.909 91.051 91.178 91.303 91.416 91.491 91.574 91.689 91.748 91.807 91.837 91.888 91.928 91.958 91.97 91.892 92.023 92.039 92.042 92.033 92.018 91.994 91.949 91.86 91.753 91.6 91.055 -6 ,13479 ,TETRA ,17606455,Sun Nov 28 20:31:07 CET,Sun Nov 28 22:22:19 CET,0.0 0.928 1.259 1.53 1.777 2.014 2.264 2.505 2.929 3.116 3.3 3.488 3.85 4.033 4.382 4.724 5.063 5.226 5.549 5.869 6.349 6.664 6.968 7.418 7.864 8.291 8.715 9.123 9.668 10.211 10.733 11.383 12.018 12.66 13.432 14.311 15.169 16.141 17.227 18.399 19.66 21.115 22.861 24.696 26.913 29.47 32.603 36.375 41.101 47.212 55.546 63.553 69.057 73.105 76.149 78.548 80.426 82.007 83.27 84.401 85.296 86.045 86.719 87.313 87.821 88.265 88.699 89.063 89.359 89.639 89.907 90.113 90.322 90.531 90.679 90.819 90.951 91.079 91.197 91.275 91.355 91.467 91.539 91.593 91.619 91.687 91.746 91.789 91.802 91.719 91.817 91.824 91.821 91.801 91.787 91.762 91.712 91.644 91.555 91.394 91.011 -7 ,12938 ,TETRA ,17606456,Sun Nov 28 20:31:06 CET,Sun Nov 28 22:22:25 CET,0.0 1.114 1.49 1.776 2.034 2.259 2.473 2.681 3.075 3.269 3.458 3.633 3.99 4.167 4.505 4.821 5.13 5.28 5.59 5.892 6.321 6.612 6.901 7.314 7.72 8.133 8.542 8.937 9.475 10.025 10.557 11.202 11.848 12.482 13.22 14.085 14.951 15.924 17.005 18.211 19.484 20.926 22.705 24.582 26.842 29.461 32.63 36.385 41.1 47.229 55.618 63.581 69.011 72.945 75.906 78.267 80.107 81.644 82.882 84.012 84.909 85.659 86.324 86.906 87.417 87.844 88.245 88.589 88.868 89.135 89.408 89.62 89.829 90.03 90.172 90.316 90.456 90.602 90.741 90.823 90.903 91.012 91.075 91.135 91.168 91.22 91.257 91.289 91.303 91.233 91.357 91.363 91.367 91.34 91.314 91.288 91.246 91.178 91.07 90.848 90.241 -8 ,32443 ,TETRA ,17606457,Sun Nov 28 20:32:04 CET,Sun Nov 28 22:23:49 CET,0.0 0.734 1.094 1.395 1.665 1.923 2.169 2.393 2.806 3.007 3.198 3.367 3.715 3.879 4.206 4.53 4.844 4.998 5.307 5.607 6.07 6.387 6.688 7.126 7.561 7.993 8.422 8.854 9.404 9.941 10.475 11.121 11.759 12.4 13.159 14.021 14.866 15.816 16.878 18.039 19.297 20.781 22.563 24.433 26.673 29.258 32.463 36.277 41.035 47.199 55.611 63.568 68.979 72.954 75.932 78.313 80.183 81.675 82.846 83.93 84.792 85.502 86.123 86.677 87.163 87.572 87.976 88.303 88.56 88.816 89.063 89.253 89.434 89.608 89.738 89.865 89.986 90.101 90.206 90.269 90.331 90.426 90.487 90.543 90.569 90.617 90.672 90.723 90.735 90.657 90.752 90.751 90.758 90.729 90.704 90.688 90.662 90.612 90.549 90.441 89.941 -9 ,6745 ,TETRA ,17606458,Sun Nov 28 20:32:04 CET,Sun Nov 28 22:26:40 CET,0.0 0.825 1.178 1.44 1.682 1.933 2.189 2.432 2.897 3.115 3.324 3.55 3.923 4.113 4.489 4.845 5.191 5.36 5.687 6.006 6.488 6.806 7.111 7.554 7.995 8.429 8.844 9.251 9.806 10.363 10.899 11.541 12.171 12.797 13.537 14.4 15.271 16.248 17.323 18.492 19.748 21.203 22.979 24.837 27.081 29.716 32.923 36.743 41.452 47.48 55.856 63.902 69.274 73.204 76.169 78.518 80.352 81.842 83.031 84.138 85.018 85.742 86.38 86.93 87.412 87.824 88.23 88.572 88.847 89.115 89.362 89.543 89.715 89.883 90.008 90.132 90.253 90.368 90.47 90.522 90.562 90.628 90.676 90.709 90.72 90.751 90.781 90.791 90.787 90.696 90.761 90.751 90.734 90.66 90.601 90.525 90.448 90.325 90.15 89.934 89.143 -10 ,11786 ,TETRA ,17606459,Sun Nov 28 20:32:04 CET,Sun Nov 28 22:21:35 CET,0.0 1.021 1.375 1.654 1.9 2.139 2.371 2.589 2.988 3.181 3.371 3.555 3.916 4.095 4.442 4.781 5.113 5.271 5.582 5.886 6.337 6.633 6.921 7.351 7.78 8.192 8.592 8.988 9.511 10.02 10.527 11.166 11.797 12.425 13.161 13.997 14.821 15.762 16.819 17.954 19.187 20.628 22.367 24.192 26.405 29.026 32.222 36.018 40.751 46.829 55.101 63.081 68.541 72.516 75.534 77.961 79.867 81.428 82.656 83.801 84.718 85.484 86.158 86.721 87.215 87.65 88.073 88.433 88.734 89.015 89.277 89.487 89.697 89.887 90.025 90.168 90.312 90.45 90.579 90.666 90.745 90.857 90.929 90.988 91.017 91.056 91.083 91.107 91.118 91.045 91.167 91.178 91.183 91.176 91.144 91.096 91.051 90.993 90.919 90.809 90.137 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_25_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_25_19.txt deleted file mode 100644 index 56be3550..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_25_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13050 ,KEBNE ,17027686,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:20:18 CET,0.0 0.739 1.169 1.538 1.873 2.179 2.464 2.746 3.283 3.545 3.807 4.07 4.558 4.788 5.241 5.71 6.173 6.39 6.827 7.27 7.919 8.341 8.771 9.42 10.042 10.637 11.215 11.786 12.542 13.288 14.033 14.965 15.89 16.797 17.881 19.122 20.326 21.704 23.239 24.913 26.741 28.88 31.453 34.145 37.432 41.262 45.901 51.497 58.517 67.498 79.65 91.016 98.632 104.167 108.277 111.493 113.98 115.98 117.528 118.936 120.05 120.982 121.805 122.497 123.083 123.577 124.048 124.413 124.73 125.053 125.335 125.565 125.781 125.987 126.141 126.275 126.397 126.503 126.606 126.673 126.73 126.787 126.812 126.84 126.853 126.877 126.893 126.884 126.873 126.752 126.812 126.771 126.722 126.628 126.582 126.531 126.428 126.282 126.094 125.852 124.827 -2 ,28438 ,KEBNE ,17027687,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:19:26 CET,0.0 1.003 1.42 1.779 2.112 2.403 2.681 2.951 3.435 3.667 3.902 4.125 4.599 4.823 5.263 5.69 6.112 6.322 6.737 7.159 7.779 8.171 8.562 9.141 9.709 10.284 10.864 11.428 12.172 12.914 13.647 14.564 15.462 16.359 17.424 18.624 19.834 21.218 22.774 24.507 26.346 28.429 30.963 33.637 36.885 40.724 45.422 50.972 57.926 66.86 79.005 90.559 98.247 103.802 107.906 111.075 113.561 115.592 117.182 118.662 119.826 120.744 121.53 122.203 122.798 123.297 123.756 124.17 124.524 124.854 125.175 125.426 125.668 125.884 126.033 126.184 126.323 126.454 126.567 126.634 126.713 126.824 126.885 126.942 126.964 127.001 127.036 127.063 127.073 126.966 127.026 126.991 126.96 126.888 126.84 126.771 126.672 126.541 126.336 126.026 125.099 -3 ,15192 ,KEBNE ,17027688,Wed Dec 22 17:44:11 CET,Wed Dec 22 19:19:03 CET,0.0 0.7 1.134 1.49 1.805 2.101 2.371 2.642 3.147 3.381 3.614 3.849 4.336 4.569 5.023 5.466 5.909 6.134 6.572 6.991 7.629 8.062 8.495 9.13 9.739 10.346 10.958 11.56 12.343 13.114 13.875 14.795 15.711 16.646 17.744 18.988 20.209 21.596 23.143 24.796 26.626 28.788 31.348 34.036 37.322 41.146 45.809 51.364 58.298 67.246 79.315 90.751 98.422 103.97 108.081 111.312 113.834 115.883 117.471 118.929 120.09 121.01 121.787 122.448 123.013 123.513 124.007 124.419 124.771 125.096 125.382 125.61 125.843 126.058 126.2 126.344 126.494 126.623 126.733 126.81 126.893 127.015 127.075 127.116 127.134 127.158 127.169 127.173 127.16 127.028 127.112 127.099 127.074 126.967 126.904 126.848 126.761 126.637 126.501 126.279 125.192 -4 ,4318 ,KEBNE ,17027689,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:18:55 CET,0.0 1.003 1.419 1.748 2.086 2.407 2.703 2.986 3.525 3.777 4.023 4.272 4.744 4.973 5.445 5.926 6.393 6.62 7.057 7.48 8.104 8.518 8.926 9.528 10.132 10.735 11.331 11.921 12.692 13.448 14.205 15.131 16.055 16.966 18.023 19.259 20.502 21.894 23.442 25.161 27.0 29.136 31.759 34.489 37.795 41.65 46.307 51.918 59.006 68.209 80.631 92.221 99.849 105.442 109.799 113.261 115.948 118.142 119.894 121.518 122.818 123.887 124.831 125.647 126.352 126.968 127.571 128.068 128.47 128.865 129.244 129.536 129.837 130.124 130.331 130.538 130.723 130.904 131.087 131.2 131.31 131.46 131.546 131.633 131.676 131.759 131.837 131.885 131.905 131.818 131.945 131.947 131.938 131.875 131.828 131.772 131.68 131.568 131.421 131.096 129.354 -5 ,1671 ,KEBNE ,17027690,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:18:56 CET,0.0 0.686 0.985 1.264 1.528 1.794 2.047 2.294 2.765 2.999 3.24 3.465 3.926 4.153 4.615 5.069 5.512 5.733 6.18 6.6 7.206 7.616 8.023 8.639 9.247 9.853 10.467 11.06 11.836 12.597 13.347 14.29 15.218 16.136 17.225 18.464 19.702 21.086 22.595 24.279 26.131 28.306 30.917 33.645 36.945 40.796 45.522 51.18 58.3 67.371 79.533 91.02 98.698 104.221 108.344 111.603 114.171 116.281 117.917 119.356 120.457 121.325 122.093 122.797 123.365 123.841 124.323 124.711 125.036 125.36 125.663 125.886 126.11 126.334 126.496 126.634 126.752 126.902 127.085 127.195 127.277 127.392 127.464 127.523 127.553 127.611 127.652 127.663 127.654 127.544 127.644 127.62 127.58 127.417 127.327 127.227 127.1 126.941 126.698 126.322 124.409 -6 ,26780 ,KEBNE ,17027691,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:20:38 CET,0.0 0.803 1.16 1.458 1.754 2.03 2.295 2.551 3.063 3.313 3.552 3.789 4.256 4.477 4.907 5.328 5.747 5.953 6.375 6.784 7.376 7.767 8.159 8.752 9.34 9.929 10.519 11.096 11.867 12.638 13.389 14.314 15.234 16.144 17.229 18.488 19.713 21.108 22.672 24.383 26.23 28.367 30.964 33.697 37.014 40.886 45.576 51.175 58.235 67.279 79.761 91.53 99.233 104.706 108.814 112.037 114.501 116.515 118.08 119.496 120.587 121.461 122.257 122.956 123.554 124.074 124.57 124.959 125.259 125.563 125.864 126.079 126.275 126.47 126.615 126.757 126.881 126.984 127.1 127.178 127.24 127.335 127.393 127.441 127.466 127.502 127.524 127.534 127.535 127.421 127.527 127.513 127.487 127.395 127.334 127.27 127.195 127.073 126.89 126.565 125.285 -7 ,5199 ,KEBNE ,17027692,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:20:16 CET,0.0 0.83 1.264 1.618 1.952 2.261 2.544 2.814 3.338 3.59 3.838 4.07 4.542 4.766 5.218 5.656 6.085 6.297 6.732 7.156 7.754 8.159 8.58 9.199 9.799 10.381 10.956 11.529 12.277 13.023 13.765 14.68 15.578 16.458 17.513 18.717 19.927 21.355 22.929 24.614 26.424 28.528 31.095 33.825 37.094 40.847 45.482 51.065 58.056 66.967 78.976 90.353 98.019 103.506 107.549 110.732 113.138 115.078 116.727 118.323 119.622 120.695 121.628 122.467 123.211 123.85 124.455 124.956 125.351 125.736 126.113 126.406 126.695 126.961 127.15 127.332 127.504 127.673 127.847 127.971 128.09 128.249 128.348 128.429 128.463 128.529 128.591 128.651 128.673 128.582 128.729 128.737 128.732 128.684 128.639 128.568 128.458 128.325 128.074 127.703 125.783 -8 ,15504 ,KEBNE ,17027693,Wed Dec 22 17:44:11 CET,Wed Dec 22 19:19:05 CET,0.0 0.943 1.368 1.713 2.035 2.321 2.58 2.838 3.344 3.59 3.829 4.05 4.526 4.747 5.172 5.603 6.034 6.248 6.688 7.113 7.72 8.116 8.494 9.072 9.654 10.207 10.764 11.329 12.062 12.779 13.493 14.374 15.236 16.094 17.13 18.332 19.552 20.95 22.46 24.113 25.95 28.082 30.648 33.35 36.647 40.474 45.084 50.598 57.564 66.513 78.609 90.108 97.816 103.322 107.406 110.611 113.125 115.16 116.749 118.198 119.349 120.282 121.057 121.728 122.34 122.87 123.356 123.734 124.046 124.345 124.628 124.845 125.037 125.217 125.35 125.474 125.583 125.691 125.833 125.944 126.05 126.182 126.245 126.297 126.329 126.392 126.445 126.496 126.519 126.431 126.561 126.558 126.549 126.496 126.448 126.404 126.338 126.235 126.088 125.779 124.295 -9 ,13364 ,KEBNE ,17027694,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:18:54 CET,0.0 0.873 1.285 1.597 1.9 2.18 2.461 2.744 3.263 3.515 3.762 3.996 4.477 4.714 5.191 5.644 6.079 6.304 6.763 7.205 7.851 8.274 8.68 9.279 9.871 10.453 11.026 11.592 12.358 13.118 13.842 14.748 15.657 16.553 17.61 18.819 20.023 21.388 22.9 24.561 26.371 28.507 31.114 33.786 37.016 40.806 45.445 51.037 58.086 67.122 79.297 90.792 98.474 104.005 108.039 111.186 113.67 115.666 117.252 118.714 119.85 120.743 121.499 122.197 122.823 123.323 123.796 124.212 124.555 124.886 125.204 125.429 125.624 125.817 125.958 126.09 126.219 126.34 126.446 126.504 126.559 126.644 126.689 126.727 126.742 126.761 126.764 126.75 126.741 126.61 126.636 126.585 126.539 126.408 126.316 126.201 126.075 125.932 125.742 125.473 124.184 -10 ,25949 ,KEBNE ,17027695,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:21:08 CET,0.0 0.888 1.327 1.695 2.047 2.369 2.638 2.903 3.419 3.67 3.927 4.175 4.647 4.876 5.323 5.779 6.231 6.455 6.893 7.319 7.944 8.356 8.758 9.362 9.964 10.543 11.12 11.704 12.465 13.213 13.954 14.882 15.799 16.696 17.769 19.017 20.265 21.672 23.218 24.925 26.766 28.903 31.552 34.293 37.607 41.476 46.172 51.875 59.037 68.173 80.4 92.058 99.82 105.361 109.495 112.721 115.213 117.21 118.747 120.152 121.304 122.227 123.027 123.741 124.357 124.868 125.344 125.739 126.054 126.346 126.634 126.879 127.106 127.305 127.439 127.57 127.704 127.836 127.947 128.008 128.066 128.161 128.239 128.325 128.357 128.401 128.429 128.455 128.481 128.394 128.515 128.512 128.488 128.442 128.406 128.334 128.238 128.136 127.986 127.709 126.484 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_25_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_25_24.txt deleted file mode 100644 index 85bcc981..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_25_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5124 ,TETRA ,17606460,Sun Nov 28 20:32:04 CET,Sun Nov 28 22:22:11 CET,0.0 0.469 0.779 1.051 1.304 1.558 1.808 2.049 2.504 2.715 2.917 3.049 3.481 3.664 4.013 4.361 4.726 4.913 5.286 5.646 6.146 6.465 6.779 7.258 7.75 8.243 8.742 9.229 9.85 10.452 11.049 11.782 12.496 13.212 14.081 15.06 16.019 17.136 18.381 19.74 21.231 22.948 24.972 27.083 29.649 32.659 36.342 40.776 46.305 53.424 63.128 72.249 78.435 83.015 86.495 89.237 91.393 93.153 94.53 95.811 96.831 97.674 98.409 99.05 99.625 100.121 100.592 100.973 101.299 101.622 101.925 102.153 102.376 102.598 102.763 102.939 103.111 103.27 103.401 103.473 103.551 103.675 103.753 103.82 103.846 103.885 103.928 103.969 103.972 103.832 103.965 103.959 103.952 103.9 103.854 103.794 103.714 103.605 103.419 103.173 101.719 -2 ,23298 ,TETRA ,17606461,Sun Nov 28 20:32:05 CET,Sun Nov 28 22:22:47 CET,0.0 0.698 1.107 1.441 1.735 1.983 2.229 2.477 2.954 3.171 3.379 3.554 4.012 4.213 4.6 4.988 5.378 5.562 5.904 6.242 6.746 7.078 7.407 7.891 8.361 8.826 9.278 9.727 10.315 10.896 11.476 12.203 12.919 13.611 14.446 15.445 16.474 17.631 18.867 20.185 21.627 23.314 25.343 27.465 30.03 33.024 36.681 41.088 46.61 53.67 63.31 72.488 78.738 83.33 86.792 89.567 91.771 93.591 95.024 96.332 97.362 98.215 98.983 99.658 100.252 100.756 101.235 101.646 101.982 102.291 102.579 102.792 102.987 103.181 103.326 103.47 103.596 103.708 103.819 103.885 103.947 104.019 104.062 104.105 104.125 104.157 104.17 104.177 104.173 104.031 104.119 104.094 104.086 104.047 104.013 103.965 103.866 103.748 103.582 103.308 102.414 -3 ,26080 ,TETRA ,17606462,Sun Nov 28 20:32:06 CET,Sun Nov 28 22:22:09 CET,0.0 2.466 3.087 3.507 3.871 4.218 4.562 4.879 5.463 5.744 6.007 6.265 6.754 6.987 7.441 7.884 8.313 8.52 8.926 9.34 9.952 10.347 10.743 11.336 11.897 12.436 12.987 13.529 14.252 14.961 15.653 16.525 17.394 18.241 19.256 20.416 21.517 22.741 24.105 25.627 27.28 29.177 31.444 33.753 36.495 39.708 43.606 48.254 54.12 61.578 71.419 80.519 86.459 90.667 93.769 96.183 98.063 99.565 100.731 101.755 102.532 103.176 103.78 104.292 104.698 105.129 105.623 106.027 106.357 106.681 107.01 107.267 107.511 107.732 107.885 108.043 108.199 108.36 108.516 108.611 108.689 108.777 108.846 108.915 108.942 108.993 109.027 109.053 109.068 108.945 109.054 109.026 109.009 108.981 108.957 108.902 108.827 108.749 108.617 108.402 107.671 -4 ,32306 ,TETRA ,17606463,Sun Nov 28 20:33:07 CET,Sun Nov 28 22:23:26 CET,0.0 0.584 0.934 1.22 1.496 1.751 1.996 2.241 2.686 2.886 3.085 3.227 3.669 3.874 4.267 4.632 4.981 5.15 5.497 5.838 6.335 6.669 7.008 7.503 7.994 8.485 8.955 9.436 10.075 10.675 11.271 12.013 12.736 13.439 14.28 15.279 16.278 17.376 18.576 19.887 21.3 22.995 25.066 27.181 29.74 32.748 36.442 40.927 46.554 53.816 63.674 72.951 79.232 83.785 87.194 89.915 92.048 93.798 95.191 96.489 97.513 98.347 99.101 99.755 100.306 100.777 101.238 101.626 101.946 102.268 102.588 102.835 103.088 103.333 103.5 103.662 103.821 103.979 104.127 104.229 104.317 104.418 104.495 104.573 104.605 104.659 104.699 104.718 104.72 104.59 104.726 104.719 104.704 104.662 104.636 104.594 104.539 104.434 104.252 104.066 103.177 -5 ,6551 ,TETRA ,17606464,Sun Nov 28 20:33:07 CET,Sun Nov 28 22:23:01 CET,0.0 0.636 1.025 1.38 1.732 2.027 2.291 2.561 3.105 3.358 3.594 3.805 4.275 4.494 4.891 5.283 5.681 5.876 6.243 6.601 7.137 7.484 7.822 8.316 8.815 9.319 9.823 10.321 10.976 11.619 12.244 13.012 13.754 14.462 15.322 16.342 17.345 18.462 19.672 20.982 22.393 24.069 26.103 28.197 30.813 33.963 37.745 42.266 47.932 55.139 64.855 74.131 80.441 84.985 88.406 91.138 93.264 95.011 96.388 97.639 98.657 99.501 100.249 100.906 101.484 101.995 102.484 102.889 103.223 103.543 103.865 104.126 104.363 104.576 104.738 104.895 105.05 105.199 105.341 105.441 105.532 105.64 105.704 105.768 105.797 105.854 105.899 105.935 105.959 105.834 105.955 105.937 105.913 105.852 105.799 105.712 105.606 105.491 105.378 105.238 104.496 -6 ,9522 ,TETRA ,17606465,Sun Nov 28 20:33:07 CET,Sun Nov 28 22:21:13 CET,0.0 0.715 1.028 1.322 1.615 1.893 2.146 2.375 2.848 3.084 3.303 3.479 3.932 4.13 4.504 4.867 5.221 5.394 5.735 6.068 6.551 6.87 7.186 7.662 8.127 8.585 9.035 9.485 10.078 10.652 11.224 11.92 12.607 13.296 14.11 15.052 15.996 17.053 18.217 19.527 20.956 22.631 24.681 26.775 29.284 32.248 35.916 40.302 45.744 52.781 62.411 71.533 77.683 82.242 85.72 88.454 90.622 92.407 93.803 95.085 96.11 96.962 97.715 98.358 98.938 99.441 99.898 100.282 100.585 100.882 101.19 101.431 101.644 101.837 101.983 102.117 102.244 102.37 102.484 102.552 102.618 102.711 102.766 102.818 102.835 102.861 102.887 102.901 102.906 102.781 102.91 102.891 102.877 102.827 102.793 102.75 102.676 102.577 102.423 102.14 101.017 -7 ,22097 ,TETRA ,17606466,Sun Nov 28 20:33:07 CET,Sun Nov 28 22:23:29 CET,0.0 0.795 1.174 1.502 1.802 2.066 2.321 2.568 3.046 3.279 3.501 3.686 4.155 4.383 4.82 5.236 5.636 5.832 6.221 6.606 7.173 7.539 7.89 8.409 8.925 9.432 9.926 10.419 11.075 11.722 12.365 13.166 13.95 14.707 15.606 16.64 17.653 18.794 20.048 21.394 22.838 24.496 26.524 28.685 31.276 34.278 37.944 42.537 48.437 55.826 65.874 75.166 81.227 85.434 88.465 90.881 92.706 94.168 95.359 96.421 97.198 97.848 98.443 98.935 99.318 99.636 99.94 100.197 100.414 100.626 100.826 100.96 101.086 101.212 101.29 101.363 101.431 101.483 101.533 101.558 101.571 101.587 101.6 101.611 101.606 101.576 101.535 101.477 101.45 101.287 101.323 101.263 101.191 101.014 100.902 100.763 100.599 100.402 100.179 99.818 97.502 -8 ,24643 ,TETRA ,17606467,Sun Nov 28 20:33:07 CET,Sun Nov 28 22:22:48 CET,0.0 0.672 1.092 1.432 1.726 1.992 2.247 2.503 2.987 3.213 3.423 3.568 4.01 4.21 4.6 4.988 5.386 5.581 5.96 6.333 6.887 7.243 7.586 8.087 8.579 9.066 9.537 9.993 10.602 11.211 11.815 12.556 13.293 14.028 14.891 15.881 16.843 17.923 19.131 20.452 21.88 23.544 25.573 27.697 30.251 33.244 36.916 41.301 46.828 53.979 63.539 72.624 78.898 83.501 86.985 89.752 91.917 93.694 95.102 96.416 97.455 98.301 99.066 99.748 100.355 100.871 101.359 101.772 102.106 102.439 102.766 103.012 103.251 103.479 103.645 103.808 103.963 104.116 104.263 104.354 104.446 104.556 104.61 104.663 104.692 104.74 104.769 104.794 104.806 104.674 104.788 104.765 104.746 104.723 104.691 104.646 104.566 104.452 104.315 103.988 102.599 -9 ,5209 ,TETRA ,17606468,Sun Nov 28 20:34:02 CET,Sun Nov 28 22:23:42 CET,0.0 0.563 0.936 1.246 1.539 1.819 2.085 2.337 2.806 3.017 3.223 3.379 3.816 4.011 4.391 4.749 5.1 5.273 5.615 5.945 6.426 6.75 7.068 7.549 8.036 8.52 8.997 9.453 10.038 10.619 11.199 11.906 12.606 13.302 14.134 15.095 16.051 17.144 18.373 19.709 21.149 22.838 24.872 26.995 29.568 32.608 36.343 40.778 46.297 53.369 63.004 72.19 78.401 82.999 86.454 89.176 91.317 93.058 94.476 95.779 96.793 97.614 98.345 99.001 99.57 100.057 100.531 100.924 101.245 101.56 101.843 102.061 102.283 102.494 102.649 102.809 102.954 103.084 103.21 103.287 103.359 103.441 103.473 103.508 103.524 103.535 103.546 103.548 103.543 103.398 103.513 103.502 103.487 103.431 103.383 103.326 103.272 103.183 103.016 102.827 101.887 -10 ,28223 ,TETRA ,17606469,Sun Nov 28 20:35:04 CET,Sun Nov 28 22:25:15 CET,0.0 1.231 1.739 2.135 2.476 2.804 3.113 3.397 3.943 4.205 4.453 4.696 5.175 5.398 5.831 6.254 6.651 6.851 7.252 7.641 8.216 8.589 8.961 9.485 9.962 10.438 10.923 11.407 12.037 12.662 13.271 14.0 14.718 15.429 16.284 17.254 18.196 19.275 20.463 21.771 23.204 24.851 26.862 28.967 31.523 34.527 38.193 42.633 48.169 55.231 64.818 74.0 80.231 84.729 88.116 90.843 92.964 94.701 96.105 97.389 98.413 99.277 100.036 100.671 101.224 101.72 102.215 102.612 102.932 103.247 103.543 103.781 104.014 104.232 104.394 104.555 104.705 104.859 105.008 105.1 105.179 105.285 105.364 105.433 105.459 105.508 105.549 105.583 105.596 105.472 105.626 105.617 105.597 105.524 105.459 105.4 105.35 105.256 105.136 104.96 103.836 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_27_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_27_24.txt deleted file mode 100644 index 2b36dfd6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_27_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25851 ,TETRA ,17606470,Sun Nov 28 20:34:03 CET,Sun Nov 28 22:25:42 CET,0.0 1.343 1.711 1.956 2.155 2.344 2.522 2.669 2.948 3.069 3.185 3.267 3.522 3.627 3.823 4.018 4.226 4.333 4.539 4.717 4.98 5.147 5.3 5.517 5.737 5.961 6.163 6.351 6.598 6.842 7.07 7.345 7.613 7.862 8.171 8.519 8.848 9.202 9.556 9.951 10.372 10.822 11.374 11.934 12.568 13.289 14.065 14.892 15.907 16.993 18.127 18.791 18.911 18.818 18.603 18.31 17.971 17.65 17.372 17.06 16.739 16.382 16.002 15.644 15.317 15.043 14.778 14.546 14.346 14.115 13.869 13.647 13.385 13.116 12.905 12.698 12.496 12.261 12.016 11.845 11.665 11.399 11.209 11.012 10.915 10.704 10.458 10.193 10.051 9.773 9.609 9.477 9.348 8.957 8.728 8.493 8.214 7.862 7.452 6.888 3.272 -2 ,21116 ,TETRA ,17606471,Sun Nov 28 20:35:04 CET,Sun Nov 28 22:28:27 CET,0.0 0.717 1.009 1.22 1.391 1.563 1.756 1.917 2.171 2.299 2.418 2.476 2.727 2.841 3.061 3.257 3.43 3.519 3.697 3.858 4.089 4.241 4.38 4.58 4.779 4.968 5.153 5.331 5.56 5.788 6.016 6.281 6.526 6.765 7.045 7.358 7.657 7.98 8.348 8.762 9.186 9.656 10.194 10.741 11.382 12.096 12.936 13.826 14.787 15.815 16.8 17.346 17.528 17.45 17.207 16.92 16.635 16.36 16.097 15.788 15.484 15.186 14.919 14.678 14.436 14.192 13.891 13.617 13.401 13.18 12.952 12.757 12.575 12.393 12.216 12.032 11.853 11.656 11.448 11.298 11.124 10.861 10.695 10.521 10.433 10.244 9.986 9.695 9.562 9.296 9.158 9.003 8.82 8.355 8.102 7.856 7.57 7.184 6.666 5.995 2.663 -3 ,1420 ,TETRA ,17606472,Sun Nov 28 20:34:02 CET,Sun Nov 28 22:25:47 CET,0.0 1.79 2.276 2.62 2.904 3.138 3.33 3.517 3.895 4.065 4.214 4.335 4.612 4.738 4.967 5.194 5.427 5.543 5.762 5.962 6.261 6.458 6.636 6.89 7.144 7.396 7.636 7.865 8.162 8.437 8.699 9.024 9.348 9.661 10.005 10.393 10.77 11.199 11.649 12.103 12.62 13.254 13.967 14.678 15.506 16.35 17.311 18.406 19.63 20.92 22.112 22.568 22.353 21.948 21.505 20.934 20.416 19.973 19.543 19.081 18.684 18.332 17.991 17.65 17.342 17.077 16.782 16.483 16.226 15.966 15.672 15.434 15.189 14.944 14.754 14.552 14.344 14.121 13.877 13.714 13.555 13.314 13.135 12.923 12.817 12.603 12.377 12.159 12.048 11.783 11.625 11.474 11.313 10.903 10.664 10.416 10.154 9.845 9.486 8.987 5.871 -4 ,17489 ,TETRA ,17606473,Sun Nov 28 20:34:02 CET,Sun Nov 28 22:25:43 CET,0.0 0.842 1.154 1.364 1.547 1.717 1.876 2.014 2.257 2.373 2.489 2.561 2.815 2.921 3.111 3.287 3.455 3.535 3.698 3.861 4.089 4.242 4.395 4.597 4.788 4.975 5.154 5.333 5.561 5.784 6.005 6.3 6.586 6.852 7.193 7.605 7.962 8.29 8.639 9.026 9.423 9.877 10.414 10.95 11.568 12.234 12.992 13.857 14.869 15.907 16.959 17.637 17.823 17.764 17.637 17.499 17.261 16.971 16.703 16.4 16.117 15.85 15.57 15.288 15.025 14.796 14.577 14.373 14.174 13.943 13.679 13.473 13.25 12.96 12.742 12.537 12.316 12.075 11.826 11.669 11.513 11.272 11.099 10.895 10.789 10.578 10.334 10.058 9.932 9.675 9.504 9.336 9.159 8.754 8.537 8.281 7.972 7.616 7.209 6.584 3.934 -5 ,23057 ,TETRA ,17606474,Sun Nov 28 20:36:08 CET,Sun Nov 28 22:27:42 CET,0.0 0.533 0.828 1.057 1.238 1.435 1.645 1.839 2.202 2.367 2.525 2.657 2.937 3.069 3.293 3.475 3.647 3.736 3.912 4.077 4.307 4.445 4.584 4.785 4.982 5.178 5.363 5.539 5.776 6.011 6.25 6.537 6.792 7.043 7.327 7.642 7.954 8.31 8.699 9.104 9.521 9.994 10.551 11.112 11.756 12.442 13.23 14.103 15.115 16.236 17.307 17.908 18.034 17.92 17.711 17.487 17.257 16.971 16.683 16.298 15.958 15.685 15.438 15.185 14.92 14.655 14.313 14.011 13.783 13.536 13.231 12.965 12.713 12.458 12.265 12.079 11.86 11.596 11.338 11.191 11.042 10.782 10.575 10.347 10.234 10.008 9.776 9.531 9.396 9.119 8.955 8.807 8.655 8.3 8.101 7.868 7.616 7.28 6.82 6.216 2.984 -6 ,16550 ,TETRA ,17606475,Sun Nov 28 20:35:04 CET,Sun Nov 28 22:16:30 CET,0.0 0.613 0.914 1.169 1.366 1.521 1.667 1.814 2.119 2.285 2.433 2.525 2.778 2.888 3.12 3.352 3.584 3.7 3.917 4.13 4.451 4.649 4.833 5.106 5.371 5.616 5.851 6.065 6.317 6.573 6.817 7.09 7.352 7.612 7.94 8.293 8.598 8.94 9.333 9.75 10.179 10.652 11.186 11.737 12.377 13.06 13.88 14.829 15.863 16.928 18.053 18.638 18.646 18.494 18.292 18.057 17.728 17.356 17.057 16.777 16.503 16.224 15.903 15.548 15.228 14.942 14.615 14.329 14.101 13.86 13.612 13.406 13.184 12.934 12.732 12.522 12.307 12.095 11.871 11.696 11.512 11.249 11.064 10.878 10.786 10.579 10.347 10.117 9.994 9.727 9.576 9.417 9.256 8.926 8.746 8.54 8.292 7.989 7.561 6.944 0.935 -7 ,32717 ,TETRA ,17606476,Sun Nov 28 20:35:04 CET,Sun Nov 28 22:26:44 CET,0.0 1.393 1.797 2.087 2.291 2.472 2.652 2.808 3.068 3.196 3.316 3.382 3.639 3.749 3.956 4.156 4.342 4.425 4.588 4.749 4.977 5.129 5.273 5.479 5.678 5.872 6.071 6.265 6.5 6.717 6.93 7.203 7.476 7.739 8.041 8.374 8.695 9.051 9.431 9.834 10.265 10.735 11.256 11.819 12.481 13.154 13.929 14.773 15.71 16.777 17.775 18.308 18.371 18.251 18.047 17.765 17.464 17.123 16.818 16.421 16.047 15.728 15.361 15.013 14.738 14.513 14.232 13.958 13.735 13.482 13.212 13.013 12.805 12.554 12.34 12.134 11.954 11.751 11.505 11.33 11.148 10.837 10.616 10.393 10.278 10.054 9.813 9.562 9.43 9.15 8.976 8.813 8.63 8.223 8.029 7.815 7.55 7.244 6.845 6.245 -0.143 -8 ,3819 ,TETRA ,17606477,Sun Nov 28 20:35:05 CET,Sun Nov 28 22:26:40 CET,0.0 1.337 1.714 2.052 2.336 2.559 2.745 2.911 3.25 3.397 3.516 3.585 3.836 3.935 4.122 4.298 4.478 4.569 4.752 4.92 5.146 5.289 5.425 5.633 5.842 6.04 6.228 6.43 6.702 6.948 7.18 7.453 7.721 7.977 8.273 8.608 8.92 9.278 9.674 10.086 10.515 10.991 11.551 12.124 12.745 13.429 14.255 15.165 16.187 17.36 18.529 18.791 18.449 18.071 17.669 17.246 16.774 16.297 15.898 15.474 15.076 14.724 14.416 14.119 13.816 13.514 13.166 12.861 12.598 12.32 12.043 11.796 11.547 11.294 11.096 10.893 10.674 10.427 10.182 10.026 9.86 9.587 9.395 9.192 9.087 8.858 8.604 8.331 8.187 7.902 7.724 7.56 7.373 6.972 6.757 6.529 6.27 5.939 5.542 4.931 0.102 -9 ,13514 ,TETRA ,17606478,Sun Nov 28 20:36:05 CET,Sun Nov 28 22:28:20 CET,0.0 1.383 1.806 2.091 2.297 2.473 2.628 2.764 3.05 3.177 3.294 3.375 3.62 3.714 3.904 4.088 4.268 4.356 4.524 4.683 4.905 5.052 5.193 5.394 5.587 5.783 5.971 6.155 6.389 6.61 6.841 7.133 7.409 7.663 7.967 8.328 8.667 9.021 9.404 9.798 10.202 10.685 11.25 11.792 12.459 13.205 14.029 14.907 15.834 16.84 17.914 18.555 18.705 18.621 18.444 18.24 18.01 17.728 17.418 17.092 16.822 16.58 16.354 16.127 15.882 15.633 15.364 15.11 14.887 14.662 14.409 14.192 13.952 13.679 13.477 13.262 13.031 12.787 12.539 12.374 12.211 11.966 11.781 11.592 11.492 11.249 10.996 10.755 10.62 10.338 10.149 9.978 9.803 9.38 9.113 8.824 8.553 8.225 7.792 7.206 1.401 -10 ,26941 ,TETRA ,17606479,Sun Nov 28 20:36:04 CET,Sun Nov 28 22:22:57 CET,0.0 0.465 0.739 0.957 1.143 1.301 1.466 1.632 1.914 2.042 2.157 2.25 2.526 2.65 2.87 3.091 3.323 3.424 3.594 3.757 3.995 4.149 4.295 4.507 4.719 4.924 5.117 5.297 5.54 5.814 6.073 6.356 6.635 6.9 7.197 7.517 7.82 8.206 8.631 9.046 9.482 9.95 10.48 11.023 11.681 12.401 13.197 14.083 15.035 16.029 17.107 17.656 17.738 17.698 17.511 17.174 16.855 16.573 16.281 15.962 15.667 15.414 15.189 14.94 14.685 14.453 14.207 13.977 13.778 13.563 13.333 13.127 12.896 12.683 12.523 12.336 12.133 11.92 11.694 11.525 11.355 11.113 10.935 10.741 10.637 10.435 10.236 10.001 9.87 9.605 9.457 9.303 9.145 8.781 8.562 8.31 8.036 7.735 7.369 6.834 2.926 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_27_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_27_25.txt deleted file mode 100644 index e81de124..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_27_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24940 ,TETRA ,17606480,Sun Nov 28 20:36:05 CET,Sun Nov 28 22:32:37 CET,0.0 0.756 0.931 1.068 1.198 1.288 1.342 1.391 1.469 1.5 1.528 1.416 1.572 1.583 1.599 1.618 1.62 1.614 1.59 1.572 1.575 1.569 1.547 1.506 1.453 1.382 1.301 1.224 1.118 0.991 0.83 0.611 0.411 0.215 -0.022 -0.301 -0.638 -1.067 -1.569 -2.167 -2.839 -3.654 -4.702 -5.889 -7.399 -9.247 -11.649 -14.616 -18.618 -24.409 -33.173 -42.506 -49.421 -54.809 -59.141 -62.793 -65.819 -68.422 -70.57 -72.608 -74.306 -75.777 -77.132 -78.389 -79.524 -80.538 -81.576 -82.464 -83.204 -83.987 -84.805 -85.457 -86.117 -86.779 -87.276 -87.773 -88.285 -88.824 -89.372 -89.758 -90.152 -90.725 -91.123 -91.514 -91.707 -92.15 -92.591 -93.025 -93.266 -93.758 -94.002 -94.259 -94.524 -95.067 -95.377 -95.697 -96.05 -96.491 -97.052 -97.847 -101.397 -2 ,23071 ,TETRA ,17606481,Sun Nov 28 20:36:05 CET,Sun Nov 28 22:28:21 CET,0.0 1.197 1.465 1.632 1.751 1.855 1.934 1.978 2.027 2.054 2.091 1.999 2.146 2.16 2.192 2.195 2.184 2.174 2.164 2.159 2.105 2.049 1.996 1.91 1.814 1.718 1.608 1.494 1.357 1.208 1.045 0.846 0.621 0.378 0.086 -0.25 -0.586 -0.98 -1.454 -2.022 -2.67 -3.5 -4.548 -5.666 -7.117 -8.911 -11.167 -14.059 -18.059 -23.736 -32.512 -41.91 -48.858 -54.261 -58.584 -62.211 -65.232 -67.859 -69.997 -72.033 -73.735 -75.195 -76.536 -77.785 -78.923 -79.917 -80.963 -81.879 -82.612 -83.343 -84.101 -84.74 -85.399 -86.055 -86.537 -87.011 -87.481 -87.969 -88.482 -88.826 -89.18 -89.74 -90.113 -90.486 -90.677 -91.077 -91.483 -91.917 -92.155 -92.625 -92.843 -93.082 -93.327 -93.841 -94.102 -94.408 -94.775 -95.151 -95.58 -96.149 -98.566 -3 ,22684 ,TETRA ,17606482,Sun Nov 28 20:36:06 CET,Sun Nov 28 22:27:58 CET,0.0 0.796 1.043 1.168 1.255 1.334 1.398 1.448 1.535 1.57 1.594 1.478 1.635 1.637 1.632 1.611 1.578 1.571 1.545 1.511 1.458 1.418 1.387 1.326 1.233 1.13 1.042 0.953 0.813 0.67 0.527 0.329 0.103 -0.133 -0.41 -0.738 -1.062 -1.454 -1.949 -2.528 -3.185 -3.996 -5.021 -6.166 -7.65 -9.473 -11.793 -14.73 -18.751 -24.425 -32.939 -41.985 -48.726 -54.04 -58.318 -61.978 -65.023 -67.608 -69.753 -71.856 -73.604 -75.103 -76.467 -77.736 -78.898 -79.907 -80.941 -81.834 -82.59 -83.377 -84.174 -84.818 -85.475 -86.147 -86.66 -87.193 -87.737 -88.289 -88.851 -89.231 -89.617 -90.197 -90.585 -90.987 -91.196 -91.621 -92.072 -92.519 -92.753 -93.256 -93.519 -93.798 -94.082 -94.637 -94.93 -95.231 -95.531 -95.876 -96.397 -97.104 -99.326 -4 ,18801 ,TETRA ,17606483,Sun Nov 28 20:36:06 CET,Sun Nov 28 22:31:07 CET,0.0 0.81 1.062 1.226 1.355 1.458 1.521 1.581 1.7 1.738 1.77 1.679 1.848 1.864 1.877 1.872 1.837 1.824 1.815 1.793 1.749 1.712 1.673 1.623 1.547 1.445 1.337 1.243 1.115 0.963 0.812 0.647 0.48 0.282 0.021 -0.327 -0.7 -1.142 -1.657 -2.226 -2.869 -3.685 -4.749 -5.907 -7.365 -9.152 -11.472 -14.414 -18.411 -24.081 -32.525 -41.379 -48.031 -53.401 -57.773 -61.354 -64.319 -66.927 -69.127 -71.264 -73.043 -74.548 -75.893 -77.137 -78.278 -79.288 -80.311 -81.203 -81.939 -82.681 -83.456 -84.087 -84.735 -85.415 -85.928 -86.435 -86.936 -87.435 -87.946 -88.301 -88.683 -89.274 -89.674 -90.095 -90.309 -90.724 -91.141 -91.573 -91.788 -92.249 -92.492 -92.744 -93.004 -93.56 -93.857 -94.178 -94.544 -94.94 -95.442 -96.205 -100.078 -5 ,13494 ,TETRA ,17606484,Sun Nov 28 20:37:05 CET,Sun Nov 28 22:33:13 CET,0.0 0.87 1.049 1.208 1.323 1.393 1.445 1.488 1.564 1.599 1.624 1.503 1.652 1.652 1.638 1.622 1.605 1.598 1.585 1.545 1.466 1.411 1.355 1.251 1.136 1.029 0.917 0.793 0.625 0.46 0.275 0.034 -0.188 -0.418 -0.71 -1.07 -1.46 -1.913 -2.436 -3.047 -3.74 -4.56 -5.577 -6.71 -8.174 -9.943 -12.239 -15.25 -19.342 -25.027 -33.608 -42.719 -49.458 -54.778 -59.084 -62.71 -65.685 -68.238 -70.366 -72.423 -74.13 -75.583 -76.932 -78.173 -79.29 -80.294 -81.306 -82.185 -82.951 -83.732 -84.511 -85.13 -85.745 -86.386 -86.887 -87.396 -87.939 -88.504 -89.058 -89.426 -89.811 -90.393 -90.786 -91.181 -91.386 -91.831 -92.283 -92.722 -92.946 -93.414 -93.646 -93.898 -94.153 -94.693 -94.987 -95.288 -95.598 -95.993 -96.509 -97.229 -100.77 -6 ,2990 ,TETRA ,17606485,Sun Nov 28 20:37:05 CET,Sun Nov 28 22:29:15 CET,0.0 1.063 1.278 1.464 1.578 1.646 1.693 1.737 1.809 1.83 1.852 1.741 1.899 1.908 1.919 1.909 1.891 1.88 1.859 1.838 1.794 1.75 1.693 1.619 1.534 1.439 1.34 1.221 1.045 0.864 0.684 0.445 0.203 -0.026 -0.323 -0.687 -1.067 -1.499 -1.981 -2.564 -3.235 -4.051 -5.091 -6.231 -7.659 -9.439 -11.777 -14.761 -18.779 -24.373 -32.807 -41.754 -48.502 -53.916 -58.284 -62.006 -65.1 -67.74 -69.928 -72.064 -73.83 -75.336 -76.726 -77.985 -79.11 -80.119 -81.159 -82.065 -82.823 -83.591 -84.375 -85.015 -85.673 -86.339 -86.846 -87.37 -87.889 -88.422 -88.971 -89.341 -89.732 -90.345 -90.751 -91.162 -91.373 -91.791 -92.216 -92.67 -92.907 -93.389 -93.658 -93.915 -94.185 -94.753 -95.04 -95.361 -95.727 -96.149 -96.619 -97.206 -100.73 -7 ,10858 ,TETRA ,17606486,Sun Nov 28 20:38:04 CET,Sun Nov 28 22:30:27 CET,0.0 0.897 1.121 1.26 1.339 1.409 1.46 1.505 1.582 1.608 1.631 1.517 1.678 1.693 1.713 1.716 1.712 1.714 1.714 1.695 1.644 1.61 1.576 1.512 1.446 1.378 1.285 1.178 1.031 0.884 0.734 0.535 0.343 0.142 -0.125 -0.461 -0.82 -1.253 -1.755 -2.32 -2.977 -3.812 -4.875 -6.027 -7.474 -9.203 -11.394 -14.322 -18.354 -24.031 -32.609 -41.745 -48.567 -53.917 -58.241 -61.934 -64.99 -67.633 -69.845 -71.935 -73.656 -75.145 -76.541 -77.819 -78.956 -79.971 -81.024 -81.922 -82.668 -83.429 -84.213 -84.858 -85.49 -86.134 -86.635 -87.143 -87.644 -88.15 -88.682 -89.046 -89.413 -89.962 -90.339 -90.725 -90.919 -91.31 -91.702 -92.121 -92.342 -92.803 -92.998 -93.228 -93.476 -94.075 -94.385 -94.674 -94.996 -95.361 -95.8 -96.391 -107.763 -8 ,6473 ,TETRA ,17606487,Sun Nov 28 20:37:05 CET,Sun Nov 28 22:27:40 CET,0.0 1.205 1.495 1.674 1.823 1.927 2.003 2.065 2.171 2.217 2.256 2.179 2.348 2.363 2.401 2.435 2.447 2.446 2.437 2.427 2.406 2.377 2.342 2.299 2.245 2.154 2.063 1.963 1.794 1.62 1.453 1.247 1.031 0.787 0.49 0.151 -0.222 -0.687 -1.211 -1.79 -2.414 -3.189 -4.246 -5.416 -6.904 -8.742 -11.146 -14.184 -18.225 -23.839 -32.368 -41.484 -48.306 -53.692 -57.971 -61.542 -64.491 -67.031 -69.143 -71.183 -72.891 -74.353 -75.685 -76.927 -78.064 -79.045 -80.06 -80.972 -81.744 -82.534 -83.338 -83.983 -84.619 -85.27 -85.78 -86.307 -86.824 -87.352 -87.909 -88.284 -88.669 -89.243 -89.631 -90.04 -90.242 -90.659 -91.088 -91.534 -91.765 -92.245 -92.504 -92.763 -93.026 -93.634 -93.982 -94.327 -94.697 -95.126 -95.648 -96.322 -99.549 -9 ,11256 ,TETRA ,17606488,Sun Nov 28 20:37:06 CET,Sun Nov 28 22:28:34 CET,0.0 0.582 0.817 1.004 1.144 1.242 1.315 1.37 1.455 1.488 1.511 1.417 1.586 1.606 1.628 1.637 1.643 1.638 1.623 1.606 1.562 1.514 1.461 1.399 1.339 1.256 1.157 1.057 0.926 0.795 0.644 0.423 0.191 -0.036 -0.296 -0.615 -0.974 -1.429 -1.955 -2.557 -3.255 -4.084 -5.129 -6.248 -7.701 -9.541 -11.911 -14.961 -18.995 -24.642 -33.263 -42.502 -49.317 -54.695 -59.008 -62.589 -65.62 -68.24 -70.362 -72.442 -74.174 -75.634 -76.998 -78.261 -79.401 -80.41 -81.435 -82.312 -83.06 -83.84 -84.625 -85.266 -85.917 -86.573 -87.083 -87.586 -88.086 -88.612 -89.148 -89.518 -89.899 -90.491 -90.906 -91.319 -91.52 -91.922 -92.331 -92.755 -92.981 -93.456 -93.688 -93.948 -94.224 -94.793 -95.078 -95.381 -95.737 -96.124 -96.587 -97.176 -99.636 -10 ,29046 ,TETRA ,17606489,Sun Nov 28 20:38:06 CET,Sun Nov 28 22:31:47 CET,0.0 0.862 1.066 1.192 1.286 1.355 1.412 1.479 1.595 1.638 1.672 1.571 1.726 1.736 1.738 1.743 1.739 1.733 1.723 1.706 1.654 1.607 1.563 1.497 1.408 1.309 1.228 1.144 1.009 0.858 0.707 0.515 0.313 0.11 -0.154 -0.494 -0.863 -1.315 -1.834 -2.422 -3.096 -3.947 -5.051 -6.243 -7.772 -9.652 -12.06 -15.109 -19.19 -24.942 -33.47 -42.609 -49.471 -54.749 -59.01 -62.59 -65.543 -68.084 -70.164 -72.168 -73.84 -75.266 -76.596 -77.826 -78.943 -79.962 -81.007 -81.906 -82.654 -83.4 -84.157 -84.779 -85.418 -86.065 -86.558 -87.064 -87.589 -88.116 -88.647 -89.036 -89.439 -90.01 -90.417 -90.847 -91.048 -91.482 -91.957 -92.428 -92.663 -93.146 -93.381 -93.619 -93.884 -94.493 -94.806 -95.108 -95.413 -95.744 -96.178 -96.825 -99.399 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_28_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_28_21.txt deleted file mode 100644 index 0ade5618..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_28_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20785 ,KEBNE ,17027696,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:20:20 CET,0.0 0.435 0.61 0.751 0.876 0.98 1.07 1.147 1.274 1.332 1.397 1.444 1.552 1.603 1.684 1.746 1.808 1.837 1.899 1.968 2.054 2.1 2.141 2.205 2.265 2.314 2.357 2.402 2.45 2.49 2.53 2.568 2.607 2.643 2.683 2.701 2.696 2.688 2.68 2.662 2.622 2.551 2.425 2.262 2.043 1.723 1.235 0.595 -0.321 -1.793 -4.257 -7.022 -9.282 -11.199 -12.777 -14.173 -15.376 -16.461 -17.398 -18.326 -19.124 -19.817 -20.452 -21.048 -21.605 -22.113 -22.63 -23.074 -23.463 -23.862 -24.264 -24.597 -24.936 -25.294 -25.569 -25.839 -26.119 -26.411 -26.708 -26.911 -27.13 -27.468 -27.689 -27.912 -28.026 -28.27 -28.538 -28.804 -28.946 -29.184 -29.396 -29.541 -29.684 -29.978 -30.133 -30.303 -30.485 -30.683 -30.926 -31.239 -31.89 -2 ,18552 ,KEBNE ,17027697,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:22:42 CET,0.0 0.461 0.655 0.782 0.89 0.993 1.082 1.164 1.318 1.388 1.449 1.514 1.633 1.692 1.808 1.894 1.972 2.014 2.095 2.165 2.24 2.289 2.346 2.415 2.467 2.531 2.597 2.655 2.732 2.797 2.844 2.893 2.937 2.978 3.028 3.077 3.114 3.125 3.116 3.093 3.056 3.0 2.874 2.725 2.513 2.212 1.806 1.201 0.213 -1.282 -3.675 -6.613 -8.984 -10.972 -12.694 -14.123 -15.345 -16.472 -17.391 -18.259 -19.0 -19.656 -20.294 -20.904 -21.451 -21.929 -22.418 -22.85 -23.217 -23.589 -23.97 -24.291 -24.617 -24.951 -25.204 -25.46 -25.733 -26.014 -26.302 -26.503 -26.712 -27.042 -27.26 -27.475 -27.587 -27.818 -28.051 -28.3 -28.432 -28.649 -28.815 -28.949 -29.082 -29.366 -29.507 -29.665 -29.848 -30.043 -30.273 -30.555 -31.592 -3 ,5495 ,KEBNE ,17027698,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:20:33 CET,0.0 0.781 0.978 1.133 1.263 1.365 1.443 1.505 1.622 1.682 1.742 1.784 1.903 1.95 2.032 2.111 2.176 2.204 2.279 2.36 2.459 2.51 2.555 2.636 2.712 2.772 2.824 2.875 2.942 2.999 3.052 3.119 3.174 3.207 3.224 3.228 3.234 3.236 3.227 3.214 3.189 3.139 3.011 2.824 2.564 2.194 1.675 0.965 -0.077 -1.66 -4.173 -7.103 -9.535 -11.585 -13.273 -14.688 -15.926 -17.077 -18.029 -18.938 -19.706 -20.397 -21.044 -21.61 -22.117 -22.582 -23.062 -23.479 -23.845 -24.224 -24.609 -24.929 -25.26 -25.594 -25.847 -26.112 -26.38 -26.648 -26.94 -27.155 -27.367 -27.679 -27.887 -28.093 -28.202 -28.431 -28.662 -28.895 -29.023 -29.242 -29.407 -29.549 -29.71 -30.053 -30.229 -30.402 -30.583 -30.77 -31.004 -31.256 -31.723 -4 ,22540 ,KEBNE ,17027699,Wed Dec 22 17:44:08 CET,Wed Dec 22 19:21:34 CET,0.0 0.822 1.0 1.144 1.278 1.392 1.492 1.567 1.674 1.725 1.775 1.807 1.927 1.981 2.055 2.132 2.202 2.23 2.291 2.359 2.448 2.498 2.54 2.594 2.648 2.696 2.738 2.777 2.819 2.846 2.88 2.923 2.952 2.976 3.007 3.039 3.069 3.102 3.114 3.103 3.076 3.014 2.889 2.733 2.516 2.203 1.787 1.209 0.274 -1.215 -3.707 -6.655 -9.008 -10.943 -12.555 -13.973 -15.197 -16.248 -17.142 -18.043 -18.807 -19.487 -20.117 -20.71 -21.244 -21.72 -22.216 -22.651 -23.021 -23.396 -23.788 -24.115 -24.434 -24.763 -25.02 -25.279 -25.542 -25.802 -26.072 -26.261 -26.459 -26.766 -26.978 -27.192 -27.305 -27.537 -27.764 -27.999 -28.121 -28.337 -28.506 -28.643 -28.793 -29.128 -29.312 -29.498 -29.684 -29.893 -30.136 -30.414 -31.236 -5 ,29481 ,KEBNE ,17027700,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:20:21 CET,0.0 0.72 0.924 1.088 1.242 1.363 1.463 1.556 1.691 1.764 1.835 1.884 1.998 2.037 2.12 2.227 2.322 2.36 2.423 2.486 2.579 2.634 2.695 2.786 2.861 2.921 2.975 3.02 3.076 3.126 3.164 3.209 3.258 3.305 3.353 3.383 3.414 3.444 3.454 3.457 3.432 3.369 3.271 3.132 2.906 2.624 2.198 1.528 0.481 -1.064 -3.529 -6.461 -8.802 -10.74 -12.36 -13.812 -15.082 -16.215 -17.168 -18.051 -18.793 -19.46 -20.069 -20.632 -21.14 -21.591 -22.057 -22.468 -22.822 -23.186 -23.554 -23.851 -24.157 -24.49 -24.74 -24.991 -25.254 -25.522 -25.799 -25.986 -26.181 -26.494 -26.704 -26.915 -27.023 -27.236 -27.46 -27.695 -27.815 -28.043 -28.229 -28.363 -28.505 -28.813 -28.982 -29.168 -29.369 -29.592 -29.846 -30.134 -30.814 -6 ,32374 ,KEBNE ,17027701,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:21:29 CET,0.0 1.181 1.44 1.641 1.779 1.903 2.019 2.134 2.347 2.432 2.494 2.551 2.675 2.745 2.858 2.933 3.011 3.05 3.122 3.198 3.292 3.34 3.386 3.457 3.526 3.589 3.636 3.679 3.742 3.8 3.848 3.899 3.944 3.98 4.021 4.062 4.087 4.094 4.098 4.11 4.108 4.059 3.949 3.797 3.573 3.275 2.815 2.169 1.22 -0.201 -2.621 -5.636 -8.098 -10.121 -11.757 -13.163 -14.361 -15.433 -16.341 -17.263 -18.052 -18.723 -19.365 -19.976 -20.535 -21.033 -21.551 -22.001 -22.384 -22.776 -23.186 -23.529 -23.872 -24.225 -24.515 -24.805 -25.09 -25.383 -25.679 -25.885 -26.101 -26.424 -26.654 -26.906 -27.03 -27.279 -27.543 -27.828 -27.969 -28.206 -28.429 -28.587 -28.747 -29.085 -29.278 -29.482 -29.678 -29.883 -30.13 -30.399 -31.16 -7 ,18680 ,KEBNE ,17027702,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:20:21 CET,0.0 0.516 0.742 0.903 1.021 1.126 1.223 1.306 1.46 1.529 1.598 1.658 1.77 1.816 1.894 1.959 2.03 2.068 2.133 2.203 2.292 2.339 2.386 2.445 2.504 2.566 2.625 2.675 2.73 2.779 2.831 2.887 2.929 2.97 3.007 3.04 3.06 3.059 3.054 3.037 3.003 2.94 2.829 2.688 2.493 2.187 1.745 1.144 0.21 -1.237 -3.657 -6.458 -8.721 -10.681 -12.364 -13.819 -15.04 -16.104 -16.986 -17.838 -18.582 -19.231 -19.836 -20.417 -20.935 -21.396 -21.867 -22.262 -22.599 -22.955 -23.32 -23.625 -23.935 -24.246 -24.48 -24.718 -24.963 -25.229 -25.515 -25.7 -25.875 -26.143 -26.337 -26.541 -26.643 -26.856 -27.066 -27.285 -27.403 -27.615 -27.78 -27.912 -28.055 -28.348 -28.503 -28.671 -28.858 -29.069 -29.29 -29.561 -30.436 -8 ,32186 ,KEBNE ,17027703,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:21:52 CET,0.0 0.872 1.093 1.293 1.433 1.533 1.614 1.693 1.837 1.904 1.962 2.006 2.124 2.182 2.28 2.379 2.477 2.519 2.596 2.661 2.736 2.787 2.847 2.924 2.981 3.039 3.096 3.149 3.206 3.252 3.299 3.355 3.388 3.418 3.446 3.47 3.496 3.51 3.517 3.494 3.443 3.369 3.257 3.124 2.892 2.542 2.058 1.406 0.477 -0.922 -3.407 -6.432 -8.898 -10.924 -12.627 -14.125 -15.395 -16.536 -17.516 -18.463 -19.24 -19.918 -20.537 -21.123 -21.678 -22.167 -22.672 -23.12 -23.493 -23.868 -24.256 -24.567 -24.898 -25.249 -25.5 -25.749 -26.016 -26.298 -26.584 -26.791 -27.004 -27.309 -27.515 -27.741 -27.858 -28.095 -28.341 -28.598 -28.736 -28.965 -29.161 -29.309 -29.459 -29.78 -29.955 -30.146 -30.345 -30.545 -30.754 -30.997 -31.641 -9 ,26411 ,KEBNE ,17027704,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:20:26 CET,0.0 0.706 0.988 1.191 1.33 1.415 1.502 1.608 1.797 1.868 1.935 2.021 2.149 2.215 2.33 2.441 2.547 2.587 2.657 2.732 2.826 2.88 2.942 3.03 3.094 3.148 3.199 3.247 3.296 3.347 3.403 3.454 3.495 3.514 3.534 3.58 3.615 3.629 3.632 3.63 3.598 3.534 3.447 3.331 3.143 2.846 2.389 1.731 0.792 -0.625 -3.036 -5.888 -8.211 -10.177 -11.824 -13.261 -14.479 -15.566 -16.497 -17.427 -18.214 -18.907 -19.526 -20.089 -20.632 -21.13 -21.634 -22.073 -22.449 -22.838 -23.234 -23.551 -23.869 -24.202 -24.461 -24.728 -25.006 -25.277 -25.565 -25.769 -25.966 -26.275 -26.501 -26.74 -26.86 -27.11 -27.371 -27.643 -27.783 -28.016 -28.213 -28.356 -28.515 -28.871 -29.059 -29.234 -29.41 -29.602 -29.8 -30.045 -30.847 -10 ,7364 ,KEBNE ,17027705,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:21:35 CET,0.0 0.559 0.714 0.873 1.0 1.105 1.2 1.284 1.432 1.491 1.548 1.597 1.698 1.749 1.853 1.934 1.997 2.033 2.104 2.164 2.247 2.296 2.347 2.424 2.479 2.521 2.575 2.624 2.667 2.719 2.772 2.818 2.856 2.898 2.937 2.979 3.017 3.041 3.046 3.023 2.986 2.946 2.873 2.763 2.56 2.247 1.83 1.233 0.344 -1.022 -3.413 -6.298 -8.586 -10.53 -12.143 -13.53 -14.764 -15.866 -16.764 -17.631 -18.362 -19.011 -19.636 -20.208 -20.737 -21.213 -21.705 -22.149 -22.531 -22.923 -23.317 -23.634 -23.953 -24.291 -24.56 -24.819 -25.079 -25.347 -25.617 -25.801 -25.988 -26.282 -26.484 -26.7 -26.809 -27.027 -27.264 -27.507 -27.627 -27.845 -28.014 -28.153 -28.306 -28.627 -28.785 -28.949 -29.125 -29.329 -29.583 -29.882 -31.069 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_28_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_28_26.txt deleted file mode 100644 index ea9581f9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_28_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4015 ,TETRA ,17606490,Sun Nov 28 20:37:06 CET,Sun Nov 28 22:33:56 CET,0.0 0.32 0.473 0.591 0.683 0.756 0.812 0.864 0.954 0.996 1.046 1.074 1.174 1.201 1.246 1.302 1.351 1.372 1.421 1.469 1.535 1.571 1.6 1.641 1.678 1.703 1.723 1.747 1.769 1.78 1.799 1.825 1.834 1.831 1.833 1.835 1.808 1.747 1.675 1.582 1.451 1.275 1.024 0.718 0.301 -0.251 -0.986 -1.959 -3.358 -5.516 -9.155 -13.512 -16.996 -19.812 -22.126 -24.131 -25.802 -27.237 -28.441 -29.613 -30.595 -31.449 -32.242 -32.96 -33.619 -34.22 -34.82 -35.338 -35.781 -36.231 -36.7 -37.093 -37.486 -37.886 -38.19 -38.494 -38.8 -39.121 -39.449 -39.664 -39.889 -40.247 -40.484 -40.718 -40.832 -41.056 -41.294 -41.553 -41.682 -41.925 -42.093 -42.235 -42.377 -42.677 -42.844 -43.006 -43.183 -43.379 -43.577 -43.81 -44.399 -2 ,15067 ,TETRA ,17606491,Sun Nov 28 20:37:06 CET,Sun Nov 28 22:30:06 CET,0.0 0.311 0.45 0.566 0.662 0.742 0.812 0.88 1.006 1.057 1.105 1.117 1.214 1.252 1.322 1.375 1.431 1.459 1.514 1.555 1.597 1.632 1.682 1.756 1.819 1.868 1.913 1.952 1.988 2.024 2.047 2.054 2.06 2.057 2.022 1.976 1.931 1.861 1.768 1.656 1.527 1.349 1.084 0.776 0.375 -0.156 -0.903 -1.935 -3.434 -5.699 -9.28 -13.56 -17.061 -19.871 -22.158 -24.114 -25.759 -27.217 -28.455 -29.639 -30.626 -31.484 -32.292 -33.049 -33.732 -34.335 -34.933 -35.454 -35.911 -36.377 -36.84 -37.211 -37.591 -37.99 -38.293 -38.597 -38.916 -39.25 -39.58 -39.803 -40.028 -40.371 -40.607 -40.845 -40.969 -41.225 -41.495 -41.776 -41.914 -42.152 -42.305 -42.443 -42.578 -42.845 -42.997 -43.158 -43.327 -43.52 -43.717 -43.969 -44.458 -3 ,5400 ,TETRA ,17606492,Sun Nov 28 20:37:07 CET,Sun Nov 28 22:30:04 CET,0.0 0.467 0.593 0.692 0.774 0.851 0.919 0.978 1.083 1.134 1.18 1.205 1.315 1.36 1.434 1.5 1.566 1.593 1.632 1.668 1.72 1.761 1.806 1.868 1.923 1.972 2.022 2.061 2.098 2.133 2.165 2.201 2.224 2.245 2.256 2.245 2.212 2.153 2.072 1.97 1.83 1.636 1.377 1.069 0.694 0.192 -0.566 -1.619 -3.104 -5.376 -9.292 -13.821 -17.283 -20.102 -22.376 -24.275 -25.908 -27.344 -28.539 -29.694 -30.659 -31.499 -32.26 -32.962 -33.611 -34.188 -34.768 -35.277 -35.708 -36.141 -36.585 -36.943 -37.292 -37.655 -37.93 -38.203 -38.491 -38.789 -39.087 -39.282 -39.483 -39.804 -40.02 -40.244 -40.363 -40.606 -40.844 -41.082 -41.203 -41.436 -41.586 -41.715 -41.848 -42.13 -42.288 -42.451 -42.618 -42.791 -42.999 -43.239 -43.694 -4 ,15959 ,TETRA ,17606493,Sun Nov 28 20:37:06 CET,Sun Nov 28 22:29:19 CET,0.0 0.415 0.576 0.699 0.797 0.879 0.954 1.017 1.14 1.193 1.241 1.264 1.366 1.4 1.46 1.526 1.585 1.609 1.65 1.692 1.756 1.805 1.851 1.9 1.952 2.001 2.044 2.082 2.137 2.184 2.229 2.284 2.316 2.335 2.356 2.36 2.34 2.331 2.301 2.231 2.143 2.014 1.826 1.582 1.227 0.735 0.023 -0.956 -2.439 -4.731 -8.447 -12.727 -16.124 -18.893 -21.155 -23.115 -24.773 -26.225 -27.445 -28.621 -29.604 -30.452 -31.236 -31.961 -32.605 -33.169 -33.757 -34.277 -34.73 -35.201 -35.67 -36.042 -36.42 -36.817 -37.115 -37.419 -37.724 -38.015 -38.315 -38.521 -38.723 -39.023 -39.237 -39.46 -39.572 -39.802 -40.034 -40.273 -40.39 -40.616 -40.759 -40.886 -41.013 -41.285 -41.431 -41.588 -41.75 -41.918 -42.119 -42.366 -42.692 -5 ,20202 ,TETRA ,17606494,Sun Nov 28 20:37:06 CET,Sun Nov 28 22:29:36 CET,0.0 0.287 0.409 0.505 0.601 0.693 0.778 0.86 0.983 1.033 1.075 1.085 1.18 1.211 1.268 1.326 1.38 1.403 1.451 1.491 1.545 1.589 1.625 1.673 1.721 1.757 1.791 1.824 1.867 1.914 1.944 1.959 1.972 1.989 2.007 2.02 2.013 1.974 1.921 1.849 1.729 1.56 1.347 1.064 0.637 0.068 -0.697 -1.671 -3.089 -5.341 -9.13 -13.415 -16.733 -19.482 -21.762 -23.724 -25.39 -26.814 -27.994 -29.173 -30.143 -30.971 -31.74 -32.455 -33.118 -33.71 -34.311 -34.839 -35.292 -35.753 -36.22 -36.59 -36.961 -37.345 -37.639 -37.95 -38.279 -38.601 -38.921 -39.13 -39.334 -39.65 -39.868 -40.091 -40.203 -40.433 -40.684 -40.944 -41.069 -41.308 -41.467 -41.605 -41.758 -42.062 -42.211 -42.378 -42.554 -42.753 -42.974 -43.257 -43.792 -6 ,30489 ,TETRA ,17606495,Sun Nov 28 20:37:07 CET,Sun Nov 28 22:29:42 CET,0.0 0.363 0.513 0.628 0.732 0.818 0.891 0.951 1.094 1.155 1.205 1.242 1.353 1.404 1.5 1.573 1.627 1.653 1.698 1.742 1.802 1.846 1.895 1.948 1.991 2.032 2.06 2.087 2.123 2.152 2.174 2.193 2.202 2.198 2.185 2.16 2.135 2.093 2.026 1.945 1.833 1.682 1.475 1.215 0.823 0.269 -0.478 -1.511 -2.988 -5.193 -8.843 -13.087 -16.539 -19.329 -21.606 -23.588 -25.242 -26.684 -27.892 -29.061 -30.046 -30.887 -31.67 -32.416 -33.087 -33.691 -34.311 -34.86 -35.335 -35.814 -36.293 -36.681 -37.078 -37.49 -37.792 -38.093 -38.415 -38.738 -39.063 -39.286 -39.505 -39.828 -40.042 -40.263 -40.377 -40.617 -40.864 -41.121 -41.253 -41.494 -41.648 -41.784 -41.922 -42.21 -42.352 -42.492 -42.658 -42.866 -43.075 -43.31 -43.686 -7 ,20379 ,TETRA ,17606496,Sun Nov 28 20:37:10 CET,Sun Nov 28 22:29:43 CET,0.0 0.473 0.641 0.748 0.832 0.919 0.995 1.068 1.209 1.262 1.312 1.35 1.458 1.498 1.583 1.663 1.735 1.771 1.839 1.905 2.0 2.063 2.124 2.194 2.243 2.294 2.339 2.379 2.431 2.474 2.509 2.533 2.547 2.565 2.571 2.56 2.535 2.483 2.405 2.294 2.168 1.988 1.74 1.444 1.026 0.471 -0.337 -1.412 -2.991 -5.364 -9.079 -13.296 -16.586 -19.324 -21.55 -23.457 -25.12 -26.582 -27.791 -28.949 -29.932 -30.796 -31.581 -32.294 -32.951 -33.548 -34.154 -34.68 -35.127 -35.565 -36.01 -36.384 -36.762 -37.152 -37.453 -37.767 -38.085 -38.408 -38.749 -38.972 -39.197 -39.55 -39.797 -40.048 -40.17 -40.427 -40.708 -41.005 -41.155 -41.403 -41.584 -41.737 -41.897 -42.223 -42.396 -42.602 -42.837 -43.08 -43.349 -43.701 -44.404 -8 ,13960 ,TETRA ,17606497,Sun Nov 28 20:37:07 CET,Sun Nov 28 22:29:42 CET,0.0 0.618 0.905 1.124 1.28 1.387 1.486 1.58 1.745 1.812 1.874 1.927 2.041 2.093 2.197 2.286 2.363 2.402 2.48 2.537 2.614 2.666 2.704 2.764 2.821 2.866 2.907 2.948 2.98 2.999 3.018 3.031 3.038 3.045 3.049 3.034 2.997 2.948 2.872 2.756 2.601 2.411 2.157 1.838 1.406 0.859 0.082 -0.998 -2.545 -4.873 -8.59 -12.859 -16.283 -19.072 -21.335 -23.275 -24.926 -26.373 -27.579 -28.723 -29.662 -30.486 -31.268 -31.998 -32.655 -33.238 -33.85 -34.382 -34.812 -35.247 -35.7 -36.07 -36.446 -36.826 -37.119 -37.424 -37.719 -38.004 -38.314 -38.534 -38.745 -39.067 -39.289 -39.523 -39.645 -39.88 -40.126 -40.378 -40.507 -40.75 -40.915 -41.047 -41.184 -41.472 -41.633 -41.802 -41.97 -42.142 -42.351 -42.599 -42.969 -9 ,22508 ,TETRA ,17606498,Sun Nov 28 20:37:09 CET,Sun Nov 28 22:29:38 CET,0.0 0.582 0.83 0.998 1.148 1.268 1.362 1.449 1.599 1.674 1.746 1.815 1.933 1.987 2.087 2.188 2.275 2.315 2.394 2.454 2.526 2.572 2.61 2.665 2.716 2.759 2.804 2.843 2.874 2.901 2.929 2.949 2.964 2.975 2.965 2.936 2.896 2.831 2.764 2.684 2.576 2.445 2.243 1.971 1.607 1.087 0.348 -0.609 -2.091 -4.422 -8.156 -12.549 -16.043 -18.839 -21.117 -23.07 -24.702 -26.13 -27.338 -28.505 -29.481 -30.334 -31.137 -31.857 -32.503 -33.088 -33.67 -34.179 -34.618 -35.058 -35.504 -35.852 -36.2 -36.558 -36.841 -37.143 -37.436 -37.729 -38.029 -38.231 -38.443 -38.768 -38.991 -39.217 -39.332 -39.571 -39.806 -40.047 -40.173 -40.405 -40.542 -40.675 -40.803 -41.087 -41.242 -41.4 -41.564 -41.728 -41.914 -42.177 -42.815 -10 ,30134 ,TETRA ,17606499,Sun Nov 28 20:38:06 CET,Sun Nov 28 22:31:57 CET,0.0 0.42 0.578 0.697 0.766 0.824 0.892 0.953 1.047 1.098 1.149 1.185 1.29 1.323 1.382 1.435 1.479 1.502 1.552 1.594 1.659 1.712 1.774 1.868 1.935 1.985 2.031 2.068 2.11 2.151 2.192 2.235 2.256 2.264 2.264 2.24 2.213 2.184 2.149 2.08 1.959 1.776 1.523 1.226 0.801 0.2 -0.601 -1.643 -3.154 -5.436 -9.232 -13.653 -17.057 -19.811 -22.077 -24.02 -25.659 -27.076 -28.261 -29.422 -30.358 -31.16 -31.932 -32.632 -33.249 -33.808 -34.377 -34.866 -35.289 -35.717 -36.157 -36.51 -36.866 -37.236 -37.515 -37.807 -38.102 -38.39 -38.69 -38.897 -39.1 -39.413 -39.626 -39.837 -39.948 -40.167 -40.392 -40.633 -40.757 -40.988 -41.126 -41.26 -41.397 -41.688 -41.847 -42.001 -42.158 -42.329 -42.525 -42.757 -43.202 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_29_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_29_25.txt deleted file mode 100644 index 8ea47813..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_29_25.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1797 ,TETRA ,17606500,Sun Nov 28 20:38:06 CET,Sun Nov 28 22:30:45 CET,0.0 0.955 1.238 1.476 1.691 1.861 2.022 2.185 2.495 2.628 2.735 2.706 3.018 3.104 3.279 3.455 3.609 3.685 3.84 3.972 4.138 4.248 4.358 4.517 4.67 4.823 4.968 5.11 5.314 5.493 5.66 5.866 6.061 6.23 6.389 6.572 6.763 6.97 7.163 7.36 7.578 7.79 7.983 8.13 8.287 8.464 8.628 8.662 8.441 7.878 6.735 5.11 3.489 1.996 0.752 -0.352 -1.316 -2.16 -2.881 -3.606 -4.227 -4.779 -5.326 -5.863 -6.352 -6.807 -7.285 -7.683 -8.036 -8.388 -8.739 -9.064 -9.415 -9.776 -10.052 -10.334 -10.612 -10.897 -11.219 -11.444 -11.665 -12.002 -12.252 -12.492 -12.601 -12.837 -13.084 -13.337 -13.476 -13.881 -14.018 -14.204 -14.397 -14.829 -15.057 -15.314 -15.57 -15.858 -16.278 -16.889 -19.141 -2 ,22884 ,TETRA ,17606501,Sun Nov 28 20:38:06 CET,Sun Nov 28 22:29:25 CET,0.0 1.748 2.18 2.514 2.774 3.01 3.216 3.39 3.699 3.844 3.982 3.987 4.316 4.422 4.609 4.772 4.932 5.022 5.212 5.393 5.646 5.81 5.964 6.186 6.387 6.553 6.729 6.902 7.113 7.315 7.529 7.783 8.005 8.221 8.447 8.687 8.932 9.195 9.444 9.691 9.943 10.207 10.498 10.759 11.011 11.204 11.19 11.048 10.75 10.054 8.624 6.782 5.176 3.736 2.461 1.267 0.205 -0.742 -1.512 -2.243 -2.874 -3.455 -4.035 -4.568 -5.055 -5.494 -5.933 -6.32 -6.669 -7.058 -7.428 -7.707 -8.007 -8.31 -8.542 -8.776 -9.019 -9.286 -9.584 -9.808 -10.042 -10.381 -10.614 -10.857 -10.97 -11.18 -11.417 -11.678 -11.819 -12.211 -12.299 -12.486 -12.667 -13.05 -13.266 -13.519 -13.809 -14.11 -14.515 -15.081 -17.281 -3 ,11177 ,TETRA ,17606502,Sun Nov 28 20:38:06 CET,Sun Nov 28 22:28:53 CET,0.0 0.941 1.279 1.51 1.73 1.912 2.073 2.24 2.544 2.674 2.781 2.746 3.067 3.167 3.377 3.56 3.731 3.815 3.957 4.085 4.251 4.359 4.479 4.655 4.814 4.964 5.107 5.269 5.517 5.738 5.904 6.085 6.249 6.418 6.628 6.833 7.033 7.243 7.456 7.686 7.929 8.176 8.38 8.563 8.76 8.925 9.067 9.057 8.829 8.262 6.88 4.95 3.296 1.837 0.565 -0.638 -1.67 -2.54 -3.275 -4.002 -4.633 -5.195 -5.759 -6.263 -6.692 -7.099 -7.519 -7.894 -8.232 -8.572 -8.903 -9.189 -9.514 -9.837 -10.068 -10.305 -10.561 -10.824 -11.087 -11.286 -11.511 -11.846 -12.055 -12.289 -12.42 -12.684 -12.949 -13.245 -13.412 -13.824 -13.91 -14.067 -14.236 -14.598 -14.777 -15.004 -15.326 -15.687 -16.077 -16.574 -19.412 -5 ,4144 ,TETRA ,17606504,Sun Nov 28 20:38:06 CET,Sun Nov 28 22:30:02 CET,0.0 1.41 1.803 2.066 2.305 2.515 2.679 2.859 3.189 3.313 3.428 3.456 3.816 3.933 4.122 4.312 4.499 4.591 4.779 4.951 5.202 5.367 5.526 5.762 5.973 6.15 6.317 6.474 6.67 6.874 7.073 7.3 7.524 7.72 7.925 8.163 8.375 8.604 8.865 9.147 9.427 9.677 9.934 10.175 10.397 10.595 10.724 10.744 10.58 9.993 8.633 6.774 5.07 3.561 2.247 1.022 -0.047 -0.963 -1.749 -2.54 -3.219 -3.839 -4.483 -5.09 -5.628 -6.119 -6.625 -7.05 -7.406 -7.774 -8.156 -8.475 -8.8 -9.12 -9.376 -9.657 -9.95 -10.245 -10.538 -10.746 -10.978 -11.341 -11.583 -11.842 -11.974 -12.233 -12.535 -12.868 -13.052 -13.507 -13.681 -13.872 -14.06 -14.477 -14.71 -14.93 -15.168 -15.507 -15.924 -16.546 -18.933 -6 ,17885 ,TETRA ,17606505,Sun Nov 28 20:38:06 CET,Sun Nov 28 22:28:50 CET,0.0 0.911 1.231 1.459 1.651 1.832 1.976 2.114 2.375 2.496 2.609 2.565 2.884 2.979 3.171 3.369 3.556 3.642 3.829 4.024 4.294 4.449 4.58 4.773 4.963 5.13 5.286 5.452 5.655 5.837 6.02 6.23 6.418 6.601 6.83 7.085 7.303 7.559 7.853 8.117 8.391 8.751 9.123 9.41 9.724 10.002 10.184 10.27 10.159 9.686 8.548 6.758 5.061 3.565 2.263 1.14 0.167 -0.694 -1.41 -2.141 -2.83 -3.419 -3.945 -4.45 -4.922 -5.345 -5.786 -6.182 -6.514 -6.882 -7.255 -7.541 -7.833 -8.136 -8.374 -8.646 -8.935 -9.213 -9.521 -9.735 -9.959 -10.344 -10.608 -10.867 -11.013 -11.312 -11.612 -11.983 -12.188 -12.638 -12.816 -13.028 -13.258 -13.789 -14.069 -14.355 -14.693 -15.08 -15.516 -16.184 -18.851 -7 ,14061 ,TETRA ,17606506,Sun Nov 28 20:38:07 CET,Sun Nov 28 22:29:32 CET,0.0 1.035 1.306 1.527 1.727 1.894 2.029 2.143 2.365 2.469 2.575 2.541 2.859 2.944 3.09 3.237 3.391 3.458 3.57 3.678 3.839 3.95 4.062 4.216 4.365 4.518 4.656 4.791 4.966 5.124 5.305 5.523 5.694 5.862 6.062 6.288 6.493 6.699 6.986 7.334 7.602 7.824 8.071 8.301 8.502 8.649 8.759 8.776 8.605 8.123 6.987 5.154 3.503 2.043 0.708 -0.515 -1.559 -2.463 -3.204 -3.94 -4.581 -5.133 -5.646 -6.123 -6.553 -6.941 -7.36 -7.747 -8.071 -8.409 -8.752 -9.031 -9.327 -9.635 -9.891 -10.148 -10.404 -10.68 -10.962 -11.142 -11.331 -11.64 -11.856 -12.108 -12.25 -12.538 -12.814 -13.094 -13.24 -13.625 -13.733 -13.935 -14.133 -14.546 -14.755 -14.974 -15.233 -15.581 -16.007 -16.585 -18.994 -8 ,32650 ,TETRA ,17606507,Sun Nov 28 20:38:05 CET,Sun Nov 28 22:29:26 CET,0.0 1.528 1.963 2.251 2.496 2.71 2.913 3.1 3.405 3.533 3.655 3.669 4.007 4.124 4.345 4.526 4.704 4.793 4.958 5.103 5.316 5.479 5.633 5.815 5.981 6.154 6.327 6.489 6.685 6.881 7.066 7.281 7.49 7.687 7.918 8.155 8.367 8.594 8.808 9.015 9.255 9.521 9.768 10.019 10.302 10.496 10.63 10.737 10.609 10.116 8.886 6.95 5.234 3.717 2.406 1.216 0.137 -0.852 -1.647 -2.356 -2.97 -3.513 -4.041 -4.544 -4.994 -5.414 -5.841 -6.218 -6.554 -6.895 -7.271 -7.588 -7.9 -8.226 -8.473 -8.706 -8.952 -9.222 -9.495 -9.687 -9.906 -10.259 -10.505 -10.773 -10.913 -11.206 -11.516 -11.827 -11.981 -12.396 -12.539 -12.728 -12.918 -13.354 -13.6 -13.859 -14.13 -14.475 -14.922 -15.439 -18.147 -9 ,7966 ,TETRA ,17606508,Sun Nov 28 20:38:06 CET,Sun Nov 28 22:30:36 CET,0.0 1.147 1.494 1.762 2.008 2.19 2.356 2.52 2.813 2.933 3.05 3.058 3.391 3.482 3.667 3.838 3.988 4.069 4.221 4.353 4.551 4.67 4.781 4.957 5.149 5.318 5.444 5.562 5.752 5.934 6.084 6.263 6.421 6.57 6.728 6.893 7.056 7.239 7.425 7.616 7.803 7.981 8.171 8.347 8.522 8.698 8.84 8.859 8.644 8.062 6.665 4.691 3.014 1.537 0.267 -0.907 -1.922 -2.85 -3.654 -4.404 -5.032 -5.573 -6.102 -6.624 -7.091 -7.497 -7.92 -8.301 -8.627 -8.953 -9.294 -9.607 -9.921 -10.207 -10.436 -10.678 -10.946 -11.219 -11.487 -11.664 -11.837 -12.158 -12.385 -12.592 -12.703 -12.937 -13.186 -13.506 -13.703 -14.145 -14.308 -14.528 -14.734 -15.173 -15.427 -15.716 -16.025 -16.39 -16.806 -17.248 -20.113 -10 ,15165 ,TETRA ,17606509,Sun Nov 28 20:38:09 CET,Sun Nov 28 22:30:37 CET,0.0 0.95 1.254 1.477 1.655 1.824 2.005 2.168 2.449 2.596 2.742 2.754 3.084 3.188 3.377 3.553 3.716 3.79 3.931 4.07 4.297 4.46 4.606 4.795 4.968 5.128 5.274 5.421 5.605 5.761 5.908 6.096 6.284 6.446 6.614 6.803 7.004 7.218 7.441 7.657 7.849 8.067 8.3 8.502 8.668 8.755 8.814 8.78 8.492 7.887 6.658 4.863 3.27 1.849 0.601 -0.523 -1.488 -2.335 -3.069 -3.815 -4.437 -4.983 -5.529 -6.039 -6.485 -6.874 -7.266 -7.613 -7.923 -8.246 -8.599 -8.911 -9.238 -9.598 -9.87 -10.14 -10.421 -10.694 -10.98 -11.178 -11.377 -11.711 -11.943 -12.198 -12.336 -12.598 -12.853 -13.14 -13.309 -13.743 -13.87 -14.039 -14.222 -14.698 -14.956 -15.239 -15.604 -16.056 -16.563 -17.215 -19.673 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_29_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_29_33.txt deleted file mode 100644 index 7e412881..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_29_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17037 ,TETRA ,17606510,Sun Nov 28 20:38:06 CET,Sun Nov 28 22:30:54 CET,0.0 0.628 1.04 1.379 1.643 1.89 2.128 2.371 2.829 3.035 3.236 3.408 3.822 4.01 4.412 4.81 5.191 5.376 5.737 6.094 6.619 6.954 7.285 7.793 8.286 8.761 9.231 9.685 10.284 10.88 11.459 12.186 12.925 13.642 14.476 15.443 16.405 17.503 18.722 20.044 21.479 23.147 25.188 27.367 30.005 33.068 36.77 41.152 46.614 53.64 63.247 72.457 78.54 82.952 86.303 88.974 91.097 92.825 94.187 95.431 96.409 97.228 97.976 98.605 99.135 99.589 100.025 100.398 100.702 100.997 101.294 101.545 101.793 102.019 102.179 102.338 102.471 102.581 102.69 102.763 102.837 102.936 102.986 103.026 103.046 103.091 103.128 103.153 103.16 103.042 103.132 103.117 103.102 103.008 102.94 102.882 102.808 102.676 102.48 102.242 101.096 -2 ,31309 ,TETRA ,17606511,Sun Nov 28 20:38:08 CET,Sun Nov 28 22:29:31 CET,0.0 0.883 1.21 1.502 1.766 2.023 2.269 2.491 2.906 3.108 3.313 3.482 3.894 4.087 4.464 4.819 5.183 5.365 5.725 6.087 6.607 6.941 7.276 7.78 8.283 8.773 9.252 9.739 10.371 10.994 11.617 12.388 13.14 13.872 14.743 15.745 16.736 17.855 19.094 20.46 21.947 23.679 25.782 27.98 30.663 33.781 37.585 42.154 47.855 55.175 64.932 74.2 80.498 84.981 88.39 91.151 93.278 95.03 96.425 97.671 98.643 99.462 100.191 100.829 101.397 101.887 102.362 102.747 103.064 103.375 103.665 103.905 104.131 104.336 104.483 104.602 104.71 104.828 104.962 105.047 105.123 105.233 105.296 105.35 105.377 105.42 105.448 105.456 105.455 105.339 105.438 105.429 105.424 105.381 105.339 105.295 105.223 105.113 104.979 104.749 103.524 -3 ,2280 ,TETRA ,17606512,Sun Nov 28 20:38:07 CET,Sun Nov 28 22:29:52 CET,0.0 0.865 1.213 1.506 1.791 2.056 2.313 2.54 2.954 3.167 3.38 3.563 3.979 4.17 4.541 4.911 5.295 5.485 5.846 6.194 6.703 7.021 7.336 7.829 8.329 8.816 9.274 9.723 10.327 10.921 11.517 12.269 13.035 13.798 14.683 15.711 16.731 17.874 19.135 20.501 21.975 23.711 25.824 28.025 30.694 33.78 37.52 42.008 47.628 54.832 64.674 74.053 80.338 84.903 88.298 90.97 93.046 94.72 96.076 97.355 98.346 99.168 99.921 100.588 101.144 101.608 102.066 102.446 102.767 103.077 103.354 103.576 103.789 103.97 104.078 104.191 104.333 104.473 104.591 104.67 104.747 104.832 104.876 104.928 104.963 105.022 105.064 105.089 105.095 104.981 105.075 105.06 105.025 104.913 104.822 104.701 104.573 104.427 104.222 103.929 102.569 -4 ,13719 ,TETRA ,17606513,Sun Nov 28 20:38:08 CET,Sun Nov 28 22:29:46 CET,0.0 1.085 1.471 1.774 2.053 2.311 2.532 2.757 3.174 3.381 3.591 3.778 4.222 4.442 4.838 5.204 5.567 5.756 6.14 6.509 7.046 7.402 7.755 8.292 8.797 9.281 9.771 10.245 10.875 11.5 12.1 12.848 13.597 14.336 15.221 16.239 17.246 18.375 19.607 20.96 22.438 24.146 26.206 28.377 31.031 34.162 37.943 42.42 48.067 55.312 65.078 74.44 80.711 85.246 88.699 91.407 93.522 95.251 96.621 97.877 98.846 99.633 100.361 101.008 101.547 102.013 102.465 102.826 103.129 103.428 103.709 103.918 104.121 104.332 104.482 104.63 104.785 104.922 105.052 105.136 105.206 105.281 105.324 105.38 105.412 105.469 105.507 105.518 105.52 105.407 105.507 105.505 105.5 105.465 105.426 105.356 105.274 105.159 104.971 104.743 103.784 -5 ,25486 ,TETRA ,17606514,Sun Nov 28 20:38:09 CET,Sun Nov 28 22:27:20 CET,0.0 0.724 1.119 1.467 1.748 2.002 2.258 2.516 2.987 3.198 3.413 3.623 4.052 4.248 4.624 4.992 5.363 5.55 5.916 6.278 6.793 7.123 7.461 7.954 8.442 8.921 9.39 9.848 10.447 11.058 11.671 12.417 13.157 13.885 14.741 15.742 16.726 17.841 19.096 20.468 21.938 23.637 25.718 27.926 30.598 33.711 37.489 42.051 47.699 54.813 64.658 73.865 80.03 84.535 87.892 90.551 92.638 94.35 95.709 96.937 97.875 98.656 99.365 99.988 100.542 101.023 101.491 101.892 102.215 102.516 102.81 103.038 103.234 103.417 103.556 103.699 103.848 103.983 104.089 104.136 104.186 104.276 104.336 104.383 104.397 104.431 104.458 104.414 104.377 104.236 104.301 104.289 104.28 104.222 104.177 104.127 104.064 103.963 103.742 103.403 102.416 -6 ,23905 ,TETRA ,17606515,Sun Nov 28 20:38:08 CET,Sun Nov 28 22:29:33 CET,0.0 0.913 1.306 1.616 1.871 2.103 2.324 2.54 2.982 3.199 3.408 3.607 4.037 4.235 4.623 4.994 5.362 5.537 5.885 6.236 6.726 7.054 7.388 7.883 8.384 8.858 9.326 9.795 10.42 11.046 11.659 12.405 13.148 13.885 14.747 15.738 16.705 17.798 19.038 20.412 21.917 23.66 25.763 28.011 30.71 33.813 37.543 41.997 47.625 54.934 64.974 74.478 80.818 85.392 88.783 91.464 93.56 95.265 96.636 97.892 98.887 99.716 100.466 101.125 101.683 102.158 102.62 103.022 103.348 103.657 103.962 104.206 104.428 104.614 104.743 104.87 104.993 105.123 105.243 105.319 105.394 105.507 105.582 105.651 105.678 105.718 105.759 105.794 105.8 105.678 105.777 105.766 105.75 105.641 105.56 105.497 105.406 105.28 105.134 104.811 103.686 -7 ,7242 ,TETRA ,17606516,Sun Nov 28 20:38:08 CET,Sun Nov 28 22:31:41 CET,0.0 1.004 1.472 1.822 2.136 2.45 2.725 2.982 3.423 3.624 3.825 3.99 4.404 4.591 4.955 5.298 5.64 5.813 6.17 6.515 7.014 7.342 7.663 8.143 8.61 9.075 9.543 10.006 10.628 11.233 11.808 12.516 13.222 13.927 14.77 15.723 16.682 17.793 19.027 20.389 21.901 23.666 25.767 27.943 30.563 33.671 37.503 42.082 47.8 55.09 64.889 74.089 80.28 84.74 88.079 90.772 92.902 94.632 95.993 97.243 98.231 99.047 99.771 100.412 100.97 101.456 101.92 102.296 102.602 102.884 103.155 103.371 103.582 103.798 103.959 104.108 104.243 104.376 104.499 104.559 104.623 104.747 104.812 104.862 104.886 104.926 104.959 104.976 104.981 104.879 104.977 104.95 104.927 104.876 104.833 104.764 104.687 104.6 104.439 104.173 103.285 -8 ,5830 ,TETRA ,17606517,Sun Nov 28 20:38:10 CET,Sun Nov 28 22:32:56 CET,0.0 1.242 1.633 1.962 2.248 2.507 2.761 2.996 3.431 3.654 3.879 4.059 4.484 4.687 5.063 5.419 5.767 5.939 6.272 6.62 7.141 7.479 7.824 8.326 8.803 9.27 9.755 10.256 10.891 11.507 12.126 12.873 13.608 14.346 15.213 16.212 17.205 18.33 19.573 20.943 22.419 24.106 26.143 28.248 30.831 33.923 37.703 42.234 47.908 55.03 64.691 73.977 80.166 84.662 88.08 90.836 92.976 94.697 96.046 97.264 98.205 98.994 99.709 100.323 100.858 101.32 101.758 102.109 102.408 102.716 103.018 103.254 103.458 103.637 103.77 103.891 104.014 104.139 104.243 104.297 104.357 104.444 104.484 104.519 104.537 104.571 104.603 104.632 104.646 104.536 104.612 104.577 104.542 104.453 104.404 104.35 104.261 104.147 104.01 103.789 102.448 -9 ,28657 ,TETRA ,17606518,Sun Nov 28 20:38:08 CET,Sun Nov 28 22:31:47 CET,0.0 0.895 1.221 1.532 1.856 2.146 2.409 2.669 3.118 3.311 3.51 3.686 4.115 4.31 4.661 5.021 5.379 5.554 5.915 6.283 6.805 7.139 7.478 7.976 8.463 8.945 9.422 9.879 10.492 11.111 11.706 12.444 13.202 13.949 14.814 15.807 16.787 17.902 19.128 20.492 22.018 23.797 25.892 28.048 30.663 33.722 37.481 42.002 47.746 55.041 64.812 74.177 80.344 84.803 88.224 90.928 93.05 94.772 96.131 97.349 98.285 99.063 99.761 100.369 100.893 101.36 101.815 102.182 102.486 102.774 103.04 103.243 103.445 103.636 103.77 103.903 104.028 104.147 104.266 104.333 104.391 104.483 104.525 104.571 104.599 104.637 104.665 104.679 104.683 104.566 104.67 104.667 104.659 104.611 104.56 104.493 104.405 104.269 104.099 103.859 102.961 -10 ,18885 ,TETRA ,17606519,Sun Nov 28 20:38:09 CET,Sun Nov 28 22:29:31 CET,0.0 1.04 1.404 1.727 2.01 2.266 2.506 2.742 3.177 3.387 3.597 3.757 4.17 4.361 4.739 5.121 5.489 5.663 6.015 6.357 6.855 7.208 7.557 8.048 8.529 9.001 9.463 9.92 10.528 11.125 11.713 12.452 13.176 13.894 14.755 15.748 16.727 17.829 19.055 20.384 21.829 23.529 25.596 27.748 30.32 33.339 37.043 41.461 46.985 54.135 63.882 73.1 79.3 83.789 87.193 89.898 92.004 93.728 95.081 96.299 97.245 98.019 98.707 99.326 99.876 100.337 100.775 101.135 101.421 101.681 101.939 102.149 102.346 102.545 102.693 102.839 102.984 103.104 103.214 103.283 103.356 103.463 103.511 103.554 103.575 103.608 103.641 103.662 103.662 103.548 103.646 103.631 103.614 103.525 103.453 103.385 103.305 103.157 102.97 102.707 101.688 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_30_13.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_30_13.txt deleted file mode 100644 index 28f1021b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_30_13.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14079 ,TETRA ,17606521,Sun Nov 28 20:38:09 CET,Sun Nov 28 22:32:56 CET,0.0 1.407 1.837 2.174 2.463 2.733 2.964 3.145 3.472 3.61 3.743 3.89 4.106 4.216 4.434 4.616 4.791 4.883 5.043 5.199 5.407 5.523 5.636 5.805 5.978 6.141 6.278 6.42 6.624 6.813 6.984 7.183 7.357 7.541 7.755 7.948 8.129 8.318 8.503 8.684 8.835 8.969 9.129 9.289 9.42 9.471 9.463 9.362 9.053 8.369 6.932 4.913 3.053 1.469 0.116 -1.071 -2.091 -3.005 -3.784 -4.554 -5.22 -5.831 -6.429 -7.011 -7.525 -7.982 -8.451 -8.877 -9.256 -9.632 -10.024 -10.358 -10.698 -11.031 -11.302 -11.601 -11.905 -12.205 -12.524 -12.75 -12.984 -13.356 -13.616 -13.889 -14.032 -14.327 -14.628 -14.922 -15.086 -15.41 -15.682 -15.894 -16.118 -16.596 -16.884 -17.187 -17.52 -17.956 -18.497 -19.27 -23.495 -2 ,32619 ,TETRA ,17606522,Sun Nov 28 20:38:08 CET,Sun Nov 28 22:29:35 CET,0.0 1.742 2.211 2.552 2.794 3.029 3.249 3.437 3.755 3.896 4.031 4.186 4.406 4.507 4.715 4.907 5.084 5.167 5.313 5.45 5.658 5.795 5.915 6.09 6.262 6.414 6.549 6.685 6.879 7.064 7.208 7.37 7.532 7.677 7.835 8.004 8.163 8.358 8.572 8.761 8.91 9.053 9.199 9.338 9.461 9.458 9.34 9.151 8.788 8.089 6.712 4.876 3.188 1.719 0.477 -0.635 -1.562 -2.391 -3.12 -3.887 -4.596 -5.207 -5.74 -6.229 -6.708 -7.175 -7.673 -8.081 -8.42 -8.793 -9.209 -9.577 -9.958 -10.328 -10.613 -10.924 -11.226 -11.518 -11.839 -12.06 -12.289 -12.677 -12.935 -13.189 -13.327 -13.627 -13.944 -14.285 -14.474 -14.803 -15.074 -15.291 -15.533 -16.041 -16.335 -16.661 -17.009 -17.437 -18.002 -18.7 -25.453 -3 ,10152 ,TETRA ,17606523,Sun Nov 28 20:38:09 CET,Sun Nov 28 22:30:08 CET,0.0 1.827 2.315 2.662 2.915 3.134 3.343 3.529 3.842 3.975 4.106 4.251 4.481 4.603 4.809 4.997 5.191 5.283 5.447 5.603 5.81 5.931 6.059 6.261 6.45 6.627 6.79 6.928 7.092 7.252 7.39 7.54 7.7 7.854 8.023 8.236 8.46 8.671 8.847 9.023 9.183 9.339 9.507 9.655 9.77 9.815 9.809 9.663 9.316 8.65 7.134 4.982 3.176 1.671 0.35 -0.853 -1.875 -2.763 -3.531 -4.306 -5.045 -5.721 -6.316 -6.847 -7.326 -7.767 -8.212 -8.621 -8.966 -9.307 -9.702 -10.05 -10.411 -10.775 -11.049 -11.341 -11.667 -11.985 -12.296 -12.526 -12.779 -13.151 -13.403 -13.68 -13.828 -14.138 -14.466 -14.847 -15.036 -15.349 -15.657 -15.874 -16.105 -16.623 -16.881 -17.169 -17.51 -17.912 -18.43 -19.115 -22.949 -4 ,28174 ,TETRA ,17606524,Sun Nov 28 20:38:11 CET,Sun Nov 28 22:30:30 CET,0.0 1.403 1.822 2.152 2.417 2.651 2.859 3.037 3.367 3.525 3.662 3.808 4.035 4.15 4.346 4.544 4.736 4.829 5.005 5.166 5.381 5.525 5.68 5.912 6.135 6.304 6.453 6.613 6.786 6.922 7.054 7.233 7.4 7.557 7.745 7.934 8.116 8.333 8.536 8.715 8.87 9.002 9.152 9.275 9.381 9.445 9.464 9.406 9.105 8.37 6.866 4.841 3.094 1.649 0.416 -0.694 -1.671 -2.546 -3.327 -4.117 -4.773 -5.332 -5.869 -6.371 -6.815 -7.258 -7.782 -8.261 -8.647 -9.014 -9.404 -9.74 -10.086 -10.451 -10.739 -11.033 -11.334 -11.635 -11.942 -12.16 -12.389 -12.794 -13.092 -13.382 -13.536 -13.849 -14.16 -14.493 -14.675 -14.983 -15.246 -15.442 -15.658 -16.161 -16.447 -16.763 -17.137 -17.62 -18.139 -18.814 -21.805 -5 ,890 ,TETRA ,17606525,Sun Nov 28 20:39:02 CET,Sun Nov 28 22:31:13 CET,0.0 1.651 2.103 2.454 2.711 2.919 3.108 3.292 3.614 3.752 3.885 4.017 4.238 4.359 4.582 4.767 4.946 5.039 5.205 5.35 5.564 5.706 5.837 6.015 6.192 6.374 6.536 6.68 6.853 7.016 7.174 7.341 7.505 7.691 7.917 8.122 8.285 8.436 8.618 8.82 8.959 9.123 9.326 9.465 9.592 9.677 9.682 9.576 9.219 8.531 7.13 5.107 3.389 1.964 0.705 -0.474 -1.499 -2.385 -3.133 -3.872 -4.506 -5.07 -5.616 -6.138 -6.65 -7.119 -7.561 -7.94 -8.302 -8.712 -9.133 -9.481 -9.837 -10.182 -10.447 -10.733 -11.052 -11.377 -11.677 -11.88 -12.107 -12.458 -12.701 -12.963 -13.104 -13.396 -13.709 -14.047 -14.228 -14.538 -14.825 -15.049 -15.287 -15.792 -16.065 -16.361 -16.698 -17.075 -17.509 -18.26 -21.743 -6 ,25518 ,TETRA ,17606526,Sun Nov 28 20:39:03 CET,Sun Nov 28 22:33:05 CET,0.0 1.269 1.727 2.057 2.319 2.535 2.74 2.933 3.247 3.387 3.517 3.655 3.867 3.97 4.175 4.367 4.548 4.631 4.785 4.936 5.143 5.271 5.402 5.599 5.773 5.941 6.12 6.272 6.444 6.617 6.779 6.97 7.162 7.347 7.563 7.808 7.998 8.161 8.336 8.52 8.679 8.826 8.997 9.141 9.263 9.358 9.377 9.232 8.89 8.272 6.871 4.883 3.217 1.775 0.516 -0.605 -1.579 -2.461 -3.23 -4.003 -4.637 -5.168 -5.685 -6.199 -6.681 -7.112 -7.546 -7.949 -8.321 -8.713 -9.126 -9.464 -9.796 -10.138 -10.42 -10.732 -11.046 -11.364 -11.689 -11.908 -12.135 -12.503 -12.754 -13.004 -13.142 -13.448 -13.772 -14.104 -14.274 -14.571 -14.825 -15.024 -15.238 -15.722 -15.978 -16.254 -16.575 -16.99 -17.598 -18.369 -23.899 -7 ,14765 ,TETRA ,17606527,Sun Nov 28 20:39:02 CET,Sun Nov 28 22:33:12 CET,0.0 1.83 2.396 2.726 3.014 3.263 3.466 3.63 3.93 4.071 4.19 4.293 4.509 4.626 4.843 5.058 5.266 5.367 5.554 5.725 5.965 6.105 6.231 6.411 6.593 6.775 6.94 7.097 7.31 7.482 7.616 7.81 8.019 8.208 8.409 8.623 8.829 9.022 9.201 9.37 9.527 9.678 9.785 9.882 9.982 10.005 9.964 9.855 9.576 8.906 7.414 5.307 3.514 1.969 0.64 -0.538 -1.57 -2.517 -3.33 -4.085 -4.708 -5.28 -5.819 -6.318 -6.794 -7.254 -7.737 -8.156 -8.515 -8.886 -9.288 -9.607 -9.923 -10.261 -10.531 -10.828 -11.135 -11.437 -11.756 -11.983 -12.21 -12.582 -12.845 -13.103 -13.24 -13.513 -13.793 -14.102 -14.263 -14.561 -14.802 -15.002 -15.215 -15.66 -15.931 -16.247 -16.623 -17.06 -17.544 -18.286 -22.261 -8 ,27332 ,TETRA ,17606528,Sun Nov 28 20:39:03 CET,Sun Nov 28 22:27:51 CET,0.0 1.671 2.126 2.426 2.67 2.892 3.126 3.338 3.676 3.834 3.986 4.145 4.364 4.47 4.674 4.86 5.041 5.128 5.272 5.412 5.63 5.767 5.898 6.066 6.229 6.389 6.53 6.655 6.814 6.976 7.129 7.305 7.492 7.683 7.899 8.119 8.324 8.565 8.781 8.962 9.141 9.304 9.511 9.681 9.751 9.781 9.787 9.738 9.542 8.957 7.603 5.755 4.067 2.531 1.205 0.038 -0.985 -1.876 -2.644 -3.432 -4.123 -4.757 -5.345 -5.868 -6.359 -6.822 -7.3 -7.722 -8.096 -8.475 -8.856 -9.179 -9.506 -9.853 -10.131 -10.431 -10.745 -11.054 -11.379 -11.61 -11.834 -12.175 -12.429 -12.698 -12.833 -13.104 -13.389 -13.699 -13.866 -14.166 -14.405 -14.621 -14.843 -15.297 -15.568 -15.909 -16.292 -16.694 -17.179 -17.965 -22.407 -9 ,3531 ,TETRA ,17606529,Sun Nov 28 20:39:03 CET,Sun Nov 28 22:31:19 CET,0.0 1.537 1.999 2.337 2.577 2.779 2.972 3.154 3.489 3.638 3.776 3.935 4.168 4.287 4.506 4.71 4.898 4.985 5.159 5.308 5.515 5.653 5.786 5.98 6.165 6.332 6.49 6.634 6.816 7.007 7.189 7.371 7.516 7.653 7.826 8.025 8.198 8.371 8.537 8.73 8.92 9.071 9.223 9.365 9.465 9.508 9.51 9.405 9.065 8.246 6.661 4.586 2.782 1.292 0.041 -1.099 -2.115 -3.006 -3.758 -4.569 -5.305 -5.924 -6.469 -7.0 -7.509 -7.97 -8.457 -8.875 -9.238 -9.637 -10.047 -10.377 -10.725 -11.075 -11.348 -11.641 -11.936 -12.231 -12.536 -12.748 -12.972 -13.329 -13.58 -13.862 -14.012 -14.3 -14.61 -14.925 -15.098 -15.412 -15.667 -15.873 -16.095 -16.579 -16.828 -17.121 -17.444 -17.814 -18.371 -19.211 -24.51 -10 ,4627 ,TETRA ,17606530,Sun Nov 28 20:39:03 CET,Sun Nov 28 22:31:33 CET,0.0 2.139 2.644 2.946 3.221 3.475 3.694 3.896 4.262 4.423 4.577 4.745 4.958 5.057 5.257 5.454 5.635 5.718 5.875 6.042 6.276 6.423 6.577 6.787 6.97 7.132 7.281 7.418 7.589 7.771 7.935 8.105 8.299 8.487 8.677 8.87 9.067 9.274 9.443 9.618 9.783 9.931 10.112 10.261 10.381 10.489 10.494 10.334 9.978 9.216 7.761 5.828 4.076 2.565 1.286 0.176 -0.854 -1.803 -2.586 -3.398 -4.1 -4.744 -5.34 -5.87 -6.348 -6.795 -7.275 -7.68 -8.031 -8.391 -8.766 -9.083 -9.416 -9.777 -10.056 -10.343 -10.646 -10.954 -11.27 -11.497 -11.721 -12.092 -12.371 -12.64 -12.778 -13.077 -13.385 -13.687 -13.852 -14.168 -14.446 -14.655 -14.88 -15.361 -15.636 -15.965 -16.33 -16.723 -17.159 -17.826 -21.901 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_30_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_30_35.txt deleted file mode 100644 index e442850c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_30_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17295 ,TETRA ,17606531,Sun Nov 28 20:39:04 CET,Sun Nov 28 22:31:44 CET,0.0 0.28 0.449 0.621 0.78 0.917 1.056 1.195 1.436 1.548 1.657 1.737 1.941 2.034 2.22 2.404 2.57 2.646 2.789 2.93 3.144 3.283 3.415 3.613 3.806 3.986 4.156 4.327 4.557 4.774 4.982 5.232 5.456 5.681 5.964 6.292 6.616 6.952 7.3 7.669 8.074 8.551 9.096 9.645 10.258 10.96 11.85 12.836 13.912 15.146 16.586 17.576 18.031 18.227 18.233 18.14 17.974 17.776 17.58 17.372 17.186 17.007 16.822 16.635 16.456 16.279 16.084 15.9 15.718 15.517 15.322 15.163 15.001 14.822 14.677 14.526 14.365 14.195 14.022 13.905 13.78 13.584 13.447 13.306 13.235 13.065 12.867 12.677 12.581 12.38 12.254 12.144 12.033 11.768 11.617 11.448 11.238 10.997 10.712 10.329 9.341 -2 ,5182 ,TETRA ,17606532,Sun Nov 28 20:39:04 CET,Sun Nov 28 22:32:16 CET,0.0 0.64 0.932 1.154 1.336 1.513 1.667 1.798 2.038 2.147 2.243 2.313 2.51 2.607 2.793 2.961 3.121 3.196 3.351 3.507 3.729 3.873 4.015 4.221 4.42 4.613 4.801 4.977 5.202 5.419 5.624 5.872 6.11 6.354 6.644 6.966 7.289 7.645 8.032 8.445 8.886 9.396 9.957 10.505 11.148 11.869 12.733 13.708 14.799 16.079 17.65 18.769 19.225 19.426 19.49 19.467 19.374 19.207 18.982 18.739 18.532 18.333 18.162 17.988 17.79 17.61 17.415 17.231 17.08 16.917 16.748 16.611 16.451 16.245 16.081 15.918 15.736 15.546 15.355 15.234 15.112 14.921 14.779 14.625 14.555 14.394 14.215 14.031 13.929 13.729 13.583 13.463 13.338 13.065 12.916 12.726 12.504 12.259 11.98 11.629 10.621 -3 ,9448 ,TETRA ,17606533,Sun Nov 28 20:39:04 CET,Sun Nov 28 22:31:37 CET,0.0 0.555 0.732 0.898 1.067 1.227 1.367 1.49 1.713 1.818 1.924 2.022 2.224 2.32 2.504 2.66 2.809 2.884 3.037 3.189 3.407 3.539 3.664 3.852 4.035 4.211 4.389 4.561 4.779 4.984 5.182 5.434 5.692 5.944 6.235 6.558 6.873 7.216 7.594 8.025 8.466 8.947 9.504 10.047 10.691 11.408 12.231 13.19 14.303 15.628 17.179 18.186 18.65 18.843 18.86 18.795 18.69 18.554 18.378 18.171 17.989 17.783 17.57 17.376 17.175 16.983 16.783 16.597 16.43 16.26 16.08 15.924 15.755 15.588 15.463 15.309 15.134 14.956 14.778 14.66 14.542 14.369 14.243 14.109 14.037 13.878 13.714 13.537 13.441 13.249 13.116 12.993 12.871 12.622 12.489 12.319 12.125 11.932 11.685 11.369 10.441 -4 ,9531 ,TETRA ,17606534,Sun Nov 28 20:39:04 CET,Sun Nov 28 22:31:24 CET,0.0 0.685 0.962 1.154 1.317 1.474 1.618 1.754 2.001 2.109 2.21 2.304 2.51 2.606 2.791 2.963 3.128 3.211 3.378 3.536 3.753 3.896 4.037 4.236 4.438 4.647 4.838 5.017 5.253 5.477 5.692 5.946 6.181 6.415 6.7 7.037 7.373 7.729 8.117 8.546 8.971 9.434 9.985 10.539 11.221 11.968 12.833 13.894 15.098 16.385 17.871 19.061 19.582 19.714 19.697 19.58 19.423 19.281 19.107 18.885 18.681 18.499 18.305 18.087 17.876 17.688 17.491 17.298 17.132 16.963 16.777 16.614 16.434 16.246 16.096 15.939 15.78 15.609 15.429 15.302 15.171 14.967 14.817 14.645 14.547 14.355 14.163 13.944 13.825 13.612 13.457 13.323 13.171 12.83 12.653 12.469 12.257 12.01 11.689 11.293 10.493 -5 ,24688 ,TETRA ,17606535,Sun Nov 28 20:39:04 CET,Sun Nov 28 22:31:44 CET,0.0 0.353 0.574 0.766 0.937 1.075 1.199 1.319 1.568 1.681 1.774 1.849 2.048 2.135 2.31 2.485 2.644 2.719 2.865 3.008 3.211 3.343 3.473 3.662 3.853 4.033 4.2 4.37 4.602 4.828 5.042 5.31 5.569 5.812 6.091 6.407 6.716 7.062 7.437 7.82 8.221 8.67 9.225 9.82 10.517 11.29 12.206 13.255 14.452 15.839 17.39 18.51 18.945 19.066 19.053 18.979 18.785 18.545 18.368 18.153 17.918 17.665 17.406 17.194 17.006 16.825 16.652 16.484 16.326 16.159 15.974 15.81 15.627 15.425 15.264 15.098 14.926 14.744 14.539 14.392 14.259 14.057 13.906 13.744 13.658 13.48 13.289 13.072 12.953 12.739 12.575 12.444 12.306 12.003 11.842 11.664 11.454 11.212 10.907 10.48 9.43 -6 ,8204 ,TETRA ,17606536,Sun Nov 28 20:39:04 CET,Sun Nov 28 22:32:18 CET,0.0 0.342 0.543 0.741 0.9 1.036 1.162 1.289 1.567 1.69 1.799 1.911 2.121 2.221 2.399 2.552 2.7 2.774 2.926 3.079 3.297 3.441 3.58 3.777 3.963 4.158 4.346 4.528 4.768 4.993 5.214 5.482 5.728 5.961 6.241 6.561 6.87 7.203 7.557 7.956 8.382 8.862 9.435 10.004 10.656 11.419 12.312 13.285 14.422 15.701 17.082 18.068 18.513 18.654 18.619 18.503 18.363 18.18 17.951 17.699 17.487 17.3 17.135 16.988 16.83 16.644 16.445 16.254 16.066 15.865 15.659 15.502 15.333 15.162 15.03 14.878 14.728 14.575 14.413 14.295 14.164 13.941 13.789 13.639 13.557 13.393 13.229 13.049 12.946 12.739 12.591 12.465 12.334 12.028 11.862 11.679 11.477 11.255 11.003 10.651 9.724 -7 ,27887 ,TETRA ,17606537,Sun Nov 28 20:39:05 CET,Sun Nov 28 22:31:30 CET,0.0 0.491 0.734 0.904 1.048 1.186 1.315 1.444 1.678 1.789 1.9 1.993 2.197 2.297 2.486 2.656 2.827 2.914 3.077 3.23 3.446 3.588 3.729 3.929 4.114 4.292 4.468 4.64 4.87 5.092 5.309 5.587 5.858 6.11 6.399 6.726 7.038 7.379 7.74 8.117 8.54 9.054 9.672 10.272 10.959 11.753 12.611 13.57 14.785 16.152 17.621 18.739 19.23 19.468 19.545 19.442 19.273 19.095 18.917 18.709 18.529 18.345 18.139 17.952 17.778 17.612 17.43 17.266 17.129 16.974 16.791 16.646 16.509 16.356 16.228 16.088 15.937 15.774 15.593 15.472 15.349 15.141 14.996 14.839 14.764 14.605 14.431 14.246 14.149 13.952 13.801 13.672 13.541 13.27 13.113 12.932 12.717 12.486 12.238 11.905 11.259 -8 ,19606 ,TETRA ,17606538,Sun Nov 28 20:40:03 CET,Sun Nov 28 22:32:37 CET,0.0 0.426 0.623 0.798 0.955 1.09 1.215 1.336 1.566 1.68 1.789 1.904 2.116 2.206 2.372 2.537 2.696 2.775 2.931 3.081 3.298 3.434 3.571 3.778 3.968 4.148 4.334 4.509 4.728 4.946 5.155 5.407 5.642 5.879 6.17 6.508 6.836 7.191 7.588 8.029 8.475 8.949 9.52 10.11 10.795 11.538 12.386 13.363 14.502 15.811 17.342 18.486 19.039 19.256 19.306 19.273 19.133 18.974 18.823 18.605 18.381 18.178 17.985 17.784 17.585 17.406 17.221 17.039 16.862 16.668 16.459 16.284 16.109 15.93 15.792 15.653 15.501 15.35 15.201 15.089 14.967 14.783 14.653 14.502 14.418 14.249 14.077 13.878 13.768 13.565 13.433 13.321 13.198 12.915 12.761 12.583 12.39 12.17 11.899 11.519 10.237 -9 ,26390 ,TETRA ,17606539,Sun Nov 28 20:40:03 CET,Sun Nov 28 22:32:57 CET,0.0 0.373 0.601 0.781 0.949 1.098 1.228 1.34 1.546 1.654 1.757 1.843 2.039 2.129 2.315 2.483 2.642 2.724 2.885 3.04 3.274 3.421 3.558 3.77 3.965 4.14 4.315 4.489 4.711 4.944 5.183 5.455 5.717 5.981 6.296 6.646 6.974 7.336 7.729 8.141 8.596 9.124 9.736 10.381 11.134 11.938 12.876 13.937 15.159 16.532 18.013 19.06 19.519 19.766 19.936 19.99 19.929 19.777 19.611 19.445 19.273 19.092 18.919 18.763 18.597 18.422 18.238 18.074 17.908 17.725 17.538 17.38 17.222 17.057 16.918 16.761 16.6 16.433 16.236 16.09 15.943 15.723 15.57 15.398 15.307 15.13 14.933 14.69 14.558 14.338 14.163 14.027 13.876 13.535 13.36 13.172 12.95 12.678 12.307 11.829 10.472 -10 ,21765 ,TETRA ,17606540,Sun Nov 28 20:40:05 CET,Sun Nov 28 22:34:23 CET,0.0 0.582 0.806 0.999 1.169 1.326 1.481 1.611 1.831 1.934 2.04 2.118 2.313 2.404 2.576 2.738 2.897 2.973 3.127 3.289 3.525 3.666 3.798 3.992 4.182 4.373 4.566 4.756 4.996 5.236 5.477 5.756 6.023 6.286 6.583 6.914 7.246 7.607 7.985 8.391 8.831 9.36 10.002 10.625 11.344 12.161 13.064 14.064 15.295 16.706 18.214 19.263 19.72 19.903 19.986 19.98 19.897 19.764 19.603 19.404 19.209 19.0 18.76 18.539 18.338 18.148 17.957 17.775 17.599 17.421 17.236 17.081 16.906 16.728 16.604 16.461 16.299 16.126 15.932 15.806 15.685 15.489 15.336 15.175 15.095 14.926 14.747 14.552 14.446 14.232 14.076 13.952 13.825 13.531 13.363 13.181 12.988 12.769 12.495 12.142 11.132 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_30_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_30_37.txt deleted file mode 100644 index 74175c97..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_30_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23829 ,TETRA ,17606541,Sun Nov 28 20:40:04 CET,Sun Nov 28 22:27:04 CET,0.0 0.867 1.175 1.427 1.641 1.81 1.962 2.104 2.361 2.475 2.579 2.674 2.878 2.974 3.172 3.353 3.525 3.605 3.757 3.904 4.093 4.214 4.345 4.551 4.743 4.912 5.075 5.225 5.415 5.599 5.768 5.995 6.231 6.437 6.649 6.909 7.181 7.467 7.752 8.056 8.386 8.745 9.174 9.612 10.106 10.666 11.29 11.897 12.536 13.264 14.022 14.449 14.515 14.387 14.228 14.001 13.779 13.591 13.415 13.232 13.053 12.874 12.669 12.469 12.288 12.108 11.908 11.724 11.556 11.378 11.197 11.041 10.863 10.682 10.545 10.406 10.25 10.087 9.934 9.822 9.7 9.505 9.369 9.226 9.152 8.996 8.816 8.624 8.527 8.328 8.182 8.057 7.925 7.642 7.482 7.304 7.098 6.806 6.476 6.127 5.203 -2 ,16216 ,TETRA ,17606542,Sun Nov 28 20:40:05 CET,Sun Nov 28 22:33:43 CET,0.0 0.754 1.085 1.338 1.553 1.724 1.877 2.019 2.286 2.402 2.515 2.616 2.819 2.91 3.091 3.261 3.418 3.495 3.651 3.798 3.996 4.13 4.26 4.44 4.607 4.765 4.917 5.078 5.291 5.489 5.688 5.927 6.151 6.355 6.587 6.84 7.08 7.352 7.645 7.955 8.273 8.624 9.047 9.477 9.941 10.457 11.088 11.798 12.574 13.394 14.236 14.683 14.729 14.586 14.376 14.179 13.965 13.724 13.506 13.27 13.05 12.85 12.65 12.458 12.271 12.081 11.885 11.721 11.583 11.445 11.302 11.172 11.036 10.901 10.783 10.653 10.515 10.379 10.24 10.139 10.029 9.847 9.728 9.611 9.549 9.408 9.253 9.101 9.028 8.855 8.779 8.679 8.565 8.316 8.189 8.049 7.882 7.684 7.434 7.1 6.364 -3 ,4945 ,TETRA ,17606543,Sun Nov 28 20:40:06 CET,Sun Nov 28 22:33:42 CET,0.0 0.766 1.024 1.24 1.423 1.592 1.757 1.899 2.161 2.282 2.392 2.483 2.685 2.775 2.947 3.113 3.272 3.344 3.49 3.636 3.844 3.975 4.096 4.278 4.458 4.623 4.779 4.929 5.131 5.328 5.505 5.741 5.973 6.175 6.406 6.661 6.906 7.185 7.505 7.843 8.188 8.586 9.041 9.5 10.037 10.609 11.236 11.876 12.604 13.365 14.048 14.377 14.317 14.125 13.903 13.666 13.42 13.172 12.945 12.708 12.512 12.312 12.091 11.88 11.679 11.493 11.294 11.112 10.953 10.791 10.614 10.463 10.306 10.132 10.0 9.867 9.722 9.557 9.384 9.268 9.138 8.926 8.787 8.643 8.558 8.374 8.204 8.03 7.935 7.736 7.596 7.46 7.31 6.988 6.803 6.596 6.366 6.088 5.746 5.3 3.354 -4 ,25962 ,TETRA ,17606544,Sun Nov 28 20:40:05 CET,Sun Nov 28 22:33:03 CET,0.0 0.635 0.918 1.158 1.355 1.524 1.684 1.826 2.075 2.198 2.319 2.432 2.639 2.737 2.923 3.087 3.243 3.316 3.459 3.6 3.801 3.93 4.056 4.242 4.421 4.587 4.748 4.909 5.115 5.308 5.488 5.715 5.928 6.126 6.36 6.613 6.852 7.112 7.387 7.67 7.979 8.344 8.779 9.197 9.67 10.219 10.83 11.491 12.195 12.913 13.569 13.886 13.942 13.843 13.652 13.432 13.218 13.016 12.805 12.562 12.361 12.183 11.987 11.787 11.596 11.411 11.216 11.038 10.868 10.676 10.482 10.331 10.162 9.979 9.844 9.707 9.563 9.41 9.25 9.133 9.013 8.814 8.67 8.528 8.451 8.283 8.102 7.9 7.795 7.598 7.445 7.307 7.157 6.835 6.653 6.456 6.24 6.001 5.718 5.271 4.159 -5 ,17583 ,TETRA ,17606546,Sun Nov 28 20:40:06 CET,Sun Nov 28 22:32:57 CET,0.0 0.496 0.758 0.964 1.139 1.305 1.46 1.601 1.839 1.945 2.046 2.137 2.342 2.433 2.604 2.76 2.91 2.988 3.14 3.282 3.482 3.608 3.734 3.915 4.094 4.274 4.446 4.602 4.806 5.01 5.199 5.417 5.623 5.828 6.064 6.328 6.576 6.856 7.15 7.458 7.803 8.172 8.602 9.061 9.574 10.079 10.657 11.284 11.92 12.636 13.465 13.849 13.86 13.784 13.609 13.39 13.156 12.938 12.746 12.527 12.339 12.172 11.979 11.777 11.591 11.427 11.253 11.091 10.942 10.78 10.599 10.449 10.297 10.122 9.972 9.823 9.682 9.529 9.369 9.253 9.132 8.948 8.818 8.677 8.604 8.455 8.295 8.109 8.008 7.817 7.696 7.578 7.449 7.175 7.027 6.859 6.638 6.39 6.099 5.666 4.6 -6 ,15741 ,TETRA ,17606547,Sun Nov 28 20:40:06 CET,Sun Nov 28 22:33:43 CET,0.0 0.853 1.162 1.425 1.649 1.826 2.0 2.165 2.453 2.578 2.69 2.787 2.991 3.087 3.272 3.443 3.601 3.678 3.842 3.999 4.214 4.353 4.482 4.673 4.861 5.035 5.203 5.361 5.563 5.77 5.973 6.209 6.429 6.655 6.917 7.21 7.485 7.76 8.054 8.373 8.712 9.096 9.545 9.982 10.469 11.033 11.676 12.357 13.122 13.936 14.704 15.121 15.236 15.195 15.069 14.916 14.726 14.514 14.293 14.034 13.794 13.581 13.374 13.156 12.931 12.731 12.548 12.381 12.224 12.051 11.871 11.721 11.558 11.383 11.252 11.122 10.99 10.846 10.686 10.572 10.455 10.262 10.127 9.988 9.913 9.754 9.603 9.44 9.344 9.146 9.02 8.908 8.792 8.522 8.374 8.213 8.017 7.765 7.454 7.033 5.814 -7 ,24968 ,TETRA ,17606548,Sun Nov 28 20:40:06 CET,Sun Nov 28 22:33:44 CET,0.0 0.96 1.259 1.487 1.67 1.847 2.012 2.151 2.408 2.53 2.645 2.757 2.964 3.063 3.246 3.409 3.56 3.632 3.783 3.936 4.151 4.288 4.421 4.619 4.812 4.992 5.168 5.332 5.531 5.727 5.911 6.124 6.321 6.507 6.738 6.999 7.251 7.528 7.829 8.153 8.473 8.818 9.241 9.664 10.134 10.646 11.219 11.836 12.528 13.228 13.858 14.167 14.239 14.127 13.914 13.624 13.308 13.029 12.768 12.501 12.279 12.065 11.851 11.642 11.436 11.232 11.014 10.829 10.669 10.512 10.353 10.221 10.076 9.916 9.789 9.647 9.491 9.327 9.154 9.029 8.905 8.714 8.581 8.441 8.365 8.199 8.027 7.847 7.751 7.555 7.417 7.291 7.164 6.866 6.676 6.478 6.259 5.988 5.662 5.253 4.244 -8 ,328 ,TETRA ,17606549,Sun Nov 28 20:41:03 CET,Sun Nov 28 22:34:58 CET,0.0 0.791 1.047 1.234 1.426 1.61 1.767 1.9 2.134 2.245 2.349 2.444 2.65 2.743 2.915 3.073 3.218 3.291 3.435 3.579 3.795 3.925 4.045 4.23 4.402 4.558 4.725 4.891 5.092 5.283 5.46 5.667 5.887 6.103 6.346 6.626 6.895 7.175 7.469 7.799 8.126 8.479 8.919 9.357 9.859 10.395 10.99 11.685 12.469 13.263 13.983 14.366 14.438 14.365 14.242 14.097 13.904 13.694 13.498 13.279 13.074 12.883 12.688 12.486 12.303 12.133 11.932 11.74 11.58 11.417 11.241 11.098 10.943 10.775 10.641 10.499 10.35 10.181 9.994 9.872 9.748 9.549 9.414 9.27 9.194 9.037 8.872 8.696 8.608 8.428 8.327 8.224 8.12 7.908 7.792 7.664 7.516 7.337 7.123 6.844 6.312 -9 ,27477 ,TETRA ,17606550,Sun Nov 28 20:41:03 CET,Sun Nov 28 22:34:45 CET,0.0 0.643 0.937 1.181 1.392 1.577 1.722 1.861 2.125 2.239 2.344 2.436 2.643 2.74 2.922 3.099 3.263 3.341 3.489 3.631 3.831 3.96 4.089 4.277 4.447 4.6 4.758 4.914 5.104 5.292 5.476 5.701 5.923 6.133 6.363 6.619 6.881 7.155 7.449 7.768 8.1 8.481 8.906 9.304 9.789 10.372 10.999 11.616 12.334 13.15 13.864 14.207 14.262 14.13 13.931 13.749 13.558 13.346 13.16 12.942 12.714 12.507 12.306 12.119 11.938 11.76 11.568 11.381 11.213 11.044 10.864 10.708 10.547 10.367 10.221 10.069 9.907 9.743 9.575 9.457 9.328 9.111 8.967 8.817 8.738 8.574 8.411 8.24 8.145 7.941 7.78 7.653 7.524 7.221 7.054 6.872 6.677 6.459 6.147 5.692 4.146 -10 ,6023 ,TETRA ,17606551,Sun Nov 28 20:41:02 CET,Sun Nov 28 22:33:56 CET,0.0 0.91 1.209 1.439 1.647 1.831 1.982 2.112 2.359 2.477 2.59 2.692 2.896 2.99 3.172 3.342 3.497 3.57 3.72 3.872 4.089 4.225 4.35 4.532 4.707 4.869 5.026 5.19 5.411 5.614 5.804 6.029 6.25 6.458 6.691 6.961 7.24 7.553 7.876 8.194 8.521 8.908 9.368 9.808 10.299 10.847 11.481 12.166 12.884 13.584 14.301 14.673 14.655 14.505 14.338 14.156 13.925 13.695 13.491 13.264 13.066 12.889 12.704 12.505 12.29 12.087 11.883 11.696 11.536 11.364 11.186 11.031 10.876 10.725 10.604 10.482 10.355 10.224 10.082 9.982 9.881 9.729 9.611 9.478 9.413 9.288 9.16 9.02 8.944 8.767 8.676 8.58 8.484 8.268 8.138 7.993 7.823 7.642 7.429 7.088 6.339 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_30_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_30_42.txt deleted file mode 100644 index a5889853..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_30_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18229 ,TETRA ,17606552,Sun Nov 28 20:41:03 CET,Sun Nov 28 22:23:37 CET,0.0 1.6 2.025 2.36 2.644 2.884 3.096 3.306 3.674 3.827 3.982 4.163 4.399 4.526 4.765 5.001 5.244 5.362 5.592 5.807 6.102 6.297 6.486 6.734 6.959 7.178 7.392 7.6 7.875 8.147 8.396 8.698 8.99 9.272 9.607 9.969 10.302 10.691 11.098 11.509 11.969 12.506 13.118 13.723 14.425 15.238 16.202 17.221 18.366 19.764 21.223 21.986 22.279 22.363 22.316 22.196 22.015 21.79 21.589 21.379 21.172 20.969 20.756 20.532 20.313 20.13 19.936 19.726 19.535 19.345 19.112 18.894 18.668 18.441 18.263 18.058 17.842 17.637 17.423 17.27 17.099 16.819 16.628 16.423 16.31 16.085 15.871 15.626 15.492 15.273 15.059 14.886 14.703 14.3 14.071 13.813 13.55 13.199 12.749 12.098 9.145 -2 ,11496 ,TETRA ,17606553,Sun Nov 28 20:41:03 CET,Sun Nov 28 22:33:28 CET,0.0 0.791 1.09 1.348 1.563 1.746 1.919 2.08 2.364 2.496 2.619 2.752 2.979 3.098 3.32 3.523 3.732 3.836 4.02 4.202 4.477 4.656 4.83 5.08 5.306 5.515 5.727 5.93 6.179 6.426 6.67 6.991 7.325 7.64 7.978 8.352 8.719 9.117 9.547 10.029 10.551 11.086 11.702 12.335 13.072 13.894 14.814 15.833 17.016 18.32 19.638 20.488 20.789 20.912 20.886 20.724 20.52 20.264 19.959 19.656 19.43 19.203 18.969 18.755 18.535 18.318 18.098 17.918 17.734 17.523 17.326 17.144 16.941 16.733 16.561 16.377 16.192 15.994 15.766 15.608 15.445 15.181 15.011 14.842 14.746 14.537 14.309 14.048 13.914 13.693 13.506 13.334 13.145 12.753 12.534 12.267 11.953 11.61 11.154 10.512 8.218 -3 ,5048 ,TETRA ,17606554,Sun Nov 28 20:41:05 CET,Sun Nov 28 22:33:39 CET,0.0 0.814 1.102 1.372 1.633 1.858 2.035 2.194 2.474 2.597 2.726 2.87 3.1 3.225 3.451 3.664 3.875 3.98 4.18 4.364 4.612 4.767 4.928 5.167 5.384 5.587 5.79 5.993 6.271 6.541 6.783 7.062 7.332 7.605 7.913 8.24 8.578 8.958 9.344 9.763 10.215 10.697 11.284 11.904 12.595 13.311 14.186 15.241 16.422 17.717 19.103 20.028 20.35 20.407 20.383 20.315 20.153 19.937 19.736 19.52 19.306 19.087 18.869 18.666 18.454 18.247 18.009 17.753 17.539 17.315 17.06 16.854 16.655 16.445 16.277 16.107 15.935 15.743 15.518 15.343 15.167 14.909 14.734 14.548 14.442 14.224 13.993 13.743 13.619 13.378 13.146 12.983 12.803 12.41 12.183 11.921 11.618 11.275 10.839 10.228 7.668 -4 ,22758 ,TETRA ,17606555,Sun Nov 28 20:41:07 CET,Sun Nov 28 22:34:08 CET,0.0 0.825 1.159 1.401 1.617 1.813 1.985 2.148 2.457 2.612 2.755 2.877 3.101 3.22 3.457 3.668 3.86 3.959 4.157 4.347 4.609 4.77 4.926 5.16 5.389 5.602 5.817 6.046 6.34 6.624 6.915 7.267 7.591 7.898 8.265 8.661 9.019 9.417 9.849 10.291 10.743 11.253 11.827 12.404 13.087 13.834 14.733 15.77 16.935 18.235 19.664 20.575 20.87 20.927 20.877 20.732 20.566 20.41 20.221 19.95 19.65 19.413 19.223 19.013 18.791 18.591 18.361 18.102 17.87 17.642 17.4 17.191 16.993 16.813 16.66 16.485 16.295 16.081 15.844 15.685 15.532 15.294 15.115 14.917 14.81 14.592 14.388 14.162 14.028 13.783 13.525 13.341 13.162 12.77 12.545 12.302 12.031 11.704 11.317 10.73 7.406 -5 ,9113 ,TETRA ,17606556,Sun Nov 28 20:41:10 CET,Sun Nov 28 22:33:36 CET,0.0 0.975 1.336 1.615 1.848 2.04 2.204 2.363 2.669 2.804 2.932 3.068 3.294 3.412 3.622 3.822 4.03 4.128 4.303 4.472 4.718 4.873 5.026 5.247 5.46 5.671 5.868 6.062 6.32 6.559 6.778 7.044 7.308 7.565 7.869 8.2 8.535 8.905 9.292 9.717 10.161 10.667 11.258 11.849 12.538 13.316 14.205 15.162 16.26 17.533 18.965 19.908 20.309 20.489 20.434 20.275 20.114 19.863 19.604 19.306 18.978 18.699 18.476 18.28 18.092 17.882 17.637 17.409 17.19 16.948 16.695 16.494 16.283 16.061 15.89 15.703 15.507 15.312 15.097 14.945 14.79 14.544 14.37 14.181 14.074 13.847 13.611 13.349 13.212 12.974 12.762 12.608 12.42 11.971 11.737 11.485 11.186 10.837 10.459 9.92 7.535 -6 ,2230 ,TETRA ,17606557,Sun Nov 28 20:41:03 CET,Sun Nov 28 22:32:55 CET,0.0 1.561 2.053 2.373 2.623 2.836 3.029 3.207 3.518 3.661 3.813 3.988 4.223 4.355 4.616 4.868 5.081 5.177 5.368 5.56 5.839 6.007 6.162 6.407 6.666 6.901 7.122 7.349 7.631 7.894 8.166 8.487 8.769 9.052 9.408 9.812 10.185 10.585 11.042 11.534 12.017 12.54 13.144 13.756 14.462 15.228 16.129 17.197 18.383 19.63 21.054 21.991 22.333 22.398 22.306 22.156 22.008 21.817 21.595 21.337 21.091 20.863 20.64 20.435 20.234 20.046 19.81 19.57 19.382 19.202 18.977 18.76 18.529 18.289 18.106 17.922 17.721 17.495 17.275 17.13 16.97 16.728 16.568 16.389 16.29 16.078 15.855 15.612 15.475 15.24 15.0 14.81 14.631 14.256 14.036 13.796 13.523 13.204 12.783 12.199 9.959 -7 ,21264 ,TETRA ,17606558,Sun Nov 28 20:41:05 CET,Sun Nov 28 22:37:01 CET,0.0 0.89 1.297 1.599 1.836 2.048 2.232 2.408 2.748 2.905 3.052 3.209 3.434 3.538 3.734 3.93 4.1 4.182 4.381 4.587 4.861 5.038 5.21 5.468 5.705 5.932 6.174 6.424 6.759 7.078 7.372 7.712 8.024 8.316 8.661 9.042 9.39 9.772 10.204 10.641 11.082 11.599 12.208 12.877 13.63 14.425 15.351 16.313 17.422 18.766 20.228 21.233 21.585 21.617 21.586 21.466 21.273 21.032 20.8 20.553 20.322 20.093 19.818 19.523 19.274 19.057 18.772 18.516 18.333 18.121 17.891 17.707 17.499 17.273 17.108 16.937 16.745 16.539 16.331 16.192 16.049 15.792 15.591 15.38 15.262 15.009 14.76 14.51 14.369 14.133 13.928 13.771 13.603 13.237 13.031 12.799 12.515 12.172 11.74 11.092 7.281 -8 ,19283 ,TETRA ,17606559,Sun Nov 28 20:41:05 CET,Sun Nov 28 22:30:43 CET,0.0 1.02 1.415 1.707 1.951 2.176 2.373 2.562 2.922 3.08 3.242 3.463 3.721 3.867 4.126 4.354 4.563 4.67 4.89 5.096 5.379 5.569 5.764 6.041 6.3 6.536 6.742 6.944 7.214 7.467 7.71 8.013 8.319 8.623 8.992 9.418 9.778 10.157 10.579 11.031 11.508 12.027 12.635 13.263 14.004 14.809 15.723 16.72 17.811 19.071 20.512 21.538 21.911 21.947 21.886 21.726 21.531 21.336 21.101 20.815 20.57 20.298 20.03 19.813 19.598 19.372 19.094 18.841 18.623 18.388 18.162 17.98 17.785 17.577 17.393 17.201 17.014 16.811 16.594 16.429 16.26 15.998 15.796 15.591 15.493 15.271 15.013 14.738 14.588 14.346 14.131 13.969 13.788 13.381 13.153 12.925 12.672 12.316 11.89 11.262 7.74 -9 ,13630 ,TETRA ,17606560,Sun Nov 28 20:41:05 CET,Sun Nov 28 22:37:52 CET,0.0 0.936 1.312 1.569 1.772 1.966 2.138 2.297 2.61 2.774 2.929 3.086 3.313 3.437 3.684 3.915 4.134 4.238 4.439 4.63 4.907 5.077 5.248 5.524 5.792 6.044 6.287 6.536 6.852 7.134 7.413 7.754 8.086 8.394 8.751 9.169 9.574 10.017 10.462 10.921 11.439 12.023 12.642 13.223 13.921 14.725 15.621 16.646 17.813 19.06 20.436 21.388 21.785 21.888 21.825 21.69 21.443 21.186 20.981 20.708 20.398 20.088 19.8 19.564 19.337 19.094 18.816 18.571 18.391 18.206 17.981 17.798 17.595 17.346 17.15 16.941 16.723 16.505 16.284 16.129 15.976 15.732 15.54 15.341 15.239 15.005 14.772 14.538 14.415 14.198 13.997 13.842 13.673 13.325 13.127 12.906 12.639 12.312 11.901 11.315 7.771 -10 ,24157 ,TETRA ,17606561,Sun Nov 28 20:41:05 CET,Sun Nov 28 22:27:26 CET,0.0 0.728 0.999 1.237 1.445 1.631 1.817 1.987 2.296 2.442 2.573 2.718 2.956 3.084 3.313 3.525 3.735 3.834 4.016 4.206 4.501 4.689 4.865 5.102 5.327 5.552 5.788 6.014 6.29 6.55 6.788 7.063 7.333 7.596 7.905 8.266 8.604 8.952 9.326 9.756 10.217 10.713 11.299 11.896 12.592 13.36 14.216 15.192 16.426 17.839 19.261 20.212 20.665 20.804 20.728 20.579 20.407 20.207 20.01 19.776 19.516 19.239 18.972 18.742 18.513 18.293 18.06 17.846 17.646 17.434 17.214 17.018 16.831 16.635 16.473 16.294 16.089 15.885 15.683 15.529 15.358 15.072 14.867 14.671 14.576 14.369 14.151 13.931 13.809 13.582 13.36 13.184 13.01 12.636 12.407 12.136 11.834 11.482 11.015 10.394 7.75 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_31_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_31_35.txt deleted file mode 100644 index de92432e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_31_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30769 ,TETRA ,17606563,Sun Nov 28 20:41:05 CET,Sun Nov 28 22:33:31 CET,0.0 0.539 0.827 1.043 1.175 1.317 1.465 1.593 1.829 1.936 2.04 2.151 2.358 2.45 2.628 2.786 2.933 3.008 3.16 3.31 3.524 3.658 3.791 3.973 4.149 4.319 4.481 4.642 4.85 5.046 5.243 5.486 5.728 5.969 6.244 6.563 6.869 7.184 7.515 7.873 8.259 8.724 9.286 9.833 10.439 11.096 11.863 12.756 13.844 15.105 16.526 17.48 17.824 17.937 17.862 17.676 17.508 17.323 17.121 16.881 16.668 16.448 16.193 15.959 15.763 15.59 15.379 15.178 15.014 14.843 14.645 14.477 14.308 14.13 13.989 13.842 13.686 13.523 13.352 13.228 13.094 12.873 12.723 12.572 12.495 12.326 12.142 11.951 11.845 11.646 11.533 11.415 11.289 10.995 10.817 10.626 10.424 10.208 9.957 9.574 8.363 -2 ,19547 ,TETRA ,17606564,Sun Nov 28 20:41:06 CET,Sun Nov 28 22:33:49 CET,0.0 0.599 0.88 1.099 1.266 1.415 1.558 1.685 1.909 2.016 2.122 2.216 2.414 2.505 2.672 2.816 2.949 3.014 3.153 3.303 3.523 3.663 3.797 3.987 4.175 4.354 4.522 4.685 4.892 5.092 5.297 5.538 5.773 5.994 6.241 6.546 6.842 7.162 7.522 7.905 8.3 8.738 9.243 9.772 10.398 11.055 11.837 12.77 13.82 15.038 16.351 17.148 17.478 17.598 17.575 17.42 17.189 16.95 16.724 16.44 16.185 15.944 15.685 15.434 15.187 14.954 14.723 14.509 14.304 14.101 13.903 13.728 13.54 13.322 13.133 12.956 12.793 12.606 12.407 12.28 12.148 11.927 11.766 11.59 11.5 11.313 11.109 10.885 10.762 10.538 10.344 10.192 10.042 9.72 9.537 9.361 9.183 8.943 8.65 8.26 7.243 -3 ,2219 ,TETRA ,17606565,Sun Nov 28 20:41:08 CET,Sun Nov 28 22:34:08 CET,0.0 0.37 0.596 0.796 0.983 1.17 1.34 1.482 1.725 1.832 1.922 1.988 2.191 2.283 2.44 2.588 2.725 2.792 2.932 3.073 3.266 3.393 3.522 3.712 3.886 4.044 4.198 4.349 4.554 4.754 4.946 5.179 5.399 5.609 5.857 6.136 6.403 6.7 7.026 7.38 7.749 8.165 8.665 9.161 9.732 10.403 11.166 12.002 13.006 14.113 15.237 16.006 16.304 16.39 16.384 16.262 16.048 15.823 15.594 15.341 15.122 14.913 14.7 14.455 14.195 13.973 13.746 13.529 13.335 13.123 12.903 12.726 12.536 12.317 12.14 11.968 11.787 11.588 11.368 11.205 11.041 10.77 10.566 10.366 10.266 10.062 9.843 9.595 9.48 9.282 9.133 9.002 8.866 8.566 8.411 8.245 8.05 7.834 7.57 7.196 5.89 -4 ,188 ,TETRA ,17606566,Sun Nov 28 20:41:10 CET,Sun Nov 28 22:33:41 CET,0.0 0.582 0.832 1.016 1.183 1.318 1.44 1.576 1.853 1.97 2.068 2.15 2.347 2.441 2.607 2.767 2.921 2.998 3.143 3.283 3.495 3.627 3.753 3.937 4.114 4.286 4.462 4.641 4.879 5.091 5.277 5.501 5.732 5.962 6.22 6.519 6.808 7.126 7.472 7.828 8.203 8.652 9.171 9.708 10.325 10.97 11.715 12.58 13.586 14.701 15.941 16.835 17.264 17.396 17.368 17.273 17.135 16.932 16.73 16.555 16.362 16.155 15.957 15.749 15.542 15.347 15.121 14.886 14.691 14.51 14.302 14.118 13.922 13.72 13.563 13.397 13.228 13.061 12.857 12.705 12.554 12.303 12.128 11.95 11.859 11.673 11.473 11.25 11.13 10.907 10.725 10.579 10.424 10.045 9.815 9.594 9.377 9.144 8.886 8.561 7.652 -5 ,23805 ,TETRA ,17606567,Sun Nov 28 20:42:05 CET,Sun Nov 28 22:38:06 CET,0.0 0.573 0.819 0.998 1.155 1.305 1.437 1.555 1.796 1.904 1.997 2.077 2.275 2.365 2.549 2.73 2.885 2.959 3.113 3.259 3.482 3.623 3.752 3.935 4.115 4.293 4.459 4.621 4.833 5.03 5.224 5.471 5.716 5.958 6.236 6.546 6.844 7.18 7.557 7.954 8.36 8.824 9.37 9.892 10.481 11.182 12.015 12.952 14.037 15.264 16.613 17.451 17.847 17.997 17.966 17.811 17.624 17.411 17.15 16.875 16.647 16.438 16.214 15.982 15.765 15.558 15.335 15.139 14.966 14.778 14.59 14.44 14.278 14.086 13.92 13.739 13.557 13.375 13.184 13.051 12.908 12.675 12.519 12.35 12.254 12.067 11.879 11.677 11.567 11.36 11.228 11.101 10.958 10.636 10.453 10.264 10.045 9.772 9.454 9.054 7.933 -6 ,20193 ,TETRA ,17606568,Sun Nov 28 20:42:07 CET,Sun Nov 28 22:38:12 CET,0.0 0.375 0.608 0.787 0.943 1.088 1.225 1.342 1.563 1.666 1.756 1.841 2.037 2.121 2.284 2.436 2.586 2.664 2.817 2.958 3.15 3.273 3.395 3.58 3.759 3.936 4.108 4.28 4.496 4.694 4.889 5.116 5.338 5.558 5.819 6.12 6.415 6.755 7.122 7.477 7.827 8.246 8.746 9.248 9.833 10.488 11.272 12.152 13.177 14.396 15.727 16.583 16.913 17.065 17.066 16.934 16.777 16.577 16.343 16.069 15.83 15.599 15.353 15.119 14.895 14.687 14.487 14.302 14.119 13.922 13.731 13.573 13.395 13.187 13.015 12.845 12.671 12.491 12.294 12.154 12.009 11.792 11.629 11.455 11.37 11.189 10.977 10.759 10.656 10.453 10.318 10.201 10.076 9.817 9.661 9.466 9.253 9.014 8.744 8.367 7.184 -7 ,23559 ,TETRA ,17606569,Sun Nov 28 20:42:04 CET,Sun Nov 28 22:36:11 CET,0.0 0.653 0.934 1.14 1.306 1.451 1.582 1.704 1.943 2.064 2.175 2.269 2.463 2.559 2.754 2.943 3.117 3.196 3.345 3.502 3.734 3.88 4.016 4.214 4.41 4.592 4.765 4.946 5.174 5.387 5.608 5.871 6.115 6.363 6.647 6.971 7.277 7.613 8.004 8.424 8.848 9.32 9.888 10.455 11.106 11.863 12.758 13.793 14.906 16.049 17.27 18.02 18.326 18.372 18.282 18.126 17.946 17.732 17.489 17.232 16.994 16.762 16.53 16.299 16.096 15.9 15.686 15.475 15.273 15.08 14.875 14.698 14.507 14.308 14.156 13.991 13.826 13.648 13.442 13.285 13.117 12.877 12.713 12.539 12.455 12.27 12.062 11.843 11.733 11.525 11.367 11.242 11.101 10.811 10.656 10.486 10.29 10.036 9.733 9.371 8.547 -8 ,31806 ,TETRA ,17606570,Sun Nov 28 20:42:07 CET,Sun Nov 28 22:35:38 CET,0.0 0.709 0.989 1.191 1.371 1.539 1.675 1.794 2.011 2.123 2.224 2.299 2.491 2.57 2.726 2.884 3.033 3.105 3.242 3.378 3.573 3.7 3.828 4.014 4.189 4.359 4.517 4.676 4.885 5.083 5.287 5.54 5.782 6.016 6.286 6.596 6.903 7.236 7.585 7.955 8.353 8.802 9.31 9.822 10.418 11.071 11.838 12.744 13.783 14.951 16.262 17.163 17.61 17.72 17.624 17.493 17.381 17.222 17.05 16.881 16.677 16.438 16.19 15.934 15.705 15.497 15.263 15.057 14.868 14.675 14.481 14.3 14.104 13.899 13.74 13.569 13.384 13.198 13.002 12.86 12.711 12.478 12.315 12.139 12.048 11.864 11.669 11.452 11.338 11.136 11.017 10.894 10.765 10.492 10.331 10.152 9.944 9.707 9.446 9.099 8.287 -9 ,12626 ,TETRA ,17606571,Sun Nov 28 20:42:05 CET,Sun Nov 28 22:37:20 CET,0.0 0.3 0.515 0.692 0.847 0.977 1.099 1.224 1.438 1.536 1.633 1.726 1.923 2.009 2.175 2.343 2.517 2.596 2.737 2.87 3.078 3.21 3.334 3.519 3.689 3.851 4.004 4.148 4.346 4.546 4.748 4.99 5.228 5.452 5.703 6.005 6.286 6.594 6.942 7.311 7.722 8.194 8.734 9.292 9.965 10.726 11.562 12.473 13.483 14.636 16.003 16.806 16.964 16.876 16.72 16.511 16.25 15.98 15.733 15.475 15.247 15.049 14.851 14.652 14.468 14.283 14.059 13.858 13.692 13.509 13.313 13.141 12.949 12.765 12.628 12.47 12.317 12.164 11.996 11.886 11.759 11.548 11.401 11.251 11.172 11.01 10.832 10.611 10.5 10.304 10.178 10.054 9.917 9.627 9.48 9.317 9.113 8.855 8.56 8.158 6.812 -10 ,3457 ,TETRA ,17606572,Sun Nov 28 20:42:05 CET,Sun Nov 28 22:34:23 CET,0.0 0.369 0.613 0.793 0.95 1.094 1.221 1.333 1.547 1.652 1.743 1.817 2.013 2.105 2.276 2.43 2.579 2.653 2.81 2.963 3.179 3.313 3.447 3.65 3.838 4.01 4.184 4.36 4.589 4.813 5.019 5.257 5.493 5.727 5.99 6.292 6.586 6.9 7.272 7.662 8.057 8.541 9.141 9.726 10.355 11.035 11.826 12.743 13.809 14.979 16.241 17.109 17.386 17.466 17.493 17.426 17.306 17.156 17.018 16.839 16.632 16.425 16.223 16.014 15.78 15.541 15.318 15.125 14.946 14.755 14.539 14.354 14.168 13.979 13.838 13.693 13.537 13.377 13.216 13.11 13.0 12.796 12.646 12.498 12.424 12.268 12.092 11.903 11.802 11.607 11.485 11.362 11.221 10.907 10.748 10.575 10.372 10.153 9.905 9.591 8.597 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_31_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_31_37.txt deleted file mode 100644 index 86f3631e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_31_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,834 ,TETRA ,17606573,Sun Nov 28 20:43:04 CET,Sun Nov 28 22:36:32 CET,0.0 0.734 1.081 1.345 1.548 1.748 1.925 2.08 2.356 2.475 2.591 2.7 2.906 3.006 3.189 3.369 3.558 3.649 3.829 3.991 4.212 4.356 4.498 4.694 4.869 5.041 5.21 5.378 5.598 5.8 5.986 6.21 6.43 6.642 6.882 7.134 7.375 7.658 7.956 8.252 8.559 8.94 9.383 9.773 10.235 10.758 11.312 11.882 12.469 13.006 13.426 13.501 13.305 13.007 12.681 12.344 12.037 11.74 11.446 11.159 10.91 10.67 10.441 10.226 10.025 9.838 9.636 9.453 9.298 9.139 8.966 8.818 8.668 8.514 8.39 8.254 8.123 7.985 7.818 7.704 7.585 7.389 7.256 7.116 7.042 6.895 6.74 6.57 6.481 6.293 6.187 6.073 5.951 5.661 5.505 5.336 5.144 4.939 4.698 4.385 3.349 -2 ,29688 ,TETRA ,17606574,Sun Nov 28 20:43:09 CET,Sun Nov 28 22:36:37 CET,0.0 1.012 1.348 1.587 1.785 1.965 2.135 2.284 2.556 2.684 2.801 2.908 3.112 3.208 3.386 3.557 3.721 3.799 3.957 4.103 4.295 4.435 4.582 4.771 4.941 5.119 5.291 5.443 5.634 5.821 6.001 6.204 6.407 6.627 6.876 7.132 7.38 7.666 7.977 8.292 8.581 8.896 9.267 9.641 10.056 10.51 11.03 11.544 12.029 12.528 13.066 13.25 13.126 12.889 12.633 12.35 12.024 11.726 11.486 11.228 10.987 10.759 10.54 10.331 10.123 9.932 9.73 9.546 9.392 9.233 9.064 8.912 8.76 8.6 8.459 8.316 8.173 8.037 7.901 7.79 7.671 7.497 7.381 7.256 7.186 7.024 6.857 6.701 6.616 6.425 6.305 6.198 6.091 5.856 5.732 5.581 5.409 5.215 4.974 4.68 3.908 -3 ,3733 ,TETRA ,17606575,Sun Nov 28 20:43:05 CET,Sun Nov 28 22:36:32 CET,0.0 1.091 1.413 1.634 1.81 1.984 2.152 2.301 2.564 2.686 2.806 2.907 3.107 3.202 3.382 3.547 3.706 3.782 3.93 4.069 4.256 4.369 4.485 4.67 4.849 5.032 5.22 5.387 5.605 5.82 6.014 6.249 6.472 6.669 6.904 7.18 7.428 7.709 8.05 8.402 8.703 9.023 9.438 9.855 10.326 10.844 11.398 11.977 12.591 13.21 13.735 13.785 13.492 13.174 12.889 12.597 12.296 11.979 11.691 11.402 11.14 10.904 10.683 10.469 10.27 10.082 9.867 9.667 9.493 9.32 9.135 8.971 8.796 8.61 8.465 8.318 8.161 7.995 7.825 7.701 7.559 7.333 7.169 7.002 6.923 6.763 6.588 6.407 6.322 6.137 6.046 5.943 5.827 5.563 5.407 5.235 5.054 4.834 4.547 4.152 3.157 -4 ,8522 ,TETRA ,17606576,Sun Nov 28 20:43:07 CET,Sun Nov 28 22:36:40 CET,0.0 0.947 1.26 1.51 1.705 1.874 2.045 2.207 2.486 2.611 2.727 2.848 3.056 3.15 3.328 3.498 3.662 3.742 3.887 4.024 4.216 4.338 4.467 4.664 4.855 5.023 5.162 5.302 5.492 5.68 5.864 6.088 6.308 6.503 6.738 7.013 7.267 7.547 7.848 8.16 8.484 8.845 9.266 9.676 10.124 10.596 11.101 11.664 12.3 13.013 13.593 13.676 13.52 13.278 12.994 12.649 12.299 11.98 11.69 11.388 11.133 10.905 10.675 10.444 10.211 10.003 9.785 9.585 9.415 9.23 9.03 8.869 8.698 8.523 8.389 8.239 8.08 7.912 7.739 7.622 7.496 7.301 7.168 7.029 6.951 6.781 6.604 6.413 6.313 6.117 5.99 5.864 5.736 5.443 5.263 5.083 4.916 4.742 4.524 4.235 3.556 -5 ,22098 ,TETRA ,17606577,Sun Nov 28 20:43:04 CET,Sun Nov 28 22:36:35 CET,0.0 0.822 1.142 1.384 1.582 1.764 1.939 2.101 2.425 2.586 2.73 2.881 3.103 3.216 3.427 3.629 3.82 3.913 4.092 4.266 4.505 4.651 4.79 4.974 5.16 5.354 5.542 5.715 5.929 6.12 6.298 6.536 6.766 6.983 7.231 7.488 7.722 7.98 8.266 8.573 8.897 9.26 9.667 10.055 10.512 11.032 11.619 12.191 12.765 13.394 13.928 13.974 13.761 13.497 13.2 12.859 12.526 12.202 11.903 11.61 11.367 11.133 10.897 10.664 10.433 10.212 9.967 9.737 9.538 9.343 9.139 8.971 8.778 8.559 8.396 8.232 8.061 7.883 7.704 7.58 7.449 7.234 7.069 6.897 6.813 6.66 6.49 6.289 6.185 5.982 5.835 5.708 5.577 5.279 5.102 4.914 4.73 4.504 4.187 3.768 2.76 -6 ,5169 ,TETRA ,17606578,Sun Nov 28 20:43:07 CET,Sun Nov 28 22:36:37 CET,0.0 0.73 1.032 1.273 1.463 1.624 1.778 1.911 2.136 2.246 2.355 2.457 2.651 2.737 2.91 3.07 3.221 3.295 3.436 3.573 3.769 3.898 4.02 4.188 4.353 4.514 4.684 4.847 5.038 5.224 5.413 5.638 5.854 6.067 6.305 6.57 6.835 7.111 7.388 7.672 7.976 8.335 8.734 9.108 9.531 9.96 10.419 10.933 11.489 11.99 12.438 12.562 12.412 12.19 11.946 11.659 11.348 11.075 10.828 10.547 10.292 10.072 9.863 9.661 9.466 9.285 9.096 8.922 8.767 8.604 8.441 8.295 8.138 7.98 7.847 7.703 7.555 7.396 7.239 7.134 7.024 6.846 6.716 6.576 6.502 6.359 6.222 6.071 5.987 5.8 5.696 5.588 5.475 5.238 5.107 4.964 4.794 4.61 4.368 4.024 3.197 -7 ,29228 ,TETRA ,17606579,Sun Nov 28 20:43:04 CET,Sun Nov 28 22:35:55 CET,0.0 0.685 0.977 1.201 1.39 1.54 1.67 1.8 2.042 2.155 2.262 2.355 2.555 2.645 2.828 3.013 3.188 3.271 3.439 3.61 3.854 3.998 4.135 4.336 4.524 4.69 4.849 5.011 5.22 5.406 5.57 5.767 5.965 6.157 6.378 6.623 6.852 7.103 7.371 7.657 7.952 8.304 8.708 9.077 9.513 9.984 10.473 10.976 11.528 12.063 12.47 12.597 12.473 12.227 11.919 11.573 11.245 10.952 10.694 10.398 10.127 9.878 9.644 9.433 9.216 9.01 8.799 8.606 8.433 8.236 8.027 7.864 7.698 7.514 7.372 7.228 7.077 6.916 6.744 6.619 6.481 6.265 6.11 5.953 5.874 5.709 5.54 5.361 5.264 5.073 4.963 4.837 4.698 4.423 4.286 4.136 3.96 3.741 3.473 3.129 2.253 -8 ,32303 ,TETRA ,17606580,Sun Nov 28 20:43:07 CET,Sun Nov 28 22:35:53 CET,0.0 1.29 1.757 2.089 2.374 2.599 2.786 2.959 3.277 3.419 3.55 3.686 3.902 4.007 4.2 4.385 4.557 4.637 4.787 4.938 5.15 5.287 5.429 5.628 5.816 5.997 6.158 6.307 6.502 6.693 6.881 7.108 7.317 7.513 7.737 7.992 8.24 8.512 8.82 9.135 9.457 9.826 10.245 10.647 11.097 11.584 12.106 12.672 13.311 13.894 14.31 14.39 14.238 14.028 13.741 13.393 13.07 12.758 12.459 12.143 11.859 11.61 11.372 11.137 10.917 10.717 10.515 10.324 10.148 9.961 9.767 9.615 9.458 9.291 9.146 8.99 8.833 8.661 8.477 8.358 8.234 8.047 7.907 7.743 7.662 7.492 7.31 7.109 6.998 6.801 6.662 6.521 6.377 6.083 5.919 5.738 5.542 5.289 4.986 4.589 3.247 -9 ,14244 ,TETRA ,17606581,Sun Nov 28 20:43:05 CET,Sun Nov 28 22:36:33 CET,0.0 0.613 0.878 1.102 1.284 1.443 1.584 1.712 1.946 2.052 2.157 2.255 2.455 2.555 2.733 2.891 3.042 3.117 3.263 3.399 3.607 3.735 3.852 4.024 4.195 4.354 4.495 4.63 4.821 5.018 5.206 5.423 5.619 5.801 6.0 6.232 6.465 6.712 6.988 7.281 7.58 7.919 8.324 8.71 9.127 9.594 10.12 10.665 11.213 11.797 12.352 12.565 12.464 12.224 11.918 11.59 11.261 10.924 10.613 10.303 10.019 9.763 9.523 9.279 9.048 8.837 8.605 8.406 8.245 8.063 7.874 7.725 7.559 7.379 7.236 7.076 6.902 6.729 6.549 6.415 6.275 6.046 5.882 5.717 5.636 5.465 5.265 5.056 4.958 4.758 4.598 4.458 4.312 3.967 3.772 3.548 3.31 3.056 2.754 2.296 0.902 -10 ,18135 ,TETRA ,17606582,Sun Nov 28 20:43:06 CET,Sun Nov 28 22:36:35 CET,0.0 0.824 1.1 1.345 1.547 1.721 1.876 2.018 2.285 2.406 2.52 2.634 2.836 2.927 3.099 3.272 3.435 3.515 3.687 3.855 4.089 4.237 4.382 4.595 4.789 4.972 5.145 5.305 5.512 5.714 5.904 6.129 6.334 6.518 6.73 6.97 7.203 7.458 7.72 7.996 8.303 8.634 8.995 9.352 9.748 10.181 10.655 11.165 11.709 12.231 12.676 12.774 12.63 12.32 11.987 11.701 11.414 11.147 10.908 10.639 10.402 10.19 9.976 9.774 9.581 9.385 9.187 9.016 8.86 8.702 8.536 8.386 8.227 8.075 7.954 7.816 7.676 7.536 7.39 7.282 7.165 6.993 6.873 6.732 6.661 6.526 6.377 6.195 6.094 5.904 5.793 5.676 5.551 5.267 5.112 4.947 4.756 4.548 4.308 3.983 3.152 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_33_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_33_19.txt deleted file mode 100644 index a65be77d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_33_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20529 ,TETRA ,17606583,Sun Nov 28 20:43:07 CET,Sun Nov 28 22:34:13 CET,0.0 0.178 0.286 0.351 0.425 0.503 0.578 0.642 0.749 0.807 0.868 0.858 1.022 1.071 1.164 1.249 1.33 1.373 1.457 1.541 1.672 1.758 1.839 1.962 2.081 2.197 2.321 2.43 2.568 2.717 2.841 2.982 3.136 3.293 3.467 3.668 3.863 4.074 4.312 4.549 4.796 5.079 5.407 5.738 6.117 6.521 6.989 7.526 8.133 8.81 9.51 9.894 9.963 9.925 9.863 9.771 9.635 9.484 9.309 9.082 8.897 8.716 8.543 8.394 8.247 8.089 7.925 7.78 7.643 7.512 7.362 7.246 7.134 6.993 6.875 6.756 6.635 6.502 6.379 6.3 6.209 6.05 5.929 5.812 5.751 5.615 5.48 5.324 5.241 5.056 4.996 4.89 4.77 4.557 4.455 4.316 4.136 3.941 3.753 3.472 2.536 -2 ,930 ,TETRA ,17606584,Sun Nov 28 20:43:09 CET,Sun Nov 28 22:34:11 CET,0.0 0.162 0.302 0.437 0.54 0.617 0.685 0.751 0.874 0.938 1.004 1.005 1.172 1.234 1.349 1.453 1.554 1.6 1.689 1.776 1.902 1.987 2.064 2.173 2.279 2.385 2.504 2.624 2.789 2.947 3.089 3.259 3.413 3.57 3.762 3.986 4.19 4.422 4.686 4.95 5.209 5.511 5.885 6.239 6.633 7.087 7.598 8.123 8.725 9.407 10.156 10.612 10.767 10.784 10.706 10.59 10.454 10.32 10.177 9.984 9.793 9.621 9.465 9.321 9.158 8.997 8.837 8.689 8.566 8.422 8.264 8.144 8.019 7.897 7.792 7.675 7.555 7.425 7.289 7.198 7.109 6.967 6.864 6.758 6.698 6.572 6.437 6.3 6.236 6.034 5.952 5.864 5.76 5.532 5.414 5.278 5.113 4.908 4.68 4.401 3.504 -3 ,19931 ,TETRA ,17606585,Sun Nov 28 20:43:06 CET,Sun Nov 28 22:33:31 CET,0.0 0.322 0.432 0.531 0.631 0.72 0.803 0.877 1.012 1.079 1.15 1.191 1.381 1.456 1.591 1.729 1.862 1.916 2.028 2.156 2.332 2.435 2.531 2.679 2.819 2.935 3.049 3.16 3.315 3.485 3.647 3.835 4.005 4.163 4.343 4.556 4.769 5.014 5.28 5.554 5.834 6.136 6.467 6.807 7.195 7.606 8.09 8.607 9.19 9.881 10.669 11.196 11.419 11.479 11.429 11.315 11.184 11.056 10.907 10.739 10.611 10.496 10.363 10.212 10.076 9.957 9.829 9.724 9.623 9.499 9.364 9.232 9.081 8.912 8.79 8.69 8.581 8.47 8.339 8.231 8.108 7.934 7.831 7.717 7.657 7.529 7.386 7.226 7.14 6.95 6.881 6.784 6.691 6.478 6.36 6.222 6.079 5.936 5.729 5.409 4.6 -4 ,10566 ,TETRA ,17606586,Sun Nov 28 20:43:06 CET,Sun Nov 28 22:33:56 CET,0.0 0.147 0.246 0.342 0.443 0.539 0.618 0.686 0.818 0.888 0.949 0.931 1.101 1.156 1.251 1.34 1.439 1.486 1.564 1.642 1.754 1.819 1.886 1.992 2.098 2.204 2.308 2.412 2.542 2.665 2.783 2.938 3.088 3.229 3.4 3.59 3.767 3.961 4.171 4.408 4.663 4.932 5.258 5.604 6.017 6.467 6.958 7.519 8.16 8.88 9.693 10.216 10.416 10.426 10.351 10.225 10.06 9.893 9.736 9.563 9.41 9.274 9.116 8.928 8.774 8.652 8.512 8.38 8.276 8.175 8.052 7.937 7.818 7.689 7.584 7.484 7.382 7.27 7.151 7.061 6.967 6.834 6.722 6.591 6.525 6.402 6.287 6.151 6.075 5.89 5.847 5.761 5.659 5.44 5.314 5.173 5.007 4.819 4.63 4.404 3.53 -5 ,32217 ,TETRA ,17606587,Sun Nov 28 20:44:02 CET,Sun Nov 28 22:35:12 CET,0.0 0.252 0.395 0.528 0.626 0.711 0.789 0.852 0.967 1.024 1.084 1.099 1.274 1.336 1.471 1.611 1.738 1.799 1.923 2.037 2.195 2.295 2.396 2.541 2.671 2.802 2.927 3.042 3.196 3.352 3.497 3.657 3.818 3.986 4.171 4.383 4.597 4.829 5.087 5.341 5.594 5.891 6.235 6.597 7.013 7.473 7.987 8.523 9.157 9.884 10.706 11.239 11.398 11.386 11.275 11.115 10.93 10.764 10.612 10.423 10.248 10.116 9.983 9.854 9.74 9.629 9.517 9.393 9.269 9.148 9.012 8.88 8.757 8.636 8.544 8.443 8.323 8.19 8.06 7.972 7.874 7.729 7.634 7.522 7.458 7.312 7.157 7.014 6.944 6.752 6.687 6.605 6.515 6.313 6.195 6.058 5.906 5.745 5.554 5.228 4.345 -6 ,23843 ,TETRA ,17606588,Sun Nov 28 20:44:04 CET,Sun Nov 28 22:35:11 CET,0.0 0.174 0.287 0.38 0.469 0.554 0.624 0.684 0.801 0.859 0.92 0.926 1.098 1.148 1.239 1.325 1.411 1.45 1.528 1.613 1.734 1.812 1.885 1.992 2.113 2.23 2.345 2.456 2.598 2.736 2.871 3.037 3.191 3.347 3.523 3.709 3.894 4.104 4.344 4.593 4.838 5.113 5.444 5.779 6.17 6.589 7.055 7.595 8.2 8.866 9.559 9.956 10.106 10.127 10.047 9.916 9.761 9.591 9.43 9.256 9.083 8.923 8.765 8.587 8.407 8.251 8.106 7.955 7.825 7.695 7.547 7.4 7.244 7.089 6.971 6.84 6.695 6.573 6.439 6.342 6.257 6.115 6.011 5.906 5.853 5.743 5.615 5.454 5.371 5.182 5.134 5.039 4.929 4.695 4.577 4.446 4.295 4.123 3.897 3.62 2.703 -7 ,19374 ,TETRA ,17606589,Sun Nov 28 20:44:03 CET,Sun Nov 28 22:34:58 CET,0.0 0.259 0.383 0.491 0.581 0.664 0.746 0.822 0.959 1.014 1.063 1.044 1.207 1.253 1.356 1.453 1.541 1.582 1.668 1.751 1.867 1.94 2.013 2.118 2.215 2.319 2.421 2.515 2.643 2.772 2.895 3.034 3.17 3.306 3.465 3.633 3.796 3.993 4.189 4.39 4.618 4.879 5.187 5.494 5.838 6.216 6.659 7.149 7.707 8.344 9.006 9.453 9.645 9.684 9.65 9.57 9.465 9.31 9.137 8.955 8.789 8.622 8.454 8.299 8.16 8.034 7.879 7.742 7.623 7.492 7.345 7.228 7.13 7.018 6.923 6.831 6.72 6.597 6.468 6.381 6.289 6.127 6.023 5.92 5.867 5.761 5.651 5.532 5.457 5.26 5.212 5.119 5.007 4.764 4.638 4.514 4.362 4.175 3.941 3.648 2.912 -8 ,727 ,TETRA ,17606590,Sun Nov 28 20:44:03 CET,Sun Nov 28 22:35:11 CET,0.0 0.179 0.311 0.416 0.485 0.553 0.624 0.697 0.824 0.879 0.938 0.949 1.12 1.175 1.285 1.393 1.502 1.55 1.634 1.732 1.882 1.976 2.059 2.167 2.27 2.366 2.467 2.573 2.707 2.83 2.945 3.082 3.209 3.337 3.502 3.68 3.839 4.011 4.203 4.42 4.652 4.911 5.209 5.496 5.85 6.252 6.695 7.173 7.748 8.435 9.153 9.652 9.803 9.737 9.603 9.454 9.308 9.122 8.94 8.773 8.637 8.497 8.345 8.188 8.03 7.901 7.764 7.631 7.503 7.354 7.201 7.077 6.951 6.819 6.71 6.582 6.449 6.314 6.179 6.091 5.992 5.837 5.714 5.556 5.477 5.32 5.164 5.017 4.937 4.745 4.664 4.558 4.458 4.204 4.047 3.884 3.698 3.493 3.245 2.888 1.669 -9 ,10010 ,TETRA ,17606591,Sun Nov 28 20:44:03 CET,Sun Nov 28 22:31:43 CET,0.0 0.153 0.294 0.402 0.499 0.593 0.664 0.735 0.872 0.934 0.991 0.984 1.153 1.209 1.328 1.441 1.541 1.591 1.682 1.764 1.886 1.968 2.055 2.178 2.289 2.404 2.516 2.62 2.756 2.893 3.026 3.188 3.342 3.49 3.661 3.845 4.031 4.252 4.497 4.762 5.043 5.361 5.741 6.101 6.489 6.928 7.437 7.983 8.61 9.354 10.171 10.596 10.73 10.73 10.633 10.515 10.383 10.227 10.047 9.843 9.672 9.511 9.348 9.183 9.016 8.867 8.714 8.565 8.434 8.293 8.146 8.015 7.865 7.72 7.619 7.506 7.387 7.251 7.101 7.002 6.892 6.719 6.594 6.457 6.387 6.248 6.097 5.942 5.86 5.666 5.604 5.504 5.394 5.154 5.011 4.863 4.701 4.501 4.275 3.968 3.034 -10 ,24428 ,TETRA ,17606592,Sun Nov 28 20:44:03 CET,Sun Nov 28 22:34:41 CET,0.0 0.21 0.376 0.496 0.595 0.681 0.751 0.813 0.928 0.986 1.051 1.087 1.278 1.357 1.514 1.668 1.782 1.834 1.938 2.041 2.198 2.303 2.41 2.571 2.71 2.841 2.972 3.092 3.249 3.392 3.533 3.703 3.871 4.034 4.224 4.439 4.636 4.849 5.076 5.336 5.613 5.917 6.271 6.628 7.055 7.519 8.041 8.593 9.216 9.927 10.615 11.038 11.228 11.27 11.224 11.124 11.001 10.842 10.675 10.467 10.253 10.066 9.885 9.708 9.542 9.391 9.232 9.086 8.949 8.799 8.642 8.509 8.355 8.199 8.086 7.947 7.79 7.636 7.486 7.391 7.274 7.065 6.919 6.773 6.7 6.531 6.375 6.241 6.166 5.979 5.917 5.817 5.706 5.457 5.319 5.157 4.993 4.827 4.648 4.39 3.569 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_34_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_34_37.txt deleted file mode 100644 index 8365e06b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_34_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22393 ,TETRA ,17606593,Sun Nov 28 20:44:05 CET,Sun Nov 28 22:36:48 CET,0.0 1.116 1.475 1.766 2.022 2.246 2.445 2.628 2.964 3.12 3.259 3.408 3.599 3.716 3.94 4.137 4.307 4.389 4.548 4.686 4.891 5.021 5.141 5.316 5.484 5.638 5.774 5.916 6.102 6.256 6.391 6.555 6.726 6.896 7.069 7.238 7.403 7.574 7.733 7.905 8.071 8.249 8.445 8.616 8.793 8.934 9.038 9.087 9.068 8.899 8.337 7.445 6.608 5.828 5.164 4.54 3.985 3.494 3.059 2.622 2.249 1.923 1.605 1.295 1.001 0.724 0.452 0.225 0.025 -0.18 -0.405 -0.611 -0.818 -1.022 -1.181 -1.344 -1.512 -1.688 -1.867 -1.994 -2.13 -2.352 -2.498 -2.657 -2.746 -2.916 -3.091 -3.27 -3.363 -3.566 -3.704 -3.813 -3.92 -4.164 -4.317 -4.484 -4.667 -4.886 -5.177 -5.567 -7.363 -2 ,22233 ,TETRA ,17606594,Sun Nov 28 20:44:04 CET,Sun Nov 28 22:34:33 CET,0.0 1.091 1.417 1.653 1.867 2.059 2.221 2.362 2.596 2.708 2.818 2.934 3.115 3.201 3.36 3.515 3.66 3.725 3.849 3.964 4.135 4.245 4.346 4.48 4.601 4.715 4.834 4.96 5.131 5.302 5.456 5.616 5.763 5.91 6.087 6.264 6.413 6.567 6.712 6.86 7.0 7.15 7.311 7.44 7.572 7.684 7.762 7.792 7.75 7.529 6.941 6.038 5.235 4.542 3.932 3.363 2.858 2.416 2.027 1.64 1.298 0.975 0.683 0.41 0.157 -0.068 -0.311 -0.524 -0.707 -0.91 -1.123 -1.296 -1.473 -1.651 -1.788 -1.934 -2.082 -2.239 -2.405 -2.511 -2.627 -2.825 -2.96 -3.09 -3.15 -3.271 -3.424 -3.599 -3.685 -3.87 -3.978 -4.09 -4.194 -4.411 -4.532 -4.677 -4.844 -5.007 -5.177 -5.4 -6.096 -3 ,21393 ,TETRA ,17606595,Sun Nov 28 20:44:04 CET,Sun Nov 28 22:36:21 CET,0.0 1.124 1.471 1.727 1.957 2.146 2.303 2.447 2.718 2.838 2.944 3.07 3.253 3.337 3.503 3.659 3.8 3.868 3.99 4.102 4.267 4.369 4.468 4.611 4.745 4.872 4.986 5.095 5.238 5.378 5.513 5.675 5.827 5.973 6.14 6.314 6.478 6.673 6.882 7.089 7.291 7.489 7.687 7.843 7.975 8.115 8.267 8.38 8.355 8.113 7.533 6.643 5.783 5.012 4.338 3.722 3.193 2.703 2.268 1.835 1.461 1.111 0.767 0.466 0.206 -0.041 -0.307 -0.546 -0.764 -0.998 -1.249 -1.459 -1.681 -1.908 -2.074 -2.251 -2.429 -2.626 -2.84 -2.972 -3.108 -3.328 -3.484 -3.651 -3.738 -3.927 -4.113 -4.296 -4.398 -4.597 -4.711 -4.83 -4.968 -5.266 -5.421 -5.573 -5.757 -5.945 -6.138 -6.422 -7.254 -4 ,4124 ,TETRA ,17606596,Sun Nov 28 20:44:04 CET,Sun Nov 28 22:36:37 CET,0.0 1.393 1.777 2.04 2.253 2.436 2.594 2.743 3.016 3.144 3.279 3.453 3.642 3.751 3.956 4.127 4.302 4.386 4.542 4.692 4.894 5.023 5.155 5.345 5.511 5.658 5.788 5.915 6.093 6.256 6.402 6.566 6.726 6.889 7.054 7.206 7.368 7.547 7.718 7.899 8.089 8.271 8.449 8.637 8.85 9.032 9.177 9.257 9.238 9.094 8.537 7.601 6.727 5.957 5.322 4.733 4.203 3.713 3.291 2.879 2.53 2.193 1.881 1.594 1.3 1.049 0.811 0.606 0.425 0.237 0.045 -0.117 -0.287 -0.471 -0.616 -0.76 -0.907 -1.067 -1.234 -1.344 -1.457 -1.636 -1.768 -1.906 -1.973 -2.112 -2.265 -2.433 -2.518 -2.695 -2.779 -2.88 -2.987 -3.222 -3.35 -3.474 -3.611 -3.777 -3.974 -4.252 -5.024 -5 ,13718 ,TETRA ,17606597,Sun Nov 28 20:44:06 CET,Sun Nov 28 22:36:34 CET,0.0 1.304 1.649 1.894 2.106 2.281 2.441 2.597 2.846 2.954 3.063 3.177 3.352 3.433 3.605 3.76 3.889 3.957 4.091 4.21 4.382 4.495 4.6 4.755 4.918 5.059 5.187 5.325 5.499 5.649 5.802 5.982 6.145 6.299 6.459 6.623 6.779 6.945 7.114 7.296 7.5 7.718 7.911 8.098 8.307 8.465 8.602 8.706 8.697 8.521 8.008 7.136 6.285 5.521 4.852 4.229 3.675 3.185 2.764 2.364 2.018 1.687 1.388 1.103 0.823 0.572 0.301 0.059 -0.136 -0.348 -0.582 -0.772 -0.948 -1.139 -1.295 -1.442 -1.603 -1.781 -1.963 -2.078 -2.199 -2.417 -2.567 -2.715 -2.795 -2.951 -3.119 -3.325 -3.433 -3.641 -3.779 -3.89 -4.001 -4.248 -4.384 -4.523 -4.662 -4.82 -5.058 -5.401 -6.223 -6 ,1767 ,TETRA ,17606598,Sun Nov 28 20:45:04 CET,Sun Nov 28 22:41:36 CET,0.0 1.15 1.501 1.772 1.998 2.191 2.366 2.523 2.784 2.9 3.008 3.114 3.295 3.383 3.547 3.698 3.831 3.895 4.017 4.128 4.281 4.388 4.503 4.678 4.855 5.015 5.158 5.284 5.439 5.594 5.746 5.915 6.059 6.197 6.363 6.533 6.686 6.855 7.04 7.241 7.422 7.598 7.786 7.96 8.159 8.33 8.466 8.555 8.527 8.272 7.677 6.866 6.105 5.357 4.668 4.087 3.573 3.089 2.662 2.237 1.875 1.542 1.217 0.907 0.623 0.369 0.102 -0.13 -0.329 -0.542 -0.755 -0.935 -1.128 -1.327 -1.482 -1.649 -1.828 -2.009 -2.191 -2.317 -2.455 -2.695 -2.852 -2.993 -3.068 -3.249 -3.461 -3.663 -3.757 -3.949 -4.044 -4.147 -4.256 -4.472 -4.606 -4.774 -4.941 -5.103 -5.299 -5.588 -6.387 -7 ,15777 ,TETRA ,17606599,Sun Nov 28 20:45:03 CET,Sun Nov 28 22:37:34 CET,0.0 1.693 2.098 2.39 2.596 2.771 2.926 3.06 3.305 3.423 3.533 3.643 3.828 3.919 4.089 4.247 4.387 4.452 4.573 4.687 4.861 4.971 5.077 5.232 5.367 5.493 5.612 5.73 5.88 6.015 6.143 6.295 6.436 6.566 6.706 6.855 7.003 7.155 7.298 7.446 7.597 7.738 7.882 8.008 8.131 8.272 8.381 8.426 8.43 8.225 7.626 6.748 5.884 5.097 4.389 3.77 3.247 2.737 2.283 1.842 1.484 1.151 0.822 0.53 0.26 -0.007 -0.273 -0.496 -0.698 -0.907 -1.114 -1.275 -1.443 -1.629 -1.773 -1.916 -2.067 -2.232 -2.403 -2.514 -2.624 -2.806 -2.932 -3.06 -3.127 -3.266 -3.424 -3.598 -3.684 -3.865 -3.943 -4.038 -4.139 -4.342 -4.453 -4.577 -4.721 -4.943 -5.198 -5.516 -6.332 -8 ,8624 ,TETRA ,17606600,Sun Nov 28 20:45:04 CET,Sun Nov 28 22:37:24 CET,0.0 1.359 1.757 2.019 2.253 2.454 2.632 2.791 3.087 3.219 3.333 3.444 3.617 3.699 3.849 3.994 4.141 4.21 4.328 4.451 4.638 4.748 4.844 4.977 5.105 5.234 5.363 5.473 5.614 5.748 5.869 6.019 6.168 6.314 6.474 6.64 6.789 6.938 7.093 7.245 7.401 7.569 7.733 7.868 8.0 8.111 8.198 8.266 8.243 8.003 7.396 6.504 5.683 4.977 4.377 3.834 3.364 2.923 2.526 2.128 1.777 1.454 1.132 0.845 0.599 0.36 0.102 -0.119 -0.312 -0.51 -0.708 -0.89 -1.089 -1.295 -1.457 -1.626 -1.806 -1.984 -2.154 -2.275 -2.395 -2.59 -2.726 -2.866 -2.934 -3.066 -3.223 -3.408 -3.504 -3.69 -3.766 -3.855 -3.952 -4.19 -4.344 -4.499 -4.645 -4.849 -5.133 -5.469 -7.158 -9 ,989 ,TETRA ,17606601,Sun Nov 28 20:45:04 CET,Sun Nov 28 22:35:36 CET,0.0 1.339 1.744 2.041 2.267 2.455 2.609 2.748 3.002 3.123 3.244 3.374 3.557 3.654 3.84 4.015 4.179 4.254 4.383 4.513 4.701 4.812 4.913 5.066 5.21 5.336 5.463 5.6 5.783 5.952 6.099 6.271 6.429 6.564 6.719 6.891 7.045 7.209 7.377 7.544 7.713 7.901 8.11 8.305 8.501 8.665 8.801 8.861 8.86 8.676 8.034 7.125 6.305 5.589 4.936 4.299 3.744 3.259 2.832 2.388 2.004 1.669 1.345 1.043 0.773 0.523 0.263 0.031 -0.175 -0.393 -0.616 -0.802 -0.987 -1.184 -1.336 -1.496 -1.673 -1.847 -2.03 -2.159 -2.295 -2.504 -2.647 -2.797 -2.875 -3.048 -3.244 -3.458 -3.563 -3.752 -3.851 -3.958 -4.075 -4.316 -4.442 -4.577 -4.74 -4.927 -5.122 -5.37 -6.167 -10 ,15228 ,TETRA ,17606602,Sun Nov 28 20:45:04 CET,Sun Nov 28 22:38:23 CET,0.0 1.384 1.781 2.069 2.317 2.518 2.682 2.84 3.104 3.231 3.355 3.478 3.658 3.753 3.931 4.088 4.239 4.31 4.44 4.561 4.727 4.84 4.954 5.108 5.243 5.386 5.536 5.685 5.862 6.007 6.147 6.299 6.435 6.566 6.72 6.895 7.049 7.21 7.378 7.555 7.725 7.876 8.032 8.173 8.338 8.531 8.679 8.73 8.707 8.531 7.911 6.948 6.109 5.352 4.666 4.085 3.574 3.078 2.637 2.18 1.789 1.451 1.132 0.832 0.569 0.34 0.101 -0.101 -0.285 -0.483 -0.682 -0.85 -1.028 -1.218 -1.365 -1.512 -1.664 -1.825 -1.997 -2.121 -2.248 -2.429 -2.551 -2.684 -2.757 -2.913 -3.077 -3.253 -3.343 -3.525 -3.607 -3.705 -3.803 -4.025 -4.153 -4.288 -4.433 -4.592 -4.795 -5.153 -6.617 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_35_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_35_19.txt deleted file mode 100644 index 43bd1089..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_35_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,48 ,KEBNE ,17076620,Sat Dec 25 00:32:32 CET,Sat Dec 25 02:06:23 CET,0.0 0.349 0.587 0.736 0.845 0.953 1.063 1.16 1.316 1.38 1.45 1.49 1.633 1.684 1.783 1.88 1.963 2.007 2.098 2.17 2.274 2.337 2.394 2.481 2.558 2.633 2.712 2.782 2.864 2.937 3.004 3.077 3.157 3.237 3.325 3.419 3.49 3.568 3.64 3.704 3.746 3.773 3.815 3.84 3.831 3.786 3.667 3.401 2.904 2.068 0.508 -1.518 -3.175 -4.525 -5.628 -6.588 -7.424 -8.196 -8.879 -9.541 -10.112 -10.616 -11.068 -11.498 -11.91 -12.288 -12.674 -13.0 -13.286 -13.599 -13.93 -14.202 -14.479 -14.78 -15.014 -15.257 -15.512 -15.774 -16.036 -16.217 -16.414 -16.717 -16.912 -17.108 -17.208 -17.411 -17.628 -17.86 -17.977 -18.205 -18.38 -18.532 -18.674 -18.987 -19.176 -19.362 -19.568 -19.819 -20.143 -20.637 -22.242 -2 ,10235 ,KEBNE ,17076621,Sat Dec 25 00:32:32 CET,Sat Dec 25 02:02:38 CET,0.0 0.192 0.332 0.425 0.503 0.577 0.643 0.702 0.807 0.86 0.912 0.915 1.059 1.103 1.179 1.241 1.305 1.337 1.394 1.456 1.557 1.607 1.651 1.719 1.776 1.834 1.889 1.932 1.991 2.051 2.112 2.185 2.246 2.294 2.352 2.403 2.441 2.491 2.543 2.588 2.629 2.653 2.643 2.62 2.594 2.577 2.462 2.165 1.739 1.016 -0.419 -2.265 -3.872 -5.241 -6.393 -7.396 -8.261 -9.049 -9.714 -10.355 -10.916 -11.435 -11.911 -12.346 -12.738 -13.099 -13.489 -13.826 -14.121 -14.438 -14.756 -15.016 -15.289 -15.581 -15.806 -16.04 -16.281 -16.52 -16.773 -16.958 -17.144 -17.431 -17.638 -17.852 -17.963 -18.177 -18.398 -18.66 -18.798 -19.044 -19.239 -19.401 -19.558 -19.9 -20.092 -20.295 -20.536 -20.818 -21.188 -21.737 -23.041 -3 ,5113 ,KEBNE ,17074301,Sat Dec 25 00:27:17 CET,Sat Dec 25 02:03:57 CET,0.0 0.242 0.342 0.45 0.556 0.632 0.692 0.752 0.854 0.895 0.941 0.937 1.068 1.104 1.17 1.24 1.302 1.333 1.401 1.473 1.596 1.67 1.729 1.815 1.89 1.968 2.049 2.116 2.195 2.263 2.32 2.39 2.454 2.524 2.601 2.668 2.733 2.811 2.887 2.956 3.012 3.049 3.07 3.083 3.065 3.018 2.911 2.641 2.152 1.337 -0.142 -1.941 -3.464 -4.775 -5.9 -6.905 -7.753 -8.508 -9.136 -9.767 -10.33 -10.834 -11.315 -11.754 -12.162 -12.54 -12.921 -13.269 -13.576 -13.9 -14.238 -14.513 -14.805 -15.112 -15.346 -15.57 -15.788 -16.024 -16.295 -16.479 -16.656 -16.934 -17.145 -17.375 -17.488 -17.73 -17.986 -18.231 -18.354 -18.597 -18.783 -18.92 -19.059 -19.413 -19.621 -19.844 -20.088 -20.353 -20.67 -21.105 -22.343 -4 ,20171 ,KEBNE ,17074302,Sat Dec 25 00:27:17 CET,Sat Dec 25 02:04:45 CET,0.0 0.13 0.242 0.33 0.4 0.467 0.529 0.584 0.689 0.734 0.784 0.773 0.9 0.937 1.005 1.063 1.119 1.144 1.194 1.256 1.347 1.397 1.442 1.508 1.574 1.635 1.695 1.746 1.806 1.866 1.927 2.004 2.064 2.108 2.16 2.207 2.251 2.314 2.372 2.419 2.458 2.476 2.472 2.447 2.393 2.281 2.044 1.715 1.291 0.597 -0.847 -2.718 -4.182 -5.456 -6.565 -7.511 -8.334 -9.075 -9.722 -10.371 -10.908 -11.381 -11.859 -12.311 -12.72 -13.1 -13.501 -13.886 -14.212 -14.53 -14.871 -15.157 -15.463 -15.777 -16.005 -16.236 -16.483 -16.751 -17.02 -17.201 -17.393 -17.702 -17.921 -18.137 -18.247 -18.475 -18.722 -18.989 -19.121 -19.361 -19.554 -19.719 -19.885 -20.238 -20.419 -20.63 -20.872 -21.144 -21.472 -21.887 -23.252 -5 ,23545 ,KEBNE ,17076624,Sat Dec 25 00:35:45 CET,Sat Dec 25 02:03:56 CET,0.0 0.255 0.371 0.494 0.581 0.648 0.71 0.766 0.867 0.912 0.958 0.949 1.082 1.122 1.193 1.25 1.301 1.326 1.385 1.454 1.553 1.607 1.657 1.725 1.794 1.854 1.91 1.981 2.073 2.154 2.227 2.308 2.392 2.476 2.565 2.641 2.711 2.78 2.855 2.928 2.973 2.997 2.988 2.984 2.968 2.876 2.677 2.35 1.866 1.03 -0.568 -2.511 -4.104 -5.475 -6.649 -7.699 -8.632 -9.455 -10.142 -10.833 -11.42 -11.924 -12.397 -12.856 -13.297 -13.683 -14.076 -14.43 -14.752 -15.094 -15.429 -15.714 -16.013 -16.315 -16.551 -16.8 -17.052 -17.3 -17.557 -17.745 -17.943 -18.264 -18.495 -18.721 -18.838 -19.093 -19.36 -19.632 -19.771 -20.026 -20.221 -20.385 -20.567 -20.938 -21.134 -21.36 -21.608 -21.893 -22.223 -22.616 -23.925 -6 ,22757 ,KEBNE ,17076625,Sat Dec 25 00:35:45 CET,Sat Dec 25 02:03:48 CET,0.0 0.159 0.232 0.314 0.39 0.484 0.582 0.667 0.802 0.861 0.914 0.908 1.047 1.089 1.16 1.22 1.275 1.303 1.359 1.413 1.483 1.532 1.585 1.67 1.75 1.821 1.887 1.942 2.012 2.08 2.149 2.232 2.306 2.371 2.438 2.487 2.523 2.567 2.603 2.63 2.664 2.712 2.727 2.685 2.603 2.496 2.297 1.975 1.485 0.667 -0.832 -2.773 -4.439 -5.827 -7.032 -8.108 -8.996 -9.772 -10.429 -11.077 -11.643 -12.175 -12.692 -13.164 -13.578 -13.95 -14.364 -14.749 -15.061 -15.37 -15.711 -15.996 -16.277 -16.549 -16.761 -16.992 -17.235 -17.476 -17.718 -17.889 -18.077 -18.375 -18.573 -18.777 -18.887 -19.12 -19.354 -19.594 -19.727 -19.98 -20.159 -20.309 -20.464 -20.794 -20.977 -21.186 -21.433 -21.696 -22.011 -22.431 -23.65 -7 ,10264 ,KEBNE ,17074307,Sat Dec 25 00:27:17 CET,Sat Dec 25 02:03:42 CET,0.0 0.273 0.399 0.491 0.57 0.636 0.699 0.753 0.857 0.903 0.954 0.956 1.09 1.124 1.177 1.235 1.295 1.324 1.385 1.44 1.52 1.573 1.628 1.713 1.791 1.865 1.946 2.017 2.096 2.183 2.266 2.362 2.454 2.528 2.598 2.673 2.739 2.815 2.889 2.943 2.993 3.049 3.097 3.137 3.122 3.03 2.875 2.591 2.05 1.168 -0.317 -2.185 -3.754 -5.064 -6.157 -7.126 -7.958 -8.73 -9.388 -10.033 -10.589 -11.078 -11.532 -11.953 -12.327 -12.642 -12.98 -13.295 -13.576 -13.879 -14.182 -14.423 -14.668 -14.925 -15.128 -15.335 -15.559 -15.791 -16.035 -16.209 -16.384 -16.648 -16.832 -17.029 -17.129 -17.333 -17.581 -17.843 -17.965 -18.21 -18.419 -18.592 -18.778 -19.169 -19.359 -19.567 -19.803 -20.065 -20.366 -20.792 -22.107 -8 ,22274 ,KEBNE ,17076627,Sat Dec 25 00:55:50 CET,Sat Dec 25 02:05:56 CET,0.0 0.181 0.272 0.356 0.433 0.489 0.547 0.598 0.687 0.733 0.776 0.749 0.877 0.916 0.995 1.068 1.129 1.16 1.228 1.293 1.393 1.459 1.521 1.601 1.676 1.766 1.847 1.906 1.988 2.073 2.145 2.23 2.311 2.385 2.464 2.533 2.603 2.686 2.764 2.836 2.906 2.977 3.035 3.08 3.072 2.979 2.827 2.545 2.085 1.291 -0.174 -1.897 -3.386 -4.711 -5.818 -6.764 -7.602 -8.377 -9.064 -9.732 -10.313 -10.832 -11.309 -11.78 -12.235 -12.638 -13.032 -13.387 -13.706 -14.038 -14.378 -14.651 -14.929 -15.225 -15.455 -15.703 -15.964 -16.229 -16.503 -16.699 -16.891 -17.166 -17.362 -17.571 -17.673 -17.867 -18.1 -18.359 -18.482 -18.717 -18.905 -19.058 -19.207 -19.526 -19.703 -19.902 -20.159 -20.452 -20.785 -21.245 -23.081 -9 ,15064 ,KEBNE ,17076628,Sat Dec 25 00:55:50 CET,Sat Dec 25 02:05:41 CET,0.0 0.209 0.301 0.382 0.456 0.538 0.607 0.663 0.769 0.822 0.872 0.865 1.002 1.038 1.105 1.165 1.239 1.285 1.377 1.468 1.58 1.65 1.722 1.823 1.903 1.981 2.058 2.135 2.24 2.329 2.409 2.501 2.58 2.657 2.729 2.798 2.858 2.923 2.992 3.057 3.116 3.174 3.224 3.234 3.204 3.114 2.908 2.576 2.055 1.17 -0.464 -2.521 -4.102 -5.365 -6.467 -7.477 -8.367 -9.149 -9.816 -10.487 -11.038 -11.536 -12.007 -12.434 -12.834 -13.204 -13.583 -13.925 -14.223 -14.532 -14.863 -15.129 -15.395 -15.688 -15.918 -16.15 -16.387 -16.621 -16.868 -17.047 -17.233 -17.505 -17.687 -17.869 -17.965 -18.173 -18.401 -18.645 -18.775 -19.022 -19.206 -19.365 -19.531 -19.879 -20.062 -20.296 -20.557 -20.829 -21.168 -21.639 -22.78 -10 ,10998 ,KEBNE ,17074312,Sat Dec 25 00:28:22 CET,Sat Dec 25 02:04:37 CET,0.0 0.214 0.309 0.369 0.419 0.485 0.551 0.608 0.714 0.762 0.807 0.791 0.928 0.966 1.023 1.08 1.135 1.16 1.221 1.28 1.357 1.414 1.463 1.54 1.616 1.677 1.738 1.795 1.863 1.923 1.982 2.059 2.133 2.194 2.251 2.313 2.381 2.454 2.528 2.583 2.598 2.613 2.647 2.666 2.638 2.539 2.362 2.07 1.586 0.793 -0.587 -2.346 -3.835 -5.107 -6.177 -7.086 -7.891 -8.628 -9.263 -9.927 -10.488 -10.969 -11.414 -11.852 -12.272 -12.643 -13.032 -13.376 -13.669 -13.987 -14.332 -14.606 -14.878 -15.161 -15.384 -15.617 -15.847 -16.085 -16.351 -16.537 -16.72 -17.012 -17.222 -17.421 -17.519 -17.721 -17.921 -18.145 -18.271 -18.503 -18.654 -18.796 -18.952 -19.29 -19.472 -19.675 -19.901 -20.157 -20.474 -20.857 -22.416 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_35_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_35_44.txt deleted file mode 100644 index 03a7affb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_35_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2345 ,KEBNE ,17027706,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:20:46 CET,0.0 0.987 1.281 1.49 1.68 1.87 2.052 2.208 2.476 2.604 2.724 2.848 3.05 3.153 3.364 3.57 3.752 3.848 4.034 4.2 4.454 4.623 4.788 5.019 5.236 5.453 5.668 5.882 6.154 6.416 6.669 6.987 7.305 7.61 7.962 8.344 8.709 9.101 9.509 9.947 10.398 10.908 11.513 12.127 12.837 13.615 14.509 15.532 16.664 17.845 19.083 19.758 19.86 19.721 19.516 19.24 18.903 18.558 18.223 17.856 17.54 17.252 16.915 16.565 16.281 16.05 15.803 15.557 15.334 15.087 14.818 14.603 14.375 14.124 13.924 13.719 13.496 13.274 13.05 12.889 12.726 12.458 12.267 12.062 11.946 11.711 11.475 11.215 11.068 10.844 10.629 10.455 10.276 9.887 9.662 9.406 9.133 8.825 8.423 7.79 5.338 -2 ,1738 ,KEBNE ,17027707,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:19:53 CET,0.0 0.762 1.033 1.234 1.409 1.571 1.722 1.869 2.142 2.264 2.386 2.5 2.693 2.797 2.994 3.19 3.382 3.475 3.656 3.824 4.06 4.207 4.354 4.578 4.793 4.989 5.17 5.36 5.62 5.865 6.088 6.374 6.678 6.968 7.288 7.627 7.952 8.325 8.74 9.184 9.651 10.15 10.692 11.243 11.897 12.607 13.42 14.376 15.39 16.458 17.646 18.274 18.374 18.212 17.946 17.649 17.355 17.003 16.635 16.244 15.88 15.575 15.298 15.034 14.79 14.545 14.275 14.026 13.794 13.534 13.27 13.062 12.838 12.608 12.422 12.215 12.003 11.782 11.558 11.405 11.233 10.979 10.802 10.614 10.517 10.292 10.031 9.744 9.593 9.367 9.126 8.96 8.792 8.449 8.249 8.002 7.712 7.313 6.839 6.201 3.34 -3 ,24650 ,KEBNE ,17027708,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:20:34 CET,0.0 1.158 1.523 1.786 2.007 2.204 2.369 2.524 2.814 2.954 3.081 3.228 3.442 3.565 3.797 4.012 4.21 4.297 4.463 4.628 4.877 5.042 5.192 5.412 5.642 5.864 6.06 6.24 6.485 6.732 6.957 7.229 7.496 7.76 8.079 8.42 8.77 9.179 9.594 10.059 10.592 11.134 11.737 12.364 13.072 13.847 14.746 15.757 16.902 18.129 19.33 20.062 20.289 20.182 19.929 19.622 19.303 18.958 18.658 18.369 18.082 17.798 17.501 17.196 16.906 16.645 16.378 16.122 15.903 15.675 15.418 15.208 14.99 14.749 14.56 14.376 14.189 13.981 13.762 13.61 13.439 13.169 12.983 12.779 12.675 12.461 12.219 11.962 11.821 11.586 11.34 11.182 11.012 10.572 10.319 10.057 9.805 9.481 9.018 8.374 5.686 -4 ,7745 ,KEBNE ,17027709,Wed Dec 22 17:44:11 CET,Wed Dec 22 19:19:32 CET,0.0 0.67 0.99 1.244 1.455 1.642 1.815 1.981 2.268 2.409 2.543 2.682 2.886 2.992 3.196 3.402 3.598 3.688 3.856 4.018 4.279 4.446 4.599 4.83 5.049 5.254 5.467 5.68 5.945 6.206 6.468 6.771 7.048 7.318 7.632 7.972 8.286 8.642 9.067 9.525 10.009 10.546 11.118 11.706 12.399 13.145 14.031 15.013 16.081 17.238 18.482 19.26 19.48 19.433 19.241 19.002 18.734 18.456 18.212 17.912 17.617 17.346 17.092 16.833 16.549 16.291 16.024 15.763 15.523 15.282 15.04 14.835 14.616 14.392 14.227 14.053 13.869 13.67 13.451 13.304 13.147 12.883 12.689 12.484 12.379 12.165 11.944 11.713 11.59 11.376 11.139 10.978 10.813 10.398 10.158 9.892 9.597 9.271 8.867 8.324 5.767 -5 ,18449 ,KEBNE ,17027710,Wed Dec 22 17:44:09 CET,Wed Dec 22 19:20:13 CET,0.0 1.177 1.517 1.798 2.039 2.221 2.376 2.519 2.78 2.9 3.023 3.159 3.362 3.482 3.709 3.914 4.107 4.198 4.392 4.587 4.866 5.037 5.193 5.424 5.639 5.848 6.057 6.259 6.531 6.78 7.013 7.304 7.578 7.839 8.154 8.519 8.89 9.282 9.678 10.093 10.534 11.04 11.601 12.151 12.817 13.534 14.324 15.266 16.454 17.795 19.034 19.65 19.742 19.632 19.429 19.147 18.874 18.605 18.318 18.011 17.709 17.442 17.209 16.937 16.637 16.37 16.081 15.819 15.603 15.373 15.129 14.913 14.688 14.436 14.219 13.987 13.762 13.536 13.291 13.124 12.943 12.65 12.446 12.23 12.113 11.871 11.644 11.391 11.247 11.02 10.759 10.58 10.407 9.993 9.741 9.481 9.171 8.821 8.397 7.802 5.377 -6 ,2891 ,KEBNE ,17027711,Wed Dec 22 17:44:10 CET,Wed Dec 22 19:22:10 CET,0.0 1.042 1.37 1.629 1.837 2.019 2.184 2.332 2.606 2.739 2.867 2.99 3.191 3.302 3.522 3.734 3.923 4.021 4.209 4.383 4.631 4.789 4.946 5.182 5.394 5.593 5.801 6.003 6.249 6.49 6.73 7.019 7.303 7.578 7.879 8.219 8.569 8.952 9.343 9.784 10.279 10.825 11.439 12.032 12.69 13.414 14.258 15.241 16.288 17.409 18.584 19.236 19.405 19.259 18.983 18.644 18.299 17.984 17.663 17.272 16.928 16.637 16.368 16.105 15.851 15.611 15.357 15.116 14.897 14.664 14.418 14.215 14.001 13.751 13.545 13.36 13.165 12.95 12.728 12.56 12.39 12.127 11.937 11.746 11.647 11.423 11.187 10.948 10.822 10.603 10.35 10.167 9.98 9.549 9.302 9.048 8.766 8.412 7.991 7.368 4.578 -7 ,13112 ,KEBNE ,17027712,Wed Dec 22 17:45:11 CET,Wed Dec 22 19:21:07 CET,0.0 0.581 0.85 1.047 1.228 1.394 1.55 1.687 1.947 2.078 2.2 2.329 2.519 2.618 2.814 3.005 3.193 3.287 3.465 3.63 3.872 4.027 4.183 4.401 4.597 4.795 4.994 5.182 5.433 5.69 5.924 6.204 6.48 6.76 7.078 7.418 7.767 8.149 8.547 8.961 9.412 9.925 10.541 11.153 11.846 12.646 13.503 14.392 15.407 16.573 17.825 18.588 18.839 18.751 18.523 18.274 18.012 17.709 17.384 17.054 16.733 16.386 16.058 15.795 15.572 15.36 15.114 14.86 14.631 14.396 14.136 13.924 13.715 13.481 13.281 13.078 12.869 12.65 12.415 12.248 12.081 11.807 11.608 11.402 11.296 11.066 10.814 10.559 10.43 10.219 10.018 9.859 9.688 9.308 9.076 8.807 8.493 8.13 7.717 7.146 4.833 -8 ,14496 ,KEBNE ,17027713,Wed Dec 22 17:45:11 CET,Wed Dec 22 19:22:27 CET,0.0 1.017 1.388 1.686 1.918 2.097 2.262 2.435 2.737 2.87 3.007 3.179 3.389 3.5 3.713 3.912 4.104 4.206 4.407 4.588 4.842 5.006 5.164 5.392 5.618 5.832 6.032 6.226 6.467 6.696 6.921 7.212 7.524 7.836 8.204 8.624 8.992 9.358 9.758 10.165 10.591 11.095 11.705 12.311 13.028 13.901 14.871 15.87 16.982 18.132 19.286 20.035 20.23 20.089 19.85 19.598 19.34 19.071 18.787 18.47 18.18 17.923 17.668 17.395 17.109 16.848 16.597 16.351 16.142 15.943 15.726 15.545 15.356 15.131 14.947 14.763 14.571 14.37 14.14 13.981 13.816 13.554 13.371 13.152 13.035 12.804 12.55 12.265 12.12 11.906 11.688 11.522 11.34 10.909 10.657 10.405 10.123 9.73 9.22 8.606 6.223 -9 ,31137 ,KEBNE ,17027714,Wed Dec 22 17:45:10 CET,Wed Dec 22 19:20:38 CET,0.0 0.603 0.825 1.027 1.217 1.38 1.518 1.659 1.929 2.048 2.163 2.299 2.507 2.619 2.84 3.048 3.235 3.328 3.523 3.709 3.974 4.134 4.284 4.508 4.723 4.921 5.107 5.298 5.541 5.776 6.0 6.264 6.516 6.762 7.071 7.406 7.718 8.086 8.498 8.941 9.42 9.936 10.544 11.162 11.863 12.647 13.549 14.564 15.654 16.839 18.063 18.814 19.043 19.002 18.808 18.527 18.249 17.997 17.75 17.44 17.129 16.832 16.553 16.302 16.044 15.778 15.524 15.297 15.078 14.86 14.647 14.457 14.248 14.019 13.838 13.649 13.458 13.25 13.02 12.872 12.712 12.456 12.283 12.091 11.986 11.764 11.528 11.283 11.154 10.933 10.692 10.518 10.344 9.955 9.726 9.475 9.207 8.863 8.399 7.679 5.523 -10 ,13942 ,KEBNE ,17027715,Wed Dec 22 17:45:11 CET,Wed Dec 22 19:22:06 CET,0.0 1.122 1.476 1.749 1.948 2.14 2.324 2.495 2.786 2.917 3.046 3.193 3.405 3.518 3.733 3.941 4.121 4.206 4.382 4.555 4.799 4.95 5.097 5.322 5.558 5.785 5.98 6.167 6.418 6.658 6.888 7.159 7.412 7.668 7.997 8.358 8.683 9.042 9.432 9.862 10.365 10.917 11.522 12.157 12.85 13.573 14.445 15.469 16.545 17.677 18.883 19.467 19.507 19.383 19.129 18.831 18.574 18.337 18.068 17.734 17.433 17.166 16.906 16.647 16.4 16.178 15.918 15.642 15.402 15.153 14.9 14.694 14.464 14.218 14.035 13.849 13.655 13.455 13.238 13.079 12.916 12.648 12.451 12.228 12.113 11.895 11.662 11.42 11.294 11.065 10.788 10.612 10.435 9.998 9.754 9.476 9.138 8.753 8.323 7.738 3.701 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_36_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_36_35.txt deleted file mode 100644 index 3b5bca11..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_36_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2328 ,TETRA ,17606603,Sun Nov 28 20:45:05 CET,Sun Nov 28 22:37:40 CET,0.0 0.608 0.836 1.029 1.186 1.322 1.459 1.588 1.813 1.92 2.026 2.121 2.297 2.389 2.572 2.735 2.9 2.982 3.137 3.279 3.5 3.644 3.782 3.984 4.169 4.339 4.512 4.689 4.887 5.064 5.23 5.429 5.628 5.809 6.015 6.258 6.473 6.705 6.981 7.253 7.533 7.889 8.315 8.711 9.159 9.658 10.146 10.598 11.093 11.545 11.718 11.611 11.42 11.133 10.766 10.324 9.851 9.41 9.054 8.649 8.284 7.955 7.602 7.281 6.981 6.69 6.374 6.091 5.853 5.589 5.316 5.092 4.86 4.607 4.412 4.212 3.98 3.745 3.52 3.351 3.182 2.943 2.749 2.535 2.429 2.214 2.003 1.778 1.653 1.435 1.272 1.128 0.985 0.666 0.482 0.277 0.078 -0.155 -0.463 -0.851 -2.199 -2 ,19265 ,TETRA ,17606604,Sun Nov 28 20:45:07 CET,Sun Nov 28 22:37:28 CET,0.0 0.667 0.911 1.12 1.289 1.443 1.586 1.71 1.95 2.06 2.169 2.286 2.465 2.55 2.73 2.907 3.072 3.149 3.284 3.417 3.599 3.699 3.793 3.95 4.109 4.259 4.396 4.528 4.715 4.891 5.055 5.249 5.443 5.637 5.88 6.154 6.41 6.687 6.956 7.25 7.565 7.898 8.286 8.668 9.105 9.575 10.072 10.57 11.11 11.668 12.061 12.129 11.888 11.466 11.019 10.527 10.084 9.668 9.262 8.844 8.496 8.201 7.916 7.639 7.379 7.136 6.873 6.642 6.441 6.233 6.009 5.822 5.633 5.428 5.27 5.11 4.937 4.748 4.558 4.425 4.278 4.044 3.884 3.717 3.629 3.445 3.252 3.072 2.985 2.788 2.652 2.528 2.405 2.123 1.96 1.794 1.639 1.452 1.219 0.909 -0.04 -3 ,13361 ,TETRA ,17606605,Sun Nov 28 20:45:04 CET,Sun Nov 28 22:40:39 CET,0.0 0.782 1.059 1.272 1.426 1.552 1.675 1.801 2.014 2.102 2.19 2.272 2.444 2.526 2.673 2.811 2.941 3.005 3.143 3.281 3.47 3.58 3.684 3.848 4.004 4.152 4.294 4.424 4.588 4.747 4.904 5.094 5.273 5.451 5.666 5.897 6.108 6.329 6.57 6.837 7.132 7.49 7.889 8.247 8.655 9.09 9.527 10.036 10.622 11.179 11.615 11.642 11.406 11.015 10.593 10.156 9.759 9.377 9.018 8.626 8.286 7.999 7.708 7.428 7.152 6.879 6.601 6.341 6.104 5.862 5.607 5.393 5.174 4.937 4.742 4.535 4.314 4.079 3.835 3.667 3.497 3.247 3.075 2.893 2.802 2.622 2.437 2.228 2.119 1.915 1.759 1.62 1.479 1.194 1.024 0.829 0.609 0.331 -0.014 -0.479 -1.763 -4 ,24393 ,TETRA ,17606606,Sun Nov 28 20:46:04 CET,Sun Nov 28 22:41:08 CET,0.0 0.401 0.607 0.769 0.929 1.082 1.22 1.357 1.593 1.69 1.787 1.881 2.067 2.159 2.327 2.476 2.613 2.682 2.83 2.97 3.155 3.282 3.418 3.623 3.821 3.999 4.161 4.319 4.522 4.72 4.906 5.135 5.356 5.561 5.799 6.07 6.333 6.641 6.972 7.297 7.625 8.017 8.457 8.828 9.255 9.736 10.246 10.784 11.341 11.931 12.367 12.326 12.045 11.668 11.281 10.864 10.418 9.983 9.611 9.203 8.832 8.53 8.258 7.978 7.681 7.393 7.101 6.846 6.632 6.424 6.198 5.997 5.772 5.54 5.355 5.161 4.978 4.77 4.561 4.412 4.239 3.963 3.773 3.576 3.471 3.253 3.017 2.758 2.622 2.398 2.182 2.015 1.868 1.563 1.39 1.192 0.929 0.602 0.277 -0.124 -1.416 -5 ,6627 ,TETRA ,17606607,Sun Nov 28 20:45:05 CET,Sun Nov 28 22:35:13 CET,0.0 0.723 0.963 1.136 1.272 1.381 1.496 1.617 1.839 1.926 2.01 2.084 2.254 2.33 2.477 2.622 2.765 2.839 2.993 3.142 3.347 3.477 3.595 3.774 3.952 4.11 4.271 4.423 4.602 4.788 4.978 5.195 5.384 5.559 5.775 6.037 6.303 6.596 6.901 7.196 7.507 7.877 8.274 8.648 9.084 9.566 10.095 10.643 11.209 11.804 12.262 12.315 12.045 11.573 11.129 10.728 10.271 9.841 9.487 9.101 8.759 8.429 8.088 7.766 7.484 7.234 6.957 6.688 6.457 6.21 5.953 5.751 5.518 5.289 5.12 4.919 4.722 4.522 4.285 4.116 3.96 3.724 3.544 3.368 3.284 3.104 2.905 2.674 2.543 2.309 2.102 1.956 1.815 1.514 1.351 1.151 0.944 0.736 0.493 0.108 -1.497 -6 ,12661 ,TETRA ,17606608,Sun Nov 28 20:45:05 CET,Sun Nov 28 22:39:13 CET,0.0 0.754 1.017 1.205 1.391 1.546 1.675 1.807 2.047 2.156 2.258 2.344 2.523 2.608 2.771 2.929 3.084 3.16 3.305 3.447 3.66 3.792 3.919 4.109 4.286 4.436 4.574 4.716 4.914 5.118 5.297 5.516 5.739 5.942 6.159 6.395 6.616 6.852 7.11 7.395 7.706 8.077 8.498 8.91 9.388 9.858 10.343 10.901 11.516 12.112 12.501 12.506 12.282 11.838 11.36 10.944 10.585 10.191 9.752 9.315 8.974 8.664 8.347 8.059 7.791 7.529 7.263 7.017 6.781 6.542 6.3 6.086 5.859 5.624 5.437 5.248 5.048 4.824 4.602 4.453 4.296 4.053 3.884 3.709 3.621 3.43 3.208 2.965 2.834 2.608 2.42 2.266 2.098 1.736 1.525 1.287 1.033 0.749 0.439 0.023 -1.381 -7 ,825 ,TETRA ,17606609,Sun Nov 28 20:45:06 CET,Sun Nov 28 22:38:14 CET,0.0 0.59 0.844 1.025 1.166 1.29 1.414 1.542 1.786 1.898 2.008 2.124 2.302 2.387 2.558 2.713 2.861 2.929 3.066 3.202 3.396 3.531 3.645 3.79 3.936 4.078 4.219 4.365 4.542 4.703 4.865 5.061 5.255 5.455 5.684 5.94 6.197 6.471 6.755 7.047 7.337 7.637 7.961 8.308 8.741 9.203 9.724 10.258 10.817 11.382 11.784 11.802 11.54 11.174 10.818 10.431 10.02 9.633 9.28 8.908 8.566 8.258 7.969 7.681 7.42 7.157 6.84 6.557 6.315 6.068 5.807 5.584 5.363 5.137 4.959 4.775 4.588 4.386 4.182 4.052 3.9 3.667 3.505 3.33 3.246 3.067 2.881 2.697 2.606 2.408 2.247 2.122 1.995 1.7 1.55 1.386 1.194 0.964 0.719 0.374 -1.367 -8 ,16068 ,TETRA ,17606610,Sun Nov 28 20:45:06 CET,Sun Nov 28 22:37:30 CET,0.0 0.773 1.148 1.421 1.613 1.777 1.926 2.059 2.311 2.426 2.533 2.631 2.81 2.894 3.042 3.184 3.321 3.381 3.498 3.605 3.758 3.866 3.969 4.12 4.26 4.383 4.504 4.639 4.831 5.016 5.201 5.439 5.649 5.839 6.076 6.34 6.579 6.842 7.126 7.415 7.709 8.022 8.372 8.731 9.162 9.622 10.114 10.64 11.19 11.7 12.119 12.095 11.822 11.492 11.055 10.608 10.191 9.792 9.465 9.103 8.749 8.418 8.113 7.838 7.581 7.331 7.056 6.816 6.604 6.365 6.097 5.861 5.612 5.356 5.164 4.963 4.744 4.513 4.272 4.113 3.959 3.713 3.525 3.328 3.224 3.0 2.762 2.493 2.346 2.104 1.898 1.739 1.574 1.207 1.011 0.821 0.624 0.383 0.091 -0.269 -1.337 -9 ,22450 ,TETRA ,17606611,Sun Nov 28 20:45:08 CET,Sun Nov 28 22:37:43 CET,0.0 0.697 1.01 1.237 1.416 1.563 1.693 1.819 2.066 2.173 2.27 2.358 2.537 2.622 2.78 2.924 3.059 3.129 3.269 3.403 3.593 3.71 3.83 4.012 4.189 4.344 4.491 4.636 4.823 5.01 5.202 5.436 5.655 5.859 6.087 6.346 6.592 6.844 7.102 7.377 7.682 8.026 8.413 8.793 9.225 9.686 10.176 10.729 11.329 11.947 12.512 12.564 12.263 11.811 11.356 10.939 10.558 10.114 9.674 9.273 8.935 8.588 8.251 7.952 7.676 7.436 7.19 6.947 6.733 6.524 6.295 6.105 5.92 5.721 5.553 5.367 5.163 4.956 4.742 4.59 4.429 4.183 4.008 3.815 3.717 3.517 3.307 3.078 2.956 2.74 2.582 2.439 2.284 1.954 1.792 1.618 1.422 1.184 0.914 0.574 -0.965 -10 ,11925 ,TETRA ,17606612,Sun Nov 28 20:45:09 CET,Sun Nov 28 22:38:33 CET,0.0 0.529 0.782 0.964 1.109 1.23 1.341 1.44 1.61 1.691 1.774 1.843 2.014 2.083 2.218 2.353 2.483 2.541 2.665 2.793 2.966 3.072 3.179 3.34 3.484 3.629 3.784 3.921 4.09 4.262 4.427 4.625 4.807 4.974 5.196 5.458 5.698 5.963 6.254 6.575 6.881 7.21 7.597 7.965 8.375 8.827 9.319 9.815 10.345 10.816 11.147 11.106 10.86 10.546 10.156 9.703 9.235 8.824 8.473 8.087 7.754 7.463 7.192 6.95 6.693 6.425 6.138 5.9 5.703 5.481 5.251 5.063 4.869 4.667 4.498 4.313 4.113 3.902 3.673 3.516 3.369 3.127 2.935 2.735 2.634 2.425 2.187 1.939 1.826 1.61 1.434 1.298 1.164 0.86 0.675 0.486 0.3 0.083 -0.242 -0.668 -2.037 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_36_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_36_37.txt deleted file mode 100644 index 52245d00..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_36_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5949 ,TETRA ,17606613,Sun Nov 28 20:45:12 CET,Sun Nov 28 22:38:29 CET,0.0 1.333 1.715 1.979 2.211 2.415 2.589 2.746 3.013 3.126 3.249 3.394 3.581 3.67 3.845 4.005 4.154 4.228 4.363 4.484 4.666 4.785 4.897 5.045 5.192 5.335 5.461 5.587 5.756 5.902 6.035 6.196 6.358 6.506 6.669 6.856 7.023 7.193 7.374 7.574 7.79 8.041 8.309 8.532 8.766 8.998 9.204 9.362 9.477 9.45 8.961 8.111 7.315 6.577 5.926 5.274 4.664 4.14 3.684 3.239 2.857 2.504 2.175 1.875 1.58 1.282 0.98 0.711 0.475 0.259 0.025 -0.186 -0.394 -0.619 -0.82 -1.023 -1.208 -1.404 -1.617 -1.761 -1.913 -2.155 -2.317 -2.496 -2.596 -2.811 -3.046 -3.285 -3.412 -3.636 -3.788 -3.917 -4.062 -4.395 -4.581 -4.778 -5.014 -5.299 -5.605 -6.015 -7.221 -2 ,4664 ,TETRA ,17606614,Sun Nov 28 20:45:05 CET,Sun Nov 28 22:38:34 CET,0.0 1.665 2.195 2.539 2.821 3.064 3.28 3.466 3.778 3.927 4.068 4.225 4.423 4.534 4.739 4.926 5.108 5.192 5.344 5.492 5.704 5.836 5.959 6.123 6.293 6.462 6.613 6.755 6.935 7.113 7.287 7.482 7.658 7.828 8.03 8.239 8.422 8.619 8.833 9.054 9.266 9.482 9.719 9.944 10.195 10.444 10.685 10.89 10.983 10.89 10.519 9.8 9.021 8.266 7.613 7.008 6.45 5.943 5.485 5.016 4.625 4.272 3.926 3.58 3.244 2.944 2.636 2.363 2.144 1.926 1.684 1.463 1.222 0.98 0.797 0.613 0.419 0.21 -0.009 -0.161 -0.325 -0.589 -0.758 -0.916 -0.997 -1.176 -1.36 -1.544 -1.651 -1.854 -1.973 -2.08 -2.186 -2.454 -2.616 -2.791 -2.996 -3.231 -3.524 -3.883 -4.934 -3 ,7723 ,TETRA ,17606616,Sun Nov 28 20:45:07 CET,Sun Nov 28 22:38:33 CET,0.0 1.555 2.026 2.415 2.732 2.974 3.146 3.296 3.58 3.712 3.853 4.006 4.201 4.303 4.494 4.67 4.831 4.909 5.061 5.205 5.414 5.546 5.679 5.867 6.029 6.178 6.315 6.464 6.652 6.825 6.996 7.209 7.417 7.586 7.777 7.991 8.19 8.391 8.59 8.815 9.029 9.245 9.484 9.695 9.909 10.125 10.353 10.548 10.667 10.626 10.233 9.484 8.711 7.982 7.33 6.713 6.177 5.706 5.297 4.865 4.475 4.133 3.782 3.447 3.163 2.875 2.547 2.288 2.057 1.801 1.557 1.365 1.158 0.921 0.741 0.561 0.375 0.181 -0.027 -0.169 -0.313 -0.545 -0.715 -0.894 -0.987 -1.179 -1.396 -1.631 -1.75 -1.967 -2.122 -2.26 -2.412 -2.721 -2.881 -3.065 -3.302 -3.583 -3.871 -4.336 -6.511 -4 ,17639 ,TETRA ,17606617,Sun Nov 28 20:45:10 CET,Sun Nov 28 22:37:46 CET,0.0 1.226 1.661 1.952 2.17 2.37 2.545 2.698 2.97 3.09 3.196 3.311 3.499 3.595 3.781 3.95 4.114 4.194 4.345 4.479 4.671 4.796 4.915 5.092 5.258 5.406 5.554 5.696 5.876 6.049 6.212 6.393 6.559 6.719 6.895 7.087 7.265 7.465 7.699 7.942 8.15 8.36 8.606 8.826 9.053 9.305 9.554 9.723 9.847 9.783 9.285 8.415 7.599 6.912 6.304 5.699 5.156 4.669 4.238 3.807 3.415 3.037 2.658 2.337 2.057 1.785 1.509 1.272 1.064 0.826 0.583 0.399 0.218 0.022 -0.149 -0.323 -0.5 -0.685 -0.885 -1.034 -1.183 -1.397 -1.547 -1.71 -1.797 -1.981 -2.163 -2.359 -2.462 -2.659 -2.805 -2.938 -3.076 -3.385 -3.567 -3.749 -3.927 -4.129 -4.386 -4.761 -6.709 -5 ,4692 ,TETRA ,17606618,Sun Nov 28 20:45:06 CET,Sun Nov 28 22:38:16 CET,0.0 1.659 2.063 2.34 2.577 2.773 2.948 3.107 3.389 3.51 3.617 3.718 3.902 3.995 4.159 4.313 4.466 4.54 4.674 4.799 4.976 5.08 5.183 5.342 5.492 5.623 5.744 5.867 6.03 6.177 6.31 6.486 6.657 6.821 6.994 7.162 7.324 7.5 7.687 7.871 8.052 8.245 8.466 8.675 8.884 9.077 9.246 9.373 9.439 9.382 9.06 8.357 7.548 6.816 6.214 5.68 5.212 4.758 4.364 3.964 3.575 3.187 2.837 2.537 2.249 1.981 1.695 1.429 1.194 0.959 0.723 0.517 0.28 0.032 -0.151 -0.327 -0.511 -0.707 -0.919 -1.078 -1.227 -1.444 -1.62 -1.81 -1.908 -2.112 -2.329 -2.559 -2.665 -2.868 -3.03 -3.173 -3.329 -3.672 -3.866 -4.069 -4.3 -4.561 -4.852 -5.264 -6.642 -6 ,22965 ,TETRA ,17606619,Sun Nov 28 20:45:07 CET,Sun Nov 28 22:37:28 CET,0.0 1.791 2.263 2.601 2.846 3.046 3.213 3.362 3.656 3.795 3.932 4.111 4.319 4.426 4.634 4.829 5.009 5.095 5.264 5.419 5.631 5.772 5.902 6.065 6.227 6.396 6.562 6.718 6.894 7.054 7.201 7.357 7.509 7.658 7.826 8.002 8.156 8.327 8.502 8.682 8.871 9.065 9.27 9.463 9.664 9.872 10.081 10.233 10.275 10.15 9.656 8.839 8.074 7.387 6.785 6.237 5.757 5.286 4.854 4.408 4.044 3.726 3.419 3.126 2.853 2.614 2.355 2.114 1.91 1.698 1.461 1.261 1.065 0.867 0.714 0.559 0.398 0.223 0.047 -0.074 -0.202 -0.412 -0.571 -0.737 -0.822 -0.993 -1.174 -1.375 -1.48 -1.688 -1.821 -1.94 -2.071 -2.342 -2.471 -2.608 -2.798 -3.026 -3.271 -3.617 -4.697 -7 ,6817 ,TETRA ,17606620,Sun Nov 28 20:45:06 CET,Sun Nov 28 22:38:40 CET,0.0 1.291 1.664 1.945 2.2 2.41 2.578 2.739 3.046 3.18 3.302 3.452 3.651 3.745 3.929 4.101 4.262 4.34 4.496 4.649 4.872 5.005 5.121 5.275 5.412 5.543 5.677 5.81 5.973 6.13 6.284 6.46 6.622 6.776 6.958 7.168 7.36 7.55 7.756 7.968 8.149 8.344 8.575 8.812 9.062 9.29 9.506 9.632 9.624 9.507 9.119 8.377 7.623 6.908 6.246 5.618 5.046 4.535 4.098 3.66 3.27 2.917 2.552 2.199 1.873 1.585 1.301 1.022 0.774 0.54 0.285 0.064 -0.17 -0.431 -0.617 -0.795 -0.989 -1.194 -1.412 -1.561 -1.72 -1.962 -2.125 -2.313 -2.404 -2.578 -2.785 -3.02 -3.127 -3.325 -3.472 -3.61 -3.755 -4.084 -4.271 -4.467 -4.667 -4.871 -5.145 -5.509 -6.501 -8 ,30396 ,TETRA ,17606621,Sun Nov 28 20:45:09 CET,Sun Nov 28 22:38:35 CET,0.0 1.066 1.462 1.789 2.019 2.208 2.379 2.536 2.796 2.916 3.026 3.137 3.332 3.431 3.618 3.791 3.954 4.024 4.156 4.279 4.453 4.567 4.68 4.848 5.007 5.153 5.286 5.408 5.563 5.702 5.837 6.021 6.193 6.342 6.514 6.703 6.888 7.079 7.268 7.476 7.689 7.916 8.177 8.415 8.664 8.894 9.087 9.238 9.345 9.282 8.875 8.109 7.256 6.492 5.854 5.234 4.674 4.178 3.73 3.27 2.874 2.538 2.203 1.89 1.615 1.34 1.045 0.783 0.561 0.327 0.07 -0.14 -0.352 -0.569 -0.751 -0.946 -1.138 -1.335 -1.54 -1.692 -1.851 -2.08 -2.24 -2.409 -2.494 -2.672 -2.87 -3.074 -3.174 -3.374 -3.496 -3.615 -3.749 -4.023 -4.162 -4.315 -4.505 -4.778 -5.079 -5.413 -6.958 -9 ,15945 ,TETRA ,17606622,Sun Nov 28 20:46:03 CET,Sun Nov 28 22:43:18 CET,0.0 1.393 1.783 2.058 2.291 2.488 2.665 2.821 3.086 3.208 3.331 3.464 3.653 3.753 3.942 4.1 4.249 4.327 4.476 4.611 4.799 4.916 5.036 5.204 5.357 5.507 5.648 5.779 5.93 6.079 6.23 6.42 6.6 6.756 6.932 7.115 7.283 7.463 7.664 7.881 8.087 8.286 8.51 8.726 8.93 9.12 9.287 9.426 9.491 9.432 9.068 8.314 7.589 6.951 6.363 5.815 5.296 4.801 4.342 3.864 3.475 3.139 2.81 2.472 2.144 1.842 1.537 1.265 1.026 0.769 0.495 0.297 0.096 -0.146 -0.335 -0.501 -0.668 -0.861 -1.063 -1.202 -1.357 -1.602 -1.752 -1.891 -1.964 -2.133 -2.316 -2.5 -2.594 -2.797 -2.942 -3.054 -3.175 -3.471 -3.629 -3.802 -3.991 -4.182 -4.411 -4.719 -5.798 -10 ,20026 ,TETRA ,17606623,Sun Nov 28 20:46:05 CET,Sun Nov 28 22:43:07 CET,0.0 1.457 1.9 2.233 2.514 2.753 2.941 3.098 3.373 3.501 3.631 3.783 3.978 4.078 4.274 4.456 4.617 4.692 4.82 4.935 5.113 5.225 5.326 5.469 5.61 5.748 5.883 6.021 6.19 6.344 6.487 6.656 6.822 6.975 7.143 7.331 7.495 7.658 7.836 8.036 8.239 8.457 8.698 8.927 9.181 9.439 9.698 9.925 10.069 10.035 9.669 8.899 8.168 7.482 6.826 6.211 5.665 5.165 4.718 4.274 3.893 3.55 3.226 2.898 2.603 2.363 2.119 1.902 1.696 1.484 1.27 1.09 0.889 0.672 0.512 0.353 0.185 0.001 -0.191 -0.328 -0.469 -0.672 -0.818 -0.975 -1.057 -1.233 -1.443 -1.665 -1.769 -1.975 -2.11 -2.229 -2.349 -2.646 -2.806 -2.962 -3.129 -3.317 -3.557 -3.867 -4.821 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_37_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_37_19.txt deleted file mode 100644 index 20977d86..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_37_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7045 ,TETRA ,17606624,Sun Nov 28 20:46:05 CET,Sun Nov 28 22:37:12 CET,0.0 0.211 0.33 0.412 0.482 0.544 0.603 0.654 0.753 0.801 0.841 0.819 0.95 0.981 1.047 1.113 1.176 1.209 1.268 1.327 1.412 1.469 1.531 1.614 1.687 1.754 1.819 1.885 1.972 2.056 2.122 2.195 2.268 2.337 2.421 2.51 2.581 2.65 2.731 2.821 2.931 3.033 3.124 3.2 3.249 3.29 3.285 3.221 3.075 2.752 1.979 0.846 -0.167 -1.14 -1.997 -2.732 -3.396 -4.036 -4.599 -5.171 -5.656 -6.082 -6.493 -6.898 -7.293 -7.64 -7.991 -8.336 -8.643 -8.943 -9.257 -9.516 -9.786 -10.093 -10.327 -10.563 -10.821 -11.092 -11.372 -11.563 -11.773 -12.122 -12.358 -12.585 -12.708 -12.972 -13.246 -13.551 -13.717 -13.998 -14.242 -14.442 -14.656 -15.111 -15.377 -15.663 -15.978 -16.323 -16.762 -17.418 -19.586 -2 ,14366 ,TETRA ,17606625,Sun Nov 28 20:46:05 CET,Sun Nov 28 22:37:45 CET,0.0 0.196 0.304 0.375 0.437 0.516 0.592 0.65 0.767 0.827 0.874 0.858 1.003 1.046 1.119 1.186 1.257 1.295 1.359 1.416 1.494 1.538 1.581 1.644 1.717 1.792 1.853 1.906 1.975 2.041 2.106 2.177 2.24 2.307 2.394 2.488 2.557 2.626 2.712 2.794 2.869 2.953 3.041 3.119 3.18 3.218 3.241 3.182 2.967 2.585 1.827 0.767 -0.151 -0.976 -1.739 -2.467 -3.113 -3.716 -4.257 -4.789 -5.254 -5.693 -6.111 -6.507 -6.891 -7.227 -7.586 -7.905 -8.167 -8.457 -8.78 -9.057 -9.35 -9.644 -9.866 -10.107 -10.365 -10.625 -10.911 -11.1 -11.293 -11.613 -11.837 -12.076 -12.203 -12.464 -12.718 -12.99 -13.142 -13.414 -13.637 -13.82 -14.025 -14.468 -14.71 -14.973 -15.275 -15.613 -16.026 -16.605 -18.59 -3 ,6797 ,TETRA ,17606626,Sun Nov 28 20:46:07 CET,Sun Nov 28 22:37:45 CET,0.0 0.249 0.377 0.477 0.574 0.648 0.703 0.757 0.863 0.916 0.964 0.948 1.087 1.128 1.195 1.254 1.308 1.334 1.384 1.434 1.499 1.54 1.582 1.651 1.716 1.776 1.844 1.909 1.982 2.041 2.102 2.173 2.229 2.281 2.342 2.416 2.493 2.577 2.67 2.762 2.872 3.0 3.094 3.162 3.211 3.218 3.225 3.147 2.898 2.468 1.519 0.212 -0.827 -1.735 -2.561 -3.33 -4.012 -4.62 -5.137 -5.648 -6.089 -6.485 -6.881 -7.261 -7.638 -7.993 -8.354 -8.68 -8.964 -9.256 -9.547 -9.811 -10.081 -10.349 -10.575 -10.803 -11.041 -11.296 -11.546 -11.708 -11.888 -12.191 -12.399 -12.632 -12.759 -13.015 -13.268 -13.549 -13.72 -14.004 -14.234 -14.416 -14.607 -15.015 -15.239 -15.514 -15.839 -16.18 -16.598 -17.198 -19.231 -4 ,2414 ,TETRA ,17606627,Sun Nov 28 20:46:05 CET,Sun Nov 28 22:37:53 CET,0.0 0.526 0.658 0.741 0.815 0.896 0.97 1.028 1.134 1.179 1.218 1.203 1.336 1.372 1.441 1.506 1.572 1.605 1.666 1.726 1.805 1.856 1.911 1.999 2.079 2.155 2.234 2.302 2.385 2.461 2.538 2.642 2.743 2.831 2.906 2.983 3.077 3.185 3.282 3.367 3.452 3.535 3.608 3.675 3.739 3.794 3.849 3.861 3.73 3.348 2.524 1.303 0.238 -0.657 -1.463 -2.249 -2.993 -3.669 -4.241 -4.824 -5.286 -5.681 -6.086 -6.469 -6.819 -7.138 -7.476 -7.782 -8.041 -8.33 -8.641 -8.89 -9.147 -9.434 -9.656 -9.876 -10.124 -10.385 -10.653 -10.837 -11.029 -11.333 -11.555 -11.785 -11.897 -12.144 -12.415 -12.702 -12.848 -13.098 -13.28 -13.437 -13.61 -14.005 -14.233 -14.499 -14.782 -15.075 -15.45 -15.996 -18.509 -5 ,10506 ,TETRA ,17606628,Sun Nov 28 20:46:06 CET,Sun Nov 28 22:37:51 CET,0.0 0.337 0.445 0.535 0.616 0.678 0.746 0.812 0.94 0.992 1.04 1.046 1.182 1.216 1.28 1.344 1.408 1.442 1.509 1.568 1.651 1.708 1.763 1.839 1.913 1.987 2.06 2.12 2.183 2.245 2.317 2.42 2.502 2.568 2.646 2.73 2.809 2.894 2.966 3.029 3.093 3.167 3.247 3.287 3.298 3.282 3.234 3.173 2.976 2.55 1.757 0.637 -0.33 -1.196 -1.973 -2.641 -3.221 -3.788 -4.285 -4.801 -5.249 -5.656 -6.066 -6.464 -6.841 -7.169 -7.518 -7.843 -8.117 -8.392 -8.675 -8.938 -9.231 -9.513 -9.722 -9.952 -10.196 -10.432 -10.67 -10.847 -11.033 -11.344 -11.576 -11.819 -11.94 -12.189 -12.45 -12.712 -12.857 -13.125 -13.357 -13.548 -13.753 -14.178 -14.409 -14.682 -14.988 -15.366 -15.852 -16.499 -18.672 -6 ,26439 ,TETRA ,17606629,Sun Nov 28 20:46:07 CET,Sun Nov 28 22:36:21 CET,0.0 0.205 0.319 0.401 0.478 0.544 0.604 0.671 0.779 0.831 0.888 0.883 1.027 1.066 1.131 1.197 1.261 1.295 1.364 1.425 1.499 1.546 1.605 1.696 1.774 1.836 1.889 1.938 1.994 2.059 2.133 2.21 2.293 2.374 2.472 2.585 2.668 2.744 2.809 2.881 2.95 3.013 3.07 3.096 3.125 3.147 3.117 3.019 2.767 2.319 1.422 0.185 -0.841 -1.751 -2.574 -3.381 -4.125 -4.771 -5.333 -5.893 -6.375 -6.785 -7.205 -7.624 -7.996 -8.352 -8.735 -9.073 -9.358 -9.667 -10.001 -10.274 -10.553 -10.861 -11.115 -11.364 -11.62 -11.898 -12.188 -12.382 -12.595 -12.925 -13.149 -13.404 -13.537 -13.807 -14.074 -14.355 -14.506 -14.776 -15.038 -15.223 -15.398 -15.781 -16.004 -16.286 -16.611 -16.973 -17.394 -17.922 -19.926 -7 ,30158 ,TETRA ,17606630,Sun Nov 28 20:47:05 CET,Sun Nov 28 22:38:43 CET,0.0 0.231 0.325 0.387 0.45 0.508 0.573 0.632 0.741 0.798 0.845 0.822 0.954 0.991 1.06 1.137 1.216 1.246 1.302 1.356 1.43 1.477 1.528 1.605 1.674 1.739 1.796 1.843 1.913 1.983 2.049 2.125 2.201 2.272 2.328 2.393 2.449 2.506 2.569 2.632 2.696 2.761 2.823 2.862 2.898 2.913 2.86 2.714 2.448 2.026 1.279 0.248 -0.645 -1.435 -2.222 -2.955 -3.573 -4.135 -4.602 -5.087 -5.524 -5.916 -6.279 -6.612 -6.94 -7.25 -7.583 -7.883 -8.143 -8.423 -8.725 -8.989 -9.268 -9.56 -9.787 -10.02 -10.251 -10.488 -10.754 -10.94 -11.125 -11.427 -11.639 -11.855 -11.978 -12.224 -12.473 -12.763 -12.919 -13.192 -13.416 -13.602 -13.805 -14.226 -14.476 -14.785 -15.106 -15.464 -15.902 -16.474 -18.297 -8 ,26824 ,TETRA ,17606631,Sun Nov 28 20:46:06 CET,Sun Nov 28 22:31:34 CET,0.0 0.221 0.325 0.414 0.488 0.555 0.616 0.664 0.753 0.801 0.849 0.834 0.966 1.003 1.077 1.146 1.228 1.268 1.329 1.381 1.466 1.522 1.58 1.661 1.727 1.797 1.862 1.927 2.014 2.093 2.165 2.253 2.355 2.452 2.547 2.657 2.759 2.862 2.965 3.056 3.163 3.294 3.407 3.508 3.607 3.657 3.67 3.606 3.402 3.01 2.309 1.209 0.194 -0.687 -1.532 -2.287 -2.922 -3.533 -4.071 -4.593 -5.056 -5.47 -5.873 -6.29 -6.699 -7.062 -7.417 -7.749 -8.054 -8.37 -8.703 -8.973 -9.248 -9.518 -9.718 -9.952 -10.204 -10.469 -10.757 -10.957 -11.164 -11.489 -11.727 -11.966 -12.088 -12.35 -12.613 -12.881 -13.025 -13.288 -13.53 -13.727 -13.925 -14.38 -14.631 -14.88 -15.163 -15.512 -15.957 -16.57 -18.338 -9 ,25226 ,TETRA ,17606632,Sun Nov 28 20:46:06 CET,Sun Nov 28 22:34:04 CET,0.0 0.176 0.315 0.412 0.474 0.54 0.604 0.658 0.758 0.806 0.859 0.87 1.013 1.051 1.12 1.191 1.254 1.285 1.344 1.393 1.47 1.52 1.572 1.653 1.731 1.805 1.868 1.919 1.978 2.034 2.097 2.171 2.24 2.322 2.416 2.525 2.624 2.713 2.811 2.93 3.044 3.166 3.288 3.375 3.442 3.454 3.421 3.359 3.196 2.848 2.07 0.901 -0.141 -1.021 -1.766 -2.494 -3.177 -3.784 -4.292 -4.817 -5.293 -5.737 -6.138 -6.52 -6.895 -7.226 -7.582 -7.904 -8.177 -8.46 -8.772 -9.035 -9.321 -9.627 -9.867 -10.123 -10.38 -10.641 -10.922 -11.12 -11.319 -11.648 -11.888 -12.113 -12.224 -12.466 -12.735 -13.035 -13.194 -13.468 -13.686 -13.87 -14.07 -14.515 -14.766 -15.028 -15.319 -15.665 -16.101 -16.696 -18.667 -10 ,10844 ,TETRA ,17606633,Sun Nov 28 20:47:06 CET,Sun Nov 28 22:39:01 CET,0.0 0.24 0.345 0.423 0.49 0.555 0.623 0.682 0.779 0.829 0.883 0.87 1.001 1.039 1.123 1.195 1.252 1.281 1.338 1.391 1.464 1.507 1.551 1.617 1.676 1.729 1.775 1.825 1.901 1.977 2.043 2.123 2.194 2.252 2.323 2.401 2.473 2.552 2.626 2.684 2.741 2.802 2.866 2.911 2.945 2.932 2.844 2.713 2.481 2.059 1.206 0.02 -1.062 -2.049 -2.919 -3.734 -4.449 -5.081 -5.627 -6.174 -6.651 -7.096 -7.541 -7.943 -8.323 -8.685 -9.068 -9.398 -9.688 -10.006 -10.315 -10.575 -10.862 -11.17 -11.406 -11.649 -11.896 -12.146 -12.402 -12.588 -12.792 -13.112 -13.346 -13.607 -13.75 -14.02 -14.279 -14.567 -14.721 -14.985 -15.213 -15.382 -15.558 -15.93 -16.14 -16.397 -16.694 -17.077 -17.553 -18.145 -20.161 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_37_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_37_26.txt deleted file mode 100644 index 2eab24f9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_37_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22529 ,TETRA ,17606634,Sun Nov 28 20:47:05 CET,Sun Nov 28 22:38:57 CET,0.0 0.635 0.861 1.063 1.231 1.364 1.502 1.627 1.841 1.936 2.025 2.109 2.294 2.378 2.545 2.717 2.877 2.946 3.084 3.221 3.39 3.482 3.583 3.736 3.886 4.033 4.172 4.325 4.531 4.718 4.88 5.053 5.208 5.353 5.517 5.686 5.84 6.012 6.207 6.408 6.601 6.791 6.985 7.152 7.309 7.492 7.638 7.718 7.643 7.259 6.365 5.027 3.845 2.831 1.944 1.164 0.475 -0.187 -0.756 -1.312 -1.792 -2.229 -2.65 -3.064 -3.448 -3.79 -4.143 -4.451 -4.72 -5.018 -5.341 -5.598 -5.871 -6.17 -6.399 -6.629 -6.866 -7.107 -7.356 -7.535 -7.732 -8.034 -8.236 -8.453 -8.56 -8.788 -9.042 -9.31 -9.455 -9.712 -9.914 -10.072 -10.242 -10.656 -10.897 -11.167 -11.463 -11.796 -12.208 -12.717 -14.686 -2 ,5247 ,TETRA ,17606635,Sun Nov 28 20:47:05 CET,Sun Nov 28 22:37:52 CET,0.0 0.443 0.689 0.886 1.05 1.202 1.331 1.454 1.661 1.749 1.827 1.899 2.081 2.166 2.327 2.483 2.617 2.679 2.806 2.925 3.086 3.193 3.3 3.456 3.605 3.749 3.883 4.009 4.169 4.324 4.473 4.656 4.817 4.958 5.123 5.295 5.453 5.628 5.821 6.007 6.199 6.432 6.688 6.888 7.079 7.266 7.427 7.565 7.633 7.498 6.886 5.815 4.798 3.94 3.203 2.484 1.826 1.261 0.777 0.269 -0.19 -0.603 -1.003 -1.4 -1.777 -2.127 -2.484 -2.802 -3.077 -3.345 -3.63 -3.889 -4.162 -4.441 -4.656 -4.883 -5.114 -5.35 -5.601 -5.763 -5.928 -6.21 -6.408 -6.594 -6.689 -6.89 -7.116 -7.377 -7.513 -7.757 -7.943 -8.107 -8.288 -8.72 -8.938 -9.144 -9.378 -9.665 -10.01 -10.446 -12.019 -3 ,27725 ,TETRA ,17606636,Sun Nov 28 20:47:06 CET,Sun Nov 28 22:38:12 CET,0.0 0.841 1.172 1.406 1.606 1.793 1.963 2.114 2.376 2.505 2.633 2.76 2.954 3.046 3.228 3.403 3.557 3.626 3.759 3.895 4.087 4.203 4.329 4.522 4.701 4.86 4.993 5.126 5.322 5.503 5.661 5.863 6.049 6.204 6.39 6.589 6.784 6.99 7.172 7.347 7.529 7.726 7.957 8.183 8.367 8.515 8.611 8.596 8.493 8.144 7.264 5.973 4.78 3.707 2.817 2.049 1.341 0.687 0.122 -0.436 -0.901 -1.318 -1.734 -2.119 -2.476 -2.82 -3.198 -3.544 -3.829 -4.122 -4.425 -4.676 -4.943 -5.229 -5.447 -5.666 -5.908 -6.168 -6.425 -6.608 -6.79 -7.083 -7.298 -7.51 -7.623 -7.863 -8.111 -8.362 -8.502 -8.758 -8.935 -9.088 -9.258 -9.652 -9.868 -10.099 -10.364 -10.678 -11.06 -11.545 -13.245 -4 ,17008 ,TETRA ,17606637,Sun Nov 28 20:47:06 CET,Sun Nov 28 22:38:15 CET,0.0 0.85 1.228 1.494 1.715 1.892 2.045 2.191 2.442 2.55 2.652 2.775 2.98 3.078 3.256 3.431 3.592 3.664 3.81 3.942 4.114 4.235 4.354 4.523 4.695 4.855 5.005 5.155 5.344 5.53 5.715 5.932 6.14 6.332 6.535 6.752 6.962 7.187 7.428 7.662 7.867 8.077 8.293 8.491 8.688 8.865 8.98 8.996 8.884 8.552 7.855 6.807 5.849 5.003 4.212 3.48 2.83 2.241 1.737 1.213 0.738 0.302 -0.113 -0.494 -0.848 -1.158 -1.471 -1.757 -2.02 -2.29 -2.554 -2.785 -3.02 -3.259 -3.452 -3.66 -3.879 -4.103 -4.338 -4.501 -4.666 -4.926 -5.116 -5.313 -5.416 -5.621 -5.843 -6.096 -6.229 -6.467 -6.66 -6.824 -6.997 -7.376 -7.582 -7.805 -8.059 -8.361 -8.715 -9.183 -10.788 -5 ,32510 ,TETRA ,17606638,Sun Nov 28 20:47:06 CET,Sun Nov 28 22:42:29 CET,0.0 0.771 1.001 1.199 1.368 1.511 1.628 1.745 1.986 2.091 2.196 2.31 2.494 2.563 2.702 2.846 2.986 3.055 3.185 3.315 3.509 3.631 3.753 3.936 4.102 4.249 4.374 4.491 4.641 4.777 4.903 5.043 5.195 5.369 5.582 5.816 6.014 6.193 6.384 6.577 6.757 6.977 7.201 7.354 7.483 7.568 7.625 7.6 7.45 7.089 6.127 4.808 3.706 2.736 1.908 1.181 0.515 -0.088 -0.602 -1.158 -1.67 -2.116 -2.517 -2.905 -3.278 -3.647 -4.041 -4.38 -4.678 -4.976 -5.275 -5.537 -5.807 -6.084 -6.295 -6.512 -6.74 -6.962 -7.19 -7.35 -7.523 -7.791 -7.987 -8.199 -8.303 -8.512 -8.742 -8.984 -9.109 -9.355 -9.53 -9.682 -9.85 -10.219 -10.418 -10.63 -10.878 -11.149 -11.492 -11.978 -13.762 -6 ,28871 ,TETRA ,17606639,Sun Nov 28 20:47:06 CET,Sun Nov 28 22:37:47 CET,0.0 1.066 1.367 1.564 1.763 1.959 2.112 2.256 2.481 2.577 2.68 2.778 2.966 3.054 3.218 3.37 3.527 3.607 3.749 3.883 4.069 4.174 4.275 4.423 4.559 4.689 4.817 4.942 5.1 5.239 5.364 5.531 5.708 5.879 6.056 6.218 6.364 6.515 6.681 6.857 7.031 7.194 7.348 7.474 7.574 7.681 7.743 7.739 7.59 7.146 6.229 5.002 4.002 3.1 2.252 1.495 0.837 0.232 -0.298 -0.853 -1.34 -1.786 -2.232 -2.674 -3.081 -3.426 -3.781 -4.108 -4.39 -4.685 -4.988 -5.245 -5.516 -5.797 -6.019 -6.25 -6.482 -6.727 -6.985 -7.156 -7.332 -7.618 -7.834 -8.059 -8.173 -8.423 -8.689 -8.956 -9.096 -9.345 -9.52 -9.676 -9.851 -10.257 -10.489 -10.734 -11.02 -11.376 -11.81 -12.398 -14.765 -7 ,8225 ,TETRA ,17606640,Sun Nov 28 20:47:08 CET,Sun Nov 28 22:41:39 CET,0.0 0.557 0.736 0.915 1.079 1.226 1.367 1.5 1.726 1.821 1.917 1.997 2.178 2.258 2.387 2.516 2.666 2.742 2.868 2.979 3.147 3.249 3.345 3.493 3.631 3.77 3.916 4.042 4.193 4.35 4.504 4.676 4.836 4.993 5.183 5.392 5.587 5.806 6.021 6.234 6.447 6.684 6.93 7.138 7.378 7.594 7.789 7.994 8.041 7.738 6.939 5.824 4.8 3.818 2.969 2.219 1.552 0.924 0.377 -0.167 -0.651 -1.089 -1.506 -1.88 -2.249 -2.6 -2.95 -3.256 -3.513 -3.79 -4.097 -4.356 -4.627 -4.907 -5.12 -5.333 -5.555 -5.771 -5.987 -6.15 -6.319 -6.583 -6.783 -6.993 -7.103 -7.324 -7.543 -7.79 -7.919 -8.166 -8.371 -8.538 -8.701 -9.046 -9.247 -9.465 -9.716 -9.995 -10.325 -10.818 -12.209 -8 ,26998 ,TETRA ,17606641,Sun Nov 28 20:47:06 CET,Sun Nov 28 22:39:19 CET,0.0 0.895 1.126 1.308 1.471 1.616 1.761 1.892 2.11 2.199 2.285 2.36 2.542 2.631 2.816 2.983 3.129 3.192 3.294 3.395 3.561 3.667 3.763 3.902 4.036 4.162 4.301 4.451 4.623 4.762 4.901 5.06 5.231 5.423 5.636 5.851 6.011 6.186 6.376 6.557 6.732 6.903 7.078 7.26 7.471 7.632 7.694 7.711 7.591 7.235 6.523 5.456 4.436 3.527 2.716 1.94 1.218 0.559 0.001 -0.563 -1.065 -1.503 -1.898 -2.279 -2.643 -2.977 -3.322 -3.632 -3.902 -4.197 -4.504 -4.738 -4.988 -5.258 -5.475 -5.702 -5.945 -6.196 -6.441 -6.61 -6.8 -7.1 -7.3 -7.507 -7.61 -7.824 -8.047 -8.292 -8.43 -8.684 -8.857 -9.009 -9.174 -9.543 -9.744 -9.946 -10.199 -10.507 -10.846 -11.303 -12.646 -9 ,28653 ,TETRA ,17606642,Sun Nov 28 20:48:03 CET,Sun Nov 28 22:40:07 CET,0.0 0.724 0.986 1.204 1.391 1.564 1.719 1.845 2.062 2.153 2.234 2.307 2.483 2.566 2.733 2.896 3.041 3.106 3.226 3.345 3.531 3.646 3.747 3.898 4.051 4.198 4.334 4.463 4.619 4.766 4.92 5.105 5.285 5.463 5.656 5.849 6.03 6.232 6.447 6.695 6.938 7.163 7.409 7.659 7.903 8.128 8.343 8.473 8.486 8.273 7.624 6.517 5.422 4.509 3.686 2.881 2.19 1.574 1.03 0.476 -0.011 -0.453 -0.872 -1.293 -1.688 -2.022 -2.375 -2.703 -2.995 -3.293 -3.592 -3.844 -4.106 -4.368 -4.573 -4.794 -5.033 -5.274 -5.515 -5.689 -5.874 -6.172 -6.379 -6.593 -6.708 -6.95 -7.201 -7.46 -7.6 -7.852 -8.045 -8.215 -8.406 -8.8 -9.007 -9.229 -9.457 -9.736 -10.106 -10.585 -11.918 -10 ,14313 ,TETRA ,17606643,Sun Nov 28 20:48:03 CET,Sun Nov 28 22:39:33 CET,0.0 0.511 0.78 0.964 1.117 1.245 1.36 1.487 1.713 1.804 1.896 1.979 2.158 2.235 2.377 2.515 2.645 2.708 2.84 2.968 3.154 3.274 3.374 3.521 3.674 3.825 3.979 4.127 4.316 4.501 4.673 4.859 5.034 5.214 5.417 5.644 5.863 6.087 6.314 6.527 6.751 7.015 7.288 7.518 7.764 8.017 8.237 8.365 8.35 8.137 7.452 6.24 5.063 4.041 3.191 2.397 1.696 1.057 0.497 -0.069 -0.564 -1.007 -1.442 -1.851 -2.234 -2.595 -2.963 -3.278 -3.557 -3.838 -4.139 -4.398 -4.667 -4.948 -5.154 -5.365 -5.587 -5.822 -6.073 -6.25 -6.427 -6.698 -6.887 -7.099 -7.215 -7.451 -7.706 -7.989 -8.14 -8.402 -8.621 -8.783 -8.955 -9.351 -9.561 -9.783 -10.025 -10.305 -10.676 -11.19 -12.518 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_37_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_37_32.txt deleted file mode 100644 index ec21925d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_37_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24776 ,TETRA ,17606644,Sun Nov 28 20:48:04 CET,Sun Nov 28 22:37:22 CET,0.0 0.182 0.225 0.261 0.309 0.35 0.377 0.4 0.446 0.463 0.484 0.43 0.549 0.563 0.581 0.603 0.639 0.658 0.679 0.686 0.693 0.696 0.699 0.718 0.729 0.729 0.735 0.744 0.74 0.728 0.727 0.721 0.697 0.664 0.612 0.545 0.477 0.391 0.304 0.197 0.051 -0.133 -0.369 -0.652 -1.033 -1.518 -2.164 -3.052 -4.279 -6.028 -8.791 -11.769 -14.073 -15.949 -17.514 -18.901 -20.061 -21.084 -21.969 -22.833 -23.561 -24.211 -24.853 -25.448 -25.981 -26.458 -26.938 -27.374 -27.774 -28.19 -28.618 -28.993 -29.392 -29.798 -30.103 -30.409 -30.716 -31.047 -31.404 -31.649 -31.898 -32.279 -32.555 -32.85 -32.996 -33.305 -33.616 -33.952 -34.143 -34.472 -34.796 -35.046 -35.294 -35.803 -36.101 -36.475 -36.926 -37.435 -38.023 -38.855 -42.2 -2 ,14612 ,TETRA ,17606645,Sun Nov 28 20:48:04 CET,Sun Nov 28 22:38:55 CET,0.0 0.123 0.227 0.281 0.318 0.36 0.402 0.433 0.486 0.513 0.543 0.493 0.611 0.629 0.649 0.673 0.704 0.72 0.743 0.759 0.786 0.807 0.827 0.847 0.865 0.884 0.905 0.921 0.936 0.955 0.958 0.947 0.935 0.903 0.866 0.839 0.782 0.711 0.653 0.564 0.443 0.297 0.101 -0.144 -0.484 -0.927 -1.567 -2.456 -3.668 -5.436 -8.204 -11.255 -13.675 -15.617 -17.178 -18.534 -19.711 -20.764 -21.646 -22.507 -23.262 -23.939 -24.579 -25.184 -25.727 -26.197 -26.679 -27.109 -27.483 -27.882 -28.301 -28.651 -29.027 -29.437 -29.753 -30.065 -30.382 -30.715 -31.061 -31.308 -31.56 -31.934 -32.212 -32.505 -32.645 -32.937 -33.275 -33.678 -33.879 -34.205 -34.498 -34.716 -34.948 -35.476 -35.798 -36.149 -36.54 -37.032 -37.677 -38.531 -41.815 -3 ,11335 ,TETRA ,17606646,Sun Nov 28 20:48:03 CET,Sun Nov 28 22:38:22 CET,0.0 0.137 0.213 0.286 0.343 0.392 0.438 0.471 0.518 0.542 0.56 0.493 0.608 0.622 0.654 0.685 0.705 0.716 0.74 0.76 0.772 0.78 0.79 0.79 0.783 0.777 0.772 0.768 0.761 0.746 0.719 0.676 0.628 0.582 0.528 0.45 0.358 0.249 0.131 -0.022 -0.197 -0.401 -0.697 -1.047 -1.493 -2.031 -2.738 -3.66 -4.954 -6.824 -9.617 -12.776 -15.238 -17.235 -18.847 -20.206 -21.381 -22.429 -23.329 -24.202 -24.943 -25.592 -26.2 -26.777 -27.31 -27.808 -28.321 -28.766 -29.173 -29.602 -30.03 -30.382 -30.751 -31.153 -31.463 -31.747 -32.046 -32.386 -32.749 -33.001 -33.249 -33.633 -33.913 -34.206 -34.359 -34.69 -35.027 -35.401 -35.606 -35.927 -36.208 -36.426 -36.677 -37.266 -37.615 -37.99 -38.382 -38.881 -39.448 -40.186 -43.062 -4 ,4667 ,TETRA ,17606647,Sun Nov 28 20:48:04 CET,Sun Nov 28 22:38:48 CET,0.0 0.234 0.319 0.368 0.404 0.432 0.458 0.491 0.554 0.579 0.601 0.537 0.658 0.69 0.73 0.747 0.759 0.768 0.784 0.791 0.805 0.814 0.818 0.818 0.813 0.806 0.812 0.825 0.811 0.778 0.746 0.704 0.65 0.589 0.523 0.439 0.343 0.22 0.063 -0.102 -0.27 -0.459 -0.721 -1.062 -1.517 -2.046 -2.746 -3.737 -5.109 -6.976 -9.751 -12.846 -15.28 -17.284 -18.954 -20.383 -21.606 -22.686 -23.638 -24.582 -25.36 -26.058 -26.734 -27.348 -27.909 -28.428 -28.97 -29.444 -29.862 -30.302 -30.747 -31.105 -31.478 -31.879 -32.175 -32.473 -32.792 -33.128 -33.479 -33.726 -33.976 -34.367 -34.657 -34.962 -35.113 -35.415 -35.741 -36.093 -36.286 -36.628 -36.922 -37.134 -37.36 -37.901 -38.235 -38.619 -39.008 -39.436 -40.031 -40.832 -44.023 -5 ,14501 ,TETRA ,17606648,Sun Nov 28 20:48:04 CET,Sun Nov 28 22:42:39 CET,0.0 0.155 0.252 0.322 0.369 0.402 0.433 0.463 0.508 0.522 0.535 0.468 0.577 0.595 0.622 0.631 0.643 0.654 0.672 0.682 0.699 0.716 0.721 0.726 0.727 0.725 0.733 0.724 0.709 0.698 0.669 0.628 0.586 0.533 0.463 0.381 0.29 0.2 0.11 -0.019 -0.186 -0.394 -0.661 -0.98 -1.391 -1.921 -2.641 -3.532 -4.712 -6.372 -9.013 -12.054 -14.403 -16.328 -17.987 -19.456 -20.705 -21.828 -22.764 -23.657 -24.443 -25.144 -25.794 -26.419 -26.982 -27.48 -27.998 -28.449 -28.842 -29.265 -29.703 -30.065 -30.455 -30.841 -31.136 -31.442 -31.778 -32.136 -32.491 -32.739 -32.993 -33.395 -33.679 -33.967 -34.128 -34.459 -34.798 -35.161 -35.348 -35.686 -36.032 -36.278 -36.535 -37.113 -37.446 -37.823 -38.213 -38.687 -39.307 -40.135 -44.312 -6 ,29722 ,TETRA ,17606649,Sun Nov 28 20:48:04 CET,Sun Nov 28 22:39:41 CET,0.0 0.144 0.232 0.315 0.375 0.419 0.456 0.497 0.572 0.602 0.625 0.559 0.673 0.69 0.71 0.727 0.751 0.765 0.787 0.802 0.815 0.822 0.83 0.838 0.851 0.867 0.881 0.889 0.888 0.894 0.899 0.891 0.874 0.845 0.799 0.742 0.689 0.632 0.559 0.458 0.329 0.145 -0.107 -0.41 -0.84 -1.374 -2.082 -3.037 -4.329 -6.115 -8.962 -12.132 -14.554 -16.525 -18.189 -19.641 -20.927 -22.076 -22.996 -23.91 -24.697 -25.377 -26.032 -26.648 -27.195 -27.682 -28.194 -28.661 -29.066 -29.472 -29.908 -30.244 -30.577 -30.941 -31.215 -31.496 -31.805 -32.14 -32.489 -32.738 -33.001 -33.407 -33.671 -33.931 -34.07 -34.398 -34.771 -35.13 -35.307 -35.638 -35.934 -36.147 -36.387 -36.926 -37.187 -37.491 -37.86 -38.318 -38.799 -39.467 -42.488 -7 ,27200 ,TETRA ,17606650,Sun Nov 28 20:49:04 CET,Sun Nov 28 22:36:55 CET,0.0 0.145 0.221 0.284 0.344 0.389 0.426 0.453 0.493 0.512 0.537 0.497 0.612 0.627 0.662 0.7 0.728 0.737 0.753 0.774 0.799 0.807 0.814 0.823 0.836 0.849 0.857 0.857 0.854 0.851 0.841 0.83 0.811 0.773 0.734 0.686 0.618 0.538 0.443 0.321 0.176 0.013 -0.213 -0.488 -0.852 -1.351 -2.029 -2.895 -4.076 -5.782 -8.494 -11.5 -13.826 -15.729 -17.287 -18.625 -19.764 -20.775 -21.639 -22.498 -23.244 -23.894 -24.491 -25.059 -25.59 -26.084 -26.623 -27.107 -27.516 -27.935 -28.37 -28.727 -29.091 -29.48 -29.805 -30.152 -30.499 -30.85 -31.219 -31.479 -31.736 -32.113 -32.379 -32.677 -32.84 -33.181 -33.534 -33.909 -34.11 -34.438 -34.713 -34.942 -35.186 -35.736 -36.053 -36.416 -36.829 -37.281 -37.866 -38.751 -42.92 -8 ,14274 ,TETRA ,17606651,Sun Nov 28 20:49:04 CET,Sun Nov 28 22:41:10 CET,0.0 0.14 0.22 0.289 0.356 0.409 0.445 0.476 0.536 0.57 0.599 0.554 0.671 0.692 0.734 0.776 0.808 0.818 0.841 0.866 0.906 0.929 0.942 0.961 0.972 0.976 0.975 0.968 0.96 0.952 0.952 0.943 0.921 0.901 0.865 0.812 0.75 0.688 0.609 0.482 0.32 0.131 -0.103 -0.39 -0.757 -1.246 -1.925 -2.795 -3.988 -5.683 -8.347 -11.38 -13.708 -15.538 -17.091 -18.478 -19.626 -20.652 -21.526 -22.403 -23.192 -23.893 -24.551 -25.158 -25.726 -26.261 -26.812 -27.266 -27.646 -28.06 -28.508 -28.868 -29.25 -29.649 -29.94 -30.242 -30.582 -30.945 -31.295 -31.533 -31.791 -32.214 -32.507 -32.822 -32.982 -33.308 -33.664 -34.033 -34.229 -34.56 -34.892 -35.146 -35.4 -35.964 -36.293 -36.657 -37.081 -37.608 -38.228 -39.077 -42.552 -9 ,20833 ,TETRA ,17606652,Sun Nov 28 20:49:05 CET,Sun Nov 28 22:41:03 CET,0.0 0.165 0.252 0.319 0.374 0.421 0.465 0.511 0.585 0.608 0.631 0.58 0.694 0.712 0.737 0.751 0.775 0.786 0.801 0.813 0.832 0.85 0.872 0.917 0.953 0.976 1.005 1.016 0.994 0.963 0.926 0.893 0.866 0.833 0.785 0.701 0.604 0.495 0.375 0.24 0.057 -0.168 -0.441 -0.765 -1.203 -1.776 -2.532 -3.491 -4.77 -6.572 -9.318 -12.423 -14.933 -17.001 -18.692 -20.16 -21.413 -22.491 -23.394 -24.301 -25.105 -25.816 -26.438 -27.026 -27.605 -28.12 -28.646 -29.09 -29.483 -29.9 -30.314 -30.662 -31.017 -31.376 -31.664 -31.969 -32.281 -32.623 -32.988 -33.229 -33.473 -33.866 -34.137 -34.412 -34.569 -34.903 -35.237 -35.61 -35.815 -36.156 -36.46 -36.694 -36.945 -37.486 -37.785 -38.106 -38.469 -38.93 -39.559 -40.512 -43.704 -10 ,28050 ,TETRA ,17606653,Sun Nov 28 20:49:08 CET,Sun Nov 28 22:38:22 CET,0.0 0.269 0.395 0.476 0.534 0.591 0.637 0.677 0.751 0.789 0.818 0.753 0.862 0.875 0.902 0.945 0.982 0.99 1.015 1.042 1.069 1.077 1.082 1.091 1.093 1.091 1.092 1.094 1.088 1.077 1.057 1.026 1.004 0.979 0.942 0.893 0.827 0.727 0.61 0.492 0.346 0.144 -0.128 -0.43 -0.811 -1.288 -1.92 -2.757 -3.967 -5.704 -8.329 -11.269 -13.646 -15.649 -17.307 -18.757 -19.997 -21.079 -21.986 -22.857 -23.614 -24.306 -24.968 -25.578 -26.144 -26.656 -27.171 -27.631 -28.028 -28.429 -28.83 -29.184 -29.56 -29.954 -30.271 -30.586 -30.896 -31.207 -31.526 -31.756 -32.001 -32.39 -32.664 -32.939 -33.085 -33.41 -33.751 -34.116 -34.307 -34.633 -34.939 -35.163 -35.414 -35.983 -36.307 -36.658 -37.061 -37.575 -38.14 -38.883 -41.98 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_37_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_37_35.txt deleted file mode 100644 index 34bef20e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_37_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6965 ,TETRA ,17606654,Sun Nov 28 20:49:05 CET,Sun Nov 28 22:40:23 CET,0.0 0.33 0.519 0.68 0.81 0.919 1.031 1.143 1.335 1.424 1.523 1.616 1.79 1.871 2.026 2.157 2.28 2.341 2.473 2.606 2.785 2.888 2.986 3.139 3.294 3.445 3.592 3.732 3.916 4.092 4.261 4.472 4.68 4.884 5.124 5.395 5.653 5.933 6.24 6.563 6.889 7.259 7.69 8.102 8.583 9.151 9.831 10.579 11.402 12.284 13.226 13.776 13.945 13.982 13.881 13.667 13.433 13.196 12.974 12.737 12.508 12.302 12.105 11.905 11.721 11.553 11.352 11.163 11.005 10.832 10.65 10.505 10.359 10.209 10.097 9.978 9.844 9.693 9.519 9.407 9.294 9.106 8.968 8.826 8.754 8.597 8.435 8.259 8.16 7.96 7.834 7.719 7.595 7.338 7.206 7.047 6.865 6.654 6.394 6.101 5.523 -2 ,32019 ,TETRA ,17606655,Sun Nov 28 20:49:05 CET,Sun Nov 28 22:42:52 CET,0.0 0.447 0.659 0.868 1.036 1.175 1.293 1.403 1.608 1.702 1.783 1.846 2.027 2.106 2.252 2.383 2.508 2.568 2.679 2.794 2.976 3.092 3.2 3.368 3.533 3.69 3.84 3.981 4.167 4.346 4.52 4.727 4.922 5.11 5.315 5.545 5.787 6.048 6.316 6.608 6.918 7.266 7.675 8.088 8.583 9.129 9.735 10.421 11.221 12.148 13.135 13.877 14.206 14.268 14.222 14.098 13.925 13.732 13.521 13.246 13.017 12.805 12.576 12.356 12.152 11.958 11.747 11.558 11.381 11.188 10.997 10.849 10.673 10.493 10.355 10.196 10.039 9.883 9.708 9.579 9.445 9.237 9.089 8.93 8.844 8.668 8.48 8.255 8.131 7.92 7.772 7.648 7.52 7.251 7.099 6.929 6.75 6.541 6.285 5.926 5.114 -3 ,5301 ,TETRA ,17606656,Sun Nov 28 20:49:06 CET,Sun Nov 28 22:43:41 CET,0.0 0.722 0.963 1.131 1.267 1.406 1.545 1.663 1.876 1.973 2.068 2.146 2.324 2.413 2.596 2.772 2.931 3.009 3.174 3.328 3.532 3.659 3.781 3.964 4.143 4.307 4.462 4.615 4.816 5.01 5.205 5.427 5.634 5.833 6.063 6.339 6.605 6.884 7.188 7.509 7.838 8.209 8.648 9.086 9.582 10.163 10.833 11.536 12.299 13.182 14.099 14.48 14.58 14.543 14.346 14.101 13.864 13.654 13.445 13.19 12.948 12.725 12.504 12.275 12.064 11.88 11.688 11.507 11.337 11.156 10.949 10.757 10.567 10.379 10.233 10.078 9.912 9.744 9.567 9.432 9.293 9.071 8.909 8.745 8.658 8.48 8.305 8.113 8.008 7.802 7.667 7.544 7.419 7.142 6.991 6.819 6.612 6.372 6.09 5.759 4.937 -4 ,19239 ,TETRA ,17606657,Sun Nov 28 20:49:05 CET,Sun Nov 28 22:41:56 CET,0.0 0.572 0.771 0.932 1.072 1.205 1.336 1.454 1.642 1.735 1.833 1.926 2.113 2.192 2.341 2.489 2.625 2.695 2.832 2.978 3.209 3.351 3.477 3.652 3.827 4.004 4.164 4.315 4.524 4.729 4.919 5.138 5.363 5.569 5.797 6.066 6.336 6.64 6.95 7.278 7.619 8.011 8.461 8.885 9.393 9.969 10.627 11.342 12.152 13.032 13.959 14.543 14.651 14.609 14.461 14.198 13.974 13.77 13.551 13.319 13.099 12.888 12.672 12.456 12.234 12.027 11.812 11.609 11.426 11.234 11.036 10.876 10.721 10.561 10.441 10.306 10.158 10.011 9.855 9.741 9.619 9.426 9.301 9.171 9.104 8.954 8.782 8.614 8.527 8.338 8.235 8.13 8.014 7.743 7.585 7.42 7.247 7.054 6.834 6.511 5.802 -5 ,5078 ,TETRA ,17606658,Sun Nov 28 20:49:05 CET,Sun Nov 28 22:42:50 CET,0.0 0.466 0.65 0.815 0.96 1.075 1.173 1.286 1.503 1.598 1.694 1.786 1.975 2.064 2.227 2.386 2.54 2.611 2.752 2.893 3.091 3.22 3.345 3.532 3.711 3.874 4.023 4.174 4.383 4.575 4.756 4.975 5.178 5.385 5.639 5.923 6.192 6.493 6.809 7.126 7.467 7.856 8.308 8.734 9.218 9.814 10.495 11.203 12.027 12.875 13.739 14.35 14.516 14.453 14.287 14.094 13.898 13.653 13.392 13.12 12.886 12.664 12.439 12.219 12.008 11.832 11.637 11.452 11.303 11.14 10.974 10.837 10.693 10.522 10.379 10.231 10.07 9.914 9.752 9.63 9.504 9.307 9.177 9.044 8.972 8.817 8.643 8.458 8.361 8.171 8.052 7.936 7.819 7.559 7.414 7.254 7.072 6.848 6.599 6.273 5.236 -6 ,12872 ,TETRA ,17606659,Sun Nov 28 20:49:06 CET,Sun Nov 28 22:43:40 CET,0.0 0.422 0.632 0.799 0.947 1.096 1.222 1.329 1.518 1.608 1.694 1.768 1.945 2.024 2.178 2.322 2.463 2.535 2.674 2.802 2.986 3.101 3.209 3.374 3.532 3.681 3.827 3.974 4.165 4.345 4.522 4.721 4.91 5.103 5.325 5.575 5.815 6.082 6.38 6.692 7.015 7.378 7.792 8.199 8.671 9.208 9.844 10.541 11.315 12.182 13.067 13.543 13.657 13.567 13.413 13.246 13.071 12.901 12.69 12.432 12.199 11.955 11.716 11.489 11.272 11.07 10.854 10.659 10.479 10.294 10.097 9.926 9.762 9.591 9.448 9.288 9.109 8.921 8.736 8.609 8.479 8.294 8.165 8.012 7.935 7.793 7.642 7.47 7.371 7.174 7.046 6.929 6.813 6.565 6.409 6.241 6.064 5.858 5.615 5.279 4.168 -7 ,3964 ,TETRA ,17606660,Sun Nov 28 20:49:06 CET,Sun Nov 28 22:41:38 CET,0.0 1.125 1.511 1.79 2.008 2.187 2.358 2.515 2.776 2.893 3.005 3.109 3.296 3.397 3.588 3.762 3.921 3.996 4.152 4.3 4.512 4.646 4.771 4.962 5.141 5.302 5.455 5.606 5.814 6.007 6.19 6.431 6.656 6.856 7.093 7.363 7.631 7.931 8.241 8.585 8.949 9.341 9.791 10.231 10.74 11.307 11.972 12.673 13.425 14.26 15.151 15.699 15.844 15.803 15.652 15.465 15.261 15.006 14.753 14.499 14.28 14.077 13.878 13.68 13.468 13.262 13.049 12.846 12.669 12.483 12.274 12.102 11.942 11.786 11.654 11.515 11.372 11.217 11.042 10.91 10.782 10.585 10.434 10.261 10.173 9.998 9.795 9.573 9.46 9.261 9.084 8.924 8.771 8.474 8.307 8.097 7.86 7.601 7.284 6.832 5.241 -8 ,12180 ,TETRA ,17606662,Sun Nov 28 20:49:08 CET,Sun Nov 28 22:42:10 CET,0.0 1.002 1.322 1.584 1.821 2.02 2.183 2.32 2.558 2.675 2.796 2.919 3.113 3.206 3.374 3.531 3.677 3.745 3.874 4.0 4.195 4.328 4.457 4.641 4.815 4.98 5.131 5.274 5.465 5.656 5.848 6.062 6.268 6.481 6.72 6.977 7.225 7.492 7.777 8.084 8.408 8.78 9.221 9.678 10.204 10.762 11.386 12.087 12.867 13.7 14.535 14.986 15.075 14.979 14.843 14.668 14.448 14.214 13.984 13.734 13.514 13.31 13.081 12.852 12.633 12.427 12.216 12.019 11.853 11.68 11.488 11.328 11.162 10.984 10.838 10.674 10.499 10.31 10.112 9.977 9.836 9.621 9.473 9.321 9.238 9.039 8.815 8.585 8.47 8.268 8.138 8.025 7.909 7.65 7.501 7.32 7.115 6.894 6.653 6.323 5.457 -9 ,126 ,TETRA ,17606663,Sun Nov 28 20:49:10 CET,Sun Nov 28 22:42:10 CET,0.0 0.895 1.176 1.402 1.605 1.787 1.943 2.088 2.341 2.455 2.56 2.677 2.876 2.976 3.158 3.324 3.481 3.559 3.704 3.832 4.022 4.149 4.274 4.457 4.631 4.795 4.953 5.113 5.327 5.529 5.726 5.968 6.192 6.404 6.646 6.924 7.188 7.464 7.789 8.127 8.46 8.836 9.28 9.723 10.227 10.788 11.444 12.164 13.027 14.022 14.957 15.552 15.732 15.691 15.545 15.398 15.195 14.916 14.697 14.478 14.243 14.016 13.779 13.538 13.321 13.13 12.926 12.74 12.569 12.384 12.182 12.007 11.831 11.652 11.514 11.371 11.218 11.049 10.874 10.746 10.607 10.397 10.249 10.078 9.988 9.812 9.629 9.428 9.318 9.113 8.97 8.848 8.704 8.352 8.161 7.96 7.726 7.451 7.113 6.63 5.341 -10 ,13681 ,TETRA ,17606664,Sun Nov 28 20:49:11 CET,Sun Nov 28 22:41:35 CET,0.0 0.583 0.796 0.957 1.101 1.223 1.342 1.468 1.688 1.78 1.865 1.948 2.128 2.204 2.346 2.482 2.623 2.694 2.835 2.969 3.17 3.3 3.422 3.61 3.794 3.959 4.115 4.265 4.457 4.64 4.817 5.028 5.233 5.442 5.685 5.958 6.213 6.497 6.792 7.106 7.448 7.822 8.248 8.682 9.191 9.76 10.396 11.079 11.839 12.712 13.674 14.25 14.372 14.314 14.21 14.015 13.762 13.521 13.296 13.03 12.783 12.559 12.31 12.076 11.872 11.689 11.475 11.263 11.089 10.911 10.722 10.56 10.39 10.215 10.072 9.914 9.745 9.579 9.403 9.28 9.152 8.935 8.788 8.627 8.538 8.372 8.196 7.981 7.866 7.659 7.503 7.372 7.244 6.942 6.758 6.546 6.323 6.101 5.836 5.474 4.499 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_38_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_38_34.txt deleted file mode 100644 index d99ccae3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_38_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17021 ,TETRA ,17606665,Sun Nov 28 20:49:05 CET,Sun Nov 28 22:40:54 CET,0.0 0.72 1.054 1.3 1.476 1.611 1.749 1.873 2.079 2.175 2.272 2.374 2.567 2.65 2.796 2.943 3.085 3.154 3.289 3.437 3.676 3.82 3.937 4.094 4.251 4.415 4.583 4.729 4.91 5.091 5.261 5.468 5.679 5.886 6.136 6.419 6.685 6.983 7.289 7.607 7.949 8.367 8.865 9.319 9.837 10.416 11.052 11.782 12.589 13.463 14.502 15.192 15.463 15.533 15.491 15.377 15.211 15.011 14.821 14.633 14.443 14.259 14.078 13.897 13.728 13.578 13.425 13.268 13.11 12.944 12.759 12.612 12.464 12.291 12.151 12.001 11.85 11.708 11.56 11.448 11.335 11.161 11.034 10.911 10.847 10.703 10.535 10.352 10.261 10.074 9.923 9.804 9.681 9.39 9.219 9.03 8.825 8.59 8.277 7.846 6.628 -2 ,29393 ,TETRA ,17606666,Sun Nov 28 20:49:06 CET,Sun Nov 28 22:45:07 CET,0.0 1.106 1.321 1.475 1.607 1.737 1.856 1.969 2.178 2.28 2.379 2.455 2.635 2.713 2.866 3.03 3.181 3.247 3.386 3.52 3.733 3.876 4.005 4.188 4.376 4.564 4.737 4.901 5.112 5.312 5.505 5.735 5.934 6.12 6.351 6.621 6.883 7.17 7.465 7.776 8.109 8.493 8.947 9.395 9.92 10.513 11.183 11.893 12.721 13.652 14.665 15.362 15.623 15.744 15.783 15.724 15.605 15.44 15.257 15.074 14.898 14.713 14.536 14.364 14.171 13.989 13.812 13.659 13.526 13.377 13.214 13.08 12.94 12.78 12.654 12.532 12.403 12.268 12.125 12.025 11.917 11.737 11.612 11.479 11.41 11.256 11.09 10.914 10.816 10.627 10.487 10.355 10.22 9.959 9.79 9.589 9.381 9.147 8.87 8.499 6.443 -3 ,8280 ,TETRA ,17606667,Sun Nov 28 20:51:05 CET,Sun Nov 28 22:43:13 CET,0.0 0.647 0.903 1.096 1.276 1.426 1.544 1.652 1.864 1.964 2.056 2.13 2.308 2.38 2.52 2.668 2.814 2.881 3.013 3.145 3.322 3.438 3.559 3.747 3.939 4.13 4.302 4.459 4.662 4.864 5.061 5.307 5.552 5.773 6.011 6.271 6.534 6.832 7.157 7.507 7.865 8.265 8.745 9.22 9.771 10.379 11.014 11.705 12.55 13.517 14.602 15.354 15.575 15.589 15.539 15.425 15.278 15.133 14.99 14.825 14.66 14.499 14.333 14.164 14.017 13.884 13.731 13.579 13.443 13.301 13.159 13.03 12.89 12.756 12.656 12.545 12.422 12.291 12.137 12.025 11.909 11.719 11.584 11.441 11.365 11.204 11.035 10.841 10.733 10.536 10.406 10.283 10.15 9.84 9.656 9.451 9.224 8.969 8.655 8.215 7.03 -4 ,13624 ,TETRA ,17606668,Sun Nov 28 20:50:04 CET,Sun Nov 28 22:42:02 CET,0.0 0.718 0.949 1.13 1.288 1.432 1.549 1.658 1.88 1.978 2.068 2.151 2.335 2.414 2.569 2.709 2.839 2.905 3.048 3.193 3.392 3.513 3.627 3.784 3.929 4.076 4.224 4.365 4.542 4.709 4.88 5.108 5.325 5.533 5.763 6.018 6.269 6.529 6.805 7.108 7.429 7.792 8.206 8.608 9.081 9.616 10.251 10.94 11.716 12.669 13.729 14.467 14.781 14.896 14.873 14.785 14.686 14.561 14.419 14.231 14.04 13.869 13.692 13.506 13.326 13.155 12.969 12.81 12.673 12.512 12.337 12.196 12.052 11.895 11.761 11.613 11.45 11.292 11.128 10.998 10.863 10.644 10.492 10.343 10.261 10.09 9.907 9.691 9.576 9.374 9.199 9.062 8.913 8.593 8.417 8.229 8.022 7.763 7.437 7.038 4.586 -5 ,4373 ,TETRA ,17606669,Sun Nov 28 20:50:06 CET,Sun Nov 28 22:42:22 CET,0.0 0.975 1.305 1.528 1.727 1.876 2.007 2.127 2.317 2.399 2.482 2.552 2.739 2.825 2.976 3.108 3.247 3.313 3.435 3.55 3.72 3.829 3.933 4.092 4.245 4.391 4.542 4.706 4.926 5.13 5.321 5.548 5.772 5.987 6.214 6.46 6.703 6.959 7.229 7.519 7.82 8.151 8.556 8.96 9.418 9.935 10.512 11.172 11.961 12.866 13.84 14.522 14.82 14.912 14.883 14.818 14.745 14.647 14.543 14.411 14.272 14.127 13.995 13.863 13.72 13.589 13.44 13.308 13.196 13.06 12.903 12.764 12.635 12.513 12.402 12.279 12.152 12.02 11.879 11.774 11.66 11.487 11.366 11.234 11.163 11.021 10.869 10.696 10.604 10.419 10.3 10.187 10.068 9.802 9.645 9.471 9.276 9.051 8.788 8.371 6.876 -6 ,21371 ,TETRA ,17606670,Sun Nov 28 20:50:05 CET,Sun Nov 28 22:44:49 CET,0.0 0.692 0.975 1.178 1.352 1.534 1.697 1.82 2.026 2.117 2.204 2.275 2.454 2.538 2.692 2.841 2.993 3.063 3.202 3.342 3.55 3.674 3.789 3.953 4.111 4.272 4.438 4.6 4.804 4.996 5.177 5.396 5.613 5.819 6.047 6.303 6.553 6.827 7.117 7.422 7.762 8.175 8.656 9.115 9.62 10.164 10.8 11.494 12.26 13.165 14.203 14.908 15.195 15.283 15.204 15.048 14.892 14.748 14.592 14.398 14.209 14.03 13.856 13.691 13.524 13.355 13.183 13.029 12.895 12.74 12.558 12.413 12.263 12.084 11.937 11.803 11.667 11.506 11.333 11.212 11.081 10.876 10.732 10.572 10.485 10.316 10.13 9.906 9.787 9.584 9.428 9.295 9.15 8.81 8.633 8.466 8.28 8.051 7.758 7.38 6.166 -7 ,11629 ,TETRA ,17606671,Sun Nov 28 20:50:07 CET,Sun Nov 28 22:44:50 CET,0.0 1.129 1.443 1.652 1.846 2.018 2.171 2.346 2.674 2.815 2.93 3.042 3.245 3.35 3.543 3.715 3.87 3.952 4.106 4.25 4.45 4.578 4.707 4.888 5.073 5.256 5.421 5.578 5.786 5.994 6.191 6.422 6.645 6.862 7.111 7.389 7.652 7.951 8.277 8.605 8.937 9.319 9.789 10.268 10.776 11.324 11.977 12.69 13.503 14.435 15.482 16.135 16.355 16.353 16.244 16.107 15.961 15.796 15.642 15.49 15.35 15.205 15.039 14.876 14.717 14.542 14.328 14.14 13.999 13.864 13.717 13.589 13.46 13.308 13.178 13.051 12.922 12.781 12.636 12.524 12.407 12.231 12.1 11.963 11.89 11.735 11.563 11.372 11.27 11.077 10.94 10.824 10.701 10.402 10.197 9.967 9.749 9.518 9.219 8.749 7.053 -8 ,15390 ,TETRA ,17606672,Sun Nov 28 20:50:04 CET,Sun Nov 28 22:45:25 CET,0.0 0.656 0.928 1.111 1.258 1.4 1.542 1.682 1.935 2.037 2.128 2.217 2.397 2.476 2.644 2.798 2.942 3.025 3.173 3.289 3.459 3.583 3.705 3.87 4.029 4.175 4.319 4.456 4.636 4.816 4.989 5.208 5.415 5.626 5.872 6.137 6.399 6.696 7.012 7.357 7.723 8.118 8.567 9.012 9.55 10.134 10.791 11.567 12.441 13.368 14.394 15.082 15.361 15.437 15.39 15.286 15.126 14.938 14.778 14.575 14.37 14.192 14.021 13.847 13.678 13.519 13.336 13.165 13.016 12.859 12.688 12.539 12.366 12.17 12.02 11.866 11.7 11.523 11.341 11.223 11.108 10.913 10.768 10.613 10.527 10.34 10.156 9.989 9.893 9.705 9.597 9.49 9.381 9.111 8.946 8.768 8.571 8.337 8.082 7.712 6.397 -9 ,17053 ,TETRA ,17606673,Sun Nov 28 20:51:05 CET,Sun Nov 28 22:41:47 CET,0.0 0.888 1.171 1.371 1.562 1.745 1.906 2.042 2.285 2.405 2.525 2.659 2.853 2.939 3.11 3.272 3.422 3.498 3.646 3.787 3.982 4.109 4.233 4.409 4.586 4.755 4.923 5.091 5.304 5.511 5.713 5.938 6.156 6.367 6.607 6.887 7.144 7.4 7.694 8.022 8.352 8.711 9.119 9.531 10.014 10.549 11.135 11.78 12.553 13.472 14.506 15.198 15.479 15.569 15.572 15.515 15.418 15.304 15.196 15.049 14.889 14.739 14.602 14.473 14.329 14.18 14.022 13.874 13.745 13.6 13.449 13.32 13.185 13.054 12.949 12.832 12.706 12.571 12.42 12.316 12.209 12.04 11.907 11.767 11.699 11.547 11.378 11.216 11.136 10.951 10.829 10.719 10.589 10.294 10.14 9.975 9.776 9.539 9.258 8.881 7.751 -10 ,22402 ,TETRA ,17606674,Sun Nov 28 20:52:03 CET,Sun Nov 28 22:44:15 CET,0.0 1.129 1.418 1.645 1.834 2.016 2.19 2.325 2.548 2.647 2.744 2.839 3.025 3.113 3.287 3.442 3.582 3.651 3.795 3.925 4.101 4.214 4.325 4.49 4.643 4.797 4.96 5.12 5.322 5.514 5.7 5.916 6.13 6.336 6.555 6.799 7.041 7.297 7.559 7.843 8.147 8.487 8.905 9.325 9.793 10.323 10.942 11.608 12.372 13.255 14.306 15.037 15.317 15.44 15.485 15.461 15.374 15.25 15.113 14.962 14.803 14.66 14.502 14.32 14.145 13.989 13.821 13.664 13.529 13.373 13.182 13.018 12.866 12.709 12.578 12.433 12.268 12.098 11.926 11.807 11.676 11.466 11.328 11.178 11.1 10.936 10.759 10.554 10.436 10.229 10.054 9.916 9.746 9.356 9.156 8.95 8.738 8.494 8.14 7.646 5.969 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_38_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_38_37.txt deleted file mode 100644 index 8adb0aed..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_38_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14138 ,TETRA ,17672833,Fri Dec 3 09:15:31 CET,Fri Dec 3 10:51:43 CET,0.0 0.464 0.719 0.914 1.072 1.218 1.347 1.459 1.661 1.76 1.862 1.95 2.137 2.217 2.373 2.52 2.65 2.71 2.832 2.955 3.115 3.22 3.328 3.474 3.608 3.738 3.868 3.988 4.138 4.28 4.412 4.576 4.744 4.908 5.093 5.295 5.49 5.686 5.888 6.102 6.33 6.601 6.91 7.192 7.501 7.829 8.175 8.538 8.924 9.295 9.562 9.543 9.321 9.038 8.734 8.394 8.09 7.809 7.555 7.294 7.046 6.819 6.604 6.377 6.162 5.96 5.734 5.528 5.346 5.163 4.974 4.808 4.63 4.449 4.312 4.155 3.994 3.819 3.632 3.499 3.362 3.157 3.006 2.857 2.786 2.633 2.465 2.276 2.173 1.963 1.815 1.692 1.567 1.269 1.093 0.886 0.66 0.422 0.122 -0.363 -1.559 -2 ,24070 ,TETRA ,17672834,Fri Dec 3 09:15:31 CET,Fri Dec 3 11:04:44 CET,0.0 0.894 1.205 1.432 1.626 1.805 1.968 2.107 2.352 2.463 2.569 2.664 2.85 2.933 3.093 3.24 3.378 3.445 3.568 3.697 3.889 4.007 4.118 4.269 4.408 4.545 4.686 4.818 4.983 5.138 5.283 5.461 5.625 5.778 5.952 6.152 6.358 6.574 6.798 7.036 7.278 7.548 7.85 8.116 8.419 8.746 9.104 9.514 9.959 10.413 10.775 10.777 10.545 10.254 9.955 9.661 9.379 9.099 8.818 8.498 8.212 7.951 7.701 7.458 7.231 7.035 6.826 6.621 6.442 6.263 6.069 5.912 5.74 5.56 5.425 5.271 5.11 4.942 4.762 4.64 4.508 4.295 4.146 3.989 3.907 3.732 3.551 3.368 3.272 3.074 2.929 2.792 2.656 2.383 2.212 2.008 1.779 1.508 1.156 0.662 -1.227 -3 ,4925 ,TETRA ,17672835,Fri Dec 3 09:15:31 CET,Fri Dec 3 11:08:07 CET,0.0 0.749 1.027 1.22 1.388 1.537 1.672 1.795 2.003 2.101 2.194 2.271 2.45 2.533 2.693 2.843 2.98 3.043 3.17 3.293 3.467 3.579 3.684 3.832 3.977 4.113 4.235 4.348 4.506 4.666 4.814 5.002 5.194 5.363 5.544 5.746 5.932 6.137 6.351 6.573 6.802 7.062 7.336 7.612 7.941 8.271 8.642 9.018 9.404 9.778 10.042 10.067 9.868 9.564 9.27 8.987 8.713 8.453 8.199 7.932 7.711 7.496 7.261 7.018 6.798 6.59 6.367 6.18 6.019 5.841 5.648 5.481 5.296 5.101 4.959 4.82 4.668 4.5 4.319 4.194 4.057 3.828 3.669 3.516 3.443 3.28 3.095 2.906 2.805 2.601 2.46 2.33 2.196 1.917 1.751 1.564 1.337 1.045 0.716 0.321 -0.724 -4 ,28384 ,TETRA ,17672836,Fri Dec 3 09:15:32 CET,Fri Dec 3 10:59:54 CET,0.0 0.489 0.726 0.919 1.088 1.231 1.367 1.5 1.735 1.838 1.933 2.02 2.21 2.294 2.464 2.618 2.747 2.806 2.923 3.046 3.228 3.34 3.446 3.599 3.744 3.88 4.01 4.127 4.275 4.425 4.576 4.76 4.937 5.109 5.306 5.517 5.711 5.911 6.118 6.343 6.575 6.818 7.093 7.364 7.671 8.022 8.399 8.766 9.16 9.556 9.835 9.818 9.607 9.312 9.006 8.705 8.404 8.087 7.782 7.462 7.185 6.948 6.713 6.474 6.242 6.029 5.811 5.621 5.458 5.282 5.096 4.935 4.767 4.586 4.443 4.3 4.147 3.98 3.809 3.692 3.567 3.364 3.215 3.054 2.972 2.795 2.59 2.381 2.275 2.063 1.911 1.784 1.639 1.324 1.161 0.971 0.752 0.481 0.123 -0.304 -1.643 -5 ,9544 ,TETRA ,17672837,Fri Dec 3 09:15:30 CET,Fri Dec 3 11:09:09 CET,0.0 0.535 0.768 0.963 1.147 1.308 1.444 1.569 1.786 1.882 1.98 2.062 2.239 2.317 2.467 2.607 2.741 2.805 2.929 3.052 3.226 3.333 3.44 3.593 3.73 3.864 3.998 4.118 4.269 4.415 4.559 4.734 4.891 5.051 5.243 5.435 5.609 5.809 6.029 6.256 6.486 6.746 7.035 7.294 7.591 7.915 8.286 8.686 9.039 9.341 9.543 9.519 9.353 9.108 8.834 8.529 8.218 7.917 7.636 7.339 7.072 6.829 6.595 6.37 6.162 5.952 5.727 5.537 5.361 5.185 5.016 4.875 4.729 4.575 4.453 4.319 4.174 4.024 3.868 3.756 3.636 3.452 3.329 3.201 3.135 2.99 2.825 2.648 2.56 2.374 2.28 2.169 2.042 1.787 1.645 1.483 1.317 1.133 0.902 0.555 -0.624 -6 ,19457 ,TETRA ,17672838,Fri Dec 3 09:15:31 CET,Fri Dec 3 11:08:31 CET,0.0 0.759 1.022 1.221 1.392 1.539 1.665 1.782 1.999 2.108 2.216 2.318 2.495 2.567 2.703 2.831 2.957 3.021 3.148 3.265 3.432 3.547 3.658 3.813 3.951 4.079 4.205 4.327 4.489 4.644 4.785 4.961 5.131 5.287 5.466 5.669 5.872 6.081 6.289 6.511 6.74 6.995 7.306 7.601 7.921 8.269 8.633 9.01 9.406 9.786 10.101 10.138 9.969 9.685 9.353 9.015 8.703 8.399 8.096 7.798 7.544 7.3 7.066 6.838 6.624 6.414 6.169 5.956 5.777 5.583 5.388 5.233 5.06 4.875 4.726 4.568 4.414 4.24 4.043 3.91 3.783 3.593 3.447 3.289 3.207 3.026 2.837 2.64 2.535 2.328 2.176 2.05 1.916 1.62 1.457 1.267 1.052 0.82 0.536 0.149 -1.001 -7 ,15427 ,TETRA ,17672839,Fri Dec 3 09:15:32 CET,Fri Dec 3 11:08:27 CET,0.0 0.928 1.169 1.333 1.479 1.618 1.753 1.878 2.098 2.198 2.295 2.381 2.561 2.635 2.779 2.928 3.068 3.129 3.254 3.376 3.54 3.656 3.774 3.928 4.077 4.217 4.341 4.464 4.62 4.77 4.919 5.106 5.283 5.448 5.634 5.843 6.042 6.26 6.485 6.71 6.936 7.179 7.474 7.783 8.126 8.473 8.828 9.206 9.638 9.997 10.239 10.191 9.993 9.743 9.437 9.146 8.859 8.59 8.355 8.088 7.841 7.626 7.419 7.223 7.02 6.807 6.578 6.367 6.189 6.004 5.821 5.674 5.513 5.332 5.178 5.024 4.87 4.704 4.53 4.406 4.278 4.076 3.928 3.775 3.7 3.552 3.398 3.233 3.143 2.958 2.867 2.764 2.646 2.394 2.245 2.091 1.929 1.751 1.537 1.208 0.342 -8 ,3361 ,TETRA ,17672840,Fri Dec 3 09:17:30 CET,Fri Dec 3 11:10:56 CET,0.0 0.731 1.033 1.222 1.402 1.575 1.727 1.864 2.093 2.2 2.307 2.404 2.582 2.66 2.813 2.955 3.086 3.15 3.281 3.411 3.582 3.686 3.791 3.938 4.073 4.206 4.333 4.459 4.626 4.784 4.928 5.083 5.24 5.394 5.564 5.754 5.938 6.138 6.341 6.55 6.765 6.992 7.27 7.572 7.908 8.255 8.625 8.996 9.37 9.703 9.917 9.88 9.673 9.403 9.121 8.83 8.537 8.236 7.991 7.732 7.485 7.256 7.027 6.802 6.588 6.391 6.174 5.971 5.801 5.616 5.416 5.25 5.078 4.905 4.767 4.623 4.471 4.301 4.102 3.958 3.82 3.614 3.465 3.315 3.231 3.042 2.862 2.671 2.561 2.346 2.194 2.069 1.938 1.632 1.458 1.274 1.07 0.809 0.442 -0.054 -1.46 -9 ,30101 ,TETRA ,17672841,Fri Dec 3 09:16:30 CET,Fri Dec 3 11:12:50 CET,0.0 0.618 0.853 1.054 1.231 1.391 1.529 1.653 1.894 2.001 2.092 2.174 2.364 2.447 2.604 2.748 2.883 2.949 3.072 3.192 3.355 3.456 3.559 3.703 3.827 3.946 4.078 4.208 4.364 4.515 4.656 4.82 4.986 5.141 5.311 5.506 5.69 5.881 6.092 6.322 6.552 6.809 7.124 7.432 7.776 8.143 8.521 8.875 9.238 9.623 9.829 9.777 9.591 9.313 8.995 8.695 8.412 8.136 7.883 7.609 7.371 7.156 6.941 6.725 6.513 6.317 6.111 5.908 5.735 5.56 5.372 5.216 5.033 4.831 4.683 4.539 4.383 4.22 4.051 3.927 3.802 3.628 3.512 3.366 3.283 3.114 2.941 2.763 2.672 2.485 2.385 2.276 2.165 1.893 1.747 1.609 1.448 1.262 1.034 0.72 -0.136 -10 ,15707 ,TETRA ,17672842,Fri Dec 3 09:16:31 CET,Fri Dec 3 11:10:11 CET,0.0 0.543 0.814 1.028 1.214 1.388 1.54 1.66 1.867 1.967 2.068 2.162 2.354 2.442 2.595 2.728 2.851 2.912 3.036 3.158 3.321 3.427 3.529 3.67 3.82 3.968 4.103 4.234 4.397 4.553 4.7 4.864 5.025 5.195 5.381 5.572 5.754 5.952 6.17 6.397 6.625 6.893 7.203 7.491 7.811 8.144 8.5 8.883 9.279 9.665 9.957 9.905 9.663 9.396 9.096 8.777 8.49 8.187 7.922 7.674 7.431 7.19 6.944 6.708 6.487 6.286 6.072 5.864 5.684 5.497 5.299 5.149 4.995 4.824 4.69 4.555 4.409 4.25 4.088 3.978 3.867 3.696 3.584 3.467 3.397 3.249 3.093 2.925 2.842 2.653 2.545 2.443 2.335 2.092 1.946 1.787 1.631 1.435 1.197 0.892 0.29 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_38_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_38_43.txt deleted file mode 100644 index f6fc1040..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_38_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6633 ,TETRA ,17606675,Sun Nov 28 20:52:03 CET,Sun Nov 28 22:43:36 CET,0.0 0.753 1.087 1.365 1.587 1.782 1.953 2.115 2.416 2.55 2.692 2.872 3.079 3.188 3.411 3.616 3.82 3.917 4.1 4.27 4.498 4.644 4.789 5.007 5.217 5.426 5.633 5.823 6.077 6.333 6.578 6.861 7.115 7.353 7.633 7.965 8.287 8.637 9.004 9.392 9.816 10.292 10.825 11.367 12.016 12.744 13.573 14.466 15.455 16.565 17.739 18.47 18.707 18.688 18.571 18.398 18.195 17.959 17.729 17.462 17.218 17.015 16.825 16.606 16.368 16.151 15.914 15.683 15.48 15.273 15.054 14.874 14.681 14.456 14.278 14.099 13.919 13.725 13.517 13.374 13.224 12.983 12.82 12.651 12.556 12.322 12.082 11.863 11.746 11.549 11.384 11.245 11.092 10.74 10.512 10.272 10.0 9.654 9.192 8.577 6.141 -2 ,19742 ,TETRA ,17606676,Sun Nov 28 20:52:03 CET,Sun Nov 28 22:41:18 CET,0.0 0.549 0.832 1.053 1.245 1.404 1.546 1.683 1.932 2.052 2.162 2.265 2.46 2.554 2.741 2.916 3.08 3.16 3.314 3.457 3.655 3.785 3.916 4.111 4.296 4.471 4.65 4.826 5.047 5.262 5.48 5.755 6.019 6.272 6.548 6.86 7.176 7.522 7.897 8.29 8.691 9.148 9.683 10.201 10.787 11.446 12.244 13.142 14.135 15.214 16.361 17.061 17.239 17.179 16.991 16.799 16.605 16.37 16.159 15.945 15.731 15.491 15.248 15.024 14.795 14.582 14.355 14.143 13.96 13.771 13.561 13.38 13.182 12.982 12.833 12.659 12.474 12.27 12.066 11.927 11.777 11.532 11.361 11.176 11.077 10.877 10.656 10.404 10.272 10.059 9.874 9.721 9.55 9.182 8.976 8.725 8.425 8.059 7.597 7.0 4.444 -3 ,30677 ,TETRA ,17606677,Sun Nov 28 20:52:04 CET,Sun Nov 28 22:44:16 CET,0.0 1.041 1.372 1.592 1.781 1.955 2.127 2.291 2.586 2.727 2.864 3.029 3.244 3.356 3.571 3.777 3.976 4.076 4.252 4.417 4.663 4.826 4.988 5.21 5.405 5.604 5.799 5.982 6.23 6.47 6.697 6.976 7.236 7.491 7.801 8.125 8.424 8.768 9.145 9.552 9.982 10.456 11.002 11.564 12.214 12.935 13.757 14.664 15.699 16.832 17.968 18.563 18.745 18.771 18.667 18.466 18.247 18.013 17.778 17.515 17.272 17.067 16.854 16.65 16.456 16.247 16.011 15.799 15.632 15.449 15.243 15.073 14.881 14.684 14.537 14.375 14.202 14.016 13.82 13.691 13.547 13.309 13.155 12.999 12.906 12.693 12.473 12.25 12.131 11.922 11.733 11.586 11.42 11.036 10.825 10.586 10.301 10.016 9.641 9.016 6.154 -4 ,214 ,TETRA ,17606678,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:43:58 CET,0.0 0.835 1.117 1.35 1.545 1.713 1.867 2.013 2.281 2.407 2.522 2.624 2.814 2.909 3.107 3.292 3.464 3.55 3.718 3.867 4.076 4.211 4.34 4.533 4.718 4.893 5.065 5.24 5.459 5.679 5.908 6.18 6.443 6.697 6.99 7.307 7.595 7.918 8.271 8.64 9.049 9.52 10.067 10.61 11.188 11.826 12.587 13.459 14.479 15.6 16.715 17.231 17.335 17.289 17.134 16.936 16.725 16.483 16.241 15.969 15.718 15.47 15.217 14.972 14.739 14.533 14.304 14.081 13.898 13.707 13.495 13.337 13.177 12.994 12.841 12.663 12.466 12.277 12.08 11.932 11.785 11.542 11.368 11.195 11.1 10.895 10.687 10.462 10.341 10.121 9.883 9.728 9.58 9.215 9.002 8.765 8.523 8.239 7.873 7.298 5.019 -5 ,14512 ,TETRA ,17606679,Sun Nov 28 20:52:03 CET,Sun Nov 28 22:43:59 CET,0.0 0.834 1.15 1.374 1.568 1.734 1.889 2.033 2.276 2.396 2.515 2.642 2.841 2.938 3.121 3.299 3.473 3.56 3.725 3.885 4.116 4.255 4.388 4.585 4.781 4.966 5.145 5.32 5.541 5.751 5.958 6.227 6.491 6.741 7.032 7.363 7.68 8.03 8.409 8.819 9.264 9.76 10.292 10.83 11.49 12.174 12.917 13.741 14.701 15.734 16.757 17.32 17.463 17.438 17.351 17.194 16.971 16.756 16.542 16.286 16.07 15.866 15.647 15.422 15.203 15.017 14.796 14.569 14.378 14.18 13.965 13.783 13.595 13.406 13.255 13.104 12.947 12.753 12.551 12.423 12.29 12.081 11.931 11.757 11.661 11.455 11.24 11.003 10.872 10.646 10.437 10.295 10.149 9.821 9.623 9.389 9.122 8.837 8.492 8.009 5.706 -6 ,28076 ,TETRA ,17606680,Sun Nov 28 20:52:03 CET,Sun Nov 28 22:43:56 CET,0.0 0.543 0.858 1.1 1.321 1.528 1.719 1.893 2.201 2.352 2.5 2.687 2.916 3.045 3.271 3.478 3.675 3.77 3.96 4.147 4.404 4.567 4.722 4.94 5.141 5.338 5.543 5.735 5.968 6.202 6.437 6.732 7.008 7.259 7.545 7.867 8.184 8.532 8.924 9.334 9.747 10.213 10.767 11.322 11.973 12.698 13.479 14.299 15.252 16.32 17.492 18.238 18.468 18.489 18.318 18.072 17.839 17.604 17.403 17.158 16.913 16.689 16.468 16.25 16.036 15.834 15.606 15.384 15.198 15.016 14.805 14.624 14.453 14.287 14.147 13.984 13.807 13.607 13.423 13.31 13.178 12.965 12.795 12.601 12.5 12.281 12.05 11.798 11.67 11.455 11.262 11.126 10.981 10.619 10.393 10.138 9.859 9.507 9.067 8.477 5.789 -7 ,27898 ,TETRA ,17606682,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:47:34 CET,0.0 0.693 1.008 1.239 1.455 1.627 1.784 1.938 2.204 2.312 2.415 2.518 2.715 2.806 2.993 3.186 3.367 3.452 3.609 3.756 3.973 4.116 4.257 4.458 4.65 4.834 5.014 5.199 5.44 5.675 5.917 6.223 6.509 6.769 7.057 7.385 7.708 8.067 8.478 8.899 9.311 9.761 10.269 10.798 11.436 12.15 12.966 13.859 14.859 15.945 17.074 17.674 17.854 17.873 17.77 17.606 17.426 17.215 16.958 16.697 16.452 16.208 15.974 15.756 15.554 15.354 15.141 14.936 14.74 14.544 14.347 14.161 13.957 13.759 13.601 13.419 13.228 13.032 12.839 12.709 12.578 12.364 12.193 12.02 11.935 11.748 11.555 11.346 11.228 11.021 10.82 10.667 10.5 10.119 9.913 9.677 9.382 9.024 8.613 8.089 5.553 -8 ,10337 ,TETRA ,17606683,Sun Nov 28 20:52:03 CET,Sun Nov 28 22:43:49 CET,0.0 0.53 0.832 1.09 1.29 1.479 1.66 1.817 2.084 2.209 2.327 2.44 2.643 2.743 2.936 3.128 3.312 3.398 3.574 3.747 3.998 4.168 4.334 4.577 4.801 4.997 5.179 5.359 5.605 5.839 6.057 6.333 6.605 6.867 7.162 7.483 7.811 8.173 8.538 8.926 9.33 9.763 10.297 10.847 11.442 12.104 12.884 13.761 14.758 15.82 16.837 17.447 17.661 17.681 17.566 17.378 17.167 16.97 16.768 16.516 16.279 16.054 15.829 15.615 15.395 15.16 14.917 14.698 14.486 14.275 14.057 13.87 13.684 13.489 13.339 13.178 12.993 12.802 12.605 12.468 12.327 12.097 11.935 11.771 11.682 11.5 11.283 11.02 10.888 10.673 10.482 10.32 10.153 9.794 9.59 9.369 9.127 8.812 8.377 7.838 5.883 -9 ,9277 ,TETRA ,17606684,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:44:15 CET,0.0 1.324 1.72 2.023 2.277 2.486 2.67 2.854 3.207 3.354 3.476 3.633 3.849 3.96 4.173 4.367 4.551 4.645 4.822 4.992 5.246 5.405 5.565 5.811 6.039 6.252 6.459 6.649 6.892 7.125 7.344 7.62 7.894 8.152 8.45 8.788 9.114 9.462 9.838 10.254 10.68 11.147 11.713 12.291 12.934 13.641 14.434 15.296 16.305 17.365 18.439 19.112 19.286 19.23 19.092 18.924 18.726 18.504 18.284 18.034 17.777 17.52 17.287 17.064 16.83 16.615 16.384 16.173 15.985 15.774 15.548 15.364 15.181 14.967 14.793 14.627 14.448 14.25 14.042 13.903 13.764 13.52 13.343 13.163 13.063 12.846 12.635 12.412 12.294 12.082 11.843 11.658 11.485 11.15 10.962 10.745 10.501 10.199 9.795 9.267 7.359 -10 ,26469 ,TETRA ,17606685,Sun Nov 28 20:52:03 CET,Sun Nov 28 22:45:02 CET,0.0 1.095 1.521 1.848 2.081 2.286 2.481 2.648 2.936 3.074 3.203 3.343 3.544 3.647 3.847 4.031 4.212 4.302 4.487 4.66 4.904 5.064 5.223 5.449 5.644 5.826 6.01 6.193 6.43 6.659 6.878 7.134 7.385 7.634 7.934 8.262 8.563 8.905 9.27 9.649 10.037 10.479 10.999 11.539 12.172 12.87 13.696 14.564 15.457 16.495 17.75 18.403 18.5 18.441 18.273 18.076 17.839 17.589 17.369 17.113 16.881 16.676 16.465 16.256 16.056 15.856 15.641 15.439 15.25 15.05 14.852 14.691 14.512 14.311 14.14 13.96 13.775 13.569 13.348 13.195 13.042 12.816 12.65 12.467 12.378 12.19 11.978 11.746 11.626 11.41 11.226 11.088 10.927 10.57 10.38 10.167 9.903 9.595 9.241 8.761 6.657 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_39_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_39_19.txt deleted file mode 100644 index 862f7f2e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_39_19.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14094 ,KEBNE ,17027716,Wed Dec 22 17:45:10 CET,Wed Dec 22 19:23:15 CET,0.0 0.223 0.316 0.393 0.472 0.537 0.581 0.616 0.685 0.72 0.752 0.726 0.829 0.849 0.888 0.93 0.959 0.97 0.995 1.022 1.052 1.064 1.077 1.108 1.142 1.17 1.19 1.198 1.201 1.202 1.207 1.204 1.204 1.213 1.21 1.187 1.156 1.12 1.08 1.041 0.983 0.874 0.713 0.526 0.288 -0.05 -0.562 -1.248 -2.237 -3.761 -6.238 -9.033 -11.266 -13.153 -14.71 -16.044 -17.197 -18.195 -19.04 -19.916 -20.638 -21.243 -21.868 -22.476 -23.007 -23.489 -23.994 -24.435 -24.814 -25.216 -25.651 -26.003 -26.343 -26.693 -26.993 -27.315 -27.63 -27.941 -28.272 -28.504 -28.747 -29.151 -29.425 -29.681 -29.811 -30.104 -30.449 -30.793 -30.979 -31.299 -31.609 -31.84 -32.088 -32.621 -32.911 -33.21 -33.54 -33.942 -34.454 -35.167 -38.84 -2 ,4552 ,KEBNE ,17027717,Wed Dec 22 17:45:10 CET,Wed Dec 22 19:22:14 CET,0.0 0.244 0.348 0.42 0.48 0.542 0.585 0.609 0.678 0.72 0.761 0.748 0.851 0.868 0.898 0.946 0.986 0.997 1.027 1.058 1.1 1.12 1.14 1.172 1.204 1.226 1.248 1.277 1.3 1.312 1.331 1.356 1.386 1.424 1.453 1.463 1.458 1.44 1.402 1.335 1.242 1.123 0.949 0.759 0.494 0.116 -0.387 -1.095 -2.186 -3.77 -6.206 -8.925 -11.148 -13.05 -14.618 -15.962 -17.116 -18.139 -19.021 -19.892 -20.619 -21.27 -21.871 -22.43 -22.956 -23.431 -23.937 -24.405 -24.805 -25.195 -25.596 -25.935 -26.267 -26.619 -26.91 -27.203 -27.51 -27.841 -28.194 -28.449 -28.702 -29.091 -29.367 -29.651 -29.796 -30.111 -30.444 -30.788 -30.975 -31.285 -31.604 -31.82 -32.036 -32.511 -32.779 -33.085 -33.43 -33.814 -34.273 -34.925 -37.351 -4 ,3243 ,KEBNE ,17027719,Wed Dec 22 17:45:11 CET,Wed Dec 22 19:20:40 CET,0.0 0.3 0.386 0.454 0.516 0.572 0.629 0.686 0.762 0.792 0.825 0.791 0.893 0.921 0.999 1.081 1.145 1.17 1.213 1.254 1.311 1.343 1.373 1.408 1.435 1.467 1.497 1.523 1.554 1.581 1.598 1.603 1.596 1.594 1.596 1.583 1.568 1.564 1.528 1.45 1.356 1.24 1.067 0.873 0.64 0.273 -0.278 -1.051 -2.139 -3.672 -6.151 -9.046 -11.297 -13.131 -14.706 -16.085 -17.217 -18.186 -19.018 -19.838 -20.556 -21.24 -21.869 -22.422 -22.935 -23.426 -23.965 -24.431 -24.833 -25.233 -25.64 -26.003 -26.376 -26.741 -27.023 -27.319 -27.648 -27.997 -28.324 -28.541 -28.768 -29.144 -29.409 -29.694 -29.835 -30.127 -30.453 -30.78 -30.955 -31.262 -31.558 -31.776 -32.027 -32.593 -32.883 -33.189 -33.546 -33.965 -34.501 -35.244 -39.283 -5 ,21753 ,KEBNE ,17027720,Wed Dec 22 17:45:11 CET,Wed Dec 22 19:20:51 CET,0.0 0.146 0.223 0.29 0.35 0.399 0.449 0.499 0.6 0.643 0.678 0.664 0.778 0.809 0.848 0.881 0.917 0.932 0.962 1.001 1.054 1.076 1.099 1.129 1.146 1.17 1.21 1.247 1.287 1.306 1.333 1.379 1.406 1.426 1.449 1.451 1.443 1.435 1.409 1.361 1.293 1.207 1.058 0.864 0.6 0.236 -0.268 -0.987 -2.045 -3.588 -6.083 -8.9 -11.147 -13.028 -14.585 -15.959 -17.157 -18.187 -19.038 -19.886 -20.62 -21.292 -21.923 -22.505 -23.048 -23.541 -24.08 -24.566 -24.967 -25.381 -25.803 -26.148 -26.506 -26.888 -27.197 -27.523 -27.852 -28.166 -28.483 -28.713 -28.953 -29.322 -29.599 -29.896 -30.046 -30.348 -30.653 -30.982 -31.159 -31.453 -31.756 -31.983 -32.232 -32.805 -33.1 -33.407 -33.762 -34.174 -34.66 -35.389 -38.69 -6 ,15850 ,KEBNE ,17027721,Wed Dec 22 17:45:11 CET,Wed Dec 22 19:21:21 CET,0.0 0.385 0.544 0.678 0.786 0.878 0.958 1.025 1.139 1.19 1.235 1.241 1.361 1.401 1.476 1.548 1.621 1.647 1.696 1.749 1.813 1.854 1.898 1.95 1.981 2.011 2.036 2.058 2.091 2.125 2.156 2.178 2.19 2.209 2.238 2.261 2.253 2.215 2.172 2.132 2.081 2.003 1.871 1.701 1.451 1.105 0.617 -0.069 -1.099 -2.678 -5.241 -8.14 -10.386 -12.199 -13.723 -15.075 -16.23 -17.248 -18.121 -18.968 -19.667 -20.277 -20.866 -21.44 -21.958 -22.417 -22.885 -23.326 -23.722 -24.132 -24.558 -24.907 -25.283 -25.67 -25.966 -26.269 -26.567 -26.871 -27.199 -27.43 -27.682 -28.086 -28.356 -28.621 -28.768 -29.077 -29.405 -29.771 -29.959 -30.269 -30.594 -30.829 -31.067 -31.54 -31.822 -32.154 -32.51 -32.912 -33.408 -34.06 -37.723 -7 ,25585 ,KEBNE ,17027722,Wed Dec 22 17:45:11 CET,Wed Dec 22 19:22:45 CET,0.0 0.237 0.332 0.406 0.463 0.5 0.539 0.577 0.652 0.687 0.718 0.696 0.807 0.838 0.891 0.938 0.982 1.001 1.03 1.064 1.117 1.145 1.17 1.211 1.242 1.266 1.299 1.324 1.353 1.4 1.44 1.46 1.471 1.477 1.475 1.473 1.464 1.435 1.391 1.337 1.27 1.187 1.048 0.851 0.591 0.22 -0.301 -0.983 -2.0 -3.557 -6.01 -8.823 -11.097 -12.957 -14.539 -15.906 -17.023 -18.024 -18.895 -19.771 -20.548 -21.237 -21.922 -22.575 -23.174 -23.717 -24.252 -24.695 -25.06 -25.449 -25.878 -26.217 -26.573 -26.98 -27.299 -27.629 -27.966 -28.291 -28.636 -28.884 -29.13 -29.491 -29.747 -30.029 -30.178 -30.496 -30.854 -31.219 -31.399 -31.7 -31.993 -32.197 -32.426 -32.979 -33.281 -33.588 -33.952 -34.408 -34.967 -35.759 -40.06 -8 ,31983 ,KEBNE ,17027723,Wed Dec 22 17:45:11 CET,Wed Dec 22 19:21:18 CET,0.0 0.204 0.354 0.453 0.514 0.564 0.621 0.681 0.79 0.852 0.908 0.906 1.024 1.066 1.139 1.209 1.276 1.303 1.364 1.424 1.49 1.529 1.569 1.625 1.676 1.727 1.766 1.803 1.853 1.887 1.919 1.957 1.976 1.981 1.994 2.014 2.023 2.017 1.979 1.92 1.852 1.744 1.585 1.408 1.146 0.762 0.253 -0.471 -1.543 -3.087 -5.497 -8.268 -10.515 -12.385 -13.912 -15.219 -16.357 -17.346 -18.195 -19.061 -19.811 -20.447 -21.017 -21.565 -22.079 -22.516 -22.98 -23.42 -23.793 -24.183 -24.597 -24.937 -25.289 -25.649 -25.92 -26.202 -26.501 -26.828 -27.171 -27.398 -27.627 -27.99 -28.242 -28.501 -28.638 -28.923 -29.221 -29.539 -29.714 -30.003 -30.297 -30.511 -30.723 -31.226 -31.527 -31.838 -32.194 -32.611 -33.1 -33.772 -36.549 -9 ,20098 ,KEBNE ,17027724,Wed Dec 22 17:45:11 CET,Wed Dec 22 19:22:46 CET,0.0 0.218 0.3 0.374 0.442 0.501 0.565 0.619 0.698 0.728 0.756 0.731 0.833 0.859 0.911 0.958 0.992 1.005 1.031 1.061 1.107 1.134 1.157 1.188 1.209 1.226 1.247 1.263 1.273 1.277 1.282 1.292 1.311 1.325 1.333 1.326 1.306 1.296 1.281 1.226 1.147 1.056 0.922 0.74 0.467 0.08 -0.446 -1.167 -2.209 -3.711 -6.165 -9.051 -11.305 -13.122 -14.618 -15.901 -17.009 -17.981 -18.793 -19.598 -20.3 -20.924 -21.501 -22.04 -22.541 -22.995 -23.481 -23.921 -24.302 -24.7 -25.117 -25.456 -25.807 -26.164 -26.452 -26.76 -27.068 -27.381 -27.71 -27.937 -28.195 -28.625 -28.901 -29.175 -29.316 -29.607 -29.918 -30.264 -30.448 -30.76 -31.092 -31.324 -31.562 -32.109 -32.417 -32.733 -33.066 -33.459 -33.953 -34.676 -37.522 -10 ,25963 ,KEBNE ,17027725,Wed Dec 22 17:45:12 CET,Wed Dec 22 19:21:37 CET,0.0 0.311 0.397 0.471 0.537 0.584 0.622 0.666 0.75 0.791 0.826 0.811 0.917 0.939 0.983 1.019 1.046 1.061 1.091 1.118 1.172 1.2 1.224 1.257 1.289 1.32 1.348 1.371 1.403 1.443 1.464 1.473 1.479 1.484 1.48 1.47 1.443 1.408 1.366 1.314 1.241 1.142 0.987 0.782 0.504 0.119 -0.419 -1.175 -2.246 -3.867 -6.513 -9.469 -11.784 -13.657 -15.217 -16.586 -17.75 -18.78 -19.647 -20.55 -21.322 -21.948 -22.54 -23.118 -23.64 -24.104 -24.591 -25.039 -25.436 -25.821 -26.204 -26.545 -26.912 -27.267 -27.536 -27.822 -28.13 -28.454 -28.78 -29.012 -29.261 -29.645 -29.912 -30.199 -30.345 -30.655 -30.974 -31.3 -31.463 -31.743 -32.021 -32.235 -32.47 -32.966 -33.234 -33.512 -33.85 -34.297 -34.874 -35.622 -38.472 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_39_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_39_28.txt deleted file mode 100644 index 4e201120..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_39_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28875 ,TETRA ,17606686,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:44:48 CET,0.0 0.775 1.05 1.294 1.501 1.675 1.823 1.966 2.226 2.341 2.465 2.638 2.839 2.956 3.169 3.371 3.564 3.658 3.854 4.041 4.309 4.492 4.675 4.92 5.143 5.368 5.595 5.816 6.11 6.402 6.679 7.011 7.345 7.667 8.036 8.459 8.862 9.305 9.776 10.296 10.858 11.485 12.221 12.977 13.822 14.762 15.858 17.031 18.427 20.059 21.87 23.059 23.49 23.57 23.481 23.28 23.058 22.815 22.541 22.27 21.994 21.7 21.448 21.207 20.963 20.735 20.489 20.256 20.049 19.827 19.593 19.398 19.191 18.978 18.802 18.614 18.411 18.204 18.006 17.867 17.719 17.487 17.309 17.105 17.003 16.801 16.58 16.323 16.19 15.978 15.727 15.574 15.397 15.005 14.812 14.599 14.36 14.08 13.681 13.142 8.996 -2 ,12111 ,TETRA ,17606687,Sun Nov 28 20:52:03 CET,Sun Nov 28 22:44:56 CET,0.0 0.551 0.812 1.055 1.241 1.379 1.508 1.635 1.892 2.019 2.139 2.28 2.462 2.56 2.754 2.937 3.128 3.217 3.38 3.545 3.787 3.944 4.109 4.337 4.556 4.771 4.986 5.202 5.472 5.738 5.993 6.3 6.587 6.864 7.204 7.607 7.994 8.405 8.851 9.331 9.85 10.468 11.183 11.891 12.751 13.707 14.814 16.079 17.51 19.209 21.093 22.428 22.98 23.097 23.024 22.845 22.624 22.384 22.169 21.897 21.639 21.39 21.127 20.88 20.634 20.411 20.167 19.926 19.696 19.444 19.187 18.969 18.744 18.496 18.293 18.083 17.878 17.662 17.413 17.24 17.063 16.785 16.568 16.326 16.212 15.968 15.707 15.421 15.266 15.052 14.791 14.614 14.434 14.061 13.848 13.603 13.315 12.997 12.613 12.069 9.02 -3 ,26557 ,TETRA ,17606688,Sun Nov 28 20:52:04 CET,Sun Nov 28 22:44:28 CET,0.0 0.795 1.069 1.298 1.47 1.645 1.825 1.978 2.236 2.365 2.493 2.636 2.824 2.937 3.146 3.362 3.578 3.673 3.844 4.014 4.28 4.453 4.621 4.86 5.079 5.304 5.531 5.755 6.039 6.308 6.588 6.944 7.298 7.64 8.023 8.455 8.876 9.337 9.836 10.379 10.961 11.621 12.406 13.222 14.176 15.232 16.427 17.769 19.331 21.117 23.147 24.586 25.252 25.538 25.561 25.46 25.302 25.116 24.892 24.592 24.305 24.049 23.779 23.514 23.296 23.091 22.846 22.608 22.394 22.16 21.901 21.689 21.477 21.246 21.064 20.876 20.678 20.476 20.264 20.114 19.947 19.671 19.469 19.258 19.154 18.932 18.708 18.457 18.308 18.098 17.868 17.69 17.517 17.143 16.905 16.642 16.355 16.026 15.595 15.004 12.009 -4 ,24870 ,TETRA ,17606689,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:44:39 CET,0.0 1.15 1.373 1.567 1.743 1.885 2.044 2.202 2.479 2.611 2.741 2.906 3.103 3.221 3.444 3.657 3.859 3.95 4.125 4.309 4.592 4.768 4.922 5.156 5.403 5.658 5.902 6.128 6.421 6.704 6.984 7.316 7.649 7.975 8.34 8.775 9.214 9.693 10.211 10.768 11.353 12.016 12.786 13.536 14.389 15.336 16.444 17.668 19.055 20.649 22.449 23.461 23.765 23.889 23.857 23.699 23.512 23.31 23.12 22.875 22.627 22.403 22.17 21.907 21.648 21.42 21.167 20.934 20.738 20.518 20.266 20.063 19.863 19.651 19.484 19.294 19.077 18.866 18.648 18.487 18.315 18.058 17.885 17.701 17.602 17.398 17.18 16.934 16.809 16.611 16.364 16.209 16.041 15.661 15.449 15.206 14.897 14.535 14.095 13.5 11.029 -5 ,131 ,TETRA ,17606690,Sun Nov 28 20:52:04 CET,Sun Nov 28 22:44:34 CET,0.0 0.871 1.165 1.428 1.658 1.854 2.021 2.18 2.505 2.66 2.798 2.947 3.143 3.257 3.485 3.706 3.914 4.015 4.212 4.406 4.7 4.884 5.061 5.315 5.556 5.788 6.018 6.245 6.529 6.808 7.081 7.396 7.704 8.013 8.373 8.789 9.197 9.649 10.135 10.663 11.227 11.86 12.592 13.314 14.175 15.202 16.422 17.754 19.277 20.995 22.806 24.036 24.618 24.817 24.797 24.641 24.407 24.184 23.959 23.722 23.466 23.193 22.939 22.688 22.434 22.195 21.93 21.665 21.442 21.21 20.964 20.769 20.559 20.329 20.15 19.959 19.759 19.536 19.3 19.147 18.988 18.736 18.555 18.354 18.253 18.044 17.818 17.574 17.445 17.25 17.011 16.849 16.686 16.321 16.101 15.861 15.586 15.261 14.843 14.299 11.599 -6 ,4257 ,TETRA ,17606691,Sun Nov 28 20:52:07 CET,Sun Nov 28 22:44:44 CET,0.0 0.756 1.013 1.242 1.451 1.644 1.807 1.945 2.225 2.366 2.495 2.655 2.841 2.947 3.149 3.341 3.544 3.642 3.823 4.003 4.29 4.481 4.662 4.928 5.19 5.459 5.72 5.95 6.242 6.525 6.819 7.189 7.522 7.853 8.248 8.692 9.112 9.572 10.066 10.582 11.131 11.755 12.497 13.244 14.136 15.134 16.262 17.555 19.078 20.801 22.659 23.982 24.639 24.824 24.738 24.654 24.57 24.433 24.275 24.071 23.831 23.573 23.317 23.069 22.834 22.609 22.365 22.159 21.964 21.748 21.526 21.328 21.109 20.886 20.719 20.524 20.311 20.112 19.902 19.756 19.6 19.326 19.134 18.93 18.827 18.612 18.385 18.145 18.012 17.8 17.536 17.37 17.199 16.803 16.587 16.35 16.078 15.775 15.412 14.841 12.109 -7 ,4139 ,TETRA ,17606692,Sun Nov 28 20:52:08 CET,Sun Nov 28 22:44:48 CET,0.0 1.179 1.517 1.743 1.935 2.123 2.302 2.461 2.72 2.848 2.98 3.153 3.348 3.466 3.714 3.934 4.129 4.234 4.435 4.619 4.911 5.099 5.275 5.552 5.824 6.088 6.344 6.59 6.916 7.221 7.52 7.896 8.249 8.586 8.966 9.377 9.786 10.255 10.77 11.334 11.912 12.524 13.25 13.993 14.907 15.931 17.061 18.368 19.949 21.763 23.82 25.366 25.955 26.144 26.207 26.094 25.873 25.621 25.386 25.091 24.794 24.517 24.23 23.955 23.702 23.463 23.208 22.968 22.745 22.48 22.185 21.948 21.699 21.433 21.237 21.037 20.811 20.572 20.329 20.161 19.982 19.695 19.48 19.247 19.135 18.902 18.653 18.376 18.224 18.012 17.768 17.608 17.446 17.097 16.883 16.639 16.381 16.099 15.739 15.195 11.576 -8 ,13186 ,TETRA ,17606693,Sun Nov 28 20:52:04 CET,Sun Nov 28 22:45:16 CET,0.0 0.567 0.789 0.979 1.157 1.325 1.485 1.627 1.895 2.031 2.165 2.331 2.523 2.625 2.826 3.033 3.223 3.314 3.502 3.684 3.944 4.113 4.284 4.535 4.783 5.013 5.229 5.447 5.742 6.048 6.34 6.681 7.01 7.325 7.703 8.143 8.551 8.986 9.474 10.021 10.599 11.242 11.998 12.762 13.644 14.618 15.729 16.97 18.4 20.01 21.781 23.041 23.515 23.619 23.58 23.422 23.237 23.088 22.9 22.663 22.436 22.188 21.938 21.685 21.423 21.169 20.907 20.666 20.46 20.233 19.979 19.769 19.555 19.334 19.164 18.982 18.786 18.589 18.377 18.221 18.062 17.828 17.667 17.493 17.394 17.183 16.966 16.729 16.595 16.393 16.188 16.044 15.868 15.456 15.218 14.971 14.702 14.373 13.913 13.243 10.749 -9 ,5496 ,TETRA ,17606694,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:45:10 CET,0.0 0.879 1.219 1.445 1.659 1.833 1.975 2.124 2.407 2.53 2.651 2.812 3.012 3.122 3.349 3.576 3.777 3.875 4.076 4.282 4.601 4.793 4.969 5.222 5.465 5.712 5.947 6.164 6.45 6.739 7.028 7.375 7.712 8.036 8.395 8.797 9.203 9.656 10.153 10.696 11.274 11.928 12.667 13.425 14.338 15.349 16.457 17.66 19.025 20.571 22.397 23.761 24.2 24.324 24.347 24.228 24.049 23.799 23.532 23.238 22.973 22.718 22.441 22.158 21.881 21.611 21.344 21.115 20.903 20.683 20.437 20.202 19.94 19.681 19.489 19.288 19.076 18.859 18.626 18.467 18.307 18.062 17.891 17.71 17.611 17.394 17.163 16.923 16.806 16.623 16.416 16.268 16.108 15.744 15.545 15.318 15.022 14.697 14.297 13.698 10.301 -10 ,29926 ,TETRA ,17606695,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:45:27 CET,0.0 0.958 1.261 1.508 1.72 1.905 2.057 2.186 2.431 2.548 2.666 2.804 2.985 3.082 3.274 3.469 3.65 3.739 3.91 4.068 4.318 4.478 4.624 4.841 5.049 5.252 5.465 5.688 5.982 6.259 6.54 6.896 7.26 7.624 8.022 8.471 8.894 9.351 9.847 10.376 10.932 11.573 12.312 13.009 13.879 14.915 16.078 17.337 18.778 20.356 22.09 23.363 23.885 24.025 23.935 23.743 23.495 23.22 22.923 22.59 22.282 21.952 21.624 21.33 21.049 20.807 20.544 20.289 20.065 19.845 19.624 19.421 19.201 18.957 18.765 18.565 18.358 18.146 17.905 17.733 17.556 17.275 17.078 16.857 16.735 16.498 16.257 15.979 15.843 15.643 15.405 15.248 15.07 14.666 14.441 14.177 13.883 13.558 13.145 12.559 8.304 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_39_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_39_37.txt deleted file mode 100644 index 1cddde4b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_39_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25857 ,TETRA ,17606696,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:45:48 CET,0.0 1.018 1.473 1.792 2.058 2.275 2.457 2.608 2.86 2.968 3.063 3.175 3.341 3.427 3.605 3.771 3.912 3.978 4.105 4.231 4.4 4.488 4.568 4.686 4.79 4.9 5.003 5.083 5.184 5.284 5.378 5.493 5.604 5.699 5.799 5.903 5.98 6.042 6.093 6.135 6.169 6.182 6.169 6.142 6.068 5.921 5.676 5.287 4.678 3.7 2.02 -0.035 -1.682 -3.038 -4.179 -5.16 -5.987 -6.726 -7.355 -7.977 -8.508 -8.97 -9.408 -9.816 -10.192 -10.529 -10.873 -11.176 -11.44 -11.723 -12.028 -12.286 -12.547 -12.81 -13.007 -13.214 -13.429 -13.645 -13.865 -14.015 -14.174 -14.44 -14.623 -14.796 -14.885 -15.076 -15.277 -15.483 -15.591 -15.801 -15.954 -16.082 -16.218 -16.538 -16.715 -16.905 -17.108 -17.331 -17.592 -17.955 -19.261 -2 ,14571 ,TETRA ,17606697,Sun Nov 28 20:52:08 CET,Sun Nov 28 22:45:45 CET,0.0 0.966 1.31 1.552 1.748 1.914 2.055 2.183 2.4 2.492 2.579 2.664 2.822 2.902 3.054 3.182 3.301 3.362 3.498 3.635 3.808 3.897 3.974 4.096 4.213 4.315 4.408 4.496 4.604 4.708 4.804 4.92 5.024 5.123 5.239 5.343 5.425 5.517 5.595 5.656 5.713 5.758 5.768 5.709 5.616 5.485 5.255 4.887 4.283 3.277 1.604 -0.326 -1.917 -3.231 -4.345 -5.299 -6.13 -6.884 -7.498 -8.108 -8.626 -9.09 -9.537 -9.95 -10.326 -10.675 -11.043 -11.362 -11.629 -11.899 -12.181 -12.412 -12.644 -12.882 -13.071 -13.269 -13.473 -13.698 -13.931 -14.083 -14.236 -14.477 -14.651 -14.833 -14.929 -15.135 -15.342 -15.558 -15.67 -15.882 -16.031 -16.157 -16.287 -16.559 -16.728 -16.928 -17.136 -17.375 -17.669 -18.037 -19.434 -3 ,9545 ,TETRA ,17606698,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:45:11 CET,0.0 0.77 1.049 1.265 1.424 1.568 1.703 1.816 2.022 2.104 2.179 2.248 2.399 2.473 2.612 2.737 2.833 2.882 2.979 3.064 3.189 3.268 3.339 3.429 3.515 3.597 3.675 3.758 3.863 3.95 4.03 4.126 4.211 4.284 4.361 4.438 4.495 4.545 4.608 4.68 4.745 4.804 4.822 4.819 4.78 4.643 4.412 4.07 3.499 2.546 0.929 -1.014 -2.679 -4.089 -5.29 -6.336 -7.197 -7.948 -8.607 -9.265 -9.827 -10.333 -10.808 -11.251 -11.665 -12.042 -12.431 -12.775 -13.065 -13.356 -13.66 -13.917 -14.178 -14.446 -14.659 -14.892 -15.133 -15.373 -15.619 -15.789 -15.961 -16.226 -16.426 -16.64 -16.749 -16.972 -17.203 -17.455 -17.581 -17.798 -17.977 -18.118 -18.258 -18.573 -18.737 -18.906 -19.113 -19.362 -19.637 -19.985 -21.51 -4 ,32233 ,TETRA ,17606699,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:45:15 CET,0.0 1.15 1.532 1.792 2.019 2.211 2.38 2.54 2.812 2.933 3.044 3.174 3.343 3.424 3.574 3.711 3.844 3.906 4.026 4.141 4.299 4.391 4.47 4.59 4.7 4.799 4.899 4.998 5.117 5.212 5.305 5.41 5.493 5.575 5.664 5.764 5.854 5.941 6.03 6.095 6.111 6.109 6.096 6.067 5.972 5.83 5.622 5.235 4.613 3.647 1.969 0.03 -1.546 -2.877 -3.971 -4.949 -5.813 -6.599 -7.267 -7.899 -8.441 -8.904 -9.322 -9.734 -10.112 -10.45 -10.793 -11.095 -11.361 -11.641 -11.935 -12.176 -12.429 -12.693 -12.902 -13.109 -13.311 -13.512 -13.717 -13.865 -14.024 -14.269 -14.442 -14.628 -14.723 -14.92 -15.122 -15.333 -15.445 -15.653 -15.816 -15.957 -16.098 -16.389 -16.561 -16.753 -16.951 -17.164 -17.405 -17.755 -19.161 -5 ,17137 ,TETRA ,17606700,Sun Nov 28 20:52:07 CET,Sun Nov 28 22:45:18 CET,0.0 0.805 1.05 1.22 1.386 1.535 1.656 1.767 1.984 2.084 2.177 2.269 2.418 2.488 2.627 2.742 2.847 2.894 2.978 3.064 3.196 3.283 3.371 3.491 3.606 3.711 3.808 3.901 4.012 4.118 4.212 4.306 4.391 4.48 4.578 4.672 4.749 4.83 4.913 4.992 5.05 5.081 5.084 5.048 4.963 4.806 4.559 4.236 3.752 2.875 1.236 -0.741 -2.353 -3.745 -4.908 -5.889 -6.714 -7.434 -8.052 -8.662 -9.195 -9.672 -10.1 -10.496 -10.875 -11.22 -11.572 -11.873 -12.138 -12.422 -12.709 -12.953 -13.204 -13.455 -13.649 -13.846 -14.047 -14.258 -14.474 -14.624 -14.781 -15.027 -15.198 -15.385 -15.483 -15.684 -15.894 -16.125 -16.247 -16.461 -16.617 -16.747 -16.886 -17.211 -17.385 -17.564 -17.772 -18.014 -18.302 -18.706 -20.243 -6 ,27253 ,TETRA ,17606701,Sun Nov 28 20:52:07 CET,Sun Nov 28 22:45:15 CET,0.0 1.071 1.434 1.729 1.942 2.116 2.272 2.427 2.718 2.837 2.949 3.088 3.258 3.345 3.498 3.63 3.761 3.82 3.926 4.039 4.198 4.291 4.38 4.513 4.644 4.746 4.834 4.921 5.022 5.123 5.23 5.365 5.488 5.574 5.668 5.775 5.858 5.928 5.967 5.981 5.998 6.021 6.01 5.958 5.862 5.704 5.448 5.085 4.503 3.535 1.87 -0.064 -1.671 -3.025 -4.156 -5.134 -5.958 -6.693 -7.31 -7.926 -8.445 -8.9 -9.331 -9.743 -10.121 -10.46 -10.829 -11.156 -11.429 -11.71 -12.009 -12.256 -12.511 -12.767 -12.963 -13.168 -13.373 -13.581 -13.802 -13.96 -14.126 -14.375 -14.539 -14.717 -14.813 -15.015 -15.216 -15.413 -15.523 -15.742 -15.898 -16.036 -16.184 -16.49 -16.658 -16.843 -17.033 -17.262 -17.591 -17.977 -19.158 -7 ,13900 ,TETRA ,17606702,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:45:53 CET,0.0 0.795 1.092 1.315 1.496 1.653 1.786 1.898 2.116 2.216 2.306 2.389 2.54 2.61 2.748 2.873 2.981 3.035 3.14 3.236 3.358 3.435 3.514 3.635 3.74 3.831 3.921 4.006 4.1 4.184 4.266 4.371 4.459 4.529 4.615 4.704 4.774 4.849 4.892 4.909 4.924 4.913 4.886 4.841 4.748 4.568 4.273 3.858 3.274 2.338 0.642 -1.422 -3.075 -4.403 -5.509 -6.488 -7.297 -8.035 -8.673 -9.27 -9.771 -10.23 -10.667 -11.06 -11.425 -11.76 -12.113 -12.43 -12.699 -12.971 -13.265 -13.512 -13.755 -14.005 -14.197 -14.398 -14.609 -14.831 -15.053 -15.197 -15.351 -15.596 -15.776 -15.967 -16.06 -16.239 -16.426 -16.627 -16.731 -16.933 -17.074 -17.205 -17.337 -17.619 -17.782 -17.96 -18.157 -18.403 -18.706 -19.071 -20.495 -8 ,25534 ,TETRA ,17606703,Sun Nov 28 20:52:08 CET,Sun Nov 28 22:45:28 CET,0.0 0.95 1.266 1.519 1.707 1.853 1.991 2.119 2.327 2.417 2.505 2.593 2.751 2.824 2.959 3.075 3.175 3.224 3.321 3.411 3.529 3.601 3.667 3.757 3.85 3.944 4.034 4.111 4.21 4.3 4.388 4.497 4.595 4.686 4.793 4.885 4.952 5.032 5.102 5.15 5.194 5.235 5.262 5.257 5.21 5.127 4.943 4.614 4.062 3.103 1.439 -0.555 -2.174 -3.526 -4.694 -5.71 -6.55 -7.306 -7.952 -8.575 -9.093 -9.545 -9.964 -10.361 -10.732 -11.056 -11.388 -11.7 -11.964 -12.234 -12.517 -12.741 -12.973 -13.22 -13.412 -13.61 -13.816 -14.029 -14.258 -14.417 -14.578 -14.828 -14.996 -15.171 -15.261 -15.457 -15.663 -15.878 -15.995 -16.211 -16.363 -16.494 -16.636 -16.945 -17.12 -17.307 -17.498 -17.722 -18.015 -18.393 -19.826 -9 ,14419 ,TETRA ,17606704,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:45:17 CET,0.0 0.973 1.29 1.522 1.732 1.901 2.046 2.184 2.427 2.534 2.63 2.728 2.89 2.964 3.09 3.206 3.329 3.384 3.486 3.576 3.687 3.757 3.82 3.9 3.991 4.083 4.16 4.237 4.344 4.436 4.512 4.594 4.677 4.756 4.828 4.894 4.947 5.004 5.073 5.145 5.196 5.239 5.265 5.235 5.179 5.047 4.775 4.406 3.828 2.836 1.148 -0.822 -2.402 -3.712 -4.795 -5.765 -6.602 -7.333 -7.965 -8.591 -9.116 -9.579 -10.016 -10.415 -10.799 -11.156 -11.515 -11.84 -12.112 -12.389 -12.685 -12.927 -13.185 -13.451 -13.655 -13.86 -14.062 -14.282 -14.517 -14.672 -14.824 -15.066 -15.236 -15.407 -15.497 -15.69 -15.89 -16.102 -16.214 -16.417 -16.553 -16.678 -16.813 -17.119 -17.299 -17.49 -17.686 -17.921 -18.218 -18.613 -20.279 -10 ,29977 ,TETRA ,17606705,Sun Nov 28 20:52:06 CET,Sun Nov 28 22:47:01 CET,0.0 1.142 1.541 1.82 2.055 2.249 2.417 2.571 2.848 2.967 3.08 3.207 3.369 3.445 3.589 3.731 3.858 3.922 4.045 4.153 4.305 4.404 4.501 4.63 4.748 4.864 4.968 5.06 5.171 5.272 5.366 5.466 5.56 5.656 5.754 5.835 5.896 5.963 6.031 6.097 6.17 6.237 6.271 6.26 6.218 6.115 5.873 5.506 4.917 3.954 2.344 0.35 -1.275 -2.587 -3.677 -4.657 -5.507 -6.245 -6.882 -7.52 -8.048 -8.502 -8.932 -9.332 -9.696 -10.034 -10.388 -10.693 -10.956 -11.226 -11.509 -11.753 -12.01 -12.267 -12.462 -12.671 -12.875 -13.081 -13.309 -13.463 -13.62 -13.871 -14.042 -14.218 -14.315 -14.527 -14.741 -14.953 -15.064 -15.275 -15.415 -15.539 -15.672 -15.955 -16.106 -16.279 -16.469 -16.681 -16.936 -17.289 -18.439 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_40_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_40_37.txt deleted file mode 100644 index 9f58ade9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_40_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1366 ,TETRA ,17606706,Sun Nov 28 20:52:07 CET,Sun Nov 28 22:47:03 CET,0.0 0.715 1.02 1.235 1.397 1.542 1.672 1.802 2.012 2.1 2.187 2.26 2.392 2.45 2.575 2.688 2.786 2.834 2.917 2.991 3.101 3.165 3.222 3.302 3.38 3.456 3.527 3.582 3.64 3.694 3.746 3.808 3.845 3.874 3.913 3.945 3.962 3.973 3.951 3.889 3.789 3.657 3.498 3.286 2.982 2.61 2.119 1.401 0.277 -1.41 -4.074 -7.198 -9.636 -11.639 -13.33 -14.773 -15.992 -17.064 -17.95 -18.813 -19.55 -20.189 -20.784 -21.344 -21.861 -22.317 -22.79 -23.197 -23.538 -23.89 -24.248 -24.54 -24.841 -25.152 -25.385 -25.622 -25.867 -26.122 -26.384 -26.563 -26.747 -27.039 -27.238 -27.436 -27.545 -27.775 -27.998 -28.223 -28.353 -28.585 -28.77 -28.917 -29.064 -29.382 -29.575 -29.794 -30.025 -30.279 -30.565 -30.953 -32.665 -2 ,28832 ,TETRA ,17606707,Sun Nov 28 20:52:33 CET,Sun Nov 28 22:46:00 CET,0.0 0.931 1.226 1.439 1.606 1.743 1.869 1.989 2.219 2.313 2.39 2.467 2.602 2.664 2.787 2.889 2.981 3.031 3.124 3.202 3.308 3.372 3.432 3.523 3.608 3.677 3.736 3.792 3.857 3.915 3.969 4.023 4.059 4.072 4.076 4.09 4.09 4.08 4.061 4.018 3.958 3.846 3.661 3.434 3.138 2.757 2.191 1.393 0.233 -1.54 -4.393 -7.603 -9.975 -11.853 -13.453 -14.832 -16.004 -17.028 -17.872 -18.697 -19.393 -19.987 -20.543 -21.061 -21.531 -21.96 -22.418 -22.832 -23.178 -23.529 -23.904 -24.219 -24.55 -24.886 -25.143 -25.415 -25.696 -25.977 -26.267 -26.472 -26.679 -26.989 -27.213 -27.448 -27.566 -27.807 -28.056 -28.307 -28.443 -28.688 -28.922 -29.096 -29.288 -29.705 -29.945 -30.213 -30.483 -30.755 -31.071 -31.49 -33.052 -3 ,10183 ,TETRA ,17606708,Sun Nov 28 20:52:34 CET,Sun Nov 28 22:46:19 CET,0.0 1.015 1.398 1.673 1.903 2.111 2.292 2.448 2.745 2.868 2.967 3.088 3.238 3.315 3.459 3.587 3.714 3.772 3.881 3.985 4.12 4.201 4.272 4.365 4.449 4.528 4.599 4.662 4.747 4.825 4.899 4.977 5.035 5.082 5.122 5.143 5.151 5.153 5.145 5.115 5.035 4.905 4.752 4.575 4.292 3.895 3.343 2.553 1.364 -0.428 -3.197 -6.306 -8.787 -10.783 -12.411 -13.815 -14.997 -16.019 -16.877 -17.739 -18.461 -19.093 -19.695 -20.256 -20.754 -21.187 -21.643 -22.04 -22.368 -22.71 -23.058 -23.351 -23.664 -23.968 -24.197 -24.433 -24.677 -24.936 -25.197 -25.374 -25.56 -25.847 -26.054 -26.264 -26.374 -26.599 -26.832 -27.078 -27.199 -27.422 -27.598 -27.742 -27.899 -28.254 -28.461 -28.666 -28.871 -29.103 -29.384 -29.749 -31.251 -4 ,32264 ,TETRA ,17606709,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:46:28 CET,0.0 0.632 0.93 1.171 1.378 1.531 1.673 1.807 2.047 2.147 2.231 2.321 2.454 2.512 2.627 2.736 2.826 2.866 2.954 3.036 3.146 3.215 3.274 3.35 3.415 3.478 3.536 3.584 3.633 3.67 3.707 3.751 3.789 3.819 3.851 3.882 3.896 3.895 3.878 3.842 3.791 3.705 3.554 3.359 3.103 2.736 2.19 1.452 0.314 -1.469 -4.215 -7.282 -9.743 -11.728 -13.354 -14.755 -15.966 -17.056 -17.963 -18.821 -19.531 -20.152 -20.75 -21.307 -21.807 -22.253 -22.711 -23.118 -23.47 -23.837 -24.213 -24.516 -24.833 -25.175 -25.443 -25.712 -25.989 -26.263 -26.547 -26.743 -26.941 -27.266 -27.499 -27.739 -27.857 -28.093 -28.335 -28.594 -28.724 -28.945 -29.131 -29.271 -29.409 -29.725 -29.907 -30.105 -30.311 -30.55 -30.839 -31.24 -33.359 -5 ,9086 ,TETRA ,17606711,Sun Nov 28 20:52:33 CET,Sun Nov 28 22:48:58 CET,0.0 0.605 0.865 1.081 1.255 1.418 1.593 1.75 2.01 2.131 2.236 2.355 2.508 2.593 2.748 2.87 2.976 3.026 3.132 3.236 3.365 3.44 3.511 3.621 3.717 3.805 3.888 3.954 4.038 4.112 4.175 4.251 4.304 4.352 4.397 4.424 4.44 4.447 4.428 4.37 4.306 4.232 4.096 3.882 3.602 3.236 2.712 1.991 0.924 -0.759 -3.6 -6.799 -9.25 -11.252 -12.93 -14.384 -15.611 -16.695 -17.603 -18.468 -19.199 -19.837 -20.418 -20.957 -21.454 -21.902 -22.371 -22.794 -23.156 -23.516 -23.892 -24.21 -24.534 -24.863 -25.113 -25.373 -25.637 -25.911 -26.185 -26.376 -26.574 -26.877 -27.109 -27.352 -27.465 -27.692 -27.923 -28.157 -28.278 -28.506 -28.684 -28.829 -28.985 -29.333 -29.52 -29.713 -29.929 -30.173 -30.454 -30.842 -32.554 -6 ,28594 ,TETRA ,17606712,Sun Nov 28 20:52:34 CET,Sun Nov 28 22:49:04 CET,0.0 0.789 1.051 1.234 1.401 1.544 1.654 1.769 1.974 2.057 2.141 2.218 2.344 2.401 2.521 2.638 2.736 2.783 2.876 2.955 3.056 3.125 3.182 3.248 3.322 3.387 3.442 3.495 3.562 3.625 3.683 3.745 3.796 3.843 3.88 3.909 3.917 3.898 3.877 3.84 3.785 3.695 3.546 3.326 2.974 2.565 2.009 1.182 0.038 -1.677 -4.407 -7.526 -10.03 -12.01 -13.646 -15.069 -16.274 -17.309 -18.17 -19.037 -19.77 -20.406 -20.994 -21.54 -22.052 -22.509 -22.978 -23.385 -23.731 -24.093 -24.464 -24.768 -25.089 -25.416 -25.669 -25.938 -26.215 -26.51 -26.813 -27.017 -27.217 -27.532 -27.75 -27.97 -28.087 -28.322 -28.57 -28.831 -28.969 -29.208 -29.411 -29.576 -29.759 -30.149 -30.353 -30.583 -30.855 -31.182 -31.576 -32.098 -33.964 -7 ,32110 ,TETRA ,17606713,Sun Nov 28 20:52:33 CET,Sun Nov 28 22:46:49 CET,0.0 1.017 1.375 1.624 1.814 1.968 2.112 2.245 2.463 2.551 2.638 2.749 2.901 2.979 3.123 3.253 3.369 3.427 3.533 3.627 3.75 3.814 3.877 3.973 4.062 4.147 4.223 4.285 4.348 4.403 4.456 4.512 4.567 4.606 4.643 4.666 4.68 4.685 4.671 4.643 4.592 4.52 4.389 4.214 3.973 3.662 3.192 2.491 1.366 -0.486 -3.318 -6.465 -8.991 -11.058 -12.731 -14.128 -15.286 -16.312 -17.192 -18.046 -18.756 -19.372 -19.954 -20.495 -20.999 -21.463 -21.938 -22.36 -22.727 -23.094 -23.473 -23.785 -24.099 -24.431 -24.687 -24.94 -25.202 -25.479 -25.761 -25.954 -26.153 -26.464 -26.679 -26.893 -27.007 -27.258 -27.514 -27.777 -27.91 -28.139 -28.318 -28.465 -28.627 -28.964 -29.131 -29.315 -29.516 -29.74 -30.029 -30.41 -32.022 -8 ,2391 ,TETRA ,17606714,Sun Nov 28 20:52:33 CET,Sun Nov 28 22:47:19 CET,0.0 1.041 1.392 1.626 1.809 1.976 2.124 2.261 2.512 2.618 2.712 2.818 2.971 3.059 3.23 3.376 3.498 3.552 3.651 3.742 3.867 3.937 3.997 4.089 4.18 4.259 4.326 4.395 4.483 4.552 4.601 4.644 4.675 4.701 4.734 4.752 4.759 4.767 4.768 4.75 4.686 4.579 4.439 4.293 4.075 3.729 3.228 2.534 1.467 -0.26 -3.027 -6.176 -8.703 -10.708 -12.302 -13.707 -14.909 -15.95 -16.819 -17.673 -18.388 -19.009 -19.596 -20.14 -20.662 -21.13 -21.584 -21.986 -22.34 -22.7 -23.063 -23.368 -23.685 -24.003 -24.249 -24.495 -24.734 -24.978 -25.236 -25.421 -25.61 -25.9 -26.099 -26.305 -26.416 -26.645 -26.879 -27.127 -27.256 -27.481 -27.66 -27.799 -27.947 -28.277 -28.456 -28.653 -28.876 -29.119 -29.412 -29.789 -31.853 -9 ,16812 ,TETRA ,17606715,Sun Nov 28 20:52:33 CET,Sun Nov 28 22:42:27 CET,0.0 0.963 1.291 1.5 1.675 1.837 1.981 2.104 2.292 2.388 2.481 2.577 2.733 2.81 2.945 3.065 3.185 3.242 3.339 3.427 3.556 3.631 3.695 3.797 3.894 3.969 4.043 4.117 4.212 4.294 4.356 4.428 4.505 4.569 4.602 4.614 4.63 4.629 4.602 4.562 4.501 4.424 4.297 4.132 3.873 3.492 2.962 2.181 1.013 -0.699 -3.519 -6.717 -9.19 -11.166 -12.816 -14.249 -15.442 -16.477 -17.328 -18.152 -18.859 -19.483 -20.064 -20.589 -21.059 -21.491 -21.951 -22.356 -22.7 -23.052 -23.422 -23.731 -24.038 -24.351 -24.59 -24.826 -25.083 -25.354 -25.611 -25.787 -25.985 -26.297 -26.512 -26.737 -26.851 -27.07 -27.292 -27.529 -27.653 -27.877 -28.038 -28.174 -28.324 -28.665 -28.852 -29.056 -29.27 -29.52 -29.845 -30.262 -32.036 -10 ,21497 ,TETRA ,17606716,Sun Nov 28 20:52:33 CET,Sun Nov 28 22:45:37 CET,0.0 0.901 1.26 1.513 1.706 1.894 2.071 2.22 2.481 2.594 2.693 2.787 2.934 3.022 3.178 3.31 3.43 3.484 3.579 3.671 3.8 3.875 3.941 4.032 4.127 4.21 4.287 4.357 4.422 4.481 4.548 4.632 4.697 4.737 4.766 4.781 4.79 4.804 4.806 4.779 4.715 4.626 4.464 4.247 3.974 3.621 3.054 2.215 1.075 -0.632 -3.417 -6.629 -9.161 -11.212 -12.921 -14.356 -15.543 -16.596 -17.482 -18.355 -19.092 -19.73 -20.324 -20.889 -21.4 -21.858 -22.343 -22.773 -23.137 -23.511 -23.897 -24.212 -24.536 -24.874 -25.134 -25.394 -25.659 -25.925 -26.205 -26.399 -26.593 -26.897 -27.098 -27.303 -27.412 -27.636 -27.871 -28.125 -28.259 -28.485 -28.653 -28.801 -28.964 -29.309 -29.486 -29.692 -29.917 -30.161 -30.46 -30.864 -32.579 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_41_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_41_37.txt deleted file mode 100644 index 7004d8b4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_41_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14486 ,TETRA ,17606717,Sun Nov 28 20:52:33 CET,Sun Nov 28 22:46:26 CET,0.0 1.142 1.505 1.768 1.987 2.179 2.343 2.478 2.727 2.846 2.962 3.096 3.292 3.394 3.572 3.746 3.923 4.003 4.146 4.27 4.433 4.546 4.657 4.807 4.943 5.082 5.23 5.364 5.509 5.647 5.791 5.967 6.132 6.289 6.47 6.667 6.841 7.023 7.215 7.424 7.633 7.848 8.09 8.325 8.58 8.833 9.09 9.323 9.52 9.645 9.531 9.134 8.674 8.168 7.669 7.185 6.74 6.34 5.998 5.633 5.292 4.994 4.726 4.463 4.213 3.979 3.722 3.495 3.292 3.078 2.845 2.652 2.461 2.259 2.101 1.931 1.746 1.552 1.355 1.229 1.104 0.897 0.755 0.613 0.536 0.374 0.194 -0.006 -0.108 -0.313 -0.445 -0.566 -0.699 -0.987 -1.142 -1.311 -1.499 -1.735 -2.031 -2.431 -4.413 -2 ,16153 ,TETRA ,17606718,Sun Nov 28 20:52:34 CET,Sun Nov 28 22:40:24 CET,0.0 0.607 0.921 1.152 1.332 1.472 1.599 1.715 1.916 2.013 2.102 2.166 2.333 2.415 2.567 2.693 2.812 2.871 2.993 3.122 3.321 3.445 3.556 3.716 3.864 4.001 4.139 4.264 4.411 4.56 4.717 4.892 5.054 5.213 5.386 5.574 5.747 5.935 6.135 6.336 6.538 6.726 6.931 7.138 7.37 7.597 7.801 7.993 8.174 8.319 8.218 7.78 7.264 6.745 6.25 5.745 5.286 4.89 4.556 4.194 3.868 3.583 3.287 3.008 2.747 2.487 2.225 1.991 1.789 1.59 1.388 1.216 1.029 0.838 0.69 0.526 0.356 0.188 0.017 -0.107 -0.243 -0.443 -0.583 -0.748 -0.832 -1.001 -1.188 -1.38 -1.481 -1.68 -1.813 -1.938 -2.075 -2.378 -2.535 -2.709 -2.899 -3.119 -3.404 -3.807 -5.306 -3 ,23802 ,TETRA ,17606719,Sun Nov 28 20:52:34 CET,Sun Nov 28 22:46:22 CET,0.0 0.855 1.167 1.388 1.569 1.727 1.874 2.021 2.279 2.39 2.491 2.603 2.79 2.884 3.068 3.23 3.386 3.464 3.618 3.755 3.935 4.047 4.159 4.315 4.458 4.607 4.75 4.879 5.043 5.209 5.361 5.531 5.692 5.841 6.018 6.22 6.396 6.577 6.778 6.977 7.179 7.403 7.64 7.844 8.07 8.323 8.58 8.819 9.024 9.157 9.035 8.537 7.941 7.364 6.861 6.403 5.95 5.533 5.195 4.84 4.511 4.194 3.892 3.635 3.397 3.156 2.894 2.663 2.45 2.225 1.999 1.815 1.627 1.427 1.278 1.126 0.96 0.783 0.599 0.469 0.331 0.114 -0.035 -0.191 -0.27 -0.428 -0.592 -0.765 -0.862 -1.06 -1.185 -1.302 -1.427 -1.695 -1.844 -2.014 -2.204 -2.417 -2.701 -3.122 -4.991 -4 ,1667 ,TETRA ,17606720,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:46:26 CET,0.0 0.565 0.818 1.013 1.173 1.316 1.449 1.567 1.787 1.894 1.993 2.078 2.255 2.335 2.491 2.647 2.785 2.848 2.966 3.081 3.248 3.352 3.45 3.594 3.728 3.846 3.956 4.063 4.206 4.35 4.482 4.632 4.778 4.918 5.068 5.223 5.376 5.552 5.737 5.924 6.131 6.356 6.591 6.814 7.056 7.296 7.542 7.785 7.969 8.061 7.902 7.441 6.913 6.39 5.93 5.464 5.036 4.642 4.289 3.921 3.592 3.294 3.002 2.713 2.445 2.207 1.942 1.715 1.527 1.325 1.104 0.916 0.724 0.51 0.339 0.176 0.0 -0.192 -0.398 -0.549 -0.705 -0.944 -1.115 -1.297 -1.387 -1.572 -1.78 -2.002 -2.118 -2.331 -2.492 -2.63 -2.782 -3.122 -3.318 -3.53 -3.741 -4.009 -4.346 -4.812 -6.527 -5 ,19617 ,TETRA ,17606721,Sun Nov 28 20:52:34 CET,Sun Nov 28 22:42:40 CET,0.0 0.767 1.034 1.269 1.471 1.649 1.812 1.949 2.189 2.3 2.406 2.527 2.73 2.829 3.007 3.18 3.341 3.426 3.585 3.723 3.915 4.022 4.127 4.297 4.46 4.594 4.722 4.855 5.023 5.185 5.332 5.498 5.654 5.804 5.978 6.168 6.342 6.528 6.726 6.928 7.143 7.376 7.626 7.86 8.103 8.359 8.63 8.868 9.091 9.222 9.121 8.739 8.242 7.72 7.25 6.827 6.409 5.996 5.65 5.316 5.01 4.72 4.453 4.192 3.935 3.705 3.482 3.272 3.078 2.877 2.668 2.489 2.303 2.129 1.989 1.829 1.66 1.49 1.308 1.175 1.043 0.838 0.689 0.532 0.449 0.275 0.092 -0.098 -0.204 -0.414 -0.545 -0.657 -0.779 -1.062 -1.217 -1.381 -1.574 -1.799 -2.059 -2.463 -4.219 -6 ,31564 ,TETRA ,17606722,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:47:35 CET,0.0 0.659 0.914 1.126 1.319 1.489 1.634 1.762 2.018 2.147 2.267 2.376 2.565 2.666 2.839 2.99 3.13 3.201 3.334 3.457 3.632 3.734 3.84 4.001 4.15 4.291 4.426 4.561 4.739 4.908 5.066 5.252 5.423 5.58 5.752 5.938 6.13 6.323 6.517 6.726 6.95 7.201 7.461 7.695 7.935 8.184 8.449 8.711 8.979 9.158 9.046 8.564 8.031 7.517 7.02 6.528 6.088 5.668 5.31 4.97 4.644 4.346 4.07 3.815 3.584 3.374 3.148 2.94 2.758 2.572 2.381 2.215 2.037 1.848 1.698 1.54 1.376 1.215 1.053 0.938 0.803 0.587 0.442 0.29 0.214 0.051 -0.13 -0.332 -0.437 -0.641 -0.775 -0.905 -1.045 -1.341 -1.506 -1.7 -1.925 -2.158 -2.422 -2.835 -5.161 -7 ,14318 ,TETRA ,17606723,Sun Nov 28 20:52:35 CET,Sun Nov 28 22:47:31 CET,0.0 0.593 0.893 1.118 1.311 1.467 1.604 1.733 1.964 2.067 2.159 2.24 2.419 2.497 2.652 2.808 2.962 3.036 3.172 3.302 3.489 3.609 3.731 3.899 4.047 4.191 4.327 4.456 4.62 4.785 4.936 5.103 5.269 5.422 5.592 5.787 5.968 6.162 6.387 6.62 6.832 7.067 7.35 7.611 7.885 8.149 8.433 8.692 8.87 8.965 8.865 8.404 7.821 7.281 6.788 6.293 5.854 5.422 5.035 4.681 4.361 4.074 3.802 3.535 3.273 3.021 2.755 2.503 2.293 2.08 1.835 1.629 1.434 1.241 1.085 0.914 0.737 0.547 0.337 0.194 0.056 -0.172 -0.348 -0.535 -0.627 -0.829 -1.05 -1.273 -1.387 -1.592 -1.718 -1.841 -1.973 -2.236 -2.392 -2.569 -2.756 -2.973 -3.241 -3.628 -5.171 -8 ,22892 ,TETRA ,17606724,Sun Nov 28 20:52:35 CET,Sun Nov 28 22:43:40 CET,0.0 0.527 0.81 1.024 1.198 1.358 1.495 1.61 1.836 1.944 2.038 2.126 2.313 2.404 2.571 2.707 2.827 2.888 3.014 3.134 3.297 3.4 3.5 3.657 3.817 3.971 4.124 4.275 4.457 4.617 4.766 4.941 5.115 5.274 5.436 5.611 5.783 5.963 6.146 6.342 6.549 6.773 7.018 7.247 7.489 7.738 8.016 8.296 8.552 8.713 8.599 8.116 7.625 7.126 6.633 6.154 5.683 5.271 4.929 4.579 4.275 3.986 3.703 3.419 3.139 2.905 2.674 2.469 2.294 2.108 1.904 1.732 1.565 1.386 1.24 1.093 0.932 0.764 0.598 0.476 0.342 0.136 -0.004 -0.154 -0.229 -0.385 -0.545 -0.728 -0.827 -1.027 -1.167 -1.284 -1.404 -1.677 -1.848 -2.033 -2.213 -2.415 -2.685 -3.075 -5.856 -9 ,21913 ,TETRA ,17606725,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:46:26 CET,0.0 0.527 0.78 0.988 1.174 1.32 1.451 1.577 1.8 1.901 1.99 2.066 2.236 2.32 2.492 2.64 2.762 2.823 2.955 3.088 3.273 3.387 3.497 3.657 3.811 3.953 4.083 4.207 4.36 4.511 4.657 4.827 4.975 5.12 5.297 5.493 5.678 5.883 6.106 6.331 6.547 6.778 7.032 7.258 7.503 7.752 8.019 8.28 8.507 8.666 8.602 8.173 7.643 7.125 6.634 6.159 5.71 5.283 4.927 4.563 4.22 3.922 3.629 3.328 3.052 2.804 2.537 2.293 2.089 1.871 1.644 1.448 1.245 1.051 0.906 0.757 0.594 0.424 0.249 0.124 -0.005 -0.203 -0.352 -0.513 -0.596 -0.755 -0.917 -1.103 -1.203 -1.407 -1.549 -1.687 -1.823 -2.094 -2.243 -2.412 -2.621 -2.865 -3.158 -3.563 -5.41 -10 ,1957 ,TETRA ,17606726,Sun Nov 28 20:52:40 CET,Sun Nov 28 22:46:19 CET,0.0 0.486 0.758 0.988 1.185 1.347 1.477 1.59 1.798 1.893 1.985 2.071 2.251 2.329 2.475 2.621 2.765 2.831 2.953 3.063 3.215 3.316 3.414 3.536 3.649 3.761 3.873 3.986 4.127 4.262 4.382 4.52 4.659 4.799 4.964 5.144 5.321 5.516 5.728 5.955 6.171 6.39 6.655 6.906 7.146 7.38 7.65 7.923 8.151 8.274 8.177 7.746 7.22 6.706 6.225 5.764 5.339 4.947 4.577 4.198 3.871 3.573 3.295 3.013 2.74 2.494 2.235 2.006 1.797 1.565 1.314 1.119 0.925 0.714 0.547 0.387 0.221 0.036 -0.157 -0.283 -0.407 -0.63 -0.782 -0.93 -1.012 -1.181 -1.346 -1.524 -1.623 -1.825 -1.96 -2.091 -2.226 -2.52 -2.691 -2.872 -3.062 -3.317 -3.654 -4.135 -6.174 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_41_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_41_40.txt deleted file mode 100644 index ea2a0720..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_41_40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24735 ,TETRA ,17606727,Sun Nov 28 20:52:35 CET,Sun Nov 28 22:47:09 CET,0.0 1.428 1.798 2.073 2.296 2.482 2.665 2.837 3.139 3.278 3.412 3.567 3.782 3.899 4.121 4.33 4.528 4.623 4.81 4.991 5.253 5.426 5.605 5.86 6.092 6.323 6.557 6.776 7.048 7.324 7.605 7.953 8.29 8.611 8.99 9.426 9.853 10.339 10.871 11.436 12.023 12.702 13.516 14.339 15.313 16.434 17.779 19.324 21.197 23.471 26.344 28.938 30.499 31.499 32.168 32.642 32.951 33.134 33.202 33.244 33.271 33.264 33.26 33.244 33.209 33.159 33.092 33.028 32.958 32.865 32.757 32.662 32.573 32.481 32.396 32.296 32.186 32.076 31.949 31.852 31.759 31.611 31.506 31.383 31.313 31.175 31.024 30.855 30.762 30.601 30.457 30.35 30.242 29.98 29.815 29.633 29.448 29.213 28.923 28.58 26.993 -2 ,15178 ,TETRA ,17606728,Sun Nov 28 20:52:35 CET,Sun Nov 28 22:46:57 CET,0.0 1.379 1.748 2.053 2.316 2.552 2.76 2.948 3.314 3.489 3.653 3.867 4.1 4.239 4.503 4.754 4.998 5.114 5.325 5.521 5.808 6.001 6.19 6.46 6.722 6.985 7.234 7.465 7.774 8.073 8.362 8.713 9.056 9.401 9.797 10.226 10.641 11.105 11.611 12.156 12.739 13.397 14.199 15.032 16.016 17.146 18.489 20.047 21.925 24.263 27.203 29.599 31.086 32.101 32.815 33.316 33.604 33.815 33.927 33.968 33.973 33.963 33.948 33.929 33.913 33.863 33.797 33.736 33.657 33.564 33.462 33.373 33.278 33.169 33.077 32.982 32.888 32.789 32.683 32.61 32.533 32.405 32.311 32.204 32.145 32.035 31.918 31.772 31.688 31.54 31.439 31.337 31.225 30.965 30.814 30.666 30.501 30.289 30.021 29.635 27.957 -3 ,4810 ,TETRA ,17606729,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:46:32 CET,0.0 1.559 1.914 2.183 2.414 2.614 2.795 2.969 3.289 3.438 3.58 3.744 3.961 4.082 4.307 4.529 4.753 4.859 5.052 5.238 5.505 5.678 5.85 6.113 6.363 6.611 6.86 7.102 7.414 7.712 8.002 8.353 8.687 9.014 9.4 9.847 10.276 10.739 11.249 11.808 12.408 13.082 13.859 14.651 15.596 16.674 17.958 19.428 21.245 23.5 26.252 28.749 30.382 31.451 32.149 32.642 32.99 33.204 33.353 33.497 33.58 33.622 33.641 33.645 33.63 33.584 33.531 33.48 33.422 33.354 33.271 33.191 33.101 33.008 32.931 32.849 32.769 32.682 32.578 32.507 32.437 32.311 32.214 32.111 32.055 31.943 31.833 31.707 31.637 31.495 31.383 31.286 31.179 30.953 30.834 30.686 30.512 30.33 30.114 29.767 28.398 -4 ,24576 ,TETRA ,17606730,Sun Nov 28 20:52:35 CET,Sun Nov 28 22:46:25 CET,0.0 1.657 2.013 2.268 2.486 2.684 2.86 3.027 3.335 3.472 3.605 3.755 3.965 4.081 4.307 4.518 4.72 4.819 5.008 5.194 5.465 5.636 5.804 6.048 6.278 6.49 6.702 6.918 7.203 7.483 7.754 8.091 8.428 8.762 9.138 9.557 9.985 10.456 10.96 11.509 12.083 12.741 13.527 14.341 15.324 16.443 17.782 19.304 21.136 23.388 26.26 28.805 30.308 31.313 32.018 32.467 32.769 32.97 33.087 33.177 33.207 33.218 33.211 33.188 33.152 33.093 33.031 32.98 32.922 32.839 32.731 32.632 32.523 32.412 32.325 32.229 32.116 31.983 31.844 31.756 31.675 31.53 31.41 31.293 31.23 31.088 30.939 30.781 30.701 30.553 30.449 30.347 30.239 29.993 29.853 29.694 29.511 29.319 29.076 28.703 26.969 -5 ,30701 ,TETRA ,17606731,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:46:29 CET,0.0 1.396 1.819 2.148 2.424 2.655 2.856 3.038 3.371 3.534 3.693 3.889 4.113 4.235 4.465 4.684 4.9 5.005 5.207 5.399 5.675 5.854 6.03 6.292 6.546 6.78 7.007 7.239 7.543 7.832 8.112 8.465 8.804 9.123 9.505 9.943 10.36 10.838 11.363 11.927 12.528 13.198 13.995 14.811 15.773 16.85 18.164 19.747 21.639 23.948 26.855 29.345 30.892 31.916 32.567 32.995 33.265 33.434 33.529 33.62 33.678 33.696 33.687 33.63 33.572 33.514 33.441 33.365 33.285 33.2 33.117 33.041 32.955 32.855 32.766 32.676 32.577 32.48 32.39 32.32 32.241 32.116 32.021 31.925 31.869 31.747 31.626 31.499 31.423 31.273 31.179 31.082 30.979 30.75 30.613 30.46 30.264 30.028 29.767 29.436 27.991 -6 ,21370 ,TETRA ,17606732,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:46:24 CET,0.0 1.368 1.7 1.958 2.19 2.394 2.569 2.731 3.029 3.17 3.306 3.475 3.694 3.808 4.042 4.27 4.493 4.603 4.81 5.007 5.296 5.482 5.654 5.899 6.142 6.387 6.635 6.875 7.183 7.477 7.763 8.115 8.462 8.812 9.214 9.662 10.094 10.552 11.055 11.601 12.182 12.856 13.661 14.482 15.44 16.551 17.882 19.436 21.356 23.725 26.668 29.147 30.589 31.509 32.125 32.56 32.845 33.005 33.121 33.22 33.272 33.303 33.324 33.332 33.31 33.281 33.264 33.236 33.184 33.128 33.067 32.998 32.921 32.824 32.742 32.665 32.569 32.457 32.348 32.276 32.203 32.094 32.01 31.907 31.849 31.727 31.601 31.456 31.377 31.225 31.119 31.028 30.935 30.708 30.57 30.417 30.248 30.05 29.812 29.418 27.572 -7 ,6162 ,TETRA ,17606733,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:45:58 CET,0.0 1.115 1.469 1.743 1.962 2.158 2.334 2.488 2.78 2.923 3.056 3.209 3.421 3.535 3.759 3.97 4.165 4.264 4.462 4.644 4.901 5.065 5.232 5.479 5.715 5.954 6.196 6.426 6.721 7.001 7.273 7.607 7.929 8.246 8.612 9.023 9.418 9.856 10.367 10.924 11.494 12.152 12.956 13.763 14.71 15.802 17.098 18.628 20.527 22.812 25.693 28.235 29.71 30.683 31.358 31.805 32.1 32.323 32.471 32.557 32.625 32.674 32.686 32.673 32.636 32.605 32.569 32.513 32.45 32.388 32.301 32.215 32.135 32.046 31.968 31.886 31.803 31.71 31.602 31.518 31.428 31.296 31.204 31.095 31.037 30.914 30.782 30.629 30.544 30.394 30.301 30.208 30.104 29.877 29.746 29.596 29.438 29.231 28.961 28.608 26.48 -8 ,29610 ,TETRA ,17606734,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:46:23 CET,0.0 1.291 1.678 1.972 2.217 2.407 2.575 2.749 3.079 3.225 3.368 3.545 3.764 3.883 4.108 4.323 4.528 4.627 4.816 4.995 5.257 5.426 5.598 5.851 6.086 6.316 6.546 6.766 7.05 7.332 7.606 7.938 8.257 8.568 8.938 9.347 9.743 10.191 10.671 11.203 11.779 12.423 13.192 13.984 14.944 16.043 17.362 18.907 20.767 23.083 25.999 28.564 30.208 31.267 31.946 32.441 32.778 33.01 33.165 33.258 33.295 33.301 33.285 33.255 33.209 33.163 33.1 33.016 32.935 32.853 32.785 32.715 32.625 32.515 32.418 32.319 32.217 32.114 32.001 31.924 31.849 31.716 31.62 31.517 31.463 31.338 31.189 31.041 30.967 30.816 30.7 30.601 30.498 30.257 30.116 29.967 29.793 29.577 29.32 28.914 26.9 -9 ,15482 ,TETRA ,17606735,Sun Nov 28 20:52:42 CET,Sun Nov 28 22:46:30 CET,0.0 1.847 2.209 2.485 2.713 2.907 3.091 3.26 3.547 3.681 3.813 3.973 4.182 4.298 4.522 4.723 4.913 5.011 5.209 5.393 5.675 5.863 6.035 6.278 6.515 6.757 6.994 7.216 7.504 7.793 8.075 8.416 8.746 9.065 9.431 9.839 10.237 10.683 11.174 11.709 12.277 12.939 13.736 14.551 15.508 16.603 17.923 19.465 21.337 23.629 26.576 29.139 30.71 31.777 32.469 32.978 33.352 33.6 33.749 33.858 33.937 33.966 33.96 33.952 33.935 33.902 33.852 33.788 33.722 33.641 33.542 33.452 33.348 33.243 33.158 33.06 32.945 32.824 32.698 32.61 32.522 32.376 32.266 32.145 32.08 31.944 31.8 31.634 31.547 31.387 31.254 31.153 31.052 30.824 30.688 30.544 30.389 30.176 29.871 29.436 27.627 -10 ,7085 ,TETRA ,17606736,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:46:29 CET,0.0 1.496 1.838 2.126 2.366 2.566 2.75 2.92 3.246 3.397 3.529 3.674 3.883 4.0 4.229 4.441 4.642 4.744 4.948 5.145 5.42 5.603 5.789 6.054 6.313 6.576 6.832 7.066 7.37 7.664 7.943 8.288 8.634 8.982 9.386 9.829 10.248 10.714 11.227 11.782 12.373 13.051 13.875 14.717 15.704 16.843 18.182 19.751 21.685 24.037 26.992 29.602 31.199 32.155 32.8 33.26 33.536 33.73 33.859 33.929 33.94 33.935 33.923 33.893 33.841 33.786 33.735 33.678 33.614 33.548 33.472 33.396 33.318 33.24 33.167 33.092 33.022 32.94 32.839 32.763 32.683 32.546 32.441 32.327 32.27 32.147 32.018 31.881 31.807 31.66 31.547 31.447 31.344 31.115 30.988 30.842 30.67 30.468 30.191 29.801 27.978 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_42_13.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_42_13.txt deleted file mode 100644 index 4765f285..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_42_13.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8265 ,TETRA ,17606737,Sun Nov 28 20:52:40 CET,Sun Nov 28 22:43:36 CET,0.0 1.463 1.873 2.167 2.4 2.604 2.795 2.95 3.205 3.327 3.436 3.545 3.736 3.841 4.036 4.197 4.326 4.383 4.513 4.649 4.818 4.925 5.031 5.169 5.293 5.395 5.479 5.556 5.652 5.745 5.836 5.954 6.048 6.106 6.179 6.263 6.324 6.393 6.465 6.51 6.534 6.534 6.518 6.432 6.245 5.949 5.505 4.854 3.836 2.353 -0.18 -3.223 -5.64 -7.698 -9.431 -10.984 -12.302 -13.463 -14.496 -15.455 -16.213 -16.884 -17.517 -18.105 -18.639 -19.139 -19.648 -20.104 -20.514 -20.918 -21.323 -21.663 -22.029 -22.412 -22.72 -23.045 -23.365 -23.674 -23.977 -24.182 -24.403 -24.779 -25.045 -25.301 -25.424 -25.686 -25.977 -26.285 -26.443 -26.733 -26.952 -27.146 -27.346 -27.75 -27.978 -28.238 -28.538 -28.867 -29.282 -29.849 -32.429 -2 ,4676 ,TETRA ,17606738,Sun Nov 28 20:52:38 CET,Sun Nov 28 22:45:25 CET,0.0 1.008 1.389 1.663 1.887 2.086 2.252 2.407 2.722 2.858 2.971 3.089 3.279 3.374 3.564 3.737 3.889 3.954 4.078 4.199 4.369 4.472 4.556 4.686 4.832 4.974 5.099 5.21 5.345 5.466 5.572 5.69 5.775 5.836 5.91 5.988 6.052 6.109 6.157 6.175 6.168 6.135 6.082 6.043 5.922 5.644 5.175 4.497 3.462 1.826 -0.856 -3.932 -6.338 -8.357 -10.08 -11.545 -12.766 -13.839 -14.744 -15.647 -16.423 -17.086 -17.694 -18.267 -18.793 -19.269 -19.769 -20.215 -20.593 -20.976 -21.372 -21.7 -22.029 -22.363 -22.626 -22.902 -23.203 -23.534 -23.858 -24.063 -24.275 -24.624 -24.879 -25.152 -25.297 -25.6 -25.901 -26.204 -26.368 -26.657 -26.882 -27.066 -27.265 -27.723 -27.971 -28.232 -28.503 -28.816 -29.216 -29.7 -31.147 -3 ,9923 ,TETRA ,17606739,Sun Nov 28 20:53:03 CET,Sun Nov 28 22:47:18 CET,0.0 1.01 1.458 1.746 1.964 2.156 2.333 2.481 2.719 2.838 2.96 3.089 3.281 3.378 3.554 3.706 3.865 3.933 4.045 4.154 4.333 4.451 4.566 4.715 4.825 4.928 5.028 5.135 5.273 5.381 5.465 5.559 5.641 5.728 5.818 5.899 5.988 6.064 6.093 6.107 6.111 6.084 6.022 5.903 5.69 5.385 4.924 4.23 3.21 1.617 -1.008 -4.026 -6.53 -8.608 -10.275 -11.76 -13.086 -14.225 -15.179 -16.113 -16.913 -17.628 -18.302 -18.933 -19.489 -19.974 -20.477 -20.923 -21.306 -21.709 -22.129 -22.472 -22.82 -23.17 -23.446 -23.731 -24.026 -24.347 -24.688 -24.915 -25.135 -25.468 -25.709 -25.961 -26.081 -26.325 -26.614 -26.932 -27.084 -27.372 -27.621 -27.815 -28.019 -28.452 -28.693 -28.962 -29.267 -29.617 -30.027 -30.576 -33.028 -4 ,2703 ,TETRA ,17606740,Sun Nov 28 20:53:03 CET,Sun Nov 28 22:45:49 CET,0.0 1.688 2.087 2.32 2.564 2.789 2.968 3.12 3.385 3.517 3.648 3.786 3.969 4.057 4.227 4.382 4.52 4.589 4.718 4.824 4.979 5.087 5.188 5.316 5.425 5.54 5.658 5.767 5.917 6.054 6.151 6.239 6.312 6.379 6.46 6.541 6.604 6.667 6.704 6.72 6.725 6.724 6.739 6.727 6.602 6.298 5.865 5.254 4.237 2.707 0.193 -2.888 -5.45 -7.571 -9.274 -10.717 -11.965 -13.164 -14.169 -15.114 -15.902 -16.582 -17.226 -17.833 -18.418 -18.948 -19.493 -19.959 -20.343 -20.741 -21.147 -21.489 -21.841 -22.206 -22.498 -22.803 -23.109 -23.415 -23.746 -23.978 -24.217 -24.589 -24.831 -25.085 -25.222 -25.494 -25.768 -26.061 -26.219 -26.503 -26.736 -26.917 -27.1 -27.527 -27.77 -28.014 -28.288 -28.609 -29.027 -29.578 -31.58 -5 ,18134 ,TETRA ,17606741,Sun Nov 28 20:53:03 CET,Sun Nov 28 22:41:51 CET,0.0 1.279 1.742 2.095 2.341 2.528 2.69 2.85 3.144 3.268 3.374 3.47 3.648 3.738 3.905 4.046 4.192 4.261 4.392 4.511 4.674 4.779 4.886 5.051 5.192 5.304 5.396 5.463 5.54 5.62 5.696 5.785 5.872 5.945 6.007 6.069 6.111 6.155 6.199 6.224 6.237 6.217 6.146 6.036 5.845 5.545 5.142 4.534 3.535 1.984 -0.593 -3.572 -5.951 -7.91 -9.58 -11.025 -12.251 -13.342 -14.228 -15.086 -15.842 -16.557 -17.217 -17.797 -18.327 -18.824 -19.347 -19.79 -20.173 -20.565 -20.966 -21.31 -21.677 -22.061 -22.35 -22.637 -22.918 -23.23 -23.582 -23.814 -24.047 -24.41 -24.667 -24.949 -25.096 -25.388 -25.682 -26.001 -26.167 -26.451 -26.675 -26.859 -27.06 -27.489 -27.708 -27.953 -28.227 -28.55 -28.993 -29.703 -32.201 -6 ,13735 ,TETRA ,17606742,Sun Nov 28 20:53:03 CET,Sun Nov 28 22:44:33 CET,0.0 0.705 1.039 1.299 1.503 1.675 1.842 1.997 2.268 2.39 2.497 2.593 2.773 2.853 3.002 3.136 3.266 3.333 3.472 3.599 3.763 3.869 3.976 4.115 4.223 4.32 4.406 4.491 4.595 4.685 4.756 4.842 4.949 5.026 5.099 5.21 5.289 5.339 5.36 5.355 5.345 5.316 5.24 5.095 4.839 4.5 4.08 3.402 2.368 0.875 -1.747 -4.892 -7.412 -9.419 -11.04 -12.47 -13.703 -14.818 -15.764 -16.702 -17.471 -18.121 -18.755 -19.353 -19.9 -20.402 -20.943 -21.432 -21.85 -22.272 -22.695 -23.053 -23.431 -23.818 -24.118 -24.408 -24.693 -24.989 -25.302 -25.532 -25.774 -26.129 -26.373 -26.635 -26.767 -27.055 -27.368 -27.677 -27.838 -28.135 -28.365 -28.557 -28.763 -29.191 -29.432 -29.704 -30.017 -30.377 -30.833 -31.415 -33.422 -7 ,8315 ,TETRA ,17606743,Sun Nov 28 20:53:04 CET,Sun Nov 28 22:43:55 CET,0.0 1.12 1.471 1.719 1.926 2.127 2.3 2.451 2.695 2.822 2.947 3.067 3.254 3.337 3.508 3.681 3.833 3.9 4.023 4.134 4.307 4.436 4.547 4.683 4.806 4.92 5.04 5.15 5.281 5.38 5.457 5.544 5.624 5.711 5.809 5.92 6.045 6.159 6.243 6.291 6.28 6.266 6.247 6.173 6.002 5.7 5.289 4.664 3.652 2.147 -0.336 -3.376 -5.862 -7.957 -9.747 -11.296 -12.63 -13.779 -14.732 -15.657 -16.427 -17.087 -17.714 -18.304 -18.833 -19.334 -19.852 -20.298 -20.684 -21.108 -21.576 -21.953 -22.331 -22.704 -22.978 -23.26 -23.554 -23.855 -24.165 -24.375 -24.587 -24.939 -25.193 -25.451 -25.588 -25.88 -26.179 -26.492 -26.661 -26.957 -27.193 -27.39 -27.592 -28.011 -28.245 -28.499 -28.796 -29.162 -29.635 -30.309 -32.602 -8 ,5476 ,TETRA ,17606744,Sun Nov 28 20:53:04 CET,Sun Nov 28 22:42:21 CET,0.0 1.189 1.634 1.942 2.158 2.341 2.518 2.684 2.975 3.102 3.219 3.332 3.525 3.628 3.806 3.962 4.108 4.18 4.316 4.456 4.664 4.776 4.873 5.005 5.102 5.194 5.287 5.364 5.458 5.577 5.71 5.849 5.944 6.002 6.075 6.156 6.211 6.283 6.37 6.425 6.451 6.462 6.426 6.334 6.17 5.88 5.392 4.731 3.76 2.198 -0.369 -3.332 -5.763 -7.803 -9.51 -10.973 -12.226 -13.339 -14.258 -15.137 -15.899 -16.575 -17.202 -17.794 -18.331 -18.801 -19.315 -19.769 -20.147 -20.558 -20.987 -21.345 -21.713 -22.075 -22.356 -22.647 -22.95 -23.263 -23.566 -23.769 -23.979 -24.305 -24.529 -24.768 -24.903 -25.196 -25.498 -25.81 -25.964 -26.24 -26.438 -26.618 -26.802 -27.219 -27.443 -27.699 -28.007 -28.352 -28.757 -29.308 -31.143 -9 ,28884 ,TETRA ,17606745,Sun Nov 28 20:53:04 CET,Sun Nov 28 22:44:27 CET,0.0 0.951 1.311 1.595 1.837 2.025 2.197 2.35 2.606 2.732 2.852 2.97 3.151 3.237 3.401 3.554 3.703 3.782 3.928 4.047 4.207 4.309 4.41 4.529 4.634 4.751 4.885 5.007 5.135 5.265 5.395 5.547 5.688 5.823 5.951 6.034 6.092 6.174 6.257 6.31 6.324 6.312 6.29 6.224 6.035 5.728 5.347 4.819 3.914 2.457 -0.077 -3.104 -5.468 -7.422 -9.076 -10.52 -11.743 -12.824 -13.799 -14.785 -15.578 -16.263 -16.906 -17.522 -18.098 -18.585 -19.062 -19.505 -19.929 -20.371 -20.828 -21.213 -21.591 -21.968 -22.263 -22.568 -22.877 -23.195 -23.503 -23.703 -23.913 -24.257 -24.494 -24.741 -24.875 -25.159 -25.447 -25.735 -25.886 -26.164 -26.394 -26.603 -26.823 -27.253 -27.49 -27.742 -28.02 -28.353 -28.744 -29.273 -31.201 -10 ,29846 ,TETRA ,17606746,Sun Nov 28 20:53:05 CET,Sun Nov 28 22:44:46 CET,0.0 1.474 1.859 2.157 2.406 2.634 2.809 2.957 3.231 3.352 3.466 3.566 3.748 3.844 4.015 4.166 4.309 4.382 4.522 4.647 4.828 4.927 5.014 5.151 5.291 5.418 5.529 5.636 5.748 5.841 5.926 6.019 6.126 6.234 6.339 6.459 6.561 6.633 6.661 6.655 6.653 6.604 6.481 6.348 6.142 5.85 5.453 4.864 3.87 2.281 -0.36 -3.382 -5.787 -7.781 -9.448 -10.932 -12.183 -13.299 -14.24 -15.161 -15.926 -16.572 -17.202 -17.823 -18.412 -18.942 -19.474 -19.928 -20.316 -20.734 -21.168 -21.504 -21.849 -22.211 -22.485 -22.765 -23.049 -23.343 -23.666 -23.888 -24.11 -24.476 -24.747 -25.015 -25.154 -25.448 -25.739 -26.061 -26.231 -26.527 -26.79 -26.999 -27.212 -27.691 -27.953 -28.234 -28.539 -28.834 -29.188 -29.704 -31.759 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_42_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_42_44.txt deleted file mode 100644 index e332f02e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_42_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29045 ,TETRA ,17606747,Sun Nov 28 20:53:09 CET,Sun Nov 28 22:44:51 CET,0.0 0.612 0.901 1.116 1.285 1.437 1.57 1.699 1.948 2.058 2.152 2.226 2.406 2.494 2.665 2.827 3.011 3.105 3.268 3.433 3.677 3.836 3.989 4.197 4.393 4.578 4.761 4.953 5.214 5.446 5.662 5.923 6.161 6.39 6.654 6.97 7.283 7.608 7.933 8.28 8.666 9.09 9.552 10.036 10.624 11.286 12.042 12.89 13.873 14.983 16.206 17.082 17.471 17.584 17.573 17.483 17.336 17.191 17.034 16.806 16.588 16.431 16.29 16.123 15.946 15.773 15.562 15.358 15.196 15.026 14.854 14.72 14.571 14.404 14.276 14.135 13.986 13.833 13.657 13.524 13.398 13.209 13.063 12.902 12.824 12.672 12.486 12.27 12.161 11.97 11.833 11.715 11.581 11.293 11.126 10.932 10.707 10.447 10.178 9.77 8.32 -2 ,24777 ,TETRA ,17606748,Sun Nov 28 20:53:04 CET,Sun Nov 28 22:44:28 CET,0.0 0.94 1.175 1.374 1.543 1.67 1.794 1.912 2.128 2.224 2.313 2.384 2.567 2.659 2.83 3.0 3.157 3.232 3.389 3.546 3.772 3.916 4.055 4.248 4.438 4.632 4.816 4.992 5.231 5.463 5.689 5.959 6.212 6.461 6.744 7.038 7.342 7.713 8.117 8.526 8.93 9.373 9.903 10.46 11.089 11.759 12.497 13.339 14.344 15.446 16.66 17.561 17.969 18.082 18.085 18.008 17.857 17.674 17.49 17.308 17.117 16.925 16.74 16.543 16.364 16.213 16.055 15.899 15.75 15.585 15.407 15.255 15.083 14.91 14.786 14.655 14.507 14.34 14.166 14.042 13.913 13.713 13.576 13.434 13.354 13.177 12.982 12.768 12.661 12.472 12.33 12.207 12.063 11.742 11.561 11.363 11.148 10.901 10.594 10.128 8.078 -3 ,14882 ,TETRA ,17606749,Sun Nov 28 20:53:05 CET,Sun Nov 28 22:44:41 CET,0.0 0.738 1.058 1.277 1.441 1.587 1.724 1.871 2.141 2.241 2.335 2.424 2.605 2.68 2.835 3.005 3.173 3.257 3.411 3.549 3.747 3.897 4.049 4.25 4.442 4.623 4.806 4.991 5.228 5.462 5.682 5.943 6.191 6.425 6.715 7.047 7.357 7.7 8.071 8.469 8.876 9.31 9.824 10.368 11.023 11.706 12.463 13.292 14.268 15.42 16.656 17.595 17.92 17.893 17.855 17.846 17.704 17.443 17.248 17.066 16.874 16.702 16.542 16.385 16.185 15.937 15.695 15.51 15.348 15.152 14.934 14.767 14.601 14.419 14.271 14.105 13.907 13.692 13.486 13.346 13.19 12.944 12.776 12.609 12.519 12.33 12.134 11.915 11.795 11.59 11.423 11.277 11.126 10.802 10.611 10.397 10.163 9.912 9.587 9.173 8.076 -4 ,28553 ,TETRA ,17606750,Sun Nov 28 20:53:05 CET,Sun Nov 28 22:44:46 CET,0.0 0.61 0.821 1.009 1.168 1.32 1.452 1.574 1.806 1.923 2.033 2.113 2.298 2.385 2.549 2.705 2.86 2.94 3.084 3.216 3.404 3.548 3.685 3.866 4.051 4.22 4.382 4.538 4.74 4.946 5.142 5.367 5.587 5.799 6.044 6.319 6.591 6.897 7.233 7.599 7.981 8.384 8.838 9.318 9.867 10.464 11.241 12.156 13.12 14.212 15.473 16.3 16.668 16.849 16.879 16.777 16.647 16.492 16.32 16.12 15.943 15.763 15.584 15.406 15.212 15.03 14.841 14.675 14.515 14.349 14.179 14.026 13.851 13.66 13.518 13.348 13.159 12.985 12.799 12.676 12.554 12.336 12.184 12.034 11.958 11.81 11.648 11.459 11.355 11.163 11.017 10.889 10.755 10.461 10.294 10.121 9.903 9.642 9.338 8.905 7.649 -5 ,19483 ,TETRA ,17606751,Sun Nov 28 20:53:06 CET,Sun Nov 28 22:44:45 CET,0.0 1.032 1.299 1.474 1.633 1.803 1.947 2.071 2.304 2.409 2.524 2.665 2.851 2.935 3.106 3.271 3.418 3.487 3.643 3.791 3.97 4.086 4.21 4.417 4.627 4.826 5.017 5.21 5.468 5.7 5.915 6.186 6.45 6.702 6.99 7.29 7.58 7.936 8.334 8.739 9.142 9.556 10.042 10.591 11.265 11.964 12.731 13.594 14.568 15.728 17.133 18.075 18.474 18.605 18.559 18.465 18.34 18.207 18.047 17.827 17.628 17.425 17.211 16.996 16.79 16.615 16.436 16.259 16.089 15.915 15.733 15.581 15.427 15.269 15.146 15.009 14.865 14.709 14.543 14.425 14.291 14.076 13.937 13.787 13.702 13.522 13.342 13.136 13.013 12.803 12.62 12.486 12.347 12.039 11.854 11.639 11.418 11.17 10.825 10.306 8.304 -6 ,16849 ,TETRA ,17606752,Sun Nov 28 20:53:05 CET,Sun Nov 28 22:44:48 CET,0.0 0.834 1.066 1.253 1.406 1.541 1.685 1.82 2.041 2.141 2.233 2.312 2.497 2.591 2.763 2.921 3.082 3.167 3.326 3.458 3.638 3.752 3.863 4.026 4.19 4.359 4.513 4.661 4.869 5.067 5.262 5.492 5.709 5.915 6.156 6.45 6.733 7.035 7.359 7.699 8.055 8.485 8.979 9.471 10.084 10.79 11.613 12.489 13.446 14.587 15.913 16.783 17.1 17.201 17.171 17.086 16.957 16.791 16.625 16.434 16.246 16.073 15.886 15.669 15.498 15.344 15.151 14.973 14.823 14.675 14.501 14.334 14.161 13.993 13.856 13.707 13.54 13.349 13.151 13.022 12.899 12.673 12.499 12.326 12.229 12.023 11.829 11.631 11.525 11.346 11.214 11.088 10.955 10.662 10.486 10.285 10.077 9.833 9.479 8.907 6.891 -7 ,27199 ,TETRA ,17606753,Sun Nov 28 20:53:07 CET,Sun Nov 28 22:45:40 CET,0.0 0.824 1.042 1.258 1.45 1.598 1.739 1.861 2.085 2.188 2.287 2.396 2.598 2.698 2.903 3.085 3.25 3.334 3.496 3.656 3.896 4.055 4.204 4.403 4.598 4.792 4.984 5.157 5.37 5.588 5.8 6.057 6.327 6.581 6.852 7.149 7.425 7.747 8.085 8.434 8.821 9.264 9.789 10.288 10.851 11.484 12.205 13.063 14.013 15.016 16.245 17.083 17.366 17.476 17.469 17.379 17.251 17.118 16.997 16.863 16.725 16.588 16.439 16.296 16.139 15.988 15.844 15.7 15.568 15.434 15.288 15.158 15.027 14.891 14.771 14.639 14.499 14.347 14.181 14.067 13.944 13.737 13.593 13.444 13.37 13.222 13.048 12.84 12.73 12.539 12.393 12.267 12.137 11.848 11.684 11.505 11.303 11.049 10.726 10.283 8.693 -8 ,24354 ,TETRA ,17606754,Sun Nov 28 20:53:05 CET,Sun Nov 28 22:44:42 CET,0.0 0.679 0.881 1.04 1.197 1.351 1.494 1.623 1.86 1.979 2.085 2.181 2.37 2.455 2.62 2.762 2.9 2.974 3.114 3.244 3.452 3.583 3.711 3.899 4.088 4.275 4.448 4.611 4.825 5.035 5.238 5.488 5.739 5.989 6.268 6.575 6.878 7.228 7.612 8.009 8.407 8.854 9.379 9.893 10.547 11.279 12.019 12.853 13.847 14.963 16.237 17.162 17.553 17.697 17.699 17.637 17.556 17.452 17.347 17.23 17.098 16.963 16.829 16.689 16.547 16.418 16.274 16.134 16.014 15.886 15.754 15.639 15.514 15.377 15.268 15.138 14.999 14.86 14.707 14.599 14.484 14.301 14.172 14.025 13.949 13.797 13.629 13.448 13.353 13.17 13.044 12.931 12.813 12.532 12.371 12.201 11.993 11.746 11.459 11.033 9.544 -9 ,12337 ,TETRA ,17606755,Sun Nov 28 20:53:06 CET,Sun Nov 28 22:44:08 CET,0.0 1.01 1.254 1.453 1.627 1.758 1.88 1.995 2.199 2.3 2.406 2.515 2.704 2.789 2.944 3.093 3.243 3.325 3.474 3.618 3.824 3.944 4.071 4.254 4.429 4.599 4.763 4.932 5.156 5.38 5.592 5.825 6.038 6.257 6.533 6.839 7.139 7.467 7.8 8.156 8.55 9.001 9.495 10.002 10.613 11.271 12.041 12.869 13.849 15.027 16.394 17.347 17.714 17.813 17.801 17.699 17.55 17.394 17.228 17.037 16.839 16.61 16.38 16.184 16.012 15.868 15.725 15.575 15.442 15.321 15.185 15.044 14.89 14.739 14.614 14.482 14.343 14.197 14.039 13.933 13.818 13.621 13.487 13.34 13.255 13.069 12.883 12.678 12.577 12.396 12.242 12.115 11.982 11.689 11.524 11.328 11.112 10.871 10.571 10.15 8.477 -10 ,18631 ,TETRA ,17606756,Sun Nov 28 20:53:06 CET,Sun Nov 28 22:44:10 CET,0.0 0.779 1.079 1.294 1.443 1.584 1.715 1.828 2.032 2.137 2.239 2.335 2.526 2.626 2.812 2.977 3.127 3.2 3.357 3.525 3.763 3.911 4.057 4.268 4.466 4.655 4.845 5.026 5.241 5.445 5.643 5.876 6.104 6.34 6.62 6.926 7.205 7.505 7.837 8.222 8.642 9.077 9.562 10.07 10.681 11.361 12.158 13.067 14.081 15.284 16.64 17.562 17.996 18.149 18.181 18.066 17.878 17.674 17.437 17.225 17.065 16.863 16.632 16.419 16.235 16.063 15.841 15.635 15.465 15.28 15.091 14.926 14.762 14.593 14.444 14.295 14.139 13.954 13.746 13.613 13.476 13.254 13.099 12.93 12.841 12.653 12.444 12.213 12.089 11.88 11.698 11.56 11.402 11.047 10.844 10.606 10.331 10.023 9.663 9.19 6.75 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_42_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_42_45.txt deleted file mode 100644 index a8b77f41..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_42_45.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13222 ,TETRA ,17606757,Sun Nov 28 20:53:07 CET,Sun Nov 28 22:44:43 CET,0.0 0.944 1.307 1.561 1.812 2.02 2.201 2.379 2.624 2.739 2.866 2.999 3.191 3.286 3.48 3.679 3.86 3.946 4.118 4.273 4.507 4.664 4.806 4.987 5.165 5.343 5.532 5.727 5.971 6.215 6.454 6.734 7.006 7.278 7.601 7.939 8.255 8.611 8.992 9.398 9.815 10.285 10.843 11.409 12.053 12.736 13.509 14.36 15.372 16.566 17.853 18.593 18.786 18.757 18.63 18.435 18.209 17.983 17.759 17.507 17.3 17.099 16.868 16.653 16.462 16.275 16.058 15.859 15.701 15.524 15.319 15.168 15.024 14.859 14.719 14.573 14.423 14.247 14.061 13.929 13.784 13.577 13.427 13.26 13.18 13.024 12.86 12.683 12.59 12.413 12.279 12.169 12.048 11.773 11.624 11.466 11.275 11.037 10.747 10.386 8.906 -2 ,2915 ,TETRA ,17606758,Sun Nov 28 20:53:05 CET,Sun Nov 28 22:45:46 CET,0.0 1.335 1.618 1.868 2.095 2.285 2.449 2.597 2.892 3.021 3.139 3.251 3.451 3.56 3.761 3.945 4.114 4.202 4.375 4.536 4.763 4.901 5.033 5.236 5.442 5.64 5.831 6.016 6.254 6.489 6.706 6.953 7.205 7.458 7.75 8.077 8.376 8.719 9.087 9.451 9.845 10.306 10.85 11.423 12.085 12.769 13.553 14.453 15.437 16.43 17.502 18.222 18.503 18.522 18.419 18.246 18.005 17.793 17.62 17.381 17.173 17.004 16.794 16.593 16.413 16.235 16.039 15.865 15.701 15.518 15.341 15.193 15.028 14.847 14.698 14.545 14.381 14.198 14.003 13.865 13.73 13.532 13.385 13.219 13.135 12.97 12.798 12.624 12.521 12.337 12.209 12.095 11.975 11.712 11.563 11.404 11.232 11.026 10.778 10.451 9.318 -3 ,22108 ,TETRA ,17606759,Sun Nov 28 20:53:06 CET,Sun Nov 28 22:44:44 CET,0.0 2.219 2.732 3.056 3.316 3.557 3.746 3.902 4.211 4.349 4.475 4.609 4.814 4.924 5.133 5.335 5.522 5.607 5.801 5.986 6.222 6.374 6.518 6.737 6.95 7.151 7.346 7.533 7.778 8.024 8.257 8.518 8.773 9.016 9.3 9.617 9.922 10.277 10.657 11.046 11.439 11.891 12.435 12.957 13.544 14.21 14.99 15.899 16.892 17.871 18.936 19.636 19.866 19.901 19.759 19.501 19.27 19.032 18.796 18.534 18.294 18.076 17.838 17.603 17.409 17.224 17.019 16.842 16.689 16.519 16.314 16.139 15.961 15.778 15.644 15.503 15.34 15.146 14.942 14.805 14.661 14.441 14.286 14.12 14.034 13.868 13.709 13.522 13.402 13.2 13.018 12.89 12.752 12.414 12.23 12.036 11.808 11.536 11.185 10.671 9.101 -4 ,18877 ,TETRA ,17606760,Sun Nov 28 20:53:06 CET,Sun Nov 28 22:44:50 CET,0.0 1.212 1.533 1.78 1.977 2.144 2.302 2.466 2.751 2.878 2.994 3.127 3.345 3.465 3.671 3.87 4.07 4.159 4.317 4.476 4.712 4.853 4.989 5.193 5.392 5.583 5.767 5.95 6.177 6.386 6.595 6.856 7.112 7.358 7.635 7.939 8.231 8.557 8.894 9.253 9.655 10.101 10.603 11.121 11.742 12.444 13.264 14.169 15.163 16.328 17.522 18.19 18.386 18.307 18.163 17.985 17.727 17.464 17.259 17.04 16.814 16.588 16.362 16.152 15.955 15.757 15.55 15.374 15.208 15.011 14.821 14.662 14.49 14.306 14.148 13.986 13.819 13.634 13.436 13.305 13.169 12.953 12.797 12.635 12.55 12.373 12.187 11.994 11.884 11.678 11.503 11.366 11.229 10.919 10.748 10.579 10.405 10.207 9.951 9.626 8.789 -5 ,16814 ,TETRA ,17606761,Sun Nov 28 20:53:06 CET,Sun Nov 28 22:44:54 CET,0.0 1.142 1.411 1.654 1.871 2.059 2.237 2.413 2.746 2.914 3.077 3.279 3.506 3.634 3.847 4.06 4.272 4.368 4.547 4.721 4.987 5.15 5.307 5.545 5.772 5.992 6.195 6.392 6.644 6.887 7.124 7.404 7.665 7.916 8.212 8.543 8.853 9.172 9.545 9.97 10.401 10.901 11.459 11.991 12.642 13.375 14.186 15.067 16.072 17.158 18.255 18.956 19.2 19.208 19.128 18.962 18.727 18.496 18.3 18.098 17.892 17.7 17.519 17.342 17.167 16.998 16.82 16.659 16.511 16.356 16.189 16.041 15.895 15.731 15.608 15.484 15.337 15.186 15.03 14.921 14.803 14.613 14.48 14.343 14.27 14.125 13.969 13.791 13.705 13.535 13.409 13.296 13.182 12.919 12.765 12.595 12.406 12.173 11.891 11.542 10.664 -6 ,8122 ,TETRA ,17606762,Sun Nov 28 20:53:09 CET,Sun Nov 28 22:45:05 CET,0.0 1.542 1.91 2.165 2.359 2.542 2.726 2.88 3.135 3.26 3.383 3.516 3.721 3.831 4.028 4.221 4.401 4.501 4.695 4.866 5.115 5.266 5.403 5.589 5.768 5.963 6.171 6.366 6.607 6.838 7.056 7.323 7.58 7.815 8.09 8.418 8.733 9.085 9.466 9.858 10.257 10.693 11.192 11.705 12.305 13.012 13.84 14.724 15.675 16.709 17.735 18.402 18.719 18.787 18.747 18.616 18.43 18.238 18.028 17.778 17.571 17.37 17.17 16.979 16.784 16.596 16.373 16.167 15.99 15.81 15.635 15.481 15.309 15.123 14.969 14.815 14.667 14.5 14.299 14.16 14.023 13.821 13.68 13.521 13.439 13.257 13.05 12.835 12.722 12.533 12.373 12.252 12.12 11.817 11.639 11.431 11.203 10.929 10.577 10.043 7.941 -7 ,32423 ,TETRA ,17606763,Sun Nov 28 20:53:10 CET,Sun Nov 28 22:44:51 CET,0.0 1.331 1.683 1.963 2.205 2.394 2.551 2.693 2.932 3.037 3.153 3.284 3.49 3.592 3.792 3.971 4.135 4.225 4.41 4.576 4.816 4.975 5.117 5.304 5.485 5.657 5.832 6.024 6.269 6.486 6.702 6.997 7.277 7.53 7.831 8.147 8.449 8.798 9.183 9.602 10.052 10.531 11.074 11.626 12.235 12.897 13.667 14.548 15.538 16.55 17.705 18.531 18.745 18.737 18.596 18.375 18.17 17.94 17.677 17.414 17.212 17.028 16.826 16.61 16.406 16.215 16.01 15.82 15.652 15.47 15.283 15.132 14.97 14.806 14.67 14.519 14.371 14.229 14.076 13.961 13.844 13.654 13.51 13.361 13.286 13.132 12.966 12.781 12.681 12.499 12.373 12.261 12.152 11.891 11.746 11.585 11.386 11.164 10.888 10.561 9.741 -8 ,5434 ,TETRA ,17606764,Sun Nov 28 20:53:06 CET,Sun Nov 28 22:44:54 CET,0.0 1.201 1.536 1.78 1.976 2.153 2.31 2.465 2.757 2.882 3.0 3.143 3.355 3.464 3.681 3.868 4.043 4.133 4.306 4.463 4.677 4.814 4.949 5.155 5.351 5.543 5.736 5.913 6.148 6.375 6.587 6.849 7.097 7.343 7.634 7.976 8.316 8.682 9.066 9.459 9.868 10.334 10.896 11.449 12.073 12.76 13.564 14.474 15.473 16.587 17.75 18.508 18.769 18.698 18.571 18.413 18.208 18.024 17.874 17.686 17.502 17.34 17.167 16.987 16.791 16.617 16.444 16.283 16.136 15.977 15.825 15.702 15.551 15.374 15.245 15.122 14.981 14.829 14.668 14.562 14.457 14.279 14.146 14.006 13.935 13.788 13.623 13.424 13.32 13.134 12.97 12.851 12.734 12.485 12.362 12.229 12.056 11.815 11.517 11.13 9.566 -9 ,15450 ,TETRA ,17606765,Sun Nov 28 20:53:09 CET,Sun Nov 28 22:44:54 CET,0.0 1.348 1.693 1.93 2.149 2.344 2.507 2.659 2.957 3.1 3.228 3.373 3.578 3.683 3.889 4.088 4.277 4.369 4.541 4.7 4.937 5.092 5.239 5.454 5.659 5.856 6.051 6.254 6.518 6.754 6.981 7.258 7.513 7.758 8.047 8.359 8.672 9.034 9.428 9.843 10.263 10.744 11.32 11.905 12.575 13.313 14.159 15.046 15.996 17.097 18.343 19.12 19.327 19.327 19.265 19.151 18.983 18.759 18.524 18.258 18.017 17.808 17.589 17.36 17.142 16.944 16.747 16.555 16.388 16.204 15.994 15.826 15.648 15.473 15.338 15.193 15.044 14.899 14.743 14.631 14.513 14.322 14.192 14.05 13.973 13.816 13.643 13.454 13.357 13.174 13.036 12.923 12.804 12.512 12.353 12.195 12.017 11.801 11.541 11.235 10.195 -10 ,31402 ,TETRA ,17606766,Sun Nov 28 20:53:11 CET,Sun Nov 28 22:45:15 CET,0.0 0.874 1.186 1.472 1.706 1.887 2.058 2.22 2.49 2.631 2.778 2.926 3.131 3.232 3.414 3.591 3.768 3.853 4.016 4.186 4.422 4.561 4.698 4.903 5.103 5.287 5.464 5.647 5.882 6.105 6.322 6.578 6.829 7.074 7.368 7.729 8.081 8.438 8.812 9.215 9.646 10.114 10.649 11.224 11.897 12.604 13.375 14.189 15.095 16.12 17.253 17.947 18.225 18.284 18.177 18.002 17.788 17.578 17.372 17.143 16.932 16.716 16.505 16.297 16.097 15.919 15.729 15.549 15.394 15.226 15.033 14.867 14.695 14.507 14.352 14.197 14.046 13.889 13.703 13.571 13.438 13.23 13.09 12.937 12.856 12.688 12.509 12.309 12.195 11.994 11.805 11.665 11.519 11.216 11.041 10.827 10.573 10.28 9.902 9.411 7.791 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_43_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_43_42.txt deleted file mode 100644 index 0ba761c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_43_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31950 ,TETRA ,17606767,Sun Nov 28 20:53:08 CET,Sun Nov 28 22:44:58 CET,0.0 0.515 0.774 0.969 1.106 1.234 1.366 1.484 1.689 1.786 1.88 1.961 2.125 2.195 2.332 2.465 2.596 2.662 2.79 2.918 3.116 3.242 3.36 3.522 3.686 3.849 3.996 4.137 4.318 4.485 4.648 4.846 5.03 5.193 5.369 5.57 5.778 6.004 6.25 6.511 6.76 7.036 7.318 7.545 7.825 8.143 8.451 8.752 9.051 9.282 9.278 8.986 8.552 8.089 7.648 7.173 6.745 6.342 5.984 5.622 5.298 5.027 4.759 4.507 4.271 4.049 3.827 3.631 3.467 3.29 3.084 2.911 2.732 2.533 2.366 2.193 2.025 1.856 1.684 1.558 1.428 1.229 1.085 0.944 0.868 0.71 0.541 0.354 0.262 0.061 -0.088 -0.21 -0.329 -0.603 -0.758 -0.914 -1.076 -1.259 -1.495 -1.781 -2.371 -2 ,19137 ,TETRA ,17606768,Sun Nov 28 20:53:07 CET,Sun Nov 28 22:45:24 CET,0.0 0.825 1.126 1.365 1.555 1.727 1.898 2.057 2.358 2.492 2.609 2.748 2.926 3.028 3.213 3.38 3.555 3.639 3.794 3.928 4.107 4.224 4.335 4.498 4.659 4.817 4.968 5.111 5.281 5.445 5.601 5.769 5.937 6.11 6.304 6.523 6.714 6.915 7.136 7.357 7.583 7.841 8.13 8.38 8.671 8.996 9.333 9.656 9.989 10.334 10.496 10.224 9.724 9.145 8.606 8.112 7.648 7.214 6.828 6.452 6.14 5.864 5.616 5.385 5.161 4.96 4.748 4.55 4.382 4.204 4.012 3.85 3.676 3.486 3.332 3.181 3.03 2.872 2.697 2.57 2.441 2.231 2.08 1.934 1.859 1.706 1.549 1.365 1.269 1.071 0.952 0.843 0.726 0.475 0.335 0.184 0.017 -0.168 -0.382 -0.66 -1.259 -3 ,23412 ,TETRA ,17606769,Sun Nov 28 20:53:10 CET,Sun Nov 28 22:44:52 CET,0.0 0.851 1.132 1.339 1.53 1.704 1.863 1.997 2.223 2.334 2.437 2.535 2.713 2.795 2.933 3.065 3.191 3.252 3.375 3.493 3.658 3.768 3.875 4.022 4.166 4.306 4.43 4.548 4.714 4.875 5.015 5.179 5.334 5.489 5.681 5.889 6.083 6.29 6.497 6.718 6.965 7.242 7.537 7.814 8.118 8.465 8.85 9.211 9.568 9.817 9.807 9.471 8.977 8.454 7.936 7.429 6.975 6.55 6.183 5.81 5.489 5.201 4.905 4.63 4.371 4.119 3.854 3.623 3.416 3.185 2.964 2.784 2.599 2.414 2.263 2.11 1.957 1.79 1.604 1.468 1.33 1.13 0.993 0.843 0.764 0.608 0.446 0.277 0.189 -0.008 -0.129 -0.243 -0.367 -0.64 -0.797 -0.958 -1.129 -1.326 -1.541 -1.83 -2.517 -4 ,6932 ,TETRA ,17606770,Sun Nov 28 20:53:11 CET,Sun Nov 28 22:45:33 CET,0.0 0.598 0.812 0.999 1.16 1.307 1.446 1.566 1.776 1.881 1.982 2.075 2.248 2.331 2.485 2.624 2.752 2.815 2.945 3.06 3.219 3.334 3.446 3.597 3.732 3.855 3.983 4.111 4.272 4.419 4.552 4.724 4.898 5.057 5.239 5.452 5.65 5.857 6.095 6.332 6.547 6.79 7.08 7.355 7.67 7.989 8.334 8.717 9.043 9.253 9.235 8.892 8.402 7.809 7.296 6.869 6.464 6.077 5.732 5.356 5.024 4.725 4.424 4.135 3.875 3.623 3.343 3.111 2.907 2.691 2.474 2.279 2.069 1.863 1.698 1.513 1.318 1.117 0.914 0.785 0.649 0.436 0.288 0.116 0.023 -0.185 -0.4 -0.627 -0.749 -0.969 -1.138 -1.264 -1.404 -1.733 -1.915 -2.121 -2.36 -2.65 -3.0 -3.405 -4.481 -5 ,20282 ,TETRA ,17606771,Sun Nov 28 20:53:35 CET,Sun Nov 28 22:46:32 CET,0.0 0.827 1.076 1.294 1.497 1.673 1.826 1.968 2.231 2.363 2.5 2.648 2.836 2.933 3.118 3.296 3.462 3.535 3.662 3.797 4.005 4.13 4.235 4.385 4.543 4.693 4.843 4.991 5.164 5.334 5.493 5.674 5.838 5.996 6.198 6.424 6.628 6.833 7.045 7.272 7.503 7.754 8.061 8.359 8.665 8.997 9.321 9.612 9.928 10.158 10.058 9.691 9.207 8.633 8.108 7.589 7.152 6.779 6.423 6.052 5.734 5.433 5.128 4.851 4.596 4.347 4.096 3.877 3.672 3.444 3.206 3.009 2.807 2.599 2.439 2.289 2.136 1.962 1.77 1.628 1.483 1.274 1.132 0.989 0.915 0.762 0.597 0.411 0.319 0.133 0.045 -0.056 -0.168 -0.434 -0.58 -0.715 -0.875 -1.066 -1.285 -1.642 -2.822 -6 ,4958 ,TETRA ,17606772,Sun Nov 28 20:53:35 CET,Sun Nov 28 22:44:57 CET,0.0 0.706 0.977 1.178 1.357 1.51 1.648 1.772 1.988 2.09 2.187 2.284 2.451 2.526 2.673 2.831 2.987 3.057 3.178 3.29 3.451 3.558 3.656 3.799 3.944 4.083 4.214 4.337 4.501 4.654 4.795 4.963 5.126 5.291 5.478 5.682 5.872 6.063 6.271 6.512 6.76 7.003 7.289 7.562 7.843 8.15 8.463 8.802 9.142 9.365 9.371 9.072 8.641 8.128 7.614 7.082 6.604 6.182 5.813 5.435 5.059 4.709 4.402 4.111 3.841 3.592 3.326 3.091 2.887 2.673 2.447 2.258 2.056 1.847 1.689 1.519 1.345 1.17 0.98 0.848 0.704 0.468 0.312 0.142 0.047 -0.146 -0.352 -0.567 -0.681 -0.896 -1.068 -1.211 -1.36 -1.672 -1.857 -2.05 -2.267 -2.53 -2.872 -3.352 -4.672 -7 ,24943 ,TETRA ,17606773,Sun Nov 28 20:53:37 CET,Sun Nov 28 22:45:24 CET,0.0 0.442 0.689 0.889 1.03 1.164 1.292 1.41 1.621 1.724 1.83 1.914 2.078 2.161 2.307 2.439 2.562 2.618 2.732 2.853 3.022 3.117 3.212 3.364 3.511 3.643 3.759 3.883 4.072 4.253 4.414 4.594 4.772 4.941 5.128 5.338 5.526 5.734 5.945 6.156 6.379 6.613 6.865 7.133 7.466 7.822 8.215 8.641 9.054 9.317 9.335 9.017 8.612 8.17 7.687 7.212 6.77 6.379 6.037 5.661 5.316 5.015 4.734 4.454 4.182 3.931 3.679 3.455 3.249 3.021 2.789 2.612 2.435 2.248 2.106 1.955 1.795 1.636 1.465 1.346 1.223 1.036 0.902 0.756 0.674 0.489 0.294 0.077 -0.036 -0.231 -0.389 -0.527 -0.663 -0.958 -1.13 -1.325 -1.547 -1.822 -2.191 -2.69 -4.047 -8 ,16346 ,TETRA ,17606775,Sun Nov 28 20:53:39 CET,Sun Nov 28 22:45:31 CET,0.0 0.593 0.868 1.078 1.237 1.375 1.499 1.607 1.8 1.892 1.979 2.061 2.234 2.317 2.466 2.604 2.735 2.8 2.925 3.045 3.205 3.302 3.398 3.534 3.667 3.796 3.917 4.034 4.182 4.326 4.452 4.593 4.73 4.876 5.049 5.24 5.416 5.594 5.8 6.041 6.291 6.544 6.827 7.118 7.432 7.715 7.971 8.241 8.545 8.721 8.688 8.41 7.889 7.339 6.84 6.312 5.82 5.367 4.959 4.552 4.198 3.877 3.574 3.292 3.027 2.774 2.507 2.268 2.064 1.844 1.602 1.403 1.206 0.995 0.825 0.661 0.498 0.319 0.129 -0.005 -0.145 -0.364 -0.525 -0.695 -0.788 -0.987 -1.174 -1.377 -1.501 -1.713 -1.889 -2.035 -2.182 -2.508 -2.679 -2.876 -3.104 -3.326 -3.6 -3.986 -4.748 -9 ,30097 ,TETRA ,17606776,Sun Nov 28 20:53:34 CET,Sun Nov 28 22:45:31 CET,0.0 0.476 0.746 0.939 1.094 1.23 1.359 1.484 1.722 1.822 1.911 2.003 2.174 2.253 2.404 2.555 2.699 2.76 2.883 3.003 3.166 3.266 3.359 3.488 3.613 3.743 3.868 3.985 4.131 4.264 4.393 4.542 4.692 4.839 5.0 5.178 5.353 5.532 5.712 5.908 6.115 6.34 6.593 6.856 7.137 7.408 7.716 8.013 8.265 8.473 8.499 8.216 7.787 7.29 6.837 6.401 5.992 5.618 5.302 4.979 4.676 4.404 4.135 3.86 3.596 3.347 3.099 2.881 2.676 2.462 2.253 2.054 1.84 1.642 1.499 1.357 1.208 1.051 0.883 0.774 0.662 0.474 0.342 0.21 0.14 -0.013 -0.187 -0.375 -0.474 -0.668 -0.786 -0.899 -1.021 -1.292 -1.447 -1.6 -1.755 -1.928 -2.147 -2.443 -3.119 -10 ,23634 ,TETRA ,17606777,Sun Nov 28 20:53:36 CET,Sun Nov 28 22:46:19 CET,0.0 1.293 1.675 1.958 2.193 2.375 2.558 2.745 3.066 3.203 3.323 3.467 3.659 3.76 3.936 4.1 4.256 4.337 4.49 4.628 4.834 4.964 5.084 5.254 5.417 5.579 5.731 5.882 6.083 6.261 6.417 6.603 6.791 6.96 7.135 7.343 7.529 7.7 7.91 8.168 8.444 8.728 9.013 9.285 9.595 9.92 10.253 10.577 10.921 11.217 11.28 10.895 10.372 9.826 9.316 8.815 8.35 7.922 7.555 7.196 6.86 6.549 6.263 5.996 5.746 5.51 5.259 5.03 4.834 4.623 4.371 4.16 3.951 3.725 3.54 3.352 3.174 3.002 2.818 2.679 2.536 2.305 2.132 1.953 1.868 1.699 1.508 1.311 1.205 0.989 0.8 0.657 0.52 0.243 0.094 -0.066 -0.242 -0.429 -0.656 -0.968 -1.772 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_44_18.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_44_18.txt deleted file mode 100644 index 709c4d3b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_44_18.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7403 ,TETRA ,17606778,Sun Nov 28 20:54:34 CET,Sun Nov 28 22:47:25 CET,0.0 0.194 0.299 0.374 0.436 0.514 0.581 0.626 0.7 0.734 0.772 0.769 0.881 0.911 0.967 1.018 1.074 1.102 1.155 1.206 1.277 1.32 1.354 1.404 1.457 1.515 1.564 1.61 1.676 1.721 1.753 1.807 1.859 1.908 1.96 1.995 2.025 2.05 2.084 2.115 2.129 2.142 2.16 2.149 2.082 1.946 1.708 1.377 0.855 0.03 -1.37 -3.21 -4.749 -5.937 -6.975 -7.957 -8.797 -9.549 -10.194 -10.818 -11.349 -11.827 -12.283 -12.695 -13.072 -13.422 -13.782 -14.112 -14.399 -14.685 -14.979 -15.232 -15.491 -15.738 -15.927 -16.132 -16.356 -16.578 -16.803 -16.962 -17.125 -17.405 -17.613 -17.827 -17.932 -18.14 -18.362 -18.6 -18.72 -18.95 -19.153 -19.306 -19.469 -19.852 -20.066 -20.297 -20.541 -20.813 -21.119 -21.519 -22.497 -2 ,5247 ,TETRA ,17606779,Sun Nov 28 20:54:34 CET,Sun Nov 28 22:45:22 CET,0.0 0.251 0.365 0.444 0.504 0.563 0.612 0.654 0.733 0.776 0.814 0.801 0.925 0.959 1.013 1.066 1.12 1.147 1.197 1.246 1.307 1.346 1.389 1.447 1.509 1.565 1.599 1.626 1.67 1.72 1.772 1.827 1.874 1.918 1.957 1.995 2.031 2.081 2.126 2.152 2.162 2.173 2.169 2.16 2.128 2.041 1.856 1.485 0.924 0.025 -1.587 -3.53 -5.111 -6.479 -7.655 -8.667 -9.544 -10.333 -11.024 -11.7 -12.261 -12.775 -13.271 -13.714 -14.105 -14.478 -14.867 -15.208 -15.516 -15.828 -16.149 -16.424 -16.704 -16.999 -17.229 -17.46 -17.706 -17.98 -18.271 -18.46 -18.651 -18.939 -19.145 -19.359 -19.461 -19.67 -19.901 -20.158 -20.297 -20.544 -20.756 -20.915 -21.096 -21.492 -21.702 -21.932 -22.181 -22.456 -22.786 -23.196 -24.559 -3 ,13559 ,TETRA ,17606780,Sun Nov 28 20:54:34 CET,Sun Nov 28 22:46:46 CET,0.0 0.174 0.264 0.349 0.42 0.495 0.569 0.632 0.739 0.785 0.824 0.827 0.947 0.981 1.05 1.118 1.185 1.218 1.278 1.336 1.409 1.449 1.488 1.537 1.586 1.642 1.693 1.732 1.786 1.841 1.883 1.938 1.994 2.033 2.071 2.124 2.169 2.218 2.258 2.271 2.288 2.278 2.237 2.192 2.111 2.0 1.802 1.489 0.991 0.246 -1.063 -2.89 -4.426 -5.701 -6.812 -7.776 -8.596 -9.326 -9.963 -10.616 -11.178 -11.667 -12.125 -12.577 -12.988 -13.35 -13.722 -14.053 -14.353 -14.656 -14.975 -15.251 -15.532 -15.827 -16.062 -16.309 -16.557 -16.798 -17.045 -17.219 -17.403 -17.682 -17.869 -18.082 -18.196 -18.413 -18.641 -18.899 -19.041 -19.281 -19.464 -19.613 -19.77 -20.107 -20.307 -20.539 -20.782 -21.052 -21.377 -21.799 -23.366 -4 ,21394 ,TETRA ,17606781,Sun Nov 28 20:54:34 CET,Sun Nov 28 22:42:52 CET,0.0 0.201 0.27 0.324 0.371 0.419 0.475 0.527 0.636 0.688 0.732 0.714 0.823 0.848 0.914 0.984 1.04 1.065 1.111 1.148 1.198 1.229 1.264 1.313 1.357 1.393 1.433 1.479 1.543 1.615 1.682 1.753 1.811 1.86 1.912 1.968 2.012 2.055 2.089 2.109 2.119 2.096 2.079 2.057 1.98 1.869 1.686 1.368 0.866 -0.009 -1.575 -3.577 -5.173 -6.448 -7.597 -8.611 -9.471 -10.265 -10.921 -11.54 -12.085 -12.585 -13.052 -13.486 -13.904 -14.27 -14.649 -14.99 -15.274 -15.572 -15.874 -16.129 -16.404 -16.698 -16.912 -17.14 -17.39 -17.63 -17.884 -18.062 -18.242 -18.537 -18.746 -18.96 -19.074 -19.311 -19.575 -19.857 -19.994 -20.24 -20.461 -20.614 -20.778 -21.159 -21.37 -21.581 -21.811 -22.054 -22.317 -22.727 -24.247 -5 ,15424 ,TETRA ,17606782,Sun Nov 28 20:54:34 CET,Sun Nov 28 22:44:04 CET,0.0 0.188 0.275 0.348 0.414 0.463 0.506 0.549 0.641 0.689 0.731 0.706 0.819 0.85 0.915 0.962 0.997 1.018 1.06 1.1 1.166 1.207 1.243 1.294 1.342 1.391 1.434 1.472 1.516 1.557 1.603 1.66 1.706 1.755 1.818 1.889 1.974 2.057 2.112 2.162 2.212 2.245 2.252 2.261 2.237 2.137 1.967 1.667 1.128 0.251 -1.148 -2.95 -4.48 -5.726 -6.795 -7.71 -8.496 -9.218 -9.848 -10.508 -11.072 -11.551 -11.998 -12.399 -12.774 -13.131 -13.497 -13.837 -14.129 -14.423 -14.723 -14.959 -15.199 -15.447 -15.649 -15.856 -16.061 -16.283 -16.529 -16.696 -16.867 -17.124 -17.295 -17.489 -17.595 -17.816 -18.052 -18.287 -18.411 -18.65 -18.837 -18.983 -19.135 -19.492 -19.691 -19.909 -20.155 -20.43 -20.722 -21.143 -22.458 -6 ,7990 ,TETRA ,17606783,Sun Nov 28 20:54:36 CET,Sun Nov 28 22:44:13 CET,0.0 0.302 0.414 0.491 0.561 0.618 0.67 0.712 0.79 0.823 0.855 0.826 0.936 0.965 1.023 1.08 1.138 1.164 1.215 1.267 1.324 1.363 1.404 1.462 1.511 1.546 1.583 1.621 1.661 1.695 1.73 1.777 1.822 1.852 1.88 1.91 1.934 1.949 1.956 1.951 1.942 1.92 1.881 1.846 1.775 1.638 1.411 1.116 0.69 -0.114 -1.693 -3.686 -5.279 -6.588 -7.738 -8.757 -9.611 -10.353 -10.991 -11.617 -12.141 -12.578 -13.003 -13.436 -13.838 -14.181 -14.521 -14.837 -15.116 -15.412 -15.701 -15.938 -16.197 -16.469 -16.685 -16.912 -17.157 -17.408 -17.653 -17.824 -18.004 -18.295 -18.485 -18.687 -18.801 -19.036 -19.286 -19.541 -19.667 -19.898 -20.09 -20.239 -20.393 -20.73 -20.912 -21.111 -21.335 -21.601 -21.912 -22.337 -23.493 -7 ,4028 ,TETRA ,17606784,Sun Nov 28 20:54:35 CET,Sun Nov 28 22:44:06 CET,0.0 0.147 0.249 0.317 0.372 0.418 0.467 0.521 0.614 0.652 0.683 0.663 0.783 0.815 0.882 0.948 0.995 1.013 1.051 1.099 1.169 1.203 1.234 1.275 1.314 1.347 1.377 1.414 1.472 1.519 1.564 1.625 1.683 1.721 1.749 1.793 1.835 1.883 1.947 2.024 2.1 2.168 2.196 2.195 2.166 2.078 1.907 1.566 1.003 0.117 -1.374 -3.234 -4.824 -6.193 -7.365 -8.393 -9.259 -10.008 -10.651 -11.279 -11.808 -12.263 -12.711 -13.148 -13.524 -13.861 -14.228 -14.561 -14.851 -15.146 -15.432 -15.667 -15.911 -16.165 -16.369 -16.581 -16.796 -17.012 -17.244 -17.406 -17.565 -17.814 -17.994 -18.183 -18.283 -18.504 -18.739 -18.988 -19.13 -19.369 -19.541 -19.692 -19.854 -20.224 -20.426 -20.637 -20.875 -21.152 -21.491 -21.908 -23.274 -8 ,16771 ,TETRA ,17606785,Sun Nov 28 20:54:36 CET,Sun Nov 28 22:44:18 CET,0.0 0.239 0.335 0.398 0.455 0.517 0.581 0.635 0.722 0.764 0.806 0.8 0.917 0.95 1.013 1.075 1.128 1.152 1.191 1.226 1.299 1.353 1.398 1.452 1.504 1.557 1.602 1.632 1.682 1.748 1.802 1.865 1.917 1.955 2.005 2.063 2.113 2.162 2.21 2.249 2.274 2.294 2.269 2.205 2.15 2.077 1.917 1.628 1.117 0.287 -1.234 -3.207 -4.778 -6.097 -7.197 -8.155 -9.005 -9.759 -10.412 -11.063 -11.61 -12.117 -12.6 -13.041 -13.437 -13.789 -14.172 -14.51 -14.789 -15.073 -15.376 -15.631 -15.888 -16.155 -16.372 -16.608 -16.855 -17.108 -17.363 -17.542 -17.723 -18.006 -18.205 -18.401 -18.505 -18.728 -18.967 -19.228 -19.366 -19.601 -19.785 -19.941 -20.102 -20.446 -20.633 -20.844 -21.082 -21.363 -21.69 -22.139 -23.572 -9 ,24418 ,TETRA ,17606786,Sun Nov 28 20:54:36 CET,Sun Nov 28 22:44:12 CET,0.0 0.263 0.401 0.486 0.55 0.604 0.653 0.694 0.779 0.813 0.849 0.842 0.96 0.989 1.048 1.109 1.157 1.179 1.216 1.261 1.331 1.364 1.393 1.431 1.476 1.521 1.561 1.603 1.655 1.696 1.742 1.814 1.881 1.927 1.975 2.043 2.129 2.22 2.284 2.349 2.413 2.462 2.491 2.488 2.451 2.365 2.219 1.968 1.474 0.601 -0.803 -2.566 -4.098 -5.377 -6.49 -7.53 -8.473 -9.311 -9.995 -10.658 -11.247 -11.74 -12.177 -12.618 -13.03 -13.4 -13.802 -14.165 -14.483 -14.808 -15.124 -15.374 -15.636 -15.902 -16.105 -16.308 -16.526 -16.774 -17.023 -17.181 -17.349 -17.627 -17.819 -18.031 -18.143 -18.371 -18.616 -18.872 -19.003 -19.24 -19.428 -19.573 -19.731 -20.075 -20.262 -20.473 -20.708 -20.978 -21.309 -21.781 -23.161 -10 ,3173 ,TETRA ,17606787,Sun Nov 28 20:55:33 CET,Sun Nov 28 22:44:51 CET,0.0 0.125 0.192 0.263 0.327 0.384 0.439 0.49 0.586 0.62 0.65 0.636 0.746 0.779 0.837 0.881 0.924 0.945 0.985 1.024 1.085 1.121 1.162 1.218 1.265 1.31 1.353 1.393 1.443 1.485 1.52 1.571 1.62 1.66 1.709 1.758 1.798 1.836 1.862 1.896 1.95 2.013 2.048 2.035 1.987 1.878 1.673 1.357 0.837 -0.054 -1.585 -3.462 -5.006 -6.266 -7.333 -8.316 -9.169 -9.932 -10.589 -11.232 -11.766 -12.245 -12.708 -13.125 -13.517 -13.885 -14.262 -14.605 -14.891 -15.185 -15.506 -15.757 -16.032 -16.314 -16.516 -16.731 -16.955 -17.191 -17.437 -17.605 -17.775 -18.048 -18.244 -18.449 -18.55 -18.764 -19.002 -19.251 -19.39 -19.621 -19.794 -19.936 -20.082 -20.398 -20.572 -20.756 -20.975 -21.255 -21.621 -22.102 -23.415 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_44_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_44_43.txt deleted file mode 100644 index fcda5bc9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_44_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13117 ,TETRA ,17698059,Sat Dec 4 16:40:04 CET,Sat Dec 4 17:58:56 CET,0.0 7.191 7.565 7.873 8.13 8.345 8.535 8.7 9.006 9.146 9.273 9.42 9.606 9.707 9.894 10.067 10.235 10.321 10.48 10.622 10.809 10.937 11.075 11.272 11.455 11.619 11.772 11.923 12.097 12.241 12.379 12.553 12.719 12.872 13.04 13.23 13.409 13.602 13.802 14.002 14.196 14.442 14.698 14.882 15.066 15.23 15.377 15.44 15.395 15.232 14.663 13.578 12.567 11.68 10.901 10.229 9.656 9.134 8.678 8.208 7.818 7.482 7.116 6.747 6.419 6.147 5.875 5.631 5.417 5.179 4.936 4.749 4.567 4.388 4.247 4.108 3.968 3.821 3.666 3.557 3.448 3.273 3.139 2.995 2.93 2.801 2.666 2.524 2.446 2.277 2.198 2.118 2.033 1.829 1.715 1.593 1.45 1.288 1.12 0.906 0.523 -2 ,22444 ,TETRA ,17675331,Sat Dec 4 16:24:54 CET,Sat Dec 4 17:49:47 CET,0.0 1.762 2.19 2.5 2.769 2.99 3.177 3.335 3.628 3.771 3.9 4.054 4.239 4.34 4.561 4.756 4.932 5.026 5.204 5.365 5.593 5.739 5.879 6.072 6.254 6.432 6.59 6.73 6.915 7.093 7.259 7.446 7.609 7.752 7.92 8.12 8.323 8.534 8.745 8.965 9.159 9.383 9.644 9.825 9.984 10.136 10.262 10.311 10.194 9.865 9.053 7.831 6.836 6.019 5.306 4.66 4.076 3.571 3.144 2.686 2.292 1.942 1.624 1.334 1.067 0.825 0.567 0.336 0.134 -0.067 -0.264 -0.428 -0.607 -0.8 -0.944 -1.09 -1.243 -1.403 -1.571 -1.691 -1.817 -2.007 -2.132 -2.268 -2.341 -2.484 -2.628 -2.783 -2.863 -3.032 -3.119 -3.205 -3.288 -3.468 -3.567 -3.669 -3.784 -3.939 -4.137 -4.363 -5.377 -3 ,28767 ,TETRA ,17675332,Sat Dec 4 16:24:56 CET,Sat Dec 4 18:14:50 CET,0.0 1.254 1.663 2.018 2.337 2.592 2.797 2.985 3.348 3.511 3.654 3.812 3.997 4.089 4.285 4.48 4.657 4.74 4.914 5.077 5.285 5.42 5.55 5.721 5.879 6.014 6.159 6.311 6.507 6.705 6.895 7.113 7.3 7.486 7.704 7.938 8.147 8.357 8.57 8.779 8.985 9.204 9.439 9.619 9.79 9.955 10.083 10.143 10.034 9.703 8.946 7.793 6.799 5.956 5.227 4.57 3.994 3.463 3.007 2.578 2.239 1.933 1.636 1.35 1.077 0.833 0.583 0.36 0.169 -0.031 -0.233 -0.402 -0.592 -0.785 -0.928 -1.079 -1.232 -1.39 -1.555 -1.664 -1.784 -1.979 -2.108 -2.242 -2.309 -2.44 -2.589 -2.754 -2.837 -3.005 -3.081 -3.164 -3.249 -3.427 -3.541 -3.667 -3.799 -3.956 -4.127 -4.328 -4.811 -4 ,25427 ,TETRA ,17675333,Sat Dec 4 16:24:58 CET,Sat Dec 4 17:58:33 CET,0.0 1.623 2.048 2.363 2.64 2.877 3.08 3.255 3.558 3.707 3.856 4.042 4.249 4.357 4.543 4.717 4.873 4.956 5.132 5.298 5.534 5.685 5.843 6.071 6.276 6.452 6.62 6.781 6.973 7.156 7.329 7.525 7.712 7.891 8.093 8.315 8.527 8.74 8.965 9.203 9.409 9.617 9.865 10.1 10.342 10.586 10.765 10.843 10.882 10.643 9.819 8.732 7.743 6.816 6.041 5.354 4.723 4.178 3.711 3.222 2.822 2.478 2.137 1.816 1.519 1.241 0.941 0.685 0.472 0.254 0.041 -0.126 -0.297 -0.486 -0.638 -0.791 -0.948 -1.116 -1.29 -1.41 -1.534 -1.728 -1.861 -1.991 -2.06 -2.208 -2.352 -2.499 -2.572 -2.739 -2.819 -2.909 -3.009 -3.222 -3.338 -3.472 -3.639 -3.829 -4.031 -4.317 -5.022 -5 ,21977 ,TETRA ,17675091,Sat Dec 4 16:05:59 CET,Sat Dec 4 17:58:17 CET,0.0 3.144 3.627 3.967 4.236 4.454 4.652 4.823 5.121 5.253 5.376 5.519 5.705 5.805 6.016 6.219 6.4 6.493 6.662 6.82 7.066 7.23 7.396 7.609 7.781 7.944 8.1 8.248 8.439 8.623 8.797 8.992 9.163 9.325 9.504 9.682 9.863 10.06 10.264 10.501 10.733 10.968 11.207 11.389 11.562 11.728 11.863 11.942 11.842 11.488 10.744 9.694 8.696 7.819 7.076 6.419 5.864 5.359 4.938 4.526 4.159 3.83 3.519 3.229 2.956 2.713 2.465 2.241 2.051 1.862 1.664 1.5 1.322 1.127 0.987 0.846 0.695 0.538 0.372 0.259 0.144 -0.031 -0.161 -0.308 -0.389 -0.536 -0.671 -0.824 -0.903 -1.074 -1.164 -1.252 -1.342 -1.542 -1.655 -1.786 -1.926 -2.069 -2.25 -2.518 -3.512 -6 ,21462 ,TETRA ,17698064,Sat Dec 4 16:42:54 CET,Sat Dec 4 17:58:02 CET,0.0 1.447 1.878 2.204 2.451 2.637 2.815 2.983 3.295 3.425 3.557 3.753 3.959 4.065 4.259 4.461 4.65 4.731 4.882 5.032 5.248 5.386 5.521 5.713 5.892 6.077 6.26 6.419 6.615 6.806 6.977 7.169 7.366 7.559 7.767 7.989 8.199 8.424 8.653 8.891 9.116 9.319 9.543 9.76 9.965 10.121 10.21 10.225 10.153 9.875 9.131 8.042 7.104 6.29 5.553 4.89 4.266 3.682 3.206 2.739 2.338 1.982 1.657 1.363 1.08 0.825 0.565 0.324 0.107 -0.116 -0.34 -0.53 -0.727 -0.922 -1.07 -1.229 -1.388 -1.549 -1.722 -1.841 -1.959 -2.143 -2.286 -2.44 -2.507 -2.638 -2.782 -2.933 -3.011 -3.18 -3.285 -3.375 -3.462 -3.671 -3.786 -3.904 -4.06 -4.219 -4.413 -4.746 -5.636 -7 ,12858 ,TETRA ,17675336,Sat Dec 4 16:24:58 CET,Sat Dec 4 17:48:18 CET,0.0 2.346 2.854 3.147 3.394 3.611 3.796 3.966 4.284 4.426 4.556 4.722 4.923 5.04 5.254 5.459 5.661 5.76 5.947 6.117 6.343 6.482 6.628 6.825 6.979 7.126 7.286 7.441 7.625 7.806 7.979 8.17 8.344 8.487 8.654 8.848 9.015 9.191 9.381 9.583 9.801 10.041 10.296 10.508 10.731 10.949 11.117 11.201 11.141 10.887 10.137 8.918 7.82 6.875 6.086 5.386 4.772 4.235 3.775 3.305 2.906 2.557 2.225 1.905 1.589 1.297 1.008 0.754 0.547 0.33 0.091 -0.097 -0.287 -0.495 -0.664 -0.832 -0.991 -1.155 -1.333 -1.456 -1.581 -1.765 -1.887 -2.006 -2.07 -2.215 -2.36 -2.504 -2.58 -2.748 -2.846 -2.95 -3.056 -3.273 -3.388 -3.509 -3.644 -3.785 -3.933 -4.16 -4.652 -8 ,14709 ,TETRA ,17675094,Sat Dec 4 16:06:52 CET,Sat Dec 4 17:47:14 CET,0.0 1.373 1.798 2.127 2.372 2.549 2.74 2.932 3.252 3.402 3.538 3.694 3.889 3.988 4.17 4.348 4.516 4.591 4.738 4.878 5.072 5.196 5.304 5.463 5.632 5.782 5.919 6.057 6.24 6.408 6.568 6.783 6.991 7.186 7.403 7.611 7.809 8.029 8.276 8.512 8.707 8.917 9.185 9.445 9.665 9.87 10.081 10.187 10.075 9.693 8.87 7.76 6.798 5.89 5.082 4.398 3.798 3.235 2.743 2.264 1.858 1.489 1.153 0.846 0.568 0.315 0.043 -0.195 -0.404 -0.621 -0.846 -1.025 -1.205 -1.397 -1.543 -1.696 -1.845 -2.004 -2.171 -2.286 -2.408 -2.59 -2.711 -2.831 -2.899 -3.034 -3.171 -3.332 -3.415 -3.579 -3.662 -3.75 -3.846 -4.05 -4.158 -4.28 -4.407 -4.558 -4.758 -5.043 -6.182 -9 ,22140 ,TETRA ,17675338,Sat Dec 4 16:24:53 CET,Sat Dec 4 17:49:37 CET,0.0 2.117 2.554 2.859 3.112 3.325 3.506 3.681 4.014 4.163 4.307 4.531 4.752 4.87 5.083 5.303 5.527 5.624 5.79 5.952 6.194 6.336 6.47 6.655 6.809 6.961 7.102 7.236 7.4 7.543 7.686 7.861 8.035 8.206 8.392 8.591 8.792 9.023 9.248 9.453 9.652 9.884 10.116 10.292 10.489 10.67 10.773 10.831 10.775 10.417 9.62 8.489 7.419 6.52 5.771 5.091 4.519 4.013 3.548 3.089 2.717 2.387 2.065 1.768 1.498 1.257 1.017 0.798 0.608 0.42 0.215 0.044 -0.131 -0.324 -0.475 -0.626 -0.773 -0.922 -1.083 -1.195 -1.304 -1.477 -1.61 -1.748 -1.813 -1.958 -2.112 -2.263 -2.341 -2.508 -2.595 -2.684 -2.782 -3.015 -3.135 -3.256 -3.395 -3.557 -3.738 -3.959 -4.432 -10 ,32398 ,TETRA ,17675339,Sat Dec 4 16:24:55 CET,Sat Dec 4 17:49:06 CET,0.0 1.775 2.233 2.587 2.856 3.077 3.27 3.438 3.716 3.856 3.989 4.149 4.35 4.458 4.673 4.873 5.047 5.131 5.276 5.419 5.633 5.76 5.879 6.055 6.238 6.42 6.588 6.738 6.915 7.088 7.26 7.468 7.677 7.856 8.034 8.255 8.461 8.668 8.903 9.148 9.373 9.577 9.789 9.986 10.171 10.312 10.419 10.471 10.419 10.114 9.296 8.169 7.175 6.302 5.59 4.954 4.381 3.891 3.468 3.035 2.66 2.327 2.02 1.728 1.456 1.208 0.94 0.698 0.498 0.297 0.089 -0.077 -0.246 -0.426 -0.565 -0.712 -0.864 -1.017 -1.173 -1.281 -1.398 -1.591 -1.725 -1.86 -1.927 -2.066 -2.207 -2.353 -2.431 -2.596 -2.672 -2.753 -2.838 -3.043 -3.168 -3.29 -3.408 -3.55 -3.734 -3.924 -4.518 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_45_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_45_44.txt deleted file mode 100644 index 186d0f4f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cdk8/water/Summary_FEP_45_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13943 ,TETRA ,17606788,Sun Nov 28 20:55:33 CET,Sun Nov 28 22:46:19 CET,0.0 0.264 0.466 0.633 0.78 0.9 1.008 1.111 1.279 1.363 1.443 1.504 1.655 1.724 1.855 1.98 2.111 2.175 2.294 2.411 2.579 2.685 2.781 2.911 3.05 3.189 3.32 3.443 3.593 3.759 3.918 4.109 4.289 4.451 4.648 4.866 5.081 5.335 5.606 5.882 6.155 6.465 6.839 7.169 7.514 7.924 8.378 8.843 9.322 9.793 10.281 10.318 10.038 9.71 9.356 8.999 8.634 8.264 7.899 7.517 7.204 6.923 6.647 6.365 6.101 5.88 5.655 5.456 5.276 5.07 4.862 4.698 4.524 4.334 4.17 4.005 3.843 3.667 3.49 3.378 3.261 3.056 2.909 2.758 2.675 2.501 2.325 2.147 2.056 1.876 1.759 1.637 1.505 1.238 1.092 0.936 0.756 0.554 0.307 -0.015 -1.314 -2 ,18690 ,TETRA ,17606789,Sun Nov 28 20:55:35 CET,Sun Nov 28 22:48:16 CET,0.0 0.715 0.893 1.031 1.154 1.274 1.383 1.474 1.662 1.758 1.849 1.948 2.119 2.208 2.389 2.568 2.736 2.812 2.955 3.095 3.284 3.406 3.53 3.702 3.863 4.021 4.164 4.303 4.494 4.675 4.847 5.044 5.223 5.393 5.593 5.826 6.057 6.305 6.579 6.867 7.148 7.462 7.831 8.202 8.635 9.084 9.576 10.132 10.707 11.271 11.669 11.648 11.35 10.959 10.564 10.157 9.768 9.388 9.049 8.69 8.357 8.068 7.789 7.505 7.239 7.005 6.766 6.543 6.336 6.121 5.904 5.723 5.539 5.359 5.191 5.009 4.84 4.66 4.467 4.325 4.192 4.01 3.866 3.693 3.606 3.435 3.254 3.043 2.921 2.709 2.506 2.357 2.214 1.904 1.739 1.558 1.331 1.013 0.627 0.168 -1.53 -3 ,27162 ,TETRA ,17606790,Sun Nov 28 20:55:35 CET,Sun Nov 28 22:47:17 CET,0.0 0.555 0.759 0.922 1.06 1.189 1.308 1.418 1.638 1.728 1.797 1.859 2.016 2.08 2.203 2.328 2.442 2.5 2.625 2.743 2.908 3.015 3.114 3.253 3.388 3.519 3.655 3.784 3.949 4.109 4.253 4.435 4.619 4.805 5.009 5.215 5.42 5.638 5.879 6.133 6.392 6.7 7.035 7.367 7.757 8.172 8.645 9.101 9.565 10.053 10.377 10.323 10.119 9.813 9.457 9.063 8.685 8.357 8.088 7.776 7.446 7.141 6.853 6.585 6.34 6.113 5.854 5.588 5.35 5.122 4.882 4.68 4.471 4.254 4.073 3.892 3.729 3.559 3.371 3.237 3.088 2.851 2.686 2.511 2.424 2.229 2.023 1.812 1.701 1.502 1.32 1.181 1.02 0.688 0.504 0.276 0.01 -0.311 -0.699 -1.23 -2.992 -4 ,15628 ,TETRA ,17606791,Sun Nov 28 20:55:35 CET,Sun Nov 28 22:47:28 CET,0.0 0.857 1.142 1.324 1.454 1.563 1.678 1.79 1.975 2.064 2.154 2.239 2.403 2.479 2.621 2.753 2.885 2.947 3.063 3.181 3.36 3.473 3.571 3.712 3.863 4.003 4.134 4.272 4.451 4.62 4.773 4.958 5.148 5.329 5.533 5.753 5.967 6.195 6.444 6.715 6.995 7.314 7.682 8.043 8.421 8.784 9.147 9.525 9.988 10.567 11.075 11.137 10.855 10.457 10.078 9.7 9.263 8.863 8.571 8.243 7.911 7.61 7.321 7.05 6.795 6.566 6.329 6.088 5.867 5.64 5.411 5.214 4.994 4.774 4.6 4.41 4.22 4.031 3.824 3.673 3.522 3.271 3.097 2.927 2.829 2.63 2.411 2.177 2.069 1.869 1.714 1.588 1.461 1.168 0.999 0.81 0.604 0.419 0.181 -0.165 -1.388 -5 ,2576 ,TETRA ,17606792,Sun Nov 28 20:55:35 CET,Sun Nov 28 22:47:21 CET,0.0 0.611 0.849 0.999 1.149 1.283 1.398 1.506 1.696 1.781 1.868 1.957 2.114 2.189 2.331 2.465 2.594 2.661 2.796 2.92 3.09 3.197 3.297 3.441 3.583 3.729 3.863 3.988 4.15 4.303 4.449 4.625 4.794 4.952 5.139 5.349 5.554 5.79 6.014 6.241 6.501 6.785 7.12 7.454 7.813 8.212 8.686 9.171 9.676 10.221 10.639 10.632 10.364 10.025 9.653 9.238 8.822 8.427 8.094 7.742 7.432 7.158 6.865 6.581 6.322 6.083 5.832 5.604 5.393 5.17 4.948 4.767 4.58 4.378 4.205 4.018 3.828 3.625 3.415 3.283 3.137 2.884 2.727 2.561 2.466 2.275 2.07 1.826 1.698 1.491 1.297 1.166 1.026 0.719 0.541 0.358 0.179 -0.034 -0.289 -0.686 -2.027 -6 ,18465 ,TETRA ,17606793,Sun Nov 28 20:55:36 CET,Sun Nov 28 22:46:54 CET,0.0 0.33 0.489 0.64 0.782 0.901 1.003 1.11 1.318 1.419 1.506 1.571 1.726 1.799 1.944 2.079 2.209 2.272 2.378 2.491 2.663 2.763 2.863 3.014 3.161 3.3 3.434 3.566 3.732 3.885 4.032 4.21 4.378 4.546 4.747 4.985 5.201 5.423 5.662 5.914 6.196 6.519 6.885 7.24 7.632 8.057 8.565 9.085 9.565 10.058 10.515 10.524 10.274 9.895 9.457 9.045 8.68 8.276 7.868 7.495 7.181 6.878 6.583 6.299 6.023 5.775 5.521 5.287 5.059 4.816 4.585 4.393 4.189 3.966 3.771 3.577 3.39 3.207 3.025 2.899 2.772 2.57 2.434 2.287 2.211 2.048 1.856 1.665 1.561 1.363 1.225 1.112 0.994 0.727 0.578 0.424 0.266 0.049 -0.213 -0.534 -1.578 -7 ,28761 ,TETRA ,17606794,Sun Nov 28 20:55:35 CET,Sun Nov 28 22:48:27 CET,0.0 0.465 0.651 0.794 0.915 1.026 1.15 1.265 1.466 1.557 1.64 1.72 1.881 1.963 2.119 2.255 2.372 2.431 2.547 2.653 2.803 2.9 2.992 3.125 3.272 3.407 3.529 3.647 3.81 3.972 4.12 4.296 4.458 4.61 4.792 5.012 5.215 5.426 5.661 5.915 6.187 6.48 6.806 7.124 7.48 7.863 8.278 8.71 9.219 9.825 10.292 10.25 10.016 9.714 9.308 8.909 8.529 8.12 7.767 7.433 7.146 6.874 6.597 6.344 6.101 5.838 5.573 5.332 5.103 4.872 4.621 4.407 4.176 3.942 3.772 3.6 3.403 3.18 2.966 2.822 2.66 2.395 2.214 2.03 1.941 1.756 1.547 1.32 1.204 1.003 0.812 0.656 0.491 0.167 -0.018 -0.233 -0.5 -0.806 -1.158 -1.71 -3.991 -8 ,621 ,TETRA ,17606795,Sun Nov 28 20:55:35 CET,Sun Nov 28 22:47:17 CET,0.0 0.34 0.539 0.682 0.794 0.887 0.993 1.101 1.269 1.348 1.429 1.496 1.641 1.71 1.844 1.977 2.104 2.164 2.282 2.403 2.568 2.675 2.774 2.907 3.047 3.193 3.33 3.456 3.62 3.78 3.928 4.109 4.298 4.476 4.67 4.883 5.086 5.33 5.612 5.902 6.18 6.497 6.875 7.244 7.679 8.167 8.717 9.28 9.87 10.374 10.656 10.574 10.264 9.896 9.5 9.12 8.739 8.322 7.952 7.58 7.24 6.908 6.589 6.317 6.076 5.841 5.586 5.346 5.134 4.922 4.695 4.508 4.321 4.132 3.99 3.843 3.689 3.527 3.35 3.223 3.088 2.879 2.734 2.574 2.491 2.32 2.136 1.934 1.832 1.661 1.575 1.471 1.347 1.052 0.883 0.705 0.512 0.292 0.036 -0.295 -1.628 -9 ,10526 ,TETRA ,17606796,Sun Nov 28 20:55:36 CET,Sun Nov 28 22:46:59 CET,0.0 0.419 0.606 0.788 0.94 1.061 1.175 1.28 1.478 1.567 1.651 1.736 1.888 1.957 2.076 2.186 2.308 2.371 2.483 2.587 2.735 2.827 2.924 3.062 3.193 3.33 3.459 3.578 3.733 3.882 4.026 4.21 4.381 4.537 4.719 4.921 5.12 5.346 5.58 5.828 6.103 6.39 6.694 7.008 7.395 7.835 8.325 8.819 9.264 9.668 9.986 9.879 9.464 9.021 8.642 8.256 7.857 7.463 7.129 6.789 6.484 6.196 5.913 5.64 5.371 5.106 4.817 4.556 4.335 4.122 3.903 3.725 3.534 3.318 3.148 2.977 2.805 2.616 2.402 2.257 2.118 1.907 1.741 1.543 1.438 1.22 0.986 0.737 0.618 0.42 0.196 0.027 -0.145 -0.516 -0.716 -0.919 -1.141 -1.426 -1.739 -2.149 -3.946 -10 ,2794 ,TETRA ,17606797,Sun Nov 28 20:55:36 CET,Sun Nov 28 22:46:52 CET,0.0 0.457 0.627 0.765 0.902 1.029 1.152 1.268 1.447 1.53 1.608 1.674 1.831 1.907 2.06 2.204 2.336 2.4 2.513 2.631 2.798 2.897 2.998 3.136 3.267 3.395 3.522 3.652 3.826 3.987 4.133 4.314 4.484 4.65 4.844 5.055 5.263 5.504 5.754 6.015 6.272 6.54 6.862 7.208 7.599 8.035 8.518 9.015 9.517 9.927 10.278 10.372 10.146 9.8 9.409 8.989 8.607 8.253 7.928 7.566 7.237 6.942 6.649 6.377 6.121 5.881 5.607 5.349 5.139 4.931 4.721 4.536 4.343 4.156 4.018 3.859 3.694 3.515 3.312 3.179 3.042 2.815 2.655 2.507 2.425 2.245 2.066 1.837 1.725 1.541 1.405 1.295 1.178 0.918 0.782 0.616 0.414 0.201 -0.037 -0.367 -1.208 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 0e81f082..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32442 ,TETRA ,17606886,Sun Nov 28 20:55:36 CET,Sun Nov 28 23:17:48 CET,0.0 3.228 3.86 4.303 4.686 5.042 5.361 5.642 6.185 6.445 6.693 7.0 7.35 7.564 7.972 8.359 8.722 8.89 9.192 9.487 9.923 10.203 10.475 10.892 11.288 11.639 11.972 12.303 12.754 13.188 13.595 14.085 14.558 15.001 15.508 16.097 16.68 17.342 18.044 18.774 19.543 20.408 21.408 22.341 23.362 24.524 25.789 27.069 28.486 29.982 31.202 31.462 31.005 30.082 29.016 27.913 26.856 25.88 25.007 24.093 23.295 22.59 21.886 21.183 20.518 19.896 19.259 18.691 18.174 17.622 17.046 16.585 16.115 15.582 15.157 14.733 14.281 13.804 13.319 12.98 12.615 12.044 11.643 11.207 10.965 10.452 9.936 9.368 9.048 8.59 8.079 7.74 7.379 6.565 6.079 5.513 4.856 4.075 3.164 2.061 -8.451 -4 ,23172 ,TETRA ,17606889,Sun Nov 28 20:56:36 CET,Sun Nov 28 23:20:40 CET,0.0 3.452 3.968 4.401 4.785 5.085 5.34 5.573 6.005 6.225 6.447 6.71 7.039 7.21 7.55 7.874 8.163 8.308 8.587 8.845 9.228 9.475 9.72 10.095 10.447 10.759 11.061 11.35 11.702 12.053 12.377 12.753 13.137 13.514 13.949 14.423 14.849 15.317 15.846 16.386 16.926 17.519 18.2 18.913 19.719 20.567 21.487 22.383 23.315 24.196 24.58 24.172 23.507 22.652 21.687 20.66 19.668 18.757 17.891 16.955 16.131 15.381 14.669 13.982 13.306 12.672 11.991 11.395 10.895 10.345 9.782 9.319 8.801 8.216 7.731 7.247 6.747 6.21 5.664 5.277 4.864 4.216 3.752 3.263 3.01 2.5 1.966 1.369 1.052 0.576 0.031 -0.35 -0.774 -1.643 -2.117 -2.669 -3.319 -4.149 -5.089 -6.354 -10.952 -9 ,30606 ,TETRA ,17606894,Sun Nov 28 20:57:33 CET,Sun Nov 28 23:20:05 CET,0.0 3.116 3.639 4.044 4.402 4.71 4.994 5.245 5.695 5.913 6.13 6.354 6.672 6.843 7.159 7.431 7.704 7.854 8.108 8.344 8.705 8.932 9.148 9.454 9.755 10.064 10.377 10.666 11.008 11.339 11.677 12.074 12.454 12.836 13.264 13.738 14.194 14.675 15.171 15.696 16.262 16.884 17.586 18.271 19.052 19.904 20.756 21.619 22.586 23.56 24.115 23.618 22.759 21.788 20.681 19.485 18.423 17.487 16.596 15.667 14.846 14.057 13.286 12.535 11.796 11.08 10.326 9.65 9.034 8.382 7.698 7.133 6.553 5.949 5.491 4.987 4.456 3.918 3.35 2.942 2.506 1.866 1.414 0.914 0.641 0.068 -0.513 -1.143 -1.484 -1.965 -2.557 -2.975 -3.442 -4.486 -5.031 -5.634 -6.287 -6.958 -7.719 -8.852 -13.193 -10 ,21790 ,TETRA ,17606895,Sun Nov 28 20:57:33 CET,Sun Nov 28 23:17:38 CET,0.0 2.173 2.81 3.335 3.77 4.148 4.484 4.788 5.366 5.635 5.872 6.175 6.538 6.742 7.08 7.381 7.694 7.857 8.203 8.531 8.966 9.244 9.526 9.946 10.32 10.689 11.053 11.387 11.79 12.19 12.634 13.165 13.638 14.109 14.644 15.2 15.726 16.321 16.955 17.661 18.425 19.264 20.26 21.274 22.459 23.725 25.08 26.537 28.141 29.766 31.291 31.865 31.625 30.969 30.068 29.079 28.119 27.107 26.155 25.162 24.276 23.486 22.707 21.97 21.283 20.632 19.917 19.265 18.703 18.12 17.492 16.973 16.463 15.94 15.524 15.074 14.628 14.168 13.66 13.302 12.916 12.295 11.857 11.386 11.145 10.673 10.176 9.616 9.313 8.882 8.401 8.048 7.673 6.809 6.317 5.815 5.282 4.625 3.741 2.473 -1.78 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt deleted file mode 100644 index 7555b4b4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11203 ,TETRA ,17606896,Sun Nov 28 20:58:33 CET,Sun Nov 28 23:28:36 CET,0.0 1.413 1.945 2.326 2.634 2.942 3.2 3.424 3.849 4.027 4.202 4.405 4.718 4.872 5.164 5.467 5.782 5.926 6.192 6.45 6.816 7.033 7.234 7.531 7.81 8.101 8.394 8.664 8.975 9.253 9.531 9.874 10.201 10.527 10.9 11.303 11.687 12.089 12.501 12.916 13.307 13.728 14.25 14.758 15.267 15.757 16.253 16.709 16.991 16.905 16.077 14.499 12.892 11.369 9.985 8.673 7.445 6.31 5.344 4.383 3.497 2.664 1.898 1.172 0.479 -0.138 -0.779 -1.369 -1.9 -2.453 -3.026 -3.494 -3.983 -4.494 -4.892 -5.326 -5.769 -6.225 -6.714 -7.053 -7.409 -7.958 -8.337 -8.74 -8.946 -9.367 -9.828 -10.313 -10.56 -10.97 -11.34 -11.633 -11.961 -12.677 -13.065 -13.48 -13.94 -14.48 -15.129 -15.801 -17.452 -2 ,23838 ,TETRA ,17606897,Sun Nov 28 20:58:33 CET,Sun Nov 28 23:21:38 CET,0.0 0.966 1.432 1.799 2.113 2.399 2.65 2.865 3.254 3.451 3.649 3.862 4.185 4.355 4.651 4.939 5.214 5.343 5.595 5.828 6.172 6.393 6.592 6.878 7.169 7.44 7.698 7.944 8.253 8.553 8.832 9.148 9.448 9.74 10.092 10.476 10.809 11.182 11.579 12.012 12.467 12.912 13.381 13.827 14.313 14.805 15.289 15.705 15.979 15.94 15.327 13.791 12.021 10.342 8.817 7.439 6.201 5.053 4.064 3.065 2.205 1.435 0.688 -0.01 -0.666 -1.275 -1.911 -2.488 -3.003 -3.549 -4.104 -4.543 -5.002 -5.497 -5.879 -6.265 -6.665 -7.086 -7.567 -7.933 -8.324 -8.944 -9.39 -9.858 -10.091 -10.54 -10.992 -11.469 -11.72 -12.147 -12.611 -12.937 -13.265 -13.996 -14.406 -14.852 -15.385 -15.997 -16.732 -17.807 -21.043 -3 ,24778 ,TETRA ,17606898,Sun Nov 28 20:58:34 CET,Sun Nov 28 23:17:16 CET,0.0 1.785 2.391 2.86 3.296 3.673 3.966 4.22 4.724 4.956 5.175 5.448 5.771 5.951 6.294 6.611 6.923 7.067 7.34 7.61 8.005 8.239 8.468 8.817 9.13 9.417 9.693 9.971 10.318 10.633 10.954 11.335 11.67 11.974 12.314 12.682 13.039 13.447 13.865 14.282 14.678 15.082 15.55 15.991 16.468 16.911 17.313 17.637 17.844 17.736 16.93 15.326 13.657 12.117 10.725 9.445 8.268 7.132 6.139 5.154 4.315 3.541 2.812 2.135 1.467 0.852 0.205 -0.361 -0.841 -1.367 -1.933 -2.41 -2.912 -3.424 -3.812 -4.23 -4.684 -5.142 -5.646 -6.012 -6.362 -6.88 -7.257 -7.704 -7.939 -8.407 -8.893 -9.447 -9.728 -10.149 -10.635 -10.962 -11.266 -11.929 -12.349 -12.833 -13.312 -13.858 -14.545 -15.341 -17.551 -4 ,6532 ,TETRA ,17606900,Sun Nov 28 20:58:34 CET,Sun Nov 28 23:25:50 CET,0.0 1.14 1.6 2.009 2.388 2.708 2.978 3.233 3.675 3.875 4.073 4.281 4.6 4.775 5.07 5.331 5.587 5.708 5.936 6.168 6.503 6.705 6.898 7.156 7.422 7.696 7.928 8.155 8.473 8.793 9.109 9.487 9.819 10.113 10.481 10.927 11.351 11.76 12.147 12.569 13.025 13.517 14.036 14.523 15.077 15.639 16.175 16.644 17.031 17.252 16.83 15.549 14.057 12.547 11.121 9.755 8.549 7.408 6.385 5.365 4.485 3.677 2.886 2.128 1.434 0.8 0.116 -0.493 -1.02 -1.547 -2.08 -2.53 -2.998 -3.48 -3.871 -4.29 -4.703 -5.115 -5.557 -5.863 -6.174 -6.686 -7.045 -7.43 -7.628 -8.013 -8.423 -8.859 -9.092 -9.497 -9.904 -10.192 -10.476 -11.101 -11.442 -11.813 -12.264 -12.805 -13.431 -14.282 -17.063 -5 ,24825 ,TETRA ,17606901,Sun Nov 28 20:59:33 CET,Sun Nov 28 23:25:18 CET,0.0 1.128 1.615 1.935 2.245 2.544 2.806 3.053 3.493 3.669 3.831 3.995 4.294 4.448 4.778 5.091 5.348 5.461 5.69 5.925 6.268 6.484 6.696 7.009 7.318 7.607 7.871 8.123 8.45 8.752 9.032 9.352 9.643 9.927 10.253 10.609 10.951 11.359 11.781 12.177 12.577 13.008 13.501 13.983 14.551 15.152 15.71 16.201 16.602 16.631 16.022 14.751 13.329 11.864 10.487 9.271 8.153 7.051 6.038 5.011 4.127 3.303 2.493 1.721 0.99 0.34 -0.315 -0.901 -1.4 -1.936 -2.538 -3.035 -3.549 -4.116 -4.547 -4.977 -5.441 -5.931 -6.427 -6.767 -7.124 -7.68 -8.082 -8.504 -8.715 -9.161 -9.657 -10.209 -10.511 -10.971 -11.464 -11.824 -12.194 -13.012 -13.487 -14.013 -14.608 -15.294 -16.125 -17.161 -20.377 -6 ,26129 ,TETRA ,17606902,Sun Nov 28 20:59:34 CET,Sun Nov 28 23:25:31 CET,0.0 0.957 1.448 1.772 2.015 2.253 2.488 2.697 3.053 3.229 3.406 3.615 3.917 4.061 4.356 4.66 4.927 5.045 5.256 5.462 5.779 5.984 6.18 6.455 6.725 6.982 7.224 7.458 7.75 8.034 8.312 8.621 8.913 9.21 9.54 9.884 10.204 10.561 10.94 11.308 11.679 12.108 12.602 13.071 13.604 14.128 14.652 15.169 15.542 15.648 15.179 13.913 12.482 11.083 9.748 8.436 7.23 6.14 5.203 4.265 3.418 2.637 1.907 1.222 0.568 -0.037 -0.666 -1.25 -1.778 -2.325 -2.896 -3.366 -3.872 -4.435 -4.869 -5.311 -5.758 -6.208 -6.672 -7.002 -7.357 -7.93 -8.346 -8.767 -8.981 -9.436 -9.895 -10.398 -10.675 -11.108 -11.514 -11.821 -12.165 -12.905 -13.279 -13.691 -14.173 -14.719 -15.338 -16.166 -18.557 -7 ,21622 ,TETRA ,17606903,Sun Nov 28 21:01:33 CET,Sun Nov 28 23:30:47 CET,0.0 1.092 1.598 1.936 2.2 2.448 2.693 2.943 3.393 3.576 3.742 3.917 4.212 4.346 4.619 4.909 5.176 5.306 5.537 5.741 6.04 6.227 6.402 6.644 6.891 7.13 7.345 7.556 7.834 8.114 8.388 8.691 8.972 9.245 9.553 9.874 10.155 10.484 10.845 11.202 11.554 11.959 12.429 12.809 13.158 13.515 13.896 14.249 14.45 14.374 13.71 12.265 10.719 9.245 7.857 6.631 5.615 4.655 3.793 2.895 2.095 1.361 0.63 -0.061 -0.694 -1.286 -1.927 -2.477 -2.947 -3.437 -3.954 -4.404 -4.856 -5.319 -5.721 -6.167 -6.633 -7.111 -7.577 -7.912 -8.273 -8.819 -9.197 -9.576 -9.771 -10.177 -10.608 -11.068 -11.314 -11.73 -12.128 -12.436 -12.761 -13.432 -13.845 -14.319 -14.887 -15.537 -16.237 -17.092 -19.093 -8 ,13595 ,TETRA ,17606904,Sun Nov 28 21:02:34 CET,Sun Nov 28 23:24:47 CET,0.0 0.984 1.465 1.807 2.07 2.312 2.548 2.77 3.18 3.375 3.56 3.765 4.067 4.228 4.541 4.823 5.074 5.198 5.442 5.658 5.953 6.141 6.322 6.593 6.844 7.08 7.312 7.55 7.858 8.154 8.429 8.734 9.028 9.299 9.598 9.929 10.238 10.572 10.946 11.364 11.766 12.23 12.795 13.317 13.853 14.396 14.949 15.406 15.727 15.775 15.135 13.588 12.011 10.504 9.066 7.73 6.525 5.39 4.389 3.407 2.522 1.726 1.016 0.318 -0.374 -1.01 -1.661 -2.256 -2.781 -3.327 -3.891 -4.343 -4.822 -5.346 -5.76 -6.177 -6.623 -7.098 -7.602 -7.942 -8.281 -8.827 -9.209 -9.605 -9.813 -10.248 -10.701 -11.185 -11.448 -11.878 -12.32 -12.635 -12.947 -13.661 -14.104 -14.61 -15.155 -15.754 -16.449 -17.271 -19.638 -9 ,14831 ,TETRA ,17606905,Sun Nov 28 21:02:33 CET,Sun Nov 28 23:32:43 CET,0.0 1.035 1.466 1.843 2.214 2.551 2.842 3.057 3.411 3.583 3.753 3.934 4.224 4.372 4.665 4.932 5.186 5.311 5.555 5.791 6.113 6.313 6.501 6.777 7.053 7.311 7.552 7.767 8.058 8.351 8.63 8.966 9.269 9.564 9.896 10.245 10.581 10.945 11.355 11.792 12.211 12.639 13.112 13.569 14.075 14.601 15.131 15.583 15.843 15.828 15.243 13.976 12.596 11.212 9.925 8.729 7.636 6.562 5.615 4.67 3.794 2.996 2.251 1.539 0.857 0.224 -0.416 -0.963 -1.433 -1.931 -2.453 -2.889 -3.349 -3.825 -4.203 -4.623 -5.072 -5.549 -6.032 -6.354 -6.693 -7.263 -7.665 -8.073 -8.282 -8.725 -9.207 -9.723 -9.987 -10.387 -10.756 -11.056 -11.367 -12.036 -12.425 -12.827 -13.251 -13.747 -14.383 -15.263 -18.739 -10 ,13860 ,TETRA ,17606906,Sun Nov 28 21:05:33 CET,Sun Nov 28 23:33:14 CET,0.0 0.672 1.063 1.414 1.748 2.029 2.252 2.454 2.841 3.027 3.218 3.452 3.773 3.927 4.192 4.459 4.724 4.848 5.094 5.333 5.672 5.894 6.107 6.381 6.647 6.925 7.2 7.456 7.773 8.063 8.323 8.634 8.924 9.201 9.53 9.895 10.251 10.627 10.992 11.348 11.702 12.101 12.586 13.076 13.562 14.032 14.493 14.855 15.039 14.871 14.071 12.551 10.937 9.444 8.121 6.817 5.59 4.495 3.556 2.573 1.709 0.953 0.22 -0.472 -1.119 -1.736 -2.388 -2.968 -3.463 -3.981 -4.538 -5.003 -5.49 -5.979 -6.357 -6.769 -7.198 -7.668 -8.185 -8.533 -8.889 -9.458 -9.873 -10.287 -10.489 -10.926 -11.386 -11.875 -12.145 -12.576 -13.028 -13.362 -13.707 -14.444 -14.847 -15.276 -15.731 -16.237 -16.848 -17.624 -19.274 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index 6c6a58aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -8 ,15816 ,KEBNE ,17027749,Wed Dec 22 17:45:11 CET,Wed Dec 22 19:43:11 CET,0.0 4.151 4.559 4.909 5.216 5.495 5.77 6.013 6.441 6.633 6.812 6.996 7.283 7.428 7.731 8.019 8.284 8.411 8.64 8.858 9.202 9.422 9.629 9.933 10.224 10.497 10.743 10.981 11.289 11.579 11.854 12.192 12.523 12.851 13.238 13.651 14.046 14.453 14.899 15.402 15.901 16.445 17.07 17.674 18.354 19.079 19.913 20.824 21.786 22.786 23.752 24.23 24.25 24.044 23.684 23.215 22.725 22.23 21.769 21.258 20.798 20.391 19.985 19.613 19.267 18.926 18.55 18.201 17.904 17.599 17.239 16.92 16.599 16.276 16.027 15.772 15.51 15.218 14.909 14.709 14.5 14.166 13.93 13.68 13.542 13.251 12.95 12.625 12.455 12.14 11.865 11.674 11.478 11.025 10.773 10.507 10.211 9.862 9.437 8.805 1.87 -10 ,8359 ,KEBNE ,17027751,Wed Dec 22 17:45:11 CET,Wed Dec 22 19:41:42 CET,0.0 3.946 4.813 5.454 5.931 6.267 6.567 6.837 7.32 7.538 7.745 7.968 8.263 8.417 8.681 8.938 9.182 9.289 9.506 9.723 10.044 10.25 10.447 10.732 11.026 11.298 11.55 11.803 12.138 12.482 12.818 13.222 13.595 13.931 14.314 14.746 15.172 15.628 16.092 16.568 17.049 17.61 18.294 18.966 19.696 20.5 21.412 22.323 23.161 23.86 24.23 23.778 22.928 22.028 21.127 20.235 19.391 18.596 17.905 17.186 16.557 15.994 15.445 14.92 14.401 13.906 13.399 12.946 12.551 12.135 11.703 11.348 10.988 10.611 10.292 9.97 9.643 9.293 8.915 8.635 8.347 7.907 7.594 7.273 7.105 6.745 6.375 5.978 5.76 5.396 5.036 4.772 4.476 3.847 3.532 3.177 2.799 2.389 1.894 1.174 -6.935 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index dac5341a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31729 ,TETRA ,17606907,Sun Nov 28 21:05:32 CET,Sun Nov 28 23:24:30 CET,0.0 2.234 2.911 3.494 3.975 4.349 4.63 4.865 5.362 5.602 5.824 6.115 6.454 6.671 7.079 7.435 7.759 7.911 8.216 8.515 8.92 9.173 9.421 9.787 10.14 10.485 10.816 11.126 11.54 11.916 12.258 12.668 13.043 13.403 13.802 14.217 14.591 14.975 15.415 15.883 16.311 16.752 17.239 17.717 18.25 18.797 19.348 19.878 20.377 20.735 20.537 19.591 18.529 17.504 16.56 15.691 14.908 14.193 13.538 12.856 12.254 11.728 11.248 10.793 10.37 9.975 9.555 9.18 8.856 8.528 8.192 7.912 7.618 7.305 7.068 6.826 6.559 6.276 5.984 5.788 5.597 5.295 5.059 4.775 4.622 4.313 3.988 3.644 3.472 3.165 2.921 2.7 2.463 1.962 1.719 1.466 1.151 0.78 0.385 -0.131 -1.553 -2 ,3310 ,TETRA ,17606908,Sun Nov 28 21:06:33 CET,Sun Nov 28 23:29:41 CET,0.0 1.426 2.015 2.407 2.717 2.955 3.197 3.451 3.885 4.076 4.248 4.442 4.722 4.879 5.164 5.401 5.635 5.759 6.006 6.234 6.557 6.756 6.953 7.259 7.542 7.825 8.123 8.389 8.699 8.991 9.266 9.599 9.921 10.235 10.589 10.964 11.316 11.693 12.1 12.533 12.963 13.402 13.89 14.357 14.865 15.382 15.913 16.401 16.825 17.117 16.959 16.268 15.42 14.495 13.582 12.687 11.874 11.146 10.5 9.836 9.263 8.741 8.245 7.789 7.354 6.927 6.468 6.055 5.67 5.243 4.799 4.444 4.085 3.721 3.432 3.125 2.789 2.425 2.057 1.805 1.54 1.147 0.886 0.607 0.468 0.19 -0.139 -0.495 -0.679 -1.002 -1.228 -1.428 -1.649 -2.156 -2.446 -2.763 -3.093 -3.445 -3.843 -4.407 -5.835 -3 ,4486 ,TETRA ,17606911,Sun Nov 28 21:06:33 CET,Sun Nov 28 23:28:17 CET,0.0 1.689 2.363 2.842 3.231 3.584 3.909 4.193 4.652 4.845 5.022 5.231 5.529 5.697 5.987 6.259 6.521 6.639 6.869 7.097 7.415 7.612 7.808 8.108 8.404 8.684 8.953 9.215 9.557 9.897 10.212 10.552 10.857 11.148 11.48 11.849 12.193 12.548 12.915 13.289 13.697 14.166 14.703 15.208 15.704 16.221 16.76 17.26 17.689 17.892 17.566 16.651 15.61 14.659 13.762 12.878 12.095 11.381 10.767 10.134 9.574 9.074 8.597 8.136 7.693 7.251 6.727 6.252 5.864 5.477 5.076 4.723 4.336 3.934 3.619 3.296 2.98 2.636 2.288 2.062 1.816 1.385 1.094 0.822 0.678 0.373 0.053 -0.306 -0.502 -0.842 -1.119 -1.337 -1.573 -2.111 -2.402 -2.716 -3.105 -3.57 -4.082 -4.751 -6.579 -4 ,32478 ,TETRA ,17606912,Sun Nov 28 21:07:34 CET,Sun Nov 28 23:22:36 CET,0.0 1.815 2.379 2.822 3.196 3.536 3.851 4.134 4.678 4.94 5.185 5.496 5.832 6.031 6.388 6.71 7.034 7.197 7.509 7.808 8.231 8.49 8.734 9.063 9.349 9.62 9.873 10.102 10.391 10.685 10.999 11.388 11.727 12.01 12.334 12.695 13.031 13.398 13.782 14.191 14.617 15.08 15.626 16.169 16.784 17.467 18.158 18.773 19.355 19.746 19.539 18.577 17.499 16.49 15.529 14.563 13.558 12.561 11.702 10.811 10.035 9.368 8.733 8.121 7.544 7.027 6.485 6.003 5.612 5.208 4.753 4.384 4.027 3.654 3.349 3.026 2.697 2.364 2.01 1.771 1.53 1.145 0.869 0.572 0.423 0.108 -0.224 -0.572 -0.762 -1.108 -1.383 -1.599 -1.836 -2.335 -2.614 -2.952 -3.335 -3.727 -4.178 -4.761 -6.321 -5 ,6020 ,TETRA ,17606913,Sun Nov 28 21:08:36 CET,Sun Nov 28 23:28:24 CET,0.0 1.213 1.731 2.084 2.39 2.655 2.889 3.1 3.491 3.676 3.854 4.052 4.335 4.49 4.791 5.059 5.313 5.441 5.69 5.92 6.235 6.457 6.67 6.952 7.205 7.453 7.703 7.937 8.235 8.519 8.813 9.181 9.516 9.812 10.122 10.461 10.796 11.176 11.573 11.982 12.417 12.941 13.535 14.069 14.653 15.25 15.872 16.51 17.067 17.464 17.366 16.579 15.585 14.403 13.3 12.317 11.421 10.568 9.839 9.138 8.496 7.885 7.311 6.779 6.273 5.816 5.35 4.884 4.447 4.023 3.601 3.255 2.901 2.508 2.207 1.918 1.618 1.28 0.914 0.666 0.406 -0.012 -0.304 -0.591 -0.727 -1.021 -1.361 -1.735 -1.932 -2.264 -2.556 -2.78 -2.994 -3.438 -3.729 -4.063 -4.416 -4.823 -5.296 -5.875 -8.004 -6 ,14327 ,TETRA ,17606914,Sun Nov 28 21:08:35 CET,Sun Nov 28 23:27:56 CET,0.0 1.522 2.127 2.584 2.949 3.273 3.568 3.845 4.355 4.597 4.831 5.131 5.462 5.663 6.031 6.371 6.708 6.868 7.178 7.477 7.896 8.156 8.405 8.769 9.118 9.457 9.778 10.077 10.442 10.791 11.155 11.591 11.986 12.348 12.769 13.217 13.611 14.056 14.529 15.034 15.561 16.073 16.584 17.055 17.615 18.239 18.834 19.373 19.856 20.175 20.041 19.198 18.147 17.156 16.301 15.542 14.826 14.124 13.49 12.843 12.276 11.785 11.317 10.868 10.464 10.092 9.675 9.296 8.978 8.658 8.314 8.015 7.712 7.386 7.116 6.849 6.557 6.247 5.95 5.752 5.552 5.243 5.037 4.811 4.683 4.4 4.069 3.661 3.444 3.087 2.756 2.533 2.301 1.783 1.484 1.167 0.858 0.543 0.155 -0.423 -1.931 -7 ,29357 ,TETRA ,17606915,Sun Nov 28 21:09:30 CET,Sun Nov 28 23:25:34 CET,0.0 1.338 1.835 2.203 2.522 2.795 3.069 3.317 3.753 3.97 4.18 4.419 4.713 4.875 5.16 5.428 5.684 5.816 6.082 6.33 6.689 6.922 7.126 7.399 7.66 7.907 8.143 8.368 8.661 8.96 9.257 9.625 9.959 10.271 10.62 11.006 11.355 11.715 12.104 12.507 12.928 13.39 13.887 14.367 14.925 15.498 16.086 16.653 17.156 17.517 17.509 16.824 15.961 15.102 14.271 13.461 12.704 11.996 11.381 10.743 10.159 9.654 9.201 8.756 8.332 7.938 7.525 7.14 6.802 6.46 6.079 5.738 5.373 5.001 4.71 4.398 4.061 3.69 3.308 3.059 2.812 2.386 2.044 1.692 1.533 1.21 0.868 0.536 0.372 0.059 -0.157 -0.342 -0.528 -0.959 -1.231 -1.52 -1.852 -2.27 -2.732 -3.262 -4.523 -8 ,16661 ,TETRA ,17606916,Sun Nov 28 21:10:30 CET,Sun Nov 28 23:29:44 CET,0.0 1.693 2.29 2.788 3.224 3.565 3.833 4.091 4.569 4.783 4.987 5.251 5.577 5.778 6.139 6.462 6.793 6.971 7.317 7.627 8.022 8.25 8.476 8.821 9.153 9.465 9.77 10.067 10.435 10.761 11.052 11.394 11.723 12.035 12.381 12.75 13.094 13.483 13.901 14.334 14.784 15.272 15.824 16.315 16.839 17.425 18.05 18.63 19.07 19.259 18.999 18.115 17.108 16.16 15.273 14.439 13.673 12.941 12.313 11.681 11.125 10.621 10.121 9.635 9.172 8.703 8.171 7.681 7.27 6.859 6.382 5.975 5.578 5.164 4.812 4.441 4.087 3.721 3.345 3.099 2.846 2.437 2.148 1.857 1.711 1.427 1.129 0.786 0.595 0.272 0.0 -0.235 -0.475 -0.964 -1.213 -1.498 -1.847 -2.276 -2.779 -3.34 -4.755 -9 ,6662 ,TETRA ,17606917,Sun Nov 28 21:11:30 CET,Sun Nov 28 23:31:45 CET,0.0 1.49 1.952 2.306 2.635 2.92 3.158 3.375 3.805 4.014 4.203 4.441 4.726 4.868 5.141 5.401 5.675 5.809 6.06 6.313 6.688 6.918 7.122 7.422 7.756 8.096 8.416 8.72 9.096 9.452 9.801 10.239 10.648 11.026 11.462 11.941 12.388 12.822 13.24 13.68 14.13 14.614 15.174 15.73 16.342 16.969 17.606 18.217 18.753 19.123 19.006 18.199 17.138 16.077 15.11 14.195 13.409 12.717 12.069 11.38 10.729 10.084 9.462 8.886 8.329 7.818 7.302 6.83 6.427 6.012 5.577 5.221 4.861 4.48 4.181 3.886 3.577 3.259 2.932 2.702 2.461 2.068 1.787 1.511 1.373 1.079 0.767 0.449 0.286 -0.029 -0.29 -0.5 -0.72 -1.209 -1.476 -1.779 -2.114 -2.451 -2.831 -3.296 -4.411 -10 ,9508 ,TETRA ,17606918,Sun Nov 28 21:11:31 CET,Sun Nov 28 23:29:32 CET,0.0 1.736 2.348 2.785 3.119 3.405 3.676 3.914 4.346 4.56 4.767 5.024 5.313 5.465 5.764 6.049 6.318 6.449 6.701 6.934 7.251 7.456 7.659 7.951 8.211 8.47 8.719 8.949 9.247 9.539 9.821 10.149 10.455 10.751 11.091 11.463 11.816 12.204 12.621 13.042 13.445 13.867 14.362 14.864 15.412 15.957 16.501 17.025 17.517 17.773 17.464 16.486 15.402 14.355 13.393 12.54 11.771 11.059 10.46 9.867 9.343 8.865 8.378 7.88 7.412 6.992 6.549 6.138 5.787 5.433 5.041 4.703 4.346 3.972 3.689 3.416 3.133 2.805 2.451 2.227 2.012 1.678 1.439 1.19 1.066 0.805 0.501 0.106 -0.125 -0.487 -0.809 -1.048 -1.307 -1.879 -2.159 -2.442 -2.75 -3.101 -3.523 -4.058 -5.61 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index dceb7114..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,24183 ,TETRA ,17606920,Sun Nov 28 21:16:31 CET,Sun Nov 28 23:35:15 CET,0.0 2.642 3.127 3.441 3.744 4.023 4.249 4.469 4.888 5.083 5.292 5.547 5.84 5.983 6.26 6.53 6.795 6.912 7.123 7.337 7.647 7.848 8.041 8.31 8.582 8.868 9.152 9.397 9.679 9.949 10.201 10.505 10.814 11.124 11.455 11.811 12.168 12.55 12.942 13.359 13.787 14.262 14.828 15.339 15.904 16.527 17.175 17.794 18.254 18.464 18.186 17.362 16.37 15.357 14.419 13.462 12.573 11.803 11.13 10.409 9.768 9.194 8.657 8.132 7.606 7.108 6.583 6.124 5.752 5.362 4.937 4.578 4.205 3.816 3.504 3.184 2.868 2.525 2.155 1.903 1.629 1.202 0.922 0.628 0.479 0.176 -0.178 -0.555 -0.746 -1.078 -1.343 -1.554 -1.781 -2.266 -2.526 -2.835 -3.206 -3.63 -4.127 -4.793 -12.662 -4 ,14082 ,TETRA ,17606922,Sun Nov 28 21:16:32 CET,Sun Nov 28 23:40:46 CET,0.0 10.943 11.513 11.863 12.168 12.475 12.764 13.007 13.412 13.618 13.817 14.038 14.321 14.467 14.75 15.009 15.247 15.364 15.595 15.811 16.108 16.3 16.497 16.779 17.043 17.287 17.495 17.696 17.972 18.231 18.49 18.806 19.087 19.351 19.648 19.997 20.343 20.683 21.038 21.423 21.801 22.218 22.745 23.253 23.794 24.357 24.945 25.572 26.218 26.769 27.031 26.766 26.246 25.653 25.015 24.394 23.825 23.307 22.881 22.453 22.072 21.703 21.336 20.986 20.643 20.33 19.98 19.648 19.368 19.074 18.764 18.518 18.252 17.984 17.772 17.543 17.312 17.063 16.792 16.593 16.386 16.071 15.863 15.659 15.534 15.244 14.95 14.647 14.492 14.184 13.942 13.761 13.575 13.134 12.878 12.574 12.24 11.917 11.551 11.035 7.173 -6 ,3807 ,TETRA ,17606924,Sun Nov 28 21:17:31 CET,Sun Nov 28 23:27:49 CET,0.0 4.786 5.344 5.636 5.89 6.143 6.375 6.575 6.958 7.146 7.313 7.48 7.768 7.923 8.184 8.427 8.643 8.752 8.98 9.179 9.452 9.636 9.82 10.099 10.374 10.652 10.919 11.147 11.427 11.683 11.926 12.22 12.49 12.747 13.039 13.397 13.756 14.137 14.556 14.99 15.437 15.937 16.51 17.081 17.717 18.37 19.107 19.838 20.43 20.943 21.387 21.211 20.615 19.881 19.096 18.378 17.718 17.06 16.495 15.94 15.434 14.963 14.492 14.049 13.636 13.212 12.758 12.378 12.065 11.732 11.393 11.12 10.831 10.518 10.272 10.006 9.727 9.445 9.156 8.966 8.766 8.44 8.216 7.971 7.839 7.579 7.286 6.986 6.844 6.563 6.38 6.216 6.045 5.647 5.42 5.14 4.818 4.466 4.064 3.58 1.834 -8 ,1907 ,TETRA ,17606926,Sun Nov 28 21:17:33 CET,Sun Nov 28 23:38:00 CET,0.0 2.473 3.111 3.595 3.908 4.178 4.442 4.662 4.999 5.16 5.312 5.439 5.704 5.83 6.087 6.337 6.557 6.664 6.877 7.1 7.439 7.654 7.862 8.147 8.401 8.641 8.871 9.086 9.347 9.587 9.821 10.117 10.406 10.682 10.984 11.326 11.68 12.069 12.462 12.881 13.338 13.83 14.403 14.966 15.561 16.2 16.876 17.495 18.049 18.487 18.295 17.293 16.187 15.101 14.092 13.076 12.124 11.236 10.446 9.679 9.027 8.455 7.921 7.411 6.935 6.491 6.031 5.607 5.245 4.867 4.452 4.099 3.728 3.339 3.029 2.701 2.368 2.036 1.685 1.436 1.185 0.803 0.53 0.236 0.084 -0.212 -0.538 -0.888 -1.063 -1.377 -1.662 -1.878 -2.107 -2.652 -2.942 -3.25 -3.581 -3.942 -4.417 -5.082 -7.546 -10 ,20617 ,TETRA ,17606928,Sun Nov 28 21:17:36 CET,Sun Nov 28 23:37:25 CET,0.0 7.419 8.048 8.483 8.836 9.122 9.381 9.624 10.071 10.263 10.432 10.609 10.88 11.02 11.312 11.601 11.859 11.978 12.196 12.399 12.712 12.917 13.104 13.36 13.615 13.875 14.117 14.345 14.637 14.917 15.203 15.529 15.822 16.095 16.406 16.754 17.069 17.411 17.78 18.134 18.488 18.885 19.324 19.727 20.175 20.66 21.176 21.643 22.054 22.214 21.781 20.691 19.375 18.158 17.1 16.095 15.17 14.31 13.541 12.735 12.019 11.382 10.808 10.259 9.723 9.244 8.743 8.286 7.893 7.475 7.021 6.658 6.298 5.909 5.589 5.271 4.93 4.573 4.214 3.951 3.692 3.308 3.028 2.737 2.585 2.244 1.882 1.502 1.299 0.952 0.596 0.344 0.094 -0.429 -0.735 -1.152 -1.651 -2.178 -2.833 -3.645 -7.715 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt deleted file mode 100644 index e7befc54..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17986 ,TETRA ,17606929,Sun Nov 28 21:17:32 CET,Sun Nov 28 23:24:29 CET,0.0 0.358 0.63 0.835 1.005 1.182 1.364 1.516 1.787 1.915 2.037 2.126 2.359 2.469 2.677 2.871 3.051 3.137 3.308 3.465 3.684 3.829 3.981 4.201 4.404 4.605 4.806 4.996 5.238 5.469 5.684 5.944 6.193 6.426 6.707 7.039 7.34 7.668 8.023 8.393 8.771 9.2 9.725 10.23 10.776 11.355 12.007 12.75 13.584 14.506 15.457 15.967 16.066 15.948 15.761 15.537 15.269 14.97 14.728 14.481 14.234 13.992 13.737 13.484 13.22 12.987 12.757 12.55 12.359 12.158 11.95 11.766 11.577 11.374 11.197 11.013 10.835 10.643 10.44 10.302 10.146 9.883 9.705 9.518 9.418 9.2 8.977 8.745 8.617 8.359 8.186 8.03 7.859 7.475 7.284 7.098 6.884 6.618 6.281 5.781 4.471 -2 ,1359 ,TETRA ,17606930,Sun Nov 28 21:17:36 CET,Sun Nov 28 23:24:54 CET,0.0 0.467 0.7 0.905 1.088 1.257 1.428 1.573 1.809 1.922 2.035 2.129 2.371 2.481 2.687 2.879 3.077 3.177 3.349 3.506 3.75 3.91 4.06 4.278 4.485 4.691 4.886 5.068 5.321 5.564 5.785 6.051 6.317 6.569 6.852 7.166 7.465 7.796 8.146 8.521 8.918 9.342 9.834 10.331 10.923 11.589 12.344 13.131 13.945 14.846 15.785 16.287 16.36 16.259 16.089 15.883 15.645 15.399 15.183 14.908 14.603 14.328 14.082 13.833 13.603 13.402 13.172 12.973 12.792 12.586 12.371 12.181 11.987 11.772 11.597 11.437 11.261 11.064 10.866 10.729 10.579 10.329 10.149 9.961 9.868 9.67 9.458 9.231 9.123 8.887 8.748 8.604 8.436 8.081 7.885 7.677 7.437 7.181 6.901 6.481 5.304 -3 ,4364 ,TETRA ,17606931,Sun Nov 28 21:17:33 CET,Sun Nov 28 23:25:23 CET,0.0 0.497 0.796 1.065 1.31 1.517 1.676 1.831 2.136 2.269 2.388 2.495 2.731 2.834 3.039 3.255 3.458 3.545 3.711 3.874 4.111 4.264 4.41 4.62 4.823 5.024 5.225 5.41 5.649 5.879 6.104 6.378 6.624 6.868 7.168 7.506 7.834 8.183 8.541 8.918 9.307 9.745 10.273 10.794 11.394 12.067 12.794 13.567 14.425 15.387 16.438 16.947 16.918 16.757 16.563 16.273 15.984 15.703 15.404 15.07 14.779 14.532 14.283 14.022 13.774 13.549 13.319 13.106 12.901 12.686 12.467 12.279 12.072 11.841 11.644 11.464 11.291 11.091 10.874 10.729 10.592 10.375 10.219 10.037 9.944 9.75 9.534 9.295 9.164 8.913 8.76 8.618 8.463 8.076 7.857 7.647 7.426 7.129 6.775 6.268 4.768 -4 ,32728 ,TETRA ,17606932,Sun Nov 28 21:17:35 CET,Sun Nov 28 23:25:14 CET,0.0 0.518 0.865 1.106 1.3 1.483 1.638 1.784 2.067 2.193 2.319 2.426 2.661 2.763 2.974 3.175 3.36 3.458 3.637 3.799 4.045 4.207 4.366 4.582 4.769 4.949 5.136 5.32 5.55 5.772 5.994 6.25 6.505 6.764 7.058 7.384 7.702 8.048 8.405 8.777 9.17 9.626 10.152 10.643 11.201 11.836 12.547 13.316 14.167 15.092 16.062 16.634 16.79 16.721 16.522 16.246 15.963 15.698 15.43 15.106 14.828 14.57 14.297 14.049 13.834 13.616 13.359 13.136 12.946 12.743 12.522 12.336 12.138 11.897 11.711 11.545 11.354 11.152 10.944 10.794 10.639 10.394 10.219 10.028 9.936 9.746 9.544 9.331 9.215 8.972 8.83 8.7 8.562 8.239 8.054 7.848 7.61 7.321 6.969 6.551 5.227 -5 ,16203 ,TETRA ,17606933,Sun Nov 28 21:17:33 CET,Sun Nov 28 23:25:18 CET,0.0 0.82 1.125 1.356 1.569 1.745 1.913 2.076 2.365 2.5 2.627 2.741 2.982 3.089 3.306 3.504 3.698 3.79 3.957 4.124 4.371 4.527 4.679 4.902 5.11 5.299 5.484 5.666 5.9 6.135 6.346 6.584 6.828 7.059 7.329 7.648 7.96 8.289 8.625 8.977 9.372 9.829 10.339 10.84 11.411 12.021 12.7 13.459 14.341 15.313 16.266 16.788 16.881 16.754 16.548 16.288 16.021 15.772 15.535 15.249 14.97 14.706 14.432 14.162 13.917 13.685 13.425 13.21 13.022 12.808 12.591 12.4 12.195 11.991 11.819 11.632 11.445 11.248 11.044 10.891 10.721 10.458 10.276 10.089 10.0 9.814 9.61 9.385 9.256 8.989 8.818 8.663 8.507 8.163 7.961 7.736 7.503 7.265 6.934 6.485 5.06 -6 ,5477 ,TETRA ,17606934,Sun Nov 28 21:17:35 CET,Sun Nov 28 23:25:03 CET,0.0 0.438 0.681 0.864 1.041 1.212 1.372 1.532 1.813 1.939 2.077 2.197 2.429 2.53 2.751 2.959 3.141 3.229 3.409 3.577 3.814 3.968 4.109 4.312 4.519 4.717 4.91 5.102 5.354 5.591 5.829 6.118 6.372 6.62 6.894 7.198 7.491 7.809 8.169 8.569 8.987 9.432 9.926 10.424 10.994 11.591 12.281 13.05 13.895 14.829 15.771 16.273 16.381 16.282 16.085 15.85 15.601 15.325 15.048 14.76 14.48 14.217 13.971 13.724 13.484 13.262 13.019 12.802 12.615 12.412 12.185 11.985 11.771 11.554 11.391 11.217 11.016 10.8 10.578 10.432 10.283 10.038 9.875 9.711 9.623 9.415 9.186 8.965 8.838 8.569 8.383 8.224 8.051 7.662 7.455 7.237 6.995 6.683 6.329 5.873 4.6 -7 ,13136 ,TETRA ,17606935,Sun Nov 28 21:17:36 CET,Sun Nov 28 23:25:04 CET,0.0 0.515 0.813 1.029 1.225 1.406 1.569 1.724 2.009 2.141 2.261 2.343 2.58 2.686 2.898 3.109 3.291 3.376 3.544 3.715 3.971 4.129 4.279 4.514 4.744 4.947 5.132 5.309 5.544 5.784 6.013 6.285 6.55 6.791 7.07 7.389 7.686 8.018 8.381 8.749 9.134 9.568 10.06 10.563 11.159 11.804 12.538 13.308 14.154 15.089 16.056 16.601 16.765 16.732 16.525 16.27 16.004 15.727 15.474 15.202 14.952 14.728 14.488 14.236 13.989 13.748 13.49 13.265 13.077 12.859 12.622 12.43 12.23 12.014 11.831 11.655 11.458 11.229 11.024 10.887 10.727 10.482 10.31 10.114 10.017 9.827 9.63 9.416 9.287 9.03 8.85 8.684 8.517 8.168 7.986 7.783 7.55 7.272 6.932 6.475 4.925 -8 ,24566 ,TETRA ,17606936,Sun Nov 28 21:17:39 CET,Sun Nov 28 23:25:04 CET,0.0 0.436 0.692 0.934 1.146 1.35 1.515 1.653 1.92 2.041 2.158 2.262 2.507 2.617 2.823 3.015 3.207 3.298 3.479 3.646 3.88 4.037 4.186 4.406 4.617 4.824 5.024 5.219 5.473 5.706 5.936 6.228 6.505 6.762 7.051 7.361 7.662 7.998 8.35 8.719 9.118 9.552 10.025 10.513 11.089 11.711 12.418 13.198 14.053 14.934 15.738 16.152 16.184 16.041 15.843 15.591 15.323 15.032 14.743 14.472 14.234 13.996 13.745 13.49 13.241 13.01 12.758 12.53 12.337 12.115 11.88 11.69 11.485 11.281 11.123 10.954 10.767 10.552 10.336 10.193 10.04 9.804 9.653 9.492 9.402 9.213 9.011 8.81 8.694 8.436 8.247 8.092 7.945 7.611 7.397 7.167 6.93 6.623 6.235 5.728 4.031 -9 ,24726 ,TETRA ,17606937,Sun Nov 28 21:17:33 CET,Sun Nov 28 23:24:46 CET,0.0 0.457 0.725 0.938 1.147 1.348 1.524 1.67 1.949 2.09 2.223 2.323 2.559 2.67 2.874 3.072 3.263 3.355 3.535 3.702 3.956 4.116 4.269 4.491 4.697 4.891 5.075 5.26 5.511 5.752 5.991 6.285 6.543 6.783 7.059 7.362 7.646 7.975 8.35 8.732 9.125 9.559 10.072 10.588 11.157 11.765 12.437 13.164 14.029 14.945 15.878 16.468 16.577 16.491 16.309 16.087 15.859 15.619 15.372 15.057 14.772 14.53 14.296 14.057 13.818 13.596 13.337 13.096 12.908 12.705 12.474 12.276 12.067 11.85 11.671 11.487 11.302 11.095 10.873 10.704 10.532 10.302 10.149 9.981 9.887 9.685 9.483 9.274 9.154 8.896 8.738 8.598 8.454 8.099 7.907 7.688 7.424 7.139 6.79 6.34 4.786 -10 ,6652 ,TETRA ,17606938,Sun Nov 28 21:17:33 CET,Sun Nov 28 23:25:06 CET,0.0 0.449 0.743 0.96 1.14 1.305 1.476 1.651 1.958 2.094 2.228 2.333 2.576 2.683 2.9 3.122 3.321 3.413 3.585 3.754 4.009 4.171 4.32 4.525 4.727 4.927 5.109 5.287 5.527 5.764 5.992 6.256 6.519 6.776 7.054 7.365 7.663 7.997 8.372 8.76 9.164 9.618 10.117 10.606 11.17 11.782 12.471 13.23 14.07 15.012 16.017 16.503 16.539 16.439 16.27 16.032 15.768 15.508 15.257 14.969 14.699 14.46 14.232 13.992 13.752 13.532 13.292 13.068 12.864 12.654 12.438 12.248 12.043 11.826 11.648 11.462 11.276 11.078 10.883 10.754 10.592 10.338 10.183 10.01 9.907 9.704 9.502 9.278 9.163 8.917 8.761 8.592 8.412 8.046 7.865 7.678 7.438 7.141 6.792 6.33 4.821 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt deleted file mode 100644 index 88b03eba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5103 ,TETRA ,17606939,Sun Nov 28 21:17:35 CET,Sun Nov 28 23:23:43 CET,0.0 0.933 1.171 1.337 1.463 1.571 1.672 1.767 1.947 2.014 2.072 2.134 2.261 2.328 2.443 2.55 2.659 2.712 2.806 2.886 2.977 3.037 3.094 3.174 3.255 3.345 3.435 3.52 3.632 3.721 3.799 3.902 4.003 4.097 4.206 4.33 4.434 4.545 4.66 4.763 4.871 4.984 5.091 5.17 5.268 5.347 5.353 5.299 5.159 4.831 4.062 3.019 2.159 1.405 0.713 0.106 -0.457 -0.993 -1.411 -1.807 -2.172 -2.514 -2.848 -3.158 -3.432 -3.672 -3.95 -4.197 -4.387 -4.576 -4.774 -4.939 -5.119 -5.332 -5.493 -5.659 -5.829 -5.987 -6.142 -6.256 -6.387 -6.597 -6.731 -6.875 -6.955 -7.134 -7.309 -7.49 -7.598 -7.774 -7.924 -8.048 -8.165 -8.405 -8.539 -8.692 -8.853 -9.016 -9.251 -9.551 -10.698 -2 ,11908 ,TETRA ,17606940,Sun Nov 28 21:17:38 CET,Sun Nov 28 23:23:24 CET,0.0 0.425 0.683 0.833 0.938 1.05 1.149 1.232 1.372 1.44 1.515 1.595 1.712 1.78 1.914 2.022 2.116 2.155 2.242 2.335 2.467 2.545 2.624 2.726 2.81 2.898 2.983 3.061 3.157 3.251 3.336 3.444 3.561 3.671 3.782 3.893 4.002 4.107 4.21 4.32 4.426 4.531 4.631 4.716 4.81 4.88 4.907 4.874 4.722 4.447 3.875 3.022 2.217 1.429 0.695 0.067 -0.472 -0.988 -1.433 -1.856 -2.23 -2.564 -2.871 -3.161 -3.41 -3.635 -3.89 -4.127 -4.335 -4.543 -4.747 -4.929 -5.13 -5.324 -5.476 -5.636 -5.803 -5.976 -6.152 -6.283 -6.421 -6.61 -6.732 -6.866 -6.938 -7.094 -7.275 -7.459 -7.552 -7.72 -7.843 -7.947 -8.06 -8.294 -8.411 -8.542 -8.711 -8.881 -9.04 -9.257 -10.123 -3 ,15742 ,TETRA ,17606941,Sun Nov 28 21:17:33 CET,Sun Nov 28 23:23:14 CET,0.0 0.613 0.858 1.032 1.179 1.279 1.385 1.486 1.654 1.73 1.8 1.864 1.982 2.032 2.13 2.254 2.384 2.44 2.533 2.614 2.729 2.803 2.869 2.965 3.057 3.149 3.242 3.327 3.426 3.515 3.607 3.702 3.797 3.891 3.988 4.11 4.224 4.325 4.419 4.507 4.603 4.74 4.893 4.994 5.079 5.142 5.158 5.13 5.033 4.764 4.051 2.992 2.132 1.36 0.616 -0.05 -0.601 -1.12 -1.581 -2.021 -2.39 -2.726 -3.028 -3.296 -3.572 -3.826 -4.072 -4.317 -4.53 -4.726 -4.931 -5.109 -5.292 -5.478 -5.634 -5.794 -5.959 -6.137 -6.331 -6.471 -6.61 -6.831 -6.99 -7.156 -7.235 -7.389 -7.55 -7.731 -7.828 -7.995 -8.111 -8.203 -8.305 -8.539 -8.668 -8.808 -8.955 -9.112 -9.359 -9.711 -10.801 -4 ,29151 ,TETRA ,17606942,Sun Nov 28 21:17:33 CET,Sun Nov 28 23:24:06 CET,0.0 0.551 0.727 0.848 0.956 1.056 1.14 1.225 1.392 1.463 1.528 1.586 1.705 1.761 1.871 1.979 2.081 2.131 2.211 2.288 2.415 2.5 2.571 2.664 2.76 2.863 2.957 3.043 3.157 3.256 3.342 3.452 3.551 3.629 3.719 3.815 3.901 3.995 4.109 4.223 4.352 4.508 4.636 4.737 4.854 4.931 4.949 4.88 4.734 4.439 3.685 2.552 1.587 0.776 0.065 -0.551 -1.099 -1.618 -2.055 -2.502 -2.877 -3.18 -3.459 -3.74 -4.006 -4.231 -4.487 -4.722 -4.907 -5.103 -5.313 -5.488 -5.669 -5.849 -5.987 -6.133 -6.282 -6.435 -6.594 -6.711 -6.842 -7.024 -7.141 -7.288 -7.366 -7.512 -7.675 -7.851 -7.941 -8.105 -8.226 -8.326 -8.432 -8.651 -8.766 -8.901 -9.057 -9.242 -9.499 -9.812 -10.774 -5 ,20532 ,TETRA ,17606943,Sun Nov 28 21:17:35 CET,Sun Nov 28 23:23:28 CET,0.0 0.323 0.491 0.65 0.815 0.938 1.035 1.124 1.273 1.349 1.425 1.513 1.631 1.684 1.785 1.867 1.951 1.999 2.091 2.179 2.326 2.418 2.491 2.587 2.688 2.794 2.882 2.963 3.073 3.181 3.279 3.385 3.492 3.624 3.765 3.881 3.975 4.078 4.189 4.277 4.371 4.487 4.607 4.724 4.857 4.952 5.021 5.037 4.913 4.663 4.101 3.206 2.311 1.404 0.611 -0.015 -0.535 -1.015 -1.418 -1.822 -2.186 -2.502 -2.81 -3.1 -3.367 -3.607 -3.851 -4.069 -4.266 -4.49 -4.713 -4.891 -5.075 -5.253 -5.405 -5.571 -5.738 -5.923 -6.126 -6.26 -6.376 -6.552 -6.69 -6.837 -6.912 -7.066 -7.219 -7.371 -7.45 -7.602 -7.716 -7.816 -7.912 -8.138 -8.275 -8.42 -8.587 -8.751 -8.952 -9.282 -10.213 -6 ,23719 ,TETRA ,17606944,Sun Nov 28 21:17:35 CET,Sun Nov 28 23:24:17 CET,0.0 0.316 0.439 0.591 0.71 0.787 0.869 0.956 1.135 1.219 1.298 1.374 1.492 1.545 1.647 1.749 1.844 1.889 1.984 2.075 2.186 2.255 2.33 2.439 2.552 2.665 2.763 2.851 2.973 3.086 3.193 3.302 3.39 3.472 3.555 3.662 3.782 3.897 4.006 4.123 4.236 4.354 4.484 4.582 4.655 4.735 4.819 4.874 4.816 4.529 3.809 2.846 1.934 1.111 0.43 -0.185 -0.705 -1.187 -1.599 -2.015 -2.383 -2.695 -3.004 -3.297 -3.563 -3.806 -4.073 -4.316 -4.514 -4.711 -4.922 -5.107 -5.298 -5.499 -5.649 -5.797 -5.962 -6.142 -6.315 -6.44 -6.585 -6.8 -6.935 -7.07 -7.147 -7.319 -7.481 -7.632 -7.708 -7.851 -7.969 -8.088 -8.207 -8.441 -8.578 -8.732 -8.885 -9.083 -9.305 -9.54 -10.147 -7 ,2417 ,TETRA ,17606945,Sun Nov 28 21:17:39 CET,Sun Nov 28 23:23:30 CET,0.0 0.361 0.568 0.727 0.847 0.949 1.03 1.121 1.294 1.361 1.42 1.47 1.58 1.629 1.723 1.806 1.884 1.92 1.997 2.1 2.249 2.332 2.41 2.507 2.592 2.68 2.778 2.873 2.976 3.061 3.138 3.239 3.35 3.447 3.544 3.66 3.77 3.892 4.021 4.144 4.272 4.409 4.528 4.623 4.724 4.803 4.857 4.868 4.79 4.527 3.871 2.935 2.076 1.309 0.64 -0.005 -0.587 -1.068 -1.469 -1.866 -2.199 -2.509 -2.821 -3.127 -3.407 -3.666 -3.937 -4.161 -4.36 -4.565 -4.781 -4.96 -5.144 -5.345 -5.498 -5.656 -5.821 -5.982 -6.159 -6.293 -6.423 -6.608 -6.74 -6.884 -6.954 -7.098 -7.258 -7.424 -7.506 -7.673 -7.828 -7.95 -8.064 -8.267 -8.388 -8.54 -8.724 -8.903 -9.085 -9.341 -10.473 -8 ,5167 ,TETRA ,17606946,Sun Nov 28 21:18:30 CET,Sun Nov 28 23:18:09 CET,0.0 0.515 0.72 0.869 0.995 1.105 1.224 1.347 1.558 1.656 1.746 1.869 2.023 2.098 2.206 2.303 2.392 2.429 2.499 2.562 2.671 2.747 2.815 2.905 2.992 3.08 3.165 3.251 3.346 3.433 3.526 3.647 3.76 3.852 3.949 4.057 4.165 4.275 4.377 4.493 4.621 4.751 4.895 4.997 5.062 5.116 5.155 5.135 5.009 4.709 3.973 2.87 1.904 1.071 0.337 -0.316 -0.852 -1.338 -1.8 -2.275 -2.635 -2.949 -3.283 -3.603 -3.89 -4.142 -4.397 -4.642 -4.864 -5.083 -5.305 -5.484 -5.669 -5.879 -6.042 -6.199 -6.365 -6.549 -6.732 -6.863 -7.0 -7.203 -7.336 -7.481 -7.571 -7.761 -7.954 -8.14 -8.224 -8.383 -8.497 -8.608 -8.725 -8.976 -9.154 -9.365 -9.572 -9.808 -10.091 -10.435 -11.654 -9 ,6687 ,TETRA ,17606947,Sun Nov 28 21:18:30 CET,Sun Nov 28 23:25:46 CET,0.0 0.553 0.741 0.872 0.979 1.124 1.247 1.321 1.461 1.528 1.604 1.679 1.79 1.85 1.949 2.042 2.14 2.187 2.296 2.405 2.535 2.612 2.684 2.785 2.877 2.95 3.02 3.094 3.187 3.286 3.375 3.472 3.57 3.663 3.766 3.873 3.97 4.064 4.164 4.271 4.355 4.418 4.497 4.577 4.644 4.724 4.78 4.775 4.678 4.362 3.688 2.782 1.927 1.167 0.485 -0.113 -0.643 -1.132 -1.557 -1.987 -2.348 -2.672 -2.971 -3.26 -3.522 -3.739 -3.992 -4.236 -4.458 -4.693 -4.92 -5.102 -5.297 -5.504 -5.651 -5.801 -5.968 -6.145 -6.329 -6.457 -6.587 -6.789 -6.934 -7.085 -7.157 -7.296 -7.442 -7.598 -7.687 -7.847 -7.965 -8.066 -8.174 -8.414 -8.55 -8.693 -8.858 -9.075 -9.311 -9.558 -10.367 -10 ,4109 ,TETRA ,17606948,Sun Nov 28 21:18:31 CET,Sun Nov 28 23:25:06 CET,0.0 0.267 0.487 0.681 0.799 0.906 1.004 1.095 1.268 1.345 1.414 1.466 1.586 1.652 1.774 1.877 1.972 2.018 2.116 2.21 2.341 2.415 2.475 2.566 2.66 2.758 2.843 2.916 3.02 3.109 3.191 3.309 3.419 3.518 3.628 3.747 3.853 3.948 4.042 4.139 4.244 4.362 4.472 4.561 4.673 4.766 4.799 4.769 4.636 4.289 3.503 2.526 1.707 0.965 0.248 -0.409 -0.955 -1.462 -1.892 -2.34 -2.73 -3.056 -3.368 -3.674 -3.97 -4.229 -4.479 -4.706 -4.914 -5.128 -5.324 -5.486 -5.662 -5.848 -6.001 -6.159 -6.322 -6.475 -6.642 -6.775 -6.919 -7.121 -7.257 -7.407 -7.475 -7.636 -7.816 -7.993 -8.087 -8.252 -8.364 -8.471 -8.59 -8.821 -8.955 -9.125 -9.301 -9.464 -9.683 -9.961 -10.792 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt deleted file mode 100644 index 5835eab8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29025 ,TETRA ,17606949,Sun Nov 28 21:18:34 CET,Sun Nov 28 23:26:14 CET,0.0 0.583 0.765 0.904 1.021 1.126 1.218 1.309 1.453 1.507 1.561 1.625 1.726 1.776 1.864 1.936 2.004 2.035 2.099 2.162 2.257 2.314 2.363 2.427 2.489 2.558 2.623 2.683 2.754 2.813 2.875 2.952 3.026 3.101 3.171 3.244 3.32 3.383 3.443 3.504 3.543 3.567 3.578 3.579 3.562 3.491 3.345 3.076 2.623 1.909 0.643 -0.939 -2.207 -3.263 -4.175 -4.97 -5.636 -6.218 -6.728 -7.236 -7.654 -8.027 -8.373 -8.696 -8.993 -9.258 -9.541 -9.791 -10.012 -10.244 -10.475 -10.661 -10.855 -11.062 -11.212 -11.364 -11.533 -11.713 -11.892 -12.017 -12.143 -12.346 -12.495 -12.642 -12.714 -12.865 -13.022 -13.19 -13.286 -13.44 -13.56 -13.666 -13.77 -13.98 -14.1 -14.23 -14.372 -14.542 -14.732 -14.996 -15.914 -2 ,14233 ,TETRA ,17606950,Sun Nov 28 21:18:36 CET,Sun Nov 28 23:25:37 CET,0.0 0.986 1.222 1.39 1.524 1.631 1.717 1.794 1.943 2.016 2.085 2.141 2.237 2.286 2.37 2.44 2.513 2.55 2.618 2.678 2.763 2.82 2.879 2.962 3.051 3.133 3.2 3.253 3.324 3.39 3.444 3.507 3.559 3.617 3.681 3.747 3.802 3.853 3.908 3.953 3.989 4.021 4.019 3.993 3.954 3.856 3.64 3.312 2.821 2.039 0.693 -0.943 -2.299 -3.451 -4.413 -5.268 -6.008 -6.678 -7.237 -7.773 -8.255 -8.682 -9.058 -9.4 -9.714 -10.0 -10.309 -10.591 -10.816 -11.037 -11.271 -11.474 -11.702 -11.928 -12.096 -12.273 -12.462 -12.653 -12.839 -12.968 -13.099 -13.303 -13.43 -13.569 -13.645 -13.798 -13.977 -14.163 -14.252 -14.407 -14.52 -14.622 -14.728 -14.95 -15.076 -15.206 -15.342 -15.508 -15.687 -15.903 -16.801 -3 ,30373 ,TETRA ,17606951,Sun Nov 28 21:19:33 CET,Sun Nov 28 23:26:26 CET,0.0 0.517 0.698 0.868 1.007 1.128 1.228 1.33 1.502 1.56 1.619 1.673 1.779 1.833 1.937 2.039 2.125 2.161 2.24 2.313 2.394 2.454 2.518 2.61 2.691 2.76 2.824 2.887 2.97 3.042 3.11 3.193 3.257 3.326 3.394 3.447 3.5 3.561 3.615 3.649 3.677 3.685 3.669 3.646 3.624 3.573 3.417 3.111 2.629 1.885 0.55 -1.075 -2.371 -3.464 -4.359 -5.118 -5.794 -6.404 -6.921 -7.437 -7.874 -8.26 -8.627 -8.955 -9.25 -9.525 -9.817 -10.084 -10.306 -10.527 -10.764 -10.965 -11.158 -11.35 -11.51 -11.679 -11.842 -12.011 -12.182 -12.298 -12.423 -12.631 -12.782 -12.937 -13.011 -13.151 -13.294 -13.437 -13.517 -13.672 -13.789 -13.908 -14.025 -14.23 -14.353 -14.483 -14.631 -14.81 -14.986 -15.228 -15.957 -4 ,17334 ,TETRA ,17606952,Sun Nov 28 21:19:35 CET,Sun Nov 28 23:27:27 CET,0.0 0.513 0.701 0.847 0.959 1.034 1.104 1.181 1.326 1.402 1.483 1.576 1.686 1.732 1.813 1.89 1.97 2.014 2.101 2.164 2.252 2.314 2.367 2.428 2.484 2.557 2.623 2.674 2.752 2.836 2.911 2.994 3.071 3.133 3.204 3.28 3.336 3.394 3.449 3.499 3.536 3.55 3.541 3.516 3.45 3.319 3.128 2.851 2.404 1.627 0.227 -1.475 -2.881 -4.024 -4.959 -5.761 -6.453 -7.107 -7.666 -8.19 -8.621 -9.004 -9.385 -9.73 -10.047 -10.32 -10.589 -10.859 -11.102 -11.325 -11.557 -11.771 -11.98 -12.182 -12.343 -12.505 -12.673 -12.861 -13.066 -13.202 -13.323 -13.52 -13.667 -13.82 -13.896 -14.047 -14.212 -14.394 -14.485 -14.645 -14.766 -14.872 -14.994 -15.236 -15.341 -15.438 -15.553 -15.707 -15.911 -16.148 -16.842 -5 ,17570 ,TETRA ,17606953,Sun Nov 28 21:19:37 CET,Sun Nov 28 23:26:43 CET,0.0 0.341 0.466 0.584 0.683 0.771 0.848 0.917 1.041 1.091 1.142 1.202 1.323 1.39 1.477 1.548 1.617 1.659 1.741 1.818 1.927 1.982 2.031 2.103 2.178 2.255 2.323 2.381 2.451 2.516 2.57 2.637 2.704 2.771 2.848 2.918 2.978 3.036 3.079 3.13 3.174 3.213 3.244 3.236 3.187 3.078 2.906 2.635 2.166 1.397 0.017 -1.644 -2.963 -4.06 -4.982 -5.798 -6.488 -7.101 -7.629 -8.137 -8.55 -8.917 -9.296 -9.666 -10.014 -10.327 -10.63 -10.887 -11.099 -11.323 -11.567 -11.763 -11.973 -12.197 -12.371 -12.558 -12.747 -12.936 -13.131 -13.266 -13.403 -13.61 -13.753 -13.905 -13.983 -14.127 -14.27 -14.427 -14.51 -14.661 -14.752 -14.844 -14.947 -15.152 -15.257 -15.382 -15.514 -15.657 -15.828 -16.063 -16.621 -6 ,1213 ,TETRA ,17606954,Sun Nov 28 21:20:33 CET,Sun Nov 28 23:27:34 CET,0.0 0.918 1.099 1.221 1.332 1.43 1.515 1.617 1.806 1.885 1.957 2.04 2.163 2.227 2.325 2.416 2.516 2.56 2.638 2.714 2.812 2.877 2.944 3.036 3.123 3.195 3.26 3.329 3.411 3.493 3.569 3.642 3.694 3.737 3.8 3.879 3.938 3.985 4.025 4.056 4.083 4.106 4.115 4.095 4.047 3.954 3.754 3.436 2.971 2.225 0.878 -0.754 -2.064 -3.196 -4.168 -5.038 -5.769 -6.416 -6.985 -7.532 -7.994 -8.392 -8.748 -9.099 -9.441 -9.734 -10.023 -10.284 -10.498 -10.715 -10.948 -11.148 -11.352 -11.549 -11.7 -11.86 -12.037 -12.226 -12.408 -12.524 -12.641 -12.833 -12.982 -13.136 -13.204 -13.342 -13.496 -13.66 -13.75 -13.906 -14.039 -14.141 -14.233 -14.443 -14.559 -14.692 -14.838 -14.988 -15.176 -15.457 -16.057 -7 ,18557 ,TETRA ,17606955,Sun Nov 28 21:20:35 CET,Sun Nov 28 23:28:29 CET,0.0 0.723 0.896 1.045 1.185 1.308 1.43 1.544 1.723 1.803 1.884 1.958 2.057 2.109 2.217 2.307 2.389 2.431 2.504 2.579 2.681 2.74 2.799 2.876 2.955 3.04 3.115 3.182 3.266 3.343 3.412 3.488 3.558 3.631 3.712 3.781 3.83 3.878 3.914 3.95 4.0 4.042 4.067 4.069 4.027 3.921 3.73 3.435 2.979 2.21 0.921 -0.652 -2.022 -3.185 -4.156 -5.01 -5.719 -6.319 -6.843 -7.373 -7.809 -8.167 -8.509 -8.85 -9.17 -9.461 -9.762 -10.02 -10.231 -10.45 -10.69 -10.89 -11.088 -11.294 -11.456 -11.609 -11.748 -11.908 -12.101 -12.227 -12.348 -12.549 -12.686 -12.82 -12.892 -13.039 -13.19 -13.339 -13.417 -13.567 -13.678 -13.769 -13.863 -14.046 -14.14 -14.258 -14.404 -14.558 -14.703 -14.901 -15.365 -8 ,16429 ,TETRA ,17606956,Sun Nov 28 21:20:31 CET,Sun Nov 28 23:27:57 CET,0.0 0.538 0.739 0.872 0.974 1.072 1.154 1.235 1.391 1.461 1.52 1.559 1.658 1.71 1.8 1.894 1.986 2.024 2.098 2.173 2.293 2.364 2.424 2.508 2.58 2.641 2.693 2.75 2.821 2.893 2.96 3.02 3.079 3.14 3.187 3.235 3.293 3.35 3.407 3.469 3.524 3.562 3.56 3.519 3.442 3.31 3.115 2.834 2.375 1.644 0.35 -1.279 -2.658 -3.824 -4.768 -5.577 -6.284 -6.91 -7.427 -7.944 -8.401 -8.803 -9.175 -9.518 -9.829 -10.11 -10.414 -10.685 -10.911 -11.146 -11.392 -11.595 -11.806 -12.02 -12.184 -12.355 -12.516 -12.692 -12.904 -13.045 -13.171 -13.372 -13.507 -13.637 -13.702 -13.847 -14.01 -14.185 -14.279 -14.439 -14.567 -14.668 -14.768 -14.979 -15.089 -15.21 -15.355 -15.513 -15.698 -15.96 -16.724 -9 ,18828 ,TETRA ,17606957,Sun Nov 28 21:20:31 CET,Sun Nov 28 23:20:55 CET,0.0 0.772 0.998 1.138 1.249 1.345 1.426 1.506 1.661 1.737 1.81 1.891 1.998 2.051 2.157 2.244 2.323 2.361 2.435 2.509 2.611 2.666 2.722 2.803 2.88 2.959 3.032 3.098 3.176 3.251 3.326 3.416 3.501 3.571 3.645 3.729 3.788 3.84 3.889 3.934 3.997 4.038 4.035 4.009 3.933 3.806 3.617 3.343 2.847 2.01 0.623 -1.088 -2.472 -3.598 -4.557 -5.391 -6.099 -6.745 -7.29 -7.817 -8.262 -8.653 -9.026 -9.355 -9.654 -9.945 -10.247 -10.524 -10.764 -10.993 -11.225 -11.418 -11.616 -11.82 -11.992 -12.172 -12.344 -12.529 -12.727 -12.864 -13.001 -13.197 -13.338 -13.495 -13.566 -13.711 -13.881 -14.048 -14.135 -14.294 -14.413 -14.513 -14.619 -14.902 -15.055 -15.183 -15.333 -15.495 -15.675 -15.916 -16.667 -10 ,24220 ,TETRA ,17606958,Sun Nov 28 21:20:31 CET,Sun Nov 28 23:26:34 CET,0.0 0.537 0.742 0.885 0.985 1.055 1.128 1.212 1.368 1.435 1.491 1.543 1.642 1.693 1.802 1.888 1.961 2.001 2.081 2.147 2.248 2.308 2.359 2.448 2.528 2.597 2.657 2.703 2.77 2.833 2.904 2.99 3.061 3.123 3.181 3.24 3.292 3.342 3.392 3.433 3.458 3.464 3.457 3.442 3.414 3.349 3.194 2.906 2.412 1.669 0.513 -0.981 -2.273 -3.357 -4.305 -5.102 -5.756 -6.362 -6.911 -7.447 -7.877 -8.252 -8.604 -8.934 -9.239 -9.518 -9.815 -10.083 -10.309 -10.528 -10.763 -10.966 -11.163 -11.371 -11.53 -11.695 -11.87 -12.038 -12.197 -12.31 -12.431 -12.616 -12.746 -12.881 -12.953 -13.1 -13.246 -13.414 -13.506 -13.662 -13.789 -13.895 -13.998 -14.223 -14.356 -14.486 -14.628 -14.793 -14.982 -15.241 -15.951 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt deleted file mode 100644 index b871688d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28084 ,TETRA ,17606959,Sun Nov 28 21:20:32 CET,Sun Nov 28 23:32:11 CET,0.0 0.558 0.79 0.962 1.101 1.232 1.335 1.426 1.624 1.714 1.79 1.871 2.018 2.082 2.201 2.325 2.445 2.495 2.599 2.719 2.876 2.968 3.062 3.205 3.354 3.494 3.618 3.723 3.868 4.016 4.158 4.332 4.494 4.644 4.812 4.997 5.175 5.361 5.57 5.798 6.036 6.309 6.609 6.907 7.237 7.593 8.027 8.495 8.935 9.368 9.776 9.831 9.67 9.44 9.224 9.005 8.76 8.52 8.286 8.018 7.795 7.604 7.416 7.242 7.076 6.914 6.753 6.622 6.505 6.375 6.238 6.122 5.999 5.866 5.761 5.652 5.535 5.419 5.299 5.212 5.131 4.996 4.891 4.786 4.737 4.635 4.512 4.383 4.321 4.188 4.118 4.046 3.957 3.761 3.65 3.541 3.44 3.34 3.234 3.058 2.79 -2 ,8670 ,TETRA ,17606960,Sun Nov 28 21:20:32 CET,Sun Nov 28 23:33:31 CET,0.0 0.462 0.625 0.767 0.898 1.01 1.098 1.17 1.297 1.362 1.426 1.477 1.607 1.67 1.798 1.924 2.044 2.099 2.214 2.332 2.49 2.592 2.693 2.836 2.958 3.073 3.191 3.298 3.427 3.554 3.679 3.827 3.978 4.131 4.307 4.5 4.674 4.864 5.072 5.284 5.493 5.74 6.045 6.342 6.686 7.056 7.449 7.904 8.389 8.859 9.31 9.458 9.359 9.161 8.916 8.642 8.405 8.204 8.008 7.767 7.541 7.345 7.165 7.01 6.848 6.678 6.492 6.329 6.202 6.08 5.943 5.815 5.683 5.543 5.432 5.31 5.183 5.057 4.937 4.866 4.796 4.668 4.563 4.454 4.4 4.29 4.177 4.058 3.994 3.866 3.781 3.69 3.609 3.441 3.323 3.184 3.048 2.91 2.738 2.511 2.228 -3 ,6552 ,TETRA ,17606961,Sun Nov 28 21:20:40 CET,Sun Nov 28 23:33:16 CET,0.0 0.49 0.67 0.787 0.886 1.009 1.145 1.265 1.487 1.585 1.668 1.743 1.877 1.935 2.046 2.157 2.277 2.335 2.439 2.546 2.713 2.815 2.906 3.048 3.186 3.315 3.443 3.552 3.692 3.836 3.968 4.133 4.297 4.452 4.621 4.806 5.008 5.209 5.391 5.613 5.85 6.109 6.435 6.761 7.127 7.511 7.918 8.358 8.842 9.281 9.683 9.778 9.593 9.369 9.121 8.858 8.6 8.335 8.1 7.864 7.645 7.444 7.258 7.078 6.906 6.746 6.577 6.43 6.295 6.15 6.003 5.891 5.776 5.652 5.546 5.43 5.314 5.168 5.0 4.896 4.798 4.655 4.56 4.458 4.397 4.26 4.114 3.97 3.895 3.738 3.624 3.538 3.453 3.271 3.164 3.051 2.931 2.764 2.577 2.29 1.778 -4 ,15827 ,TETRA ,17606962,Sun Nov 28 21:20:32 CET,Sun Nov 28 23:27:01 CET,0.0 0.505 0.707 0.85 0.963 1.068 1.172 1.27 1.435 1.534 1.626 1.71 1.852 1.918 2.038 2.157 2.282 2.333 2.431 2.529 2.662 2.747 2.834 2.968 3.093 3.198 3.295 3.39 3.528 3.672 3.806 3.961 4.106 4.262 4.439 4.624 4.809 5.006 5.211 5.416 5.629 5.877 6.181 6.493 6.869 7.275 7.695 8.128 8.593 9.016 9.334 9.51 9.426 9.257 9.087 8.84 8.582 8.352 8.135 7.887 7.675 7.494 7.309 7.133 6.983 6.848 6.697 6.567 6.451 6.313 6.164 6.04 5.907 5.768 5.67 5.581 5.477 5.368 5.245 5.147 5.055 4.911 4.818 4.725 4.666 4.54 4.424 4.308 4.234 4.091 3.989 3.888 3.796 3.611 3.507 3.385 3.259 3.124 2.928 2.636 1.981 -5 ,7536 ,TETRA ,17606963,Sun Nov 28 21:20:35 CET,Sun Nov 28 23:27:09 CET,0.0 0.84 1.043 1.215 1.36 1.463 1.559 1.642 1.799 1.878 1.956 2.034 2.18 2.254 2.396 2.526 2.649 2.702 2.803 2.916 3.065 3.158 3.25 3.372 3.5 3.622 3.736 3.846 3.999 4.15 4.279 4.439 4.609 4.778 4.959 5.145 5.333 5.551 5.782 6.013 6.256 6.524 6.826 7.122 7.443 7.796 8.176 8.538 8.941 9.39 9.809 9.957 9.89 9.747 9.543 9.283 9.046 8.824 8.598 8.355 8.137 7.948 7.773 7.6 7.435 7.289 7.118 6.953 6.81 6.657 6.519 6.406 6.276 6.137 6.019 5.902 5.789 5.663 5.525 5.44 5.356 5.226 5.136 5.02 4.96 4.848 4.739 4.611 4.545 4.414 4.311 4.213 4.118 3.942 3.864 3.787 3.706 3.589 3.452 3.266 2.672 -6 ,696 ,TETRA ,17606964,Sun Nov 28 21:22:30 CET,Sun Nov 28 23:33:35 CET,0.0 0.315 0.504 0.644 0.759 0.851 0.947 1.048 1.237 1.321 1.4 1.461 1.595 1.654 1.758 1.881 2.001 2.054 2.155 2.242 2.369 2.46 2.549 2.68 2.803 2.909 3.02 3.136 3.287 3.425 3.556 3.717 3.876 4.031 4.199 4.378 4.561 4.777 4.993 5.205 5.448 5.735 6.059 6.377 6.738 7.126 7.55 7.985 8.414 8.899 9.4 9.479 9.366 9.185 8.945 8.708 8.485 8.253 8.043 7.842 7.658 7.469 7.286 7.123 6.973 6.837 6.691 6.558 6.429 6.289 6.149 6.024 5.901 5.776 5.68 5.588 5.482 5.36 5.233 5.148 5.063 4.939 4.847 4.754 4.702 4.584 4.46 4.325 4.26 4.122 4.003 3.906 3.817 3.641 3.563 3.454 3.302 3.17 3.011 2.83 2.455 -7 ,23085 ,TETRA ,17606965,Sun Nov 28 21:22:30 CET,Sun Nov 28 23:29:16 CET,0.0 0.32 0.483 0.674 0.836 0.955 1.054 1.156 1.353 1.441 1.515 1.584 1.727 1.802 1.945 2.073 2.195 2.256 2.369 2.479 2.641 2.74 2.831 2.973 3.109 3.226 3.345 3.476 3.643 3.785 3.915 4.072 4.218 4.367 4.544 4.734 4.91 5.108 5.343 5.593 5.834 6.101 6.401 6.689 7.013 7.373 7.801 8.242 8.716 9.168 9.549 9.761 9.753 9.603 9.397 9.182 8.958 8.742 8.523 8.267 8.043 7.838 7.657 7.478 7.311 7.169 7.0 6.832 6.697 6.575 6.434 6.304 6.173 6.028 5.914 5.8 5.683 5.558 5.415 5.312 5.212 5.061 4.949 4.833 4.774 4.657 4.522 4.37 4.296 4.154 4.067 3.983 3.905 3.735 3.616 3.488 3.385 3.288 3.164 2.951 2.441 -8 ,16615 ,TETRA ,17606966,Sun Nov 28 21:23:30 CET,Sun Nov 28 23:30:16 CET,0.0 0.396 0.558 0.699 0.815 0.938 1.053 1.146 1.321 1.411 1.488 1.55 1.683 1.745 1.875 1.993 2.111 2.169 2.287 2.404 2.556 2.652 2.754 2.896 3.016 3.14 3.265 3.369 3.5 3.641 3.772 3.931 4.087 4.242 4.436 4.649 4.849 5.06 5.277 5.497 5.723 5.97 6.237 6.512 6.832 7.161 7.572 8.042 8.529 8.973 9.219 9.253 9.101 8.881 8.651 8.384 8.122 7.868 7.638 7.395 7.17 6.977 6.815 6.662 6.506 6.36 6.208 6.064 5.938 5.799 5.633 5.507 5.386 5.244 5.135 5.036 4.936 4.826 4.698 4.608 4.522 4.392 4.289 4.183 4.128 4.022 3.932 3.824 3.761 3.631 3.552 3.465 3.386 3.252 3.183 3.089 2.967 2.841 2.692 2.54 2.303 -9 ,16950 ,TETRA ,17606967,Sun Nov 28 21:25:30 CET,Sun Nov 28 23:32:43 CET,0.0 0.411 0.594 0.746 0.876 0.983 1.081 1.204 1.449 1.542 1.623 1.7 1.849 1.928 2.087 2.235 2.38 2.447 2.559 2.664 2.818 2.916 3.02 3.179 3.323 3.453 3.571 3.689 3.85 4.006 4.156 4.319 4.463 4.608 4.789 4.996 5.193 5.408 5.632 5.879 6.128 6.382 6.695 7.02 7.367 7.722 8.138 8.611 9.117 9.624 10.059 10.213 10.162 9.998 9.782 9.555 9.298 9.06 8.854 8.605 8.399 8.22 8.034 7.855 7.679 7.511 7.332 7.181 7.058 6.918 6.757 6.626 6.495 6.359 6.254 6.147 6.039 5.931 5.817 5.726 5.629 5.48 5.384 5.297 5.249 5.153 5.06 4.952 4.893 4.769 4.708 4.62 4.521 4.322 4.223 4.109 3.959 3.793 3.591 3.319 2.291 -10 ,13464 ,TETRA ,17606969,Sun Nov 28 21:29:39 CET,Sun Nov 28 23:35:33 CET,0.0 0.813 1.038 1.182 1.304 1.414 1.531 1.647 1.859 1.938 1.999 2.069 2.208 2.265 2.37 2.487 2.609 2.667 2.783 2.898 3.054 3.149 3.238 3.365 3.494 3.626 3.758 3.886 4.033 4.172 4.312 4.456 4.59 4.735 4.911 5.104 5.29 5.496 5.709 5.929 6.152 6.415 6.728 7.018 7.365 7.75 8.162 8.584 9.009 9.492 9.937 10.014 9.814 9.564 9.337 9.091 8.825 8.568 8.358 8.135 7.928 7.742 7.568 7.405 7.243 7.08 6.917 6.768 6.634 6.489 6.334 6.209 6.081 5.947 5.851 5.758 5.659 5.554 5.442 5.36 5.266 5.092 4.971 4.861 4.805 4.702 4.59 4.449 4.374 4.233 4.134 4.051 3.959 3.787 3.718 3.635 3.51 3.369 3.184 2.889 2.466 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt deleted file mode 100644 index e4f88275..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9237 ,TETRA ,17606970,Sun Nov 28 21:31:09 CET,Sun Nov 28 23:40:30 CET,0.0 0.765 0.96 1.08 1.175 1.277 1.369 1.449 1.607 1.685 1.755 1.823 1.95 2.007 2.131 2.255 2.366 2.414 2.501 2.594 2.72 2.796 2.871 2.975 3.076 3.18 3.277 3.366 3.493 3.618 3.733 3.869 3.998 4.131 4.275 4.409 4.543 4.705 4.866 5.009 5.16 5.335 5.508 5.696 5.94 6.174 6.393 6.589 6.741 6.846 6.784 6.381 5.892 5.376 4.872 4.405 3.956 3.545 3.199 2.833 2.494 2.202 1.938 1.684 1.424 1.176 0.935 0.727 0.545 0.354 0.153 -0.036 -0.224 -0.396 -0.536 -0.669 -0.79 -0.921 -1.055 -1.15 -1.26 -1.453 -1.612 -1.783 -1.873 -2.067 -2.277 -2.5 -2.616 -2.797 -2.937 -3.038 -3.142 -3.361 -3.47 -3.59 -3.74 -3.897 -4.086 -4.36 -4.797 -2 ,14619 ,TETRA ,17606971,Sun Nov 28 21:31:11 CET,Sun Nov 28 23:40:45 CET,0.0 0.592 0.765 0.927 1.067 1.182 1.281 1.389 1.564 1.639 1.713 1.772 1.891 1.95 2.058 2.162 2.263 2.308 2.401 2.49 2.612 2.693 2.767 2.876 2.991 3.111 3.224 3.319 3.438 3.565 3.689 3.826 3.954 4.071 4.207 4.368 4.536 4.723 4.913 5.107 5.29 5.49 5.718 5.932 6.184 6.461 6.766 7.072 7.321 7.523 7.541 7.2 6.772 6.328 5.913 5.519 5.178 4.87 4.486 4.019 3.642 3.296 2.948 2.665 2.446 2.217 1.937 1.668 1.444 1.219 0.971 0.756 0.527 0.283 0.093 -0.078 -0.214 -0.348 -0.488 -0.591 -0.7 -0.877 -1.022 -1.192 -1.279 -1.448 -1.623 -1.828 -1.943 -2.12 -2.269 -2.381 -2.505 -2.747 -2.894 -3.065 -3.217 -3.369 -3.53 -3.765 -4.374 -3 ,20449 ,TETRA ,17606972,Sun Nov 28 21:31:13 CET,Sun Nov 28 23:40:51 CET,0.0 0.452 0.601 0.756 0.892 0.99 1.1 1.202 1.37 1.446 1.519 1.606 1.73 1.788 1.913 2.042 2.173 2.236 2.336 2.42 2.557 2.644 2.724 2.836 2.947 3.062 3.169 3.265 3.385 3.511 3.637 3.77 3.903 4.037 4.177 4.345 4.519 4.7 4.87 5.046 5.237 5.444 5.678 5.882 6.119 6.383 6.636 6.899 7.147 7.339 7.314 6.984 6.537 6.08 5.658 5.232 4.834 4.427 4.07 3.724 3.423 3.164 2.903 2.634 2.354 2.086 1.806 1.548 1.312 1.066 0.825 0.625 0.405 0.189 0.045 -0.102 -0.256 -0.415 -0.601 -0.743 -0.893 -1.118 -1.268 -1.427 -1.51 -1.683 -1.86 -2.046 -2.149 -2.319 -2.462 -2.592 -2.716 -2.954 -3.099 -3.25 -3.393 -3.549 -3.757 -4.068 -4.646 -4 ,6132 ,TETRA ,17606973,Sun Nov 28 21:31:15 CET,Sun Nov 28 23:39:52 CET,0.0 0.426 0.618 0.761 0.893 1.019 1.132 1.235 1.406 1.485 1.562 1.639 1.775 1.848 1.972 2.09 2.202 2.258 2.362 2.457 2.593 2.685 2.771 2.884 2.995 3.103 3.206 3.309 3.441 3.571 3.693 3.827 3.957 4.076 4.208 4.354 4.497 4.656 4.804 4.971 5.165 5.374 5.607 5.827 6.069 6.315 6.58 6.817 6.994 7.078 6.892 6.422 5.872 5.263 4.73 4.251 3.804 3.399 3.05 2.684 2.357 2.07 1.81 1.579 1.352 1.132 0.914 0.723 0.553 0.367 0.165 -0.013 -0.214 -0.419 -0.58 -0.762 -0.946 -1.124 -1.307 -1.441 -1.594 -1.839 -2.011 -2.19 -2.278 -2.445 -2.624 -2.82 -2.924 -3.096 -3.236 -3.357 -3.474 -3.729 -3.881 -4.035 -4.192 -4.363 -4.561 -4.827 -5.391 -5 ,28784 ,TETRA ,17606974,Sun Nov 28 21:31:10 CET,Sun Nov 28 23:37:09 CET,0.0 0.499 0.668 0.782 0.92 1.05 1.156 1.265 1.456 1.533 1.607 1.688 1.818 1.886 2.015 2.127 2.232 2.284 2.385 2.477 2.603 2.686 2.77 2.891 3.002 3.101 3.199 3.299 3.427 3.55 3.664 3.805 3.943 4.062 4.2 4.367 4.519 4.68 4.848 5.026 5.218 5.423 5.627 5.819 6.044 6.277 6.507 6.714 6.922 7.021 6.893 6.456 5.892 5.345 4.832 4.377 3.959 3.559 3.221 2.881 2.577 2.291 2.012 1.755 1.513 1.285 1.041 0.84 0.677 0.495 0.316 0.17 -0.014 -0.216 -0.355 -0.497 -0.65 -0.816 -1.006 -1.148 -1.305 -1.544 -1.704 -1.862 -1.939 -2.099 -2.271 -2.462 -2.568 -2.752 -2.932 -3.056 -3.179 -3.459 -3.605 -3.753 -3.943 -4.18 -4.425 -4.701 -5.271 -6 ,26019 ,TETRA ,17606975,Sun Nov 28 21:31:11 CET,Sun Nov 28 23:40:01 CET,0.0 0.528 0.705 0.829 0.936 1.044 1.154 1.24 1.387 1.457 1.53 1.597 1.725 1.791 1.897 2.0 2.097 2.146 2.245 2.342 2.475 2.556 2.638 2.761 2.884 3.005 3.115 3.216 3.351 3.482 3.603 3.749 3.883 4.007 4.145 4.291 4.438 4.591 4.754 4.94 5.152 5.394 5.617 5.798 6.019 6.258 6.534 6.796 7.007 7.141 7.086 6.788 6.421 5.934 5.321 4.713 4.164 3.64 3.22 2.888 2.613 2.355 2.112 1.834 1.534 1.25 0.962 0.712 0.496 0.269 0.017 -0.207 -0.426 -0.643 -0.819 -1.001 -1.191 -1.388 -1.589 -1.73 -1.867 -2.076 -2.226 -2.38 -2.458 -2.62 -2.791 -2.964 -3.062 -3.236 -3.382 -3.508 -3.65 -3.954 -4.104 -4.242 -4.394 -4.557 -4.734 -5.024 -5.733 -7 ,3797 ,TETRA ,17606976,Sun Nov 28 21:31:11 CET,Sun Nov 28 23:39:44 CET,0.0 0.522 0.72 0.859 0.996 1.102 1.179 1.269 1.465 1.548 1.628 1.708 1.841 1.912 2.047 2.172 2.282 2.334 2.431 2.522 2.66 2.75 2.836 2.959 3.073 3.184 3.305 3.426 3.559 3.677 3.792 3.936 4.078 4.208 4.351 4.515 4.665 4.821 5.006 5.207 5.422 5.654 5.893 6.123 6.389 6.662 6.933 7.189 7.437 7.694 7.78 7.561 7.214 6.822 6.412 6.006 5.622 5.245 4.899 4.508 4.135 3.781 3.437 3.101 2.789 2.514 2.254 2.048 1.849 1.635 1.419 1.226 1.007 0.776 0.594 0.404 0.22 0.039 -0.168 -0.315 -0.461 -0.697 -0.867 -1.041 -1.131 -1.308 -1.496 -1.707 -1.818 -1.999 -2.148 -2.259 -2.384 -2.658 -2.802 -2.968 -3.161 -3.364 -3.576 -3.805 -4.304 -8 ,1442 ,TETRA ,17606978,Sun Nov 28 21:31:11 CET,Sun Nov 28 23:40:37 CET,0.0 0.608 0.771 0.925 1.053 1.166 1.265 1.355 1.542 1.616 1.685 1.779 1.917 1.989 2.112 2.217 2.324 2.382 2.492 2.59 2.719 2.795 2.874 2.994 3.11 3.231 3.355 3.466 3.607 3.746 3.875 4.025 4.169 4.301 4.444 4.603 4.757 4.915 5.078 5.251 5.439 5.649 5.886 6.114 6.356 6.583 6.814 7.075 7.322 7.506 7.473 7.061 6.521 5.971 5.48 5.067 4.669 4.252 3.88 3.51 3.203 2.94 2.686 2.422 2.17 1.943 1.703 1.484 1.286 1.099 0.922 0.773 0.606 0.443 0.315 0.15 -0.029 -0.222 -0.428 -0.569 -0.714 -0.928 -1.07 -1.221 -1.303 -1.464 -1.643 -1.84 -1.934 -2.094 -2.222 -2.329 -2.45 -2.715 -2.849 -2.999 -3.165 -3.32 -3.519 -3.775 -4.425 -9 ,29351 ,TETRA ,17606979,Sun Nov 28 21:31:13 CET,Sun Nov 28 23:40:02 CET,0.0 0.648 0.858 1.001 1.132 1.251 1.349 1.441 1.606 1.684 1.756 1.832 1.963 2.027 2.146 2.256 2.353 2.402 2.507 2.604 2.745 2.838 2.924 3.052 3.176 3.284 3.391 3.49 3.613 3.736 3.856 3.999 4.131 4.249 4.385 4.535 4.677 4.851 5.039 5.22 5.413 5.62 5.833 6.044 6.292 6.539 6.806 7.061 7.226 7.222 6.931 6.248 5.503 4.766 4.084 3.442 2.849 2.322 1.894 1.475 1.106 0.806 0.556 0.311 0.06 -0.159 -0.374 -0.617 -0.855 -1.091 -1.345 -1.551 -1.753 -1.965 -2.132 -2.303 -2.479 -2.671 -2.867 -3.004 -3.15 -3.36 -3.504 -3.658 -3.74 -3.933 -4.137 -4.338 -4.44 -4.606 -4.726 -4.835 -4.956 -5.221 -5.357 -5.504 -5.666 -5.815 -5.991 -6.228 -6.684 -10 ,23430 ,TETRA ,17606980,Sun Nov 28 21:31:15 CET,Sun Nov 28 23:43:41 CET,0.0 0.727 0.956 1.157 1.335 1.463 1.565 1.663 1.844 1.923 1.994 2.051 2.172 2.237 2.366 2.475 2.575 2.626 2.713 2.796 2.935 3.021 3.099 3.204 3.309 3.424 3.532 3.636 3.771 3.895 4.013 4.152 4.286 4.413 4.565 4.726 4.875 5.035 5.198 5.388 5.581 5.762 5.981 6.194 6.424 6.695 6.999 7.284 7.496 7.604 7.511 7.077 6.586 6.098 5.639 5.195 4.784 4.399 4.031 3.681 3.41 3.145 2.864 2.578 2.311 2.097 1.878 1.677 1.498 1.321 1.139 0.973 0.801 0.634 0.509 0.372 0.229 0.071 -0.102 -0.219 -0.34 -0.528 -0.675 -0.839 -0.927 -1.118 -1.315 -1.523 -1.626 -1.798 -1.932 -2.04 -2.154 -2.405 -2.543 -2.69 -2.853 -3.058 -3.329 -3.678 -4.344 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt deleted file mode 100644 index 6f914111..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20664 ,TETRA ,17606982,Sun Nov 28 21:31:16 CET,Sun Nov 28 23:43:30 CET,0.0 1.128 1.415 1.626 1.79 1.946 2.092 2.237 2.483 2.585 2.678 2.784 2.915 2.986 3.129 3.25 3.377 3.436 3.539 3.64 3.784 3.873 3.968 4.109 4.238 4.367 4.493 4.621 4.791 4.946 5.089 5.254 5.404 5.541 5.716 5.901 6.089 6.31 6.515 6.725 6.945 7.208 7.515 7.809 8.125 8.472 8.862 9.246 9.669 10.11 10.471 10.49 10.32 10.074 9.814 9.564 9.298 9.03 8.802 8.555 8.334 8.132 7.924 7.718 7.512 7.308 7.096 6.919 6.765 6.595 6.42 6.279 6.128 5.958 5.824 5.694 5.568 5.414 5.241 5.139 5.028 4.846 4.717 4.582 4.511 4.36 4.185 3.992 3.9 3.741 3.593 3.486 3.357 3.071 2.942 2.805 2.646 2.468 2.249 1.943 0.774 -2 ,22593 ,TETRA ,17606983,Sun Nov 28 21:32:08 CET,Sun Nov 28 23:21:51 CET,0.0 1.084 1.381 1.588 1.77 1.92 2.063 2.18 2.375 2.467 2.562 2.705 2.858 2.938 3.076 3.195 3.331 3.4 3.523 3.64 3.814 3.93 4.04 4.171 4.291 4.42 4.558 4.691 4.854 5.004 5.148 5.325 5.494 5.645 5.808 5.985 6.16 6.352 6.549 6.757 6.979 7.228 7.515 7.829 8.211 8.577 8.914 9.273 9.685 10.096 10.348 10.185 9.884 9.584 9.276 8.95 8.665 8.426 8.193 7.935 7.694 7.447 7.206 7.0 6.807 6.622 6.411 6.224 6.067 5.891 5.701 5.547 5.407 5.26 5.129 4.991 4.838 4.684 4.548 4.452 4.352 4.185 4.053 3.915 3.854 3.72 3.561 3.411 3.335 3.195 3.093 2.997 2.899 2.674 2.528 2.356 2.172 1.989 1.775 1.507 0.62 -3 ,3249 ,TETRA ,17606984,Sun Nov 28 21:32:08 CET,Sun Nov 28 23:43:28 CET,0.0 1.064 1.287 1.466 1.642 1.795 1.952 2.087 2.364 2.518 2.652 2.816 2.971 3.049 3.216 3.371 3.493 3.552 3.668 3.779 3.943 4.049 4.156 4.311 4.451 4.584 4.718 4.859 5.043 5.2 5.358 5.555 5.73 5.899 6.097 6.322 6.549 6.78 7.004 7.243 7.493 7.755 8.043 8.341 8.657 8.991 9.364 9.757 10.188 10.623 10.916 10.822 10.591 10.312 9.983 9.658 9.39 9.137 8.875 8.596 8.345 8.134 7.934 7.695 7.47 7.278 7.081 6.899 6.732 6.577 6.401 6.241 6.077 5.896 5.741 5.585 5.43 5.265 5.083 4.957 4.842 4.666 4.545 4.415 4.346 4.193 4.04 3.88 3.79 3.629 3.458 3.346 3.232 2.966 2.813 2.666 2.522 2.378 2.198 1.958 1.268 -4 ,31847 ,TETRA ,17606985,Sun Nov 28 21:34:10 CET,Sun Nov 28 23:31:35 CET,0.0 0.731 0.895 1.022 1.167 1.326 1.475 1.597 1.782 1.867 1.961 2.064 2.199 2.28 2.427 2.554 2.684 2.747 2.861 2.976 3.133 3.227 3.323 3.46 3.586 3.704 3.81 3.91 4.056 4.201 4.331 4.496 4.663 4.815 4.988 5.178 5.347 5.539 5.741 5.955 6.199 6.474 6.775 7.061 7.376 7.728 8.116 8.486 8.871 9.257 9.54 9.559 9.323 8.986 8.688 8.375 8.063 7.766 7.473 7.172 6.935 6.71 6.496 6.316 6.126 5.927 5.707 5.505 5.334 5.15 4.959 4.795 4.635 4.481 4.35 4.219 4.096 3.966 3.83 3.733 3.625 3.458 3.346 3.221 3.146 2.993 2.844 2.685 2.603 2.454 2.328 2.234 2.133 1.903 1.765 1.594 1.411 1.204 0.999 0.805 0.209 -5 ,16472 ,TETRA ,17606986,Sun Nov 28 21:34:11 CET,Sun Nov 28 23:29:45 CET,0.0 0.999 1.292 1.475 1.65 1.802 1.934 2.075 2.346 2.476 2.579 2.665 2.811 2.895 3.057 3.2 3.329 3.397 3.518 3.622 3.776 3.874 3.971 4.128 4.276 4.418 4.564 4.689 4.838 4.977 5.111 5.273 5.433 5.595 5.777 5.984 6.189 6.412 6.636 6.842 7.066 7.33 7.612 7.879 8.179 8.507 8.869 9.212 9.537 9.841 10.053 9.964 9.628 9.282 8.973 8.655 8.363 8.081 7.827 7.563 7.336 7.131 6.904 6.667 6.451 6.258 6.053 5.882 5.736 5.577 5.394 5.221 5.056 4.89 4.752 4.61 4.466 4.316 4.167 4.061 3.945 3.752 3.617 3.485 3.418 3.267 3.118 2.969 2.88 2.733 2.632 2.546 2.451 2.22 2.089 1.943 1.802 1.654 1.433 1.119 0.419 -6 ,27163 ,TETRA ,17606987,Sun Nov 28 21:36:08 CET,Sun Nov 28 23:44:49 CET,0.0 1.291 1.562 1.781 1.924 2.061 2.209 2.327 2.514 2.618 2.717 2.828 2.974 3.051 3.196 3.337 3.461 3.523 3.641 3.743 3.894 3.999 4.103 4.244 4.371 4.485 4.598 4.709 4.853 5.0 5.139 5.296 5.451 5.611 5.798 6.002 6.193 6.397 6.607 6.824 7.058 7.318 7.627 7.927 8.245 8.554 8.888 9.277 9.721 10.183 10.492 10.452 10.273 10.029 9.751 9.475 9.202 8.92 8.643 8.35 8.078 7.817 7.576 7.367 7.192 7.032 6.828 6.635 6.489 6.331 6.151 6.003 5.845 5.683 5.555 5.422 5.292 5.158 5.006 4.905 4.807 4.641 4.52 4.403 4.352 4.243 4.119 3.986 3.909 3.759 3.616 3.507 3.394 3.134 2.972 2.826 2.676 2.478 2.255 1.894 1.358 -7 ,12273 ,TETRA ,17606988,Sun Nov 28 21:36:09 CET,Sun Nov 28 23:44:20 CET,0.0 1.148 1.486 1.686 1.84 1.994 2.127 2.244 2.504 2.616 2.709 2.819 2.959 3.041 3.184 3.328 3.463 3.526 3.65 3.754 3.909 4.02 4.126 4.274 4.412 4.537 4.658 4.773 4.92 5.071 5.222 5.401 5.574 5.724 5.899 6.105 6.276 6.458 6.668 6.901 7.142 7.406 7.716 8.026 8.338 8.656 9.021 9.406 9.81 10.15 10.415 10.422 10.211 9.929 9.634 9.34 9.036 8.738 8.465 8.198 7.964 7.726 7.497 7.3 7.127 6.963 6.771 6.583 6.416 6.252 6.086 5.945 5.793 5.61 5.471 5.34 5.195 5.026 4.845 4.714 4.587 4.398 4.26 4.12 4.045 3.893 3.743 3.58 3.492 3.342 3.204 3.105 3.02 2.826 2.686 2.529 2.383 2.228 2.063 1.847 1.3 -8 ,10234 ,TETRA ,17606989,Sun Nov 28 21:36:10 CET,Sun Nov 28 23:44:59 CET,0.0 1.636 1.976 2.175 2.343 2.502 2.674 2.817 3.05 3.153 3.229 3.32 3.465 3.536 3.693 3.843 3.976 4.048 4.189 4.314 4.482 4.579 4.673 4.816 4.953 5.087 5.218 5.352 5.519 5.663 5.8 5.972 6.141 6.312 6.493 6.694 6.894 7.099 7.313 7.541 7.769 8.016 8.312 8.601 8.916 9.267 9.639 10.02 10.401 10.737 10.957 10.821 10.566 10.253 9.915 9.574 9.274 9.008 8.759 8.489 8.239 8.028 7.827 7.617 7.433 7.259 7.059 6.884 6.723 6.543 6.362 6.224 6.095 5.953 5.832 5.702 5.562 5.412 5.248 5.143 5.04 4.882 4.787 4.679 4.618 4.473 4.319 4.158 4.066 3.917 3.8 3.704 3.61 3.384 3.24 3.082 2.911 2.728 2.528 2.305 1.5 -9 ,4488 ,TETRA ,17606991,Sun Nov 28 21:36:12 CET,Sun Nov 28 23:44:11 CET,0.0 0.583 0.757 0.951 1.118 1.248 1.381 1.508 1.714 1.8 1.874 1.945 2.086 2.174 2.343 2.479 2.59 2.643 2.754 2.857 3.008 3.109 3.203 3.324 3.435 3.533 3.632 3.738 3.872 4.01 4.145 4.296 4.449 4.596 4.768 4.966 5.145 5.322 5.5 5.692 5.906 6.152 6.43 6.694 6.976 7.276 7.605 7.959 8.339 8.661 8.913 8.941 8.748 8.472 8.173 7.858 7.556 7.27 7.012 6.75 6.516 6.276 6.025 5.795 5.596 5.406 5.21 5.029 4.864 4.704 4.538 4.403 4.252 4.091 3.956 3.817 3.673 3.529 3.385 3.276 3.153 2.945 2.817 2.695 2.626 2.466 2.303 2.151 2.076 1.933 1.815 1.711 1.602 1.388 1.258 1.114 0.962 0.78 0.553 0.236 -0.677 -10 ,7997 ,TETRA ,17606992,Sun Nov 28 21:36:09 CET,Sun Nov 28 23:44:24 CET,0.0 1.092 1.356 1.531 1.713 1.867 1.992 2.096 2.284 2.366 2.439 2.532 2.67 2.748 2.9 3.013 3.129 3.191 3.301 3.401 3.547 3.639 3.721 3.832 3.947 4.058 4.165 4.274 4.42 4.561 4.686 4.851 5.015 5.161 5.318 5.502 5.686 5.876 6.07 6.263 6.471 6.722 7.004 7.29 7.62 7.94 8.261 8.632 9.065 9.471 9.843 9.964 9.76 9.452 9.163 8.851 8.547 8.256 7.99 7.703 7.439 7.192 6.965 6.761 6.546 6.334 6.116 5.918 5.748 5.567 5.392 5.266 5.133 4.985 4.852 4.707 4.566 4.422 4.268 4.167 4.062 3.869 3.724 3.588 3.52 3.377 3.228 3.056 2.97 2.826 2.68 2.568 2.457 2.196 2.057 1.914 1.75 1.563 1.329 0.929 -0.551 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt deleted file mode 100644 index beb72a1b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,739 ,TETRA ,17606993,Sun Nov 28 21:36:12 CET,Sun Nov 28 23:45:05 CET,0.0 0.458 0.627 0.786 0.918 1.048 1.173 1.28 1.465 1.555 1.634 1.708 1.845 1.921 2.063 2.198 2.328 2.395 2.524 2.643 2.813 2.915 3.026 3.187 3.324 3.461 3.602 3.737 3.898 4.053 4.209 4.415 4.616 4.799 5.012 5.244 5.469 5.725 5.998 6.284 6.587 6.921 7.322 7.747 8.237 8.769 9.396 10.125 10.959 11.855 12.85 13.541 13.881 14.052 14.1 14.067 13.986 13.867 13.752 13.62 13.487 13.389 13.278 13.153 13.047 12.942 12.817 12.705 12.598 12.485 12.374 12.275 12.173 12.076 11.995 11.904 11.803 11.694 11.591 11.508 11.415 11.294 11.213 11.123 11.078 10.993 10.905 10.793 10.722 10.598 10.49 10.413 10.342 10.174 10.072 9.958 9.839 9.713 9.58 9.405 9.171 -2 ,16087 ,TETRA ,17606995,Sun Nov 28 21:36:12 CET,Sun Nov 28 23:44:57 CET,0.0 0.713 0.988 1.148 1.267 1.385 1.507 1.619 1.822 1.925 2.021 2.122 2.261 2.333 2.483 2.629 2.768 2.835 2.959 3.077 3.248 3.359 3.463 3.619 3.77 3.9 4.042 4.189 4.359 4.519 4.674 4.873 5.078 5.277 5.496 5.718 5.933 6.179 6.455 6.75 7.047 7.387 7.804 8.236 8.73 9.279 9.9 10.581 11.354 12.216 13.167 13.892 14.287 14.449 14.478 14.449 14.354 14.243 14.152 14.039 13.908 13.768 13.638 13.509 13.38 13.268 13.147 13.028 12.928 12.824 12.707 12.597 12.483 12.358 12.26 12.172 12.074 11.962 11.846 11.767 11.694 11.58 11.495 11.406 11.353 11.234 11.127 11.033 10.989 10.883 10.801 10.739 10.682 10.544 10.464 10.376 10.271 10.167 10.067 9.915 9.189 -3 ,26279 ,TETRA ,17606996,Sun Nov 28 21:36:10 CET,Sun Nov 28 23:44:53 CET,0.0 0.623 0.774 0.9 1.03 1.154 1.257 1.355 1.55 1.646 1.744 1.865 2.017 2.106 2.252 2.372 2.493 2.556 2.68 2.794 2.954 3.059 3.172 3.342 3.487 3.63 3.769 3.903 4.085 4.263 4.422 4.608 4.795 4.973 5.182 5.418 5.642 5.893 6.168 6.458 6.754 7.094 7.506 7.904 8.356 8.861 9.446 10.126 10.942 11.87 12.865 13.512 13.792 13.933 13.979 13.952 13.894 13.834 13.771 13.687 13.585 13.474 13.362 13.254 13.148 13.044 12.929 12.822 12.715 12.606 12.493 12.39 12.291 12.193 12.104 12.013 11.924 11.833 11.751 11.687 11.609 11.495 11.42 11.337 11.289 11.193 11.104 11.004 10.948 10.835 10.745 10.682 10.623 10.507 10.448 10.351 10.22 10.118 10.019 9.914 9.572 -4 ,16571 ,TETRA ,17606997,Sun Nov 28 21:36:09 CET,Sun Nov 28 23:44:56 CET,0.0 0.315 0.454 0.561 0.67 0.765 0.848 0.937 1.116 1.2 1.281 1.372 1.504 1.579 1.74 1.901 2.045 2.112 2.239 2.356 2.526 2.634 2.745 2.909 3.059 3.2 3.334 3.462 3.63 3.796 3.953 4.143 4.345 4.542 4.756 4.992 5.218 5.458 5.709 5.985 6.279 6.638 7.051 7.443 7.913 8.434 9.039 9.735 10.517 11.414 12.463 13.162 13.492 13.595 13.609 13.581 13.501 13.406 13.283 13.133 13.02 12.922 12.797 12.65 12.524 12.409 12.282 12.183 12.099 12.002 11.883 11.777 11.672 11.563 11.476 11.387 11.297 11.206 11.106 11.037 10.969 10.849 10.766 10.694 10.654 10.556 10.458 10.37 10.325 10.219 10.136 10.062 9.983 9.817 9.728 9.642 9.54 9.415 9.296 9.147 8.832 -5 ,20774 ,TETRA ,17606998,Sun Nov 28 21:36:12 CET,Sun Nov 28 23:45:29 CET,0.0 0.623 0.799 0.952 1.079 1.22 1.351 1.456 1.637 1.715 1.794 1.878 2.017 2.097 2.257 2.397 2.513 2.576 2.694 2.811 2.981 3.087 3.2 3.359 3.497 3.64 3.783 3.913 4.084 4.253 4.42 4.617 4.811 5.001 5.221 5.461 5.684 5.945 6.224 6.523 6.834 7.17 7.559 7.939 8.406 8.952 9.571 10.258 11.081 12.016 12.969 13.616 13.907 14.029 14.073 14.044 13.975 13.883 13.78 13.673 13.569 13.457 13.346 13.234 13.125 13.025 12.902 12.788 12.701 12.599 12.485 12.389 12.281 12.162 12.065 11.963 11.859 11.755 11.648 11.566 11.484 11.348 11.25 11.146 11.091 10.986 10.877 10.762 10.704 10.586 10.49 10.414 10.337 10.172 10.074 9.978 9.85 9.715 9.61 9.455 9.133 -6 ,14565 ,TETRA ,17606999,Sun Nov 28 21:36:14 CET,Sun Nov 28 23:45:08 CET,0.0 0.476 0.648 0.805 0.942 1.058 1.16 1.267 1.461 1.548 1.634 1.751 1.896 1.974 2.138 2.285 2.415 2.477 2.583 2.693 2.872 2.978 3.079 3.24 3.397 3.54 3.676 3.807 3.969 4.13 4.291 4.49 4.682 4.862 5.06 5.292 5.539 5.814 6.096 6.399 6.717 7.07 7.502 7.923 8.381 8.884 9.477 10.146 10.915 11.799 12.781 13.458 13.763 13.906 13.926 13.869 13.784 13.673 13.567 13.456 13.342 13.236 13.116 12.998 12.897 12.781 12.644 12.526 12.416 12.299 12.179 12.079 11.967 11.853 11.769 11.68 11.587 11.487 11.38 11.313 11.241 11.101 10.996 10.9 10.856 10.752 10.631 10.518 10.457 10.336 10.265 10.199 10.113 9.894 9.783 9.679 9.55 9.411 9.246 8.991 8.556 -7 ,9402 ,TETRA ,17607000,Sun Nov 28 21:36:15 CET,Sun Nov 28 23:45:50 CET,0.0 0.393 0.579 0.749 0.887 0.996 1.089 1.18 1.361 1.438 1.505 1.586 1.722 1.786 1.901 2.024 2.15 2.206 2.318 2.427 2.591 2.699 2.812 2.978 3.122 3.268 3.407 3.539 3.713 3.889 4.048 4.22 4.411 4.6 4.806 5.046 5.271 5.538 5.839 6.148 6.461 6.8 7.196 7.6 8.085 8.63 9.249 9.93 10.688 11.563 12.594 13.33 13.69 13.85 13.91 13.909 13.825 13.727 13.645 13.54 13.434 13.325 13.212 13.097 12.979 12.86 12.738 12.63 12.521 12.406 12.29 12.194 12.095 11.981 11.894 11.802 11.703 11.604 11.501 11.426 11.344 11.209 11.108 11.01 10.962 10.866 10.759 10.641 10.585 10.476 10.406 10.34 10.268 10.116 10.021 9.914 9.801 9.685 9.544 9.295 8.855 -8 ,26009 ,TETRA ,17607001,Sun Nov 28 21:36:10 CET,Sun Nov 28 23:45:18 CET,0.0 0.778 0.996 1.146 1.259 1.362 1.452 1.53 1.703 1.796 1.884 1.982 2.113 2.179 2.316 2.45 2.578 2.633 2.738 2.843 2.995 3.097 3.199 3.346 3.48 3.606 3.737 3.871 4.042 4.207 4.363 4.561 4.757 4.94 5.152 5.396 5.641 5.903 6.19 6.496 6.806 7.156 7.563 7.978 8.491 9.069 9.694 10.38 11.166 12.123 13.243 14.032 14.393 14.564 14.626 14.629 14.576 14.473 14.358 14.217 14.083 13.97 13.866 13.766 13.661 13.556 13.447 13.345 13.247 13.136 13.016 12.925 12.838 12.728 12.63 12.541 12.45 12.344 12.236 12.158 12.073 11.946 11.86 11.772 11.723 11.619 11.511 11.395 11.336 11.219 11.131 11.061 10.981 10.83 10.747 10.653 10.542 10.41 10.258 10.096 9.728 -9 ,29127 ,TETRA ,17607002,Sun Nov 28 21:36:10 CET,Sun Nov 28 23:45:14 CET,0.0 0.574 0.759 0.913 1.02 1.116 1.221 1.314 1.485 1.567 1.645 1.731 1.861 1.926 2.054 2.173 2.285 2.341 2.449 2.561 2.722 2.823 2.924 3.065 3.197 3.334 3.476 3.623 3.8 3.959 4.115 4.297 4.472 4.639 4.837 5.057 5.271 5.514 5.776 6.063 6.367 6.7 7.099 7.532 8.06 8.613 9.218 9.908 10.709 11.633 12.65 13.363 13.722 13.908 13.95 13.907 13.838 13.767 13.678 13.551 13.446 13.352 13.257 13.149 13.028 12.915 12.8 12.693 12.593 12.488 12.387 12.31 12.215 12.102 12.022 11.934 11.844 11.761 11.669 11.607 11.541 11.433 11.349 11.255 11.215 11.142 11.057 10.951 10.891 10.778 10.696 10.63 10.558 10.364 10.259 10.159 10.063 9.955 9.833 9.705 9.528 -10 ,24734 ,TETRA ,17607003,Sun Nov 28 21:36:12 CET,Sun Nov 28 23:47:05 CET,0.0 0.532 0.734 0.902 1.015 1.104 1.203 1.31 1.494 1.574 1.649 1.726 1.862 1.932 2.065 2.206 2.331 2.385 2.485 2.596 2.768 2.874 2.981 3.128 3.265 3.399 3.527 3.663 3.838 3.993 4.145 4.338 4.52 4.696 4.9 5.127 5.352 5.615 5.9 6.19 6.502 6.865 7.28 7.695 8.176 8.724 9.354 10.05 10.859 11.753 12.748 13.488 13.833 13.973 13.998 13.94 13.849 13.771 13.68 13.541 13.411 13.295 13.176 13.054 12.93 12.809 12.671 12.54 12.426 12.317 12.209 12.114 12.01 11.897 11.808 11.721 11.625 11.528 11.427 11.348 11.263 11.143 11.063 10.971 10.924 10.824 10.713 10.604 10.549 10.437 10.337 10.269 10.216 10.067 9.977 9.892 9.804 9.703 9.586 9.422 8.965 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt deleted file mode 100644 index 3891b1b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23799 ,TETRA ,17607004,Sun Nov 28 21:36:14 CET,Sun Nov 28 23:46:20 CET,0.0 0.16 0.265 0.304 0.311 0.321 0.332 0.359 0.412 0.42 0.417 0.33 0.382 0.37 0.341 0.327 0.29 0.268 0.235 0.195 0.134 0.087 0.032 -0.059 -0.155 -0.241 -0.333 -0.429 -0.557 -0.696 -0.843 -1.034 -1.227 -1.412 -1.647 -1.943 -2.255 -2.616 -3.031 -3.498 -4.015 -4.637 -5.446 -6.341 -7.456 -8.802 -10.514 -12.727 -15.696 -19.738 -25.705 -32.014 -36.643 -40.243 -43.134 -45.553 -47.542 -49.236 -50.629 -51.969 -53.073 -54.021 -54.896 -55.683 -56.396 -57.027 -57.661 -58.221 -58.704 -59.2 -59.698 -60.103 -60.512 -60.929 -61.239 -61.551 -61.877 -62.204 -62.534 -62.767 -63.007 -63.361 -63.606 -63.85 -63.973 -64.23 -64.489 -64.759 -64.895 -65.161 -65.32 -65.471 -65.625 -65.933 -66.096 -66.254 -66.422 -66.639 -66.906 -67.232 -67.688 -2 ,10607 ,TETRA ,17607005,Sun Nov 28 21:36:11 CET,Sun Nov 28 23:47:19 CET,0.0 0.285 0.429 0.491 0.546 0.592 0.612 0.614 0.635 0.648 0.655 0.585 0.643 0.639 0.61 0.591 0.582 0.571 0.54 0.51 0.453 0.412 0.364 0.285 0.207 0.122 0.034 -0.061 -0.205 -0.358 -0.507 -0.689 -0.883 -1.081 -1.321 -1.616 -1.926 -2.278 -2.685 -3.149 -3.675 -4.321 -5.13 -6.021 -7.151 -8.531 -10.285 -12.481 -15.405 -19.407 -25.314 -31.622 -36.273 -39.894 -42.81 -45.223 -47.179 -48.883 -50.294 -51.633 -52.755 -53.72 -54.602 -55.407 -56.128 -56.768 -57.437 -58.022 -58.509 -58.985 -59.478 -59.887 -60.291 -60.699 -61.019 -61.339 -61.643 -61.965 -62.308 -62.537 -62.778 -63.141 -63.374 -63.618 -63.747 -64.023 -64.32 -64.622 -64.76 -65.019 -65.18 -65.33 -65.49 -65.809 -65.963 -66.134 -66.319 -66.5 -66.675 -66.889 -67.218 -3 ,12806 ,TETRA ,17607006,Sun Nov 28 21:36:14 CET,Sun Nov 28 23:47:02 CET,0.0 0.321 0.391 0.471 0.542 0.587 0.608 0.625 0.649 0.66 0.666 0.606 0.665 0.66 0.638 0.603 0.574 0.56 0.53 0.502 0.444 0.404 0.371 0.321 0.245 0.154 0.063 -0.033 -0.171 -0.31 -0.448 -0.649 -0.862 -1.058 -1.296 -1.603 -1.926 -2.295 -2.717 -3.197 -3.732 -4.379 -5.195 -6.085 -7.229 -8.632 -10.396 -12.627 -15.601 -19.699 -25.744 -32.07 -36.742 -40.346 -43.22 -45.656 -47.677 -49.413 -50.844 -52.211 -53.336 -54.308 -55.202 -56.018 -56.755 -57.426 -58.105 -58.674 -59.164 -59.674 -60.188 -60.59 -61.001 -61.43 -61.751 -62.073 -62.409 -62.75 -63.088 -63.322 -63.564 -63.926 -64.175 -64.427 -64.556 -64.839 -65.12 -65.405 -65.553 -65.828 -65.988 -66.13 -66.282 -66.601 -66.769 -66.948 -67.143 -67.347 -67.577 -67.839 -68.219 -4 ,21413 ,TETRA ,17607007,Sun Nov 28 21:36:16 CET,Sun Nov 28 23:47:17 CET,0.0 0.116 0.156 0.185 0.231 0.266 0.292 0.302 0.304 0.306 0.309 0.255 0.316 0.314 0.306 0.298 0.289 0.273 0.227 0.18 0.11 0.058 0.01 -0.064 -0.144 -0.236 -0.333 -0.427 -0.561 -0.707 -0.867 -1.067 -1.267 -1.48 -1.744 -2.044 -2.344 -2.709 -3.129 -3.6 -4.132 -4.762 -5.574 -6.489 -7.635 -9.016 -10.78 -13.042 -16.066 -20.221 -26.312 -32.695 -37.393 -41.079 -44.029 -46.45 -48.453 -50.179 -51.59 -52.938 -54.058 -55.033 -55.929 -56.733 -57.457 -58.106 -58.773 -59.354 -59.847 -60.346 -60.841 -61.24 -61.65 -62.078 -62.412 -62.748 -63.083 -63.433 -63.795 -64.039 -64.3 -64.679 -64.925 -65.18 -65.306 -65.561 -65.83 -66.121 -66.266 -66.535 -66.681 -66.821 -66.96 -67.27 -67.425 -67.571 -67.735 -67.923 -68.113 -68.296 -68.572 -5 ,28723 ,TETRA ,17607008,Sun Nov 28 21:36:12 CET,Sun Nov 28 23:45:40 CET,0.0 0.112 0.184 0.27 0.345 0.403 0.437 0.452 0.496 0.517 0.534 0.496 0.56 0.549 0.53 0.504 0.469 0.454 0.421 0.386 0.334 0.298 0.253 0.178 0.101 0.022 -0.067 -0.177 -0.32 -0.45 -0.593 -0.784 -0.98 -1.19 -1.443 -1.737 -2.051 -2.417 -2.825 -3.271 -3.771 -4.405 -5.224 -6.103 -7.234 -8.64 -10.43 -12.7 -15.702 -19.78 -25.77 -32.068 -36.69 -40.301 -43.213 -45.641 -47.635 -49.338 -50.765 -52.156 -53.294 -54.265 -55.157 -55.99 -56.747 -57.406 -58.066 -58.644 -59.132 -59.607 -60.089 -60.486 -60.896 -61.322 -61.649 -61.986 -62.318 -62.649 -62.979 -63.196 -63.421 -63.758 -63.989 -64.223 -64.34 -64.587 -64.847 -65.126 -65.271 -65.544 -65.712 -65.87 -66.026 -66.322 -66.476 -66.631 -66.796 -66.972 -67.157 -67.366 -67.711 -6 ,6475 ,TETRA ,17607009,Sun Nov 28 21:36:12 CET,Sun Nov 28 23:45:35 CET,0.0 0.389 0.497 0.57 0.589 0.618 0.652 0.667 0.704 0.724 0.736 0.681 0.744 0.738 0.718 0.703 0.677 0.656 0.612 0.574 0.504 0.46 0.42 0.339 0.251 0.158 0.063 -0.029 -0.162 -0.304 -0.447 -0.637 -0.839 -1.038 -1.28 -1.57 -1.88 -2.245 -2.666 -3.155 -3.686 -4.322 -5.126 -6.0 -7.124 -8.489 -10.177 -12.319 -15.205 -19.173 -25.117 -31.456 -36.118 -39.713 -42.538 -44.901 -46.852 -48.494 -49.849 -51.172 -52.27 -53.216 -54.09 -54.884 -55.614 -56.269 -56.922 -57.488 -57.964 -58.456 -58.97 -59.37 -59.77 -60.186 -60.499 -60.815 -61.132 -61.461 -61.801 -62.027 -62.249 -62.574 -62.809 -63.072 -63.197 -63.442 -63.697 -63.964 -64.098 -64.359 -64.508 -64.651 -64.804 -65.111 -65.264 -65.42 -65.585 -65.775 -65.962 -66.169 -66.715 -7 ,25709 ,TETRA ,17607010,Sun Nov 28 21:36:14 CET,Sun Nov 28 23:45:11 CET,0.0 0.106 0.197 0.239 0.255 0.261 0.274 0.286 0.281 0.281 0.288 0.231 0.289 0.278 0.253 0.216 0.176 0.155 0.114 0.075 0.02 -0.016 -0.061 -0.144 -0.235 -0.337 -0.435 -0.527 -0.672 -0.829 -0.974 -1.156 -1.353 -1.553 -1.801 -2.095 -2.396 -2.744 -3.155 -3.635 -4.17 -4.818 -5.639 -6.534 -7.672 -9.045 -10.794 -12.988 -15.934 -20.058 -26.081 -32.357 -37.018 -40.661 -43.607 -46.07 -48.075 -49.781 -51.188 -52.547 -53.663 -54.62 -55.502 -56.305 -57.017 -57.649 -58.306 -58.878 -59.353 -59.822 -60.303 -60.694 -61.097 -61.515 -61.823 -62.131 -62.434 -62.754 -63.095 -63.319 -63.541 -63.882 -64.116 -64.357 -64.485 -64.741 -64.999 -65.269 -65.41 -65.669 -65.796 -65.933 -66.07 -66.365 -66.522 -66.685 -66.862 -67.029 -67.206 -67.49 -67.993 -8 ,558 ,TETRA ,17607011,Sun Nov 28 21:36:16 CET,Sun Nov 28 23:45:55 CET,0.0 0.627 0.784 0.84 0.883 0.916 0.935 0.959 0.985 0.98 0.974 0.912 0.978 0.976 0.979 0.972 0.948 0.936 0.91 0.883 0.843 0.815 0.78 0.717 0.643 0.558 0.459 0.354 0.213 0.075 -0.073 -0.276 -0.485 -0.709 -0.982 -1.29 -1.602 -1.959 -2.381 -2.861 -3.397 -4.052 -4.875 -5.747 -6.841 -8.204 -9.972 -12.203 -15.113 -19.151 -25.198 -31.524 -36.199 -39.845 -42.73 -45.176 -47.184 -48.871 -50.26 -51.59 -52.695 -53.641 -54.524 -55.331 -56.069 -56.732 -57.406 -57.991 -58.478 -58.972 -59.457 -59.864 -60.286 -60.687 -60.991 -61.298 -61.608 -61.929 -62.261 -62.493 -62.724 -63.077 -63.31 -63.543 -63.663 -63.91 -64.174 -64.448 -64.582 -64.841 -64.989 -65.13 -65.28 -65.595 -65.741 -65.907 -66.1 -66.31 -66.552 -66.776 -67.059 -9 ,1345 ,TETRA ,17607012,Sun Nov 28 21:36:18 CET,Sun Nov 28 23:46:09 CET,0.0 0.337 0.398 0.423 0.457 0.499 0.522 0.537 0.561 0.56 0.55 0.462 0.52 0.518 0.5 0.466 0.431 0.417 0.382 0.34 0.268 0.219 0.174 0.106 0.026 -0.057 -0.136 -0.216 -0.344 -0.493 -0.644 -0.841 -1.049 -1.259 -1.517 -1.816 -2.102 -2.442 -2.867 -3.354 -3.883 -4.513 -5.32 -6.22 -7.354 -8.721 -10.466 -12.67 -15.587 -19.638 -25.647 -31.92 -36.512 -40.068 -42.922 -45.296 -47.255 -48.962 -50.355 -51.677 -52.775 -53.735 -54.619 -55.416 -56.144 -56.794 -57.452 -58.011 -58.478 -58.955 -59.442 -59.848 -60.262 -60.67 -60.988 -61.308 -61.614 -61.917 -62.232 -62.451 -62.669 -63.005 -63.244 -63.491 -63.608 -63.858 -64.149 -64.427 -64.555 -64.813 -64.948 -65.087 -65.228 -65.508 -65.658 -65.82 -65.993 -66.177 -66.347 -66.543 -66.845 -10 ,11342 ,TETRA ,17607013,Sun Nov 28 21:37:09 CET,Sun Nov 28 23:47:59 CET,0.0 0.248 0.308 0.363 0.419 0.459 0.486 0.497 0.498 0.502 0.498 0.43 0.485 0.473 0.457 0.442 0.413 0.391 0.353 0.315 0.245 0.194 0.145 0.083 0.004 -0.089 -0.19 -0.3 -0.441 -0.587 -0.736 -0.924 -1.127 -1.335 -1.583 -1.887 -2.199 -2.567 -2.991 -3.472 -4.017 -4.668 -5.479 -6.383 -7.522 -8.894 -10.656 -12.875 -15.816 -19.916 -25.977 -32.258 -36.894 -40.485 -43.379 -45.827 -47.825 -49.523 -50.924 -52.26 -53.358 -54.315 -55.199 -55.998 -56.719 -57.353 -57.987 -58.551 -59.038 -59.522 -60.017 -60.426 -60.829 -61.241 -61.562 -61.884 -62.21 -62.531 -62.854 -63.075 -63.307 -63.666 -63.901 -64.13 -64.242 -64.478 -64.73 -64.981 -65.116 -65.387 -65.533 -65.682 -65.839 -66.152 -66.318 -66.487 -66.659 -66.862 -67.079 -67.354 -67.739 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt deleted file mode 100644 index d660a0ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26756 ,TETRA ,17607014,Sun Nov 28 21:38:03 CET,Sun Nov 28 23:45:04 CET,0.0 0.451 0.719 0.953 1.163 1.355 1.518 1.686 2.013 2.174 2.334 2.497 2.755 2.878 3.122 3.355 3.585 3.706 3.937 4.151 4.476 4.698 4.912 5.209 5.504 5.812 6.107 6.38 6.741 7.111 7.477 7.92 8.365 8.814 9.355 9.979 10.572 11.232 11.975 12.791 13.671 14.689 15.904 17.183 18.752 20.557 22.73 25.338 28.622 32.788 38.361 43.61 47.146 49.683 51.593 53.142 54.295 55.202 55.91 56.56 57.062 57.451 57.799 58.104 58.37 58.594 58.809 58.972 59.081 59.171 59.262 59.336 59.414 59.48 59.523 59.56 59.595 59.616 59.609 59.607 59.606 59.593 59.574 59.545 59.521 59.46 59.42 59.391 59.373 59.289 59.314 59.278 59.235 59.118 59.059 58.977 58.875 58.734 58.487 58.166 56.803 -2 ,23585 ,TETRA ,17607015,Sun Nov 28 21:38:04 CET,Sun Nov 28 23:44:30 CET,0.0 0.69 0.928 1.136 1.359 1.583 1.77 1.936 2.233 2.372 2.514 2.656 2.91 3.036 3.295 3.535 3.765 3.88 4.101 4.316 4.642 4.852 5.069 5.394 5.706 6.017 6.322 6.617 7.0 7.376 7.752 8.207 8.654 9.112 9.647 10.247 10.84 11.509 12.249 13.063 13.936 14.93 16.118 17.39 18.939 20.723 22.882 25.435 28.674 32.883 38.436 43.685 47.269 49.848 51.77 53.273 54.428 55.36 56.079 56.71 57.189 57.58 57.933 58.241 58.506 58.727 58.913 59.063 59.183 59.293 59.404 59.492 59.559 59.61 59.646 59.68 59.723 59.764 59.804 59.827 59.851 59.887 59.885 59.879 59.874 59.857 59.848 59.803 59.778 59.692 59.693 59.653 59.603 59.459 59.394 59.314 59.19 59.047 58.854 58.574 57.259 -3 ,31031 ,TETRA ,17607016,Sun Nov 28 21:38:07 CET,Sun Nov 28 23:46:07 CET,0.0 0.507 0.735 0.927 1.105 1.282 1.464 1.64 1.972 2.128 2.274 2.431 2.69 2.81 3.034 3.267 3.505 3.619 3.844 4.055 4.373 4.585 4.789 5.092 5.406 5.706 5.989 6.273 6.65 7.03 7.41 7.865 8.294 8.72 9.23 9.826 10.408 11.065 11.806 12.592 13.438 14.441 15.666 16.959 18.506 20.293 22.498 25.174 28.511 32.791 38.517 43.877 47.437 49.952 51.842 53.311 54.424 55.345 56.076 56.737 57.245 57.665 58.033 58.339 58.6 58.821 59.036 59.206 59.349 59.497 59.63 59.723 59.811 59.891 59.94 59.991 60.038 60.074 60.103 60.113 60.122 60.143 60.151 60.151 60.142 60.13 60.133 60.115 60.095 60.009 60.054 60.028 59.985 59.882 59.816 59.753 59.659 59.534 59.411 59.154 58.279 -4 ,12766 ,TETRA ,17607017,Sun Nov 28 21:38:08 CET,Sun Nov 28 23:45:48 CET,0.0 1.104 1.474 1.779 2.02 2.196 2.374 2.548 2.857 2.996 3.14 3.294 3.55 3.673 3.913 4.142 4.368 4.483 4.705 4.92 5.235 5.443 5.648 5.945 6.243 6.534 6.812 7.095 7.473 7.833 8.173 8.599 9.024 9.437 9.934 10.505 11.072 11.724 12.442 13.221 14.072 15.065 16.247 17.508 19.045 20.799 22.954 25.52 28.735 32.907 38.458 43.748 47.341 49.876 51.682 53.077 54.215 55.16 55.89 56.543 57.055 57.481 57.852 58.158 58.422 58.651 58.864 59.054 59.211 59.35 59.463 59.531 59.606 59.679 59.706 59.739 59.779 59.809 59.837 59.846 59.841 59.82 59.811 59.797 59.785 59.758 59.73 59.693 59.671 59.564 59.545 59.5 59.453 59.338 59.261 59.179 59.083 58.95 58.765 58.549 57.772 -5 ,26800 ,TETRA ,17607018,Sun Nov 28 21:39:01 CET,Sun Nov 28 23:45:27 CET,0.0 1.096 1.441 1.674 1.866 2.062 2.23 2.385 2.697 2.844 2.985 3.124 3.386 3.526 3.799 4.039 4.264 4.379 4.603 4.831 5.157 5.371 5.586 5.892 6.192 6.489 6.788 7.083 7.467 7.843 8.221 8.698 9.16 9.606 10.118 10.702 11.295 11.976 12.721 13.52 14.376 15.367 16.592 17.871 19.411 21.226 23.409 26.017 29.282 33.463 39.052 44.251 47.704 50.166 51.994 53.445 54.544 55.403 56.091 56.702 57.155 57.533 57.87 58.143 58.386 58.594 58.781 58.948 59.096 59.229 59.347 59.434 59.509 59.58 59.621 59.654 59.68 59.703 59.716 59.725 59.728 59.716 59.699 59.68 59.666 59.632 59.596 59.543 59.512 59.399 59.383 59.339 59.292 59.18 59.123 59.062 58.984 58.9 58.769 58.531 57.498 -6 ,24191 ,TETRA ,17607019,Sun Nov 28 21:39:01 CET,Sun Nov 28 23:45:40 CET,0.0 0.742 0.995 1.24 1.443 1.622 1.795 1.935 2.206 2.349 2.481 2.616 2.878 2.999 3.254 3.5 3.722 3.837 4.061 4.279 4.602 4.81 5.01 5.313 5.613 5.913 6.214 6.51 6.898 7.273 7.65 8.114 8.562 8.997 9.514 10.103 10.673 11.33 12.066 12.88 13.756 14.757 15.978 17.281 18.824 20.607 22.831 25.48 28.779 33.007 38.726 44.101 47.666 50.26 52.206 53.689 54.791 55.654 56.339 57.0 57.523 57.951 58.311 58.621 58.882 59.076 59.276 59.436 59.54 59.653 59.776 59.855 59.931 60.002 60.039 60.069 60.095 60.112 60.121 60.125 60.112 60.065 60.053 60.044 60.029 59.98 59.926 59.863 59.825 59.724 59.719 59.664 59.611 59.451 59.334 59.204 59.073 58.901 58.656 58.345 57.199 -7 ,27478 ,TETRA ,17607020,Sun Nov 28 21:39:04 CET,Sun Nov 28 23:45:34 CET,0.0 0.672 0.949 1.153 1.348 1.523 1.704 1.898 2.241 2.402 2.556 2.699 2.949 3.072 3.305 3.535 3.774 3.888 4.113 4.353 4.704 4.919 5.126 5.424 5.719 6.027 6.338 6.637 7.022 7.394 7.753 8.194 8.633 9.077 9.596 10.192 10.781 11.444 12.175 12.971 13.83 14.842 16.058 17.321 18.877 20.69 22.92 25.543 28.782 32.994 38.685 44.011 47.587 50.163 52.07 53.588 54.742 55.654 56.375 57.041 57.557 57.986 58.369 58.69 58.973 59.205 59.41 59.573 59.713 59.856 59.975 60.053 60.129 60.21 60.265 60.305 60.331 60.355 60.397 60.424 60.448 60.465 60.447 60.424 60.415 60.393 60.368 60.323 60.293 60.189 60.177 60.135 60.087 59.96 59.888 59.812 59.722 59.6 59.463 59.24 58.114 -8 ,25426 ,TETRA ,17607021,Sun Nov 28 21:39:05 CET,Sun Nov 28 23:45:07 CET,0.0 0.572 0.856 1.099 1.308 1.481 1.653 1.812 2.092 2.228 2.365 2.486 2.733 2.852 3.103 3.342 3.559 3.672 3.897 4.108 4.42 4.624 4.82 5.108 5.408 5.696 5.965 6.234 6.586 6.939 7.297 7.743 8.182 8.617 9.138 9.741 10.342 11.019 11.754 12.557 13.434 14.443 15.664 16.931 18.436 20.21 22.381 24.982 28.224 32.355 37.993 43.342 46.978 49.602 51.525 53.032 54.218 55.181 55.917 56.552 57.018 57.382 57.72 58.026 58.279 58.485 58.673 58.84 58.97 59.079 59.189 59.28 59.368 59.433 59.474 59.515 59.54 59.547 59.567 59.584 59.59 59.585 59.574 59.55 59.533 59.503 59.479 59.431 59.392 59.275 59.262 59.225 59.168 58.996 58.902 58.805 58.714 58.607 58.46 58.239 57.091 -9 ,14642 ,TETRA ,17607022,Sun Nov 28 21:39:02 CET,Sun Nov 28 23:45:47 CET,0.0 0.878 1.206 1.483 1.674 1.845 2.007 2.16 2.449 2.588 2.735 2.907 3.173 3.305 3.561 3.798 4.046 4.165 4.385 4.609 4.94 5.157 5.371 5.676 5.962 6.244 6.532 6.814 7.177 7.534 7.906 8.384 8.852 9.301 9.831 10.44 11.032 11.684 12.415 13.226 14.089 15.081 16.28 17.535 19.09 20.923 23.125 25.727 29.01 33.19 38.769 44.046 47.58 50.101 51.963 53.403 54.531 55.48 56.222 56.885 57.393 57.8 58.15 58.472 58.756 58.982 59.176 59.32 59.437 59.547 59.658 59.736 59.804 59.874 59.912 59.942 59.982 60.014 60.038 60.049 60.056 60.059 60.05 60.03 60.02 59.993 59.95 59.918 59.906 59.817 59.852 59.826 59.789 59.699 59.63 59.525 59.401 59.289 59.144 58.909 57.974 -10 ,27131 ,TETRA ,17607023,Sun Nov 28 21:39:04 CET,Sun Nov 28 23:46:11 CET,0.0 0.978 1.284 1.558 1.803 2.013 2.2 2.37 2.729 2.884 3.014 3.155 3.413 3.539 3.794 4.046 4.292 4.411 4.644 4.863 5.192 5.407 5.621 5.942 6.262 6.582 6.888 7.179 7.557 7.941 8.332 8.811 9.281 9.741 10.275 10.886 11.479 12.16 12.917 13.726 14.591 15.602 16.835 18.113 19.653 21.459 23.666 26.293 29.527 33.708 39.433 44.862 48.472 51.03 52.915 54.362 55.488 56.421 57.139 57.789 58.304 58.714 59.076 59.379 59.625 59.813 60.002 60.167 60.289 60.412 60.493 60.547 60.609 60.651 60.687 60.722 60.755 60.784 60.795 60.79 60.767 60.727 60.7 60.67 60.667 60.67 60.643 60.592 60.563 60.445 60.42 60.372 60.32 60.18 60.081 59.971 59.842 59.673 59.442 59.202 58.123 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt deleted file mode 100644 index 78b829b4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17327 ,TETRA ,17607024,Sun Nov 28 21:39:06 CET,Sun Nov 28 23:47:05 CET,0.0 0.616 0.888 1.103 1.284 1.461 1.649 1.834 2.173 2.335 2.489 2.63 2.885 3.021 3.289 3.534 3.79 3.916 4.168 4.42 4.78 5.01 5.237 5.573 5.9 6.22 6.533 6.843 7.251 7.655 8.053 8.54 9.017 9.476 10.039 10.691 11.32 12.022 12.782 13.632 14.572 15.668 17.008 18.409 20.086 22.027 24.379 27.208 30.765 35.264 41.385 47.24 50.923 53.396 55.151 56.449 57.44 58.253 58.92 59.59 60.128 60.545 60.913 61.236 61.523 61.769 62.005 62.182 62.318 62.463 62.601 62.709 62.785 62.849 62.91 62.962 63.019 63.08 63.123 63.136 63.151 63.166 63.167 63.169 63.168 63.168 63.156 63.135 63.124 63.033 63.061 63.038 62.993 62.897 62.846 62.787 62.731 62.653 62.547 62.365 61.686 -2 ,3838 ,TETRA ,17607025,Sun Nov 28 21:39:08 CET,Sun Nov 28 23:46:43 CET,0.0 0.539 0.794 1.025 1.246 1.453 1.623 1.772 2.034 2.169 2.311 2.451 2.717 2.862 3.137 3.398 3.646 3.772 4.028 4.271 4.637 4.872 5.095 5.425 5.749 6.072 6.392 6.707 7.123 7.526 7.912 8.4 8.883 9.351 9.899 10.522 11.146 11.857 12.647 13.505 14.454 15.554 16.876 18.243 19.898 21.873 24.254 27.117 30.698 35.264 41.48 47.414 51.427 54.315 56.502 58.217 59.549 60.647 61.446 62.077 62.523 62.882 63.214 63.496 63.735 63.947 64.135 64.268 64.376 64.472 64.555 64.617 64.683 64.744 64.785 64.832 64.864 64.892 64.919 64.932 64.942 64.937 64.92 64.915 64.911 64.899 64.899 64.872 64.847 64.756 64.782 64.76 64.725 64.622 64.576 64.51 64.432 64.343 64.248 64.134 63.84 -3 ,30603 ,TETRA ,17607026,Sun Nov 28 21:39:01 CET,Sun Nov 28 23:48:05 CET,0.0 0.609 0.901 1.121 1.279 1.433 1.586 1.755 2.077 2.226 2.37 2.507 2.771 2.905 3.159 3.395 3.624 3.736 3.964 4.189 4.517 4.732 4.942 5.248 5.558 5.866 6.158 6.451 6.842 7.228 7.611 8.089 8.559 9.017 9.567 10.197 10.828 11.546 12.324 13.16 14.062 15.12 16.417 17.772 19.407 21.312 23.646 26.49 30.003 34.455 40.566 46.439 50.364 53.157 55.166 56.731 57.954 58.931 59.691 60.378 60.935 61.404 61.769 62.046 62.277 62.473 62.656 62.79 62.906 63.026 63.136 63.216 63.285 63.357 63.402 63.439 63.479 63.511 63.536 63.548 63.559 63.565 63.561 63.547 63.535 63.514 63.487 63.447 63.43 63.343 63.358 63.312 63.261 63.17 63.11 63.049 62.986 62.888 62.768 62.593 61.715 -4 ,20661 ,TETRA ,17607027,Sun Nov 28 21:39:04 CET,Sun Nov 28 23:48:13 CET,0.0 0.599 0.872 1.123 1.33 1.515 1.693 1.861 2.179 2.338 2.499 2.661 2.93 3.071 3.339 3.601 3.854 3.973 4.204 4.426 4.755 4.98 5.202 5.525 5.845 6.164 6.48 6.79 7.191 7.592 7.998 8.485 8.965 9.454 10.032 10.682 11.319 12.033 12.806 13.65 14.581 15.684 17.028 18.429 20.112 22.069 24.426 27.242 30.806 35.412 41.621 47.518 51.537 54.449 56.552 58.152 59.275 60.069 60.69 61.273 61.722 62.083 62.382 62.638 62.884 63.079 63.243 63.376 63.484 63.581 63.664 63.731 63.794 63.859 63.904 63.93 63.951 63.967 63.967 63.96 63.951 63.932 63.922 63.916 63.912 63.882 63.837 63.8 63.786 63.7 63.697 63.663 63.643 63.555 63.486 63.419 63.371 63.317 63.215 63.044 62.721 -5 ,11477 ,TETRA ,17607028,Sun Nov 28 21:39:05 CET,Sun Nov 28 23:47:27 CET,0.0 0.646 0.929 1.163 1.384 1.594 1.772 1.943 2.262 2.405 2.554 2.726 2.998 3.137 3.411 3.672 3.916 4.034 4.27 4.497 4.842 5.076 5.305 5.624 5.937 6.256 6.564 6.872 7.276 7.665 8.062 8.562 9.039 9.506 10.079 10.73 11.355 12.069 12.86 13.729 14.686 15.8 17.132 18.531 20.217 22.14 24.472 27.305 30.872 35.423 41.607 47.449 51.297 54.049 56.191 57.923 59.247 60.342 61.181 61.941 62.521 62.978 63.413 63.81 64.146 64.413 64.665 64.871 65.031 65.177 65.315 65.427 65.543 65.652 65.709 65.754 65.798 65.841 65.875 65.892 65.912 65.943 65.967 65.984 65.981 65.961 65.922 65.882 65.859 65.762 65.782 65.762 65.728 65.62 65.57 65.523 65.441 65.367 65.293 65.171 64.918 -6 ,27607 ,TETRA ,17607029,Sun Nov 28 21:39:08 CET,Sun Nov 28 23:47:15 CET,0.0 0.74 0.998 1.231 1.45 1.674 1.867 2.022 2.329 2.479 2.631 2.795 3.065 3.2 3.471 3.727 3.97 4.091 4.331 4.572 4.924 5.143 5.356 5.675 6.003 6.338 6.65 6.947 7.349 7.743 8.126 8.609 9.091 9.558 10.105 10.73 11.347 12.04 12.819 13.675 14.594 15.663 16.976 18.349 19.977 21.867 24.177 26.966 30.508 35.027 41.126 46.911 50.729 53.428 55.424 57.047 58.3 59.271 60.052 60.812 61.415 61.889 62.287 62.627 62.917 63.153 63.383 63.566 63.704 63.841 63.975 64.071 64.158 64.249 64.32 64.384 64.443 64.511 64.566 64.59 64.621 64.671 64.689 64.697 64.691 64.671 64.649 64.618 64.601 64.509 64.526 64.488 64.44 64.344 64.283 64.206 64.126 64.031 63.912 63.775 63.436 -7 ,13088 ,TETRA ,17607030,Sun Nov 28 21:39:03 CET,Sun Nov 28 23:46:04 CET,0.0 0.575 0.895 1.14 1.357 1.539 1.724 1.912 2.247 2.403 2.56 2.743 3.023 3.167 3.442 3.718 3.986 4.11 4.356 4.6 4.956 5.182 5.403 5.738 6.065 6.379 6.694 7.018 7.435 7.841 8.237 8.72 9.205 9.679 10.245 10.884 11.514 12.221 13.01 13.872 14.779 15.827 17.102 18.429 20.037 21.916 24.204 26.957 30.401 34.806 40.635 46.005 49.657 52.392 54.469 56.092 57.34 58.365 59.168 59.903 60.476 60.938 61.349 61.693 61.976 62.23 62.475 62.654 62.79 62.923 63.05 63.149 63.246 63.335 63.401 63.458 63.506 63.55 63.59 63.616 63.639 63.658 63.662 63.662 63.657 63.653 63.653 63.639 63.632 63.55 63.57 63.529 63.478 63.413 63.367 63.307 63.231 63.12 63.001 62.798 62.145 -8 ,44 ,TETRA ,17607031,Sun Nov 28 21:39:08 CET,Sun Nov 28 23:46:21 CET,0.0 0.897 1.176 1.41 1.611 1.785 1.955 2.129 2.443 2.581 2.718 2.895 3.18 3.316 3.558 3.805 4.056 4.176 4.408 4.635 4.984 5.215 5.445 5.791 6.117 6.425 6.731 7.045 7.451 7.853 8.264 8.777 9.276 9.754 10.318 10.976 11.619 12.326 13.107 13.965 14.895 15.997 17.329 18.691 20.37 22.341 24.7 27.539 31.124 35.731 41.969 47.86 51.829 54.697 56.807 58.485 59.811 60.883 61.632 62.323 62.946 63.427 63.851 64.228 64.54 64.799 65.005 65.143 65.261 65.381 65.476 65.536 65.597 65.656 65.695 65.734 65.765 65.786 65.801 65.805 65.805 65.789 65.767 65.736 65.72 65.707 65.703 65.679 65.658 65.56 65.566 65.534 65.492 65.395 65.337 65.266 65.164 65.016 64.834 64.618 64.178 -9 ,10906 ,TETRA ,17607032,Sun Nov 28 21:39:04 CET,Sun Nov 28 23:48:15 CET,0.0 0.698 0.946 1.175 1.369 1.534 1.694 1.851 2.157 2.307 2.451 2.608 2.872 2.999 3.25 3.497 3.736 3.852 4.092 4.328 4.652 4.859 5.067 5.378 5.684 5.999 6.312 6.615 7.016 7.411 7.802 8.282 8.752 9.21 9.751 10.398 11.03 11.736 12.532 13.393 14.324 15.402 16.701 18.062 19.693 21.567 23.859 26.661 30.152 34.57 40.6 46.423 50.35 53.1 55.162 56.798 58.041 59.086 59.939 60.69 61.243 61.693 62.08 62.415 62.721 62.984 63.224 63.421 63.574 63.713 63.856 63.977 64.102 64.219 64.295 64.365 64.437 64.506 64.555 64.584 64.619 64.656 64.663 64.671 64.669 64.645 64.629 64.609 64.579 64.475 64.5 64.481 64.454 64.354 64.29 64.215 64.125 64.028 63.902 63.746 63.38 -10 ,26301 ,TETRA ,17607033,Sun Nov 28 21:39:05 CET,Sun Nov 28 23:47:50 CET,0.0 0.807 1.078 1.32 1.541 1.734 1.916 2.094 2.439 2.603 2.767 2.96 3.239 3.38 3.643 3.897 4.153 4.285 4.545 4.793 5.16 5.403 5.639 5.976 6.304 6.616 6.92 7.223 7.629 8.045 8.448 8.927 9.401 9.869 10.421 11.057 11.682 12.385 13.164 14.01 14.933 16.04 17.361 18.714 20.372 22.296 24.623 27.447 30.965 35.443 41.471 47.188 51.048 53.822 55.95 57.617 58.906 59.975 60.801 61.518 62.082 62.565 62.996 63.36 63.634 63.843 64.035 64.17 64.267 64.353 64.446 64.524 64.594 64.659 64.689 64.703 64.731 64.79 64.832 64.838 64.847 64.857 64.847 64.829 64.815 64.771 64.743 64.709 64.678 64.574 64.573 64.528 64.482 64.377 64.325 64.284 64.229 64.143 64.006 63.811 63.125 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt deleted file mode 100644 index bd319349..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16220 ,TETRA ,17607034,Sun Nov 28 21:39:04 CET,Sun Nov 28 23:46:55 CET,0.0 0.49 0.708 0.919 1.112 1.292 1.478 1.649 1.947 2.094 2.243 2.397 2.675 2.821 3.098 3.359 3.601 3.725 3.967 4.208 4.577 4.825 5.089 5.463 5.807 6.147 6.475 6.795 7.228 7.674 8.116 8.654 9.178 9.693 10.302 10.993 11.673 12.44 13.313 14.277 15.311 16.51 17.979 19.529 21.412 23.626 26.324 29.571 33.642 38.875 46.06 52.912 57.523 60.913 63.505 65.551 67.155 68.48 69.541 70.529 71.31 71.956 72.533 73.044 73.479 73.85 74.209 74.512 74.764 75.003 75.234 75.418 75.606 75.787 75.909 76.024 76.139 76.251 76.36 76.433 76.499 76.577 76.628 76.685 76.714 76.762 76.8 76.84 76.857 76.822 76.9 76.908 76.902 76.864 76.827 76.751 76.692 76.678 76.628 76.521 75.954 -2 ,29737 ,TETRA ,17607035,Sun Nov 28 21:39:05 CET,Sun Nov 28 23:47:05 CET,0.0 0.89 1.182 1.394 1.581 1.755 1.947 2.143 2.503 2.673 2.834 3.019 3.297 3.441 3.712 3.979 4.251 4.388 4.658 4.921 5.306 5.551 5.795 6.153 6.493 6.832 7.168 7.488 7.921 8.361 8.793 9.322 9.835 10.34 10.944 11.639 12.323 13.102 13.982 14.936 15.955 17.164 18.644 20.188 22.076 24.286 26.98 30.22 34.326 39.609 46.796 53.72 58.428 61.868 64.458 66.524 68.16 69.503 70.551 71.524 72.29 72.905 73.452 73.926 74.335 74.701 75.073 75.395 75.662 75.916 76.163 76.363 76.557 76.732 76.863 77.0 77.119 77.222 77.322 77.384 77.452 77.55 77.606 77.673 77.704 77.753 77.787 77.801 77.809 77.767 77.844 77.853 77.849 77.817 77.797 77.755 77.699 77.643 77.577 77.528 77.332 -3 ,849 ,TETRA ,17607036,Sun Nov 28 21:39:08 CET,Sun Nov 28 23:50:53 CET,0.0 0.918 1.246 1.474 1.672 1.866 2.039 2.205 2.533 2.686 2.833 2.998 3.269 3.4 3.669 3.934 4.172 4.294 4.542 4.788 5.16 5.402 5.638 5.996 6.359 6.711 7.059 7.408 7.87 8.306 8.715 9.244 9.796 10.338 10.966 11.673 12.351 13.113 13.973 14.934 15.976 17.188 18.657 20.196 22.066 24.271 26.976 30.199 34.236 39.506 46.781 53.742 58.454 61.887 64.458 66.499 68.112 69.449 70.521 71.506 72.295 72.951 73.528 74.027 74.465 74.833 75.184 75.484 75.717 75.928 76.138 76.303 76.47 76.636 76.747 76.857 76.977 77.09 77.193 77.262 77.334 77.43 77.49 77.544 77.564 77.599 77.632 77.655 77.654 77.597 77.643 77.64 77.635 77.608 77.596 77.57 77.53 77.476 77.377 77.28 76.799 -4 ,16073 ,TETRA ,17607037,Sun Nov 28 21:39:09 CET,Sun Nov 28 23:50:05 CET,0.0 0.742 0.988 1.188 1.372 1.555 1.731 1.903 2.231 2.374 2.515 2.669 2.934 3.068 3.341 3.608 3.867 3.993 4.249 4.501 4.858 5.092 5.328 5.682 6.03 6.377 6.722 7.06 7.488 7.905 8.33 8.855 9.378 9.903 10.516 11.225 11.934 12.734 13.621 14.587 15.63 16.849 18.323 19.861 21.735 23.949 26.644 29.852 33.914 39.218 46.463 53.364 58.055 61.515 64.125 66.155 67.759 69.09 70.139 71.1 71.863 72.511 73.088 73.591 74.023 74.401 74.781 75.085 75.334 75.594 75.841 76.026 76.21 76.387 76.514 76.645 76.767 76.877 76.99 77.064 77.13 77.229 77.303 77.37 77.393 77.447 77.503 77.546 77.571 77.546 77.627 77.64 77.645 77.63 77.619 77.598 77.569 77.539 77.505 77.37 76.947 -5 ,15815 ,TETRA ,17607038,Sun Nov 28 21:39:04 CET,Sun Nov 28 23:47:17 CET,0.0 0.803 1.128 1.386 1.62 1.812 1.991 2.153 2.45 2.593 2.731 2.879 3.146 3.287 3.568 3.843 4.104 4.225 4.466 4.71 5.075 5.305 5.53 5.886 6.234 6.582 6.932 7.27 7.714 8.149 8.586 9.124 9.642 10.156 10.77 11.484 12.191 12.967 13.833 14.812 15.873 17.102 18.589 20.15 22.049 24.263 26.959 30.195 34.312 39.649 46.963 53.931 58.654 62.12 64.735 66.829 68.461 69.778 70.834 71.823 72.628 73.297 73.877 74.385 74.824 75.197 75.552 75.86 76.117 76.362 76.607 76.794 76.968 77.139 77.266 77.388 77.51 77.632 77.743 77.818 77.879 77.952 77.998 78.042 78.065 78.116 78.161 78.185 78.19 78.142 78.198 78.198 78.204 78.21 78.197 78.169 78.109 78.038 77.964 77.886 77.657 -6 ,9424 ,TETRA ,17607039,Sun Nov 28 21:39:05 CET,Sun Nov 28 23:46:50 CET,0.0 0.444 0.671 0.883 1.084 1.272 1.445 1.616 1.954 2.104 2.258 2.447 2.718 2.852 3.123 3.389 3.667 3.806 4.071 4.33 4.712 4.959 5.205 5.563 5.904 6.238 6.576 6.917 7.357 7.799 8.247 8.783 9.302 9.811 10.417 11.123 11.823 12.608 13.479 14.446 15.496 16.704 18.151 19.671 21.544 23.726 26.398 29.618 33.668 38.951 46.134 52.962 57.604 61.022 63.634 65.726 67.383 68.741 69.806 70.789 71.545 72.172 72.746 73.231 73.66 74.048 74.419 74.726 74.959 75.187 75.419 75.594 75.769 75.944 76.072 76.198 76.321 76.435 76.545 76.616 76.689 76.789 76.846 76.905 76.932 76.97 76.993 77.002 77.005 76.959 77.011 77.01 77.009 77.004 76.987 76.958 76.946 76.929 76.818 76.679 76.448 -7 ,25428 ,TETRA ,17607040,Sun Nov 28 21:39:08 CET,Sun Nov 28 23:52:31 CET,0.0 0.622 0.898 1.106 1.297 1.47 1.627 1.786 2.092 2.235 2.377 2.544 2.821 2.963 3.234 3.508 3.797 3.937 4.187 4.426 4.785 5.017 5.257 5.635 5.989 6.336 6.683 7.016 7.458 7.901 8.336 8.855 9.37 9.898 10.534 11.254 11.956 12.744 13.611 14.562 15.592 16.798 18.262 19.795 21.662 23.86 26.57 29.817 33.893 39.185 46.43 53.408 58.143 61.574 64.147 66.183 67.803 69.128 70.168 71.126 71.897 72.54 73.096 73.592 74.036 74.408 74.764 75.066 75.323 75.569 75.786 75.969 76.154 76.327 76.45 76.553 76.651 76.743 76.83 76.896 76.962 77.055 77.111 77.161 77.186 77.241 77.286 77.328 77.352 77.315 77.385 77.384 77.384 77.39 77.373 77.335 77.293 77.26 77.219 77.127 76.592 -8 ,21464 ,TETRA ,17607041,Sun Nov 28 21:39:09 CET,Sun Nov 28 23:52:12 CET,0.0 0.65 0.969 1.202 1.378 1.557 1.731 1.903 2.25 2.413 2.568 2.745 3.018 3.144 3.395 3.658 3.927 4.064 4.334 4.589 4.952 5.194 5.431 5.765 6.094 6.428 6.756 7.086 7.522 7.94 8.363 8.897 9.425 9.941 10.54 11.232 11.911 12.68 13.542 14.501 15.552 16.75 18.209 19.749 21.617 23.818 26.517 29.751 33.798 38.988 46.114 53.04 57.758 61.216 63.784 65.823 67.472 68.828 69.897 70.88 71.648 72.293 72.867 73.365 73.822 74.214 74.575 74.869 75.108 75.354 75.607 75.795 75.975 76.159 76.298 76.433 76.563 76.684 76.8 76.874 76.942 77.035 77.086 77.138 77.164 77.212 77.255 77.287 77.302 77.258 77.31 77.297 77.284 77.271 77.26 77.231 77.167 77.098 77.03 76.913 76.458 -9 ,23828 ,TETRA ,17607042,Sun Nov 28 21:40:01 CET,Sun Nov 28 23:50:01 CET,0.0 0.775 1.044 1.299 1.515 1.714 1.902 2.088 2.473 2.635 2.782 2.956 3.24 3.389 3.665 3.927 4.197 4.335 4.598 4.844 5.207 5.454 5.696 6.035 6.367 6.703 7.041 7.385 7.826 8.237 8.659 9.205 9.736 10.254 10.877 11.59 12.285 13.075 13.958 14.923 15.971 17.204 18.697 20.237 22.09 24.27 26.937 30.108 34.135 39.389 46.555 53.402 58.093 61.575 64.211 66.262 67.888 69.258 70.336 71.318 72.093 72.724 73.297 73.825 74.281 74.669 75.046 75.355 75.609 75.852 76.08 76.259 76.431 76.608 76.74 76.858 76.971 77.086 77.192 77.253 77.319 77.421 77.481 77.529 77.551 77.601 77.654 77.701 77.716 77.681 77.763 77.772 77.779 77.76 77.742 77.734 77.715 77.67 77.603 77.477 77.127 -10 ,293 ,TETRA ,17607043,Sun Nov 28 21:40:01 CET,Sun Nov 28 23:49:00 CET,0.0 0.428 0.689 0.907 1.09 1.259 1.415 1.566 1.877 2.029 2.174 2.346 2.624 2.756 3.006 3.265 3.529 3.662 3.93 4.184 4.551 4.792 5.028 5.372 5.718 6.061 6.397 6.735 7.181 7.622 8.057 8.592 9.119 9.639 10.25 10.957 11.647 12.41 13.272 14.231 15.289 16.528 17.997 19.535 21.429 23.654 26.338 29.55 33.614 38.882 46.113 53.092 57.791 61.182 63.756 65.82 67.46 68.802 69.868 70.859 71.627 72.258 72.842 73.353 73.779 74.146 74.517 74.833 75.082 75.325 75.581 75.768 75.935 76.111 76.252 76.389 76.503 76.607 76.729 76.806 76.869 76.97 77.034 77.084 77.107 77.149 77.187 77.22 77.234 77.195 77.254 77.243 77.228 77.228 77.235 77.222 77.179 77.131 77.073 76.976 76.762 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt deleted file mode 100644 index 40a0bf2c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2721 ,TETRA ,17607044,Sun Nov 28 21:40:03 CET,Sun Nov 28 23:49:48 CET,0.0 0.825 1.107 1.281 1.409 1.508 1.577 1.631 1.734 1.78 1.831 1.869 1.934 1.961 1.995 2.012 2.037 2.052 2.067 2.063 2.027 1.994 1.963 1.906 1.841 1.771 1.696 1.624 1.515 1.406 1.294 1.138 0.969 0.777 0.551 0.276 -0.026 -0.383 -0.804 -1.291 -1.848 -2.532 -3.406 -4.369 -5.565 -7.043 -8.962 -11.396 -14.644 -19.178 -26.003 -33.243 -38.622 -42.798 -46.116 -48.927 -51.339 -53.453 -55.214 -56.909 -58.292 -59.515 -60.672 -61.715 -62.667 -63.529 -64.409 -65.166 -65.813 -66.497 -67.188 -67.74 -68.302 -68.856 -69.288 -69.736 -70.199 -70.678 -71.167 -71.494 -71.82 -72.325 -72.674 -73.031 -73.215 -73.588 -73.987 -74.394 -74.599 -74.939 -75.267 -75.491 -75.72 -76.241 -76.518 -76.815 -77.139 -77.478 -77.863 -78.33 -79.752 -2 ,4726 ,TETRA ,17607045,Sun Nov 28 21:40:06 CET,Sun Nov 28 23:49:36 CET,0.0 0.394 0.6 0.768 0.905 1.024 1.129 1.224 1.379 1.449 1.512 1.569 1.65 1.682 1.72 1.756 1.795 1.807 1.831 1.837 1.817 1.806 1.803 1.79 1.758 1.708 1.642 1.577 1.48 1.369 1.251 1.084 0.895 0.7 0.476 0.196 -0.101 -0.446 -0.856 -1.342 -1.91 -2.599 -3.469 -4.397 -5.587 -7.077 -8.997 -11.443 -14.679 -19.189 -26.076 -33.41 -38.808 -43.052 -46.425 -49.236 -51.574 -53.588 -55.253 -56.861 -58.179 -59.296 -60.345 -61.312 -62.203 -63.002 -63.789 -64.472 -65.063 -65.66 -66.249 -66.725 -67.221 -67.727 -68.121 -68.533 -68.958 -69.405 -69.871 -70.172 -70.477 -70.975 -71.327 -71.676 -71.842 -72.153 -72.497 -72.897 -73.102 -73.438 -73.776 -74.005 -74.223 -74.671 -74.934 -75.226 -75.528 -75.853 -76.198 -76.689 -78.419 -3 ,29182 ,TETRA ,17607046,Sun Nov 28 21:40:01 CET,Sun Nov 28 23:48:04 CET,0.0 0.318 0.509 0.658 0.792 0.896 0.97 1.041 1.159 1.209 1.253 1.265 1.324 1.347 1.378 1.405 1.43 1.437 1.433 1.416 1.389 1.371 1.347 1.307 1.254 1.191 1.129 1.053 0.94 0.822 0.7 0.543 0.382 0.215 -0.002 -0.267 -0.545 -0.882 -1.288 -1.77 -2.322 -2.997 -3.846 -4.757 -5.936 -7.44 -9.352 -11.735 -14.946 -19.466 -26.296 -33.506 -38.826 -42.992 -46.293 -49.067 -51.369 -53.333 -54.965 -56.527 -57.811 -58.934 -60.048 -61.096 -61.996 -62.753 -63.503 -64.159 -64.721 -65.311 -65.92 -66.419 -66.941 -67.489 -67.897 -68.308 -68.75 -69.204 -69.679 -70.012 -70.343 -70.837 -71.171 -71.516 -71.696 -72.065 -72.451 -72.864 -73.072 -73.396 -73.707 -73.947 -74.193 -74.703 -74.963 -75.242 -75.545 -75.875 -76.261 -76.746 -77.707 -4 ,30961 ,TETRA ,17607047,Sun Nov 28 21:40:03 CET,Sun Nov 28 23:47:57 CET,0.0 0.438 0.665 0.827 0.951 1.048 1.131 1.205 1.32 1.36 1.387 1.399 1.461 1.481 1.508 1.523 1.528 1.528 1.535 1.543 1.53 1.505 1.481 1.449 1.409 1.368 1.318 1.252 1.151 1.045 0.934 0.776 0.61 0.423 0.186 -0.096 -0.383 -0.717 -1.129 -1.624 -2.173 -2.837 -3.693 -4.646 -5.857 -7.338 -9.27 -11.743 -15.048 -19.662 -26.673 -34.043 -39.511 -43.899 -47.464 -50.438 -52.856 -54.898 -56.538 -58.103 -59.453 -60.64 -61.74 -62.766 -63.69 -64.489 -65.299 -66.037 -66.677 -67.313 -67.956 -68.496 -69.04 -69.593 -70.016 -70.443 -70.878 -71.314 -71.774 -72.087 -72.398 -72.87 -73.206 -73.556 -73.732 -74.097 -74.467 -74.841 -75.041 -75.373 -75.706 -75.949 -76.185 -76.706 -76.993 -77.282 -77.577 -77.886 -78.255 -78.767 -79.993 -5 ,28311 ,TETRA ,17607048,Sun Nov 28 21:40:05 CET,Sun Nov 28 23:47:20 CET,0.0 0.429 0.571 0.723 0.863 0.962 1.038 1.095 1.221 1.288 1.341 1.387 1.46 1.48 1.504 1.527 1.534 1.538 1.545 1.534 1.519 1.506 1.485 1.452 1.405 1.341 1.271 1.205 1.104 0.982 0.86 0.701 0.524 0.343 0.127 -0.125 -0.395 -0.737 -1.13 -1.59 -2.13 -2.803 -3.665 -4.6 -5.784 -7.254 -9.144 -11.551 -14.806 -19.278 -25.931 -33.031 -38.475 -42.861 -46.365 -49.268 -51.673 -53.779 -55.525 -57.197 -58.57 -59.746 -60.844 -61.861 -62.775 -63.601 -64.444 -65.179 -65.813 -66.462 -67.103 -67.633 -68.171 -68.715 -69.141 -69.571 -70.022 -70.482 -70.944 -71.256 -71.575 -72.081 -72.441 -72.813 -73.0 -73.381 -73.763 -74.153 -74.354 -74.678 -74.984 -75.214 -75.452 -75.957 -76.224 -76.492 -76.782 -77.13 -77.518 -77.922 -78.881 -6 ,23906 ,TETRA ,17607049,Sun Nov 28 21:40:07 CET,Sun Nov 28 23:47:37 CET,0.0 0.334 0.457 0.599 0.728 0.838 0.936 1.017 1.133 1.168 1.197 1.218 1.279 1.299 1.33 1.355 1.375 1.385 1.394 1.389 1.373 1.354 1.334 1.287 1.229 1.164 1.106 1.049 0.957 0.853 0.731 0.555 0.372 0.199 -0.024 -0.311 -0.605 -0.967 -1.378 -1.839 -2.378 -3.042 -3.892 -4.833 -6.04 -7.525 -9.428 -11.863 -15.164 -19.77 -26.521 -33.567 -38.837 -42.978 -46.322 -49.142 -51.502 -53.532 -55.185 -56.798 -58.148 -59.303 -60.37 -61.351 -62.24 -63.038 -63.844 -64.553 -65.184 -65.843 -66.514 -67.058 -67.626 -68.22 -68.663 -69.102 -69.555 -70.008 -70.464 -70.775 -71.084 -71.579 -71.915 -72.245 -72.419 -72.794 -73.18 -73.565 -73.768 -74.1 -74.426 -74.657 -74.898 -75.427 -75.699 -75.968 -76.251 -76.585 -76.962 -77.421 -78.539 -7 ,15879 ,TETRA ,17607050,Sun Nov 28 21:40:02 CET,Sun Nov 28 23:49:54 CET,0.0 0.381 0.595 0.731 0.84 0.94 1.026 1.091 1.202 1.26 1.333 1.398 1.458 1.478 1.525 1.572 1.598 1.606 1.612 1.611 1.596 1.581 1.563 1.523 1.476 1.419 1.36 1.294 1.187 1.067 0.934 0.758 0.565 0.374 0.143 -0.135 -0.428 -0.779 -1.191 -1.674 -2.231 -2.9 -3.72 -4.632 -5.853 -7.36 -9.282 -11.736 -15.029 -19.606 -26.448 -33.735 -39.139 -43.35 -46.682 -49.485 -51.835 -53.891 -55.63 -57.277 -58.601 -59.744 -60.786 -61.758 -62.653 -63.431 -64.236 -64.923 -65.519 -66.15 -66.798 -67.324 -67.873 -68.416 -68.803 -69.198 -69.598 -70.003 -70.424 -70.721 -71.01 -71.445 -71.741 -72.069 -72.239 -72.555 -72.869 -73.207 -73.385 -73.683 -73.959 -74.176 -74.401 -74.84 -75.059 -75.283 -75.531 -75.83 -76.181 -76.589 -77.587 -8 ,7892 ,TETRA ,17607051,Sun Nov 28 21:40:04 CET,Sun Nov 28 23:50:20 CET,0.0 0.372 0.582 0.713 0.792 0.878 0.962 1.022 1.13 1.179 1.212 1.226 1.28 1.296 1.339 1.38 1.392 1.393 1.399 1.393 1.371 1.347 1.326 1.291 1.24 1.18 1.122 1.05 0.935 0.816 0.693 0.534 0.37 0.196 -0.03 -0.326 -0.635 -0.996 -1.423 -1.911 -2.46 -3.124 -3.986 -4.948 -6.192 -7.728 -9.646 -12.09 -15.411 -20.042 -26.961 -34.197 -39.526 -43.663 -47.007 -49.841 -52.133 -54.084 -55.702 -57.265 -58.569 -59.684 -60.732 -61.74 -62.672 -63.485 -64.329 -65.108 -65.76 -66.409 -67.091 -67.649 -68.219 -68.811 -69.262 -69.714 -70.175 -70.637 -71.098 -71.407 -71.73 -72.237 -72.585 -72.931 -73.105 -73.48 -73.891 -74.303 -74.497 -74.817 -75.126 -75.352 -75.583 -76.074 -76.343 -76.611 -76.875 -77.196 -77.606 -78.06 -79.279 -9 ,17534 ,TETRA ,17607052,Sun Nov 28 21:40:07 CET,Sun Nov 28 23:47:33 CET,0.0 0.431 0.604 0.731 0.833 0.915 0.988 1.053 1.127 1.157 1.193 1.214 1.273 1.292 1.316 1.329 1.328 1.326 1.327 1.325 1.308 1.285 1.258 1.208 1.145 1.076 1.008 0.937 0.835 0.722 0.595 0.428 0.252 0.075 -0.153 -0.447 -0.75 -1.098 -1.499 -1.976 -2.528 -3.219 -4.11 -5.076 -6.3 -7.799 -9.723 -12.217 -15.535 -20.038 -26.811 -34.022 -39.355 -43.497 -46.828 -49.638 -51.94 -53.913 -55.525 -57.048 -58.317 -59.428 -60.456 -61.39 -62.284 -63.116 -63.972 -64.687 -65.26 -65.871 -66.517 -67.051 -67.612 -68.19 -68.627 -69.073 -69.514 -69.947 -70.412 -70.739 -71.071 -71.574 -71.916 -72.262 -72.435 -72.791 -73.185 -73.595 -73.793 -74.115 -74.421 -74.64 -74.863 -75.354 -75.628 -75.905 -76.194 -76.52 -76.925 -77.42 -78.993 -10 ,10238 ,TETRA ,17607053,Sun Nov 28 21:40:03 CET,Sun Nov 28 23:47:50 CET,0.0 0.319 0.481 0.607 0.713 0.794 0.854 0.917 1.015 1.051 1.095 1.134 1.192 1.214 1.256 1.268 1.262 1.257 1.253 1.245 1.214 1.195 1.17 1.119 1.063 0.997 0.924 0.856 0.76 0.636 0.496 0.317 0.136 -0.044 -0.269 -0.558 -0.86 -1.218 -1.637 -2.119 -2.661 -3.317 -4.173 -5.106 -6.309 -7.783 -9.654 -12.09 -15.405 -19.968 -26.759 -34.009 -39.365 -43.517 -46.871 -49.714 -52.055 -54.121 -55.862 -57.497 -58.887 -60.101 -61.204 -62.222 -63.111 -63.902 -64.734 -65.455 -66.074 -66.695 -67.326 -67.856 -68.401 -68.944 -69.348 -69.766 -70.201 -70.647 -71.091 -71.398 -71.73 -72.23 -72.568 -72.905 -73.071 -73.439 -73.838 -74.242 -74.443 -74.771 -75.11 -75.342 -75.57 -76.056 -76.315 -76.595 -76.906 -77.225 -77.563 -77.986 -79.11 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt deleted file mode 100644 index a1b529bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1971 ,TETRA ,17607055,Sun Nov 28 21:40:02 CET,Sun Nov 28 23:51:34 CET,0.0 2.035 2.42 2.631 2.833 2.993 3.107 3.198 3.344 3.411 3.485 3.568 3.655 3.69 3.741 3.781 3.803 3.807 3.802 3.794 3.778 3.772 3.76 3.733 3.699 3.654 3.594 3.517 3.409 3.285 3.142 2.951 2.755 2.561 2.311 1.996 1.661 1.252 0.777 0.239 -0.367 -1.11 -2.048 -3.11 -4.468 -6.11 -8.227 -10.917 -14.578 -19.672 -27.189 -35.055 -40.866 -45.412 -49.062 -52.121 -54.609 -56.713 -58.458 -60.146 -61.546 -62.741 -63.841 -64.85 -65.758 -66.561 -67.39 -68.123 -68.739 -69.361 -69.99 -70.489 -71.0 -71.535 -71.926 -72.326 -72.737 -73.144 -73.563 -73.841 -74.149 -74.667 -75.019 -75.375 -75.56 -75.942 -76.333 -76.742 -76.953 -77.299 -77.608 -77.84 -78.085 -78.58 -78.864 -79.192 -79.515 -79.868 -80.271 -80.775 -83.092 -2 ,23957 ,TETRA ,17607056,Sun Nov 28 21:40:04 CET,Sun Nov 28 23:51:18 CET,0.0 1.951 2.325 2.549 2.74 2.9 3.038 3.136 3.26 3.316 3.363 3.395 3.469 3.499 3.562 3.609 3.623 3.633 3.661 3.67 3.655 3.636 3.617 3.583 3.526 3.47 3.417 3.347 3.231 3.107 2.973 2.784 2.59 2.389 2.125 1.81 1.499 1.099 0.606 0.055 -0.564 -1.319 -2.277 -3.356 -4.748 -6.453 -8.616 -11.377 -15.116 -20.252 -27.838 -35.87 -41.795 -46.357 -49.991 -53.073 -55.606 -57.753 -59.535 -61.274 -62.707 -63.914 -65.026 -66.07 -67.004 -67.807 -68.625 -69.35 -69.958 -70.603 -71.301 -71.867 -72.445 -73.028 -73.469 -73.915 -74.371 -74.84 -75.313 -75.638 -75.976 -76.492 -76.842 -77.209 -77.396 -77.779 -78.168 -78.554 -78.754 -79.096 -79.395 -79.613 -79.843 -80.32 -80.578 -80.87 -81.197 -81.555 -81.975 -82.504 -84.932 -3 ,15050 ,TETRA ,17607058,Sun Nov 28 21:40:07 CET,Sun Nov 28 23:49:55 CET,0.0 1.703 2.04 2.27 2.471 2.632 2.762 2.854 2.981 3.039 3.1 3.178 3.256 3.296 3.357 3.391 3.424 3.434 3.448 3.453 3.452 3.451 3.448 3.429 3.389 3.336 3.27 3.193 3.076 2.944 2.808 2.643 2.47 2.272 2.014 1.703 1.369 0.984 0.564 0.061 -0.561 -1.309 -2.244 -3.304 -4.645 -6.307 -8.464 -11.183 -14.834 -19.965 -27.549 -35.517 -41.425 -45.955 -49.582 -52.631 -55.111 -57.221 -58.96 -60.629 -62.007 -63.212 -64.332 -65.339 -66.278 -67.133 -67.993 -68.752 -69.377 -69.999 -70.63 -71.133 -71.651 -72.172 -72.563 -72.96 -73.375 -73.797 -74.228 -74.515 -74.8 -75.238 -75.519 -75.82 -75.979 -76.284 -76.595 -76.929 -77.106 -77.422 -77.675 -77.879 -78.101 -78.594 -78.862 -79.142 -79.449 -79.798 -80.193 -80.662 -82.126 -4 ,27410 ,TETRA ,17607059,Sun Nov 28 21:40:09 CET,Sun Nov 28 23:50:21 CET,0.0 1.922 2.3 2.523 2.691 2.85 2.988 3.093 3.278 3.349 3.416 3.499 3.581 3.614 3.664 3.688 3.7 3.705 3.709 3.707 3.679 3.666 3.666 3.649 3.607 3.552 3.495 3.427 3.327 3.215 3.089 2.924 2.742 2.545 2.29 1.97 1.641 1.254 0.804 0.274 -0.365 -1.139 -2.099 -3.139 -4.492 -6.202 -8.338 -11.048 -14.726 -19.776 -27.237 -35.13 -40.958 -45.459 -49.056 -52.08 -54.565 -56.664 -58.383 -60.046 -61.417 -62.601 -63.692 -64.669 -65.557 -66.368 -67.215 -67.982 -68.629 -69.262 -69.902 -70.424 -70.958 -71.511 -71.941 -72.366 -72.785 -73.218 -73.677 -73.99 -74.308 -74.808 -75.142 -75.485 -75.675 -76.057 -76.441 -76.843 -77.051 -77.397 -77.679 -77.898 -78.129 -78.62 -78.888 -79.16 -79.447 -79.794 -80.203 -80.792 -83.357 -5 ,12316 ,TETRA ,17607060,Sun Nov 28 21:40:03 CET,Sun Nov 28 23:49:57 CET,0.0 1.429 1.79 2.029 2.237 2.385 2.503 2.637 2.839 2.908 2.984 3.071 3.156 3.206 3.276 3.315 3.346 3.36 3.378 3.392 3.404 3.394 3.372 3.343 3.304 3.253 3.192 3.123 3.029 2.909 2.772 2.6 2.431 2.247 1.996 1.675 1.343 0.944 0.492 -0.023 -0.633 -1.383 -2.334 -3.362 -4.688 -6.317 -8.398 -11.096 -14.766 -19.837 -27.327 -35.202 -41.031 -45.535 -49.156 -52.223 -54.771 -56.972 -58.802 -60.604 -62.146 -63.476 -64.68 -65.764 -66.743 -67.639 -68.556 -69.36 -70.031 -70.702 -71.393 -71.955 -72.531 -73.121 -73.577 -74.04 -74.518 -75.025 -75.537 -75.875 -76.225 -76.771 -77.134 -77.506 -77.699 -78.087 -78.485 -78.892 -79.097 -79.44 -79.788 -80.034 -80.277 -80.792 -81.063 -81.341 -81.637 -81.968 -82.361 -82.83 -85.124 -6 ,21972 ,TETRA ,17607061,Sun Nov 28 21:40:03 CET,Sun Nov 28 23:49:29 CET,0.0 1.733 2.14 2.438 2.69 2.897 3.059 3.186 3.416 3.521 3.623 3.725 3.802 3.839 3.906 3.958 4.0 4.02 4.058 4.082 4.105 4.111 4.11 4.081 4.046 3.997 3.919 3.842 3.745 3.633 3.508 3.344 3.166 2.987 2.766 2.477 2.155 1.753 1.286 0.781 0.188 -0.578 -1.552 -2.633 -3.986 -5.635 -7.788 -10.489 -14.122 -19.288 -26.921 -34.869 -40.707 -45.23 -48.844 -51.867 -54.353 -56.48 -58.231 -59.921 -61.307 -62.483 -63.574 -64.565 -65.468 -66.328 -67.248 -68.058 -68.742 -69.433 -70.149 -70.736 -71.32 -71.906 -72.348 -72.798 -73.271 -73.761 -74.258 -74.589 -74.919 -75.438 -75.796 -76.155 -76.338 -76.701 -77.082 -77.49 -77.699 -78.041 -78.362 -78.593 -78.83 -79.355 -79.638 -79.936 -80.261 -80.621 -81.057 -81.564 -82.974 -7 ,21407 ,TETRA ,17607062,Sun Nov 28 21:40:05 CET,Sun Nov 28 23:49:25 CET,0.0 2.84 3.198 3.419 3.61 3.756 3.868 3.961 4.09 4.144 4.206 4.267 4.339 4.377 4.44 4.486 4.513 4.518 4.542 4.557 4.563 4.555 4.529 4.479 4.425 4.374 4.317 4.25 4.14 3.999 3.847 3.648 3.439 3.226 2.959 2.643 2.308 1.898 1.419 0.87 0.254 -0.517 -1.52 -2.619 -3.996 -5.668 -7.842 -10.584 -14.249 -19.393 -26.999 -34.987 -40.835 -45.387 -49.019 -52.034 -54.507 -56.634 -58.395 -60.058 -61.429 -62.605 -63.671 -64.641 -65.523 -66.295 -67.071 -67.753 -68.336 -68.934 -69.576 -70.139 -70.722 -71.319 -71.778 -72.244 -72.717 -73.193 -73.69 -74.036 -74.387 -74.908 -75.253 -75.618 -75.811 -76.195 -76.577 -76.992 -77.207 -77.543 -77.849 -78.074 -78.308 -78.801 -79.068 -79.368 -79.708 -80.038 -80.41 -80.899 -82.134 -8 ,16480 ,TETRA ,17607063,Sun Nov 28 21:40:07 CET,Sun Nov 28 23:49:00 CET,0.0 2.811 3.242 3.53 3.717 3.87 4.004 4.102 4.249 4.32 4.387 4.461 4.539 4.577 4.653 4.721 4.77 4.789 4.817 4.812 4.792 4.765 4.737 4.705 4.654 4.578 4.503 4.431 4.31 4.178 4.034 3.857 3.659 3.44 3.171 2.855 2.541 2.174 1.734 1.216 0.616 -0.144 -1.118 -2.17 -3.517 -5.178 -7.306 -10.006 -13.638 -18.709 -26.223 -34.134 -39.972 -44.487 -48.088 -51.089 -53.565 -55.688 -57.424 -59.101 -60.49 -61.674 -62.762 -63.752 -64.653 -65.472 -66.311 -67.031 -67.635 -68.254 -68.88 -69.383 -69.887 -70.393 -70.788 -71.19 -71.597 -72.011 -72.436 -72.731 -73.018 -73.469 -73.801 -74.146 -74.306 -74.623 -74.967 -75.309 -75.473 -75.774 -76.009 -76.193 -76.388 -76.808 -77.036 -77.279 -77.537 -77.841 -78.185 -78.575 -80.347 -9 ,15949 ,TETRA ,17607064,Sun Nov 28 21:40:04 CET,Sun Nov 28 23:50:56 CET,0.0 1.765 2.192 2.468 2.653 2.807 2.948 3.06 3.235 3.295 3.338 3.372 3.45 3.488 3.542 3.597 3.652 3.673 3.706 3.726 3.733 3.713 3.686 3.647 3.593 3.532 3.463 3.388 3.283 3.166 3.045 2.873 2.676 2.483 2.241 1.928 1.587 1.197 0.748 0.208 -0.422 -1.198 -2.186 -3.257 -4.601 -6.28 -8.426 -11.161 -14.863 -19.937 -27.573 -35.616 -41.537 -46.16 -49.811 -52.899 -55.471 -57.658 -59.446 -61.167 -62.597 -63.821 -64.948 -65.995 -66.941 -67.774 -68.62 -69.355 -69.991 -70.652 -71.324 -71.853 -72.418 -73.046 -73.519 -73.981 -74.453 -74.902 -75.35 -75.661 -75.975 -76.448 -76.76 -77.087 -77.258 -77.611 -77.961 -78.314 -78.495 -78.816 -79.079 -79.285 -79.517 -80.039 -80.34 -80.655 -80.979 -81.318 -81.699 -82.239 -85.968 -10 ,18939 ,TETRA ,17607065,Sun Nov 28 21:40:07 CET,Sun Nov 28 23:50:04 CET,0.0 1.955 2.311 2.562 2.751 2.928 3.038 3.096 3.244 3.318 3.38 3.432 3.501 3.535 3.597 3.64 3.671 3.681 3.681 3.68 3.69 3.676 3.661 3.634 3.585 3.529 3.477 3.425 3.333 3.211 3.074 2.898 2.702 2.499 2.237 1.904 1.557 1.143 0.686 0.169 -0.45 -1.206 -2.136 -3.158 -4.469 -6.076 -8.182 -10.903 -14.499 -19.406 -26.746 -34.615 -40.432 -44.963 -48.617 -51.66 -54.17 -56.295 -58.021 -59.686 -61.06 -62.23 -63.304 -64.286 -65.173 -65.965 -66.773 -67.472 -68.073 -68.692 -69.312 -69.841 -70.419 -71.009 -71.46 -71.916 -72.378 -72.864 -73.352 -73.673 -74.006 -74.527 -74.87 -75.219 -75.399 -75.775 -76.165 -76.576 -76.792 -77.136 -77.439 -77.636 -77.821 -78.218 -78.449 -78.72 -79.015 -79.329 -79.69 -80.11 -82.634 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt deleted file mode 100644 index 3647c92c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14843 ,TETRA ,17607066,Sun Nov 28 21:40:09 CET,Sun Nov 28 23:48:46 CET,0.0 0.484 0.625 0.775 0.908 1.012 1.098 1.168 1.282 1.338 1.399 1.475 1.567 1.619 1.709 1.783 1.844 1.875 1.939 2.0 2.088 2.125 2.15 2.2 2.238 2.253 2.269 2.294 2.311 2.315 2.315 2.308 2.294 2.275 2.234 2.191 2.158 2.107 2.045 1.965 1.853 1.691 1.448 1.172 0.782 0.235 -0.448 -1.371 -2.69 -4.568 -7.512 -10.79 -13.337 -15.387 -17.072 -18.471 -19.657 -20.72 -21.612 -22.486 -23.204 -23.82 -24.397 -24.929 -25.416 -25.839 -26.262 -26.648 -26.978 -27.307 -27.635 -27.903 -28.183 -28.482 -28.717 -28.951 -29.184 -29.418 -29.661 -29.827 -30.001 -30.275 -30.461 -30.644 -30.733 -30.94 -31.167 -31.374 -31.473 -31.669 -31.883 -32.014 -32.127 -32.351 -32.503 -32.67 -32.822 -33.002 -33.211 -33.458 -34.153 -2 ,10896 ,TETRA ,17607067,Sun Nov 28 21:40:05 CET,Sun Nov 28 23:47:39 CET,0.0 0.796 0.976 1.088 1.202 1.316 1.401 1.478 1.622 1.685 1.739 1.797 1.89 1.944 2.026 2.087 2.149 2.177 2.226 2.276 2.329 2.357 2.389 2.432 2.468 2.49 2.512 2.544 2.567 2.572 2.582 2.599 2.591 2.574 2.555 2.522 2.476 2.391 2.296 2.18 2.036 1.879 1.654 1.352 0.944 0.415 -0.3 -1.228 -2.553 -4.462 -7.38 -10.623 -13.097 -15.083 -16.765 -18.221 -19.416 -20.436 -21.297 -22.158 -22.883 -23.509 -24.086 -24.611 -25.097 -25.529 -25.957 -26.334 -26.653 -26.973 -27.302 -27.571 -27.844 -28.135 -28.365 -28.599 -28.832 -29.077 -29.333 -29.503 -29.676 -29.939 -30.116 -30.303 -30.403 -30.611 -30.822 -31.035 -31.143 -31.331 -31.525 -31.656 -31.786 -32.05 -32.185 -32.339 -32.52 -32.709 -32.915 -33.191 -34.06 -3 ,6058 ,TETRA ,17607068,Sun Nov 28 21:40:05 CET,Sun Nov 28 23:52:09 CET,0.0 0.518 0.713 0.867 0.977 1.068 1.141 1.206 1.357 1.428 1.491 1.563 1.654 1.703 1.78 1.844 1.896 1.914 1.945 1.977 2.03 2.072 2.113 2.16 2.187 2.211 2.239 2.261 2.277 2.285 2.285 2.278 2.262 2.249 2.223 2.177 2.131 2.074 2.003 1.89 1.753 1.584 1.365 1.093 0.717 0.255 -0.423 -1.336 -2.629 -4.584 -7.58 -10.844 -13.381 -15.399 -17.064 -18.501 -19.69 -20.722 -21.579 -22.432 -23.156 -23.767 -24.333 -24.875 -25.372 -25.814 -26.273 -26.662 -26.983 -27.314 -27.652 -27.922 -28.206 -28.512 -28.748 -28.985 -29.224 -29.456 -29.693 -29.868 -30.051 -30.325 -30.518 -30.721 -30.818 -31.014 -31.217 -31.404 -31.498 -31.672 -31.806 -31.915 -32.04 -32.293 -32.434 -32.587 -32.747 -32.942 -33.183 -33.445 -34.164 -4 ,5970 ,TETRA ,17607069,Sun Nov 28 21:40:07 CET,Sun Nov 28 23:51:43 CET,0.0 0.759 0.937 1.067 1.182 1.257 1.343 1.43 1.598 1.667 1.713 1.762 1.837 1.869 1.926 1.981 2.037 2.057 2.085 2.117 2.168 2.199 2.228 2.269 2.321 2.365 2.397 2.419 2.432 2.446 2.46 2.461 2.435 2.399 2.36 2.315 2.255 2.179 2.081 1.958 1.811 1.624 1.371 1.077 0.68 0.142 -0.576 -1.503 -2.766 -4.619 -7.598 -10.967 -13.571 -15.636 -17.304 -18.735 -19.914 -20.939 -21.813 -22.666 -23.374 -23.978 -24.547 -25.084 -25.579 -26.025 -26.474 -26.862 -27.196 -27.528 -27.864 -28.138 -28.431 -28.742 -28.978 -29.225 -29.474 -29.708 -29.944 -30.113 -30.276 -30.527 -30.711 -30.899 -30.998 -31.202 -31.416 -31.642 -31.754 -31.937 -32.083 -32.211 -32.345 -32.596 -32.744 -32.905 -33.068 -33.248 -33.469 -33.75 -34.347 -5 ,17708 ,TETRA ,17607070,Sun Nov 28 21:40:09 CET,Sun Nov 28 23:48:38 CET,0.0 0.436 0.65 0.807 0.93 1.046 1.146 1.228 1.36 1.413 1.462 1.532 1.618 1.655 1.733 1.803 1.855 1.88 1.924 1.961 2.023 2.062 2.093 2.132 2.172 2.209 2.241 2.266 2.284 2.299 2.306 2.302 2.294 2.29 2.274 2.237 2.194 2.136 2.066 1.978 1.857 1.668 1.412 1.126 0.726 0.211 -0.46 -1.355 -2.619 -4.472 -7.374 -10.604 -13.13 -15.178 -16.869 -18.328 -19.565 -20.634 -21.515 -22.357 -23.057 -23.676 -24.243 -24.772 -25.264 -25.693 -26.135 -26.531 -26.862 -27.193 -27.537 -27.822 -28.103 -28.384 -28.609 -28.845 -29.085 -29.334 -29.59 -29.765 -29.937 -30.194 -30.37 -30.55 -30.653 -30.851 -31.045 -31.263 -31.383 -31.578 -31.763 -31.886 -32.001 -32.268 -32.408 -32.549 -32.703 -32.874 -33.067 -33.352 -34.143 -6 ,4607 ,TETRA ,17607071,Sun Nov 28 21:40:11 CET,Sun Nov 28 23:48:08 CET,0.0 0.313 0.507 0.653 0.732 0.805 0.887 0.956 1.088 1.154 1.218 1.301 1.384 1.417 1.471 1.54 1.618 1.643 1.683 1.714 1.749 1.77 1.796 1.838 1.874 1.908 1.927 1.941 1.958 1.976 2.003 2.021 2.026 2.027 1.999 1.942 1.88 1.8 1.7 1.581 1.442 1.254 0.978 0.671 0.283 -0.231 -0.923 -1.827 -3.113 -5.009 -7.982 -11.326 -13.899 -15.979 -17.677 -19.095 -20.307 -21.358 -22.202 -23.018 -23.714 -24.326 -24.893 -25.421 -25.905 -26.332 -26.784 -27.17 -27.495 -27.839 -28.178 -28.458 -28.758 -29.061 -29.284 -29.511 -29.754 -29.999 -30.249 -30.419 -30.591 -30.851 -31.029 -31.215 -31.308 -31.503 -31.711 -31.918 -32.019 -32.195 -32.346 -32.459 -32.573 -32.811 -32.943 -33.08 -33.236 -33.414 -33.605 -33.813 -34.24 -7 ,17783 ,TETRA ,17607072,Sun Nov 28 21:40:05 CET,Sun Nov 28 23:48:36 CET,0.0 0.523 0.746 0.894 1.005 1.11 1.197 1.268 1.389 1.458 1.521 1.58 1.659 1.697 1.774 1.845 1.909 1.938 1.994 2.042 2.087 2.112 2.143 2.185 2.205 2.225 2.254 2.284 2.313 2.32 2.336 2.355 2.365 2.376 2.375 2.349 2.303 2.255 2.209 2.122 1.991 1.82 1.584 1.324 0.987 0.549 -0.055 -0.901 -2.127 -3.909 -6.772 -10.007 -12.548 -14.606 -16.295 -17.745 -18.937 -19.956 -20.799 -21.628 -22.336 -22.944 -23.511 -24.034 -24.507 -24.939 -25.369 -25.73 -26.045 -26.366 -26.694 -26.963 -27.238 -27.525 -27.756 -27.983 -28.205 -28.442 -28.691 -28.864 -29.041 -29.306 -29.481 -29.662 -29.756 -29.956 -30.161 -30.368 -30.475 -30.651 -30.789 -30.912 -31.054 -31.354 -31.503 -31.636 -31.783 -31.937 -32.121 -32.351 -33.154 -8 ,121 ,TETRA ,17607073,Sun Nov 28 21:40:05 CET,Sun Nov 28 23:48:09 CET,0.0 0.613 0.85 1.006 1.134 1.245 1.356 1.452 1.6 1.666 1.732 1.818 1.913 1.964 2.061 2.144 2.214 2.251 2.33 2.396 2.477 2.526 2.572 2.624 2.655 2.682 2.708 2.731 2.756 2.761 2.764 2.766 2.75 2.731 2.712 2.685 2.637 2.564 2.475 2.353 2.2 2.01 1.745 1.43 1.033 0.512 -0.194 -1.125 -2.486 -4.438 -7.392 -10.641 -13.195 -15.262 -16.944 -18.367 -19.571 -20.635 -21.52 -22.368 -23.076 -23.699 -24.28 -24.825 -25.32 -25.75 -26.19 -26.585 -26.915 -27.254 -27.599 -27.875 -28.156 -28.456 -28.691 -28.923 -29.154 -29.387 -29.646 -29.833 -30.017 -30.287 -30.47 -30.669 -30.767 -30.964 -31.186 -31.418 -31.54 -31.734 -31.891 -32.005 -32.136 -32.433 -32.578 -32.728 -32.879 -33.045 -33.268 -33.566 -34.241 -9 ,2637 ,TETRA ,17607074,Sun Nov 28 21:40:08 CET,Sun Nov 28 23:49:56 CET,0.0 0.222 0.421 0.612 0.734 0.826 0.91 0.98 1.094 1.154 1.208 1.246 1.319 1.352 1.435 1.512 1.577 1.611 1.672 1.712 1.772 1.812 1.843 1.879 1.908 1.935 1.956 1.977 2.011 2.04 2.053 2.052 2.046 2.049 2.031 1.989 1.951 1.894 1.809 1.707 1.577 1.375 1.101 0.807 0.427 -0.075 -0.757 -1.66 -2.956 -4.893 -7.877 -11.121 -13.642 -15.667 -17.28 -18.66 -19.842 -20.873 -21.727 -22.564 -23.276 -23.897 -24.472 -24.997 -25.464 -25.878 -26.319 -26.697 -27.012 -27.349 -27.68 -27.954 -28.244 -28.543 -28.773 -28.993 -29.232 -29.489 -29.743 -29.911 -30.078 -30.341 -30.519 -30.708 -30.804 -31.0 -31.215 -31.44 -31.556 -31.737 -31.876 -31.987 -32.103 -32.372 -32.525 -32.67 -32.816 -33.003 -33.209 -33.441 -33.856 -10 ,8980 ,TETRA ,17607075,Sun Nov 28 21:40:09 CET,Sun Nov 28 23:49:24 CET,0.0 0.788 0.923 1.025 1.129 1.226 1.295 1.362 1.494 1.537 1.584 1.632 1.709 1.753 1.842 1.914 1.97 1.995 2.048 2.095 2.16 2.195 2.217 2.263 2.312 2.353 2.385 2.414 2.438 2.438 2.434 2.413 2.392 2.371 2.337 2.296 2.253 2.19 2.088 1.964 1.837 1.668 1.424 1.157 0.791 0.279 -0.428 -1.35 -2.655 -4.582 -7.588 -10.918 -13.472 -15.539 -17.26 -18.732 -19.954 -21.007 -21.883 -22.725 -23.461 -24.114 -24.707 -25.252 -25.735 -26.167 -26.621 -27.017 -27.352 -27.697 -28.053 -28.331 -28.613 -28.914 -29.139 -29.36 -29.59 -29.834 -30.07 -30.229 -30.396 -30.646 -30.818 -31.005 -31.099 -31.286 -31.483 -31.687 -31.792 -31.972 -32.126 -32.248 -32.377 -32.627 -32.771 -32.934 -33.088 -33.255 -33.432 -33.632 -34.221 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt deleted file mode 100644 index 8e22aa53..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11514 ,TETRA ,17607076,Sun Nov 28 21:40:32 CET,Sun Nov 28 23:49:47 CET,0.0 0.418 0.569 0.699 0.82 0.928 1.017 1.106 1.256 1.304 1.34 1.39 1.479 1.535 1.638 1.728 1.814 1.856 1.932 1.991 2.067 2.121 2.171 2.242 2.325 2.399 2.449 2.488 2.534 2.569 2.598 2.635 2.67 2.696 2.734 2.777 2.795 2.803 2.804 2.795 2.766 2.698 2.601 2.477 2.281 2.005 1.615 1.08 0.277 -0.919 -2.926 -5.297 -7.171 -8.747 -10.062 -11.178 -12.125 -12.974 -13.683 -14.347 -14.901 -15.416 -15.908 -16.356 -16.767 -17.125 -17.486 -17.804 -18.074 -18.35 -18.637 -18.878 -19.122 -19.375 -19.572 -19.77 -19.975 -20.193 -20.414 -20.56 -20.713 -20.944 -21.082 -21.23 -21.313 -21.481 -21.672 -21.871 -21.966 -22.121 -22.244 -22.343 -22.449 -22.696 -22.813 -22.939 -23.105 -23.276 -23.464 -23.686 -23.98 -2 ,5131 ,TETRA ,17607077,Sun Nov 28 21:40:33 CET,Sun Nov 28 23:50:35 CET,0.0 0.55 0.692 0.826 0.944 1.022 1.091 1.166 1.306 1.369 1.429 1.489 1.571 1.609 1.681 1.746 1.804 1.834 1.896 1.953 2.024 2.056 2.087 2.134 2.179 2.227 2.274 2.313 2.352 2.399 2.451 2.498 2.528 2.548 2.562 2.577 2.585 2.583 2.577 2.553 2.515 2.451 2.316 2.127 1.877 1.562 1.126 0.514 -0.37 -1.678 -3.797 -6.255 -8.195 -9.752 -11.036 -12.125 -13.016 -13.79 -14.454 -15.117 -15.693 -16.206 -16.689 -17.121 -17.511 -17.869 -18.216 -18.52 -18.789 -19.073 -19.368 -19.602 -19.833 -20.069 -20.261 -20.456 -20.648 -20.846 -21.052 -21.197 -21.349 -21.577 -21.731 -21.899 -21.984 -22.147 -22.316 -22.491 -22.585 -22.75 -22.885 -22.975 -23.071 -23.291 -23.41 -23.528 -23.656 -23.78 -23.902 -24.046 -24.381 -3 ,16153 ,TETRA ,17607078,Sun Nov 28 21:40:35 CET,Sun Nov 28 23:52:37 CET,0.0 0.327 0.485 0.618 0.746 0.848 0.931 1.007 1.132 1.186 1.246 1.323 1.413 1.463 1.561 1.651 1.725 1.764 1.839 1.92 2.033 2.099 2.161 2.238 2.317 2.389 2.449 2.501 2.562 2.62 2.678 2.748 2.804 2.851 2.904 2.943 2.96 2.966 2.96 2.943 2.894 2.831 2.775 2.679 2.5 2.262 1.926 1.428 0.632 -0.599 -2.624 -5.003 -6.9 -8.425 -9.683 -10.809 -11.749 -12.543 -13.229 -13.903 -14.466 -14.955 -15.42 -15.861 -16.251 -16.602 -16.966 -17.278 -17.552 -17.832 -18.116 -18.347 -18.581 -18.823 -19.003 -19.18 -19.363 -19.558 -19.768 -19.912 -20.052 -20.268 -20.422 -20.58 -20.655 -20.811 -20.984 -21.175 -21.273 -21.437 -21.58 -21.673 -21.766 -21.993 -22.107 -22.221 -22.347 -22.499 -22.677 -22.91 -23.333 -4 ,31451 ,TETRA ,17607079,Sun Nov 28 21:40:36 CET,Sun Nov 28 23:52:20 CET,0.0 0.49 0.713 0.847 0.937 1.039 1.153 1.233 1.353 1.416 1.479 1.533 1.613 1.672 1.762 1.852 1.95 1.992 2.064 2.124 2.2 2.24 2.278 2.338 2.406 2.47 2.538 2.597 2.652 2.698 2.74 2.787 2.834 2.882 2.917 2.943 2.967 2.99 3.009 3.001 2.959 2.896 2.8 2.653 2.426 2.128 1.725 1.125 0.249 -1.075 -3.177 -5.566 -7.514 -9.136 -10.5 -11.639 -12.592 -13.457 -14.18 -14.871 -15.459 -15.988 -16.487 -16.94 -17.354 -17.729 -18.103 -18.42 -18.695 -18.983 -19.273 -19.51 -19.756 -20.007 -20.197 -20.384 -20.566 -20.756 -20.961 -21.107 -21.258 -21.494 -21.65 -21.804 -21.892 -22.077 -22.253 -22.433 -22.53 -22.686 -22.824 -22.934 -23.05 -23.298 -23.428 -23.571 -23.713 -23.883 -24.088 -24.305 -24.689 -5 ,5471 ,TETRA ,17607080,Sun Nov 28 21:40:32 CET,Sun Nov 28 23:50:00 CET,0.0 0.229 0.378 0.532 0.677 0.813 0.93 1.021 1.143 1.208 1.274 1.346 1.435 1.491 1.586 1.658 1.738 1.777 1.842 1.905 1.997 2.049 2.1 2.182 2.253 2.311 2.366 2.418 2.479 2.54 2.592 2.644 2.691 2.718 2.744 2.77 2.782 2.793 2.795 2.769 2.715 2.66 2.577 2.458 2.278 2.027 1.642 1.058 0.205 -1.037 -3.075 -5.492 -7.368 -8.933 -10.239 -11.344 -12.307 -13.143 -13.827 -14.498 -15.064 -15.561 -16.018 -16.437 -16.828 -17.172 -17.515 -17.826 -18.102 -18.392 -18.67 -18.886 -19.117 -19.358 -19.541 -19.726 -19.929 -20.141 -20.345 -20.48 -20.62 -20.841 -20.999 -21.164 -21.252 -21.446 -21.631 -21.799 -21.894 -22.066 -22.207 -22.305 -22.409 -22.637 -22.756 -22.865 -22.964 -23.076 -23.209 -23.386 -23.726 -6 ,21129 ,TETRA ,17607082,Sun Nov 28 21:40:36 CET,Sun Nov 28 23:49:36 CET,0.0 0.235 0.416 0.554 0.631 0.709 0.78 0.843 0.994 1.058 1.102 1.171 1.264 1.312 1.391 1.451 1.508 1.535 1.584 1.639 1.735 1.797 1.85 1.925 1.994 2.048 2.093 2.14 2.198 2.245 2.287 2.344 2.391 2.418 2.448 2.471 2.485 2.495 2.486 2.456 2.41 2.336 2.208 2.054 1.864 1.598 1.19 0.631 -0.202 -1.48 -3.557 -5.891 -7.733 -9.269 -10.526 -11.64 -12.62 -13.479 -14.185 -14.864 -15.428 -15.918 -16.377 -16.79 -17.17 -17.524 -17.893 -18.217 -18.488 -18.759 -19.034 -19.263 -19.494 -19.727 -19.911 -20.096 -20.277 -20.459 -20.649 -20.779 -20.911 -21.11 -21.249 -21.406 -21.486 -21.657 -21.829 -21.994 -22.083 -22.233 -22.35 -22.435 -22.535 -22.784 -22.896 -23.008 -23.152 -23.31 -23.459 -23.611 -23.883 -7 ,9697 ,TETRA ,17607083,Sun Nov 28 21:40:32 CET,Sun Nov 28 23:49:53 CET,0.0 0.704 0.935 1.082 1.216 1.327 1.408 1.471 1.634 1.709 1.773 1.851 1.934 1.98 2.057 2.12 2.192 2.229 2.303 2.379 2.477 2.535 2.593 2.676 2.745 2.8 2.862 2.923 2.986 3.045 3.093 3.143 3.18 3.204 3.229 3.265 3.291 3.304 3.312 3.305 3.275 3.215 3.123 2.982 2.778 2.528 2.137 1.569 0.716 -0.612 -2.759 -5.162 -7.084 -8.678 -9.979 -11.097 -12.04 -12.88 -13.601 -14.285 -14.85 -15.353 -15.836 -16.288 -16.684 -17.033 -17.384 -17.694 -17.975 -18.261 -18.547 -18.782 -19.017 -19.256 -19.443 -19.633 -19.821 -20.016 -20.228 -20.37 -20.514 -20.729 -20.878 -21.043 -21.126 -21.297 -21.466 -21.643 -21.744 -21.902 -22.049 -22.159 -22.255 -22.446 -22.544 -22.654 -22.786 -22.933 -23.078 -23.236 -23.607 -8 ,22191 ,TETRA ,17607084,Sun Nov 28 21:40:33 CET,Sun Nov 28 23:49:45 CET,0.0 0.606 0.782 0.886 0.954 1.024 1.113 1.196 1.335 1.391 1.447 1.524 1.613 1.662 1.775 1.875 1.95 1.978 2.03 2.095 2.182 2.233 2.276 2.325 2.382 2.437 2.484 2.519 2.563 2.596 2.61 2.64 2.679 2.708 2.729 2.748 2.773 2.803 2.814 2.817 2.796 2.735 2.654 2.543 2.364 2.109 1.725 1.175 0.326 -0.97 -3.015 -5.332 -7.198 -8.763 -10.071 -11.169 -12.105 -12.954 -13.647 -14.327 -14.906 -15.41 -15.903 -16.353 -16.756 -17.11 -17.471 -17.785 -18.052 -18.335 -18.621 -18.857 -19.089 -19.312 -19.492 -19.683 -19.871 -20.064 -20.257 -20.386 -20.529 -20.752 -20.895 -21.047 -21.127 -21.281 -21.438 -21.6 -21.688 -21.833 -21.93 -22.016 -22.112 -22.312 -22.431 -22.563 -22.695 -22.835 -22.967 -23.101 -23.301 -9 ,16609 ,TETRA ,17607085,Sun Nov 28 21:40:33 CET,Sun Nov 28 23:53:32 CET,0.0 0.352 0.508 0.624 0.72 0.798 0.87 0.939 1.099 1.174 1.246 1.325 1.411 1.458 1.547 1.632 1.701 1.731 1.794 1.852 1.935 1.983 2.034 2.115 2.184 2.233 2.277 2.322 2.376 2.424 2.464 2.504 2.529 2.561 2.609 2.639 2.651 2.646 2.635 2.601 2.547 2.498 2.427 2.316 2.121 1.831 1.412 0.819 0.003 -1.25 -3.415 -5.862 -7.777 -9.425 -10.807 -11.982 -12.928 -13.726 -14.424 -15.116 -15.7 -16.212 -16.674 -17.089 -17.464 -17.805 -18.158 -18.469 -18.751 -19.052 -19.356 -19.593 -19.839 -20.104 -20.289 -20.462 -20.654 -20.874 -21.104 -21.252 -21.397 -21.624 -21.779 -21.936 -22.022 -22.194 -22.379 -22.577 -22.666 -22.808 -22.942 -23.047 -23.159 -23.39 -23.511 -23.649 -23.778 -23.923 -24.089 -24.318 -24.896 -10 ,4183 ,TETRA ,17607086,Sun Nov 28 21:40:35 CET,Sun Nov 28 23:53:25 CET,0.0 0.356 0.538 0.713 0.874 0.976 1.065 1.141 1.273 1.34 1.395 1.451 1.54 1.586 1.682 1.774 1.844 1.88 1.956 2.023 2.114 2.182 2.241 2.314 2.39 2.458 2.513 2.557 2.604 2.644 2.688 2.736 2.772 2.8 2.822 2.838 2.849 2.861 2.863 2.835 2.792 2.734 2.621 2.474 2.277 1.99 1.561 0.975 0.158 -1.073 -3.135 -5.486 -7.322 -8.867 -10.18 -11.309 -12.259 -13.067 -13.731 -14.391 -14.948 -15.436 -15.905 -16.347 -16.747 -17.098 -17.443 -17.756 -18.035 -18.32 -18.616 -18.864 -19.103 -19.362 -19.577 -19.793 -20.01 -20.219 -20.414 -20.552 -20.699 -20.938 -21.105 -21.267 -21.346 -21.52 -21.696 -21.877 -21.975 -22.142 -22.277 -22.372 -22.482 -22.701 -22.803 -22.924 -23.062 -23.194 -23.342 -23.507 -23.895 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index a8a5590d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,13628 ,TETRA ,17607089,Sun Nov 28 21:40:33 CET,Mon Nov 29 00:06:27 CET,0.0 2.803 3.377 3.8 4.173 4.49 4.766 5.016 5.475 5.69 5.894 6.153 6.458 6.656 7.021 7.335 7.653 7.804 8.064 8.294 8.64 8.865 9.079 9.399 9.707 9.993 10.252 10.5 10.827 11.149 11.474 11.851 12.208 12.554 12.943 13.391 13.819 14.279 14.763 15.241 15.736 16.287 16.953 17.633 18.369 19.188 20.102 21.024 21.999 22.967 23.594 23.624 23.32 22.816 22.184 21.476 20.817 20.151 19.493 18.815 18.262 17.801 17.346 16.854 16.345 15.869 15.375 14.908 14.476 14.037 13.582 13.2 12.791 12.363 12.023 11.663 11.299 10.922 10.534 10.274 10.007 9.595 9.295 8.974 8.813 8.453 8.059 7.67 7.471 7.121 6.793 6.572 6.356 5.846 5.545 5.212 4.865 4.487 3.965 3.266 -0.355 -5 ,23930 ,TETRA ,17607091,Sun Nov 28 21:40:36 CET,Mon Nov 29 00:04:30 CET,0.0 3.543 4.185 4.672 5.06 5.394 5.711 5.987 6.461 6.692 6.92 7.225 7.536 7.703 8.033 8.348 8.648 8.795 9.076 9.342 9.716 9.951 10.194 10.545 10.852 11.139 11.418 11.697 12.069 12.429 12.769 13.169 13.547 13.91 14.33 14.815 15.31 15.839 16.393 16.995 17.621 18.298 19.081 19.892 20.807 21.744 22.768 23.938 25.079 26.072 26.944 26.858 26.249 25.596 24.883 24.121 23.441 22.815 22.249 21.612 21.031 20.507 19.922 19.319 18.778 18.293 17.748 17.267 16.875 16.441 15.972 15.596 15.186 14.718 14.366 14.007 13.629 13.252 12.849 12.547 12.239 11.782 11.449 11.096 10.923 10.568 10.194 9.817 9.62 9.266 8.912 8.655 8.387 7.847 7.556 7.213 6.82 6.417 5.895 5.212 nan -6 ,14918 ,TETRA ,17607092,Sun Nov 28 21:40:37 CET,Mon Nov 29 00:03:55 CET,0.0 1.051 1.554 1.959 2.264 2.567 2.856 3.082 3.446 3.62 3.797 4.007 4.289 4.457 4.739 4.99 5.238 5.357 5.596 5.831 6.16 6.37 6.575 6.872 7.155 7.426 7.688 7.938 8.237 8.522 8.796 9.108 9.412 9.72 10.082 10.468 10.821 11.203 11.59 11.983 12.4 12.829 13.306 13.767 14.259 14.768 15.316 15.955 16.593 17.097 17.211 16.537 15.722 14.896 14.067 13.308 12.576 11.867 11.263 10.654 10.063 9.508 8.984 8.494 8.047 7.615 7.142 6.706 6.334 5.952 5.521 5.153 4.789 4.393 4.078 3.749 3.384 3.021 2.606 2.285 1.988 1.543 1.221 0.873 0.691 0.333 -0.053 -0.481 -0.697 -1.048 -1.393 -1.648 -1.929 -2.564 -2.922 -3.286 -3.676 -4.177 -4.737 -5.531 -15.999 -9 ,9065 ,TETRA ,17607095,Sun Nov 28 21:40:36 CET,Mon Nov 29 00:02:34 CET,0.0 6.057 6.676 7.057 7.436 7.761 8.045 8.296 8.724 8.933 9.136 9.398 9.679 9.831 10.132 10.418 10.665 10.774 10.994 11.193 11.485 11.695 11.904 12.203 12.482 12.744 12.997 13.223 13.533 13.827 14.105 14.471 14.795 15.102 15.462 15.831 16.192 16.59 16.98 17.392 17.814 18.313 18.951 19.498 20.061 20.714 21.456 22.194 23.068 24.047 24.806 24.866 24.465 23.928 23.285 22.607 21.938 21.316 20.802 20.266 19.764 19.296 18.819 18.3 17.719 17.144 16.552 16.033 15.569 15.071 14.584 14.191 13.773 13.338 12.993 12.625 12.259 11.891 11.482 11.189 10.894 10.436 10.106 9.755 9.57 9.201 8.827 8.406 8.187 7.835 7.495 7.236 6.952 6.391 6.111 5.764 5.326 4.811 4.202 3.319 -0.504 -10 ,11212 ,TETRA ,17607096,Sun Nov 28 21:40:35 CET,Mon Nov 29 00:02:02 CET,0.0 1.954 2.366 2.749 3.093 3.418 3.722 3.993 4.464 4.659 4.853 5.122 5.418 5.588 5.929 6.251 6.548 6.687 6.949 7.211 7.581 7.803 8.02 8.337 8.64 8.942 9.241 9.542 9.92 10.255 10.578 10.977 11.367 11.768 12.208 12.671 13.135 13.627 14.13 14.648 15.2 15.829 16.581 17.313 18.147 19.071 20.059 21.071 22.122 23.168 23.921 23.894 23.492 22.995 22.459 21.923 21.393 20.886 20.401 19.859 19.3 18.743 18.281 17.827 17.343 16.917 16.486 16.066 15.678 15.277 14.868 14.531 14.162 13.761 13.451 13.143 12.823 12.484 12.136 11.858 11.558 11.082 10.738 10.403 10.232 9.859 9.476 9.077 8.874 8.528 8.156 7.901 7.657 7.113 6.798 6.453 6.058 5.579 4.994 4.21 -3.155 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index 4bf3ad3d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7555 ,TETRA ,17607097,Sun Nov 28 21:40:35 CET,Mon Nov 29 00:10:07 CET,0.0 0.922 1.346 1.643 1.918 2.133 2.321 2.519 2.847 2.991 3.138 3.289 3.542 3.681 3.934 4.172 4.385 4.482 4.676 4.864 5.141 5.332 5.513 5.761 6.011 6.266 6.518 6.734 7.003 7.294 7.569 7.891 8.214 8.537 8.904 9.292 9.654 10.049 10.491 10.957 11.46 12.05 12.722 13.373 14.143 15.013 15.947 17.007 18.18 19.375 20.745 21.564 21.652 21.455 21.176 20.848 20.53 20.202 19.895 19.559 19.229 18.932 18.647 18.371 18.107 17.863 17.599 17.356 17.145 16.929 16.714 16.542 16.352 16.146 15.991 15.842 15.681 15.512 15.324 15.18 15.032 14.803 14.649 14.489 14.407 14.243 14.064 13.871 13.778 13.571 13.415 13.27 13.129 12.808 12.62 12.422 12.219 11.969 11.648 11.183 9.848 -2 ,27733 ,TETRA ,17607098,Sun Nov 28 21:40:36 CET,Mon Nov 29 00:09:24 CET,0.0 1.081 1.53 1.884 2.19 2.472 2.731 2.97 3.4 3.591 3.781 4.008 4.285 4.429 4.707 4.944 5.15 5.249 5.438 5.618 5.875 6.05 6.228 6.482 6.729 6.961 7.178 7.39 7.659 7.922 8.167 8.451 8.745 9.043 9.377 9.727 10.06 10.424 10.808 11.23 11.671 12.164 12.733 13.306 13.989 14.743 15.576 16.484 17.481 18.565 19.744 20.34 20.386 20.279 20.093 19.866 19.613 19.339 19.06 18.771 18.497 18.234 18.008 17.786 17.555 17.344 17.115 16.897 16.7 16.486 16.251 16.054 15.851 15.632 15.449 15.263 15.094 14.892 14.644 14.475 14.302 14.04 13.862 13.685 13.587 13.366 13.153 12.952 12.845 12.614 12.453 12.308 12.16 11.839 11.663 11.476 11.272 11.059 10.831 10.484 9.189 -3 ,30577 ,TETRA ,17607099,Sun Nov 28 21:40:39 CET,Mon Nov 29 00:05:18 CET,0.0 1.412 1.772 2.086 2.339 2.532 2.713 2.887 3.182 3.313 3.441 3.572 3.816 3.941 4.177 4.409 4.642 4.751 4.959 5.154 5.435 5.618 5.804 6.06 6.287 6.505 6.713 6.913 7.178 7.439 7.688 7.993 8.285 8.569 8.892 9.227 9.551 9.925 10.334 10.762 11.215 11.764 12.464 13.173 13.966 14.812 15.784 16.839 17.941 19.103 20.256 20.846 20.885 20.691 20.45 20.145 19.847 19.564 19.265 18.882 18.516 18.198 17.887 17.589 17.313 17.053 16.763 16.507 16.307 16.098 15.877 15.696 15.516 15.344 15.203 15.051 14.896 14.736 14.56 14.433 14.303 14.077 13.906 13.736 13.663 13.521 13.359 13.186 13.09 12.864 12.675 12.536 12.397 12.055 11.857 11.64 11.431 11.154 10.753 10.27 8.695 -4 ,3596 ,TETRA ,17607100,Sun Nov 28 21:40:40 CET,Mon Nov 29 00:05:39 CET,0.0 0.8 1.154 1.395 1.593 1.766 1.932 2.083 2.385 2.534 2.668 2.796 3.034 3.158 3.403 3.636 3.856 3.962 4.172 4.383 4.707 4.91 5.104 5.388 5.653 5.916 6.16 6.379 6.639 6.894 7.159 7.489 7.811 8.113 8.459 8.871 9.284 9.738 10.227 10.725 11.248 11.832 12.478 13.099 13.844 14.675 15.562 16.543 17.709 18.938 20.099 20.779 20.917 20.823 20.604 20.324 20.041 19.743 19.454 19.117 18.82 18.546 18.279 18.029 17.772 17.524 17.275 17.06 16.858 16.636 16.395 16.205 16.015 15.794 15.625 15.453 15.269 15.091 14.915 14.789 14.643 14.409 14.26 14.108 14.028 13.872 13.705 13.501 13.394 13.185 13.094 12.973 12.836 12.551 12.411 12.25 12.07 11.861 11.552 11.053 9.692 -5 ,31518 ,TETRA ,17607101,Sun Nov 28 21:40:35 CET,Mon Nov 29 00:03:54 CET,0.0 0.842 1.177 1.485 1.73 1.921 2.102 2.284 2.633 2.785 2.917 3.03 3.266 3.389 3.623 3.841 4.065 4.175 4.385 4.581 4.87 5.051 5.234 5.535 5.811 6.046 6.273 6.49 6.77 7.042 7.291 7.567 7.853 8.158 8.5 8.892 9.271 9.679 10.106 10.557 11.052 11.6 12.209 12.835 13.544 14.298 15.157 16.082 17.15 18.329 19.545 20.14 20.198 20.063 19.82 19.516 19.25 18.928 18.607 18.322 18.054 17.794 17.534 17.264 17.003 16.788 16.558 16.322 16.124 15.928 15.716 15.515 15.291 15.072 14.897 14.705 14.496 14.28 14.047 13.869 13.687 13.419 13.239 13.043 12.946 12.737 12.529 12.303 12.18 11.947 11.806 11.671 11.519 11.182 11.005 10.808 10.591 10.352 10.027 9.604 7.847 -6 ,3167 ,TETRA ,17607102,Sun Nov 28 21:40:35 CET,Mon Nov 29 00:04:01 CET,0.0 1.739 2.191 2.538 2.8 3.035 3.263 3.441 3.755 3.914 4.057 4.192 4.435 4.569 4.798 4.986 5.171 5.273 5.494 5.706 6.025 6.238 6.447 6.739 6.989 7.226 7.469 7.697 7.982 8.257 8.529 8.871 9.213 9.545 9.935 10.387 10.789 11.169 11.562 12.006 12.49 13.054 13.702 14.336 15.048 15.822 16.707 17.664 18.727 19.986 21.32 22.028 22.265 22.267 22.088 21.864 21.6 21.298 21.003 20.677 20.375 20.061 19.735 19.435 19.173 18.933 18.67 18.42 18.199 17.973 17.741 17.546 17.328 17.106 16.95 16.785 16.606 16.418 16.223 16.085 15.936 15.695 15.526 15.361 15.279 15.12 14.958 14.76 14.652 14.431 14.291 14.15 13.996 13.697 13.547 13.387 13.205 12.964 12.697 12.375 11.684 -7 ,25600 ,TETRA ,17607103,Sun Nov 28 21:40:38 CET,Mon Nov 29 00:04:25 CET,0.0 0.965 1.36 1.663 1.9 2.137 2.33 2.496 2.816 2.969 3.12 3.26 3.502 3.625 3.857 4.071 4.277 4.378 4.572 4.753 5.015 5.18 5.347 5.597 5.827 6.047 6.269 6.495 6.798 7.092 7.36 7.668 7.952 8.232 8.561 8.918 9.26 9.623 10.029 10.48 10.948 11.453 12.035 12.604 13.246 13.991 14.83 15.715 16.696 17.717 18.761 19.387 19.502 19.406 19.184 18.908 18.64 18.364 18.096 17.82 17.584 17.362 17.138 16.915 16.697 16.487 16.266 16.075 15.898 15.689 15.465 15.267 15.044 14.808 14.636 14.464 14.262 14.051 13.831 13.681 13.53 13.277 13.1 12.915 12.821 12.623 12.417 12.184 12.057 11.825 11.674 11.529 11.371 11.045 10.863 10.659 10.445 10.194 9.909 9.512 8.163 -8 ,7481 ,TETRA ,17607104,Sun Nov 28 21:40:40 CET,Mon Nov 29 00:03:54 CET,0.0 0.894 1.218 1.494 1.754 2.005 2.232 2.427 2.806 2.981 3.135 3.311 3.572 3.712 3.988 4.248 4.496 4.608 4.805 5.0 5.304 5.501 5.69 5.975 6.245 6.494 6.73 6.958 7.26 7.543 7.799 8.124 8.486 8.831 9.21 9.642 10.056 10.523 11.026 11.556 12.096 12.701 13.363 14.036 14.862 15.762 16.792 17.913 19.049 20.111 21.284 22.025 22.154 22.023 21.739 21.413 21.089 20.747 20.432 20.109 19.805 19.493 19.198 18.941 18.679 18.421 18.164 17.933 17.702 17.442 17.179 16.966 16.751 16.526 16.351 16.18 15.995 15.79 15.565 15.408 15.237 14.936 14.73 14.53 14.421 14.185 13.938 13.675 13.547 13.318 13.139 12.985 12.837 12.494 12.299 12.098 11.889 11.668 11.415 11.086 9.902 -9 ,9155 ,TETRA ,17607105,Sun Nov 28 21:40:36 CET,Mon Nov 29 00:03:50 CET,0.0 1.363 1.726 1.979 2.204 2.425 2.64 2.828 3.144 3.28 3.427 3.609 3.869 3.997 4.239 4.469 4.687 4.787 4.98 5.164 5.441 5.634 5.811 6.056 6.306 6.537 6.753 6.979 7.281 7.563 7.85 8.195 8.509 8.813 9.162 9.546 9.913 10.329 10.782 11.252 11.755 12.332 12.982 13.625 14.386 15.245 16.209 17.309 18.589 19.925 21.259 21.91 21.938 21.77 21.559 21.29 21.017 20.741 20.443 20.11 19.786 19.495 19.223 18.964 18.713 18.486 18.239 17.987 17.785 17.57 17.321 17.115 16.913 16.723 16.577 16.423 16.26 16.077 15.865 15.726 15.587 15.36 15.204 15.033 14.945 14.767 14.575 14.37 14.267 14.052 13.943 13.825 13.694 13.401 13.233 13.033 12.819 12.591 12.326 11.968 10.721 -10 ,5696 ,TETRA ,17607106,Sun Nov 28 21:40:39 CET,Mon Nov 29 00:03:19 CET,0.0 1.002 1.41 1.67 1.89 2.107 2.301 2.479 2.84 3.0 3.142 3.282 3.509 3.618 3.835 4.055 4.281 4.399 4.636 4.866 5.186 5.383 5.579 5.852 6.095 6.33 6.552 6.764 7.026 7.277 7.534 7.849 8.141 8.422 8.751 9.119 9.473 9.877 10.329 10.797 11.293 11.839 12.47 13.104 13.858 14.702 15.653 16.71 17.89 19.256 20.644 21.397 21.611 21.556 21.313 21.012 20.718 20.389 20.061 19.702 19.402 19.165 18.949 18.713 18.433 18.155 17.874 17.66 17.496 17.329 17.148 16.981 16.791 16.583 16.433 16.295 16.145 15.992 15.838 15.724 15.587 15.364 15.211 15.031 14.936 14.737 14.538 14.352 14.25 14.029 13.906 13.777 13.636 13.321 13.163 13.004 12.829 12.651 12.45 12.193 11.511 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index 26b4f945..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31172 ,TETRA ,17607107,Sun Nov 28 21:40:36 CET,Mon Nov 29 00:03:56 CET,0.0 0.421 0.634 0.807 0.965 1.107 1.248 1.384 1.62 1.717 1.792 1.822 2.01 2.077 2.199 2.313 2.436 2.494 2.606 2.704 2.854 2.964 3.06 3.215 3.373 3.515 3.646 3.762 3.903 4.027 4.138 4.272 4.398 4.51 4.628 4.742 4.844 4.958 5.073 5.194 5.317 5.429 5.551 5.668 5.752 5.776 5.714 5.524 5.105 4.356 2.924 0.939 -0.765 -2.242 -3.474 -4.584 -5.563 -6.444 -7.197 -7.949 -8.617 -9.211 -9.791 -10.366 -10.899 -11.375 -11.868 -12.305 -12.675 -13.044 -13.432 -13.747 -14.06 -14.393 -14.663 -14.945 -15.218 -15.493 -15.791 -16.007 -16.227 -16.546 -16.765 -16.996 -17.124 -17.382 -17.619 -17.889 -18.043 -18.327 -18.486 -18.652 -18.825 -19.168 -19.346 -19.542 -19.767 -20.017 -20.304 -20.652 -21.501 -2 ,27668 ,TETRA ,17607108,Sun Nov 28 21:41:01 CET,Mon Nov 29 00:04:07 CET,0.0 0.486 0.753 0.96 1.121 1.246 1.359 1.474 1.687 1.77 1.85 1.882 2.068 2.137 2.279 2.399 2.507 2.563 2.666 2.767 2.92 3.024 3.13 3.277 3.408 3.525 3.628 3.725 3.854 3.985 4.107 4.244 4.362 4.464 4.581 4.714 4.838 4.966 5.092 5.204 5.31 5.429 5.541 5.611 5.644 5.657 5.595 5.393 5.002 4.289 2.91 1.06 -0.54 -1.909 -3.091 -4.18 -5.152 -6.022 -6.758 -7.481 -8.126 -8.71 -9.25 -9.771 -10.275 -10.71 -11.157 -11.567 -11.906 -12.242 -12.605 -12.895 -13.165 -13.447 -13.667 -13.907 -14.161 -14.413 -14.68 -14.856 -15.036 -15.329 -15.544 -15.774 -15.884 -16.102 -16.334 -16.592 -16.726 -17.001 -17.179 -17.35 -17.508 -17.836 -18.033 -18.248 -18.464 -18.69 -18.944 -19.268 -19.877 -3 ,30620 ,TETRA ,17607109,Sun Nov 28 21:41:02 CET,Mon Nov 29 00:06:58 CET,0.0 0.398 0.614 0.783 0.95 1.11 1.239 1.356 1.576 1.67 1.767 1.854 2.073 2.173 2.36 2.524 2.659 2.716 2.818 2.925 3.078 3.176 3.281 3.432 3.564 3.676 3.779 3.877 3.997 4.115 4.24 4.374 4.5 4.629 4.766 4.904 5.037 5.187 5.337 5.478 5.617 5.731 5.805 5.856 5.879 5.887 5.815 5.58 5.161 4.449 3.041 1.258 -0.238 -1.61 -2.884 -4.043 -5.087 -6.022 -6.794 -7.538 -8.177 -8.784 -9.334 -9.82 -10.283 -10.705 -11.15 -11.555 -11.897 -12.261 -12.636 -12.934 -13.25 -13.568 -13.809 -14.062 -14.312 -14.58 -14.879 -15.087 -15.296 -15.618 -15.838 -16.042 -16.142 -16.368 -16.629 -16.907 -17.057 -17.349 -17.535 -17.712 -17.89 -18.251 -18.455 -18.687 -18.943 -19.217 -19.533 -19.966 -20.962 -4 ,12408 ,TETRA ,17607110,Sun Nov 28 21:41:03 CET,Mon Nov 29 00:06:58 CET,0.0 0.334 0.528 0.674 0.783 0.889 1.002 1.112 1.31 1.389 1.468 1.508 1.699 1.771 1.905 2.025 2.141 2.201 2.313 2.412 2.563 2.661 2.76 2.899 3.023 3.138 3.249 3.353 3.478 3.606 3.738 3.887 4.009 4.125 4.261 4.4 4.518 4.659 4.829 4.989 5.148 5.316 5.473 5.595 5.683 5.711 5.626 5.479 5.15 4.366 2.846 0.841 -0.89 -2.366 -3.617 -4.717 -5.734 -6.703 -7.532 -8.34 -9.039 -9.629 -10.169 -10.699 -11.206 -11.669 -12.144 -12.548 -12.878 -13.213 -13.578 -13.905 -14.252 -14.592 -14.844 -15.11 -15.387 -15.656 -15.933 -16.132 -16.335 -16.671 -16.9 -17.14 -17.275 -17.55 -17.822 -18.1 -18.246 -18.544 -18.741 -18.912 -19.109 -19.518 -19.724 -19.948 -20.187 -20.466 -20.805 -21.215 -22.225 -5 ,231 ,TETRA ,17607111,Sun Nov 28 21:41:06 CET,Mon Nov 29 00:04:36 CET,0.0 0.41 0.614 0.785 0.945 1.079 1.182 1.282 1.494 1.587 1.668 1.704 1.898 1.97 2.113 2.246 2.372 2.433 2.55 2.658 2.818 2.924 3.01 3.121 3.244 3.365 3.478 3.6 3.77 3.916 4.041 4.181 4.301 4.419 4.57 4.74 4.891 5.03 5.172 5.312 5.444 5.588 5.713 5.816 5.898 5.877 5.753 5.502 5.123 4.476 3.074 1.103 -0.596 -2.055 -3.285 -4.364 -5.326 -6.184 -6.928 -7.687 -8.354 -8.919 -9.445 -9.954 -10.442 -10.882 -11.33 -11.75 -12.121 -12.473 -12.829 -13.153 -13.495 -13.835 -14.102 -14.392 -14.702 -15.006 -15.308 -15.524 -15.752 -16.097 -16.321 -16.569 -16.699 -16.953 -17.214 -17.502 -17.658 -17.959 -18.118 -18.283 -18.478 -18.906 -19.146 -19.407 -19.671 -19.945 -20.243 -20.597 -21.303 -6 ,6041 ,TETRA ,17607112,Sun Nov 28 21:41:08 CET,Mon Nov 29 00:04:59 CET,0.0 0.281 0.49 0.69 0.836 0.95 1.074 1.196 1.389 1.48 1.567 1.595 1.781 1.847 1.995 2.134 2.263 2.327 2.448 2.559 2.723 2.829 2.931 3.084 3.226 3.357 3.482 3.594 3.738 3.864 3.965 4.08 4.19 4.298 4.419 4.554 4.694 4.829 4.949 5.082 5.211 5.324 5.435 5.532 5.622 5.683 5.672 5.534 5.194 4.553 3.198 1.306 -0.354 -1.788 -3.073 -4.275 -5.411 -6.413 -7.18 -7.943 -8.602 -9.198 -9.746 -10.231 -10.678 -11.091 -11.52 -11.892 -12.218 -12.562 -12.923 -13.248 -13.606 -13.96 -14.217 -14.481 -14.753 -15.021 -15.304 -15.511 -15.732 -16.085 -16.326 -16.563 -16.686 -16.959 -17.225 -17.485 -17.63 -17.92 -18.084 -18.237 -18.385 -18.727 -18.937 -19.137 -19.342 -19.626 -19.916 -20.251 -20.987 -7 ,30922 ,TETRA ,17607113,Sun Nov 28 21:41:02 CET,Mon Nov 29 00:05:25 CET,0.0 0.667 0.932 1.14 1.323 1.473 1.587 1.712 1.961 2.06 2.152 2.19 2.378 2.45 2.584 2.714 2.859 2.924 3.033 3.15 3.325 3.436 3.546 3.702 3.84 3.971 4.101 4.212 4.341 4.458 4.567 4.704 4.833 4.96 5.102 5.247 5.374 5.496 5.623 5.758 5.884 5.988 6.084 6.168 6.216 6.238 6.216 6.087 5.748 5.039 3.612 1.715 0.039 -1.426 -2.659 -3.729 -4.656 -5.521 -6.272 -6.985 -7.584 -8.124 -8.638 -9.143 -9.615 -10.053 -10.506 -10.888 -11.218 -11.557 -11.929 -12.243 -12.545 -12.852 -13.101 -13.378 -13.653 -13.915 -14.2 -14.418 -14.642 -14.957 -15.173 -15.398 -15.511 -15.755 -16.018 -16.291 -16.431 -16.729 -16.95 -17.125 -17.286 -17.635 -17.828 -18.053 -18.334 -18.625 -18.926 -19.3 -19.957 -8 ,24110 ,TETRA ,17607114,Sun Nov 28 21:41:03 CET,Mon Nov 29 00:06:18 CET,0.0 0.425 0.594 0.773 0.932 1.064 1.175 1.284 1.518 1.63 1.73 1.764 1.947 2.01 2.142 2.271 2.379 2.434 2.547 2.657 2.815 2.916 3.013 3.148 3.275 3.403 3.532 3.641 3.778 3.908 4.039 4.211 4.368 4.498 4.641 4.801 4.939 5.094 5.239 5.352 5.455 5.589 5.744 5.839 5.91 5.953 5.9 5.722 5.36 4.665 3.309 1.448 -0.172 -1.637 -2.924 -4.047 -5.027 -5.898 -6.64 -7.386 -8.028 -8.609 -9.149 -9.652 -10.139 -10.565 -11.007 -11.414 -11.777 -12.172 -12.589 -12.914 -13.246 -13.601 -13.864 -14.109 -14.364 -14.643 -14.936 -15.135 -15.333 -15.64 -15.851 -16.074 -16.19 -16.434 -16.683 -16.958 -17.111 -17.391 -17.545 -17.698 -17.86 -18.202 -18.393 -18.603 -18.83 -19.094 -19.378 -19.737 -20.423 -9 ,26651 ,TETRA ,17607115,Sun Nov 28 21:41:05 CET,Mon Nov 29 00:06:28 CET,0.0 0.249 0.438 0.578 0.703 0.812 0.925 1.02 1.201 1.307 1.404 1.445 1.64 1.721 1.871 2.003 2.135 2.192 2.288 2.389 2.545 2.633 2.718 2.857 2.983 3.103 3.223 3.336 3.458 3.559 3.678 3.826 3.949 4.062 4.196 4.344 4.463 4.584 4.726 4.872 5.008 5.137 5.264 5.369 5.449 5.461 5.355 5.174 4.864 4.151 2.701 0.885 -0.679 -2.092 -3.323 -4.416 -5.355 -6.179 -6.902 -7.668 -8.299 -8.832 -9.349 -9.866 -10.346 -10.763 -11.193 -11.561 -11.88 -12.212 -12.547 -12.833 -13.139 -13.447 -13.689 -13.953 -14.23 -14.517 -14.826 -15.062 -15.297 -15.622 -15.859 -16.102 -16.224 -16.471 -16.714 -16.988 -17.136 -17.418 -17.591 -17.752 -17.901 -18.218 -18.402 -18.596 -18.858 -19.189 -19.557 -19.971 -20.52 -10 ,22639 ,TETRA ,17607116,Sun Nov 28 21:41:07 CET,Mon Nov 29 00:06:32 CET,0.0 0.339 0.572 0.746 0.895 1.009 1.114 1.215 1.385 1.462 1.547 1.604 1.798 1.856 1.976 2.09 2.203 2.26 2.362 2.469 2.621 2.711 2.799 2.916 3.029 3.147 3.255 3.352 3.484 3.604 3.728 3.88 4.009 4.125 4.25 4.383 4.502 4.624 4.751 4.886 5.02 5.164 5.293 5.385 5.484 5.529 5.48 5.299 4.909 4.188 2.75 0.752 -0.986 -2.436 -3.653 -4.806 -5.802 -6.699 -7.49 -8.255 -8.921 -9.529 -10.091 -10.62 -11.115 -11.544 -11.97 -12.36 -12.707 -13.065 -13.437 -13.737 -14.032 -14.329 -14.568 -14.818 -15.089 -15.379 -15.673 -15.874 -16.091 -16.432 -16.676 -16.934 -17.055 -17.289 -17.554 -17.848 -17.984 -18.259 -18.398 -18.546 -18.704 -19.067 -19.27 -19.47 -19.678 -19.915 -20.206 -20.558 -21.451 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index 49010b86..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14474 ,KEBNE ,17027752,Wed Dec 22 17:46:12 CET,Wed Dec 22 19:47:11 CET,0.0 1.832 2.344 2.767 3.131 3.46 3.763 4.02 4.476 4.693 4.887 5.148 5.445 5.621 5.961 6.269 6.554 6.699 6.975 7.225 7.564 7.787 8.004 8.332 8.636 8.916 9.194 9.452 9.783 10.109 10.422 10.777 11.106 11.41 11.757 12.157 12.535 12.938 13.366 13.832 14.334 14.899 15.516 16.082 16.684 17.307 17.9 18.448 19.047 19.459 19.219 18.188 16.982 15.688 14.522 13.458 12.458 11.521 10.632 9.67 8.842 8.117 7.42 6.746 6.137 5.614 5.066 4.612 4.219 3.769 3.292 2.896 2.486 2.054 1.704 1.315 0.911 0.496 0.049 -0.242 -0.529 -1.013 -1.345 -1.66 -1.828 -2.2 -2.618 -3.067 -3.29 -3.665 -4.047 -4.283 -4.554 -5.202 -5.553 -5.95 -6.376 -6.824 -7.36 -8.051 -10.844 -2 ,4005 ,KEBNE ,17027753,Wed Dec 22 17:46:12 CET,Wed Dec 22 19:46:50 CET,0.0 1.105 1.585 1.974 2.296 2.581 2.855 3.1 3.516 3.71 3.902 4.179 4.469 4.629 4.931 5.214 5.486 5.627 5.894 6.137 6.481 6.691 6.897 7.209 7.502 7.797 8.09 8.368 8.712 9.046 9.375 9.757 10.125 10.477 10.866 11.25 11.605 12.024 12.448 12.877 13.318 13.747 14.22 14.703 15.237 15.828 16.457 17.052 17.591 17.893 17.528 16.579 15.464 14.267 13.217 12.203 11.217 10.278 9.489 8.697 8.014 7.437 6.878 6.348 5.829 5.267 4.643 4.115 3.658 3.2 2.737 2.348 1.937 1.521 1.199 0.832 0.455 0.076 -0.352 -0.656 -0.974 -1.471 -1.801 -2.131 -2.302 -2.68 -3.089 -3.54 -3.783 -4.158 -4.56 -4.83 -5.1 -5.717 -6.09 -6.52 -6.962 -7.428 -8.044 -9.005 -12.831 -3 ,13366 ,KEBNE ,17027754,Wed Dec 22 17:46:16 CET,Wed Dec 22 19:59:42 CET,0.0 1.165 1.768 2.161 2.45 2.731 3.007 3.238 3.602 3.786 3.974 4.217 4.508 4.69 5.016 5.301 5.567 5.693 5.937 6.174 6.511 6.731 6.937 7.214 7.49 7.765 8.033 8.298 8.646 8.97 9.273 9.66 10.03 10.356 10.722 11.16 11.593 12.049 12.515 13.004 13.504 14.023 14.591 15.145 15.758 16.404 17.058 17.647 18.173 18.518 18.316 17.08 15.515 14.244 13.176 12.109 11.141 10.263 9.45 8.629 7.861 7.135 6.492 5.901 5.33 4.781 4.2 3.703 3.272 2.819 2.312 1.862 1.426 1.005 0.68 0.357 0.009 -0.375 -0.777 -1.043 -1.328 -1.793 -2.117 -2.458 -2.625 -2.976 -3.369 -3.792 -4.008 -4.35 -4.674 -4.919 -5.188 -5.838 -6.207 -6.579 -6.958 -7.351 -7.821 -8.495 -11.87 -5 ,27347 ,KEBNE ,17027756,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 19:57:21 CET,0.0 1.157 1.547 1.885 2.215 2.458 2.666 2.873 3.286 3.499 3.684 3.887 4.161 4.322 4.64 4.957 5.273 5.42 5.678 5.911 6.259 6.486 6.719 7.05 7.358 7.667 7.971 8.249 8.592 8.918 9.237 9.603 9.929 10.234 10.594 10.993 11.359 11.749 12.132 12.516 12.927 13.394 13.937 14.479 15.091 15.739 16.513 17.28 18.001 18.591 18.536 17.683 16.723 15.755 14.801 13.911 13.124 12.381 11.686 10.944 10.303 9.688 9.039 8.377 7.729 7.183 6.689 6.265 5.877 5.489 5.08 4.731 4.317 3.831 3.476 3.126 2.767 2.388 1.992 1.715 1.416 0.95 0.633 0.297 0.119 -0.239 -0.596 -0.961 -1.155 -1.489 -1.763 -1.972 -2.199 -2.702 -2.988 -3.29 -3.609 -4.001 -4.455 -5.047 -7.286 -6 ,7935 ,KEBNE ,17027757,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 19:57:09 CET,0.0 1.156 1.689 2.079 2.359 2.604 2.845 3.062 3.478 3.673 3.849 4.079 4.349 4.519 4.847 5.162 5.452 5.585 5.846 6.097 6.442 6.658 6.875 7.178 7.445 7.718 7.99 8.228 8.512 8.787 9.062 9.395 9.7 9.986 10.312 10.663 11.001 11.385 11.789 12.205 12.654 13.168 13.708 14.134 14.577 15.082 15.612 16.138 16.596 16.85 16.627 15.763 14.716 13.663 12.595 11.449 10.473 9.659 8.981 8.327 7.743 7.203 6.66 6.149 5.646 5.14 4.645 4.225 3.833 3.427 3.007 2.626 2.215 1.794 1.485 1.201 0.917 0.598 0.248 0.013 -0.246 -0.694 -1.02 -1.366 -1.541 -1.913 -2.303 -2.709 -2.933 -3.285 -3.636 -3.911 -4.185 -4.752 -5.083 -5.447 -5.857 -6.343 -6.899 -7.652 -10.355 -7 ,27578 ,KEBNE ,17027758,Wed Dec 22 17:57:39 CET,Wed Dec 22 19:56:39 CET,0.0 1.542 1.98 2.366 2.709 2.993 3.259 3.52 3.986 4.189 4.376 4.585 4.846 5.004 5.301 5.574 5.849 5.992 6.253 6.484 6.836 7.061 7.267 7.568 7.856 8.134 8.408 8.671 9.002 9.319 9.63 9.981 10.311 10.619 10.993 11.412 11.789 12.205 12.64 13.08 13.546 14.097 14.714 15.272 15.883 16.515 17.195 17.846 18.366 18.717 18.711 17.8 16.496 15.251 14.113 13.013 12.001 11.002 10.075 9.081 8.19 7.427 6.663 5.92 5.252 4.657 4.033 3.456 2.952 2.44 1.899 1.445 0.989 0.51 0.135 -0.258 -0.674 -1.108 -1.537 -1.826 -2.144 -2.643 -2.981 -3.334 -3.512 -3.899 -4.293 -4.658 -4.847 -5.209 -5.617 -5.883 -6.162 -6.793 -7.143 -7.512 -7.907 -8.369 -8.964 -9.731 -12.687 -8 ,6610 ,KEBNE ,17027759,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 19:56:54 CET,0.0 0.929 1.393 1.777 2.107 2.383 2.652 2.924 3.369 3.547 3.712 3.936 4.203 4.354 4.632 4.897 5.178 5.321 5.586 5.823 6.15 6.362 6.565 6.865 7.15 7.414 7.66 7.888 8.187 8.486 8.776 9.124 9.457 9.753 10.073 10.448 10.804 11.164 11.548 11.954 12.395 12.901 13.438 13.932 14.469 14.986 15.504 16.066 16.577 16.779 16.361 15.132 13.737 12.428 11.303 10.284 9.292 8.322 7.449 6.571 5.836 5.179 4.52 3.903 3.348 2.833 2.305 1.822 1.396 0.98 0.545 0.174 -0.207 -0.603 -0.916 -1.245 -1.578 -1.909 -2.293 -2.597 -2.913 -3.38 -3.712 -4.079 -4.271 -4.655 -5.053 -5.487 -5.716 -6.05 -6.401 -6.662 -6.897 -7.429 -7.751 -8.078 -8.458 -8.936 -9.501 -10.29 -18.018 -9 ,32230 ,KEBNE ,17027760,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 19:57:20 CET,0.0 2.224 2.825 3.266 3.686 4.044 4.329 4.571 5.044 5.271 5.469 5.707 5.991 6.17 6.476 6.762 7.047 7.185 7.46 7.726 8.081 8.3 8.508 8.819 9.131 9.425 9.704 9.978 10.331 10.665 10.974 11.315 11.648 11.982 12.349 12.759 13.156 13.577 14.017 14.466 14.912 15.366 15.859 16.36 16.938 17.487 18.037 18.579 19.06 19.412 19.265 18.39 17.31 16.144 15.055 14.037 13.113 12.244 11.464 10.68 10.01 9.385 8.768 8.195 7.667 7.207 6.697 6.219 5.849 5.463 4.993 4.591 4.204 3.781 3.421 3.039 2.663 2.274 1.855 1.572 1.286 0.812 0.48 0.116 -0.073 -0.43 -0.804 -1.214 -1.446 -1.812 -2.181 -2.433 -2.683 -3.231 -3.568 -3.953 -4.385 -4.863 -5.444 -6.279 -8.973 -10 ,27780 ,KEBNE ,17027761,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 19:56:50 CET,0.0 1.074 1.643 2.083 2.436 2.742 3.003 3.241 3.684 3.887 4.09 4.341 4.612 4.765 5.065 5.344 5.608 5.739 6.004 6.26 6.649 6.914 7.154 7.477 7.762 8.028 8.306 8.565 8.889 9.206 9.501 9.851 10.197 10.557 10.981 11.415 11.817 12.231 12.693 13.21 13.717 14.295 14.946 15.548 16.202 16.836 17.395 17.901 18.357 18.642 18.426 17.277 15.967 14.821 13.691 12.577 11.581 10.702 9.895 8.997 8.212 7.483 6.768 6.109 5.495 4.93 4.312 3.743 3.29 2.842 2.351 1.94 1.527 1.078 0.733 0.413 0.106 -0.22 -0.572 -0.821 -1.095 -1.532 -1.838 -2.178 -2.356 -2.748 -3.197 -3.669 -3.906 -4.274 -4.599 -4.848 -5.15 -5.797 -6.139 -6.557 -7.034 -7.587 -8.27 -9.241 -13.493 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index ed70a063..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18846 ,TETRA ,17607117,Sun Nov 28 21:41:03 CET,Mon Nov 29 00:08:38 CET,0.0 0.887 1.113 1.273 1.451 1.614 1.757 1.905 2.166 2.286 2.395 2.461 2.66 2.75 2.907 3.035 3.163 3.237 3.379 3.504 3.671 3.778 3.883 4.021 4.157 4.263 4.348 4.45 4.591 4.718 4.823 4.916 5.018 5.11 5.202 5.307 5.397 5.477 5.54 5.605 5.661 5.712 5.728 5.689 5.622 5.435 5.144 4.706 3.81 2.284 -0.209 -3.178 -5.626 -7.673 -9.431 -10.964 -12.204 -13.253 -14.171 -15.077 -15.828 -16.495 -17.123 -17.723 -18.277 -18.784 -19.328 -19.806 -20.201 -20.62 -21.094 -21.479 -21.861 -22.232 -22.521 -22.841 -23.165 -23.494 -23.834 -24.061 -24.289 -24.654 -24.905 -25.149 -25.269 -25.535 -25.838 -26.179 -26.365 -26.684 -26.942 -27.146 -27.345 -27.804 -28.077 -28.366 -28.68 -29.031 -29.426 -29.953 -31.672 -2 ,32467 ,TETRA ,17607118,Sun Nov 28 21:41:05 CET,Mon Nov 29 00:07:31 CET,0.0 0.495 0.743 0.971 1.153 1.304 1.426 1.532 1.739 1.831 1.914 1.973 2.171 2.245 2.383 2.518 2.65 2.72 2.85 2.975 3.148 3.248 3.343 3.473 3.591 3.701 3.806 3.91 4.053 4.181 4.289 4.422 4.536 4.627 4.725 4.839 4.93 5.009 5.105 5.209 5.272 5.292 5.294 5.298 5.238 5.054 4.757 4.29 3.489 2.02 -0.475 -3.397 -5.841 -7.943 -9.707 -11.184 -12.391 -13.469 -14.404 -15.327 -16.119 -16.812 -17.455 -18.052 -18.595 -19.092 -19.616 -20.055 -20.432 -20.858 -21.298 -21.654 -22.043 -22.439 -22.753 -23.078 -23.387 -23.696 -24.017 -24.233 -24.456 -24.812 -25.052 -25.322 -25.465 -25.746 -26.047 -26.36 -26.524 -26.825 -27.01 -27.181 -27.355 -27.731 -27.944 -28.166 -28.421 -28.747 -29.113 -29.558 -30.927 -3 ,30282 ,TETRA ,17607119,Sun Nov 28 21:41:07 CET,Mon Nov 29 00:02:10 CET,0.0 1.064 1.295 1.454 1.616 1.779 1.922 2.059 2.315 2.431 2.544 2.653 2.864 2.947 3.086 3.224 3.351 3.417 3.545 3.661 3.845 3.957 4.056 4.197 4.324 4.443 4.56 4.668 4.812 4.945 5.082 5.235 5.355 5.455 5.533 5.618 5.721 5.822 5.896 5.93 5.947 5.956 5.941 5.892 5.767 5.575 5.25 4.762 3.986 2.653 0.248 -2.752 -5.155 -7.147 -8.852 -10.422 -11.753 -12.881 -13.878 -14.891 -15.724 -16.434 -17.095 -17.691 -18.233 -18.763 -19.343 -19.852 -20.285 -20.722 -21.162 -21.527 -21.894 -22.276 -22.592 -22.917 -23.237 -23.549 -23.872 -24.106 -24.359 -24.734 -24.978 -25.232 -25.365 -25.624 -25.89 -26.198 -26.37 -26.688 -26.909 -27.09 -27.314 -27.804 -28.04 -28.306 -28.622 -28.943 -29.3 -29.849 -32.341 -4 ,7994 ,TETRA ,17607120,Sun Nov 28 21:41:04 CET,Mon Nov 29 00:01:48 CET,0.0 0.754 1.076 1.348 1.539 1.693 1.866 2.013 2.246 2.354 2.443 2.532 2.741 2.832 3.021 3.191 3.334 3.397 3.516 3.636 3.796 3.895 3.986 4.101 4.22 4.321 4.404 4.491 4.613 4.724 4.817 4.929 5.007 5.073 5.163 5.246 5.313 5.389 5.46 5.517 5.57 5.603 5.573 5.518 5.421 5.222 4.908 4.479 3.787 2.603 0.494 -2.127 -4.34 -6.317 -8.044 -9.558 -10.822 -11.931 -12.894 -13.825 -14.614 -15.324 -16.002 -16.65 -17.243 -17.774 -18.328 -18.809 -19.221 -19.64 -20.051 -20.406 -20.781 -21.148 -21.433 -21.743 -22.058 -22.38 -22.705 -22.927 -23.176 -23.551 -23.787 -24.033 -24.158 -24.434 -24.735 -25.044 -25.205 -25.507 -25.715 -25.893 -26.069 -26.454 -26.678 -26.916 -27.162 -27.441 -27.745 -28.158 -29.123 -5 ,11360 ,TETRA ,17607121,Sun Nov 28 21:41:05 CET,Mon Nov 29 00:03:03 CET,0.0 1.081 1.384 1.593 1.759 1.906 2.05 2.175 2.398 2.495 2.587 2.651 2.855 2.937 3.081 3.211 3.335 3.39 3.49 3.608 3.771 3.867 3.967 4.101 4.223 4.337 4.447 4.559 4.686 4.795 4.895 5.009 5.127 5.263 5.416 5.563 5.684 5.791 5.907 6.034 6.16 6.254 6.264 6.226 6.157 5.982 5.658 5.165 4.375 3.016 0.571 -2.359 -4.76 -6.774 -8.431 -9.921 -11.215 -12.336 -13.298 -14.263 -15.068 -15.763 -16.442 -17.078 -17.651 -18.163 -18.707 -19.214 -19.64 -20.055 -20.484 -20.84 -21.213 -21.61 -21.919 -22.232 -22.553 -22.89 -23.237 -23.468 -23.693 -24.04 -24.288 -24.537 -24.66 -24.916 -25.194 -25.491 -25.644 -25.946 -26.173 -26.36 -26.548 -26.984 -27.206 -27.442 -27.711 -28.003 -28.397 -28.839 -29.723 -6 ,31895 ,TETRA ,17607122,Sun Nov 28 21:41:05 CET,Mon Nov 29 00:02:42 CET,0.0 0.676 0.918 1.151 1.399 1.576 1.72 1.853 2.116 2.249 2.366 2.452 2.655 2.754 2.946 3.112 3.257 3.328 3.457 3.56 3.706 3.802 3.892 4.038 4.197 4.348 4.479 4.601 4.75 4.899 5.039 5.183 5.31 5.425 5.553 5.706 5.826 5.915 6.007 6.115 6.212 6.268 6.29 6.284 6.232 6.082 5.847 5.442 4.74 3.59 1.187 -1.916 -4.37 -6.399 -8.111 -9.682 -11.036 -12.223 -13.24 -14.24 -15.125 -15.905 -16.634 -17.323 -17.943 -18.48 -19.049 -19.571 -20.032 -20.505 -20.986 -21.385 -21.759 -22.118 -22.408 -22.694 -22.98 -23.291 -23.615 -23.835 -24.064 -24.432 -24.698 -25.003 -25.167 -25.493 -25.823 -26.173 -26.355 -26.671 -26.89 -27.087 -27.28 -27.722 -27.992 -28.265 -28.567 -28.927 -29.351 -29.849 -31.748 -7 ,298 ,TETRA ,17607123,Sun Nov 28 21:41:07 CET,Mon Nov 29 00:06:10 CET,0.0 1.065 1.44 1.707 1.907 2.075 2.238 2.394 2.635 2.733 2.832 2.916 3.11 3.183 3.321 3.469 3.623 3.688 3.797 3.909 4.075 4.174 4.283 4.455 4.604 4.735 4.848 4.942 5.054 5.167 5.276 5.395 5.482 5.543 5.62 5.708 5.779 5.848 5.912 5.964 5.984 5.973 5.92 5.841 5.702 5.478 5.209 4.782 3.984 2.644 0.23 -2.775 -5.251 -7.352 -9.129 -10.681 -12.027 -13.206 -14.185 -15.102 -15.851 -16.524 -17.163 -17.783 -18.362 -18.859 -19.382 -19.842 -20.232 -20.645 -21.059 -21.407 -21.782 -22.157 -22.433 -22.728 -23.029 -23.324 -23.639 -23.86 -24.082 -24.406 -24.65 -24.928 -25.07 -25.353 -25.656 -25.99 -26.161 -26.476 -26.709 -26.905 -27.112 -27.55 -27.791 -28.063 -28.362 -28.673 -28.992 -29.343 -30.506 -8 ,23035 ,TETRA ,17607124,Sun Nov 28 21:41:10 CET,Mon Nov 29 00:05:45 CET,0.0 1.302 1.598 1.832 2.004 2.14 2.267 2.393 2.602 2.693 2.785 2.836 3.021 3.106 3.274 3.422 3.566 3.633 3.747 3.849 4.032 4.165 4.27 4.389 4.486 4.586 4.702 4.803 4.914 5.009 5.092 5.208 5.331 5.434 5.544 5.646 5.724 5.814 5.89 5.929 5.975 6.044 6.12 6.151 6.11 5.977 5.674 5.147 4.296 2.928 0.534 -2.374 -4.763 -6.794 -8.511 -10.017 -11.363 -12.552 -13.536 -14.567 -15.475 -16.236 -16.901 -17.505 -18.056 -18.549 -19.06 -19.487 -19.841 -20.219 -20.639 -21.004 -21.382 -21.752 -22.04 -22.346 -22.647 -22.967 -23.302 -23.514 -23.731 -24.102 -24.378 -24.65 -24.789 -25.083 -25.399 -25.725 -25.877 -26.168 -26.368 -26.547 -26.733 -27.16 -27.404 -27.654 -27.922 -28.22 -28.59 -29.113 -31.273 -9 ,23999 ,TETRA ,17607125,Sun Nov 28 21:41:04 CET,Mon Nov 29 00:01:59 CET,0.0 1.102 1.417 1.644 1.846 2.06 2.215 2.334 2.555 2.668 2.79 2.895 3.095 3.173 3.33 3.502 3.672 3.756 3.904 4.041 4.244 4.374 4.499 4.665 4.812 4.945 5.064 5.183 5.344 5.49 5.618 5.781 5.925 6.052 6.198 6.345 6.469 6.582 6.677 6.782 6.882 6.956 7.028 7.055 6.972 6.811 6.558 6.057 5.202 3.792 1.218 -1.854 -4.26 -6.36 -8.131 -9.619 -10.901 -12.04 -13.028 -14.015 -14.845 -15.559 -16.253 -16.922 -17.525 -18.061 -18.615 -19.14 -19.606 -20.08 -20.58 -20.978 -21.373 -21.788 -22.115 -22.45 -22.785 -23.122 -23.454 -23.676 -23.913 -24.302 -24.576 -24.873 -25.021 -25.297 -25.588 -25.894 -26.054 -26.356 -26.58 -26.762 -26.929 -27.304 -27.517 -27.725 -27.975 -28.303 -28.671 -29.187 -31.731 -10 ,8425 ,TETRA ,17607126,Sun Nov 28 21:41:05 CET,Mon Nov 29 00:01:31 CET,0.0 0.913 1.213 1.451 1.636 1.789 1.942 2.082 2.31 2.423 2.526 2.59 2.789 2.884 3.055 3.206 3.336 3.404 3.55 3.675 3.832 3.928 4.016 4.154 4.278 4.376 4.47 4.553 4.656 4.758 4.857 4.981 5.092 5.182 5.268 5.347 5.41 5.481 5.553 5.626 5.691 5.726 5.717 5.659 5.574 5.414 5.098 4.678 3.977 2.557 0.131 -2.847 -5.431 -7.555 -9.365 -10.991 -12.315 -13.46 -14.412 -15.361 -16.197 -16.933 -17.636 -18.265 -18.829 -19.349 -19.881 -20.328 -20.722 -21.144 -21.554 -21.882 -22.25 -22.639 -22.928 -23.224 -23.531 -23.849 -24.161 -24.363 -24.572 -24.921 -25.166 -25.405 -25.533 -25.819 -26.119 -26.449 -26.616 -26.905 -27.124 -27.307 -27.488 -27.897 -28.117 -28.348 -28.592 -28.864 -29.222 -29.71 -31.37 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index 409353c6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7196 ,TETRA ,17607127,Sun Nov 28 21:41:06 CET,Mon Nov 29 00:00:39 CET,0.0 0.742 1.063 1.322 1.566 1.775 1.954 2.132 2.45 2.582 2.701 2.805 3.031 3.142 3.33 3.506 3.685 3.767 3.918 4.062 4.286 4.44 4.596 4.809 4.996 5.179 5.368 5.553 5.775 5.999 6.229 6.504 6.77 7.026 7.327 7.665 8.0 8.367 8.758 9.18 9.622 10.119 10.657 11.175 11.807 12.495 13.255 14.089 14.991 15.814 16.437 16.594 16.312 15.855 15.363 14.813 14.28 13.734 13.21 12.701 12.249 11.836 11.436 11.055 10.687 10.329 9.965 9.665 9.382 9.07 8.764 8.513 8.242 7.956 7.731 7.495 7.247 6.981 6.702 6.51 6.318 6.011 5.8 5.576 5.445 5.167 4.895 4.61 4.462 4.201 3.936 3.751 3.557 3.1 2.864 2.631 2.358 2.001 1.576 1.072 -0.601 -2 ,15159 ,TETRA ,17607128,Sun Nov 28 21:41:09 CET,Mon Nov 29 00:00:47 CET,0.0 0.587 0.924 1.192 1.445 1.68 1.878 2.054 2.362 2.505 2.639 2.76 2.987 3.098 3.301 3.511 3.725 3.826 4.032 4.222 4.486 4.659 4.83 5.094 5.349 5.585 5.814 6.038 6.331 6.618 6.87 7.171 7.467 7.756 8.091 8.451 8.812 9.211 9.62 10.066 10.546 11.065 11.66 12.247 12.898 13.599 14.408 15.249 16.137 17.01 17.703 17.765 17.364 16.821 16.256 15.684 15.124 14.524 13.964 13.428 12.978 12.558 12.161 11.788 11.424 11.086 10.725 10.407 10.125 9.839 9.537 9.264 8.962 8.664 8.441 8.197 7.943 7.698 7.432 7.244 7.041 6.706 6.476 6.243 6.128 5.889 5.648 5.375 5.224 4.957 4.694 4.487 4.273 3.825 3.595 3.361 3.073 2.749 2.407 1.943 0.475 -3 ,27200 ,TETRA ,17607129,Sun Nov 28 21:41:05 CET,Mon Nov 29 00:02:13 CET,0.0 1.045 1.4 1.706 1.983 2.22 2.446 2.654 2.999 3.16 3.319 3.488 3.746 3.893 4.158 4.382 4.604 4.708 4.895 5.084 5.362 5.541 5.718 5.971 6.219 6.449 6.671 6.89 7.159 7.409 7.653 7.94 8.212 8.495 8.796 9.116 9.438 9.81 10.196 10.576 10.994 11.494 12.09 12.685 13.353 14.046 14.82 15.665 16.541 17.392 18.036 18.082 17.803 17.346 16.784 16.259 15.795 15.307 14.861 14.393 13.972 13.579 13.198 12.844 12.492 12.149 11.817 11.529 11.251 10.963 10.667 10.408 10.126 9.856 9.658 9.443 9.201 8.943 8.697 8.523 8.336 8.056 7.858 7.639 7.522 7.285 7.046 6.787 6.658 6.428 6.268 6.112 5.942 5.565 5.356 5.13 4.861 4.574 4.251 3.81 2.461 -4 ,4386 ,TETRA ,17607130,Sun Nov 28 21:41:06 CET,Mon Nov 29 00:01:40 CET,0.0 0.49 0.753 1.0 1.219 1.411 1.579 1.717 1.958 2.068 2.181 2.286 2.513 2.611 2.785 2.975 3.18 3.279 3.46 3.638 3.875 4.016 4.162 4.4 4.631 4.834 5.04 5.241 5.487 5.722 5.964 6.267 6.564 6.837 7.14 7.517 7.887 8.277 8.699 9.128 9.519 9.931 10.423 10.903 11.431 11.995 12.665 13.423 14.198 14.955 15.626 15.665 15.245 14.662 14.036 13.444 12.863 12.285 11.798 11.27 10.767 10.319 9.902 9.483 9.084 8.756 8.422 8.082 7.78 7.482 7.178 6.907 6.619 6.349 6.149 5.936 5.713 5.469 5.204 5.022 4.845 4.578 4.389 4.2 4.093 3.853 3.607 3.341 3.196 2.945 2.742 2.593 2.435 2.07 1.875 1.643 1.362 1.082 0.711 0.174 -1.061 -5 ,15305 ,TETRA ,17607131,Sun Nov 28 21:41:09 CET,Mon Nov 29 00:00:50 CET,0.0 0.604 0.915 1.184 1.424 1.677 1.881 2.014 2.275 2.418 2.551 2.669 2.889 2.991 3.203 3.425 3.63 3.716 3.889 4.079 4.347 4.51 4.669 4.902 5.124 5.34 5.543 5.734 5.989 6.25 6.493 6.777 7.03 7.267 7.563 7.905 8.232 8.591 8.969 9.346 9.737 10.174 10.695 11.227 11.838 12.516 13.309 14.147 14.984 15.78 16.413 16.355 15.847 15.245 14.683 14.141 13.577 13.041 12.545 11.976 11.52 11.157 10.789 10.397 9.998 9.636 9.255 8.907 8.606 8.298 7.988 7.743 7.485 7.211 6.981 6.731 6.475 6.183 5.867 5.65 5.423 5.055 4.789 4.513 4.379 4.124 3.838 3.506 3.345 3.082 2.833 2.631 2.423 2.009 1.807 1.58 1.297 0.972 0.61 0.193 -1.145 -6 ,32124 ,TETRA ,17607132,Sun Nov 28 21:41:10 CET,Mon Nov 29 00:01:18 CET,0.0 0.867 1.149 1.372 1.558 1.727 1.898 2.056 2.31 2.426 2.547 2.689 2.921 3.028 3.244 3.447 3.633 3.716 3.879 4.037 4.26 4.408 4.564 4.793 5.01 5.217 5.41 5.605 5.855 6.085 6.306 6.562 6.799 7.027 7.305 7.644 7.99 8.369 8.775 9.211 9.647 10.127 10.719 11.317 11.974 12.673 13.454 14.277 15.151 15.987 16.699 16.8 16.453 16.011 15.506 14.97 14.451 13.931 13.447 12.94 12.507 12.136 11.791 11.477 11.193 10.934 10.649 10.379 10.154 9.927 9.665 9.421 9.158 8.885 8.67 8.435 8.208 7.985 7.727 7.543 7.364 7.082 6.887 6.696 6.593 6.352 6.078 5.801 5.653 5.389 5.194 5.032 4.85 4.467 4.28 4.061 3.813 3.532 3.205 2.773 1.346 -7 ,5554 ,TETRA ,17607133,Sun Nov 28 21:41:06 CET,Mon Nov 29 00:01:02 CET,0.0 0.819 1.114 1.327 1.524 1.687 1.827 1.962 2.209 2.344 2.479 2.607 2.835 2.94 3.155 3.368 3.558 3.648 3.829 4.022 4.302 4.472 4.644 4.907 5.161 5.396 5.609 5.812 6.067 6.306 6.544 6.838 7.097 7.343 7.647 7.984 8.319 8.696 9.09 9.507 9.941 10.42 10.969 11.486 12.065 12.719 13.443 14.198 15.072 15.939 16.437 16.447 16.126 15.66 15.112 14.558 14.085 13.606 13.146 12.628 12.151 11.746 11.34 10.933 10.568 10.229 9.846 9.51 9.227 8.912 8.575 8.292 8.007 7.712 7.464 7.212 6.95 6.675 6.365 6.14 5.927 5.595 5.369 5.152 5.046 4.827 4.575 4.295 4.151 3.898 3.697 3.548 3.397 3.008 2.79 2.576 2.345 2.078 1.762 1.319 0.064 -8 ,8092 ,TETRA ,17607134,Sun Nov 28 21:41:07 CET,Mon Nov 29 00:00:44 CET,0.0 1.132 1.48 1.719 1.947 2.151 2.329 2.492 2.787 2.933 3.077 3.219 3.465 3.599 3.837 4.044 4.238 4.332 4.502 4.667 4.92 5.075 5.237 5.475 5.694 5.907 6.118 6.331 6.608 6.868 7.125 7.46 7.793 8.096 8.42 8.784 9.137 9.494 9.855 10.25 10.67 11.14 11.711 12.284 12.955 13.715 14.491 15.281 16.168 17.001 17.674 17.782 17.488 17.066 16.543 15.995 15.506 15.014 14.565 14.103 13.672 13.276 12.894 12.518 12.155 11.821 11.47 11.145 10.861 10.568 10.253 9.994 9.728 9.44 9.204 8.951 8.685 8.411 8.129 7.928 7.715 7.382 7.147 6.928 6.825 6.602 6.356 6.091 5.957 5.711 5.485 5.31 5.132 4.713 4.48 4.23 3.935 3.621 3.242 2.722 1.421 -9 ,26668 ,TETRA ,17607135,Sun Nov 28 21:41:09 CET,Mon Nov 29 00:01:33 CET,0.0 0.956 1.273 1.547 1.78 1.993 2.191 2.377 2.709 2.854 2.994 3.152 3.397 3.521 3.772 3.992 4.185 4.282 4.463 4.634 4.914 5.096 5.254 5.478 5.695 5.897 6.098 6.295 6.552 6.799 7.021 7.286 7.55 7.815 8.128 8.464 8.773 9.101 9.456 9.855 10.292 10.773 11.343 11.929 12.575 13.246 14.016 14.848 15.685 16.458 17.058 17.089 16.758 16.291 15.747 15.16 14.621 14.101 13.59 13.068 12.61 12.157 11.703 11.288 10.89 10.504 10.082 9.692 9.348 8.984 8.61 8.291 7.93 7.554 7.279 7.009 6.733 6.454 6.172 5.968 5.752 5.434 5.206 4.949 4.824 4.562 4.288 4.009 3.863 3.597 3.352 3.17 2.977 2.527 2.28 2.001 1.684 1.358 0.96 0.423 -1.128 -10 ,22063 ,TETRA ,17607136,Sun Nov 28 21:41:12 CET,Mon Nov 29 00:00:58 CET,0.0 0.583 0.833 1.102 1.299 1.475 1.649 1.803 2.083 2.202 2.311 2.414 2.645 2.746 2.952 3.162 3.36 3.461 3.654 3.85 4.111 4.267 4.419 4.647 4.872 5.087 5.3 5.51 5.791 6.065 6.304 6.566 6.821 7.071 7.347 7.663 7.984 8.339 8.722 9.132 9.559 10.028 10.574 11.097 11.713 12.439 13.228 14.049 14.899 15.736 16.362 16.429 16.154 15.673 15.165 14.625 14.054 13.502 13.005 12.524 12.112 11.718 11.335 10.986 10.637 10.314 9.972 9.646 9.345 9.04 8.737 8.48 8.209 7.937 7.728 7.5 7.289 7.08 6.83 6.652 6.47 6.173 5.975 5.771 5.655 5.393 5.131 4.878 4.739 4.506 4.343 4.181 4.003 3.606 3.361 3.091 2.812 2.513 2.131 1.583 0.3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index bc3897b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15623 ,TETRA ,17607137,Sun Nov 28 21:41:06 CET,Mon Nov 29 00:00:42 CET,0.0 4.162 4.534 4.785 4.961 5.143 5.315 5.479 5.731 5.829 5.931 6.033 6.275 6.381 6.554 6.716 6.871 6.948 7.102 7.236 7.389 7.496 7.614 7.789 7.958 8.107 8.237 8.362 8.51 8.628 8.736 8.863 8.981 9.085 9.199 9.314 9.412 9.53 9.643 9.734 9.811 9.879 9.921 9.946 9.925 9.825 9.648 9.308 8.71 7.685 5.747 3.207 1.063 -0.712 -2.226 -3.642 -4.888 -6.001 -6.964 -7.891 -8.712 -9.477 -10.221 -10.921 -11.568 -12.17 -12.812 -13.376 -13.845 -14.35 -14.891 -15.329 -15.769 -16.234 -16.612 -16.999 -17.398 -17.809 -18.215 -18.478 -18.749 -19.187 -19.499 -19.831 -20.004 -20.359 -20.727 -21.128 -21.329 -21.659 -21.928 -22.161 -22.429 -23.031 -23.373 -23.757 -24.167 -24.578 -25.076 -25.843 -36.043 -2 ,25743 ,TETRA ,17607138,Sun Nov 28 21:41:09 CET,Mon Nov 29 00:01:08 CET,0.0 1.1 1.457 1.667 1.865 2.072 2.238 2.387 2.67 2.795 2.901 3.019 3.247 3.344 3.545 3.739 3.918 4.007 4.172 4.305 4.512 4.661 4.788 4.963 5.128 5.275 5.422 5.551 5.676 5.789 5.901 6.024 6.135 6.248 6.373 6.509 6.636 6.749 6.851 6.95 7.047 7.14 7.246 7.33 7.327 7.218 7.024 6.708 6.126 5.095 3.138 0.644 -1.521 -3.318 -4.834 -6.199 -7.391 -8.49 -9.436 -10.351 -11.155 -11.851 -12.46 -13.017 -13.535 -14.033 -14.553 -15.024 -15.429 -15.837 -16.268 -16.603 -16.946 -17.349 -17.692 -18.068 -18.45 -18.832 -19.226 -19.492 -19.755 -20.162 -20.439 -20.726 -20.879 -21.203 -21.551 -21.95 -22.181 -22.567 -22.925 -23.19 -23.44 -23.93 -24.225 -24.566 -24.927 -25.343 -25.831 -26.511 -30.789 -3 ,2301 ,TETRA ,17607139,Sun Nov 28 21:41:07 CET,Mon Nov 29 00:00:38 CET,0.0 10.109 10.509 10.766 10.977 11.169 11.341 11.476 11.66 11.749 11.847 11.919 12.12 12.188 12.322 12.463 12.589 12.65 12.757 12.854 13.014 13.139 13.264 13.408 13.521 13.628 13.723 13.805 13.919 14.069 14.236 14.434 14.601 14.723 14.866 14.999 15.098 15.202 15.298 15.392 15.474 15.546 15.603 15.614 15.584 15.521 15.373 15.05 14.459 13.331 11.271 8.726 6.549 4.735 3.189 1.751 0.414 -0.808 -1.87 -2.94 -3.84 -4.627 -5.354 -6.014 -6.633 -7.196 -7.804 -8.361 -8.827 -9.287 -9.746 -10.116 -10.479 -10.875 -11.207 -11.556 -11.916 -12.285 -12.685 -12.956 -13.233 -13.665 -13.948 -14.232 -14.393 -14.725 -15.038 -15.382 -15.574 -15.93 -16.245 -16.487 -16.76 -17.313 -17.621 -17.942 -18.255 -18.639 -19.182 -19.935 -23.436 -4 ,10607 ,TETRA ,17607140,Sun Nov 28 21:41:32 CET,Mon Nov 29 00:01:08 CET,0.0 1.77 2.156 2.404 2.601 2.797 3.004 3.171 3.425 3.541 3.654 3.731 3.944 4.032 4.164 4.3 4.438 4.498 4.618 4.751 4.941 5.049 5.151 5.306 5.45 5.563 5.672 5.788 5.923 6.039 6.134 6.246 6.377 6.486 6.576 6.683 6.808 6.982 7.173 7.347 7.52 7.668 7.778 7.878 7.963 7.946 7.838 7.578 7.111 6.233 4.42 2.037 -0.167 -2.184 -3.991 -5.596 -6.94 -8.132 -9.123 -10.12 -10.988 -11.752 -12.503 -13.202 -13.829 -14.389 -14.95 -15.446 -15.885 -16.325 -16.764 -17.145 -17.544 -17.937 -18.222 -18.531 -18.882 -19.227 -19.577 -19.822 -20.077 -20.469 -20.737 -21.009 -21.15 -21.499 -21.878 -22.23 -22.411 -22.75 -23.035 -23.243 -23.46 -23.975 -24.249 -24.57 -24.948 -25.332 -25.83 -26.628 -32.104 -6 ,4206 ,TETRA ,17607142,Sun Nov 28 21:41:34 CET,Mon Nov 29 00:01:31 CET,0.0 4.759 5.141 5.36 5.592 5.797 5.943 6.059 6.266 6.365 6.458 6.544 6.754 6.821 6.948 7.065 7.182 7.255 7.405 7.516 7.657 7.748 7.832 7.948 8.052 8.159 8.278 8.386 8.509 8.62 8.723 8.842 8.966 9.101 9.267 9.436 9.585 9.749 9.918 10.087 10.246 10.39 10.507 10.579 10.607 10.555 10.375 10.026 9.429 8.389 6.497 4.06 1.906 0.04 -1.572 -3.016 -4.276 -5.435 -6.404 -7.374 -8.206 -8.953 -9.665 -10.32 -10.911 -11.441 -12.011 -12.528 -12.985 -13.456 -13.957 -14.377 -14.807 -15.251 -15.559 -15.876 -16.249 -16.65 -17.082 -17.384 -17.678 -18.128 -18.425 -18.735 -18.899 -19.235 -19.606 -20.011 -20.214 -20.563 -20.86 -21.09 -21.323 -21.857 -22.165 -22.517 -22.97 -23.531 -24.264 -25.173 -35.699 -7 ,29091 ,TETRA ,17607143,Sun Nov 28 21:41:35 CET,Mon Nov 29 00:00:21 CET,0.0 3.565 4.083 4.461 4.764 4.949 5.098 5.251 5.546 5.678 5.798 5.899 6.125 6.213 6.392 6.584 6.758 6.844 7.013 7.175 7.398 7.537 7.675 7.887 8.072 8.227 8.38 8.531 8.712 8.892 9.069 9.257 9.441 9.612 9.792 10.005 10.198 10.392 10.589 10.766 10.945 11.12 11.212 11.207 11.167 11.062 10.868 10.557 10.001 8.937 6.99 4.483 2.336 0.524 -1.01 -2.385 -3.663 -4.841 -5.839 -6.855 -7.718 -8.456 -9.157 -9.796 -10.39 -10.979 -11.585 -12.112 -12.581 -13.085 -13.597 -14.02 -14.48 -14.93 -15.26 -15.593 -15.942 -16.308 -16.694 -16.977 -17.269 -17.703 -18.012 -18.325 -18.475 -18.793 -19.111 -19.434 -19.607 -19.933 -20.205 -20.424 -20.661 -21.187 -21.473 -21.772 -22.112 -22.548 -23.104 -23.858 -26.713 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index bfc3256c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8360 ,TETRA ,17607147,Sun Nov 28 21:41:36 CET,Mon Nov 29 00:04:36 CET,0.0 2.819 3.342 3.763 4.077 4.358 4.594 4.764 5.03 5.177 5.333 5.516 5.776 5.911 6.149 6.396 6.674 6.796 6.984 7.174 7.448 7.611 7.781 8.015 8.237 8.46 8.674 8.881 9.147 9.409 9.651 9.939 10.211 10.476 10.796 11.167 11.537 11.958 12.383 12.78 13.189 13.641 14.133 14.65 15.311 16.061 16.875 17.724 18.587 19.39 19.982 19.906 19.515 18.949 18.357 17.779 17.192 16.662 16.246 15.818 15.41 15.019 14.643 14.318 14.013 13.703 13.374 13.086 12.842 12.574 12.286 12.049 11.799 11.532 11.307 11.068 10.842 10.592 10.311 10.121 9.927 9.621 9.395 9.155 9.038 8.815 8.562 8.286 8.137 7.869 7.671 7.514 7.325 6.921 6.718 6.486 6.245 5.972 5.528 4.747 nan -2 ,11829 ,TETRA ,17607148,Sun Nov 28 21:41:37 CET,Mon Nov 29 00:04:31 CET,0.0 3.628 4.226 4.649 4.992 5.254 5.496 5.696 6.059 6.223 6.386 6.552 6.793 6.912 7.149 7.39 7.624 7.745 7.98 8.185 8.464 8.635 8.799 9.04 9.29 9.529 9.757 9.983 10.285 10.576 10.846 11.188 11.538 11.862 12.221 12.671 13.1 13.515 13.917 14.3 14.675 15.104 15.631 16.14 16.682 17.268 17.958 18.739 19.525 20.199 20.685 20.727 20.406 19.914 19.394 18.906 18.408 17.918 17.498 17.067 16.661 16.209 15.797 15.459 15.128 14.792 14.418 14.102 13.828 13.526 13.222 12.984 12.738 12.457 12.219 11.958 11.67 11.359 11.022 10.809 10.607 10.291 10.09 9.872 9.759 9.536 9.278 8.979 8.83 8.566 8.332 8.171 8.005 7.584 7.319 7.017 6.705 6.311 5.84 5.345 3.346 -3 ,1771 ,TETRA ,17607149,Sun Nov 28 21:41:33 CET,Mon Nov 29 00:07:37 CET,0.0 3.083 3.603 3.978 4.306 4.603 4.869 5.112 5.56 5.745 5.906 6.081 6.325 6.463 6.738 6.959 7.156 7.255 7.459 7.686 8.021 8.234 8.439 8.701 8.946 9.191 9.408 9.601 9.854 10.101 10.354 10.657 10.943 11.224 11.546 11.898 12.215 12.563 12.949 13.341 13.751 14.233 14.771 15.294 15.879 16.535 17.348 18.253 19.168 19.838 20.134 20.031 19.601 18.976 18.284 17.647 17.128 16.658 16.222 15.783 15.393 15.031 14.684 14.348 14.01 13.7 13.393 13.107 12.857 12.599 12.315 12.077 11.827 11.547 11.328 11.102 10.861 10.604 10.34 10.167 9.997 9.727 9.522 9.29 9.171 8.938 8.692 8.429 8.299 8.059 7.885 7.723 7.547 7.187 6.966 6.681 6.392 6.097 5.724 5.294 0.736 -4 ,30299 ,TETRA ,17607150,Sun Nov 28 21:41:38 CET,Mon Nov 29 00:07:31 CET,0.0 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan -5 ,2459 ,TETRA ,17607151,Sun Nov 28 21:41:34 CET,Mon Nov 29 00:04:38 CET,0.0 2.294 2.753 3.114 3.409 3.663 3.908 4.163 4.632 4.808 4.946 5.129 5.383 5.493 5.695 5.902 6.114 6.215 6.415 6.615 6.892 7.049 7.193 7.416 7.65 7.864 8.053 8.238 8.497 8.751 8.989 9.279 9.551 9.804 10.1 10.464 10.827 11.19 11.555 11.943 12.363 12.848 13.401 13.93 14.507 15.082 15.674 16.303 16.982 17.736 18.376 18.349 18.006 17.49 16.855 16.23 15.653 15.077 14.531 13.997 13.553 13.145 12.774 12.416 12.072 11.773 11.465 11.193 10.947 10.672 10.345 10.062 9.776 9.475 9.25 9.018 8.783 8.527 8.227 8.011 7.791 7.432 7.172 6.911 6.781 6.513 6.239 5.921 5.735 5.445 5.144 4.894 4.646 4.096 3.777 3.44 3.084 2.618 2.002 1.227 -1.914 -6 ,4473 ,TETRA ,17607152,Sun Nov 28 21:41:36 CET,Mon Nov 29 00:04:20 CET,0.0 2.004 2.44 2.747 3.038 3.307 3.545 3.761 4.124 4.28 4.433 4.594 4.822 4.933 5.159 5.367 5.556 5.645 5.825 6.004 6.256 6.428 6.602 6.829 7.039 7.273 7.492 7.709 8.015 8.299 8.553 8.837 9.098 9.35 9.648 9.99 10.316 10.674 11.07 11.496 11.923 12.378 12.909 13.421 13.972 14.573 15.335 16.202 17.019 17.702 18.212 18.231 17.94 17.561 17.131 16.673 16.262 15.885 15.513 15.09 14.716 14.391 14.088 13.795 13.509 13.199 12.832 12.505 12.228 11.954 11.672 11.413 11.121 10.838 10.636 10.412 10.164 9.9 9.631 9.438 9.231 8.926 8.695 8.437 8.311 8.062 7.775 7.489 7.356 7.092 6.862 6.686 6.476 6.009 5.756 5.515 5.247 4.918 4.532 3.978 -5.567 -7 ,2231 ,TETRA ,17607153,Sun Nov 28 21:41:34 CET,Mon Nov 29 00:03:58 CET,0.0 9.17 9.627 10.004 10.323 10.615 10.881 11.101 11.519 11.704 11.862 12.06 12.333 12.482 12.774 13.026 13.257 13.387 13.656 13.898 14.216 14.413 14.597 14.862 15.105 15.336 15.553 15.76 16.031 16.278 16.518 16.82 17.104 17.378 17.701 18.074 18.433 18.806 19.219 19.671 20.141 20.674 21.252 21.799 22.462 23.23 24.078 24.91 25.786 26.694 27.454 27.532 27.073 26.483 25.904 25.328 24.79 24.278 23.815 23.269 22.75 22.297 21.868 21.439 21.018 20.635 20.226 19.855 19.55 19.228 18.888 18.617 18.308 17.957 17.689 17.42 17.113 16.793 16.484 16.284 16.072 15.723 15.48 15.212 15.072 14.788 14.48 14.137 13.956 13.652 13.345 13.127 12.888 12.347 12.072 11.791 11.462 11.062 10.563 9.808 6.011 -8 ,17921 ,TETRA ,17607154,Sun Nov 28 21:41:36 CET,Mon Nov 29 00:04:06 CET,0.0 2.449 3.016 3.398 3.675 3.913 4.132 4.311 4.641 4.805 4.969 5.199 5.462 5.578 5.807 6.031 6.223 6.318 6.519 6.716 7.011 7.196 7.374 7.635 7.883 8.131 8.356 8.559 8.854 9.139 9.401 9.716 10.01 10.293 10.611 10.961 11.289 11.646 12.025 12.451 12.933 13.455 14.023 14.594 15.247 15.934 16.675 17.43 18.19 18.937 19.592 19.648 19.245 18.778 18.215 17.593 17.034 16.485 16.005 15.488 15.017 14.595 14.179 13.786 13.417 13.104 12.793 12.494 12.233 11.959 11.688 11.453 11.196 10.954 10.747 10.505 10.26 10.004 9.744 9.558 9.363 9.08 8.877 8.681 8.585 8.366 8.124 7.879 7.757 7.512 7.307 7.13 6.95 6.549 6.317 6.086 5.831 5.52 5.082 4.501 1.627 -10 ,25668 ,TETRA ,17607156,Sun Nov 28 21:41:40 CET,Mon Nov 29 00:04:33 CET,0.0 1.91 2.301 2.605 2.894 3.127 3.324 3.511 3.871 4.033 4.189 4.368 4.621 4.755 5.013 5.249 5.441 5.53 5.721 5.897 6.166 6.349 6.533 6.809 7.054 7.281 7.485 7.682 7.93 8.163 8.402 8.709 9.023 9.308 9.624 9.964 10.271 10.622 11.01 11.401 11.808 12.27 12.784 13.258 13.825 14.494 15.207 15.897 16.663 17.476 18.128 18.255 17.973 17.55 17.105 16.643 16.167 15.7 15.274 14.824 14.41 14.017 13.631 13.257 12.928 12.64 12.274 11.92 11.621 11.309 11.007 10.752 10.48 10.207 9.976 9.73 9.473 9.199 8.907 8.709 8.523 8.234 8.03 7.815 7.698 7.468 7.239 6.988 6.837 6.559 6.324 6.16 6.004 5.602 5.356 5.09 4.784 4.43 3.952 3.325 0.301 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt deleted file mode 100644 index 02457c8a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,31359 ,TETRA ,17607159,Sun Nov 28 21:41:37 CET,Mon Nov 29 00:01:15 CET,0.0 0.845 1.034 1.166 1.324 1.481 1.621 1.746 1.968 2.079 2.183 2.29 2.442 2.529 2.702 2.859 2.992 3.055 3.183 3.305 3.488 3.605 3.717 3.905 4.079 4.232 4.377 4.509 4.682 4.838 4.98 5.16 5.343 5.521 5.728 5.957 6.168 6.416 6.703 6.995 7.279 7.6 7.959 8.293 8.623 8.939 9.266 9.582 9.82 9.887 9.592 8.676 7.627 6.586 5.658 4.857 4.113 3.368 2.709 2.076 1.534 1.034 0.55 0.079 -0.363 -0.78 -1.237 -1.655 -1.989 -2.321 -2.681 -2.996 -3.316 -3.652 -3.927 -4.204 -4.484 -4.771 -5.078 -5.305 -5.551 -5.932 -6.174 -6.436 -6.578 -6.874 -7.198 -7.579 -7.788 -8.041 -8.421 -8.676 -8.915 -9.464 -9.784 -10.167 -10.667 -11.294 -11.92 -12.623 -18.256 -6 ,2924 ,TETRA ,17607162,Sun Nov 28 21:41:38 CET,Sun Nov 28 23:59:54 CET,0.0 0.56 0.783 0.962 1.107 1.25 1.402 1.54 1.794 1.917 2.027 2.135 2.297 2.393 2.55 2.693 2.844 2.92 3.059 3.18 3.368 3.488 3.608 3.799 3.964 4.128 4.306 4.458 4.638 4.817 4.985 5.182 5.365 5.542 5.755 5.992 6.2 6.426 6.677 6.933 7.193 7.488 7.847 8.215 8.613 9.019 9.404 9.724 9.887 9.692 8.94 7.765 6.558 5.388 4.334 3.377 2.543 1.762 1.064 0.373 -0.212 -0.746 -1.271 -1.757 -2.216 -2.646 -3.093 -3.494 -3.832 -4.169 -4.518 -4.816 -5.121 -5.447 -5.702 -5.975 -6.281 -6.601 -6.931 -7.148 -7.377 -7.745 -7.992 -8.271 -8.431 -8.784 -9.121 -9.444 -9.639 -9.933 -10.367 -10.63 -10.918 -11.531 -11.831 -12.152 -12.576 -13.179 -13.939 -14.994 nan -10 ,26867 ,TETRA ,17607166,Sun Nov 28 21:41:38 CET,Mon Nov 29 00:02:12 CET,0.0 0.471 0.636 0.821 1.008 1.159 1.285 1.396 1.579 1.673 1.761 1.854 2.012 2.104 2.28 2.43 2.56 2.622 2.745 2.864 3.043 3.16 3.275 3.448 3.621 3.792 3.944 4.087 4.277 4.452 4.625 4.834 5.024 5.209 5.43 5.681 5.927 6.17 6.416 6.697 6.994 7.303 7.667 8.005 8.348 8.737 9.121 9.465 9.753 9.805 9.292 8.077 6.838 5.691 4.667 3.746 2.9 2.127 1.453 0.755 0.16 -0.369 -0.877 -1.349 -1.816 -2.24 -2.701 -3.132 -3.491 -3.881 -4.288 -4.609 -4.927 -5.278 -5.557 -5.824 -6.132 -6.477 -6.823 -7.06 -7.303 -7.706 -7.995 -8.299 -8.461 -8.795 -9.144 -9.513 -9.728 -10.017 -10.431 -10.676 -10.923 -11.526 -11.88 -12.247 -12.628 -13.145 -13.864 -14.823 -21.893 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt deleted file mode 100644 index ae4925cf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,22560 ,TETRA ,17607168,Sun Nov 28 21:41:41 CET,Mon Nov 29 00:00:37 CET,0.0 0.341 0.454 0.536 0.617 0.685 0.742 0.798 0.865 0.877 0.892 0.846 0.918 0.93 0.949 0.946 0.93 0.923 0.914 0.904 0.888 0.874 0.855 0.809 0.747 0.675 0.601 0.528 0.42 0.31 0.194 0.038 -0.144 -0.34 -0.565 -0.818 -1.067 -1.379 -1.756 -2.178 -2.648 -3.231 -3.965 -4.772 -5.81 -7.134 -8.892 -11.056 -14.071 -18.613 -25.421 -32.54 -37.845 -41.974 -45.363 -48.268 -50.619 -52.641 -54.369 -56.063 -57.471 -58.693 -59.83 -60.878 -61.872 -62.771 -63.66 -64.427 -65.1 -65.798 -66.485 -67.056 -67.642 -68.248 -68.718 -69.212 -69.717 -70.227 -70.763 -71.122 -71.483 -72.04 -72.433 -72.839 -73.042 -73.483 -73.956 -74.425 -74.673 -75.072 -75.521 -75.83 -76.15 -76.853 -77.257 -77.693 -78.175 -78.766 -79.53 -80.801 -91.618 -5 ,16851 ,TETRA ,17607171,Sun Nov 28 21:41:38 CET,Mon Nov 29 00:05:00 CET,0.0 0.333 0.452 0.575 0.7 0.767 0.819 0.858 0.925 0.95 0.968 0.939 1.015 1.028 1.056 1.054 1.035 1.023 0.994 0.968 0.938 0.912 0.875 0.812 0.743 0.667 0.597 0.527 0.427 0.311 0.174 0.003 -0.177 -0.371 -0.603 -0.867 -1.13 -1.437 -1.789 -2.209 -2.702 -3.314 -4.112 -4.974 -6.039 -7.428 -9.312 -11.657 -14.734 -19.094 -25.809 -32.874 -38.165 -42.354 -45.719 -48.595 -51.012 -53.096 -54.834 -56.483 -57.855 -59.087 -60.219 -61.258 -62.22 -63.077 -63.95 -64.713 -65.378 -66.05 -66.76 -67.369 -67.997 -68.629 -69.115 -69.62 -70.142 -70.693 -71.257 -71.652 -72.069 -72.688 -73.072 -73.475 -73.696 -74.126 -74.577 -75.066 -75.323 -75.72 -76.158 -76.46 -76.822 -77.613 -78.012 -78.481 -79.032 -79.625 -80.469 -81.582 -86.528 -7 ,23388 ,TETRA ,17607173,Sun Nov 28 21:42:09 CET,Mon Nov 29 00:04:36 CET,0.0 0.447 0.569 0.676 0.779 0.827 0.86 0.904 0.969 0.995 1.009 0.947 1.026 1.04 1.052 1.038 1.011 0.995 0.96 0.923 0.862 0.824 0.781 0.718 0.655 0.589 0.516 0.43 0.314 0.191 0.058 -0.122 -0.305 -0.494 -0.742 -1.028 -1.308 -1.648 -2.051 -2.51 -3.027 -3.656 -4.456 -5.282 -6.326 -7.625 -9.316 -11.599 -14.674 -19.06 -25.779 -32.92 -38.238 -42.388 -45.763 -48.655 -51.049 -53.136 -54.882 -56.559 -57.974 -59.202 -60.341 -61.425 -62.405 -63.245 -64.095 -64.85 -65.511 -66.187 -66.878 -67.449 -68.033 -68.647 -69.116 -69.584 -70.091 -70.622 -71.164 -71.543 -71.932 -72.515 -72.907 -73.331 -73.556 -74.018 -74.488 -74.976 -75.24 -75.649 -76.113 -76.388 -76.636 -77.268 -77.666 -78.111 -78.65 -79.293 -80.037 -81.068 -86.517 -8 ,29854 ,TETRA ,17607174,Sun Nov 28 21:42:09 CET,Sun Nov 28 23:41:58 CET,0.0 0.346 0.397 0.45 0.489 0.518 0.544 0.566 0.587 0.589 0.599 0.546 0.618 0.626 0.616 0.606 0.605 0.6 0.586 0.561 0.502 0.458 0.414 0.344 0.264 0.182 0.095 0.014 -0.092 -0.226 -0.363 -0.525 -0.707 -0.906 -1.141 -1.432 -1.737 -2.073 -2.449 -2.895 -3.394 -4.007 -4.826 -5.732 -6.874 -8.327 -10.164 -12.492 -15.698 -20.175 -27.083 -34.56 -40.067 -44.345 -47.827 -50.73 -53.141 -55.234 -56.975 -58.66 -60.052 -61.251 -62.373 -63.409 -64.351 -65.197 -66.06 -66.798 -67.421 -68.058 -68.711 -69.259 -69.84 -70.475 -70.952 -71.452 -71.971 -72.478 -72.996 -73.333 -73.684 -74.253 -74.631 -75.012 -75.21 -75.643 -76.094 -76.548 -76.796 -77.168 -77.542 -77.825 -78.153 -78.912 -79.333 -79.781 -80.308 -80.907 -81.567 -82.654 -91.261 -9 ,17789 ,TETRA ,17607175,Sun Nov 28 21:44:08 CET,Sun Nov 28 23:57:29 CET,0.0 0.191 0.314 0.375 0.443 0.517 0.59 0.654 0.741 0.774 0.804 0.782 0.859 0.865 0.854 0.826 0.791 0.77 0.737 0.722 0.688 0.654 0.622 0.569 0.508 0.439 0.364 0.297 0.192 0.069 -0.056 -0.217 -0.392 -0.57 -0.797 -1.071 -1.347 -1.661 -2.027 -2.465 -2.948 -3.522 -4.248 -5.067 -6.13 -7.475 -9.241 -11.49 -14.531 -18.875 -25.628 -32.9 -38.339 -42.654 -46.147 -49.095 -51.563 -53.735 -55.546 -57.298 -58.778 -60.075 -61.272 -62.347 -63.339 -64.269 -65.219 -66.035 -66.725 -67.439 -68.198 -68.814 -69.452 -70.137 -70.669 -71.219 -71.794 -72.361 -72.894 -73.266 -73.662 -74.275 -74.705 -75.131 -75.342 -75.806 -76.306 -76.79 -77.03 -77.426 -77.86 -78.177 -78.522 -79.184 -79.535 -79.952 -80.445 -80.955 -81.487 -82.538 nan -10 ,13483 ,TETRA ,17607176,Sun Nov 28 21:44:09 CET,Sun Nov 28 23:56:05 CET,0.0 0.561 0.781 0.91 0.975 1.037 1.082 1.114 1.171 1.199 1.218 1.178 1.256 1.269 1.283 1.269 1.251 1.245 1.226 1.205 1.181 1.171 1.154 1.101 1.045 0.977 0.898 0.815 0.709 0.602 0.493 0.35 0.207 0.064 -0.131 -0.368 -0.608 -0.901 -1.245 -1.634 -2.072 -2.644 -3.414 -4.27 -5.356 -6.662 -8.332 -10.545 -13.568 -17.856 -24.282 -31.361 -36.781 -41.098 -44.672 -47.716 -50.251 -52.449 -54.267 -55.993 -57.431 -58.676 -59.829 -60.913 -61.912 -62.803 -63.757 -64.597 -65.287 -65.986 -66.684 -67.287 -67.915 -68.536 -69.032 -69.535 -70.038 -70.575 -71.114 -71.472 -71.843 -72.426 -72.861 -73.351 -73.594 -74.069 -74.571 -75.097 -75.369 -75.782 -76.254 -76.555 -76.865 -77.604 -78.038 -78.507 -79.052 -79.756 -80.678 -81.755 nan diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index a6fcb1d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12676 ,TETRA ,17607177,Sun Nov 28 21:44:10 CET,Sun Nov 28 23:53:35 CET,0.0 1.471 1.925 2.245 2.515 2.754 2.982 3.191 3.526 3.672 3.813 3.975 4.227 4.358 4.579 4.789 4.995 5.097 5.301 5.489 5.748 5.913 6.075 6.316 6.551 6.778 6.986 7.177 7.425 7.669 7.903 8.189 8.48 8.75 9.045 9.376 9.686 10.037 10.428 10.837 11.257 11.724 12.262 12.787 13.36 13.992 14.771 15.542 16.249 16.838 17.218 17.068 16.488 15.753 14.966 14.204 13.512 12.9 12.3 11.642 11.115 10.647 10.178 9.721 9.264 8.81 8.361 7.997 7.69 7.355 6.983 6.661 6.313 5.999 5.772 5.514 5.249 4.973 4.687 4.497 4.292 3.949 3.71 3.46 3.333 3.074 2.805 2.515 2.351 2.067 1.831 1.655 1.455 1.058 0.82 0.512 0.216 -0.112 -0.596 -1.266 -2.757 -2 ,28754 ,TETRA ,17607178,Sun Nov 28 21:44:09 CET,Sun Nov 28 23:59:59 CET,0.0 0.811 1.079 1.299 1.497 1.675 1.849 1.995 2.284 2.443 2.592 2.756 2.993 3.122 3.373 3.586 3.793 3.895 4.093 4.275 4.526 4.692 4.871 5.133 5.379 5.618 5.842 6.041 6.284 6.505 6.715 6.985 7.243 7.48 7.76 8.085 8.371 8.682 9.034 9.412 9.812 10.257 10.781 11.282 11.887 12.513 13.146 13.85 14.43 14.836 15.12 14.752 14.047 13.285 12.555 11.85 11.212 10.637 10.09 9.493 8.965 8.508 8.044 7.594 7.203 6.833 6.444 6.111 5.816 5.494 5.154 4.862 4.557 4.227 3.978 3.741 3.467 3.158 2.848 2.643 2.428 2.089 1.851 1.597 1.463 1.175 0.874 0.584 0.429 0.144 -0.138 -0.353 -0.559 -1.0 -1.254 -1.544 -1.876 -2.236 -2.659 -3.326 -5.525 -3 ,22729 ,TETRA ,17607179,Sun Nov 28 21:46:08 CET,Sun Nov 28 23:54:10 CET,0.0 0.713 1.057 1.335 1.584 1.787 1.95 2.097 2.346 2.471 2.609 2.77 3.013 3.143 3.375 3.603 3.831 3.939 4.137 4.327 4.622 4.807 4.97 5.207 5.473 5.742 5.986 6.196 6.441 6.681 6.947 7.27 7.554 7.815 8.105 8.44 8.755 9.088 9.457 9.853 10.26 10.726 11.258 11.752 12.333 12.976 13.592 14.165 14.775 15.342 15.646 15.246 14.495 13.704 12.996 12.308 11.629 11.027 10.514 9.982 9.472 8.983 8.54 8.146 7.763 7.402 7.018 6.657 6.343 6.006 5.643 5.337 5.016 4.696 4.459 4.219 3.954 3.677 3.414 3.224 3.016 2.697 2.478 2.24 2.118 1.866 1.592 1.303 1.152 0.888 0.65 0.449 0.249 -0.249 -0.574 -0.925 -1.285 -1.664 -2.192 -2.873 -5.436 -4 ,19924 ,TETRA ,17607180,Sun Nov 28 21:48:05 CET,Mon Nov 29 00:11:28 CET,0.0 0.551 0.825 1.054 1.242 1.427 1.618 1.81 2.135 2.265 2.398 2.535 2.749 2.852 3.045 3.235 3.442 3.543 3.743 3.944 4.223 4.388 4.541 4.776 5.014 5.247 5.463 5.671 5.932 6.167 6.4 6.693 6.967 7.221 7.52 7.874 8.217 8.615 9.048 9.491 9.956 10.477 11.041 11.606 12.267 12.912 13.552 14.255 14.994 15.625 15.783 15.188 14.374 13.6 12.937 12.274 11.597 10.922 10.297 9.681 9.144 8.641 8.173 7.746 7.339 6.947 6.504 6.086 5.738 5.383 5.013 4.705 4.372 4.034 3.793 3.548 3.29 3.009 2.697 2.485 2.234 1.82 1.556 1.293 1.16 0.88 0.582 0.286 0.123 -0.173 -0.455 -0.668 -0.887 -1.384 -1.698 -2.062 -2.455 -2.834 -3.307 -4.087 -6.555 -5 ,10980 ,TETRA ,17607181,Sun Nov 28 21:48:06 CET,Mon Nov 29 00:12:45 CET,0.0 0.748 1.089 1.32 1.513 1.683 1.856 2.018 2.305 2.448 2.579 2.712 2.943 3.059 3.281 3.503 3.716 3.812 4.011 4.226 4.525 4.697 4.852 5.081 5.313 5.529 5.739 5.947 6.217 6.495 6.753 7.037 7.301 7.554 7.862 8.223 8.539 8.858 9.205 9.589 10.008 10.472 11.027 11.591 12.211 12.865 13.522 14.149 14.84 15.536 15.908 15.574 14.852 14.023 13.233 12.503 11.866 11.261 10.669 10.029 9.492 9.025 8.558 8.105 7.673 7.265 6.86 6.499 6.183 5.849 5.497 5.182 4.842 4.491 4.224 3.948 3.655 3.359 3.059 2.85 2.625 2.256 1.987 1.7 1.551 1.244 0.934 0.595 0.406 0.105 -0.181 -0.389 -0.604 -1.041 -1.266 -1.537 -1.847 -2.19 -2.622 -3.181 -5.188 -6 ,29356 ,TETRA ,17607182,Sun Nov 28 21:49:07 CET,Mon Nov 29 00:11:48 CET,0.0 0.915 1.243 1.492 1.707 1.897 2.082 2.257 2.555 2.697 2.839 2.999 3.23 3.346 3.577 3.789 3.983 4.07 4.249 4.417 4.654 4.807 4.962 5.185 5.394 5.611 5.83 6.034 6.287 6.544 6.802 7.116 7.419 7.697 7.996 8.322 8.649 9.017 9.433 9.885 10.342 10.856 11.441 11.997 12.616 13.318 14.108 14.955 15.877 16.676 16.982 16.506 15.811 15.111 14.447 13.784 13.205 12.636 12.054 11.454 10.92 10.399 9.905 9.468 9.043 8.636 8.212 7.836 7.508 7.161 6.808 6.521 6.213 5.866 5.594 5.319 5.039 4.758 4.474 4.269 4.04 3.682 3.442 3.187 3.04 2.733 2.447 2.16 2.003 1.737 1.511 1.313 1.114 0.712 0.488 0.225 -0.075 -0.39 -0.741 -1.234 -2.899 -7 ,9503 ,TETRA ,17607183,Sun Nov 28 21:49:07 CET,Mon Nov 29 00:12:15 CET,0.0 0.893 1.195 1.471 1.7 1.896 2.077 2.254 2.582 2.723 2.86 3.024 3.27 3.396 3.629 3.871 4.101 4.211 4.423 4.62 4.902 5.07 5.227 5.455 5.681 5.905 6.119 6.326 6.58 6.806 7.033 7.323 7.612 7.892 8.202 8.526 8.844 9.212 9.603 10.023 10.448 10.889 11.386 11.913 12.544 13.208 13.935 14.762 15.642 16.28 16.501 16.285 15.713 15.046 14.315 13.532 12.804 12.106 11.476 10.806 10.221 9.697 9.209 8.754 8.294 7.869 7.43 7.029 6.68 6.312 5.946 5.644 5.327 4.997 4.739 4.465 4.15 3.837 3.54 3.318 3.08 2.719 2.474 2.21 2.059 1.739 1.393 1.019 0.845 0.573 0.297 0.062 -0.184 -0.672 -0.942 -1.225 -1.525 -1.878 -2.316 -2.921 -4.605 -8 ,15940 ,TETRA ,17607184,Sun Nov 28 21:50:05 CET,Mon Nov 29 00:12:58 CET,0.0 0.793 1.181 1.497 1.711 1.918 2.114 2.274 2.583 2.734 2.877 3.024 3.26 3.378 3.623 3.859 4.081 4.188 4.398 4.588 4.853 5.021 5.186 5.429 5.653 5.875 6.083 6.268 6.513 6.752 6.984 7.275 7.551 7.814 8.113 8.452 8.777 9.127 9.508 9.922 10.349 10.812 11.341 11.86 12.482 13.167 13.884 14.62 15.316 15.988 16.539 16.199 15.515 14.761 13.935 13.095 12.313 11.592 10.969 10.337 9.789 9.299 8.839 8.407 7.992 7.606 7.198 6.804 6.436 6.044 5.649 5.327 4.986 4.651 4.405 4.143 3.866 3.582 3.276 3.068 2.838 2.451 2.183 1.897 1.746 1.445 1.138 0.798 0.632 0.357 0.1 -0.099 -0.317 -0.831 -1.128 -1.472 -1.83 -2.181 -2.627 -3.33 -6.402 -9 ,14104 ,TETRA ,17607185,Sun Nov 28 21:50:06 CET,Mon Nov 29 00:13:41 CET,0.0 1.114 1.497 1.755 2.016 2.258 2.483 2.693 3.052 3.198 3.349 3.514 3.763 3.904 4.156 4.398 4.635 4.749 4.953 5.136 5.411 5.587 5.773 6.042 6.286 6.535 6.768 6.98 7.271 7.572 7.853 8.168 8.48 8.78 9.115 9.48 9.848 10.278 10.722 11.162 11.623 12.155 12.766 13.37 14.041 14.772 15.58 16.352 17.114 17.879 18.274 17.828 17.038 16.295 15.633 14.9 14.213 13.568 12.948 12.331 11.806 11.311 10.808 10.335 9.9 9.483 9.024 8.611 8.244 7.837 7.425 7.086 6.717 6.321 6.03 5.736 5.411 5.085 4.762 4.535 4.29 3.909 3.632 3.345 3.215 2.956 2.666 2.355 2.209 1.939 1.656 1.453 1.249 0.791 0.537 0.252 -0.109 -0.595 -1.218 -2.003 -4.737 -10 ,29479 ,TETRA ,17607186,Sun Nov 28 21:50:06 CET,Mon Nov 29 00:04:21 CET,0.0 0.706 1.031 1.311 1.542 1.744 1.918 2.059 2.315 2.451 2.59 2.724 2.947 3.06 3.269 3.463 3.664 3.771 3.981 4.168 4.435 4.605 4.772 5.01 5.233 5.456 5.678 5.903 6.187 6.439 6.687 6.99 7.276 7.551 7.865 8.222 8.566 8.94 9.349 9.769 10.182 10.643 11.237 11.859 12.511 13.186 13.941 14.753 15.58 16.286 16.698 16.301 15.621 14.906 14.186 13.515 12.917 12.347 11.811 11.235 10.718 10.255 9.825 9.435 9.065 8.72 8.368 8.028 7.724 7.395 7.045 6.769 6.483 6.18 5.934 5.682 5.429 5.185 4.927 4.74 4.545 4.236 4.017 3.791 3.661 3.379 3.094 2.789 2.631 2.354 2.1 1.916 1.719 1.299 1.064 0.759 0.386 0.013 -0.424 -1.057 -3.27 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt deleted file mode 100644 index ec2a694c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23538 ,KEBNE ,17027762,Wed Dec 22 17:57:39 CET,Wed Dec 22 20:01:20 CET,0.0 2.758 3.313 3.729 4.104 4.413 4.657 4.874 5.279 5.466 5.659 5.918 6.195 6.344 6.631 6.9 7.16 7.29 7.55 7.785 8.114 8.346 8.567 8.879 9.164 9.433 9.69 9.93 10.247 10.555 10.854 11.226 11.555 11.874 12.272 12.696 13.095 13.537 13.98 14.451 14.932 15.444 16.047 16.631 17.285 17.974 18.723 19.497 20.184 20.701 20.921 20.279 19.314 18.295 17.298 16.433 15.634 14.845 14.141 13.44 12.844 12.307 11.779 11.289 10.825 10.392 9.934 9.488 9.094 8.698 8.287 7.974 7.653 7.283 6.992 6.688 6.368 6.046 5.713 5.491 5.267 4.905 4.633 4.349 4.207 3.895 3.553 3.165 2.949 2.62 2.327 2.11 1.882 1.416 1.155 0.862 0.51 0.06 -0.479 -1.177 -3.799 -2 ,28553 ,KEBNE ,17027763,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 20:01:27 CET,0.0 3.083 3.731 4.222 4.662 5.054 5.401 5.684 6.206 6.465 6.699 7.007 7.32 7.535 7.928 8.294 8.638 8.792 9.089 9.377 9.776 10.022 10.258 10.616 10.961 11.295 11.627 11.921 12.273 12.603 12.912 13.26 13.583 13.909 14.285 14.737 15.181 15.621 16.103 16.612 17.102 17.626 18.179 18.691 19.291 19.909 20.553 21.296 22.017 22.617 22.951 22.536 21.8 20.824 19.824 18.928 18.091 17.277 16.597 15.962 15.391 14.86 14.348 13.841 13.354 12.922 12.463 12.039 11.688 11.312 10.884 10.526 10.189 9.886 9.635 9.351 9.068 8.755 8.426 8.2 7.97 7.597 7.323 7.049 6.898 6.579 6.253 5.918 5.739 5.443 5.173 4.931 4.678 4.177 3.894 3.592 3.268 2.912 2.462 1.811 -2.117 -3 ,3992 ,KEBNE ,17027764,Wed Dec 22 17:57:39 CET,Wed Dec 22 20:00:49 CET,0.0 3.324 4.138 4.685 5.109 5.474 5.814 6.112 6.632 6.867 7.082 7.363 7.652 7.823 8.183 8.524 8.854 9.0 9.277 9.556 9.938 10.174 10.398 10.742 11.089 11.392 11.658 11.913 12.263 12.595 12.904 13.29 13.647 13.989 14.399 14.825 15.205 15.621 16.055 16.518 16.998 17.52 18.134 18.752 19.437 20.102 20.741 21.367 22.021 22.597 22.709 22.166 21.362 20.349 19.418 18.578 17.768 17.01 16.338 15.695 15.149 14.648 14.129 13.621 13.165 12.735 12.276 11.865 11.508 11.139 10.742 10.385 10.023 9.661 9.384 9.091 8.765 8.429 8.086 7.843 7.584 7.183 6.895 6.598 6.446 6.118 5.762 5.359 5.157 4.819 4.457 4.201 3.959 3.49 3.202 2.887 2.568 2.175 1.665 1.049 -1.162 -4 ,21060 ,KEBNE ,17027765,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 20:01:06 CET,0.0 2.082 2.774 3.226 3.597 3.933 4.224 4.482 4.915 5.121 5.331 5.577 5.84 5.99 6.274 6.523 6.781 6.912 7.19 7.454 7.803 8.011 8.197 8.475 8.753 9.036 9.308 9.559 9.861 10.153 10.449 10.813 11.163 11.498 11.872 12.264 12.626 13.012 13.429 13.9 14.417 14.955 15.542 16.132 16.782 17.488 18.189 18.77 19.302 19.741 19.827 19.253 18.456 17.581 16.648 15.653 14.733 13.896 13.197 12.509 11.89 11.316 10.768 10.259 9.753 9.281 8.796 8.353 7.99 7.642 7.26 6.93 6.588 6.237 5.967 5.672 5.36 5.048 4.724 4.493 4.255 3.894 3.638 3.345 3.198 2.912 2.605 2.268 2.091 1.79 1.482 1.27 1.066 0.611 0.352 0.068 -0.267 -0.688 -1.157 -1.688 -4.39 -5 ,9330 ,KEBNE ,17027766,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 20:01:14 CET,0.0 2.237 2.931 3.38 3.732 4.072 4.391 4.674 5.152 5.364 5.576 5.818 6.085 6.244 6.556 6.838 7.121 7.256 7.507 7.756 8.111 8.331 8.532 8.824 9.118 9.414 9.698 9.984 10.338 10.663 10.983 11.362 11.709 12.013 12.387 12.837 13.251 13.687 14.157 14.609 15.036 15.55 16.17 16.768 17.4 18.019 18.706 19.414 20.156 20.908 21.302 20.977 20.306 19.384 18.431 17.555 16.729 15.941 15.258 14.578 13.974 13.441 12.956 12.483 12.029 11.613 11.166 10.756 10.399 10.037 9.666 9.325 8.93 8.54 8.253 7.931 7.56 7.162 6.774 6.488 6.17 5.684 5.354 5.05 4.895 4.557 4.23 3.871 3.662 3.326 2.983 2.755 2.502 1.909 1.616 1.295 0.903 0.457 -0.065 -0.779 -4.79 -6 ,6972 ,KEBNE ,17027767,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 20:00:39 CET,0.0 4.004 4.752 5.332 5.755 6.077 6.411 6.759 7.363 7.623 7.853 8.164 8.483 8.692 9.055 9.367 9.659 9.816 10.128 10.412 10.836 11.099 11.326 11.632 11.921 12.212 12.496 12.756 13.099 13.449 13.778 14.132 14.466 14.821 15.232 15.666 16.062 16.484 16.933 17.42 17.947 18.495 19.058 19.569 20.098 20.688 21.322 21.856 22.342 22.724 22.652 21.867 20.875 19.94 19.091 18.193 17.38 16.666 16.001 15.296 14.693 14.184 13.683 13.172 12.701 12.273 11.799 11.375 11.019 10.641 10.236 9.92 9.587 9.236 8.965 8.662 8.323 7.969 7.633 7.407 7.153 6.722 6.412 6.09 5.933 5.644 5.359 5.035 4.846 4.528 4.173 3.918 3.661 3.116 2.814 2.475 2.126 1.735 1.259 0.57 -4.47 -7 ,32647 ,KEBNE ,17027768,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 20:01:06 CET,0.0 3.044 3.698 4.251 4.659 5.007 5.312 5.553 6.014 6.248 6.453 6.715 7.02 7.2 7.557 7.886 8.188 8.337 8.613 8.877 9.254 9.504 9.728 10.042 10.365 10.676 10.962 11.221 11.586 11.943 12.272 12.652 13.005 13.351 13.735 14.153 14.566 15.0 15.433 15.869 16.339 16.883 17.497 18.077 18.732 19.439 20.17 20.902 21.58 21.885 21.487 20.58 19.461 18.364 17.413 16.502 15.639 14.795 14.089 13.39 12.767 12.221 11.673 11.137 10.662 10.218 9.762 9.362 9.005 8.639 8.258 7.937 7.591 7.233 6.964 6.704 6.431 6.124 5.789 5.547 5.307 4.956 4.714 4.448 4.315 4.07 3.793 3.475 3.294 2.971 2.666 2.445 2.212 1.702 1.403 1.085 0.713 0.239 -0.375 -1.234 -4.599 -8 ,10068 ,KEBNE ,17027769,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 20:01:11 CET,0.0 2.706 3.515 4.073 4.534 4.956 5.328 5.654 6.218 6.462 6.699 6.997 7.296 7.462 7.747 8.02 8.29 8.435 8.712 8.954 9.304 9.529 9.756 10.123 10.477 10.76 10.996 11.238 11.571 11.914 12.246 12.631 13.005 13.348 13.74 14.208 14.617 15.05 15.517 15.996 16.494 17.032 17.669 18.296 19.004 19.709 20.397 21.112 21.802 22.347 22.409 21.578 20.467 19.408 18.416 17.487 16.704 15.975 15.302 14.611 13.995 13.43 12.93 12.461 11.967 11.512 11.082 10.7 10.341 9.949 9.535 9.2 8.861 8.515 8.232 7.914 7.607 7.309 6.977 6.738 6.509 6.154 5.882 5.586 5.441 5.132 4.791 4.415 4.204 3.871 3.568 3.344 3.112 2.566 2.248 1.918 1.596 1.208 0.679 0.006 -1.977 -9 ,4540 ,KEBNE ,17027770,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 20:02:34 CET,0.0 2.777 3.637 4.215 4.709 5.132 5.492 5.786 6.344 6.6 6.81 7.094 7.391 7.57 7.928 8.271 8.598 8.752 9.054 9.341 9.776 10.064 10.325 10.685 11.041 11.366 11.642 11.916 12.287 12.626 12.961 13.389 13.796 14.182 14.616 15.094 15.561 16.055 16.558 17.092 17.634 18.184 18.761 19.318 19.896 20.44 21.071 21.726 22.326 22.639 22.531 21.939 21.022 20.029 19.0 18.013 17.219 16.458 15.74 15.055 14.46 13.904 13.392 12.924 12.489 12.095 11.666 11.278 10.941 10.577 10.201 9.882 9.532 9.177 8.914 8.642 8.354 8.057 7.75 7.556 7.371 7.047 6.817 6.595 6.47 6.178 5.867 5.538 5.367 5.056 4.767 4.549 4.316 3.786 3.484 3.168 2.787 2.311 1.772 1.005 -9.08 -10 ,11651 ,KEBNE ,17027771,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 20:01:07 CET,0.0 4.272 4.992 5.583 6.001 6.309 6.591 6.875 7.407 7.641 7.843 8.1 8.391 8.567 8.891 9.178 9.469 9.616 9.88 10.125 10.498 10.749 10.964 11.261 11.564 11.844 12.099 12.333 12.653 12.993 13.322 13.685 14.024 14.363 14.748 15.16 15.555 16.003 16.476 16.943 17.413 17.948 18.567 19.17 19.873 20.645 21.396 22.02 22.609 23.085 23.173 22.465 21.383 20.336 19.381 18.447 17.648 16.88 16.133 15.415 14.814 14.212 13.607 13.082 12.582 12.114 11.662 11.263 10.892 10.489 10.088 9.76 9.394 9.02 8.749 8.45 8.108 7.757 7.392 7.131 6.862 6.436 6.15 5.853 5.684 5.317 4.941 4.564 4.379 4.062 3.781 3.576 3.36 2.908 2.657 2.369 2.054 1.703 1.263 0.635 -8.777 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt deleted file mode 100644 index da442fc8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22376 ,TETRA ,17607187,Sun Nov 28 21:50:06 CET,Mon Nov 29 00:13:52 CET,0.0 0.765 1.091 1.358 1.581 1.769 1.938 2.085 2.38 2.519 2.646 2.778 2.995 3.098 3.295 3.486 3.673 3.765 3.939 4.101 4.333 4.485 4.641 4.865 5.07 5.264 5.446 5.629 5.85 6.045 6.25 6.487 6.7 6.903 7.122 7.379 7.658 7.971 8.292 8.598 8.914 9.276 9.689 10.069 10.441 10.826 11.269 11.746 12.246 12.711 12.749 12.01 11.112 10.269 9.519 8.795 8.148 7.592 7.092 6.573 6.136 5.736 5.336 4.953 4.573 4.194 3.8 3.464 3.176 2.892 2.594 2.334 2.07 1.796 1.577 1.333 1.089 0.852 0.596 0.394 0.183 -0.102 -0.287 -0.492 -0.598 -0.809 -1.045 -1.288 -1.417 -1.675 -1.862 -2.029 -2.206 -2.581 -2.781 -3.013 -3.269 -3.566 -3.922 -4.316 -5.64 -2 ,26338 ,TETRA ,17607188,Sun Nov 28 21:50:08 CET,Mon Nov 29 00:14:24 CET,0.0 0.533 0.812 1.043 1.219 1.367 1.527 1.688 1.937 2.061 2.188 2.314 2.543 2.648 2.84 3.031 3.225 3.319 3.507 3.687 3.921 4.077 4.233 4.448 4.652 4.848 5.031 5.213 5.449 5.672 5.88 6.125 6.358 6.58 6.828 7.098 7.356 7.647 7.968 8.293 8.63 9.016 9.434 9.844 10.326 10.845 11.385 11.858 12.322 12.727 12.652 12.013 11.284 10.55 9.824 9.12 8.527 7.99 7.484 6.957 6.479 6.035 5.605 5.188 4.808 4.466 4.111 3.804 3.538 3.245 2.935 2.672 2.402 2.107 1.869 1.632 1.391 1.15 0.89 0.702 0.519 0.242 0.05 -0.148 -0.252 -0.481 -0.725 -0.993 -1.141 -1.403 -1.622 -1.787 -1.95 -2.303 -2.481 -2.684 -2.924 -3.183 -3.496 -3.94 -5.237 -3 ,32434 ,TETRA ,17607189,Sun Nov 28 21:50:10 CET,Mon Nov 29 00:14:46 CET,0.0 0.795 1.083 1.307 1.49 1.641 1.805 1.951 2.161 2.263 2.381 2.522 2.741 2.838 3.04 3.232 3.413 3.501 3.662 3.807 4.018 4.163 4.297 4.491 4.688 4.887 5.077 5.242 5.434 5.629 5.836 6.102 6.357 6.586 6.848 7.137 7.399 7.68 7.973 8.281 8.601 8.965 9.38 9.779 10.235 10.719 11.25 11.77 12.239 12.599 12.582 12.032 11.377 10.659 9.968 9.372 8.774 8.178 7.672 7.138 6.65 6.225 5.828 5.443 5.073 4.729 4.387 4.08 3.799 3.497 3.184 2.92 2.622 2.327 2.117 1.885 1.631 1.374 1.115 0.931 0.737 0.402 0.157 -0.075 -0.186 -0.425 -0.688 -0.973 -1.122 -1.392 -1.592 -1.747 -1.91 -2.262 -2.467 -2.688 -2.929 -3.21 -3.545 -3.987 -5.733 -4 ,5456 ,TETRA ,17607190,Sun Nov 28 21:50:06 CET,Mon Nov 29 00:08:32 CET,0.0 0.537 0.835 1.088 1.283 1.474 1.662 1.815 2.063 2.182 2.3 2.428 2.654 2.761 2.964 3.157 3.335 3.427 3.596 3.739 3.959 4.103 4.234 4.427 4.619 4.801 4.988 5.172 5.378 5.578 5.788 6.031 6.256 6.473 6.722 7.001 7.28 7.569 7.872 8.214 8.563 8.931 9.37 9.801 10.219 10.639 11.119 11.574 11.93 12.201 12.315 11.903 11.223 10.509 9.802 9.13 8.53 7.976 7.501 6.99 6.525 6.111 5.705 5.333 4.985 4.647 4.282 3.957 3.67 3.382 3.097 2.85 2.596 2.324 2.106 1.879 1.621 1.335 1.055 0.879 0.707 0.441 0.251 0.046 -0.058 -0.271 -0.522 -0.811 -0.953 -1.208 -1.383 -1.549 -1.716 -2.052 -2.257 -2.473 -2.697 -2.986 -3.364 -3.878 -5.225 -5 ,9934 ,TETRA ,17607191,Sun Nov 28 21:50:06 CET,Sun Nov 28 23:59:35 CET,0.0 0.967 1.263 1.509 1.708 1.869 2.04 2.213 2.519 2.67 2.805 2.94 3.178 3.303 3.527 3.714 3.894 3.979 4.137 4.285 4.494 4.647 4.808 5.024 5.215 5.39 5.553 5.71 5.924 6.14 6.348 6.604 6.846 7.081 7.351 7.619 7.874 8.183 8.491 8.787 9.113 9.479 9.865 10.2 10.573 10.981 11.455 11.963 12.42 12.744 12.753 12.176 11.332 10.477 9.741 9.073 8.418 7.793 7.223 6.641 6.148 5.701 5.291 4.915 4.562 4.255 3.92 3.602 3.335 3.043 2.732 2.478 2.208 1.901 1.67 1.454 1.192 0.898 0.626 0.438 0.233 -0.059 -0.264 -0.496 -0.614 -0.859 -1.117 -1.384 -1.528 -1.797 -2.023 -2.202 -2.384 -2.762 -2.977 -3.229 -3.496 -3.762 -4.08 -4.577 -6.543 -6 ,4779 ,TETRA ,17607192,Sun Nov 28 21:50:06 CET,Sun Nov 28 23:56:48 CET,0.0 1.138 1.457 1.694 1.876 2.037 2.197 2.337 2.619 2.752 2.894 3.059 3.287 3.401 3.601 3.768 3.939 4.017 4.161 4.313 4.526 4.663 4.806 5.016 5.228 5.438 5.622 5.789 6.003 6.225 6.452 6.721 6.967 7.19 7.443 7.725 8.007 8.307 8.631 8.968 9.315 9.683 10.08 10.477 10.895 11.312 11.727 12.155 12.631 12.938 12.749 12.094 11.294 10.431 9.659 8.939 8.265 7.624 7.052 6.475 5.987 5.578 5.185 4.789 4.409 4.063 3.701 3.366 3.062 2.754 2.433 2.162 1.877 1.569 1.34 1.106 0.864 0.6 0.326 0.155 -0.028 -0.337 -0.558 -0.773 -0.884 -1.132 -1.406 -1.705 -1.862 -2.131 -2.357 -2.54 -2.705 -3.059 -3.263 -3.474 -3.698 -3.979 -4.36 -4.855 -7.046 -7 ,18534 ,TETRA ,17607193,Sun Nov 28 21:52:06 CET,Mon Nov 29 00:14:50 CET,0.0 0.751 1.081 1.328 1.523 1.704 1.868 2.01 2.268 2.38 2.487 2.584 2.79 2.875 3.043 3.22 3.386 3.467 3.625 3.771 3.999 4.143 4.273 4.477 4.66 4.816 4.981 5.146 5.352 5.557 5.763 6.02 6.257 6.489 6.76 7.052 7.337 7.63 7.924 8.229 8.541 8.874 9.253 9.641 10.057 10.473 10.899 11.276 11.648 11.964 11.963 11.387 10.66 9.943 9.278 8.609 7.971 7.375 6.874 6.392 5.923 5.481 5.092 4.725 4.378 4.058 3.704 3.383 3.11 2.806 2.478 2.224 1.964 1.693 1.48 1.247 1.002 0.761 0.493 0.306 0.123 -0.167 -0.375 -0.606 -0.722 -0.964 -1.227 -1.504 -1.65 -1.921 -2.131 -2.295 -2.48 -2.91 -3.124 -3.345 -3.604 -3.925 -4.281 -4.737 -5.862 -8 ,17904 ,TETRA ,17607194,Sun Nov 28 21:51:04 CET,Mon Nov 29 00:14:05 CET,0.0 0.77 1.075 1.302 1.476 1.636 1.803 1.976 2.262 2.379 2.493 2.6 2.806 2.902 3.082 3.251 3.428 3.512 3.671 3.832 4.072 4.218 4.357 4.57 4.778 4.99 5.193 5.374 5.612 5.844 6.072 6.339 6.588 6.831 7.115 7.43 7.721 8.021 8.339 8.657 8.973 9.34 9.775 10.204 10.675 11.171 11.683 12.218 12.741 13.118 13.189 12.629 11.824 11.053 10.283 9.579 9.028 8.526 8.039 7.521 7.068 6.648 6.248 5.861 5.485 5.146 4.8 4.478 4.181 3.879 3.554 3.267 2.971 2.677 2.456 2.23 2.004 1.763 1.488 1.295 1.108 0.798 0.571 0.343 0.229 -0.004 -0.248 -0.519 -0.665 -0.929 -1.113 -1.282 -1.458 -1.801 -1.99 -2.216 -2.478 -2.768 -3.096 -3.543 -5.266 -9 ,8838 ,TETRA ,17607195,Sun Nov 28 21:51:07 CET,Mon Nov 29 00:14:20 CET,0.0 0.801 1.078 1.28 1.477 1.634 1.788 1.943 2.224 2.36 2.486 2.607 2.832 2.938 3.14 3.333 3.526 3.617 3.799 3.979 4.22 4.376 4.52 4.719 4.919 5.124 5.316 5.495 5.728 5.952 6.159 6.406 6.652 6.88 7.146 7.445 7.706 7.983 8.28 8.589 8.898 9.24 9.652 10.061 10.505 10.969 11.454 11.866 12.174 12.339 12.126 11.333 10.492 9.661 8.865 8.092 7.414 6.809 6.274 5.735 5.228 4.751 4.318 3.927 3.569 3.234 2.871 2.539 2.257 1.958 1.635 1.375 1.113 0.831 0.609 0.391 0.174 -0.057 -0.313 -0.488 -0.671 -0.969 -1.171 -1.377 -1.488 -1.731 -1.985 -2.243 -2.38 -2.634 -2.81 -2.978 -3.175 -3.598 -3.816 -4.031 -4.264 -4.575 -4.984 -5.454 -6.927 -10 ,2272 ,TETRA ,17607196,Sun Nov 28 21:51:04 CET,Mon Nov 29 00:13:27 CET,0.0 0.78 1.116 1.364 1.568 1.746 1.9 2.039 2.31 2.452 2.589 2.724 2.951 3.061 3.269 3.466 3.657 3.742 3.914 4.098 4.34 4.486 4.65 4.888 5.097 5.306 5.499 5.674 5.901 6.117 6.328 6.571 6.793 7.014 7.261 7.531 7.804 8.11 8.428 8.748 9.083 9.449 9.874 10.311 10.76 11.2 11.717 12.288 12.797 13.176 13.255 12.74 12.119 11.459 10.714 9.994 9.322 8.684 8.12 7.537 7.042 6.597 6.175 5.77 5.391 5.039 4.658 4.344 4.084 3.781 3.461 3.198 2.92 2.64 2.419 2.196 1.963 1.731 1.493 1.308 1.11 0.79 0.566 0.351 0.241 0.021 -0.19 -0.445 -0.591 -0.846 -1.029 -1.207 -1.408 -1.822 -2.035 -2.282 -2.533 -2.782 -3.11 -3.566 -5.106 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 1a54e137..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,29283 ,TETRA ,17607198,Sun Nov 28 21:51:07 CET,Mon Nov 29 00:06:58 CET,0.0 3.498 4.205 4.7 5.1 5.445 5.751 6.028 6.538 6.783 7.017 7.262 7.583 7.772 8.141 8.473 8.816 8.988 9.317 9.62 10.024 10.297 10.56 10.917 11.235 11.532 11.82 12.105 12.458 12.795 13.133 13.544 13.95 14.33 14.774 15.265 15.721 16.23 16.787 17.377 17.984 18.663 19.431 20.19 21.071 22.038 23.149 24.338 25.653 27.109 28.611 29.417 29.392 29.142 28.83 28.453 28.044 27.572 27.113 26.607 26.123 25.683 25.25 24.815 24.388 23.987 23.562 23.177 22.838 22.483 22.103 21.763 21.399 21.008 20.701 20.384 20.057 19.717 19.366 19.125 18.866 18.466 18.196 17.924 17.784 17.466 17.126 16.756 16.541 16.175 15.863 15.613 15.305 14.658 14.312 13.917 13.454 12.936 12.368 11.551 7.42 -3 ,728 ,TETRA ,17607199,Sun Nov 28 21:51:04 CET,Mon Nov 29 00:06:46 CET,0.0 2.627 3.291 3.882 4.375 4.794 5.16 5.52 6.222 6.517 6.789 7.153 7.537 7.758 8.212 8.656 9.062 9.247 9.591 9.913 10.369 10.662 10.935 11.317 11.696 12.066 12.419 12.749 13.172 13.593 13.999 14.485 14.956 15.405 15.942 16.545 17.113 17.742 18.42 19.133 19.905 20.765 21.714 22.666 23.777 25.001 26.414 27.936 29.597 31.51 33.708 35.269 35.611 35.356 34.963 34.463 33.97 33.479 33.035 32.56 32.095 31.674 31.235 30.812 30.426 30.051 29.651 29.298 28.966 28.576 28.184 27.856 27.505 27.153 26.857 26.533 26.199 25.841 25.424 25.129 24.84 24.368 24.037 23.712 23.545 23.171 22.76 22.33 22.094 21.714 21.377 21.126 20.866 20.283 19.951 19.593 19.158 18.593 17.904 16.999 7.525 -7 ,14713 ,TETRA ,17607203,Sun Nov 28 21:52:08 CET,Mon Nov 29 00:08:49 CET,0.0 2.262 2.792 3.199 3.531 3.807 4.053 4.284 4.67 4.85 5.031 5.202 5.496 5.644 5.957 6.257 6.526 6.651 6.901 7.15 7.515 7.746 7.973 8.302 8.605 8.896 9.172 9.436 9.779 10.122 10.47 10.894 11.291 11.66 12.099 12.586 13.058 13.597 14.16 14.726 15.31 15.949 16.686 17.414 18.244 19.174 20.241 21.444 23.032 25.228 27.609 28.915 29.255 29.256 28.971 28.406 27.795 27.235 26.75 26.226 25.705 25.177 24.619 24.049 23.528 23.077 22.618 22.204 21.849 21.464 21.058 20.724 20.377 20.016 19.72 19.406 19.077 18.697 18.278 17.999 17.724 17.312 17.014 16.693 16.523 16.155 15.772 15.377 15.163 14.796 14.44 14.186 13.931 13.342 12.998 12.654 12.267 11.77 11.133 10.255 5.641 -9 ,20189 ,TETRA ,17607205,Sun Nov 28 21:52:09 CET,Mon Nov 29 00:12:15 CET,0.0 2.551 3.179 3.661 4.062 4.457 4.828 5.182 5.846 6.136 6.396 6.733 7.128 7.363 7.794 8.187 8.552 8.729 9.072 9.393 9.838 10.121 10.422 10.881 11.286 11.651 12.006 12.345 12.793 13.221 13.627 14.118 14.604 15.088 15.643 16.242 16.814 17.451 18.167 18.961 19.791 20.73 21.806 22.869 24.114 25.511 27.103 28.837 30.82 33.071 35.482 37.085 37.617 37.432 36.936 36.371 35.798 35.209 34.679 34.127 33.636 33.181 32.726 32.307 31.894 31.467 31.01 30.611 30.278 29.936 29.586 29.286 28.95 28.568 28.261 27.956 27.629 27.299 26.984 26.755 26.512 26.125 25.831 25.521 25.362 25.021 24.667 24.281 24.073 23.719 23.396 23.151 22.909 22.398 22.112 21.774 21.349 20.883 20.355 19.572 15.975 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index 267b930b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23865 ,TETRA ,17607207,Sun Nov 28 21:52:11 CET,Mon Nov 29 00:12:42 CET,0.0 1.782 2.343 2.756 3.113 3.419 3.7 3.956 4.385 4.6 4.819 5.087 5.409 5.596 5.929 6.255 6.565 6.709 6.989 7.236 7.565 7.76 7.935 8.198 8.455 8.696 8.928 9.153 9.45 9.735 10.002 10.327 10.626 10.904 11.235 11.599 11.941 12.318 12.711 13.113 13.52 13.992 14.534 15.06 15.681 16.334 17.001 17.683 18.412 19.145 19.787 19.943 19.731 19.356 18.9 18.425 17.925 17.439 16.961 16.441 16.013 15.612 15.208 14.802 14.376 13.961 13.548 13.184 12.852 12.499 12.136 11.839 11.538 11.213 10.949 10.674 10.376 10.055 9.731 9.507 9.265 8.894 8.643 8.36 8.205 7.911 7.622 7.317 7.136 6.809 6.574 6.366 6.138 5.672 5.417 5.14 4.83 4.482 4.042 3.417 1.393 -2 ,18599 ,TETRA ,17607208,Sun Nov 28 21:52:13 CET,Mon Nov 29 00:12:02 CET,0.0 2.583 3.12 3.48 3.774 4.051 4.274 4.488 4.878 5.06 5.228 5.382 5.67 5.83 6.138 6.409 6.658 6.784 7.021 7.232 7.517 7.702 7.881 8.137 8.389 8.652 8.905 9.126 9.406 9.67 9.936 10.249 10.528 10.806 11.134 11.479 11.825 12.269 12.784 13.306 13.822 14.376 15.02 15.615 16.211 16.86 17.575 18.316 19.102 19.896 20.633 20.817 20.537 20.133 19.666 19.115 18.611 18.165 17.745 17.311 16.912 16.508 16.108 15.726 15.385 15.057 14.685 14.35 14.054 13.753 13.434 13.175 12.912 12.61 12.359 12.091 11.811 11.534 11.237 11.016 10.791 10.438 10.207 9.982 9.859 9.593 9.294 8.953 8.782 8.473 8.221 8.027 7.807 7.314 7.053 6.752 6.406 6.033 5.55 4.848 0.724 -3 ,2526 ,TETRA ,17607210,Sun Nov 28 21:52:09 CET,Mon Nov 29 00:12:52 CET,0.0 2.851 3.462 3.94 4.303 4.632 4.92 5.185 5.68 5.891 6.108 6.429 6.767 6.943 7.255 7.53 7.789 7.914 8.15 8.369 8.684 8.878 9.059 9.321 9.568 9.816 10.051 10.285 10.588 10.867 11.121 11.418 11.708 11.99 12.304 12.642 12.981 13.358 13.745 14.143 14.584 15.089 15.654 16.189 16.765 17.386 18.075 18.819 19.604 20.329 20.921 21.008 20.767 20.375 19.931 19.407 18.883 18.4 17.976 17.531 17.109 16.707 16.301 15.922 15.571 15.244 14.884 14.555 14.262 13.954 13.63 13.347 13.048 12.734 12.494 12.239 11.978 11.706 11.402 11.163 10.902 10.496 10.228 9.978 9.854 9.592 9.318 9.009 8.817 8.497 8.301 8.092 7.816 7.17 6.785 6.363 5.895 5.335 4.685 3.895 1.617 -4 ,26511 ,TETRA ,17607211,Sun Nov 28 21:53:05 CET,Mon Nov 29 00:13:40 CET,0.0 2.177 2.757 3.191 3.577 3.934 4.248 4.545 5.038 5.263 5.481 5.743 6.069 6.242 6.583 6.922 7.245 7.396 7.682 7.95 8.333 8.581 8.822 9.165 9.479 9.779 10.083 10.372 10.747 11.112 11.47 11.908 12.325 12.708 13.141 13.632 14.075 14.541 15.049 15.595 16.183 16.854 17.66 18.465 19.376 20.395 21.513 22.74 24.217 25.729 27.008 27.597 27.714 27.6 27.287 26.854 26.393 25.897 25.421 24.926 24.475 24.036 23.571 23.108 22.672 22.268 21.833 21.462 21.17 20.858 20.505 20.2 19.889 19.592 19.361 19.107 18.838 18.559 18.269 18.06 17.832 17.481 17.241 16.982 16.847 16.573 16.28 15.938 15.766 15.473 15.245 15.05 14.848 14.382 14.113 13.803 13.454 13.067 12.606 12.026 2.305 -5 ,6726 ,TETRA ,17607212,Sun Nov 28 21:53:04 CET,Mon Nov 29 00:14:32 CET,0.0 1.229 1.836 2.329 2.725 3.064 3.389 3.68 4.203 4.443 4.679 4.985 5.344 5.542 5.9 6.218 6.49 6.627 6.907 7.165 7.529 7.775 8.006 8.327 8.63 8.934 9.257 9.602 10.025 10.402 10.772 11.206 11.599 11.968 12.405 12.901 13.375 13.894 14.439 15.014 15.62 16.281 17.031 17.783 18.617 19.498 20.564 21.759 23.016 24.273 25.441 25.992 26.043 25.842 25.45 24.907 24.358 23.809 23.325 22.806 22.315 21.884 21.475 21.081 20.67 20.259 19.839 19.489 19.181 18.857 18.521 18.209 17.854 17.482 17.195 16.901 16.591 16.266 15.931 15.677 15.397 14.993 14.709 14.414 14.267 13.933 13.598 13.251 13.062 12.729 12.43 12.206 11.962 11.408 11.118 10.813 10.465 10.057 9.573 8.926 6.468 -7 ,30444 ,TETRA ,17607214,Sun Nov 28 21:54:03 CET,Mon Nov 29 00:14:03 CET,0.0 2.884 3.659 4.12 4.533 4.909 5.219 5.498 6.029 6.261 6.479 6.766 7.102 7.315 7.764 8.167 8.49 8.643 8.943 9.244 9.662 9.907 10.133 10.458 10.773 11.067 11.356 11.642 12.031 12.396 12.733 13.158 13.564 13.952 14.385 14.848 15.294 15.774 16.3 16.89 17.522 18.248 19.087 19.902 20.81 21.799 22.945 24.18 25.56 27.117 28.427 28.721 28.543 28.218 27.789 27.224 26.663 26.2 25.807 25.38 24.948 24.525 24.094 23.648 23.228 22.835 22.419 22.062 21.742 21.385 20.998 20.699 20.401 20.043 19.755 19.48 19.195 18.905 18.608 18.4 18.177 17.806 17.558 17.312 17.184 16.898 16.589 16.251 16.06 15.738 15.493 15.286 15.05 14.499 14.173 13.777 13.318 12.805 12.183 11.359 4.794 -8 ,1376 ,TETRA ,17607215,Sun Nov 28 21:54:04 CET,Mon Nov 29 00:09:03 CET,0.0 2.217 2.757 3.124 3.463 3.819 4.143 4.439 4.935 5.156 5.378 5.665 5.999 6.196 6.582 6.921 7.211 7.345 7.612 7.871 8.284 8.563 8.824 9.211 9.541 9.822 10.13 10.439 10.793 11.127 11.463 11.879 12.265 12.628 13.084 13.616 14.097 14.594 15.13 15.703 16.303 17.001 17.796 18.573 19.468 20.42 21.563 22.859 24.181 25.465 26.5 26.778 26.582 26.209 25.759 25.247 24.711 24.219 23.785 23.291 22.857 22.478 22.113 21.746 21.37 21.025 20.632 20.257 19.953 19.64 19.302 19.005 18.701 18.406 18.168 17.913 17.635 17.3 16.945 16.712 16.472 16.109 15.862 15.61 15.475 15.202 14.915 14.583 14.414 14.121 13.873 13.663 13.451 12.975 12.706 12.408 12.073 11.714 11.279 10.674 7.584 -9 ,30317 ,TETRA ,17607216,Sun Nov 28 21:54:05 CET,Mon Nov 29 00:14:47 CET,0.0 2.729 3.594 4.043 4.448 4.807 5.101 5.365 5.868 6.087 6.296 6.581 6.892 7.05 7.365 7.682 7.984 8.126 8.41 8.684 9.072 9.308 9.527 9.862 10.184 10.483 10.772 11.054 11.418 11.778 12.129 12.534 12.907 13.29 13.75 14.246 14.71 15.2 15.728 16.304 16.916 17.622 18.438 19.2 20.02 20.964 22.105 23.391 24.747 26.185 27.74 28.391 28.37 28.132 27.755 27.282 26.804 26.356 25.935 25.468 25.056 24.66 24.281 23.922 23.569 23.249 22.899 22.582 22.298 21.974 21.632 21.358 21.062 20.735 20.484 20.218 19.932 19.655 19.366 19.137 18.897 18.538 18.281 18.017 17.88 17.57 17.242 16.924 16.748 16.421 16.138 15.91 15.679 15.196 14.931 14.607 14.225 13.772 13.175 12.403 8.152 -10 ,25144 ,TETRA ,17607217,Sun Nov 28 21:54:03 CET,Mon Nov 29 00:15:23 CET,0.0 2.025 2.627 3.091 3.466 3.823 4.154 4.427 4.913 5.148 5.375 5.66 5.98 6.151 6.476 6.795 7.095 7.241 7.531 7.802 8.194 8.448 8.695 9.044 9.386 9.719 10.053 10.372 10.781 11.176 11.545 11.984 12.4 12.8 13.261 13.755 14.211 14.695 15.211 15.771 16.355 16.994 17.798 18.653 19.574 20.549 21.677 22.891 24.211 25.486 26.533 26.956 26.826 26.388 25.832 25.274 24.725 24.171 23.682 23.214 22.819 22.441 22.047 21.666 21.307 20.962 20.588 20.248 19.958 19.658 19.324 19.037 18.749 18.442 18.2 17.943 17.683 17.4 17.083 16.879 16.678 16.353 16.122 15.863 15.723 15.428 15.115 14.783 14.603 14.295 14.055 13.849 13.651 13.208 12.934 12.651 12.338 11.972 11.534 10.954 8.893 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index eb71df9c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1045 ,TETRA ,17607218,Sun Nov 28 21:54:03 CET,Mon Nov 29 00:11:02 CET,0.0 1.728 2.324 2.739 3.065 3.364 3.629 3.843 4.216 4.383 4.537 4.697 4.971 5.102 5.361 5.6 5.832 5.958 6.225 6.458 6.758 6.964 7.168 7.445 7.691 7.927 8.158 8.38 8.664 8.936 9.196 9.532 9.846 10.134 10.458 10.828 11.216 11.634 12.068 12.527 12.99 13.511 14.101 14.668 15.325 16.049 16.833 17.647 18.548 19.444 20.128 20.233 19.93 19.429 18.918 18.417 17.897 17.362 16.839 16.298 15.795 15.303 14.8 14.323 13.886 13.48 13.031 12.651 12.333 11.955 11.578 11.283 10.966 10.637 10.364 10.071 9.779 9.477 9.166 8.949 8.71 8.335 8.075 7.798 7.65 7.349 7.04 6.68 6.489 6.173 5.901 5.668 5.438 4.963 4.681 4.336 3.931 3.484 2.977 2.277 0.049 -5 ,9415 ,TETRA ,17607222,Sun Nov 28 21:55:07 CET,Mon Nov 29 00:16:40 CET,0.0 1.716 2.183 2.567 2.903 3.206 3.507 3.801 4.329 4.572 4.783 5.031 5.337 5.481 5.729 5.975 6.233 6.351 6.564 6.78 7.131 7.369 7.589 7.889 8.163 8.413 8.656 8.895 9.205 9.504 9.786 10.137 10.46 10.765 11.115 11.505 11.879 12.273 12.677 13.113 13.591 14.121 14.714 15.269 15.924 16.659 17.466 18.298 19.144 19.957 20.586 20.667 20.297 19.746 19.186 18.625 18.068 17.505 16.95 16.383 15.903 15.448 15.017 14.604 14.18 13.79 13.392 12.999 12.655 12.326 11.973 11.671 11.358 11.031 10.776 10.482 10.163 9.86 9.557 9.327 9.085 8.731 8.49 8.231 8.085 7.777 7.463 7.1 6.901 6.581 6.326 6.106 5.875 5.344 5.032 4.674 4.267 3.809 3.276 2.581 0.397 -7 ,13995 ,TETRA ,17607224,Sun Nov 28 21:55:07 CET,Mon Nov 29 00:16:42 CET,0.0 2.254 2.751 3.13 3.439 3.707 3.953 4.185 4.606 4.804 4.999 5.215 5.517 5.677 5.99 6.277 6.521 6.632 6.849 7.075 7.397 7.597 7.785 8.042 8.283 8.526 8.762 8.983 9.273 9.565 9.845 10.166 10.463 10.752 11.094 11.47 11.846 12.26 12.715 13.233 13.742 14.26 14.863 15.445 16.09 16.844 17.67 18.498 19.359 20.188 20.951 21.102 20.799 20.361 19.783 19.15 18.601 18.064 17.513 16.97 16.517 16.106 15.698 15.313 14.95 14.6 14.211 13.862 13.559 13.221 12.852 12.541 12.235 11.906 11.64 11.382 11.105 10.795 10.476 10.252 10.03 9.688 9.424 9.139 8.989 8.692 8.385 8.007 7.818 7.491 7.189 6.955 6.716 6.231 5.961 5.663 5.304 4.867 4.331 3.61 1.012 -8 ,28343 ,TETRA ,17607225,Sun Nov 28 21:55:07 CET,Mon Nov 29 00:14:55 CET,0.0 4.0 4.645 5.101 5.435 5.734 6.028 6.279 6.71 6.912 7.122 7.387 7.699 7.865 8.19 8.504 8.807 8.944 9.192 9.419 9.711 9.91 10.114 10.429 10.725 10.983 11.248 11.511 11.855 12.173 12.455 12.8 13.139 13.472 13.85 14.266 14.655 15.104 15.569 15.989 16.436 16.938 17.505 18.066 18.698 19.35 20.06 20.816 21.622 22.517 23.181 23.097 22.664 22.128 21.501 20.794 20.153 19.59 19.08 18.558 18.112 17.725 17.301 16.877 16.494 16.139 15.727 15.311 14.939 14.571 14.236 13.947 13.63 13.273 12.993 12.715 12.432 12.134 11.784 11.54 11.286 10.877 10.588 10.287 10.139 9.826 9.476 9.09 8.902 8.586 8.32 8.092 7.849 7.308 6.989 6.628 6.254 5.838 5.35 4.77 2.659 -9 ,15358 ,TETRA ,17607226,Sun Nov 28 21:56:04 CET,Mon Nov 29 00:18:28 CET,0.0 1.843 2.311 2.656 2.967 3.249 3.47 3.665 4.037 4.232 4.418 4.587 4.874 5.025 5.313 5.603 5.88 6.009 6.256 6.492 6.802 6.991 7.182 7.466 7.721 7.953 8.179 8.401 8.695 8.993 9.302 9.656 9.948 10.223 10.554 10.934 11.302 11.694 12.1 12.505 12.933 13.446 14.06 14.676 15.377 16.138 16.969 17.812 18.741 19.726 20.488 20.625 20.407 19.985 19.49 18.916 18.356 17.846 17.382 16.893 16.444 16.015 15.582 15.154 14.733 14.325 13.88 13.479 13.113 12.733 12.363 12.045 11.718 11.389 11.132 10.855 10.545 10.219 9.869 9.623 9.371 8.961 8.682 8.407 8.263 7.966 7.651 7.322 7.138 6.815 6.538 6.294 6.031 5.468 5.15 4.768 4.339 3.875 3.366 2.75 -1.166 -10 ,16512 ,TETRA ,17607227,Sun Nov 28 21:56:03 CET,Mon Nov 29 00:17:47 CET,0.0 3.255 3.823 4.213 4.524 4.794 5.046 5.306 5.756 5.925 6.086 6.25 6.527 6.666 6.955 7.245 7.52 7.659 7.936 8.183 8.508 8.705 8.895 9.179 9.446 9.7 9.945 10.18 10.476 10.754 11.03 11.375 11.711 12.035 12.407 12.843 13.243 13.662 14.1 14.531 14.984 15.5 16.105 16.681 17.33 18.013 18.723 19.502 20.368 21.183 21.816 21.949 21.727 21.317 20.769 20.171 19.577 18.927 18.376 17.835 17.337 16.856 16.361 15.921 15.535 15.128 14.688 14.321 13.995 13.653 13.284 12.971 12.632 12.244 11.933 11.613 11.275 10.926 10.552 10.3 10.034 9.602 9.323 9.016 8.842 8.465 8.05 7.628 7.429 7.096 6.79 6.548 6.306 5.757 5.414 5.07 4.715 4.255 3.674 2.986 0.601 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index fb63813c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,31593 ,TETRA ,17607229,Sun Nov 28 21:56:05 CET,Sun Nov 28 23:53:04 CET,0.0 3.404 4.24 4.798 5.261 5.684 6.036 6.372 6.99 7.263 7.51 7.876 8.25 8.453 8.834 9.189 9.53 9.695 10.013 10.315 10.746 11.034 11.315 11.719 12.086 12.436 12.8 13.145 13.588 14.017 14.428 14.916 15.376 15.821 16.345 16.923 17.452 18.017 18.644 19.322 20.007 20.733 21.544 22.35 23.265 24.208 25.219 26.306 27.46 28.595 29.464 29.343 28.624 27.783 26.889 25.91 24.999 24.116 23.296 22.388 21.552 20.788 20.049 19.348 18.653 18.016 17.39 16.822 16.294 15.732 15.14 14.639 14.117 13.558 13.119 12.666 12.205 11.708 11.188 10.837 10.461 9.851 9.427 8.977 8.743 8.244 7.669 7.066 6.768 6.325 5.744 5.372 4.99 4.008 3.431 2.841 2.197 1.397 0.416 -0.802 -5.858 -5 ,15155 ,TETRA ,17607232,Sun Nov 28 21:57:03 CET,Sun Nov 28 23:54:13 CET,0.0 4.273 4.91 5.325 5.639 5.918 6.211 6.49 7.012 7.247 7.475 7.796 8.124 8.298 8.634 8.948 9.251 9.408 9.71 9.998 10.4 10.65 10.891 11.219 11.531 11.82 12.104 12.382 12.734 13.087 13.426 13.835 14.239 14.613 15.014 15.46 15.892 16.379 16.921 17.472 18.028 18.685 19.393 19.987 20.638 21.358 22.143 22.939 23.666 24.208 24.401 23.803 22.818 21.808 20.802 19.726 18.654 17.672 16.881 16.028 15.237 14.547 13.83 13.104 12.445 11.837 11.19 10.599 10.071 9.52 8.933 8.446 7.943 7.385 6.942 6.486 6.014 5.541 5.048 4.692 4.319 3.727 3.288 2.831 2.597 2.084 1.519 0.883 0.544 0.08 -0.517 -0.932 -1.346 -2.241 -2.762 -3.307 -3.989 -4.812 -5.772 -7.113 -11.612 -6 ,30154 ,TETRA ,17607233,Sun Nov 28 21:57:03 CET,Sun Nov 28 23:56:28 CET,0.0 3.226 4.06 4.629 5.135 5.608 6.028 6.393 7.003 7.268 7.514 7.799 8.132 8.325 8.711 9.08 9.439 9.615 9.948 10.265 10.709 10.986 11.266 11.679 12.076 12.444 12.81 13.159 13.584 14.027 14.464 14.965 15.43 15.849 16.335 16.884 17.39 17.957 18.606 19.302 20.008 20.76 21.607 22.429 23.374 24.415 25.526 26.66 27.907 29.295 30.443 30.543 29.92 29.003 27.985 26.821 25.672 24.579 23.55 22.469 21.527 20.693 19.893 19.133 18.418 17.731 16.984 16.302 15.707 15.105 14.454 13.9 13.337 12.731 12.259 11.788 11.28 10.732 10.177 9.805 9.418 8.805 8.359 7.895 7.653 7.149 6.608 5.996 5.684 5.248 4.739 4.37 3.97 3.108 2.605 2.037 1.457 0.777 -0.148 -1.373 -5.854 -7 ,12209 ,TETRA ,17607234,Sun Nov 28 21:57:03 CET,Sun Nov 28 23:53:59 CET,0.0 5.183 5.946 6.523 7.001 7.437 7.825 8.173 8.784 9.068 9.36 9.733 10.076 10.274 10.679 11.045 11.378 11.55 11.89 12.207 12.667 12.96 13.244 13.671 14.059 14.39 14.709 15.036 15.453 15.846 16.24 16.719 17.184 17.637 18.149 18.692 19.231 19.816 20.41 21.048 21.732 22.496 23.406 24.357 25.398 26.472 27.659 28.905 30.177 31.443 32.414 32.307 31.5 30.46 29.411 28.351 27.328 26.352 25.423 24.44 23.576 22.771 21.961 21.18 20.452 19.788 19.079 18.427 17.867 17.275 16.629 16.072 15.518 14.942 14.478 13.988 13.479 12.965 12.407 12.019 11.641 11.027 10.573 10.103 9.861 9.361 8.814 8.225 7.912 7.458 6.94 6.581 6.199 5.383 4.915 4.382 3.774 3.038 2.104 0.761 -5.277 -8 ,19385 ,TETRA ,17607235,Sun Nov 28 21:57:03 CET,Sun Nov 28 23:53:45 CET,0.0 3.043 3.765 4.244 4.623 4.946 5.244 5.533 6.067 6.31 6.521 6.742 7.057 7.234 7.555 7.863 8.143 8.272 8.519 8.765 9.127 9.362 9.603 9.959 10.309 10.649 10.964 11.251 11.608 11.953 12.29 12.681 13.051 13.404 13.815 14.282 14.737 15.267 15.815 16.326 16.857 17.448 18.058 18.666 19.388 20.119 20.899 21.718 22.516 23.187 23.511 23.07 22.136 21.041 20.003 18.918 17.848 16.84 15.942 15.012 14.154 13.365 12.611 11.889 11.235 10.638 9.97 9.361 8.841 8.289 7.699 7.211 6.707 6.193 5.775 5.319 4.861 4.376 3.868 3.511 3.127 2.516 2.079 1.606 1.358 0.861 0.319 -0.278 -0.572 -1.021 -1.572 -1.942 -2.351 -3.184 -3.627 -4.165 -4.814 -5.607 -6.609 -7.877 -17.913 -9 ,4492 ,TETRA ,17607236,Sun Nov 28 21:57:03 CET,Sun Nov 28 23:54:00 CET,0.0 4.394 5.209 5.871 6.368 6.762 7.093 7.41 8.023 8.298 8.556 8.905 9.26 9.459 9.853 10.23 10.568 10.735 11.055 11.352 11.793 12.087 12.356 12.724 13.099 13.462 13.793 14.096 14.49 14.895 15.299 15.755 16.183 16.606 17.079 17.622 18.17 18.734 19.313 19.934 20.577 21.318 22.179 23.006 23.937 24.969 26.06 27.145 28.326 29.581 30.612 30.322 29.377 28.308 27.256 26.234 25.223 24.217 23.329 22.422 21.63 20.915 20.188 19.488 18.834 18.219 17.591 17.006 16.473 15.929 15.355 14.854 14.31 13.745 13.299 12.859 12.41 11.92 11.376 10.998 10.621 10.012 9.587 9.154 8.925 8.431 7.876 7.298 6.992 6.545 6.045 5.688 5.268 4.256 3.703 3.116 2.472 1.69 0.621 -0.91 -11.918 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt deleted file mode 100644 index 4033b317..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30036 ,TETRA ,17607238,Sun Nov 28 21:58:03 CET,Sun Nov 28 23:56:29 CET,0.0 1.501 2.048 2.464 2.84 3.149 3.433 3.67 4.085 4.297 4.484 4.675 4.962 5.104 5.374 5.643 5.898 6.02 6.262 6.486 6.792 6.981 7.18 7.491 7.773 8.021 8.242 8.452 8.736 8.991 9.233 9.538 9.815 10.078 10.395 10.777 11.16 11.536 11.882 12.245 12.624 13.037 13.482 13.895 14.343 14.793 15.191 15.483 15.672 15.576 14.739 13.112 11.544 10.008 8.587 7.302 6.135 5.036 4.054 3.05 2.202 1.443 0.694 -0.006 -0.672 -1.294 -1.931 -2.517 -3.045 -3.596 -4.19 -4.678 -5.184 -5.731 -6.177 -6.652 -7.137 -7.622 -8.11 -8.445 -8.791 -9.333 -9.727 -10.156 -10.364 -10.785 -11.254 -11.761 -12.016 -12.422 -12.841 -13.162 -13.505 -14.267 -14.697 -15.153 -15.653 -16.227 -16.851 -17.685 -21.02 -2 ,7204 ,TETRA ,17607239,Sun Nov 28 21:58:03 CET,Sun Nov 28 23:56:58 CET,0.0 1.237 1.72 2.111 2.418 2.713 2.992 3.242 3.685 3.871 4.049 4.252 4.55 4.701 4.978 5.264 5.534 5.657 5.9 6.141 6.455 6.632 6.812 7.075 7.323 7.566 7.811 8.048 8.353 8.646 8.933 9.281 9.597 9.878 10.212 10.593 10.934 11.271 11.629 12.008 12.389 12.806 13.252 13.654 14.095 14.501 14.889 15.233 15.378 15.238 14.443 12.772 11.048 9.487 8.048 6.692 5.434 4.229 3.164 2.096 1.206 0.428 -0.332 -1.038 -1.68 -2.266 -2.874 -3.448 -3.944 -4.465 -5.021 -5.482 -5.954 -6.454 -6.852 -7.258 -7.685 -8.11 -8.534 -8.829 -9.155 -9.704 -10.075 -10.459 -10.661 -11.086 -11.547 -12.019 -12.262 -12.666 -13.071 -13.386 -13.719 -14.401 -14.773 -15.197 -15.677 -16.279 -17.011 -17.864 -20.203 -3 ,6640 ,TETRA ,17607240,Sun Nov 28 21:58:07 CET,Sun Nov 28 23:56:51 CET,0.0 1.234 1.72 2.107 2.419 2.705 2.967 3.205 3.658 3.86 4.057 4.268 4.565 4.744 5.094 5.41 5.699 5.824 6.069 6.324 6.689 6.903 7.098 7.37 7.625 7.88 8.127 8.357 8.677 9.001 9.293 9.627 9.933 10.207 10.516 10.861 11.184 11.536 11.897 12.267 12.633 13.026 13.472 13.879 14.332 14.779 15.196 15.485 15.604 15.486 14.648 13.022 11.46 9.927 8.475 7.208 6.053 4.948 3.994 3.022 2.138 1.332 0.536 -0.211 -0.866 -1.458 -2.072 -2.617 -3.118 -3.661 -4.22 -4.69 -5.185 -5.688 -6.066 -6.472 -6.897 -7.318 -7.766 -8.099 -8.43 -8.926 -9.279 -9.659 -9.864 -10.291 -10.738 -11.222 -11.47 -11.872 -12.262 -12.552 -12.867 -13.556 -13.946 -14.398 -14.919 -15.538 -16.279 -17.205 -20.38 -4 ,15411 ,TETRA ,17607241,Sun Nov 28 21:58:05 CET,Sun Nov 28 23:56:30 CET,0.0 1.084 1.633 2.051 2.411 2.714 2.973 3.202 3.589 3.755 3.931 4.129 4.43 4.608 4.944 5.258 5.545 5.681 5.937 6.163 6.492 6.697 6.89 7.186 7.472 7.728 7.959 8.174 8.452 8.731 9.004 9.324 9.617 9.898 10.212 10.53 10.855 11.217 11.576 11.935 12.291 12.687 13.123 13.506 13.906 14.313 14.683 14.958 15.13 14.992 14.138 12.585 11.001 9.497 8.092 6.793 5.659 4.611 3.678 2.714 1.885 1.152 0.411 -0.323 -0.977 -1.571 -2.225 -2.813 -3.344 -3.912 -4.495 -4.978 -5.463 -5.969 -6.375 -6.803 -7.268 -7.776 -8.306 -8.667 -9.029 -9.573 -9.948 -10.343 -10.551 -10.979 -11.454 -11.972 -12.242 -12.665 -13.085 -13.4 -13.717 -14.386 -14.791 -15.257 -15.758 -16.323 -16.978 -17.884 -20.963 -5 ,13447 ,TETRA ,17607242,Sun Nov 28 21:58:05 CET,Sun Nov 28 23:56:43 CET,0.0 1.8 2.446 2.953 3.35 3.634 3.883 4.135 4.584 4.769 4.948 5.144 5.443 5.617 5.937 6.214 6.483 6.622 6.919 7.179 7.494 7.702 7.922 8.243 8.538 8.827 9.099 9.357 9.697 10.036 10.368 10.767 11.123 11.432 11.776 12.16 12.526 12.895 13.264 13.643 14.021 14.415 14.85 15.245 15.654 16.034 16.382 16.7 16.926 16.836 16.01 14.491 12.933 11.5 10.175 8.916 7.758 6.659 5.705 4.727 3.873 3.114 2.384 1.669 0.991 0.38 -0.241 -0.782 -1.253 -1.754 -2.277 -2.743 -3.251 -3.771 -4.187 -4.625 -5.079 -5.553 -6.076 -6.456 -6.83 -7.378 -7.763 -8.16 -8.357 -8.77 -9.2 -9.657 -9.906 -10.312 -10.7 -11.0 -11.345 -12.101 -12.513 -12.959 -13.472 -14.045 -14.71 -15.611 -19.148 -6 ,1107 ,TETRA ,17607243,Sun Nov 28 21:58:06 CET,Sun Nov 28 23:56:35 CET,0.0 1.351 1.915 2.373 2.753 3.076 3.355 3.62 4.082 4.272 4.451 4.652 4.955 5.114 5.436 5.738 5.99 6.104 6.313 6.517 6.832 7.059 7.275 7.576 7.861 8.1 8.314 8.531 8.823 9.119 9.408 9.755 10.096 10.416 10.744 11.09 11.417 11.745 12.082 12.425 12.782 13.178 13.597 13.973 14.384 14.804 15.182 15.457 15.6 15.439 14.582 13.051 11.481 9.988 8.598 7.297 6.126 5.088 4.192 3.223 2.375 1.611 0.851 0.159 -0.476 -1.088 -1.737 -2.312 -2.827 -3.371 -3.929 -4.38 -4.862 -5.395 -5.818 -6.257 -6.689 -7.139 -7.624 -7.972 -8.338 -8.91 -9.318 -9.737 -9.953 -10.403 -10.902 -11.44 -11.705 -12.127 -12.61 -12.928 -13.251 -13.984 -14.399 -14.855 -15.348 -15.915 -16.657 -17.557 -20.075 -7 ,30520 ,TETRA ,17607244,Sun Nov 28 21:58:09 CET,Sun Nov 28 23:55:38 CET,0.0 1.795 2.374 2.832 3.23 3.55 3.826 4.06 4.476 4.673 4.854 5.104 5.431 5.6 5.907 6.216 6.497 6.621 6.863 7.082 7.37 7.548 7.728 8.004 8.276 8.539 8.777 9.023 9.342 9.635 9.925 10.285 10.637 10.941 11.254 11.596 11.928 12.281 12.64 12.999 13.375 13.818 14.252 14.618 15.013 15.381 15.754 16.077 16.22 16.056 15.153 13.553 11.97 10.489 9.13 7.805 6.606 5.515 4.575 3.61 2.74 1.942 1.161 0.431 -0.247 -0.877 -1.519 -2.092 -2.601 -3.125 -3.672 -4.147 -4.65 -5.153 -5.526 -5.923 -6.342 -6.769 -7.227 -7.547 -7.87 -8.409 -8.808 -9.206 -9.407 -9.836 -10.287 -10.775 -11.045 -11.459 -11.854 -12.136 -12.449 -13.177 -13.557 -13.937 -14.355 -14.879 -15.583 -16.494 -19.63 -8 ,13577 ,TETRA ,17607245,Sun Nov 28 21:58:05 CET,Sun Nov 28 23:56:05 CET,0.0 1.444 1.923 2.292 2.611 2.883 3.136 3.37 3.775 3.966 4.145 4.326 4.617 4.77 5.071 5.353 5.614 5.737 5.972 6.204 6.538 6.745 6.938 7.209 7.478 7.728 7.96 8.19 8.503 8.793 9.069 9.412 9.711 9.994 10.325 10.665 10.975 11.29 11.628 11.998 12.383 12.799 13.226 13.638 14.071 14.46 14.843 15.153 15.323 15.218 14.477 12.93 11.328 9.832 8.444 7.141 5.972 4.871 3.898 2.904 2.06 1.314 0.581 -0.111 -0.764 -1.364 -1.985 -2.551 -3.041 -3.545 -4.091 -4.554 -5.023 -5.534 -5.949 -6.366 -6.8 -7.235 -7.684 -8.002 -8.339 -8.878 -9.249 -9.643 -9.845 -10.271 -10.726 -11.237 -11.52 -11.961 -12.453 -12.797 -13.166 -13.951 -14.382 -14.878 -15.464 -16.112 -16.858 -17.904 -20.888 -9 ,11932 ,TETRA ,17607246,Sun Nov 28 21:58:05 CET,Sun Nov 28 23:56:36 CET,0.0 1.318 1.814 2.224 2.584 2.897 3.182 3.442 3.853 4.044 4.244 4.449 4.738 4.879 5.155 5.428 5.685 5.804 6.031 6.253 6.565 6.755 6.937 7.2 7.461 7.716 7.95 8.169 8.45 8.732 9.003 9.335 9.647 9.949 10.305 10.671 11.017 11.39 11.773 12.161 12.527 12.911 13.361 13.771 14.203 14.652 15.071 15.36 15.533 15.445 14.618 13.077 11.465 9.924 8.536 7.278 6.132 5.061 4.096 3.137 2.293 1.503 0.763 0.071 -0.571 -1.17 -1.819 -2.4 -2.899 -3.413 -3.952 -4.421 -4.912 -5.408 -5.799 -6.206 -6.633 -7.097 -7.582 -7.903 -8.228 -8.746 -9.118 -9.517 -9.731 -10.173 -10.628 -11.118 -11.377 -11.786 -12.222 -12.543 -12.882 -13.581 -13.946 -14.375 -14.892 -15.501 -16.218 -17.208 -20.037 -10 ,2940 ,TETRA ,17607247,Sun Nov 28 21:59:06 CET,Sun Nov 28 23:56:29 CET,0.0 1.599 2.176 2.551 2.852 3.126 3.375 3.627 4.107 4.308 4.498 4.726 5.024 5.188 5.502 5.782 6.06 6.191 6.433 6.676 7.044 7.281 7.493 7.788 8.078 8.347 8.606 8.839 9.11 9.385 9.658 9.977 10.27 10.554 10.873 11.195 11.486 11.81 12.18 12.553 12.907 13.29 13.711 14.106 14.537 14.958 15.352 15.656 15.868 15.782 14.966 13.438 11.87 10.411 9.024 7.747 6.628 5.578 4.669 3.729 2.891 2.134 1.404 0.704 0.021 -0.617 -1.265 -1.825 -2.318 -2.832 -3.384 -3.841 -4.326 -4.848 -5.254 -5.67 -6.1 -6.55 -7.015 -7.341 -7.689 -8.227 -8.581 -8.957 -9.159 -9.604 -10.099 -10.628 -10.887 -11.281 -11.63 -11.916 -12.226 -12.922 -13.323 -13.758 -14.262 -14.837 -15.592 -16.622 -19.622 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index 3f9db304..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4271 ,KEBNE ,17027772,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 19:37:10 CET,0.0 3.102 3.845 4.426 4.937 5.352 5.695 5.983 6.488 6.71 6.918 7.199 7.532 7.718 8.055 8.402 8.731 8.88 9.146 9.376 9.688 9.896 10.101 10.389 10.669 10.94 11.198 11.457 11.802 12.146 12.467 12.812 13.12 13.431 13.816 14.233 14.625 15.037 15.46 15.904 16.377 16.925 17.555 18.175 18.863 19.61 20.418 21.256 22.094 22.845 23.455 23.504 23.135 22.611 22.07 21.529 20.982 20.451 19.961 19.421 18.938 18.482 18.023 17.59 17.172 16.734 16.264 15.86 15.526 15.185 14.825 14.532 14.239 13.921 13.651 13.361 13.032 12.662 12.294 12.071 11.838 11.451 11.186 10.917 10.772 10.472 10.166 9.811 9.623 9.285 9.03 8.827 8.606 8.104 7.818 7.513 7.187 6.807 6.339 5.742 -0.025 -2 ,30766 ,KEBNE ,17027773,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 19:36:41 CET,0.0 5.869 6.654 7.265 7.762 8.178 8.485 8.734 9.192 9.442 9.701 10.013 10.332 10.537 10.97 11.322 11.627 11.771 12.023 12.24 12.569 12.781 13.007 13.343 13.64 13.91 14.168 14.454 14.839 15.193 15.517 15.865 16.206 16.545 16.944 17.388 17.793 18.256 18.752 19.247 19.75 20.323 20.972 21.59 22.291 23.031 23.812 24.613 25.457 26.265 26.847 26.783 26.387 25.871 25.323 24.74 24.17 23.644 23.159 22.625 22.143 21.725 21.303 20.864 20.418 19.981 19.523 19.11 18.751 18.373 17.981 17.662 17.34 17.007 16.754 16.477 16.179 15.873 15.541 15.325 15.12 14.796 14.555 14.302 14.176 13.907 13.609 13.276 13.091 12.762 12.497 12.279 12.056 11.552 11.228 10.851 10.435 9.931 9.334 8.535 3.892 -3 ,11214 ,KEBNE ,17027774,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 19:35:38 CET,0.0 3.441 4.168 4.635 5.077 5.539 5.943 6.302 6.898 7.139 7.346 7.539 7.825 7.996 8.352 8.681 9.0 9.145 9.418 9.691 10.054 10.259 10.479 10.808 11.11 11.396 11.669 11.939 12.277 12.586 12.874 13.214 13.539 13.844 14.196 14.584 14.951 15.369 15.818 16.293 16.756 17.265 17.878 18.444 19.089 19.798 20.528 21.198 21.861 22.439 22.634 22.121 21.23 20.308 19.439 18.535 17.846 17.312 16.819 16.258 15.747 15.306 14.901 14.526 14.138 13.774 13.398 13.041 12.731 12.42 12.076 11.747 11.401 11.051 10.787 10.526 10.251 9.959 9.649 9.454 9.239 8.858 8.598 8.306 8.147 7.841 7.546 7.228 7.052 6.728 6.483 6.253 6.004 5.496 5.22 4.891 4.513 4.079 3.546 2.74 -0.897 -4 ,11037 ,KEBNE ,17027775,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 19:37:14 CET,0.0 3.89 4.474 4.888 5.299 5.656 5.96 6.26 6.792 7.016 7.24 7.515 7.842 8.026 8.343 8.627 8.918 9.053 9.315 9.568 9.892 10.091 10.325 10.723 11.086 11.408 11.727 12.04 12.401 12.708 12.996 13.329 13.671 14.026 14.432 14.888 15.324 15.807 16.322 16.849 17.378 17.916 18.55 19.186 19.853 20.541 21.292 22.112 22.981 23.779 24.325 24.252 23.857 23.348 22.754 22.12 21.547 21.019 20.534 20.06 19.623 19.192 18.772 18.369 17.993 17.629 17.241 16.882 16.533 16.16 15.779 15.442 15.067 14.676 14.377 14.071 13.757 13.418 13.052 12.805 12.555 12.153 11.874 11.61 11.479 11.177 10.86 10.543 10.376 10.061 9.8 9.59 9.362 8.871 8.587 8.261 7.913 7.548 7.014 6.262 2.875 -6 ,31574 ,KEBNE ,17027777,Wed Dec 22 17:57:39 CET,Wed Dec 22 19:37:14 CET,0.0 2.882 3.494 3.986 4.386 4.729 5.06 5.366 5.9 6.126 6.334 6.615 6.952 7.141 7.493 7.836 8.162 8.314 8.6 8.877 9.272 9.524 9.774 10.131 10.454 10.741 11.001 11.246 11.574 11.885 12.173 12.529 12.911 13.298 13.732 14.198 14.636 15.109 15.597 16.1 16.611 17.186 17.815 18.4 19.06 19.747 20.458 21.14 21.828 22.484 22.753 22.13 21.117 20.062 19.05 18.073 17.159 16.305 15.541 14.738 14.046 13.376 12.69 12.08 11.523 11.022 10.47 9.945 9.518 9.073 8.598 8.209 7.811 7.4 7.053 6.682 6.311 5.912 5.484 5.172 4.848 4.367 4.033 3.686 3.496 3.084 2.64 2.183 1.953 1.581 1.178 0.88 0.568 -0.093 -0.49 -0.93 -1.391 -1.954 -2.588 -3.416 -7.071 -7 ,12745 ,KEBNE ,17027778,Wed Dec 22 17:57:38 CET,Wed Dec 22 19:36:40 CET,0.0 2.618 3.264 3.735 4.144 4.504 4.799 5.055 5.546 5.792 6.045 6.403 6.758 6.94 7.283 7.613 7.916 8.063 8.352 8.62 8.963 9.195 9.426 9.747 10.048 10.346 10.637 10.912 11.229 11.507 11.783 12.147 12.501 12.82 13.177 13.574 13.969 14.384 14.81 15.257 15.71 16.211 16.794 17.416 18.18 18.953 19.747 20.59 21.442 22.146 22.503 22.138 21.371 20.504 19.607 18.676 17.78 16.99 16.305 15.521 14.788 14.139 13.513 12.898 12.329 11.8 11.243 10.754 10.329 9.887 9.456 9.096 8.666 8.222 7.907 7.584 7.24 6.887 6.508 6.232 5.932 5.456 5.132 4.779 4.586 4.176 3.746 3.312 3.09 2.724 2.366 2.084 1.785 1.162 0.787 0.337 -0.205 -0.851 -1.562 -2.502 -6.437 -8 ,1129 ,KEBNE ,17027779,Wed Dec 22 17:59:42 CET,Wed Dec 22 19:40:03 CET,0.0 4.023 4.783 5.466 6.093 6.534 6.86 7.146 7.654 7.9 8.136 8.438 8.775 8.968 9.332 9.651 9.949 10.088 10.356 10.614 10.966 11.196 11.429 11.775 12.098 12.41 12.711 12.989 13.338 13.666 13.999 14.403 14.782 15.148 15.583 16.06 16.518 17.033 17.546 18.068 18.63 19.256 19.899 20.473 21.103 21.798 22.544 23.328 24.196 24.91 25.107 24.55 23.687 22.715 21.708 20.715 19.836 19.041 18.313 17.545 16.891 16.282 15.689 15.126 14.589 14.09 13.577 13.095 12.649 12.189 11.735 11.368 10.956 10.503 10.154 9.801 9.417 9.009 8.603 8.328 8.044 7.559 7.212 6.85 6.659 6.28 5.876 5.435 5.212 4.837 4.489 4.239 3.957 3.31 2.974 2.607 2.155 1.647 1.036 0.123 -3.424 -9 ,1988 ,KEBNE ,17027780,Wed Dec 22 17:59:42 CET,Wed Dec 22 19:39:43 CET,0.0 2.641 3.23 3.647 4.003 4.321 4.618 4.873 5.309 5.537 5.767 6.014 6.318 6.482 6.808 7.096 7.354 7.481 7.731 7.972 8.301 8.522 8.767 9.135 9.467 9.785 10.101 10.396 10.783 11.163 11.504 11.871 12.208 12.544 12.924 13.32 13.715 14.193 14.692 15.184 15.68 16.234 16.848 17.462 18.143 18.809 19.567 20.36 21.033 21.564 21.812 21.103 20.039 19.015 18.08 17.187 16.311 15.457 14.705 13.937 13.285 12.711 12.135 11.574 11.023 10.505 9.973 9.5 9.063 8.596 8.116 7.713 7.299 6.862 6.519 6.157 5.776 5.397 4.996 4.713 4.429 3.977 3.652 3.302 3.134 2.796 2.412 2.016 1.81 1.458 1.138 0.886 0.622 0.056 -0.287 -0.684 -1.148 -1.663 -2.243 -3.023 -6.689 -10 ,17559 ,KEBNE ,17027781,Wed Dec 22 17:59:42 CET,Wed Dec 22 19:39:55 CET,0.0 3.862 4.538 4.995 5.322 5.607 5.873 6.115 6.6 6.819 6.999 7.193 7.504 7.676 7.995 8.33 8.697 8.868 9.171 9.458 9.842 10.082 10.319 10.671 10.991 11.301 11.607 11.898 12.273 12.621 12.921 13.24 13.541 13.84 14.196 14.623 15.041 15.484 15.962 16.446 16.959 17.568 18.27 18.939 19.684 20.461 21.242 22.029 22.889 23.683 24.156 24.041 23.664 23.163 22.585 22.012 21.456 20.86 20.333 19.838 19.363 18.835 18.316 17.827 17.394 17.035 16.669 16.327 15.999 15.631 15.228 14.905 14.571 14.22 13.945 13.672 13.4 13.117 12.817 12.6 12.357 11.966 11.7 11.411 11.256 10.959 10.644 10.298 10.112 9.784 9.5 9.273 9.056 8.558 8.258 7.882 7.459 6.955 6.274 5.476 -0.453 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 0afdb42e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8338 ,TETRA ,17607248,Sun Nov 28 21:59:03 CET,Sun Nov 28 23:54:37 CET,0.0 2.153 2.728 3.196 3.629 3.996 4.304 4.575 5.067 5.299 5.523 5.812 6.127 6.312 6.693 7.051 7.357 7.505 7.791 8.065 8.448 8.704 8.937 9.238 9.55 9.84 10.101 10.358 10.69 11.01 11.308 11.647 11.966 12.278 12.668 13.104 13.508 13.932 14.334 14.734 15.156 15.608 16.1 16.589 17.192 17.819 18.397 18.988 19.52 19.832 19.754 18.986 17.987 16.997 16.071 15.238 14.491 13.768 13.093 12.423 11.884 11.38 10.863 10.38 9.943 9.534 9.118 8.742 8.408 8.066 7.691 7.343 6.945 6.542 6.243 5.919 5.577 5.217 4.832 4.569 4.301 3.865 3.562 3.266 3.122 2.814 2.471 2.119 1.934 1.598 1.343 1.136 0.89 0.307 0.004 -0.315 -0.678 -1.066 -1.556 -2.255 -4.238 -2 ,17229 ,TETRA ,17607249,Sun Nov 28 21:58:05 CET,Sun Nov 28 23:41:32 CET,0.0 1.695 2.316 2.786 3.141 3.456 3.756 4.035 4.528 4.748 4.964 5.239 5.558 5.76 6.162 6.525 6.846 6.989 7.272 7.576 8.015 8.281 8.516 8.838 9.138 9.408 9.667 9.918 10.225 10.522 10.8 11.109 11.413 11.718 12.07 12.452 12.81 13.189 13.56 13.938 14.356 14.814 15.327 15.814 16.318 16.876 17.483 18.073 18.603 18.944 18.896 18.215 17.254 16.257 15.366 14.551 13.794 13.077 12.405 11.711 11.138 10.635 10.159 9.711 9.271 8.86 8.426 8.031 7.697 7.37 7.028 6.731 6.384 5.989 5.701 5.407 5.064 4.69 4.311 4.043 3.771 3.366 3.078 2.764 2.603 2.251 1.874 1.489 1.297 0.973 0.692 0.469 0.249 -0.279 -0.591 -0.919 -1.254 -1.604 -2.024 -2.603 -4.306 -3 ,29753 ,TETRA ,17607250,Sun Nov 28 21:58:06 CET,Sun Nov 28 23:51:58 CET,0.0 1.588 2.192 2.679 3.078 3.435 3.76 4.051 4.552 4.772 4.971 5.191 5.487 5.646 5.94 6.223 6.498 6.63 6.882 7.119 7.463 7.688 7.909 8.237 8.539 8.825 9.092 9.36 9.706 10.02 10.323 10.689 11.055 11.411 11.832 12.306 12.701 13.081 13.478 13.887 14.296 14.742 15.255 15.74 16.235 16.757 17.291 17.768 18.223 18.483 18.28 17.408 16.394 15.409 14.508 13.666 12.876 12.153 11.522 10.89 10.327 9.814 9.319 8.841 8.412 8.004 7.514 7.071 6.727 6.382 5.975 5.598 5.248 4.941 4.706 4.457 4.197 3.908 3.595 3.386 3.163 2.804 2.543 2.267 2.13 1.867 1.592 1.271 1.087 0.762 0.507 0.279 0.04 -0.459 -0.74 -1.03 -1.353 -1.706 -2.094 -2.636 -4.43 -4 ,20339 ,TETRA ,17607251,Sun Nov 28 21:59:03 CET,Sun Nov 28 23:46:03 CET,0.0 2.003 2.643 3.133 3.527 3.865 4.173 4.467 5.019 5.255 5.467 5.769 6.088 6.278 6.658 6.99 7.276 7.415 7.68 7.919 8.257 8.47 8.668 8.96 9.255 9.541 9.816 10.078 10.422 10.747 11.056 11.432 11.766 12.067 12.405 12.776 13.126 13.502 13.905 14.328 14.743 15.182 15.674 16.163 16.721 17.278 17.839 18.395 18.87 19.147 19.009 18.298 17.415 16.492 15.614 14.781 14.005 13.29 12.683 12.049 11.477 10.973 10.47 9.99 9.551 9.135 8.706 8.325 8.001 7.662 7.294 6.958 6.59 6.201 5.879 5.55 5.206 4.839 4.459 4.204 3.941 3.51 3.205 2.89 2.736 2.412 2.048 1.65 1.447 1.104 0.795 0.573 0.322 -0.293 -0.633 -0.995 -1.405 -1.818 -2.308 -2.94 -4.396 -5 ,11696 ,TETRA ,17607252,Sun Nov 28 21:59:05 CET,Sun Nov 28 23:44:43 CET,0.0 2.653 3.373 3.925 4.402 4.84 5.209 5.536 6.136 6.392 6.619 6.906 7.242 7.43 7.768 8.078 8.359 8.491 8.738 8.977 9.34 9.572 9.813 10.171 10.482 10.784 11.057 11.298 11.636 11.973 12.285 12.652 13.018 13.342 13.671 14.038 14.389 14.742 15.102 15.5 15.914 16.355 16.822 17.294 17.857 18.411 18.969 19.525 20.006 20.259 20.035 19.255 18.32 17.375 16.524 15.716 14.96 14.281 13.689 13.071 12.516 11.997 11.47 10.994 10.571 10.185 9.787 9.41 9.059 8.683 8.262 7.894 7.519 7.135 6.856 6.57 6.267 5.961 5.629 5.388 5.144 4.775 4.522 4.268 4.133 3.862 3.576 3.247 3.075 2.759 2.529 2.317 2.073 1.513 1.177 0.831 0.489 0.048 -0.528 -1.249 -3.118 -6 ,20385 ,TETRA ,17607253,Sun Nov 28 21:59:03 CET,Sun Nov 28 23:53:02 CET,0.0 1.742 2.438 2.951 3.385 3.769 4.102 4.396 4.893 5.121 5.344 5.616 5.939 6.14 6.551 6.953 7.293 7.446 7.743 8.001 8.375 8.622 8.862 9.211 9.554 9.876 10.177 10.475 10.839 11.186 11.52 11.874 12.182 12.484 12.833 13.218 13.576 13.944 14.32 14.712 15.12 15.569 16.072 16.546 17.068 17.606 18.16 18.647 19.033 19.281 19.191 18.523 17.658 16.787 15.949 15.133 14.376 13.668 13.077 12.503 11.968 11.461 10.969 10.512 10.091 9.699 9.273 8.878 8.536 8.17 7.776 7.43 7.059 6.669 6.353 6.017 5.662 5.301 4.943 4.696 4.438 4.042 3.754 3.438 3.271 2.912 2.547 2.176 1.987 1.668 1.396 1.187 0.974 0.458 0.171 -0.128 -0.486 -0.897 -1.355 -2.049 -4.028 -7 ,11963 ,TETRA ,17607254,Sun Nov 28 21:59:03 CET,Sun Nov 28 23:53:27 CET,0.0 2.291 2.991 3.503 3.936 4.294 4.594 4.897 5.453 5.707 5.918 6.123 6.421 6.596 6.942 7.286 7.587 7.721 8.001 8.247 8.564 8.778 8.993 9.329 9.669 10.003 10.322 10.596 10.897 11.183 11.484 11.849 12.198 12.511 12.842 13.207 13.549 13.909 14.288 14.674 15.064 15.512 16.05 16.591 17.189 17.793 18.441 19.042 19.564 20.007 19.983 19.231 18.325 17.454 16.626 15.836 15.101 14.397 13.775 13.107 12.498 11.953 11.431 10.955 10.516 10.099 9.635 9.198 8.82 8.433 8.046 7.72 7.377 7.041 6.78 6.485 6.188 5.892 5.574 5.356 5.117 4.71 4.452 4.212 4.075 3.775 3.473 3.148 2.972 2.651 2.388 2.148 1.917 1.464 1.195 0.912 0.589 0.194 -0.258 -0.825 -2.212 -8 ,10318 ,TETRA ,17607255,Sun Nov 28 21:59:03 CET,Sun Nov 28 23:53:32 CET,0.0 1.602 2.335 2.949 3.422 3.81 4.11 4.378 4.898 5.145 5.365 5.677 6.014 6.2 6.57 6.931 7.26 7.414 7.695 7.966 8.371 8.617 8.87 9.211 9.476 9.73 9.988 10.248 10.587 10.887 11.159 11.489 11.806 12.105 12.443 12.814 13.152 13.527 13.945 14.361 14.787 15.241 15.733 16.212 16.754 17.336 17.867 18.359 18.826 19.121 18.981 18.251 17.342 16.41 15.523 14.65 13.862 13.146 12.517 11.859 11.268 10.739 10.237 9.744 9.239 8.76 8.236 7.73 7.303 6.867 6.404 6.023 5.643 5.265 4.979 4.678 4.347 3.985 3.624 3.389 3.136 2.728 2.446 2.144 1.987 1.643 1.249 0.857 0.658 0.321 0.037 -0.19 -0.413 -0.915 -1.195 -1.504 -1.877 -2.308 -2.799 -3.375 -5.08 -9 ,23803 ,TETRA ,17607256,Sun Nov 28 21:59:06 CET,Sun Nov 28 23:53:54 CET,0.0 1.446 2.044 2.541 2.934 3.29 3.607 3.887 4.407 4.645 4.882 5.226 5.568 5.772 6.146 6.494 6.826 6.984 7.297 7.59 8.006 8.277 8.535 8.908 9.257 9.591 9.91 10.204 10.591 10.959 11.297 11.711 12.087 12.407 12.751 13.131 13.499 13.874 14.257 14.673 15.104 15.575 16.095 16.635 17.263 17.87 18.491 19.079 19.629 20.024 20.002 19.321 18.381 17.433 16.561 15.756 15.033 14.328 13.704 13.074 12.526 12.045 11.568 11.094 10.643 10.224 9.8 9.425 9.09 8.753 8.406 8.082 7.724 7.384 7.133 6.863 6.572 6.274 5.97 5.76 5.539 5.153 4.865 4.553 4.387 4.043 3.678 3.281 3.081 2.765 2.513 2.291 2.053 1.538 1.262 0.931 0.553 0.166 -0.264 -0.791 -2.159 -10 ,26714 ,TETRA ,17607257,Sun Nov 28 21:59:08 CET,Sun Nov 28 23:53:30 CET,0.0 1.355 1.913 2.373 2.807 3.18 3.478 3.756 4.295 4.559 4.81 5.14 5.489 5.703 6.09 6.424 6.729 6.89 7.186 7.45 7.826 8.049 8.253 8.549 8.824 9.09 9.351 9.596 9.913 10.226 10.523 10.853 11.172 11.499 11.873 12.297 12.715 13.142 13.587 14.058 14.498 14.937 15.446 15.924 16.421 16.949 17.491 18.019 18.471 18.804 18.79 18.046 17.104 16.173 15.299 14.496 13.756 13.061 12.43 11.81 11.279 10.783 10.295 9.811 9.287 8.769 8.227 7.709 7.267 6.833 6.374 5.973 5.568 5.122 4.773 4.442 4.096 3.746 3.378 3.118 2.845 2.404 2.093 1.785 1.63 1.3 0.941 0.566 0.367 0.025 -0.269 -0.51 -0.75 -1.231 -1.518 -1.817 -2.142 -2.543 -3.005 -3.571 -5.304 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index cd1e20a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3661 ,TETRA ,17607258,Sun Nov 28 21:59:03 CET,Sun Nov 28 23:53:21 CET,0.0 2.395 2.87 3.217 3.517 3.846 4.196 4.508 5.044 5.275 5.498 5.769 6.079 6.26 6.609 6.907 7.192 7.338 7.606 7.864 8.234 8.453 8.658 8.96 9.247 9.509 9.745 9.978 10.288 10.585 10.87 11.199 11.511 11.82 12.163 12.521 12.842 13.168 13.538 13.936 14.31 14.705 15.177 15.696 16.286 16.909 17.639 18.315 18.886 19.217 18.893 17.907 16.769 15.674 14.672 13.695 12.799 11.932 11.15 10.359 9.681 9.069 8.463 7.901 7.404 6.959 6.477 6.022 5.632 5.227 4.788 4.425 4.069 3.653 3.293 2.953 2.607 2.23 1.837 1.568 1.291 0.849 0.548 0.237 0.072 -0.275 -0.651 -1.064 -1.28 -1.634 -1.96 -2.217 -2.503 -3.134 -3.494 -3.868 -4.252 -4.682 -5.186 -5.905 -9.266 -2 ,25600 ,TETRA ,17607259,Sun Nov 28 21:59:07 CET,Sun Nov 28 23:53:17 CET,0.0 2.938 3.591 4.063 4.451 4.766 5.042 5.277 5.676 5.873 6.062 6.291 6.592 6.762 7.096 7.418 7.726 7.864 8.107 8.326 8.628 8.825 9.006 9.271 9.538 9.788 10.03 10.276 10.582 10.866 11.135 11.455 11.761 12.039 12.353 12.682 12.996 13.346 13.694 14.063 14.44 14.853 15.351 15.897 16.533 17.155 17.758 18.308 18.862 19.407 19.599 19.196 18.506 17.758 17.017 16.286 15.613 14.958 14.37 13.759 13.213 12.722 12.271 11.84 11.43 11.032 10.612 10.247 9.917 9.545 9.127 8.809 8.496 8.158 7.892 7.632 7.369 7.079 6.775 6.553 6.316 5.962 5.714 5.445 5.301 5.004 4.683 4.341 4.164 3.838 3.575 3.365 3.138 2.614 2.317 2.015 1.677 1.26 0.713 -0.053 -4.676 -3 ,5514 ,TETRA ,17607260,Sun Nov 28 21:59:05 CET,Sun Nov 28 23:53:05 CET,0.0 3.362 4.076 4.562 4.945 5.285 5.594 5.862 6.365 6.584 6.781 7.042 7.352 7.525 7.861 8.156 8.412 8.538 8.777 8.991 9.292 9.492 9.687 9.957 10.215 10.461 10.687 10.898 11.18 11.473 11.752 12.075 12.404 12.723 13.058 13.422 13.75 14.08 14.448 14.837 15.234 15.674 16.164 16.654 17.235 17.827 18.417 18.986 19.521 19.923 19.861 19.22 18.487 17.703 16.961 16.228 15.571 15.0 14.47 13.933 13.472 13.002 12.553 12.144 11.743 11.376 10.994 10.647 10.304 9.926 9.527 9.182 8.833 8.478 8.198 7.903 7.607 7.318 7.043 6.853 6.645 6.294 6.036 5.764 5.61 5.261 4.887 4.488 4.287 3.946 3.635 3.399 3.132 2.527 2.215 1.889 1.548 1.134 0.638 -0.155 -3.329 -4 ,31856 ,TETRA ,17607261,Sun Nov 28 21:59:05 CET,Sun Nov 28 23:53:54 CET,0.0 4.728 5.409 5.826 6.193 6.559 6.883 7.132 7.566 7.753 7.951 8.243 8.574 8.763 9.104 9.425 9.709 9.843 10.128 10.393 10.749 10.98 11.194 11.503 11.806 12.098 12.355 12.588 12.915 13.23 13.515 13.848 14.167 14.476 14.834 15.222 15.561 15.905 16.251 16.606 17.001 17.494 18.088 18.651 19.233 19.819 20.439 20.966 21.352 21.519 21.235 20.375 19.307 18.244 17.228 16.269 15.371 14.52 13.765 12.961 12.249 11.65 11.091 10.526 9.991 9.488 8.947 8.472 8.059 7.646 7.218 6.837 6.432 6.014 5.69 5.353 5.009 4.663 4.302 4.037 3.764 3.344 3.036 2.706 2.534 2.191 1.829 1.425 1.221 0.876 0.549 0.312 0.057 -0.503 -0.799 -1.117 -1.529 -2.077 -2.774 -3.619 -10.197 -5 ,1463 ,TETRA ,17607262,Sun Nov 28 21:59:06 CET,Sun Nov 28 23:53:34 CET,0.0 3.574 4.329 4.859 5.255 5.583 5.865 6.136 6.635 6.859 7.098 7.403 7.713 7.89 8.215 8.498 8.757 8.876 9.114 9.34 9.664 9.886 10.096 10.395 10.682 10.949 11.189 11.417 11.703 11.97 12.22 12.524 12.821 13.108 13.438 13.783 14.095 14.419 14.761 15.113 15.492 15.954 16.442 16.878 17.376 17.865 18.355 18.872 19.342 19.735 19.815 19.344 18.69 17.967 17.301 16.638 15.98 15.388 14.887 14.356 13.859 13.406 12.955 12.514 12.095 11.684 11.239 10.833 10.478 10.099 9.714 9.402 9.081 8.755 8.502 8.239 7.965 7.687 7.39 7.167 6.924 6.536 6.275 6.013 5.86 5.534 5.218 4.901 4.735 4.429 4.197 3.967 3.72 3.219 2.935 2.619 2.285 1.909 1.467 0.803 -5.871 -6 ,20696 ,TETRA ,17607263,Sun Nov 28 21:59:05 CET,Sun Nov 28 23:53:40 CET,0.0 6.489 7.291 7.823 8.234 8.606 8.934 9.224 9.728 9.942 10.132 10.397 10.704 10.879 11.227 11.559 11.862 11.996 12.252 12.494 12.808 13.019 13.244 13.562 13.848 14.126 14.401 14.666 14.995 15.288 15.553 15.888 16.218 16.525 16.89 17.281 17.639 18.016 18.404 18.829 19.259 19.734 20.282 20.785 21.353 21.981 22.625 23.223 23.796 24.269 24.286 23.721 22.991 22.196 21.456 20.747 20.101 19.491 18.925 18.339 17.817 17.315 16.794 16.285 15.839 15.446 15.028 14.681 14.397 14.085 13.759 13.486 13.154 12.787 12.504 12.214 11.939 11.67 11.366 11.16 10.964 10.647 10.413 10.159 10.025 9.758 9.491 9.175 9.004 8.682 8.446 8.26 8.058 7.599 7.324 7.041 6.713 6.246 5.706 5.046 1.072 -7 ,13378 ,TETRA ,17607264,Sun Nov 28 21:59:06 CET,Sun Nov 28 23:53:20 CET,0.0 3.34 4.13 4.73 5.147 5.45 5.714 5.959 6.406 6.614 6.816 7.06 7.358 7.524 7.851 8.146 8.435 8.593 8.91 9.196 9.614 9.912 10.191 10.538 10.827 11.094 11.343 11.563 11.854 12.169 12.468 12.802 13.134 13.463 13.814 14.176 14.528 14.905 15.293 15.691 16.075 16.502 17.011 17.49 18.039 18.594 19.18 19.784 20.336 20.777 20.836 20.315 19.605 18.877 18.183 17.494 16.831 16.223 15.659 15.045 14.514 14.036 13.61 13.22 12.804 12.401 12.015 11.671 11.343 11.017 10.69 10.38 10.019 9.643 9.376 9.109 8.81 8.488 8.169 7.96 7.748 7.414 7.184 6.943 6.816 6.541 6.212 5.861 5.676 5.332 5.06 4.858 4.629 4.095 3.798 3.464 3.077 2.621 2.026 1.336 -2.336 -8 ,12385 ,TETRA ,17607265,Sun Nov 28 21:59:05 CET,Sun Nov 28 23:52:56 CET,0.0 3.856 4.493 5.024 5.465 5.827 6.167 6.476 7.03 7.252 7.446 7.672 7.971 8.154 8.487 8.79 9.067 9.191 9.427 9.643 9.955 10.173 10.396 10.719 10.997 11.25 11.51 11.766 12.098 12.444 12.758 13.078 13.363 13.651 13.986 14.348 14.738 15.145 15.508 15.88 16.257 16.685 17.172 17.636 18.131 18.648 19.194 19.709 20.227 20.639 20.727 20.252 19.59 18.845 18.092 17.376 16.711 16.063 15.476 14.905 14.411 13.967 13.538 13.125 12.701 12.298 11.917 11.557 11.217 10.864 10.5 10.198 9.876 9.541 9.268 8.968 8.679 8.404 8.108 7.886 7.652 7.31 7.073 6.83 6.702 6.424 6.106 5.745 5.561 5.24 4.982 4.768 4.544 4.059 3.775 3.433 3.043 2.591 2.043 1.398 -1.289 -10 ,19552 ,TETRA ,17607267,Sun Nov 28 22:00:03 CET,Sun Nov 28 23:43:32 CET,0.0 7.16 7.79 8.203 8.529 8.826 9.1 9.347 9.756 9.938 10.116 10.336 10.62 10.767 11.064 11.349 11.617 11.75 12.004 12.238 12.556 12.756 12.942 13.199 13.446 13.691 13.935 14.175 14.476 14.768 15.038 15.334 15.626 15.913 16.25 16.619 16.986 17.415 17.863 18.329 18.799 19.323 19.92 20.524 21.191 21.79 22.328 22.834 23.221 23.364 23.012 22.044 20.892 19.68 18.469 17.343 16.372 15.471 14.683 13.891 13.209 12.611 12.042 11.48 10.958 10.499 10.01 9.54 9.124 8.684 8.231 7.861 7.477 7.075 6.763 6.446 6.105 5.73 5.314 5.03 4.731 4.278 3.989 3.676 3.5 3.122 2.743 2.342 2.121 1.75 1.396 1.132 0.835 0.206 -0.132 -0.532 -0.996 -1.451 -1.956 -2.577 -6.581 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt deleted file mode 100644 index e5fe9e36..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14985 ,TETRA ,17607268,Sun Nov 28 21:59:06 CET,Sun Nov 28 23:48:24 CET,0.0 0.284 0.515 0.681 0.828 0.971 1.102 1.231 1.494 1.627 1.761 1.906 2.128 2.231 2.441 2.645 2.828 2.915 3.087 3.248 3.48 3.64 3.795 4.014 4.224 4.424 4.612 4.802 5.051 5.271 5.478 5.741 5.989 6.231 6.503 6.791 7.086 7.416 7.773 8.142 8.522 8.937 9.393 9.872 10.423 11.014 11.672 12.391 13.199 14.06 14.894 15.248 15.258 15.091 14.827 14.541 14.24 13.947 13.67 13.368 13.098 12.838 12.563 12.276 12.03 11.808 11.57 11.358 11.161 10.959 10.738 10.55 10.344 10.113 9.927 9.73 9.533 9.319 9.099 8.953 8.802 8.558 8.375 8.19 8.104 7.923 7.72 7.502 7.386 7.161 7.001 6.86 6.712 6.362 6.15 5.925 5.681 5.38 5.052 4.665 3.679 -2 ,22069 ,TETRA ,17607269,Sun Nov 28 21:59:08 CET,Sun Nov 28 23:47:58 CET,0.0 0.332 0.55 0.741 0.912 1.079 1.244 1.388 1.646 1.775 1.904 2.037 2.256 2.369 2.584 2.784 2.98 3.072 3.248 3.41 3.631 3.784 3.938 4.153 4.361 4.564 4.756 4.938 5.18 5.416 5.643 5.925 6.189 6.445 6.728 7.024 7.317 7.645 7.999 8.368 8.767 9.196 9.663 10.153 10.725 11.338 12.037 12.775 13.56 14.397 15.211 15.588 15.582 15.416 15.172 14.889 14.593 14.274 13.977 13.656 13.358 13.062 12.776 12.524 12.279 12.041 11.788 11.565 11.371 11.167 10.946 10.758 10.562 10.339 10.159 9.985 9.811 9.623 9.422 9.27 9.105 8.851 8.672 8.479 8.376 8.17 7.961 7.722 7.594 7.352 7.163 7.015 6.849 6.486 6.278 6.052 5.824 5.562 5.21 4.687 3.481 -3 ,16734 ,TETRA ,17607270,Sun Nov 28 21:59:06 CET,Sun Nov 28 23:48:27 CET,0.0 0.43 0.641 0.818 0.972 1.127 1.264 1.391 1.624 1.735 1.844 1.93 2.141 2.234 2.416 2.589 2.752 2.831 2.984 3.14 3.37 3.515 3.655 3.862 4.068 4.261 4.436 4.612 4.84 5.057 5.271 5.528 5.775 6.018 6.3 6.609 6.894 7.212 7.558 7.923 8.303 8.708 9.161 9.625 10.166 10.748 11.427 12.164 12.916 13.702 14.514 14.932 14.958 14.789 14.518 14.221 13.943 13.653 13.344 13.013 12.731 12.463 12.198 11.943 11.698 11.465 11.22 10.999 10.8 10.594 10.376 10.176 9.973 9.761 9.585 9.407 9.229 9.043 8.842 8.699 8.557 8.333 8.171 7.991 7.889 7.688 7.491 7.275 7.158 6.931 6.765 6.612 6.451 6.09 5.883 5.667 5.438 5.194 4.861 4.397 3.397 -4 ,8340 ,TETRA ,17607271,Sun Nov 28 21:59:06 CET,Sun Nov 28 23:47:38 CET,0.0 0.334 0.549 0.749 0.922 1.062 1.195 1.329 1.581 1.693 1.793 1.874 2.078 2.17 2.353 2.533 2.709 2.793 2.958 3.122 3.363 3.517 3.671 3.896 4.103 4.3 4.491 4.668 4.897 5.127 5.348 5.615 5.862 6.093 6.367 6.666 6.962 7.3 7.663 8.041 8.417 8.831 9.298 9.765 10.31 10.903 11.571 12.264 12.997 13.836 14.707 15.124 15.147 14.989 14.726 14.421 14.086 13.755 13.466 13.154 12.884 12.628 12.367 12.123 11.89 11.658 11.397 11.156 10.945 10.732 10.512 10.329 10.133 9.921 9.754 9.57 9.377 9.178 8.963 8.823 8.67 8.405 8.222 8.036 7.942 7.74 7.519 7.273 7.147 6.91 6.726 6.588 6.447 6.112 5.915 5.694 5.432 5.153 4.838 4.424 3.391 -5 ,16893 ,TETRA ,17607272,Sun Nov 28 22:00:02 CET,Sun Nov 28 23:49:06 CET,0.0 0.373 0.606 0.803 0.986 1.17 1.356 1.547 1.882 2.018 2.142 2.279 2.506 2.617 2.837 3.044 3.237 3.332 3.514 3.684 3.923 4.082 4.237 4.461 4.673 4.881 5.085 5.271 5.506 5.742 5.969 6.237 6.482 6.711 6.985 7.304 7.604 7.922 8.261 8.614 8.977 9.386 9.856 10.312 10.859 11.459 12.095 12.774 13.54 14.393 15.214 15.569 15.582 15.393 15.145 14.874 14.585 14.302 14.017 13.69 13.405 13.15 12.889 12.622 12.364 12.131 11.878 11.642 11.439 11.227 10.995 10.8 10.605 10.394 10.224 10.042 9.847 9.655 9.462 9.321 9.172 8.93 8.758 8.574 8.48 8.296 8.096 7.871 7.746 7.502 7.335 7.189 7.035 6.713 6.517 6.285 6.044 5.746 5.358 4.806 3.275 -6 ,25025 ,TETRA ,17607273,Sun Nov 28 22:00:04 CET,Sun Nov 28 23:49:04 CET,0.0 0.321 0.528 0.707 0.881 1.037 1.176 1.303 1.531 1.639 1.749 1.838 2.046 2.139 2.312 2.477 2.638 2.719 2.872 3.019 3.248 3.402 3.555 3.779 3.983 4.179 4.365 4.538 4.769 4.984 5.193 5.453 5.704 5.948 6.221 6.529 6.814 7.115 7.456 7.832 8.202 8.598 9.08 9.555 10.075 10.646 11.308 12.028 12.805 13.667 14.53 14.96 15.014 14.892 14.68 14.375 14.046 13.715 13.42 13.129 12.861 12.614 12.361 12.105 11.881 11.677 11.452 11.227 11.023 10.81 10.57 10.379 10.186 9.981 9.816 9.628 9.431 9.226 9.014 8.872 8.727 8.496 8.327 8.156 8.066 7.866 7.656 7.438 7.314 7.076 6.913 6.773 6.617 6.268 6.057 5.842 5.621 5.349 4.999 4.532 3.505 -7 ,18160 ,TETRA ,17607274,Sun Nov 28 22:00:03 CET,Sun Nov 28 23:48:12 CET,0.0 0.291 0.499 0.679 0.848 0.993 1.13 1.258 1.484 1.593 1.701 1.793 1.999 2.093 2.274 2.435 2.603 2.691 2.859 3.02 3.257 3.418 3.574 3.788 3.996 4.199 4.389 4.575 4.808 5.028 5.243 5.513 5.77 6.011 6.287 6.589 6.881 7.199 7.527 7.881 8.256 8.667 9.163 9.654 10.201 10.807 11.498 12.251 13.066 13.908 14.682 15.016 14.978 14.784 14.57 14.338 14.071 13.8 13.528 13.229 12.943 12.664 12.398 12.129 11.872 11.638 11.387 11.164 10.97 10.772 10.555 10.361 10.157 9.945 9.776 9.601 9.416 9.217 9.001 8.851 8.696 8.442 8.273 8.099 8.001 7.802 7.599 7.392 7.274 7.039 6.857 6.691 6.521 6.197 6.01 5.795 5.572 5.314 5.006 4.536 3.381 -8 ,12661 ,TETRA ,17607275,Sun Nov 28 22:00:03 CET,Sun Nov 28 23:48:48 CET,0.0 0.737 1.138 1.46 1.719 1.942 2.126 2.285 2.57 2.701 2.83 2.957 3.171 3.275 3.481 3.662 3.848 3.946 4.125 4.292 4.532 4.686 4.84 5.066 5.276 5.476 5.669 5.861 6.118 6.359 6.577 6.828 7.071 7.311 7.59 7.897 8.188 8.51 8.847 9.198 9.57 9.99 10.463 10.922 11.468 12.063 12.699 13.375 14.126 14.946 15.745 16.158 16.166 15.966 15.737 15.474 15.158 14.838 14.542 14.213 13.909 13.636 13.385 13.145 12.909 12.688 12.438 12.203 12.003 11.796 11.578 11.399 11.209 11.011 10.848 10.673 10.49 10.294 10.093 9.946 9.789 9.551 9.38 9.196 9.101 8.9 8.68 8.441 8.323 8.101 7.924 7.76 7.592 7.238 7.043 6.837 6.594 6.294 5.928 5.442 4.312 -9 ,5777 ,TETRA ,17607276,Sun Nov 28 22:00:05 CET,Sun Nov 28 23:48:59 CET,0.0 0.328 0.541 0.717 0.867 1.007 1.144 1.279 1.516 1.62 1.731 1.843 2.055 2.158 2.372 2.577 2.76 2.846 3.013 3.182 3.42 3.562 3.706 3.917 4.123 4.327 4.519 4.702 4.934 5.147 5.361 5.643 5.91 6.15 6.427 6.743 7.043 7.363 7.696 8.049 8.423 8.836 9.308 9.779 10.328 10.939 11.625 12.346 13.148 13.987 14.781 15.191 15.218 15.043 14.791 14.512 14.229 13.925 13.638 13.327 13.035 12.764 12.494 12.229 11.984 11.755 11.497 11.271 11.082 10.882 10.666 10.482 10.289 10.086 9.914 9.73 9.551 9.349 9.126 8.973 8.81 8.549 8.374 8.195 8.098 7.893 7.68 7.452 7.328 7.092 6.92 6.775 6.621 6.272 6.072 5.858 5.625 5.371 5.073 4.634 3.526 -10 ,5813 ,TETRA ,17607277,Sun Nov 28 22:00:03 CET,Sun Nov 28 23:45:49 CET,0.0 0.35 0.584 0.77 0.928 1.083 1.236 1.383 1.665 1.803 1.935 2.071 2.301 2.42 2.642 2.839 3.02 3.103 3.277 3.454 3.701 3.861 4.014 4.217 4.412 4.603 4.789 4.969 5.194 5.417 5.635 5.902 6.16 6.396 6.654 6.954 7.25 7.577 7.927 8.294 8.677 9.098 9.57 10.026 10.579 11.192 11.873 12.606 13.389 14.206 15.004 15.429 15.418 15.197 14.923 14.619 14.32 14.033 13.76 13.46 13.159 12.873 12.617 12.369 12.13 11.916 11.674 11.432 11.22 11.009 10.778 10.582 10.382 10.165 10.005 9.837 9.663 9.482 9.284 9.144 8.993 8.764 8.605 8.43 8.338 8.149 7.95 7.717 7.589 7.365 7.2 7.05 6.882 6.508 6.309 6.104 5.863 5.574 5.248 4.831 3.452 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt deleted file mode 100644 index cf367215..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,654 ,TETRA ,17607278,Sun Nov 28 22:00:03 CET,Sun Nov 28 23:38:30 CET,0.0 0.509 0.77 0.983 1.146 1.288 1.419 1.531 1.706 1.79 1.878 1.991 2.097 2.159 2.27 2.374 2.484 2.543 2.656 2.753 2.888 2.97 3.046 3.145 3.233 3.328 3.427 3.514 3.615 3.703 3.787 3.908 4.016 4.101 4.204 4.314 4.417 4.527 4.635 4.752 4.859 4.952 5.068 5.155 5.213 5.249 5.261 5.224 5.044 4.65 3.818 2.61 1.512 0.578 -0.2 -0.881 -1.467 -2.014 -2.49 -2.938 -3.318 -3.672 -4.028 -4.374 -4.684 -4.943 -5.21 -5.458 -5.672 -5.888 -6.132 -6.34 -6.535 -6.731 -6.896 -7.074 -7.256 -7.436 -7.624 -7.749 -7.874 -8.078 -8.212 -8.352 -8.433 -8.596 -8.76 -8.933 -9.025 -9.177 -9.334 -9.442 -9.547 -9.792 -9.948 -10.114 -10.284 -10.463 -10.665 -10.935 -11.748 -2 ,13694 ,TETRA ,17607279,Sun Nov 28 22:00:04 CET,Sun Nov 28 23:51:04 CET,0.0 0.686 0.981 1.176 1.321 1.463 1.593 1.7 1.886 1.961 2.033 2.139 2.256 2.333 2.472 2.588 2.694 2.746 2.847 2.937 3.066 3.149 3.232 3.362 3.477 3.569 3.645 3.716 3.827 3.932 4.021 4.136 4.248 4.348 4.455 4.583 4.723 4.861 4.962 5.064 5.18 5.284 5.384 5.473 5.546 5.593 5.612 5.571 5.423 5.058 4.206 3.08 2.122 1.243 0.482 -0.164 -0.707 -1.237 -1.715 -2.183 -2.599 -2.951 -3.286 -3.611 -3.901 -4.157 -4.426 -4.677 -4.89 -5.101 -5.324 -5.518 -5.725 -5.926 -6.077 -6.232 -6.392 -6.568 -6.757 -6.882 -7.001 -7.189 -7.325 -7.472 -7.544 -7.692 -7.856 -8.021 -8.102 -8.235 -8.374 -8.496 -8.619 -8.834 -8.96 -9.105 -9.249 -9.43 -9.647 -9.925 -10.845 -3 ,27967 ,TETRA ,17607280,Sun Nov 28 22:00:04 CET,Sun Nov 28 23:48:12 CET,0.0 0.577 0.803 0.966 1.086 1.21 1.338 1.451 1.618 1.69 1.768 1.877 1.984 2.047 2.169 2.288 2.396 2.448 2.546 2.635 2.759 2.837 2.921 3.035 3.129 3.221 3.303 3.382 3.478 3.558 3.642 3.748 3.848 3.944 4.05 4.168 4.27 4.385 4.512 4.641 4.768 4.868 4.949 5.024 5.096 5.142 5.16 5.144 5.023 4.683 3.886 2.781 1.805 0.942 0.219 -0.421 -0.987 -1.506 -1.951 -2.388 -2.78 -3.152 -3.494 -3.798 -4.095 -4.37 -4.638 -4.89 -5.111 -5.324 -5.55 -5.738 -5.933 -6.135 -6.291 -6.446 -6.612 -6.797 -6.987 -7.114 -7.245 -7.443 -7.576 -7.724 -7.797 -7.95 -8.103 -8.258 -8.351 -8.497 -8.636 -8.732 -8.843 -9.098 -9.216 -9.343 -9.514 -9.688 -9.918 -10.25 -11.15 -4 ,17812 ,TETRA ,17607281,Sun Nov 28 22:00:07 CET,Sun Nov 28 23:48:33 CET,0.0 0.659 0.939 1.138 1.288 1.415 1.526 1.631 1.813 1.889 1.975 2.095 2.205 2.27 2.395 2.514 2.624 2.674 2.76 2.84 2.949 3.024 3.109 3.228 3.33 3.431 3.528 3.616 3.725 3.815 3.899 4.002 4.096 4.189 4.298 4.406 4.509 4.629 4.739 4.847 4.962 5.085 5.204 5.294 5.391 5.459 5.463 5.386 5.19 4.801 3.974 2.747 1.696 0.826 0.07 -0.637 -1.265 -1.821 -2.298 -2.777 -3.181 -3.526 -3.853 -4.163 -4.456 -4.726 -5.013 -5.254 -5.452 -5.671 -5.903 -6.094 -6.297 -6.498 -6.645 -6.806 -6.978 -7.152 -7.323 -7.445 -7.584 -7.803 -7.955 -8.108 -8.184 -8.345 -8.513 -8.677 -8.77 -8.92 -9.052 -9.143 -9.238 -9.471 -9.602 -9.728 -9.88 -10.051 -10.256 -10.576 -11.402 -5 ,18302 ,TETRA ,17607282,Sun Nov 28 22:02:05 CET,Sun Nov 28 23:51:24 CET,0.0 0.646 0.897 1.093 1.273 1.431 1.551 1.649 1.837 1.919 2.001 2.1 2.2 2.254 2.368 2.464 2.548 2.596 2.691 2.783 2.921 3.002 3.078 3.191 3.289 3.377 3.463 3.546 3.655 3.749 3.837 3.949 4.046 4.137 4.24 4.356 4.469 4.577 4.675 4.773 4.869 4.969 5.068 5.154 5.241 5.308 5.335 5.267 5.085 4.705 3.89 2.72 1.662 0.74 -0.054 -0.754 -1.362 -1.92 -2.399 -2.861 -3.243 -3.597 -3.929 -4.228 -4.524 -4.798 -5.077 -5.327 -5.549 -5.771 -5.991 -6.181 -6.389 -6.602 -6.753 -6.914 -7.096 -7.269 -7.434 -7.549 -7.676 -7.889 -8.037 -8.186 -8.261 -8.417 -8.585 -8.75 -8.832 -8.976 -9.127 -9.234 -9.342 -9.597 -9.746 -9.898 -10.048 -10.226 -10.478 -10.817 -11.665 -6 ,23758 ,TETRA ,17607283,Sun Nov 28 22:01:03 CET,Sun Nov 28 23:49:38 CET,0.0 0.709 0.954 1.132 1.289 1.414 1.524 1.635 1.836 1.919 1.989 2.086 2.201 2.267 2.378 2.489 2.599 2.651 2.743 2.831 2.98 3.073 3.155 3.272 3.377 3.47 3.566 3.659 3.772 3.878 3.98 4.103 4.226 4.328 4.426 4.522 4.608 4.704 4.813 4.92 5.033 5.159 5.287 5.383 5.462 5.499 5.505 5.443 5.249 4.867 4.015 2.838 1.823 0.944 0.197 -0.486 -1.107 -1.675 -2.148 -2.591 -2.98 -3.336 -3.677 -3.982 -4.262 -4.527 -4.805 -5.058 -5.275 -5.5 -5.729 -5.915 -6.115 -6.32 -6.469 -6.621 -6.779 -6.947 -7.137 -7.268 -7.394 -7.591 -7.73 -7.878 -7.954 -8.099 -8.258 -8.436 -8.523 -8.66 -8.805 -8.918 -9.032 -9.284 -9.424 -9.58 -9.759 -9.963 -10.173 -10.432 -11.234 -7 ,2883 ,TETRA ,17607284,Sun Nov 28 22:01:04 CET,Sun Nov 28 23:50:00 CET,0.0 0.701 0.985 1.169 1.332 1.463 1.6 1.719 1.91 2.004 2.083 2.181 2.292 2.354 2.487 2.612 2.727 2.785 2.894 2.982 3.086 3.162 3.245 3.367 3.475 3.571 3.663 3.744 3.841 3.927 4.011 4.115 4.218 4.32 4.438 4.571 4.684 4.786 4.895 5.004 5.09 5.182 5.298 5.386 5.451 5.488 5.482 5.404 5.208 4.81 3.994 2.853 1.852 0.97 0.178 -0.529 -1.131 -1.684 -2.151 -2.582 -2.95 -3.296 -3.622 -3.922 -4.204 -4.466 -4.76 -5.021 -5.24 -5.455 -5.673 -5.861 -6.057 -6.263 -6.422 -6.583 -6.754 -6.939 -7.132 -7.261 -7.387 -7.576 -7.71 -7.854 -7.927 -8.09 -8.26 -8.43 -8.522 -8.671 -8.805 -8.902 -9.016 -9.27 -9.424 -9.595 -9.757 -9.937 -10.144 -10.442 -11.59 -8 ,5518 ,TETRA ,17607285,Sun Nov 28 22:01:10 CET,Sun Nov 28 23:49:42 CET,0.0 0.958 1.272 1.496 1.688 1.844 1.961 2.064 2.251 2.335 2.414 2.515 2.625 2.689 2.814 2.933 3.036 3.082 3.174 3.264 3.387 3.467 3.554 3.678 3.782 3.875 3.968 4.061 4.16 4.254 4.358 4.473 4.589 4.697 4.813 4.934 5.033 5.151 5.271 5.379 5.495 5.607 5.702 5.794 5.884 5.94 5.971 5.922 5.761 5.415 4.623 3.481 2.47 1.598 0.809 0.094 -0.507 -1.051 -1.524 -1.965 -2.359 -2.723 -3.042 -3.35 -3.643 -3.912 -4.206 -4.447 -4.656 -4.887 -5.121 -5.315 -5.511 -5.713 -5.872 -6.034 -6.21 -6.393 -6.575 -6.707 -6.836 -7.02 -7.154 -7.294 -7.367 -7.52 -7.684 -7.869 -7.955 -8.095 -8.244 -8.352 -8.46 -8.702 -8.852 -9.011 -9.162 -9.327 -9.54 -9.821 -10.569 -9 ,27993 ,TETRA ,17607286,Sun Nov 28 22:01:04 CET,Sun Nov 28 23:49:21 CET,0.0 0.536 0.801 1.014 1.185 1.328 1.462 1.575 1.761 1.844 1.922 2.028 2.143 2.208 2.331 2.443 2.549 2.599 2.692 2.788 2.912 2.988 3.068 3.175 3.272 3.37 3.464 3.548 3.658 3.759 3.855 3.969 4.075 4.173 4.274 4.385 4.482 4.582 4.697 4.813 4.916 5.017 5.125 5.202 5.273 5.327 5.325 5.263 5.085 4.692 3.85 2.63 1.54 0.595 -0.18 -0.849 -1.412 -1.915 -2.367 -2.816 -3.213 -3.575 -3.904 -4.208 -4.488 -4.742 -5.012 -5.249 -5.456 -5.674 -5.899 -6.092 -6.3 -6.507 -6.661 -6.831 -7.003 -7.183 -7.373 -7.493 -7.621 -7.812 -7.94 -8.083 -8.161 -8.331 -8.521 -8.716 -8.812 -8.967 -9.124 -9.228 -9.339 -9.589 -9.731 -9.879 -10.03 -10.23 -10.497 -10.832 -11.688 -10 ,11171 ,TETRA ,17607287,Sun Nov 28 22:01:10 CET,Sun Nov 28 23:49:41 CET,0.0 0.738 1.002 1.183 1.34 1.459 1.561 1.665 1.822 1.895 1.987 2.116 2.23 2.292 2.417 2.546 2.655 2.704 2.792 2.876 3.005 3.082 3.156 3.273 3.374 3.469 3.564 3.651 3.759 3.855 3.942 4.037 4.124 4.216 4.33 4.445 4.551 4.663 4.754 4.86 4.982 5.097 5.221 5.337 5.44 5.496 5.512 5.435 5.216 4.814 3.918 2.782 1.817 0.945 0.2 -0.475 -1.076 -1.609 -2.063 -2.512 -2.905 -3.264 -3.605 -3.912 -4.193 -4.462 -4.735 -4.97 -5.173 -5.392 -5.621 -5.814 -6.013 -6.219 -6.381 -6.541 -6.706 -6.888 -7.078 -7.206 -7.336 -7.534 -7.671 -7.812 -7.884 -8.032 -8.191 -8.362 -8.454 -8.596 -8.74 -8.845 -8.951 -9.2 -9.343 -9.491 -9.647 -9.836 -10.074 -10.412 -11.236 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt deleted file mode 100644 index 67653587..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,918 ,TETRA ,17607288,Sun Nov 28 22:01:08 CET,Sun Nov 28 23:49:24 CET,0.0 0.682 0.922 1.085 1.22 1.335 1.438 1.523 1.689 1.772 1.849 1.95 2.04 2.098 2.2 2.294 2.381 2.422 2.503 2.58 2.692 2.759 2.812 2.893 2.975 3.052 3.116 3.174 3.26 3.326 3.382 3.45 3.502 3.553 3.615 3.684 3.741 3.786 3.821 3.858 3.888 3.896 3.885 3.851 3.76 3.622 3.434 3.113 2.588 1.735 0.277 -1.451 -2.831 -3.986 -4.99 -5.87 -6.625 -7.278 -7.822 -8.381 -8.856 -9.252 -9.624 -9.973 -10.296 -10.591 -10.887 -11.15 -11.381 -11.627 -11.885 -12.102 -12.318 -12.535 -12.709 -12.887 -13.077 -13.275 -13.471 -13.608 -13.75 -13.948 -14.089 -14.244 -14.322 -14.485 -14.659 -14.838 -14.928 -15.075 -15.244 -15.349 -15.463 -15.729 -15.862 -15.994 -16.159 -16.345 -16.533 -16.833 -17.72 -2 ,12107 ,TETRA ,17607289,Sun Nov 28 22:01:05 CET,Sun Nov 28 23:50:41 CET,0.0 0.474 0.676 0.818 0.946 1.058 1.15 1.227 1.382 1.466 1.542 1.65 1.74 1.797 1.906 2.009 2.094 2.129 2.206 2.286 2.401 2.469 2.542 2.646 2.725 2.796 2.87 2.944 3.033 3.102 3.161 3.228 3.286 3.348 3.399 3.444 3.494 3.544 3.583 3.61 3.623 3.612 3.584 3.554 3.486 3.354 3.144 2.818 2.304 1.445 -0.048 -1.823 -3.217 -4.374 -5.371 -6.253 -7.02 -7.693 -8.249 -8.805 -9.285 -9.701 -10.09 -10.444 -10.766 -11.056 -11.356 -11.621 -11.855 -12.094 -12.342 -12.564 -12.787 -13.009 -13.177 -13.353 -13.535 -13.725 -13.928 -14.067 -14.202 -14.405 -14.555 -14.714 -14.794 -14.95 -15.116 -15.295 -15.384 -15.527 -15.687 -15.794 -15.911 -16.184 -16.336 -16.482 -16.622 -16.788 -16.978 -17.183 -17.965 -3 ,17689 ,TETRA ,17607290,Sun Nov 28 22:01:06 CET,Sun Nov 28 23:52:06 CET,0.0 0.674 0.891 1.077 1.214 1.318 1.422 1.518 1.67 1.74 1.806 1.906 1.997 2.052 2.147 2.224 2.303 2.346 2.432 2.509 2.597 2.654 2.708 2.779 2.848 2.922 2.992 3.057 3.138 3.204 3.267 3.34 3.404 3.47 3.532 3.573 3.611 3.66 3.698 3.72 3.743 3.739 3.706 3.68 3.611 3.464 3.263 2.971 2.47 1.652 0.159 -1.628 -3.048 -4.252 -5.279 -6.153 -6.9 -7.559 -8.106 -8.643 -9.103 -9.515 -9.914 -10.296 -10.643 -10.937 -11.239 -11.512 -11.745 -11.991 -12.243 -12.452 -12.663 -12.881 -13.052 -13.217 -13.385 -13.571 -13.764 -13.894 -14.028 -14.239 -14.39 -14.54 -14.614 -14.777 -14.948 -15.137 -15.246 -15.404 -15.559 -15.655 -15.758 -15.997 -16.126 -16.265 -16.412 -16.586 -16.83 -17.11 -17.851 -4 ,23180 ,TETRA ,17607291,Sun Nov 28 22:01:06 CET,Sun Nov 28 23:51:03 CET,0.0 0.799 1.032 1.204 1.322 1.421 1.508 1.608 1.787 1.861 1.928 2.002 2.088 2.15 2.26 2.35 2.441 2.487 2.569 2.647 2.749 2.804 2.859 2.936 3.012 3.079 3.139 3.195 3.265 3.336 3.407 3.487 3.563 3.626 3.685 3.749 3.804 3.855 3.892 3.92 3.947 3.966 3.946 3.904 3.823 3.669 3.422 3.067 2.515 1.637 0.188 -1.535 -2.943 -4.132 -5.124 -5.989 -6.74 -7.397 -7.938 -8.468 -8.942 -9.368 -9.768 -10.134 -10.464 -10.76 -11.072 -11.347 -11.573 -11.809 -12.045 -12.251 -12.47 -12.684 -12.847 -13.023 -13.207 -13.395 -13.594 -13.729 -13.865 -14.068 -14.207 -14.352 -14.43 -14.592 -14.754 -14.928 -15.021 -15.161 -15.294 -15.404 -15.532 -15.771 -15.887 -16.028 -16.201 -16.402 -16.644 -16.922 -17.469 -5 ,23949 ,TETRA ,17607292,Sun Nov 28 22:01:08 CET,Sun Nov 28 23:51:05 CET,0.0 0.717 0.955 1.096 1.238 1.377 1.485 1.569 1.722 1.793 1.857 1.942 2.036 2.102 2.199 2.275 2.363 2.409 2.503 2.591 2.688 2.747 2.81 2.906 2.996 3.078 3.159 3.228 3.298 3.379 3.458 3.534 3.594 3.653 3.721 3.778 3.826 3.87 3.916 3.961 3.987 3.993 3.966 3.914 3.849 3.746 3.55 3.249 2.745 1.879 0.448 -1.308 -2.743 -3.904 -4.886 -5.75 -6.478 -7.14 -7.71 -8.268 -8.735 -9.151 -9.551 -9.92 -10.261 -10.559 -10.851 -11.118 -11.35 -11.583 -11.823 -12.021 -12.223 -12.428 -12.592 -12.763 -12.931 -13.109 -13.31 -13.447 -13.585 -13.804 -13.955 -14.11 -14.185 -14.346 -14.525 -14.712 -14.802 -14.942 -15.108 -15.219 -15.333 -15.6 -15.743 -15.887 -16.05 -16.24 -16.439 -16.692 -17.445 -6 ,758 ,TETRA ,17607293,Sun Nov 28 22:01:06 CET,Sun Nov 28 23:50:04 CET,0.0 0.482 0.66 0.811 0.932 1.046 1.156 1.254 1.437 1.514 1.582 1.684 1.771 1.828 1.928 2.007 2.087 2.13 2.207 2.275 2.371 2.441 2.511 2.596 2.662 2.728 2.797 2.854 2.924 2.988 3.048 3.11 3.17 3.224 3.276 3.342 3.394 3.427 3.454 3.479 3.498 3.506 3.49 3.452 3.366 3.229 3.021 2.68 2.107 1.198 -0.311 -2.106 -3.559 -4.803 -5.83 -6.715 -7.467 -8.113 -8.671 -9.22 -9.693 -10.118 -10.514 -10.883 -11.222 -11.523 -11.826 -12.1 -12.336 -12.581 -12.846 -13.05 -13.253 -13.472 -13.638 -13.809 -13.99 -14.181 -14.372 -14.507 -14.652 -14.877 -15.027 -15.188 -15.272 -15.425 -15.581 -15.754 -15.849 -16.004 -16.161 -16.265 -16.373 -16.61 -16.74 -16.879 -17.035 -17.221 -17.44 -17.771 -18.76 -7 ,26562 ,TETRA ,17607294,Sun Nov 28 22:01:06 CET,Sun Nov 28 23:49:19 CET,0.0 0.469 0.675 0.828 0.963 1.093 1.205 1.295 1.462 1.543 1.612 1.7 1.793 1.846 1.96 2.072 2.163 2.203 2.277 2.35 2.452 2.515 2.579 2.67 2.743 2.82 2.896 2.961 3.036 3.102 3.173 3.247 3.304 3.355 3.41 3.468 3.531 3.589 3.637 3.673 3.708 3.726 3.712 3.678 3.609 3.503 3.285 2.921 2.373 1.529 0.024 -1.788 -3.196 -4.391 -5.378 -6.215 -6.955 -7.642 -8.237 -8.793 -9.259 -9.669 -10.052 -10.411 -10.739 -11.038 -11.342 -11.617 -11.855 -12.098 -12.343 -12.538 -12.743 -12.969 -13.137 -13.31 -13.495 -13.676 -13.869 -14.003 -14.141 -14.363 -14.518 -14.674 -14.753 -14.908 -15.068 -15.249 -15.342 -15.488 -15.643 -15.753 -15.876 -16.123 -16.254 -16.406 -16.567 -16.752 -16.97 -17.263 -18.227 -8 ,12361 ,TETRA ,17607295,Sun Nov 28 22:01:08 CET,Sun Nov 28 23:49:16 CET,0.0 0.535 0.732 0.906 1.061 1.181 1.276 1.366 1.546 1.627 1.701 1.803 1.887 1.945 2.054 2.145 2.245 2.285 2.357 2.429 2.519 2.583 2.656 2.763 2.856 2.932 2.997 3.053 3.127 3.202 3.282 3.366 3.438 3.509 3.571 3.62 3.661 3.706 3.762 3.804 3.838 3.867 3.836 3.773 3.692 3.565 3.352 3.028 2.503 1.666 0.28 -1.503 -2.919 -4.047 -5.024 -5.895 -6.644 -7.28 -7.831 -8.411 -8.904 -9.308 -9.683 -10.035 -10.355 -10.64 -10.945 -11.231 -11.468 -11.702 -11.947 -12.147 -12.349 -12.556 -12.715 -12.875 -13.045 -13.228 -13.428 -13.564 -13.695 -13.9 -14.049 -14.198 -14.278 -14.452 -14.625 -14.796 -14.889 -15.04 -15.193 -15.292 -15.4 -15.657 -15.797 -15.943 -16.091 -16.251 -16.478 -16.757 -17.556 -9 ,16668 ,TETRA ,17607296,Sun Nov 28 22:01:06 CET,Sun Nov 28 23:49:21 CET,0.0 0.605 0.801 0.922 1.045 1.164 1.254 1.34 1.512 1.59 1.657 1.752 1.847 1.907 2.011 2.096 2.164 2.205 2.292 2.362 2.466 2.536 2.604 2.697 2.776 2.847 2.915 2.981 3.063 3.13 3.188 3.264 3.333 3.386 3.439 3.499 3.55 3.595 3.646 3.704 3.761 3.798 3.792 3.753 3.689 3.578 3.367 3.043 2.534 1.715 0.309 -1.417 -2.837 -4.039 -5.037 -5.923 -6.706 -7.377 -7.945 -8.507 -8.981 -9.396 -9.767 -10.112 -10.429 -10.743 -11.074 -11.344 -11.572 -11.81 -12.057 -12.259 -12.467 -12.677 -12.841 -13.017 -13.197 -13.38 -13.57 -13.696 -13.827 -14.042 -14.177 -14.327 -14.408 -14.566 -14.726 -14.892 -14.99 -15.143 -15.312 -15.422 -15.531 -15.778 -15.919 -16.057 -16.206 -16.393 -16.616 -16.868 -17.589 -10 ,26364 ,TETRA ,17607297,Sun Nov 28 22:01:07 CET,Sun Nov 28 23:40:47 CET,0.0 1.004 1.236 1.393 1.535 1.675 1.795 1.907 2.094 2.168 2.232 2.314 2.396 2.448 2.543 2.63 2.716 2.758 2.832 2.908 3.012 3.067 3.12 3.192 3.259 3.326 3.39 3.459 3.548 3.624 3.68 3.757 3.827 3.879 3.936 3.986 4.04 4.094 4.135 4.19 4.235 4.247 4.235 4.193 4.116 3.991 3.774 3.392 2.815 1.914 0.394 -1.363 -2.801 -4.056 -5.097 -5.979 -6.717 -7.361 -7.938 -8.497 -8.948 -9.346 -9.733 -10.101 -10.425 -10.713 -11.016 -11.285 -11.515 -11.753 -11.994 -12.194 -12.399 -12.612 -12.791 -12.981 -13.168 -13.347 -13.542 -13.677 -13.809 -14.013 -14.152 -14.301 -14.377 -14.537 -14.711 -14.895 -14.991 -15.135 -15.283 -15.39 -15.503 -15.738 -15.868 -16.011 -16.173 -16.377 -16.618 -16.87 -17.683 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt deleted file mode 100644 index e30b1e44..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4296 ,TETRA ,17607298,Sun Nov 28 22:02:07 CET,Sun Nov 28 23:51:21 CET,0.0 0.656 0.924 1.119 1.274 1.432 1.574 1.68 1.875 1.963 2.041 2.146 2.288 2.373 2.523 2.655 2.774 2.833 2.953 3.063 3.218 3.313 3.411 3.552 3.685 3.812 3.931 4.054 4.214 4.366 4.513 4.693 4.866 5.028 5.211 5.41 5.601 5.821 6.048 6.281 6.533 6.826 7.154 7.464 7.816 8.202 8.651 9.129 9.635 10.165 10.658 10.869 10.755 10.593 10.432 10.219 9.997 9.759 9.526 9.302 9.108 8.935 8.78 8.627 8.475 8.315 8.134 7.997 7.889 7.778 7.665 7.571 7.477 7.381 7.298 7.212 7.127 7.041 6.951 6.889 6.824 6.717 6.636 6.559 6.522 6.433 6.339 6.244 6.195 6.091 6.033 5.974 5.91 5.772 5.703 5.624 5.529 5.411 5.299 5.172 4.846 -2 ,6933 ,TETRA ,17607299,Sun Nov 28 22:02:05 CET,Sun Nov 28 23:52:37 CET,0.0 0.522 0.783 0.976 1.124 1.246 1.364 1.476 1.665 1.748 1.821 1.911 2.032 2.098 2.229 2.372 2.525 2.594 2.718 2.829 2.982 3.074 3.165 3.306 3.446 3.584 3.716 3.83 3.972 4.114 4.249 4.422 4.6 4.765 4.949 5.147 5.339 5.557 5.781 6.021 6.268 6.546 6.868 7.171 7.529 7.938 8.371 8.813 9.273 9.731 10.163 10.364 10.336 10.186 9.985 9.759 9.562 9.353 9.139 8.919 8.743 8.581 8.401 8.244 8.097 7.945 7.776 7.622 7.492 7.349 7.209 7.104 6.997 6.883 6.799 6.719 6.638 6.554 6.465 6.399 6.328 6.208 6.125 6.044 5.998 5.905 5.815 5.709 5.658 5.558 5.501 5.433 5.361 5.212 5.138 5.066 4.97 4.867 4.746 4.594 4.224 -3 ,13433 ,TETRA ,17607300,Sun Nov 28 22:02:07 CET,Sun Nov 28 23:51:00 CET,0.0 0.505 0.747 0.945 1.105 1.245 1.375 1.484 1.677 1.766 1.855 1.972 2.107 2.183 2.322 2.448 2.572 2.637 2.752 2.853 3.005 3.105 3.209 3.354 3.492 3.629 3.761 3.885 4.034 4.177 4.321 4.509 4.684 4.835 5.023 5.248 5.453 5.677 5.926 6.165 6.402 6.685 7.032 7.359 7.707 8.091 8.529 9.022 9.563 10.093 10.563 10.727 10.66 10.538 10.376 10.167 9.954 9.738 9.545 9.333 9.145 8.984 8.812 8.634 8.471 8.325 8.175 8.04 7.92 7.789 7.638 7.516 7.407 7.297 7.217 7.14 7.059 6.963 6.861 6.792 6.726 6.624 6.549 6.464 6.419 6.33 6.233 6.129 6.072 5.966 5.925 5.871 5.805 5.671 5.595 5.509 5.419 5.321 5.193 5.032 4.733 -4 ,13049 ,TETRA ,17607301,Sun Nov 28 22:02:07 CET,Sun Nov 28 23:47:21 CET,0.0 0.449 0.624 0.784 0.953 1.096 1.222 1.329 1.519 1.615 1.705 1.816 1.945 2.017 2.161 2.302 2.423 2.485 2.616 2.728 2.888 3.002 3.112 3.256 3.386 3.515 3.645 3.762 3.91 4.056 4.202 4.378 4.544 4.702 4.879 5.076 5.273 5.491 5.724 5.971 6.211 6.476 6.814 7.162 7.54 7.932 8.394 8.896 9.414 9.916 10.339 10.492 10.387 10.194 9.996 9.791 9.586 9.397 9.22 9.014 8.836 8.678 8.517 8.362 8.208 8.063 7.925 7.781 7.648 7.52 7.373 7.263 7.154 7.026 6.928 6.835 6.742 6.645 6.546 6.479 6.408 6.292 6.208 6.128 6.086 5.997 5.91 5.817 5.773 5.672 5.591 5.515 5.444 5.285 5.196 5.115 5.032 4.946 4.846 4.706 4.318 -5 ,6036 ,TETRA ,17607302,Sun Nov 28 22:02:07 CET,Sun Nov 28 23:52:15 CET,0.0 0.542 0.828 1.01 1.157 1.3 1.425 1.542 1.773 1.874 1.963 2.071 2.197 2.272 2.409 2.523 2.641 2.699 2.814 2.93 3.103 3.209 3.298 3.429 3.552 3.674 3.802 3.92 4.074 4.225 4.36 4.519 4.678 4.828 5.001 5.214 5.423 5.648 5.883 6.116 6.364 6.65 6.975 7.311 7.692 8.067 8.496 8.958 9.429 9.936 10.458 10.691 10.638 10.473 10.277 10.081 9.901 9.738 9.577 9.374 9.184 9.014 8.865 8.72 8.582 8.47 8.348 8.233 8.137 8.023 7.907 7.825 7.738 7.639 7.547 7.455 7.369 7.287 7.205 7.147 7.092 6.99 6.912 6.831 6.786 6.696 6.595 6.481 6.427 6.319 6.258 6.205 6.151 6.03 5.949 5.851 5.746 5.65 5.55 5.402 5.092 -6 ,10539 ,TETRA ,17607303,Sun Nov 28 22:02:06 CET,Sun Nov 28 23:50:09 CET,0.0 0.759 1.033 1.231 1.373 1.516 1.644 1.753 1.968 2.065 2.149 2.245 2.367 2.443 2.595 2.739 2.884 2.949 3.065 3.172 3.323 3.424 3.525 3.671 3.802 3.93 4.054 4.17 4.317 4.467 4.608 4.767 4.934 5.102 5.289 5.491 5.693 5.919 6.159 6.427 6.709 7.003 7.329 7.652 8.008 8.372 8.8 9.265 9.771 10.338 10.85 11.073 11.065 10.944 10.759 10.541 10.331 10.12 9.925 9.709 9.507 9.324 9.151 8.978 8.808 8.655 8.484 8.328 8.196 8.061 7.913 7.79 7.669 7.538 7.44 7.338 7.234 7.133 7.024 6.944 6.86 6.738 6.642 6.535 6.485 6.387 6.299 6.213 6.167 6.058 5.973 5.914 5.86 5.712 5.628 5.54 5.438 5.325 5.213 5.096 4.592 -7 ,26954 ,TETRA ,17607304,Sun Nov 28 22:02:08 CET,Sun Nov 28 23:50:23 CET,0.0 0.601 0.803 0.967 1.112 1.246 1.393 1.52 1.714 1.811 1.905 2.011 2.138 2.213 2.352 2.483 2.603 2.656 2.763 2.873 3.027 3.127 3.225 3.357 3.484 3.616 3.737 3.855 4.03 4.197 4.336 4.5 4.673 4.85 5.042 5.247 5.441 5.651 5.885 6.126 6.375 6.658 6.976 7.303 7.678 8.076 8.519 8.999 9.531 10.062 10.557 10.791 10.737 10.574 10.376 10.144 9.917 9.702 9.521 9.333 9.14 8.97 8.806 8.644 8.497 8.359 8.21 8.072 7.954 7.847 7.735 7.631 7.526 7.428 7.349 7.269 7.184 7.087 6.99 6.923 6.857 6.763 6.698 6.625 6.584 6.495 6.396 6.296 6.245 6.142 6.088 6.03 5.961 5.801 5.714 5.624 5.528 5.411 5.296 5.121 4.699 -8 ,9013 ,TETRA ,17607305,Sun Nov 28 22:02:07 CET,Sun Nov 28 23:52:49 CET,0.0 0.788 0.99 1.142 1.293 1.423 1.539 1.65 1.848 1.941 2.026 2.12 2.248 2.323 2.473 2.627 2.764 2.829 2.956 3.063 3.208 3.304 3.395 3.526 3.665 3.81 3.944 4.069 4.23 4.381 4.531 4.703 4.862 5.01 5.187 5.386 5.568 5.774 6.007 6.249 6.49 6.751 7.056 7.368 7.733 8.125 8.56 9.034 9.555 10.092 10.609 10.866 10.834 10.683 10.487 10.277 10.052 9.831 9.637 9.422 9.228 9.051 8.886 8.73 8.569 8.422 8.262 8.118 7.997 7.867 7.732 7.62 7.507 7.402 7.324 7.24 7.149 7.05 6.941 6.874 6.814 6.713 6.638 6.553 6.505 6.41 6.321 6.225 6.169 6.063 6.018 5.965 5.906 5.778 5.697 5.62 5.553 5.461 5.354 5.238 4.994 -9 ,14179 ,TETRA ,17607306,Sun Nov 28 22:02:07 CET,Sun Nov 28 23:51:26 CET,0.0 0.75 1.002 1.181 1.318 1.447 1.58 1.701 1.908 2.0 2.085 2.173 2.298 2.364 2.486 2.606 2.724 2.781 2.891 3.006 3.169 3.268 3.366 3.508 3.645 3.776 3.904 4.027 4.181 4.335 4.489 4.658 4.821 4.986 5.171 5.376 5.577 5.801 6.036 6.268 6.517 6.798 7.118 7.449 7.823 8.213 8.656 9.128 9.635 10.187 10.674 10.85 10.808 10.692 10.511 10.266 10.047 9.832 9.618 9.406 9.222 9.064 8.899 8.722 8.558 8.411 8.255 8.119 8.01 7.903 7.795 7.7 7.603 7.513 7.442 7.36 7.27 7.184 7.098 7.035 6.97 6.872 6.795 6.701 6.653 6.556 6.458 6.35 6.29 6.183 6.128 6.066 6.0 5.862 5.787 5.704 5.611 5.504 5.4 5.258 4.823 -10 ,4238 ,TETRA ,17607307,Sun Nov 28 22:02:07 CET,Sun Nov 28 23:50:33 CET,0.0 0.862 1.072 1.233 1.383 1.51 1.626 1.736 1.945 2.042 2.124 2.22 2.354 2.428 2.569 2.706 2.84 2.904 3.021 3.128 3.282 3.385 3.482 3.615 3.754 3.883 4.003 4.125 4.295 4.452 4.593 4.771 4.94 5.094 5.271 5.478 5.661 5.867 6.111 6.351 6.597 6.881 7.187 7.483 7.817 8.186 8.615 9.081 9.592 10.119 10.579 10.76 10.714 10.575 10.41 10.234 10.08 9.931 9.792 9.65 9.515 9.388 9.264 9.14 9.016 8.904 8.784 8.663 8.555 8.441 8.318 8.223 8.131 8.027 7.94 7.841 7.731 7.624 7.534 7.472 7.405 7.309 7.233 7.149 7.104 7.013 6.914 6.791 6.728 6.617 6.541 6.477 6.42 6.302 6.223 6.139 6.062 5.971 5.85 5.705 5.406 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt deleted file mode 100644 index cd6913d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13687 ,TETRA ,17607308,Sun Nov 28 22:02:08 CET,Sun Nov 28 23:51:22 CET,0.0 0.899 1.145 1.327 1.476 1.602 1.719 1.83 2.015 2.097 2.181 2.302 2.414 2.477 2.602 2.72 2.825 2.876 2.975 3.063 3.183 3.26 3.336 3.452 3.568 3.674 3.771 3.86 3.977 4.094 4.212 4.349 4.473 4.607 4.762 4.922 5.072 5.228 5.399 5.572 5.737 5.92 6.132 6.335 6.543 6.758 6.952 7.067 7.137 7.098 6.762 6.082 5.398 4.774 4.185 3.613 3.112 2.661 2.253 1.82 1.438 1.107 0.792 0.483 0.199 -0.057 -0.321 -0.559 -0.77 -0.98 -1.21 -1.419 -1.631 -1.851 -2.016 -2.176 -2.352 -2.525 -2.706 -2.844 -2.989 -3.203 -3.346 -3.497 -3.573 -3.735 -3.915 -4.104 -4.204 -4.365 -4.533 -4.634 -4.739 -4.989 -5.14 -5.294 -5.466 -5.682 -5.927 -6.219 -6.873 -2 ,7610 ,TETRA ,17607309,Sun Nov 28 22:02:08 CET,Sun Nov 28 23:51:43 CET,0.0 0.409 0.552 0.664 0.777 0.902 1.024 1.13 1.317 1.399 1.467 1.559 1.672 1.742 1.867 1.978 2.082 2.131 2.23 2.327 2.464 2.553 2.646 2.78 2.898 3.008 3.116 3.218 3.343 3.459 3.572 3.705 3.832 3.949 4.092 4.259 4.411 4.567 4.734 4.909 5.068 5.237 5.427 5.612 5.827 6.043 6.24 6.401 6.509 6.456 6.069 5.364 4.646 3.984 3.371 2.833 2.359 1.888 1.468 1.037 0.675 0.347 0.029 -0.264 -0.523 -0.77 -1.039 -1.28 -1.498 -1.723 -1.969 -2.17 -2.372 -2.571 -2.724 -2.894 -3.074 -3.264 -3.467 -3.605 -3.747 -3.976 -4.139 -4.308 -4.393 -4.565 -4.74 -4.916 -5.013 -5.17 -5.34 -5.462 -5.591 -5.876 -6.036 -6.204 -6.386 -6.619 -6.898 -7.229 -7.969 -3 ,17783 ,TETRA ,17607310,Sun Nov 28 22:03:04 CET,Sun Nov 28 23:52:28 CET,0.0 0.833 1.12 1.322 1.461 1.567 1.666 1.767 1.936 2.013 2.092 2.186 2.3 2.365 2.474 2.591 2.705 2.757 2.856 2.951 3.093 3.18 3.264 3.383 3.492 3.603 3.707 3.811 3.947 4.074 4.197 4.338 4.481 4.62 4.768 4.924 5.073 5.24 5.418 5.597 5.779 5.964 6.189 6.405 6.639 6.87 7.077 7.276 7.381 7.313 6.904 6.149 5.44 4.771 4.116 3.536 3.035 2.573 2.15 1.719 1.355 1.01 0.677 0.38 0.096 -0.169 -0.443 -0.673 -0.874 -1.092 -1.32 -1.512 -1.715 -1.927 -2.089 -2.264 -2.442 -2.617 -2.801 -2.929 -3.066 -3.276 -3.427 -3.606 -3.696 -3.87 -4.049 -4.227 -4.327 -4.481 -4.634 -4.746 -4.863 -5.118 -5.269 -5.447 -5.645 -5.842 -6.045 -6.278 -7.419 -4 ,23430 ,TETRA ,17607311,Sun Nov 28 22:03:07 CET,Sun Nov 28 23:52:26 CET,0.0 0.57 0.824 0.998 1.128 1.267 1.389 1.475 1.655 1.738 1.81 1.928 2.051 2.119 2.242 2.359 2.477 2.53 2.628 2.725 2.862 2.944 3.024 3.138 3.244 3.348 3.448 3.551 3.681 3.802 3.91 4.043 4.184 4.314 4.451 4.587 4.715 4.866 5.038 5.207 5.364 5.544 5.744 5.952 6.202 6.426 6.66 6.885 7.059 7.081 6.794 6.207 5.521 4.839 4.206 3.642 3.167 2.714 2.307 1.901 1.537 1.202 0.883 0.577 0.294 0.041 -0.23 -0.484 -0.717 -0.966 -1.208 -1.393 -1.584 -1.797 -1.955 -2.109 -2.276 -2.457 -2.648 -2.776 -2.913 -3.138 -3.287 -3.434 -3.516 -3.692 -3.867 -4.061 -4.163 -4.316 -4.469 -4.577 -4.689 -4.959 -5.104 -5.254 -5.441 -5.668 -5.921 -6.231 -7.085 -5 ,23894 ,TETRA ,17607312,Sun Nov 28 22:03:04 CET,Sun Nov 28 23:52:40 CET,0.0 0.392 0.641 0.825 0.982 1.108 1.208 1.308 1.511 1.601 1.68 1.781 1.894 1.96 2.089 2.205 2.305 2.352 2.437 2.528 2.671 2.756 2.833 2.953 3.071 3.177 3.283 3.386 3.507 3.621 3.724 3.852 3.976 4.087 4.227 4.387 4.538 4.704 4.878 5.057 5.229 5.409 5.622 5.828 6.042 6.259 6.464 6.625 6.705 6.684 6.419 5.784 5.093 4.427 3.867 3.352 2.858 2.412 2.023 1.622 1.284 0.971 0.638 0.328 0.059 -0.189 -0.458 -0.706 -0.916 -1.125 -1.339 -1.529 -1.73 -1.933 -2.099 -2.269 -2.451 -2.643 -2.827 -2.953 -3.088 -3.298 -3.442 -3.593 -3.674 -3.848 -4.032 -4.229 -4.328 -4.483 -4.665 -4.782 -4.896 -5.169 -5.315 -5.487 -5.701 -5.915 -6.147 -6.492 -7.368 -6 ,29899 ,TETRA ,17607313,Sun Nov 28 22:03:04 CET,Sun Nov 28 23:53:47 CET,0.0 0.675 0.914 1.069 1.218 1.333 1.424 1.51 1.675 1.755 1.831 1.92 2.028 2.094 2.217 2.329 2.427 2.476 2.586 2.69 2.815 2.892 2.972 3.088 3.2 3.308 3.406 3.503 3.634 3.758 3.876 4.018 4.147 4.279 4.44 4.591 4.724 4.872 5.042 5.227 5.407 5.603 5.82 6.041 6.283 6.502 6.72 6.893 6.972 6.931 6.629 5.927 5.173 4.494 3.886 3.261 2.738 2.277 1.842 1.41 1.018 0.668 0.364 0.074 -0.213 -0.473 -0.744 -0.982 -1.194 -1.421 -1.653 -1.848 -2.054 -2.266 -2.422 -2.585 -2.754 -2.93 -3.117 -3.241 -3.372 -3.612 -3.781 -3.941 -4.019 -4.175 -4.348 -4.537 -4.637 -4.786 -4.948 -5.08 -5.215 -5.505 -5.65 -5.792 -5.964 -6.149 -6.355 -6.673 -7.391 -7 ,14738 ,TETRA ,17607314,Sun Nov 28 22:03:06 CET,Sun Nov 28 23:52:31 CET,0.0 0.87 1.101 1.277 1.437 1.563 1.676 1.793 2.004 2.09 2.167 2.265 2.375 2.438 2.549 2.658 2.763 2.813 2.905 2.994 3.139 3.234 3.319 3.445 3.562 3.662 3.759 3.851 3.968 4.091 4.213 4.356 4.486 4.601 4.741 4.9 5.04 5.188 5.353 5.537 5.728 5.938 6.152 6.325 6.514 6.703 6.897 7.089 7.204 7.209 6.902 6.244 5.623 4.977 4.356 3.817 3.341 2.886 2.478 2.069 1.697 1.35 1.02 0.705 0.418 0.156 -0.134 -0.381 -0.589 -0.814 -1.047 -1.237 -1.432 -1.643 -1.806 -1.968 -2.134 -2.306 -2.501 -2.632 -2.759 -2.979 -3.144 -3.313 -3.397 -3.566 -3.742 -3.921 -4.02 -4.18 -4.34 -4.46 -4.597 -4.865 -5.009 -5.182 -5.378 -5.575 -5.815 -6.188 -6.896 -8 ,22198 ,TETRA ,17607315,Sun Nov 28 22:03:06 CET,Sun Nov 28 23:45:53 CET,0.0 0.524 0.773 0.943 1.064 1.168 1.27 1.374 1.56 1.644 1.72 1.806 1.926 2.0 2.119 2.224 2.334 2.395 2.507 2.606 2.742 2.819 2.896 3.002 3.108 3.219 3.318 3.414 3.543 3.664 3.777 3.917 4.045 4.15 4.274 4.415 4.548 4.715 4.901 5.075 5.247 5.436 5.636 5.823 6.019 6.223 6.456 6.682 6.815 6.789 6.518 5.919 5.263 4.638 4.031 3.459 2.952 2.49 2.087 1.683 1.323 0.987 0.647 0.336 0.092 -0.145 -0.412 -0.652 -0.863 -1.087 -1.334 -1.534 -1.734 -1.952 -2.121 -2.28 -2.437 -2.608 -2.814 -2.956 -3.084 -3.295 -3.447 -3.605 -3.686 -3.848 -4.03 -4.231 -4.336 -4.494 -4.636 -4.74 -4.846 -5.129 -5.291 -5.452 -5.629 -5.828 -6.049 -6.364 -7.282 -9 ,5714 ,TETRA ,17607316,Sun Nov 28 22:03:06 CET,Sun Nov 28 23:52:43 CET,0.0 0.761 0.954 1.095 1.216 1.337 1.435 1.52 1.702 1.788 1.87 1.978 2.092 2.156 2.279 2.395 2.503 2.552 2.649 2.748 2.875 2.957 3.04 3.157 3.27 3.379 3.477 3.565 3.688 3.813 3.932 4.067 4.196 4.329 4.475 4.62 4.751 4.901 5.069 5.25 5.429 5.616 5.828 6.017 6.223 6.443 6.641 6.797 6.892 6.858 6.592 6.019 5.33 4.652 4.052 3.471 2.958 2.509 2.093 1.662 1.302 0.969 0.653 0.371 0.105 -0.151 -0.436 -0.688 -0.898 -1.119 -1.357 -1.557 -1.756 -1.952 -2.102 -2.261 -2.43 -2.608 -2.808 -2.95 -3.092 -3.308 -3.455 -3.618 -3.703 -3.877 -4.054 -4.227 -4.325 -4.481 -4.641 -4.756 -4.888 -5.186 -5.336 -5.492 -5.67 -5.886 -6.144 -6.44 -7.198 -10 ,28365 ,TETRA ,17607317,Sun Nov 28 22:03:08 CET,Sun Nov 28 23:52:30 CET,0.0 0.763 0.971 1.139 1.28 1.39 1.487 1.584 1.781 1.87 1.95 2.048 2.156 2.216 2.326 2.439 2.55 2.603 2.705 2.8 2.938 3.029 3.111 3.215 3.313 3.422 3.535 3.642 3.769 3.887 4.0 4.133 4.263 4.389 4.528 4.67 4.809 4.969 5.142 5.312 5.479 5.683 5.9 6.087 6.29 6.5 6.729 6.923 7.051 7.061 6.76 6.118 5.448 4.82 4.247 3.685 3.189 2.749 2.353 1.949 1.586 1.251 0.928 0.635 0.381 0.137 -0.14 -0.387 -0.599 -0.821 -1.056 -1.25 -1.454 -1.661 -1.816 -1.984 -2.161 -2.336 -2.516 -2.644 -2.785 -3.008 -3.153 -3.305 -3.382 -3.55 -3.741 -3.937 -4.039 -4.201 -4.369 -4.491 -4.615 -4.871 -5.016 -5.168 -5.339 -5.559 -5.847 -6.189 -7.106 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt deleted file mode 100644 index e15f4b40..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26077 ,TETRA ,17607318,Sun Nov 28 22:03:06 CET,Sun Nov 28 23:51:36 CET,0.0 0.731 0.968 1.17 1.342 1.501 1.646 1.765 1.975 2.068 2.151 2.278 2.413 2.498 2.649 2.791 2.92 2.981 3.097 3.198 3.35 3.455 3.561 3.71 3.858 3.995 4.127 4.265 4.429 4.581 4.723 4.881 5.042 5.201 5.377 5.579 5.777 5.983 6.197 6.447 6.703 6.963 7.269 7.577 7.926 8.294 8.674 9.08 9.532 9.952 10.177 10.117 9.877 9.526 9.159 8.779 8.421 8.089 7.788 7.474 7.201 6.942 6.672 6.406 6.175 5.982 5.776 5.579 5.411 5.234 5.038 4.873 4.694 4.494 4.326 4.158 3.992 3.817 3.649 3.532 3.401 3.185 3.042 2.895 2.812 2.647 2.473 2.276 2.179 2.046 1.902 1.786 1.659 1.408 1.269 1.121 0.943 0.714 0.456 0.101 -0.672 -2 ,27107 ,TETRA ,17607319,Sun Nov 28 22:03:06 CET,Sun Nov 28 23:52:06 CET,0.0 1.262 1.622 1.84 2.055 2.223 2.352 2.464 2.659 2.755 2.849 2.995 3.132 3.206 3.343 3.478 3.598 3.661 3.787 3.904 4.07 4.176 4.281 4.424 4.55 4.672 4.79 4.911 5.077 5.232 5.386 5.557 5.708 5.861 6.046 6.264 6.47 6.667 6.875 7.114 7.371 7.645 7.946 8.239 8.543 8.87 9.257 9.683 10.136 10.534 10.79 10.673 10.37 10.027 9.654 9.263 8.92 8.576 8.242 7.895 7.587 7.299 7.029 6.803 6.587 6.368 6.128 5.921 5.75 5.561 5.377 5.22 5.045 4.86 4.708 4.546 4.382 4.233 4.078 3.96 3.829 3.622 3.483 3.339 3.261 3.096 2.923 2.744 2.651 2.507 2.33 2.218 2.09 1.821 1.688 1.538 1.368 1.15 0.852 0.438 -0.634 -3 ,24500 ,TETRA ,17607320,Sun Nov 28 22:03:07 CET,Sun Nov 28 23:52:25 CET,0.0 1.3 1.561 1.788 1.944 2.081 2.208 2.326 2.532 2.635 2.735 2.854 2.983 3.062 3.204 3.346 3.479 3.541 3.658 3.774 3.941 4.044 4.143 4.293 4.433 4.564 4.689 4.802 4.954 5.107 5.26 5.444 5.611 5.769 5.964 6.176 6.364 6.577 6.794 7.025 7.301 7.603 7.949 8.278 8.623 9.001 9.403 9.793 10.189 10.59 10.879 10.79 10.48 10.094 9.709 9.362 9.039 8.708 8.403 8.093 7.826 7.596 7.365 7.134 6.918 6.713 6.483 6.272 6.085 5.895 5.711 5.554 5.39 5.213 5.065 4.897 4.726 4.557 4.377 4.25 4.128 3.951 3.818 3.675 3.598 3.435 3.276 3.111 3.012 2.862 2.687 2.567 2.437 2.178 2.042 1.893 1.72 1.502 1.245 0.888 -0.336 -4 ,709 ,TETRA ,17607321,Sun Nov 28 22:04:04 CET,Sun Nov 28 23:54:54 CET,0.0 0.734 1.023 1.26 1.455 1.627 1.785 1.917 2.105 2.185 2.272 2.406 2.535 2.617 2.77 2.911 3.035 3.092 3.204 3.319 3.48 3.587 3.701 3.865 4.012 4.143 4.27 4.398 4.546 4.69 4.834 5.006 5.173 5.332 5.512 5.709 5.899 6.111 6.333 6.554 6.776 7.027 7.345 7.671 8.018 8.401 8.799 9.175 9.59 9.986 10.259 10.203 9.97 9.647 9.267 8.876 8.517 8.164 7.842 7.517 7.239 6.995 6.751 6.501 6.268 6.072 5.866 5.662 5.486 5.303 5.082 4.906 4.726 4.535 4.395 4.241 4.083 3.926 3.768 3.653 3.528 3.321 3.18 3.051 2.977 2.814 2.655 2.482 2.386 2.234 2.037 1.915 1.787 1.514 1.352 1.16 0.944 0.7 0.414 0.055 -0.961 -5 ,17505 ,TETRA ,17607322,Sun Nov 28 22:04:04 CET,Sun Nov 28 23:53:05 CET,0.0 0.697 0.972 1.197 1.378 1.531 1.661 1.781 1.997 2.099 2.193 2.307 2.422 2.493 2.641 2.792 2.935 3.0 3.128 3.246 3.4 3.49 3.583 3.734 3.883 4.021 4.15 4.272 4.427 4.583 4.741 4.928 5.107 5.264 5.442 5.645 5.838 6.046 6.257 6.497 6.747 7.02 7.333 7.631 7.986 8.356 8.758 9.198 9.646 10.042 10.334 10.298 9.996 9.647 9.298 8.936 8.597 8.265 7.965 7.651 7.372 7.118 6.869 6.634 6.412 6.201 5.971 5.754 5.583 5.414 5.219 5.055 4.889 4.704 4.561 4.414 4.258 4.098 3.924 3.794 3.661 3.453 3.301 3.156 3.084 2.925 2.758 2.571 2.479 2.35 2.192 2.071 1.938 1.691 1.556 1.394 1.214 0.983 0.728 0.373 -0.945 -6 ,29379 ,TETRA ,17607323,Sun Nov 28 22:04:04 CET,Sun Nov 28 23:53:33 CET,0.0 1.12 1.338 1.556 1.743 1.893 2.032 2.149 2.345 2.428 2.501 2.615 2.741 2.816 2.975 3.133 3.269 3.331 3.46 3.586 3.761 3.869 3.966 4.099 4.234 4.362 4.485 4.622 4.791 4.943 5.093 5.257 5.419 5.576 5.744 5.948 6.149 6.352 6.571 6.811 7.053 7.318 7.627 7.937 8.313 8.71 9.113 9.528 9.942 10.332 10.591 10.485 10.183 9.831 9.456 9.053 8.7 8.369 8.062 7.752 7.473 7.22 6.972 6.734 6.519 6.311 6.087 5.882 5.697 5.506 5.306 5.133 4.949 4.77 4.63 4.483 4.329 4.164 3.994 3.875 3.752 3.571 3.437 3.291 3.217 3.045 2.861 2.673 2.579 2.45 2.285 2.169 2.053 1.784 1.609 1.424 1.236 1.043 0.794 0.462 -0.386 -7 ,29288 ,TETRA ,17607324,Sun Nov 28 22:04:07 CET,Sun Nov 28 23:53:27 CET,0.0 0.84 1.119 1.317 1.493 1.672 1.824 1.955 2.202 2.315 2.42 2.581 2.726 2.821 2.981 3.138 3.287 3.356 3.486 3.603 3.788 3.907 4.009 4.148 4.293 4.427 4.547 4.67 4.836 4.995 5.143 5.302 5.455 5.609 5.795 6.003 6.181 6.387 6.622 6.86 7.104 7.382 7.706 8.023 8.372 8.734 9.141 9.542 9.916 10.279 10.517 10.395 10.126 9.781 9.427 9.053 8.703 8.38 8.078 7.767 7.503 7.266 7.019 6.787 6.576 6.373 6.154 5.946 5.749 5.549 5.341 5.165 4.993 4.822 4.671 4.513 4.357 4.176 3.983 3.845 3.71 3.514 3.38 3.246 3.17 3.002 2.82 2.625 2.526 2.372 2.188 2.084 1.976 1.735 1.59 1.413 1.194 0.965 0.718 0.375 -0.706 -8 ,31409 ,TETRA ,17607325,Sun Nov 28 22:04:04 CET,Sun Nov 28 23:53:03 CET,0.0 1.111 1.431 1.676 1.872 2.015 2.129 2.24 2.478 2.583 2.676 2.811 2.943 3.024 3.185 3.339 3.476 3.537 3.661 3.78 3.954 4.058 4.15 4.299 4.44 4.566 4.688 4.806 4.96 5.118 5.267 5.437 5.596 5.751 5.927 6.124 6.319 6.533 6.766 7.018 7.284 7.56 7.873 8.178 8.498 8.864 9.289 9.694 10.116 10.565 10.811 10.753 10.519 10.148 9.77 9.405 9.057 8.705 8.389 8.08 7.797 7.533 7.283 7.042 6.814 6.591 6.358 6.161 5.99 5.806 5.619 5.465 5.299 5.11 4.958 4.81 4.643 4.455 4.272 4.151 4.019 3.82 3.686 3.532 3.453 3.28 3.092 2.923 2.834 2.688 2.498 2.376 2.256 1.991 1.841 1.698 1.527 1.28 0.98 0.603 -0.166 -9 ,4640 ,TETRA ,17607326,Sun Nov 28 22:04:07 CET,Sun Nov 28 23:52:47 CET,0.0 1.539 1.864 2.085 2.278 2.466 2.64 2.782 3.026 3.146 3.252 3.398 3.534 3.613 3.755 3.893 4.028 4.093 4.211 4.324 4.498 4.611 4.712 4.85 4.987 5.107 5.222 5.342 5.497 5.645 5.788 5.957 6.124 6.284 6.468 6.68 6.883 7.091 7.303 7.524 7.765 8.04 8.328 8.623 8.973 9.327 9.707 10.119 10.575 11.005 11.267 11.235 10.98 10.617 10.237 9.864 9.524 9.194 8.888 8.556 8.271 8.013 7.756 7.512 7.279 7.065 6.838 6.637 6.472 6.297 6.094 5.915 5.742 5.552 5.401 5.247 5.086 4.922 4.756 4.639 4.51 4.306 4.166 4.017 3.945 3.786 3.59 3.406 3.318 3.17 2.99 2.874 2.749 2.486 2.333 2.151 1.939 1.694 1.391 0.991 -0.176 -10 ,25953 ,TETRA ,17607327,Sun Nov 28 22:04:04 CET,Sun Nov 28 23:52:59 CET,0.0 1.347 1.634 1.878 2.094 2.27 2.434 2.591 2.848 2.955 3.057 3.213 3.344 3.43 3.6 3.757 3.893 3.955 4.078 4.199 4.369 4.48 4.585 4.744 4.899 5.045 5.192 5.327 5.488 5.648 5.794 5.958 6.12 6.273 6.442 6.637 6.824 7.027 7.25 7.482 7.718 7.987 8.303 8.618 8.965 9.31 9.682 10.103 10.56 10.961 11.161 11.027 10.763 10.402 10.025 9.642 9.281 8.965 8.666 8.352 8.086 7.834 7.585 7.347 7.127 6.925 6.693 6.483 6.313 6.122 5.905 5.735 5.558 5.363 5.214 5.06 4.901 4.739 4.559 4.425 4.283 4.06 3.909 3.761 3.683 3.514 3.337 3.151 3.059 2.924 2.751 2.634 2.508 2.224 2.074 1.914 1.722 1.503 1.23 0.782 -1.235 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt deleted file mode 100644 index 38d532da..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29040 ,TETRA ,17607328,Sun Nov 28 22:04:07 CET,Sun Nov 28 23:52:56 CET,0.0 0.948 1.227 1.439 1.604 1.746 1.87 1.975 2.187 2.291 2.383 2.513 2.638 2.714 2.856 3.012 3.174 3.249 3.389 3.528 3.74 3.868 3.981 4.147 4.318 4.483 4.637 4.782 4.971 5.151 5.316 5.522 5.721 5.911 6.136 6.389 6.627 6.89 7.198 7.536 7.875 8.24 8.658 9.08 9.604 10.191 10.834 11.554 12.382 13.336 14.393 15.12 15.46 15.62 15.656 15.613 15.548 15.453 15.333 15.206 15.108 15.01 14.88 14.751 14.636 14.518 14.389 14.274 14.175 14.07 13.941 13.834 13.726 13.609 13.517 13.421 13.329 13.237 13.129 13.052 12.97 12.827 12.732 12.641 12.585 12.475 12.371 12.237 12.166 12.051 11.909 11.828 11.748 11.565 11.45 11.321 11.188 11.043 10.878 10.587 9.991 -2 ,19720 ,TETRA ,17607329,Sun Nov 28 22:04:06 CET,Sun Nov 28 23:53:27 CET,0.0 0.404 0.62 0.8 0.943 1.067 1.17 1.268 1.499 1.61 1.701 1.82 1.949 2.037 2.206 2.359 2.505 2.574 2.699 2.822 3.018 3.141 3.245 3.397 3.558 3.716 3.868 4.006 4.17 4.339 4.508 4.717 4.914 5.106 5.331 5.578 5.828 6.106 6.405 6.721 7.038 7.39 7.806 8.234 8.745 9.325 9.987 10.74 11.607 12.542 13.576 14.318 14.685 14.842 14.865 14.833 14.783 14.701 14.588 14.471 14.372 14.262 14.134 13.997 13.872 13.755 13.624 13.507 13.401 13.284 13.158 13.05 12.942 12.829 12.727 12.614 12.508 12.405 12.295 12.215 12.127 11.98 11.881 11.778 11.721 11.614 11.478 11.325 11.256 11.159 11.045 10.971 10.894 10.721 10.64 10.56 10.451 10.304 10.133 9.951 9.524 -3 ,25394 ,TETRA ,17607330,Sun Nov 28 22:04:08 CET,Sun Nov 28 23:53:35 CET,0.0 0.627 0.824 0.951 1.079 1.218 1.358 1.494 1.724 1.816 1.907 2.047 2.174 2.254 2.411 2.567 2.706 2.766 2.887 3.011 3.199 3.318 3.43 3.604 3.766 3.914 4.058 4.199 4.389 4.585 4.77 4.981 5.182 5.375 5.604 5.866 6.114 6.378 6.655 6.947 7.261 7.624 8.037 8.452 8.961 9.523 10.158 10.857 11.664 12.641 13.753 14.543 14.884 14.988 14.979 14.921 14.829 14.714 14.595 14.47 14.359 14.224 14.083 13.965 13.84 13.712 13.589 13.481 13.376 13.261 13.131 13.014 12.895 12.777 12.672 12.553 12.441 12.329 12.215 12.142 12.063 11.928 11.836 11.741 11.689 11.573 11.439 11.304 11.237 11.137 11.033 10.967 10.891 10.724 10.625 10.499 10.361 10.211 10.034 9.764 9.003 -4 ,14793 ,TETRA ,17607331,Sun Nov 28 22:04:06 CET,Sun Nov 28 23:43:07 CET,0.0 0.796 1.052 1.244 1.423 1.587 1.739 1.88 2.131 2.24 2.342 2.491 2.62 2.699 2.855 2.998 3.135 3.203 3.332 3.463 3.653 3.76 3.866 4.038 4.205 4.369 4.516 4.652 4.838 5.021 5.198 5.404 5.598 5.796 6.035 6.283 6.521 6.792 7.078 7.388 7.721 8.088 8.512 8.938 9.436 9.992 10.641 11.369 12.193 13.13 14.25 14.993 15.292 15.409 15.4 15.347 15.271 15.163 15.032 14.902 14.79 14.667 14.536 14.408 14.285 14.172 14.043 13.912 13.795 13.682 13.563 13.46 13.35 13.235 13.141 13.037 12.944 12.835 12.702 12.615 12.524 12.377 12.277 12.172 12.115 12.0 11.878 11.753 11.688 11.587 11.474 11.394 11.307 11.102 10.986 10.871 10.757 10.631 10.475 10.25 9.764 -5 ,12142 ,TETRA ,17607332,Sun Nov 28 22:04:06 CET,Sun Nov 28 23:54:28 CET,0.0 0.547 0.751 0.943 1.102 1.234 1.364 1.487 1.706 1.799 1.884 1.995 2.119 2.205 2.356 2.495 2.645 2.719 2.851 2.979 3.155 3.257 3.367 3.531 3.686 3.834 3.986 4.141 4.334 4.523 4.697 4.891 5.091 5.292 5.517 5.764 6.011 6.288 6.586 6.902 7.215 7.578 8.014 8.458 8.984 9.56 10.243 10.978 11.768 12.697 13.755 14.509 14.851 15.013 15.031 14.965 14.883 14.778 14.667 14.542 14.428 14.314 14.198 14.078 13.947 13.819 13.681 13.559 13.451 13.333 13.212 13.106 12.995 12.874 12.771 12.669 12.57 12.455 12.334 12.252 12.164 12.036 11.932 11.817 11.764 11.653 11.528 11.4 11.337 11.247 11.14 11.055 10.967 10.777 10.661 10.552 10.438 10.298 10.163 9.996 9.621 -6 ,1423 ,TETRA ,17607333,Sun Nov 28 22:04:06 CET,Sun Nov 28 23:54:38 CET,0.0 0.453 0.702 0.901 1.054 1.177 1.302 1.408 1.578 1.658 1.749 1.89 2.019 2.1 2.245 2.387 2.529 2.597 2.729 2.86 3.05 3.168 3.277 3.442 3.597 3.74 3.888 4.034 4.225 4.405 4.572 4.772 4.976 5.178 5.412 5.683 5.938 6.205 6.482 6.786 7.118 7.479 7.898 8.33 8.852 9.443 10.091 10.803 11.626 12.558 13.637 14.395 14.706 14.81 14.833 14.785 14.705 14.635 14.554 14.432 14.306 14.182 14.056 13.937 13.811 13.693 13.571 13.447 13.331 13.21 13.084 12.983 12.879 12.761 12.657 12.559 12.459 12.332 12.202 12.114 12.021 11.883 11.787 11.688 11.637 11.528 11.414 11.29 11.224 11.127 11.003 10.924 10.849 10.679 10.565 10.434 10.298 10.147 9.988 9.757 9.181 -7 ,16413 ,TETRA ,17607334,Sun Nov 28 22:04:07 CET,Sun Nov 28 23:53:23 CET,0.0 0.416 0.602 0.75 0.897 1.027 1.157 1.273 1.474 1.577 1.68 1.799 1.915 1.998 2.185 2.34 2.476 2.542 2.667 2.786 2.966 3.087 3.197 3.369 3.536 3.686 3.836 3.969 4.142 4.32 4.495 4.706 4.912 5.11 5.333 5.579 5.812 6.08 6.377 6.704 7.038 7.402 7.839 8.27 8.777 9.36 10.016 10.752 11.566 12.447 13.406 14.117 14.485 14.608 14.593 14.539 14.44 14.303 14.181 14.035 13.915 13.784 13.639 13.518 13.405 13.301 13.175 13.038 12.919 12.798 12.667 12.563 12.445 12.309 12.216 12.121 12.02 11.916 11.8 11.717 11.632 11.492 11.391 11.293 11.244 11.131 11.006 10.884 10.819 10.716 10.597 10.515 10.437 10.268 10.164 10.067 9.953 9.809 9.638 9.419 8.807 -8 ,4068 ,TETRA ,17607335,Sun Nov 28 22:04:09 CET,Sun Nov 28 23:53:16 CET,0.0 0.914 1.161 1.314 1.45 1.575 1.692 1.806 1.99 2.08 2.175 2.306 2.433 2.513 2.674 2.825 2.975 3.045 3.173 3.296 3.467 3.58 3.691 3.853 4.022 4.196 4.35 4.497 4.685 4.855 5.016 5.22 5.416 5.599 5.82 6.084 6.337 6.61 6.908 7.223 7.562 7.944 8.393 8.835 9.326 9.885 10.528 11.239 12.075 13.031 14.141 14.893 15.175 15.283 15.298 15.233 15.121 14.985 14.861 14.721 14.577 14.434 14.313 14.204 14.087 13.974 13.851 13.74 13.632 13.5 13.371 13.262 13.143 13.023 12.926 12.825 12.716 12.599 12.475 12.388 12.301 12.172 12.085 11.985 11.929 11.818 11.696 11.559 11.491 11.391 11.275 11.2 11.116 10.912 10.794 10.673 10.561 10.44 10.266 9.986 9.416 -9 ,10308 ,TETRA ,17607336,Sun Nov 28 22:04:11 CET,Sun Nov 28 23:53:13 CET,0.0 0.658 0.946 1.166 1.317 1.452 1.567 1.678 1.888 1.987 2.081 2.213 2.339 2.415 2.571 2.721 2.866 2.934 3.066 3.195 3.38 3.497 3.609 3.772 3.935 4.097 4.259 4.41 4.591 4.769 4.945 5.164 5.372 5.571 5.804 6.058 6.298 6.565 6.869 7.192 7.519 7.892 8.326 8.766 9.302 9.877 10.518 11.254 12.069 13.016 14.127 14.879 15.197 15.294 15.295 15.251 15.177 15.082 14.977 14.846 14.712 14.586 14.449 14.293 14.141 14.012 13.882 13.772 13.676 13.554 13.413 13.299 13.173 13.043 12.947 12.855 12.756 12.64 12.511 12.423 12.342 12.213 12.116 12.02 11.971 11.863 11.751 11.625 11.555 11.452 11.332 11.244 11.153 10.966 10.865 10.745 10.604 10.457 10.296 10.095 9.335 -10 ,13595 ,TETRA ,17607337,Sun Nov 28 22:04:07 CET,Sun Nov 28 23:55:20 CET,0.0 0.516 0.756 0.967 1.136 1.268 1.389 1.509 1.753 1.857 1.944 2.065 2.182 2.26 2.417 2.563 2.697 2.761 2.89 3.017 3.197 3.319 3.44 3.605 3.757 3.896 4.038 4.179 4.354 4.525 4.689 4.892 5.096 5.286 5.509 5.772 6.022 6.287 6.56 6.865 7.197 7.544 7.934 8.355 8.867 9.412 10.034 10.762 11.6 12.563 13.646 14.407 14.739 14.865 14.893 14.872 14.816 14.719 14.603 14.478 14.368 14.252 14.126 13.992 13.867 13.762 13.644 13.523 13.417 13.304 13.186 13.089 12.966 12.836 12.742 12.638 12.532 12.419 12.308 12.229 12.141 12.003 11.912 11.825 11.777 11.677 11.569 11.444 11.384 11.289 11.174 11.091 10.996 10.807 10.714 10.613 10.49 10.347 10.18 9.991 9.207 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt deleted file mode 100644 index 0546829b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11748 ,TETRA ,17607338,Sun Nov 28 22:04:07 CET,Sun Nov 28 23:55:48 CET,0.0 0.549 0.738 0.867 0.949 1.019 1.069 1.089 1.117 1.122 1.131 1.117 1.164 1.163 1.165 1.159 1.15 1.144 1.132 1.115 1.06 1.017 0.977 0.908 0.84 0.776 0.7 0.62 0.509 0.393 0.271 0.109 -0.066 -0.251 -0.471 -0.731 -0.995 -1.317 -1.708 -2.141 -2.618 -3.201 -3.946 -4.779 -5.848 -7.153 -8.851 -11.016 -13.912 -17.842 -23.633 -29.819 -34.392 -37.93 -40.774 -43.218 -45.257 -46.989 -48.403 -49.753 -50.867 -51.837 -52.735 -53.562 -54.312 -54.966 -55.64 -56.236 -56.727 -57.227 -57.747 -58.168 -58.588 -59.011 -59.34 -59.683 -60.022 -60.363 -60.715 -60.945 -61.175 -61.536 -61.787 -62.046 -62.184 -62.45 -62.702 -62.971 -63.118 -63.37 -63.554 -63.707 -63.865 -64.177 -64.344 -64.54 -64.757 -65.001 -65.28 -65.553 -65.998 -2 ,12532 ,TETRA ,17607339,Sun Nov 28 22:04:07 CET,Sun Nov 28 23:53:38 CET,0.0 0.356 0.514 0.6 0.658 0.704 0.745 0.777 0.819 0.833 0.852 0.834 0.889 0.897 0.892 0.872 0.855 0.848 0.818 0.78 0.741 0.719 0.68 0.604 0.522 0.443 0.366 0.287 0.18 0.066 -0.056 -0.22 -0.389 -0.571 -0.794 -1.062 -1.349 -1.684 -2.067 -2.505 -2.995 -3.58 -4.33 -5.164 -6.225 -7.527 -9.196 -11.294 -14.078 -17.942 -23.753 -29.961 -34.557 -38.162 -41.056 -43.452 -45.421 -47.161 -48.627 -50.019 -51.156 -52.135 -53.024 -53.829 -54.573 -55.243 -55.917 -56.498 -56.992 -57.5 -58.019 -58.437 -58.857 -59.278 -59.596 -59.923 -60.25 -60.587 -60.943 -61.185 -61.433 -61.807 -62.05 -62.289 -62.418 -62.685 -62.945 -63.225 -63.366 -63.622 -63.826 -63.978 -64.132 -64.484 -64.679 -64.886 -65.09 -65.301 -65.579 -65.883 -66.392 -3 ,31183 ,TETRA ,17607340,Sun Nov 28 22:04:09 CET,Sun Nov 28 23:53:45 CET,0.0 0.521 0.697 0.82 0.887 0.946 0.989 1.016 1.057 1.075 1.089 1.059 1.104 1.107 1.103 1.087 1.07 1.059 1.032 1.005 0.962 0.921 0.876 0.811 0.741 0.672 0.603 0.525 0.413 0.293 0.172 0.031 -0.119 -0.287 -0.503 -0.74 -0.987 -1.312 -1.687 -2.116 -2.626 -3.235 -3.989 -4.841 -5.931 -7.226 -8.88 -10.996 -13.813 -17.714 -23.528 -29.734 -34.311 -37.892 -40.778 -43.189 -45.187 -46.893 -48.292 -49.668 -50.815 -51.785 -52.692 -53.533 -54.287 -54.941 -55.594 -56.173 -56.681 -57.195 -57.711 -58.141 -58.583 -59.019 -59.345 -59.677 -60.01 -60.349 -60.694 -60.927 -61.163 -61.525 -61.781 -62.053 -62.185 -62.448 -62.721 -62.999 -63.14 -63.398 -63.59 -63.748 -63.913 -64.253 -64.425 -64.603 -64.806 -65.022 -65.238 -65.49 -66.079 -4 ,2391 ,TETRA ,17607341,Sun Nov 28 22:04:07 CET,Sun Nov 28 23:53:07 CET,0.0 0.376 0.578 0.726 0.832 0.889 0.911 0.932 0.986 1.012 1.032 1.022 1.081 1.082 1.064 1.051 1.04 1.036 1.029 1.017 0.971 0.931 0.888 0.824 0.755 0.675 0.59 0.505 0.393 0.271 0.152 -0.002 -0.171 -0.347 -0.569 -0.845 -1.129 -1.457 -1.836 -2.264 -2.753 -3.363 -4.152 -5.006 -6.087 -7.406 -9.091 -11.21 -14.016 -17.945 -23.832 -30.099 -34.756 -38.359 -41.188 -43.601 -45.63 -47.362 -48.774 -50.109 -51.224 -52.193 -53.091 -53.906 -54.648 -55.319 -56.004 -56.602 -57.108 -57.615 -58.135 -58.563 -58.992 -59.426 -59.762 -60.099 -60.441 -60.792 -61.15 -61.391 -61.632 -62.001 -62.254 -62.513 -62.642 -62.907 -63.194 -63.484 -63.623 -63.874 -64.077 -64.238 -64.39 -64.699 -64.876 -65.074 -65.293 -65.517 -65.777 -66.112 -66.708 -5 ,9308 ,TETRA ,17607342,Sun Nov 28 22:04:07 CET,Sun Nov 28 23:53:31 CET,0.0 0.243 0.357 0.452 0.563 0.656 0.709 0.75 0.839 0.871 0.9 0.913 0.967 0.971 0.994 1.007 0.984 0.971 0.948 0.935 0.904 0.861 0.811 0.757 0.697 0.615 0.535 0.459 0.356 0.249 0.129 -0.033 -0.195 -0.363 -0.575 -0.824 -1.086 -1.388 -1.748 -2.173 -2.66 -3.257 -4.008 -4.848 -5.906 -7.192 -8.853 -10.959 -13.766 -17.7 -23.619 -29.782 -34.346 -37.975 -40.879 -43.3 -45.28 -46.978 -48.397 -49.749 -50.873 -51.849 -52.745 -53.562 -54.309 -54.991 -55.677 -56.26 -56.744 -57.24 -57.748 -58.157 -58.579 -59.023 -59.364 -59.707 -60.047 -60.386 -60.728 -60.964 -61.203 -61.565 -61.824 -62.09 -62.223 -62.492 -62.767 -63.041 -63.176 -63.429 -63.613 -63.767 -63.932 -64.268 -64.441 -64.636 -64.842 -65.058 -65.301 -65.652 -66.65 -6 ,26552 ,TETRA ,17607343,Sun Nov 28 22:04:07 CET,Sun Nov 28 23:53:33 CET,0.0 0.312 0.408 0.488 0.537 0.573 0.617 0.658 0.7 0.712 0.727 0.708 0.763 0.768 0.772 0.774 0.771 0.768 0.757 0.729 0.681 0.65 0.619 0.56 0.49 0.414 0.333 0.251 0.13 -0.001 -0.127 -0.28 -0.45 -0.633 -0.855 -1.113 -1.394 -1.729 -2.098 -2.53 -3.04 -3.655 -4.416 -5.26 -6.335 -7.63 -9.292 -11.403 -14.227 -18.178 -24.063 -30.217 -34.784 -38.337 -41.203 -43.638 -45.646 -47.351 -48.771 -50.15 -51.297 -52.291 -53.203 -54.03 -54.77 -55.419 -56.071 -56.647 -57.144 -57.64 -58.134 -58.544 -58.971 -59.399 -59.715 -60.046 -60.389 -60.739 -61.104 -61.35 -61.591 -61.952 -62.205 -62.467 -62.595 -62.852 -63.12 -63.406 -63.554 -63.813 -64.009 -64.169 -64.328 -64.655 -64.829 -65.009 -65.186 -65.372 -65.622 -65.911 -66.342 -7 ,27787 ,TETRA ,17607344,Sun Nov 28 22:04:10 CET,Sun Nov 28 23:53:25 CET,0.0 0.304 0.464 0.555 0.63 0.7 0.76 0.811 0.871 0.889 0.904 0.887 0.946 0.952 0.955 0.96 0.963 0.959 0.932 0.904 0.864 0.832 0.796 0.731 0.658 0.586 0.512 0.431 0.304 0.168 0.032 -0.14 -0.319 -0.505 -0.724 -0.991 -1.27 -1.615 -2.024 -2.482 -2.979 -3.581 -4.351 -5.173 -6.202 -7.467 -9.101 -11.218 -14.073 -18.004 -23.863 -30.097 -34.72 -38.326 -41.222 -43.635 -45.625 -47.347 -48.781 -50.153 -51.286 -52.263 -53.162 -53.98 -54.729 -55.4 -56.068 -56.652 -57.144 -57.644 -58.154 -58.565 -58.986 -59.42 -59.75 -60.086 -60.422 -60.755 -61.104 -61.347 -61.587 -61.956 -62.208 -62.471 -62.604 -62.863 -63.128 -63.406 -63.546 -63.793 -63.961 -64.105 -64.257 -64.575 -64.747 -64.948 -65.16 -65.367 -65.587 -65.872 -66.439 -8 ,2412 ,TETRA ,17607345,Sun Nov 28 22:04:07 CET,Sun Nov 28 23:56:19 CET,0.0 0.31 0.457 0.556 0.627 0.69 0.744 0.792 0.866 0.883 0.886 0.855 0.904 0.91 0.912 0.915 0.922 0.914 0.896 0.872 0.813 0.776 0.736 0.672 0.602 0.52 0.441 0.36 0.244 0.128 0.001 -0.183 -0.372 -0.556 -0.776 -1.044 -1.323 -1.632 -1.976 -2.388 -2.862 -3.446 -4.207 -5.041 -6.08 -7.35 -9.009 -11.122 -13.963 -17.913 -23.77 -29.938 -34.497 -38.062 -40.913 -43.296 -45.282 -46.973 -48.37 -49.748 -50.884 -51.846 -52.74 -53.573 -54.339 -55.017 -55.697 -56.285 -56.781 -57.289 -57.8 -58.216 -58.628 -59.044 -59.364 -59.687 -60.01 -60.348 -60.693 -60.917 -61.159 -61.547 -61.811 -62.07 -62.195 -62.452 -62.727 -63.015 -63.16 -63.41 -63.612 -63.784 -63.967 -64.331 -64.523 -64.722 -64.928 -65.16 -65.425 -65.728 -66.272 -9 ,4071 ,TETRA ,17607346,Sun Nov 28 22:05:02 CET,Sun Nov 28 23:55:25 CET,0.0 0.485 0.687 0.807 0.868 0.919 0.969 1.001 1.031 1.056 1.087 1.085 1.147 1.164 1.188 1.2 1.191 1.178 1.163 1.143 1.087 1.052 1.021 0.975 0.93 0.864 0.777 0.699 0.596 0.484 0.357 0.192 0.023 -0.153 -0.373 -0.649 -0.936 -1.262 -1.626 -2.05 -2.542 -3.15 -3.929 -4.786 -5.857 -7.147 -8.812 -10.962 -13.8 -17.702 -23.541 -29.737 -34.328 -37.945 -40.83 -43.237 -45.219 -46.916 -48.33 -49.694 -50.824 -51.794 -52.691 -53.509 -54.247 -54.896 -55.552 -56.135 -56.629 -57.133 -57.65 -58.062 -58.474 -58.903 -59.231 -59.561 -59.895 -60.231 -60.568 -60.804 -61.053 -61.431 -61.689 -61.951 -62.087 -62.364 -62.632 -62.902 -63.047 -63.306 -63.517 -63.681 -63.836 -64.147 -64.315 -64.511 -64.727 -64.943 -65.16 -65.439 -65.832 -10 ,31710 ,TETRA ,17607347,Sun Nov 28 22:05:04 CET,Sun Nov 28 23:55:19 CET,0.0 0.465 0.625 0.727 0.82 0.883 0.912 0.941 0.991 1.014 1.037 1.032 1.085 1.081 1.07 1.06 1.045 1.034 1.004 0.977 0.933 0.9 0.864 0.807 0.742 0.67 0.602 0.524 0.4 0.279 0.151 -0.014 -0.168 -0.324 -0.532 -0.793 -1.073 -1.41 -1.797 -2.231 -2.714 -3.291 -4.037 -4.882 -5.921 -7.164 -8.786 -10.906 -13.74 -17.628 -23.424 -29.609 -34.179 -37.748 -40.635 -43.029 -45.039 -46.788 -48.216 -49.599 -50.749 -51.72 -52.62 -53.461 -54.211 -54.867 -55.53 -56.119 -56.624 -57.126 -57.632 -58.05 -58.474 -58.905 -59.222 -59.537 -59.869 -60.21 -60.556 -60.789 -61.026 -61.394 -61.651 -61.909 -62.04 -62.305 -62.576 -62.862 -63.012 -63.267 -63.452 -63.597 -63.751 -64.095 -64.28 -64.478 -64.679 -64.904 -65.149 -65.461 -66.043 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt deleted file mode 100644 index b66fe38b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7959 ,TETRA ,17607348,Sun Nov 28 22:06:08 CET,Mon Nov 29 00:04:16 CET,0.0 0.601 0.891 1.145 1.365 1.544 1.719 1.881 2.192 2.342 2.485 2.645 2.882 3.012 3.292 3.557 3.791 3.907 4.129 4.34 4.657 4.868 5.071 5.374 5.681 5.98 6.272 6.555 6.919 7.284 7.649 8.091 8.528 8.972 9.488 10.07 10.654 11.308 12.017 12.793 13.639 14.618 15.786 17.013 18.518 20.262 22.367 24.904 28.055 32.019 37.337 42.262 45.484 47.776 49.488 50.822 51.856 52.703 53.352 53.924 54.356 54.699 54.992 55.25 55.459 55.62 55.783 55.913 56.017 56.116 56.188 56.24 56.3 56.349 56.37 56.391 56.428 56.462 56.471 56.466 56.456 56.432 56.407 56.38 56.363 56.321 56.279 56.223 56.191 56.098 56.036 55.981 55.923 55.747 55.651 55.563 55.45 55.284 55.081 54.826 54.088 -2 ,29905 ,TETRA ,17607349,Sun Nov 28 22:05:02 CET,Sun Nov 28 23:54:35 CET,0.0 0.811 1.118 1.36 1.58 1.777 1.964 2.145 2.46 2.599 2.741 2.906 3.147 3.278 3.529 3.777 4.026 4.144 4.372 4.595 4.91 5.118 5.328 5.64 5.944 6.246 6.546 6.826 7.192 7.559 7.919 8.372 8.82 9.253 9.761 10.355 10.935 11.576 12.299 13.086 13.921 14.902 16.102 17.347 18.836 20.579 22.703 25.201 28.317 32.29 37.572 42.526 45.819 48.14 49.813 51.139 52.165 52.986 53.648 54.229 54.652 54.99 55.293 55.549 55.739 55.908 56.077 56.212 56.31 56.388 56.47 56.539 56.604 56.655 56.682 56.7 56.713 56.726 56.729 56.722 56.708 56.682 56.659 56.623 56.598 56.545 56.49 56.415 56.385 56.303 56.253 56.195 56.149 56.018 55.925 55.827 55.709 55.556 55.36 55.133 54.001 -3 ,20864 ,TETRA ,17607350,Sun Nov 28 22:06:03 CET,Sun Nov 28 23:58:35 CET,0.0 0.778 1.067 1.303 1.531 1.738 1.906 2.076 2.396 2.539 2.683 2.849 3.084 3.208 3.453 3.697 3.921 4.031 4.263 4.486 4.806 5.021 5.232 5.525 5.816 6.11 6.396 6.674 7.042 7.411 7.772 8.217 8.652 9.078 9.584 10.159 10.73 11.378 12.095 12.876 13.707 14.668 15.843 17.074 18.567 20.317 22.407 24.878 27.973 31.922 37.201 42.117 45.358 47.701 49.401 50.71 51.719 52.51 53.128 53.693 54.127 54.465 54.757 55.016 55.246 55.433 55.585 55.697 55.802 55.906 55.984 56.046 56.108 56.158 56.187 56.214 56.236 56.245 56.25 56.252 56.243 56.225 56.209 56.18 56.155 56.098 56.042 55.987 55.954 55.86 55.817 55.763 55.7 55.536 55.441 55.339 55.223 55.09 54.903 54.591 53.574 -4 ,13174 ,TETRA ,17607351,Sun Nov 28 22:05:02 CET,Sun Nov 28 23:53:54 CET,0.0 0.739 1.032 1.282 1.471 1.653 1.84 2.003 2.293 2.438 2.579 2.739 2.983 3.118 3.374 3.619 3.858 3.973 4.206 4.43 4.748 4.957 5.163 5.474 5.782 6.089 6.383 6.66 7.036 7.417 7.778 8.212 8.649 9.079 9.603 10.207 10.78 11.43 12.158 12.941 13.774 14.75 15.941 17.17 18.638 20.384 22.527 25.031 28.128 32.033 37.292 42.267 45.558 47.889 49.606 50.929 51.941 52.76 53.385 53.949 54.395 54.755 55.07 55.329 55.538 55.717 55.869 55.976 56.072 56.159 56.239 56.304 56.354 56.391 56.405 56.424 56.442 56.438 56.424 56.415 56.4 56.367 56.348 56.326 56.312 56.275 56.215 56.143 56.11 56.019 55.984 55.937 55.873 55.708 55.612 55.509 55.411 55.296 55.15 54.923 53.603 -5 ,1437 ,TETRA ,17607352,Sun Nov 28 22:05:02 CET,Sun Nov 28 23:55:20 CET,0.0 1.131 1.469 1.72 1.915 2.095 2.262 2.417 2.716 2.87 3.02 3.185 3.426 3.559 3.814 4.052 4.288 4.403 4.633 4.855 5.175 5.389 5.603 5.921 6.224 6.533 6.84 7.126 7.498 7.872 8.236 8.688 9.142 9.572 10.07 10.646 11.22 11.875 12.586 13.359 14.206 15.201 16.387 17.612 19.102 20.835 22.952 25.496 28.657 32.665 38.02 42.997 46.259 48.619 50.37 51.721 52.767 53.588 54.232 54.787 55.202 55.562 55.871 56.111 56.313 56.489 56.646 56.765 56.856 56.936 56.999 57.047 57.107 57.146 57.169 57.199 57.214 57.215 57.217 57.217 57.205 57.166 57.133 57.093 57.07 57.014 56.947 56.868 56.826 56.721 56.672 56.623 56.556 56.397 56.311 56.211 56.105 55.973 55.767 55.471 54.316 -6 ,7683 ,TETRA ,17607353,Sun Nov 28 22:05:04 CET,Sun Nov 28 23:56:48 CET,0.0 1.298 1.652 1.886 2.071 2.251 2.421 2.576 2.89 3.046 3.192 3.339 3.575 3.701 3.957 4.212 4.455 4.579 4.818 5.031 5.346 5.554 5.752 6.054 6.362 6.663 6.957 7.247 7.627 8.003 8.378 8.831 9.268 9.706 10.214 10.78 11.349 11.992 12.704 13.487 14.328 15.3 16.487 17.717 19.189 20.928 23.03 25.546 28.702 32.698 38.061 43.107 46.4 48.719 50.417 51.731 52.76 53.589 54.223 54.772 55.196 55.547 55.849 56.086 56.287 56.474 56.639 56.766 56.87 56.978 57.063 57.115 57.164 57.201 57.227 57.255 57.276 57.283 57.275 57.262 57.249 57.236 57.214 57.176 57.158 57.126 57.086 57.026 56.988 56.901 56.89 56.841 56.791 56.689 56.606 56.491 56.337 56.158 56.002 55.824 54.819 -7 ,29411 ,TETRA ,17607354,Sun Nov 28 22:06:03 CET,Sun Nov 28 23:54:40 CET,0.0 0.906 1.227 1.487 1.688 1.88 2.074 2.252 2.552 2.697 2.829 2.969 3.212 3.345 3.614 3.872 4.113 4.233 4.474 4.705 5.047 5.264 5.467 5.753 6.032 6.333 6.638 6.924 7.303 7.674 8.026 8.469 8.912 9.334 9.834 10.413 11.0 11.658 12.368 13.142 13.98 14.953 16.151 17.411 18.915 20.658 22.766 25.289 28.402 32.326 37.676 42.702 45.955 48.27 50.005 51.328 52.321 53.085 53.682 54.248 54.672 55.005 55.306 55.563 55.774 55.948 56.108 56.251 56.365 56.461 56.539 56.585 56.62 56.657 56.686 56.716 56.74 56.762 56.774 56.771 56.768 56.755 56.739 56.716 56.699 56.651 56.602 56.553 56.516 56.422 56.41 56.369 56.31 56.151 56.057 55.953 55.837 55.722 55.552 55.241 54.273 -8 ,31678 ,TETRA ,17607355,Sun Nov 28 22:05:03 CET,Sun Nov 28 23:44:24 CET,0.0 0.621 0.899 1.15 1.358 1.533 1.711 1.885 2.203 2.362 2.516 2.689 2.935 3.062 3.319 3.578 3.818 3.933 4.157 4.378 4.701 4.904 5.105 5.41 5.702 5.982 6.266 6.564 6.961 7.332 7.693 8.138 8.584 9.03 9.547 10.135 10.718 11.364 12.06 12.829 13.659 14.64 15.828 17.043 18.529 20.263 22.383 24.908 27.972 31.879 37.169 42.102 45.343 47.64 49.315 50.624 51.659 52.49 53.122 53.7 54.156 54.525 54.834 55.09 55.303 55.482 55.64 55.76 55.859 55.954 56.025 56.066 56.122 56.175 56.207 56.232 56.248 56.248 56.234 56.233 56.23 56.212 56.191 56.152 56.13 56.083 56.03 55.972 55.943 55.853 55.808 55.758 55.706 55.557 55.463 55.348 55.202 55.035 54.837 54.576 53.544 -9 ,32707 ,TETRA ,17607356,Sun Nov 28 22:05:03 CET,Sun Nov 28 23:53:33 CET,0.0 0.702 1.015 1.224 1.397 1.572 1.748 1.928 2.284 2.444 2.583 2.725 2.957 3.077 3.302 3.538 3.774 3.889 4.118 4.342 4.673 4.884 5.094 5.411 5.719 6.015 6.302 6.592 6.98 7.357 7.721 8.173 8.612 9.04 9.549 10.141 10.73 11.374 12.085 12.865 13.701 14.67 15.846 17.064 18.531 20.251 22.332 24.833 27.989 32.0 37.341 42.295 45.572 47.877 49.552 50.877 51.898 52.703 53.328 53.903 54.338 54.691 55.006 55.28 55.499 55.671 55.848 55.995 56.103 56.194 56.267 56.317 56.368 56.412 56.435 56.463 56.486 56.484 56.476 56.473 56.475 56.463 56.431 56.389 56.371 56.329 56.286 56.237 56.197 56.101 56.057 55.998 55.934 55.793 55.716 55.618 55.504 55.378 55.207 54.92 53.917 -10 ,17990 ,TETRA ,17607357,Sun Nov 28 22:05:04 CET,Sun Nov 28 23:55:40 CET,0.0 0.874 1.249 1.504 1.717 1.915 2.083 2.251 2.571 2.715 2.859 3.02 3.256 3.381 3.609 3.833 4.058 4.168 4.394 4.617 4.958 5.184 5.391 5.69 5.974 6.26 6.556 6.842 7.223 7.6 7.966 8.431 8.878 9.309 9.833 10.414 10.987 11.652 12.365 13.14 13.998 15.003 16.214 17.453 18.95 20.709 22.818 25.34 28.485 32.492 37.815 42.712 45.984 48.321 50.025 51.369 52.416 53.236 53.868 54.441 54.883 55.238 55.547 55.807 56.019 56.192 56.348 56.467 56.56 56.646 56.714 56.762 56.811 56.853 56.879 56.905 56.926 56.935 56.926 56.917 56.91 56.89 56.868 56.837 56.822 56.792 56.756 56.694 56.65 56.559 56.534 56.477 56.417 56.302 56.217 56.107 55.961 55.788 55.638 55.435 54.484 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt deleted file mode 100644 index 186d00e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8516 ,TETRA ,17607360,Sun Nov 28 22:05:03 CET,Sun Nov 28 23:53:58 CET,0.0 0.502 0.789 1.027 1.272 1.495 1.692 1.872 2.19 2.347 2.501 2.677 2.922 3.057 3.32 3.583 3.837 3.96 4.201 4.436 4.788 5.022 5.246 5.584 5.919 6.237 6.548 6.858 7.266 7.665 8.065 8.568 9.043 9.509 10.065 10.702 11.338 12.048 12.831 13.7 14.644 15.726 17.047 18.413 20.042 21.953 24.234 26.938 30.348 34.681 40.471 45.914 49.506 52.107 54.035 55.501 56.61 57.501 58.176 58.768 59.25 59.637 59.946 60.208 60.447 60.647 60.831 60.973 61.086 61.201 61.297 61.367 61.443 61.499 61.529 61.556 61.581 61.596 61.604 61.609 61.6 61.565 61.541 61.518 61.504 61.484 61.452 61.404 61.377 61.295 61.293 61.257 61.211 61.102 61.029 60.953 60.859 60.729 60.567 60.295 59.518 -2 ,4871 ,TETRA ,17607361,Sun Nov 28 22:05:03 CET,Sun Nov 28 23:54:12 CET,0.0 0.583 0.904 1.176 1.385 1.572 1.754 1.924 2.226 2.376 2.522 2.705 2.948 3.078 3.354 3.624 3.869 3.992 4.235 4.469 4.819 5.051 5.27 5.594 5.923 6.258 6.587 6.905 7.318 7.723 8.119 8.617 9.099 9.565 10.122 10.758 11.386 12.091 12.873 13.716 14.617 15.682 16.982 18.342 19.99 21.879 24.158 26.887 30.264 34.55 40.266 45.636 49.208 51.73 53.592 55.057 56.165 57.055 57.743 58.334 58.778 59.143 59.467 59.754 59.998 60.186 60.363 60.499 60.594 60.692 60.785 60.846 60.892 60.934 60.97 60.996 61.01 61.022 61.021 61.016 61.007 60.976 60.959 60.943 60.932 60.904 60.869 60.828 60.805 60.72 60.693 60.648 60.596 60.471 60.393 60.308 60.212 60.076 59.924 59.723 58.794 -3 ,26392 ,TETRA ,17607363,Sun Nov 28 22:05:05 CET,Sun Nov 28 23:46:54 CET,0.0 0.738 1.088 1.362 1.586 1.805 2.0 2.174 2.512 2.677 2.834 3.018 3.272 3.411 3.678 3.95 4.197 4.315 4.556 4.796 5.144 5.367 5.588 5.92 6.246 6.559 6.87 7.184 7.581 7.977 8.386 8.896 9.39 9.865 10.416 11.047 11.671 12.367 13.145 13.999 14.907 15.973 17.288 18.637 20.257 22.131 24.404 27.128 30.497 34.79 40.535 45.937 49.504 52.077 53.959 55.386 56.494 57.388 58.09 58.722 59.19 59.557 59.87 60.143 60.382 60.583 60.777 60.929 61.043 61.143 61.231 61.288 61.341 61.396 61.439 61.473 61.493 61.493 61.487 61.483 61.478 61.461 61.44 61.423 61.413 61.374 61.322 61.267 61.235 61.151 61.136 61.102 61.053 60.937 60.88 60.817 60.73 60.6 60.435 60.195 59.4 -4 ,22005 ,TETRA ,17607364,Sun Nov 28 22:05:05 CET,Sun Nov 28 23:53:59 CET,0.0 0.741 1.068 1.32 1.558 1.768 1.965 2.141 2.462 2.61 2.758 2.946 3.196 3.333 3.597 3.848 4.098 4.22 4.47 4.719 5.081 5.313 5.535 5.873 6.213 6.543 6.858 7.163 7.573 7.976 8.368 8.856 9.328 9.787 10.329 10.967 11.603 12.301 13.067 13.907 14.814 15.874 17.147 18.48 20.126 22.026 24.324 27.054 30.416 34.675 40.373 45.632 49.084 51.52 53.3 54.695 55.776 56.62 57.286 57.906 58.371 58.724 59.027 59.287 59.514 59.703 59.886 60.046 60.166 60.258 60.347 60.426 60.497 60.553 60.59 60.624 60.641 60.645 60.657 60.661 60.662 60.66 60.651 60.633 60.619 60.592 60.554 60.499 60.469 60.39 60.408 60.38 60.335 60.238 60.18 60.11 60.028 59.922 59.77 59.534 58.817 -5 ,1573 ,TETRA ,17607365,Sun Nov 28 22:05:04 CET,Sun Nov 28 23:54:19 CET,0.0 0.861 1.182 1.458 1.706 1.922 2.129 2.309 2.638 2.786 2.929 3.104 3.347 3.483 3.754 4.014 4.261 4.391 4.643 4.881 5.239 5.471 5.693 6.015 6.335 6.661 6.974 7.279 7.686 8.085 8.475 8.964 9.447 9.914 10.471 11.11 11.733 12.434 13.217 14.085 15.015 16.077 17.367 18.707 20.326 22.218 24.508 27.23 30.603 34.868 40.583 45.943 49.465 51.919 53.714 55.123 56.191 57.033 57.694 58.279 58.742 59.134 59.468 59.751 59.988 60.185 60.373 60.515 60.617 60.721 60.825 60.893 60.962 61.034 61.07 61.099 61.124 61.134 61.133 61.132 61.126 61.11 61.092 61.069 61.062 61.035 60.992 60.935 60.903 60.812 60.77 60.72 60.677 60.581 60.507 60.416 60.305 60.163 59.995 59.742 58.838 -6 ,2938 ,TETRA ,17607366,Sun Nov 28 22:06:05 CET,Sun Nov 28 23:54:55 CET,0.0 0.77 1.092 1.343 1.546 1.738 1.913 2.071 2.411 2.577 2.731 2.923 3.174 3.307 3.564 3.812 4.05 4.175 4.413 4.644 5.001 5.231 5.456 5.792 6.121 6.446 6.767 7.08 7.493 7.905 8.299 8.785 9.272 9.748 10.302 10.948 11.586 12.296 13.078 13.933 14.878 15.956 17.222 18.565 20.182 22.049 24.334 27.072 30.529 34.863 40.541 45.913 49.455 51.964 53.788 55.172 56.25 57.099 57.754 58.359 58.836 59.202 59.498 59.761 59.99 60.171 60.342 60.498 60.62 60.73 60.834 60.912 60.978 61.018 61.047 61.075 61.093 61.113 61.128 61.13 61.122 61.097 61.082 61.055 61.034 61.002 60.963 60.907 60.876 60.788 60.763 60.72 60.668 60.555 60.499 60.421 60.319 60.188 60.018 59.729 58.789 -7 ,23496 ,TETRA ,17607367,Sun Nov 28 22:06:03 CET,Sun Nov 28 23:55:02 CET,0.0 0.991 1.306 1.525 1.739 1.944 2.141 2.333 2.689 2.85 2.996 3.17 3.424 3.567 3.836 4.093 4.346 4.477 4.739 4.975 5.319 5.545 5.767 6.101 6.431 6.755 7.072 7.39 7.804 8.207 8.597 9.068 9.531 9.989 10.538 11.173 11.792 12.487 13.273 14.138 15.061 16.141 17.468 18.835 20.471 22.345 24.615 27.314 30.585 34.761 40.446 45.753 49.24 51.722 53.524 54.916 55.992 56.848 57.554 58.18 58.63 58.995 59.321 59.596 59.823 60.005 60.185 60.317 60.409 60.508 60.604 60.684 60.744 60.787 60.823 60.857 60.89 60.914 60.922 60.917 60.911 60.894 60.878 60.864 60.859 60.836 60.793 60.748 60.723 60.643 60.63 60.587 60.533 60.395 60.311 60.225 60.117 59.98 59.832 59.664 58.982 -8 ,13280 ,TETRA ,17607368,Sun Nov 28 22:06:03 CET,Sun Nov 28 23:54:55 CET,0.0 0.765 1.064 1.293 1.496 1.686 1.862 2.033 2.385 2.555 2.712 2.9 3.147 3.28 3.54 3.807 4.069 4.196 4.445 4.682 5.033 5.268 5.494 5.826 6.157 6.482 6.809 7.135 7.549 7.94 8.324 8.806 9.284 9.758 10.318 10.959 11.587 12.29 13.046 13.881 14.808 15.876 17.177 18.542 20.188 22.129 24.449 27.194 30.631 34.908 40.544 45.844 49.351 51.817 53.648 55.069 56.153 57.047 57.723 58.323 58.8 59.189 59.535 59.818 60.048 60.256 60.46 60.603 60.713 60.819 60.904 60.964 61.024 61.074 61.106 61.14 61.163 61.181 61.19 61.185 61.176 61.157 61.139 61.126 61.123 61.109 61.091 61.06 61.034 60.954 60.939 60.894 60.841 60.715 60.644 60.564 60.447 60.287 60.087 59.844 58.905 -9 ,26311 ,TETRA ,17607369,Sun Nov 28 22:06:03 CET,Sun Nov 28 23:54:52 CET,0.0 0.648 0.98 1.187 1.383 1.575 1.765 1.929 2.254 2.415 2.563 2.729 2.969 3.108 3.382 3.643 3.892 4.013 4.254 4.484 4.811 5.033 5.269 5.616 5.947 6.265 6.58 6.893 7.291 7.682 8.066 8.537 8.997 9.457 10.008 10.645 11.275 11.988 12.794 13.666 14.59 15.637 16.902 18.245 19.88 21.783 24.044 26.755 30.158 34.438 40.235 45.687 49.197 51.686 53.514 54.903 56.006 56.912 57.584 58.173 58.622 58.993 59.325 59.619 59.865 60.051 60.215 60.353 60.465 60.576 60.68 60.758 60.821 60.875 60.909 60.944 60.98 61.001 61.009 61.012 61.016 61.011 61.0 60.983 60.974 60.933 60.878 60.816 60.78 60.689 60.651 60.599 60.545 60.436 60.369 60.279 60.168 60.045 59.894 59.664 58.879 -10 ,8096 ,TETRA ,17607370,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:54:45 CET,0.0 0.705 0.989 1.23 1.456 1.659 1.831 2.001 2.333 2.489 2.647 2.841 3.092 3.226 3.484 3.754 4.02 4.146 4.383 4.617 4.965 5.189 5.405 5.726 6.056 6.382 6.695 7.009 7.422 7.825 8.228 8.716 9.182 9.652 10.226 10.878 11.502 12.196 12.971 13.814 14.733 15.803 17.087 18.432 20.056 21.94 24.216 26.95 30.332 34.609 40.401 45.722 49.206 51.715 53.56 54.965 56.02 56.877 57.552 58.151 58.611 58.975 59.286 59.562 59.797 59.998 60.196 60.35 60.467 60.576 60.691 60.78 60.847 60.896 60.931 60.974 61.012 61.035 61.048 61.049 61.046 61.044 61.031 61.003 60.99 60.958 60.92 60.882 60.861 60.781 60.771 60.735 60.679 60.532 60.462 60.38 60.282 60.162 60.006 59.801 58.935 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt deleted file mode 100644 index b7233ac6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2615 ,TETRA ,17607371,Sun Nov 28 22:06:05 CET,Sun Nov 28 23:54:24 CET,0.0 0.46 0.73 0.957 1.179 1.373 1.55 1.726 2.057 2.209 2.357 2.548 2.802 2.939 3.213 3.484 3.754 3.891 4.167 4.439 4.832 5.081 5.322 5.673 6.026 6.373 6.713 7.05 7.479 7.905 8.332 8.86 9.387 9.918 10.545 11.265 11.981 12.785 13.673 14.653 15.71 16.927 18.421 19.983 21.865 24.099 26.819 30.084 34.139 39.275 46.332 53.129 57.746 61.121 63.652 65.671 67.265 68.547 69.55 70.471 71.214 71.836 72.388 72.865 73.261 73.593 73.933 74.228 74.456 74.677 74.9 75.072 75.24 75.403 75.525 75.638 75.735 75.827 75.913 75.968 76.024 76.095 76.148 76.197 76.216 76.25 76.278 76.302 76.313 76.29 76.328 76.33 76.327 76.306 76.287 76.251 76.197 76.143 76.071 75.97 75.388 -2 ,18618 ,TETRA ,17607372,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:54:33 CET,0.0 0.619 0.921 1.187 1.415 1.619 1.819 2.013 2.345 2.495 2.645 2.844 3.109 3.257 3.544 3.83 4.129 4.274 4.55 4.812 5.183 5.428 5.668 6.019 6.363 6.708 7.053 7.39 7.845 8.302 8.736 9.276 9.816 10.341 10.967 11.691 12.397 13.19 14.09 15.058 16.096 17.332 18.822 20.372 22.265 24.481 27.169 30.411 34.511 39.8 46.983 53.749 58.332 61.688 64.199 66.187 67.736 68.999 70.013 70.956 71.71 72.315 72.847 73.329 73.742 74.072 74.391 74.656 74.868 75.087 75.304 75.474 75.645 75.813 75.927 76.032 76.131 76.229 76.328 76.387 76.443 76.503 76.533 76.574 76.592 76.623 76.65 76.664 76.669 76.644 76.675 76.675 76.671 76.63 76.59 76.542 76.488 76.414 76.336 76.241 75.693 -3 ,23550 ,TETRA ,17607373,Sun Nov 28 22:06:03 CET,Sun Nov 28 23:54:46 CET,0.0 0.592 0.891 1.142 1.364 1.551 1.737 1.924 2.269 2.435 2.598 2.79 3.046 3.195 3.468 3.728 3.994 4.127 4.396 4.649 5.004 5.243 5.484 5.849 6.204 6.559 6.916 7.259 7.713 8.15 8.58 9.109 9.644 10.184 10.807 11.538 12.268 13.078 13.986 14.979 16.015 17.211 18.681 20.237 22.146 24.368 27.059 30.293 34.348 39.55 46.7 53.502 58.08 61.432 63.966 65.982 67.551 68.835 69.861 70.803 71.542 72.159 72.72 73.212 73.643 74.014 74.357 74.642 74.876 75.105 75.337 75.511 75.678 75.842 75.962 76.072 76.184 76.297 76.389 76.444 76.492 76.55 76.59 76.636 76.66 76.696 76.713 76.715 76.715 76.682 76.708 76.7 76.69 76.667 76.646 76.613 76.557 76.474 76.374 76.227 75.684 -4 ,10646 ,TETRA ,17607374,Sun Nov 28 22:06:07 CET,Sun Nov 28 23:54:42 CET,0.0 0.515 0.799 1.062 1.278 1.475 1.667 1.847 2.186 2.354 2.514 2.725 2.995 3.144 3.431 3.715 3.994 4.129 4.394 4.662 5.053 5.303 5.549 5.92 6.278 6.623 6.965 7.304 7.748 8.187 8.627 9.17 9.7 10.222 10.85 11.582 12.298 13.099 13.993 14.972 16.021 17.233 18.691 20.228 22.13 24.372 27.05 30.245 34.289 39.49 46.567 53.303 57.886 61.249 63.784 65.792 67.363 68.646 69.66 70.587 71.321 71.931 72.481 72.966 73.392 73.759 74.113 74.408 74.66 74.899 75.115 75.291 75.472 75.632 75.741 75.845 75.937 76.031 76.129 76.192 76.253 76.334 76.372 76.398 76.411 76.446 76.468 76.483 76.493 76.462 76.473 76.459 76.433 76.374 76.355 76.321 76.264 76.207 76.125 76.015 75.776 -5 ,23904 ,TETRA ,17607375,Sun Nov 28 22:06:04 CET,Sun Nov 28 23:44:29 CET,0.0 0.482 0.771 1.031 1.26 1.469 1.662 1.83 2.139 2.303 2.456 2.62 2.873 3.02 3.3 3.575 3.842 3.974 4.235 4.499 4.888 5.135 5.386 5.764 6.127 6.477 6.82 7.159 7.602 8.04 8.473 9.002 9.528 10.061 10.7 11.422 12.109 12.894 13.785 14.745 15.788 17.025 18.533 20.104 22.001 24.229 26.937 30.153 34.208 39.412 46.516 53.346 57.927 61.25 63.784 65.776 67.312 68.573 69.582 70.53 71.275 71.883 72.423 72.898 73.301 73.643 73.993 74.287 74.524 74.759 74.979 75.145 75.32 75.497 75.621 75.733 75.836 75.93 76.007 76.057 76.109 76.195 76.254 76.307 76.33 76.371 76.401 76.42 76.428 76.403 76.447 76.445 76.435 76.401 76.377 76.343 76.306 76.25 76.144 75.966 75.007 -6 ,28121 ,TETRA ,17607376,Sun Nov 28 22:06:04 CET,Sun Nov 28 23:54:27 CET,0.0 0.737 1.037 1.254 1.465 1.666 1.852 2.034 2.383 2.551 2.717 2.934 3.201 3.355 3.642 3.92 4.196 4.328 4.589 4.841 5.216 5.474 5.726 6.094 6.463 6.824 7.175 7.516 7.956 8.398 8.839 9.372 9.903 10.432 11.055 11.757 12.454 13.249 14.128 15.099 16.163 17.396 18.878 20.421 22.306 24.527 27.238 30.512 34.574 39.745 46.798 53.611 58.239 61.592 64.073 66.062 67.645 68.918 69.933 70.89 71.647 72.262 72.811 73.291 73.705 74.053 74.384 74.669 74.913 75.161 75.395 75.567 75.731 75.887 75.998 76.11 76.224 76.327 76.423 76.482 76.532 76.604 76.649 76.675 76.687 76.724 76.763 76.792 76.798 76.769 76.804 76.796 76.781 76.734 76.702 76.661 76.608 76.553 76.482 76.331 76.032 -7 ,5673 ,TETRA ,17607377,Sun Nov 28 22:06:07 CET,Sun Nov 28 23:54:42 CET,0.0 0.699 1.004 1.216 1.393 1.563 1.739 1.911 2.227 2.373 2.523 2.718 2.979 3.137 3.447 3.724 3.986 4.119 4.39 4.653 5.039 5.286 5.523 5.874 6.213 6.56 6.906 7.252 7.697 8.124 8.557 9.093 9.633 10.156 10.764 11.474 12.175 12.966 13.842 14.792 15.84 17.081 18.567 20.1 21.967 24.167 26.856 30.073 34.126 39.353 46.405 53.209 57.847 61.219 63.775 65.782 67.336 68.618 69.651 70.612 71.371 71.982 72.521 72.991 73.393 73.747 74.1 74.4 74.639 74.864 75.087 75.255 75.416 75.578 75.693 75.8 75.9 75.997 76.097 76.161 76.218 76.3 76.349 76.389 76.405 76.435 76.457 76.469 76.479 76.455 76.49 76.49 76.487 76.454 76.424 76.385 76.341 76.301 76.234 76.063 75.406 -8 ,14971 ,TETRA ,17607378,Sun Nov 28 22:06:04 CET,Sun Nov 28 23:54:36 CET,0.0 0.555 0.864 1.106 1.332 1.544 1.738 1.918 2.261 2.423 2.575 2.753 2.999 3.13 3.407 3.687 3.954 4.084 4.337 4.6 4.996 5.248 5.49 5.846 6.189 6.53 6.875 7.215 7.665 8.115 8.556 9.087 9.606 10.13 10.749 11.461 12.169 12.966 13.842 14.815 15.879 17.096 18.562 20.113 21.995 24.183 26.856 30.049 34.068 39.276 46.369 53.13 57.738 61.143 63.697 65.69 67.256 68.563 69.611 70.569 71.303 71.908 72.451 72.922 73.328 73.684 74.035 74.335 74.576 74.8 75.032 75.213 75.379 75.542 75.658 75.763 75.861 75.968 76.07 76.132 76.192 76.271 76.308 76.337 76.356 76.396 76.435 76.474 76.489 76.464 76.49 76.482 76.475 76.462 76.453 76.428 76.383 76.331 76.259 76.094 75.235 -9 ,7791 ,TETRA ,17607379,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:54:19 CET,0.0 0.69 1.008 1.275 1.501 1.69 1.882 2.076 2.438 2.604 2.764 2.967 3.225 3.372 3.651 3.928 4.201 4.337 4.611 4.875 5.257 5.5 5.747 6.108 6.449 6.796 7.138 7.468 7.91 8.357 8.793 9.326 9.854 10.377 10.996 11.708 12.416 13.219 14.119 15.092 16.131 17.345 18.813 20.361 22.244 24.458 27.147 30.371 34.481 39.77 46.851 53.577 58.171 61.523 64.036 66.027 67.613 68.921 69.952 70.891 71.643 72.269 72.812 73.29 73.704 74.043 74.361 74.636 74.861 75.073 75.296 75.472 75.629 75.789 75.912 76.023 76.13 76.219 76.288 76.336 76.382 76.448 76.493 76.534 76.549 76.572 76.591 76.606 76.608 76.579 76.612 76.605 76.591 76.559 76.536 76.494 76.444 76.399 76.334 76.243 76.013 -10 ,27028 ,TETRA ,17607380,Sun Nov 28 22:06:04 CET,Sun Nov 28 23:53:42 CET,0.0 0.584 0.859 1.105 1.318 1.516 1.71 1.898 2.233 2.39 2.542 2.729 2.981 3.123 3.395 3.67 3.949 4.084 4.346 4.608 4.986 5.225 5.466 5.827 6.189 6.542 6.879 7.209 7.649 8.091 8.52 9.041 9.563 10.086 10.721 11.451 12.163 12.959 13.833 14.81 15.866 17.08 18.559 20.112 22.001 24.204 26.876 30.063 34.059 39.249 46.294 52.962 57.561 60.946 63.438 65.407 66.988 68.281 69.288 70.198 70.924 71.549 72.101 72.586 73.024 73.395 73.745 74.028 74.26 74.492 74.71 74.88 75.05 75.208 75.321 75.43 75.547 75.654 75.744 75.798 75.849 75.926 75.973 76.002 76.015 76.047 76.07 76.084 76.08 76.045 76.055 76.036 76.029 75.988 75.956 75.921 75.862 75.789 75.709 75.604 75.07 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt deleted file mode 100644 index d2f216a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23891 ,TETRA ,17607381,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:53:15 CET,0.0 0.359 0.555 0.69 0.783 0.873 0.963 1.039 1.166 1.217 1.268 1.327 1.375 1.401 1.427 1.45 1.472 1.476 1.474 1.467 1.448 1.434 1.417 1.378 1.341 1.3 1.245 1.181 1.093 0.987 0.869 0.709 0.537 0.359 0.131 -0.151 -0.448 -0.792 -1.191 -1.645 -2.161 -2.832 -3.689 -4.625 -5.841 -7.332 -9.277 -11.787 -15.186 -19.884 -26.785 -34.135 -39.608 -43.923 -47.417 -50.33 -52.739 -54.824 -56.539 -58.18 -59.552 -60.715 -61.778 -62.777 -63.695 -64.503 -65.324 -66.042 -66.645 -67.253 -67.87 -68.368 -68.881 -69.406 -69.797 -70.203 -70.623 -71.05 -71.484 -71.774 -72.064 -72.505 -72.817 -73.147 -73.309 -73.638 -73.992 -74.35 -74.53 -74.819 -75.101 -75.304 -75.516 -75.95 -76.194 -76.474 -76.77 -77.073 -77.4 -77.773 -78.747 -2 ,27715 ,TETRA ,17607382,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:55:30 CET,0.0 0.293 0.458 0.576 0.664 0.734 0.805 0.87 0.985 1.024 1.051 1.087 1.142 1.172 1.216 1.236 1.246 1.25 1.252 1.252 1.249 1.246 1.232 1.194 1.144 1.084 1.008 0.924 0.821 0.716 0.596 0.428 0.254 0.072 -0.163 -0.442 -0.72 -1.056 -1.461 -1.936 -2.487 -3.159 -3.994 -4.911 -6.13 -7.636 -9.561 -12.029 -15.297 -19.881 -26.828 -34.185 -39.64 -43.894 -47.289 -50.149 -52.528 -54.572 -56.256 -57.875 -59.246 -60.428 -61.499 -62.513 -63.431 -64.23 -65.06 -65.785 -66.385 -66.987 -67.614 -68.129 -68.645 -69.171 -69.571 -69.976 -70.39 -70.809 -71.244 -71.539 -71.84 -72.301 -72.612 -72.94 -73.105 -73.442 -73.802 -74.161 -74.336 -74.626 -74.908 -75.1 -75.311 -75.761 -76.0 -76.258 -76.539 -76.838 -77.197 -77.657 -78.422 -3 ,12014 ,TETRA ,17607383,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:54:10 CET,0.0 0.249 0.401 0.499 0.576 0.636 0.69 0.739 0.81 0.845 0.877 0.898 0.948 0.976 1.015 1.05 1.073 1.085 1.11 1.126 1.142 1.149 1.155 1.154 1.139 1.107 1.059 1.015 0.955 0.884 0.81 0.706 0.582 0.452 0.277 0.058 -0.163 -0.441 -0.797 -1.206 -1.684 -2.28 -3.022 -3.836 -4.869 -6.183 -7.939 -10.245 -13.375 -17.851 -24.806 -32.264 -37.878 -42.38 -46.078 -49.115 -51.599 -53.771 -55.596 -57.387 -58.87 -60.13 -61.301 -62.38 -63.36 -64.233 -65.112 -65.885 -66.535 -67.2 -67.89 -68.436 -68.99 -69.561 -69.99 -70.434 -70.888 -71.34 -71.801 -72.119 -72.446 -72.943 -73.282 -73.621 -73.793 -74.144 -74.507 -74.88 -75.07 -75.371 -75.692 -75.914 -76.137 -76.606 -76.85 -77.126 -77.452 -77.787 -78.129 -78.591 -79.614 -4 ,26544 ,TETRA ,17607384,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:51:00 CET,0.0 0.411 0.567 0.676 0.756 0.828 0.877 0.926 1.019 1.059 1.096 1.128 1.177 1.206 1.244 1.258 1.267 1.27 1.273 1.267 1.256 1.243 1.226 1.2 1.158 1.099 1.037 0.984 0.896 0.787 0.678 0.523 0.348 0.167 -0.051 -0.324 -0.624 -0.988 -1.41 -1.89 -2.443 -3.115 -3.983 -4.944 -6.161 -7.674 -9.635 -12.104 -15.447 -20.19 -27.173 -34.466 -39.924 -44.232 -47.658 -50.557 -52.984 -55.069 -56.781 -58.419 -59.774 -60.95 -62.042 -63.036 -63.925 -64.722 -65.536 -66.235 -66.824 -67.442 -68.082 -68.593 -69.107 -69.634 -70.047 -70.453 -70.856 -71.272 -71.689 -71.971 -72.267 -72.742 -73.065 -73.395 -73.56 -73.904 -74.266 -74.632 -74.814 -75.102 -75.395 -75.599 -75.806 -76.249 -76.477 -76.729 -76.999 -77.288 -77.663 -78.126 -79.27 -5 ,3798 ,TETRA ,17607385,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:55:24 CET,0.0 0.339 0.506 0.617 0.701 0.769 0.825 0.875 0.967 1.001 1.023 1.025 1.055 1.063 1.074 1.072 1.062 1.054 1.037 1.02 0.983 0.955 0.927 0.878 0.828 0.769 0.699 0.632 0.533 0.422 0.299 0.134 -0.037 -0.214 -0.438 -0.71 -1.004 -1.358 -1.769 -2.25 -2.81 -3.498 -4.354 -5.279 -6.482 -8.018 -10.009 -12.519 -15.824 -20.426 -27.381 -34.767 -40.268 -44.616 -48.088 -50.977 -53.351 -55.405 -57.122 -58.763 -60.102 -61.256 -62.339 -63.339 -64.247 -65.057 -65.869 -66.566 -67.169 -67.786 -68.407 -68.901 -69.401 -69.928 -70.335 -70.744 -71.163 -71.593 -72.035 -72.338 -72.647 -73.13 -73.455 -73.785 -73.95 -74.278 -74.604 -74.943 -75.116 -75.393 -75.668 -75.866 -76.072 -76.493 -76.721 -76.966 -77.223 -77.515 -77.89 -78.334 -79.327 -6 ,10823 ,TETRA ,17607386,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:54:55 CET,0.0 0.277 0.425 0.537 0.624 0.701 0.779 0.851 0.942 0.983 1.026 1.065 1.109 1.134 1.17 1.188 1.211 1.22 1.222 1.224 1.211 1.191 1.168 1.132 1.085 1.024 0.96 0.887 0.775 0.654 0.528 0.364 0.189 0.007 -0.227 -0.517 -0.802 -1.148 -1.57 -2.06 -2.611 -3.263 -4.105 -5.061 -6.277 -7.78 -9.752 -12.254 -15.612 -20.309 -27.273 -34.601 -40.08 -44.383 -47.793 -50.665 -53.024 -55.05 -56.745 -58.37 -59.723 -60.896 -61.976 -62.958 -63.858 -64.663 -65.481 -66.199 -66.803 -67.41 -68.023 -68.524 -69.035 -69.549 -69.947 -70.355 -70.775 -71.21 -71.645 -71.943 -72.241 -72.702 -73.025 -73.355 -73.524 -73.866 -74.222 -74.586 -74.77 -75.061 -75.349 -75.548 -75.753 -76.212 -76.452 -76.698 -76.972 -77.279 -77.644 -78.131 -79.706 -7 ,6331 ,TETRA ,17607387,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:55:45 CET,0.0 0.562 0.779 0.942 1.054 1.141 1.227 1.316 1.448 1.494 1.535 1.573 1.616 1.638 1.675 1.704 1.736 1.749 1.76 1.77 1.77 1.762 1.752 1.719 1.679 1.624 1.553 1.479 1.374 1.277 1.17 1.018 0.858 0.671 0.436 0.16 -0.133 -0.48 -0.877 -1.346 -1.882 -2.553 -3.423 -4.359 -5.576 -7.088 -9.043 -11.562 -14.931 -19.592 -26.524 -33.862 -39.354 -43.682 -47.15 -50.055 -52.465 -54.521 -56.215 -57.856 -59.206 -60.384 -61.49 -62.495 -63.402 -64.224 -65.048 -65.753 -66.348 -66.942 -67.564 -68.081 -68.602 -69.125 -69.515 -69.91 -70.315 -70.729 -71.155 -71.449 -71.745 -72.189 -72.493 -72.806 -72.967 -73.301 -73.644 -73.996 -74.173 -74.456 -74.742 -74.939 -75.142 -75.615 -75.87 -76.12 -76.394 -76.704 -77.035 -77.429 -78.745 -8 ,16004 ,TETRA ,17607388,Sun Nov 28 22:06:08 CET,Sun Nov 28 23:55:27 CET,0.0 0.271 0.426 0.533 0.62 0.692 0.752 0.797 0.862 0.896 0.924 0.928 0.962 0.97 0.981 0.99 0.99 0.986 0.969 0.95 0.927 0.909 0.892 0.857 0.812 0.762 0.696 0.625 0.522 0.408 0.288 0.129 -0.039 -0.223 -0.452 -0.734 -1.033 -1.388 -1.81 -2.289 -2.839 -3.528 -4.396 -5.348 -6.573 -8.085 -10.053 -12.555 -15.871 -20.461 -27.374 -34.774 -40.268 -44.57 -47.988 -50.833 -53.212 -55.251 -56.955 -58.607 -59.973 -61.149 -62.224 -63.218 -64.116 -64.894 -65.69 -66.398 -66.998 -67.608 -68.241 -68.751 -69.259 -69.78 -70.184 -70.61 -71.04 -71.473 -71.918 -72.218 -72.52 -72.978 -73.296 -73.625 -73.791 -74.123 -74.466 -74.816 -74.998 -75.3 -75.6 -75.815 -76.044 -76.507 -76.745 -76.992 -77.257 -77.549 -77.89 -78.321 -79.534 -9 ,6376 ,TETRA ,17607389,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:54:47 CET,0.0 0.401 0.528 0.631 0.715 0.789 0.851 0.895 0.961 0.989 1.02 1.042 1.076 1.093 1.124 1.141 1.147 1.153 1.153 1.15 1.154 1.145 1.129 1.094 1.042 0.993 0.943 0.886 0.797 0.682 0.553 0.394 0.227 0.054 -0.157 -0.415 -0.697 -1.036 -1.438 -1.911 -2.446 -3.113 -3.987 -4.933 -6.13 -7.64 -9.581 -12.069 -15.437 -20.096 -27.059 -34.448 -39.909 -44.169 -47.648 -50.59 -53.007 -55.092 -56.79 -58.411 -59.778 -60.951 -62.03 -63.029 -63.945 -64.743 -65.546 -66.261 -66.866 -67.482 -68.113 -68.624 -69.141 -69.676 -70.08 -70.481 -70.889 -71.302 -71.725 -72.014 -72.307 -72.756 -73.065 -73.386 -73.55 -73.885 -74.228 -74.587 -74.772 -75.063 -75.353 -75.552 -75.769 -76.239 -76.479 -76.729 -77.018 -77.347 -77.692 -78.118 -79.032 -10 ,19239 ,TETRA ,17607390,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:55:07 CET,0.0 0.326 0.519 0.674 0.78 0.863 0.937 1.01 1.146 1.205 1.251 1.297 1.337 1.358 1.401 1.439 1.465 1.472 1.478 1.475 1.45 1.431 1.416 1.379 1.333 1.28 1.221 1.147 1.026 0.906 0.784 0.623 0.451 0.264 0.024 -0.263 -0.561 -0.907 -1.326 -1.819 -2.369 -3.043 -3.916 -4.894 -6.127 -7.634 -9.597 -12.1 -15.416 -20.047 -27.021 -34.38 -39.86 -44.182 -47.629 -50.543 -52.979 -55.058 -56.76 -58.398 -59.758 -60.914 -61.973 -62.944 -63.835 -64.644 -65.45 -66.143 -66.753 -67.365 -67.988 -68.513 -69.041 -69.576 -69.985 -70.386 -70.794 -71.224 -71.662 -71.948 -72.231 -72.673 -72.98 -73.307 -73.472 -73.798 -74.126 -74.469 -74.646 -74.925 -75.206 -75.412 -75.629 -76.078 -76.309 -76.544 -76.811 -77.102 -77.402 -77.788 -79.18 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt deleted file mode 100644 index 4544c87a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1085 ,TETRA ,17607391,Sun Nov 28 22:06:08 CET,Sun Nov 28 23:55:19 CET,0.0 2.044 2.468 2.749 2.951 3.105 3.222 3.341 3.538 3.613 3.68 3.755 3.813 3.849 3.917 3.971 4.004 4.016 4.04 4.043 4.035 4.027 4.014 3.979 3.924 3.868 3.812 3.741 3.636 3.524 3.392 3.215 3.035 2.842 2.595 2.28 1.958 1.593 1.17 0.675 0.094 -0.637 -1.598 -2.666 -4.018 -5.681 -7.802 -10.497 -14.151 -19.201 -26.749 -34.717 -40.562 -45.126 -48.792 -51.893 -54.463 -56.663 -58.475 -60.209 -61.663 -62.903 -64.021 -65.046 -65.995 -66.864 -67.742 -68.489 -69.11 -69.739 -70.38 -70.915 -71.464 -72.011 -72.427 -72.852 -73.283 -73.738 -74.188 -74.478 -74.783 -75.255 -75.577 -75.899 -76.062 -76.402 -76.759 -77.13 -77.318 -77.614 -77.878 -78.078 -78.282 -78.729 -78.985 -79.242 -79.524 -79.856 -80.22 -80.677 -82.883 -2 ,31108 ,TETRA ,17607392,Sun Nov 28 22:06:33 CET,Sun Nov 28 23:55:35 CET,0.0 3.51 3.923 4.199 4.367 4.493 4.625 4.755 4.94 5.004 5.059 5.151 5.217 5.252 5.321 5.376 5.42 5.437 5.452 5.45 5.439 5.431 5.412 5.374 5.328 5.278 5.224 5.15 5.041 4.926 4.804 4.639 4.473 4.297 4.06 3.781 3.491 3.119 2.672 2.155 1.56 0.828 -0.127 -1.167 -2.458 -4.055 -6.194 -8.95 -12.596 -17.644 -25.204 -33.189 -39.078 -43.669 -47.361 -50.467 -53.003 -55.17 -56.97 -58.689 -60.1 -61.309 -62.413 -63.443 -64.391 -65.232 -66.084 -66.832 -67.464 -68.102 -68.756 -69.282 -69.805 -70.348 -70.765 -71.19 -71.625 -72.057 -72.495 -72.792 -73.103 -73.595 -73.922 -74.239 -74.402 -74.749 -75.107 -75.475 -75.66 -75.958 -76.241 -76.446 -76.657 -77.102 -77.338 -77.591 -77.889 -78.206 -78.545 -78.968 -81.596 -3 ,10449 ,TETRA ,17607393,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:57:21 CET,0.0 1.212 1.652 1.938 2.134 2.32 2.482 2.613 2.81 2.884 2.948 3.048 3.132 3.191 3.286 3.354 3.4 3.42 3.449 3.462 3.468 3.463 3.444 3.405 3.366 3.315 3.246 3.176 3.092 2.993 2.866 2.69 2.505 2.314 2.067 1.766 1.455 1.075 0.637 0.139 -0.432 -1.154 -2.09 -3.101 -4.419 -6.064 -8.19 -10.884 -14.506 -19.516 -27.006 -34.953 -40.848 -45.413 -49.065 -52.14 -54.672 -56.845 -58.636 -60.39 -61.833 -63.05 -64.19 -65.234 -66.184 -67.037 -67.892 -68.632 -69.253 -69.879 -70.523 -71.045 -71.571 -72.123 -72.539 -72.96 -73.392 -73.831 -74.289 -74.601 -74.912 -75.378 -75.692 -76.019 -76.181 -76.516 -76.861 -77.225 -77.416 -77.709 -77.994 -78.214 -78.43 -78.853 -79.079 -79.335 -79.62 -79.918 -80.231 -80.642 -82.406 -4 ,20431 ,TETRA ,17607394,Sun Nov 28 22:06:06 CET,Sun Nov 28 23:55:11 CET,0.0 1.83 2.189 2.437 2.616 2.778 2.904 3.011 3.192 3.273 3.351 3.442 3.506 3.545 3.623 3.684 3.724 3.74 3.78 3.802 3.798 3.785 3.761 3.716 3.664 3.606 3.541 3.476 3.373 3.256 3.126 2.962 2.783 2.58 2.331 2.026 1.698 1.308 0.865 0.357 -0.24 -0.993 -1.953 -2.996 -4.326 -5.98 -8.125 -10.849 -14.475 -19.505 -27.085 -35.082 -40.991 -45.607 -49.303 -52.404 -54.967 -57.145 -58.93 -60.675 -62.118 -63.36 -64.505 -65.535 -66.467 -67.313 -68.178 -68.928 -69.57 -70.217 -70.858 -71.376 -71.911 -72.457 -72.874 -73.301 -73.735 -74.166 -74.597 -74.887 -75.186 -75.654 -75.972 -76.294 -76.461 -76.811 -77.164 -77.516 -77.697 -77.993 -78.276 -78.488 -78.706 -79.148 -79.394 -79.644 -79.928 -80.26 -80.575 -80.967 -83.896 -5 ,18252 ,TETRA ,17607395,Sun Nov 28 22:06:34 CET,Sun Nov 28 23:56:14 CET,0.0 2.111 2.546 2.865 3.064 3.226 3.355 3.463 3.629 3.684 3.728 3.785 3.843 3.883 3.965 4.045 4.107 4.122 4.142 4.153 4.15 4.142 4.127 4.087 4.043 3.998 3.94 3.87 3.765 3.659 3.541 3.369 3.186 3.009 2.776 2.47 2.154 1.769 1.298 0.767 0.166 -0.571 -1.509 -2.552 -3.898 -5.562 -7.699 -10.394 -13.99 -19.024 -26.551 -34.526 -40.457 -45.077 -48.745 -51.838 -54.397 -56.546 -58.327 -60.054 -61.49 -62.728 -63.855 -64.876 -65.821 -66.67 -67.513 -68.251 -68.877 -69.512 -70.149 -70.663 -71.18 -71.707 -72.121 -72.536 -72.953 -73.381 -73.819 -74.118 -74.421 -74.892 -75.223 -75.554 -75.713 -76.034 -76.377 -76.733 -76.914 -77.214 -77.522 -77.741 -77.952 -78.408 -78.663 -78.94 -79.211 -79.507 -79.863 -80.364 -82.468 -6 ,8295 ,TETRA ,17607396,Sun Nov 28 22:06:37 CET,Sun Nov 28 23:56:20 CET,0.0 1.883 2.239 2.548 2.793 2.963 3.088 3.211 3.412 3.499 3.581 3.684 3.748 3.783 3.864 3.931 3.987 4.013 4.053 4.077 4.095 4.102 4.108 4.102 4.086 4.071 4.033 3.968 3.87 3.757 3.632 3.471 3.291 3.102 2.859 2.544 2.209 1.821 1.378 0.873 0.284 -0.451 -1.37 -2.388 -3.725 -5.393 -7.534 -10.259 -13.923 -18.967 -26.491 -34.448 -40.349 -44.933 -48.567 -51.668 -54.27 -56.471 -58.271 -59.977 -61.383 -62.613 -63.768 -64.827 -65.778 -66.636 -67.49 -68.224 -68.853 -69.491 -70.14 -70.667 -71.195 -71.741 -72.17 -72.596 -73.024 -73.462 -73.911 -74.218 -74.533 -75.004 -75.307 -75.609 -75.767 -76.118 -76.477 -76.824 -77.018 -77.319 -77.594 -77.808 -78.021 -78.472 -78.707 -78.958 -79.234 -79.52 -79.876 -80.307 -83.829 -7 ,22786 ,TETRA ,17607397,Sun Nov 28 22:06:35 CET,Sun Nov 28 23:57:54 CET,0.0 1.926 2.31 2.55 2.756 2.93 3.057 3.178 3.393 3.466 3.524 3.609 3.679 3.723 3.794 3.838 3.874 3.892 3.919 3.932 3.935 3.93 3.913 3.875 3.828 3.772 3.719 3.659 3.561 3.446 3.323 3.159 2.967 2.759 2.504 2.192 1.87 1.485 1.031 0.525 -0.049 -0.76 -1.677 -2.687 -3.995 -5.642 -7.749 -10.439 -14.059 -19.097 -26.673 -34.702 -40.62 -45.219 -48.898 -51.943 -54.437 -56.598 -58.367 -60.06 -61.485 -62.735 -63.885 -64.93 -65.894 -66.746 -67.58 -68.295 -68.91 -69.542 -70.192 -70.72 -71.244 -71.782 -72.194 -72.601 -73.012 -73.447 -73.895 -74.183 -74.476 -74.952 -75.279 -75.596 -75.763 -76.112 -76.457 -76.804 -76.986 -77.283 -77.54 -77.74 -77.952 -78.38 -78.617 -78.868 -79.116 -79.406 -79.766 -80.232 -82.158 -8 ,25631 ,TETRA ,17607398,Sun Nov 28 22:06:35 CET,Sun Nov 28 23:42:06 CET,0.0 2.1 2.471 2.716 2.901 3.053 3.174 3.274 3.451 3.523 3.593 3.68 3.743 3.784 3.869 3.933 3.979 3.993 3.995 3.995 3.989 3.976 3.961 3.933 3.888 3.843 3.789 3.713 3.604 3.492 3.374 3.211 3.04 2.862 2.618 2.302 1.971 1.582 1.142 0.631 0.046 -0.672 -1.619 -2.648 -3.962 -5.631 -7.753 -10.41 -14.014 -19.087 -26.642 -34.627 -40.526 -45.127 -48.833 -51.916 -54.444 -56.62 -58.444 -60.179 -61.607 -62.831 -63.953 -64.977 -65.898 -66.729 -67.595 -68.343 -68.975 -69.621 -70.268 -70.802 -71.356 -71.902 -72.308 -72.722 -73.141 -73.558 -73.986 -74.286 -74.588 -75.064 -75.404 -75.739 -75.908 -76.266 -76.62 -76.976 -77.169 -77.472 -77.746 -77.945 -78.157 -78.606 -78.84 -79.083 -79.354 -79.677 -80.049 -80.48 -82.071 -9 ,28653 ,TETRA ,17607399,Sun Nov 28 22:06:35 CET,Sun Nov 28 23:56:06 CET,0.0 1.622 2.028 2.317 2.543 2.72 2.843 2.952 3.131 3.202 3.273 3.39 3.458 3.492 3.558 3.613 3.646 3.66 3.689 3.7 3.684 3.666 3.638 3.586 3.539 3.483 3.417 3.347 3.252 3.145 3.024 2.86 2.673 2.472 2.215 1.906 1.599 1.229 0.784 0.277 -0.298 -1.025 -1.977 -3.03 -4.381 -6.043 -8.17 -10.902 -14.558 -19.601 -27.13 -35.106 -40.997 -45.57 -49.232 -52.322 -54.866 -57.054 -58.871 -60.591 -62.014 -63.248 -64.394 -65.435 -66.363 -67.194 -68.03 -68.751 -69.382 -70.027 -70.671 -71.191 -71.715 -72.266 -72.688 -73.102 -73.532 -73.976 -74.41 -74.708 -75.025 -75.498 -75.818 -76.135 -76.287 -76.616 -76.976 -77.342 -77.528 -77.835 -78.121 -78.321 -78.533 -78.979 -79.219 -79.479 -79.776 -80.116 -80.463 -80.882 -83.045 -10 ,27101 ,TETRA ,17607400,Sun Nov 28 22:06:35 CET,Sun Nov 28 23:55:43 CET,0.0 1.718 2.111 2.418 2.607 2.757 2.893 3.0 3.169 3.241 3.308 3.392 3.47 3.523 3.598 3.657 3.696 3.716 3.761 3.791 3.804 3.809 3.816 3.804 3.757 3.698 3.643 3.577 3.478 3.364 3.247 3.089 2.9 2.703 2.451 2.154 1.855 1.467 0.996 0.47 -0.121 -0.859 -1.801 -2.824 -4.127 -5.766 -7.862 -10.512 -14.147 -19.161 -26.625 -34.634 -40.604 -45.277 -48.985 -52.047 -54.58 -56.78 -58.615 -60.366 -61.806 -63.039 -64.145 -65.154 -66.096 -66.94 -67.785 -68.508 -69.131 -69.777 -70.426 -70.944 -71.469 -72.022 -72.453 -72.877 -73.3 -73.725 -74.162 -74.463 -74.772 -75.243 -75.564 -75.9 -76.069 -76.409 -76.764 -77.136 -77.331 -77.639 -77.92 -78.121 -78.34 -78.825 -79.071 -79.314 -79.563 -79.851 -80.267 -80.771 -82.356 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt deleted file mode 100644 index 8857adc2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27862 ,TETRA ,17607401,Sun Nov 28 22:06:37 CET,Sun Nov 28 23:55:31 CET,0.0 0.521 0.718 0.856 0.956 1.048 1.129 1.2 1.325 1.372 1.421 1.518 1.586 1.628 1.725 1.796 1.846 1.865 1.909 1.967 2.034 2.065 2.095 2.14 2.176 2.197 2.213 2.219 2.219 2.229 2.236 2.223 2.205 2.196 2.168 2.107 2.039 1.948 1.835 1.702 1.54 1.335 1.057 0.726 0.309 -0.236 -0.982 -1.932 -3.28 -5.324 -8.553 -12.034 -14.661 -16.781 -18.546 -20.079 -21.353 -22.455 -23.387 -24.294 -25.048 -25.705 -26.319 -26.884 -27.393 -27.848 -28.322 -28.728 -29.066 -29.411 -29.773 -30.082 -30.385 -30.692 -30.929 -31.167 -31.413 -31.671 -31.943 -32.12 -32.299 -32.58 -32.772 -32.973 -33.074 -33.278 -33.496 -33.724 -33.837 -34.004 -34.194 -34.339 -34.487 -34.783 -34.951 -35.123 -35.301 -35.51 -35.745 -36.026 -37.125 -2 ,10499 ,TETRA ,17607402,Sun Nov 28 22:06:38 CET,Sun Nov 28 23:55:00 CET,0.0 0.667 0.913 1.104 1.257 1.361 1.439 1.52 1.639 1.684 1.734 1.804 1.862 1.9 1.986 2.069 2.134 2.156 2.192 2.226 2.284 2.328 2.36 2.399 2.436 2.467 2.486 2.499 2.517 2.523 2.515 2.504 2.492 2.471 2.439 2.4 2.351 2.266 2.168 2.052 1.882 1.647 1.352 1.04 0.625 0.089 -0.629 -1.593 -2.938 -4.924 -8.12 -11.649 -14.341 -16.492 -18.248 -19.766 -21.023 -22.115 -23.038 -23.927 -24.69 -25.343 -25.933 -26.491 -27.007 -27.464 -27.937 -28.354 -28.692 -29.046 -29.422 -29.728 -30.042 -30.353 -30.586 -30.823 -31.066 -31.319 -31.581 -31.758 -31.939 -32.216 -32.407 -32.619 -32.726 -32.931 -33.153 -33.385 -33.502 -33.678 -33.864 -33.985 -34.121 -34.421 -34.593 -34.781 -34.973 -35.195 -35.471 -35.778 -36.489 -3 ,21736 ,TETRA ,17607403,Sun Nov 28 22:06:35 CET,Sun Nov 28 23:55:18 CET,0.0 0.735 0.952 1.115 1.221 1.315 1.406 1.479 1.585 1.633 1.687 1.75 1.811 1.858 1.929 1.996 2.068 2.1 2.142 2.178 2.242 2.285 2.321 2.36 2.393 2.428 2.45 2.452 2.442 2.451 2.466 2.475 2.482 2.469 2.435 2.379 2.319 2.241 2.127 1.99 1.834 1.632 1.372 1.057 0.632 0.094 -0.647 -1.662 -3.096 -5.14 -8.331 -11.834 -14.533 -16.713 -18.479 -19.981 -21.273 -22.413 -23.364 -24.279 -25.025 -25.676 -26.288 -26.838 -27.339 -27.804 -28.278 -28.685 -29.021 -29.36 -29.724 -30.022 -30.325 -30.64 -30.887 -31.14 -31.385 -31.629 -31.886 -32.064 -32.252 -32.555 -32.765 -32.971 -33.069 -33.277 -33.501 -33.727 -33.84 -34.007 -34.192 -34.319 -34.449 -34.734 -34.903 -35.088 -35.271 -35.452 -35.66 -35.97 -36.634 -4 ,15303 ,TETRA ,17607404,Sun Nov 28 22:06:36 CET,Sun Nov 28 23:55:16 CET,0.0 0.556 0.776 0.971 1.119 1.237 1.336 1.417 1.566 1.629 1.684 1.758 1.821 1.861 1.937 2.004 2.064 2.094 2.151 2.203 2.27 2.308 2.338 2.371 2.403 2.423 2.432 2.451 2.479 2.498 2.511 2.519 2.507 2.475 2.435 2.386 2.337 2.275 2.183 2.075 1.93 1.727 1.451 1.127 0.717 0.174 -0.573 -1.585 -3.002 -5.024 -8.226 -11.747 -14.445 -16.628 -18.427 -19.965 -21.238 -22.357 -23.295 -24.189 -24.933 -25.577 -26.186 -26.748 -27.252 -27.714 -28.199 -28.618 -28.965 -29.317 -29.67 -29.962 -30.263 -30.571 -30.811 -31.056 -31.312 -31.57 -31.83 -32.015 -32.199 -32.477 -32.684 -32.9 -33.007 -33.223 -33.435 -33.649 -33.766 -33.951 -34.17 -34.301 -34.434 -34.714 -34.886 -35.087 -35.292 -35.509 -35.761 -36.032 -36.53 -5 ,11315 ,TETRA ,17607405,Sun Nov 28 22:06:35 CET,Sun Nov 28 23:45:09 CET,0.0 0.428 0.673 0.863 0.989 1.091 1.189 1.277 1.418 1.49 1.548 1.615 1.677 1.71 1.778 1.843 1.892 1.919 1.964 2.001 2.055 2.087 2.116 2.158 2.2 2.229 2.253 2.281 2.3 2.295 2.297 2.297 2.276 2.243 2.206 2.163 2.109 2.031 1.936 1.798 1.631 1.429 1.146 0.838 0.445 -0.086 -0.826 -1.82 -3.203 -5.202 -8.357 -11.785 -14.416 -16.57 -18.336 -19.847 -21.127 -22.236 -23.156 -24.048 -24.806 -25.466 -26.064 -26.61 -27.109 -27.547 -27.997 -28.409 -28.773 -29.137 -29.494 -29.775 -30.07 -30.392 -30.645 -30.901 -31.152 -31.403 -31.659 -31.836 -32.015 -32.279 -32.464 -32.658 -32.758 -32.978 -33.214 -33.461 -33.585 -33.764 -33.985 -34.134 -34.273 -34.564 -34.738 -34.909 -35.078 -35.277 -35.505 -35.762 -36.245 -6 ,5838 ,TETRA ,17607406,Sun Nov 28 22:07:35 CET,Sun Nov 28 23:57:13 CET,0.0 1.063 1.331 1.479 1.596 1.711 1.801 1.881 2.031 2.094 2.155 2.252 2.316 2.355 2.429 2.504 2.576 2.6 2.638 2.687 2.762 2.805 2.836 2.866 2.884 2.899 2.913 2.917 2.92 2.93 2.937 2.937 2.941 2.93 2.897 2.859 2.817 2.741 2.631 2.511 2.362 2.143 1.856 1.524 1.078 0.537 -0.205 -1.182 -2.537 -4.53 -7.639 -11.091 -13.763 -15.927 -17.705 -19.259 -20.56 -21.669 -22.601 -23.513 -24.269 -24.929 -25.53 -26.075 -26.587 -27.044 -27.509 -27.922 -28.277 -28.642 -29.02 -29.322 -29.619 -29.932 -30.177 -30.426 -30.685 -30.94 -31.206 -31.4 -31.584 -31.858 -32.058 -32.267 -32.373 -32.59 -32.817 -33.037 -33.145 -33.322 -33.531 -33.671 -33.814 -34.091 -34.242 -34.415 -34.623 -34.872 -35.126 -35.438 -36.021 -7 ,5642 ,TETRA ,17607407,Sun Nov 28 22:07:35 CET,Mon Nov 29 00:04:02 CET,0.0 0.674 0.942 1.088 1.204 1.306 1.404 1.496 1.652 1.71 1.765 1.862 1.931 1.977 2.062 2.141 2.214 2.243 2.284 2.328 2.394 2.43 2.464 2.51 2.547 2.573 2.587 2.596 2.602 2.596 2.585 2.575 2.574 2.569 2.545 2.499 2.434 2.357 2.268 2.15 1.982 1.764 1.484 1.165 0.76 0.207 -0.523 -1.498 -2.922 -4.96 -8.138 -11.654 -14.364 -16.534 -18.313 -19.84 -21.098 -22.199 -23.148 -24.052 -24.789 -25.434 -26.029 -26.579 -27.091 -27.541 -27.993 -28.407 -28.77 -29.123 -29.487 -29.787 -30.094 -30.413 -30.646 -30.878 -31.125 -31.384 -31.653 -31.834 -32.013 -32.303 -32.515 -32.725 -32.831 -33.035 -33.244 -33.474 -33.601 -33.792 -34.004 -34.139 -34.275 -34.568 -34.732 -34.897 -35.077 -35.294 -35.521 -35.81 -36.494 -8 ,30527 ,TETRA ,17607408,Sun Nov 28 22:07:35 CET,Sun Nov 28 23:56:26 CET,0.0 0.408 0.632 0.8 0.938 1.052 1.138 1.216 1.349 1.411 1.48 1.582 1.653 1.701 1.794 1.877 1.946 1.97 2.012 2.06 2.132 2.166 2.185 2.21 2.235 2.256 2.27 2.283 2.304 2.307 2.299 2.295 2.287 2.278 2.254 2.202 2.153 2.093 2.004 1.889 1.748 1.554 1.263 0.941 0.529 -0.006 -0.768 -1.808 -3.219 -5.188 -8.301 -11.867 -14.595 -16.759 -18.504 -19.982 -21.231 -22.322 -23.236 -24.132 -24.888 -25.531 -26.133 -26.701 -27.225 -27.683 -28.143 -28.558 -28.909 -29.261 -29.617 -29.9 -30.194 -30.504 -30.741 -30.985 -31.238 -31.499 -31.758 -31.935 -32.114 -32.383 -32.574 -32.776 -32.879 -33.091 -33.306 -33.539 -33.658 -33.834 -34.045 -34.179 -34.328 -34.654 -34.817 -34.98 -35.148 -35.337 -35.55 -35.828 -36.448 -9 ,30080 ,TETRA ,17607409,Sun Nov 28 22:07:35 CET,Sun Nov 28 23:55:59 CET,0.0 0.526 0.788 0.969 1.107 1.204 1.279 1.354 1.511 1.576 1.632 1.716 1.774 1.804 1.861 1.91 1.954 1.977 2.018 2.06 2.121 2.155 2.187 2.242 2.286 2.305 2.318 2.323 2.329 2.334 2.33 2.327 2.328 2.327 2.315 2.267 2.211 2.154 2.065 1.942 1.785 1.571 1.298 0.991 0.566 0.022 -0.716 -1.709 -3.068 -5.039 -8.199 -11.709 -14.401 -16.562 -18.329 -19.847 -21.13 -22.258 -23.203 -24.135 -24.917 -25.573 -26.173 -26.73 -27.241 -27.699 -28.17 -28.583 -28.927 -29.275 -29.625 -29.912 -30.214 -30.522 -30.76 -31.01 -31.262 -31.515 -31.784 -31.968 -32.154 -32.443 -32.64 -32.847 -32.954 -33.158 -33.369 -33.601 -33.725 -33.907 -34.111 -34.242 -34.375 -34.659 -34.816 -34.968 -35.127 -35.322 -35.57 -35.883 -36.608 -10 ,2220 ,TETRA ,17607410,Sun Nov 28 22:07:36 CET,Sun Nov 28 23:56:14 CET,0.0 0.494 0.703 0.848 0.972 1.101 1.208 1.299 1.429 1.494 1.559 1.637 1.701 1.74 1.814 1.883 1.94 1.967 2.015 2.054 2.112 2.152 2.186 2.226 2.259 2.277 2.29 2.308 2.331 2.341 2.34 2.335 2.319 2.298 2.262 2.2 2.132 2.053 1.961 1.844 1.699 1.485 1.185 0.861 0.453 -0.091 -0.857 -1.887 -3.308 -5.32 -8.474 -11.967 -14.66 -16.808 -18.55 -20.05 -21.306 -22.416 -23.359 -24.263 -25.009 -25.655 -26.261 -26.828 -27.339 -27.79 -28.259 -28.671 -29.014 -29.363 -29.723 -30.02 -30.326 -30.638 -30.87 -31.103 -31.349 -31.604 -31.865 -32.047 -32.228 -32.504 -32.7 -32.899 -32.999 -33.208 -33.427 -33.681 -33.826 -34.017 -34.206 -34.335 -34.474 -34.751 -34.914 -35.092 -35.29 -35.53 -35.781 -36.115 -36.709 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt deleted file mode 100644 index 3a0a4b85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17870 ,TETRA ,17607411,Sun Nov 28 22:07:38 CET,Sun Nov 28 23:57:00 CET,0.0 0.597 0.796 0.986 1.15 1.247 1.349 1.453 1.663 1.749 1.812 1.91 1.983 2.038 2.146 2.241 2.334 2.377 2.467 2.552 2.655 2.714 2.768 2.847 2.921 2.987 3.054 3.115 3.163 3.205 3.25 3.303 3.357 3.398 3.433 3.467 3.495 3.519 3.535 3.546 3.53 3.483 3.402 3.303 3.158 2.919 2.536 1.973 1.182 -0.059 -2.171 -4.631 -6.597 -8.165 -9.47 -10.626 -11.615 -12.487 -13.228 -13.964 -14.583 -15.127 -15.649 -16.129 -16.548 -16.908 -17.284 -17.622 -17.91 -18.205 -18.499 -18.738 -18.984 -19.235 -19.437 -19.65 -19.854 -20.062 -20.29 -20.44 -20.594 -20.84 -21.008 -21.176 -21.258 -21.436 -21.635 -21.837 -21.942 -22.093 -22.287 -22.418 -22.548 -22.812 -22.947 -23.096 -23.251 -23.423 -23.636 -23.931 -24.715 -2 ,24645 ,TETRA ,17607412,Sun Nov 28 22:07:36 CET,Sun Nov 28 23:56:50 CET,0.0 0.596 0.879 1.074 1.221 1.327 1.421 1.525 1.692 1.758 1.819 1.916 1.995 2.055 2.187 2.303 2.389 2.426 2.504 2.586 2.697 2.76 2.816 2.896 2.978 3.055 3.123 3.189 3.262 3.323 3.387 3.456 3.509 3.547 3.589 3.64 3.686 3.719 3.729 3.726 3.716 3.684 3.62 3.53 3.375 3.135 2.763 2.232 1.472 0.251 -1.87 -4.364 -6.35 -8.016 -9.403 -10.567 -11.55 -12.425 -13.16 -13.865 -14.461 -14.985 -15.485 -15.945 -16.355 -16.729 -17.113 -17.443 -17.727 -18.027 -18.347 -18.601 -18.853 -19.114 -19.315 -19.524 -19.739 -19.966 -20.199 -20.349 -20.502 -20.741 -20.907 -21.075 -21.157 -21.328 -21.518 -21.719 -21.823 -21.985 -22.185 -22.306 -22.418 -22.665 -22.808 -22.958 -23.117 -23.295 -23.502 -23.758 -24.509 -3 ,23575 ,TETRA ,17607413,Sun Nov 28 22:07:38 CET,Sun Nov 28 23:57:23 CET,0.0 0.581 0.784 0.98 1.151 1.28 1.383 1.468 1.645 1.724 1.794 1.906 1.985 2.038 2.136 2.223 2.3 2.337 2.418 2.494 2.596 2.662 2.721 2.809 2.883 2.946 3.015 3.075 3.136 3.195 3.254 3.316 3.364 3.407 3.448 3.495 3.537 3.564 3.592 3.604 3.582 3.523 3.433 3.324 3.163 2.937 2.576 2.016 1.181 -0.097 -2.233 -4.708 -6.706 -8.342 -9.686 -10.865 -11.847 -12.696 -13.417 -14.127 -14.75 -15.296 -15.796 -16.265 -16.697 -17.081 -17.473 -17.815 -18.105 -18.409 -18.724 -18.988 -19.257 -19.526 -19.727 -19.931 -20.142 -20.363 -20.588 -20.74 -20.898 -21.131 -21.293 -21.462 -21.546 -21.715 -21.893 -22.093 -22.198 -22.359 -22.535 -22.659 -22.79 -23.038 -23.171 -23.307 -23.446 -23.582 -23.771 -24.016 -24.6 -4 ,18600 ,TETRA ,17607414,Sun Nov 28 22:07:40 CET,Sun Nov 28 23:57:06 CET,0.0 0.546 0.827 1.031 1.173 1.304 1.42 1.519 1.681 1.75 1.817 1.927 2.01 2.066 2.169 2.263 2.353 2.398 2.479 2.558 2.672 2.741 2.809 2.905 2.979 3.044 3.1 3.161 3.248 3.316 3.37 3.43 3.483 3.53 3.584 3.646 3.681 3.698 3.717 3.717 3.686 3.639 3.574 3.461 3.292 3.041 2.659 2.129 1.304 0.019 -2.113 -4.627 -6.588 -8.202 -9.563 -10.733 -11.747 -12.631 -13.356 -14.047 -14.633 -15.144 -15.623 -16.086 -16.504 -16.869 -17.249 -17.598 -17.894 -18.187 -18.484 -18.732 -18.978 -19.226 -19.432 -19.652 -19.869 -20.083 -20.307 -20.463 -20.613 -20.848 -21.022 -21.21 -21.302 -21.484 -21.675 -21.863 -21.963 -22.104 -22.245 -22.354 -22.473 -22.74 -22.88 -23.015 -23.173 -23.346 -23.554 -23.818 -24.341 -5 ,2040 ,TETRA ,17607415,Sun Nov 28 22:07:35 CET,Sun Nov 28 23:57:21 CET,0.0 0.645 0.886 1.041 1.171 1.285 1.391 1.473 1.634 1.725 1.795 1.891 1.967 2.019 2.117 2.218 2.321 2.369 2.45 2.512 2.596 2.659 2.721 2.8 2.871 2.938 3.01 3.069 3.13 3.192 3.249 3.32 3.388 3.44 3.485 3.519 3.544 3.578 3.601 3.604 3.59 3.557 3.484 3.369 3.19 2.927 2.534 1.979 1.181 -0.129 -2.341 -4.816 -6.745 -8.314 -9.647 -10.833 -11.831 -12.684 -13.409 -14.143 -14.752 -15.285 -15.787 -16.252 -16.67 -17.054 -17.459 -17.802 -18.088 -18.387 -18.704 -18.961 -19.218 -19.481 -19.684 -19.89 -20.101 -20.327 -20.561 -20.719 -20.874 -21.118 -21.291 -21.458 -21.548 -21.743 -21.936 -22.146 -22.257 -22.408 -22.589 -22.712 -22.84 -23.111 -23.261 -23.424 -23.587 -23.748 -23.925 -24.12 -24.448 -6 ,15816 ,TETRA ,17607416,Sun Nov 28 22:07:36 CET,Sun Nov 28 23:56:52 CET,0.0 0.502 0.734 0.918 1.049 1.168 1.267 1.342 1.478 1.554 1.628 1.736 1.817 1.868 1.964 2.065 2.152 2.196 2.275 2.339 2.444 2.512 2.577 2.657 2.72 2.785 2.845 2.904 2.98 3.046 3.108 3.163 3.203 3.241 3.28 3.326 3.348 3.36 3.386 3.405 3.386 3.322 3.233 3.12 2.963 2.726 2.377 1.854 1.033 -0.247 -2.42 -4.914 -6.919 -8.581 -9.954 -11.134 -12.124 -12.996 -13.722 -14.433 -15.03 -15.561 -16.067 -16.542 -16.958 -17.318 -17.708 -18.052 -18.344 -18.636 -18.937 -19.19 -19.444 -19.701 -19.909 -20.129 -20.344 -20.55 -20.764 -20.918 -21.074 -21.308 -21.47 -21.641 -21.73 -21.905 -22.081 -22.267 -22.369 -22.524 -22.71 -22.818 -22.932 -23.19 -23.323 -23.478 -23.666 -23.877 -24.099 -24.34 -25.233 -7 ,10383 ,TETRA ,17607417,Sun Nov 28 22:07:38 CET,Sun Nov 28 23:57:03 CET,0.0 0.773 0.999 1.175 1.308 1.432 1.534 1.62 1.779 1.851 1.921 2.032 2.113 2.166 2.259 2.343 2.429 2.47 2.538 2.602 2.71 2.78 2.838 2.918 2.989 3.05 3.108 3.161 3.233 3.297 3.359 3.425 3.464 3.51 3.561 3.604 3.644 3.667 3.674 3.67 3.646 3.602 3.514 3.415 3.27 3.039 2.673 2.112 1.286 0.006 -2.128 -4.704 -6.761 -8.407 -9.759 -10.926 -11.912 -12.777 -13.491 -14.192 -14.802 -15.344 -15.836 -16.283 -16.705 -17.092 -17.476 -17.806 -18.098 -18.401 -18.711 -18.961 -19.221 -19.481 -19.672 -19.875 -20.093 -20.314 -20.533 -20.681 -20.835 -21.069 -21.231 -21.404 -21.498 -21.689 -21.873 -22.069 -22.177 -22.332 -22.509 -22.617 -22.725 -22.964 -23.101 -23.267 -23.464 -23.686 -23.929 -24.17 -24.674 -8 ,16571 ,TETRA ,17607418,Sun Nov 28 22:07:38 CET,Sun Nov 28 23:56:54 CET,0.0 0.41 0.591 0.773 0.916 1.029 1.136 1.224 1.371 1.434 1.503 1.607 1.682 1.736 1.842 1.949 2.043 2.081 2.156 2.228 2.335 2.397 2.454 2.537 2.611 2.675 2.74 2.801 2.867 2.917 2.971 3.051 3.111 3.159 3.217 3.266 3.288 3.316 3.353 3.365 3.35 3.307 3.244 3.167 3.017 2.783 2.403 1.848 1.03 -0.257 -2.431 -4.937 -6.888 -8.515 -9.848 -11.005 -12.023 -12.913 -13.628 -14.32 -14.925 -15.451 -15.931 -16.373 -16.778 -17.146 -17.54 -17.9 -18.203 -18.501 -18.811 -19.063 -19.315 -19.578 -19.776 -19.984 -20.19 -20.391 -20.604 -20.753 -20.916 -21.164 -21.329 -21.508 -21.594 -21.766 -21.963 -22.171 -22.269 -22.412 -22.582 -22.687 -22.791 -23.017 -23.14 -23.271 -23.428 -23.611 -23.817 -24.13 -24.968 -9 ,1002 ,TETRA ,17607419,Sun Nov 28 22:07:36 CET,Sun Nov 28 23:56:57 CET,0.0 0.409 0.577 0.702 0.819 0.953 1.058 1.15 1.354 1.443 1.518 1.621 1.697 1.75 1.843 1.937 2.029 2.071 2.146 2.213 2.315 2.381 2.443 2.519 2.586 2.649 2.707 2.768 2.843 2.913 2.976 3.045 3.107 3.16 3.224 3.276 3.307 3.327 3.332 3.325 3.297 3.241 3.162 3.052 2.885 2.644 2.265 1.727 0.943 -0.312 -2.406 -4.935 -7.001 -8.672 -10.024 -11.195 -12.218 -13.078 -13.8 -14.518 -15.12 -15.661 -16.163 -16.622 -17.048 -17.427 -17.807 -18.134 -18.409 -18.702 -19.005 -19.248 -19.5 -19.763 -19.977 -20.207 -20.432 -20.656 -20.871 -21.015 -21.165 -21.406 -21.58 -21.759 -21.852 -22.045 -22.24 -22.43 -22.524 -22.676 -22.86 -22.976 -23.097 -23.354 -23.51 -23.677 -23.858 -24.073 -24.299 -24.535 -24.901 -10 ,30323 ,TETRA ,17607420,Sun Nov 28 22:07:36 CET,Sun Nov 28 23:56:48 CET,0.0 0.444 0.692 0.884 1.015 1.137 1.242 1.323 1.477 1.555 1.63 1.743 1.822 1.876 1.975 2.07 2.152 2.191 2.278 2.35 2.447 2.513 2.568 2.642 2.707 2.774 2.846 2.908 2.976 3.03 3.08 3.143 3.191 3.223 3.267 3.314 3.348 3.384 3.412 3.417 3.402 3.352 3.292 3.205 3.047 2.801 2.403 1.841 1.035 -0.245 -2.406 -4.894 -6.871 -8.468 -9.817 -11.01 -12.032 -12.933 -13.67 -14.367 -14.952 -15.474 -15.969 -16.426 -16.851 -17.232 -17.62 -17.962 -18.261 -18.562 -18.862 -19.105 -19.357 -19.628 -19.842 -20.061 -20.263 -20.474 -20.693 -20.837 -20.996 -21.252 -21.414 -21.584 -21.675 -21.861 -22.055 -22.249 -22.344 -22.491 -22.666 -22.778 -22.906 -23.18 -23.311 -23.449 -23.61 -23.795 -23.975 -24.212 -24.867 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index 0403b3d6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9951 ,TETRA ,17607421,Sun Nov 28 22:07:36 CET,Mon Nov 29 00:02:17 CET,0.0 2.512 3.211 3.673 4.044 4.392 4.683 4.941 5.41 5.615 5.832 6.141 6.423 6.587 6.877 7.141 7.411 7.545 7.799 8.022 8.324 8.516 8.712 8.994 9.247 9.503 9.762 10.01 10.327 10.641 10.937 11.249 11.534 11.839 12.2 12.554 12.874 13.222 13.578 13.957 14.353 14.786 15.264 15.718 16.241 16.842 17.477 18.084 18.671 18.948 18.52 17.49 16.395 15.225 14.111 13.118 12.157 11.223 10.411 9.589 8.855 8.21 7.613 7.039 6.497 5.994 5.473 5.017 4.622 4.187 3.727 3.355 2.976 2.558 2.223 1.892 1.549 1.192 0.814 0.552 0.282 -0.126 -0.408 -0.717 -0.881 -1.229 -1.595 -1.991 -2.195 -2.536 -2.854 -3.08 -3.31 -3.829 -4.123 -4.45 -4.812 -5.239 -5.759 -6.465 -9.814 -2 ,3323 ,TETRA ,17607422,Sun Nov 28 22:07:37 CET,Mon Nov 29 00:03:04 CET,0.0 2.226 2.868 3.399 3.89 4.282 4.604 4.888 5.4 5.613 5.825 6.129 6.432 6.618 6.973 7.307 7.619 7.773 8.058 8.314 8.724 8.987 9.234 9.616 9.995 10.346 10.666 10.967 11.363 11.742 12.093 12.517 12.937 13.347 13.812 14.33 14.793 15.272 15.815 16.385 16.969 17.603 18.281 18.961 19.732 20.532 21.402 22.307 23.145 23.926 24.493 24.263 23.577 22.746 21.876 21.013 20.142 19.291 18.548 17.773 17.143 16.563 15.977 15.421 14.891 14.405 13.893 13.428 13.022 12.585 12.133 11.765 11.37 10.961 10.652 10.313 9.962 9.599 9.207 8.953 8.692 8.286 8.008 7.71 7.543 7.17 6.784 6.408 6.219 5.894 5.589 5.35 5.105 4.57 4.28 3.958 3.588 3.164 2.612 1.869 -8.595 -3 ,10028 ,TETRA ,17607423,Sun Nov 28 22:07:38 CET,Mon Nov 29 00:06:00 CET,0.0 2.897 3.58 4.155 4.591 4.949 5.276 5.574 6.132 6.365 6.586 6.897 7.209 7.406 7.786 8.154 8.482 8.634 8.942 9.236 9.645 9.906 10.157 10.516 10.88 11.247 11.59 11.9 12.3 12.692 13.068 13.513 13.946 14.375 14.855 15.381 15.891 16.44 16.969 17.468 17.996 18.598 19.284 19.993 20.814 21.689 22.643 23.602 24.558 25.488 26.038 25.809 25.138 24.16 23.177 22.274 21.419 20.553 19.766 18.94 18.224 17.595 16.967 16.368 15.799 15.293 14.768 14.289 13.876 13.431 12.955 12.589 12.227 11.827 11.506 11.171 10.811 10.445 10.081 9.831 9.561 9.114 8.815 8.508 8.345 8.006 7.656 7.294 7.105 6.782 6.489 6.281 6.046 5.48 5.166 4.836 4.439 3.947 3.342 2.482 -1.128 -4 ,28685 ,TETRA ,17607424,Sun Nov 28 22:07:38 CET,Mon Nov 29 00:04:38 CET,0.0 4.149 4.816 5.3 5.654 5.992 6.303 6.578 7.098 7.343 7.56 7.831 8.125 8.305 8.655 8.998 9.332 9.487 9.781 10.073 10.483 10.737 10.984 11.34 11.685 12.013 12.325 12.634 13.031 13.412 13.784 14.23 14.661 15.063 15.52 16.043 16.512 17.006 17.575 18.186 18.8 19.472 20.211 20.952 21.809 22.676 23.587 24.45 25.255 25.991 26.185 25.428 24.501 23.592 22.666 21.76 20.92 20.096 19.319 18.507 17.822 17.208 16.592 16.029 15.524 15.056 14.574 14.151 13.761 13.355 12.927 12.555 12.168 11.744 11.423 11.114 10.79 10.438 10.067 9.811 9.536 9.086 8.765 8.42 8.252 7.917 7.561 7.217 7.04 6.718 6.376 6.102 5.794 5.108 4.769 4.404 4.01 3.583 2.974 2.06 -3.264 -5 ,5736 ,TETRA ,17607425,Sun Nov 28 22:07:37 CET,Sun Nov 28 23:50:06 CET,0.0 5.179 5.968 6.572 7.049 7.402 7.707 7.97 8.491 8.754 9.001 9.368 9.69 9.875 10.218 10.522 10.812 10.97 11.274 11.55 11.938 12.194 12.44 12.796 13.152 13.486 13.796 14.08 14.442 14.82 15.176 15.596 16.01 16.411 16.876 17.364 17.835 18.344 18.866 19.454 20.101 20.819 21.621 22.363 23.225 24.123 25.04 25.958 26.814 27.631 27.961 27.351 26.428 25.429 24.463 23.503 22.631 21.834 21.11 20.343 19.648 19.021 18.409 17.813 17.263 16.776 16.285 15.836 15.43 15.013 14.568 14.185 13.795 13.409 13.093 12.744 12.387 12.008 11.597 11.312 11.016 10.574 10.265 9.947 9.794 9.49 9.138 8.723 8.522 8.203 7.914 7.687 7.442 6.912 6.596 6.254 5.866 5.344 4.712 3.9 -1.093 -6 ,22113 ,TETRA ,17607426,Sun Nov 28 22:07:38 CET,Sun Nov 28 23:51:25 CET,0.0 3.797 4.339 4.741 5.088 5.412 5.748 6.074 6.597 6.837 7.067 7.351 7.668 7.867 8.213 8.535 8.854 9.006 9.293 9.556 9.94 10.195 10.437 10.77 11.072 11.374 11.674 11.963 12.343 12.705 13.063 13.51 13.915 14.31 14.754 15.245 15.725 16.235 16.794 17.391 17.97 18.577 19.282 19.941 20.639 21.366 22.176 23.01 23.808 24.521 24.88 24.487 23.562 22.528 21.577 20.609 19.695 18.865 18.136 17.375 16.696 16.095 15.521 14.973 14.434 13.925 13.4 12.895 12.456 12.017 11.558 11.175 10.789 10.413 10.13 9.815 9.469 9.116 8.762 8.52 8.259 7.861 7.59 7.281 7.115 6.786 6.438 6.037 5.824 5.487 5.158 4.924 4.703 4.201 3.902 3.579 3.232 2.803 2.281 1.536 -2.553 -7 ,12892 ,TETRA ,17607427,Sun Nov 28 22:07:38 CET,Mon Nov 29 00:02:09 CET,0.0 4.006 4.801 5.389 5.827 6.2 6.542 6.828 7.328 7.571 7.845 8.207 8.481 8.655 9.03 9.389 9.729 9.904 10.233 10.524 10.947 11.226 11.509 11.958 12.399 12.759 13.054 13.343 13.72 14.069 14.403 14.813 15.222 15.638 16.147 16.725 17.256 17.819 18.408 18.99 19.564 20.215 20.981 21.708 22.491 23.364 24.374 25.387 26.39 27.286 27.715 27.216 26.132 24.873 23.759 22.688 21.689 20.822 20.033 19.171 18.41 17.735 17.108 16.53 15.99 15.491 14.982 14.508 14.093 13.667 13.228 12.874 12.496 12.083 11.754 11.423 11.084 10.74 10.37 10.12 9.865 9.441 9.137 8.832 8.672 8.324 7.95 7.545 7.342 7.015 6.691 6.428 6.155 5.603 5.301 4.95 4.542 4.1 3.514 2.583 -1.098 -9 ,5549 ,TETRA ,17607430,Sun Nov 28 22:08:06 CET,Mon Nov 29 00:04:28 CET,0.0 4.645 5.415 5.945 6.395 6.831 7.259 7.618 8.141 8.378 8.607 8.921 9.24 9.423 9.787 10.129 10.438 10.597 10.925 11.235 11.678 11.973 12.258 12.646 13.008 13.37 13.723 14.05 14.458 14.853 15.258 15.76 16.236 16.67 17.14 17.662 18.145 18.677 19.256 19.83 20.427 21.08 21.83 22.565 23.421 24.327 25.223 26.124 27.056 27.976 28.45 27.89 26.792 25.643 24.63 23.622 22.693 21.808 21.027 20.271 19.59 18.945 18.304 17.678 17.104 16.601 16.079 15.592 15.153 14.698 14.229 13.837 13.441 13.031 12.708 12.388 12.064 11.703 11.323 11.078 10.822 10.404 10.119 9.81 9.64 9.309 8.969 8.578 8.368 8.028 7.707 7.482 7.239 6.68 6.379 6.062 5.685 5.264 4.802 4.136 -3.295 -10 ,30450 ,TETRA ,17607431,Sun Nov 28 22:07:38 CET,Mon Nov 29 00:02:26 CET,0.0 2.421 3.038 3.496 3.872 4.245 4.608 4.943 5.529 5.767 5.972 6.253 6.545 6.709 7.018 7.316 7.606 7.742 7.987 8.23 8.611 8.862 9.088 9.408 9.718 10.012 10.291 10.552 10.886 11.223 11.556 11.954 12.332 12.703 13.135 13.59 14.029 14.508 14.979 15.483 16.018 16.61 17.291 17.92 18.608 19.383 20.289 21.239 22.202 23.104 23.598 23.206 22.429 21.556 20.691 19.813 18.936 18.101 17.362 16.605 15.956 15.37 14.807 14.274 13.755 13.288 12.785 12.316 11.926 11.508 11.049 10.656 10.241 9.803 9.45 9.09 8.741 8.39 8.007 7.744 7.485 7.074 6.788 6.48 6.322 6.002 5.639 5.263 5.071 4.736 4.407 4.153 3.868 3.24 2.928 2.596 2.202 1.736 1.134 0.374 -5.541 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index 8099ea10..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27665 ,TETRA ,17607432,Sun Nov 28 22:07:37 CET,Mon Nov 29 00:03:53 CET,0.0 1.371 1.813 2.119 2.365 2.574 2.778 2.965 3.306 3.468 3.64 3.85 4.108 4.243 4.498 4.736 4.952 5.063 5.307 5.543 5.872 6.084 6.281 6.564 6.836 7.109 7.367 7.602 7.894 8.169 8.432 8.743 9.047 9.342 9.687 10.082 10.458 10.872 11.312 11.783 12.285 12.811 13.399 13.984 14.643 15.352 16.154 17.119 18.263 19.45 20.59 21.218 21.321 21.122 20.797 20.445 20.119 19.76 19.402 19.017 18.679 18.363 18.053 17.78 17.524 17.26 16.978 16.753 16.537 16.29 16.044 15.83 15.605 15.377 15.202 15.0 14.797 14.581 14.338 14.175 14.004 13.736 13.535 13.32 13.209 12.971 12.715 12.443 12.3 12.035 11.794 11.616 11.433 11.056 10.831 10.555 10.266 9.959 9.567 9.012 7.01 -2 ,13328 ,TETRA ,17607433,Sun Nov 28 22:07:39 CET,Mon Nov 29 00:03:51 CET,0.0 2.233 2.815 3.234 3.563 3.843 4.11 4.319 4.666 4.842 5.038 5.293 5.577 5.743 6.039 6.319 6.58 6.695 6.905 7.102 7.375 7.545 7.715 7.982 8.256 8.539 8.821 9.082 9.392 9.694 10.003 10.39 10.75 11.052 11.383 11.755 12.106 12.493 12.893 13.318 13.767 14.275 14.86 15.459 16.178 16.956 17.85 18.84 19.92 21.101 22.295 22.769 22.749 22.585 22.321 22.002 21.657 21.282 20.927 20.563 20.239 19.939 19.646 19.359 19.081 18.82 18.522 18.245 18.021 17.8 17.572 17.362 17.126 16.9 16.732 16.565 16.39 16.208 16.012 15.849 15.682 15.445 15.281 15.115 15.03 14.831 14.595 14.335 14.201 13.976 13.847 13.708 13.559 13.241 13.061 12.848 12.584 12.274 11.916 11.463 9.451 -3 ,10692 ,TETRA ,17607434,Sun Nov 28 22:08:07 CET,Mon Nov 29 00:03:37 CET,0.0 1.879 2.416 2.791 3.121 3.397 3.623 3.813 4.152 4.318 4.493 4.715 4.979 5.126 5.387 5.652 5.907 6.027 6.262 6.48 6.773 6.967 7.146 7.395 7.645 7.888 8.128 8.38 8.698 8.993 9.259 9.555 9.856 10.157 10.508 10.931 11.333 11.764 12.245 12.747 13.249 13.808 14.479 15.124 15.851 16.657 17.576 18.602 19.733 20.972 22.13 22.656 22.736 22.621 22.403 22.16 21.889 21.586 21.301 20.986 20.708 20.447 20.162 19.873 19.592 19.342 19.098 18.869 18.66 18.443 18.208 18.007 17.792 17.544 17.35 17.163 16.967 16.759 16.54 16.388 16.23 15.984 15.812 15.625 15.516 15.287 15.069 14.837 14.706 14.462 14.244 14.067 13.893 13.538 13.342 13.126 12.886 12.609 12.274 11.892 10.842 -4 ,17879 ,TETRA ,17607435,Sun Nov 28 22:08:08 CET,Mon Nov 29 00:02:53 CET,0.0 1.074 1.509 1.843 2.097 2.339 2.55 2.746 3.125 3.275 3.422 3.592 3.836 3.97 4.239 4.472 4.683 4.793 5.019 5.224 5.504 5.679 5.858 6.137 6.407 6.653 6.888 7.136 7.452 7.74 8.02 8.375 8.739 9.095 9.483 9.901 10.306 10.751 11.205 11.658 12.154 12.727 13.354 13.962 14.684 15.521 16.503 17.557 18.711 20.036 21.353 21.897 21.855 21.645 21.391 21.093 20.787 20.457 20.131 19.78 19.468 19.165 18.863 18.586 18.31 18.043 17.765 17.502 17.284 17.057 16.791 16.576 16.365 16.135 15.962 15.782 15.57 15.361 15.165 15.016 14.852 14.603 14.415 14.208 14.098 13.864 13.632 13.392 13.265 13.032 12.827 12.65 12.484 12.131 11.91 11.69 11.474 11.21 10.904 10.557 9.402 -5 ,30401 ,TETRA ,17607436,Sun Nov 28 22:08:08 CET,Mon Nov 29 00:03:14 CET,0.0 1.323 1.77 2.154 2.469 2.747 2.988 3.216 3.582 3.727 3.874 4.06 4.311 4.448 4.723 4.986 5.236 5.347 5.549 5.755 6.057 6.25 6.436 6.699 6.957 7.212 7.472 7.732 8.049 8.338 8.628 8.993 9.331 9.638 9.981 10.363 10.74 11.153 11.588 12.047 12.511 13.02 13.583 14.152 14.823 15.567 16.419 17.338 18.426 19.597 20.721 21.26 21.184 20.936 20.595 20.195 19.799 19.435 19.109 18.731 18.362 18.01 17.675 17.346 17.053 16.779 16.475 16.197 15.949 15.701 15.453 15.228 14.984 14.74 14.554 14.372 14.174 13.974 13.771 13.621 13.468 13.227 13.053 12.88 12.795 12.607 12.392 12.156 12.032 11.79 11.578 11.406 11.233 10.882 10.702 10.501 10.245 9.943 9.528 9.008 7.214 -6 ,28079 ,TETRA ,17607437,Sun Nov 28 22:08:09 CET,Mon Nov 29 00:02:51 CET,0.0 1.94 2.436 2.833 3.148 3.426 3.682 3.917 4.35 4.548 4.729 4.94 5.204 5.361 5.671 5.944 6.202 6.325 6.556 6.773 7.07 7.256 7.445 7.725 7.987 8.26 8.528 8.781 9.119 9.424 9.698 10.014 10.313 10.607 10.939 11.308 11.669 12.076 12.519 12.973 13.428 13.936 14.549 15.155 15.835 16.59 17.424 18.334 19.369 20.462 21.524 22.101 22.228 22.142 21.952 21.716 21.475 21.202 20.918 20.605 20.318 20.073 19.849 19.61 19.366 19.142 18.888 18.646 18.431 18.205 17.968 17.757 17.536 17.309 17.123 16.917 16.692 16.464 16.229 16.072 15.922 15.682 15.51 15.33 15.239 15.061 14.865 14.646 14.538 14.326 14.17 14.028 13.874 13.536 13.351 13.12 12.867 12.598 12.261 11.864 10.575 -7 ,28154 ,TETRA ,17607438,Sun Nov 28 22:08:08 CET,Mon Nov 29 00:03:50 CET,0.0 1.6 2.093 2.437 2.73 2.96 3.151 3.349 3.733 3.931 4.112 4.306 4.564 4.701 4.945 5.173 5.411 5.528 5.758 5.984 6.286 6.488 6.688 6.959 7.221 7.467 7.708 7.945 8.244 8.533 8.804 9.113 9.417 9.719 10.064 10.457 10.837 11.263 11.751 12.255 12.757 13.352 14.018 14.599 15.264 15.997 16.822 17.754 18.797 20.013 21.346 21.961 21.964 21.748 21.447 21.125 20.833 20.546 20.229 19.862 19.566 19.337 19.086 18.811 18.559 18.309 18.014 17.76 17.556 17.33 17.075 16.869 16.671 16.462 16.298 16.136 15.957 15.743 15.499 15.35 15.209 14.974 14.798 14.606 14.51 14.305 14.088 13.863 13.739 13.505 13.353 13.232 13.092 12.735 12.528 12.277 11.986 11.704 11.352 10.841 9.237 -8 ,1257 ,TETRA ,17607439,Sun Nov 28 22:08:08 CET,Sun Nov 28 23:52:51 CET,0.0 1.307 1.82 2.247 2.605 2.912 3.167 3.371 3.755 3.932 4.106 4.33 4.579 4.71 4.993 5.289 5.562 5.686 5.917 6.148 6.487 6.699 6.9 7.189 7.469 7.729 7.973 8.21 8.511 8.788 9.041 9.352 9.666 9.974 10.343 10.76 11.144 11.559 12.022 12.516 13.045 13.634 14.284 14.918 15.658 16.482 17.429 18.482 19.617 20.807 21.995 22.594 22.673 22.521 22.241 21.872 21.474 21.082 20.731 20.397 20.103 19.816 19.527 19.245 18.974 18.736 18.468 18.204 17.987 17.767 17.53 17.325 17.097 16.854 16.677 16.499 16.315 16.118 15.903 15.752 15.584 15.295 15.095 14.906 14.804 14.574 14.336 14.096 13.98 13.741 13.551 13.412 13.261 12.924 12.745 12.557 12.32 12.067 11.816 11.441 10.026 -9 ,21266 ,TETRA ,17607440,Sun Nov 28 22:08:08 CET,Mon Nov 29 00:03:15 CET,0.0 1.076 1.462 1.765 2.019 2.234 2.433 2.613 2.909 3.053 3.202 3.378 3.63 3.752 3.977 4.192 4.403 4.502 4.708 4.914 5.211 5.404 5.578 5.817 6.057 6.307 6.552 6.784 7.076 7.363 7.637 7.959 8.272 8.564 8.891 9.286 9.678 10.088 10.538 11.026 11.519 12.076 12.732 13.39 14.099 14.822 15.67 16.607 17.603 18.71 19.95 20.63 20.716 20.576 20.374 20.115 19.814 19.524 19.236 18.866 18.536 18.255 17.972 17.675 17.367 17.085 16.792 16.533 16.314 16.085 15.853 15.655 15.435 15.195 14.997 14.801 14.603 14.404 14.195 14.049 13.897 13.63 13.438 13.253 13.151 12.93 12.716 12.473 12.333 12.068 11.834 11.669 11.488 11.093 10.896 10.692 10.452 10.196 9.876 9.422 8.047 -10 ,28468 ,TETRA ,17607441,Sun Nov 28 22:08:09 CET,Mon Nov 29 00:05:34 CET,0.0 1.118 1.534 1.847 2.117 2.39 2.659 2.897 3.273 3.45 3.625 3.841 4.114 4.261 4.548 4.825 5.088 5.211 5.452 5.691 6.039 6.254 6.454 6.764 7.069 7.332 7.567 7.794 8.082 8.351 8.627 8.979 9.304 9.609 9.958 10.342 10.738 11.182 11.614 12.054 12.562 13.13 13.729 14.314 14.977 15.7 16.522 17.456 18.55 19.789 20.977 21.504 21.566 21.403 21.113 20.783 20.451 20.115 19.788 19.422 19.135 18.902 18.649 18.411 18.184 17.951 17.684 17.422 17.18 16.933 16.662 16.427 16.183 15.926 15.738 15.544 15.319 15.092 14.886 14.743 14.595 14.363 14.178 13.962 13.853 13.628 13.396 13.157 13.028 12.786 12.595 12.435 12.24 11.807 11.585 11.363 11.144 10.876 10.495 9.96 8.294 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index 9001fea7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27481 ,TETRA ,17607442,Sun Nov 28 22:08:11 CET,Mon Nov 29 00:05:17 CET,0.0 0.543 0.741 0.902 1.029 1.13 1.231 1.329 1.498 1.572 1.647 1.685 1.87 1.935 2.07 2.195 2.313 2.368 2.478 2.6 2.805 2.932 3.04 3.196 3.328 3.46 3.596 3.719 3.881 4.048 4.208 4.399 4.586 4.751 4.918 5.089 5.247 5.403 5.544 5.685 5.819 5.945 6.084 6.203 6.3 6.359 6.331 6.199 5.909 5.231 3.838 1.909 0.177 -1.319 -2.587 -3.725 -4.714 -5.576 -6.318 -7.047 -7.68 -8.264 -8.811 -9.32 -9.802 -10.248 -10.706 -11.101 -11.438 -11.797 -12.175 -12.484 -12.799 -13.123 -13.381 -13.657 -13.933 -14.206 -14.495 -14.699 -14.904 -15.221 -15.455 -15.726 -15.869 -16.139 -16.416 -16.713 -16.873 -17.183 -17.426 -17.608 -17.78 -18.149 -18.368 -18.606 -18.863 -19.162 -19.508 -19.968 -20.825 -2 ,9862 ,TETRA ,17607443,Sun Nov 28 22:10:07 CET,Mon Nov 29 00:06:54 CET,0.0 0.578 0.873 1.084 1.241 1.39 1.521 1.642 1.89 2.005 2.114 2.182 2.373 2.452 2.599 2.766 2.942 3.013 3.144 3.264 3.428 3.528 3.619 3.761 3.925 4.096 4.247 4.378 4.532 4.667 4.799 4.953 5.094 5.23 5.381 5.544 5.71 5.888 6.05 6.194 6.318 6.46 6.599 6.718 6.838 6.912 6.905 6.753 6.437 5.857 4.545 2.59 0.932 -0.503 -1.799 -2.952 -3.944 -4.854 -5.618 -6.378 -7.042 -7.642 -8.249 -8.801 -9.282 -9.71 -10.156 -10.568 -10.921 -11.268 -11.618 -11.914 -12.217 -12.532 -12.783 -13.047 -13.32 -13.605 -13.899 -14.091 -14.293 -14.631 -14.863 -15.107 -15.239 -15.485 -15.728 -15.994 -16.131 -16.421 -16.624 -16.803 -17.005 -17.47 -17.731 -18.016 -18.349 -18.766 -19.228 -19.724 -20.756 -3 ,17569 ,TETRA ,17607444,Sun Nov 28 22:08:09 CET,Mon Nov 29 00:03:26 CET,0.0 0.669 0.999 1.241 1.433 1.592 1.74 1.891 2.162 2.269 2.371 2.447 2.65 2.739 2.904 3.053 3.186 3.256 3.394 3.501 3.669 3.78 3.876 4.019 4.157 4.291 4.411 4.513 4.654 4.817 4.98 5.172 5.337 5.474 5.616 5.769 5.918 6.069 6.211 6.347 6.492 6.635 6.751 6.837 6.917 6.938 6.898 6.781 6.453 5.702 4.223 2.368 0.731 -0.722 -2.004 -3.182 -4.188 -5.085 -5.857 -6.618 -7.291 -7.912 -8.491 -9.012 -9.494 -9.947 -10.437 -10.885 -11.275 -11.692 -12.12 -12.472 -12.835 -13.187 -13.436 -13.694 -13.991 -14.302 -14.614 -14.819 -15.014 -15.307 -15.525 -15.761 -15.88 -16.116 -16.369 -16.648 -16.794 -17.086 -17.309 -17.501 -17.685 -18.063 -18.256 -18.468 -18.713 -19.033 -19.41 -19.893 -21.637 -4 ,25311 ,TETRA ,17607445,Sun Nov 28 22:08:09 CET,Mon Nov 29 00:03:36 CET,0.0 0.825 1.134 1.4 1.655 1.882 2.087 2.257 2.557 2.674 2.766 2.841 3.05 3.127 3.264 3.399 3.532 3.595 3.716 3.833 4.011 4.126 4.24 4.414 4.57 4.713 4.838 4.947 5.085 5.225 5.343 5.477 5.617 5.747 5.884 6.03 6.175 6.341 6.498 6.628 6.767 6.929 7.105 7.241 7.347 7.407 7.398 7.316 7.015 6.344 4.968 2.994 1.288 -0.197 -1.515 -2.715 -3.756 -4.675 -5.469 -6.247 -6.889 -7.451 -8.007 -8.558 -9.047 -9.47 -9.932 -10.353 -10.704 -11.072 -11.479 -11.815 -12.146 -12.489 -12.762 -13.053 -13.349 -13.649 -13.962 -14.18 -14.398 -14.731 -14.951 -15.18 -15.303 -15.552 -15.81 -16.077 -16.224 -16.51 -16.697 -16.862 -17.034 -17.421 -17.636 -17.877 -18.135 -18.44 -18.774 -19.237 -20.562 -5 ,22695 ,TETRA ,17607446,Sun Nov 28 22:08:09 CET,Mon Nov 29 00:05:47 CET,0.0 0.774 1.054 1.276 1.477 1.669 1.855 2.01 2.259 2.381 2.495 2.573 2.779 2.864 3.025 3.18 3.322 3.387 3.501 3.604 3.761 3.863 3.961 4.092 4.223 4.366 4.508 4.635 4.79 4.952 5.108 5.26 5.39 5.525 5.693 5.871 6.027 6.188 6.329 6.455 6.591 6.728 6.861 6.966 7.052 7.121 7.105 6.931 6.584 5.883 4.473 2.544 0.872 -0.589 -1.887 -3.022 -3.985 -4.859 -5.621 -6.366 -7.016 -7.579 -8.116 -8.636 -9.111 -9.549 -10.013 -10.437 -10.801 -11.176 -11.577 -11.906 -12.24 -12.585 -12.857 -13.146 -13.447 -13.756 -14.073 -14.275 -14.476 -14.818 -15.061 -15.296 -15.407 -15.638 -15.898 -16.17 -16.317 -16.607 -16.806 -16.977 -17.147 -17.524 -17.719 -17.938 -18.211 -18.529 -18.972 -19.564 -20.738 -6 ,1194 ,TETRA ,17607447,Sun Nov 28 22:08:09 CET,Mon Nov 29 00:02:54 CET,0.0 0.733 1.054 1.276 1.452 1.634 1.8 1.941 2.191 2.297 2.395 2.461 2.666 2.75 2.896 3.031 3.179 3.25 3.372 3.495 3.658 3.766 3.877 4.021 4.15 4.283 4.421 4.554 4.719 4.864 5.003 5.16 5.314 5.474 5.64 5.806 5.949 6.093 6.237 6.385 6.554 6.737 6.902 7.018 7.129 7.231 7.252 7.126 6.782 6.102 4.754 2.856 1.099 -0.435 -1.724 -2.86 -3.853 -4.739 -5.504 -6.283 -6.943 -7.53 -8.086 -8.588 -9.059 -9.521 -9.996 -10.404 -10.758 -11.12 -11.51 -11.845 -12.189 -12.536 -12.807 -13.091 -13.381 -13.675 -13.982 -14.204 -14.422 -14.766 -15.0 -15.233 -15.355 -15.592 -15.834 -16.094 -16.223 -16.494 -16.64 -16.794 -16.95 -17.271 -17.457 -17.652 -17.862 -18.092 -18.355 -18.683 -19.577 -7 ,19535 ,TETRA ,17607448,Sun Nov 28 22:08:09 CET,Mon Nov 29 00:02:40 CET,0.0 0.394 0.597 0.758 0.914 1.075 1.205 1.305 1.491 1.578 1.665 1.726 1.934 2.018 2.177 2.329 2.469 2.534 2.661 2.787 2.964 3.087 3.21 3.378 3.53 3.666 3.791 3.921 4.084 4.236 4.402 4.601 4.776 4.934 5.118 5.312 5.489 5.68 5.858 6.02 6.172 6.318 6.447 6.562 6.659 6.672 6.63 6.5 6.202 5.586 4.217 2.244 0.51 -0.926 -2.188 -3.326 -4.301 -5.202 -6.003 -6.842 -7.572 -8.206 -8.789 -9.316 -9.793 -10.232 -10.707 -11.128 -11.474 -11.834 -12.215 -12.526 -12.844 -13.185 -13.457 -13.728 -14.011 -14.309 -14.616 -14.82 -15.025 -15.365 -15.614 -15.875 -16.009 -16.308 -16.622 -16.933 -17.102 -17.404 -17.613 -17.796 -17.989 -18.407 -18.652 -18.907 -19.176 -19.478 -19.817 -20.257 -21.348 -8 ,24875 ,TETRA ,17607449,Sun Nov 28 22:08:11 CET,Mon Nov 29 00:03:38 CET,0.0 0.91 1.244 1.494 1.703 1.903 2.093 2.262 2.538 2.665 2.788 2.895 3.107 3.197 3.375 3.532 3.672 3.738 3.869 3.993 4.161 4.272 4.385 4.529 4.66 4.787 4.908 5.02 5.15 5.285 5.419 5.566 5.703 5.841 5.991 6.135 6.279 6.482 6.698 6.867 7.018 7.173 7.345 7.475 7.565 7.6 7.568 7.428 7.079 6.394 5.019 3.188 1.545 0.083 -1.15 -2.26 -3.259 -4.156 -4.927 -5.685 -6.33 -6.908 -7.461 -7.975 -8.446 -8.862 -9.305 -9.708 -10.053 -10.411 -10.781 -11.089 -11.405 -11.715 -11.949 -12.208 -12.484 -12.778 -13.076 -13.27 -13.467 -13.79 -14.037 -14.315 -14.464 -14.769 -15.1 -15.438 -15.601 -15.9 -16.09 -16.26 -16.445 -16.817 -17.025 -17.289 -17.559 -17.823 -18.166 -18.629 -19.802 -9 ,15315 ,TETRA ,17607450,Sun Nov 28 22:08:10 CET,Mon Nov 29 00:03:54 CET,0.0 0.457 0.713 0.941 1.121 1.283 1.435 1.558 1.788 1.914 2.031 2.102 2.291 2.37 2.536 2.694 2.845 2.915 3.055 3.193 3.39 3.506 3.608 3.762 3.923 4.068 4.189 4.309 4.463 4.614 4.755 4.912 5.065 5.208 5.364 5.532 5.692 5.843 5.97 6.112 6.256 6.408 6.571 6.696 6.793 6.864 6.888 6.746 6.4 5.697 4.301 2.431 0.7 -0.792 -2.035 -3.16 -4.174 -5.105 -5.896 -6.647 -7.299 -7.878 -8.417 -8.937 -9.437 -9.903 -10.382 -10.799 -11.149 -11.508 -11.881 -12.205 -12.543 -12.875 -13.144 -13.44 -13.738 -14.034 -14.324 -14.517 -14.717 -15.047 -15.302 -15.565 -15.693 -15.963 -16.24 -16.512 -16.65 -16.933 -17.153 -17.358 -17.576 -18.034 -18.285 -18.576 -18.876 -19.207 -19.576 -19.998 -21.413 -10 ,32689 ,TETRA ,17607451,Sun Nov 28 22:09:06 CET,Mon Nov 29 00:05:27 CET,0.0 0.586 0.945 1.277 1.528 1.73 1.901 2.05 2.317 2.439 2.556 2.672 2.892 2.995 3.202 3.39 3.545 3.613 3.746 3.87 4.031 4.137 4.242 4.391 4.534 4.657 4.767 4.895 5.058 5.189 5.323 5.494 5.638 5.764 5.903 6.048 6.186 6.333 6.472 6.608 6.749 6.892 7.033 7.12 7.171 7.201 7.152 7.009 6.678 5.974 4.526 2.597 0.933 -0.554 -1.859 -3.055 -4.084 -4.986 -5.78 -6.559 -7.221 -7.801 -8.351 -8.866 -9.342 -9.777 -10.233 -10.64 -10.993 -11.358 -11.726 -12.031 -12.361 -12.697 -12.957 -13.243 -13.548 -13.847 -14.13 -14.323 -14.516 -14.841 -15.094 -15.339 -15.457 -15.702 -15.961 -16.231 -16.379 -16.67 -16.864 -17.037 -17.22 -17.623 -17.85 -18.094 -18.379 -18.726 -19.079 -19.562 -21.092 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index d2e1731b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13474 ,KEBNE ,17027782,Wed Dec 22 17:59:42 CET,Wed Dec 22 19:40:19 CET,0.0 1.873 2.573 3.055 3.436 3.788 4.113 4.419 4.96 5.198 5.428 5.739 6.03 6.198 6.513 6.81 7.087 7.221 7.474 7.712 8.044 8.254 8.459 8.768 9.072 9.354 9.625 9.884 10.212 10.533 10.849 11.233 11.585 11.899 12.262 12.686 13.086 13.509 13.944 14.404 14.888 15.426 16.028 16.621 17.322 17.959 18.534 19.138 19.635 19.82 19.403 18.156 16.726 15.268 13.907 12.666 11.531 10.51 9.611 8.681 7.888 7.164 6.461 5.792 5.158 4.565 3.944 3.415 2.976 2.51 2.005 1.595 1.177 0.74 0.401 0.052 -0.307 -0.679 -1.059 -1.339 -1.631 -2.085 -2.399 -2.734 -2.919 -3.313 -3.688 -4.067 -4.286 -4.63 -4.969 -5.222 -5.486 -6.052 -6.363 -6.695 -7.075 -7.537 -8.078 -8.8 -12.033 -2 ,23996 ,KEBNE ,17027783,Wed Dec 22 17:59:42 CET,Wed Dec 22 19:39:58 CET,0.0 1.369 1.898 2.3 2.634 2.92 3.201 3.488 4.021 4.249 4.457 4.746 5.026 5.188 5.509 5.831 6.144 6.294 6.586 6.851 7.215 7.452 7.668 7.952 8.227 8.511 8.797 9.067 9.407 9.739 10.059 10.438 10.796 11.124 11.497 11.913 12.3 12.731 13.206 13.682 14.159 14.705 15.283 15.792 16.366 16.971 17.591 18.125 18.487 18.608 18.124 16.838 15.346 13.741 12.237 10.929 9.776 8.692 7.773 6.863 6.053 5.317 4.604 3.93 3.304 2.713 2.111 1.612 1.165 0.678 0.211 -0.16 -0.569 -1.032 -1.406 -1.779 -2.158 -2.548 -2.953 -3.221 -3.486 -3.942 -4.262 -4.584 -4.754 -5.106 -5.465 -5.838 -6.036 -6.361 -6.666 -6.897 -7.127 -7.714 -8.073 -8.468 -8.905 -9.402 -10.025 -10.854 -13.708 -3 ,26948 ,KEBNE ,17027784,Wed Dec 22 17:59:42 CET,Wed Dec 22 19:40:27 CET,0.0 2.255 2.845 3.294 3.69 4.057 4.393 4.703 5.281 5.548 5.784 6.082 6.374 6.548 6.872 7.189 7.494 7.642 7.944 8.226 8.611 8.868 9.113 9.458 9.79 10.103 10.42 10.735 11.104 11.45 11.799 12.221 12.623 12.998 13.417 13.871 14.304 14.789 15.302 15.813 16.317 16.887 17.537 18.179 18.923 19.682 20.451 21.058 21.441 21.7 21.305 19.891 18.34 16.812 15.366 14.089 12.999 11.995 11.124 10.212 9.408 8.698 8.007 7.357 6.777 6.255 5.706 5.213 4.784 4.324 3.828 3.421 3.002 2.555 2.192 1.814 1.422 1.007 0.576 0.268 -0.061 -0.582 -0.923 -1.263 -1.438 -1.798 -2.173 -2.552 -2.753 -3.075 -3.369 -3.582 -3.811 -4.309 -4.598 -4.938 -5.328 -5.762 -6.252 -6.964 -9.666 -4 ,9089 ,KEBNE ,17027785,Wed Dec 22 18:06:58 CET,Wed Dec 22 19:45:58 CET,0.0 2.462 3.073 3.535 3.9 4.229 4.546 4.852 5.386 5.607 5.812 6.094 6.39 6.586 6.943 7.292 7.611 7.757 8.043 8.309 8.667 8.899 9.136 9.483 9.813 10.128 10.441 10.767 11.163 11.519 11.87 12.265 12.627 13.003 13.432 13.913 14.391 14.898 15.435 15.999 16.548 17.089 17.699 18.282 18.917 19.568 20.153 20.625 21.037 21.181 20.481 18.999 17.347 15.749 14.343 13.015 11.851 10.812 9.876 8.914 8.087 7.345 6.652 5.991 5.353 4.776 4.179 3.632 3.142 2.648 2.141 1.716 1.277 0.801 0.433 0.055 -0.344 -0.749 -1.17 -1.47 -1.782 -2.241 -2.549 -2.894 -3.081 -3.448 -3.842 -4.281 -4.508 -4.865 -5.226 -5.473 -5.725 -6.296 -6.621 -6.957 -7.327 -7.769 -8.289 -8.966 -11.299 -5 ,32223 ,KEBNE ,17027786,Wed Dec 22 18:09:03 CET,Wed Dec 22 19:49:52 CET,0.0 1.533 2.145 2.623 3.029 3.392 3.705 4.001 4.57 4.826 5.068 5.379 5.662 5.834 6.184 6.525 6.825 6.966 7.247 7.522 7.908 8.156 8.381 8.695 9.007 9.307 9.602 9.895 10.257 10.615 10.965 11.367 11.752 12.125 12.54 12.973 13.365 13.781 14.245 14.717 15.179 15.694 16.267 16.813 17.424 18.048 18.697 19.267 19.639 19.843 19.295 17.808 16.26 14.757 13.364 12.073 10.901 9.828 8.874 7.935 7.192 6.53 5.885 5.23 4.565 3.974 3.391 2.878 2.433 1.989 1.525 1.106 0.67 0.231 -0.124 -0.49 -0.859 -1.26 -1.683 -1.972 -2.273 -2.739 -3.066 -3.401 -3.578 -3.941 -4.295 -4.706 -4.93 -5.271 -5.633 -5.895 -6.157 -6.738 -7.042 -7.353 -7.707 -8.134 -8.668 -9.285 -12.746 -6 ,8532 ,KEBNE ,17027787,Wed Dec 22 18:09:03 CET,Wed Dec 22 19:48:03 CET,0.0 1.65 2.152 2.593 2.972 3.286 3.575 3.842 4.331 4.557 4.76 5.049 5.329 5.493 5.839 6.166 6.439 6.574 6.851 7.119 7.513 7.756 7.985 8.316 8.637 8.944 9.232 9.516 9.888 10.252 10.586 10.967 11.322 11.661 12.063 12.52 12.949 13.425 13.907 14.398 14.943 15.543 16.19 16.764 17.381 18.035 18.72 19.326 19.887 20.297 19.944 18.466 16.767 15.157 13.636 12.192 10.937 9.865 8.949 7.988 7.141 6.384 5.651 4.969 4.353 3.804 3.241 2.742 2.31 1.853 1.374 0.981 0.579 0.153 -0.178 -0.513 -0.869 -1.251 -1.643 -1.905 -2.173 -2.594 -2.879 -3.183 -3.346 -3.68 -4.044 -4.437 -4.638 -4.986 -5.345 -5.58 -5.825 -6.407 -6.739 -7.126 -7.593 -8.1 -8.698 -9.545 -13.114 -7 ,2944 ,KEBNE ,17027788,Wed Dec 22 18:09:03 CET,Wed Dec 22 19:49:21 CET,0.0 2.258 2.903 3.387 3.782 4.12 4.442 4.725 5.226 5.451 5.66 5.946 6.241 6.438 6.805 7.134 7.463 7.623 7.917 8.199 8.596 8.857 9.11 9.452 9.767 10.066 10.351 10.632 11.007 11.336 11.613 11.944 12.279 12.628 13.028 13.46 13.868 14.297 14.747 15.214 15.684 16.179 16.754 17.365 18.069 18.786 19.513 20.189 20.696 20.85 20.154 18.568 16.986 15.452 14.006 12.628 11.348 10.2 9.252 8.305 7.451 6.664 5.926 5.231 4.575 3.965 3.317 2.752 2.283 1.802 1.283 0.853 0.421 -0.051 -0.419 -0.773 -1.128 -1.509 -1.931 -2.216 -2.491 -2.943 -3.275 -3.602 -3.771 -4.145 -4.542 -4.93 -5.132 -5.473 -5.812 -6.047 -6.298 -6.878 -7.203 -7.572 -8.005 -8.463 -9.045 -9.974 -13.344 -8 ,14932 ,KEBNE ,17027789,Wed Dec 22 18:09:03 CET,Wed Dec 22 19:48:30 CET,0.0 1.999 2.623 2.982 3.267 3.526 3.779 4.006 4.38 4.545 4.705 4.902 5.148 5.29 5.57 5.836 6.073 6.183 6.389 6.596 6.903 7.1 7.299 7.593 7.889 8.183 8.436 8.666 8.971 9.253 9.505 9.785 10.067 10.342 10.64 10.99 11.351 11.758 12.16 12.548 12.939 13.346 13.763 14.153 14.546 14.897 15.291 15.577 15.713 15.574 14.503 12.621 10.818 9.096 7.613 6.278 5.064 3.992 3.065 2.124 1.306 0.582 -0.09 -0.735 -1.325 -1.856 -2.415 -2.906 -3.329 -3.779 -4.245 -4.626 -5.024 -5.445 -5.78 -6.133 -6.499 -6.869 -7.266 -7.552 -7.842 -8.279 -8.576 -8.89 -9.053 -9.389 -9.755 -10.146 -10.35 -10.692 -10.99 -11.2 -11.452 -12.024 -12.348 -12.705 -13.072 -13.48 -14.028 -14.839 -21.489 -9 ,14909 ,KEBNE ,17027790,Wed Dec 22 18:09:03 CET,Wed Dec 22 19:48:00 CET,0.0 1.93 2.639 3.119 3.519 3.895 4.221 4.504 5.047 5.288 5.498 5.769 6.048 6.224 6.548 6.845 7.132 7.279 7.589 7.896 8.325 8.579 8.831 9.208 9.557 9.888 10.198 10.49 10.864 11.224 11.544 11.918 12.29 12.63 13.006 13.438 13.872 14.358 14.863 15.359 15.85 16.384 16.975 17.58 18.252 18.894 19.525 20.143 20.657 20.957 20.587 19.305 17.912 16.503 15.119 13.74 12.542 11.413 10.39 9.39 8.551 7.825 7.11 6.424 5.796 5.232 4.652 4.126 3.672 3.197 2.69 2.26 1.792 1.312 0.952 0.575 0.198 -0.165 -0.544 -0.812 -1.102 -1.59 -1.916 -2.238 -2.405 -2.736 -3.095 -3.516 -3.747 -4.09 -4.403 -4.644 -4.88 -5.4 -5.703 -6.042 -6.457 -6.939 -7.498 -8.312 -10.895 -10 ,29514 ,KEBNE ,17027791,Wed Dec 22 18:09:03 CET,Wed Dec 22 19:47:51 CET,0.0 1.715 2.443 3.02 3.432 3.741 4.028 4.3 4.802 5.014 5.213 5.504 5.803 5.988 6.322 6.639 6.943 7.096 7.389 7.648 7.994 8.226 8.464 8.81 9.139 9.455 9.749 10.03 10.403 10.755 11.08 11.468 11.842 12.184 12.593 13.08 13.522 14.002 14.491 14.942 15.414 15.933 16.493 17.014 17.594 18.26 18.971 19.661 20.317 20.711 20.321 19.024 17.443 15.862 14.459 13.145 11.957 10.823 9.851 8.892 8.032 7.274 6.593 5.969 5.373 4.811 4.239 3.737 3.297 2.827 2.313 1.886 1.447 0.99 0.635 0.278 -0.09 -0.485 -0.92 -1.219 -1.512 -1.95 -2.275 -2.624 -2.793 -3.145 -3.532 -3.924 -4.125 -4.469 -4.81 -5.077 -5.368 -5.997 -6.33 -6.67 -7.06 -7.554 -8.106 -8.92 -13.927 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index 54e4674d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21527 ,TETRA ,17607452,Sun Nov 28 22:09:06 CET,Mon Nov 29 00:00:59 CET,0.0 1.042 1.42 1.695 1.944 2.177 2.377 2.535 2.815 2.946 3.067 3.172 3.375 3.476 3.652 3.815 3.96 4.027 4.158 4.281 4.447 4.553 4.654 4.804 4.964 5.114 5.242 5.367 5.514 5.636 5.764 5.902 6.005 6.102 6.199 6.299 6.413 6.536 6.65 6.775 6.907 7.006 7.078 7.106 7.065 6.992 6.776 6.329 5.675 4.543 2.284 -0.615 -3.031 -5.111 -6.886 -8.429 -9.744 -10.924 -11.935 -12.943 -13.801 -14.565 -15.288 -15.954 -16.565 -17.121 -17.679 -18.174 -18.621 -19.093 -19.562 -19.94 -20.336 -20.767 -21.113 -21.457 -21.801 -22.162 -22.542 -22.79 -23.049 -23.439 -23.685 -23.953 -24.093 -24.37 -24.696 -25.055 -25.227 -25.54 -25.767 -25.961 -26.174 -26.657 -26.957 -27.303 -27.712 -28.198 -28.737 -29.445 -31.372 -2 ,12252 ,TETRA ,17607453,Sun Nov 28 22:09:06 CET,Sun Nov 28 23:57:37 CET,0.0 1.626 2.055 2.381 2.616 2.843 3.058 3.25 3.605 3.754 3.875 3.994 4.197 4.288 4.46 4.633 4.822 4.909 5.063 5.209 5.412 5.533 5.643 5.8 5.944 6.085 6.224 6.346 6.485 6.616 6.735 6.859 6.973 7.091 7.232 7.379 7.514 7.648 7.776 7.882 7.935 7.974 7.985 7.953 7.87 7.761 7.559 7.138 6.392 5.032 2.562 -0.373 -2.772 -4.789 -6.536 -8.106 -9.45 -10.625 -11.648 -12.683 -13.524 -14.245 -14.928 -15.561 -16.167 -16.735 -17.31 -17.805 -18.241 -18.683 -19.11 -19.458 -19.811 -20.172 -20.465 -20.779 -21.092 -21.409 -21.75 -21.98 -22.212 -22.594 -22.879 -23.162 -23.309 -23.62 -23.936 -24.27 -24.444 -24.768 -25.033 -25.25 -25.475 -25.934 -26.195 -26.475 -26.777 -27.135 -27.535 -28.043 -29.627 -3 ,15483 ,TETRA ,17607454,Sun Nov 28 22:10:07 CET,Sun Nov 28 23:53:57 CET,0.0 1.599 2.038 2.343 2.584 2.798 3.012 3.204 3.553 3.717 3.859 3.986 4.191 4.281 4.446 4.6 4.743 4.83 5.014 5.159 5.349 5.478 5.606 5.781 5.947 6.109 6.264 6.406 6.581 6.747 6.899 7.071 7.221 7.366 7.513 7.619 7.696 7.76 7.811 7.887 7.979 8.052 8.099 8.086 7.979 7.778 7.453 6.936 6.103 4.794 2.528 -0.269 -2.513 -4.375 -5.932 -7.375 -8.653 -9.732 -10.651 -11.579 -12.367 -13.087 -13.786 -14.425 -15.021 -15.578 -16.153 -16.659 -17.106 -17.556 -18.004 -18.378 -18.758 -19.163 -19.476 -19.792 -20.123 -20.464 -20.826 -21.066 -21.308 -21.692 -21.969 -22.258 -22.397 -22.688 -22.998 -23.326 -23.505 -23.823 -24.051 -24.245 -24.453 -24.94 -25.21 -25.473 -25.759 -26.116 -26.549 -27.082 -29.895 -4 ,29295 ,TETRA ,17607455,Sun Nov 28 22:09:07 CET,Mon Nov 29 00:05:15 CET,0.0 1.471 1.935 2.267 2.529 2.722 2.888 3.051 3.355 3.49 3.615 3.746 3.953 4.053 4.252 4.431 4.596 4.677 4.825 4.966 5.156 5.276 5.388 5.54 5.687 5.823 5.956 6.081 6.216 6.328 6.449 6.603 6.749 6.877 7.001 7.123 7.232 7.345 7.448 7.559 7.663 7.74 7.796 7.816 7.783 7.692 7.47 7.02 6.251 4.966 2.625 -0.203 -2.511 -4.454 -6.085 -7.537 -8.793 -9.88 -10.795 -11.709 -12.516 -13.241 -13.905 -14.511 -15.068 -15.583 -16.133 -16.615 -17.05 -17.514 -17.968 -18.336 -18.718 -19.124 -19.445 -19.754 -20.072 -20.403 -20.725 -20.967 -21.235 -21.647 -21.932 -22.229 -22.38 -22.664 -22.964 -23.272 -23.432 -23.74 -23.971 -24.168 -24.373 -24.842 -25.088 -25.334 -25.636 -26.01 -26.41 -26.963 -28.868 -5 ,13556 ,TETRA ,17607456,Sun Nov 28 22:09:07 CET,Mon Nov 29 00:07:00 CET,0.0 1.352 1.848 2.197 2.426 2.602 2.737 2.879 3.145 3.268 3.381 3.47 3.666 3.752 3.931 4.117 4.295 4.381 4.531 4.656 4.843 4.968 5.085 5.236 5.369 5.494 5.602 5.682 5.794 5.91 6.004 6.12 6.233 6.33 6.426 6.526 6.616 6.703 6.796 6.883 6.953 6.976 6.96 6.917 6.803 6.603 6.27 5.793 5.067 3.848 1.615 -1.2 -3.57 -5.603 -7.318 -8.819 -10.131 -11.296 -12.233 -13.154 -13.983 -14.713 -15.383 -16.008 -16.57 -17.082 -17.623 -18.1 -18.53 -18.982 -19.45 -19.814 -20.164 -20.543 -20.855 -21.209 -21.586 -21.957 -22.329 -22.58 -22.83 -23.237 -23.529 -23.806 -23.94 -24.222 -24.525 -24.861 -25.043 -25.359 -25.631 -25.847 -26.062 -26.547 -26.855 -27.209 -27.608 -28.029 -28.464 -29.023 -30.649 -6 ,26888 ,TETRA ,17607457,Sun Nov 28 22:09:07 CET,Mon Nov 29 00:04:44 CET,0.0 1.131 1.495 1.776 1.995 2.182 2.338 2.472 2.726 2.849 2.962 3.058 3.26 3.344 3.502 3.669 3.836 3.913 4.06 4.194 4.377 4.505 4.638 4.824 4.984 5.113 5.228 5.331 5.461 5.58 5.701 5.867 6.025 6.185 6.383 6.586 6.771 6.951 7.099 7.221 7.292 7.323 7.325 7.318 7.318 7.282 7.123 6.72 6.008 4.816 2.655 -0.181 -2.671 -4.805 -6.588 -8.121 -9.439 -10.618 -11.612 -12.574 -13.417 -14.185 -14.9 -15.567 -16.189 -16.741 -17.306 -17.831 -18.276 -18.737 -19.233 -19.644 -20.063 -20.481 -20.806 -21.14 -21.486 -21.843 -22.208 -22.472 -22.741 -23.115 -23.357 -23.599 -23.731 -24.039 -24.37 -24.706 -24.874 -25.181 -25.443 -25.655 -25.871 -26.358 -26.611 -26.872 -27.152 -27.469 -27.902 -28.498 -30.384 -7 ,5124 ,TETRA ,17607458,Sun Nov 28 22:09:07 CET,Mon Nov 29 00:04:38 CET,0.0 1.209 1.565 1.868 2.137 2.342 2.506 2.674 2.995 3.121 3.23 3.329 3.526 3.612 3.788 3.965 4.11 4.181 4.322 4.452 4.65 4.765 4.868 5.014 5.145 5.271 5.394 5.515 5.664 5.801 5.93 6.064 6.178 6.282 6.405 6.55 6.672 6.768 6.847 6.918 6.953 6.941 6.917 6.91 6.899 6.816 6.609 6.253 5.56 4.379 2.197 -0.633 -3.001 -4.975 -6.685 -8.224 -9.515 -10.611 -11.545 -12.504 -13.32 -14.03 -14.725 -15.374 -15.95 -16.464 -16.996 -17.483 -17.909 -18.348 -18.799 -19.165 -19.539 -19.922 -20.219 -20.526 -20.836 -21.177 -21.553 -21.819 -22.086 -22.481 -22.752 -23.032 -23.174 -23.462 -23.782 -24.133 -24.308 -24.62 -24.9 -25.112 -25.326 -25.805 -26.077 -26.363 -26.673 -27.089 -27.577 -28.133 -29.984 -8 ,24194 ,TETRA ,17607459,Sun Nov 28 22:09:09 CET,Mon Nov 29 00:04:48 CET,0.0 1.689 2.15 2.519 2.799 3.024 3.221 3.368 3.619 3.737 3.861 4.009 4.239 4.35 4.554 4.744 4.904 4.987 5.143 5.274 5.459 5.575 5.689 5.851 5.988 6.106 6.224 6.328 6.479 6.633 6.766 6.93 7.07 7.186 7.314 7.456 7.575 7.684 7.779 7.844 7.89 7.943 8.005 8.015 7.974 7.87 7.663 7.217 6.348 5.038 2.814 -0.065 -2.536 -4.593 -6.315 -7.922 -9.33 -10.537 -11.555 -12.558 -13.382 -14.104 -14.79 -15.427 -16.016 -16.562 -17.126 -17.617 -18.047 -18.492 -18.973 -19.369 -19.755 -20.17 -20.499 -20.827 -21.164 -21.52 -21.904 -22.172 -22.45 -22.885 -23.179 -23.463 -23.606 -23.904 -24.223 -24.57 -24.767 -25.114 -25.385 -25.607 -25.828 -26.246 -26.472 -26.713 -27.029 -27.402 -27.775 -28.257 -29.868 -9 ,4462 ,TETRA ,17607460,Sun Nov 28 22:09:07 CET,Mon Nov 29 00:04:13 CET,0.0 1.598 2.01 2.288 2.491 2.671 2.845 3.007 3.288 3.413 3.524 3.638 3.851 3.944 4.114 4.277 4.427 4.495 4.636 4.785 4.989 5.114 5.227 5.385 5.535 5.663 5.796 5.916 6.075 6.24 6.383 6.549 6.704 6.837 6.993 7.186 7.354 7.512 7.631 7.713 7.791 7.878 7.929 7.921 7.869 7.756 7.558 7.171 6.471 5.232 2.883 -0.053 -2.469 -4.492 -6.19 -7.744 -9.08 -10.253 -11.249 -12.229 -13.072 -13.815 -14.533 -15.197 -15.779 -16.299 -16.839 -17.342 -17.798 -18.261 -18.711 -19.073 -19.46 -19.871 -20.205 -20.548 -20.895 -21.263 -21.644 -21.896 -22.15 -22.552 -22.826 -23.122 -23.275 -23.59 -23.916 -24.231 -24.396 -24.708 -24.943 -25.145 -25.385 -25.929 -26.194 -26.473 -26.776 -27.086 -27.445 -27.937 -29.189 -10 ,27894 ,TETRA ,17607461,Sun Nov 28 22:09:07 CET,Mon Nov 29 00:05:04 CET,0.0 1.601 2.221 2.556 2.763 2.97 3.163 3.337 3.638 3.759 3.866 3.989 4.205 4.306 4.519 4.731 4.905 4.987 5.143 5.285 5.502 5.631 5.747 5.907 6.04 6.157 6.276 6.407 6.573 6.713 6.841 6.984 7.108 7.223 7.349 7.499 7.617 7.729 7.853 7.957 8.046 8.118 8.173 8.212 8.177 8.048 7.799 7.376 6.623 5.355 3.004 -0.011 -2.43 -4.519 -6.39 -8.027 -9.408 -10.613 -11.609 -12.597 -13.452 -14.21 -14.902 -15.511 -16.07 -16.604 -17.162 -17.634 -18.02 -18.423 -18.852 -19.214 -19.604 -20.004 -20.302 -20.606 -20.909 -21.222 -21.555 -21.796 -22.063 -22.482 -22.754 -23.039 -23.19 -23.509 -23.827 -24.142 -24.315 -24.62 -24.846 -25.053 -25.281 -25.765 -26.013 -26.282 -26.599 -26.946 -27.341 -27.889 -30.247 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index 85a01495..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21112 ,TETRA ,17607462,Sun Nov 28 22:09:08 CET,Mon Nov 29 00:06:17 CET,0.0 1.047 1.436 1.771 2.07 2.338 2.566 2.77 3.149 3.327 3.492 3.691 3.943 4.067 4.295 4.507 4.704 4.8 5.009 5.217 5.49 5.664 5.84 6.094 6.34 6.582 6.821 7.051 7.334 7.616 7.879 8.165 8.456 8.749 9.091 9.463 9.822 10.193 10.55 10.916 11.304 11.761 12.283 12.791 13.359 13.971 14.682 15.479 16.415 17.414 18.186 18.277 17.896 17.339 16.757 16.228 15.688 15.134 14.636 14.096 13.64 13.21 12.781 12.395 12.048 11.732 11.382 11.072 10.803 10.519 10.229 9.986 9.711 9.417 9.183 8.926 8.673 8.417 8.128 7.918 7.714 7.408 7.181 6.939 6.824 6.594 6.348 6.092 5.957 5.707 5.503 5.335 5.149 4.717 4.473 4.228 3.96 3.664 3.302 2.783 1.586 -2 ,25123 ,TETRA ,17607463,Sun Nov 28 22:09:08 CET,Mon Nov 29 00:06:29 CET,0.0 0.655 0.983 1.237 1.462 1.661 1.862 2.042 2.365 2.526 2.687 2.853 3.085 3.199 3.42 3.631 3.831 3.932 4.123 4.311 4.588 4.768 4.93 5.161 5.384 5.6 5.811 6.004 6.251 6.509 6.769 7.074 7.363 7.65 7.971 8.318 8.66 9.041 9.461 9.9 10.362 10.857 11.414 11.965 12.577 13.209 13.885 14.623 15.44 16.209 16.642 16.479 16.04 15.426 14.779 14.16 13.571 13.002 12.455 11.875 11.388 10.933 10.512 10.113 9.734 9.389 9.016 8.683 8.388 8.061 7.712 7.435 7.147 6.835 6.599 6.359 6.096 5.82 5.54 5.351 5.151 4.836 4.606 4.365 4.25 3.996 3.721 3.415 3.25 2.979 2.739 2.553 2.357 1.946 1.709 1.458 1.196 0.875 0.495 -0.032 -1.44 -3 ,32371 ,TETRA ,17607464,Sun Nov 28 22:09:10 CET,Mon Nov 29 00:06:25 CET,0.0 0.87 1.279 1.551 1.748 1.934 2.126 2.299 2.607 2.758 2.92 3.131 3.397 3.545 3.823 4.078 4.309 4.42 4.642 4.861 5.179 5.378 5.556 5.813 6.06 6.296 6.539 6.77 7.059 7.327 7.558 7.851 8.156 8.44 8.757 9.117 9.455 9.829 10.222 10.589 10.97 11.407 11.927 12.418 12.953 13.546 14.204 14.955 15.787 16.59 17.173 17.131 16.729 16.155 15.526 14.888 14.287 13.728 13.241 12.72 12.248 11.822 11.404 11.003 10.607 10.238 9.858 9.521 9.237 8.943 8.634 8.375 8.107 7.831 7.618 7.398 7.161 6.883 6.571 6.367 6.175 5.871 5.651 5.413 5.282 5.018 4.763 4.49 4.343 4.092 3.862 3.688 3.516 3.135 2.915 2.661 2.356 2.032 1.672 1.218 -0.234 -4 ,4808 ,TETRA ,17607465,Sun Nov 28 22:09:08 CET,Mon Nov 29 00:06:15 CET,0.0 0.991 1.337 1.607 1.864 2.069 2.235 2.402 2.731 2.884 3.036 3.182 3.418 3.544 3.788 4.015 4.23 4.334 4.535 4.741 5.036 5.22 5.386 5.619 5.838 6.052 6.275 6.496 6.764 7.011 7.268 7.59 7.897 8.188 8.532 8.914 9.251 9.604 9.968 10.345 10.732 11.165 11.677 12.171 12.718 13.319 14.039 14.851 15.737 16.61 17.169 17.164 16.811 16.275 15.698 15.052 14.434 13.885 13.372 12.821 12.359 11.936 11.526 11.128 10.728 10.362 9.983 9.63 9.323 8.996 8.668 8.411 8.136 7.843 7.596 7.336 7.082 6.821 6.525 6.311 6.093 5.741 5.503 5.257 5.128 4.859 4.586 4.309 4.159 3.897 3.668 3.485 3.276 2.836 2.615 2.375 2.098 1.776 1.403 0.968 -0.23 -5 ,28106 ,TETRA ,17607466,Sun Nov 28 22:09:09 CET,Mon Nov 29 00:06:16 CET,0.0 0.749 1.146 1.427 1.648 1.852 2.05 2.231 2.591 2.742 2.887 3.06 3.296 3.426 3.671 3.913 4.154 4.265 4.473 4.663 4.919 5.086 5.259 5.517 5.759 5.984 6.191 6.39 6.67 6.938 7.196 7.527 7.84 8.123 8.439 8.79 9.144 9.526 9.924 10.343 10.769 11.253 11.836 12.425 13.045 13.65 14.312 15.043 15.785 16.503 16.959 16.789 16.395 15.863 15.275 14.707 14.139 13.603 13.157 12.675 12.215 11.805 11.395 10.981 10.597 10.244 9.878 9.539 9.242 8.928 8.582 8.29 8.006 7.718 7.485 7.24 6.997 6.748 6.463 6.261 6.06 5.74 5.521 5.291 5.167 4.916 4.654 4.345 4.181 3.92 3.685 3.509 3.316 2.863 2.602 2.328 2.02 1.64 1.162 0.552 -1.218 -6 ,14498 ,TETRA ,17607467,Sun Nov 28 22:09:08 CET,Mon Nov 29 00:05:43 CET,0.0 0.886 1.237 1.561 1.821 2.043 2.251 2.427 2.729 2.881 3.024 3.174 3.417 3.545 3.781 4.001 4.223 4.329 4.523 4.702 4.95 5.113 5.281 5.518 5.735 5.956 6.179 6.389 6.66 6.927 7.19 7.497 7.794 8.093 8.425 8.774 9.091 9.449 9.845 10.271 10.72 11.203 11.746 12.252 12.802 13.41 14.109 14.837 15.601 16.34 16.785 16.577 16.032 15.481 14.943 14.404 13.913 13.442 13.009 12.563 12.157 11.775 11.407 11.063 10.74 10.427 10.076 9.742 9.446 9.142 8.813 8.533 8.254 7.959 7.722 7.471 7.194 6.897 6.605 6.41 6.213 5.908 5.689 5.45 5.327 5.075 4.788 4.474 4.324 4.062 3.753 3.528 3.289 2.811 2.547 2.259 1.966 1.622 1.23 0.613 -1.407 -7 ,31231 ,TETRA ,17607468,Sun Nov 28 22:09:10 CET,Mon Nov 29 00:05:41 CET,0.0 0.965 1.355 1.631 1.887 2.125 2.33 2.498 2.81 2.961 3.104 3.242 3.468 3.578 3.778 3.972 4.158 4.251 4.434 4.618 4.908 5.086 5.25 5.49 5.717 5.933 6.146 6.355 6.627 6.871 7.09 7.363 7.632 7.882 8.182 8.537 8.892 9.303 9.749 10.209 10.67 11.155 11.713 12.273 12.899 13.581 14.315 15.077 15.857 16.556 17.005 16.817 16.269 15.667 15.086 14.512 13.945 13.36 12.863 12.368 11.913 11.503 11.091 10.692 10.326 9.993 9.64 9.309 9.008 8.683 8.359 8.106 7.838 7.552 7.325 7.084 6.832 6.556 6.263 6.057 5.839 5.518 5.299 5.061 4.935 4.682 4.414 4.132 3.979 3.717 3.505 3.332 3.143 2.748 2.521 2.26 1.968 1.656 1.294 0.775 -0.755 -8 ,28728 ,TETRA ,17607469,Sun Nov 28 22:09:08 CET,Mon Nov 29 00:05:40 CET,0.0 1.218 1.576 1.834 2.078 2.29 2.481 2.647 2.949 3.1 3.245 3.409 3.656 3.778 4.005 4.24 4.473 4.575 4.771 4.961 5.212 5.378 5.551 5.795 6.015 6.226 6.442 6.658 6.943 7.22 7.478 7.782 8.068 8.35 8.683 9.048 9.373 9.712 10.102 10.511 10.944 11.438 12.004 12.57 13.194 13.845 14.56 15.365 16.277 17.211 17.924 17.958 17.511 16.919 16.372 15.807 15.247 14.728 14.255 13.745 13.277 12.824 12.385 11.995 11.647 11.315 10.949 10.624 10.353 10.066 9.761 9.499 9.224 8.942 8.718 8.48 8.235 7.972 7.693 7.494 7.286 6.977 6.748 6.489 6.358 6.1 5.832 5.541 5.395 5.144 4.908 4.721 4.517 4.042 3.792 3.539 3.252 2.891 2.495 2.019 0.749 -9 ,28756 ,TETRA ,17607470,Sun Nov 28 22:09:08 CET,Mon Nov 29 00:07:06 CET,0.0 1.119 1.479 1.751 2.03 2.285 2.486 2.677 3.034 3.187 3.324 3.488 3.721 3.832 4.051 4.265 4.472 4.573 4.772 4.964 5.232 5.407 5.581 5.82 6.063 6.3 6.523 6.739 7.016 7.276 7.531 7.827 8.088 8.347 8.655 9.023 9.398 9.792 10.191 10.615 11.06 11.566 12.173 12.765 13.399 14.08 14.835 15.616 16.416 17.198 17.714 17.56 17.12 16.591 16.052 15.497 14.931 14.363 13.878 13.407 12.995 12.612 12.231 11.863 11.511 11.179 10.828 10.499 10.196 9.866 9.531 9.268 8.99 8.717 8.521 8.32 8.08 7.797 7.506 7.32 7.137 6.829 6.602 6.376 6.265 6.016 5.734 5.427 5.259 4.979 4.69 4.49 4.292 3.862 3.622 3.342 3.019 2.68 2.276 1.685 -0.099 -10 ,2484 ,TETRA ,17607471,Sun Nov 28 22:09:08 CET,Mon Nov 29 00:07:01 CET,0.0 1.048 1.418 1.726 2.0 2.238 2.454 2.642 3.022 3.206 3.376 3.586 3.839 3.981 4.249 4.504 4.747 4.862 5.083 5.284 5.553 5.731 5.899 6.143 6.387 6.616 6.837 7.047 7.313 7.572 7.832 8.149 8.437 8.706 9.016 9.386 9.754 10.13 10.528 10.94 11.344 11.796 12.336 12.875 13.495 14.189 14.951 15.726 16.549 17.305 17.77 17.64 17.185 16.538 15.881 15.287 14.722 14.186 13.683 13.143 12.665 12.225 11.79 11.384 10.993 10.637 10.277 9.941 9.649 9.332 8.996 8.728 8.453 8.183 7.974 7.763 7.555 7.309 7.049 6.864 6.645 6.299 6.061 5.826 5.704 5.437 5.157 4.855 4.693 4.42 4.155 3.96 3.755 3.277 3.011 2.739 2.448 2.095 1.642 1.026 -0.328 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index 3cf6e3a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23607 ,TETRA ,17607472,Sun Nov 28 22:09:10 CET,Mon Nov 29 00:06:19 CET,0.0 2.031 2.459 2.816 3.098 3.338 3.55 3.744 4.093 4.258 4.416 4.567 4.805 4.937 5.172 5.407 5.625 5.712 5.876 6.03 6.251 6.386 6.497 6.652 6.795 6.927 7.048 7.161 7.311 7.45 7.584 7.738 7.87 8.0 8.13 8.247 8.362 8.473 8.582 8.701 8.803 8.893 8.972 9.008 8.985 8.873 8.639 8.27 7.694 6.646 4.652 2.155 0.015 -1.828 -3.399 -4.819 -6.047 -7.132 -8.079 -9.033 -9.842 -10.555 -11.249 -11.903 -12.517 -13.075 -13.632 -14.133 -14.569 -15.027 -15.501 -15.873 -16.254 -16.703 -17.099 -17.502 -17.91 -18.361 -18.844 -19.153 -19.438 -19.927 -20.27 -20.609 -20.792 -21.169 -21.586 -22.023 -22.247 -22.613 -22.984 -23.276 -23.592 -24.279 -24.669 -25.083 -25.526 -26.056 -26.679 -27.432 -36.791 -2 ,27195 ,TETRA ,17607473,Sun Nov 28 22:09:09 CET,Mon Nov 29 00:06:45 CET,0.0 2.114 2.584 2.932 3.224 3.494 3.729 3.916 4.253 4.411 4.557 4.727 4.961 5.074 5.308 5.524 5.716 5.823 6.014 6.146 6.322 6.458 6.594 6.739 6.865 7.003 7.146 7.28 7.438 7.581 7.709 7.863 8.001 8.112 8.264 8.44 8.571 8.696 8.866 9.03 9.171 9.303 9.374 9.405 9.377 9.3 9.148 8.806 8.235 7.221 5.204 2.654 0.529 -1.325 -2.949 -4.428 -5.744 -6.904 -7.892 -8.896 -9.75 -10.502 -11.21 -11.867 -12.473 -13.045 -13.643 -14.133 -14.555 -15.004 -15.494 -15.924 -16.377 -16.855 -17.215 -17.587 -17.985 -18.4 -18.81 -19.086 -19.405 -19.908 -20.248 -20.622 -20.822 -21.254 -21.716 -22.192 -22.444 -22.836 -23.219 -23.507 -23.808 -24.484 -24.875 -25.286 -25.716 -26.23 -26.836 -27.559 -31.456 -3 ,15762 ,TETRA ,17607474,Sun Nov 28 22:09:09 CET,Mon Nov 29 00:06:27 CET,0.0 4.947 5.422 5.696 5.919 6.145 6.354 6.545 6.898 7.046 7.17 7.28 7.499 7.605 7.816 8.012 8.18 8.26 8.424 8.562 8.748 8.873 8.998 9.196 9.378 9.541 9.699 9.852 10.037 10.215 10.388 10.576 10.741 10.87 11.0 11.136 11.253 11.395 11.568 11.766 11.968 12.154 12.334 12.501 12.662 12.765 12.741 12.575 12.154 11.167 9.22 6.68 4.523 2.686 1.129 -0.263 -1.511 -2.625 -3.565 -4.497 -5.312 -6.061 -6.764 -7.419 -8.031 -8.585 -9.15 -9.631 -10.064 -10.547 -11.049 -11.454 -11.863 -12.285 -12.617 -12.963 -13.316 -13.68 -14.067 -14.327 -14.596 -15.024 -15.316 -15.619 -15.776 -16.1 -16.439 -16.803 -17.009 -17.358 -17.676 -17.918 -18.175 -18.718 -19.027 -19.375 -19.757 -20.211 -20.774 -21.547 -24.48 -4 ,29351 ,TETRA ,17607475,Sun Nov 28 22:09:09 CET,Mon Nov 29 00:05:22 CET,0.0 2.015 2.507 2.936 3.304 3.562 3.787 4.008 4.431 4.628 4.799 4.951 5.181 5.286 5.466 5.649 5.833 5.926 6.105 6.274 6.513 6.656 6.783 6.949 7.101 7.253 7.418 7.576 7.774 7.971 8.159 8.381 8.583 8.758 8.94 9.146 9.331 9.481 9.599 9.712 9.807 9.896 9.996 10.055 10.092 10.056 9.863 9.494 8.901 7.815 5.733 3.151 0.989 -0.873 -2.472 -3.898 -5.143 -6.276 -7.224 -8.12 -8.886 -9.572 -10.223 -10.834 -11.466 -12.074 -12.688 -13.263 -13.736 -14.182 -14.647 -15.027 -15.42 -15.861 -16.217 -16.575 -16.942 -17.34 -17.748 -18.022 -18.318 -18.792 -19.121 -19.467 -19.635 -19.946 -20.291 -20.686 -20.886 -21.218 -21.521 -21.762 -22.027 -22.629 -22.954 -23.284 -23.656 -24.057 -24.607 -25.529 -30.945 -5 ,8723 ,TETRA ,17607476,Sun Nov 28 22:09:12 CET,Mon Nov 29 00:06:00 CET,0.0 3.382 3.887 4.269 4.607 4.863 5.107 5.372 5.808 5.974 6.113 6.247 6.492 6.628 6.874 7.085 7.268 7.356 7.519 7.659 7.853 7.987 8.118 8.284 8.455 8.626 8.781 8.954 9.171 9.351 9.512 9.679 9.818 9.955 10.117 10.274 10.394 10.516 10.649 10.77 10.874 10.989 11.119 11.186 11.202 11.121 10.904 10.615 10.091 9.068 7.1 4.556 2.414 0.614 -0.951 -2.382 -3.643 -4.74 -5.675 -6.616 -7.419 -8.122 -8.786 -9.423 -10.024 -10.58 -11.146 -11.645 -12.07 -12.494 -12.961 -13.381 -13.817 -14.253 -14.617 -15.021 -15.42 -15.816 -16.265 -16.591 -16.923 -17.427 -17.755 -18.105 -18.293 -18.678 -19.068 -19.473 -19.688 -20.05 -20.465 -20.752 -21.054 -21.737 -22.103 -22.49 -22.95 -23.514 -24.173 -25.048 -29.982 -6 ,4634 ,TETRA ,17607477,Sun Nov 28 22:09:13 CET,Mon Nov 29 00:05:40 CET,0.0 2.774 3.182 3.48 3.722 3.929 4.135 4.31 4.602 4.744 4.868 4.981 5.206 5.31 5.527 5.726 5.895 5.974 6.122 6.27 6.49 6.635 6.766 6.948 7.105 7.234 7.373 7.514 7.694 7.853 7.98 8.136 8.302 8.473 8.672 8.879 9.076 9.28 9.487 9.684 9.863 10.059 10.262 10.432 10.506 10.44 10.27 9.937 9.318 8.226 6.254 3.823 1.742 -0.066 -1.626 -3.025 -4.199 -5.24 -6.133 -7.051 -7.89 -8.662 -9.396 -10.092 -10.759 -11.355 -11.968 -12.507 -12.957 -13.416 -13.895 -14.294 -14.697 -15.107 -15.441 -15.797 -16.164 -16.548 -16.929 -17.198 -17.493 -17.936 -18.222 -18.543 -18.718 -19.051 -19.426 -19.867 -20.09 -20.458 -20.818 -21.068 -21.368 -22.037 -22.378 -22.779 -23.228 -23.724 -24.413 -25.486 -31.527 -7 ,32056 ,TETRA ,17607478,Sun Nov 28 22:09:10 CET,Mon Nov 29 00:06:03 CET,0.0 3.373 3.935 4.292 4.571 4.792 4.958 5.129 5.485 5.66 5.811 5.981 6.231 6.352 6.589 6.81 7.008 7.106 7.295 7.466 7.704 7.843 7.962 8.114 8.244 8.383 8.516 8.639 8.793 8.931 9.056 9.216 9.387 9.562 9.763 9.972 10.159 10.339 10.529 10.698 10.862 11.029 11.183 11.342 11.495 11.563 11.496 11.227 10.655 9.621 7.628 5.1 2.955 1.132 -0.445 -1.874 -3.103 -4.196 -5.138 -6.078 -6.905 -7.658 -8.346 -9.001 -9.646 -10.238 -10.881 -11.476 -11.976 -12.48 -12.994 -13.417 -13.864 -14.332 -14.688 -15.047 -15.427 -15.82 -16.23 -16.512 -16.789 -17.23 -17.545 -17.869 -18.033 -18.374 -18.73 -19.111 -19.315 -19.649 -19.963 -20.236 -20.524 -21.132 -21.457 -21.815 -22.224 -22.675 -23.242 -24.05 -29.239 -8 ,23077 ,TETRA ,17607479,Sun Nov 28 22:09:12 CET,Mon Nov 29 00:06:14 CET,0.0 9.349 9.871 10.18 10.428 10.679 10.907 11.078 11.367 11.521 11.651 11.751 11.967 12.059 12.234 12.42 12.611 12.699 12.87 13.019 13.221 13.357 13.481 13.637 13.772 13.919 14.075 14.222 14.419 14.584 14.712 14.867 15.027 15.177 15.33 15.495 15.656 15.8 15.904 16.022 16.139 16.212 16.243 16.25 16.231 16.174 16.047 15.795 15.324 14.33 12.253 9.507 7.25 5.425 3.875 2.518 1.337 0.234 -0.758 -1.755 -2.593 -3.314 -3.987 -4.655 -5.304 -5.872 -6.444 -6.954 -7.382 -7.824 -8.288 -8.686 -9.105 -9.525 -9.853 -10.211 -10.589 -10.973 -11.368 -11.638 -11.932 -12.415 -12.736 -13.061 -13.22 -13.556 -13.94 -14.344 -14.553 -14.908 -15.253 -15.503 -15.777 -16.414 -16.735 -17.07 -17.484 -17.977 -18.54 -19.35 -29.254 -9 ,26594 ,TETRA ,17607480,Sun Nov 28 22:10:08 CET,Mon Nov 29 00:06:27 CET,0.0 3.221 3.887 4.314 4.655 4.978 5.293 5.561 5.966 6.145 6.311 6.485 6.73 6.857 7.065 7.254 7.438 7.523 7.677 7.802 7.968 8.079 8.176 8.322 8.466 8.589 8.706 8.821 8.985 9.134 9.258 9.406 9.54 9.662 9.799 9.946 10.099 10.288 10.477 10.663 10.835 10.966 11.072 11.155 11.227 11.235 11.132 10.817 10.207 9.183 7.145 4.552 2.372 0.485 -1.121 -2.542 -3.775 -4.895 -5.868 -6.839 -7.655 -8.367 -9.034 -9.642 -10.211 -10.721 -11.25 -11.731 -12.15 -12.593 -13.076 -13.511 -13.948 -14.388 -14.725 -15.05 -15.412 -15.81 -16.213 -16.494 -16.778 -17.216 -17.522 -17.846 -18.011 -18.35 -18.734 -19.16 -19.384 -19.751 -20.121 -20.377 -20.628 -21.199 -21.57 -21.993 -22.452 -22.967 -23.645 -24.53 -30.114 -10 ,27367 ,TETRA ,17607481,Sun Nov 28 22:10:08 CET,Mon Nov 29 00:07:00 CET,0.0 3.434 3.886 4.166 4.418 4.653 4.872 5.096 5.489 5.654 5.798 5.943 6.177 6.297 6.515 6.714 6.918 7.006 7.168 7.339 7.556 7.664 7.77 7.924 8.066 8.205 8.352 8.504 8.702 8.869 8.99 9.11 9.23 9.363 9.528 9.7 9.831 9.958 10.082 10.203 10.295 10.351 10.406 10.431 10.409 10.324 10.162 9.835 9.185 8.112 6.242 3.819 1.667 -0.216 -1.825 -3.25 -4.44 -5.514 -6.476 -7.441 -8.241 -8.939 -9.603 -10.254 -10.898 -11.499 -12.118 -12.66 -13.135 -13.632 -14.169 -14.627 -15.119 -15.604 -15.943 -16.292 -16.645 -17.018 -17.421 -17.694 -17.977 -18.434 -18.76 -19.082 -19.249 -19.6 -19.961 -20.38 -20.609 -20.964 -21.363 -21.647 -21.922 -22.508 -22.832 -23.19 -23.587 -24.027 -24.525 -25.293 -29.206 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index bc6af2f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22097 ,TETRA ,17607482,Sun Nov 28 22:10:08 CET,Mon Nov 29 00:06:27 CET,0.0 2.917 3.477 3.864 4.194 4.461 4.688 4.916 5.322 5.509 5.69 5.903 6.164 6.308 6.589 6.839 7.054 7.164 7.406 7.624 7.879 8.056 8.242 8.499 8.745 8.991 9.241 9.471 9.779 10.097 10.396 10.739 11.048 11.322 11.602 11.92 12.248 12.586 12.938 13.311 13.683 14.094 14.556 15.048 15.626 16.221 16.837 17.471 18.121 18.676 18.936 18.677 18.122 17.456 16.778 16.093 15.456 14.862 14.329 13.784 13.294 12.877 12.503 12.127 11.745 11.374 10.956 10.56 10.237 9.903 9.554 9.292 9.021 8.724 8.487 8.231 7.966 7.688 7.398 7.2 6.993 6.666 6.416 6.148 6.015 5.763 5.515 5.232 5.081 4.831 4.61 4.426 4.228 3.752 3.474 3.183 2.853 2.468 1.957 1.247 -2.499 -2 ,32488 ,TETRA ,17607483,Sun Nov 28 22:10:09 CET,Mon Nov 29 00:06:26 CET,0.0 3.636 4.264 4.769 5.196 5.54 5.829 6.07 6.472 6.657 6.828 7.058 7.314 7.449 7.736 8.018 8.272 8.397 8.629 8.822 9.089 9.258 9.43 9.709 9.978 10.208 10.432 10.672 10.988 11.297 11.573 11.888 12.227 12.542 12.837 13.139 13.432 13.76 14.112 14.499 14.911 15.344 15.829 16.297 16.802 17.35 17.943 18.521 19.116 19.691 19.959 19.557 18.945 18.264 17.601 16.994 16.408 15.844 15.337 14.814 14.377 13.997 13.628 13.256 12.877 12.51 12.121 11.775 11.471 11.148 10.817 10.545 10.277 10.004 9.789 9.571 9.337 9.083 8.797 8.59 8.371 8.026 7.802 7.581 7.463 7.214 6.954 6.664 6.503 6.227 5.953 5.754 5.512 4.984 4.723 4.439 4.109 3.688 3.119 2.353 -1.128 -3 ,27914 ,TETRA ,17607484,Sun Nov 28 22:10:09 CET,Mon Nov 29 00:05:34 CET,0.0 3.187 4.002 4.55 4.889 5.155 5.382 5.591 5.998 6.21 6.428 6.724 7.001 7.162 7.465 7.716 7.967 8.102 8.372 8.645 9.02 9.242 9.478 9.794 10.056 10.315 10.561 10.814 11.151 11.459 11.779 12.145 12.449 12.721 13.033 13.394 13.728 14.087 14.463 14.838 15.225 15.65 16.116 16.59 17.114 17.657 18.273 18.98 19.695 20.291 20.661 20.399 19.821 19.092 18.365 17.661 16.987 16.373 15.815 15.258 14.792 14.35 13.919 13.503 13.104 12.744 12.352 11.981 11.66 11.339 11.003 10.732 10.446 10.147 9.92 9.66 9.377 9.098 8.815 8.609 8.387 8.038 7.813 7.589 7.467 7.199 6.894 6.552 6.375 6.092 5.818 5.623 5.412 4.939 4.681 4.419 4.112 3.747 3.28 2.701 -0.226 -5 ,27213 ,TETRA ,17607486,Sun Nov 28 22:10:39 CET,Mon Nov 29 00:07:34 CET,0.0 2.389 2.948 3.342 3.67 3.918 4.141 4.352 4.763 4.955 5.145 5.449 5.753 5.934 6.291 6.614 6.903 7.03 7.245 7.443 7.732 7.928 8.103 8.355 8.625 8.899 9.161 9.405 9.673 9.905 10.144 10.416 10.677 10.943 11.241 11.576 11.902 12.248 12.601 12.973 13.39 13.868 14.39 14.911 15.476 16.042 16.61 17.182 17.863 18.556 18.878 18.391 17.673 16.937 16.188 15.496 14.867 14.259 13.695 13.106 12.587 12.107 11.669 11.256 10.853 10.485 10.129 9.832 9.561 9.262 8.938 8.667 8.394 8.108 7.884 7.651 7.411 7.153 6.876 6.688 6.497 6.192 5.973 5.765 5.653 5.403 5.163 4.901 4.748 4.485 4.228 4.016 3.808 3.357 3.109 2.865 2.594 2.182 1.614 0.847 -7.174 -6 ,16828 ,TETRA ,17607487,Sun Nov 28 22:10:09 CET,Mon Nov 29 00:11:02 CET,0.0 5.114 5.769 6.203 6.508 6.759 7.012 7.244 7.646 7.841 8.027 8.296 8.592 8.76 9.068 9.342 9.599 9.73 9.994 10.239 10.542 10.724 10.902 11.149 11.377 11.608 11.829 12.02 12.293 12.595 12.885 13.249 13.595 13.911 14.277 14.709 15.112 15.525 15.963 16.403 16.865 17.353 17.873 18.416 19.027 19.659 20.331 21.036 21.814 22.444 22.733 22.409 21.704 20.945 20.142 19.389 18.71 18.056 17.503 16.942 16.435 15.964 15.484 15.005 14.548 14.131 13.737 13.38 13.039 12.678 12.292 11.986 11.712 11.45 11.229 10.981 10.72 10.453 10.171 9.986 9.788 9.46 9.245 9.016 8.895 8.653 8.409 8.151 8.003 7.736 7.526 7.36 7.169 6.673 6.404 6.124 5.779 5.32 4.76 4.072 -0.013 -7 ,8105 ,TETRA ,17607488,Sun Nov 28 22:10:09 CET,Mon Nov 29 00:06:51 CET,0.0 3.172 3.644 3.986 4.325 4.643 4.943 5.21 5.62 5.804 5.966 6.168 6.437 6.591 6.881 7.146 7.403 7.525 7.74 7.957 8.286 8.473 8.634 8.901 9.168 9.399 9.622 9.823 10.078 10.34 10.58 10.878 11.191 11.492 11.82 12.164 12.5 12.88 13.282 13.693 14.116 14.587 15.119 15.625 16.174 16.77 17.454 18.156 18.868 19.508 19.812 19.536 18.921 18.188 17.473 16.811 16.207 15.604 15.034 14.452 13.948 13.473 13.01 12.566 12.152 11.768 11.362 11.015 10.715 10.411 10.097 9.833 9.537 9.212 8.959 8.686 8.37 8.025 7.688 7.457 7.217 6.849 6.602 6.341 6.203 5.934 5.631 5.302 5.138 4.861 4.61 4.408 4.193 3.747 3.473 3.165 2.797 2.269 1.672 0.959 -3.819 -9 ,7535 ,TETRA ,17607490,Sun Nov 28 22:10:11 CET,Mon Nov 29 00:06:47 CET,0.0 5.161 5.799 6.3 6.758 7.118 7.387 7.673 8.202 8.433 8.632 8.837 9.091 9.246 9.557 9.807 10.021 10.132 10.377 10.613 10.93 11.134 11.317 11.575 11.832 12.072 12.278 12.469 12.727 12.988 13.245 13.552 13.864 14.168 14.518 14.874 15.183 15.522 15.881 16.256 16.632 17.053 17.533 18.0 18.575 19.23 19.914 20.572 21.187 21.697 21.933 21.65 21.017 20.293 19.602 18.934 18.35 17.788 17.237 16.642 16.109 15.62 15.155 14.716 14.3 13.915 13.514 13.163 12.868 12.569 12.249 11.968 11.663 11.362 11.133 10.887 10.619 10.339 10.06 9.861 9.66 9.325 9.071 8.81 8.677 8.408 8.133 7.821 7.661 7.41 7.186 6.996 6.803 6.401 6.168 5.895 5.596 5.251 4.859 4.385 0.787 -10 ,1827 ,TETRA ,17607491,Sun Nov 28 22:10:12 CET,Mon Nov 29 00:06:25 CET,0.0 2.837 3.33 3.712 4.042 4.36 4.621 4.837 5.204 5.373 5.527 5.721 5.971 6.1 6.339 6.575 6.813 6.927 7.159 7.378 7.67 7.845 8.014 8.289 8.565 8.804 9.017 9.21 9.447 9.681 9.922 10.229 10.506 10.752 11.049 11.404 11.718 12.052 12.421 12.787 13.164 13.585 14.035 14.472 14.992 15.517 16.064 16.659 17.31 17.873 18.076 17.744 17.195 16.568 15.913 15.272 14.701 14.159 13.665 13.151 12.709 12.325 11.945 11.574 11.232 10.918 10.566 10.239 9.951 9.648 9.327 9.051 8.758 8.452 8.218 7.974 7.702 7.416 7.122 6.906 6.685 6.352 6.102 5.822 5.675 5.37 5.055 4.767 4.623 4.358 4.117 3.933 3.728 3.307 3.072 2.77 2.387 1.959 1.441 0.66 -2.75 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt deleted file mode 100644 index dfec0f1d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7096 ,TETRA ,17607492,Sun Nov 28 22:10:08 CET,Mon Nov 29 00:09:40 CET,0.0 0.633 0.951 1.19 1.387 1.546 1.678 1.811 2.043 2.148 2.251 2.396 2.531 2.624 2.794 2.945 3.091 3.158 3.293 3.427 3.61 3.724 3.834 3.987 4.128 4.271 4.418 4.556 4.73 4.897 5.038 5.199 5.366 5.533 5.721 5.93 6.136 6.351 6.564 6.78 7.021 7.283 7.547 7.772 8.021 8.271 8.482 8.631 8.65 8.471 7.62 5.921 4.208 2.679 1.36 0.117 -0.997 -1.945 -2.762 -3.594 -4.296 -4.943 -5.565 -6.112 -6.635 -7.135 -7.635 -8.084 -8.491 -8.896 -9.324 -9.698 -10.083 -10.489 -10.82 -11.178 -11.546 -11.915 -12.281 -12.53 -12.794 -13.222 -13.527 -13.862 -14.034 -14.389 -14.778 -15.221 -15.449 -15.708 -16.138 -16.405 -16.687 -17.279 -17.612 -17.993 -18.408 -18.935 -19.667 -20.728 -31.519 -4 ,4747 ,TETRA ,17607495,Sun Nov 28 22:10:35 CET,Mon Nov 29 00:06:00 CET,0.0 0.901 1.222 1.45 1.629 1.782 1.925 2.056 2.291 2.407 2.522 2.682 2.813 2.899 3.064 3.211 3.344 3.414 3.555 3.696 3.897 4.022 4.139 4.303 4.457 4.616 4.777 4.92 5.102 5.278 5.441 5.632 5.807 5.967 6.156 6.38 6.603 6.837 7.052 7.287 7.555 7.831 8.115 8.387 8.7 8.93 9.054 9.135 9.147 9.018 8.217 6.75 5.231 3.718 2.429 1.277 0.242 -0.714 -1.524 -2.323 -3.029 -3.667 -4.274 -4.804 -5.278 -5.742 -6.261 -6.739 -7.136 -7.514 -7.926 -8.285 -8.666 -9.059 -9.367 -9.691 -10.019 -10.387 -10.777 -11.048 -11.329 -11.735 -12.002 -12.293 -12.447 -12.759 -13.114 -13.546 -13.794 -14.08 -14.507 -14.748 -15.008 -15.651 -15.992 -16.395 -16.858 -17.401 -18.113 -19.102 -31.422 -6 ,6801 ,TETRA ,17607497,Sun Nov 28 22:10:36 CET,Mon Nov 29 00:03:22 CET,0.0 0.76 1.016 1.185 1.351 1.517 1.665 1.792 2.03 2.14 2.246 2.394 2.52 2.603 2.775 2.925 3.066 3.135 3.264 3.394 3.587 3.711 3.828 4.006 4.175 4.318 4.455 4.588 4.755 4.907 5.054 5.239 5.42 5.585 5.763 5.982 6.199 6.442 6.692 6.94 7.184 7.426 7.683 7.93 8.214 8.502 8.747 8.87 8.901 8.608 7.469 5.722 4.065 2.56 1.273 0.16 -0.839 -1.774 -2.581 -3.419 -4.125 -4.748 -5.378 -5.971 -6.526 -7.027 -7.551 -8.007 -8.393 -8.786 -9.193 -9.545 -9.908 -10.282 -10.572 -10.889 -11.222 -11.551 -11.866 -12.097 -12.363 -12.786 -13.093 -13.402 -13.562 -13.909 -14.284 -14.681 -14.9 -15.167 -15.575 -15.826 -16.098 -16.736 -17.113 -17.539 -18.005 -18.553 -19.212 -20.128 -25.257 -7 ,14940 ,TETRA ,17607498,Sun Nov 28 22:10:36 CET,Mon Nov 29 00:03:03 CET,0.0 0.669 0.934 1.157 1.343 1.506 1.657 1.804 2.053 2.164 2.267 2.411 2.536 2.616 2.777 2.936 3.106 3.184 3.319 3.444 3.629 3.751 3.87 4.037 4.183 4.332 4.479 4.611 4.783 4.947 5.095 5.277 5.472 5.657 5.853 6.068 6.276 6.506 6.76 7.019 7.267 7.511 7.793 8.084 8.404 8.654 8.807 8.974 9.052 8.841 7.87 5.959 4.253 2.755 1.407 0.235 -0.837 -1.833 -2.683 -3.582 -4.355 -5.018 -5.674 -6.284 -6.822 -7.3 -7.792 -8.241 -8.626 -9.018 -9.442 -9.804 -10.176 -10.563 -10.872 -11.181 -11.486 -11.82 -12.194 -12.456 -12.718 -13.152 -13.448 -13.735 -13.886 -14.208 -14.564 -14.959 -15.159 -15.392 -15.778 -15.998 -16.222 -16.74 -17.068 -17.473 -17.912 -18.425 -19.117 -20.242 -25.859 -8 ,21164 ,TETRA ,17607499,Sun Nov 28 22:10:36 CET,Mon Nov 29 00:03:37 CET,0.0 1.176 1.464 1.661 1.82 1.963 2.099 2.237 2.473 2.577 2.684 2.849 2.986 3.068 3.219 3.36 3.501 3.571 3.715 3.85 4.029 4.14 4.253 4.414 4.562 4.721 4.878 5.023 5.207 5.37 5.512 5.705 5.902 6.072 6.258 6.46 6.66 6.881 7.111 7.354 7.591 7.83 8.101 8.336 8.573 8.832 9.069 9.212 9.257 9.025 8.076 6.489 4.935 3.529 2.214 0.934 -0.163 -1.118 -1.897 -2.644 -3.322 -3.959 -4.552 -5.091 -5.6 -6.079 -6.586 -7.041 -7.43 -7.832 -8.254 -8.591 -8.944 -9.318 -9.622 -9.947 -10.261 -10.589 -10.962 -11.235 -11.513 -11.923 -12.219 -12.547 -12.715 -13.067 -13.456 -13.847 -14.047 -14.3 -14.726 -15.007 -15.312 -16.033 -16.415 -16.838 -17.336 -17.889 -18.627 -19.706 -28.521 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt deleted file mode 100644 index a1dc9e1e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,28181 ,TETRA ,17607505,Sun Nov 28 22:10:36 CET,Mon Nov 29 00:04:34 CET,0.0 0.714 0.872 0.988 1.064 1.121 1.182 1.241 1.316 1.339 1.365 1.375 1.428 1.434 1.447 1.447 1.449 1.45 1.434 1.396 1.333 1.307 1.277 1.208 1.144 1.074 0.993 0.919 0.827 0.721 0.599 0.441 0.273 0.101 -0.135 -0.422 -0.686 -0.989 -1.348 -1.791 -2.305 -2.919 -3.732 -4.643 -5.788 -7.199 -9.029 -11.48 -14.874 -19.543 -26.529 -34.139 -39.979 -44.66 -48.464 -51.684 -54.394 -56.768 -58.718 -60.557 -62.063 -63.359 -64.577 -65.708 -66.736 -67.656 -68.624 -69.48 -70.202 -70.934 -71.647 -72.233 -72.878 -73.522 -73.983 -74.457 -74.954 -75.491 -76.055 -76.452 -76.871 -77.504 -77.934 -78.382 -78.612 -79.068 -79.529 -80.029 -80.299 -80.677 -81.126 -81.422 -81.736 -82.428 -82.81 -83.25 -83.768 -84.411 -85.162 -86.273 -91.536 -6 ,18445 ,TETRA ,17607507,Sun Nov 28 22:10:36 CET,Mon Nov 29 00:04:46 CET,0.0 0.609 0.787 0.915 1.009 1.067 1.116 1.166 1.226 1.242 1.254 1.226 1.277 1.276 1.286 1.305 1.317 1.312 1.298 1.283 1.251 1.228 1.195 1.144 1.084 1.015 0.945 0.874 0.77 0.648 0.515 0.344 0.161 -0.03 -0.269 -0.528 -0.802 -1.147 -1.556 -2.035 -2.584 -3.239 -4.053 -4.971 -6.183 -7.648 -9.479 -11.858 -15.058 -19.681 -26.922 -34.778 -40.692 -45.297 -49.032 -52.177 -54.765 -57.03 -58.923 -60.736 -62.263 -63.599 -64.841 -65.984 -67.034 -67.975 -68.924 -69.768 -70.476 -71.196 -71.94 -72.57 -73.226 -73.876 -74.37 -74.877 -75.399 -75.934 -76.485 -76.869 -77.256 -77.827 -78.237 -78.66 -78.869 -79.306 -79.762 -80.259 -80.536 -80.917 -81.356 -81.673 -82.0 -82.677 -83.05 -83.475 -83.954 -84.555 -85.357 -86.454 -91.791 -9 ,15248 ,TETRA ,17607510,Sun Nov 28 22:10:37 CET,Mon Nov 29 00:03:23 CET,0.0 0.749 0.888 0.998 1.083 1.143 1.212 1.277 1.363 1.389 1.419 1.435 1.5 1.516 1.527 1.532 1.535 1.537 1.536 1.522 1.481 1.455 1.423 1.362 1.301 1.238 1.172 1.101 0.991 0.872 0.75 0.605 0.441 0.266 0.058 -0.211 -0.494 -0.823 -1.21 -1.671 -2.194 -2.833 -3.653 -4.535 -5.646 -7.054 -8.935 -11.377 -14.658 -19.243 -26.299 -33.766 -39.415 -43.994 -47.669 -50.821 -53.471 -55.72 -57.566 -59.374 -60.903 -62.231 -63.472 -64.602 -65.612 -66.522 -67.474 -68.303 -69.018 -69.743 -70.488 -71.11 -71.736 -72.379 -72.881 -73.397 -73.915 -74.45 -74.994 -75.368 -75.764 -76.355 -76.75 -77.164 -77.389 -77.851 -78.301 -78.783 -79.041 -79.416 -79.866 -80.168 -80.486 -81.171 -81.562 -82.004 -82.485 -83.062 -83.727 -84.632 -96.465 -10 ,1405 ,TETRA ,17607511,Sun Nov 28 22:10:39 CET,Mon Nov 29 00:03:25 CET,0.0 0.593 0.735 0.826 0.902 0.959 1.014 1.067 1.131 1.147 1.166 1.149 1.199 1.207 1.211 1.204 1.197 1.193 1.181 1.16 1.115 1.078 1.041 0.971 0.893 0.811 0.721 0.63 0.526 0.411 0.274 0.093 -0.096 -0.278 -0.501 -0.782 -1.072 -1.427 -1.834 -2.284 -2.816 -3.483 -4.329 -5.233 -6.393 -7.843 -9.692 -12.072 -15.401 -20.083 -27.146 -34.793 -40.512 -45.08 -48.767 -51.874 -54.472 -56.734 -58.608 -60.408 -61.91 -63.202 -64.43 -65.559 -66.574 -67.484 -68.41 -69.234 -69.943 -70.643 -71.358 -71.951 -72.57 -73.22 -73.727 -74.247 -74.763 -75.288 -75.84 -76.221 -76.613 -77.208 -77.621 -78.049 -78.265 -78.722 -79.208 -79.72 -79.982 -80.36 -80.834 -81.123 -81.404 -82.064 -82.45 -82.893 -83.415 -84.0 -84.65 -85.513 -91.384 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index f7ccef3e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11052 ,TETRA ,17607512,Sun Nov 28 22:10:41 CET,Mon Nov 29 00:07:41 CET,0.0 1.751 2.113 2.37 2.607 2.816 2.984 3.154 3.488 3.64 3.777 3.923 4.147 4.271 4.511 4.722 4.92 5.014 5.206 5.399 5.687 5.875 6.049 6.283 6.49 6.698 6.918 7.141 7.425 7.677 7.907 8.191 8.463 8.714 9.006 9.317 9.621 9.971 10.319 10.683 11.067 11.486 11.984 12.481 13.048 13.635 14.236 14.825 15.367 15.722 15.716 15.059 14.188 13.294 12.388 11.54 10.726 9.974 9.317 8.6 7.983 7.446 6.911 6.406 5.958 5.554 5.112 4.696 4.328 3.944 3.558 3.264 2.965 2.638 2.372 2.092 1.798 1.491 1.18 0.971 0.747 0.378 0.123 -0.148 -0.295 -0.604 -0.908 -1.232 -1.399 -1.664 -1.939 -2.152 -2.37 -2.856 -3.141 -3.44 -3.743 -4.079 -4.5 -5.104 -7.514 -2 ,21588 ,TETRA ,17607513,Sun Nov 28 22:10:43 CET,Mon Nov 29 00:07:30 CET,0.0 1.379 1.832 2.137 2.383 2.608 2.808 3.013 3.375 3.527 3.669 3.857 4.11 4.248 4.5 4.749 4.976 5.08 5.284 5.474 5.735 5.897 6.064 6.32 6.569 6.808 7.018 7.211 7.462 7.708 7.947 8.246 8.524 8.778 9.053 9.362 9.678 10.05 10.428 10.775 11.146 11.559 12.016 12.475 12.948 13.404 13.94 14.487 15.022 15.463 15.462 14.72 13.804 12.861 11.984 11.152 10.348 9.579 8.934 8.279 7.682 7.137 6.601 6.112 5.671 5.258 4.79 4.343 3.971 3.609 3.232 2.904 2.552 2.192 1.913 1.602 1.261 0.935 0.607 0.383 0.165 -0.195 -0.445 -0.697 -0.836 -1.137 -1.43 -1.742 -1.916 -2.2 -2.488 -2.699 -2.92 -3.396 -3.68 -4.008 -4.37 -4.778 -5.234 -5.872 -8.472 -3 ,26920 ,TETRA ,17607514,Sun Nov 28 22:10:38 CET,Mon Nov 29 00:07:23 CET,0.0 1.034 1.43 1.743 2.002 2.219 2.427 2.621 2.984 3.166 3.336 3.51 3.733 3.861 4.103 4.301 4.505 4.612 4.799 4.958 5.2 5.377 5.557 5.804 6.032 6.236 6.427 6.622 6.882 7.123 7.355 7.637 7.907 8.173 8.469 8.789 9.1 9.451 9.827 10.198 10.599 11.069 11.595 12.119 12.713 13.296 13.877 14.46 14.993 15.465 15.616 15.042 14.27 13.383 12.439 11.555 10.755 10.012 9.359 8.692 8.107 7.591 7.109 6.629 6.177 5.77 5.312 4.9 4.538 4.162 3.782 3.459 3.127 2.791 2.54 2.265 1.957 1.63 1.296 1.076 0.857 0.517 0.256 -0.014 -0.147 -0.443 -0.754 -1.073 -1.237 -1.521 -1.811 -2.029 -2.246 -2.734 -3.006 -3.307 -3.661 -4.064 -4.56 -5.196 -7.247 -4 ,26880 ,TETRA ,17607515,Sun Nov 28 22:10:39 CET,Mon Nov 29 00:07:30 CET,0.0 2.061 2.654 3.087 3.402 3.667 3.898 4.101 4.469 4.633 4.807 5.033 5.271 5.407 5.663 5.921 6.177 6.293 6.506 6.707 6.985 7.161 7.331 7.565 7.78 7.98 8.183 8.387 8.657 8.923 9.176 9.485 9.752 9.998 10.31 10.658 10.967 11.303 11.676 12.062 12.44 12.869 13.388 13.888 14.442 15.02 15.636 16.252 16.811 17.19 17.164 16.474 15.558 14.591 13.659 12.776 12.01 11.324 10.698 10.071 9.508 8.994 8.509 8.033 7.593 7.191 6.753 6.359 6.029 5.678 5.293 4.957 4.609 4.26 3.987 3.712 3.434 3.139 2.833 2.615 2.372 1.997 1.769 1.527 1.395 1.114 0.81 0.499 0.338 0.054 -0.248 -0.46 -0.685 -1.166 -1.428 -1.748 -2.127 -2.519 -3.001 -3.7 -6.669 -5 ,8828 ,TETRA ,17607516,Sun Nov 28 22:10:41 CET,Mon Nov 29 00:07:38 CET,0.0 1.141 1.533 1.854 2.123 2.354 2.557 2.74 3.093 3.256 3.394 3.575 3.821 3.958 4.215 4.455 4.669 4.768 4.964 5.16 5.452 5.639 5.819 6.055 6.275 6.492 6.7 6.901 7.162 7.412 7.655 7.96 8.247 8.504 8.805 9.163 9.494 9.851 10.231 10.611 11.022 11.482 12.013 12.543 13.127 13.711 14.32 14.951 15.545 16.019 16.126 15.666 14.923 14.087 13.272 12.485 11.709 10.983 10.339 9.68 9.139 8.644 8.144 7.658 7.225 6.839 6.439 6.069 5.72 5.352 5.001 4.701 4.355 3.999 3.72 3.427 3.13 2.823 2.517 2.308 2.079 1.702 1.441 1.167 1.024 0.725 0.422 0.111 -0.047 -0.314 -0.585 -0.782 -1.0 -1.484 -1.757 -2.056 -2.368 -2.776 -3.29 -3.879 -5.419 -6 ,12342 ,TETRA ,17607517,Sun Nov 28 22:10:42 CET,Mon Nov 29 00:07:37 CET,0.0 2.44 2.902 3.188 3.436 3.67 3.901 4.114 4.451 4.604 4.76 4.937 5.162 5.277 5.494 5.702 5.896 5.994 6.187 6.373 6.63 6.788 6.952 7.197 7.434 7.666 7.886 8.091 8.355 8.614 8.85 9.125 9.393 9.666 9.987 10.354 10.709 11.075 11.451 11.828 12.208 12.626 13.108 13.583 14.127 14.73 15.373 16.034 16.649 17.126 17.272 16.57 15.6 14.629 13.725 12.859 12.064 11.322 10.68 10.031 9.454 8.964 8.496 8.007 7.531 7.119 6.703 6.325 5.988 5.634 5.255 4.931 4.599 4.245 3.976 3.709 3.429 3.134 2.818 2.588 2.347 1.981 1.741 1.492 1.359 1.079 0.77 0.447 0.286 0.017 -0.262 -0.485 -0.731 -1.271 -1.554 -1.865 -2.233 -2.67 -3.2 -3.809 -5.916 -7 ,28441 ,TETRA ,17607518,Sun Nov 28 22:10:38 CET,Mon Nov 29 00:07:29 CET,0.0 0.884 1.297 1.67 1.997 2.269 2.489 2.682 3.033 3.194 3.354 3.547 3.775 3.899 4.121 4.32 4.531 4.633 4.823 5.0 5.253 5.422 5.583 5.808 6.017 6.233 6.448 6.644 6.888 7.125 7.351 7.616 7.884 8.167 8.481 8.816 9.159 9.535 9.904 10.265 10.648 11.062 11.515 11.958 12.479 13.041 13.604 14.152 14.66 15.042 15.064 14.401 13.491 12.582 11.735 10.923 10.123 9.37 8.741 8.086 7.533 7.036 6.559 6.11 5.662 5.247 4.816 4.43 4.092 3.743 3.376 3.064 2.728 2.377 2.114 1.844 1.574 1.289 0.977 0.75 0.522 0.173 -0.074 -0.346 -0.487 -0.769 -1.059 -1.372 -1.555 -1.848 -2.141 -2.362 -2.585 -3.065 -3.35 -3.701 -4.097 -4.558 -5.117 -5.832 -8.776 -8 ,25467 ,TETRA ,17607519,Sun Nov 28 22:10:40 CET,Mon Nov 29 00:07:38 CET,0.0 1.232 1.667 1.985 2.273 2.515 2.735 2.928 3.243 3.384 3.529 3.688 3.914 4.045 4.293 4.526 4.75 4.858 5.058 5.24 5.513 5.696 5.868 6.12 6.364 6.587 6.803 7.031 7.329 7.602 7.861 8.175 8.485 8.759 9.059 9.417 9.76 10.129 10.518 10.934 11.374 11.847 12.42 13.002 13.564 14.061 14.602 15.178 15.701 16.129 16.205 15.503 14.483 13.498 12.633 11.81 11.056 10.319 9.663 9.032 8.486 7.967 7.46 6.975 6.518 6.116 5.698 5.331 5.013 4.66 4.288 3.979 3.636 3.272 2.995 2.701 2.396 2.106 1.804 1.58 1.348 0.995 0.747 0.485 0.352 0.063 -0.255 -0.6 -0.773 -1.05 -1.304 -1.501 -1.716 -2.171 -2.422 -2.704 -3.029 -3.44 -3.894 -4.459 -6.142 -9 ,12127 ,TETRA ,17607520,Sun Nov 28 22:10:39 CET,Mon Nov 29 00:09:38 CET,0.0 1.479 1.907 2.24 2.526 2.775 3.013 3.222 3.556 3.701 3.835 4.0 4.222 4.346 4.611 4.851 5.068 5.18 5.396 5.587 5.875 6.068 6.248 6.505 6.741 6.954 7.155 7.356 7.62 7.879 8.129 8.421 8.692 8.934 9.221 9.558 9.871 10.194 10.541 10.91 11.285 11.696 12.168 12.655 13.176 13.739 14.346 14.921 15.522 16.004 16.093 15.441 14.566 13.641 12.675 11.816 11.05 10.298 9.645 9.022 8.473 7.957 7.454 6.968 6.507 6.081 5.663 5.302 4.967 4.61 4.218 3.889 3.573 3.232 2.953 2.669 2.396 2.109 1.799 1.582 1.356 1.012 0.767 0.516 0.39 0.124 -0.171 -0.512 -0.696 -0.982 -1.291 -1.496 -1.724 -2.27 -2.551 -2.861 -3.217 -3.64 -4.185 -4.893 -7.211 -10 ,4536 ,TETRA ,17607521,Sun Nov 28 22:10:39 CET,Mon Nov 29 00:09:19 CET,0.0 1.743 2.207 2.548 2.831 3.098 3.321 3.523 3.925 4.112 4.292 4.496 4.728 4.844 5.063 5.278 5.487 5.591 5.784 5.976 6.252 6.415 6.568 6.785 7.007 7.222 7.426 7.629 7.889 8.144 8.396 8.691 8.971 9.244 9.549 9.88 10.186 10.528 10.915 11.309 11.676 12.089 12.593 13.069 13.577 14.105 14.661 15.185 15.698 16.101 16.074 15.343 14.357 13.397 12.467 11.555 10.755 10.035 9.401 8.756 8.182 7.671 7.182 6.703 6.265 5.866 5.429 5.044 4.726 4.37 3.971 3.635 3.28 2.912 2.632 2.343 2.032 1.712 1.392 1.176 0.964 0.633 0.388 0.13 -0.005 -0.3 -0.633 -0.985 -1.16 -1.448 -1.718 -1.905 -2.118 -2.629 -2.926 -3.221 -3.56 -3.975 -4.47 -5.193 -7.354 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt deleted file mode 100644 index 091a6cd3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25816 ,KEBNE ,17027792,Wed Dec 22 18:09:03 CET,Wed Dec 22 19:51:43 CET,0.0 3.619 4.409 4.935 5.351 5.709 6.021 6.296 6.775 6.982 7.17 7.421 7.698 7.868 8.172 8.437 8.694 8.82 9.066 9.313 9.664 9.892 10.106 10.403 10.693 10.978 11.25 11.505 11.821 12.115 12.407 12.739 13.045 13.358 13.722 14.114 14.476 14.867 15.268 15.676 16.113 16.592 17.137 17.695 18.289 18.838 19.409 20.044 20.639 20.902 20.531 19.431 18.17 16.98 15.87 14.814 13.866 12.943 12.144 11.35 10.635 9.986 9.373 8.806 8.274 7.795 7.307 6.858 6.46 6.056 5.641 5.295 4.944 4.578 4.281 3.96 3.64 3.325 2.982 2.743 2.507 2.115 1.838 1.562 1.414 1.097 0.768 0.423 0.235 -0.058 -0.354 -0.588 -0.819 -1.309 -1.597 -1.932 -2.351 -2.821 -3.33 -4.047 -7.788 -2 ,19801 ,KEBNE ,17027793,Wed Dec 22 18:09:04 CET,Wed Dec 22 19:52:25 CET,0.0 3.804 4.564 5.058 5.459 5.787 6.076 6.348 6.874 7.108 7.318 7.625 7.923 8.112 8.467 8.776 9.073 9.23 9.51 9.746 10.086 10.304 10.528 10.848 11.149 11.441 11.715 11.988 12.349 12.689 12.997 13.33 13.638 13.933 14.271 14.652 15.014 15.404 15.832 16.259 16.674 17.154 17.711 18.243 18.787 19.332 19.935 20.515 21.044 21.322 20.877 19.732 18.556 17.373 16.288 15.24 14.232 13.333 12.58 11.79 11.12 10.551 9.98 9.409 8.883 8.405 7.902 7.451 7.067 6.677 6.263 5.924 5.558 5.149 4.826 4.5 4.173 3.827 3.458 3.205 2.959 2.57 2.3 2.027 1.872 1.549 1.233 0.901 0.722 0.414 0.096 -0.13 -0.368 -0.926 -1.253 -1.592 -1.995 -2.503 -3.054 -3.822 -10.453 -3 ,17026 ,KEBNE ,17027794,Wed Dec 22 18:09:03 CET,Wed Dec 22 19:51:58 CET,0.0 3.14 3.828 4.309 4.694 5.015 5.3 5.555 6.012 6.211 6.403 6.664 6.935 7.101 7.408 7.683 7.949 8.079 8.326 8.566 8.906 9.123 9.332 9.627 9.901 10.16 10.412 10.662 10.99 11.284 11.562 11.919 12.262 12.579 12.933 13.33 13.708 14.109 14.508 14.91 15.312 15.721 16.234 16.759 17.308 17.871 18.395 18.945 19.469 19.698 19.352 18.417 17.405 16.323 15.217 14.198 13.28 12.382 11.615 10.875 10.232 9.652 9.088 8.561 8.078 7.617 7.129 6.693 6.306 5.899 5.49 5.153 4.78 4.377 4.059 3.734 3.408 3.061 2.705 2.467 2.211 1.784 1.494 1.208 1.057 0.734 0.386 0.034 -0.147 -0.458 -0.784 -1.003 -1.242 -1.792 -2.091 -2.425 -2.791 -3.217 -3.784 -4.559 -7.961 -4 ,11527 ,KEBNE ,17027795,Wed Dec 22 18:09:04 CET,Wed Dec 22 19:52:26 CET,0.0 2.725 3.465 3.998 4.431 4.823 5.156 5.407 5.858 6.099 6.324 6.592 6.872 7.045 7.372 7.678 7.95 8.082 8.345 8.587 8.96 9.2 9.413 9.733 10.044 10.318 10.581 10.825 11.104 11.384 11.675 12.027 12.375 12.721 13.084 13.449 13.798 14.167 14.583 15.039 15.484 15.95 16.497 16.999 17.526 18.083 18.637 19.201 19.73 19.995 19.683 18.693 17.467 16.184 15.041 13.974 13.007 12.155 11.402 10.607 9.908 9.283 8.689 8.133 7.633 7.16 6.636 6.186 5.802 5.41 5.003 4.649 4.275 3.842 3.502 3.19 2.876 2.537 2.182 1.943 1.711 1.345 1.074 0.781 0.629 0.312 -0.025 -0.375 -0.554 -0.855 -1.17 -1.401 -1.645 -2.169 -2.467 -2.806 -3.179 -3.647 -4.251 -5.033 -8.426 -5 ,18670 ,KEBNE ,17027796,Wed Dec 22 18:09:03 CET,Wed Dec 22 19:52:33 CET,0.0 2.902 3.62 4.114 4.487 4.87 5.196 5.466 5.988 6.224 6.45 6.77 7.067 7.263 7.639 7.988 8.313 8.465 8.74 9.006 9.392 9.631 9.859 10.165 10.448 10.73 11.021 11.313 11.691 12.05 12.376 12.746 13.125 13.476 13.841 14.244 14.625 15.046 15.478 15.889 16.295 16.738 17.265 17.792 18.39 18.989 19.543 20.082 20.56 20.868 20.67 19.72 18.629 17.529 16.428 15.309 14.308 13.421 12.661 11.868 11.129 10.497 9.913 9.349 8.836 8.375 7.88 7.414 7.014 6.596 6.163 5.821 5.458 5.077 4.777 4.463 4.143 3.802 3.446 3.193 2.921 2.502 2.213 1.903 1.755 1.467 1.139 0.785 0.604 0.302 0.0 -0.226 -0.466 -0.999 -1.276 -1.576 -1.907 -2.302 -2.812 -3.488 -7.012 -6 ,9713 ,KEBNE ,17027797,Wed Dec 22 18:09:03 CET,Wed Dec 22 19:52:31 CET,0.0 2.428 3.127 3.593 3.97 4.312 4.614 4.893 5.383 5.597 5.794 6.076 6.356 6.526 6.824 7.095 7.366 7.502 7.764 8.007 8.34 8.537 8.736 9.025 9.296 9.584 9.875 10.151 10.497 10.838 11.17 11.555 11.922 12.266 12.643 13.04 13.408 13.804 14.212 14.66 15.126 15.615 16.166 16.685 17.269 17.904 18.537 19.12 19.616 19.857 19.531 18.495 17.332 16.143 14.966 13.829 12.846 11.975 11.234 10.477 9.823 9.228 8.639 8.075 7.551 7.067 6.553 6.092 5.706 5.311 4.89 4.552 4.187 3.796 3.504 3.196 2.857 2.501 2.141 1.895 1.632 1.232 0.976 0.7 0.548 0.219 -0.135 -0.504 -0.688 -0.989 -1.27 -1.47 -1.706 -2.262 -2.583 -2.905 -3.227 -3.614 -4.129 -4.847 -8.482 -7 ,25855 ,KEBNE ,17027798,Wed Dec 22 18:09:04 CET,Wed Dec 22 19:51:02 CET,0.0 2.622 3.261 3.775 4.241 4.592 4.887 5.191 5.72 5.937 6.131 6.425 6.717 6.896 7.21 7.479 7.744 7.886 8.179 8.458 8.842 9.085 9.325 9.665 9.966 10.25 10.525 10.786 11.105 11.398 11.689 12.042 12.385 12.719 13.088 13.487 13.851 14.237 14.656 15.112 15.591 16.134 16.728 17.3 17.969 18.629 19.296 19.871 20.317 20.608 20.449 19.409 18.119 17.04 16.073 15.066 14.131 13.245 12.47 11.692 10.992 10.371 9.777 9.225 8.715 8.247 7.773 7.343 6.947 6.537 6.097 5.704 5.314 4.94 4.644 4.34 4.019 3.684 3.344 3.095 2.843 2.466 2.205 1.916 1.77 1.455 1.091 0.712 0.519 0.207 -0.114 -0.344 -0.594 -1.176 -1.506 -1.871 -2.262 -2.69 -3.187 -3.818 -7.759 -8 ,19686 ,KEBNE ,17027799,Wed Dec 22 18:09:03 CET,Wed Dec 22 19:52:30 CET,0.0 2.956 3.74 4.247 4.663 5.006 5.317 5.616 6.111 6.318 6.514 6.783 7.066 7.237 7.563 7.877 8.177 8.325 8.609 8.874 9.263 9.519 9.766 10.08 10.369 10.647 10.906 11.16 11.476 11.77 12.067 12.447 12.817 13.162 13.563 13.985 14.363 14.768 15.188 15.627 16.078 16.598 17.202 17.751 18.314 18.896 19.536 20.142 20.674 21.036 20.848 19.761 18.553 17.412 16.321 15.281 14.331 13.485 12.739 11.974 11.297 10.672 10.065 9.529 9.051 8.584 8.111 7.697 7.315 6.919 6.503 6.14 5.78 5.418 5.112 4.791 4.449 4.092 3.753 3.519 3.263 2.858 2.577 2.285 2.128 1.821 1.511 1.14 0.946 0.637 0.337 0.121 -0.107 -0.592 -0.872 -1.193 -1.519 -1.892 -2.374 -3.029 -5.98 -9 ,31614 ,KEBNE ,17027800,Wed Dec 22 18:10:07 CET,Wed Dec 22 19:54:09 CET,0.0 2.472 3.143 3.627 4.007 4.321 4.607 4.861 5.284 5.484 5.697 5.978 6.245 6.409 6.753 7.075 7.36 7.508 7.785 8.029 8.373 8.583 8.787 9.104 9.398 9.677 9.949 10.196 10.511 10.817 11.117 11.48 11.838 12.17 12.54 12.952 13.319 13.704 14.112 14.532 14.963 15.43 15.956 16.48 17.061 17.653 18.277 18.91 19.47 19.75 19.392 18.403 17.197 15.979 14.929 13.946 13.011 12.124 11.354 10.554 9.851 9.245 8.654 8.076 7.529 7.024 6.489 6.014 5.623 5.24 4.823 4.481 4.143 3.766 3.479 3.182 2.862 2.53 2.179 1.931 1.674 1.266 0.974 0.679 0.53 0.193 -0.149 -0.468 -0.638 -0.948 -1.302 -1.537 -1.79 -2.431 -2.784 -3.16 -3.618 -4.137 -4.745 -5.55 -8.638 -10 ,30409 ,KEBNE ,17027801,Wed Dec 22 18:10:07 CET,Wed Dec 22 19:53:01 CET,0.0 2.778 3.421 3.877 4.234 4.545 4.835 5.127 5.655 5.862 6.045 6.316 6.601 6.765 7.066 7.342 7.584 7.706 7.952 8.175 8.492 8.72 8.948 9.253 9.543 9.821 10.069 10.309 10.619 10.91 11.196 11.538 11.857 12.162 12.532 12.935 13.27 13.641 14.061 14.485 14.934 15.436 15.962 16.439 16.973 17.56 18.155 18.699 19.197 19.511 19.234 18.154 16.95 15.718 14.53 13.432 12.445 11.561 10.82 10.094 9.469 8.886 8.313 7.745 7.207 6.74 6.248 5.811 5.43 5.034 4.642 4.307 3.941 3.557 3.258 2.952 2.639 2.314 1.975 1.739 1.502 1.12 0.831 0.525 0.372 0.055 -0.27 -0.617 -0.805 -1.117 -1.432 -1.668 -1.92 -2.504 -2.835 -3.186 -3.605 -4.126 -4.728 -5.48 -8.804 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt deleted file mode 100644 index d8520e14..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29723 ,TETRA ,17607522,Sun Nov 28 22:10:39 CET,Mon Nov 29 00:08:19 CET,0.0 0.862 1.24 1.548 1.802 2.039 2.236 2.407 2.757 2.93 3.093 3.273 3.512 3.651 3.901 4.132 4.341 4.446 4.669 4.873 5.161 5.353 5.53 5.755 5.957 6.152 6.347 6.546 6.796 7.016 7.225 7.481 7.72 7.949 8.218 8.503 8.782 9.086 9.386 9.714 10.044 10.394 10.809 11.183 11.584 12.02 12.482 12.902 13.241 13.455 13.331 12.722 11.876 10.967 10.153 9.409 8.731 8.114 7.57 6.982 6.435 5.936 5.47 5.056 4.689 4.334 3.947 3.617 3.339 3.041 2.733 2.469 2.183 1.895 1.669 1.435 1.199 0.94 0.668 0.482 0.288 -0.033 -0.268 -0.518 -0.644 -0.889 -1.144 -1.43 -1.586 -1.865 -2.099 -2.261 -2.453 -2.918 -3.168 -3.433 -3.714 -4.023 -4.386 -4.871 -6.204 -2 ,15976 ,TETRA ,17607523,Sun Nov 28 22:11:07 CET,Mon Nov 29 00:08:57 CET,0.0 1.59 2.078 2.378 2.659 2.915 3.122 3.316 3.661 3.826 3.97 4.114 4.33 4.439 4.651 4.859 5.054 5.142 5.308 5.476 5.721 5.878 6.022 6.207 6.414 6.621 6.799 6.967 7.184 7.391 7.601 7.864 8.11 8.347 8.614 8.897 9.153 9.435 9.739 10.057 10.379 10.745 11.177 11.583 12.013 12.466 12.996 13.566 14.128 14.532 14.451 13.774 12.991 12.202 11.423 10.641 9.9 9.248 8.719 8.173 7.673 7.215 6.777 6.356 5.959 5.584 5.184 4.821 4.508 4.19 3.874 3.622 3.355 3.062 2.83 2.595 2.347 2.08 1.798 1.611 1.423 1.117 0.905 0.686 0.572 0.329 0.085 -0.169 -0.31 -0.557 -0.756 -0.929 -1.116 -1.527 -1.753 -2.019 -2.359 -2.745 -3.148 -3.692 -5.495 -3 ,3056 ,TETRA ,17607524,Sun Nov 28 22:11:07 CET,Mon Nov 29 00:10:05 CET,0.0 0.988 1.382 1.661 1.888 2.079 2.258 2.418 2.725 2.875 3.013 3.165 3.381 3.498 3.739 3.958 4.148 4.239 4.417 4.583 4.823 4.989 5.134 5.34 5.552 5.749 5.931 6.112 6.354 6.585 6.803 7.05 7.272 7.486 7.746 8.041 8.325 8.609 8.894 9.195 9.526 9.934 10.392 10.828 11.308 11.802 12.328 12.835 13.289 13.586 13.479 12.842 11.99 11.127 10.373 9.631 8.924 8.274 7.712 7.135 6.646 6.202 5.776 5.362 4.944 4.564 4.174 3.832 3.536 3.218 2.89 2.619 2.338 2.04 1.816 1.589 1.339 1.091 0.833 0.64 0.446 0.145 -0.071 -0.298 -0.411 -0.659 -0.953 -1.231 -1.365 -1.62 -1.836 -2.01 -2.183 -2.557 -2.785 -3.053 -3.374 -3.712 -4.079 -4.542 -6.185 -4 ,10015 ,TETRA ,17607525,Sun Nov 28 22:11:07 CET,Mon Nov 29 00:08:54 CET,0.0 1.006 1.354 1.607 1.809 2.003 2.175 2.358 2.711 2.847 2.981 3.129 3.341 3.456 3.684 3.907 4.106 4.196 4.382 4.565 4.802 4.95 5.098 5.305 5.498 5.685 5.87 6.045 6.264 6.476 6.686 6.946 7.187 7.422 7.689 7.969 8.239 8.527 8.824 9.154 9.484 9.818 10.213 10.614 11.03 11.467 11.935 12.417 12.87 13.211 13.176 12.534 11.771 10.969 10.191 9.46 8.794 8.163 7.593 7.016 6.505 6.047 5.62 5.186 4.781 4.427 4.053 3.721 3.425 3.093 2.752 2.484 2.193 1.899 1.68 1.433 1.173 0.904 0.62 0.437 0.259 -0.026 -0.227 -0.436 -0.543 -0.769 -1.015 -1.268 -1.399 -1.638 -1.827 -2.006 -2.205 -2.59 -2.793 -3.039 -3.337 -3.684 -4.091 -4.642 -6.653 -5 ,30235 ,TETRA ,17607526,Sun Nov 28 22:11:09 CET,Mon Nov 29 00:09:05 CET,0.0 1.204 1.696 2.02 2.267 2.469 2.636 2.795 3.105 3.254 3.392 3.519 3.729 3.842 4.06 4.27 4.471 4.565 4.741 4.903 5.139 5.291 5.437 5.65 5.853 6.049 6.242 6.436 6.689 6.904 7.101 7.356 7.6 7.832 8.1 8.387 8.64 8.913 9.21 9.519 9.848 10.218 10.638 11.052 11.499 11.943 12.437 12.899 13.341 13.719 13.768 13.195 12.393 11.563 10.73 9.947 9.269 8.622 8.031 7.439 6.925 6.471 6.046 5.649 5.272 4.919 4.555 4.22 3.926 3.611 3.264 2.97 2.671 2.367 2.121 1.866 1.603 1.313 1.024 0.838 0.647 0.335 0.109 -0.133 -0.255 -0.501 -0.774 -1.073 -1.231 -1.496 -1.712 -1.89 -2.081 -2.485 -2.692 -2.937 -3.221 -3.542 -3.926 -4.363 -6.328 -6 ,7317 ,TETRA ,17607527,Sun Nov 28 22:11:07 CET,Mon Nov 29 00:09:02 CET,0.0 0.929 1.216 1.462 1.688 1.894 2.081 2.239 2.533 2.685 2.823 2.971 3.187 3.296 3.501 3.685 3.874 3.973 4.164 4.351 4.625 4.799 4.967 5.229 5.471 5.68 5.865 6.042 6.275 6.488 6.688 6.933 7.169 7.398 7.669 7.966 8.233 8.532 8.842 9.152 9.471 9.816 10.226 10.624 11.058 11.527 12.004 12.449 12.862 13.131 13.069 12.495 11.711 10.946 10.256 9.569 8.889 8.183 7.554 6.959 6.452 6.008 5.572 5.162 4.786 4.427 4.054 3.73 3.452 3.15 2.822 2.557 2.279 1.993 1.773 1.524 1.256 0.997 0.721 0.515 0.308 -0.011 -0.229 -0.464 -0.589 -0.855 -1.133 -1.404 -1.547 -1.811 -2.031 -2.214 -2.422 -2.822 -3.043 -3.308 -3.588 -3.904 -4.265 -4.744 -6.405 -7 ,6248 ,TETRA ,17607528,Sun Nov 28 22:11:08 CET,Mon Nov 29 00:08:37 CET,0.0 0.97 1.311 1.601 1.86 2.083 2.31 2.52 2.887 3.066 3.23 3.409 3.633 3.753 3.983 4.204 4.413 4.525 4.755 4.955 5.232 5.405 5.563 5.794 6.027 6.251 6.451 6.65 6.914 7.155 7.387 7.645 7.875 8.095 8.335 8.618 8.894 9.168 9.468 9.783 10.104 10.47 10.891 11.287 11.711 12.163 12.652 13.111 13.509 13.761 13.688 13.047 12.215 11.385 10.577 9.794 9.084 8.403 7.768 7.147 6.623 6.163 5.703 5.237 4.824 4.462 4.073 3.715 3.403 3.093 2.776 2.498 2.211 1.925 1.698 1.46 1.209 0.947 0.664 0.474 0.285 -0.028 -0.248 -0.482 -0.599 -0.829 -1.07 -1.321 -1.46 -1.712 -1.915 -2.09 -2.293 -2.766 -3.002 -3.226 -3.473 -3.766 -4.115 -4.577 -5.923 -8 ,11842 ,TETRA ,17607529,Sun Nov 28 22:11:08 CET,Mon Nov 29 00:10:06 CET,0.0 1.662 2.154 2.498 2.754 2.965 3.189 3.389 3.716 3.887 4.059 4.233 4.444 4.558 4.772 4.969 5.17 5.272 5.465 5.639 5.904 6.084 6.256 6.495 6.712 6.925 7.141 7.345 7.598 7.823 8.031 8.283 8.543 8.817 9.133 9.47 9.75 10.037 10.364 10.707 11.056 11.439 11.857 12.256 12.684 13.131 13.619 14.089 14.464 14.685 14.569 13.872 13.023 12.215 11.457 10.716 10.006 9.345 8.794 8.227 7.706 7.236 6.793 6.369 5.963 5.59 5.225 4.891 4.578 4.24 3.873 3.586 3.312 3.022 2.787 2.543 2.288 2.021 1.754 1.571 1.377 1.07 0.854 0.619 0.495 0.236 -0.055 -0.372 -0.536 -0.805 -1.065 -1.274 -1.484 -1.913 -2.175 -2.458 -2.737 -3.081 -3.553 -4.166 -6.335 -9 ,12395 ,TETRA ,17607530,Sun Nov 28 22:11:08 CET,Mon Nov 29 00:08:41 CET,0.0 0.825 1.199 1.477 1.693 1.889 2.082 2.291 2.687 2.865 3.033 3.187 3.404 3.521 3.743 3.963 4.17 4.272 4.451 4.63 4.904 5.068 5.228 5.458 5.673 5.87 6.062 6.251 6.486 6.725 6.954 7.201 7.438 7.68 7.969 8.288 8.601 8.941 9.268 9.601 9.928 10.289 10.69 11.068 11.543 12.046 12.503 12.937 13.334 13.557 13.45 12.828 12.009 11.151 10.365 9.627 8.942 8.294 7.705 7.103 6.597 6.131 5.67 5.249 4.868 4.524 4.148 3.8 3.513 3.196 2.85 2.573 2.293 2.008 1.79 1.553 1.293 1.033 0.757 0.564 0.366 0.031 -0.22 -0.483 -0.615 -0.889 -1.169 -1.449 -1.593 -1.857 -2.094 -2.266 -2.448 -2.853 -3.11 -3.376 -3.657 -4.02 -4.455 -5.01 -6.944 -10 ,411 ,TETRA ,17607531,Sun Nov 28 22:11:09 CET,Mon Nov 29 00:09:02 CET,0.0 1.555 1.953 2.239 2.454 2.657 2.854 3.028 3.36 3.507 3.636 3.81 4.05 4.185 4.451 4.695 4.896 4.994 5.185 5.352 5.592 5.744 5.89 6.099 6.29 6.484 6.675 6.844 7.064 7.272 7.48 7.746 7.968 8.182 8.437 8.711 8.982 9.272 9.576 9.911 10.263 10.66 11.108 11.501 11.91 12.359 12.83 13.309 13.799 14.115 13.988 13.322 12.499 11.667 10.919 10.163 9.463 8.829 8.26 7.699 7.184 6.721 6.29 5.873 5.465 5.095 4.715 4.361 4.044 3.724 3.396 3.125 2.84 2.54 2.308 2.059 1.795 1.532 1.27 1.086 0.899 0.594 0.364 0.117 -0.011 -0.275 -0.553 -0.845 -0.998 -1.258 -1.471 -1.65 -1.847 -2.263 -2.469 -2.694 -2.973 -3.271 -3.641 -4.147 -6.444 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index fcd42190..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8135 ,TETRA ,17607532,Sun Nov 28 22:11:08 CET,Mon Nov 29 00:06:07 CET,0.0 3.507 4.036 4.439 4.809 5.165 5.492 5.788 6.31 6.533 6.749 7.041 7.386 7.575 7.958 8.311 8.623 8.77 9.066 9.356 9.787 10.07 10.351 10.752 11.109 11.436 11.77 12.091 12.457 12.796 13.128 13.52 13.898 14.269 14.688 15.16 15.644 16.168 16.685 17.229 17.805 18.443 19.176 19.908 20.77 21.674 22.721 24.122 25.805 27.636 29.682 30.923 31.264 31.32 31.209 30.899 30.412 29.89 29.453 28.96 28.495 28.061 27.61 27.153 26.722 26.318 25.872 25.47 25.116 24.739 24.333 23.993 23.615 23.193 22.875 22.565 22.252 21.929 21.584 21.332 21.059 20.61 20.295 19.984 19.822 19.46 19.068 18.66 18.442 18.062 17.697 17.434 17.143 16.486 16.118 15.741 15.337 14.843 14.191 13.256 3.757 -2 ,26250 ,TETRA ,17607533,Sun Nov 28 22:11:09 CET,Mon Nov 29 00:06:54 CET,0.0 3.336 4.033 4.568 5.035 5.474 5.857 6.192 6.77 7.01 7.234 7.531 7.879 8.069 8.419 8.704 8.98 9.133 9.442 9.728 10.14 10.448 10.73 11.069 11.405 11.746 12.086 12.42 12.854 13.262 13.663 14.157 14.616 15.034 15.464 15.918 16.351 16.834 17.397 17.98 18.556 19.211 19.976 20.729 21.603 22.567 23.604 24.751 25.994 27.307 28.723 29.443 29.451 29.144 28.673 28.143 27.616 27.086 26.624 26.14 25.66 25.204 24.758 24.33 23.934 23.551 23.087 22.64 22.264 21.852 21.423 21.069 20.682 20.296 19.997 19.671 19.337 19.017 18.677 18.439 18.18 17.734 17.425 17.104 16.939 16.587 16.211 15.792 15.556 15.176 14.777 14.5 14.22 13.583 13.235 12.839 12.418 11.931 11.283 10.442 6.013 -7 ,17448 ,TETRA ,17607538,Sun Nov 28 22:11:09 CET,Mon Nov 29 00:07:24 CET,0.0 2.377 2.884 3.251 3.57 3.868 4.146 4.402 4.869 5.094 5.318 5.632 5.988 6.168 6.512 6.836 7.147 7.295 7.571 7.854 8.259 8.51 8.752 9.109 9.474 9.823 10.16 10.493 10.919 11.336 11.741 12.217 12.657 13.082 13.599 14.192 14.757 15.359 15.975 16.617 17.305 18.062 18.877 19.715 20.734 21.812 23.002 24.289 25.648 27.126 28.58 29.307 29.429 29.181 28.805 28.346 27.83 27.281 26.761 26.216 25.692 25.224 24.751 24.305 23.91 23.497 23.055 22.667 22.32 21.941 21.513 21.159 20.789 20.371 20.06 19.762 19.439 19.093 18.749 18.497 18.221 17.792 17.478 17.151 16.99 16.643 16.258 15.839 15.61 15.244 14.9 14.652 14.376 13.739 13.395 13.019 12.561 11.967 11.2 10.174 6.523 -9 ,856 ,TETRA ,17607540,Sun Nov 28 22:11:09 CET,Mon Nov 29 00:06:47 CET,0.0 4.31 4.943 5.434 5.867 6.224 6.543 6.843 7.371 7.591 7.826 8.137 8.479 8.678 9.051 9.403 9.735 9.897 10.215 10.521 10.945 11.184 11.409 11.749 12.1 12.443 12.771 13.085 13.489 13.877 14.218 14.611 14.987 15.354 15.799 16.318 16.809 17.337 17.895 18.462 19.035 19.703 20.511 21.303 22.226 23.203 24.229 25.349 26.579 27.892 29.284 30.117 30.219 29.96 29.586 29.129 28.618 28.134 27.677 27.156 26.687 26.26 25.84 25.427 25.027 24.642 24.209 23.796 23.446 23.089 22.69 22.341 21.968 21.57 21.26 20.95 20.631 20.29 19.923 19.668 19.395 18.934 18.615 18.282 18.1 17.703 17.254 16.777 16.549 16.182 15.804 15.537 15.265 14.691 14.363 13.926 13.442 12.947 12.309 11.36 3.363 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index 026063b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15679 ,TETRA ,17607542,Sun Nov 28 22:11:10 CET,Mon Nov 29 00:06:27 CET,0.0 2.063 2.563 2.957 3.294 3.595 3.874 4.12 4.547 4.743 4.938 5.158 5.457 5.615 5.898 6.166 6.431 6.555 6.79 7.027 7.353 7.565 7.775 8.053 8.322 8.597 8.867 9.124 9.444 9.743 10.036 10.412 10.767 11.086 11.45 11.841 12.216 12.629 13.062 13.507 13.97 14.49 15.053 15.62 16.275 16.969 17.731 18.558 19.465 20.359 21.104 21.237 20.912 20.429 19.93 19.348 18.734 18.118 17.569 17.01 16.514 16.068 15.624 15.2 14.817 14.473 14.101 13.756 13.452 13.118 12.759 12.446 12.105 11.738 11.443 11.145 10.846 10.527 10.187 9.948 9.692 9.312 9.057 8.777 8.634 8.357 8.06 7.732 7.55 7.231 6.945 6.732 6.51 6.002 5.733 5.439 5.067 4.624 4.081 3.377 1.032 -2 ,22888 ,TETRA ,17607543,Sun Nov 28 22:11:10 CET,Mon Nov 29 00:06:28 CET,0.0 1.506 2.115 2.561 2.978 3.345 3.657 3.927 4.386 4.608 4.82 5.08 5.391 5.556 5.867 6.147 6.42 6.554 6.808 7.049 7.374 7.578 7.768 8.037 8.297 8.539 8.77 9.006 9.326 9.631 9.914 10.228 10.528 10.829 11.17 11.54 11.909 12.311 12.728 13.172 13.639 14.151 14.73 15.313 15.972 16.66 17.419 18.22 19.073 19.921 20.674 20.885 20.656 20.295 19.86 19.34 18.818 18.311 17.814 17.283 16.836 16.433 16.031 15.63 15.25 14.9 14.534 14.198 13.884 13.528 13.131 12.791 12.437 12.077 11.795 11.521 11.241 10.94 10.616 10.385 10.143 9.738 9.455 9.162 9.012 8.712 8.397 8.077 7.918 7.619 7.38 7.166 6.924 6.413 6.134 5.834 5.513 5.151 4.651 3.862 -7.419 -3 ,23574 ,TETRA ,17607544,Sun Nov 28 22:11:09 CET,Mon Nov 29 00:05:47 CET,0.0 2.259 2.81 3.277 3.637 3.947 4.245 4.526 5.04 5.272 5.484 5.758 6.088 6.271 6.624 6.961 7.283 7.441 7.746 8.025 8.423 8.676 8.921 9.292 9.64 9.971 10.293 10.606 11.009 11.391 11.759 12.2 12.625 13.032 13.489 13.987 14.463 15.014 15.615 16.235 16.902 17.634 18.435 19.237 20.138 21.165 22.388 23.663 24.958 26.174 27.266 27.559 27.208 26.777 26.366 25.851 25.289 24.728 24.225 23.715 23.254 22.832 22.396 21.972 21.598 21.266 20.902 20.57 20.268 19.94 19.602 19.318 19.011 18.673 18.392 18.086 17.781 17.472 17.144 16.917 16.671 16.261 15.969 15.681 15.529 15.198 14.856 14.502 14.324 14.007 13.733 13.518 13.282 12.755 12.468 12.17 11.832 11.417 10.927 10.263 7.029 -4 ,22465 ,TETRA ,17607545,Sun Nov 28 22:11:12 CET,Mon Nov 29 00:06:19 CET,0.0 2.667 3.263 3.692 4.076 4.398 4.655 4.912 5.362 5.555 5.748 5.978 6.274 6.438 6.762 7.039 7.297 7.429 7.701 7.956 8.319 8.551 8.776 9.104 9.415 9.706 9.974 10.218 10.515 10.818 11.111 11.439 11.747 12.046 12.387 12.76 13.116 13.527 13.982 14.426 14.855 15.337 15.906 16.461 17.096 17.782 18.541 19.345 20.163 20.957 21.588 21.673 21.398 21.001 20.531 20.018 19.527 19.049 18.627 18.171 17.759 17.363 16.983 16.604 16.204 15.843 15.45 15.075 14.755 14.419 14.068 13.789 13.474 13.149 12.887 12.593 12.301 12.001 11.69 11.475 11.244 10.874 10.624 10.373 10.238 9.958 9.651 9.296 9.107 8.782 8.457 8.218 7.974 7.41 7.097 6.774 6.396 5.94 5.455 4.812 0.39 -5 ,31809 ,TETRA ,17607546,Sun Nov 28 22:11:10 CET,Mon Nov 29 00:05:58 CET,0.0 1.945 2.667 3.193 3.628 3.983 4.302 4.605 5.146 5.383 5.602 5.884 6.226 6.423 6.8 7.157 7.484 7.646 7.964 8.256 8.674 8.951 9.213 9.574 9.918 10.241 10.541 10.84 11.235 11.603 11.96 12.375 12.763 13.151 13.611 14.135 14.633 15.211 15.842 16.495 17.169 17.891 18.735 19.59 20.589 21.684 22.881 24.104 25.443 26.863 28.18 28.691 28.528 28.184 27.748 27.213 26.692 26.202 25.734 25.217 24.73 24.295 23.885 23.48 23.101 22.762 22.395 22.046 21.732 21.412 21.085 20.79 20.475 20.141 19.872 19.593 19.307 19.019 18.719 18.498 18.246 17.85 17.577 17.288 17.136 16.81 16.475 16.116 15.926 15.602 15.293 15.064 14.815 14.263 13.979 13.664 13.283 12.867 12.383 11.747 7.089 -6 ,20352 ,TETRA ,17607547,Sun Nov 28 22:11:10 CET,Mon Nov 29 00:06:46 CET,0.0 1.724 2.339 2.83 3.21 3.508 3.799 4.068 4.574 4.806 5.01 5.264 5.59 5.767 6.096 6.43 6.761 6.921 7.216 7.493 7.883 8.137 8.384 8.74 9.089 9.439 9.783 10.113 10.528 10.908 11.272 11.716 12.145 12.561 13.028 13.549 14.054 14.603 15.187 15.795 16.441 17.176 18.015 18.832 19.796 20.837 21.965 23.227 24.624 26.076 27.356 27.802 27.58 27.06 26.44 25.757 25.112 24.504 23.984 23.427 22.912 22.454 22.01 21.597 21.187 20.792 20.387 20.021 19.689 19.313 18.914 18.592 18.257 17.906 17.619 17.331 17.053 16.741 16.407 16.196 15.978 15.612 15.351 15.076 14.938 14.655 14.336 13.962 13.771 13.468 13.194 12.966 12.727 12.248 11.984 11.665 11.265 10.732 10.152 9.356 5.188 -7 ,18051 ,TETRA ,17607548,Sun Nov 28 22:11:13 CET,Mon Nov 29 00:06:52 CET,0.0 2.386 3.132 3.638 4.017 4.373 4.714 5.012 5.562 5.805 6.021 6.278 6.61 6.815 7.205 7.543 7.856 8.01 8.334 8.647 9.081 9.34 9.572 9.917 10.244 10.568 10.898 11.21 11.612 12.002 12.361 12.785 13.209 13.637 14.118 14.644 15.154 15.726 16.355 16.989 17.621 18.324 19.121 19.879 20.72 21.667 22.754 23.88 25.093 26.353 27.534 27.954 27.827 27.361 26.697 26.117 25.575 25.032 24.576 24.114 23.699 23.295 22.86 22.411 21.949 21.521 21.103 20.708 20.333 19.951 19.546 19.201 18.855 18.497 18.208 17.905 17.601 17.289 16.969 16.754 16.528 16.148 15.879 15.611 15.466 15.161 14.843 14.517 14.36 14.07 13.824 13.609 13.371 12.89 12.613 12.27 11.879 11.416 10.893 10.253 7.871 -8 ,2665 ,TETRA ,17607549,Sun Nov 28 22:11:11 CET,Mon Nov 29 00:06:36 CET,0.0 2.259 2.881 3.364 3.799 4.165 4.492 4.797 5.336 5.587 5.835 6.18 6.56 6.781 7.177 7.579 7.926 8.078 8.388 8.695 9.145 9.418 9.671 10.046 10.409 10.752 11.079 11.396 11.809 12.228 12.641 13.114 13.552 13.96 14.438 14.978 15.473 15.971 16.512 17.109 17.723 18.421 19.22 19.97 20.83 21.776 22.788 23.879 25.136 26.461 27.644 28.132 28.091 27.806 27.39 26.85 26.279 25.685 25.161 24.642 24.176 23.742 23.322 22.943 22.599 22.264 21.87 21.511 21.179 20.815 20.448 20.147 19.845 19.531 19.281 19.006 18.733 18.465 18.148 17.918 17.691 17.313 17.044 16.76 16.607 16.308 16.003 15.683 15.508 15.185 14.885 14.658 14.418 13.856 13.491 13.118 12.74 12.286 11.768 11.112 7.962 -9 ,30641 ,TETRA ,17607550,Sun Nov 28 22:11:10 CET,Mon Nov 29 00:06:19 CET,0.0 2.407 3.068 3.591 4.022 4.372 4.676 4.967 5.52 5.754 5.973 6.271 6.613 6.814 7.178 7.509 7.84 8.001 8.291 8.58 9.01 9.289 9.546 9.924 10.304 10.654 11.003 11.331 11.721 12.104 12.478 12.917 13.343 13.761 14.283 14.863 15.359 15.889 16.47 17.085 17.719 18.439 19.285 20.097 20.973 21.927 23.084 24.324 25.636 27.02 28.329 28.754 28.562 28.15 27.637 27.078 26.541 25.949 25.358 24.774 24.253 23.788 23.341 22.892 22.443 22.023 21.566 21.148 20.807 20.465 20.078 19.742 19.412 19.053 18.757 18.452 18.144 17.841 17.543 17.338 17.111 16.77 16.537 16.273 16.132 15.829 15.523 15.196 15.001 14.678 14.369 14.124 13.871 13.36 13.097 12.788 12.436 12.052 11.589 10.927 7.88 -10 ,14891 ,TETRA ,17607551,Sun Nov 28 22:11:36 CET,Mon Nov 29 00:06:27 CET,0.0 2.496 3.105 3.556 3.914 4.239 4.551 4.827 5.274 5.488 5.708 5.941 6.229 6.396 6.702 6.962 7.21 7.35 7.627 7.861 8.197 8.417 8.627 8.917 9.183 9.439 9.685 9.926 10.247 10.544 10.819 11.163 11.495 11.818 12.2 12.621 13.034 13.483 13.919 14.35 14.804 15.31 15.898 16.473 17.092 17.758 18.521 19.304 20.094 20.94 21.677 21.751 21.493 21.082 20.573 20.043 19.524 18.987 18.506 18.035 17.608 17.188 16.777 16.398 16.039 15.692 15.308 14.964 14.662 14.339 13.996 13.701 13.396 13.062 12.762 12.442 12.122 11.791 11.451 11.226 11.001 10.65 10.393 10.121 9.982 9.694 9.388 9.052 8.872 8.547 8.251 8.024 7.78 7.292 7.007 6.665 6.239 5.733 5.13 4.36 -4.784 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index 1b2db2d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2025 ,TETRA ,17607552,Sun Nov 28 22:11:37 CET,Mon Nov 29 00:00:24 CET,0.0 2.099 2.593 2.988 3.319 3.617 3.864 4.084 4.512 4.702 4.875 5.071 5.353 5.489 5.754 6.021 6.313 6.449 6.696 6.939 7.301 7.538 7.758 8.055 8.334 8.616 8.905 9.166 9.474 9.767 10.047 10.376 10.677 10.964 11.322 11.748 12.153 12.605 13.115 13.612 14.049 14.539 15.104 15.627 16.219 16.884 17.61 18.385 19.244 20.042 20.528 20.445 19.965 19.337 18.738 18.155 17.582 17.019 16.489 15.908 15.376 14.889 14.421 13.969 13.534 13.141 12.737 12.345 11.979 11.575 11.119 10.75 10.389 10.004 9.708 9.431 9.126 8.764 8.378 8.12 7.861 7.459 7.173 6.868 6.708 6.369 6.024 5.642 5.439 5.107 4.828 4.579 4.293 3.696 3.39 3.065 2.704 2.272 1.714 0.996 -5.362 -2 ,25512 ,TETRA ,17607553,Sun Nov 28 22:11:10 CET,Mon Nov 29 00:07:03 CET,0.0 3.052 3.691 4.191 4.603 4.957 5.293 5.561 5.991 6.184 6.384 6.635 6.942 7.111 7.441 7.718 7.97 8.117 8.41 8.672 9.012 9.227 9.445 9.728 10.023 10.331 10.617 10.886 11.225 11.551 11.858 12.198 12.492 12.779 13.154 13.579 13.944 14.337 14.763 15.201 15.708 16.29 16.908 17.485 18.066 18.716 19.426 20.106 20.837 21.564 22.06 21.929 21.491 20.933 20.361 19.767 19.157 18.54 17.996 17.44 16.936 16.464 16.01 15.588 15.164 14.752 14.309 13.909 13.557 13.187 12.809 12.498 12.174 11.81 11.509 11.198 10.876 10.529 10.174 9.94 9.672 9.225 8.93 8.621 8.462 8.131 7.774 7.393 7.2 6.86 6.536 6.304 6.071 5.542 5.249 4.895 4.495 4.041 3.501 2.775 -7.131 -4 ,19919 ,TETRA ,17607555,Sun Nov 28 22:11:37 CET,Mon Nov 29 00:06:59 CET,0.0 3.341 4.135 4.719 5.078 5.373 5.629 5.857 6.284 6.502 6.709 6.991 7.321 7.475 7.774 8.077 8.354 8.486 8.759 9.028 9.404 9.636 9.847 10.15 10.445 10.725 11.001 11.26 11.573 11.875 12.176 12.538 12.873 13.191 13.548 13.942 14.31 14.693 15.096 15.527 15.986 16.502 17.086 17.654 18.275 18.93 19.654 20.413 21.231 22.006 22.504 22.334 21.856 21.262 20.626 20.0 19.408 18.852 18.333 17.772 17.276 16.816 16.357 15.921 15.494 15.066 14.606 14.175 13.803 13.437 13.058 12.73 12.377 12.032 11.766 11.477 11.17 10.833 10.458 10.196 9.933 9.512 9.218 8.914 8.752 8.431 8.083 7.688 7.489 7.148 6.858 6.645 6.428 5.928 5.644 5.299 4.862 4.355 3.784 3.038 -0.818 -5 ,2071 ,TETRA ,17607556,Sun Nov 28 22:11:39 CET,Mon Nov 29 00:06:28 CET,0.0 1.905 2.49 3.009 3.466 3.817 4.107 4.36 4.83 5.039 5.216 5.431 5.731 5.892 6.205 6.486 6.744 6.87 7.111 7.342 7.678 7.898 8.11 8.409 8.691 8.951 9.194 9.428 9.727 10.015 10.296 10.65 11.001 11.334 11.719 12.155 12.566 12.982 13.405 13.869 14.335 14.825 15.39 15.979 16.628 17.324 18.058 18.76 19.474 20.158 20.731 20.665 20.196 19.596 18.953 18.324 17.738 17.159 16.591 16.015 15.523 15.057 14.593 14.121 13.674 13.265 12.828 12.434 12.094 11.729 11.344 11.032 10.704 10.366 10.098 9.794 9.476 9.152 8.801 8.564 8.31 7.898 7.613 7.307 7.146 6.814 6.469 6.079 5.865 5.513 5.186 4.953 4.692 4.08 3.75 3.371 2.966 2.517 1.885 0.916 -5.899 -6 ,11868 ,TETRA ,17607557,Sun Nov 28 22:11:42 CET,Mon Nov 29 00:06:37 CET,0.0 1.939 2.465 2.906 3.276 3.569 3.823 4.085 4.544 4.733 4.907 5.104 5.394 5.542 5.828 6.092 6.349 6.472 6.703 6.931 7.268 7.481 7.684 7.98 8.278 8.568 8.828 9.067 9.387 9.708 10.003 10.334 10.645 10.947 11.295 11.682 12.043 12.428 12.842 13.261 13.703 14.205 14.798 15.412 16.122 16.831 17.584 18.382 19.2 19.939 20.451 20.371 19.944 19.332 18.639 17.86 17.138 16.526 16.0 15.436 14.905 14.44 13.983 13.533 13.074 12.645 12.195 11.773 11.399 11.005 10.597 10.248 9.888 9.506 9.186 8.864 8.552 8.221 7.871 7.636 7.399 7.013 6.73 6.434 6.284 5.987 5.662 5.288 5.094 4.767 4.493 4.254 3.99 3.403 3.09 2.741 2.315 1.799 1.204 0.455 -2.282 -7 ,15501 ,TETRA ,17607558,Sun Nov 28 22:11:37 CET,Mon Nov 29 00:06:37 CET,0.0 3.518 4.183 4.614 4.943 5.23 5.496 5.741 6.183 6.382 6.566 6.787 7.089 7.248 7.573 7.865 8.124 8.248 8.474 8.689 8.993 9.193 9.392 9.686 9.983 10.285 10.575 10.843 11.194 11.538 11.855 12.226 12.596 12.943 13.332 13.734 14.129 14.623 15.171 15.721 16.221 16.716 17.272 17.815 18.453 19.147 19.855 20.569 21.311 21.981 22.41 22.336 21.887 21.302 20.671 20.032 19.419 18.813 18.264 17.695 17.171 16.624 16.082 15.578 15.093 14.622 14.131 13.689 13.276 12.848 12.414 12.066 11.712 11.317 11.013 10.729 10.416 10.079 9.738 9.481 9.214 8.809 8.529 8.236 8.079 7.75 7.394 7.004 6.791 6.435 6.128 5.895 5.652 5.101 4.783 4.406 3.969 3.516 3.02 2.368 -1.512 -8 ,11861 ,TETRA ,17607559,Sun Nov 28 22:11:39 CET,Mon Nov 29 00:06:36 CET,0.0 2.485 3.086 3.525 3.852 4.153 4.43 4.689 5.211 5.446 5.653 5.916 6.247 6.436 6.793 7.131 7.43 7.566 7.814 8.05 8.411 8.645 8.856 9.146 9.432 9.697 9.939 10.171 10.47 10.765 11.041 11.389 11.729 12.042 12.404 12.819 13.229 13.668 14.133 14.613 15.089 15.624 16.22 16.787 17.439 18.153 18.919 19.69 20.461 21.125 21.614 21.538 21.043 20.396 19.732 19.045 18.413 17.842 17.298 16.703 16.165 15.652 15.129 14.653 14.232 13.829 13.411 13.021 12.66 12.276 11.848 11.485 11.127 10.745 10.423 10.094 9.769 9.436 9.081 8.822 8.531 8.091 7.804 7.494 7.332 7.008 6.672 6.291 6.082 5.732 5.411 5.166 4.921 4.429 4.133 3.778 3.386 2.944 2.439 1.587 -3.993 -9 ,12812 ,TETRA ,17607560,Sun Nov 28 22:11:42 CET,Mon Nov 29 00:06:46 CET,0.0 3.445 3.96 4.342 4.655 4.92 5.179 5.415 5.84 6.037 6.223 6.426 6.714 6.867 7.175 7.467 7.754 7.897 8.148 8.38 8.719 8.924 9.116 9.407 9.708 9.998 10.287 10.569 10.909 11.229 11.513 11.827 12.138 12.441 12.791 13.186 13.545 13.943 14.373 14.816 15.272 15.775 16.373 16.951 17.587 18.256 18.951 19.671 20.428 21.167 21.665 21.509 21.009 20.408 19.794 19.18 18.556 17.948 17.397 16.794 16.24 15.748 15.273 14.812 14.351 13.888 13.379 12.924 12.539 12.123 11.673 11.306 10.927 10.534 10.242 9.931 9.619 9.308 8.98 8.75 8.495 8.115 7.85 7.545 7.394 7.091 6.764 6.374 6.149 5.797 5.517 5.274 5.011 4.451 4.144 3.793 3.41 3.004 2.481 1.668 -4.503 -10 ,14041 ,TETRA ,17607561,Sun Nov 28 22:11:43 CET,Mon Nov 29 00:06:35 CET,0.0 3.015 3.775 4.305 4.733 5.139 5.495 5.769 6.236 6.453 6.675 6.973 7.294 7.473 7.819 8.126 8.403 8.536 8.789 9.018 9.382 9.61 9.812 10.104 10.364 10.609 10.854 11.089 11.392 11.683 11.982 12.357 12.69 13.018 13.419 13.847 14.237 14.654 15.099 15.559 16.019 16.506 17.065 17.617 18.225 18.872 19.575 20.352 21.14 21.829 22.312 22.19 21.777 21.176 20.525 19.902 19.297 18.685 18.104 17.523 16.992 16.487 15.987 15.491 15.027 14.603 14.173 13.761 13.386 13.035 12.663 12.324 11.979 11.631 11.359 11.086 10.797 10.473 10.116 9.868 9.608 9.185 8.887 8.572 8.409 8.076 7.724 7.36 7.173 6.833 6.531 6.29 6.037 5.447 5.105 4.733 4.329 3.865 3.279 2.47 -1.959 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt deleted file mode 100644 index 7e927a2a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3090 ,TETRA ,17616201,Mon Nov 29 09:48:50 CET,Mon Nov 29 12:11:16 CET,0.0 1.723 2.129 2.41 2.687 2.952 3.187 3.41 3.823 4.007 4.177 4.223 4.66 4.804 5.089 5.353 5.597 5.714 5.937 6.144 6.438 6.64 6.839 7.107 7.366 7.619 7.855 8.077 8.374 8.664 8.947 9.299 9.641 9.965 10.339 10.768 11.19 11.723 12.365 13.025 13.707 14.448 15.33 16.262 17.315 18.484 19.848 21.365 23.011 24.795 26.788 28.304 29.051 29.412 29.612 29.719 29.76 29.727 29.657 29.576 29.498 29.406 29.307 29.188 29.051 28.939 28.829 28.731 28.643 28.552 28.447 28.352 28.248 28.137 28.042 27.915 27.769 27.612 27.419 27.286 27.185 27.044 26.919 26.763 26.68 26.511 26.339 26.163 26.063 25.699 25.756 25.655 25.559 25.332 25.197 25.027 24.82 24.615 24.413 24.101 23.437 -2 ,6063 ,TETRA ,17616202,Mon Nov 29 09:49:18 CET,Mon Nov 29 12:16:14 CET,0.0 0.803 1.074 1.319 1.541 1.723 1.901 2.076 2.393 2.555 2.699 2.655 3.066 3.193 3.443 3.678 3.901 4.011 4.232 4.42 4.695 4.887 5.084 5.396 5.714 6.004 6.245 6.482 6.823 7.143 7.435 7.788 8.133 8.472 8.86 9.298 9.734 10.205 10.705 11.26 11.85 12.527 13.344 14.164 15.121 16.156 17.354 18.754 20.429 22.453 24.79 26.65 27.646 28.156 28.468 28.648 28.666 28.643 28.616 28.548 28.463 28.376 28.299 28.199 28.087 28.006 27.913 27.795 27.681 27.556 27.423 27.323 27.213 27.084 26.984 26.88 26.768 26.653 26.53 26.443 26.349 26.197 26.093 25.977 25.904 25.75 25.579 25.369 25.266 24.913 25.003 24.922 24.822 24.541 24.399 24.26 24.092 23.92 23.731 23.473 22.846 -3 ,26165 ,TETRA ,17616203,Mon Nov 29 09:48:50 CET,Mon Nov 29 12:10:09 CET,0.0 1.064 1.46 1.713 1.932 2.146 2.35 2.544 2.901 3.071 3.234 3.235 3.668 3.798 4.046 4.277 4.518 4.642 4.888 5.124 5.452 5.673 5.888 6.169 6.413 6.647 6.885 7.141 7.475 7.771 8.057 8.417 8.759 9.091 9.489 9.938 10.372 10.86 11.376 11.939 12.568 13.269 14.097 14.939 15.915 17.004 18.281 19.731 21.372 23.279 25.53 27.282 28.143 28.582 28.825 28.989 29.088 29.12 29.076 29.009 28.948 28.871 28.801 28.718 28.624 28.529 28.424 28.316 28.226 28.133 28.009 27.903 27.798 27.694 27.603 27.478 27.326 27.16 27.012 26.926 26.835 26.69 26.584 26.471 26.412 26.289 26.152 26.011 25.948 25.631 25.731 25.632 25.526 25.265 25.124 24.974 24.784 24.571 24.308 23.993 23.245 -4 ,25282 ,TETRA ,17616204,Mon Nov 29 09:48:46 CET,Mon Nov 29 12:10:18 CET,0.0 1.21 1.614 1.894 2.14 2.379 2.59 2.762 3.077 3.223 3.368 3.375 3.806 3.943 4.204 4.456 4.695 4.809 5.016 5.219 5.541 5.732 5.911 6.191 6.458 6.709 6.935 7.163 7.475 7.769 8.065 8.409 8.743 9.084 9.498 9.961 10.418 10.924 11.433 11.98 12.566 13.227 14.037 14.835 15.757 16.833 18.046 19.407 21.062 23.021 25.38 27.309 28.377 29.0 29.357 29.573 29.661 29.656 29.631 29.588 29.521 29.446 29.359 29.264 29.167 29.059 28.901 28.753 28.647 28.538 28.426 28.333 28.226 28.099 27.978 27.852 27.746 27.646 27.522 27.433 27.344 27.189 27.087 26.997 26.948 26.827 26.684 26.536 26.462 26.116 26.2 26.115 26.019 25.798 25.692 25.57 25.418 25.268 25.078 24.762 23.954 -5 ,29730 ,TETRA ,17616205,Mon Nov 29 09:48:47 CET,Mon Nov 29 12:08:58 CET,0.0 0.712 1.075 1.376 1.644 1.904 2.16 2.382 2.759 2.933 3.098 3.094 3.496 3.621 3.879 4.123 4.354 4.466 4.703 4.946 5.301 5.523 5.724 6.0 6.259 6.514 6.765 7.003 7.315 7.64 7.962 8.343 8.72 9.08 9.489 9.952 10.401 10.902 11.46 12.061 12.681 13.379 14.172 14.943 15.873 16.927 18.145 19.53 21.192 23.198 25.561 27.413 28.363 28.908 29.205 29.345 29.4 29.399 29.392 29.335 29.229 29.142 29.059 28.963 28.866 28.753 28.622 28.522 28.432 28.298 28.117 27.97 27.82 27.653 27.521 27.382 27.236 27.099 26.969 26.88 26.786 26.613 26.499 26.397 26.348 26.237 26.103 25.953 25.879 25.551 25.653 25.561 25.465 25.246 25.115 24.976 24.823 24.648 24.46 24.148 23.123 -6 ,22558 ,TETRA ,17616206,Mon Nov 29 09:48:46 CET,Mon Nov 29 12:01:30 CET,0.0 0.691 1.066 1.335 1.565 1.784 1.978 2.158 2.512 2.665 2.797 2.774 3.206 3.348 3.6 3.836 4.077 4.199 4.435 4.65 4.998 5.229 5.439 5.741 6.012 6.279 6.536 6.77 7.076 7.373 7.668 8.035 8.399 8.744 9.12 9.54 9.958 10.422 10.924 11.476 12.076 12.749 13.565 14.419 15.408 16.518 17.815 19.268 20.928 22.873 25.225 27.034 28.004 28.592 28.938 29.121 29.185 29.184 29.153 29.086 28.968 28.809 28.668 28.54 28.407 28.289 28.166 28.051 27.946 27.831 27.713 27.581 27.445 27.336 27.237 27.12 26.984 26.843 26.71 26.622 26.525 26.375 26.277 26.171 26.115 25.983 25.852 25.718 25.648 25.312 25.387 25.283 25.162 24.901 24.766 24.605 24.44 24.287 24.096 23.824 23.302 -7 ,11565 ,TETRA ,17616207,Mon Nov 29 09:48:47 CET,Mon Nov 29 12:09:33 CET,0.0 0.985 1.353 1.665 1.954 2.211 2.449 2.664 3.042 3.239 3.423 3.431 3.861 4.014 4.311 4.584 4.832 4.955 5.199 5.428 5.738 5.939 6.139 6.424 6.707 6.994 7.291 7.59 7.95 8.265 8.561 8.913 9.248 9.573 9.943 10.364 10.779 11.238 11.728 12.241 12.789 13.404 14.171 15.003 15.955 16.998 18.218 19.568 21.106 22.952 25.227 26.957 27.817 28.303 28.576 28.712 28.767 28.773 28.745 28.66 28.555 28.454 28.359 28.28 28.185 28.077 27.97 27.872 27.768 27.648 27.511 27.395 27.285 27.165 27.074 26.987 26.879 26.733 26.564 26.453 26.362 26.228 26.113 25.984 25.911 25.776 25.647 25.507 25.44 25.102 25.184 25.092 24.989 24.75 24.628 24.496 24.352 24.169 23.923 23.604 22.495 -8 ,16660 ,TETRA ,17616208,Mon Nov 29 09:48:49 CET,Mon Nov 29 12:10:40 CET,0.0 0.696 0.993 1.285 1.528 1.721 1.911 2.088 2.406 2.552 2.69 2.658 3.073 3.193 3.455 3.727 3.98 4.095 4.303 4.507 4.797 4.988 5.181 5.441 5.701 5.951 6.179 6.401 6.707 6.997 7.285 7.642 7.979 8.321 8.733 9.202 9.63 10.071 10.54 11.083 11.699 12.354 13.1 13.867 14.76 15.79 16.986 18.316 19.883 21.734 23.914 25.621 26.562 27.085 27.345 27.453 27.489 27.497 27.47 27.428 27.388 27.323 27.233 27.141 27.038 26.929 26.798 26.668 26.574 26.477 26.357 26.239 26.123 26.0 25.901 25.798 25.684 25.566 25.441 25.352 25.267 25.131 25.019 24.895 24.837 24.719 24.591 24.456 24.374 24.017 24.093 23.984 23.88 23.683 23.565 23.446 23.323 23.193 23.032 22.775 22.25 -9 ,18679 ,TETRA ,17616209,Mon Nov 29 09:48:47 CET,Mon Nov 29 12:07:19 CET,0.0 0.943 1.212 1.444 1.648 1.836 2.01 2.177 2.496 2.66 2.828 2.835 3.261 3.397 3.677 3.949 4.207 4.335 4.568 4.792 5.118 5.319 5.509 5.781 6.047 6.311 6.576 6.83 7.149 7.466 7.79 8.184 8.546 8.904 9.305 9.761 10.22 10.702 11.215 11.757 12.349 13.037 13.827 14.64 15.598 16.66 17.899 19.266 20.832 22.687 24.888 26.674 27.667 28.2 28.471 28.536 28.541 28.516 28.419 28.31 28.223 28.112 27.979 27.863 27.782 27.7 27.588 27.492 27.415 27.31 27.186 27.09 26.988 26.861 26.758 26.654 26.549 26.437 26.307 26.212 26.107 25.94 25.805 25.679 25.618 25.483 25.35 25.164 25.066 24.725 24.83 24.75 24.665 24.446 24.311 24.165 24.012 23.838 23.621 23.313 22.273 -10 ,17730 ,TETRA ,17616210,Mon Nov 29 09:48:48 CET,Mon Nov 29 12:08:24 CET,0.0 1.152 1.589 1.903 2.146 2.376 2.599 2.835 3.29 3.484 3.668 3.731 4.196 4.355 4.667 4.968 5.239 5.352 5.546 5.741 6.025 6.2 6.383 6.662 6.925 7.186 7.432 7.667 7.977 8.276 8.557 8.892 9.223 9.539 9.917 10.359 10.782 11.254 11.759 12.309 12.892 13.551 14.34 15.116 16.028 17.068 18.279 19.668 21.293 23.209 25.603 27.577 28.63 29.176 29.456 29.651 29.736 29.702 29.608 29.487 29.389 29.297 29.204 29.083 28.937 28.809 28.642 28.461 28.286 28.099 27.934 27.817 27.682 27.529 27.424 27.306 27.177 27.053 26.919 26.824 26.721 26.566 26.459 26.345 26.282 26.137 25.952 25.748 25.66 25.309 25.386 25.274 25.147 24.839 24.663 24.494 24.33 24.143 23.951 23.72 22.837 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 90d1fe89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12855 ,KEBNE ,17027805,Wed Dec 22 18:10:07 CET,Wed Dec 22 20:07:02 CET,0.0 0.75 0.878 0.987 1.093 1.178 1.291 1.457 1.788 1.883 1.906 1.607 1.884 1.879 1.893 1.903 1.874 1.849 1.796 1.766 1.73 1.669 1.597 1.496 1.387 1.269 1.135 0.995 0.815 0.625 0.414 0.147 -0.103 -0.351 -0.707 -1.19 -1.711 -2.322 -3.013 -3.827 -4.729 -5.772 -7.102 -8.593 -10.494 -12.768 -15.655 -19.365 -24.537 -31.931 -42.997 -54.801 -63.638 -70.68 -76.359 -81.134 -85.074 -88.475 -91.291 -93.96 -96.154 -98.043 -99.803 -101.426 -102.89 -104.188 -105.513 -106.669 -107.64 -108.641 -109.656 -110.463 -111.279 -112.095 -112.719 -113.367 -114.01 -114.664 -115.332 -115.782 -116.248 -116.943 -117.404 -117.882 -118.128 -118.64 -119.168 -119.702 -119.978 -120.695 -120.865 -121.175 -121.484 -122.129 -122.492 -122.879 -123.268 -123.67 -124.097 -124.634 -126.132 -2 ,25196 ,KEBNE ,17027806,Wed Dec 22 18:10:07 CET,Wed Dec 22 20:06:37 CET,0.0 1.491 1.823 2.023 2.175 2.317 2.457 2.571 2.706 2.752 2.811 2.623 2.921 2.958 3.033 3.039 3.036 3.039 3.04 3.026 2.973 2.925 2.872 2.799 2.75 2.69 2.603 2.506 2.348 2.136 1.894 1.593 1.286 0.961 0.536 0.04 -0.434 -1.005 -1.67 -2.447 -3.333 -4.385 -5.741 -7.245 -9.16 -11.533 -14.58 -18.453 -23.665 -30.958 -42.037 -53.845 -62.677 -69.637 -75.19 -79.864 -83.751 -87.089 -89.844 -92.483 -94.665 -96.55 -98.316 -99.93 -101.373 -102.653 -103.961 -105.094 -106.051 -107.016 -107.978 -108.777 -109.587 -110.389 -111.001 -111.631 -112.264 -112.919 -113.625 -114.125 -114.621 -115.369 -115.914 -116.487 -116.766 -117.315 -117.86 -118.422 -118.728 -119.461 -119.672 -119.996 -120.334 -121.062 -121.458 -121.885 -122.335 -122.814 -123.392 -124.22 -126.494 -3 ,24928 ,KEBNE ,17027807,Wed Dec 22 18:10:07 CET,Wed Dec 22 20:07:21 CET,0.0 0.874 1.056 1.178 1.288 1.396 1.495 1.593 1.717 1.744 1.766 1.54 1.837 1.85 1.873 1.909 1.946 1.957 1.956 1.928 1.865 1.834 1.789 1.7 1.627 1.546 1.434 1.294 1.08 0.864 0.632 0.31 -0.026 -0.356 -0.734 -1.174 -1.652 -2.248 -2.955 -3.758 -4.62 -5.632 -6.98 -8.489 -10.355 -12.649 -15.593 -19.35 -24.477 -31.673 -42.346 -53.81 -62.527 -69.383 -74.907 -79.514 -83.251 -86.427 -89.088 -91.657 -93.767 -95.633 -97.402 -99.026 -100.479 -101.762 -103.098 -104.251 -105.207 -106.173 -107.138 -107.932 -108.756 -109.586 -110.21 -110.846 -111.495 -112.154 -112.816 -113.258 -113.708 -114.396 -114.861 -115.35 -115.611 -116.139 -116.671 -117.2 -117.467 -118.165 -118.306 -118.593 -118.877 -119.51 -119.853 -120.183 -120.537 -120.954 -121.398 -122.012 -124.245 -4 ,24770 ,KEBNE ,17027808,Wed Dec 22 18:14:16 CET,Wed Dec 22 20:09:50 CET,0.0 1.047 1.331 1.573 1.737 1.852 1.951 2.036 2.172 2.205 2.219 1.969 2.269 2.27 2.267 2.259 2.259 2.258 2.24 2.205 2.125 2.065 1.999 1.884 1.763 1.625 1.471 1.318 1.119 0.903 0.666 0.368 0.063 -0.251 -0.654 -1.139 -1.624 -2.198 -2.857 -3.624 -4.493 -5.532 -6.843 -8.313 -10.235 -12.593 -15.617 -19.523 -24.713 -31.895 -42.802 -54.239 -62.88 -69.816 -75.382 -80.069 -83.93 -87.239 -89.993 -92.662 -94.893 -96.804 -98.582 -100.24 -101.752 -103.068 -104.37 -105.529 -106.523 -107.515 -108.542 -109.388 -110.226 -111.053 -111.688 -112.358 -113.036 -113.72 -114.422 -114.886 -115.347 -116.054 -116.541 -117.031 -117.282 -117.802 -118.318 -118.847 -119.126 -119.838 -119.998 -120.312 -120.638 -121.343 -121.74 -122.14 -122.54 -122.978 -123.494 -124.208 -126.182 -5 ,14880 ,KEBNE ,17027809,Wed Dec 22 18:14:15 CET,Wed Dec 22 20:10:32 CET,0.0 0.904 1.158 1.374 1.562 1.712 1.817 1.9 2.025 2.071 2.11 1.901 2.205 2.196 2.172 2.153 2.124 2.107 2.061 1.998 1.876 1.803 1.727 1.597 1.472 1.335 1.171 1.018 0.829 0.603 0.354 0.041 -0.27 -0.577 -0.952 -1.428 -1.927 -2.523 -3.216 -4.023 -4.935 -6.026 -7.413 -8.929 -10.843 -13.16 -16.152 -20.005 -25.242 -32.534 -43.392 -55.015 -63.692 -70.558 -76.076 -80.705 -84.492 -87.703 -90.376 -92.954 -95.101 -96.956 -98.676 -100.266 -101.712 -103.009 -104.302 -105.418 -106.392 -107.385 -108.377 -109.189 -110.012 -110.833 -111.456 -112.086 -112.724 -113.385 -114.055 -114.521 -114.995 -115.704 -116.191 -116.694 -116.952 -117.469 -117.985 -118.531 -118.824 -119.555 -119.746 -120.055 -120.37 -121.035 -121.386 -121.766 -122.178 -122.65 -123.17 -123.779 -125.42 -6 ,13324 ,KEBNE ,17027810,Wed Dec 22 18:14:15 CET,Wed Dec 22 20:09:55 CET,0.0 1.155 1.485 1.773 1.971 2.119 2.227 2.323 2.528 2.618 2.692 2.498 2.829 2.873 2.955 3.021 3.053 3.059 3.069 3.09 3.118 3.116 3.109 3.099 3.054 2.966 2.865 2.744 2.53 2.312 2.097 1.811 1.512 1.195 0.81 0.355 -0.127 -0.684 -1.336 -2.114 -3.011 -4.082 -5.408 -6.888 -8.791 -11.141 -14.131 -17.912 -23.023 -30.308 -41.364 -53.086 -61.915 -68.843 -74.399 -79.02 -82.82 -86.15 -88.956 -91.632 -93.816 -95.683 -97.389 -98.982 -100.448 -101.736 -103.061 -104.223 -105.188 -106.154 -107.145 -107.961 -108.784 -109.625 -110.275 -110.937 -111.607 -112.297 -113.018 -113.502 -113.987 -114.714 -115.218 -115.745 -116.003 -116.507 -117.025 -117.587 -117.869 -118.578 -118.718 -118.998 -119.302 -119.98 -120.322 -120.695 -121.13 -121.594 -122.11 -122.753 -124.618 -7 ,28823 ,KEBNE ,17027811,Wed Dec 22 18:14:15 CET,Wed Dec 22 20:10:18 CET,0.0 0.837 1.11 1.322 1.478 1.589 1.706 1.822 1.999 2.039 2.075 1.851 2.147 2.157 2.144 2.115 2.094 2.084 2.054 2.011 1.943 1.903 1.853 1.744 1.612 1.475 1.339 1.194 0.996 0.789 0.548 0.233 -0.082 -0.412 -0.817 -1.305 -1.805 -2.382 -3.055 -3.821 -4.695 -5.78 -7.168 -8.652 -10.557 -12.925 -15.889 -19.631 -24.714 -31.929 -42.951 -54.743 -63.49 -70.279 -75.715 -80.275 -84.044 -87.27 -89.931 -92.48 -94.584 -96.415 -98.11 -99.669 -101.075 -102.332 -103.623 -104.739 -105.677 -106.639 -107.63 -108.428 -109.235 -110.064 -110.685 -111.313 -111.954 -112.599 -113.251 -113.693 -114.144 -114.836 -115.312 -115.787 -116.023 -116.504 -116.998 -117.51 -117.779 -118.493 -118.678 -118.989 -119.295 -119.927 -120.263 -120.63 -121.049 -121.494 -121.962 -122.572 -124.778 -8 ,21317 ,KEBNE ,17027812,Wed Dec 22 18:14:15 CET,Wed Dec 22 20:09:54 CET,0.0 1.552 1.835 1.978 2.065 2.171 2.286 2.354 2.422 2.448 2.476 2.221 2.526 2.529 2.519 2.512 2.498 2.473 2.405 2.352 2.306 2.275 2.228 2.111 1.973 1.834 1.695 1.567 1.379 1.156 0.928 0.639 0.335 0.019 -0.379 -0.854 -1.351 -1.96 -2.636 -3.392 -4.273 -5.342 -6.699 -8.212 -10.156 -12.53 -15.558 -19.43 -24.622 -31.8 -42.737 -54.558 -63.345 -70.259 -75.819 -80.426 -84.261 -87.586 -90.322 -93.029 -95.295 -97.245 -99.053 -100.68 -102.18 -103.528 -104.871 -106.046 -107.042 -108.057 -109.093 -109.944 -110.811 -111.687 -112.355 -113.014 -113.68 -114.36 -115.034 -115.501 -115.981 -116.701 -117.196 -117.695 -117.948 -118.467 -119.001 -119.562 -119.849 -120.559 -120.74 -121.064 -121.392 -122.055 -122.399 -122.777 -123.193 -123.661 -124.203 -124.851 -127.229 -9 ,11176 ,KEBNE ,17027813,Wed Dec 22 18:14:15 CET,Wed Dec 22 20:10:26 CET,0.0 1.907 2.148 2.301 2.447 2.588 2.705 2.799 2.885 2.914 2.952 2.692 2.978 2.982 2.965 2.951 2.953 2.941 2.923 2.898 2.853 2.816 2.743 2.621 2.508 2.395 2.287 2.166 1.98 1.774 1.535 1.247 0.934 0.59 0.198 -0.264 -0.756 -1.357 -2.06 -2.846 -3.738 -4.826 -6.226 -7.76 -9.701 -12.112 -15.213 -19.153 -24.349 -31.497 -42.172 -53.549 -62.214 -69.151 -74.683 -79.288 -83.106 -86.428 -89.246 -91.956 -94.182 -96.131 -97.918 -99.542 -100.998 -102.307 -103.677 -104.838 -105.808 -106.812 -107.845 -108.692 -109.579 -110.473 -111.119 -111.775 -112.437 -113.097 -113.787 -114.266 -114.747 -115.482 -115.996 -116.534 -116.805 -117.365 -117.953 -118.573 -118.89 -119.625 -119.824 -120.154 -120.494 -121.22 -121.597 -121.992 -122.433 -122.949 -123.549 -124.294 -127.102 -10 ,31766 ,KEBNE ,17027814,Wed Dec 22 18:14:16 CET,Wed Dec 22 20:10:24 CET,0.0 1.631 2.014 2.284 2.465 2.588 2.676 2.73 2.834 2.882 2.943 2.762 3.092 3.128 3.16 3.187 3.209 3.221 3.242 3.242 3.226 3.219 3.212 3.179 3.132 3.074 2.979 2.832 2.613 2.39 2.156 1.864 1.558 1.228 0.828 0.338 -0.178 -0.779 -1.472 -2.244 -3.126 -4.205 -5.578 -7.1 -9.031 -11.361 -14.289 -18.09 -23.244 -30.393 -41.323 -53.01 -61.787 -68.654 -74.191 -78.959 -82.858 -86.141 -88.835 -91.478 -93.718 -95.633 -97.412 -99.091 -100.631 -101.985 -103.337 -104.483 -105.457 -106.461 -107.475 -108.305 -109.161 -110.019 -110.662 -111.311 -111.985 -112.671 -113.381 -113.865 -114.336 -115.052 -115.56 -116.102 -116.374 -116.916 -117.48 -118.061 -118.37 -119.125 -119.32 -119.634 -119.969 -120.698 -121.115 -121.536 -121.955 -122.399 -122.891 -123.463 -125.148 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index c0c750c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,32058 ,TETRA ,17616212,Mon Nov 29 09:48:47 CET,Mon Nov 29 12:02:36 CET,0.0 0.265 0.516 0.712 0.889 1.069 1.245 1.408 1.722 1.882 2.044 2.08 2.523 2.678 2.999 3.32 3.626 3.772 4.071 4.377 4.831 5.129 5.411 5.829 6.258 6.688 7.093 7.488 8.012 8.528 9.044 9.675 10.301 10.938 11.676 12.508 13.346 14.289 15.311 16.401 17.565 18.933 20.556 22.192 24.104 26.307 29.118 32.226 35.586 39.462 43.642 46.21 47.124 47.438 47.468 47.28 46.923 46.485 46.055 45.495 44.961 44.468 43.97 43.49 43.014 42.58 42.126 41.735 41.391 41.0 40.572 40.215 39.863 39.471 39.147 38.812 38.47 38.119 37.758 37.502 37.231 36.77 36.435 36.109 35.93 35.565 35.198 34.805 34.592 34.131 33.904 33.637 33.362 32.776 32.457 32.075 31.58 31.002 30.339 29.183 23.051 -8 ,27749 ,TETRA ,17616218,Mon Nov 29 09:48:48 CET,Mon Nov 29 12:01:54 CET,0.0 0.376 0.586 0.77 0.936 1.106 1.274 1.432 1.741 1.899 2.059 2.079 2.516 2.667 2.94 3.217 3.504 3.638 3.902 4.167 4.554 4.804 5.054 5.425 5.807 6.191 6.579 6.967 7.466 7.954 8.414 8.982 9.531 10.087 10.766 11.525 12.251 13.072 13.997 14.994 16.044 17.257 18.705 20.172 21.954 24.081 26.615 29.371 32.427 36.084 40.309 43.372 45.097 46.045 46.484 46.61 46.539 46.43 46.322 46.085 45.821 45.586 45.289 45.006 44.749 44.484 44.18 43.863 43.569 43.261 42.961 42.713 42.438 42.152 41.917 41.659 41.355 41.018 40.643 40.39 40.168 39.847 39.59 39.299 39.151 38.844 38.532 38.168 37.94 37.453 37.226 36.998 36.746 36.145 35.793 35.385 34.919 34.359 33.657 32.776 25.56 -9 ,28506 ,TETRA ,17616219,Mon Nov 29 09:48:48 CET,Mon Nov 29 12:02:14 CET,0.0 0.345 0.597 0.789 0.976 1.174 1.355 1.529 1.878 2.048 2.21 2.227 2.67 2.832 3.152 3.457 3.765 3.929 4.249 4.536 4.95 5.229 5.508 5.915 6.323 6.748 7.167 7.563 8.08 8.589 9.109 9.762 10.397 11.009 11.746 12.605 13.448 14.404 15.447 16.583 17.803 19.199 20.886 22.6 24.558 26.735 29.293 32.169 35.542 39.458 43.728 46.515 47.67 48.089 48.139 48.001 47.693 47.276 46.815 46.267 45.761 45.306 44.855 44.4 43.946 43.527 43.084 42.647 42.275 41.89 41.47 41.102 40.717 40.322 39.996 39.663 39.348 39.011 38.634 38.386 38.135 37.712 37.412 37.089 36.928 36.61 36.273 35.888 35.674 35.208 34.978 34.721 34.427 33.785 33.404 32.907 32.339 31.574 30.556 29.349 24.24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt deleted file mode 100644 index 49d29971..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9908 ,TETRA ,17616221,Mon Nov 29 09:48:49 CET,Mon Nov 29 12:11:50 CET,0.0 0.384 0.566 0.746 0.899 1.039 1.171 1.287 1.508 1.614 1.717 1.795 2.012 2.106 2.274 2.426 2.585 2.667 2.82 2.967 3.184 3.325 3.472 3.697 3.908 4.105 4.293 4.478 4.718 4.952 5.184 5.467 5.746 6.014 6.331 6.718 7.099 7.512 7.958 8.421 8.896 9.446 10.105 10.778 11.567 12.458 13.498 14.683 16.132 17.949 20.234 22.102 23.186 23.789 24.174 24.441 24.58 24.65 24.672 24.661 24.615 24.556 24.481 24.389 24.289 24.191 24.102 24.018 23.938 23.856 23.757 23.669 23.57 23.479 23.408 23.325 23.241 23.153 23.054 22.976 22.884 22.722 22.604 22.486 22.435 22.345 22.251 22.151 22.093 21.93 21.852 21.763 21.677 21.497 21.396 21.291 21.152 21.006 20.862 20.664 20.295 -2 ,27170 ,TETRA ,17616222,Mon Nov 29 09:48:50 CET,Mon Nov 29 12:08:17 CET,0.0 0.84 1.085 1.24 1.391 1.527 1.656 1.777 1.995 2.116 2.245 2.34 2.554 2.652 2.851 3.033 3.201 3.281 3.441 3.603 3.855 4.018 4.166 4.374 4.57 4.764 4.971 5.174 5.427 5.675 5.917 6.209 6.496 6.771 7.093 7.459 7.819 8.217 8.65 9.137 9.662 10.245 10.929 11.639 12.509 13.525 14.72 16.076 17.682 19.608 22.153 24.368 25.624 26.437 26.963 27.327 27.585 27.736 27.818 27.866 27.839 27.802 27.764 27.688 27.608 27.525 27.434 27.344 27.255 27.159 27.055 26.977 26.905 26.803 26.716 26.624 26.52 26.431 26.342 26.28 26.213 26.1 26.026 25.947 25.903 25.808 25.695 25.573 25.52 25.362 25.299 25.226 25.14 24.931 24.81 24.657 24.478 24.281 24.098 23.851 22.844 -3 ,26315 ,TETRA ,17616223,Mon Nov 29 09:48:53 CET,Mon Nov 29 11:59:03 CET,0.0 0.448 0.701 0.885 1.05 1.197 1.323 1.453 1.7 1.811 1.917 1.981 2.197 2.3 2.492 2.663 2.831 2.919 3.084 3.236 3.467 3.622 3.775 3.989 4.194 4.402 4.614 4.82 5.067 5.303 5.538 5.822 6.105 6.388 6.717 7.098 7.46 7.859 8.312 8.795 9.284 9.862 10.562 11.267 12.097 13.031 14.166 15.476 17.064 19.085 21.661 23.849 25.147 26.024 26.594 26.95 27.199 27.352 27.424 27.459 27.476 27.49 27.485 27.457 27.412 27.374 27.327 27.266 27.216 27.165 27.085 26.99 26.895 26.803 26.713 26.603 26.494 26.386 26.259 26.165 26.066 25.903 25.793 25.684 25.625 25.501 25.367 25.23 25.163 25.004 24.961 24.889 24.808 24.641 24.559 24.452 24.313 24.182 24.013 23.704 22.658 -4 ,5839 ,TETRA ,17616224,Mon Nov 29 09:48:49 CET,Mon Nov 29 12:18:22 CET,0.0 0.546 0.767 0.982 1.18 1.334 1.462 1.598 1.881 2.011 2.135 2.253 2.493 2.602 2.805 3.012 3.204 3.297 3.472 3.638 3.882 4.033 4.179 4.4 4.607 4.8 4.992 5.181 5.441 5.689 5.919 6.205 6.496 6.785 7.133 7.542 7.944 8.374 8.829 9.33 9.857 10.435 11.137 11.913 12.83 13.829 15.012 16.43 18.162 20.244 22.815 25.117 26.519 27.305 27.768 28.083 28.306 28.483 28.588 28.601 28.538 28.462 28.392 28.329 28.273 28.217 28.148 28.076 28.01 27.925 27.817 27.736 27.65 27.562 27.489 27.402 27.311 27.203 27.09 27.013 26.931 26.79 26.692 26.6 26.554 26.465 26.365 26.259 26.21 26.057 26.007 25.942 25.882 25.713 25.619 25.526 25.416 25.252 25.057 24.817 24.41 -5 ,22699 ,TETRA ,17616226,Mon Nov 29 09:48:50 CET,Mon Nov 29 12:13:47 CET,0.0 0.411 0.604 0.784 0.919 1.054 1.191 1.315 1.536 1.634 1.727 1.788 2.0 2.091 2.265 2.423 2.579 2.658 2.808 2.948 3.151 3.282 3.409 3.6 3.794 3.989 4.186 4.372 4.617 4.861 5.106 5.409 5.692 5.964 6.272 6.613 6.952 7.338 7.766 8.23 8.708 9.249 9.905 10.589 11.404 12.376 13.536 14.817 16.337 18.249 20.678 22.723 23.869 24.518 24.969 25.277 25.452 25.559 25.603 25.611 25.546 25.43 25.311 25.188 25.059 24.956 24.841 24.725 24.634 24.524 24.376 24.254 24.125 23.992 23.897 23.782 23.645 23.491 23.327 23.227 23.118 22.937 22.825 22.718 22.667 22.546 22.413 22.251 22.147 21.96 21.884 21.791 21.691 21.474 21.35 21.226 21.06 20.829 20.644 20.415 19.56 -6 ,12291 ,TETRA ,17616227,Mon Nov 29 09:48:51 CET,Mon Nov 29 12:00:41 CET,0.0 0.384 0.573 0.755 0.908 1.033 1.174 1.304 1.537 1.639 1.731 1.784 2.003 2.109 2.298 2.472 2.637 2.72 2.9 3.071 3.291 3.436 3.585 3.805 4.025 4.255 4.479 4.685 4.946 5.208 5.458 5.765 6.078 6.382 6.725 7.088 7.44 7.847 8.294 8.762 9.25 9.806 10.509 11.222 12.014 12.927 14.077 15.469 17.106 19.088 21.673 23.744 24.823 25.453 25.786 25.991 26.108 26.208 26.269 26.281 26.298 26.277 26.225 26.172 26.108 26.031 25.909 25.787 25.697 25.605 25.506 25.416 25.319 25.196 25.099 25.011 24.927 24.833 24.73 24.664 24.601 24.506 24.436 24.352 24.311 24.23 24.126 24.015 23.96 23.807 23.768 23.7 23.635 23.496 23.404 23.282 23.155 23.029 22.882 22.683 22.201 -7 ,186 ,TETRA ,17616228,Mon Nov 29 09:48:50 CET,Mon Nov 29 11:58:18 CET,0.0 0.513 0.72 0.889 1.054 1.211 1.344 1.46 1.692 1.813 1.919 1.999 2.22 2.317 2.501 2.675 2.842 2.924 3.091 3.252 3.494 3.658 3.807 4.011 4.227 4.451 4.665 4.877 5.144 5.395 5.651 5.972 6.283 6.58 6.907 7.279 7.656 8.073 8.515 8.978 9.471 10.046 10.742 11.456 12.318 13.27 14.341 15.582 17.148 19.062 21.364 23.316 24.479 25.226 25.645 25.897 26.06 26.163 26.256 26.317 26.313 26.312 26.311 26.282 26.247 26.215 26.172 26.121 26.078 26.022 25.93 25.836 25.733 25.628 25.546 25.453 25.347 25.227 25.12 25.047 24.965 24.857 24.776 24.676 24.624 24.506 24.363 24.216 24.142 23.972 23.889 23.797 23.69 23.411 23.285 23.153 23.009 22.874 22.676 22.405 21.678 -8 ,30321 ,TETRA ,17616229,Mon Nov 29 09:48:49 CET,Mon Nov 29 12:11:55 CET,0.0 0.276 0.417 0.572 0.741 0.89 1.019 1.135 1.359 1.474 1.588 1.7 1.922 2.018 2.217 2.415 2.594 2.679 2.844 2.997 3.222 3.378 3.527 3.736 3.952 4.153 4.34 4.531 4.782 5.031 5.278 5.594 5.901 6.18 6.491 6.838 7.182 7.566 7.99 8.43 8.885 9.403 10.036 10.698 11.474 12.359 13.438 14.727 16.263 18.144 20.458 22.301 23.318 23.939 24.332 24.589 24.734 24.812 24.869 24.9 24.879 24.849 24.792 24.704 24.609 24.501 24.368 24.227 24.104 23.985 23.849 23.739 23.637 23.522 23.416 23.296 23.177 23.071 22.962 22.878 22.79 22.652 22.548 22.442 22.395 22.284 22.143 21.996 21.933 21.775 21.698 21.614 21.549 21.374 21.269 21.164 21.034 20.877 20.692 20.341 19.403 -9 ,31069 ,TETRA ,17616230,Mon Nov 29 09:48:52 CET,Mon Nov 29 12:12:26 CET,0.0 0.561 0.745 0.918 1.098 1.253 1.383 1.493 1.705 1.808 1.918 2.02 2.248 2.352 2.548 2.734 2.901 2.982 3.146 3.295 3.516 3.663 3.804 4.008 4.2 4.387 4.567 4.741 4.974 5.206 5.441 5.734 6.02 6.306 6.634 7.008 7.381 7.785 8.236 8.721 9.233 9.832 10.523 11.244 12.118 13.09 14.253 15.621 17.252 19.227 21.712 23.718 24.803 25.444 25.843 26.1 26.225 26.25 26.222 26.167 26.125 26.089 26.019 25.935 25.845 25.762 25.671 25.565 25.483 25.406 25.31 25.222 25.144 25.071 25.004 24.92 24.828 24.735 24.622 24.541 24.47 24.354 24.263 24.16 24.108 24.009 23.903 23.785 23.725 23.571 23.532 23.45 23.362 23.202 23.121 23.037 22.931 22.807 22.665 22.5 22.253 -10 ,10931 ,TETRA ,17616231,Mon Nov 29 09:48:53 CET,Mon Nov 29 11:58:44 CET,0.0 0.454 0.655 0.824 0.977 1.103 1.222 1.346 1.594 1.711 1.825 1.907 2.122 2.22 2.421 2.6 2.771 2.86 3.027 3.181 3.408 3.556 3.695 3.905 4.135 4.363 4.569 4.761 5.023 5.288 5.549 5.868 6.17 6.461 6.797 7.173 7.552 7.978 8.44 8.951 9.511 10.148 10.872 11.608 12.487 13.509 14.71 16.008 17.475 19.23 21.461 23.396 24.534 25.192 25.623 25.9 26.062 26.17 26.187 26.154 26.078 25.983 25.911 25.831 25.746 25.67 25.584 25.493 25.414 25.329 25.222 25.103 24.959 24.841 24.759 24.661 24.555 24.445 24.346 24.275 24.208 24.116 24.038 23.935 23.887 23.809 23.711 23.604 23.552 23.402 23.359 23.284 23.198 22.986 22.857 22.714 22.568 22.409 22.244 22.052 21.446 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index f0e9ba14..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1848 ,TETRA ,17616232,Mon Nov 29 09:48:50 CET,Mon Nov 29 12:14:11 CET,0.0 0.399 0.629 0.822 0.966 1.107 1.253 1.382 1.62 1.738 1.856 1.949 2.161 2.257 2.448 2.622 2.79 2.872 3.036 3.2 3.447 3.61 3.772 4.011 4.233 4.449 4.668 4.883 5.15 5.418 5.697 6.045 6.382 6.702 7.075 7.495 7.905 8.376 8.894 9.452 10.057 10.745 11.545 12.361 13.334 14.436 15.717 17.23 19.1 21.376 24.243 26.774 28.355 29.441 30.216 30.755 31.14 31.43 31.64 31.814 31.917 31.985 32.041 32.082 32.116 32.15 32.182 32.19 32.185 32.169 32.127 32.081 32.017 31.952 31.914 31.855 31.782 31.719 31.663 31.628 31.584 31.508 31.461 31.408 31.376 31.31 31.236 31.149 31.112 30.986 30.976 30.931 30.891 30.803 30.754 30.688 30.604 30.541 30.472 30.346 30.008 -2 ,32357 ,TETRA ,17616233,Mon Nov 29 09:48:50 CET,Mon Nov 29 12:13:59 CET,0.0 0.275 0.45 0.613 0.784 0.94 1.074 1.185 1.392 1.493 1.601 1.691 1.904 1.99 2.153 2.323 2.501 2.588 2.759 2.916 3.141 3.294 3.443 3.666 3.886 4.08 4.27 4.469 4.742 5.016 5.282 5.607 5.925 6.241 6.608 7.004 7.403 7.87 8.393 8.968 9.565 10.246 11.051 11.874 12.849 13.973 15.332 16.89 18.79 21.072 23.835 26.118 27.444 28.365 29.027 29.497 29.826 30.081 30.286 30.438 30.528 30.599 30.667 30.717 30.745 30.76 30.765 30.771 30.771 30.74 30.693 30.662 30.628 30.602 30.587 30.557 30.517 30.48 30.432 30.399 30.359 30.275 30.225 30.179 30.15 30.088 30.038 29.991 29.963 29.843 29.861 29.817 29.758 29.635 29.561 29.485 29.398 29.277 29.133 28.959 28.678 -3 ,3820 ,TETRA ,17616234,Mon Nov 29 09:48:53 CET,Mon Nov 29 12:05:15 CET,0.0 0.332 0.569 0.76 0.923 1.041 1.155 1.275 1.494 1.598 1.696 1.766 1.984 2.085 2.26 2.433 2.6 2.683 2.856 3.028 3.262 3.408 3.555 3.771 3.989 4.205 4.406 4.596 4.84 5.096 5.357 5.667 5.972 6.277 6.628 6.999 7.363 7.789 8.255 8.77 9.312 9.924 10.662 11.426 12.344 13.396 14.668 16.15 17.934 20.129 23.073 25.602 26.986 27.864 28.477 28.934 29.253 29.501 29.668 29.794 29.877 29.926 29.958 29.964 29.95 29.925 29.898 29.881 29.859 29.838 29.819 29.794 29.757 29.716 29.692 29.669 29.642 29.606 29.564 29.525 29.471 29.388 29.335 29.281 29.255 29.202 29.154 29.1 29.066 28.934 28.943 28.903 28.86 28.756 28.694 28.628 28.55 28.464 28.346 28.159 27.755 -4 ,16488 ,TETRA ,17616235,Mon Nov 29 09:49:18 CET,Mon Nov 29 12:16:13 CET,0.0 0.234 0.406 0.572 0.73 0.854 0.965 1.069 1.262 1.359 1.456 1.507 1.713 1.799 1.972 2.146 2.319 2.408 2.586 2.755 3.002 3.158 3.317 3.563 3.797 4.019 4.249 4.478 4.767 5.041 5.308 5.632 5.941 6.252 6.614 7.025 7.43 7.851 8.315 8.823 9.35 9.979 10.75 11.538 12.474 13.556 14.8 16.187 17.901 20.024 22.711 25.087 26.593 27.571 28.236 28.758 29.12 29.364 29.521 29.642 29.724 29.774 29.826 29.848 29.832 29.814 29.781 29.741 29.704 29.66 29.608 29.561 29.515 29.468 29.44 29.412 29.375 29.324 29.249 29.202 29.163 29.116 29.06 28.995 28.967 28.907 28.855 28.812 28.785 28.658 28.68 28.637 28.591 28.493 28.434 28.384 28.339 28.268 28.183 28.023 27.743 -5 ,1447 ,TETRA ,17616236,Mon Nov 29 09:49:19 CET,Mon Nov 29 12:16:05 CET,0.0 0.215 0.396 0.553 0.696 0.838 0.98 1.099 1.309 1.419 1.541 1.676 1.907 2.016 2.237 2.417 2.596 2.695 2.876 3.043 3.281 3.442 3.612 3.85 4.084 4.321 4.546 4.767 5.059 5.348 5.631 5.962 6.293 6.633 7.037 7.473 7.884 8.339 8.82 9.345 9.917 10.6 11.412 12.206 13.148 14.226 15.486 17.021 18.944 21.196 23.958 26.358 27.751 28.652 29.278 29.719 30.01 30.192 30.315 30.392 30.422 30.433 30.441 30.434 30.407 30.393 30.38 30.352 30.331 30.297 30.247 30.21 30.175 30.135 30.095 30.044 29.982 29.92 29.844 29.792 29.746 29.672 29.603 29.532 29.498 29.426 29.336 29.23 29.183 29.046 29.019 28.954 28.892 28.782 28.737 28.663 28.572 28.468 28.339 28.219 28.108 -6 ,23657 ,TETRA ,17616237,Mon Nov 29 09:49:18 CET,Mon Nov 29 12:12:48 CET,0.0 0.325 0.529 0.693 0.85 1.005 1.129 1.251 1.479 1.58 1.668 1.717 1.925 2.014 2.188 2.357 2.523 2.609 2.781 2.937 3.163 3.315 3.468 3.691 3.9 4.101 4.295 4.493 4.765 5.035 5.302 5.627 5.937 6.237 6.591 7.003 7.402 7.829 8.286 8.768 9.294 9.928 10.703 11.491 12.41 13.454 14.711 16.222 18.113 20.432 23.346 26.008 27.698 28.825 29.589 30.142 30.56 30.895 31.116 31.278 31.385 31.462 31.527 31.585 31.634 31.647 31.643 31.632 31.616 31.604 31.589 31.568 31.54 31.493 31.449 31.405 31.356 31.308 31.261 31.23 31.193 31.131 31.094 31.055 31.038 30.991 30.919 30.837 30.797 30.673 30.676 30.618 30.564 30.473 30.416 30.343 30.263 30.179 30.055 29.937 29.807 -7 ,7699 ,TETRA ,17616238,Mon Nov 29 09:49:19 CET,Mon Nov 29 12:14:26 CET,0.0 0.166 0.333 0.516 0.669 0.788 0.915 1.033 1.231 1.333 1.433 1.492 1.7 1.794 1.986 2.176 2.371 2.464 2.643 2.814 3.056 3.218 3.376 3.623 3.872 4.106 4.338 4.567 4.866 5.16 5.442 5.783 6.101 6.416 6.791 7.208 7.628 8.114 8.644 9.182 9.733 10.374 11.171 11.99 12.968 14.074 15.364 16.858 18.624 20.786 23.487 25.869 27.445 28.555 29.341 29.926 30.344 30.618 30.796 30.916 30.965 30.987 30.984 30.969 30.955 30.934 30.9 30.869 30.845 30.826 30.8 30.762 30.723 30.68 30.646 30.602 30.553 30.5 30.432 30.379 30.317 30.216 30.141 30.057 30.016 29.932 29.842 29.746 29.694 29.555 29.532 29.469 29.401 29.243 29.143 29.034 28.918 28.78 28.646 28.529 28.351 -8 ,14079 ,TETRA ,17616239,Mon Nov 29 09:49:21 CET,Mon Nov 29 12:14:18 CET,0.0 0.495 0.731 0.934 1.088 1.241 1.401 1.553 1.83 1.958 2.074 2.158 2.375 2.473 2.662 2.855 3.028 3.104 3.257 3.407 3.627 3.777 3.928 4.153 4.393 4.626 4.84 5.049 5.314 5.568 5.802 6.079 6.377 6.687 7.042 7.444 7.843 8.288 8.769 9.305 9.899 10.587 11.398 12.217 13.199 14.32 15.651 17.227 19.156 21.568 24.683 27.347 29.022 30.2 31.075 31.71 32.128 32.433 32.634 32.811 32.933 32.997 33.047 33.091 33.112 33.126 33.134 33.112 33.079 33.035 32.995 32.953 32.89 32.821 32.769 32.71 32.634 32.548 32.458 32.402 32.337 32.236 32.169 32.099 32.064 31.968 31.864 31.777 31.733 31.584 31.559 31.507 31.452 31.343 31.276 31.187 31.091 31.003 30.862 30.673 30.206 -9 ,7845 ,TETRA ,17616240,Mon Nov 29 09:49:19 CET,Mon Nov 29 11:55:02 CET,0.0 0.281 0.501 0.659 0.797 0.943 1.096 1.233 1.453 1.564 1.686 1.793 2.02 2.122 2.327 2.528 2.701 2.784 2.95 3.125 3.392 3.561 3.735 3.999 4.246 4.471 4.697 4.926 5.219 5.502 5.783 6.13 6.458 6.782 7.172 7.616 8.049 8.502 8.971 9.483 10.038 10.664 11.41 12.191 13.164 14.26 15.5 16.986 18.817 21.074 24.024 26.581 28.125 29.146 29.847 30.356 30.724 30.978 31.142 31.298 31.422 31.509 31.561 31.597 31.63 31.638 31.626 31.617 31.607 31.597 31.577 31.549 31.522 31.486 31.446 31.398 31.35 31.309 31.25 31.199 31.155 31.092 31.05 31.002 30.968 30.895 30.824 30.742 30.695 30.563 30.547 30.467 30.388 30.245 30.148 30.055 29.986 29.897 29.795 29.659 29.426 -10 ,30943 ,TETRA ,17616241,Mon Nov 29 09:49:19 CET,Mon Nov 29 12:00:25 CET,0.0 0.319 0.485 0.62 0.734 0.842 0.96 1.074 1.285 1.386 1.49 1.584 1.803 1.907 2.101 2.276 2.45 2.535 2.695 2.854 3.104 3.267 3.428 3.671 3.892 4.1 4.318 4.537 4.828 5.102 5.367 5.681 5.989 6.294 6.651 7.075 7.493 7.972 8.513 9.083 9.685 10.379 11.19 12.005 12.937 14.005 15.296 16.817 18.687 20.89 23.668 26.053 27.506 28.506 29.143 29.549 29.829 30.042 30.183 30.241 30.257 30.259 30.249 30.247 30.239 30.22 30.176 30.123 30.085 30.05 29.994 29.939 29.892 29.841 29.796 29.752 29.701 29.638 29.576 29.527 29.472 29.384 29.318 29.244 29.213 29.154 29.072 28.973 28.918 28.783 28.794 28.754 28.7 28.561 28.485 28.407 28.337 28.261 28.165 28.034 27.724 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt deleted file mode 100644 index 0c618e0e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2747 ,TETRA ,17616243,Mon Nov 29 09:49:19 CET,Mon Nov 29 12:15:20 CET,0.0 0.236 0.432 0.569 0.665 0.751 0.832 0.903 1.049 1.124 1.183 1.182 1.337 1.39 1.487 1.571 1.658 1.699 1.772 1.848 1.957 2.025 2.084 2.166 2.242 2.317 2.392 2.46 2.547 2.616 2.69 2.789 2.871 2.941 3.021 3.113 3.18 3.233 3.302 3.393 3.454 3.476 3.468 3.436 3.363 3.208 2.979 2.624 2.091 1.276 -0.204 -1.987 -3.43 -4.708 -5.772 -6.652 -7.423 -8.107 -8.677 -9.24 -9.729 -10.158 -10.561 -10.976 -11.364 -11.718 -12.105 -12.446 -12.733 -13.027 -13.316 -13.542 -13.762 -13.983 -14.17 -14.359 -14.55 -14.759 -14.972 -15.117 -15.278 -15.521 -15.679 -15.847 -15.921 -16.06 -16.214 -16.388 -16.485 -16.704 -16.778 -16.888 -17.007 -17.229 -17.334 -17.443 -17.559 -17.691 -17.828 -17.994 -18.374 -2 ,18728 ,TETRA ,17616244,Mon Nov 29 09:49:21 CET,Mon Nov 29 12:15:47 CET,0.0 0.435 0.54 0.65 0.769 0.874 0.969 1.063 1.248 1.335 1.415 1.454 1.618 1.678 1.781 1.869 1.955 1.995 2.072 2.147 2.251 2.313 2.37 2.457 2.545 2.628 2.714 2.796 2.898 3.0 3.099 3.22 3.335 3.428 3.529 3.622 3.716 3.818 3.898 3.984 4.072 4.149 4.2 4.212 4.191 4.079 3.86 3.538 2.97 2.045 0.434 -1.514 -3.114 -4.461 -5.621 -6.684 -7.6 -8.39 -9.07 -9.75 -10.348 -10.885 -11.375 -11.827 -12.243 -12.627 -13.016 -13.349 -13.643 -13.957 -14.274 -14.535 -14.813 -15.093 -15.302 -15.514 -15.731 -15.959 -16.19 -16.348 -16.512 -16.774 -16.96 -17.151 -17.254 -17.463 -17.674 -17.884 -17.988 -18.227 -18.381 -18.516 -18.641 -18.889 -19.023 -19.178 -19.336 -19.494 -19.671 -19.9 -20.533 -3 ,8595 ,TETRA ,17616245,Mon Nov 29 09:49:20 CET,Mon Nov 29 12:17:25 CET,0.0 0.218 0.32 0.39 0.466 0.554 0.634 0.692 0.787 0.841 0.892 0.881 1.043 1.088 1.18 1.282 1.378 1.424 1.521 1.597 1.672 1.723 1.777 1.862 1.936 2.005 2.083 2.157 2.247 2.332 2.414 2.513 2.598 2.68 2.777 2.886 2.975 3.043 3.101 3.155 3.213 3.297 3.393 3.421 3.39 3.349 3.302 3.157 2.821 2.136 0.873 -0.663 -1.973 -3.054 -3.956 -4.757 -5.471 -6.119 -6.672 -7.196 -7.622 -8.005 -8.387 -8.745 -9.075 -9.373 -9.682 -9.951 -10.172 -10.404 -10.647 -10.847 -11.055 -11.263 -11.42 -11.586 -11.762 -11.947 -12.125 -12.241 -12.365 -12.566 -12.695 -12.826 -12.901 -13.058 -13.213 -13.376 -13.464 -13.678 -13.754 -13.854 -13.95 -14.153 -14.266 -14.389 -14.51 -14.647 -14.818 -14.968 -15.217 -4 ,19874 ,TETRA ,17616246,Mon Nov 29 09:49:22 CET,Mon Nov 29 12:24:11 CET,0.0 0.213 0.319 0.425 0.522 0.612 0.726 0.827 0.982 1.054 1.126 1.143 1.313 1.372 1.47 1.562 1.652 1.697 1.786 1.854 1.947 2.007 2.057 2.142 2.245 2.351 2.444 2.532 2.645 2.749 2.844 2.952 3.046 3.132 3.233 3.33 3.419 3.513 3.587 3.669 3.724 3.719 3.678 3.641 3.615 3.56 3.418 3.09 2.534 1.711 0.313 -1.424 -2.863 -4.067 -5.132 -6.083 -6.891 -7.6 -8.252 -8.997 -9.663 -10.255 -10.813 -11.322 -11.742 -12.078 -12.428 -12.749 -13.019 -13.285 -13.558 -13.78 -14.012 -14.254 -14.44 -14.629 -14.823 -15.019 -15.213 -15.35 -15.492 -15.705 -15.863 -16.028 -16.104 -16.278 -16.478 -16.679 -16.778 -16.992 -17.062 -17.173 -17.294 -17.555 -17.699 -17.83 -17.972 -18.136 -18.323 -18.577 -18.941 -5 ,9899 ,TETRA ,17616247,Mon Nov 29 09:49:20 CET,Mon Nov 29 12:15:14 CET,0.0 0.27 0.391 0.533 0.64 0.719 0.803 0.871 0.972 1.028 1.087 1.084 1.23 1.275 1.359 1.44 1.525 1.565 1.648 1.726 1.825 1.885 1.944 2.027 2.111 2.185 2.256 2.329 2.42 2.504 2.579 2.668 2.746 2.817 2.904 3.01 3.099 3.166 3.237 3.323 3.413 3.503 3.554 3.559 3.541 3.487 3.331 3.068 2.676 1.938 0.685 -0.778 -2.085 -3.195 -4.121 -4.959 -5.643 -6.231 -6.761 -7.321 -7.81 -8.203 -8.554 -8.904 -9.218 -9.504 -9.808 -10.067 -10.312 -10.57 -10.822 -11.024 -11.226 -11.449 -11.622 -11.794 -11.986 -12.188 -12.382 -12.516 -12.659 -12.886 -13.047 -13.22 -13.313 -13.499 -13.689 -13.898 -14.019 -14.269 -14.389 -14.511 -14.646 -14.915 -15.046 -15.205 -15.372 -15.524 -15.71 -15.978 -16.517 -6 ,9871 ,TETRA ,17616248,Mon Nov 29 09:49:20 CET,Mon Nov 29 12:17:19 CET,0.0 0.204 0.339 0.459 0.553 0.646 0.727 0.799 0.96 1.033 1.096 1.119 1.279 1.332 1.428 1.523 1.608 1.649 1.73 1.811 1.916 1.978 2.044 2.153 2.259 2.346 2.438 2.535 2.654 2.782 2.887 2.979 3.063 3.128 3.194 3.256 3.312 3.373 3.439 3.484 3.496 3.52 3.527 3.493 3.39 3.199 2.908 2.544 2.012 1.103 -0.57 -2.622 -4.258 -5.62 -6.75 -7.732 -8.636 -9.454 -10.124 -10.793 -11.38 -11.899 -12.355 -12.77 -13.167 -13.529 -13.904 -14.244 -14.545 -14.874 -15.217 -15.493 -15.791 -16.127 -16.375 -16.607 -16.847 -17.093 -17.348 -17.518 -17.689 -17.954 -18.142 -18.36 -18.469 -18.656 -18.828 -19.004 -19.098 -19.32 -19.403 -19.515 -19.635 -19.91 -20.08 -20.241 -20.389 -20.55 -20.728 -20.925 -21.581 -7 ,7692 ,TETRA ,17616249,Mon Nov 29 09:49:21 CET,Mon Nov 29 12:16:43 CET,0.0 0.201 0.336 0.448 0.552 0.655 0.755 0.831 0.951 1.012 1.073 1.072 1.233 1.284 1.382 1.464 1.544 1.58 1.648 1.718 1.816 1.88 1.941 2.039 2.132 2.22 2.303 2.371 2.47 2.579 2.683 2.804 2.911 2.997 3.075 3.16 3.256 3.363 3.479 3.596 3.677 3.731 3.78 3.809 3.807 3.749 3.614 3.41 3.025 2.307 0.953 -0.873 -2.372 -3.585 -4.631 -5.545 -6.337 -7.056 -7.679 -8.33 -8.884 -9.359 -9.805 -10.226 -10.615 -10.958 -11.313 -11.628 -11.897 -12.166 -12.436 -12.655 -12.872 -13.103 -13.276 -13.462 -13.674 -13.889 -14.116 -14.276 -14.438 -14.68 -14.832 -14.994 -15.086 -15.255 -15.432 -15.628 -15.731 -15.957 -16.047 -16.161 -16.285 -16.559 -16.71 -16.857 -16.995 -17.141 -17.296 -17.533 -17.966 -8 ,27862 ,TETRA ,17616250,Mon Nov 29 09:49:22 CET,Mon Nov 29 12:16:41 CET,0.0 0.204 0.332 0.446 0.543 0.633 0.706 0.776 0.899 0.956 1.018 1.022 1.173 1.222 1.329 1.421 1.503 1.543 1.615 1.686 1.809 1.88 1.933 2.011 2.083 2.155 2.232 2.296 2.374 2.447 2.513 2.6 2.675 2.744 2.828 2.925 3.014 3.097 3.175 3.259 3.326 3.373 3.442 3.49 3.489 3.433 3.278 3.042 2.616 1.773 0.331 -1.465 -3.046 -4.356 -5.471 -6.426 -7.211 -7.92 -8.527 -9.114 -9.602 -10.043 -10.478 -10.882 -11.243 -11.555 -11.88 -12.184 -12.449 -12.711 -12.965 -13.182 -13.41 -13.64 -13.817 -13.998 -14.192 -14.391 -14.594 -14.728 -14.855 -15.048 -15.183 -15.328 -15.401 -15.551 -15.711 -15.872 -15.952 -16.158 -16.217 -16.307 -16.403 -16.616 -16.718 -16.813 -16.931 -17.071 -17.2 -17.342 -17.658 -9 ,1358 ,TETRA ,17616251,Mon Nov 29 09:49:21 CET,Mon Nov 29 12:18:08 CET,0.0 0.477 0.606 0.698 0.785 0.876 0.966 1.053 1.216 1.301 1.38 1.403 1.573 1.634 1.76 1.894 2.007 2.051 2.141 2.229 2.364 2.458 2.543 2.659 2.772 2.868 2.945 3.011 3.086 3.16 3.24 3.323 3.386 3.447 3.508 3.582 3.648 3.703 3.764 3.833 3.879 3.895 3.9 3.877 3.824 3.723 3.52 3.234 2.792 2.049 0.718 -0.961 -2.391 -3.609 -4.66 -5.549 -6.329 -7.06 -7.679 -8.264 -8.759 -9.231 -9.672 -10.089 -10.478 -10.826 -11.177 -11.467 -11.71 -11.964 -12.231 -12.453 -12.684 -12.927 -13.125 -13.332 -13.54 -13.762 -13.996 -14.139 -14.284 -14.521 -14.676 -14.835 -14.922 -15.11 -15.294 -15.49 -15.598 -15.828 -15.926 -16.056 -16.189 -16.42 -16.545 -16.678 -16.824 -16.978 -17.134 -17.331 -17.664 -10 ,26169 ,TETRA ,17616252,Mon Nov 29 09:49:23 CET,Mon Nov 29 12:18:31 CET,0.0 0.241 0.315 0.382 0.447 0.519 0.595 0.669 0.785 0.841 0.891 0.889 1.042 1.086 1.173 1.26 1.351 1.392 1.457 1.513 1.593 1.648 1.707 1.785 1.858 1.928 1.994 2.056 2.133 2.203 2.261 2.335 2.407 2.482 2.581 2.682 2.77 2.851 2.935 3.025 3.106 3.188 3.248 3.245 3.204 3.133 2.99 2.733 2.348 1.645 0.297 -1.323 -2.705 -3.867 -4.844 -5.758 -6.55 -7.244 -7.841 -8.448 -8.965 -9.4 -9.798 -10.17 -10.519 -10.837 -11.171 -11.473 -11.723 -11.996 -12.288 -12.503 -12.723 -12.956 -13.133 -13.322 -13.519 -13.722 -13.92 -14.052 -14.189 -14.403 -14.555 -14.706 -14.783 -14.942 -15.106 -15.269 -15.354 -15.556 -15.606 -15.716 -15.829 -16.074 -16.202 -16.328 -16.472 -16.593 -16.724 -16.894 -17.325 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 7a275016..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15412 ,TETRA ,17616253,Mon Nov 29 09:49:20 CET,Mon Nov 29 12:15:17 CET,0.0 0.167 0.261 0.361 0.461 0.544 0.622 0.709 0.872 0.946 1.016 1.062 1.241 1.31 1.449 1.573 1.702 1.766 1.882 1.995 2.161 2.265 2.37 2.55 2.722 2.863 3.002 3.148 3.337 3.518 3.693 3.892 4.089 4.286 4.515 4.767 5.008 5.288 5.619 5.985 6.356 6.762 7.262 7.811 8.447 9.129 9.912 10.787 11.77 12.88 14.274 15.362 15.824 16.017 16.076 16.037 15.939 15.833 15.715 15.562 15.429 15.299 15.17 15.052 14.934 14.827 14.71 14.593 14.502 14.406 14.308 14.225 14.116 13.98 13.871 13.761 13.645 13.516 13.379 13.295 13.222 13.096 12.998 12.9 12.848 12.743 12.632 12.522 12.462 12.309 12.26 12.19 12.117 11.955 11.875 11.778 11.662 11.515 11.355 11.176 10.634 -2 ,16820 ,TETRA ,17616254,Mon Nov 29 09:49:24 CET,Mon Nov 29 12:15:18 CET,0.0 0.133 0.259 0.369 0.466 0.553 0.624 0.698 0.869 0.959 1.045 1.09 1.263 1.335 1.462 1.588 1.71 1.77 1.888 1.996 2.167 2.29 2.408 2.578 2.738 2.893 3.048 3.201 3.395 3.577 3.764 3.988 4.197 4.402 4.646 4.921 5.2 5.513 5.839 6.171 6.518 6.915 7.394 7.878 8.433 9.066 9.811 10.653 11.658 12.86 14.271 15.38 15.959 16.215 16.331 16.385 16.345 16.258 16.191 16.14 16.073 15.969 15.858 15.736 15.612 15.505 15.377 15.244 15.11 14.96 14.806 14.689 14.576 14.455 14.351 14.251 14.152 14.039 13.918 13.831 13.746 13.621 13.524 13.409 13.352 13.235 13.114 12.982 12.907 12.747 12.691 12.601 12.504 12.321 12.219 12.099 11.974 11.838 11.69 11.483 11.069 -3 ,31484 ,TETRA ,17616255,Mon Nov 29 09:49:22 CET,Mon Nov 29 12:16:07 CET,0.0 0.242 0.43 0.541 0.663 0.797 0.913 1.029 1.242 1.329 1.405 1.448 1.619 1.696 1.825 1.949 2.082 2.148 2.278 2.404 2.582 2.697 2.809 2.97 3.124 3.273 3.425 3.576 3.765 3.95 4.139 4.379 4.618 4.846 5.106 5.391 5.672 5.995 6.327 6.642 6.994 7.429 7.931 8.452 9.059 9.719 10.466 11.319 12.295 13.433 14.782 15.768 16.266 16.376 16.331 16.266 16.17 16.084 15.99 15.879 15.758 15.628 15.494 15.359 15.238 15.143 15.039 14.933 14.841 14.748 14.652 14.556 14.447 14.341 14.263 14.181 14.09 13.998 13.91 13.845 13.76 13.605 13.495 13.378 13.324 13.231 13.129 13.013 12.95 12.797 12.751 12.684 12.612 12.45 12.36 12.267 12.143 12.0 11.831 11.647 11.225 -4 ,4895 ,TETRA ,17616256,Mon Nov 29 09:49:21 CET,Mon Nov 29 12:15:47 CET,0.0 0.486 0.647 0.756 0.869 0.971 1.069 1.167 1.35 1.442 1.528 1.583 1.772 1.85 2.003 2.146 2.276 2.342 2.473 2.587 2.757 2.871 2.975 3.127 3.285 3.443 3.594 3.743 3.944 4.125 4.292 4.492 4.696 4.899 5.12 5.363 5.603 5.879 6.169 6.489 6.855 7.246 7.69 8.149 8.706 9.333 10.037 10.772 11.602 12.613 13.729 14.459 14.731 14.834 14.84 14.719 14.565 14.419 14.241 14.027 13.851 13.692 13.515 13.328 13.163 13.023 12.866 12.722 12.596 12.461 12.306 12.181 12.063 11.933 11.824 11.715 11.608 11.496 11.386 11.303 11.207 11.065 10.97 10.878 10.824 10.714 10.594 10.468 10.41 10.26 10.247 10.194 10.12 9.933 9.846 9.746 9.62 9.465 9.286 9.101 8.761 -5 ,24377 ,TETRA ,17616257,Mon Nov 29 09:49:23 CET,Mon Nov 29 12:15:50 CET,0.0 0.224 0.381 0.543 0.709 0.849 0.963 1.07 1.272 1.367 1.455 1.509 1.686 1.753 1.883 2.007 2.137 2.207 2.346 2.475 2.656 2.765 2.871 3.031 3.186 3.342 3.503 3.665 3.871 4.07 4.259 4.482 4.709 4.916 5.13 5.388 5.66 5.971 6.305 6.67 7.059 7.492 8.011 8.54 9.167 9.873 10.659 11.47 12.387 13.482 14.702 15.418 15.611 15.629 15.582 15.493 15.384 15.215 15.021 14.807 14.604 14.411 14.242 14.073 13.912 13.762 13.595 13.451 13.33 13.204 13.072 12.974 12.874 12.752 12.655 12.566 12.47 12.366 12.257 12.181 12.099 11.956 11.853 11.746 11.691 11.58 11.457 11.336 11.274 11.118 11.027 10.93 10.838 10.654 10.558 10.473 10.401 10.3 10.162 9.971 9.483 -6 ,17156 ,TETRA ,17616258,Mon Nov 29 09:49:25 CET,Mon Nov 29 12:16:55 CET,0.0 0.185 0.319 0.43 0.541 0.651 0.736 0.823 1.003 1.085 1.162 1.181 1.347 1.416 1.55 1.687 1.826 1.896 2.025 2.134 2.295 2.409 2.526 2.692 2.855 3.009 3.159 3.302 3.493 3.69 3.876 4.1 4.314 4.517 4.769 5.074 5.364 5.663 5.974 6.308 6.668 7.097 7.631 8.164 8.769 9.425 10.154 10.954 11.873 12.926 14.274 15.294 15.662 15.756 15.764 15.751 15.705 15.629 15.526 15.379 15.235 15.122 15.013 14.909 14.817 14.706 14.57 14.451 14.364 14.259 14.137 14.038 13.929 13.815 13.726 13.629 13.53 13.425 13.3 13.222 13.153 13.038 12.949 12.854 12.807 12.708 12.602 12.487 12.421 12.268 12.194 12.12 12.042 11.899 11.84 11.751 11.642 11.553 11.458 11.319 11.039 -7 ,10889 ,TETRA ,17616259,Mon Nov 29 09:49:22 CET,Mon Nov 29 12:18:53 CET,0.0 0.175 0.325 0.481 0.641 0.768 0.895 1.018 1.224 1.323 1.418 1.5 1.697 1.779 1.936 2.089 2.247 2.325 2.48 2.62 2.811 2.938 3.07 3.266 3.449 3.634 3.81 3.978 4.196 4.411 4.622 4.874 5.129 5.383 5.668 5.997 6.323 6.679 7.059 7.46 7.877 8.365 8.957 9.544 10.173 10.815 11.593 12.484 13.444 14.607 16.036 17.174 17.782 18.029 18.126 18.188 18.21 18.204 18.175 18.086 17.995 17.931 17.843 17.748 17.646 17.528 17.393 17.286 17.204 17.111 17.017 16.946 16.863 16.749 16.647 16.549 16.456 16.358 16.246 16.167 16.089 15.965 15.878 15.796 15.754 15.655 15.546 15.437 15.379 15.23 15.178 15.09 15.018 14.864 14.778 14.704 14.596 14.461 14.319 14.172 13.839 -8 ,24689 ,TETRA ,17616260,Mon Nov 29 09:49:24 CET,Mon Nov 29 12:18:32 CET,0.0 0.312 0.437 0.56 0.693 0.815 0.914 0.993 1.147 1.231 1.311 1.363 1.539 1.606 1.754 1.907 2.032 2.092 2.218 2.343 2.525 2.643 2.756 2.919 3.08 3.244 3.394 3.532 3.728 3.913 4.077 4.282 4.48 4.678 4.92 5.178 5.42 5.695 5.994 6.32 6.669 7.061 7.522 7.979 8.516 9.155 9.901 10.726 11.719 12.82 13.994 14.736 15.026 15.059 14.913 14.753 14.623 14.463 14.266 14.074 13.926 13.777 13.618 13.454 13.292 13.16 13.046 12.94 12.81 12.652 12.489 12.355 12.212 12.045 11.91 11.758 11.594 11.454 11.321 11.231 11.133 10.968 10.844 10.707 10.643 10.51 10.361 10.214 10.14 9.965 9.864 9.774 9.679 9.471 9.353 9.214 9.066 8.913 8.736 8.518 8.076 -9 ,18288 ,TETRA ,17616261,Mon Nov 29 09:49:26 CET,Mon Nov 29 12:16:32 CET,0.0 0.213 0.349 0.475 0.597 0.711 0.829 0.953 1.141 1.218 1.292 1.337 1.515 1.593 1.748 1.888 2.03 2.097 2.219 2.334 2.517 2.635 2.742 2.908 3.068 3.219 3.368 3.518 3.718 3.911 4.102 4.341 4.56 4.776 5.03 5.302 5.567 5.867 6.207 6.565 6.926 7.339 7.835 8.338 8.957 9.666 10.447 11.297 12.251 13.229 14.153 14.663 14.853 14.876 14.738 14.578 14.407 14.16 13.914 13.678 13.467 13.272 13.092 12.93 12.756 12.58 12.4 12.252 12.119 11.971 11.802 11.647 11.484 11.311 11.174 11.03 10.882 10.724 10.555 10.44 10.323 10.148 10.025 9.898 9.836 9.706 9.554 9.37 9.283 9.123 9.048 8.953 8.854 8.638 8.518 8.376 8.238 8.106 7.962 7.804 7.361 -10 ,12552 ,TETRA ,17616262,Mon Nov 29 09:49:22 CET,Mon Nov 29 12:12:27 CET,0.0 0.479 0.628 0.728 0.849 0.978 1.101 1.21 1.415 1.514 1.599 1.66 1.848 1.928 2.079 2.218 2.35 2.41 2.53 2.651 2.841 2.966 3.091 3.281 3.456 3.615 3.774 3.934 4.14 4.343 4.545 4.779 4.995 5.205 5.454 5.736 6.0 6.296 6.642 7.021 7.42 7.858 8.363 8.86 9.434 10.105 10.881 11.845 13.002 14.288 15.787 16.897 17.429 17.623 17.689 17.742 17.747 17.68 17.582 17.441 17.31 17.206 17.099 16.983 16.878 16.795 16.7 16.594 16.501 16.401 16.301 16.21 16.104 16.0 15.922 15.849 15.769 15.661 15.543 15.465 15.387 15.26 15.162 15.061 15.017 14.922 14.819 14.718 14.664 14.513 14.476 14.4 14.328 14.216 14.138 14.036 13.921 13.777 13.601 13.356 12.82 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 4eaec5e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14336 ,KEBNE ,17027815,Wed Dec 22 18:14:16 CET,Wed Dec 22 20:05:21 CET,0.0 0.309 0.532 0.767 0.967 1.146 1.305 1.453 1.74 1.866 2.004 2.038 2.418 2.551 2.824 3.087 3.342 3.463 3.713 3.96 4.301 4.529 4.757 5.096 5.437 5.778 6.112 6.433 6.858 7.27 7.664 8.152 8.633 9.117 9.689 10.355 11.036 11.786 12.593 13.492 14.469 15.595 16.949 18.335 19.977 21.942 24.355 27.226 30.749 34.975 40.558 45.823 49.146 51.412 53.065 54.337 55.279 55.974 56.507 57.019 57.42 57.729 57.992 58.186 58.3 58.385 58.451 58.496 58.504 58.506 58.539 58.543 58.518 58.479 58.44 58.406 58.373 58.319 58.225 58.15 58.069 57.915 57.804 57.697 57.644 57.511 57.351 57.18 57.075 56.781 56.769 56.644 56.489 56.107 55.88 55.676 55.448 55.128 54.72 53.962 49.559 -2 ,31854 ,KEBNE ,17027816,Wed Dec 22 18:15:20 CET,Wed Dec 22 20:06:44 CET,0.0 0.387 0.648 0.854 1.043 1.247 1.438 1.605 1.915 2.059 2.192 2.216 2.611 2.746 3.014 3.277 3.523 3.646 3.903 4.159 4.519 4.756 5.001 5.361 5.7 6.03 6.356 6.682 7.115 7.556 8.002 8.555 9.088 9.606 10.212 10.911 11.605 12.371 13.203 14.107 15.084 16.217 17.6 19.044 20.76 22.765 25.199 28.055 31.624 36.166 42.147 47.553 51.059 53.577 55.338 56.612 57.626 58.485 59.091 59.604 59.971 60.242 60.507 60.711 60.849 60.956 61.071 61.144 61.168 61.18 61.205 61.213 61.202 61.182 61.149 61.106 61.069 61.02 60.925 60.858 60.794 60.66 60.571 60.473 60.418 60.298 60.111 59.94 59.852 59.558 59.525 59.362 59.159 58.766 58.574 58.348 58.016 57.637 57.238 56.606 54.282 -3 ,5415 ,KEBNE ,17027817,Wed Dec 22 18:15:20 CET,Wed Dec 22 20:06:16 CET,0.0 0.472 0.783 1.027 1.254 1.469 1.66 1.835 2.204 2.379 2.542 2.592 3.005 3.163 3.465 3.752 4.03 4.169 4.442 4.704 5.086 5.339 5.598 5.987 6.366 6.735 7.091 7.442 7.922 8.393 8.847 9.405 9.943 10.482 11.146 11.908 12.634 13.457 14.387 15.394 16.475 17.707 19.222 20.79 22.613 24.772 27.358 30.388 34.163 38.856 44.873 50.213 53.699 56.184 57.926 59.144 60.026 60.739 61.263 61.701 62.023 62.25 62.436 62.578 62.66 62.693 62.71 62.737 62.743 62.726 62.725 62.72 62.682 62.645 62.6 62.521 62.44 62.381 62.3 62.22 62.15 62.022 61.916 61.788 61.715 61.569 61.402 61.197 61.077 60.771 60.723 60.583 60.436 60.134 59.947 59.716 59.447 59.115 58.633 57.919 53.905 -4 ,29807 ,KEBNE ,17027818,Wed Dec 22 18:15:20 CET,Wed Dec 22 20:06:56 CET,0.0 0.797 1.09 1.312 1.521 1.71 1.9 2.094 2.465 2.634 2.798 2.869 3.285 3.437 3.733 4.015 4.292 4.437 4.727 4.996 5.369 5.62 5.873 6.244 6.603 6.965 7.321 7.659 8.108 8.545 8.971 9.508 10.042 10.561 11.164 11.867 12.566 13.342 14.169 15.101 16.16 17.342 18.754 20.225 21.99 24.062 26.581 29.537 33.188 37.749 43.622 48.987 52.429 54.754 56.418 57.682 58.595 59.353 59.975 60.539 60.973 61.311 61.608 61.872 62.076 62.188 62.262 62.355 62.439 62.5 62.505 62.477 62.449 62.396 62.343 62.279 62.19 62.082 61.966 61.883 61.801 61.66 61.544 61.412 61.328 61.158 60.973 60.756 60.647 60.337 60.273 60.132 59.943 59.591 59.414 59.156 58.86 58.442 57.759 56.848 49.457 -5 ,6933 ,KEBNE ,17027819,Wed Dec 22 18:15:20 CET,Wed Dec 22 20:06:44 CET,0.0 0.381 0.65 0.884 1.111 1.335 1.55 1.727 2.033 2.197 2.364 2.412 2.808 2.944 3.219 3.483 3.746 3.882 4.149 4.423 4.837 5.098 5.351 5.71 6.056 6.396 6.719 7.043 7.488 7.939 8.386 8.929 9.456 9.984 10.611 11.323 12.041 12.859 13.721 14.64 15.647 16.807 18.191 19.636 21.371 23.367 25.821 28.74 32.333 36.852 42.874 48.368 51.848 54.278 56.062 57.361 58.331 59.074 59.547 59.931 60.233 60.483 60.685 60.862 61.017 61.091 61.156 61.218 61.218 61.193 61.175 61.141 61.098 61.066 61.031 60.97 60.893 60.809 60.739 60.703 60.639 60.535 60.472 60.365 60.287 60.115 59.94 59.742 59.636 59.328 59.261 59.137 58.992 58.66 58.484 58.297 58.025 57.69 57.289 56.527 52.707 -6 ,41 ,KEBNE ,17027820,Wed Dec 22 18:15:20 CET,Wed Dec 22 20:06:44 CET,0.0 0.582 0.837 1.078 1.294 1.485 1.667 1.843 2.158 2.319 2.476 2.508 2.908 3.043 3.32 3.605 3.874 4.005 4.265 4.524 4.897 5.135 5.377 5.735 6.092 6.443 6.783 7.12 7.571 8.008 8.442 8.972 9.487 10.017 10.633 11.304 11.96 12.709 13.541 14.466 15.488 16.674 18.093 19.534 21.281 23.32 25.742 28.598 32.092 36.461 42.35 47.891 51.55 54.175 56.05 57.449 58.471 59.165 59.651 60.084 60.404 60.677 60.895 61.068 61.205 61.298 61.372 61.42 61.441 61.458 61.458 61.414 61.37 61.36 61.346 61.298 61.254 61.227 61.17 61.11 61.043 60.906 60.8 60.689 60.625 60.503 60.38 60.201 60.087 59.79 59.769 59.649 59.504 59.203 59.02 58.767 58.527 58.285 57.889 57.291 52.9 -7 ,1369 ,KEBNE ,17027821,Wed Dec 22 18:20:29 CET,Wed Dec 22 20:12:43 CET,0.0 0.541 0.797 1.026 1.22 1.402 1.579 1.748 2.064 2.204 2.334 2.33 2.728 2.863 3.127 3.414 3.69 3.816 4.064 4.304 4.66 4.904 5.145 5.492 5.82 6.156 6.492 6.822 7.263 7.681 8.091 8.613 9.129 9.626 10.224 10.915 11.589 12.362 13.21 14.117 15.108 16.296 17.692 19.105 20.867 22.97 25.526 28.508 32.117 36.615 42.416 47.696 51.022 53.254 54.911 56.14 56.996 57.621 58.071 58.484 58.746 58.903 59.049 59.189 59.284 59.347 59.414 59.464 59.494 59.484 59.452 59.428 59.396 59.349 59.295 59.228 59.148 59.083 58.996 58.92 58.833 58.704 58.623 58.523 58.479 58.361 58.205 58.033 57.922 57.615 57.578 57.456 57.313 56.949 56.739 56.531 56.293 55.979 55.55 54.943 47.683 -8 ,10868 ,KEBNE ,17027822,Wed Dec 22 18:20:29 CET,Wed Dec 22 20:11:54 CET,0.0 0.364 0.57 0.788 0.987 1.161 1.344 1.535 1.865 2.014 2.16 2.193 2.58 2.715 2.996 3.261 3.509 3.633 3.879 4.13 4.502 4.744 5.004 5.396 5.765 6.123 6.461 6.786 7.214 7.639 8.074 8.61 9.126 9.643 10.252 10.937 11.618 12.393 13.244 14.176 15.203 16.405 17.839 19.363 21.183 23.206 25.66 28.579 32.199 36.809 42.951 48.52 52.154 54.679 56.414 57.662 58.578 59.305 59.803 60.229 60.542 60.773 60.993 61.173 61.289 61.356 61.41 61.477 61.514 61.506 61.46 61.413 61.385 61.351 61.333 61.305 61.229 61.154 61.091 61.043 60.96 60.815 60.713 60.601 60.54 60.357 60.168 59.987 59.866 59.535 59.452 59.33 59.218 58.909 58.708 58.466 58.166 57.807 57.377 56.658 48.367 -9 ,19678 ,KEBNE ,17027823,Wed Dec 22 18:20:29 CET,Wed Dec 22 20:12:00 CET,0.0 0.383 0.63 0.813 0.997 1.182 1.353 1.521 1.854 2.005 2.151 2.175 2.574 2.72 2.997 3.237 3.482 3.608 3.85 4.089 4.439 4.67 4.907 5.242 5.559 5.887 6.215 6.527 6.932 7.337 7.743 8.263 8.766 9.243 9.813 10.478 11.141 11.91 12.773 13.694 14.678 15.819 17.205 18.638 20.371 22.403 24.848 27.738 31.249 35.615 41.254 46.37 49.776 52.167 53.858 55.054 55.918 56.604 57.095 57.508 57.843 58.107 58.319 58.49 58.62 58.684 58.714 58.744 58.762 58.773 58.756 58.719 58.676 58.645 58.608 58.556 58.486 58.388 58.261 58.151 58.056 57.919 57.813 57.691 57.608 57.449 57.286 57.085 56.976 56.678 56.644 56.492 56.347 56.067 55.864 55.632 55.37 55.064 54.655 53.897 47.878 -10 ,20978 ,KEBNE ,17027824,Wed Dec 22 18:20:29 CET,Wed Dec 22 20:12:32 CET,0.0 0.381 0.609 0.836 1.056 1.25 1.421 1.586 1.916 2.058 2.186 2.183 2.57 2.695 2.967 3.243 3.492 3.607 3.837 4.08 4.437 4.668 4.898 5.233 5.56 5.888 6.223 6.545 6.957 7.372 7.785 8.285 8.783 9.277 9.859 10.533 11.198 11.956 12.798 13.702 14.689 15.832 17.178 18.563 20.239 22.188 24.503 27.243 30.639 34.983 40.666 45.788 49.204 51.604 53.217 54.352 55.218 55.881 56.356 56.724 57.018 57.292 57.482 57.62 57.72 57.755 57.766 57.785 57.799 57.792 57.749 57.72 57.696 57.654 57.621 57.567 57.491 57.392 57.297 57.232 57.158 57.052 56.964 56.864 56.804 56.679 56.551 56.406 56.324 56.046 56.046 55.925 55.79 55.511 55.34 55.131 54.85 54.454 53.968 53.286 48.946 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt deleted file mode 100644 index 6b0d19d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23202 ,TETRA ,17616263,Mon Nov 29 09:49:23 CET,Mon Nov 29 12:06:20 CET,0.0 0.553 0.884 1.127 1.345 1.541 1.738 1.944 2.312 2.497 2.688 2.765 3.173 3.313 3.583 3.838 4.084 4.209 4.461 4.715 5.104 5.352 5.585 5.937 6.285 6.626 6.978 7.321 7.758 8.189 8.605 9.11 9.6 10.093 10.677 11.336 11.994 12.756 13.612 14.563 15.582 16.739 18.135 19.582 21.28 23.23 25.553 28.282 31.785 36.191 41.751 46.722 49.922 52.148 53.692 54.807 55.666 56.327 56.783 57.162 57.441 57.643 57.789 57.888 57.968 58.015 58.027 58.037 58.036 58.03 58.017 57.996 57.962 57.91 57.871 57.827 57.767 57.704 57.63 57.563 57.498 57.368 57.244 57.129 57.078 56.967 56.803 56.599 56.506 56.214 56.168 56.033 55.893 55.576 55.411 55.23 55.018 54.768 54.411 53.854 50.514 -2 ,14096 ,TETRA ,17616264,Mon Nov 29 09:49:26 CET,Mon Nov 29 12:06:20 CET,0.0 0.348 0.596 0.786 0.983 1.166 1.334 1.497 1.831 2.007 2.179 2.256 2.661 2.804 3.089 3.374 3.644 3.767 4.019 4.287 4.681 4.928 5.169 5.546 5.914 6.257 6.587 6.915 7.35 7.782 8.22 8.752 9.255 9.769 10.398 11.099 11.786 12.56 13.411 14.354 15.39 16.565 17.946 19.383 21.137 23.219 25.745 28.8 32.589 37.289 43.451 49.212 53.023 55.649 57.469 58.798 59.836 60.621 61.195 61.727 62.105 62.39 62.621 62.806 62.972 63.121 63.219 63.233 63.216 63.206 63.194 63.175 63.16 63.092 63.005 62.916 62.802 62.686 62.594 62.527 62.466 62.365 62.262 62.134 62.068 61.953 61.834 61.669 61.567 61.267 61.228 61.118 60.983 60.672 60.483 60.269 60.05 59.765 59.327 58.714 54.737 -3 ,1314 ,TETRA ,17616265,Mon Nov 29 09:49:23 CET,Mon Nov 29 12:06:49 CET,0.0 0.677 0.97 1.237 1.47 1.675 1.88 2.055 2.395 2.567 2.722 2.772 3.195 3.346 3.628 3.929 4.228 4.361 4.615 4.885 5.323 5.595 5.839 6.198 6.552 6.887 7.225 7.559 7.988 8.425 8.862 9.409 9.942 10.45 11.031 11.686 12.352 13.118 13.958 14.862 15.845 17.002 18.392 19.805 21.468 23.403 25.778 28.646 32.164 36.501 42.266 47.674 50.999 53.202 54.74 55.894 56.794 57.465 57.932 58.328 58.611 58.845 59.053 59.196 59.298 59.363 59.385 59.371 59.343 59.326 59.304 59.248 59.143 59.021 58.93 58.832 58.725 58.594 58.468 58.374 58.268 58.1 57.97 57.818 57.733 57.57 57.395 57.21 57.118 56.799 56.694 56.541 56.391 56.055 55.869 55.64 55.347 54.995 54.563 54.015 51.605 -4 ,19787 ,TETRA ,17616266,Mon Nov 29 09:49:50 CET,Mon Nov 29 12:05:56 CET,0.0 0.334 0.593 0.855 1.116 1.344 1.554 1.729 2.043 2.205 2.375 2.447 2.858 3.014 3.316 3.575 3.831 3.962 4.238 4.513 4.906 5.164 5.412 5.76 6.113 6.473 6.835 7.202 7.691 8.17 8.641 9.246 9.837 10.404 11.084 11.851 12.562 13.347 14.209 15.159 16.206 17.413 18.878 20.403 22.233 24.309 26.761 29.671 33.268 37.8 43.76 49.294 52.833 55.283 57.023 58.238 59.051 59.634 60.101 60.54 60.861 61.072 61.213 61.323 61.418 61.481 61.5 61.498 61.495 61.459 61.411 61.388 61.35 61.278 61.201 61.106 61.016 60.928 60.83 60.76 60.684 60.535 60.411 60.285 60.218 60.065 59.895 59.703 59.589 59.247 59.163 59.011 58.849 58.497 58.302 58.089 57.888 57.594 57.153 56.568 53.702 -5 ,3946 ,TETRA ,17616267,Mon Nov 29 09:49:50 CET,Mon Nov 29 12:07:47 CET,0.0 0.546 0.901 1.199 1.429 1.615 1.786 1.96 2.319 2.501 2.665 2.695 3.09 3.228 3.494 3.766 4.039 4.173 4.446 4.703 5.055 5.286 5.52 5.866 6.21 6.562 6.908 7.244 7.691 8.12 8.539 9.052 9.556 10.073 10.68 11.36 12.022 12.779 13.635 14.552 15.537 16.696 18.068 19.48 21.176 23.138 25.515 28.233 31.479 35.622 40.957 45.609 48.623 50.694 52.095 53.156 53.983 54.652 55.148 55.557 55.803 55.961 56.102 56.216 56.306 56.361 56.399 56.421 56.417 56.4 56.384 56.355 56.311 56.262 56.203 56.119 56.046 55.964 55.842 55.743 55.633 55.452 55.321 55.196 55.138 55.017 54.877 54.691 54.583 54.268 54.236 54.121 53.981 53.561 53.335 53.11 52.87 52.578 52.175 51.7 49.398 -6 ,27084 ,TETRA ,17616268,Mon Nov 29 09:49:50 CET,Mon Nov 29 12:05:31 CET,0.0 0.607 0.886 1.123 1.351 1.543 1.723 1.906 2.238 2.387 2.532 2.579 2.985 3.136 3.429 3.724 3.999 4.123 4.37 4.626 5.03 5.311 5.566 5.907 6.242 6.574 6.914 7.255 7.682 8.102 8.538 9.073 9.589 10.094 10.694 11.415 12.128 12.903 13.774 14.712 15.694 16.85 18.241 19.687 21.473 23.575 26.105 29.115 32.855 37.556 43.803 49.558 53.26 55.766 57.556 58.942 60.015 60.833 61.409 61.904 62.29 62.595 62.844 63.056 63.169 63.191 63.202 63.205 63.221 63.245 63.269 63.289 63.288 63.275 63.261 63.215 63.143 63.053 62.988 62.961 62.905 62.785 62.708 62.616 62.565 62.464 62.316 62.12 62.009 61.709 61.601 61.431 61.262 60.908 60.681 60.41 60.093 59.723 59.271 58.616 55.232 -7 ,23892 ,TETRA ,17616269,Mon Nov 29 09:49:52 CET,Mon Nov 29 12:05:48 CET,0.0 0.401 0.701 0.928 1.137 1.332 1.529 1.74 2.089 2.231 2.377 2.427 2.834 2.975 3.256 3.52 3.779 3.91 4.179 4.439 4.797 5.027 5.251 5.593 5.937 6.272 6.614 6.956 7.402 7.843 8.27 8.798 9.319 9.832 10.439 11.152 11.844 12.593 13.429 14.341 15.355 16.537 17.949 19.424 21.15 23.117 25.501 28.301 31.736 36.053 41.747 47.027 50.427 52.809 54.496 55.663 56.479 57.174 57.719 58.165 58.483 58.719 58.906 59.025 59.107 59.169 59.205 59.204 59.207 59.215 59.199 59.194 59.171 59.115 59.07 59.028 58.961 58.885 58.812 58.749 58.665 58.504 58.382 58.257 58.189 58.033 57.886 57.725 57.628 57.333 57.311 57.176 57.045 56.765 56.6 56.418 56.162 55.791 55.361 54.802 52.198 -8 ,21760 ,TETRA ,17616270,Mon Nov 29 09:49:54 CET,Mon Nov 29 12:08:31 CET,0.0 0.623 0.919 1.144 1.368 1.588 1.787 1.974 2.317 2.484 2.659 2.751 3.177 3.335 3.631 3.889 4.159 4.302 4.574 4.831 5.211 5.465 5.713 6.074 6.424 6.771 7.135 7.511 7.982 8.424 8.865 9.405 9.946 10.484 11.1 11.792 12.455 13.193 14.043 14.968 15.922 17.019 18.352 19.758 21.435 23.377 25.808 28.699 32.182 36.479 41.984 46.929 50.25 52.577 54.14 55.302 56.201 56.887 57.401 57.833 58.14 58.405 58.608 58.734 58.831 58.905 58.97 59.008 59.025 59.023 58.989 58.953 58.914 58.86 58.809 58.753 58.693 58.622 58.528 58.46 58.392 58.268 58.165 58.021 57.946 57.832 57.719 57.561 57.442 57.113 57.056 56.91 56.747 56.385 56.19 55.987 55.743 55.466 55.13 54.488 51.775 -9 ,23800 ,TETRA ,17616271,Mon Nov 29 09:49:51 CET,Mon Nov 29 12:05:26 CET,0.0 0.715 1.107 1.434 1.68 1.892 2.085 2.265 2.62 2.791 2.946 2.987 3.398 3.554 3.85 4.132 4.397 4.531 4.798 5.052 5.412 5.654 5.89 6.231 6.568 6.921 7.273 7.607 8.048 8.474 8.891 9.41 9.917 10.432 11.046 11.741 12.435 13.219 14.12 15.104 16.119 17.308 18.769 20.262 22.025 24.041 26.46 29.375 33.033 37.629 43.63 49.015 52.446 54.688 56.165 57.27 58.134 58.796 59.276 59.661 59.922 60.123 60.305 60.471 60.568 60.624 60.666 60.669 60.658 60.638 60.601 60.586 60.564 60.521 60.467 60.364 60.261 60.184 60.088 60.005 59.904 59.717 59.59 59.474 59.405 59.239 59.076 58.904 58.81 58.513 58.499 58.372 58.244 57.965 57.759 57.502 57.266 57.0 56.599 56.069 53.546 -10 ,25356 ,TETRA ,17616272,Mon Nov 29 09:49:53 CET,Mon Nov 29 12:05:47 CET,0.0 0.6 0.943 1.194 1.414 1.626 1.826 2.005 2.323 2.471 2.626 2.674 3.083 3.241 3.549 3.858 4.142 4.282 4.572 4.844 5.228 5.476 5.721 6.08 6.421 6.764 7.102 7.428 7.874 8.31 8.721 9.24 9.757 10.255 10.843 11.527 12.206 12.977 13.805 14.694 15.681 16.859 18.256 19.702 21.442 23.42 25.816 28.643 32.122 36.571 42.445 47.694 50.973 53.252 54.908 56.147 57.022 57.68 58.191 58.615 58.89 59.095 59.258 59.395 59.497 59.546 59.587 59.605 59.598 59.587 59.564 59.532 59.491 59.453 59.403 59.34 59.288 59.214 59.11 59.047 58.996 58.896 58.805 58.705 58.653 58.549 58.413 58.224 58.117 57.815 57.758 57.63 57.489 57.148 56.944 56.702 56.41 56.076 55.751 55.3 52.104 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt deleted file mode 100644 index 3e82b544..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24710 ,TETRA ,17616273,Mon Nov 29 09:49:55 CET,Mon Nov 29 12:09:35 CET,0.0 0.594 0.802 1.034 1.268 1.456 1.62 1.78 2.056 2.185 2.32 2.316 2.686 2.795 2.997 3.211 3.413 3.509 3.696 3.87 4.126 4.29 4.453 4.701 4.954 5.204 5.433 5.649 5.93 6.205 6.479 6.825 7.165 7.505 7.896 8.345 8.791 9.26 9.754 10.279 10.839 11.499 12.285 13.107 14.082 15.168 16.481 18.056 20.025 22.408 25.128 27.459 28.89 29.781 30.369 30.806 31.124 31.314 31.408 31.462 31.516 31.544 31.549 31.55 31.542 31.525 31.495 31.48 31.461 31.428 31.385 31.35 31.309 31.248 31.204 31.154 31.093 31.038 30.976 30.934 30.902 30.813 30.736 30.671 30.641 30.576 30.509 30.45 30.42 30.165 30.286 30.236 30.18 30.049 29.981 29.915 29.834 29.74 29.651 29.514 29.084 -2 ,21214 ,TETRA ,17616274,Mon Nov 29 09:49:51 CET,Mon Nov 29 12:11:42 CET,0.0 0.317 0.515 0.701 0.88 1.045 1.197 1.345 1.62 1.74 1.851 1.809 2.154 2.255 2.46 2.648 2.825 2.912 3.095 3.277 3.544 3.721 3.884 4.11 4.325 4.548 4.771 4.999 5.299 5.575 5.844 6.188 6.534 6.868 7.244 7.671 8.107 8.603 9.135 9.714 10.318 10.988 11.802 12.653 13.693 14.893 16.321 17.975 19.981 22.474 25.571 28.223 29.816 30.886 31.673 32.226 32.636 32.958 33.173 33.322 33.421 33.509 33.575 33.63 33.68 33.687 33.678 33.674 33.671 33.663 33.63 33.606 33.594 33.583 33.561 33.523 33.479 33.436 33.384 33.345 33.307 33.232 33.167 33.096 33.065 33.015 32.955 32.875 32.839 32.592 32.731 32.682 32.629 32.523 32.447 32.37 32.303 32.217 32.124 31.978 31.586 -3 ,10264 ,TETRA ,17616275,Mon Nov 29 09:49:52 CET,Mon Nov 29 12:11:35 CET,0.0 0.441 0.721 0.933 1.115 1.276 1.427 1.547 1.778 1.898 2.017 2.01 2.378 2.486 2.686 2.882 3.08 3.175 3.359 3.549 3.819 3.988 4.165 4.42 4.664 4.897 5.117 5.333 5.622 5.902 6.171 6.504 6.841 7.164 7.522 7.925 8.339 8.823 9.336 9.873 10.459 11.155 11.993 12.82 13.789 14.914 16.251 17.88 19.896 22.282 25.17 27.615 29.128 30.147 30.816 31.27 31.609 31.874 32.022 32.131 32.21 32.245 32.25 32.249 32.244 32.233 32.206 32.16 32.115 32.066 32.024 31.993 31.953 31.91 31.87 31.819 31.762 31.7 31.636 31.596 31.55 31.468 31.406 31.333 31.296 31.218 31.132 31.054 31.017 30.765 30.892 30.844 30.787 30.636 30.549 30.45 30.346 30.245 30.113 29.966 29.594 -4 ,20687 ,TETRA ,17616276,Mon Nov 29 09:49:54 CET,Mon Nov 29 12:09:58 CET,0.0 0.425 0.718 0.937 1.111 1.274 1.415 1.531 1.739 1.842 1.95 1.903 2.247 2.357 2.582 2.783 2.963 3.048 3.234 3.415 3.658 3.814 3.968 4.201 4.433 4.661 4.881 5.096 5.381 5.654 5.919 6.248 6.581 6.909 7.287 7.728 8.178 8.678 9.211 9.774 10.361 11.039 11.859 12.717 13.767 14.987 16.42 18.099 20.128 22.523 25.555 28.275 29.971 31.043 31.734 32.189 32.462 32.639 32.736 32.837 32.943 33.027 33.086 33.106 33.106 33.106 33.114 33.11 33.099 33.075 33.043 33.022 33.008 32.987 32.953 32.907 32.858 32.81 32.764 32.726 32.68 32.611 32.557 32.503 32.478 32.41 32.33 32.232 32.175 31.913 32.031 31.974 31.91 31.769 31.687 31.591 31.447 31.292 31.165 31.063 30.932 -5 ,26359 ,TETRA ,17616277,Mon Nov 29 09:49:52 CET,Mon Nov 29 12:10:35 CET,0.0 0.272 0.494 0.676 0.855 1.025 1.176 1.316 1.572 1.692 1.812 1.786 2.15 2.264 2.473 2.661 2.842 2.927 3.1 3.281 3.549 3.718 3.875 4.105 4.333 4.571 4.797 5.01 5.294 5.569 5.841 6.18 6.512 6.832 7.2 7.634 8.079 8.584 9.148 9.758 10.388 11.097 11.929 12.81 13.878 15.096 16.509 18.122 20.075 22.448 25.432 28.142 29.74 30.707 31.281 31.701 32.036 32.231 32.327 32.375 32.394 32.403 32.415 32.428 32.437 32.433 32.432 32.431 32.394 32.336 32.284 32.233 32.183 32.129 32.076 32.022 31.967 31.915 31.868 31.82 31.759 31.67 31.605 31.529 31.492 31.411 31.327 31.251 31.203 30.939 31.048 30.984 30.915 30.767 30.68 30.586 30.46 30.316 30.2 30.081 29.73 -6 ,2127 ,TETRA ,17616278,Mon Nov 29 09:49:53 CET,Mon Nov 29 12:11:34 CET,0.0 0.501 0.748 0.939 1.105 1.25 1.377 1.494 1.723 1.837 1.955 1.92 2.265 2.364 2.555 2.747 2.943 3.032 3.189 3.352 3.596 3.747 3.9 4.135 4.353 4.577 4.802 5.021 5.299 5.557 5.816 6.145 6.464 6.773 7.14 7.563 7.979 8.445 8.955 9.504 10.108 10.804 11.618 12.464 13.474 14.624 16.001 17.658 19.689 22.164 25.355 28.104 29.725 30.809 31.545 31.979 32.196 32.331 32.427 32.509 32.567 32.591 32.594 32.584 32.553 32.509 32.453 32.402 32.355 32.294 32.232 32.173 32.103 32.042 32.001 31.963 31.907 31.846 31.79 31.742 31.694 31.619 31.572 31.533 31.501 31.426 31.355 31.261 31.222 30.968 31.07 31.016 30.958 30.832 30.763 30.669 30.562 30.435 30.298 30.169 29.738 -7 ,23509 ,TETRA ,17616279,Mon Nov 29 09:49:56 CET,Mon Nov 29 12:10:45 CET,0.0 0.379 0.566 0.712 0.865 1.021 1.157 1.301 1.587 1.707 1.838 1.842 2.199 2.307 2.524 2.737 2.933 3.023 3.202 3.371 3.615 3.778 3.936 4.155 4.375 4.594 4.814 5.021 5.295 5.572 5.84 6.174 6.515 6.88 7.327 7.838 8.344 8.895 9.453 10.034 10.652 11.357 12.195 13.043 14.068 15.27 16.688 18.326 20.383 22.924 26.133 28.955 30.632 31.732 32.469 32.991 33.345 33.622 33.823 33.948 34.034 34.086 34.112 34.14 34.162 34.165 34.159 34.141 34.104 34.056 34.011 33.955 33.895 33.85 33.816 33.762 33.7 33.632 33.542 33.478 33.416 33.317 33.24 33.174 33.145 33.09 33.031 32.958 32.924 32.671 32.788 32.737 32.667 32.53 32.475 32.416 32.329 32.218 32.085 31.958 31.557 -8 ,29260 ,TETRA ,17616280,Mon Nov 29 09:49:52 CET,Mon Nov 29 12:17:23 CET,0.0 0.45 0.654 0.833 1.0 1.174 1.317 1.443 1.662 1.762 1.863 1.813 2.151 2.245 2.422 2.598 2.769 2.854 3.017 3.166 3.394 3.551 3.714 3.949 4.166 4.383 4.6 4.817 5.105 5.388 5.653 5.98 6.324 6.658 7.046 7.48 7.906 8.387 8.903 9.466 10.056 10.717 11.516 12.353 13.365 14.559 15.996 17.647 19.617 22.026 25.005 27.614 29.263 30.353 31.14 31.67 32.055 32.353 32.563 32.75 32.881 32.972 33.037 33.088 33.117 33.132 33.133 33.115 33.077 33.037 32.997 32.948 32.898 32.854 32.809 32.759 32.712 32.653 32.594 32.548 32.504 32.43 32.36 32.296 32.269 32.214 32.145 32.069 32.031 31.775 31.891 31.838 31.777 31.641 31.573 31.504 31.431 31.339 31.222 31.069 30.788 -9 ,13857 ,TETRA ,17616281,Mon Nov 29 09:49:52 CET,Mon Nov 29 12:17:37 CET,0.0 0.399 0.622 0.79 0.95 1.093 1.215 1.321 1.538 1.651 1.749 1.703 2.049 2.147 2.333 2.525 2.717 2.807 2.99 3.168 3.425 3.595 3.757 3.982 4.198 4.414 4.629 4.834 5.098 5.358 5.63 5.975 6.312 6.635 7.019 7.471 7.899 8.355 8.857 9.396 9.96 10.597 11.363 12.18 13.17 14.312 15.687 17.272 19.013 21.082 23.882 26.404 28.0 29.014 29.69 30.179 30.5 30.729 30.872 30.973 31.05 31.1 31.15 31.186 31.159 31.105 31.06 31.012 30.96 30.923 30.89 30.854 30.785 30.684 30.615 30.558 30.503 30.463 30.425 30.386 30.331 30.256 30.209 30.145 30.108 30.039 29.976 29.91 29.869 29.595 29.673 29.604 29.524 29.359 29.272 29.189 29.1 28.987 28.807 28.582 27.728 -10 ,18693 ,TETRA ,17616282,Mon Nov 29 09:49:55 CET,Mon Nov 29 12:08:58 CET,0.0 0.32 0.471 0.634 0.808 0.966 1.108 1.235 1.468 1.583 1.709 1.727 2.085 2.181 2.373 2.551 2.72 2.805 2.976 3.15 3.397 3.549 3.705 3.942 4.163 4.38 4.598 4.813 5.082 5.365 5.649 5.975 6.311 6.646 7.035 7.457 7.884 8.377 8.901 9.472 10.075 10.746 11.56 12.384 13.367 14.528 15.902 17.526 19.512 21.969 25.071 27.729 29.379 30.45 31.183 31.75 32.168 32.476 32.71 32.885 32.985 33.061 33.124 33.167 33.18 33.175 33.155 33.126 33.107 33.083 33.054 33.035 33.019 32.993 32.957 32.921 32.889 32.86 32.818 32.776 32.721 32.648 32.603 32.544 32.521 32.465 32.369 32.282 32.245 31.983 32.074 32.015 31.95 31.794 31.716 31.64 31.566 31.482 31.376 31.22 30.87 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 8a97bfb0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20847 ,TETRA ,17616283,Mon Nov 29 09:49:53 CET,Mon Nov 29 12:13:08 CET,0.0 0.561 0.918 1.21 1.465 1.702 1.906 2.104 2.504 2.699 2.891 2.975 3.398 3.577 3.892 4.159 4.422 4.559 4.833 5.094 5.471 5.715 5.954 6.313 6.656 6.982 7.3 7.613 8.03 8.424 8.794 9.255 9.711 10.158 10.688 11.296 11.887 12.535 13.233 13.994 14.801 15.727 16.801 17.867 19.134 20.604 22.296 24.253 26.688 29.668 33.587 37.143 39.346 40.858 41.963 42.77 43.352 43.797 44.128 44.422 44.624 44.781 44.905 44.985 45.051 45.116 45.165 45.182 45.187 45.175 45.16 45.139 45.107 45.074 45.038 45.008 44.974 44.913 44.827 44.767 44.702 44.601 44.538 44.459 44.416 44.357 44.304 44.228 44.177 43.904 43.928 43.852 43.797 43.687 43.633 43.577 43.481 43.365 43.243 43.047 42.71 -2 ,12569 ,TETRA ,17616284,Mon Nov 29 09:49:55 CET,Mon Nov 29 12:15:03 CET,0.0 0.827 1.205 1.5 1.762 1.967 2.155 2.346 2.688 2.872 3.06 3.127 3.524 3.663 3.925 4.18 4.435 4.559 4.806 5.037 5.368 5.595 5.811 6.128 6.442 6.761 7.082 7.381 7.766 8.152 8.539 9.01 9.449 9.891 10.432 11.034 11.63 12.296 13.029 13.799 14.593 15.541 16.677 17.816 19.164 20.718 22.593 24.786 27.445 30.67 34.685 38.167 40.339 41.837 42.875 43.634 44.228 44.681 44.967 45.193 45.357 45.491 45.601 45.674 45.718 45.754 45.804 45.828 45.817 45.803 45.78 45.765 45.758 45.717 45.677 45.646 45.603 45.56 45.522 45.494 45.459 45.395 45.347 45.299 45.276 45.217 45.133 45.037 44.994 44.743 44.843 44.791 44.733 44.578 44.506 44.446 44.353 44.244 44.126 43.975 43.751 -3 ,32331 ,TETRA ,17616285,Mon Nov 29 09:49:53 CET,Mon Nov 29 12:18:08 CET,0.0 1.402 1.717 1.955 2.171 2.358 2.546 2.72 3.086 3.276 3.451 3.545 3.959 4.113 4.39 4.658 4.931 5.066 5.315 5.545 5.877 6.097 6.318 6.637 6.959 7.282 7.598 7.897 8.277 8.652 9.012 9.443 9.866 10.277 10.764 11.318 11.863 12.505 13.21 13.957 14.762 15.673 16.754 17.872 19.215 20.758 22.562 24.633 27.16 30.294 34.364 38.012 40.344 41.934 43.039 43.829 44.371 44.778 45.092 45.288 45.404 45.549 45.689 45.801 45.878 45.938 46.0 46.045 46.065 46.065 46.067 46.077 46.074 46.04 46.018 46.006 45.978 45.949 45.914 45.878 45.828 45.743 45.697 45.655 45.635 45.591 45.543 45.484 45.451 45.219 45.369 45.338 45.305 45.211 45.145 45.075 45.009 44.935 44.826 44.685 44.368 -4 ,30517 ,TETRA ,17616286,Mon Nov 29 09:49:55 CET,Mon Nov 29 12:17:39 CET,0.0 0.861 1.261 1.509 1.743 1.969 2.188 2.383 2.69 2.848 3.021 3.089 3.486 3.637 3.931 4.204 4.465 4.598 4.848 5.083 5.432 5.673 5.907 6.232 6.553 6.87 7.187 7.499 7.904 8.294 8.668 9.107 9.537 9.971 10.485 11.054 11.6 12.219 12.897 13.635 14.411 15.296 16.372 17.489 18.81 20.257 21.924 23.911 26.359 29.382 33.261 36.684 38.78 40.116 40.954 41.583 42.073 42.431 42.719 42.958 43.112 43.228 43.309 43.372 43.415 43.436 43.458 43.478 43.506 43.529 43.528 43.517 43.51 43.505 43.49 43.467 43.445 43.421 43.384 43.355 43.337 43.31 43.288 43.255 43.228 43.168 43.108 43.009 42.952 42.699 42.785 42.723 42.669 42.534 42.446 42.357 42.266 42.184 42.102 41.956 41.333 -5 ,21670 ,TETRA ,17616287,Mon Nov 29 09:49:57 CET,Mon Nov 29 12:13:29 CET,0.0 0.669 1.017 1.297 1.56 1.806 2.043 2.256 2.637 2.828 3.0 3.043 3.422 3.563 3.851 4.13 4.381 4.498 4.739 4.994 5.359 5.58 5.79 6.106 6.425 6.729 7.016 7.31 7.691 8.061 8.434 8.878 9.301 9.72 10.226 10.824 11.406 12.04 12.721 13.439 14.21 15.112 16.2 17.315 18.658 20.226 22.073 24.245 26.89 30.167 34.343 38.007 40.285 41.701 42.666 43.408 43.957 44.358 44.651 44.899 45.093 45.255 45.386 45.499 45.58 45.624 45.657 45.687 45.721 45.76 45.791 45.808 45.816 45.804 45.785 45.758 45.747 45.737 45.69 45.656 45.639 45.607 45.574 45.535 45.505 45.439 45.387 45.325 45.282 45.025 45.139 45.102 45.052 44.935 44.877 44.803 44.717 44.626 44.515 44.327 44.044 -6 ,7835 ,TETRA ,17616288,Mon Nov 29 09:49:54 CET,Mon Nov 29 12:18:03 CET,0.0 0.587 0.949 1.251 1.528 1.765 1.975 2.17 2.54 2.714 2.876 2.955 3.362 3.517 3.828 4.125 4.416 4.55 4.784 5.0 5.325 5.538 5.749 6.071 6.388 6.685 6.955 7.218 7.572 7.936 8.297 8.731 9.161 9.577 10.068 10.636 11.183 11.802 12.493 13.219 13.976 14.824 15.844 16.885 18.109 19.508 21.192 23.175 25.506 28.203 31.713 34.868 36.818 38.173 39.132 39.876 40.433 40.832 41.074 41.272 41.47 41.65 41.783 41.883 41.955 41.97 41.944 41.918 41.879 41.843 41.823 41.814 41.806 41.775 41.736 41.705 41.68 41.644 41.612 41.579 41.534 41.461 41.396 41.321 41.284 41.21 41.14 41.067 41.028 40.773 40.852 40.792 40.74 40.646 40.594 40.52 40.427 40.338 40.26 40.161 39.952 -7 ,2595 ,TETRA ,17616289,Mon Nov 29 09:49:56 CET,Mon Nov 29 12:17:52 CET,0.0 1.469 2.025 2.436 2.753 3.006 3.241 3.473 3.9 4.096 4.268 4.34 4.751 4.906 5.199 5.496 5.788 5.925 6.184 6.438 6.809 7.06 7.301 7.644 7.992 8.332 8.65 8.968 9.392 9.799 10.19 10.666 11.119 11.548 12.065 12.669 13.235 13.872 14.563 15.302 16.133 17.078 18.197 19.343 20.702 22.279 24.111 26.24 28.836 31.947 35.772 39.052 41.17 42.676 43.72 44.461 45.012 45.435 45.719 45.98 46.19 46.339 46.455 46.546 46.634 46.684 46.709 46.741 46.765 46.78 46.786 46.792 46.792 46.777 46.764 46.747 46.723 46.694 46.655 46.63 46.603 46.558 46.528 46.496 46.477 46.435 46.399 46.356 46.329 46.089 46.224 46.183 46.129 45.988 45.915 45.841 45.756 45.652 45.522 45.341 45.06 -8 ,17067 ,TETRA ,17616290,Mon Nov 29 09:49:58 CET,Mon Nov 29 12:13:29 CET,0.0 0.617 0.94 1.202 1.423 1.638 1.852 2.036 2.356 2.525 2.696 2.76 3.155 3.305 3.627 3.934 4.197 4.319 4.557 4.785 5.144 5.394 5.649 6.005 6.336 6.663 6.971 7.28 7.666 8.036 8.406 8.862 9.308 9.745 10.257 10.819 11.376 12.01 12.722 13.491 14.289 15.211 16.322 17.455 18.78 20.269 21.963 23.911 26.361 29.423 33.301 36.578 38.504 39.683 40.438 40.978 41.381 41.687 41.918 42.14 42.299 42.391 42.425 42.426 42.458 42.504 42.546 42.562 42.566 42.573 42.571 42.563 42.553 42.541 42.536 42.517 42.483 42.455 42.411 42.384 42.359 42.307 42.271 42.233 42.215 42.176 42.12 42.061 42.038 41.804 41.934 41.89 41.832 41.706 41.642 41.584 41.536 41.466 41.325 41.108 40.721 -9 ,10365 ,TETRA ,17616291,Mon Nov 29 09:49:53 CET,Mon Nov 29 12:12:44 CET,0.0 0.965 1.372 1.684 1.974 2.261 2.518 2.75 3.2 3.41 3.603 3.705 4.133 4.302 4.608 4.888 5.171 5.31 5.553 5.796 6.169 6.416 6.665 7.037 7.399 7.76 8.139 8.499 8.937 9.367 9.789 10.288 10.77 11.239 11.773 12.376 12.947 13.594 14.32 15.089 15.9 16.825 17.917 19.031 20.365 21.878 23.705 25.897 28.489 31.645 35.663 39.19 41.431 42.908 43.928 44.678 45.244 45.713 46.091 46.413 46.627 46.765 46.878 46.99 47.079 47.135 47.173 47.207 47.228 47.245 47.265 47.27 47.264 47.217 47.172 47.12 47.061 47.009 46.958 46.929 46.893 46.846 46.807 46.765 46.737 46.658 46.594 46.522 46.476 46.234 46.386 46.35 46.298 46.185 46.104 46.006 45.907 45.812 45.729 45.631 45.383 -10 ,25807 ,TETRA ,17616292,Mon Nov 29 09:49:55 CET,Mon Nov 29 12:12:32 CET,0.0 0.949 1.325 1.641 1.902 2.127 2.348 2.56 2.948 3.125 3.306 3.414 3.83 3.983 4.3 4.611 4.883 5.011 5.27 5.523 5.883 6.116 6.354 6.701 7.025 7.345 7.666 7.972 8.356 8.722 9.073 9.521 9.992 10.457 11.016 11.662 12.281 12.972 13.746 14.587 15.458 16.445 17.658 18.874 20.294 21.94 23.812 25.88 28.387 31.563 35.71 39.365 41.596 43.069 44.041 44.79 45.375 45.779 46.069 46.315 46.493 46.604 46.685 46.742 46.769 46.78 46.783 46.768 46.747 46.739 46.723 46.697 46.664 46.628 46.606 46.581 46.552 46.534 46.502 46.458 46.411 46.333 46.282 46.225 46.191 46.126 46.048 45.955 45.897 45.631 45.747 45.704 45.642 45.504 45.434 45.351 45.245 45.124 44.986 44.787 44.476 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 95f6c8a0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1328 ,TETRA ,17616293,Mon Nov 29 09:49:57 CET,Mon Nov 29 11:58:24 CET,0.0 0.439 0.61 0.77 0.908 1.041 1.164 1.268 1.465 1.557 1.649 1.646 1.926 2.013 2.186 2.343 2.499 2.576 2.71 2.831 3.021 3.155 3.288 3.471 3.645 3.81 3.96 4.113 4.308 4.489 4.672 4.909 5.126 5.347 5.62 5.899 6.162 6.458 6.772 7.099 7.44 7.837 8.307 8.769 9.324 9.966 10.709 11.529 12.435 13.458 14.608 15.373 15.691 15.79 15.743 15.557 15.326 15.137 14.963 14.763 14.582 14.384 14.173 13.985 13.814 13.642 13.44 13.253 13.091 12.93 12.761 12.61 12.462 12.298 12.162 12.019 11.874 11.731 11.577 11.456 11.33 11.157 11.03 10.897 10.829 10.68 10.507 10.325 10.235 9.962 9.965 9.856 9.745 9.5 9.364 9.234 9.086 8.906 8.686 8.338 7.056 -2 ,29293 ,TETRA ,17616294,Mon Nov 29 09:49:53 CET,Mon Nov 29 12:10:39 CET,0.0 0.385 0.604 0.816 1.013 1.166 1.283 1.422 1.707 1.824 1.924 1.911 2.191 2.285 2.454 2.603 2.756 2.837 2.992 3.112 3.268 3.372 3.475 3.632 3.788 3.933 4.075 4.223 4.411 4.587 4.768 4.999 5.209 5.405 5.65 5.932 6.203 6.519 6.845 7.165 7.49 7.849 8.291 8.736 9.249 9.83 10.474 11.18 12.037 13.034 14.066 14.736 15.022 15.028 14.91 14.775 14.617 14.439 14.254 14.036 13.824 13.622 13.44 13.279 13.103 12.929 12.749 12.582 12.429 12.257 12.085 11.949 11.814 11.676 11.551 11.42 11.294 11.143 10.974 10.86 10.736 10.567 10.462 10.339 10.275 10.134 9.969 9.788 9.694 9.405 9.376 9.272 9.176 8.944 8.796 8.628 8.449 8.247 7.981 7.625 6.039 -3 ,6334 ,TETRA ,17616295,Mon Nov 29 09:49:55 CET,Mon Nov 29 12:10:55 CET,0.0 0.269 0.545 0.729 0.849 0.955 1.073 1.202 1.402 1.483 1.558 1.528 1.821 1.91 2.057 2.191 2.325 2.395 2.528 2.652 2.835 2.958 3.084 3.275 3.446 3.607 3.755 3.891 4.08 4.273 4.465 4.693 4.921 5.145 5.412 5.713 5.974 6.257 6.566 6.893 7.231 7.607 8.049 8.474 8.933 9.421 9.993 10.697 11.522 12.355 13.285 13.783 13.781 13.589 13.348 13.078 12.81 12.556 12.322 12.062 11.822 11.599 11.365 11.156 10.968 10.782 10.588 10.419 10.259 10.082 9.897 9.741 9.567 9.378 9.243 9.103 8.948 8.786 8.625 8.511 8.387 8.208 8.088 7.967 7.902 7.769 7.642 7.5 7.416 7.133 7.124 7.018 6.905 6.65 6.505 6.344 6.13 5.895 5.66 5.372 4.809 -4 ,30508 ,TETRA ,17616296,Mon Nov 29 09:49:58 CET,Mon Nov 29 11:59:35 CET,0.0 0.838 1.147 1.356 1.499 1.642 1.766 1.863 2.054 2.147 2.231 2.205 2.478 2.563 2.715 2.868 3.034 3.112 3.246 3.372 3.561 3.683 3.802 3.97 4.13 4.281 4.417 4.551 4.737 4.918 5.09 5.293 5.496 5.692 5.922 6.2 6.457 6.714 6.994 7.311 7.653 8.037 8.451 8.857 9.383 9.994 10.677 11.454 12.311 13.226 14.192 14.897 15.185 15.249 15.204 15.074 14.894 14.701 14.47 14.189 13.938 13.708 13.491 13.268 13.071 12.917 12.747 12.588 12.446 12.285 12.112 11.967 11.806 11.638 11.499 11.356 11.23 11.106 10.945 10.811 10.68 10.494 10.375 10.255 10.195 10.06 9.892 9.73 9.643 9.365 9.391 9.298 9.192 8.963 8.84 8.71 8.557 8.368 8.152 7.829 6.735 -5 ,14189 ,TETRA ,17616297,Mon Nov 29 09:51:14 CET,Mon Nov 29 12:15:23 CET,0.0 0.636 0.888 1.073 1.257 1.426 1.566 1.692 1.914 2.01 2.107 2.105 2.399 2.49 2.667 2.829 2.987 3.072 3.248 3.4 3.591 3.703 3.817 3.998 4.167 4.321 4.488 4.657 4.86 5.056 5.247 5.469 5.681 5.908 6.183 6.467 6.723 7.014 7.338 7.67 8.023 8.427 8.895 9.368 9.925 10.539 11.21 11.932 12.741 13.633 14.563 15.156 15.333 15.309 15.195 15.042 14.892 14.722 14.56 14.383 14.206 14.034 13.861 13.699 13.538 13.366 13.182 13.017 12.873 12.72 12.55 12.416 12.271 12.121 12.01 11.895 11.768 11.62 11.466 11.359 11.242 11.067 10.947 10.813 10.74 10.583 10.418 10.233 10.133 9.846 9.836 9.726 9.62 9.395 9.248 9.109 8.971 8.803 8.546 8.232 7.628 -6 ,26691 ,TETRA ,17616298,Mon Nov 29 09:50:26 CET,Mon Nov 29 12:13:41 CET,0.0 0.309 0.483 0.647 0.826 0.981 1.119 1.26 1.527 1.636 1.729 1.703 1.988 2.081 2.263 2.419 2.565 2.637 2.778 2.917 3.115 3.237 3.356 3.537 3.703 3.86 4.015 4.172 4.378 4.563 4.734 4.941 5.143 5.342 5.578 5.843 6.091 6.37 6.684 7.016 7.361 7.751 8.188 8.633 9.178 9.822 10.584 11.413 12.358 13.455 14.622 15.357 15.669 15.783 15.79 15.687 15.547 15.425 15.29 15.134 14.979 14.828 14.669 14.5 14.34 14.201 14.053 13.898 13.749 13.584 13.403 13.261 13.105 12.941 12.822 12.691 12.553 12.407 12.249 12.13 11.987 11.748 11.584 11.429 11.35 11.169 10.981 10.798 10.713 10.435 10.43 10.324 10.213 9.975 9.865 9.748 9.603 9.427 9.195 8.836 7.697 -7 ,19224 ,TETRA ,17616299,Mon Nov 29 09:50:22 CET,Mon Nov 29 12:06:54 CET,0.0 0.724 0.996 1.179 1.328 1.48 1.609 1.719 1.961 2.087 2.196 2.194 2.486 2.589 2.77 2.945 3.121 3.199 3.344 3.476 3.653 3.768 3.872 4.035 4.2 4.352 4.509 4.659 4.847 5.042 5.233 5.449 5.66 5.868 6.104 6.369 6.63 6.914 7.227 7.585 7.956 8.335 8.753 9.182 9.703 10.301 10.97 11.755 12.648 13.599 14.733 15.473 15.768 15.917 15.945 15.86 15.7 15.523 15.368 15.204 15.029 14.846 14.689 14.52 14.328 14.167 14.006 13.865 13.738 13.592 13.452 13.342 13.223 13.098 12.99 12.849 12.707 12.568 12.408 12.295 12.175 12.002 11.884 11.766 11.711 11.591 11.457 11.328 11.255 10.99 11.018 10.92 10.818 10.599 10.454 10.29 10.127 9.952 9.727 9.395 8.301 -8 ,13305 ,TETRA ,17616300,Mon Nov 29 09:50:22 CET,Mon Nov 29 12:12:12 CET,0.0 0.553 0.776 0.929 1.075 1.213 1.353 1.487 1.71 1.802 1.891 1.852 2.133 2.215 2.377 2.541 2.713 2.797 2.962 3.125 3.348 3.48 3.594 3.769 3.949 4.106 4.257 4.406 4.599 4.791 4.972 5.197 5.438 5.659 5.899 6.174 6.448 6.745 7.052 7.393 7.753 8.171 8.68 9.187 9.773 10.449 11.245 12.113 13.166 14.348 15.484 16.178 16.448 16.521 16.489 16.409 16.287 16.146 16.018 15.866 15.714 15.572 15.405 15.222 15.06 14.912 14.743 14.589 14.443 14.283 14.11 13.954 13.798 13.645 13.538 13.431 13.314 13.198 13.08 12.993 12.894 12.743 12.641 12.539 12.486 12.369 12.238 12.084 12.007 11.748 11.761 11.671 11.58 11.367 11.234 11.081 10.917 10.715 10.499 10.218 9.216 -9 ,18048 ,TETRA ,17616301,Mon Nov 29 09:50:23 CET,Mon Nov 29 12:12:05 CET,0.0 0.63 0.927 1.147 1.333 1.508 1.666 1.79 1.974 2.07 2.175 2.164 2.453 2.548 2.719 2.872 3.017 3.08 3.211 3.341 3.535 3.673 3.799 3.967 4.129 4.282 4.422 4.57 4.781 4.982 5.16 5.37 5.585 5.802 6.044 6.3 6.547 6.81 7.106 7.435 7.767 8.158 8.609 9.054 9.575 10.151 10.824 11.517 12.251 13.049 13.958 14.605 14.799 14.791 14.723 14.605 14.434 14.256 14.088 13.907 13.757 13.601 13.414 13.241 13.095 12.951 12.782 12.628 12.494 12.351 12.194 12.054 11.906 11.748 11.61 11.452 11.287 11.125 10.969 10.857 10.737 10.561 10.445 10.315 10.243 10.098 9.947 9.791 9.708 9.437 9.483 9.406 9.314 9.1 8.966 8.817 8.663 8.483 8.29 8.034 7.083 -10 ,24388 ,TETRA ,17616302,Mon Nov 29 09:50:23 CET,Mon Nov 29 12:15:15 CET,0.0 0.264 0.463 0.627 0.767 0.884 0.986 1.085 1.294 1.403 1.508 1.492 1.765 1.845 1.987 2.118 2.25 2.317 2.439 2.546 2.704 2.815 2.927 3.089 3.24 3.384 3.521 3.656 3.83 4.027 4.228 4.463 4.683 4.885 5.131 5.399 5.651 5.922 6.203 6.505 6.834 7.217 7.643 8.064 8.541 9.061 9.671 10.342 11.133 12.119 13.24 13.897 14.094 14.116 14.03 13.895 13.715 13.505 13.312 13.096 12.891 12.711 12.546 12.384 12.229 12.08 11.919 11.777 11.646 11.499 11.342 11.201 11.051 10.895 10.774 10.645 10.506 10.367 10.214 10.105 9.994 9.818 9.696 9.571 9.504 9.368 9.228 9.072 8.995 8.724 8.702 8.585 8.475 8.245 8.106 7.944 7.754 7.531 7.305 6.944 5.984 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt deleted file mode 100644 index 53dd7eca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4672 ,TETRA ,17616303,Mon Nov 29 09:50:25 CET,Mon Nov 29 12:15:16 CET,0.0 0.291 0.473 0.627 0.752 0.85 0.945 1.024 1.223 1.337 1.423 1.456 1.603 1.672 1.809 1.908 2.009 2.064 2.171 2.267 2.389 2.475 2.56 2.687 2.817 2.935 3.038 3.136 3.27 3.409 3.538 3.67 3.808 3.945 4.102 4.289 4.469 4.668 4.866 5.063 5.258 5.46 5.71 5.941 6.16 6.409 6.679 6.982 7.346 7.671 7.788 7.58 7.254 6.853 6.421 5.996 5.621 5.273 4.974 4.669 4.399 4.169 3.959 3.759 3.553 3.358 3.154 2.962 2.789 2.619 2.448 2.297 2.139 1.986 1.87 1.74 1.599 1.456 1.309 1.198 1.083 0.919 0.801 0.667 0.6 0.477 0.338 0.184 0.108 -0.062 -0.133 -0.215 -0.303 -0.507 -0.625 -0.764 -0.911 -1.067 -1.251 -1.517 -2.484 -2 ,27777 ,TETRA ,17616304,Mon Nov 29 09:50:23 CET,Mon Nov 29 12:11:21 CET,0.0 0.214 0.377 0.523 0.663 0.81 0.922 0.987 1.127 1.201 1.268 1.293 1.445 1.509 1.625 1.729 1.829 1.888 2.02 2.134 2.283 2.375 2.455 2.569 2.696 2.805 2.905 3.004 3.122 3.245 3.364 3.504 3.64 3.772 3.922 4.096 4.266 4.446 4.623 4.802 5.007 5.242 5.508 5.788 6.085 6.387 6.72 7.033 7.333 7.583 7.678 7.445 7.062 6.652 6.264 5.908 5.556 5.231 4.942 4.599 4.298 4.053 3.834 3.628 3.438 3.266 3.078 2.907 2.754 2.59 2.423 2.29 2.151 2.004 1.886 1.765 1.644 1.522 1.391 1.292 1.184 1.029 0.933 0.827 0.766 0.629 0.484 0.335 0.26 0.091 0.023 -0.066 -0.173 -0.402 -0.534 -0.673 -0.825 -0.995 -1.169 -1.409 -2.118 -3 ,21940 ,TETRA ,17616305,Mon Nov 29 09:50:25 CET,Mon Nov 29 12:10:54 CET,0.0 0.646 0.926 1.096 1.291 1.473 1.602 1.757 1.982 2.045 2.113 2.149 2.299 2.363 2.484 2.593 2.71 2.756 2.847 2.948 3.087 3.181 3.278 3.404 3.516 3.628 3.736 3.837 3.971 4.109 4.247 4.399 4.53 4.658 4.828 5.028 5.203 5.38 5.564 5.77 5.971 6.175 6.409 6.652 6.94 7.237 7.505 7.768 8.048 8.279 8.303 8.035 7.726 7.349 6.991 6.668 6.31 5.962 5.67 5.362 5.089 4.846 4.617 4.405 4.209 4.047 3.877 3.705 3.559 3.407 3.239 3.106 2.968 2.813 2.691 2.568 2.456 2.338 2.192 2.088 1.991 1.83 1.716 1.6 1.537 1.391 1.254 1.132 1.064 0.897 0.841 0.75 0.643 0.411 0.291 0.163 -0.002 -0.183 -0.389 -0.633 -1.27 -4 ,23662 ,TETRA ,17616306,Mon Nov 29 09:50:23 CET,Mon Nov 29 11:54:02 CET,0.0 0.39 0.523 0.652 0.796 0.926 1.018 1.098 1.232 1.3 1.383 1.452 1.618 1.684 1.802 1.92 2.032 2.081 2.185 2.292 2.431 2.52 2.609 2.738 2.856 2.972 3.085 3.186 3.304 3.417 3.542 3.713 3.874 4.019 4.176 4.36 4.546 4.73 4.92 5.114 5.323 5.561 5.809 6.052 6.336 6.633 6.95 7.274 7.608 7.878 7.957 7.787 7.434 6.973 6.512 6.1 5.709 5.317 4.987 4.658 4.374 4.125 3.876 3.656 3.461 3.28 3.082 2.905 2.75 2.589 2.429 2.283 2.127 1.965 1.844 1.725 1.593 1.455 1.322 1.228 1.124 0.959 0.849 0.739 0.682 0.558 0.415 0.268 0.196 0.021 -0.058 -0.142 -0.222 -0.403 -0.514 -0.647 -0.813 -1.008 -1.236 -1.481 -2.203 -5 ,30623 ,TETRA ,17616307,Mon Nov 29 09:50:25 CET,Mon Nov 29 11:57:33 CET,0.0 0.48 0.724 0.869 0.966 1.07 1.175 1.282 1.467 1.531 1.586 1.619 1.777 1.846 1.97 2.068 2.174 2.232 2.357 2.479 2.637 2.726 2.803 2.917 3.034 3.153 3.268 3.369 3.49 3.607 3.718 3.861 4.004 4.151 4.332 4.512 4.676 4.859 5.057 5.256 5.451 5.678 5.947 6.223 6.528 6.83 7.139 7.456 7.769 8.075 8.283 8.157 7.853 7.509 7.173 6.867 6.583 6.292 6.047 5.786 5.559 5.357 5.138 4.926 4.741 4.575 4.385 4.205 4.045 3.881 3.719 3.588 3.447 3.294 3.177 3.058 2.933 2.803 2.663 2.57 2.477 2.333 2.243 2.148 2.093 1.985 1.881 1.764 1.703 1.538 1.478 1.405 1.323 1.144 1.05 0.952 0.839 0.693 0.543 0.371 -0.089 -6 ,3166 ,TETRA ,17616308,Mon Nov 29 09:50:23 CET,Mon Nov 29 12:11:36 CET,0.0 0.269 0.505 0.724 0.913 1.064 1.15 1.219 1.366 1.438 1.51 1.572 1.736 1.795 1.907 2.029 2.154 2.206 2.296 2.378 2.49 2.565 2.646 2.768 2.888 2.997 3.108 3.213 3.354 3.497 3.644 3.82 3.967 4.118 4.285 4.467 4.643 4.829 5.032 5.255 5.493 5.761 6.071 6.363 6.671 7.009 7.393 7.802 8.278 8.703 8.955 8.891 8.625 8.309 8.006 7.7 7.404 7.145 6.908 6.649 6.407 6.168 5.949 5.754 5.572 5.4 5.221 5.065 4.921 4.763 4.606 4.48 4.352 4.219 4.112 4.006 3.895 3.763 3.623 3.531 3.437 3.299 3.205 3.102 3.045 2.928 2.816 2.693 2.621 2.457 2.415 2.338 2.257 2.082 1.981 1.872 1.759 1.631 1.489 1.332 0.672 -7 ,5912 ,TETRA ,17616309,Mon Nov 29 09:50:25 CET,Mon Nov 29 12:11:27 CET,0.0 0.446 0.661 0.764 0.853 0.929 1.011 1.097 1.265 1.34 1.407 1.451 1.61 1.681 1.833 1.966 2.088 2.145 2.243 2.339 2.486 2.583 2.683 2.817 2.94 3.065 3.18 3.292 3.43 3.555 3.676 3.821 3.967 4.119 4.293 4.471 4.629 4.803 5.002 5.212 5.421 5.632 5.855 6.066 6.321 6.624 6.94 7.209 7.475 7.727 7.817 7.665 7.38 7.038 6.676 6.329 5.994 5.658 5.355 5.043 4.761 4.503 4.265 4.054 3.864 3.691 3.51 3.343 3.197 3.029 2.848 2.705 2.564 2.415 2.302 2.185 2.062 1.943 1.814 1.716 1.611 1.44 1.322 1.2 1.14 1.026 0.896 0.767 0.695 0.529 0.456 0.352 0.254 0.053 -0.058 -0.167 -0.294 -0.454 -0.64 -0.901 -1.388 -8 ,22301 ,TETRA ,17616310,Mon Nov 29 09:50:27 CET,Mon Nov 29 12:00:56 CET,0.0 0.319 0.431 0.54 0.643 0.736 0.826 0.937 1.156 1.24 1.319 1.4 1.575 1.647 1.784 1.919 2.07 2.135 2.234 2.329 2.471 2.565 2.652 2.775 2.887 2.988 3.094 3.215 3.359 3.488 3.619 3.765 3.912 4.066 4.237 4.419 4.595 4.79 4.976 5.178 5.392 5.618 5.876 6.122 6.405 6.676 6.965 7.301 7.604 7.842 7.932 7.669 7.349 7.033 6.66 6.297 5.971 5.661 5.402 5.153 4.936 4.71 4.469 4.249 4.049 3.863 3.661 3.489 3.347 3.201 3.052 2.918 2.791 2.677 2.573 2.455 2.33 2.198 2.071 1.988 1.902 1.744 1.635 1.53 1.472 1.364 1.249 1.125 1.057 0.897 0.829 0.745 0.666 0.488 0.382 0.249 0.104 -0.043 -0.204 -0.41 -1.131 -9 ,31047 ,TETRA ,17616311,Mon Nov 29 09:50:23 CET,Mon Nov 29 12:11:22 CET,0.0 0.785 0.994 1.11 1.232 1.383 1.514 1.592 1.752 1.843 1.916 1.944 2.107 2.175 2.314 2.435 2.545 2.597 2.696 2.813 2.979 3.069 3.16 3.29 3.406 3.529 3.662 3.782 3.903 4.023 4.157 4.332 4.502 4.647 4.809 5.002 5.165 5.33 5.522 5.73 5.942 6.163 6.421 6.678 6.955 7.283 7.639 7.953 8.268 8.554 8.808 8.824 8.63 8.373 8.053 7.699 7.386 7.087 6.808 6.532 6.287 6.056 5.859 5.679 5.504 5.344 5.157 4.976 4.811 4.639 4.464 4.323 4.181 4.02 3.892 3.778 3.663 3.534 3.394 3.297 3.203 3.067 2.965 2.86 2.806 2.686 2.559 2.415 2.341 2.18 2.133 2.063 1.996 1.829 1.722 1.6 1.462 1.335 1.176 0.928 0.385 -10 ,31684 ,TETRA ,17616312,Mon Nov 29 09:50:26 CET,Mon Nov 29 12:12:07 CET,0.0 0.258 0.379 0.485 0.577 0.67 0.776 0.893 1.125 1.223 1.291 1.324 1.485 1.556 1.707 1.845 1.955 2.007 2.1 2.183 2.299 2.375 2.458 2.585 2.704 2.818 2.934 3.039 3.162 3.28 3.392 3.533 3.677 3.808 3.957 4.131 4.295 4.475 4.669 4.874 5.087 5.316 5.58 5.842 6.137 6.456 6.816 7.213 7.604 7.9 7.988 7.755 7.362 6.963 6.586 6.223 5.887 5.564 5.285 4.988 4.729 4.505 4.286 4.084 3.895 3.727 3.564 3.414 3.269 3.107 2.933 2.794 2.651 2.491 2.36 2.24 2.122 1.989 1.838 1.733 1.63 1.476 1.372 1.265 1.211 1.091 0.952 0.793 0.716 0.545 0.488 0.414 0.315 0.088 -0.017 -0.142 -0.266 -0.426 -0.64 -0.844 -1.726 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 4a0f3fd1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7735 ,TETRA ,17616313,Mon Nov 29 09:50:28 CET,Mon Nov 29 12:01:31 CET,0.0 0.806 1.002 1.152 1.267 1.341 1.406 1.485 1.615 1.665 1.705 1.43 1.809 1.838 1.895 1.952 1.984 1.989 2.006 2.03 2.037 2.032 2.036 2.05 2.06 2.081 2.082 2.06 2.02 1.967 1.917 1.833 1.741 1.638 1.5 1.342 1.161 0.933 0.674 0.376 0.043 -0.375 -0.95 -1.599 -2.478 -3.598 -5.013 -6.839 -9.394 -13.119 -19.128 -25.94 -31.32 -35.693 -39.3 -42.473 -45.14 -47.422 -49.304 -51.1 -52.617 -53.944 -55.166 -56.292 -57.345 -58.304 -59.278 -60.126 -60.874 -61.654 -62.413 -63.035 -63.711 -64.397 -64.91 -65.425 -65.958 -66.547 -67.172 -67.604 -68.031 -68.677 -69.136 -69.593 -69.822 -70.297 -70.802 -71.339 -71.603 -72.307 -72.466 -72.781 -73.111 -73.799 -74.188 -74.581 -75.0 -75.499 -76.087 -76.856 -80.275 -2 ,12009 ,TETRA ,17616314,Mon Nov 29 09:50:24 CET,Mon Nov 29 12:14:00 CET,0.0 0.531 0.661 0.774 0.882 0.984 1.064 1.139 1.272 1.326 1.368 1.096 1.473 1.491 1.516 1.539 1.557 1.566 1.593 1.624 1.646 1.655 1.668 1.668 1.659 1.661 1.656 1.627 1.59 1.558 1.513 1.424 1.32 1.228 1.093 0.912 0.714 0.46 0.158 -0.206 -0.593 -1.034 -1.617 -2.251 -3.102 -4.219 -5.655 -7.505 -10.011 -13.657 -19.626 -26.383 -31.553 -35.692 -39.14 -42.102 -44.615 -46.843 -48.682 -50.445 -51.932 -53.231 -54.443 -55.561 -56.598 -57.522 -58.468 -59.313 -60.05 -60.82 -61.622 -62.266 -62.9 -63.559 -64.064 -64.581 -65.126 -65.676 -66.226 -66.607 -66.998 -67.599 -68.021 -68.455 -68.661 -69.068 -69.506 -69.972 -70.213 -70.887 -70.985 -71.257 -71.547 -72.173 -72.519 -72.879 -73.275 -73.726 -74.272 -74.92 -76.794 -3 ,14323 ,TETRA ,17616315,Mon Nov 29 09:50:26 CET,Mon Nov 29 12:18:52 CET,0.0 0.54 0.7 0.813 0.932 1.067 1.159 1.246 1.394 1.447 1.503 1.257 1.639 1.664 1.713 1.753 1.781 1.793 1.815 1.833 1.862 1.876 1.893 1.914 1.912 1.899 1.886 1.872 1.832 1.77 1.7 1.618 1.518 1.406 1.284 1.14 0.967 0.778 0.573 0.303 -0.011 -0.415 -0.927 -1.515 -2.332 -3.378 -4.773 -6.67 -9.323 -13.109 -19.245 -26.064 -31.319 -35.655 -39.201 -42.271 -44.866 -47.106 -48.966 -50.754 -52.272 -53.633 -54.898 -56.04 -57.076 -58.009 -58.985 -59.854 -60.601 -61.364 -62.117 -62.736 -63.377 -64.042 -64.558 -65.085 -65.619 -66.16 -66.712 -67.084 -67.475 -68.074 -68.486 -68.911 -69.129 -69.59 -70.093 -70.617 -70.87 -71.554 -71.731 -72.057 -72.367 -73.033 -73.416 -73.797 -74.222 -74.71 -75.244 -75.978 -78.857 -4 ,27792 ,TETRA ,17616316,Mon Nov 29 09:50:26 CET,Mon Nov 29 12:17:26 CET,0.0 0.495 0.646 0.751 0.84 0.915 0.975 1.048 1.169 1.213 1.252 0.963 1.335 1.367 1.418 1.442 1.483 1.511 1.559 1.606 1.666 1.693 1.7 1.713 1.722 1.718 1.713 1.695 1.658 1.611 1.553 1.477 1.387 1.276 1.132 0.972 0.829 0.654 0.432 0.162 -0.188 -0.65 -1.238 -1.863 -2.7 -3.786 -5.227 -7.069 -9.749 -13.805 -20.076 -27.068 -32.415 -36.732 -40.331 -43.552 -46.312 -48.674 -50.651 -52.542 -54.112 -55.511 -56.797 -57.967 -59.037 -60.012 -61.019 -61.889 -62.625 -63.386 -64.186 -64.852 -65.536 -66.212 -66.711 -67.238 -67.786 -68.354 -68.943 -69.342 -69.768 -70.439 -70.883 -71.343 -71.581 -72.081 -72.616 -73.159 -73.426 -74.119 -74.27 -74.576 -74.887 -75.541 -75.892 -76.288 -76.723 -77.204 -77.775 -78.56 -83.344 -5 ,8818 ,TETRA ,17616317,Mon Nov 29 09:50:26 CET,Mon Nov 29 12:18:05 CET,0.0 1.065 1.326 1.467 1.587 1.697 1.796 1.866 1.96 2.009 2.062 1.794 2.179 2.209 2.254 2.312 2.344 2.352 2.371 2.383 2.383 2.382 2.389 2.411 2.429 2.436 2.425 2.393 2.355 2.309 2.273 2.23 2.156 2.067 1.945 1.756 1.557 1.342 1.071 0.749 0.406 -0.022 -0.621 -1.31 -2.198 -3.314 -4.771 -6.659 -9.284 -13.05 -18.98 -25.723 -31.001 -35.192 -38.585 -41.505 -44.046 -46.326 -48.23 -50.075 -51.63 -52.985 -54.24 -55.37 -56.393 -57.337 -58.326 -59.21 -59.946 -60.676 -61.435 -62.057 -62.691 -63.352 -63.862 -64.387 -64.934 -65.483 -66.047 -66.451 -66.869 -67.498 -67.94 -68.393 -68.618 -69.095 -69.601 -70.107 -70.368 -71.062 -71.207 -71.522 -71.864 -72.698 -73.176 -73.658 -74.181 -74.713 -75.232 -75.988 -78.933 -6 ,547 ,TETRA ,17616318,Mon Nov 29 09:50:26 CET,Mon Nov 29 12:23:41 CET,0.0 0.839 1.032 1.196 1.326 1.442 1.54 1.614 1.728 1.769 1.804 1.511 1.886 1.91 1.952 1.972 1.975 1.986 2.015 2.038 2.046 2.034 2.021 1.996 1.962 1.93 1.901 1.856 1.798 1.754 1.707 1.629 1.526 1.421 1.271 1.094 0.915 0.677 0.401 0.064 -0.32 -0.794 -1.425 -2.1 -3.001 -4.173 -5.705 -7.709 -10.427 -14.287 -20.496 -27.439 -32.815 -37.101 -40.571 -43.595 -46.159 -48.372 -50.277 -52.162 -53.703 -55.047 -56.295 -57.456 -58.572 -59.577 -60.57 -61.431 -62.149 -62.871 -63.614 -64.214 -64.817 -65.421 -65.889 -66.386 -66.903 -67.444 -68.02 -68.411 -68.798 -69.365 -69.758 -70.171 -70.38 -70.804 -71.254 -71.718 -71.957 -72.639 -72.781 -73.067 -73.342 -73.975 -74.359 -74.787 -75.245 -75.706 -76.257 -77.03 -78.956 -7 ,29188 ,TETRA ,17616319,Mon Nov 29 09:50:27 CET,Mon Nov 29 12:24:24 CET,0.0 0.78 0.992 1.179 1.307 1.419 1.51 1.571 1.67 1.729 1.787 1.514 1.892 1.927 1.989 2.037 2.083 2.103 2.128 2.131 2.151 2.189 2.216 2.23 2.232 2.228 2.208 2.181 2.146 2.102 2.036 1.934 1.84 1.739 1.604 1.448 1.273 1.041 0.764 0.445 0.047 -0.446 -1.05 -1.739 -2.586 -3.681 -5.238 -7.316 -10.21 -14.4 -21.031 -28.333 -33.986 -38.539 -42.296 -45.563 -48.299 -50.682 -52.651 -54.599 -56.22 -57.614 -58.91 -60.099 -61.193 -62.182 -63.214 -64.108 -64.857 -65.614 -66.372 -67.0 -67.664 -68.348 -68.876 -69.424 -69.997 -70.572 -71.14 -71.526 -71.93 -72.549 -72.98 -73.441 -73.676 -74.153 -74.635 -75.143 -75.411 -76.108 -76.222 -76.51 -76.805 -77.419 -77.758 -78.13 -78.544 -78.995 -79.55 -80.363 -82.925 -8 ,28512 ,TETRA ,17616320,Mon Nov 29 09:50:25 CET,Mon Nov 29 12:17:09 CET,0.0 0.641 0.853 1.024 1.142 1.219 1.28 1.321 1.37 1.384 1.402 1.107 1.479 1.491 1.509 1.523 1.533 1.535 1.526 1.519 1.521 1.521 1.504 1.471 1.448 1.424 1.391 1.347 1.277 1.228 1.169 1.069 0.982 0.897 0.768 0.598 0.419 0.203 -0.066 -0.398 -0.768 -1.231 -1.856 -2.575 -3.506 -4.644 -6.135 -8.129 -10.93 -15.065 -21.372 -28.194 -33.561 -37.935 -41.505 -44.564 -47.176 -49.452 -51.334 -53.173 -54.723 -56.059 -57.273 -58.396 -59.45 -60.407 -61.377 -62.235 -62.966 -63.684 -64.428 -65.054 -65.705 -66.373 -66.868 -67.369 -67.88 -68.398 -68.944 -69.329 -69.734 -70.368 -70.786 -71.231 -71.47 -71.951 -72.436 -72.946 -73.214 -73.91 -74.007 -74.303 -74.606 -75.268 -75.673 -76.073 -76.487 -76.932 -77.459 -78.131 -80.606 -9 ,31929 ,TETRA ,17616321,Mon Nov 29 09:50:26 CET,Mon Nov 29 12:15:37 CET,0.0 0.627 0.863 0.991 1.089 1.146 1.216 1.286 1.357 1.39 1.427 1.15 1.535 1.564 1.591 1.619 1.645 1.651 1.655 1.674 1.707 1.727 1.743 1.759 1.766 1.756 1.742 1.728 1.697 1.634 1.571 1.489 1.391 1.294 1.17 1.005 0.814 0.609 0.387 0.093 -0.275 -0.728 -1.324 -2.022 -2.887 -3.945 -5.417 -7.346 -9.975 -13.807 -19.663 -26.298 -31.508 -35.803 -39.335 -42.302 -44.864 -47.166 -49.103 -51.014 -52.633 -54.032 -55.343 -56.551 -57.615 -58.559 -59.566 -60.453 -61.213 -61.993 -62.793 -63.443 -64.091 -64.751 -65.251 -65.77 -66.322 -66.882 -67.462 -67.852 -68.234 -68.833 -69.263 -69.71 -69.938 -70.394 -70.852 -71.332 -71.586 -72.288 -72.43 -72.718 -73.017 -73.679 -74.056 -74.454 -74.871 -75.334 -75.901 -76.643 -78.915 -10 ,18036 ,TETRA ,17616322,Mon Nov 29 09:50:26 CET,Mon Nov 29 12:15:16 CET,0.0 0.243 0.414 0.529 0.622 0.694 0.761 0.842 0.965 0.995 1.033 0.74 1.107 1.132 1.194 1.246 1.287 1.306 1.344 1.365 1.377 1.385 1.379 1.365 1.364 1.363 1.35 1.331 1.291 1.242 1.185 1.089 0.975 0.868 0.742 0.588 0.427 0.229 -0.007 -0.283 -0.621 -1.055 -1.603 -2.229 -3.066 -4.118 -5.516 -7.415 -10.199 -14.161 -20.222 -26.989 -32.349 -36.767 -40.345 -43.431 -45.994 -48.188 -50.092 -51.938 -53.425 -54.707 -55.982 -57.214 -58.271 -59.186 -60.156 -61.033 -61.778 -62.551 -63.342 -63.963 -64.611 -65.294 -65.811 -66.331 -66.867 -67.44 -68.036 -68.426 -68.825 -69.448 -69.875 -70.296 -70.516 -70.981 -71.441 -71.938 -72.211 -72.916 -73.059 -73.33 -73.628 -74.352 -74.726 -75.146 -75.651 -76.22 -76.949 -77.791 -80.449 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt deleted file mode 100644 index 32b31c9f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16754 ,TETRA ,17616323,Mon Nov 29 09:50:26 CET,Mon Nov 29 12:15:42 CET,0.0 1.529 1.942 2.241 2.46 2.653 2.842 3.024 3.352 3.495 3.619 3.512 3.98 4.093 4.309 4.531 4.735 4.827 5.003 5.18 5.422 5.584 5.742 5.969 6.181 6.39 6.605 6.798 7.053 7.308 7.544 7.821 8.092 8.346 8.642 8.981 9.299 9.666 10.079 10.551 11.049 11.528 12.051 12.563 13.081 13.655 14.339 15.025 15.717 16.314 16.49 16.088 15.394 14.545 13.651 12.728 11.867 11.058 10.431 9.826 9.245 8.713 8.184 7.651 7.145 6.704 6.285 5.892 5.513 5.102 4.682 4.326 3.955 3.593 3.302 2.996 2.691 2.371 2.009 1.74 1.472 1.052 0.751 0.449 0.289 -0.054 -0.415 -0.798 -0.994 -1.543 -1.637 -1.855 -2.073 -2.577 -2.884 -3.191 -3.517 -3.892 -4.337 -5.011 -7.143 -2 ,1549 ,TETRA ,17616324,Mon Nov 29 09:50:26 CET,Mon Nov 29 12:14:54 CET,0.0 1.654 2.012 2.268 2.529 2.757 2.943 3.11 3.433 3.593 3.755 3.712 4.203 4.345 4.623 4.892 5.158 5.284 5.526 5.78 6.138 6.344 6.537 6.817 7.086 7.353 7.63 7.865 8.117 8.348 8.568 8.836 9.08 9.307 9.573 9.872 10.148 10.457 10.785 11.104 11.436 11.82 12.261 12.696 13.19 13.743 14.359 14.954 15.499 15.874 15.841 15.11 14.207 13.312 12.442 11.572 10.73 9.902 9.157 8.43 7.83 7.291 6.776 6.281 5.828 5.416 4.984 4.602 4.268 3.923 3.569 3.271 2.958 2.646 2.4 2.125 1.839 1.545 1.24 1.03 0.815 0.474 0.236 -0.002 -0.134 -0.393 -0.655 -0.955 -1.113 -1.619 -1.615 -1.791 -1.976 -2.415 -2.677 -2.963 -3.265 -3.598 -4.005 -4.532 -6.587 -3 ,22249 ,TETRA ,17616325,Mon Nov 29 09:51:14 CET,Mon Nov 29 12:16:54 CET,0.0 1.365 1.719 1.994 2.248 2.468 2.665 2.835 3.176 3.348 3.495 3.415 3.901 4.019 4.243 4.461 4.659 4.745 4.912 5.075 5.323 5.494 5.665 5.907 6.137 6.361 6.564 6.764 7.028 7.271 7.527 7.821 8.076 8.33 8.628 8.983 9.319 9.663 10.022 10.412 10.828 11.264 11.747 12.258 12.861 13.456 14.119 14.862 15.624 16.38 16.763 16.38 15.732 14.954 14.1 13.297 12.566 11.869 11.281 10.661 10.144 9.687 9.192 8.688 8.218 7.792 7.334 6.934 6.586 6.195 5.778 5.42 5.036 4.641 4.345 4.047 3.731 3.393 3.043 2.804 2.562 2.187 1.922 1.639 1.499 1.198 0.859 0.522 0.342 -0.178 -0.208 -0.429 -0.667 -1.179 -1.469 -1.772 -2.125 -2.539 -3.048 -3.722 -6.238 -4 ,8511 ,TETRA ,17616326,Mon Nov 29 09:52:12 CET,Mon Nov 29 12:16:58 CET,0.0 1.883 2.275 2.531 2.764 3.012 3.241 3.441 3.815 3.994 4.168 4.132 4.626 4.76 4.995 5.229 5.468 5.576 5.758 5.94 6.209 6.373 6.532 6.768 6.987 7.192 7.397 7.594 7.844 8.085 8.309 8.592 8.881 9.178 9.522 9.877 10.197 10.555 10.941 11.335 11.737 12.18 12.686 13.181 13.765 14.381 15.055 15.788 16.528 17.278 17.862 17.672 16.932 16.099 15.281 14.459 13.687 12.964 12.31 11.592 10.971 10.448 9.948 9.452 8.963 8.498 8.02 7.587 7.203 6.798 6.378 6.031 5.67 5.304 5.003 4.695 4.394 4.059 3.664 3.394 3.119 2.656 2.327 1.99 1.818 1.455 1.075 0.651 0.41 -0.19 -0.395 -0.686 -0.988 -1.633 -2.011 -2.42 -2.856 -3.342 -3.917 -4.673 -8.278 -5 ,30457 ,TETRA ,17616327,Mon Nov 29 09:52:12 CET,Mon Nov 29 12:17:15 CET,0.0 1.124 1.508 1.784 2.002 2.19 2.36 2.527 2.836 2.994 3.138 3.032 3.512 3.632 3.848 4.068 4.295 4.4 4.577 4.741 4.972 5.109 5.245 5.448 5.642 5.828 6.002 6.177 6.415 6.649 6.873 7.14 7.404 7.675 7.991 8.34 8.657 8.994 9.376 9.749 10.142 10.627 11.224 11.798 12.357 12.902 13.491 14.109 14.755 15.377 15.693 15.373 14.69 13.848 13.021 12.227 11.48 10.777 10.145 9.465 8.849 8.29 7.755 7.278 6.836 6.43 5.998 5.591 5.226 4.841 4.458 4.12 3.759 3.405 3.134 2.837 2.521 2.194 1.849 1.619 1.356 0.931 0.656 0.369 0.216 -0.098 -0.428 -0.765 -0.937 -1.469 -1.505 -1.703 -1.926 -2.404 -2.674 -2.971 -3.297 -3.669 -4.161 -4.806 -7.382 -6 ,29803 ,TETRA ,17616328,Mon Nov 29 09:55:05 CET,Mon Nov 29 12:30:23 CET,0.0 1.463 1.803 2.051 2.259 2.477 2.69 2.875 3.194 3.328 3.443 3.311 3.764 3.873 4.114 4.351 4.576 4.686 4.897 5.089 5.346 5.504 5.647 5.846 6.046 6.235 6.43 6.621 6.857 7.089 7.301 7.559 7.82 8.081 8.392 8.727 9.022 9.362 9.757 10.156 10.572 11.042 11.546 12.021 12.52 13.05 13.638 14.178 14.711 15.155 15.071 14.224 13.272 12.403 11.606 10.777 9.92 9.15 8.533 7.909 7.365 6.856 6.349 5.867 5.398 4.97 4.51 4.1 3.769 3.41 3.013 2.677 2.328 1.959 1.669 1.368 1.067 0.752 0.432 0.211 -0.05 -0.459 -0.736 -1.047 -1.198 -1.478 -1.779 -2.104 -2.284 -2.826 -2.885 -3.115 -3.376 -3.9 -4.19 -4.531 -4.874 -5.223 -5.716 -6.432 -8.804 -7 ,16096 ,TETRA ,17616329,Mon Nov 29 09:55:54 CET,Mon Nov 29 12:21:13 CET,0.0 1.814 2.237 2.544 2.812 3.041 3.225 3.393 3.685 3.809 3.932 3.843 4.312 4.422 4.627 4.824 5.021 5.116 5.29 5.453 5.676 5.815 5.96 6.173 6.369 6.552 6.731 6.914 7.16 7.401 7.633 7.905 8.171 8.444 8.765 9.085 9.378 9.712 10.091 10.495 10.889 11.333 11.857 12.34 12.854 13.433 14.065 14.737 15.441 16.002 16.196 15.727 14.959 14.175 13.439 12.692 11.981 11.311 10.711 10.083 9.54 9.057 8.591 8.127 7.679 7.263 6.837 6.483 6.185 5.848 5.458 5.142 4.822 4.488 4.234 3.966 3.706 3.454 3.187 2.993 2.776 2.402 2.139 1.901 1.782 1.518 1.226 0.93 0.771 0.249 0.242 0.05 -0.159 -0.603 -0.847 -1.108 -1.408 -1.762 -2.217 -2.871 -4.988 -8 ,8888 ,TETRA ,17616330,Mon Nov 29 09:56:46 CET,Mon Nov 29 12:19:06 CET,0.0 1.919 2.273 2.531 2.767 3.001 3.192 3.362 3.719 3.892 4.054 4.002 4.477 4.608 4.873 5.106 5.298 5.385 5.559 5.75 6.027 6.182 6.331 6.567 6.79 7.005 7.222 7.435 7.693 7.931 8.16 8.434 8.711 8.98 9.254 9.549 9.862 10.199 10.54 10.912 11.316 11.749 12.259 12.796 13.402 14.051 14.71 15.312 15.854 16.354 16.651 16.321 15.53 14.619 13.8 12.96 12.129 11.359 10.666 9.953 9.361 8.834 8.282 7.766 7.303 6.874 6.413 5.985 5.605 5.194 4.753 4.387 4.011 3.625 3.327 3.007 2.684 2.339 1.974 1.724 1.466 1.063 0.775 0.502 0.362 0.057 -0.272 -0.66 -0.873 -1.44 -1.576 -1.821 -2.064 -2.56 -2.838 -3.166 -3.542 -3.987 -4.594 -5.328 -9.811 -9 ,24460 ,TETRA ,17616331,Mon Nov 29 09:59:25 CET,Mon Nov 29 12:24:57 CET,0.0 1.591 2.041 2.355 2.636 2.842 3.011 3.176 3.479 3.614 3.74 3.644 4.117 4.244 4.498 4.714 4.902 4.999 5.181 5.357 5.614 5.778 5.931 6.134 6.316 6.493 6.668 6.847 7.08 7.308 7.542 7.814 8.062 8.316 8.614 8.943 9.276 9.64 10.001 10.358 10.727 11.137 11.632 12.128 12.652 13.151 13.696 14.299 14.802 15.146 15.095 14.383 13.448 12.43 11.469 10.589 9.744 8.929 8.196 7.403 6.689 6.066 5.479 4.906 4.361 3.828 3.259 2.753 2.304 1.854 1.397 1.008 0.601 0.183 -0.129 -0.441 -0.755 -1.087 -1.451 -1.717 -1.982 -2.385 -2.687 -3.005 -3.161 -3.482 -3.805 -4.155 -4.347 -4.875 -4.93 -5.169 -5.433 -5.977 -6.28 -6.634 -6.997 -7.375 -7.867 -8.617 -10.706 -10 ,13473 ,TETRA ,17616332,Mon Nov 29 09:59:26 CET,Mon Nov 29 12:11:08 CET,0.0 2.207 2.579 2.881 3.126 3.359 3.565 3.732 3.996 4.131 4.273 4.169 4.632 4.743 4.942 5.142 5.35 5.451 5.633 5.809 6.068 6.234 6.39 6.623 6.838 7.029 7.229 7.419 7.659 7.895 8.12 8.396 8.662 8.919 9.215 9.531 9.821 10.139 10.485 10.864 11.25 11.664 12.159 12.665 13.218 13.788 14.379 14.982 15.697 16.296 16.3 15.636 14.903 14.103 13.241 12.39 11.669 11.033 10.426 9.783 9.242 8.746 8.261 7.789 7.279 6.824 6.373 5.941 5.571 5.184 4.746 4.358 3.933 3.437 3.029 2.6 2.175 1.759 1.338 1.049 0.752 0.301 -0.021 -0.373 -0.555 -0.907 -1.295 -1.74 -1.966 -2.564 -2.757 -3.039 -3.328 -3.923 -4.259 -4.627 -5.014 -5.461 -6.015 -6.716 -9.475 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt deleted file mode 100644 index 70808e3c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,14951 ,TETRA ,17616334,Mon Nov 29 10:03:25 CET,Mon Nov 29 12:29:39 CET,0.0 1.98 2.382 2.715 3.016 3.281 3.513 3.698 4.039 4.203 4.333 4.292 4.669 4.779 4.975 5.164 5.361 5.462 5.68 5.88 6.123 6.285 6.432 6.61 6.766 6.912 7.059 7.193 7.358 7.516 7.66 7.843 7.99 8.103 8.215 8.341 8.465 8.621 8.798 8.871 8.845 8.732 8.51 8.197 7.716 6.989 6.006 4.687 2.442 -1.565 -8.574 -17.389 -25.338 -32.166 -37.909 -42.899 -47.106 -50.867 -54.123 -57.314 -60.002 -62.344 -64.517 -66.528 -68.371 -70.047 -71.742 -73.199 -74.46 -75.758 -77.096 -78.189 -79.291 -80.416 -81.268 -82.141 -83.034 -83.953 -84.903 -85.547 -86.208 -87.203 -87.875 -88.565 -88.917 -89.687 -90.493 -91.326 -91.765 -92.608 -93.162 -93.643 -94.158 -95.254 -95.851 -96.531 -97.26 -98.111 -99.163 -100.521 -105.772 -3 ,7436 ,TETRA ,17616335,Mon Nov 29 10:05:27 CET,Mon Nov 29 12:28:15 CET,0.0 2.301 2.773 3.103 3.398 3.657 3.864 4.054 4.349 4.489 4.626 4.615 4.975 5.068 5.274 5.513 5.722 5.797 5.972 6.149 6.362 6.494 6.623 6.816 6.978 7.108 7.223 7.32 7.422 7.541 7.66 7.795 7.917 8.021 8.097 8.102 8.078 8.042 7.975 7.855 7.704 7.504 7.167 6.71 6.073 5.198 3.883 2.054 -0.484 -4.373 -11.699 -21.496 -29.435 -35.949 -41.556 -46.54 -50.778 -54.481 -57.648 -60.751 -63.306 -65.549 -67.715 -69.712 -71.537 -73.173 -74.827 -76.289 -77.552 -78.855 -80.222 -81.375 -82.534 -83.721 -84.643 -85.573 -86.518 -87.497 -88.521 -89.221 -89.947 -91.102 -91.866 -92.673 -93.09 -93.875 -94.669 -95.538 -96.022 -96.898 -97.513 -98.064 -98.62 -99.759 -100.415 -101.159 -101.922 -102.761 -103.856 -105.228 -116.159 -7 ,28088 ,TETRA ,17616339,Mon Nov 29 10:07:29 CET,Mon Nov 29 12:34:59 CET,0.0 4.033 4.499 4.83 5.117 5.362 5.564 5.767 6.155 6.312 6.446 6.432 6.79 6.872 7.07 7.268 7.458 7.538 7.676 7.818 8.003 8.102 8.204 8.366 8.521 8.661 8.764 8.843 8.952 9.028 9.059 9.068 9.084 9.098 9.058 8.973 8.866 8.754 8.636 8.495 8.395 8.26 7.913 7.432 6.864 6.028 4.706 2.826 -0.023 -4.463 -12.457 -22.186 -30.089 -36.703 -42.066 -46.68 -50.524 -53.93 -56.944 -59.963 -62.514 -64.815 -67.021 -69.05 -70.917 -72.579 -74.298 -75.825 -77.098 -78.367 -79.66 -80.745 -81.867 -83.002 -83.869 -84.746 -85.64 -86.56 -87.49 -88.126 -88.793 -89.838 -90.547 -91.264 -91.628 -92.376 -93.152 -93.968 -94.395 -95.217 -95.8 -96.299 -96.78 -97.858 -98.462 -99.107 -99.833 -100.68 -101.651 -102.886 -113.588 -9 ,2427 ,TETRA ,17616341,Mon Nov 29 10:08:26 CET,Mon Nov 29 12:35:18 CET,0.0 7.451 7.97 8.311 8.57 8.78 9.006 9.214 9.575 9.741 9.898 9.91 10.314 10.432 10.631 10.811 10.983 11.064 11.195 11.31 11.48 11.589 11.688 11.831 11.95 12.021 12.061 12.093 12.147 12.17 12.189 12.209 12.234 12.232 12.137 12.015 11.89 11.726 11.49 11.163 10.768 10.288 9.662 8.883 7.828 6.518 4.67 2.136 -1.029 -5.433 -13.22 -23.151 -31.538 -38.273 -43.703 -48.325 -52.121 -55.35 -58.063 -60.775 -63.058 -65.006 -66.816 -68.505 -70.0 -71.32 -72.693 -73.944 -75.02 -76.079 -77.166 -78.063 -79.004 -79.977 -80.746 -81.549 -82.341 -83.126 -83.948 -84.538 -85.138 -86.093 -86.748 -87.397 -87.732 -88.426 -89.179 -90.019 -90.493 -91.391 -91.996 -92.515 -93.078 -94.169 -94.725 -95.353 -96.1 -97.025 -98.163 -99.566 -110.384 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt deleted file mode 100644 index dff11aa7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31559 ,TETRA ,17616343,Mon Nov 29 10:09:29 CET,Mon Nov 29 12:34:49 CET,0.0 2.763 3.506 3.994 4.41 4.801 5.159 5.483 6.071 6.348 6.62 6.882 7.392 7.629 8.091 8.546 8.984 9.184 9.566 9.943 10.485 10.837 11.179 11.695 12.192 12.673 13.142 13.583 14.147 14.69 15.2 15.778 16.345 16.911 17.571 18.342 19.072 19.856 20.661 21.496 22.424 23.473 24.613 25.771 27.191 28.665 30.215 31.848 33.643 35.324 36.207 35.843 34.888 33.758 32.708 31.753 30.771 29.773 28.842 27.874 27.025 26.258 25.554 24.845 24.158 23.525 22.875 22.329 21.844 21.306 20.703 20.156 19.605 19.098 18.707 18.298 17.87 17.374 16.838 16.465 16.067 15.45 15.029 14.617 14.418 13.982 13.494 12.973 12.698 12.168 11.836 11.485 11.076 10.131 9.574 9.02 8.45 7.724 6.859 5.789 -0.909 -2 ,19596 ,TETRA ,17616344,Mon Nov 29 10:12:28 CET,Mon Nov 29 12:43:01 CET,0.0 2.866 3.58 4.1 4.551 4.956 5.331 5.693 6.345 6.633 6.917 7.201 7.717 7.963 8.434 8.852 9.275 9.486 9.894 10.3 10.857 11.212 11.574 12.126 12.648 13.131 13.61 14.081 14.7 15.304 15.889 16.628 17.361 18.07 18.886 19.796 20.706 21.735 22.816 23.952 25.165 26.547 28.166 29.726 31.524 33.493 35.509 37.512 39.555 41.586 43.154 42.823 41.564 39.979 38.285 36.65 35.18 33.768 32.436 31.09 29.909 28.867 27.905 26.969 26.136 25.405 24.656 24.015 23.459 22.872 22.247 21.748 21.223 20.669 20.218 19.731 19.246 18.738 18.203 17.842 17.479 16.905 16.499 16.074 15.854 15.399 14.927 14.395 14.107 13.549 13.197 12.846 12.476 11.702 11.244 10.665 9.977 9.114 8.06 6.725 0.576 -3 ,14548 ,TETRA ,17616345,Mon Nov 29 10:12:30 CET,Mon Nov 29 12:40:30 CET,0.0 3.469 4.271 4.86 5.344 5.761 6.137 6.475 7.039 7.304 7.563 7.785 8.292 8.539 8.984 9.38 9.763 9.95 10.335 10.733 11.317 11.689 12.041 12.513 12.952 13.387 13.835 14.288 14.862 15.406 15.944 16.609 17.233 17.839 18.585 19.439 20.274 21.195 22.181 23.219 24.281 25.493 26.891 28.272 29.908 31.745 33.724 35.639 37.663 39.544 40.678 40.258 39.019 37.64 36.263 34.861 33.502 32.208 31.046 29.895 28.914 28.045 27.224 26.417 25.595 24.79 23.997 23.332 22.766 22.183 21.572 21.071 20.53 19.954 19.481 18.975 18.486 17.999 17.446 17.055 16.672 16.057 15.623 15.15 14.911 14.458 13.983 13.418 13.099 12.506 12.093 11.717 11.328 10.495 10.033 9.461 8.76 7.976 7.025 5.779 0.995 -4 ,20273 ,TETRA ,17616346,Mon Nov 29 10:12:28 CET,Mon Nov 29 12:42:01 CET,0.0 4.658 5.39 5.912 6.347 6.731 7.07 7.409 8.047 8.353 8.641 8.93 9.464 9.716 10.208 10.675 11.112 11.326 11.736 12.128 12.714 13.116 13.499 14.031 14.56 15.077 15.574 16.047 16.676 17.272 17.831 18.53 19.223 19.87 20.596 21.429 22.227 23.118 24.132 25.174 26.213 27.372 28.732 30.124 31.689 33.39 35.309 37.316 39.245 41.037 42.237 41.806 40.614 39.227 37.813 36.474 35.232 33.998 32.914 31.852 30.944 30.084 29.217 28.478 27.816 27.181 26.52 25.923 25.406 24.864 24.293 23.816 23.307 22.733 22.28 21.809 21.346 20.912 20.413 20.055 19.707 19.187 18.815 18.421 18.21 17.762 17.308 16.788 16.512 15.984 15.655 15.308 14.927 14.102 13.62 13.055 12.433 11.775 10.964 9.665 1.167 -5 ,21894 ,TETRA ,17616347,Mon Nov 29 10:13:28 CET,Mon Nov 29 12:45:19 CET,0.0 3.002 3.723 4.287 4.739 5.135 5.512 5.844 6.488 6.805 7.089 7.349 7.861 8.11 8.621 9.09 9.528 9.75 10.183 10.583 11.153 11.533 11.895 12.402 12.91 13.407 13.871 14.331 14.948 15.565 16.183 16.937 17.676 18.366 19.127 19.966 20.806 21.735 22.699 23.704 24.78 26.087 27.658 29.21 30.991 32.938 35.111 37.329 39.698 42.295 44.3 44.602 43.967 42.945 41.811 40.329 38.808 37.429 36.184 34.818 33.622 32.582 31.495 30.418 29.421 28.542 27.646 26.811 26.026 25.21 24.431 23.815 23.176 22.543 22.08 21.594 21.078 20.52 19.961 19.599 19.225 18.624 18.198 17.747 17.523 17.057 16.533 15.978 15.684 15.108 14.697 14.31 13.854 12.794 12.23 11.665 11.067 10.418 9.63 8.228 -1.906 -6 ,8362 ,TETRA ,17616348,Mon Nov 29 10:18:26 CET,Mon Nov 29 12:50:38 CET,0.0 3.579 4.464 5.124 5.646 6.117 6.518 6.856 7.426 7.685 7.957 8.269 8.8 9.048 9.53 9.999 10.428 10.632 11.02 11.407 11.995 12.384 12.753 13.265 13.784 14.3 14.804 15.286 15.906 16.523 17.145 17.901 18.615 19.291 20.085 21.019 21.911 22.866 23.874 24.951 26.115 27.429 28.915 30.228 31.58 33.082 34.714 36.366 38.0 39.562 40.678 40.369 39.237 37.823 36.289 34.682 33.252 31.895 30.729 29.642 28.7 27.829 26.939 26.128 25.414 24.735 24.024 23.415 22.889 22.336 21.761 21.308 20.873 20.392 19.974 19.547 19.124 18.631 18.073 17.7 17.329 16.742 16.284 15.738 15.464 14.979 14.519 14.058 13.811 13.265 12.863 12.507 12.148 11.367 10.912 10.337 9.659 8.867 7.997 6.8 0.048 -7 ,22253 ,TETRA ,17616349,Mon Nov 29 10:18:29 CET,Mon Nov 29 12:44:33 CET,0.0 3.253 4.024 4.564 5.011 5.426 5.821 6.188 6.877 7.203 7.487 7.743 8.281 8.552 9.029 9.434 9.828 10.028 10.438 10.843 11.441 11.821 12.193 12.751 13.294 13.827 14.337 14.816 15.434 16.03 16.602 17.293 17.966 18.611 19.37 20.236 21.054 21.913 22.829 23.876 24.964 26.146 27.506 28.802 30.316 32.041 33.938 35.966 38.239 40.711 42.958 43.419 42.544 41.218 39.784 38.413 37.196 35.989 34.939 33.888 32.908 32.022 31.218 30.468 29.75 29.068 28.348 27.676 27.117 26.578 26.014 25.497 24.915 24.32 23.866 23.403 22.923 22.414 21.893 21.523 21.141 20.568 20.159 19.744 19.533 19.071 18.564 18.052 17.796 17.246 16.869 16.543 16.183 15.314 14.836 14.304 13.717 13.059 12.165 10.957 6.312 -8 ,9658 ,TETRA ,17616350,Mon Nov 29 10:18:27 CET,Mon Nov 29 12:40:30 CET,0.0 2.383 3.173 3.728 4.178 4.597 5.022 5.418 6.11 6.414 6.69 6.928 7.435 7.687 8.187 8.689 9.167 9.387 9.819 10.244 10.84 11.207 11.572 12.126 12.67 13.194 13.691 14.159 14.799 15.434 16.038 16.762 17.411 18.03 18.757 19.535 20.273 21.115 22.041 23.049 24.115 25.312 26.734 28.131 29.755 31.548 33.715 36.387 39.182 41.594 43.339 43.526 42.93 41.869 40.578 39.222 37.837 36.569 35.445 34.293 33.34 32.444 31.573 30.807 30.115 29.475 28.8 28.164 27.566 26.956 26.364 25.85 25.301 24.761 24.33 23.858 23.372 22.879 22.36 21.991 21.618 21.036 20.624 20.219 20.015 19.583 19.121 18.597 18.301 17.741 17.373 17.019 16.661 15.837 15.358 14.813 14.217 13.438 12.401 10.902 5.631 -9 ,14903 ,TETRA ,17616351,Mon Nov 29 10:19:27 CET,Mon Nov 29 12:50:32 CET,0.0 4.736 5.49 6.052 6.525 6.955 7.34 7.694 8.349 8.652 8.942 9.244 9.785 10.044 10.517 10.946 11.376 11.59 11.987 12.355 12.892 13.218 13.52 13.989 14.456 14.895 15.325 15.74 16.278 16.812 17.311 17.914 18.477 18.996 19.617 20.342 21.045 21.799 22.603 23.481 24.421 25.469 26.671 27.822 29.109 30.567 32.162 33.774 35.375 36.575 37.233 36.966 35.923 34.62 33.414 32.299 31.197 30.077 29.099 28.167 27.394 26.659 25.926 25.254 24.641 24.043 23.37 22.762 22.252 21.745 21.14 20.617 20.107 19.572 19.134 18.651 18.169 17.678 17.139 16.742 16.336 15.733 15.319 14.86 14.605 14.094 13.593 13.046 12.742 12.166 11.717 11.329 10.9 9.895 9.36 8.78 8.137 7.435 6.47 5.139 -1.591 -10 ,8998 ,TETRA ,17616352,Mon Nov 29 10:21:27 CET,Mon Nov 29 12:42:13 CET,0.0 3.213 3.968 4.498 4.96 5.385 5.749 6.085 6.749 7.058 7.338 7.606 8.127 8.373 8.853 9.318 9.774 10.002 10.455 10.917 11.574 11.965 12.347 12.899 13.429 13.956 14.477 14.974 15.6 16.22 16.823 17.56 18.292 19.004 19.838 20.762 21.655 22.627 23.661 24.808 26.02 27.366 28.899 30.39 32.141 34.102 36.282 38.576 41.017 43.514 45.361 45.493 44.619 43.397 42.107 40.633 39.182 37.951 36.884 35.695 34.636 33.649 32.697 31.803 31.015 30.346 29.661 29.054 28.501 27.923 27.324 26.838 26.34 25.784 25.363 24.933 24.486 24.039 23.53 23.159 22.785 22.186 21.759 21.313 21.074 20.618 20.175 19.684 19.414 18.866 18.501 18.129 17.7 16.756 16.266 15.763 15.209 14.6 13.809 12.441 6.686 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 39cc9202..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1920 ,KEBNE ,17027825,Wed Dec 22 18:20:29 CET,Wed Dec 22 20:17:00 CET,0.0 0.582 0.725 0.852 0.959 1.022 1.057 1.085 1.128 1.123 1.111 0.84 1.088 1.065 1.022 0.963 0.875 0.837 0.751 0.647 0.479 0.363 0.248 0.072 -0.121 -0.337 -0.556 -0.775 -1.069 -1.382 -1.701 -2.094 -2.514 -2.947 -3.469 -4.078 -4.689 -5.418 -6.269 -7.23 -8.321 -9.622 -11.25 -13.055 -15.308 -18.019 -21.519 -25.982 -31.969 -40.377 -53.077 -66.608 -76.543 -84.4 -90.725 -95.968 -100.297 -104.033 -107.107 -110.04 -112.483 -114.563 -116.434 -118.141 -119.705 -121.108 -122.505 -123.688 -124.702 -125.745 -126.842 -127.767 -128.709 -129.663 -130.385 -131.127 -131.911 -132.701 -133.492 -134.038 -134.598 -135.425 -135.976 -136.573 -136.881 -137.504 -138.141 -138.793 -139.129 -139.899 -140.193 -140.569 -140.93 -141.738 -142.181 -142.62 -143.082 -143.604 -144.222 -145.04 -147.871 -2 ,7480 ,KEBNE ,17027826,Wed Dec 22 18:25:39 CET,Wed Dec 22 20:21:35 CET,0.0 0.715 0.888 1.01 1.081 1.125 1.15 1.176 1.234 1.252 1.243 0.936 1.182 1.162 1.121 1.063 0.993 0.959 0.899 0.808 0.641 0.518 0.391 0.207 0.009 -0.206 -0.43 -0.655 -0.958 -1.278 -1.606 -2.016 -2.432 -2.88 -3.444 -4.111 -4.775 -5.52 -6.378 -7.347 -8.442 -9.794 -11.475 -13.307 -15.685 -18.559 -22.22 -26.875 -33.106 -41.853 -54.911 -68.847 -78.989 -87.049 -93.679 -99.126 -103.627 -107.585 -110.81 -113.867 -116.402 -118.578 -120.62 -122.505 -124.194 -125.68 -127.206 -128.553 -129.663 -130.759 -131.882 -132.8 -133.733 -134.688 -135.422 -136.169 -136.926 -137.685 -138.446 -138.962 -139.483 -140.264 -140.801 -141.365 -141.656 -142.251 -142.854 -143.459 -143.771 -144.517 -144.738 -145.082 -145.427 -146.086 -146.426 -146.792 -147.191 -147.631 -148.148 -148.794 -150.418 -3 ,27896 ,KEBNE ,17027827,Wed Dec 22 18:25:39 CET,Wed Dec 22 20:21:37 CET,0.0 0.687 0.833 0.957 1.028 1.07 1.095 1.108 1.098 1.09 1.081 0.781 1.02 1.004 0.955 0.891 0.821 0.785 0.715 0.632 0.48 0.381 0.284 0.127 -0.04 -0.216 -0.386 -0.574 -0.867 -1.173 -1.48 -1.886 -2.309 -2.734 -3.265 -3.9 -4.531 -5.254 -6.106 -7.084 -8.17 -9.497 -11.176 -12.985 -15.308 -18.151 -21.738 -26.354 -32.567 -41.143 -53.95 -67.55 -77.888 -86.01 -92.457 -97.908 -102.464 -106.371 -109.57 -112.663 -115.219 -117.406 -119.429 -121.263 -122.911 -124.365 -125.829 -127.105 -128.186 -129.289 -130.417 -131.328 -132.251 -133.2 -133.919 -134.629 -135.338 -136.063 -136.802 -137.306 -137.816 -138.612 -139.155 -139.708 -139.993 -140.553 -141.132 -141.715 -142.008 -142.731 -142.932 -143.259 -143.598 -144.331 -144.711 -145.104 -145.52 -145.977 -146.499 -147.056 -148.34 -4 ,27863 ,KEBNE ,17027828,Wed Dec 22 18:25:43 CET,Wed Dec 22 20:20:59 CET,0.0 1.572 1.928 2.106 2.222 2.315 2.422 2.526 2.673 2.725 2.775 2.606 2.886 2.871 2.833 2.809 2.78 2.766 2.747 2.688 2.524 2.416 2.308 2.129 1.944 1.748 1.539 1.324 1.015 0.681 0.338 -0.092 -0.514 -0.944 -1.477 -2.109 -2.747 -3.494 -4.381 -5.389 -6.511 -7.853 -9.525 -11.369 -13.693 -16.512 -20.134 -24.732 -30.891 -39.474 -52.243 -65.913 -76.239 -84.432 -90.863 -96.1 -100.48 -104.28 -107.414 -110.39 -112.837 -114.936 -116.841 -118.593 -120.196 -121.616 -123.074 -124.349 -125.413 -126.486 -127.567 -128.451 -129.359 -130.284 -130.995 -131.724 -132.478 -133.24 -133.992 -134.492 -134.998 -135.767 -136.268 -136.773 -137.045 -137.62 -138.223 -138.811 -139.095 -139.819 -140.029 -140.344 -140.674 -141.387 -141.756 -142.143 -142.555 -142.996 -143.542 -144.25 -146.205 -5 ,8233 ,KEBNE ,17027829,Wed Dec 22 18:25:43 CET,Wed Dec 22 20:16:21 CET,0.0 0.86 1.1 1.218 1.311 1.408 1.473 1.514 1.567 1.566 1.566 1.26 1.489 1.461 1.406 1.346 1.272 1.228 1.153 1.066 0.899 0.787 0.681 0.492 0.29 0.112 -0.074 -0.285 -0.549 -0.819 -1.13 -1.548 -1.968 -2.386 -2.905 -3.524 -4.144 -4.872 -5.71 -6.672 -7.756 -9.033 -10.675 -12.517 -14.841 -17.613 -21.147 -25.695 -31.904 -40.695 -53.609 -67.225 -77.473 -85.725 -92.411 -97.962 -102.536 -106.383 -109.507 -112.5 -115.018 -117.197 -119.172 -120.991 -122.656 -124.146 -125.65 -126.951 -128.064 -129.208 -130.4 -131.365 -132.344 -133.36 -134.133 -134.901 -135.671 -136.451 -137.235 -137.762 -138.281 -139.048 -139.582 -140.141 -140.424 -140.997 -141.595 -142.214 -142.53 -143.27 -143.482 -143.822 -144.172 -144.899 -145.272 -145.642 -146.026 -146.443 -146.926 -147.566 -149.465 -6 ,9584 ,KEBNE ,17027830,Wed Dec 22 18:27:44 CET,Wed Dec 22 20:23:13 CET,0.0 0.844 1.014 1.132 1.229 1.282 1.306 1.34 1.374 1.36 1.341 1.047 1.295 1.263 1.213 1.16 1.1 1.059 0.976 0.883 0.699 0.568 0.434 0.228 0.062 -0.098 -0.306 -0.536 -0.837 -1.136 -1.457 -1.853 -2.262 -2.704 -3.236 -3.86 -4.516 -5.318 -6.213 -7.193 -8.32 -9.693 -11.409 -13.273 -15.606 -18.48 -22.251 -26.982 -33.288 -42.151 -55.374 -69.502 -79.915 -87.831 -94.055 -99.335 -103.743 -107.514 -110.604 -113.586 -116.061 -118.183 -120.16 -121.997 -123.663 -125.136 -126.646 -127.965 -129.071 -130.223 -131.404 -132.342 -133.29 -134.248 -134.981 -135.729 -136.467 -137.21 -137.966 -138.475 -139.0 -139.813 -140.36 -140.905 -141.181 -141.761 -142.365 -142.956 -143.253 -143.986 -144.208 -144.565 -144.913 -145.578 -145.947 -146.389 -146.859 -147.331 -147.888 -148.686 -151.11 -7 ,25713 ,KEBNE ,17027831,Wed Dec 22 18:27:44 CET,Wed Dec 22 20:22:51 CET,0.0 0.658 0.965 1.182 1.324 1.422 1.497 1.556 1.627 1.641 1.653 1.423 1.694 1.708 1.72 1.709 1.67 1.636 1.568 1.506 1.386 1.286 1.199 1.071 0.914 0.745 0.575 0.409 0.157 -0.127 -0.404 -0.766 -1.159 -1.569 -2.088 -2.729 -3.378 -4.12 -4.973 -5.938 -7.027 -8.359 -10.031 -11.813 -14.103 -16.92 -20.463 -24.98 -31.047 -39.413 -52.169 -65.996 -76.209 -84.222 -90.62 -96.0 -100.479 -104.326 -107.461 -110.455 -112.946 -115.088 -117.044 -118.804 -120.429 -121.886 -123.354 -124.617 -125.669 -126.74 -127.839 -128.724 -129.609 -130.509 -131.194 -131.892 -132.605 -133.311 -134.013 -134.497 -134.997 -135.762 -136.266 -136.764 -137.02 -137.563 -138.137 -138.726 -139.02 -139.749 -139.966 -140.275 -140.588 -141.265 -141.644 -142.058 -142.466 -142.891 -143.401 -144.035 -145.464 -8 ,30959 ,KEBNE ,17027832,Wed Dec 22 18:27:44 CET,Wed Dec 22 20:23:21 CET,0.0 1.268 1.511 1.731 1.855 1.919 1.999 2.087 2.177 2.186 2.189 1.965 2.24 2.222 2.156 2.087 2.011 1.973 1.888 1.8 1.654 1.534 1.411 1.238 1.061 0.87 0.664 0.444 0.141 -0.17 -0.48 -0.864 -1.269 -1.687 -2.201 -2.81 -3.439 -4.193 -5.063 -6.043 -7.128 -8.444 -10.123 -11.982 -14.382 -17.319 -21.06 -25.785 -32.165 -41.001 -53.941 -67.758 -78.112 -86.192 -92.689 -98.134 -102.59 -106.404 -109.561 -112.622 -115.181 -117.377 -119.383 -121.215 -122.882 -124.351 -125.846 -127.185 -128.316 -129.464 -130.658 -131.621 -132.596 -133.553 -134.256 -134.974 -135.714 -136.463 -137.207 -137.726 -138.277 -139.107 -139.653 -140.209 -140.483 -141.033 -141.602 -142.186 -142.487 -143.213 -143.423 -143.762 -144.103 -144.852 -145.26 -145.694 -146.157 -146.66 -147.29 -148.069 -150.119 -9 ,31755 ,KEBNE ,17027833,Wed Dec 22 18:27:44 CET,Wed Dec 22 20:22:56 CET,0.0 0.702 0.865 0.952 1.024 1.058 1.099 1.153 1.223 1.237 1.234 0.91 1.142 1.112 1.037 0.953 0.869 0.827 0.739 0.634 0.47 0.362 0.246 0.08 -0.088 -0.27 -0.483 -0.709 -1.01 -1.318 -1.63 -2.029 -2.445 -2.878 -3.404 -4.033 -4.685 -5.458 -6.354 -7.354 -8.458 -9.796 -11.535 -13.443 -15.846 -18.774 -22.467 -27.108 -33.289 -41.813 -54.758 -68.554 -78.647 -86.565 -92.894 -98.226 -102.691 -106.536 -109.659 -112.654 -115.161 -117.31 -119.272 -121.045 -122.662 -124.103 -125.574 -126.859 -127.925 -128.971 -130.058 -130.976 -131.902 -132.837 -133.537 -134.24 -134.958 -135.683 -136.438 -136.954 -137.463 -138.255 -138.798 -139.351 -139.63 -140.198 -140.776 -141.392 -141.732 -142.512 -142.84 -143.198 -143.519 -144.195 -144.578 -144.99 -145.4 -145.831 -146.31 -146.973 -148.294 -10 ,7974 ,KEBNE ,17027834,Wed Dec 22 18:27:43 CET,Wed Dec 22 20:23:14 CET,0.0 1.144 1.365 1.569 1.744 1.863 1.964 2.036 2.173 2.238 2.266 2.024 2.299 2.297 2.244 2.188 2.145 2.118 2.055 1.996 1.885 1.811 1.76 1.659 1.536 1.396 1.201 0.993 0.728 0.44 0.139 -0.243 -0.641 -1.074 -1.62 -2.249 -2.895 -3.671 -4.572 -5.613 -6.772 -8.134 -9.847 -11.737 -14.122 -17.018 -20.691 -25.35 -31.62 -40.137 -52.714 -66.022 -75.835 -83.599 -89.985 -95.332 -99.693 -103.499 -106.686 -109.749 -112.277 -114.472 -116.486 -118.341 -120.004 -121.434 -122.903 -124.204 -125.298 -126.399 -127.547 -128.497 -129.459 -130.44 -131.17 -131.902 -132.645 -133.378 -134.115 -134.619 -135.137 -135.915 -136.434 -136.955 -137.225 -137.785 -138.342 -138.933 -139.239 -139.981 -140.214 -140.537 -140.859 -141.55 -141.922 -142.301 -142.723 -143.23 -143.798 -144.455 -146.858 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 5b2b52bd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25017 ,TETRA ,17616353,Mon Nov 29 10:21:28 CET,Mon Nov 29 12:31:37 CET,0.0 0.211 0.401 0.583 0.739 0.892 1.056 1.38 1.519 1.652 1.666 2.075 2.208 2.456 2.711 2.968 3.092 3.332 3.557 3.888 4.113 4.343 4.688 5.012 5.327 5.626 5.911 6.3 6.696 7.097 7.59 8.042 8.477 9.006 9.603 10.199 10.869 11.592 12.409 13.309 14.274 15.374 16.491 17.818 19.284 20.899 22.631 24.595 26.978 29.387 30.502 30.361 29.702 28.893 28.126 27.268 26.309 25.502 24.619 23.813 23.096 22.435 21.866 21.332 20.847 20.367 19.918 19.508 19.049 18.553 18.175 17.795 17.39 17.067 16.707 16.314 15.914 15.509 15.229 14.94 14.458 14.105 13.729 13.546 13.209 12.833 12.391 12.178 11.745 11.537 11.262 10.957 10.304 9.981 9.634 9.222 8.692 7.83 6.391 -2 ,10061 ,TETRA ,17616354,Mon Nov 29 10:24:27 CET,Mon Nov 29 12:36:20 CET,0.0 0.198 0.381 0.564 0.733 0.881 1.016 1.298 1.433 1.561 1.573 1.974 2.117 2.398 2.67 2.935 3.06 3.298 3.536 3.9 4.136 4.363 4.703 5.033 5.359 5.678 5.984 6.384 6.783 7.181 7.694 8.205 8.702 9.276 9.92 10.579 11.346 12.177 13.047 13.98 15.031 16.276 17.579 19.064 20.616 22.409 24.495 26.713 28.897 30.725 31.528 31.606 31.308 30.914 30.404 29.831 29.232 28.682 28.108 27.562 27.024 26.519 26.043 25.587 25.147 24.67 24.243 23.871 23.499 23.073 22.723 22.386 22.01 21.681 21.333 20.968 20.553 20.149 19.871 19.565 19.11 18.793 18.432 18.238 17.857 17.471 17.069 16.848 16.35 16.04 15.767 15.514 14.937 14.578 14.169 13.667 13.05 12.359 11.365 -3 ,4246 ,TETRA ,17616355,Mon Nov 29 10:24:27 CET,Mon Nov 29 12:39:01 CET,0.0 0.213 0.42 0.605 0.79 0.96 1.124 1.443 1.601 1.754 1.767 2.166 2.308 2.564 2.816 3.07 3.192 3.419 3.656 4.02 4.25 4.469 4.794 5.113 5.422 5.719 6.009 6.383 6.749 7.108 7.574 8.046 8.488 8.976 9.519 10.065 10.731 11.456 12.181 12.94 13.822 14.932 16.026 17.297 18.778 20.416 22.204 24.28 26.474 28.692 29.874 29.839 29.392 28.842 28.263 27.625 26.959 26.373 25.754 25.168 24.625 24.099 23.609 23.14 22.714 22.278 21.861 21.468 21.046 20.583 20.175 19.773 19.396 19.104 18.784 18.437 18.041 17.603 17.29 16.965 16.474 16.158 15.847 15.695 15.373 15.015 14.607 14.392 13.934 13.693 13.437 13.16 12.448 12.025 11.588 11.132 10.666 9.957 8.665 -4 ,15247 ,TETRA ,17616356,Mon Nov 29 10:26:29 CET,Mon Nov 29 12:40:39 CET,0.0 0.258 0.489 0.668 0.818 0.974 1.154 1.506 1.669 1.818 1.837 2.231 2.362 2.613 2.871 3.124 3.244 3.479 3.709 4.047 4.283 4.508 4.831 5.17 5.511 5.843 6.166 6.594 6.988 7.351 7.816 8.298 8.79 9.384 10.066 10.732 11.44 12.196 13.041 13.928 14.867 15.964 17.131 18.478 19.957 21.638 23.501 25.636 28.032 30.512 31.944 32.288 32.042 31.514 30.853 30.17 29.53 28.983 28.416 27.883 27.401 26.918 26.421 25.9 25.42 24.935 24.517 24.182 23.763 23.25 22.834 22.409 21.99 21.677 21.347 21.012 20.646 20.231 19.932 19.612 19.095 18.755 18.407 18.223 17.848 17.419 16.936 16.695 16.217 15.969 15.695 15.372 14.616 14.2 13.715 13.159 12.57 11.829 10.56 -5 ,10576 ,TETRA ,17616357,Mon Nov 29 10:26:29 CET,Mon Nov 29 12:44:04 CET,0.0 0.166 0.318 0.469 0.618 0.765 0.913 1.202 1.339 1.481 1.501 1.897 2.025 2.288 2.559 2.815 2.937 3.177 3.408 3.747 3.969 4.185 4.504 4.829 5.15 5.452 5.755 6.165 6.569 6.967 7.441 7.914 8.389 8.928 9.535 10.137 10.822 11.584 12.413 13.304 14.312 15.481 16.717 18.128 19.706 21.56 23.531 25.706 27.967 30.285 31.484 31.634 31.425 30.945 30.295 29.646 29.023 28.446 27.749 27.092 26.511 25.915 25.373 24.897 24.44 23.94 23.478 23.068 22.63 22.169 21.791 21.378 20.945 20.633 20.313 19.974 19.625 19.244 18.956 18.671 18.233 17.925 17.597 17.419 17.059 16.678 16.295 16.103 15.657 15.47 15.225 14.936 14.32 13.988 13.594 13.104 12.53 11.843 10.883 -6 ,28810 ,TETRA ,17616358,Mon Nov 29 10:26:29 CET,Mon Nov 29 12:39:54 CET,0.0 0.176 0.359 0.541 0.701 0.854 1.005 1.324 1.469 1.601 1.619 2.014 2.145 2.405 2.669 2.933 3.06 3.301 3.547 3.894 4.099 4.303 4.613 4.923 5.231 5.522 5.789 6.146 6.506 6.848 7.273 7.687 8.096 8.629 9.264 9.881 10.59 11.376 12.246 13.184 14.228 15.471 16.783 18.33 20.003 21.94 24.127 26.332 28.462 30.318 30.81 30.453 29.954 29.301 28.428 27.519 26.579 25.761 24.947 24.199 23.51 22.84 22.206 21.587 21.013 20.49 20.086 19.682 19.204 18.709 18.329 17.929 17.468 17.119 16.752 16.352 15.935 15.495 15.178 14.854 14.354 13.993 13.616 13.437 13.068 12.638 12.198 11.987 11.522 11.238 10.929 10.63 10.015 9.663 9.254 8.795 8.238 7.564 6.508 -7 ,31832 ,TETRA ,17616359,Mon Nov 29 10:27:26 CET,Mon Nov 29 12:40:49 CET,0.0 0.24 0.45 0.626 0.782 0.947 1.111 1.403 1.532 1.662 1.669 2.061 2.187 2.445 2.706 2.964 3.085 3.322 3.548 3.887 4.119 4.356 4.707 5.035 5.345 5.651 5.964 6.374 6.776 7.16 7.61 8.044 8.473 8.982 9.567 10.165 10.826 11.514 12.25 13.03 13.926 15.0 16.057 17.257 18.585 20.108 21.803 23.644 25.687 27.925 29.172 29.416 29.14 28.581 27.887 27.119 26.356 25.691 25.057 24.511 23.914 23.284 22.688 22.135 21.607 21.021 20.474 19.998 19.512 19.028 18.621 18.196 17.781 17.448 17.07 16.671 16.27 15.839 15.536 15.231 14.75 14.393 14.024 13.84 13.462 13.07 12.661 12.458 11.976 11.698 11.421 11.115 10.462 10.129 9.734 9.283 8.845 8.3 7.377 -8 ,7548 ,TETRA ,17616360,Mon Nov 29 10:28:28 CET,Mon Nov 29 12:42:14 CET,0.0 0.18 0.348 0.504 0.653 0.799 0.944 1.246 1.396 1.541 1.546 1.934 2.064 2.314 2.557 2.792 2.905 3.136 3.372 3.726 3.957 4.185 4.508 4.828 5.145 5.451 5.762 6.168 6.553 6.93 7.403 7.871 8.345 8.937 9.608 10.232 10.911 11.673 12.49 13.348 14.329 15.444 16.589 17.98 19.556 21.356 23.361 25.76 28.309 30.646 31.628 31.524 31.022 30.345 29.614 28.9 28.181 27.515 26.82 26.185 25.629 25.087 24.524 23.989 23.496 22.99 22.546 22.138 21.704 21.247 20.852 20.418 19.996 19.698 19.381 19.036 18.688 18.321 18.037 17.74 17.269 16.952 16.623 16.441 16.085 15.728 15.266 15.02 14.506 14.132 13.848 13.558 12.827 12.39 11.951 11.474 10.882 10.133 8.985 -9 ,12265 ,TETRA ,17616361,Mon Nov 29 10:28:30 CET,Mon Nov 29 12:42:11 CET,0.0 0.202 0.385 0.553 0.708 0.864 1.006 1.282 1.414 1.541 1.522 1.909 2.032 2.292 2.543 2.785 2.9 3.119 3.34 3.664 3.877 4.085 4.401 4.714 5.022 5.339 5.652 6.04 6.398 6.736 7.16 7.607 8.053 8.587 9.21 9.81 10.485 11.242 12.021 12.816 13.735 14.815 15.878 17.132 18.595 20.205 21.892 23.739 25.641 27.549 28.342 28.222 27.686 26.895 26.006 25.16 24.304 23.515 22.673 21.935 21.363 20.875 20.416 19.936 19.464 18.995 18.56 18.178 17.788 17.341 16.962 16.59 16.186 15.86 15.536 15.199 14.825 14.418 14.148 13.881 13.43 13.103 12.773 12.604 12.221 11.805 11.383 11.162 10.69 10.461 10.175 9.861 9.216 8.832 8.354 7.812 7.219 6.511 5.138 -10 ,32593 ,TETRA ,17616362,Mon Nov 29 10:30:27 CET,Mon Nov 29 12:50:39 CET,0.0 0.282 0.519 0.706 0.881 1.054 1.221 1.539 1.694 1.846 1.877 2.294 2.437 2.708 2.962 3.214 3.336 3.584 3.839 4.197 4.423 4.648 4.99 5.327 5.657 5.984 6.298 6.711 7.11 7.49 7.981 8.475 8.954 9.491 10.108 10.727 11.392 12.069 12.756 13.521 14.405 15.401 16.421 17.681 19.136 20.753 22.41 24.349 26.548 28.569 29.684 29.938 29.731 29.303 28.675 28.042 27.436 26.883 26.32 25.809 25.234 24.618 24.069 23.559 23.063 22.538 22.082 21.692 21.292 20.867 20.506 20.119 19.711 19.387 19.041 18.665 18.277 17.866 17.572 17.255 16.74 16.396 16.054 15.889 15.518 15.033 14.549 14.329 13.821 13.445 13.086 12.699 11.95 11.581 11.158 10.616 10.0 9.238 8.094 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836.txt deleted file mode 100644 index 1b097528..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19153 ,KEBNE ,17027835,Wed Dec 22 18:27:44 CET,Wed Dec 22 20:23:21 CET,0.0 1.223 1.683 2.193 2.657 3.05 3.433 3.819 4.58 4.943 5.301 5.574 6.348 6.703 7.388 8.049 8.699 9.026 9.69 10.343 11.302 11.948 12.596 13.545 14.464 15.379 16.301 17.209 18.399 19.584 20.775 22.254 23.711 25.154 26.857 28.795 30.727 32.964 35.478 38.216 41.155 44.637 48.838 53.191 58.479 64.689 72.235 81.139 92.268 106.509 125.469 142.901 154.431 162.715 168.84 173.574 177.181 180.068 182.341 184.376 185.95 187.249 188.407 189.401 190.254 190.973 191.665 192.244 192.728 193.208 193.658 193.996 194.323 194.629 194.839 195.045 195.25 195.434 195.609 195.709 195.791 195.87 195.912 195.973 195.986 195.959 195.933 195.905 195.882 195.653 195.751 195.714 195.662 195.397 195.228 195.06 194.822 194.48 193.988 193.104 188.388 -2 ,3262 ,KEBNE ,17027836,Wed Dec 22 18:27:43 CET,Wed Dec 22 20:23:32 CET,0.0 0.878 1.418 1.899 2.368 2.832 3.244 3.641 4.447 4.835 5.21 5.537 6.344 6.701 7.396 8.109 8.806 9.134 9.795 10.453 11.43 12.068 12.697 13.646 14.583 15.514 16.456 17.397 18.633 19.851 21.07 22.565 24.03 25.5 27.235 29.24 31.249 33.514 36.03 38.817 41.855 45.354 49.565 53.997 59.438 65.815 73.538 82.811 94.431 109.144 128.298 145.799 157.228 165.328 171.312 175.92 179.461 182.375 184.666 186.776 188.475 189.852 191.024 192.057 192.931 193.658 194.411 195.05 195.547 196.045 196.51 196.849 197.173 197.472 197.688 197.893 198.086 198.269 198.448 198.562 198.661 198.771 198.826 198.882 198.914 198.978 199.039 199.083 199.09 198.878 198.986 198.942 198.903 198.74 198.609 198.444 198.209 197.907 197.527 196.943 194.094 -3 ,18832 ,KEBNE ,17027837,Wed Dec 22 18:27:47 CET,Wed Dec 22 20:22:30 CET,0.0 0.772 1.26 1.683 2.122 2.578 2.999 3.388 4.139 4.515 4.891 5.189 5.969 6.315 7.023 7.717 8.383 8.713 9.383 10.059 11.054 11.7 12.333 13.279 14.225 15.158 16.075 16.993 18.228 19.45 20.649 22.153 23.645 25.107 26.84 28.832 30.793 32.993 35.43 38.103 41.037 44.516 48.71 53.062 58.351 64.485 71.962 80.845 91.714 105.633 124.268 141.592 153.159 161.491 167.598 172.36 176.056 179.054 181.451 183.64 185.344 186.759 188.04 189.158 190.118 190.93 191.712 192.353 192.879 193.426 193.962 194.352 194.705 195.046 195.299 195.552 195.785 195.998 196.197 196.328 196.442 196.561 196.643 196.712 196.726 196.733 196.748 196.76 196.743 196.519 196.579 196.495 196.436 196.292 196.176 196.013 195.813 195.548 195.161 194.528 189.574 -4 ,8083 ,KEBNE ,17027838,Wed Dec 22 18:27:47 CET,Wed Dec 22 20:20:52 CET,0.0 0.902 1.475 1.962 2.387 2.788 3.19 3.568 4.301 4.649 5.007 5.295 6.05 6.389 7.096 7.78 8.435 8.759 9.395 10.019 10.94 11.56 12.18 13.119 14.071 15.011 15.938 16.842 18.031 19.211 20.389 21.847 23.289 24.732 26.453 28.438 30.427 32.686 35.197 37.942 40.906 44.387 48.605 52.992 58.36 64.623 72.047 80.968 92.178 106.349 125.41 143.429 155.58 164.383 171.026 176.23 180.234 183.548 186.156 188.344 189.91 191.202 192.385 193.429 194.297 195.054 195.79 196.395 196.898 197.369 197.819 198.148 198.458 198.772 199.0 199.207 199.398 199.592 199.763 199.843 199.908 199.973 199.985 199.995 200.006 200.03 200.033 199.984 199.947 199.713 199.822 199.77 199.701 199.417 199.24 199.073 198.818 198.424 197.965 197.259 191.361 -5 ,9207 ,KEBNE ,17027839,Wed Dec 22 18:28:48 CET,Wed Dec 22 20:24:55 CET,0.0 0.837 1.417 1.92 2.37 2.787 3.193 3.592 4.355 4.725 5.07 5.326 6.097 6.435 7.1 7.761 8.435 8.773 9.439 10.092 11.071 11.729 12.379 13.329 14.286 15.231 16.144 17.041 18.243 19.445 20.62 22.091 23.579 25.039 26.752 28.73 30.687 32.915 35.405 38.122 41.045 44.445 48.557 52.833 58.09 64.3 71.861 80.931 92.237 106.471 125.294 142.846 154.373 162.459 168.448 173.123 176.713 179.642 181.954 184.041 185.68 187.043 188.233 189.24 190.096 190.824 191.512 192.066 192.499 192.9 193.288 193.575 193.828 194.041 194.181 194.335 194.484 194.607 194.73 194.807 194.877 194.989 195.059 195.102 195.115 195.102 195.026 194.962 194.934 194.704 194.832 194.771 194.694 194.529 194.411 194.249 194.027 193.761 193.421 192.863 187.444 -6 ,10042 ,KEBNE ,17027840,Wed Dec 22 18:38:09 CET,Wed Dec 22 20:33:18 CET,0.0 1.793 2.432 2.862 3.295 3.741 4.168 4.543 5.26 5.61 5.957 6.219 6.99 7.333 8.046 8.765 9.471 9.822 10.498 11.16 12.161 12.817 13.464 14.455 15.446 16.433 17.431 18.408 19.633 20.821 22.009 23.486 24.95 26.422 28.184 30.18 32.137 34.352 36.802 39.521 42.554 46.126 50.444 54.946 60.378 66.694 74.46 83.759 95.3 109.986 129.608 147.678 159.484 167.766 173.847 178.562 182.192 185.143 187.438 189.536 191.166 192.481 193.657 194.696 195.602 196.383 197.139 197.741 198.205 198.652 199.079 199.414 199.73 200.007 200.214 200.438 200.651 200.863 201.053 201.159 201.262 201.411 201.488 201.528 201.539 201.543 201.543 201.535 201.508 201.28 201.396 201.344 201.294 201.123 201.007 200.888 200.76 200.525 200.091 199.45 192.469 -7 ,23001 ,KEBNE ,17027841,Wed Dec 22 18:38:09 CET,Wed Dec 22 20:33:29 CET,0.0 0.868 1.409 1.907 2.372 2.79 3.192 3.606 4.417 4.8 5.178 5.487 6.276 6.63 7.335 8.026 8.713 9.054 9.727 10.395 11.392 12.059 12.729 13.706 14.653 15.593 16.526 17.445 18.652 19.86 21.07 22.572 24.044 25.482 27.191 29.187 31.185 33.457 35.986 38.766 41.78 45.322 49.622 54.083 59.548 66.009 73.823 83.038 94.422 108.731 127.706 145.334 157.076 165.523 171.809 176.794 180.518 183.447 185.699 187.719 189.322 190.63 191.816 192.836 193.673 194.394 195.102 195.68 196.128 196.563 197.014 197.355 197.674 197.968 198.17 198.364 198.553 198.715 198.873 198.968 199.047 199.186 199.253 199.272 199.268 199.266 199.272 199.251 199.223 199.004 199.069 198.977 198.877 198.581 198.432 198.255 197.953 197.62 197.22 196.582 192.653 -8 ,17512 ,KEBNE ,17027842,Wed Dec 22 18:38:09 CET,Wed Dec 22 20:34:16 CET,0.0 1.477 2.092 2.6 3.059 3.469 3.898 4.301 5.029 5.4 5.772 6.073 6.855 7.205 7.918 8.649 9.36 9.699 10.383 11.059 12.041 12.697 13.342 14.294 15.243 16.184 17.126 18.063 19.308 20.556 21.778 23.27 24.76 26.249 28.006 29.993 31.983 34.247 36.722 39.392 42.209 45.608 49.894 54.324 59.664 65.858 73.269 82.089 92.998 106.789 125.558 143.047 154.703 163.371 169.834 174.9 178.939 182.218 184.735 187.023 188.815 190.283 191.588 192.738 193.75 194.633 195.475 196.125 196.617 197.068 197.482 197.806 198.124 198.436 198.651 198.843 199.024 199.163 199.296 199.381 199.451 199.564 199.637 199.69 199.705 199.722 199.717 199.704 199.672 199.404 199.441 199.357 199.277 199.067 198.884 198.683 198.414 198.076 197.635 196.948 192.505 -9 ,14288 ,KEBNE ,17027843,Wed Dec 22 18:38:08 CET,Wed Dec 22 20:34:47 CET,0.0 1.373 1.892 2.315 2.763 3.196 3.602 4.009 4.78 5.141 5.486 5.752 6.519 6.856 7.561 8.28 8.989 9.339 10.037 10.744 11.768 12.422 13.086 14.075 15.023 15.967 16.911 17.834 19.03 20.228 21.41 22.85 24.291 25.744 27.476 29.433 31.389 33.66 36.244 39.025 41.925 45.322 49.481 53.817 59.097 65.284 72.817 81.83 93.033 107.282 126.088 143.377 154.792 162.946 168.975 173.652 177.229 180.12 182.401 184.463 186.08 187.412 188.578 189.588 190.455 191.185 191.901 192.507 192.998 193.469 193.926 194.273 194.593 194.901 195.122 195.343 195.568 195.781 195.979 196.097 196.194 196.318 196.382 196.432 196.453 196.49 196.526 196.529 196.51 196.282 196.373 196.331 196.286 196.121 196.035 195.925 195.738 195.463 195.095 194.523 190.775 -10 ,18301 ,KEBNE ,17027844,Wed Dec 22 18:38:09 CET,Wed Dec 22 20:35:26 CET,0.0 1.056 1.551 2.033 2.494 2.915 3.337 3.747 4.516 4.909 5.28 5.561 6.352 6.717 7.438 8.153 8.84 9.168 9.804 10.443 11.395 12.034 12.675 13.621 14.549 15.481 16.41 17.33 18.56 19.767 20.964 22.449 23.917 25.375 27.106 29.109 31.101 33.364 35.867 38.595 41.568 45.07 49.314 53.74 59.112 65.376 72.977 82.128 93.452 107.707 126.669 144.095 155.68 163.98 169.997 174.653 178.301 181.31 183.644 185.691 187.295 188.621 189.771 190.802 191.712 192.48 193.211 193.787 194.239 194.658 195.066 195.368 195.647 195.95 196.176 196.386 196.565 196.716 196.85 196.942 197.024 197.109 197.143 197.164 197.179 197.194 197.181 197.156 197.134 196.902 196.961 196.876 196.819 196.662 196.535 196.373 196.173 195.964 195.659 195.09 187.854 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index fb387ad8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17897 ,TETRA ,17616363,Mon Nov 29 10:31:27 CET,Mon Nov 29 12:55:08 CET,0.0 0.66 1.087 1.464 1.812 2.158 2.487 2.808 3.416 3.716 4.017 4.176 4.889 5.182 5.771 6.355 6.935 7.217 7.772 8.329 9.153 9.695 10.24 11.064 11.874 12.67 13.47 14.255 15.285 16.315 17.336 18.614 19.877 21.141 22.669 24.41 26.168 28.184 30.394 32.774 35.339 38.286 41.819 45.509 49.97 55.192 61.452 68.829 78.023 89.8 105.331 119.552 128.749 135.02 139.601 143.135 145.906 148.175 149.828 151.257 152.319 153.151 153.853 154.434 154.969 155.449 155.887 156.187 156.394 156.586 156.735 156.84 156.937 156.987 157.02 157.026 157.008 157.007 156.983 156.949 156.896 156.775 156.689 156.572 156.492 156.348 156.204 155.998 155.883 155.516 155.444 155.249 155.056 154.634 154.347 154.016 153.667 153.238 152.563 151.498 145.344 -2 ,13070 ,TETRA ,17616364,Mon Nov 29 10:32:29 CET,Mon Nov 29 12:47:37 CET,0.0 0.389 0.798 1.17 1.498 1.813 2.133 2.457 3.088 3.4 3.708 3.888 4.612 4.905 5.487 6.08 6.663 6.953 7.529 8.099 8.96 9.527 10.085 10.907 11.714 12.519 13.319 14.12 15.201 16.266 17.303 18.608 19.891 21.115 22.541 24.19 25.851 27.753 29.841 32.095 34.571 37.511 41.096 44.838 49.387 54.682 60.983 68.39 77.661 89.601 105.733 120.64 130.252 136.791 141.559 145.368 148.384 150.756 152.504 154.08 155.288 156.3 157.189 157.952 158.606 159.134 159.637 160.029 160.324 160.595 160.833 161.028 161.207 161.374 161.508 161.612 161.688 161.765 161.826 161.852 161.875 161.888 161.867 161.83 161.813 161.781 161.711 161.6 161.519 161.184 161.182 161.067 160.962 160.573 160.217 159.692 159.153 158.624 157.791 156.578 145.748 -3 ,22603 ,TETRA ,17616365,Mon Nov 29 10:33:29 CET,Mon Nov 29 12:48:53 CET,0.0 0.569 1.029 1.376 1.718 2.054 2.401 2.752 3.385 3.685 3.993 4.195 4.928 5.224 5.808 6.385 6.966 7.248 7.799 8.36 9.207 9.776 10.348 11.189 12.019 12.835 13.645 14.44 15.457 16.469 17.513 18.829 20.142 21.461 22.977 24.696 26.418 28.358 30.528 32.912 35.515 38.633 42.377 46.249 50.93 56.3 62.792 70.527 80.177 92.299 108.206 122.449 131.55 138.12 142.972 146.7 149.49 151.654 153.317 154.807 156.008 156.984 157.782 158.425 158.954 159.371 159.759 160.06 160.281 160.453 160.587 160.69 160.831 160.99 161.066 161.124 161.183 161.213 161.19 161.169 161.169 161.132 161.088 161.028 160.974 160.844 160.717 160.522 160.414 160.074 160.102 159.985 159.827 159.417 159.165 158.839 158.358 157.744 157.054 155.954 150.341 -6 ,16003 ,TETRA ,17616368,Mon Nov 29 10:36:28 CET,Mon Nov 29 12:52:50 CET,0.0 0.473 0.893 1.297 1.664 1.984 2.293 2.609 3.246 3.554 3.86 4.045 4.772 5.061 5.638 6.217 6.792 7.076 7.628 8.193 9.044 9.588 10.125 10.929 11.74 12.538 13.337 14.135 15.174 16.193 17.194 18.444 19.687 20.909 22.371 24.113 25.894 27.934 30.178 32.563 35.156 38.221 41.95 45.855 50.44 55.729 62.136 69.689 79.117 90.968 106.754 121.484 130.911 137.404 142.115 145.81 148.646 150.863 152.556 154.07 155.227 156.206 157.068 157.797 158.428 158.942 159.448 159.83 160.096 160.35 160.585 160.764 160.927 161.076 161.157 161.197 161.256 161.323 161.361 161.388 161.413 161.438 161.437 161.421 161.426 161.422 161.38 161.277 161.196 160.877 160.949 160.859 160.748 160.484 160.335 160.136 159.942 159.699 159.134 158.02 149.561 -8 ,19160 ,TETRA ,17616370,Mon Nov 29 10:38:27 CET,Mon Nov 29 12:54:53 CET,0.0 0.639 1.011 1.337 1.667 1.997 2.32 2.638 3.27 3.581 3.882 4.049 4.769 5.071 5.655 6.215 6.776 7.068 7.661 8.243 9.102 9.658 10.205 11.027 11.835 12.642 13.46 14.278 15.32 16.321 17.322 18.557 19.787 21.042 22.575 24.349 26.114 28.132 30.337 32.682 35.217 38.167 41.747 45.548 50.229 55.607 61.965 69.504 79.014 91.068 106.951 121.404 130.72 137.266 141.936 145.568 148.366 150.566 152.318 153.89 155.11 156.095 156.91 157.552 158.017 158.391 158.735 158.995 159.234 159.465 159.632 159.755 159.868 159.955 160.032 160.09 160.097 160.108 160.096 160.065 160.029 159.963 159.918 159.847 159.801 159.675 159.526 159.341 159.2 158.803 158.793 158.649 158.484 158.086 157.829 157.551 157.182 156.689 155.923 154.814 145.93 -9 ,11513 ,TETRA ,17616371,Mon Nov 29 10:40:30 CET,Mon Nov 29 12:58:39 CET,0.0 0.422 0.805 1.175 1.524 1.847 2.176 2.496 3.121 3.433 3.743 3.93 4.67 4.976 5.565 6.146 6.716 7.002 7.571 8.148 9.019 9.589 10.163 11.015 11.84 12.666 13.497 14.312 15.365 16.392 17.428 18.754 20.046 21.322 22.859 24.616 26.362 28.329 30.471 32.823 35.38 38.413 42.141 45.968 50.58 55.931 62.396 70.172 79.739 91.841 108.004 122.784 132.223 138.798 143.588 147.288 150.141 152.338 153.896 155.162 156.1 156.818 157.419 157.943 158.473 158.984 159.476 159.904 160.243 160.571 160.879 161.066 161.218 161.355 161.462 161.569 161.658 161.727 161.789 161.823 161.826 161.822 161.799 161.728 161.68 161.588 161.493 161.367 161.256 160.868 160.845 160.687 160.523 160.165 159.91 159.622 159.272 158.832 158.194 157.133 147.742 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index ac9f1fee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14389 ,TETRA ,17616373,Mon Nov 29 10:43:28 CET,Mon Nov 29 13:10:16 CET,0.0 0.962 1.548 2.083 2.56 3.008 3.465 3.886 4.65 5.037 5.426 5.781 6.602 6.975 7.685 8.386 9.093 9.444 10.137 10.822 11.839 12.506 13.171 14.158 15.12 16.067 17.035 17.993 19.22 20.446 21.669 23.179 24.636 26.067 27.799 29.812 31.796 34.022 36.502 39.236 42.22 45.705 49.903 54.248 59.547 65.792 73.347 82.467 93.758 107.923 126.608 143.763 154.929 162.709 168.451 172.975 176.51 179.35 181.509 183.481 185.061 186.351 187.479 188.476 189.315 190.022 190.72 191.304 191.781 192.229 192.64 192.963 193.28 193.577 193.785 193.962 194.113 194.284 194.456 194.545 194.624 194.744 194.813 194.852 194.865 194.875 194.855 194.812 194.787 194.56 194.69 194.634 194.575 194.375 194.218 194.018 193.787 193.554 193.247 192.656 181.721 -2 ,5842 ,TETRA ,17616374,Mon Nov 29 10:44:28 CET,Mon Nov 29 13:04:35 CET,0.0 1.919 2.484 2.996 3.459 3.899 4.313 4.704 5.5 5.882 6.245 6.528 7.309 7.662 8.353 9.019 9.686 10.019 10.675 11.318 12.249 12.869 13.498 14.439 15.384 16.319 17.232 18.134 19.353 20.577 21.801 23.325 24.817 26.275 28.004 30.021 32.017 34.262 36.757 39.494 42.467 45.941 50.106 54.454 59.773 66.011 73.561 82.51 93.53 107.62 126.449 143.601 154.886 163.102 169.201 173.784 177.315 180.252 182.538 184.585 186.182 187.453 188.579 189.603 190.473 191.193 191.889 192.456 192.915 193.339 193.737 194.056 194.351 194.632 194.849 195.064 195.283 195.472 195.602 195.696 195.795 195.92 196.014 196.089 196.095 196.074 196.055 196.006 195.965 195.736 195.892 195.825 195.734 195.515 195.338 195.126 194.878 194.577 194.15 193.488 189.453 -3 ,310 ,TETRA ,17616375,Mon Nov 29 10:46:27 CET,Mon Nov 29 13:06:41 CET,0.0 1.167 1.777 2.306 2.836 3.315 3.746 4.154 4.953 5.378 5.796 6.123 6.903 7.266 7.991 8.682 9.368 9.722 10.427 11.109 12.11 12.759 13.408 14.396 15.355 16.276 17.2 18.141 19.389 20.609 21.82 23.326 24.81 26.237 27.915 29.885 31.835 34.07 36.564 39.259 42.163 45.483 49.508 53.814 59.165 65.433 72.97 81.902 92.904 106.792 125.088 142.177 153.348 161.107 166.911 171.463 174.944 177.775 179.978 181.994 183.583 184.882 186.013 186.98 187.825 188.552 189.253 189.813 190.257 190.729 191.189 191.517 191.826 192.13 192.343 192.524 192.7 192.866 193.013 193.102 193.186 193.305 193.367 193.416 193.441 193.482 193.461 193.366 193.312 193.063 193.203 193.134 193.032 192.771 192.631 192.482 192.235 191.874 191.39 190.726 186.098 -4 ,30155 ,TETRA ,17616376,Mon Nov 29 10:46:29 CET,Mon Nov 29 13:07:36 CET,0.0 1.36 1.957 2.486 2.987 3.457 3.928 4.365 5.195 5.574 5.937 6.249 7.04 7.398 8.124 8.84 9.525 9.865 10.543 11.206 12.2 12.856 13.505 14.47 15.422 16.364 17.279 18.188 19.392 20.577 21.763 23.234 24.697 26.153 27.876 29.889 31.922 34.184 36.667 39.424 42.416 45.88 50.109 54.547 59.915 66.18 73.851 83.01 94.323 108.285 126.503 143.573 154.577 162.274 167.999 172.534 176.069 178.905 181.12 183.198 184.831 186.142 187.323 188.36 189.251 190.01 190.744 191.369 191.871 192.352 192.818 193.174 193.526 193.869 194.109 194.348 194.566 194.745 194.917 195.027 195.132 195.283 195.375 195.438 195.469 195.537 195.575 195.57 195.53 195.272 195.341 195.267 195.205 195.075 194.988 194.848 194.666 194.463 194.127 193.497 188.005 -5 ,19015 ,TETRA ,17616377,Mon Nov 29 10:47:28 CET,Mon Nov 29 13:07:44 CET,0.0 0.945 1.546 2.138 2.633 3.088 3.537 3.988 4.883 5.291 5.695 6.039 6.827 7.197 7.922 8.628 9.324 9.663 10.336 10.999 11.97 12.619 13.265 14.204 15.128 16.058 16.976 17.883 19.108 20.316 21.504 22.968 24.435 25.908 27.634 29.599 31.543 33.743 36.156 38.859 41.88 45.346 49.462 53.813 59.052 65.266 73.06 82.346 93.818 108.212 127.032 144.442 155.819 163.832 169.712 174.222 177.685 180.512 182.731 184.753 186.338 187.594 188.711 189.716 190.587 191.321 192.022 192.588 193.048 193.507 193.941 194.254 194.561 194.868 195.095 195.3 195.467 195.613 195.762 195.883 196.002 196.126 196.187 196.239 196.261 196.3 196.33 196.338 196.334 196.107 196.221 196.163 196.078 195.805 195.66 195.468 195.23 194.977 194.561 193.857 188.746 -6 ,12513 ,TETRA ,17616378,Mon Nov 29 10:52:28 CET,Mon Nov 29 13:16:15 CET,0.0 1.124 1.653 2.145 2.607 3.062 3.497 3.92 4.718 5.106 5.494 5.82 6.617 6.97 7.669 8.363 9.047 9.386 10.057 10.718 11.704 12.363 13.014 13.967 14.91 15.855 16.79 17.714 18.936 20.137 21.32 22.797 24.272 25.722 27.452 29.44 31.39 33.597 36.04 38.712 41.631 45.073 49.248 53.613 58.917 65.1 72.604 81.485 92.518 106.399 124.721 141.802 153.159 161.435 167.601 172.401 176.171 179.264 181.662 183.79 185.466 186.864 188.114 189.252 190.223 191.048 191.876 192.557 193.103 193.617 194.102 194.452 194.771 195.106 195.348 195.566 195.774 195.982 196.17 196.272 196.358 196.463 196.551 196.639 196.664 196.681 196.65 196.589 196.537 196.287 196.375 196.311 196.23 195.898 195.699 195.464 195.098 194.64 194.168 193.507 189.454 -7 ,4265 ,TETRA ,17616379,Mon Nov 29 10:53:30 CET,Mon Nov 29 13:13:34 CET,0.0 0.891 1.484 2.012 2.503 2.988 3.425 3.836 4.666 5.076 5.472 5.812 6.628 7.0 7.742 8.475 9.202 9.558 10.272 10.965 11.946 12.594 13.245 14.212 15.163 16.117 17.069 17.999 19.211 20.413 21.604 23.083 24.554 26.007 27.739 29.733 31.747 34.091 36.647 39.326 42.163 45.443 49.404 53.587 58.665 64.553 71.66 80.044 90.478 103.573 120.844 136.996 147.689 155.356 161.015 165.382 168.856 171.859 174.334 176.635 178.442 179.9 181.175 182.307 183.257 184.036 184.778 185.384 185.874 186.338 186.78 187.114 187.441 187.745 187.963 188.174 188.362 188.514 188.644 188.732 188.819 188.918 188.962 189.015 189.043 189.076 189.061 189.008 188.962 188.684 188.7 188.561 188.402 188.124 187.962 187.749 187.49 187.189 186.818 186.198 180.175 -8 ,7503 ,TETRA ,17616380,Mon Nov 29 10:53:33 CET,Mon Nov 29 13:13:34 CET,0.0 1.254 1.894 2.421 2.912 3.334 3.76 4.185 4.936 5.287 5.636 5.894 6.657 7.001 7.69 8.354 9.017 9.343 9.977 10.619 11.577 12.207 12.83 13.739 14.629 15.518 16.411 17.301 18.478 19.638 20.787 22.212 23.612 24.983 26.619 28.521 30.381 32.453 34.773 37.358 40.16 43.433 47.43 51.586 56.65 62.634 69.932 78.669 89.672 103.718 122.301 139.66 151.178 159.509 165.854 170.836 174.607 177.692 180.155 182.334 184.038 185.432 186.658 187.752 188.629 189.317 190.02 190.618 191.088 191.514 191.914 192.237 192.551 192.833 192.993 193.126 193.275 193.408 193.507 193.577 193.642 193.726 193.774 193.8 193.804 193.777 193.753 193.728 193.697 193.457 193.547 193.47 193.387 193.211 193.089 192.922 192.726 192.527 192.04 191.14 186.229 -9 ,3762 ,TETRA ,17616381,Mon Nov 29 10:54:28 CET,Mon Nov 29 13:14:53 CET,0.0 1.615 2.215 2.701 3.172 3.592 3.992 4.406 5.213 5.62 6.019 6.363 7.178 7.565 8.313 9.017 9.725 10.085 10.788 11.485 12.523 13.189 13.838 14.805 15.766 16.718 17.651 18.581 19.815 21.042 22.269 23.804 25.348 26.854 28.63 30.689 32.705 34.957 37.462 40.227 43.209 46.644 50.775 55.078 60.337 66.53 73.956 82.802 93.943 108.022 126.477 143.709 155.108 163.185 169.19 173.914 177.644 180.693 183.019 185.143 186.852 188.257 189.489 190.535 191.449 192.243 193.002 193.588 194.061 194.558 195.037 195.405 195.775 196.119 196.359 196.591 196.807 197.02 197.214 197.324 197.422 197.543 197.623 197.688 197.706 197.719 197.722 197.713 197.693 197.449 197.56 197.503 197.435 197.296 197.196 196.989 196.735 196.472 196.036 195.258 190.209 -10 ,16176 ,TETRA ,17616382,Mon Nov 29 10:54:29 CET,Mon Nov 29 13:17:05 CET,0.0 1.544 2.241 2.81 3.272 3.74 4.19 4.608 5.466 5.887 6.291 6.65 7.466 7.848 8.598 9.333 10.031 10.372 11.037 11.68 12.649 13.285 13.905 14.852 15.799 16.725 17.644 18.557 19.789 21.025 22.252 23.757 25.221 26.697 28.472 30.531 32.578 34.834 37.302 40.082 43.141 46.674 50.932 55.404 60.805 67.002 74.396 83.232 94.321 108.157 126.472 143.439 154.834 162.893 168.747 173.352 176.875 179.731 181.971 184.016 185.604 186.86 187.961 188.962 189.794 190.48 191.148 191.709 192.156 192.565 192.978 193.317 193.644 193.962 194.188 194.384 194.551 194.713 194.871 194.966 195.062 195.2 195.259 195.29 195.308 195.335 195.31 195.227 195.192 194.953 195.051 194.968 194.857 194.623 194.454 194.232 193.978 193.676 193.277 192.662 188.507 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 7f816a07..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6682 ,KEBNE ,17027845,Wed Dec 22 18:38:11 CET,Wed Dec 22 20:37:08 CET,0.0 0.893 1.135 1.316 1.483 1.621 1.75 1.858 2.064 2.162 2.25 2.006 2.472 2.549 2.702 2.834 2.957 3.017 3.14 3.262 3.441 3.55 3.65 3.787 3.933 4.081 4.203 4.312 4.456 4.605 4.768 4.957 5.103 5.226 5.367 5.517 5.672 5.795 5.867 5.953 6.018 6.048 6.046 5.998 5.868 5.641 5.181 4.405 3.239 1.259 -2.18 -6.287 -9.904 -13.112 -15.854 -18.277 -20.297 -22.034 -23.495 -24.917 -26.165 -27.302 -28.345 -29.296 -30.178 -30.963 -31.741 -32.453 -33.091 -33.772 -34.503 -35.104 -35.702 -36.305 -36.765 -37.258 -37.77 -38.264 -38.754 -39.093 -39.468 -40.043 -40.416 -40.798 -40.995 -41.396 -41.821 -42.264 -42.481 -43.135 -43.25 -43.527 -43.797 -44.406 -44.726 -45.082 -45.483 -45.905 -46.418 -47.011 -48.754 -2 ,9839 ,KEBNE ,17027846,Wed Dec 22 18:38:09 CET,Wed Dec 22 20:37:33 CET,0.0 0.598 0.798 0.949 1.092 1.225 1.352 1.484 1.673 1.735 1.81 1.578 2.044 2.114 2.247 2.352 2.44 2.487 2.586 2.676 2.779 2.841 2.916 3.029 3.119 3.214 3.296 3.358 3.437 3.507 3.586 3.672 3.746 3.813 3.862 3.895 3.916 3.948 3.985 3.998 3.966 3.878 3.769 3.646 3.431 3.077 2.469 1.57 0.37 -1.523 -5.181 -9.551 -13.032 -15.989 -18.445 -20.584 -22.452 -24.078 -25.488 -26.882 -28.013 -28.994 -29.977 -31.005 -32.026 -32.947 -33.854 -34.634 -35.313 -36.016 -36.729 -37.301 -37.871 -38.445 -38.902 -39.373 -39.85 -40.334 -40.821 -41.156 -41.502 -42.037 -42.41 -42.801 -43.002 -43.405 -43.826 -44.25 -44.469 -45.13 -45.178 -45.439 -45.709 -46.384 -46.781 -47.162 -47.574 -48.063 -48.605 -49.372 -52.132 -3 ,12955 ,KEBNE ,17027847,Wed Dec 22 18:38:11 CET,Wed Dec 22 20:37:06 CET,0.0 0.842 1.115 1.268 1.414 1.543 1.648 1.752 1.953 2.035 2.112 1.851 2.304 2.376 2.503 2.61 2.709 2.754 2.847 2.954 3.089 3.171 3.255 3.357 3.44 3.518 3.597 3.673 3.768 3.83 3.861 3.905 3.96 4.009 4.054 4.099 4.149 4.175 4.159 4.128 4.08 3.977 3.788 3.578 3.262 2.794 2.195 1.343 -0.06 -2.356 -6.095 -10.519 -14.237 -17.348 -19.972 -22.224 -24.161 -25.87 -27.369 -28.983 -30.36 -31.537 -32.628 -33.632 -34.553 -35.381 -36.215 -36.932 -37.544 -38.198 -38.87 -39.418 -39.993 -40.587 -41.06 -41.557 -42.051 -42.541 -43.054 -43.402 -43.763 -44.326 -44.704 -45.076 -45.277 -45.706 -46.126 -46.555 -46.79 -47.471 -47.551 -47.808 -48.08 -48.658 -49.006 -49.406 -49.811 -50.232 -50.748 -51.55 -54.582 -4 ,7503 ,KEBNE ,17027848,Wed Dec 22 18:38:11 CET,Wed Dec 22 20:36:11 CET,0.0 0.676 0.941 1.139 1.311 1.436 1.544 1.672 1.893 1.977 2.05 1.803 2.262 2.325 2.449 2.564 2.679 2.731 2.825 2.912 3.042 3.125 3.198 3.295 3.401 3.503 3.581 3.65 3.729 3.811 3.905 4.0 4.087 4.171 4.249 4.321 4.363 4.391 4.423 4.448 4.457 4.432 4.348 4.193 3.93 3.542 2.936 2.074 0.752 -1.378 -5.086 -9.393 -12.747 -15.657 -18.174 -20.341 -22.173 -23.822 -25.238 -26.653 -27.845 -28.876 -29.846 -30.725 -31.533 -32.283 -33.067 -33.766 -34.339 -34.909 -35.527 -36.063 -36.63 -37.216 -37.676 -38.148 -38.638 -39.163 -39.7 -40.054 -40.406 -40.96 -41.35 -41.747 -41.946 -42.37 -42.844 -43.342 -43.598 -44.278 -44.347 -44.608 -44.887 -45.505 -45.85 -46.236 -46.654 -47.12 -47.654 -48.291 -50.947 -5 ,12265 ,KEBNE ,17027849,Wed Dec 22 18:38:11 CET,Wed Dec 22 20:36:33 CET,0.0 0.899 1.098 1.241 1.391 1.518 1.623 1.719 1.866 1.939 2.021 1.798 2.266 2.342 2.456 2.552 2.646 2.696 2.778 2.849 2.96 3.03 3.093 3.183 3.263 3.336 3.403 3.45 3.514 3.591 3.671 3.775 3.861 3.944 4.025 4.067 4.105 4.167 4.205 4.222 4.211 4.155 4.094 3.929 3.684 3.363 2.867 2.122 0.803 -1.217 -4.565 -8.758 -12.437 -15.523 -18.156 -20.469 -22.401 -24.09 -25.49 -26.889 -28.097 -29.159 -30.143 -31.044 -31.864 -32.607 -33.387 -34.078 -34.675 -35.285 -35.906 -36.393 -36.878 -37.408 -37.837 -38.269 -38.708 -39.17 -39.639 -39.957 -40.278 -40.761 -41.115 -41.518 -41.738 -42.191 -42.662 -43.152 -43.398 -44.08 -44.169 -44.44 -44.722 -45.332 -45.663 -46.04 -46.49 -46.987 -47.554 -48.298 -51.423 -6 ,19620 ,KEBNE ,17027850,Wed Dec 22 18:38:08 CET,Wed Dec 22 20:36:52 CET,0.0 0.849 1.051 1.205 1.314 1.416 1.508 1.602 1.779 1.858 1.931 1.668 2.117 2.177 2.284 2.396 2.502 2.552 2.651 2.744 2.865 2.941 3.015 3.111 3.194 3.264 3.323 3.386 3.466 3.544 3.619 3.717 3.813 3.894 3.979 4.052 4.108 4.144 4.168 4.205 4.216 4.148 4.041 3.923 3.693 3.331 2.779 1.833 0.398 -1.688 -5.199 -9.309 -12.531 -15.165 -17.463 -19.528 -21.3 -22.844 -24.13 -25.394 -26.467 -27.422 -28.303 -29.138 -29.914 -30.604 -31.319 -32.004 -32.608 -33.215 -33.855 -34.367 -34.907 -35.515 -35.997 -36.476 -36.94 -37.406 -37.909 -38.264 -38.639 -39.243 -39.649 -40.058 -40.286 -40.758 -41.205 -41.648 -41.888 -42.558 -42.638 -42.905 -43.182 -43.826 -44.166 -44.535 -44.927 -45.336 -45.833 -46.453 -48.82 -7 ,4394 ,KEBNE ,17027851,Wed Dec 22 18:38:08 CET,Wed Dec 22 20:36:30 CET,0.0 1.068 1.457 1.755 2.002 2.183 2.345 2.51 2.77 2.876 2.976 2.77 3.236 3.312 3.47 3.609 3.719 3.773 3.889 4.001 4.151 4.237 4.315 4.426 4.517 4.595 4.666 4.73 4.815 4.896 4.965 5.06 5.157 5.24 5.33 5.405 5.469 5.537 5.587 5.623 5.606 5.505 5.367 5.256 5.039 4.672 4.098 3.202 1.781 -0.402 -3.831 -7.813 -11.148 -13.957 -16.292 -18.324 -20.051 -21.626 -23.004 -24.405 -25.614 -26.675 -27.69 -28.61 -29.424 -30.172 -30.964 -31.695 -32.314 -32.956 -33.629 -34.177 -34.765 -35.366 -35.814 -36.275 -36.748 -37.225 -37.715 -38.067 -38.432 -38.997 -39.398 -39.816 -40.028 -40.446 -40.889 -41.351 -41.588 -42.258 -42.324 -42.573 -42.832 -43.405 -43.728 -44.078 -44.454 -44.898 -45.431 -46.121 -48.434 -8 ,27010 ,KEBNE ,17027852,Wed Dec 22 18:38:11 CET,Wed Dec 22 20:36:39 CET,0.0 0.71 0.857 0.999 1.133 1.265 1.386 1.479 1.65 1.728 1.796 1.539 2.005 2.072 2.207 2.331 2.444 2.506 2.622 2.716 2.83 2.905 2.976 3.081 3.174 3.267 3.371 3.447 3.536 3.628 3.716 3.821 3.912 3.981 4.029 4.076 4.109 4.14 4.196 4.233 4.244 4.224 4.137 3.992 3.737 3.438 2.959 2.086 0.774 -1.391 -5.082 -9.353 -12.842 -15.743 -18.173 -20.291 -22.111 -23.722 -25.061 -26.382 -27.527 -28.553 -29.513 -30.383 -31.208 -32.005 -32.839 -33.593 -34.239 -34.895 -35.563 -36.093 -36.644 -37.215 -37.652 -38.103 -38.561 -39.026 -39.523 -39.864 -40.185 -40.688 -41.073 -41.472 -41.669 -42.074 -42.53 -43.008 -43.232 -43.888 -43.927 -44.193 -44.484 -45.08 -45.394 -45.748 -46.15 -46.58 -47.071 -47.711 -50.001 -9 ,14378 ,KEBNE ,17027853,Wed Dec 22 18:38:11 CET,Wed Dec 22 20:37:26 CET,0.0 0.454 0.629 0.766 0.912 1.032 1.131 1.218 1.378 1.448 1.517 1.277 1.735 1.796 1.895 1.981 2.072 2.117 2.203 2.284 2.407 2.484 2.554 2.655 2.741 2.808 2.876 2.945 3.031 3.106 3.171 3.244 3.297 3.348 3.425 3.495 3.538 3.565 3.598 3.617 3.58 3.519 3.458 3.335 3.074 2.645 1.981 1.048 -0.385 -2.562 -6.078 -10.331 -13.773 -16.554 -18.961 -21.085 -22.815 -24.343 -25.678 -26.997 -28.112 -29.093 -30.005 -30.843 -31.583 -32.254 -32.966 -33.605 -34.17 -34.798 -35.466 -35.991 -36.535 -37.119 -37.581 -38.039 -38.51 -39.01 -39.529 -39.891 -40.261 -40.83 -41.205 -41.591 -41.804 -42.274 -42.731 -43.151 -43.371 -44.04 -44.13 -44.39 -44.667 -45.285 -45.625 -45.98 -46.36 -46.807 -47.35 -48.029 -51.023 -10 ,25959 ,KEBNE ,17027854,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:36:50 CET,0.0 0.743 1.121 1.328 1.466 1.6 1.734 1.86 2.091 2.186 2.288 2.083 2.549 2.623 2.746 2.899 3.058 3.137 3.292 3.422 3.614 3.731 3.833 3.974 4.102 4.229 4.355 4.463 4.587 4.692 4.797 4.924 5.03 5.124 5.233 5.339 5.417 5.504 5.575 5.583 5.59 5.597 5.545 5.475 5.35 5.077 4.623 3.916 2.708 0.696 -2.79 -7.143 -10.808 -13.919 -16.568 -18.824 -20.735 -22.446 -23.956 -25.517 -26.808 -27.882 -28.896 -29.841 -30.715 -31.488 -32.245 -32.913 -33.491 -34.079 -34.67 -35.155 -35.649 -36.161 -36.555 -36.956 -37.396 -37.855 -38.302 -38.594 -38.897 -39.375 -39.733 -40.126 -40.322 -40.729 -41.163 -41.624 -41.858 -42.513 -42.592 -42.867 -43.152 -43.762 -44.087 -44.404 -44.755 -45.176 -45.658 -46.24 -48.04 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index ea0f00e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10475 ,TETRA ,17616383,Mon Nov 29 10:56:29 CET,Mon Nov 29 13:25:23 CET,0.0 0.209 0.363 0.465 0.52 0.554 0.597 0.649 0.774 0.834 0.887 0.794 1.03 1.071 1.159 1.237 1.302 1.331 1.4 1.47 1.568 1.643 1.711 1.799 1.883 1.955 2.011 2.06 2.135 2.201 2.251 2.316 2.388 2.469 2.566 2.648 2.705 2.754 2.782 2.817 2.854 2.89 2.954 3.024 3.059 3.055 3.01 2.821 2.378 1.482 -0.217 -2.747 -5.143 -7.218 -9.037 -10.772 -12.26 -13.531 -14.735 -16.101 -17.236 -18.187 -19.11 -19.979 -20.821 -21.635 -22.469 -23.19 -23.824 -24.523 -25.252 -25.852 -26.521 -27.199 -27.714 -28.279 -28.829 -29.39 -30.03 -30.457 -30.888 -31.544 -31.975 -32.475 -32.748 -33.311 -33.954 -34.634 -34.974 -35.582 -36.132 -36.575 -37.058 -38.108 -38.703 -39.322 -40.004 -40.851 -41.84 -43.093 -48.788 -2 ,22525 ,TETRA ,17616384,Mon Nov 29 10:57:31 CET,Mon Nov 29 13:23:09 CET,0.0 0.17 0.265 0.352 0.413 0.467 0.525 0.592 0.719 0.773 0.829 0.731 0.97 1.013 1.099 1.178 1.255 1.292 1.349 1.409 1.486 1.527 1.573 1.642 1.711 1.773 1.83 1.889 1.959 2.027 2.091 2.149 2.203 2.267 2.347 2.433 2.51 2.583 2.648 2.68 2.699 2.731 2.735 2.705 2.648 2.529 2.315 1.894 1.15 -0.046 -2.29 -5.258 -7.778 -10.026 -12.107 -14.02 -15.71 -17.345 -18.841 -20.351 -21.706 -22.944 -24.105 -25.211 -26.254 -27.203 -28.226 -29.165 -29.973 -30.822 -31.688 -32.383 -33.097 -33.836 -34.435 -35.056 -35.698 -36.351 -37.045 -37.55 -38.089 -38.931 -39.492 -40.1 -40.419 -41.073 -41.741 -42.424 -42.8 -43.455 -44.067 -44.482 -44.859 -45.698 -46.198 -46.72 -47.314 -48.034 -48.923 -50.368 -57.622 -3 ,21943 ,TETRA ,17616385,Mon Nov 29 10:57:33 CET,Mon Nov 29 13:23:37 CET,0.0 0.074 0.156 0.234 0.299 0.364 0.415 0.47 0.595 0.654 0.714 0.612 0.851 0.887 0.957 1.026 1.099 1.131 1.199 1.276 1.384 1.443 1.495 1.58 1.661 1.73 1.798 1.863 1.957 2.048 2.122 2.206 2.3 2.4 2.498 2.588 2.669 2.741 2.79 2.823 2.875 2.95 3.029 3.074 3.063 2.99 2.761 2.419 1.718 0.201 -2.416 -5.923 -9.036 -11.55 -13.564 -15.34 -16.939 -18.37 -19.676 -21.137 -22.402 -23.492 -24.507 -25.486 -26.39 -27.202 -28.073 -28.868 -29.562 -30.259 -30.948 -31.52 -32.142 -32.808 -33.346 -33.884 -34.411 -34.968 -35.541 -35.915 -36.303 -36.972 -37.453 -37.921 -38.168 -38.724 -39.286 -39.817 -40.099 -40.662 -41.152 -41.56 -41.967 -42.816 -43.357 -43.991 -44.599 -45.322 -46.346 -47.727 -52.615 -4 ,22301 ,TETRA ,17616386,Mon Nov 29 10:57:31 CET,Mon Nov 29 13:23:14 CET,0.0 0.564 0.698 0.809 0.909 1.005 1.085 1.148 1.281 1.348 1.397 1.288 1.543 1.59 1.672 1.742 1.813 1.85 1.937 2.011 2.102 2.166 2.232 2.325 2.407 2.486 2.555 2.622 2.703 2.778 2.861 2.964 3.055 3.131 3.224 3.327 3.41 3.49 3.573 3.653 3.715 3.787 3.846 3.855 3.835 3.792 3.691 3.449 2.904 1.861 0.142 -2.103 -4.426 -6.661 -8.554 -10.246 -11.698 -13.041 -14.293 -15.55 -16.65 -17.621 -18.503 -19.376 -20.231 -20.991 -21.783 -22.467 -23.027 -23.618 -24.252 -24.8 -25.396 -26.052 -26.57 -27.116 -27.663 -28.223 -28.852 -29.283 -29.688 -30.307 -30.759 -31.24 -31.483 -31.963 -32.497 -33.138 -33.486 -34.06 -34.551 -34.955 -35.361 -36.295 -36.833 -37.456 -38.151 -38.931 -39.832 -41.173 -46.788 -5 ,10740 ,TETRA ,17616387,Mon Nov 29 10:57:32 CET,Mon Nov 29 13:22:45 CET,0.0 0.152 0.246 0.314 0.383 0.468 0.545 0.612 0.733 0.782 0.833 0.746 0.981 1.03 1.122 1.204 1.286 1.326 1.395 1.462 1.581 1.652 1.712 1.798 1.89 1.98 2.075 2.163 2.253 2.335 2.405 2.476 2.529 2.582 2.655 2.743 2.825 2.908 3.005 3.105 3.187 3.258 3.302 3.289 3.248 3.168 2.97 2.59 1.913 0.709 -1.543 -4.428 -6.906 -9.165 -11.235 -13.197 -15.006 -16.651 -18.027 -19.407 -20.617 -21.7 -22.767 -23.803 -24.749 -25.63 -26.582 -27.402 -28.096 -28.821 -29.551 -30.158 -30.781 -31.416 -31.902 -32.45 -33.065 -33.737 -34.428 -34.886 -35.352 -36.024 -36.457 -36.911 -37.166 -37.694 -38.233 -38.808 -39.104 -39.666 -40.177 -40.555 -40.914 -41.69 -42.168 -42.767 -43.382 -44.121 -45.113 -46.38 -51.129 -6 ,164 ,TETRA ,17616388,Mon Nov 29 10:57:32 CET,Mon Nov 29 13:23:17 CET,0.0 0.403 0.523 0.609 0.687 0.746 0.803 0.846 0.926 0.972 1.016 0.893 1.126 1.159 1.206 1.265 1.336 1.367 1.424 1.47 1.536 1.584 1.633 1.699 1.753 1.805 1.868 1.927 2.003 2.072 2.118 2.179 2.258 2.334 2.412 2.494 2.558 2.622 2.682 2.749 2.802 2.81 2.824 2.804 2.681 2.499 2.235 1.836 1.247 0.042 -2.491 -5.496 -7.859 -9.998 -11.94 -13.756 -15.366 -16.849 -18.218 -19.668 -20.875 -21.963 -23.008 -23.963 -24.812 -25.55 -26.358 -27.133 -27.826 -28.516 -29.203 -29.781 -30.387 -31.003 -31.474 -31.978 -32.531 -33.112 -33.691 -34.076 -34.496 -35.198 -35.664 -36.171 -36.467 -37.096 -37.711 -38.298 -38.61 -39.174 -39.591 -39.963 -40.376 -41.322 -41.903 -42.551 -43.197 -43.914 -44.897 -46.471 -51.672 -7 ,13404 ,TETRA ,17616389,Mon Nov 29 10:57:34 CET,Mon Nov 29 13:23:02 CET,0.0 0.116 0.192 0.278 0.344 0.418 0.484 0.526 0.621 0.666 0.705 0.576 0.803 0.838 0.899 0.961 1.029 1.059 1.115 1.16 1.225 1.265 1.307 1.372 1.443 1.509 1.558 1.607 1.669 1.735 1.795 1.857 1.929 2.004 2.085 2.165 2.229 2.28 2.348 2.401 2.409 2.391 2.359 2.31 2.195 1.999 1.671 1.173 0.385 -0.798 -3.025 -6.137 -8.853 -11.263 -13.411 -15.338 -17.064 -18.59 -19.912 -21.292 -22.507 -23.661 -24.783 -25.849 -26.826 -27.66 -28.511 -29.278 -29.961 -30.677 -31.4 -31.989 -32.596 -33.229 -33.726 -34.249 -34.783 -35.311 -35.853 -36.229 -36.646 -37.319 -37.779 -38.294 -38.574 -39.181 -39.84 -40.492 -40.801 -41.381 -41.913 -42.342 -42.784 -43.755 -44.305 -44.886 -45.536 -46.294 -47.328 -48.834 -54.583 -8 ,28826 ,TETRA ,17616390,Mon Nov 29 11:00:30 CET,Mon Nov 29 13:28:19 CET,0.0 0.25 0.376 0.461 0.515 0.584 0.659 0.718 0.816 0.863 0.91 0.788 1.024 1.061 1.126 1.188 1.255 1.293 1.358 1.414 1.491 1.534 1.587 1.658 1.726 1.805 1.884 1.953 2.034 2.122 2.212 2.309 2.406 2.501 2.591 2.686 2.785 2.907 3.025 3.114 3.199 3.288 3.346 3.394 3.432 3.342 3.14 2.922 2.542 1.705 -0.159 -2.735 -4.951 -7.044 -8.874 -10.541 -12.084 -13.528 -14.866 -16.24 -17.43 -18.501 -19.509 -20.502 -21.506 -22.458 -23.464 -24.282 -24.92 -25.606 -26.364 -27.032 -27.735 -28.419 -28.925 -29.448 -30.007 -30.606 -31.243 -31.696 -32.175 -32.908 -33.424 -33.985 -34.263 -34.831 -35.446 -36.09 -36.457 -37.119 -37.775 -38.252 -38.751 -39.723 -40.24 -40.849 -41.517 -42.272 -43.271 -44.696 -49.874 -9 ,28466 ,TETRA ,17616391,Mon Nov 29 11:00:31 CET,Mon Nov 29 13:27:50 CET,0.0 0.183 0.327 0.407 0.481 0.556 0.61 0.654 0.751 0.802 0.852 0.769 1.019 1.067 1.157 1.232 1.295 1.327 1.386 1.429 1.486 1.537 1.588 1.65 1.713 1.773 1.816 1.866 1.946 2.013 2.067 2.131 2.193 2.249 2.309 2.387 2.481 2.597 2.698 2.76 2.823 2.871 2.885 2.893 2.87 2.76 2.545 2.184 1.488 0.258 -1.722 -4.434 -7.089 -9.4 -11.317 -12.97 -14.47 -15.853 -17.028 -18.211 -19.274 -20.236 -21.142 -22.021 -22.865 -23.636 -24.457 -25.22 -25.906 -26.622 -27.384 -28.034 -28.681 -29.352 -29.911 -30.534 -31.189 -31.873 -32.605 -33.119 -33.647 -34.437 -35.001 -35.61 -35.911 -36.5 -37.143 -37.873 -38.262 -38.898 -39.494 -39.958 -40.465 -41.594 -42.223 -42.898 -43.661 -44.513 -45.584 -47.065 -55.413 -10 ,19335 ,TETRA ,17616392,Mon Nov 29 11:12:31 CET,Mon Nov 29 13:30:00 CET,0.0 0.117 0.215 0.334 0.428 0.5 0.557 0.604 0.723 0.791 0.847 0.768 1.021 1.066 1.153 1.252 1.349 1.393 1.486 1.567 1.676 1.739 1.794 1.88 1.956 2.024 2.099 2.178 2.288 2.382 2.448 2.532 2.617 2.691 2.79 2.895 2.974 3.038 3.073 3.101 3.129 3.146 3.134 3.092 3.032 2.896 2.608 2.19 1.557 0.448 -1.773 -4.588 -7.319 -9.798 -12.001 -13.998 -15.777 -17.527 -19.043 -20.578 -21.923 -23.142 -24.289 -25.372 -26.391 -27.301 -28.248 -29.112 -29.86 -30.619 -31.417 -32.104 -32.809 -33.526 -34.09 -34.682 -35.276 -35.885 -36.544 -37.017 -37.506 -38.231 -38.747 -39.292 -39.569 -40.151 -40.74 -41.384 -41.727 -42.308 -42.775 -43.131 -43.497 -44.402 -44.961 -45.618 -46.384 -47.292 -48.445 -50.063 -57.652 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index bc4ebe71..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1142 ,TETRA ,17616393,Mon Nov 29 11:15:33 CET,Mon Nov 29 13:36:19 CET,0.0 0.332 0.523 0.671 0.805 0.915 1.019 1.13 1.359 1.458 1.545 1.513 1.787 1.861 2.02 2.172 2.315 2.39 2.553 2.706 2.9 3.019 3.139 3.331 3.526 3.705 3.88 4.061 4.263 4.45 4.657 4.905 5.142 5.382 5.657 5.955 6.252 6.561 6.881 7.228 7.59 8.001 8.48 8.978 9.517 10.083 10.69 11.209 11.656 12.017 12.223 11.722 10.732 9.797 9.093 8.388 7.662 6.941 6.293 5.61 4.965 4.393 3.848 3.327 2.833 2.361 1.873 1.457 1.092 0.702 0.285 -0.081 -0.446 -0.824 -1.136 -1.463 -1.788 -2.156 -2.551 -2.81 -3.11 -3.608 -3.944 -4.263 -4.422 -4.748 -5.079 -5.441 -5.645 -6.067 -6.357 -6.616 -6.886 -7.527 -7.905 -8.288 -8.683 -9.173 -9.745 -10.453 -13.703 -2 ,13243 ,TETRA ,17616394,Mon Nov 29 11:16:31 CET,Mon Nov 29 13:37:45 CET,0.0 0.297 0.475 0.62 0.745 0.867 0.978 1.081 1.277 1.374 1.463 1.432 1.715 1.799 1.948 2.089 2.22 2.284 2.42 2.554 2.75 2.872 2.989 3.164 3.323 3.475 3.624 3.76 3.948 4.144 4.333 4.56 4.775 4.982 5.223 5.491 5.756 6.034 6.319 6.642 6.997 7.381 7.815 8.241 8.738 9.328 9.94 10.495 11.092 11.732 12.135 11.783 10.894 10.102 9.433 8.664 7.946 7.259 6.639 5.975 5.37 4.822 4.274 3.754 3.28 2.853 2.394 1.985 1.646 1.296 0.916 0.596 0.252 -0.122 -0.403 -0.681 -1.004 -1.373 -1.748 -2.009 -2.288 -2.722 -3.002 -3.297 -3.454 -3.753 -4.066 -4.418 -4.601 -5.002 -5.283 -5.552 -5.802 -6.311 -6.587 -6.888 -7.258 -7.727 -8.361 -9.249 -12.699 -3 ,6476 ,TETRA ,17616395,Mon Nov 29 11:16:33 CET,Mon Nov 29 13:36:37 CET,0.0 0.723 0.929 1.088 1.231 1.358 1.488 1.615 1.82 1.919 2.02 1.984 2.27 2.367 2.566 2.74 2.89 2.957 3.085 3.205 3.393 3.516 3.627 3.792 3.963 4.14 4.319 4.509 4.74 4.945 5.151 5.385 5.6 5.798 6.035 6.309 6.579 6.881 7.203 7.527 7.833 8.155 8.524 8.928 9.405 9.88 10.401 10.907 11.348 11.691 11.755 11.422 10.627 9.671 8.82 7.971 7.141 6.397 5.752 5.055 4.485 3.976 3.405 2.861 2.386 1.964 1.546 1.124 0.732 0.314 -0.143 -0.506 -0.865 -1.235 -1.533 -1.864 -2.23 -2.582 -2.929 -3.178 -3.443 -3.867 -4.168 -4.481 -4.636 -4.946 -5.27 -5.648 -5.86 -6.285 -6.525 -6.739 -6.973 -7.522 -7.84 -8.194 -8.643 -9.169 -9.724 -10.548 -13.913 -4 ,23475 ,TETRA ,17616396,Mon Nov 29 11:22:32 CET,Mon Nov 29 13:54:02 CET,0.0 0.297 0.458 0.632 0.787 0.91 1.048 1.171 1.373 1.474 1.567 1.549 1.835 1.924 2.09 2.247 2.399 2.48 2.645 2.798 3.013 3.144 3.268 3.46 3.658 3.858 4.051 4.224 4.444 4.664 4.874 5.138 5.396 5.63 5.912 6.245 6.552 6.874 7.235 7.634 8.05 8.533 9.065 9.538 10.074 10.675 11.339 12.092 13.003 13.977 14.624 14.365 13.655 12.829 12.061 11.346 10.717 10.123 9.561 8.923 8.318 7.774 7.246 6.669 6.132 5.686 5.197 4.717 4.302 3.903 3.486 3.126 2.75 2.363 2.051 1.719 1.364 0.977 0.567 0.289 0.018 -0.461 -0.855 -1.266 -1.474 -1.883 -2.315 -2.758 -2.972 -3.401 -3.739 -4.029 -4.321 -4.953 -5.303 -5.698 -6.134 -6.61 -7.241 -8.106 -10.271 -5 ,12612 ,TETRA ,17616397,Mon Nov 29 11:22:34 CET,Mon Nov 29 13:54:03 CET,0.0 0.355 0.511 0.649 0.783 0.893 0.995 1.091 1.248 1.325 1.401 1.364 1.636 1.702 1.835 1.969 2.097 2.163 2.301 2.439 2.63 2.753 2.876 3.069 3.259 3.428 3.595 3.749 3.947 4.145 4.327 4.543 4.761 4.984 5.221 5.476 5.732 6.004 6.306 6.625 6.93 7.283 7.718 8.167 8.705 9.318 10.061 10.912 11.779 12.619 13.32 13.375 13.09 12.554 11.879 11.174 10.502 9.884 9.244 8.523 7.907 7.391 6.896 6.392 5.914 5.478 5.012 4.579 4.195 3.779 3.331 2.949 2.532 2.095 1.759 1.407 1.064 0.695 0.273 -0.011 -0.305 -0.752 -1.041 -1.328 -1.489 -1.888 -2.31 -2.756 -3.0 -3.434 -3.716 -3.983 -4.247 -4.817 -5.173 -5.597 -6.109 -6.694 -7.33 -8.149 -11.421 -6 ,19703 ,TETRA ,17616398,Mon Nov 29 11:22:33 CET,Mon Nov 29 13:57:12 CET,0.0 0.241 0.468 0.654 0.81 0.96 1.095 1.204 1.377 1.476 1.58 1.571 1.86 1.952 2.12 2.275 2.429 2.504 2.654 2.797 3.012 3.153 3.284 3.474 3.66 3.84 4.01 4.182 4.407 4.621 4.837 5.088 5.322 5.56 5.833 6.139 6.44 6.753 7.085 7.451 7.824 8.222 8.686 9.149 9.693 10.343 11.059 11.777 12.53 13.224 13.621 13.232 12.549 11.852 11.177 10.432 9.662 8.906 8.258 7.61 6.995 6.412 5.894 5.412 4.907 4.42 3.902 3.423 3.003 2.575 2.134 1.737 1.303 0.862 0.531 0.192 -0.173 -0.549 -0.935 -1.21 -1.514 -1.976 -2.285 -2.634 -2.816 -3.187 -3.577 -3.997 -4.226 -4.663 -4.935 -5.229 -5.546 -6.182 -6.543 -6.996 -7.599 -8.318 -9.183 -10.331 -17.295 -7 ,8351 ,TETRA ,17616399,Mon Nov 29 11:23:32 CET,Mon Nov 29 13:54:42 CET,0.0 0.438 0.673 0.88 1.047 1.186 1.305 1.417 1.649 1.761 1.859 1.837 2.113 2.203 2.368 2.522 2.665 2.739 2.899 3.042 3.23 3.353 3.481 3.683 3.878 4.062 4.241 4.414 4.645 4.876 5.103 5.376 5.634 5.876 6.149 6.477 6.797 7.116 7.472 7.877 8.309 8.789 9.337 9.863 10.467 11.15 11.913 12.768 13.68 14.5 15.28 15.581 15.292 14.783 14.186 13.567 12.888 12.262 11.706 11.095 10.545 9.98 9.424 8.95 8.523 8.115 7.692 7.312 6.993 6.655 6.272 5.954 5.619 5.243 4.955 4.687 4.386 4.071 3.76 3.518 3.259 2.852 2.574 2.288 2.124 1.779 1.395 0.983 0.767 0.342 0.089 -0.187 -0.475 -1.059 -1.392 -1.741 -2.136 -2.651 -3.342 -4.268 -7.005 -8 ,13884 ,TETRA ,17616400,Mon Nov 29 11:24:34 CET,Mon Nov 29 13:37:06 CET,0.0 0.226 0.389 0.502 0.604 0.712 0.813 0.909 1.088 1.169 1.253 1.213 1.489 1.57 1.744 1.899 2.025 2.097 2.255 2.399 2.605 2.746 2.882 3.069 3.241 3.402 3.57 3.735 3.935 4.118 4.305 4.544 4.782 5.007 5.263 5.539 5.806 6.127 6.476 6.844 7.234 7.679 8.211 8.758 9.354 9.988 10.72 11.578 12.551 13.419 13.782 13.387 12.749 11.899 10.946 10.089 9.331 8.613 7.986 7.32 6.721 6.163 5.616 5.07 4.516 4.009 3.506 3.06 2.679 2.306 1.914 1.554 1.161 0.746 0.407 0.043 -0.329 -0.717 -1.131 -1.417 -1.71 -2.186 -2.536 -2.909 -3.093 -3.469 -3.909 -4.395 -4.613 -5.033 -5.341 -5.588 -5.827 -6.304 -6.593 -6.937 -7.328 -7.856 -8.636 -9.641 -14.255 -9 ,6573 ,TETRA ,17616401,Mon Nov 29 11:28:33 CET,Mon Nov 29 14:00:45 CET,0.0 0.154 0.272 0.423 0.573 0.702 0.829 0.954 1.184 1.284 1.385 1.378 1.666 1.744 1.893 2.05 2.211 2.288 2.431 2.564 2.774 2.908 3.026 3.207 3.38 3.541 3.692 3.832 4.024 4.221 4.403 4.633 4.857 5.064 5.301 5.57 5.831 6.11 6.389 6.675 6.962 7.304 7.764 8.182 8.643 9.142 9.697 10.281 10.835 11.319 11.476 11.076 10.358 9.543 8.767 7.983 7.223 6.496 5.82 5.117 4.498 3.921 3.346 2.793 2.292 1.844 1.373 0.936 0.55 0.18 -0.188 -0.531 -0.912 -1.302 -1.6 -1.9 -2.218 -2.546 -2.882 -3.111 -3.351 -3.75 -4.038 -4.331 -4.482 -4.786 -5.082 -5.427 -5.613 -6.003 -6.218 -6.432 -6.671 -7.244 -7.595 -7.988 -8.349 -8.747 -9.274 -10.11 -13.489 -10 ,8504 ,TETRA ,17616402,Mon Nov 29 11:28:35 CET,Mon Nov 29 14:00:55 CET,0.0 0.796 0.97 1.106 1.24 1.363 1.485 1.601 1.789 1.875 1.962 1.934 2.21 2.304 2.495 2.656 2.808 2.883 3.017 3.151 3.362 3.505 3.64 3.835 4.021 4.206 4.403 4.589 4.823 5.057 5.271 5.525 5.784 6.031 6.318 6.654 6.985 7.333 7.712 8.132 8.574 9.087 9.685 10.276 10.959 11.703 12.535 13.415 14.345 15.401 16.28 16.451 16.343 15.821 15.147 14.487 13.799 13.075 12.413 11.722 11.08 10.488 9.925 9.407 8.885 8.393 7.902 7.449 7.055 6.662 6.255 5.884 5.46 5.002 4.659 4.291 3.905 3.517 3.116 2.844 2.551 2.121 1.841 1.556 1.408 1.088 0.728 0.308 0.083 -0.34 -0.635 -0.915 -1.214 -1.971 -2.412 -2.844 -3.265 -3.697 -4.259 -5.131 -8.323 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 90cf15ad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,7910 ,TETRA ,17616405,Mon Nov 29 11:31:36 CET,Mon Nov 29 13:28:45 CET,0.0 0.206 0.395 0.557 0.736 0.932 1.098 1.253 1.544 1.672 1.792 1.837 2.219 2.356 2.591 2.815 3.043 3.152 3.366 3.578 3.883 4.091 4.318 4.67 5.023 5.377 5.716 6.048 6.494 6.935 7.376 7.914 8.449 8.965 9.54 10.195 10.828 11.523 12.285 13.135 14.032 15.061 16.317 17.556 19.027 20.736 22.725 24.947 27.511 30.398 33.537 35.955 37.211 37.813 38.063 38.16 38.14 37.981 37.787 37.553 37.296 37.035 36.769 36.488 36.219 35.938 35.62 35.349 35.104 34.837 34.565 34.346 34.11 33.83 33.586 33.34 33.089 32.824 32.568 32.394 32.21 31.909 31.695 31.454 31.326 31.063 30.748 30.43 30.263 29.887 29.693 29.502 29.285 28.742 28.415 28.003 27.556 27.114 26.488 25.594 16.415 -4 ,16709 ,TETRA ,17616406,Mon Nov 29 11:31:36 CET,Mon Nov 29 13:27:52 CET,0.0 0.581 0.819 1.017 1.209 1.379 1.54 1.693 1.996 2.149 2.297 2.363 2.733 2.875 3.151 3.413 3.683 3.81 4.053 4.295 4.638 4.859 5.078 5.402 5.726 6.055 6.376 6.679 7.077 7.484 7.879 8.385 8.893 9.366 9.928 10.586 11.226 11.94 12.728 13.584 14.482 15.482 16.68 17.905 19.283 20.806 22.623 24.732 27.226 30.141 33.387 35.776 36.988 37.516 37.641 37.581 37.379 37.113 36.838 36.512 36.175 35.847 35.551 35.262 34.984 34.71 34.421 34.143 33.886 33.66 33.405 33.162 32.918 32.68 32.477 32.232 31.974 31.696 31.405 31.23 31.041 30.726 30.492 30.238 30.117 29.856 29.555 29.214 29.023 28.634 28.419 28.221 27.986 27.325 26.928 26.505 26.071 25.643 25.148 24.352 17.677 -6 ,2078 ,TETRA ,17616408,Mon Nov 29 11:31:36 CET,Mon Nov 29 13:28:04 CET,0.0 0.828 1.097 1.307 1.485 1.65 1.796 1.941 2.225 2.358 2.493 2.546 2.912 3.038 3.293 3.554 3.807 3.932 4.195 4.454 4.806 5.031 5.263 5.601 5.913 6.215 6.533 6.869 7.305 7.72 8.125 8.626 9.105 9.578 10.149 10.814 11.464 12.18 12.974 13.816 14.725 15.77 17.004 18.287 19.763 21.446 23.432 25.731 28.512 31.72 35.304 37.563 38.452 38.83 38.936 38.852 38.727 38.554 38.278 37.924 37.655 37.443 37.205 36.944 36.654 36.356 36.015 35.679 35.379 35.082 34.778 34.527 34.264 33.979 33.766 33.542 33.306 33.018 32.691 32.495 32.287 31.912 31.659 31.392 31.257 30.953 30.627 30.31 30.139 29.753 29.537 29.32 29.077 28.527 28.204 27.811 27.408 26.945 26.304 25.37 16.032 -7 ,26460 ,TETRA ,17616409,Mon Nov 29 11:41:30 CET,Mon Nov 29 13:57:04 CET,0.0 0.562 0.801 1.054 1.289 1.473 1.623 1.773 2.082 2.227 2.369 2.43 2.803 2.947 3.226 3.498 3.769 3.898 4.133 4.365 4.716 4.943 5.168 5.5 5.83 6.158 6.478 6.79 7.208 7.631 8.039 8.529 9.017 9.5 10.076 10.732 11.367 12.078 12.841 13.696 14.611 15.631 16.83 18.062 19.56 21.168 22.993 25.244 27.993 31.087 34.702 37.421 38.765 39.325 39.489 39.552 39.514 39.336 39.072 38.771 38.477 38.17 37.863 37.551 37.247 36.969 36.67 36.401 36.16 35.909 35.658 35.42 35.145 34.855 34.628 34.394 34.151 33.878 33.559 33.34 33.109 32.77 32.56 32.323 32.197 31.93 31.618 31.264 31.067 30.678 30.45 30.247 30.032 29.461 29.15 28.84 28.449 28.001 27.455 26.587 20.794 -9 ,19482 ,TETRA ,17616411,Mon Nov 29 11:42:29 CET,Mon Nov 29 13:53:02 CET,0.0 0.387 0.635 0.825 0.998 1.177 1.351 1.499 1.787 1.937 2.084 2.128 2.5 2.636 2.912 3.189 3.451 3.576 3.824 4.057 4.398 4.629 4.865 5.199 5.525 5.854 6.167 6.475 6.889 7.278 7.661 8.162 8.666 9.141 9.689 10.321 10.953 11.68 12.487 13.32 14.181 15.199 16.454 17.755 19.298 21.038 23.095 25.477 28.165 31.137 34.402 36.548 37.408 37.709 37.743 37.611 37.381 37.075 36.736 36.405 36.106 35.815 35.505 35.189 34.889 34.612 34.322 34.065 33.825 33.546 33.254 33.021 32.776 32.512 32.314 32.086 31.831 31.569 31.27 31.057 30.852 30.532 30.295 30.043 29.919 29.659 29.329 28.979 28.806 28.43 28.196 27.969 27.713 27.127 26.837 26.507 26.169 25.772 25.07 24.012 17.557 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt deleted file mode 100644 index 245f6bf6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,9559 ,TETRA ,17616414,Mon Nov 29 11:42:31 CET,Mon Nov 29 14:03:16 CET,0.0 2.854 3.212 3.49 3.741 3.963 4.165 4.34 4.688 4.857 5.003 5.033 5.375 5.49 5.72 5.942 6.155 6.256 6.453 6.637 6.874 7.024 7.169 7.389 7.598 7.78 7.98 8.182 8.41 8.622 8.824 9.067 9.304 9.536 9.793 10.072 10.341 10.628 10.954 11.333 11.719 12.109 12.502 12.879 13.287 13.688 14.068 14.334 14.443 13.978 12.292 9.489 6.792 4.374 2.186 0.247 -1.412 -2.908 -4.176 -5.487 -6.614 -7.583 -8.473 -9.27 -10.005 -10.692 -11.457 -12.129 -12.668 -13.221 -13.815 -14.305 -14.786 -15.279 -15.662 -16.056 -16.473 -16.918 -17.373 -17.683 -18.007 -18.478 -18.791 -19.128 -19.296 -19.637 -20.0 -20.391 -20.59 -21.054 -21.243 -21.473 -21.703 -22.177 -22.444 -22.743 -23.057 -23.39 -23.77 -24.292 -27.497 -3 ,18523 ,TETRA ,17616415,Mon Nov 29 11:44:32 CET,Mon Nov 29 14:02:01 CET,0.0 1.215 1.498 1.71 1.865 2.015 2.175 2.322 2.582 2.707 2.822 2.832 3.177 3.278 3.487 3.694 3.878 3.965 4.139 4.295 4.514 4.658 4.794 4.997 5.21 5.441 5.659 5.848 6.079 6.3 6.519 6.787 7.025 7.252 7.505 7.777 8.027 8.323 8.671 8.986 9.305 9.665 10.063 10.411 10.762 11.107 11.375 11.512 11.361 10.628 8.725 5.785 2.926 0.368 -1.804 -3.77 -5.506 -7.029 -8.273 -9.531 -10.642 -11.616 -12.462 -13.224 -13.969 -14.685 -15.44 -16.075 -16.618 -17.201 -17.809 -18.287 -18.774 -19.281 -19.673 -20.071 -20.464 -20.872 -21.333 -21.652 -21.956 -22.422 -22.739 -23.05 -23.202 -23.533 -23.895 -24.294 -24.508 -24.971 -25.164 -25.399 -25.659 -26.197 -26.472 -26.771 -27.083 -27.403 -27.801 -28.34 -29.807 -4 ,18762 ,TETRA ,17616416,Mon Nov 29 11:45:34 CET,Mon Nov 29 14:03:24 CET,0.0 2.079 2.398 2.633 2.808 2.966 3.121 3.26 3.52 3.645 3.757 3.734 4.066 4.17 4.36 4.545 4.727 4.806 4.967 5.114 5.316 5.456 5.601 5.81 5.991 6.171 6.367 6.571 6.838 7.062 7.242 7.46 7.708 7.974 8.249 8.517 8.779 9.049 9.315 9.578 9.836 10.116 10.414 10.683 10.946 11.173 11.354 11.403 11.407 10.875 8.917 6.076 3.492 1.16 -1.004 -3.016 -4.786 -6.344 -7.608 -8.899 -10.02 -11.027 -11.953 -12.781 -13.587 -14.308 -15.078 -15.795 -16.392 -16.994 -17.584 -18.053 -18.542 -19.056 -19.464 -19.878 -20.288 -20.722 -21.18 -21.499 -21.823 -22.298 -22.618 -22.956 -23.122 -23.449 -23.813 -24.181 -24.375 -24.849 -25.058 -25.296 -25.539 -26.038 -26.303 -26.597 -26.882 -27.165 -27.518 -28.033 -32.43 -5 ,27420 ,TETRA ,17616417,Mon Nov 29 11:45:34 CET,Mon Nov 29 14:04:22 CET,0.0 1.122 1.515 1.773 1.998 2.201 2.402 2.593 2.881 2.994 3.116 3.121 3.452 3.556 3.769 3.974 4.157 4.246 4.424 4.609 4.874 5.038 5.2 5.431 5.674 5.911 6.115 6.302 6.528 6.748 6.973 7.224 7.485 7.758 8.094 8.457 8.762 9.056 9.348 9.678 10.049 10.462 10.894 11.285 11.667 11.955 12.258 12.509 12.393 11.686 9.716 6.618 3.783 1.187 -1.12 -3.169 -4.893 -6.422 -7.711 -9.042 -10.176 -11.136 -12.018 -12.832 -13.621 -14.341 -15.085 -15.747 -16.311 -16.89 -17.494 -18.008 -18.511 -19.014 -19.409 -19.816 -20.248 -20.682 -21.113 -21.391 -21.682 -22.153 -22.475 -22.803 -22.988 -23.361 -23.728 -24.139 -24.348 -24.803 -24.93 -25.141 -25.384 -25.947 -26.239 -26.554 -26.925 -27.352 -27.881 -28.618 -31.898 -6 ,14840 ,TETRA ,17616418,Mon Nov 29 11:45:34 CET,Mon Nov 29 14:03:15 CET,0.0 3.791 4.218 4.552 4.819 5.037 5.222 5.399 5.727 5.88 6.017 6.006 6.35 6.468 6.693 6.902 7.091 7.184 7.369 7.539 7.777 7.932 8.092 8.317 8.508 8.694 8.89 9.06 9.228 9.398 9.607 9.88 10.115 10.333 10.578 10.837 11.113 11.398 11.689 11.991 12.264 12.54 12.838 13.132 13.428 13.654 13.741 13.678 13.448 12.683 10.41 6.643 3.171 0.334 -2.082 -4.224 -6.029 -7.597 -8.91 -10.213 -11.312 -12.288 -13.219 -14.106 -14.93 -15.648 -16.377 -17.041 -17.612 -18.188 -18.782 -19.273 -19.771 -20.283 -20.66 -21.041 -21.448 -21.862 -22.308 -22.629 -22.956 -23.465 -23.808 -24.144 -24.326 -24.714 -25.084 -25.479 -25.701 -26.177 -26.38 -26.624 -26.886 -27.457 -27.773 -28.104 -28.437 -28.776 -29.223 -29.888 -33.011 -7 ,28504 ,TETRA ,17616419,Mon Nov 29 11:46:33 CET,Mon Nov 29 14:05:47 CET,0.0 1.075 1.393 1.63 1.846 2.059 2.267 2.449 2.77 2.923 3.071 3.109 3.469 3.582 3.792 3.983 4.159 4.247 4.414 4.574 4.831 5.005 5.144 5.335 5.545 5.734 5.908 6.086 6.302 6.504 6.706 6.943 7.19 7.445 7.72 7.998 8.27 8.586 8.906 9.186 9.45 9.782 10.154 10.455 10.761 11.053 11.265 11.367 11.26 10.768 8.931 5.343 2.24 -0.376 -2.692 -4.751 -6.451 -7.899 -9.128 -10.397 -11.523 -12.539 -13.475 -14.313 -15.1 -15.818 -16.561 -17.208 -17.768 -18.37 -18.979 -19.463 -19.963 -20.457 -20.829 -21.236 -21.693 -22.164 -22.619 -22.937 -23.266 -23.755 -24.092 -24.462 -24.645 -25.012 -25.407 -25.813 -26.025 -26.488 -26.645 -26.864 -27.104 -27.61 -27.893 -28.211 -28.551 -28.949 -29.426 -29.984 -36.22 -8 ,13519 ,TETRA ,17616420,Mon Nov 29 11:46:31 CET,Mon Nov 29 14:03:18 CET,0.0 1.19 1.512 1.743 1.932 2.083 2.212 2.332 2.572 2.693 2.815 2.813 3.152 3.263 3.488 3.685 3.85 3.934 4.105 4.267 4.501 4.658 4.807 5.042 5.276 5.489 5.686 5.874 6.109 6.336 6.556 6.836 7.122 7.369 7.656 7.995 8.291 8.593 8.901 9.198 9.503 9.845 10.193 10.502 10.808 11.11 11.322 11.425 11.376 10.743 8.802 5.665 2.815 0.372 -1.774 -3.717 -5.407 -6.855 -8.127 -9.401 -10.447 -11.401 -12.328 -13.198 -14.003 -14.729 -15.449 -16.105 -16.683 -17.239 -17.784 -18.223 -18.686 -19.232 -19.679 -20.127 -20.577 -21.018 -21.474 -21.781 -22.084 -22.556 -22.891 -23.234 -23.401 -23.731 -24.078 -24.45 -24.646 -25.113 -25.287 -25.518 -25.768 -26.289 -26.572 -26.886 -27.222 -27.594 -28.012 -28.465 -37.884 -9 ,16379 ,TETRA ,17616421,Mon Nov 29 11:47:32 CET,Mon Nov 29 14:03:07 CET,0.0 1.666 2.102 2.364 2.535 2.708 2.889 3.062 3.363 3.498 3.623 3.637 3.976 4.068 4.262 4.488 4.712 4.815 5.022 5.219 5.489 5.683 5.868 6.13 6.396 6.63 6.841 7.041 7.307 7.554 7.787 8.08 8.356 8.596 8.891 9.248 9.554 9.857 10.173 10.515 10.855 11.206 11.573 11.901 12.296 12.718 13.046 13.173 13.13 12.457 9.926 6.301 3.249 0.625 -1.663 -3.685 -5.418 -6.932 -8.228 -9.527 -10.618 -11.588 -12.5 -13.377 -14.186 -14.9 -15.662 -16.356 -16.929 -17.518 -18.139 -18.634 -19.145 -19.683 -20.115 -20.558 -21.006 -21.485 -21.983 -22.327 -22.661 -23.176 -23.535 -23.884 -24.071 -24.478 -24.885 -25.308 -25.523 -25.991 -26.206 -26.448 -26.713 -27.378 -27.758 -28.128 -28.497 -28.925 -29.466 -30.097 -39.889 -10 ,23912 ,TETRA ,17616422,Mon Nov 29 11:47:30 CET,Mon Nov 29 14:08:26 CET,0.0 0.936 1.268 1.549 1.762 1.94 2.094 2.24 2.518 2.651 2.775 2.778 3.104 3.199 3.392 3.577 3.763 3.856 4.05 4.248 4.504 4.669 4.84 5.073 5.28 5.479 5.666 5.83 6.033 6.228 6.434 6.694 6.916 7.113 7.33 7.581 7.844 8.13 8.431 8.73 9.029 9.345 9.661 10.029 10.43 10.72 10.936 10.965 10.741 10.129 8.432 5.654 3.049 0.721 -1.327 -3.176 -4.777 -6.262 -7.594 -8.875 -9.936 -10.886 -11.781 -12.589 -13.34 -14.025 -14.711 -15.325 -15.852 -16.384 -16.954 -17.449 -17.948 -18.437 -18.828 -19.228 -19.606 -19.995 -20.411 -20.697 -20.991 -21.464 -21.795 -22.122 -22.296 -22.668 -23.104 -23.601 -23.865 -24.424 -24.79 -25.088 -25.363 -25.946 -26.269 -26.638 -27.044 -27.498 -28.032 -28.67 -31.251 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt deleted file mode 100644 index 114171f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13814 ,TETRA ,17616423,Mon Nov 29 11:47:30 CET,Mon Nov 29 14:05:54 CET,0.0 2.01 2.46 2.773 3.039 3.251 3.421 3.565 3.848 3.982 4.068 3.956 4.234 4.299 4.427 4.537 4.633 4.666 4.714 4.761 4.795 4.804 4.818 4.847 4.872 4.854 4.776 4.671 4.523 4.375 4.248 4.096 3.925 3.73 3.481 3.17 2.832 2.421 1.924 1.381 0.754 -0.049 -1.067 -2.202 -3.698 -5.617 -8.217 -11.573 -16.062 -22.289 -31.583 -41.651 -49.169 -54.977 -59.534 -63.444 -66.776 -69.625 -71.999 -74.26 -76.099 -77.714 -79.229 -80.612 -81.866 -82.984 -84.114 -85.088 -85.927 -86.77 -87.584 -88.252 -88.962 -89.697 -90.266 -90.854 -91.449 -92.065 -92.698 -93.105 -93.525 -94.202 -94.672 -95.152 -95.395 -95.894 -96.367 -96.847 -97.098 -97.69 -97.874 -98.156 -98.439 -99.017 -99.317 -99.632 -99.996 -100.374 -100.812 -101.386 -103.028 -2 ,14837 ,TETRA ,17616424,Mon Nov 29 11:47:30 CET,Mon Nov 29 14:09:55 CET,0.0 0.764 1.023 1.225 1.381 1.511 1.608 1.691 1.84 1.896 1.936 1.753 2.013 2.036 2.06 2.073 2.067 2.061 2.064 2.057 1.996 1.929 1.86 1.794 1.735 1.665 1.588 1.492 1.351 1.189 1.012 0.786 0.546 0.304 0.026 -0.321 -0.691 -1.136 -1.687 -2.349 -3.12 -4.057 -5.223 -6.499 -8.141 -10.164 -12.787 -16.123 -20.557 -26.827 -36.231 -46.007 -53.294 -59.084 -63.895 -68.024 -71.393 -74.286 -76.667 -78.966 -80.889 -82.537 -84.032 -85.407 -86.681 -87.808 -88.974 -89.997 -90.854 -91.725 -92.632 -93.379 -94.122 -94.866 -95.438 -96.026 -96.601 -97.198 -97.831 -98.253 -98.673 -99.308 -99.737 -100.183 -100.412 -100.888 -101.364 -101.84 -102.087 -102.687 -102.919 -103.22 -103.519 -104.148 -104.474 -104.835 -105.197 -105.571 -106.095 -106.77 -109.447 -3 ,10056 ,TETRA ,17616425,Mon Nov 29 11:47:32 CET,Mon Nov 29 14:04:39 CET,0.0 0.974 1.234 1.456 1.624 1.748 1.848 1.93 2.031 2.065 2.116 1.972 2.218 2.24 2.304 2.33 2.335 2.34 2.347 2.335 2.298 2.273 2.247 2.183 2.106 2.021 1.908 1.802 1.677 1.525 1.357 1.141 0.899 0.641 0.324 -0.08 -0.522 -1.017 -1.587 -2.236 -2.967 -3.857 -4.986 -6.249 -7.87 -9.902 -12.506 -15.772 -20.14 -26.209 -35.356 -45.106 -52.425 -58.153 -62.757 -66.754 -70.141 -73.073 -75.462 -77.704 -79.55 -81.153 -82.649 -84.023 -85.281 -86.404 -87.509 -88.466 -89.314 -90.188 -91.07 -91.764 -92.463 -93.197 -93.746 -94.293 -94.868 -95.453 -96.046 -96.454 -96.856 -97.478 -97.912 -98.374 -98.621 -99.118 -99.595 -100.088 -100.34 -100.937 -101.133 -101.42 -101.717 -102.333 -102.646 -102.961 -103.337 -103.747 -104.215 -104.848 -106.494 -4 ,19279 ,TETRA ,17616426,Mon Nov 29 11:48:32 CET,Mon Nov 29 14:20:47 CET,0.0 1.338 1.639 1.829 1.984 2.109 2.213 2.295 2.459 2.518 2.547 2.368 2.635 2.671 2.738 2.787 2.8 2.797 2.79 2.774 2.723 2.681 2.641 2.563 2.477 2.385 2.271 2.156 1.995 1.813 1.624 1.404 1.171 0.922 0.595 0.187 -0.226 -0.721 -1.265 -1.855 -2.515 -3.366 -4.516 -5.767 -7.334 -9.293 -11.897 -15.184 -19.584 -25.795 -35.145 -45.187 -52.724 -58.62 -63.3 -67.223 -70.485 -73.276 -75.625 -77.896 -79.772 -81.4 -82.89 -84.25 -85.482 -86.586 -87.712 -88.698 -89.52 -90.358 -91.211 -91.898 -92.587 -93.295 -93.867 -94.442 -95.024 -95.61 -96.191 -96.587 -96.982 -97.579 -97.983 -98.376 -98.576 -99.019 -99.482 -99.936 -100.17 -100.768 -100.942 -101.216 -101.503 -102.078 -102.369 -102.712 -103.13 -103.573 -104.033 -104.598 -106.461 -5 ,989 ,TETRA ,17616427,Mon Nov 29 11:48:32 CET,Mon Nov 29 14:07:31 CET,0.0 2.201 2.572 2.826 3.038 3.201 3.354 3.488 3.659 3.716 3.769 3.6 3.857 3.89 3.949 3.98 4.003 4.029 4.074 4.102 4.122 4.103 4.089 4.091 4.09 4.04 3.972 3.907 3.795 3.695 3.593 3.439 3.219 2.943 2.621 2.254 1.862 1.36 0.766 0.105 -0.645 -1.582 -2.739 -4.014 -5.653 -7.66 -10.259 -13.6 -18.105 -24.382 -33.847 -43.871 -51.294 -56.99 -61.559 -65.422 -68.642 -71.45 -73.777 -76.075 -78.013 -79.661 -81.168 -82.541 -83.77 -84.866 -85.983 -86.937 -87.752 -88.58 -89.416 -90.095 -90.802 -91.546 -92.099 -92.65 -93.214 -93.777 -94.358 -94.747 -95.126 -95.722 -96.135 -96.56 -96.781 -97.234 -97.702 -98.189 -98.429 -99.012 -99.176 -99.43 -99.681 -100.172 -100.433 -100.744 -101.081 -101.451 -101.877 -102.435 -104.654 -6 ,3723 ,TETRA ,17616428,Mon Nov 29 11:48:35 CET,Mon Nov 29 14:07:29 CET,0.0 0.845 1.09 1.336 1.534 1.682 1.809 1.918 2.084 2.152 2.214 2.093 2.361 2.379 2.415 2.452 2.49 2.518 2.577 2.616 2.638 2.633 2.635 2.616 2.578 2.534 2.466 2.395 2.292 2.209 2.1 1.896 1.691 1.499 1.239 0.864 0.488 0.041 -0.529 -1.178 -1.933 -2.868 -4.024 -5.28 -6.912 -9.003 -11.691 -15.059 -19.644 -25.897 -34.995 -44.749 -52.264 -58.276 -63.083 -67.117 -70.485 -73.37 -75.752 -78.038 -79.919 -81.543 -83.103 -84.55 -85.846 -87.014 -88.192 -89.195 -90.041 -90.906 -91.808 -92.588 -93.395 -94.203 -94.83 -95.453 -96.056 -96.676 -97.294 -97.689 -98.11 -98.776 -99.223 -99.687 -99.922 -100.393 -100.852 -101.305 -101.547 -102.133 -102.289 -102.525 -102.766 -103.304 -103.611 -103.927 -104.271 -104.675 -105.13 -105.61 -108.873 -7 ,237 ,TETRA ,17616429,Mon Nov 29 11:48:32 CET,Mon Nov 29 14:09:13 CET,0.0 0.914 1.261 1.509 1.704 1.874 2.001 2.125 2.358 2.445 2.515 2.399 2.661 2.706 2.811 2.909 2.966 2.985 3.005 2.998 2.972 2.956 2.933 2.878 2.831 2.761 2.698 2.664 2.596 2.517 2.411 2.243 2.056 1.833 1.568 1.24 0.848 0.41 -0.103 -0.747 -1.489 -2.405 -3.573 -4.867 -6.564 -8.67 -11.315 -14.653 -19.067 -25.118 -34.294 -44.188 -51.734 -57.752 -62.515 -66.412 -69.639 -72.434 -74.748 -77.013 -78.94 -80.603 -82.139 -83.511 -84.762 -85.931 -87.116 -88.137 -89.008 -89.903 -90.822 -91.558 -92.319 -93.099 -93.684 -94.264 -94.868 -95.483 -96.094 -96.536 -97.005 -97.731 -98.232 -98.75 -99.012 -99.55 -100.119 -100.698 -101.004 -101.662 -101.961 -102.288 -102.597 -103.265 -103.668 -104.134 -104.576 -104.989 -105.508 -106.286 -109.027 -8 ,1515 ,TETRA ,17616430,Mon Nov 29 11:48:32 CET,Mon Nov 29 14:10:34 CET,0.0 1.224 1.586 1.796 1.935 2.08 2.232 2.342 2.491 2.55 2.592 2.461 2.75 2.794 2.872 2.946 3.006 3.016 3.002 2.989 2.972 2.954 2.943 2.906 2.854 2.79 2.724 2.652 2.539 2.419 2.274 2.102 1.941 1.78 1.561 1.263 0.958 0.577 0.083 -0.549 -1.283 -2.153 -3.26 -4.491 -6.101 -8.084 -10.655 -14.012 -18.53 -24.928 -34.569 -45.008 -52.736 -58.624 -63.426 -67.522 -70.869 -73.765 -76.154 -78.389 -80.239 -81.833 -83.333 -84.714 -85.938 -87.045 -88.176 -89.17 -90.018 -90.864 -91.717 -92.417 -93.142 -93.919 -94.526 -95.126 -95.71 -96.295 -96.88 -97.27 -97.676 -98.287 -98.689 -99.107 -99.336 -99.794 -100.25 -100.714 -100.953 -101.541 -101.704 -101.978 -102.277 -102.881 -103.209 -103.571 -103.919 -104.323 -104.84 -105.465 -107.308 -9 ,1463 ,TETRA ,17616431,Mon Nov 29 11:48:33 CET,Mon Nov 29 14:11:50 CET,0.0 1.143 1.469 1.741 1.964 2.1 2.19 2.261 2.369 2.432 2.484 2.316 2.588 2.62 2.673 2.707 2.725 2.732 2.72 2.695 2.675 2.661 2.63 2.546 2.451 2.36 2.261 2.147 1.995 1.836 1.664 1.444 1.215 0.971 0.669 0.289 -0.113 -0.591 -1.157 -1.794 -2.487 -3.337 -4.461 -5.693 -7.263 -9.227 -11.732 -14.898 -19.159 -25.162 -34.244 -44.024 -51.449 -57.261 -61.931 -65.897 -69.171 -72.011 -74.368 -76.641 -78.531 -80.139 -81.631 -83.014 -84.282 -85.42 -86.576 -87.58 -88.417 -89.259 -90.116 -90.816 -91.525 -92.237 -92.777 -93.324 -93.871 -94.436 -95.028 -95.431 -95.831 -96.444 -96.867 -97.284 -97.494 -97.953 -98.44 -98.928 -99.171 -99.766 -99.94 -100.209 -100.507 -101.126 -101.413 -101.737 -102.088 -102.425 -102.83 -103.339 -104.496 -10 ,519 ,TETRA ,17616432,Mon Nov 29 11:48:32 CET,Mon Nov 29 14:10:47 CET,0.0 1.263 1.535 1.787 2.05 2.24 2.353 2.444 2.626 2.711 2.779 2.629 2.898 2.925 2.976 3.058 3.134 3.157 3.215 3.251 3.24 3.214 3.183 3.171 3.16 3.136 3.097 3.033 2.945 2.836 2.721 2.545 2.347 2.143 1.895 1.591 1.234 0.822 0.327 -0.288 -0.996 -1.894 -3.063 -4.282 -5.819 -7.799 -10.38 -13.681 -18.2 -24.568 -34.029 -43.993 -51.331 -57.033 -61.623 -65.461 -68.739 -71.646 -74.052 -76.31 -78.167 -79.768 -81.235 -82.599 -83.835 -84.972 -86.19 -87.265 -88.182 -89.13 -90.078 -90.841 -91.627 -92.424 -93.044 -93.668 -94.284 -94.942 -95.624 -96.07 -96.523 -97.22 -97.697 -98.189 -98.433 -98.912 -99.397 -99.923 -100.195 -100.816 -101.047 -101.349 -101.67 -102.34 -102.683 -103.039 -103.421 -103.86 -104.377 -105.035 -106.924 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 8ab1b9d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,26052 ,TETRA ,17616435,Mon Nov 29 11:48:34 CET,Mon Nov 29 14:06:52 CET,0.0 1.019 1.477 1.856 2.193 2.475 2.724 2.985 3.515 3.79 4.066 4.343 4.767 4.998 5.442 5.856 6.286 6.512 6.947 7.347 7.913 8.285 8.657 9.203 9.728 10.222 10.696 11.171 11.798 12.427 13.056 13.842 14.612 15.36 16.264 17.335 18.406 19.612 20.959 22.4 23.904 25.611 27.721 29.979 32.682 35.783 39.494 43.893 49.36 56.148 65.049 73.371 78.707 82.502 85.33 87.518 89.186 90.522 91.519 92.408 93.115 93.654 94.116 94.507 94.832 95.114 95.381 95.594 95.748 95.894 96.037 96.121 96.196 96.286 96.335 96.342 96.331 96.316 96.275 96.242 96.215 96.137 96.06 95.991 95.952 95.83 95.687 95.496 95.372 95.171 95.04 94.926 94.794 94.432 94.192 93.922 93.587 92.994 92.104 91.062 81.236 -5 ,10254 ,TETRA ,17616437,Mon Nov 29 11:49:31 CET,Mon Nov 29 14:09:16 CET,0.0 0.856 1.285 1.637 1.956 2.249 2.51 2.769 3.272 3.522 3.76 3.995 4.421 4.645 5.079 5.498 5.902 6.104 6.505 6.894 7.452 7.813 8.176 8.71 9.23 9.739 10.247 10.759 11.429 12.079 12.728 13.535 14.316 15.087 16.006 17.053 18.093 19.271 20.554 21.942 23.432 25.161 27.237 29.366 31.982 35.042 38.671 42.989 48.378 55.222 64.405 72.881 78.372 82.317 85.23 87.453 89.166 90.526 91.575 92.533 93.274 93.897 94.438 94.855 95.171 95.433 95.685 95.877 96.029 96.192 96.335 96.405 96.474 96.53 96.537 96.551 96.56 96.565 96.568 96.542 96.496 96.433 96.39 96.344 96.311 96.236 96.119 95.959 95.884 95.711 95.594 95.478 95.362 95.008 94.793 94.581 94.277 93.85 93.384 92.331 87.282 -7 ,28014 ,TETRA ,17616440,Mon Nov 29 11:50:30 CET,Mon Nov 29 14:09:41 CET,0.0 0.916 1.36 1.712 2.037 2.334 2.606 2.853 3.346 3.589 3.826 4.074 4.491 4.707 5.15 5.57 5.987 6.189 6.563 6.947 7.524 7.903 8.281 8.854 9.409 9.933 10.46 10.974 11.633 12.294 12.961 13.794 14.604 15.41 16.369 17.46 18.547 19.783 21.138 22.58 24.108 25.906 28.095 30.345 33.072 36.197 39.81 44.035 49.489 56.48 65.521 73.764 79.211 83.122 86.073 88.309 89.96 91.348 92.436 93.396 94.13 94.735 95.287 95.727 96.07 96.364 96.627 96.807 96.948 97.1 97.261 97.381 97.471 97.541 97.568 97.563 97.554 97.557 97.561 97.55 97.53 97.467 97.403 97.324 97.271 97.146 97.005 96.803 96.705 96.503 96.327 96.217 96.079 95.695 95.468 95.184 94.892 94.478 93.758 92.803 83.534 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt deleted file mode 100644 index fad6e7d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7292 ,TETRA ,17616444,Mon Nov 29 11:53:39 CET,Mon Nov 29 14:07:46 CET,0.0 1.412 1.834 2.215 2.524 2.802 3.09 3.36 3.825 4.036 4.243 4.476 4.879 5.059 5.415 5.809 6.2 6.381 6.734 7.083 7.584 7.908 8.233 8.712 9.166 9.583 9.996 10.411 10.949 11.474 11.995 12.657 13.311 13.952 14.718 15.568 16.408 17.385 18.472 19.641 20.848 22.228 23.95 25.752 27.866 30.277 33.196 36.646 40.932 46.294 53.42 60.177 64.62 67.812 70.214 72.063 73.42 74.474 75.273 75.981 76.514 76.915 77.255 77.551 77.813 78.035 78.235 78.386 78.495 78.593 78.667 78.74 78.824 78.877 78.886 78.881 78.883 78.882 78.877 78.881 78.876 78.815 78.763 78.722 78.694 78.626 78.542 78.431 78.36 78.168 78.051 77.932 77.806 77.542 77.406 77.202 76.918 76.591 76.144 75.497 64.976 -2 ,13614 ,TETRA ,17616445,Mon Nov 29 11:54:31 CET,Mon Nov 29 14:15:33 CET,0.0 0.851 1.218 1.497 1.725 1.983 2.261 2.508 2.932 3.142 3.365 3.599 4.014 4.22 4.582 4.926 5.268 5.439 5.78 6.13 6.667 7.005 7.319 7.783 8.258 8.712 9.169 9.651 10.267 10.858 11.451 12.192 12.921 13.654 14.515 15.483 16.424 17.476 18.675 19.966 21.34 22.967 24.864 26.766 29.032 31.599 34.698 38.392 42.906 48.518 56.01 62.984 67.46 70.603 72.89 74.601 75.863 76.875 77.698 78.442 78.985 79.421 79.808 80.126 80.394 80.61 80.773 80.912 81.042 81.155 81.246 81.311 81.358 81.356 81.341 81.314 81.281 81.225 81.129 81.045 80.946 80.816 80.742 80.663 80.616 80.493 80.314 80.124 80.041 79.854 79.765 79.644 79.495 79.125 78.947 78.724 78.433 78.149 77.828 77.276 74.323 -3 ,21342 ,TETRA ,17616446,Mon Nov 29 11:54:33 CET,Mon Nov 29 14:16:32 CET,0.0 1.079 1.47 1.799 2.106 2.389 2.666 2.924 3.431 3.7 3.943 4.154 4.569 4.784 5.198 5.594 5.977 6.159 6.507 6.854 7.351 7.666 7.976 8.429 8.867 9.306 9.742 10.17 10.747 11.317 11.893 12.621 13.306 13.957 14.73 15.637 16.564 17.595 18.686 19.879 21.179 22.697 24.487 26.309 28.546 31.146 34.228 37.888 42.385 48.051 55.707 62.753 67.333 70.557 72.892 74.657 76.014 77.116 77.957 78.697 79.253 79.685 80.03 80.32 80.566 80.764 80.956 81.097 81.184 81.25 81.327 81.38 81.414 81.462 81.473 81.449 81.429 81.41 81.37 81.326 81.276 81.177 81.089 80.987 80.94 80.859 80.756 80.615 80.529 80.345 80.278 80.146 80.027 79.77 79.6 79.408 79.164 78.857 78.504 77.982 75.255 -4 ,883 ,TETRA ,17616447,Mon Nov 29 11:54:31 CET,Mon Nov 29 13:51:20 CET,0.0 1.642 2.074 2.39 2.682 2.955 3.229 3.505 3.985 4.212 4.43 4.649 5.073 5.28 5.676 6.034 6.379 6.562 6.925 7.261 7.759 8.092 8.404 8.857 9.309 9.739 10.163 10.596 11.165 11.722 12.277 12.963 13.638 14.311 15.111 16.019 16.929 17.98 19.114 20.333 21.65 23.183 25.031 26.933 29.268 31.984 35.257 39.197 44.024 49.921 57.645 64.831 69.517 72.746 75.076 76.899 78.293 79.414 80.239 80.932 81.466 81.882 82.217 82.478 82.697 82.888 83.053 83.197 83.298 83.382 83.449 83.45 83.445 83.436 83.42 83.404 83.393 83.348 83.239 83.164 83.098 82.985 82.856 82.705 82.637 82.497 82.355 82.201 82.121 81.913 81.788 81.652 81.498 81.143 80.955 80.746 80.445 80.023 79.502 78.776 69.243 -6 ,29758 ,TETRA ,17616449,Mon Nov 29 11:55:34 CET,Mon Nov 29 14:09:32 CET,0.0 1.455 1.909 2.287 2.623 2.925 3.203 3.466 3.958 4.197 4.436 4.683 5.089 5.282 5.649 6.014 6.396 6.59 6.96 7.304 7.781 8.1 8.428 8.917 9.405 9.881 10.335 10.774 11.334 11.87 12.392 13.058 13.723 14.371 15.155 16.056 16.926 17.888 18.932 20.067 21.291 22.718 24.429 26.228 28.451 30.919 33.881 37.503 41.98 47.505 54.85 61.686 66.017 68.965 71.109 72.849 74.147 75.103 75.877 76.602 77.147 77.585 77.948 78.283 78.554 78.751 78.946 79.094 79.198 79.261 79.329 79.407 79.469 79.495 79.485 79.46 79.415 79.37 79.336 79.307 79.256 79.153 79.098 79.047 78.999 78.858 78.678 78.516 78.458 78.28 78.163 78.054 77.943 77.696 77.547 77.315 76.977 76.585 76.15 75.592 68.169 -8 ,2309 ,TETRA ,17616451,Mon Nov 29 11:58:28 CET,Mon Nov 29 13:58:37 CET,0.0 1.617 2.08 2.455 2.771 3.054 3.311 3.565 4.056 4.285 4.504 4.724 5.132 5.34 5.738 6.121 6.493 6.677 7.024 7.354 7.856 8.187 8.508 8.984 9.445 9.912 10.394 10.852 11.421 11.968 12.514 13.199 13.877 14.539 15.312 16.19 17.067 18.082 19.201 20.388 21.664 23.137 24.882 26.715 28.945 31.491 34.505 38.083 42.524 48.208 55.922 63.08 67.663 70.824 73.113 74.849 76.174 77.252 78.091 78.834 79.38 79.821 80.211 80.554 80.849 81.057 81.221 81.339 81.413 81.469 81.508 81.526 81.52 81.485 81.45 81.416 81.378 81.327 81.269 81.23 81.186 81.116 81.069 80.998 80.958 80.875 80.776 80.643 80.56 80.368 80.288 80.207 80.135 79.93 79.754 79.568 79.389 79.114 78.773 78.205 71.779 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt deleted file mode 100644 index 3b46ad89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6106 ,TETRA ,17616454,Mon Nov 29 11:59:31 CET,Mon Nov 29 14:17:11 CET,0.0 0.698 1.036 1.298 1.568 1.795 1.985 2.145 2.385 2.5 2.611 2.603 2.919 3.016 3.191 3.359 3.527 3.617 3.806 3.976 4.217 4.381 4.532 4.736 4.93 5.114 5.295 5.48 5.707 5.924 6.13 6.352 6.557 6.766 7.027 7.329 7.602 7.894 8.231 8.596 8.961 9.378 9.872 10.34 10.874 11.421 11.99 12.599 13.259 13.989 14.634 14.728 14.527 14.243 13.913 13.554 13.204 12.879 12.599 12.312 12.057 11.812 11.562 11.305 11.061 10.855 10.636 10.434 10.263 10.092 9.892 9.718 9.534 9.309 9.144 8.993 8.839 8.686 8.538 8.432 8.322 8.154 8.034 7.904 7.835 7.703 7.557 7.404 7.317 7.016 7.043 6.955 6.855 6.634 6.526 6.408 6.262 6.101 5.897 5.582 4.388 -2 ,32173 ,TETRA ,17616455,Mon Nov 29 12:00:30 CET,Mon Nov 29 14:17:03 CET,0.0 0.876 1.275 1.6 1.83 2.043 2.236 2.385 2.675 2.823 2.956 2.972 3.3 3.417 3.638 3.834 4.026 4.118 4.289 4.45 4.701 4.877 5.042 5.27 5.496 5.711 5.902 6.099 6.366 6.617 6.85 7.12 7.376 7.609 7.885 8.193 8.497 8.839 9.196 9.561 9.914 10.303 10.798 11.327 11.895 12.466 13.093 13.783 14.492 15.202 15.883 16.13 16.037 15.826 15.544 15.188 14.852 14.518 14.213 13.927 13.676 13.435 13.194 12.993 12.816 12.606 12.341 12.095 11.897 11.711 11.546 11.427 11.278 11.104 10.961 10.8 10.628 10.447 10.258 10.129 10.004 9.826 9.695 9.543 9.468 9.312 9.149 8.986 8.895 8.588 8.621 8.524 8.429 8.238 8.124 7.993 7.835 7.67 7.462 7.171 6.35 -3 ,32251 ,TETRA ,17616456,Mon Nov 29 12:00:30 CET,Mon Nov 29 14:15:45 CET,0.0 0.656 1.031 1.279 1.468 1.669 1.877 2.056 2.365 2.505 2.626 2.62 2.928 3.023 3.222 3.422 3.598 3.682 3.857 4.026 4.25 4.397 4.548 4.776 4.995 5.207 5.407 5.597 5.85 6.107 6.353 6.631 6.902 7.165 7.457 7.81 8.15 8.49 8.868 9.26 9.67 10.109 10.612 11.119 11.644 12.207 12.85 13.563 14.312 15.036 15.611 15.76 15.668 15.442 15.07 14.672 14.385 14.111 13.841 13.539 13.247 12.959 12.696 12.458 12.232 12.035 11.813 11.616 11.458 11.292 11.115 10.952 10.78 10.609 10.461 10.295 10.124 9.953 9.769 9.633 9.493 9.289 9.14 8.986 8.911 8.75 8.573 8.387 8.306 8.025 8.083 7.993 7.888 7.661 7.529 7.394 7.271 7.105 6.876 6.608 5.492 -4 ,3702 ,TETRA ,17616457,Mon Nov 29 12:01:30 CET,Mon Nov 29 14:12:39 CET,0.0 1.104 1.496 1.794 2.062 2.273 2.471 2.657 2.992 3.15 3.291 3.339 3.7 3.844 4.094 4.327 4.546 4.656 4.856 5.06 5.37 5.558 5.745 6.011 6.274 6.539 6.79 7.022 7.31 7.585 7.845 8.161 8.471 8.769 9.123 9.51 9.878 10.294 10.717 11.14 11.604 12.099 12.639 13.211 13.844 14.502 15.206 15.932 16.709 17.427 17.926 17.992 17.772 17.485 17.18 16.85 16.49 16.105 15.782 15.454 15.175 14.922 14.658 14.404 14.168 13.95 13.733 13.545 13.371 13.178 12.985 12.824 12.654 12.464 12.306 12.132 11.959 11.804 11.631 11.505 11.398 11.243 11.115 10.983 10.916 10.763 10.583 10.398 10.314 10.012 10.011 9.886 9.758 9.482 9.332 9.161 8.961 8.717 8.427 8.056 7.375 -5 ,19977 ,TETRA ,17616458,Mon Nov 29 12:01:31 CET,Mon Nov 29 14:13:39 CET,0.0 0.575 0.882 1.138 1.307 1.464 1.622 1.772 2.069 2.197 2.302 2.289 2.598 2.695 2.868 3.014 3.163 3.237 3.371 3.5 3.698 3.822 3.951 4.139 4.307 4.48 4.662 4.855 5.12 5.37 5.6 5.877 6.15 6.409 6.724 7.103 7.495 7.928 8.298 8.639 9.009 9.406 9.859 10.303 10.8 11.329 11.896 12.462 13.1 13.758 14.196 14.182 13.905 13.526 13.164 12.833 12.557 12.282 12.024 11.766 11.524 11.318 11.118 10.914 10.712 10.524 10.318 10.107 9.925 9.744 9.553 9.395 9.215 9.038 8.905 8.765 8.634 8.497 8.323 8.207 8.095 7.907 7.784 7.668 7.611 7.496 7.375 7.228 7.146 6.853 6.892 6.798 6.684 6.467 6.358 6.233 6.112 5.978 5.831 5.586 5.001 -6 ,18365 ,TETRA ,17616459,Mon Nov 29 12:01:31 CET,Mon Nov 29 14:09:22 CET,0.0 0.848 1.23 1.502 1.738 1.953 2.131 2.299 2.597 2.76 2.917 2.93 3.264 3.379 3.573 3.763 3.975 4.085 4.298 4.506 4.819 5.008 5.185 5.42 5.64 5.865 6.08 6.295 6.58 6.84 7.075 7.347 7.615 7.892 8.242 8.618 8.938 9.301 9.693 10.117 10.572 11.061 11.638 12.206 12.876 13.611 14.367 15.169 16.025 16.861 17.707 18.0 17.814 17.504 17.133 16.757 16.393 16.048 15.766 15.451 15.162 14.898 14.635 14.402 14.193 13.987 13.781 13.603 13.433 13.265 13.09 12.932 12.764 12.591 12.459 12.317 12.162 12.003 11.838 11.722 11.598 11.387 11.248 11.107 11.033 10.89 10.735 10.575 10.501 10.208 10.235 10.146 10.055 9.855 9.737 9.598 9.468 9.33 9.14 8.962 8.716 -7 ,11254 ,TETRA ,17616460,Mon Nov 29 12:02:30 CET,Mon Nov 29 14:24:16 CET,0.0 0.933 1.429 1.7 1.898 2.085 2.261 2.408 2.673 2.803 2.929 2.964 3.304 3.432 3.659 3.861 4.054 4.146 4.318 4.472 4.699 4.858 5.016 5.242 5.462 5.655 5.835 6.022 6.268 6.519 6.749 7.009 7.256 7.489 7.748 8.028 8.3 8.597 8.917 9.254 9.592 9.978 10.427 10.866 11.397 11.953 12.584 13.306 14.017 14.709 15.266 15.329 15.115 14.795 14.484 14.164 13.803 13.461 13.167 12.879 12.627 12.381 12.136 11.892 11.658 11.455 11.246 11.052 10.871 10.672 10.464 10.299 10.139 9.979 9.857 9.732 9.589 9.438 9.281 9.167 9.048 8.868 8.74 8.609 8.55 8.411 8.236 8.072 8.001 7.703 7.713 7.617 7.506 7.268 7.156 7.02 6.868 6.712 6.489 6.197 5.788 -8 ,1287 ,TETRA ,17616461,Mon Nov 29 12:02:33 CET,Mon Nov 29 14:24:27 CET,0.0 0.599 0.916 1.184 1.399 1.592 1.746 1.881 2.155 2.291 2.417 2.445 2.789 2.913 3.111 3.301 3.492 3.589 3.776 3.949 4.205 4.358 4.494 4.693 4.9 5.103 5.29 5.466 5.695 5.919 6.132 6.392 6.635 6.871 7.155 7.472 7.771 8.09 8.418 8.773 9.168 9.605 10.083 10.515 11.011 11.543 12.125 12.718 13.329 13.937 14.351 14.358 14.095 13.707 13.311 12.909 12.538 12.231 11.965 11.67 11.399 11.134 10.873 10.622 10.385 10.172 9.95 9.739 9.559 9.393 9.22 9.069 8.9 8.721 8.594 8.46 8.316 8.174 8.022 7.906 7.788 7.617 7.504 7.391 7.33 7.207 7.082 6.926 6.84 6.543 6.54 6.436 6.329 6.082 5.954 5.801 5.634 5.473 5.286 5.045 4.642 -9 ,26028 ,TETRA ,17616462,Mon Nov 29 12:02:30 CET,Mon Nov 29 14:11:52 CET,0.0 0.519 0.797 1.018 1.251 1.443 1.583 1.723 1.982 2.099 2.214 2.226 2.541 2.646 2.848 3.02 3.173 3.254 3.43 3.597 3.829 3.98 4.128 4.35 4.552 4.723 4.884 5.043 5.264 5.487 5.697 5.94 6.165 6.367 6.612 6.891 7.153 7.445 7.762 8.115 8.465 8.817 9.233 9.664 10.124 10.616 11.198 11.808 12.41 13.013 13.515 13.529 13.278 12.992 12.647 12.31 12.008 11.692 11.392 11.086 10.818 10.577 10.356 10.144 9.946 9.754 9.549 9.368 9.207 9.043 8.869 8.721 8.568 8.418 8.303 8.186 8.073 7.963 7.84 7.741 7.633 7.469 7.363 7.25 7.19 7.052 6.902 6.755 6.679 6.399 6.459 6.383 6.306 6.122 6.021 5.909 5.785 5.644 5.476 5.274 4.792 -10 ,22536 ,TETRA ,17616463,Mon Nov 29 12:02:31 CET,Mon Nov 29 14:12:54 CET,0.0 0.616 0.931 1.194 1.411 1.582 1.748 1.911 2.198 2.334 2.474 2.515 2.851 2.967 3.203 3.424 3.64 3.743 3.935 4.108 4.345 4.5 4.654 4.878 5.097 5.309 5.506 5.691 5.91 6.117 6.342 6.642 6.933 7.193 7.476 7.802 8.124 8.453 8.8 9.174 9.532 9.925 10.403 10.88 11.393 11.95 12.584 13.194 13.819 14.458 15.088 15.292 15.021 14.681 14.323 13.962 13.631 13.281 12.941 12.605 12.324 12.053 11.798 11.566 11.34 11.134 10.928 10.739 10.571 10.401 10.235 10.096 9.952 9.799 9.666 9.532 9.396 9.241 9.082 8.97 8.838 8.629 8.481 8.342 8.274 8.11 7.93 7.75 7.671 7.377 7.397 7.295 7.186 6.955 6.813 6.676 6.53 6.328 6.108 5.924 5.24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 8ba3260d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11428 ,TETRA ,17616464,Mon Nov 29 12:03:32 CET,Mon Nov 29 14:07:05 CET,0.0 0.291 0.402 0.506 0.616 0.713 0.811 0.901 1.019 1.071 1.12 0.981 1.235 1.276 1.355 1.431 1.494 1.521 1.586 1.659 1.755 1.813 1.866 1.937 2.011 2.073 2.132 2.188 2.245 2.296 2.349 2.406 2.46 2.531 2.604 2.663 2.754 2.881 3.009 3.121 3.199 3.241 3.252 3.24 3.18 3.054 2.843 2.565 2.084 1.14 -0.429 -2.397 -4.07 -5.447 -6.639 -7.73 -8.765 -9.696 -10.45 -11.194 -11.842 -12.429 -12.982 -13.513 -14.017 -14.489 -14.984 -15.402 -15.765 -16.146 -16.549 -16.889 -17.232 -17.586 -17.851 -18.121 -18.406 -18.71 -19.028 -19.239 -19.46 -19.794 -20.014 -20.244 -20.362 -20.615 -20.888 -21.18 -21.321 -21.7 -21.756 -21.93 -22.115 -22.466 -22.649 -22.831 -23.033 -23.275 -23.565 -24.008 -25.528 -2 ,11364 ,TETRA ,17616465,Mon Nov 29 12:03:31 CET,Mon Nov 29 14:22:21 CET,0.0 0.5 0.664 0.767 0.865 0.946 1.014 1.1 1.267 1.321 1.379 1.274 1.536 1.58 1.657 1.739 1.813 1.845 1.906 1.967 2.049 2.092 2.133 2.199 2.264 2.317 2.37 2.43 2.488 2.536 2.596 2.668 2.72 2.775 2.852 2.944 3.036 3.146 3.26 3.368 3.462 3.537 3.543 3.473 3.357 3.155 2.832 2.372 1.722 0.713 -1.102 -3.376 -5.321 -6.931 -8.315 -9.589 -10.683 -11.658 -12.496 -13.335 -14.047 -14.667 -15.248 -15.777 -16.26 -16.706 -17.167 -17.584 -17.971 -18.393 -18.819 -19.164 -19.51 -19.867 -20.155 -20.453 -20.752 -21.044 -21.339 -21.534 -21.729 -22.031 -22.255 -22.497 -22.618 -22.869 -23.151 -23.457 -23.604 -24.001 -24.08 -24.253 -24.439 -24.86 -25.072 -25.307 -25.578 -25.884 -26.23 -26.655 -27.733 -3 ,8011 ,TETRA ,17616466,Mon Nov 29 12:03:33 CET,Mon Nov 29 14:21:39 CET,0.0 0.304 0.477 0.599 0.675 0.736 0.812 0.88 0.962 1.002 1.05 0.927 1.187 1.237 1.334 1.411 1.466 1.494 1.553 1.608 1.693 1.76 1.827 1.911 1.993 2.086 2.175 2.243 2.301 2.347 2.403 2.474 2.531 2.572 2.612 2.651 2.694 2.735 2.76 2.797 2.816 2.812 2.801 2.77 2.694 2.534 2.304 1.947 1.323 0.315 -1.494 -3.695 -5.477 -7.031 -8.422 -9.706 -10.891 -11.93 -12.791 -13.7 -14.457 -15.102 -15.706 -16.293 -16.875 -17.386 -17.931 -18.398 -18.766 -19.142 -19.53 -19.855 -20.192 -20.558 -20.853 -21.141 -21.428 -21.719 -22.025 -22.245 -22.458 -22.79 -23.018 -23.244 -23.358 -23.588 -23.849 -24.123 -24.258 -24.661 -24.748 -24.904 -25.056 -25.375 -25.571 -25.787 -26.02 -26.305 -26.658 -27.05 -27.821 -4 ,15363 ,TETRA ,17616467,Mon Nov 29 12:03:33 CET,Mon Nov 29 14:22:23 CET,0.0 0.126 0.233 0.345 0.432 0.504 0.583 0.663 0.8 0.847 0.892 0.788 1.059 1.107 1.198 1.289 1.387 1.429 1.503 1.578 1.687 1.757 1.824 1.914 2.001 2.102 2.208 2.299 2.408 2.497 2.582 2.7 2.8 2.891 2.992 3.086 3.179 3.276 3.365 3.431 3.471 3.501 3.494 3.445 3.381 3.272 3.075 2.75 2.166 1.248 -0.369 -2.671 -4.623 -6.286 -7.799 -9.009 -9.955 -10.86 -11.713 -12.633 -13.467 -14.224 -14.934 -15.578 -16.141 -16.639 -17.136 -17.584 -18.005 -18.45 -18.883 -19.23 -19.604 -19.994 -20.274 -20.557 -20.853 -21.17 -21.534 -21.768 -21.984 -22.315 -22.54 -22.776 -22.897 -23.154 -23.427 -23.726 -23.883 -24.299 -24.378 -24.565 -24.78 -25.18 -25.38 -25.585 -25.818 -26.101 -26.447 -26.916 -28.581 -5 ,12035 ,TETRA ,17616468,Mon Nov 29 12:04:31 CET,Mon Nov 29 14:23:40 CET,0.0 0.299 0.493 0.631 0.718 0.798 0.869 0.928 1.027 1.077 1.139 1.041 1.302 1.343 1.407 1.48 1.554 1.589 1.662 1.744 1.848 1.901 1.954 2.021 2.087 2.153 2.212 2.268 2.347 2.417 2.477 2.544 2.603 2.66 2.725 2.787 2.841 2.892 2.924 2.958 2.975 2.963 2.94 2.867 2.733 2.549 2.273 1.862 1.228 0.226 -1.616 -3.934 -5.864 -7.442 -8.776 -9.975 -11.114 -12.195 -13.041 -13.868 -14.611 -15.319 -16.033 -16.688 -17.243 -17.713 -18.209 -18.656 -19.056 -19.485 -19.945 -20.312 -20.673 -21.05 -21.337 -21.633 -21.945 -22.262 -22.571 -22.775 -22.985 -23.325 -23.562 -23.796 -23.92 -24.163 -24.389 -24.638 -24.781 -25.173 -25.218 -25.378 -25.548 -25.923 -26.143 -26.379 -26.602 -26.846 -27.152 -27.642 -28.817 -6 ,18660 ,TETRA ,17616469,Mon Nov 29 12:05:30 CET,Mon Nov 29 14:15:41 CET,0.0 0.291 0.46 0.592 0.686 0.77 0.843 0.917 1.072 1.127 1.168 1.045 1.311 1.358 1.44 1.509 1.584 1.616 1.674 1.735 1.811 1.862 1.922 2.009 2.089 2.156 2.223 2.29 2.369 2.451 2.52 2.591 2.671 2.749 2.826 2.899 2.953 3.012 3.075 3.13 3.171 3.19 3.201 3.207 3.145 2.959 2.702 2.328 1.702 0.676 -1.191 -3.432 -5.227 -6.776 -8.19 -9.486 -10.592 -11.646 -12.543 -13.373 -14.07 -14.689 -15.239 -15.738 -16.219 -16.672 -17.141 -17.549 -17.907 -18.281 -18.679 -18.996 -19.318 -19.669 -19.947 -20.23 -20.52 -20.811 -21.129 -21.349 -21.559 -21.896 -22.124 -22.366 -22.501 -22.756 -23.002 -23.258 -23.4 -23.807 -23.9 -24.072 -24.262 -24.686 -24.916 -25.136 -25.36 -25.623 -25.931 -26.326 -27.313 -7 ,27220 ,TETRA ,17616470,Mon Nov 29 12:07:31 CET,Mon Nov 29 14:27:47 CET,0.0 0.325 0.486 0.601 0.692 0.771 0.842 0.926 1.079 1.137 1.192 1.068 1.321 1.373 1.46 1.516 1.57 1.601 1.668 1.736 1.829 1.883 1.935 2.01 2.078 2.159 2.232 2.283 2.35 2.404 2.446 2.518 2.579 2.612 2.663 2.72 2.768 2.828 2.859 2.868 2.881 2.88 2.855 2.787 2.673 2.551 2.341 1.962 1.337 0.308 -1.429 -3.554 -5.354 -6.845 -8.085 -9.203 -10.256 -11.268 -12.097 -12.831 -13.479 -14.095 -14.69 -15.264 -15.765 -16.21 -16.674 -17.074 -17.424 -17.805 -18.199 -18.507 -18.828 -19.15 -19.39 -19.648 -19.918 -20.193 -20.462 -20.641 -20.835 -21.151 -21.376 -21.609 -21.727 -21.968 -22.226 -22.491 -22.643 -23.069 -23.195 -23.385 -23.579 -23.966 -24.14 -24.353 -24.643 -24.965 -25.276 -25.682 -27.206 -8 ,8641 ,TETRA ,17616471,Mon Nov 29 12:06:31 CET,Mon Nov 29 14:24:46 CET,0.0 0.165 0.33 0.447 0.547 0.646 0.729 0.799 0.943 1.013 1.061 0.95 1.215 1.261 1.339 1.41 1.485 1.52 1.592 1.649 1.726 1.784 1.833 1.899 1.962 2.017 2.063 2.111 2.183 2.249 2.312 2.389 2.449 2.495 2.543 2.595 2.639 2.683 2.719 2.748 2.77 2.773 2.757 2.705 2.603 2.461 2.259 1.935 1.325 0.324 -1.41 -3.55 -5.344 -6.908 -8.282 -9.506 -10.552 -11.503 -12.3 -13.077 -13.736 -14.315 -14.88 -15.468 -16.016 -16.471 -16.984 -17.468 -17.864 -18.277 -18.691 -19.023 -19.392 -19.762 -20.024 -20.288 -20.559 -20.855 -21.165 -21.37 -21.581 -21.906 -22.146 -22.398 -22.519 -22.76 -23.031 -23.316 -23.454 -23.845 -23.928 -24.09 -24.253 -24.604 -24.803 -25.05 -25.317 -25.617 -25.962 -26.387 -27.847 -9 ,14597 ,TETRA ,17616472,Mon Nov 29 12:06:30 CET,Mon Nov 29 14:25:27 CET,0.0 0.437 0.58 0.677 0.781 0.886 0.955 1.007 1.115 1.164 1.204 1.083 1.336 1.376 1.46 1.535 1.599 1.63 1.702 1.765 1.841 1.893 1.945 2.021 2.093 2.15 2.209 2.267 2.334 2.405 2.477 2.566 2.645 2.697 2.749 2.815 2.872 2.913 2.926 2.92 2.907 2.884 2.821 2.744 2.63 2.436 2.108 1.646 1.038 0.11 -1.59 -3.752 -5.605 -7.269 -8.711 -9.945 -10.991 -11.945 -12.791 -13.651 -14.36 -14.963 -15.538 -16.075 -16.532 -16.947 -17.441 -17.87 -18.212 -18.562 -18.931 -19.242 -19.555 -19.87 -20.11 -20.364 -20.628 -20.902 -21.185 -21.388 -21.604 -21.935 -22.167 -22.411 -22.529 -22.783 -23.072 -23.349 -23.486 -23.887 -23.997 -24.165 -24.325 -24.669 -24.877 -25.109 -25.344 -25.596 -25.884 -26.271 -27.217 -10 ,3064 ,TETRA ,17616473,Mon Nov 29 12:06:33 CET,Mon Nov 29 14:25:13 CET,0.0 0.252 0.374 0.493 0.593 0.667 0.734 0.789 0.874 0.918 0.967 0.837 1.1 1.151 1.235 1.311 1.377 1.406 1.471 1.548 1.648 1.698 1.742 1.812 1.883 1.948 1.999 2.043 2.107 2.17 2.217 2.261 2.301 2.334 2.365 2.41 2.454 2.49 2.518 2.546 2.57 2.572 2.54 2.476 2.338 2.162 1.9 1.466 0.799 -0.296 -2.346 -4.757 -6.719 -8.331 -9.712 -10.946 -12.024 -13.038 -13.896 -14.716 -15.403 -16.072 -16.754 -17.351 -17.883 -18.361 -18.845 -19.281 -19.668 -20.081 -20.503 -20.846 -21.183 -21.526 -21.795 -22.066 -22.348 -22.647 -22.956 -23.168 -23.382 -23.722 -23.978 -24.24 -24.372 -24.653 -24.937 -25.218 -25.356 -25.734 -25.772 -25.936 -26.116 -26.485 -26.694 -26.931 -27.173 -27.435 -27.794 -28.336 -30.051 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index c36cbfe2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30912 ,TETRA ,17616475,Mon Nov 29 12:06:31 CET,Mon Nov 29 14:30:57 CET,0.0 1.057 1.465 1.756 2.004 2.233 2.453 2.66 3.009 3.163 3.304 3.354 3.712 3.848 4.085 4.308 4.517 4.613 4.799 4.991 5.264 5.435 5.607 5.856 6.106 6.346 6.574 6.793 7.067 7.327 7.585 7.885 8.168 8.462 8.789 9.134 9.472 9.888 10.383 10.855 11.293 11.744 12.262 12.809 13.401 14.043 14.725 15.432 16.259 17.173 18.0 18.428 18.525 18.459 18.342 18.216 18.045 17.846 17.685 17.508 17.335 17.186 17.048 16.896 16.749 16.619 16.473 16.346 16.232 16.11 15.983 15.881 15.782 15.668 15.569 15.477 15.385 15.274 15.148 15.062 14.984 14.863 14.776 14.682 14.631 14.533 14.434 14.307 14.229 13.947 13.994 13.919 13.835 13.649 13.56 13.48 13.381 13.257 13.132 12.977 12.598 -2 ,18112 ,TETRA ,17616476,Mon Nov 29 12:06:33 CET,Mon Nov 29 14:30:42 CET,0.0 0.898 1.237 1.549 1.821 2.037 2.231 2.416 2.788 2.969 3.129 3.216 3.586 3.72 3.957 4.187 4.407 4.514 4.704 4.872 5.117 5.278 5.446 5.707 5.946 6.163 6.369 6.572 6.83 7.07 7.301 7.578 7.841 8.123 8.447 8.775 9.081 9.408 9.767 10.157 10.57 11.006 11.498 12.014 12.613 13.236 13.885 14.555 15.326 16.222 17.065 17.406 17.489 17.467 17.333 17.152 17.015 16.863 16.696 16.526 16.365 16.183 15.981 15.805 15.644 15.482 15.295 15.132 14.992 14.829 14.66 14.525 14.391 14.257 14.158 14.051 13.935 13.811 13.691 13.606 13.5 13.311 13.174 13.04 12.975 12.84 12.681 12.492 12.396 12.101 12.127 12.026 11.922 11.709 11.584 11.46 11.338 11.207 11.047 10.842 10.427 -3 ,5115 ,TETRA ,17616477,Mon Nov 29 12:07:33 CET,Mon Nov 29 14:34:08 CET,0.0 1.353 1.739 1.994 2.225 2.44 2.63 2.821 3.182 3.334 3.487 3.568 3.921 4.073 4.373 4.634 4.882 4.993 5.202 5.414 5.722 5.912 6.084 6.322 6.555 6.798 7.028 7.239 7.527 7.807 8.063 8.361 8.648 8.932 9.254 9.605 9.937 10.303 10.709 11.15 11.618 12.115 12.644 13.162 13.775 14.453 15.199 15.974 16.825 17.692 18.556 19.013 19.069 18.933 18.76 18.555 18.358 18.176 18.002 17.835 17.672 17.524 17.39 17.246 17.093 16.95 16.789 16.635 16.513 16.388 16.249 16.14 16.038 15.926 15.831 15.732 15.629 15.528 15.421 15.338 15.254 15.142 15.069 14.987 14.942 14.837 14.725 14.614 14.561 14.304 14.385 14.327 14.26 14.118 14.055 13.993 13.897 13.767 13.643 13.499 13.173 -4 ,20359 ,TETRA ,17616478,Mon Nov 29 12:07:30 CET,Mon Nov 29 14:34:14 CET,0.0 0.888 1.254 1.559 1.807 2.008 2.208 2.402 2.764 2.917 3.06 3.13 3.467 3.582 3.828 4.065 4.281 4.384 4.585 4.788 5.077 5.254 5.43 5.702 5.959 6.177 6.381 6.586 6.832 7.058 7.281 7.569 7.851 8.121 8.457 8.823 9.161 9.542 9.924 10.298 10.696 11.152 11.681 12.2 12.784 13.418 14.15 14.953 15.836 16.818 17.848 18.488 18.692 18.656 18.555 18.413 18.205 17.973 17.753 17.526 17.343 17.193 17.044 16.902 16.774 16.65 16.514 16.378 16.25 16.122 15.983 15.859 15.733 15.594 15.482 15.375 15.273 15.165 15.046 14.97 14.893 14.743 14.635 14.533 14.477 14.36 14.232 14.101 14.03 13.749 13.795 13.706 13.609 13.403 13.293 13.162 13.038 12.918 12.763 12.605 12.209 -5 ,10586 ,TETRA ,17616479,Mon Nov 29 12:07:30 CET,Mon Nov 29 14:30:05 CET,0.0 0.79 1.141 1.431 1.632 1.791 1.945 2.104 2.399 2.526 2.647 2.697 3.043 3.165 3.397 3.621 3.831 3.937 4.148 4.338 4.61 4.775 4.938 5.197 5.437 5.657 5.876 6.091 6.355 6.59 6.805 7.067 7.333 7.589 7.881 8.229 8.577 8.94 9.315 9.704 10.13 10.634 11.201 11.756 12.394 13.065 13.771 14.572 15.475 16.444 17.417 17.886 18.004 17.926 17.755 17.553 17.314 17.08 16.859 16.601 16.372 16.164 15.939 15.726 15.551 15.394 15.225 15.077 14.942 14.793 14.647 14.526 14.399 14.255 14.135 14.02 13.92 13.813 13.685 13.594 13.499 13.349 13.235 13.12 13.068 12.965 12.842 12.715 12.654 12.386 12.457 12.379 12.285 12.075 11.97 11.874 11.76 11.62 11.443 11.19 10.516 -6 ,24979 ,TETRA ,17616480,Mon Nov 29 12:09:31 CET,Mon Nov 29 14:36:42 CET,0.0 1.05 1.327 1.588 1.831 2.035 2.212 2.36 2.626 2.757 2.893 2.936 3.24 3.343 3.555 3.758 3.957 4.052 4.226 4.386 4.633 4.798 4.965 5.212 5.441 5.645 5.837 6.033 6.29 6.531 6.75 6.996 7.222 7.448 7.714 7.994 8.262 8.584 8.954 9.343 9.726 10.123 10.587 11.058 11.676 12.417 13.127 13.816 14.655 15.648 16.543 16.962 17.093 17.096 17.007 16.802 16.537 16.271 16.025 15.773 15.561 15.367 15.129 14.898 14.732 14.592 14.44 14.293 14.148 13.991 13.836 13.705 13.577 13.457 13.358 13.254 13.142 13.01 12.866 12.769 12.668 12.502 12.377 12.259 12.202 12.077 11.921 11.742 11.655 11.364 11.413 11.328 11.249 11.06 10.944 10.828 10.71 10.587 10.424 10.235 9.899 -7 ,13912 ,TETRA ,17616481,Mon Nov 29 12:08:31 CET,Mon Nov 29 14:36:19 CET,0.0 0.773 1.019 1.193 1.376 1.562 1.735 1.893 2.159 2.274 2.384 2.384 2.716 2.823 3.031 3.225 3.401 3.491 3.664 3.82 4.053 4.214 4.37 4.592 4.795 4.976 5.163 5.366 5.623 5.852 6.072 6.327 6.574 6.83 7.124 7.443 7.768 8.137 8.517 8.917 9.35 9.826 10.35 10.842 11.442 12.115 12.879 13.713 14.52 15.383 16.353 16.954 17.119 17.063 16.909 16.718 16.518 16.325 16.162 15.997 15.847 15.709 15.578 15.444 15.32 15.203 15.073 14.947 14.828 14.697 14.56 14.454 14.336 14.217 14.137 14.045 13.935 13.828 13.736 13.666 13.586 13.445 13.353 13.263 13.215 13.126 13.019 12.896 12.834 12.557 12.588 12.512 12.443 12.26 12.153 12.042 11.936 11.817 11.665 11.422 11.106 -8 ,4170 ,TETRA ,17616482,Mon Nov 29 12:08:30 CET,Mon Nov 29 14:31:24 CET,0.0 0.987 1.361 1.606 1.866 2.12 2.328 2.524 2.874 3.019 3.167 3.218 3.57 3.7 3.914 4.121 4.316 4.41 4.598 4.775 5.031 5.195 5.353 5.596 5.836 6.045 6.257 6.47 6.742 6.992 7.222 7.492 7.758 8.006 8.305 8.67 8.993 9.343 9.739 10.183 10.638 11.129 11.694 12.253 12.915 13.62 14.384 15.222 16.128 17.098 18.084 18.678 18.796 18.719 18.592 18.416 18.22 17.997 17.791 17.569 17.355 17.162 16.979 16.809 16.644 16.489 16.338 16.207 16.089 15.954 15.799 15.676 15.564 15.453 15.373 15.29 15.188 15.084 14.971 14.886 14.806 14.68 14.598 14.52 14.476 14.381 14.275 14.155 14.092 13.825 13.887 13.822 13.757 13.59 13.48 13.363 13.217 13.037 12.877 12.703 11.789 -9 ,32675 ,TETRA ,17616483,Mon Nov 29 12:09:31 CET,Mon Nov 29 14:29:54 CET,0.0 0.712 1.058 1.352 1.637 1.899 2.136 2.348 2.709 2.871 3.025 3.096 3.452 3.585 3.822 4.064 4.301 4.403 4.593 4.798 5.099 5.28 5.44 5.663 5.889 6.113 6.338 6.555 6.822 7.073 7.303 7.58 7.863 8.131 8.415 8.725 9.03 9.38 9.753 10.131 10.542 11.009 11.547 12.109 12.769 13.44 14.177 15.031 15.926 16.873 17.882 18.475 18.683 18.649 18.467 18.209 17.965 17.739 17.53 17.316 17.12 16.945 16.767 16.598 16.43 16.26 16.055 15.852 15.681 15.512 15.338 15.192 15.041 14.883 14.764 14.653 14.555 14.453 14.324 14.23 14.142 14.004 13.903 13.799 13.747 13.661 13.576 13.474 13.418 13.157 13.231 13.158 13.085 12.934 12.859 12.786 12.675 12.533 12.355 12.135 11.804 -10 ,24918 ,TETRA ,17616484,Mon Nov 29 12:09:31 CET,Mon Nov 29 14:37:34 CET,0.0 1.139 1.525 1.824 2.091 2.327 2.543 2.746 3.108 3.271 3.43 3.516 3.886 4.019 4.285 4.545 4.8 4.919 5.161 5.391 5.695 5.894 6.085 6.359 6.62 6.868 7.117 7.357 7.666 7.956 8.245 8.598 8.938 9.267 9.629 10.028 10.432 10.89 11.367 11.878 12.402 12.967 13.628 14.266 14.963 15.727 16.669 17.724 18.82 20.034 21.236 21.85 22.037 22.02 21.896 21.7 21.399 21.066 20.76 20.442 20.158 19.901 19.669 19.431 19.222 19.046 18.854 18.683 18.534 18.387 18.217 18.066 17.916 17.76 17.64 17.508 17.377 17.25 17.123 17.034 16.935 16.789 16.698 16.596 16.536 16.411 16.283 16.162 16.099 15.825 15.883 15.803 15.713 15.526 15.427 15.292 15.152 15.036 14.885 14.697 14.256 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt deleted file mode 100644 index a77c6e0b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5201 ,TETRA ,17616485,Mon Nov 29 12:09:32 CET,Mon Nov 29 14:39:23 CET,0.0 0.805 0.983 1.149 1.285 1.416 1.534 1.638 1.829 1.922 2.017 1.987 2.272 2.361 2.542 2.697 2.845 2.922 3.062 3.19 3.388 3.508 3.599 3.722 3.833 3.937 4.043 4.147 4.287 4.433 4.58 4.765 4.959 5.144 5.341 5.549 5.745 5.971 6.202 6.437 6.671 6.915 7.179 7.43 7.695 7.958 8.26 8.532 8.73 8.765 8.362 7.534 6.722 5.97 5.292 4.663 4.094 3.586 3.153 2.676 2.258 1.897 1.55 1.248 0.965 0.689 0.395 0.13 -0.09 -0.336 -0.616 -0.819 -1.007 -1.217 -1.387 -1.551 -1.72 -1.894 -2.079 -2.21 -2.351 -2.579 -2.745 -2.913 -2.995 -3.17 -3.339 -3.514 -3.607 -3.923 -3.941 -4.043 -4.152 -4.392 -4.521 -4.676 -4.853 -5.045 -5.245 -5.546 -6.65 -2 ,31670 ,TETRA ,17616486,Mon Nov 29 12:09:34 CET,Mon Nov 29 14:38:41 CET,0.0 0.637 1.01 1.214 1.341 1.436 1.506 1.578 1.753 1.836 1.914 1.847 2.117 2.182 2.323 2.457 2.573 2.632 2.753 2.871 3.034 3.133 3.235 3.377 3.496 3.608 3.719 3.829 3.97 4.113 4.257 4.421 4.567 4.71 4.879 5.079 5.27 5.457 5.651 5.866 6.073 6.281 6.526 6.754 6.987 7.225 7.513 7.797 7.997 8.076 7.936 7.452 6.879 6.264 5.612 4.986 4.415 3.911 3.498 3.096 2.757 2.447 2.128 1.82 1.541 1.282 0.998 0.75 0.552 0.341 0.112 -0.064 -0.25 -0.45 -0.593 -0.742 -0.909 -1.082 -1.258 -1.379 -1.503 -1.706 -1.849 -1.994 -2.075 -2.255 -2.444 -2.621 -2.698 -3.007 -3.005 -3.1 -3.199 -3.443 -3.585 -3.73 -3.875 -4.044 -4.21 -4.38 -4.709 -3 ,25965 ,TETRA ,17616487,Mon Nov 29 12:10:29 CET,Mon Nov 29 14:41:36 CET,0.0 0.517 0.709 0.874 1.008 1.11 1.205 1.293 1.443 1.512 1.584 1.525 1.806 1.878 2.003 2.121 2.245 2.302 2.404 2.501 2.652 2.752 2.842 2.958 3.069 3.193 3.334 3.465 3.604 3.737 3.873 4.027 4.164 4.312 4.483 4.648 4.807 4.983 5.171 5.365 5.55 5.742 5.969 6.208 6.465 6.715 6.984 7.245 7.406 7.328 6.955 6.338 5.591 4.846 4.178 3.568 3.03 2.534 2.095 1.645 1.242 0.878 0.527 0.185 -0.131 -0.422 -0.731 -1.001 -1.227 -1.466 -1.702 -1.902 -2.12 -2.324 -2.469 -2.615 -2.776 -2.959 -3.157 -3.298 -3.442 -3.664 -3.812 -3.961 -4.042 -4.236 -4.44 -4.623 -4.704 -5.003 -5.014 -5.133 -5.251 -5.504 -5.658 -5.809 -5.935 -6.085 -6.269 -6.513 -6.992 -4 ,29584 ,TETRA ,17616488,Mon Nov 29 12:10:28 CET,Mon Nov 29 14:40:20 CET,0.0 0.621 0.795 0.933 1.028 1.129 1.231 1.334 1.494 1.556 1.625 1.567 1.84 1.911 2.042 2.174 2.301 2.351 2.442 2.544 2.697 2.788 2.869 2.996 3.127 3.255 3.371 3.482 3.634 3.77 3.915 4.099 4.262 4.409 4.561 4.738 4.915 5.106 5.31 5.518 5.726 5.958 6.211 6.441 6.694 6.964 7.217 7.407 7.521 7.479 7.063 6.298 5.594 4.96 4.367 3.817 3.321 2.86 2.445 2.011 1.659 1.361 1.063 0.78 0.536 0.304 0.048 -0.171 -0.362 -0.564 -0.771 -0.952 -1.137 -1.317 -1.468 -1.622 -1.767 -1.919 -2.09 -2.206 -2.327 -2.528 -2.657 -2.798 -2.88 -3.046 -3.222 -3.408 -3.509 -3.823 -3.825 -3.951 -4.085 -4.364 -4.518 -4.671 -4.829 -5.022 -5.237 -5.477 -6.382 -5 ,1479 ,TETRA ,17616489,Mon Nov 29 12:10:30 CET,Mon Nov 29 14:40:19 CET,0.0 0.701 1.072 1.347 1.501 1.616 1.723 1.811 1.969 2.048 2.136 2.134 2.428 2.508 2.656 2.792 2.921 2.979 3.081 3.192 3.382 3.513 3.631 3.803 3.98 4.142 4.281 4.405 4.557 4.702 4.842 5.0 5.15 5.29 5.457 5.649 5.836 6.034 6.252 6.466 6.647 6.846 7.076 7.299 7.552 7.783 8.011 8.233 8.39 8.371 8.047 7.42 6.721 6.034 5.386 4.782 4.252 3.754 3.29 2.823 2.429 2.06 1.719 1.413 1.136 0.887 0.59 0.288 0.019 -0.25 -0.513 -0.723 -0.938 -1.157 -1.318 -1.481 -1.655 -1.841 -2.029 -2.156 -2.29 -2.508 -2.657 -2.817 -2.9 -3.077 -3.273 -3.478 -3.585 -3.909 -3.976 -4.11 -4.242 -4.524 -4.663 -4.824 -4.99 -5.16 -5.331 -5.523 -5.927 -6 ,7565 ,TETRA ,17616490,Mon Nov 29 12:10:30 CET,Mon Nov 29 14:42:42 CET,0.0 0.7 0.92 1.082 1.228 1.36 1.467 1.571 1.77 1.86 1.951 1.918 2.201 2.274 2.405 2.542 2.681 2.743 2.856 2.974 3.148 3.252 3.365 3.525 3.67 3.81 3.938 4.065 4.226 4.368 4.507 4.696 4.885 5.073 5.274 5.482 5.687 5.917 6.154 6.376 6.589 6.81 7.042 7.265 7.514 7.728 7.909 8.079 8.192 8.216 7.952 7.322 6.703 5.967 5.219 4.575 4.041 3.562 3.115 2.667 2.3 1.997 1.709 1.421 1.151 0.908 0.671 0.45 0.241 0.028 -0.188 -0.367 -0.544 -0.722 -0.862 -1.008 -1.169 -1.342 -1.511 -1.634 -1.771 -1.993 -2.154 -2.319 -2.401 -2.549 -2.715 -2.909 -3.008 -3.318 -3.326 -3.438 -3.549 -3.798 -3.939 -4.098 -4.268 -4.443 -4.622 -4.87 -5.639 -7 ,25276 ,TETRA ,17616491,Mon Nov 29 12:11:29 CET,Mon Nov 29 14:43:49 CET,0.0 0.242 0.415 0.574 0.722 0.856 0.978 1.099 1.327 1.422 1.508 1.455 1.73 1.799 1.925 2.062 2.199 2.26 2.376 2.498 2.667 2.766 2.86 2.988 3.108 3.225 3.339 3.456 3.604 3.738 3.869 4.014 4.156 4.3 4.472 4.66 4.844 5.052 5.272 5.502 5.727 5.985 6.291 6.556 6.841 7.13 7.406 7.635 7.771 7.823 7.561 6.813 6.069 5.391 4.767 4.219 3.713 3.224 2.825 2.434 2.053 1.651 1.262 0.928 0.63 0.358 0.084 -0.152 -0.353 -0.571 -0.818 -1.012 -1.211 -1.42 -1.572 -1.736 -1.916 -2.094 -2.282 -2.424 -2.573 -2.792 -2.934 -3.078 -3.158 -3.329 -3.501 -3.684 -3.779 -4.087 -4.097 -4.209 -4.321 -4.605 -4.774 -4.958 -5.141 -5.308 -5.512 -5.812 -6.344 -8 ,3711 ,TETRA ,17616492,Mon Nov 29 12:11:30 CET,Mon Nov 29 14:37:52 CET,0.0 0.572 0.794 0.931 1.049 1.165 1.276 1.409 1.686 1.797 1.902 1.89 2.172 2.245 2.375 2.495 2.61 2.669 2.79 2.899 3.051 3.149 3.245 3.377 3.502 3.63 3.753 3.871 4.038 4.209 4.357 4.53 4.701 4.859 5.034 5.248 5.457 5.665 5.891 6.103 6.313 6.56 6.85 7.142 7.425 7.683 7.945 8.186 8.388 8.451 8.104 7.372 6.65 5.938 5.282 4.693 4.186 3.703 3.262 2.804 2.347 1.903 1.553 1.266 0.99 0.734 0.455 0.196 -0.013 -0.224 -0.466 -0.684 -0.919 -1.157 -1.327 -1.494 -1.664 -1.845 -2.036 -2.17 -2.308 -2.525 -2.667 -2.812 -2.894 -3.063 -3.22 -3.394 -3.485 -3.775 -3.74 -3.833 -3.928 -4.14 -4.252 -4.374 -4.509 -4.657 -4.837 -5.106 -5.779 -9 ,7877 ,TETRA ,17616493,Mon Nov 29 12:11:30 CET,Mon Nov 29 14:42:26 CET,0.0 0.302 0.521 0.705 0.843 0.962 1.07 1.18 1.394 1.491 1.57 1.49 1.765 1.831 1.944 2.062 2.188 2.245 2.358 2.466 2.622 2.721 2.806 2.927 3.035 3.131 3.243 3.365 3.524 3.679 3.831 3.996 4.137 4.272 4.419 4.581 4.739 4.925 5.143 5.367 5.599 5.85 6.117 6.367 6.62 6.885 7.16 7.427 7.719 7.859 7.548 6.853 6.139 5.425 4.774 4.196 3.665 3.175 2.763 2.339 1.963 1.641 1.336 1.006 0.693 0.424 0.136 -0.147 -0.4 -0.65 -0.896 -1.093 -1.292 -1.503 -1.66 -1.81 -1.969 -2.136 -2.301 -2.41 -2.527 -2.712 -2.842 -2.995 -3.07 -3.21 -3.376 -3.553 -3.64 -3.935 -3.901 -3.991 -4.084 -4.276 -4.382 -4.511 -4.664 -4.804 -4.97 -5.209 -5.591 -10 ,12016 ,TETRA ,17616494,Mon Nov 29 12:11:32 CET,Mon Nov 29 14:42:40 CET,0.0 0.888 1.054 1.186 1.314 1.449 1.606 1.781 2.041 2.138 2.218 2.151 2.42 2.479 2.604 2.735 2.852 2.906 3.009 3.115 3.277 3.372 3.458 3.578 3.698 3.825 3.935 4.041 4.187 4.32 4.447 4.602 4.763 4.915 5.082 5.275 5.454 5.632 5.819 6.018 6.249 6.491 6.74 6.979 7.195 7.428 7.704 7.927 8.04 8.075 7.82 7.177 6.497 5.85 5.231 4.61 4.057 3.589 3.187 2.743 2.354 2.013 1.681 1.378 1.098 0.831 0.558 0.301 0.052 -0.201 -0.456 -0.681 -0.91 -1.127 -1.294 -1.469 -1.644 -1.82 -1.994 -2.108 -2.228 -2.422 -2.568 -2.733 -2.822 -3.009 -3.193 -3.376 -3.477 -3.791 -3.785 -3.898 -4.028 -4.282 -4.409 -4.557 -4.726 -4.898 -5.107 -5.392 -5.882 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt deleted file mode 100644 index 34e56e7e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28436 ,TETRA ,17616495,Mon Nov 29 12:11:30 CET,Mon Nov 29 14:42:19 CET,0.0 0.488 0.765 0.925 1.068 1.188 1.3 1.419 1.652 1.759 1.863 1.866 2.158 2.247 2.409 2.553 2.698 2.763 2.891 3.033 3.256 3.396 3.535 3.739 3.933 4.11 4.27 4.434 4.652 4.868 5.078 5.337 5.587 5.819 6.088 6.383 6.666 6.988 7.33 7.68 8.076 8.545 9.055 9.547 10.127 10.764 11.49 12.291 13.176 14.117 15.126 15.739 15.881 15.813 15.618 15.346 15.06 14.746 14.444 14.139 13.858 13.571 13.285 13.014 12.747 12.512 12.278 12.051 11.83 11.604 11.376 11.179 10.961 10.738 10.567 10.371 10.143 9.911 9.694 9.543 9.39 9.165 9.008 8.835 8.739 8.535 8.312 8.074 7.952 7.635 7.556 7.405 7.253 6.926 6.742 6.529 6.307 6.065 5.755 5.315 4.278 -2 ,13617 ,TETRA ,17616496,Mon Nov 29 12:11:32 CET,Mon Nov 29 14:41:43 CET,0.0 0.476 0.716 0.898 1.056 1.189 1.307 1.423 1.678 1.788 1.881 1.871 2.161 2.255 2.43 2.605 2.794 2.884 3.04 3.175 3.372 3.508 3.652 3.858 4.058 4.263 4.453 4.607 4.785 4.956 5.114 5.314 5.517 5.718 5.963 6.222 6.463 6.73 7.012 7.32 7.646 8.005 8.408 8.811 9.282 9.777 10.324 10.927 11.617 12.331 12.977 13.195 13.085 12.836 12.572 12.294 11.955 11.631 11.346 11.035 10.77 10.528 10.283 10.046 9.825 9.623 9.414 9.206 9.007 8.802 8.581 8.385 8.176 7.973 7.805 7.607 7.407 7.21 7.006 6.861 6.723 6.527 6.379 6.21 6.123 5.942 5.74 5.533 5.431 5.13 5.08 4.942 4.806 4.525 4.352 4.157 3.965 3.778 3.545 3.241 2.683 -3 ,21554 ,TETRA ,17616497,Mon Nov 29 12:11:30 CET,Mon Nov 29 14:39:59 CET,0.0 0.459 0.663 0.846 0.982 1.103 1.228 1.355 1.584 1.686 1.778 1.757 2.047 2.128 2.283 2.436 2.581 2.644 2.756 2.857 3.01 3.116 3.224 3.379 3.527 3.669 3.805 3.934 4.099 4.275 4.462 4.695 4.917 5.116 5.335 5.573 5.821 6.104 6.39 6.69 7.013 7.367 7.754 8.16 8.661 9.194 9.774 10.399 11.138 11.962 12.741 13.094 12.996 12.821 12.619 12.308 11.968 11.651 11.349 11.016 10.714 10.44 10.181 9.919 9.658 9.417 9.18 8.976 8.786 8.589 8.383 8.207 8.026 7.83 7.682 7.536 7.377 7.217 7.054 6.929 6.791 6.598 6.463 6.313 6.242 6.084 5.898 5.702 5.608 5.32 5.299 5.166 5.029 4.762 4.617 4.447 4.268 4.074 3.829 3.519 3.036 -4 ,31212 ,TETRA ,17616498,Mon Nov 29 12:11:30 CET,Mon Nov 29 14:43:27 CET,0.0 0.765 1.012 1.207 1.399 1.536 1.65 1.768 1.984 2.082 2.18 2.156 2.443 2.525 2.684 2.822 2.954 3.024 3.162 3.288 3.46 3.573 3.688 3.858 4.035 4.201 4.347 4.497 4.696 4.875 5.051 5.266 5.461 5.648 5.871 6.125 6.384 6.674 6.977 7.297 7.62 7.989 8.426 8.835 9.299 9.836 10.44 11.085 11.817 12.567 13.178 13.341 13.281 13.063 12.757 12.443 12.127 11.775 11.419 11.077 10.774 10.49 10.217 9.957 9.712 9.474 9.217 8.99 8.795 8.583 8.355 8.161 7.956 7.749 7.592 7.425 7.239 7.029 6.806 6.66 6.497 6.229 6.054 5.87 5.776 5.594 5.408 5.205 5.086 4.766 4.692 4.542 4.394 4.069 3.883 3.7 3.514 3.317 3.091 2.792 1.823 -5 ,28918 ,TETRA ,17616499,Mon Nov 29 12:12:31 CET,Mon Nov 29 14:44:12 CET,0.0 0.324 0.51 0.689 0.857 0.993 1.119 1.254 1.487 1.58 1.682 1.697 1.995 2.099 2.298 2.476 2.638 2.712 2.853 2.972 3.132 3.243 3.347 3.489 3.636 3.788 3.935 4.08 4.271 4.452 4.631 4.848 5.061 5.266 5.493 5.747 5.995 6.267 6.56 6.858 7.145 7.473 7.892 8.34 8.831 9.361 9.975 10.628 11.343 12.105 12.903 13.275 13.254 13.066 12.803 12.509 12.228 11.935 11.652 11.346 11.057 10.802 10.538 10.25 9.982 9.766 9.557 9.356 9.165 8.968 8.773 8.616 8.45 8.267 8.121 7.97 7.81 7.636 7.435 7.293 7.157 6.958 6.817 6.672 6.601 6.445 6.274 6.092 5.993 5.692 5.673 5.574 5.469 5.205 5.057 4.878 4.668 4.448 4.214 3.917 3.156 -6 ,7015 ,TETRA ,17616500,Mon Nov 29 12:12:31 CET,Mon Nov 29 14:42:06 CET,0.0 0.231 0.381 0.504 0.644 0.764 0.874 0.991 1.214 1.326 1.429 1.437 1.743 1.824 1.978 2.142 2.286 2.341 2.457 2.581 2.771 2.897 3.001 3.147 3.313 3.497 3.691 3.877 4.118 4.35 4.539 4.733 4.928 5.125 5.368 5.628 5.857 6.119 6.414 6.725 7.067 7.466 7.892 8.3 8.797 9.379 10.0 10.659 11.439 12.305 13.183 13.643 13.68 13.478 13.179 12.858 12.527 12.191 11.89 11.583 11.301 11.036 10.774 10.522 10.268 10.006 9.735 9.473 9.23 8.984 8.737 8.545 8.352 8.153 7.981 7.794 7.58 7.344 7.105 6.953 6.795 6.526 6.342 6.145 6.036 5.818 5.599 5.36 5.228 4.905 4.885 4.745 4.584 4.245 4.055 3.858 3.634 3.384 3.087 2.685 1.571 -7 ,31846 ,TETRA ,17616501,Mon Nov 29 12:12:31 CET,Mon Nov 29 14:42:30 CET,0.0 0.199 0.39 0.584 0.742 0.858 0.964 1.066 1.287 1.389 1.481 1.446 1.72 1.792 1.933 2.076 2.225 2.297 2.413 2.514 2.67 2.774 2.88 3.038 3.192 3.344 3.494 3.639 3.821 4.028 4.249 4.508 4.718 4.897 5.121 5.37 5.603 5.851 6.125 6.426 6.72 7.109 7.599 8.021 8.491 9.017 9.604 10.235 10.964 11.719 12.425 12.811 12.852 12.745 12.548 12.289 12.03 11.767 11.514 11.256 11.018 10.808 10.611 10.392 10.183 10.008 9.835 9.667 9.511 9.343 9.151 8.987 8.821 8.624 8.463 8.294 8.123 7.968 7.808 7.696 7.576 7.391 7.266 7.129 7.061 6.917 6.766 6.615 6.534 6.262 6.272 6.167 6.057 5.817 5.7 5.573 5.411 5.232 5.019 4.734 3.995 -8 ,28767 ,TETRA ,17616502,Mon Nov 29 12:12:31 CET,Mon Nov 29 14:42:15 CET,0.0 0.317 0.512 0.647 0.765 0.882 0.988 1.083 1.274 1.363 1.442 1.4 1.682 1.766 1.929 2.091 2.25 2.323 2.459 2.602 2.806 2.922 3.041 3.217 3.377 3.514 3.643 3.783 3.967 4.151 4.349 4.592 4.82 5.035 5.258 5.493 5.723 5.988 6.279 6.579 6.893 7.239 7.655 8.086 8.559 9.068 9.68 10.344 11.006 11.705 12.475 12.852 12.84 12.71 12.482 12.138 11.783 11.452 11.157 10.842 10.534 10.256 10.01 9.775 9.546 9.333 9.082 8.846 8.633 8.38 8.103 7.851 7.578 7.306 7.088 6.869 6.648 6.41 6.14 5.954 5.797 5.567 5.405 5.244 5.163 4.985 4.778 4.565 4.458 4.148 4.108 3.982 3.826 3.464 3.259 3.047 2.835 2.604 2.349 2.048 1.493 -9 ,32255 ,TETRA ,17616503,Mon Nov 29 12:12:31 CET,Mon Nov 29 14:42:02 CET,0.0 0.45 0.646 0.827 0.998 1.151 1.266 1.374 1.604 1.709 1.802 1.768 2.05 2.133 2.315 2.494 2.638 2.702 2.832 2.954 3.129 3.257 3.392 3.605 3.811 4.004 4.172 4.325 4.532 4.727 4.907 5.125 5.339 5.536 5.77 6.032 6.264 6.521 6.814 7.197 7.618 8.015 8.478 8.963 9.487 10.046 10.655 11.264 11.937 12.687 13.486 13.821 13.771 13.587 13.309 13.012 12.737 12.439 12.134 11.809 11.52 11.233 10.965 10.735 10.542 10.357 10.129 9.923 9.731 9.511 9.271 9.066 8.861 8.657 8.502 8.329 8.135 7.919 7.679 7.5 7.312 7.021 6.816 6.602 6.485 6.245 5.982 5.689 5.542 5.193 5.069 4.923 4.79 4.501 4.335 4.131 3.887 3.617 3.338 3.062 2.431 -10 ,15233 ,TETRA ,17616504,Mon Nov 29 12:12:31 CET,Mon Nov 29 14:41:54 CET,0.0 0.378 0.563 0.778 0.965 1.121 1.27 1.411 1.676 1.807 1.937 1.98 2.291 2.398 2.603 2.769 2.908 2.97 3.07 3.172 3.345 3.464 3.576 3.737 3.906 4.056 4.195 4.333 4.506 4.687 4.861 5.056 5.26 5.454 5.658 5.895 6.139 6.406 6.696 7.019 7.379 7.78 8.212 8.623 9.084 9.587 10.115 10.667 11.325 12.08 12.808 13.146 13.137 12.947 12.694 12.386 12.026 11.669 11.364 11.022 10.71 10.432 10.154 9.896 9.661 9.434 9.193 8.973 8.775 8.58 8.372 8.189 7.992 7.803 7.648 7.47 7.297 7.12 6.93 6.799 6.67 6.468 6.319 6.166 6.092 5.947 5.802 5.634 5.542 5.256 5.244 5.13 5.004 4.727 4.558 4.374 4.185 3.979 3.773 3.511 3.033 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 75f33791..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5078 ,TETRA ,17616505,Mon Nov 29 12:12:33 CET,Mon Nov 29 14:37:36 CET,0.0 0.177 0.311 0.436 0.536 0.627 0.684 0.723 0.815 0.868 0.907 0.761 0.998 1.026 1.088 1.141 1.191 1.219 1.263 1.295 1.341 1.369 1.401 1.453 1.505 1.554 1.593 1.631 1.686 1.734 1.767 1.792 1.813 1.824 1.828 1.832 1.85 1.863 1.85 1.81 1.736 1.628 1.483 1.313 1.066 0.732 0.292 -0.326 -1.263 -2.688 -5.013 -7.827 -10.244 -12.253 -13.982 -15.528 -16.857 -18.075 -19.141 -20.204 -21.109 -21.947 -22.745 -23.504 -24.197 -24.781 -25.375 -25.891 -26.345 -26.864 -27.393 -27.812 -28.225 -28.652 -29.003 -29.352 -29.718 -30.105 -30.514 -30.8 -31.077 -31.52 -31.828 -32.132 -32.295 -32.649 -33.007 -33.369 -33.567 -34.022 -34.202 -34.414 -34.636 -35.13 -35.406 -35.707 -36.003 -36.337 -36.778 -37.375 -38.916 -2 ,8779 ,TETRA ,17616506,Mon Nov 29 12:12:32 CET,Mon Nov 29 14:38:02 CET,0.0 0.324 0.515 0.617 0.732 0.845 0.927 0.988 1.103 1.153 1.197 1.067 1.303 1.339 1.408 1.463 1.515 1.543 1.6 1.654 1.716 1.751 1.79 1.845 1.89 1.935 1.978 2.018 2.068 2.11 2.152 2.194 2.227 2.25 2.257 2.272 2.29 2.285 2.255 2.206 2.137 2.05 1.947 1.811 1.586 1.247 0.759 0.057 -0.98 -2.551 -5.078 -8.05 -10.619 -12.761 -14.469 -15.987 -17.351 -18.572 -19.595 -20.652 -21.589 -22.349 -23.081 -23.827 -24.505 -25.092 -25.686 -26.224 -26.697 -27.162 -27.632 -28.044 -28.496 -28.958 -29.3 -29.671 -30.042 -30.39 -30.784 -31.092 -31.42 -31.899 -32.227 -32.586 -32.762 -33.101 -33.458 -33.845 -34.042 -34.488 -34.634 -34.842 -35.071 -35.579 -35.877 -36.175 -36.464 -36.827 -37.294 -37.911 -39.407 -3 ,14533 ,TETRA ,17616507,Mon Nov 29 12:12:33 CET,Mon Nov 29 14:38:40 CET,0.0 0.261 0.442 0.545 0.629 0.703 0.776 0.839 0.939 1.0 1.064 0.958 1.205 1.243 1.309 1.387 1.473 1.504 1.563 1.636 1.732 1.782 1.826 1.89 1.938 1.976 2.023 2.065 2.109 2.145 2.178 2.203 2.223 2.245 2.259 2.263 2.253 2.25 2.254 2.234 2.171 2.089 1.968 1.785 1.543 1.227 0.793 0.159 -0.855 -2.411 -4.918 -7.948 -10.5 -12.719 -14.643 -16.332 -17.772 -19.027 -20.121 -21.29 -22.301 -23.128 -23.932 -24.708 -25.382 -25.996 -26.645 -27.22 -27.735 -28.269 -28.804 -29.258 -29.728 -30.211 -30.6 -30.99 -31.355 -31.705 -32.072 -32.352 -32.644 -33.085 -33.395 -33.727 -33.904 -34.272 -34.641 -35.028 -35.242 -35.706 -35.925 -36.166 -36.424 -37.005 -37.326 -37.686 -38.097 -38.506 -38.988 -39.659 -41.919 -4 ,10399 ,TETRA ,17616508,Mon Nov 29 12:13:30 CET,Mon Nov 29 14:39:28 CET,0.0 0.137 0.212 0.299 0.404 0.488 0.556 0.615 0.725 0.779 0.833 0.714 0.95 0.987 1.077 1.167 1.242 1.278 1.338 1.376 1.43 1.472 1.506 1.547 1.591 1.63 1.661 1.7 1.75 1.786 1.835 1.899 1.939 1.959 1.962 1.951 1.935 1.913 1.885 1.843 1.784 1.712 1.6 1.428 1.191 0.865 0.413 -0.179 -1.107 -2.497 -4.732 -7.504 -9.778 -11.726 -13.408 -14.829 -16.039 -17.138 -18.102 -19.104 -19.988 -20.767 -21.525 -22.26 -22.935 -23.549 -24.211 -24.78 -25.254 -25.765 -26.27 -26.701 -27.184 -27.676 -28.048 -28.421 -28.778 -29.157 -29.576 -29.852 -30.129 -30.565 -30.87 -31.2 -31.368 -31.728 -32.1 -32.466 -32.665 -33.113 -33.282 -33.495 -33.725 -34.285 -34.587 -34.904 -35.269 -35.684 -36.153 -36.799 -39.427 -5 ,13688 ,TETRA ,17616509,Mon Nov 29 12:13:29 CET,Mon Nov 29 14:37:16 CET,0.0 0.219 0.369 0.483 0.586 0.679 0.778 0.851 0.944 0.989 1.019 0.868 1.105 1.128 1.171 1.222 1.267 1.288 1.324 1.358 1.395 1.414 1.441 1.479 1.517 1.561 1.592 1.613 1.636 1.655 1.666 1.69 1.727 1.747 1.752 1.746 1.726 1.698 1.666 1.613 1.548 1.45 1.294 1.118 0.888 0.589 0.188 -0.359 -1.23 -2.671 -5.248 -8.32 -10.931 -13.165 -14.995 -16.645 -18.101 -19.388 -20.494 -21.57 -22.51 -23.354 -24.121 -24.856 -25.546 -26.18 -26.833 -27.42 -27.933 -28.44 -28.946 -29.363 -29.813 -30.299 -30.663 -31.017 -31.389 -31.762 -32.151 -32.429 -32.722 -33.181 -33.493 -33.814 -33.977 -34.318 -34.674 -35.037 -35.23 -35.687 -35.87 -36.098 -36.337 -36.845 -37.149 -37.473 -37.81 -38.167 -38.583 -39.129 -40.86 -6 ,22296 ,TETRA ,17616510,Mon Nov 29 12:13:30 CET,Mon Nov 29 14:38:12 CET,0.0 0.322 0.464 0.574 0.651 0.724 0.803 0.884 1.002 1.059 1.106 0.978 1.233 1.272 1.341 1.418 1.483 1.513 1.582 1.642 1.706 1.741 1.773 1.819 1.867 1.917 1.96 2.011 2.075 2.104 2.112 2.122 2.129 2.141 2.146 2.132 2.126 2.121 2.099 2.053 1.981 1.872 1.737 1.581 1.309 0.937 0.42 -0.3 -1.296 -2.799 -5.259 -8.178 -10.588 -12.607 -14.435 -16.145 -17.567 -18.769 -19.803 -20.921 -21.932 -22.797 -23.573 -24.307 -25.012 -25.658 -26.319 -26.891 -27.391 -27.893 -28.4 -28.839 -29.309 -29.773 -30.106 -30.467 -30.859 -31.261 -31.692 -31.984 -32.276 -32.752 -33.085 -33.421 -33.577 -33.91 -34.27 -34.622 -34.818 -35.29 -35.531 -35.781 -36.03 -36.554 -36.818 -37.108 -37.476 -37.892 -38.351 -38.901 -40.928 -7 ,24069 ,TETRA ,17616511,Mon Nov 29 12:13:30 CET,Mon Nov 29 14:41:08 CET,0.0 0.318 0.433 0.521 0.589 0.65 0.712 0.76 0.831 0.884 0.948 0.835 1.066 1.102 1.186 1.271 1.341 1.366 1.421 1.485 1.561 1.602 1.645 1.7 1.741 1.786 1.825 1.86 1.914 1.957 1.992 2.023 2.044 2.056 2.085 2.113 2.113 2.099 2.082 2.06 2.017 1.954 1.829 1.662 1.436 1.104 0.617 -0.017 -0.942 -2.406 -4.908 -7.818 -10.171 -12.305 -14.186 -15.801 -17.245 -18.575 -19.714 -20.857 -21.808 -22.647 -23.458 -24.217 -24.962 -25.656 -26.344 -26.948 -27.46 -27.966 -28.478 -28.912 -29.368 -29.838 -30.194 -30.563 -30.956 -31.368 -31.783 -32.071 -32.369 -32.816 -33.132 -33.455 -33.622 -33.983 -34.35 -34.754 -34.978 -35.447 -35.654 -35.893 -36.136 -36.634 -36.916 -37.262 -37.657 -38.106 -38.615 -39.231 -40.802 -8 ,3500 ,TETRA ,17616512,Mon Nov 29 12:13:32 CET,Mon Nov 29 14:41:36 CET,0.0 0.331 0.502 0.602 0.666 0.737 0.795 0.843 0.931 0.979 1.032 0.918 1.154 1.184 1.242 1.293 1.333 1.355 1.403 1.45 1.507 1.533 1.563 1.618 1.687 1.769 1.844 1.911 1.991 2.043 2.085 2.137 2.171 2.193 2.204 2.19 2.18 2.175 2.158 2.107 2.03 1.923 1.765 1.606 1.371 1.015 0.5 -0.205 -1.222 -2.789 -5.36 -8.432 -10.972 -13.079 -14.92 -16.568 -18.001 -19.271 -20.398 -21.524 -22.437 -23.248 -24.008 -24.713 -25.376 -25.992 -26.658 -27.252 -27.767 -28.284 -28.813 -29.275 -29.764 -30.276 -30.671 -31.063 -31.44 -31.825 -32.223 -32.493 -32.779 -33.246 -33.554 -33.86 -34.023 -34.37 -34.758 -35.162 -35.369 -35.842 -36.081 -36.33 -36.583 -37.123 -37.419 -37.738 -38.092 -38.507 -38.997 -39.624 -42.134 -9 ,22866 ,TETRA ,17616513,Mon Nov 29 12:13:31 CET,Mon Nov 29 14:39:09 CET,0.0 0.499 0.665 0.829 0.941 1.018 1.09 1.16 1.284 1.341 1.384 1.257 1.503 1.534 1.607 1.691 1.759 1.788 1.849 1.904 1.984 2.033 2.073 2.127 2.168 2.2 2.228 2.256 2.286 2.314 2.34 2.364 2.384 2.401 2.408 2.398 2.391 2.374 2.341 2.288 2.238 2.179 2.057 1.889 1.646 1.311 0.891 0.297 -0.694 -2.191 -4.658 -7.684 -10.26 -12.36 -14.131 -15.773 -17.254 -18.62 -19.776 -20.878 -21.8 -22.621 -23.365 -24.026 -24.651 -25.246 -25.874 -26.454 -26.948 -27.443 -27.969 -28.402 -28.833 -29.282 -29.63 -29.988 -30.365 -30.766 -31.176 -31.466 -31.784 -32.274 -32.616 -32.97 -33.138 -33.493 -33.89 -34.29 -34.493 -34.946 -35.118 -35.335 -35.586 -36.135 -36.421 -36.743 -37.103 -37.484 -37.95 -38.626 -40.651 -10 ,16264 ,TETRA ,17616514,Mon Nov 29 12:13:29 CET,Mon Nov 29 14:39:19 CET,0.0 0.321 0.492 0.605 0.701 0.796 0.877 0.929 1.008 1.05 1.092 0.961 1.198 1.232 1.294 1.338 1.382 1.408 1.459 1.513 1.61 1.663 1.703 1.759 1.811 1.856 1.891 1.926 1.97 2.0 2.014 2.03 2.054 2.076 2.095 2.106 2.105 2.105 2.11 2.102 2.084 2.036 1.924 1.786 1.555 1.213 0.719 0.011 -0.965 -2.468 -4.925 -7.922 -10.508 -12.67 -14.479 -16.105 -17.587 -18.901 -20.009 -21.073 -21.975 -22.805 -23.591 -24.271 -24.878 -25.46 -26.076 -26.65 -27.163 -27.674 -28.192 -28.617 -29.062 -29.507 -29.83 -30.17 -30.542 -30.957 -31.4 -31.7 -31.993 -32.452 -32.772 -33.085 -33.243 -33.598 -33.962 -34.333 -34.539 -34.997 -35.208 -35.456 -35.709 -36.282 -36.595 -36.906 -37.249 -37.662 -38.127 -38.717 -40.368 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt deleted file mode 100644 index d152a359..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,830 ,TETRA ,17616515,Mon Nov 29 12:13:32 CET,Mon Nov 29 14:22:17 CET,0.0 0.394 0.542 0.661 0.75 0.834 0.901 0.976 1.111 1.155 1.192 1.198 1.317 1.375 1.482 1.568 1.655 1.695 1.771 1.834 1.917 1.98 2.053 2.155 2.247 2.336 2.413 2.479 2.578 2.676 2.758 2.847 2.931 3.03 3.157 3.298 3.428 3.552 3.693 3.863 4.033 4.212 4.399 4.578 4.776 4.978 5.209 5.441 5.651 5.795 5.788 5.455 4.999 4.569 4.201 3.864 3.559 3.258 3.003 2.754 2.538 2.355 2.171 1.986 1.825 1.68 1.514 1.37 1.255 1.13 0.998 0.883 0.769 0.664 0.572 0.471 0.372 0.274 0.17 0.092 0.02 -0.087 -0.166 -0.254 -0.303 -0.403 -0.499 -0.583 -0.63 -0.763 -0.786 -0.847 -0.916 -1.064 -1.151 -1.237 -1.308 -1.368 -1.433 -1.568 -1.77 -2 ,7073 ,TETRA ,17616516,Mon Nov 29 12:13:31 CET,Mon Nov 29 14:23:21 CET,0.0 0.203 0.313 0.407 0.491 0.57 0.639 0.723 0.886 0.946 1.0 1.023 1.151 1.204 1.289 1.364 1.443 1.481 1.551 1.616 1.711 1.781 1.856 1.947 2.033 2.102 2.163 2.226 2.308 2.401 2.496 2.601 2.695 2.781 2.884 3.027 3.158 3.286 3.418 3.563 3.722 3.868 4.035 4.199 4.368 4.544 4.731 4.904 5.064 5.197 5.174 4.873 4.548 4.228 3.885 3.536 3.237 2.968 2.721 2.465 2.22 2.007 1.819 1.65 1.496 1.358 1.211 1.067 0.939 0.805 0.665 0.559 0.455 0.352 0.265 0.169 0.07 -0.041 -0.156 -0.225 -0.291 -0.398 -0.477 -0.559 -0.604 -0.699 -0.792 -0.889 -0.94 -1.065 -1.074 -1.136 -1.198 -1.303 -1.366 -1.434 -1.519 -1.622 -1.756 -1.893 -2.196 -3 ,4367 ,TETRA ,17616517,Mon Nov 29 12:13:32 CET,Mon Nov 29 14:23:21 CET,0.0 0.178 0.358 0.473 0.54 0.582 0.633 0.69 0.788 0.842 0.896 0.9 1.005 1.035 1.108 1.172 1.234 1.268 1.325 1.369 1.436 1.478 1.527 1.602 1.673 1.756 1.835 1.91 2.007 2.093 2.177 2.272 2.348 2.425 2.526 2.654 2.77 2.877 2.988 3.118 3.265 3.416 3.595 3.78 3.955 4.126 4.332 4.533 4.749 4.935 4.896 4.602 4.27 3.938 3.64 3.344 3.068 2.848 2.637 2.4 2.199 2.019 1.839 1.671 1.527 1.382 1.225 1.095 0.987 0.858 0.725 0.624 0.52 0.394 0.294 0.202 0.101 -0.01 -0.123 -0.19 -0.245 -0.323 -0.388 -0.463 -0.503 -0.575 -0.641 -0.716 -0.756 -0.887 -0.913 -0.96 -1.011 -1.121 -1.177 -1.236 -1.307 -1.395 -1.495 -1.605 -1.769 -4 ,25237 ,TETRA ,17616518,Mon Nov 29 12:14:30 CET,Mon Nov 29 14:27:49 CET,0.0 0.229 0.359 0.429 0.488 0.551 0.618 0.682 0.797 0.853 0.917 0.963 1.088 1.129 1.207 1.285 1.362 1.406 1.486 1.562 1.669 1.729 1.786 1.864 1.941 2.023 2.111 2.193 2.28 2.356 2.426 2.521 2.623 2.717 2.823 2.935 3.044 3.166 3.296 3.432 3.557 3.689 3.832 3.962 4.113 4.265 4.427 4.605 4.746 4.851 4.803 4.551 4.286 3.991 3.683 3.411 3.192 2.981 2.769 2.544 2.372 2.22 2.056 1.898 1.753 1.615 1.475 1.359 1.251 1.13 1.018 0.918 0.811 0.71 0.63 0.543 0.451 0.367 0.267 0.197 0.132 0.025 -0.045 -0.115 -0.153 -0.229 -0.312 -0.403 -0.444 -0.568 -0.603 -0.662 -0.713 -0.826 -0.894 -0.963 -1.03 -1.113 -1.195 -1.269 -1.449 -5 ,30858 ,TETRA ,17616519,Mon Nov 29 12:14:31 CET,Mon Nov 29 14:23:13 CET,0.0 0.312 0.426 0.534 0.619 0.693 0.771 0.852 0.997 1.061 1.12 1.148 1.28 1.335 1.432 1.527 1.614 1.657 1.738 1.812 1.912 1.978 2.038 2.119 2.203 2.283 2.354 2.421 2.512 2.603 2.686 2.79 2.891 2.987 3.109 3.237 3.357 3.498 3.634 3.776 3.919 4.082 4.271 4.433 4.605 4.781 4.969 5.144 5.301 5.389 5.323 5.066 4.72 4.357 4.027 3.736 3.474 3.214 2.973 2.737 2.525 2.329 2.146 1.974 1.818 1.672 1.53 1.41 1.3 1.186 1.071 0.97 0.862 0.747 0.663 0.581 0.488 0.382 0.28 0.22 0.16 0.043 -0.049 -0.134 -0.177 -0.268 -0.368 -0.49 -0.549 -0.678 -0.718 -0.787 -0.853 -0.975 -1.028 -1.079 -1.143 -1.253 -1.396 -1.575 -1.993 -6 ,26261 ,TETRA ,17616520,Mon Nov 29 12:14:31 CET,Mon Nov 29 14:24:20 CET,0.0 0.212 0.296 0.373 0.454 0.549 0.649 0.735 0.86 0.921 0.983 0.997 1.122 1.172 1.258 1.339 1.423 1.46 1.532 1.597 1.682 1.743 1.802 1.885 1.956 2.018 2.09 2.156 2.242 2.326 2.411 2.518 2.619 2.713 2.814 2.924 3.03 3.134 3.237 3.346 3.464 3.588 3.726 3.866 4.021 4.207 4.402 4.566 4.723 4.816 4.752 4.475 4.145 3.852 3.561 3.249 2.973 2.734 2.521 2.31 2.128 1.973 1.832 1.692 1.569 1.452 1.334 1.23 1.126 1.015 0.906 0.817 0.726 0.634 0.565 0.495 0.42 0.337 0.25 0.193 0.125 0.01 -0.066 -0.14 -0.179 -0.263 -0.343 -0.442 -0.502 -0.634 -0.651 -0.698 -0.751 -0.856 -0.913 -0.989 -1.075 -1.146 -1.204 -1.312 -1.533 -7 ,7216 ,TETRA ,17616521,Mon Nov 29 12:14:31 CET,Mon Nov 29 14:23:33 CET,0.0 0.236 0.397 0.509 0.597 0.66 0.712 0.773 0.922 0.987 1.036 1.059 1.184 1.226 1.305 1.386 1.465 1.502 1.58 1.66 1.779 1.846 1.907 2.003 2.106 2.199 2.272 2.349 2.439 2.537 2.657 2.797 2.904 2.995 3.107 3.229 3.354 3.486 3.615 3.756 3.9 4.047 4.214 4.361 4.531 4.719 4.913 5.106 5.287 5.417 5.368 5.123 4.824 4.496 4.18 3.901 3.633 3.374 3.141 2.897 2.68 2.48 2.304 2.145 1.995 1.857 1.713 1.583 1.463 1.345 1.238 1.147 1.046 0.936 0.849 0.757 0.669 0.567 0.446 0.374 0.298 0.163 0.066 -0.027 -0.065 -0.152 -0.267 -0.37 -0.418 -0.55 -0.584 -0.649 -0.708 -0.826 -0.899 -0.985 -1.082 -1.177 -1.291 -1.435 -1.756 -8 ,28688 ,TETRA ,17616522,Mon Nov 29 12:14:33 CET,Mon Nov 29 14:24:11 CET,0.0 0.231 0.354 0.479 0.57 0.652 0.745 0.833 0.975 1.032 1.087 1.12 1.248 1.294 1.384 1.472 1.569 1.616 1.711 1.809 1.931 1.988 2.041 2.125 2.206 2.289 2.363 2.436 2.532 2.622 2.713 2.819 2.924 3.031 3.146 3.271 3.389 3.517 3.665 3.82 3.979 4.145 4.311 4.469 4.655 4.849 5.053 5.266 5.455 5.521 5.403 5.09 4.685 4.29 3.953 3.638 3.337 3.054 2.807 2.568 2.363 2.179 1.991 1.812 1.661 1.515 1.359 1.223 1.111 1.001 0.872 0.764 0.647 0.523 0.433 0.337 0.24 0.144 0.041 -0.035 -0.108 -0.22 -0.301 -0.389 -0.433 -0.519 -0.607 -0.703 -0.754 -0.886 -0.898 -0.946 -1.006 -1.152 -1.233 -1.321 -1.403 -1.493 -1.599 -1.707 -1.922 -9 ,25880 ,TETRA ,17616523,Mon Nov 29 12:14:31 CET,Mon Nov 29 14:28:24 CET,0.0 0.135 0.271 0.371 0.467 0.543 0.604 0.667 0.78 0.825 0.872 0.878 1.003 1.056 1.155 1.236 1.299 1.333 1.413 1.482 1.557 1.609 1.665 1.739 1.815 1.893 1.968 2.046 2.135 2.219 2.302 2.402 2.502 2.595 2.679 2.771 2.869 2.973 3.093 3.231 3.37 3.509 3.667 3.827 3.977 4.115 4.264 4.392 4.501 4.594 4.55 4.234 3.876 3.534 3.224 2.932 2.662 2.417 2.214 1.991 1.795 1.626 1.458 1.308 1.171 1.037 0.903 0.793 0.69 0.58 0.472 0.378 0.278 0.176 0.099 0.021 -0.068 -0.169 -0.268 -0.326 -0.388 -0.484 -0.544 -0.621 -0.663 -0.745 -0.828 -0.906 -0.944 -1.062 -1.085 -1.15 -1.214 -1.33 -1.387 -1.448 -1.503 -1.569 -1.675 -1.842 -2.089 -10 ,19685 ,TETRA ,17616524,Mon Nov 29 12:14:31 CET,Mon Nov 29 14:23:02 CET,0.0 0.514 0.626 0.705 0.771 0.835 0.92 0.998 1.101 1.147 1.195 1.193 1.312 1.35 1.428 1.516 1.595 1.632 1.704 1.766 1.849 1.903 1.959 2.042 2.111 2.175 2.234 2.286 2.37 2.459 2.538 2.643 2.742 2.836 2.937 3.027 3.11 3.214 3.325 3.437 3.553 3.68 3.814 3.944 4.1 4.254 4.402 4.53 4.658 4.775 4.739 4.42 4.082 3.77 3.502 3.251 2.999 2.776 2.582 2.394 2.225 2.061 1.907 1.749 1.602 1.474 1.331 1.2 1.09 0.982 0.873 0.77 0.665 0.562 0.471 0.37 0.271 0.169 0.063 -0.005 -0.069 -0.169 -0.233 -0.294 -0.331 -0.412 -0.511 -0.619 -0.669 -0.804 -0.833 -0.891 -0.951 -1.073 -1.155 -1.243 -1.311 -1.385 -1.462 -1.553 -1.923 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt deleted file mode 100644 index dac40c1e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17141 ,TETRA ,17616525,Mon Nov 29 12:15:30 CET,Mon Nov 29 14:38:30 CET,0.0 0.269 0.34 0.427 0.514 0.574 0.631 0.688 0.794 0.841 0.882 0.897 1.032 1.07 1.156 1.248 1.33 1.367 1.441 1.511 1.614 1.678 1.738 1.831 1.915 1.99 2.066 2.14 2.235 2.324 2.416 2.535 2.649 2.752 2.881 3.024 3.147 3.271 3.393 3.515 3.638 3.764 3.907 4.046 4.205 4.342 4.448 4.513 4.503 4.344 3.868 3.187 2.55 1.969 1.43 0.892 0.41 -0.011 -0.358 -0.705 -1.026 -1.318 -1.578 -1.816 -2.036 -2.24 -2.474 -2.677 -2.829 -2.995 -3.177 -3.315 -3.461 -3.615 -3.738 -3.86 -3.984 -4.114 -4.256 -4.359 -4.459 -4.617 -4.722 -4.825 -4.887 -5.029 -5.171 -5.325 -5.4 -5.565 -5.61 -5.693 -5.795 -6.006 -6.102 -6.188 -6.292 -6.404 -6.543 -6.72 -7.356 -2 ,7574 ,TETRA ,17616526,Mon Nov 29 12:16:31 CET,Mon Nov 29 14:20:12 CET,0.0 0.177 0.344 0.507 0.609 0.683 0.751 0.856 1.045 1.098 1.152 1.159 1.296 1.34 1.428 1.518 1.591 1.628 1.705 1.772 1.871 1.949 2.03 2.141 2.243 2.332 2.418 2.505 2.61 2.697 2.785 2.894 3.008 3.114 3.23 3.352 3.461 3.6 3.754 3.91 4.055 4.194 4.364 4.529 4.715 4.905 5.062 5.188 5.275 5.207 4.822 4.075 3.295 2.565 1.964 1.465 1.02 0.597 0.214 -0.154 -0.452 -0.715 -0.985 -1.253 -1.507 -1.728 -1.932 -2.114 -2.282 -2.462 -2.635 -2.78 -2.953 -3.133 -3.264 -3.39 -3.522 -3.669 -3.81 -3.898 -3.989 -4.139 -4.246 -4.357 -4.417 -4.566 -4.721 -4.868 -4.942 -5.106 -5.161 -5.249 -5.349 -5.559 -5.67 -5.787 -5.914 -6.049 -6.197 -6.369 -6.75 -3 ,10958 ,TETRA ,17616527,Mon Nov 29 12:15:31 CET,Mon Nov 29 14:39:10 CET,0.0 1.044 1.195 1.312 1.419 1.52 1.575 1.642 1.775 1.833 1.89 1.916 2.064 2.102 2.178 2.251 2.332 2.368 2.432 2.506 2.613 2.675 2.725 2.789 2.863 2.938 3.009 3.088 3.185 3.276 3.363 3.46 3.564 3.669 3.776 3.878 3.964 4.059 4.163 4.259 4.36 4.494 4.651 4.781 4.911 5.058 5.216 5.331 5.379 5.277 4.801 4.078 3.338 2.654 2.082 1.528 1.06 0.683 0.349 -0.029 -0.35 -0.611 -0.869 -1.118 -1.338 -1.531 -1.738 -1.922 -2.085 -2.28 -2.486 -2.647 -2.808 -2.973 -3.109 -3.244 -3.373 -3.506 -3.641 -3.737 -3.832 -3.98 -4.079 -4.187 -4.246 -4.368 -4.496 -4.61 -4.664 -4.811 -4.855 -4.931 -5.009 -5.157 -5.23 -5.311 -5.398 -5.491 -5.588 -5.717 -5.961 -4 ,20105 ,TETRA ,17616528,Mon Nov 29 12:15:31 CET,Mon Nov 29 14:41:31 CET,0.0 0.478 0.633 0.73 0.799 0.874 0.952 1.006 1.124 1.183 1.244 1.277 1.413 1.458 1.54 1.636 1.734 1.778 1.863 1.95 2.08 2.155 2.221 2.314 2.391 2.463 2.534 2.607 2.703 2.799 2.903 3.032 3.141 3.244 3.366 3.488 3.597 3.723 3.857 4.005 4.17 4.334 4.512 4.68 4.848 4.978 5.083 5.175 5.226 5.131 4.737 3.995 3.245 2.579 2.021 1.531 1.086 0.663 0.292 -0.079 -0.412 -0.706 -0.967 -1.217 -1.465 -1.699 -1.939 -2.143 -2.319 -2.512 -2.717 -2.883 -3.047 -3.228 -3.361 -3.485 -3.63 -3.794 -3.95 -4.054 -4.173 -4.361 -4.481 -4.598 -4.655 -4.771 -4.909 -5.057 -5.132 -5.309 -5.386 -5.488 -5.59 -5.793 -5.89 -5.983 -6.099 -6.254 -6.453 -6.662 -7.08 -5 ,1145 ,TETRA ,17616529,Mon Nov 29 12:15:32 CET,Mon Nov 29 14:41:23 CET,0.0 0.216 0.457 0.672 0.8 0.877 0.96 1.028 1.142 1.2 1.252 1.248 1.38 1.426 1.528 1.618 1.698 1.741 1.82 1.897 2.019 2.089 2.148 2.229 2.318 2.399 2.463 2.531 2.631 2.727 2.809 2.905 3.004 3.098 3.197 3.314 3.429 3.539 3.67 3.822 3.961 4.099 4.242 4.351 4.461 4.587 4.689 4.748 4.741 4.599 4.167 3.46 2.774 2.112 1.514 0.997 0.551 0.132 -0.252 -0.664 -1.014 -1.306 -1.574 -1.827 -2.059 -2.279 -2.537 -2.759 -2.931 -3.113 -3.312 -3.473 -3.637 -3.816 -3.953 -4.088 -4.225 -4.358 -4.521 -4.645 -4.766 -4.955 -5.095 -5.245 -5.312 -5.433 -5.574 -5.731 -5.807 -5.978 -6.047 -6.128 -6.212 -6.389 -6.474 -6.566 -6.69 -6.837 -6.988 -7.158 -7.541 -6 ,31235 ,TETRA ,17616530,Mon Nov 29 12:15:31 CET,Mon Nov 29 14:38:18 CET,0.0 0.43 0.53 0.615 0.698 0.773 0.846 0.917 1.053 1.114 1.162 1.149 1.284 1.331 1.422 1.518 1.623 1.672 1.751 1.819 1.924 1.994 2.065 2.171 2.266 2.356 2.441 2.524 2.625 2.723 2.808 2.894 2.979 3.072 3.189 3.305 3.412 3.533 3.668 3.794 3.921 4.076 4.232 4.365 4.489 4.611 4.737 4.84 4.891 4.761 4.269 3.44 2.635 1.88 1.192 0.615 0.167 -0.239 -0.61 -0.996 -1.32 -1.602 -1.874 -2.138 -2.382 -2.599 -2.831 -3.044 -3.224 -3.417 -3.618 -3.777 -3.929 -4.076 -4.203 -4.342 -4.466 -4.581 -4.708 -4.796 -4.884 -5.029 -5.14 -5.257 -5.312 -5.426 -5.545 -5.658 -5.726 -5.897 -5.953 -6.035 -6.106 -6.282 -6.385 -6.491 -6.6 -6.726 -6.891 -7.102 -7.516 -7 ,13060 ,TETRA ,17616531,Mon Nov 29 12:15:31 CET,Mon Nov 29 14:39:03 CET,0.0 0.157 0.33 0.506 0.622 0.722 0.801 0.874 1.003 1.058 1.112 1.136 1.277 1.331 1.424 1.507 1.592 1.637 1.728 1.814 1.93 2.004 2.07 2.164 2.271 2.374 2.463 2.539 2.633 2.737 2.832 2.937 3.043 3.159 3.292 3.432 3.578 3.727 3.862 4.003 4.165 4.333 4.501 4.657 4.807 4.952 5.073 5.141 5.187 5.088 4.621 3.926 3.24 2.571 1.962 1.414 0.918 0.494 0.153 -0.233 -0.569 -0.868 -1.171 -1.455 -1.709 -1.929 -2.154 -2.371 -2.569 -2.767 -2.981 -3.172 -3.376 -3.582 -3.739 -3.899 -4.065 -4.224 -4.39 -4.51 -4.619 -4.78 -4.904 -5.044 -5.112 -5.253 -5.382 -5.511 -5.592 -5.769 -5.852 -5.937 -6.02 -6.219 -6.338 -6.468 -6.592 -6.73 -6.914 -7.11 -7.448 -8 ,18710 ,TETRA ,17616532,Mon Nov 29 12:16:29 CET,Mon Nov 29 14:40:30 CET,0.0 0.408 0.515 0.61 0.695 0.771 0.845 0.907 1.012 1.064 1.123 1.152 1.294 1.348 1.442 1.53 1.627 1.675 1.763 1.847 1.974 2.051 2.123 2.225 2.317 2.404 2.483 2.564 2.681 2.791 2.894 3.017 3.13 3.244 3.363 3.478 3.602 3.739 3.88 4.022 4.134 4.248 4.386 4.532 4.691 4.791 4.873 4.97 4.98 4.822 4.35 3.549 2.838 2.237 1.695 1.195 0.731 0.307 -0.067 -0.451 -0.781 -1.081 -1.357 -1.616 -1.857 -2.08 -2.315 -2.521 -2.697 -2.869 -3.06 -3.22 -3.375 -3.535 -3.662 -3.798 -3.937 -4.079 -4.233 -4.342 -4.453 -4.617 -4.724 -4.826 -4.876 -4.982 -5.098 -5.228 -5.292 -5.455 -5.498 -5.565 -5.637 -5.793 -5.888 -5.995 -6.104 -6.216 -6.354 -6.547 -6.906 -9 ,19684 ,TETRA ,17616533,Mon Nov 29 12:16:30 CET,Mon Nov 29 14:40:41 CET,0.0 0.599 0.83 0.961 1.051 1.141 1.218 1.277 1.396 1.451 1.513 1.553 1.693 1.742 1.839 1.938 2.032 2.079 2.168 2.242 2.342 2.404 2.468 2.573 2.678 2.768 2.841 2.911 3.0 3.086 3.167 3.265 3.358 3.449 3.553 3.656 3.764 3.898 4.03 4.143 4.243 4.375 4.559 4.716 4.842 4.953 5.071 5.105 5.019 4.847 4.38 3.614 2.937 2.295 1.714 1.18 0.691 0.259 -0.111 -0.489 -0.817 -1.092 -1.352 -1.62 -1.871 -2.087 -2.325 -2.547 -2.731 -2.917 -3.115 -3.289 -3.471 -3.654 -3.797 -3.946 -4.098 -4.249 -4.395 -4.505 -4.63 -4.831 -4.963 -5.103 -5.18 -5.343 -5.504 -5.663 -5.741 -5.915 -5.997 -6.091 -6.188 -6.4 -6.508 -6.621 -6.741 -6.89 -7.074 -7.234 -7.826 -10 ,16115 ,TETRA ,17616534,Mon Nov 29 12:16:29 CET,Mon Nov 29 14:42:20 CET,0.0 0.437 0.573 0.674 0.755 0.861 0.985 1.068 1.167 1.213 1.264 1.282 1.414 1.455 1.535 1.613 1.682 1.717 1.798 1.871 1.967 2.036 2.108 2.208 2.304 2.403 2.497 2.58 2.675 2.775 2.879 3.009 3.126 3.229 3.345 3.472 3.585 3.704 3.84 3.986 4.122 4.242 4.351 4.47 4.631 4.774 4.874 4.932 4.953 4.836 4.371 3.629 2.942 2.339 1.812 1.272 0.761 0.29 -0.104 -0.498 -0.863 -1.18 -1.476 -1.771 -2.067 -2.331 -2.586 -2.803 -2.984 -3.188 -3.416 -3.603 -3.787 -3.971 -4.123 -4.276 -4.418 -4.557 -4.714 -4.827 -4.934 -5.1 -5.223 -5.346 -5.407 -5.537 -5.665 -5.791 -5.859 -6.025 -6.079 -6.157 -6.249 -6.467 -6.59 -6.72 -6.85 -6.983 -7.133 -7.328 -7.735 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt deleted file mode 100644 index 41cd0ebd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19880 ,TETRA ,17616535,Mon Nov 29 12:16:29 CET,Mon Nov 29 14:48:59 CET,0.0 0.514 0.711 0.861 1.014 1.143 1.231 1.313 1.471 1.545 1.626 1.686 1.84 1.901 2.011 2.116 2.22 2.269 2.353 2.432 2.571 2.653 2.721 2.82 2.912 3.005 3.102 3.198 3.326 3.445 3.557 3.679 3.777 3.876 4.001 4.134 4.249 4.368 4.497 4.637 4.779 4.928 5.105 5.266 5.42 5.573 5.697 5.791 5.819 5.687 5.19 4.33 3.574 2.886 2.27 1.741 1.259 0.799 0.393 0.003 -0.332 -0.634 -0.917 -1.207 -1.482 -1.734 -2.008 -2.246 -2.461 -2.697 -2.929 -3.126 -3.338 -3.563 -3.727 -3.875 -4.025 -4.196 -4.384 -4.512 -4.645 -4.85 -4.98 -5.109 -5.174 -5.309 -5.46 -5.616 -5.696 -5.875 -5.964 -6.063 -6.165 -6.364 -6.464 -6.574 -6.692 -6.802 -6.911 -7.064 -7.588 -2 ,14057 ,TETRA ,17616536,Mon Nov 29 12:16:29 CET,Mon Nov 29 14:40:39 CET,0.0 0.33 0.529 0.678 0.79 0.877 0.949 1.022 1.168 1.237 1.294 1.322 1.467 1.515 1.623 1.727 1.829 1.879 1.971 2.054 2.177 2.258 2.337 2.451 2.558 2.658 2.744 2.827 2.95 3.072 3.178 3.296 3.403 3.506 3.63 3.762 3.881 4.021 4.174 4.329 4.495 4.684 4.877 5.04 5.229 5.425 5.628 5.793 5.889 5.881 5.553 4.89 4.242 3.663 3.141 2.668 2.22 1.769 1.387 1.031 0.725 0.44 0.179 -0.064 -0.3 -0.521 -0.76 -0.957 -1.128 -1.317 -1.521 -1.693 -1.863 -2.042 -2.18 -2.336 -2.502 -2.664 -2.851 -2.987 -3.117 -3.301 -3.432 -3.574 -3.644 -3.795 -3.936 -4.07 -4.142 -4.31 -4.401 -4.507 -4.601 -4.782 -4.899 -5.035 -5.174 -5.339 -5.555 -5.803 -6.123 -3 ,13798 ,TETRA ,17616537,Mon Nov 29 12:16:32 CET,Mon Nov 29 14:42:11 CET,0.0 0.558 0.726 0.896 1.031 1.132 1.22 1.299 1.442 1.515 1.583 1.618 1.761 1.814 1.926 2.033 2.138 2.187 2.272 2.354 2.476 2.557 2.63 2.737 2.848 2.96 3.062 3.15 3.265 3.391 3.517 3.649 3.772 3.89 4.015 4.144 4.272 4.404 4.527 4.668 4.818 4.987 5.159 5.313 5.507 5.72 5.917 6.05 6.085 5.988 5.573 4.881 4.29 3.729 3.182 2.69 2.29 1.915 1.579 1.223 0.875 0.556 0.265 -0.004 -0.27 -0.51 -0.74 -0.963 -1.156 -1.346 -1.541 -1.704 -1.893 -2.089 -2.241 -2.383 -2.524 -2.68 -2.843 -2.956 -3.067 -3.235 -3.363 -3.502 -3.573 -3.727 -3.88 -4.043 -4.122 -4.29 -4.376 -4.477 -4.587 -4.791 -4.893 -5.001 -5.11 -5.246 -5.393 -5.593 -6.269 -4 ,19147 ,TETRA ,17616538,Mon Nov 29 12:16:29 CET,Mon Nov 29 14:38:47 CET,0.0 0.448 0.647 0.806 0.954 1.091 1.223 1.332 1.546 1.633 1.71 1.769 1.924 1.989 2.118 2.229 2.333 2.389 2.493 2.596 2.742 2.823 2.902 3.019 3.129 3.225 3.313 3.412 3.543 3.673 3.804 3.952 4.081 4.211 4.369 4.524 4.654 4.794 4.949 5.112 5.264 5.41 5.575 5.723 5.865 6.013 6.127 6.178 6.134 5.954 5.477 4.67 3.894 3.176 2.528 1.934 1.381 0.91 0.527 0.114 -0.242 -0.549 -0.846 -1.124 -1.365 -1.593 -1.837 -2.041 -2.234 -2.444 -2.641 -2.802 -2.973 -3.158 -3.308 -3.462 -3.623 -3.784 -3.952 -4.073 -4.193 -4.383 -4.518 -4.651 -4.713 -4.839 -4.964 -5.107 -5.189 -5.36 -5.458 -5.558 -5.655 -5.872 -5.98 -6.078 -6.188 -6.333 -6.497 -6.669 -7.088 -5 ,5899 ,TETRA ,17616539,Mon Nov 29 12:16:32 CET,Mon Nov 29 14:40:22 CET,0.0 0.221 0.34 0.476 0.593 0.673 0.742 0.814 0.952 1.016 1.069 1.086 1.231 1.284 1.393 1.505 1.61 1.662 1.76 1.853 1.981 2.063 2.141 2.253 2.361 2.451 2.532 2.61 2.717 2.834 2.955 3.094 3.211 3.327 3.463 3.613 3.758 3.919 4.092 4.261 4.413 4.556 4.712 4.852 5.002 5.173 5.34 5.463 5.549 5.532 5.229 4.607 3.959 3.36 2.806 2.252 1.746 1.318 0.968 0.616 0.314 0.031 -0.248 -0.51 -0.766 -0.993 -1.222 -1.426 -1.602 -1.79 -1.978 -2.137 -2.303 -2.467 -2.589 -2.731 -2.887 -3.031 -3.174 -3.282 -3.395 -3.56 -3.668 -3.776 -3.835 -3.955 -4.095 -4.271 -4.359 -4.523 -4.571 -4.648 -4.733 -4.931 -5.039 -5.148 -5.259 -5.394 -5.544 -5.723 -6.134 -6 ,8401 ,TETRA ,17616540,Mon Nov 29 12:16:30 CET,Mon Nov 29 14:39:19 CET,0.0 0.285 0.408 0.528 0.654 0.778 0.882 0.954 1.103 1.18 1.249 1.295 1.443 1.498 1.599 1.696 1.791 1.848 1.96 2.057 2.182 2.253 2.326 2.438 2.548 2.651 2.739 2.822 2.938 3.048 3.153 3.292 3.417 3.513 3.627 3.77 3.917 4.083 4.257 4.419 4.553 4.687 4.849 5.023 5.202 5.346 5.472 5.541 5.528 5.376 4.896 4.135 3.378 2.699 2.11 1.555 1.017 0.524 0.114 -0.299 -0.639 -0.928 -1.206 -1.47 -1.728 -1.967 -2.202 -2.426 -2.623 -2.812 -3.018 -3.19 -3.356 -3.524 -3.668 -3.818 -3.951 -4.085 -4.241 -4.354 -4.468 -4.637 -4.76 -4.903 -4.977 -5.143 -5.329 -5.502 -5.579 -5.749 -5.809 -5.895 -5.99 -6.197 -6.309 -6.421 -6.551 -6.731 -6.929 -7.135 -7.563 -7 ,16920 ,TETRA ,17616541,Mon Nov 29 12:16:29 CET,Mon Nov 29 14:40:53 CET,0.0 0.326 0.508 0.652 0.786 0.901 1.007 1.105 1.262 1.333 1.399 1.443 1.598 1.663 1.778 1.878 1.976 2.026 2.135 2.232 2.358 2.443 2.529 2.645 2.75 2.857 2.96 3.054 3.171 3.285 3.392 3.507 3.628 3.751 3.879 4.019 4.161 4.313 4.461 4.613 4.773 4.939 5.113 5.263 5.417 5.581 5.725 5.808 5.841 5.745 5.289 4.502 3.798 3.14 2.511 1.938 1.413 0.901 0.452 0.017 -0.353 -0.688 -0.992 -1.269 -1.533 -1.785 -2.046 -2.253 -2.429 -2.631 -2.857 -3.038 -3.222 -3.412 -3.547 -3.683 -3.837 -4.007 -4.176 -4.285 -4.402 -4.588 -4.709 -4.83 -4.895 -5.037 -5.19 -5.354 -5.441 -5.614 -5.678 -5.767 -5.858 -6.064 -6.186 -6.334 -6.497 -6.629 -6.753 -6.932 -7.453 -8 ,27996 ,TETRA ,17616542,Mon Nov 29 12:16:29 CET,Mon Nov 29 14:39:51 CET,0.0 0.552 0.727 0.853 0.945 1.033 1.145 1.253 1.431 1.516 1.592 1.64 1.789 1.849 1.966 2.071 2.169 2.218 2.311 2.399 2.514 2.582 2.66 2.773 2.873 2.981 3.085 3.193 3.345 3.481 3.605 3.747 3.871 3.997 4.138 4.282 4.423 4.579 4.742 4.893 5.051 5.235 5.434 5.615 5.774 5.93 6.093 6.194 6.208 6.135 5.783 5.03 4.311 3.715 3.142 2.591 2.123 1.693 1.299 0.911 0.592 0.312 0.037 -0.209 -0.438 -0.668 -0.92 -1.132 -1.303 -1.491 -1.677 -1.837 -2.001 -2.157 -2.294 -2.434 -2.561 -2.699 -2.859 -2.971 -3.075 -3.218 -3.319 -3.433 -3.496 -3.627 -3.755 -3.884 -3.953 -4.122 -4.201 -4.28 -4.353 -4.531 -4.644 -4.754 -4.845 -4.963 -5.128 -5.315 -5.721 -9 ,21445 ,TETRA ,17616543,Mon Nov 29 12:17:30 CET,Mon Nov 29 14:41:53 CET,0.0 0.432 0.627 0.785 0.905 1.031 1.148 1.242 1.427 1.51 1.578 1.624 1.774 1.833 1.956 2.071 2.197 2.258 2.365 2.47 2.611 2.695 2.779 2.898 3.013 3.116 3.214 3.316 3.43 3.526 3.629 3.763 3.89 4.003 4.121 4.245 4.351 4.464 4.586 4.723 4.891 5.08 5.255 5.411 5.582 5.704 5.822 5.936 5.911 5.706 5.182 4.376 3.667 3.04 2.424 1.874 1.41 0.959 0.563 0.178 -0.152 -0.451 -0.734 -0.99 -1.226 -1.441 -1.66 -1.846 -2.003 -2.185 -2.381 -2.534 -2.695 -2.86 -2.985 -3.113 -3.239 -3.377 -3.521 -3.614 -3.71 -3.867 -3.989 -4.112 -4.172 -4.302 -4.43 -4.573 -4.653 -4.83 -4.929 -5.037 -5.138 -5.35 -5.457 -5.57 -5.705 -5.855 -6.014 -6.155 -6.481 -10 ,686 ,TETRA ,17616544,Mon Nov 29 12:17:31 CET,Mon Nov 29 14:41:51 CET,0.0 0.564 0.714 0.849 0.96 1.063 1.16 1.245 1.415 1.504 1.592 1.656 1.82 1.886 2.003 2.121 2.233 2.286 2.382 2.477 2.621 2.707 2.787 2.911 3.028 3.119 3.217 3.319 3.418 3.516 3.627 3.766 3.895 4.018 4.164 4.328 4.479 4.636 4.8 4.97 5.137 5.311 5.504 5.697 5.923 6.134 6.334 6.49 6.543 6.434 6.052 5.421 4.74 4.107 3.541 3.008 2.526 2.1 1.725 1.353 1.048 0.762 0.49 0.243 0.004 -0.224 -0.457 -0.657 -0.83 -1.03 -1.25 -1.414 -1.572 -1.738 -1.864 -2.006 -2.172 -2.338 -2.504 -2.628 -2.764 -2.97 -3.098 -3.22 -3.283 -3.411 -3.551 -3.699 -3.775 -3.949 -4.033 -4.134 -4.24 -4.45 -4.575 -4.711 -4.842 -4.966 -5.085 -5.296 -6.084 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt deleted file mode 100644 index b975fc0b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24213 ,TETRA ,17616545,Mon Nov 29 12:18:30 CET,Mon Nov 29 14:31:15 CET,0.0 0.158 0.298 0.398 0.486 0.56 0.632 0.704 0.839 0.909 0.983 1.035 1.186 1.241 1.341 1.438 1.527 1.571 1.662 1.741 1.867 1.956 2.042 2.172 2.292 2.405 2.525 2.647 2.797 2.925 3.045 3.199 3.353 3.503 3.679 3.876 4.064 4.268 4.49 4.723 4.969 5.244 5.568 5.908 6.297 6.724 7.23 7.801 8.412 9.015 9.58 9.867 9.829 9.601 9.32 8.996 8.641 8.306 8.031 7.715 7.409 7.131 6.841 6.578 6.323 6.071 5.797 5.559 5.372 5.154 4.921 4.731 4.516 4.291 4.102 3.905 3.73 3.556 3.347 3.197 3.058 2.851 2.677 2.476 2.384 2.185 1.976 1.75 1.623 1.416 1.245 1.116 0.963 0.601 0.402 0.191 -0.065 -0.389 -0.786 -1.271 -2.595 -2 ,23785 ,TETRA ,17616546,Mon Nov 29 12:17:31 CET,Mon Nov 29 14:37:00 CET,0.0 0.123 0.277 0.389 0.463 0.546 0.625 0.687 0.802 0.861 0.92 0.947 1.081 1.131 1.238 1.34 1.43 1.471 1.554 1.639 1.766 1.846 1.932 2.066 2.182 2.273 2.364 2.465 2.593 2.711 2.829 2.972 3.113 3.265 3.433 3.603 3.775 3.97 4.179 4.399 4.634 4.908 5.242 5.576 5.952 6.378 6.897 7.475 8.093 8.774 9.551 10.0 10.089 10.055 9.926 9.698 9.462 9.23 9.022 8.819 8.638 8.459 8.264 8.066 7.891 7.744 7.586 7.432 7.298 7.153 6.989 6.849 6.707 6.55 6.424 6.297 6.167 6.027 5.873 5.766 5.658 5.495 5.373 5.241 5.173 5.039 4.912 4.762 4.674 4.5 4.385 4.283 4.177 3.94 3.796 3.633 3.447 3.22 2.929 2.581 1.417 -3 ,8979 ,TETRA ,17616547,Mon Nov 29 12:17:31 CET,Mon Nov 29 14:37:08 CET,0.0 0.21 0.322 0.427 0.501 0.574 0.656 0.732 0.872 0.94 0.991 1.001 1.143 1.193 1.289 1.389 1.491 1.537 1.628 1.722 1.854 1.938 2.023 2.142 2.253 2.36 2.458 2.555 2.698 2.831 2.958 3.124 3.28 3.424 3.581 3.769 3.967 4.179 4.386 4.609 4.861 5.151 5.477 5.778 6.141 6.564 7.045 7.592 8.264 8.993 9.736 10.261 10.408 10.358 10.227 10.039 9.84 9.645 9.473 9.278 9.085 8.895 8.694 8.501 8.329 8.158 7.949 7.757 7.589 7.415 7.222 7.054 6.885 6.721 6.583 6.416 6.251 6.089 5.918 5.802 5.67 5.44 5.279 5.133 5.055 4.859 4.664 4.467 4.363 4.177 4.021 3.898 3.768 3.493 3.339 3.182 2.984 2.751 2.53 2.22 1.223 -4 ,3118 ,TETRA ,17616548,Mon Nov 29 12:17:33 CET,Mon Nov 29 14:36:42 CET,0.0 0.646 0.79 0.888 0.97 1.037 1.093 1.158 1.298 1.366 1.428 1.465 1.612 1.662 1.755 1.859 1.96 2.015 2.119 2.205 2.335 2.42 2.501 2.616 2.731 2.839 2.934 3.038 3.183 3.324 3.455 3.615 3.779 3.938 4.118 4.314 4.5 4.719 4.956 5.203 5.462 5.747 6.07 6.403 6.792 7.213 7.695 8.226 8.832 9.533 10.233 10.539 10.585 10.534 10.433 10.303 10.13 9.918 9.705 9.496 9.299 9.08 8.857 8.643 8.432 8.23 8.021 7.836 7.694 7.548 7.375 7.21 7.019 6.833 6.689 6.523 6.348 6.167 5.993 5.876 5.759 5.577 5.441 5.309 5.234 5.069 4.901 4.718 4.623 4.453 4.319 4.204 4.077 3.746 3.55 3.367 3.181 2.943 2.669 2.379 1.673 -5 ,25933 ,TETRA ,17616549,Mon Nov 29 12:17:31 CET,Mon Nov 29 14:37:15 CET,0.0 0.141 0.241 0.339 0.441 0.543 0.627 0.704 0.843 0.911 0.974 1.006 1.157 1.228 1.354 1.462 1.569 1.618 1.708 1.784 1.898 1.981 2.058 2.168 2.278 2.376 2.472 2.57 2.702 2.835 2.962 3.105 3.245 3.382 3.541 3.727 3.913 4.123 4.351 4.595 4.85 5.138 5.453 5.767 6.146 6.572 7.06 7.6 8.208 8.813 9.378 9.621 9.604 9.468 9.215 8.931 8.645 8.301 7.989 7.658 7.353 7.084 6.815 6.569 6.341 6.118 5.884 5.682 5.494 5.264 5.024 4.824 4.62 4.425 4.252 4.062 3.879 3.697 3.496 3.354 3.206 2.951 2.782 2.598 2.493 2.287 2.063 1.836 1.717 1.509 1.295 1.13 0.961 0.585 0.36 0.13 -0.11 -0.413 -0.788 -1.298 -3.048 -6 ,13713 ,TETRA ,17616550,Mon Nov 29 12:18:30 CET,Mon Nov 29 14:40:21 CET,0.0 0.121 0.206 0.285 0.341 0.407 0.485 0.558 0.668 0.727 0.785 0.798 0.935 0.987 1.095 1.206 1.306 1.345 1.42 1.49 1.605 1.687 1.762 1.867 1.961 2.054 2.149 2.236 2.345 2.456 2.563 2.707 2.845 2.97 3.122 3.301 3.471 3.659 3.861 4.077 4.301 4.555 4.874 5.198 5.549 5.955 6.447 7.019 7.684 8.432 9.312 9.851 10.002 9.968 9.828 9.671 9.497 9.287 9.082 8.867 8.65 8.436 8.236 8.042 7.841 7.654 7.45 7.248 7.085 6.925 6.729 6.581 6.455 6.3 6.16 6.015 5.859 5.696 5.533 5.421 5.296 5.095 4.964 4.83 4.757 4.596 4.421 4.229 4.132 3.961 3.822 3.705 3.577 3.28 3.1 2.918 2.736 2.519 2.251 1.871 0.49 -7 ,25974 ,TETRA ,17616551,Mon Nov 29 12:18:31 CET,Mon Nov 29 14:41:14 CET,0.0 0.32 0.462 0.562 0.659 0.753 0.836 0.903 1.026 1.082 1.131 1.137 1.272 1.321 1.41 1.496 1.584 1.626 1.705 1.779 1.895 1.977 2.065 2.179 2.274 2.376 2.477 2.574 2.708 2.838 2.965 3.113 3.252 3.391 3.552 3.727 3.892 4.079 4.277 4.477 4.699 4.972 5.292 5.581 5.909 6.279 6.707 7.214 7.829 8.526 9.292 9.761 9.866 9.849 9.783 9.621 9.378 9.135 8.921 8.699 8.506 8.306 8.101 7.898 7.701 7.549 7.39 7.226 7.081 6.94 6.797 6.666 6.513 6.356 6.228 6.068 5.892 5.705 5.508 5.369 5.224 5.002 4.847 4.687 4.605 4.426 4.227 4.004 3.884 3.689 3.508 3.358 3.207 2.874 2.654 2.402 2.154 1.892 1.566 1.157 -0.025 -8 ,14342 ,TETRA ,17616552,Mon Nov 29 12:18:33 CET,Mon Nov 29 14:40:31 CET,0.0 0.173 0.295 0.391 0.475 0.552 0.615 0.686 0.829 0.889 0.949 0.975 1.116 1.172 1.284 1.374 1.46 1.504 1.583 1.657 1.766 1.841 1.915 2.02 2.122 2.222 2.324 2.429 2.565 2.695 2.818 2.964 3.105 3.229 3.374 3.548 3.715 3.904 4.127 4.369 4.61 4.883 5.206 5.537 5.92 6.312 6.751 7.253 7.834 8.457 9.102 9.485 9.526 9.462 9.315 9.077 8.832 8.589 8.338 8.059 7.782 7.497 7.233 6.984 6.732 6.509 6.291 6.085 5.911 5.726 5.534 5.392 5.24 5.076 4.963 4.825 4.646 4.46 4.284 4.168 4.039 3.821 3.673 3.519 3.431 3.259 3.08 2.891 2.803 2.631 2.512 2.398 2.266 1.98 1.804 1.615 1.431 1.21 0.898 0.502 -0.652 -9 ,6412 ,TETRA ,17616553,Mon Nov 29 12:18:31 CET,Mon Nov 29 14:41:11 CET,0.0 0.242 0.362 0.444 0.518 0.583 0.65 0.733 0.867 0.933 0.997 1.012 1.158 1.221 1.336 1.435 1.523 1.573 1.671 1.756 1.873 1.954 2.042 2.182 2.309 2.425 2.534 2.641 2.797 2.933 3.067 3.229 3.366 3.508 3.686 3.891 4.075 4.274 4.515 4.778 5.037 5.32 5.676 6.044 6.447 6.9 7.469 8.116 8.81 9.588 10.471 11.069 11.318 11.378 11.323 11.214 11.031 10.805 10.592 10.341 10.1 9.881 9.684 9.499 9.301 9.108 8.924 8.753 8.597 8.443 8.28 8.125 7.962 7.81 7.699 7.585 7.47 7.342 7.195 7.084 6.972 6.808 6.669 6.516 6.44 6.293 6.139 5.958 5.863 5.681 5.495 5.361 5.22 4.905 4.741 4.553 4.322 4.061 3.762 3.328 2.173 -10 ,8164 ,TETRA ,17616554,Mon Nov 29 12:18:33 CET,Mon Nov 29 14:40:18 CET,0.0 0.22 0.321 0.409 0.483 0.545 0.603 0.678 0.829 0.897 0.96 0.988 1.124 1.162 1.249 1.347 1.443 1.492 1.588 1.677 1.792 1.867 1.942 2.041 2.142 2.238 2.329 2.425 2.547 2.663 2.78 2.923 3.061 3.2 3.36 3.526 3.688 3.875 4.09 4.308 4.538 4.811 5.114 5.427 5.805 6.223 6.725 7.31 7.936 8.58 9.301 9.817 10.008 10.032 9.906 9.712 9.532 9.313 9.08 8.843 8.627 8.422 8.233 8.06 7.879 7.704 7.52 7.347 7.192 7.031 6.866 6.73 6.594 6.446 6.322 6.178 6.027 5.868 5.69 5.582 5.474 5.303 5.181 5.047 4.979 4.814 4.623 4.427 4.323 4.146 4.0 3.871 3.748 3.493 3.35 3.191 2.995 2.755 2.492 2.18 1.324 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt deleted file mode 100644 index 792c8285..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25317 ,TETRA ,17616555,Mon Nov 29 12:18:31 CET,Mon Nov 29 14:38:55 CET,0.0 0.257 0.361 0.427 0.494 0.555 0.617 0.68 0.801 0.859 0.912 0.921 1.053 1.101 1.199 1.307 1.404 1.442 1.524 1.612 1.732 1.807 1.879 1.988 2.102 2.202 2.294 2.389 2.531 2.669 2.781 2.936 3.096 3.23 3.386 3.572 3.74 3.918 4.115 4.344 4.591 4.856 5.168 5.477 5.834 6.233 6.707 7.256 7.853 8.508 9.224 9.606 9.601 9.486 9.293 8.998 8.738 8.486 8.273 8.085 7.892 7.684 7.447 7.22 7.024 6.838 6.624 6.41 6.224 6.022 5.824 5.675 5.516 5.347 5.218 5.086 4.94 4.766 4.569 4.422 4.279 4.066 3.9 3.722 3.632 3.445 3.249 3.022 2.894 2.693 2.524 2.396 2.265 1.977 1.819 1.629 1.401 1.096 0.746 0.329 -1.513 -2 ,26737 ,TETRA ,17616556,Mon Nov 29 12:18:32 CET,Mon Nov 29 14:39:43 CET,0.0 0.138 0.214 0.306 0.407 0.494 0.572 0.641 0.749 0.799 0.845 0.847 0.98 1.031 1.129 1.23 1.325 1.369 1.451 1.535 1.658 1.741 1.824 1.938 2.055 2.163 2.264 2.358 2.475 2.586 2.697 2.829 2.965 3.107 3.26 3.417 3.567 3.733 3.92 4.128 4.356 4.616 4.91 5.197 5.544 5.963 6.445 6.977 7.573 8.186 8.791 9.05 9.04 8.919 8.715 8.479 8.261 8.026 7.774 7.481 7.19 6.956 6.762 6.54 6.324 6.132 5.934 5.768 5.606 5.428 5.261 5.128 4.974 4.787 4.633 4.471 4.303 4.129 3.919 3.757 3.602 3.394 3.246 3.067 2.976 2.794 2.6 2.398 2.302 2.114 1.939 1.808 1.659 1.33 1.157 0.977 0.765 0.507 0.208 -0.229 -1.4 -3 ,15876 ,TETRA ,17616557,Mon Nov 29 12:18:32 CET,Mon Nov 29 14:37:06 CET,0.0 0.327 0.416 0.514 0.598 0.682 0.773 0.854 0.987 1.047 1.103 1.119 1.266 1.332 1.464 1.57 1.662 1.712 1.796 1.874 1.995 2.064 2.131 2.237 2.342 2.451 2.555 2.652 2.785 2.915 3.038 3.183 3.326 3.469 3.633 3.813 3.993 4.193 4.414 4.648 4.893 5.157 5.473 5.791 6.153 6.562 7.033 7.594 8.236 8.92 9.695 10.163 10.319 10.341 10.222 10.081 9.908 9.716 9.548 9.335 9.137 8.955 8.765 8.56 8.358 8.178 7.994 7.82 7.667 7.5 7.31 7.152 6.978 6.79 6.64 6.489 6.332 6.157 5.967 5.839 5.711 5.507 5.363 5.226 5.153 4.988 4.799 4.597 4.499 4.317 4.177 4.064 3.957 3.731 3.582 3.381 3.165 2.93 2.622 2.183 1.077 -4 ,2039 ,TETRA ,17616558,Mon Nov 29 12:19:31 CET,Mon Nov 29 14:39:57 CET,0.0 0.34 0.5 0.598 0.688 0.782 0.866 0.929 1.051 1.11 1.165 1.184 1.321 1.375 1.472 1.566 1.663 1.709 1.794 1.885 2.024 2.102 2.177 2.284 2.383 2.48 2.576 2.677 2.803 2.917 3.033 3.177 3.312 3.44 3.594 3.778 3.959 4.154 4.362 4.574 4.788 5.041 5.34 5.643 6.007 6.416 6.861 7.349 7.857 8.381 8.928 9.097 9.023 8.95 8.813 8.576 8.328 8.023 7.702 7.419 7.213 7.033 6.819 6.599 6.407 6.212 6.01 5.843 5.683 5.508 5.326 5.166 4.998 4.813 4.668 4.521 4.36 4.191 4.033 3.922 3.799 3.571 3.386 3.206 3.112 2.905 2.692 2.483 2.383 2.205 2.082 1.978 1.864 1.597 1.454 1.294 1.121 0.952 0.719 0.376 -0.933 -5 ,8205 ,TETRA ,17616559,Mon Nov 29 12:19:30 CET,Mon Nov 29 14:41:27 CET,0.0 0.215 0.327 0.415 0.498 0.569 0.643 0.718 0.854 0.913 0.969 0.995 1.129 1.177 1.277 1.382 1.477 1.521 1.609 1.694 1.814 1.879 1.948 2.057 2.163 2.26 2.35 2.443 2.575 2.703 2.813 2.949 3.09 3.23 3.4 3.585 3.756 3.946 4.168 4.411 4.66 4.933 5.257 5.613 6.021 6.459 6.96 7.498 8.106 8.763 9.38 9.705 9.728 9.608 9.441 9.24 9.016 8.759 8.546 8.331 8.118 7.91 7.689 7.46 7.259 7.09 6.905 6.718 6.534 6.345 6.144 5.97 5.793 5.6 5.437 5.253 5.075 4.91 4.736 4.607 4.476 4.26 4.096 3.936 3.86 3.706 3.539 3.367 3.279 3.097 2.95 2.823 2.693 2.453 2.312 2.139 1.973 1.792 1.568 1.32 0.666 -6 ,15313 ,TETRA ,17616560,Mon Nov 29 12:19:33 CET,Mon Nov 29 14:40:32 CET,0.0 0.232 0.349 0.459 0.554 0.655 0.77 0.864 1.004 1.072 1.142 1.173 1.316 1.378 1.484 1.576 1.679 1.725 1.804 1.883 2.009 2.096 2.175 2.294 2.413 2.516 2.622 2.733 2.873 3.0 3.109 3.245 3.388 3.525 3.685 3.858 4.027 4.218 4.424 4.652 4.906 5.185 5.505 5.83 6.198 6.589 7.046 7.594 8.203 8.812 9.367 9.647 9.547 9.21 8.855 8.558 8.3 7.978 7.646 7.3 7.008 6.794 6.607 6.419 6.226 6.025 5.788 5.575 5.391 5.19 4.965 4.749 4.506 4.253 4.064 3.868 3.656 3.428 3.183 3.017 2.849 2.593 2.416 2.215 2.111 1.915 1.7 1.455 1.331 1.134 0.985 0.852 0.705 0.388 0.188 -0.046 -0.297 -0.586 -0.917 -1.412 -2.896 -7 ,16586 ,TETRA ,17616561,Mon Nov 29 12:19:30 CET,Mon Nov 29 14:37:48 CET,0.0 0.141 0.225 0.3 0.367 0.447 0.536 0.612 0.753 0.815 0.876 0.893 1.025 1.07 1.158 1.247 1.334 1.383 1.471 1.547 1.664 1.741 1.823 1.937 2.043 2.147 2.258 2.361 2.479 2.596 2.708 2.851 2.984 3.109 3.257 3.429 3.605 3.811 4.025 4.255 4.486 4.737 5.037 5.33 5.661 6.036 6.508 7.057 7.649 8.273 8.89 9.201 9.188 9.057 8.876 8.658 8.45 8.227 8.005 7.811 7.655 7.492 7.322 7.148 6.967 6.793 6.598 6.43 6.28 6.115 5.943 5.794 5.644 5.48 5.358 5.242 5.114 4.954 4.784 4.676 4.563 4.38 4.243 4.105 4.034 3.885 3.732 3.565 3.482 3.308 3.168 3.055 2.949 2.712 2.57 2.408 2.201 1.986 1.784 1.48 0.419 -8 ,16504 ,TETRA ,17616562,Mon Nov 29 12:19:32 CET,Mon Nov 29 14:41:49 CET,0.0 0.105 0.243 0.346 0.415 0.481 0.546 0.616 0.749 0.812 0.876 0.9 1.042 1.103 1.222 1.337 1.44 1.482 1.569 1.655 1.784 1.866 1.952 2.077 2.196 2.3 2.396 2.494 2.619 2.735 2.853 3.006 3.155 3.297 3.461 3.669 3.865 4.061 4.268 4.51 4.767 5.042 5.361 5.663 6.047 6.495 6.993 7.57 8.243 9.041 9.907 10.509 10.806 10.899 10.87 10.764 10.612 10.42 10.207 9.964 9.728 9.516 9.316 9.119 8.925 8.747 8.566 8.406 8.264 8.107 7.947 7.818 7.674 7.524 7.412 7.287 7.152 7.02 6.883 6.781 6.676 6.477 6.325 6.164 6.083 5.947 5.795 5.62 5.534 5.368 5.272 5.178 5.081 4.859 4.724 4.544 4.332 4.091 3.826 3.534 2.528 -9 ,23408 ,TETRA ,17616563,Mon Nov 29 12:19:32 CET,Mon Nov 29 14:41:23 CET,0.0 0.207 0.314 0.394 0.462 0.52 0.577 0.638 0.763 0.821 0.883 0.919 1.062 1.114 1.222 1.328 1.427 1.479 1.576 1.666 1.798 1.877 1.962 2.081 2.179 2.282 2.395 2.501 2.638 2.77 2.881 3.016 3.153 3.286 3.448 3.638 3.821 4.021 4.231 4.453 4.673 4.922 5.22 5.519 5.903 6.33 6.782 7.295 7.87 8.456 9.077 9.437 9.454 9.344 9.205 9.027 8.84 8.634 8.407 8.161 7.944 7.753 7.538 7.326 7.147 6.987 6.807 6.637 6.477 6.299 6.133 5.998 5.85 5.68 5.53 5.373 5.219 5.074 4.927 4.819 4.686 4.465 4.325 4.159 4.074 3.919 3.734 3.535 3.433 3.244 3.071 2.937 2.8 2.514 2.341 2.131 1.923 1.68 1.366 0.991 -0.11 -10 ,12142 ,TETRA ,17616564,Mon Nov 29 12:19:32 CET,Mon Nov 29 14:41:46 CET,0.0 0.311 0.399 0.498 0.587 0.662 0.728 0.797 0.944 1.006 1.068 1.1 1.239 1.289 1.379 1.472 1.56 1.599 1.68 1.769 1.899 1.973 2.044 2.159 2.267 2.359 2.455 2.548 2.67 2.802 2.926 3.073 3.22 3.356 3.512 3.696 3.872 4.061 4.277 4.514 4.745 4.989 5.281 5.587 5.942 6.326 6.736 7.199 7.748 8.331 8.845 9.071 9.138 9.12 9.019 8.852 8.655 8.446 8.26 8.036 7.809 7.591 7.354 7.128 6.92 6.723 6.516 6.329 6.157 5.971 5.771 5.611 5.446 5.271 5.138 4.998 4.838 4.673 4.503 4.375 4.247 4.048 3.908 3.761 3.685 3.513 3.314 3.107 3.001 2.811 2.692 2.583 2.456 2.219 2.09 1.945 1.773 1.577 1.319 0.922 -0.232 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt deleted file mode 100644 index 78fdf982..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8007 ,TETRA ,17616565,Mon Nov 29 12:21:28 CET,Mon Nov 29 14:46:25 CET,0.0 4.471 5.131 5.583 5.958 6.236 6.464 6.711 7.092 7.232 7.368 7.34 7.724 7.849 8.071 8.248 8.395 8.468 8.61 8.733 8.886 9.0 9.107 9.207 9.271 9.315 9.356 9.409 9.492 9.558 9.583 9.572 9.523 9.47 9.371 9.232 9.118 8.959 8.706 8.374 7.985 7.528 6.884 6.107 5.142 3.738 1.786 -0.709 -4.379 -9.899 -18.702 -28.492 -35.954 -41.924 -46.808 -51.085 -54.698 -57.787 -60.333 -62.801 -64.85 -66.658 -68.399 -69.985 -71.419 -72.71 -74.046 -75.229 -76.216 -77.211 -78.241 -79.073 -79.899 -80.772 -81.446 -82.129 -82.833 -83.555 -84.292 -84.776 -85.281 -86.097 -86.638 -87.171 -87.448 -88.017 -88.591 -89.237 -89.584 -90.303 -90.537 -90.863 -91.215 -91.957 -92.365 -92.807 -93.279 -93.784 -94.461 -95.472 -101.367 -2 ,14289 ,TETRA ,17616566,Mon Nov 29 12:23:29 CET,Mon Nov 29 14:46:04 CET,0.0 1.832 2.276 2.576 2.863 3.128 3.358 3.593 4.001 4.149 4.27 4.279 4.683 4.797 5.032 5.208 5.366 5.459 5.644 5.792 5.962 6.052 6.126 6.222 6.296 6.379 6.461 6.516 6.589 6.652 6.666 6.641 6.581 6.491 6.361 6.205 6.028 5.783 5.444 5.048 4.615 4.037 3.212 2.262 1.051 -0.499 -2.637 -5.472 -9.444 -15.233 -24.166 -34.275 -42.305 -48.71 -53.86 -58.204 -61.862 -65.063 -67.732 -70.315 -72.442 -74.277 -75.976 -77.542 -78.977 -80.269 -81.616 -82.803 -83.804 -84.855 -85.94 -86.796 -87.652 -88.526 -89.203 -89.887 -90.6 -91.335 -92.066 -92.568 -93.109 -93.934 -94.464 -95.015 -95.324 -95.953 -96.561 -97.195 -97.54 -98.273 -98.618 -99.021 -99.399 -100.141 -100.61 -101.175 -101.833 -102.571 -103.413 -104.541 -107.571 -3 ,5113 ,TETRA ,17616567,Mon Nov 29 12:25:31 CET,Mon Nov 29 14:51:00 CET,0.0 4.829 5.712 6.33 6.803 7.209 7.554 7.846 8.364 8.576 8.77 8.849 9.241 9.369 9.623 9.854 10.012 10.056 10.133 10.226 10.369 10.46 10.576 10.758 10.926 11.1 11.288 11.468 11.647 11.702 11.667 11.617 11.568 11.503 11.362 11.156 10.948 10.692 10.409 10.153 9.829 9.314 8.628 7.854 6.789 5.335 3.232 0.435 -3.395 -8.963 -17.732 -27.579 -35.136 -41.06 -45.788 -49.852 -53.189 -56.032 -58.47 -60.841 -62.833 -64.59 -66.198 -67.66 -69.006 -70.211 -71.451 -72.565 -73.517 -74.485 -75.467 -76.258 -77.075 -77.922 -78.547 -79.186 -79.867 -80.59 -81.315 -81.773 -82.268 -83.119 -83.72 -84.321 -84.625 -85.239 -85.894 -86.58 -86.922 -87.652 -88.059 -88.475 -88.878 -89.7 -90.116 -90.573 -91.119 -91.723 -92.415 -93.278 -97.655 -5 ,30010 ,TETRA ,17616569,Mon Nov 29 12:25:31 CET,Mon Nov 29 14:50:02 CET,0.0 4.416 5.099 5.628 6.003 6.307 6.573 6.809 7.192 7.372 7.546 7.578 7.967 8.085 8.288 8.444 8.609 8.687 8.801 8.919 9.065 9.132 9.19 9.242 9.297 9.355 9.397 9.437 9.468 9.468 9.467 9.445 9.414 9.372 9.277 9.119 8.918 8.655 8.329 7.947 7.459 6.84 6.011 5.024 3.775 2.19 -0.033 -2.988 -7.127 -13.064 -22.027 -32.158 -40.044 -46.362 -51.576 -56.015 -59.654 -62.765 -65.375 -67.917 -70.03 -71.855 -73.54 -75.1 -76.544 -77.871 -79.229 -80.388 -81.383 -82.449 -83.532 -84.373 -85.25 -86.191 -86.926 -87.695 -88.459 -89.232 -90.05 -90.609 -91.177 -92.079 -92.705 -93.336 -93.653 -94.292 -94.995 -95.734 -96.108 -96.893 -97.326 -97.775 -98.239 -99.191 -99.689 -100.23 -100.797 -101.429 -102.193 -103.187 -109.459 -7 ,17309 ,TETRA ,17616571,Mon Nov 29 12:25:33 CET,Mon Nov 29 15:00:21 CET,0.0 1.954 2.529 2.96 3.316 3.588 3.821 4.026 4.37 4.506 4.63 4.604 4.972 5.069 5.25 5.395 5.502 5.549 5.629 5.7 5.801 5.876 5.951 5.993 6.031 6.075 6.104 6.121 6.101 6.074 6.062 6.02 5.954 5.852 5.698 5.531 5.375 5.178 4.878 4.429 3.912 3.36 2.65 1.74 0.426 -1.28 -3.569 -6.558 -10.741 -16.789 -26.179 -36.502 -44.38 -50.715 -55.939 -60.407 -64.11 -67.318 -69.944 -72.478 -74.651 -76.55 -78.27 -79.833 -81.286 -82.61 -83.98 -85.195 -86.235 -87.282 -88.352 -89.229 -90.135 -91.087 -91.82 -92.57 -93.335 -94.095 -94.869 -95.387 -95.888 -96.649 -97.189 -97.758 -98.052 -98.686 -99.345 -100.005 -100.35 -101.078 -101.371 -101.742 -102.152 -103.036 -103.497 -104.019 -104.676 -105.411 -106.229 -107.227 -110.38 -8 ,13914 ,TETRA ,17616572,Mon Nov 29 12:27:31 CET,Mon Nov 29 14:53:37 CET,0.0 1.835 2.406 2.785 3.125 3.443 3.707 3.942 4.322 4.458 4.59 4.602 4.997 5.109 5.323 5.558 5.771 5.859 6.015 6.146 6.313 6.407 6.497 6.601 6.678 6.732 6.762 6.798 6.82 6.808 6.804 6.808 6.779 6.682 6.504 6.286 6.078 5.821 5.527 5.141 4.645 4.018 3.209 2.283 1.019 -0.576 -2.64 -5.377 -9.107 -14.48 -23.043 -32.558 -39.655 -45.189 -49.767 -53.745 -57.118 -60.036 -62.488 -64.853 -66.835 -68.568 -70.179 -71.687 -73.036 -74.225 -75.457 -76.522 -77.421 -78.357 -79.306 -80.074 -80.846 -81.659 -82.293 -82.926 -83.575 -84.243 -84.915 -85.379 -85.873 -86.662 -87.197 -87.726 -87.991 -88.544 -89.145 -89.788 -90.131 -90.86 -91.221 -91.619 -92.051 -92.912 -93.337 -93.784 -94.279 -94.835 -95.5 -96.455 -101.029 -10 ,8635 ,TETRA ,17616574,Mon Nov 29 12:28:30 CET,Mon Nov 29 14:53:30 CET,0.0 3.063 3.65 4.04 4.377 4.66 4.903 5.107 5.461 5.654 5.842 5.86 6.266 6.417 6.696 6.92 7.139 7.262 7.498 7.719 8.014 8.175 8.311 8.43 8.484 8.525 8.567 8.614 8.636 8.603 8.561 8.506 8.451 8.378 8.242 8.032 7.787 7.519 7.194 6.768 6.295 5.69 4.841 3.885 2.555 0.847 -1.38 -4.347 -8.528 -14.489 -23.646 -33.744 -41.533 -47.735 -52.74 -57.07 -60.733 -63.897 -66.538 -69.114 -71.264 -73.146 -74.898 -76.509 -77.984 -79.303 -80.634 -81.806 -82.785 -83.786 -84.827 -85.678 -86.529 -87.401 -88.083 -88.789 -89.497 -90.184 -90.918 -91.425 -91.94 -92.743 -93.287 -93.813 -94.088 -94.698 -95.322 -95.966 -96.315 -97.062 -97.387 -97.757 -98.115 -98.833 -99.247 -99.699 -100.204 -100.786 -101.548 -102.641 -106.643 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index a4054175..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,12794 ,TETRA ,17616577,Mon Nov 29 12:30:31 CET,Mon Nov 29 14:52:08 CET,0.0 0.253 0.435 0.587 0.728 0.877 1.027 1.166 1.448 1.582 1.706 1.686 2.069 2.184 2.424 2.659 2.87 2.971 3.19 3.405 3.713 3.919 4.128 4.443 4.745 5.043 5.331 5.597 5.929 6.259 6.599 7.012 7.429 7.857 8.356 8.878 9.36 9.904 10.495 11.131 11.796 12.577 13.558 14.526 15.617 16.891 18.397 20.04 21.816 23.726 25.626 26.625 26.671 26.212 25.654 25.159 24.708 24.191 23.691 23.111 22.554 22.022 21.467 20.976 20.519 20.027 19.448 18.942 18.511 18.044 17.553 17.138 16.677 16.23 15.92 15.562 15.158 14.728 14.287 13.986 13.666 13.133 12.741 12.356 12.163 11.744 11.264 10.741 10.481 9.975 9.587 9.229 8.844 8.033 7.563 7.045 6.336 5.393 4.349 2.891 -5.763 -7 ,21800 ,TETRA ,17616581,Mon Nov 29 12:33:34 CET,Mon Nov 29 14:54:22 CET,0.0 0.237 0.439 0.581 0.707 0.826 0.948 1.063 1.278 1.386 1.499 1.465 1.832 1.936 2.153 2.353 2.548 2.653 2.856 3.052 3.35 3.539 3.728 4.027 4.318 4.589 4.841 5.092 5.438 5.778 6.09 6.482 6.881 7.244 7.672 8.168 8.649 9.209 9.827 10.492 11.184 11.945 12.873 13.838 14.935 16.179 17.641 19.265 21.056 22.972 25.039 26.05 26.136 25.837 25.218 24.55 23.906 23.222 22.572 21.881 21.302 20.785 20.241 19.693 19.183 18.677 18.153 17.69 17.253 16.774 16.249 15.789 15.299 14.788 14.405 14.019 13.58 13.124 12.655 12.322 11.972 11.431 11.044 10.626 10.407 9.948 9.445 8.902 8.636 8.082 7.644 7.298 6.935 6.124 5.681 5.149 4.463 3.713 2.724 1.221 -7.057 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index cd7c728f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9309 ,TETRA ,17616585,Mon Nov 29 12:35:33 CET,Mon Nov 29 14:55:41 CET,0.0 0.808 1.132 1.41 1.662 1.89 2.08 2.246 2.581 2.742 2.886 3.044 3.277 3.406 3.65 3.893 4.145 4.262 4.483 4.688 4.977 5.171 5.355 5.605 5.851 6.096 6.33 6.559 6.861 7.157 7.447 7.792 8.112 8.433 8.82 9.236 9.637 10.073 10.553 11.083 11.626 12.252 12.995 13.752 14.579 15.432 16.468 17.658 19.018 20.594 22.489 23.986 24.659 24.905 24.998 24.994 24.862 24.708 24.542 24.326 24.126 23.919 23.691 23.44 23.185 22.949 22.702 22.483 22.29 22.083 21.867 21.682 21.488 21.26 21.076 20.907 20.725 20.524 20.331 20.207 20.064 19.813 19.631 19.436 19.331 19.085 18.818 18.542 18.406 18.197 18.022 17.85 17.681 17.327 17.121 16.887 16.532 16.178 15.803 15.22 12.383 -2 ,22649 ,TETRA ,17616586,Mon Nov 29 12:36:33 CET,Mon Nov 29 14:55:50 CET,0.0 0.788 1.057 1.312 1.515 1.702 1.888 2.081 2.424 2.58 2.732 2.899 3.134 3.267 3.506 3.718 3.926 4.032 4.249 4.448 4.725 4.92 5.106 5.377 5.633 5.874 6.11 6.335 6.632 6.926 7.211 7.568 7.915 8.239 8.611 9.02 9.409 9.824 10.269 10.733 11.204 11.736 12.387 13.102 13.932 14.799 15.734 16.701 17.804 19.034 20.298 21.155 21.486 21.533 21.469 21.368 21.297 21.168 20.988 20.783 20.62 20.457 20.263 20.08 19.922 19.728 19.517 19.366 19.231 19.076 18.9 18.75 18.595 18.452 18.333 18.189 18.048 17.888 17.702 17.586 17.456 17.198 16.986 16.79 16.708 16.541 16.371 16.18 16.069 15.874 15.727 15.613 15.478 15.04 14.792 14.57 14.321 14.049 13.692 13.122 7.843 -4 ,13919 ,TETRA ,17616588,Mon Nov 29 12:37:33 CET,Mon Nov 29 14:57:28 CET,0.0 0.633 0.885 1.09 1.269 1.427 1.582 1.721 1.987 2.119 2.246 2.375 2.604 2.728 2.978 3.203 3.41 3.516 3.73 3.936 4.219 4.4 4.568 4.811 5.053 5.284 5.517 5.74 6.036 6.329 6.602 6.933 7.246 7.553 7.921 8.338 8.743 9.189 9.677 10.209 10.746 11.305 11.966 12.692 13.594 14.589 15.692 16.944 18.345 19.909 21.71 22.848 23.4 23.702 23.705 23.556 23.42 23.276 23.146 22.979 22.745 22.506 22.286 22.121 21.962 21.765 21.528 21.308 21.126 20.918 20.711 20.55 20.334 20.102 19.938 19.77 19.614 19.453 19.246 19.084 18.924 18.68 18.502 18.299 18.19 17.97 17.73 17.49 17.352 17.097 16.892 16.748 16.58 16.224 15.982 15.716 15.445 15.093 14.567 13.843 11.662 -5 ,6881 ,TETRA ,17616589,Mon Nov 29 12:38:33 CET,Mon Nov 29 14:58:52 CET,0.0 0.64 0.944 1.176 1.367 1.559 1.726 1.867 2.13 2.258 2.387 2.52 2.74 2.859 3.086 3.298 3.502 3.604 3.796 3.979 4.248 4.408 4.566 4.812 5.053 5.271 5.486 5.715 6.013 6.296 6.565 6.882 7.185 7.492 7.856 8.24 8.604 9.027 9.507 10.015 10.562 11.196 11.894 12.586 13.42 14.361 15.444 16.645 18.052 19.755 21.739 23.142 23.851 24.147 24.181 24.083 23.931 23.801 23.675 23.498 23.239 22.99 22.796 22.599 22.41 22.24 22.027 21.825 21.659 21.488 21.286 21.104 20.944 20.767 20.591 20.408 20.235 20.046 19.833 19.675 19.511 19.247 19.039 18.824 18.714 18.479 18.238 17.989 17.858 17.632 17.42 17.267 17.099 16.638 16.391 16.148 15.853 15.497 15.015 14.284 11.058 -6 ,13895 ,TETRA ,17616590,Mon Nov 29 12:39:33 CET,Mon Nov 29 15:04:42 CET,0.0 0.58 0.82 1.02 1.169 1.309 1.446 1.577 1.844 1.965 2.083 2.196 2.404 2.514 2.734 2.932 3.11 3.2 3.385 3.566 3.827 3.992 4.153 4.403 4.667 4.918 5.129 5.339 5.635 5.912 6.173 6.48 6.773 7.081 7.463 7.907 8.291 8.672 9.102 9.559 10.032 10.569 11.216 11.888 12.675 13.553 14.605 15.795 17.146 18.669 20.273 21.473 22.003 22.13 22.107 22.002 21.766 21.48 21.232 20.961 20.736 20.55 20.354 20.127 19.912 19.727 19.525 19.36 19.206 19.015 18.817 18.671 18.514 18.337 18.197 18.047 17.889 17.718 17.548 17.419 17.26 17.008 16.852 16.68 16.581 16.402 16.207 15.96 15.806 15.544 15.284 15.118 14.945 14.553 14.32 14.078 13.827 13.522 13.118 12.535 9.882 -7 ,27976 ,TETRA ,17616591,Mon Nov 29 12:39:32 CET,Mon Nov 29 14:59:07 CET,0.0 1.007 1.293 1.53 1.746 1.935 2.111 2.259 2.512 2.644 2.778 2.933 3.169 3.28 3.507 3.724 3.92 4.008 4.184 4.363 4.627 4.788 4.934 5.154 5.369 5.599 5.841 6.065 6.326 6.593 6.88 7.208 7.517 7.829 8.2 8.603 8.971 9.39 9.856 10.354 10.874 11.461 12.135 12.82 13.625 14.52 15.552 16.681 18.009 19.45 20.914 21.947 22.424 22.698 22.792 22.757 22.702 22.595 22.449 22.293 22.166 22.042 21.906 21.761 21.622 21.468 21.288 21.132 20.99 20.842 20.676 20.525 20.341 20.134 19.973 19.795 19.602 19.403 19.197 19.055 18.907 18.672 18.506 18.338 18.244 18.029 17.821 17.6 17.481 17.259 17.028 16.869 16.703 16.293 16.055 15.77 15.45 15.093 14.647 13.893 4.288 -8 ,981 ,TETRA ,17616592,Mon Nov 29 12:40:35 CET,Mon Nov 29 14:58:04 CET,0.0 0.879 1.151 1.332 1.504 1.659 1.817 1.98 2.259 2.377 2.501 2.653 2.87 2.977 3.205 3.426 3.615 3.71 3.912 4.117 4.398 4.566 4.729 4.976 5.225 5.47 5.707 5.912 6.171 6.45 6.717 7.042 7.353 7.658 8.016 8.429 8.829 9.248 9.697 10.171 10.677 11.245 11.929 12.665 13.463 14.335 15.417 16.592 17.885 19.416 21.231 22.533 23.252 23.602 23.69 23.719 23.709 23.659 23.584 23.46 23.299 23.137 22.982 22.818 22.663 22.51 22.303 22.085 21.884 21.698 21.497 21.299 21.11 20.926 20.771 20.607 20.444 20.265 20.071 19.939 19.781 19.497 19.29 19.079 18.975 18.784 18.59 18.35 18.231 18.034 17.836 17.67 17.494 17.056 16.813 16.567 16.28 15.966 15.554 14.987 10.401 -9 ,14655 ,TETRA ,17616593,Mon Nov 29 12:41:35 CET,Mon Nov 29 15:00:21 CET,0.0 0.676 0.965 1.166 1.357 1.55 1.727 1.884 2.181 2.307 2.43 2.586 2.822 2.95 3.214 3.45 3.686 3.801 3.991 4.171 4.472 4.671 4.841 5.085 5.323 5.543 5.771 6.005 6.308 6.604 6.889 7.226 7.55 7.864 8.227 8.644 9.054 9.502 10.007 10.506 11.033 11.657 12.361 13.059 13.845 14.71 15.753 16.918 18.227 19.791 21.394 22.354 22.802 22.943 22.928 22.831 22.692 22.545 22.358 22.102 21.856 21.664 21.487 21.291 21.105 20.944 20.781 20.63 20.476 20.296 20.109 19.962 19.788 19.61 19.488 19.331 19.132 18.925 18.722 18.583 18.443 18.214 18.05 17.872 17.778 17.6 17.394 17.14 17.012 16.781 16.574 16.437 16.294 15.916 15.686 15.467 15.245 14.972 14.577 13.939 11.065 -10 ,21950 ,TETRA ,17616594,Mon Nov 29 12:41:37 CET,Mon Nov 29 14:59:36 CET,0.0 1.204 1.528 1.776 1.987 2.178 2.348 2.509 2.795 2.93 3.052 3.2 3.429 3.542 3.771 3.985 4.192 4.295 4.501 4.697 4.976 5.154 5.32 5.553 5.765 5.978 6.196 6.407 6.688 6.969 7.248 7.573 7.877 8.174 8.52 8.91 9.283 9.689 10.133 10.593 11.084 11.678 12.369 13.096 13.904 14.729 15.686 16.798 18.063 19.417 20.973 22.067 22.565 22.749 22.821 22.795 22.661 22.475 22.292 22.105 21.939 21.78 21.603 21.408 21.227 21.082 20.927 20.761 20.591 20.416 20.233 20.09 19.932 19.768 19.637 19.484 19.306 19.141 18.969 18.844 18.722 18.513 18.361 18.216 18.143 17.96 17.734 17.488 17.375 17.169 16.95 16.765 16.571 16.221 16.005 15.724 15.421 15.061 14.631 13.956 10.387 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 12522d84..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22806 ,TETRA ,17616595,Mon Nov 29 12:41:37 CET,Mon Nov 29 14:59:25 CET,0.0 0.25 0.424 0.568 0.698 0.854 0.996 1.116 1.374 1.486 1.584 1.575 1.848 1.929 2.081 2.215 2.338 2.4 2.518 2.631 2.799 2.92 3.035 3.182 3.35 3.525 3.681 3.828 4.016 4.19 4.362 4.58 4.805 5.026 5.253 5.481 5.706 5.954 6.235 6.555 6.86 7.174 7.534 7.907 8.361 8.84 9.326 9.787 10.213 10.579 10.756 10.477 9.989 9.507 8.975 8.449 8.033 7.649 7.302 6.947 6.601 6.277 5.99 5.698 5.423 5.177 4.922 4.683 4.479 4.29 4.075 3.875 3.655 3.425 3.235 3.053 2.877 2.694 2.503 2.366 2.231 2.023 1.87 1.71 1.616 1.414 1.206 0.971 0.853 0.541 0.47 0.333 0.186 -0.14 -0.305 -0.488 -0.703 -0.941 -1.231 -1.602 -2.726 -2 ,32082 ,TETRA ,17616596,Mon Nov 29 12:41:36 CET,Mon Nov 29 14:54:20 CET,0.0 0.291 0.456 0.587 0.696 0.817 0.95 1.071 1.286 1.386 1.473 1.442 1.715 1.802 1.964 2.103 2.233 2.298 2.418 2.536 2.71 2.82 2.938 3.11 3.258 3.398 3.54 3.686 3.871 4.057 4.246 4.458 4.663 4.852 5.06 5.306 5.535 5.799 6.083 6.372 6.685 7.033 7.442 7.846 8.302 8.806 9.39 10.016 10.613 11.229 11.659 11.513 11.217 10.801 10.353 9.91 9.477 9.048 8.64 8.242 7.92 7.621 7.331 7.057 6.79 6.526 6.219 5.958 5.763 5.57 5.36 5.161 4.942 4.731 4.578 4.405 4.22 4.029 3.814 3.653 3.479 3.213 3.039 2.863 2.766 2.555 2.339 2.109 1.999 1.697 1.632 1.502 1.363 1.047 0.859 0.642 0.424 0.183 -0.106 -0.47 -1.78 -3 ,4200 ,TETRA ,17616597,Mon Nov 29 12:42:38 CET,Mon Nov 29 14:57:26 CET,0.0 0.637 0.803 0.914 1.022 1.118 1.226 1.323 1.491 1.581 1.671 1.628 1.884 1.95 2.081 2.196 2.315 2.38 2.509 2.633 2.819 2.921 3.012 3.161 3.311 3.448 3.584 3.728 3.927 4.112 4.285 4.492 4.679 4.862 5.071 5.3 5.521 5.762 6.009 6.256 6.51 6.826 7.26 7.745 8.283 8.825 9.439 10.058 10.705 11.365 11.929 12.129 11.958 11.588 11.161 10.687 10.201 9.734 9.329 8.914 8.547 8.224 7.934 7.659 7.375 7.105 6.825 6.586 6.382 6.176 5.961 5.757 5.532 5.313 5.154 4.984 4.785 4.584 4.375 4.221 4.082 3.879 3.703 3.523 3.447 3.287 3.123 2.952 2.856 2.573 2.543 2.417 2.272 1.943 1.758 1.55 1.336 1.115 0.86 0.526 -0.513 -4 ,25622 ,TETRA ,17616598,Mon Nov 29 12:42:35 CET,Mon Nov 29 14:58:06 CET,0.0 0.187 0.343 0.513 0.69 0.848 0.964 1.078 1.296 1.393 1.472 1.438 1.716 1.801 1.958 2.101 2.234 2.301 2.423 2.541 2.712 2.818 2.924 3.081 3.24 3.41 3.569 3.714 3.901 4.069 4.227 4.424 4.624 4.83 5.067 5.305 5.539 5.821 6.118 6.428 6.746 7.113 7.541 7.99 8.532 9.066 9.646 10.254 10.816 11.316 11.744 11.917 11.736 11.308 10.84 10.358 9.867 9.395 8.979 8.577 8.237 7.921 7.61 7.325 7.062 6.815 6.555 6.327 6.123 5.895 5.662 5.473 5.259 5.015 4.812 4.62 4.454 4.284 4.098 3.961 3.805 3.558 3.393 3.225 3.14 2.966 2.781 2.585 2.48 2.17 2.096 1.954 1.801 1.49 1.32 1.121 0.894 0.67 0.425 0.104 -1.046 -5 ,26833 ,TETRA ,17616599,Mon Nov 29 12:42:35 CET,Mon Nov 29 14:47:30 CET,0.0 0.172 0.346 0.516 0.67 0.826 0.966 1.097 1.34 1.457 1.57 1.575 1.847 1.919 2.072 2.22 2.365 2.435 2.564 2.687 2.854 2.957 3.067 3.237 3.396 3.544 3.686 3.831 4.029 4.202 4.36 4.557 4.739 4.932 5.147 5.358 5.573 5.819 6.086 6.359 6.634 6.956 7.318 7.659 8.065 8.506 8.977 9.476 9.999 10.486 10.857 10.747 10.388 10.012 9.593 9.163 8.753 8.385 8.068 7.75 7.466 7.195 6.937 6.684 6.408 6.159 5.928 5.722 5.54 5.355 5.167 4.997 4.809 4.624 4.474 4.308 4.138 3.965 3.773 3.627 3.489 3.284 3.137 2.987 2.909 2.756 2.566 2.311 2.18 1.866 1.777 1.639 1.513 1.209 1.045 0.87 0.629 0.362 0.07 -0.329 -1.781 -6 ,31551 ,TETRA ,17616600,Mon Nov 29 12:42:37 CET,Mon Nov 29 15:02:08 CET,0.0 0.369 0.602 0.82 1.006 1.203 1.357 1.45 1.629 1.718 1.799 1.757 2.028 2.114 2.254 2.383 2.515 2.576 2.707 2.842 3.019 3.127 3.238 3.388 3.54 3.699 3.844 3.983 4.165 4.342 4.513 4.724 4.927 5.128 5.354 5.585 5.804 6.047 6.315 6.609 6.914 7.245 7.645 8.052 8.499 8.972 9.483 10.015 10.571 11.061 11.353 11.201 10.796 10.351 9.936 9.526 9.117 8.717 8.352 7.974 7.638 7.337 7.017 6.692 6.409 6.165 5.895 5.644 5.433 5.225 5.019 4.858 4.668 4.46 4.299 4.116 3.943 3.776 3.599 3.481 3.348 3.109 2.938 2.769 2.681 2.478 2.268 2.06 1.937 1.63 1.577 1.44 1.31 1.05 0.927 0.799 0.608 0.388 0.152 -0.18 -1.472 -7 ,14209 ,TETRA ,17616601,Mon Nov 29 12:43:34 CET,Mon Nov 29 15:02:52 CET,0.0 0.313 0.508 0.649 0.799 0.937 1.048 1.159 1.354 1.438 1.532 1.517 1.783 1.848 1.995 2.145 2.29 2.356 2.481 2.613 2.793 2.903 3.021 3.207 3.377 3.527 3.675 3.826 4.008 4.168 4.324 4.538 4.748 4.946 5.172 5.397 5.61 5.858 6.155 6.455 6.706 6.995 7.369 7.71 8.075 8.475 8.899 9.386 9.931 10.331 10.43 10.254 9.841 9.295 8.719 8.188 7.74 7.365 7.041 6.716 6.442 6.204 5.983 5.742 5.494 5.227 4.918 4.66 4.464 4.274 4.067 3.878 3.679 3.464 3.291 3.13 2.96 2.756 2.535 2.377 2.214 1.969 1.788 1.618 1.532 1.35 1.177 0.996 0.888 0.569 0.494 0.363 0.228 -0.063 -0.228 -0.412 -0.616 -0.835 -1.119 -1.477 -2.409 -8 ,8442 ,TETRA ,17616602,Mon Nov 29 12:44:34 CET,Mon Nov 29 15:03:38 CET,0.0 0.355 0.514 0.628 0.734 0.831 0.923 1.029 1.227 1.308 1.385 1.351 1.623 1.695 1.834 1.971 2.109 2.179 2.316 2.445 2.62 2.733 2.843 2.996 3.14 3.267 3.382 3.507 3.67 3.817 3.975 4.16 4.336 4.518 4.719 4.943 5.172 5.424 5.704 6.003 6.297 6.611 6.986 7.344 7.704 8.121 8.623 9.187 9.81 10.353 10.614 10.412 10.023 9.656 9.278 8.882 8.523 8.154 7.814 7.484 7.185 6.903 6.617 6.325 6.071 5.855 5.62 5.4 5.197 4.984 4.76 4.563 4.362 4.134 3.954 3.771 3.573 3.387 3.202 3.073 2.928 2.699 2.556 2.389 2.293 2.094 1.875 1.659 1.543 1.239 1.171 1.037 0.895 0.549 0.373 0.212 -0.002 -0.271 -0.578 -0.948 -1.957 -9 ,30517 ,TETRA ,17616603,Mon Nov 29 12:45:33 CET,Mon Nov 29 15:00:38 CET,0.0 0.353 0.525 0.708 0.849 0.963 1.069 1.177 1.383 1.483 1.577 1.543 1.824 1.894 2.008 2.128 2.263 2.331 2.453 2.563 2.735 2.846 2.962 3.134 3.286 3.428 3.56 3.693 3.859 4.018 4.179 4.375 4.566 4.744 4.95 5.184 5.405 5.662 5.93 6.176 6.43 6.765 7.162 7.532 7.943 8.337 8.761 9.225 9.71 10.2 10.514 10.444 10.238 9.898 9.466 9.001 8.594 8.223 7.867 7.508 7.184 6.882 6.597 6.332 6.055 5.797 5.532 5.284 5.088 4.892 4.665 4.471 4.277 4.077 3.91 3.75 3.596 3.413 3.215 3.08 2.937 2.707 2.547 2.381 2.301 2.14 1.945 1.723 1.613 1.317 1.248 1.105 0.958 0.595 0.384 0.191 0.003 -0.218 -0.531 -0.965 -2.137 -10 ,3754 ,TETRA ,17616604,Mon Nov 29 12:46:33 CET,Mon Nov 29 15:08:37 CET,0.0 0.481 0.704 0.878 1.021 1.129 1.227 1.322 1.521 1.612 1.686 1.635 1.891 1.955 2.081 2.215 2.35 2.414 2.54 2.66 2.833 2.94 3.041 3.182 3.315 3.445 3.572 3.709 3.896 4.074 4.238 4.434 4.621 4.808 5.027 5.265 5.478 5.715 5.999 6.304 6.622 6.969 7.375 7.787 8.223 8.647 9.07 9.521 10.005 10.428 10.642 10.372 9.9 9.369 8.832 8.352 7.928 7.559 7.234 6.869 6.556 6.253 5.932 5.631 5.355 5.092 4.789 4.47 4.198 3.921 3.614 3.383 3.187 2.986 2.809 2.632 2.451 2.246 2.029 1.874 1.713 1.475 1.312 1.142 1.051 0.871 0.665 0.428 0.316 0.015 -0.055 -0.19 -0.328 -0.664 -0.851 -1.043 -1.227 -1.463 -1.772 -2.147 -3.939 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt deleted file mode 100644 index c90fc942..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10788 ,TETRA ,17616605,Mon Nov 29 12:48:34 CET,Mon Nov 29 14:47:01 CET,0.0 0.981 1.379 1.674 1.958 2.221 2.417 2.61 3.024 3.213 3.376 3.511 3.843 3.983 4.254 4.494 4.703 4.805 5.023 5.267 5.613 5.813 5.996 6.273 6.551 6.814 7.071 7.334 7.672 7.975 8.274 8.639 8.99 9.324 9.707 10.2 10.723 11.28 11.828 12.389 12.99 13.674 14.478 15.281 16.233 17.319 18.584 20.011 21.605 23.435 25.668 27.397 28.262 28.747 29.035 29.183 29.24 29.242 29.201 29.13 29.048 28.973 28.886 28.761 28.599 28.431 28.259 28.075 27.89 27.704 27.51 27.352 27.21 27.075 26.963 26.841 26.714 26.578 26.435 26.327 26.215 26.06 25.952 25.805 25.732 25.586 25.438 25.292 25.202 24.943 24.87 24.743 24.604 24.289 24.137 23.999 23.839 23.643 23.363 22.967 21.779 -2 ,18524 ,TETRA ,17616606,Mon Nov 29 12:48:34 CET,Mon Nov 29 14:47:50 CET,0.0 1.895 2.364 2.676 2.931 3.176 3.448 3.699 4.1 4.267 4.422 4.55 4.88 5.016 5.275 5.523 5.762 5.879 6.108 6.328 6.639 6.839 7.049 7.346 7.615 7.878 8.136 8.388 8.706 9.014 9.329 9.719 10.085 10.438 10.846 11.311 11.751 12.232 12.771 13.334 13.909 14.566 15.363 16.18 17.097 18.153 19.412 20.794 22.379 24.176 26.323 28.018 28.917 29.398 29.627 29.774 29.892 29.924 29.88 29.781 29.677 29.6 29.509 29.394 29.273 29.157 29.024 28.876 28.719 28.554 28.384 28.221 28.068 27.929 27.814 27.68 27.546 27.414 27.263 27.156 27.036 26.843 26.712 26.567 26.49 26.34 26.196 26.006 25.899 25.624 25.547 25.435 25.302 24.99 24.828 24.667 24.467 24.22 23.969 23.653 22.089 -3 ,31213 ,TETRA ,17616607,Mon Nov 29 12:49:33 CET,Mon Nov 29 14:49:47 CET,0.0 1.856 2.292 2.611 2.887 3.13 3.347 3.556 3.972 4.162 4.339 4.436 4.754 4.889 5.158 5.409 5.651 5.77 6.023 6.29 6.646 6.858 7.064 7.335 7.587 7.852 8.1 8.346 8.663 8.967 9.278 9.647 10.026 10.401 10.83 11.308 11.747 12.228 12.736 13.261 13.853 14.54 15.337 16.139 17.072 18.134 19.366 20.782 22.456 24.394 26.658 28.435 29.359 29.866 30.166 30.3 30.343 30.344 30.293 30.206 30.129 30.04 29.927 29.8 29.663 29.522 29.381 29.255 29.141 29.013 28.852 28.689 28.501 28.313 28.167 28.022 27.876 27.719 27.562 27.453 27.328 27.125 26.973 26.819 26.737 26.561 26.386 26.203 26.094 25.824 25.786 25.678 25.562 25.32 25.183 25.03 24.851 24.638 24.411 24.066 22.697 -4 ,19193 ,TETRA ,17616608,Mon Nov 29 12:49:33 CET,Mon Nov 29 14:50:29 CET,0.0 1.729 2.223 2.575 2.863 3.132 3.354 3.565 3.975 4.149 4.304 4.422 4.75 4.893 5.164 5.437 5.702 5.824 6.064 6.305 6.668 6.885 7.086 7.406 7.707 7.975 8.235 8.48 8.782 9.081 9.394 9.779 10.137 10.478 10.884 11.366 11.806 12.265 12.773 13.33 13.907 14.559 15.334 16.137 17.094 18.169 19.394 20.779 22.47 24.425 26.669 28.425 29.369 29.87 30.151 30.298 30.312 30.302 30.282 30.206 30.117 30.013 29.882 29.759 29.624 29.485 29.34 29.206 29.072 28.914 28.746 28.608 28.46 28.294 28.156 28.015 27.855 27.681 27.52 27.408 27.295 27.107 26.974 26.835 26.763 26.619 26.465 26.315 26.232 25.983 25.938 25.83 25.726 25.45 25.288 25.116 24.925 24.738 24.464 24.061 22.619 -5 ,30659 ,TETRA ,17616609,Mon Nov 29 12:51:33 CET,Mon Nov 29 15:01:33 CET,0.0 1.735 2.159 2.54 2.896 3.227 3.509 3.732 4.173 4.362 4.519 4.628 4.958 5.106 5.385 5.644 5.885 6.01 6.237 6.449 6.775 6.974 7.17 7.469 7.754 8.023 8.288 8.533 8.857 9.179 9.481 9.841 10.186 10.522 10.93 11.393 11.832 12.33 12.871 13.436 14.042 14.727 15.533 16.364 17.325 18.406 19.654 21.003 22.568 24.415 26.578 28.253 29.137 29.661 29.987 30.151 30.188 30.169 30.124 30.039 29.938 29.819 29.693 29.564 29.428 29.304 29.147 28.968 28.811 28.66 28.506 28.39 28.282 28.163 28.06 27.944 27.819 27.698 27.555 27.438 27.313 27.104 26.97 26.85 26.775 26.611 26.445 26.266 26.17 25.904 25.842 25.725 25.614 25.415 25.289 25.118 24.925 24.692 24.371 23.981 22.552 -6 ,30813 ,TETRA ,17616610,Mon Nov 29 12:51:35 CET,Mon Nov 29 14:54:53 CET,0.0 1.131 1.535 1.868 2.121 2.352 2.57 2.783 3.197 3.402 3.603 3.789 4.143 4.301 4.583 4.825 5.06 5.177 5.394 5.595 5.893 6.094 6.296 6.608 6.91 7.2 7.493 7.796 8.203 8.569 8.905 9.305 9.674 10.018 10.428 10.886 11.323 11.83 12.36 12.911 13.529 14.217 14.994 15.81 16.757 17.816 19.027 20.374 21.978 23.827 26.076 27.882 28.765 29.249 29.538 29.683 29.743 29.733 29.669 29.606 29.503 29.39 29.279 29.15 29.038 28.932 28.775 28.627 28.494 28.347 28.212 28.099 27.982 27.848 27.731 27.615 27.484 27.324 27.149 27.04 26.928 26.728 26.593 26.45 26.372 26.19 25.968 25.725 25.576 25.279 25.232 25.136 25.032 24.788 24.642 24.473 24.286 24.062 23.768 23.341 22.046 -7 ,28284 ,TETRA ,17616611,Mon Nov 29 12:51:35 CET,Mon Nov 29 14:54:40 CET,0.0 1.098 1.564 1.912 2.212 2.461 2.645 2.826 3.214 3.398 3.552 3.658 3.983 4.128 4.419 4.697 4.977 5.117 5.375 5.623 5.959 6.165 6.37 6.655 6.946 7.247 7.548 7.845 8.214 8.554 8.887 9.29 9.663 10.035 10.476 10.954 11.387 11.868 12.42 13.02 13.635 14.292 15.065 15.849 16.749 17.786 19.01 20.366 21.994 23.949 26.239 27.968 28.93 29.559 29.901 30.055 30.109 30.086 30.03 29.964 29.898 29.82 29.717 29.607 29.488 29.366 29.212 29.039 28.899 28.761 28.615 28.496 28.368 28.235 28.132 28.013 27.865 27.706 27.549 27.45 27.343 27.145 26.994 26.842 26.772 26.638 26.49 26.308 26.201 25.939 25.895 25.786 25.679 25.438 25.303 25.128 24.911 24.685 24.433 24.085 22.848 -8 ,26590 ,TETRA ,17616612,Mon Nov 29 12:51:35 CET,Mon Nov 29 14:53:58 CET,0.0 1.586 2.049 2.392 2.672 2.929 3.157 3.362 3.743 3.916 4.083 4.22 4.548 4.681 4.956 5.201 5.428 5.539 5.751 5.956 6.258 6.461 6.668 6.965 7.242 7.511 7.76 8.014 8.349 8.666 8.998 9.43 9.856 10.259 10.706 11.176 11.617 12.12 12.642 13.183 13.759 14.422 15.226 16.028 16.965 18.017 19.259 20.697 22.341 24.21 26.407 28.22 29.214 29.751 30.079 30.257 30.317 30.291 30.229 30.139 30.014 29.891 29.789 29.677 29.532 29.407 29.295 29.178 29.058 28.903 28.741 28.617 28.492 28.366 28.235 28.082 27.934 27.795 27.663 27.563 27.456 27.299 27.199 27.072 26.993 26.827 26.674 26.541 26.466 26.209 26.185 26.065 25.92 25.579 25.374 25.172 24.981 24.789 24.54 24.229 23.074 -9 ,6077 ,TETRA ,17616613,Mon Nov 29 12:52:33 CET,Mon Nov 29 14:52:12 CET,0.0 2.057 2.474 2.82 3.105 3.332 3.549 3.767 4.162 4.328 4.486 4.595 4.919 5.058 5.334 5.61 5.854 5.97 6.199 6.43 6.755 6.948 7.143 7.449 7.748 8.019 8.264 8.509 8.845 9.189 9.527 9.938 10.327 10.675 11.089 11.563 12.003 12.484 12.979 13.503 14.07 14.723 15.521 16.356 17.32 18.37 19.58 20.963 22.573 24.49 26.738 28.386 29.207 29.671 29.958 30.11 30.21 30.24 30.215 30.162 30.064 29.95 29.827 29.703 29.605 29.515 29.402 29.28 29.165 29.061 28.938 28.809 28.659 28.494 28.372 28.25 28.12 27.984 27.845 27.735 27.609 27.429 27.302 27.159 27.084 26.93 26.767 26.601 26.517 26.259 26.18 26.062 25.946 25.688 25.541 25.398 25.236 25.021 24.779 24.436 23.05 -10 ,12042 ,TETRA ,17616614,Mon Nov 29 12:53:34 CET,Mon Nov 29 14:53:26 CET,0.0 1.244 1.693 2.036 2.321 2.563 2.786 3.011 3.417 3.586 3.75 3.907 4.255 4.413 4.72 5.028 5.339 5.496 5.774 6.017 6.382 6.605 6.8 7.061 7.338 7.635 7.903 8.147 8.462 8.765 9.076 9.452 9.803 10.139 10.529 10.991 11.473 11.984 12.504 13.061 13.66 14.329 15.102 15.902 16.849 17.911 19.136 20.527 22.125 23.954 26.106 27.804 28.725 29.252 29.541 29.67 29.692 29.672 29.634 29.576 29.495 29.387 29.265 29.159 29.064 28.967 28.861 28.747 28.601 28.432 28.253 28.107 27.976 27.847 27.735 27.613 27.487 27.353 27.211 27.091 26.957 26.766 26.623 26.468 26.386 26.223 26.068 25.894 25.804 25.555 25.482 25.352 25.216 24.892 24.696 24.479 24.265 24.052 23.781 23.393 22.129 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index be7c478c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10786 ,KEBNE ,17027855,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:20:59 CET,0.0 2.047 2.429 2.664 2.844 2.992 3.1 3.193 3.349 3.418 3.475 3.396 3.637 3.688 3.758 3.805 3.827 3.829 3.818 3.808 3.787 3.771 3.743 3.677 3.601 3.486 3.374 3.264 3.11 2.96 2.81 2.602 2.362 2.109 1.791 1.392 0.978 0.518 -0.033 -0.724 -1.497 -2.443 -3.681 -5.044 -6.804 -8.998 -11.92 -15.719 -20.882 -28.109 -39.003 -50.674 -59.422 -66.294 -71.739 -76.338 -80.164 -83.468 -86.192 -88.805 -90.976 -92.836 -94.554 -96.121 -97.531 -98.798 -100.115 -101.257 -102.203 -103.167 -104.153 -104.961 -105.78 -106.6 -107.225 -107.868 -108.523 -109.179 -109.859 -110.312 -110.764 -111.482 -111.975 -112.472 -112.727 -113.253 -113.792 -114.375 -114.667 -115.279 -115.58 -115.909 -116.239 -116.923 -117.302 -117.698 -118.141 -118.626 -119.198 -120.0 -122.786 -2 ,14569 ,KEBNE ,17027856,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:19:40 CET,0.0 1.506 1.758 1.995 2.202 2.367 2.499 2.624 2.817 2.887 2.949 2.89 3.118 3.151 3.177 3.217 3.238 3.244 3.25 3.24 3.204 3.17 3.132 3.067 3.005 2.952 2.904 2.84 2.716 2.544 2.368 2.161 1.931 1.693 1.4 1.013 0.578 0.046 -0.604 -1.406 -2.298 -3.367 -4.71 -6.163 -8.007 -10.235 -13.111 -16.809 -21.827 -28.929 -39.719 -51.316 -59.983 -66.768 -72.235 -76.813 -80.531 -83.734 -86.439 -89.057 -91.221 -93.074 -94.795 -96.367 -97.788 -99.072 -100.395 -101.543 -102.497 -103.459 -104.466 -105.286 -106.1 -106.93 -107.558 -108.196 -108.847 -109.495 -110.152 -110.605 -111.07 -111.793 -112.308 -112.832 -113.084 -113.591 -114.149 -114.718 -114.997 -115.608 -115.901 -116.227 -116.558 -117.256 -117.631 -118.036 -118.491 -118.994 -119.556 -120.233 -122.648 -3 ,22737 ,KEBNE ,17027857,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:18:56 CET,0.0 1.772 2.147 2.384 2.56 2.693 2.824 2.942 3.1 3.154 3.219 3.165 3.402 3.446 3.512 3.564 3.598 3.61 3.621 3.637 3.643 3.628 3.605 3.554 3.472 3.363 3.274 3.159 2.93 2.698 2.471 2.186 1.874 1.56 1.195 0.724 0.226 -0.344 -0.999 -1.764 -2.639 -3.717 -5.123 -6.655 -8.587 -10.888 -13.862 -17.716 -22.898 -30.159 -40.987 -52.522 -61.184 -68.036 -73.545 -78.133 -81.897 -85.167 -87.917 -90.564 -92.738 -94.582 -96.272 -97.836 -99.273 -100.571 -101.883 -103.018 -104.001 -104.978 -105.954 -106.752 -107.564 -108.394 -109.025 -109.665 -110.303 -110.964 -111.642 -112.083 -112.536 -113.241 -113.704 -114.172 -114.413 -114.908 -115.427 -115.968 -116.256 -116.871 -117.15 -117.449 -117.75 -118.41 -118.794 -119.224 -119.642 -120.088 -120.58 -121.191 -123.117 -4 ,16815 ,KEBNE ,17027858,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:19:01 CET,0.0 1.968 2.345 2.622 2.828 2.952 3.067 3.198 3.414 3.487 3.545 3.436 3.652 3.687 3.728 3.749 3.756 3.753 3.754 3.783 3.798 3.792 3.79 3.732 3.635 3.531 3.414 3.284 3.109 2.941 2.763 2.533 2.282 2.02 1.701 1.3 0.867 0.334 -0.329 -1.094 -1.93 -2.936 -4.228 -5.618 -7.379 -9.617 -12.529 -16.283 -21.367 -28.436 -39.113 -50.705 -59.305 -65.987 -71.456 -76.082 -79.881 -83.137 -85.811 -88.368 -90.523 -92.425 -94.153 -95.722 -97.141 -98.379 -99.641 -100.715 -101.628 -102.61 -103.617 -104.407 -105.2 -106.032 -106.67 -107.307 -107.954 -108.615 -109.287 -109.773 -110.278 -111.026 -111.522 -112.031 -112.3 -112.849 -113.423 -114.025 -114.336 -114.97 -115.333 -115.67 -116.019 -116.812 -117.239 -117.707 -118.207 -118.741 -119.394 -120.196 -122.679 -5 ,16947 ,KEBNE ,17027859,Wed Dec 22 18:38:09 CET,Wed Dec 22 20:20:36 CET,0.0 1.618 1.924 2.172 2.402 2.613 2.792 2.907 3.071 3.145 3.201 3.093 3.298 3.319 3.359 3.397 3.432 3.453 3.484 3.484 3.462 3.442 3.405 3.337 3.263 3.174 3.085 3.009 2.893 2.729 2.551 2.301 1.993 1.672 1.293 0.819 0.34 -0.22 -0.911 -1.68 -2.536 -3.593 -4.922 -6.435 -8.356 -10.689 -13.77 -17.695 -22.794 -29.908 -40.891 -52.711 -61.49 -68.43 -74.066 -78.753 -82.535 -85.714 -88.367 -90.984 -93.153 -95.023 -96.756 -98.311 -99.716 -100.991 -102.285 -103.41 -104.352 -105.299 -106.274 -107.072 -107.877 -108.69 -109.312 -109.943 -110.586 -111.264 -111.954 -112.408 -112.876 -113.581 -114.062 -114.572 -114.828 -115.32 -115.834 -116.382 -116.664 -117.268 -117.513 -117.797 -118.104 -118.792 -119.167 -119.573 -119.989 -120.452 -121.01 -121.761 -124.716 -6 ,5946 ,KEBNE ,17027860,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:19:11 CET,0.0 1.77 2.299 2.6 2.824 3.023 3.166 3.284 3.461 3.528 3.603 3.556 3.787 3.818 3.869 3.912 3.947 3.959 3.967 3.957 3.922 3.891 3.834 3.731 3.628 3.504 3.361 3.216 3.012 2.784 2.566 2.298 2.004 1.693 1.296 0.815 0.322 -0.222 -0.834 -1.585 -2.418 -3.453 -4.816 -6.301 -8.215 -10.585 -13.65 -17.536 -22.717 -29.848 -40.494 -52.102 -60.826 -67.604 -72.984 -77.51 -81.298 -84.617 -87.439 -90.102 -92.249 -94.09 -95.776 -97.33 -98.738 -99.991 -101.276 -102.359 -103.285 -104.254 -105.22 -106.002 -106.787 -107.575 -108.192 -108.825 -109.467 -110.119 -110.79 -111.247 -111.697 -112.393 -112.865 -113.349 -113.611 -114.152 -114.706 -115.272 -115.563 -116.179 -116.448 -116.756 -117.088 -117.819 -118.227 -118.646 -119.095 -119.617 -120.21 -120.912 -123.497 -7 ,24622 ,KEBNE ,17027861,Wed Dec 22 18:38:08 CET,Wed Dec 22 20:20:21 CET,0.0 1.632 1.856 2.049 2.231 2.404 2.534 2.643 2.807 2.875 2.932 2.828 3.056 3.094 3.147 3.17 3.177 3.181 3.197 3.2 3.172 3.142 3.103 3.041 2.957 2.878 2.802 2.69 2.528 2.362 2.177 1.927 1.667 1.379 0.998 0.58 0.163 -0.347 -0.917 -1.572 -2.365 -3.404 -4.777 -6.303 -8.241 -10.539 -13.478 -17.326 -22.6 -29.902 -40.799 -52.437 -61.099 -67.95 -73.385 -77.888 -81.68 -84.977 -87.684 -90.307 -92.503 -94.395 -96.134 -97.708 -99.124 -100.373 -101.644 -102.762 -103.702 -104.695 -105.728 -106.543 -107.351 -108.148 -108.75 -109.373 -110.003 -110.645 -111.332 -111.798 -112.247 -112.923 -113.399 -113.894 -114.143 -114.646 -115.14 -115.645 -115.911 -116.518 -116.802 -117.111 -117.436 -118.14 -118.52 -118.92 -119.368 -119.873 -120.389 -121.026 -122.911 -8 ,15890 ,KEBNE ,17027862,Wed Dec 22 18:38:08 CET,Wed Dec 22 20:19:35 CET,0.0 1.857 2.296 2.542 2.705 2.818 2.925 3.043 3.262 3.346 3.402 3.329 3.576 3.619 3.662 3.695 3.708 3.708 3.726 3.731 3.695 3.659 3.622 3.538 3.439 3.344 3.232 3.103 2.92 2.745 2.549 2.285 2.017 1.743 1.394 0.964 0.508 -0.051 -0.696 -1.421 -2.214 -3.183 -4.471 -5.882 -7.655 -9.856 -12.794 -16.697 -21.811 -28.702 -39.278 -50.602 -59.069 -65.905 -71.371 -75.964 -79.785 -83.011 -85.684 -88.257 -90.381 -92.265 -94.026 -95.624 -97.067 -98.355 -99.659 -100.791 -101.748 -102.708 -103.682 -104.492 -105.33 -106.185 -106.846 -107.516 -108.183 -108.865 -109.574 -110.05 -110.532 -111.275 -111.778 -112.289 -112.554 -113.104 -113.655 -114.214 -114.511 -115.132 -115.475 -115.83 -116.194 -116.955 -117.368 -117.773 -118.221 -118.751 -119.352 -120.205 -124.308 -9 ,12 ,KEBNE ,17027863,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:18:58 CET,0.0 1.842 2.197 2.437 2.614 2.764 2.892 2.987 3.125 3.18 3.244 3.174 3.404 3.443 3.499 3.534 3.541 3.533 3.523 3.499 3.452 3.423 3.384 3.336 3.307 3.271 3.191 3.055 2.859 2.672 2.466 2.214 1.984 1.733 1.401 0.999 0.547 -0.031 -0.692 -1.451 -2.308 -3.316 -4.61 -6.085 -8.004 -10.344 -13.294 -17.104 -22.285 -29.491 -40.346 -51.925 -60.446 -67.113 -72.514 -77.061 -80.795 -84.005 -86.696 -89.287 -91.405 -93.236 -94.95 -96.509 -97.948 -99.254 -100.565 -101.687 -102.633 -103.617 -104.635 -105.45 -106.258 -107.069 -107.702 -108.352 -109.015 -109.707 -110.422 -110.891 -111.33 -112.022 -112.524 -113.04 -113.292 -113.787 -114.296 -114.849 -115.144 -115.749 -116.043 -116.378 -116.705 -117.395 -117.782 -118.209 -118.683 -119.225 -119.869 -120.616 -123.278 -10 ,29296 ,KEBNE ,17027864,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:19:10 CET,0.0 1.147 1.55 1.884 2.109 2.274 2.42 2.549 2.741 2.803 2.865 2.789 3.022 3.072 3.162 3.238 3.296 3.316 3.335 3.334 3.306 3.273 3.227 3.141 3.045 2.932 2.795 2.652 2.459 2.252 2.04 1.754 1.444 1.132 0.742 0.278 -0.226 -0.807 -1.473 -2.267 -3.162 -4.261 -5.646 -7.122 -9.0 -11.325 -14.373 -18.234 -23.353 -30.543 -41.393 -52.913 -61.497 -68.289 -73.76 -78.331 -82.048 -85.241 -87.92 -90.545 -92.733 -94.611 -96.34 -97.913 -99.332 -100.609 -101.914 -103.057 -104.015 -104.97 -105.951 -106.744 -107.538 -108.347 -108.966 -109.605 -110.259 -110.912 -111.556 -112.003 -112.471 -113.171 -113.648 -114.139 -114.383 -114.876 -115.402 -115.957 -116.236 -116.843 -117.127 -117.437 -117.756 -118.431 -118.804 -119.187 -119.609 -120.066 -120.521 -121.176 -123.457 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index b611ae32..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,132 ,TETRA ,17616618,Mon Nov 29 12:59:34 CET,Mon Nov 29 14:55:46 CET,0.0 0.307 0.562 0.805 1.009 1.18 1.343 1.506 1.822 1.975 2.124 2.248 2.563 2.705 2.978 3.245 3.507 3.64 3.91 4.18 4.601 4.881 5.143 5.527 5.933 6.339 6.714 7.069 7.527 7.963 8.406 8.968 9.503 10.032 10.635 11.288 11.944 12.73 13.67 14.716 15.847 17.177 18.723 20.283 22.195 24.387 26.865 29.677 32.955 36.765 41.179 44.012 44.874 44.935 44.649 44.257 43.782 43.187 42.628 42.028 41.486 40.992 40.493 40.035 39.619 39.219 38.765 38.326 37.943 37.559 37.151 36.81 36.448 36.055 35.735 35.394 35.056 34.722 34.361 34.092 33.803 33.308 32.999 32.731 32.591 32.273 31.869 31.37 31.099 30.699 30.289 29.979 29.666 28.994 28.604 28.147 27.614 27.029 26.332 25.265 12.593 -5 ,17170 ,TETRA ,17616619,Mon Nov 29 13:02:32 CET,Mon Nov 29 14:56:44 CET,0.0 0.786 1.031 1.251 1.452 1.642 1.814 1.974 2.291 2.445 2.595 2.706 3.039 3.194 3.507 3.81 4.108 4.258 4.543 4.818 5.237 5.509 5.78 6.187 6.602 7.015 7.412 7.805 8.329 8.852 9.382 10.018 10.625 11.217 11.918 12.739 13.555 14.445 15.397 16.46 17.615 18.907 20.461 22.078 24.015 26.218 28.743 31.545 34.819 38.554 42.669 45.127 46.006 46.389 46.295 45.952 45.569 45.097 44.617 44.059 43.518 43.003 42.516 42.091 41.645 41.195 40.748 40.36 40.007 39.625 39.224 38.883 38.522 38.123 37.814 37.5 37.185 36.867 36.522 36.279 36.023 35.622 35.342 35.039 34.873 34.528 34.18 33.787 33.564 33.189 32.819 32.564 32.315 31.702 31.307 30.881 30.436 29.817 29.058 28.039 17.304 -7 ,27075 ,TETRA ,17616621,Mon Nov 29 13:04:38 CET,Mon Nov 29 15:00:27 CET,0.0 0.265 0.46 0.602 0.755 0.906 1.049 1.187 1.462 1.598 1.729 1.822 2.138 2.27 2.526 2.796 3.073 3.201 3.45 3.705 4.069 4.302 4.536 4.893 5.252 5.597 5.935 6.275 6.725 7.165 7.596 8.145 8.686 9.227 9.891 10.633 11.339 12.126 12.987 13.922 14.964 16.167 17.568 19.025 20.745 22.708 25.029 27.642 30.787 34.502 38.685 41.869 43.439 44.182 44.486 44.479 44.327 44.135 43.876 43.445 43.011 42.667 42.346 42.019 41.703 41.387 41.019 40.651 40.299 39.914 39.511 39.179 38.816 38.433 38.137 37.838 37.53 37.2 36.852 36.625 36.397 36.053 35.821 35.533 35.383 35.074 34.744 34.395 34.196 33.855 33.576 33.333 33.068 32.381 31.941 31.464 30.951 30.352 29.628 28.578 19.942 -9 ,16642 ,TETRA ,17616623,Mon Nov 29 13:05:29 CET,Mon Nov 29 15:01:58 CET,0.0 0.186 0.371 0.554 0.751 0.935 1.1 1.253 1.532 1.676 1.816 1.922 2.237 2.381 2.676 2.967 3.272 3.421 3.695 3.963 4.379 4.652 4.915 5.288 5.649 6.032 6.41 6.763 7.219 7.67 8.11 8.65 9.201 9.742 10.369 11.078 11.753 12.542 13.452 14.432 15.472 16.641 18.045 19.524 21.264 23.252 25.612 28.255 31.375 34.975 39.012 41.725 43.031 43.818 44.158 44.247 44.077 43.77 43.475 43.112 42.754 42.419 42.089 41.756 41.423 41.091 40.729 40.382 40.052 39.69 39.286 38.941 38.598 38.192 37.845 37.495 37.167 36.841 36.474 36.216 35.925 35.445 35.127 34.775 34.583 34.205 33.799 33.348 33.124 32.761 32.384 32.079 31.763 31.143 30.806 30.421 29.928 29.281 28.573 27.61 14.946 -10 ,1574 ,TETRA ,17616624,Mon Nov 29 13:07:38 CET,Mon Nov 29 15:04:20 CET,0.0 0.247 0.462 0.657 0.831 1.02 1.187 1.342 1.67 1.832 1.989 2.103 2.439 2.587 2.878 3.167 3.453 3.594 3.88 4.17 4.59 4.857 5.128 5.524 5.907 6.311 6.722 7.115 7.625 8.149 8.676 9.299 9.902 10.506 11.224 12.039 12.83 13.741 14.77 15.859 17.017 18.366 19.968 21.575 23.486 25.645 28.133 31.023 34.261 37.91 42.124 44.943 46.071 46.388 46.256 45.961 45.623 45.191 44.709 44.181 43.68 43.208 42.747 42.292 41.855 41.451 41.028 40.654 40.328 39.96 39.553 39.214 38.865 38.507 38.223 37.93 37.617 37.288 36.963 36.744 36.515 36.156 35.88 35.577 35.422 35.102 34.807 34.49 34.305 33.972 33.68 33.414 33.109 32.458 32.103 31.704 31.189 30.518 29.726 28.694 22.357 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt deleted file mode 100644 index e5f9fe99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30430 ,TETRA ,17616625,Mon Nov 29 13:08:39 CET,Mon Nov 29 15:02:47 CET,0.0 0.782 1.047 1.27 1.457 1.618 1.773 1.922 2.209 2.347 2.479 2.614 2.824 2.934 3.141 3.33 3.518 3.611 3.787 3.966 4.229 4.385 4.535 4.767 4.987 5.195 5.394 5.586 5.844 6.086 6.331 6.644 6.945 7.227 7.554 7.924 8.282 8.676 9.103 9.572 10.077 10.65 11.315 12.0 12.801 13.697 14.758 15.988 17.444 19.123 21.118 22.803 23.861 24.502 24.875 25.141 25.293 25.355 25.362 25.357 25.336 25.296 25.241 25.19 25.138 25.073 25.001 24.93 24.86 24.769 24.669 24.586 24.497 24.404 24.327 24.254 24.183 24.102 24.016 23.948 23.87 23.75 23.668 23.583 23.537 23.436 23.328 23.221 23.158 23.016 22.937 22.856 22.777 22.58 22.466 22.335 22.193 22.018 21.808 21.519 20.642 -2 ,8545 ,TETRA ,17616626,Mon Nov 29 13:08:39 CET,Mon Nov 29 15:04:01 CET,0.0 0.433 0.663 0.874 1.049 1.212 1.358 1.493 1.76 1.879 1.998 2.135 2.345 2.452 2.66 2.858 3.045 3.132 3.295 3.456 3.699 3.853 4.011 4.248 4.472 4.682 4.884 5.087 5.348 5.599 5.85 6.148 6.428 6.701 7.031 7.41 7.775 8.184 8.631 9.097 9.583 10.146 10.819 11.518 12.344 13.261 14.32 15.536 17.038 18.856 21.025 22.736 23.608 24.109 24.425 24.61 24.716 24.81 24.882 24.907 24.873 24.819 24.765 24.703 24.629 24.551 24.457 24.367 24.277 24.188 24.114 24.043 23.962 23.876 23.797 23.717 23.639 23.54 23.428 23.355 23.276 23.147 23.063 22.971 22.917 22.792 22.658 22.514 22.44 22.294 22.207 22.115 22.021 21.824 21.726 21.627 21.507 21.373 21.185 20.923 20.371 -3 ,31388 ,TETRA ,17616627,Mon Nov 29 13:10:34 CET,Mon Nov 29 15:06:06 CET,0.0 0.773 1.093 1.325 1.513 1.668 1.802 1.941 2.216 2.329 2.437 2.543 2.742 2.844 3.041 3.228 3.418 3.51 3.685 3.855 4.098 4.255 4.406 4.626 4.848 5.06 5.265 5.458 5.704 5.951 6.189 6.488 6.778 7.043 7.361 7.722 8.07 8.481 8.919 9.381 9.878 10.433 11.078 11.754 12.579 13.515 14.626 15.876 17.345 19.089 21.19 22.872 23.826 24.439 24.804 25.018 25.153 25.206 25.2 25.162 25.12 25.075 25.011 24.953 24.889 24.821 24.746 24.671 24.606 24.533 24.451 24.377 24.286 24.178 24.093 24.009 23.926 23.83 23.726 23.654 23.576 23.453 23.356 23.249 23.197 23.098 22.983 22.864 22.801 22.655 22.577 22.495 22.409 22.197 22.08 21.958 21.819 21.676 21.507 21.267 20.667 -4 ,7345 ,TETRA ,17616628,Mon Nov 29 13:15:33 CET,Mon Nov 29 15:08:27 CET,0.0 0.635 0.901 1.085 1.278 1.459 1.627 1.787 2.069 2.2 2.326 2.465 2.684 2.792 2.994 3.18 3.356 3.439 3.604 3.768 4.006 4.168 4.328 4.55 4.761 4.964 5.166 5.373 5.641 5.91 6.172 6.472 6.758 7.027 7.339 7.699 8.05 8.456 8.907 9.372 9.856 10.397 11.05 11.764 12.606 13.55 14.613 15.81 17.235 18.895 21.016 22.802 23.81 24.411 24.752 24.975 25.104 25.153 25.19 25.209 25.177 25.128 25.084 25.027 24.954 24.882 24.808 24.731 24.662 24.575 24.469 24.393 24.305 24.202 24.12 24.028 23.928 23.82 23.715 23.647 23.573 23.457 23.375 23.288 23.245 23.139 23.026 22.905 22.839 22.688 22.585 22.493 22.393 22.162 22.049 21.929 21.777 21.599 21.387 21.115 20.239 -5 ,13 ,TETRA ,17616629,Mon Nov 29 13:16:33 CET,Mon Nov 29 15:12:35 CET,0.0 0.673 0.971 1.202 1.404 1.593 1.763 1.909 2.155 2.287 2.421 2.544 2.749 2.849 3.044 3.244 3.452 3.549 3.724 3.892 4.127 4.279 4.434 4.669 4.901 5.123 5.329 5.526 5.783 6.022 6.259 6.548 6.823 7.097 7.426 7.794 8.139 8.525 8.954 9.423 9.925 10.479 11.142 11.819 12.625 13.542 14.565 15.736 17.204 19.009 21.129 22.794 23.753 24.355 24.722 24.939 25.065 25.139 25.163 25.173 25.161 25.122 25.073 25.014 24.952 24.887 24.811 24.737 24.664 24.592 24.516 24.44 24.361 24.277 24.2 24.115 24.027 23.921 23.81 23.738 23.654 23.503 23.399 23.298 23.244 23.125 22.993 22.856 22.792 22.645 22.57 22.492 22.401 22.206 22.109 21.995 21.874 21.746 21.54 21.282 20.614 -6 ,31274 ,TETRA ,17616630,Mon Nov 29 13:19:31 CET,Mon Nov 29 15:16:07 CET,0.0 0.604 0.85 1.034 1.205 1.379 1.524 1.654 1.917 2.036 2.153 2.28 2.494 2.604 2.797 2.987 3.173 3.257 3.422 3.595 3.837 3.989 4.14 4.365 4.589 4.804 5.003 5.196 5.446 5.692 5.944 6.252 6.553 6.843 7.171 7.534 7.892 8.307 8.752 9.225 9.722 10.3 10.992 11.659 12.433 13.323 14.374 15.577 17.03 18.785 20.9 22.618 23.577 24.129 24.448 24.639 24.739 24.801 24.831 24.842 24.839 24.814 24.778 24.737 24.681 24.614 24.54 24.462 24.386 24.31 24.224 24.141 24.046 23.942 23.864 23.774 23.675 23.594 23.509 23.434 23.36 23.251 23.164 23.058 23.004 22.894 22.764 22.616 22.549 22.41 22.336 22.258 22.172 21.972 21.859 21.743 21.606 21.43 21.232 20.976 20.379 -7 ,22180 ,TETRA ,17616631,Mon Nov 29 13:22:33 CET,Mon Nov 29 15:24:22 CET,0.0 0.683 0.959 1.166 1.333 1.49 1.644 1.799 2.085 2.207 2.318 2.426 2.633 2.736 2.939 3.134 3.329 3.427 3.621 3.812 4.068 4.231 4.386 4.608 4.83 5.045 5.264 5.46 5.703 5.946 6.182 6.463 6.746 7.028 7.343 7.695 8.037 8.43 8.862 9.311 9.794 10.362 11.04 11.726 12.529 13.497 14.647 15.911 17.363 19.037 21.212 22.954 23.901 24.529 24.893 25.088 25.204 25.274 25.312 25.335 25.305 25.255 25.213 25.166 25.103 25.028 24.936 24.847 24.769 24.683 24.593 24.518 24.43 24.327 24.254 24.183 24.096 23.995 23.881 23.808 23.741 23.619 23.523 23.432 23.384 23.266 23.141 23.009 22.939 22.795 22.711 22.617 22.515 22.31 22.211 22.085 21.916 21.747 21.576 21.333 20.693 -8 ,17628 ,TETRA ,17616632,Mon Nov 29 13:23:32 CET,Mon Nov 29 15:25:38 CET,0.0 0.513 0.825 1.073 1.256 1.41 1.565 1.72 1.982 2.099 2.214 2.327 2.535 2.644 2.85 3.041 3.218 3.306 3.479 3.643 3.893 4.058 4.214 4.437 4.654 4.863 5.059 5.252 5.505 5.75 5.994 6.304 6.595 6.873 7.202 7.567 7.918 8.317 8.76 9.229 9.749 10.371 11.082 11.751 12.553 13.479 14.533 15.747 17.193 18.891 21.004 22.739 23.689 24.234 24.564 24.741 24.838 24.908 24.922 24.894 24.867 24.844 24.82 24.787 24.738 24.679 24.616 24.557 24.482 24.396 24.304 24.223 24.136 24.039 23.958 23.875 23.79 23.69 23.591 23.524 23.443 23.31 23.215 23.105 23.046 22.94 22.826 22.687 22.61 22.459 22.365 22.272 22.187 22.015 21.914 21.782 21.639 21.5 21.33 21.072 20.274 -9 ,31762 ,TETRA ,17616633,Mon Nov 29 13:23:32 CET,Mon Nov 29 15:15:49 CET,0.0 0.768 1.014 1.242 1.435 1.607 1.763 1.906 2.173 2.306 2.435 2.563 2.775 2.881 3.08 3.268 3.443 3.531 3.707 3.869 4.1 4.253 4.408 4.641 4.855 5.055 5.251 5.443 5.703 5.964 6.216 6.51 6.786 7.061 7.387 7.746 8.101 8.503 8.93 9.393 9.881 10.421 11.076 11.748 12.529 13.439 14.505 15.702 17.109 18.814 20.864 22.514 23.466 24.037 24.403 24.639 24.787 24.88 24.901 24.893 24.872 24.834 24.782 24.725 24.66 24.597 24.524 24.436 24.354 24.263 24.159 24.082 24.0 23.905 23.832 23.747 23.658 23.568 23.462 23.382 23.299 23.173 23.085 22.994 22.946 22.848 22.746 22.628 22.559 22.41 22.336 22.248 22.172 21.991 21.864 21.731 21.609 21.45 21.229 20.915 19.867 -10 ,7965 ,TETRA ,17616634,Mon Nov 29 13:23:32 CET,Mon Nov 29 15:15:44 CET,0.0 0.75 1.017 1.245 1.441 1.623 1.79 1.941 2.225 2.362 2.48 2.599 2.816 2.925 3.141 3.352 3.552 3.648 3.824 3.988 4.227 4.382 4.538 4.768 4.981 5.183 5.383 5.585 5.864 6.132 6.386 6.692 6.984 7.273 7.611 7.98 8.335 8.743 9.197 9.684 10.205 10.774 11.424 12.099 12.916 13.853 14.922 16.115 17.524 19.193 21.225 22.922 23.928 24.538 24.886 25.093 25.233 25.334 25.388 25.409 25.399 25.358 25.307 25.261 25.195 25.124 25.043 24.958 24.881 24.801 24.72 24.644 24.55 24.45 24.375 24.283 24.189 24.087 23.977 23.91 23.828 23.687 23.603 23.524 23.481 23.383 23.268 23.133 23.061 22.915 22.857 22.774 22.675 22.474 22.378 22.271 22.118 21.942 21.766 21.54 20.918 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 6c3343be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20116 ,TETRA ,17616635,Mon Nov 29 13:23:34 CET,Mon Nov 29 15:16:02 CET,0.0 0.831 1.125 1.369 1.601 1.784 1.93 2.06 2.298 2.421 2.552 2.703 2.927 3.034 3.232 3.434 3.628 3.719 3.902 4.085 4.334 4.491 4.651 4.887 5.103 5.311 5.52 5.725 5.997 6.266 6.532 6.849 7.153 7.457 7.811 8.215 8.611 9.069 9.567 10.077 10.636 11.302 12.071 12.844 13.776 14.845 16.111 17.549 19.288 21.382 23.909 26.09 27.457 28.377 28.99 29.393 29.677 29.893 30.043 30.144 30.205 30.26 30.29 30.29 30.275 30.249 30.218 30.193 30.175 30.141 30.083 30.031 29.981 29.919 29.859 29.803 29.748 29.682 29.604 29.551 29.498 29.404 29.343 29.267 29.219 29.13 29.032 28.929 28.882 28.758 28.699 28.626 28.549 28.38 28.274 28.144 28.022 27.873 27.67 27.407 26.679 -2 ,25568 ,TETRA ,17616636,Mon Nov 29 13:23:32 CET,Mon Nov 29 15:16:23 CET,0.0 0.923 1.306 1.561 1.774 1.952 2.121 2.266 2.535 2.673 2.801 2.925 3.138 3.257 3.479 3.691 3.893 3.99 4.164 4.326 4.58 4.753 4.92 5.156 5.383 5.615 5.849 6.061 6.335 6.628 6.904 7.225 7.535 7.828 8.171 8.58 8.976 9.421 9.91 10.421 10.968 11.609 12.375 13.128 14.015 15.083 16.357 17.771 19.469 21.595 24.278 26.528 27.821 28.701 29.309 29.715 29.999 30.205 30.331 30.414 30.476 30.524 30.546 30.562 30.566 30.545 30.529 30.507 30.468 30.422 30.369 30.32 30.268 30.208 30.15 30.101 30.06 30.011 29.954 29.908 29.857 29.77 29.705 29.636 29.596 29.511 29.414 29.308 29.26 29.14 29.097 29.033 28.954 28.78 28.679 28.551 28.404 28.227 28.028 27.797 27.404 -3 ,16573 ,TETRA ,17616637,Mon Nov 29 13:23:33 CET,Mon Nov 29 15:16:23 CET,0.0 0.686 1.07 1.313 1.507 1.694 1.877 2.031 2.303 2.432 2.557 2.692 2.903 3.014 3.226 3.423 3.626 3.72 3.895 4.07 4.315 4.478 4.636 4.866 5.097 5.32 5.543 5.771 6.06 6.33 6.594 6.914 7.216 7.516 7.867 8.267 8.67 9.104 9.568 10.077 10.614 11.238 12.001 12.783 13.707 14.756 16.021 17.485 19.224 21.365 24.051 26.297 27.652 28.571 29.198 29.621 29.91 30.104 30.229 30.349 30.418 30.433 30.445 30.459 30.467 30.459 30.431 30.401 30.373 30.339 30.291 30.238 30.184 30.123 30.064 30.001 29.937 29.866 29.79 29.731 29.672 29.578 29.511 29.442 29.404 29.317 29.214 29.094 29.03 28.886 28.793 28.715 28.638 28.475 28.38 28.266 28.149 28.027 27.827 27.514 26.897 -4 ,4249 ,TETRA ,17616638,Mon Nov 29 13:24:31 CET,Mon Nov 29 15:17:10 CET,0.0 0.82 1.146 1.365 1.528 1.681 1.815 1.94 2.187 2.305 2.418 2.541 2.761 2.875 3.083 3.278 3.475 3.574 3.748 3.906 4.154 4.317 4.472 4.702 4.921 5.131 5.336 5.536 5.799 6.063 6.322 6.628 6.931 7.237 7.598 8.01 8.392 8.812 9.279 9.775 10.306 10.933 11.703 12.465 13.371 14.451 15.72 17.172 18.901 20.945 23.587 25.895 27.288 28.194 28.799 29.253 29.577 29.83 29.998 30.109 30.188 30.248 30.29 30.3 30.29 30.267 30.243 30.221 30.19 30.156 30.118 30.077 30.029 29.962 29.897 29.832 29.763 29.685 29.613 29.556 29.496 29.412 29.35 29.282 29.24 29.153 29.069 28.983 28.939 28.822 28.771 28.7 28.624 28.475 28.393 28.294 28.171 28.028 27.857 27.611 26.693 -5 ,16283 ,TETRA ,17616639,Mon Nov 29 13:25:33 CET,Mon Nov 29 15:19:37 CET,0.0 1.167 1.579 1.84 2.044 2.237 2.411 2.575 2.873 3.006 3.129 3.27 3.486 3.594 3.808 4.006 4.197 4.284 4.446 4.607 4.849 5.01 5.168 5.393 5.619 5.848 6.07 6.284 6.555 6.821 7.088 7.415 7.734 8.049 8.424 8.847 9.254 9.69 10.165 10.693 11.249 11.876 12.625 13.392 14.307 15.369 16.628 18.053 19.821 22.026 24.736 26.996 28.34 29.177 29.749 30.19 30.498 30.713 30.837 30.916 30.967 30.995 31.002 30.994 30.99 30.979 30.96 30.946 30.926 30.888 30.839 30.807 30.766 30.699 30.642 30.593 30.538 30.47 30.397 30.35 30.286 30.177 30.114 30.041 29.999 29.928 29.846 29.733 29.667 29.534 29.494 29.427 29.349 29.181 29.091 28.978 28.856 28.706 28.524 28.281 27.883 -6 ,16879 ,TETRA ,17616640,Mon Nov 29 13:25:33 CET,Mon Nov 29 15:19:20 CET,0.0 0.59 0.971 1.227 1.436 1.606 1.748 1.879 2.131 2.256 2.375 2.502 2.718 2.826 3.034 3.224 3.416 3.511 3.686 3.857 4.122 4.299 4.463 4.694 4.911 5.123 5.343 5.559 5.829 6.094 6.358 6.678 6.984 7.286 7.643 8.06 8.459 8.9 9.383 9.893 10.458 11.113 11.877 12.66 13.577 14.622 15.893 17.376 19.172 21.306 23.946 26.229 27.584 28.461 29.042 29.459 29.755 29.982 30.15 30.271 30.334 30.373 30.39 30.401 30.408 30.398 30.379 30.337 30.287 30.231 30.17 30.125 30.077 30.02 29.975 29.92 29.851 29.781 29.71 29.663 29.608 29.525 29.467 29.389 29.351 29.262 29.158 29.054 29.003 28.879 28.833 28.763 28.684 28.521 28.43 28.329 28.217 28.064 27.889 27.658 27.045 -7 ,22915 ,TETRA ,17616641,Mon Nov 29 13:25:35 CET,Mon Nov 29 15:21:47 CET,0.0 0.381 0.625 0.845 1.033 1.165 1.306 1.462 1.738 1.863 1.988 2.122 2.329 2.437 2.646 2.843 3.03 3.116 3.287 3.461 3.711 3.865 4.01 4.24 4.467 4.68 4.884 5.09 5.369 5.636 5.897 6.226 6.537 6.833 7.199 7.614 8.004 8.44 8.93 9.448 9.996 10.635 11.411 12.217 13.168 14.233 15.484 16.924 18.673 20.746 23.257 25.486 26.862 27.752 28.354 28.785 29.075 29.277 29.414 29.532 29.606 29.651 29.671 29.672 29.664 29.649 29.625 29.587 29.547 29.497 29.439 29.393 29.346 29.302 29.257 29.19 29.127 29.059 28.978 28.925 28.87 28.778 28.699 28.617 28.579 28.489 28.4 28.295 28.237 28.111 28.052 27.98 27.907 27.733 27.633 27.535 27.435 27.312 27.15 26.911 26.357 -8 ,32726 ,TETRA ,17616642,Mon Nov 29 13:26:32 CET,Mon Nov 29 15:22:09 CET,0.0 0.823 1.137 1.375 1.561 1.739 1.907 2.062 2.365 2.5 2.622 2.736 2.935 3.031 3.233 3.428 3.61 3.706 3.892 4.065 4.32 4.486 4.646 4.873 5.092 5.308 5.525 5.73 5.993 6.257 6.524 6.855 7.175 7.491 7.853 8.258 8.654 9.078 9.561 10.091 10.634 11.267 12.022 12.767 13.674 14.746 16.011 17.464 19.218 21.334 23.891 26.029 27.355 28.245 28.849 29.287 29.58 29.769 29.886 29.993 30.077 30.12 30.143 30.15 30.123 30.1 30.083 30.053 30.023 29.977 29.916 29.868 29.822 29.776 29.739 29.693 29.632 29.557 29.472 29.419 29.363 29.271 29.207 29.134 29.097 29.017 28.919 28.821 28.764 28.632 28.601 28.547 28.477 28.293 28.198 28.098 27.981 27.825 27.664 27.445 26.867 -9 ,2047 ,TETRA ,17616643,Mon Nov 29 13:28:31 CET,Mon Nov 29 15:23:28 CET,0.0 0.704 1.022 1.304 1.545 1.725 1.884 2.027 2.303 2.423 2.548 2.693 2.914 3.03 3.234 3.434 3.629 3.72 3.895 4.072 4.327 4.481 4.635 4.874 5.107 5.331 5.548 5.758 6.019 6.268 6.525 6.844 7.148 7.454 7.82 8.232 8.632 9.082 9.573 10.101 10.676 11.323 12.081 12.857 13.8 14.886 16.157 17.598 19.284 21.393 24.087 26.366 27.715 28.589 29.17 29.558 29.845 30.052 30.196 30.311 30.389 30.442 30.47 30.48 30.487 30.482 30.453 30.424 30.406 30.372 30.317 30.276 30.236 30.189 30.145 30.088 30.027 29.963 29.895 29.846 29.793 29.707 29.629 29.543 29.504 29.416 29.32 29.213 29.15 29.021 28.973 28.902 28.821 28.613 28.5 28.386 28.262 28.131 27.94 27.699 27.017 -10 ,1565 ,TETRA ,17616644,Mon Nov 29 13:28:33 CET,Mon Nov 29 15:26:47 CET,0.0 0.907 1.254 1.497 1.68 1.826 1.967 2.119 2.408 2.533 2.651 2.766 2.977 3.087 3.294 3.479 3.662 3.757 3.938 4.114 4.374 4.541 4.709 4.949 5.174 5.405 5.63 5.845 6.127 6.386 6.632 6.943 7.252 7.563 7.921 8.328 8.736 9.182 9.654 10.164 10.723 11.355 12.109 12.895 13.815 14.873 16.096 17.467 19.156 21.26 23.917 26.203 27.58 28.478 29.108 29.577 29.89 30.094 30.225 30.32 30.389 30.413 30.414 30.418 30.412 30.401 30.386 30.37 30.345 30.295 30.233 30.177 30.127 30.084 30.047 29.999 29.936 29.876 29.817 29.767 29.716 29.638 29.571 29.487 29.441 29.351 29.258 29.164 29.114 28.983 28.899 28.822 28.748 28.585 28.505 28.422 28.327 28.196 28.035 27.83 27.275 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt deleted file mode 100644 index 795a4b42..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23912 ,TETRA ,17616645,Mon Nov 29 13:28:33 CET,Mon Nov 29 15:21:57 CET,0.0 0.542 0.801 1.005 1.168 1.305 1.424 1.529 1.722 1.806 1.875 1.921 2.069 2.127 2.238 2.335 2.442 2.504 2.628 2.733 2.869 2.953 3.023 3.109 3.2 3.287 3.357 3.431 3.531 3.619 3.692 3.764 3.863 4.002 4.158 4.262 4.332 4.432 4.519 4.57 4.625 4.67 4.675 4.655 4.655 4.568 4.349 4.044 3.522 2.648 1.161 -0.679 -2.236 -3.547 -4.637 -5.566 -6.4 -7.147 -7.762 -8.377 -8.897 -9.349 -9.765 -10.167 -10.55 -10.89 -11.25 -11.559 -11.821 -12.122 -12.448 -12.716 -12.984 -13.262 -13.474 -13.692 -13.92 -14.141 -14.366 -14.522 -14.673 -14.916 -15.094 -15.268 -15.356 -15.539 -15.718 -15.899 -16.006 -16.239 -16.399 -16.529 -16.666 -16.989 -17.167 -17.348 -17.536 -17.751 -18.015 -18.376 -19.222 -2 ,26180 ,TETRA ,17616646,Mon Nov 29 13:28:33 CET,Mon Nov 29 15:21:38 CET,0.0 0.733 0.972 1.146 1.314 1.447 1.567 1.68 1.887 1.981 2.064 2.135 2.299 2.368 2.5 2.633 2.753 2.805 2.894 2.972 3.081 3.144 3.205 3.303 3.408 3.515 3.611 3.704 3.824 3.918 3.994 4.087 4.201 4.306 4.392 4.473 4.536 4.605 4.712 4.823 4.886 4.919 4.942 4.948 4.896 4.768 4.57 4.276 3.761 2.917 1.466 -0.315 -1.832 -3.175 -4.33 -5.291 -6.1 -6.864 -7.542 -8.207 -8.74 -9.205 -9.637 -10.034 -10.41 -10.768 -11.116 -11.402 -11.658 -11.934 -12.215 -12.438 -12.673 -12.918 -13.109 -13.307 -13.503 -13.7 -13.916 -14.075 -14.232 -14.471 -14.65 -14.852 -14.952 -15.147 -15.358 -15.58 -15.682 -15.887 -16.002 -16.13 -16.27 -16.529 -16.658 -16.803 -16.978 -17.165 -17.361 -17.65 -18.584 -3 ,15971 ,TETRA ,17616647,Mon Nov 29 13:29:31 CET,Mon Nov 29 15:22:23 CET,0.0 0.531 0.757 0.912 1.042 1.162 1.287 1.392 1.584 1.68 1.776 1.856 2.007 2.074 2.196 2.297 2.396 2.452 2.562 2.65 2.754 2.83 2.915 3.034 3.15 3.254 3.352 3.456 3.577 3.676 3.755 3.834 3.897 3.953 4.028 4.143 4.267 4.405 4.533 4.635 4.711 4.757 4.785 4.792 4.785 4.731 4.588 4.353 3.894 3.037 1.5 -0.335 -1.837 -3.094 -4.168 -5.123 -5.946 -6.661 -7.267 -7.876 -8.396 -8.854 -9.281 -9.672 -10.029 -10.359 -10.702 -11.014 -11.293 -11.567 -11.84 -12.071 -12.309 -12.555 -12.747 -12.947 -13.158 -13.373 -13.577 -13.715 -13.863 -14.088 -14.239 -14.403 -14.49 -14.684 -14.89 -15.091 -15.194 -15.403 -15.522 -15.652 -15.797 -16.076 -16.207 -16.342 -16.5 -16.691 -16.909 -17.213 -17.844 -4 ,32446 ,TETRA ,17616648,Mon Nov 29 13:29:32 CET,Mon Nov 29 15:23:24 CET,0.0 0.46 0.665 0.852 0.999 1.124 1.24 1.353 1.565 1.656 1.738 1.791 1.943 2.011 2.13 2.235 2.333 2.38 2.471 2.559 2.69 2.785 2.866 2.956 3.044 3.134 3.223 3.295 3.392 3.513 3.612 3.701 3.777 3.834 3.903 3.98 4.053 4.129 4.2 4.261 4.33 4.413 4.467 4.466 4.394 4.286 4.146 3.894 3.445 2.694 1.285 -0.434 -1.887 -3.121 -4.165 -5.114 -5.949 -6.689 -7.321 -7.953 -8.485 -8.94 -9.369 -9.771 -10.144 -10.477 -10.832 -11.152 -11.417 -11.677 -11.942 -12.167 -12.394 -12.63 -12.815 -13.012 -13.207 -13.406 -13.625 -13.768 -13.914 -14.151 -14.314 -14.486 -14.582 -14.781 -14.977 -15.175 -15.281 -15.497 -15.612 -15.725 -15.854 -16.134 -16.288 -16.472 -16.659 -16.84 -17.088 -17.474 -18.562 -5 ,27507 ,TETRA ,17616649,Mon Nov 29 13:29:32 CET,Mon Nov 29 15:22:52 CET,0.0 0.799 1.12 1.344 1.515 1.669 1.799 1.909 2.11 2.191 2.272 2.347 2.491 2.543 2.655 2.77 2.885 2.95 3.086 3.206 3.357 3.452 3.547 3.681 3.811 3.945 4.049 4.127 4.234 4.324 4.409 4.523 4.643 4.772 4.896 4.994 5.066 5.128 5.196 5.251 5.293 5.329 5.356 5.368 5.321 5.21 5.031 4.72 4.207 3.412 1.886 -0.048 -1.6 -2.913 -4.01 -4.976 -5.83 -6.619 -7.321 -8.024 -8.61 -9.082 -9.49 -9.875 -10.247 -10.579 -10.913 -11.215 -11.482 -11.755 -12.031 -12.256 -12.482 -12.709 -12.89 -13.082 -13.288 -13.504 -13.731 -13.901 -14.07 -14.312 -14.471 -14.627 -14.706 -14.873 -15.057 -15.259 -15.358 -15.565 -15.709 -15.84 -15.975 -16.3 -16.477 -16.663 -16.857 -17.087 -17.363 -17.659 -18.211 -6 ,27262 ,TETRA ,17616650,Mon Nov 29 13:29:34 CET,Mon Nov 29 15:22:30 CET,0.0 0.744 1.01 1.22 1.361 1.473 1.586 1.689 1.898 2.019 2.126 2.21 2.364 2.433 2.564 2.682 2.796 2.855 2.963 3.059 3.194 3.282 3.359 3.453 3.54 3.615 3.681 3.743 3.823 3.904 3.983 4.077 4.168 4.249 4.34 4.426 4.504 4.59 4.67 4.737 4.786 4.814 4.832 4.839 4.817 4.753 4.58 4.29 3.836 3.08 1.676 -0.135 -1.63 -2.94 -4.048 -4.991 -5.81 -6.536 -7.153 -7.758 -8.264 -8.727 -9.161 -9.536 -9.898 -10.25 -10.625 -10.951 -11.228 -11.502 -11.792 -12.039 -12.299 -12.578 -12.783 -12.994 -13.213 -13.429 -13.641 -13.784 -13.937 -14.173 -14.336 -14.506 -14.597 -14.79 -14.976 -15.18 -15.281 -15.482 -15.611 -15.733 -15.861 -16.121 -16.257 -16.389 -16.539 -16.728 -16.984 -17.299 -18.033 -7 ,9930 ,TETRA ,17616651,Mon Nov 29 13:30:32 CET,Mon Nov 29 15:23:10 CET,0.0 0.351 0.576 0.761 0.927 1.075 1.196 1.296 1.468 1.568 1.665 1.718 1.859 1.912 2.022 2.144 2.243 2.284 2.377 2.469 2.59 2.669 2.75 2.86 2.958 3.059 3.16 3.254 3.355 3.432 3.511 3.609 3.691 3.76 3.84 3.954 4.076 4.163 4.218 4.276 4.339 4.408 4.459 4.439 4.386 4.293 4.081 3.783 3.356 2.577 1.115 -0.771 -2.357 -3.657 -4.72 -5.645 -6.458 -7.198 -7.821 -8.426 -8.927 -9.359 -9.778 -10.17 -10.531 -10.861 -11.219 -11.553 -11.84 -12.141 -12.436 -12.686 -12.96 -13.226 -13.419 -13.607 -13.792 -13.984 -14.191 -14.337 -14.49 -14.735 -14.909 -15.089 -15.179 -15.357 -15.553 -15.761 -15.857 -16.052 -16.159 -16.274 -16.398 -16.708 -16.881 -17.032 -17.183 -17.373 -17.63 -17.978 -18.677 -8 ,20400 ,TETRA ,17616652,Mon Nov 29 13:31:32 CET,Mon Nov 29 15:24:53 CET,0.0 0.55 0.819 0.977 1.117 1.242 1.354 1.451 1.628 1.7 1.765 1.822 1.969 2.022 2.122 2.238 2.359 2.416 2.53 2.643 2.814 2.92 3.012 3.135 3.259 3.375 3.469 3.543 3.628 3.706 3.787 3.899 4.017 4.137 4.278 4.42 4.531 4.639 4.722 4.78 4.826 4.87 4.901 4.885 4.826 4.721 4.526 4.2 3.726 2.924 1.428 -0.438 -1.966 -3.265 -4.391 -5.336 -6.126 -6.845 -7.478 -8.104 -8.623 -9.086 -9.513 -9.903 -10.258 -10.587 -10.941 -11.245 -11.491 -11.75 -12.025 -12.253 -12.504 -12.761 -12.958 -13.168 -13.369 -13.569 -13.781 -13.93 -14.086 -14.331 -14.493 -14.659 -14.743 -14.92 -15.106 -15.299 -15.4 -15.607 -15.718 -15.833 -15.954 -16.215 -16.366 -16.527 -16.695 -16.899 -17.129 -17.441 -18.052 -9 ,13498 ,TETRA ,17616653,Mon Nov 29 13:31:34 CET,Mon Nov 29 15:25:02 CET,0.0 0.413 0.624 0.8 0.924 1.04 1.155 1.261 1.467 1.562 1.657 1.751 1.922 2.0 2.15 2.284 2.396 2.449 2.544 2.634 2.761 2.82 2.887 3.004 3.115 3.219 3.312 3.406 3.519 3.617 3.718 3.823 3.913 3.999 4.088 4.174 4.24 4.303 4.368 4.428 4.474 4.512 4.532 4.538 4.524 4.47 4.333 4.064 3.66 2.942 1.465 -0.383 -1.917 -3.182 -4.268 -5.245 -6.069 -6.794 -7.394 -7.984 -8.484 -8.921 -9.333 -9.724 -10.098 -10.435 -10.774 -11.066 -11.313 -11.583 -11.881 -12.133 -12.405 -12.693 -12.918 -13.129 -13.325 -13.537 -13.764 -13.91 -14.053 -14.283 -14.457 -14.636 -14.723 -14.901 -15.091 -15.291 -15.388 -15.586 -15.696 -15.816 -15.941 -16.223 -16.379 -16.533 -16.691 -16.884 -17.108 -17.404 -18.13 -10 ,21546 ,TETRA ,17616654,Mon Nov 29 13:31:36 CET,Mon Nov 29 15:24:22 CET,0.0 0.712 1.031 1.242 1.405 1.545 1.66 1.763 1.965 2.059 2.148 2.218 2.369 2.432 2.539 2.649 2.752 2.794 2.878 2.959 3.063 3.128 3.195 3.3 3.394 3.465 3.533 3.611 3.718 3.823 3.928 4.048 4.156 4.261 4.384 4.5 4.597 4.675 4.74 4.796 4.825 4.846 4.861 4.858 4.845 4.835 4.736 4.452 3.936 3.067 1.572 -0.199 -1.729 -3.037 -4.106 -5.063 -5.897 -6.624 -7.234 -7.842 -8.371 -8.82 -9.233 -9.621 -9.982 -10.308 -10.644 -10.952 -11.227 -11.509 -11.794 -12.023 -12.252 -12.496 -12.687 -12.87 -13.06 -13.261 -13.472 -13.618 -13.785 -14.067 -14.257 -14.438 -14.528 -14.711 -14.893 -15.069 -15.159 -15.366 -15.509 -15.639 -15.769 -16.054 -16.215 -16.39 -16.589 -16.819 -17.078 -17.455 -18.535 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 1506b2b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32048 ,TETRA ,17616655,Mon Nov 29 13:31:32 CET,Mon Nov 29 15:24:12 CET,0.0 0.511 0.801 1.015 1.186 1.337 1.46 1.566 1.801 1.928 2.048 2.162 2.331 2.417 2.575 2.723 2.864 2.936 3.083 3.229 3.437 3.56 3.671 3.84 4.013 4.187 4.35 4.495 4.687 4.879 5.064 5.293 5.521 5.734 5.974 6.259 6.543 6.832 7.132 7.468 7.827 8.226 8.71 9.211 9.776 10.398 11.1 11.827 12.64 13.573 14.669 15.44 15.698 15.732 15.668 15.56 15.382 15.16 14.965 14.75 14.518 14.297 14.113 13.953 13.805 13.673 13.527 13.396 13.275 13.132 12.982 12.848 12.699 12.548 12.426 12.304 12.177 12.042 11.896 11.788 11.681 11.517 11.401 11.276 11.215 11.102 10.973 10.831 10.755 10.603 10.486 10.371 10.247 10.019 9.896 9.751 9.578 9.412 9.232 8.933 8.24 -2 ,13955 ,TETRA ,17616656,Mon Nov 29 13:31:32 CET,Mon Nov 29 15:24:36 CET,0.0 0.436 0.675 0.894 1.085 1.236 1.358 1.481 1.687 1.784 1.889 1.998 2.165 2.251 2.426 2.575 2.72 2.794 2.935 3.076 3.278 3.403 3.528 3.706 3.87 4.025 4.178 4.332 4.549 4.773 4.991 5.245 5.495 5.737 6.006 6.302 6.577 6.869 7.189 7.546 7.923 8.331 8.792 9.253 9.769 10.345 11.073 11.928 12.846 13.837 14.887 15.529 15.801 15.857 15.813 15.659 15.448 15.238 15.017 14.773 14.542 14.348 14.161 13.962 13.778 13.614 13.447 13.295 13.163 13.029 12.893 12.787 12.667 12.532 12.416 12.289 12.156 12.019 11.879 11.789 11.698 11.539 11.426 11.311 11.245 11.098 10.959 10.823 10.745 10.588 10.485 10.394 10.298 10.081 9.959 9.831 9.668 9.49 9.3 9.068 8.557 -3 ,18647 ,TETRA ,17616657,Mon Nov 29 13:31:34 CET,Mon Nov 29 15:24:12 CET,0.0 0.448 0.741 0.955 1.123 1.306 1.464 1.594 1.84 1.943 2.047 2.186 2.368 2.46 2.636 2.79 2.938 3.012 3.153 3.283 3.459 3.575 3.69 3.853 4.017 4.182 4.341 4.502 4.715 4.918 5.109 5.334 5.562 5.791 6.046 6.344 6.619 6.908 7.236 7.572 7.916 8.305 8.765 9.229 9.77 10.385 11.082 11.829 12.702 13.647 14.61 15.305 15.56 15.583 15.511 15.365 15.19 15.023 14.863 14.677 14.497 14.317 14.154 14.004 13.836 13.67 13.493 13.338 13.201 13.05 12.887 12.754 12.618 12.479 12.378 12.267 12.16 12.053 11.917 11.819 11.721 11.566 11.458 11.351 11.294 11.178 11.053 10.909 10.833 10.683 10.582 10.487 10.387 10.169 10.037 9.874 9.694 9.51 9.287 8.926 7.937 -4 ,14977 ,TETRA ,17616658,Mon Nov 29 13:31:32 CET,Mon Nov 29 15:25:07 CET,0.0 0.651 0.915 1.141 1.349 1.528 1.672 1.796 1.995 2.093 2.193 2.292 2.462 2.551 2.711 2.859 3.016 3.091 3.229 3.363 3.552 3.683 3.813 3.997 4.181 4.362 4.533 4.695 4.909 5.126 5.331 5.575 5.817 6.04 6.304 6.619 6.912 7.224 7.546 7.878 8.235 8.642 9.129 9.591 10.135 10.762 11.463 12.251 13.16 14.143 15.159 15.833 16.03 16.048 16.03 15.936 15.753 15.525 15.322 15.119 14.936 14.787 14.645 14.488 14.32 14.148 13.959 13.788 13.644 13.504 13.37 13.262 13.145 13.019 12.923 12.815 12.697 12.578 12.446 12.353 12.257 12.1 11.99 11.885 11.833 11.717 11.591 11.463 11.393 11.25 11.176 11.093 11.004 10.82 10.708 10.556 10.387 10.203 10.006 9.771 8.931 -5 ,5518 ,TETRA ,17616659,Mon Nov 29 13:31:34 CET,Mon Nov 29 15:25:21 CET,0.0 0.649 0.896 1.104 1.261 1.408 1.539 1.657 1.875 1.984 2.098 2.211 2.378 2.462 2.622 2.787 2.952 3.029 3.182 3.324 3.538 3.673 3.793 3.985 4.17 4.347 4.52 4.68 4.887 5.088 5.28 5.508 5.728 5.946 6.197 6.474 6.742 7.05 7.396 7.744 8.101 8.502 8.969 9.448 10.024 10.674 11.395 12.154 13.02 13.976 14.968 15.585 15.81 15.919 15.928 15.821 15.664 15.508 15.338 15.142 14.98 14.844 14.694 14.54 14.388 14.247 14.089 13.929 13.798 13.672 13.547 13.433 13.299 13.16 13.059 12.958 12.841 12.706 12.579 12.497 12.405 12.246 12.13 12.005 11.939 11.799 11.647 11.494 11.414 11.256 11.138 11.036 10.929 10.691 10.562 10.416 10.252 10.05 9.833 9.573 8.447 -6 ,1456 ,TETRA ,17616660,Mon Nov 29 13:31:36 CET,Mon Nov 29 15:24:46 CET,0.0 0.812 1.004 1.186 1.38 1.537 1.674 1.814 2.036 2.137 2.241 2.344 2.513 2.601 2.778 2.938 3.093 3.168 3.307 3.438 3.632 3.763 3.898 4.087 4.252 4.418 4.585 4.744 4.942 5.139 5.332 5.569 5.795 6.007 6.26 6.533 6.789 7.079 7.407 7.75 8.098 8.491 8.954 9.432 9.964 10.575 11.293 12.064 12.983 14.038 15.126 15.783 16.036 16.1 16.028 15.888 15.731 15.564 15.406 15.239 15.072 14.899 14.738 14.598 14.457 14.309 14.159 14.009 13.87 13.726 13.56 13.431 13.313 13.187 13.082 12.974 12.861 12.744 12.625 12.538 12.447 12.302 12.195 12.083 12.025 11.897 11.756 11.602 11.516 11.359 11.255 11.148 11.037 10.823 10.712 10.58 10.429 10.275 10.108 9.852 8.724 -7 ,25522 ,TETRA ,17616661,Mon Nov 29 13:31:32 CET,Mon Nov 29 15:25:42 CET,0.0 0.516 0.817 1.046 1.187 1.321 1.45 1.564 1.775 1.877 1.981 2.085 2.255 2.338 2.491 2.643 2.8 2.878 3.03 3.174 3.377 3.51 3.642 3.825 4.004 4.18 4.353 4.525 4.745 4.946 5.138 5.383 5.614 5.82 6.058 6.345 6.617 6.915 7.249 7.59 7.948 8.347 8.801 9.272 9.809 10.406 11.13 11.934 12.858 13.836 14.721 15.319 15.596 15.633 15.585 15.508 15.37 15.203 15.044 14.877 14.709 14.543 14.393 14.259 14.126 13.992 13.84 13.694 13.567 13.429 13.279 13.159 13.03 12.891 12.783 12.676 12.578 12.464 12.332 12.245 12.15 11.994 11.894 11.792 11.735 11.609 11.48 11.356 11.291 11.14 11.026 10.936 10.838 10.59 10.439 10.278 10.132 9.968 9.787 9.568 9.239 -8 ,2756 ,TETRA ,17616662,Mon Nov 29 13:31:34 CET,Mon Nov 29 15:24:25 CET,0.0 0.457 0.672 0.841 1.009 1.175 1.32 1.434 1.635 1.735 1.831 1.913 2.069 2.146 2.32 2.479 2.616 2.683 2.81 2.93 3.103 3.222 3.341 3.515 3.693 3.86 4.016 4.169 4.371 4.566 4.762 4.998 5.21 5.415 5.661 5.95 6.211 6.497 6.841 7.199 7.552 7.962 8.463 8.941 9.478 10.095 10.803 11.58 12.495 13.49 14.468 15.116 15.319 15.272 15.14 15.013 14.891 14.744 14.576 14.368 14.17 14.001 13.861 13.713 13.556 13.406 13.249 13.118 12.994 12.839 12.665 12.519 12.375 12.23 12.118 12.001 11.876 11.754 11.619 11.526 11.434 11.289 11.171 11.044 10.983 10.849 10.712 10.573 10.501 10.351 10.259 10.166 10.057 9.831 9.7 9.529 9.366 9.213 8.997 8.672 7.94 -9 ,17727 ,TETRA ,17616663,Mon Nov 29 13:31:35 CET,Mon Nov 29 15:24:09 CET,0.0 0.635 0.926 1.171 1.366 1.519 1.653 1.776 2.014 2.127 2.232 2.361 2.541 2.629 2.778 2.915 3.049 3.116 3.245 3.372 3.559 3.68 3.798 3.978 4.152 4.316 4.475 4.619 4.805 4.998 5.183 5.407 5.63 5.829 6.06 6.327 6.582 6.876 7.203 7.558 7.926 8.342 8.827 9.306 9.846 10.438 11.16 11.949 12.83 13.848 14.814 15.37 15.602 15.612 15.514 15.401 15.27 15.098 14.925 14.767 14.622 14.459 14.303 14.167 14.021 13.868 13.697 13.543 13.421 13.293 13.164 13.056 12.928 12.792 12.685 12.565 12.436 12.298 12.147 12.043 11.941 11.795 11.68 11.565 11.507 11.379 11.249 11.103 11.018 10.869 10.784 10.696 10.603 10.402 10.293 10.164 10.024 9.843 9.588 9.24 8.138 -10 ,11939 ,TETRA ,17616664,Mon Nov 29 13:31:34 CET,Mon Nov 29 15:24:42 CET,0.0 0.35 0.592 0.781 0.925 1.042 1.172 1.299 1.516 1.618 1.711 1.789 1.948 2.035 2.203 2.344 2.48 2.548 2.685 2.825 3.024 3.154 3.276 3.453 3.629 3.791 3.951 4.109 4.312 4.517 4.71 4.931 5.146 5.356 5.596 5.869 6.132 6.41 6.718 7.055 7.421 7.822 8.299 8.792 9.334 9.925 10.623 11.405 12.267 13.251 14.304 15.011 15.211 15.166 15.085 14.977 14.841 14.695 14.544 14.374 14.204 14.009 13.813 13.632 13.448 13.278 13.115 12.967 12.833 12.692 12.553 12.44 12.312 12.176 12.074 11.964 11.836 11.706 11.578 11.483 11.387 11.23 11.126 11.023 10.962 10.839 10.711 10.566 10.493 10.349 10.236 10.132 10.032 9.818 9.7 9.583 9.467 9.31 9.085 8.779 7.866 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 07f4e7d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21229 ,KEBNE ,17027865,Wed Dec 22 18:38:11 CET,Wed Dec 22 20:15:21 CET,0.0 0.731 1.007 1.238 1.459 1.676 1.876 2.043 2.372 2.53 2.67 2.813 3.109 3.254 3.556 3.856 4.14 4.281 4.549 4.806 5.202 5.454 5.699 6.062 6.41 6.743 7.07 7.389 7.809 8.219 8.625 9.142 9.656 10.156 10.732 11.394 12.047 12.778 13.599 14.503 15.475 16.584 17.913 19.288 20.926 22.841 25.143 27.855 31.29 35.526 40.929 45.729 48.749 50.855 52.349 53.456 54.286 54.946 55.463 55.924 56.242 56.474 56.698 56.894 57.028 57.117 57.184 57.21 57.217 57.218 57.211 57.182 57.137 57.079 57.007 56.934 56.858 56.782 56.692 56.627 56.556 56.423 56.307 56.157 56.086 55.934 55.756 55.559 55.446 55.256 55.1 54.954 54.781 54.36 54.112 53.849 53.553 53.142 52.618 51.872 47.464 -2 ,26358 ,KEBNE ,17027866,Wed Dec 22 18:38:09 CET,Wed Dec 22 20:15:20 CET,0.0 0.687 1.011 1.266 1.489 1.69 1.876 2.073 2.426 2.589 2.744 2.889 3.203 3.363 3.657 3.926 4.193 4.325 4.587 4.847 5.216 5.452 5.682 6.017 6.35 6.678 7.002 7.313 7.715 8.12 8.524 9.028 9.523 10.018 10.61 11.277 11.918 12.638 13.435 14.312 15.287 16.417 17.78 19.211 20.902 22.823 25.182 27.89 31.133 35.315 40.881 45.811 48.813 50.859 52.351 53.488 54.329 54.973 55.467 55.902 56.208 56.433 56.611 56.741 56.827 56.884 56.936 56.971 56.976 56.965 56.951 56.912 56.855 56.804 56.751 56.686 56.626 56.557 56.469 56.405 56.342 56.211 56.102 55.981 55.91 55.771 55.605 55.398 55.29 55.087 54.917 54.774 54.612 54.21 53.968 53.698 53.365 53.015 52.58 51.842 47.192 -3 ,5886 ,KEBNE ,17027867,Wed Dec 22 18:38:11 CET,Wed Dec 22 20:15:09 CET,0.0 1.063 1.371 1.577 1.779 1.983 2.174 2.385 2.81 2.996 3.157 3.314 3.601 3.735 4.013 4.283 4.54 4.66 4.897 5.137 5.502 5.747 5.986 6.356 6.706 7.024 7.347 7.674 8.104 8.522 8.944 9.468 9.977 10.49 11.103 11.788 12.452 13.19 13.992 14.856 15.812 16.945 18.262 19.624 21.301 23.216 25.476 28.215 31.652 35.913 41.325 46.114 49.243 51.446 52.978 54.118 54.975 55.631 56.069 56.438 56.751 57.002 57.228 57.418 57.556 57.638 57.709 57.756 57.765 57.77 57.765 57.743 57.727 57.697 57.654 57.607 57.532 57.437 57.348 57.292 57.236 57.133 57.021 56.858 56.783 56.642 56.508 56.345 56.238 56.054 55.909 55.745 55.552 55.173 54.945 54.686 54.386 54.047 53.565 52.858 48.15 -4 ,20050 ,KEBNE ,17027868,Wed Dec 22 18:38:09 CET,Wed Dec 22 20:15:09 CET,0.0 1.076 1.491 1.755 1.983 2.194 2.385 2.556 2.892 3.056 3.216 3.368 3.664 3.804 4.077 4.345 4.606 4.738 5.003 5.248 5.594 5.83 6.068 6.414 6.753 7.081 7.393 7.709 8.137 8.553 8.958 9.463 9.966 10.46 11.042 11.709 12.378 13.122 13.93 14.806 15.75 16.856 18.202 19.635 21.366 23.352 25.656 28.325 31.663 35.835 41.303 46.203 49.232 51.322 52.82 53.899 54.692 55.296 55.77 56.202 56.516 56.777 56.979 57.116 57.213 57.285 57.351 57.381 57.387 57.402 57.4 57.372 57.338 57.286 57.234 57.166 57.088 57.002 56.898 56.817 56.726 56.606 56.53 56.429 56.373 56.24 56.076 55.897 55.799 55.602 55.432 55.291 55.149 54.83 54.616 54.371 54.083 53.729 53.225 52.425 46.631 -5 ,21411 ,KEBNE ,17027869,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:15:33 CET,0.0 0.952 1.238 1.466 1.676 1.868 2.047 2.219 2.539 2.69 2.847 3.012 3.312 3.458 3.742 4.043 4.347 4.49 4.756 5.01 5.378 5.607 5.828 6.172 6.513 6.836 7.17 7.499 7.912 8.336 8.76 9.271 9.772 10.271 10.866 11.542 12.211 12.979 13.825 14.735 15.708 16.825 18.167 19.534 21.172 23.086 25.371 28.099 31.481 35.666 41.132 46.046 49.158 51.243 52.69 53.782 54.602 55.235 55.713 56.108 56.362 56.544 56.697 56.84 56.942 57.007 57.033 57.037 57.061 57.083 57.074 57.038 56.983 56.914 56.874 56.822 56.737 56.629 56.528 56.472 56.4 56.283 56.199 56.08 56.01 55.889 55.772 55.623 55.537 55.348 55.18 55.056 54.929 54.571 54.336 54.092 53.802 53.427 52.951 52.259 46.553 -6 ,19104 ,KEBNE ,17027870,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:15:09 CET,0.0 0.713 1.002 1.226 1.426 1.608 1.789 1.973 2.333 2.5 2.656 2.772 3.046 3.166 3.417 3.658 3.896 4.021 4.262 4.493 4.838 5.067 5.289 5.624 5.956 6.272 6.58 6.882 7.292 7.71 8.118 8.614 9.108 9.596 10.171 10.841 11.501 12.242 13.046 13.905 14.832 15.927 17.267 18.64 20.295 22.192 24.418 27.082 30.448 34.586 39.874 44.713 47.816 49.953 51.471 52.588 53.433 54.095 54.569 54.972 55.263 55.495 55.663 55.794 55.919 55.998 56.066 56.123 56.144 56.143 56.129 56.112 56.082 56.025 55.974 55.913 55.847 55.776 55.7 55.647 55.592 55.472 55.371 55.251 55.185 55.055 54.917 54.757 54.665 54.483 54.356 54.25 54.109 53.733 53.523 53.306 53.015 52.633 52.153 51.486 47.496 -7 ,5091 ,KEBNE ,17027871,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:15:17 CET,0.0 0.657 0.933 1.167 1.392 1.596 1.788 1.978 2.336 2.508 2.679 2.846 3.148 3.281 3.55 3.843 4.123 4.254 4.506 4.766 5.139 5.367 5.601 5.962 6.316 6.671 7.015 7.346 7.775 8.201 8.62 9.108 9.58 10.061 10.644 11.306 11.951 12.704 13.568 14.486 15.462 16.581 17.902 19.267 20.914 22.85 25.202 27.922 31.212 35.339 40.752 45.631 48.653 50.73 52.223 53.341 54.188 54.807 55.269 55.673 55.982 56.232 56.425 56.593 56.722 56.815 56.887 56.919 56.952 56.977 56.98 56.961 56.923 56.878 56.834 56.78 56.714 56.644 56.575 56.519 56.447 56.323 56.233 56.13 56.08 55.968 55.814 55.652 55.577 55.398 55.249 55.113 54.959 54.624 54.442 54.233 53.98 53.632 53.12 52.415 49.116 -8 ,30993 ,KEBNE ,17027872,Wed Dec 22 18:38:11 CET,Wed Dec 22 20:15:24 CET,0.0 1.101 1.408 1.663 1.87 2.058 2.247 2.417 2.735 2.888 3.043 3.197 3.499 3.66 3.934 4.18 4.429 4.558 4.804 5.051 5.411 5.635 5.865 6.21 6.548 6.89 7.216 7.527 7.934 8.338 8.747 9.247 9.728 10.197 10.758 11.406 12.038 12.761 13.576 14.465 15.437 16.541 17.853 19.223 20.877 22.781 25.019 27.688 31.002 35.098 40.518 45.4 48.457 50.535 52.003 53.076 53.915 54.589 55.089 55.504 55.78 55.996 56.2 56.384 56.522 56.62 56.691 56.739 56.765 56.779 56.788 56.785 56.774 56.74 56.701 56.649 56.605 56.558 56.486 56.431 56.355 56.212 56.111 55.995 55.931 55.807 55.664 55.494 55.398 55.211 55.052 54.891 54.741 54.45 54.27 54.058 53.767 53.392 52.849 52.114 46.242 -9 ,26796 ,KEBNE ,17027873,Wed Dec 22 18:38:07 CET,Wed Dec 22 20:17:26 CET,0.0 0.639 0.965 1.239 1.468 1.682 1.88 2.061 2.415 2.581 2.732 2.873 3.164 3.296 3.567 3.845 4.119 4.254 4.517 4.767 5.127 5.364 5.603 5.943 6.261 6.584 6.911 7.244 7.681 8.093 8.493 8.996 9.502 10.005 10.594 11.267 11.91 12.623 13.424 14.287 15.218 16.297 17.614 19.023 20.726 22.672 24.986 27.718 31.06 35.149 40.502 45.297 48.314 50.426 51.917 52.969 53.69 54.239 54.646 55.009 55.282 55.469 55.622 55.742 55.838 55.92 55.996 56.032 56.001 55.975 55.939 55.874 55.822 55.765 55.707 55.64 55.557 55.475 55.398 55.324 55.235 55.114 55.015 54.891 54.824 54.695 54.561 54.384 54.29 54.104 53.928 53.782 53.641 53.307 53.088 52.815 52.487 52.107 51.616 50.909 47.068 -10 ,17714 ,KEBNE ,17027874,Wed Dec 22 18:38:09 CET,Wed Dec 22 20:15:08 CET,0.0 0.591 0.887 1.135 1.36 1.567 1.751 1.929 2.269 2.431 2.587 2.727 3.031 3.182 3.451 3.726 3.993 4.115 4.351 4.584 4.94 5.176 5.401 5.732 6.064 6.387 6.704 7.014 7.429 7.83 8.214 8.7 9.18 9.659 10.222 10.884 11.563 12.327 13.173 14.083 15.061 16.159 17.462 18.842 20.532 22.489 24.81 27.518 30.871 35.096 40.496 45.385 48.528 50.709 52.284 53.43 54.308 55.036 55.547 55.946 56.256 56.505 56.731 56.905 57.026 57.128 57.197 57.224 57.25 57.261 57.237 57.219 57.215 57.193 57.153 57.089 57.016 56.928 56.842 56.788 56.71 56.553 56.417 56.275 56.21 56.05 55.868 55.677 55.556 55.343 55.164 55.024 54.863 54.549 54.379 54.156 53.906 53.533 52.973 52.156 48.194 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt deleted file mode 100644 index b6cea643..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27513 ,TETRA ,17616665,Mon Nov 29 13:31:36 CET,Mon Nov 29 15:26:00 CET,0.0 0.824 1.175 1.433 1.676 1.909 2.13 2.339 2.717 2.883 3.037 3.204 3.524 3.681 3.986 4.283 4.568 4.701 4.96 5.226 5.626 5.877 6.108 6.464 6.835 7.196 7.551 7.9 8.376 8.859 9.321 9.867 10.392 10.901 11.515 12.23 12.909 13.661 14.542 15.532 16.555 17.717 19.124 20.567 22.26 24.177 26.527 29.344 32.724 36.93 42.457 47.34 50.356 52.352 53.736 54.787 55.579 56.175 56.622 57.035 57.321 57.488 57.614 57.739 57.852 57.909 57.918 57.921 57.901 57.843 57.772 57.716 57.671 57.607 57.539 57.477 57.408 57.329 57.251 57.172 57.064 56.891 56.766 56.627 56.55 56.387 56.196 55.987 55.876 55.679 55.537 55.415 55.281 54.956 54.756 54.51 54.247 53.967 53.609 53.044 50.505 -2 ,4579 ,TETRA ,17616666,Mon Nov 29 13:31:38 CET,Mon Nov 29 15:25:48 CET,0.0 0.965 1.356 1.686 1.94 2.163 2.376 2.58 2.966 3.138 3.316 3.515 3.828 3.978 4.269 4.56 4.85 4.991 5.262 5.536 5.955 6.22 6.48 6.868 7.24 7.616 7.976 8.319 8.786 9.217 9.637 10.183 10.71 11.233 11.843 12.535 13.235 14.01 14.86 15.777 16.742 17.865 19.223 20.639 22.346 24.291 26.623 29.389 32.731 36.898 42.39 47.286 50.292 52.304 53.71 54.763 55.56 56.149 56.586 56.97 57.235 57.445 57.589 57.667 57.758 57.856 57.935 57.961 57.969 57.966 57.921 57.866 57.815 57.764 57.73 57.685 57.59 57.487 57.371 57.286 57.216 57.09 56.986 56.87 56.809 56.678 56.542 56.387 56.295 56.105 55.931 55.785 55.646 55.353 55.16 54.938 54.717 54.43 53.985 53.406 50.5 -3 ,15236 ,TETRA ,17616667,Mon Nov 29 13:37:36 CET,Mon Nov 29 15:27:43 CET,0.0 1.152 1.555 1.86 2.124 2.357 2.587 2.806 3.185 3.381 3.562 3.711 4.003 4.154 4.456 4.759 5.06 5.202 5.481 5.745 6.129 6.389 6.65 7.034 7.401 7.758 8.105 8.45 8.902 9.341 9.782 10.311 10.81 11.303 11.907 12.599 13.238 13.973 14.805 15.679 16.608 17.749 19.152 20.577 22.319 24.305 26.626 29.409 32.878 37.195 42.816 47.857 51.066 53.293 54.871 56.013 56.849 57.47 57.91 58.302 58.581 58.794 58.936 59.026 59.126 59.206 59.247 59.26 59.26 59.228 59.179 59.149 59.117 59.067 59.002 58.918 58.817 58.703 58.596 58.518 58.42 58.26 58.149 58.029 57.972 57.846 57.665 57.444 57.333 57.137 56.964 56.817 56.663 56.289 56.081 55.861 55.589 55.292 54.942 54.35 51.932 -4 ,30005 ,TETRA ,17616668,Mon Nov 29 13:37:36 CET,Mon Nov 29 15:32:01 CET,0.0 0.734 1.107 1.402 1.68 1.908 2.104 2.291 2.668 2.868 3.059 3.254 3.556 3.699 3.988 4.267 4.568 4.726 5.014 5.285 5.687 5.956 6.215 6.586 6.943 7.297 7.649 7.991 8.438 8.878 9.306 9.825 10.339 10.849 11.471 12.181 12.86 13.618 14.483 15.429 16.418 17.54 18.906 20.304 21.913 23.868 26.258 29.006 32.339 36.412 41.846 46.766 49.779 51.821 53.25 54.309 55.1 55.672 56.06 56.392 56.651 56.851 56.997 57.079 57.099 57.117 57.129 57.118 57.098 57.07 57.05 57.034 56.991 56.926 56.882 56.819 56.727 56.624 56.502 56.399 56.294 56.149 56.026 55.891 55.823 55.668 55.505 55.347 55.267 55.102 54.967 54.833 54.711 54.43 54.251 54.044 53.82 53.571 53.261 52.768 49.395 -5 ,12313 ,TETRA ,17616669,Mon Nov 29 13:37:35 CET,Mon Nov 29 15:22:29 CET,0.0 1.376 1.697 2.009 2.279 2.499 2.71 2.905 3.251 3.422 3.596 3.77 4.054 4.195 4.478 4.75 5.022 5.159 5.437 5.698 6.079 6.341 6.594 6.96 7.329 7.686 8.045 8.411 8.876 9.324 9.751 10.269 10.794 11.309 11.911 12.599 13.282 14.053 14.903 15.83 16.836 18.014 19.449 20.911 22.618 24.651 27.11 29.938 33.365 37.728 43.45 48.555 51.741 53.933 55.514 56.674 57.445 57.987 58.417 58.803 59.087 59.294 59.469 59.628 59.737 59.789 59.84 59.848 59.822 59.806 59.791 59.764 59.718 59.657 59.596 59.529 59.458 59.381 59.298 59.23 59.149 59.028 58.938 58.831 58.77 58.611 58.432 58.241 58.151 57.979 57.824 57.703 57.589 57.303 57.099 56.858 56.617 56.296 55.866 55.29 52.353 -6 ,5540 ,TETRA ,17616670,Mon Nov 29 13:37:36 CET,Mon Nov 29 15:32:10 CET,0.0 0.975 1.33 1.594 1.816 2.024 2.23 2.452 2.881 3.063 3.229 3.405 3.707 3.859 4.163 4.439 4.706 4.84 5.1 5.382 5.799 6.044 6.298 6.692 7.061 7.42 7.78 8.132 8.59 9.033 9.47 10.011 10.545 11.067 11.681 12.393 13.084 13.861 14.725 15.65 16.659 17.802 19.125 20.523 22.217 24.203 26.629 29.453 32.922 37.323 43.063 48.055 51.189 53.417 54.972 56.121 56.995 57.674 58.186 58.603 58.898 59.086 59.219 59.33 59.4 59.449 59.467 59.455 59.433 59.398 59.342 59.275 59.192 59.122 59.065 58.981 58.89 58.794 58.688 58.612 58.52 58.354 58.239 58.111 58.042 57.902 57.742 57.56 57.457 57.264 57.124 57.002 56.864 56.531 56.333 56.11 55.857 55.558 55.14 54.458 51.435 -7 ,29332 ,TETRA ,17616671,Mon Nov 29 13:38:37 CET,Mon Nov 29 15:25:14 CET,0.0 0.627 0.942 1.169 1.39 1.608 1.818 2.033 2.426 2.602 2.763 2.915 3.213 3.361 3.645 3.924 4.2 4.345 4.649 4.935 5.33 5.593 5.852 6.211 6.56 6.91 7.266 7.618 8.072 8.515 8.928 9.427 9.932 10.443 11.056 11.778 12.48 13.252 14.111 15.042 16.032 17.144 18.47 19.848 21.483 23.367 25.663 28.352 31.601 35.77 41.167 46.065 49.193 51.291 52.746 53.81 54.642 55.28 55.739 56.118 56.391 56.605 56.751 56.858 56.946 57.011 57.054 57.063 57.048 57.032 57.039 57.045 57.031 56.987 56.93 56.848 56.747 56.644 56.548 56.491 56.427 56.295 56.2 56.095 56.037 55.897 55.704 55.483 55.385 55.194 55.065 54.958 54.821 54.463 54.271 54.07 53.833 53.546 53.112 52.451 48.704 -8 ,32459 ,TETRA ,17616672,Mon Nov 29 13:38:38 CET,Mon Nov 29 15:32:49 CET,0.0 0.47 0.808 1.112 1.364 1.576 1.763 1.938 2.272 2.428 2.584 2.752 3.049 3.2 3.51 3.813 4.103 4.243 4.538 4.834 5.242 5.504 5.762 6.146 6.516 6.865 7.217 7.584 8.066 8.522 8.958 9.48 9.972 10.463 11.071 11.761 12.429 13.189 14.047 14.956 15.898 17.004 18.347 19.73 21.393 23.285 25.563 28.369 31.878 36.305 42.058 47.179 50.414 52.66 54.23 55.381 56.227 56.871 57.356 57.783 58.078 58.291 58.483 58.627 58.726 58.8 58.836 58.829 58.806 58.76 58.684 58.636 58.598 58.512 58.427 58.36 58.292 58.191 58.083 58.004 57.91 57.742 57.617 57.495 57.434 57.291 57.135 57.002 56.925 56.731 56.58 56.455 56.324 55.996 55.781 55.544 55.263 54.912 54.443 53.764 49.798 -9 ,5793 ,TETRA ,17616673,Mon Nov 29 13:38:40 CET,Mon Nov 29 15:32:45 CET,0.0 1.126 1.544 1.861 2.13 2.361 2.568 2.78 3.169 3.351 3.531 3.697 3.994 4.148 4.434 4.696 4.971 5.12 5.405 5.659 6.026 6.268 6.506 6.865 7.214 7.56 7.901 8.223 8.659 9.094 9.51 10.026 10.531 11.031 11.615 12.294 12.969 13.736 14.585 15.501 16.482 17.612 19.007 20.462 22.192 24.181 26.598 29.388 32.813 37.136 42.729 47.737 50.88 53.01 54.523 55.662 56.444 56.967 57.357 57.743 58.009 58.17 58.292 58.352 58.354 58.352 58.347 58.32 58.311 58.308 58.286 58.258 58.198 58.12 58.046 57.966 57.892 57.793 57.674 57.59 57.495 57.357 57.259 57.139 57.071 56.946 56.83 56.667 56.562 56.365 56.249 56.141 56.006 55.728 55.573 55.386 55.139 54.843 54.457 53.865 50.886 -10 ,7368 ,TETRA ,17616674,Mon Nov 29 13:48:35 CET,Mon Nov 29 15:28:27 CET,0.0 0.9 1.28 1.566 1.83 2.07 2.267 2.452 2.809 2.981 3.157 3.346 3.642 3.8 4.118 4.425 4.729 4.874 5.148 5.416 5.813 6.065 6.31 6.677 7.033 7.385 7.724 8.054 8.504 8.943 9.38 9.934 10.463 10.99 11.621 12.315 13.007 13.794 14.623 15.503 16.481 17.638 19.02 20.435 22.145 24.206 26.684 29.503 32.894 37.149 42.747 47.827 51.079 53.293 54.887 56.046 56.882 57.548 58.048 58.492 58.804 58.997 59.121 59.246 59.367 59.429 59.464 59.482 59.482 59.474 59.461 59.434 59.396 59.339 59.277 59.196 59.098 59.007 58.916 58.842 58.761 58.633 58.52 58.403 58.349 58.207 58.015 57.803 57.689 57.477 57.301 57.155 56.968 56.581 56.35 56.076 55.774 55.463 55.037 54.32 50.941 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt deleted file mode 100644 index 22db99c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20371 ,TETRA ,17616675,Mon Nov 29 13:48:35 CET,Mon Nov 29 15:28:18 CET,0.0 0.614 0.874 1.089 1.297 1.479 1.624 1.754 2.001 2.133 2.264 2.346 2.602 2.713 2.908 3.108 3.31 3.407 3.603 3.792 4.044 4.211 4.381 4.618 4.855 5.092 5.321 5.563 5.875 6.18 6.476 6.815 7.152 7.482 7.858 8.281 8.7 9.175 9.685 10.222 10.795 11.461 12.257 13.083 14.066 15.171 16.423 17.892 19.702 21.855 24.62 26.942 28.316 29.198 29.777 30.171 30.451 30.664 30.809 30.915 30.975 30.999 30.99 30.983 30.97 30.961 30.956 30.93 30.895 30.86 30.816 30.758 30.678 30.593 30.53 30.466 30.403 30.333 30.24 30.18 30.128 30.041 29.983 29.925 29.891 29.799 29.687 29.574 29.524 29.364 29.368 29.303 29.227 29.071 28.973 28.858 28.751 28.628 28.468 28.243 27.535 -2 ,13454 ,TETRA ,17616676,Mon Nov 29 13:48:35 CET,Mon Nov 29 15:28:10 CET,0.0 0.962 1.297 1.533 1.702 1.855 2.008 2.154 2.44 2.576 2.7 2.803 3.065 3.181 3.395 3.602 3.809 3.905 4.101 4.303 4.613 4.813 4.993 5.231 5.468 5.709 5.936 6.159 6.452 6.743 7.026 7.366 7.719 8.08 8.479 8.902 9.321 9.8 10.324 10.868 11.441 12.109 12.937 13.793 14.782 15.912 17.189 18.692 20.594 22.907 25.726 27.97 29.355 30.31 30.946 31.406 31.75 31.983 32.123 32.23 32.255 32.249 32.27 32.279 32.262 32.249 32.238 32.224 32.199 32.163 32.121 32.078 32.025 31.96 31.904 31.847 31.8 31.754 31.677 31.614 31.557 31.471 31.409 31.337 31.299 31.219 31.136 31.036 30.977 30.815 30.792 30.717 30.638 30.435 30.337 30.248 30.12 29.962 29.816 29.629 28.717 -3 ,29990 ,TETRA ,17616677,Mon Nov 29 13:48:36 CET,Mon Nov 29 15:28:36 CET,0.0 0.785 1.082 1.336 1.562 1.758 1.938 2.098 2.392 2.531 2.669 2.791 3.056 3.182 3.44 3.686 3.921 4.037 4.26 4.457 4.729 4.905 5.077 5.334 5.595 5.838 6.058 6.28 6.581 6.873 7.16 7.511 7.844 8.166 8.569 9.06 9.526 10.005 10.508 11.061 11.649 12.305 13.097 13.943 14.91 16.004 17.339 18.844 20.628 22.801 25.557 27.919 29.283 30.151 30.745 31.176 31.468 31.678 31.826 31.933 31.998 32.045 32.076 32.089 32.084 32.068 32.038 32.002 31.97 31.945 31.911 31.872 31.833 31.789 31.746 31.706 31.663 31.608 31.536 31.475 31.403 31.301 31.246 31.189 31.153 31.056 30.954 30.849 30.794 30.632 30.624 30.562 30.479 30.297 30.205 30.11 30.014 29.878 29.688 29.451 28.654 -4 ,10008 ,TETRA ,17616678,Mon Nov 29 13:48:36 CET,Mon Nov 29 15:28:32 CET,0.0 0.637 0.909 1.123 1.318 1.518 1.711 1.871 2.169 2.308 2.433 2.524 2.778 2.888 3.097 3.311 3.522 3.627 3.833 4.024 4.317 4.502 4.681 4.936 5.173 5.4 5.625 5.87 6.208 6.52 6.804 7.152 7.504 7.841 8.224 8.66 9.072 9.531 10.058 10.63 11.219 11.902 12.74 13.623 14.704 15.899 17.24 18.74 20.535 22.775 25.602 28.027 29.474 30.422 31.059 31.521 31.852 32.058 32.195 32.294 32.365 32.413 32.432 32.448 32.449 32.435 32.412 32.391 32.369 32.338 32.294 32.229 32.158 32.08 32.019 31.958 31.868 31.775 31.7 31.651 31.596 31.513 31.454 31.383 31.352 31.302 31.226 31.126 31.072 30.899 30.849 30.778 30.713 30.554 30.461 30.372 30.255 30.104 29.951 29.712 29.23 -5 ,15136 ,TETRA ,17616679,Mon Nov 29 13:48:36 CET,Mon Nov 29 15:28:09 CET,0.0 0.887 1.195 1.446 1.691 1.914 2.099 2.254 2.549 2.685 2.802 2.903 3.166 3.276 3.498 3.704 3.897 3.996 4.205 4.4 4.675 4.849 5.015 5.259 5.501 5.734 5.954 6.162 6.446 6.748 7.051 7.398 7.727 8.046 8.407 8.83 9.249 9.717 10.228 10.77 11.35 12.031 12.832 13.646 14.637 15.753 17.084 18.656 20.56 22.882 25.685 28.021 29.429 30.344 30.964 31.384 31.659 31.879 32.03 32.156 32.241 32.278 32.296 32.291 32.279 32.264 32.231 32.172 32.128 32.104 32.07 32.03 31.987 31.939 31.894 31.852 31.815 31.759 31.694 31.638 31.564 31.442 31.349 31.266 31.233 31.16 31.065 30.972 30.924 30.762 30.763 30.702 30.638 30.499 30.415 30.307 30.175 30.033 29.866 29.621 29.163 -6 ,16560 ,TETRA ,17616680,Mon Nov 29 13:48:36 CET,Mon Nov 29 15:26:36 CET,0.0 0.564 0.857 1.096 1.3 1.474 1.625 1.778 2.079 2.229 2.377 2.485 2.746 2.864 3.093 3.312 3.521 3.619 3.8 3.976 4.221 4.37 4.533 4.782 5.016 5.25 5.487 5.717 6.001 6.282 6.564 6.902 7.246 7.569 7.927 8.358 8.781 9.248 9.767 10.31 10.884 11.586 12.425 13.238 14.189 15.273 16.536 18.001 19.827 22.091 24.799 27.072 28.454 29.354 29.99 30.446 30.769 31.006 31.172 31.289 31.357 31.403 31.424 31.443 31.469 31.463 31.429 31.392 31.364 31.344 31.323 31.295 31.243 31.174 31.125 31.067 30.997 30.911 30.818 30.768 30.713 30.619 30.554 30.478 30.437 30.349 30.255 30.151 30.093 29.935 29.936 29.872 29.808 29.649 29.56 29.458 29.317 29.158 28.976 28.73 27.694 -7 ,27512 ,TETRA ,17616681,Mon Nov 29 13:52:33 CET,Mon Nov 29 15:31:18 CET,0.0 0.748 1.043 1.277 1.503 1.7 1.864 2.022 2.334 2.472 2.605 2.704 2.952 3.057 3.267 3.461 3.655 3.752 3.933 4.101 4.338 4.501 4.663 4.897 5.149 5.41 5.659 5.911 6.247 6.552 6.829 7.161 7.498 7.834 8.216 8.651 9.079 9.546 10.057 10.61 11.192 11.868 12.682 13.499 14.463 15.559 16.832 18.322 20.181 22.439 25.143 27.493 28.856 29.704 30.319 30.757 31.043 31.229 31.361 31.46 31.509 31.525 31.534 31.549 31.54 31.517 31.5 31.485 31.46 31.418 31.374 31.33 31.267 31.202 31.153 31.077 31.0 30.928 30.857 30.818 30.77 30.688 30.627 30.558 30.525 30.457 30.375 30.274 30.214 30.042 30.008 29.934 29.868 29.685 29.578 29.474 29.367 29.266 29.125 28.91 28.474 -8 ,30365 ,TETRA ,17616682,Mon Nov 29 13:53:36 CET,Mon Nov 29 15:43:36 CET,0.0 0.814 1.136 1.38 1.571 1.748 1.899 2.053 2.369 2.501 2.621 2.719 2.971 3.073 3.284 3.485 3.677 3.782 3.993 4.193 4.464 4.626 4.786 5.026 5.263 5.496 5.723 5.94 6.225 6.507 6.794 7.136 7.442 7.744 8.108 8.535 8.95 9.414 9.937 10.497 11.104 11.806 12.619 13.44 14.395 15.473 16.79 18.364 20.22 22.42 25.094 27.373 28.77 29.634 30.213 30.652 30.962 31.181 31.313 31.405 31.466 31.495 31.504 31.5 31.485 31.43 31.36 31.322 31.28 31.221 31.142 31.078 31.026 30.959 30.889 30.813 30.746 30.678 30.595 30.539 30.485 30.398 30.329 30.254 30.223 30.163 30.061 29.957 29.914 29.749 29.724 29.653 29.584 29.409 29.317 29.225 29.134 29.024 28.886 28.714 28.18 -9 ,14334 ,TETRA ,17616683,Mon Nov 29 13:53:34 CET,Mon Nov 29 15:45:24 CET,0.0 0.573 0.895 1.153 1.369 1.546 1.701 1.847 2.14 2.272 2.398 2.508 2.773 2.885 3.098 3.299 3.485 3.583 3.781 3.982 4.273 4.456 4.629 4.876 5.113 5.334 5.556 5.773 6.067 6.375 6.672 7.022 7.35 7.668 8.047 8.476 8.897 9.386 9.918 10.46 11.042 11.725 12.544 13.377 14.34 15.433 16.768 18.339 20.211 22.465 25.164 27.399 28.76 29.681 30.291 30.691 30.955 31.18 31.345 31.438 31.498 31.539 31.557 31.563 31.562 31.538 31.512 31.497 31.465 31.428 31.383 31.337 31.294 31.263 31.234 31.196 31.155 31.108 31.044 30.991 30.937 30.834 30.755 30.683 30.65 30.588 30.51 30.418 30.373 30.209 30.171 30.107 30.033 29.83 29.722 29.612 29.511 29.387 29.2 28.925 27.957 -10 ,5004 ,TETRA ,17616684,Mon Nov 29 13:53:33 CET,Mon Nov 29 15:43:09 CET,0.0 0.934 1.249 1.531 1.76 1.945 2.118 2.275 2.553 2.686 2.822 2.923 3.177 3.291 3.494 3.685 3.877 3.972 4.156 4.338 4.605 4.779 4.962 5.234 5.5 5.754 5.977 6.195 6.489 6.78 7.077 7.419 7.74 8.049 8.403 8.816 9.243 9.733 10.239 10.777 11.366 12.03 12.843 13.693 14.677 15.804 17.142 18.675 20.503 22.683 25.348 27.595 28.952 29.88 30.532 30.981 31.303 31.524 31.652 31.772 31.833 31.85 31.868 31.876 31.87 31.857 31.819 31.772 31.731 31.692 31.661 31.625 31.574 31.518 31.456 31.394 31.336 31.261 31.174 31.118 31.071 30.988 30.923 30.857 30.824 30.745 30.655 30.547 30.488 30.333 30.334 30.264 30.188 30.021 29.928 29.816 29.682 29.524 29.349 29.14 28.201 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 0d14f135..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20810 ,TETRA ,17616685,Mon Nov 29 13:55:33 CET,Mon Nov 29 15:50:21 CET,0.0 1.153 1.575 1.915 2.188 2.424 2.64 2.867 3.289 3.477 3.657 3.857 4.16 4.32 4.637 4.942 5.234 5.373 5.638 5.883 6.229 6.456 6.68 7.01 7.344 7.681 8.007 8.304 8.678 9.045 9.402 9.839 10.273 10.699 11.195 11.742 12.261 12.859 13.52 14.218 14.984 15.86 16.878 17.952 19.226 20.637 22.254 24.103 26.374 29.085 32.536 35.612 37.505 38.729 39.567 40.172 40.544 40.827 41.065 41.275 41.401 41.489 41.567 41.609 41.642 41.664 41.684 41.699 41.699 41.691 41.681 41.671 41.655 41.638 41.626 41.603 41.574 41.539 41.493 41.465 41.434 41.363 41.303 41.238 41.202 41.124 41.054 40.997 40.96 40.816 40.836 40.79 40.733 40.598 40.522 40.449 40.366 40.256 40.159 40.068 39.828 -2 ,29449 ,TETRA ,17616686,Mon Nov 29 13:57:36 CET,Mon Nov 29 15:56:08 CET,0.0 0.924 1.329 1.663 1.945 2.213 2.445 2.648 3.025 3.211 3.383 3.562 3.869 4.026 4.33 4.619 4.904 5.04 5.298 5.546 5.893 6.13 6.372 6.696 7.006 7.332 7.648 7.953 8.342 8.721 9.098 9.534 9.958 10.396 10.911 11.477 12.02 12.634 13.306 14.004 14.766 15.636 16.663 17.731 18.97 20.364 21.987 23.899 26.228 29.029 32.541 35.524 37.343 38.519 39.301 39.874 40.309 40.634 40.853 41.046 41.195 41.307 41.391 41.448 41.477 41.489 41.502 41.509 41.506 41.504 41.506 41.502 41.483 41.45 41.428 41.407 41.378 41.35 41.327 41.305 41.276 41.234 41.202 41.167 41.147 41.098 41.039 40.97 40.934 40.802 40.817 40.764 40.713 40.612 40.569 40.52 40.452 40.352 40.227 40.099 39.864 -3 ,11442 ,TETRA ,17616687,Mon Nov 29 13:57:36 CET,Mon Nov 29 15:53:36 CET,0.0 1.271 1.675 2.025 2.305 2.553 2.767 2.979 3.384 3.564 3.739 3.925 4.221 4.383 4.697 4.996 5.287 5.427 5.689 5.928 6.272 6.513 6.74 7.067 7.38 7.688 7.992 8.291 8.69 9.062 9.42 9.854 10.285 10.716 11.217 11.77 12.307 12.914 13.573 14.304 15.071 15.931 16.974 18.037 19.274 20.693 22.419 24.371 26.66 29.414 32.876 35.838 37.624 38.852 39.694 40.294 40.74 41.064 41.272 41.437 41.567 41.657 41.725 41.786 41.837 41.882 41.914 41.925 41.935 41.941 41.939 41.938 41.926 41.906 41.882 41.856 41.832 41.799 41.761 41.728 41.691 41.644 41.601 41.548 41.525 41.479 41.421 41.346 41.31 41.164 41.17 41.122 41.066 40.955 40.906 40.853 40.78 40.694 40.603 40.506 40.201 -4 ,7456 ,TETRA ,17616688,Mon Nov 29 13:58:30 CET,Mon Nov 29 15:54:10 CET,0.0 0.829 1.261 1.63 1.943 2.217 2.456 2.671 3.053 3.241 3.411 3.579 3.886 4.045 4.351 4.637 4.909 5.042 5.316 5.57 5.906 6.138 6.376 6.707 7.009 7.294 7.577 7.872 8.254 8.62 8.992 9.454 9.904 10.335 10.835 11.408 11.981 12.592 13.237 13.938 14.695 15.558 16.55 17.592 18.854 20.262 21.899 23.772 26.1 28.954 32.465 35.415 37.188 38.309 39.123 39.777 40.218 40.525 40.743 40.929 41.034 41.1 41.15 41.191 41.243 41.275 41.293 41.302 41.293 41.283 41.274 41.27 41.264 41.255 41.239 41.215 41.185 41.151 41.118 41.092 41.063 41.006 40.96 40.924 40.908 40.867 40.818 40.765 40.738 40.609 40.641 40.599 40.564 40.478 40.423 40.37 40.311 40.238 40.136 40.006 39.768 -5 ,17835 ,TETRA ,17616689,Mon Nov 29 13:58:32 CET,Mon Nov 29 15:54:50 CET,0.0 1.333 1.752 2.061 2.37 2.628 2.846 3.061 3.476 3.681 3.867 4.039 4.328 4.476 4.783 5.071 5.336 5.467 5.726 5.978 6.344 6.569 6.786 7.099 7.416 7.73 8.035 8.332 8.716 9.099 9.478 9.936 10.365 10.776 11.263 11.814 12.368 12.991 13.646 14.36 15.133 16.0 17.037 18.064 19.266 20.71 22.375 24.286 26.641 29.412 32.956 36.038 37.857 39.1 39.975 40.612 41.072 41.373 41.579 41.754 41.877 41.948 41.994 42.034 42.07 42.117 42.154 42.178 42.192 42.197 42.185 42.167 42.143 42.108 42.079 42.047 42.02 41.986 41.944 41.913 41.875 41.808 41.753 41.704 41.683 41.639 41.584 41.515 41.481 41.345 41.376 41.33 41.282 41.177 41.113 41.048 40.967 40.866 40.754 40.647 40.476 -6 ,7635 ,TETRA ,17616690,Mon Nov 29 13:58:32 CET,Mon Nov 29 16:02:52 CET,0.0 0.834 1.268 1.586 1.881 2.157 2.407 2.606 2.972 3.172 3.352 3.532 3.833 3.993 4.301 4.609 4.909 5.046 5.312 5.567 5.926 6.153 6.376 6.702 7.024 7.341 7.646 7.937 8.315 8.697 9.064 9.488 9.909 10.33 10.81 11.359 11.902 12.508 13.16 13.852 14.592 15.463 16.522 17.57 18.808 20.224 21.851 23.728 26.021 28.771 32.209 35.164 36.979 38.171 38.986 39.575 39.992 40.314 40.531 40.705 40.827 40.896 40.953 41.012 41.052 41.079 41.103 41.116 41.119 41.112 41.105 41.106 41.104 41.09 41.074 41.056 41.03 41.0 40.973 40.955 40.935 40.889 40.855 40.824 40.809 40.77 40.718 40.653 40.61 40.468 40.485 40.426 40.36 40.249 40.2 40.132 40.053 39.954 39.854 39.704 39.338 -7 ,8897 ,TETRA ,17616691,Mon Nov 29 13:58:34 CET,Mon Nov 29 15:54:50 CET,0.0 1.407 1.835 2.163 2.448 2.728 2.975 3.17 3.536 3.721 3.91 4.125 4.433 4.589 4.89 5.18 5.456 5.589 5.848 6.094 6.434 6.664 6.891 7.217 7.548 7.863 8.155 8.443 8.825 9.23 9.648 10.146 10.607 11.035 11.522 12.064 12.606 13.208 13.864 14.59 15.353 16.192 17.199 18.253 19.482 20.926 22.662 24.63 26.973 29.788 33.225 36.15 37.998 39.225 40.08 40.707 41.124 41.429 41.651 41.844 41.997 42.096 42.158 42.195 42.203 42.196 42.185 42.189 42.184 42.186 42.212 42.228 42.235 42.227 42.208 42.187 42.17 42.128 42.079 42.052 42.031 42.004 41.976 41.932 41.91 41.858 41.796 41.748 41.721 41.581 41.612 41.571 41.521 41.419 41.365 41.301 41.214 41.109 41.004 40.86 40.55 -8 ,17010 ,TETRA ,17616692,Mon Nov 29 13:59:30 CET,Mon Nov 29 15:42:41 CET,0.0 1.01 1.435 1.737 2.039 2.298 2.523 2.75 3.174 3.347 3.511 3.705 4.01 4.167 4.469 4.761 5.041 5.169 5.422 5.668 6.018 6.242 6.453 6.765 7.07 7.369 7.68 7.989 8.385 8.77 9.14 9.601 10.072 10.529 11.054 11.634 12.193 12.8 13.449 14.158 14.919 15.806 16.833 17.86 19.121 20.557 22.263 24.225 26.498 29.261 32.748 35.665 37.449 38.658 39.465 40.067 40.494 40.784 40.999 41.2 41.349 41.451 41.531 41.563 41.552 41.555 41.577 41.585 41.585 41.578 41.557 41.536 41.514 41.487 41.463 41.444 41.424 41.397 41.364 41.337 41.316 41.283 41.251 41.213 41.192 41.15 41.105 41.052 41.019 40.875 40.894 40.855 40.819 40.741 40.682 40.597 40.522 40.436 40.315 40.177 39.852 -9 ,9126 ,TETRA ,17616693,Mon Nov 29 14:00:40 CET,Mon Nov 29 15:55:20 CET,0.0 1.118 1.541 1.853 2.13 2.374 2.593 2.796 3.176 3.364 3.545 3.744 4.048 4.208 4.533 4.842 5.107 5.241 5.517 5.765 6.116 6.351 6.579 6.907 7.233 7.548 7.845 8.131 8.511 8.895 9.268 9.736 10.215 10.662 11.156 11.715 12.267 12.863 13.513 14.233 14.993 15.868 16.958 18.068 19.322 20.729 22.384 24.318 26.64 29.413 32.896 35.955 37.848 39.077 39.89 40.477 40.893 41.212 41.428 41.58 41.681 41.761 41.821 41.843 41.851 41.851 41.843 41.846 41.852 41.845 41.831 41.821 41.802 41.784 41.77 41.755 41.732 41.698 41.659 41.626 41.588 41.525 41.486 41.445 41.423 41.37 41.323 41.276 41.243 41.109 41.14 41.091 41.021 40.871 40.792 40.697 40.598 40.515 40.406 40.267 39.787 -10 ,16013 ,TETRA ,17616694,Mon Nov 29 14:01:29 CET,Mon Nov 29 15:51:47 CET,0.0 1.396 1.847 2.174 2.457 2.722 2.951 3.155 3.54 3.72 3.9 4.1 4.407 4.574 4.893 5.186 5.459 5.591 5.838 6.077 6.435 6.675 6.91 7.247 7.586 7.915 8.237 8.548 8.944 9.326 9.684 10.119 10.552 10.956 11.426 11.982 12.531 13.143 13.809 14.537 15.286 16.161 17.231 18.278 19.521 20.926 22.523 24.377 26.65 29.431 32.924 35.925 37.748 38.963 39.805 40.404 40.81 41.1 41.31 41.505 41.659 41.766 41.85 41.894 41.911 41.927 41.94 41.943 41.945 41.93 41.898 41.877 41.864 41.842 41.816 41.781 41.744 41.721 41.685 41.654 41.631 41.583 41.536 41.487 41.462 41.401 41.348 41.295 41.263 41.129 41.165 41.123 41.079 40.991 40.937 40.883 40.822 40.737 40.634 40.514 40.227 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index aab8be99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10588 ,TETRA ,17616695,Mon Nov 29 14:01:31 CET,Mon Nov 29 15:53:57 CET,0.0 0.725 1.077 1.322 1.474 1.634 1.814 1.978 2.258 2.385 2.493 2.613 2.814 2.906 3.094 3.264 3.421 3.505 3.654 3.786 3.998 4.139 4.266 4.444 4.61 4.788 4.96 5.119 5.324 5.527 5.731 5.993 6.242 6.474 6.742 7.017 7.281 7.586 7.94 8.31 8.667 9.061 9.539 10.016 10.551 11.155 11.834 12.57 13.399 14.34 15.378 16.044 16.267 16.26 16.166 16.005 15.813 15.629 15.443 15.234 15.04 14.863 14.683 14.481 14.288 14.123 13.952 13.802 13.674 13.534 13.383 13.25 13.088 12.91 12.782 12.672 12.551 12.4 12.25 12.158 12.058 11.878 11.74 11.596 11.52 11.354 11.19 11.007 10.911 10.736 10.64 10.543 10.434 10.183 10.054 9.918 9.768 9.589 9.328 8.922 7.924 -2 ,9353 ,TETRA ,17616696,Mon Nov 29 14:01:28 CET,Mon Nov 29 15:54:47 CET,0.0 0.913 1.197 1.421 1.611 1.791 1.971 2.114 2.362 2.478 2.579 2.663 2.848 2.929 3.079 3.239 3.406 3.489 3.658 3.816 4.031 4.173 4.317 4.532 4.729 4.899 5.067 5.235 5.447 5.641 5.82 6.036 6.255 6.468 6.72 7.006 7.281 7.58 7.906 8.245 8.592 8.981 9.435 9.898 10.427 11.009 11.704 12.466 13.327 14.315 15.375 16.08 16.175 16.103 16.025 15.905 15.77 15.584 15.395 15.185 15.006 14.851 14.68 14.501 14.333 14.169 13.984 13.824 13.696 13.558 13.398 13.254 13.096 12.921 12.776 12.64 12.492 12.333 12.187 12.088 11.986 11.821 11.702 11.57 11.493 11.338 11.203 11.055 10.966 10.788 10.715 10.632 10.529 10.293 10.153 9.991 9.815 9.625 9.364 9.048 7.934 -3 ,6859 ,TETRA ,17616697,Mon Nov 29 14:02:28 CET,Mon Nov 29 15:56:23 CET,0.0 0.902 1.255 1.486 1.7 1.9 2.063 2.2 2.447 2.563 2.672 2.769 2.958 3.041 3.196 3.348 3.512 3.598 3.755 3.895 4.097 4.214 4.317 4.476 4.65 4.811 4.953 5.1 5.299 5.494 5.67 5.902 6.144 6.378 6.644 6.919 7.185 7.485 7.813 8.155 8.512 8.906 9.342 9.765 10.278 10.881 11.564 12.32 13.192 14.169 15.196 15.817 16.036 16.075 16.019 15.911 15.765 15.571 15.365 15.157 14.97 14.798 14.619 14.438 14.263 14.1 13.927 13.767 13.63 13.481 13.321 13.198 13.062 12.911 12.795 12.664 12.519 12.362 12.205 12.094 11.984 11.821 11.693 11.544 11.473 11.341 11.19 11.014 10.92 10.746 10.638 10.518 10.408 10.175 10.032 9.877 9.688 9.471 9.195 8.847 7.33 -4 ,10300 ,TETRA ,17616698,Mon Nov 29 14:03:27 CET,Mon Nov 29 15:49:13 CET,0.0 0.881 1.132 1.388 1.615 1.785 1.942 2.089 2.331 2.458 2.586 2.709 2.906 3.006 3.201 3.398 3.564 3.645 3.798 3.938 4.142 4.272 4.408 4.611 4.792 4.948 5.099 5.253 5.466 5.679 5.873 6.089 6.302 6.515 6.748 7.021 7.297 7.594 7.902 8.23 8.58 8.97 9.423 9.902 10.509 11.17 11.881 12.675 13.571 14.52 15.541 16.247 16.47 16.499 16.443 16.291 16.092 15.908 15.752 15.565 15.381 15.223 15.05 14.859 14.679 14.51 14.331 14.172 14.026 13.85 13.649 13.47 13.297 13.135 12.998 12.857 12.704 12.522 12.338 12.224 12.121 11.97 11.863 11.737 11.668 11.532 11.393 11.25 11.163 10.982 10.876 10.771 10.667 10.445 10.319 10.169 10.02 9.843 9.6 9.243 8.23 -5 ,9291 ,TETRA ,17616699,Mon Nov 29 14:04:28 CET,Mon Nov 29 15:58:11 CET,0.0 0.552 0.779 0.954 1.129 1.265 1.386 1.499 1.685 1.777 1.875 1.957 2.133 2.219 2.398 2.57 2.728 2.81 2.971 3.121 3.341 3.492 3.637 3.827 4.006 4.188 4.371 4.542 4.762 4.961 5.149 5.375 5.589 5.813 6.072 6.363 6.651 6.971 7.324 7.683 8.041 8.432 8.881 9.345 9.89 10.487 11.16 11.901 12.748 13.696 14.724 15.341 15.529 15.56 15.506 15.392 15.258 15.112 14.945 14.737 14.535 14.363 14.21 14.054 13.885 13.721 13.558 13.409 13.273 13.133 12.98 12.84 12.696 12.527 12.394 12.269 12.147 12.019 11.875 11.765 11.651 11.482 11.352 11.221 11.154 11.011 10.86 10.685 10.592 10.406 10.276 10.161 10.05 9.8 9.662 9.51 9.331 9.125 8.861 8.562 7.613 -6 ,14217 ,TETRA ,17616700,Mon Nov 29 14:05:29 CET,Mon Nov 29 15:58:13 CET,0.0 1.174 1.564 1.836 2.058 2.218 2.35 2.51 2.803 2.915 3.012 3.081 3.25 3.334 3.501 3.656 3.821 3.913 4.102 4.291 4.553 4.71 4.853 5.064 5.263 5.449 5.634 5.809 6.06 6.293 6.486 6.718 6.948 7.163 7.4 7.661 7.907 8.188 8.502 8.854 9.222 9.618 10.079 10.555 11.118 11.744 12.447 13.213 14.09 15.06 16.12 16.804 17.052 17.099 17.058 16.954 16.798 16.621 16.467 16.269 16.049 15.861 15.703 15.537 15.365 15.208 15.035 14.862 14.703 14.519 14.308 14.126 13.935 13.733 13.601 13.49 13.362 13.225 13.069 12.955 12.843 12.679 12.563 12.424 12.348 12.201 12.056 11.889 11.792 11.615 11.54 11.45 11.345 11.096 10.952 10.809 10.64 10.445 10.221 9.895 8.64 -7 ,10196 ,TETRA ,17616701,Mon Nov 29 14:04:27 CET,Mon Nov 29 15:58:47 CET,0.0 0.722 1.074 1.391 1.622 1.793 1.964 2.12 2.373 2.494 2.624 2.758 2.956 3.051 3.217 3.376 3.539 3.623 3.774 3.913 4.116 4.246 4.369 4.536 4.707 4.886 5.063 5.224 5.436 5.645 5.838 6.074 6.294 6.502 6.74 7.003 7.265 7.554 7.895 8.265 8.633 9.045 9.498 9.954 10.503 11.111 11.782 12.498 13.322 14.271 15.29 15.864 16.029 16.03 15.954 15.842 15.7 15.518 15.335 15.14 14.943 14.752 14.567 14.39 14.229 14.083 13.918 13.757 13.611 13.465 13.317 13.19 13.057 12.901 12.762 12.617 12.475 12.332 12.193 12.1 11.996 11.822 11.698 11.565 11.494 11.348 11.191 11.01 10.916 10.733 10.605 10.497 10.381 10.112 9.976 9.839 9.693 9.513 9.265 8.926 7.861 -8 ,24505 ,TETRA ,17616702,Mon Nov 29 14:04:29 CET,Mon Nov 29 15:59:47 CET,0.0 0.981 1.278 1.527 1.722 1.902 2.062 2.2 2.478 2.615 2.738 2.869 3.074 3.177 3.375 3.569 3.745 3.83 3.983 4.123 4.329 4.465 4.599 4.795 5.0 5.184 5.344 5.502 5.722 5.932 6.129 6.366 6.581 6.792 7.033 7.3 7.563 7.849 8.154 8.496 8.868 9.273 9.742 10.215 10.743 11.339 12.067 12.845 13.716 14.722 15.848 16.59 16.837 16.861 16.781 16.655 16.481 16.289 16.128 15.945 15.75 15.565 15.402 15.237 15.062 14.91 14.733 14.56 14.426 14.283 14.089 13.898 13.726 13.585 13.477 13.346 13.208 13.074 12.918 12.811 12.705 12.531 12.397 12.243 12.164 12.006 11.841 11.656 11.572 11.403 11.299 11.193 11.082 10.861 10.747 10.626 10.487 10.306 10.064 9.748 8.669 -9 ,23674 ,TETRA ,17616703,Mon Nov 29 14:06:25 CET,Mon Nov 29 16:00:31 CET,0.0 0.847 1.16 1.369 1.57 1.74 1.878 2.016 2.312 2.444 2.552 2.672 2.869 2.962 3.146 3.343 3.538 3.622 3.78 3.937 4.175 4.33 4.465 4.655 4.844 5.024 5.207 5.387 5.609 5.822 6.029 6.292 6.544 6.774 7.036 7.324 7.6 7.9 8.221 8.549 8.888 9.283 9.726 10.166 10.688 11.265 11.94 12.722 13.605 14.591 15.685 16.392 16.597 16.592 16.55 16.47 16.329 16.148 15.979 15.794 15.596 15.419 15.26 15.082 14.916 14.771 14.613 14.467 14.318 14.148 13.982 13.847 13.714 13.583 13.477 13.356 13.218 13.069 12.917 12.807 12.701 12.535 12.409 12.286 12.222 12.086 11.924 11.738 11.651 11.481 11.377 11.27 11.161 10.904 10.739 10.575 10.396 10.206 10.017 9.756 8.637 -10 ,2635 ,TETRA ,17616704,Mon Nov 29 14:06:25 CET,Mon Nov 29 16:00:47 CET,0.0 1.105 1.375 1.601 1.775 1.926 2.072 2.234 2.541 2.668 2.78 2.88 3.075 3.168 3.35 3.536 3.696 3.766 3.916 4.066 4.273 4.417 4.563 4.758 4.936 5.104 5.287 5.47 5.685 5.888 6.081 6.317 6.544 6.76 7.003 7.273 7.535 7.827 8.136 8.459 8.827 9.246 9.72 10.184 10.692 11.256 11.914 12.662 13.564 14.531 15.52 16.098 16.269 16.251 16.149 16.013 15.84 15.642 15.465 15.254 15.047 14.865 14.684 14.494 14.313 14.166 14.008 13.837 13.678 13.513 13.346 13.216 13.059 12.865 12.722 12.598 12.47 12.319 12.154 12.048 11.939 11.765 11.642 11.505 11.432 11.278 11.145 11.004 10.918 10.738 10.61 10.51 10.403 10.131 9.991 9.844 9.669 9.435 9.154 8.796 7.5 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt deleted file mode 100644 index 895456dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17502 ,TETRA ,17616705,Mon Nov 29 14:07:24 CET,Mon Nov 29 15:40:49 CET,0.0 0.441 0.673 0.818 0.958 1.085 1.197 1.316 1.558 1.662 1.748 1.835 1.983 2.048 2.165 2.3 2.444 2.506 2.626 2.745 2.923 3.029 3.118 3.234 3.346 3.461 3.575 3.69 3.845 3.998 4.142 4.3 4.454 4.601 4.764 4.93 5.101 5.313 5.529 5.739 5.962 6.194 6.461 6.727 7.002 7.289 7.605 7.923 8.206 8.423 8.483 8.239 7.897 7.548 7.187 6.822 6.52 6.226 5.945 5.665 5.415 5.193 4.978 4.765 4.569 4.373 4.161 3.973 3.804 3.634 3.453 3.304 3.149 2.982 2.853 2.726 2.603 2.481 2.353 2.248 2.137 1.979 1.861 1.737 1.678 1.563 1.429 1.267 1.181 1.018 0.906 0.8 0.705 0.499 0.371 0.234 0.067 -0.11 -0.288 -0.535 -1.268 -2 ,11261 ,TETRA ,17616706,Mon Nov 29 14:07:23 CET,Mon Nov 29 16:01:04 CET,0.0 0.828 1.054 1.212 1.36 1.512 1.659 1.799 2.024 2.105 2.179 2.255 2.407 2.48 2.621 2.749 2.893 2.962 3.079 3.185 3.335 3.438 3.537 3.681 3.822 3.95 4.066 4.184 4.335 4.479 4.61 4.752 4.907 5.06 5.236 5.439 5.627 5.819 6.004 6.199 6.393 6.618 6.878 7.134 7.422 7.716 8.039 8.345 8.643 8.933 9.023 8.773 8.429 8.062 7.683 7.307 6.971 6.643 6.352 6.063 5.807 5.585 5.365 5.154 4.953 4.76 4.561 4.377 4.214 4.043 3.866 3.723 3.573 3.413 3.287 3.166 3.038 2.897 2.749 2.641 2.534 2.371 2.253 2.127 2.062 1.915 1.753 1.589 1.511 1.357 1.257 1.157 1.05 0.804 0.674 0.533 0.347 0.148 -0.067 -0.336 -1.196 -3 ,17370 ,TETRA ,17616707,Mon Nov 29 14:07:25 CET,Mon Nov 29 16:01:27 CET,0.0 0.808 1.174 1.423 1.625 1.821 1.993 2.13 2.367 2.466 2.567 2.693 2.865 2.946 3.086 3.221 3.343 3.403 3.51 3.613 3.772 3.87 3.965 4.11 4.257 4.391 4.511 4.626 4.77 4.905 5.033 5.189 5.338 5.481 5.65 5.836 6.002 6.175 6.365 6.556 6.751 6.975 7.224 7.46 7.73 8.019 8.31 8.61 8.894 9.135 9.24 8.998 8.657 8.28 7.918 7.581 7.255 6.949 6.678 6.376 6.112 5.894 5.689 5.48 5.277 5.092 4.885 4.695 4.527 4.356 4.189 4.042 3.88 3.712 3.584 3.452 3.312 3.168 3.018 2.913 2.8 2.609 2.472 2.336 2.268 2.13 1.989 1.847 1.772 1.625 1.543 1.448 1.341 1.107 0.982 0.843 0.687 0.509 0.305 0.027 -0.553 -4 ,6408 ,TETRA ,17616708,Mon Nov 29 14:08:23 CET,Mon Nov 29 16:00:01 CET,0.0 0.549 0.797 0.986 1.159 1.341 1.511 1.655 1.873 1.957 2.054 2.188 2.362 2.452 2.602 2.765 2.904 2.959 3.063 3.167 3.325 3.427 3.518 3.65 3.784 3.911 4.038 4.154 4.295 4.418 4.534 4.695 4.854 4.995 5.155 5.337 5.502 5.673 5.866 6.073 6.287 6.529 6.781 7.024 7.308 7.611 7.934 8.214 8.515 8.838 8.984 8.772 8.43 8.044 7.632 7.256 6.912 6.609 6.351 6.056 5.778 5.539 5.328 5.112 4.909 4.729 4.529 4.345 4.178 4.002 3.833 3.701 3.56 3.399 3.269 3.135 2.994 2.845 2.689 2.587 2.477 2.3 2.175 2.044 1.983 1.844 1.684 1.519 1.429 1.259 1.153 1.052 0.949 0.723 0.6 0.473 0.313 0.14 -0.078 -0.418 -1.397 -5 ,12154 ,TETRA ,17616709,Mon Nov 29 14:08:23 CET,Mon Nov 29 15:59:43 CET,0.0 1.02 1.361 1.565 1.783 1.928 2.032 2.142 2.358 2.455 2.535 2.63 2.782 2.855 3.003 3.133 3.246 3.309 3.451 3.568 3.707 3.8 3.894 4.031 4.176 4.321 4.451 4.574 4.73 4.877 5.016 5.175 5.329 5.478 5.645 5.829 6.005 6.185 6.376 6.572 6.777 7.01 7.249 7.5 7.799 8.087 8.384 8.685 8.973 9.213 9.314 9.092 8.738 8.372 8.0 7.658 7.343 7.035 6.741 6.434 6.18 5.943 5.718 5.513 5.309 5.118 4.905 4.704 4.544 4.382 4.202 4.06 3.917 3.748 3.611 3.472 3.342 3.209 3.06 2.953 2.847 2.69 2.578 2.456 2.395 2.263 2.105 1.948 1.87 1.711 1.611 1.515 1.41 1.173 1.041 0.905 0.767 0.613 0.386 0.095 -0.396 -6 ,32133 ,TETRA ,17616710,Mon Nov 29 14:10:23 CET,Mon Nov 29 16:03:09 CET,0.0 0.907 1.132 1.314 1.439 1.566 1.699 1.812 2.017 2.129 2.238 2.325 2.473 2.54 2.677 2.819 2.978 3.047 3.168 3.281 3.433 3.531 3.619 3.742 3.869 3.996 4.11 4.22 4.368 4.499 4.628 4.799 4.943 5.076 5.235 5.414 5.589 5.769 5.964 6.171 6.378 6.598 6.866 7.129 7.388 7.663 7.986 8.346 8.704 8.928 8.947 8.734 8.442 8.092 7.716 7.355 7.03 6.705 6.398 6.111 5.864 5.63 5.404 5.192 5.001 4.812 4.598 4.411 4.257 4.108 3.946 3.804 3.655 3.498 3.374 3.247 3.113 2.969 2.821 2.718 2.612 2.439 2.323 2.208 2.143 2.005 1.864 1.713 1.629 1.469 1.361 1.256 1.147 0.92 0.797 0.669 0.532 0.353 0.148 -0.112 -0.794 -7 ,31608 ,TETRA ,17616711,Mon Nov 29 14:09:24 CET,Mon Nov 29 16:04:57 CET,0.0 1.021 1.304 1.512 1.66 1.793 1.929 2.067 2.314 2.416 2.51 2.598 2.751 2.839 3.007 3.143 3.259 3.314 3.412 3.508 3.667 3.786 3.889 4.021 4.167 4.309 4.47 4.631 4.803 4.961 5.099 5.253 5.418 5.578 5.744 5.927 6.108 6.299 6.496 6.709 6.924 7.151 7.416 7.664 7.935 8.248 8.574 8.864 9.157 9.455 9.597 9.414 9.102 8.734 8.362 8.007 7.675 7.364 7.094 6.81 6.549 6.313 6.098 5.896 5.697 5.512 5.322 5.161 5.016 4.858 4.685 4.538 4.388 4.227 4.105 3.973 3.839 3.706 3.561 3.453 3.347 3.187 3.065 2.934 2.872 2.744 2.609 2.464 2.385 2.226 2.139 2.043 1.945 1.751 1.635 1.501 1.351 1.183 0.988 0.715 -0.074 -8 ,24716 ,TETRA ,17616712,Mon Nov 29 14:09:24 CET,Mon Nov 29 16:01:23 CET,0.0 0.422 0.639 0.85 1.018 1.187 1.336 1.455 1.672 1.766 1.855 1.939 2.09 2.159 2.296 2.428 2.557 2.627 2.75 2.845 2.985 3.082 3.171 3.297 3.431 3.562 3.686 3.8 3.951 4.11 4.248 4.395 4.537 4.683 4.85 5.034 5.212 5.398 5.591 5.788 5.997 6.22 6.45 6.674 6.944 7.236 7.536 7.839 8.172 8.481 8.594 8.378 8.06 7.714 7.363 7.032 6.711 6.373 6.073 5.773 5.515 5.282 5.047 4.827 4.638 4.466 4.287 4.125 3.978 3.825 3.663 3.521 3.373 3.226 3.113 2.999 2.87 2.735 2.589 2.472 2.346 2.168 2.04 1.902 1.837 1.713 1.589 1.458 1.384 1.22 1.115 1.028 0.935 0.74 0.616 0.473 0.313 0.139 -0.049 -0.302 -0.907 -9 ,4425 ,TETRA ,17616713,Mon Nov 29 14:10:23 CET,Mon Nov 29 16:03:24 CET,0.0 0.742 1.018 1.155 1.3 1.471 1.632 1.767 1.966 2.062 2.157 2.246 2.404 2.484 2.658 2.818 2.947 3.005 3.124 3.243 3.414 3.517 3.611 3.772 3.923 4.053 4.179 4.293 4.441 4.583 4.712 4.874 5.019 5.161 5.331 5.519 5.708 5.905 6.091 6.272 6.46 6.68 6.927 7.174 7.458 7.733 8.031 8.341 8.644 8.902 9.025 8.867 8.524 8.139 7.775 7.417 7.077 6.733 6.437 6.162 5.903 5.666 5.439 5.191 4.965 4.778 4.565 4.355 4.194 4.039 3.873 3.737 3.581 3.426 3.318 3.198 3.068 2.931 2.784 2.679 2.567 2.397 2.279 2.162 2.099 1.973 1.84 1.69 1.611 1.456 1.355 1.264 1.169 0.953 0.834 0.696 0.518 0.316 0.085 -0.268 -1.192 -10 ,16359 ,TETRA ,17616714,Mon Nov 29 14:10:23 CET,Mon Nov 29 16:05:39 CET,0.0 0.742 1.038 1.242 1.398 1.534 1.641 1.744 1.989 2.104 2.206 2.315 2.465 2.532 2.663 2.774 2.886 2.944 3.049 3.148 3.303 3.413 3.513 3.64 3.764 3.885 3.993 4.095 4.233 4.369 4.501 4.669 4.827 4.968 5.131 5.322 5.5 5.675 5.856 6.043 6.237 6.462 6.733 6.99 7.257 7.559 7.896 8.218 8.525 8.772 8.872 8.704 8.414 8.099 7.741 7.37 7.049 6.741 6.459 6.169 5.914 5.669 5.424 5.196 4.984 4.788 4.584 4.409 4.256 4.088 3.918 3.775 3.622 3.459 3.331 3.202 3.075 2.944 2.808 2.706 2.595 2.431 2.314 2.199 2.141 2.005 1.863 1.712 1.627 1.463 1.368 1.275 1.177 0.957 0.828 0.698 0.567 0.371 0.112 -0.2 -0.858 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 5173824c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,788 ,TETRA ,17616715,Mon Nov 29 14:10:25 CET,Mon Nov 29 16:12:39 CET,0.0 0.478 0.663 0.781 0.879 0.961 1.035 1.121 1.276 1.332 1.385 1.238 1.524 1.564 1.639 1.735 1.812 1.83 1.861 1.908 1.974 1.994 2.013 2.049 2.083 2.118 2.136 2.134 2.119 2.092 2.048 1.967 1.886 1.812 1.718 1.599 1.45 1.255 1.012 0.727 0.395 -0.021 -0.598 -1.301 -2.188 -3.286 -4.755 -6.711 -9.424 -13.294 -19.477 -26.426 -31.813 -36.169 -39.718 -42.768 -45.387 -47.621 -49.488 -51.332 -52.866 -54.19 -55.428 -56.579 -57.591 -58.499 -59.469 -60.353 -61.099 -61.842 -62.618 -63.249 -63.887 -64.567 -65.089 -65.621 -66.162 -66.706 -67.267 -67.646 -68.04 -68.648 -69.052 -69.481 -69.703 -70.149 -70.637 -71.16 -71.428 -72.018 -72.257 -72.553 -72.863 -73.514 -73.884 -74.323 -74.796 -75.334 -76.061 -77.03 -80.393 -2 ,6788 ,TETRA ,17616716,Mon Nov 29 14:10:25 CET,Mon Nov 29 16:11:15 CET,0.0 1.07 1.282 1.417 1.526 1.615 1.654 1.698 1.786 1.827 1.877 1.729 2.012 2.041 2.078 2.108 2.141 2.158 2.175 2.178 2.174 2.179 2.181 2.16 2.138 2.118 2.104 2.076 2.02 1.991 1.96 1.884 1.792 1.681 1.543 1.408 1.265 1.059 0.823 0.543 0.181 -0.282 -0.884 -1.551 -2.42 -3.522 -4.96 -6.868 -9.54 -13.435 -19.68 -26.742 -32.182 -36.543 -40.089 -43.12 -45.757 -48.11 -50.054 -51.912 -53.484 -54.857 -56.118 -57.282 -58.363 -59.335 -60.313 -61.168 -61.911 -62.684 -63.484 -64.113 -64.782 -65.523 -66.088 -66.648 -67.217 -67.789 -68.382 -68.796 -69.21 -69.878 -70.353 -70.826 -71.064 -71.547 -72.064 -72.617 -72.894 -73.485 -73.746 -74.059 -74.361 -75.02 -75.4 -75.801 -76.232 -76.723 -77.316 -78.271 -82.514 -3 ,12544 ,TETRA ,17616717,Mon Nov 29 14:10:25 CET,Mon Nov 29 16:13:40 CET,0.0 0.619 0.726 0.809 0.902 1.003 1.087 1.168 1.288 1.326 1.361 1.189 1.473 1.519 1.602 1.647 1.685 1.71 1.749 1.786 1.834 1.849 1.862 1.876 1.87 1.853 1.835 1.82 1.798 1.762 1.723 1.674 1.612 1.532 1.419 1.28 1.12 0.915 0.663 0.372 0.032 -0.421 -1.022 -1.695 -2.591 -3.712 -5.198 -7.177 -9.892 -13.803 -19.975 -26.833 -32.254 -36.764 -40.423 -43.5 -46.122 -48.429 -50.355 -52.218 -53.773 -55.141 -56.415 -57.58 -58.629 -59.578 -60.586 -61.48 -62.215 -62.973 -63.786 -64.481 -65.212 -65.954 -66.509 -67.088 -67.692 -68.289 -68.898 -69.319 -69.751 -70.418 -70.878 -71.351 -71.596 -72.109 -72.639 -73.167 -73.438 -74.055 -74.358 -74.674 -74.995 -75.688 -76.073 -76.501 -76.973 -77.488 -78.119 -78.887 -82.267 -4 ,25809 ,TETRA ,17616718,Mon Nov 29 14:10:25 CET,Mon Nov 29 16:09:28 CET,0.0 0.669 0.88 1.043 1.19 1.307 1.39 1.477 1.676 1.755 1.827 1.752 2.077 2.145 2.253 2.359 2.439 2.469 2.533 2.588 2.647 2.708 2.773 2.846 2.914 2.935 2.917 2.892 2.836 2.784 2.755 2.734 2.699 2.622 2.513 2.383 2.215 2.007 1.774 1.482 1.12 0.664 0.053 -0.612 -1.469 -2.623 -4.147 -6.058 -8.758 -12.682 -18.795 -25.684 -31.084 -35.466 -39.073 -42.244 -44.918 -47.204 -49.112 -50.947 -52.492 -53.857 -55.115 -56.29 -57.394 -58.369 -59.362 -60.235 -60.975 -61.726 -62.494 -63.134 -63.779 -64.433 -64.941 -65.46 -65.987 -66.54 -67.106 -67.487 -67.883 -68.496 -68.907 -69.343 -69.574 -70.032 -70.539 -71.113 -71.407 -72.027 -72.323 -72.634 -72.951 -73.653 -74.063 -74.527 -75.005 -75.514 -76.094 -76.793 -79.393 -5 ,18067 ,TETRA ,17616719,Mon Nov 29 14:10:25 CET,Mon Nov 29 15:53:03 CET,0.0 1.186 1.4 1.539 1.656 1.763 1.847 1.908 2.002 2.045 2.093 1.933 2.209 2.246 2.306 2.356 2.421 2.451 2.499 2.536 2.574 2.593 2.616 2.642 2.645 2.65 2.655 2.655 2.648 2.621 2.58 2.512 2.426 2.343 2.217 2.036 1.867 1.662 1.4 1.094 0.727 0.281 -0.279 -0.944 -1.811 -2.872 -4.281 -6.187 -8.929 -12.847 -18.923 -25.846 -31.218 -35.543 -39.121 -42.199 -44.788 -46.997 -48.848 -50.667 -52.184 -53.505 -54.761 -55.939 -56.988 -57.916 -58.877 -59.725 -60.47 -61.242 -62.025 -62.675 -63.344 -64.014 -64.519 -65.044 -65.581 -66.126 -66.682 -67.061 -67.46 -68.1 -68.536 -69.0 -69.245 -69.73 -70.236 -70.767 -71.032 -71.621 -71.893 -72.205 -72.525 -73.236 -73.619 -74.054 -74.562 -75.076 -75.645 -76.395 -80.72 -6 ,6487 ,TETRA ,17616720,Mon Nov 29 14:10:25 CET,Mon Nov 29 16:06:45 CET,0.0 0.592 0.781 0.923 1.058 1.165 1.243 1.314 1.422 1.461 1.503 1.345 1.635 1.684 1.766 1.84 1.896 1.92 1.97 2.019 2.08 2.095 2.099 2.123 2.139 2.136 2.123 2.112 2.101 2.081 2.056 1.99 1.904 1.819 1.709 1.579 1.428 1.224 0.979 0.692 0.355 -0.069 -0.629 -1.29 -2.171 -3.254 -4.692 -6.598 -9.164 -12.93 -19.072 -26.049 -31.435 -35.777 -39.351 -42.398 -44.977 -47.248 -49.164 -51.006 -52.543 -53.872 -55.109 -56.275 -57.344 -58.279 -59.223 -60.076 -60.841 -61.617 -62.385 -63.008 -63.638 -64.294 -64.802 -65.317 -65.839 -66.375 -66.933 -67.325 -67.718 -68.316 -68.736 -69.175 -69.401 -69.865 -70.345 -70.823 -71.07 -71.644 -71.821 -72.09 -72.377 -73.014 -73.368 -73.791 -74.293 -74.854 -75.482 -76.382 -80.295 -7 ,28162 ,TETRA ,17616721,Mon Nov 29 14:11:26 CET,Mon Nov 29 16:13:53 CET,0.0 0.821 1.07 1.271 1.426 1.54 1.645 1.753 1.945 2.051 2.149 2.067 2.382 2.455 2.578 2.667 2.711 2.736 2.782 2.845 2.951 3.002 3.046 3.104 3.164 3.237 3.291 3.309 3.339 3.405 3.462 3.52 3.578 3.605 3.63 3.645 3.595 3.478 3.302 3.078 2.82 2.428 1.853 1.199 0.328 -0.808 -2.293 -4.189 -6.822 -10.691 -16.851 -23.79 -29.17 -33.48 -37.039 -40.154 -42.779 -45.001 -46.85 -48.659 -50.196 -51.561 -52.831 -54.002 -55.061 -55.999 -56.96 -57.807 -58.532 -59.284 -60.041 -60.662 -61.318 -61.988 -62.499 -63.032 -63.595 -64.157 -64.727 -65.13 -65.547 -66.207 -66.66 -67.135 -67.378 -67.86 -68.368 -68.918 -69.2 -69.795 -70.065 -70.387 -70.741 -71.483 -71.872 -72.293 -72.772 -73.322 -73.946 -74.761 -78.583 -8 ,5725 ,TETRA ,17616722,Mon Nov 29 14:11:26 CET,Mon Nov 29 16:12:52 CET,0.0 0.546 0.806 0.993 1.12 1.229 1.314 1.379 1.495 1.535 1.576 1.401 1.691 1.717 1.753 1.795 1.851 1.878 1.918 1.953 2.005 2.047 2.083 2.12 2.136 2.14 2.135 2.111 2.077 2.042 1.997 1.941 1.866 1.781 1.677 1.54 1.394 1.214 0.961 0.645 0.293 -0.149 -0.701 -1.308 -2.13 -3.161 -4.564 -6.468 -9.117 -12.934 -18.938 -25.829 -31.167 -35.433 -38.951 -42.009 -44.602 -46.85 -48.742 -50.556 -52.078 -53.431 -54.672 -55.826 -56.906 -57.87 -58.848 -59.713 -60.471 -61.257 -62.05 -62.688 -63.334 -63.99 -64.496 -65.008 -65.536 -66.081 -66.63 -67.021 -67.426 -68.059 -68.481 -68.896 -69.114 -69.581 -70.075 -70.567 -70.82 -71.436 -71.71 -72.011 -72.314 -72.963 -73.305 -73.679 -74.092 -74.587 -75.211 -76.008 -79.077 -9 ,10434 ,TETRA ,17616723,Mon Nov 29 14:11:26 CET,Mon Nov 29 16:12:52 CET,0.0 0.541 0.733 0.856 0.986 1.093 1.206 1.304 1.43 1.488 1.571 1.518 1.828 1.902 2.021 2.121 2.215 2.254 2.335 2.43 2.572 2.657 2.727 2.797 2.861 2.933 3.005 3.059 3.106 3.14 3.167 3.183 3.168 3.12 3.023 2.887 2.745 2.574 2.376 2.143 1.877 1.517 1.004 0.432 -0.335 -1.404 -2.916 -4.908 -7.598 -11.49 -17.608 -24.502 -29.971 -34.431 -38.022 -41.032 -43.59 -45.806 -47.689 -49.562 -51.128 -52.499 -53.784 -54.959 -56.037 -56.993 -57.981 -58.856 -59.574 -60.307 -61.065 -61.683 -62.313 -62.966 -63.475 -63.995 -64.534 -65.104 -65.694 -66.094 -66.493 -67.089 -67.497 -67.928 -68.161 -68.645 -69.126 -69.621 -69.882 -70.473 -70.721 -71.024 -71.329 -71.983 -72.362 -72.77 -73.191 -73.642 -74.182 -74.977 -78.229 -10 ,6657 ,TETRA ,17616724,Mon Nov 29 14:11:26 CET,Mon Nov 29 16:10:27 CET,0.0 0.525 0.694 0.811 0.913 1.019 1.095 1.146 1.295 1.363 1.409 1.272 1.564 1.629 1.746 1.84 1.925 1.956 2.013 2.068 2.14 2.188 2.229 2.302 2.385 2.443 2.486 2.519 2.566 2.621 2.666 2.678 2.673 2.661 2.639 2.601 2.525 2.422 2.297 2.061 1.686 1.222 0.647 0.001 -0.86 -1.99 -3.523 -5.479 -8.198 -12.168 -18.35 -25.262 -30.677 -35.052 -38.656 -41.721 -44.259 -46.49 -48.408 -50.277 -51.818 -53.177 -54.446 -55.606 -56.67 -57.613 -58.568 -59.423 -60.167 -60.902 -61.656 -62.287 -62.938 -63.612 -64.121 -64.637 -65.167 -65.733 -66.328 -66.738 -67.154 -67.808 -68.269 -68.734 -68.965 -69.443 -69.946 -70.455 -70.719 -71.316 -71.565 -71.866 -72.186 -72.88 -73.261 -73.66 -74.076 -74.574 -75.201 -76.08 -79.392 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt deleted file mode 100644 index a4a946e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32577 ,TETRA ,17616725,Mon Nov 29 14:12:24 CET,Mon Nov 29 16:13:33 CET,0.0 2.458 3.07 3.489 3.834 4.079 4.28 4.469 4.808 4.948 5.079 5.098 5.475 5.606 5.852 6.08 6.294 6.396 6.59 6.78 7.06 7.23 7.392 7.629 7.857 8.078 8.284 8.483 8.751 9.018 9.274 9.572 9.855 10.111 10.396 10.728 11.044 11.392 11.756 12.124 12.534 12.992 13.5 13.969 14.486 15.082 15.74 16.41 17.032 17.528 17.791 17.386 16.56 15.664 14.807 13.959 13.206 12.484 11.822 11.183 10.629 10.122 9.642 9.185 8.738 8.327 7.888 7.473 7.117 6.753 6.37 6.05 5.712 5.329 5.019 4.691 4.374 4.07 3.751 3.523 3.269 2.85 2.55 2.258 2.118 1.832 1.535 1.213 1.04 0.618 0.451 0.229 -0.008 -0.538 -0.841 -1.14 -1.508 -1.927 -2.379 -3.044 -5.395 -2 ,20984 ,TETRA ,17616727,Mon Nov 29 14:12:23 CET,Mon Nov 29 16:11:41 CET,0.0 1.266 1.567 1.824 2.051 2.262 2.461 2.632 2.94 3.085 3.225 3.27 3.657 3.789 4.026 4.256 4.475 4.575 4.769 4.964 5.238 5.406 5.571 5.816 6.037 6.25 6.461 6.668 6.924 7.168 7.418 7.718 7.994 8.257 8.572 8.909 9.204 9.52 9.892 10.303 10.729 11.174 11.662 12.112 12.616 13.17 13.778 14.452 15.032 15.431 15.493 14.976 14.251 13.468 12.675 11.864 11.152 10.52 9.928 9.307 8.774 8.307 7.827 7.307 6.82 6.386 5.885 5.383 4.932 4.471 4.015 3.644 3.239 2.818 2.503 2.163 1.79 1.422 1.054 0.789 0.51 0.065 -0.259 -0.588 -0.753 -1.105 -1.494 -1.899 -2.102 -2.537 -2.719 -2.941 -3.163 -3.676 -3.964 -4.266 -4.634 -5.065 -5.553 -6.242 -9.081 -3 ,12079 ,TETRA ,17616728,Mon Nov 29 14:12:25 CET,Mon Nov 29 16:11:53 CET,0.0 1.591 2.016 2.338 2.597 2.829 3.059 3.276 3.637 3.806 3.964 4.015 4.401 4.535 4.789 5.04 5.29 5.41 5.639 5.857 6.174 6.377 6.57 6.853 7.11 7.34 7.544 7.729 7.984 8.247 8.489 8.772 9.032 9.279 9.578 9.911 10.245 10.627 11.007 11.379 11.767 12.208 12.725 13.224 13.798 14.403 15.014 15.696 16.394 16.87 16.916 16.327 15.567 14.671 13.72 12.819 12.012 11.24 10.542 9.805 9.151 8.574 8.02 7.504 7.038 6.605 6.169 5.802 5.476 5.119 4.732 4.383 4.011 3.63 3.331 3.015 2.675 2.343 2.021 1.802 1.567 1.175 0.903 0.631 0.487 0.178 -0.168 -0.57 -0.786 -1.215 -1.379 -1.61 -1.851 -2.376 -2.673 -3.011 -3.41 -3.884 -4.461 -5.27 -8.269 -4 ,29079 ,TETRA ,17616729,Mon Nov 29 14:12:27 CET,Mon Nov 29 16:11:25 CET,0.0 1.122 1.518 1.802 2.038 2.259 2.466 2.651 2.989 3.151 3.303 3.326 3.689 3.81 4.05 4.285 4.509 4.608 4.802 4.996 5.259 5.433 5.618 5.877 6.102 6.319 6.524 6.722 6.973 7.225 7.47 7.74 8.013 8.275 8.555 8.906 9.26 9.619 10.009 10.405 10.815 11.291 11.814 12.293 12.846 13.41 14.021 14.715 15.383 15.926 16.016 15.461 14.721 13.871 13.033 12.264 11.567 10.886 10.281 9.696 9.172 8.648 8.158 7.715 7.29 6.877 6.433 6.034 5.684 5.327 4.942 4.626 4.317 3.978 3.704 3.42 3.123 2.814 2.488 2.256 2.004 1.605 1.334 1.045 0.893 0.58 0.233 -0.149 -0.347 -0.791 -0.998 -1.238 -1.503 -2.077 -2.364 -2.683 -3.063 -3.485 -4.013 -4.746 -8.385 -5 ,30203 ,TETRA ,17616730,Mon Nov 29 14:13:24 CET,Mon Nov 29 16:13:29 CET,0.0 1.283 1.643 1.948 2.233 2.454 2.653 2.855 3.226 3.411 3.582 3.646 4.042 4.187 4.45 4.7 4.952 5.072 5.295 5.507 5.815 5.999 6.159 6.394 6.615 6.829 7.042 7.243 7.498 7.764 8.051 8.391 8.685 8.97 9.297 9.65 9.984 10.353 10.773 11.205 11.632 12.084 12.589 13.102 13.685 14.316 14.966 15.599 16.293 16.818 16.869 16.326 15.448 14.471 13.508 12.57 11.71 10.889 10.176 9.457 8.849 8.34 7.84 7.342 6.868 6.427 5.98 5.589 5.225 4.837 4.447 4.125 3.786 3.415 3.119 2.811 2.486 2.147 1.78 1.517 1.254 0.847 0.541 0.219 0.059 -0.265 -0.597 -0.947 -1.137 -1.576 -1.784 -2.024 -2.259 -2.786 -3.082 -3.393 -3.794 -4.276 -4.844 -5.597 -8.187 -6 ,30172 ,TETRA ,17616731,Mon Nov 29 14:13:24 CET,Mon Nov 29 16:15:35 CET,0.0 1.472 1.914 2.225 2.491 2.744 2.975 3.194 3.547 3.697 3.837 3.843 4.204 4.33 4.584 4.814 5.017 5.117 5.302 5.483 5.772 5.968 6.127 6.342 6.554 6.753 6.958 7.166 7.431 7.684 7.945 8.258 8.546 8.83 9.158 9.507 9.826 10.182 10.571 10.98 11.377 11.786 12.254 12.741 13.29 13.875 14.507 15.096 15.666 16.143 16.249 15.688 14.849 14.006 13.214 12.421 11.675 10.975 10.334 9.681 9.11 8.576 8.042 7.534 7.08 6.665 6.223 5.789 5.383 4.94 4.485 4.138 3.765 3.344 3.03 2.71 2.343 1.976 1.61 1.352 1.097 0.685 0.383 0.069 -0.092 -0.414 -0.75 -1.11 -1.301 -1.749 -1.963 -2.181 -2.399 -2.914 -3.22 -3.549 -3.911 -4.323 -4.819 -5.582 -8.54 -7 ,27420 ,TETRA ,17616732,Mon Nov 29 14:13:26 CET,Mon Nov 29 16:11:40 CET,0.0 1.075 1.43 1.751 2.04 2.304 2.51 2.683 3.019 3.186 3.34 3.39 3.786 3.917 4.159 4.396 4.611 4.721 4.958 5.2 5.525 5.717 5.899 6.128 6.35 6.569 6.774 6.981 7.232 7.474 7.707 7.977 8.247 8.507 8.791 9.092 9.385 9.693 10.031 10.406 10.769 11.172 11.671 12.156 12.649 13.149 13.717 14.294 14.848 15.279 15.329 14.806 14.001 13.171 12.412 11.655 10.924 10.221 9.575 8.856 8.226 7.688 7.175 6.668 6.106 5.565 5.032 4.52 4.077 3.639 3.178 2.772 2.347 1.919 1.572 1.212 0.865 0.522 0.158 -0.089 -0.335 -0.751 -1.058 -1.369 -1.533 -1.887 -2.246 -2.65 -2.848 -3.285 -3.507 -3.742 -3.982 -4.538 -4.906 -5.304 -5.696 -6.129 -6.627 -7.369 -10.306 -8 ,6004 ,TETRA ,17616733,Mon Nov 29 14:13:23 CET,Mon Nov 29 16:09:10 CET,0.0 1.221 1.725 2.084 2.406 2.69 2.935 3.162 3.557 3.74 3.924 4.049 4.447 4.577 4.813 5.026 5.246 5.355 5.561 5.753 6.046 6.23 6.401 6.644 6.866 7.087 7.306 7.517 7.788 8.051 8.343 8.722 9.042 9.316 9.644 10.012 10.35 10.712 11.075 11.487 11.938 12.433 12.976 13.453 14.009 14.638 15.339 16.025 16.65 17.16 17.36 16.863 16.019 15.124 14.283 13.487 12.727 12.029 11.409 10.739 10.162 9.647 9.141 8.641 8.161 7.71 7.246 6.851 6.493 6.118 5.696 5.313 4.947 4.593 4.319 4.026 3.697 3.353 3.007 2.763 2.504 2.118 1.855 1.573 1.423 1.114 0.783 0.433 0.257 -0.171 -0.291 -0.494 -0.718 -1.218 -1.505 -1.815 -2.177 -2.61 -3.144 -3.797 -6.09 -9 ,27494 ,TETRA ,17616734,Mon Nov 29 14:16:37 CET,Mon Nov 29 16:24:41 CET,0.0 1.656 2.016 2.269 2.515 2.742 2.935 3.131 3.475 3.634 3.803 3.898 4.301 4.453 4.729 4.987 5.247 5.356 5.56 5.762 6.042 6.217 6.385 6.632 6.866 7.079 7.281 7.476 7.733 7.987 8.222 8.517 8.817 9.105 9.437 9.797 10.117 10.429 10.764 11.138 11.546 12.019 12.538 13.02 13.533 14.065 14.659 15.281 15.869 16.338 16.505 15.999 15.206 14.406 13.622 12.816 12.085 11.407 10.763 10.092 9.521 8.999 8.491 8.005 7.529 7.108 6.688 6.304 5.953 5.57 5.179 4.846 4.498 4.155 3.897 3.609 3.293 2.973 2.65 2.42 2.168 1.776 1.499 1.207 1.058 0.757 0.411 0.008 -0.198 -0.628 -0.798 -1.024 -1.255 -1.744 -2.055 -2.408 -2.763 -3.149 -3.59 -4.268 -7.588 -10 ,23931 ,TETRA ,17616735,Mon Nov 29 14:16:37 CET,Mon Nov 29 16:11:24 CET,0.0 1.48 1.917 2.251 2.544 2.78 2.978 3.164 3.517 3.673 3.812 3.87 4.259 4.395 4.659 4.911 5.163 5.278 5.48 5.657 5.917 6.091 6.26 6.517 6.755 6.972 7.186 7.401 7.679 7.938 8.191 8.489 8.753 8.998 9.292 9.614 9.91 10.247 10.584 10.93 11.274 11.645 12.085 12.534 13.055 13.612 14.157 14.704 15.301 15.809 16.051 15.675 14.954 14.127 13.372 12.654 11.989 11.361 10.768 10.129 9.564 9.068 8.568 8.066 7.615 7.199 6.753 6.36 6.007 5.637 5.281 4.972 4.621 4.26 3.998 3.735 3.456 3.152 2.815 2.58 2.323 1.895 1.596 1.282 1.116 0.786 0.454 0.096 -0.105 -0.543 -0.709 -0.94 -1.181 -1.679 -1.953 -2.257 -2.612 -3.04 -3.58 -4.269 -6.594 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt deleted file mode 100644 index 16597d6f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,9903 ,TETRA ,17616737,Mon Nov 29 14:17:39 CET,Mon Nov 29 16:17:17 CET,0.0 2.424 3.009 3.377 3.644 3.886 4.092 4.256 4.55 4.662 4.761 4.793 5.059 5.159 5.342 5.515 5.666 5.734 5.861 5.973 6.152 6.272 6.39 6.571 6.722 6.83 6.939 7.058 7.198 7.338 7.476 7.605 7.723 7.832 7.947 8.021 7.979 7.908 7.786 7.502 7.094 6.582 5.922 5.119 4.022 2.636 0.802 -1.662 -5.167 -10.362 -18.711 -28.212 -35.543 -41.431 -46.254 -50.319 -53.844 -56.956 -59.618 -62.328 -64.61 -66.566 -68.376 -70.04 -71.588 -73.006 -74.475 -75.741 -76.767 -77.824 -78.94 -79.82 -80.713 -81.63 -82.364 -83.15 -83.914 -84.669 -85.459 -86.023 -86.609 -87.471 -88.069 -88.718 -89.055 -89.742 -90.443 -91.169 -91.539 -92.198 -92.724 -93.146 -93.617 -94.765 -95.478 -96.239 -97.042 -98.0 -99.119 -100.702 -109.383 -3 ,13311 ,TETRA ,17616738,Mon Nov 29 14:17:39 CET,Mon Nov 29 16:10:10 CET,0.0 3.822 4.46 4.9 5.266 5.591 5.889 6.127 6.514 6.708 6.869 6.972 7.238 7.34 7.543 7.771 7.994 8.113 8.346 8.52 8.75 8.884 8.995 9.158 9.314 9.455 9.584 9.702 9.865 10.012 10.129 10.274 10.392 10.476 10.573 10.656 10.688 10.69 10.654 10.599 10.519 10.373 10.167 9.935 9.498 8.845 7.843 6.293 3.865 -0.123 -7.163 -16.185 -24.309 -31.467 -37.454 -42.625 -47.011 -50.97 -54.332 -57.518 -60.177 -62.525 -64.622 -66.472 -68.205 -69.872 -71.609 -73.084 -74.341 -75.633 -76.971 -78.053 -79.141 -80.292 -81.185 -82.068 -82.963 -83.887 -84.815 -85.447 -86.113 -87.134 -87.842 -88.556 -88.919 -89.67 -90.434 -91.24 -91.668 -92.375 -93.027 -93.549 -94.075 -95.209 -95.819 -96.46 -97.188 -98.092 -99.178 -100.774 -107.892 -7 ,18522 ,TETRA ,17616742,Mon Nov 29 14:23:46 CET,Mon Nov 29 16:23:20 CET,0.0 3.946 4.701 5.082 5.437 5.768 6.033 6.268 6.648 6.809 6.96 7.081 7.366 7.482 7.669 7.862 8.053 8.134 8.285 8.417 8.595 8.733 8.871 9.045 9.199 9.337 9.489 9.639 9.803 9.922 9.986 10.019 10.044 10.047 10.022 10.035 9.978 9.794 9.574 9.33 8.993 8.506 7.903 7.155 6.09 4.666 2.767 0.302 -3.156 -8.201 -16.238 -25.382 -32.418 -38.065 -42.826 -46.88 -50.311 -53.366 -55.91 -58.417 -60.587 -62.453 -64.171 -65.77 -67.212 -68.49 -69.807 -70.998 -72.031 -73.077 -74.18 -75.099 -76.032 -76.974 -77.688 -78.446 -79.245 -80.023 -80.821 -81.383 -81.951 -82.889 -83.573 -84.267 -84.601 -85.284 -86.038 -86.847 -87.26 -87.953 -88.541 -89.004 -89.531 -90.672 -91.301 -91.969 -92.749 -93.622 -94.714 -96.376 -109.086 -8 ,1956 ,TETRA ,17616743,Mon Nov 29 14:23:45 CET,Mon Nov 29 16:23:09 CET,0.0 2.117 2.54 2.863 3.117 3.316 3.493 3.656 3.971 4.103 4.204 4.254 4.511 4.623 4.832 5.028 5.21 5.291 5.45 5.596 5.821 5.979 6.108 6.286 6.485 6.665 6.822 6.979 7.178 7.346 7.483 7.632 7.778 7.936 8.109 8.191 8.181 8.177 8.172 8.134 7.991 7.738 7.353 6.654 5.536 4.08 2.106 -0.51 -4.33 -9.902 -18.582 -28.248 -35.47 -41.251 -45.973 -49.986 -53.346 -56.267 -58.685 -61.037 -63.005 -64.723 -66.335 -67.773 -69.097 -70.311 -71.55 -72.628 -73.556 -74.589 -75.716 -76.689 -77.724 -78.749 -79.501 -80.254 -81.05 -81.863 -82.72 -83.319 -83.908 -84.815 -85.445 -86.086 -86.431 -87.15 -87.83 -88.547 -88.947 -89.64 -90.334 -90.829 -91.324 -92.465 -93.113 -93.799 -94.517 -95.367 -96.447 -97.807 -108.807 -9 ,32413 ,TETRA ,17616744,Mon Nov 29 14:23:45 CET,Mon Nov 29 16:22:09 CET,0.0 1.776 2.148 2.406 2.626 2.841 3.005 3.146 3.407 3.518 3.619 3.668 3.912 4.001 4.162 4.296 4.427 4.498 4.642 4.785 4.974 5.08 5.191 5.355 5.524 5.694 5.827 5.939 6.077 6.182 6.27 6.378 6.449 6.44 6.362 6.255 6.126 5.969 5.754 5.457 5.094 4.597 3.908 3.09 1.97 0.573 -1.281 -3.789 -7.316 -12.504 -20.818 -30.011 -37.191 -43.071 -47.954 -52.1 -55.547 -58.588 -61.172 -63.633 -65.684 -67.488 -69.111 -70.59 -71.956 -73.185 -74.473 -75.62 -76.557 -77.51 -78.539 -79.418 -80.331 -81.231 -81.915 -82.606 -83.326 -84.086 -84.853 -85.37 -85.907 -86.736 -87.307 -87.908 -88.223 -88.918 -89.627 -90.289 -90.631 -91.259 -91.786 -92.208 -92.666 -93.689 -94.225 -94.834 -95.531 -96.297 -97.196 -98.43 -105.858 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt deleted file mode 100644 index 782bc41f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9771 ,TETRA ,17616746,Mon Nov 29 14:24:47 CET,Mon Nov 29 16:24:18 CET,0.0 3.914 4.48 4.941 5.341 5.675 5.992 6.311 6.868 7.131 7.394 7.734 8.127 8.368 8.838 9.291 9.732 9.932 10.319 10.72 11.313 11.682 12.039 12.59 13.131 13.635 14.125 14.612 15.249 15.869 16.462 17.177 17.867 18.539 19.315 20.152 20.973 21.926 22.965 24.046 25.265 26.636 28.133 29.635 31.311 33.114 35.207 37.475 39.875 42.147 43.825 43.688 42.434 40.935 39.319 37.676 36.118 34.657 33.355 32.08 31.057 30.157 29.302 28.513 27.774 27.087 26.364 25.715 25.162 24.571 23.92 23.401 22.86 22.262 21.803 21.35 20.859 20.329 19.764 19.394 18.986 18.297 17.86 17.434 17.212 16.739 16.222 15.642 15.348 14.88 14.311 13.913 13.485 12.519 11.997 11.409 10.69 9.814 8.843 7.616 0.185 -3 ,8805 ,TETRA ,17616748,Mon Nov 29 14:26:42 CET,Mon Nov 29 16:25:54 CET,0.0 2.26 2.862 3.352 3.774 4.127 4.434 4.748 5.387 5.672 5.929 6.289 6.7 6.951 7.431 7.867 8.277 8.487 8.903 9.312 9.916 10.299 10.67 11.217 11.741 12.254 12.744 13.225 13.856 14.453 15.045 15.76 16.441 17.129 17.924 18.82 19.69 20.621 21.633 22.709 23.874 25.215 26.772 28.315 30.049 31.95 34.11 36.425 38.811 41.0 42.608 42.341 40.906 39.214 37.532 35.849 34.328 33.079 32.044 30.98 30.107 29.326 28.505 27.695 26.976 26.342 25.681 25.08 24.563 24.006 23.389 22.875 22.37 21.895 21.518 21.092 20.663 20.211 19.728 19.399 19.045 18.46 18.029 17.59 17.369 16.888 16.393 15.878 15.595 15.129 14.596 14.207 13.793 12.8 12.229 11.62 10.907 10.073 9.116 7.734 1.295 -4 ,30632 ,TETRA ,17616749,Mon Nov 29 14:26:43 CET,Mon Nov 29 16:25:58 CET,0.0 2.836 3.48 3.992 4.416 4.817 5.185 5.514 6.114 6.384 6.634 6.929 7.294 7.505 7.931 8.355 8.749 8.943 9.326 9.694 10.208 10.521 10.842 11.305 11.749 12.196 12.63 13.05 13.587 14.108 14.612 15.216 15.761 16.275 16.904 17.625 18.302 19.062 19.94 20.828 21.689 22.69 23.837 24.905 26.113 27.352 28.556 29.82 31.158 32.267 32.803 32.204 31.071 30.003 28.995 27.986 27.057 26.166 25.331 24.433 23.661 22.96 22.276 21.639 21.019 20.433 19.779 19.185 18.714 18.235 17.726 17.293 16.801 16.257 15.862 15.469 15.016 14.48 13.905 13.538 13.166 12.622 12.285 11.883 11.639 11.162 10.677 10.142 9.871 9.442 8.998 8.661 8.288 7.436 6.932 6.385 5.788 5.112 4.285 3.04 -2.816 -5 ,29776 ,TETRA ,17616750,Mon Nov 29 14:26:42 CET,Mon Nov 29 16:29:02 CET,0.0 2.917 3.673 4.165 4.56 4.926 5.281 5.591 6.156 6.424 6.698 7.087 7.506 7.753 8.204 8.585 8.947 9.127 9.488 9.846 10.369 10.705 11.022 11.482 11.931 12.356 12.778 13.199 13.737 14.243 14.728 15.34 15.921 16.479 17.142 17.861 18.568 19.367 20.216 21.085 21.998 23.032 24.143 25.078 25.974 26.933 28.061 29.121 30.155 31.213 31.933 31.67 30.859 29.968 29.006 27.907 26.833 25.916 25.141 24.304 23.512 22.757 22.049 21.389 20.753 20.179 19.555 18.986 18.446 17.841 17.213 16.695 16.172 15.618 15.181 14.755 14.315 13.809 13.268 12.914 12.543 11.931 11.516 11.078 10.835 10.334 9.827 9.315 9.051 8.608 8.1 7.734 7.372 6.541 6.049 5.52 4.949 4.285 3.382 2.103 -10.569 -6 ,17648 ,TETRA ,17616751,Mon Nov 29 14:26:42 CET,Mon Nov 29 16:28:06 CET,0.0 3.203 4.119 4.736 5.189 5.574 5.91 6.229 6.804 7.072 7.346 7.703 8.094 8.331 8.798 9.22 9.624 9.821 10.209 10.586 11.098 11.427 11.753 12.245 12.704 13.127 13.533 13.937 14.465 14.965 15.471 16.081 16.664 17.226 17.872 18.618 19.335 20.105 20.96 21.874 22.822 23.896 25.068 26.15 27.402 28.628 29.761 30.97 32.188 33.096 33.416 32.725 31.581 30.393 29.289 28.256 27.292 26.379 25.541 24.678 23.911 23.219 22.507 21.821 21.178 20.576 19.986 19.431 18.912 18.351 17.801 17.371 16.912 16.389 15.956 15.508 14.996 14.44 13.9 13.535 13.173 12.625 12.222 11.759 11.506 11.019 10.509 9.965 9.676 9.216 8.733 8.412 8.075 7.296 6.795 6.169 5.504 4.749 3.803 2.504 -7.583 -8 ,23787 ,TETRA ,17616753,Mon Nov 29 14:26:43 CET,Mon Nov 29 16:26:03 CET,0.0 2.21 2.897 3.388 3.807 4.197 4.547 4.887 5.498 5.764 6.023 6.344 6.726 6.953 7.424 7.862 8.243 8.429 8.791 9.137 9.648 9.991 10.335 10.839 11.322 11.773 12.194 12.612 13.149 13.652 14.146 14.757 15.339 15.875 16.531 17.279 17.96 18.715 19.588 20.477 21.342 22.35 23.471 24.521 25.698 26.952 28.255 29.536 30.711 31.725 32.381 31.948 30.963 29.815 28.716 27.686 26.713 25.815 25.017 24.187 23.461 22.764 22.058 21.433 20.866 20.346 19.777 19.189 18.623 18.02 17.461 16.979 16.47 15.96 15.554 15.14 14.696 14.244 13.769 13.401 13.012 12.45 12.046 11.592 11.372 10.955 10.491 9.945 9.64 9.169 8.627 8.253 7.879 7.092 6.635 6.121 5.5 4.775 3.829 2.476 -4.201 -9 ,29437 ,TETRA ,17616754,Mon Nov 29 14:28:41 CET,Mon Nov 29 16:29:08 CET,0.0 5.79 6.411 6.903 7.335 7.697 8.026 8.333 8.867 9.113 9.351 9.663 10.037 10.258 10.687 11.095 11.457 11.63 11.974 12.316 12.83 13.156 13.463 13.918 14.338 14.722 15.104 15.474 15.953 16.426 16.884 17.429 17.943 18.482 19.121 19.797 20.45 21.16 21.905 22.672 23.467 24.334 25.25 26.094 27.038 28.112 29.329 30.566 31.866 33.161 34.086 33.936 33.218 32.273 31.317 30.362 29.509 28.742 28.027 27.218 26.505 25.859 25.233 24.628 23.996 23.395 22.727 22.104 21.592 21.054 20.489 20.005 19.486 18.985 18.605 18.186 17.739 17.247 16.704 16.323 15.926 15.326 14.907 14.493 14.298 13.868 13.413 12.922 12.646 12.218 11.791 11.484 11.153 10.429 9.999 9.555 9.062 8.433 7.64 6.537 -2.465 -10 ,2946 ,TETRA ,17616755,Mon Nov 29 14:28:42 CET,Mon Nov 29 16:31:44 CET,0.0 3.501 4.221 4.757 5.17 5.504 5.828 6.163 6.767 7.025 7.287 7.635 8.036 8.249 8.653 9.059 9.456 9.653 10.004 10.354 10.886 11.23 11.567 12.051 12.516 12.954 13.372 13.797 14.349 14.891 15.427 16.058 16.645 17.197 17.833 18.558 19.28 20.078 20.903 21.726 22.581 23.545 24.687 25.812 27.003 28.246 29.533 30.676 31.869 32.969 33.305 32.657 31.642 30.631 29.608 28.52 27.496 26.529 25.672 24.791 23.995 23.278 22.592 21.925 21.298 20.744 20.129 19.516 18.97 18.393 17.799 17.355 16.903 16.348 15.922 15.525 15.102 14.662 14.173 13.825 13.476 12.921 12.511 12.049 11.811 11.338 10.848 10.293 9.985 9.507 8.918 8.508 8.099 7.242 6.756 6.202 5.595 4.835 3.843 2.477 -7.833 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 881586bd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13179 ,KEBNE ,17027875,Wed Dec 22 18:38:08 CET,Wed Dec 22 20:19:04 CET,0.0 1.241 1.523 1.733 1.903 2.042 2.124 2.179 2.293 2.327 2.328 2.159 2.301 2.302 2.268 2.192 2.106 2.063 1.967 1.866 1.724 1.619 1.502 1.328 1.145 0.951 0.745 0.537 0.239 -0.079 -0.394 -0.799 -1.225 -1.659 -2.201 -2.839 -3.466 -4.207 -5.095 -6.13 -7.271 -8.624 -10.334 -12.219 -14.595 -17.502 -21.158 -25.762 -31.998 -40.559 -53.272 -66.739 -76.754 -84.609 -90.91 -96.236 -100.623 -104.371 -107.471 -110.446 -112.891 -114.978 -116.9 -118.655 -120.24 -121.655 -123.096 -124.334 -125.369 -126.427 -127.507 -128.391 -129.294 -130.201 -130.878 -131.574 -132.293 -133.027 -133.759 -134.258 -134.775 -135.549 -136.06 -136.591 -136.868 -137.43 -138.013 -138.603 -138.885 -139.498 -139.811 -140.128 -140.451 -141.133 -141.493 -141.882 -142.303 -142.759 -143.266 -143.898 -146.152 -2 ,31372 ,KEBNE ,17027876,Wed Dec 22 18:38:12 CET,Wed Dec 22 20:15:03 CET,0.0 1.675 2.066 2.283 2.438 2.567 2.649 2.708 2.786 2.815 2.835 2.679 2.843 2.844 2.821 2.78 2.735 2.71 2.648 2.577 2.46 2.372 2.275 2.121 1.955 1.781 1.602 1.416 1.14 0.85 0.556 0.168 -0.245 -0.68 -1.218 -1.849 -2.487 -3.248 -4.11 -5.061 -6.142 -7.437 -9.065 -10.865 -13.118 -15.916 -19.543 -24.097 -30.197 -38.559 -51.005 -64.184 -74.003 -81.731 -87.911 -93.182 -97.56 -101.273 -104.32 -107.231 -109.633 -111.737 -113.677 -115.452 -117.043 -118.435 -119.859 -121.108 -122.185 -123.284 -124.375 -125.254 -126.145 -127.035 -127.722 -128.434 -129.174 -129.931 -130.683 -131.212 -131.756 -132.54 -133.051 -133.566 -133.83 -134.359 -134.911 -135.495 -135.805 -136.448 -136.768 -137.093 -137.433 -138.178 -138.57 -138.972 -139.413 -139.917 -140.511 -141.241 -143.359 -3 ,10739 ,KEBNE ,17027877,Wed Dec 22 18:38:16 CET,Wed Dec 22 20:15:11 CET,0.0 1.44 1.806 1.986 2.136 2.232 2.304 2.35 2.381 2.384 2.376 2.182 2.325 2.315 2.268 2.21 2.141 2.107 2.031 1.941 1.802 1.71 1.616 1.459 1.29 1.112 0.923 0.732 0.481 0.216 -0.059 -0.393 -0.743 -1.133 -1.61 -2.167 -2.78 -3.544 -4.413 -5.41 -6.542 -7.903 -9.608 -11.432 -13.756 -16.677 -20.373 -24.957 -31.164 -39.745 -52.379 -65.87 -75.819 -83.625 -89.938 -95.214 -99.541 -103.248 -106.329 -109.273 -111.711 -113.842 -115.788 -117.564 -119.175 -120.598 -122.052 -123.294 -124.346 -125.447 -126.567 -127.48 -128.406 -129.327 -130.013 -130.707 -131.423 -132.14 -132.858 -133.352 -133.861 -134.652 -135.193 -135.736 -136.015 -136.592 -137.172 -137.749 -138.041 -138.665 -138.971 -139.303 -139.652 -140.409 -140.798 -141.216 -141.668 -142.134 -142.662 -143.386 -145.501 -4 ,25709 ,KEBNE ,17027878,Wed Dec 22 18:38:13 CET,Wed Dec 22 20:15:04 CET,0.0 1.571 1.828 2.031 2.176 2.272 2.345 2.405 2.496 2.521 2.546 2.418 2.576 2.574 2.546 2.504 2.458 2.431 2.366 2.29 2.185 2.106 2.014 1.865 1.695 1.5 1.311 1.127 0.856 0.567 0.265 -0.112 -0.487 -0.879 -1.369 -1.95 -2.547 -3.268 -4.13 -5.11 -6.209 -7.565 -9.276 -11.134 -13.459 -16.289 -19.963 -24.559 -30.754 -39.399 -52.276 -65.98 -75.996 -83.724 -89.959 -95.208 -99.54 -103.241 -106.279 -109.222 -111.692 -113.8 -115.725 -117.487 -119.066 -120.481 -121.923 -123.173 -124.231 -125.306 -126.392 -127.259 -128.148 -129.055 -129.745 -130.453 -131.175 -131.891 -132.604 -133.117 -133.648 -134.43 -134.946 -135.461 -135.722 -136.26 -136.842 -137.463 -137.772 -138.394 -138.686 -139.004 -139.337 -140.061 -140.482 -140.94 -141.397 -141.879 -142.427 -143.096 -145.005 -5 ,27348 ,KEBNE ,17027879,Wed Dec 22 18:38:13 CET,Wed Dec 22 20:14:42 CET,0.0 1.2 1.515 1.751 1.893 1.989 2.075 2.128 2.172 2.191 2.205 2.064 2.213 2.205 2.187 2.153 2.107 2.072 1.989 1.909 1.76 1.647 1.534 1.369 1.192 1.001 0.788 0.57 0.296 0.003 -0.304 -0.689 -1.077 -1.48 -1.981 -2.592 -3.226 -3.962 -4.806 -5.747 -6.813 -8.145 -9.817 -11.599 -13.858 -16.653 -20.246 -24.779 -30.85 -39.122 -51.44 -64.614 -74.366 -82.062 -88.256 -93.466 -97.765 -101.472 -104.561 -107.492 -109.937 -112.05 -113.983 -115.753 -117.35 -118.782 -120.235 -121.49 -122.561 -123.646 -124.724 -125.6 -126.507 -127.42 -128.128 -128.856 -129.573 -130.296 -131.031 -131.536 -132.062 -132.865 -133.389 -133.916 -134.186 -134.749 -135.345 -135.956 -136.269 -136.903 -137.223 -137.555 -137.9 -138.652 -139.048 -139.46 -139.898 -140.392 -140.934 -141.6 -143.572 -6 ,12120 ,KEBNE ,17027880,Wed Dec 22 18:38:13 CET,Wed Dec 22 20:16:30 CET,0.0 1.319 1.594 1.755 1.854 1.917 2.009 2.104 2.207 2.248 2.28 2.145 2.292 2.283 2.257 2.221 2.175 2.156 2.125 2.067 1.958 1.86 1.749 1.578 1.388 1.178 0.955 0.731 0.441 0.142 -0.163 -0.53 -0.901 -1.304 -1.822 -2.431 -3.036 -3.743 -4.545 -5.469 -6.54 -7.85 -9.542 -11.384 -13.739 -16.612 -20.256 -24.847 -30.914 -39.268 -51.653 -64.781 -74.654 -82.403 -88.598 -93.856 -98.178 -101.841 -104.846 -107.728 -110.102 -112.148 -114.061 -115.789 -117.337 -118.744 -120.199 -121.457 -122.515 -123.581 -124.655 -125.543 -126.45 -127.391 -128.108 -128.815 -129.55 -130.293 -131.039 -131.547 -132.068 -132.893 -133.46 -134.043 -134.336 -134.929 -135.544 -136.177 -136.488 -137.108 -137.442 -137.787 -138.153 -138.919 -139.316 -139.724 -140.176 -140.682 -141.182 -141.806 -144.064 -7 ,21348 ,KEBNE ,17027881,Wed Dec 22 18:38:09 CET,Wed Dec 22 20:18:35 CET,0.0 1.388 1.652 1.804 1.939 2.083 2.194 2.256 2.364 2.388 2.389 2.218 2.369 2.362 2.336 2.294 2.247 2.222 2.149 2.061 1.919 1.814 1.702 1.538 1.381 1.217 1.045 0.86 0.569 0.272 -0.037 -0.441 -0.845 -1.271 -1.796 -2.413 -3.019 -3.715 -4.532 -5.501 -6.606 -7.954 -9.641 -11.43 -13.732 -16.565 -20.189 -24.808 -31.006 -39.543 -52.206 -65.617 -75.521 -83.374 -89.673 -94.928 -99.268 -103.017 -106.15 -109.149 -111.624 -113.734 -115.651 -117.398 -118.986 -120.393 -121.813 -123.039 -124.085 -125.182 -126.295 -127.177 -128.084 -129.022 -129.747 -130.475 -131.21 -131.96 -132.682 -133.158 -133.666 -134.491 -135.046 -135.592 -135.872 -136.446 -137.027 -137.618 -137.925 -138.548 -138.87 -139.211 -139.544 -140.266 -140.657 -141.045 -141.465 -141.936 -142.466 -143.107 -145.093 -8 ,3024 ,KEBNE ,17027882,Wed Dec 22 18:38:11 CET,Wed Dec 22 20:18:50 CET,0.0 1.45 1.688 1.806 1.902 1.99 2.074 2.126 2.163 2.177 2.203 2.072 2.231 2.236 2.225 2.179 2.127 2.098 2.032 1.955 1.822 1.73 1.634 1.485 1.308 1.107 0.885 0.677 0.417 0.137 -0.164 -0.561 -0.972 -1.378 -1.852 -2.421 -3.034 -3.774 -4.652 -5.667 -6.79 -8.134 -9.821 -11.649 -13.938 -16.77 -20.466 -25.173 -31.488 -40.072 -52.638 -65.946 -75.865 -83.6 -89.787 -94.97 -99.261 -102.983 -106.072 -109.03 -111.477 -113.556 -115.448 -117.158 -118.708 -120.147 -121.625 -122.874 -123.907 -124.954 -126.004 -126.851 -127.728 -128.623 -129.302 -129.995 -130.697 -131.403 -132.12 -132.621 -133.153 -133.978 -134.531 -135.092 -135.371 -135.926 -136.511 -137.135 -137.445 -138.073 -138.41 -138.761 -139.116 -139.854 -140.255 -140.683 -141.129 -141.634 -142.206 -142.839 -144.752 -9 ,16695 ,KEBNE ,17027883,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:20:49 CET,0.0 1.342 1.746 1.981 2.133 2.223 2.278 2.314 2.355 2.379 2.399 2.284 2.458 2.451 2.437 2.4 2.341 2.312 2.257 2.187 2.072 2.0 1.918 1.765 1.6 1.429 1.228 1.003 0.694 0.392 0.085 -0.304 -0.706 -1.12 -1.598 -2.179 -2.793 -3.51 -4.351 -5.306 -6.407 -7.745 -9.403 -11.201 -13.479 -16.329 -20.021 -24.695 -30.912 -39.449 -52.254 -65.811 -75.843 -83.712 -90.052 -95.391 -99.801 -103.618 -106.773 -109.811 -112.295 -114.433 -116.427 -118.209 -119.814 -121.261 -122.759 -124.074 -125.152 -126.229 -127.339 -128.234 -129.128 -130.023 -130.717 -131.421 -132.134 -132.863 -133.609 -134.127 -134.645 -135.431 -135.97 -136.498 -136.764 -137.319 -137.882 -138.452 -138.744 -139.385 -139.757 -140.085 -140.421 -141.175 -141.573 -142.005 -142.506 -143.058 -143.608 -144.23 -146.193 -10 ,4704 ,KEBNE ,17027884,Wed Dec 22 18:38:08 CET,Wed Dec 22 20:18:44 CET,0.0 1.931 2.284 2.539 2.743 2.894 3.005 3.085 3.178 3.205 3.219 3.074 3.234 3.233 3.206 3.162 3.118 3.095 3.03 2.954 2.824 2.73 2.633 2.481 2.315 2.131 1.954 1.774 1.517 1.269 1.011 0.669 0.321 -0.032 -0.481 -1.047 -1.624 -2.288 -3.089 -4.066 -5.176 -6.521 -8.241 -10.127 -12.531 -15.449 -19.109 -23.791 -30.064 -38.716 -51.608 -65.146 -75.14 -82.927 -89.201 -94.417 -98.641 -102.26 -105.324 -108.265 -110.675 -112.775 -114.698 -116.442 -118.033 -119.434 -120.832 -122.052 -123.081 -124.109 -125.141 -125.98 -126.844 -127.758 -128.454 -129.151 -129.868 -130.588 -131.313 -131.81 -132.327 -133.092 -133.607 -134.136 -134.401 -134.967 -135.529 -136.11 -136.417 -137.039 -137.368 -137.726 -138.078 -138.744 -139.117 -139.526 -139.958 -140.413 -140.908 -141.585 -143.687 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 61de3a50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3216 ,TETRA ,17616756,Mon Nov 29 14:29:45 CET,Mon Nov 29 16:27:02 CET,0.0 0.186 0.384 0.572 0.768 0.984 1.17 1.486 1.632 1.776 1.924 2.207 2.332 2.572 2.813 3.039 3.149 3.378 3.607 3.945 4.159 4.356 4.648 4.952 5.234 5.495 5.762 6.126 6.497 6.876 7.343 7.812 8.283 8.816 9.43 10.059 10.741 11.465 12.27 13.076 13.921 14.953 16.079 17.461 18.976 20.711 22.611 24.789 27.129 29.208 30.246 30.332 29.892 29.335 28.649 27.906 27.204 26.475 25.697 25.036 24.39 23.721 23.053 22.45 21.916 21.362 20.873 20.465 20.039 19.58 19.208 18.817 18.396 18.091 17.779 17.433 17.072 16.685 16.415 16.12 15.63 15.295 14.981 14.829 14.507 14.166 13.781 13.559 13.205 12.874 12.604 12.331 11.746 11.395 10.99 10.573 10.107 9.469 8.5 -2 ,20633 ,TETRA ,17616757,Mon Nov 29 14:31:43 CET,Mon Nov 29 16:26:15 CET,0.0 0.184 0.348 0.498 0.639 0.77 0.9 1.153 1.278 1.404 1.478 1.759 1.883 2.124 2.359 2.599 2.713 2.93 3.14 3.45 3.65 3.852 4.161 4.454 4.748 5.052 5.355 5.75 6.135 6.507 6.968 7.435 7.91 8.487 9.127 9.74 10.433 11.183 11.976 12.843 13.804 14.834 15.848 17.066 18.473 20.167 22.039 24.013 26.075 28.123 29.233 29.379 29.014 28.384 27.653 26.873 26.04 25.281 24.54 23.889 23.295 22.717 22.149 21.62 21.136 20.62 20.154 19.729 19.264 18.77 18.375 17.98 17.571 17.25 16.914 16.568 16.199 15.799 15.53 15.26 14.85 14.575 14.285 14.133 13.815 13.462 13.057 12.853 12.523 12.227 11.957 11.649 10.946 10.543 10.066 9.5 8.911 8.174 7.019 -3 ,389 ,TETRA ,17616758,Mon Nov 29 14:31:43 CET,Mon Nov 29 16:30:21 CET,0.0 0.225 0.417 0.609 0.782 0.949 1.118 1.451 1.61 1.761 1.889 2.189 2.331 2.611 2.874 3.137 3.263 3.507 3.751 4.129 4.374 4.609 4.952 5.276 5.602 5.927 6.243 6.665 7.086 7.502 8.028 8.533 9.01 9.578 10.232 10.842 11.496 12.211 12.954 13.734 14.649 15.737 16.869 18.185 19.6 21.219 23.14 25.47 27.809 29.776 30.729 30.79 30.399 29.749 29.102 28.52 27.841 27.156 26.448 25.791 25.169 24.544 23.944 23.399 22.876 22.316 21.853 21.448 21.01 20.544 20.136 19.707 19.279 18.954 18.6 18.239 17.863 17.477 17.207 16.918 16.486 16.171 15.812 15.632 15.277 14.901 14.476 14.228 13.842 13.516 13.249 12.945 12.324 11.99 11.623 11.178 10.526 9.589 8.383 -4 ,5174 ,TETRA ,17616759,Mon Nov 29 14:32:41 CET,Mon Nov 29 16:24:25 CET,0.0 0.166 0.313 0.456 0.611 0.762 0.896 1.17 1.307 1.441 1.533 1.816 1.933 2.161 2.39 2.622 2.74 2.963 3.177 3.492 3.696 3.902 4.207 4.506 4.803 5.094 5.388 5.788 6.158 6.499 6.912 7.322 7.718 8.193 8.776 9.339 9.976 10.735 11.528 12.329 13.253 14.371 15.566 16.896 18.325 20.061 21.968 23.999 26.078 28.148 29.311 29.446 29.207 28.71 28.048 27.415 26.768 26.126 25.428 24.816 24.236 23.669 23.114 22.574 22.088 21.547 21.064 20.627 20.163 19.681 19.262 18.839 18.402 18.066 17.72 17.343 16.924 16.503 16.23 15.949 15.495 15.17 14.808 14.621 14.256 13.865 13.426 13.199 12.808 12.418 12.154 11.862 11.226 10.89 10.521 10.033 9.364 8.554 7.282 -5 ,12628 ,TETRA ,17616760,Mon Nov 29 14:32:42 CET,Mon Nov 29 16:28:41 CET,0.0 0.172 0.331 0.485 0.629 0.77 0.908 1.173 1.304 1.43 1.5 1.78 1.892 2.115 2.341 2.576 2.695 2.927 3.153 3.48 3.699 3.925 4.245 4.547 4.853 5.165 5.479 5.888 6.274 6.642 7.094 7.546 7.999 8.543 9.149 9.767 10.493 11.22 11.939 12.728 13.625 14.646 15.679 16.91 18.278 19.841 21.579 23.504 25.524 27.437 28.314 28.104 27.553 26.784 25.871 25.036 24.235 23.43 22.562 21.85 21.211 20.565 19.971 19.439 18.953 18.432 17.954 17.541 17.126 16.688 16.287 15.861 15.428 15.105 14.782 14.452 14.107 13.719 13.44 13.162 12.701 12.364 12.007 11.813 11.435 11.051 10.632 10.399 10.01 9.606 9.335 9.05 8.363 7.999 7.592 7.123 6.592 5.913 4.886 -6 ,2892 ,TETRA ,17616761,Mon Nov 29 14:34:42 CET,Mon Nov 29 16:31:20 CET,0.0 0.178 0.349 0.504 0.659 0.81 0.963 1.264 1.417 1.573 1.705 2.008 2.145 2.42 2.684 2.921 3.036 3.279 3.527 3.884 4.099 4.303 4.604 4.896 5.193 5.501 5.806 6.2 6.59 6.982 7.466 7.935 8.388 8.925 9.543 10.131 10.782 11.511 12.318 13.175 14.142 15.269 16.399 17.717 19.219 20.973 22.852 24.879 27.098 29.247 30.315 30.49 30.25 29.845 29.252 28.536 27.787 27.124 26.427 25.756 25.088 24.408 23.77 23.178 22.645 22.085 21.583 21.149 20.654 20.124 19.69 19.252 18.835 18.501 18.15 17.81 17.453 17.063 16.797 16.522 16.058 15.727 15.402 15.238 14.896 14.555 14.173 13.957 13.59 13.244 12.99 12.706 12.063 11.695 11.299 10.9 10.392 9.685 8.667 -7 ,22920 ,TETRA ,17616762,Mon Nov 29 14:34:42 CET,Mon Nov 29 16:29:49 CET,0.0 0.202 0.38 0.539 0.675 0.801 0.932 1.195 1.321 1.446 1.521 1.803 1.919 2.169 2.411 2.633 2.743 2.954 3.163 3.498 3.715 3.919 4.225 4.536 4.843 5.147 5.456 5.855 6.239 6.622 7.089 7.558 8.051 8.638 9.291 9.896 10.566 11.344 12.193 13.04 13.96 15.068 16.189 17.455 18.855 20.527 22.379 24.435 26.736 28.798 29.792 29.873 29.409 28.802 28.148 27.493 26.833 26.201 25.529 24.926 24.355 23.764 23.19 22.665 22.18 21.681 21.227 20.809 20.371 19.94 19.564 19.166 18.782 18.439 18.056 17.696 17.33 16.93 16.639 16.336 15.879 15.557 15.215 15.049 14.686 14.274 13.832 13.605 13.228 12.856 12.592 12.31 11.659 11.304 10.913 10.473 9.911 9.204 8.205 -8 ,26010 ,TETRA ,17616763,Mon Nov 29 14:34:45 CET,Mon Nov 29 16:29:40 CET,0.0 0.181 0.357 0.508 0.649 0.791 0.932 1.196 1.319 1.44 1.521 1.802 1.921 2.146 2.361 2.563 2.666 2.878 3.076 3.356 3.549 3.744 4.022 4.296 4.575 4.857 5.134 5.491 5.847 6.206 6.651 7.095 7.529 8.037 8.623 9.218 9.872 10.569 11.353 12.189 13.13 14.255 15.397 16.643 17.939 19.449 21.145 23.067 25.299 27.56 28.688 28.89 28.693 28.303 27.698 27.045 26.376 25.725 25.036 24.331 23.657 23.042 22.469 21.924 21.417 20.887 20.4 19.963 19.531 19.104 18.725 18.301 17.869 17.564 17.264 16.932 16.543 16.165 15.91 15.635 15.192 14.854 14.5 14.326 13.968 13.586 13.183 12.958 12.581 12.224 11.935 11.641 11.041 10.702 10.324 9.821 9.251 8.628 7.586 -9 ,4843 ,TETRA ,17616764,Mon Nov 29 14:35:45 CET,Mon Nov 29 16:32:32 CET,0.0 0.245 0.443 0.625 0.805 0.974 1.133 1.435 1.58 1.723 1.837 2.125 2.261 2.535 2.79 3.031 3.155 3.397 3.624 3.952 4.174 4.397 4.717 5.024 5.323 5.62 5.918 6.302 6.681 7.065 7.53 7.982 8.422 8.935 9.518 10.083 10.729 11.435 12.208 13.077 14.073 15.193 16.304 17.631 19.156 20.879 22.699 24.729 26.932 29.155 30.074 29.99 29.527 28.819 27.988 27.168 26.393 25.721 25.025 24.397 23.806 23.221 22.651 22.124 21.599 20.991 20.462 20.001 19.508 18.998 18.582 18.142 17.643 17.267 16.905 16.53 16.169 15.794 15.499 15.177 14.685 14.349 13.978 13.777 13.388 12.986 12.542 12.29 11.886 11.486 11.2 10.906 10.228 9.856 9.429 8.853 8.224 7.556 6.558 -10 ,28605 ,TETRA ,17616765,Mon Nov 29 14:37:43 CET,Mon Nov 29 16:33:15 CET,0.0 0.223 0.409 0.557 0.695 0.832 0.969 1.248 1.389 1.522 1.602 1.881 1.991 2.207 2.424 2.639 2.746 2.959 3.166 3.474 3.679 3.881 4.173 4.459 4.74 5.02 5.308 5.693 6.07 6.47 6.988 7.467 7.928 8.468 9.067 9.636 10.266 10.974 11.703 12.428 13.248 14.222 15.209 16.352 17.658 19.271 21.053 23.003 25.129 27.083 28.044 28.015 27.321 26.426 25.579 24.812 24.041 23.268 22.414 21.67 21.0 20.374 19.775 19.16 18.583 17.977 17.436 16.963 16.478 15.966 15.543 15.114 14.671 14.337 13.994 13.625 13.226 12.84 12.575 12.283 11.831 11.516 11.176 11.0 10.637 10.259 9.868 9.656 9.289 8.956 8.684 8.393 7.736 7.37 6.961 6.419 5.676 4.715 3.601 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836.txt deleted file mode 100644 index 26dbfd0f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4234 ,KEBNE ,17027885,Wed Dec 22 18:38:08 CET,Wed Dec 22 20:18:32 CET,0.0 1.344 1.986 2.533 3.028 3.492 3.924 4.326 5.107 5.486 5.869 6.347 7.052 7.414 8.109 8.798 9.48 9.815 10.46 11.095 12.047 12.673 13.288 14.21 15.123 16.027 16.928 17.82 19.005 20.163 21.298 22.726 24.178 25.631 27.359 29.33 31.28 33.487 35.928 38.601 41.523 44.947 49.121 53.507 58.812 65.017 72.528 81.516 92.737 106.956 126.018 143.842 155.629 163.867 169.957 174.744 178.426 181.395 183.748 185.883 187.477 188.76 189.892 190.853 191.644 192.332 193.007 193.535 193.961 194.394 194.78 195.067 195.371 195.655 195.864 196.048 196.188 196.327 196.468 196.562 196.647 196.739 196.777 196.805 196.814 196.826 196.81 196.737 196.698 196.545 196.45 196.358 196.264 196.003 195.832 195.655 195.416 195.073 194.532 193.731 190.359 -2 ,4882 ,KEBNE ,17027886,Wed Dec 22 18:38:09 CET,Wed Dec 22 20:17:49 CET,0.0 1.063 1.583 2.081 2.548 2.978 3.371 3.754 4.512 4.88 5.241 5.63 6.309 6.663 7.344 8.011 8.676 9.007 9.678 10.339 11.305 11.947 12.583 13.524 14.449 15.356 16.259 17.166 18.36 19.527 20.687 22.123 23.544 24.957 26.627 28.574 30.475 32.625 35.094 37.817 40.759 44.182 48.343 52.692 57.939 63.987 71.297 79.963 90.76 104.554 123.037 140.478 152.062 160.353 166.452 171.231 174.94 177.903 180.195 182.307 183.981 185.292 186.372 187.331 188.166 188.864 189.541 190.102 190.552 190.988 191.394 191.702 192.01 192.324 192.549 192.73 192.871 192.993 193.113 193.181 193.244 193.344 193.398 193.455 193.472 193.463 193.447 193.421 193.395 193.26 193.25 193.184 193.114 192.926 192.78 192.597 192.365 192.084 191.696 191.226 188.129 -3 ,28336 ,KEBNE ,17027887,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:17:55 CET,0.0 1.033 1.626 2.128 2.617 3.061 3.476 3.874 4.631 5.006 5.393 5.835 6.515 6.854 7.525 8.194 8.869 9.199 9.859 10.518 11.481 12.111 12.728 13.663 14.592 15.504 16.423 17.325 18.516 19.723 20.907 22.357 23.79 25.194 26.879 28.833 30.778 33.006 35.469 38.147 41.085 44.547 48.714 53.069 58.37 64.542 72.126 81.283 92.698 106.978 125.731 143.419 155.123 163.218 169.19 173.94 177.597 180.57 182.942 185.13 186.879 188.306 189.58 190.727 191.703 192.506 193.263 193.898 194.393 194.848 195.301 195.661 196.01 196.343 196.589 196.819 197.026 197.225 197.398 197.498 197.585 197.707 197.797 197.888 197.919 197.949 197.962 197.925 197.905 197.808 197.827 197.778 197.712 197.485 197.371 197.179 196.916 196.655 196.295 195.57 190.462 -5 ,5289 ,KEBNE ,17027889,Wed Dec 22 18:38:10 CET,Wed Dec 22 20:17:33 CET,0.0 1.075 1.702 2.227 2.718 3.176 3.614 4.046 4.879 5.271 5.646 6.044 6.747 7.125 7.859 8.57 9.273 9.628 10.328 11.002 11.982 12.617 13.235 14.144 15.051 15.962 16.863 17.772 18.99 20.224 21.454 22.919 24.351 25.767 27.45 29.409 31.341 33.526 35.925 38.565 41.48 44.896 49.041 53.345 58.605 64.742 72.122 80.847 91.612 105.377 123.933 141.107 152.397 160.369 166.249 170.916 174.561 177.525 179.832 181.805 183.387 184.784 186.023 187.072 187.979 188.785 189.554 190.171 190.684 191.191 191.664 192.022 192.385 192.74 192.987 193.214 193.418 193.601 193.78 193.892 193.994 194.147 194.223 194.267 194.289 194.342 194.351 194.306 194.266 194.12 194.077 194.008 193.917 193.649 193.49 193.291 193.06 192.713 192.102 191.127 186.036 -7 ,21258 ,KEBNE ,17027891,Wed Dec 22 18:39:11 CET,Wed Dec 22 20:20:17 CET,0.0 2.133 2.789 3.298 3.765 4.197 4.59 4.976 5.749 6.13 6.503 6.902 7.583 7.946 8.665 9.362 10.045 10.396 11.117 11.827 12.864 13.54 14.195 15.161 16.117 17.046 17.965 18.891 20.134 21.356 22.542 24.009 25.464 26.915 28.631 30.59 32.517 34.717 37.185 39.888 42.82 46.199 50.27 54.523 59.719 65.858 73.231 81.994 93.009 106.833 125.218 142.551 154.005 162.201 168.342 173.197 176.923 179.933 182.298 184.416 186.0 187.244 188.345 189.323 190.198 190.98 191.768 192.443 192.97 193.458 193.948 194.341 194.711 195.022 195.219 195.393 195.536 195.68 195.822 195.901 195.968 196.082 196.158 196.213 196.233 196.25 196.261 196.252 196.228 196.091 196.082 196.015 195.934 195.695 195.552 195.43 195.243 194.939 194.565 193.991 189.545 -8 ,25840 ,KEBNE ,17027892,Wed Dec 22 18:39:11 CET,Wed Dec 22 20:18:00 CET,0.0 1.376 2.001 2.524 3.025 3.483 3.903 4.291 5.045 5.424 5.81 6.224 6.889 7.23 7.913 8.584 9.242 9.566 10.207 10.834 11.754 12.357 12.967 13.885 14.774 15.648 16.524 17.404 18.589 19.761 20.904 22.333 23.76 25.17 26.852 28.801 30.728 32.919 35.408 38.148 41.103 44.519 48.611 52.875 58.145 64.403 71.993 81.11 92.459 106.95 126.44 144.245 155.819 163.981 170.048 174.812 178.447 181.369 183.668 185.76 187.394 188.732 189.908 190.95 191.875 192.678 193.444 194.065 194.576 195.06 195.522 195.881 196.218 196.501 196.668 196.818 196.962 197.094 197.217 197.293 197.353 197.417 197.455 197.483 197.486 197.473 197.437 197.378 197.342 197.204 197.172 197.091 196.997 196.698 196.489 196.23 195.913 195.478 194.914 194.064 189.424 -9 ,4908 ,KEBNE ,17027893,Wed Dec 22 18:39:15 CET,Wed Dec 22 20:17:17 CET,0.0 1.324 1.925 2.431 2.902 3.34 3.738 4.113 4.851 5.234 5.611 5.986 6.655 7.015 7.705 8.371 9.04 9.37 10.022 10.684 11.663 12.289 12.909 13.847 14.774 15.692 16.594 17.482 18.668 19.85 21.035 22.498 23.943 25.381 27.063 28.998 30.942 33.137 35.569 38.264 41.201 44.631 48.806 53.165 58.43 64.628 72.154 81.11 92.342 106.728 126.175 144.022 155.529 163.67 169.673 174.283 177.799 180.659 182.907 184.951 186.565 187.878 189.032 190.036 190.889 191.652 192.412 193.022 193.514 194.0 194.452 194.794 195.119 195.406 195.625 195.824 195.989 196.149 196.287 196.376 196.47 196.565 196.614 196.671 196.693 196.71 196.706 196.67 196.633 196.488 196.461 196.391 196.295 196.064 195.929 195.756 195.487 195.155 194.694 193.974 190.56 -10 ,12231 ,KEBNE ,17027894,Wed Dec 22 18:39:11 CET,Wed Dec 22 20:17:54 CET,0.0 1.428 1.99 2.478 2.944 3.392 3.819 4.226 5.002 5.363 5.724 6.133 6.806 7.139 7.797 8.459 9.106 9.429 10.09 10.746 11.708 12.337 12.973 13.935 14.878 15.801 16.727 17.654 18.862 20.052 21.235 22.692 24.117 25.517 27.193 29.122 31.033 33.208 35.634 38.289 41.175 44.589 48.68 52.993 58.326 64.475 71.87 80.661 91.708 105.813 124.592 142.287 154.026 162.371 168.562 173.435 177.201 180.224 182.571 184.737 186.446 187.826 189.045 190.088 190.999 191.8 192.559 193.173 193.669 194.15 194.63 195.003 195.343 195.668 195.882 196.084 196.281 196.462 196.633 196.733 196.828 196.952 197.024 197.085 197.098 197.109 197.112 197.076 197.049 196.913 196.881 196.807 196.714 196.481 196.333 196.151 195.849 195.433 194.921 194.194 190.489 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index e20aafa6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24519 ,TETRA ,17616766,Mon Nov 29 14:37:43 CET,Mon Nov 29 16:35:39 CET,0.0 0.619 1.057 1.426 1.781 2.115 2.427 2.732 3.343 3.649 3.947 4.201 4.807 5.092 5.67 6.251 6.815 7.091 7.637 8.177 8.983 9.513 10.024 10.786 11.561 12.333 13.091 13.831 14.826 15.832 16.815 18.027 19.243 20.46 21.915 23.615 25.3 27.206 29.315 31.605 34.1 37.05 40.682 44.438 48.99 54.363 60.849 68.437 77.962 90.219 106.313 120.831 129.969 136.251 140.854 144.363 147.062 149.337 151.096 152.484 153.499 154.333 154.975 155.511 156.028 156.447 156.796 157.071 157.302 157.529 157.708 157.827 157.951 158.089 158.189 158.286 158.371 158.402 158.401 158.392 158.364 158.292 158.234 158.184 158.152 158.065 157.953 157.777 157.694 157.479 157.437 157.326 157.172 156.821 156.624 156.391 156.125 155.777 155.147 154.066 146.706 -2 ,18495 ,TETRA ,17616767,Mon Nov 29 14:37:43 CET,Mon Nov 29 16:32:09 CET,0.0 0.527 0.866 1.227 1.605 1.957 2.297 2.627 3.245 3.553 3.872 4.184 4.799 5.098 5.687 6.268 6.846 7.126 7.674 8.232 9.054 9.595 10.128 10.915 11.705 12.473 13.228 13.998 15.026 16.048 17.079 18.357 19.599 20.832 22.302 23.988 25.656 27.542 29.648 31.976 34.432 37.223 40.659 44.293 48.658 53.697 59.798 67.067 76.224 87.815 103.055 116.811 125.537 131.676 136.156 139.692 142.371 144.488 146.115 147.532 148.644 149.57 150.393 151.086 151.657 152.136 152.577 152.923 153.191 153.45 153.683 153.856 154.042 154.209 154.293 154.357 154.431 154.506 154.551 154.557 154.565 154.564 154.529 154.48 154.45 154.35 154.226 154.074 153.998 153.779 153.673 153.555 153.424 153.052 152.82 152.492 152.087 151.638 151.065 150.021 142.488 -3 ,9839 ,TETRA ,17616768,Mon Nov 29 14:38:43 CET,Mon Nov 29 16:35:12 CET,0.0 0.472 0.814 1.132 1.445 1.754 2.08 2.394 3.011 3.322 3.628 3.919 4.524 4.814 5.393 5.955 6.505 6.769 7.297 7.836 8.645 9.173 9.697 10.492 11.274 12.041 12.807 13.555 14.538 15.505 16.465 17.687 18.893 20.09 21.535 23.205 24.854 26.691 28.728 30.972 33.4 36.263 39.748 43.396 47.876 53.077 59.182 66.428 75.52 87.022 102.519 116.814 125.884 132.303 137.033 140.666 143.499 145.762 147.531 149.115 150.295 151.235 152.079 152.82 153.427 153.926 154.412 154.802 155.105 155.394 155.649 155.816 155.957 156.068 156.13 156.154 156.143 156.136 156.116 156.075 156.021 155.941 155.855 155.748 155.703 155.603 155.474 155.336 155.26 155.021 154.95 154.825 154.647 154.276 154.076 153.788 153.425 152.959 152.424 151.48 143.808 -4 ,8860 ,TETRA ,17616769,Mon Nov 29 14:37:43 CET,Mon Nov 29 16:33:18 CET,0.0 0.359 0.728 1.042 1.342 1.66 1.974 2.262 2.828 3.113 3.396 3.641 4.237 4.506 5.055 5.618 6.178 6.449 6.981 7.522 8.329 8.86 9.399 10.195 10.963 11.725 12.491 13.256 14.271 15.265 16.245 17.475 18.691 19.891 21.319 23.001 24.653 26.495 28.555 30.827 33.272 36.072 39.502 43.114 47.456 52.496 58.633 66.088 75.411 87.19 102.689 116.844 126.064 132.479 137.114 140.755 143.6 145.857 147.62 149.194 150.391 151.365 152.158 152.803 153.371 153.851 154.291 154.634 154.929 155.219 155.431 155.541 155.686 155.834 155.919 156.014 156.1 156.152 156.193 156.226 156.224 156.21 156.191 156.128 156.091 155.991 155.878 155.766 155.709 155.519 155.485 155.349 155.197 154.786 154.538 154.226 153.747 153.177 152.549 151.421 140.155 -5 ,1198 ,TETRA ,17616770,Mon Nov 29 14:38:43 CET,Mon Nov 29 16:32:29 CET,0.0 0.477 0.898 1.257 1.595 1.928 2.253 2.565 3.166 3.463 3.76 4.037 4.636 4.914 5.489 6.04 6.585 6.866 7.43 7.982 8.789 9.325 9.862 10.68 11.473 12.237 13.002 13.788 14.846 15.876 16.89 18.17 19.448 20.7 22.166 23.843 25.482 27.324 29.396 31.667 34.129 37.054 40.629 44.356 48.844 53.96 60.075 67.371 76.47 87.942 103.188 117.354 126.614 133.116 137.71 141.129 143.703 145.758 147.385 148.864 150.006 150.946 151.755 152.426 153.026 153.564 154.03 154.322 154.51 154.673 154.809 154.912 155.012 155.081 155.123 155.173 155.244 155.32 155.344 155.325 155.283 155.207 155.145 155.054 154.99 154.848 154.697 154.526 154.396 154.105 153.993 153.865 153.701 153.175 152.832 152.507 152.079 151.498 150.762 149.616 138.279 -6 ,27267 ,TETRA ,17616771,Mon Nov 29 14:38:43 CET,Mon Nov 29 16:29:00 CET,0.0 0.413 0.73 1.035 1.344 1.668 1.983 2.285 2.872 3.157 3.441 3.709 4.331 4.625 5.206 5.793 6.378 6.666 7.229 7.788 8.616 9.148 9.669 10.445 11.22 12.002 12.767 13.523 14.57 15.633 16.664 17.888 19.08 20.311 21.77 23.377 24.976 26.784 28.786 30.992 33.392 36.234 39.703 43.345 47.75 52.88 59.167 66.788 76.446 88.725 104.834 119.428 128.915 135.665 140.433 144.086 146.912 149.09 150.83 152.462 153.607 154.482 155.274 155.9 156.397 156.85 157.265 157.551 157.8 158.068 158.328 158.53 158.681 158.814 158.932 159.037 159.127 159.211 159.278 159.309 159.322 159.311 159.288 159.251 159.23 159.142 158.981 158.81 158.718 158.461 158.309 158.121 157.939 157.6 157.356 157.035 156.67 156.205 155.64 154.807 145.248 -8 ,12512 ,TETRA ,17616773,Mon Nov 29 14:38:43 CET,Mon Nov 29 16:32:28 CET,0.0 0.436 0.79 1.093 1.396 1.72 2.034 2.324 2.892 3.172 3.446 3.669 4.269 4.544 5.096 5.652 6.205 6.465 6.979 7.505 8.292 8.804 9.303 10.043 10.79 11.531 12.264 12.989 13.948 14.927 15.916 17.137 18.343 19.533 20.972 22.64 24.268 26.149 28.257 30.581 33.136 36.12 39.754 43.535 48.124 53.504 59.977 67.662 77.108 88.935 104.907 119.435 128.604 134.875 139.346 142.971 145.802 148.024 149.635 151.004 152.096 152.954 153.558 154.073 154.556 154.968 155.386 155.719 155.946 156.122 156.251 156.333 156.429 156.513 156.546 156.572 156.596 156.592 156.6 156.608 156.597 156.555 156.514 156.444 156.385 156.28 156.213 156.135 156.071 155.848 155.798 155.688 155.53 155.034 154.758 154.51 154.216 153.78 153.218 152.246 146.961 -9 ,21138 ,TETRA ,17616774,Mon Nov 29 14:39:40 CET,Mon Nov 29 16:33:30 CET,0.0 0.43 0.735 1.054 1.36 1.673 1.971 2.246 2.797 3.081 3.363 3.586 4.186 4.453 4.978 5.514 6.04 6.302 6.834 7.354 8.123 8.647 9.175 9.963 10.735 11.494 12.264 13.028 14.023 15.006 15.988 17.218 18.429 19.619 21.045 22.713 24.359 26.218 28.306 30.596 33.075 35.983 39.524 43.226 47.753 53.07 59.521 67.197 76.678 88.774 104.877 119.57 129.032 135.632 140.333 144.037 146.934 149.252 151.039 152.529 153.633 154.555 155.366 156.075 156.672 157.146 157.585 157.953 158.269 158.554 158.801 158.987 159.197 159.383 159.485 159.577 159.641 159.697 159.734 159.728 159.728 159.742 159.717 159.673 159.655 159.626 159.564 159.443 159.359 159.098 158.959 158.823 158.672 158.311 158.086 157.758 157.353 156.843 156.096 154.95 148.604 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 26c50e1a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6593 ,TETRA ,17616776,Mon Nov 29 14:39:40 CET,Mon Nov 29 16:36:20 CET,0.0 1.706 2.386 2.929 3.429 3.913 4.36 4.78 5.576 5.97 6.355 6.772 7.472 7.839 8.564 9.288 9.984 10.326 11.003 11.675 12.662 13.294 13.925 14.875 15.798 16.715 17.623 18.525 19.745 20.96 22.138 23.546 24.958 26.382 28.088 30.098 32.106 34.361 36.834 39.517 42.414 45.796 49.93 54.233 59.447 65.588 73.012 81.802 92.738 106.857 125.607 142.945 154.456 162.619 168.638 173.389 177.137 180.154 182.45 184.534 186.224 187.627 188.84 189.889 190.814 191.611 192.36 192.986 193.491 193.956 194.408 194.773 195.12 195.393 195.566 195.743 195.917 196.087 196.243 196.356 196.48 196.627 196.703 196.784 196.822 196.865 196.872 196.863 196.829 196.68 196.694 196.628 196.504 196.181 195.99 195.772 195.528 195.275 194.946 194.323 190.302 -2 ,10061 ,TETRA ,17616777,Mon Nov 29 14:39:40 CET,Mon Nov 29 16:35:50 CET,0.0 1.821 2.515 3.11 3.645 4.115 4.6 5.046 5.851 6.245 6.633 7.072 7.769 8.149 8.884 9.586 10.27 10.615 11.295 11.971 12.985 13.647 14.299 15.282 16.254 17.208 18.145 19.065 20.277 21.492 22.704 24.187 25.679 27.179 28.923 30.873 32.781 34.944 37.345 40.036 42.994 46.393 50.439 54.593 59.527 65.263 72.291 80.666 91.116 104.422 122.125 138.848 149.894 157.741 163.566 168.114 171.599 174.423 176.667 178.645 180.162 181.413 182.527 183.509 184.365 185.111 185.853 186.456 186.926 187.378 187.814 188.154 188.476 188.783 189.025 189.274 189.502 189.699 189.883 189.994 190.101 190.242 190.32 190.391 190.417 190.449 190.457 190.463 190.471 190.36 190.384 190.323 190.253 190.074 189.916 189.728 189.504 189.169 188.737 188.083 184.063 -3 ,27474 ,TETRA ,17616778,Mon Nov 29 14:39:40 CET,Mon Nov 29 16:36:42 CET,0.0 1.164 1.83 2.366 2.882 3.39 3.838 4.268 5.111 5.523 5.919 6.352 7.046 7.408 8.112 8.81 9.486 9.825 10.502 11.166 12.158 12.79 13.406 14.339 15.265 16.186 17.111 18.061 19.332 20.558 21.742 23.174 24.566 25.945 27.613 29.542 31.433 33.583 35.964 38.564 41.41 44.699 48.725 52.983 58.102 64.053 71.195 79.71 90.433 104.056 121.977 138.868 150.321 158.451 164.452 169.093 172.606 175.433 177.62 179.587 181.155 182.428 183.491 184.41 185.214 185.89 186.554 187.078 187.441 187.761 188.089 188.335 188.548 188.744 188.901 189.064 189.191 189.295 189.391 189.434 189.461 189.499 189.511 189.5 189.492 189.488 189.461 189.38 189.336 189.194 189.139 189.047 188.964 188.718 188.55 188.341 188.088 187.783 187.379 186.689 181.503 -4 ,21913 ,TETRA ,17616779,Mon Nov 29 14:39:43 CET,Mon Nov 29 16:32:22 CET,0.0 1.665 2.361 2.928 3.436 3.932 4.422 4.884 5.73 6.143 6.564 7.032 7.722 8.097 8.821 9.507 10.188 10.534 11.219 11.896 12.905 13.556 14.195 15.156 16.096 17.016 17.945 18.894 20.135 21.337 22.535 24.001 25.446 26.906 28.639 30.628 32.618 34.861 37.304 39.933 42.796 46.137 50.106 54.28 59.4 65.363 72.507 80.924 91.478 104.841 122.605 139.391 150.491 158.385 164.17 168.626 172.127 174.98 177.164 179.13 180.721 182.048 183.251 184.335 185.243 185.994 186.729 187.344 187.834 188.325 188.808 189.165 189.513 189.861 190.091 190.31 190.532 190.752 190.95 191.049 191.129 191.214 191.257 191.315 191.335 191.354 191.353 191.316 191.292 191.154 191.151 191.028 190.852 190.542 190.389 190.233 190.027 189.753 189.422 188.831 185.311 -5 ,16994 ,TETRA ,17616780,Mon Nov 29 14:39:41 CET,Mon Nov 29 16:38:12 CET,0.0 1.061 1.711 2.242 2.715 3.169 3.603 4.033 4.872 5.272 5.674 6.131 6.826 7.214 7.978 8.706 9.402 9.74 10.402 11.058 12.059 12.706 13.325 14.27 15.241 16.215 17.182 18.127 19.374 20.627 21.847 23.334 24.81 26.27 27.984 29.938 31.855 33.977 36.324 38.981 41.926 45.322 49.404 53.648 58.744 64.744 72.027 80.574 91.093 104.471 122.496 139.134 150.049 157.928 163.754 168.297 171.834 174.774 177.123 179.243 180.899 182.273 183.474 184.488 185.366 186.137 186.869 187.431 187.887 188.327 188.726 189.032 189.322 189.596 189.791 189.97 190.13 190.265 190.386 190.465 190.532 190.614 190.656 190.673 190.68 190.692 190.685 190.679 190.66 190.529 190.555 190.513 190.455 190.209 190.048 189.875 189.643 189.316 188.926 188.314 183.704 -6 ,15274 ,TETRA ,17616781,Mon Nov 29 14:39:40 CET,Mon Nov 29 16:35:46 CET,0.0 1.549 2.228 2.753 3.264 3.742 4.185 4.596 5.386 5.778 6.172 6.604 7.281 7.635 8.347 9.055 9.766 10.116 10.803 11.476 12.463 13.098 13.72 14.642 15.546 16.466 17.39 18.302 19.497 20.677 21.862 23.336 24.784 26.217 27.912 29.851 31.772 33.952 36.383 39.073 41.987 45.384 49.532 53.854 59.104 65.253 72.674 81.556 92.712 106.81 125.484 142.704 154.177 162.376 168.379 173.057 176.637 179.491 181.699 183.706 185.26 186.538 187.683 188.664 189.534 190.28 190.978 191.544 191.992 192.422 192.823 193.135 193.423 193.713 193.948 194.161 194.344 194.516 194.669 194.74 194.794 194.877 194.928 194.969 194.985 194.995 194.992 194.983 194.951 194.803 194.792 194.725 194.66 194.5 194.373 194.215 194.021 193.729 193.341 192.783 189.716 -7 ,4552 ,TETRA ,17616782,Mon Nov 29 14:40:35 CET,Mon Nov 29 16:37:05 CET,0.0 1.283 1.913 2.446 2.915 3.378 3.806 4.21 5.013 5.42 5.81 6.221 6.92 7.295 8.024 8.744 9.455 9.803 10.483 11.159 12.16 12.816 13.475 14.455 15.409 16.354 17.303 18.246 19.476 20.681 21.909 23.452 24.944 26.385 28.099 30.064 31.993 34.2 36.64 39.312 42.252 45.674 49.729 53.966 59.104 64.947 71.945 80.3 90.79 104.166 122.124 138.836 150.051 158.186 164.11 168.635 172.146 174.981 177.243 179.305 180.914 182.265 183.416 184.434 185.342 186.094 186.812 187.39 187.863 188.323 188.79 189.156 189.497 189.831 190.077 190.308 190.516 190.712 190.875 190.982 191.097 191.254 191.33 191.369 191.386 191.414 191.421 191.428 191.416 191.277 191.277 191.233 191.159 190.949 190.838 190.639 190.38 190.044 189.59 188.958 185.339 -8 ,29252 ,TETRA ,17616783,Mon Nov 29 14:40:35 CET,Mon Nov 29 16:37:03 CET,0.0 1.362 2.032 2.561 3.024 3.462 3.882 4.297 5.108 5.491 5.852 6.254 6.917 7.27 7.971 8.658 9.331 9.664 10.315 10.958 11.902 12.515 13.123 14.04 14.941 15.828 16.724 17.599 18.747 19.909 21.057 22.472 23.876 25.28 26.952 28.882 30.802 32.956 35.322 37.941 40.761 44.007 47.962 52.094 57.158 63.087 70.294 78.958 89.799 103.594 122.025 139.276 150.862 159.106 165.276 170.26 174.096 177.18 179.605 181.847 183.567 184.948 186.191 187.266 188.2 189.015 189.816 190.474 190.999 191.501 191.976 192.331 192.679 193.034 193.269 193.448 193.625 193.8 193.95 194.037 194.112 194.195 194.242 194.301 194.319 194.329 194.326 194.289 194.276 194.173 194.206 194.136 194.05 193.821 193.674 193.499 193.244 192.91 192.502 191.803 188.611 -9 ,19484 ,TETRA ,17616784,Mon Nov 29 14:40:35 CET,Mon Nov 29 16:31:21 CET,0.0 1.411 1.984 2.498 3.012 3.51 3.977 4.421 5.257 5.656 6.055 6.501 7.184 7.548 8.271 8.987 9.694 10.039 10.716 11.391 12.404 13.075 13.726 14.668 15.606 16.533 17.469 18.418 19.648 20.838 22.015 23.498 24.963 26.382 28.057 29.996 31.897 34.021 36.359 38.943 41.789 45.111 49.15 53.388 58.458 64.314 71.432 79.927 90.637 104.273 122.475 139.621 151.127 159.445 165.592 170.413 174.161 177.182 179.507 181.583 183.207 184.511 185.673 186.713 187.605 188.368 189.134 189.779 190.298 190.787 191.234 191.555 191.853 192.128 192.345 192.568 192.793 193.025 193.21 193.31 193.389 193.493 193.554 193.596 193.617 193.64 193.636 193.603 193.57 193.439 193.442 193.379 193.323 193.158 193.031 192.825 192.558 192.235 191.826 191.245 187.315 -10 ,11650 ,TETRA ,17616785,Mon Nov 29 14:40:35 CET,Mon Nov 29 16:40:31 CET,0.0 1.361 1.96 2.401 2.832 3.266 3.688 4.094 4.87 5.236 5.58 5.924 6.582 6.926 7.611 8.297 8.971 9.303 9.963 10.611 11.549 12.17 12.797 13.716 14.637 15.552 16.446 17.325 18.468 19.604 20.75 22.189 23.607 25.012 26.663 28.563 30.462 32.624 35.049 37.7 40.576 43.929 47.997 52.285 57.491 63.51 70.771 79.538 90.516 104.545 123.505 140.943 152.215 160.277 166.272 170.963 174.597 177.503 179.788 181.885 183.5 184.838 186.021 187.009 187.863 188.601 189.334 189.959 190.455 190.914 191.334 191.646 191.918 192.163 192.347 192.522 192.697 192.84 192.954 193.041 193.127 193.208 193.222 193.239 193.243 193.24 193.239 193.223 193.203 193.065 193.076 193.013 192.939 192.718 192.555 192.389 192.181 191.902 191.585 190.976 179.97 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 198b88f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13725 ,KEBNE ,17027895,Wed Dec 22 18:39:11 CET,Wed Dec 22 20:19:53 CET,0.0 1.982 2.341 2.561 2.719 2.877 3.041 3.193 3.44 3.554 3.674 3.587 3.945 4.028 4.192 4.344 4.494 4.57 4.722 4.851 5.017 5.129 5.232 5.362 5.48 5.592 5.709 5.832 5.992 6.136 6.244 6.359 6.452 6.5 6.556 6.606 6.632 6.654 6.644 6.622 6.608 6.535 6.385 6.203 5.907 5.483 4.88 4.018 2.659 0.426 -3.358 -7.814 -11.387 -14.303 -16.766 -18.923 -20.793 -22.444 -23.82 -25.2 -26.366 -27.337 -28.263 -29.186 -30.059 -30.846 -31.666 -32.397 -33.0 -33.615 -34.275 -34.824 -35.378 -35.951 -36.408 -36.881 -37.343 -37.795 -38.259 -38.578 -38.899 -39.399 -39.749 -40.101 -40.284 -40.653 -41.036 -41.444 -41.66 -42.203 -42.338 -42.575 -42.817 -43.333 -43.601 -43.876 -44.165 -44.519 -44.932 -45.443 -47.052 -2 ,3656 ,KEBNE ,17027896,Wed Dec 22 18:39:11 CET,Wed Dec 22 20:21:07 CET,0.0 1.522 1.948 2.215 2.396 2.557 2.709 2.861 3.151 3.276 3.384 3.287 3.65 3.733 3.892 4.039 4.183 4.253 4.387 4.51 4.662 4.756 4.855 4.991 5.124 5.248 5.344 5.415 5.501 5.591 5.668 5.75 5.82 5.875 5.923 5.974 6.007 6.014 5.997 5.954 5.891 5.826 5.683 5.454 5.161 4.7 4.058 3.166 1.762 -0.442 -4.178 -8.636 -12.207 -15.179 -17.733 -19.947 -21.801 -23.448 -24.877 -26.298 -27.47 -28.468 -29.419 -30.318 -31.139 -31.887 -32.673 -33.357 -33.927 -34.516 -35.145 -35.672 -36.222 -36.805 -37.253 -37.694 -38.135 -38.594 -39.06 -39.377 -39.709 -40.222 -40.569 -40.938 -41.126 -41.504 -41.905 -42.333 -42.567 -43.139 -43.362 -43.649 -43.967 -44.7 -45.13 -45.603 -46.067 -46.561 -47.183 -48.055 -50.973 -3 ,25358 ,KEBNE ,17027897,Wed Dec 22 18:39:12 CET,Wed Dec 22 20:19:47 CET,0.0 1.574 1.929 2.19 2.405 2.602 2.758 2.892 3.152 3.281 3.398 3.323 3.702 3.791 3.952 4.103 4.244 4.303 4.418 4.533 4.699 4.807 4.908 5.049 5.168 5.285 5.403 5.509 5.648 5.764 5.853 5.944 6.012 6.073 6.151 6.234 6.3 6.348 6.352 6.323 6.273 6.181 6.044 5.851 5.573 5.192 4.596 3.69 2.27 0.13 -3.616 -8.158 -11.827 -14.858 -17.34 -19.482 -21.335 -22.993 -24.456 -25.956 -27.23 -28.326 -29.356 -30.332 -31.226 -32.017 -32.824 -33.545 -34.17 -34.828 -35.51 -36.056 -36.632 -37.222 -37.669 -38.126 -38.611 -39.114 -39.61 -39.967 -40.359 -40.959 -41.352 -41.739 -41.943 -42.38 -42.801 -43.231 -43.476 -44.05 -44.241 -44.507 -44.775 -45.377 -45.711 -46.067 -46.476 -46.946 -47.476 -48.269 -51.307 -4 ,10807 ,KEBNE ,17027898,Wed Dec 22 18:39:12 CET,Wed Dec 22 20:19:50 CET,0.0 1.109 1.455 1.685 1.883 2.028 2.177 2.336 2.564 2.662 2.76 2.652 3.019 3.093 3.249 3.383 3.514 3.584 3.706 3.808 3.965 4.058 4.135 4.244 4.354 4.467 4.565 4.649 4.746 4.83 4.908 4.987 5.061 5.146 5.242 5.333 5.401 5.44 5.445 5.432 5.38 5.301 5.148 4.896 4.545 4.073 3.374 2.325 0.736 -1.596 -5.344 -9.768 -13.431 -16.449 -19.019 -21.315 -23.232 -24.904 -26.259 -27.602 -28.772 -29.756 -30.66 -31.573 -32.435 -33.174 -33.943 -34.677 -35.319 -35.974 -36.661 -37.24 -37.838 -38.425 -38.864 -39.301 -39.746 -40.221 -40.71 -41.043 -41.375 -41.881 -42.237 -42.599 -42.783 -43.17 -43.577 -44.001 -44.213 -44.748 -44.891 -45.135 -45.382 -45.903 -46.186 -46.493 -46.855 -47.245 -47.667 -48.15 -49.544 -5 ,26254 ,KEBNE ,17027899,Wed Dec 22 18:39:12 CET,Wed Dec 22 20:21:53 CET,0.0 1.772 2.304 2.617 2.877 3.098 3.302 3.475 3.772 3.928 4.069 4.038 4.444 4.577 4.825 5.027 5.21 5.291 5.435 5.574 5.781 5.912 6.027 6.213 6.416 6.604 6.773 6.918 7.065 7.171 7.25 7.335 7.413 7.468 7.508 7.561 7.601 7.625 7.649 7.647 7.604 7.541 7.468 7.317 7.022 6.577 5.922 4.984 3.578 1.416 -2.316 -6.867 -10.546 -13.715 -16.451 -18.913 -21.086 -23.025 -24.68 -26.29 -27.618 -28.754 -29.809 -30.78 -31.678 -32.487 -33.318 -34.065 -34.709 -35.384 -36.099 -36.663 -37.224 -37.81 -38.248 -38.689 -39.153 -39.636 -40.137 -40.483 -40.834 -41.359 -41.714 -42.091 -42.292 -42.71 -43.136 -43.59 -43.835 -44.397 -44.577 -44.83 -45.091 -45.642 -45.95 -46.293 -46.681 -47.13 -47.652 -48.35 -50.698 -6 ,22055 ,KEBNE ,17027900,Wed Dec 22 18:39:11 CET,Wed Dec 22 20:19:32 CET,0.0 0.512 0.83 1.075 1.292 1.481 1.657 1.801 2.036 2.146 2.255 2.162 2.523 2.604 2.757 2.905 3.03 3.088 3.208 3.323 3.476 3.576 3.679 3.823 3.953 4.049 4.116 4.194 4.294 4.378 4.453 4.542 4.62 4.684 4.757 4.808 4.83 4.846 4.851 4.862 4.831 4.736 4.608 4.417 4.07 3.627 3.053 2.1 0.667 -1.403 -5.019 -9.616 -13.335 -16.267 -18.725 -20.983 -22.92 -24.561 -25.928 -27.252 -28.326 -29.282 -30.221 -31.119 -31.957 -32.735 -33.572 -34.319 -34.949 -35.584 -36.249 -36.791 -37.343 -37.928 -38.374 -38.818 -39.266 -39.735 -40.237 -40.583 -40.929 -41.464 -41.837 -42.231 -42.437 -42.851 -43.3 -43.783 -44.026 -44.594 -44.814 -45.094 -45.372 -45.989 -46.324 -46.685 -47.08 -47.543 -48.079 -48.827 -53.919 -7 ,24314 ,KEBNE ,17027901,Wed Dec 22 18:39:12 CET,Wed Dec 22 20:22:02 CET,0.0 1.224 1.563 1.818 2.012 2.179 2.322 2.456 2.7 2.797 2.897 2.822 3.183 3.259 3.387 3.497 3.6 3.651 3.746 3.834 3.949 4.027 4.111 4.217 4.303 4.389 4.472 4.549 4.637 4.723 4.815 4.915 5.0 5.062 5.127 5.188 5.214 5.225 5.232 5.206 5.164 5.085 4.947 4.759 4.431 3.996 3.358 2.423 1.04 -1.142 -4.86 -9.193 -12.752 -15.75 -18.214 -20.375 -22.271 -23.974 -25.451 -26.877 -28.041 -29.069 -30.068 -31.037 -31.954 -32.783 -33.631 -34.395 -35.043 -35.68 -36.344 -36.896 -37.451 -38.019 -38.453 -38.905 -39.371 -39.837 -40.316 -40.646 -40.976 -41.495 -41.852 -42.208 -42.403 -42.809 -43.228 -43.652 -43.881 -44.473 -44.711 -44.994 -45.302 -45.947 -46.275 -46.633 -47.052 -47.509 -48.015 -48.729 -51.842 -8 ,11289 ,KEBNE ,17027902,Wed Dec 22 18:39:12 CET,Wed Dec 22 20:19:56 CET,0.0 0.979 1.301 1.527 1.699 1.849 1.996 2.132 2.371 2.469 2.558 2.472 2.836 2.908 3.034 3.155 3.28 3.335 3.442 3.543 3.673 3.749 3.82 3.931 4.036 4.119 4.2 4.266 4.332 4.404 4.472 4.54 4.602 4.671 4.731 4.756 4.755 4.755 4.761 4.756 4.733 4.68 4.553 4.377 4.097 3.685 3.071 2.189 0.824 -1.42 -5.136 -9.547 -13.142 -16.098 -18.59 -20.785 -22.718 -24.435 -25.801 -27.116 -28.264 -29.264 -30.168 -31.0 -31.752 -32.472 -33.249 -33.914 -34.476 -35.073 -35.716 -36.232 -36.768 -37.363 -37.831 -38.321 -38.847 -39.379 -39.94 -40.33 -40.706 -41.258 -41.634 -42.022 -42.226 -42.654 -43.111 -43.627 -43.893 -44.481 -44.711 -44.973 -45.236 -45.867 -46.251 -46.686 -47.179 -47.727 -48.358 -49.132 -51.908 -9 ,19989 ,KEBNE ,17027903,Wed Dec 22 18:39:11 CET,Wed Dec 22 20:21:02 CET,0.0 0.922 1.233 1.452 1.67 1.859 2.014 2.155 2.406 2.516 2.633 2.589 2.975 3.075 3.285 3.51 3.716 3.81 3.995 4.177 4.429 4.579 4.723 4.928 5.095 5.206 5.316 5.425 5.53 5.616 5.697 5.788 5.864 5.925 5.977 6.017 6.031 6.036 6.036 6.007 5.95 5.888 5.768 5.544 5.163 4.633 3.913 2.861 1.305 -1.178 -5.46 -10.442 -14.369 -17.749 -20.583 -22.992 -25.083 -26.939 -28.527 -30.068 -31.381 -32.545 -33.612 -34.597 -35.5 -36.302 -37.14 -37.893 -38.524 -39.17 -39.842 -40.396 -40.951 -41.504 -41.933 -42.39 -42.854 -43.333 -43.864 -44.225 -44.589 -45.134 -45.507 -45.901 -46.104 -46.547 -47.009 -47.516 -47.767 -48.316 -48.473 -48.733 -49.014 -49.622 -49.946 -50.272 -50.657 -51.082 -51.611 -52.349 -54.798 -10 ,30822 ,KEBNE ,17027904,Wed Dec 22 18:39:11 CET,Wed Dec 22 20:19:56 CET,0.0 1.126 1.589 1.951 2.228 2.462 2.665 2.848 3.164 3.314 3.472 3.475 3.87 3.986 4.195 4.386 4.563 4.64 4.771 4.889 5.049 5.146 5.227 5.348 5.468 5.578 5.691 5.797 5.915 6.022 6.136 6.276 6.387 6.473 6.553 6.617 6.665 6.696 6.691 6.667 6.636 6.548 6.394 6.193 5.875 5.415 4.751 3.846 2.453 0.223 -3.597 -8.107 -11.683 -14.591 -17.014 -19.119 -20.959 -22.61 -23.97 -25.277 -26.394 -27.375 -28.307 -29.214 -30.031 -30.76 -31.573 -32.332 -32.956 -33.588 -34.258 -34.813 -35.379 -35.959 -36.405 -36.864 -37.33 -37.789 -38.255 -38.587 -38.929 -39.43 -39.775 -40.138 -40.324 -40.697 -41.103 -41.534 -41.737 -42.271 -42.416 -42.666 -42.926 -43.477 -43.772 -44.115 -44.514 -44.99 -45.476 -46.025 -48.954 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index dd871771..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29863 ,TETRA ,17616786,Mon Nov 29 14:40:35 CET,Mon Nov 29 16:40:40 CET,0.0 0.274 0.4 0.474 0.538 0.602 0.653 0.711 0.813 0.858 0.903 0.877 1.007 1.043 1.108 1.172 1.243 1.281 1.338 1.378 1.441 1.479 1.522 1.585 1.634 1.682 1.73 1.77 1.816 1.865 1.912 1.964 2.003 2.032 2.064 2.103 2.135 2.183 2.259 2.336 2.404 2.484 2.559 2.557 2.513 2.417 2.204 1.78 0.955 -0.434 -2.876 -6.103 -8.998 -11.608 -13.972 -16.113 -17.97 -19.642 -21.082 -22.471 -23.655 -24.724 -25.738 -26.699 -27.561 -28.344 -29.178 -29.919 -30.55 -31.191 -31.846 -32.377 -32.918 -33.502 -33.976 -34.468 -34.973 -35.502 -36.063 -36.444 -36.821 -37.421 -37.839 -38.251 -38.468 -38.921 -39.4 -39.923 -40.2 -40.629 -41.116 -41.471 -41.861 -42.669 -43.111 -43.588 -44.124 -44.87 -45.711 -46.819 -58.928 -2 ,21869 ,TETRA ,17616787,Mon Nov 29 14:40:35 CET,Mon Nov 29 16:38:10 CET,0.0 0.174 0.301 0.403 0.458 0.513 0.582 0.638 0.734 0.785 0.823 0.796 0.935 0.977 1.047 1.113 1.177 1.205 1.263 1.326 1.405 1.451 1.486 1.533 1.585 1.644 1.703 1.755 1.811 1.857 1.907 1.981 2.047 2.096 2.155 2.236 2.317 2.377 2.424 2.472 2.514 2.55 2.531 2.432 2.295 2.088 1.696 1.118 0.305 -0.973 -3.577 -7.337 -10.628 -13.401 -15.804 -18.013 -19.917 -21.579 -23.038 -24.506 -25.745 -26.825 -27.824 -28.781 -29.679 -30.52 -31.407 -32.162 -32.814 -33.498 -34.219 -34.814 -35.427 -36.07 -36.56 -37.086 -37.641 -38.204 -38.804 -39.209 -39.603 -40.224 -40.672 -41.112 -41.332 -41.83 -42.37 -42.927 -43.202 -43.63 -44.131 -44.474 -44.877 -45.791 -46.273 -46.807 -47.407 -48.086 -48.954 -50.258 -55.329 -3 ,5343 ,TETRA ,17616788,Mon Nov 29 14:40:36 CET,Mon Nov 29 16:37:07 CET,0.0 0.167 0.268 0.337 0.4 0.457 0.511 0.559 0.658 0.706 0.747 0.735 0.876 0.919 0.997 1.063 1.123 1.153 1.208 1.262 1.335 1.379 1.42 1.492 1.558 1.607 1.65 1.693 1.753 1.8 1.831 1.87 1.924 1.976 2.04 2.12 2.179 2.255 2.334 2.415 2.495 2.575 2.648 2.677 2.687 2.622 2.416 2.024 1.344 0.082 -2.51 -6.103 -9.077 -11.495 -13.732 -15.857 -17.737 -19.413 -20.849 -22.304 -23.524 -24.582 -25.602 -26.541 -27.419 -28.262 -29.153 -29.913 -30.557 -31.226 -31.917 -32.501 -33.09 -33.664 -34.116 -34.61 -35.119 -35.635 -36.181 -36.582 -37.031 -37.752 -38.227 -38.72 -38.969 -39.481 -40.066 -40.721 -41.079 -41.578 -42.199 -42.596 -42.982 -43.868 -44.352 -44.887 -45.547 -46.321 -47.174 -48.431 -52.691 -4 ,21144 ,TETRA ,17616789,Mon Nov 29 14:40:38 CET,Mon Nov 29 16:36:54 CET,0.0 0.208 0.373 0.467 0.528 0.587 0.639 0.693 0.79 0.836 0.883 0.861 0.996 1.029 1.089 1.138 1.187 1.217 1.274 1.321 1.388 1.439 1.487 1.56 1.634 1.71 1.793 1.862 1.947 2.034 2.107 2.182 2.258 2.339 2.415 2.482 2.555 2.63 2.687 2.727 2.744 2.74 2.749 2.769 2.683 2.487 2.224 1.788 0.97 -0.397 -2.752 -5.921 -8.725 -11.293 -13.646 -15.714 -17.417 -18.892 -20.214 -21.621 -22.828 -23.906 -24.899 -25.809 -26.664 -27.436 -28.254 -29.006 -29.657 -30.316 -30.999 -31.578 -32.202 -32.829 -33.293 -33.784 -34.32 -34.859 -35.411 -35.803 -36.229 -36.889 -37.335 -37.812 -38.06 -38.568 -39.083 -39.633 -39.935 -40.387 -40.926 -41.289 -41.635 -42.452 -42.946 -43.51 -44.162 -44.914 -45.848 -47.258 -51.855 -5 ,29574 ,TETRA ,17616790,Mon Nov 29 14:41:39 CET,Mon Nov 29 16:44:45 CET,0.0 0.145 0.274 0.36 0.435 0.499 0.557 0.619 0.721 0.769 0.808 0.785 0.915 0.948 1.017 1.077 1.129 1.156 1.21 1.256 1.325 1.369 1.408 1.466 1.53 1.593 1.655 1.714 1.775 1.841 1.906 1.968 2.024 2.083 2.162 2.248 2.317 2.383 2.451 2.524 2.591 2.644 2.688 2.716 2.725 2.647 2.444 2.122 1.525 0.276 -2.148 -5.071 -7.752 -10.207 -12.379 -14.337 -16.037 -17.531 -18.832 -20.196 -21.365 -22.38 -23.356 -24.303 -25.183 -26.007 -26.9 -27.678 -28.338 -29.021 -29.721 -30.308 -30.93 -31.574 -32.066 -32.547 -33.033 -33.556 -34.113 -34.498 -34.925 -35.606 -36.065 -36.552 -36.806 -37.332 -37.873 -38.468 -38.784 -39.254 -39.877 -40.278 -40.701 -41.646 -42.171 -42.792 -43.535 -44.338 -45.255 -46.622 -57.059 -6 ,10389 ,TETRA ,17616791,Mon Nov 29 14:41:39 CET,Mon Nov 29 16:40:11 CET,0.0 0.328 0.428 0.505 0.588 0.664 0.718 0.766 0.857 0.899 0.937 0.905 1.034 1.074 1.153 1.219 1.283 1.316 1.374 1.426 1.503 1.546 1.581 1.637 1.697 1.754 1.797 1.838 1.887 1.925 1.967 2.002 2.037 2.084 2.128 2.185 2.249 2.308 2.36 2.403 2.425 2.416 2.372 2.297 2.18 1.971 1.609 1.107 0.367 -0.886 -3.379 -6.691 -9.61 -12.084 -14.164 -16.037 -17.625 -19.093 -20.432 -21.804 -23.032 -24.185 -25.269 -26.238 -27.103 -27.87 -28.681 -29.428 -30.064 -30.724 -31.409 -31.963 -32.513 -33.101 -33.562 -34.012 -34.485 -34.993 -35.529 -35.9 -36.293 -36.904 -37.321 -37.761 -38.002 -38.487 -38.987 -39.506 -39.769 -40.184 -40.61 -40.948 -41.308 -42.048 -42.473 -42.923 -43.41 -44.044 -44.857 -45.999 -52.062 -7 ,3961 ,TETRA ,17616792,Mon Nov 29 14:41:38 CET,Mon Nov 29 16:38:28 CET,0.0 0.122 0.195 0.257 0.319 0.386 0.445 0.495 0.582 0.626 0.671 0.638 0.766 0.803 0.876 0.952 1.02 1.045 1.092 1.141 1.211 1.249 1.28 1.338 1.414 1.484 1.541 1.59 1.634 1.677 1.718 1.756 1.803 1.849 1.899 1.959 2.004 2.071 2.168 2.219 2.235 2.251 2.206 2.099 1.933 1.718 1.375 0.789 -0.077 -1.34 -3.624 -6.702 -9.494 -11.778 -13.601 -15.33 -16.967 -18.434 -19.662 -20.922 -22.026 -23.053 -24.088 -25.006 -25.803 -26.563 -27.415 -28.167 -28.787 -29.42 -30.057 -30.582 -31.151 -31.759 -32.222 -32.68 -33.154 -33.655 -34.204 -34.598 -34.996 -35.59 -36.021 -36.485 -36.731 -37.225 -37.759 -38.364 -38.68 -39.157 -39.702 -40.057 -40.451 -41.314 -41.776 -42.331 -42.972 -43.664 -44.513 -45.637 -51.482 -9 ,8931 ,TETRA ,17616794,Mon Nov 29 14:42:30 CET,Mon Nov 29 16:39:09 CET,0.0 0.158 0.264 0.355 0.419 0.494 0.576 0.636 0.725 0.773 0.827 0.839 0.988 1.043 1.115 1.165 1.222 1.248 1.292 1.334 1.413 1.47 1.522 1.59 1.645 1.693 1.747 1.8 1.867 1.924 1.973 2.032 2.081 2.128 2.184 2.242 2.282 2.325 2.368 2.396 2.403 2.386 2.333 2.241 2.084 1.828 1.435 0.926 0.079 -1.5 -4.254 -7.723 -10.714 -13.343 -15.709 -17.818 -19.665 -21.297 -22.68 -24.119 -25.372 -26.453 -27.457 -28.425 -29.312 -30.105 -30.929 -31.639 -32.237 -32.856 -33.505 -34.071 -34.672 -35.281 -35.776 -36.3 -36.816 -37.361 -37.944 -38.348 -38.766 -39.416 -39.876 -40.357 -40.611 -41.132 -41.677 -42.261 -42.559 -42.992 -43.477 -43.822 -44.216 -45.066 -45.54 -46.099 -46.697 -47.359 -48.205 -49.43 -57.411 -10 ,9044 ,TETRA ,17616795,Mon Nov 29 14:42:30 CET,Mon Nov 29 16:41:43 CET,0.0 0.199 0.322 0.42 0.506 0.588 0.656 0.705 0.812 0.86 0.902 0.888 1.021 1.062 1.144 1.216 1.279 1.308 1.363 1.409 1.465 1.505 1.547 1.604 1.658 1.714 1.767 1.816 1.873 1.925 1.972 2.028 2.083 2.132 2.198 2.277 2.337 2.389 2.441 2.474 2.47 2.438 2.391 2.308 2.195 2.055 1.842 1.484 0.875 -0.196 -2.595 -6.007 -8.899 -11.375 -13.542 -15.62 -17.446 -19.064 -20.475 -21.868 -23.085 -24.145 -25.142 -26.096 -26.968 -27.734 -28.565 -29.31 -29.934 -30.597 -31.287 -31.843 -32.423 -33.029 -33.496 -33.991 -34.493 -35.027 -35.596 -35.964 -36.329 -36.933 -37.38 -37.838 -38.074 -38.551 -39.03 -39.555 -39.818 -40.232 -40.701 -41.037 -41.42 -42.22 -42.663 -43.183 -43.794 -44.531 -45.472 -46.838 -53.019 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index c8d8c369..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4943 ,TETRA ,17616796,Mon Nov 29 14:42:30 CET,Mon Nov 29 16:43:26 CET,0.0 0.626 0.861 1.065 1.273 1.449 1.597 1.737 1.963 2.063 2.165 2.271 2.449 2.528 2.681 2.844 3.008 3.092 3.258 3.399 3.606 3.743 3.866 4.051 4.234 4.404 4.563 4.713 4.91 5.09 5.273 5.501 5.722 5.953 6.221 6.529 6.821 7.105 7.411 7.743 8.091 8.518 9.019 9.452 9.93 10.491 11.118 11.714 12.268 12.767 12.938 12.505 11.924 11.301 10.667 9.979 9.306 8.664 8.089 7.504 6.944 6.404 5.859 5.336 4.865 4.422 3.959 3.555 3.192 2.798 2.39 2.052 1.681 1.301 1.008 0.69 0.359 0.029 -0.311 -0.549 -0.783 -1.165 -1.462 -1.757 -1.892 -2.167 -2.524 -2.961 -3.185 -3.506 -3.872 -4.121 -4.388 -5.003 -5.336 -5.72 -6.208 -6.798 -7.51 -8.495 -12.729 -2 ,15540 ,TETRA ,17616797,Mon Nov 29 14:42:30 CET,Mon Nov 29 16:50:35 CET,0.0 0.516 0.715 0.901 1.063 1.221 1.377 1.514 1.752 1.862 1.968 2.093 2.283 2.376 2.554 2.725 2.88 2.953 3.1 3.25 3.444 3.559 3.677 3.855 4.029 4.202 4.377 4.536 4.719 4.914 5.111 5.333 5.557 5.779 6.037 6.318 6.586 6.87 7.165 7.477 7.804 8.173 8.608 9.05 9.537 10.054 10.649 11.248 11.848 12.341 12.701 12.547 11.724 10.736 9.801 8.936 8.17 7.432 6.779 6.121 5.556 5.068 4.586 4.08 3.58 3.138 2.7 2.322 1.971 1.595 1.215 0.895 0.564 0.202 -0.102 -0.43 -0.767 -1.109 -1.474 -1.724 -1.979 -2.38 -2.689 -3.015 -3.173 -3.503 -3.856 -4.236 -4.444 -4.753 -5.069 -5.316 -5.611 -6.269 -6.613 -6.978 -7.411 -7.892 -8.528 -9.446 -12.944 -3 ,16755 ,TETRA ,17616798,Mon Nov 29 14:42:30 CET,Mon Nov 29 16:40:59 CET,0.0 0.474 0.748 0.978 1.181 1.342 1.46 1.584 1.832 1.939 2.047 2.172 2.364 2.468 2.653 2.824 2.983 3.054 3.199 3.344 3.549 3.68 3.8 3.973 4.141 4.299 4.465 4.632 4.846 5.049 5.237 5.457 5.676 5.89 6.139 6.416 6.686 6.987 7.286 7.602 7.921 8.252 8.65 9.062 9.536 10.049 10.63 11.216 11.766 12.158 12.058 11.331 10.436 9.542 8.651 7.809 7.074 6.315 5.623 4.975 4.373 3.805 3.276 2.802 2.362 1.91 1.418 1.004 0.656 0.255 -0.191 -0.547 -0.903 -1.279 -1.592 -1.937 -2.281 -2.635 -3.023 -3.285 -3.545 -3.976 -4.295 -4.636 -4.819 -5.206 -5.595 -6.005 -6.22 -6.524 -6.866 -7.119 -7.395 -8.017 -8.382 -8.792 -9.244 -9.749 -10.369 -11.181 -15.349 -4 ,27436 ,TETRA ,17616799,Mon Nov 29 14:42:30 CET,Mon Nov 29 16:43:28 CET,0.0 0.835 1.168 1.375 1.532 1.679 1.817 1.944 2.181 2.285 2.379 2.459 2.641 2.724 2.874 3.029 3.198 3.284 3.438 3.588 3.812 3.952 4.088 4.281 4.466 4.649 4.839 5.02 5.227 5.419 5.605 5.826 6.049 6.291 6.562 6.84 7.11 7.424 7.774 8.124 8.461 8.849 9.309 9.741 10.248 10.835 11.485 12.155 12.799 13.323 13.654 13.374 12.742 12.021 11.261 10.489 9.793 9.068 8.424 7.842 7.301 6.752 6.205 5.714 5.294 4.896 4.453 4.043 3.687 3.326 2.914 2.555 2.193 1.799 1.484 1.179 0.871 0.543 0.2 -0.033 -0.277 -0.682 -0.967 -1.277 -1.434 -1.744 -2.1 -2.505 -2.719 -3.04 -3.415 -3.663 -3.932 -4.553 -4.923 -5.316 -5.715 -6.221 -6.814 -7.599 -11.999 -5 ,20932 ,TETRA ,17616800,Mon Nov 29 14:42:30 CET,Mon Nov 29 16:44:12 CET,0.0 0.875 1.173 1.37 1.524 1.658 1.791 1.903 2.117 2.241 2.359 2.477 2.666 2.759 2.926 3.081 3.234 3.303 3.433 3.568 3.783 3.918 4.047 4.245 4.436 4.604 4.77 4.939 5.144 5.351 5.552 5.781 6.01 6.235 6.5 6.793 7.068 7.363 7.653 7.948 8.264 8.631 9.069 9.491 9.953 10.481 11.053 11.622 12.23 12.804 13.116 12.866 12.343 11.656 10.893 10.093 9.342 8.706 8.158 7.549 6.986 6.46 5.941 5.452 5.017 4.61 4.161 3.737 3.353 2.941 2.526 2.157 1.77 1.412 1.121 0.803 0.458 0.098 -0.3 -0.576 -0.837 -1.235 -1.531 -1.846 -1.992 -2.29 -2.654 -3.035 -3.231 -3.534 -3.869 -4.087 -4.314 -4.881 -5.25 -5.663 -6.119 -6.622 -7.206 -8.104 -11.253 -6 ,29852 ,TETRA ,17616801,Mon Nov 29 14:42:30 CET,Mon Nov 29 16:40:00 CET,0.0 0.292 0.423 0.542 0.665 0.774 0.88 0.979 1.159 1.241 1.315 1.366 1.54 1.614 1.762 1.905 2.028 2.088 2.203 2.315 2.49 2.601 2.71 2.869 3.013 3.161 3.305 3.433 3.597 3.767 3.94 4.151 4.363 4.573 4.81 5.072 5.334 5.615 5.908 6.198 6.487 6.828 7.236 7.635 8.073 8.546 9.041 9.506 9.975 10.313 10.284 9.89 9.395 8.707 7.916 7.122 6.353 5.621 4.979 4.318 3.724 3.18 2.669 2.169 1.694 1.244 0.77 0.345 -0.02 -0.397 -0.802 -1.14 -1.491 -1.843 -2.122 -2.438 -2.769 -3.128 -3.499 -3.74 -3.99 -4.398 -4.68 -4.961 -5.123 -5.468 -5.821 -6.192 -6.388 -6.697 -7.029 -7.257 -7.515 -8.12 -8.442 -8.794 -9.217 -9.703 -10.282 -11.035 -14.778 -7 ,11279 ,TETRA ,17616802,Mon Nov 29 14:42:31 CET,Mon Nov 29 16:43:37 CET,0.0 0.575 0.778 0.942 1.087 1.226 1.357 1.477 1.687 1.783 1.882 1.987 2.169 2.258 2.426 2.598 2.781 2.866 3.014 3.152 3.366 3.505 3.641 3.82 3.986 4.168 4.34 4.497 4.709 4.905 5.088 5.326 5.568 5.8 6.053 6.342 6.625 6.941 7.277 7.616 7.974 8.367 8.847 9.349 9.883 10.405 10.916 11.5 12.214 12.818 13.133 12.898 12.174 11.406 10.702 10.031 9.403 8.735 8.147 7.55 6.987 6.442 5.895 5.365 4.897 4.509 4.098 3.684 3.317 2.94 2.544 2.225 1.89 1.51 1.197 0.885 0.583 0.257 -0.121 -0.385 -0.637 -1.025 -1.302 -1.599 -1.765 -2.11 -2.463 -2.838 -3.049 -3.38 -3.789 -4.052 -4.315 -4.893 -5.233 -5.611 -6.03 -6.525 -7.092 -7.975 -11.506 -8 ,14558 ,TETRA ,17616803,Mon Nov 29 14:42:31 CET,Mon Nov 29 16:45:55 CET,0.0 0.276 0.561 0.791 0.955 1.105 1.241 1.366 1.591 1.695 1.799 1.903 2.089 2.179 2.335 2.476 2.602 2.672 2.817 2.954 3.148 3.27 3.39 3.563 3.729 3.888 4.038 4.202 4.42 4.609 4.789 5.009 5.213 5.409 5.66 5.963 6.243 6.509 6.774 7.068 7.401 7.79 8.232 8.667 9.128 9.619 10.15 10.686 11.31 11.857 12.214 12.096 11.685 11.146 10.496 9.833 9.1 8.342 7.702 7.048 6.463 5.927 5.409 4.927 4.484 4.062 3.607 3.185 2.829 2.476 2.101 1.784 1.459 1.108 0.811 0.517 0.212 -0.119 -0.455 -0.695 -0.952 -1.352 -1.639 -1.961 -2.124 -2.44 -2.782 -3.144 -3.332 -3.63 -3.978 -4.225 -4.474 -5.024 -5.377 -5.746 -6.124 -6.62 -7.251 -8.128 -11.445 -9 ,14514 ,TETRA ,17616804,Mon Nov 29 14:43:28 CET,Mon Nov 29 16:41:41 CET,0.0 0.537 0.798 0.969 1.109 1.262 1.412 1.548 1.804 1.906 2.002 2.105 2.283 2.37 2.534 2.678 2.828 2.906 3.06 3.209 3.415 3.544 3.671 3.862 4.036 4.204 4.366 4.516 4.707 4.887 5.066 5.279 5.486 5.695 5.93 6.192 6.451 6.733 7.024 7.327 7.629 7.964 8.395 8.829 9.29 9.789 10.362 10.922 11.472 11.931 11.842 11.219 10.461 9.655 8.751 7.822 7.117 6.529 5.998 5.371 4.739 4.162 3.65 3.206 2.764 2.327 1.88 1.481 1.127 0.75 0.368 0.048 -0.287 -0.641 -0.915 -1.201 -1.514 -1.831 -2.16 -2.402 -2.655 -3.062 -3.346 -3.627 -3.787 -4.13 -4.48 -4.873 -5.064 -5.356 -5.731 -6.0 -6.266 -6.86 -7.179 -7.519 -7.969 -8.509 -9.097 -9.942 -15.038 -10 ,17970 ,TETRA ,17616805,Mon Nov 29 14:43:29 CET,Mon Nov 29 16:36:59 CET,0.0 0.903 1.152 1.324 1.457 1.598 1.747 1.865 2.05 2.143 2.247 2.35 2.53 2.612 2.76 2.911 3.059 3.137 3.286 3.42 3.626 3.755 3.886 4.078 4.255 4.433 4.606 4.765 4.961 5.162 5.362 5.611 5.853 6.077 6.331 6.628 6.901 7.196 7.512 7.842 8.205 8.609 9.061 9.508 10.008 10.522 11.053 11.57 12.129 12.654 12.915 12.611 12.043 11.354 10.657 9.979 9.289 8.585 7.936 7.305 6.733 6.177 5.654 5.162 4.701 4.283 3.85 3.444 3.089 2.734 2.372 2.069 1.748 1.414 1.148 0.87 0.586 0.262 -0.077 -0.309 -0.572 -0.979 -1.248 -1.528 -1.688 -2.034 -2.39 -2.776 -2.982 -3.283 -3.627 -3.864 -4.103 -4.618 -4.924 -5.264 -5.65 -6.102 -6.626 -7.498 -12.014 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 2baf6dbf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23480 ,TETRA ,17616806,Mon Nov 29 14:43:29 CET,Mon Nov 29 16:36:31 CET,0.0 0.552 0.827 1.076 1.324 1.531 1.732 1.929 2.286 2.445 2.587 2.735 2.993 3.146 3.444 3.716 3.985 4.118 4.374 4.618 4.984 5.233 5.478 5.83 6.173 6.508 6.852 7.184 7.607 8.033 8.438 8.942 9.446 9.92 10.481 11.143 11.788 12.512 13.292 14.115 14.975 15.956 17.169 18.437 19.884 21.444 23.31 25.52 28.045 30.795 33.772 35.843 36.786 37.223 37.353 37.324 37.176 36.935 36.662 36.364 36.094 35.837 35.536 35.236 34.967 34.682 34.371 34.095 33.827 33.54 33.25 32.996 32.725 32.45 32.243 32.015 31.753 31.463 31.177 30.994 30.79 30.439 30.183 29.912 29.775 29.496 29.195 28.849 28.654 28.362 28.03 27.814 27.557 26.905 26.577 26.285 25.932 25.441 24.784 23.952 16.317 -2 ,10263 ,TETRA ,17616807,Mon Nov 29 14:43:29 CET,Mon Nov 29 16:38:08 CET,0.0 0.543 0.85 1.081 1.295 1.517 1.72 1.902 2.237 2.388 2.538 2.7 2.957 3.105 3.413 3.704 3.978 4.108 4.36 4.605 4.989 5.24 5.469 5.808 6.158 6.496 6.815 7.145 7.584 8.012 8.431 8.948 9.457 9.95 10.528 11.186 11.818 12.529 13.316 14.164 15.074 16.131 17.386 18.65 20.129 21.756 23.703 25.928 28.462 31.397 34.793 37.492 38.661 39.145 39.366 39.3 39.093 38.873 38.596 38.238 37.939 37.645 37.355 37.064 36.767 36.482 36.152 35.836 35.558 35.27 34.968 34.703 34.412 34.105 33.873 33.638 33.39 33.125 32.84 32.627 32.381 32.011 31.776 31.535 31.407 31.151 30.882 30.544 30.342 30.055 29.714 29.478 29.187 28.495 28.129 27.779 27.428 26.963 26.282 25.336 19.253 -3 ,1456 ,TETRA ,17616808,Mon Nov 29 14:43:29 CET,Mon Nov 29 16:38:00 CET,0.0 0.515 0.818 1.089 1.337 1.569 1.775 1.969 2.356 2.533 2.697 2.879 3.143 3.287 3.573 3.841 4.103 4.237 4.511 4.767 5.134 5.38 5.615 5.963 6.316 6.656 6.983 7.314 7.758 8.182 8.587 9.077 9.554 10.043 10.616 11.272 11.934 12.654 13.417 14.241 15.119 16.156 17.402 18.656 20.154 21.818 23.736 25.927 28.433 31.3 34.591 36.905 37.89 38.298 38.456 38.449 38.3 38.041 37.751 37.418 37.119 36.836 36.496 36.149 35.83 35.522 35.179 34.869 34.606 34.332 34.025 33.767 33.485 33.188 32.933 32.649 32.382 32.087 31.771 31.549 31.313 30.943 30.674 30.383 30.237 29.947 29.631 29.322 29.148 28.875 28.553 28.329 28.095 27.514 27.157 26.801 26.397 25.85 25.143 24.048 18.549 -4 ,11338 ,TETRA ,17616809,Mon Nov 29 14:43:30 CET,Mon Nov 29 16:37:39 CET,0.0 0.286 0.478 0.666 0.833 1.004 1.196 1.379 1.7 1.842 1.968 2.111 2.363 2.497 2.746 2.996 3.237 3.349 3.571 3.795 4.144 4.368 4.575 4.886 5.197 5.512 5.816 6.102 6.474 6.854 7.239 7.698 8.143 8.581 9.096 9.677 10.261 10.931 11.657 12.455 13.302 14.268 15.397 16.538 17.929 19.475 21.202 23.215 25.713 28.745 32.14 34.554 35.693 36.191 36.425 36.482 36.373 36.217 36.022 35.759 35.429 35.076 34.746 34.399 34.048 33.734 33.382 33.049 32.776 32.482 32.152 31.885 31.61 31.296 31.059 30.828 30.58 30.293 29.977 29.783 29.575 29.205 28.94 28.667 28.524 28.209 27.905 27.596 27.419 27.135 26.793 26.575 26.352 25.86 25.568 25.208 24.801 24.32 23.649 22.733 16.214 -5 ,11030 ,TETRA ,17616810,Mon Nov 29 14:44:27 CET,Mon Nov 29 16:40:29 CET,0.0 0.943 1.206 1.435 1.628 1.826 2.043 2.249 2.63 2.806 2.969 3.179 3.46 3.611 3.89 4.155 4.414 4.539 4.79 5.045 5.417 5.659 5.888 6.218 6.539 6.859 7.178 7.499 7.924 8.335 8.756 9.271 9.746 10.222 10.8 11.432 12.051 12.765 13.53 14.358 15.26 16.273 17.475 18.683 20.103 21.763 23.699 25.849 28.38 31.293 34.526 36.844 37.748 38.128 38.313 38.274 38.067 37.779 37.48 37.136 36.861 36.65 36.43 36.18 35.906 35.632 35.347 35.082 34.869 34.612 34.286 34.002 33.712 33.423 33.183 32.914 32.634 32.333 32.003 31.789 31.578 31.242 30.999 30.746 30.618 30.35 30.054 29.734 29.561 29.289 28.972 28.75 28.494 27.935 27.604 27.233 26.79 26.254 25.584 24.483 17.534 -6 ,5430 ,TETRA ,17616811,Mon Nov 29 14:44:27 CET,Mon Nov 29 16:39:48 CET,0.0 0.512 0.747 0.975 1.227 1.453 1.648 1.844 2.224 2.405 2.574 2.773 3.053 3.203 3.499 3.787 4.077 4.218 4.489 4.761 5.165 5.422 5.669 6.051 6.441 6.817 7.176 7.535 8.016 8.482 8.935 9.459 9.943 10.427 10.996 11.666 12.303 12.99 13.775 14.637 15.538 16.546 17.748 18.964 20.41 22.053 23.977 26.16 28.643 31.471 34.924 37.256 38.031 38.326 38.441 38.339 38.13 37.919 37.648 37.319 37.035 36.745 36.442 36.137 35.826 35.542 35.227 34.956 34.728 34.471 34.184 33.923 33.649 33.37 33.146 32.911 32.646 32.375 32.103 31.895 31.685 31.347 31.104 30.859 30.717 30.415 30.107 29.774 29.602 29.323 28.963 28.736 28.499 27.967 27.657 27.326 26.93 26.401 25.743 24.747 12.458 -7 ,8798 ,TETRA ,17616812,Mon Nov 29 14:45:32 CET,Mon Nov 29 16:44:38 CET,0.0 0.553 0.816 1.034 1.219 1.39 1.552 1.715 2.053 2.217 2.366 2.512 2.77 2.908 3.176 3.438 3.7 3.829 4.089 4.344 4.706 4.933 5.162 5.525 5.877 6.196 6.507 6.816 7.206 7.604 8.008 8.493 8.968 9.449 10.008 10.623 11.247 11.978 12.764 13.606 14.523 15.547 16.766 18.061 19.575 21.181 23.03 25.25 27.888 30.807 34.0 36.263 37.264 37.717 37.836 37.72 37.474 37.209 36.942 36.605 36.3 36.008 35.707 35.386 35.061 34.757 34.447 34.183 33.933 33.65 33.349 33.094 32.833 32.551 32.328 32.085 31.805 31.528 31.263 31.062 30.832 30.473 30.223 29.982 29.864 29.609 29.318 28.958 28.764 28.487 28.144 27.91 27.669 27.15 26.835 26.442 25.957 25.391 24.76 23.927 10.869 -8 ,1912 ,TETRA ,17616813,Mon Nov 29 14:45:31 CET,Mon Nov 29 16:39:27 CET,0.0 0.385 0.665 0.9 1.12 1.34 1.542 1.72 2.054 2.226 2.395 2.597 2.877 3.026 3.301 3.572 3.853 3.994 4.258 4.501 4.882 5.138 5.377 5.743 6.096 6.431 6.758 7.081 7.519 7.949 8.362 8.862 9.356 9.835 10.38 11.024 11.688 12.413 13.166 13.986 14.892 15.903 17.083 18.303 19.765 21.451 23.422 25.703 28.406 31.414 34.686 37.021 38.197 38.805 39.028 39.124 39.126 39.0 38.836 38.654 38.462 38.261 38.031 37.774 37.507 37.234 36.911 36.604 36.307 35.96 35.62 35.372 35.12 34.844 34.617 34.37 34.125 33.864 33.579 33.381 33.169 32.848 32.611 32.343 32.204 31.932 31.609 31.242 31.067 30.816 30.527 30.291 30.041 29.509 29.179 28.812 28.431 28.007 27.454 26.672 17.748 -10 ,15129 ,TETRA ,17616815,Mon Nov 29 14:47:45 CET,Mon Nov 29 16:37:21 CET,0.0 0.273 0.464 0.627 0.784 0.942 1.096 1.253 1.579 1.736 1.877 2.018 2.286 2.42 2.662 2.902 3.143 3.261 3.497 3.735 4.089 4.321 4.546 4.873 5.2 5.527 5.867 6.201 6.621 7.031 7.42 7.911 8.4 8.869 9.417 10.049 10.685 11.38 12.126 12.964 13.896 14.94 16.145 17.409 18.907 20.607 22.589 24.799 27.525 30.605 33.869 36.153 37.161 37.595 37.744 37.676 37.486 37.243 37.001 36.689 36.364 36.094 35.794 35.462 35.153 34.869 34.559 34.271 34.006 33.704 33.404 33.173 32.928 32.661 32.436 32.198 31.957 31.679 31.389 31.192 30.969 30.62 30.363 30.071 29.924 29.643 29.343 28.997 28.818 28.563 28.248 28.007 27.76 27.285 26.975 26.572 26.13 25.663 25.162 24.366 16.127 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt deleted file mode 100644 index 797b0192..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30842 ,TETRA ,17616816,Mon Nov 29 14:47:46 CET,Mon Nov 29 16:40:28 CET,0.0 1.446 1.846 2.086 2.293 2.513 2.72 2.923 3.295 3.431 3.556 3.687 3.908 4.012 4.215 4.389 4.563 4.657 4.842 5.034 5.337 5.518 5.666 5.875 6.081 6.27 6.451 6.632 6.884 7.132 7.368 7.648 7.888 8.111 8.371 8.652 8.945 9.273 9.601 9.937 10.27 10.625 11.062 11.45 11.793 12.094 12.321 12.323 12.119 11.644 10.021 7.11 4.369 1.996 -0.01 -1.819 -3.453 -4.911 -6.204 -7.448 -8.484 -9.443 -10.36 -11.196 -11.99 -12.741 -13.517 -14.227 -14.825 -15.418 -16.026 -16.517 -17.026 -17.545 -17.946 -18.363 -18.779 -19.198 -19.656 -19.977 -20.29 -20.785 -21.139 -21.512 -21.701 -22.09 -22.494 -22.896 -23.097 -23.457 -23.753 -23.982 -24.218 -24.757 -25.055 -25.358 -25.682 -26.016 -26.396 -26.966 -30.062 -2 ,6759 ,TETRA ,17616817,Mon Nov 29 14:47:46 CET,Mon Nov 29 16:43:31 CET,0.0 3.128 3.547 3.897 4.168 4.373 4.56 4.748 5.066 5.198 5.336 5.492 5.744 5.869 6.089 6.306 6.508 6.598 6.779 6.965 7.24 7.409 7.565 7.796 8.008 8.204 8.401 8.58 8.806 9.04 9.271 9.537 9.78 10.006 10.264 10.551 10.804 11.076 11.366 11.656 11.991 12.327 12.63 12.957 13.279 13.535 13.796 13.909 13.816 13.205 11.363 8.705 6.17 3.868 1.871 0.112 -1.441 -2.928 -4.189 -5.409 -6.473 -7.44 -8.328 -9.145 -9.903 -10.575 -11.283 -11.933 -12.482 -13.037 -13.611 -14.072 -14.556 -15.09 -15.496 -15.892 -16.304 -16.734 -17.176 -17.482 -17.806 -18.307 -18.655 -19.016 -19.194 -19.551 -19.93 -20.317 -20.517 -20.882 -21.183 -21.435 -21.707 -22.321 -22.677 -23.041 -23.453 -23.943 -24.491 -25.257 -28.005 -3 ,15343 ,TETRA ,17616818,Mon Nov 29 14:47:48 CET,Mon Nov 29 16:43:29 CET,0.0 1.852 2.282 2.567 2.805 3.026 3.234 3.416 3.713 3.833 3.962 4.097 4.331 4.444 4.653 4.845 5.043 5.153 5.363 5.554 5.824 5.988 6.157 6.404 6.622 6.838 7.048 7.252 7.526 7.794 8.047 8.322 8.575 8.792 9.027 9.291 9.528 9.785 10.054 10.328 10.598 10.905 11.274 11.572 11.808 12.029 12.179 12.238 12.103 11.206 9.016 6.247 3.743 1.453 -0.52 -2.301 -3.888 -5.262 -6.412 -7.608 -8.679 -9.605 -10.485 -11.352 -12.16 -12.88 -13.613 -14.255 -14.817 -15.404 -16.002 -16.494 -17.001 -17.507 -17.876 -18.254 -18.663 -19.086 -19.536 -19.834 -20.126 -20.589 -20.918 -21.275 -21.458 -21.825 -22.209 -22.615 -22.837 -23.218 -23.561 -23.812 -24.08 -24.638 -24.928 -25.238 -25.578 -25.95 -26.383 -26.976 -30.672 -4 ,16668 ,TETRA ,17616819,Mon Nov 29 14:47:47 CET,Mon Nov 29 16:44:35 CET,0.0 2.27 2.681 3.001 3.251 3.457 3.655 3.831 4.193 4.369 4.525 4.703 4.968 5.107 5.369 5.613 5.836 5.94 6.145 6.345 6.643 6.819 6.978 7.213 7.433 7.631 7.82 8.016 8.267 8.502 8.723 8.998 9.257 9.489 9.751 10.036 10.316 10.607 10.906 11.23 11.546 11.902 12.266 12.594 12.965 13.311 13.626 13.775 13.641 13.017 11.346 8.752 6.203 3.9 1.85 -0.001 -1.666 -3.21 -4.47 -5.676 -6.699 -7.626 -8.505 -9.342 -10.145 -10.847 -11.564 -12.226 -12.788 -13.347 -13.942 -14.436 -14.962 -15.505 -15.895 -16.278 -16.668 -17.091 -17.544 -17.847 -18.143 -18.602 -18.918 -19.257 -19.432 -19.799 -20.184 -20.578 -20.792 -21.163 -21.47 -21.719 -21.97 -22.472 -22.761 -23.08 -23.422 -23.84 -24.305 -24.879 -26.51 -5 ,14357 ,TETRA ,17616820,Mon Nov 29 14:48:30 CET,Mon Nov 29 16:38:25 CET,0.0 1.355 1.718 1.984 2.206 2.416 2.596 2.738 3.04 3.188 3.328 3.476 3.711 3.84 4.095 4.308 4.523 4.626 4.808 4.99 5.234 5.375 5.518 5.736 5.933 6.104 6.267 6.425 6.63 6.834 7.018 7.222 7.42 7.62 7.849 8.099 8.334 8.585 8.873 9.187 9.496 9.84 10.214 10.523 10.787 11.079 11.323 11.36 11.251 10.733 9.153 6.635 4.29 2.127 0.238 -1.341 -2.759 -4.22 -5.561 -6.876 -7.965 -8.967 -9.917 -10.764 -11.553 -12.279 -13.037 -13.719 -14.28 -14.843 -15.456 -15.962 -16.477 -17.01 -17.423 -17.847 -18.289 -18.751 -19.22 -19.548 -19.874 -20.351 -20.678 -21.036 -21.222 -21.593 -21.976 -22.375 -22.585 -22.96 -23.307 -23.556 -23.838 -24.478 -24.836 -25.222 -25.585 -25.938 -26.396 -27.016 -30.454 -6 ,1038 ,TETRA ,17616821,Mon Nov 29 14:48:30 CET,Mon Nov 29 16:45:51 CET,0.0 1.387 1.702 1.969 2.219 2.428 2.606 2.756 3.01 3.126 3.233 3.329 3.553 3.645 3.828 4.011 4.2 4.287 4.443 4.599 4.847 5.014 5.159 5.349 5.532 5.721 5.915 6.091 6.291 6.49 6.714 6.976 7.207 7.427 7.67 7.927 8.165 8.441 8.726 9.015 9.3 9.57 9.815 10.012 10.251 10.504 10.741 10.923 10.832 10.21 8.413 5.589 3.112 0.878 -1.133 -2.952 -4.567 -6.033 -7.33 -8.618 -9.682 -10.635 -11.53 -12.397 -13.212 -13.918 -14.638 -15.276 -15.821 -16.385 -16.977 -17.463 -17.938 -18.413 -18.795 -19.184 -19.583 -20.009 -20.45 -20.76 -21.082 -21.542 -21.858 -22.188 -22.371 -22.758 -23.141 -23.549 -23.763 -24.139 -24.451 -24.684 -24.923 -25.455 -25.731 -26.024 -26.371 -26.796 -27.302 -27.92 -30.869 -7 ,20814 ,TETRA ,17616822,Mon Nov 29 14:50:30 CET,Mon Nov 29 16:50:02 CET,0.0 1.483 1.922 2.244 2.461 2.645 2.832 3.019 3.35 3.501 3.641 3.786 4.026 4.138 4.358 4.575 4.782 4.879 5.055 5.225 5.476 5.638 5.791 6.023 6.245 6.431 6.623 6.822 7.076 7.307 7.527 7.805 8.068 8.316 8.562 8.797 9.03 9.303 9.597 9.883 10.157 10.429 10.743 11.028 11.284 11.494 11.533 11.289 10.782 9.857 7.735 4.686 2.06 -0.267 -2.284 -4.053 -5.575 -6.97 -8.15 -9.298 -10.283 -11.208 -12.124 -12.953 -13.697 -14.371 -15.086 -15.746 -16.329 -16.911 -17.492 -17.977 -18.468 -18.966 -19.35 -19.734 -20.138 -20.575 -21.015 -21.31 -21.62 -22.113 -22.457 -22.804 -22.98 -23.354 -23.769 -24.214 -24.432 -24.783 -25.086 -25.338 -25.594 -26.108 -26.401 -26.723 -27.076 -27.482 -27.919 -28.501 -32.115 -8 ,125 ,TETRA ,17616823,Mon Nov 29 14:50:30 CET,Mon Nov 29 16:47:37 CET,0.0 1.549 2.057 2.461 2.791 3.06 3.302 3.52 3.881 4.036 4.17 4.306 4.551 4.669 4.884 5.095 5.292 5.389 5.58 5.753 6.009 6.173 6.319 6.539 6.781 6.997 7.191 7.373 7.614 7.854 8.069 8.315 8.535 8.736 8.949 9.174 9.409 9.668 9.94 10.202 10.434 10.672 10.971 11.277 11.515 11.688 11.765 11.671 11.223 10.15 7.991 4.985 2.382 0.105 -1.89 -3.714 -5.251 -6.628 -7.831 -9.037 -10.074 -10.968 -11.799 -12.578 -13.33 -14.033 -14.747 -15.372 -15.929 -16.504 -17.115 -17.625 -18.124 -18.647 -19.055 -19.471 -19.885 -20.308 -20.741 -21.044 -21.356 -21.828 -22.172 -22.531 -22.71 -23.073 -23.458 -23.881 -24.092 -24.448 -24.772 -25.018 -25.264 -25.77 -26.052 -26.357 -26.709 -27.112 -27.641 -28.328 -31.978 -9 ,19628 ,TETRA ,17616824,Mon Nov 29 14:50:30 CET,Mon Nov 29 16:48:56 CET,0.0 1.941 2.531 2.963 3.22 3.453 3.698 3.929 4.318 4.477 4.627 4.785 5.03 5.143 5.362 5.567 5.759 5.854 6.032 6.198 6.447 6.607 6.764 6.988 7.2 7.406 7.614 7.809 8.031 8.24 8.444 8.697 8.935 9.153 9.409 9.697 9.965 10.225 10.515 10.848 11.156 11.462 11.866 12.314 12.727 12.998 13.171 13.296 13.236 12.798 11.33 8.655 6.094 3.778 1.808 0.021 -1.582 -3.037 -4.345 -5.603 -6.649 -7.597 -8.489 -9.325 -10.086 -10.756 -11.471 -12.139 -12.685 -13.238 -13.809 -14.274 -14.768 -15.29 -15.692 -16.107 -16.548 -16.995 -17.445 -17.761 -18.088 -18.566 -18.893 -19.232 -19.397 -19.749 -20.138 -20.527 -20.718 -21.078 -21.387 -21.611 -21.843 -22.365 -22.633 -22.93 -23.254 -23.63 -24.077 -24.641 -27.631 -10 ,2892 ,TETRA ,17616825,Mon Nov 29 14:51:36 CET,Mon Nov 29 16:48:07 CET,0.0 2.33 2.762 3.142 3.475 3.729 3.903 4.057 4.358 4.515 4.673 4.818 5.056 5.172 5.392 5.603 5.797 5.89 6.08 6.254 6.513 6.693 6.859 7.089 7.298 7.513 7.738 7.951 8.213 8.471 8.725 9.018 9.33 9.623 9.926 10.232 10.495 10.787 11.119 11.46 11.807 12.164 12.501 12.822 13.175 13.46 13.643 13.731 13.633 13.099 11.51 8.766 6.183 3.844 1.784 -0.133 -1.837 -3.358 -4.64 -5.939 -7.044 -7.986 -8.898 -9.736 -10.48 -11.156 -11.884 -12.538 -13.105 -13.723 -14.366 -14.867 -15.374 -15.896 -16.305 -16.716 -17.129 -17.558 -18.013 -18.329 -18.645 -19.123 -19.458 -19.826 -20.009 -20.39 -20.803 -21.233 -21.459 -21.835 -22.137 -22.371 -22.625 -23.188 -23.474 -23.757 -24.112 -24.578 -25.178 -26.01 -28.841 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt deleted file mode 100644 index e01b9719..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17246 ,TETRA ,17616826,Mon Nov 29 14:51:36 CET,Mon Nov 29 16:51:22 CET,0.0 2.643 3.102 3.384 3.623 3.81 3.947 4.056 4.241 4.315 4.377 4.343 4.502 4.544 4.616 4.665 4.698 4.725 4.783 4.83 4.857 4.87 4.892 4.883 4.866 4.875 4.858 4.791 4.68 4.6 4.545 4.397 4.175 3.932 3.628 3.243 2.859 2.42 1.882 1.247 0.509 -0.37 -1.431 -2.642 -4.279 -6.298 -8.883 -12.176 -16.599 -22.835 -32.188 -42.081 -49.481 -55.305 -59.991 -63.919 -67.143 -69.923 -72.241 -74.497 -76.406 -78.041 -79.549 -80.947 -82.208 -83.325 -84.46 -85.448 -86.274 -87.102 -87.953 -88.663 -89.382 -90.077 -90.608 -91.147 -91.689 -92.261 -92.848 -93.249 -93.677 -94.329 -94.778 -95.254 -95.497 -95.99 -96.468 -96.984 -97.256 -97.765 -98.108 -98.396 -98.664 -99.262 -99.608 -99.961 -100.314 -100.735 -101.185 -101.658 -103.565 -2 ,28879 ,TETRA ,17616827,Mon Nov 29 14:52:31 CET,Mon Nov 29 16:47:58 CET,0.0 1.228 1.521 1.705 1.895 2.055 2.178 2.286 2.482 2.56 2.617 2.602 2.768 2.799 2.834 2.859 2.88 2.893 2.912 2.911 2.906 2.898 2.876 2.837 2.793 2.742 2.663 2.551 2.374 2.187 2.011 1.791 1.556 1.292 0.97 0.627 0.263 -0.193 -0.746 -1.433 -2.238 -3.193 -4.381 -5.712 -7.392 -9.429 -12.075 -15.4 -19.783 -25.922 -35.229 -45.156 -52.536 -58.338 -63.042 -66.989 -70.266 -73.134 -75.502 -77.776 -79.642 -81.203 -82.666 -84.03 -85.247 -86.336 -87.45 -88.426 -89.251 -90.09 -90.953 -91.639 -92.324 -93.02 -93.548 -94.109 -94.694 -95.297 -95.926 -96.339 -96.751 -97.373 -97.777 -98.191 -98.407 -98.853 -99.318 -99.781 -100.022 -100.52 -100.846 -101.123 -101.405 -101.989 -102.279 -102.596 -102.983 -103.417 -103.897 -104.442 -106.394 -3 ,19536 ,TETRA ,17616828,Mon Nov 29 14:52:31 CET,Mon Nov 29 16:40:58 CET,0.0 1.62 2.022 2.277 2.454 2.59 2.705 2.803 2.945 3.002 3.042 2.981 3.14 3.162 3.221 3.297 3.352 3.377 3.42 3.444 3.444 3.417 3.395 3.337 3.26 3.185 3.106 3.02 2.922 2.808 2.655 2.452 2.243 2.021 1.752 1.398 1.008 0.536 0.006 -0.571 -1.234 -2.086 -3.237 -4.532 -6.197 -8.268 -10.886 -14.2 -18.751 -25.008 -34.353 -44.274 -51.608 -57.377 -62.003 -65.931 -69.208 -71.978 -74.213 -76.353 -78.158 -79.74 -81.212 -82.538 -83.697 -84.745 -85.852 -86.816 -87.621 -88.451 -89.31 -89.998 -90.694 -91.414 -91.97 -92.543 -93.118 -93.702 -94.299 -94.706 -95.125 -95.77 -96.21 -96.655 -96.883 -97.366 -97.864 -98.367 -98.624 -99.132 -99.427 -99.708 -99.995 -100.625 -101.001 -101.414 -101.883 -102.409 -103.057 -103.909 -106.932 -4 ,30172 ,TETRA ,17616829,Mon Nov 29 14:52:32 CET,Mon Nov 29 16:52:02 CET,0.0 1.685 1.957 2.166 2.332 2.476 2.61 2.706 2.857 2.92 2.965 2.909 3.076 3.129 3.201 3.25 3.293 3.293 3.264 3.241 3.201 3.167 3.131 3.054 2.961 2.862 2.761 2.655 2.504 2.336 2.159 1.941 1.703 1.442 1.121 0.726 0.322 -0.128 -0.648 -1.286 -2.045 -2.939 -4.095 -5.377 -7.009 -9.065 -11.709 -15.066 -19.612 -25.829 -35.114 -45.051 -52.405 -58.164 -62.826 -66.766 -70.029 -72.872 -75.194 -77.398 -79.278 -80.899 -82.362 -83.69 -84.895 -85.978 -87.085 -88.049 -88.87 -89.709 -90.551 -91.228 -91.914 -92.61 -93.138 -93.674 -94.218 -94.791 -95.386 -95.787 -96.198 -96.844 -97.29 -97.742 -97.966 -98.428 -98.922 -99.448 -99.715 -100.203 -100.516 -100.814 -101.122 -101.777 -102.131 -102.507 -102.938 -103.446 -104.085 -104.932 -107.411 -5 ,11564 ,TETRA ,17616830,Mon Nov 29 14:52:32 CET,Mon Nov 29 16:50:02 CET,0.0 1.977 2.349 2.606 2.823 2.994 3.12 3.203 3.365 3.442 3.501 3.477 3.638 3.666 3.713 3.762 3.796 3.802 3.813 3.816 3.802 3.788 3.762 3.704 3.664 3.634 3.574 3.51 3.414 3.271 3.107 2.896 2.67 2.447 2.17 1.82 1.463 1.025 0.53 -0.053 -0.762 -1.663 -2.835 -4.09 -5.671 -7.641 -10.223 -13.498 -17.96 -24.254 -33.585 -43.525 -50.902 -56.654 -61.336 -65.274 -68.496 -71.328 -73.676 -75.893 -77.726 -79.316 -80.799 -82.144 -83.343 -84.4 -85.5 -86.473 -87.288 -88.109 -88.948 -89.638 -90.335 -91.057 -91.609 -92.158 -92.712 -93.266 -93.842 -94.245 -94.653 -95.283 -95.717 -96.15 -96.364 -96.81 -97.264 -97.701 -97.937 -98.43 -98.742 -99.035 -99.335 -99.955 -100.292 -100.647 -100.999 -101.397 -101.857 -102.442 -105.168 -6 ,6034 ,TETRA ,17616831,Mon Nov 29 14:52:32 CET,Mon Nov 29 16:49:14 CET,0.0 2.263 2.773 3.102 3.317 3.447 3.548 3.654 3.864 3.955 4.046 4.093 4.273 4.327 4.42 4.474 4.503 4.502 4.49 4.496 4.518 4.516 4.512 4.493 4.451 4.409 4.357 4.298 4.204 4.08 3.93 3.737 3.551 3.32 2.993 2.599 2.183 1.696 1.137 0.483 -0.279 -1.218 -2.383 -3.657 -5.296 -7.305 -9.888 -13.17 -17.645 -23.848 -33.152 -43.217 -50.666 -56.488 -61.167 -65.151 -68.445 -71.242 -73.566 -75.781 -77.602 -79.183 -80.647 -81.988 -83.22 -84.311 -85.408 -86.372 -87.194 -88.047 -88.916 -89.608 -90.3 -90.999 -91.531 -92.085 -92.67 -93.264 -93.867 -94.274 -94.675 -95.28 -95.714 -96.153 -96.36 -96.81 -97.303 -97.801 -98.053 -98.546 -98.829 -99.109 -99.405 -100.019 -100.352 -100.701 -101.065 -101.494 -102.017 -102.649 -105.478 -7 ,21331 ,TETRA ,17616832,Mon Nov 29 14:52:32 CET,Mon Nov 29 16:49:11 CET,0.0 1.378 1.801 2.103 2.331 2.496 2.618 2.717 2.874 2.946 3.016 3.001 3.158 3.185 3.239 3.275 3.297 3.303 3.302 3.287 3.246 3.202 3.149 3.071 2.978 2.876 2.766 2.651 2.521 2.37 2.19 1.981 1.751 1.501 1.19 0.79 0.372 -0.104 -0.658 -1.29 -2.009 -2.894 -4.02 -5.276 -6.877 -8.841 -11.338 -14.557 -19.004 -25.185 -34.407 -44.198 -51.411 -57.184 -61.918 -65.875 -69.143 -71.915 -74.217 -76.489 -78.358 -79.962 -81.426 -82.761 -83.992 -85.059 -86.144 -87.126 -87.981 -88.847 -89.704 -90.4 -91.114 -91.84 -92.38 -92.921 -93.498 -94.1 -94.694 -95.096 -95.515 -96.144 -96.58 -97.041 -97.268 -97.708 -98.163 -98.658 -98.911 -99.406 -99.735 -100.017 -100.3 -100.936 -101.324 -101.74 -102.146 -102.563 -103.042 -103.699 -105.566 -8 ,15048 ,TETRA ,17616833,Mon Nov 29 14:52:32 CET,Mon Nov 29 16:51:50 CET,0.0 1.229 1.561 1.781 1.985 2.166 2.306 2.403 2.562 2.64 2.712 2.68 2.829 2.852 2.885 2.913 2.928 2.916 2.907 2.921 2.913 2.883 2.833 2.752 2.665 2.56 2.436 2.315 2.157 1.984 1.815 1.604 1.373 1.139 0.858 0.503 0.117 -0.341 -0.878 -1.508 -2.237 -3.113 -4.224 -5.49 -7.15 -9.186 -11.813 -15.128 -19.516 -25.637 -34.781 -44.623 -52.04 -57.847 -62.537 -66.511 -69.818 -72.678 -75.009 -77.207 -79.044 -80.613 -82.054 -83.403 -84.632 -85.715 -86.817 -87.795 -88.655 -89.528 -90.392 -91.073 -91.765 -92.479 -93.009 -93.567 -94.152 -94.733 -95.334 -95.746 -96.17 -96.841 -97.293 -97.751 -97.985 -98.482 -99.004 -99.49 -99.734 -100.218 -100.483 -100.748 -101.024 -101.636 -101.981 -102.35 -102.738 -103.186 -103.768 -104.43 -106.017 -9 ,64 ,TETRA ,17616834,Mon Nov 29 14:53:27 CET,Mon Nov 29 16:51:26 CET,0.0 1.853 2.22 2.464 2.646 2.757 2.852 2.95 3.106 3.171 3.23 3.203 3.368 3.409 3.482 3.524 3.55 3.556 3.561 3.557 3.572 3.578 3.541 3.465 3.39 3.31 3.22 3.117 2.956 2.8 2.651 2.446 2.228 2.001 1.745 1.439 1.074 0.6 0.027 -0.619 -1.349 -2.253 -3.381 -4.62 -6.254 -8.33 -10.976 -14.308 -18.824 -25.086 -34.347 -44.182 -51.639 -57.49 -62.139 -66.031 -69.211 -71.973 -74.292 -76.525 -78.389 -79.999 -81.504 -82.893 -84.135 -85.231 -86.337 -87.292 -88.105 -88.936 -89.766 -90.44 -91.126 -91.811 -92.347 -92.897 -93.454 -94.038 -94.638 -95.053 -95.461 -96.061 -96.489 -96.939 -97.163 -97.605 -98.065 -98.545 -98.788 -99.278 -99.571 -99.847 -100.148 -100.753 -101.064 -101.402 -101.793 -102.251 -102.799 -103.505 -105.996 -10 ,22296 ,TETRA ,17616835,Mon Nov 29 14:53:28 CET,Mon Nov 29 16:50:29 CET,0.0 1.778 2.154 2.458 2.7 2.878 3.028 3.16 3.35 3.401 3.438 3.388 3.542 3.568 3.624 3.661 3.671 3.667 3.654 3.644 3.624 3.601 3.568 3.489 3.405 3.339 3.249 3.147 3.019 2.871 2.706 2.474 2.228 1.969 1.646 1.267 0.864 0.382 -0.171 -0.827 -1.566 -2.46 -3.615 -4.873 -6.487 -8.487 -11.009 -14.225 -18.565 -24.639 -33.822 -43.658 -51.065 -56.853 -61.438 -65.306 -68.527 -71.282 -73.559 -75.78 -77.622 -79.185 -80.637 -81.987 -83.21 -84.302 -85.421 -86.415 -87.273 -88.167 -89.081 -89.788 -90.482 -91.2 -91.761 -92.32 -92.888 -93.477 -94.069 -94.471 -94.886 -95.497 -95.91 -96.341 -96.557 -97.007 -97.499 -98.031 -98.306 -98.815 -99.142 -99.436 -99.733 -100.359 -100.687 -101.022 -101.403 -101.849 -102.353 -102.987 -105.304 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 1677b854..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15323 ,TETRA ,17616836,Mon Nov 29 14:53:29 CET,Mon Nov 29 16:48:03 CET,0.0 0.922 1.34 1.707 2.038 2.318 2.587 2.847 3.319 3.539 3.761 4.029 4.437 4.65 5.052 5.438 5.824 6.013 6.393 6.773 7.309 7.654 8.007 8.532 9.043 9.54 10.018 10.493 11.131 11.763 12.389 13.16 13.919 14.66 15.541 16.551 17.535 18.678 19.949 21.308 22.758 24.455 26.516 28.678 31.313 34.335 38.006 42.404 47.777 54.643 63.817 72.09 77.525 81.365 84.131 86.244 87.842 89.153 90.183 91.098 91.788 92.332 92.805 93.216 93.551 93.827 94.083 94.289 94.451 94.583 94.699 94.793 94.867 94.929 94.971 95.004 95.043 95.071 95.071 95.07 95.077 95.058 95.009 94.934 94.893 94.807 94.716 94.595 94.529 94.393 94.318 94.216 94.081 93.757 93.546 93.29 92.997 92.637 92.18 91.473 82.509 -4 ,32418 ,TETRA ,17616839,Mon Nov 29 14:54:27 CET,Mon Nov 29 16:48:46 CET,0.0 1.087 1.503 1.852 2.144 2.43 2.723 2.996 3.473 3.708 3.94 4.196 4.59 4.793 5.195 5.59 5.977 6.168 6.556 6.929 7.47 7.825 8.176 8.683 9.19 9.707 10.208 10.7 11.333 11.953 12.568 13.311 14.047 14.776 15.63 16.612 17.58 18.679 19.904 21.237 22.69 24.382 26.42 28.546 31.157 34.204 37.851 42.142 47.396 54.109 63.094 71.204 76.481 80.238 82.943 85.014 86.634 87.926 88.914 89.806 90.498 91.067 91.557 91.979 92.339 92.627 92.905 93.143 93.329 93.498 93.658 93.761 93.834 93.909 93.962 94.004 94.031 94.012 93.988 93.989 93.976 93.933 93.891 93.829 93.797 93.753 93.689 93.576 93.511 93.36 93.253 93.148 93.033 92.709 92.51 92.292 92.026 91.689 91.142 90.114 82.151 -5 ,29047 ,TETRA ,17616840,Mon Nov 29 14:55:33 CET,Mon Nov 29 16:52:06 CET,0.0 0.933 1.428 1.792 2.095 2.374 2.646 2.917 3.413 3.639 3.865 4.124 4.529 4.742 5.145 5.561 5.971 6.16 6.534 6.903 7.446 7.799 8.142 8.656 9.168 9.664 10.147 10.63 11.281 11.924 12.556 13.318 14.067 14.823 15.722 16.743 17.745 18.874 20.122 21.494 22.972 24.681 26.745 28.877 31.464 34.472 38.109 42.468 47.859 54.604 63.272 71.118 76.377 80.155 82.908 85.028 86.628 87.912 88.895 89.76 90.439 90.983 91.469 91.908 92.254 92.503 92.737 92.927 93.077 93.225 93.378 93.491 93.588 93.668 93.715 93.768 93.805 93.801 93.789 93.781 93.77 93.727 93.669 93.594 93.55 93.463 93.367 93.235 93.166 93.029 92.907 92.792 92.67 92.31 92.105 91.91 91.631 91.301 90.879 90.136 87.364 -9 ,6165 ,TETRA ,17616844,Mon Nov 29 14:56:27 CET,Mon Nov 29 16:48:55 CET,0.0 0.832 1.233 1.567 1.888 2.189 2.475 2.752 3.237 3.467 3.695 3.95 4.345 4.551 4.959 5.339 5.706 5.895 6.267 6.631 7.169 7.53 7.883 8.382 8.878 9.365 9.849 10.337 10.967 11.601 12.237 12.995 13.731 14.467 15.333 16.319 17.29 18.397 19.617 20.934 22.377 24.065 26.094 28.217 30.845 33.906 37.529 41.797 47.066 53.693 62.552 70.704 75.98 79.701 82.437 84.642 86.344 87.696 88.745 89.659 90.331 90.858 91.313 91.744 92.092 92.358 92.625 92.838 93.022 93.201 93.35 93.455 93.544 93.631 93.662 93.664 93.686 93.696 93.686 93.668 93.634 93.524 93.437 93.346 93.301 93.218 93.103 93.019 92.957 92.787 92.68 92.591 92.452 92.063 91.834 91.594 91.35 91.081 90.603 89.759 83.233 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt deleted file mode 100644 index e7296d3a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28600 ,TETRA ,17616846,Mon Nov 29 14:56:27 CET,Mon Nov 29 16:52:25 CET,0.0 1.325 1.709 2.006 2.306 2.591 2.869 3.118 3.556 3.771 3.984 4.21 4.582 4.776 5.159 5.529 5.887 6.054 6.383 6.716 7.201 7.508 7.825 8.289 8.746 9.216 9.682 10.123 10.681 11.248 11.807 12.48 13.146 13.811 14.59 15.472 16.344 17.317 18.379 19.53 20.766 22.209 23.976 25.821 28.063 30.666 33.796 37.467 41.954 47.738 55.44 62.439 67.025 70.211 72.505 74.231 75.522 76.542 77.323 78.037 78.568 78.978 79.338 79.645 79.896 80.087 80.241 80.345 80.428 80.505 80.541 80.538 80.553 80.576 80.582 80.581 80.549 80.51 80.461 80.399 80.343 80.28 80.198 80.098 80.06 79.957 79.825 79.697 79.619 79.433 79.318 79.203 79.065 78.735 78.538 78.3 78.007 77.698 77.278 76.524 71.715 -2 ,28146 ,TETRA ,17616847,Mon Nov 29 14:56:29 CET,Mon Nov 29 16:52:37 CET,0.0 2.17 2.779 3.251 3.62 3.943 4.243 4.516 5.041 5.29 5.512 5.741 6.119 6.32 6.712 7.071 7.409 7.584 7.925 8.25 8.733 9.045 9.37 9.882 10.365 10.81 11.244 11.684 12.262 12.805 13.345 14.028 14.693 15.338 16.104 16.981 17.821 18.757 19.79 20.925 22.193 23.662 25.402 27.18 29.342 31.866 34.889 38.489 42.967 48.726 56.422 63.421 68.007 71.155 73.387 75.103 76.345 77.312 78.058 78.746 79.292 79.726 80.078 80.366 80.582 80.744 80.916 81.043 81.126 81.206 81.261 81.293 81.345 81.39 81.404 81.381 81.337 81.293 81.237 81.187 81.142 81.051 80.991 80.941 80.904 80.799 80.669 80.523 80.423 80.226 80.104 79.971 79.794 79.371 79.145 78.913 78.676 78.432 78.046 77.423 74.547 -3 ,31274 ,TETRA ,17616848,Mon Nov 29 14:57:25 CET,Mon Nov 29 16:49:14 CET,0.0 1.176 1.604 1.938 2.223 2.481 2.732 2.987 3.451 3.672 3.902 4.164 4.543 4.722 5.078 5.428 5.779 5.961 6.316 6.66 7.163 7.489 7.808 8.261 8.714 9.159 9.591 10.023 10.594 11.145 11.665 12.297 12.933 13.564 14.311 15.183 16.041 17.0 18.058 19.233 20.538 22.081 23.89 25.752 27.993 30.552 33.657 37.326 41.811 47.464 55.068 62.046 66.608 69.881 72.238 74.053 75.433 76.518 77.356 78.108 78.658 79.082 79.44 79.711 79.943 80.126 80.272 80.4 80.511 80.616 80.673 80.695 80.714 80.723 80.727 80.719 80.717 80.712 80.688 80.653 80.615 80.558 80.496 80.419 80.368 80.261 80.167 80.06 79.97 79.785 79.688 79.576 79.464 79.198 79.005 78.795 78.535 78.207 77.867 77.35 73.542 -4 ,17640 ,TETRA ,17616849,Mon Nov 29 14:57:27 CET,Mon Nov 29 16:52:03 CET,0.0 1.168 1.575 1.906 2.226 2.514 2.782 3.03 3.484 3.702 3.909 4.121 4.497 4.696 5.093 5.466 5.831 6.013 6.372 6.712 7.206 7.535 7.854 8.334 8.799 9.248 9.707 10.167 10.752 11.33 11.89 12.561 13.236 13.912 14.71 15.611 16.502 17.508 18.598 19.759 21.024 22.508 24.295 26.167 28.378 30.943 34.11 37.837 42.449 48.305 55.938 62.934 67.485 70.692 73.002 74.73 76.053 77.127 77.932 78.638 79.195 79.625 79.999 80.322 80.575 80.788 80.984 81.133 81.23 81.309 81.372 81.401 81.427 81.459 81.481 81.484 81.474 81.442 81.386 81.353 81.323 81.245 81.184 81.114 81.066 80.942 80.784 80.637 80.573 80.424 80.346 80.23 80.095 79.741 79.513 79.258 78.99 78.691 78.251 77.625 74.051 -5 ,11112 ,TETRA ,17616850,Mon Nov 29 14:57:27 CET,Mon Nov 29 16:51:24 CET,0.0 2.578 3.082 3.469 3.809 4.107 4.38 4.626 5.089 5.311 5.52 5.73 6.108 6.301 6.683 7.049 7.402 7.575 7.929 8.285 8.802 9.138 9.459 9.922 10.366 10.812 11.26 11.701 12.284 12.872 13.464 14.171 14.876 15.575 16.351 17.23 18.099 19.106 20.208 21.373 22.62 24.074 25.84 27.69 29.94 32.485 35.516 39.148 43.668 49.327 56.945 64.018 68.501 71.646 73.947 75.754 77.12 78.161 78.924 79.593 80.136 80.57 80.938 81.243 81.484 81.677 81.84 81.944 82.01 82.073 82.127 82.163 82.187 82.165 82.133 82.109 82.101 82.091 82.065 82.028 81.986 81.93 81.879 81.821 81.786 81.698 81.569 81.424 81.353 81.186 81.06 80.942 80.82 80.461 80.257 79.997 79.675 79.341 78.889 78.142 73.555 -6 ,10101 ,TETRA ,17616851,Mon Nov 29 14:58:33 CET,Mon Nov 29 16:51:30 CET,0.0 1.312 1.759 2.082 2.373 2.632 2.882 3.118 3.551 3.76 3.974 4.211 4.585 4.781 5.15 5.494 5.835 6.006 6.34 6.665 7.154 7.482 7.793 8.24 8.7 9.164 9.611 10.047 10.619 11.194 11.758 12.432 13.098 13.767 14.542 15.409 16.282 17.295 18.388 19.554 20.837 22.314 24.089 25.944 28.189 30.8 33.936 37.631 42.152 47.786 55.26 62.177 66.598 69.7 71.972 73.689 75.007 76.029 76.743 77.347 77.833 78.243 78.61 78.932 79.188 79.354 79.442 79.489 79.559 79.658 79.734 79.768 79.786 79.756 79.73 79.738 79.724 79.668 79.609 79.575 79.544 79.482 79.422 79.356 79.314 79.199 79.058 78.919 78.846 78.673 78.574 78.463 78.316 77.98 77.793 77.586 77.354 77.057 76.646 76.022 71.677 -7 ,19202 ,TETRA ,17616852,Mon Nov 29 14:58:33 CET,Mon Nov 29 16:52:36 CET,0.0 0.865 1.247 1.563 1.863 2.147 2.404 2.643 3.094 3.316 3.535 3.778 4.157 4.351 4.715 5.063 5.412 5.581 5.908 6.237 6.717 7.035 7.34 7.777 8.201 8.628 9.072 9.521 10.114 10.677 11.227 11.882 12.515 13.148 13.887 14.739 15.573 16.497 17.522 18.675 19.94 21.367 23.075 24.847 26.982 29.502 32.536 36.121 40.617 46.3 53.917 60.927 65.481 68.618 70.897 72.67 73.95 74.947 75.723 76.425 76.911 77.247 77.524 77.789 78.059 78.276 78.451 78.566 78.633 78.68 78.722 78.735 78.732 78.731 78.729 78.703 78.657 78.63 78.604 78.561 78.503 78.405 78.321 78.205 78.148 78.033 77.903 77.775 77.712 77.571 77.502 77.393 77.27 76.973 76.803 76.607 76.361 76.042 75.591 74.946 70.507 -8 ,5680 ,TETRA ,17616853,Mon Nov 29 14:59:33 CET,Mon Nov 29 16:56:53 CET,0.0 1.359 1.745 2.082 2.396 2.683 2.95 3.194 3.612 3.814 4.02 4.241 4.623 4.828 5.217 5.58 5.934 6.107 6.457 6.806 7.312 7.634 7.946 8.404 8.867 9.34 9.803 10.241 10.818 11.415 11.998 12.697 13.396 14.083 14.884 15.77 16.614 17.583 18.66 19.853 21.145 22.628 24.466 26.345 28.559 31.164 34.284 37.938 42.474 48.233 55.941 62.922 67.428 70.631 72.897 74.643 75.962 76.988 77.779 78.482 79.024 79.445 79.785 80.066 80.324 80.517 80.676 80.794 80.881 80.969 81.048 81.098 81.121 81.121 81.116 81.112 81.1 81.073 81.03 80.998 80.962 80.879 80.809 80.753 80.724 80.633 80.507 80.357 80.27 80.098 80.013 79.91 79.784 79.453 79.278 79.08 78.816 78.456 77.97 77.339 73.182 -9 ,1441 ,TETRA ,17616854,Mon Nov 29 14:59:33 CET,Mon Nov 29 16:54:08 CET,0.0 0.784 1.169 1.506 1.812 2.09 2.355 2.6 3.084 3.314 3.533 3.802 4.207 4.413 4.8 5.172 5.532 5.714 6.078 6.426 6.929 7.266 7.596 8.08 8.541 8.972 9.408 9.843 10.392 10.925 11.455 12.108 12.754 13.402 14.18 15.061 15.9 16.87 17.951 19.102 20.35 21.809 23.576 25.416 27.642 30.209 33.288 36.971 41.569 47.339 55.03 62.159 66.718 69.948 72.297 74.027 75.308 76.325 77.112 77.8 78.31 78.729 79.078 79.335 79.53 79.696 79.885 80.035 80.134 80.201 80.226 80.233 80.243 80.236 80.197 80.141 80.08 80.031 79.978 79.926 79.888 79.825 79.752 79.661 79.604 79.465 79.299 79.096 78.987 78.792 78.641 78.5 78.363 78.077 77.881 77.645 77.403 77.046 76.461 75.655 64.715 -10 ,25799 ,TETRA ,17616855,Mon Nov 29 14:59:33 CET,Mon Nov 29 16:56:01 CET,0.0 2.96 3.611 4.119 4.488 4.822 5.126 5.37 5.835 6.052 6.265 6.495 6.875 7.062 7.413 7.761 8.108 8.276 8.601 8.912 9.372 9.677 9.985 10.453 10.901 11.34 11.786 12.233 12.807 13.359 13.908 14.609 15.295 15.929 16.661 17.519 18.376 19.347 20.407 21.552 22.807 24.303 26.091 27.888 30.059 32.588 35.663 39.338 43.849 49.546 57.13 64.126 68.668 71.846 74.182 76.004 77.28 78.226 79.0 79.685 80.161 80.52 80.85 81.139 81.368 81.549 81.716 81.854 81.948 82.019 82.072 82.092 82.107 82.125 82.116 82.11 82.113 82.088 82.053 82.019 81.974 81.904 81.831 81.75 81.714 81.615 81.487 81.341 81.261 81.088 80.99 80.881 80.754 80.442 80.258 80.049 79.805 79.51 79.132 78.571 73.664 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt deleted file mode 100644 index bb8038c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21106 ,TETRA ,17616856,Mon Nov 29 14:59:34 CET,Mon Nov 29 16:54:15 CET,0.0 0.847 1.125 1.381 1.622 1.826 2.025 2.221 2.53 2.655 2.782 2.935 3.165 3.273 3.485 3.692 3.882 3.977 4.183 4.383 4.663 4.847 5.017 5.234 5.432 5.627 5.814 5.988 6.216 6.452 6.666 6.909 7.157 7.388 7.645 7.947 8.226 8.524 8.853 9.2 9.549 9.944 10.385 10.794 11.269 11.765 12.302 12.856 13.415 13.971 14.4 14.385 14.086 13.744 13.389 12.955 12.56 12.209 11.881 11.55 11.259 10.956 10.634 10.358 10.138 9.943 9.733 9.544 9.37 9.199 9.029 8.887 8.749 8.606 8.481 8.345 8.215 8.08 7.95 7.861 7.76 7.603 7.492 7.375 7.314 7.192 7.061 6.92 6.844 6.652 6.598 6.515 6.419 6.23 6.122 5.999 5.885 5.757 5.587 5.407 4.853 -2 ,16641 ,TETRA ,17616857,Mon Nov 29 15:01:35 CET,Mon Nov 29 16:56:32 CET,0.0 1.743 2.156 2.45 2.7 2.919 3.156 3.372 3.652 3.777 3.899 4.061 4.306 4.434 4.667 4.869 5.074 5.17 5.346 5.518 5.748 5.905 6.075 6.311 6.545 6.756 6.929 7.103 7.341 7.569 7.786 8.043 8.292 8.553 8.83 9.124 9.418 9.739 10.054 10.366 10.713 11.086 11.485 11.906 12.4 12.914 13.484 14.063 14.608 15.193 15.668 15.622 15.308 14.848 14.366 13.977 13.624 13.245 12.885 12.509 12.18 11.902 11.645 11.401 11.163 10.946 10.737 10.547 10.391 10.238 10.074 9.937 9.791 9.632 9.501 9.365 9.228 9.095 8.951 8.844 8.749 8.596 8.489 8.384 8.323 8.194 8.061 7.913 7.835 7.652 7.612 7.537 7.45 7.252 7.142 7.039 6.934 6.815 6.679 6.478 5.906 -3 ,14837 ,TETRA ,17616858,Mon Nov 29 15:00:36 CET,Mon Nov 29 16:53:44 CET,0.0 0.972 1.285 1.491 1.747 1.994 2.182 2.343 2.668 2.811 2.929 3.034 3.247 3.354 3.569 3.784 3.987 4.085 4.289 4.473 4.702 4.866 5.026 5.234 5.424 5.621 5.825 6.012 6.252 6.48 6.699 6.963 7.192 7.415 7.68 7.967 8.24 8.534 8.855 9.181 9.526 9.926 10.375 10.799 11.241 11.732 12.294 12.901 13.579 14.154 14.383 14.272 13.985 13.608 13.229 12.852 12.508 12.118 11.75 11.415 11.124 10.863 10.614 10.355 10.107 9.899 9.679 9.486 9.326 9.159 8.99 8.845 8.696 8.539 8.404 8.261 8.114 7.978 7.85 7.753 7.647 7.489 7.384 7.274 7.214 7.081 6.946 6.808 6.732 6.546 6.498 6.405 6.323 6.153 6.055 5.946 5.813 5.661 5.482 5.276 4.947 -4 ,9615 ,TETRA ,17616859,Mon Nov 29 15:00:36 CET,Mon Nov 29 16:56:41 CET,0.0 1.092 1.483 1.736 2.019 2.286 2.49 2.66 2.99 3.145 3.29 3.43 3.652 3.761 3.987 4.221 4.425 4.517 4.691 4.858 5.111 5.281 5.442 5.681 5.911 6.114 6.301 6.478 6.702 6.933 7.148 7.383 7.613 7.835 8.089 8.373 8.638 8.936 9.279 9.642 10.019 10.435 10.865 11.273 11.741 12.266 12.866 13.486 14.107 14.653 15.139 15.233 14.99 14.65 14.248 13.853 13.512 13.152 12.797 12.444 12.149 11.877 11.615 11.367 11.137 10.919 10.682 10.485 10.306 10.123 9.929 9.76 9.602 9.439 9.309 9.189 9.063 8.929 8.797 8.698 8.589 8.439 8.34 8.224 8.168 8.057 7.939 7.818 7.741 7.549 7.506 7.42 7.317 7.07 6.951 6.837 6.715 6.583 6.423 6.247 5.962 -5 ,17583 ,TETRA ,17616860,Mon Nov 29 15:01:36 CET,Mon Nov 29 16:57:41 CET,0.0 0.996 1.389 1.678 1.913 2.121 2.343 2.542 2.813 2.937 3.06 3.199 3.425 3.534 3.758 3.967 4.152 4.247 4.461 4.652 4.881 5.028 5.187 5.437 5.656 5.856 6.04 6.201 6.415 6.638 6.855 7.106 7.343 7.576 7.836 8.113 8.382 8.686 9.007 9.335 9.684 10.081 10.509 10.898 11.342 11.819 12.358 12.925 13.489 14.082 14.537 14.479 14.179 13.777 13.361 12.94 12.523 12.143 11.802 11.453 11.158 10.902 10.657 10.425 10.215 10.019 9.818 9.64 9.488 9.32 9.135 8.985 8.835 8.689 8.57 8.447 8.311 8.165 8.034 7.947 7.852 7.699 7.59 7.472 7.414 7.304 7.18 7.046 6.977 6.805 6.772 6.686 6.585 6.346 6.24 6.144 6.046 5.925 5.774 5.58 5.248 -6 ,28647 ,TETRA ,17616861,Mon Nov 29 15:01:36 CET,Mon Nov 29 16:55:27 CET,0.0 1.216 1.769 2.147 2.413 2.623 2.792 2.946 3.224 3.355 3.489 3.675 3.919 4.031 4.233 4.409 4.592 4.684 4.858 5.022 5.234 5.367 5.509 5.732 5.95 6.16 6.349 6.523 6.767 6.999 7.209 7.453 7.684 7.906 8.169 8.461 8.744 9.04 9.355 9.702 10.042 10.42 10.875 11.327 11.808 12.309 12.824 13.358 13.96 14.551 15.062 15.075 14.827 14.456 14.0 13.556 13.166 12.796 12.473 12.152 11.889 11.661 11.425 11.19 10.96 10.76 10.563 10.386 10.233 10.076 9.909 9.757 9.591 9.419 9.292 9.163 9.016 8.872 8.734 8.627 8.521 8.382 8.278 8.148 8.085 7.962 7.799 7.621 7.534 7.336 7.251 7.151 7.048 6.825 6.709 6.603 6.493 6.351 6.172 5.983 5.544 -7 ,27653 ,TETRA ,17616862,Mon Nov 29 15:02:39 CET,Mon Nov 29 16:53:22 CET,0.0 1.279 1.689 1.959 2.222 2.477 2.666 2.845 3.161 3.306 3.445 3.578 3.804 3.925 4.177 4.404 4.611 4.719 4.918 5.096 5.331 5.478 5.637 5.872 6.085 6.283 6.477 6.665 6.902 7.117 7.322 7.574 7.802 8.018 8.283 8.597 8.895 9.22 9.559 9.888 10.231 10.622 11.07 11.514 12.001 12.516 13.085 13.67 14.301 14.883 15.329 15.317 15.038 14.659 14.264 13.86 13.467 13.103 12.769 12.427 12.101 11.778 11.488 11.248 11.031 10.822 10.614 10.426 10.258 10.094 9.927 9.788 9.634 9.471 9.35 9.229 9.092 8.955 8.826 8.73 8.629 8.469 8.361 8.243 8.179 8.047 7.908 7.766 7.695 7.519 7.481 7.4 7.323 7.145 7.04 6.937 6.832 6.696 6.551 6.391 6.025 -8 ,29981 ,TETRA ,17616863,Mon Nov 29 15:02:39 CET,Mon Nov 29 17:26:20 CET,0.0 1.097 1.448 1.729 1.983 2.197 2.389 2.547 2.822 2.959 3.093 3.261 3.501 3.63 3.873 4.071 4.265 4.361 4.551 4.734 4.983 5.146 5.294 5.532 5.776 5.98 6.161 6.342 6.573 6.789 6.991 7.219 7.453 7.681 7.954 8.249 8.513 8.821 9.159 9.526 9.894 10.281 10.698 11.086 11.543 12.065 12.634 13.213 13.835 14.417 14.808 14.793 14.534 14.171 13.752 13.351 13.001 12.647 12.31 11.957 11.661 11.421 11.189 10.951 10.711 10.498 10.288 10.1 9.93 9.745 9.555 9.412 9.262 9.09 8.953 8.815 8.671 8.525 8.387 8.291 8.185 8.024 7.924 7.819 7.761 7.641 7.509 7.383 7.325 7.149 7.108 7.033 6.95 6.757 6.649 6.531 6.403 6.254 6.093 5.866 5.422 -9 ,21484 ,TETRA ,17616864,Mon Nov 29 15:02:39 CET,Mon Nov 29 16:58:05 CET,0.0 1.273 1.689 1.982 2.257 2.481 2.709 2.906 3.192 3.333 3.464 3.581 3.806 3.921 4.143 4.351 4.536 4.627 4.803 4.964 5.198 5.347 5.492 5.694 5.889 6.082 6.267 6.452 6.685 6.893 7.09 7.327 7.547 7.769 8.024 8.303 8.585 8.898 9.218 9.538 9.885 10.272 10.709 11.135 11.624 12.15 12.713 13.285 13.858 14.44 14.935 14.915 14.648 14.305 13.917 13.529 13.169 12.815 12.481 12.144 11.84 11.577 11.339 11.108 10.901 10.718 10.525 10.348 10.192 10.02 9.818 9.652 9.492 9.323 9.199 9.083 8.953 8.818 8.676 8.579 8.468 8.297 8.19 8.077 8.014 7.878 7.752 7.615 7.537 7.346 7.269 7.172 7.077 6.861 6.747 6.619 6.465 6.309 6.137 5.886 5.215 -10 ,10125 ,TETRA ,17616865,Mon Nov 29 15:02:39 CET,Mon Nov 29 17:00:05 CET,0.0 1.091 1.55 1.918 2.151 2.354 2.556 2.746 3.088 3.229 3.361 3.497 3.73 3.855 4.094 4.311 4.494 4.574 4.73 4.91 5.194 5.354 5.488 5.684 5.893 6.1 6.309 6.497 6.729 6.968 7.183 7.432 7.674 7.91 8.18 8.47 8.743 9.038 9.347 9.657 9.993 10.375 10.794 11.217 11.713 12.256 12.832 13.408 13.996 14.534 14.943 14.907 14.601 14.234 13.847 13.458 13.096 12.748 12.428 12.108 11.829 11.546 11.27 11.008 10.763 10.533 10.306 10.131 9.978 9.81 9.635 9.5 9.358 9.204 9.075 8.94 8.812 8.674 8.519 8.414 8.307 8.144 8.036 7.921 7.861 7.729 7.589 7.47 7.407 7.222 7.189 7.114 7.033 6.857 6.739 6.612 6.486 6.342 6.152 5.877 5.151 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 7c588797..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6768 ,TETRA ,17616866,Mon Nov 29 15:03:41 CET,Mon Nov 29 16:56:31 CET,0.0 0.527 0.763 0.991 1.17 1.308 1.423 1.53 1.718 1.788 1.855 1.877 2.046 2.101 2.196 2.284 2.368 2.406 2.467 2.523 2.617 2.679 2.737 2.82 2.894 2.955 3.01 3.062 3.13 3.195 3.255 3.316 3.367 3.423 3.484 3.519 3.541 3.558 3.565 3.553 3.548 3.557 3.532 3.473 3.346 3.143 2.818 2.339 1.664 0.574 -1.376 -3.741 -5.716 -7.475 -8.986 -10.221 -11.304 -12.316 -13.162 -14.037 -14.786 -15.442 -16.051 -16.611 -17.124 -17.583 -18.068 -18.494 -18.859 -19.25 -19.652 -19.973 -20.326 -20.68 -20.943 -21.234 -21.524 -21.813 -22.12 -22.334 -22.551 -22.87 -23.094 -23.33 -23.449 -23.706 -23.972 -24.233 -24.371 -24.67 -24.863 -25.029 -25.199 -25.549 -25.748 -25.978 -26.235 -26.51 -26.813 -27.233 -28.279 -2 ,20030 ,TETRA ,17616867,Mon Nov 29 15:03:42 CET,Mon Nov 29 16:53:47 CET,0.0 0.47 0.615 0.761 0.909 1.033 1.141 1.231 1.405 1.487 1.557 1.566 1.736 1.8 1.904 2.005 2.098 2.14 2.223 2.292 2.379 2.44 2.491 2.562 2.64 2.709 2.774 2.834 2.901 2.97 3.03 3.09 3.144 3.192 3.24 3.286 3.333 3.366 3.381 3.395 3.401 3.408 3.397 3.32 3.181 2.977 2.616 2.074 1.291 0.107 -1.856 -4.327 -6.347 -8.027 -9.581 -11.02 -12.203 -13.203 -14.024 -14.826 -15.521 -16.126 -16.694 -17.211 -17.684 -18.147 -18.626 -19.04 -19.398 -19.748 -20.104 -20.413 -20.728 -21.046 -21.299 -21.571 -21.86 -22.149 -22.442 -22.652 -22.878 -23.222 -23.454 -23.683 -23.797 -24.032 -24.288 -24.556 -24.69 -24.973 -25.157 -25.335 -25.519 -25.905 -26.096 -26.308 -26.559 -26.838 -27.171 -27.618 -29.007 -3 ,22077 ,TETRA ,17616868,Mon Nov 29 15:04:43 CET,Mon Nov 29 16:57:05 CET,0.0 0.243 0.385 0.463 0.524 0.588 0.644 0.693 0.794 0.846 0.896 0.872 1.017 1.05 1.128 1.204 1.273 1.304 1.354 1.399 1.471 1.512 1.546 1.596 1.653 1.722 1.79 1.846 1.915 1.976 2.038 2.111 2.167 2.214 2.267 2.309 2.331 2.351 2.375 2.397 2.4 2.385 2.338 2.3 2.212 2.03 1.76 1.326 0.623 -0.526 -2.419 -4.713 -6.607 -8.319 -9.76 -10.999 -12.154 -13.162 -13.978 -14.798 -15.501 -16.111 -16.696 -17.253 -17.786 -18.261 -18.723 -19.124 -19.477 -19.845 -20.226 -20.548 -20.884 -21.245 -21.523 -21.792 -22.067 -22.348 -22.642 -22.86 -23.089 -23.428 -23.658 -23.906 -24.04 -24.291 -24.562 -24.87 -25.007 -25.287 -25.453 -25.614 -25.789 -26.143 -26.35 -26.586 -26.839 -27.112 -27.435 -27.865 -28.941 -4 ,5887 ,TETRA ,17616869,Mon Nov 29 15:04:43 CET,Mon Nov 29 17:03:30 CET,0.0 0.285 0.362 0.438 0.496 0.542 0.585 0.627 0.721 0.767 0.808 0.776 0.929 0.966 1.024 1.089 1.16 1.197 1.273 1.339 1.421 1.471 1.525 1.599 1.665 1.722 1.78 1.835 1.892 1.938 1.986 2.049 2.103 2.148 2.2 2.26 2.308 2.354 2.41 2.449 2.451 2.434 2.387 2.302 2.18 1.987 1.697 1.279 0.591 -0.542 -2.577 -5.069 -6.999 -8.685 -10.226 -11.553 -12.664 -13.707 -14.591 -15.413 -16.122 -16.731 -17.328 -17.893 -18.388 -18.833 -19.294 -19.71 -20.089 -20.468 -20.842 -21.153 -21.464 -21.81 -22.091 -22.377 -22.673 -22.98 -23.295 -23.503 -23.715 -24.065 -24.305 -24.533 -24.651 -24.892 -25.147 -25.424 -25.562 -25.855 -26.029 -26.202 -26.379 -26.777 -26.976 -27.177 -27.435 -27.765 -28.163 -28.696 -29.935 -5 ,19678 ,TETRA ,17616870,Mon Nov 29 15:04:44 CET,Mon Nov 29 16:58:50 CET,0.0 0.16 0.277 0.345 0.41 0.483 0.547 0.602 0.717 0.785 0.849 0.853 1.02 1.07 1.178 1.281 1.361 1.4 1.477 1.541 1.628 1.684 1.745 1.833 1.905 1.972 2.036 2.087 2.162 2.252 2.332 2.413 2.497 2.588 2.678 2.77 2.827 2.858 2.882 2.888 2.878 2.861 2.82 2.744 2.624 2.444 2.178 1.792 1.118 -0.042 -2.077 -4.504 -6.443 -8.124 -9.513 -10.67 -11.688 -12.628 -13.445 -14.271 -14.957 -15.609 -16.25 -16.816 -17.338 -17.823 -18.341 -18.799 -19.184 -19.563 -19.953 -20.276 -20.617 -20.962 -21.222 -21.501 -21.79 -22.082 -22.386 -22.599 -22.809 -23.124 -23.34 -23.573 -23.697 -23.945 -24.183 -24.427 -24.566 -24.868 -25.047 -25.214 -25.388 -25.762 -25.978 -26.196 -26.434 -26.728 -27.055 -27.481 -28.678 -6 ,18597 ,TETRA ,17616871,Mon Nov 29 15:05:31 CET,Mon Nov 29 17:19:34 CET,0.0 1.095 1.421 1.607 1.724 1.841 1.958 2.052 2.202 2.265 2.326 2.328 2.484 2.526 2.618 2.716 2.799 2.839 2.926 3.005 3.103 3.157 3.203 3.275 3.345 3.404 3.465 3.522 3.579 3.623 3.659 3.711 3.768 3.82 3.882 3.952 3.995 4.034 4.074 4.088 4.082 4.052 3.999 3.928 3.803 3.595 3.281 2.834 2.171 1.115 -0.787 -3.184 -5.147 -6.8 -8.229 -9.525 -10.676 -11.692 -12.515 -13.314 -14.059 -14.749 -15.374 -15.982 -16.547 -17.03 -17.522 -17.96 -18.332 -18.726 -19.122 -19.428 -19.75 -20.087 -20.363 -20.637 -20.914 -21.209 -21.514 -21.73 -21.941 -22.277 -22.508 -22.74 -22.864 -23.111 -23.372 -23.649 -23.793 -24.092 -24.27 -24.425 -24.588 -24.981 -25.215 -25.442 -25.671 -25.953 -26.296 -26.726 -28.055 -7 ,1316 ,TETRA ,17616872,Mon Nov 29 15:05:31 CET,Mon Nov 29 16:58:28 CET,0.0 0.203 0.268 0.335 0.396 0.445 0.49 0.534 0.618 0.652 0.685 0.63 0.775 0.807 0.861 0.906 0.953 0.977 1.014 1.046 1.095 1.124 1.151 1.194 1.242 1.289 1.335 1.387 1.461 1.539 1.616 1.693 1.737 1.773 1.817 1.853 1.87 1.891 1.918 1.924 1.91 1.924 1.943 1.874 1.748 1.605 1.371 0.978 0.336 -0.749 -2.643 -5.07 -7.059 -8.754 -10.185 -11.426 -12.573 -13.631 -14.526 -15.391 -16.117 -16.768 -17.354 -17.93 -18.487 -18.962 -19.439 -19.866 -20.237 -20.614 -20.998 -21.313 -21.645 -21.982 -22.239 -22.51 -22.788 -23.074 -23.363 -23.557 -23.766 -24.1 -24.321 -24.556 -24.681 -24.927 -25.17 -25.432 -25.578 -25.879 -26.069 -26.24 -26.426 -26.834 -27.06 -27.299 -27.554 -27.844 -28.166 -28.606 -30.263 -8 ,14523 ,TETRA ,17616873,Mon Nov 29 15:06:34 CET,Mon Nov 29 16:42:09 CET,0.0 0.629 0.842 0.973 1.083 1.205 1.31 1.395 1.529 1.593 1.661 1.675 1.841 1.902 2.029 2.145 2.233 2.268 2.34 2.415 2.519 2.588 2.652 2.743 2.839 2.921 2.995 3.068 3.142 3.202 3.256 3.314 3.367 3.418 3.475 3.532 3.581 3.606 3.617 3.634 3.648 3.61 3.531 3.458 3.353 3.171 2.845 2.367 1.648 0.465 -1.602 -4.022 -6.018 -7.736 -9.241 -10.526 -11.609 -12.612 -13.442 -14.291 -15.054 -15.727 -16.334 -16.886 -17.391 -17.852 -18.342 -18.762 -19.122 -19.498 -19.889 -20.211 -20.557 -20.913 -21.176 -21.441 -21.717 -21.978 -22.238 -22.439 -22.653 -22.988 -23.211 -23.455 -23.587 -23.829 -24.092 -24.406 -24.558 -24.844 -25.032 -25.209 -25.392 -25.791 -25.992 -26.205 -26.447 -26.724 -27.048 -27.481 -28.663 -9 ,13030 ,TETRA ,17616874,Mon Nov 29 15:06:33 CET,Mon Nov 29 16:59:33 CET,0.0 0.427 0.589 0.729 0.871 0.997 1.118 1.243 1.447 1.514 1.566 1.572 1.727 1.772 1.881 1.977 2.068 2.114 2.182 2.236 2.316 2.366 2.417 2.48 2.528 2.578 2.633 2.686 2.752 2.807 2.851 2.906 2.952 2.986 3.018 3.059 3.101 3.136 3.166 3.183 3.19 3.179 3.143 3.06 2.915 2.722 2.422 1.962 1.27 0.139 -1.87 -4.194 -6.136 -7.924 -9.386 -10.634 -11.672 -12.568 -13.378 -14.173 -14.847 -15.472 -16.096 -16.7 -17.255 -17.738 -18.235 -18.679 -19.06 -19.45 -19.857 -20.198 -20.537 -20.876 -21.149 -21.433 -21.722 -22.012 -22.288 -22.465 -22.661 -22.989 -23.21 -23.447 -23.57 -23.824 -24.09 -24.352 -24.489 -24.775 -24.97 -25.16 -25.343 -25.732 -25.955 -26.199 -26.442 -26.699 -27.026 -27.434 -28.337 -10 ,309 ,TETRA ,17616875,Mon Nov 29 15:08:33 CET,Mon Nov 29 17:08:35 CET,0.0 0.168 0.271 0.358 0.426 0.481 0.535 0.582 0.667 0.703 0.735 0.676 0.816 0.85 0.906 0.952 0.992 1.011 1.051 1.081 1.129 1.167 1.198 1.243 1.282 1.312 1.343 1.379 1.448 1.543 1.638 1.715 1.754 1.776 1.818 1.874 1.918 1.955 1.985 2.0 1.988 1.966 1.929 1.872 1.766 1.574 1.276 0.845 0.15 -0.994 -2.901 -5.176 -7.06 -8.691 -10.181 -11.541 -12.705 -13.757 -14.649 -15.495 -16.197 -16.802 -17.398 -17.999 -18.546 -19.01 -19.491 -19.943 -20.335 -20.723 -21.121 -21.45 -21.786 -22.129 -22.388 -22.66 -22.931 -23.212 -23.513 -23.723 -23.946 -24.295 -24.521 -24.749 -24.872 -25.121 -25.381 -25.669 -25.816 -26.093 -26.238 -26.406 -26.582 -26.965 -27.169 -27.377 -27.628 -27.939 -28.298 -28.72 -30.02 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index fac17845..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26039 ,TETRA ,17616876,Mon Nov 29 15:09:42 CET,Mon Nov 29 17:35:26 CET,0.0 1.36 1.762 2.065 2.309 2.524 2.72 2.893 3.225 3.371 3.513 3.699 3.943 4.077 4.336 4.568 4.778 4.877 5.065 5.262 5.527 5.679 5.835 6.061 6.288 6.52 6.732 6.921 7.157 7.388 7.62 7.911 8.195 8.461 8.762 9.116 9.466 9.833 10.199 10.583 10.983 11.432 11.955 12.46 13.053 13.693 14.396 15.152 16.007 16.929 17.831 18.309 18.395 18.316 18.151 17.962 17.781 17.589 17.395 17.181 16.985 16.798 16.568 16.369 16.233 16.102 15.96 15.825 15.705 15.567 15.424 15.313 15.206 15.105 15.018 14.92 14.815 14.707 14.591 14.512 14.437 14.33 14.252 14.157 14.106 13.995 13.893 13.801 13.747 13.591 13.582 13.52 13.458 13.3 13.211 13.136 13.056 12.946 12.8 12.627 12.227 -2 ,18250 ,TETRA ,17616877,Mon Nov 29 15:09:42 CET,Mon Nov 29 17:03:25 CET,0.0 1.011 1.472 1.757 1.976 2.176 2.361 2.539 2.866 3.012 3.158 3.327 3.552 3.684 3.949 4.168 4.373 4.471 4.657 4.832 5.086 5.254 5.426 5.679 5.899 6.117 6.333 6.521 6.762 7.004 7.23 7.52 7.804 8.057 8.349 8.678 8.986 9.312 9.682 10.096 10.504 10.941 11.463 11.972 12.542 13.167 13.883 14.68 15.545 16.424 17.269 17.681 17.753 17.679 17.526 17.322 17.104 16.906 16.701 16.474 16.276 16.08 15.882 15.69 15.503 15.346 15.193 15.051 14.933 14.814 14.688 14.583 14.471 14.357 14.27 14.174 14.071 13.972 13.864 13.786 13.706 13.585 13.511 13.432 13.388 13.292 13.19 13.095 13.047 12.886 12.843 12.779 12.728 12.598 12.522 12.445 12.355 12.25 12.14 12.014 11.824 -3 ,8755 ,TETRA ,17616878,Mon Nov 29 15:13:38 CET,Mon Nov 29 17:09:51 CET,0.0 0.865 1.248 1.574 1.877 2.118 2.321 2.511 2.846 2.998 3.154 3.32 3.559 3.684 3.912 4.116 4.316 4.422 4.611 4.789 5.061 5.219 5.367 5.594 5.819 6.032 6.231 6.416 6.65 6.881 7.11 7.385 7.655 7.912 8.21 8.54 8.847 9.172 9.525 9.927 10.356 10.812 11.37 11.93 12.501 13.135 13.867 14.644 15.492 16.415 17.324 17.786 17.92 17.872 17.74 17.579 17.393 17.192 16.998 16.781 16.589 16.421 16.251 16.057 15.878 15.739 15.602 15.475 15.351 15.213 15.077 14.97 14.864 14.746 14.644 14.551 14.451 14.343 14.242 14.164 14.087 13.972 13.881 13.782 13.729 13.619 13.505 13.392 13.338 13.176 13.151 13.082 13.005 12.846 12.765 12.682 12.582 12.474 12.354 12.208 11.773 -4 ,21296 ,TETRA ,17616879,Mon Nov 29 15:13:37 CET,Mon Nov 29 17:08:24 CET,0.0 1.631 2.092 2.455 2.742 2.974 3.187 3.371 3.671 3.824 3.986 4.156 4.392 4.506 4.73 4.959 5.16 5.258 5.452 5.65 5.937 6.11 6.264 6.493 6.714 6.918 7.118 7.312 7.568 7.82 8.051 8.331 8.602 8.864 9.156 9.476 9.779 10.113 10.492 10.89 11.288 11.716 12.206 12.699 13.273 13.894 14.603 15.365 16.184 17.106 18.053 18.623 18.792 18.754 18.636 18.441 18.204 17.999 17.821 17.611 17.412 17.218 17.032 16.876 16.725 16.566 16.409 16.289 16.184 16.068 15.949 15.854 15.757 15.656 15.578 15.495 15.403 15.303 15.186 15.106 15.033 14.931 14.86 14.779 14.739 14.647 14.543 14.446 14.396 14.244 14.239 14.176 14.107 13.967 13.889 13.805 13.722 13.601 13.409 13.177 12.864 -5 ,28131 ,TETRA ,17616880,Mon Nov 29 15:13:38 CET,Mon Nov 29 17:08:31 CET,0.0 1.198 1.574 1.861 2.105 2.352 2.578 2.76 3.097 3.243 3.372 3.524 3.756 3.877 4.104 4.305 4.497 4.597 4.796 4.976 5.22 5.374 5.523 5.735 5.946 6.152 6.355 6.553 6.815 7.096 7.36 7.676 7.969 8.236 8.549 8.883 9.205 9.556 9.915 10.301 10.734 11.2 11.713 12.236 12.844 13.521 14.243 14.984 15.84 16.744 17.635 18.162 18.261 18.181 18.069 17.917 17.73 17.507 17.29 17.081 16.872 16.672 16.495 16.33 16.184 16.056 15.909 15.782 15.665 15.533 15.408 15.301 15.183 15.073 14.982 14.888 14.789 14.677 14.562 14.483 14.404 14.279 14.195 14.102 14.051 13.944 13.825 13.711 13.657 13.501 13.494 13.429 13.358 13.209 13.126 13.024 12.915 12.791 12.62 12.417 11.911 -6 ,29477 ,TETRA ,17616881,Mon Nov 29 15:16:35 CET,Mon Nov 29 17:19:46 CET,0.0 0.777 1.125 1.412 1.66 1.875 2.074 2.262 2.58 2.746 2.915 3.075 3.315 3.447 3.676 3.886 4.093 4.202 4.417 4.606 4.876 5.056 5.229 5.462 5.692 5.916 6.121 6.308 6.552 6.796 7.026 7.32 7.586 7.844 8.157 8.483 8.781 9.104 9.456 9.829 10.252 10.799 11.433 12.022 12.698 13.39 14.086 14.85 15.713 16.649 17.633 18.104 18.113 18.009 17.836 17.639 17.454 17.248 17.003 16.768 16.599 16.448 16.298 16.162 16.04 15.911 15.774 15.653 15.532 15.406 15.289 15.189 15.085 14.973 14.887 14.808 14.716 14.611 14.512 14.441 14.366 14.247 14.165 14.081 14.039 13.953 13.865 13.772 13.719 13.56 13.548 13.495 13.433 13.28 13.197 13.098 12.986 12.859 12.714 12.569 12.28 -7 ,23504 ,TETRA ,17616882,Mon Nov 29 15:16:37 CET,Mon Nov 29 17:11:10 CET,0.0 0.843 1.164 1.437 1.668 1.879 2.056 2.229 2.545 2.678 2.814 2.962 3.197 3.323 3.547 3.757 3.961 4.055 4.233 4.41 4.654 4.814 4.978 5.202 5.402 5.592 5.779 5.974 6.248 6.509 6.744 7.017 7.273 7.507 7.792 8.119 8.421 8.742 9.1 9.496 9.905 10.369 10.929 11.476 12.068 12.709 13.426 14.173 14.975 15.907 16.836 17.253 17.327 17.277 17.145 16.959 16.762 16.543 16.333 16.095 15.88 15.689 15.51 15.327 15.153 15.012 14.856 14.705 14.58 14.448 14.315 14.206 14.08 13.951 13.86 13.755 13.645 13.539 13.43 13.35 13.272 13.156 13.067 12.978 12.937 12.853 12.754 12.652 12.6 12.44 12.415 12.344 12.28 12.154 12.069 11.963 11.843 11.72 11.6 11.456 11.035 -8 ,10097 ,TETRA ,17616883,Mon Nov 29 15:16:36 CET,Mon Nov 29 17:10:26 CET,0.0 0.718 1.039 1.281 1.511 1.714 1.913 2.106 2.416 2.556 2.713 2.913 3.15 3.271 3.501 3.712 3.911 4.01 4.199 4.377 4.632 4.797 4.955 5.192 5.418 5.628 5.839 6.047 6.306 6.546 6.776 7.054 7.322 7.588 7.895 8.207 8.508 8.847 9.206 9.582 9.965 10.408 10.941 11.45 12.01 12.646 13.331 14.034 14.847 15.699 16.495 16.934 17.021 16.987 16.885 16.713 16.507 16.284 16.066 15.843 15.666 15.5 15.331 15.169 15.022 14.874 14.704 14.557 14.44 14.328 14.216 14.118 14.016 13.904 13.801 13.705 13.618 13.518 13.415 13.344 13.262 13.123 13.033 12.946 12.904 12.812 12.709 12.613 12.565 12.415 12.404 12.337 12.271 12.13 12.053 11.967 11.863 11.753 11.655 11.508 11.003 -9 ,9762 ,TETRA ,17616884,Mon Nov 29 15:16:36 CET,Mon Nov 29 17:11:23 CET,0.0 0.848 1.245 1.557 1.824 2.055 2.244 2.419 2.769 2.936 3.084 3.246 3.486 3.607 3.84 4.07 4.284 4.386 4.576 4.755 5.003 5.161 5.321 5.551 5.783 6.003 6.215 6.429 6.697 6.951 7.192 7.47 7.739 7.996 8.283 8.592 8.909 9.259 9.622 10.015 10.429 10.887 11.391 11.883 12.441 13.055 13.757 14.521 15.352 16.208 17.094 17.633 17.713 17.644 17.498 17.285 17.051 16.818 16.623 16.409 16.147 15.923 15.763 15.611 15.464 15.329 15.185 15.043 14.911 14.767 14.638 14.538 14.42 14.299 14.207 14.109 14.007 13.9 13.787 13.719 13.648 13.526 13.442 13.36 13.313 13.211 13.104 12.979 12.909 12.735 12.698 12.625 12.548 12.364 12.273 12.194 12.095 11.952 11.794 11.639 11.424 -10 ,16335 ,TETRA ,17616885,Mon Nov 29 15:17:32 CET,Mon Nov 29 17:12:13 CET,0.0 0.887 1.223 1.476 1.683 1.898 2.104 2.288 2.622 2.773 2.91 3.054 3.28 3.393 3.621 3.857 4.094 4.207 4.417 4.595 4.831 4.992 5.155 5.384 5.588 5.792 5.997 6.189 6.441 6.687 6.923 7.218 7.511 7.79 8.091 8.423 8.751 9.1 9.457 9.833 10.237 10.665 11.161 11.66 12.194 12.843 13.638 14.432 15.266 16.114 16.96 17.444 17.527 17.409 17.233 17.027 16.837 16.676 16.519 16.31 16.1 15.916 15.732 15.544 15.39 15.255 15.115 14.992 14.875 14.756 14.623 14.508 14.374 14.229 14.125 14.016 13.916 13.82 13.721 13.649 13.576 13.451 13.365 13.279 13.232 13.14 13.047 12.945 12.9 12.758 12.752 12.684 12.61 12.468 12.398 12.323 12.235 12.137 12.017 11.869 11.601 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt deleted file mode 100644 index 96d412ef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17523 ,TETRA ,17616886,Mon Nov 29 15:17:32 CET,Mon Nov 29 17:11:10 CET,0.0 0.751 1.003 1.167 1.324 1.482 1.638 1.78 2.007 2.117 2.227 2.308 2.488 2.569 2.743 2.916 3.063 3.126 3.244 3.356 3.522 3.637 3.752 3.906 4.048 4.184 4.318 4.452 4.61 4.757 4.903 5.091 5.281 5.466 5.67 5.868 6.043 6.232 6.434 6.651 6.874 7.113 7.37 7.63 7.919 8.16 8.365 8.57 8.751 8.761 8.35 7.576 6.821 6.111 5.447 4.817 4.25 3.721 3.259 2.82 2.437 2.063 1.665 1.308 1.017 0.753 0.478 0.241 0.035 -0.191 -0.448 -0.655 -0.859 -1.087 -1.259 -1.431 -1.626 -1.831 -2.026 -2.165 -2.325 -2.571 -2.728 -2.89 -2.972 -3.154 -3.34 -3.526 -3.626 -3.836 -3.973 -4.1 -4.228 -4.51 -4.67 -4.845 -5.033 -5.223 -5.453 -5.723 -6.283 -2 ,21317 ,TETRA ,17616887,Mon Nov 29 15:17:34 CET,Mon Nov 29 17:10:20 CET,0.0 1.411 1.761 2.004 2.223 2.383 2.533 2.696 2.987 3.112 3.202 3.269 3.455 3.546 3.704 3.847 3.99 4.06 4.19 4.32 4.523 4.647 4.761 4.916 5.064 5.206 5.342 5.49 5.668 5.817 5.961 6.133 6.299 6.456 6.624 6.815 7.004 7.194 7.393 7.603 7.831 8.081 8.355 8.616 8.894 9.185 9.471 9.739 9.89 9.895 9.612 8.897 8.152 7.481 6.858 6.266 5.737 5.227 4.753 4.303 3.941 3.599 3.259 2.931 2.633 2.367 2.082 1.831 1.62 1.405 1.163 0.957 0.746 0.531 0.367 0.194 0.01 -0.186 -0.385 -0.519 -0.664 -0.883 -1.026 -1.181 -1.255 -1.404 -1.572 -1.75 -1.847 -2.053 -2.158 -2.27 -2.384 -2.641 -2.79 -2.953 -3.151 -3.357 -3.57 -3.86 -4.449 -3 ,20543 ,TETRA ,17616888,Mon Nov 29 15:20:38 CET,Mon Nov 29 17:13:01 CET,0.0 0.685 1.031 1.295 1.473 1.683 1.879 2.015 2.233 2.329 2.43 2.537 2.723 2.806 2.982 3.16 3.319 3.389 3.522 3.655 3.854 3.981 4.103 4.267 4.415 4.56 4.695 4.816 4.965 5.119 5.266 5.44 5.604 5.753 5.915 6.094 6.274 6.476 6.686 6.9 7.114 7.349 7.606 7.856 8.141 8.442 8.722 8.905 9.012 8.975 8.552 7.794 7.008 6.27 5.653 5.008 4.398 3.897 3.471 3.033 2.652 2.302 1.945 1.608 1.296 1.018 0.749 0.511 0.317 0.104 -0.143 -0.339 -0.522 -0.729 -0.899 -1.06 -1.231 -1.42 -1.624 -1.757 -1.889 -2.115 -2.27 -2.424 -2.505 -2.688 -2.892 -3.084 -3.181 -3.394 -3.518 -3.632 -3.749 -3.973 -4.1 -4.28 -4.498 -4.747 -5.068 -5.483 -6.401 -4 ,3180 ,TETRA ,17616889,Mon Nov 29 15:20:40 CET,Mon Nov 29 17:13:20 CET,0.0 0.909 1.261 1.546 1.721 1.872 1.99 2.097 2.324 2.431 2.527 2.615 2.802 2.882 3.039 3.176 3.318 3.389 3.52 3.652 3.831 3.938 4.048 4.211 4.376 4.539 4.692 4.839 5.017 5.188 5.347 5.52 5.676 5.839 6.026 6.203 6.373 6.571 6.788 7.022 7.253 7.469 7.712 7.943 8.168 8.412 8.685 8.946 9.143 9.118 8.72 8.006 7.288 6.534 5.853 5.265 4.714 4.199 3.748 3.297 2.912 2.54 2.183 1.865 1.561 1.281 1.006 0.759 0.535 0.308 0.073 -0.128 -0.34 -0.577 -0.763 -0.948 -1.136 -1.324 -1.528 -1.672 -1.812 -2.022 -2.174 -2.333 -2.42 -2.605 -2.786 -2.967 -3.069 -3.284 -3.389 -3.512 -3.651 -3.944 -4.1 -4.271 -4.447 -4.617 -4.818 -5.128 -5.848 -5 ,26729 ,TETRA ,17616890,Mon Nov 29 15:22:42 CET,Mon Nov 29 17:12:59 CET,0.0 0.653 0.996 1.188 1.333 1.466 1.613 1.73 1.914 2.015 2.109 2.172 2.353 2.435 2.588 2.721 2.844 2.902 3.017 3.131 3.288 3.381 3.466 3.609 3.755 3.881 4.0 4.115 4.271 4.432 4.581 4.74 4.882 5.025 5.193 5.376 5.547 5.724 5.907 6.11 6.327 6.569 6.842 7.104 7.377 7.637 7.9 8.107 8.208 8.161 7.843 7.158 6.385 5.641 4.939 4.281 3.701 3.18 2.727 2.289 1.922 1.579 1.256 0.943 0.645 0.371 0.075 -0.183 -0.422 -0.673 -0.913 -1.107 -1.309 -1.508 -1.661 -1.828 -2.001 -2.194 -2.409 -2.545 -2.674 -2.914 -3.084 -3.232 -3.306 -3.458 -3.608 -3.789 -3.895 -4.116 -4.244 -4.364 -4.497 -4.796 -4.95 -5.117 -5.307 -5.544 -5.827 -6.239 -7.125 -6 ,18082 ,TETRA ,17616891,Mon Nov 29 15:22:41 CET,Mon Nov 29 17:30:20 CET,0.0 0.842 1.182 1.431 1.656 1.852 1.999 2.107 2.33 2.435 2.524 2.596 2.77 2.85 3.008 3.156 3.307 3.374 3.492 3.61 3.774 3.877 3.984 4.129 4.267 4.402 4.524 4.646 4.806 4.947 5.074 5.23 5.397 5.547 5.696 5.864 6.025 6.206 6.392 6.589 6.842 7.118 7.36 7.601 7.858 8.082 8.292 8.488 8.663 8.727 8.466 7.759 6.971 6.242 5.555 4.923 4.374 3.866 3.419 2.959 2.571 2.229 1.893 1.58 1.303 1.035 0.755 0.492 0.241 -0.015 -0.273 -0.48 -0.689 -0.924 -1.101 -1.272 -1.445 -1.616 -1.797 -1.919 -2.045 -2.25 -2.406 -2.569 -2.651 -2.822 -3.003 -3.196 -3.3 -3.511 -3.618 -3.725 -3.848 -4.121 -4.277 -4.457 -4.625 -4.795 -5.039 -5.413 -6.888 -7 ,13883 ,TETRA ,17616892,Mon Nov 29 15:22:42 CET,Mon Nov 29 17:18:58 CET,0.0 0.926 1.171 1.391 1.573 1.714 1.855 1.965 2.151 2.239 2.332 2.429 2.62 2.701 2.847 2.998 3.153 3.227 3.367 3.487 3.634 3.724 3.816 3.967 4.12 4.264 4.403 4.541 4.702 4.847 4.997 5.179 5.349 5.505 5.683 5.876 6.047 6.251 6.487 6.722 6.95 7.167 7.388 7.618 7.895 8.154 8.396 8.604 8.74 8.782 8.497 7.772 7.006 6.301 5.673 5.093 4.567 4.039 3.566 3.12 2.743 2.406 2.067 1.722 1.424 1.17 0.885 0.607 0.35 0.089 -0.157 -0.357 -0.564 -0.77 -0.939 -1.112 -1.275 -1.445 -1.64 -1.778 -1.924 -2.157 -2.331 -2.524 -2.618 -2.793 -2.955 -3.12 -3.209 -3.418 -3.548 -3.673 -3.805 -4.11 -4.277 -4.467 -4.665 -4.878 -5.158 -5.519 -6.191 -8 ,11218 ,TETRA ,17616893,Mon Nov 29 15:22:41 CET,Mon Nov 29 17:17:05 CET,0.0 0.526 0.806 1.043 1.21 1.356 1.493 1.616 1.836 1.957 2.093 2.209 2.392 2.489 2.661 2.801 2.939 3.008 3.138 3.256 3.421 3.536 3.644 3.786 3.925 4.057 4.182 4.315 4.499 4.656 4.786 4.946 5.109 5.272 5.452 5.642 5.834 6.049 6.257 6.474 6.689 6.91 7.157 7.392 7.649 7.915 8.174 8.379 8.555 8.557 8.18 7.467 6.782 6.096 5.394 4.77 4.24 3.732 3.269 2.809 2.417 2.073 1.734 1.409 1.109 0.832 0.537 0.275 0.048 -0.179 -0.417 -0.624 -0.829 -1.038 -1.215 -1.407 -1.59 -1.773 -1.961 -2.087 -2.219 -2.421 -2.573 -2.747 -2.836 -3.026 -3.237 -3.453 -3.563 -3.779 -3.907 -4.032 -4.16 -4.451 -4.625 -4.805 -4.979 -5.209 -5.498 -5.841 -6.905 -9 ,27528 ,TETRA ,17616894,Mon Nov 29 15:23:43 CET,Mon Nov 29 17:20:59 CET,0.0 0.878 1.168 1.385 1.576 1.722 1.845 1.978 2.235 2.342 2.46 2.634 2.856 2.955 3.128 3.283 3.429 3.497 3.627 3.76 3.942 4.054 4.167 4.329 4.479 4.611 4.737 4.878 5.056 5.215 5.365 5.548 5.71 5.864 6.068 6.291 6.471 6.651 6.848 7.063 7.284 7.517 7.757 7.971 8.226 8.48 8.701 8.883 8.992 8.95 8.605 7.863 7.116 6.441 5.797 5.191 4.638 4.136 3.699 3.237 2.836 2.465 2.12 1.813 1.521 1.252 0.94 0.648 0.418 0.183 -0.06 -0.256 -0.461 -0.677 -0.838 -0.993 -1.161 -1.342 -1.538 -1.675 -1.815 -2.033 -2.185 -2.337 -2.409 -2.568 -2.734 -2.909 -3.017 -3.239 -3.369 -3.498 -3.638 -3.985 -4.174 -4.34 -4.497 -4.694 -5.003 -5.372 -6.34 -10 ,28659 ,TETRA ,17616895,Mon Nov 29 15:23:44 CET,Mon Nov 29 17:01:14 CET,0.0 0.747 1.041 1.318 1.531 1.691 1.845 1.977 2.195 2.303 2.401 2.457 2.628 2.713 2.875 3.013 3.15 3.21 3.314 3.422 3.582 3.677 3.771 3.915 4.054 4.186 4.306 4.414 4.554 4.686 4.812 4.965 5.111 5.253 5.42 5.595 5.775 5.965 6.142 6.321 6.511 6.73 6.97 7.201 7.445 7.673 7.893 8.079 8.19 8.165 7.849 7.229 6.524 5.809 5.174 4.582 4.05 3.565 3.143 2.707 2.315 1.954 1.613 1.298 0.994 0.713 0.406 0.124 -0.109 -0.333 -0.548 -0.737 -0.958 -1.182 -1.343 -1.514 -1.707 -1.899 -2.092 -2.238 -2.397 -2.623 -2.763 -2.92 -3.004 -3.169 -3.341 -3.509 -3.593 -3.801 -3.935 -4.054 -4.181 -4.458 -4.611 -4.771 -4.939 -5.146 -5.387 -5.699 -6.292 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt deleted file mode 100644 index 0cb18067..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23049 ,TETRA ,17616896,Mon Nov 29 15:23:44 CET,Mon Nov 29 17:15:53 CET,0.0 1.21 1.557 1.83 2.072 2.257 2.409 2.552 2.79 2.907 3.015 3.098 3.285 3.371 3.552 3.717 3.877 3.954 4.095 4.234 4.429 4.544 4.65 4.813 4.98 5.141 5.287 5.436 5.637 5.827 6.0 6.214 6.432 6.631 6.854 7.101 7.344 7.601 7.869 8.156 8.462 8.815 9.208 9.589 10.037 10.516 11.056 11.673 12.328 12.991 13.594 13.826 13.835 13.666 13.351 13.038 12.734 12.414 12.14 11.846 11.572 11.331 11.083 10.826 10.594 10.373 10.143 9.947 9.77 9.594 9.397 9.211 9.022 8.842 8.7 8.54 8.38 8.213 8.038 7.915 7.771 7.528 7.365 7.207 7.127 6.966 6.795 6.6 6.494 6.292 6.146 6.016 5.89 5.604 5.444 5.271 5.088 4.871 4.637 4.32 3.116 -2 ,30446 ,TETRA ,17616897,Mon Nov 29 15:24:39 CET,Mon Nov 29 17:18:53 CET,0.0 0.459 0.717 0.924 1.085 1.221 1.354 1.475 1.722 1.845 1.948 2.041 2.228 2.317 2.498 2.655 2.804 2.885 3.05 3.209 3.431 3.566 3.69 3.873 4.051 4.205 4.349 4.486 4.661 4.837 5.014 5.23 5.427 5.615 5.849 6.097 6.32 6.574 6.851 7.155 7.463 7.79 8.17 8.572 9.036 9.525 10.076 10.669 11.347 12.103 12.863 13.223 13.178 12.958 12.711 12.429 12.129 11.854 11.62 11.362 11.096 10.837 10.575 10.319 10.086 9.872 9.651 9.459 9.293 9.102 8.895 8.707 8.499 8.304 8.167 8.025 7.867 7.691 7.494 7.352 7.207 6.977 6.814 6.659 6.584 6.41 6.222 6.021 5.902 5.695 5.587 5.478 5.352 5.076 4.926 4.764 4.569 4.337 4.076 3.765 2.9 -3 ,22579 ,TETRA ,17616898,Mon Nov 29 15:25:33 CET,Mon Nov 29 17:21:27 CET,0.0 0.585 0.85 1.054 1.228 1.409 1.58 1.713 1.923 2.028 2.136 2.244 2.438 2.52 2.673 2.837 2.993 3.069 3.203 3.328 3.511 3.618 3.727 3.893 4.066 4.229 4.373 4.507 4.687 4.868 5.048 5.291 5.514 5.704 5.912 6.139 6.365 6.631 6.922 7.214 7.528 7.886 8.283 8.671 9.149 9.691 10.27 10.887 11.6 12.357 13.057 13.419 13.413 13.238 13.02 12.773 12.507 12.219 11.949 11.661 11.387 11.158 10.956 10.744 10.532 10.336 10.118 9.899 9.714 9.539 9.321 9.123 8.929 8.726 8.57 8.412 8.258 8.107 7.938 7.814 7.687 7.494 7.345 7.181 7.102 6.919 6.714 6.523 6.422 6.227 6.112 5.983 5.856 5.58 5.434 5.277 5.096 4.895 4.669 4.391 3.149 -4 ,24175 ,TETRA ,17616899,Mon Nov 29 15:26:33 CET,Mon Nov 29 17:06:21 CET,0.0 1.204 1.567 1.797 1.975 2.123 2.27 2.419 2.691 2.81 2.912 3.004 3.202 3.297 3.449 3.593 3.743 3.821 3.968 4.112 4.325 4.442 4.559 4.734 4.912 5.096 5.253 5.393 5.578 5.753 5.914 6.117 6.319 6.504 6.72 6.981 7.234 7.507 7.811 8.119 8.411 8.743 9.139 9.532 9.986 10.499 11.09 11.69 12.336 13.02 13.734 14.078 14.067 13.938 13.727 13.391 13.021 12.686 12.39 12.112 11.864 11.626 11.401 11.191 10.963 10.734 10.52 10.317 10.114 9.891 9.646 9.447 9.266 9.093 8.953 8.793 8.626 8.456 8.28 8.161 8.036 7.849 7.71 7.557 7.486 7.332 7.163 6.968 6.853 6.644 6.497 6.366 6.234 5.955 5.793 5.621 5.426 5.207 4.952 4.527 3.255 -5 ,30101 ,TETRA ,17616900,Mon Nov 29 15:26:33 CET,Mon Nov 29 17:25:10 CET,0.0 0.935 1.183 1.367 1.54 1.716 1.875 2.006 2.235 2.354 2.463 2.55 2.738 2.826 3.0 3.157 3.313 3.389 3.532 3.661 3.834 3.938 4.032 4.189 4.351 4.525 4.703 4.851 5.031 5.21 5.38 5.583 5.776 5.964 6.187 6.447 6.694 6.94 7.205 7.512 7.845 8.201 8.589 8.978 9.435 9.925 10.516 11.155 11.838 12.617 13.319 13.594 13.609 13.496 13.242 12.966 12.696 12.399 12.122 11.822 11.573 11.339 11.091 10.822 10.58 10.386 10.166 9.971 9.796 9.581 9.36 9.195 9.013 8.822 8.672 8.505 8.324 8.12 7.917 7.789 7.651 7.447 7.306 7.147 7.063 6.885 6.69 6.485 6.377 6.175 6.049 5.926 5.789 5.478 5.308 5.137 4.951 4.75 4.507 4.163 3.411 -6 ,5909 ,TETRA ,17616901,Mon Nov 29 15:26:33 CET,Mon Nov 29 17:22:55 CET,0.0 0.449 0.697 0.956 1.147 1.29 1.414 1.553 1.815 1.925 2.026 2.097 2.285 2.388 2.565 2.706 2.842 2.908 3.033 3.152 3.333 3.45 3.567 3.741 3.903 4.06 4.214 4.356 4.534 4.714 4.891 5.109 5.321 5.522 5.773 6.078 6.345 6.614 6.906 7.208 7.504 7.839 8.242 8.65 9.112 9.602 10.171 10.789 11.454 12.177 12.872 13.199 13.183 12.991 12.742 12.458 12.162 11.867 11.606 11.311 11.031 10.793 10.543 10.293 10.066 9.858 9.64 9.434 9.267 9.081 8.875 8.71 8.54 8.348 8.195 8.036 7.865 7.682 7.491 7.363 7.23 7.019 6.876 6.744 6.675 6.509 6.32 6.123 6.017 5.816 5.695 5.57 5.448 5.19 5.037 4.861 4.643 4.405 4.132 3.778 3.093 -7 ,25744 ,TETRA ,17616902,Mon Nov 29 15:26:35 CET,Mon Nov 29 17:22:55 CET,0.0 1.488 1.869 2.139 2.31 2.454 2.582 2.692 2.912 3.012 3.109 3.203 3.379 3.453 3.617 3.788 3.957 4.035 4.183 4.323 4.523 4.654 4.768 4.921 5.079 5.229 5.368 5.508 5.708 5.906 6.076 6.269 6.459 6.656 6.885 7.149 7.397 7.655 7.931 8.226 8.546 8.91 9.321 9.731 10.19 10.666 11.212 11.829 12.516 13.231 13.884 14.108 13.999 13.751 13.454 13.113 12.797 12.516 12.257 11.965 11.692 11.447 11.192 10.948 10.726 10.521 10.306 10.108 9.932 9.748 9.546 9.367 9.182 8.989 8.824 8.658 8.506 8.334 8.155 8.032 7.901 7.713 7.575 7.428 7.346 7.165 6.97 6.767 6.663 6.462 6.335 6.224 6.108 5.862 5.724 5.562 5.376 5.152 4.877 4.528 3.744 -8 ,31618 ,TETRA ,17616903,Mon Nov 29 15:27:38 CET,Mon Nov 29 17:24:07 CET,0.0 0.609 0.897 1.1 1.304 1.478 1.621 1.753 1.999 2.132 2.253 2.338 2.523 2.612 2.794 2.963 3.105 3.169 3.301 3.427 3.596 3.705 3.823 3.994 4.141 4.296 4.448 4.591 4.772 4.944 5.116 5.319 5.509 5.708 5.935 6.179 6.42 6.681 6.96 7.245 7.542 7.902 8.326 8.742 9.224 9.74 10.335 10.964 11.617 12.304 12.963 13.286 13.262 13.093 12.866 12.616 12.33 12.002 11.705 11.409 11.156 10.925 10.67 10.426 10.205 9.997 9.771 9.556 9.36 9.154 8.941 8.762 8.587 8.392 8.234 8.069 7.899 7.723 7.535 7.409 7.278 7.068 6.926 6.776 6.695 6.521 6.331 6.138 6.037 5.835 5.69 5.569 5.451 5.139 4.93 4.719 4.533 4.313 4.031 3.694 2.502 -9 ,16507 ,TETRA ,17616904,Mon Nov 29 15:27:39 CET,Mon Nov 29 17:08:03 CET,0.0 0.936 1.267 1.485 1.658 1.808 1.946 2.09 2.323 2.419 2.516 2.608 2.801 2.887 3.042 3.193 3.341 3.418 3.556 3.686 3.879 3.994 4.105 4.268 4.439 4.605 4.754 4.898 5.094 5.293 5.487 5.71 5.915 6.117 6.353 6.604 6.836 7.101 7.383 7.684 8.012 8.362 8.749 9.147 9.6 10.105 10.69 11.299 11.971 12.679 13.346 13.652 13.594 13.397 13.198 12.938 12.648 12.365 12.094 11.815 11.555 11.309 11.059 10.822 10.612 10.408 10.185 9.986 9.809 9.628 9.433 9.259 9.062 8.851 8.698 8.534 8.359 8.184 8.006 7.883 7.76 7.54 7.386 7.244 7.163 6.983 6.799 6.608 6.509 6.317 6.187 6.064 5.945 5.68 5.537 5.378 5.166 4.944 4.675 4.306 3.055 -10 ,17841 ,TETRA ,17616905,Mon Nov 29 15:29:34 CET,Mon Nov 29 17:09:36 CET,0.0 0.724 0.998 1.222 1.396 1.583 1.751 1.882 2.114 2.224 2.336 2.477 2.685 2.773 2.922 3.059 3.201 3.276 3.414 3.535 3.72 3.838 3.955 4.14 4.317 4.48 4.631 4.773 4.951 5.125 5.292 5.486 5.693 5.901 6.135 6.388 6.645 6.925 7.193 7.48 7.794 8.139 8.544 8.949 9.396 9.874 10.413 11.02 11.671 12.387 13.12 13.453 13.422 13.224 12.972 12.689 12.368 12.015 11.7 11.387 11.127 10.888 10.643 10.413 10.19 9.984 9.755 9.537 9.348 9.154 8.95 8.768 8.579 8.38 8.214 8.047 7.904 7.773 7.631 7.526 7.422 7.275 7.168 7.041 6.974 6.841 6.7 6.529 6.437 6.255 6.158 6.051 5.955 5.754 5.645 5.527 5.397 5.239 5.036 4.8 4.268 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 2ba7b83e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24236 ,TETRA ,17616906,Mon Nov 29 15:28:33 CET,Mon Nov 29 17:07:21 CET,0.0 0.181 0.309 0.403 0.47 0.518 0.555 0.587 0.648 0.683 0.714 0.649 0.779 0.806 0.846 0.887 0.924 0.941 0.97 0.99 1.024 1.047 1.063 1.086 1.109 1.123 1.132 1.149 1.168 1.184 1.195 1.201 1.214 1.214 1.207 1.198 1.178 1.14 1.092 1.042 0.978 0.886 0.734 0.553 0.297 -0.067 -0.569 -1.28 -2.32 -3.889 -6.527 -9.739 -12.347 -14.593 -16.502 -18.144 -19.539 -20.767 -21.812 -22.846 -23.756 -24.561 -25.315 -26.017 -26.676 -27.279 -27.87 -28.391 -28.845 -29.306 -29.789 -30.209 -30.64 -31.058 -31.393 -31.75 -32.117 -32.501 -32.892 -33.159 -33.431 -33.845 -34.13 -34.434 -34.601 -34.947 -35.287 -35.646 -35.836 -36.173 -36.44 -36.66 -36.883 -37.366 -37.635 -37.921 -38.235 -38.595 -39.028 -39.62 -41.257 -2 ,15483 ,TETRA ,17616907,Mon Nov 29 15:28:33 CET,Mon Nov 29 17:07:09 CET,0.0 0.22 0.323 0.387 0.438 0.5 0.579 0.646 0.75 0.789 0.823 0.789 0.927 0.959 1.019 1.071 1.116 1.135 1.166 1.188 1.22 1.246 1.274 1.308 1.333 1.345 1.361 1.375 1.391 1.412 1.422 1.422 1.419 1.421 1.414 1.391 1.374 1.373 1.361 1.344 1.289 1.178 1.035 0.858 0.598 0.246 -0.249 -0.914 -1.912 -3.483 -6.163 -9.309 -11.814 -14.041 -15.995 -17.698 -19.195 -20.496 -21.544 -22.602 -23.507 -24.299 -25.053 -25.766 -26.446 -27.052 -27.667 -28.215 -28.693 -29.187 -29.68 -30.092 -30.511 -30.945 -31.284 -31.631 -31.986 -32.359 -32.756 -33.027 -33.306 -33.738 -34.041 -34.349 -34.501 -34.809 -35.148 -35.51 -35.698 -36.029 -36.269 -36.479 -36.705 -37.211 -37.501 -37.808 -38.153 -38.534 -38.958 -39.564 -41.398 -3 ,17521 ,TETRA ,17616908,Mon Nov 29 15:29:34 CET,Mon Nov 29 17:08:40 CET,0.0 0.184 0.278 0.362 0.438 0.507 0.557 0.603 0.699 0.738 0.768 0.725 0.862 0.898 0.957 1.001 1.046 1.066 1.098 1.133 1.183 1.218 1.259 1.328 1.395 1.441 1.459 1.486 1.542 1.559 1.557 1.567 1.572 1.575 1.571 1.562 1.57 1.562 1.53 1.5 1.45 1.366 1.238 1.069 0.882 0.596 0.083 -0.619 -1.624 -3.152 -5.705 -8.739 -11.286 -13.489 -15.396 -17.147 -18.591 -19.835 -20.925 -22.008 -22.916 -23.696 -24.441 -25.143 -25.765 -26.325 -26.922 -27.472 -27.942 -28.427 -28.928 -29.333 -29.757 -30.185 -30.512 -30.866 -31.236 -31.61 -31.988 -32.251 -32.528 -32.966 -33.264 -33.564 -33.715 -34.022 -34.36 -34.725 -34.915 -35.244 -35.481 -35.69 -35.927 -36.432 -36.698 -36.975 -37.266 -37.617 -38.09 -38.693 -40.176 -4 ,22133 ,TETRA ,17616909,Mon Nov 29 15:29:34 CET,Mon Nov 29 17:08:33 CET,0.0 0.144 0.223 0.285 0.349 0.416 0.475 0.516 0.6 0.637 0.677 0.647 0.773 0.802 0.865 0.908 0.948 0.971 1.017 1.059 1.119 1.166 1.209 1.267 1.318 1.361 1.4 1.437 1.493 1.546 1.579 1.611 1.648 1.673 1.699 1.734 1.756 1.759 1.744 1.711 1.639 1.531 1.389 1.224 0.967 0.593 0.074 -0.624 -1.655 -3.267 -5.885 -9.012 -11.543 -13.611 -15.395 -16.987 -18.34 -19.6 -20.704 -21.795 -22.728 -23.534 -24.295 -25.01 -25.651 -26.234 -26.851 -27.386 -27.854 -28.357 -28.863 -29.28 -29.718 -30.166 -30.517 -30.885 -31.245 -31.616 -32.012 -32.283 -32.562 -32.986 -33.271 -33.569 -33.73 -34.056 -34.389 -34.749 -34.941 -35.284 -35.547 -35.758 -35.983 -36.436 -36.691 -36.978 -37.28 -37.64 -38.119 -38.734 -40.442 -5 ,4993 ,TETRA ,17616910,Mon Nov 29 15:29:34 CET,Mon Nov 29 17:08:24 CET,0.0 0.153 0.278 0.366 0.426 0.486 0.538 0.586 0.664 0.704 0.746 0.713 0.842 0.866 0.911 0.961 1.01 1.029 1.062 1.092 1.133 1.159 1.187 1.223 1.256 1.28 1.308 1.335 1.369 1.396 1.404 1.411 1.429 1.429 1.418 1.419 1.423 1.423 1.423 1.405 1.354 1.267 1.135 0.961 0.721 0.408 -0.091 -0.81 -1.859 -3.399 -5.917 -9.019 -11.555 -13.673 -15.473 -17.05 -18.484 -19.817 -20.924 -22.009 -22.983 -23.84 -24.617 -25.318 -25.964 -26.558 -27.177 -27.743 -28.228 -28.72 -29.207 -29.605 -30.029 -30.476 -30.815 -31.148 -31.492 -31.857 -32.233 -32.493 -32.754 -33.168 -33.454 -33.738 -33.885 -34.198 -34.525 -34.883 -35.069 -35.402 -35.662 -35.868 -36.088 -36.581 -36.837 -37.118 -37.452 -37.788 -38.155 -38.648 -40.002 -6 ,28856 ,TETRA ,17616911,Mon Nov 29 15:32:44 CET,Mon Nov 29 17:36:53 CET,0.0 0.17 0.262 0.372 0.473 0.556 0.605 0.653 0.75 0.79 0.827 0.786 0.919 0.943 0.995 1.045 1.079 1.095 1.132 1.17 1.223 1.255 1.292 1.335 1.365 1.388 1.41 1.435 1.458 1.469 1.485 1.504 1.521 1.539 1.55 1.548 1.538 1.504 1.444 1.383 1.317 1.22 1.079 0.93 0.702 0.359 -0.131 -0.826 -1.86 -3.386 -5.924 -8.979 -11.484 -13.534 -15.326 -17.025 -18.528 -19.827 -20.904 -21.971 -22.889 -23.671 -24.389 -25.097 -25.758 -26.351 -26.964 -27.508 -27.969 -28.439 -28.931 -29.341 -29.772 -30.2 -30.533 -30.897 -31.278 -31.693 -32.126 -32.408 -32.693 -33.134 -33.423 -33.715 -33.87 -34.198 -34.553 -34.937 -35.127 -35.458 -35.736 -35.961 -36.199 -36.7 -36.984 -37.289 -37.602 -37.937 -38.349 -38.872 -40.493 -7 ,23169 ,TETRA ,17616912,Mon Nov 29 15:32:43 CET,Mon Nov 29 17:12:49 CET,0.0 0.356 0.453 0.566 0.662 0.718 0.762 0.81 0.905 0.943 0.976 0.94 1.071 1.096 1.148 1.196 1.225 1.244 1.292 1.326 1.366 1.396 1.422 1.458 1.491 1.513 1.531 1.548 1.568 1.596 1.627 1.646 1.658 1.665 1.676 1.688 1.68 1.664 1.638 1.585 1.526 1.441 1.284 1.088 0.829 0.471 -0.053 -0.749 -1.741 -3.282 -5.896 -9.034 -11.532 -13.6 -15.393 -17.001 -18.428 -19.704 -20.769 -21.874 -22.805 -23.596 -24.383 -25.135 -25.798 -26.388 -27.015 -27.57 -28.058 -28.551 -29.045 -29.435 -29.83 -30.256 -30.588 -30.926 -31.279 -31.638 -32.013 -32.281 -32.544 -32.946 -33.232 -33.533 -33.69 -34.018 -34.347 -34.698 -34.882 -35.209 -35.463 -35.663 -35.87 -36.344 -36.607 -36.889 -37.229 -37.613 -38.044 -38.598 -40.433 -8 ,3797 ,TETRA ,17616913,Mon Nov 29 15:32:43 CET,Mon Nov 29 17:27:32 CET,0.0 0.297 0.391 0.477 0.569 0.652 0.724 0.777 0.877 0.928 0.97 0.921 1.051 1.08 1.145 1.204 1.262 1.285 1.314 1.34 1.377 1.404 1.432 1.472 1.509 1.543 1.567 1.593 1.618 1.634 1.65 1.655 1.65 1.646 1.645 1.656 1.667 1.66 1.656 1.658 1.617 1.551 1.463 1.308 1.07 0.732 0.239 -0.433 -1.449 -3.043 -5.719 -8.882 -11.43 -13.6 -15.412 -17.004 -18.378 -19.567 -20.568 -21.577 -22.478 -23.274 -24.014 -24.74 -25.436 -26.064 -26.703 -27.256 -27.717 -28.188 -28.656 -29.035 -29.443 -29.871 -30.203 -30.543 -30.9 -31.267 -31.644 -31.909 -32.18 -32.59 -32.872 -33.175 -33.329 -33.654 -34.003 -34.365 -34.563 -34.917 -35.19 -35.408 -35.635 -36.126 -36.389 -36.66 -36.957 -37.317 -37.748 -38.29 -40.068 -9 ,4840 ,TETRA ,17616914,Mon Nov 29 15:33:38 CET,Mon Nov 29 17:28:32 CET,0.0 0.221 0.34 0.444 0.551 0.626 0.683 0.742 0.845 0.896 0.945 0.942 1.086 1.126 1.181 1.221 1.269 1.291 1.335 1.375 1.427 1.458 1.484 1.52 1.551 1.582 1.607 1.619 1.636 1.663 1.686 1.7 1.703 1.699 1.691 1.678 1.659 1.632 1.603 1.558 1.488 1.392 1.292 1.162 0.921 0.563 0.016 -0.698 -1.686 -3.226 -5.877 -9.06 -11.687 -13.85 -15.633 -17.306 -18.808 -20.097 -21.164 -22.239 -23.134 -23.925 -24.7 -25.422 -26.085 -26.679 -27.272 -27.8 -28.266 -28.752 -29.249 -29.657 -30.092 -30.529 -30.856 -31.197 -31.554 -31.92 -32.311 -32.585 -32.866 -33.318 -33.617 -33.91 -34.063 -34.396 -34.766 -35.159 -35.355 -35.697 -35.966 -36.169 -36.383 -36.862 -37.138 -37.435 -37.762 -38.134 -38.605 -39.257 -41.025 -10 ,21457 ,TETRA ,17616915,Mon Nov 29 15:33:40 CET,Mon Nov 29 17:28:33 CET,0.0 0.158 0.27 0.357 0.431 0.486 0.534 0.58 0.655 0.693 0.728 0.71 0.845 0.87 0.926 0.973 1.016 1.039 1.075 1.1 1.145 1.177 1.204 1.233 1.254 1.277 1.307 1.339 1.379 1.401 1.408 1.424 1.438 1.458 1.487 1.49 1.472 1.452 1.434 1.402 1.33 1.234 1.111 0.964 0.721 0.342 -0.167 -0.849 -1.883 -3.453 -6.046 -9.141 -11.789 -14.046 -15.87 -17.445 -18.788 -20.001 -21.057 -22.082 -22.941 -23.744 -24.499 -25.184 -25.838 -26.43 -27.04 -27.577 -28.039 -28.51 -28.998 -29.4 -29.811 -30.258 -30.609 -30.965 -31.326 -31.704 -32.089 -32.349 -32.628 -33.066 -33.346 -33.635 -33.792 -34.129 -34.464 -34.799 -34.978 -35.313 -35.563 -35.768 -35.993 -36.478 -36.735 -37.021 -37.367 -37.746 -38.149 -38.699 -40.586 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt deleted file mode 100644 index a0173bb9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15561 ,TETRA ,17616916,Mon Nov 29 15:41:40 CET,Mon Nov 29 17:13:01 CET,0.0 0.572 0.821 1.023 1.163 1.256 1.351 1.447 1.601 1.67 1.738 1.805 1.927 1.992 2.135 2.26 2.361 2.406 2.484 2.566 2.693 2.767 2.841 2.955 3.061 3.155 3.242 3.322 3.422 3.529 3.639 3.765 3.879 3.991 4.12 4.261 4.401 4.555 4.706 4.85 4.99 5.141 5.321 5.495 5.678 5.885 6.119 6.359 6.583 6.729 6.771 6.656 6.428 6.146 5.854 5.577 5.32 5.098 4.905 4.694 4.506 4.332 4.166 4.016 3.882 3.748 3.604 3.477 3.367 3.252 3.13 3.029 2.926 2.82 2.735 2.642 2.541 2.433 2.326 2.243 2.162 2.043 1.947 1.847 1.798 1.686 1.566 1.451 1.389 1.263 1.199 1.119 1.024 0.82 0.714 0.611 0.493 0.364 0.236 0.083 -0.324 -2 ,24944 ,TETRA ,17616917,Mon Nov 29 15:49:49 CET,Mon Nov 29 17:27:07 CET,0.0 0.529 0.747 0.907 1.051 1.209 1.331 1.424 1.598 1.677 1.755 1.841 1.976 2.039 2.166 2.299 2.415 2.47 2.578 2.668 2.793 2.873 2.951 3.065 3.164 3.255 3.344 3.429 3.532 3.631 3.732 3.851 3.969 4.083 4.203 4.341 4.475 4.601 4.734 4.883 5.034 5.188 5.371 5.574 5.794 6.008 6.24 6.493 6.722 6.882 6.956 6.802 6.568 6.29 5.999 5.737 5.518 5.303 5.092 4.889 4.707 4.529 4.354 4.202 4.068 3.927 3.774 3.646 3.528 3.411 3.288 3.183 3.074 2.962 2.875 2.782 2.689 2.579 2.464 2.389 2.311 2.187 2.106 2.027 1.981 1.877 1.77 1.645 1.583 1.454 1.36 1.282 1.198 1.007 0.908 0.801 0.677 0.53 0.361 0.149 -0.208 -3 ,22666 ,TETRA ,17616918,Mon Nov 29 22:20:40 CET,Tue Nov 30 00:19:11 CET,0.0 0.547 0.753 0.915 1.054 1.154 1.273 1.384 1.54 1.616 1.692 1.762 1.887 1.948 2.055 2.158 2.257 2.302 2.384 2.458 2.574 2.65 2.729 2.85 2.959 3.057 3.157 3.256 3.373 3.473 3.573 3.693 3.797 3.898 4.013 4.14 4.268 4.399 4.541 4.687 4.841 5.018 5.208 5.387 5.573 5.758 5.974 6.218 6.442 6.619 6.639 6.386 6.087 5.796 5.511 5.229 4.986 4.773 4.588 4.395 4.221 4.057 3.893 3.738 3.589 3.454 3.32 3.194 3.071 2.943 2.823 2.716 2.595 2.471 2.384 2.294 2.191 2.091 1.989 1.919 1.835 1.703 1.614 1.517 1.471 1.374 1.258 1.127 1.058 0.926 0.859 0.784 0.708 0.551 0.464 0.373 0.244 0.084 -0.065 -0.304 -1.009 -4 ,29824 ,TETRA ,17616919,Mon Nov 29 22:20:40 CET,Tue Nov 30 00:36:06 CET,0.0 1.029 1.315 1.507 1.664 1.794 1.92 2.028 2.219 2.301 2.369 2.431 2.56 2.62 2.734 2.843 2.942 2.99 3.08 3.155 3.262 3.335 3.41 3.515 3.617 3.714 3.799 3.893 4.015 4.132 4.245 4.371 4.493 4.608 4.726 4.858 4.985 5.121 5.267 5.417 5.575 5.749 5.947 6.131 6.319 6.526 6.761 6.997 7.224 7.387 7.39 7.189 6.928 6.642 6.344 6.071 5.843 5.606 5.378 5.152 4.966 4.801 4.651 4.494 4.326 4.185 4.043 3.915 3.8 3.676 3.545 3.438 3.323 3.198 3.106 3.008 2.896 2.787 2.688 2.614 2.533 2.412 2.312 2.205 2.158 2.059 1.96 1.855 1.798 1.673 1.607 1.528 1.443 1.268 1.175 1.069 0.926 0.761 0.59 0.345 -0.196 -5 ,22955 ,TETRA ,17616920,Mon Nov 29 22:20:40 CET,Tue Nov 30 00:09:52 CET,0.0 0.576 0.774 0.927 1.058 1.174 1.3 1.412 1.603 1.689 1.762 1.834 1.969 2.035 2.147 2.247 2.337 2.38 2.464 2.545 2.679 2.77 2.847 2.939 3.037 3.136 3.225 3.311 3.421 3.524 3.619 3.73 3.844 3.956 4.073 4.197 4.317 4.442 4.576 4.726 4.886 5.056 5.255 5.466 5.705 5.933 6.133 6.33 6.577 6.783 6.81 6.663 6.472 6.221 5.942 5.653 5.391 5.153 4.943 4.733 4.555 4.394 4.239 4.078 3.92 3.786 3.654 3.533 3.413 3.294 3.175 3.061 2.95 2.845 2.756 2.66 2.547 2.428 2.318 2.249 2.176 2.052 1.959 1.853 1.802 1.714 1.617 1.497 1.436 1.307 1.226 1.147 1.07 0.912 0.82 0.684 0.536 0.374 0.177 -0.091 -0.792 -6 ,6866 ,TETRA ,17616921,Mon Nov 29 22:20:40 CET,Tue Nov 30 00:21:43 CET,0.0 0.558 0.723 0.861 0.984 1.105 1.203 1.295 1.487 1.584 1.659 1.723 1.855 1.92 2.037 2.139 2.232 2.277 2.37 2.459 2.586 2.666 2.741 2.851 2.958 3.055 3.147 3.24 3.364 3.486 3.59 3.706 3.819 3.933 4.075 4.23 4.364 4.51 4.662 4.792 4.927 5.101 5.297 5.455 5.627 5.821 6.055 6.308 6.547 6.719 6.764 6.569 6.262 5.966 5.695 5.434 5.191 4.945 4.731 4.527 4.332 4.158 3.99 3.829 3.681 3.541 3.391 3.247 3.128 3.003 2.859 2.74 2.626 2.515 2.418 2.319 2.218 2.109 1.993 1.913 1.836 1.713 1.626 1.537 1.487 1.39 1.293 1.172 1.11 0.988 0.94 0.869 0.8 0.656 0.559 0.449 0.326 0.185 0.027 -0.239 -0.991 -7 ,721 ,TETRA ,17616922,Mon Nov 29 22:20:40 CET,Tue Nov 30 00:10:26 CET,0.0 0.629 0.828 0.964 1.11 1.252 1.347 1.428 1.593 1.662 1.724 1.789 1.923 1.983 2.097 2.21 2.324 2.375 2.476 2.579 2.709 2.788 2.872 2.986 3.078 3.162 3.248 3.337 3.443 3.546 3.646 3.767 3.881 3.996 4.124 4.254 4.372 4.485 4.606 4.752 4.906 5.082 5.278 5.452 5.641 5.838 6.057 6.28 6.488 6.648 6.723 6.59 6.365 6.119 5.849 5.579 5.334 5.104 4.91 4.696 4.504 4.337 4.154 3.975 3.823 3.699 3.566 3.446 3.336 3.212 3.086 2.98 2.868 2.755 2.667 2.569 2.466 2.365 2.257 2.188 2.122 2.0 1.91 1.829 1.784 1.684 1.572 1.453 1.393 1.263 1.202 1.134 1.055 0.879 0.783 0.677 0.558 0.413 0.21 -0.043 -0.757 -8 ,8040 ,TETRA ,17616923,Mon Nov 29 22:20:41 CET,Tue Nov 30 00:13:30 CET,0.0 0.621 0.861 1.02 1.138 1.238 1.334 1.421 1.587 1.66 1.73 1.804 1.941 2.012 2.148 2.265 2.36 2.405 2.494 2.582 2.725 2.825 2.914 3.02 3.124 3.232 3.34 3.439 3.552 3.662 3.764 3.882 3.989 4.082 4.181 4.304 4.428 4.561 4.705 4.851 4.987 5.137 5.323 5.514 5.716 5.918 6.169 6.421 6.632 6.8 6.856 6.692 6.418 6.149 5.898 5.635 5.392 5.178 4.972 4.753 4.561 4.394 4.238 4.076 3.923 3.791 3.64 3.498 3.381 3.261 3.136 3.026 2.901 2.771 2.679 2.58 2.478 2.381 2.278 2.203 2.132 2.015 1.925 1.82 1.765 1.661 1.55 1.421 1.359 1.233 1.158 1.073 0.982 0.771 0.657 0.565 0.453 0.323 0.183 -0.023 -0.495 -9 ,28808 ,TETRA ,17616924,Mon Nov 29 22:20:41 CET,Mon Nov 29 23:55:14 CET,0.0 0.792 1.023 1.213 1.345 1.447 1.535 1.613 1.762 1.838 1.918 2.014 2.144 2.204 2.326 2.422 2.523 2.577 2.671 2.757 2.885 2.966 3.044 3.159 3.266 3.358 3.451 3.539 3.645 3.751 3.849 3.961 4.073 4.182 4.314 4.449 4.567 4.699 4.828 4.969 5.123 5.276 5.449 5.623 5.812 6.021 6.234 6.436 6.64 6.781 6.803 6.619 6.318 5.973 5.656 5.382 5.13 4.888 4.686 4.476 4.279 4.11 3.958 3.808 3.661 3.524 3.382 3.257 3.151 3.034 2.898 2.796 2.701 2.594 2.502 2.4 2.292 2.192 2.089 2.017 1.944 1.827 1.745 1.662 1.622 1.53 1.424 1.317 1.258 1.124 1.042 0.981 0.908 0.738 0.646 0.534 0.404 0.245 0.054 -0.197 -1.065 -10 ,30332 ,TETRA ,17616925,Mon Nov 29 22:20:41 CET,Mon Nov 29 23:57:12 CET,0.0 0.386 0.635 0.872 1.052 1.19 1.299 1.395 1.567 1.641 1.714 1.796 1.931 2.003 2.119 2.222 2.326 2.372 2.46 2.537 2.642 2.715 2.791 2.9 3.005 3.108 3.197 3.276 3.378 3.485 3.598 3.727 3.832 3.932 4.046 4.163 4.288 4.434 4.582 4.725 4.871 5.035 5.204 5.364 5.547 5.725 5.892 6.078 6.268 6.421 6.466 6.268 5.989 5.715 5.452 5.201 4.962 4.726 4.521 4.306 4.106 3.915 3.737 3.574 3.42 3.289 3.159 3.041 2.939 2.818 2.69 2.592 2.492 2.382 2.293 2.195 2.095 1.997 1.886 1.807 1.723 1.596 1.505 1.404 1.357 1.258 1.154 1.042 0.979 0.85 0.768 0.697 0.633 0.475 0.379 0.278 0.167 -0.001 -0.202 -0.434 -1.243 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt deleted file mode 100644 index 215721f6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8515 ,TETRA ,17616926,Mon Nov 29 22:20:41 CET,Tue Nov 30 00:02:42 CET,0.0 0.694 0.962 1.163 1.316 1.442 1.567 1.676 1.875 1.96 2.038 2.117 2.245 2.295 2.419 2.54 2.637 2.678 2.769 2.863 2.999 3.093 3.177 3.284 3.385 3.487 3.577 3.657 3.764 3.871 3.975 4.102 4.213 4.313 4.435 4.559 4.673 4.794 4.924 5.052 5.174 5.319 5.482 5.627 5.761 5.88 5.99 6.068 6.07 5.933 5.459 4.67 3.93 3.244 2.644 2.115 1.617 1.157 0.753 0.346 0.005 -0.303 -0.594 -0.85 -1.085 -1.311 -1.551 -1.766 -1.947 -2.127 -2.31 -2.466 -2.634 -2.813 -2.947 -3.088 -3.242 -3.398 -3.561 -3.673 -3.791 -3.983 -4.114 -4.252 -4.324 -4.468 -4.613 -4.772 -4.86 -5.021 -5.14 -5.243 -5.345 -5.568 -5.68 -5.804 -5.957 -6.139 -6.324 -6.589 -7.37 -2 ,14004 ,TETRA ,17616927,Mon Nov 29 22:20:41 CET,Tue Nov 30 00:14:50 CET,0.0 0.704 0.957 1.15 1.305 1.419 1.529 1.634 1.798 1.869 1.939 2.02 2.16 2.218 2.327 2.439 2.542 2.59 2.69 2.784 2.903 2.976 3.043 3.138 3.242 3.338 3.423 3.508 3.628 3.742 3.845 3.959 4.06 4.161 4.284 4.423 4.564 4.715 4.848 4.961 5.084 5.22 5.376 5.514 5.636 5.754 5.876 5.972 5.995 5.906 5.503 4.706 3.942 3.272 2.666 2.119 1.665 1.244 0.846 0.46 0.135 -0.178 -0.477 -0.753 -1.02 -1.254 -1.486 -1.712 -1.918 -2.12 -2.319 -2.485 -2.663 -2.846 -2.984 -3.131 -3.284 -3.449 -3.617 -3.724 -3.837 -4.032 -4.168 -4.301 -4.368 -4.508 -4.662 -4.831 -4.925 -5.098 -5.218 -5.32 -5.429 -5.653 -5.772 -5.906 -6.074 -6.302 -6.563 -6.884 -7.838 -3 ,22664 ,TETRA ,17616928,Mon Nov 29 22:20:41 CET,Tue Nov 30 00:14:04 CET,0.0 0.845 1.128 1.307 1.453 1.605 1.753 1.846 1.994 2.082 2.174 2.24 2.361 2.414 2.526 2.638 2.752 2.803 2.898 2.988 3.126 3.208 3.28 3.386 3.489 3.585 3.674 3.757 3.856 3.951 4.043 4.154 4.27 4.382 4.501 4.621 4.743 4.883 5.015 5.14 5.28 5.44 5.606 5.746 5.886 6.015 6.11 6.165 6.13 5.922 5.456 4.717 3.942 3.27 2.716 2.196 1.734 1.323 0.962 0.594 0.263 -0.045 -0.331 -0.601 -0.863 -1.096 -1.333 -1.553 -1.737 -1.918 -2.109 -2.276 -2.45 -2.623 -2.767 -2.928 -3.078 -3.215 -3.363 -3.47 -3.584 -3.754 -3.873 -4.008 -4.081 -4.23 -4.389 -4.556 -4.642 -4.805 -4.927 -5.033 -5.141 -5.396 -5.53 -5.658 -5.826 -6.032 -6.256 -6.53 -7.62 -4 ,28199 ,TETRA ,17616929,Mon Nov 29 22:20:41 CET,Tue Nov 30 00:24:48 CET,0.0 0.89 1.179 1.294 1.398 1.503 1.612 1.712 1.906 1.996 2.06 2.119 2.248 2.297 2.427 2.571 2.698 2.752 2.846 2.931 3.066 3.151 3.219 3.328 3.438 3.534 3.631 3.729 3.847 3.959 4.06 4.17 4.275 4.374 4.486 4.621 4.746 4.867 4.992 5.119 5.239 5.356 5.479 5.609 5.763 5.913 6.033 6.081 6.018 5.836 5.389 4.59 3.84 3.175 2.572 2.035 1.551 1.105 0.733 0.367 0.045 -0.239 -0.504 -0.757 -0.997 -1.222 -1.463 -1.672 -1.849 -2.044 -2.256 -2.418 -2.579 -2.756 -2.898 -3.042 -3.187 -3.344 -3.507 -3.616 -3.731 -3.915 -4.047 -4.18 -4.245 -4.384 -4.543 -4.709 -4.794 -4.963 -5.079 -5.176 -5.272 -5.48 -5.624 -5.787 -5.931 -6.076 -6.273 -6.482 -6.945 -5 ,3469 ,TETRA ,17616930,Mon Nov 29 22:20:42 CET,Tue Nov 30 00:02:04 CET,0.0 0.744 1.016 1.267 1.454 1.576 1.708 1.828 2.011 2.093 2.165 2.221 2.352 2.417 2.533 2.644 2.769 2.828 2.919 2.999 3.132 3.217 3.292 3.389 3.481 3.587 3.689 3.775 3.889 3.997 4.096 4.215 4.317 4.409 4.526 4.655 4.779 4.914 5.055 5.183 5.297 5.429 5.585 5.723 5.857 5.977 6.094 6.168 6.15 5.994 5.528 4.73 3.963 3.297 2.705 2.166 1.677 1.206 0.798 0.417 0.097 -0.198 -0.482 -0.753 -1.005 -1.243 -1.497 -1.711 -1.892 -2.084 -2.282 -2.447 -2.616 -2.789 -2.932 -3.083 -3.229 -3.374 -3.535 -3.658 -3.779 -3.955 -4.079 -4.201 -4.271 -4.413 -4.549 -4.712 -4.801 -4.959 -5.048 -5.149 -5.257 -5.486 -5.616 -5.752 -5.892 -6.03 -6.184 -6.4 -6.961 -6 ,22135 ,TETRA ,17616931,Mon Nov 29 22:20:42 CET,Tue Nov 30 00:15:17 CET,0.0 0.879 1.071 1.233 1.417 1.548 1.649 1.761 1.935 2.021 2.116 2.228 2.383 2.453 2.571 2.69 2.808 2.858 2.941 3.022 3.144 3.225 3.303 3.419 3.521 3.614 3.705 3.794 3.904 3.998 4.096 4.228 4.349 4.448 4.555 4.675 4.787 4.917 5.045 5.17 5.299 5.436 5.589 5.719 5.862 6.004 6.127 6.193 6.174 5.997 5.639 4.932 4.157 3.497 2.883 2.302 1.819 1.393 1.021 0.636 0.298 0.004 -0.287 -0.56 -0.801 -1.02 -1.253 -1.476 -1.668 -1.858 -2.063 -2.237 -2.413 -2.592 -2.742 -2.899 -3.047 -3.201 -3.378 -3.498 -3.612 -3.8 -3.931 -4.073 -4.154 -4.314 -4.479 -4.656 -4.743 -4.908 -5.036 -5.142 -5.244 -5.476 -5.619 -5.785 -5.973 -6.175 -6.369 -6.646 -7.677 -7 ,25391 ,TETRA ,17616932,Mon Nov 29 22:20:42 CET,Tue Nov 30 00:14:20 CET,0.0 0.647 0.844 1.002 1.162 1.297 1.427 1.536 1.756 1.852 1.924 1.984 2.123 2.186 2.294 2.409 2.541 2.612 2.731 2.822 2.954 3.038 3.108 3.217 3.328 3.432 3.522 3.602 3.708 3.814 3.918 4.047 4.158 4.254 4.36 4.467 4.574 4.692 4.817 4.948 5.077 5.217 5.366 5.494 5.617 5.718 5.808 5.869 5.853 5.679 5.169 4.377 3.657 2.987 2.378 1.844 1.372 0.932 0.543 0.156 -0.173 -0.486 -0.783 -1.038 -1.267 -1.479 -1.708 -1.919 -2.106 -2.3 -2.493 -2.655 -2.837 -3.024 -3.167 -3.312 -3.459 -3.609 -3.769 -3.884 -3.996 -4.168 -4.3 -4.443 -4.514 -4.648 -4.809 -5.006 -5.1 -5.272 -5.383 -5.479 -5.571 -5.791 -5.922 -6.053 -6.204 -6.374 -6.554 -6.77 -7.179 -8 ,26315 ,TETRA ,17616933,Mon Nov 29 22:20:41 CET,Tue Nov 30 00:08:57 CET,0.0 0.411 0.662 0.83 0.973 1.112 1.246 1.352 1.508 1.593 1.679 1.78 1.927 1.991 2.11 2.218 2.331 2.385 2.48 2.57 2.692 2.77 2.844 2.954 3.061 3.157 3.259 3.359 3.497 3.634 3.73 3.841 3.953 4.056 4.175 4.301 4.428 4.557 4.68 4.823 4.97 5.112 5.258 5.389 5.517 5.648 5.77 5.831 5.82 5.692 5.184 4.355 3.628 2.985 2.416 1.897 1.418 0.965 0.584 0.192 -0.142 -0.437 -0.724 -0.995 -1.241 -1.47 -1.726 -1.948 -2.131 -2.334 -2.546 -2.709 -2.873 -3.048 -3.181 -3.32 -3.468 -3.615 -3.776 -3.886 -3.998 -4.177 -4.301 -4.429 -4.496 -4.635 -4.782 -4.937 -5.019 -5.182 -5.298 -5.411 -5.541 -5.81 -5.949 -6.101 -6.26 -6.463 -6.701 -6.97 -7.751 -9 ,23212 ,TETRA ,17616934,Mon Nov 29 22:20:42 CET,Tue Nov 30 00:35:30 CET,0.0 0.467 0.643 0.792 0.928 1.033 1.143 1.249 1.42 1.511 1.606 1.688 1.82 1.888 2.015 2.11 2.218 2.27 2.365 2.461 2.592 2.679 2.767 2.882 2.979 3.07 3.155 3.241 3.357 3.483 3.595 3.715 3.827 3.928 4.046 4.181 4.299 4.421 4.557 4.678 4.809 4.958 5.098 5.235 5.388 5.505 5.591 5.653 5.606 5.412 5.0 4.262 3.492 2.786 2.159 1.604 1.119 0.681 0.305 -0.076 -0.417 -0.724 -1.001 -1.27 -1.527 -1.748 -1.985 -2.194 -2.371 -2.562 -2.77 -2.94 -3.112 -3.283 -3.412 -3.551 -3.693 -3.855 -4.025 -4.135 -4.254 -4.445 -4.576 -4.713 -4.782 -4.921 -5.062 -5.208 -5.288 -5.447 -5.541 -5.638 -5.741 -5.953 -6.067 -6.188 -6.343 -6.519 -6.718 -7.0 -8.151 -10 ,28375 ,TETRA ,17616935,Mon Nov 29 22:20:42 CET,Tue Nov 30 00:02:48 CET,0.0 0.629 0.814 0.959 1.091 1.203 1.295 1.384 1.55 1.628 1.706 1.787 1.925 1.987 2.109 2.223 2.318 2.367 2.477 2.589 2.731 2.812 2.889 3.003 3.119 3.228 3.325 3.421 3.541 3.635 3.732 3.865 3.992 4.12 4.26 4.398 4.518 4.637 4.754 4.871 5.0 5.14 5.274 5.395 5.524 5.653 5.77 5.83 5.823 5.686 5.225 4.483 3.753 3.072 2.454 1.887 1.412 0.976 0.579 0.186 -0.143 -0.439 -0.719 -0.985 -1.228 -1.439 -1.665 -1.863 -2.041 -2.228 -2.433 -2.612 -2.786 -2.959 -3.098 -3.25 -3.413 -3.57 -3.73 -3.85 -3.976 -4.168 -4.299 -4.445 -4.519 -4.675 -4.832 -4.984 -5.066 -5.235 -5.341 -5.435 -5.539 -5.783 -5.925 -6.062 -6.207 -6.38 -6.595 -6.851 -7.645 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt deleted file mode 100644 index 8712f56e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22827 ,TETRA ,17616936,Mon Nov 29 22:20:43 CET,Tue Nov 30 00:15:21 CET,0.0 0.74 1.042 1.276 1.469 1.62 1.752 1.861 2.057 2.156 2.252 2.35 2.499 2.571 2.708 2.838 2.969 3.034 3.147 3.242 3.377 3.468 3.553 3.68 3.8 3.912 4.022 4.122 4.246 4.368 4.485 4.625 4.76 4.883 5.003 5.139 5.262 5.392 5.529 5.678 5.849 6.033 6.204 6.348 6.523 6.688 6.818 6.912 6.943 6.826 6.323 5.503 4.772 4.097 3.475 2.891 2.396 1.952 1.558 1.179 0.879 0.603 0.317 0.05 -0.196 -0.42 -0.655 -0.871 -1.057 -1.255 -1.468 -1.646 -1.824 -2.004 -2.141 -2.283 -2.436 -2.587 -2.74 -2.844 -2.956 -3.146 -3.284 -3.421 -3.487 -3.623 -3.774 -3.932 -4.012 -4.173 -4.275 -4.377 -4.488 -4.693 -4.799 -4.931 -5.09 -5.266 -5.457 -5.733 -6.497 -2 ,27727 ,TETRA ,17616937,Mon Nov 29 22:20:43 CET,Tue Nov 30 00:14:35 CET,0.0 0.573 0.839 1.029 1.177 1.312 1.436 1.534 1.704 1.786 1.868 1.952 2.104 2.19 2.347 2.481 2.617 2.679 2.797 2.907 3.041 3.129 3.22 3.352 3.473 3.579 3.687 3.798 3.932 4.061 4.187 4.318 4.432 4.539 4.665 4.803 4.948 5.103 5.24 5.38 5.526 5.679 5.833 5.988 6.148 6.277 6.382 6.463 6.483 6.351 5.928 5.201 4.469 3.799 3.212 2.663 2.186 1.747 1.354 0.967 0.644 0.354 0.066 -0.205 -0.47 -0.702 -0.941 -1.176 -1.372 -1.568 -1.768 -1.925 -2.088 -2.265 -2.4 -2.535 -2.68 -2.839 -3.01 -3.133 -3.26 -3.438 -3.554 -3.695 -3.769 -3.911 -4.071 -4.236 -4.322 -4.494 -4.625 -4.729 -4.829 -5.052 -5.175 -5.308 -5.441 -5.584 -5.755 -5.998 -6.568 -3 ,15604 ,TETRA ,17616938,Mon Nov 29 22:22:33 CET,Tue Nov 30 00:24:57 CET,0.0 0.627 0.85 1.022 1.199 1.357 1.476 1.575 1.796 1.902 1.999 2.12 2.265 2.339 2.484 2.622 2.743 2.802 2.918 3.023 3.175 3.273 3.368 3.504 3.622 3.73 3.83 3.924 4.055 4.181 4.291 4.43 4.569 4.686 4.812 4.954 5.084 5.226 5.378 5.533 5.682 5.832 5.997 6.173 6.35 6.487 6.605 6.672 6.675 6.547 6.101 5.408 4.719 4.062 3.481 2.921 2.436 2.015 1.614 1.201 0.859 0.551 0.26 0.001 -0.246 -0.462 -0.685 -0.892 -1.066 -1.255 -1.461 -1.632 -1.816 -2.01 -2.16 -2.3 -2.443 -2.597 -2.757 -2.872 -2.992 -3.18 -3.303 -3.434 -3.503 -3.646 -3.798 -3.96 -4.041 -4.202 -4.343 -4.451 -4.555 -4.801 -4.938 -5.077 -5.235 -5.399 -5.606 -5.882 -6.677 -4 ,6334 ,TETRA ,17616939,Mon Nov 29 22:20:43 CET,Tue Nov 30 00:11:31 CET,0.0 0.679 0.929 1.141 1.316 1.458 1.597 1.727 1.954 2.057 2.147 2.239 2.395 2.466 2.594 2.722 2.845 2.903 3.006 3.101 3.244 3.341 3.435 3.558 3.675 3.786 3.888 3.994 4.121 4.239 4.355 4.49 4.617 4.732 4.867 5.013 5.143 5.281 5.417 5.559 5.714 5.886 6.072 6.229 6.382 6.537 6.693 6.812 6.849 6.766 6.431 5.72 5.026 4.383 3.79 3.237 2.745 2.309 1.936 1.557 1.22 0.928 0.658 0.405 0.164 -0.069 -0.33 -0.56 -0.754 -0.956 -1.157 -1.334 -1.514 -1.691 -1.828 -1.971 -2.12 -2.279 -2.451 -2.564 -2.674 -2.844 -2.97 -3.108 -3.178 -3.32 -3.471 -3.632 -3.723 -3.894 -4.001 -4.1 -4.213 -4.433 -4.553 -4.685 -4.839 -5.042 -5.266 -5.523 -6.383 -5 ,20281 ,TETRA ,17616940,Mon Nov 29 22:20:43 CET,Tue Nov 30 00:14:32 CET,0.0 0.694 0.947 1.162 1.326 1.469 1.603 1.722 1.913 1.989 2.064 2.133 2.263 2.324 2.445 2.563 2.681 2.737 2.843 2.941 3.078 3.172 3.259 3.381 3.503 3.616 3.719 3.808 3.925 4.043 4.159 4.293 4.41 4.531 4.672 4.817 4.95 5.086 5.224 5.371 5.528 5.709 5.897 6.031 6.184 6.351 6.49 6.584 6.592 6.462 6.025 5.27 4.528 3.896 3.336 2.773 2.282 1.842 1.457 1.076 0.751 0.46 0.161 -0.112 -0.363 -0.596 -0.838 -1.064 -1.259 -1.46 -1.686 -1.875 -2.044 -2.209 -2.342 -2.487 -2.645 -2.806 -2.953 -3.06 -3.178 -3.372 -3.507 -3.645 -3.711 -3.843 -3.998 -4.156 -4.229 -4.384 -4.492 -4.594 -4.691 -4.889 -5.0 -5.134 -5.288 -5.465 -5.69 -5.961 -6.711 -6 ,2967 ,TETRA ,17616941,Mon Nov 29 22:20:43 CET,Tue Nov 30 00:17:02 CET,0.0 0.759 1.001 1.203 1.39 1.549 1.666 1.768 1.958 2.043 2.127 2.211 2.352 2.42 2.552 2.671 2.786 2.841 2.937 3.031 3.171 3.263 3.358 3.498 3.624 3.728 3.824 3.921 4.045 4.159 4.272 4.408 4.535 4.656 4.793 4.936 5.078 5.226 5.369 5.52 5.679 5.851 6.027 6.187 6.351 6.489 6.613 6.698 6.717 6.595 6.104 5.343 4.609 3.952 3.366 2.829 2.362 1.907 1.496 1.097 0.774 0.483 0.202 -0.053 -0.307 -0.536 -0.762 -0.96 -1.124 -1.313 -1.521 -1.688 -1.87 -2.061 -2.209 -2.361 -2.515 -2.675 -2.851 -2.979 -3.1 -3.278 -3.401 -3.527 -3.599 -3.759 -3.919 -4.074 -4.163 -4.337 -4.453 -4.556 -4.668 -4.93 -5.069 -5.199 -5.33 -5.499 -5.703 -5.954 -6.466 -7 ,18747 ,TETRA ,17616942,Mon Nov 29 22:20:43 CET,Tue Nov 30 00:20:02 CET,0.0 0.434 0.616 0.793 0.981 1.139 1.27 1.379 1.572 1.661 1.737 1.816 1.962 2.029 2.157 2.285 2.417 2.481 2.585 2.686 2.836 2.924 3.007 3.136 3.264 3.375 3.477 3.576 3.699 3.811 3.919 4.047 4.17 4.288 4.429 4.581 4.724 4.879 5.025 5.176 5.346 5.521 5.698 5.871 6.039 6.193 6.335 6.442 6.479 6.352 5.866 5.114 4.434 3.793 3.225 2.719 2.276 1.85 1.452 1.066 0.739 0.446 0.174 -0.079 -0.331 -0.582 -0.839 -1.065 -1.261 -1.448 -1.636 -1.802 -1.985 -2.172 -2.314 -2.463 -2.614 -2.775 -2.953 -3.077 -3.2 -3.392 -3.528 -3.665 -3.734 -3.877 -4.03 -4.2 -4.289 -4.451 -4.555 -4.654 -4.766 -5.018 -5.146 -5.293 -5.446 -5.598 -5.788 -6.085 -6.851 -8 ,9475 ,TETRA ,17616943,Mon Nov 29 22:20:44 CET,Tue Nov 30 00:22:44 CET,0.0 0.538 0.791 0.991 1.163 1.331 1.483 1.623 1.86 1.948 2.035 2.145 2.302 2.379 2.509 2.625 2.745 2.805 2.921 3.034 3.191 3.291 3.385 3.519 3.65 3.765 3.874 3.977 4.103 4.222 4.329 4.457 4.588 4.708 4.848 5.006 5.151 5.301 5.435 5.567 5.724 5.889 6.043 6.194 6.356 6.511 6.661 6.753 6.772 6.624 6.171 5.462 4.768 4.115 3.516 2.977 2.469 2.014 1.629 1.222 0.88 0.593 0.308 0.037 -0.21 -0.444 -0.692 -0.909 -1.105 -1.312 -1.528 -1.703 -1.875 -2.054 -2.189 -2.344 -2.511 -2.661 -2.817 -2.943 -3.07 -3.255 -3.378 -3.503 -3.571 -3.727 -3.884 -4.039 -4.12 -4.284 -4.396 -4.489 -4.585 -4.828 -4.975 -5.128 -5.297 -5.499 -5.734 -6.07 -7.05 -9 ,19644 ,TETRA ,17616944,Mon Nov 29 22:20:44 CET,Tue Nov 30 00:20:14 CET,0.0 0.599 0.845 1.027 1.198 1.365 1.502 1.619 1.84 1.932 2.014 2.088 2.23 2.305 2.447 2.579 2.7 2.755 2.867 2.971 3.11 3.207 3.304 3.435 3.556 3.664 3.758 3.852 3.982 4.101 4.206 4.326 4.44 4.552 4.679 4.818 4.943 5.066 5.201 5.335 5.466 5.617 5.78 5.928 6.069 6.211 6.361 6.47 6.491 6.363 5.972 5.304 4.6 3.939 3.371 2.852 2.36 1.912 1.542 1.173 0.848 0.543 0.254 -0.003 -0.248 -0.479 -0.706 -0.904 -1.087 -1.288 -1.496 -1.665 -1.838 -2.013 -2.149 -2.297 -2.445 -2.594 -2.755 -2.868 -2.989 -3.182 -3.311 -3.441 -3.508 -3.657 -3.829 -3.993 -4.076 -4.242 -4.339 -4.429 -4.528 -4.748 -4.88 -5.026 -5.186 -5.401 -5.665 -5.967 -6.997 -10 ,10232 ,TETRA ,17616945,Mon Nov 29 22:20:44 CET,Tue Nov 30 00:14:51 CET,0.0 0.637 0.9 1.128 1.29 1.435 1.57 1.686 1.887 1.979 2.072 2.177 2.329 2.408 2.546 2.667 2.781 2.835 2.941 3.049 3.201 3.288 3.378 3.507 3.626 3.751 3.869 3.965 4.082 4.196 4.305 4.427 4.548 4.669 4.797 4.934 5.062 5.201 5.365 5.52 5.655 5.798 5.978 6.165 6.347 6.507 6.653 6.748 6.807 6.762 6.331 5.537 4.787 4.139 3.585 3.092 2.646 2.207 1.833 1.474 1.15 0.858 0.573 0.301 0.062 -0.155 -0.393 -0.597 -0.77 -0.966 -1.167 -1.327 -1.5 -1.673 -1.813 -1.976 -2.129 -2.282 -2.448 -2.563 -2.688 -2.883 -3.015 -3.151 -3.221 -3.364 -3.513 -3.673 -3.749 -3.905 -4.019 -4.134 -4.259 -4.501 -4.63 -4.778 -4.926 -5.068 -5.284 -5.603 -6.233 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt deleted file mode 100644 index f82ad874..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26216 ,TETRA ,17616946,Mon Nov 29 22:20:44 CET,Tue Nov 30 00:13:39 CET,0.0 0.229 0.403 0.55 0.669 0.762 0.853 0.938 1.091 1.162 1.224 1.277 1.414 1.474 1.587 1.693 1.786 1.833 1.927 2.014 2.139 2.214 2.286 2.388 2.494 2.609 2.712 2.811 2.943 3.071 3.193 3.336 3.468 3.585 3.723 3.888 4.045 4.222 4.416 4.626 4.851 5.087 5.37 5.664 5.99 6.347 6.746 7.168 7.664 8.197 8.671 8.846 8.825 8.738 8.569 8.351 8.158 7.961 7.758 7.546 7.347 7.153 6.958 6.771 6.598 6.431 6.224 6.026 5.857 5.682 5.499 5.347 5.195 5.033 4.903 4.766 4.612 4.458 4.293 4.167 4.042 3.855 3.716 3.562 3.481 3.295 3.091 2.908 2.806 2.621 2.447 2.309 2.161 1.835 1.63 1.427 1.224 0.954 0.609 0.101 -1.786 -2 ,30934 ,TETRA ,17616947,Mon Nov 29 22:20:44 CET,Tue Nov 30 00:14:06 CET,0.0 0.72 0.955 1.098 1.23 1.365 1.478 1.575 1.749 1.811 1.863 1.91 2.042 2.095 2.193 2.29 2.382 2.432 2.536 2.634 2.757 2.83 2.91 3.029 3.14 3.241 3.335 3.431 3.557 3.667 3.768 3.907 4.052 4.187 4.34 4.506 4.668 4.855 5.048 5.254 5.472 5.715 5.998 6.286 6.621 6.997 7.403 7.826 8.29 8.794 9.336 9.575 9.504 9.361 9.195 9.003 8.798 8.559 8.314 8.073 7.876 7.699 7.498 7.289 7.088 6.892 6.703 6.527 6.358 6.182 6.004 5.857 5.704 5.538 5.403 5.264 5.109 4.939 4.767 4.644 4.505 4.285 4.136 3.983 3.906 3.738 3.561 3.357 3.246 3.068 2.879 2.744 2.599 2.3 2.128 1.943 1.732 1.471 1.178 0.766 -0.576 -3 ,27987 ,TETRA ,17616948,Mon Nov 29 22:20:44 CET,Tue Nov 30 00:16:08 CET,0.0 0.748 1.018 1.196 1.315 1.413 1.513 1.62 1.798 1.86 1.92 1.966 2.102 2.169 2.283 2.387 2.488 2.536 2.618 2.7 2.833 2.919 2.996 3.111 3.216 3.315 3.415 3.513 3.646 3.771 3.876 4.008 4.146 4.279 4.429 4.608 4.778 4.954 5.156 5.37 5.593 5.833 6.102 6.365 6.66 6.987 7.382 7.828 8.327 8.843 9.279 9.497 9.496 9.38 9.223 9.033 8.826 8.607 8.404 8.174 7.943 7.742 7.557 7.358 7.164 6.99 6.795 6.61 6.44 6.256 6.064 5.911 5.763 5.596 5.464 5.316 5.154 4.989 4.82 4.701 4.573 4.373 4.232 4.08 4.0 3.836 3.666 3.478 3.376 3.201 3.032 2.912 2.777 2.483 2.302 2.101 1.902 1.642 1.299 0.851 -0.249 -4 ,11041 ,TETRA ,17616949,Mon Nov 29 22:20:45 CET,Tue Nov 30 00:19:28 CET,0.0 0.473 0.639 0.773 0.898 1.01 1.128 1.23 1.389 1.455 1.521 1.582 1.712 1.772 1.888 2.003 2.104 2.151 2.247 2.34 2.479 2.569 2.644 2.744 2.856 2.969 3.071 3.17 3.295 3.417 3.531 3.671 3.811 3.939 4.083 4.236 4.382 4.546 4.73 4.935 5.138 5.365 5.648 5.933 6.266 6.615 7.005 7.45 7.928 8.453 8.934 9.093 9.039 8.888 8.66 8.44 8.218 7.957 7.735 7.503 7.272 7.045 6.826 6.625 6.447 6.271 6.068 5.891 5.737 5.555 5.344 5.176 5.027 4.864 4.725 4.587 4.431 4.263 4.09 3.972 3.849 3.653 3.503 3.342 3.261 3.093 2.907 2.692 2.587 2.41 2.224 2.094 1.94 1.616 1.444 1.247 1.002 0.741 0.468 0.083 -1.131 -5 ,11705 ,TETRA ,17616950,Mon Nov 29 22:20:45 CET,Tue Nov 30 00:19:58 CET,0.0 0.474 0.657 0.802 0.923 1.048 1.17 1.27 1.439 1.516 1.592 1.677 1.811 1.862 1.971 2.074 2.176 2.224 2.314 2.399 2.527 2.614 2.692 2.802 2.919 3.035 3.141 3.236 3.357 3.476 3.592 3.74 3.887 4.023 4.174 4.336 4.494 4.669 4.866 5.082 5.291 5.521 5.776 6.028 6.348 6.699 7.092 7.531 8.027 8.565 9.084 9.283 9.242 9.139 8.961 8.722 8.465 8.21 7.992 7.758 7.54 7.341 7.147 6.958 6.763 6.583 6.39 6.209 6.047 5.877 5.685 5.516 5.36 5.199 5.071 4.926 4.76 4.599 4.416 4.283 4.147 3.932 3.784 3.646 3.568 3.385 3.214 3.038 2.941 2.769 2.601 2.485 2.363 2.082 1.926 1.748 1.557 1.334 1.036 0.624 -0.605 -6 ,8766 ,TETRA ,17616951,Mon Nov 29 22:22:33 CET,Tue Nov 30 00:19:21 CET,0.0 0.561 0.772 0.932 1.086 1.223 1.328 1.421 1.582 1.656 1.733 1.797 1.927 1.989 2.119 2.224 2.321 2.37 2.462 2.55 2.676 2.76 2.845 2.965 3.081 3.186 3.278 3.378 3.507 3.622 3.739 3.869 3.988 4.123 4.284 4.454 4.611 4.779 4.965 5.157 5.361 5.593 5.866 6.14 6.461 6.819 7.221 7.666 8.145 8.648 9.195 9.514 9.549 9.428 9.27 9.099 8.9 8.688 8.506 8.315 8.097 7.893 7.72 7.518 7.308 7.112 6.899 6.735 6.594 6.412 6.219 6.068 5.899 5.7 5.546 5.402 5.264 5.114 4.943 4.821 4.688 4.48 4.335 4.194 4.124 3.97 3.786 3.57 3.465 3.298 3.139 3.017 2.886 2.561 2.361 2.153 1.934 1.674 1.33 0.857 -0.898 -7 ,31152 ,TETRA ,17616952,Mon Nov 29 22:22:32 CET,Tue Nov 30 00:13:50 CET,0.0 0.637 0.836 0.99 1.125 1.222 1.307 1.389 1.55 1.627 1.7 1.754 1.884 1.95 2.072 2.18 2.277 2.325 2.421 2.511 2.628 2.702 2.779 2.897 3.022 3.13 3.224 3.32 3.448 3.568 3.677 3.802 3.915 4.027 4.166 4.324 4.478 4.645 4.825 5.014 5.209 5.435 5.695 5.953 6.256 6.598 6.986 7.382 7.849 8.415 9.007 9.373 9.473 9.452 9.36 9.21 9.046 8.852 8.676 8.51 8.347 8.174 8.003 7.85 7.71 7.578 7.427 7.291 7.172 7.031 6.87 6.734 6.593 6.442 6.327 6.201 6.067 5.932 5.777 5.668 5.562 5.395 5.267 5.118 5.036 4.868 4.68 4.488 4.383 4.207 4.046 3.922 3.778 3.459 3.282 3.089 2.9 2.679 2.378 1.91 0.337 -8 ,6131 ,TETRA ,17616953,Mon Nov 29 22:22:34 CET,Tue Nov 30 00:39:59 CET,0.0 0.387 0.547 0.702 0.845 0.946 1.051 1.151 1.299 1.373 1.444 1.514 1.649 1.713 1.839 1.951 2.059 2.111 2.207 2.302 2.441 2.526 2.606 2.723 2.835 2.943 3.05 3.157 3.283 3.39 3.507 3.657 3.797 3.938 4.1 4.269 4.428 4.608 4.808 5.011 5.212 5.433 5.706 5.986 6.297 6.639 7.03 7.475 7.992 8.552 9.088 9.351 9.356 9.22 9.012 8.798 8.602 8.375 8.15 7.929 7.725 7.537 7.331 7.123 6.933 6.743 6.547 6.384 6.232 6.057 5.868 5.704 5.536 5.341 5.188 5.041 4.876 4.711 4.543 4.418 4.285 4.082 3.934 3.775 3.7 3.539 3.358 3.17 3.07 2.898 2.724 2.596 2.459 2.144 1.969 1.784 1.589 1.356 1.045 0.573 -0.68 -9 ,6404 ,TETRA ,17616954,Mon Nov 29 22:22:34 CET,Tue Nov 30 00:16:58 CET,0.0 0.344 0.548 0.701 0.838 0.945 1.028 1.1 1.26 1.343 1.417 1.483 1.613 1.666 1.773 1.879 1.981 2.031 2.129 2.222 2.35 2.429 2.497 2.591 2.694 2.799 2.9 2.991 3.102 3.215 3.321 3.452 3.586 3.715 3.861 4.026 4.178 4.341 4.52 4.73 4.953 5.186 5.448 5.727 6.063 6.414 6.807 7.246 7.72 8.19 8.697 8.968 8.979 8.858 8.642 8.407 8.167 7.926 7.706 7.471 7.252 7.036 6.832 6.635 6.447 6.274 6.085 5.898 5.724 5.553 5.377 5.237 5.075 4.909 4.772 4.6 4.432 4.273 4.117 3.995 3.864 3.666 3.518 3.369 3.296 3.131 2.951 2.754 2.652 2.484 2.319 2.197 2.065 1.771 1.603 1.423 1.218 0.924 0.569 0.101 -1.441 -10 ,18400 ,TETRA ,17616955,Mon Nov 29 22:22:34 CET,Mon Nov 29 23:57:43 CET,0.0 0.533 0.759 0.947 1.088 1.199 1.285 1.366 1.533 1.605 1.672 1.736 1.868 1.924 2.02 2.11 2.194 2.237 2.331 2.423 2.55 2.63 2.706 2.826 2.941 3.046 3.144 3.242 3.373 3.508 3.631 3.764 3.898 4.033 4.188 4.359 4.528 4.716 4.918 5.132 5.355 5.61 5.893 6.168 6.492 6.849 7.249 7.667 8.123 8.608 8.998 9.169 9.131 8.925 8.715 8.49 8.252 8.018 7.797 7.571 7.364 7.162 6.94 6.735 6.548 6.367 6.156 5.95 5.78 5.594 5.399 5.246 5.075 4.895 4.762 4.617 4.464 4.303 4.129 4.008 3.882 3.673 3.526 3.383 3.306 3.126 2.94 2.735 2.626 2.456 2.299 2.17 2.026 1.688 1.493 1.303 1.086 0.825 0.498 0.091 -1.091 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt deleted file mode 100644 index 39bbba38..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14628 ,TETRA ,17616956,Mon Nov 29 22:22:34 CET,Tue Nov 30 00:25:14 CET,0.0 0.457 0.633 0.775 0.882 0.966 1.053 1.141 1.289 1.367 1.44 1.497 1.629 1.691 1.797 1.897 1.995 2.045 2.146 2.234 2.355 2.437 2.517 2.632 2.747 2.854 2.961 3.069 3.198 3.31 3.43 3.582 3.716 3.843 3.995 4.173 4.342 4.516 4.707 4.922 5.136 5.359 5.615 5.883 6.202 6.54 6.931 7.366 7.824 8.322 8.792 8.991 8.94 8.788 8.597 8.351 8.087 7.842 7.636 7.403 7.169 6.959 6.741 6.517 6.31 6.116 5.922 5.755 5.606 5.438 5.257 5.099 4.926 4.755 4.622 4.481 4.334 4.173 3.975 3.836 3.702 3.485 3.334 3.186 3.108 2.93 2.739 2.534 2.427 2.258 2.078 1.935 1.797 1.488 1.307 1.087 0.832 0.596 0.298 -0.234 -1.756 -2 ,21213 ,TETRA ,17616957,Mon Nov 29 22:22:34 CET,Tue Nov 30 00:01:05 CET,0.0 0.537 0.699 0.812 0.921 1.014 1.09 1.178 1.344 1.419 1.484 1.528 1.662 1.721 1.831 1.936 2.034 2.081 2.167 2.248 2.363 2.442 2.528 2.661 2.789 2.904 3.01 3.119 3.257 3.385 3.508 3.657 3.796 3.928 4.087 4.262 4.412 4.568 4.747 4.947 5.156 5.386 5.662 5.944 6.258 6.589 6.977 7.429 7.915 8.385 8.816 9.015 8.949 8.756 8.518 8.272 8.042 7.792 7.561 7.343 7.13 6.908 6.694 6.502 6.318 6.122 5.917 5.744 5.589 5.423 5.222 5.043 4.883 4.705 4.559 4.408 4.249 4.086 3.91 3.784 3.639 3.418 3.275 3.119 3.04 2.881 2.703 2.509 2.405 2.23 2.056 1.927 1.794 1.488 1.302 1.097 0.876 0.623 0.299 -0.157 -1.415 -3 ,26739 ,TETRA ,17616958,Mon Nov 29 22:22:34 CET,Tue Nov 30 00:14:22 CET,0.0 0.248 0.385 0.509 0.601 0.698 0.8 0.894 1.055 1.123 1.189 1.246 1.383 1.447 1.566 1.671 1.758 1.8 1.889 1.984 2.123 2.212 2.295 2.422 2.55 2.674 2.799 2.906 3.041 3.169 3.281 3.42 3.566 3.706 3.863 4.038 4.206 4.396 4.606 4.822 5.039 5.287 5.564 5.831 6.15 6.513 6.904 7.322 7.831 8.384 8.863 9.085 9.098 8.969 8.752 8.512 8.277 8.032 7.79 7.519 7.273 7.048 6.82 6.614 6.436 6.245 6.033 5.856 5.688 5.493 5.299 5.139 4.959 4.757 4.597 4.442 4.279 4.102 3.916 3.792 3.66 3.445 3.292 3.124 3.038 2.843 2.635 2.447 2.34 2.152 1.958 1.822 1.681 1.334 1.135 0.919 0.677 0.385 -0.002 -0.517 -1.828 -4 ,25935 ,TETRA ,17616959,Mon Nov 29 22:26:34 CET,Tue Nov 30 00:16:43 CET,0.0 0.657 0.869 1.055 1.203 1.312 1.415 1.514 1.677 1.745 1.81 1.859 1.994 2.05 2.153 2.258 2.353 2.405 2.515 2.609 2.745 2.835 2.925 3.051 3.168 3.275 3.373 3.474 3.615 3.742 3.854 3.994 4.129 4.252 4.398 4.576 4.738 4.895 5.074 5.263 5.464 5.706 5.982 6.258 6.588 6.936 7.303 7.714 8.194 8.68 9.124 9.319 9.249 9.084 8.842 8.58 8.345 8.076 7.821 7.572 7.347 7.126 6.896 6.679 6.461 6.25 6.042 5.849 5.674 5.491 5.314 5.171 5.011 4.833 4.693 4.546 4.386 4.216 4.034 3.907 3.776 3.566 3.416 3.266 3.193 3.037 2.847 2.62 2.508 2.338 2.157 2.024 1.871 1.498 1.3 1.094 0.861 0.557 0.182 -0.261 -1.87 -5 ,21680 ,TETRA ,17616960,Mon Nov 29 22:26:34 CET,Tue Nov 30 00:16:21 CET,0.0 0.279 0.474 0.616 0.718 0.827 0.944 1.043 1.22 1.302 1.373 1.427 1.563 1.624 1.744 1.863 1.964 2.011 2.113 2.211 2.343 2.436 2.523 2.64 2.75 2.859 2.961 3.057 3.182 3.305 3.424 3.561 3.695 3.832 3.99 4.171 4.349 4.535 4.73 4.937 5.161 5.408 5.704 6.003 6.314 6.658 7.051 7.462 7.918 8.423 8.868 8.944 8.824 8.665 8.467 8.207 7.937 7.677 7.429 7.166 6.936 6.72 6.509 6.29 6.077 5.883 5.673 5.482 5.3 5.109 4.914 4.742 4.562 4.38 4.239 4.093 3.934 3.761 3.592 3.473 3.35 3.163 3.023 2.865 2.781 2.603 2.423 2.221 2.111 1.932 1.762 1.63 1.49 1.2 1.037 0.865 0.655 0.407 0.086 -0.373 -1.976 -6 ,18882 ,TETRA ,17616961,Mon Nov 29 22:26:35 CET,Tue Nov 30 00:18:13 CET,0.0 0.534 0.733 0.895 1.025 1.133 1.22 1.312 1.487 1.564 1.634 1.681 1.814 1.877 1.996 2.1 2.196 2.244 2.339 2.438 2.572 2.654 2.736 2.855 2.976 3.088 3.19 3.292 3.421 3.545 3.675 3.826 3.965 4.105 4.252 4.407 4.562 4.742 4.939 5.139 5.334 5.559 5.841 6.116 6.441 6.817 7.207 7.601 8.062 8.584 9.055 9.22 9.195 9.073 8.864 8.628 8.394 8.167 7.963 7.718 7.486 7.275 7.065 6.861 6.653 6.451 6.244 6.06 5.889 5.696 5.504 5.342 5.165 4.979 4.841 4.698 4.545 4.379 4.212 4.098 3.97 3.764 3.615 3.46 3.379 3.214 3.02 2.808 2.696 2.516 2.335 2.201 2.059 1.765 1.602 1.389 1.138 0.843 0.502 0.082 -1.73 -7 ,29890 ,TETRA ,17616962,Mon Nov 29 22:26:37 CET,Tue Nov 30 00:20:57 CET,0.0 0.264 0.454 0.6 0.719 0.825 0.925 1.005 1.139 1.215 1.29 1.349 1.478 1.538 1.66 1.773 1.877 1.923 2.021 2.12 2.257 2.349 2.432 2.544 2.656 2.769 2.877 2.98 3.114 3.25 3.379 3.524 3.668 3.817 3.983 4.158 4.324 4.502 4.687 4.889 5.093 5.313 5.582 5.852 6.151 6.475 6.846 7.267 7.749 8.273 8.786 9.019 9.039 8.956 8.764 8.512 8.248 7.992 7.759 7.509 7.261 7.022 6.809 6.598 6.399 6.21 5.991 5.789 5.616 5.443 5.257 5.099 4.938 4.761 4.622 4.473 4.318 4.156 3.977 3.851 3.723 3.528 3.379 3.21 3.126 2.952 2.77 2.576 2.475 2.301 2.112 1.962 1.81 1.515 1.346 1.133 0.897 0.646 0.293 -0.154 -1.322 -8 ,4444 ,TETRA ,17616963,Mon Nov 29 22:39:39 CET,Tue Nov 30 00:33:33 CET,0.0 0.359 0.608 0.798 0.918 1.006 1.089 1.18 1.333 1.405 1.48 1.535 1.665 1.724 1.836 1.946 2.045 2.092 2.193 2.282 2.414 2.499 2.579 2.693 2.802 2.925 3.045 3.145 3.265 3.387 3.515 3.669 3.807 3.939 4.091 4.27 4.445 4.626 4.813 4.999 5.186 5.419 5.71 5.985 6.299 6.648 7.063 7.519 7.993 8.493 8.977 9.205 9.157 8.964 8.773 8.575 8.347 8.111 7.888 7.645 7.396 7.157 6.935 6.71 6.498 6.314 6.125 5.942 5.769 5.595 5.428 5.278 5.093 4.906 4.771 4.623 4.467 4.303 4.148 4.038 3.91 3.709 3.556 3.394 3.314 3.157 2.975 2.768 2.664 2.473 2.279 2.146 1.979 1.622 1.419 1.23 1.054 0.823 0.498 0.024 -1.642 -9 ,547 ,TETRA ,17616964,Mon Nov 29 22:39:42 CET,Tue Nov 30 00:31:16 CET,0.0 0.504 0.685 0.808 0.921 1.046 1.175 1.282 1.45 1.515 1.571 1.616 1.745 1.8 1.906 2.014 2.125 2.177 2.282 2.396 2.55 2.641 2.731 2.839 2.953 3.071 3.169 3.27 3.4 3.518 3.639 3.78 3.915 4.052 4.221 4.403 4.56 4.737 4.93 5.121 5.319 5.54 5.814 6.103 6.43 6.781 7.155 7.57 8.016 8.504 8.99 9.174 9.101 8.902 8.669 8.444 8.207 7.984 7.787 7.56 7.325 7.104 6.889 6.662 6.443 6.247 6.059 5.894 5.735 5.563 5.369 5.204 5.04 4.86 4.72 4.58 4.425 4.256 4.076 3.951 3.816 3.592 3.447 3.288 3.201 3.024 2.841 2.634 2.528 2.363 2.183 2.06 1.93 1.62 1.441 1.251 1.044 0.81 0.519 0.109 -1.601 -10 ,1528 ,TETRA ,17616965,Mon Nov 29 22:57:08 CET,Tue Nov 30 00:45:16 CET,0.0 0.351 0.528 0.65 0.755 0.856 0.969 1.073 1.214 1.279 1.347 1.425 1.563 1.615 1.713 1.813 1.907 1.953 2.05 2.142 2.272 2.357 2.443 2.569 2.679 2.794 2.917 3.022 3.146 3.268 3.391 3.536 3.662 3.789 3.93 4.08 4.24 4.421 4.606 4.801 5.007 5.24 5.513 5.784 6.103 6.444 6.832 7.253 7.707 8.22 8.694 8.889 8.843 8.691 8.479 8.272 8.052 7.803 7.555 7.292 7.062 6.857 6.661 6.464 6.288 6.11 5.893 5.695 5.527 5.345 5.147 4.973 4.788 4.6 4.437 4.269 4.115 3.964 3.804 3.695 3.575 3.356 3.198 3.038 2.955 2.788 2.614 2.425 2.318 2.133 1.941 1.807 1.673 1.352 1.152 0.948 0.741 0.489 0.154 -0.337 -2.007 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt deleted file mode 100644 index a6042435..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31319 ,TETRA ,17616966,Mon Nov 29 22:57:07 CET,Tue Nov 30 00:53:40 CET,0.0 4.092 4.915 5.417 5.844 6.253 6.57 6.828 7.299 7.498 7.679 7.846 8.17 8.319 8.59 8.872 9.114 9.219 9.438 9.657 9.945 10.111 10.234 10.348 10.441 10.579 10.704 10.762 10.819 10.834 10.861 10.908 10.898 10.819 10.667 10.483 10.298 10.11 9.887 9.52 9.013 8.372 7.504 6.536 5.36 3.9 1.899 -0.923 -5.016 -10.971 -20.417 -30.818 -38.672 -44.928 -50.035 -54.374 -57.96 -61.047 -63.631 -66.146 -68.254 -70.087 -71.798 -73.421 -74.91 -76.183 -77.462 -78.589 -79.551 -80.532 -81.518 -82.324 -83.164 -84.036 -84.694 -85.33 -85.968 -86.641 -87.346 -87.832 -88.328 -89.076 -89.57 -90.08 -90.356 -90.941 -91.571 -92.212 -92.531 -93.13 -93.507 -93.858 -94.254 -95.094 -95.547 -96.036 -96.537 -97.116 -97.759 -98.459 -101.261 -2 ,6598 ,TETRA ,17616967,Mon Nov 29 23:31:05 CET,Tue Nov 30 01:32:16 CET,0.0 3.936 4.739 5.258 5.702 6.064 6.393 6.702 7.254 7.502 7.716 7.927 8.252 8.394 8.627 8.826 9.03 9.134 9.332 9.52 9.75 9.873 9.991 10.159 10.302 10.387 10.439 10.515 10.599 10.635 10.666 10.695 10.689 10.667 10.617 10.553 10.496 10.332 10.164 9.966 9.592 9.085 8.439 7.666 6.558 5.109 3.181 0.484 -3.594 -9.641 -18.839 -28.973 -36.803 -42.874 -47.601 -51.549 -54.87 -57.781 -60.214 -62.588 -64.548 -66.234 -67.806 -69.263 -70.608 -71.836 -73.11 -74.207 -75.147 -76.121 -77.112 -77.93 -78.768 -79.659 -80.376 -81.084 -81.817 -82.575 -83.304 -83.8 -84.292 -85.011 -85.527 -86.055 -86.317 -86.87 -87.436 -88.032 -88.34 -88.931 -89.346 -89.713 -90.116 -90.963 -91.404 -91.86 -92.346 -92.885 -93.534 -94.291 -98.26 -3 ,17118 ,TETRA ,17616968,Mon Nov 29 23:31:05 CET,Tue Nov 30 01:24:03 CET,0.0 2.877 3.544 4.029 4.374 4.672 4.941 5.159 5.521 5.684 5.84 5.976 6.26 6.408 6.687 6.932 7.146 7.251 7.455 7.623 7.842 7.976 8.095 8.213 8.307 8.388 8.452 8.518 8.603 8.65 8.658 8.667 8.66 8.611 8.512 8.372 8.187 7.92 7.538 7.089 6.581 5.904 5.081 4.171 2.901 1.274 -0.806 -3.658 -7.774 -13.657 -23.127 -33.675 -41.699 -48.206 -53.425 -57.821 -61.514 -64.732 -67.41 -70.001 -72.164 -74.021 -75.718 -77.317 -78.8 -80.118 -81.46 -82.616 -83.62 -84.647 -85.686 -86.52 -87.376 -88.265 -88.94 -89.62 -90.313 -91.024 -91.715 -92.176 -92.66 -93.416 -93.93 -94.451 -94.718 -95.246 -95.784 -96.351 -96.642 -97.223 -97.57 -97.902 -98.241 -98.943 -99.35 -99.801 -100.275 -100.772 -101.313 -102.025 -110.309 -4 ,5596 ,TETRA ,17616969,Mon Nov 29 23:31:06 CET,Tue Nov 30 01:31:14 CET,0.0 4.11 4.843 5.318 5.734 6.095 6.378 6.63 7.125 7.344 7.528 7.658 7.969 8.126 8.403 8.624 8.838 8.949 9.179 9.363 9.608 9.767 9.882 10.024 10.162 10.307 10.445 10.541 10.639 10.718 10.794 10.864 10.901 10.89 10.841 10.775 10.646 10.472 10.25 9.96 9.595 9.061 8.365 7.597 6.473 5.067 3.203 0.487 -3.599 -9.54 -18.843 -29.089 -36.888 -43.189 -48.319 -52.629 -56.201 -59.312 -61.898 -64.428 -66.565 -68.374 -70.045 -71.558 -72.931 -74.19 -75.496 -76.657 -77.622 -78.583 -79.585 -80.422 -81.259 -82.103 -82.752 -83.412 -84.085 -84.754 -85.418 -85.87 -86.336 -87.052 -87.547 -88.055 -88.321 -88.866 -89.414 -89.963 -90.239 -90.806 -91.167 -91.49 -91.79 -92.428 -92.785 -93.185 -93.653 -94.169 -94.694 -95.372 -98.983 -5 ,23285 ,TETRA ,17616970,Mon Nov 29 23:31:06 CET,Tue Nov 30 01:30:44 CET,0.0 2.88 3.715 4.29 4.755 5.201 5.586 5.949 6.54 6.764 6.971 7.147 7.439 7.565 7.821 8.073 8.298 8.396 8.589 8.742 8.959 9.132 9.281 9.447 9.578 9.688 9.754 9.799 9.836 9.844 9.84 9.801 9.727 9.628 9.476 9.295 9.09 8.815 8.488 8.116 7.666 7.068 6.261 5.285 3.996 2.399 0.198 -2.842 -6.955 -12.795 -22.007 -32.242 -40.286 -46.806 -52.066 -56.414 -60.023 -63.193 -65.844 -68.353 -70.415 -72.201 -73.855 -75.395 -76.77 -77.992 -79.235 -80.305 -81.221 -82.155 -83.131 -83.935 -84.75 -85.585 -86.217 -86.886 -87.587 -88.295 -89.011 -89.496 -89.989 -90.728 -91.236 -91.76 -92.026 -92.577 -93.15 -93.743 -94.04 -94.615 -94.955 -95.295 -95.667 -96.429 -96.845 -97.292 -97.781 -98.359 -99.093 -99.99 -103.05 -6 ,22342 ,TETRA ,17616971,Mon Nov 29 23:31:06 CET,Tue Nov 30 01:33:18 CET,0.0 4.012 4.786 5.321 5.739 6.06 6.309 6.545 6.945 7.104 7.229 7.305 7.58 7.7 7.953 8.157 8.313 8.39 8.546 8.708 8.918 9.025 9.116 9.216 9.306 9.405 9.514 9.616 9.657 9.635 9.586 9.483 9.382 9.296 9.182 9.013 8.787 8.489 8.179 7.817 7.386 6.852 6.032 5.068 3.828 2.222 0.11 -2.618 -6.316 -11.653 -20.207 -29.706 -37.033 -42.852 -47.578 -51.739 -55.284 -58.311 -60.8 -63.208 -65.291 -67.108 -68.765 -70.345 -71.796 -73.102 -74.442 -75.609 -76.624 -77.635 -78.609 -79.417 -80.246 -81.054 -81.665 -82.305 -82.95 -83.619 -84.321 -84.784 -85.253 -85.951 -86.428 -86.924 -87.179 -87.686 -88.176 -88.668 -88.939 -89.496 -89.806 -90.117 -90.463 -91.158 -91.52 -91.936 -92.374 -92.838 -93.42 -94.228 -96.415 -7 ,4145 ,TETRA ,17616972,Mon Nov 29 23:31:06 CET,Tue Nov 30 01:30:31 CET,0.0 2.685 3.339 3.735 4.031 4.298 4.53 4.76 5.143 5.306 5.442 5.526 5.81 5.932 6.163 6.355 6.529 6.628 6.821 6.978 7.184 7.313 7.421 7.559 7.699 7.777 7.819 7.862 7.93 7.989 7.996 7.964 7.933 7.877 7.76 7.607 7.442 7.203 6.879 6.486 6.015 5.429 4.721 3.93 2.777 1.285 -0.683 -3.293 -7.021 -12.464 -21.128 -31.085 -38.607 -44.587 -49.459 -53.594 -57.192 -60.354 -62.919 -65.451 -67.587 -69.417 -71.157 -72.778 -74.253 -75.572 -76.902 -78.042 -78.998 -79.957 -80.957 -81.79 -82.622 -83.482 -84.159 -84.85 -85.533 -86.212 -86.902 -87.368 -87.861 -88.63 -89.154 -89.695 -89.972 -90.531 -91.095 -91.674 -91.979 -92.587 -92.958 -93.289 -93.633 -94.365 -94.789 -95.248 -95.711 -96.242 -96.888 -97.6 -102.085 -8 ,14146 ,TETRA ,17616973,Mon Nov 29 23:31:06 CET,Tue Nov 30 01:31:02 CET,0.0 2.444 3.044 3.472 3.772 4.082 4.383 4.637 5.055 5.228 5.377 5.47 5.755 5.894 6.154 6.373 6.571 6.668 6.853 7.015 7.259 7.412 7.532 7.675 7.85 8.045 8.213 8.362 8.544 8.725 8.856 8.978 9.013 8.95 8.84 8.684 8.534 8.378 8.205 7.984 7.667 7.188 6.501 5.585 4.212 2.512 0.288 -2.631 -6.771 -12.785 -21.974 -32.072 -39.939 -46.249 -51.314 -55.592 -59.181 -62.324 -64.889 -67.369 -69.516 -71.4 -73.103 -74.621 -76.004 -77.261 -78.529 -79.658 -80.647 -81.643 -82.655 -83.475 -84.32 -85.203 -85.875 -86.566 -87.275 -87.976 -88.688 -89.183 -89.689 -90.452 -90.955 -91.462 -91.728 -92.287 -92.872 -93.458 -93.761 -94.353 -94.738 -95.091 -95.436 -96.205 -96.631 -97.062 -97.514 -98.046 -98.772 -99.652 -103.821 -9 ,16713 ,TETRA ,17616974,Mon Nov 29 23:31:06 CET,Tue Nov 30 01:31:11 CET,0.0 3.983 4.685 5.171 5.594 5.991 6.289 6.52 6.949 7.159 7.361 7.553 7.829 7.938 8.151 8.322 8.478 8.549 8.665 8.769 8.895 8.961 9.021 9.07 9.131 9.194 9.208 9.203 9.19 9.176 9.145 9.089 9.022 8.941 8.804 8.609 8.364 8.03 7.619 7.13 6.543 5.852 4.987 3.963 2.621 0.948 -1.242 -4.067 -7.966 -13.659 -22.742 -32.923 -40.592 -46.609 -51.487 -55.658 -59.168 -62.197 -64.693 -67.132 -69.194 -70.96 -72.608 -74.112 -75.488 -76.72 -77.973 -79.089 -80.033 -81.006 -82.001 -82.827 -83.683 -84.565 -85.241 -85.914 -86.563 -87.194 -87.84 -88.29 -88.781 -89.534 -90.034 -90.552 -90.825 -91.388 -91.94 -92.498 -92.803 -93.4 -93.764 -94.081 -94.443 -95.263 -95.716 -96.179 -96.668 -97.212 -97.828 -98.653 -102.398 -10 ,5035 ,TETRA ,17616975,Mon Nov 29 23:31:07 CET,Tue Nov 30 01:30:01 CET,0.0 4.602 5.254 5.642 5.976 6.3 6.589 6.84 7.276 7.502 7.719 7.924 8.238 8.386 8.676 8.95 9.207 9.325 9.556 9.78 10.021 10.108 10.186 10.304 10.391 10.472 10.552 10.615 10.685 10.766 10.801 10.765 10.678 10.573 10.443 10.243 10.019 9.724 9.362 8.95 8.451 7.821 6.979 6.017 4.722 3.025 0.815 -2.058 -6.098 -12.011 -21.426 -31.961 -39.899 -46.128 -51.128 -55.407 -59.063 -62.269 -64.888 -67.394 -69.49 -71.304 -73.046 -74.643 -76.048 -77.309 -78.605 -79.711 -80.651 -81.644 -82.646 -83.452 -84.288 -85.163 -85.818 -86.464 -87.116 -87.759 -88.414 -88.895 -89.392 -90.12 -90.62 -91.141 -91.406 -91.938 -92.524 -93.138 -93.444 -94.037 -94.409 -94.746 -95.107 -95.854 -96.271 -96.735 -97.182 -97.686 -98.332 -99.238 -103.956 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 6e5e03ab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9028 ,TETRA ,17616976,Mon Nov 29 23:31:07 CET,Tue Nov 30 01:21:35 CET,0.0 0.205 0.424 0.61 0.794 0.984 1.162 1.327 1.642 1.803 1.951 2.055 2.349 2.479 2.747 3.021 3.283 3.403 3.641 3.878 4.229 4.451 4.662 4.973 5.262 5.547 5.837 6.133 6.525 6.889 7.243 7.686 8.127 8.555 9.045 9.613 10.172 10.798 11.515 12.307 13.15 14.104 15.192 16.317 17.641 19.049 20.579 22.245 24.138 26.072 27.725 28.4 28.299 27.681 26.767 25.747 24.759 23.802 22.943 22.004 21.135 20.304 19.455 18.643 17.921 17.276 16.574 15.927 15.346 14.765 14.183 13.676 13.151 12.631 12.25 11.868 11.485 11.087 10.657 10.336 9.994 9.491 9.147 8.782 8.593 8.197 7.762 7.285 7.047 6.675 6.269 5.938 5.595 4.901 4.526 4.089 3.448 2.585 1.506 -0.099 -7.017 -2 ,9551 ,TETRA ,17616977,Mon Nov 29 23:32:07 CET,Tue Nov 30 01:28:34 CET,0.0 0.171 0.311 0.448 0.594 0.741 0.868 0.995 1.249 1.37 1.495 1.579 1.858 1.974 2.202 2.43 2.66 2.767 2.968 3.173 3.469 3.66 3.872 4.188 4.475 4.761 5.041 5.328 5.713 6.076 6.425 6.862 7.328 7.772 8.265 8.843 9.389 9.96 10.564 11.183 11.836 12.586 13.481 14.384 15.433 16.631 17.976 19.448 21.093 22.903 24.733 25.632 25.581 25.171 24.647 24.025 23.369 22.664 22.005 21.303 20.66 20.077 19.507 18.953 18.475 18.027 17.517 17.064 16.662 16.223 15.762 15.385 15.004 14.591 14.241 13.904 13.581 13.222 12.828 12.565 12.297 11.84 11.521 11.183 11.009 10.641 10.231 9.786 9.557 9.168 8.731 8.423 8.115 7.382 6.939 6.49 5.951 5.153 4.138 2.718 -6.656 -6 ,5515 ,TETRA ,17616981,Mon Nov 29 23:32:07 CET,Tue Nov 30 01:28:27 CET,0.0 0.207 0.38 0.532 0.694 0.841 0.984 1.131 1.41 1.547 1.679 1.774 2.058 2.171 2.388 2.609 2.829 2.942 3.164 3.382 3.721 3.94 4.153 4.481 4.797 5.092 5.366 5.627 5.964 6.3 6.623 7.004 7.417 7.846 8.327 8.857 9.358 9.873 10.437 11.075 11.745 12.498 13.353 14.245 15.351 16.606 18.093 19.692 21.368 23.059 24.684 25.317 25.055 24.535 23.957 23.322 22.659 22.02 21.434 20.795 20.221 19.681 19.125 18.568 18.056 17.624 17.167 16.728 16.306 15.855 15.387 14.981 14.56 14.129 13.787 13.449 13.082 12.679 12.25 11.955 11.656 11.16 10.819 10.432 10.217 9.795 9.343 8.833 8.548 8.116 7.715 7.413 7.069 6.344 5.912 5.408 4.838 4.186 3.261 1.969 -7.557 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 2b98cda7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28597 ,TETRA ,17616986,Mon Nov 29 23:58:03 CET,Tue Nov 30 01:38:35 CET,0.0 0.534 0.872 1.142 1.359 1.575 1.765 1.932 2.242 2.39 2.531 2.714 2.939 3.059 3.285 3.514 3.722 3.82 4.017 4.203 4.456 4.625 4.792 5.028 5.255 5.474 5.694 5.913 6.194 6.472 6.737 7.053 7.364 7.657 7.994 8.381 8.747 9.157 9.594 10.071 10.594 11.16 11.821 12.492 13.252 14.151 15.223 16.379 17.697 19.161 20.774 21.902 22.354 22.513 22.516 22.407 22.264 22.113 21.929 21.698 21.483 21.291 21.102 20.92 20.743 20.564 20.377 20.209 20.054 19.884 19.705 19.564 19.42 19.252 19.118 18.989 18.843 18.69 18.532 18.408 18.277 18.08 17.933 17.794 17.724 17.561 17.385 17.168 17.045 16.848 16.664 16.547 16.429 16.143 15.952 15.73 15.525 15.295 14.954 14.377 12.15 -2 ,29105 ,TETRA ,17616987,Mon Nov 29 23:58:04 CET,Tue Nov 30 01:52:31 CET,0.0 0.731 1.031 1.276 1.483 1.683 1.873 2.041 2.348 2.493 2.616 2.774 2.986 3.089 3.296 3.52 3.73 3.828 4.029 4.208 4.454 4.624 4.788 5.029 5.261 5.484 5.691 5.887 6.166 6.448 6.701 7.004 7.309 7.608 7.948 8.325 8.699 9.121 9.575 10.061 10.571 11.154 11.857 12.552 13.309 14.109 15.08 16.209 17.511 18.915 20.49 21.628 22.041 22.193 22.191 22.081 21.939 21.774 21.575 21.351 21.169 21.012 20.861 20.694 20.515 20.338 20.166 20.038 19.902 19.744 19.595 19.456 19.286 19.124 19.008 18.868 18.703 18.54 18.392 18.289 18.169 17.962 17.811 17.649 17.573 17.422 17.245 17.059 16.968 16.791 16.63 16.503 16.36 15.975 15.768 15.569 15.327 15.044 14.694 14.167 11.093 -3 ,32662 ,TETRA ,17616988,Mon Nov 29 23:58:04 CET,Tue Nov 30 01:52:57 CET,0.0 1.029 1.346 1.637 1.847 2.019 2.192 2.359 2.662 2.811 2.955 3.136 3.354 3.479 3.702 3.905 4.099 4.193 4.378 4.568 4.838 5.005 5.169 5.423 5.678 5.921 6.146 6.367 6.65 6.916 7.179 7.494 7.796 8.099 8.436 8.809 9.17 9.571 10.022 10.491 10.969 11.534 12.222 12.898 13.659 14.536 15.552 16.665 17.936 19.351 21.002 22.199 22.65 22.777 22.77 22.721 22.628 22.493 22.34 22.134 21.915 21.71 21.504 21.294 21.102 20.926 20.75 20.59 20.436 20.278 20.123 19.991 19.844 19.681 19.556 19.423 19.278 19.134 18.963 18.835 18.714 18.518 18.367 18.192 18.104 17.936 17.763 17.574 17.468 17.294 17.128 17.005 16.877 16.542 16.332 16.091 15.844 15.577 15.216 14.66 11.917 -4 ,15280 ,TETRA ,17616989,Mon Nov 29 23:58:05 CET,Tue Nov 30 02:02:08 CET,0.0 0.795 1.136 1.413 1.667 1.897 2.079 2.242 2.533 2.671 2.81 2.986 3.203 3.322 3.55 3.759 3.974 4.08 4.275 4.458 4.733 4.908 5.07 5.303 5.531 5.769 6.0 6.221 6.514 6.787 7.025 7.313 7.613 7.913 8.253 8.624 8.994 9.426 9.885 10.364 10.866 11.445 12.152 12.849 13.624 14.458 15.424 16.563 17.896 19.427 21.07 22.102 22.545 22.696 22.752 22.705 22.584 22.427 22.256 22.067 21.899 21.744 21.584 21.425 21.247 21.057 20.859 20.696 20.552 20.399 20.232 20.087 19.933 19.745 19.584 19.438 19.306 19.17 19.019 18.909 18.794 18.593 18.446 18.281 18.197 18.041 17.85 17.63 17.524 17.337 17.15 17.019 16.887 16.582 16.397 16.183 15.949 15.7 15.324 14.698 11.911 -5 ,29350 ,TETRA ,17616990,Mon Nov 29 23:59:03 CET,Tue Nov 30 01:35:17 CET,0.0 0.926 1.24 1.485 1.699 1.92 2.108 2.273 2.606 2.752 2.882 3.049 3.254 3.358 3.569 3.779 3.987 4.084 4.269 4.46 4.722 4.889 5.054 5.303 5.556 5.792 6.006 6.214 6.489 6.748 7.008 7.345 7.658 7.949 8.292 8.68 9.053 9.472 9.933 10.416 10.912 11.466 12.127 12.818 13.618 14.465 15.432 16.548 17.831 19.309 20.875 21.918 22.38 22.524 22.525 22.44 22.338 22.204 22.055 21.872 21.684 21.504 21.324 21.143 20.962 20.799 20.613 20.448 20.32 20.176 20.024 19.893 19.749 19.61 19.501 19.378 19.237 19.065 18.897 18.783 18.648 18.436 18.287 18.128 18.043 17.884 17.718 17.503 17.398 17.228 17.071 16.952 16.834 16.552 16.385 16.196 15.954 15.692 15.36 14.848 11.596 -6 ,13834 ,TETRA ,17616991,Tue Nov 30 00:02:14 CET,Tue Nov 30 01:49:40 CET,0.0 0.92 1.193 1.44 1.642 1.796 1.959 2.12 2.396 2.53 2.658 2.827 3.038 3.15 3.386 3.633 3.85 3.947 4.134 4.309 4.564 4.74 4.919 5.158 5.383 5.611 5.829 6.043 6.317 6.581 6.833 7.139 7.441 7.73 8.067 8.438 8.8 9.214 9.66 10.121 10.606 11.159 11.82 12.468 13.205 14.058 15.011 16.075 17.347 18.8 20.441 21.555 22.019 22.188 22.231 22.166 22.041 21.911 21.766 21.601 21.41 21.217 21.044 20.846 20.658 20.507 20.337 20.177 20.032 19.888 19.74 19.598 19.459 19.309 19.177 19.059 18.932 18.788 18.628 18.494 18.36 18.159 18.018 17.878 17.796 17.625 17.462 17.29 17.191 16.996 16.754 16.602 16.457 16.119 15.946 15.759 15.542 15.286 14.999 14.526 12.06 -7 ,10744 ,TETRA ,17616992,Tue Nov 30 00:02:14 CET,Tue Nov 30 01:39:33 CET,0.0 0.947 1.264 1.488 1.697 1.875 2.061 2.239 2.554 2.706 2.848 3.013 3.217 3.34 3.577 3.799 4.004 4.102 4.291 4.465 4.718 4.883 5.05 5.286 5.52 5.749 5.964 6.173 6.444 6.712 6.984 7.311 7.628 7.933 8.268 8.637 8.992 9.395 9.848 10.333 10.846 11.423 12.074 12.741 13.53 14.389 15.372 16.466 17.751 19.26 20.961 22.08 22.506 22.671 22.701 22.653 22.53 22.368 22.202 22.016 21.836 21.658 21.489 21.328 21.155 20.977 20.813 20.672 20.527 20.372 20.218 20.071 19.908 19.747 19.628 19.504 19.372 19.219 19.056 18.944 18.821 18.628 18.49 18.353 18.28 18.107 17.934 17.765 17.661 17.478 17.3 17.156 17.017 16.721 16.548 16.37 16.157 15.875 15.566 15.155 11.636 -8 ,32157 ,TETRA ,17616993,Tue Nov 30 00:03:13 CET,Tue Nov 30 01:45:20 CET,0.0 0.934 1.23 1.484 1.682 1.874 2.082 2.261 2.574 2.718 2.854 3.039 3.263 3.382 3.61 3.828 4.032 4.131 4.309 4.48 4.746 4.935 5.125 5.38 5.61 5.831 6.04 6.248 6.528 6.801 7.07 7.396 7.708 8.002 8.345 8.719 9.074 9.474 9.916 10.398 10.895 11.464 12.148 12.81 13.575 14.448 15.47 16.619 17.925 19.421 21.085 22.185 22.678 22.907 22.943 22.851 22.706 22.516 22.311 22.103 21.913 21.745 21.584 21.414 21.239 21.064 20.875 20.713 20.575 20.441 20.295 20.176 20.043 19.882 19.768 19.645 19.501 19.352 19.186 19.051 18.915 18.723 18.586 18.444 18.373 18.23 18.07 17.885 17.78 17.602 17.449 17.324 17.198 16.904 16.715 16.511 16.251 15.91 15.539 15.023 12.355 -9 ,22581 ,TETRA ,17616994,Tue Nov 30 00:38:29 CET,Tue Nov 30 03:00:26 CET,0.0 0.714 1.019 1.272 1.489 1.683 1.848 1.998 2.292 2.424 2.561 2.738 2.945 3.056 3.266 3.471 3.664 3.761 3.949 4.125 4.387 4.554 4.719 4.967 5.198 5.421 5.643 5.859 6.138 6.42 6.685 6.988 7.282 7.586 7.933 8.294 8.655 9.071 9.518 9.986 10.491 11.064 11.718 12.383 13.163 14.032 15.018 16.106 17.334 18.639 20.001 20.962 21.375 21.47 21.412 21.274 21.114 20.936 20.751 20.544 20.369 20.18 19.964 19.753 19.574 19.426 19.249 19.082 18.938 18.793 18.649 18.522 18.376 18.215 18.087 17.938 17.788 17.629 17.46 17.349 17.221 17.004 16.857 16.699 16.615 16.432 16.232 16.034 15.931 15.747 15.585 15.467 15.34 15.032 14.856 14.622 14.369 14.116 13.781 13.267 8.97 -10 ,14012 ,TETRA ,17616995,Tue Nov 30 00:38:29 CET,Tue Nov 30 02:21:49 CET,0.0 0.817 1.109 1.354 1.572 1.767 1.955 2.12 2.408 2.543 2.675 2.834 3.037 3.158 3.376 3.568 3.76 3.853 4.034 4.223 4.509 4.678 4.833 5.072 5.319 5.55 5.76 5.964 6.236 6.499 6.764 7.087 7.397 7.694 8.033 8.405 8.775 9.191 9.641 10.109 10.584 11.156 11.842 12.517 13.288 14.138 15.126 16.268 17.613 19.06 20.607 21.719 22.238 22.365 22.297 22.161 21.975 21.782 21.617 21.446 21.271 21.088 20.899 20.696 20.503 20.332 20.143 19.978 19.822 19.651 19.477 19.329 19.188 19.054 18.933 18.792 18.641 18.485 18.322 18.204 18.081 17.889 17.745 17.597 17.521 17.36 17.202 17.006 16.9 16.73 16.605 16.48 16.33 16.001 15.825 15.627 15.353 15.03 14.698 14.153 9.127 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index ef40188b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8682 ,TETRA ,17616996,Tue Nov 30 00:38:29 CET,Tue Nov 30 02:30:40 CET,0.0 0.887 1.151 1.372 1.558 1.713 1.839 1.962 2.175 2.266 2.376 2.506 2.678 2.756 2.903 3.058 3.237 3.317 3.446 3.57 3.752 3.86 3.968 4.141 4.307 4.459 4.599 4.728 4.899 5.069 5.22 5.412 5.602 5.769 5.962 6.198 6.435 6.675 6.945 7.256 7.583 7.948 8.373 8.825 9.301 9.761 10.24 10.73 11.211 11.608 11.892 11.803 11.461 11.027 10.613 10.192 9.744 9.323 8.962 8.571 8.233 7.929 7.632 7.355 7.086 6.835 6.551 6.306 6.103 5.868 5.622 5.426 5.227 5.013 4.841 4.661 4.461 4.243 4.031 3.891 3.746 3.512 3.349 3.199 3.121 2.936 2.73 2.503 2.382 2.173 2.015 1.889 1.763 1.487 1.326 1.122 0.875 0.617 0.332 -0.06 -1.459 -2 ,10853 ,TETRA ,17616997,Tue Nov 30 00:38:29 CET,Tue Nov 30 02:30:14 CET,0.0 0.821 1.155 1.409 1.618 1.816 1.98 2.105 2.327 2.42 2.516 2.617 2.79 2.873 3.033 3.207 3.379 3.455 3.6 3.73 3.913 4.032 4.149 4.333 4.507 4.67 4.819 4.966 5.169 5.372 5.555 5.775 5.985 6.166 6.378 6.627 6.862 7.126 7.392 7.651 7.916 8.219 8.584 8.934 9.332 9.753 10.19 10.616 11.037 11.373 11.48 11.199 10.697 10.149 9.666 9.167 8.704 8.314 7.956 7.587 7.263 6.944 6.623 6.31 6.025 5.791 5.521 5.252 5.019 4.782 4.538 4.326 4.104 3.888 3.737 3.568 3.376 3.167 2.951 2.823 2.688 2.462 2.302 2.114 2.019 1.84 1.666 1.483 1.376 1.182 1.053 0.931 0.798 0.494 0.325 0.125 -0.101 -0.334 -0.677 -1.105 -3.2 -3 ,18966 ,TETRA ,17616998,Tue Nov 30 00:38:29 CET,Tue Nov 30 02:40:33 CET,0.0 0.662 0.903 1.115 1.286 1.427 1.571 1.705 1.931 2.034 2.131 2.22 2.4 2.492 2.67 2.839 2.991 3.063 3.204 3.348 3.551 3.679 3.805 3.981 4.148 4.296 4.442 4.585 4.765 4.948 5.124 5.335 5.539 5.715 5.921 6.163 6.419 6.699 6.949 7.204 7.475 7.777 8.162 8.554 8.969 9.405 9.922 10.434 10.902 11.367 11.7 11.538 11.125 10.636 10.148 9.692 9.265 8.825 8.448 8.077 7.733 7.435 7.146 6.843 6.569 6.329 6.075 5.85 5.636 5.409 5.186 5.004 4.825 4.635 4.461 4.26 4.073 3.903 3.719 3.588 3.433 3.18 3.008 2.828 2.733 2.544 2.372 2.191 2.077 1.865 1.696 1.562 1.42 1.1 0.929 0.741 0.505 0.235 -0.098 -0.517 -2.009 -4 ,26810 ,TETRA ,17616999,Tue Nov 30 00:38:30 CET,Tue Nov 30 02:37:08 CET,0.0 0.908 1.162 1.383 1.574 1.737 1.884 2.017 2.269 2.377 2.483 2.606 2.783 2.871 3.048 3.239 3.423 3.5 3.637 3.774 3.987 4.121 4.238 4.411 4.577 4.741 4.899 5.041 5.222 5.399 5.578 5.783 5.96 6.135 6.352 6.605 6.848 7.109 7.362 7.631 7.925 8.246 8.613 8.968 9.361 9.797 10.303 10.806 11.315 11.8 12.096 11.971 11.609 11.163 10.699 10.215 9.766 9.371 9.003 8.594 8.255 7.971 7.682 7.389 7.084 6.788 6.507 6.254 6.031 5.816 5.6 5.425 5.246 5.048 4.876 4.696 4.494 4.281 4.1 3.974 3.819 3.586 3.425 3.236 3.141 2.959 2.782 2.579 2.455 2.252 2.094 1.921 1.705 1.319 1.138 0.924 0.671 0.358 -0.03 -0.438 -1.749 -5 ,21471 ,TETRA ,17617000,Tue Nov 30 00:38:30 CET,Tue Nov 30 02:31:06 CET,0.0 0.754 0.989 1.186 1.352 1.5 1.645 1.764 1.977 2.078 2.192 2.329 2.515 2.615 2.817 2.978 3.113 3.187 3.328 3.45 3.643 3.793 3.938 4.13 4.302 4.456 4.593 4.727 4.917 5.093 5.258 5.494 5.727 5.928 6.14 6.379 6.628 6.878 7.132 7.414 7.706 8.023 8.388 8.781 9.231 9.687 10.161 10.626 11.137 11.598 11.9 11.91 11.608 11.211 10.763 10.259 9.826 9.438 9.083 8.722 8.399 8.107 7.801 7.487 7.202 6.944 6.668 6.437 6.232 6.006 5.769 5.562 5.349 5.13 4.978 4.808 4.604 4.404 4.215 4.086 3.938 3.703 3.54 3.375 3.282 3.083 2.892 2.67 2.543 2.326 2.133 1.989 1.837 1.526 1.35 1.128 0.886 0.649 0.355 -0.084 -1.742 -6 ,9207 ,TETRA ,17617001,Tue Nov 30 00:38:30 CET,Tue Nov 30 02:42:51 CET,0.0 0.596 0.821 1.008 1.179 1.337 1.47 1.6 1.856 1.966 2.08 2.208 2.397 2.498 2.673 2.857 3.013 3.078 3.206 3.33 3.516 3.643 3.76 3.92 4.074 4.235 4.385 4.517 4.702 4.875 5.051 5.268 5.463 5.655 5.868 6.101 6.335 6.585 6.844 7.121 7.409 7.728 8.094 8.448 8.864 9.326 9.805 10.251 10.682 11.126 11.448 11.221 10.826 10.446 10.019 9.602 9.233 8.863 8.486 8.068 7.727 7.45 7.17 6.889 6.639 6.404 6.151 5.919 5.702 5.481 5.271 5.083 4.872 4.644 4.467 4.307 4.147 3.958 3.73 3.565 3.407 3.181 3.027 2.857 2.771 2.603 2.418 2.204 2.081 1.876 1.729 1.608 1.479 1.19 1.03 0.843 0.63 0.38 0.084 -0.356 -2.015 -7 ,22053 ,TETRA ,17617002,Tue Nov 30 00:38:29 CET,Tue Nov 30 02:31:48 CET,0.0 0.671 0.968 1.195 1.358 1.486 1.595 1.705 1.951 2.067 2.168 2.29 2.48 2.573 2.731 2.872 3.014 3.089 3.232 3.361 3.541 3.661 3.789 3.985 4.163 4.332 4.489 4.636 4.82 5.003 5.183 5.386 5.574 5.765 5.989 6.23 6.476 6.752 7.038 7.328 7.597 7.891 8.25 8.592 9.001 9.442 9.888 10.347 10.819 11.179 11.337 11.073 10.584 10.104 9.586 9.07 8.59 8.154 7.774 7.355 6.997 6.678 6.36 6.063 5.787 5.512 5.227 5.003 4.804 4.569 4.298 4.074 3.859 3.651 3.499 3.335 3.161 2.987 2.788 2.641 2.489 2.259 2.113 1.958 1.871 1.661 1.439 1.228 1.112 0.905 0.721 0.585 0.434 0.088 -0.09 -0.29 -0.509 -0.766 -1.097 -1.545 -3.974 -8 ,1945 ,TETRA ,17617003,Tue Nov 30 00:38:30 CET,Tue Nov 30 02:25:25 CET,0.0 0.761 1.082 1.279 1.455 1.641 1.813 1.966 2.212 2.314 2.424 2.549 2.727 2.806 2.947 3.112 3.284 3.371 3.53 3.657 3.837 3.966 4.086 4.242 4.402 4.56 4.705 4.854 5.04 5.204 5.362 5.546 5.728 5.911 6.125 6.365 6.6 6.855 7.112 7.392 7.705 8.046 8.434 8.814 9.22 9.654 10.097 10.54 11.015 11.513 11.872 11.743 11.346 10.835 10.356 9.924 9.518 9.122 8.741 8.354 8.042 7.742 7.451 7.173 6.913 6.687 6.438 6.216 6.023 5.802 5.573 5.39 5.165 4.924 4.753 4.588 4.407 4.197 4.001 3.872 3.732 3.519 3.351 3.177 3.096 2.901 2.678 2.455 2.348 2.155 1.963 1.814 1.653 1.299 1.107 0.899 0.666 0.394 0.054 -0.397 -2.372 -9 ,6344 ,TETRA ,17617004,Tue Nov 30 00:38:31 CET,Tue Nov 30 02:53:16 CET,0.0 0.87 1.15 1.384 1.607 1.794 1.942 2.066 2.287 2.392 2.494 2.61 2.797 2.903 3.093 3.255 3.406 3.483 3.64 3.788 3.995 4.116 4.239 4.43 4.6 4.754 4.902 5.048 5.237 5.418 5.597 5.843 6.073 6.269 6.493 6.75 6.99 7.227 7.472 7.741 8.041 8.376 8.767 9.155 9.576 10.003 10.44 10.872 11.343 11.805 12.06 11.856 11.397 10.897 10.375 9.864 9.402 8.968 8.593 8.236 7.924 7.629 7.327 7.002 6.711 6.49 6.265 6.026 5.814 5.589 5.333 5.109 4.889 4.68 4.51 4.341 4.172 3.974 3.781 3.658 3.527 3.321 3.169 2.997 2.896 2.697 2.491 2.266 2.15 1.935 1.762 1.635 1.504 1.216 1.036 0.84 0.627 0.362 0.048 -0.369 -1.872 -10 ,27983 ,TETRA ,17617005,Tue Nov 30 00:38:31 CET,Tue Nov 30 02:33:16 CET,0.0 0.734 1.021 1.246 1.449 1.614 1.726 1.831 2.003 2.086 2.183 2.281 2.449 2.529 2.678 2.811 2.946 3.019 3.16 3.292 3.483 3.593 3.7 3.878 4.048 4.195 4.339 4.485 4.662 4.838 5.01 5.214 5.419 5.607 5.834 6.096 6.318 6.565 6.838 7.115 7.421 7.748 8.104 8.429 8.769 9.169 9.612 10.036 10.436 10.798 10.895 10.467 9.865 9.301 8.821 8.339 7.866 7.438 7.078 6.727 6.415 6.094 5.777 5.502 5.245 5.002 4.747 4.501 4.277 4.05 3.797 3.587 3.384 3.156 2.968 2.78 2.599 2.395 2.17 2.011 1.838 1.559 1.38 1.205 1.11 0.908 0.694 0.487 0.376 0.181 0.044 -0.081 -0.222 -0.544 -0.719 -0.917 -1.138 -1.416 -1.741 -2.138 -3.388 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/get_summary_files.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/get_summary_files.py deleted file mode 100644 index 64d2f916..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/get_summary_files.py +++ /dev/null @@ -1,15 +0,0 @@ -import glob -import os -import shlex -import subprocess - -wd = os.getcwd() -for target in glob.glob('*/'): - os.chdir(os.path.join(wd, target)) - for leg in glob.glob('*/'): - os.chdir(os.path.join(wd, target, leg)) - executable = 'rsync -av kebne:/proj/nobackup/uucompbiochem/diazalej/qligfep-benchmarking/openFF/{}*{}*/analysis/*.txt .'.format(target, leg) - #print(executable) - #print(os.getcwd()) - run = subprocess.run(shlex.split(executable)) - os.chdir(wd) diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_124_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_124_41.txt deleted file mode 100644 index 531bb36d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_124_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2430 ,TETRA ,17617026,Tue Nov 30 00:38:31 CET,Tue Nov 30 02:24:29 CET,0.0 1.321 1.671 1.928 2.167 2.371 2.535 2.692 2.98 3.107 3.219 3.405 3.512 3.601 3.773 3.94 4.109 4.196 4.363 4.504 4.706 4.839 4.948 5.111 5.277 5.41 5.519 5.612 5.727 5.838 5.931 6.012 6.111 6.224 6.318 6.422 6.522 6.592 6.64 6.679 6.687 6.689 6.684 6.619 6.503 6.346 6.07 5.539 4.644 3.326 1.245 -1.206 -3.185 -4.778 -6.09 -7.212 -8.183 -9.048 -9.778 -10.525 -11.178 -11.732 -12.241 -12.733 -13.195 -13.626 -14.087 -14.475 -14.796 -15.13 -15.465 -15.729 -16.027 -16.346 -16.577 -16.819 -17.074 -17.324 -17.589 -17.784 -17.98 -18.269 -18.46 -18.649 -18.752 -18.96 -19.159 -19.383 -19.495 -19.658 -19.876 -20.018 -20.179 -20.5 -20.669 -20.855 -21.049 -21.278 -21.572 -21.923 -22.886 -2 ,19339 ,TETRA ,17617027,Tue Nov 30 00:38:31 CET,Tue Nov 30 02:23:17 CET,0.0 1.081 1.504 1.782 2.016 2.207 2.371 2.533 2.808 2.932 3.05 3.234 3.345 3.442 3.613 3.76 3.905 3.976 4.12 4.261 4.439 4.553 4.66 4.796 4.925 5.051 5.17 5.291 5.428 5.563 5.693 5.818 5.96 6.109 6.252 6.403 6.503 6.54 6.568 6.563 6.512 6.486 6.469 6.377 6.21 5.935 5.507 4.919 4.078 2.793 0.495 -2.338 -4.615 -6.46 -7.954 -9.263 -10.398 -11.386 -12.23 -13.034 -13.718 -14.32 -14.859 -15.385 -15.882 -16.306 -16.718 -17.07 -17.363 -17.682 -18.041 -18.345 -18.649 -18.96 -19.209 -19.453 -19.691 -19.94 -20.19 -20.36 -20.538 -20.825 -21.023 -21.219 -21.322 -21.549 -21.801 -22.069 -22.202 -22.38 -22.601 -22.739 -22.892 -23.226 -23.413 -23.605 -23.805 -24.034 -24.285 -24.593 -25.668 -3 ,2985 ,TETRA ,17617028,Tue Nov 30 00:38:31 CET,Tue Nov 30 02:23:15 CET,0.0 1.059 1.434 1.726 1.947 2.156 2.359 2.542 2.845 2.976 3.106 3.338 3.461 3.557 3.734 3.891 4.031 4.103 4.259 4.401 4.605 4.745 4.868 5.029 5.192 5.332 5.425 5.533 5.688 5.789 5.893 6.034 6.145 6.227 6.294 6.352 6.403 6.475 6.587 6.658 6.692 6.726 6.674 6.526 6.345 6.155 5.768 5.126 4.19 2.79 0.485 -2.304 -4.536 -6.366 -7.925 -9.285 -10.436 -11.397 -12.173 -12.964 -13.648 -14.237 -14.816 -15.377 -15.882 -16.325 -16.759 -17.114 -17.424 -17.743 -18.06 -18.334 -18.625 -18.938 -19.176 -19.421 -19.688 -19.968 -20.247 -20.433 -20.628 -20.931 -21.128 -21.323 -21.43 -21.675 -21.913 -22.141 -22.266 -22.447 -22.705 -22.869 -23.018 -23.312 -23.498 -23.701 -23.926 -24.186 -24.502 -24.895 -25.939 -4 ,27729 ,TETRA ,17617029,Tue Nov 30 00:38:31 CET,Tue Nov 30 02:24:14 CET,0.0 1.104 1.534 1.868 2.124 2.332 2.518 2.682 2.943 3.064 3.193 3.423 3.557 3.657 3.845 4.034 4.192 4.272 4.431 4.564 4.741 4.861 4.975 5.134 5.289 5.443 5.571 5.664 5.762 5.863 5.983 6.115 6.221 6.313 6.407 6.506 6.613 6.726 6.811 6.843 6.828 6.826 6.826 6.715 6.522 6.289 5.884 5.272 4.374 2.968 0.583 -2.141 -4.241 -6.041 -7.549 -8.818 -9.903 -10.857 -11.656 -12.438 -13.093 -13.666 -14.209 -14.746 -15.247 -15.672 -16.086 -16.463 -16.792 -17.118 -17.468 -17.766 -18.064 -18.348 -18.557 -18.785 -19.029 -19.286 -19.554 -19.725 -19.892 -20.157 -20.358 -20.566 -20.674 -20.916 -21.158 -21.418 -21.557 -21.731 -21.943 -22.084 -22.24 -22.605 -22.8 -23.006 -23.242 -23.519 -23.828 -24.209 -25.447 -5 ,18186 ,TETRA ,17617030,Tue Nov 30 00:38:32 CET,Tue Nov 30 02:26:30 CET,0.0 1.146 1.539 1.83 2.057 2.237 2.401 2.564 2.864 2.992 3.112 3.319 3.419 3.502 3.685 3.825 3.932 3.99 4.118 4.251 4.458 4.569 4.649 4.782 4.891 4.986 5.107 5.235 5.386 5.494 5.566 5.649 5.73 5.781 5.823 5.875 5.933 5.976 6.025 6.049 6.021 5.938 5.853 5.774 5.597 5.308 4.837 4.149 3.116 1.518 -0.965 -3.721 -5.848 -7.564 -9.019 -10.324 -11.45 -12.412 -13.199 -13.982 -14.641 -15.212 -15.792 -16.353 -16.847 -17.309 -17.756 -18.117 -18.439 -18.78 -19.128 -19.399 -19.683 -19.962 -20.179 -20.414 -20.655 -20.902 -21.14 -21.299 -21.474 -21.755 -21.959 -22.186 -22.296 -22.523 -22.761 -22.999 -23.127 -23.308 -23.535 -23.687 -23.855 -24.216 -24.391 -24.576 -24.787 -25.041 -25.351 -25.735 -26.812 -6 ,14536 ,TETRA ,17617031,Tue Nov 30 00:38:32 CET,Tue Nov 30 02:25:06 CET,0.0 1.046 1.381 1.662 1.906 2.107 2.309 2.48 2.766 2.91 3.033 3.207 3.305 3.388 3.551 3.705 3.851 3.919 4.016 4.103 4.274 4.383 4.479 4.613 4.731 4.828 4.914 5.005 5.116 5.203 5.277 5.38 5.479 5.551 5.615 5.646 5.652 5.665 5.672 5.704 5.705 5.614 5.453 5.299 5.153 4.942 4.543 3.873 2.875 1.398 -1.07 -3.943 -6.253 -8.122 -9.593 -10.906 -12.053 -13.061 -13.907 -14.723 -15.402 -15.987 -16.554 -17.088 -17.561 -18.011 -18.502 -18.899 -19.226 -19.57 -19.919 -20.218 -20.542 -20.873 -21.124 -21.384 -21.646 -21.919 -22.216 -22.417 -22.608 -22.905 -23.126 -23.353 -23.467 -23.704 -23.95 -24.207 -24.34 -24.524 -24.77 -24.926 -25.087 -25.422 -25.619 -25.839 -26.07 -26.337 -26.661 -27.084 -28.293 -7 ,14669 ,TETRA ,17617032,Tue Nov 30 00:38:32 CET,Tue Nov 30 02:32:41 CET,0.0 1.371 1.803 2.136 2.386 2.59 2.79 2.976 3.277 3.413 3.539 3.739 3.849 3.942 4.131 4.307 4.481 4.569 4.723 4.852 5.03 5.141 5.245 5.382 5.509 5.64 5.747 5.839 5.979 6.107 6.227 6.366 6.484 6.593 6.727 6.882 7.011 7.108 7.156 7.167 7.165 7.155 7.108 7.019 6.856 6.602 6.226 5.629 4.65 3.184 0.818 -1.982 -4.231 -6.081 -7.592 -8.875 -9.922 -10.834 -11.624 -12.426 -13.092 -13.659 -14.19 -14.677 -15.125 -15.527 -15.968 -16.377 -16.719 -17.047 -17.363 -17.647 -17.944 -18.231 -18.467 -18.727 -18.981 -19.222 -19.478 -19.656 -19.841 -20.158 -20.379 -20.59 -20.696 -20.908 -21.123 -21.366 -21.498 -21.678 -21.906 -22.053 -22.212 -22.6 -22.798 -22.989 -23.205 -23.437 -23.695 -24.063 -25.002 -8 ,1791 ,TETRA ,17617033,Tue Nov 30 00:38:33 CET,Tue Nov 30 02:28:16 CET,0.0 1.316 1.734 2.048 2.285 2.492 2.672 2.846 3.17 3.311 3.442 3.652 3.771 3.867 4.04 4.197 4.339 4.411 4.561 4.716 4.912 5.008 5.094 5.218 5.337 5.45 5.554 5.631 5.721 5.814 5.902 6.03 6.164 6.263 6.351 6.445 6.531 6.637 6.744 6.794 6.812 6.844 6.853 6.809 6.665 6.426 6.131 5.692 4.856 3.501 1.34 -1.235 -3.277 -4.963 -6.377 -7.523 -8.492 -9.351 -10.07 -10.784 -11.367 -11.91 -12.415 -12.854 -13.274 -13.67 -14.085 -14.425 -14.711 -15.027 -15.353 -15.616 -15.9 -16.19 -16.41 -16.645 -16.901 -17.159 -17.404 -17.571 -17.746 -18.033 -18.244 -18.461 -18.563 -18.771 -18.991 -19.217 -19.342 -19.524 -19.759 -19.901 -20.045 -20.383 -20.576 -20.775 -21.017 -21.298 -21.605 -21.946 -23.107 -9 ,9408 ,TETRA ,17617034,Tue Nov 30 00:38:32 CET,Tue Nov 30 02:24:01 CET,0.0 1.078 1.472 1.736 1.994 2.237 2.439 2.605 2.887 3.015 3.128 3.319 3.448 3.56 3.735 3.892 4.038 4.102 4.218 4.317 4.453 4.547 4.645 4.775 4.903 5.05 5.198 5.316 5.449 5.572 5.68 5.791 5.876 5.939 6.023 6.137 6.23 6.317 6.423 6.502 6.531 6.567 6.575 6.476 6.241 5.949 5.541 4.949 3.999 2.416 -0.146 -2.996 -5.197 -6.977 -8.439 -9.674 -10.732 -11.675 -12.451 -13.237 -13.886 -14.434 -14.982 -15.502 -15.971 -16.389 -16.82 -17.199 -17.513 -17.845 -18.204 -18.506 -18.817 -19.132 -19.381 -19.627 -19.875 -20.145 -20.418 -20.592 -20.762 -21.034 -21.226 -21.432 -21.542 -21.766 -21.997 -22.255 -22.395 -22.581 -22.83 -22.987 -23.14 -23.477 -23.656 -23.849 -24.064 -24.295 -24.563 -24.919 -25.985 -10 ,16463 ,TETRA ,17617035,Tue Nov 30 00:38:31 CET,Tue Nov 30 02:24:16 CET,0.0 1.067 1.481 1.798 2.027 2.235 2.468 2.664 2.969 3.102 3.24 3.501 3.64 3.754 3.971 4.16 4.323 4.393 4.534 4.673 4.857 4.975 5.098 5.255 5.381 5.508 5.628 5.748 5.881 5.994 6.109 6.218 6.328 6.466 6.593 6.708 6.811 6.89 6.934 6.962 6.979 6.983 6.97 6.912 6.788 6.55 6.178 5.587 4.586 3.011 0.553 -2.176 -4.426 -6.315 -7.84 -9.105 -10.161 -11.093 -11.889 -12.676 -13.333 -13.893 -14.412 -14.92 -15.368 -15.742 -16.153 -16.528 -16.844 -17.18 -17.532 -17.823 -18.12 -18.404 -18.616 -18.845 -19.088 -19.342 -19.609 -19.796 -19.998 -20.308 -20.505 -20.7 -20.81 -21.039 -21.262 -21.493 -21.617 -21.799 -22.041 -22.186 -22.327 -22.641 -22.812 -22.996 -23.192 -23.404 -23.688 -24.098 -25.292 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_124_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_124_54.txt deleted file mode 100644 index 6ebb2235..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_124_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11886 ,TETRA ,17617036,Tue Nov 30 00:38:34 CET,Tue Nov 30 02:29:26 CET,0.0 1.044 1.34 1.605 1.786 1.876 1.965 2.046 2.113 2.131 2.147 2.128 2.147 2.161 2.167 2.133 2.075 2.042 1.953 1.854 1.696 1.584 1.463 1.255 1.028 0.819 0.614 0.384 0.071 -0.247 -0.592 -1.034 -1.492 -1.978 -2.557 -3.236 -3.935 -4.765 -5.738 -6.839 -8.059 -9.513 -11.331 -13.347 -15.922 -19.008 -22.951 -27.948 -34.511 -43.432 -56.433 -69.766 -79.406 -86.851 -92.737 -97.672 -101.709 -105.085 -107.895 -110.643 -112.913 -114.828 -116.551 -118.08 -119.441 -120.66 -121.926 -123.029 -123.932 -124.831 -125.748 -126.494 -127.253 -128.041 -128.649 -129.262 -129.892 -130.509 -131.105 -131.523 -131.954 -132.6 -133.04 -133.494 -133.726 -134.212 -134.711 -135.209 -135.463 -135.887 -136.286 -136.569 -136.853 -137.44 -137.759 -138.109 -138.48 -138.89 -139.363 -139.946 -141.551 -2 ,13469 ,TETRA ,17617037,Tue Nov 30 00:38:34 CET,Tue Nov 30 02:14:34 CET,0.0 0.994 1.296 1.459 1.602 1.717 1.809 1.898 1.996 2.004 2.014 2.027 2.037 2.026 2.006 1.953 1.879 1.839 1.748 1.684 1.588 1.483 1.356 1.172 0.983 0.782 0.574 0.336 0.017 -0.29 -0.625 -1.077 -1.534 -1.988 -2.543 -3.235 -3.955 -4.78 -5.731 -6.82 -8.031 -9.484 -11.342 -13.376 -15.96 -19.097 -22.988 -27.878 -34.434 -43.33 -56.413 -69.924 -79.648 -87.133 -93.01 -97.84 -101.801 -105.193 -107.949 -110.552 -112.707 -114.567 -116.272 -117.856 -119.308 -120.583 -121.881 -123.02 -123.975 -124.948 -125.929 -126.695 -127.477 -128.276 -128.885 -129.506 -130.14 -130.782 -131.42 -131.854 -132.295 -132.96 -133.417 -133.892 -134.131 -134.608 -135.09 -135.591 -135.849 -136.282 -136.673 -136.942 -137.212 -137.774 -138.096 -138.466 -138.898 -139.342 -139.79 -140.352 -141.89 -3 ,9407 ,TETRA ,17617038,Tue Nov 30 00:38:34 CET,Tue Nov 30 02:29:23 CET,0.0 1.319 1.683 1.943 2.104 2.207 2.29 2.333 2.356 2.361 2.372 2.383 2.388 2.373 2.33 2.267 2.21 2.185 2.114 2.018 1.849 1.721 1.584 1.38 1.187 0.969 0.74 0.521 0.242 -0.051 -0.362 -0.752 -1.168 -1.602 -2.133 -2.78 -3.475 -4.293 -5.224 -6.286 -7.486 -8.938 -10.773 -12.793 -15.358 -18.42 -22.304 -27.24 -33.736 -42.504 -55.263 -68.458 -77.987 -85.35 -91.18 -95.972 -99.872 -103.179 -105.897 -108.534 -110.743 -112.605 -114.28 -115.847 -117.28 -118.539 -119.804 -120.882 -121.787 -122.713 -123.663 -124.425 -125.187 -125.974 -126.569 -127.158 -127.76 -128.359 -128.971 -129.402 -129.838 -130.503 -130.944 -131.374 -131.603 -132.083 -132.569 -133.066 -133.321 -133.744 -134.153 -134.439 -134.721 -135.358 -135.719 -136.082 -136.461 -136.865 -137.308 -137.894 -139.273 -4 ,11639 ,TETRA ,17617039,Tue Nov 30 00:38:34 CET,Tue Nov 30 02:30:53 CET,0.0 1.41 1.827 2.087 2.23 2.338 2.455 2.542 2.625 2.653 2.691 2.705 2.724 2.724 2.719 2.696 2.645 2.621 2.542 2.435 2.271 2.158 2.039 1.841 1.625 1.422 1.237 1.032 0.721 0.39 0.043 -0.405 -0.851 -1.298 -1.859 -2.55 -3.264 -4.099 -5.045 -6.121 -7.276 -8.668 -10.493 -12.413 -14.835 -17.909 -21.884 -26.835 -33.35 -42.256 -55.275 -68.652 -78.426 -85.979 -91.939 -96.893 -100.888 -104.249 -106.975 -109.555 -111.677 -113.504 -115.186 -116.708 -118.086 -119.301 -120.528 -121.596 -122.521 -123.459 -124.391 -125.171 -125.944 -126.717 -127.323 -127.932 -128.542 -129.161 -129.796 -130.214 -130.638 -131.285 -131.71 -132.13 -132.339 -132.768 -133.208 -133.678 -133.917 -134.321 -134.658 -134.912 -135.188 -135.744 -136.011 -136.284 -136.579 -136.92 -137.369 -137.966 -139.092 -5 ,31847 ,TETRA ,17617040,Tue Nov 30 00:38:34 CET,Tue Nov 30 02:32:35 CET,0.0 1.376 1.725 1.954 2.134 2.258 2.344 2.403 2.493 2.516 2.515 2.497 2.517 2.529 2.532 2.485 2.428 2.398 2.325 2.236 2.08 1.981 1.861 1.653 1.435 1.207 1.0 0.799 0.487 0.151 -0.188 -0.605 -1.05 -1.538 -2.114 -2.808 -3.5 -4.323 -5.28 -6.355 -7.595 -9.084 -10.947 -12.97 -15.51 -18.633 -22.625 -27.626 -34.162 -42.97 -55.794 -69.065 -78.752 -86.206 -92.07 -96.962 -100.966 -104.32 -107.07 -109.689 -111.828 -113.667 -115.364 -116.891 -118.26 -119.467 -120.678 -121.74 -122.635 -123.544 -124.465 -125.198 -125.93 -126.68 -127.267 -127.866 -128.464 -129.067 -129.664 -130.063 -130.463 -131.06 -131.491 -131.955 -132.186 -132.647 -133.122 -133.61 -133.858 -134.263 -134.601 -134.873 -135.152 -135.735 -136.044 -136.391 -136.761 -137.168 -137.651 -138.296 -139.931 -6 ,6456 ,TETRA ,17617041,Tue Nov 30 00:38:34 CET,Tue Nov 30 02:26:28 CET,0.0 1.004 1.333 1.51 1.612 1.689 1.75 1.803 1.906 1.954 1.998 2.017 2.027 2.022 2.005 1.944 1.889 1.86 1.782 1.688 1.519 1.404 1.289 1.087 0.872 0.661 0.439 0.218 -0.076 -0.39 -0.725 -1.185 -1.651 -2.109 -2.671 -3.327 -4.015 -4.828 -5.75 -6.818 -8.039 -9.531 -11.409 -13.409 -15.904 -18.976 -22.895 -27.765 -34.139 -42.854 -55.63 -68.809 -78.376 -85.772 -91.631 -96.466 -100.45 -103.945 -106.836 -109.58 -111.837 -113.752 -115.479 -117.041 -118.472 -119.742 -121.025 -122.142 -123.094 -124.059 -125.025 -125.791 -126.554 -127.345 -127.954 -128.572 -129.2 -129.834 -130.474 -130.914 -131.363 -132.03 -132.475 -132.936 -133.173 -133.639 -134.114 -134.607 -134.857 -135.274 -135.655 -135.938 -136.229 -136.826 -137.128 -137.446 -137.808 -138.219 -138.672 -139.246 -140.879 -7 ,19253 ,TETRA ,17617042,Tue Nov 30 00:38:34 CET,Tue Nov 30 02:23:15 CET,0.0 1.243 1.647 1.898 2.072 2.209 2.297 2.34 2.408 2.427 2.428 2.411 2.421 2.422 2.4 2.332 2.262 2.229 2.137 2.029 1.869 1.755 1.638 1.458 1.262 1.055 0.859 0.641 0.311 -0.027 -0.385 -0.845 -1.318 -1.806 -2.395 -3.113 -3.854 -4.709 -5.678 -6.759 -7.987 -9.483 -11.36 -13.394 -15.938 -19.049 -23.021 -28.019 -34.638 -43.54 -56.384 -69.688 -79.39 -86.808 -92.732 -97.714 -101.774 -105.2 -107.938 -110.568 -112.817 -114.76 -116.526 -118.109 -119.544 -120.831 -122.141 -123.269 -124.212 -125.175 -126.149 -126.943 -127.744 -128.539 -129.134 -129.753 -130.388 -131.025 -131.665 -132.087 -132.516 -133.185 -133.62 -134.075 -134.325 -134.826 -135.322 -135.83 -136.095 -136.525 -136.919 -137.213 -137.514 -138.146 -138.479 -138.813 -139.163 -139.554 -139.99 -140.513 -142.251 -8 ,27244 ,TETRA ,17617043,Tue Nov 30 00:38:34 CET,Tue Nov 30 02:28:03 CET,0.0 1.856 2.377 2.688 2.921 3.098 3.197 3.257 3.355 3.368 3.374 3.358 3.367 3.359 3.312 3.243 3.164 3.132 3.068 2.967 2.807 2.707 2.597 2.402 2.195 1.958 1.7 1.451 1.127 0.786 0.423 -0.032 -0.478 -0.921 -1.494 -2.178 -2.855 -3.673 -4.626 -5.697 -6.926 -8.432 -10.23 -12.159 -14.692 -17.767 -21.637 -26.541 -33.02 -41.859 -54.857 -68.234 -77.975 -85.559 -91.502 -96.341 -100.33 -103.706 -106.471 -109.165 -111.42 -113.389 -115.172 -116.749 -118.148 -119.374 -120.631 -121.734 -122.686 -123.673 -124.657 -125.45 -126.258 -127.094 -127.727 -128.356 -128.994 -129.651 -130.316 -130.764 -131.223 -131.92 -132.392 -132.872 -133.113 -133.59 -134.07 -134.562 -134.815 -135.244 -135.616 -135.891 -136.164 -136.743 -137.055 -137.38 -137.739 -138.118 -138.542 -139.033 -140.262 -9 ,22382 ,TETRA ,17617044,Tue Nov 30 00:38:34 CET,Tue Nov 30 02:32:10 CET,0.0 1.282 1.656 1.934 2.145 2.288 2.421 2.537 2.692 2.731 2.751 2.781 2.81 2.793 2.747 2.7 2.641 2.605 2.525 2.45 2.299 2.169 2.031 1.832 1.629 1.406 1.186 0.965 0.648 0.311 -0.029 -0.477 -0.948 -1.422 -1.977 -2.629 -3.324 -4.163 -5.146 -6.25 -7.476 -8.983 -10.886 -12.906 -15.469 -18.617 -22.54 -27.45 -33.996 -42.858 -55.654 -68.908 -78.571 -85.982 -91.833 -96.656 -100.572 -103.939 -106.74 -109.394 -111.54 -113.367 -115.027 -116.534 -117.938 -119.22 -120.515 -121.609 -122.55 -123.523 -124.506 -125.299 -126.086 -126.891 -127.529 -128.18 -128.831 -129.495 -130.155 -130.601 -131.061 -131.761 -132.221 -132.68 -132.914 -133.387 -133.887 -134.401 -134.659 -135.095 -135.504 -135.794 -136.105 -136.782 -137.111 -137.456 -137.843 -138.245 -138.663 -139.245 -140.972 -10 ,22178 ,TETRA ,17617045,Tue Nov 30 00:38:34 CET,Tue Nov 30 02:24:21 CET,0.0 1.008 1.31 1.513 1.708 1.864 1.966 2.033 2.133 2.179 2.214 2.236 2.237 2.206 2.168 2.117 2.039 2.004 1.923 1.816 1.667 1.565 1.44 1.234 1.004 0.765 0.533 0.302 -0.02 -0.374 -0.733 -1.183 -1.663 -2.156 -2.761 -3.472 -4.186 -4.986 -5.903 -6.998 -8.218 -9.666 -11.512 -13.514 -16.035 -19.123 -23.027 -27.987 -34.553 -43.329 -56.085 -69.21 -78.734 -86.144 -92.011 -96.825 -100.746 -104.103 -106.868 -109.474 -111.592 -113.402 -115.058 -116.61 -118.009 -119.223 -120.475 -121.55 -122.445 -123.345 -124.241 -124.965 -125.703 -126.45 -127.029 -127.642 -128.252 -128.866 -129.506 -129.941 -130.38 -131.051 -131.499 -131.949 -132.186 -132.642 -133.065 -133.51 -133.761 -134.191 -134.588 -134.866 -135.146 -135.76 -136.085 -136.438 -136.832 -137.256 -137.723 -138.319 -140.042 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_1.txt deleted file mode 100644 index fe53ba20..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24605 ,TETRA ,17617046,Tue Nov 30 00:39:13 CET,Tue Nov 30 02:30:44 CET,0.0 1.206 1.532 1.761 1.959 2.141 2.301 2.447 2.719 2.836 2.943 3.104 3.257 3.341 3.504 3.666 3.825 3.892 4.01 4.148 4.358 4.492 4.613 4.774 4.912 5.015 5.129 5.233 5.374 5.538 5.672 5.803 5.941 6.09 6.255 6.394 6.504 6.632 6.761 6.892 7.021 7.147 7.281 7.423 7.581 7.696 7.799 7.87 7.822 7.597 6.978 6.017 5.201 4.473 3.806 3.227 2.754 2.321 1.913 1.505 1.155 0.829 0.515 0.219 -0.082 -0.398 -0.718 -0.968 -1.171 -1.406 -1.648 -1.852 -2.09 -2.328 -2.518 -2.719 -2.911 -3.096 -3.284 -3.427 -3.586 -3.852 -4.029 -4.202 -4.285 -4.46 -4.67 -4.876 -4.98 -5.146 -5.318 -5.45 -5.585 -5.895 -6.066 -6.266 -6.496 -6.75 -7.068 -7.512 -8.898 -2 ,32766 ,TETRA ,17617047,Tue Nov 30 00:40:22 CET,Tue Nov 30 02:29:16 CET,0.0 0.929 1.244 1.487 1.687 1.857 2.011 2.161 2.449 2.58 2.695 2.846 2.99 3.076 3.235 3.391 3.53 3.591 3.705 3.823 3.992 4.094 4.197 4.35 4.521 4.69 4.839 4.955 5.089 5.214 5.327 5.487 5.638 5.76 5.89 6.014 6.135 6.3 6.476 6.612 6.71 6.835 7.005 7.127 7.218 7.278 7.38 7.441 7.302 6.989 6.292 5.383 4.62 3.924 3.299 2.709 2.205 1.755 1.354 0.948 0.555 0.185 -0.138 -0.424 -0.688 -0.953 -1.258 -1.507 -1.699 -1.883 -2.082 -2.279 -2.493 -2.711 -2.863 -2.997 -3.139 -3.316 -3.495 -3.617 -3.755 -3.988 -4.166 -4.357 -4.452 -4.65 -4.869 -5.104 -5.226 -5.4 -5.556 -5.667 -5.788 -6.057 -6.207 -6.366 -6.555 -6.823 -7.141 -7.512 -8.883 -3 ,19965 ,TETRA ,17617048,Tue Nov 30 00:40:22 CET,Tue Nov 30 02:29:39 CET,0.0 1.36 1.805 2.082 2.295 2.471 2.642 2.799 3.042 3.149 3.253 3.384 3.531 3.619 3.77 3.905 4.043 4.109 4.243 4.361 4.51 4.611 4.716 4.876 5.029 5.188 5.348 5.488 5.66 5.831 5.992 6.162 6.291 6.395 6.504 6.625 6.753 6.882 6.987 7.091 7.227 7.37 7.513 7.653 7.779 7.89 7.96 7.971 7.943 7.748 7.156 6.298 5.541 4.835 4.161 3.531 2.992 2.537 2.139 1.73 1.387 1.077 0.782 0.493 0.227 0.001 -0.24 -0.473 -0.682 -0.897 -1.125 -1.309 -1.492 -1.713 -1.908 -2.106 -2.305 -2.5 -2.716 -2.87 -3.017 -3.248 -3.4 -3.559 -3.646 -3.814 -3.989 -4.186 -4.298 -4.47 -4.626 -4.737 -4.853 -5.122 -5.263 -5.419 -5.603 -5.86 -6.197 -6.648 -8.448 -4 ,8355 ,TETRA ,17617049,Tue Nov 30 00:40:22 CET,Tue Nov 30 02:28:48 CET,0.0 1.092 1.443 1.708 1.9 2.069 2.23 2.382 2.647 2.764 2.874 3.024 3.179 3.277 3.447 3.608 3.76 3.824 3.946 4.058 4.214 4.302 4.38 4.499 4.601 4.698 4.798 4.888 5.001 5.139 5.272 5.394 5.513 5.624 5.735 5.863 5.989 6.135 6.277 6.395 6.5 6.662 6.879 7.016 7.123 7.216 7.292 7.299 7.181 6.918 6.35 5.467 4.677 3.986 3.371 2.825 2.324 1.836 1.438 1.061 0.679 0.341 0.057 -0.235 -0.506 -0.745 -1.009 -1.252 -1.455 -1.656 -1.865 -2.032 -2.232 -2.472 -2.631 -2.777 -2.926 -3.086 -3.265 -3.378 -3.493 -3.686 -3.826 -3.983 -4.068 -4.261 -4.472 -4.691 -4.801 -4.971 -5.129 -5.253 -5.383 -5.641 -5.806 -6.001 -6.199 -6.442 -6.755 -7.194 -8.765 -5 ,4619 ,TETRA ,17617050,Tue Nov 30 00:40:23 CET,Tue Nov 30 02:29:00 CET,0.0 1.342 1.655 1.915 2.139 2.303 2.449 2.587 2.824 2.936 3.049 3.194 3.327 3.405 3.563 3.7 3.823 3.89 4.015 4.126 4.289 4.403 4.498 4.612 4.729 4.841 4.947 5.035 5.145 5.274 5.412 5.551 5.666 5.769 5.884 6.015 6.126 6.25 6.389 6.515 6.632 6.759 6.894 7.011 7.123 7.235 7.341 7.381 7.343 7.157 6.654 5.838 5.025 4.344 3.717 3.137 2.619 2.119 1.693 1.274 0.912 0.597 0.296 0.001 -0.269 -0.539 -0.833 -1.074 -1.269 -1.477 -1.693 -1.863 -2.06 -2.292 -2.473 -2.643 -2.809 -2.981 -3.183 -3.345 -3.516 -3.764 -3.914 -4.083 -4.179 -4.367 -4.559 -4.748 -4.836 -4.989 -5.147 -5.281 -5.417 -5.706 -5.869 -6.047 -6.253 -6.534 -6.863 -7.231 -8.613 -6 ,28143 ,TETRA ,17617051,Tue Nov 30 00:40:23 CET,Tue Nov 30 02:30:33 CET,0.0 1.159 1.474 1.721 1.903 2.064 2.212 2.343 2.572 2.678 2.779 2.904 3.046 3.133 3.292 3.438 3.58 3.648 3.778 3.89 4.036 4.137 4.242 4.404 4.557 4.709 4.828 4.926 5.053 5.148 5.247 5.384 5.531 5.661 5.788 5.909 6.021 6.133 6.236 6.351 6.492 6.665 6.835 6.94 7.07 7.191 7.241 7.237 7.108 6.82 6.183 5.317 4.611 3.969 3.348 2.745 2.233 1.781 1.387 1.012 0.666 0.332 0.015 -0.271 -0.535 -0.823 -1.122 -1.355 -1.553 -1.782 -2.012 -2.173 -2.37 -2.621 -2.81 -2.988 -3.177 -3.378 -3.583 -3.729 -3.875 -4.064 -4.189 -4.324 -4.396 -4.535 -4.676 -4.853 -4.943 -5.099 -5.258 -5.388 -5.529 -5.805 -5.956 -6.15 -6.384 -6.638 -6.948 -7.388 -9.143 -7 ,13598 ,TETRA ,17617052,Tue Nov 30 00:40:24 CET,Tue Nov 30 02:28:04 CET,0.0 1.238 1.574 1.806 2.002 2.176 2.349 2.503 2.747 2.871 2.992 3.157 3.315 3.404 3.544 3.678 3.814 3.882 4.018 4.155 4.353 4.479 4.602 4.771 4.911 5.023 5.134 5.249 5.392 5.512 5.644 5.828 5.985 6.107 6.222 6.348 6.495 6.643 6.763 6.914 7.062 7.176 7.302 7.4 7.508 7.629 7.723 7.756 7.701 7.438 6.801 5.854 4.987 4.214 3.526 2.911 2.37 1.905 1.507 1.108 0.754 0.442 0.16 -0.125 -0.396 -0.628 -0.881 -1.114 -1.32 -1.549 -1.805 -2.023 -2.249 -2.497 -2.684 -2.866 -3.035 -3.194 -3.382 -3.524 -3.66 -3.878 -4.045 -4.217 -4.302 -4.482 -4.682 -4.885 -4.99 -5.161 -5.319 -5.437 -5.562 -5.829 -5.985 -6.166 -6.369 -6.62 -6.939 -7.371 -8.579 -8 ,27326 ,TETRA ,17617053,Tue Nov 30 00:40:22 CET,Tue Nov 30 02:27:50 CET,0.0 1.043 1.371 1.613 1.817 1.996 2.156 2.302 2.553 2.665 2.755 2.871 3.02 3.116 3.288 3.431 3.563 3.63 3.75 3.859 4.008 4.093 4.188 4.328 4.456 4.584 4.704 4.814 4.973 5.133 5.296 5.475 5.598 5.702 5.816 5.934 6.054 6.192 6.312 6.436 6.569 6.707 6.873 7.024 7.149 7.253 7.331 7.312 7.18 6.92 6.322 5.414 4.606 3.891 3.253 2.667 2.155 1.693 1.292 0.878 0.516 0.174 -0.137 -0.412 -0.686 -0.942 -1.236 -1.519 -1.748 -1.958 -2.165 -2.339 -2.537 -2.753 -2.926 -3.107 -3.28 -3.463 -3.694 -3.861 -4.025 -4.29 -4.472 -4.657 -4.748 -4.937 -5.135 -5.34 -5.446 -5.601 -5.748 -5.876 -6.011 -6.31 -6.476 -6.663 -6.862 -7.077 -7.336 -7.742 -9.12 -9 ,23055 ,TETRA ,17617054,Tue Nov 30 00:40:23 CET,Tue Nov 30 02:27:33 CET,0.0 1.433 1.8 2.062 2.277 2.46 2.61 2.759 3.031 3.144 3.251 3.392 3.541 3.629 3.801 3.964 4.11 4.172 4.283 4.4 4.569 4.669 4.763 4.888 5.01 5.14 5.276 5.409 5.553 5.676 5.784 5.901 6.02 6.134 6.302 6.519 6.723 6.906 7.026 7.158 7.307 7.463 7.63 7.764 7.876 7.978 8.047 8.048 7.949 7.667 7.001 6.063 5.271 4.58 3.962 3.368 2.862 2.419 1.998 1.552 1.176 0.84 0.476 0.157 -0.11 -0.366 -0.624 -0.856 -1.073 -1.306 -1.544 -1.736 -1.934 -2.146 -2.318 -2.489 -2.655 -2.824 -3.005 -3.168 -3.341 -3.584 -3.749 -3.898 -3.973 -4.133 -4.3 -4.493 -4.592 -4.757 -4.935 -5.056 -5.196 -5.507 -5.644 -5.801 -6.023 -6.311 -6.618 -7.017 -8.303 -10 ,10095 ,TETRA ,17617055,Tue Nov 30 00:40:23 CET,Tue Nov 30 02:27:07 CET,0.0 1.343 1.782 2.09 2.298 2.459 2.617 2.759 2.997 3.104 3.199 3.311 3.436 3.505 3.669 3.829 3.959 4.029 4.169 4.293 4.455 4.564 4.676 4.823 4.973 5.121 5.261 5.4 5.553 5.691 5.814 5.926 6.037 6.156 6.29 6.459 6.629 6.78 6.932 7.096 7.246 7.379 7.507 7.637 7.774 7.868 7.925 7.928 7.887 7.669 7.066 6.183 5.334 4.583 3.94 3.298 2.743 2.254 1.819 1.395 1.014 0.69 0.379 0.065 -0.253 -0.553 -0.87 -1.159 -1.409 -1.648 -1.889 -2.118 -2.369 -2.597 -2.757 -2.941 -3.14 -3.348 -3.556 -3.709 -3.876 -4.127 -4.311 -4.519 -4.621 -4.829 -5.049 -5.271 -5.392 -5.581 -5.781 -5.921 -6.063 -6.364 -6.536 -6.723 -6.938 -7.179 -7.448 -7.906 -9.369 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_156.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_156.txt deleted file mode 100644 index 05bff0d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_156.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,622 ,TETRA ,17617056,Tue Nov 30 00:40:24 CET,Tue Nov 30 02:27:32 CET,0.0 1.206 1.534 1.79 2.029 2.225 2.388 2.529 2.763 2.878 3.004 3.19 3.352 3.462 3.674 3.873 4.048 4.128 4.296 4.452 4.69 4.845 4.984 5.181 5.363 5.542 5.733 5.937 6.196 6.411 6.602 6.853 7.089 7.332 7.654 7.971 8.256 8.625 9.063 9.505 9.904 10.362 10.911 11.435 12.054 12.756 13.53 14.397 15.433 16.683 18.231 19.474 20.153 20.519 20.727 20.877 20.959 20.945 20.896 20.829 20.757 20.708 20.635 20.543 20.461 20.384 20.282 20.175 20.086 19.998 19.905 19.812 19.716 19.634 19.568 19.492 19.408 19.311 19.194 19.099 18.985 18.812 18.676 18.526 18.456 18.313 18.169 18.017 17.938 17.816 17.686 17.603 17.508 17.283 17.16 17.007 16.834 16.653 16.396 16.043 14.678 -2 ,27825 ,TETRA ,17617057,Tue Nov 30 00:41:22 CET,Tue Nov 30 02:44:27 CET,0.0 0.814 1.12 1.376 1.602 1.792 1.94 2.063 2.335 2.47 2.591 2.776 2.943 3.042 3.222 3.401 3.574 3.661 3.842 4.016 4.269 4.432 4.59 4.796 4.968 5.143 5.322 5.49 5.705 5.906 6.099 6.333 6.596 6.894 7.245 7.61 7.913 8.25 8.627 9.048 9.489 9.917 10.393 10.904 11.525 12.2 13.002 13.912 14.969 16.198 17.677 18.898 19.565 19.98 20.237 20.378 20.439 20.45 20.413 20.369 20.297 20.15 19.992 19.874 19.776 19.677 19.56 19.447 19.349 19.241 19.132 19.06 18.967 18.846 18.757 18.641 18.498 18.348 18.207 18.11 17.997 17.815 17.684 17.542 17.481 17.373 17.247 17.106 17.029 16.911 16.792 16.698 16.582 16.339 16.214 16.067 15.899 15.7 15.471 15.185 14.113 -3 ,13776 ,TETRA ,17617058,Tue Nov 30 00:46:12 CET,Tue Nov 30 02:35:07 CET,0.0 0.819 1.113 1.349 1.569 1.765 1.941 2.094 2.357 2.489 2.619 2.792 2.959 3.068 3.281 3.488 3.659 3.743 3.916 4.073 4.316 4.459 4.597 4.794 4.98 5.175 5.366 5.539 5.775 6.029 6.256 6.531 6.826 7.11 7.43 7.778 8.116 8.505 8.894 9.277 9.7 10.173 10.684 11.202 11.831 12.548 13.336 14.24 15.36 16.698 18.264 19.547 20.282 20.696 20.926 21.021 21.065 21.098 21.102 21.08 21.004 20.925 20.858 20.772 20.681 20.586 20.483 20.385 20.285 20.189 20.089 19.997 19.902 19.793 19.708 19.628 19.529 19.413 19.294 19.198 19.077 18.882 18.745 18.602 18.534 18.402 18.267 18.106 18.019 17.896 17.733 17.624 17.522 17.248 17.084 16.924 16.757 16.568 16.319 15.993 14.936 -4 ,22001 ,TETRA ,17617059,Tue Nov 30 00:48:13 CET,Tue Nov 30 02:32:28 CET,0.0 1.204 1.536 1.793 2.004 2.184 2.33 2.455 2.69 2.809 2.923 3.078 3.246 3.368 3.597 3.794 3.956 4.027 4.189 4.363 4.607 4.745 4.874 5.065 5.237 5.401 5.565 5.749 5.988 6.201 6.397 6.644 6.888 7.108 7.355 7.638 7.917 8.228 8.572 8.916 9.277 9.704 10.193 10.692 11.277 11.927 12.683 13.528 14.566 15.893 17.517 18.76 19.453 19.917 20.219 20.372 20.379 20.358 20.36 20.313 20.248 20.147 20.031 19.959 19.898 19.82 19.716 19.632 19.56 19.476 19.373 19.274 19.18 19.081 18.991 18.908 18.828 18.746 18.651 18.576 18.5 18.353 18.245 18.144 18.1 18.009 17.893 17.772 17.708 17.594 17.467 17.384 17.292 17.072 16.946 16.812 16.676 16.5 16.251 15.877 14.716 -5 ,9056 ,TETRA ,17617060,Tue Nov 30 00:50:25 CET,Tue Nov 30 02:33:13 CET,0.0 0.959 1.232 1.478 1.672 1.83 1.974 2.125 2.381 2.493 2.602 2.752 2.909 3.003 3.162 3.318 3.481 3.558 3.702 3.849 4.059 4.184 4.304 4.492 4.686 4.894 5.096 5.277 5.506 5.725 5.934 6.181 6.43 6.705 7.04 7.373 7.669 7.995 8.33 8.683 9.074 9.56 10.135 10.646 11.253 11.953 12.717 13.586 14.649 15.948 17.441 18.65 19.374 19.786 20.065 20.202 20.227 20.238 20.25 20.234 20.189 20.114 19.977 19.85 19.764 19.679 19.573 19.479 19.396 19.277 19.143 19.042 18.913 18.778 18.691 18.591 18.485 18.363 18.213 18.115 18.01 17.835 17.711 17.602 17.548 17.409 17.262 17.103 17.017 16.89 16.739 16.634 16.525 16.278 16.148 16.014 15.849 15.653 15.425 15.127 14.201 -6 ,13692 ,TETRA ,17617061,Tue Nov 30 00:57:27 CET,Tue Nov 30 02:50:25 CET,0.0 0.821 1.131 1.384 1.597 1.787 1.956 2.107 2.388 2.522 2.655 2.83 2.998 3.109 3.297 3.479 3.672 3.77 3.957 4.141 4.395 4.536 4.66 4.864 5.076 5.268 5.446 5.613 5.832 6.062 6.286 6.532 6.803 7.093 7.419 7.745 8.026 8.338 8.666 9.007 9.376 9.838 10.38 10.885 11.491 12.192 12.994 13.898 14.974 16.221 17.748 19.05 19.755 20.12 20.296 20.391 20.428 20.435 20.424 20.379 20.32 20.241 20.159 20.087 20.023 19.96 19.879 19.779 19.664 19.554 19.45 19.357 19.251 19.113 19.004 18.9 18.779 18.66 18.554 18.478 18.401 18.28 18.173 18.046 17.987 17.871 17.746 17.592 17.503 17.373 17.232 17.129 17.015 16.785 16.649 16.481 16.318 16.156 15.908 15.541 14.603 -7 ,12570 ,TETRA ,17617062,Tue Nov 30 00:58:19 CET,Tue Nov 30 02:44:37 CET,0.0 1.062 1.36 1.595 1.812 2.004 2.174 2.344 2.664 2.797 2.904 3.036 3.186 3.289 3.492 3.679 3.86 3.951 4.136 4.317 4.554 4.713 4.878 5.105 5.303 5.485 5.678 5.877 6.131 6.364 6.583 6.834 7.068 7.29 7.544 7.821 8.106 8.463 8.858 9.236 9.616 10.05 10.533 11.024 11.629 12.322 13.129 14.03 15.114 16.384 17.836 19.052 19.736 20.131 20.335 20.406 20.453 20.484 20.459 20.399 20.334 20.263 20.183 20.072 19.94 19.846 19.769 19.697 19.622 19.526 19.422 19.343 19.272 19.187 19.116 19.007 18.864 18.748 18.604 18.487 18.37 18.17 18.045 17.911 17.836 17.7 17.57 17.413 17.331 17.206 17.06 16.96 16.849 16.619 16.483 16.318 16.123 15.887 15.604 15.253 13.998 -8 ,31604 ,TETRA ,17617063,Tue Nov 30 00:58:20 CET,Tue Nov 30 02:46:59 CET,0.0 0.885 1.185 1.436 1.641 1.814 1.969 2.118 2.383 2.497 2.61 2.785 2.959 3.064 3.222 3.398 3.61 3.708 3.878 4.034 4.25 4.391 4.545 4.791 5.026 5.218 5.387 5.548 5.759 5.97 6.171 6.458 6.734 6.972 7.252 7.562 7.854 8.169 8.515 8.893 9.288 9.724 10.219 10.723 11.347 12.023 12.778 13.695 14.788 16.054 17.557 18.761 19.441 19.849 20.08 20.21 20.276 20.311 20.322 20.275 20.201 20.145 20.098 20.038 19.973 19.887 19.772 19.68 19.604 19.515 19.407 19.319 19.232 19.113 18.997 18.867 18.753 18.659 18.541 18.455 18.383 18.271 18.183 18.086 18.034 17.919 17.799 17.667 17.579 17.446 17.31 17.219 17.114 16.869 16.736 16.587 16.406 16.19 15.917 15.548 14.625 -9 ,13831 ,TETRA ,17617064,Tue Nov 30 00:58:22 CET,Tue Nov 30 02:46:14 CET,0.0 0.905 1.222 1.467 1.687 1.873 2.024 2.154 2.39 2.513 2.636 2.792 2.949 3.055 3.254 3.449 3.652 3.747 3.929 4.097 4.309 4.442 4.58 4.785 4.981 5.194 5.411 5.616 5.882 6.142 6.361 6.634 6.918 7.16 7.416 7.712 8.003 8.337 8.699 9.074 9.488 9.961 10.495 11.022 11.638 12.311 13.118 14.03 15.085 16.348 17.905 19.176 19.891 20.328 20.557 20.657 20.708 20.767 20.785 20.743 20.667 20.573 20.481 20.392 20.311 20.229 20.097 19.93 19.768 19.608 19.444 19.318 19.21 19.119 19.037 18.936 18.844 18.747 18.633 18.559 18.485 18.358 18.264 18.151 18.083 17.962 17.846 17.685 17.59 17.456 17.301 17.199 17.096 16.876 16.752 16.603 16.43 16.232 15.964 15.607 14.589 -10 ,32558 ,TETRA ,17617065,Tue Nov 30 00:59:19 CET,Tue Nov 30 02:47:07 CET,0.0 1.005 1.314 1.539 1.726 1.902 2.075 2.239 2.525 2.644 2.762 2.956 3.115 3.203 3.386 3.58 3.765 3.849 4.008 4.178 4.436 4.591 4.733 4.933 5.122 5.306 5.485 5.657 5.878 6.081 6.274 6.511 6.744 6.981 7.254 7.572 7.875 8.176 8.51 8.886 9.287 9.736 10.247 10.749 11.329 12.028 12.891 13.826 14.886 16.118 17.601 18.785 19.435 19.847 20.053 20.147 20.202 20.195 20.157 20.118 20.057 19.987 19.912 19.83 19.755 19.69 19.613 19.534 19.459 19.371 19.264 19.173 19.098 18.995 18.894 18.806 18.706 18.601 18.488 18.4 18.314 18.168 18.051 17.926 17.857 17.712 17.567 17.419 17.349 17.24 17.105 17.001 16.884 16.635 16.49 16.333 16.158 15.95 15.702 15.394 14.33 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_23.txt deleted file mode 100644 index 29f8c5b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4975 ,TETRA ,17617066,Tue Nov 30 00:59:18 CET,Tue Nov 30 02:48:42 CET,0.0 1.054 1.377 1.64 1.883 2.079 2.258 2.415 2.702 2.823 2.92 3.062 3.213 3.302 3.463 3.627 3.793 3.872 4.014 4.149 4.343 4.46 4.572 4.718 4.837 4.96 5.084 5.19 5.325 5.493 5.691 5.933 6.15 6.295 6.419 6.578 6.733 6.894 7.067 7.227 7.375 7.537 7.704 7.867 8.043 8.211 8.342 8.386 8.385 8.311 7.95 7.241 6.436 5.67 5.04 4.483 3.978 3.511 3.087 2.644 2.271 1.944 1.628 1.304 0.986 0.709 0.413 0.15 -0.093 -0.373 -0.646 -0.877 -1.129 -1.38 -1.574 -1.764 -1.965 -2.183 -2.423 -2.6 -2.777 -3.039 -3.214 -3.403 -3.513 -3.723 -3.936 -4.189 -4.314 -4.497 -4.699 -4.839 -4.989 -5.319 -5.511 -5.722 -5.943 -6.228 -6.576 -7.042 -8.852 -2 ,10346 ,TETRA ,17617067,Tue Nov 30 01:09:10 CET,Tue Nov 30 02:56:13 CET,0.0 1.032 1.361 1.622 1.851 2.042 2.213 2.371 2.649 2.774 2.897 3.034 3.16 3.25 3.438 3.608 3.776 3.858 4.008 4.129 4.31 4.445 4.574 4.744 4.881 5.013 5.145 5.253 5.383 5.524 5.658 5.789 5.901 6.026 6.202 6.385 6.552 6.772 6.978 7.123 7.271 7.508 7.794 7.978 8.117 8.237 8.346 8.367 8.283 8.057 7.535 6.689 5.87 5.13 4.447 3.846 3.315 2.852 2.472 2.029 1.593 1.227 0.915 0.618 0.34 0.106 -0.124 -0.352 -0.55 -0.752 -0.979 -1.202 -1.473 -1.714 -1.894 -2.093 -2.274 -2.478 -2.693 -2.828 -2.981 -3.241 -3.413 -3.581 -3.672 -3.869 -4.06 -4.248 -4.353 -4.524 -4.679 -4.796 -4.953 -5.332 -5.552 -5.788 -6.023 -6.276 -6.601 -7.102 -9.075 -3 ,8637 ,TETRA ,17617068,Tue Nov 30 01:17:10 CET,Tue Nov 30 02:58:35 CET,0.0 1.338 1.777 2.074 2.304 2.5 2.671 2.829 3.124 3.253 3.382 3.549 3.689 3.772 3.93 4.09 4.253 4.326 4.458 4.592 4.773 4.886 5.001 5.158 5.287 5.4 5.508 5.636 5.829 5.988 6.113 6.25 6.384 6.516 6.658 6.809 6.944 7.106 7.276 7.442 7.615 7.81 8.006 8.159 8.349 8.532 8.67 8.766 8.807 8.701 8.267 7.461 6.664 5.953 5.326 4.713 4.178 3.694 3.285 2.871 2.511 2.21 1.91 1.625 1.355 1.116 0.873 0.623 0.402 0.179 -0.062 -0.259 -0.479 -0.721 -0.912 -1.106 -1.296 -1.471 -1.645 -1.78 -1.94 -2.183 -2.342 -2.516 -2.605 -2.78 -2.959 -3.155 -3.261 -3.444 -3.653 -3.806 -3.974 -4.344 -4.541 -4.761 -5.025 -5.33 -5.714 -6.24 -7.663 -4 ,24014 ,TETRA ,17617069,Tue Nov 30 01:18:11 CET,Tue Nov 30 03:06:03 CET,0.0 0.843 1.131 1.373 1.6 1.786 1.948 2.095 2.334 2.447 2.559 2.711 2.878 2.993 3.169 3.33 3.518 3.596 3.718 3.831 4.006 4.136 4.261 4.416 4.537 4.657 4.782 4.897 5.036 5.175 5.314 5.5 5.702 5.869 6.016 6.178 6.323 6.473 6.637 6.831 7.033 7.216 7.418 7.593 7.816 8.062 8.25 8.395 8.499 8.451 8.004 7.239 6.508 5.835 5.204 4.607 4.116 3.667 3.241 2.809 2.44 2.083 1.722 1.382 1.082 0.827 0.563 0.32 0.077 -0.207 -0.499 -0.738 -0.963 -1.169 -1.329 -1.499 -1.682 -1.894 -2.132 -2.284 -2.424 -2.642 -2.805 -2.988 -3.086 -3.292 -3.52 -3.778 -3.911 -4.096 -4.284 -4.411 -4.539 -4.867 -5.057 -5.303 -5.602 -5.895 -6.261 -6.749 -8.285 -5 ,17286 ,TETRA ,17617070,Tue Nov 30 01:19:19 CET,Tue Nov 30 03:04:40 CET,0.0 1.467 1.864 2.131 2.354 2.559 2.737 2.889 3.165 3.281 3.387 3.532 3.68 3.771 3.923 4.056 4.183 4.247 4.384 4.516 4.681 4.776 4.883 5.044 5.189 5.35 5.516 5.684 5.903 6.107 6.303 6.483 6.626 6.757 6.881 7.038 7.177 7.293 7.424 7.575 7.736 7.902 8.073 8.225 8.387 8.522 8.647 8.759 8.787 8.649 8.147 7.343 6.616 5.954 5.322 4.709 4.144 3.663 3.261 2.817 2.435 2.113 1.79 1.492 1.223 0.958 0.693 0.48 0.288 0.058 -0.197 -0.41 -0.633 -0.852 -1.025 -1.201 -1.376 -1.561 -1.743 -1.864 -2.004 -2.246 -2.409 -2.579 -2.669 -2.868 -3.078 -3.305 -3.422 -3.594 -3.763 -3.903 -4.054 -4.348 -4.497 -4.664 -4.858 -5.112 -5.428 -5.84 -7.833 -6 ,16898 ,TETRA ,17617071,Tue Nov 30 01:21:18 CET,Tue Nov 30 03:12:56 CET,0.0 1.617 1.966 2.252 2.488 2.683 2.861 3.005 3.277 3.409 3.523 3.693 3.848 3.927 4.098 4.274 4.427 4.497 4.627 4.737 4.878 4.985 5.108 5.285 5.437 5.59 5.739 5.859 5.984 6.102 6.246 6.464 6.661 6.806 6.946 7.083 7.213 7.365 7.537 7.693 7.836 7.996 8.181 8.361 8.523 8.68 8.872 9.042 9.126 9.11 8.678 7.837 7.063 6.339 5.702 5.068 4.475 3.999 3.618 3.213 2.85 2.511 2.177 1.875 1.6 1.361 1.108 0.879 0.682 0.471 0.261 0.073 -0.166 -0.437 -0.643 -0.845 -1.074 -1.308 -1.504 -1.631 -1.777 -2.016 -2.178 -2.364 -2.461 -2.658 -2.882 -3.115 -3.236 -3.431 -3.648 -3.796 -3.942 -4.276 -4.483 -4.715 -4.961 -5.253 -5.618 -6.116 -8.109 -7 ,1529 ,TETRA ,17617072,Tue Nov 30 01:22:17 CET,Tue Nov 30 03:12:16 CET,0.0 1.157 1.451 1.669 1.882 2.094 2.286 2.452 2.713 2.825 2.936 3.097 3.249 3.338 3.502 3.673 3.828 3.9 4.041 4.174 4.373 4.497 4.615 4.783 4.921 5.048 5.166 5.269 5.415 5.559 5.681 5.823 5.962 6.122 6.325 6.504 6.652 6.798 6.947 7.122 7.285 7.447 7.614 7.781 7.954 8.103 8.259 8.366 8.346 8.147 7.596 6.71 5.918 5.231 4.654 4.141 3.664 3.222 2.8 2.335 1.951 1.613 1.303 1.032 0.771 0.534 0.243 -0.043 -0.294 -0.531 -0.755 -0.947 -1.142 -1.34 -1.493 -1.668 -1.864 -2.049 -2.218 -2.353 -2.503 -2.754 -2.938 -3.116 -3.207 -3.38 -3.559 -3.752 -3.859 -4.042 -4.253 -4.432 -4.62 -4.987 -5.197 -5.405 -5.63 -5.9 -6.227 -6.679 -8.487 -8 ,3874 ,TETRA ,17617073,Tue Nov 30 01:24:17 CET,Tue Nov 30 03:12:47 CET,0.0 0.962 1.27 1.539 1.769 1.965 2.125 2.266 2.508 2.613 2.725 2.896 3.054 3.158 3.336 3.484 3.627 3.696 3.839 3.984 4.189 4.316 4.433 4.588 4.734 4.89 5.041 5.204 5.39 5.513 5.65 5.814 5.948 6.102 6.276 6.434 6.57 6.714 6.867 7.019 7.163 7.309 7.489 7.663 7.805 7.932 8.057 8.165 8.214 8.064 7.514 6.733 6.046 5.381 4.719 4.109 3.601 3.129 2.719 2.319 1.947 1.625 1.346 1.08 0.818 0.553 0.265 0.017 -0.201 -0.436 -0.666 -0.848 -1.063 -1.306 -1.466 -1.627 -1.812 -1.992 -2.168 -2.297 -2.45 -2.709 -2.889 -3.079 -3.176 -3.386 -3.596 -3.815 -3.934 -4.118 -4.294 -4.42 -4.554 -4.883 -5.083 -5.305 -5.531 -5.779 -6.162 -6.696 -8.511 -9 ,24241 ,TETRA ,17617074,Tue Nov 30 01:25:17 CET,Tue Nov 30 03:07:52 CET,0.0 1.246 1.588 1.817 2.002 2.165 2.316 2.459 2.721 2.841 2.954 3.111 3.26 3.357 3.549 3.728 3.89 3.967 4.117 4.265 4.473 4.602 4.732 4.895 5.026 5.152 5.292 5.44 5.597 5.732 5.86 6.026 6.207 6.369 6.545 6.759 6.945 7.138 7.362 7.535 7.676 7.86 8.047 8.173 8.294 8.419 8.562 8.639 8.615 8.414 7.813 6.872 5.964 5.179 4.494 3.848 3.267 2.706 2.187 1.658 1.203 0.828 0.486 0.171 -0.111 -0.372 -0.644 -0.892 -1.101 -1.321 -1.559 -1.748 -1.937 -2.14 -2.302 -2.476 -2.665 -2.847 -3.028 -3.159 -3.313 -3.565 -3.732 -3.911 -4.004 -4.203 -4.432 -4.669 -4.788 -4.969 -5.196 -5.353 -5.503 -5.839 -6.035 -6.244 -6.473 -6.755 -7.127 -7.593 -9.137 -10 ,15659 ,TETRA ,17617075,Tue Nov 30 01:26:17 CET,Tue Nov 30 03:06:42 CET,0.0 1.06 1.397 1.651 1.852 2.049 2.215 2.358 2.612 2.723 2.832 2.972 3.11 3.192 3.353 3.491 3.614 3.675 3.789 3.897 4.052 4.147 4.245 4.409 4.561 4.696 4.829 4.953 5.1 5.247 5.391 5.558 5.713 5.841 5.983 6.152 6.301 6.45 6.609 6.795 6.973 7.13 7.286 7.46 7.675 7.855 7.993 8.039 7.997 7.871 7.458 6.738 6.039 5.342 4.669 4.042 3.501 3.029 2.606 2.184 1.835 1.526 1.238 0.955 0.686 0.415 0.119 -0.118 -0.309 -0.531 -0.808 -1.03 -1.241 -1.469 -1.637 -1.798 -1.962 -2.141 -2.347 -2.483 -2.619 -2.825 -2.973 -3.155 -3.254 -3.449 -3.653 -3.887 -4.016 -4.192 -4.352 -4.48 -4.615 -4.911 -5.08 -5.269 -5.469 -5.727 -6.091 -6.528 -8.247 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_30.txt deleted file mode 100644 index 49805061..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30038 ,TETRA ,17617076,Tue Nov 30 01:26:19 CET,Tue Nov 30 03:13:50 CET,0.0 0.742 0.956 1.132 1.276 1.399 1.501 1.582 1.731 1.818 1.912 2.02 2.143 2.208 2.351 2.478 2.587 2.638 2.722 2.809 2.938 3.011 3.074 3.168 3.256 3.337 3.431 3.528 3.635 3.724 3.809 3.91 4.008 4.097 4.194 4.295 4.384 4.483 4.574 4.661 4.751 4.841 4.927 4.981 5.017 5.034 4.959 4.716 4.359 3.752 2.523 0.984 -0.39 -1.606 -2.667 -3.589 -4.349 -5.039 -5.635 -6.261 -6.851 -7.353 -7.83 -8.287 -8.709 -9.087 -9.466 -9.793 -10.086 -10.408 -10.723 -10.98 -11.252 -11.528 -11.738 -11.968 -12.203 -12.432 -12.663 -12.818 -12.983 -13.239 -13.429 -13.646 -13.756 -13.958 -14.164 -14.39 -14.507 -14.703 -14.896 -15.034 -15.172 -15.448 -15.61 -15.783 -15.958 -16.158 -16.428 -16.772 -17.77 -2 ,8772 ,TETRA ,17617077,Tue Nov 30 01:26:19 CET,Tue Nov 30 03:12:43 CET,0.0 0.671 0.97 1.193 1.374 1.525 1.648 1.767 2.001 2.092 2.165 2.265 2.397 2.467 2.578 2.692 2.806 2.855 2.942 3.031 3.17 3.258 3.334 3.422 3.509 3.601 3.686 3.763 3.863 3.964 4.057 4.175 4.269 4.344 4.442 4.544 4.634 4.715 4.796 4.889 4.965 5.033 5.092 5.126 5.125 5.089 4.997 4.774 4.395 3.768 2.561 0.914 -0.477 -1.629 -2.71 -3.688 -4.455 -5.105 -5.678 -6.331 -6.913 -7.411 -7.875 -8.298 -8.676 -9.034 -9.431 -9.783 -10.082 -10.39 -10.708 -10.957 -11.211 -11.484 -11.693 -11.902 -12.124 -12.353 -12.594 -12.769 -12.946 -13.218 -13.401 -13.588 -13.685 -13.903 -14.13 -14.332 -14.438 -14.619 -14.789 -14.928 -15.072 -15.362 -15.52 -15.697 -15.916 -16.16 -16.443 -16.811 -17.83 -3 ,27041 ,TETRA ,17617078,Tue Nov 30 01:28:19 CET,Tue Nov 30 03:15:04 CET,0.0 0.582 0.848 1.064 1.225 1.348 1.442 1.539 1.751 1.833 1.906 1.988 2.102 2.158 2.265 2.38 2.495 2.543 2.63 2.722 2.858 2.927 2.994 3.108 3.223 3.326 3.409 3.479 3.58 3.68 3.76 3.841 3.921 4.002 4.089 4.196 4.292 4.384 4.47 4.559 4.661 4.763 4.846 4.881 4.876 4.836 4.704 4.416 3.98 3.243 1.916 0.268 -1.124 -2.337 -3.409 -4.371 -5.231 -6.034 -6.697 -7.285 -7.769 -8.239 -8.687 -9.084 -9.442 -9.763 -10.095 -10.412 -10.696 -10.969 -11.242 -11.475 -11.722 -11.97 -12.161 -12.364 -12.56 -12.756 -12.985 -13.156 -13.33 -13.586 -13.756 -13.937 -14.029 -14.227 -14.451 -14.696 -14.819 -15.015 -15.178 -15.302 -15.444 -15.751 -15.92 -16.086 -16.285 -16.531 -16.813 -17.156 -18.168 -4 ,13558 ,TETRA ,17617079,Tue Nov 30 01:30:13 CET,Tue Nov 30 03:16:13 CET,0.0 0.699 0.93 1.116 1.266 1.386 1.491 1.597 1.776 1.839 1.9 1.965 2.083 2.14 2.237 2.336 2.431 2.475 2.559 2.631 2.733 2.805 2.873 2.981 3.084 3.173 3.256 3.333 3.417 3.496 3.588 3.705 3.798 3.866 3.962 4.077 4.164 4.242 4.327 4.412 4.478 4.53 4.549 4.557 4.551 4.462 4.325 4.053 3.494 2.586 1.17 -0.516 -1.961 -3.173 -4.219 -5.182 -6.055 -6.848 -7.545 -8.25 -8.833 -9.354 -9.849 -10.308 -10.731 -11.112 -11.501 -11.83 -12.096 -12.374 -12.683 -12.944 -13.216 -13.495 -13.71 -13.919 -14.135 -14.364 -14.614 -14.786 -14.964 -15.26 -15.472 -15.678 -15.78 -15.989 -16.198 -16.436 -16.557 -16.743 -16.916 -17.054 -17.201 -17.5 -17.668 -17.85 -18.069 -18.343 -18.658 -19.007 -20.125 -5 ,17136 ,TETRA ,17617080,Tue Nov 30 01:31:13 CET,Tue Nov 30 03:20:00 CET,0.0 0.908 1.216 1.445 1.637 1.771 1.88 1.973 2.146 2.218 2.288 2.379 2.497 2.557 2.67 2.775 2.885 2.94 3.039 3.125 3.259 3.347 3.423 3.532 3.647 3.75 3.839 3.932 4.056 4.168 4.264 4.37 4.471 4.572 4.676 4.776 4.87 4.965 5.065 5.159 5.226 5.267 5.297 5.321 5.328 5.303 5.213 5.038 4.715 4.068 2.82 1.223 -0.168 -1.331 -2.375 -3.319 -4.101 -4.793 -5.362 -5.913 -6.414 -6.889 -7.325 -7.695 -8.038 -8.355 -8.684 -8.995 -9.288 -9.601 -9.897 -10.135 -10.383 -10.624 -10.816 -11.012 -11.205 -11.396 -11.591 -11.749 -11.922 -12.177 -12.362 -12.537 -12.624 -12.818 -13.009 -13.2 -13.306 -13.494 -13.704 -13.852 -13.988 -14.26 -14.405 -14.561 -14.763 -15.002 -15.286 -15.631 -16.912 -6 ,4050 ,TETRA ,17617081,Tue Nov 30 01:31:13 CET,Tue Nov 30 03:19:27 CET,0.0 0.6 0.855 1.046 1.19 1.32 1.447 1.554 1.751 1.856 1.955 2.07 2.194 2.256 2.376 2.476 2.563 2.613 2.721 2.813 2.938 3.018 3.088 3.204 3.319 3.417 3.503 3.58 3.674 3.767 3.861 3.966 4.056 4.149 4.271 4.392 4.488 4.583 4.682 4.789 4.894 4.994 5.062 5.096 5.107 5.065 4.948 4.688 4.302 3.677 2.417 0.854 -0.46 -1.664 -2.683 -3.551 -4.328 -5.012 -5.568 -6.119 -6.635 -7.122 -7.581 -7.996 -8.389 -8.761 -9.112 -9.406 -9.663 -9.946 -10.26 -10.52 -10.782 -11.032 -11.225 -11.431 -11.639 -11.865 -12.108 -12.274 -12.445 -12.704 -12.882 -13.064 -13.155 -13.345 -13.554 -13.772 -13.882 -14.069 -14.235 -14.355 -14.488 -14.773 -14.933 -15.119 -15.322 -15.519 -15.761 -16.111 -17.408 -7 ,8115 ,TETRA ,17617082,Tue Nov 30 01:31:13 CET,Tue Nov 30 03:17:58 CET,0.0 0.634 0.867 1.065 1.245 1.388 1.519 1.645 1.893 2.01 2.103 2.207 2.338 2.409 2.531 2.638 2.744 2.801 2.906 3.001 3.128 3.211 3.291 3.413 3.536 3.636 3.719 3.785 3.866 3.946 4.029 4.126 4.229 4.334 4.433 4.525 4.61 4.719 4.819 4.894 4.977 5.057 5.108 5.118 5.125 5.116 5.083 4.927 4.523 3.792 2.392 0.636 -0.806 -2.009 -3.082 -4.042 -4.835 -5.548 -6.154 -6.717 -7.208 -7.672 -8.144 -8.61 -9.032 -9.406 -9.776 -10.09 -10.383 -10.7 -11.023 -11.286 -11.565 -11.857 -12.084 -12.331 -12.573 -12.81 -13.054 -13.215 -13.381 -13.64 -13.834 -14.045 -14.145 -14.348 -14.585 -14.828 -14.944 -15.134 -15.325 -15.472 -15.623 -15.949 -16.14 -16.354 -16.589 -16.841 -17.152 -17.535 -18.356 -8 ,17220 ,TETRA ,17617083,Tue Nov 30 01:32:12 CET,Tue Nov 30 03:18:05 CET,0.0 0.668 0.947 1.149 1.325 1.468 1.578 1.691 1.91 1.997 2.078 2.185 2.314 2.39 2.535 2.657 2.75 2.792 2.89 2.988 3.125 3.208 3.284 3.401 3.503 3.597 3.689 3.763 3.847 3.939 4.038 4.147 4.252 4.353 4.453 4.557 4.647 4.729 4.81 4.891 4.956 5.008 5.058 5.067 5.023 4.935 4.799 4.595 4.215 3.524 2.175 0.485 -0.909 -2.121 -3.185 -4.147 -4.989 -5.756 -6.419 -7.125 -7.699 -8.167 -8.615 -9.064 -9.493 -9.864 -10.226 -10.544 -10.83 -11.125 -11.429 -11.652 -11.874 -12.129 -12.338 -12.562 -12.775 -12.998 -13.243 -13.421 -13.604 -13.889 -14.092 -14.302 -14.409 -14.628 -14.865 -15.111 -15.239 -15.437 -15.634 -15.782 -15.925 -16.208 -16.37 -16.562 -16.765 -16.989 -17.289 -17.688 -19.05 -9 ,27016 ,TETRA ,17617084,Tue Nov 30 01:32:12 CET,Tue Nov 30 03:19:59 CET,0.0 0.771 1.065 1.232 1.392 1.554 1.694 1.802 1.986 2.077 2.159 2.258 2.386 2.453 2.575 2.689 2.792 2.84 2.931 3.016 3.117 3.182 3.254 3.357 3.459 3.554 3.638 3.718 3.833 3.949 4.04 4.126 4.203 4.288 4.386 4.495 4.609 4.712 4.813 4.905 4.954 4.977 4.972 4.907 4.795 4.671 4.482 4.161 3.612 2.743 1.374 -0.239 -1.593 -2.757 -3.781 -4.682 -5.445 -6.168 -6.818 -7.445 -7.973 -8.468 -8.964 -9.426 -9.848 -10.231 -10.617 -10.935 -11.211 -11.522 -11.851 -12.124 -12.386 -12.63 -12.827 -13.037 -13.249 -13.485 -13.73 -13.885 -14.051 -14.326 -14.516 -14.71 -14.809 -15.014 -15.24 -15.488 -15.615 -15.815 -16.0 -16.136 -16.278 -16.585 -16.755 -16.932 -17.121 -17.327 -17.589 -17.953 -18.611 -10 ,26141 ,TETRA ,17617085,Tue Nov 30 01:32:13 CET,Tue Nov 30 03:17:45 CET,0.0 0.673 0.932 1.124 1.296 1.441 1.572 1.694 1.9 1.977 2.05 2.135 2.25 2.308 2.413 2.515 2.622 2.678 2.777 2.858 2.983 3.067 3.145 3.252 3.356 3.452 3.543 3.635 3.751 3.858 3.965 4.103 4.222 4.318 4.417 4.516 4.615 4.711 4.799 4.875 4.919 4.972 5.038 5.079 5.096 5.053 4.899 4.63 4.186 3.409 2.017 0.329 -1.066 -2.232 -3.259 -4.183 -4.957 -5.628 -6.203 -6.789 -7.289 -7.748 -8.223 -8.684 -9.09 -9.441 -9.783 -10.077 -10.333 -10.607 -10.885 -11.125 -11.387 -11.64 -11.835 -12.045 -12.26 -12.498 -12.763 -12.944 -13.124 -13.403 -13.596 -13.79 -13.89 -14.092 -14.314 -14.548 -14.662 -14.855 -15.05 -15.177 -15.305 -15.614 -15.794 -15.982 -16.201 -16.444 -16.733 -17.1 -17.965 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_42.txt deleted file mode 100644 index 446bb161..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18787 ,KEBNE ,17076673,Sat Dec 25 02:05:32 CET,Sat Dec 25 03:36:31 CET,0.0 0.832 1.19 1.467 1.709 1.919 2.096 2.269 2.605 2.746 2.862 3.025 3.192 3.304 3.511 3.699 3.89 3.99 4.17 4.337 4.582 4.735 4.895 5.133 5.36 5.574 5.77 5.972 6.219 6.423 6.62 6.886 7.146 7.387 7.667 7.965 8.257 8.563 8.882 9.264 9.643 10.021 10.468 10.894 11.413 11.99 12.622 13.345 14.145 14.962 15.738 16.215 16.403 16.423 16.344 16.21 16.086 15.966 15.824 15.656 15.509 15.37 15.213 15.033 14.839 14.673 14.497 14.339 14.212 14.065 13.913 13.775 13.606 13.425 13.288 13.163 13.041 12.915 12.782 12.674 12.561 12.398 12.283 12.162 12.091 11.947 11.81 11.676 11.606 11.48 11.369 11.29 11.192 10.944 10.797 10.626 10.428 10.234 10.055 9.779 8.98 -2 ,29350 ,KEBNE ,17076674,Sat Dec 25 02:06:36 CET,Sat Dec 25 03:37:23 CET,0.0 0.777 1.108 1.379 1.624 1.847 2.038 2.202 2.502 2.636 2.748 2.896 3.065 3.193 3.424 3.627 3.827 3.928 4.121 4.306 4.561 4.71 4.861 5.087 5.303 5.514 5.709 5.917 6.183 6.431 6.685 6.968 7.211 7.446 7.72 8.021 8.338 8.674 8.987 9.355 9.747 10.139 10.583 11.038 11.557 12.13 12.781 13.495 14.298 15.142 15.962 16.502 16.699 16.689 16.518 16.313 16.147 15.934 15.728 15.547 15.388 15.23 15.061 14.868 14.68 14.511 14.343 14.199 14.075 13.956 13.805 13.671 13.556 13.44 13.324 13.204 13.09 12.966 12.814 12.702 12.597 12.431 12.31 12.182 12.112 11.966 11.821 11.671 11.592 11.467 11.335 11.241 11.152 10.933 10.791 10.634 10.456 10.258 10.042 9.758 8.99 -3 ,4011 ,KEBNE ,17076675,Sat Dec 25 02:06:36 CET,Sat Dec 25 03:37:20 CET,0.0 0.871 1.191 1.396 1.588 1.795 1.99 2.151 2.392 2.513 2.648 2.854 3.037 3.168 3.403 3.609 3.821 3.921 4.108 4.296 4.561 4.719 4.864 5.089 5.303 5.501 5.707 5.9 6.124 6.364 6.606 6.883 7.136 7.367 7.642 7.958 8.255 8.581 8.913 9.239 9.589 9.976 10.414 10.841 11.339 11.893 12.538 13.244 14.0 14.824 15.729 16.309 16.506 16.547 16.526 16.426 16.308 16.181 16.055 15.903 15.742 15.59 15.433 15.275 15.128 14.988 14.831 14.689 14.569 14.448 14.325 14.225 14.115 13.988 13.866 13.738 13.614 13.483 13.349 13.252 13.152 12.984 12.854 12.712 12.644 12.507 12.35 12.182 12.099 11.968 11.821 11.71 11.588 11.319 11.169 11.015 10.86 10.69 10.448 10.108 9.212 -4 ,1450 ,KEBNE ,17076676,Sat Dec 25 02:06:35 CET,Sat Dec 25 03:36:53 CET,0.0 0.86 1.236 1.51 1.719 1.898 2.074 2.243 2.547 2.68 2.807 2.991 3.158 3.273 3.516 3.746 3.948 4.045 4.236 4.411 4.64 4.794 4.957 5.191 5.405 5.601 5.783 5.955 6.189 6.405 6.622 6.879 7.106 7.352 7.654 7.989 8.292 8.597 8.914 9.235 9.579 9.996 10.49 10.975 11.52 12.098 12.769 13.486 14.216 15.057 16.03 16.705 16.932 16.955 16.884 16.778 16.671 16.529 16.367 16.179 16.017 15.883 15.743 15.566 15.351 15.15 14.982 14.807 14.646 14.513 14.358 14.214 14.069 13.912 13.771 13.62 13.469 13.312 13.162 13.071 12.972 12.787 12.651 12.493 12.414 12.268 12.102 11.909 11.819 11.688 11.545 11.439 11.326 11.057 10.903 10.745 10.571 10.379 10.171 9.892 9.191 -5 ,18918 ,KEBNE ,17076677,Sat Dec 25 02:06:35 CET,Sat Dec 25 03:37:24 CET,0.0 1.023 1.348 1.575 1.793 2.001 2.162 2.301 2.596 2.739 2.867 3.039 3.203 3.319 3.526 3.719 3.931 4.033 4.209 4.391 4.642 4.787 4.946 5.188 5.381 5.547 5.745 5.963 6.241 6.508 6.775 7.098 7.382 7.632 7.898 8.166 8.414 8.699 9.023 9.367 9.712 10.099 10.533 10.967 11.477 12.013 12.597 13.22 13.951 14.806 15.737 16.402 16.619 16.65 16.607 16.525 16.42 16.277 16.118 15.945 15.781 15.614 15.421 15.208 14.971 14.767 14.588 14.441 14.309 14.13 13.913 13.731 13.57 13.414 13.285 13.149 13.014 12.856 12.679 12.563 12.433 12.234 12.112 11.99 11.924 11.776 11.618 11.446 11.345 11.182 10.996 10.889 10.778 10.511 10.376 10.235 10.067 9.844 9.551 9.141 8.08 -6 ,6021 ,KEBNE ,17076678,Sat Dec 25 02:06:35 CET,Sat Dec 25 03:37:16 CET,0.0 0.647 0.976 1.264 1.52 1.706 1.871 2.037 2.31 2.438 2.565 2.746 2.909 3.007 3.199 3.396 3.596 3.693 3.88 4.053 4.292 4.437 4.575 4.779 4.965 5.163 5.385 5.584 5.806 6.037 6.248 6.497 6.731 6.949 7.213 7.531 7.835 8.135 8.459 8.784 9.136 9.539 9.992 10.412 10.862 11.376 11.959 12.628 13.41 14.218 15.05 15.651 15.905 15.981 15.934 15.805 15.657 15.513 15.369 15.211 15.059 14.888 14.708 14.543 14.392 14.258 14.093 13.924 13.788 13.651 13.477 13.325 13.183 13.032 12.906 12.762 12.605 12.442 12.287 12.183 12.06 11.854 11.704 11.555 11.487 11.338 11.177 11.018 10.93 10.792 10.642 10.539 10.437 10.214 10.053 9.896 9.758 9.576 9.335 9.047 8.298 -7 ,17751 ,KEBNE ,17076679,Sat Dec 25 02:09:45 CET,Sat Dec 25 03:40:04 CET,0.0 0.793 1.133 1.397 1.592 1.766 1.936 2.083 2.336 2.461 2.585 2.762 2.929 3.043 3.264 3.487 3.68 3.767 3.953 4.127 4.365 4.517 4.659 4.876 5.09 5.294 5.492 5.657 5.851 6.066 6.3 6.58 6.826 7.058 7.355 7.67 7.929 8.218 8.552 8.918 9.291 9.696 10.155 10.617 11.173 11.795 12.441 13.117 13.882 14.734 15.629 16.129 16.269 16.284 16.192 16.044 15.901 15.746 15.584 15.418 15.288 15.157 15.007 14.839 14.684 14.533 14.329 14.135 13.982 13.819 13.649 13.513 13.372 13.213 13.092 12.983 12.842 12.669 12.494 12.392 12.295 12.136 12.023 11.913 11.856 11.74 11.613 11.444 11.363 11.227 11.044 10.934 10.831 10.596 10.458 10.318 10.16 9.977 9.788 9.557 8.874 -8 ,5853 ,KEBNE ,17076680,Sat Dec 25 02:09:49 CET,Sat Dec 25 03:37:38 CET,0.0 0.767 1.101 1.366 1.592 1.785 1.966 2.135 2.454 2.596 2.724 2.91 3.081 3.202 3.419 3.611 3.789 3.87 4.027 4.183 4.399 4.539 4.693 4.915 5.106 5.277 5.439 5.595 5.808 6.024 6.226 6.457 6.688 6.928 7.203 7.499 7.794 8.117 8.411 8.707 9.033 9.419 9.883 10.34 10.859 11.412 12.028 12.703 13.463 14.334 15.274 15.835 16.0 15.927 15.796 15.626 15.403 15.18 15.015 14.869 14.728 14.579 14.422 14.233 14.017 13.82 13.595 13.406 13.244 13.089 12.938 12.793 12.642 12.476 12.348 12.204 12.055 11.923 11.796 11.701 11.586 11.405 11.277 11.147 11.08 10.939 10.801 10.656 10.574 10.445 10.309 10.217 10.104 9.842 9.714 9.575 9.412 9.227 8.98 8.624 7.711 -9 ,10397 ,KEBNE ,17076681,Sat Dec 25 02:09:46 CET,Sat Dec 25 03:40:39 CET,0.0 0.692 0.989 1.242 1.486 1.691 1.873 2.036 2.333 2.467 2.592 2.77 2.932 3.035 3.234 3.424 3.598 3.69 3.893 4.092 4.355 4.5 4.651 4.876 5.071 5.272 5.48 5.677 5.911 6.149 6.388 6.658 6.909 7.151 7.454 7.804 8.131 8.473 8.83 9.196 9.532 9.936 10.484 11.015 11.542 12.12 12.795 13.494 14.282 15.164 16.136 16.771 17.021 17.068 16.961 16.82 16.686 16.544 16.405 16.253 16.104 15.948 15.771 15.593 15.425 15.262 15.102 14.959 14.826 14.659 14.465 14.301 14.126 13.96 13.836 13.721 13.598 13.446 13.306 13.215 13.104 12.923 12.803 12.678 12.604 12.451 12.286 12.119 12.044 11.917 11.774 11.677 11.586 11.388 11.263 11.123 10.969 10.776 10.551 10.281 9.534 -10 ,4141 ,KEBNE ,17076682,Sat Dec 25 02:09:46 CET,Sat Dec 25 03:40:37 CET,0.0 1.151 1.531 1.791 2.013 2.203 2.36 2.529 2.829 2.954 3.074 3.256 3.425 3.542 3.748 3.918 4.095 4.184 4.354 4.521 4.732 4.867 5.013 5.23 5.439 5.626 5.803 5.991 6.238 6.48 6.713 6.986 7.26 7.505 7.76 8.034 8.303 8.621 8.977 9.357 9.72 10.118 10.545 10.942 11.41 11.922 12.496 13.149 13.934 14.796 15.741 16.345 16.564 16.569 16.463 16.33 16.186 16.05 15.914 15.745 15.589 15.437 15.283 15.145 14.992 14.845 14.707 14.575 14.443 14.285 14.098 13.935 13.757 13.562 13.424 13.28 13.11 12.943 12.783 12.677 12.563 12.374 12.255 12.135 12.064 11.919 11.779 11.622 11.536 11.4 11.267 11.176 11.089 10.866 10.727 10.578 10.398 10.19 9.971 9.736 8.862 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_61.txt deleted file mode 100644 index 244de50a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_155_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8649 ,TETRA ,17617086,Tue Nov 30 01:33:13 CET,Tue Nov 30 03:22:34 CET,0.0 1.384 1.69 1.881 2.026 2.148 2.261 2.358 2.526 2.591 2.644 2.686 2.787 2.851 2.952 3.001 3.028 3.04 3.081 3.12 3.166 3.198 3.219 3.217 3.198 3.176 3.15 3.109 3.041 2.995 2.942 2.829 2.716 2.599 2.448 2.263 2.077 1.845 1.544 1.239 0.921 0.496 -0.079 -0.731 -1.583 -2.647 -4.004 -5.741 -8.042 -11.209 -16.025 -21.179 -25.043 -28.042 -30.461 -32.541 -34.274 -35.766 -36.976 -38.119 -39.104 -39.957 -40.731 -41.429 -42.065 -42.638 -43.231 -43.763 -44.209 -44.671 -45.152 -45.541 -45.948 -46.371 -46.679 -46.98 -47.303 -47.656 -48.036 -48.298 -48.574 -48.985 -49.268 -49.557 -49.697 -49.984 -50.3 -50.632 -50.787 -51.068 -51.33 -51.51 -51.694 -52.095 -52.336 -52.613 -52.922 -53.238 -53.603 -54.11 -56.335 -2 ,11738 ,TETRA ,17617087,Tue Nov 30 01:34:25 CET,Tue Nov 30 03:22:44 CET,0.0 1.061 1.387 1.652 1.874 2.038 2.143 2.214 2.339 2.406 2.479 2.549 2.653 2.7 2.777 2.837 2.901 2.93 2.97 3.013 3.066 3.089 3.105 3.109 3.123 3.125 3.084 3.036 2.965 2.903 2.836 2.74 2.65 2.54 2.389 2.219 2.073 1.911 1.67 1.342 0.97 0.508 -0.079 -0.682 -1.448 -2.408 -3.699 -5.377 -7.675 -10.99 -15.997 -21.161 -24.981 -28.052 -30.501 -32.52 -34.22 -35.72 -36.936 -38.076 -39.043 -39.906 -40.742 -41.549 -42.299 -42.945 -43.561 -44.086 -44.521 -44.97 -45.439 -45.809 -46.179 -46.573 -46.876 -47.172 -47.466 -47.766 -48.088 -48.319 -48.57 -48.958 -49.222 -49.495 -49.63 -49.883 -50.137 -50.425 -50.581 -50.848 -51.067 -51.244 -51.437 -51.845 -52.075 -52.325 -52.592 -52.89 -53.227 -53.693 -55.584 -3 ,10499 ,TETRA ,17617088,Tue Nov 30 01:34:24 CET,Tue Nov 30 03:23:52 CET,0.0 2.258 2.512 2.666 2.793 2.91 3.01 3.102 3.252 3.303 3.346 3.368 3.464 3.512 3.585 3.655 3.709 3.721 3.736 3.752 3.774 3.785 3.797 3.806 3.8 3.79 3.765 3.719 3.641 3.575 3.517 3.417 3.295 3.161 2.993 2.798 2.593 2.359 2.082 1.78 1.438 0.989 0.446 -0.146 -0.946 -1.991 -3.375 -5.125 -7.468 -10.739 -15.675 -20.855 -24.657 -27.626 -29.962 -31.939 -33.645 -35.16 -36.406 -37.583 -38.6 -39.496 -40.356 -41.146 -41.814 -42.406 -43.027 -43.559 -44.005 -44.477 -44.952 -45.339 -45.736 -46.132 -46.427 -46.724 -47.04 -47.379 -47.731 -47.964 -48.191 -48.545 -48.802 -49.089 -49.238 -49.534 -49.842 -50.177 -50.351 -50.628 -50.854 -51.038 -51.243 -51.639 -51.839 -52.056 -52.307 -52.626 -52.997 -53.462 -55.236 -4 ,13574 ,TETRA ,17617089,Tue Nov 30 01:36:26 CET,Tue Nov 30 03:24:37 CET,0.0 1.126 1.482 1.708 1.875 2.021 2.128 2.204 2.325 2.379 2.433 2.477 2.57 2.604 2.65 2.687 2.733 2.757 2.789 2.829 2.901 2.944 2.985 3.015 3.016 3.008 2.99 2.957 2.902 2.837 2.761 2.681 2.622 2.551 2.427 2.25 2.062 1.836 1.56 1.223 0.859 0.455 -0.074 -0.711 -1.552 -2.577 -3.924 -5.655 -7.973 -11.195 -16.005 -21.162 -25.017 -28.006 -30.414 -32.512 -34.38 -35.94 -37.147 -38.325 -39.327 -40.184 -40.963 -41.68 -42.337 -42.918 -43.513 -44.024 -44.463 -44.916 -45.377 -45.763 -46.165 -46.584 -46.906 -47.232 -47.545 -47.866 -48.187 -48.405 -48.631 -48.984 -49.225 -49.467 -49.591 -49.847 -50.152 -50.477 -50.641 -50.922 -51.182 -51.379 -51.583 -52.003 -52.226 -52.466 -52.73 -53.022 -53.372 -53.823 -55.252 -5 ,2903 ,TETRA ,17617090,Tue Nov 30 01:36:25 CET,Tue Nov 30 03:08:08 CET,0.0 1.117 1.458 1.668 1.819 1.943 2.054 2.165 2.342 2.419 2.492 2.555 2.664 2.709 2.775 2.83 2.893 2.927 2.967 2.995 3.048 3.071 3.086 3.087 3.06 3.031 3.003 2.968 2.948 2.944 2.881 2.77 2.682 2.585 2.43 2.235 2.041 1.847 1.669 1.411 1.049 0.59 0.002 -0.654 -1.503 -2.547 -3.877 -5.571 -7.937 -11.194 -16.016 -21.193 -25.057 -28.128 -30.602 -32.679 -34.414 -35.932 -37.185 -38.402 -39.393 -40.232 -41.017 -41.735 -42.422 -43.068 -43.69 -44.209 -44.656 -45.118 -45.591 -45.978 -46.364 -46.751 -47.06 -47.399 -47.761 -48.131 -48.498 -48.727 -48.949 -49.289 -49.528 -49.783 -49.919 -50.188 -50.447 -50.741 -50.899 -51.173 -51.433 -51.616 -51.809 -52.239 -52.465 -52.7 -52.963 -53.268 -53.635 -54.082 -55.436 -6 ,19532 ,TETRA ,17617091,Tue Nov 30 01:37:12 CET,Tue Nov 30 03:28:14 CET,0.0 1.159 1.535 1.765 1.908 2.04 2.149 2.232 2.372 2.445 2.504 2.527 2.62 2.651 2.7 2.739 2.766 2.783 2.813 2.839 2.892 2.915 2.912 2.905 2.902 2.902 2.906 2.895 2.871 2.846 2.796 2.703 2.594 2.471 2.346 2.212 2.043 1.795 1.503 1.178 0.795 0.308 -0.305 -0.98 -1.839 -2.895 -4.282 -6.062 -8.424 -11.684 -16.612 -21.826 -25.643 -28.673 -31.12 -33.175 -34.894 -36.373 -37.589 -38.757 -39.711 -40.515 -41.269 -41.999 -42.679 -43.271 -43.882 -44.425 -44.882 -45.372 -45.867 -46.246 -46.634 -47.056 -47.4 -47.738 -48.069 -48.419 -48.801 -49.07 -49.317 -49.66 -49.904 -50.156 -50.295 -50.615 -50.933 -51.249 -51.411 -51.692 -51.935 -52.106 -52.303 -52.731 -52.969 -53.237 -53.508 -53.799 -54.183 -54.755 -56.612 -7 ,1020 ,TETRA ,17617092,Tue Nov 30 01:38:21 CET,Tue Nov 30 03:11:03 CET,0.0 1.144 1.474 1.688 1.857 1.985 2.098 2.203 2.362 2.42 2.485 2.549 2.649 2.694 2.78 2.853 2.901 2.916 2.939 2.951 2.964 2.973 2.97 2.945 2.929 2.912 2.887 2.871 2.856 2.843 2.812 2.752 2.672 2.551 2.387 2.202 1.999 1.741 1.496 1.247 0.883 0.409 -0.195 -0.862 -1.689 -2.726 -4.096 -5.893 -8.29 -11.506 -16.392 -21.705 -25.59 -28.559 -30.989 -33.053 -34.744 -36.305 -37.684 -39.02 -40.073 -40.907 -41.676 -42.431 -43.119 -43.713 -44.316 -44.851 -45.328 -45.828 -46.32 -46.7 -47.078 -47.471 -47.789 -48.122 -48.464 -48.803 -49.14 -49.374 -49.602 -49.949 -50.199 -50.471 -50.617 -50.919 -51.23 -51.56 -51.723 -51.993 -52.226 -52.414 -52.623 -53.052 -53.293 -53.554 -53.812 -54.129 -54.505 -55.002 -56.736 -8 ,18181 ,TETRA ,17617093,Tue Nov 30 01:38:22 CET,Tue Nov 30 03:24:26 CET,0.0 1.527 1.826 2.013 2.168 2.307 2.413 2.496 2.638 2.708 2.772 2.812 2.911 2.956 3.026 3.077 3.114 3.131 3.171 3.198 3.238 3.252 3.253 3.252 3.228 3.204 3.191 3.166 3.112 3.066 3.014 2.919 2.825 2.719 2.582 2.412 2.201 1.958 1.676 1.341 0.959 0.49 -0.119 -0.817 -1.677 -2.718 -4.084 -5.844 -8.187 -11.438 -16.35 -21.57 -25.481 -28.543 -30.96 -32.982 -34.678 -36.156 -37.372 -38.533 -39.539 -40.47 -41.37 -42.205 -42.943 -43.591 -44.243 -44.807 -45.269 -45.72 -46.215 -46.604 -46.983 -47.378 -47.679 -48.003 -48.341 -48.691 -49.061 -49.313 -49.566 -49.96 -50.236 -50.501 -50.627 -50.891 -51.191 -51.508 -51.671 -51.956 -52.198 -52.385 -52.578 -52.974 -53.195 -53.439 -53.716 -54.033 -54.422 -54.96 -56.814 -9 ,31398 ,TETRA ,17617094,Tue Nov 30 01:38:24 CET,Tue Nov 30 03:24:37 CET,0.0 1.225 1.538 1.769 1.952 2.088 2.215 2.335 2.522 2.597 2.656 2.687 2.78 2.813 2.857 2.884 2.906 2.913 2.925 2.945 2.958 2.951 2.949 2.956 2.962 2.966 2.973 2.978 2.956 2.889 2.801 2.699 2.59 2.456 2.284 2.078 1.855 1.62 1.365 1.086 0.829 0.487 -0.053 -0.719 -1.569 -2.621 -3.992 -5.724 -8.073 -11.346 -16.136 -21.266 -25.206 -28.251 -30.701 -32.74 -34.411 -35.869 -37.074 -38.243 -39.224 -40.064 -40.852 -41.583 -42.242 -42.871 -43.538 -44.103 -44.567 -45.025 -45.499 -45.882 -46.272 -46.672 -46.965 -47.264 -47.59 -47.962 -48.339 -48.582 -48.83 -49.201 -49.452 -49.699 -49.826 -50.099 -50.395 -50.709 -50.876 -51.155 -51.377 -51.557 -51.759 -52.213 -52.44 -52.677 -52.979 -53.309 -53.653 -54.136 -55.923 -10 ,13230 ,TETRA ,17617095,Tue Nov 30 01:39:24 CET,Tue Nov 30 03:15:00 CET,0.0 1.506 1.798 2.021 2.178 2.295 2.395 2.485 2.661 2.739 2.807 2.849 2.946 3.003 3.098 3.176 3.246 3.275 3.327 3.36 3.375 3.378 3.374 3.381 3.387 3.363 3.326 3.3 3.283 3.239 3.167 3.07 2.964 2.841 2.674 2.471 2.275 2.042 1.816 1.566 1.206 0.763 0.168 -0.521 -1.367 -2.405 -3.741 -5.432 -7.737 -11.031 -15.931 -21.025 -24.919 -27.963 -30.369 -32.404 -34.081 -35.579 -36.839 -38.019 -38.993 -39.828 -40.592 -41.294 -41.948 -42.528 -43.107 -43.63 -44.074 -44.513 -44.978 -45.367 -45.784 -46.225 -46.547 -46.857 -47.189 -47.539 -47.909 -48.157 -48.395 -48.761 -49.02 -49.292 -49.428 -49.708 -49.981 -50.251 -50.395 -50.674 -50.947 -51.134 -51.328 -51.755 -51.979 -52.211 -52.477 -52.788 -53.128 -53.562 -55.366 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_156_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_156_1.txt deleted file mode 100644 index 08def44b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_156_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19885 ,TETRA ,17617096,Tue Nov 30 01:40:24 CET,Tue Nov 30 03:11:26 CET,0.0 2.14 2.561 2.879 3.109 3.309 3.494 3.652 3.905 4.017 4.124 4.257 4.375 4.458 4.603 4.719 4.82 4.866 4.959 5.052 5.177 5.258 5.336 5.451 5.574 5.696 5.792 5.87 5.953 6.032 6.104 6.193 6.31 6.38 6.41 6.451 6.492 6.503 6.492 6.467 6.421 6.353 6.257 6.188 6.075 5.796 5.403 4.854 4.062 2.919 0.98 -1.308 -3.099 -4.556 -5.757 -6.809 -7.729 -8.534 -9.2 -9.871 -10.447 -10.961 -11.426 -11.834 -12.226 -12.576 -12.933 -13.256 -13.539 -13.828 -14.124 -14.361 -14.596 -14.858 -15.07 -15.311 -15.574 -15.852 -16.147 -16.334 -16.521 -16.824 -17.037 -17.245 -17.345 -17.553 -17.773 -18.002 -18.129 -18.327 -18.562 -18.712 -18.866 -19.219 -19.405 -19.615 -19.849 -20.109 -20.449 -20.955 -22.894 -2 ,32203 ,TETRA ,17617097,Tue Nov 30 01:42:24 CET,Tue Nov 30 03:28:44 CET,0.0 1.615 2.03 2.27 2.481 2.663 2.819 2.961 3.224 3.34 3.444 3.612 3.742 3.813 3.933 4.054 4.169 4.217 4.315 4.418 4.569 4.651 4.715 4.797 4.873 4.949 5.009 5.062 5.128 5.191 5.252 5.347 5.434 5.491 5.532 5.546 5.576 5.628 5.667 5.671 5.66 5.619 5.556 5.477 5.295 5.044 4.644 4.046 3.23 2.064 0.131 -2.144 -3.944 -5.418 -6.685 -7.772 -8.67 -9.46 -10.138 -10.799 -11.346 -11.842 -12.324 -12.786 -13.196 -13.546 -13.904 -14.255 -14.592 -14.928 -15.246 -15.52 -15.804 -16.062 -16.254 -16.455 -16.669 -16.89 -17.11 -17.267 -17.435 -17.701 -17.902 -18.131 -18.241 -18.452 -18.691 -18.945 -19.084 -19.284 -19.489 -19.641 -19.803 -20.146 -20.341 -20.584 -20.85 -21.123 -21.462 -21.97 -24.6 -3 ,1028 ,TETRA ,17617098,Tue Nov 30 01:43:18 CET,Tue Nov 30 03:33:53 CET,0.0 1.833 2.208 2.486 2.705 2.864 3.016 3.166 3.432 3.551 3.652 3.779 3.898 3.983 4.144 4.288 4.409 4.456 4.541 4.615 4.718 4.791 4.858 4.952 5.042 5.125 5.2 5.266 5.334 5.424 5.531 5.63 5.725 5.794 5.83 5.863 5.906 5.939 5.93 5.915 5.907 5.871 5.758 5.619 5.431 5.149 4.775 4.276 3.477 2.266 0.288 -2.035 -3.84 -5.312 -6.546 -7.621 -8.537 -9.37 -10.062 -10.717 -11.293 -11.786 -12.221 -12.641 -13.033 -13.388 -13.752 -14.06 -14.322 -14.6 -14.893 -15.136 -15.396 -15.661 -15.86 -16.075 -16.297 -16.53 -16.778 -16.942 -17.121 -17.437 -17.654 -17.869 -17.976 -18.181 -18.388 -18.64 -18.783 -18.985 -19.22 -19.371 -19.533 -19.889 -20.082 -20.297 -20.543 -20.823 -21.199 -21.717 -23.647 -4 ,25405 ,TETRA ,17617099,Tue Nov 30 01:44:14 CET,Tue Nov 30 03:34:20 CET,0.0 1.682 2.067 2.338 2.576 2.771 2.946 3.115 3.388 3.508 3.631 3.805 3.934 4.019 4.193 4.342 4.482 4.55 4.663 4.778 4.929 5.011 5.094 5.21 5.298 5.38 5.476 5.556 5.626 5.68 5.731 5.829 5.961 6.09 6.215 6.343 6.421 6.433 6.416 6.389 6.365 6.321 6.232 6.1 5.937 5.696 5.305 4.792 4.048 2.854 0.84 -1.484 -3.322 -4.816 -6.032 -7.077 -7.948 -8.755 -9.482 -10.157 -10.692 -11.177 -11.634 -12.069 -12.495 -12.854 -13.255 -13.645 -13.948 -14.243 -14.555 -14.802 -15.043 -15.306 -15.519 -15.741 -15.958 -16.165 -16.386 -16.556 -16.732 -16.991 -17.181 -17.389 -17.503 -17.746 -17.99 -18.235 -18.358 -18.542 -18.734 -18.879 -19.029 -19.357 -19.561 -19.788 -20.015 -20.283 -20.629 -21.156 -23.21 -5 ,24368 ,TETRA ,17617100,Tue Nov 30 01:46:21 CET,Tue Nov 30 03:35:04 CET,0.0 1.48 1.877 2.181 2.421 2.607 2.778 2.942 3.228 3.364 3.497 3.674 3.804 3.9 4.087 4.248 4.388 4.458 4.6 4.71 4.834 4.917 4.99 5.07 5.147 5.228 5.308 5.388 5.508 5.622 5.716 5.85 5.967 6.039 6.117 6.182 6.235 6.29 6.325 6.336 6.374 6.403 6.328 6.205 6.039 5.773 5.393 4.908 4.133 2.916 0.892 -1.473 -3.326 -4.835 -6.058 -7.082 -7.955 -8.756 -9.433 -10.089 -10.616 -11.096 -11.573 -11.993 -12.379 -12.733 -13.102 -13.436 -13.724 -14.012 -14.308 -14.579 -14.861 -15.14 -15.371 -15.617 -15.846 -16.077 -16.329 -16.485 -16.644 -16.909 -17.093 -17.286 -17.391 -17.635 -17.88 -18.106 -18.223 -18.415 -18.633 -18.776 -18.935 -19.3 -19.502 -19.729 -19.972 -20.24 -20.617 -21.128 -23.499 -6 ,15865 ,TETRA ,17617101,Tue Nov 30 01:46:21 CET,Tue Nov 30 03:22:27 CET,0.0 1.901 2.314 2.631 2.858 3.037 3.205 3.359 3.613 3.726 3.839 3.998 4.126 4.211 4.369 4.525 4.663 4.722 4.835 4.935 5.083 5.194 5.311 5.456 5.568 5.666 5.763 5.861 5.989 6.111 6.199 6.271 6.327 6.365 6.418 6.463 6.482 6.505 6.517 6.511 6.483 6.413 6.309 6.185 6.001 5.737 5.344 4.754 3.922 2.732 0.777 -1.5 -3.296 -4.754 -5.974 -7.057 -7.995 -8.819 -9.506 -10.185 -10.764 -11.268 -11.736 -12.181 -12.589 -12.949 -13.321 -13.65 -13.939 -14.241 -14.562 -14.822 -15.08 -15.367 -15.587 -15.814 -16.067 -16.312 -16.539 -16.697 -16.882 -17.18 -17.364 -17.539 -17.638 -17.848 -18.073 -18.321 -18.452 -18.64 -18.829 -18.973 -19.137 -19.491 -19.688 -19.909 -20.166 -20.463 -20.805 -21.259 -23.115 -7 ,5520 ,TETRA ,17617102,Tue Nov 30 01:50:20 CET,Tue Nov 30 03:37:35 CET,0.0 1.692 2.103 2.357 2.56 2.749 2.914 3.035 3.263 3.373 3.472 3.593 3.71 3.782 3.923 4.052 4.155 4.203 4.298 4.396 4.545 4.643 4.738 4.878 5.005 5.105 5.185 5.261 5.339 5.411 5.493 5.569 5.627 5.707 5.803 5.862 5.937 6.024 6.057 6.059 6.045 5.994 5.905 5.804 5.679 5.472 5.103 4.588 3.826 2.632 0.607 -1.672 -3.459 -4.951 -6.18 -7.208 -8.063 -8.821 -9.455 -10.069 -10.606 -11.086 -11.538 -11.958 -12.338 -12.678 -13.027 -13.345 -13.649 -13.995 -14.359 -14.649 -14.912 -15.162 -15.361 -15.57 -15.786 -16.007 -16.239 -16.398 -16.558 -16.825 -17.014 -17.2 -17.299 -17.498 -17.694 -17.92 -18.053 -18.252 -18.471 -18.625 -18.792 -19.161 -19.376 -19.594 -19.816 -20.087 -20.431 -20.878 -23.088 -8 ,15696 ,TETRA ,17617103,Tue Nov 30 01:53:18 CET,Tue Nov 30 03:42:02 CET,0.0 1.541 1.929 2.197 2.445 2.669 2.842 2.989 3.249 3.373 3.488 3.651 3.781 3.866 4.034 4.189 4.317 4.372 4.49 4.604 4.757 4.848 4.926 5.03 5.118 5.197 5.277 5.353 5.458 5.555 5.642 5.736 5.826 5.917 5.989 6.032 6.049 6.065 6.079 6.082 6.076 6.025 5.919 5.809 5.648 5.387 4.993 4.447 3.677 2.547 0.693 -1.511 -3.268 -4.699 -5.948 -7.029 -7.922 -8.716 -9.429 -10.146 -10.718 -11.194 -11.628 -12.026 -12.421 -12.788 -13.151 -13.467 -13.748 -14.048 -14.364 -14.623 -14.871 -15.118 -15.31 -15.533 -15.786 -16.037 -16.288 -16.459 -16.638 -16.922 -17.11 -17.3 -17.413 -17.646 -17.875 -18.098 -18.209 -18.398 -18.624 -18.778 -18.941 -19.299 -19.491 -19.696 -19.926 -20.185 -20.48 -20.912 -22.705 -9 ,3094 ,TETRA ,17617104,Tue Nov 30 01:53:18 CET,Tue Nov 30 03:43:04 CET,0.0 1.734 2.17 2.445 2.644 2.812 2.972 3.119 3.39 3.502 3.614 3.791 3.923 4.014 4.164 4.3 4.45 4.522 4.643 4.742 4.857 4.918 4.994 5.119 5.236 5.355 5.464 5.554 5.647 5.752 5.874 6.01 6.092 6.138 6.182 6.24 6.297 6.318 6.343 6.367 6.37 6.333 6.225 6.105 5.931 5.71 5.4 4.915 4.12 2.888 0.862 -1.466 -3.281 -4.782 -6.002 -7.045 -7.935 -8.706 -9.381 -10.062 -10.61 -11.062 -11.53 -12.004 -12.408 -12.755 -13.131 -13.475 -13.747 -14.013 -14.301 -14.549 -14.811 -15.087 -15.315 -15.543 -15.748 -15.961 -16.186 -16.344 -16.52 -16.797 -16.978 -17.16 -17.259 -17.463 -17.681 -17.908 -18.027 -18.227 -18.455 -18.617 -18.795 -19.191 -19.401 -19.611 -19.847 -20.114 -20.447 -20.946 -23.288 -10 ,29480 ,TETRA ,17617105,Tue Nov 30 01:54:23 CET,Tue Nov 30 03:41:20 CET,0.0 1.555 1.992 2.299 2.562 2.795 2.99 3.148 3.412 3.527 3.633 3.776 3.897 3.993 4.19 4.34 4.462 4.523 4.659 4.794 4.953 5.043 5.136 5.274 5.4 5.523 5.641 5.744 5.852 5.934 6.026 6.139 6.241 6.353 6.484 6.607 6.679 6.729 6.805 6.866 6.892 6.893 6.853 6.846 6.786 6.585 6.259 5.776 5.031 3.823 1.781 -0.463 -2.325 -3.876 -5.107 -6.189 -7.121 -7.952 -8.664 -9.346 -9.914 -10.423 -10.919 -11.414 -11.869 -12.269 -12.663 -12.988 -13.26 -13.559 -13.867 -14.119 -14.394 -14.682 -14.906 -15.131 -15.36 -15.621 -15.91 -16.1 -16.287 -16.565 -16.758 -16.965 -17.066 -17.261 -17.48 -17.706 -17.821 -18.017 -18.262 -18.43 -18.591 -18.935 -19.139 -19.379 -19.659 -19.953 -20.316 -20.829 -23.022 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_156_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_156_31.txt deleted file mode 100644 index 780fbb8d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_156_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1196 ,TETRA ,17617106,Tue Nov 30 02:01:13 CET,Tue Nov 30 03:50:59 CET,0.0 1.079 1.406 1.671 1.878 2.069 2.225 2.355 2.603 2.712 2.809 2.951 3.074 3.147 3.291 3.43 3.557 3.62 3.735 3.85 4.017 4.107 4.192 4.323 4.449 4.561 4.671 4.786 4.92 5.048 5.174 5.325 5.458 5.584 5.727 5.87 6.003 6.154 6.291 6.412 6.56 6.743 6.907 7.025 7.11 7.14 7.142 7.08 6.897 6.493 5.587 4.35 3.297 2.337 1.394 0.56 -0.101 -0.712 -1.243 -1.788 -2.263 -2.66 -3.046 -3.45 -3.829 -4.157 -4.498 -4.795 -5.054 -5.337 -5.619 -5.868 -6.137 -6.396 -6.588 -6.777 -6.968 -7.16 -7.374 -7.532 -7.707 -7.981 -8.163 -8.357 -8.457 -8.648 -8.843 -9.052 -9.155 -9.316 -9.527 -9.666 -9.798 -10.115 -10.3 -10.503 -10.707 -10.918 -11.181 -11.544 -12.873 -2 ,25013 ,TETRA ,17617107,Tue Nov 30 02:02:12 CET,Tue Nov 30 03:50:12 CET,0.0 1.021 1.348 1.606 1.829 2.015 2.162 2.3 2.538 2.654 2.765 2.91 3.037 3.116 3.265 3.411 3.549 3.613 3.734 3.85 4.021 4.136 4.246 4.391 4.523 4.654 4.786 4.912 5.054 5.18 5.31 5.462 5.599 5.722 5.849 5.981 6.126 6.286 6.446 6.618 6.76 6.909 7.107 7.28 7.442 7.581 7.665 7.679 7.629 7.342 6.508 5.325 4.247 3.291 2.488 1.736 1.07 0.432 -0.151 -0.678 -1.124 -1.571 -2.003 -2.393 -2.768 -3.115 -3.468 -3.792 -4.072 -4.345 -4.616 -4.849 -5.108 -5.372 -5.569 -5.772 -5.988 -6.215 -6.454 -6.624 -6.799 -7.072 -7.252 -7.435 -7.531 -7.722 -7.926 -8.165 -8.291 -8.463 -8.668 -8.801 -8.937 -9.237 -9.415 -9.613 -9.816 -10.03 -10.374 -10.823 -12.014 -3 ,12357 ,TETRA ,17617108,Tue Nov 30 02:02:14 CET,Tue Nov 30 03:51:10 CET,0.0 1.02 1.287 1.487 1.666 1.826 1.965 2.094 2.322 2.419 2.507 2.653 2.78 2.858 3.003 3.138 3.263 3.323 3.438 3.554 3.708 3.798 3.898 4.035 4.159 4.278 4.386 4.488 4.614 4.724 4.83 4.971 5.095 5.209 5.338 5.469 5.591 5.724 5.862 6.005 6.137 6.253 6.369 6.479 6.586 6.646 6.694 6.723 6.607 6.196 5.256 4.011 2.934 1.986 1.182 0.432 -0.246 -0.814 -1.306 -1.796 -2.196 -2.561 -2.907 -3.243 -3.586 -3.934 -4.319 -4.657 -4.934 -5.214 -5.511 -5.755 -6.018 -6.303 -6.522 -6.744 -6.955 -7.163 -7.397 -7.569 -7.74 -7.986 -8.161 -8.347 -8.439 -8.633 -8.859 -9.094 -9.209 -9.372 -9.562 -9.688 -9.832 -10.157 -10.322 -10.496 -10.694 -10.936 -11.259 -11.664 -12.828 -4 ,2545 ,TETRA ,17617109,Tue Nov 30 02:03:12 CET,Tue Nov 30 03:55:25 CET,0.0 1.147 1.514 1.792 2.023 2.201 2.36 2.5 2.758 2.88 2.989 3.139 3.262 3.342 3.504 3.663 3.823 3.9 4.029 4.15 4.34 4.454 4.558 4.704 4.842 4.977 5.097 5.213 5.357 5.482 5.594 5.743 5.889 6.026 6.171 6.314 6.462 6.603 6.747 6.909 7.074 7.239 7.409 7.549 7.629 7.687 7.763 7.794 7.639 7.227 6.279 4.965 3.859 2.886 1.991 1.161 0.469 -0.208 -0.823 -1.446 -1.955 -2.397 -2.809 -3.171 -3.523 -3.846 -4.205 -4.549 -4.828 -5.099 -5.384 -5.614 -5.845 -6.102 -6.299 -6.494 -6.703 -6.929 -7.148 -7.297 -7.457 -7.712 -7.901 -8.103 -8.205 -8.408 -8.621 -8.849 -8.967 -9.133 -9.323 -9.456 -9.6 -9.925 -10.104 -10.287 -10.494 -10.733 -11.026 -11.421 -12.562 -5 ,31889 ,TETRA ,17617110,Tue Nov 30 02:05:12 CET,Tue Nov 30 03:52:00 CET,0.0 1.089 1.387 1.622 1.801 1.956 2.103 2.245 2.497 2.614 2.728 2.914 3.051 3.131 3.304 3.48 3.637 3.706 3.836 3.956 4.113 4.219 4.322 4.456 4.59 4.735 4.865 4.981 5.119 5.237 5.358 5.511 5.647 5.773 5.903 6.045 6.186 6.321 6.451 6.61 6.782 6.953 7.129 7.275 7.442 7.584 7.639 7.654 7.599 7.311 6.558 5.426 4.317 3.328 2.502 1.709 0.981 0.308 -0.251 -0.778 -1.221 -1.633 -2.055 -2.444 -2.784 -3.086 -3.421 -3.746 -4.038 -4.333 -4.635 -4.883 -5.137 -5.397 -5.6 -5.819 -6.027 -6.239 -6.469 -6.629 -6.8 -7.069 -7.245 -7.416 -7.512 -7.714 -7.916 -8.154 -8.278 -8.44 -8.626 -8.757 -8.899 -9.211 -9.367 -9.535 -9.725 -9.933 -10.215 -10.597 -12.226 -6 ,12627 ,TETRA ,17617111,Tue Nov 30 02:07:11 CET,Tue Nov 30 03:54:32 CET,0.0 1.176 1.511 1.732 1.932 2.111 2.269 2.4 2.628 2.733 2.834 2.983 3.105 3.19 3.357 3.495 3.624 3.69 3.828 3.966 4.141 4.247 4.347 4.479 4.612 4.74 4.864 4.979 5.123 5.26 5.378 5.525 5.665 5.781 5.927 6.092 6.227 6.358 6.506 6.646 6.786 6.948 7.081 7.185 7.29 7.386 7.429 7.377 7.203 6.811 5.901 4.59 3.437 2.416 1.545 0.768 0.091 -0.496 -1.037 -1.585 -2.091 -2.587 -3.041 -3.432 -3.762 -4.047 -4.344 -4.63 -4.874 -5.13 -5.413 -5.647 -5.89 -6.139 -6.325 -6.506 -6.694 -6.91 -7.137 -7.291 -7.455 -7.694 -7.843 -8.005 -8.094 -8.285 -8.485 -8.681 -8.784 -8.946 -9.139 -9.268 -9.414 -9.727 -9.891 -10.075 -10.281 -10.512 -10.785 -11.126 -12.054 -7 ,29032 ,TETRA ,17617112,Tue Nov 30 02:08:09 CET,Tue Nov 30 03:55:43 CET,0.0 0.896 1.207 1.462 1.68 1.882 2.05 2.189 2.428 2.537 2.643 2.793 2.92 3.0 3.143 3.287 3.415 3.479 3.6 3.712 3.877 3.975 4.06 4.178 4.294 4.404 4.507 4.612 4.746 4.864 4.97 5.101 5.225 5.332 5.457 5.604 5.741 5.86 5.972 6.098 6.223 6.347 6.465 6.578 6.696 6.79 6.868 6.864 6.705 6.314 5.5 4.343 3.234 2.268 1.389 0.598 -0.053 -0.642 -1.206 -1.775 -2.243 -2.676 -3.091 -3.456 -3.802 -4.139 -4.48 -4.781 -5.054 -5.325 -5.574 -5.788 -6.013 -6.252 -6.451 -6.648 -6.852 -7.058 -7.268 -7.431 -7.59 -7.821 -7.987 -8.158 -8.254 -8.464 -8.695 -8.923 -9.031 -9.189 -9.375 -9.506 -9.64 -9.939 -10.116 -10.304 -10.528 -10.767 -10.996 -11.29 -12.334 -8 ,1565 ,TETRA ,17617113,Tue Nov 30 02:13:16 CET,Tue Nov 30 04:01:56 CET,0.0 0.95 1.286 1.541 1.75 1.926 2.094 2.264 2.563 2.693 2.806 2.971 3.107 3.199 3.394 3.563 3.704 3.77 3.896 4.019 4.202 4.321 4.426 4.564 4.694 4.816 4.928 5.041 5.183 5.303 5.428 5.591 5.736 5.854 5.988 6.137 6.269 6.42 6.592 6.761 6.916 7.079 7.241 7.381 7.538 7.651 7.692 7.697 7.611 7.31 6.539 5.364 4.288 3.335 2.48 1.707 0.987 0.323 -0.228 -0.79 -1.29 -1.742 -2.158 -2.537 -2.882 -3.186 -3.51 -3.818 -4.086 -4.364 -4.636 -4.847 -5.066 -5.309 -5.496 -5.679 -5.878 -6.092 -6.309 -6.454 -6.616 -6.883 -7.069 -7.266 -7.367 -7.583 -7.816 -8.045 -8.16 -8.328 -8.517 -8.645 -8.784 -9.092 -9.263 -9.456 -9.661 -9.887 -10.206 -10.627 -12.21 -9 ,16261 ,TETRA ,17617114,Tue Nov 30 02:14:18 CET,Tue Nov 30 04:03:14 CET,0.0 0.929 1.257 1.534 1.739 1.901 2.066 2.208 2.433 2.532 2.628 2.782 2.915 3.008 3.171 3.309 3.444 3.509 3.631 3.749 3.929 4.032 4.124 4.262 4.393 4.521 4.646 4.763 4.908 5.045 5.169 5.31 5.444 5.561 5.686 5.838 5.995 6.146 6.289 6.435 6.57 6.694 6.827 6.965 7.113 7.249 7.378 7.437 7.298 6.842 5.774 4.335 3.174 2.148 1.196 0.355 -0.396 -1.076 -1.629 -2.178 -2.68 -3.164 -3.621 -4.036 -4.439 -4.786 -5.118 -5.414 -5.681 -5.971 -6.268 -6.507 -6.756 -7.013 -7.222 -7.444 -7.658 -7.865 -8.073 -8.22 -8.38 -8.634 -8.799 -8.966 -9.058 -9.262 -9.477 -9.718 -9.849 -10.027 -10.247 -10.397 -10.547 -10.861 -11.025 -11.203 -11.437 -11.705 -11.989 -12.404 -14.268 -10 ,28111 ,TETRA ,17617115,Tue Nov 30 02:14:18 CET,Tue Nov 30 04:00:54 CET,0.0 1.201 1.541 1.805 1.998 2.169 2.306 2.429 2.654 2.764 2.873 3.03 3.159 3.241 3.382 3.518 3.648 3.708 3.831 3.958 4.143 4.258 4.363 4.51 4.645 4.769 4.885 4.997 5.141 5.278 5.407 5.554 5.704 5.852 6.009 6.166 6.32 6.487 6.649 6.788 6.942 7.126 7.314 7.511 7.711 7.85 7.917 7.902 7.797 7.445 6.59 5.378 4.319 3.394 2.57 1.844 1.195 0.586 0.067 -0.473 -0.945 -1.362 -1.762 -2.146 -2.495 -2.79 -3.111 -3.415 -3.674 -3.943 -4.241 -4.478 -4.708 -4.963 -5.163 -5.367 -5.561 -5.757 -5.969 -6.123 -6.284 -6.523 -6.698 -6.879 -6.971 -7.172 -7.39 -7.616 -7.741 -7.921 -8.11 -8.234 -8.372 -8.693 -8.875 -9.059 -9.255 -9.49 -9.786 -10.17 -11.191 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_15_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_15_163.txt deleted file mode 100644 index 3832a389..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_15_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23964 ,TETRA ,17617116,Tue Nov 30 02:15:17 CET,Tue Nov 30 04:01:03 CET,0.0 0.505 0.708 0.803 0.865 0.924 0.976 1.005 1.037 1.059 1.082 1.055 1.1 1.096 1.084 1.064 1.029 1.009 0.982 0.943 0.859 0.802 0.743 0.633 0.513 0.395 0.27 0.144 -0.01 -0.182 -0.396 -0.638 -0.867 -1.11 -1.411 -1.806 -2.189 -2.622 -3.165 -3.788 -4.502 -5.383 -6.428 -7.556 -9.051 -10.883 -13.217 -16.099 -19.945 -25.216 -32.807 -40.782 -46.635 -51.204 -54.843 -57.844 -60.33 -62.482 -64.247 -65.914 -67.28 -68.46 -69.544 -70.531 -71.44 -72.287 -73.184 -73.929 -74.535 -75.163 -75.822 -76.373 -76.917 -77.438 -77.835 -78.264 -78.679 -79.074 -79.482 -79.758 -80.035 -80.46 -80.768 -81.11 -81.286 -81.642 -82.013 -82.387 -82.574 -82.895 -83.178 -83.403 -83.621 -84.05 -84.289 -84.558 -84.827 -85.117 -85.434 -85.876 -87.082 -2 ,23514 ,TETRA ,17617117,Tue Nov 30 00:54:18 CET,Tue Nov 30 02:40:39 CET,0.0 0.562 0.783 0.927 1.03 1.12 1.165 1.209 1.293 1.317 1.317 1.234 1.275 1.267 1.235 1.2 1.153 1.123 1.071 1.028 0.969 0.907 0.819 0.689 0.553 0.409 0.262 0.124 -0.055 -0.253 -0.463 -0.712 -0.969 -1.218 -1.478 -1.798 -2.165 -2.636 -3.161 -3.685 -4.261 -5.046 -6.058 -7.184 -8.727 -10.565 -12.83 -15.711 -19.563 -24.774 -32.363 -40.269 -46.074 -50.565 -54.13 -57.1 -59.529 -61.603 -63.433 -65.189 -66.53 -67.684 -68.772 -69.779 -70.678 -71.483 -72.33 -73.084 -73.744 -74.375 -74.974 -75.459 -75.938 -76.443 -76.853 -77.273 -77.71 -78.157 -78.611 -78.923 -79.249 -79.779 -80.158 -80.552 -80.741 -81.091 -81.452 -81.821 -82.013 -82.344 -82.646 -82.89 -83.151 -83.716 -84.011 -84.305 -84.635 -85.029 -85.443 -85.937 -87.279 -3 ,7406 ,TETRA ,17617118,Tue Nov 30 01:03:24 CET,Tue Nov 30 02:49:47 CET,0.0 0.555 0.759 0.875 0.979 1.069 1.137 1.187 1.265 1.286 1.294 1.26 1.312 1.321 1.346 1.346 1.308 1.285 1.258 1.233 1.172 1.116 1.045 0.925 0.788 0.65 0.529 0.394 0.201 0.033 -0.146 -0.382 -0.624 -0.893 -1.235 -1.649 -2.08 -2.587 -3.153 -3.787 -4.495 -5.333 -6.417 -7.59 -9.054 -10.866 -13.178 -16.079 -19.92 -25.129 -32.746 -40.74 -46.6 -51.121 -54.735 -57.782 -60.267 -62.4 -64.166 -65.845 -67.227 -68.415 -69.506 -70.496 -71.4 -72.211 -73.026 -73.742 -74.383 -75.024 -75.638 -76.137 -76.663 -77.203 -77.623 -78.062 -78.498 -78.958 -79.444 -79.761 -80.075 -80.555 -80.891 -81.241 -81.415 -81.745 -82.068 -82.407 -82.584 -82.911 -83.178 -83.382 -83.592 -84.036 -84.28 -84.525 -84.781 -85.077 -85.441 -85.897 -87.135 -4 ,14066 ,TETRA ,17617119,Tue Nov 30 02:20:12 CET,Tue Nov 30 04:09:12 CET,0.0 0.776 0.951 1.051 1.172 1.257 1.297 1.322 1.385 1.413 1.429 1.419 1.485 1.485 1.459 1.414 1.36 1.341 1.29 1.218 1.132 1.091 1.044 0.947 0.822 0.686 0.549 0.409 0.22 0.054 -0.111 -0.364 -0.644 -0.913 -1.238 -1.639 -2.054 -2.551 -3.113 -3.751 -4.455 -5.302 -6.371 -7.522 -9.004 -10.777 -13.014 -15.838 -19.547 -24.669 -32.256 -40.2 -45.981 -50.401 -53.951 -56.955 -59.376 -61.408 -63.104 -64.734 -66.097 -67.293 -68.421 -69.457 -70.37 -71.175 -71.968 -72.647 -73.245 -73.855 -74.463 -74.95 -75.441 -75.951 -76.335 -76.722 -77.12 -77.519 -77.926 -78.232 -78.549 -79.016 -79.338 -79.649 -79.797 -80.092 -80.409 -80.766 -80.949 -81.258 -81.482 -81.672 -81.877 -82.314 -82.559 -82.82 -83.072 -83.33 -83.641 -84.06 -85.005 -5 ,19543 ,TETRA ,17617120,Tue Nov 30 02:22:17 CET,Tue Nov 30 04:00:11 CET,0.0 0.561 0.756 0.869 0.97 1.045 1.097 1.116 1.146 1.155 1.152 1.115 1.177 1.185 1.188 1.182 1.164 1.15 1.109 1.051 0.948 0.877 0.805 0.694 0.577 0.48 0.397 0.286 0.105 -0.089 -0.289 -0.534 -0.785 -1.056 -1.401 -1.792 -2.188 -2.684 -3.244 -3.861 -4.56 -5.431 -6.525 -7.622 -8.989 -10.735 -12.961 -15.768 -19.502 -24.634 -32.233 -40.194 -45.956 -50.398 -54.011 -57.021 -59.437 -61.483 -63.203 -64.903 -66.3 -67.492 -68.577 -69.559 -70.487 -71.333 -72.215 -72.966 -73.556 -74.15 -74.755 -75.238 -75.741 -76.283 -76.711 -77.14 -77.552 -77.967 -78.392 -78.676 -78.96 -79.404 -79.72 -80.032 -80.19 -80.539 -80.911 -81.29 -81.469 -81.78 -82.02 -82.2 -82.377 -82.752 -82.964 -83.201 -83.452 -83.726 -84.041 -84.441 -85.865 -6 ,14252 ,TETRA ,17617121,Tue Nov 30 02:24:11 CET,Tue Nov 30 04:13:04 CET,0.0 0.434 0.612 0.725 0.787 0.846 0.897 0.943 1.014 1.024 1.032 1.002 1.047 1.029 0.974 0.92 0.863 0.838 0.795 0.758 0.715 0.67 0.604 0.498 0.381 0.249 0.117 -0.027 -0.234 -0.446 -0.652 -0.908 -1.163 -1.412 -1.7 -2.058 -2.437 -2.874 -3.396 -4.024 -4.753 -5.632 -6.73 -7.924 -9.426 -11.241 -13.555 -16.451 -20.265 -25.509 -33.252 -41.253 -47.079 -51.612 -55.293 -58.375 -60.86 -62.996 -64.762 -66.443 -67.855 -69.077 -70.184 -71.214 -72.166 -73.01 -73.883 -74.638 -75.29 -75.969 -76.62 -77.126 -77.648 -78.166 -78.559 -78.97 -79.386 -79.817 -80.269 -80.562 -80.856 -81.323 -81.632 -81.949 -82.117 -82.462 -82.809 -83.172 -83.363 -83.693 -83.95 -84.163 -84.38 -84.842 -85.105 -85.378 -85.656 -85.939 -86.237 -86.604 -87.558 -7 ,4569 ,TETRA ,17617122,Tue Nov 30 02:24:11 CET,Tue Nov 30 04:11:46 CET,0.0 0.54 0.72 0.824 0.891 0.94 0.984 1.016 1.062 1.091 1.117 1.115 1.179 1.181 1.159 1.126 1.086 1.065 1.019 0.961 0.887 0.839 0.778 0.696 0.615 0.523 0.419 0.298 0.144 0.009 -0.132 -0.325 -0.553 -0.812 -1.142 -1.528 -1.882 -2.272 -2.787 -3.423 -4.133 -4.994 -6.043 -7.197 -8.679 -10.481 -12.775 -15.668 -19.554 -24.856 -32.591 -40.576 -46.319 -50.81 -54.413 -57.424 -59.879 -61.982 -63.745 -65.42 -66.794 -67.977 -69.052 -70.018 -70.9 -71.708 -72.584 -73.334 -73.919 -74.501 -75.143 -75.706 -76.236 -76.733 -77.108 -77.49 -77.889 -78.296 -78.713 -78.996 -79.277 -79.751 -80.093 -80.43 -80.606 -80.979 -81.347 -81.718 -81.911 -82.24 -82.517 -82.722 -82.918 -83.301 -83.533 -83.803 -84.076 -84.372 -84.744 -85.172 -86.12 -8 ,26633 ,TETRA ,17617123,Tue Nov 30 02:24:10 CET,Tue Nov 30 04:10:47 CET,0.0 0.588 0.756 0.879 0.991 1.069 1.111 1.136 1.171 1.179 1.182 1.124 1.154 1.142 1.122 1.088 1.032 1.006 0.952 0.9 0.818 0.739 0.667 0.585 0.51 0.407 0.276 0.141 -0.042 -0.225 -0.409 -0.641 -0.874 -1.115 -1.399 -1.751 -2.154 -2.615 -3.134 -3.757 -4.475 -5.34 -6.441 -7.629 -9.121 -10.933 -13.221 -16.133 -19.936 -25.145 -32.892 -40.916 -46.783 -51.347 -54.931 -57.924 -60.383 -62.504 -64.275 -65.972 -67.383 -68.572 -69.659 -70.676 -71.596 -72.388 -73.192 -73.896 -74.485 -75.119 -75.797 -76.355 -76.905 -77.43 -77.823 -78.221 -78.62 -79.036 -79.464 -79.744 -80.023 -80.469 -80.786 -81.098 -81.256 -81.593 -81.947 -82.322 -82.526 -82.858 -83.125 -83.352 -83.572 -84.0 -84.237 -84.495 -84.788 -85.116 -85.512 -86.018 -87.342 -9 ,31631 ,TETRA ,17617124,Tue Nov 30 02:25:10 CET,Tue Nov 30 04:13:37 CET,0.0 0.585 0.775 0.897 0.965 1.023 1.086 1.119 1.147 1.159 1.173 1.134 1.184 1.19 1.2 1.2 1.187 1.175 1.135 1.089 1.03 0.995 0.954 0.845 0.713 0.595 0.477 0.362 0.204 0.02 -0.184 -0.443 -0.718 -1.003 -1.336 -1.737 -2.159 -2.652 -3.227 -3.879 -4.603 -5.465 -6.536 -7.714 -9.215 -11.022 -13.309 -16.2 -20.038 -25.263 -32.964 -40.946 -46.742 -51.243 -54.83 -57.8 -60.272 -62.408 -64.159 -65.82 -67.208 -68.412 -69.514 -70.562 -71.542 -72.424 -73.275 -73.982 -74.607 -75.258 -75.902 -76.406 -76.927 -77.454 -77.849 -78.259 -78.674 -79.088 -79.513 -79.816 -80.124 -80.595 -80.925 -81.254 -81.426 -81.794 -82.157 -82.526 -82.722 -83.054 -83.285 -83.468 -83.67 -84.134 -84.408 -84.678 -84.946 -85.247 -85.556 -85.905 -86.9 -10 ,29697 ,TETRA ,17617125,Tue Nov 30 02:25:11 CET,Tue Nov 30 04:13:20 CET,0.0 0.534 0.662 0.743 0.813 0.893 0.952 0.988 1.049 1.072 1.084 1.04 1.088 1.093 1.095 1.08 1.058 1.049 1.028 0.996 0.942 0.894 0.831 0.734 0.645 0.547 0.434 0.306 0.12 -0.077 -0.282 -0.545 -0.82 -1.1 -1.45 -1.879 -2.311 -2.803 -3.373 -4.004 -4.666 -5.425 -6.435 -7.607 -9.097 -10.928 -13.243 -16.137 -19.954 -25.192 -32.944 -40.988 -46.853 -51.398 -55.033 -58.069 -60.532 -62.636 -64.386 -66.057 -67.448 -68.628 -69.695 -70.667 -71.591 -72.436 -73.305 -74.082 -74.749 -75.423 -76.057 -76.563 -77.08 -77.582 -77.969 -78.396 -78.822 -79.238 -79.663 -79.946 -80.236 -80.704 -81.04 -81.372 -81.538 -81.886 -82.242 -82.617 -82.806 -83.12 -83.384 -83.589 -83.798 -84.231 -84.456 -84.691 -84.951 -85.243 -85.541 -85.87 -86.667 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_15_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_15_25.txt deleted file mode 100644 index 01f3bc90..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_15_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21158 ,TETRA ,17617126,Tue Nov 30 02:25:10 CET,Tue Nov 30 04:13:10 CET,0.0 1.598 2.044 2.366 2.637 2.868 3.082 3.293 3.671 3.84 4.004 4.251 4.443 4.59 4.877 5.163 5.433 5.561 5.803 6.034 6.373 6.589 6.801 7.108 7.404 7.687 7.978 8.254 8.582 8.888 9.181 9.553 9.926 10.288 10.7 11.151 11.631 12.226 12.853 13.469 14.101 14.825 15.69 16.563 17.594 18.788 20.244 21.979 24.154 26.878 30.376 33.491 35.5 36.862 37.747 38.392 38.873 39.237 39.487 39.7 39.856 39.956 40.042 40.109 40.148 40.165 40.169 40.18 40.184 40.18 40.163 40.144 40.123 40.065 40.003 39.916 39.809 39.711 39.633 39.589 39.536 39.423 39.319 39.199 39.144 39.019 38.865 38.729 38.657 38.567 38.417 38.317 38.199 37.911 37.754 37.585 37.385 37.113 36.736 36.166 33.381 -2 ,14017 ,TETRA ,17617127,Tue Nov 30 02:25:10 CET,Tue Nov 30 04:12:56 CET,0.0 2.109 2.607 2.967 3.242 3.472 3.682 3.904 4.304 4.479 4.641 4.907 5.111 5.26 5.554 5.825 6.057 6.165 6.386 6.597 6.901 7.089 7.279 7.564 7.837 8.119 8.387 8.624 8.925 9.232 9.538 9.902 10.259 10.607 11.013 11.468 11.918 12.414 12.959 13.573 14.231 14.957 15.846 16.774 17.85 19.093 20.593 22.359 24.5 27.171 30.675 33.801 35.809 37.218 38.248 39.052 39.653 40.107 40.449 40.735 40.917 41.06 41.179 41.236 41.284 41.331 41.307 41.28 41.268 41.238 41.207 41.168 41.126 41.078 41.046 41.02 40.964 40.871 40.755 40.678 40.603 40.481 40.365 40.238 40.182 40.055 39.918 39.758 39.66 39.553 39.385 39.285 39.172 38.895 38.72 38.512 38.277 38.026 37.707 37.175 35.119 -3 ,5936 ,TETRA ,17617128,Tue Nov 30 02:25:10 CET,Tue Nov 30 04:12:24 CET,0.0 2.07 2.568 2.922 3.223 3.488 3.718 3.941 4.35 4.537 4.7 4.933 5.121 5.26 5.523 5.768 6.01 6.122 6.332 6.555 6.876 7.072 7.26 7.551 7.846 8.115 8.378 8.657 9.023 9.345 9.648 10.016 10.365 10.703 11.097 11.556 12.013 12.508 13.044 13.633 14.286 15.079 15.986 16.889 17.997 19.244 20.675 22.364 24.505 27.228 30.76 33.93 35.972 37.373 38.332 39.033 39.545 39.929 40.226 40.509 40.727 40.894 41.031 41.128 41.191 41.23 41.28 41.317 41.33 41.33 41.302 41.23 41.155 41.116 41.073 41.024 40.962 40.862 40.737 40.644 40.537 40.394 40.3 40.196 40.143 40.023 39.914 39.791 39.7 39.596 39.447 39.357 39.246 38.953 38.768 38.556 38.306 37.988 37.581 37.077 34.56 -4 ,939 ,TETRA ,17617129,Tue Nov 30 02:26:09 CET,Tue Nov 30 04:07:07 CET,0.0 1.829 2.224 2.508 2.748 2.968 3.171 3.361 3.724 3.887 4.047 4.32 4.524 4.677 4.967 5.24 5.495 5.619 5.869 6.112 6.439 6.653 6.865 7.172 7.486 7.785 8.077 8.363 8.704 9.005 9.3 9.663 10.019 10.365 10.773 11.248 11.712 12.223 12.783 13.389 14.084 14.861 15.708 16.585 17.625 18.854 20.347 22.126 24.349 27.072 30.684 33.956 36.003 37.468 38.519 39.283 39.854 40.287 40.608 40.89 41.068 41.196 41.309 41.404 41.457 41.481 41.499 41.515 41.526 41.529 41.53 41.528 41.508 41.478 41.45 41.402 41.338 41.281 41.186 41.12 41.07 40.966 40.892 40.781 40.71 40.583 40.427 40.244 40.162 40.063 39.883 39.772 39.647 39.376 39.213 39.028 38.78 38.486 38.176 37.71 35.323 -5 ,25971 ,TETRA ,17617130,Tue Nov 30 02:26:10 CET,Tue Nov 30 04:15:10 CET,0.0 2.125 2.56 2.901 3.212 3.472 3.712 3.961 4.389 4.576 4.746 4.988 5.193 5.348 5.627 5.894 6.126 6.236 6.442 6.639 6.948 7.143 7.333 7.617 7.897 8.178 8.432 8.68 9.013 9.323 9.618 9.971 10.315 10.663 11.095 11.598 12.072 12.564 13.092 13.687 14.317 15.073 16.07 17.039 18.112 19.347 20.822 22.573 24.692 27.354 30.873 34.08 36.072 37.394 38.332 39.035 39.561 39.969 40.268 40.501 40.677 40.817 40.876 40.908 40.929 40.935 40.959 40.97 40.963 40.926 40.849 40.791 40.745 40.694 40.66 40.62 40.566 40.509 40.426 40.351 40.265 40.124 40.049 39.993 39.954 39.853 39.701 39.513 39.418 39.305 39.113 39.007 38.901 38.608 38.437 38.253 38.031 37.765 37.367 36.796 33.811 -6 ,3699 ,TETRA ,17617131,Tue Nov 30 02:27:16 CET,Tue Nov 30 04:17:36 CET,0.0 1.703 2.095 2.39 2.654 2.9 3.133 3.352 3.744 3.91 4.051 4.281 4.464 4.601 4.874 5.124 5.371 5.5 5.741 5.976 6.336 6.565 6.789 7.093 7.357 7.62 7.899 8.189 8.569 8.933 9.248 9.604 9.959 10.296 10.7 11.175 11.627 12.125 12.686 13.297 13.942 14.699 15.601 16.5 17.568 18.823 20.348 22.122 24.289 27.035 30.634 33.88 35.932 37.325 38.34 39.103 39.56 39.94 40.265 40.535 40.743 40.891 41.008 41.074 41.102 41.12 41.088 41.013 40.958 40.914 40.858 40.783 40.699 40.595 40.505 40.437 40.376 40.312 40.231 40.169 40.089 39.964 39.896 39.808 39.761 39.678 39.585 39.441 39.359 39.277 39.108 38.992 38.881 38.631 38.472 38.277 38.058 37.805 37.446 36.954 34.792 -7 ,17384 ,TETRA ,17617132,Tue Nov 30 02:27:16 CET,Tue Nov 30 04:17:03 CET,0.0 1.697 2.141 2.475 2.762 3.008 3.231 3.433 3.773 3.935 4.104 4.385 4.584 4.728 4.993 5.242 5.497 5.632 5.889 6.135 6.498 6.724 6.926 7.197 7.474 7.752 8.008 8.255 8.565 8.867 9.163 9.528 9.913 10.277 10.697 11.199 11.665 12.17 12.763 13.411 14.089 14.848 15.696 16.572 17.612 18.804 20.238 21.931 24.017 26.648 30.112 33.218 35.227 36.64 37.637 38.365 38.879 39.259 39.513 39.673 39.786 39.885 39.973 40.046 40.076 40.074 40.061 40.045 40.027 40.006 39.978 39.933 39.854 39.766 39.719 39.648 39.539 39.435 39.32 39.234 39.155 39.04 38.968 38.878 38.824 38.68 38.502 38.346 38.273 38.175 37.969 37.849 37.731 37.452 37.27 37.047 36.816 36.54 36.193 35.755 33.901 -8 ,6251 ,TETRA ,17617133,Tue Nov 30 02:29:12 CET,Tue Nov 30 04:17:07 CET,0.0 2.406 2.86 3.21 3.51 3.782 4.026 4.252 4.641 4.807 4.969 5.264 5.474 5.623 5.913 6.2 6.476 6.609 6.854 7.077 7.421 7.638 7.835 8.113 8.404 8.698 8.952 9.211 9.575 9.919 10.249 10.662 11.071 11.445 11.896 12.426 12.896 13.406 13.977 14.578 15.226 15.991 16.886 17.835 18.929 20.177 21.731 23.479 25.541 28.139 31.604 34.738 36.668 37.975 38.879 39.535 40.071 40.476 40.753 40.981 41.139 41.267 41.359 41.397 41.425 41.451 41.439 41.387 41.318 41.208 41.058 40.933 40.812 40.691 40.597 40.516 40.448 40.369 40.277 40.187 40.087 39.926 39.805 39.701 39.652 39.571 39.471 39.302 39.206 39.107 38.915 38.811 38.707 38.429 38.26 38.082 37.874 37.592 37.258 36.755 34.771 -9 ,10145 ,TETRA ,17617134,Tue Nov 30 02:28:11 CET,Tue Nov 30 04:14:06 CET,0.0 2.883 3.345 3.669 3.955 4.211 4.425 4.625 5.008 5.186 5.355 5.626 5.826 5.979 6.271 6.56 6.852 6.983 7.213 7.437 7.761 7.96 8.148 8.433 8.718 8.983 9.251 9.514 9.83 10.142 10.454 10.827 11.185 11.531 11.98 12.537 13.046 13.597 14.18 14.771 15.418 16.165 17.044 17.952 19.03 20.274 21.79 23.553 25.653 28.276 31.719 34.841 36.891 38.296 39.302 40.041 40.561 40.947 41.181 41.362 41.508 41.624 41.725 41.753 41.725 41.679 41.615 41.553 41.502 41.437 41.33 41.237 41.138 41.022 40.929 40.824 40.724 40.646 40.567 40.511 40.448 40.308 40.208 40.115 40.062 39.932 39.78 39.618 39.529 39.399 39.167 39.051 38.918 38.623 38.45 38.244 38.006 37.728 37.379 36.858 34.337 -10 ,12715 ,TETRA ,17617135,Tue Nov 30 02:28:12 CET,Tue Nov 30 04:14:53 CET,0.0 1.289 1.708 2.029 2.296 2.526 2.734 2.922 3.237 3.384 3.532 3.803 4.0 4.132 4.381 4.628 4.873 4.99 5.225 5.45 5.75 5.952 6.167 6.476 6.751 7.004 7.249 7.494 7.856 8.212 8.527 8.898 9.277 9.647 10.065 10.531 10.975 11.484 12.039 12.622 13.249 13.983 14.887 15.833 16.943 18.193 19.673 21.389 23.515 26.183 29.681 32.853 34.89 36.284 37.294 38.072 38.638 39.089 39.42 39.657 39.843 40.008 40.115 40.19 40.244 40.275 40.304 40.317 40.316 40.308 40.28 40.247 40.193 40.115 40.055 39.995 39.936 39.867 39.796 39.74 39.684 39.563 39.467 39.381 39.328 39.211 39.07 38.918 38.847 38.74 38.518 38.408 38.298 38.051 37.9 37.724 37.535 37.323 37.042 36.613 30.337 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_15_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_15_252.txt deleted file mode 100644 index e26ad6cc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_15_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17772 ,TETRA ,17617136,Tue Nov 30 02:29:12 CET,Tue Nov 30 04:21:38 CET,0.0 0.498 0.572 0.567 0.553 0.525 0.505 0.488 0.383 0.308 0.218 -0.029 -0.073 -0.17 -0.378 -0.595 -0.819 -0.938 -1.185 -1.428 -1.799 -2.058 -2.306 -2.688 -3.071 -3.428 -3.794 -4.174 -4.683 -5.206 -5.746 -6.448 -7.181 -7.909 -8.777 -9.821 -10.894 -12.119 -13.51 -15.082 -16.815 -18.895 -21.49 -24.269 -27.738 -31.874 -37.047 -43.558 -52.192 -63.889 -80.86 -98.276 -110.975 -120.74 -128.428 -134.837 -140.092 -144.565 -148.215 -151.636 -154.419 -156.852 -159.144 -161.232 -163.078 -164.737 -166.463 -167.961 -169.206 -170.448 -171.701 -172.705 -173.712 -174.725 -175.497 -176.29 -177.08 -177.85 -178.641 -179.183 -179.737 -180.588 -181.167 -181.763 -182.061 -182.661 -183.279 -183.922 -184.254 -184.83 -185.253 -185.602 -185.964 -186.692 -187.066 -187.463 -187.903 -188.393 -188.925 -189.602 -191.62 -2 ,17115 ,TETRA ,17617137,Tue Nov 30 02:29:12 CET,Tue Nov 30 04:18:43 CET,0.0 0.634 0.718 0.743 0.755 0.761 0.734 0.678 0.539 0.468 0.412 0.203 0.158 0.074 -0.095 -0.265 -0.44 -0.537 -0.761 -1.003 -1.365 -1.6 -1.84 -2.204 -2.555 -2.933 -3.335 -3.734 -4.277 -4.841 -5.412 -6.138 -6.874 -7.616 -8.503 -9.532 -10.585 -11.806 -13.167 -14.673 -16.367 -18.423 -20.983 -23.723 -27.176 -31.337 -36.55 -42.994 -51.41 -62.779 -79.176 -95.973 -108.069 -117.31 -124.596 -130.645 -135.584 -139.784 -143.272 -146.607 -149.314 -151.664 -153.853 -155.94 -157.976 -159.83 -161.735 -163.395 -164.811 -166.27 -167.723 -168.887 -170.06 -171.281 -172.21 -173.118 -174.019 -174.93 -175.85 -176.446 -177.039 -177.944 -178.568 -179.21 -179.538 -180.214 -180.885 -181.558 -181.904 -182.549 -183.053 -183.452 -183.838 -184.601 -185.007 -185.444 -185.922 -186.464 -187.074 -187.77 -189.558 -3 ,20304 ,TETRA ,17617138,Tue Nov 30 02:29:12 CET,Tue Nov 30 04:23:10 CET,0.0 0.439 0.551 0.63 0.668 0.658 0.629 0.609 0.556 0.512 0.449 0.246 0.213 0.135 -0.02 -0.2 -0.394 -0.498 -0.734 -0.984 -1.339 -1.569 -1.811 -2.178 -2.563 -2.931 -3.295 -3.706 -4.241 -4.764 -5.326 -6.05 -6.771 -7.479 -8.348 -9.388 -10.442 -11.677 -13.037 -14.547 -16.262 -18.306 -20.849 -23.576 -26.962 -31.067 -36.229 -42.622 -51.03 -62.355 -78.639 -95.355 -107.448 -116.791 -124.143 -130.241 -135.238 -139.451 -142.917 -146.268 -149.03 -151.357 -153.47 -155.383 -157.113 -158.654 -160.239 -161.616 -162.766 -163.926 -165.106 -166.059 -167.011 -167.992 -168.754 -169.523 -170.284 -171.034 -171.824 -172.367 -172.904 -173.71 -174.265 -174.848 -175.139 -175.72 -176.317 -176.949 -177.28 -177.854 -178.297 -178.647 -179.004 -179.751 -180.15 -180.556 -180.976 -181.449 -181.99 -182.584 -184.686 -4 ,31395 ,TETRA ,17617139,Tue Nov 30 02:30:11 CET,Tue Nov 30 04:18:55 CET,0.0 0.727 0.92 0.959 0.985 1.017 0.995 0.931 0.786 0.726 0.659 0.447 0.416 0.332 0.159 -0.01 -0.18 -0.27 -0.459 -0.649 -0.945 -1.155 -1.384 -1.741 -2.107 -2.475 -2.866 -3.26 -3.77 -4.295 -4.817 -5.448 -6.12 -6.845 -7.701 -8.713 -9.769 -10.986 -12.358 -13.878 -15.567 -17.584 -20.1 -22.79 -26.113 -30.167 -35.32 -41.702 -50.04 -61.307 -77.693 -94.595 -106.815 -116.211 -123.606 -129.689 -134.646 -138.866 -142.36 -145.674 -148.413 -150.824 -153.023 -154.965 -156.685 -158.219 -159.787 -161.131 -162.246 -163.388 -164.58 -165.555 -166.519 -167.485 -168.233 -168.989 -169.742 -170.499 -171.271 -171.795 -172.323 -173.12 -173.673 -174.218 -174.488 -175.043 -175.61 -176.207 -176.515 -177.067 -177.483 -177.819 -178.167 -178.882 -179.245 -179.627 -180.067 -180.552 -181.095 -181.784 -183.692 -5 ,25370 ,TETRA ,17617141,Tue Nov 30 02:30:11 CET,Tue Nov 30 04:20:00 CET,0.0 0.526 0.625 0.639 0.631 0.606 0.559 0.507 0.401 0.337 0.248 -0.011 -0.065 -0.162 -0.357 -0.554 -0.753 -0.854 -1.077 -1.32 -1.671 -1.902 -2.143 -2.518 -2.908 -3.308 -3.714 -4.126 -4.676 -5.236 -5.791 -6.486 -7.206 -7.937 -8.81 -9.858 -10.913 -12.124 -13.518 -15.074 -16.789 -18.846 -21.388 -24.106 -27.497 -31.58 -36.746 -43.189 -51.593 -62.914 -79.264 -96.024 -108.129 -117.411 -124.749 -130.832 -135.804 -139.991 -143.384 -146.651 -149.341 -151.665 -153.829 -155.783 -157.551 -159.114 -160.687 -162.04 -163.175 -164.311 -165.451 -166.386 -167.356 -168.328 -169.044 -169.765 -170.49 -171.231 -172.001 -172.531 -173.064 -173.867 -174.41 -174.951 -175.22 -175.762 -176.355 -177.022 -177.382 -178.031 -178.519 -178.918 -179.319 -180.157 -180.602 -181.053 -181.523 -182.03 -182.593 -183.262 -185.045 -6 ,15020 ,TETRA ,17617142,Tue Nov 30 02:30:11 CET,Tue Nov 30 04:20:51 CET,0.0 0.752 0.838 0.873 0.924 0.951 0.929 0.89 0.76 0.684 0.605 0.407 0.374 0.285 0.102 -0.084 -0.281 -0.386 -0.605 -0.811 -1.108 -1.317 -1.533 -1.888 -2.281 -2.694 -3.109 -3.505 -4.04 -4.607 -5.179 -5.887 -6.593 -7.31 -8.176 -9.172 -10.158 -11.332 -12.708 -14.276 -16.017 -18.075 -20.628 -23.377 -26.816 -30.945 -36.133 -42.636 -51.139 -62.544 -79.0 -95.874 -108.041 -117.338 -124.652 -130.713 -135.694 -139.921 -143.35 -146.613 -149.312 -151.609 -153.747 -155.691 -157.401 -158.926 -160.479 -161.845 -162.99 -164.128 -165.267 -166.18 -167.113 -168.067 -168.794 -169.548 -170.352 -171.18 -172.029 -172.605 -173.17 -174.042 -174.634 -175.238 -175.551 -176.176 -176.807 -177.428 -177.735 -178.282 -178.712 -179.068 -179.428 -180.162 -180.557 -180.973 -181.41 -181.893 -182.46 -183.145 -184.748 -7 ,1591 ,TETRA ,17617143,Tue Nov 30 02:30:11 CET,Tue Nov 30 04:18:20 CET,0.0 0.505 0.607 0.664 0.678 0.663 0.61 0.545 0.431 0.377 0.314 0.113 0.077 -0.013 -0.211 -0.441 -0.649 -0.741 -0.949 -1.183 -1.554 -1.808 -2.052 -2.394 -2.729 -3.087 -3.459 -3.824 -4.319 -4.807 -5.311 -5.997 -6.672 -7.338 -8.19 -9.233 -10.29 -11.494 -12.883 -14.463 -16.208 -18.275 -20.841 -23.599 -27.007 -31.09 -36.238 -42.614 -50.967 -62.308 -78.718 -95.415 -107.447 -116.692 -123.938 -129.938 -134.851 -139.02 -142.45 -145.746 -148.462 -150.746 -152.849 -154.774 -156.494 -158.041 -159.615 -160.977 -162.129 -163.278 -164.422 -165.356 -166.317 -167.299 -168.047 -168.805 -169.559 -170.304 -171.067 -171.6 -172.14 -172.94 -173.47 -174.036 -174.352 -175.031 -175.718 -176.421 -176.788 -177.434 -177.909 -178.291 -178.677 -179.529 -179.991 -180.482 -180.994 -181.507 -182.076 -182.755 -184.463 -8 ,12874 ,TETRA ,17617144,Tue Nov 30 02:30:13 CET,Tue Nov 30 04:22:11 CET,0.0 0.404 0.5 0.537 0.545 0.552 0.533 0.481 0.378 0.319 0.254 0.1 0.079 -0.022 -0.23 -0.43 -0.651 -0.767 -0.999 -1.238 -1.61 -1.865 -2.12 -2.505 -2.903 -3.309 -3.716 -4.129 -4.686 -5.233 -5.76 -6.429 -7.137 -7.871 -8.729 -9.73 -10.777 -11.988 -13.353 -14.898 -16.635 -18.694 -21.24 -24.003 -27.454 -31.597 -36.793 -43.207 -51.607 -62.967 -79.386 -96.146 -108.266 -117.59 -124.912 -130.987 -135.965 -140.19 -143.654 -146.968 -149.688 -152.009 -154.155 -156.108 -157.83 -159.322 -160.847 -162.19 -163.326 -164.495 -165.803 -166.965 -168.139 -169.327 -170.214 -171.104 -172.008 -172.888 -173.81 -174.469 -175.134 -176.155 -176.848 -177.506 -177.836 -178.524 -179.222 -179.928 -180.288 -180.947 -181.419 -181.815 -182.219 -183.037 -183.463 -183.926 -184.424 -184.983 -185.59 -186.324 -187.573 -9 ,26153 ,TETRA ,17617145,Tue Nov 30 02:31:11 CET,Tue Nov 30 04:18:30 CET,0.0 0.5 0.603 0.661 0.689 0.697 0.658 0.604 0.488 0.421 0.341 0.119 0.076 -0.014 -0.19 -0.382 -0.597 -0.7 -0.915 -1.156 -1.537 -1.793 -2.055 -2.445 -2.82 -3.183 -3.57 -3.986 -4.531 -5.079 -5.652 -6.374 -7.101 -7.84 -8.738 -9.788 -10.863 -12.113 -13.493 -15.043 -16.773 -18.842 -21.443 -24.215 -27.663 -31.793 -36.955 -43.378 -51.78 -63.137 -79.554 -96.448 -108.647 -117.948 -125.33 -131.534 -136.579 -140.805 -144.247 -147.525 -150.227 -152.531 -154.658 -156.596 -158.349 -159.911 -161.475 -162.798 -163.896 -165.013 -166.143 -167.056 -167.977 -168.922 -169.659 -170.492 -171.433 -172.386 -173.341 -173.974 -174.602 -175.577 -176.223 -176.879 -177.218 -177.893 -178.59 -179.313 -179.69 -180.37 -180.891 -181.292 -181.707 -182.548 -182.958 -183.384 -183.862 -184.391 -184.958 -185.628 -187.562 -10 ,32094 ,TETRA ,17617146,Tue Nov 30 02:31:11 CET,Tue Nov 30 04:18:05 CET,0.0 0.409 0.495 0.529 0.56 0.575 0.558 0.518 0.406 0.358 0.299 0.071 0.014 -0.096 -0.309 -0.535 -0.77 -0.874 -1.071 -1.266 -1.604 -1.849 -2.097 -2.483 -2.855 -3.21 -3.574 -3.937 -4.423 -4.918 -5.421 -6.085 -6.777 -7.498 -8.38 -9.389 -10.406 -11.603 -12.973 -14.525 -16.243 -18.281 -20.83 -23.56 -26.934 -31.021 -36.184 -42.588 -50.948 -62.21 -78.515 -95.239 -107.335 -116.695 -124.014 -130.012 -134.974 -139.212 -142.645 -145.879 -148.568 -150.884 -152.981 -154.891 -156.633 -158.17 -159.819 -161.466 -162.959 -164.448 -165.927 -167.107 -168.278 -169.485 -170.408 -171.32 -172.237 -173.193 -174.174 -174.809 -175.442 -176.426 -177.102 -177.801 -178.17 -178.925 -179.695 -180.458 -180.832 -181.506 -182.013 -182.415 -182.834 -183.705 -184.155 -184.627 -185.127 -185.667 -186.306 -187.097 -188.904 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_164.txt deleted file mode 100644 index 7889882f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24904 ,TETRA ,17617147,Tue Nov 30 02:31:13 CET,Tue Nov 30 04:26:31 CET,0.0 0.661 0.937 1.17 1.379 1.551 1.702 1.838 2.105 2.244 2.374 2.463 2.706 2.805 3.001 3.194 3.387 3.48 3.653 3.819 4.057 4.225 4.412 4.665 4.875 5.08 5.275 5.47 5.735 5.99 6.235 6.528 6.807 7.075 7.394 7.75 8.082 8.464 8.88 9.331 9.824 10.4 11.083 11.773 12.58 13.454 14.457 15.622 17.085 18.897 21.126 22.982 24.08 24.756 25.187 25.451 25.595 25.706 25.763 25.786 25.798 25.77 25.706 25.646 25.586 25.532 25.434 25.317 25.233 25.134 25.005 24.899 24.804 24.701 24.613 24.507 24.389 24.27 24.146 24.054 23.956 23.811 23.713 23.597 23.531 23.407 23.283 23.146 23.063 22.858 22.798 22.704 22.598 22.364 22.232 22.093 21.931 21.757 21.558 21.288 20.437 -2 ,10325 ,TETRA ,17617148,Tue Nov 30 02:32:11 CET,Tue Nov 30 04:19:43 CET,0.0 1.285 1.68 1.988 2.21 2.393 2.549 2.705 3.003 3.132 3.259 3.382 3.645 3.761 3.962 4.154 4.351 4.448 4.631 4.814 5.091 5.26 5.414 5.63 5.836 6.031 6.22 6.42 6.698 6.956 7.212 7.529 7.831 8.113 8.438 8.816 9.182 9.599 10.035 10.475 10.961 11.538 12.216 12.899 13.675 14.561 15.668 16.996 18.546 20.351 22.584 24.492 25.639 26.317 26.767 27.065 27.247 27.385 27.464 27.493 27.488 27.48 27.462 27.409 27.356 27.295 27.226 27.171 27.083 26.96 26.849 26.772 26.691 26.584 26.493 26.386 26.279 26.192 26.101 26.038 25.967 25.831 25.723 25.608 25.549 25.435 25.316 25.18 25.098 24.903 24.853 24.762 24.673 24.479 24.353 24.208 24.042 23.837 23.583 23.256 22.445 -3 ,855 ,TETRA ,17617149,Tue Nov 30 02:31:13 CET,Tue Nov 30 04:25:49 CET,0.0 1.101 1.505 1.787 1.987 2.174 2.371 2.534 2.825 2.971 3.095 3.201 3.451 3.568 3.781 3.966 4.141 4.225 4.393 4.564 4.81 4.966 5.111 5.339 5.573 5.795 6.01 6.22 6.478 6.73 6.979 7.267 7.551 7.828 8.153 8.514 8.866 9.281 9.729 10.195 10.683 11.215 11.844 12.48 13.221 14.078 15.08 16.225 17.651 19.362 21.411 23.097 24.106 24.795 25.236 25.51 25.7 25.814 25.848 25.858 25.858 25.807 25.719 25.653 25.596 25.531 25.46 25.399 25.338 25.272 25.191 25.12 25.047 24.967 24.902 24.817 24.713 24.598 24.477 24.399 24.324 24.213 24.128 24.037 23.99 23.872 23.726 23.575 23.502 23.314 23.237 23.143 23.043 22.8 22.663 22.521 22.369 22.203 21.998 21.705 20.896 -4 ,3474 ,TETRA ,17617150,Tue Nov 30 02:31:13 CET,Tue Nov 30 04:22:51 CET,0.0 0.839 1.156 1.41 1.624 1.802 1.955 2.089 2.323 2.454 2.586 2.696 2.937 3.033 3.213 3.382 3.546 3.63 3.794 3.952 4.177 4.322 4.46 4.659 4.864 5.068 5.259 5.437 5.671 5.901 6.117 6.38 6.643 6.907 7.216 7.554 7.872 8.23 8.629 9.035 9.456 9.938 10.522 11.137 11.853 12.661 13.59 14.593 15.789 17.29 19.22 20.793 21.705 22.292 22.658 22.882 23.029 23.11 23.126 23.098 23.051 22.971 22.863 22.761 22.682 22.61 22.514 22.425 22.341 22.236 22.138 22.058 21.968 21.874 21.786 21.671 21.549 21.422 21.297 21.211 21.118 20.984 20.888 20.788 20.736 20.603 20.465 20.343 20.28 20.095 20.046 19.949 19.843 19.618 19.503 19.375 19.22 19.012 18.732 18.402 17.237 -5 ,3725 ,TETRA ,17617151,Tue Nov 30 02:32:11 CET,Tue Nov 30 04:21:31 CET,0.0 0.818 1.142 1.391 1.599 1.77 1.935 2.095 2.381 2.506 2.625 2.716 2.958 3.069 3.281 3.481 3.657 3.735 3.894 4.059 4.297 4.435 4.574 4.793 4.993 5.184 5.385 5.582 5.83 6.073 6.307 6.59 6.859 7.114 7.422 7.788 8.151 8.567 9.018 9.494 10.017 10.601 11.268 11.965 12.773 13.657 14.657 15.792 17.201 18.926 21.016 22.699 23.689 24.277 24.618 24.831 24.972 25.089 25.145 25.153 25.141 25.083 24.994 24.889 24.768 24.659 24.565 24.485 24.414 24.317 24.18 24.058 23.952 23.849 23.752 23.662 23.579 23.482 23.368 23.284 23.195 23.046 22.949 22.848 22.791 22.668 22.536 22.403 22.33 22.128 22.048 21.947 21.841 21.63 21.522 21.393 21.239 21.067 20.864 20.571 19.825 -6 ,7918 ,TETRA ,17617152,Tue Nov 30 02:32:11 CET,Tue Nov 30 04:21:29 CET,0.0 0.608 0.891 1.153 1.415 1.638 1.834 2.007 2.267 2.392 2.53 2.643 2.893 3.0 3.201 3.39 3.591 3.686 3.869 4.052 4.304 4.472 4.637 4.885 5.13 5.34 5.534 5.725 5.984 6.236 6.467 6.761 7.054 7.334 7.653 8.018 8.373 8.778 9.223 9.653 10.094 10.639 11.277 11.919 12.692 13.561 14.594 15.821 17.285 19.012 21.205 23.08 24.164 24.842 25.356 25.676 25.835 25.914 25.931 25.936 25.895 25.835 25.748 25.657 25.587 25.5 25.416 25.331 25.243 25.155 25.052 24.964 24.853 24.711 24.601 24.488 24.374 24.267 24.161 24.091 24.01 23.865 23.759 23.641 23.578 23.459 23.341 23.204 23.125 22.936 22.885 22.789 22.682 22.454 22.346 22.217 22.051 21.855 21.612 21.311 20.245 -7 ,19518 ,TETRA ,17617153,Tue Nov 30 02:32:13 CET,Tue Nov 30 04:21:34 CET,0.0 0.658 0.987 1.228 1.424 1.601 1.763 1.903 2.156 2.28 2.408 2.53 2.79 2.909 3.137 3.35 3.55 3.65 3.853 4.039 4.282 4.448 4.614 4.849 5.078 5.314 5.543 5.763 6.044 6.303 6.571 6.891 7.191 7.497 7.87 8.291 8.689 9.126 9.565 9.999 10.477 11.053 11.715 12.382 13.195 14.113 15.172 16.397 17.85 19.545 21.69 23.466 24.462 25.109 25.476 25.638 25.694 25.739 25.777 25.775 25.74 25.684 25.629 25.558 25.475 25.406 25.323 25.214 25.104 25.001 24.882 24.767 24.669 24.582 24.502 24.42 24.337 24.244 24.146 24.074 23.971 23.798 23.691 23.574 23.518 23.411 23.292 23.169 23.098 22.899 22.829 22.727 22.615 22.364 22.233 22.113 21.97 21.797 21.592 21.319 20.569 -8 ,14781 ,TETRA ,17617154,Tue Nov 30 02:33:11 CET,Tue Nov 30 04:17:33 CET,0.0 0.837 1.154 1.381 1.605 1.822 2.018 2.188 2.45 2.576 2.713 2.854 3.116 3.236 3.451 3.659 3.862 3.962 4.156 4.345 4.609 4.767 4.924 5.165 5.392 5.595 5.79 5.981 6.244 6.502 6.728 7.004 7.272 7.543 7.868 8.229 8.607 9.023 9.447 9.91 10.407 10.955 11.604 12.253 13.018 13.93 14.999 16.194 17.618 19.329 21.429 23.135 24.107 24.756 25.204 25.436 25.568 25.67 25.714 25.711 25.683 25.593 25.487 25.416 25.326 25.234 25.136 25.037 24.951 24.855 24.741 24.661 24.58 24.468 24.373 24.281 24.189 24.083 23.953 23.859 23.773 23.649 23.562 23.47 23.414 23.302 23.195 23.074 22.997 22.806 22.764 22.684 22.59 22.391 22.265 22.12 21.97 21.79 21.578 21.318 20.485 -9 ,25555 ,TETRA ,17617155,Tue Nov 30 02:33:12 CET,Tue Nov 30 04:29:59 CET,0.0 0.774 1.102 1.348 1.547 1.739 1.931 2.102 2.426 2.572 2.71 2.866 3.122 3.24 3.472 3.688 3.877 3.965 4.143 4.323 4.601 4.769 4.923 5.153 5.373 5.589 5.806 6.007 6.258 6.517 6.762 7.038 7.31 7.579 7.897 8.266 8.632 9.054 9.533 10.046 10.565 11.14 11.831 12.538 13.362 14.284 15.352 16.577 18.028 19.774 21.909 23.696 24.751 25.405 25.869 26.148 26.267 26.338 26.374 26.383 26.369 26.337 26.267 26.19 26.106 26.017 25.914 25.803 25.725 25.65 25.559 25.482 25.405 25.308 25.227 25.145 25.055 24.952 24.826 24.728 24.624 24.471 24.352 24.235 24.185 24.063 23.939 23.832 23.771 23.591 23.516 23.416 23.316 23.112 22.994 22.833 22.661 22.486 22.27 21.958 21.007 -10 ,2580 ,TETRA ,17617156,Tue Nov 30 02:33:12 CET,Tue Nov 30 04:28:56 CET,0.0 0.838 1.216 1.501 1.743 1.949 2.129 2.29 2.589 2.729 2.872 3.019 3.264 3.369 3.573 3.764 3.95 4.038 4.216 4.401 4.666 4.828 4.982 5.207 5.428 5.637 5.838 6.036 6.291 6.539 6.773 7.057 7.328 7.589 7.92 8.294 8.635 9.021 9.463 9.949 10.464 11.041 11.738 12.449 13.282 14.239 15.338 16.607 18.15 20.011 22.3 24.228 25.449 26.275 26.818 27.19 27.463 27.688 27.81 27.807 27.749 27.715 27.677 27.619 27.528 27.439 27.353 27.273 27.193 27.088 26.966 26.856 26.752 26.658 26.592 26.506 26.395 26.273 26.155 26.078 25.994 25.846 25.737 25.625 25.569 25.463 25.333 25.18 25.1 24.916 24.874 24.789 24.7 24.479 24.355 24.223 24.07 23.866 23.599 23.288 22.52 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_165.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_165.txt deleted file mode 100644 index eccc8aa8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_165.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16539 ,TETRA ,17617157,Tue Nov 30 02:33:13 CET,Tue Nov 30 04:29:34 CET,0.0 0.851 1.185 1.453 1.678 1.867 2.047 2.207 2.49 2.624 2.752 2.871 3.133 3.252 3.471 3.666 3.848 3.94 4.122 4.299 4.556 4.724 4.887 5.132 5.378 5.613 5.828 6.035 6.324 6.585 6.808 7.067 7.308 7.54 7.814 8.124 8.425 8.761 9.127 9.528 9.95 10.427 10.983 11.533 12.161 12.858 13.661 14.553 15.623 16.842 18.287 19.497 20.133 20.49 20.717 20.811 20.834 20.824 20.767 20.697 20.633 20.567 20.485 20.379 20.286 20.207 20.12 20.041 19.977 19.905 19.817 19.75 19.679 19.576 19.485 19.394 19.289 19.177 19.061 18.993 18.931 18.825 18.746 18.657 18.604 18.488 18.374 18.262 18.198 18.009 17.976 17.883 17.79 17.612 17.503 17.371 17.227 17.071 16.874 16.543 15.763 -2 ,23736 ,TETRA ,17617158,Tue Nov 30 02:34:12 CET,Tue Nov 30 04:22:21 CET,0.0 0.703 0.985 1.233 1.43 1.602 1.754 1.891 2.147 2.259 2.361 2.439 2.671 2.77 2.961 3.137 3.304 3.382 3.543 3.705 3.937 4.08 4.207 4.388 4.578 4.766 4.943 5.116 5.34 5.555 5.758 6.001 6.247 6.493 6.768 7.086 7.376 7.685 8.043 8.433 8.847 9.316 9.87 10.439 11.112 11.862 12.739 13.757 14.955 16.36 18.021 19.273 19.958 20.388 20.585 20.639 20.633 20.587 20.491 20.379 20.291 20.198 20.116 20.034 19.951 19.877 19.778 19.674 19.587 19.495 19.396 19.308 19.214 19.089 18.982 18.883 18.765 18.654 18.532 18.442 18.363 18.237 18.153 18.054 18.002 17.895 17.768 17.6 17.511 17.31 17.268 17.184 17.092 16.871 16.749 16.633 16.505 16.35 16.147 15.833 15.117 -3 ,18796 ,TETRA ,17617159,Tue Nov 30 02:34:13 CET,Tue Nov 30 04:17:39 CET,0.0 0.859 1.185 1.418 1.59 1.738 1.866 1.974 2.234 2.374 2.493 2.589 2.833 2.935 3.129 3.319 3.505 3.591 3.755 3.921 4.152 4.289 4.428 4.634 4.831 5.026 5.209 5.381 5.608 5.829 6.049 6.322 6.565 6.79 7.063 7.374 7.667 7.999 8.36 8.72 9.092 9.524 10.036 10.54 11.133 11.821 12.626 13.543 14.636 15.921 17.406 18.447 19.034 19.393 19.519 19.587 19.636 19.653 19.639 19.592 19.528 19.427 19.322 19.249 19.152 19.036 18.923 18.834 18.769 18.7 18.612 18.539 18.432 18.309 18.213 18.102 17.997 17.881 17.762 17.698 17.642 17.53 17.436 17.349 17.301 17.19 17.085 16.977 16.91 16.719 16.698 16.619 16.528 16.343 16.24 16.123 15.994 15.838 15.642 15.383 14.625 -4 ,377 ,TETRA ,17617160,Tue Nov 30 02:34:13 CET,Tue Nov 30 04:20:21 CET,0.0 0.542 0.823 1.084 1.321 1.522 1.699 1.856 2.129 2.268 2.411 2.539 2.794 2.906 3.1 3.272 3.442 3.527 3.701 3.864 4.088 4.237 4.383 4.602 4.813 5.002 5.18 5.354 5.589 5.815 6.043 6.316 6.565 6.81 7.106 7.44 7.751 8.1 8.473 8.86 9.265 9.719 10.271 10.845 11.523 12.287 13.169 14.173 15.362 16.689 18.093 19.172 19.733 20.024 20.181 20.248 20.257 20.196 20.108 20.042 19.99 19.93 19.841 19.719 19.621 19.545 19.452 19.357 19.275 19.184 19.074 18.966 18.845 18.713 18.608 18.498 18.4 18.3 18.163 18.069 17.982 17.845 17.735 17.62 17.561 17.444 17.332 17.206 17.134 16.948 16.916 16.829 16.739 16.511 16.383 16.248 16.108 15.958 15.759 15.493 14.769 -5 ,14142 ,TETRA ,17617161,Tue Nov 30 02:36:10 CET,Tue Nov 30 04:26:21 CET,0.0 0.944 1.239 1.516 1.758 1.957 2.137 2.298 2.596 2.74 2.871 2.97 3.23 3.365 3.626 3.873 4.093 4.194 4.386 4.566 4.812 4.979 5.15 5.4 5.652 5.892 6.116 6.347 6.651 6.931 7.203 7.545 7.86 8.162 8.525 8.93 9.301 9.689 10.088 10.515 10.981 11.504 12.106 12.655 13.264 13.967 14.778 15.693 16.768 17.999 19.454 20.636 21.395 21.886 22.071 22.126 22.165 22.157 22.066 21.931 21.825 21.725 21.622 21.516 21.408 21.281 21.145 21.031 20.93 20.823 20.712 20.61 20.462 20.285 20.158 20.042 19.935 19.829 19.708 19.613 19.513 19.361 19.26 19.148 19.082 18.944 18.801 18.64 18.558 18.356 18.31 18.217 18.112 17.873 17.742 17.607 17.47 17.305 17.11 16.849 16.056 -6 ,22188 ,TETRA ,17617162,Tue Nov 30 02:38:10 CET,Tue Nov 30 04:31:50 CET,0.0 0.839 1.122 1.349 1.555 1.719 1.867 2.012 2.29 2.425 2.543 2.632 2.871 2.977 3.189 3.393 3.569 3.654 3.821 3.969 4.175 4.312 4.451 4.666 4.886 5.098 5.292 5.473 5.711 5.932 6.14 6.391 6.628 6.865 7.147 7.45 7.717 8.001 8.319 8.679 9.067 9.51 10.04 10.554 11.132 11.783 12.545 13.415 14.471 15.779 17.354 18.622 19.317 19.689 19.914 20.072 20.161 20.14 20.035 19.886 19.753 19.661 19.568 19.48 19.409 19.301 19.147 19.009 18.887 18.783 18.702 18.636 18.57 18.494 18.426 18.338 18.242 18.136 18.032 17.958 17.87 17.725 17.627 17.545 17.501 17.395 17.276 17.151 17.08 16.889 16.829 16.727 16.625 16.418 16.316 16.196 16.047 15.879 15.697 15.448 14.843 -7 ,456 ,TETRA ,17617163,Tue Nov 30 02:41:10 CET,Tue Nov 30 07:17:34 CET,0.0 0.687 0.997 1.26 1.474 1.654 1.812 1.949 2.226 2.352 2.463 2.549 2.794 2.906 3.113 3.301 3.5 3.592 3.75 3.899 4.106 4.245 4.383 4.572 4.746 4.9 5.051 5.208 5.422 5.644 5.871 6.138 6.396 6.641 6.935 7.28 7.607 7.984 8.383 8.77 9.181 9.678 10.268 10.845 11.494 12.22 13.117 14.178 15.417 16.877 18.532 19.835 20.619 21.071 21.292 21.395 21.416 21.381 21.32 21.185 21.059 20.992 20.933 20.873 20.819 20.75 20.648 20.555 20.469 20.378 20.288 20.202 20.11 20.013 19.934 19.835 19.708 19.57 19.437 19.355 19.268 19.123 19.014 18.89 18.825 18.709 18.607 18.491 18.424 18.238 18.206 18.124 18.038 17.854 17.742 17.64 17.525 17.361 17.164 16.929 16.284 -8 ,26880 ,TETRA ,17617164,Tue Nov 30 02:41:11 CET,Tue Nov 30 04:27:54 CET,0.0 0.797 1.115 1.351 1.535 1.714 1.875 2.025 2.294 2.411 2.521 2.6 2.825 2.917 3.096 3.264 3.425 3.509 3.679 3.838 4.052 4.189 4.326 4.538 4.738 4.917 5.094 5.264 5.485 5.693 5.9 6.159 6.405 6.645 6.914 7.207 7.49 7.804 8.151 8.509 8.889 9.326 9.839 10.363 10.949 11.587 12.35 13.249 14.348 15.631 17.171 18.4 19.043 19.38 19.573 19.698 19.748 19.745 19.728 19.709 19.663 19.608 19.521 19.425 19.344 19.256 19.166 19.088 18.999 18.9 18.79 18.663 18.511 18.371 18.271 18.161 18.052 17.943 17.818 17.73 17.638 17.484 17.382 17.289 17.237 17.115 16.989 16.856 16.777 16.582 16.528 16.432 16.336 16.158 16.041 15.886 15.72 15.552 15.367 15.115 14.38 -9 ,17060 ,TETRA ,17617165,Tue Nov 30 02:44:27 CET,Tue Nov 30 04:39:30 CET,0.0 0.754 1.05 1.271 1.453 1.627 1.784 1.946 2.268 2.403 2.529 2.641 2.885 2.994 3.201 3.408 3.598 3.686 3.869 4.042 4.293 4.457 4.62 4.862 5.09 5.312 5.531 5.753 6.039 6.287 6.501 6.774 7.042 7.287 7.571 7.898 8.219 8.57 8.942 9.342 9.781 10.284 10.86 11.434 12.119 12.879 13.703 14.613 15.699 17.008 18.517 19.683 20.337 20.668 20.82 20.899 20.93 20.919 20.879 20.838 20.797 20.748 20.683 20.616 20.552 20.485 20.378 20.264 20.179 20.098 19.986 19.865 19.732 19.586 19.47 19.349 19.239 19.137 19.024 18.946 18.866 18.717 18.624 18.532 18.476 18.359 18.237 18.115 18.053 17.866 17.805 17.709 17.623 17.45 17.363 17.25 17.108 16.945 16.75 16.496 15.875 -10 ,3454 ,TETRA ,17617166,Tue Nov 30 02:45:27 CET,Tue Nov 30 04:31:45 CET,0.0 0.661 0.951 1.19 1.396 1.581 1.745 1.883 2.128 2.243 2.35 2.407 2.627 2.717 2.91 3.104 3.283 3.361 3.512 3.675 3.917 4.059 4.19 4.391 4.591 4.779 4.957 5.121 5.335 5.557 5.776 6.038 6.283 6.527 6.816 7.122 7.411 7.75 8.136 8.561 9.008 9.493 10.054 10.645 11.335 12.082 12.967 13.996 15.163 16.469 17.977 19.139 19.728 19.994 20.12 20.165 20.163 20.106 20.012 19.909 19.801 19.714 19.634 19.549 19.468 19.363 19.243 19.15 19.051 18.926 18.782 18.658 18.532 18.403 18.294 18.191 18.08 17.951 17.835 17.76 17.678 17.536 17.421 17.278 17.202 17.047 16.887 16.704 16.6 16.391 16.355 16.257 16.137 15.901 15.775 15.617 15.458 15.276 15.069 14.76 13.58 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_231.txt deleted file mode 100644 index 47651aba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1154 ,KEBNE ,17027933,Wed Dec 22 18:43:20 CET,Wed Dec 22 20:14:40 CET,0.0 1.33 1.633 1.84 2.013 2.152 2.284 2.421 2.683 2.801 2.91 2.978 3.191 3.27 3.431 3.59 3.729 3.785 3.901 4.003 4.119 4.193 4.279 4.448 4.626 4.77 4.883 4.982 5.09 5.184 5.282 5.409 5.535 5.641 5.747 5.917 6.143 6.392 6.59 6.719 6.847 7.0 7.139 7.238 7.341 7.45 7.523 7.567 7.505 7.209 6.611 5.827 5.11 4.435 3.792 3.21 2.706 2.27 1.893 1.42 1.032 0.75 0.481 0.178 -0.134 -0.397 -0.65 -0.879 -1.076 -1.258 -1.468 -1.666 -1.861 -2.05 -2.196 -2.343 -2.483 -2.633 -2.797 -2.919 -3.045 -3.233 -3.38 -3.542 -3.624 -3.788 -3.955 -4.141 -4.239 -4.479 -4.562 -4.679 -4.786 -5.025 -5.166 -5.326 -5.504 -5.691 -5.896 -6.209 -7.091 -2 ,5465 ,KEBNE ,17027934,Wed Dec 22 18:43:20 CET,Wed Dec 22 20:14:15 CET,0.0 0.782 1.094 1.303 1.463 1.616 1.773 1.915 2.159 2.28 2.392 2.431 2.649 2.733 2.903 3.06 3.207 3.274 3.395 3.528 3.732 3.855 3.968 4.145 4.298 4.415 4.529 4.658 4.831 4.972 5.12 5.325 5.512 5.682 5.859 6.037 6.192 6.334 6.497 6.683 6.847 7.029 7.261 7.46 7.668 7.891 8.068 8.242 8.332 8.157 7.675 7.031 6.268 5.477 4.816 4.218 3.676 3.188 2.765 2.32 1.934 1.575 1.216 0.892 0.599 0.324 0.045 -0.224 -0.5 -0.786 -1.063 -1.273 -1.472 -1.678 -1.836 -2.005 -2.188 -2.374 -2.58 -2.743 -2.901 -3.119 -3.267 -3.426 -3.508 -3.678 -3.876 -4.104 -4.213 -4.453 -4.531 -4.653 -4.787 -5.072 -5.239 -5.416 -5.615 -5.855 -6.124 -6.476 -7.515 -3 ,26793 ,KEBNE ,17027935,Wed Dec 22 18:43:19 CET,Wed Dec 22 20:14:14 CET,0.0 0.869 1.142 1.336 1.525 1.676 1.797 1.905 2.119 2.212 2.299 2.337 2.561 2.654 2.824 2.956 3.071 3.129 3.245 3.367 3.565 3.691 3.793 3.939 4.086 4.218 4.352 4.507 4.709 4.871 4.999 5.134 5.267 5.39 5.533 5.677 5.801 5.954 6.122 6.31 6.537 6.804 7.057 7.258 7.422 7.539 7.669 7.82 7.851 7.581 6.995 6.09 5.242 4.539 3.921 3.361 2.854 2.407 2.069 1.733 1.416 1.133 0.862 0.579 0.311 0.079 -0.162 -0.371 -0.559 -0.763 -0.986 -1.2 -1.408 -1.609 -1.77 -1.93 -2.118 -2.351 -2.539 -2.641 -2.768 -3.001 -3.176 -3.337 -3.415 -3.58 -3.746 -3.908 -4.006 -4.261 -4.346 -4.459 -4.578 -4.836 -4.981 -5.141 -5.334 -5.543 -5.804 -6.183 -7.142 -4 ,8906 ,KEBNE ,17027936,Wed Dec 22 18:43:20 CET,Wed Dec 22 20:15:26 CET,0.0 0.724 0.972 1.197 1.371 1.497 1.621 1.75 1.957 2.041 2.127 2.164 2.376 2.445 2.587 2.746 2.889 2.958 3.096 3.228 3.399 3.498 3.602 3.736 3.848 3.966 4.09 4.218 4.366 4.481 4.594 4.721 4.819 4.905 5.002 5.145 5.283 5.39 5.492 5.609 5.741 5.864 6.018 6.183 6.309 6.41 6.488 6.523 6.43 6.179 5.72 4.972 4.236 3.563 2.972 2.399 1.916 1.494 1.112 0.715 0.31 -0.035 -0.317 -0.571 -0.853 -1.14 -1.417 -1.645 -1.827 -2.017 -2.233 -2.421 -2.614 -2.836 -3.018 -3.188 -3.341 -3.5 -3.684 -3.834 -4.0 -4.257 -4.426 -4.614 -4.717 -4.906 -5.107 -5.325 -5.429 -5.667 -5.742 -5.858 -5.974 -6.231 -6.375 -6.53 -6.691 -6.876 -7.144 -7.429 -8.093 -5 ,365 ,KEBNE ,17027937,Wed Dec 22 18:44:22 CET,Wed Dec 22 20:15:33 CET,0.0 0.809 1.073 1.286 1.447 1.584 1.706 1.813 2.007 2.1 2.193 2.228 2.441 2.519 2.668 2.812 2.932 2.993 3.13 3.237 3.355 3.45 3.551 3.705 3.852 3.989 4.137 4.255 4.372 4.489 4.606 4.757 4.875 4.967 5.087 5.238 5.393 5.569 5.742 5.915 6.113 6.324 6.517 6.655 6.785 6.905 7.013 7.078 7.011 6.724 6.091 5.289 4.592 3.891 3.252 2.692 2.189 1.721 1.33 0.946 0.597 0.289 -0.007 -0.304 -0.574 -0.807 -1.064 -1.302 -1.493 -1.713 -1.998 -2.238 -2.441 -2.64 -2.8 -2.964 -3.132 -3.302 -3.467 -3.597 -3.765 -4.032 -4.201 -4.359 -4.442 -4.613 -4.794 -5.002 -5.107 -5.349 -5.444 -5.568 -5.697 -5.961 -6.089 -6.235 -6.405 -6.6 -6.836 -7.149 -7.749 -6 ,20555 ,KEBNE ,17027938,Wed Dec 22 18:43:22 CET,Wed Dec 22 20:08:54 CET,0.0 0.626 0.925 1.146 1.315 1.45 1.58 1.697 1.889 1.97 2.042 2.062 2.284 2.362 2.496 2.63 2.747 2.799 2.918 3.035 3.195 3.3 3.395 3.521 3.643 3.76 3.873 3.993 4.137 4.243 4.342 4.5 4.679 4.827 4.961 5.105 5.265 5.446 5.649 5.818 5.929 6.061 6.193 6.329 6.477 6.587 6.652 6.666 6.62 6.395 5.812 4.982 4.262 3.574 2.962 2.402 1.925 1.503 1.129 0.726 0.371 0.057 -0.241 -0.509 -0.755 -1.014 -1.286 -1.498 -1.696 -1.905 -2.12 -2.306 -2.519 -2.765 -2.965 -3.17 -3.376 -3.593 -3.817 -3.967 -4.122 -4.37 -4.54 -4.716 -4.811 -4.984 -5.152 -5.35 -5.451 -5.687 -5.764 -5.883 -6.008 -6.285 -6.444 -6.599 -6.75 -6.962 -7.22 -7.555 -8.411 -7 ,15349 ,KEBNE ,17027939,Wed Dec 22 18:43:21 CET,Wed Dec 22 20:07:31 CET,0.0 0.707 0.959 1.149 1.323 1.478 1.624 1.768 2.024 2.131 2.232 2.263 2.462 2.526 2.637 2.748 2.843 2.891 3.002 3.112 3.252 3.335 3.42 3.569 3.708 3.814 3.924 4.037 4.155 4.252 4.354 4.474 4.582 4.698 4.872 5.053 5.168 5.272 5.373 5.496 5.615 5.713 5.816 5.972 6.146 6.243 6.331 6.373 6.292 6.034 5.454 4.602 3.798 3.102 2.527 1.992 1.516 1.083 0.7 0.314 -0.016 -0.33 -0.635 -0.916 -1.169 -1.394 -1.668 -1.905 -2.079 -2.261 -2.457 -2.632 -2.846 -3.052 -3.187 -3.33 -3.486 -3.662 -3.854 -3.982 -4.095 -4.267 -4.401 -4.559 -4.645 -4.824 -5.013 -5.203 -5.306 -5.544 -5.588 -5.69 -5.803 -6.05 -6.187 -6.331 -6.511 -6.76 -7.054 -7.405 -8.214 -8 ,886 ,KEBNE ,17027940,Wed Dec 22 18:45:25 CET,Wed Dec 22 20:16:45 CET,0.0 0.779 1.047 1.253 1.415 1.571 1.734 1.883 2.131 2.233 2.324 2.374 2.585 2.662 2.823 2.963 3.065 3.112 3.214 3.328 3.502 3.615 3.737 3.902 4.031 4.148 4.26 4.382 4.56 4.74 4.898 5.052 5.18 5.298 5.425 5.557 5.679 5.803 5.946 6.098 6.228 6.372 6.511 6.616 6.718 6.819 6.916 6.945 6.859 6.607 6.081 5.256 4.471 3.768 3.126 2.494 1.969 1.53 1.14 0.769 0.458 0.162 -0.13 -0.397 -0.648 -0.88 -1.137 -1.378 -1.587 -1.813 -2.05 -2.245 -2.432 -2.625 -2.784 -2.955 -3.135 -3.322 -3.526 -3.665 -3.818 -4.07 -4.227 -4.392 -4.477 -4.649 -4.82 -4.979 -5.068 -5.301 -5.362 -5.481 -5.607 -5.882 -6.044 -6.213 -6.407 -6.642 -6.93 -7.293 -8.224 -9 ,28009 ,KEBNE ,17027941,Wed Dec 22 18:43:21 CET,Wed Dec 22 20:14:18 CET,0.0 0.857 1.159 1.388 1.579 1.75 1.892 2.013 2.2 2.287 2.387 2.439 2.657 2.748 2.903 3.019 3.137 3.208 3.356 3.472 3.624 3.719 3.803 3.926 4.056 4.178 4.289 4.397 4.535 4.67 4.795 4.928 5.044 5.151 5.293 5.464 5.646 5.823 5.953 6.085 6.231 6.377 6.54 6.693 6.848 7.001 7.11 7.269 7.409 7.286 6.739 5.864 5.094 4.391 3.773 3.192 2.667 2.193 1.785 1.383 1.053 0.774 0.513 0.2 -0.081 -0.3 -0.565 -0.807 -1.026 -1.249 -1.463 -1.631 -1.822 -2.032 -2.184 -2.336 -2.506 -2.683 -2.865 -3.002 -3.128 -3.309 -3.441 -3.586 -3.672 -3.862 -4.034 -4.203 -4.303 -4.544 -4.612 -4.735 -4.867 -5.151 -5.305 -5.481 -5.672 -5.865 -6.118 -6.536 -7.589 -10 ,18696 ,KEBNE ,17027942,Wed Dec 22 18:43:20 CET,Wed Dec 22 20:15:01 CET,0.0 0.881 1.11 1.301 1.47 1.622 1.766 1.909 2.149 2.25 2.348 2.374 2.588 2.674 2.832 2.979 3.124 3.194 3.327 3.454 3.629 3.727 3.812 3.942 4.074 4.183 4.27 4.373 4.513 4.635 4.746 4.893 5.032 5.156 5.318 5.505 5.647 5.776 5.935 6.095 6.249 6.405 6.556 6.68 6.886 7.088 7.2 7.293 7.279 7.083 6.583 5.786 5.002 4.227 3.552 2.981 2.494 2.052 1.658 1.254 0.895 0.553 0.214 -0.095 -0.388 -0.657 -0.919 -1.156 -1.372 -1.588 -1.821 -2.016 -2.203 -2.404 -2.575 -2.744 -2.912 -3.09 -3.304 -3.475 -3.639 -3.873 -4.037 -4.21 -4.298 -4.471 -4.643 -4.825 -4.931 -5.181 -5.257 -5.383 -5.516 -5.816 -5.988 -6.169 -6.378 -6.626 -6.903 -7.203 -8.079 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_234.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_234.txt deleted file mode 100644 index e54758df..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_234.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24114 ,TETRA ,17617167,Tue Nov 30 02:45:28 CET,Tue Nov 30 04:47:05 CET,0.0 0.785 1.099 1.343 1.541 1.741 1.926 2.088 2.381 2.52 2.649 2.743 2.998 3.113 3.322 3.537 3.73 3.817 4.001 4.175 4.402 4.56 4.718 4.906 5.07 5.237 5.397 5.553 5.75 5.929 6.1 6.318 6.516 6.689 6.894 7.13 7.356 7.609 7.912 8.224 8.507 8.831 9.217 9.596 10.051 10.559 11.097 11.672 12.296 12.989 13.64 13.907 13.938 13.808 13.613 13.435 13.265 13.07 12.9 12.723 12.559 12.366 12.146 11.973 11.817 11.66 11.492 11.339 11.204 11.079 10.945 10.821 10.675 10.478 10.323 10.192 10.074 9.953 9.818 9.714 9.607 9.445 9.331 9.198 9.119 8.961 8.803 8.618 8.519 8.284 8.197 8.085 7.977 7.77 7.651 7.518 7.368 7.187 6.956 6.657 5.859 -2 ,22326 ,TETRA ,17617168,Tue Nov 30 02:48:29 CET,Tue Nov 30 04:37:56 CET,0.0 0.909 1.25 1.506 1.726 1.911 2.073 2.218 2.474 2.602 2.732 2.831 3.066 3.168 3.372 3.566 3.743 3.827 3.973 4.101 4.296 4.422 4.562 4.763 4.927 5.083 5.233 5.394 5.639 5.85 6.029 6.247 6.442 6.628 6.844 7.095 7.33 7.569 7.83 8.116 8.431 8.768 9.119 9.475 9.926 10.436 10.945 11.475 12.09 12.727 13.422 13.841 13.952 13.946 13.844 13.68 13.532 13.407 13.283 13.131 12.986 12.848 12.692 12.529 12.375 12.21 12.034 11.895 11.769 11.634 11.486 11.356 11.219 11.081 10.968 10.837 10.691 10.553 10.425 10.335 10.241 10.075 9.955 9.829 9.751 9.579 9.407 9.239 9.152 8.928 8.864 8.759 8.635 8.336 8.169 7.998 7.83 7.653 7.44 7.14 6.003 -3 ,6822 ,TETRA ,17617169,Tue Nov 30 02:48:31 CET,Tue Nov 30 04:37:58 CET,0.0 0.94 1.319 1.6 1.821 2.003 2.187 2.365 2.668 2.805 2.935 3.038 3.277 3.382 3.589 3.798 4.001 4.093 4.268 4.434 4.686 4.85 5.003 5.212 5.399 5.594 5.8 5.993 6.224 6.412 6.569 6.757 6.945 7.13 7.379 7.652 7.86 8.088 8.334 8.588 8.858 9.155 9.498 9.876 10.302 10.769 11.294 11.823 12.428 13.083 13.743 14.126 14.178 14.13 14.026 13.881 13.739 13.534 13.346 13.185 13.024 12.886 12.761 12.626 12.506 12.397 12.267 12.144 12.034 11.905 11.75 11.596 11.408 11.243 11.137 11.008 10.871 10.743 10.614 10.52 10.414 10.232 10.096 9.954 9.889 9.769 9.651 9.505 9.415 9.189 9.09 8.97 8.85 8.593 8.442 8.268 8.085 7.869 7.625 7.361 6.498 -4 ,26475 ,TETRA ,17617170,Tue Nov 30 02:49:29 CET,Tue Nov 30 04:38:13 CET,0.0 1.072 1.429 1.7 1.923 2.098 2.249 2.418 2.732 2.869 3.004 3.129 3.392 3.504 3.711 3.902 4.081 4.165 4.328 4.487 4.711 4.859 5.01 5.222 5.424 5.638 5.855 6.043 6.243 6.411 6.589 6.819 7.014 7.201 7.422 7.638 7.866 8.14 8.447 8.761 9.035 9.341 9.712 10.08 10.468 10.897 11.383 11.913 12.465 13.066 13.726 14.018 14.056 13.981 13.839 13.659 13.442 13.234 13.082 12.93 12.796 12.669 12.506 12.335 12.187 12.053 11.906 11.766 11.64 11.52 11.396 11.282 11.15 10.981 10.845 10.698 10.551 10.432 10.295 10.192 10.102 9.965 9.855 9.735 9.677 9.542 9.375 9.206 9.126 8.919 8.887 8.792 8.687 8.443 8.313 8.183 8.03 7.864 7.669 7.333 6.17 -5 ,32339 ,TETRA ,17617171,Tue Nov 30 02:50:29 CET,Tue Nov 30 04:37:41 CET,0.0 0.892 1.219 1.464 1.668 1.849 2.023 2.187 2.476 2.6 2.718 2.821 3.066 3.164 3.34 3.512 3.685 3.773 3.95 4.126 4.375 4.524 4.664 4.864 5.049 5.235 5.414 5.572 5.794 6.008 6.182 6.394 6.644 6.881 7.128 7.401 7.63 7.876 8.149 8.472 8.798 9.118 9.51 9.893 10.309 10.781 11.304 11.838 12.469 13.16 13.791 14.105 14.172 14.125 14.008 13.845 13.649 13.444 13.248 13.038 12.854 12.665 12.427 12.179 11.956 11.777 11.611 11.436 11.269 11.11 10.958 10.827 10.69 10.55 10.435 10.32 10.194 10.038 9.869 9.758 9.638 9.443 9.326 9.212 9.149 9.019 8.884 8.713 8.605 8.364 8.283 8.186 8.078 7.832 7.706 7.57 7.397 7.156 6.864 6.488 5.108 -6 ,6128 ,TETRA ,17617172,Tue Nov 30 02:57:26 CET,Tue Nov 30 04:44:41 CET,0.0 1.067 1.389 1.633 1.836 2.031 2.196 2.349 2.649 2.78 2.9 2.978 3.204 3.305 3.497 3.679 3.843 3.912 4.034 4.152 4.336 4.448 4.56 4.732 4.886 5.034 5.179 5.328 5.516 5.691 5.883 6.105 6.299 6.496 6.708 6.939 7.169 7.428 7.688 7.952 8.245 8.561 8.896 9.217 9.582 9.993 10.481 11.011 11.584 12.223 12.889 13.219 13.268 13.223 13.097 12.911 12.718 12.52 12.336 12.147 11.996 11.844 11.671 11.511 11.372 11.254 11.116 10.966 10.838 10.714 10.589 10.456 10.282 10.126 10.004 9.857 9.702 9.54 9.368 9.247 9.113 8.925 8.82 8.715 8.662 8.543 8.378 8.191 8.099 7.884 7.828 7.739 7.64 7.398 7.278 7.156 7.012 6.85 6.653 6.35 5.059 -7 ,21107 ,TETRA ,17617173,Tue Nov 30 02:59:26 CET,Tue Nov 30 04:45:14 CET,0.0 0.943 1.268 1.508 1.698 1.87 2.032 2.175 2.434 2.553 2.655 2.71 2.927 3.008 3.171 3.336 3.501 3.587 3.762 3.925 4.143 4.277 4.408 4.594 4.764 4.932 5.094 5.238 5.427 5.602 5.77 5.97 6.149 6.329 6.53 6.757 7.003 7.251 7.487 7.781 8.144 8.534 8.937 9.348 9.818 10.291 10.787 11.295 11.851 12.466 13.078 13.407 13.455 13.408 13.322 13.189 13.029 12.845 12.661 12.471 12.314 12.162 12.022 11.895 11.76 11.63 11.482 11.309 11.167 11.053 10.937 10.833 10.709 10.569 10.464 10.361 10.239 10.1 9.96 9.867 9.77 9.616 9.516 9.408 9.345 9.205 9.064 8.92 8.844 8.641 8.586 8.478 8.37 8.144 8.015 7.883 7.73 7.534 7.319 7.055 6.289 -8 ,23502 ,TETRA ,17617174,Tue Nov 30 03:07:25 CET,Tue Nov 30 04:48:01 CET,0.0 0.971 1.255 1.501 1.689 1.856 2.015 2.161 2.414 2.536 2.662 2.751 2.987 3.085 3.259 3.429 3.589 3.658 3.782 3.896 4.069 4.203 4.354 4.58 4.77 4.915 5.043 5.161 5.332 5.533 5.717 5.933 6.177 6.407 6.656 6.937 7.217 7.498 7.753 8.012 8.301 8.678 9.093 9.459 9.893 10.379 10.913 11.429 11.981 12.596 13.255 13.661 13.768 13.736 13.615 13.461 13.315 13.174 13.033 12.869 12.681 12.501 12.322 12.148 11.988 11.848 11.718 11.572 11.438 11.316 11.186 11.068 10.934 10.798 10.707 10.61 10.499 10.383 10.247 10.138 10.019 9.848 9.739 9.627 9.575 9.456 9.321 9.175 9.098 8.888 8.831 8.731 8.636 8.44 8.325 8.199 8.035 7.843 7.655 7.407 6.501 -9 ,10924 ,TETRA ,17617175,Tue Nov 30 03:07:25 CET,Tue Nov 30 04:53:57 CET,0.0 1.142 1.483 1.73 1.928 2.13 2.303 2.44 2.687 2.808 2.931 3.031 3.269 3.365 3.556 3.763 3.962 4.059 4.251 4.42 4.654 4.812 4.972 5.181 5.349 5.514 5.661 5.79 5.953 6.129 6.316 6.542 6.759 6.987 7.243 7.499 7.75 8.009 8.28 8.576 8.862 9.19 9.587 9.99 10.445 10.888 11.387 11.938 12.543 13.184 13.792 14.137 14.242 14.198 14.087 13.96 13.818 13.625 13.424 13.219 13.037 12.883 12.727 12.582 12.456 12.318 12.126 11.916 11.737 11.596 11.477 11.367 11.236 11.11 11.017 10.92 10.815 10.677 10.506 10.388 10.271 10.069 9.944 9.839 9.78 9.657 9.531 9.399 9.331 9.122 9.068 8.985 8.897 8.67 8.539 8.387 8.222 8.043 7.847 7.59 6.699 -10 ,6930 ,TETRA ,17617176,Tue Nov 30 03:07:26 CET,Tue Nov 30 04:56:03 CET,0.0 1.105 1.448 1.689 1.882 2.07 2.234 2.372 2.665 2.795 2.913 2.992 3.212 3.307 3.484 3.632 3.775 3.848 4.005 4.154 4.345 4.456 4.566 4.741 4.93 5.121 5.314 5.486 5.678 5.893 6.104 6.339 6.556 6.744 6.959 7.196 7.418 7.657 7.909 8.182 8.491 8.847 9.261 9.674 10.149 10.637 11.169 11.767 12.428 13.157 13.885 14.2 14.219 14.13 13.965 13.775 13.593 13.398 13.142 12.845 12.631 12.447 12.269 12.095 11.898 11.719 11.548 11.392 11.254 11.106 10.93 10.787 10.628 10.452 10.317 10.182 10.056 9.918 9.78 9.683 9.566 9.367 9.242 9.124 9.063 8.938 8.809 8.669 8.592 8.377 8.311 8.196 8.068 7.841 7.728 7.59 7.44 7.267 7.036 6.747 6.023 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_252.txt deleted file mode 100644 index 0b4de9b8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_163_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3496 ,TETRA ,17617177,Tue Nov 30 03:08:25 CET,Tue Nov 30 04:50:39 CET,0.0 0.608 0.773 0.864 0.921 0.975 1.022 1.059 1.1 1.109 1.116 0.995 1.12 1.102 1.052 1.011 0.986 0.971 0.93 0.886 0.804 0.738 0.654 0.529 0.431 0.315 0.177 0.041 -0.126 -0.312 -0.538 -0.845 -1.134 -1.384 -1.695 -2.124 -2.589 -3.122 -3.732 -4.429 -5.216 -6.167 -7.383 -8.717 -10.342 -12.304 -14.849 -18.079 -22.397 -28.296 -36.972 -45.964 -52.567 -57.746 -61.873 -65.342 -68.178 -70.61 -72.658 -74.615 -76.227 -77.603 -78.852 -80.002 -81.033 -81.932 -82.847 -83.65 -84.328 -85.026 -85.738 -86.308 -86.886 -87.468 -87.922 -88.401 -88.88 -89.355 -89.832 -90.16 -90.495 -91.0 -91.348 -91.72 -91.919 -92.32 -92.725 -93.138 -93.376 -93.919 -94.191 -94.486 -94.775 -95.357 -95.659 -95.986 -96.348 -96.781 -97.284 -97.859 -99.174 -2 ,18043 ,TETRA ,17617178,Tue Nov 30 02:51:30 CET,Tue Nov 30 04:32:34 CET,0.0 0.565 0.742 0.875 0.961 1.033 1.105 1.155 1.217 1.237 1.254 1.145 1.278 1.273 1.233 1.186 1.162 1.156 1.137 1.101 1.033 0.987 0.923 0.785 0.65 0.508 0.344 0.182 -0.04 -0.264 -0.474 -0.741 -0.99 -1.258 -1.63 -2.093 -2.579 -3.131 -3.773 -4.531 -5.376 -6.369 -7.613 -8.959 -10.643 -12.647 -15.166 -18.389 -22.688 -28.579 -37.193 -46.065 -52.628 -57.767 -61.857 -65.255 -68.002 -70.341 -72.286 -74.164 -75.712 -77.028 -78.253 -79.393 -80.429 -81.378 -82.338 -83.137 -83.815 -84.514 -85.225 -85.822 -86.437 -87.068 -87.562 -88.059 -88.545 -89.026 -89.514 -89.846 -90.185 -90.698 -91.046 -91.399 -91.585 -91.971 -92.38 -92.81 -93.015 -93.452 -93.638 -93.853 -94.071 -94.52 -94.761 -95.013 -95.275 -95.564 -95.922 -96.382 -97.46 -3 ,29275 ,TETRA ,17617179,Tue Nov 30 02:51:30 CET,Tue Nov 30 04:44:20 CET,0.0 0.568 0.734 0.852 0.915 0.951 1.004 1.05 1.078 1.086 1.096 0.982 1.124 1.133 1.11 1.063 1.024 1.004 0.947 0.898 0.829 0.774 0.7 0.566 0.415 0.26 0.107 -0.059 -0.288 -0.531 -0.771 -1.066 -1.375 -1.669 -2.006 -2.431 -2.904 -3.483 -4.135 -4.86 -5.682 -6.667 -7.908 -9.278 -10.977 -13.011 -15.589 -18.85 -23.208 -29.18 -37.962 -47.192 -53.991 -59.288 -63.521 -67.098 -70.045 -72.609 -74.724 -76.689 -78.307 -79.707 -80.999 -82.233 -83.338 -84.279 -85.244 -86.073 -86.762 -87.46 -88.175 -88.766 -89.37 -89.966 -90.43 -90.92 -91.419 -91.937 -92.461 -92.811 -93.166 -93.697 -94.047 -94.408 -94.593 -94.961 -95.346 -95.742 -95.943 -96.389 -96.574 -96.792 -97.017 -97.486 -97.739 -98.013 -98.334 -98.727 -99.204 -99.783 -101.182 -4 ,14326 ,TETRA ,17617180,Tue Nov 30 02:52:29 CET,Tue Nov 30 04:35:34 CET,0.0 0.574 0.791 0.936 1.023 1.08 1.12 1.16 1.217 1.225 1.214 1.045 1.166 1.155 1.141 1.132 1.097 1.064 0.985 0.906 0.813 0.769 0.71 0.603 0.481 0.343 0.188 0.039 -0.166 -0.409 -0.644 -0.946 -1.269 -1.587 -1.989 -2.467 -2.947 -3.512 -4.154 -4.844 -5.606 -6.559 -7.751 -9.056 -10.744 -12.746 -15.263 -18.502 -22.743 -28.509 -37.207 -46.354 -52.992 -58.19 -62.32 -65.762 -68.589 -70.988 -72.981 -74.9 -76.483 -77.809 -79.069 -80.267 -81.549 -82.836 -84.103 -85.209 -86.143 -87.106 -88.073 -88.854 -89.641 -90.401 -90.971 -91.542 -92.126 -92.732 -93.345 -93.763 -94.197 -94.891 -95.374 -95.848 -96.092 -96.571 -97.047 -97.555 -97.813 -98.381 -98.664 -98.962 -99.301 -100.029 -100.418 -100.807 -101.2 -101.646 -102.163 -102.847 -104.41 -5 ,15053 ,TETRA ,17617181,Tue Nov 30 02:52:29 CET,Tue Nov 30 04:33:41 CET,0.0 0.663 0.844 0.936 1.004 1.061 1.101 1.123 1.155 1.169 1.182 1.074 1.2 1.194 1.19 1.201 1.189 1.166 1.105 1.044 0.964 0.906 0.84 0.725 0.594 0.451 0.29 0.119 -0.104 -0.322 -0.559 -0.886 -1.215 -1.545 -1.94 -2.388 -2.85 -3.401 -4.054 -4.797 -5.582 -6.525 -7.742 -9.035 -10.654 -12.615 -15.067 -18.149 -22.258 -27.924 -36.484 -45.51 -52.074 -57.171 -61.253 -64.701 -67.527 -69.961 -71.986 -73.882 -75.436 -76.764 -78.015 -79.199 -80.259 -81.198 -82.156 -83.004 -83.727 -84.456 -85.168 -85.752 -86.368 -86.973 -87.417 -87.861 -88.317 -88.792 -89.275 -89.611 -89.957 -90.48 -90.834 -91.196 -91.385 -91.769 -92.154 -92.561 -92.799 -93.336 -93.557 -93.826 -94.124 -94.768 -95.096 -95.433 -95.785 -96.169 -96.605 -97.108 -98.523 -6 ,16225 ,TETRA ,17617182,Tue Nov 30 02:54:27 CET,Tue Nov 30 04:53:02 CET,0.0 0.632 0.881 1.023 1.14 1.232 1.31 1.368 1.427 1.444 1.454 1.331 1.468 1.479 1.495 1.454 1.403 1.386 1.331 1.262 1.136 1.05 0.97 0.834 0.683 0.531 0.397 0.279 0.091 -0.142 -0.373 -0.646 -0.906 -1.152 -1.499 -1.929 -2.358 -2.887 -3.514 -4.241 -5.061 -6.026 -7.2 -8.467 -10.107 -12.112 -14.657 -17.892 -22.187 -28.017 -36.595 -45.605 -52.207 -57.343 -61.459 -64.965 -67.808 -70.174 -72.162 -74.093 -75.655 -76.971 -78.199 -79.342 -80.38 -81.293 -82.252 -83.127 -83.846 -84.55 -85.28 -85.879 -86.459 -87.042 -87.487 -87.936 -88.412 -88.898 -89.387 -89.704 -90.022 -90.531 -90.876 -91.225 -91.407 -91.781 -92.157 -92.533 -92.726 -93.176 -93.359 -93.576 -93.795 -94.235 -94.491 -94.778 -95.072 -95.412 -95.803 -96.264 -97.594 -7 ,26344 ,TETRA ,17617183,Tue Nov 30 03:09:24 CET,Tue Nov 30 04:40:50 CET,0.0 0.601 0.825 0.913 0.981 1.064 1.119 1.149 1.205 1.216 1.217 1.09 1.226 1.223 1.218 1.209 1.187 1.171 1.121 1.068 0.993 0.938 0.866 0.742 0.63 0.507 0.345 0.169 -0.046 -0.246 -0.453 -0.741 -1.045 -1.358 -1.747 -2.204 -2.684 -3.249 -3.883 -4.608 -5.423 -6.414 -7.678 -9.055 -10.784 -12.906 -15.592 -18.929 -23.361 -29.344 -38.095 -47.334 -54.146 -59.408 -63.599 -67.081 -69.908 -72.333 -74.338 -76.288 -77.906 -79.275 -80.583 -81.779 -82.818 -83.752 -84.712 -85.53 -86.216 -86.903 -87.604 -88.179 -88.75 -89.339 -89.816 -90.3 -90.788 -91.311 -91.848 -92.218 -92.582 -93.088 -93.425 -93.764 -93.939 -94.306 -94.684 -95.076 -95.27 -95.709 -95.88 -96.098 -96.326 -96.834 -97.109 -97.38 -97.642 -97.94 -98.322 -98.791 -99.913 -8 ,3497 ,TETRA ,17617184,Tue Nov 30 03:19:28 CET,Tue Nov 30 05:06:49 CET,0.0 0.673 0.853 0.981 1.069 1.134 1.186 1.225 1.296 1.322 1.325 1.195 1.342 1.346 1.324 1.286 1.233 1.203 1.148 1.103 1.025 0.963 0.894 0.787 0.681 0.572 0.437 0.266 0.031 -0.215 -0.462 -0.775 -1.091 -1.393 -1.771 -2.203 -2.652 -3.225 -3.895 -4.652 -5.495 -6.497 -7.733 -9.071 -10.756 -12.806 -15.425 -18.734 -23.117 -29.15 -38.001 -47.183 -53.938 -59.227 -63.485 -67.072 -70.045 -72.595 -74.666 -76.628 -78.265 -79.659 -80.94 -82.118 -83.168 -84.086 -85.015 -85.82 -86.509 -87.209 -87.927 -88.532 -89.152 -89.789 -90.273 -90.762 -91.26 -91.771 -92.289 -92.64 -92.986 -93.512 -93.868 -94.221 -94.401 -94.765 -95.151 -95.553 -95.76 -96.209 -96.398 -96.629 -96.861 -97.335 -97.575 -97.833 -98.113 -98.421 -98.767 -99.201 -100.088 -9 ,17697 ,TETRA ,17617185,Tue Nov 30 03:19:28 CET,Tue Nov 30 04:54:48 CET,0.0 0.604 0.768 0.849 0.925 0.999 1.043 1.065 1.082 1.093 1.095 0.936 1.06 1.056 1.041 1.012 0.964 0.937 0.882 0.828 0.759 0.712 0.657 0.549 0.407 0.271 0.13 -0.015 -0.219 -0.44 -0.66 -0.962 -1.27 -1.551 -1.888 -2.297 -2.706 -3.195 -3.806 -4.523 -5.25 -6.104 -7.277 -8.581 -10.234 -12.255 -14.884 -18.262 -22.688 -28.575 -37.354 -46.709 -53.466 -58.653 -62.813 -66.259 -69.071 -71.458 -73.462 -75.472 -77.129 -78.524 -79.791 -80.93 -81.961 -82.892 -83.838 -84.675 -85.402 -86.139 -86.868 -87.442 -88.015 -88.612 -89.081 -89.559 -90.062 -90.574 -91.1 -91.446 -91.773 -92.282 -92.628 -92.977 -93.161 -93.534 -93.907 -94.295 -94.497 -94.946 -95.13 -95.353 -95.592 -96.089 -96.345 -96.608 -96.902 -97.232 -97.623 -98.131 -99.451 -10 ,8246 ,TETRA ,17617186,Tue Nov 30 03:19:28 CET,Tue Nov 30 05:05:26 CET,0.0 0.647 0.822 0.931 1.017 1.088 1.151 1.199 1.282 1.319 1.345 1.244 1.39 1.384 1.368 1.357 1.322 1.289 1.221 1.153 1.046 0.974 0.889 0.775 0.676 0.533 0.377 0.228 0.017 -0.219 -0.444 -0.728 -1.033 -1.342 -1.724 -2.146 -2.549 -3.053 -3.675 -4.388 -5.189 -6.147 -7.357 -8.672 -10.337 -12.394 -15.017 -18.301 -22.619 -28.501 -37.195 -46.235 -52.83 -57.959 -62.031 -65.484 -68.373 -70.812 -72.806 -74.708 -76.34 -77.786 -79.062 -80.219 -81.278 -82.209 -83.159 -83.989 -84.696 -85.436 -86.196 -86.804 -87.411 -88.008 -88.457 -88.917 -89.4 -89.906 -90.405 -90.741 -91.083 -91.61 -91.982 -92.354 -92.536 -92.893 -93.249 -93.635 -93.838 -94.289 -94.491 -94.712 -94.938 -95.436 -95.73 -96.033 -96.344 -96.686 -97.07 -97.548 -98.6 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_164_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_164_231.txt deleted file mode 100644 index 3155c64d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_164_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21281 ,KEBNE ,17076683,Sat Dec 25 02:10:48 CET,Sat Dec 25 03:42:06 CET,0.0 0.799 1.119 1.355 1.546 1.707 1.837 1.952 2.153 2.232 2.309 2.355 2.54 2.601 2.711 2.813 2.921 2.967 3.04 3.119 3.236 3.303 3.362 3.454 3.535 3.604 3.673 3.745 3.84 3.904 3.948 4.006 4.064 4.121 4.194 4.276 4.347 4.405 4.423 4.422 4.413 4.379 4.281 4.152 3.944 3.628 3.239 2.721 1.895 0.528 -1.833 -4.369 -6.27 -7.88 -9.283 -10.502 -11.531 -12.446 -13.244 -14.03 -14.673 -15.241 -15.8 -16.318 -16.781 -17.214 -17.673 -18.074 -18.423 -18.775 -19.131 -19.444 -19.766 -20.089 -20.332 -20.585 -20.847 -21.116 -21.393 -21.578 -21.768 -22.048 -22.242 -22.455 -22.565 -22.797 -23.032 -23.284 -23.419 -23.698 -23.857 -24.021 -24.19 -24.51 -24.68 -24.887 -25.122 -25.374 -25.657 -26.041 -26.943 -2 ,16056 ,KEBNE ,17076684,Sat Dec 25 02:10:48 CET,Sat Dec 25 03:41:43 CET,0.0 0.933 1.151 1.312 1.457 1.578 1.701 1.825 2.031 2.111 2.184 2.212 2.398 2.458 2.555 2.656 2.758 2.806 2.891 2.975 3.103 3.178 3.253 3.373 3.48 3.573 3.659 3.727 3.807 3.885 3.958 4.032 4.115 4.186 4.234 4.312 4.385 4.436 4.474 4.481 4.483 4.485 4.494 4.505 4.433 4.249 3.954 3.434 2.621 1.43 -0.842 -3.551 -5.708 -7.596 -9.229 -10.643 -11.862 -12.963 -13.881 -14.762 -15.51 -16.146 -16.745 -17.336 -17.874 -18.334 -18.815 -19.23 -19.581 -19.958 -20.334 -20.625 -20.919 -21.231 -21.469 -21.718 -21.988 -22.284 -22.598 -22.814 -23.028 -23.36 -23.587 -23.82 -23.944 -24.191 -24.448 -24.739 -24.893 -25.188 -25.344 -25.508 -25.689 -26.075 -26.265 -26.469 -26.723 -27.022 -27.342 -27.738 -28.794 -3 ,14503 ,KEBNE ,17076685,Sat Dec 25 02:10:48 CET,Sat Dec 25 03:42:17 CET,0.0 1.21 1.502 1.684 1.826 1.95 2.07 2.183 2.392 2.484 2.566 2.595 2.778 2.851 2.974 3.081 3.187 3.242 3.355 3.462 3.601 3.679 3.761 3.878 3.972 4.056 4.138 4.212 4.301 4.39 4.475 4.557 4.609 4.659 4.707 4.741 4.799 4.87 4.922 4.95 4.942 4.896 4.819 4.713 4.541 4.305 3.967 3.46 2.612 1.201 -1.044 -3.636 -5.801 -7.56 -9.045 -10.381 -11.548 -12.572 -13.382 -14.129 -14.797 -15.417 -15.971 -16.505 -17.027 -17.49 -17.963 -18.391 -18.757 -19.137 -19.535 -19.883 -20.236 -20.571 -20.827 -21.098 -21.379 -21.659 -21.936 -22.126 -22.329 -22.651 -22.88 -23.117 -23.237 -23.472 -23.714 -23.988 -24.139 -24.436 -24.618 -24.795 -24.97 -25.328 -25.537 -25.769 -26.032 -26.324 -26.659 -27.117 -28.271 -4 ,9 ,KEBNE ,17076686,Sat Dec 25 02:10:48 CET,Sat Dec 25 03:42:42 CET,0.0 0.715 0.984 1.213 1.393 1.528 1.656 1.766 1.933 2.012 2.088 2.109 2.278 2.338 2.455 2.562 2.659 2.702 2.794 2.883 2.994 3.066 3.126 3.204 3.279 3.339 3.398 3.459 3.532 3.597 3.639 3.686 3.739 3.771 3.796 3.823 3.836 3.843 3.833 3.849 3.908 3.925 3.842 3.685 3.417 3.018 2.441 1.69 0.661 -0.75 -2.837 -5.308 -7.371 -9.155 -10.602 -11.834 -12.921 -13.878 -14.671 -15.485 -16.231 -16.909 -17.509 -18.03 -18.505 -18.938 -19.397 -19.796 -20.135 -20.475 -20.815 -21.105 -21.407 -21.716 -21.949 -22.188 -22.454 -22.731 -23.016 -23.214 -23.429 -23.761 -23.974 -24.189 -24.297 -24.528 -24.776 -25.041 -25.176 -25.453 -25.63 -25.784 -25.939 -26.285 -26.489 -26.72 -26.96 -27.23 -27.563 -28.009 -29.29 -5 ,8511 ,KEBNE ,17076687,Sat Dec 25 02:10:48 CET,Sat Dec 25 03:42:47 CET,0.0 0.926 1.128 1.276 1.422 1.562 1.7 1.813 1.983 2.052 2.124 2.178 2.375 2.449 2.564 2.675 2.785 2.837 2.926 3.005 3.121 3.196 3.265 3.364 3.458 3.54 3.614 3.696 3.784 3.858 3.946 4.029 4.103 4.194 4.304 4.389 4.455 4.546 4.617 4.656 4.669 4.668 4.604 4.423 4.15 3.838 3.459 2.861 1.874 0.517 -1.635 -4.441 -6.742 -8.51 -9.985 -11.352 -12.567 -13.604 -14.407 -15.204 -15.918 -16.528 -17.098 -17.654 -18.189 -18.673 -19.164 -19.597 -19.965 -20.336 -20.711 -21.038 -21.382 -21.715 -21.965 -22.224 -22.502 -22.795 -23.089 -23.284 -23.496 -23.848 -24.08 -24.315 -24.437 -24.679 -24.928 -25.192 -25.332 -25.627 -25.8 -25.965 -26.147 -26.532 -26.74 -26.951 -27.175 -27.44 -27.723 -28.071 -29.019 -6 ,7500 ,KEBNE ,17076688,Sat Dec 25 02:10:48 CET,Sat Dec 25 03:42:00 CET,0.0 0.642 0.888 1.073 1.234 1.375 1.491 1.59 1.763 1.842 1.918 1.94 2.116 2.182 2.3 2.406 2.521 2.572 2.655 2.737 2.852 2.918 2.979 3.061 3.142 3.232 3.316 3.394 3.48 3.545 3.611 3.71 3.8 3.857 3.91 3.98 4.036 4.094 4.165 4.193 4.168 4.115 4.068 4.023 3.88 3.655 3.29 2.65 1.634 0.115 -2.36 -5.148 -7.244 -8.974 -10.435 -11.721 -12.864 -13.933 -14.847 -15.717 -16.463 -17.119 -17.747 -18.312 -18.805 -19.261 -19.748 -20.184 -20.568 -20.971 -21.378 -21.708 -22.058 -22.43 -22.72 -23.004 -23.274 -23.546 -23.839 -24.048 -24.255 -24.58 -24.819 -25.054 -25.169 -25.405 -25.653 -25.908 -26.042 -26.329 -26.525 -26.703 -26.882 -27.286 -27.514 -27.751 -27.988 -28.274 -28.625 -29.061 -30.243 -7 ,22103 ,KEBNE ,17076689,Sat Dec 25 02:11:51 CET,Sat Dec 25 03:42:32 CET,0.0 0.779 1.017 1.223 1.418 1.562 1.671 1.767 1.924 1.994 2.068 2.107 2.277 2.334 2.452 2.559 2.66 2.716 2.832 2.928 3.058 3.14 3.212 3.304 3.389 3.471 3.547 3.61 3.687 3.772 3.844 3.923 3.969 4.005 4.075 4.152 4.208 4.261 4.322 4.343 4.328 4.271 4.158 4.004 3.751 3.431 2.977 2.307 1.387 0.132 -1.889 -4.347 -6.369 -8.063 -9.506 -10.758 -11.81 -12.717 -13.481 -14.233 -14.863 -15.45 -16.036 -16.575 -17.063 -17.501 -17.931 -18.332 -18.696 -19.081 -19.469 -19.76 -20.069 -20.401 -20.653 -20.921 -21.194 -21.467 -21.75 -21.947 -22.142 -22.438 -22.648 -22.869 -22.983 -23.233 -23.502 -23.763 -23.895 -24.181 -24.351 -24.505 -24.661 -25.022 -25.239 -25.476 -25.711 -25.966 -26.284 -26.698 -27.735 -8 ,27670 ,KEBNE ,17076690,Sat Dec 25 02:11:52 CET,Sat Dec 25 03:44:06 CET,0.0 0.655 0.876 1.094 1.279 1.409 1.523 1.615 1.779 1.854 1.928 1.964 2.148 2.208 2.292 2.39 2.496 2.534 2.593 2.66 2.765 2.818 2.864 2.934 3.001 3.074 3.133 3.172 3.212 3.246 3.275 3.304 3.322 3.322 3.316 3.312 3.32 3.303 3.26 3.254 3.253 3.207 3.072 2.884 2.61 2.242 1.732 1.032 0.051 -1.45 -3.848 -6.586 -8.803 -10.748 -12.385 -13.77 -14.941 -15.96 -16.815 -17.666 -18.382 -19.008 -19.578 -20.097 -20.603 -21.082 -21.554 -21.952 -22.305 -22.662 -23.032 -23.339 -23.658 -23.994 -24.238 -24.492 -24.779 -25.078 -25.386 -25.596 -25.798 -26.117 -26.345 -26.58 -26.7 -26.933 -27.19 -27.467 -27.593 -27.868 -28.037 -28.199 -28.358 -28.66 -28.838 -29.047 -29.271 -29.539 -29.87 -30.27 -31.049 -9 ,1976 ,KEBNE ,17076691,Sat Dec 25 02:11:51 CET,Sat Dec 25 03:43:12 CET,0.0 1.152 1.416 1.637 1.844 2.011 2.149 2.262 2.444 2.524 2.603 2.662 2.86 2.942 3.078 3.181 3.265 3.304 3.382 3.439 3.536 3.605 3.661 3.75 3.85 3.951 4.042 4.12 4.21 4.295 4.379 4.468 4.521 4.554 4.586 4.624 4.647 4.641 4.648 4.669 4.648 4.58 4.482 4.378 4.201 3.87 3.381 2.802 2.015 0.768 -1.358 -3.831 -5.907 -7.775 -9.337 -10.644 -11.75 -12.766 -13.641 -14.468 -15.145 -15.729 -16.267 -16.768 -17.234 -17.669 -18.112 -18.52 -18.903 -19.292 -19.693 -20.033 -20.362 -20.692 -20.945 -21.195 -21.458 -21.768 -22.099 -22.313 -22.522 -22.826 -23.042 -23.266 -23.377 -23.618 -23.87 -24.121 -24.26 -24.563 -24.742 -24.903 -25.086 -25.477 -25.675 -25.885 -26.124 -26.401 -26.712 -27.13 -28.13 -10 ,2253 ,KEBNE ,17076692,Sat Dec 25 02:52:38 CET,Sat Dec 25 04:23:42 CET,0.0 0.718 0.982 1.184 1.339 1.468 1.591 1.713 1.938 2.03 2.112 2.149 2.326 2.392 2.511 2.629 2.736 2.787 2.877 2.957 3.089 3.173 3.251 3.352 3.426 3.489 3.552 3.621 3.723 3.808 3.883 3.943 3.99 4.044 4.082 4.111 4.133 4.157 4.185 4.218 4.219 4.169 4.059 3.913 3.722 3.421 2.919 2.181 1.122 -0.338 -2.544 -5.044 -7.073 -8.903 -10.608 -12.096 -13.248 -14.215 -15.04 -15.833 -16.49 -17.075 -17.637 -18.179 -18.69 -19.143 -19.612 -20.017 -20.322 -20.642 -21.01 -21.32 -21.638 -21.967 -22.228 -22.49 -22.773 -23.067 -23.353 -23.549 -23.753 -24.076 -24.303 -24.536 -24.654 -24.914 -25.179 -25.466 -25.62 -25.899 -26.048 -26.199 -26.361 -26.685 -26.863 -27.071 -27.287 -27.537 -27.826 -28.191 -29.087 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_167_234.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_167_234.txt deleted file mode 100644 index 2d77ed29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_167_234.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1775 ,TETRA ,17617187,Tue Nov 30 03:19:29 CET,Tue Nov 30 05:11:34 CET,0.0 0.618 0.803 0.923 1.029 1.139 1.249 1.347 1.507 1.571 1.627 1.634 1.767 1.822 1.918 1.994 2.057 2.085 2.127 2.151 2.185 2.214 2.228 2.213 2.189 2.176 2.184 2.207 2.23 2.215 2.171 2.137 2.094 2.016 1.911 1.778 1.616 1.418 1.189 0.908 0.6 0.239 -0.243 -0.782 -1.468 -2.359 -3.492 -4.911 -6.849 -9.637 -13.887 -18.397 -21.822 -24.527 -26.677 -28.46 -29.959 -31.282 -32.369 -33.436 -34.33 -35.122 -35.848 -36.49 -37.124 -37.704 -38.26 -38.72 -39.106 -39.521 -39.955 -40.289 -40.63 -41.011 -41.31 -41.602 -41.885 -42.187 -42.538 -42.78 -43.01 -43.361 -43.6 -43.837 -43.966 -44.252 -44.532 -44.806 -44.947 -45.225 -45.403 -45.558 -45.72 -46.068 -46.247 -46.438 -46.65 -46.886 -47.174 -47.557 -48.58 -2 ,2609 ,TETRA ,17617188,Tue Nov 30 03:19:29 CET,Tue Nov 30 05:08:05 CET,0.0 0.527 0.707 0.866 0.986 1.076 1.155 1.229 1.361 1.429 1.491 1.482 1.595 1.628 1.671 1.72 1.778 1.8 1.822 1.843 1.896 1.931 1.961 1.997 2.023 2.04 2.028 2.006 1.976 1.932 1.875 1.801 1.726 1.648 1.537 1.396 1.245 1.039 0.794 0.529 0.221 -0.17 -0.662 -1.209 -1.932 -2.82 -3.926 -5.358 -7.32 -10.054 -14.13 -18.51 -21.823 -24.421 -26.55 -28.337 -29.783 -31.031 -32.102 -33.143 -33.994 -34.753 -35.459 -36.087 -36.661 -37.161 -37.664 -38.126 -38.538 -38.987 -39.466 -39.851 -40.233 -40.617 -40.906 -41.198 -41.486 -41.768 -42.059 -42.253 -42.456 -42.806 -43.059 -43.312 -43.442 -43.705 -43.964 -44.238 -44.382 -44.653 -44.845 -45.013 -45.178 -45.533 -45.725 -45.932 -46.167 -46.447 -46.753 -47.093 -47.833 -3 ,13347 ,TETRA ,17617189,Tue Nov 30 03:19:29 CET,Tue Nov 30 05:07:18 CET,0.0 0.779 1.003 1.191 1.326 1.405 1.486 1.562 1.671 1.73 1.8 1.835 1.96 1.993 2.073 2.159 2.226 2.247 2.299 2.344 2.357 2.355 2.357 2.365 2.359 2.344 2.344 2.345 2.315 2.262 2.199 2.119 2.031 1.947 1.852 1.709 1.564 1.395 1.181 0.939 0.65 0.27 -0.234 -0.796 -1.518 -2.375 -3.483 -4.913 -6.823 -9.537 -13.714 -18.221 -21.555 -24.176 -26.303 -28.072 -29.559 -30.835 -31.869 -32.874 -33.715 -34.446 -35.129 -35.756 -36.336 -36.858 -37.381 -37.832 -38.253 -38.731 -39.188 -39.522 -39.86 -40.217 -40.493 -40.769 -41.049 -41.339 -41.651 -41.858 -42.067 -42.407 -42.649 -42.912 -43.043 -43.292 -43.554 -43.824 -43.95 -44.208 -44.355 -44.503 -44.663 -45.02 -45.214 -45.411 -45.623 -45.856 -46.11 -46.443 -47.672 -4 ,28867 ,TETRA ,17617190,Tue Nov 30 03:19:29 CET,Tue Nov 30 05:07:09 CET,0.0 0.471 0.706 0.844 0.94 1.023 1.093 1.152 1.257 1.297 1.333 1.322 1.429 1.45 1.496 1.53 1.559 1.571 1.586 1.601 1.611 1.618 1.617 1.604 1.584 1.56 1.535 1.499 1.445 1.399 1.357 1.297 1.211 1.107 0.98 0.826 0.67 0.541 0.378 0.104 -0.197 -0.567 -1.071 -1.626 -2.328 -3.193 -4.331 -5.794 -7.744 -10.449 -14.599 -19.017 -22.33 -24.936 -27.023 -28.799 -30.276 -31.554 -32.63 -33.672 -34.532 -35.266 -35.944 -36.564 -37.116 -37.615 -38.134 -38.581 -38.955 -39.352 -39.778 -40.113 -40.453 -40.815 -41.11 -41.424 -41.748 -42.086 -42.433 -42.663 -42.869 -43.181 -43.418 -43.659 -43.791 -44.076 -44.35 -44.6 -44.729 -45.006 -45.176 -45.338 -45.506 -45.862 -46.058 -46.271 -46.498 -46.749 -47.044 -47.398 -48.237 -5 ,15030 ,TETRA ,17617191,Tue Nov 30 03:19:29 CET,Tue Nov 30 05:07:52 CET,0.0 0.524 0.715 0.862 1.001 1.113 1.203 1.297 1.484 1.557 1.61 1.61 1.729 1.758 1.812 1.881 1.929 1.945 1.97 1.989 2.054 2.1 2.13 2.162 2.163 2.137 2.111 2.081 2.077 2.104 2.111 2.062 1.972 1.915 1.881 1.781 1.63 1.432 1.184 0.957 0.703 0.33 -0.161 -0.703 -1.405 -2.28 -3.403 -4.863 -6.827 -9.614 -13.8 -18.205 -21.516 -24.108 -26.21 -28.01 -29.486 -30.758 -31.82 -32.846 -33.702 -34.448 -35.13 -35.781 -36.374 -36.883 -37.408 -37.866 -38.26 -38.661 -39.067 -39.403 -39.748 -40.093 -40.357 -40.624 -40.898 -41.184 -41.482 -41.682 -41.881 -42.178 -42.382 -42.598 -42.71 -42.934 -43.152 -43.391 -43.532 -43.81 -43.988 -44.142 -44.306 -44.667 -44.858 -45.045 -45.25 -45.482 -45.751 -46.126 -47.044 -6 ,23362 ,TETRA ,17617192,Tue Nov 30 03:19:29 CET,Tue Nov 30 05:08:58 CET,0.0 0.497 0.687 0.834 0.957 1.043 1.123 1.211 1.369 1.435 1.481 1.48 1.595 1.627 1.694 1.754 1.808 1.829 1.874 1.911 1.935 1.949 1.957 1.975 1.999 2.01 2.031 2.053 2.072 2.087 2.095 2.089 2.068 2.03 1.977 1.876 1.748 1.604 1.416 1.164 0.856 0.486 -0.004 -0.56 -1.265 -2.132 -3.251 -4.65 -6.567 -9.319 -13.452 -17.839 -21.11 -23.705 -25.814 -27.57 -29.03 -30.303 -31.334 -32.329 -33.172 -33.906 -34.595 -35.23 -35.797 -36.288 -36.786 -37.231 -37.616 -38.006 -38.39 -38.7 -39.031 -39.359 -39.615 -39.907 -40.224 -40.515 -40.777 -40.964 -41.159 -41.443 -41.632 -41.834 -41.942 -42.176 -42.433 -42.7 -42.832 -43.091 -43.236 -43.379 -43.524 -43.833 -44.001 -44.184 -44.401 -44.669 -44.932 -45.227 -45.982 -7 ,10368 ,TETRA ,17617193,Tue Nov 30 03:19:29 CET,Tue Nov 30 05:07:10 CET,0.0 0.626 0.87 1.007 1.125 1.254 1.353 1.408 1.529 1.592 1.64 1.635 1.747 1.771 1.809 1.844 1.868 1.875 1.896 1.922 1.956 1.968 1.969 1.965 1.986 2.017 2.038 2.032 1.98 1.941 1.938 1.916 1.879 1.808 1.663 1.503 1.36 1.185 0.969 0.706 0.419 0.07 -0.409 -0.94 -1.579 -2.39 -3.508 -4.968 -6.992 -9.801 -14.026 -18.573 -22.02 -24.817 -27.026 -28.864 -30.464 -31.872 -33.004 -34.059 -34.941 -35.69 -36.358 -37.039 -37.681 -38.234 -38.832 -39.386 -39.869 -40.337 -40.788 -41.13 -41.457 -41.795 -42.068 -42.368 -42.671 -42.958 -43.254 -43.463 -43.676 -44.025 -44.287 -44.557 -44.689 -44.941 -45.182 -45.435 -45.574 -45.86 -46.052 -46.222 -46.391 -46.743 -46.943 -47.151 -47.374 -47.602 -47.839 -48.135 -49.049 -8 ,21101 ,TETRA ,17617194,Tue Nov 30 03:19:30 CET,Tue Nov 30 04:59:53 CET,0.0 0.487 0.69 0.831 0.963 1.071 1.144 1.22 1.327 1.369 1.421 1.458 1.599 1.653 1.739 1.812 1.868 1.887 1.906 1.924 1.949 1.952 1.957 1.974 1.977 1.976 1.992 2.015 2.016 1.985 1.936 1.856 1.766 1.672 1.546 1.392 1.227 1.033 0.827 0.583 0.296 -0.066 -0.549 -1.087 -1.782 -2.646 -3.75 -5.171 -7.144 -9.889 -14.016 -18.499 -21.799 -24.393 -26.507 -28.273 -29.733 -31.01 -32.071 -33.118 -33.994 -34.744 -35.447 -36.098 -36.685 -37.201 -37.721 -38.169 -38.547 -38.966 -39.393 -39.711 -40.025 -40.347 -40.598 -40.854 -41.107 -41.377 -41.666 -41.863 -42.058 -42.365 -42.599 -42.839 -42.962 -43.219 -43.466 -43.721 -43.858 -44.122 -44.258 -44.414 -44.593 -44.929 -45.107 -45.294 -45.515 -45.796 -46.084 -46.425 -47.42 -9 ,1473 ,TETRA ,17617195,Tue Nov 30 03:19:30 CET,Tue Nov 30 05:07:44 CET,0.0 0.548 0.78 0.956 1.08 1.168 1.231 1.291 1.42 1.481 1.535 1.536 1.651 1.686 1.757 1.834 1.886 1.901 1.943 1.988 2.051 2.077 2.085 2.083 2.075 2.075 2.079 2.062 2.017 1.975 1.951 1.916 1.85 1.776 1.66 1.514 1.375 1.21 1.01 0.769 0.482 0.108 -0.385 -0.933 -1.625 -2.44 -3.496 -4.903 -6.849 -9.651 -13.894 -18.373 -21.746 -24.385 -26.47 -28.275 -29.804 -31.085 -32.136 -33.151 -34.007 -34.779 -35.484 -36.102 -36.665 -37.209 -37.781 -38.251 -38.672 -39.153 -39.619 -39.957 -40.318 -40.708 -41.017 -41.342 -41.692 -42.036 -42.36 -42.59 -42.835 -43.185 -43.391 -43.613 -43.744 -44.025 -44.317 -44.616 -44.775 -45.064 -45.248 -45.416 -45.596 -45.972 -46.161 -46.337 -46.544 -46.789 -47.07 -47.45 -48.38 -10 ,12275 ,TETRA ,17617196,Tue Nov 30 03:19:30 CET,Tue Nov 30 05:08:28 CET,0.0 0.645 0.939 1.132 1.279 1.383 1.468 1.543 1.681 1.74 1.795 1.81 1.937 1.983 2.09 2.183 2.236 2.256 2.305 2.348 2.387 2.403 2.407 2.414 2.423 2.418 2.391 2.368 2.343 2.309 2.269 2.215 2.156 2.093 1.996 1.869 1.74 1.564 1.346 1.086 0.77 0.404 -0.066 -0.601 -1.277 -2.139 -3.308 -4.814 -6.786 -9.554 -13.81 -18.346 -21.725 -24.424 -26.596 -28.436 -29.963 -31.251 -32.315 -33.345 -34.212 -34.968 -35.681 -36.343 -36.951 -37.543 -38.141 -38.628 -39.079 -39.576 -40.075 -40.493 -40.922 -41.359 -41.696 -42.019 -42.328 -42.647 -42.974 -43.188 -43.423 -43.823 -44.111 -44.398 -44.537 -44.822 -45.114 -45.418 -45.585 -45.882 -46.09 -46.279 -46.484 -46.904 -47.123 -47.355 -47.588 -47.854 -48.157 -48.559 -49.556 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_1_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_1_61.txt deleted file mode 100644 index bba01441..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_1_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17443 ,TETRA ,17617197,Tue Nov 30 03:19:31 CET,Tue Nov 30 05:06:58 CET,0.0 0.745 0.962 1.127 1.259 1.364 1.434 1.501 1.649 1.712 1.766 1.796 1.895 1.928 1.986 2.049 2.094 2.107 2.127 2.146 2.161 2.17 2.183 2.201 2.223 2.227 2.202 2.171 2.142 2.098 2.067 2.051 2.023 1.997 1.917 1.782 1.629 1.486 1.334 1.082 0.801 0.441 -0.035 -0.539 -1.207 -2.039 -3.098 -4.497 -6.453 -9.178 -13.337 -17.894 -21.202 -23.713 -25.724 -27.42 -28.919 -30.206 -31.259 -32.32 -33.231 -34.011 -34.703 -35.336 -35.918 -36.466 -37.006 -37.475 -37.914 -38.364 -38.801 -39.135 -39.482 -39.837 -40.091 -40.364 -40.662 -40.979 -41.303 -41.524 -41.757 -42.123 -42.373 -42.616 -42.742 -42.995 -43.242 -43.498 -43.636 -43.885 -44.072 -44.236 -44.404 -44.752 -44.938 -45.141 -45.368 -45.611 -45.899 -46.272 -47.157 -2 ,20416 ,TETRA ,17617198,Tue Nov 30 03:20:27 CET,Tue Nov 30 05:10:04 CET,0.0 0.764 1.048 1.254 1.413 1.54 1.656 1.766 1.93 1.988 2.038 2.065 2.174 2.231 2.318 2.36 2.395 2.416 2.449 2.472 2.506 2.517 2.526 2.549 2.571 2.589 2.606 2.605 2.603 2.594 2.547 2.487 2.455 2.419 2.321 2.18 2.034 1.851 1.627 1.366 1.067 0.697 0.219 -0.319 -1.005 -1.846 -2.959 -4.392 -6.329 -9.055 -13.099 -17.383 -20.623 -23.198 -25.284 -27.061 -28.559 -29.877 -30.962 -32.003 -32.86 -33.584 -34.247 -34.855 -35.412 -35.917 -36.431 -36.881 -37.27 -37.664 -38.055 -38.372 -38.713 -39.072 -39.343 -39.623 -39.906 -40.193 -40.51 -40.74 -40.968 -41.318 -41.561 -41.815 -41.948 -42.216 -42.486 -42.766 -42.907 -43.151 -43.337 -43.498 -43.662 -44.027 -44.237 -44.444 -44.661 -44.923 -45.269 -45.725 -46.633 -3 ,13990 ,TETRA ,17617199,Tue Nov 30 03:29:13 CET,Tue Nov 30 05:18:16 CET,0.0 0.772 0.985 1.144 1.267 1.357 1.446 1.541 1.696 1.754 1.816 1.852 1.952 2.002 2.103 2.182 2.239 2.265 2.322 2.375 2.426 2.45 2.485 2.514 2.519 2.519 2.499 2.476 2.43 2.38 2.331 2.262 2.187 2.103 2.006 1.881 1.752 1.589 1.379 1.122 0.803 0.429 -0.037 -0.568 -1.266 -2.141 -3.278 -4.707 -6.668 -9.428 -13.519 -17.899 -21.158 -23.735 -25.871 -27.726 -29.343 -30.699 -31.754 -32.77 -33.652 -34.417 -35.076 -35.671 -36.233 -36.748 -37.266 -37.729 -38.126 -38.519 -38.948 -39.3 -39.663 -40.064 -40.374 -40.688 -40.989 -41.284 -41.582 -41.78 -41.979 -42.281 -42.499 -42.723 -42.844 -43.091 -43.335 -43.593 -43.725 -43.974 -44.171 -44.329 -44.499 -44.869 -45.066 -45.268 -45.487 -45.746 -46.042 -46.395 -47.652 -4 ,24187 ,TETRA ,17617200,Tue Nov 30 03:29:14 CET,Tue Nov 30 05:14:46 CET,0.0 0.792 1.013 1.159 1.293 1.412 1.505 1.588 1.755 1.837 1.906 1.958 2.066 2.105 2.182 2.271 2.339 2.36 2.393 2.42 2.456 2.479 2.495 2.507 2.508 2.49 2.477 2.471 2.427 2.376 2.34 2.283 2.221 2.157 2.063 1.933 1.772 1.587 1.396 1.159 0.869 0.508 0.054 -0.474 -1.167 -2.006 -3.109 -4.544 -6.446 -9.118 -13.252 -17.661 -20.997 -23.673 -25.834 -27.669 -29.145 -30.427 -31.492 -32.484 -33.344 -34.137 -34.91 -35.647 -36.322 -36.889 -37.452 -37.952 -38.356 -38.75 -39.155 -39.488 -39.83 -40.2 -40.49 -40.776 -41.056 -41.345 -41.646 -41.856 -42.072 -42.415 -42.657 -42.889 -43.001 -43.243 -43.516 -43.791 -43.927 -44.17 -44.35 -44.51 -44.681 -45.047 -45.238 -45.438 -45.658 -45.902 -46.19 -46.546 -47.341 -5 ,20114 ,TETRA ,17617201,Tue Nov 30 03:34:29 CET,Tue Nov 30 05:23:53 CET,0.0 1.065 1.312 1.511 1.668 1.787 1.886 1.971 2.108 2.172 2.249 2.315 2.417 2.45 2.509 2.571 2.644 2.683 2.746 2.797 2.869 2.896 2.916 2.938 2.932 2.92 2.931 2.968 2.993 2.988 2.97 2.924 2.853 2.783 2.742 2.657 2.528 2.416 2.248 2.026 1.751 1.365 0.878 0.328 -0.408 -1.271 -2.36 -3.794 -5.76 -8.505 -12.507 -16.735 -19.968 -22.591 -24.698 -26.481 -27.994 -29.284 -30.344 -31.379 -32.244 -33.017 -33.74 -34.414 -35.034 -35.589 -36.121 -36.563 -36.948 -37.338 -37.726 -38.041 -38.376 -38.747 -39.022 -39.289 -39.561 -39.85 -40.182 -40.414 -40.649 -40.998 -41.224 -41.458 -41.587 -41.866 -42.159 -42.442 -42.587 -42.851 -43.073 -43.249 -43.436 -43.818 -44.013 -44.221 -44.452 -44.711 -45.023 -45.454 -46.359 -6 ,23482 ,TETRA ,17617202,Tue Nov 30 03:35:25 CET,Tue Nov 30 05:25:02 CET,0.0 0.788 1.044 1.238 1.396 1.518 1.608 1.696 1.856 1.918 1.978 2.024 2.13 2.176 2.264 2.338 2.405 2.433 2.467 2.492 2.548 2.585 2.598 2.597 2.583 2.562 2.54 2.519 2.491 2.459 2.426 2.387 2.332 2.285 2.24 2.146 2.01 1.826 1.607 1.353 1.063 0.695 0.193 -0.362 -1.053 -1.927 -3.042 -4.46 -6.419 -9.141 -13.185 -17.588 -20.898 -23.462 -25.53 -27.3 -28.783 -30.028 -31.078 -32.134 -33.01 -33.772 -34.488 -35.146 -35.737 -36.261 -36.793 -37.26 -37.663 -38.064 -38.473 -38.801 -39.12 -39.462 -39.73 -40.001 -40.292 -40.59 -40.877 -41.081 -41.298 -41.635 -41.884 -42.144 -42.266 -42.513 -42.786 -43.076 -43.217 -43.465 -43.656 -43.811 -43.987 -44.391 -44.609 -44.827 -45.051 -45.296 -45.569 -45.958 -47.106 -7 ,2734 ,TETRA ,17617203,Tue Nov 30 03:36:19 CET,Tue Nov 30 05:25:10 CET,0.0 0.659 0.936 1.139 1.29 1.401 1.496 1.579 1.723 1.792 1.857 1.91 2.025 2.076 2.172 2.249 2.313 2.34 2.395 2.445 2.5 2.518 2.532 2.553 2.555 2.558 2.581 2.597 2.61 2.6 2.556 2.482 2.409 2.333 2.218 2.07 1.921 1.741 1.552 1.342 1.047 0.688 0.249 -0.243 -0.91 -1.764 -2.848 -4.234 -6.151 -8.829 -12.86 -17.297 -20.601 -23.162 -25.263 -27.085 -28.676 -30.018 -31.067 -32.075 -32.931 -33.704 -34.419 -35.058 -35.625 -36.128 -36.659 -37.135 -37.524 -37.947 -38.422 -38.794 -39.158 -39.516 -39.79 -40.069 -40.347 -40.638 -40.934 -41.136 -41.344 -41.649 -41.856 -42.085 -42.208 -42.471 -42.752 -43.032 -43.179 -43.44 -43.651 -43.826 -44.002 -44.363 -44.562 -44.775 -45.0 -45.257 -45.555 -45.917 -46.778 -8 ,20002 ,TETRA ,17617204,Tue Nov 30 03:38:19 CET,Tue Nov 30 05:26:14 CET,0.0 1.092 1.348 1.521 1.634 1.725 1.807 1.887 2.06 2.136 2.208 2.261 2.362 2.411 2.49 2.531 2.569 2.591 2.634 2.681 2.742 2.77 2.795 2.839 2.875 2.88 2.862 2.837 2.797 2.749 2.692 2.632 2.594 2.538 2.429 2.282 2.119 1.958 1.769 1.503 1.22 0.868 0.383 -0.168 -0.862 -1.704 -2.805 -4.192 -6.09 -8.818 -12.945 -17.276 -20.497 -23.115 -25.244 -27.012 -28.488 -29.762 -30.826 -31.864 -32.742 -33.503 -34.188 -34.796 -35.356 -35.869 -36.403 -36.874 -37.27 -37.686 -38.132 -38.513 -38.901 -39.296 -39.584 -39.863 -40.162 -40.471 -40.792 -41.012 -41.232 -41.572 -41.799 -42.037 -42.167 -42.429 -42.694 -42.962 -43.098 -43.356 -43.556 -43.711 -43.862 -44.169 -44.342 -44.526 -44.736 -44.97 -45.239 -45.581 -46.568 -9 ,25046 ,TETRA ,17617205,Tue Nov 30 03:42:28 CET,Tue Nov 30 05:31:33 CET,0.0 0.65 0.902 1.072 1.211 1.323 1.408 1.488 1.638 1.7 1.761 1.807 1.912 1.953 2.036 2.109 2.176 2.206 2.254 2.29 2.346 2.383 2.423 2.458 2.463 2.451 2.428 2.407 2.399 2.392 2.374 2.331 2.253 2.157 2.038 1.909 1.788 1.63 1.414 1.162 0.896 0.563 0.119 -0.376 -1.051 -1.901 -3.02 -4.476 -6.415 -9.09 -13.108 -17.438 -20.685 -23.238 -25.31 -27.098 -28.594 -29.883 -30.968 -32.019 -32.877 -33.606 -34.281 -34.894 -35.492 -36.034 -36.569 -37.039 -37.457 -37.88 -38.292 -38.638 -39.013 -39.405 -39.702 -39.989 -40.28 -40.601 -40.925 -41.136 -41.353 -41.703 -41.939 -42.173 -42.296 -42.555 -42.822 -43.099 -43.242 -43.496 -43.693 -43.853 -44.021 -44.378 -44.568 -44.76 -44.955 -45.181 -45.434 -45.764 -46.854 -10 ,18033 ,TETRA ,17617206,Tue Nov 30 03:43:26 CET,Tue Nov 30 05:31:35 CET,0.0 0.634 0.865 1.019 1.16 1.268 1.362 1.459 1.643 1.711 1.769 1.827 1.941 1.976 2.029 2.071 2.111 2.134 2.178 2.223 2.303 2.352 2.38 2.404 2.431 2.464 2.489 2.481 2.452 2.423 2.403 2.364 2.274 2.192 2.099 1.953 1.79 1.614 1.414 1.166 0.917 0.653 0.244 -0.272 -0.941 -1.801 -2.911 -4.326 -6.309 -9.066 -13.131 -17.561 -20.885 -23.49 -25.593 -27.401 -28.934 -30.246 -31.304 -32.307 -33.168 -33.929 -34.609 -35.265 -35.876 -36.397 -36.931 -37.406 -37.818 -38.235 -38.683 -39.046 -39.42 -39.824 -40.123 -40.42 -40.733 -41.052 -41.372 -41.584 -41.792 -42.129 -42.356 -42.579 -42.693 -42.931 -43.193 -43.471 -43.606 -43.856 -44.051 -44.207 -44.364 -44.683 -44.875 -45.086 -45.312 -45.567 -45.865 -46.226 -47.11 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_1_84.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_1_84.txt deleted file mode 100644 index 321e3e0b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_1_84.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13228 ,TETRA ,17617207,Tue Nov 30 03:44:27 CET,Tue Nov 30 05:33:05 CET,0.0 0.672 0.893 1.073 1.235 1.36 1.465 1.561 1.744 1.83 1.909 1.988 2.112 2.172 2.309 2.435 2.547 2.597 2.685 2.773 2.89 2.956 3.018 3.11 3.195 3.273 3.347 3.408 3.477 3.549 3.618 3.691 3.747 3.801 3.859 3.919 3.974 4.027 4.085 4.134 4.163 4.179 4.198 4.177 4.105 4.002 3.811 3.478 2.919 2.037 0.52 -1.422 -3.029 -4.447 -5.645 -6.637 -7.477 -8.246 -8.935 -9.648 -10.266 -10.821 -11.345 -11.82 -12.266 -12.653 -13.046 -13.396 -13.681 -13.982 -14.305 -14.589 -14.879 -15.17 -15.389 -15.612 -15.849 -16.075 -16.3 -16.46 -16.636 -16.93 -17.144 -17.346 -17.442 -17.648 -17.872 -18.118 -18.244 -18.449 -18.646 -18.798 -18.95 -19.279 -19.465 -19.658 -19.878 -20.14 -20.432 -20.784 -21.519 -2 ,6594 ,TETRA ,17617208,Tue Nov 30 03:52:26 CET,Tue Nov 30 05:42:10 CET,0.0 0.743 1.046 1.241 1.401 1.544 1.657 1.757 1.955 2.05 2.134 2.211 2.329 2.382 2.486 2.581 2.673 2.719 2.804 2.882 3.004 3.087 3.166 3.263 3.353 3.44 3.523 3.601 3.688 3.769 3.85 3.947 4.038 4.119 4.184 4.252 4.315 4.372 4.425 4.457 4.474 4.497 4.505 4.478 4.435 4.352 4.195 3.842 3.218 2.279 0.565 -1.582 -3.3 -4.703 -5.876 -6.899 -7.813 -8.649 -9.372 -10.122 -10.755 -11.327 -11.892 -12.39 -12.824 -13.225 -13.651 -14.044 -14.382 -14.717 -15.052 -15.325 -15.611 -15.896 -16.13 -16.385 -16.65 -16.918 -17.186 -17.37 -17.545 -17.819 -18.012 -18.199 -18.295 -18.509 -18.741 -18.978 -19.106 -19.322 -19.499 -19.634 -19.777 -20.095 -20.279 -20.481 -20.692 -20.935 -21.236 -21.613 -22.463 -3 ,2560 ,TETRA ,17617209,Tue Nov 30 03:53:25 CET,Tue Nov 30 05:39:21 CET,0.0 0.657 0.878 1.074 1.239 1.377 1.502 1.623 1.821 1.895 1.97 2.05 2.168 2.228 2.351 2.458 2.556 2.6 2.678 2.755 2.862 2.931 3.005 3.106 3.199 3.274 3.35 3.431 3.517 3.592 3.666 3.756 3.831 3.889 3.955 4.027 4.084 4.142 4.202 4.252 4.292 4.331 4.347 4.32 4.284 4.223 4.064 3.76 3.211 2.237 0.583 -1.376 -2.958 -4.294 -5.46 -6.488 -7.395 -8.265 -8.997 -9.705 -10.31 -10.804 -11.289 -11.761 -12.171 -12.544 -12.959 -13.335 -13.643 -13.938 -14.273 -14.567 -14.853 -15.156 -15.39 -15.623 -15.871 -16.14 -16.416 -16.598 -16.774 -17.046 -17.242 -17.455 -17.566 -17.795 -18.033 -18.276 -18.399 -18.603 -18.777 -18.926 -19.077 -19.386 -19.555 -19.747 -19.981 -20.232 -20.515 -20.97 -22.172 -4 ,192 ,TETRA ,17617210,Tue Nov 30 03:55:26 CET,Tue Nov 30 05:42:50 CET,0.0 0.843 1.11 1.308 1.468 1.601 1.714 1.818 1.999 2.081 2.173 2.268 2.397 2.466 2.592 2.724 2.846 2.895 2.984 3.077 3.214 3.297 3.365 3.449 3.527 3.599 3.672 3.748 3.834 3.908 3.977 4.054 4.124 4.185 4.253 4.339 4.417 4.489 4.558 4.625 4.686 4.717 4.71 4.692 4.647 4.564 4.383 4.074 3.549 2.554 0.718 -1.47 -3.137 -4.599 -5.84 -6.905 -7.895 -8.759 -9.484 -10.21 -10.823 -11.364 -11.86 -12.338 -12.807 -13.229 -13.648 -13.998 -14.295 -14.6 -14.939 -15.228 -15.513 -15.816 -16.041 -16.262 -16.495 -16.751 -17.028 -17.218 -17.408 -17.684 -17.88 -18.088 -18.195 -18.419 -18.65 -18.896 -19.026 -19.248 -19.465 -19.612 -19.764 -20.115 -20.303 -20.514 -20.756 -21.017 -21.311 -21.695 -22.789 -5 ,7295 ,TETRA ,17617211,Tue Nov 30 03:56:24 CET,Tue Nov 30 05:43:18 CET,0.0 0.6 0.872 1.065 1.201 1.333 1.457 1.561 1.741 1.822 1.904 1.983 2.109 2.17 2.282 2.396 2.494 2.542 2.637 2.728 2.851 2.926 2.994 3.082 3.155 3.223 3.304 3.377 3.461 3.527 3.586 3.66 3.717 3.78 3.852 3.915 3.959 3.996 4.03 4.061 4.071 4.051 4.026 3.984 3.905 3.761 3.49 3.048 2.338 1.252 -0.635 -3.012 -5.008 -6.609 -7.921 -9.114 -10.13 -11.026 -11.831 -12.679 -13.387 -13.991 -14.557 -15.099 -15.61 -16.057 -16.542 -16.965 -17.307 -17.667 -18.044 -18.358 -18.708 -19.078 -19.342 -19.615 -19.897 -20.192 -20.496 -20.706 -20.914 -21.235 -21.469 -21.714 -21.833 -22.067 -22.321 -22.602 -22.752 -22.996 -23.221 -23.382 -23.556 -23.926 -24.113 -24.317 -24.558 -24.827 -25.121 -25.457 -26.598 -6 ,30279 ,TETRA ,17617212,Tue Nov 30 03:56:23 CET,Tue Nov 30 05:47:24 CET,0.0 0.929 1.191 1.369 1.501 1.623 1.757 1.876 2.062 2.138 2.212 2.291 2.422 2.485 2.614 2.75 2.86 2.907 2.995 3.081 3.192 3.257 3.325 3.421 3.51 3.595 3.682 3.756 3.839 3.921 3.995 4.081 4.158 4.229 4.295 4.352 4.399 4.442 4.468 4.503 4.526 4.523 4.516 4.488 4.434 4.306 4.053 3.668 3.072 2.171 0.756 -1.094 -2.706 -4.055 -5.229 -6.325 -7.304 -8.17 -8.909 -9.611 -10.202 -10.747 -11.275 -11.778 -12.25 -12.663 -13.077 -13.448 -13.76 -14.087 -14.442 -14.739 -15.047 -15.35 -15.573 -15.809 -16.061 -16.314 -16.56 -16.737 -16.937 -17.238 -17.432 -17.631 -17.741 -17.969 -18.199 -18.457 -18.594 -18.822 -19.039 -19.19 -19.342 -19.672 -19.859 -20.05 -20.265 -20.527 -20.82 -21.172 -22.162 -7 ,6979 ,TETRA ,17617213,Tue Nov 30 04:01:20 CET,Tue Nov 30 05:37:50 CET,0.0 0.676 0.931 1.112 1.256 1.395 1.519 1.62 1.801 1.891 1.971 2.046 2.172 2.238 2.357 2.456 2.553 2.602 2.7 2.791 2.923 3.007 3.076 3.168 3.258 3.343 3.418 3.48 3.56 3.637 3.705 3.778 3.845 3.915 4.001 4.087 4.144 4.189 4.231 4.265 4.29 4.294 4.258 4.207 4.1 3.922 3.665 3.267 2.644 1.57 -0.296 -2.506 -4.324 -5.879 -7.198 -8.391 -9.393 -10.292 -11.111 -11.91 -12.602 -13.189 -13.732 -14.26 -14.756 -15.209 -15.659 -16.067 -16.433 -16.818 -17.215 -17.526 -17.843 -18.176 -18.418 -18.672 -18.94 -19.228 -19.535 -19.742 -19.952 -20.263 -20.474 -20.705 -20.828 -21.088 -21.356 -21.61 -21.737 -21.96 -22.181 -22.34 -22.503 -22.884 -23.09 -23.298 -23.524 -23.773 -24.067 -24.47 -25.94 -8 ,3199 ,TETRA ,17617214,Tue Nov 30 04:02:21 CET,Tue Nov 30 05:48:00 CET,0.0 0.888 1.145 1.329 1.503 1.669 1.815 1.941 2.145 2.23 2.305 2.388 2.512 2.57 2.675 2.768 2.851 2.889 2.969 3.047 3.153 3.234 3.313 3.406 3.488 3.563 3.628 3.681 3.746 3.821 3.909 4.006 4.081 4.156 4.238 4.324 4.396 4.453 4.508 4.549 4.585 4.601 4.592 4.582 4.539 4.432 4.218 3.884 3.282 2.227 0.477 -1.707 -3.516 -5.005 -6.271 -7.45 -8.459 -9.307 -10.049 -10.787 -11.412 -11.975 -12.497 -12.97 -13.409 -13.81 -14.238 -14.642 -14.984 -15.346 -15.734 -16.048 -16.36 -16.668 -16.906 -17.16 -17.413 -17.667 -17.93 -18.107 -18.294 -18.59 -18.798 -19.019 -19.134 -19.37 -19.6 -19.843 -19.995 -20.242 -20.463 -20.62 -20.792 -21.139 -21.32 -21.522 -21.733 -21.971 -22.275 -22.665 -23.828 -9 ,14271 ,TETRA ,17617215,Tue Nov 30 04:02:21 CET,Tue Nov 30 05:48:22 CET,0.0 0.957 1.217 1.439 1.61 1.752 1.897 1.999 2.165 2.241 2.31 2.357 2.475 2.529 2.624 2.712 2.793 2.837 2.928 3.01 3.118 3.179 3.235 3.326 3.406 3.472 3.543 3.609 3.677 3.729 3.78 3.836 3.889 3.956 4.026 4.079 4.112 4.154 4.185 4.205 4.227 4.196 4.147 4.101 4.017 3.886 3.667 3.31 2.664 1.628 -0.107 -2.255 -4.025 -5.493 -6.812 -7.998 -8.975 -9.862 -10.613 -11.381 -12.047 -12.615 -13.158 -13.658 -14.112 -14.518 -14.929 -15.286 -15.596 -15.922 -16.264 -16.552 -16.841 -17.127 -17.338 -17.566 -17.81 -18.059 -18.314 -18.483 -18.667 -18.948 -19.134 -19.342 -19.452 -19.664 -19.886 -20.124 -20.243 -20.453 -20.647 -20.805 -20.969 -21.303 -21.488 -21.674 -21.877 -22.13 -22.398 -22.728 -23.773 -10 ,20302 ,TETRA ,17617216,Tue Nov 30 04:03:15 CET,Tue Nov 30 05:50:27 CET,0.0 0.641 0.878 1.047 1.201 1.332 1.446 1.554 1.783 1.879 1.962 2.057 2.183 2.245 2.355 2.456 2.547 2.592 2.676 2.753 2.851 2.917 2.991 3.083 3.167 3.251 3.323 3.385 3.473 3.56 3.634 3.715 3.801 3.882 3.957 4.027 4.087 4.145 4.202 4.263 4.326 4.367 4.348 4.303 4.245 4.132 3.924 3.59 3.069 2.183 0.574 -1.408 -3.05 -4.419 -5.606 -6.717 -7.716 -8.629 -9.411 -10.173 -10.81 -11.385 -11.927 -12.415 -12.864 -13.263 -13.655 -13.993 -14.296 -14.618 -14.959 -15.247 -15.532 -15.809 -16.037 -16.272 -16.495 -16.734 -16.993 -17.178 -17.371 -17.668 -17.874 -18.078 -18.19 -18.439 -18.68 -18.917 -19.044 -19.257 -19.468 -19.629 -19.787 -20.115 -20.291 -20.476 -20.679 -20.925 -21.219 -21.572 -22.4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_206_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_206_163.txt deleted file mode 100644 index 98d8a827..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_206_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5548 ,TETRA ,17617217,Tue Nov 30 04:04:15 CET,Tue Nov 30 05:54:57 CET,0.0 0.578 0.784 0.971 1.124 1.25 1.373 1.485 1.666 1.751 1.842 1.882 2.061 2.115 2.219 2.334 2.442 2.49 2.584 2.68 2.806 2.899 2.998 3.13 3.233 3.309 3.369 3.424 3.519 3.627 3.719 3.846 3.972 4.071 4.15 4.197 4.236 4.257 4.269 4.279 4.265 4.237 4.176 4.076 3.929 3.757 3.483 3.036 2.38 1.387 -0.261 -2.231 -3.859 -5.21 -6.347 -7.359 -8.215 -8.959 -9.573 -10.186 -10.721 -11.245 -11.795 -12.257 -12.643 -13.008 -13.433 -13.833 -14.149 -14.483 -14.869 -15.173 -15.504 -15.853 -16.099 -16.327 -16.557 -16.815 -17.091 -17.28 -17.465 -17.747 -17.927 -18.114 -18.218 -18.444 -18.683 -18.909 -19.013 -19.264 -19.461 -19.642 -19.826 -20.242 -20.475 -20.719 -20.976 -21.261 -21.58 -21.984 -23.379 -2 ,13997 ,TETRA ,17617218,Tue Nov 30 04:08:14 CET,Tue Nov 30 05:57:13 CET,0.0 0.918 1.239 1.444 1.594 1.727 1.843 1.954 2.168 2.264 2.358 2.423 2.62 2.688 2.791 2.894 3.004 3.046 3.116 3.205 3.324 3.381 3.437 3.527 3.636 3.72 3.781 3.858 3.968 4.058 4.135 4.228 4.306 4.359 4.405 4.433 4.445 4.463 4.477 4.492 4.492 4.471 4.481 4.477 4.358 4.11 3.752 3.272 2.527 1.354 -0.477 -2.691 -4.526 -5.99 -7.184 -8.273 -9.213 -10.018 -10.703 -11.409 -12.015 -12.548 -13.063 -13.553 -14.037 -14.469 -14.888 -15.268 -15.59 -15.931 -16.291 -16.567 -16.856 -17.168 -17.41 -17.687 -17.959 -18.203 -18.479 -18.677 -18.885 -19.223 -19.446 -19.673 -19.791 -20.032 -20.284 -20.569 -20.723 -20.999 -21.169 -21.328 -21.49 -21.86 -22.079 -22.313 -22.561 -22.859 -23.191 -23.563 -24.924 -3 ,80 ,TETRA ,17617219,Tue Nov 30 04:10:19 CET,Tue Nov 30 05:59:27 CET,0.0 0.781 1.028 1.223 1.382 1.536 1.672 1.794 2.01 2.099 2.177 2.218 2.408 2.477 2.614 2.742 2.848 2.907 3.033 3.14 3.267 3.341 3.41 3.504 3.614 3.729 3.831 3.924 4.013 4.064 4.106 4.163 4.233 4.288 4.315 4.354 4.419 4.482 4.506 4.495 4.458 4.398 4.353 4.283 4.14 3.966 3.707 3.31 2.652 1.602 -0.166 -2.241 -3.905 -5.382 -6.616 -7.616 -8.519 -9.388 -10.116 -10.806 -11.406 -11.951 -12.47 -12.924 -13.32 -13.719 -14.158 -14.557 -14.911 -15.281 -15.655 -15.94 -16.228 -16.534 -16.775 -17.024 -17.292 -17.596 -17.926 -18.137 -18.351 -18.681 -18.907 -19.141 -19.268 -19.521 -19.77 -20.08 -20.253 -20.545 -20.741 -20.907 -21.097 -21.563 -21.825 -22.11 -22.428 -22.789 -23.166 -23.701 -25.889 -4 ,30091 ,TETRA ,17617220,Tue Nov 30 04:11:17 CET,Tue Nov 30 05:58:16 CET,0.0 0.689 0.897 1.058 1.179 1.284 1.393 1.492 1.665 1.733 1.796 1.826 2.005 2.073 2.202 2.291 2.349 2.379 2.459 2.553 2.679 2.755 2.834 2.937 3.023 3.088 3.141 3.216 3.32 3.374 3.45 3.58 3.683 3.757 3.819 3.873 3.923 3.962 3.987 4.028 4.054 4.037 3.978 3.949 3.88 3.673 3.372 2.976 2.338 1.293 -0.472 -2.524 -4.086 -5.358 -6.468 -7.461 -8.317 -9.076 -9.736 -10.472 -11.185 -11.8 -12.32 -12.81 -13.318 -13.78 -14.216 -14.604 -14.931 -15.273 -15.659 -15.977 -16.3 -16.626 -16.87 -17.118 -17.38 -17.68 -17.999 -18.214 -18.426 -18.741 -18.944 -19.143 -19.258 -19.511 -19.767 -20.035 -20.188 -20.502 -20.691 -20.845 -20.999 -21.332 -21.536 -21.769 -22.013 -22.295 -22.635 -23.124 -24.357 -5 ,5529 ,TETRA ,17617221,Tue Nov 30 04:12:18 CET,Tue Nov 30 06:02:11 CET,0.0 0.691 0.926 1.101 1.271 1.433 1.565 1.692 1.891 1.965 2.046 2.079 2.26 2.324 2.429 2.518 2.604 2.645 2.719 2.802 2.936 3.027 3.115 3.239 3.348 3.461 3.565 3.639 3.688 3.731 3.782 3.839 3.894 3.943 4.021 4.15 4.221 4.221 4.207 4.197 4.218 4.201 4.115 4.039 3.909 3.695 3.394 2.968 2.311 1.231 -0.672 -2.872 -4.535 -5.917 -7.111 -8.255 -9.223 -10.036 -10.756 -11.536 -12.183 -12.694 -13.159 -13.583 -13.959 -14.307 -14.703 -15.066 -15.369 -15.67 -15.983 -16.25 -16.547 -16.877 -17.129 -17.396 -17.672 -17.918 -18.144 -18.304 -18.483 -18.772 -18.969 -19.161 -19.257 -19.467 -19.71 -19.98 -20.115 -20.398 -20.608 -20.766 -20.927 -21.255 -21.421 -21.609 -21.835 -22.099 -22.41 -22.838 -23.639 -6 ,25680 ,TETRA ,17617222,Tue Nov 30 04:14:19 CET,Tue Nov 30 06:03:12 CET,0.0 0.779 1.036 1.238 1.404 1.544 1.67 1.781 1.965 2.052 2.152 2.22 2.406 2.478 2.606 2.722 2.822 2.869 2.979 3.078 3.219 3.316 3.406 3.514 3.601 3.693 3.787 3.874 3.96 4.011 4.049 4.105 4.173 4.239 4.332 4.431 4.464 4.483 4.505 4.507 4.507 4.542 4.618 4.607 4.454 4.247 3.937 3.461 2.754 1.682 -0.108 -2.225 -3.943 -5.338 -6.491 -7.475 -8.327 -9.102 -9.747 -10.391 -10.946 -11.441 -11.918 -12.371 -12.788 -13.161 -13.577 -13.947 -14.262 -14.595 -14.908 -15.177 -15.493 -15.794 -16.003 -16.227 -16.463 -16.705 -16.965 -17.155 -17.343 -17.65 -17.87 -18.094 -18.21 -18.45 -18.72 -19.0 -19.141 -19.42 -19.631 -19.819 -20.014 -20.447 -20.69 -20.948 -21.233 -21.561 -21.934 -22.38 -23.669 -7 ,6914 ,TETRA ,17617223,Tue Nov 30 04:14:20 CET,Tue Nov 30 06:02:17 CET,0.0 0.598 0.847 1.021 1.176 1.318 1.433 1.535 1.725 1.802 1.867 1.886 2.058 2.124 2.257 2.358 2.455 2.503 2.592 2.679 2.825 2.903 2.957 3.025 3.116 3.218 3.285 3.35 3.466 3.593 3.687 3.778 3.871 3.925 3.972 4.03 4.059 4.072 4.082 4.101 4.1 4.079 4.047 3.975 3.847 3.629 3.317 2.886 2.249 1.215 -0.546 -2.674 -4.367 -5.754 -6.978 -8.084 -9.057 -9.893 -10.585 -11.278 -11.879 -12.426 -12.941 -13.416 -13.845 -14.252 -14.676 -15.027 -15.329 -15.641 -15.936 -16.189 -16.459 -16.722 -16.935 -17.163 -17.398 -17.64 -17.886 -18.06 -18.255 -18.551 -18.732 -18.94 -19.057 -19.299 -19.567 -19.859 -20.006 -20.292 -20.487 -20.64 -20.804 -21.187 -21.417 -21.661 -21.912 -22.176 -22.478 -22.888 -24.18 -8 ,16413 ,TETRA ,17617224,Tue Nov 30 04:14:20 CET,Tue Nov 30 06:03:20 CET,0.0 0.615 0.848 1.035 1.193 1.332 1.458 1.589 1.802 1.883 1.954 1.94 2.095 2.151 2.281 2.404 2.511 2.565 2.657 2.747 2.899 2.997 3.093 3.201 3.288 3.368 3.446 3.527 3.608 3.655 3.701 3.759 3.803 3.838 3.881 3.923 3.976 4.024 4.022 4.025 4.053 4.093 4.067 3.982 3.844 3.571 3.167 2.678 2.043 1.056 -0.659 -2.763 -4.467 -5.835 -7.009 -8.087 -8.996 -9.79 -10.462 -11.122 -11.714 -12.256 -12.749 -13.172 -13.553 -13.914 -14.295 -14.652 -14.977 -15.294 -15.597 -15.856 -16.126 -16.403 -16.622 -16.848 -17.103 -17.385 -17.661 -17.835 -18.006 -18.268 -18.458 -18.657 -18.759 -18.996 -19.258 -19.531 -19.663 -19.926 -20.089 -20.248 -20.41 -20.769 -20.97 -21.211 -21.459 -21.718 -22.077 -22.596 -24.199 -9 ,4468 ,TETRA ,17617225,Tue Nov 30 04:14:20 CET,Tue Nov 30 06:03:08 CET,0.0 0.643 0.933 1.161 1.313 1.454 1.593 1.715 1.891 1.952 2.014 2.041 2.22 2.28 2.372 2.465 2.583 2.634 2.711 2.774 2.892 2.989 3.081 3.21 3.33 3.437 3.54 3.641 3.758 3.854 3.931 4.008 4.059 4.092 4.134 4.186 4.24 4.288 4.317 4.32 4.294 4.259 4.201 4.119 3.966 3.741 3.45 3.038 2.367 1.314 -0.405 -2.537 -4.234 -5.56 -6.721 -7.809 -8.744 -9.564 -10.269 -10.977 -11.569 -12.072 -12.553 -13.022 -13.438 -13.789 -14.155 -14.489 -14.769 -15.062 -15.379 -15.646 -15.923 -16.214 -16.438 -16.661 -16.887 -17.129 -17.379 -17.564 -17.771 -18.083 -18.295 -18.516 -18.63 -18.873 -19.101 -19.315 -19.432 -19.707 -19.89 -20.069 -20.256 -20.615 -20.818 -21.022 -21.222 -21.447 -21.726 -22.11 -23.009 -10 ,21445 ,TETRA ,17617226,Tue Nov 30 04:14:20 CET,Tue Nov 30 06:02:31 CET,0.0 0.68 0.913 1.065 1.184 1.28 1.374 1.464 1.616 1.69 1.764 1.775 1.946 2.012 2.144 2.249 2.351 2.408 2.493 2.556 2.635 2.678 2.722 2.787 2.865 2.958 3.03 3.105 3.228 3.339 3.442 3.546 3.622 3.684 3.729 3.755 3.776 3.837 3.905 3.922 3.935 3.958 3.932 3.848 3.695 3.462 3.154 2.736 2.103 1.083 -0.687 -2.819 -4.506 -5.907 -7.102 -8.112 -8.979 -9.761 -10.446 -11.132 -11.71 -12.264 -12.8 -13.251 -13.641 -14.034 -14.475 -14.851 -15.159 -15.471 -15.794 -16.068 -16.372 -16.706 -16.94 -17.167 -17.434 -17.73 -18.032 -18.239 -18.447 -18.769 -18.981 -19.199 -19.323 -19.589 -19.859 -20.156 -20.32 -20.616 -20.826 -21.004 -21.198 -21.602 -21.821 -22.061 -22.315 -22.588 -22.91 -23.362 -24.477 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_206_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_206_252.txt deleted file mode 100644 index 620b2106..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_206_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31564 ,KEBNE ,17076693,Sat Dec 25 02:54:43 CET,Sat Dec 25 04:25:49 CET,0.0 0.785 0.955 1.043 1.081 1.113 1.165 1.208 1.236 1.229 1.219 1.089 1.193 1.169 1.116 1.041 0.941 0.894 0.807 0.73 0.621 0.546 0.459 0.3 0.115 -0.077 -0.262 -0.446 -0.673 -0.902 -1.147 -1.451 -1.777 -2.129 -2.586 -3.153 -3.748 -4.447 -5.238 -6.154 -7.197 -8.44 -9.977 -11.532 -13.478 -15.903 -18.957 -22.87 -28.082 -35.181 -45.357 -55.81 -63.725 -70.274 -75.601 -80.027 -83.724 -87.003 -89.746 -92.305 -94.387 -96.212 -97.913 -99.441 -100.832 -102.085 -103.373 -104.506 -105.466 -106.448 -107.442 -108.239 -109.037 -109.86 -110.475 -111.104 -111.747 -112.383 -113.061 -113.531 -114.005 -114.717 -115.182 -115.676 -115.945 -116.472 -117.009 -117.582 -117.862 -118.387 -118.799 -119.165 -119.515 -120.255 -120.661 -121.082 -121.551 -122.069 -122.662 -123.414 -125.207 -2 ,20331 ,KEBNE ,17076694,Sat Dec 25 02:55:46 CET,Sat Dec 25 04:27:29 CET,0.0 0.469 0.582 0.727 0.865 0.933 0.96 0.983 1.005 1.014 1.029 0.912 1.006 0.981 0.927 0.858 0.789 0.746 0.664 0.588 0.44 0.331 0.208 0.023 -0.162 -0.353 -0.555 -0.77 -1.042 -1.316 -1.611 -2.003 -2.411 -2.812 -3.294 -3.885 -4.494 -5.213 -6.04 -6.954 -7.965 -9.184 -10.704 -12.34 -14.394 -16.88 -20.053 -24.037 -29.266 -36.397 -46.812 -57.677 -65.676 -71.912 -76.91 -81.064 -84.502 -87.462 -89.89 -92.166 -94.037 -95.652 -97.125 -98.478 -99.692 -100.815 -102.04 -103.084 -103.922 -104.783 -105.661 -106.408 -107.193 -107.977 -108.574 -109.204 -109.861 -110.535 -111.206 -111.649 -112.106 -112.788 -113.241 -113.692 -113.918 -114.388 -114.89 -115.422 -115.694 -116.217 -116.594 -116.899 -117.205 -117.883 -118.258 -118.672 -119.124 -119.609 -120.176 -120.986 -123.38 -3 ,6132 ,KEBNE ,17076695,Sat Dec 25 02:57:51 CET,Sat Dec 25 04:29:19 CET,0.0 0.653 0.874 0.968 1.024 1.076 1.131 1.168 1.186 1.194 1.198 1.08 1.199 1.192 1.145 1.086 1.017 0.985 0.909 0.822 0.699 0.606 0.508 0.335 0.147 -0.022 -0.202 -0.392 -0.645 -0.907 -1.181 -1.567 -1.947 -2.3 -2.745 -3.27 -3.825 -4.491 -5.271 -6.183 -7.178 -8.382 -9.899 -11.562 -13.67 -16.196 -19.382 -23.385 -28.666 -35.819 -46.346 -57.436 -65.581 -71.827 -76.828 -81.105 -84.706 -87.828 -90.444 -92.92 -94.909 -96.624 -98.211 -99.645 -100.933 -102.071 -103.271 -104.346 -105.231 -106.128 -107.048 -107.813 -108.598 -109.411 -110.042 -110.674 -111.308 -111.959 -112.624 -113.072 -113.524 -114.213 -114.674 -115.137 -115.383 -115.904 -116.435 -116.968 -117.237 -117.756 -118.104 -118.401 -118.72 -119.421 -119.803 -120.207 -120.653 -121.135 -121.712 -122.513 -125.418 -4 ,32668 ,KEBNE ,17076696,Sat Dec 25 03:01:00 CET,Sat Dec 25 04:32:26 CET,0.0 0.999 1.236 1.358 1.449 1.5 1.538 1.568 1.574 1.575 1.586 1.481 1.577 1.551 1.513 1.473 1.413 1.369 1.258 1.163 1.047 0.966 0.861 0.687 0.512 0.314 0.111 -0.093 -0.373 -0.667 -0.977 -1.38 -1.782 -2.176 -2.668 -3.273 -3.887 -4.588 -5.374 -6.261 -7.234 -8.407 -9.941 -11.609 -13.715 -16.25 -19.433 -23.484 -28.814 -36.007 -46.555 -57.552 -65.634 -71.924 -76.906 -81.039 -84.429 -87.3 -89.697 -92.013 -93.928 -95.543 -97.012 -98.352 -99.577 -100.709 -101.866 -102.909 -103.791 -104.661 -105.572 -106.312 -107.051 -107.804 -108.381 -108.975 -109.603 -110.246 -110.911 -111.366 -111.816 -112.513 -112.998 -113.517 -113.791 -114.311 -114.817 -115.365 -115.657 -116.206 -116.632 -116.961 -117.3 -118.024 -118.41 -118.829 -119.3 -119.845 -120.478 -121.27 -125.27 -5 ,26117 ,KEBNE ,17076697,Sat Dec 25 03:01:00 CET,Sat Dec 25 04:32:23 CET,0.0 0.805 0.965 1.084 1.183 1.254 1.291 1.292 1.274 1.259 1.245 1.1 1.174 1.128 1.042 0.946 0.862 0.824 0.75 0.676 0.526 0.419 0.311 0.129 -0.066 -0.267 -0.465 -0.665 -0.942 -1.234 -1.549 -1.944 -2.328 -2.722 -3.225 -3.835 -4.451 -5.156 -5.98 -6.902 -7.916 -9.081 -10.492 -12.109 -14.228 -16.791 -19.985 -24.043 -29.501 -36.883 -47.599 -58.876 -67.234 -73.753 -78.972 -83.367 -86.995 -90.084 -92.653 -95.077 -97.107 -98.915 -100.569 -102.065 -103.407 -104.606 -105.816 -106.88 -107.76 -108.606 -109.493 -110.239 -110.982 -111.73 -112.301 -112.898 -113.539 -114.156 -114.754 -115.173 -115.588 -116.241 -116.698 -117.16 -117.383 -117.832 -118.321 -118.832 -119.099 -119.605 -119.919 -120.223 -120.555 -121.251 -121.626 -122.04 -122.494 -122.991 -123.576 -124.331 -127.102 -6 ,18298 ,KEBNE ,17076698,Sat Dec 25 03:09:22 CET,Sat Dec 25 04:41:15 CET,0.0 0.796 1.029 1.158 1.248 1.332 1.412 1.451 1.444 1.437 1.434 1.301 1.393 1.366 1.308 1.239 1.176 1.146 1.079 0.998 0.866 0.775 0.685 0.541 0.36 0.155 -0.067 -0.283 -0.569 -0.86 -1.153 -1.544 -1.935 -2.321 -2.771 -3.347 -3.979 -4.622 -5.292 -6.125 -7.133 -8.335 -9.812 -11.411 -13.421 -15.902 -19.079 -23.125 -28.485 -35.691 -46.236 -57.12 -65.071 -71.288 -76.237 -80.376 -83.748 -86.627 -89.042 -91.412 -93.383 -95.052 -96.585 -97.981 -99.195 -100.258 -101.367 -102.349 -103.178 -104.08 -105.134 -106.046 -106.993 -107.957 -108.68 -109.44 -110.207 -110.974 -111.781 -112.321 -112.854 -113.674 -114.228 -114.773 -115.05 -115.648 -116.264 -116.886 -117.198 -117.794 -118.18 -118.51 -118.869 -119.668 -120.101 -120.57 -121.106 -121.692 -122.266 -122.986 -126.164 -7 ,30594 ,KEBNE ,17076699,Sat Dec 25 03:09:22 CET,Sat Dec 25 04:41:31 CET,0.0 0.646 0.914 1.131 1.281 1.348 1.382 1.418 1.478 1.501 1.527 1.419 1.513 1.503 1.485 1.432 1.353 1.315 1.243 1.157 1.031 0.935 0.829 0.647 0.449 0.251 0.069 -0.109 -0.349 -0.608 -0.911 -1.274 -1.607 -1.923 -2.343 -2.869 -3.384 -3.986 -4.709 -5.594 -6.598 -7.793 -9.281 -10.888 -12.929 -15.393 -18.539 -22.518 -27.767 -34.977 -45.565 -56.48 -64.52 -70.942 -76.139 -80.5 -84.074 -87.067 -89.551 -91.943 -93.906 -95.616 -97.22 -98.721 -100.085 -101.284 -102.485 -103.506 -104.381 -105.284 -106.188 -106.909 -107.669 -108.467 -109.073 -109.681 -110.276 -110.895 -111.541 -111.984 -112.441 -113.127 -113.596 -114.076 -114.319 -114.812 -115.316 -115.847 -116.127 -116.656 -117.026 -117.333 -117.637 -118.294 -118.657 -119.056 -119.491 -119.968 -120.544 -121.357 -123.89 -8 ,10571 ,KEBNE ,17076700,Sat Dec 25 03:09:22 CET,Sat Dec 25 04:41:08 CET,0.0 0.674 0.933 1.089 1.178 1.23 1.264 1.296 1.342 1.348 1.344 1.191 1.275 1.244 1.157 1.071 0.99 0.948 0.842 0.731 0.615 0.526 0.418 0.273 0.121 -0.036 -0.224 -0.446 -0.742 -1.032 -1.33 -1.702 -2.051 -2.396 -2.849 -3.386 -3.918 -4.602 -5.431 -6.37 -7.416 -8.636 -10.12 -11.73 -13.811 -16.353 -19.531 -23.505 -28.8 -36.059 -46.67 -57.678 -65.718 -71.921 -76.855 -80.987 -84.393 -87.371 -89.857 -92.279 -94.317 -96.09 -97.754 -99.25 -100.574 -101.772 -103.014 -104.076 -104.991 -105.969 -106.984 -107.761 -108.483 -109.231 -109.818 -110.404 -111.016 -111.661 -112.316 -112.761 -113.206 -113.886 -114.363 -114.856 -115.099 -115.588 -116.085 -116.596 -116.864 -117.36 -117.696 -118.034 -118.401 -119.233 -119.666 -120.106 -120.59 -121.095 -121.662 -122.452 -124.465 -9 ,889 ,KEBNE ,17076701,Sat Dec 25 03:09:21 CET,Sat Dec 25 04:40:53 CET,0.0 0.555 0.707 0.813 0.88 0.93 0.979 1.005 1.014 1.013 0.997 0.846 0.939 0.913 0.85 0.813 0.77 0.736 0.645 0.54 0.385 0.286 0.195 0.049 -0.114 -0.277 -0.444 -0.634 -0.918 -1.198 -1.453 -1.807 -2.205 -2.598 -3.092 -3.696 -4.323 -5.059 -5.887 -6.796 -7.8 -9.005 -10.529 -12.154 -14.157 -16.561 -19.632 -23.524 -28.693 -35.781 -46.228 -57.106 -65.022 -71.117 -76.03 -80.227 -83.652 -86.618 -89.109 -91.444 -93.362 -95.017 -96.531 -97.965 -99.342 -100.558 -101.806 -103.028 -104.137 -105.287 -106.479 -107.446 -108.428 -109.419 -110.178 -110.959 -111.741 -112.552 -113.385 -113.933 -114.499 -115.369 -115.953 -116.567 -116.884 -117.456 -117.987 -118.529 -118.808 -119.374 -119.678 -119.994 -120.329 -121.013 -121.378 -121.775 -122.185 -122.634 -123.128 -123.851 -126.934 -10 ,18664 ,KEBNE ,17076702,Sat Dec 25 03:09:22 CET,Sat Dec 25 04:41:26 CET,0.0 0.816 1.061 1.218 1.326 1.414 1.497 1.541 1.57 1.569 1.56 1.414 1.507 1.484 1.425 1.346 1.259 1.213 1.129 1.05 0.923 0.814 0.694 0.529 0.341 0.142 -0.043 -0.225 -0.498 -0.79 -1.091 -1.487 -1.889 -2.295 -2.795 -3.401 -3.978 -4.586 -5.275 -6.105 -7.081 -8.285 -9.818 -11.49 -13.62 -16.166 -19.296 -23.214 -28.425 -35.498 -45.853 -56.796 -64.888 -71.107 -76.042 -80.152 -83.585 -86.569 -89.049 -91.47 -93.435 -95.053 -96.538 -97.907 -99.146 -100.251 -101.397 -102.386 -103.226 -104.11 -105.03 -105.793 -106.566 -107.34 -107.936 -108.545 -109.16 -109.788 -110.413 -110.825 -111.263 -112.029 -112.615 -113.203 -113.487 -114.052 -114.642 -115.279 -115.598 -116.204 -116.612 -116.975 -117.342 -118.094 -118.49 -118.903 -119.379 -119.925 -120.562 -121.398 -124.123 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_215_167.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_215_167.txt deleted file mode 100644 index 35b6fba0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_215_167.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21395 ,TETRA ,17617227,Tue Nov 30 04:15:19 CET,Tue Nov 30 06:02:09 CET,0.0 1.57 2.028 2.342 2.605 2.839 3.057 3.254 3.607 3.778 3.934 4.114 4.38 4.531 4.818 5.091 5.349 5.47 5.699 5.929 6.273 6.487 6.682 6.953 7.22 7.479 7.724 7.97 8.276 8.557 8.844 9.202 9.563 9.907 10.272 10.687 11.1 11.614 12.236 12.915 13.577 14.247 15.027 15.834 16.811 17.962 19.323 20.889 22.783 25.12 28.172 30.904 32.601 33.744 34.516 35.059 35.444 35.722 35.931 36.113 36.245 36.328 36.379 36.423 36.461 36.499 36.524 36.496 36.454 36.43 36.404 36.363 36.291 36.201 36.126 36.028 35.908 35.804 35.722 35.67 35.605 35.472 35.381 35.278 35.219 35.099 34.971 34.831 34.768 34.623 34.534 34.432 34.329 34.102 33.957 33.795 33.613 33.378 33.082 32.716 31.723 -2 ,29147 ,TETRA ,17617228,Tue Nov 30 04:15:20 CET,Tue Nov 30 06:01:27 CET,0.0 1.759 2.213 2.505 2.756 2.991 3.199 3.4 3.758 3.907 4.048 4.182 4.408 4.531 4.765 4.976 5.178 5.278 5.481 5.692 5.984 6.161 6.337 6.593 6.835 7.069 7.298 7.551 7.868 8.148 8.455 8.856 9.264 9.621 9.996 10.448 10.9 11.388 11.892 12.451 13.052 13.74 14.549 15.369 16.367 17.525 18.884 20.459 22.409 24.762 27.649 30.21 31.842 32.937 33.71 34.266 34.649 34.932 35.124 35.273 35.39 35.482 35.531 35.562 35.578 35.587 35.572 35.528 35.488 35.412 35.328 35.295 35.253 35.19 35.142 35.098 35.051 34.987 34.907 34.853 34.791 34.688 34.617 34.528 34.473 34.348 34.221 34.078 33.992 33.835 33.772 33.67 33.555 33.318 33.19 33.039 32.863 32.635 32.338 31.953 30.785 -3 ,25436 ,TETRA ,17617229,Tue Nov 30 04:16:17 CET,Tue Nov 30 06:05:48 CET,0.0 1.124 1.55 1.881 2.135 2.356 2.567 2.764 3.122 3.272 3.412 3.552 3.786 3.915 4.167 4.402 4.618 4.715 4.92 5.136 5.46 5.683 5.886 6.141 6.394 6.641 6.861 7.074 7.38 7.682 7.954 8.287 8.618 8.928 9.286 9.701 10.101 10.557 11.067 11.586 12.131 12.778 13.575 14.403 15.375 16.506 17.85 19.336 21.141 23.416 26.402 29.044 30.636 31.746 32.544 33.138 33.548 33.862 34.105 34.292 34.417 34.521 34.593 34.647 34.689 34.72 34.739 34.735 34.72 34.685 34.644 34.615 34.571 34.513 34.468 34.419 34.358 34.297 34.227 34.17 34.101 33.967 33.877 33.791 33.747 33.652 33.527 33.382 33.309 33.143 33.028 32.934 32.83 32.589 32.466 32.316 32.138 31.932 31.694 31.343 30.219 -4 ,7868 ,TETRA ,17617230,Tue Nov 30 04:18:17 CET,Tue Nov 30 06:00:50 CET,0.0 1.514 1.915 2.229 2.493 2.743 2.956 3.14 3.484 3.654 3.811 3.956 4.195 4.331 4.601 4.844 5.053 5.16 5.372 5.566 5.849 6.022 6.191 6.446 6.691 6.926 7.186 7.466 7.81 8.145 8.489 8.883 9.232 9.563 9.954 10.412 10.875 11.389 11.96 12.557 13.146 13.823 14.619 15.417 16.416 17.571 18.918 20.46 22.262 24.536 27.444 29.941 31.534 32.623 33.364 33.875 34.246 34.541 34.743 34.891 35.002 35.069 35.101 35.113 35.083 35.055 35.047 35.026 34.984 34.928 34.87 34.811 34.743 34.688 34.639 34.545 34.422 34.302 34.181 34.095 34.019 33.901 33.811 33.721 33.67 33.558 33.452 33.333 33.257 33.1 33.013 32.916 32.816 32.6 32.487 32.34 32.156 31.938 31.673 31.3 30.14 -5 ,18814 ,TETRA ,17617231,Tue Nov 30 04:18:17 CET,Tue Nov 30 06:02:10 CET,0.0 1.183 1.632 1.963 2.258 2.495 2.68 2.856 3.203 3.358 3.49 3.63 3.863 3.985 4.228 4.457 4.672 4.784 5.016 5.236 5.556 5.765 5.978 6.29 6.589 6.875 7.155 7.404 7.687 7.968 8.251 8.588 8.918 9.279 9.707 10.159 10.599 11.069 11.577 12.132 12.798 13.589 14.45 15.296 16.276 17.403 18.723 20.179 21.994 24.321 27.26 29.85 31.498 32.635 33.421 33.987 34.401 34.719 34.935 35.103 35.223 35.309 35.382 35.428 35.439 35.447 35.423 35.367 35.329 35.295 35.242 35.194 35.139 35.068 35.012 34.954 34.893 34.815 34.698 34.596 34.503 34.385 34.287 34.177 34.13 34.035 33.904 33.762 33.695 33.541 33.439 33.334 33.234 32.991 32.848 32.685 32.488 32.265 31.994 31.616 30.13 -6 ,2211 ,TETRA ,17617232,Tue Nov 30 04:18:19 CET,Tue Nov 30 06:08:28 CET,0.0 1.155 1.583 1.91 2.169 2.393 2.605 2.801 3.143 3.31 3.474 3.657 3.916 4.051 4.31 4.562 4.799 4.917 5.152 5.366 5.656 5.845 6.023 6.288 6.577 6.853 7.095 7.325 7.648 7.959 8.234 8.552 8.87 9.195 9.591 10.036 10.444 10.892 11.403 11.957 12.541 13.23 14.058 14.913 15.936 17.111 18.436 19.948 21.818 24.15 27.128 29.765 31.415 32.527 33.283 33.81 34.173 34.453 34.667 34.827 34.911 34.957 34.977 34.977 34.971 34.907 34.78 34.685 34.611 34.538 34.487 34.457 34.405 34.332 34.28 34.216 34.149 34.077 34.001 33.952 33.897 33.76 33.636 33.521 33.472 33.369 33.231 33.076 33.003 32.853 32.76 32.665 32.566 32.327 32.205 32.069 31.89 31.672 31.431 31.109 29.93 -7 ,18857 ,TETRA ,17617233,Tue Nov 30 04:18:19 CET,Tue Nov 30 06:05:37 CET,0.0 1.333 1.743 2.05 2.299 2.541 2.763 2.964 3.33 3.502 3.673 3.877 4.144 4.289 4.558 4.819 5.074 5.19 5.41 5.642 5.992 6.202 6.402 6.71 7.007 7.281 7.526 7.752 8.06 8.369 8.652 8.988 9.33 9.671 10.064 10.502 10.975 11.544 12.107 12.647 13.215 13.88 14.67 15.441 16.361 17.482 18.833 20.396 22.283 24.593 27.486 30.034 31.653 32.777 33.553 34.1 34.524 34.822 35.021 35.196 35.26 35.309 35.365 35.353 35.325 35.288 35.247 35.217 35.178 35.134 35.081 35.007 34.9 34.787 34.712 34.624 34.507 34.382 34.279 34.22 34.159 34.047 33.962 33.855 33.794 33.688 33.565 33.402 33.313 33.153 33.052 32.933 32.81 32.518 32.344 32.162 31.957 31.723 31.44 31.011 29.847 -8 ,18006 ,TETRA ,17617234,Tue Nov 30 04:18:19 CET,Tue Nov 30 06:08:33 CET,0.0 1.276 1.652 1.967 2.225 2.43 2.608 2.774 3.091 3.246 3.392 3.546 3.797 3.936 4.18 4.418 4.662 4.78 5.0 5.22 5.52 5.69 5.869 6.136 6.384 6.611 6.838 7.074 7.358 7.626 7.884 8.217 8.548 8.851 9.206 9.621 10.039 10.514 11.024 11.566 12.158 12.838 13.639 14.462 15.434 16.538 17.815 19.301 21.162 23.532 26.637 29.359 31.058 32.174 32.87 33.332 33.693 34.02 34.256 34.443 34.561 34.649 34.721 34.753 34.71 34.644 34.569 34.511 34.469 34.408 34.353 34.313 34.254 34.178 34.121 34.028 33.916 33.802 33.684 33.614 33.526 33.385 33.31 33.227 33.183 33.093 32.984 32.862 32.797 32.64 32.534 32.435 32.317 32.044 31.907 31.742 31.53 31.301 31.014 30.635 29.49 -9 ,8770 ,TETRA ,17617235,Tue Nov 30 03:01:25 CET,Tue Nov 30 05:06:58 CET,0.0 1.476 1.911 2.204 2.438 2.627 2.797 2.968 3.314 3.488 3.648 3.832 4.095 4.229 4.462 4.692 4.9 5.004 5.224 5.438 5.755 5.972 6.191 6.499 6.801 7.092 7.377 7.651 7.977 8.272 8.558 8.928 9.276 9.59 9.985 10.44 10.85 11.318 11.848 12.407 12.989 13.654 14.463 15.308 16.288 17.406 18.718 20.256 22.143 24.429 27.364 30.011 31.753 32.928 33.75 34.365 34.813 35.119 35.312 35.488 35.615 35.708 35.766 35.789 35.779 35.712 35.65 35.637 35.608 35.555 35.484 35.401 35.303 35.219 35.156 35.099 35.021 34.924 34.815 34.72 34.636 34.508 34.403 34.291 34.236 34.104 33.944 33.788 33.701 33.529 33.435 33.339 33.245 33.055 32.92 32.755 32.584 32.377 32.13 31.772 30.705 -10 ,29787 ,TETRA ,17617236,Tue Nov 30 03:05:25 CET,Tue Nov 30 04:53:48 CET,0.0 1.355 1.776 2.074 2.353 2.598 2.805 2.994 3.341 3.509 3.674 3.846 4.089 4.218 4.475 4.725 4.98 5.105 5.319 5.5 5.801 6.032 6.255 6.576 6.873 7.148 7.431 7.704 8.006 8.282 8.551 8.875 9.205 9.518 9.897 10.372 10.813 11.265 11.772 12.328 12.927 13.63 14.44 15.237 16.189 17.283 18.566 20.073 21.939 24.232 27.177 29.709 31.246 32.327 33.131 33.707 34.117 34.444 34.671 34.836 34.929 34.972 35.008 35.021 34.996 34.973 34.951 34.931 34.896 34.833 34.771 34.732 34.681 34.599 34.529 34.464 34.392 34.303 34.203 34.141 34.082 33.984 33.902 33.807 33.75 33.623 33.485 33.351 33.288 33.123 33.016 32.922 32.818 32.574 32.437 32.284 32.112 31.914 31.656 31.247 30.053 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_215_206.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_215_206.txt deleted file mode 100644 index b43b6012..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_215_206.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11544 ,TETRA ,17617237,Tue Nov 30 04:19:16 CET,Tue Nov 30 06:07:22 CET,0.0 1.155 1.552 1.867 2.089 2.293 2.48 2.641 2.935 3.085 3.229 3.374 3.61 3.73 3.955 4.138 4.287 4.358 4.512 4.678 4.914 5.071 5.231 5.468 5.691 5.886 6.038 6.187 6.405 6.609 6.823 7.093 7.337 7.558 7.806 8.057 8.279 8.555 8.842 9.102 9.411 9.735 10.041 10.346 10.686 11.019 11.356 11.724 12.134 12.528 12.772 12.665 12.382 12.042 11.689 11.351 11.049 10.767 10.496 10.207 9.945 9.649 9.267 8.926 8.694 8.477 8.201 7.974 7.809 7.604 7.375 7.193 7.004 6.818 6.672 6.497 6.327 6.165 5.992 5.879 5.762 5.574 5.434 5.275 5.192 5.018 4.832 4.643 4.546 4.33 4.202 4.078 3.951 3.643 3.484 3.32 3.119 2.875 2.597 2.262 1.456 -2 ,3791 ,TETRA ,17617238,Tue Nov 30 04:19:16 CET,Tue Nov 30 06:06:56 CET,0.0 0.846 1.113 1.376 1.6 1.769 1.942 2.117 2.436 2.583 2.72 2.869 3.099 3.209 3.422 3.624 3.817 3.909 4.082 4.242 4.468 4.605 4.738 4.938 5.123 5.299 5.456 5.596 5.769 5.941 6.124 6.334 6.505 6.669 6.876 7.114 7.336 7.621 7.909 8.147 8.424 8.748 9.057 9.329 9.624 9.923 10.254 10.594 10.912 11.209 11.384 11.243 10.902 10.511 10.138 9.797 9.459 9.054 8.699 8.372 8.064 7.784 7.531 7.298 7.085 6.873 6.654 6.444 6.231 6.031 5.852 5.67 5.446 5.211 5.058 4.93 4.77 4.582 4.422 4.301 4.16 3.963 3.831 3.69 3.605 3.424 3.26 3.112 3.03 2.817 2.736 2.628 2.514 2.247 2.079 1.91 1.755 1.573 1.332 0.965 0.161 -3 ,19433 ,TETRA ,17617239,Tue Nov 30 04:19:16 CET,Tue Nov 30 06:06:44 CET,0.0 0.87 1.224 1.44 1.621 1.791 1.963 2.12 2.378 2.494 2.615 2.729 2.93 3.019 3.191 3.335 3.47 3.545 3.713 3.857 4.047 4.176 4.286 4.461 4.63 4.766 4.895 5.031 5.225 5.41 5.582 5.803 6.023 6.218 6.433 6.68 6.925 7.154 7.356 7.578 7.823 8.094 8.465 8.831 9.147 9.482 9.852 10.193 10.5 10.743 10.793 10.518 10.092 9.649 9.209 8.774 8.411 8.084 7.792 7.465 7.154 6.878 6.575 6.276 6.021 5.799 5.567 5.316 5.09 4.886 4.693 4.526 4.313 4.062 3.871 3.685 3.515 3.337 3.134 2.992 2.852 2.65 2.508 2.339 2.248 2.078 1.887 1.669 1.556 1.316 1.187 1.054 0.909 0.619 0.465 0.281 0.077 -0.15 -0.439 -0.82 -1.963 -4 ,24404 ,TETRA ,17617240,Tue Nov 30 04:19:18 CET,Tue Nov 30 06:08:46 CET,0.0 0.999 1.317 1.548 1.749 1.915 2.069 2.213 2.456 2.59 2.734 2.854 3.07 3.173 3.352 3.526 3.699 3.782 3.937 4.083 4.295 4.436 4.594 4.826 5.023 5.216 5.421 5.628 5.864 6.046 6.198 6.366 6.528 6.687 6.876 7.08 7.311 7.635 7.953 8.206 8.442 8.71 9.015 9.287 9.574 9.878 10.204 10.54 10.878 11.193 11.371 11.259 10.983 10.637 10.271 9.922 9.595 9.277 9.009 8.735 8.476 8.229 7.976 7.716 7.439 7.162 6.871 6.604 6.339 6.071 5.816 5.62 5.428 5.225 5.062 4.866 4.648 4.437 4.239 4.098 3.948 3.742 3.605 3.467 3.394 3.222 3.027 2.822 2.729 2.521 2.417 2.294 2.156 1.848 1.693 1.531 1.338 1.134 0.927 0.638 -0.217 -5 ,24719 ,TETRA ,17617241,Tue Nov 30 04:19:18 CET,Tue Nov 30 06:07:30 CET,0.0 1.021 1.403 1.67 1.899 2.112 2.275 2.419 2.683 2.825 2.969 3.083 3.303 3.41 3.609 3.803 3.984 4.068 4.239 4.412 4.64 4.788 4.923 5.097 5.287 5.49 5.666 5.807 5.977 6.143 6.315 6.547 6.751 6.923 7.129 7.351 7.567 7.798 8.025 8.26 8.494 8.752 9.069 9.367 9.646 9.916 10.231 10.58 10.924 11.241 11.417 11.323 11.075 10.728 10.362 10.015 9.702 9.431 9.197 8.947 8.722 8.509 8.283 8.014 7.755 7.554 7.327 7.126 6.951 6.729 6.506 6.323 6.115 5.916 5.777 5.617 5.433 5.228 5.01 4.857 4.709 4.505 4.354 4.182 4.092 3.911 3.722 3.515 3.407 3.182 3.065 2.959 2.85 2.58 2.425 2.246 2.038 1.807 1.54 1.163 0.074 -6 ,12903 ,TETRA ,17617242,Tue Nov 30 04:20:19 CET,Tue Nov 30 06:08:12 CET,0.0 0.678 1.012 1.258 1.46 1.667 1.842 1.996 2.267 2.391 2.519 2.643 2.865 2.976 3.158 3.318 3.482 3.554 3.703 3.85 4.058 4.189 4.316 4.517 4.702 4.885 5.059 5.227 5.441 5.61 5.768 5.976 6.208 6.455 6.706 6.938 7.142 7.389 7.649 7.883 8.13 8.408 8.723 9.018 9.321 9.638 9.973 10.318 10.64 10.896 11.026 10.783 10.385 9.977 9.586 9.224 8.892 8.573 8.286 7.925 7.598 7.258 6.93 6.673 6.433 6.233 6.02 5.802 5.606 5.403 5.207 5.046 4.859 4.652 4.483 4.3 4.095 3.905 3.728 3.598 3.461 3.242 3.081 2.934 2.858 2.677 2.486 2.289 2.186 1.971 1.871 1.755 1.647 1.428 1.277 1.096 0.902 0.675 0.408 0.068 -1.085 -7 ,12868 ,TETRA ,17617243,Tue Nov 30 04:21:14 CET,Tue Nov 30 06:10:46 CET,0.0 0.66 0.996 1.238 1.424 1.607 1.79 1.944 2.219 2.357 2.49 2.62 2.838 2.932 3.119 3.293 3.443 3.521 3.699 3.874 4.118 4.281 4.428 4.645 4.865 5.039 5.205 5.372 5.58 5.771 5.936 6.127 6.342 6.575 6.806 7.051 7.314 7.587 7.857 8.163 8.441 8.674 8.94 9.233 9.578 9.934 10.272 10.622 10.961 11.176 11.173 10.834 10.343 9.872 9.486 9.107 8.717 8.349 8.016 7.671 7.386 7.141 6.871 6.616 6.395 6.185 5.967 5.758 5.572 5.358 5.14 4.986 4.823 4.651 4.527 4.406 4.268 4.103 3.925 3.809 3.699 3.52 3.392 3.243 3.163 3.005 2.846 2.672 2.565 2.33 2.201 2.079 1.93 1.601 1.446 1.289 1.116 0.901 0.659 0.369 -0.568 -8 ,15829 ,TETRA ,17617244,Tue Nov 30 04:21:13 CET,Tue Nov 30 06:12:26 CET,0.0 1.378 1.812 2.128 2.396 2.626 2.828 2.997 3.281 3.419 3.543 3.656 3.881 3.989 4.184 4.358 4.51 4.588 4.767 4.925 5.119 5.232 5.34 5.523 5.721 5.898 6.081 6.284 6.536 6.768 6.98 7.198 7.392 7.58 7.809 8.074 8.304 8.544 8.783 9.014 9.285 9.609 9.932 10.236 10.556 10.884 11.239 11.571 11.854 12.109 12.306 12.153 11.752 11.291 10.876 10.523 10.176 9.803 9.463 9.155 8.896 8.635 8.397 8.173 7.919 7.661 7.389 7.183 7.022 6.856 6.673 6.501 6.311 6.104 5.949 5.791 5.628 5.469 5.306 5.174 5.026 4.81 4.671 4.511 4.423 4.259 4.095 3.902 3.796 3.584 3.482 3.359 3.234 2.924 2.756 2.589 2.4 2.174 1.915 1.578 0.563 -9 ,8336 ,TETRA ,17617245,Tue Nov 30 04:21:15 CET,Tue Nov 30 06:07:32 CET,0.0 1.149 1.541 1.791 2.0 2.21 2.396 2.549 2.846 2.995 3.133 3.273 3.497 3.601 3.797 3.998 4.199 4.289 4.458 4.612 4.844 4.993 5.132 5.351 5.565 5.753 5.919 6.087 6.318 6.531 6.736 7.001 7.263 7.531 7.846 8.165 8.442 8.776 9.171 9.516 9.816 10.133 10.47 10.789 11.105 11.385 11.697 12.041 12.322 12.522 12.639 12.451 12.12 11.746 11.374 11.03 10.706 10.326 9.936 9.531 9.218 8.979 8.744 8.535 8.311 8.079 7.868 7.685 7.503 7.31 7.12 6.95 6.773 6.597 6.467 6.332 6.163 5.98 5.794 5.67 5.538 5.313 5.162 5.0 4.905 4.688 4.481 4.291 4.189 3.965 3.857 3.735 3.593 3.263 3.101 2.941 2.747 2.53 2.293 1.977 1.206 -10 ,7345 ,TETRA ,17617246,Tue Nov 30 04:22:15 CET,Tue Nov 30 06:15:48 CET,0.0 1.011 1.366 1.588 1.796 1.978 2.137 2.3 2.613 2.759 2.897 3.02 3.239 3.353 3.574 3.756 3.93 4.024 4.19 4.345 4.55 4.674 4.796 4.994 5.19 5.349 5.492 5.635 5.848 6.044 6.189 6.365 6.556 6.77 7.015 7.239 7.461 7.705 7.933 8.188 8.435 8.682 8.946 9.226 9.593 9.949 10.267 10.585 10.885 11.118 11.217 11.092 10.812 10.483 10.1 9.692 9.317 8.983 8.717 8.426 8.153 7.886 7.611 7.349 7.128 6.934 6.712 6.511 6.323 6.109 5.878 5.69 5.497 5.303 5.166 5.033 4.899 4.749 4.589 4.474 4.339 4.107 3.947 3.788 3.705 3.545 3.392 3.224 3.122 2.895 2.767 2.65 2.53 2.267 2.109 1.94 1.76 1.566 1.328 0.988 0.163 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_215_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_215_252.txt deleted file mode 100644 index dea2a085..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_215_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26247 ,TETRA ,17617247,Tue Nov 30 04:22:15 CET,Tue Nov 30 06:09:29 CET,0.0 0.781 0.97 1.057 1.085 1.103 1.138 1.177 1.188 1.172 1.141 0.952 1.033 1.007 0.953 0.889 0.807 0.76 0.678 0.605 0.497 0.405 0.311 0.152 -0.042 -0.245 -0.473 -0.7 -0.994 -1.299 -1.607 -2.005 -2.419 -2.791 -3.227 -3.812 -4.408 -5.084 -5.885 -6.792 -7.803 -9.042 -10.6 -12.24 -14.322 -16.874 -20.072 -24.136 -29.512 -36.822 -47.453 -58.493 -66.589 -72.89 -77.951 -82.219 -85.709 -88.691 -91.136 -93.47 -95.397 -97.056 -98.637 -100.085 -101.425 -102.654 -103.858 -104.89 -105.789 -106.694 -107.601 -108.345 -109.112 -109.908 -110.527 -111.151 -111.776 -112.419 -113.072 -113.514 -113.958 -114.624 -115.077 -115.542 -115.78 -116.265 -116.772 -117.291 -117.555 -118.065 -118.389 -118.671 -118.958 -119.581 -119.919 -120.288 -120.723 -121.19 -121.686 -122.332 -124.123 -2 ,9269 ,TETRA ,17617248,Tue Nov 30 04:22:15 CET,Tue Nov 30 06:08:48 CET,0.0 0.696 0.855 0.96 1.036 1.096 1.15 1.182 1.193 1.174 1.142 0.98 1.079 1.079 1.066 1.022 0.969 0.938 0.871 0.793 0.658 0.548 0.426 0.228 0.026 -0.14 -0.29 -0.472 -0.746 -1.034 -1.32 -1.698 -2.088 -2.463 -2.896 -3.43 -4.029 -4.715 -5.482 -6.373 -7.379 -8.564 -10.063 -11.715 -13.775 -16.292 -19.508 -23.485 -28.709 -35.886 -46.383 -57.309 -65.305 -71.505 -76.446 -80.616 -84.069 -87.001 -89.429 -91.737 -93.63 -95.251 -96.753 -98.113 -99.35 -100.482 -101.638 -102.675 -103.588 -104.539 -105.499 -106.276 -107.072 -107.869 -108.471 -109.078 -109.666 -110.264 -110.911 -111.353 -111.787 -112.447 -112.908 -113.406 -113.682 -114.264 -114.864 -115.479 -115.795 -116.358 -116.722 -117.053 -117.405 -118.165 -118.575 -119.025 -119.482 -119.88 -120.3 -120.889 -123.224 -3 ,20338 ,TETRA ,17617249,Tue Nov 30 04:22:17 CET,Tue Nov 30 06:08:30 CET,0.0 0.589 0.762 0.842 0.902 0.984 1.048 1.079 1.111 1.109 1.091 0.939 1.026 0.99 0.907 0.814 0.726 0.679 0.583 0.481 0.302 0.171 0.031 -0.186 -0.398 -0.611 -0.824 -1.039 -1.342 -1.638 -1.939 -2.343 -2.73 -3.086 -3.564 -4.167 -4.759 -5.463 -6.282 -7.204 -8.213 -9.42 -10.957 -12.638 -14.721 -17.225 -20.438 -24.49 -29.787 -37.036 -47.715 -58.691 -66.689 -72.876 -77.816 -81.944 -85.296 -88.172 -90.576 -92.904 -94.84 -96.474 -97.943 -99.288 -100.52 -101.614 -102.76 -103.814 -104.711 -105.59 -106.442 -107.142 -107.871 -108.645 -109.307 -110.015 -110.743 -111.514 -112.311 -112.825 -113.319 -114.085 -114.64 -115.216 -115.497 -116.062 -116.658 -117.284 -117.601 -118.209 -118.636 -119.001 -119.373 -120.129 -120.52 -120.925 -121.365 -121.86 -122.446 -123.157 -125.431 -4 ,12435 ,TETRA ,17617250,Tue Nov 30 04:23:17 CET,Tue Nov 30 06:11:13 CET,0.0 0.832 0.992 1.071 1.13 1.191 1.251 1.302 1.341 1.343 1.34 1.181 1.263 1.24 1.175 1.086 0.993 0.956 0.874 0.776 0.624 0.508 0.381 0.181 -0.019 -0.215 -0.398 -0.586 -0.878 -1.168 -1.426 -1.734 -2.055 -2.411 -2.878 -3.467 -4.08 -4.788 -5.604 -6.535 -7.565 -8.79 -10.351 -12.041 -14.167 -16.76 -20.005 -23.992 -29.271 -36.521 -47.147 -58.274 -66.374 -72.565 -77.468 -81.572 -84.978 -87.872 -90.231 -92.512 -94.396 -96.081 -97.64 -99.007 -100.267 -101.389 -102.501 -103.448 -104.225 -105.01 -105.828 -106.514 -107.319 -108.212 -108.872 -109.537 -110.235 -110.955 -111.711 -112.24 -112.78 -113.619 -114.181 -114.739 -115.025 -115.598 -116.19 -116.81 -117.123 -117.731 -118.1 -118.431 -118.778 -119.505 -119.89 -120.296 -120.73 -121.196 -121.693 -122.352 -123.783 -5 ,22170 ,TETRA ,17617251,Tue Nov 30 04:23:14 CET,Tue Nov 30 06:15:35 CET,0.0 0.762 0.929 1.043 1.143 1.21 1.257 1.291 1.314 1.316 1.306 1.179 1.282 1.257 1.195 1.11 1.027 0.989 0.91 0.81 0.674 0.602 0.512 0.346 0.155 -0.018 -0.196 -0.403 -0.693 -0.984 -1.287 -1.694 -2.11 -2.524 -3.028 -3.629 -4.183 -4.823 -5.618 -6.519 -7.52 -8.73 -10.265 -11.906 -13.976 -16.512 -19.71 -23.724 -29.028 -36.17 -46.602 -57.561 -65.65 -71.968 -77.059 -81.4 -84.953 -87.953 -90.419 -92.764 -94.72 -96.39 -97.907 -99.294 -100.534 -101.666 -102.85 -103.875 -104.748 -105.639 -106.55 -107.29 -108.042 -108.818 -109.402 -109.981 -110.586 -111.224 -111.87 -112.314 -112.76 -113.416 -113.861 -114.32 -114.564 -115.077 -115.59 -116.107 -116.369 -116.867 -117.199 -117.499 -117.79 -118.393 -118.732 -119.11 -119.536 -120.019 -120.559 -121.302 -123.562 -6 ,31996 ,TETRA ,17617252,Tue Nov 30 04:23:14 CET,Tue Nov 30 06:12:52 CET,0.0 0.574 0.74 0.855 0.936 0.983 1.014 1.037 1.068 1.07 1.068 0.963 1.067 1.038 0.972 0.902 0.828 0.794 0.733 0.673 0.556 0.452 0.337 0.163 -0.024 -0.22 -0.434 -0.645 -0.924 -1.212 -1.487 -1.822 -2.168 -2.55 -3.033 -3.606 -4.16 -4.754 -5.456 -6.316 -7.32 -8.509 -9.988 -11.605 -13.625 -16.079 -19.209 -23.165 -28.375 -35.454 -45.876 -56.775 -64.71 -70.92 -75.911 -80.072 -83.504 -86.476 -88.935 -91.278 -93.261 -94.953 -96.505 -97.974 -99.323 -100.506 -101.679 -102.684 -103.512 -104.37 -105.258 -106.07 -107.003 -107.981 -108.724 -109.454 -110.207 -110.996 -111.783 -112.295 -112.809 -113.609 -114.177 -114.752 -115.031 -115.605 -116.193 -116.783 -117.082 -117.66 -118.037 -118.394 -118.749 -119.522 -119.928 -120.343 -120.772 -121.232 -121.826 -122.572 -124.926 -7 ,27640 ,TETRA ,17617253,Tue Nov 30 04:24:14 CET,Tue Nov 30 06:16:21 CET,0.0 0.79 0.991 1.115 1.215 1.278 1.324 1.355 1.392 1.399 1.408 1.303 1.387 1.352 1.297 1.244 1.195 1.166 1.08 0.975 0.815 0.714 0.611 0.45 0.286 0.096 -0.112 -0.325 -0.63 -0.94 -1.237 -1.615 -2.009 -2.418 -2.92 -3.508 -4.093 -4.792 -5.593 -6.498 -7.534 -8.775 -10.319 -11.986 -14.076 -16.578 -19.731 -23.704 -28.952 -36.095 -46.633 -57.671 -65.795 -72.167 -77.226 -81.434 -84.892 -87.872 -90.339 -92.692 -94.616 -96.295 -97.926 -99.46 -100.827 -101.999 -103.301 -104.544 -105.605 -106.698 -107.783 -108.671 -109.603 -110.562 -111.305 -112.052 -112.794 -113.532 -114.303 -114.831 -115.358 -116.181 -116.747 -117.322 -117.609 -118.186 -118.8 -119.456 -119.781 -120.391 -120.8 -121.15 -121.503 -122.248 -122.642 -123.052 -123.495 -123.97 -124.532 -125.28 -127.752 -8 ,9882 ,TETRA ,17617254,Tue Nov 30 04:25:23 CET,Tue Nov 30 06:12:45 CET,0.0 0.617 0.804 0.893 0.972 1.034 1.062 1.071 1.072 1.079 1.096 0.979 1.074 1.05 0.969 0.904 0.865 0.836 0.75 0.651 0.509 0.418 0.313 0.123 -0.075 -0.281 -0.502 -0.727 -1.038 -1.346 -1.644 -2.023 -2.42 -2.83 -3.327 -3.922 -4.52 -5.21 -6.018 -6.939 -7.966 -9.191 -10.745 -12.448 -14.576 -17.14 -20.368 -24.401 -29.729 -37.041 -47.735 -58.916 -67.071 -73.317 -78.257 -82.385 -85.768 -88.697 -91.131 -93.408 -95.319 -96.999 -98.576 -100.054 -101.372 -102.525 -103.665 -104.616 -105.411 -106.263 -107.188 -107.964 -108.747 -109.514 -110.106 -110.722 -111.334 -111.945 -112.554 -112.958 -113.391 -114.089 -114.568 -115.056 -115.305 -115.806 -116.317 -116.865 -117.147 -117.661 -118.05 -118.378 -118.691 -119.348 -119.707 -120.099 -120.54 -121.037 -121.611 -122.351 -124.416 -9 ,6206 ,TETRA ,17617255,Tue Nov 30 04:26:25 CET,Tue Nov 30 06:19:13 CET,0.0 0.563 0.707 0.811 0.906 0.951 0.973 0.997 1.046 1.06 1.056 0.918 1.013 0.997 0.963 0.919 0.859 0.816 0.716 0.605 0.419 0.303 0.199 0.034 -0.152 -0.351 -0.551 -0.748 -1.022 -1.293 -1.587 -1.993 -2.391 -2.785 -3.277 -3.878 -4.484 -5.187 -5.991 -6.895 -7.915 -9.132 -10.638 -12.276 -14.294 -16.717 -19.886 -23.93 -29.301 -36.588 -47.132 -58.114 -66.204 -72.428 -77.38 -81.519 -84.936 -87.885 -90.295 -92.659 -94.622 -96.316 -97.928 -99.43 -100.78 -101.937 -103.108 -104.144 -105.003 -105.875 -106.776 -107.52 -108.277 -109.027 -109.582 -110.149 -110.746 -111.364 -112.007 -112.452 -112.894 -113.562 -114.023 -114.491 -114.731 -115.21 -115.683 -116.169 -116.422 -116.925 -117.239 -117.51 -117.801 -118.449 -118.796 -119.15 -119.52 -119.955 -120.483 -121.186 -123.254 -10 ,10311 ,TETRA ,17617256,Tue Nov 30 03:21:27 CET,Tue Nov 30 05:12:03 CET,0.0 0.717 0.868 0.964 1.027 1.065 1.126 1.189 1.251 1.265 1.267 1.152 1.258 1.239 1.201 1.172 1.135 1.108 1.035 0.956 0.848 0.761 0.647 0.456 0.266 0.084 -0.078 -0.237 -0.489 -0.775 -1.075 -1.469 -1.866 -2.264 -2.742 -3.309 -3.901 -4.565 -5.316 -6.186 -7.155 -8.33 -9.808 -11.395 -13.413 -15.891 -19.034 -22.924 -28.064 -35.166 -45.673 -56.583 -64.583 -70.749 -75.637 -79.745 -83.118 -85.975 -88.357 -90.665 -92.553 -94.174 -95.673 -97.058 -98.34 -99.498 -100.686 -101.726 -102.612 -103.523 -104.45 -105.193 -105.937 -106.697 -107.287 -107.9 -108.53 -109.176 -109.84 -110.281 -110.718 -111.436 -111.927 -112.394 -112.626 -113.113 -113.672 -114.298 -114.622 -115.22 -115.607 -115.958 -116.317 -117.057 -117.456 -117.887 -118.344 -118.829 -119.415 -120.092 -122.111 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_227_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_227_231.txt deleted file mode 100644 index 6b2ffd1c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_227_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6106 ,TETRA ,17617257,Tue Nov 30 03:21:27 CET,Tue Nov 30 05:10:06 CET,0.0 0.46 0.605 0.679 0.722 0.756 0.772 0.768 0.716 0.667 0.614 0.538 0.487 0.419 0.28 0.139 -0.003 -0.081 -0.241 -0.395 -0.653 -0.834 -0.998 -1.242 -1.501 -1.752 -2.001 -2.252 -2.598 -2.956 -3.3 -3.743 -4.231 -4.731 -5.315 -6.004 -6.713 -7.58 -8.619 -9.789 -11.071 -12.592 -14.486 -16.536 -19.157 -22.314 -26.259 -31.18 -37.58 -46.208 -58.76 -71.669 -81.045 -88.283 -93.97 -98.678 -102.539 -105.824 -108.529 -111.114 -113.229 -115.056 -116.727 -118.241 -119.631 -120.897 -122.216 -123.344 -124.29 -125.224 -126.14 -126.876 -127.626 -128.414 -129.014 -129.602 -130.186 -130.781 -131.396 -131.819 -132.255 -132.933 -133.399 -133.867 -134.099 -134.581 -135.076 -135.569 -135.826 -136.233 -136.626 -136.901 -137.182 -137.786 -138.113 -138.456 -138.818 -139.25 -139.76 -140.337 -141.579 -2 ,17073 ,TETRA ,17617258,Tue Nov 30 03:23:29 CET,Tue Nov 30 05:12:14 CET,0.0 0.626 0.838 0.924 0.949 0.956 0.939 0.906 0.833 0.8 0.762 0.659 0.606 0.544 0.414 0.278 0.138 0.076 -0.045 -0.181 -0.397 -0.555 -0.72 -0.971 -1.228 -1.486 -1.766 -2.068 -2.468 -2.871 -3.291 -3.799 -4.274 -4.758 -5.386 -6.138 -6.86 -7.697 -8.696 -9.858 -11.15 -12.679 -14.58 -16.612 -19.166 -22.257 -26.136 -30.945 -37.252 -45.787 -58.156 -70.901 -80.116 -87.142 -92.682 -97.328 -101.147 -104.394 -107.011 -109.488 -111.552 -113.328 -114.987 -116.511 -117.884 -119.112 -120.344 -121.386 -122.272 -123.171 -124.089 -124.828 -125.57 -126.379 -126.984 -127.541 -128.086 -128.641 -129.215 -129.613 -130.03 -130.671 -131.114 -131.575 -131.81 -132.278 -132.738 -133.189 -133.42 -133.797 -134.158 -134.427 -134.728 -135.349 -135.647 -135.944 -136.281 -136.662 -137.12 -137.724 -139.386 -3 ,6891 ,TETRA ,17617259,Tue Nov 30 03:23:30 CET,Tue Nov 30 05:13:55 CET,0.0 0.469 0.579 0.647 0.691 0.695 0.688 0.684 0.663 0.636 0.593 0.483 0.429 0.379 0.263 0.133 0.001 -0.072 -0.224 -0.371 -0.6 -0.754 -0.899 -1.144 -1.406 -1.656 -1.923 -2.212 -2.615 -3.028 -3.435 -3.946 -4.469 -4.999 -5.642 -6.4 -7.175 -8.08 -9.109 -10.276 -11.513 -12.968 -14.839 -16.864 -19.437 -22.528 -26.387 -31.168 -37.48 -46.07 -58.592 -71.43 -80.635 -87.713 -93.308 -97.928 -101.71 -104.948 -107.649 -110.246 -112.337 -114.085 -115.739 -117.26 -118.593 -119.812 -121.054 -122.081 -122.926 -123.784 -124.663 -125.371 -126.09 -126.821 -127.381 -127.95 -128.524 -129.128 -129.752 -130.153 -130.554 -131.181 -131.602 -132.025 -132.241 -132.687 -133.142 -133.617 -133.857 -134.233 -134.608 -134.879 -135.159 -135.775 -136.097 -136.433 -136.771 -137.107 -137.484 -137.945 -139.329 -4 ,2404 ,TETRA ,17617260,Tue Nov 30 03:23:29 CET,Tue Nov 30 04:59:48 CET,0.0 0.691 0.869 0.963 1.008 1.009 0.998 0.994 0.97 0.944 0.911 0.831 0.78 0.727 0.639 0.539 0.423 0.368 0.248 0.108 -0.115 -0.261 -0.409 -0.662 -0.939 -1.207 -1.453 -1.7 -2.027 -2.364 -2.719 -3.195 -3.695 -4.206 -4.833 -5.591 -6.361 -7.254 -8.272 -9.423 -10.736 -12.296 -14.22 -16.296 -18.905 -22.044 -25.98 -30.878 -37.235 -45.823 -58.402 -71.235 -80.471 -87.628 -93.288 -97.968 -101.75 -104.936 -107.575 -110.089 -112.131 -113.878 -115.49 -116.996 -118.38 -119.573 -120.74 -121.758 -122.608 -123.447 -124.302 -124.993 -125.685 -126.394 -126.946 -127.503 -128.07 -128.655 -129.255 -129.653 -130.045 -130.679 -131.124 -131.564 -131.781 -132.217 -132.652 -133.084 -133.317 -133.693 -134.027 -134.272 -134.53 -135.051 -135.317 -135.581 -135.866 -136.2 -136.556 -136.972 -137.945 -5 ,14041 ,TETRA ,17617261,Tue Nov 30 03:24:25 CET,Tue Nov 30 05:13:51 CET,0.0 0.495 0.602 0.657 0.694 0.707 0.698 0.688 0.655 0.621 0.576 0.487 0.452 0.396 0.246 0.091 -0.056 -0.127 -0.28 -0.434 -0.676 -0.848 -1.025 -1.283 -1.54 -1.822 -2.122 -2.416 -2.81 -3.212 -3.609 -4.122 -4.639 -5.148 -5.781 -6.524 -7.276 -8.166 -9.137 -10.238 -11.516 -13.026 -14.909 -16.934 -19.462 -22.545 -26.435 -31.23 -37.486 -45.996 -58.345 -70.935 -80.062 -87.065 -92.612 -97.204 -100.913 -104.085 -106.683 -109.145 -111.171 -112.898 -114.531 -116.007 -117.282 -118.416 -119.56 -120.558 -121.41 -122.276 -123.157 -123.87 -124.632 -125.436 -126.032 -126.642 -127.271 -127.9 -128.528 -128.956 -129.403 -130.1 -130.576 -131.065 -131.315 -131.823 -132.352 -132.885 -133.14 -133.54 -134.007 -134.307 -134.594 -135.206 -135.551 -135.945 -136.355 -136.775 -137.282 -137.89 -139.287 -6 ,431 ,TETRA ,17617262,Tue Nov 30 03:24:25 CET,Tue Nov 30 05:12:24 CET,0.0 0.437 0.563 0.633 0.673 0.689 0.71 0.725 0.701 0.676 0.647 0.561 0.512 0.47 0.378 0.271 0.157 0.091 -0.044 -0.176 -0.401 -0.567 -0.722 -0.959 -1.198 -1.434 -1.679 -1.919 -2.252 -2.613 -3.004 -3.532 -4.07 -4.612 -5.253 -6.009 -6.796 -7.699 -8.671 -9.761 -11.032 -12.573 -14.504 -16.577 -19.132 -22.191 -26.056 -30.885 -37.202 -45.767 -58.255 -71.02 -80.22 -87.292 -92.873 -97.48 -101.209 -104.44 -107.105 -109.628 -111.729 -113.502 -115.118 -116.61 -117.938 -119.097 -120.305 -121.391 -122.278 -123.142 -124.021 -124.723 -125.431 -126.165 -126.735 -127.301 -127.859 -128.436 -129.037 -129.439 -129.84 -130.469 -130.913 -131.391 -131.633 -132.126 -132.644 -133.184 -133.46 -133.858 -134.232 -134.492 -134.765 -135.361 -135.669 -135.987 -136.332 -136.705 -137.15 -137.794 -139.508 -7 ,30974 ,TETRA ,17617263,Tue Nov 30 03:25:25 CET,Tue Nov 30 05:14:28 CET,0.0 0.408 0.503 0.551 0.551 0.564 0.584 0.579 0.525 0.481 0.429 0.326 0.273 0.208 0.062 -0.087 -0.225 -0.296 -0.456 -0.617 -0.852 -1.016 -1.2 -1.487 -1.768 -2.031 -2.278 -2.52 -2.857 -3.213 -3.58 -4.048 -4.553 -5.099 -5.768 -6.546 -7.333 -8.249 -9.278 -10.428 -11.698 -13.222 -15.107 -17.117 -19.633 -22.68 -26.563 -31.418 -37.794 -46.437 -58.881 -71.573 -80.815 -87.899 -93.491 -98.158 -101.919 -105.123 -107.809 -110.389 -112.484 -114.341 -116.116 -117.675 -119.037 -120.236 -121.446 -122.504 -123.412 -124.358 -125.307 -126.085 -126.872 -127.655 -128.258 -128.877 -129.513 -130.127 -130.724 -131.127 -131.535 -132.168 -132.602 -133.05 -133.278 -133.736 -134.212 -134.705 -134.949 -135.334 -135.723 -136.0 -136.281 -136.868 -137.194 -137.556 -137.932 -138.28 -138.641 -139.103 -140.036 -8 ,1980 ,TETRA ,17617264,Tue Nov 30 03:25:26 CET,Tue Nov 30 05:12:23 CET,0.0 0.433 0.562 0.618 0.648 0.655 0.635 0.607 0.533 0.49 0.445 0.354 0.308 0.261 0.173 0.077 -0.03 -0.102 -0.264 -0.428 -0.682 -0.858 -1.034 -1.313 -1.606 -1.899 -2.198 -2.503 -2.909 -3.323 -3.741 -4.259 -4.788 -5.329 -5.997 -6.78 -7.573 -8.487 -9.508 -10.646 -11.909 -13.419 -15.326 -17.379 -19.912 -23.004 -26.941 -31.82 -38.199 -46.81 -59.363 -72.285 -81.498 -88.505 -94.048 -98.622 -102.357 -105.55 -108.148 -110.62 -112.704 -114.464 -116.032 -117.472 -118.781 -119.943 -121.115 -122.185 -123.138 -124.085 -125.016 -125.771 -126.543 -127.346 -127.955 -128.556 -129.171 -129.791 -130.403 -130.822 -131.242 -131.844 -132.257 -132.704 -132.938 -133.403 -133.866 -134.348 -134.587 -134.95 -135.282 -135.541 -135.81 -136.355 -136.641 -136.94 -137.25 -137.595 -138.05 -138.631 -139.932 -9 ,31104 ,TETRA ,17617265,Tue Nov 30 03:25:28 CET,Tue Nov 30 05:11:46 CET,0.0 0.568 0.672 0.748 0.79 0.804 0.793 0.768 0.674 0.627 0.591 0.507 0.46 0.409 0.294 0.169 0.034 -0.038 -0.195 -0.356 -0.598 -0.748 -0.902 -1.157 -1.41 -1.678 -1.94 -2.198 -2.555 -2.911 -3.301 -3.82 -4.334 -4.86 -5.518 -6.291 -7.065 -7.968 -8.997 -10.156 -11.462 -13.007 -14.931 -17.014 -19.593 -22.688 -26.578 -31.407 -37.748 -46.348 -58.847 -71.659 -80.871 -87.961 -93.534 -98.153 -101.949 -105.191 -107.905 -110.524 -112.643 -114.405 -116.041 -117.547 -118.885 -120.089 -121.318 -122.355 -123.236 -124.12 -124.996 -125.699 -126.411 -127.13 -127.666 -128.22 -128.802 -129.402 -130.003 -130.406 -130.824 -131.469 -131.906 -132.358 -132.58 -133.031 -133.519 -134.009 -134.245 -134.627 -135.011 -135.276 -135.55 -136.103 -136.4 -136.724 -137.071 -137.433 -137.808 -138.29 -139.222 -10 ,24934 ,TETRA ,17617266,Tue Nov 30 04:27:22 CET,Tue Nov 30 06:15:57 CET,0.0 0.539 0.68 0.737 0.753 0.768 0.771 0.743 0.677 0.633 0.585 0.497 0.448 0.393 0.289 0.184 0.061 -0.004 -0.145 -0.289 -0.504 -0.655 -0.818 -1.051 -1.278 -1.544 -1.845 -2.145 -2.544 -2.96 -3.351 -3.807 -4.28 -4.797 -5.445 -6.175 -6.923 -7.815 -8.836 -10.005 -11.304 -12.829 -14.71 -16.754 -19.35 -22.454 -26.294 -31.077 -37.41 -45.983 -58.45 -71.215 -80.46 -87.629 -93.262 -97.878 -101.663 -104.911 -107.567 -110.088 -112.145 -113.906 -115.543 -117.04 -118.407 -119.606 -120.792 -121.825 -122.697 -123.55 -124.396 -125.109 -125.832 -126.556 -127.127 -127.71 -128.311 -128.924 -129.524 -129.908 -130.296 -130.912 -131.327 -131.746 -131.966 -132.441 -132.924 -133.434 -133.699 -134.095 -134.49 -134.772 -135.078 -135.729 -136.031 -136.331 -136.657 -137.002 -137.399 -137.897 -139.195 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_227_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_227_57.txt deleted file mode 100644 index 6b3b9393..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_227_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13443 ,TETRA ,17617267,Tue Nov 30 04:27:22 CET,Tue Nov 30 06:20:27 CET,0.0 0.9 1.238 1.461 1.655 1.816 1.96 2.086 2.323 2.442 2.552 2.75 2.845 2.934 3.1 3.249 3.378 3.44 3.565 3.698 3.901 4.014 4.11 4.256 4.393 4.512 4.627 4.742 4.908 5.055 5.185 5.352 5.507 5.646 5.814 6.0 6.169 6.375 6.616 6.863 7.099 7.324 7.563 7.786 8.011 8.239 8.485 8.718 8.937 9.009 8.787 8.282 7.687 7.121 6.604 6.112 5.622 5.162 4.79 4.423 4.108 3.812 3.519 3.249 3.002 2.768 2.523 2.301 2.092 1.88 1.679 1.502 1.32 1.14 0.985 0.826 0.666 0.495 0.337 0.23 0.102 -0.111 -0.262 -0.417 -0.502 -0.691 -0.899 -1.109 -1.219 -1.335 -1.525 -1.628 -1.739 -2.011 -2.166 -2.34 -2.541 -2.757 -2.983 -3.284 -4.028 -2 ,10898 ,TETRA ,17617268,Tue Nov 30 04:28:28 CET,Tue Nov 30 06:15:13 CET,0.0 0.744 1.029 1.248 1.442 1.586 1.709 1.847 2.115 2.219 2.306 2.483 2.577 2.664 2.816 2.959 3.103 3.169 3.293 3.415 3.592 3.706 3.805 3.943 4.102 4.251 4.395 4.541 4.714 4.878 5.042 5.218 5.36 5.496 5.672 5.865 6.035 6.227 6.424 6.617 6.807 7.011 7.245 7.462 7.7 7.958 8.259 8.555 8.818 8.964 8.788 8.265 7.698 7.168 6.659 6.186 5.767 5.298 4.861 4.471 4.144 3.86 3.6 3.323 3.018 2.698 2.368 2.078 1.834 1.615 1.413 1.24 1.05 0.856 0.704 0.546 0.382 0.21 0.023 -0.113 -0.247 -0.456 -0.603 -0.761 -0.843 -1.001 -1.174 -1.368 -1.478 -1.598 -1.796 -1.901 -2.026 -2.281 -2.419 -2.591 -2.77 -2.991 -3.279 -3.626 -4.526 -3 ,31004 ,TETRA ,17617269,Tue Nov 30 04:40:02 CET,Tue Nov 30 06:33:30 CET,0.0 1.008 1.345 1.578 1.78 1.963 2.135 2.282 2.514 2.627 2.733 2.91 2.989 3.064 3.205 3.339 3.486 3.556 3.683 3.806 3.982 4.089 4.201 4.372 4.527 4.681 4.829 4.969 5.152 5.318 5.472 5.643 5.795 5.937 6.112 6.348 6.588 6.834 7.088 7.329 7.544 7.802 8.152 8.48 8.759 9.006 9.285 9.54 9.714 9.83 9.739 9.214 8.635 8.06 7.529 7.047 6.624 6.233 5.878 5.51 5.114 4.765 4.488 4.23 3.996 3.784 3.558 3.357 3.173 2.98 2.766 2.581 2.4 2.2 2.033 1.876 1.73 1.576 1.397 1.255 1.101 0.861 0.7 0.539 0.451 0.263 0.073 -0.14 -0.262 -0.389 -0.629 -0.752 -0.874 -1.174 -1.354 -1.554 -1.766 -1.98 -2.209 -2.462 -3.211 -4 ,13447 ,TETRA ,17617270,Tue Nov 30 04:40:02 CET,Tue Nov 30 06:22:47 CET,0.0 0.791 1.089 1.341 1.542 1.693 1.825 1.955 2.216 2.32 2.414 2.604 2.698 2.786 2.945 3.098 3.247 3.319 3.472 3.613 3.779 3.877 3.977 4.138 4.298 4.435 4.558 4.674 4.827 4.976 5.123 5.308 5.514 5.698 5.883 6.113 6.314 6.503 6.693 6.893 7.103 7.325 7.584 7.881 8.208 8.469 8.703 8.953 9.182 9.283 9.156 8.675 8.087 7.511 7.02 6.557 6.112 5.682 5.188 4.654 4.27 3.96 3.679 3.423 3.184 2.956 2.689 2.463 2.29 2.099 1.894 1.707 1.513 1.32 1.139 0.92 0.706 0.5 0.279 0.141 0.018 -0.204 -0.376 -0.543 -0.619 -0.767 -0.936 -1.122 -1.219 -1.329 -1.521 -1.626 -1.749 -2.019 -2.174 -2.341 -2.523 -2.701 -2.915 -3.221 -4.092 -5 ,31706 ,TETRA ,17617271,Tue Nov 30 03:12:23 CET,Tue Nov 30 04:46:28 CET,0.0 0.75 1.042 1.292 1.509 1.69 1.845 1.982 2.222 2.333 2.436 2.626 2.725 2.816 2.986 3.139 3.268 3.335 3.48 3.619 3.8 3.914 4.036 4.208 4.378 4.523 4.648 4.792 4.989 5.159 5.309 5.497 5.677 5.844 6.024 6.207 6.379 6.573 6.792 7.047 7.342 7.669 8.002 8.274 8.557 8.829 9.085 9.341 9.566 9.688 9.543 9.024 8.45 7.886 7.383 6.927 6.485 6.06 5.715 5.384 5.07 4.77 4.485 4.19 3.925 3.7 3.458 3.237 3.039 2.82 2.577 2.37 2.152 1.921 1.728 1.523 1.317 1.101 0.889 0.756 0.614 0.371 0.201 0.023 -0.068 -0.248 -0.428 -0.61 -0.699 -0.8 -1.009 -1.137 -1.277 -1.582 -1.743 -1.894 -2.076 -2.305 -2.531 -2.759 -3.59 -6 ,6476 ,TETRA ,17617272,Tue Nov 30 04:40:02 CET,Tue Nov 30 06:28:21 CET,0.0 0.808 1.113 1.317 1.473 1.635 1.798 1.936 2.158 2.257 2.348 2.532 2.616 2.685 2.841 2.997 3.146 3.22 3.363 3.491 3.65 3.763 3.878 4.036 4.201 4.364 4.518 4.671 4.87 5.028 5.168 5.355 5.535 5.691 5.886 6.119 6.319 6.543 6.762 6.962 7.157 7.371 7.602 7.813 8.06 8.343 8.642 8.913 9.162 9.326 9.259 8.817 8.274 7.708 7.179 6.698 6.243 5.818 5.441 5.038 4.672 4.339 3.985 3.616 3.282 2.984 2.692 2.468 2.286 2.088 1.888 1.717 1.54 1.347 1.186 1.015 0.822 0.618 0.413 0.268 0.12 -0.098 -0.267 -0.449 -0.534 -0.742 -0.956 -1.164 -1.272 -1.379 -1.588 -1.701 -1.835 -2.145 -2.304 -2.49 -2.696 -2.928 -3.195 -3.565 -4.513 -7 ,2579 ,TETRA ,17617273,Tue Nov 30 03:12:23 CET,Tue Nov 30 04:44:23 CET,0.0 0.712 1.021 1.285 1.484 1.64 1.782 1.915 2.143 2.253 2.357 2.513 2.602 2.689 2.873 3.053 3.185 3.243 3.378 3.511 3.694 3.816 3.937 4.12 4.293 4.434 4.553 4.675 4.84 5.0 5.165 5.373 5.552 5.726 5.948 6.199 6.421 6.612 6.812 7.045 7.274 7.524 7.805 8.065 8.335 8.601 8.87 9.098 9.313 9.485 9.438 9.065 8.482 7.891 7.376 6.888 6.372 5.893 5.54 5.197 4.876 4.584 4.299 4.042 3.809 3.575 3.339 3.098 2.852 2.6 2.346 2.136 1.921 1.695 1.51 1.312 1.11 0.911 0.698 0.558 0.429 0.217 0.06 -0.111 -0.204 -0.386 -0.555 -0.75 -0.85 -0.944 -1.149 -1.281 -1.421 -1.739 -1.918 -2.104 -2.278 -2.46 -2.698 -2.958 -3.727 -8 ,4947 ,TETRA ,17617274,Tue Nov 30 04:40:03 CET,Tue Nov 30 06:29:27 CET,0.0 0.912 1.28 1.566 1.78 1.968 2.121 2.257 2.535 2.674 2.798 3.005 3.108 3.203 3.376 3.526 3.669 3.744 3.901 4.051 4.243 4.366 4.486 4.649 4.808 4.965 5.104 5.219 5.37 5.519 5.663 5.845 6.018 6.181 6.374 6.59 6.788 6.989 7.204 7.438 7.662 7.897 8.157 8.42 8.695 8.926 9.171 9.472 9.807 9.98 9.789 9.263 8.678 8.092 7.492 6.967 6.543 6.13 5.77 5.418 5.096 4.791 4.508 4.209 3.88 3.602 3.341 3.111 2.887 2.613 2.32 2.075 1.83 1.606 1.435 1.239 1.037 0.865 0.704 0.581 0.455 0.255 0.107 -0.05 -0.144 -0.334 -0.517 -0.711 -0.812 -0.926 -1.16 -1.298 -1.448 -1.731 -1.877 -2.044 -2.224 -2.45 -2.727 -3.038 -3.964 -9 ,31006 ,TETRA ,17617275,Tue Nov 30 04:40:03 CET,Tue Nov 30 06:36:27 CET,0.0 0.743 1.007 1.234 1.412 1.554 1.714 1.871 2.13 2.245 2.338 2.503 2.581 2.656 2.793 2.937 3.084 3.152 3.27 3.373 3.546 3.683 3.817 3.995 4.158 4.306 4.446 4.577 4.734 4.877 5.029 5.221 5.373 5.513 5.69 5.888 6.066 6.251 6.428 6.623 6.848 7.084 7.353 7.601 7.844 8.103 8.36 8.602 8.799 8.876 8.748 8.301 7.755 7.241 6.759 6.302 5.89 5.494 5.138 4.793 4.484 4.171 3.874 3.596 3.332 3.043 2.725 2.465 2.213 1.937 1.66 1.433 1.204 0.965 0.784 0.6 0.408 0.219 0.011 -0.144 -0.282 -0.48 -0.626 -0.768 -0.839 -0.984 -1.131 -1.3 -1.4 -1.514 -1.735 -1.853 -1.98 -2.258 -2.4 -2.574 -2.762 -2.936 -3.157 -3.456 -4.376 -10 ,26824 ,TETRA ,17617276,Tue Nov 30 04:40:03 CET,Tue Nov 30 06:27:56 CET,0.0 0.72 0.97 1.157 1.343 1.537 1.698 1.831 2.055 2.151 2.252 2.439 2.528 2.613 2.781 2.93 3.076 3.152 3.311 3.467 3.651 3.748 3.842 3.986 4.141 4.296 4.434 4.565 4.747 4.916 5.071 5.271 5.483 5.665 5.851 6.043 6.202 6.371 6.561 6.76 6.97 7.203 7.437 7.666 7.915 8.181 8.442 8.685 8.918 9.021 8.853 8.3 7.73 7.146 6.607 6.12 5.667 5.229 4.835 4.447 4.137 3.887 3.637 3.385 3.144 2.916 2.695 2.499 2.306 2.109 1.904 1.724 1.547 1.358 1.192 1.013 0.84 0.671 0.477 0.34 0.21 -0.011 -0.18 -0.353 -0.437 -0.592 -0.76 -0.96 -1.068 -1.181 -1.384 -1.502 -1.637 -1.92 -2.075 -2.267 -2.476 -2.678 -2.911 -3.195 -3.87 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_235_167.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_235_167.txt deleted file mode 100644 index 98586d4c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_235_167.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9223 ,TETRA ,17617277,Tue Nov 30 04:40:03 CET,Tue Nov 30 06:34:41 CET,0.0 1.934 2.314 2.561 2.777 2.942 3.086 3.198 3.326 3.374 3.412 3.501 3.527 3.573 3.658 3.7 3.713 3.715 3.719 3.727 3.734 3.724 3.699 3.671 3.622 3.56 3.487 3.384 3.242 3.078 2.878 2.641 2.39 2.104 1.777 1.394 0.973 0.437 -0.176 -0.864 -1.631 -2.54 -3.693 -4.971 -6.609 -8.601 -11.133 -14.333 -18.591 -24.499 -33.296 -42.426 -49.122 -54.293 -58.394 -61.85 -64.71 -67.14 -69.133 -71.061 -72.683 -74.103 -75.404 -76.58 -77.639 -78.57 -79.516 -80.351 -81.061 -81.777 -82.5 -83.079 -83.66 -84.258 -84.709 -85.153 -85.604 -86.071 -86.547 -86.864 -87.196 -87.72 -88.072 -88.428 -88.612 -89.003 -89.407 -89.815 -90.021 -90.312 -90.668 -90.893 -91.131 -91.642 -91.919 -92.226 -92.542 -92.877 -93.279 -93.795 -95.334 -2 ,5901 ,TETRA ,17617278,Tue Nov 30 04:40:02 CET,Tue Nov 30 06:20:45 CET,0.0 1.37 1.845 2.155 2.353 2.509 2.631 2.729 2.892 2.962 3.018 3.101 3.118 3.163 3.236 3.262 3.267 3.27 3.271 3.261 3.236 3.204 3.156 3.057 2.939 2.809 2.672 2.524 2.314 2.094 1.864 1.591 1.318 1.021 0.653 0.195 -0.285 -0.818 -1.422 -2.109 -2.896 -3.849 -5.05 -6.381 -8.058 -10.097 -12.715 -16.051 -20.459 -26.452 -35.322 -44.574 -51.336 -56.541 -60.672 -64.169 -67.034 -69.442 -71.43 -73.332 -74.884 -76.205 -77.422 -78.537 -79.536 -80.432 -81.349 -82.132 -82.796 -83.492 -84.24 -84.865 -85.48 -86.103 -86.589 -87.083 -87.559 -88.034 -88.528 -88.863 -89.203 -89.735 -90.103 -90.469 -90.648 -91.012 -91.403 -91.814 -92.024 -92.315 -92.633 -92.84 -93.064 -93.538 -93.795 -94.082 -94.396 -94.749 -95.136 -95.605 -97.188 -3 ,11733 ,TETRA ,17617279,Tue Nov 30 04:40:03 CET,Tue Nov 30 06:36:09 CET,0.0 1.927 2.282 2.54 2.736 2.863 2.967 3.062 3.231 3.293 3.324 3.405 3.421 3.433 3.447 3.462 3.466 3.467 3.46 3.438 3.384 3.331 3.266 3.184 3.133 3.102 3.055 2.987 2.908 2.815 2.673 2.429 2.149 1.864 1.518 1.113 0.683 0.157 -0.478 -1.206 -2.008 -2.984 -4.241 -5.602 -7.292 -9.322 -11.93 -15.263 -19.697 -25.738 -34.635 -43.923 -50.704 -55.943 -60.072 -63.515 -66.347 -68.758 -70.73 -72.646 -74.246 -75.606 -76.894 -78.063 -79.094 -80.053 -81.022 -81.827 -82.496 -83.169 -83.89 -84.5 -85.102 -85.717 -86.179 -86.642 -87.132 -87.634 -88.146 -88.486 -88.814 -89.323 -89.68 -90.061 -90.259 -90.646 -91.037 -91.432 -91.626 -91.909 -92.261 -92.496 -92.733 -93.206 -93.459 -93.737 -94.038 -94.371 -94.745 -95.202 -96.696 -4 ,4016 ,TETRA ,17617280,Tue Nov 30 04:40:03 CET,Tue Nov 30 06:26:09 CET,0.0 1.639 2.018 2.266 2.42 2.507 2.554 2.594 2.636 2.667 2.705 2.757 2.752 2.774 2.802 2.832 2.844 2.84 2.842 2.817 2.745 2.691 2.631 2.542 2.436 2.305 2.192 2.077 1.901 1.709 1.507 1.281 1.04 0.773 0.477 0.113 -0.301 -0.8 -1.4 -2.089 -2.854 -3.782 -4.963 -6.272 -7.967 -10.045 -12.617 -15.844 -20.163 -26.118 -34.925 -44.024 -50.714 -55.909 -60.002 -63.443 -66.345 -68.823 -70.792 -72.654 -74.201 -75.534 -76.763 -77.896 -78.903 -79.792 -80.706 -81.491 -82.156 -82.836 -83.528 -84.104 -84.721 -85.342 -85.806 -86.278 -86.733 -87.201 -87.703 -88.035 -88.376 -88.907 -89.25 -89.577 -89.747 -90.116 -90.5 -90.893 -91.095 -91.381 -91.715 -91.944 -92.178 -92.626 -92.86 -93.106 -93.378 -93.667 -94.027 -94.514 -95.855 -5 ,8884 ,TETRA ,17617281,Tue Nov 30 04:40:06 CET,Tue Nov 30 06:25:18 CET,0.0 1.17 1.441 1.625 1.769 1.889 1.977 2.057 2.217 2.295 2.363 2.487 2.497 2.51 2.538 2.569 2.576 2.565 2.576 2.583 2.549 2.515 2.459 2.369 2.275 2.174 2.078 1.996 1.859 1.676 1.474 1.239 1.0 0.706 0.344 -0.063 -0.498 -1.02 -1.632 -2.345 -3.136 -4.072 -5.276 -6.601 -8.253 -10.298 -12.898 -16.139 -20.375 -26.202 -34.859 -43.898 -50.529 -55.647 -59.684 -63.044 -65.856 -68.299 -70.31 -72.227 -73.811 -75.148 -76.368 -77.501 -78.573 -79.561 -80.534 -81.341 -82.002 -82.683 -83.383 -83.949 -84.524 -85.111 -85.565 -86.041 -86.539 -87.038 -87.547 -87.888 -88.242 -88.773 -89.112 -89.461 -89.639 -89.992 -90.359 -90.765 -90.976 -91.263 -91.598 -91.817 -92.053 -92.552 -92.813 -93.087 -93.407 -93.789 -94.214 -94.738 -96.465 -6 ,6780 ,TETRA ,17617282,Tue Nov 30 04:41:03 CET,Tue Nov 30 06:36:49 CET,0.0 1.864 2.336 2.63 2.851 3.02 3.16 3.273 3.423 3.469 3.526 3.643 3.657 3.674 3.688 3.716 3.739 3.747 3.762 3.766 3.763 3.75 3.724 3.653 3.567 3.476 3.366 3.231 3.036 2.842 2.649 2.428 2.196 1.911 1.542 1.113 0.66 0.113 -0.515 -1.206 -2.002 -2.979 -4.208 -5.556 -7.204 -9.204 -11.804 -15.086 -19.498 -25.541 -34.338 -43.53 -50.243 -55.415 -59.508 -63.051 -65.987 -68.421 -70.406 -72.286 -73.829 -75.146 -76.399 -77.555 -78.572 -79.515 -80.501 -81.351 -82.046 -82.729 -83.432 -84.0 -84.579 -85.16 -85.586 -86.019 -86.48 -86.975 -87.491 -87.834 -88.175 -88.706 -89.074 -89.434 -89.607 -89.96 -90.345 -90.736 -90.931 -91.222 -91.584 -91.816 -92.052 -92.54 -92.811 -93.096 -93.386 -93.711 -94.109 -94.603 -95.904 -7 ,3159 ,TETRA ,17617283,Tue Nov 30 04:42:02 CET,Tue Nov 30 06:14:03 CET,0.0 1.438 1.823 2.08 2.262 2.381 2.486 2.576 2.688 2.718 2.739 2.781 2.77 2.779 2.788 2.796 2.799 2.784 2.744 2.71 2.667 2.643 2.615 2.553 2.487 2.396 2.281 2.165 1.983 1.78 1.557 1.274 1.008 0.726 0.353 -0.102 -0.557 -1.048 -1.628 -2.326 -3.11 -4.086 -5.33 -6.668 -8.345 -10.409 -13.038 -16.348 -20.69 -26.577 -35.233 -44.348 -51.02 -56.17 -60.298 -63.758 -66.584 -69.032 -71.089 -73.023 -74.615 -76.045 -77.364 -78.533 -79.616 -80.565 -81.514 -82.351 -83.05 -83.749 -84.458 -85.025 -85.602 -86.193 -86.652 -87.13 -87.62 -88.123 -88.628 -88.965 -89.3 -89.801 -90.151 -90.523 -90.714 -91.108 -91.511 -91.92 -92.131 -92.427 -92.789 -93.018 -93.253 -93.747 -93.996 -94.257 -94.542 -94.857 -95.235 -95.731 -97.004 -8 ,6707 ,TETRA ,17617284,Tue Nov 30 04:45:02 CET,Tue Nov 30 06:36:00 CET,0.0 1.397 1.701 1.942 2.148 2.309 2.451 2.574 2.717 2.762 2.799 2.869 2.874 2.884 2.879 2.866 2.872 2.874 2.864 2.834 2.754 2.705 2.656 2.557 2.436 2.306 2.168 2.014 1.802 1.611 1.422 1.173 0.95 0.76 0.456 -0.006 -0.501 -1.066 -1.715 -2.446 -3.256 -4.246 -5.456 -6.75 -8.403 -10.414 -12.973 -16.231 -20.574 -26.544 -35.357 -44.606 -51.383 -56.663 -60.896 -64.388 -67.221 -69.63 -71.625 -73.56 -75.146 -76.486 -77.751 -78.934 -79.985 -80.894 -81.806 -82.61 -83.287 -83.955 -84.619 -85.163 -85.727 -86.312 -86.774 -87.256 -87.728 -88.209 -88.721 -89.047 -89.36 -89.876 -90.24 -90.602 -90.776 -91.125 -91.51 -91.92 -92.125 -92.409 -92.746 -92.968 -93.199 -93.673 -93.919 -94.179 -94.463 -94.828 -95.233 -95.69 -97.168 -9 ,21419 ,TETRA ,17617285,Tue Nov 30 04:45:02 CET,Tue Nov 30 06:16:17 CET,0.0 1.469 1.834 2.105 2.258 2.371 2.47 2.538 2.624 2.67 2.72 2.812 2.815 2.835 2.843 2.819 2.819 2.817 2.802 2.786 2.726 2.679 2.655 2.622 2.538 2.425 2.303 2.173 1.973 1.759 1.547 1.275 0.998 0.722 0.369 -0.086 -0.552 -1.068 -1.625 -2.228 -2.926 -3.863 -5.113 -6.441 -8.101 -10.159 -12.736 -15.998 -20.382 -26.358 -35.113 -44.289 -51.043 -56.311 -60.489 -63.976 -66.866 -69.319 -71.313 -73.232 -74.843 -76.216 -77.453 -78.588 -79.655 -80.639 -81.654 -82.52 -83.22 -83.926 -84.654 -85.241 -85.842 -86.47 -86.958 -87.443 -87.931 -88.433 -88.938 -89.275 -89.608 -90.116 -90.48 -90.853 -91.036 -91.41 -91.789 -92.194 -92.411 -92.712 -93.06 -93.282 -93.516 -94.021 -94.285 -94.563 -94.869 -95.198 -95.584 -96.095 -97.844 -10 ,6669 ,TETRA ,17617286,Tue Nov 30 04:46:02 CET,Tue Nov 30 06:33:15 CET,0.0 1.446 1.834 2.097 2.294 2.438 2.561 2.678 2.862 2.933 2.991 3.095 3.125 3.163 3.227 3.267 3.286 3.291 3.264 3.22 3.167 3.122 3.062 2.953 2.825 2.721 2.637 2.518 2.329 2.144 1.961 1.72 1.449 1.161 0.794 0.356 -0.09 -0.612 -1.219 -1.915 -2.693 -3.636 -4.82 -6.111 -7.784 -9.842 -12.419 -15.688 -20.083 -26.058 -34.881 -44.13 -50.83 -56.023 -60.188 -63.683 -66.513 -68.95 -70.97 -72.855 -74.417 -75.764 -77.022 -78.17 -79.197 -80.118 -81.049 -81.853 -82.526 -83.216 -83.923 -84.492 -85.072 -85.67 -86.123 -86.58 -87.041 -87.501 -87.962 -88.277 -88.595 -89.075 -89.414 -89.768 -89.949 -90.311 -90.68 -91.075 -91.29 -91.594 -91.955 -92.179 -92.414 -92.919 -93.187 -93.476 -93.785 -94.13 -94.519 -94.979 -96.318 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_235_224.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_235_224.txt deleted file mode 100644 index 67a76b39..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_235_224.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1120 ,TETRA ,17617287,Tue Nov 30 04:46:02 CET,Tue Nov 30 06:32:40 CET,0.0 1.635 1.957 2.214 2.425 2.612 2.783 2.933 3.214 3.343 3.465 3.722 3.826 3.943 4.168 4.379 4.571 4.658 4.823 4.988 5.234 5.393 5.539 5.75 5.944 6.132 6.315 6.49 6.726 6.941 7.138 7.381 7.602 7.815 8.064 8.351 8.625 8.925 9.281 9.657 9.998 10.372 10.832 11.277 11.778 12.331 12.917 13.517 14.171 14.851 15.58 15.981 15.942 15.733 15.394 15.054 14.775 14.473 14.144 13.785 13.505 13.237 12.971 12.72 12.489 12.294 12.086 11.875 11.685 11.439 11.149 10.924 10.69 10.426 10.2 9.95 9.702 9.454 9.217 9.055 8.879 8.608 8.413 8.199 8.081 7.852 7.616 7.371 7.249 7.131 6.793 6.619 6.43 6.032 5.81 5.551 5.249 4.921 4.516 3.948 2.073 -2 ,29453 ,TETRA ,17617288,Tue Nov 30 04:48:03 CET,Tue Nov 30 06:20:16 CET,0.0 1.04 1.388 1.647 1.875 2.081 2.264 2.437 2.753 2.894 3.023 3.284 3.375 3.48 3.679 3.859 4.047 4.141 4.327 4.512 4.771 4.93 5.082 5.311 5.536 5.75 5.957 6.161 6.402 6.62 6.828 7.064 7.304 7.552 7.827 8.121 8.399 8.685 9.003 9.347 9.694 10.064 10.484 10.906 11.411 11.934 12.511 13.133 13.766 14.446 15.047 15.207 15.147 15.006 14.754 14.427 14.019 13.612 13.306 13.008 12.758 12.527 12.275 12.014 11.759 11.494 11.213 10.972 10.769 10.564 10.342 10.146 9.934 9.718 9.532 9.303 9.057 8.806 8.523 8.325 8.117 7.767 7.541 7.311 7.18 6.924 6.658 6.38 6.253 6.141 5.825 5.667 5.491 5.1 4.893 4.656 4.378 4.072 3.733 3.248 1.306 -3 ,24729 ,TETRA ,17617289,Tue Nov 30 04:48:04 CET,Tue Nov 30 06:49:40 CET,0.0 1.809 2.169 2.459 2.661 2.843 3.024 3.183 3.479 3.63 3.773 4.022 4.106 4.207 4.421 4.63 4.818 4.912 5.106 5.288 5.552 5.721 5.869 6.076 6.287 6.495 6.707 6.916 7.189 7.442 7.665 7.923 8.172 8.417 8.68 8.956 9.213 9.491 9.788 10.115 10.465 10.836 11.254 11.679 12.179 12.712 13.272 13.866 14.565 15.332 16.098 16.458 16.339 16.061 15.763 15.438 15.08 14.713 14.422 14.115 13.829 13.575 13.316 13.043 12.76 12.505 12.253 11.989 11.729 11.469 11.197 10.968 10.715 10.422 10.21 10.011 9.785 9.545 9.286 9.101 8.917 8.648 8.454 8.239 8.122 7.874 7.628 7.374 7.232 7.104 6.751 6.571 6.39 5.99 5.758 5.489 5.202 4.866 4.442 3.84 1.863 -4 ,20256 ,TETRA ,17617290,Tue Nov 30 04:49:03 CET,Tue Nov 30 06:27:44 CET,0.0 1.453 1.738 1.943 2.137 2.344 2.53 2.689 2.956 3.082 3.202 3.441 3.542 3.664 3.885 4.087 4.282 4.381 4.574 4.752 5.005 5.163 5.299 5.482 5.668 5.858 6.044 6.242 6.518 6.768 6.977 7.203 7.415 7.628 7.87 8.185 8.506 8.815 9.131 9.458 9.81 10.205 10.644 11.076 11.571 12.104 12.689 13.309 14.013 14.745 15.39 15.763 15.816 15.643 15.381 14.972 14.557 14.195 13.851 13.468 13.132 12.835 12.52 12.216 11.932 11.666 11.382 11.141 10.924 10.662 10.362 10.121 9.901 9.685 9.511 9.317 9.103 8.866 8.627 8.459 8.266 7.959 7.757 7.556 7.449 7.227 6.983 6.707 6.567 6.454 6.14 5.971 5.794 5.398 5.185 4.951 4.682 4.354 3.962 3.407 1.102 -5 ,528 ,TETRA ,17617291,Tue Nov 30 04:52:02 CET,Tue Nov 30 06:34:31 CET,0.0 1.43 1.796 2.049 2.265 2.449 2.607 2.762 3.057 3.186 3.31 3.568 3.679 3.812 4.055 4.273 4.487 4.593 4.791 4.975 5.234 5.407 5.578 5.824 6.047 6.262 6.46 6.629 6.861 7.113 7.358 7.663 7.927 8.148 8.41 8.7 8.966 9.255 9.586 9.929 10.269 10.67 11.124 11.571 12.101 12.674 13.333 14.036 14.756 15.561 16.352 16.691 16.655 16.481 16.27 15.939 15.58 15.215 14.907 14.615 14.315 14.033 13.783 13.541 13.305 13.044 12.714 12.461 12.269 12.075 11.845 11.623 11.398 11.164 10.993 10.806 10.591 10.355 10.098 9.942 9.783 9.521 9.34 9.147 9.051 8.853 8.628 8.37 8.237 8.123 7.778 7.594 7.402 6.977 6.74 6.489 6.203 5.852 5.428 4.871 2.82 -6 ,14937 ,TETRA ,17617292,Tue Nov 30 04:54:04 CET,Tue Nov 30 06:53:14 CET,0.0 1.29 1.64 1.882 2.089 2.293 2.486 2.656 2.959 3.104 3.238 3.502 3.598 3.71 3.937 4.14 4.308 4.387 4.547 4.699 4.902 5.03 5.165 5.372 5.564 5.737 5.917 6.109 6.343 6.559 6.774 7.032 7.281 7.542 7.834 8.119 8.406 8.705 9.021 9.372 9.795 10.257 10.674 11.085 11.568 12.092 12.687 13.31 13.941 14.648 15.299 15.533 15.471 15.213 14.894 14.595 14.301 13.978 13.668 13.294 12.942 12.648 12.361 12.044 11.745 11.488 11.193 10.908 10.66 10.426 10.188 9.979 9.755 9.488 9.255 9.026 8.805 8.574 8.343 8.192 8.017 7.704 7.486 7.268 7.15 6.902 6.647 6.369 6.231 6.11 5.796 5.631 5.459 5.07 4.836 4.598 4.357 4.09 3.74 3.267 1.15 -7 ,32422 ,TETRA ,17617293,Tue Nov 30 04:55:02 CET,Tue Nov 30 06:38:26 CET,0.0 1.226 1.547 1.793 2.009 2.218 2.411 2.576 2.879 3.02 3.161 3.435 3.541 3.662 3.897 4.112 4.322 4.433 4.616 4.763 4.995 5.148 5.297 5.529 5.759 5.986 6.207 6.412 6.664 6.933 7.179 7.424 7.653 7.877 8.131 8.404 8.682 8.988 9.285 9.586 9.924 10.318 10.77 11.203 11.691 12.192 12.76 13.408 14.095 14.821 15.471 15.738 15.654 15.377 15.024 14.687 14.404 14.121 13.819 13.465 13.153 12.877 12.572 12.245 11.931 11.609 11.268 10.97 10.71 10.461 10.204 9.983 9.751 9.488 9.284 9.067 8.832 8.584 8.353 8.199 8.004 7.703 7.512 7.309 7.2 6.969 6.713 6.421 6.255 6.12 5.803 5.641 5.468 5.073 4.853 4.596 4.293 3.944 3.56 3.08 1.15 -8 ,30126 ,TETRA ,17617294,Tue Nov 30 04:55:02 CET,Tue Nov 30 06:41:12 CET,0.0 1.359 1.705 1.954 2.17 2.368 2.543 2.718 3.026 3.169 3.318 3.58 3.674 3.791 4.016 4.223 4.409 4.491 4.652 4.818 5.071 5.239 5.403 5.621 5.814 5.997 6.179 6.355 6.572 6.794 7.013 7.282 7.533 7.772 8.085 8.398 8.677 9.007 9.351 9.689 10.046 10.437 10.864 11.312 11.818 12.366 12.996 13.667 14.386 15.136 15.88 16.273 16.286 16.137 15.888 15.543 15.188 14.853 14.578 14.27 13.931 13.606 13.33 13.079 12.808 12.506 12.174 11.909 11.685 11.428 11.162 10.935 10.684 10.452 10.278 10.083 9.876 9.656 9.403 9.228 9.064 8.824 8.658 8.477 8.373 8.148 7.916 7.673 7.536 7.402 7.076 6.916 6.726 6.301 6.077 5.828 5.547 5.218 4.788 4.07 1.523 -9 ,21577 ,TETRA ,17617295,Tue Nov 30 04:56:01 CET,Tue Nov 30 06:25:52 CET,0.0 1.655 2.046 2.314 2.553 2.755 2.941 3.113 3.385 3.512 3.635 3.879 3.966 4.061 4.248 4.424 4.602 4.697 4.879 5.058 5.298 5.441 5.589 5.799 5.996 6.187 6.385 6.591 6.849 7.101 7.35 7.627 7.884 8.151 8.462 8.782 9.064 9.361 9.718 10.119 10.493 10.93 11.415 11.849 12.315 12.831 13.446 14.082 14.787 15.598 16.365 16.592 16.462 16.219 15.931 15.592 15.272 14.958 14.629 14.234 13.856 13.527 13.255 12.957 12.644 12.364 12.093 11.883 11.678 11.433 11.169 10.939 10.707 10.488 10.3 10.07 9.843 9.616 9.377 9.221 9.06 8.79 8.592 8.388 8.296 8.099 7.872 7.626 7.483 7.361 7.037 6.856 6.654 6.226 6.007 5.766 5.48 5.152 4.756 4.225 1.966 -10 ,27140 ,TETRA ,17617296,Tue Nov 30 04:57:02 CET,Tue Nov 30 06:45:04 CET,0.0 2.138 2.529 2.817 3.054 3.279 3.489 3.664 3.985 4.135 4.265 4.54 4.656 4.777 5.008 5.244 5.456 5.542 5.699 5.864 6.093 6.23 6.371 6.575 6.763 6.948 7.131 7.308 7.543 7.776 7.983 8.255 8.553 8.827 9.118 9.425 9.703 9.978 10.282 10.628 11.011 11.437 11.899 12.393 12.961 13.511 14.073 14.653 15.326 16.029 16.519 16.593 16.471 16.22 15.873 15.497 15.135 14.771 14.468 14.133 13.806 13.529 13.264 12.98 12.706 12.473 12.185 11.928 11.738 11.502 11.207 10.981 10.791 10.57 10.375 10.152 9.9 9.66 9.424 9.236 9.04 8.755 8.558 8.344 8.221 7.964 7.706 7.441 7.298 7.166 6.803 6.621 6.445 6.048 5.816 5.565 5.278 4.951 4.54 3.966 1.213 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_155.txt deleted file mode 100644 index d0a17d32..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32749 ,TETRA ,17617297,Tue Nov 30 05:13:02 CET,Tue Nov 30 07:19:09 CET,0.0 0.946 1.262 1.491 1.675 1.846 1.98 2.091 2.306 2.409 2.501 2.635 2.743 2.801 2.901 3.01 3.111 3.16 3.276 3.388 3.546 3.652 3.755 3.904 4.048 4.158 4.228 4.292 4.381 4.465 4.539 4.63 4.727 4.813 4.895 5.01 5.116 5.215 5.287 5.303 5.328 5.341 5.324 5.301 5.277 5.28 5.208 4.917 4.374 3.493 1.739 -0.474 -2.252 -3.683 -4.941 -6.088 -7.044 -7.902 -8.636 -9.33 -9.915 -10.445 -10.977 -11.484 -11.953 -12.374 -12.795 -13.145 -13.426 -13.726 -14.062 -14.337 -14.619 -14.903 -15.108 -15.316 -15.54 -15.786 -16.05 -16.237 -16.442 -16.748 -16.948 -17.156 -17.256 -17.481 -17.74 -18.01 -18.148 -18.34 -18.567 -18.722 -18.886 -19.204 -19.383 -19.588 -19.794 -20.004 -20.275 -20.652 -21.7 -2 ,10256 ,TETRA ,17617298,Tue Nov 30 05:13:02 CET,Tue Nov 30 07:01:54 CET,0.0 0.697 0.944 1.122 1.286 1.436 1.566 1.68 1.862 1.939 2.015 2.13 2.237 2.305 2.437 2.565 2.677 2.734 2.847 2.96 3.119 3.214 3.299 3.393 3.487 3.599 3.703 3.797 3.917 4.025 4.128 4.232 4.306 4.372 4.452 4.532 4.597 4.66 4.721 4.779 4.833 4.907 5.006 5.096 5.108 4.961 4.667 4.253 3.602 2.555 0.748 -1.346 -3.174 -4.748 -6.025 -7.112 -7.999 -8.793 -9.463 -10.131 -10.718 -11.228 -11.687 -12.126 -12.572 -12.996 -13.411 -13.765 -14.09 -14.452 -14.844 -15.149 -15.437 -15.724 -15.958 -16.215 -16.473 -16.732 -17.007 -17.189 -17.378 -17.679 -17.883 -18.094 -18.202 -18.429 -18.673 -18.917 -19.046 -19.236 -19.443 -19.585 -19.747 -20.137 -20.339 -20.546 -20.753 -20.976 -21.276 -21.698 -22.881 -3 ,30075 ,TETRA ,17617299,Tue Nov 30 05:13:02 CET,Tue Nov 30 07:00:35 CET,0.0 0.676 0.914 1.081 1.219 1.349 1.476 1.592 1.776 1.85 1.933 2.068 2.183 2.253 2.373 2.486 2.604 2.661 2.754 2.831 2.934 3.005 3.077 3.166 3.25 3.344 3.425 3.497 3.6 3.704 3.8 3.906 4.015 4.117 4.215 4.309 4.392 4.476 4.54 4.585 4.629 4.679 4.722 4.762 4.757 4.639 4.424 4.093 3.576 2.741 1.13 -0.992 -2.793 -4.296 -5.585 -6.698 -7.64 -8.471 -9.173 -9.874 -10.444 -10.923 -11.415 -11.917 -12.358 -12.738 -13.134 -13.486 -13.788 -14.103 -14.437 -14.709 -14.985 -15.287 -15.534 -15.789 -16.036 -16.284 -16.554 -16.748 -16.937 -17.219 -17.415 -17.608 -17.708 -17.905 -18.111 -18.33 -18.448 -18.631 -18.848 -18.981 -19.114 -19.452 -19.629 -19.808 -20.004 -20.203 -20.463 -20.776 -21.611 -4 ,16114 ,TETRA ,17617300,Tue Nov 30 05:13:03 CET,Tue Nov 30 07:03:59 CET,0.0 0.613 0.881 1.094 1.262 1.423 1.566 1.688 1.927 2.031 2.115 2.212 2.314 2.373 2.482 2.593 2.688 2.733 2.834 2.932 3.045 3.114 3.191 3.309 3.427 3.526 3.607 3.696 3.815 3.929 4.043 4.151 4.242 4.347 4.461 4.543 4.604 4.667 4.732 4.82 4.888 4.91 4.947 4.971 4.92 4.83 4.632 4.246 3.755 2.995 1.454 -0.545 -2.239 -3.63 -4.821 -5.891 -6.828 -7.687 -8.436 -9.195 -9.819 -10.349 -10.852 -11.304 -11.726 -12.123 -12.536 -12.908 -13.225 -13.56 -13.91 -14.193 -14.484 -14.792 -15.037 -15.292 -15.54 -15.78 -16.045 -16.241 -16.435 -16.719 -16.924 -17.142 -17.261 -17.507 -17.738 -17.98 -18.101 -18.286 -18.516 -18.664 -18.814 -19.171 -19.38 -19.589 -19.813 -20.062 -20.378 -20.784 -21.729 -5 ,25234 ,TETRA ,17617301,Tue Nov 30 05:13:02 CET,Tue Nov 30 06:49:41 CET,0.0 0.688 0.951 1.164 1.35 1.498 1.635 1.768 1.997 2.093 2.175 2.279 2.378 2.448 2.58 2.694 2.807 2.863 2.967 3.076 3.215 3.29 3.368 3.473 3.569 3.671 3.767 3.837 3.913 3.996 4.083 4.18 4.272 4.366 4.473 4.582 4.662 4.732 4.802 4.844 4.887 4.924 4.911 4.862 4.751 4.61 4.351 3.923 3.28 2.218 0.41 -1.849 -3.734 -5.299 -6.591 -7.724 -8.763 -9.645 -10.369 -11.081 -11.686 -12.242 -12.752 -13.215 -13.64 -14.036 -14.433 -14.773 -15.074 -15.396 -15.75 -16.04 -16.337 -16.646 -16.881 -17.127 -17.376 -17.632 -17.891 -18.066 -18.252 -18.539 -18.72 -18.905 -19.011 -19.232 -19.469 -19.733 -19.873 -20.07 -20.313 -20.478 -20.658 -21.015 -21.189 -21.387 -21.6 -21.832 -22.118 -22.461 -23.472 -6 ,20741 ,TETRA ,17617302,Tue Nov 30 05:13:02 CET,Tue Nov 30 07:01:31 CET,0.0 0.902 1.21 1.418 1.576 1.714 1.856 1.981 2.16 2.235 2.312 2.401 2.502 2.579 2.713 2.832 2.948 3.005 3.118 3.224 3.378 3.479 3.567 3.703 3.838 3.956 4.045 4.119 4.216 4.309 4.407 4.522 4.618 4.7 4.788 4.898 4.985 5.038 5.092 5.136 5.155 5.158 5.137 5.105 5.09 5.001 4.779 4.402 3.761 2.744 1.069 -0.98 -2.711 -4.191 -5.433 -6.512 -7.471 -8.335 -9.017 -9.672 -10.265 -10.8 -11.281 -11.74 -12.181 -12.57 -12.99 -13.38 -13.707 -14.038 -14.382 -14.663 -14.947 -15.245 -15.48 -15.719 -15.971 -16.215 -16.489 -16.696 -16.892 -17.186 -17.392 -17.608 -17.718 -17.929 -18.14 -18.346 -18.45 -18.616 -18.817 -18.964 -19.123 -19.482 -19.683 -19.899 -20.172 -20.469 -20.78 -21.156 -22.297 -7 ,22479 ,TETRA ,17617303,Tue Nov 30 05:13:02 CET,Tue Nov 30 07:01:03 CET,0.0 0.575 0.812 1.019 1.192 1.361 1.487 1.597 1.803 1.89 1.971 2.101 2.211 2.274 2.398 2.534 2.653 2.704 2.805 2.904 3.044 3.133 3.218 3.349 3.479 3.592 3.7 3.802 3.929 4.039 4.129 4.223 4.321 4.432 4.567 4.7 4.81 4.905 4.995 5.112 5.221 5.293 5.355 5.417 5.461 5.427 5.298 5.071 4.626 3.712 2.029 0.039 -1.619 -2.994 -4.19 -5.311 -6.282 -7.151 -7.872 -8.545 -9.119 -9.617 -10.07 -10.514 -10.952 -11.339 -11.712 -12.055 -12.362 -12.688 -13.045 -13.338 -13.622 -13.908 -14.138 -14.387 -14.637 -14.902 -15.173 -15.346 -15.519 -15.793 -16.002 -16.22 -16.322 -16.545 -16.777 -17.02 -17.157 -17.35 -17.575 -17.72 -17.876 -18.228 -18.418 -18.605 -18.812 -19.063 -19.361 -19.781 -20.881 -8 ,31532 ,TETRA ,17617304,Tue Nov 30 05:13:02 CET,Tue Nov 30 07:01:28 CET,0.0 0.899 1.13 1.275 1.411 1.547 1.685 1.799 1.983 2.077 2.173 2.305 2.425 2.508 2.632 2.727 2.827 2.871 2.955 3.05 3.181 3.271 3.347 3.433 3.531 3.639 3.74 3.826 3.934 4.047 4.142 4.256 4.376 4.48 4.59 4.71 4.811 4.898 4.986 5.086 5.22 5.311 5.335 5.333 5.346 5.332 5.164 4.843 4.244 3.251 1.424 -0.85 -2.684 -4.197 -5.536 -6.729 -7.687 -8.546 -9.299 -10.001 -10.578 -11.109 -11.624 -12.096 -12.541 -12.958 -13.385 -13.764 -14.088 -14.431 -14.779 -15.056 -15.344 -15.646 -15.893 -16.155 -16.41 -16.682 -16.976 -17.168 -17.355 -17.64 -17.84 -18.051 -18.162 -18.409 -18.652 -18.887 -19.014 -19.198 -19.428 -19.595 -19.762 -20.131 -20.349 -20.575 -20.805 -21.063 -21.356 -21.746 -22.918 -9 ,32590 ,TETRA ,17617305,Tue Nov 30 05:13:03 CET,Tue Nov 30 06:58:23 CET,0.0 0.844 1.118 1.298 1.439 1.583 1.72 1.844 2.05 2.13 2.214 2.37 2.498 2.581 2.729 2.857 2.962 3.005 3.093 3.186 3.317 3.396 3.463 3.545 3.669 3.801 3.899 3.99 4.134 4.301 4.424 4.526 4.619 4.713 4.801 4.865 4.936 5.044 5.167 5.255 5.311 5.348 5.363 5.333 5.242 5.079 4.849 4.469 3.884 2.789 0.706 -1.656 -3.562 -5.105 -6.404 -7.561 -8.561 -9.46 -10.211 -10.939 -11.542 -12.064 -12.583 -13.086 -13.547 -13.946 -14.348 -14.712 -15.031 -15.356 -15.699 -15.992 -16.294 -16.604 -16.85 -17.112 -17.377 -17.635 -17.902 -18.105 -18.314 -18.625 -18.841 -19.06 -19.168 -19.4 -19.645 -19.9 -20.042 -20.248 -20.518 -20.687 -20.86 -21.24 -21.425 -21.616 -21.862 -22.156 -22.481 -22.881 -23.853 -10 ,22533 ,TETRA ,17617306,Tue Nov 30 05:13:03 CET,Tue Nov 30 07:02:36 CET,0.0 0.864 1.154 1.372 1.567 1.738 1.919 2.091 2.342 2.467 2.575 2.685 2.784 2.865 3.046 3.193 3.32 3.385 3.498 3.59 3.753 3.859 3.945 4.074 4.187 4.279 4.366 4.445 4.543 4.661 4.76 4.846 4.935 5.032 5.149 5.247 5.336 5.436 5.528 5.599 5.661 5.728 5.758 5.754 5.711 5.629 5.45 5.125 4.596 3.789 2.216 0.133 -1.624 -3.103 -4.35 -5.445 -6.404 -7.279 -8.022 -8.798 -9.459 -10.016 -10.533 -11.028 -11.5 -11.918 -12.354 -12.753 -13.089 -13.418 -13.749 -14.025 -14.296 -14.575 -14.806 -15.048 -15.309 -15.584 -15.867 -16.056 -16.249 -16.55 -16.747 -16.957 -17.069 -17.29 -17.508 -17.748 -17.875 -18.064 -18.3 -18.452 -18.616 -18.983 -19.19 -19.405 -19.633 -19.871 -20.165 -20.568 -21.441 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_163.txt deleted file mode 100644 index 10493bef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18184 ,TETRA ,17617307,Tue Nov 30 05:13:03 CET,Tue Nov 30 07:01:57 CET,0.0 0.63 0.848 0.985 1.076 1.145 1.191 1.214 1.257 1.282 1.297 1.275 1.311 1.312 1.298 1.251 1.196 1.166 1.091 1.01 0.886 0.803 0.715 0.577 0.434 0.301 0.169 0.019 -0.202 -0.429 -0.654 -0.924 -1.2 -1.503 -1.877 -2.346 -2.841 -3.433 -4.086 -4.816 -5.693 -6.772 -8.13 -9.53 -11.296 -13.506 -16.261 -19.706 -24.304 -30.614 -39.901 -49.497 -56.511 -61.992 -66.348 -69.935 -72.851 -75.408 -77.536 -79.537 -81.18 -82.607 -83.943 -85.179 -86.278 -87.251 -88.257 -89.122 -89.844 -90.59 -91.357 -91.976 -92.601 -93.222 -93.694 -94.182 -94.681 -95.181 -95.682 -96.019 -96.351 -96.857 -97.205 -97.561 -97.754 -98.136 -98.519 -98.929 -99.141 -99.484 -99.793 -100.017 -100.25 -100.74 -100.995 -101.267 -101.58 -101.931 -102.323 -102.843 -104.072 -2 ,29766 ,TETRA ,17617308,Tue Nov 30 05:13:03 CET,Tue Nov 30 07:00:42 CET,0.0 1.015 1.261 1.396 1.486 1.546 1.6 1.662 1.75 1.773 1.787 1.745 1.772 1.762 1.731 1.701 1.677 1.66 1.624 1.58 1.48 1.4 1.31 1.165 1.018 0.865 0.702 0.529 0.279 0.02 -0.237 -0.569 -0.889 -1.2 -1.589 -2.033 -2.458 -2.983 -3.651 -4.431 -5.296 -6.326 -7.57 -8.896 -10.636 -12.791 -15.46 -18.788 -23.281 -29.527 -38.694 -48.18 -55.101 -60.384 -64.542 -68.059 -70.958 -73.423 -75.438 -77.352 -78.959 -80.327 -81.588 -82.743 -83.789 -84.733 -85.68 -86.49 -87.156 -87.823 -88.518 -89.086 -89.65 -90.234 -90.679 -91.129 -91.593 -92.059 -92.531 -92.85 -93.163 -93.651 -93.992 -94.348 -94.535 -94.911 -95.308 -95.731 -95.946 -96.305 -96.625 -96.848 -97.081 -97.589 -97.837 -98.095 -98.386 -98.718 -99.087 -99.488 -100.259 -3 ,14129 ,TETRA ,17617309,Tue Nov 30 05:13:03 CET,Tue Nov 30 07:01:07 CET,0.0 0.633 0.842 0.929 1.0 1.07 1.137 1.192 1.26 1.267 1.266 1.228 1.262 1.252 1.211 1.168 1.125 1.094 1.026 0.963 0.872 0.795 0.696 0.575 0.465 0.336 0.203 0.066 -0.132 -0.343 -0.562 -0.872 -1.203 -1.521 -1.894 -2.33 -2.795 -3.368 -4.046 -4.804 -5.637 -6.647 -7.926 -9.342 -11.131 -13.295 -16.044 -19.465 -23.953 -30.111 -39.313 -48.861 -55.712 -61.068 -65.37 -68.948 -71.855 -74.326 -76.375 -78.353 -79.993 -81.415 -82.712 -83.898 -84.984 -85.96 -86.951 -87.806 -88.507 -89.232 -89.997 -90.598 -91.197 -91.796 -92.245 -92.713 -93.194 -93.669 -94.164 -94.516 -94.872 -95.403 -95.767 -96.143 -96.331 -96.705 -97.091 -97.508 -97.71 -98.035 -98.29 -98.5 -98.725 -99.186 -99.443 -99.734 -100.039 -100.364 -100.729 -101.136 -102.29 -4 ,11889 ,TETRA ,17617310,Tue Nov 30 05:13:03 CET,Tue Nov 30 07:01:08 CET,0.0 0.52 0.711 0.829 0.912 0.996 1.079 1.136 1.184 1.195 1.2 1.141 1.156 1.138 1.087 1.032 0.993 0.982 0.955 0.929 0.874 0.81 0.727 0.583 0.427 0.259 0.083 -0.089 -0.318 -0.555 -0.777 -1.056 -1.36 -1.675 -2.059 -2.527 -3.022 -3.585 -4.225 -4.961 -5.781 -6.727 -7.897 -9.198 -10.904 -13.035 -15.607 -18.861 -23.414 -29.718 -38.904 -48.39 -55.436 -60.886 -65.164 -68.67 -71.553 -74.037 -76.075 -78.013 -79.614 -81.001 -82.267 -83.443 -84.526 -85.483 -86.455 -87.294 -88.009 -88.732 -89.458 -90.047 -90.634 -91.255 -91.72 -92.177 -92.653 -93.134 -93.627 -93.963 -94.313 -94.854 -95.207 -95.559 -95.747 -96.12 -96.49 -96.875 -97.072 -97.408 -97.7 -97.916 -98.134 -98.595 -98.844 -99.102 -99.381 -99.707 -100.116 -100.618 -101.948 -5 ,8298 ,TETRA ,17617311,Tue Nov 30 05:13:04 CET,Tue Nov 30 07:00:45 CET,0.0 0.498 0.706 0.811 0.868 0.925 0.972 1.0 1.023 1.02 1.008 0.967 0.994 0.984 0.951 0.91 0.872 0.852 0.804 0.738 0.633 0.551 0.461 0.336 0.208 0.058 -0.108 -0.28 -0.524 -0.782 -1.013 -1.301 -1.629 -1.94 -2.322 -2.8 -3.293 -3.879 -4.533 -5.292 -6.167 -7.205 -8.444 -9.787 -11.486 -13.558 -16.246 -19.595 -24.071 -30.278 -39.35 -48.777 -55.674 -61.115 -65.448 -69.001 -71.912 -74.421 -76.496 -78.466 -80.135 -81.614 -82.961 -84.162 -85.244 -86.202 -87.141 -87.975 -88.704 -89.438 -90.184 -90.786 -91.394 -91.998 -92.455 -92.937 -93.424 -93.922 -94.434 -94.777 -95.124 -95.661 -96.037 -96.414 -96.603 -96.99 -97.394 -97.827 -98.053 -98.41 -98.725 -98.957 -99.195 -99.687 -99.934 -100.187 -100.482 -100.835 -101.23 -101.721 -103.188 -6 ,12452 ,TETRA ,17617312,Tue Nov 30 05:13:04 CET,Tue Nov 30 07:00:51 CET,0.0 0.716 0.894 1.049 1.188 1.263 1.325 1.389 1.469 1.498 1.515 1.495 1.537 1.542 1.55 1.552 1.548 1.54 1.507 1.462 1.364 1.276 1.188 1.05 0.912 0.792 0.657 0.495 0.272 0.046 -0.18 -0.454 -0.706 -0.94 -1.262 -1.718 -2.208 -2.755 -3.387 -4.154 -4.984 -5.966 -7.212 -8.55 -10.272 -12.39 -15.084 -18.438 -22.891 -29.052 -38.157 -47.626 -54.617 -60.03 -64.302 -67.86 -70.797 -73.384 -75.568 -77.629 -79.282 -80.697 -82.026 -83.228 -84.297 -85.254 -86.227 -87.06 -87.764 -88.501 -89.248 -89.833 -90.415 -91.017 -91.482 -91.947 -92.415 -92.896 -93.389 -93.73 -94.071 -94.575 -94.921 -95.268 -95.448 -95.828 -96.209 -96.613 -96.825 -97.173 -97.486 -97.713 -97.95 -98.479 -98.765 -99.043 -99.333 -99.665 -100.046 -100.482 -101.587 -7 ,186 ,TETRA ,17617313,Tue Nov 30 05:13:04 CET,Tue Nov 30 06:54:36 CET,0.0 0.534 0.663 0.763 0.84 0.909 0.945 0.955 0.966 0.969 0.97 0.933 0.964 0.963 0.942 0.909 0.865 0.844 0.791 0.727 0.613 0.526 0.444 0.317 0.161 -0.003 -0.165 -0.339 -0.566 -0.8 -1.06 -1.395 -1.729 -2.045 -2.413 -2.878 -3.361 -3.939 -4.619 -5.352 -6.115 -7.019 -8.24 -9.598 -11.313 -13.441 -16.165 -19.593 -24.124 -30.329 -39.384 -48.87 -55.846 -61.248 -65.54 -69.136 -72.157 -74.751 -76.872 -78.892 -80.573 -82.043 -83.369 -84.553 -85.629 -86.583 -87.561 -88.398 -89.098 -89.824 -90.546 -91.129 -91.725 -92.339 -92.824 -93.306 -93.797 -94.298 -94.79 -95.131 -95.492 -96.032 -96.392 -96.76 -96.939 -97.293 -97.677 -98.099 -98.318 -98.675 -99.0 -99.231 -99.48 -100.0 -100.291 -100.6 -100.907 -101.257 -101.666 -102.127 -103.231 -8 ,7699 ,TETRA ,17617314,Tue Nov 30 05:13:04 CET,Tue Nov 30 07:00:39 CET,0.0 0.818 1.062 1.22 1.329 1.406 1.466 1.507 1.595 1.631 1.643 1.625 1.656 1.655 1.647 1.607 1.575 1.558 1.51 1.448 1.335 1.259 1.179 1.051 0.909 0.772 0.631 0.478 0.266 0.033 -0.193 -0.467 -0.747 -1.03 -1.398 -1.826 -2.26 -2.795 -3.431 -4.122 -4.875 -5.829 -7.071 -8.423 -10.133 -12.224 -14.913 -18.348 -22.891 -29.165 -38.265 -47.636 -54.545 -59.956 -64.281 -67.878 -70.842 -73.362 -75.421 -77.386 -79.026 -80.447 -81.766 -82.979 -84.052 -84.969 -85.911 -86.751 -87.459 -88.164 -88.87 -89.457 -90.051 -90.653 -91.113 -91.57 -92.034 -92.531 -93.035 -93.382 -93.747 -94.296 -94.666 -95.028 -95.214 -95.6 -95.982 -96.367 -96.566 -96.897 -97.202 -97.441 -97.691 -98.215 -98.482 -98.781 -99.099 -99.445 -99.847 -100.336 -101.593 -9 ,30619 ,TETRA ,17617315,Tue Nov 30 05:13:05 CET,Tue Nov 30 07:01:22 CET,0.0 0.609 0.814 0.945 1.034 1.105 1.144 1.166 1.2 1.212 1.216 1.174 1.199 1.188 1.159 1.125 1.079 1.054 0.999 0.934 0.808 0.717 0.628 0.501 0.384 0.255 0.119 -0.026 -0.256 -0.514 -0.768 -1.088 -1.43 -1.781 -2.185 -2.665 -3.164 -3.739 -4.391 -5.14 -6.008 -7.068 -8.376 -9.789 -11.601 -13.745 -16.408 -19.785 -24.275 -30.421 -39.414 -48.864 -55.884 -61.355 -65.663 -69.252 -72.236 -74.795 -76.905 -78.896 -80.513 -81.902 -83.182 -84.331 -85.369 -86.304 -87.253 -88.071 -88.759 -89.474 -90.208 -90.793 -91.371 -91.986 -92.465 -92.944 -93.424 -93.906 -94.407 -94.742 -95.076 -95.599 -95.948 -96.285 -96.471 -96.86 -97.24 -97.64 -97.847 -98.188 -98.481 -98.699 -98.921 -99.412 -99.676 -99.937 -100.207 -100.525 -100.876 -101.296 -102.318 -10 ,4147 ,TETRA ,17617316,Tue Nov 30 05:13:04 CET,Tue Nov 30 07:00:48 CET,0.0 0.744 0.901 1.054 1.172 1.242 1.291 1.329 1.358 1.366 1.366 1.318 1.339 1.327 1.313 1.294 1.244 1.212 1.142 1.065 0.945 0.857 0.767 0.635 0.506 0.378 0.238 0.085 -0.112 -0.306 -0.523 -0.835 -1.151 -1.48 -1.89 -2.375 -2.866 -3.434 -4.082 -4.789 -5.608 -6.632 -7.915 -9.303 -11.072 -13.237 -15.954 -19.359 -23.913 -30.137 -39.232 -48.679 -55.599 -60.948 -65.22 -68.79 -71.736 -74.303 -76.426 -78.43 -80.042 -81.428 -82.757 -83.984 -85.063 -86.021 -87.011 -87.88 -88.626 -89.369 -90.091 -90.66 -91.229 -91.827 -92.306 -92.789 -93.262 -93.743 -94.24 -94.58 -94.928 -95.46 -95.821 -96.197 -96.388 -96.775 -97.17 -97.563 -97.765 -98.101 -98.388 -98.609 -98.833 -99.333 -99.605 -99.879 -100.184 -100.518 -100.891 -101.372 -102.477 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_164.txt deleted file mode 100644 index 0045bb59..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28744 ,KEBNE ,17076703,Sat Dec 25 03:10:24 CET,Sat Dec 25 04:41:05 CET,0.0 0.472 0.614 0.715 0.777 0.845 0.905 0.931 0.968 0.979 0.994 0.996 1.052 1.064 1.077 1.085 1.083 1.076 1.055 1.02 0.963 0.92 0.877 0.81 0.73 0.646 0.559 0.46 0.306 0.151 0.001 -0.211 -0.433 -0.658 -0.94 -1.256 -1.582 -1.969 -2.398 -2.868 -3.404 -4.098 -5.01 -6.011 -7.302 -8.897 -10.869 -13.335 -16.664 -21.289 -28.203 -35.608 -41.086 -45.282 -48.623 -51.377 -53.629 -55.563 -57.144 -58.688 -60.026 -61.219 -62.304 -63.298 -64.19 -64.972 -65.77 -66.454 -67.051 -67.675 -68.295 -68.79 -69.305 -69.849 -70.269 -70.695 -71.145 -71.61 -72.059 -72.352 -72.655 -73.127 -73.454 -73.787 -73.952 -74.286 -74.646 -75.019 -75.207 -75.517 -75.787 -75.979 -76.178 -76.606 -76.839 -77.092 -77.374 -77.682 -78.051 -78.523 -79.64 -2 ,14621 ,KEBNE ,17076704,Sat Dec 25 03:10:24 CET,Sat Dec 25 04:41:46 CET,0.0 0.405 0.523 0.603 0.679 0.736 0.764 0.779 0.816 0.842 0.861 0.842 0.875 0.871 0.864 0.848 0.816 0.795 0.753 0.703 0.628 0.577 0.519 0.431 0.333 0.232 0.128 0.013 -0.151 -0.326 -0.513 -0.751 -0.984 -1.223 -1.524 -1.877 -2.24 -2.693 -3.227 -3.825 -4.49 -5.297 -6.311 -7.404 -8.767 -10.41 -12.514 -15.243 -18.954 -23.921 -31.18 -38.771 -44.294 -48.611 -52.03 -54.863 -57.244 -59.296 -60.972 -62.587 -63.949 -65.143 -66.246 -67.271 -68.211 -69.029 -69.859 -70.587 -71.198 -71.825 -72.465 -72.986 -73.507 -74.021 -74.408 -74.805 -75.218 -75.639 -76.076 -76.386 -76.704 -77.18 -77.501 -77.828 -77.99 -78.309 -78.641 -78.995 -79.177 -79.476 -79.736 -79.929 -80.12 -80.539 -80.778 -81.03 -81.291 -81.585 -81.915 -82.313 -83.316 -3 ,6502 ,KEBNE ,17076705,Sat Dec 25 03:10:24 CET,Sat Dec 25 04:41:47 CET,0.0 0.651 0.821 0.916 0.971 1.024 1.068 1.096 1.137 1.154 1.171 1.17 1.2 1.187 1.164 1.144 1.115 1.095 1.061 1.025 0.962 0.915 0.855 0.756 0.651 0.543 0.436 0.325 0.159 -0.01 -0.182 -0.396 -0.619 -0.866 -1.163 -1.516 -1.884 -2.329 -2.843 -3.408 -4.035 -4.802 -5.774 -6.809 -8.093 -9.659 -11.673 -14.223 -17.617 -22.248 -29.047 -36.204 -41.553 -45.873 -49.417 -52.343 -54.768 -56.849 -58.554 -60.212 -61.59 -62.766 -63.858 -64.874 -65.781 -66.582 -67.421 -68.147 -68.774 -69.423 -70.066 -70.59 -71.108 -71.624 -72.025 -72.444 -72.884 -73.333 -73.775 -74.068 -74.366 -74.83 -75.146 -75.468 -75.628 -75.948 -76.284 -76.641 -76.829 -77.135 -77.417 -77.622 -77.829 -78.245 -78.479 -78.756 -79.033 -79.317 -79.647 -80.066 -81.25 -4 ,23422 ,KEBNE ,17076706,Sat Dec 25 03:10:24 CET,Sat Dec 25 04:42:13 CET,0.0 0.849 1.166 1.363 1.476 1.598 1.724 1.811 1.934 1.982 2.021 2.031 2.074 2.079 2.09 2.126 2.154 2.156 2.149 2.134 2.108 2.082 2.057 2.017 1.961 1.895 1.826 1.752 1.643 1.532 1.403 1.2 0.974 0.738 0.442 0.078 -0.294 -0.724 -1.219 -1.784 -2.405 -3.144 -4.09 -5.139 -6.442 -8.022 -10.081 -12.694 -16.165 -20.918 -27.863 -35.132 -40.572 -44.877 -48.26 -51.04 -53.382 -55.432 -57.101 -58.691 -60.013 -61.143 -62.18 -63.118 -63.966 -64.721 -65.481 -66.144 -66.703 -67.27 -67.842 -68.308 -68.79 -69.291 -69.672 -70.048 -70.437 -70.832 -71.227 -71.5 -71.788 -72.224 -72.499 -72.773 -72.916 -73.226 -73.553 -73.883 -74.051 -74.333 -74.577 -74.765 -74.958 -75.354 -75.559 -75.786 -76.045 -76.317 -76.62 -77.03 -78.101 -5 ,6514 ,KEBNE ,17076707,Sat Dec 25 03:13:30 CET,Sat Dec 25 04:45:35 CET,0.0 0.654 0.882 1.026 1.148 1.244 1.317 1.375 1.474 1.52 1.556 1.569 1.626 1.654 1.683 1.687 1.687 1.689 1.687 1.671 1.645 1.616 1.583 1.532 1.478 1.417 1.343 1.267 1.156 1.03 0.906 0.719 0.492 0.254 -0.034 -0.38 -0.747 -1.164 -1.635 -2.175 -2.784 -3.536 -4.497 -5.555 -6.9 -8.525 -10.572 -13.154 -16.574 -21.286 -28.343 -35.668 -41.022 -45.245 -48.702 -51.654 -54.049 -56.062 -57.715 -59.33 -60.685 -61.852 -62.918 -63.864 -64.699 -65.447 -66.224 -66.897 -67.471 -68.055 -68.636 -69.107 -69.586 -70.09 -70.477 -70.855 -71.242 -71.636 -72.034 -72.303 -72.58 -73.026 -73.326 -73.623 -73.774 -74.076 -74.388 -74.73 -74.907 -75.189 -75.443 -75.636 -75.84 -76.251 -76.489 -76.755 -77.028 -77.335 -77.701 -78.174 -79.551 -6 ,21127 ,KEBNE ,17076708,Sat Dec 25 03:29:07 CET,Sat Dec 25 05:00:07 CET,0.0 0.453 0.608 0.739 0.816 0.873 0.906 0.927 0.952 0.961 0.959 0.91 0.928 0.913 0.883 0.842 0.789 0.767 0.73 0.692 0.619 0.561 0.5 0.399 0.288 0.165 0.047 -0.071 -0.234 -0.398 -0.563 -0.789 -1.026 -1.264 -1.564 -1.926 -2.295 -2.726 -3.224 -3.807 -4.471 -5.286 -6.337 -7.466 -8.859 -10.536 -12.676 -15.375 -18.936 -23.795 -30.985 -38.522 -44.005 -48.305 -51.814 -54.736 -57.093 -59.108 -60.795 -62.428 -63.766 -64.892 -65.925 -66.871 -67.746 -68.544 -69.334 -69.993 -70.555 -71.135 -71.738 -72.236 -72.731 -73.244 -73.634 -74.013 -74.398 -74.797 -75.213 -75.498 -75.795 -76.257 -76.564 -76.871 -77.03 -77.355 -77.684 -78.02 -78.189 -78.47 -78.726 -78.913 -79.097 -79.479 -79.689 -79.918 -80.151 -80.418 -80.746 -81.145 -82.09 -7 ,32635 ,KEBNE ,17076709,Sat Dec 25 03:29:07 CET,Sat Dec 25 05:00:23 CET,0.0 0.355 0.49 0.6 0.673 0.72 0.774 0.827 0.889 0.912 0.936 0.915 0.943 0.941 0.925 0.904 0.883 0.87 0.833 0.79 0.731 0.683 0.639 0.585 0.51 0.415 0.302 0.185 0.041 -0.103 -0.258 -0.46 -0.666 -0.881 -1.147 -1.471 -1.805 -2.205 -2.691 -3.258 -3.902 -4.677 -5.613 -6.622 -7.941 -9.566 -11.614 -14.22 -17.683 -22.405 -29.372 -36.672 -42.039 -46.175 -49.449 -52.166 -54.383 -56.311 -57.971 -59.6 -60.931 -62.068 -63.123 -64.078 -64.921 -65.694 -66.5 -67.198 -67.788 -68.412 -69.043 -69.535 -70.036 -70.552 -70.945 -71.351 -71.774 -72.202 -72.648 -72.938 -73.224 -73.671 -73.971 -74.289 -74.454 -74.775 -75.108 -75.458 -75.635 -75.933 -76.25 -76.47 -76.685 -77.154 -77.403 -77.643 -77.913 -78.209 -78.531 -78.943 -80.026 -8 ,4030 ,KEBNE ,17076710,Sat Dec 25 03:30:09 CET,Sat Dec 25 05:01:40 CET,0.0 0.474 0.613 0.745 0.832 0.888 0.936 0.978 1.032 1.046 1.052 1.022 1.061 1.063 1.048 1.026 0.995 0.979 0.944 0.895 0.821 0.764 0.702 0.615 0.528 0.433 0.32 0.198 0.035 -0.132 -0.309 -0.541 -0.776 -1.021 -1.332 -1.693 -2.056 -2.481 -2.983 -3.56 -4.181 -4.901 -5.788 -6.762 -8.035 -9.601 -11.566 -14.02 -17.316 -22.095 -29.398 -37.004 -42.608 -47.036 -50.656 -53.684 -56.108 -58.142 -59.845 -61.52 -62.92 -64.127 -65.261 -66.281 -67.17 -67.963 -68.783 -69.521 -70.137 -70.754 -71.371 -71.854 -72.348 -72.856 -73.249 -73.641 -74.038 -74.46 -74.884 -75.172 -75.463 -75.905 -76.204 -76.515 -76.678 -76.997 -77.335 -77.704 -77.883 -78.17 -78.426 -78.631 -78.834 -79.247 -79.485 -79.741 -80.004 -80.289 -80.653 -81.104 -82.02 -9 ,27191 ,KEBNE ,17076711,Sat Dec 25 03:33:21 CET,Sat Dec 25 04:57:58 CET,0.0 0.655 0.84 0.95 1.038 1.106 1.149 1.201 1.283 1.308 1.328 1.317 1.361 1.376 1.398 1.391 1.36 1.348 1.327 1.291 1.226 1.168 1.103 1.008 0.913 0.816 0.715 0.612 0.462 0.294 0.133 -0.07 -0.291 -0.521 -0.824 -1.199 -1.579 -2.019 -2.527 -3.097 -3.726 -4.507 -5.474 -6.501 -7.837 -9.482 -11.57 -14.229 -17.767 -22.665 -29.863 -37.404 -42.957 -47.356 -50.921 -53.792 -56.118 -58.12 -59.81 -61.434 -62.745 -63.871 -64.94 -65.913 -66.779 -67.58 -68.407 -69.111 -69.69 -70.271 -70.865 -71.347 -71.845 -72.355 -72.739 -73.128 -73.53 -73.955 -74.378 -74.673 -74.974 -75.407 -75.709 -76.029 -76.191 -76.506 -76.825 -77.154 -77.326 -77.623 -77.909 -78.112 -78.31 -78.739 -78.962 -79.193 -79.454 -79.741 -80.075 -80.514 -81.827 -10 ,12076 ,KEBNE ,17076712,Sat Dec 25 03:34:20 CET,Sat Dec 25 05:05:45 CET,0.0 0.595 0.78 0.906 0.977 1.037 1.093 1.134 1.197 1.232 1.264 1.277 1.318 1.315 1.315 1.314 1.287 1.268 1.231 1.193 1.131 1.081 1.029 0.95 0.865 0.774 0.674 0.56 0.402 0.24 0.069 -0.156 -0.377 -0.607 -0.886 -1.222 -1.588 -2.019 -2.51 -3.075 -3.711 -4.469 -5.426 -6.46 -7.774 -9.38 -11.443 -14.066 -17.575 -22.352 -29.32 -36.628 -42.01 -46.261 -49.676 -52.514 -54.852 -56.867 -58.523 -60.118 -61.451 -62.584 -63.619 -64.598 -65.507 -66.304 -67.116 -67.823 -68.431 -69.048 -69.654 -70.142 -70.645 -71.15 -71.536 -71.924 -72.306 -72.692 -73.085 -73.357 -73.638 -74.073 -74.38 -74.699 -74.862 -75.174 -75.482 -75.826 -76.003 -76.278 -76.511 -76.708 -76.928 -77.413 -77.65 -77.892 -78.171 -78.49 -78.866 -79.325 -80.431 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_215.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_215.txt deleted file mode 100644 index 79e3b7e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_215.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20730 ,TETRA ,17667987,Fri Dec 3 06:13:48 CET,Fri Dec 3 08:00:33 CET,0.0 0.532 0.725 0.876 1.006 1.098 1.165 1.236 1.381 1.437 1.5 1.575 1.64 1.657 1.677 1.701 1.723 1.74 1.759 1.767 1.766 1.748 1.736 1.714 1.687 1.663 1.627 1.561 1.457 1.34 1.195 0.989 0.787 0.599 0.375 0.118 -0.163 -0.498 -0.898 -1.363 -1.906 -2.595 -3.436 -4.373 -5.637 -7.252 -9.317 -11.911 -15.346 -20.082 -27.142 -34.601 -40.104 -44.474 -47.946 -50.832 -53.258 -55.384 -57.147 -58.808 -60.164 -61.321 -62.385 -63.354 -64.222 -64.988 -65.759 -66.443 -67.046 -67.67 -68.307 -68.833 -69.363 -69.895 -70.298 -70.698 -71.116 -71.552 -71.996 -72.296 -72.594 -73.055 -73.372 -73.693 -73.851 -74.159 -74.501 -74.874 -75.066 -75.372 -75.651 -75.86 -76.082 -76.55 -76.793 -77.049 -77.34 -77.636 -77.979 -78.432 -79.754 -2 ,14956 ,TETRA ,17667988,Fri Dec 3 06:13:43 CET,Fri Dec 3 08:01:17 CET,0.0 0.961 1.212 1.393 1.535 1.67 1.782 1.868 2.027 2.101 2.154 2.206 2.287 2.321 2.385 2.413 2.414 2.411 2.421 2.443 2.467 2.475 2.462 2.428 2.384 2.32 2.237 2.157 2.063 1.952 1.823 1.68 1.577 1.472 1.292 1.059 0.821 0.505 0.112 -0.338 -0.832 -1.434 -2.233 -3.11 -4.247 -5.662 -7.47 -9.798 -12.903 -17.23 -23.74 -30.725 -35.932 -39.99 -43.332 -46.211 -48.599 -50.705 -52.463 -54.123 -55.497 -56.678 -57.739 -58.713 -59.608 -60.389 -61.186 -61.876 -62.442 -63.02 -63.621 -64.12 -64.625 -65.133 -65.525 -65.937 -66.355 -66.782 -67.232 -67.532 -67.83 -68.274 -68.565 -68.871 -69.026 -69.354 -69.689 -70.037 -70.22 -70.508 -70.781 -70.977 -71.164 -71.595 -71.838 -72.09 -72.38 -72.705 -73.022 -73.372 -74.184 -3 ,17266 ,TETRA ,17667989,Fri Dec 3 06:13:45 CET,Fri Dec 3 08:01:12 CET,0.0 1.553 1.846 2.021 2.155 2.275 2.396 2.506 2.662 2.705 2.763 2.832 2.888 2.911 2.962 3.016 3.062 3.074 3.082 3.08 3.058 3.032 2.997 2.935 2.866 2.802 2.76 2.715 2.61 2.481 2.343 2.157 1.966 1.786 1.555 1.27 0.971 0.593 0.158 -0.336 -0.882 -1.537 -2.405 -3.384 -4.65 -6.164 -8.067 -10.448 -13.602 -18.309 -25.796 -33.685 -39.351 -43.688 -47.128 -50.0 -52.399 -54.476 -56.162 -57.784 -59.157 -60.336 -61.413 -62.398 -63.291 -64.074 -64.846 -65.508 -66.088 -66.69 -67.3 -67.816 -68.354 -68.898 -69.308 -69.704 -70.1 -70.523 -70.967 -71.264 -71.565 -72.027 -72.334 -72.667 -72.841 -73.191 -73.546 -73.894 -74.084 -74.383 -74.618 -74.809 -75.013 -75.416 -75.635 -75.882 -76.145 -76.428 -76.756 -77.154 -78.069 -4 ,32708 ,TETRA ,17667990,Fri Dec 3 06:13:44 CET,Fri Dec 3 07:58:38 CET,0.0 1.059 1.342 1.585 1.758 1.876 1.949 2.022 2.172 2.244 2.317 2.395 2.469 2.499 2.537 2.574 2.613 2.626 2.638 2.644 2.637 2.624 2.617 2.598 2.552 2.492 2.423 2.352 2.253 2.138 2.021 1.878 1.723 1.56 1.373 1.16 0.92 0.608 0.235 -0.182 -0.682 -1.351 -2.265 -3.293 -4.582 -6.05 -7.918 -10.429 -13.857 -18.584 -25.563 -33.011 -38.517 -42.782 -46.231 -49.173 -51.608 -53.685 -55.375 -56.998 -58.357 -59.53 -60.594 -61.545 -62.404 -63.194 -64.02 -64.749 -65.378 -66.007 -66.647 -67.168 -67.705 -68.25 -68.656 -69.068 -69.491 -69.926 -70.38 -70.673 -70.964 -71.439 -71.762 -72.078 -72.238 -72.57 -72.916 -73.29 -73.479 -73.79 -74.096 -74.305 -74.519 -74.954 -75.198 -75.478 -75.779 -76.105 -76.518 -77.073 -78.285 -5 ,26891 ,TETRA ,17667991,Fri Dec 3 06:13:45 CET,Fri Dec 3 08:00:55 CET,0.0 0.713 1.005 1.213 1.372 1.49 1.584 1.666 1.826 1.893 1.947 2.008 2.074 2.106 2.163 2.199 2.222 2.228 2.229 2.229 2.217 2.204 2.182 2.121 2.079 2.057 2.02 1.965 1.873 1.762 1.63 1.441 1.272 1.113 0.89 0.623 0.317 -0.097 -0.582 -1.123 -1.707 -2.406 -3.285 -4.238 -5.485 -7.044 -9.068 -11.65 -15.096 -19.907 -27.015 -34.396 -39.954 -44.406 -47.889 -50.744 -53.099 -55.113 -56.787 -58.405 -59.74 -60.913 -62.021 -63.013 -63.888 -64.663 -65.464 -66.154 -66.736 -67.343 -67.957 -68.453 -68.947 -69.458 -69.848 -70.232 -70.622 -71.019 -71.426 -71.718 -72.027 -72.492 -72.802 -73.114 -73.274 -73.601 -73.939 -74.297 -74.483 -74.785 -75.052 -75.246 -75.457 -75.899 -76.143 -76.399 -76.667 -76.959 -77.299 -77.749 -78.683 -6 ,18611 ,TETRA ,17667992,Fri Dec 3 06:13:45 CET,Fri Dec 3 08:02:08 CET,0.0 1.129 1.397 1.617 1.798 1.921 2.014 2.106 2.239 2.276 2.305 2.336 2.401 2.433 2.482 2.517 2.55 2.565 2.58 2.596 2.609 2.611 2.607 2.59 2.574 2.527 2.448 2.384 2.325 2.226 2.104 1.942 1.757 1.565 1.33 1.029 0.699 0.319 -0.128 -0.628 -1.157 -1.807 -2.694 -3.672 -4.882 -6.329 -8.129 -10.534 -13.958 -18.66 -25.517 -32.789 -38.173 -42.423 -45.891 -48.792 -51.155 -53.176 -54.821 -56.393 -57.716 -58.86 -59.908 -60.841 -61.714 -62.506 -63.278 -63.955 -64.545 -65.154 -65.766 -66.251 -66.751 -67.249 -67.621 -68.007 -68.398 -68.786 -69.208 -69.511 -69.812 -70.282 -70.608 -70.934 -71.09 -71.408 -71.739 -72.077 -72.258 -72.556 -72.82 -73.007 -73.205 -73.626 -73.846 -74.097 -74.381 -74.699 -75.058 -75.521 -76.566 -7 ,15094 ,TETRA ,17667993,Fri Dec 3 06:14:43 CET,Fri Dec 3 08:02:25 CET,0.0 1.339 1.619 1.799 1.939 2.091 2.214 2.292 2.435 2.502 2.554 2.606 2.663 2.671 2.713 2.774 2.811 2.82 2.835 2.853 2.852 2.834 2.809 2.764 2.706 2.629 2.55 2.467 2.357 2.244 2.137 1.997 1.818 1.639 1.427 1.165 0.888 0.566 0.193 -0.281 -0.778 -1.357 -2.168 -3.087 -4.255 -5.699 -7.571 -9.936 -13.207 -17.821 -24.557 -31.792 -37.216 -41.511 -44.988 -47.896 -50.254 -52.246 -53.869 -55.433 -56.738 -57.876 -58.92 -59.879 -60.802 -61.618 -62.416 -63.111 -63.7 -64.296 -64.888 -65.362 -65.866 -66.382 -66.773 -67.173 -67.578 -68.003 -68.446 -68.741 -69.033 -69.504 -69.814 -70.127 -70.289 -70.611 -70.945 -71.283 -71.46 -71.762 -72.054 -72.251 -72.448 -72.891 -73.136 -73.404 -73.71 -74.039 -74.41 -74.857 -75.846 -8 ,31552 ,TETRA ,17667994,Fri Dec 3 06:14:43 CET,Fri Dec 3 08:02:14 CET,0.0 0.685 0.92 1.098 1.263 1.415 1.545 1.658 1.833 1.905 1.966 2.033 2.115 2.168 2.24 2.289 2.329 2.334 2.324 2.339 2.363 2.364 2.35 2.293 2.22 2.146 2.079 2.004 1.893 1.766 1.639 1.483 1.32 1.168 0.99 0.77 0.507 0.159 -0.274 -0.784 -1.353 -2.023 -2.88 -3.869 -5.143 -6.714 -8.688 -11.205 -14.637 -19.32 -26.363 -33.844 -39.294 -43.513 -46.858 -49.669 -52.036 -54.094 -55.805 -57.45 -58.783 -59.938 -61.02 -61.997 -62.884 -63.665 -64.451 -65.144 -65.731 -66.318 -66.935 -67.453 -67.966 -68.484 -68.874 -69.268 -69.68 -70.109 -70.542 -70.837 -71.139 -71.595 -71.896 -72.203 -72.363 -72.704 -73.058 -73.415 -73.597 -73.887 -74.172 -74.391 -74.607 -75.072 -75.327 -75.6 -75.881 -76.177 -76.561 -77.049 -78.252 -9 ,18016 ,TETRA ,17667995,Fri Dec 3 06:14:46 CET,Fri Dec 3 08:02:14 CET,0.0 0.851 1.17 1.424 1.623 1.759 1.889 2.008 2.184 2.266 2.334 2.386 2.448 2.474 2.534 2.574 2.598 2.605 2.61 2.602 2.601 2.604 2.595 2.572 2.54 2.504 2.473 2.433 2.336 2.21 2.09 1.933 1.779 1.619 1.387 1.093 0.775 0.421 0.046 -0.387 -0.906 -1.599 -2.501 -3.479 -4.78 -6.393 -8.425 -11.005 -14.449 -19.168 -26.193 -33.687 -39.226 -43.496 -46.86 -49.726 -52.123 -54.173 -55.894 -57.541 -58.887 -60.061 -61.148 -62.143 -63.059 -63.881 -64.708 -65.427 -66.054 -66.696 -67.339 -67.862 -68.387 -68.902 -69.284 -69.669 -70.072 -70.5 -70.938 -71.237 -71.538 -71.99 -72.308 -72.649 -72.815 -73.134 -73.471 -73.817 -73.99 -74.277 -74.557 -74.759 -74.955 -75.392 -75.617 -75.858 -76.141 -76.452 -76.814 -77.268 -78.309 -10 ,25918 ,TETRA ,17667996,Fri Dec 3 06:14:49 CET,Fri Dec 3 08:02:14 CET,0.0 0.912 1.182 1.317 1.431 1.546 1.63 1.714 1.877 1.937 1.984 2.028 2.1 2.138 2.196 2.261 2.323 2.33 2.32 2.315 2.303 2.29 2.278 2.233 2.169 2.117 2.073 2.018 1.91 1.799 1.699 1.559 1.402 1.206 0.931 0.644 0.357 -0.019 -0.459 -0.981 -1.569 -2.269 -3.186 -4.127 -5.329 -6.902 -8.935 -11.507 -14.894 -19.531 -26.462 -33.815 -39.237 -43.561 -47.035 -49.953 -52.354 -54.384 -56.067 -57.683 -58.995 -60.143 -61.235 -62.221 -63.101 -63.883 -64.681 -65.376 -65.97 -66.592 -67.232 -67.733 -68.229 -68.736 -69.11 -69.498 -69.923 -70.353 -70.766 -71.04 -71.322 -71.759 -72.066 -72.373 -72.533 -72.86 -73.188 -73.525 -73.708 -74.013 -74.286 -74.485 -74.687 -75.141 -75.394 -75.664 -75.949 -76.26 -76.65 -77.128 -78.178 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_235.txt deleted file mode 100644 index 686835af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25575 ,KEBNE ,17076713,Sat Dec 25 03:37:28 CET,Sat Dec 25 05:08:56 CET,0.0 1.407 1.871 2.218 2.525 2.815 3.069 3.286 3.685 3.865 4.042 4.35 4.552 4.714 5.027 5.338 5.628 5.777 6.071 6.338 6.733 7.001 7.279 7.684 8.054 8.418 8.771 9.114 9.563 9.973 10.382 10.908 11.412 11.91 12.479 13.096 13.714 14.428 15.225 16.055 16.903 17.866 19.021 20.22 21.634 23.327 25.419 27.853 30.831 34.563 39.462 43.857 46.726 48.789 50.299 51.39 52.145 52.734 53.175 53.557 53.864 54.083 54.258 54.417 54.524 54.593 54.648 54.689 54.704 54.704 54.702 54.695 54.686 54.659 54.617 54.58 54.549 54.51 54.452 54.399 54.342 54.252 54.196 54.125 54.082 54.001 53.91 53.803 53.738 53.684 53.506 53.412 53.324 53.139 53.025 52.903 52.74 52.53 52.247 51.814 50.433 -2 ,12384 ,KEBNE ,17076714,Sat Dec 25 03:37:27 CET,Sat Dec 25 05:09:41 CET,0.0 2.228 2.781 3.144 3.442 3.706 3.944 4.178 4.626 4.83 5.028 5.366 5.56 5.733 6.09 6.394 6.679 6.821 7.079 7.325 7.7 7.951 8.202 8.577 8.946 9.293 9.633 9.976 10.397 10.786 11.153 11.6 12.052 12.513 13.069 13.708 14.34 15.026 15.769 16.583 17.451 18.457 19.676 20.927 22.4 24.039 25.991 28.316 31.181 34.8 39.525 43.805 46.569 48.426 49.707 50.677 51.421 52.004 52.441 52.823 53.092 53.31 53.516 53.657 53.761 53.842 53.905 53.938 53.952 53.965 53.964 53.956 53.969 53.991 53.991 53.978 53.953 53.917 53.875 53.844 53.812 53.755 53.707 53.633 53.593 53.514 53.418 53.297 53.226 53.177 53.019 52.936 52.85 52.656 52.535 52.397 52.257 52.07 51.808 51.52 49.492 -3 ,14114 ,KEBNE ,17076715,Sat Dec 25 03:37:28 CET,Sat Dec 25 05:09:49 CET,0.0 0.912 1.323 1.674 2.015 2.307 2.566 2.809 3.244 3.439 3.623 3.936 4.144 4.304 4.614 4.913 5.207 5.353 5.638 5.918 6.314 6.565 6.822 7.198 7.555 7.918 8.291 8.649 9.089 9.523 9.958 10.47 10.943 11.424 12.024 12.678 13.287 13.987 14.751 15.547 16.395 17.422 18.659 19.928 21.532 23.282 25.215 27.481 30.3 33.913 38.669 42.974 45.724 47.633 49.021 50.107 50.93 51.552 51.974 52.327 52.595 52.803 52.971 53.103 53.182 53.228 53.251 53.251 53.233 53.204 53.184 53.17 53.156 53.138 53.113 53.09 53.063 53.01 52.931 52.876 52.82 52.717 52.651 52.578 52.533 52.442 52.338 52.217 52.151 52.097 51.907 51.807 51.718 51.508 51.366 51.213 51.026 50.814 50.543 50.11 48.8 -4 ,21600 ,KEBNE ,17076716,Sat Dec 25 03:37:27 CET,Sat Dec 25 05:08:02 CET,0.0 1.642 2.114 2.472 2.785 3.068 3.292 3.506 3.919 4.124 4.32 4.647 4.847 5.009 5.313 5.589 5.87 6.017 6.299 6.56 6.942 7.189 7.434 7.799 8.14 8.482 8.82 9.139 9.563 9.985 10.386 10.871 11.339 11.795 12.343 12.971 13.595 14.317 15.109 15.96 16.869 17.919 19.179 20.486 22.055 23.805 25.856 28.279 31.222 34.903 39.822 44.4 47.296 49.281 50.802 51.97 52.833 53.505 54.01 54.424 54.717 54.957 55.147 55.298 55.403 55.468 55.526 55.577 55.612 55.626 55.624 55.626 55.63 55.628 55.624 55.608 55.578 55.531 55.47 55.435 55.387 55.296 55.245 55.18 55.133 55.03 54.924 54.794 54.719 54.669 54.51 54.41 54.293 54.048 53.91 53.755 53.564 53.309 52.99 52.546 51.394 -5 ,10612 ,KEBNE ,17076717,Sat Dec 25 03:38:31 CET,Sat Dec 25 05:09:36 CET,0.0 1.07 1.535 1.901 2.21 2.48 2.725 2.956 3.379 3.568 3.761 4.102 4.309 4.475 4.767 5.085 5.4 5.535 5.797 6.072 6.47 6.723 6.976 7.354 7.707 8.043 8.382 8.717 9.156 9.577 9.975 10.448 10.905 11.346 11.85 12.432 13.013 13.672 14.43 15.256 16.12 17.158 18.377 19.543 20.967 22.604 24.568 26.889 29.711 33.289 38.027 42.331 44.982 46.784 48.11 49.096 49.84 50.422 50.846 51.252 51.56 51.79 51.986 52.15 52.282 52.394 52.498 52.576 52.637 52.685 52.699 52.681 52.641 52.583 52.54 52.489 52.428 52.367 52.293 52.229 52.164 52.081 52.022 51.95 51.907 51.815 51.725 51.611 51.544 51.487 51.31 51.223 51.129 50.888 50.75 50.594 50.401 50.158 49.871 49.468 47.922 -6 ,19908 ,KEBNE ,17076718,Sat Dec 25 03:38:31 CET,Sat Dec 25 05:10:13 CET,0.0 1.424 1.907 2.24 2.51 2.771 3.019 3.243 3.67 3.862 4.034 4.339 4.542 4.713 5.032 5.332 5.626 5.769 6.031 6.298 6.716 6.985 7.252 7.642 8.003 8.359 8.71 9.032 9.447 9.869 10.307 10.853 11.373 11.893 12.52 13.218 13.895 14.628 15.41 16.258 17.143 18.185 19.427 20.647 22.11 23.787 25.783 28.115 30.948 34.547 39.232 43.348 45.999 47.841 49.134 50.083 50.759 51.251 51.65 52.067 52.383 52.624 52.839 53.02 53.161 53.277 53.381 53.457 53.512 53.541 53.549 53.549 53.55 53.544 53.525 53.489 53.444 53.395 53.345 53.297 53.233 53.14 53.086 53.019 52.985 52.917 52.82 52.704 52.636 52.576 52.414 52.327 52.228 52.006 51.877 51.739 51.552 51.328 51.044 50.675 49.244 -7 ,21976 ,KEBNE ,17076719,Sat Dec 25 03:38:30 CET,Sat Dec 25 05:10:15 CET,0.0 1.34 1.747 2.063 2.351 2.62 2.866 3.1 3.564 3.774 3.958 4.27 4.459 4.598 4.885 5.193 5.477 5.612 5.881 6.144 6.526 6.769 6.999 7.334 7.66 7.983 8.307 8.629 9.054 9.458 9.862 10.371 10.841 11.293 11.85 12.49 13.132 13.829 14.554 15.336 16.19 17.184 18.328 19.503 20.974 22.683 24.651 26.933 29.823 33.481 38.298 42.7 45.472 47.33 48.661 49.709 50.503 51.122 51.597 51.976 52.222 52.407 52.583 52.727 52.818 52.888 52.945 52.988 53.017 53.025 53.022 52.998 52.969 52.95 52.916 52.863 52.804 52.743 52.673 52.622 52.57 52.493 52.424 52.333 52.276 52.155 52.024 51.86 51.779 51.707 51.508 51.421 51.328 51.107 50.976 50.84 50.687 50.468 50.15 49.755 48.016 -8 ,30270 ,KEBNE ,17076720,Sat Dec 25 03:38:34 CET,Sat Dec 25 05:05:09 CET,0.0 1.377 1.899 2.3 2.613 2.856 3.096 3.324 3.745 3.937 4.108 4.422 4.626 4.787 5.098 5.394 5.688 5.825 6.104 6.396 6.806 7.064 7.322 7.704 8.086 8.444 8.782 9.116 9.542 9.959 10.37 10.879 11.381 11.877 12.464 13.098 13.706 14.418 15.231 16.1 17.011 18.049 19.285 20.562 22.052 23.742 25.731 28.071 30.891 34.42 39.162 43.4 46.13 48.061 49.404 50.41 51.17 51.714 52.09 52.417 52.666 52.862 53.02 53.159 53.288 53.389 53.46 53.476 53.481 53.491 53.488 53.47 53.442 53.408 53.363 53.299 53.242 53.19 53.127 53.079 53.018 52.91 52.837 52.755 52.706 52.608 52.484 52.342 52.272 52.215 52.016 51.913 51.809 51.54 51.377 51.202 51.009 50.78 50.492 50.037 48.353 -9 ,279 ,KEBNE ,17076721,Sat Dec 25 03:38:32 CET,Sat Dec 25 05:04:57 CET,0.0 1.23 1.721 2.096 2.415 2.699 2.942 3.16 3.593 3.791 3.976 4.306 4.511 4.674 4.977 5.289 5.595 5.745 6.036 6.304 6.701 6.955 7.201 7.562 7.918 8.283 8.642 8.985 9.41 9.815 10.228 10.764 11.288 11.787 12.353 12.991 13.649 14.387 15.174 16.027 16.948 18.01 19.278 20.592 22.141 23.888 25.908 28.201 30.993 34.493 39.133 43.42 46.17 48.124 49.547 50.609 51.341 51.873 52.277 52.642 52.944 53.188 53.373 53.504 53.6 53.664 53.709 53.732 53.729 53.717 53.712 53.704 53.673 53.639 53.613 53.573 53.531 53.487 53.431 53.394 53.353 53.268 53.192 53.108 53.069 52.983 52.879 52.764 52.695 52.632 52.475 52.4 52.309 52.085 51.955 51.808 51.641 51.437 51.154 50.769 49.307 -10 ,30977 ,KEBNE ,17076722,Sat Dec 25 03:38:34 CET,Sat Dec 25 05:06:39 CET,0.0 1.409 1.865 2.184 2.487 2.762 2.981 3.192 3.589 3.774 3.955 4.252 4.452 4.616 4.912 5.222 5.532 5.675 5.939 6.213 6.619 6.875 7.129 7.478 7.807 8.131 8.457 8.787 9.224 9.649 10.057 10.535 10.988 11.45 11.979 12.551 13.118 13.758 14.482 15.271 16.149 17.203 18.409 19.618 21.052 22.737 24.785 27.105 29.938 33.509 38.133 42.341 45.146 47.063 48.39 49.414 50.205 50.814 51.259 51.675 51.992 52.221 52.407 52.561 52.684 52.785 52.88 52.95 52.99 53.025 53.053 53.081 53.088 53.061 53.045 53.023 52.988 52.952 52.895 52.85 52.816 52.749 52.684 52.617 52.584 52.519 52.441 52.346 52.296 52.251 52.078 51.99 51.901 51.684 51.554 51.418 51.261 51.061 50.832 50.495 48.847 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_25.txt deleted file mode 100644 index 6e23c06a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25060 ,TETRA ,17617317,Tue Nov 30 05:13:06 CET,Tue Nov 30 06:59:16 CET,0.0 3.145 3.674 4.064 4.38 4.638 4.851 5.046 5.419 5.59 5.745 5.991 6.162 6.296 6.536 6.765 7.002 7.122 7.337 7.538 7.846 8.038 8.24 8.553 8.828 9.071 9.309 9.547 9.842 10.119 10.395 10.743 11.112 11.462 11.859 12.292 12.676 13.084 13.521 14.0 14.513 15.096 15.781 16.54 17.426 18.339 19.433 20.737 22.264 23.988 26.048 27.739 28.662 29.177 29.497 29.663 29.732 29.766 29.727 29.634 29.551 29.447 29.335 29.218 29.069 28.928 28.778 28.636 28.509 28.373 28.221 28.065 27.89 27.712 27.576 27.44 27.29 27.139 26.989 26.867 26.727 26.511 26.361 26.203 26.12 25.914 25.7 25.503 25.392 25.264 25.008 24.854 24.705 24.363 24.153 23.944 23.714 23.399 23.038 22.516 19.608 -2 ,25080 ,TETRA ,17617318,Tue Nov 30 05:13:07 CET,Tue Nov 30 06:58:52 CET,0.0 1.741 2.236 2.575 2.859 3.108 3.308 3.496 3.855 4.018 4.178 4.443 4.604 4.735 5.012 5.268 5.488 5.596 5.82 6.036 6.345 6.543 6.739 7.022 7.302 7.58 7.838 8.089 8.409 8.69 8.955 9.293 9.619 9.924 10.273 10.659 11.031 11.428 11.854 12.348 12.857 13.394 14.037 14.711 15.492 16.41 17.5 18.687 20.069 21.708 23.769 25.527 26.396 27.025 27.561 27.841 27.995 28.074 28.056 28.029 27.998 27.925 27.815 27.678 27.537 27.39 27.251 27.13 27.013 26.881 26.725 26.613 26.502 26.362 26.243 26.123 26.002 25.866 25.708 25.594 25.465 25.251 25.109 24.967 24.895 24.738 24.567 24.387 24.298 24.189 23.951 23.82 23.68 23.355 23.155 22.92 22.634 22.318 21.93 21.361 16.803 -3 ,28671 ,TETRA ,17617319,Tue Nov 30 06:16:05 CET,Tue Nov 30 07:58:54 CET,0.0 1.479 1.95 2.308 2.632 2.924 3.149 3.373 3.76 3.918 4.071 4.318 4.489 4.627 4.874 5.098 5.321 5.431 5.635 5.827 6.125 6.337 6.559 6.874 7.143 7.386 7.648 7.9 8.222 8.564 8.887 9.261 9.625 9.978 10.358 10.789 11.242 11.748 12.305 12.878 13.426 14.052 14.829 15.633 16.544 17.513 18.646 19.92 21.41 23.159 25.213 26.837 27.76 28.313 28.619 28.785 28.803 28.713 28.634 28.557 28.455 28.319 28.149 27.999 27.896 27.79 27.663 27.522 27.377 27.203 27.009 26.868 26.717 26.562 26.443 26.328 26.215 26.083 25.932 25.824 25.705 25.5 25.349 25.181 25.094 24.921 24.731 24.514 24.402 24.273 24.032 23.893 23.741 23.401 23.188 22.918 22.56 22.156 21.722 21.154 18.523 -4 ,25209 ,TETRA ,17617320,Tue Nov 30 06:16:07 CET,Tue Nov 30 08:06:49 CET,0.0 2.392 2.911 3.31 3.645 3.911 4.153 4.39 4.787 4.956 5.116 5.394 5.571 5.698 5.943 6.178 6.419 6.53 6.73 6.939 7.267 7.475 7.673 7.958 8.232 8.487 8.726 8.96 9.254 9.545 9.861 10.249 10.613 10.96 11.349 11.78 12.2 12.672 13.164 13.674 14.24 14.884 15.636 16.425 17.337 18.359 19.579 20.989 22.628 24.559 27.005 29.076 30.205 30.822 31.176 31.367 31.445 31.474 31.441 31.312 31.156 31.012 30.881 30.735 30.586 30.427 30.267 30.15 30.032 29.908 29.779 29.669 29.547 29.412 29.303 29.172 29.039 28.905 28.754 28.641 28.513 28.319 28.181 28.031 27.949 27.753 27.551 27.355 27.245 27.118 26.863 26.709 26.552 26.22 26.031 25.796 25.54 25.255 24.898 24.373 21.409 -5 ,5346 ,TETRA ,17617321,Tue Nov 30 06:16:07 CET,Tue Nov 30 07:54:00 CET,0.0 1.865 2.358 2.736 3.038 3.305 3.552 3.786 4.198 4.374 4.541 4.864 5.063 5.204 5.476 5.741 5.985 6.098 6.317 6.533 6.846 7.043 7.233 7.501 7.77 8.025 8.266 8.499 8.793 9.09 9.388 9.734 10.065 10.393 10.771 11.206 11.621 12.06 12.53 13.017 13.527 14.109 14.844 15.596 16.422 17.369 18.501 19.725 21.211 23.087 25.339 27.148 28.044 28.542 28.93 29.246 29.478 29.617 29.697 29.719 29.678 29.63 29.571 29.519 29.479 29.427 29.365 29.303 29.229 29.127 29.015 28.919 28.801 28.669 28.564 28.451 28.337 28.23 28.111 28.017 27.903 27.708 27.585 27.472 27.409 27.265 27.095 26.911 26.81 26.693 26.478 26.361 26.232 25.89 25.707 25.5 25.252 24.971 24.586 23.985 21.024 -6 ,10889 ,TETRA ,17617322,Tue Nov 30 06:16:07 CET,Tue Nov 30 08:00:01 CET,0.0 1.619 2.065 2.424 2.72 2.966 3.197 3.395 3.743 3.912 4.077 4.366 4.551 4.687 4.948 5.203 5.445 5.559 5.764 5.961 6.256 6.445 6.623 6.873 7.133 7.409 7.662 7.896 8.199 8.48 8.751 9.099 9.437 9.759 10.128 10.533 10.893 11.272 11.704 12.209 12.75 13.33 13.995 14.662 15.47 16.381 17.431 18.677 20.21 22.017 24.204 26.006 27.044 27.663 28.006 28.177 28.233 28.225 28.186 28.111 28.045 27.972 27.866 27.749 27.613 27.46 27.291 27.141 27.005 26.863 26.704 26.55 26.413 26.276 26.158 26.037 25.9 25.76 25.604 25.478 25.347 25.139 24.988 24.833 24.749 24.572 24.368 24.158 24.046 23.911 23.693 23.553 23.384 23.049 22.872 22.671 22.419 22.106 21.676 21.093 18.615 -7 ,21646 ,TETRA ,17617323,Tue Nov 30 06:16:07 CET,Tue Nov 30 08:06:26 CET,0.0 2.042 2.573 2.924 3.2 3.452 3.69 3.901 4.266 4.448 4.616 4.868 5.036 5.175 5.435 5.67 5.916 6.041 6.273 6.507 6.844 7.046 7.248 7.539 7.797 8.051 8.312 8.559 8.868 9.177 9.47 9.797 10.129 10.455 10.846 11.295 11.702 12.15 12.637 13.15 13.691 14.271 14.929 15.613 16.44 17.373 18.436 19.684 21.249 23.036 25.018 26.669 27.619 28.171 28.483 28.703 28.809 28.791 28.746 28.681 28.611 28.552 28.484 28.402 28.31 28.202 28.077 27.956 27.832 27.701 27.577 27.464 27.336 27.199 27.088 26.973 26.85 26.719 26.573 26.472 26.37 26.201 26.079 25.928 25.836 25.649 25.471 25.287 25.19 25.055 24.753 24.586 24.421 24.06 23.859 23.619 23.333 23.001 22.584 22.013 19.492 -8 ,8844 ,TETRA ,17617324,Tue Nov 30 06:16:07 CET,Tue Nov 30 08:03:15 CET,0.0 1.962 2.452 2.798 3.108 3.377 3.629 3.866 4.279 4.467 4.649 4.938 5.125 5.275 5.555 5.818 6.049 6.165 6.385 6.598 6.928 7.122 7.298 7.558 7.824 8.093 8.371 8.637 8.959 9.278 9.573 9.901 10.224 10.543 10.921 11.347 11.758 12.205 12.69 13.218 13.779 14.416 15.18 15.961 16.87 17.882 19.038 20.345 21.877 23.627 25.738 27.447 28.308 28.746 28.961 29.082 29.162 29.173 29.139 29.057 28.938 28.826 28.716 28.585 28.431 28.291 28.155 28.031 27.918 27.788 27.631 27.483 27.347 27.211 27.091 26.961 26.828 26.689 26.517 26.395 26.276 26.074 25.917 25.757 25.674 25.504 25.31 25.085 24.959 24.823 24.601 24.467 24.309 23.897 23.673 23.433 23.141 22.79 22.383 21.823 19.662 -9 ,18986 ,TETRA ,17617325,Tue Nov 30 06:16:07 CET,Tue Nov 30 08:07:19 CET,0.0 2.464 2.953 3.284 3.562 3.816 4.051 4.265 4.669 4.853 5.023 5.312 5.491 5.632 5.921 6.198 6.438 6.558 6.804 7.033 7.352 7.559 7.77 8.068 8.361 8.642 8.893 9.125 9.444 9.771 10.078 10.46 10.832 11.19 11.603 12.038 12.464 12.948 13.453 13.981 14.543 15.193 15.961 16.72 17.622 18.646 19.849 21.242 22.869 24.764 27.118 28.992 30.015 30.688 31.094 31.333 31.444 31.485 31.482 31.403 31.331 31.264 31.172 31.05 30.895 30.734 30.56 30.429 30.329 30.218 30.095 29.98 29.837 29.675 29.547 29.41 29.261 29.101 28.923 28.798 28.673 28.483 28.353 28.193 28.096 27.891 27.683 27.465 27.349 27.218 26.953 26.805 26.655 26.267 26.05 25.822 25.543 25.198 24.754 24.084 21.67 -10 ,24665 ,TETRA ,17617326,Tue Nov 30 06:16:07 CET,Tue Nov 30 08:03:19 CET,0.0 2.077 2.595 2.949 3.249 3.521 3.772 4.014 4.441 4.624 4.794 5.064 5.248 5.406 5.706 5.974 6.22 6.341 6.565 6.757 7.03 7.207 7.381 7.633 7.876 8.127 8.391 8.658 8.987 9.284 9.565 9.906 10.238 10.565 10.958 11.387 11.768 12.176 12.625 13.159 13.73 14.36 15.095 15.835 16.721 17.643 18.672 19.917 21.45 23.212 25.345 27.067 28.052 28.642 29.015 29.253 29.353 29.329 29.238 29.138 29.028 28.919 28.803 28.675 28.564 28.442 28.302 28.17 28.042 27.911 27.77 27.643 27.515 27.384 27.273 27.141 26.985 26.824 26.65 26.534 26.426 26.197 26.03 25.888 25.809 25.648 25.456 25.216 25.093 24.948 24.678 24.535 24.382 24.037 23.822 23.605 23.358 23.009 22.576 22.041 18.829 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_252.txt deleted file mode 100644 index 68e1dd45..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_237_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7306 ,TETRA ,17617327,Tue Nov 30 06:16:08 CET,Tue Nov 30 08:05:08 CET,0.0 0.595 0.705 0.751 0.761 0.764 0.751 0.712 0.552 0.465 0.381 0.155 0.087 -0.02 -0.233 -0.444 -0.656 -0.77 -1.017 -1.269 -1.62 -1.836 -2.051 -2.396 -2.782 -3.191 -3.582 -3.96 -4.502 -5.082 -5.669 -6.414 -7.174 -7.95 -8.9 -10.009 -11.111 -12.393 -13.858 -15.467 -17.235 -19.409 -22.097 -24.924 -28.51 -32.955 -38.619 -45.689 -54.904 -67.279 -85.246 -103.718 -117.134 -127.392 -135.434 -142.088 -147.509 -152.194 -156.043 -159.653 -162.612 -165.15 -167.468 -169.58 -171.49 -173.184 -174.906 -176.388 -177.631 -178.891 -180.169 -181.202 -182.251 -183.323 -184.125 -184.916 -185.78 -186.732 -187.714 -188.377 -189.041 -190.069 -190.767 -191.466 -191.819 -192.55 -193.308 -194.084 -194.486 -195.169 -195.717 -196.14 -196.563 -197.451 -197.929 -198.457 -199.023 -199.607 -200.239 -201.072 -203.817 -2 ,474 ,TETRA ,17617328,Tue Nov 30 06:16:08 CET,Tue Nov 30 08:04:57 CET,0.0 0.433 0.599 0.643 0.606 0.56 0.528 0.486 0.373 0.296 0.202 -0.035 -0.105 -0.208 -0.433 -0.663 -0.896 -0.999 -1.213 -1.471 -1.865 -2.139 -2.415 -2.833 -3.277 -3.731 -4.176 -4.624 -5.201 -5.761 -6.362 -7.143 -7.923 -8.678 -9.58 -10.661 -11.734 -12.966 -14.392 -15.979 -17.743 -19.882 -22.553 -25.5 -29.236 -33.73 -39.347 -46.294 -55.421 -67.786 -85.557 -103.851 -117.289 -127.594 -135.655 -142.384 -147.964 -152.713 -156.572 -160.263 -163.323 -165.9 -168.281 -170.494 -172.51 -174.306 -176.116 -177.672 -178.979 -180.309 -181.65 -182.73 -183.819 -184.916 -185.745 -186.58 -187.427 -188.29 -189.175 -189.762 -190.35 -191.256 -191.884 -192.531 -192.858 -193.524 -194.186 -194.859 -195.207 -195.81 -196.286 -196.65 -197.032 -197.896 -198.361 -198.839 -199.324 -199.832 -200.452 -201.187 -203.075 -3 ,16940 ,TETRA ,17617329,Tue Nov 30 06:16:07 CET,Tue Nov 30 08:02:27 CET,0.0 0.715 0.799 0.823 0.835 0.812 0.764 0.709 0.586 0.507 0.421 0.226 0.179 0.098 -0.073 -0.261 -0.461 -0.57 -0.808 -1.043 -1.395 -1.641 -1.894 -2.285 -2.687 -3.11 -3.527 -3.942 -4.517 -5.087 -5.645 -6.362 -7.081 -7.806 -8.717 -9.804 -10.921 -12.2 -13.599 -15.208 -17.031 -19.198 -21.916 -24.837 -28.512 -32.965 -38.589 -45.601 -54.742 -67.008 -84.732 -102.984 -116.175 -126.41 -134.576 -141.349 -146.826 -151.431 -155.211 -158.823 -161.778 -164.29 -166.601 -168.694 -170.567 -172.227 -173.899 -175.338 -176.56 -177.814 -179.081 -180.117 -181.181 -182.236 -183.023 -183.815 -184.619 -185.448 -186.282 -186.84 -187.411 -188.304 -188.913 -189.531 -189.85 -190.506 -191.194 -191.913 -192.277 -192.876 -193.376 -193.773 -194.188 -195.075 -195.543 -196.034 -196.569 -197.15 -197.809 -198.599 -200.731 -4 ,28189 ,TETRA ,17617330,Tue Nov 30 06:16:08 CET,Tue Nov 30 08:05:03 CET,0.0 1.149 1.326 1.419 1.468 1.49 1.471 1.441 1.37 1.304 1.223 1.015 0.954 0.861 0.659 0.442 0.211 0.09 -0.146 -0.376 -0.727 -0.962 -1.197 -1.565 -1.942 -2.338 -2.763 -3.181 -3.73 -4.292 -4.856 -5.577 -6.336 -7.122 -8.086 -9.19 -10.3 -11.625 -13.14 -14.791 -16.578 -18.731 -21.452 -24.433 -28.171 -32.705 -38.41 -45.384 -54.492 -67.008 -85.347 -104.294 -117.938 -128.323 -136.458 -143.217 -148.77 -153.492 -157.386 -161.087 -164.137 -166.75 -169.148 -171.325 -173.297 -175.079 -176.882 -178.399 -179.693 -181.014 -182.315 -183.368 -184.434 -185.507 -186.329 -187.172 -188.013 -188.847 -189.702 -190.292 -190.886 -191.783 -192.398 -193.014 -193.326 -193.962 -194.642 -195.363 -195.719 -196.323 -196.841 -197.223 -197.597 -198.366 -198.792 -199.254 -199.75 -200.284 -200.858 -201.548 -203.321 -5 ,27445 ,TETRA ,17617331,Tue Nov 30 06:16:08 CET,Tue Nov 30 08:04:49 CET,0.0 0.819 0.939 0.977 0.988 1.01 1.008 0.969 0.863 0.797 0.729 0.512 0.441 0.346 0.162 -0.042 -0.254 -0.361 -0.593 -0.835 -1.206 -1.473 -1.759 -2.193 -2.618 -3.053 -3.499 -3.95 -4.545 -5.149 -5.759 -6.518 -7.316 -8.126 -9.103 -10.254 -11.396 -12.7 -14.167 -15.834 -17.717 -19.949 -22.729 -25.719 -29.441 -33.878 -39.419 -46.325 -55.444 -67.81 -85.711 -104.059 -117.237 -127.471 -135.689 -142.572 -148.224 -152.974 -156.856 -160.587 -163.671 -166.286 -168.658 -170.803 -172.748 -174.485 -176.257 -177.79 -179.064 -180.341 -181.638 -182.69 -183.73 -184.773 -185.579 -186.402 -187.236 -188.088 -188.963 -189.562 -190.161 -191.067 -191.677 -192.279 -192.588 -193.211 -193.825 -194.481 -194.829 -195.456 -196.009 -196.428 -196.865 -197.76 -198.212 -198.692 -199.212 -199.794 -200.445 -201.254 -204.104 -6 ,18129 ,TETRA ,17617332,Tue Nov 30 06:16:09 CET,Tue Nov 30 08:04:35 CET,0.0 0.838 0.929 0.963 0.963 0.928 0.88 0.835 0.748 0.681 0.607 0.418 0.361 0.268 0.091 -0.088 -0.279 -0.377 -0.592 -0.809 -1.157 -1.41 -1.66 -2.029 -2.404 -2.8 -3.208 -3.622 -4.182 -4.754 -5.354 -6.108 -6.86 -7.631 -8.569 -9.646 -10.726 -11.987 -13.443 -15.09 -16.91 -19.038 -21.675 -24.618 -28.362 -32.831 -38.446 -45.506 -54.824 -67.359 -85.378 -103.856 -117.296 -127.615 -135.717 -142.415 -147.976 -152.733 -156.569 -160.204 -163.239 -165.854 -168.233 -170.375 -172.277 -173.998 -175.761 -177.286 -178.58 -179.899 -181.219 -182.251 -183.307 -184.401 -185.226 -186.044 -186.859 -187.686 -188.549 -189.13 -189.699 -190.592 -191.213 -191.82 -192.116 -192.728 -193.36 -194.017 -194.361 -194.933 -195.376 -195.751 -196.123 -196.866 -197.282 -197.727 -198.198 -198.717 -199.301 -199.962 -201.718 -7 ,17197 ,TETRA ,17617333,Tue Nov 30 06:16:08 CET,Tue Nov 30 08:06:52 CET,0.0 0.527 0.628 0.689 0.737 0.757 0.723 0.684 0.571 0.487 0.393 0.169 0.111 0.024 -0.168 -0.369 -0.566 -0.674 -0.905 -1.135 -1.497 -1.745 -1.993 -2.363 -2.751 -3.177 -3.602 -4.036 -4.64 -5.254 -5.876 -6.644 -7.405 -8.175 -9.088 -10.161 -11.283 -12.585 -14.062 -15.716 -17.553 -19.725 -22.343 -25.1 -28.689 -33.173 -38.795 -45.821 -55.119 -67.66 -85.698 -104.251 -117.773 -128.237 -136.451 -143.208 -148.765 -153.488 -157.314 -160.976 -163.987 -166.567 -168.935 -171.053 -172.964 -174.676 -176.421 -177.919 -179.157 -180.421 -181.704 -182.732 -183.797 -184.882 -185.685 -186.501 -187.322 -188.139 -188.968 -189.569 -190.215 -191.175 -191.802 -192.427 -192.746 -193.404 -194.075 -194.756 -195.101 -195.759 -196.309 -196.733 -197.167 -198.045 -198.501 -198.979 -199.49 -200.062 -200.674 -201.423 -203.593 -8 ,18634 ,TETRA ,17617334,Tue Nov 30 06:16:08 CET,Tue Nov 30 08:04:54 CET,0.0 0.639 0.722 0.735 0.752 0.759 0.727 0.671 0.556 0.478 0.393 0.235 0.215 0.127 -0.102 -0.341 -0.573 -0.686 -0.927 -1.181 -1.548 -1.795 -2.054 -2.472 -2.912 -3.34 -3.756 -4.175 -4.746 -5.337 -5.933 -6.669 -7.43 -8.213 -9.169 -10.293 -11.406 -12.659 -14.057 -15.676 -17.514 -19.711 -22.394 -25.268 -28.962 -33.416 -39.019 -46.005 -55.152 -67.545 -85.57 -104.062 -117.375 -127.628 -135.711 -142.397 -147.888 -152.555 -156.364 -159.988 -163.008 -165.598 -167.982 -170.145 -172.062 -173.765 -175.481 -176.967 -178.22 -179.474 -180.86 -182.064 -183.276 -184.509 -185.419 -186.341 -187.318 -188.315 -189.323 -190.006 -190.703 -191.768 -192.469 -193.17 -193.526 -194.25 -194.988 -195.745 -196.131 -196.793 -197.291 -197.699 -198.126 -199.017 -199.492 -200.001 -200.526 -201.079 -201.713 -202.528 -204.589 -9 ,7067 ,TETRA ,17617335,Tue Nov 30 06:16:08 CET,Tue Nov 30 08:04:16 CET,0.0 0.655 0.848 0.956 0.996 0.987 0.959 0.909 0.752 0.665 0.577 0.362 0.302 0.207 0.01 -0.199 -0.414 -0.526 -0.748 -0.981 -1.361 -1.614 -1.872 -2.274 -2.691 -3.112 -3.536 -3.973 -4.562 -5.17 -5.768 -6.486 -7.213 -7.953 -8.874 -10.0 -11.149 -12.435 -13.842 -15.452 -17.285 -19.485 -22.204 -25.151 -28.881 -33.376 -39.053 -46.094 -55.27 -67.611 -85.398 -103.653 -116.923 -127.33 -135.637 -142.466 -148.055 -152.815 -156.682 -160.356 -163.393 -166.01 -168.403 -170.558 -172.485 -174.192 -175.947 -177.481 -178.751 -180.035 -181.347 -182.395 -183.447 -184.52 -185.345 -186.176 -187.008 -187.85 -188.702 -189.294 -189.895 -190.783 -191.383 -191.997 -192.301 -192.899 -193.524 -194.174 -194.506 -195.078 -195.576 -195.961 -196.341 -197.137 -197.566 -198.029 -198.527 -199.088 -199.713 -200.445 -202.593 -10 ,30898 ,TETRA ,17617336,Tue Nov 30 06:16:08 CET,Tue Nov 30 08:06:08 CET,0.0 0.799 1.051 1.199 1.27 1.264 1.21 1.164 1.08 1.028 0.966 0.779 0.735 0.654 0.48 0.288 0.081 -0.026 -0.228 -0.442 -0.767 -0.988 -1.235 -1.626 -2.022 -2.421 -2.837 -3.272 -3.861 -4.465 -5.063 -5.817 -6.598 -7.373 -8.309 -9.409 -10.528 -11.835 -13.315 -14.977 -16.808 -18.98 -21.71 -24.685 -28.4 -32.869 -38.507 -45.488 -54.763 -67.527 -85.868 -104.787 -118.506 -129.001 -137.304 -144.164 -149.754 -154.512 -158.428 -162.153 -165.197 -167.785 -170.158 -172.318 -174.254 -175.953 -177.662 -179.17 -180.453 -181.738 -183.02 -184.052 -185.099 -186.148 -186.957 -187.788 -188.618 -189.474 -190.358 -190.944 -191.538 -192.451 -193.051 -193.668 -193.994 -194.645 -195.306 -195.978 -196.312 -196.894 -197.393 -197.774 -198.159 -198.946 -199.373 -199.814 -200.252 -200.735 -201.28 -201.981 -203.715 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_23_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_23_1.txt deleted file mode 100644 index 320539e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_23_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11851 ,TETRA ,17617337,Tue Nov 30 06:16:08 CET,Tue Nov 30 08:04:02 CET,0.0 1.326 1.7 1.962 2.2 2.404 2.586 2.754 3.034 3.166 3.297 3.482 3.656 3.759 3.956 4.139 4.309 4.399 4.577 4.734 4.96 5.113 5.241 5.406 5.559 5.719 5.905 6.072 6.25 6.411 6.565 6.742 6.904 7.071 7.265 7.472 7.668 7.887 8.121 8.336 8.554 8.807 9.092 9.373 9.666 9.964 10.281 10.593 10.888 11.157 11.284 11.066 10.724 10.34 9.935 9.548 9.2 8.879 8.588 8.281 8.016 7.781 7.506 7.242 7.034 6.833 6.627 6.442 6.266 6.093 5.925 5.783 5.627 5.454 5.31 5.156 5.016 4.888 4.732 4.617 4.493 4.276 4.111 3.95 3.878 3.744 3.598 3.409 3.297 3.12 2.916 2.78 2.653 2.373 2.219 2.061 1.88 1.684 1.452 1.157 0.043 -2 ,6925 ,TETRA ,17617338,Tue Nov 30 06:16:10 CET,Tue Nov 30 08:04:34 CET,0.0 1.09 1.453 1.721 1.947 2.126 2.277 2.421 2.691 2.822 2.935 3.085 3.245 3.337 3.518 3.691 3.863 3.943 4.095 4.234 4.426 4.552 4.677 4.858 5.027 5.186 5.335 5.478 5.655 5.821 5.972 6.14 6.311 6.505 6.716 6.927 7.127 7.328 7.558 7.801 8.038 8.302 8.582 8.8 9.026 9.293 9.561 9.825 10.097 10.331 10.397 10.093 9.687 9.3 8.92 8.57 8.291 8.035 7.787 7.517 7.275 7.04 6.813 6.574 6.332 6.129 5.913 5.697 5.479 5.251 5.012 4.809 4.627 4.443 4.299 4.155 4.004 3.85 3.679 3.56 3.425 3.195 3.044 2.902 2.835 2.694 2.528 2.322 2.218 2.059 1.888 1.767 1.652 1.398 1.258 1.096 0.901 0.703 0.467 0.112 -1.086 -3 ,30185 ,TETRA ,17617339,Tue Nov 30 06:16:10 CET,Tue Nov 30 08:05:02 CET,0.0 1.184 1.587 1.858 2.074 2.278 2.459 2.614 2.887 3.023 3.156 3.334 3.496 3.589 3.77 3.938 4.1 4.188 4.359 4.521 4.739 4.853 4.962 5.127 5.291 5.466 5.619 5.737 5.889 6.034 6.193 6.417 6.636 6.829 7.02 7.235 7.431 7.618 7.806 8.035 8.288 8.551 8.842 9.103 9.409 9.744 10.086 10.451 10.829 11.145 11.336 11.257 10.949 10.557 10.151 9.717 9.336 9.002 8.652 8.266 7.966 7.7 7.452 7.235 7.022 6.827 6.616 6.427 6.275 6.074 5.835 5.674 5.511 5.33 5.204 5.073 4.934 4.782 4.621 4.509 4.399 4.239 4.115 3.987 3.922 3.775 3.609 3.441 3.359 3.205 3.042 2.916 2.786 2.49 2.323 2.156 1.982 1.784 1.53 1.183 0.028 -4 ,10178 ,TETRA ,17617340,Tue Nov 30 06:16:59 CET,Tue Nov 30 08:08:37 CET,0.0 1.198 1.565 1.863 2.104 2.295 2.466 2.621 2.896 3.009 3.113 3.264 3.425 3.517 3.68 3.833 3.988 4.067 4.226 4.381 4.609 4.755 4.881 5.052 5.222 5.39 5.56 5.71 5.892 6.062 6.21 6.385 6.583 6.798 7.059 7.317 7.523 7.725 7.914 8.119 8.344 8.598 8.892 9.15 9.438 9.771 10.133 10.464 10.762 11.031 11.081 10.784 10.423 10.023 9.619 9.23 8.861 8.474 8.054 7.624 7.314 7.046 6.791 6.532 6.263 6.045 5.82 5.6 5.416 5.202 4.972 4.789 4.588 4.379 4.219 4.043 3.847 3.631 3.405 3.247 3.087 2.853 2.699 2.542 2.458 2.279 2.09 1.894 1.785 1.614 1.441 1.325 1.198 0.902 0.748 0.571 0.357 0.122 -0.172 -0.529 -1.401 -5 ,11009 ,TETRA ,17617341,Tue Nov 30 06:17:00 CET,Tue Nov 30 08:05:21 CET,0.0 1.304 1.704 1.943 2.158 2.363 2.556 2.731 3.053 3.194 3.318 3.495 3.671 3.778 3.985 4.179 4.353 4.432 4.586 4.748 4.966 5.104 5.236 5.422 5.599 5.761 5.913 6.048 6.207 6.362 6.518 6.699 6.868 7.072 7.334 7.618 7.852 8.046 8.259 8.494 8.746 9.026 9.319 9.625 9.987 10.346 10.694 10.99 11.315 11.65 11.789 11.626 11.347 11.022 10.679 10.344 9.99 9.627 9.343 9.037 8.758 8.549 8.346 8.139 7.958 7.769 7.558 7.372 7.203 7.027 6.829 6.637 6.43 6.222 6.067 5.925 5.79 5.621 5.423 5.305 5.19 4.994 4.84 4.678 4.601 4.455 4.305 4.118 4.004 3.83 3.676 3.563 3.455 3.19 3.034 2.864 2.686 2.476 2.209 1.896 0.945 -6 ,30344 ,TETRA ,17617342,Tue Nov 30 06:17:01 CET,Tue Nov 30 08:06:05 CET,0.0 1.067 1.432 1.714 1.949 2.157 2.323 2.457 2.736 2.881 3.009 3.178 3.354 3.466 3.68 3.886 4.056 4.139 4.308 4.46 4.678 4.832 4.985 5.197 5.397 5.581 5.756 5.915 6.123 6.343 6.525 6.706 6.912 7.125 7.338 7.544 7.729 7.937 8.155 8.383 8.621 8.884 9.172 9.464 9.812 10.157 10.471 10.741 11.011 11.266 11.359 11.121 10.787 10.402 10.003 9.63 9.308 8.997 8.709 8.413 8.15 7.905 7.636 7.378 7.125 6.905 6.699 6.492 6.315 6.111 5.878 5.677 5.454 5.244 5.085 4.92 4.768 4.61 4.437 4.312 4.166 3.929 3.775 3.635 3.56 3.401 3.253 3.091 3.002 2.846 2.688 2.57 2.448 2.156 1.99 1.825 1.661 1.451 1.207 0.891 -0.23 -7 ,22625 ,TETRA ,17617343,Tue Nov 30 06:17:01 CET,Tue Nov 30 08:04:56 CET,0.0 1.152 1.483 1.718 1.923 2.107 2.265 2.405 2.673 2.792 2.904 3.062 3.222 3.314 3.465 3.615 3.775 3.861 4.039 4.187 4.379 4.504 4.62 4.797 4.963 5.105 5.234 5.362 5.551 5.725 5.884 6.072 6.247 6.41 6.596 6.802 7.024 7.27 7.518 7.784 8.039 8.286 8.533 8.8 9.091 9.368 9.666 9.927 10.185 10.46 10.613 10.437 10.141 9.812 9.445 9.052 8.657 8.272 7.954 7.576 7.17 6.861 6.641 6.389 6.136 5.906 5.662 5.456 5.269 5.087 4.911 4.758 4.6 4.452 4.343 4.214 4.069 3.897 3.711 3.589 3.459 3.243 3.085 2.933 2.853 2.68 2.516 2.333 2.235 2.074 1.924 1.81 1.685 1.392 1.216 1.027 0.84 0.639 0.409 0.112 -0.993 -8 ,19716 ,TETRA ,17617344,Tue Nov 30 06:17:01 CET,Tue Nov 30 08:05:07 CET,0.0 1.338 1.685 1.941 2.18 2.385 2.562 2.73 3.017 3.144 3.268 3.44 3.607 3.711 3.919 4.119 4.303 4.389 4.554 4.719 4.924 5.032 5.137 5.281 5.421 5.559 5.715 5.886 6.109 6.321 6.513 6.735 6.944 7.123 7.317 7.571 7.808 8.026 8.248 8.478 8.714 8.974 9.258 9.523 9.834 10.153 10.46 10.777 11.1 11.396 11.523 11.318 11.014 10.694 10.351 10.016 9.716 9.41 9.14 8.861 8.603 8.353 8.096 7.872 7.676 7.49 7.29 7.12 6.974 6.808 6.63 6.469 6.304 6.136 5.986 5.819 5.666 5.533 5.385 5.25 5.098 4.889 4.752 4.598 4.514 4.346 4.166 3.968 3.859 3.684 3.504 3.372 3.234 2.924 2.752 2.583 2.418 2.234 1.981 1.617 0.389 -9 ,18929 ,TETRA ,17617345,Tue Nov 30 06:17:00 CET,Tue Nov 30 08:07:29 CET,0.0 1.297 1.719 2.054 2.286 2.474 2.642 2.791 3.075 3.217 3.353 3.533 3.726 3.852 4.075 4.277 4.46 4.553 4.726 4.87 5.083 5.23 5.374 5.579 5.778 5.958 6.124 6.293 6.516 6.738 6.942 7.165 7.364 7.529 7.694 7.887 8.127 8.38 8.583 8.792 9.009 9.233 9.52 9.839 10.151 10.458 10.82 11.161 11.444 11.716 11.861 11.686 11.313 10.885 10.48 10.103 9.784 9.468 9.183 8.876 8.605 8.377 8.148 7.905 7.664 7.403 7.15 6.949 6.744 6.519 6.278 6.09 5.918 5.748 5.613 5.468 5.279 5.077 4.885 4.739 4.581 4.344 4.195 4.038 3.953 3.762 3.564 3.377 3.283 3.126 2.978 2.859 2.723 2.418 2.252 2.07 1.877 1.658 1.375 1.012 -0.011 -10 ,629 ,TETRA ,17617346,Tue Nov 30 06:17:01 CET,Tue Nov 30 08:06:26 CET,0.0 0.991 1.346 1.612 1.858 2.055 2.217 2.364 2.602 2.732 2.864 3.011 3.159 3.244 3.415 3.587 3.746 3.816 3.964 4.123 4.362 4.508 4.646 4.825 4.978 5.13 5.281 5.426 5.589 5.74 5.892 6.077 6.259 6.423 6.604 6.808 6.999 7.215 7.442 7.668 7.891 8.122 8.388 8.646 8.917 9.223 9.601 9.958 10.25 10.505 10.616 10.309 9.934 9.495 9.053 8.687 8.346 7.995 7.687 7.369 7.08 6.85 6.643 6.427 6.22 5.995 5.724 5.51 5.345 5.162 4.946 4.768 4.575 4.356 4.208 4.082 3.941 3.771 3.586 3.444 3.305 3.122 2.98 2.796 2.7 2.519 2.333 2.125 2.011 1.831 1.634 1.499 1.359 1.04 0.874 0.687 0.476 0.27 0.018 -0.349 -1.515 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_251_256.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_251_256.txt deleted file mode 100644 index d6c93445..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_251_256.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24706 ,TETRA ,17617347,Tue Nov 30 06:17:01 CET,Tue Nov 30 08:04:14 CET,0.0 0.652 0.875 1.016 1.126 1.217 1.287 1.354 1.501 1.558 1.607 1.504 1.727 1.767 1.829 1.88 1.932 1.957 1.986 1.991 1.988 1.989 1.984 1.986 2.001 2.004 1.987 1.954 1.901 1.856 1.8 1.709 1.61 1.491 1.347 1.176 1.01 0.861 0.719 0.521 0.264 -0.078 -0.567 -1.105 -1.827 -2.798 -4.061 -5.661 -7.815 -10.883 -15.535 -20.551 -24.45 -27.552 -30.064 -32.228 -34.081 -35.705 -37.043 -38.359 -39.498 -40.492 -41.377 -42.149 -42.849 -43.501 -44.183 -44.756 -45.246 -45.77 -46.306 -46.739 -47.182 -47.646 -48.02 -48.409 -48.793 -49.178 -49.562 -49.812 -50.083 -50.512 -50.81 -51.142 -51.305 -51.609 -51.909 -52.219 -52.383 -52.808 -52.972 -53.194 -53.417 -53.855 -54.112 -54.413 -54.74 -55.126 -55.584 -56.115 -58.586 -2 ,7625 ,TETRA ,17617348,Tue Nov 30 06:17:07 CET,Tue Nov 30 08:09:45 CET,0.0 0.6 0.812 0.989 1.128 1.221 1.297 1.366 1.489 1.561 1.627 1.528 1.757 1.795 1.843 1.891 1.929 1.945 1.973 1.994 2.014 2.016 2.011 1.997 1.988 1.988 1.998 2.024 2.053 2.043 1.987 1.902 1.867 1.86 1.804 1.696 1.567 1.384 1.181 0.94 0.604 0.205 -0.292 -0.835 -1.531 -2.45 -3.658 -5.19 -7.272 -10.228 -14.754 -19.626 -23.277 -26.27 -28.767 -30.824 -32.498 -33.951 -35.164 -36.356 -37.376 -38.314 -39.189 -39.975 -40.739 -41.427 -42.13 -42.775 -43.312 -43.859 -44.408 -44.854 -45.323 -45.792 -46.154 -46.527 -46.892 -47.265 -47.668 -47.951 -48.248 -48.704 -49.022 -49.356 -49.516 -49.84 -50.181 -50.527 -50.704 -51.141 -51.319 -51.537 -51.753 -52.238 -52.51 -52.792 -53.123 -53.53 -53.989 -54.532 -56.618 -3 ,25444 ,TETRA ,17617349,Tue Nov 30 06:17:02 CET,Tue Nov 30 08:04:47 CET,0.0 0.749 0.954 1.099 1.238 1.365 1.479 1.575 1.72 1.776 1.821 1.709 1.94 1.993 2.093 2.156 2.209 2.246 2.308 2.355 2.427 2.463 2.496 2.525 2.549 2.558 2.543 2.53 2.508 2.486 2.47 2.45 2.429 2.381 2.287 2.161 2.044 1.944 1.824 1.648 1.374 0.987 0.499 -0.048 -0.74 -1.589 -2.713 -4.203 -6.214 -8.959 -13.304 -18.249 -22.024 -25.084 -27.594 -29.854 -31.829 -33.554 -34.936 -36.266 -37.461 -38.549 -39.487 -40.307 -41.074 -41.764 -42.458 -43.049 -43.567 -44.113 -44.673 -45.105 -45.535 -45.979 -46.318 -46.668 -47.031 -47.385 -47.76 -48.037 -48.31 -48.729 -49.028 -49.326 -49.472 -49.783 -50.104 -50.433 -50.608 -51.038 -51.201 -51.413 -51.628 -52.061 -52.294 -52.548 -52.834 -53.131 -53.431 -53.868 -55.508 -4 ,15839 ,TETRA ,17617350,Tue Nov 30 06:17:02 CET,Tue Nov 30 08:04:50 CET,0.0 0.678 0.923 1.086 1.185 1.272 1.378 1.481 1.645 1.727 1.79 1.677 1.889 1.92 2.004 2.092 2.166 2.201 2.249 2.28 2.297 2.3 2.306 2.31 2.306 2.292 2.282 2.263 2.214 2.164 2.107 2.032 1.961 1.89 1.785 1.638 1.509 1.357 1.152 0.933 0.668 0.293 -0.227 -0.815 -1.566 -2.491 -3.661 -5.2 -7.333 -10.287 -14.808 -19.745 -23.51 -26.54 -29.032 -31.122 -32.884 -34.415 -35.671 -36.896 -37.916 -38.787 -39.597 -40.354 -41.012 -41.576 -42.174 -42.719 -43.209 -43.75 -44.341 -44.848 -45.379 -45.918 -46.329 -46.758 -47.188 -47.624 -48.09 -48.395 -48.695 -49.162 -49.484 -49.813 -49.976 -50.316 -50.681 -51.071 -51.289 -51.761 -51.97 -52.218 -52.487 -53.035 -53.325 -53.644 -53.983 -54.38 -54.855 -55.514 -57.722 -5 ,13966 ,TETRA ,17617351,Tue Nov 30 06:17:02 CET,Tue Nov 30 08:05:51 CET,0.0 0.745 1.006 1.182 1.304 1.404 1.502 1.594 1.739 1.805 1.874 1.806 2.039 2.081 2.196 2.302 2.384 2.422 2.51 2.595 2.685 2.73 2.769 2.8 2.798 2.786 2.775 2.752 2.716 2.696 2.719 2.769 2.804 2.827 2.817 2.749 2.676 2.619 2.519 2.35 2.141 1.858 1.419 0.859 0.14 -0.75 -1.925 -3.434 -5.51 -8.442 -12.917 -17.813 -21.588 -24.629 -27.079 -29.158 -30.897 -32.38 -33.637 -34.86 -35.911 -36.823 -37.704 -38.518 -39.231 -39.958 -40.721 -41.316 -41.815 -42.348 -42.889 -43.347 -43.819 -44.287 -44.638 -45.076 -45.605 -46.132 -46.667 -47.033 -47.403 -47.968 -48.37 -48.789 -49.009 -49.469 -49.94 -50.436 -50.695 -51.27 -51.564 -51.856 -52.153 -52.8 -53.145 -53.506 -53.89 -54.305 -54.796 -55.421 -57.977 -6 ,22067 ,TETRA ,17617352,Tue Nov 30 06:17:02 CET,Tue Nov 30 08:06:40 CET,0.0 0.625 0.802 0.933 1.05 1.139 1.22 1.323 1.522 1.6 1.65 1.544 1.769 1.806 1.88 1.939 1.994 2.014 2.035 2.05 2.062 2.06 2.056 2.063 2.077 2.09 2.087 2.058 2.011 1.943 1.863 1.766 1.667 1.563 1.413 1.239 1.058 0.821 0.562 0.273 -0.049 -0.412 -0.893 -1.46 -2.226 -3.224 -4.523 -6.185 -8.438 -11.592 -16.337 -21.519 -25.586 -28.94 -31.707 -34.128 -36.117 -37.807 -39.241 -40.643 -41.813 -42.806 -43.723 -44.58 -45.374 -46.075 -46.815 -47.481 -48.018 -48.57 -49.137 -49.601 -50.117 -50.643 -51.031 -51.429 -51.83 -52.233 -52.642 -52.923 -53.223 -53.709 -54.034 -54.352 -54.532 -54.933 -55.33 -55.712 -55.899 -56.349 -56.545 -56.779 -57.019 -57.529 -57.794 -58.062 -58.339 -58.669 -59.09 -59.6 -61.439 -7 ,4835 ,TETRA ,17617353,Tue Nov 30 06:17:02 CET,Tue Nov 30 08:05:09 CET,0.0 0.632 0.845 1.012 1.134 1.235 1.313 1.376 1.485 1.528 1.571 1.49 1.727 1.767 1.843 1.923 1.984 2.007 2.05 2.087 2.132 2.16 2.199 2.256 2.309 2.361 2.399 2.417 2.419 2.396 2.356 2.294 2.201 2.116 2.025 1.904 1.776 1.622 1.411 1.154 0.862 0.478 -0.035 -0.581 -1.296 -2.201 -3.386 -4.942 -7.063 -10.085 -14.704 -19.633 -23.414 -26.451 -28.87 -30.923 -32.65 -34.156 -35.406 -36.602 -37.604 -38.46 -39.253 -40.01 -40.714 -41.339 -41.964 -42.507 -42.972 -43.441 -43.917 -44.323 -44.739 -45.149 -45.462 -45.779 -46.097 -46.428 -46.777 -47.019 -47.262 -47.624 -47.879 -48.142 -48.273 -48.543 -48.835 -49.156 -49.337 -49.798 -49.995 -50.252 -50.519 -51.094 -51.403 -51.726 -52.083 -52.467 -52.885 -53.452 -55.255 -8 ,3175 ,TETRA ,17617354,Tue Nov 30 06:17:03 CET,Tue Nov 30 08:09:45 CET,0.0 0.727 0.953 1.13 1.269 1.377 1.484 1.586 1.758 1.828 1.898 1.843 2.083 2.122 2.199 2.265 2.316 2.345 2.412 2.472 2.561 2.622 2.664 2.685 2.684 2.683 2.725 2.769 2.788 2.802 2.788 2.759 2.724 2.67 2.606 2.524 2.413 2.268 2.086 1.835 1.542 1.194 0.753 0.24 -0.462 -1.351 -2.489 -3.992 -6.145 -9.259 -13.987 -19.152 -23.112 -26.28 -28.952 -31.297 -33.183 -34.803 -36.191 -37.519 -38.585 -39.516 -40.466 -41.341 -42.085 -42.773 -43.462 -44.039 -44.517 -45.028 -45.56 -45.959 -46.377 -46.824 -47.173 -47.542 -47.951 -48.377 -48.789 -49.066 -49.343 -49.785 -50.113 -50.441 -50.597 -50.928 -51.292 -51.675 -51.861 -52.28 -52.439 -52.658 -52.878 -53.364 -53.643 -53.94 -54.253 -54.615 -55.066 -55.597 -57.193 -9 ,3512 ,TETRA ,17617355,Tue Nov 30 06:17:03 CET,Tue Nov 30 08:06:00 CET,0.0 0.558 0.765 0.895 0.997 1.079 1.149 1.224 1.361 1.415 1.465 1.357 1.581 1.626 1.712 1.783 1.837 1.86 1.882 1.898 1.913 1.906 1.894 1.869 1.84 1.815 1.789 1.763 1.735 1.707 1.662 1.58 1.5 1.421 1.338 1.25 1.101 0.883 0.637 0.349 0.025 -0.373 -0.923 -1.535 -2.312 -3.296 -4.6 -6.276 -8.502 -11.549 -16.164 -21.199 -24.996 -28.09 -30.675 -32.842 -34.662 -36.221 -37.486 -38.723 -39.773 -40.698 -41.55 -42.31 -43.015 -43.687 -44.399 -45.048 -45.59 -46.139 -46.699 -47.147 -47.591 -48.026 -48.378 -48.738 -49.097 -49.466 -49.836 -50.091 -50.356 -50.773 -51.079 -51.405 -51.573 -51.922 -52.304 -52.698 -52.887 -53.335 -53.523 -53.754 -53.994 -54.525 -54.816 -55.123 -55.475 -55.874 -56.335 -56.978 -59.049 -10 ,26830 ,TETRA ,17617356,Tue Nov 30 06:17:03 CET,Tue Nov 30 08:06:40 CET,0.0 0.615 0.85 1.011 1.129 1.247 1.355 1.447 1.611 1.681 1.739 1.628 1.853 1.892 1.938 1.972 2.0 2.008 2.027 2.049 2.075 2.092 2.102 2.109 2.104 2.093 2.089 2.101 2.115 2.098 2.097 2.094 2.058 2.006 1.919 1.798 1.66 1.486 1.279 1.041 0.752 0.381 -0.097 -0.633 -1.318 -2.198 -3.392 -4.985 -7.219 -10.352 -15.102 -20.52 -24.827 -28.231 -30.962 -33.291 -35.255 -37.004 -38.501 -39.953 -41.127 -42.146 -43.128 -44.042 -44.875 -45.597 -46.34 -47.028 -47.619 -48.221 -48.824 -49.322 -49.84 -50.361 -50.757 -51.152 -51.558 -51.985 -52.423 -52.722 -53.032 -53.51 -53.834 -54.184 -54.363 -54.718 -55.086 -55.489 -55.731 -56.28 -56.513 -56.77 -57.044 -57.634 -57.96 -58.316 -58.698 -59.126 -59.613 -60.22 -61.82 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_155.txt deleted file mode 100644 index 7b73e296..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28315 ,TETRA ,17617357,Tue Nov 30 06:17:03 CET,Tue Nov 30 08:04:04 CET,0.0 1.602 2.247 2.815 3.347 3.816 4.247 4.656 5.441 5.816 6.18 6.601 7.227 7.562 8.205 8.851 9.502 9.832 10.477 11.101 12.032 12.654 13.289 14.152 14.911 15.655 16.37 17.07 17.998 18.925 19.873 21.068 22.246 23.399 24.755 26.33 27.897 29.645 31.588 33.705 35.987 38.642 41.853 45.191 49.221 54.018 59.922 66.995 75.874 87.476 103.676 119.429 130.298 138.269 144.343 149.281 153.199 156.46 159.097 161.514 163.435 165.056 166.528 167.849 169.005 169.953 170.892 171.727 172.425 173.1 173.743 174.263 174.779 175.28 175.645 176.01 176.388 176.735 177.044 177.247 177.448 177.754 177.954 178.136 178.213 178.344 178.477 178.598 178.662 178.684 178.896 178.958 179.002 179.097 179.155 179.203 179.181 179.119 179.066 178.914 178.173 -2 ,16583 ,TETRA ,17617358,Tue Nov 30 06:17:04 CET,Tue Nov 30 08:08:29 CET,0.0 1.387 2.027 2.578 3.059 3.501 3.925 4.336 5.127 5.505 5.878 6.339 6.979 7.317 7.988 8.649 9.305 9.628 10.27 10.899 11.814 12.422 13.018 13.861 14.606 15.301 15.994 16.696 17.652 18.566 19.445 20.56 21.665 22.755 24.076 25.606 27.116 28.814 30.669 32.701 34.923 37.526 40.809 44.32 48.46 53.196 58.985 66.034 75.084 86.939 103.233 119.045 129.904 137.927 144.06 148.97 152.838 156.058 158.652 161.027 162.945 164.572 166.031 167.321 168.458 169.426 170.366 171.156 171.824 172.5 173.167 173.675 174.175 174.664 175.014 175.366 175.693 176.006 176.321 176.532 176.749 177.062 177.251 177.429 177.521 177.707 177.86 177.994 178.063 178.08 178.269 178.314 178.351 178.462 178.509 178.521 178.485 178.406 178.3 178.162 177.505 -3 ,24075 ,TETRA ,17617359,Tue Nov 30 06:17:03 CET,Tue Nov 30 08:04:12 CET,0.0 1.957 2.716 3.317 3.822 4.301 4.752 5.177 6.019 6.426 6.809 7.265 7.918 8.284 8.992 9.68 10.355 10.695 11.359 12.001 12.981 13.612 14.184 14.982 15.759 16.522 17.276 18.04 19.057 20.047 20.995 22.151 23.311 24.476 25.874 27.478 29.093 30.933 32.973 35.245 37.664 40.453 43.805 47.336 51.687 56.761 62.931 70.165 79.215 91.106 107.511 123.349 134.268 142.349 148.503 153.43 157.357 160.627 163.236 165.688 167.685 169.364 170.85 172.166 173.336 174.315 175.244 176.037 176.673 177.304 177.946 178.444 178.927 179.385 179.736 180.109 180.48 180.805 181.107 181.309 181.486 181.743 181.941 182.16 182.259 182.435 182.607 182.747 182.797 182.795 182.941 182.968 182.997 183.035 183.041 183.041 183.022 182.976 182.869 182.684 182.015 -4 ,637 ,TETRA ,17617360,Tue Nov 30 06:17:03 CET,Tue Nov 30 08:05:19 CET,0.0 1.412 2.094 2.665 3.149 3.58 3.978 4.354 5.076 5.428 5.766 6.176 6.729 7.034 7.614 8.171 8.743 9.033 9.58 10.113 10.888 11.38 11.878 12.619 13.342 14.048 14.739 15.425 16.335 17.232 18.118 19.223 20.322 21.42 22.721 24.251 25.79 27.499 29.361 31.429 33.728 36.357 39.511 42.913 47.112 51.954 57.794 64.827 73.796 85.506 101.699 117.491 128.359 136.385 142.506 147.431 151.363 154.614 157.212 159.642 161.596 163.224 164.677 165.949 167.038 167.946 168.823 169.597 170.249 170.864 171.481 172.005 172.512 173.001 173.369 173.736 174.1 174.465 174.82 175.05 175.285 175.64 175.862 176.073 176.169 176.346 176.537 176.721 176.814 176.846 177.055 177.123 177.188 177.291 177.32 177.345 177.359 177.339 177.278 177.146 176.362 -5 ,9750 ,TETRA ,17617361,Tue Nov 30 06:17:04 CET,Tue Nov 30 08:05:54 CET,0.0 2.014 2.741 3.313 3.809 4.267 4.683 5.068 5.82 6.176 6.52 6.958 7.51 7.834 8.464 9.075 9.681 9.975 10.554 11.131 11.982 12.52 13.042 13.826 14.608 15.377 16.118 16.861 17.856 18.828 19.794 20.955 22.062 23.156 24.471 26.049 27.668 29.47 31.463 33.629 35.931 38.593 41.829 45.229 49.337 54.227 60.292 67.537 76.77 88.734 104.99 120.841 131.778 139.893 146.033 150.927 154.838 158.106 160.713 163.136 165.074 166.677 168.132 169.434 170.546 171.478 172.379 173.158 173.84 174.509 175.152 175.669 176.192 176.713 177.096 177.47 177.839 178.165 178.448 178.644 178.86 179.184 179.373 179.551 179.637 179.814 179.986 180.133 180.195 180.197 180.362 180.412 180.456 180.549 180.591 180.604 180.599 180.589 180.52 180.32 179.713 -6 ,9050 ,TETRA ,17617362,Tue Nov 30 06:17:04 CET,Tue Nov 30 07:49:13 CET,0.0 2.309 3.073 3.721 4.267 4.764 5.2 5.559 6.207 6.534 6.86 7.232 7.753 8.033 8.573 9.126 9.688 9.966 10.522 11.056 11.819 12.311 12.81 13.566 14.31 15.04 15.75 16.448 17.355 18.273 19.204 20.359 21.504 22.643 23.992 25.533 27.044 28.752 30.705 32.853 35.151 37.803 41.038 44.434 48.542 53.385 59.512 67.042 76.244 87.957 104.133 119.856 130.719 138.753 144.937 149.902 153.849 157.129 159.745 162.203 164.18 165.789 167.222 168.525 169.681 170.651 171.599 172.418 173.093 173.772 174.438 174.961 175.482 175.99 176.372 176.764 177.146 177.507 177.862 178.093 178.318 178.66 178.88 179.087 179.183 179.376 179.57 179.761 179.839 179.843 180.01 180.062 180.118 180.217 180.256 180.29 180.297 180.242 180.146 180.01 179.423 -7 ,2264 ,TETRA ,17617363,Tue Nov 30 06:17:58 CET,Tue Nov 30 08:08:58 CET,0.0 1.203 1.883 2.444 2.936 3.406 3.877 4.323 5.129 5.511 5.897 6.372 7.011 7.365 8.067 8.75 9.402 9.723 10.366 10.997 11.918 12.538 13.168 14.084 14.961 15.82 16.667 17.518 18.653 19.782 20.907 22.26 23.577 24.859 26.285 27.827 29.308 31.008 32.926 35.025 37.298 39.957 43.212 46.586 50.696 55.521 61.364 68.432 77.443 89.155 105.325 121.082 131.97 140.041 146.18 151.137 155.119 158.406 161.033 163.488 165.453 167.102 168.604 169.949 171.128 172.118 173.019 173.765 174.424 175.102 175.736 176.194 176.67 177.138 177.464 177.78 178.089 178.414 178.728 178.927 179.122 179.412 179.597 179.754 179.831 180.004 180.182 180.354 180.433 180.453 180.622 180.668 180.715 180.765 180.77 180.79 180.793 180.72 180.609 180.468 179.878 -8 ,820 ,TETRA ,17617364,Tue Nov 30 06:18:00 CET,Tue Nov 30 08:06:24 CET,0.0 2.027 2.723 3.303 3.823 4.275 4.69 5.102 5.865 6.224 6.574 7.009 7.57 7.887 8.507 9.124 9.731 10.022 10.577 11.132 11.947 12.47 13.001 13.795 14.571 15.338 16.086 16.813 17.767 18.721 19.676 20.883 22.079 23.24 24.644 26.23 27.741 29.43 31.259 33.291 35.515 38.091 41.25 44.577 48.665 53.506 59.377 66.392 75.366 87.243 103.722 119.811 130.814 138.795 144.887 149.824 153.78 157.068 159.701 162.16 164.131 165.773 167.254 168.545 169.679 170.685 171.665 172.48 173.132 173.777 174.456 175.013 175.536 176.047 176.434 176.805 177.162 177.505 177.842 178.072 178.297 178.613 178.818 179.02 179.117 179.32 179.511 179.68 179.752 179.751 179.896 179.938 179.994 180.092 180.11 180.098 180.082 180.009 179.848 179.616 178.748 -9 ,8237 ,TETRA ,17617365,Tue Nov 30 06:17:59 CET,Tue Nov 30 07:50:15 CET,0.0 1.809 2.472 2.999 3.478 3.924 4.342 4.741 5.495 5.855 6.207 6.628 7.17 7.464 8.051 8.647 9.254 9.549 10.118 10.689 11.507 12.032 12.561 13.347 14.107 14.843 15.575 16.305 17.265 18.191 19.084 20.206 21.308 22.392 23.71 25.252 26.79 28.546 30.539 32.694 34.976 37.663 40.892 44.255 48.364 53.15 59.01 66.116 75.12 86.822 102.984 118.816 129.769 137.893 144.163 149.184 153.155 156.456 159.073 161.481 163.381 164.961 166.372 167.578 168.675 169.684 170.637 171.436 172.117 172.78 173.401 173.899 174.426 174.941 175.29 175.613 175.933 176.246 176.547 176.749 176.937 177.184 177.362 177.55 177.642 177.82 177.986 178.108 178.173 178.195 178.368 178.422 178.466 178.53 178.556 178.587 178.593 178.566 178.494 178.327 177.421 -10 ,2376 ,TETRA ,17617366,Tue Nov 30 06:18:00 CET,Tue Nov 30 08:05:50 CET,0.0 1.888 2.553 3.152 3.673 4.161 4.606 5.003 5.742 6.098 6.449 6.898 7.468 7.791 8.435 9.084 9.708 10.014 10.621 11.217 12.083 12.642 13.192 14.026 14.856 15.653 16.422 17.183 18.18 19.153 20.117 21.317 22.506 23.669 25.066 26.666 28.186 29.858 31.713 33.77 36.017 38.634 41.816 45.169 49.251 54.023 59.919 67.059 76.071 87.843 104.129 120.05 131.009 139.11 145.331 150.294 154.194 157.416 159.982 162.373 164.306 165.944 167.42 168.751 169.926 170.927 171.921 172.774 173.465 174.137 174.816 175.346 175.869 176.389 176.771 177.142 177.512 177.878 178.222 178.449 178.669 179.003 179.228 179.424 179.501 179.651 179.825 179.988 180.048 180.05 180.221 180.266 180.32 180.409 180.411 180.41 180.407 180.356 180.282 180.118 179.185 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_164.txt deleted file mode 100644 index ab27889e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10667 ,KEBNE ,17076723,Sat Dec 25 03:40:37 CET,Sat Dec 25 05:12:53 CET,0.0 1.516 2.107 2.6 3.012 3.394 3.761 4.119 4.794 5.107 5.415 5.733 6.301 6.579 7.116 7.653 8.187 8.453 8.978 9.482 10.232 10.732 11.215 11.917 12.61 13.248 13.826 14.392 15.121 15.83 16.538 17.412 18.267 19.09 20.091 21.256 22.375 23.651 25.083 26.633 28.314 30.299 32.707 35.183 38.174 41.736 46.021 51.134 57.646 66.074 77.436 88.113 95.349 100.701 104.771 108.004 110.584 112.683 114.34 115.832 117.03 118.07 118.997 119.817 120.518 121.109 121.672 122.156 122.573 122.971 123.333 123.61 123.893 124.163 124.345 124.529 124.719 124.899 125.068 125.183 125.287 125.416 125.494 125.56 125.591 125.643 125.683 125.723 125.741 125.639 125.721 125.706 125.704 125.682 125.669 125.657 125.628 125.551 125.423 125.22 124.345 -2 ,9739 ,KEBNE ,17076724,Sat Dec 25 03:40:37 CET,Sat Dec 25 05:11:36 CET,0.0 1.424 2.022 2.5 2.902 3.231 3.541 3.82 4.303 4.534 4.765 4.972 5.43 5.654 6.1 6.514 6.912 7.107 7.491 7.874 8.464 8.854 9.235 9.778 10.329 10.895 11.429 11.943 12.617 13.273 13.932 14.755 15.576 16.396 17.365 18.474 19.554 20.768 22.121 23.603 25.216 27.09 29.366 31.787 34.737 38.189 42.405 47.427 53.704 61.809 72.953 83.726 91.081 96.494 100.603 103.853 106.415 108.521 110.172 111.715 112.968 114.008 114.929 115.731 116.408 117.002 117.606 118.116 118.517 118.885 119.263 119.575 119.877 120.179 120.402 120.612 120.817 121.003 121.173 121.285 121.386 121.534 121.629 121.711 121.744 121.803 121.878 121.947 121.971 121.877 122.027 122.04 122.045 122.029 122.002 121.977 121.948 121.898 121.822 121.649 120.969 -3 ,16983 ,KEBNE ,17076725,Sat Dec 25 03:40:39 CET,Sat Dec 25 05:07:33 CET,0.0 1.631 2.326 2.886 3.359 3.773 4.145 4.501 5.16 5.478 5.798 6.134 6.74 7.044 7.624 8.199 8.765 9.051 9.629 10.185 10.987 11.494 11.979 12.7 13.421 14.127 14.792 15.396 16.134 16.844 17.541 18.409 19.278 20.133 21.113 22.235 23.371 24.644 26.032 27.534 29.148 31.048 33.354 35.759 38.663 42.054 46.228 51.265 57.559 65.598 76.629 87.369 94.78 100.177 104.216 107.426 109.944 112.025 113.693 115.224 116.438 117.442 118.291 119.049 119.751 120.37 120.977 121.488 121.91 122.31 122.677 122.946 123.194 123.44 123.644 123.861 124.058 124.229 124.391 124.498 124.601 124.749 124.837 124.914 124.947 125.007 125.075 125.121 125.146 125.082 125.241 125.249 125.255 125.241 125.202 125.144 125.095 125.042 124.909 124.686 123.828 -4 ,25702 ,KEBNE ,17076726,Sat Dec 25 03:41:40 CET,Sat Dec 25 05:12:46 CET,0.0 1.344 1.861 2.236 2.574 2.895 3.192 3.471 4.005 4.262 4.511 4.737 5.208 5.434 5.88 6.325 6.762 6.982 7.409 7.808 8.389 8.769 9.147 9.71 10.254 10.793 11.332 11.876 12.589 13.289 13.986 14.835 15.66 16.482 17.446 18.536 19.617 20.851 22.236 23.728 25.342 27.239 29.554 31.983 34.929 38.342 42.463 47.434 53.727 61.89 73.062 83.792 91.079 96.394 100.407 103.629 106.188 108.282 109.936 111.472 112.646 113.617 114.509 115.283 115.923 116.482 117.074 117.581 117.992 118.407 118.8 119.09 119.391 119.67 119.865 120.063 120.265 120.458 120.613 120.708 120.816 120.973 121.072 121.161 121.201 121.273 121.321 121.377 121.396 121.289 121.415 121.415 121.404 121.356 121.327 121.274 121.195 121.122 121.026 120.841 120.098 -5 ,31578 ,KEBNE ,17076727,Sat Dec 25 03:41:40 CET,Sat Dec 25 05:12:42 CET,0.0 1.129 1.659 2.068 2.388 2.72 3.063 3.372 3.922 4.182 4.446 4.703 5.181 5.419 5.858 6.286 6.717 6.92 7.307 7.697 8.292 8.683 9.074 9.645 10.188 10.723 11.25 11.771 12.464 13.147 13.829 14.671 15.499 16.328 17.314 18.446 19.554 20.794 22.182 23.714 25.367 27.283 29.567 31.949 34.886 38.313 42.467 47.451 53.695 61.788 72.931 83.605 90.901 96.271 100.308 103.469 105.991 108.106 109.746 111.276 112.508 113.525 114.422 115.204 115.906 116.526 117.136 117.624 117.998 118.378 118.763 119.074 119.371 119.614 119.797 119.998 120.188 120.369 120.551 120.676 120.804 121.001 121.114 121.203 121.243 121.327 121.392 121.445 121.473 121.388 121.522 121.511 121.496 121.449 121.402 121.35 121.294 121.221 121.108 120.915 120.131 -6 ,13909 ,KEBNE ,17076728,Sat Dec 25 03:42:42 CET,Sat Dec 25 05:13:27 CET,0.0 1.549 2.174 2.667 3.11 3.514 3.896 4.264 4.937 5.252 5.568 5.907 6.494 6.784 7.336 7.886 8.45 8.728 9.271 9.801 10.557 11.056 11.555 12.287 13.016 13.757 14.494 15.206 16.14 17.073 17.967 18.989 19.884 20.7 21.653 22.746 23.839 25.073 26.449 27.94 29.539 31.405 33.682 36.063 38.968 42.446 46.669 51.704 58.081 66.278 77.451 88.199 95.575 100.977 105.012 108.2 110.718 112.783 114.413 115.933 117.15 118.141 119.027 119.817 120.477 121.039 121.586 122.049 122.434 122.804 123.185 123.478 123.736 123.973 124.147 124.321 124.498 124.669 124.838 124.959 125.068 125.2 125.272 125.343 125.388 125.475 125.546 125.624 125.657 125.567 125.712 125.718 125.721 125.71 125.691 125.657 125.61 125.523 125.373 125.188 124.562 -7 ,27520 ,KEBNE ,17076729,Sat Dec 25 03:42:42 CET,Sat Dec 25 05:13:33 CET,0.0 1.117 1.659 2.081 2.415 2.708 2.985 3.262 3.807 4.065 4.314 4.538 4.985 5.2 5.639 6.073 6.488 6.686 7.081 7.469 8.051 8.447 8.836 9.399 9.978 10.563 11.134 11.682 12.379 13.059 13.742 14.592 15.407 16.206 17.152 18.248 19.337 20.562 21.934 23.441 25.079 26.993 29.28 31.658 34.559 37.948 42.092 47.109 53.399 61.58 72.693 83.304 90.577 95.843 99.832 103.037 105.597 107.731 109.407 110.935 112.15 113.156 114.062 114.849 115.503 116.085 116.668 117.142 117.533 117.922 118.272 118.529 118.788 119.039 119.224 119.411 119.588 119.746 119.888 119.982 120.074 120.2 120.289 120.386 120.433 120.507 120.582 120.649 120.673 120.587 120.752 120.766 120.774 120.782 120.783 120.762 120.738 120.711 120.642 120.464 119.701 -8 ,8404 ,KEBNE ,17076730,Sat Dec 25 03:42:42 CET,Sat Dec 25 05:13:04 CET,0.0 1.346 1.881 2.272 2.596 2.894 3.174 3.442 3.971 4.219 4.46 4.681 5.15 5.374 5.805 6.228 6.628 6.83 7.23 7.612 8.182 8.555 8.93 9.481 10.013 10.544 11.068 11.58 12.258 12.932 13.599 14.404 15.199 16.008 16.94 18.014 19.101 20.306 21.633 23.095 24.674 26.534 28.839 31.239 34.129 37.515 41.635 46.554 52.755 60.836 71.987 82.747 90.045 95.381 99.427 102.662 105.181 107.242 108.883 110.394 111.6 112.609 113.517 114.325 115.024 115.605 116.174 116.673 117.094 117.497 117.877 118.182 118.487 118.781 118.995 119.179 119.337 119.492 119.641 119.748 119.851 119.986 120.086 120.188 120.232 120.313 120.381 120.44 120.466 120.376 120.537 120.546 120.544 120.525 120.509 120.472 120.403 120.299 120.144 119.949 119.223 -9 ,23086 ,KEBNE ,17076731,Sat Dec 25 03:42:42 CET,Sat Dec 25 05:13:17 CET,0.0 1.145 1.647 2.015 2.337 2.644 2.931 3.214 3.741 3.99 4.227 4.432 4.891 5.105 5.545 5.977 6.383 6.586 6.997 7.415 8.026 8.411 8.789 9.336 9.864 10.391 10.913 11.426 12.099 12.764 13.434 14.261 15.065 15.855 16.8 17.918 19.035 20.284 21.652 23.146 24.777 26.698 29.049 31.486 34.413 37.783 41.842 46.811 53.166 61.358 72.602 83.451 90.765 96.071 100.089 103.328 105.873 107.909 109.546 111.083 112.284 113.294 114.205 115.013 115.713 116.28 116.811 117.271 117.663 118.028 118.368 118.627 118.871 119.138 119.357 119.566 119.75 119.912 120.051 120.144 120.243 120.354 120.423 120.497 120.532 120.606 120.674 120.716 120.721 120.617 120.753 120.762 120.769 120.723 120.684 120.644 120.578 120.5 120.381 120.17 119.359 -10 ,29293 ,KEBNE ,17076732,Sat Dec 25 03:42:42 CET,Sat Dec 25 05:13:24 CET,0.0 1.021 1.479 1.854 2.192 2.486 2.779 3.061 3.557 3.788 4.02 4.258 4.739 4.97 5.41 5.827 6.236 6.439 6.83 7.216 7.785 8.163 8.537 9.083 9.617 10.155 10.69 11.213 11.902 12.588 13.267 14.098 14.938 15.769 16.731 17.837 18.924 20.159 21.527 23.018 24.636 26.516 28.81 31.224 34.147 37.546 41.673 46.621 52.857 60.88 71.848 82.413 89.669 94.99 98.99 102.198 104.718 106.786 108.398 109.859 111.053 112.089 113.033 113.86 114.579 115.19 115.765 116.249 116.655 117.042 117.407 117.684 117.949 118.194 118.354 118.502 118.662 118.837 118.993 119.088 119.191 119.334 119.412 119.487 119.523 119.578 119.618 119.645 119.661 119.569 119.735 119.741 119.733 119.692 119.648 119.587 119.508 119.4 119.25 119.018 118.318 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_256.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_256.txt deleted file mode 100644 index 0a3f5c2e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_256.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1782 ,TETRA ,17617367,Tue Nov 30 06:18:02 CET,Tue Nov 30 08:05:07 CET,0.0 1.519 1.852 2.082 2.256 2.421 2.567 2.689 2.898 2.992 3.08 3.006 3.329 3.425 3.615 3.776 3.911 3.978 4.109 4.229 4.4 4.51 4.604 4.752 4.904 5.055 5.203 5.365 5.561 5.717 5.856 6.021 6.181 6.303 6.426 6.578 6.751 7.103 7.664 8.066 8.256 8.46 8.706 8.941 9.154 9.324 9.476 9.576 9.553 9.314 8.642 7.561 6.492 5.518 4.658 3.898 3.216 2.577 2.051 1.505 0.978 0.525 0.132 -0.248 -0.61 -0.941 -1.293 -1.591 -1.837 -2.089 -2.351 -2.572 -2.789 -3.004 -3.18 -3.383 -3.614 -3.864 -4.111 -4.268 -4.413 -4.648 -4.825 -5.009 -5.098 -5.277 -5.48 -5.699 -5.817 -6.196 -6.195 -6.316 -6.444 -6.709 -6.863 -7.044 -7.224 -7.435 -7.739 -8.136 -9.673 -2 ,29704 ,TETRA ,17617368,Tue Nov 30 06:17:59 CET,Tue Nov 30 08:06:14 CET,0.0 1.265 1.607 1.856 2.049 2.209 2.368 2.512 2.783 2.915 3.025 2.969 3.298 3.392 3.576 3.732 3.865 3.926 4.04 4.15 4.315 4.425 4.53 4.685 4.851 4.995 5.108 5.215 5.353 5.51 5.674 5.869 6.068 6.238 6.429 6.62 6.763 6.919 7.112 7.359 7.6 7.829 8.077 8.282 8.507 8.709 8.864 8.983 8.987 8.743 8.067 6.997 5.93 4.956 4.106 3.282 2.499 1.801 1.158 0.462 -0.063 -0.545 -1.075 -1.526 -1.904 -2.248 -2.613 -2.934 -3.211 -3.501 -3.794 -4.024 -4.265 -4.53 -4.734 -4.942 -5.168 -5.413 -5.65 -5.83 -6.06 -6.459 -6.753 -7.05 -7.194 -7.502 -7.843 -8.201 -8.388 -8.862 -8.945 -9.154 -9.37 -9.789 -10.022 -10.281 -10.553 -10.846 -11.171 -11.621 -13.308 -3 ,27427 ,TETRA ,17617369,Tue Nov 30 06:20:51 CET,Tue Nov 30 07:53:09 CET,0.0 1.722 2.047 2.263 2.447 2.61 2.765 2.911 3.157 3.268 3.372 3.333 3.672 3.774 3.957 4.124 4.276 4.356 4.516 4.657 4.834 4.933 5.021 5.152 5.285 5.41 5.546 5.696 5.873 6.049 6.251 6.513 6.739 6.922 7.125 7.371 7.623 7.84 8.007 8.207 8.422 8.64 8.863 9.054 9.309 9.663 9.948 10.043 10.028 9.806 9.175 8.181 7.255 6.397 5.598 4.868 4.231 3.629 3.061 2.499 2.05 1.653 1.277 0.931 0.587 0.247 -0.113 -0.428 -0.701 -0.996 -1.292 -1.515 -1.748 -1.981 -2.159 -2.357 -2.562 -2.781 -3.001 -3.135 -3.289 -3.561 -3.757 -3.953 -4.037 -4.214 -4.423 -4.668 -4.799 -5.172 -5.171 -5.29 -5.417 -5.68 -5.821 -5.98 -6.169 -6.391 -6.649 -7.04 -8.982 -4 ,22134 ,TETRA ,17617370,Tue Nov 30 06:20:50 CET,Tue Nov 30 08:07:47 CET,0.0 1.301 1.584 1.802 2.002 2.178 2.342 2.503 2.787 2.909 3.017 2.974 3.313 3.409 3.585 3.733 3.874 3.947 4.087 4.206 4.37 4.484 4.584 4.712 4.837 4.973 5.114 5.241 5.39 5.515 5.638 5.797 5.947 6.081 6.235 6.439 6.634 6.802 6.987 7.211 7.454 7.708 7.974 8.237 8.492 8.73 8.996 9.137 9.101 8.918 8.283 7.239 6.278 5.342 4.424 3.523 2.767 2.118 1.564 1.043 0.59 0.186 -0.201 -0.574 -0.92 -1.225 -1.544 -1.833 -2.077 -2.359 -2.681 -2.92 -3.16 -3.416 -3.608 -3.818 -4.056 -4.296 -4.53 -4.696 -4.864 -5.108 -5.295 -5.502 -5.604 -5.818 -6.06 -6.301 -6.407 -6.763 -6.746 -6.881 -7.028 -7.359 -7.534 -7.724 -7.934 -8.167 -8.469 -8.873 -10.241 -5 ,22563 ,TETRA ,17617371,Tue Nov 30 06:21:47 CET,Tue Nov 30 08:13:36 CET,0.0 0.94 1.281 1.511 1.72 1.933 2.098 2.237 2.509 2.633 2.742 2.699 3.031 3.119 3.281 3.419 3.546 3.609 3.731 3.857 4.04 4.146 4.249 4.393 4.53 4.67 4.812 4.952 5.118 5.255 5.381 5.538 5.683 5.813 5.961 6.112 6.264 6.444 6.626 6.807 6.979 7.169 7.409 7.635 7.899 8.17 8.365 8.476 8.486 8.358 8.01 7.145 6.048 5.007 4.146 3.34 2.653 2.024 1.411 0.81 0.321 -0.099 -0.475 -0.809 -1.114 -1.413 -1.755 -2.065 -2.337 -2.63 -2.946 -3.225 -3.517 -3.806 -4.005 -4.218 -4.465 -4.715 -4.969 -5.144 -5.327 -5.614 -5.811 -6.025 -6.136 -6.354 -6.581 -6.813 -6.934 -7.303 -7.305 -7.441 -7.599 -7.953 -8.125 -8.296 -8.491 -8.701 -8.972 -9.371 -11.099 -6 ,29298 ,TETRA ,17617372,Tue Nov 30 06:21:47 CET,Tue Nov 30 08:04:54 CET,0.0 1.83 2.254 2.552 2.8 3.028 3.235 3.435 3.827 4.003 4.16 4.177 4.601 4.742 5.003 5.244 5.451 5.529 5.651 5.764 5.915 6.022 6.151 6.35 6.537 6.718 6.864 6.989 7.155 7.287 7.407 7.554 7.701 7.843 7.995 8.154 8.309 8.472 8.639 8.836 9.044 9.239 9.428 9.604 9.797 10.105 10.434 10.563 10.552 10.273 9.568 8.446 7.371 6.334 5.398 4.615 3.945 3.344 2.836 2.321 1.837 1.409 1.012 0.61 0.232 -0.098 -0.432 -0.759 -1.069 -1.373 -1.657 -1.893 -2.168 -2.476 -2.732 -2.986 -3.242 -3.505 -3.779 -3.986 -4.199 -4.524 -4.739 -4.956 -5.068 -5.294 -5.552 -5.844 -5.999 -6.399 -6.48 -6.66 -6.846 -7.236 -7.439 -7.659 -7.903 -8.183 -8.537 -9.044 -10.516 -7 ,14298 ,TETRA ,17617373,Tue Nov 30 06:23:48 CET,Tue Nov 30 08:12:49 CET,0.0 1.455 1.864 2.171 2.447 2.67 2.885 3.092 3.484 3.676 3.859 3.918 4.365 4.519 4.815 5.093 5.345 5.462 5.72 5.971 6.246 6.382 6.516 6.708 6.883 7.06 7.216 7.367 7.551 7.71 7.88 8.092 8.284 8.445 8.631 8.844 9.04 9.27 9.537 9.785 9.988 10.195 10.452 10.688 10.965 11.273 11.505 11.65 11.652 11.481 10.895 9.83 8.829 7.902 7.016 6.192 5.496 4.899 4.351 3.75 3.188 2.717 2.333 1.972 1.597 1.216 0.827 0.505 0.249 -0.004 -0.268 -0.512 -0.786 -1.032 -1.198 -1.371 -1.555 -1.757 -1.973 -2.12 -2.283 -2.545 -2.725 -2.904 -2.997 -3.191 -3.41 -3.646 -3.76 -4.124 -4.131 -4.263 -4.395 -4.677 -4.833 -5.015 -5.223 -5.487 -5.791 -6.216 -8.49 -8 ,14942 ,TETRA ,17617374,Tue Nov 30 06:25:48 CET,Tue Nov 30 08:12:25 CET,0.0 1.451 1.847 2.153 2.357 2.528 2.688 2.835 3.105 3.225 3.336 3.303 3.641 3.748 3.954 4.136 4.299 4.375 4.51 4.625 4.817 4.952 5.082 5.263 5.426 5.568 5.695 5.815 5.957 6.092 6.222 6.373 6.523 6.665 6.81 6.966 7.128 7.306 7.491 7.666 7.843 8.054 8.284 8.493 8.714 8.965 9.198 9.337 9.398 9.289 8.802 7.881 6.816 5.809 4.941 4.159 3.476 2.872 2.351 1.819 1.364 0.91 0.469 0.08 -0.295 -0.631 -0.966 -1.269 -1.528 -1.781 -2.038 -2.245 -2.449 -2.677 -2.87 -3.087 -3.323 -3.573 -3.845 -4.029 -4.212 -4.486 -4.667 -4.865 -4.968 -5.164 -5.419 -5.744 -5.89 -6.275 -6.301 -6.432 -6.571 -6.905 -7.096 -7.29 -7.486 -7.686 -7.928 -8.278 -10.17 -9 ,20179 ,TETRA ,17617375,Tue Nov 30 06:26:42 CET,Tue Nov 30 07:56:27 CET,0.0 1.014 1.341 1.573 1.786 1.986 2.148 2.29 2.561 2.676 2.779 2.745 3.087 3.188 3.382 3.566 3.737 3.817 3.977 4.135 4.351 4.488 4.619 4.811 4.994 5.146 5.285 5.424 5.617 5.802 5.966 6.143 6.287 6.428 6.597 6.816 7.024 7.207 7.388 7.567 7.748 7.948 8.161 8.334 8.5 8.692 8.887 9.001 8.972 8.705 7.986 6.814 5.745 4.824 3.942 3.112 2.424 1.817 1.249 0.664 0.182 -0.223 -0.584 -0.922 -1.242 -1.526 -1.81 -2.068 -2.299 -2.552 -2.827 -3.064 -3.313 -3.548 -3.722 -3.915 -4.127 -4.351 -4.584 -4.75 -4.916 -5.168 -5.345 -5.529 -5.621 -5.811 -6.022 -6.252 -6.366 -6.719 -6.691 -6.833 -6.985 -7.281 -7.449 -7.665 -7.932 -8.235 -8.604 -9.119 -11.294 -10 ,11144 ,TETRA ,17617376,Tue Nov 30 06:26:42 CET,Tue Nov 30 08:13:24 CET,0.0 1.088 1.456 1.716 1.921 2.107 2.295 2.465 2.747 2.877 2.991 2.944 3.279 3.379 3.557 3.726 3.886 3.951 4.074 4.197 4.373 4.479 4.579 4.721 4.859 5.0 5.136 5.273 5.443 5.599 5.734 5.881 6.04 6.194 6.394 6.627 6.832 7.032 7.233 7.451 7.634 7.833 8.102 8.33 8.527 8.712 8.896 9.071 9.196 9.099 8.489 7.391 6.315 5.359 4.493 3.699 3.015 2.332 1.751 1.252 0.828 0.446 0.066 -0.317 -0.669 -0.983 -1.315 -1.622 -1.914 -2.215 -2.523 -2.778 -3.039 -3.354 -3.606 -3.849 -4.112 -4.422 -4.764 -4.998 -5.231 -5.591 -5.816 -6.011 -6.104 -6.348 -6.697 -7.083 -7.268 -7.74 -7.852 -8.065 -8.277 -8.758 -9.017 -9.289 -9.58 -9.905 -10.337 -10.903 -12.812 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_336.txt deleted file mode 100644 index 6d987888..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9130 ,TETRA ,17617377,Tue Nov 30 06:26:42 CET,Tue Nov 30 08:13:42 CET,0.0 0.735 1.049 1.263 1.473 1.646 1.783 1.926 2.194 2.332 2.461 2.424 2.762 2.861 3.078 3.274 3.431 3.503 3.652 3.791 3.987 4.118 4.256 4.461 4.629 4.777 4.945 5.104 5.314 5.525 5.704 5.878 6.033 6.2 6.402 6.623 6.816 7.004 7.18 7.354 7.533 7.729 7.952 8.15 8.346 8.526 8.674 8.761 8.72 8.451 7.725 6.564 5.475 4.486 3.587 2.77 2.068 1.451 0.931 0.382 -0.153 -0.611 -1.009 -1.383 -1.725 -2.039 -2.357 -2.639 -2.903 -3.188 -3.462 -3.676 -3.913 -4.164 -4.365 -4.583 -4.814 -5.059 -5.316 -5.504 -5.704 -5.981 -6.167 -6.385 -6.508 -6.759 -7.003 -7.258 -7.392 -7.776 -7.826 -7.99 -8.153 -8.5 -8.684 -8.862 -9.051 -9.254 -9.494 -9.874 -10.771 -2 ,15280 ,TETRA ,17617378,Tue Nov 30 06:28:46 CET,Tue Nov 30 08:17:54 CET,0.0 0.803 1.122 1.345 1.529 1.71 1.885 2.025 2.261 2.4 2.538 2.497 2.824 2.921 3.104 3.279 3.461 3.547 3.706 3.847 4.053 4.201 4.363 4.576 4.735 4.874 5.024 5.183 5.362 5.532 5.719 5.955 6.167 6.386 6.656 6.958 7.201 7.394 7.578 7.765 7.987 8.335 8.705 8.926 9.142 9.355 9.548 9.722 9.804 9.634 9.092 8.06 6.989 5.991 5.091 4.294 3.62 3.0 2.427 1.855 1.395 0.994 0.604 0.231 -0.123 -0.477 -0.836 -1.134 -1.381 -1.628 -1.895 -2.118 -2.348 -2.589 -2.769 -2.959 -3.174 -3.389 -3.611 -3.767 -3.926 -4.196 -4.387 -4.582 -4.686 -4.888 -5.082 -5.276 -5.375 -5.734 -5.718 -5.852 -5.997 -6.283 -6.429 -6.591 -6.774 -6.994 -7.271 -7.605 -8.514 -3 ,6817 ,TETRA ,17617379,Tue Nov 30 06:28:45 CET,Tue Nov 30 08:16:34 CET,0.0 0.777 1.044 1.251 1.464 1.659 1.832 2.0 2.266 2.376 2.483 2.439 2.763 2.851 3.051 3.254 3.453 3.531 3.663 3.811 4.013 4.125 4.236 4.398 4.559 4.713 4.868 5.01 5.173 5.371 5.576 5.773 5.936 6.091 6.265 6.465 6.662 6.862 7.039 7.215 7.397 7.594 7.81 8.021 8.221 8.388 8.53 8.631 8.7 8.567 7.902 6.805 5.781 4.86 3.998 3.205 2.45 1.722 1.107 0.498 -0.006 -0.44 -0.844 -1.236 -1.64 -1.994 -2.361 -2.711 -3.036 -3.384 -3.7 -3.942 -4.199 -4.478 -4.688 -4.895 -5.101 -5.299 -5.535 -5.731 -5.923 -6.206 -6.419 -6.628 -6.728 -6.946 -7.182 -7.437 -7.566 -7.94 -7.935 -8.069 -8.213 -8.517 -8.688 -8.889 -9.106 -9.354 -9.657 -9.997 -10.621 -4 ,13280 ,TETRA ,17617380,Tue Nov 30 06:28:47 CET,Tue Nov 30 08:09:41 CET,0.0 0.704 1.013 1.282 1.54 1.776 1.983 2.162 2.489 2.647 2.813 2.874 3.309 3.441 3.684 3.919 4.142 4.243 4.441 4.645 4.954 5.129 5.251 5.405 5.543 5.666 5.794 5.927 6.109 6.265 6.387 6.558 6.73 6.882 7.071 7.283 7.473 7.664 7.864 8.078 8.297 8.525 8.774 9.006 9.25 9.485 9.657 9.737 9.732 9.556 8.917 7.766 6.586 5.423 4.432 3.559 2.753 2.073 1.513 0.952 0.46 0.012 -0.428 -0.902 -1.343 -1.735 -2.158 -2.524 -2.83 -3.12 -3.39 -3.625 -3.893 -4.172 -4.376 -4.581 -4.792 -5.041 -5.315 -5.502 -5.679 -5.935 -6.126 -6.348 -6.46 -6.674 -6.9 -7.199 -7.382 -7.855 -7.979 -8.192 -8.413 -8.874 -9.114 -9.366 -9.62 -9.895 -10.204 -10.575 -11.474 -5 ,11793 ,TETRA ,17617381,Tue Nov 30 06:28:47 CET,Tue Nov 30 08:14:03 CET,0.0 0.909 1.267 1.569 1.843 2.076 2.284 2.487 2.863 3.036 3.194 3.215 3.658 3.83 4.161 4.441 4.658 4.754 4.936 5.098 5.304 5.441 5.593 5.81 5.988 6.143 6.296 6.448 6.62 6.775 6.963 7.196 7.384 7.555 7.758 7.969 8.165 8.403 8.632 8.86 9.121 9.359 9.53 9.698 9.914 10.15 10.344 10.475 10.53 10.329 9.697 8.678 7.628 6.608 5.724 4.934 4.229 3.609 3.071 2.523 2.05 1.64 1.273 0.907 0.494 0.099 -0.268 -0.586 -0.861 -1.138 -1.441 -1.723 -1.997 -2.25 -2.459 -2.693 -2.938 -3.192 -3.461 -3.64 -3.824 -4.128 -4.345 -4.579 -4.696 -4.93 -5.168 -5.4 -5.515 -5.879 -5.91 -6.062 -6.214 -6.537 -6.722 -6.934 -7.169 -7.445 -7.772 -8.176 -9.456 -6 ,25739 ,TETRA ,17617382,Tue Nov 30 06:30:50 CET,Tue Nov 30 08:19:21 CET,0.0 0.88 1.172 1.417 1.613 1.787 1.939 2.091 2.392 2.515 2.628 2.589 2.919 3.009 3.166 3.331 3.472 3.531 3.651 3.773 3.95 4.063 4.193 4.389 4.572 4.734 4.897 5.075 5.291 5.483 5.649 5.828 6.001 6.186 6.385 6.598 6.788 6.966 7.162 7.39 7.629 7.897 8.218 8.504 8.747 8.902 9.026 9.117 9.105 8.803 7.954 6.744 5.711 4.75 3.892 3.11 2.41 1.78 1.235 0.68 0.213 -0.25 -0.709 -1.087 -1.42 -1.72 -2.062 -2.418 -2.732 -3.047 -3.384 -3.658 -3.91 -4.175 -4.413 -4.662 -4.926 -5.195 -5.437 -5.607 -5.792 -6.101 -6.316 -6.515 -6.617 -6.834 -7.075 -7.348 -7.49 -7.881 -7.956 -8.114 -8.258 -8.577 -8.726 -8.889 -9.09 -9.328 -9.612 -9.936 -11.027 -7 ,30723 ,TETRA ,17617383,Tue Nov 30 06:33:48 CET,Tue Nov 30 08:21:08 CET,0.0 0.862 1.181 1.404 1.587 1.77 1.934 2.078 2.337 2.443 2.546 2.5 2.834 2.933 3.122 3.279 3.428 3.509 3.668 3.814 4.005 4.112 4.219 4.384 4.548 4.697 4.833 4.962 5.117 5.251 5.372 5.525 5.689 5.87 6.069 6.245 6.395 6.586 6.802 7.013 7.219 7.415 7.603 7.77 7.947 8.122 8.271 8.395 8.428 8.211 7.48 6.268 5.077 4.002 3.102 2.278 1.54 0.896 0.358 -0.238 -0.803 -1.271 -1.665 -2.016 -2.35 -2.659 -2.991 -3.314 -3.609 -3.898 -4.19 -4.444 -4.718 -4.979 -5.176 -5.41 -5.642 -5.866 -6.104 -6.278 -6.464 -6.745 -6.942 -7.144 -7.252 -7.48 -7.714 -7.977 -8.149 -8.641 -8.766 -8.981 -9.212 -9.722 -9.998 -10.296 -10.601 -10.938 -11.336 -11.848 -13.332 -8 ,8939 ,TETRA ,17617384,Tue Nov 30 06:33:48 CET,Tue Nov 30 08:20:43 CET,0.0 0.654 0.912 1.113 1.284 1.462 1.634 1.765 1.988 2.091 2.183 2.107 2.43 2.528 2.705 2.866 3.032 3.117 3.28 3.425 3.614 3.723 3.824 3.978 4.113 4.243 4.366 4.49 4.663 4.837 5.012 5.217 5.429 5.624 5.833 6.051 6.235 6.423 6.615 6.81 7.005 7.187 7.366 7.549 7.729 7.85 7.923 7.963 7.917 7.68 6.93 5.72 4.588 3.55 2.644 1.836 1.113 0.464 -0.091 -0.624 -1.078 -1.509 -1.92 -2.319 -2.706 -3.037 -3.367 -3.655 -3.9 -4.166 -4.434 -4.665 -4.916 -5.171 -5.364 -5.556 -5.768 -6.011 -6.247 -6.403 -6.575 -6.846 -7.014 -7.182 -7.283 -7.512 -7.747 -7.971 -8.08 -8.439 -8.455 -8.602 -8.768 -9.135 -9.345 -9.601 -9.837 -10.087 -10.416 -10.855 -11.857 -9 ,14639 ,TETRA ,17617385,Tue Nov 30 06:34:46 CET,Tue Nov 30 08:28:03 CET,0.0 0.991 1.385 1.684 1.924 2.142 2.334 2.529 2.909 3.077 3.215 3.219 3.584 3.688 3.871 4.041 4.186 4.254 4.388 4.534 4.748 4.882 5.023 5.23 5.401 5.561 5.73 5.902 6.128 6.328 6.515 6.717 6.9 7.064 7.216 7.384 7.551 7.755 7.976 8.155 8.332 8.536 8.755 8.943 9.216 9.576 9.849 9.994 10.076 10.007 9.451 8.404 7.393 6.458 5.608 4.843 4.117 3.363 2.722 2.134 1.61 1.093 0.625 0.22 -0.181 -0.558 -0.949 -1.284 -1.566 -1.855 -2.146 -2.397 -2.655 -2.914 -3.119 -3.325 -3.561 -3.829 -4.101 -4.29 -4.487 -4.795 -5.003 -5.219 -5.334 -5.582 -5.841 -6.102 -6.231 -6.611 -6.667 -6.828 -6.998 -7.367 -7.573 -7.789 -8.031 -8.336 -8.72 -9.194 -10.212 -10 ,9026 ,TETRA ,17617386,Tue Nov 30 06:34:46 CET,Tue Nov 30 08:22:27 CET,0.0 0.805 1.056 1.274 1.456 1.65 1.836 1.997 2.292 2.437 2.561 2.526 2.856 2.939 3.109 3.273 3.437 3.517 3.661 3.796 3.996 4.118 4.239 4.406 4.548 4.667 4.779 4.899 5.077 5.233 5.36 5.527 5.703 5.883 6.085 6.281 6.433 6.571 6.747 7.002 7.297 7.568 7.845 8.108 8.338 8.61 8.847 8.976 9.023 8.811 8.173 7.065 5.949 4.923 4.01 3.201 2.508 1.851 1.258 0.692 0.219 -0.199 -0.594 -0.978 -1.336 -1.649 -1.983 -2.291 -2.551 -2.815 -3.086 -3.31 -3.545 -3.781 -3.966 -4.16 -4.361 -4.58 -4.812 -4.98 -5.167 -5.461 -5.647 -5.834 -5.933 -6.138 -6.373 -6.61 -6.73 -7.111 -7.133 -7.277 -7.433 -7.777 -7.957 -8.146 -8.367 -8.639 -8.985 -9.423 -10.599 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_67.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_67.txt deleted file mode 100644 index c0f43d0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_252_67.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9456 ,TETRA ,17617387,Tue Nov 30 06:35:47 CET,Tue Nov 30 08:13:22 CET,0.0 1.38 1.881 2.343 2.764 3.124 3.471 3.793 4.428 4.741 5.054 5.399 5.982 6.278 6.855 7.424 7.977 8.244 8.779 9.315 10.086 10.584 11.081 11.806 12.526 13.245 13.944 14.582 15.379 16.187 16.991 17.968 18.917 19.866 21.014 22.347 23.666 25.15 26.784 28.582 30.535 32.817 35.615 38.573 42.196 46.453 51.645 57.858 65.804 76.221 90.563 104.535 114.118 121.155 126.488 130.683 133.964 136.65 138.769 140.741 142.31 143.598 144.77 145.819 146.742 147.518 148.24 148.83 149.309 149.774 150.232 150.581 150.873 151.148 151.375 151.625 151.879 152.108 152.311 152.443 152.574 152.757 152.875 152.977 153.022 153.108 153.191 153.258 153.268 153.198 153.294 153.285 153.272 153.214 153.171 153.13 153.059 152.921 152.7 152.335 149.766 -2 ,30983 ,TETRA ,17617388,Tue Nov 30 06:35:46 CET,Tue Nov 30 08:17:09 CET,0.0 1.558 2.003 2.364 2.686 2.989 3.274 3.545 4.064 4.312 4.562 4.809 5.278 5.499 5.947 6.393 6.835 7.054 7.484 7.913 8.564 8.996 9.424 10.058 10.675 11.273 11.873 12.479 13.283 14.087 14.899 15.894 16.87 17.842 19.0 20.345 21.681 23.181 24.848 26.676 28.673 31.029 33.896 36.923 40.648 45.023 50.366 56.742 64.773 75.283 89.796 103.736 113.249 120.268 125.61 129.871 133.198 135.946 138.136 140.087 141.593 142.848 143.945 144.906 145.768 146.506 147.216 147.8 148.276 148.754 149.212 149.547 149.859 150.153 150.368 150.567 150.745 150.918 151.092 151.206 151.311 151.454 151.535 151.602 151.63 151.679 151.728 151.768 151.78 151.698 151.727 151.69 151.661 151.59 151.529 151.437 151.312 151.142 150.854 150.396 147.501 -3 ,7988 ,TETRA ,17617389,Tue Nov 30 06:36:42 CET,Tue Nov 30 08:25:55 CET,0.0 1.038 1.55 1.99 2.425 2.836 3.171 3.444 3.956 4.208 4.462 4.74 5.23 5.467 5.928 6.399 6.857 7.095 7.633 8.186 8.976 9.49 10.012 10.793 11.56 12.306 13.04 13.77 14.74 15.705 16.658 17.84 19.027 20.204 21.599 23.177 24.665 26.196 27.802 29.585 31.537 33.842 36.655 39.614 43.241 47.508 52.673 58.854 66.825 77.145 91.028 104.361 113.466 120.196 125.317 129.392 132.6 135.21 137.28 139.233 140.791 142.047 143.172 144.204 145.122 145.909 146.675 147.32 147.844 148.324 148.753 149.096 149.444 149.778 150.026 150.276 150.528 150.76 150.967 151.093 151.23 151.448 151.565 151.658 151.704 151.801 151.884 151.954 151.987 151.931 152.035 152.036 152.024 151.935 151.848 151.75 151.662 151.528 151.271 150.825 148.49 -4 ,4908 ,TETRA ,17617390,Tue Nov 30 06:36:43 CET,Tue Nov 30 08:30:53 CET,0.0 1.266 1.755 2.145 2.499 2.854 3.184 3.501 4.127 4.435 4.745 5.053 5.617 5.899 6.449 6.983 7.508 7.771 8.292 8.8 9.544 10.039 10.534 11.275 12.017 12.751 13.464 14.171 15.116 16.052 16.91 17.87 18.812 19.746 20.843 22.086 23.312 24.727 26.312 28.042 29.927 32.151 34.85 37.689 41.201 45.364 50.43 56.545 64.289 74.306 88.123 101.493 110.649 117.392 122.496 126.538 129.753 132.391 134.47 136.389 137.914 139.178 140.307 141.3 142.176 142.931 143.654 144.282 144.804 145.316 145.831 146.208 146.557 146.905 147.162 147.412 147.647 147.857 148.068 148.202 148.325 148.524 148.645 148.752 148.805 148.926 149.029 149.091 149.11 149.048 149.147 149.154 149.146 149.095 149.067 149.005 148.863 148.695 148.49 148.119 146.063 -5 ,22193 ,TETRA ,17617391,Tue Nov 30 06:37:43 CET,Tue Nov 30 08:32:57 CET,0.0 1.519 2.011 2.395 2.738 3.053 3.344 3.628 4.182 4.448 4.703 4.961 5.436 5.674 6.143 6.596 7.035 7.253 7.685 8.112 8.74 9.153 9.564 10.168 10.763 11.354 11.957 12.554 13.335 14.112 14.878 15.827 16.78 17.745 18.883 20.187 21.465 22.895 24.483 26.255 28.192 30.468 33.267 36.202 39.806 44.08 49.313 55.646 63.722 74.237 88.623 102.571 112.063 118.952 124.207 128.447 131.794 134.518 136.699 138.722 140.309 141.623 142.804 143.832 144.736 145.523 146.262 146.886 147.397 147.886 148.383 148.765 149.121 149.471 149.717 149.946 150.176 150.415 150.639 150.782 150.919 151.1 151.201 151.301 151.353 151.421 151.467 151.503 151.506 151.447 151.564 151.571 151.563 151.525 151.468 151.35 151.206 151.053 150.877 150.442 148.084 -6 ,6493 ,TETRA ,17617392,Tue Nov 30 06:37:43 CET,Tue Nov 30 08:30:25 CET,0.0 1.591 2.1 2.526 2.937 3.327 3.69 4.038 4.715 5.026 5.324 5.623 6.203 6.494 7.072 7.646 8.181 8.442 8.966 9.489 10.269 10.775 11.281 12.058 12.829 13.515 14.118 14.71 15.487 16.259 17.041 18.028 18.994 19.945 21.074 22.393 23.709 25.199 26.86 28.658 30.6 32.874 35.637 38.535 42.075 46.247 51.349 57.524 65.365 75.585 89.726 103.379 112.659 119.481 124.565 128.535 131.677 134.3 136.4 138.331 139.868 141.135 142.246 143.229 144.105 144.839 145.544 146.123 146.602 147.072 147.504 147.857 148.231 148.599 148.863 149.12 149.379 149.638 149.859 149.971 150.102 150.328 150.465 150.568 150.614 150.718 150.783 150.814 150.831 150.756 150.798 150.779 150.754 150.642 150.559 150.466 150.334 150.146 149.857 149.39 146.834 -7 ,23890 ,TETRA ,17617393,Tue Nov 30 06:39:42 CET,Tue Nov 30 08:28:05 CET,0.0 1.524 2.034 2.508 2.937 3.32 3.663 3.988 4.61 4.908 5.197 5.495 6.02 6.262 6.723 7.179 7.624 7.846 8.285 8.716 9.36 9.785 10.202 10.807 11.403 11.996 12.582 13.169 13.946 14.711 15.465 16.402 17.346 18.279 19.365 20.611 21.86 23.315 24.972 26.77 28.706 30.979 33.757 36.698 40.296 44.549 49.737 55.92 63.808 74.152 88.315 101.839 111.193 118.101 123.28 127.456 130.727 133.381 135.511 137.476 139.06 140.394 141.566 142.592 143.491 144.262 144.977 145.563 146.072 146.571 147.055 147.455 147.854 148.221 148.486 148.753 149.0 149.235 149.479 149.638 149.781 149.984 150.11 150.224 150.285 150.413 150.53 150.615 150.653 150.616 150.738 150.743 150.739 150.694 150.634 150.536 150.418 150.28 150.05 149.644 147.519 -8 ,16286 ,TETRA ,17617394,Tue Nov 30 06:41:44 CET,Tue Nov 30 08:27:46 CET,0.0 1.454 1.94 2.322 2.666 2.977 3.261 3.539 4.077 4.339 4.588 4.844 5.314 5.545 6.003 6.447 6.886 7.102 7.529 7.952 8.573 8.988 9.399 10.01 10.637 11.259 11.855 12.434 13.188 13.937 14.69 15.621 16.544 17.467 18.565 19.838 21.095 22.516 24.137 25.954 27.933 30.255 33.082 36.018 39.566 43.751 48.868 55.058 62.898 72.992 86.793 100.144 109.357 116.138 121.246 125.339 128.564 131.225 133.355 135.326 136.904 138.201 139.37 140.428 141.343 142.106 142.857 143.491 143.993 144.484 144.97 145.359 145.744 146.119 146.395 146.656 146.907 147.145 147.375 147.515 147.639 147.831 147.944 148.023 148.052 148.093 148.156 148.225 148.256 148.211 148.294 148.295 148.285 148.206 148.139 148.054 147.954 147.807 147.574 147.172 144.183 -9 ,14407 ,TETRA ,17617395,Tue Nov 30 06:45:50 CET,Tue Nov 30 08:33:29 CET,0.0 0.913 1.367 1.768 2.133 2.446 2.739 3.022 3.559 3.824 4.088 4.364 4.86 5.111 5.61 6.095 6.561 6.787 7.232 7.67 8.325 8.768 9.212 9.864 10.5 11.132 11.756 12.373 13.208 14.023 14.816 15.796 16.75 17.722 18.913 20.302 21.682 23.221 24.902 26.724 28.701 31.013 33.858 36.905 40.588 44.884 50.171 56.546 64.705 75.423 90.25 104.503 114.085 121.132 126.538 130.777 134.014 136.658 138.739 140.629 142.127 143.387 144.53 145.543 146.438 147.18 147.922 148.577 149.101 149.601 150.088 150.474 150.847 151.223 151.483 151.713 151.932 152.135 152.329 152.461 152.605 152.801 152.911 153.022 153.071 153.125 153.169 153.2 153.191 153.096 153.151 153.14 153.133 153.085 153.025 152.92 152.78 152.607 152.359 151.882 149.092 -10 ,14107 ,TETRA ,17617396,Tue Nov 30 06:50:47 CET,Tue Nov 30 08:26:12 CET,0.0 1.895 2.457 2.892 3.237 3.582 3.956 4.295 4.911 5.211 5.505 5.788 6.303 6.55 7.032 7.5 7.947 8.17 8.62 9.054 9.7 10.124 10.531 11.133 11.735 12.352 12.968 13.576 14.384 15.191 15.997 16.975 17.93 18.872 19.988 21.278 22.559 24.046 25.688 27.476 29.43 31.675 34.377 37.222 40.704 44.806 49.873 56.005 63.8 73.914 87.757 101.236 110.438 117.063 122.094 126.154 129.357 131.99 134.109 136.076 137.642 138.952 140.138 141.204 142.112 142.855 143.573 144.186 144.665 145.134 145.619 145.996 146.362 146.693 146.932 147.167 147.365 147.557 147.745 147.851 147.953 148.12 148.229 148.321 148.36 148.426 148.469 148.513 148.534 148.465 148.539 148.528 148.511 148.456 148.392 148.284 148.133 147.956 147.685 147.239 144.735 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_254_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_254_163.txt deleted file mode 100644 index 125f41fc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_254_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22195 ,TETRA ,17617397,Tue Nov 30 06:50:48 CET,Tue Nov 30 08:48:03 CET,0.0 0.93 1.247 1.473 1.674 1.884 2.077 2.227 2.523 2.687 2.841 2.93 3.247 3.377 3.62 3.839 4.072 4.191 4.416 4.647 5.005 5.234 5.46 5.785 6.092 6.4 6.703 6.97 7.296 7.635 7.969 8.375 8.784 9.215 9.735 10.29 10.815 11.392 12.028 12.712 13.423 14.241 15.248 16.342 17.661 19.15 20.914 23.031 25.668 28.928 33.189 37.056 39.585 41.345 42.567 43.51 44.235 44.766 45.201 45.579 45.853 46.084 46.259 46.391 46.48 46.532 46.543 46.532 46.562 46.602 46.61 46.612 46.624 46.625 46.616 46.595 46.553 46.49 46.383 46.3 46.214 46.078 45.992 45.909 45.861 45.758 45.66 45.555 45.486 45.272 45.213 45.106 44.997 44.753 44.606 44.45 44.268 44.051 43.82 43.5 41.676 -2 ,7259 ,TETRA ,17617398,Tue Nov 30 06:53:55 CET,Tue Nov 30 08:54:12 CET,0.0 0.765 1.181 1.497 1.732 1.943 2.142 2.329 2.686 2.851 3.014 3.13 3.448 3.576 3.815 4.068 4.34 4.471 4.71 4.953 5.308 5.54 5.755 6.032 6.3 6.576 6.846 7.112 7.471 7.827 8.169 8.586 8.987 9.373 9.852 10.413 10.972 11.596 12.25 12.976 13.761 14.638 15.689 16.759 18.016 19.462 21.211 23.277 25.828 29.071 33.317 37.163 39.683 41.405 42.684 43.726 44.546 45.203 45.686 46.098 46.403 46.635 46.834 46.995 47.055 47.081 47.144 47.204 47.254 47.289 47.308 47.313 47.287 47.244 47.198 47.136 47.091 47.034 46.953 46.889 46.817 46.7 46.614 46.518 46.46 46.355 46.266 46.161 46.102 45.899 45.845 45.742 45.63 45.386 45.259 45.118 44.944 44.763 44.54 44.157 41.912 -3 ,1971 ,TETRA ,17617399,Tue Nov 30 06:55:48 CET,Tue Nov 30 08:43:54 CET,0.0 0.533 0.821 1.052 1.266 1.484 1.679 1.869 2.239 2.401 2.554 2.647 2.93 3.039 3.302 3.573 3.829 3.949 4.168 4.389 4.731 4.95 5.163 5.475 5.769 6.059 6.342 6.623 6.984 7.307 7.621 8.035 8.459 8.847 9.324 9.881 10.384 10.947 11.556 12.207 12.893 13.714 14.725 15.757 17.013 18.426 20.089 22.061 24.481 27.51 31.621 35.451 37.907 39.586 40.796 41.737 42.461 43.055 43.475 43.803 44.035 44.219 44.308 44.33 44.385 44.457 44.486 44.504 44.542 44.534 44.489 44.455 44.41 44.342 44.289 44.253 44.222 44.19 44.161 44.127 44.078 43.978 43.883 43.779 43.731 43.644 43.535 43.419 43.366 43.182 43.179 43.09 43.002 42.757 42.594 42.448 42.31 42.11 41.849 41.529 40.538 -4 ,9871 ,TETRA ,17617400,Tue Nov 30 06:58:36 CET,Tue Nov 30 08:42:07 CET,0.0 0.859 1.246 1.545 1.776 1.992 2.199 2.382 2.713 2.873 3.039 3.174 3.518 3.665 3.926 4.186 4.425 4.53 4.745 4.966 5.294 5.514 5.737 6.072 6.375 6.645 6.907 7.171 7.516 7.864 8.207 8.638 9.065 9.477 9.95 10.471 10.982 11.558 12.198 12.886 13.631 14.491 15.516 16.568 17.842 19.313 21.064 23.171 25.785 29.099 33.446 37.381 39.933 41.698 42.994 44.041 44.844 45.422 45.779 46.101 46.384 46.572 46.687 46.775 46.875 46.967 47.046 47.106 47.147 47.176 47.189 47.192 47.199 47.199 47.164 47.097 47.019 46.922 46.833 46.773 46.693 46.572 46.485 46.39 46.35 46.255 46.143 46.009 45.937 45.736 45.702 45.611 45.511 45.287 45.157 45.011 44.863 44.674 44.442 44.123 43.077 -5 ,30894 ,TETRA ,17617401,Tue Nov 30 06:58:36 CET,Tue Nov 30 08:37:15 CET,0.0 0.66 0.972 1.231 1.461 1.663 1.839 1.986 2.286 2.433 2.577 2.692 3.022 3.151 3.413 3.683 3.945 4.07 4.305 4.529 4.857 5.076 5.295 5.619 5.951 6.267 6.553 6.822 7.193 7.568 7.933 8.38 8.791 9.178 9.634 10.15 10.669 11.265 11.899 12.587 13.337 14.198 15.211 16.246 17.508 18.968 20.722 22.791 25.331 28.559 32.829 36.758 39.301 41.06 42.323 43.272 44.037 44.658 45.112 45.497 45.789 46.005 46.183 46.336 46.465 46.567 46.628 46.67 46.667 46.642 46.652 46.651 46.598 46.518 46.458 46.407 46.361 46.278 46.166 46.103 46.059 45.989 45.919 45.857 45.835 45.773 45.67 45.569 45.522 45.338 45.377 45.313 45.229 45.038 44.917 44.763 44.612 44.438 44.218 43.89 42.848 -6 ,10332 ,TETRA ,17617402,Tue Nov 30 06:59:36 CET,Tue Nov 30 08:45:08 CET,0.0 0.85 1.184 1.473 1.715 1.919 2.114 2.309 2.688 2.85 3.007 3.131 3.452 3.584 3.841 4.09 4.351 4.48 4.723 4.969 5.334 5.553 5.748 6.036 6.324 6.604 6.874 7.15 7.505 7.836 8.161 8.58 8.991 9.397 9.881 10.449 11.017 11.635 12.298 13.029 13.835 14.744 15.833 16.979 18.329 19.878 21.753 23.954 26.67 30.067 34.613 38.879 41.685 43.619 44.999 46.053 46.839 47.502 48.016 48.445 48.77 49.017 49.191 49.267 49.343 49.436 49.514 49.575 49.601 49.602 49.613 49.632 49.619 49.564 49.519 49.482 49.453 49.418 49.352 49.28 49.204 49.096 49.001 48.91 48.866 48.769 48.68 48.552 48.481 48.282 48.291 48.222 48.132 47.917 47.786 47.634 47.463 47.279 47.052 46.705 45.437 -7 ,11603 ,TETRA ,17617403,Tue Nov 30 06:59:36 CET,Tue Nov 30 08:47:14 CET,0.0 0.681 1.039 1.319 1.569 1.803 2.019 2.204 2.531 2.686 2.837 2.983 3.322 3.457 3.7 3.927 4.138 4.236 4.441 4.653 4.954 5.152 5.341 5.643 5.959 6.254 6.547 6.841 7.223 7.589 7.934 8.354 8.759 9.163 9.678 10.256 10.778 11.345 11.966 12.651 13.375 14.207 15.21 16.239 17.494 18.959 20.69 22.716 25.221 28.424 32.639 36.405 38.759 40.367 41.512 42.322 42.915 43.434 43.875 44.278 44.568 44.786 44.973 45.122 45.244 45.346 45.417 45.476 45.515 45.539 45.578 45.591 45.574 45.543 45.523 45.512 45.495 45.473 45.447 45.406 45.338 45.215 45.128 45.057 45.021 44.939 44.845 44.734 44.679 44.494 44.52 44.452 44.367 44.157 44.027 43.867 43.706 43.556 43.33 42.97 41.685 -8 ,31588 ,TETRA ,17617404,Tue Nov 30 06:59:38 CET,Tue Nov 30 08:47:16 CET,0.0 1.01 1.377 1.632 1.864 2.075 2.261 2.433 2.764 2.934 3.094 3.211 3.547 3.699 3.988 4.247 4.491 4.613 4.867 5.124 5.494 5.736 5.967 6.31 6.649 6.975 7.287 7.573 7.93 8.269 8.614 9.041 9.443 9.835 10.303 10.887 11.479 12.098 12.733 13.42 14.164 14.991 15.995 17.041 18.311 19.781 21.523 23.577 26.135 29.355 33.56 37.408 39.872 41.627 42.908 43.85 44.55 45.118 45.584 45.97 46.243 46.477 46.677 46.814 46.877 46.936 47.011 47.059 47.077 47.053 47.028 47.001 46.981 46.991 46.992 46.966 46.924 46.893 46.859 46.828 46.795 46.74 46.68 46.59 46.54 46.436 46.35 46.265 46.203 45.994 45.963 45.857 45.738 45.526 45.397 45.247 45.098 44.915 44.666 44.339 43.245 -9 ,21381 ,TETRA ,17617405,Tue Nov 30 07:01:36 CET,Tue Nov 30 08:50:39 CET,0.0 0.836 1.099 1.321 1.517 1.694 1.894 2.098 2.444 2.596 2.747 2.857 3.181 3.312 3.549 3.78 4.004 4.112 4.334 4.577 4.945 5.167 5.389 5.745 6.073 6.355 6.617 6.875 7.22 7.584 7.969 8.432 8.84 9.216 9.691 10.254 10.764 11.313 11.946 12.713 13.516 14.364 15.391 16.424 17.679 19.175 20.956 23.051 25.624 28.794 32.892 36.64 39.079 40.78 42.049 43.021 43.725 44.242 44.619 44.976 45.246 45.458 45.634 45.777 45.893 45.977 46.054 46.106 46.142 46.18 46.207 46.217 46.234 46.226 46.191 46.143 46.094 46.047 45.986 45.924 45.849 45.768 45.725 45.663 45.626 45.548 45.474 45.376 45.305 45.098 45.077 44.999 44.917 44.698 44.565 44.422 44.258 44.085 43.845 43.492 42.314 -10 ,17355 ,TETRA ,17617406,Tue Nov 30 07:02:35 CET,Tue Nov 30 08:51:59 CET,0.0 0.732 1.054 1.321 1.558 1.767 1.96 2.137 2.446 2.602 2.754 2.835 3.149 3.283 3.539 3.769 3.998 4.118 4.338 4.554 4.879 5.085 5.278 5.579 5.906 6.235 6.548 6.836 7.216 7.601 7.955 8.376 8.798 9.207 9.682 10.253 10.811 11.419 12.088 12.805 13.566 14.484 15.6 16.692 17.966 19.458 21.265 23.383 26.011 29.255 33.541 37.48 40.022 41.833 43.137 44.127 44.853 45.386 45.795 46.128 46.345 46.544 46.728 46.878 46.972 46.982 46.963 46.943 46.921 46.91 46.892 46.862 46.819 46.776 46.74 46.694 46.641 46.576 46.504 46.438 46.358 46.252 46.177 46.09 46.057 45.979 45.861 45.728 45.659 45.457 45.449 45.369 45.276 45.052 44.922 44.771 44.588 44.345 44.035 43.681 42.656 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_254_251.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_254_251.txt deleted file mode 100644 index 0b834f4d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_254_251.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11166 ,TETRA ,17617407,Tue Nov 30 07:01:36 CET,Tue Nov 30 08:49:56 CET,0.0 1.194 1.536 1.806 2.031 2.204 2.355 2.515 2.833 2.979 3.129 3.245 3.547 3.644 3.811 3.968 4.117 4.187 4.329 4.484 4.701 4.836 4.963 5.117 5.267 5.404 5.533 5.649 5.788 5.921 6.04 6.179 6.326 6.472 6.624 6.779 6.932 7.11 7.308 7.512 7.727 7.947 8.165 8.392 8.638 8.842 9.0 9.132 9.192 9.068 8.573 7.736 6.875 6.044 5.351 4.703 4.115 3.601 3.138 2.678 2.272 1.907 1.556 1.211 0.899 0.613 0.303 0.018 -0.253 -0.553 -0.835 -1.041 -1.261 -1.489 -1.657 -1.832 -2.011 -2.196 -2.397 -2.545 -2.696 -2.914 -3.077 -3.261 -3.358 -3.553 -3.761 -4.007 -4.134 -4.448 -4.543 -4.693 -4.843 -5.204 -5.399 -5.582 -5.843 -6.165 -6.51 -7.008 -8.581 -2 ,28226 ,TETRA ,17617408,Tue Nov 30 07:01:36 CET,Tue Nov 30 08:50:29 CET,0.0 0.978 1.347 1.627 1.82 1.976 2.115 2.249 2.51 2.627 2.727 2.743 3.017 3.099 3.275 3.447 3.613 3.696 3.834 3.948 4.122 4.245 4.368 4.546 4.721 4.892 5.046 5.185 5.373 5.56 5.709 5.855 6.006 6.165 6.332 6.498 6.66 6.857 7.061 7.247 7.423 7.629 7.87 8.067 8.262 8.444 8.631 8.795 8.837 8.664 8.074 7.074 6.111 5.252 4.5 3.822 3.208 2.62 2.121 1.617 1.167 0.787 0.425 0.081 -0.224 -0.515 -0.824 -1.095 -1.337 -1.583 -1.838 -2.057 -2.279 -2.501 -2.667 -2.827 -3.002 -3.212 -3.45 -3.608 -3.768 -4.039 -4.23 -4.433 -4.54 -4.748 -4.955 -5.194 -5.315 -5.602 -5.672 -5.827 -5.983 -6.337 -6.532 -6.734 -6.962 -7.236 -7.601 -8.115 -9.879 -3 ,16 ,TETRA ,17617409,Tue Nov 30 07:01:36 CET,Tue Nov 30 08:50:26 CET,0.0 1.534 1.879 2.131 2.347 2.547 2.721 2.878 3.156 3.276 3.388 3.403 3.683 3.778 3.952 4.104 4.249 4.32 4.438 4.563 4.768 4.892 5.017 5.181 5.313 5.441 5.57 5.695 5.875 6.047 6.183 6.333 6.491 6.64 6.819 7.059 7.274 7.453 7.613 7.773 7.947 8.145 8.327 8.496 8.69 8.852 9.001 9.16 9.263 9.209 8.797 7.944 7.031 6.199 5.464 4.769 4.14 3.586 3.138 2.687 2.298 1.951 1.611 1.293 0.994 0.717 0.397 0.072 -0.218 -0.483 -0.74 -0.976 -1.229 -1.473 -1.656 -1.879 -2.126 -2.369 -2.616 -2.786 -2.963 -3.239 -3.428 -3.624 -3.733 -3.959 -4.187 -4.415 -4.534 -4.854 -4.93 -5.07 -5.214 -5.552 -5.75 -5.957 -6.203 -6.483 -6.877 -7.451 -9.675 -4 ,24169 ,TETRA ,17617410,Tue Nov 30 07:01:36 CET,Tue Nov 30 08:50:04 CET,0.0 0.912 1.316 1.62 1.87 2.083 2.258 2.432 2.753 2.885 3.002 3.056 3.363 3.48 3.712 3.953 4.158 4.245 4.421 4.584 4.83 4.996 5.127 5.281 5.438 5.592 5.709 5.811 5.94 6.063 6.184 6.326 6.48 6.641 6.825 7.006 7.157 7.334 7.528 7.703 7.858 8.044 8.297 8.53 8.735 8.963 9.165 9.283 9.337 9.182 8.65 7.771 6.904 6.084 5.368 4.711 4.102 3.552 3.114 2.688 2.295 1.934 1.598 1.285 0.979 0.685 0.345 0.026 -0.215 -0.473 -0.767 -0.975 -1.171 -1.386 -1.55 -1.718 -1.919 -2.131 -2.324 -2.453 -2.578 -2.791 -2.959 -3.134 -3.22 -3.41 -3.64 -3.898 -4.03 -4.349 -4.416 -4.535 -4.669 -5.023 -5.232 -5.448 -5.651 -5.898 -6.191 -6.696 -9.68 -5 ,15805 ,TETRA ,17617411,Tue Nov 30 07:01:37 CET,Tue Nov 30 08:51:55 CET,0.0 1.289 1.654 1.93 2.164 2.365 2.535 2.711 3.031 3.167 3.29 3.329 3.62 3.724 3.927 4.118 4.278 4.348 4.478 4.63 4.839 4.938 5.039 5.211 5.389 5.555 5.699 5.838 5.997 6.132 6.263 6.425 6.572 6.701 6.873 7.092 7.28 7.468 7.658 7.864 8.073 8.272 8.477 8.662 8.868 9.068 9.257 9.42 9.506 9.401 8.911 8.072 7.211 6.39 5.655 4.961 4.342 3.8 3.348 2.875 2.463 2.102 1.751 1.434 1.137 0.855 0.582 0.346 0.124 -0.149 -0.456 -0.698 -0.918 -1.124 -1.299 -1.483 -1.683 -1.893 -2.11 -2.27 -2.44 -2.721 -2.909 -3.103 -3.212 -3.422 -3.621 -3.836 -3.964 -4.285 -4.394 -4.549 -4.718 -5.094 -5.293 -5.531 -5.806 -6.101 -6.421 -6.9 -8.737 -6 ,30121 ,TETRA ,17617412,Tue Nov 30 07:01:37 CET,Tue Nov 30 08:50:29 CET,0.0 1.066 1.399 1.641 1.829 1.986 2.15 2.308 2.583 2.7 2.81 2.832 3.114 3.226 3.429 3.61 3.772 3.852 4.018 4.166 4.342 4.456 4.581 4.741 4.877 5.02 5.165 5.318 5.489 5.625 5.753 5.9 6.028 6.145 6.284 6.426 6.566 6.745 6.93 7.116 7.299 7.487 7.702 7.92 8.15 8.359 8.54 8.631 8.629 8.536 8.013 6.986 6.026 5.171 4.427 3.72 3.072 2.486 1.982 1.481 1.059 0.687 0.331 -0.015 -0.386 -0.728 -1.06 -1.372 -1.639 -1.889 -2.144 -2.392 -2.649 -2.876 -3.047 -3.22 -3.394 -3.591 -3.811 -3.982 -4.166 -4.443 -4.638 -4.845 -4.948 -5.174 -5.428 -5.686 -5.81 -6.111 -6.199 -6.377 -6.55 -6.856 -7.016 -7.217 -7.491 -7.81 -8.154 -8.606 -10.407 -7 ,30899 ,TETRA ,17617413,Tue Nov 30 07:01:37 CET,Tue Nov 30 08:51:36 CET,0.0 1.311 1.728 2.033 2.25 2.466 2.666 2.807 3.054 3.166 3.267 3.281 3.551 3.64 3.829 3.979 4.109 4.18 4.308 4.42 4.571 4.669 4.769 4.908 5.036 5.176 5.327 5.468 5.65 5.831 5.998 6.208 6.422 6.603 6.774 6.942 7.103 7.27 7.439 7.613 7.824 8.047 8.221 8.384 8.603 8.833 9.014 9.137 9.148 8.965 8.389 7.422 6.527 5.754 5.041 4.353 3.628 2.975 2.493 2.014 1.623 1.274 0.928 0.58 0.236 -0.063 -0.388 -0.715 -0.984 -1.234 -1.501 -1.717 -1.938 -2.167 -2.341 -2.535 -2.741 -2.954 -3.196 -3.368 -3.533 -3.789 -3.98 -4.186 -4.283 -4.477 -4.699 -4.946 -5.077 -5.411 -5.542 -5.699 -5.859 -6.223 -6.423 -6.641 -6.89 -7.192 -7.577 -8.177 -10.469 -8 ,14662 ,TETRA ,17617414,Tue Nov 30 07:01:37 CET,Tue Nov 30 08:51:26 CET,0.0 1.25 1.607 1.904 2.13 2.335 2.521 2.668 2.943 3.072 3.19 3.257 3.552 3.654 3.837 4.001 4.161 4.238 4.39 4.55 4.763 4.896 5.024 5.214 5.41 5.573 5.705 5.825 5.988 6.165 6.354 6.574 6.786 6.981 7.178 7.384 7.56 7.737 7.921 8.107 8.295 8.5 8.784 9.055 9.293 9.538 9.755 9.921 9.954 9.772 9.286 8.414 7.467 6.625 5.894 5.22 4.618 4.06 3.552 3.051 2.621 2.172 1.76 1.411 1.076 0.772 0.453 0.178 -0.047 -0.314 -0.581 -0.779 -1.013 -1.273 -1.46 -1.641 -1.847 -2.061 -2.276 -2.423 -2.574 -2.811 -2.984 -3.197 -3.309 -3.505 -3.694 -3.903 -4.016 -4.324 -4.393 -4.544 -4.701 -5.015 -5.197 -5.374 -5.557 -5.801 -6.145 -6.615 -8.267 -9 ,16156 ,TETRA ,17617415,Tue Nov 30 07:01:37 CET,Tue Nov 30 08:50:55 CET,0.0 1.22 1.578 1.854 2.069 2.279 2.437 2.589 2.87 2.99 3.096 3.089 3.364 3.455 3.634 3.807 3.981 4.068 4.233 4.382 4.569 4.692 4.821 4.99 5.153 5.347 5.538 5.686 5.847 5.991 6.161 6.393 6.614 6.833 7.049 7.244 7.43 7.636 7.854 8.095 8.353 8.623 8.915 9.213 9.534 9.841 10.131 10.406 10.588 10.455 9.97 9.108 8.244 7.471 6.743 6.037 5.39 4.828 4.374 3.904 3.487 3.124 2.76 2.405 2.082 1.786 1.484 1.197 0.927 0.64 0.311 0.045 -0.202 -0.456 -0.647 -0.843 -1.043 -1.256 -1.504 -1.69 -1.88 -2.163 -2.356 -2.563 -2.675 -2.917 -3.144 -3.367 -3.483 -3.8 -3.899 -4.046 -4.189 -4.493 -4.702 -4.932 -5.139 -5.379 -5.676 -6.183 -8.461 -10 ,29400 ,TETRA ,17617416,Tue Nov 30 07:02:36 CET,Tue Nov 30 08:51:42 CET,0.0 0.964 1.307 1.554 1.746 1.899 2.051 2.204 2.494 2.629 2.751 2.775 3.061 3.159 3.33 3.485 3.638 3.714 3.853 3.983 4.17 4.294 4.412 4.599 4.778 4.93 5.078 5.226 5.416 5.581 5.728 5.923 6.117 6.274 6.435 6.654 6.888 7.138 7.376 7.616 7.86 8.118 8.396 8.661 8.941 9.209 9.48 9.686 9.805 9.73 9.237 8.364 7.482 6.687 5.967 5.244 4.588 3.988 3.426 2.788 2.258 1.81 1.377 0.989 0.62 0.285 -0.044 -0.339 -0.595 -0.865 -1.161 -1.398 -1.639 -1.902 -2.09 -2.267 -2.45 -2.638 -2.855 -3.006 -3.144 -3.371 -3.548 -3.739 -3.84 -4.077 -4.337 -4.581 -4.713 -5.039 -5.127 -5.28 -5.428 -5.741 -5.928 -6.166 -6.401 -6.63 -6.922 -7.431 -9.296 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_254_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_254_252.txt deleted file mode 100644 index 0ae63eb6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_254_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31625 ,KEBNE ,17076733,Sat Dec 25 03:42:42 CET,Sat Dec 25 05:13:20 CET,0.0 0.503 0.739 0.913 1.032 1.12 1.19 1.263 1.406 1.466 1.513 1.406 1.626 1.656 1.689 1.708 1.722 1.73 1.745 1.765 1.807 1.824 1.827 1.828 1.828 1.815 1.802 1.801 1.773 1.727 1.668 1.58 1.5 1.436 1.344 1.205 1.045 0.898 0.713 0.433 0.113 -0.254 -0.716 -1.285 -2.041 -2.952 -4.092 -5.541 -7.527 -10.352 -14.848 -20.056 -23.946 -26.967 -29.5 -31.673 -33.461 -35.019 -36.319 -37.575 -38.697 -39.715 -40.698 -41.558 -42.302 -43.022 -43.815 -44.522 -45.134 -45.754 -46.351 -46.856 -47.396 -47.951 -48.364 -48.818 -49.358 -49.932 -50.516 -50.93 -51.336 -51.96 -52.394 -52.824 -53.042 -53.5 -53.98 -54.487 -54.755 -55.291 -55.531 -55.814 -56.105 -56.774 -57.114 -57.471 -57.854 -58.293 -58.843 -59.538 -61.595 -2 ,12191 ,KEBNE ,17076734,Sat Dec 25 03:42:42 CET,Sat Dec 25 05:13:52 CET,0.0 0.811 1.002 1.134 1.261 1.384 1.49 1.571 1.72 1.791 1.85 1.775 2.014 2.066 2.164 2.241 2.307 2.339 2.389 2.436 2.496 2.523 2.542 2.561 2.568 2.587 2.607 2.603 2.594 2.581 2.549 2.5 2.441 2.368 2.274 2.167 2.102 2.026 1.891 1.691 1.413 1.069 0.622 0.127 -0.511 -1.32 -2.377 -3.806 -5.821 -8.644 -12.976 -18.008 -22.055 -25.265 -27.879 -30.17 -32.095 -33.727 -35.088 -36.409 -37.533 -38.578 -39.548 -40.403 -41.208 -41.955 -42.728 -43.405 -43.959 -44.531 -45.123 -45.601 -46.09 -46.582 -46.972 -47.364 -47.759 -48.178 -48.615 -48.91 -49.212 -49.676 -49.983 -50.316 -50.496 -50.856 -51.234 -51.627 -51.829 -52.286 -52.494 -52.718 -52.946 -53.455 -53.731 -54.013 -54.324 -54.669 -55.067 -55.532 -56.765 -3 ,31551 ,KEBNE ,17076735,Sat Dec 25 03:43:44 CET,Sat Dec 25 05:15:09 CET,0.0 0.625 0.835 0.997 1.129 1.239 1.328 1.41 1.574 1.641 1.697 1.635 1.866 1.901 1.995 2.101 2.193 2.235 2.313 2.373 2.47 2.528 2.566 2.609 2.642 2.67 2.724 2.795 2.859 2.876 2.872 2.868 2.866 2.853 2.805 2.713 2.587 2.428 2.241 2.015 1.748 1.426 0.996 0.483 -0.211 -0.937 -1.897 -3.393 -5.452 -8.413 -13.006 -18.094 -21.973 -25.06 -27.587 -29.775 -31.63 -33.248 -34.558 -35.808 -36.861 -37.792 -38.673 -39.457 -40.179 -40.827 -41.488 -42.104 -42.624 -43.132 -43.658 -44.093 -44.552 -45.008 -45.348 -45.695 -46.052 -46.438 -46.818 -47.071 -47.331 -47.812 -48.188 -48.588 -48.811 -49.253 -49.71 -50.205 -50.443 -50.959 -51.188 -51.458 -51.751 -52.406 -52.746 -53.088 -53.47 -53.9 -54.376 -55.005 -57.009 -4 ,19432 ,KEBNE ,17076736,Sat Dec 25 03:43:44 CET,Sat Dec 25 05:15:12 CET,0.0 0.704 0.987 1.186 1.334 1.487 1.619 1.721 1.887 1.971 2.05 1.987 2.217 2.263 2.36 2.455 2.544 2.585 2.642 2.703 2.808 2.85 2.894 2.966 3.015 3.043 3.076 3.098 3.098 3.088 3.064 3.023 2.99 2.962 2.906 2.828 2.743 2.63 2.49 2.339 2.144 1.859 1.498 1.084 0.564 -0.102 -1.083 -2.394 -4.209 -6.935 -11.307 -16.093 -19.819 -22.88 -25.409 -27.58 -29.423 -31.037 -32.448 -33.865 -34.987 -35.912 -36.776 -37.575 -38.283 -38.948 -39.646 -40.242 -40.741 -41.266 -41.82 -42.27 -42.738 -43.218 -43.605 -44.024 -44.443 -44.86 -45.282 -45.563 -45.858 -46.339 -46.676 -47.011 -47.183 -47.533 -47.894 -48.275 -48.46 -48.889 -49.096 -49.355 -49.629 -50.218 -50.538 -50.869 -51.224 -51.64 -52.133 -52.73 -54.819 -5 ,12781 ,KEBNE ,17076737,Sat Dec 25 03:43:45 CET,Sat Dec 25 05:14:26 CET,0.0 0.425 0.619 0.782 0.901 1.01 1.109 1.19 1.326 1.38 1.427 1.354 1.577 1.628 1.725 1.784 1.83 1.859 1.925 1.977 2.019 2.032 2.044 2.054 2.072 2.107 2.14 2.141 2.106 2.077 2.054 2.004 1.932 1.838 1.712 1.568 1.428 1.258 1.04 0.781 0.488 0.135 -0.324 -0.841 -1.519 -2.356 -3.424 -4.854 -6.908 -9.913 -14.516 -19.508 -23.313 -26.396 -28.922 -31.039 -32.811 -34.498 -36.005 -37.427 -38.598 -39.639 -40.631 -41.53 -42.342 -43.08 -43.83 -44.506 -45.08 -45.656 -46.265 -46.792 -47.344 -47.882 -48.284 -48.703 -49.136 -49.565 -50.009 -50.331 -50.666 -51.168 -51.511 -51.863 -52.037 -52.389 -52.737 -53.078 -53.262 -53.704 -53.913 -54.15 -54.417 -55.026 -55.367 -55.74 -56.139 -56.565 -57.054 -57.669 -59.27 -6 ,30378 ,KEBNE ,17076738,Sat Dec 25 03:43:45 CET,Sat Dec 25 05:14:30 CET,0.0 0.574 0.836 1.031 1.174 1.288 1.387 1.48 1.655 1.739 1.817 1.75 1.98 2.01 2.054 2.112 2.189 2.226 2.281 2.316 2.34 2.346 2.357 2.382 2.389 2.379 2.363 2.35 2.331 2.335 2.353 2.324 2.27 2.221 2.207 2.182 2.072 1.928 1.756 1.539 1.282 0.964 0.537 0.058 -0.534 -1.303 -2.325 -3.704 -5.709 -8.611 -13.112 -18.057 -21.955 -25.083 -27.601 -29.769 -31.597 -33.172 -34.53 -35.895 -37.07 -38.122 -39.15 -40.153 -41.049 -41.864 -42.713 -43.445 -44.067 -44.722 -45.393 -45.934 -46.453 -46.942 -47.352 -47.805 -48.248 -48.702 -49.182 -49.509 -49.857 -50.426 -50.806 -51.182 -51.386 -51.838 -52.308 -52.796 -53.054 -53.599 -53.873 -54.171 -54.489 -55.167 -55.531 -55.91 -56.311 -56.75 -57.259 -57.863 -59.311 -7 ,26358 ,KEBNE ,17076739,Sat Dec 25 03:43:44 CET,Sat Dec 25 05:14:39 CET,0.0 0.434 0.656 0.8 0.939 1.036 1.108 1.174 1.284 1.334 1.387 1.284 1.514 1.569 1.697 1.795 1.879 1.928 2.012 2.081 2.188 2.267 2.339 2.418 2.467 2.498 2.548 2.596 2.613 2.61 2.604 2.596 2.562 2.509 2.43 2.316 2.202 2.09 1.955 1.757 1.497 1.159 0.731 0.268 -0.368 -1.214 -2.311 -3.754 -5.71 -8.501 -12.867 -17.646 -21.345 -24.331 -26.755 -28.802 -30.537 -32.064 -33.348 -34.607 -35.679 -36.658 -37.535 -38.302 -39.17 -40.139 -41.162 -42.017 -42.727 -43.441 -44.169 -44.783 -45.403 -46.067 -46.594 -47.13 -47.682 -48.218 -48.77 -49.152 -49.542 -50.117 -50.495 -50.881 -51.072 -51.469 -51.877 -52.304 -52.529 -53.029 -53.218 -53.47 -53.741 -54.332 -54.618 -54.937 -55.337 -55.783 -56.275 -56.907 -58.608 -8 ,3758 ,KEBNE ,17076740,Sat Dec 25 03:43:44 CET,Sat Dec 25 05:15:33 CET,0.0 0.514 0.722 0.892 1.008 1.102 1.178 1.252 1.406 1.463 1.506 1.407 1.622 1.65 1.694 1.723 1.751 1.761 1.771 1.785 1.815 1.826 1.836 1.852 1.861 1.866 1.865 1.876 1.887 1.885 1.879 1.855 1.827 1.779 1.707 1.647 1.559 1.402 1.211 1.02 0.785 0.449 0.002 -0.536 -1.206 -2.072 -3.285 -4.855 -7.005 -10.037 -14.654 -19.767 -23.619 -26.625 -29.097 -31.275 -33.12 -34.715 -36.041 -37.293 -38.34 -39.276 -40.154 -40.971 -41.737 -42.444 -43.15 -43.75 -44.28 -44.831 -45.38 -45.82 -46.259 -46.704 -47.087 -47.553 -48.063 -48.592 -49.137 -49.491 -49.855 -50.442 -50.852 -51.265 -51.471 -51.887 -52.334 -52.796 -53.037 -53.576 -53.825 -54.105 -54.397 -54.99 -55.295 -55.588 -55.905 -56.282 -56.704 -57.231 -58.475 -9 ,6934 ,KEBNE ,17076741,Sat Dec 25 03:43:45 CET,Sat Dec 25 05:15:16 CET,0.0 0.543 0.76 0.923 1.041 1.15 1.262 1.365 1.527 1.59 1.653 1.596 1.818 1.846 1.901 1.961 2.026 2.06 2.116 2.148 2.157 2.174 2.197 2.195 2.188 2.185 2.166 2.142 2.098 2.05 2.007 1.936 1.865 1.797 1.712 1.589 1.443 1.264 1.023 0.75 0.469 0.128 -0.314 -0.809 -1.445 -2.255 -3.362 -4.857 -6.916 -9.831 -14.345 -19.305 -23.102 -26.114 -28.624 -30.791 -32.618 -34.212 -35.524 -36.826 -37.979 -38.95 -39.758 -40.487 -41.184 -41.868 -42.613 -43.269 -43.821 -44.383 -44.946 -45.405 -45.89 -46.385 -46.763 -47.159 -47.562 -47.976 -48.401 -48.68 -48.959 -49.406 -49.724 -50.068 -50.248 -50.601 -50.968 -51.347 -51.551 -52.018 -52.235 -52.459 -52.681 -53.15 -53.413 -53.703 -54.018 -54.361 -54.759 -55.31 -57.236 -10 ,30927 ,KEBNE ,17076742,Sat Dec 25 03:43:45 CET,Sat Dec 25 05:14:53 CET,0.0 0.515 0.721 0.869 0.993 1.125 1.245 1.337 1.488 1.547 1.601 1.511 1.738 1.789 1.879 1.94 1.976 1.994 2.049 2.115 2.211 2.262 2.299 2.352 2.409 2.442 2.453 2.47 2.493 2.499 2.495 2.467 2.453 2.469 2.471 2.451 2.388 2.244 2.038 1.816 1.587 1.307 0.972 0.594 0.088 -0.541 -1.428 -2.675 -4.398 -7.144 -11.814 -16.963 -20.837 -23.915 -26.424 -28.599 -30.439 -32.061 -33.509 -34.97 -36.188 -37.19 -38.123 -39.009 -39.803 -40.533 -41.296 -41.979 -42.555 -43.123 -43.702 -44.189 -44.695 -45.267 -45.782 -46.333 -46.87 -47.398 -47.938 -48.311 -48.679 -49.198 -49.537 -49.876 -50.052 -50.433 -50.823 -51.231 -51.466 -52.003 -52.271 -52.553 -52.847 -53.472 -53.797 -54.133 -54.503 -54.944 -55.442 -56.007 -57.574 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_256_67.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_256_67.txt deleted file mode 100644 index 8e63b979..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_256_67.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14907 ,TETRA ,17617417,Tue Nov 30 07:02:36 CET,Tue Nov 30 08:38:53 CET,0.0 1.01 1.528 1.981 2.349 2.69 3.037 3.381 4.045 4.359 4.653 4.942 5.519 5.814 6.403 6.972 7.539 7.815 8.348 8.881 9.695 10.234 10.762 11.541 12.3 13.04 13.783 14.544 15.565 16.498 17.317 18.306 19.296 20.275 21.439 22.782 24.108 25.623 27.298 29.137 31.136 33.462 36.314 39.314 42.97 47.288 52.596 59.017 67.247 77.979 92.681 106.936 116.782 124.002 129.461 133.874 137.351 140.182 142.383 144.42 146.098 147.496 148.72 149.832 150.846 151.676 152.434 153.044 153.566 154.115 154.655 155.08 155.488 155.858 156.131 156.397 156.671 156.956 157.221 157.396 157.552 157.77 157.903 158.014 158.069 158.176 158.286 158.384 158.415 158.368 158.506 158.527 158.544 158.56 158.545 158.495 158.422 158.345 158.175 157.922 156.857 -2 ,20443 ,TETRA ,17617418,Tue Nov 30 07:02:36 CET,Tue Nov 30 08:52:13 CET,0.0 1.198 1.654 2.043 2.377 2.672 2.945 3.218 3.76 4.023 4.284 4.569 5.082 5.333 5.833 6.314 6.769 6.999 7.454 7.904 8.568 9.004 9.443 10.093 10.735 11.38 12.032 12.673 13.52 14.356 15.17 16.187 17.189 18.163 19.307 20.627 21.944 23.457 25.143 26.967 28.975 31.361 34.284 37.343 41.09 45.536 50.953 57.51 65.896 76.856 91.988 106.624 116.64 123.976 129.538 133.9 137.319 140.165 142.41 144.448 146.131 147.58 148.865 150.027 151.054 151.927 152.763 153.451 154.023 154.586 155.146 155.59 156.029 156.467 156.801 157.128 157.443 157.743 158.035 158.236 158.418 158.648 158.793 158.94 159.013 159.14 159.239 159.341 159.384 159.347 159.496 159.538 159.571 159.586 159.566 159.523 159.471 159.399 159.281 159.046 157.666 -3 ,31125 ,TETRA ,17617419,Tue Nov 30 07:02:36 CET,Tue Nov 30 08:49:59 CET,0.0 0.991 1.45 1.856 2.205 2.527 2.835 3.121 3.661 3.921 4.183 4.456 4.961 5.218 5.72 6.203 6.667 6.896 7.356 7.807 8.468 8.91 9.347 9.984 10.613 11.243 11.862 12.47 13.277 14.086 14.896 15.912 16.92 17.918 19.128 20.512 21.862 23.404 25.123 27.002 29.043 31.468 34.432 37.54 41.364 45.818 51.202 57.635 65.798 76.471 91.181 105.522 115.391 122.78 128.411 132.856 136.374 139.29 141.573 143.66 145.339 146.757 148.062 149.215 150.214 151.072 151.906 152.593 153.141 153.681 154.221 154.651 155.081 155.509 155.819 156.117 156.404 156.692 156.966 157.129 157.291 157.513 157.648 157.784 157.847 157.944 158.032 158.127 158.151 158.074 158.152 158.163 158.163 158.11 158.075 158.032 157.953 157.822 157.62 157.28 155.946 -4 ,23654 ,TETRA ,17617420,Tue Nov 30 07:03:35 CET,Tue Nov 30 08:52:32 CET,0.0 1.48 2.0 2.432 2.832 3.213 3.56 3.884 4.466 4.728 4.984 5.252 5.746 5.99 6.469 6.934 7.396 7.628 8.094 8.562 9.252 9.701 10.145 10.802 11.454 12.099 12.743 13.382 14.232 15.072 15.881 16.891 17.906 18.894 20.067 21.422 22.795 24.382 26.138 28.08 30.215 32.706 35.744 38.922 42.719 47.102 52.427 58.863 67.092 77.859 92.652 106.935 116.754 123.955 129.422 133.854 137.334 140.188 142.487 144.603 146.309 147.735 149.02 150.137 151.115 151.972 152.793 153.488 154.07 154.67 155.247 155.685 156.122 156.548 156.859 157.175 157.478 157.763 158.035 158.204 158.361 158.601 158.75 158.88 158.944 159.056 159.149 159.235 159.272 159.223 159.347 159.356 159.355 159.352 159.351 159.332 159.29 159.219 159.085 158.779 157.519 -5 ,2344 ,TETRA ,17617421,Tue Nov 30 07:04:36 CET,Tue Nov 30 08:52:53 CET,0.0 1.273 1.735 2.144 2.545 2.922 3.271 3.607 4.258 4.578 4.892 5.206 5.79 6.085 6.664 7.225 7.777 8.048 8.592 9.131 9.928 10.455 10.985 11.765 12.535 13.323 14.106 14.876 15.883 16.883 17.884 19.125 20.36 21.561 22.982 24.571 26.023 27.586 29.28 31.102 33.082 35.41 38.239 41.208 44.839 49.095 54.304 60.651 68.693 79.105 93.556 107.698 117.452 124.676 130.209 134.635 138.116 140.99 143.288 145.447 147.165 148.567 149.816 150.908 151.837 152.654 153.469 154.169 154.761 155.345 155.903 156.337 156.756 157.146 157.43 157.687 157.924 158.143 158.351 158.498 158.651 158.885 159.025 159.147 159.2 159.282 159.377 159.486 159.532 159.501 159.653 159.668 159.669 159.647 159.598 159.517 159.407 159.28 159.115 158.858 157.416 -6 ,13025 ,TETRA ,17617422,Tue Nov 30 07:18:36 CET,Tue Nov 30 09:09:52 CET,0.0 1.206 1.682 2.053 2.38 2.688 2.988 3.274 3.821 4.085 4.348 4.621 5.117 5.357 5.83 6.301 6.769 7.0 7.458 7.911 8.59 9.037 9.457 10.083 10.712 11.35 11.981 12.604 13.445 14.273 15.085 16.084 17.089 18.1 19.281 20.642 22.024 23.617 25.384 27.334 29.45 31.855 34.739 37.78 41.518 45.91 51.269 57.739 65.981 76.708 91.442 105.765 115.604 122.913 128.496 132.947 136.509 139.44 141.744 143.886 145.605 147.025 148.287 149.415 150.415 151.275 152.11 152.795 153.349 153.898 154.445 154.862 155.258 155.654 155.952 156.245 156.511 156.748 156.973 157.133 157.284 157.503 157.659 157.801 157.865 157.982 158.082 158.179 158.22 158.181 158.314 158.318 158.321 158.309 158.268 158.193 158.094 157.962 157.801 157.537 156.209 -7 ,16321 ,TETRA ,17617423,Tue Nov 30 07:19:35 CET,Tue Nov 30 09:23:53 CET,0.0 0.966 1.341 1.701 2.044 2.371 2.672 2.952 3.478 3.725 3.97 4.222 4.71 4.949 5.414 5.89 6.352 6.573 7.011 7.444 8.089 8.521 8.952 9.594 10.217 10.83 11.446 12.058 12.872 13.683 14.493 15.504 16.496 17.486 18.656 19.998 21.341 22.874 24.579 26.417 28.403 30.732 33.562 36.535 40.183 44.496 49.814 56.257 64.523 75.412 90.432 104.958 114.932 122.226 127.76 132.21 135.679 138.539 140.813 142.88 144.523 145.881 147.081 148.133 149.065 149.873 150.631 151.255 151.787 152.331 152.873 153.298 153.713 154.11 154.402 154.667 154.9 155.128 155.372 155.547 155.697 155.901 156.056 156.203 156.267 156.4 156.497 156.548 156.576 156.543 156.697 156.721 156.739 156.738 156.72 156.674 156.603 156.519 156.392 156.172 154.81 -8 ,16890 ,TETRA ,17617424,Tue Nov 30 07:46:38 CET,Tue Nov 30 09:33:24 CET,0.0 1.053 1.52 1.929 2.32 2.7 3.065 3.4 3.993 4.264 4.517 4.772 5.263 5.512 6.0 6.468 6.936 7.167 7.622 8.088 8.769 9.203 9.632 10.269 10.892 11.513 12.145 12.765 13.582 14.399 15.199 16.19 17.186 18.18 19.374 20.741 22.092 23.642 25.386 27.282 29.323 31.725 34.686 37.801 41.616 46.103 51.597 58.241 66.617 77.483 92.368 107.007 117.099 124.476 130.071 134.501 137.983 140.876 143.197 145.363 147.105 148.551 149.848 150.982 151.961 152.801 153.637 154.347 154.917 155.461 156.003 156.451 156.897 157.33 157.643 157.955 158.251 158.53 158.804 158.969 159.118 159.319 159.461 159.612 159.679 159.806 159.925 160.029 160.083 160.06 160.203 160.242 160.277 160.323 160.327 160.312 160.274 160.21 160.108 159.892 158.588 -9 ,11846 ,TETRA ,17617425,Tue Nov 30 07:46:38 CET,Tue Nov 30 09:32:42 CET,0.0 1.248 1.726 2.116 2.471 2.806 3.116 3.397 3.947 4.218 4.48 4.74 5.249 5.512 6.021 6.521 6.996 7.228 7.708 8.178 8.876 9.339 9.795 10.461 11.117 11.778 12.437 13.076 13.905 14.729 15.545 16.55 17.542 18.533 19.709 21.052 22.369 23.865 25.544 27.396 29.437 31.838 34.751 37.817 41.61 46.085 51.511 58.083 66.446 77.425 92.45 106.8 116.689 123.944 129.453 133.862 137.328 140.178 142.424 144.503 146.179 147.566 148.817 149.923 150.89 151.731 152.531 153.193 153.723 154.239 154.748 155.138 155.521 155.881 156.146 156.396 156.63 156.88 157.099 157.218 157.332 157.512 157.631 157.736 157.79 157.892 157.983 158.039 158.063 157.997 158.047 158.027 158.01 157.944 157.901 157.836 157.713 157.566 157.374 157.019 155.217 -10 ,5966 ,TETRA ,17617426,Tue Nov 30 07:46:40 CET,Tue Nov 30 09:32:51 CET,0.0 1.149 1.612 1.992 2.32 2.618 2.911 3.197 3.747 4.009 4.262 4.518 5.012 5.261 5.736 6.201 6.658 6.879 7.32 7.77 8.448 8.908 9.365 10.034 10.703 11.371 12.032 12.687 13.542 14.382 15.229 16.273 17.294 18.293 19.47 20.834 22.192 23.757 25.524 27.423 29.444 31.826 34.73 37.751 41.432 45.789 51.173 57.737 66.11 76.957 91.772 106.066 115.918 123.206 128.768 133.186 136.658 139.563 141.885 144.034 145.739 147.113 148.346 149.451 150.43 151.293 152.126 152.823 153.372 153.901 154.458 154.908 155.347 155.767 156.071 156.368 156.652 156.931 157.198 157.364 157.527 157.776 157.927 158.072 158.139 158.266 158.39 158.494 158.533 158.487 158.597 158.603 158.61 158.588 158.56 158.523 158.462 158.332 158.106 157.808 156.401 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_266_224.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_266_224.txt deleted file mode 100644 index 9664053e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_266_224.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9577 ,TETRA ,17617427,Tue Nov 30 07:47:36 CET,Tue Nov 30 09:34:01 CET,0.0 1.374 1.711 1.96 2.144 2.322 2.484 2.617 2.858 2.972 3.078 3.303 3.382 3.463 3.626 3.788 3.966 4.052 4.208 4.351 4.534 4.656 4.775 4.942 5.136 5.347 5.522 5.673 5.901 6.122 6.303 6.51 6.71 6.898 7.13 7.424 7.694 7.962 8.25 8.566 8.889 9.228 9.621 10.017 10.469 10.946 11.489 12.057 12.62 13.156 13.537 13.552 13.31 12.991 12.63 12.197 11.72 11.277 10.921 10.558 10.231 9.913 9.61 9.32 9.016 8.722 8.421 8.16 7.931 7.7 7.438 7.208 6.984 6.734 6.522 6.289 6.025 5.76 5.501 5.328 5.155 4.863 4.647 4.418 4.292 4.047 3.799 3.522 3.382 3.253 2.892 2.714 2.521 2.086 1.858 1.618 1.356 1.054 0.688 0.18 -1.99 -2 ,4220 ,TETRA ,17617428,Tue Nov 30 07:47:38 CET,Tue Nov 30 09:32:55 CET,0.0 1.626 2.044 2.363 2.58 2.752 2.904 3.042 3.285 3.398 3.52 3.778 3.877 3.994 4.21 4.406 4.579 4.66 4.83 4.995 5.23 5.379 5.528 5.741 5.934 6.117 6.297 6.471 6.691 6.914 7.137 7.373 7.565 7.77 8.009 8.264 8.526 8.825 9.12 9.414 9.713 10.065 10.499 10.946 11.441 11.925 12.471 13.053 13.617 14.199 14.708 14.788 14.583 14.231 13.823 13.429 13.035 12.665 12.329 11.948 11.594 11.289 11.001 10.722 10.471 10.24 9.998 9.769 9.54 9.298 9.051 8.823 8.573 8.328 8.132 7.926 7.733 7.539 7.335 7.194 7.045 6.771 6.559 6.329 6.211 5.991 5.739 5.455 5.318 5.201 4.875 4.714 4.53 4.082 3.856 3.636 3.373 3.069 2.719 2.228 -0.311 -3 ,1794 ,TETRA ,17617429,Tue Nov 30 07:47:36 CET,Tue Nov 30 09:42:29 CET,0.0 1.553 1.906 2.159 2.393 2.605 2.788 2.952 3.246 3.367 3.474 3.709 3.793 3.89 4.065 4.244 4.427 4.51 4.668 4.819 5.049 5.208 5.364 5.579 5.781 5.971 6.135 6.293 6.522 6.746 6.947 7.169 7.368 7.566 7.843 8.15 8.395 8.652 8.916 9.205 9.552 9.94 10.331 10.7 11.154 11.645 12.169 12.753 13.367 13.934 14.415 14.543 14.349 14.039 13.679 13.261 12.84 12.41 12.039 11.687 11.32 10.966 10.67 10.39 10.087 9.796 9.522 9.279 9.06 8.803 8.479 8.203 7.919 7.627 7.395 7.143 6.888 6.634 6.363 6.172 5.985 5.7 5.489 5.261 5.143 4.907 4.683 4.439 4.288 4.16 3.851 3.677 3.489 3.076 2.849 2.589 2.283 1.947 1.563 1.019 -1.953 -4 ,1571 ,TETRA ,17617430,Tue Nov 30 07:47:38 CET,Tue Nov 30 09:27:48 CET,0.0 1.489 1.857 2.142 2.366 2.518 2.668 2.825 3.107 3.228 3.334 3.559 3.642 3.737 3.908 4.066 4.231 4.321 4.506 4.675 4.89 5.026 5.158 5.338 5.521 5.687 5.828 5.964 6.146 6.359 6.565 6.77 6.966 7.147 7.354 7.59 7.821 8.083 8.358 8.648 8.955 9.296 9.694 10.103 10.55 10.992 11.488 12.038 12.647 13.263 13.765 13.905 13.741 13.441 13.103 12.748 12.377 12.008 11.65 11.283 10.979 10.653 10.322 10.05 9.799 9.543 9.256 8.981 8.728 8.488 8.261 8.033 7.763 7.473 7.24 7.016 6.774 6.53 6.313 6.169 6.005 5.712 5.504 5.285 5.169 4.947 4.717 4.459 4.322 4.202 3.872 3.711 3.549 3.191 2.989 2.749 2.454 2.118 1.713 1.133 -1.611 -5 ,21676 ,TETRA ,17617431,Tue Nov 30 07:47:37 CET,Tue Nov 30 09:37:03 CET,0.0 1.34 1.674 1.925 2.121 2.304 2.474 2.637 2.94 3.09 3.22 3.451 3.538 3.633 3.798 3.978 4.162 4.251 4.416 4.569 4.783 4.924 5.078 5.314 5.531 5.737 5.941 6.133 6.353 6.542 6.716 6.952 7.191 7.411 7.646 7.905 8.153 8.416 8.697 9.0 9.303 9.654 10.075 10.457 10.989 11.578 12.134 12.753 13.408 14.038 14.517 14.621 14.473 14.175 13.801 13.372 12.959 12.569 12.161 11.735 11.338 10.995 10.715 10.43 10.173 9.944 9.687 9.438 9.202 8.942 8.66 8.448 8.238 7.997 7.791 7.568 7.33 7.07 6.804 6.642 6.466 6.164 5.961 5.748 5.631 5.381 5.117 4.82 4.659 4.513 4.158 3.989 3.812 3.417 3.203 2.94 2.612 2.213 1.68 1.068 -0.864 -6 ,20184 ,TETRA ,17617432,Tue Nov 30 07:47:39 CET,Tue Nov 30 09:36:02 CET,0.0 0.886 1.18 1.39 1.56 1.72 1.865 1.996 2.232 2.342 2.443 2.651 2.724 2.812 2.983 3.15 3.309 3.392 3.571 3.721 3.919 4.057 4.181 4.355 4.523 4.685 4.842 5.017 5.246 5.437 5.619 5.835 6.05 6.265 6.547 6.877 7.181 7.504 7.809 8.109 8.432 8.777 9.149 9.525 9.971 10.45 10.956 11.549 12.158 12.645 13.107 13.188 12.966 12.614 12.239 11.872 11.539 11.233 10.906 10.535 10.192 9.867 9.565 9.293 9.047 8.806 8.541 8.289 8.058 7.827 7.609 7.416 7.193 6.966 6.778 6.568 6.358 6.155 5.933 5.76 5.59 5.329 5.146 4.96 4.861 4.656 4.421 4.148 3.999 3.875 3.541 3.364 3.175 2.752 2.517 2.255 1.964 1.633 1.251 0.685 -2.856 -7 ,14435 ,TETRA ,17617433,Tue Nov 30 07:47:37 CET,Tue Nov 30 09:35:25 CET,0.0 0.967 1.262 1.493 1.693 1.876 2.05 2.215 2.513 2.644 2.773 3.023 3.11 3.204 3.389 3.589 3.789 3.882 4.048 4.204 4.421 4.566 4.703 4.885 5.054 5.231 5.436 5.635 5.872 6.083 6.288 6.557 6.826 7.059 7.327 7.648 7.918 8.225 8.591 8.948 9.281 9.635 10.015 10.396 10.849 11.328 11.837 12.354 12.891 13.402 13.851 14.061 13.928 13.688 13.427 13.071 12.663 12.251 11.902 11.556 11.243 10.952 10.615 10.279 9.968 9.641 9.296 8.999 8.741 8.463 8.151 7.886 7.612 7.355 7.185 7.012 6.831 6.642 6.416 6.24 6.062 5.798 5.617 5.438 5.34 5.121 4.871 4.609 4.477 4.345 3.95 3.761 3.582 3.132 2.883 2.644 2.377 2.079 1.744 1.159 -1.382 -8 ,994 ,TETRA ,17617434,Tue Nov 30 07:47:40 CET,Tue Nov 30 09:37:14 CET,0.0 2.661 3.112 3.411 3.653 3.853 4.021 4.148 4.39 4.509 4.626 4.88 4.975 5.076 5.257 5.424 5.592 5.68 5.858 6.032 6.273 6.421 6.552 6.738 6.946 7.161 7.361 7.554 7.8 8.034 8.256 8.525 8.767 8.975 9.198 9.444 9.675 9.944 10.282 10.635 10.978 11.349 11.73 12.099 12.53 13.013 13.53 14.071 14.638 15.176 15.676 15.746 15.476 15.168 14.865 14.514 14.131 13.743 13.392 13.025 12.685 12.386 12.102 11.789 11.499 11.226 10.921 10.671 10.422 10.157 9.923 9.709 9.466 9.206 8.993 8.76 8.503 8.242 7.999 7.855 7.704 7.45 7.282 7.104 6.977 6.674 6.367 6.049 5.891 5.729 5.35 5.185 5.003 4.621 4.396 4.14 3.846 3.499 3.1 2.527 -0.117 -9 ,20510 ,TETRA ,17617435,Tue Nov 30 07:47:38 CET,Tue Nov 30 09:37:04 CET,0.0 1.094 1.359 1.587 1.793 1.972 2.139 2.307 2.645 2.802 2.927 3.168 3.257 3.354 3.538 3.724 3.912 3.999 4.155 4.312 4.551 4.711 4.866 5.073 5.267 5.446 5.598 5.738 5.92 6.096 6.262 6.496 6.743 6.954 7.177 7.423 7.664 7.925 8.192 8.478 8.766 9.105 9.515 9.903 10.345 10.824 11.359 11.935 12.573 13.253 13.874 14.016 13.889 13.713 13.421 13.043 12.672 12.32 11.996 11.651 11.35 11.104 10.852 10.573 10.306 10.068 9.811 9.551 9.337 9.113 8.847 8.617 8.398 8.189 8.024 7.845 7.647 7.432 7.197 7.019 6.83 6.527 6.308 6.067 5.951 5.728 5.462 5.176 5.024 4.891 4.549 4.37 4.176 3.754 3.504 3.217 2.916 2.582 2.15 1.52 -1.722 -10 ,7770 ,TETRA ,17617436,Tue Nov 30 07:47:40 CET,Tue Nov 30 09:37:25 CET,0.0 1.066 1.396 1.646 1.834 2.01 2.182 2.342 2.633 2.764 2.884 3.117 3.198 3.303 3.51 3.713 3.92 4.01 4.155 4.283 4.467 4.588 4.706 4.879 5.047 5.202 5.347 5.486 5.667 5.854 6.057 6.329 6.607 6.854 7.09 7.349 7.612 7.884 8.164 8.453 8.743 9.074 9.486 9.907 10.356 10.823 11.334 11.874 12.474 13.083 13.593 13.674 13.475 13.207 12.911 12.575 12.208 11.83 11.482 11.098 10.76 10.467 10.199 9.942 9.654 9.377 9.088 8.832 8.611 8.355 8.052 7.81 7.581 7.343 7.153 6.953 6.748 6.535 6.308 6.155 6.0 5.744 5.558 5.364 5.262 5.056 4.848 4.63 4.512 4.393 4.051 3.874 3.691 3.314 3.104 2.87 2.603 2.31 1.93 1.377 -1.16 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_266_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_266_235.txt deleted file mode 100644 index c4e4eb89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_266_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17969 ,TETRA ,17617437,Tue Nov 30 07:48:36 CET,Tue Nov 30 09:36:39 CET,0.0 2.04 2.657 3.087 3.422 3.692 3.956 4.217 4.671 4.875 5.062 5.427 5.573 5.714 5.965 6.215 6.468 6.592 6.827 7.05 7.359 7.561 7.757 8.056 8.359 8.607 8.814 9.019 9.279 9.527 9.766 10.05 10.312 10.532 10.76 11.027 11.299 11.622 11.965 12.298 12.63 12.959 13.307 13.615 13.965 14.391 14.784 15.153 15.518 15.788 15.882 15.554 15.062 14.539 14.012 13.494 13.017 12.569 12.157 11.731 11.371 11.054 10.739 10.381 10.046 9.763 9.459 9.193 8.954 8.7 8.422 8.19 7.97 7.732 7.547 7.37 7.17 6.934 6.68 6.497 6.304 6.009 5.812 5.59 5.476 5.241 4.977 4.709 4.58 4.451 4.1 3.936 3.769 3.385 3.165 2.916 2.658 2.379 1.998 1.426 -0.949 -2 ,11369 ,TETRA ,17617438,Tue Nov 30 07:48:38 CET,Tue Nov 30 09:36:14 CET,0.0 2.078 2.633 3.095 3.49 3.819 4.092 4.329 4.732 4.901 5.075 5.413 5.543 5.683 5.947 6.211 6.47 6.595 6.819 7.02 7.301 7.471 7.624 7.859 8.083 8.282 8.465 8.643 8.897 9.144 9.365 9.636 9.947 10.259 10.553 10.801 11.032 11.279 11.515 11.79 12.103 12.425 12.767 13.108 13.487 13.894 14.293 14.69 15.059 15.31 15.289 14.874 14.378 13.844 13.332 12.841 12.379 11.935 11.502 11.037 10.639 10.301 9.96 9.587 9.206 8.853 8.526 8.226 7.937 7.627 7.34 7.146 6.951 6.745 6.574 6.396 6.216 6.018 5.782 5.603 5.419 5.138 4.953 4.756 4.647 4.407 4.155 3.875 3.731 3.612 3.32 3.166 2.994 2.563 2.329 2.091 1.829 1.501 1.08 0.512 -1.917 -3 ,29623 ,TETRA ,17617439,Tue Nov 30 07:49:36 CET,Tue Nov 30 09:36:43 CET,0.0 2.263 2.846 3.269 3.608 3.903 4.169 4.409 4.795 4.963 5.115 5.413 5.536 5.672 5.939 6.192 6.419 6.533 6.758 6.968 7.248 7.426 7.583 7.811 8.043 8.271 8.503 8.716 8.979 9.254 9.524 9.819 10.074 10.315 10.57 10.816 11.041 11.294 11.641 11.993 12.27 12.563 12.922 13.294 13.678 14.069 14.499 14.94 15.276 15.412 15.357 14.935 14.373 13.828 13.321 12.843 12.41 11.991 11.602 11.215 10.86 10.487 10.096 9.759 9.423 9.072 8.73 8.443 8.182 7.898 7.631 7.424 7.218 7.013 6.833 6.629 6.41 6.162 5.902 5.728 5.554 5.303 5.134 4.945 4.843 4.62 4.378 4.105 3.958 3.83 3.498 3.321 3.138 2.732 2.515 2.263 1.922 1.55 1.144 0.6 -1.609 -4 ,25651 ,TETRA ,17617440,Tue Nov 30 07:49:37 CET,Tue Nov 30 09:36:22 CET,0.0 2.741 3.282 3.695 4.046 4.367 4.649 4.911 5.377 5.568 5.733 6.049 6.171 6.308 6.564 6.807 7.056 7.179 7.387 7.569 7.828 8.0 8.174 8.416 8.653 8.9 9.118 9.289 9.5 9.699 9.891 10.124 10.33 10.541 10.764 10.999 11.231 11.466 11.743 12.027 12.299 12.595 12.945 13.337 13.727 14.085 14.443 14.769 15.08 15.313 15.271 14.793 14.261 13.729 13.174 12.644 12.187 11.708 11.273 10.849 10.446 10.086 9.743 9.389 9.054 8.763 8.446 8.14 7.893 7.664 7.411 7.185 6.967 6.729 6.51 6.266 6.026 5.797 5.559 5.397 5.22 4.944 4.75 4.53 4.421 4.169 3.879 3.623 3.494 3.375 3.065 2.899 2.727 2.328 2.1 1.823 1.506 1.148 0.739 0.236 -2.059 -5 ,10443 ,TETRA ,17617441,Tue Nov 30 07:49:37 CET,Tue Nov 30 09:23:03 CET,0.0 2.224 2.78 3.161 3.441 3.707 3.976 4.195 4.584 4.759 4.922 5.236 5.374 5.532 5.818 6.082 6.309 6.414 6.626 6.833 7.13 7.313 7.501 7.789 8.054 8.306 8.537 8.767 9.069 9.32 9.531 9.756 10.01 10.288 10.578 10.856 11.086 11.38 11.717 12.003 12.272 12.582 12.921 13.259 13.644 14.05 14.464 14.913 15.379 15.663 15.635 15.249 14.77 14.301 13.862 13.414 12.981 12.582 12.252 11.863 11.466 11.108 10.785 10.499 10.21 9.943 9.628 9.318 9.063 8.838 8.63 8.439 8.212 7.937 7.733 7.532 7.312 7.106 6.88 6.713 6.542 6.28 6.101 5.919 5.824 5.616 5.386 5.139 5.008 4.876 4.532 4.361 4.181 3.758 3.512 3.258 2.998 2.692 2.298 1.732 -0.991 -6 ,32646 ,TETRA ,17617442,Tue Nov 30 07:50:36 CET,Tue Nov 30 09:22:40 CET,0.0 2.351 2.873 3.274 3.6 3.859 4.087 4.305 4.709 4.883 5.037 5.322 5.433 5.568 5.843 6.11 6.339 6.447 6.671 6.886 7.186 7.38 7.556 7.806 8.062 8.291 8.519 8.754 9.044 9.28 9.48 9.733 9.991 10.226 10.458 10.716 10.956 11.206 11.506 11.857 12.158 12.456 12.86 13.229 13.59 13.947 14.334 14.701 15.033 15.311 15.328 14.978 14.54 14.089 13.654 13.231 12.846 12.474 12.136 11.806 11.496 11.145 10.804 10.507 10.199 9.905 9.575 9.289 9.072 8.818 8.533 8.307 8.088 7.872 7.71 7.521 7.309 7.11 6.906 6.772 6.629 6.37 6.189 5.998 5.895 5.676 5.446 5.209 5.085 4.962 4.642 4.491 4.339 3.983 3.777 3.535 3.25 2.946 2.539 1.981 -0.583 -7 ,30597 ,TETRA ,17617443,Tue Nov 30 07:51:38 CET,Tue Nov 30 09:39:02 CET,0.0 1.441 1.894 2.223 2.5 2.752 2.993 3.227 3.649 3.827 3.999 4.346 4.478 4.621 4.899 5.154 5.385 5.494 5.722 5.947 6.238 6.402 6.559 6.815 7.055 7.262 7.476 7.708 8.014 8.301 8.55 8.838 9.098 9.327 9.588 9.884 10.18 10.458 10.716 10.989 11.281 11.587 11.902 12.197 12.568 12.991 13.382 13.748 14.062 14.238 14.193 13.728 13.112 12.545 11.949 11.313 10.78 10.293 9.818 9.331 8.935 8.59 8.227 7.897 7.612 7.335 7.056 6.81 6.591 6.371 6.144 5.943 5.723 5.493 5.309 5.114 4.895 4.654 4.409 4.241 4.077 3.824 3.631 3.431 3.329 3.092 2.831 2.555 2.413 2.277 1.954 1.809 1.649 1.274 1.057 0.81 0.55 0.258 -0.095 -0.55 -3.082 -8 ,29797 ,TETRA ,17617444,Tue Nov 30 07:51:40 CET,Tue Nov 30 09:39:03 CET,0.0 2.4 3.037 3.463 3.772 4.031 4.277 4.517 4.929 5.114 5.298 5.649 5.789 5.931 6.2 6.471 6.729 6.839 7.035 7.235 7.508 7.672 7.825 8.044 8.257 8.473 8.675 8.859 9.104 9.359 9.599 9.87 10.125 10.351 10.589 10.871 11.144 11.426 11.725 12.033 12.319 12.638 13.074 13.483 13.903 14.341 14.743 15.14 15.515 15.815 15.869 15.473 14.929 14.28 13.677 13.137 12.622 12.094 11.652 11.249 10.872 10.524 10.202 9.906 9.642 9.402 9.12 8.86 8.629 8.346 8.018 7.745 7.47 7.171 6.938 6.705 6.464 6.221 5.967 5.787 5.602 5.317 5.124 4.917 4.809 4.593 4.36 4.119 3.99 3.872 3.585 3.439 3.269 2.873 2.647 2.415 2.179 1.896 1.541 1.093 -0.616 -9 ,19896 ,TETRA ,17617445,Tue Nov 30 07:53:40 CET,Tue Nov 30 09:27:52 CET,0.0 1.936 2.465 2.878 3.197 3.479 3.743 3.973 4.393 4.578 4.749 5.115 5.255 5.395 5.676 5.927 6.157 6.274 6.517 6.745 7.045 7.229 7.41 7.685 7.93 8.144 8.355 8.56 8.824 9.072 9.308 9.59 9.844 10.088 10.389 10.722 11.026 11.393 11.761 12.095 12.484 12.928 13.355 13.731 14.139 14.548 14.938 15.305 15.677 15.934 15.967 15.603 15.065 14.515 13.966 13.44 12.967 12.513 12.098 11.668 11.301 10.971 10.637 10.34 10.06 9.785 9.484 9.163 8.908 8.662 8.387 8.151 7.879 7.586 7.368 7.15 6.925 6.688 6.426 6.253 6.097 5.847 5.658 5.452 5.331 5.063 4.794 4.523 4.387 4.269 4.001 3.855 3.682 3.274 3.049 2.795 2.512 2.196 1.804 1.246 -1.434 -10 ,9429 ,TETRA ,17617446,Tue Nov 30 07:55:45 CET,Tue Nov 30 09:35:06 CET,0.0 2.044 2.582 2.967 3.296 3.625 3.942 4.195 4.584 4.748 4.898 5.205 5.332 5.464 5.704 5.94 6.165 6.274 6.5 6.705 7.002 7.208 7.39 7.644 7.883 8.105 8.286 8.466 8.749 9.035 9.291 9.541 9.757 9.97 10.192 10.441 10.698 10.959 11.216 11.486 11.765 12.068 12.393 12.705 13.052 13.437 13.84 14.197 14.564 14.88 14.929 14.571 14.149 13.7 13.22 12.753 12.335 11.939 11.583 11.217 10.875 10.535 10.197 9.896 9.629 9.378 9.099 8.789 8.48 8.176 7.854 7.599 7.338 7.055 6.852 6.644 6.423 6.184 5.916 5.733 5.556 5.266 5.043 4.8 4.675 4.416 4.141 3.877 3.753 3.633 3.325 3.179 3.026 2.672 2.471 2.254 2.003 1.706 1.348 0.816 -1.296 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_289_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_289_231.txt deleted file mode 100644 index 54564d0b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_289_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27762 ,TETRA ,17617447,Tue Nov 30 07:55:46 CET,Tue Nov 30 09:43:31 CET,0.0 0.756 1.068 1.311 1.518 1.691 1.855 2.017 2.283 2.391 2.495 2.567 2.854 2.975 3.181 3.376 3.557 3.639 3.796 3.965 4.218 4.386 4.545 4.765 4.97 5.155 5.333 5.503 5.72 5.964 6.206 6.48 6.733 6.953 7.199 7.478 7.755 8.068 8.401 8.74 9.118 9.579 10.117 10.655 11.297 11.997 12.781 13.685 14.746 16.058 17.756 19.091 19.823 20.29 20.594 20.802 20.909 20.924 20.854 20.734 20.648 20.563 20.457 20.356 20.278 20.212 20.136 20.053 19.947 19.827 19.727 19.633 19.527 19.41 19.318 19.233 19.131 19.027 18.897 18.776 18.655 18.468 18.324 18.184 18.113 17.975 17.855 17.723 17.656 17.436 17.386 17.294 17.202 16.989 16.867 16.735 16.589 16.425 16.23 15.955 15.056 -2 ,14306 ,TETRA ,17617448,Tue Nov 30 07:55:48 CET,Tue Nov 30 09:43:36 CET,0.0 0.771 1.062 1.293 1.477 1.633 1.79 1.937 2.175 2.291 2.407 2.444 2.694 2.794 2.981 3.166 3.345 3.431 3.611 3.791 4.036 4.18 4.331 4.565 4.787 4.994 5.175 5.333 5.534 5.757 6.012 6.324 6.611 6.857 7.109 7.397 7.676 7.989 8.338 8.705 9.106 9.588 10.115 10.613 11.216 11.89 12.679 13.616 14.676 15.906 17.444 18.738 19.477 19.889 20.161 20.355 20.469 20.528 20.565 20.589 20.58 20.544 20.478 20.417 20.363 20.262 20.141 20.055 19.948 19.809 19.686 19.597 19.495 19.368 19.248 19.115 18.985 18.843 18.683 18.571 18.46 18.298 18.195 18.073 18.001 17.869 17.738 17.588 17.513 17.314 17.314 17.217 17.116 16.911 16.796 16.676 16.528 16.35 16.144 15.892 15.177 -3 ,11007 ,TETRA ,17617449,Tue Nov 30 07:57:37 CET,Tue Nov 30 09:27:30 CET,0.0 0.97 1.277 1.516 1.723 1.897 2.047 2.192 2.435 2.557 2.685 2.774 3.056 3.167 3.361 3.543 3.716 3.805 3.988 4.157 4.399 4.552 4.701 4.915 5.113 5.302 5.481 5.668 5.913 6.129 6.34 6.599 6.85 7.137 7.482 7.845 8.175 8.497 8.841 9.206 9.616 10.103 10.687 11.249 11.875 12.601 13.455 14.423 15.547 16.921 18.617 19.962 20.738 21.203 21.462 21.577 21.605 21.63 21.634 21.62 21.607 21.572 21.508 21.402 21.272 21.139 21.001 20.893 20.809 20.723 20.605 20.481 20.347 20.208 20.11 20.031 19.946 19.842 19.726 19.632 19.53 19.393 19.308 19.214 19.168 19.076 18.975 18.863 18.786 18.568 18.582 18.504 18.422 18.201 18.054 17.891 17.703 17.485 17.265 17.013 16.367 -4 ,18353 ,TETRA ,17617450,Tue Nov 30 07:59:37 CET,Tue Nov 30 09:48:15 CET,0.0 0.943 1.288 1.517 1.709 1.884 2.052 2.202 2.471 2.609 2.741 2.82 3.093 3.196 3.385 3.567 3.751 3.839 4.005 4.164 4.387 4.541 4.696 4.917 5.136 5.352 5.556 5.762 6.058 6.32 6.522 6.761 6.999 7.242 7.525 7.825 8.131 8.489 8.898 9.313 9.712 10.18 10.728 11.274 11.927 12.645 13.488 14.46 15.532 16.803 18.46 19.765 20.52 20.997 21.259 21.432 21.544 21.526 21.469 21.451 21.439 21.414 21.31 21.152 21.054 20.997 20.919 20.838 20.758 20.668 20.567 20.464 20.364 20.278 20.208 20.132 20.036 19.93 19.833 19.764 19.676 19.53 19.432 19.326 19.273 19.175 19.07 18.933 18.847 18.621 18.606 18.517 18.425 18.208 18.08 17.939 17.774 17.592 17.397 17.142 16.252 -5 ,26759 ,TETRA ,17617451,Tue Nov 30 08:00:39 CET,Tue Nov 30 09:50:37 CET,0.0 0.973 1.353 1.594 1.817 2.028 2.203 2.371 2.67 2.799 2.929 3.042 3.342 3.469 3.677 3.849 4.014 4.106 4.29 4.453 4.692 4.857 5.013 5.238 5.44 5.623 5.817 5.997 6.224 6.456 6.665 6.929 7.184 7.398 7.648 7.926 8.202 8.518 8.855 9.215 9.596 10.014 10.495 11.012 11.667 12.404 13.211 14.11 15.219 16.553 18.109 19.372 20.15 20.657 20.967 21.16 21.262 21.199 21.123 21.112 21.074 21.037 20.996 20.943 20.872 20.757 20.609 20.483 20.386 20.307 20.238 20.172 20.053 19.902 19.791 19.658 19.518 19.392 19.278 19.203 19.104 18.939 18.838 18.746 18.7 18.612 18.524 18.425 18.367 18.154 18.141 18.053 17.96 17.742 17.617 17.472 17.305 17.113 16.877 16.589 15.683 -6 ,687 ,TETRA ,17617452,Tue Nov 30 08:02:36 CET,Tue Nov 30 09:49:48 CET,0.0 0.46 0.682 0.855 1.018 1.182 1.352 1.515 1.818 1.958 2.085 2.16 2.433 2.537 2.731 2.915 3.091 3.179 3.359 3.532 3.771 3.924 4.072 4.279 4.48 4.674 4.848 5.01 5.224 5.443 5.669 5.932 6.166 6.386 6.649 6.953 7.262 7.64 8.068 8.514 8.955 9.424 9.987 10.609 11.373 12.146 12.972 13.914 14.998 16.263 17.859 19.136 19.826 20.255 20.511 20.67 20.741 20.749 20.759 20.76 20.736 20.703 20.628 20.542 20.452 20.345 20.229 20.117 20.019 19.917 19.778 19.658 19.557 19.459 19.382 19.299 19.218 19.116 18.977 18.876 18.787 18.66 18.569 18.486 18.444 18.34 18.198 18.025 17.939 17.718 17.716 17.639 17.531 17.268 17.133 16.981 16.839 16.687 16.504 16.259 15.596 -7 ,16112 ,TETRA ,17617453,Tue Nov 30 08:02:39 CET,Tue Nov 30 09:50:10 CET,0.0 0.944 1.238 1.46 1.647 1.816 1.957 2.079 2.325 2.454 2.59 2.679 2.938 3.035 3.236 3.444 3.642 3.731 3.892 4.04 4.252 4.384 4.517 4.718 4.906 5.079 5.249 5.407 5.602 5.825 6.083 6.392 6.672 6.933 7.223 7.551 7.847 8.161 8.508 8.894 9.308 9.776 10.346 10.891 11.502 12.215 13.033 13.955 15.063 16.344 17.883 19.202 20.0 20.488 20.799 20.99 21.08 21.117 21.114 21.094 21.073 21.042 21.0 20.944 20.843 20.752 20.635 20.481 20.375 20.301 20.22 20.137 20.055 19.972 19.899 19.829 19.757 19.673 19.575 19.51 19.447 19.331 19.248 19.166 19.115 18.987 18.85 18.718 18.655 18.45 18.459 18.391 18.32 18.183 18.097 17.983 17.854 17.712 17.527 17.267 16.471 -8 ,14585 ,TETRA ,17617454,Tue Nov 30 08:03:36 CET,Tue Nov 30 09:51:04 CET,0.0 0.703 1.002 1.243 1.439 1.618 1.798 1.958 2.234 2.35 2.46 2.515 2.771 2.863 3.05 3.233 3.404 3.483 3.635 3.77 3.975 4.128 4.298 4.546 4.778 5.007 5.218 5.417 5.684 5.949 6.194 6.459 6.689 6.895 7.146 7.426 7.715 8.047 8.388 8.759 9.151 9.597 10.128 10.671 11.319 12.06 12.936 13.917 15.036 16.373 17.955 19.171 19.839 20.247 20.499 20.661 20.749 20.805 20.821 20.791 20.756 20.729 20.688 20.61 20.525 20.459 20.381 20.301 20.228 20.13 19.994 19.906 19.843 19.745 19.648 19.556 19.47 19.384 19.288 19.211 19.121 18.995 18.916 18.827 18.779 18.663 18.539 18.404 18.33 18.107 18.069 17.976 17.883 17.684 17.583 17.482 17.36 17.217 17.02 16.742 15.866 -9 ,26218 ,TETRA ,17617455,Tue Nov 30 08:03:36 CET,Tue Nov 30 09:50:27 CET,0.0 0.892 1.211 1.482 1.708 1.897 2.059 2.219 2.53 2.677 2.813 2.874 3.15 3.26 3.473 3.666 3.839 3.92 4.064 4.201 4.427 4.578 4.722 4.927 5.117 5.307 5.489 5.664 5.89 6.106 6.355 6.657 6.893 7.117 7.392 7.704 7.999 8.332 8.692 9.068 9.484 9.972 10.526 11.075 11.704 12.378 13.164 14.103 15.225 16.572 18.218 19.56 20.357 20.843 21.118 21.286 21.394 21.45 21.455 21.445 21.408 21.374 21.345 21.253 21.161 21.093 20.958 20.831 20.755 20.636 20.504 20.426 20.308 20.146 20.037 19.949 19.856 19.746 19.618 19.524 19.428 19.294 19.21 19.124 19.079 18.973 18.85 18.714 18.644 18.419 18.392 18.281 18.169 17.927 17.781 17.628 17.474 17.281 17.036 16.746 16.033 -10 ,20088 ,TETRA ,17617456,Tue Nov 30 08:03:38 CET,Tue Nov 30 09:53:19 CET,0.0 0.914 1.251 1.517 1.743 1.926 2.082 2.222 2.481 2.625 2.775 2.861 3.114 3.209 3.407 3.586 3.767 3.865 4.034 4.182 4.411 4.563 4.705 4.898 5.08 5.271 5.469 5.671 5.919 6.132 6.329 6.554 6.784 7.017 7.285 7.593 7.873 8.194 8.541 8.894 9.292 9.738 10.257 10.799 11.432 12.146 13.012 13.986 15.079 16.355 17.939 19.262 19.995 20.436 20.702 20.847 20.927 20.976 20.983 20.961 20.927 20.879 20.827 20.758 20.665 20.556 20.439 20.35 20.256 20.111 19.973 19.893 19.794 19.688 19.607 19.518 19.415 19.3 19.192 19.118 19.018 18.85 18.729 18.597 18.534 18.423 18.296 18.154 18.079 17.845 17.785 17.677 17.571 17.325 17.187 17.044 16.863 16.655 16.436 16.14 15.092 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_289_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_289_336.txt deleted file mode 100644 index c5fc8676..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_289_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28987 ,TETRA ,17617457,Tue Nov 30 08:04:36 CET,Tue Nov 30 09:52:42 CET,0.0 0.769 0.959 1.065 1.152 1.211 1.256 1.3 1.387 1.418 1.439 1.299 1.459 1.456 1.449 1.448 1.438 1.418 1.367 1.309 1.205 1.136 1.066 0.959 0.871 0.777 0.673 0.56 0.406 0.27 0.107 -0.106 -0.33 -0.594 -0.874 -1.206 -1.607 -2.074 -2.582 -3.149 -3.795 -4.603 -5.623 -6.722 -8.118 -9.85 -12.079 -14.849 -18.547 -23.684 -31.239 -39.125 -44.985 -49.583 -53.249 -56.324 -58.942 -61.198 -63.04 -64.803 -66.241 -67.515 -68.676 -69.708 -70.65 -71.483 -72.321 -73.049 -73.691 -74.366 -75.032 -75.545 -76.095 -76.671 -77.078 -77.507 -77.958 -78.417 -78.885 -79.191 -79.492 -79.935 -80.241 -80.549 -80.705 -81.056 -81.44 -81.84 -82.039 -82.483 -82.638 -82.848 -83.061 -83.538 -83.79 -84.044 -84.305 -84.578 -84.873 -85.23 -86.303 -2 ,10986 ,TETRA ,17617458,Tue Nov 30 08:04:37 CET,Tue Nov 30 09:51:36 CET,0.0 0.428 0.596 0.744 0.839 0.89 0.924 0.977 1.081 1.122 1.156 1.041 1.228 1.25 1.277 1.294 1.295 1.303 1.314 1.284 1.218 1.167 1.113 1.038 0.93 0.814 0.69 0.566 0.404 0.228 0.049 -0.19 -0.451 -0.719 -1.01 -1.325 -1.672 -2.107 -2.578 -3.113 -3.765 -4.558 -5.549 -6.648 -8.043 -9.731 -11.896 -14.649 -18.352 -23.459 -30.965 -38.933 -44.869 -49.508 -53.239 -56.385 -58.981 -61.239 -63.139 -64.891 -66.304 -67.563 -68.754 -69.85 -70.829 -71.657 -72.487 -73.261 -73.944 -74.612 -75.274 -75.821 -76.393 -76.966 -77.402 -77.862 -78.318 -78.791 -79.294 -79.628 -79.98 -80.541 -80.906 -81.258 -81.44 -81.806 -82.224 -82.732 -83.003 -83.565 -83.845 -84.132 -84.412 -85.006 -85.34 -85.695 -86.053 -86.465 -86.952 -87.541 -89.011 -3 ,537 ,TETRA ,17617459,Tue Nov 30 08:04:36 CET,Tue Nov 30 09:51:06 CET,0.0 0.766 0.936 1.044 1.118 1.169 1.203 1.224 1.242 1.256 1.263 1.099 1.265 1.266 1.264 1.264 1.251 1.241 1.23 1.222 1.193 1.168 1.12 1.045 0.996 0.917 0.81 0.703 0.552 0.375 0.189 -0.055 -0.303 -0.55 -0.865 -1.233 -1.601 -2.043 -2.561 -3.158 -3.819 -4.626 -5.665 -6.782 -8.193 -9.904 -12.085 -14.839 -18.433 -23.365 -30.753 -38.605 -44.436 -48.99 -52.645 -55.703 -58.228 -60.412 -62.205 -63.91 -65.307 -66.54 -67.691 -68.712 -69.637 -70.453 -71.276 -72.017 -72.646 -73.279 -73.928 -74.446 -74.968 -75.499 -75.906 -76.325 -76.758 -77.196 -77.634 -77.933 -78.235 -78.694 -79.009 -79.333 -79.499 -79.829 -80.181 -80.561 -80.756 -81.209 -81.363 -81.578 -81.809 -82.263 -82.499 -82.758 -83.035 -83.318 -83.638 -84.018 -84.824 -4 ,26196 ,TETRA ,17617460,Tue Nov 30 08:04:35 CET,Tue Nov 30 09:50:51 CET,0.0 0.48 0.686 0.844 0.941 1.006 1.06 1.124 1.282 1.341 1.375 1.234 1.402 1.423 1.456 1.464 1.447 1.436 1.404 1.36 1.319 1.302 1.265 1.184 1.119 1.049 0.943 0.815 0.646 0.468 0.29 0.111 -0.066 -0.297 -0.577 -0.914 -1.285 -1.724 -2.247 -2.834 -3.499 -4.328 -5.319 -6.396 -7.814 -9.516 -11.704 -14.462 -18.052 -23.039 -30.472 -38.395 -44.295 -49.008 -52.732 -55.726 -58.208 -60.332 -62.105 -63.852 -65.318 -66.582 -67.731 -68.778 -69.718 -70.548 -71.391 -72.115 -72.729 -73.366 -74.025 -74.553 -75.092 -75.66 -76.083 -76.52 -76.982 -77.442 -77.912 -78.224 -78.544 -79.046 -79.383 -79.729 -79.907 -80.258 -80.61 -80.965 -81.156 -81.608 -81.761 -81.973 -82.186 -82.64 -82.877 -83.124 -83.405 -83.722 -84.07 -84.49 -85.659 -5 ,30165 ,TETRA ,17617461,Tue Nov 30 08:04:36 CET,Tue Nov 30 09:52:46 CET,0.0 0.639 0.832 0.968 1.066 1.135 1.178 1.206 1.263 1.277 1.283 1.119 1.271 1.277 1.291 1.285 1.273 1.264 1.241 1.211 1.137 1.096 1.053 0.951 0.835 0.731 0.645 0.539 0.372 0.205 0.029 -0.186 -0.403 -0.63 -0.925 -1.281 -1.646 -2.084 -2.588 -3.192 -3.871 -4.645 -5.637 -6.757 -8.15 -9.839 -11.998 -14.714 -18.336 -23.319 -30.715 -38.476 -44.315 -48.924 -52.499 -55.446 -57.891 -60.002 -61.771 -63.486 -64.936 -66.19 -67.323 -68.402 -69.391 -70.23 -71.111 -71.898 -72.548 -73.209 -73.897 -74.452 -75.001 -75.588 -76.032 -76.47 -76.93 -77.386 -77.836 -78.157 -78.481 -78.988 -79.351 -79.713 -79.887 -80.224 -80.571 -80.942 -81.141 -81.609 -81.812 -82.049 -82.288 -82.77 -83.029 -83.317 -83.634 -83.976 -84.36 -84.859 -86.469 -6 ,12841 ,TETRA ,17617462,Tue Nov 30 08:05:36 CET,Tue Nov 30 09:54:16 CET,0.0 0.709 0.91 1.057 1.195 1.275 1.343 1.4 1.454 1.47 1.481 1.319 1.479 1.486 1.5 1.52 1.53 1.524 1.504 1.479 1.415 1.361 1.301 1.221 1.146 1.05 0.957 0.854 0.685 0.536 0.424 0.254 0.058 -0.145 -0.396 -0.696 -1.048 -1.49 -2.005 -2.6 -3.279 -4.085 -5.091 -6.203 -7.624 -9.357 -11.537 -14.28 -17.963 -23.078 -30.549 -38.319 -44.086 -48.585 -52.21 -55.28 -57.802 -59.967 -61.743 -63.438 -64.84 -66.05 -67.16 -68.155 -69.07 -69.892 -70.714 -71.419 -72.032 -72.688 -73.334 -73.833 -74.358 -74.883 -75.273 -75.68 -76.118 -76.597 -77.09 -77.414 -77.734 -78.221 -78.541 -78.845 -78.998 -79.332 -79.675 -80.009 -80.195 -80.65 -80.818 -81.034 -81.244 -81.648 -81.866 -82.116 -82.392 -82.692 -83.025 -83.455 -84.609 -7 ,12134 ,TETRA ,17617463,Tue Nov 30 08:05:36 CET,Tue Nov 30 09:54:36 CET,0.0 0.486 0.663 0.828 0.951 1.035 1.103 1.15 1.195 1.214 1.237 1.09 1.244 1.245 1.243 1.234 1.222 1.205 1.156 1.11 1.031 0.975 0.929 0.852 0.734 0.601 0.479 0.356 0.175 -0.014 -0.212 -0.467 -0.727 -0.986 -1.304 -1.682 -2.091 -2.567 -3.053 -3.561 -4.182 -5.01 -6.069 -7.215 -8.676 -10.488 -12.74 -15.571 -19.342 -24.451 -32.067 -40.111 -46.059 -50.684 -54.387 -57.485 -60.029 -62.198 -63.984 -65.709 -67.124 -68.361 -69.504 -70.531 -71.493 -72.369 -73.23 -73.96 -74.579 -75.196 -75.8 -76.3 -76.847 -77.409 -77.819 -78.22 -78.643 -79.085 -79.509 -79.788 -80.096 -80.587 -80.922 -81.282 -81.462 -81.798 -82.136 -82.503 -82.69 -83.125 -83.252 -83.441 -83.656 -84.145 -84.388 -84.642 -84.93 -85.241 -85.58 -86.028 -86.99 -8 ,16478 ,TETRA ,17617464,Tue Nov 30 08:05:35 CET,Tue Nov 30 09:53:53 CET,0.0 0.429 0.582 0.709 0.804 0.868 0.925 0.971 1.046 1.081 1.108 0.999 1.184 1.209 1.214 1.197 1.174 1.154 1.105 1.055 0.987 0.937 0.892 0.843 0.761 0.668 0.581 0.495 0.396 0.278 0.131 -0.072 -0.251 -0.44 -0.735 -1.104 -1.483 -1.937 -2.451 -3.04 -3.71 -4.503 -5.48 -6.548 -7.935 -9.635 -11.811 -14.565 -18.191 -23.22 -30.686 -38.518 -44.262 -48.767 -52.45 -55.553 -58.075 -60.208 -61.962 -63.648 -65.05 -66.234 -67.303 -68.286 -69.228 -70.077 -70.928 -71.686 -72.336 -72.986 -73.605 -74.093 -74.624 -75.187 -75.6 -76.003 -76.43 -76.871 -77.303 -77.594 -77.898 -78.378 -78.7 -79.03 -79.196 -79.535 -79.897 -80.289 -80.511 -81.041 -81.276 -81.544 -81.814 -82.395 -82.702 -82.996 -83.304 -83.644 -84.034 -84.503 -85.697 -9 ,1947 ,TETRA ,17617465,Tue Nov 30 08:05:36 CET,Tue Nov 30 09:54:05 CET,0.0 1.125 1.381 1.546 1.679 1.758 1.815 1.857 1.91 1.937 1.967 1.833 2.018 2.032 2.026 2.014 2.014 2.016 2.004 1.968 1.891 1.832 1.776 1.684 1.575 1.468 1.366 1.265 1.135 0.987 0.805 0.556 0.301 0.049 -0.262 -0.641 -1.027 -1.465 -1.967 -2.568 -3.25 -4.06 -5.061 -6.143 -7.525 -9.219 -11.387 -14.104 -17.663 -22.573 -29.924 -37.723 -43.538 -48.091 -51.689 -54.687 -57.177 -59.331 -61.131 -62.86 -64.289 -65.53 -66.686 -67.737 -68.692 -69.553 -70.434 -71.242 -71.916 -72.569 -73.232 -73.777 -74.333 -74.881 -75.302 -75.747 -76.214 -76.699 -77.168 -77.469 -77.782 -78.284 -78.633 -78.986 -79.162 -79.51 -79.872 -80.236 -80.415 -80.855 -81.018 -81.238 -81.484 -82.009 -82.277 -82.54 -82.814 -83.129 -83.505 -83.967 -85.067 -10 ,7781 ,TETRA ,17617466,Tue Nov 30 08:05:36 CET,Tue Nov 30 09:53:50 CET,0.0 0.479 0.64 0.75 0.843 0.912 0.977 1.036 1.143 1.198 1.254 1.161 1.337 1.347 1.382 1.415 1.421 1.407 1.364 1.338 1.334 1.342 1.337 1.28 1.2 1.116 1.034 0.942 0.784 0.649 0.54 0.348 0.107 -0.106 -0.367 -0.735 -1.122 -1.572 -2.072 -2.631 -3.28 -4.075 -5.072 -6.135 -7.506 -9.23 -11.445 -14.275 -18.025 -23.139 -30.73 -38.645 -44.503 -49.136 -52.821 -55.865 -58.37 -60.531 -62.33 -64.076 -65.506 -66.734 -67.877 -68.915 -69.843 -70.696 -71.595 -72.354 -73.004 -73.658 -74.289 -74.804 -75.329 -75.87 -76.282 -76.696 -77.131 -77.598 -78.071 -78.38 -78.701 -79.18 -79.509 -79.853 -80.02 -80.365 -80.721 -81.093 -81.284 -81.731 -81.887 -82.093 -82.326 -82.833 -83.094 -83.363 -83.645 -83.945 -84.277 -84.669 -85.695 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_164.txt deleted file mode 100644 index 3684fa9c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3139 ,TETRA ,17617467,Tue Nov 30 08:05:37 CET,Tue Nov 30 09:54:21 CET,0.0 0.795 1.042 1.22 1.356 1.464 1.541 1.563 1.526 1.509 1.49 1.437 1.383 1.345 1.274 1.19 1.083 1.029 0.912 0.791 0.609 0.477 0.338 0.122 -0.087 -0.303 -0.532 -0.761 -1.09 -1.434 -1.766 -2.184 -2.621 -3.066 -3.613 -4.261 -4.926 -5.699 -6.565 -7.55 -8.667 -10.008 -11.681 -13.482 -15.755 -18.509 -21.992 -26.384 -32.196 -40.104 -51.587 -63.685 -72.631 -79.499 -84.882 -89.375 -93.064 -96.208 -98.807 -101.288 -103.329 -105.077 -106.707 -108.223 -109.596 -110.812 -112.058 -113.141 -114.044 -114.967 -115.932 -116.695 -117.45 -118.211 -118.793 -119.397 -120.007 -120.613 -121.238 -121.668 -122.106 -122.798 -123.271 -123.736 -123.967 -124.445 -124.937 -125.441 -125.708 -126.091 -126.551 -126.846 -127.161 -127.864 -128.224 -128.582 -128.979 -129.438 -129.948 -130.603 -132.914 -2 ,7042 ,TETRA ,17617468,Tue Nov 30 08:05:37 CET,Tue Nov 30 09:55:05 CET,0.0 0.781 0.994 1.137 1.253 1.313 1.355 1.39 1.45 1.478 1.496 1.524 1.503 1.482 1.441 1.402 1.335 1.287 1.208 1.125 0.966 0.852 0.736 0.565 0.391 0.206 0.008 -0.201 -0.504 -0.817 -1.14 -1.559 -1.972 -2.388 -2.913 -3.517 -4.13 -4.863 -5.691 -6.637 -7.717 -9.0 -10.603 -12.331 -14.535 -17.266 -20.693 -24.964 -30.609 -38.447 -50.202 -62.525 -71.54 -78.522 -84.029 -88.607 -92.395 -95.633 -98.296 -100.854 -103.005 -104.856 -106.55 -108.092 -109.48 -110.706 -111.911 -112.96 -113.859 -114.785 -115.741 -116.504 -117.27 -118.06 -118.657 -119.252 -119.878 -120.539 -121.2 -121.64 -122.087 -122.747 -123.185 -123.634 -123.86 -124.311 -124.761 -125.223 -125.471 -125.846 -126.277 -126.552 -126.84 -127.443 -127.778 -128.138 -128.509 -128.927 -129.419 -130.059 -131.607 -3 ,20084 ,TETRA ,17617469,Tue Nov 30 08:05:37 CET,Tue Nov 30 09:55:00 CET,0.0 0.785 1.008 1.151 1.236 1.305 1.358 1.392 1.417 1.41 1.399 1.368 1.314 1.272 1.194 1.13 1.061 1.013 0.908 0.8 0.629 0.514 0.392 0.192 -0.003 -0.193 -0.397 -0.62 -0.933 -1.266 -1.595 -2.003 -2.444 -2.903 -3.449 -4.098 -4.746 -5.492 -6.362 -7.337 -8.44 -9.809 -11.528 -13.337 -15.59 -18.355 -21.849 -26.181 -31.953 -39.889 -51.585 -63.768 -72.642 -79.51 -84.949 -89.486 -93.23 -96.458 -99.107 -101.64 -103.731 -105.53 -107.201 -108.721 -110.083 -111.292 -112.509 -113.542 -114.414 -115.315 -116.23 -116.966 -117.711 -118.472 -119.055 -119.648 -120.253 -120.864 -121.489 -121.912 -122.336 -122.972 -123.385 -123.822 -124.057 -124.533 -125.038 -125.572 -125.837 -126.209 -126.626 -126.904 -127.224 -127.907 -128.259 -128.641 -129.053 -129.539 -130.097 -130.737 -132.277 -4 ,8163 ,TETRA ,17617470,Tue Nov 30 08:05:37 CET,Tue Nov 30 09:54:17 CET,0.0 0.522 0.712 0.86 0.964 1.019 1.042 1.046 1.03 1.031 1.031 0.984 0.924 0.882 0.78 0.661 0.543 0.488 0.381 0.27 0.101 -0.037 -0.191 -0.411 -0.636 -0.874 -1.116 -1.357 -1.693 -2.019 -2.334 -2.76 -3.205 -3.654 -4.191 -4.829 -5.497 -6.271 -7.136 -8.111 -9.215 -10.541 -12.242 -14.081 -16.339 -19.037 -22.407 -26.728 -32.532 -40.44 -52.101 -64.215 -73.144 -80.04 -85.476 -90.016 -93.742 -96.927 -99.58 -102.08 -104.131 -105.913 -107.54 -109.031 -110.394 -111.613 -112.829 -113.901 -114.805 -115.708 -116.626 -117.36 -118.105 -118.858 -119.425 -120.007 -120.605 -121.204 -121.81 -122.226 -122.659 -123.321 -123.762 -124.219 -124.456 -124.936 -125.432 -125.943 -126.203 -126.573 -127.015 -127.312 -127.624 -128.257 -128.577 -128.929 -129.349 -129.797 -130.297 -130.924 -132.443 -5 ,26869 ,TETRA ,17617471,Tue Nov 30 08:05:37 CET,Tue Nov 30 09:53:19 CET,0.0 0.767 0.984 1.129 1.218 1.269 1.301 1.311 1.32 1.322 1.313 1.285 1.231 1.191 1.125 1.043 0.956 0.907 0.801 0.711 0.564 0.453 0.339 0.148 -0.066 -0.28 -0.501 -0.728 -1.028 -1.339 -1.657 -2.051 -2.463 -2.903 -3.436 -4.079 -4.74 -5.482 -6.323 -7.285 -8.373 -9.701 -11.377 -13.216 -15.573 -18.407 -21.965 -26.525 -32.634 -40.92 -52.997 -65.319 -74.067 -80.687 -85.962 -90.399 -94.103 -97.289 -99.882 -102.368 -104.436 -106.193 -107.811 -109.298 -110.625 -111.816 -113.028 -114.052 -114.919 -115.81 -116.709 -117.447 -118.207 -118.986 -119.579 -120.17 -120.765 -121.368 -121.973 -122.389 -122.82 -123.474 -123.923 -124.373 -124.599 -125.077 -125.589 -126.115 -126.386 -126.764 -127.193 -127.474 -127.746 -128.349 -128.687 -129.053 -129.452 -129.869 -130.331 -130.904 -132.074 -6 ,32684 ,TETRA ,17617472,Tue Nov 30 08:05:37 CET,Tue Nov 30 09:54:29 CET,0.0 0.768 0.969 1.09 1.201 1.299 1.374 1.429 1.502 1.515 1.518 1.543 1.521 1.487 1.396 1.308 1.209 1.15 1.042 0.944 0.78 0.659 0.527 0.33 0.13 -0.084 -0.308 -0.539 -0.843 -1.142 -1.464 -1.887 -2.306 -2.729 -3.243 -3.855 -4.491 -5.244 -6.107 -7.076 -8.18 -9.545 -11.261 -13.071 -15.306 -18.015 -21.462 -25.818 -31.62 -39.45 -50.909 -62.888 -71.672 -78.642 -84.175 -88.739 -92.555 -95.88 -98.647 -101.285 -103.432 -105.268 -106.974 -108.555 -109.98 -111.207 -112.416 -113.47 -114.366 -115.271 -116.193 -116.937 -117.695 -118.468 -119.039 -119.609 -120.196 -120.795 -121.419 -121.841 -122.257 -122.905 -123.354 -123.804 -124.023 -124.46 -124.91 -125.388 -125.635 -125.987 -126.379 -126.646 -126.917 -127.469 -127.762 -128.083 -128.457 -128.874 -129.334 -129.899 -131.565 -7 ,5924 ,TETRA ,17617473,Tue Nov 30 08:05:38 CET,Tue Nov 30 09:54:53 CET,0.0 0.581 0.801 0.964 1.072 1.153 1.196 1.215 1.239 1.241 1.235 1.215 1.177 1.154 1.088 1.017 0.932 0.889 0.804 0.709 0.554 0.435 0.305 0.107 -0.096 -0.294 -0.484 -0.678 -0.962 -1.247 -1.542 -1.933 -2.348 -2.773 -3.287 -3.908 -4.556 -5.309 -6.179 -7.15 -8.202 -9.443 -11.036 -12.824 -15.093 -17.84 -21.292 -25.62 -31.277 -38.96 -50.228 -61.932 -70.556 -77.268 -82.574 -86.969 -90.62 -93.831 -96.534 -99.083 -101.112 -102.849 -104.466 -105.935 -107.267 -108.46 -109.701 -110.792 -111.678 -112.562 -113.486 -114.275 -115.078 -115.886 -116.524 -117.183 -117.844 -118.515 -119.196 -119.641 -120.096 -120.824 -121.312 -121.812 -122.064 -122.568 -123.096 -123.653 -123.94 -124.342 -124.825 -125.119 -125.434 -126.135 -126.49 -126.879 -127.311 -127.77 -128.276 -128.884 -130.049 -8 ,513 ,TETRA ,17617474,Tue Nov 30 08:05:38 CET,Tue Nov 30 09:55:08 CET,0.0 0.696 0.862 0.913 0.928 0.968 1.006 1.008 0.982 0.971 0.963 0.952 0.898 0.849 0.764 0.668 0.561 0.508 0.403 0.306 0.148 0.035 -0.069 -0.24 -0.442 -0.66 -0.887 -1.121 -1.445 -1.776 -2.105 -2.518 -2.946 -3.386 -3.933 -4.588 -5.261 -6.037 -6.926 -7.952 -9.075 -10.364 -11.989 -13.783 -16.051 -18.817 -22.282 -26.613 -32.364 -40.179 -51.618 -63.588 -72.477 -79.327 -84.687 -89.149 -92.83 -96.021 -98.682 -101.252 -103.333 -105.066 -106.672 -108.14 -109.444 -110.589 -111.761 -112.826 -113.739 -114.652 -115.566 -116.305 -117.06 -117.829 -118.401 -118.969 -119.547 -120.139 -120.742 -121.141 -121.545 -122.176 -122.614 -123.062 -123.295 -123.781 -124.265 -124.755 -125.003 -125.365 -125.755 -126.023 -126.303 -126.916 -127.245 -127.593 -127.968 -128.378 -128.89 -129.493 -130.871 -9 ,2715 ,TETRA ,17617475,Tue Nov 30 08:05:38 CET,Tue Nov 30 09:55:06 CET,0.0 0.566 0.747 0.881 0.957 0.999 1.033 1.063 1.114 1.13 1.129 1.105 1.057 1.025 0.969 0.911 0.85 0.815 0.718 0.618 0.477 0.371 0.253 0.067 -0.123 -0.33 -0.539 -0.754 -1.058 -1.366 -1.686 -2.103 -2.551 -3.029 -3.592 -4.243 -4.926 -5.725 -6.604 -7.593 -8.724 -10.061 -11.711 -13.494 -15.736 -18.462 -21.945 -26.331 -32.115 -39.961 -51.652 -63.941 -72.947 -79.931 -85.401 -89.933 -93.647 -96.826 -99.43 -101.887 -103.935 -105.728 -107.371 -108.84 -110.167 -111.346 -112.534 -113.567 -114.443 -115.317 -116.193 -116.901 -117.627 -118.368 -118.929 -119.51 -120.107 -120.72 -121.326 -121.731 -122.158 -122.831 -123.276 -123.726 -123.969 -124.474 -124.973 -125.482 -125.747 -126.139 -126.62 -126.915 -127.235 -127.915 -128.263 -128.651 -129.088 -129.583 -130.134 -130.784 -132.306 -10 ,12415 ,TETRA ,17617476,Tue Nov 30 08:05:38 CET,Tue Nov 30 09:54:17 CET,0.0 0.531 0.7 0.789 0.865 0.913 0.94 0.966 0.996 0.995 0.99 0.979 0.934 0.903 0.815 0.718 0.611 0.559 0.449 0.321 0.124 -0.005 -0.132 -0.333 -0.55 -0.764 -0.982 -1.21 -1.518 -1.835 -2.166 -2.578 -2.989 -3.418 -3.945 -4.585 -5.237 -5.996 -6.878 -7.864 -8.956 -10.267 -11.896 -13.652 -15.857 -18.579 -22.109 -26.602 -32.618 -40.845 -52.887 -65.407 -74.754 -82.014 -87.62 -92.187 -95.93 -99.107 -101.695 -104.158 -106.168 -107.916 -109.525 -110.989 -112.334 -113.541 -114.761 -115.813 -116.702 -117.586 -118.471 -119.197 -119.946 -120.704 -121.295 -121.878 -122.456 -123.055 -123.657 -124.065 -124.471 -125.112 -125.568 -126.045 -126.287 -126.757 -127.235 -127.731 -127.994 -128.378 -128.844 -129.143 -129.453 -130.08 -130.403 -130.745 -131.113 -131.523 -132.01 -132.574 -133.924 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_165.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_165.txt deleted file mode 100644 index 585d5b16..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_165.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29918 ,TETRA ,17617477,Tue Nov 30 08:05:40 CET,Tue Nov 30 09:43:37 CET,0.0 0.336 0.445 0.524 0.569 0.597 0.595 0.578 0.522 0.493 0.459 0.386 0.327 0.284 0.185 0.08 -0.04 -0.103 -0.228 -0.356 -0.555 -0.696 -0.85 -1.1 -1.367 -1.643 -1.917 -2.194 -2.555 -2.927 -3.314 -3.79 -4.28 -4.783 -5.413 -6.168 -6.926 -7.798 -8.793 -9.913 -11.171 -12.687 -14.582 -16.613 -19.134 -22.168 -25.96 -30.654 -36.852 -45.292 -57.524 -70.167 -79.353 -86.411 -91.96 -96.549 -100.316 -103.503 -106.109 -108.607 -110.657 -112.452 -114.148 -115.688 -117.061 -118.275 -119.515 -120.581 -121.468 -122.362 -123.273 -124.02 -124.767 -125.521 -126.086 -126.657 -127.255 -127.86 -128.466 -128.874 -129.294 -129.929 -130.355 -130.789 -131.002 -131.436 -131.883 -132.34 -132.575 -132.932 -133.298 -133.545 -133.808 -134.365 -134.644 -134.956 -135.287 -135.642 -136.066 -136.553 -137.806 -2 ,8423 ,TETRA ,17617478,Tue Nov 30 08:05:40 CET,Tue Nov 30 09:53:38 CET,0.0 0.46 0.553 0.619 0.677 0.701 0.686 0.645 0.552 0.502 0.444 0.338 0.252 0.179 0.029 -0.109 -0.231 -0.302 -0.465 -0.626 -0.895 -1.082 -1.265 -1.544 -1.823 -2.119 -2.419 -2.716 -3.123 -3.533 -3.943 -4.469 -4.996 -5.514 -6.148 -6.911 -7.7 -8.609 -9.636 -10.785 -12.079 -13.621 -15.517 -17.558 -20.111 -23.195 -27.1 -31.978 -38.33 -46.869 -59.249 -71.982 -81.149 -88.178 -93.752 -98.394 -102.192 -105.398 -108.024 -110.526 -112.566 -114.319 -115.933 -117.381 -118.69 -119.872 -121.062 -122.074 -122.924 -123.785 -124.641 -125.331 -126.044 -126.784 -127.343 -127.906 -128.481 -129.065 -129.653 -130.04 -130.424 -131.019 -131.434 -131.844 -132.047 -132.475 -132.898 -133.334 -133.565 -133.915 -134.284 -134.525 -134.786 -135.361 -135.675 -135.978 -136.279 -136.599 -136.91 -137.274 -138.479 -3 ,7052 ,TETRA ,17617479,Tue Nov 30 08:06:36 CET,Tue Nov 30 09:57:00 CET,0.0 0.584 0.663 0.69 0.705 0.712 0.699 0.683 0.655 0.639 0.616 0.569 0.506 0.445 0.305 0.17 0.037 -0.027 -0.154 -0.288 -0.504 -0.661 -0.822 -1.063 -1.303 -1.552 -1.819 -2.093 -2.451 -2.819 -3.201 -3.68 -4.159 -4.647 -5.245 -5.95 -6.675 -7.506 -8.423 -9.459 -10.633 -12.062 -13.92 -15.971 -18.511 -21.546 -25.362 -30.099 -36.318 -44.796 -57.117 -69.741 -78.881 -85.953 -91.546 -96.172 -99.959 -103.17 -105.811 -108.359 -110.451 -112.217 -113.836 -115.309 -116.624 -117.778 -118.964 -119.993 -120.856 -121.734 -122.605 -123.309 -124.03 -124.764 -125.319 -125.868 -126.431 -127.035 -127.666 -128.082 -128.493 -129.117 -129.541 -129.964 -130.175 -130.598 -131.017 -131.469 -131.704 -132.05 -132.404 -132.658 -132.919 -133.431 -133.7 -133.987 -134.306 -134.629 -135.01 -135.546 -136.601 -4 ,29000 ,TETRA ,17617480,Tue Nov 30 08:06:36 CET,Tue Nov 30 09:55:59 CET,0.0 0.441 0.554 0.634 0.66 0.652 0.631 0.613 0.566 0.528 0.479 0.376 0.298 0.234 0.102 -0.037 -0.187 -0.26 -0.409 -0.569 -0.818 -0.982 -1.134 -1.376 -1.659 -1.944 -2.234 -2.53 -2.926 -3.338 -3.742 -4.247 -4.762 -5.29 -5.926 -6.67 -7.428 -8.299 -9.279 -10.371 -11.616 -13.134 -15.017 -17.038 -19.582 -22.646 -26.518 -31.303 -37.501 -46.008 -58.454 -71.211 -80.463 -87.554 -93.118 -97.721 -101.51 -104.747 -107.367 -109.86 -111.921 -113.706 -115.366 -116.887 -118.26 -119.466 -120.677 -121.73 -122.6 -123.47 -124.352 -125.07 -125.793 -126.522 -127.076 -127.641 -128.236 -128.846 -129.448 -129.85 -130.259 -130.882 -131.298 -131.721 -131.943 -132.396 -132.847 -133.314 -133.548 -133.909 -134.325 -134.595 -134.866 -135.427 -135.726 -136.047 -136.374 -136.707 -137.097 -137.616 -138.562 -5 ,16839 ,TETRA ,17617481,Tue Nov 30 08:06:36 CET,Tue Nov 30 09:57:06 CET,0.0 0.836 0.98 1.046 1.07 1.068 1.056 1.037 0.973 0.927 0.876 0.784 0.712 0.653 0.522 0.378 0.243 0.173 0.018 -0.147 -0.408 -0.582 -0.757 -1.03 -1.305 -1.565 -1.829 -2.118 -2.518 -2.923 -3.34 -3.861 -4.379 -4.899 -5.531 -6.284 -7.046 -7.935 -8.965 -10.117 -11.391 -12.92 -14.805 -16.826 -19.343 -22.373 -26.21 -31.016 -37.331 -45.864 -58.233 -70.987 -80.203 -87.279 -92.889 -97.521 -101.329 -104.572 -107.204 -109.707 -111.762 -113.519 -115.142 -116.625 -117.947 -119.123 -120.336 -121.395 -122.282 -123.186 -124.109 -124.852 -125.593 -126.35 -126.925 -127.502 -128.089 -128.679 -129.273 -129.678 -130.093 -130.714 -131.135 -131.564 -131.781 -132.222 -132.679 -133.13 -133.363 -133.725 -134.087 -134.34 -134.598 -135.139 -135.425 -135.71 -136.008 -136.349 -136.745 -137.251 -138.266 -6 ,26911 ,TETRA ,17617482,Tue Nov 30 08:06:37 CET,Tue Nov 30 09:56:50 CET,0.0 0.716 0.844 0.918 0.964 0.96 0.941 0.909 0.826 0.781 0.737 0.666 0.597 0.543 0.43 0.313 0.19 0.122 -0.013 -0.152 -0.37 -0.521 -0.681 -0.939 -1.191 -1.449 -1.729 -2.002 -2.365 -2.751 -3.146 -3.663 -4.192 -4.724 -5.362 -6.11 -6.88 -7.763 -8.769 -9.919 -11.189 -12.679 -14.544 -16.556 -19.091 -22.174 -26.054 -30.908 -37.267 -45.883 -58.334 -71.026 -80.274 -87.437 -93.095 -97.753 -101.531 -104.77 -107.428 -109.971 -112.057 -113.826 -115.463 -116.945 -118.276 -119.448 -120.613 -121.624 -122.472 -123.329 -124.199 -124.901 -125.608 -126.329 -126.874 -127.415 -127.971 -128.538 -129.118 -129.514 -129.91 -130.497 -130.909 -131.337 -131.554 -132.004 -132.451 -132.891 -133.111 -133.461 -133.829 -134.089 -134.354 -134.89 -135.178 -135.473 -135.772 -136.111 -136.504 -136.98 -138.124 -7 ,30215 ,TETRA ,17617483,Tue Nov 30 08:06:37 CET,Tue Nov 30 09:57:22 CET,0.0 0.619 0.767 0.835 0.831 0.83 0.827 0.814 0.766 0.73 0.683 0.593 0.525 0.465 0.324 0.186 0.049 -0.025 -0.18 -0.341 -0.598 -0.763 -0.928 -1.204 -1.491 -1.765 -2.046 -2.34 -2.72 -3.115 -3.517 -4.008 -4.497 -4.997 -5.619 -6.36 -7.121 -8.017 -9.035 -10.176 -11.449 -12.976 -14.892 -16.92 -19.452 -22.528 -26.357 -31.108 -37.33 -45.789 -58.126 -70.817 -79.973 -87.015 -92.575 -97.167 -100.945 -104.162 -106.792 -109.301 -111.37 -113.146 -114.786 -116.271 -117.593 -118.754 -119.928 -120.96 -121.826 -122.698 -123.574 -124.278 -124.996 -125.727 -126.282 -126.844 -127.415 -127.983 -128.557 -128.952 -129.359 -129.974 -130.389 -130.823 -131.045 -131.487 -131.933 -132.376 -132.608 -132.971 -133.356 -133.603 -133.847 -134.353 -134.627 -134.937 -135.246 -135.549 -135.906 -136.384 -137.496 -8 ,4686 ,TETRA ,17617484,Tue Nov 30 08:06:38 CET,Tue Nov 30 09:56:02 CET,0.0 0.696 0.805 0.867 0.903 0.917 0.915 0.892 0.836 0.803 0.771 0.708 0.638 0.582 0.474 0.349 0.218 0.151 0.009 -0.145 -0.399 -0.575 -0.751 -0.993 -1.246 -1.523 -1.803 -2.09 -2.486 -2.882 -3.28 -3.792 -4.316 -4.835 -5.451 -6.183 -6.927 -7.797 -8.811 -9.943 -11.193 -12.678 -14.543 -16.57 -19.089 -22.121 -25.938 -30.713 -37.041 -45.601 -57.932 -70.634 -79.884 -87.032 -92.682 -97.377 -101.185 -104.39 -107.04 -109.596 -111.681 -113.445 -115.066 -116.56 -117.926 -119.14 -120.369 -121.422 -122.319 -123.242 -124.16 -124.902 -125.663 -126.419 -126.984 -127.561 -128.134 -128.714 -129.302 -129.691 -130.091 -130.699 -131.119 -131.554 -131.77 -132.219 -132.695 -133.162 -133.391 -133.752 -134.136 -134.391 -134.64 -135.141 -135.409 -135.69 -135.988 -136.318 -136.691 -137.156 -138.47 -9 ,4315 ,TETRA ,17617485,Tue Nov 30 08:06:38 CET,Tue Nov 30 09:55:39 CET,0.0 0.642 0.764 0.833 0.889 0.916 0.92 0.916 0.876 0.85 0.82 0.752 0.674 0.613 0.497 0.367 0.233 0.167 0.032 -0.114 -0.347 -0.5 -0.652 -0.887 -1.128 -1.385 -1.666 -1.95 -2.332 -2.722 -3.102 -3.57 -4.049 -4.551 -5.184 -5.932 -6.687 -7.568 -8.565 -9.674 -10.927 -12.428 -14.306 -16.349 -18.907 -21.989 -25.854 -30.692 -37.077 -45.681 -58.175 -70.997 -80.235 -87.375 -93.058 -97.738 -101.577 -104.85 -107.511 -110.08 -112.172 -113.923 -115.534 -116.998 -118.319 -119.494 -120.684 -121.729 -122.618 -123.516 -124.414 -125.135 -125.867 -126.611 -127.176 -127.749 -128.326 -128.9 -129.474 -129.871 -130.28 -130.903 -131.318 -131.744 -131.955 -132.374 -132.823 -133.284 -133.519 -133.882 -134.25 -134.498 -134.753 -135.29 -135.573 -135.874 -136.203 -136.565 -136.966 -137.498 -138.501 -10 ,13857 ,TETRA ,17617486,Tue Nov 30 08:06:38 CET,Tue Nov 30 09:57:08 CET,0.0 0.484 0.599 0.651 0.703 0.715 0.702 0.68 0.619 0.581 0.535 0.452 0.376 0.31 0.174 0.041 -0.093 -0.164 -0.294 -0.435 -0.678 -0.847 -1.03 -1.297 -1.566 -1.843 -2.12 -2.41 -2.805 -3.204 -3.616 -4.139 -4.666 -5.197 -5.828 -6.565 -7.321 -8.201 -9.184 -10.304 -11.565 -13.057 -14.929 -16.92 -19.431 -22.503 -26.368 -31.191 -37.486 -45.964 -58.299 -71.005 -80.202 -87.241 -92.793 -97.418 -101.205 -104.407 -107.036 -109.565 -111.65 -113.433 -115.058 -116.544 -117.899 -119.102 -120.307 -121.352 -122.224 -123.102 -123.99 -124.717 -125.447 -126.176 -126.744 -127.315 -127.893 -128.474 -129.057 -129.468 -129.891 -130.518 -130.925 -131.35 -131.571 -132.002 -132.454 -132.93 -133.169 -133.526 -133.909 -134.172 -134.434 -134.959 -135.236 -135.548 -135.889 -136.276 -136.767 -137.413 -139.487 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_227.txt deleted file mode 100644 index 25ef2de5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8688 ,TETRA ,17667997,Fri Dec 3 06:14:48 CET,Fri Dec 3 08:02:53 CET,0.0 0.769 1.088 1.315 1.508 1.68 1.828 1.957 2.176 2.268 2.358 2.552 2.614 2.688 2.832 2.957 3.071 3.131 3.253 3.365 3.513 3.619 3.713 3.822 3.916 3.975 4.029 4.086 4.167 4.244 4.314 4.416 4.516 4.595 4.689 4.813 4.882 4.918 4.955 4.964 4.993 5.102 5.156 5.108 4.979 4.784 4.512 4.062 3.336 2.044 -0.051 -2.506 -4.611 -6.299 -7.691 -8.893 -9.906 -10.779 -11.493 -12.199 -12.802 -13.327 -13.83 -14.303 -14.741 -15.142 -15.541 -15.898 -16.232 -16.584 -16.927 -17.205 -17.495 -17.795 -18.026 -18.26 -18.495 -18.739 -19.008 -19.203 -19.403 -19.698 -19.908 -20.137 -20.259 -20.511 -20.765 -21.036 -21.171 -21.306 -21.622 -21.793 -21.967 -22.349 -22.53 -22.735 -22.984 -23.247 -23.59 -24.039 -25.216 -2 ,15748 ,TETRA ,17667998,Fri Dec 3 06:14:43 CET,Fri Dec 3 08:02:40 CET,0.0 0.775 1.029 1.232 1.395 1.524 1.641 1.757 1.958 2.05 2.142 2.365 2.428 2.488 2.604 2.707 2.799 2.848 2.949 3.056 3.205 3.305 3.401 3.51 3.614 3.727 3.833 3.927 4.026 4.112 4.188 4.259 4.338 4.409 4.474 4.566 4.68 4.783 4.854 4.911 4.945 4.95 4.926 4.919 4.869 4.717 4.492 4.097 3.483 2.491 0.7 -1.484 -3.262 -4.743 -5.974 -7.06 -7.977 -8.768 -9.452 -10.169 -10.81 -11.343 -11.835 -12.291 -12.708 -13.084 -13.47 -13.837 -14.153 -14.462 -14.779 -15.048 -15.334 -15.632 -15.86 -16.091 -16.321 -16.57 -16.825 -16.991 -17.175 -17.466 -17.67 -17.895 -18.007 -18.222 -18.452 -18.686 -18.801 -18.938 -19.233 -19.372 -19.512 -19.81 -19.979 -20.174 -20.402 -20.651 -20.957 -21.38 -22.342 -3 ,17222 ,TETRA ,17667999,Fri Dec 3 06:14:44 CET,Fri Dec 3 08:04:19 CET,0.0 0.855 1.163 1.4 1.58 1.711 1.824 1.917 2.08 2.152 2.224 2.393 2.444 2.509 2.641 2.762 2.88 2.927 3.009 3.081 3.184 3.262 3.338 3.443 3.55 3.643 3.716 3.787 3.869 3.943 4.031 4.136 4.207 4.261 4.334 4.418 4.494 4.576 4.621 4.637 4.636 4.633 4.618 4.557 4.456 4.305 4.007 3.54 2.843 1.747 -0.091 -2.239 -4.013 -5.484 -6.709 -7.793 -8.724 -9.597 -10.423 -11.291 -11.989 -12.527 -13.012 -13.486 -13.923 -14.324 -14.736 -15.074 -15.357 -15.657 -15.967 -16.226 -16.495 -16.778 -16.987 -17.191 -17.397 -17.613 -17.845 -18.013 -18.19 -18.451 -18.626 -18.804 -18.893 -19.085 -19.299 -19.518 -19.641 -19.77 -20.004 -20.128 -20.26 -20.556 -20.724 -20.897 -21.076 -21.281 -21.555 -21.979 -22.929 -4 ,24749 ,TETRA ,17668000,Fri Dec 3 06:14:47 CET,Fri Dec 3 08:04:18 CET,0.0 0.695 0.931 1.073 1.225 1.378 1.503 1.61 1.806 1.91 2.002 2.186 2.249 2.323 2.457 2.579 2.681 2.727 2.829 2.922 3.04 3.113 3.176 3.262 3.367 3.479 3.576 3.665 3.751 3.816 3.895 3.999 4.099 4.209 4.368 4.512 4.584 4.618 4.666 4.729 4.748 4.828 4.856 4.711 4.535 4.273 3.869 3.309 2.447 1.134 -0.99 -3.4 -5.346 -6.977 -8.356 -9.478 -10.413 -11.273 -12.0 -12.72 -13.318 -13.85 -14.346 -14.792 -15.224 -15.624 -16.027 -16.383 -16.677 -16.973 -17.301 -17.564 -17.826 -18.117 -18.334 -18.542 -18.745 -18.944 -19.166 -19.332 -19.502 -19.763 -19.951 -20.144 -20.243 -20.449 -20.657 -20.877 -20.994 -21.118 -21.361 -21.49 -21.637 -21.978 -22.158 -22.345 -22.542 -22.766 -23.047 -23.406 -24.278 -5 ,11228 ,TETRA ,17668001,Fri Dec 3 06:14:49 CET,Fri Dec 3 08:03:17 CET,0.0 0.666 0.948 1.142 1.275 1.395 1.517 1.638 1.851 1.942 2.047 2.252 2.308 2.377 2.499 2.611 2.718 2.782 2.91 3.012 3.162 3.255 3.328 3.443 3.567 3.671 3.752 3.835 3.949 4.044 4.131 4.263 4.415 4.563 4.718 4.862 4.98 5.087 5.188 5.312 5.428 5.48 5.475 5.419 5.304 5.124 4.869 4.5 3.813 2.582 0.525 -1.905 -3.917 -5.545 -6.848 -7.999 -8.987 -9.851 -10.613 -11.381 -12.033 -12.607 -13.126 -13.601 -14.054 -14.459 -14.863 -15.211 -15.516 -15.83 -16.151 -16.421 -16.694 -16.975 -17.197 -17.43 -17.662 -17.893 -18.118 -18.268 -18.427 -18.7 -18.894 -19.087 -19.193 -19.415 -19.648 -19.882 -19.99 -20.104 -20.348 -20.491 -20.647 -20.962 -21.138 -21.327 -21.538 -21.767 -22.03 -22.37 -23.248 -6 ,10461 ,TETRA ,17668002,Fri Dec 3 06:14:44 CET,Fri Dec 3 08:03:10 CET,0.0 0.852 1.141 1.341 1.505 1.626 1.726 1.814 1.991 2.089 2.176 2.346 2.399 2.459 2.603 2.754 2.905 2.976 3.088 3.195 3.355 3.457 3.543 3.644 3.731 3.81 3.894 3.977 4.101 4.205 4.301 4.435 4.523 4.591 4.68 4.762 4.845 4.956 5.047 5.129 5.208 5.219 5.183 5.15 5.071 4.911 4.643 4.21 3.576 2.592 0.829 -1.301 -3.053 -4.526 -5.771 -6.868 -7.812 -8.696 -9.423 -10.108 -10.709 -11.238 -11.712 -12.15 -12.579 -12.963 -13.348 -13.684 -13.988 -14.309 -14.63 -14.902 -15.182 -15.467 -15.684 -15.904 -16.137 -16.371 -16.599 -16.759 -16.936 -17.205 -17.394 -17.598 -17.695 -17.889 -18.083 -18.279 -18.388 -18.503 -18.736 -18.857 -18.992 -19.305 -19.483 -19.674 -19.871 -20.144 -20.437 -20.755 -21.745 -7 ,32302 ,TETRA ,17668003,Fri Dec 3 06:14:43 CET,Fri Dec 3 08:02:59 CET,0.0 0.705 1.015 1.238 1.411 1.585 1.732 1.853 2.081 2.195 2.279 2.437 2.513 2.603 2.744 2.872 2.985 3.033 3.142 3.256 3.416 3.521 3.607 3.72 3.841 3.965 4.081 4.178 4.296 4.408 4.508 4.64 4.764 4.86 4.947 5.041 5.115 5.17 5.26 5.385 5.474 5.522 5.567 5.551 5.442 5.276 4.999 4.551 3.86 2.781 0.926 -1.372 -3.316 -4.905 -6.216 -7.366 -8.345 -9.21 -9.935 -10.734 -11.475 -12.128 -12.747 -13.319 -13.849 -14.313 -14.788 -15.214 -15.576 -15.946 -16.331 -16.644 -16.959 -17.294 -17.54 -17.78 -18.037 -18.309 -18.6 -18.796 -18.995 -19.308 -19.53 -19.762 -19.877 -20.094 -20.322 -20.585 -20.724 -20.863 -21.14 -21.276 -21.425 -21.782 -21.961 -22.162 -22.404 -22.67 -23.013 -23.464 -24.426 -8 ,14268 ,TETRA ,17668004,Fri Dec 3 06:14:46 CET,Fri Dec 3 08:02:34 CET,0.0 0.764 1.048 1.234 1.393 1.532 1.646 1.746 1.952 2.052 2.139 2.298 2.35 2.426 2.564 2.682 2.782 2.838 2.957 3.063 3.219 3.313 3.403 3.529 3.639 3.741 3.828 3.895 3.983 4.061 4.121 4.205 4.309 4.432 4.585 4.731 4.846 4.943 5.011 5.065 5.092 5.13 5.218 5.256 5.168 5.008 4.698 4.133 3.287 2.024 -0.058 -2.495 -4.43 -6.033 -7.352 -8.472 -9.418 -10.266 -10.995 -11.699 -12.299 -12.829 -13.321 -13.794 -14.24 -14.656 -15.059 -15.403 -15.712 -16.015 -16.323 -16.582 -16.859 -17.154 -17.379 -17.595 -17.823 -18.06 -18.302 -18.472 -18.648 -18.927 -19.11 -19.285 -19.379 -19.59 -19.813 -20.054 -20.184 -20.316 -20.576 -20.7 -20.842 -21.17 -21.341 -21.54 -21.764 -22.013 -22.288 -22.607 -23.43 -9 ,24260 ,TETRA ,17668005,Fri Dec 3 06:14:48 CET,Fri Dec 3 08:03:02 CET,0.0 0.732 1.029 1.314 1.535 1.679 1.793 1.898 2.08 2.179 2.27 2.441 2.502 2.58 2.718 2.837 2.941 2.99 3.087 3.182 3.305 3.391 3.479 3.605 3.731 3.827 3.911 4.003 4.133 4.241 4.326 4.414 4.517 4.609 4.695 4.827 4.952 5.055 5.121 5.15 5.157 5.204 5.228 5.142 5.001 4.782 4.48 4.104 3.51 2.45 0.624 -1.511 -3.284 -4.796 -6.059 -7.15 -8.108 -8.988 -9.716 -10.401 -10.973 -11.475 -11.963 -12.438 -12.873 -13.261 -13.65 -13.981 -14.266 -14.569 -14.877 -15.116 -15.368 -15.634 -15.849 -16.073 -16.301 -16.53 -16.76 -16.936 -17.124 -17.391 -17.565 -17.751 -17.855 -18.057 -18.243 -18.439 -18.547 -18.669 -18.938 -19.084 -19.239 -19.607 -19.817 -20.03 -20.248 -20.491 -20.823 -21.271 -22.044 -10 ,19176 ,TETRA ,17668006,Fri Dec 3 06:14:49 CET,Fri Dec 3 08:02:37 CET,0.0 0.78 1.124 1.4 1.63 1.799 1.95 2.091 2.352 2.463 2.565 2.775 2.84 2.915 3.056 3.195 3.311 3.364 3.461 3.538 3.666 3.756 3.848 3.986 4.11 4.223 4.314 4.418 4.564 4.679 4.774 4.898 5.013 5.106 5.228 5.352 5.441 5.537 5.627 5.673 5.702 5.774 5.826 5.832 5.816 5.698 5.44 4.997 4.29 3.153 1.21 -1.007 -2.812 -4.328 -5.592 -6.717 -7.689 -8.536 -9.256 -9.947 -10.527 -11.075 -11.607 -12.084 -12.526 -12.912 -13.294 -13.652 -13.965 -14.279 -14.598 -14.866 -15.145 -15.442 -15.677 -15.905 -16.134 -16.381 -16.631 -16.797 -16.964 -17.229 -17.422 -17.63 -17.734 -17.934 -18.154 -18.378 -18.492 -18.618 -18.887 -19.034 -19.186 -19.529 -19.725 -19.921 -20.13 -20.369 -20.66 -21.049 -22.106 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_235.txt deleted file mode 100644 index 1179c053..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20298 ,TETRA ,17617487,Tue Nov 30 08:07:37 CET,Tue Nov 30 09:58:37 CET,0.0 1.245 1.6 1.849 2.039 2.231 2.432 2.599 2.87 2.989 3.094 3.31 3.396 3.501 3.699 3.867 4.015 4.092 4.242 4.383 4.589 4.71 4.824 4.992 5.153 5.327 5.505 5.672 5.871 6.06 6.26 6.51 6.723 6.92 7.156 7.398 7.636 7.901 8.194 8.502 8.821 9.164 9.556 9.958 10.391 10.878 11.423 11.896 12.294 12.629 12.767 12.489 12.064 11.533 10.97 10.469 10.013 9.579 9.197 8.793 8.435 8.11 7.791 7.473 7.184 6.947 6.708 6.485 6.277 6.036 5.784 5.584 5.382 5.159 4.987 4.822 4.65 4.472 4.298 4.171 4.031 3.808 3.641 3.477 3.393 3.209 3.023 2.82 2.715 2.622 2.361 2.234 2.097 1.784 1.605 1.431 1.234 0.965 0.65 0.258 -1.268 -2 ,22343 ,TETRA ,17617488,Tue Nov 30 08:07:37 CET,Tue Nov 30 09:59:21 CET,0.0 1.233 1.614 1.886 2.096 2.278 2.436 2.591 2.88 3.016 3.15 3.392 3.463 3.549 3.732 3.912 4.074 4.151 4.3 4.433 4.622 4.751 4.882 5.058 5.221 5.391 5.569 5.734 5.926 6.111 6.289 6.502 6.716 6.934 7.164 7.406 7.62 7.836 8.071 8.317 8.593 8.925 9.298 9.627 9.964 10.373 10.832 11.231 11.614 12.025 12.249 11.933 11.449 10.929 10.396 9.881 9.397 8.91 8.518 8.138 7.779 7.46 7.173 6.9 6.642 6.406 6.145 5.908 5.697 5.473 5.245 5.056 4.849 4.635 4.476 4.29 4.092 3.912 3.731 3.597 3.448 3.2 3.032 2.869 2.783 2.613 2.426 2.218 2.11 2.013 1.752 1.616 1.477 1.183 1.002 0.817 0.633 0.391 0.076 -0.323 -1.899 -3 ,21413 ,TETRA ,17617489,Tue Nov 30 08:08:37 CET,Tue Nov 30 10:00:59 CET,0.0 1.24 1.591 1.848 2.067 2.258 2.441 2.62 2.921 3.034 3.143 3.373 3.457 3.552 3.719 3.882 4.044 4.117 4.245 4.379 4.599 4.741 4.875 5.058 5.224 5.393 5.563 5.716 5.909 6.088 6.246 6.446 6.668 6.902 7.155 7.43 7.712 8.03 8.311 8.586 8.906 9.236 9.565 9.86 10.224 10.662 11.101 11.478 11.813 12.072 12.073 11.678 11.077 10.422 9.849 9.341 8.872 8.416 8.022 7.601 7.215 6.883 6.577 6.283 5.999 5.737 5.462 5.216 5.015 4.803 4.575 4.369 4.15 3.934 3.78 3.619 3.441 3.251 3.045 2.909 2.773 2.576 2.439 2.281 2.196 2.018 1.816 1.602 1.501 1.42 1.167 1.024 0.883 0.584 0.432 0.266 0.062 -0.177 -0.463 -0.846 -2.103 -4 ,6703 ,TETRA ,17617490,Tue Nov 30 08:07:37 CET,Tue Nov 30 09:57:58 CET,0.0 1.033 1.397 1.684 1.896 2.068 2.232 2.382 2.658 2.779 2.889 3.113 3.19 3.282 3.473 3.666 3.837 3.914 4.077 4.241 4.452 4.588 4.713 4.877 5.048 5.209 5.363 5.511 5.679 5.839 6.027 6.25 6.442 6.612 6.818 7.052 7.26 7.505 7.775 8.054 8.366 8.701 9.036 9.36 9.703 10.049 10.41 10.755 11.067 11.344 11.436 11.027 10.466 9.916 9.381 8.864 8.405 7.964 7.582 7.198 6.825 6.485 6.167 5.864 5.591 5.324 5.014 4.729 4.491 4.248 3.996 3.775 3.554 3.332 3.148 2.971 2.793 2.61 2.435 2.307 2.155 1.909 1.745 1.579 1.493 1.305 1.096 0.885 0.774 0.673 0.428 0.299 0.155 -0.132 -0.287 -0.467 -0.682 -0.933 -1.202 -1.548 -3.004 -5 ,25074 ,TETRA ,17617491,Tue Nov 30 08:07:37 CET,Tue Nov 30 09:58:37 CET,0.0 1.194 1.546 1.804 2.014 2.223 2.405 2.553 2.805 2.93 3.051 3.268 3.347 3.439 3.608 3.771 3.925 4.002 4.158 4.294 4.498 4.642 4.775 4.967 5.141 5.299 5.452 5.611 5.837 6.047 6.227 6.467 6.71 6.927 7.193 7.491 7.785 8.107 8.422 8.718 9.033 9.436 9.866 10.244 10.658 11.093 11.589 12.195 12.726 12.97 12.925 12.413 11.785 11.199 10.659 10.145 9.685 9.241 8.848 8.438 8.063 7.732 7.409 7.089 6.79 6.537 6.277 6.033 5.827 5.619 5.384 5.197 5.007 4.792 4.621 4.462 4.307 4.128 3.94 3.809 3.67 3.451 3.297 3.13 3.042 2.849 2.638 2.421 2.307 2.205 1.968 1.854 1.725 1.408 1.225 1.038 0.825 0.566 0.219 -0.206 -1.708 -6 ,26835 ,TETRA ,17617492,Tue Nov 30 08:07:37 CET,Tue Nov 30 09:58:13 CET,0.0 1.496 1.88 2.145 2.38 2.612 2.808 2.982 3.302 3.441 3.567 3.818 3.922 4.042 4.272 4.477 4.66 4.743 4.904 5.062 5.278 5.425 5.567 5.753 5.944 6.128 6.293 6.459 6.686 6.904 7.122 7.383 7.596 7.788 8.045 8.319 8.555 8.811 9.072 9.33 9.609 9.948 10.345 10.73 11.193 11.687 12.122 12.533 12.946 13.247 13.245 12.852 12.282 11.644 11.082 10.555 10.064 9.558 9.097 8.658 8.275 7.923 7.583 7.263 6.956 6.654 6.349 6.096 5.876 5.639 5.39 5.181 4.972 4.764 4.596 4.419 4.228 4.021 3.809 3.666 3.508 3.255 3.076 2.893 2.807 2.62 2.404 2.167 2.047 1.93 1.644 1.507 1.36 1.035 0.845 0.622 0.396 0.154 -0.164 -0.568 -2.241 -7 ,32555 ,TETRA ,17617493,Tue Nov 30 08:07:37 CET,Tue Nov 30 09:57:54 CET,0.0 1.132 1.506 1.79 2.02 2.211 2.385 2.539 2.847 2.992 3.108 3.35 3.442 3.543 3.738 3.915 4.077 4.157 4.299 4.428 4.616 4.734 4.857 5.048 5.231 5.398 5.553 5.7 5.889 6.066 6.239 6.465 6.701 6.929 7.179 7.442 7.69 7.975 8.256 8.532 8.81 9.081 9.382 9.629 9.869 10.118 10.412 10.712 10.973 11.104 10.852 10.251 9.615 8.96 8.382 7.825 7.301 6.837 6.439 6.001 5.6 5.258 4.927 4.6 4.31 4.063 3.798 3.556 3.345 3.118 2.885 2.7 2.512 2.32 2.171 2.006 1.834 1.662 1.465 1.319 1.179 0.978 0.83 0.669 0.584 0.392 0.198 0.012 -0.085 -0.174 -0.424 -0.559 -0.707 -1.004 -1.165 -1.34 -1.536 -1.782 -2.06 -2.471 -4.091 -8 ,14578 ,TETRA ,17617494,Tue Nov 30 08:07:37 CET,Tue Nov 30 09:58:23 CET,0.0 1.768 2.136 2.388 2.61 2.823 2.983 3.13 3.407 3.527 3.64 3.878 3.967 4.064 4.241 4.409 4.588 4.681 4.849 4.991 5.188 5.306 5.417 5.594 5.776 5.95 6.117 6.284 6.49 6.679 6.864 7.093 7.309 7.513 7.737 7.984 8.234 8.497 8.755 9.014 9.293 9.615 9.974 10.328 10.744 11.172 11.573 11.981 12.4 12.757 12.912 12.558 12.024 11.444 10.822 10.221 9.692 9.2 8.759 8.318 7.945 7.615 7.287 6.968 6.682 6.434 6.18 5.936 5.73 5.522 5.295 5.104 4.905 4.701 4.538 4.375 4.194 3.996 3.804 3.675 3.534 3.303 3.145 2.989 2.9 2.711 2.517 2.294 2.176 2.068 1.785 1.658 1.525 1.21 1.038 0.849 0.622 0.36 0.068 -0.336 -1.864 -9 ,26175 ,TETRA ,17617495,Tue Nov 30 08:08:36 CET,Tue Nov 30 09:56:35 CET,0.0 1.408 1.789 2.074 2.28 2.449 2.601 2.752 3.024 3.142 3.259 3.496 3.58 3.674 3.86 4.054 4.229 4.309 4.47 4.625 4.842 4.97 5.097 5.297 5.491 5.667 5.834 6.012 6.226 6.409 6.586 6.784 6.975 7.169 7.407 7.674 7.926 8.211 8.505 8.816 9.139 9.506 9.958 10.342 10.687 11.01 11.306 11.568 11.887 12.236 12.366 12.134 11.67 11.081 10.53 10.025 9.568 9.154 8.775 8.365 8.009 7.69 7.391 7.121 6.864 6.631 6.386 6.148 5.941 5.724 5.48 5.28 5.076 4.86 4.691 4.509 4.314 4.116 3.92 3.788 3.648 3.427 3.271 3.111 3.033 2.872 2.683 2.497 2.412 2.324 2.079 1.962 1.848 1.606 1.455 1.292 1.107 0.896 0.626 0.213 -1.698 -10 ,4555 ,TETRA ,17617496,Tue Nov 30 08:09:36 CET,Tue Nov 30 09:58:48 CET,0.0 1.515 1.895 2.19 2.409 2.599 2.762 2.906 3.199 3.338 3.463 3.713 3.807 3.915 4.103 4.268 4.424 4.501 4.644 4.773 4.975 5.109 5.23 5.405 5.587 5.755 5.916 6.075 6.263 6.446 6.632 6.871 7.119 7.336 7.565 7.833 8.089 8.355 8.627 8.888 9.149 9.48 9.863 10.19 10.528 10.883 11.266 11.674 12.119 12.521 12.627 12.182 11.608 11.038 10.489 9.953 9.456 8.975 8.543 8.103 7.72 7.383 7.049 6.725 6.43 6.172 5.881 5.599 5.355 5.097 4.837 4.636 4.441 4.227 4.041 3.844 3.638 3.451 3.272 3.134 2.998 2.805 2.663 2.514 2.436 2.239 2.018 1.795 1.686 1.589 1.336 1.205 1.069 0.784 0.612 0.413 0.202 -0.029 -0.288 -0.59 -1.918 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_252.txt deleted file mode 100644 index 8797d033..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21240 ,TETRA ,17617497,Tue Nov 30 08:09:38 CET,Tue Nov 30 10:01:42 CET,0.0 0.491 0.5 0.484 0.456 0.383 0.278 0.166 -0.059 -0.183 -0.312 -0.573 -0.741 -0.889 -1.184 -1.51 -1.848 -2.019 -2.36 -2.707 -3.251 -3.605 -3.97 -4.523 -5.067 -5.623 -6.198 -6.79 -7.596 -8.416 -9.236 -10.274 -11.309 -12.339 -13.568 -15.002 -16.426 -18.088 -20.016 -22.167 -24.574 -27.434 -30.962 -34.779 -39.536 -45.154 -52.139 -60.909 -72.385 -87.86 -110.26 -133.124 -149.63 -162.305 -172.208 -180.341 -187.015 -192.695 -197.33 -201.733 -205.332 -208.385 -211.193 -213.738 -216.028 -218.075 -220.123 -221.896 -223.383 -224.87 -226.366 -227.578 -228.832 -230.109 -231.055 -231.996 -232.955 -233.94 -234.936 -235.622 -236.32 -237.333 -237.992 -238.686 -239.058 -239.813 -240.594 -241.393 -241.821 -242.572 -243.256 -243.735 -244.223 -245.243 -245.79 -246.383 -247.008 -247.7 -248.487 -249.423 -252.222 -2 ,4148 ,TETRA ,17617498,Tue Nov 30 08:09:38 CET,Tue Nov 30 10:01:58 CET,0.0 0.325 0.37 0.341 0.265 0.172 0.068 -0.046 -0.276 -0.402 -0.544 -0.824 -1.002 -1.171 -1.506 -1.85 -2.19 -2.35 -2.67 -3.003 -3.532 -3.89 -4.251 -4.811 -5.372 -5.945 -6.542 -7.142 -7.956 -8.781 -9.601 -10.635 -11.694 -12.762 -14.037 -15.547 -17.049 -18.763 -20.73 -22.928 -25.354 -28.248 -31.836 -35.654 -40.352 -45.973 -53.049 -61.868 -73.408 -88.95 -111.328 -134.174 -150.675 -163.269 -173.151 -181.317 -187.962 -193.589 -198.185 -202.584 -206.189 -209.249 -212.068 -214.676 -217.003 -219.0 -221.008 -222.762 -224.243 -225.763 -227.287 -228.473 -229.656 -230.857 -231.779 -232.718 -233.664 -234.613 -235.614 -236.318 -237.025 -238.091 -238.821 -239.573 -239.95 -240.694 -241.463 -242.283 -242.692 -243.337 -243.961 -244.408 -244.875 -245.852 -246.361 -246.912 -247.502 -248.131 -248.775 -249.592 -251.491 -3 ,10968 ,TETRA ,17617499,Tue Nov 30 08:10:38 CET,Tue Nov 30 09:55:41 CET,0.0 0.528 0.575 0.538 0.466 0.376 0.274 0.149 -0.138 -0.284 -0.442 -0.756 -0.933 -1.077 -1.38 -1.721 -2.065 -2.24 -2.599 -2.974 -3.556 -3.93 -4.278 -4.805 -5.351 -5.908 -6.484 -7.07 -7.854 -8.651 -9.47 -10.509 -11.546 -12.58 -13.824 -15.306 -16.821 -18.52 -20.389 -22.518 -24.954 -27.856 -31.432 -35.246 -39.969 -45.681 -52.861 -61.731 -73.311 -88.881 -111.341 -134.408 -151.124 -163.897 -173.889 -182.138 -188.963 -194.822 -199.546 -204.02 -207.728 -210.896 -213.803 -216.445 -218.787 -220.838 -222.909 -224.695 -226.206 -227.747 -229.306 -230.575 -231.86 -233.148 -234.116 -235.112 -236.139 -237.163 -238.176 -238.852 -239.542 -240.598 -241.307 -242.024 -242.385 -243.108 -243.867 -244.662 -245.068 -245.725 -246.361 -246.805 -247.242 -248.154 -248.644 -249.158 -249.698 -250.269 -250.99 -251.884 -254.636 -4 ,21657 ,TETRA ,17617500,Tue Nov 30 08:10:38 CET,Tue Nov 30 10:03:59 CET,0.0 0.474 0.504 0.503 0.462 0.388 0.293 0.181 -0.079 -0.229 -0.37 -0.608 -0.761 -0.906 -1.233 -1.566 -1.885 -2.043 -2.381 -2.733 -3.242 -3.599 -3.981 -4.553 -5.136 -5.722 -6.305 -6.889 -7.675 -8.457 -9.238 -10.209 -11.193 -12.234 -13.513 -15.019 -16.522 -18.24 -20.198 -22.395 -24.841 -27.751 -31.329 -35.154 -39.895 -45.603 -52.794 -61.7 -73.314 -88.923 -111.438 -134.517 -151.202 -164.046 -174.157 -182.46 -189.258 -195.059 -199.805 -204.301 -207.965 -211.104 -213.97 -216.578 -219.001 -221.185 -223.381 -225.28 -226.885 -228.505 -230.13 -231.44 -232.762 -234.104 -235.121 -236.15 -237.178 -238.219 -239.298 -240.024 -240.769 -241.904 -242.675 -243.459 -243.851 -244.648 -245.444 -246.252 -246.676 -247.353 -248.011 -248.467 -248.927 -249.899 -250.42 -250.993 -251.64 -252.331 -253.094 -254.019 -256.204 -5 ,10825 ,TETRA ,17617501,Tue Nov 30 08:10:38 CET,Tue Nov 30 10:04:28 CET,0.0 0.443 0.479 0.444 0.375 0.276 0.163 0.031 -0.235 -0.364 -0.496 -0.764 -0.934 -1.082 -1.379 -1.715 -2.063 -2.236 -2.581 -2.926 -3.452 -3.789 -4.139 -4.688 -5.224 -5.778 -6.349 -6.925 -7.73 -8.545 -9.362 -10.392 -11.431 -12.483 -13.742 -15.221 -16.719 -18.423 -20.37 -22.526 -24.913 -27.795 -31.338 -35.145 -39.926 -45.643 -52.78 -61.614 -73.136 -88.661 -111.102 -134.003 -150.418 -162.97 -172.823 -180.988 -187.643 -193.278 -197.887 -202.225 -205.768 -208.804 -211.615 -214.188 -216.476 -218.483 -220.528 -222.29 -223.767 -225.258 -226.756 -227.956 -229.19 -230.565 -231.658 -232.728 -233.825 -234.947 -236.099 -236.87 -237.622 -238.769 -239.544 -240.329 -240.731 -241.545 -242.355 -243.2 -243.64 -244.366 -244.999 -245.454 -245.923 -246.972 -247.533 -248.098 -248.679 -249.281 -249.976 -250.876 -253.146 -6 ,16428 ,TETRA ,17617502,Tue Nov 30 08:12:36 CET,Tue Nov 30 10:00:04 CET,0.0 0.563 0.624 0.609 0.584 0.499 0.38 0.249 -0.014 -0.147 -0.288 -0.569 -0.74 -0.889 -1.184 -1.517 -1.856 -2.026 -2.378 -2.733 -3.269 -3.622 -3.985 -4.554 -5.116 -5.687 -6.268 -6.837 -7.566 -8.326 -9.137 -10.167 -11.202 -12.249 -13.511 -14.994 -16.481 -18.164 -20.044 -22.177 -24.562 -27.404 -30.955 -34.775 -39.531 -45.184 -52.287 -61.154 -72.731 -88.334 -110.877 -133.887 -150.403 -163.031 -172.969 -181.213 -187.92 -193.575 -198.172 -202.548 -206.162 -209.242 -212.072 -214.631 -216.925 -218.96 -221.028 -222.826 -224.327 -225.829 -227.321 -228.537 -229.792 -231.043 -231.976 -232.928 -233.902 -234.9 -235.898 -236.554 -237.229 -238.295 -239.023 -239.723 -240.06 -240.744 -241.462 -242.223 -242.636 -243.349 -243.957 -244.424 -244.895 -245.845 -246.354 -246.892 -247.457 -248.053 -248.714 -249.434 -250.781 -7 ,32737 ,TETRA ,17617503,Tue Nov 30 08:13:35 CET,Tue Nov 30 10:03:53 CET,0.0 0.519 0.566 0.55 0.486 0.417 0.324 0.213 -0.006 -0.113 -0.239 -0.522 -0.702 -0.866 -1.195 -1.533 -1.877 -2.04 -2.37 -2.722 -3.272 -3.653 -4.039 -4.615 -5.185 -5.752 -6.322 -6.896 -7.671 -8.456 -9.245 -10.269 -11.322 -12.38 -13.645 -15.146 -16.682 -18.434 -20.398 -22.532 -24.905 -27.809 -31.412 -35.262 -40.042 -45.716 -52.818 -61.723 -73.355 -88.973 -111.435 -134.306 -150.773 -163.366 -173.26 -181.457 -188.159 -193.826 -198.436 -202.823 -206.438 -209.505 -212.278 -214.808 -217.082 -219.083 -221.116 -222.87 -224.335 -225.825 -227.33 -228.541 -229.754 -230.962 -231.879 -232.825 -233.828 -234.879 -235.928 -236.607 -237.33 -238.49 -239.257 -240.022 -240.419 -241.216 -242.006 -242.817 -243.237 -243.94 -244.531 -244.974 -245.429 -246.398 -246.917 -247.465 -248.044 -248.699 -249.475 -250.381 -252.951 -8 ,2221 ,TETRA ,17617505,Tue Nov 30 08:13:35 CET,Tue Nov 30 10:01:29 CET,0.0 0.447 0.465 0.423 0.358 0.279 0.209 0.138 -0.053 -0.153 -0.275 -0.56 -0.733 -0.895 -1.212 -1.547 -1.903 -2.069 -2.387 -2.725 -3.275 -3.654 -4.019 -4.581 -5.177 -5.768 -6.351 -6.92 -7.684 -8.495 -9.324 -10.36 -11.409 -12.424 -13.643 -15.142 -16.667 -18.411 -20.39 -22.604 -25.063 -27.944 -31.494 -35.326 -40.027 -45.63 -52.786 -61.748 -73.422 -89.098 -111.596 -134.511 -151.015 -163.636 -173.572 -181.787 -188.517 -194.219 -198.855 -203.258 -206.979 -210.227 -213.118 -215.678 -217.961 -219.969 -222.051 -223.991 -225.709 -227.429 -229.155 -230.579 -232.032 -233.508 -234.628 -235.767 -236.913 -238.048 -239.2 -239.993 -240.812 -242.032 -242.839 -243.681 -244.112 -244.971 -245.843 -246.737 -247.184 -247.923 -248.62 -249.117 -249.635 -250.719 -251.273 -251.824 -252.397 -253.043 -253.795 -254.702 -256.948 -9 ,25000 ,TETRA ,17617506,Tue Nov 30 08:13:35 CET,Tue Nov 30 10:03:46 CET,0.0 0.353 0.352 0.313 0.261 0.177 0.071 -0.06 -0.346 -0.495 -0.638 -0.883 -1.044 -1.196 -1.513 -1.842 -2.177 -2.349 -2.686 -3.029 -3.569 -3.925 -4.291 -4.861 -5.43 -6.002 -6.567 -7.135 -7.916 -8.716 -9.533 -10.569 -11.616 -12.641 -13.859 -15.326 -16.829 -18.529 -20.404 -22.508 -24.854 -27.701 -31.266 -35.043 -39.76 -45.471 -52.67 -61.573 -73.135 -88.768 -111.36 -134.325 -150.966 -163.726 -173.696 -182.002 -188.766 -194.444 -199.088 -203.56 -207.254 -210.459 -213.489 -216.193 -218.539 -220.601 -222.664 -224.448 -225.962 -227.502 -229.056 -230.324 -231.644 -232.975 -233.968 -234.978 -235.99 -237.023 -238.11 -238.858 -239.599 -240.708 -241.466 -242.231 -242.614 -243.387 -244.183 -244.999 -245.41 -246.075 -246.718 -247.175 -247.667 -248.705 -249.255 -249.826 -250.425 -251.079 -251.767 -252.555 -254.414 -10 ,15334 ,TETRA ,17617507,Tue Nov 30 08:14:34 CET,Tue Nov 30 10:08:02 CET,0.0 0.638 0.682 0.645 0.567 0.46 0.346 0.211 -0.08 -0.234 -0.388 -0.669 -0.846 -1.021 -1.363 -1.697 -2.046 -2.225 -2.564 -2.91 -3.465 -3.851 -4.243 -4.839 -5.437 -6.031 -6.633 -7.219 -8.014 -8.824 -9.625 -10.65 -11.679 -12.717 -13.991 -15.476 -16.965 -18.692 -20.627 -22.771 -25.154 -27.999 -31.556 -35.362 -40.085 -45.759 -52.858 -61.63 -73.115 -88.68 -111.106 -134.023 -150.716 -163.493 -173.44 -181.645 -188.369 -194.129 -198.926 -203.549 -207.271 -210.402 -213.316 -215.972 -218.349 -220.464 -222.619 -224.451 -225.976 -227.542 -229.118 -230.387 -231.666 -232.953 -233.917 -234.878 -235.866 -236.869 -237.889 -238.581 -239.271 -240.329 -241.054 -241.79 -242.161 -242.902 -243.649 -244.42 -244.818 -245.461 -246.071 -246.506 -246.96 -247.933 -248.471 -249.037 -249.615 -250.207 -250.918 -251.894 -254.087 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_57.txt deleted file mode 100644 index 033e49a4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_290_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10522 ,TETRA ,17617508,Tue Nov 30 08:14:35 CET,Tue Nov 30 10:04:27 CET,0.0 0.969 1.299 1.512 1.689 1.853 1.997 2.101 2.275 2.356 2.435 2.619 2.68 2.746 2.874 2.994 3.094 3.141 3.242 3.337 3.455 3.524 3.59 3.679 3.755 3.831 3.904 3.98 4.092 4.191 4.261 4.315 4.387 4.472 4.554 4.628 4.7 4.782 4.814 4.801 4.784 4.77 4.791 4.759 4.613 4.43 4.174 3.698 2.828 1.364 -1.067 -3.796 -5.937 -7.729 -9.241 -10.565 -11.692 -12.701 -13.547 -14.368 -15.082 -15.707 -16.28 -16.799 -17.28 -17.709 -18.14 -18.532 -18.877 -19.232 -19.579 -19.862 -20.167 -20.499 -20.761 -21.025 -21.295 -21.571 -21.837 -22.027 -22.225 -22.484 -22.665 -22.864 -22.961 -23.165 -23.392 -23.646 -23.777 -23.915 -24.16 -24.295 -24.445 -24.767 -24.934 -25.12 -25.334 -25.594 -25.891 -26.214 -26.974 -2 ,6374 ,TETRA ,17617509,Tue Nov 30 08:14:34 CET,Tue Nov 30 10:02:07 CET,0.0 0.732 0.921 1.074 1.233 1.385 1.505 1.615 1.844 1.938 2.007 2.178 2.231 2.289 2.399 2.497 2.597 2.641 2.723 2.808 2.921 2.99 3.059 3.164 3.246 3.312 3.375 3.432 3.507 3.587 3.662 3.736 3.801 3.853 3.902 3.963 4.008 4.024 4.048 4.078 4.098 4.116 4.095 4.062 4.006 3.875 3.638 3.17 2.401 1.198 -0.866 -3.485 -5.632 -7.404 -8.936 -10.255 -11.369 -12.379 -13.212 -14.01 -14.689 -15.288 -15.834 -16.333 -16.802 -17.238 -17.682 -18.078 -18.431 -18.799 -19.169 -19.463 -19.767 -20.076 -20.312 -20.556 -20.813 -21.072 -21.351 -21.544 -21.751 -22.086 -22.313 -22.543 -22.658 -22.877 -23.09 -23.34 -23.468 -23.594 -23.857 -24.013 -24.17 -24.493 -24.675 -24.887 -25.102 -25.339 -25.637 -26.011 -27.018 -3 ,338 ,TETRA ,17617510,Tue Nov 30 08:14:35 CET,Tue Nov 30 09:53:50 CET,0.0 0.584 0.803 0.976 1.143 1.275 1.376 1.473 1.674 1.773 1.865 2.047 2.096 2.157 2.266 2.368 2.483 2.541 2.644 2.739 2.866 2.948 3.031 3.136 3.226 3.324 3.421 3.497 3.588 3.692 3.793 3.884 3.95 4.008 4.075 4.147 4.217 4.306 4.383 4.436 4.456 4.444 4.418 4.384 4.313 4.068 3.565 2.884 2.058 0.839 -1.365 -3.989 -6.021 -7.74 -9.245 -10.566 -11.659 -12.647 -13.501 -14.333 -15.04 -15.639 -16.21 -16.77 -17.273 -17.702 -18.145 -18.558 -18.908 -19.256 -19.621 -19.917 -20.226 -20.555 -20.807 -21.059 -21.314 -21.584 -21.875 -22.072 -22.273 -22.598 -22.825 -23.035 -23.14 -23.378 -23.62 -23.85 -23.968 -24.106 -24.361 -24.506 -24.661 -24.981 -25.157 -25.329 -25.532 -25.77 -26.067 -26.459 -27.55 -4 ,20637 ,TETRA ,17617511,Tue Nov 30 08:14:36 CET,Tue Nov 30 10:04:08 CET,0.0 0.643 0.843 1.018 1.137 1.255 1.374 1.465 1.621 1.704 1.78 1.913 1.95 2.007 2.106 2.191 2.269 2.31 2.385 2.462 2.584 2.656 2.715 2.802 2.89 2.971 3.053 3.132 3.237 3.34 3.427 3.509 3.583 3.654 3.723 3.773 3.833 3.905 3.949 3.977 3.993 3.976 3.908 3.795 3.606 3.359 3.07 2.577 1.769 0.525 -1.823 -4.733 -6.962 -8.763 -10.323 -11.671 -12.782 -13.74 -14.548 -15.347 -16.028 -16.635 -17.207 -17.739 -18.232 -18.673 -19.123 -19.509 -19.83 -20.15 -20.485 -20.785 -21.099 -21.408 -21.632 -21.869 -22.142 -22.424 -22.696 -22.88 -23.066 -23.368 -23.584 -23.809 -23.924 -24.147 -24.382 -24.648 -24.793 -24.953 -25.245 -25.397 -25.561 -25.924 -26.121 -26.34 -26.577 -26.826 -27.092 -27.454 -28.188 -5 ,30612 ,TETRA ,17617512,Tue Nov 30 08:16:34 CET,Tue Nov 30 10:02:22 CET,0.0 0.606 0.872 1.069 1.214 1.334 1.464 1.585 1.773 1.846 1.92 2.101 2.166 2.24 2.368 2.48 2.571 2.621 2.723 2.82 2.953 3.037 3.12 3.238 3.35 3.442 3.517 3.582 3.67 3.755 3.83 3.902 3.963 4.024 4.089 4.165 4.237 4.286 4.303 4.3 4.311 4.324 4.276 4.179 4.078 3.891 3.493 2.953 2.099 0.613 -1.801 -4.572 -6.758 -8.538 -10.05 -11.375 -12.487 -13.458 -14.279 -15.084 -15.763 -16.368 -16.946 -17.464 -17.95 -18.399 -18.847 -19.251 -19.609 -19.965 -20.331 -20.654 -20.991 -21.333 -21.578 -21.813 -22.058 -22.325 -22.598 -22.774 -22.963 -23.265 -23.467 -23.684 -23.802 -24.052 -24.3 -24.555 -24.69 -24.84 -25.132 -25.275 -25.421 -25.744 -25.906 -26.094 -26.303 -26.533 -26.804 -27.114 -27.917 -6 ,1933 ,TETRA ,17617513,Tue Nov 30 08:16:35 CET,Tue Nov 30 10:08:30 CET,0.0 0.643 0.899 1.101 1.267 1.409 1.513 1.595 1.743 1.809 1.88 2.042 2.088 2.146 2.264 2.371 2.466 2.513 2.607 2.694 2.813 2.88 2.944 3.031 3.097 3.165 3.245 3.317 3.382 3.456 3.524 3.589 3.653 3.711 3.761 3.804 3.84 3.87 3.897 3.91 3.924 3.916 3.843 3.752 3.608 3.379 3.04 2.498 1.623 0.283 -1.925 -4.621 -6.802 -8.604 -10.11 -11.41 -12.52 -13.509 -14.352 -15.163 -15.837 -16.421 -16.985 -17.515 -17.994 -18.44 -18.905 -19.301 -19.628 -19.963 -20.317 -20.622 -20.947 -21.284 -21.541 -21.812 -22.1 -22.394 -22.685 -22.879 -23.062 -23.358 -23.581 -23.796 -23.901 -24.137 -24.396 -24.65 -24.779 -24.913 -25.17 -25.316 -25.471 -25.796 -25.977 -26.184 -26.414 -26.674 -26.974 -27.314 -28.248 -7 ,7844 ,TETRA ,17617514,Tue Nov 30 08:16:35 CET,Tue Nov 30 10:09:14 CET,0.0 0.531 0.755 0.942 1.093 1.198 1.298 1.4 1.576 1.665 1.742 1.883 1.922 1.971 2.055 2.135 2.211 2.244 2.313 2.388 2.486 2.539 2.591 2.66 2.713 2.769 2.822 2.87 2.936 3.003 3.058 3.099 3.14 3.197 3.264 3.323 3.368 3.395 3.41 3.436 3.434 3.436 3.46 3.436 3.325 3.122 2.809 2.292 1.431 0.111 -1.992 -4.48 -6.581 -8.314 -9.76 -11.027 -12.088 -13.007 -13.79 -14.548 -15.164 -15.698 -16.192 -16.653 -17.095 -17.508 -17.943 -18.325 -18.643 -18.986 -19.36 -19.65 -19.921 -20.207 -20.451 -20.698 -20.94 -21.194 -21.451 -21.63 -21.814 -22.08 -22.261 -22.442 -22.536 -22.74 -22.94 -23.153 -23.269 -23.393 -23.649 -23.788 -23.927 -24.214 -24.385 -24.559 -24.732 -24.935 -25.173 -25.487 -26.11 -8 ,5451 ,TETRA ,17617515,Tue Nov 30 08:16:35 CET,Tue Nov 30 10:05:49 CET,0.0 0.768 1.024 1.233 1.412 1.555 1.666 1.754 1.908 1.979 2.061 2.234 2.278 2.336 2.457 2.57 2.679 2.722 2.801 2.883 2.984 3.051 3.127 3.248 3.352 3.448 3.542 3.615 3.692 3.763 3.824 3.885 3.952 4.028 4.124 4.214 4.268 4.324 4.379 4.426 4.438 4.454 4.469 4.375 4.209 3.979 3.629 3.197 2.462 1.114 -1.2 -3.923 -6.061 -7.799 -9.269 -10.567 -11.688 -12.688 -13.536 -14.388 -15.1 -15.726 -16.313 -16.851 -17.372 -17.862 -18.362 -18.795 -19.155 -19.518 -19.885 -20.175 -20.49 -20.816 -21.045 -21.293 -21.551 -21.803 -22.06 -22.237 -22.425 -22.707 -22.913 -23.131 -23.241 -23.466 -23.702 -23.955 -24.086 -24.242 -24.541 -24.688 -24.851 -25.22 -25.409 -25.601 -25.814 -26.05 -26.302 -26.621 -27.403 -9 ,27178 ,TETRA ,17617516,Tue Nov 30 08:16:35 CET,Tue Nov 30 10:06:59 CET,0.0 0.66 0.895 1.063 1.204 1.32 1.413 1.489 1.651 1.741 1.831 2.022 2.078 2.148 2.267 2.364 2.455 2.491 2.552 2.621 2.724 2.777 2.839 2.936 3.015 3.098 3.176 3.242 3.34 3.414 3.477 3.591 3.696 3.789 3.873 3.938 4.009 4.069 4.102 4.116 4.129 4.13 4.112 4.072 3.976 3.878 3.666 3.16 2.467 1.53 -0.284 -2.759 -4.859 -6.606 -8.062 -9.382 -10.528 -11.514 -12.337 -13.152 -13.815 -14.402 -14.966 -15.451 -15.899 -16.321 -16.757 -17.156 -17.499 -17.85 -18.215 -18.514 -18.819 -19.126 -19.356 -19.596 -19.849 -20.111 -20.391 -20.591 -20.793 -21.097 -21.304 -21.518 -21.631 -21.862 -22.094 -22.333 -22.454 -22.588 -22.836 -22.978 -23.13 -23.472 -23.658 -23.84 -24.048 -24.295 -24.607 -24.961 -25.77 -10 ,16055 ,TETRA ,17617517,Tue Nov 30 08:17:35 CET,Tue Nov 30 10:07:23 CET,0.0 0.611 0.921 1.109 1.274 1.429 1.556 1.689 1.935 2.021 2.096 2.255 2.298 2.358 2.479 2.581 2.68 2.73 2.82 2.895 3.015 3.104 3.184 3.268 3.346 3.418 3.481 3.546 3.625 3.695 3.747 3.805 3.879 3.962 4.035 4.102 4.163 4.234 4.306 4.331 4.333 4.344 4.368 4.379 4.282 4.055 3.634 2.974 2.074 0.612 -1.876 -4.717 -7.001 -8.849 -10.389 -11.716 -12.832 -13.808 -14.637 -15.445 -16.136 -16.763 -17.34 -17.857 -18.319 -18.727 -19.159 -19.533 -19.839 -20.168 -20.516 -20.803 -21.093 -21.394 -21.628 -21.884 -22.148 -22.408 -22.676 -22.856 -23.05 -23.359 -23.565 -23.771 -23.874 -24.082 -24.308 -24.546 -24.669 -24.799 -25.048 -25.188 -25.343 -25.687 -25.871 -26.065 -26.273 -26.518 -26.816 -27.165 -28.156 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_30_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_30_42.txt deleted file mode 100644 index 598d4db9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_30_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4584 ,TETRA ,17617518,Tue Nov 30 08:17:36 CET,Tue Nov 30 10:04:45 CET,0.0 1.445 1.858 2.171 2.433 2.677 2.913 3.125 3.462 3.613 3.77 3.996 4.201 4.334 4.616 4.895 5.143 5.255 5.473 5.686 6.0 6.209 6.404 6.67 6.917 7.164 7.411 7.655 7.965 8.253 8.533 8.89 9.244 9.574 9.946 10.379 10.816 11.295 11.792 12.329 12.931 13.614 14.392 15.165 16.054 17.05 18.267 19.662 21.268 23.194 25.595 27.532 28.645 29.395 29.918 30.269 30.486 30.644 30.742 30.796 30.812 30.835 30.863 30.864 30.855 30.835 30.8 30.768 30.741 30.705 30.657 30.605 30.547 30.484 30.437 30.38 30.298 30.217 30.151 30.106 30.055 29.962 29.892 29.814 29.771 29.675 29.566 29.439 29.376 29.27 29.185 29.116 29.043 28.896 28.812 28.711 28.594 28.453 28.222 27.9 27.034 -2 ,12421 ,TETRA ,17617519,Tue Nov 30 08:17:37 CET,Tue Nov 30 10:00:47 CET,0.0 1.332 1.79 2.103 2.351 2.565 2.773 2.972 3.328 3.491 3.637 3.849 4.067 4.2 4.453 4.708 4.938 5.05 5.281 5.494 5.827 6.047 6.24 6.501 6.763 7.026 7.288 7.563 7.902 8.198 8.48 8.821 9.156 9.486 9.882 10.349 10.798 11.269 11.768 12.318 12.91 13.582 14.391 15.208 16.135 17.208 18.464 19.871 21.574 23.657 26.165 28.209 29.448 30.189 30.662 31.031 31.293 31.474 31.567 31.62 31.641 31.64 31.661 31.669 31.653 31.639 31.615 31.579 31.537 31.488 31.44 31.408 31.359 31.294 31.242 31.188 31.134 31.08 31.02 30.973 30.911 30.805 30.742 30.678 30.639 30.556 30.469 30.378 30.326 30.217 30.15 30.082 30.008 29.848 29.733 29.594 29.467 29.34 29.179 28.97 28.253 -3 ,30830 ,TETRA ,17617520,Tue Nov 30 08:17:37 CET,Tue Nov 30 10:03:52 CET,0.0 1.235 1.671 1.999 2.263 2.467 2.659 2.86 3.199 3.352 3.504 3.722 3.922 4.049 4.301 4.548 4.783 4.897 5.131 5.357 5.664 5.845 6.035 6.327 6.611 6.87 7.115 7.367 7.704 8.003 8.287 8.651 9.003 9.346 9.74 10.175 10.583 11.05 11.59 12.197 12.854 13.572 14.354 15.128 16.062 17.103 18.337 19.767 21.372 23.228 25.55 27.502 28.694 29.465 29.954 30.288 30.528 30.704 30.798 30.853 30.882 30.875 30.85 30.828 30.807 30.773 30.726 30.677 30.627 30.577 30.524 30.473 30.41 30.331 30.27 30.218 30.161 30.089 29.997 29.939 29.891 29.803 29.74 29.677 29.639 29.553 29.478 29.39 29.329 29.227 29.18 29.12 29.054 28.91 28.814 28.691 28.554 28.426 28.287 28.084 27.538 -4 ,6735 ,TETRA ,17617521,Tue Nov 30 08:18:36 CET,Tue Nov 30 10:05:18 CET,0.0 0.728 1.093 1.362 1.583 1.789 1.982 2.157 2.513 2.694 2.874 3.141 3.361 3.499 3.747 3.971 4.18 4.29 4.507 4.718 5.04 5.247 5.444 5.721 5.991 6.26 6.508 6.743 7.053 7.354 7.637 8.007 8.381 8.723 9.12 9.579 10.021 10.514 11.052 11.596 12.181 12.859 13.615 14.392 15.322 16.352 17.59 19.008 20.637 22.592 25.007 26.958 28.152 29.011 29.594 30.001 30.303 30.509 30.629 30.697 30.734 30.768 30.791 30.819 30.826 30.812 30.783 30.744 30.705 30.654 30.604 30.572 30.517 30.452 30.411 30.359 30.293 30.223 30.162 30.119 30.061 29.962 29.896 29.815 29.773 29.681 29.564 29.418 29.343 29.236 29.146 29.069 28.99 28.809 28.701 28.603 28.505 28.332 28.104 27.858 27.11 -5 ,17023 ,TETRA ,17617522,Tue Nov 30 08:18:35 CET,Tue Nov 30 10:08:10 CET,0.0 1.205 1.531 1.811 2.05 2.262 2.469 2.672 3.055 3.224 3.385 3.651 3.875 4.004 4.248 4.479 4.699 4.814 5.036 5.249 5.562 5.755 5.941 6.24 6.524 6.78 7.032 7.272 7.586 7.909 8.222 8.582 8.939 9.289 9.685 10.125 10.568 11.058 11.563 12.114 12.707 13.387 14.207 15.031 16.02 17.127 18.418 19.942 21.749 23.908 26.559 28.755 30.008 30.83 31.392 31.733 31.945 32.106 32.204 32.294 32.372 32.413 32.433 32.447 32.443 32.418 32.378 32.344 32.306 32.257 32.207 32.158 32.094 32.014 31.948 31.88 31.818 31.743 31.663 31.608 31.547 31.444 31.37 31.296 31.256 31.173 31.074 30.967 30.911 30.803 30.719 30.646 30.563 30.402 30.317 30.211 30.07 29.914 29.728 29.397 28.65 -6 ,6109 ,TETRA ,17617523,Tue Nov 30 08:18:38 CET,Tue Nov 30 10:08:51 CET,0.0 1.004 1.399 1.732 2.011 2.265 2.5 2.682 2.99 3.16 3.321 3.514 3.706 3.831 4.082 4.324 4.558 4.678 4.902 5.107 5.397 5.582 5.77 6.053 6.308 6.558 6.81 7.043 7.351 7.652 7.958 8.328 8.675 9.013 9.429 9.896 10.325 10.805 11.326 11.879 12.463 13.099 13.856 14.666 15.635 16.694 17.906 19.277 20.848 22.789 25.249 27.253 28.427 29.152 29.652 30.018 30.234 30.38 30.488 30.544 30.578 30.609 30.615 30.609 30.592 30.562 30.523 30.491 30.469 30.434 30.383 30.326 30.248 30.176 30.125 30.069 30.006 29.937 29.86 29.794 29.725 29.636 29.575 29.497 29.448 29.354 29.262 29.157 29.1 28.995 28.937 28.885 28.829 28.686 28.579 28.461 28.322 28.14 27.912 27.604 26.953 -7 ,14063 ,TETRA ,17617524,Tue Nov 30 08:19:35 CET,Tue Nov 30 10:05:28 CET,0.0 1.279 1.719 2.035 2.316 2.551 2.761 2.953 3.291 3.449 3.6 3.831 4.043 4.179 4.427 4.669 4.909 5.017 5.216 5.426 5.72 5.912 6.09 6.334 6.582 6.838 7.076 7.304 7.628 7.944 8.252 8.627 8.988 9.342 9.737 10.167 10.586 11.068 11.608 12.18 12.764 13.424 14.244 15.1 16.087 17.22 18.601 20.092 21.749 23.749 26.124 28.026 29.219 30.037 30.571 30.915 31.147 31.319 31.449 31.555 31.618 31.634 31.634 31.633 31.607 31.582 31.552 31.511 31.484 31.445 31.366 31.287 31.207 31.128 31.065 30.991 30.92 30.852 30.773 30.708 30.63 30.5 30.422 30.347 30.308 30.223 30.12 30.01 29.953 29.843 29.745 29.667 29.583 29.375 29.248 29.114 28.987 28.855 28.712 28.43 27.584 -8 ,17584 ,TETRA ,17617525,Tue Nov 30 08:21:35 CET,Tue Nov 30 10:07:11 CET,0.0 0.989 1.362 1.673 1.946 2.18 2.389 2.581 2.925 3.085 3.245 3.47 3.674 3.816 4.069 4.314 4.557 4.669 4.883 5.08 5.371 5.555 5.744 6.048 6.323 6.587 6.838 7.078 7.39 7.696 7.998 8.371 8.723 9.07 9.471 9.92 10.368 10.848 11.378 11.943 12.534 13.245 14.074 14.868 15.805 16.898 18.234 19.711 21.434 23.54 26.139 28.389 29.66 30.441 30.967 31.33 31.586 31.755 31.844 31.907 31.923 31.923 31.929 31.926 31.918 31.891 31.84 31.773 31.715 31.665 31.598 31.534 31.464 31.383 31.319 31.253 31.189 31.105 31.025 30.978 30.918 30.81 30.737 30.661 30.617 30.526 30.427 30.321 30.259 30.146 30.062 29.987 29.902 29.705 29.604 29.488 29.35 29.196 29.026 28.806 28.1 -9 ,4754 ,TETRA ,17617526,Tue Nov 30 08:21:35 CET,Tue Nov 30 10:05:56 CET,0.0 0.924 1.318 1.591 1.815 2.032 2.249 2.446 2.794 2.97 3.136 3.361 3.569 3.694 3.933 4.168 4.406 4.52 4.737 4.946 5.262 5.458 5.646 5.931 6.204 6.464 6.718 6.972 7.292 7.622 7.954 8.332 8.696 9.045 9.452 9.922 10.354 10.824 11.353 11.91 12.505 13.196 13.974 14.741 15.662 16.729 17.925 19.32 21.008 22.97 25.382 27.412 28.629 29.407 29.919 30.261 30.535 30.753 30.895 30.989 31.044 31.07 31.062 31.034 30.994 30.968 30.944 30.901 30.85 30.79 30.727 30.675 30.607 30.53 30.475 30.406 30.34 30.281 30.208 30.148 30.087 30.006 29.942 29.853 29.809 29.726 29.635 29.539 29.488 29.383 29.281 29.194 29.108 28.908 28.794 28.685 28.554 28.41 28.242 27.996 27.287 -10 ,25000 ,TETRA ,17617527,Tue Nov 30 08:23:34 CET,Tue Nov 30 10:08:04 CET,0.0 0.989 1.403 1.689 1.939 2.173 2.388 2.579 2.938 3.103 3.256 3.456 3.652 3.776 4.018 4.269 4.512 4.628 4.864 5.092 5.421 5.64 5.839 6.126 6.395 6.63 6.877 7.136 7.467 7.782 8.081 8.442 8.773 9.081 9.467 9.901 10.317 10.786 11.293 11.828 12.38 13.063 13.91 14.76 15.763 16.88 18.148 19.575 21.26 23.297 25.732 27.727 28.992 29.832 30.357 30.746 30.997 31.148 31.247 31.318 31.348 31.346 31.348 31.336 31.306 31.286 31.26 31.216 31.164 31.099 31.025 30.972 30.926 30.87 30.818 30.758 30.697 30.633 30.556 30.507 30.448 30.334 30.248 30.167 30.129 30.049 29.968 29.888 29.836 29.731 29.663 29.592 29.519 29.356 29.257 29.137 29.003 28.868 28.686 28.385 27.447 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_338_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_338_252.txt deleted file mode 100644 index 9087645e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_338_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9040 ,TETRA ,17617528,Tue Nov 30 08:26:34 CET,Tue Nov 30 10:17:24 CET,0.0 0.785 1.106 1.322 1.493 1.664 1.827 1.972 2.215 2.336 2.453 2.4 2.732 2.825 3.013 3.193 3.37 3.457 3.614 3.744 3.921 4.052 4.196 4.416 4.623 4.808 4.975 5.128 5.316 5.491 5.687 5.932 6.127 6.313 6.533 6.769 7.005 7.285 7.602 7.928 8.286 8.721 9.205 9.621 10.035 10.498 11.054 11.655 12.3 12.803 12.987 12.796 12.432 11.948 11.409 10.852 10.311 9.824 9.451 9.081 8.732 8.379 8.063 7.804 7.539 7.301 7.03 6.752 6.526 6.309 6.05 5.831 5.633 5.42 5.252 5.092 4.924 4.742 4.561 4.433 4.308 4.125 3.995 3.849 3.766 3.602 3.437 3.265 3.171 2.817 2.8 2.682 2.564 2.281 2.112 1.925 1.754 1.548 1.277 0.942 0.074 -2 ,32391 ,TETRA ,17617529,Tue Nov 30 08:26:35 CET,Tue Nov 30 10:03:11 CET,0.0 0.893 1.256 1.51 1.705 1.88 2.043 2.189 2.451 2.555 2.652 2.603 2.931 3.028 3.219 3.413 3.629 3.73 3.911 4.094 4.377 4.55 4.697 4.885 5.061 5.238 5.417 5.598 5.82 6.022 6.214 6.438 6.654 6.87 7.133 7.464 7.797 8.133 8.45 8.739 9.017 9.307 9.629 9.989 10.442 10.932 11.454 12.011 12.618 13.087 13.181 12.924 12.516 12.044 11.582 11.127 10.701 10.307 9.941 9.558 9.241 8.928 8.568 8.21 7.889 7.56 7.204 6.912 6.681 6.471 6.237 6.009 5.785 5.552 5.372 5.181 4.966 4.743 4.523 4.369 4.202 3.96 3.811 3.66 3.571 3.388 3.179 2.96 2.865 2.526 2.534 2.408 2.277 1.989 1.827 1.644 1.436 1.217 0.926 0.513 -0.513 -3 ,24532 ,TETRA ,17617530,Tue Nov 30 08:27:35 CET,Tue Nov 30 10:09:57 CET,0.0 0.883 1.254 1.563 1.857 2.114 2.353 2.564 2.917 3.103 3.308 3.393 3.854 4.018 4.319 4.604 4.898 5.052 5.36 5.667 6.122 6.41 6.66 7.001 7.346 7.661 7.96 8.26 8.641 8.955 9.189 9.439 9.66 9.874 10.128 10.395 10.629 10.904 11.242 11.613 11.956 12.305 12.678 13.002 13.337 13.704 14.108 14.522 14.939 15.213 15.194 14.698 14.07 13.565 13.104 12.596 12.136 11.739 11.39 11.02 10.678 10.365 10.002 9.618 9.29 8.981 8.657 8.395 8.169 7.934 7.654 7.415 7.197 6.962 6.77 6.566 6.343 6.105 5.886 5.745 5.588 5.336 5.165 4.978 4.878 4.692 4.509 4.298 4.182 3.819 3.79 3.655 3.516 3.185 2.992 2.757 2.475 2.189 1.883 1.512 0.75 -4 ,7737 ,TETRA ,17617531,Tue Nov 30 08:27:34 CET,Tue Nov 30 10:10:05 CET,0.0 0.626 0.954 1.242 1.491 1.731 1.966 2.185 2.574 2.759 2.945 3.007 3.443 3.595 3.931 4.262 4.557 4.704 4.948 5.133 5.392 5.538 5.656 5.829 6.0 6.165 6.357 6.566 6.838 7.073 7.258 7.477 7.695 7.908 8.141 8.409 8.671 8.956 9.263 9.59 9.936 10.299 10.692 11.06 11.47 11.91 12.402 12.872 13.296 13.657 13.848 13.571 13.076 12.564 12.082 11.599 11.105 10.63 10.235 9.85 9.482 9.148 8.839 8.563 8.317 8.061 7.743 7.476 7.284 7.072 6.82 6.611 6.405 6.203 6.046 5.862 5.657 5.441 5.212 5.05 4.903 4.602 4.325 4.053 3.929 3.681 3.393 3.085 2.925 2.493 2.449 2.284 2.123 1.788 1.611 1.416 1.176 0.887 0.593 0.28 -0.602 -5 ,24257 ,TETRA ,17617532,Tue Nov 30 08:28:35 CET,Tue Nov 30 10:22:35 CET,0.0 0.647 1.005 1.318 1.578 1.823 2.057 2.266 2.65 2.824 2.981 3.012 3.452 3.616 3.928 4.188 4.389 4.478 4.655 4.82 5.066 5.249 5.464 5.794 6.091 6.314 6.454 6.593 6.792 6.978 7.147 7.341 7.559 7.796 8.019 8.225 8.415 8.63 8.899 9.213 9.51 9.804 10.123 10.428 10.753 11.081 11.454 11.833 12.198 12.461 12.426 11.979 11.386 10.795 10.265 9.773 9.309 8.868 8.483 8.1 7.745 7.432 7.154 6.876 6.617 6.394 6.129 5.874 5.659 5.445 5.228 5.03 4.833 4.645 4.508 4.376 4.235 4.078 3.913 3.799 3.672 3.451 3.288 3.14 3.071 2.915 2.73 2.521 2.414 2.07 2.085 1.963 1.839 1.586 1.453 1.306 1.136 0.953 0.752 0.477 -0.305 -6 ,9704 ,TETRA ,17617533,Tue Nov 30 08:28:36 CET,Tue Nov 30 10:17:21 CET,0.0 0.484 0.709 0.903 1.075 1.22 1.364 1.514 1.788 1.911 2.033 2.016 2.359 2.457 2.642 2.817 2.985 3.066 3.244 3.422 3.646 3.779 3.898 4.061 4.227 4.391 4.572 4.759 4.993 5.206 5.381 5.584 5.786 5.983 6.234 6.519 6.754 6.995 7.253 7.512 7.785 8.11 8.522 8.902 9.285 9.651 9.978 10.245 10.51 10.753 10.649 10.116 9.471 8.846 8.239 7.636 7.08 6.557 6.131 5.72 5.362 5.036 4.713 4.387 4.082 3.805 3.521 3.261 3.006 2.746 2.464 2.212 1.967 1.704 1.487 1.257 1.034 0.81 0.58 0.421 0.244 -0.055 -0.263 -0.481 -0.59 -0.796 -1.02 -1.245 -1.347 -1.691 -1.696 -1.833 -1.973 -2.246 -2.398 -2.563 -2.726 -2.925 -3.169 -3.517 -4.209 -7 ,12543 ,TETRA ,17617534,Tue Nov 30 08:28:36 CET,Tue Nov 30 10:16:36 CET,0.0 0.91 1.295 1.617 1.896 2.146 2.365 2.552 2.909 3.097 3.292 3.37 3.807 3.963 4.275 4.595 4.92 5.067 5.349 5.638 6.076 6.328 6.501 6.714 6.924 7.111 7.273 7.41 7.598 7.786 7.955 8.147 8.331 8.514 8.736 8.989 9.239 9.536 9.883 10.252 10.592 10.915 11.32 11.82 12.345 12.793 13.292 13.81 14.261 14.739 15.085 14.746 14.18 13.683 13.229 12.765 12.317 11.879 11.45 10.985 10.582 10.219 9.881 9.563 9.223 8.91 8.637 8.39 8.148 7.858 7.536 7.27 7.003 6.729 6.509 6.288 6.056 5.817 5.587 5.426 5.258 4.999 4.829 4.66 4.571 4.398 4.22 4.034 3.931 3.573 3.567 3.43 3.292 3.014 2.876 2.724 2.533 2.301 2.056 1.783 1.099 -8 ,25847 ,TETRA ,17617535,Tue Nov 30 08:30:36 CET,Tue Nov 30 10:21:17 CET,0.0 0.719 0.981 1.205 1.419 1.609 1.769 1.903 2.138 2.243 2.352 2.327 2.667 2.764 2.95 3.142 3.324 3.403 3.538 3.664 3.896 4.059 4.182 4.36 4.555 4.739 4.907 5.064 5.265 5.447 5.618 5.822 6.017 6.197 6.408 6.655 6.879 7.126 7.41 7.699 7.999 8.346 8.749 9.143 9.589 10.094 10.643 11.181 11.763 12.301 12.568 12.428 12.024 11.525 10.979 10.426 9.897 9.387 8.945 8.477 8.055 7.711 7.418 7.116 6.826 6.577 6.323 6.087 5.882 5.651 5.374 5.144 4.93 4.722 4.559 4.401 4.251 4.081 3.897 3.767 3.63 3.419 3.279 3.141 3.065 2.899 2.7 2.424 2.265 1.842 1.81 1.639 1.469 1.122 0.936 0.709 0.459 0.178 -0.154 -0.57 -1.478 -9 ,16019 ,TETRA ,17617536,Tue Nov 30 08:31:36 CET,Tue Nov 30 10:28:06 CET,0.0 0.836 1.082 1.292 1.468 1.62 1.766 1.902 2.145 2.273 2.406 2.402 2.738 2.832 3.02 3.21 3.409 3.506 3.673 3.82 4.041 4.185 4.331 4.534 4.721 4.916 5.083 5.23 5.441 5.677 5.925 6.205 6.44 6.669 6.94 7.222 7.494 7.791 8.114 8.464 8.814 9.185 9.619 10.067 10.57 11.086 11.676 12.294 12.866 13.441 13.802 13.443 12.731 12.045 11.407 10.79 10.26 9.739 9.216 8.652 8.215 7.868 7.514 7.144 6.781 6.445 6.124 5.857 5.61 5.355 5.089 4.867 4.652 4.377 4.13 3.89 3.67 3.457 3.225 3.064 2.902 2.597 2.341 2.034 1.869 1.552 1.227 0.888 0.719 0.257 0.151 -0.053 -0.255 -0.676 -0.888 -1.112 -1.371 -1.648 -1.96 -2.344 -3.164 -10 ,21766 ,TETRA ,17617537,Tue Nov 30 08:33:38 CET,Tue Nov 30 10:29:26 CET,0.0 0.765 1.117 1.372 1.56 1.745 1.928 2.097 2.44 2.594 2.718 2.679 3.023 3.118 3.304 3.498 3.667 3.75 3.924 4.074 4.269 4.4 4.523 4.681 4.838 4.987 5.135 5.29 5.48 5.661 5.842 6.042 6.231 6.423 6.638 6.888 7.135 7.401 7.704 8.041 8.38 8.72 9.089 9.438 9.802 10.225 10.715 11.169 11.613 12.04 12.072 11.516 10.852 10.212 9.632 9.057 8.529 7.987 7.499 7.067 6.693 6.345 5.964 5.616 5.341 5.069 4.745 4.433 4.203 3.989 3.759 3.557 3.322 3.08 2.9 2.71 2.517 2.335 2.156 2.029 1.886 1.652 1.492 1.329 1.24 1.057 0.867 0.663 0.552 0.19 0.18 0.045 -0.09 -0.385 -0.539 -0.688 -0.854 -1.038 -1.276 -1.613 -2.484 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_338_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_338_336.txt deleted file mode 100644 index a0eddc86..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_338_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27784 ,TETRA ,17617538,Tue Nov 30 08:34:38 CET,Tue Nov 30 10:24:50 CET,0.0 0.728 0.979 1.154 1.297 1.44 1.587 1.723 1.962 2.079 2.188 2.127 2.459 2.561 2.754 2.931 3.104 3.184 3.333 3.497 3.74 3.867 3.973 4.123 4.266 4.406 4.562 4.705 4.862 5.012 5.144 5.302 5.496 5.67 5.852 6.084 6.331 6.603 6.811 6.973 7.144 7.355 7.587 7.829 8.092 8.297 8.476 8.567 8.566 8.344 7.583 6.343 5.114 4.027 3.113 2.247 1.468 0.781 0.156 -0.472 -0.984 -1.414 -1.835 -2.288 -2.691 -3.04 -3.401 -3.725 -3.992 -4.285 -4.621 -4.878 -5.139 -5.424 -5.636 -5.839 -6.076 -6.317 -6.535 -6.686 -6.861 -7.167 -7.396 -7.633 -7.744 -7.967 -8.219 -8.484 -8.631 -9.029 -9.051 -9.205 -9.383 -9.779 -10.003 -10.244 -10.499 -10.794 -11.129 -11.561 -12.609 -2 ,14537 ,TETRA ,17617539,Tue Nov 30 08:37:40 CET,Tue Nov 30 10:25:00 CET,0.0 0.505 0.742 0.96 1.152 1.312 1.448 1.568 1.783 1.881 1.961 1.859 2.169 2.242 2.394 2.543 2.696 2.775 2.909 3.015 3.175 3.287 3.404 3.591 3.783 3.969 4.147 4.297 4.456 4.619 4.794 5.032 5.242 5.404 5.601 5.823 6.04 6.27 6.483 6.71 6.955 7.197 7.431 7.627 7.829 8.034 8.228 8.31 8.207 7.897 7.112 5.856 4.705 3.642 2.699 1.859 1.119 0.467 -0.078 -0.628 -1.136 -1.6 -2.055 -2.482 -2.861 -3.245 -3.629 -3.94 -4.214 -4.491 -4.826 -5.135 -5.447 -5.756 -5.977 -6.196 -6.452 -6.718 -6.979 -7.17 -7.353 -7.628 -7.837 -8.065 -8.185 -8.432 -8.673 -8.917 -9.04 -9.412 -9.481 -9.663 -9.839 -10.187 -10.362 -10.528 -10.71 -10.924 -11.199 -11.543 -12.253 -3 ,571 ,TETRA ,17617540,Tue Nov 30 08:39:37 CET,Tue Nov 30 10:21:58 CET,0.0 1.059 1.432 1.762 2.04 2.31 2.557 2.782 3.215 3.421 3.619 3.699 4.146 4.299 4.61 4.913 5.203 5.343 5.596 5.831 6.177 6.403 6.61 6.904 7.168 7.36 7.517 7.673 7.875 8.064 8.252 8.476 8.677 8.864 9.101 9.351 9.53 9.721 9.906 10.08 10.271 10.467 10.667 10.853 11.061 11.227 11.305 11.415 11.561 11.452 10.665 9.288 8.04 6.973 6.076 5.251 4.526 3.876 3.324 2.733 2.221 1.778 1.347 0.937 0.559 0.221 -0.135 -0.457 -0.745 -1.045 -1.359 -1.616 -1.888 -2.171 -2.375 -2.566 -2.759 -2.965 -3.199 -3.376 -3.568 -3.879 -4.099 -4.321 -4.424 -4.636 -4.859 -5.069 -5.176 -5.553 -5.611 -5.783 -5.963 -6.347 -6.543 -6.75 -6.986 -7.247 -7.537 -7.92 -8.867 -4 ,5698 ,TETRA ,17617541,Tue Nov 30 08:42:39 CET,Tue Nov 30 10:37:03 CET,0.0 0.684 0.942 1.164 1.368 1.556 1.747 1.931 2.225 2.351 2.469 2.429 2.747 2.825 2.975 3.117 3.253 3.325 3.477 3.618 3.811 3.929 4.058 4.267 4.463 4.651 4.796 4.914 5.122 5.352 5.535 5.719 5.893 6.039 6.199 6.393 6.584 6.801 7.049 7.289 7.503 7.718 7.931 8.111 8.304 8.488 8.66 8.78 8.8 8.669 8.033 6.879 5.791 4.826 3.967 3.048 2.253 1.638 1.082 0.477 -0.058 -0.486 -0.86 -1.214 -1.538 -1.826 -2.124 -2.393 -2.622 -2.869 -3.152 -3.399 -3.658 -3.915 -4.125 -4.355 -4.574 -4.797 -5.054 -5.26 -5.473 -5.797 -6.024 -6.234 -6.338 -6.566 -6.797 -7.076 -7.244 -7.644 -7.639 -7.782 -7.956 -8.385 -8.62 -8.886 -9.198 -9.577 -10.014 -10.552 -11.981 -5 ,624 ,TETRA ,17617542,Tue Nov 30 08:44:40 CET,Tue Nov 30 10:32:27 CET,0.0 0.817 1.167 1.502 1.811 2.106 2.38 2.616 3.062 3.285 3.498 3.579 4.019 4.169 4.393 4.573 4.752 4.837 5.002 5.181 5.409 5.529 5.657 5.853 6.053 6.257 6.434 6.575 6.755 6.938 7.148 7.396 7.615 7.818 8.035 8.287 8.5 8.698 8.929 9.17 9.376 9.589 9.834 10.034 10.225 10.463 10.732 10.984 11.16 10.968 10.188 9.042 7.961 6.877 5.821 4.873 4.08 3.343 2.687 2.044 1.472 0.926 0.402 -0.051 -0.435 -0.785 -1.137 -1.452 -1.757 -2.08 -2.419 -2.703 -3.01 -3.351 -3.623 -3.892 -4.162 -4.44 -4.718 -4.91 -5.118 -5.423 -5.626 -5.842 -5.953 -6.201 -6.456 -6.727 -6.879 -7.286 -7.398 -7.58 -7.74 -8.089 -8.29 -8.508 -8.75 -8.998 -9.275 -9.697 -10.851 -6 ,9394 ,TETRA ,17617543,Tue Nov 30 08:48:39 CET,Tue Nov 30 10:39:23 CET,0.0 0.876 1.227 1.492 1.714 1.912 2.096 2.254 2.48 2.577 2.677 2.619 2.947 3.046 3.235 3.411 3.556 3.625 3.769 3.899 4.062 4.161 4.266 4.419 4.572 4.727 4.896 5.084 5.394 5.674 5.825 5.967 6.105 6.24 6.394 6.566 6.733 6.921 7.113 7.277 7.436 7.602 7.778 7.957 8.135 8.281 8.421 8.487 8.45 8.218 7.465 6.316 5.255 4.297 3.409 2.539 1.82 1.201 0.649 0.082 -0.464 -0.954 -1.376 -1.751 -2.096 -2.412 -2.745 -3.038 -3.297 -3.594 -3.894 -4.125 -4.404 -4.72 -4.94 -5.14 -5.344 -5.575 -5.832 -6.015 -6.198 -6.498 -6.697 -6.884 -6.982 -7.187 -7.405 -7.634 -7.756 -8.136 -8.177 -8.339 -8.499 -8.838 -9.023 -9.215 -9.434 -9.686 -10.023 -10.425 -11.229 -7 ,10745 ,TETRA ,17617544,Tue Nov 30 08:50:41 CET,Tue Nov 30 10:38:23 CET,0.0 0.99 1.373 1.676 1.946 2.18 2.393 2.599 2.974 3.141 3.298 3.306 3.726 3.866 4.13 4.33 4.495 4.587 4.8 5.036 5.385 5.593 5.778 5.995 6.15 6.283 6.401 6.533 6.713 6.878 7.036 7.221 7.405 7.579 7.788 8.022 8.232 8.471 8.7 8.949 9.248 9.553 9.853 10.098 10.311 10.57 10.885 11.121 11.168 10.919 10.059 8.702 7.468 6.394 5.478 4.66 3.92 3.193 2.533 1.893 1.357 0.855 0.367 -0.056 -0.449 -0.804 -1.191 -1.541 -1.842 -2.164 -2.492 -2.796 -3.114 -3.424 -3.681 -3.956 -4.242 -4.548 -4.88 -5.097 -5.305 -5.66 -5.903 -6.134 -6.245 -6.467 -6.724 -7.019 -7.177 -7.576 -7.628 -7.82 -8.049 -8.582 -8.879 -9.197 -9.522 -9.853 -10.26 -10.802 -12.075 -8 ,26302 ,TETRA ,17617545,Tue Nov 30 08:50:41 CET,Tue Nov 30 10:39:39 CET,0.0 1.192 1.589 1.902 2.133 2.342 2.549 2.722 2.979 3.103 3.221 3.191 3.532 3.643 3.84 4.008 4.157 4.226 4.37 4.52 4.726 4.849 4.974 5.144 5.289 5.423 5.56 5.695 5.867 6.03 6.172 6.349 6.519 6.688 6.864 7.042 7.241 7.449 7.646 7.855 8.08 8.342 8.572 8.744 8.955 9.182 9.335 9.437 9.479 9.231 8.485 7.386 6.355 5.37 4.488 3.667 2.911 2.243 1.629 0.996 0.481 0.017 -0.421 -0.84 -1.224 -1.577 -1.973 -2.299 -2.562 -2.87 -3.205 -3.46 -3.716 -3.982 -4.182 -4.399 -4.64 -4.879 -5.12 -5.282 -5.447 -5.733 -5.964 -6.208 -6.329 -6.56 -6.8 -7.056 -7.187 -7.581 -7.651 -7.829 -8.01 -8.385 -8.595 -8.838 -9.117 -9.414 -9.768 -10.253 -11.199 -9 ,24838 ,TETRA ,17617546,Tue Nov 30 08:50:41 CET,Tue Nov 30 10:38:04 CET,0.0 0.811 1.1 1.293 1.45 1.596 1.731 1.847 2.046 2.134 2.222 2.149 2.469 2.547 2.68 2.813 2.951 3.01 3.137 3.268 3.465 3.587 3.683 3.831 3.995 4.146 4.291 4.432 4.587 4.749 4.894 5.045 5.21 5.375 5.538 5.692 5.831 5.993 6.156 6.334 6.521 6.701 6.892 7.053 7.209 7.346 7.492 7.596 7.537 7.192 6.325 5.127 4.023 3.016 2.074 1.199 0.481 -0.167 -0.712 -1.291 -1.84 -2.317 -2.739 -3.112 -3.447 -3.764 -4.1 -4.405 -4.676 -4.944 -5.213 -5.445 -5.69 -5.939 -6.167 -6.431 -6.684 -6.919 -7.177 -7.372 -7.569 -7.862 -8.062 -8.247 -8.332 -8.531 -8.754 -8.979 -9.094 -9.468 -9.497 -9.638 -9.777 -10.076 -10.254 -10.454 -10.659 -10.881 -11.127 -11.431 -12.387 -10 ,13935 ,TETRA ,17617547,Tue Nov 30 08:50:41 CET,Tue Nov 30 10:39:16 CET,0.0 0.735 1.029 1.252 1.436 1.601 1.767 1.953 2.351 2.538 2.715 2.788 3.24 3.394 3.688 3.959 4.217 4.347 4.602 4.858 5.245 5.482 5.654 5.851 6.045 6.212 6.36 6.492 6.67 6.846 6.998 7.205 7.414 7.597 7.824 8.088 8.331 8.578 8.812 9.054 9.317 9.645 10.038 10.306 10.525 10.777 11.047 11.285 11.38 11.188 10.47 9.321 8.252 7.168 6.146 5.327 4.622 3.949 3.385 2.796 2.23 1.738 1.291 0.856 0.462 0.137 -0.186 -0.486 -0.784 -1.088 -1.385 -1.649 -1.928 -2.225 -2.447 -2.676 -2.926 -3.17 -3.434 -3.639 -3.85 -4.182 -4.401 -4.616 -4.717 -4.923 -5.165 -5.426 -5.565 -5.968 -6.041 -6.182 -6.322 -6.724 -6.954 -7.182 -7.426 -7.705 -8.029 -8.457 -9.529 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_35_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_35_41.txt deleted file mode 100644 index 41bf7b57..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_35_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19437 ,TETRA ,17617548,Tue Nov 30 08:51:40 CET,Tue Nov 30 10:39:02 CET,0.0 0.995 1.344 1.623 1.859 2.082 2.282 2.466 2.798 2.948 3.101 3.345 3.543 3.666 3.936 4.197 4.417 4.522 4.715 4.898 5.175 5.354 5.524 5.771 6.022 6.27 6.5 6.727 7.04 7.342 7.638 8.0 8.351 8.671 9.04 9.443 9.816 10.288 10.817 11.311 11.787 12.351 13.028 13.703 14.487 15.378 16.389 17.486 18.743 20.208 21.962 23.335 24.076 24.502 24.736 24.856 24.889 24.864 24.771 24.648 24.548 24.466 24.38 24.265 24.137 23.999 23.839 23.706 23.572 23.414 23.282 23.18 23.038 22.868 22.72 22.581 22.445 22.289 22.121 22.008 21.905 21.724 21.588 21.46 21.389 21.234 21.065 20.863 20.762 20.608 20.444 20.341 20.23 19.984 19.836 19.681 19.496 19.276 19.039 18.695 17.719 -2 ,29168 ,TETRA ,17617549,Tue Nov 30 08:51:39 CET,Tue Nov 30 10:38:09 CET,0.0 0.945 1.316 1.614 1.844 2.048 2.247 2.423 2.72 2.853 2.986 3.202 3.404 3.529 3.761 4.0 4.233 4.34 4.549 4.74 5.03 5.221 5.381 5.611 5.849 6.086 6.306 6.524 6.8 7.063 7.327 7.641 7.941 8.244 8.6 8.996 9.374 9.768 10.188 10.66 11.157 11.702 12.339 12.985 13.75 14.581 15.502 16.527 17.795 19.334 21.139 22.544 23.29 23.706 23.958 24.077 24.092 24.069 24.025 23.956 23.866 23.756 23.628 23.492 23.348 23.187 23.031 22.902 22.769 22.643 22.504 22.363 22.227 22.093 21.97 21.842 21.718 21.585 21.424 21.308 21.191 21.017 20.91 20.793 20.728 20.591 20.449 20.298 20.212 20.069 19.888 19.77 19.659 19.419 19.272 19.099 18.916 18.718 18.499 18.196 16.979 -3 ,5801 ,TETRA ,17617550,Tue Nov 30 08:51:41 CET,Tue Nov 30 10:38:06 CET,0.0 1.117 1.475 1.762 2.005 2.223 2.438 2.652 3.048 3.205 3.347 3.577 3.78 3.902 4.143 4.391 4.623 4.73 4.932 5.146 5.448 5.632 5.792 6.012 6.234 6.438 6.652 6.888 7.176 7.447 7.719 8.035 8.338 8.647 9.0 9.34 9.654 10.027 10.439 10.883 11.373 11.899 12.469 13.066 13.789 14.615 15.562 16.632 17.873 19.263 20.953 22.385 23.115 23.518 23.78 23.92 23.957 23.911 23.87 23.827 23.742 23.651 23.54 23.408 23.292 23.191 23.062 22.931 22.813 22.689 22.544 22.429 22.314 22.163 22.039 21.922 21.801 21.652 21.486 21.363 21.238 21.081 20.97 20.827 20.745 20.576 20.392 20.193 20.098 19.954 19.764 19.636 19.503 19.205 19.041 18.888 18.74 18.528 18.267 17.908 16.731 -4 ,13962 ,TETRA ,17617551,Tue Nov 30 08:51:41 CET,Tue Nov 30 10:39:38 CET,0.0 0.8 1.179 1.482 1.761 1.983 2.168 2.346 2.711 2.88 3.017 3.225 3.438 3.572 3.821 4.055 4.287 4.412 4.642 4.834 5.102 5.266 5.434 5.689 5.925 6.144 6.351 6.561 6.843 7.107 7.379 7.723 8.031 8.312 8.656 9.046 9.404 9.801 10.225 10.676 11.162 11.691 12.324 12.974 13.75 14.589 15.506 16.621 17.955 19.471 21.234 22.727 23.57 24.009 24.294 24.478 24.545 24.54 24.474 24.346 24.226 24.129 24.013 23.89 23.767 23.646 23.515 23.397 23.291 23.148 23.007 22.896 22.766 22.622 22.503 22.374 22.229 22.072 21.914 21.807 21.684 21.476 21.342 21.215 21.141 20.964 20.777 20.571 20.462 20.307 20.145 20.034 19.912 19.617 19.446 19.26 19.076 18.885 18.656 18.357 17.395 -5 ,2255 ,TETRA ,17617552,Tue Nov 30 08:51:41 CET,Tue Nov 30 10:39:04 CET,0.0 1.051 1.446 1.727 1.97 2.17 2.338 2.504 2.833 2.978 3.106 3.285 3.468 3.578 3.798 4.016 4.23 4.329 4.527 4.723 4.987 5.166 5.341 5.579 5.811 6.038 6.25 6.464 6.758 7.04 7.296 7.603 7.901 8.182 8.527 8.934 9.32 9.732 10.153 10.599 11.083 11.632 12.238 12.889 13.663 14.474 15.407 16.471 17.73 19.198 21.004 22.483 23.254 23.679 23.941 24.083 24.138 24.117 24.077 24.02 23.92 23.8 23.686 23.576 23.459 23.356 23.257 23.158 23.05 22.929 22.776 22.642 22.513 22.377 22.265 22.144 22.004 21.835 21.665 21.558 21.455 21.292 21.177 21.049 20.981 20.855 20.712 20.53 20.437 20.296 20.131 20.024 19.903 19.636 19.488 19.32 19.161 18.965 18.715 18.396 17.42 -6 ,6607 ,TETRA ,17617553,Tue Nov 30 08:52:40 CET,Tue Nov 30 10:42:18 CET,0.0 1.102 1.476 1.732 1.932 2.131 2.325 2.499 2.784 2.917 3.053 3.261 3.458 3.578 3.794 4.017 4.232 4.334 4.533 4.724 5.014 5.211 5.384 5.612 5.862 6.097 6.305 6.516 6.808 7.059 7.293 7.603 7.893 8.176 8.533 8.918 9.257 9.638 10.047 10.492 10.976 11.522 12.182 12.836 13.583 14.422 15.386 16.481 17.768 19.236 20.969 22.383 23.19 23.658 23.932 24.088 24.131 24.078 23.992 23.918 23.826 23.722 23.633 23.543 23.448 23.339 23.193 23.036 22.869 22.715 22.593 22.495 22.379 22.24 22.124 22.004 21.878 21.748 21.625 21.537 21.439 21.267 21.137 21.001 20.923 20.749 20.56 20.366 20.26 20.104 19.944 19.842 19.725 19.431 19.279 19.122 18.953 18.769 18.537 18.183 17.036 -7 ,20006 ,TETRA ,17617554,Tue Nov 30 08:52:41 CET,Tue Nov 30 10:40:01 CET,0.0 1.126 1.488 1.768 2.0 2.196 2.389 2.56 2.869 3.026 3.177 3.399 3.598 3.717 3.933 4.145 4.344 4.445 4.658 4.866 5.143 5.309 5.477 5.739 5.987 6.235 6.48 6.709 6.992 7.259 7.527 7.834 8.108 8.378 8.691 9.033 9.369 9.73 10.123 10.578 11.08 11.622 12.24 12.878 13.62 14.447 15.429 16.607 17.986 19.54 21.44 22.987 23.792 24.227 24.484 24.64 24.707 24.689 24.608 24.513 24.43 24.324 24.206 24.069 23.943 23.853 23.757 23.666 23.57 23.447 23.295 23.173 23.035 22.879 22.789 22.685 22.54 22.394 22.249 22.151 22.045 21.863 21.733 21.586 21.514 21.371 21.206 21.045 20.956 20.815 20.667 20.549 20.416 20.102 19.923 19.746 19.551 19.299 19.026 18.712 17.773 -8 ,3908 ,TETRA ,17617555,Tue Nov 30 08:52:41 CET,Tue Nov 30 10:40:25 CET,0.0 1.324 1.722 2.031 2.29 2.524 2.728 2.918 3.261 3.417 3.574 3.794 3.994 4.125 4.37 4.601 4.831 4.942 5.16 5.364 5.645 5.821 5.989 6.264 6.53 6.763 7.006 7.23 7.499 7.778 8.033 8.34 8.64 8.922 9.248 9.628 10.009 10.391 10.797 11.241 11.741 12.329 12.977 13.627 14.339 15.159 16.132 17.198 18.509 20.046 21.807 23.25 24.015 24.454 24.734 24.853 24.889 24.931 24.898 24.812 24.724 24.632 24.528 24.402 24.255 24.088 23.923 23.794 23.682 23.574 23.451 23.331 23.202 23.066 22.961 22.828 22.679 22.526 22.355 22.243 22.13 21.954 21.84 21.716 21.646 21.491 21.331 21.156 21.054 20.897 20.724 20.611 20.489 20.223 20.08 19.918 19.734 19.514 19.228 18.889 17.974 -9 ,19982 ,TETRA ,17617556,Tue Nov 30 08:52:41 CET,Tue Nov 30 10:39:28 CET,0.0 1.165 1.564 1.834 2.072 2.291 2.49 2.685 3.022 3.176 3.329 3.576 3.794 3.936 4.198 4.426 4.639 4.749 4.966 5.168 5.448 5.629 5.802 6.056 6.311 6.564 6.803 7.01 7.27 7.525 7.779 8.09 8.381 8.656 8.986 9.369 9.729 10.109 10.511 10.931 11.386 11.925 12.543 13.146 13.848 14.666 15.632 16.71 17.985 19.46 21.221 22.644 23.417 23.825 24.074 24.206 24.267 24.274 24.245 24.184 24.08 23.98 23.864 23.756 23.664 23.559 23.462 23.353 23.243 23.141 23.026 22.927 22.8 22.633 22.508 22.383 22.245 22.088 21.937 21.852 21.75 21.557 21.423 21.289 21.217 21.068 20.907 20.73 20.641 20.505 20.361 20.245 20.119 19.843 19.671 19.465 19.25 19.036 18.78 18.431 17.637 -10 ,15832 ,TETRA ,17617557,Tue Nov 30 08:53:40 CET,Tue Nov 30 10:43:11 CET,0.0 0.853 1.254 1.542 1.813 2.044 2.228 2.406 2.721 2.863 3.01 3.215 3.406 3.535 3.781 4.011 4.245 4.355 4.537 4.718 5.012 5.197 5.372 5.611 5.843 6.081 6.315 6.556 6.835 7.07 7.32 7.659 7.985 8.282 8.608 8.985 9.382 9.794 10.219 10.703 11.193 11.737 12.41 13.056 13.758 14.549 15.497 16.608 17.886 19.355 21.225 22.741 23.584 24.092 24.354 24.499 24.552 24.551 24.498 24.393 24.287 24.182 24.059 23.931 23.824 23.734 23.608 23.455 23.305 23.147 23.005 22.874 22.709 22.533 22.391 22.256 22.108 21.935 21.766 21.661 21.545 21.34 21.207 21.063 20.983 20.833 20.689 20.527 20.434 20.293 20.137 20.016 19.892 19.639 19.486 19.301 19.093 18.889 18.656 18.299 17.342 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_35_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_35_50.txt deleted file mode 100644 index a55cbc35..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_35_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28188 ,TETRA ,17617558,Tue Nov 30 08:53:41 CET,Tue Nov 30 10:40:53 CET,0.0 0.965 1.194 1.312 1.382 1.425 1.448 1.47 1.519 1.523 1.514 1.409 1.452 1.436 1.407 1.365 1.311 1.283 1.218 1.143 1.014 0.916 0.816 0.66 0.502 0.345 0.191 0.025 -0.212 -0.454 -0.709 -1.041 -1.385 -1.721 -2.12 -2.606 -3.098 -3.672 -4.339 -5.096 -5.962 -7.006 -8.297 -9.72 -11.517 -13.722 -16.53 -20.035 -24.692 -31.059 -40.32 -49.927 -56.968 -62.543 -67.071 -70.936 -74.171 -76.962 -79.265 -81.426 -83.206 -84.745 -86.153 -87.427 -88.562 -89.579 -90.636 -91.541 -92.294 -93.087 -93.9 -94.553 -95.219 -95.895 -96.423 -96.979 -97.516 -98.021 -98.544 -98.898 -99.257 -99.839 -100.244 -100.665 -100.881 -101.332 -101.823 -102.307 -102.555 -102.987 -103.365 -103.627 -103.886 -104.434 -104.732 -105.06 -105.405 -105.78 -106.275 -106.88 -108.805 -2 ,20639 ,TETRA ,17617559,Tue Nov 30 08:58:42 CET,Tue Nov 30 10:57:17 CET,0.0 0.683 0.876 0.985 1.079 1.148 1.188 1.207 1.238 1.245 1.248 1.184 1.24 1.224 1.206 1.182 1.131 1.097 1.033 0.967 0.855 0.772 0.692 0.552 0.397 0.236 0.073 -0.091 -0.327 -0.561 -0.806 -1.116 -1.415 -1.733 -2.133 -2.599 -3.094 -3.681 -4.348 -5.113 -5.977 -6.997 -8.263 -9.68 -11.472 -13.657 -16.46 -19.971 -24.578 -30.817 -39.96 -49.503 -56.656 -62.168 -66.417 -70.0 -72.99 -75.606 -77.757 -79.783 -81.478 -82.935 -84.297 -85.583 -86.746 -87.759 -88.781 -89.659 -90.402 -91.165 -91.937 -92.564 -93.205 -93.87 -94.378 -94.902 -95.452 -96.007 -96.566 -96.94 -97.325 -97.907 -98.296 -98.685 -98.882 -99.287 -99.698 -100.131 -100.365 -100.778 -101.096 -101.334 -101.587 -102.131 -102.429 -102.754 -103.112 -103.483 -103.88 -104.336 -105.699 -3 ,13217 ,TETRA ,17617560,Tue Nov 30 09:10:42 CET,Tue Nov 30 11:00:25 CET,0.0 0.694 0.886 0.985 1.055 1.106 1.141 1.163 1.182 1.182 1.188 1.135 1.197 1.188 1.154 1.115 1.064 1.037 0.974 0.89 0.766 0.675 0.573 0.414 0.252 0.091 -0.071 -0.242 -0.479 -0.714 -0.945 -1.245 -1.565 -1.898 -2.306 -2.794 -3.295 -3.87 -4.527 -5.267 -6.104 -7.115 -8.384 -9.784 -11.574 -13.765 -16.538 -19.974 -24.479 -30.63 -39.691 -49.061 -55.967 -61.403 -65.754 -69.407 -72.378 -74.915 -77.016 -79.063 -80.824 -82.371 -83.776 -85.023 -86.139 -87.149 -88.228 -89.177 -89.95 -90.731 -91.541 -92.195 -92.849 -93.525 -94.041 -94.555 -95.093 -95.643 -96.187 -96.561 -96.947 -97.562 -97.983 -98.395 -98.604 -99.029 -99.472 -99.953 -100.206 -100.623 -100.985 -101.265 -101.542 -102.132 -102.455 -102.797 -103.158 -103.562 -104.037 -104.59 -106.261 -4 ,27098 ,TETRA ,17617561,Tue Nov 30 09:23:43 CET,Tue Nov 30 10:54:44 CET,0.0 0.862 1.082 1.211 1.295 1.355 1.398 1.444 1.502 1.506 1.501 1.419 1.478 1.464 1.43 1.397 1.346 1.315 1.234 1.159 1.052 0.975 0.891 0.753 0.602 0.445 0.284 0.114 -0.12 -0.368 -0.623 -0.939 -1.263 -1.593 -1.995 -2.476 -2.973 -3.559 -4.235 -4.98 -5.819 -6.85 -8.14 -9.543 -11.312 -13.464 -16.186 -19.618 -24.191 -30.427 -39.552 -49.044 -55.955 -61.31 -65.615 -69.215 -72.21 -74.841 -77.038 -79.103 -80.756 -82.171 -83.471 -84.65 -85.724 -86.694 -87.691 -88.535 -89.251 -90.001 -90.762 -91.39 -92.027 -92.649 -93.122 -93.617 -94.122 -94.631 -95.15 -95.513 -95.873 -96.41 -96.793 -97.186 -97.382 -97.773 -98.172 -98.58 -98.791 -99.177 -99.475 -99.71 -99.952 -100.487 -100.755 -101.06 -101.387 -101.704 -102.08 -102.545 -103.847 -5 ,6454 ,TETRA ,17617562,Tue Nov 30 09:24:43 CET,Tue Nov 30 11:27:51 CET,0.0 0.733 0.949 1.088 1.179 1.223 1.263 1.29 1.312 1.312 1.308 1.223 1.271 1.245 1.19 1.122 1.047 1.01 0.929 0.841 0.695 0.593 0.491 0.333 0.168 -0.009 -0.191 -0.369 -0.609 -0.858 -1.117 -1.451 -1.79 -2.151 -2.581 -3.072 -3.585 -4.198 -4.899 -5.68 -6.542 -7.566 -8.857 -10.282 -12.085 -14.246 -16.955 -20.341 -24.819 -30.955 -40.062 -49.502 -56.303 -61.567 -65.816 -69.375 -72.317 -74.913 -77.086 -79.183 -80.893 -82.371 -83.756 -85.006 -86.115 -87.072 -88.036 -88.884 -89.608 -90.34 -91.09 -91.694 -92.328 -92.981 -93.471 -93.979 -94.496 -95.029 -95.574 -95.947 -96.338 -96.959 -97.374 -97.787 -98.0 -98.431 -98.884 -99.359 -99.6 -100.003 -100.337 -100.599 -100.877 -101.485 -101.806 -102.14 -102.519 -102.941 -103.38 -103.919 -105.315 -6 ,25635 ,TETRA ,17617563,Tue Nov 30 09:28:47 CET,Tue Nov 30 11:00:56 CET,0.0 0.669 0.855 0.968 1.045 1.094 1.119 1.144 1.179 1.181 1.182 1.096 1.146 1.133 1.092 1.034 0.983 0.955 0.883 0.797 0.663 0.574 0.481 0.331 0.18 0.033 -0.12 -0.287 -0.521 -0.769 -1.034 -1.372 -1.71 -2.053 -2.474 -2.975 -3.47 -4.042 -4.701 -5.456 -6.293 -7.293 -8.587 -10.036 -11.857 -14.044 -16.821 -20.322 -24.986 -31.352 -40.652 -50.297 -57.321 -62.762 -67.162 -70.823 -73.828 -76.379 -78.488 -80.571 -82.286 -83.741 -85.112 -86.387 -87.536 -88.559 -89.583 -90.494 -91.29 -92.072 -92.852 -93.503 -94.148 -94.789 -95.285 -95.782 -96.28 -96.795 -97.326 -97.678 -98.044 -98.642 -99.062 -99.493 -99.71 -100.143 -100.598 -101.076 -101.328 -101.75 -102.07 -102.306 -102.561 -103.129 -103.416 -103.711 -104.069 -104.45 -104.853 -105.384 -106.732 -7 ,30097 ,TETRA ,17617564,Tue Nov 30 09:28:47 CET,Tue Nov 30 10:57:25 CET,0.0 0.685 0.864 0.985 1.076 1.151 1.207 1.238 1.256 1.251 1.247 1.175 1.239 1.231 1.205 1.164 1.105 1.069 1.001 0.947 0.837 0.748 0.663 0.527 0.379 0.224 0.069 -0.091 -0.315 -0.541 -0.778 -1.102 -1.424 -1.751 -2.163 -2.656 -3.154 -3.738 -4.412 -5.143 -5.958 -6.966 -8.242 -9.658 -11.457 -13.637 -16.373 -19.761 -24.249 -30.369 -39.392 -48.92 -55.894 -61.242 -65.504 -69.083 -72.09 -74.713 -76.844 -78.867 -80.554 -81.998 -83.338 -84.586 -85.716 -86.756 -87.824 -88.775 -89.6 -90.426 -91.273 -91.961 -92.641 -93.315 -93.823 -94.347 -94.885 -95.417 -95.974 -96.361 -96.747 -97.346 -97.763 -98.179 -98.385 -98.803 -99.253 -99.727 -99.964 -100.372 -100.71 -100.976 -101.263 -101.855 -102.16 -102.491 -102.867 -103.287 -103.736 -104.228 -105.573 -8 ,16621 ,TETRA ,17617565,Tue Nov 30 09:28:47 CET,Tue Nov 30 11:06:49 CET,0.0 0.908 1.113 1.226 1.314 1.382 1.439 1.48 1.529 1.547 1.552 1.476 1.534 1.525 1.494 1.448 1.4 1.367 1.286 1.2 1.059 0.968 0.883 0.74 0.589 0.436 0.265 0.08 -0.157 -0.396 -0.647 -0.969 -1.305 -1.65 -2.075 -2.578 -3.081 -3.678 -4.361 -5.127 -5.998 -7.042 -8.344 -9.777 -11.589 -13.797 -16.614 -20.12 -24.694 -30.958 -40.226 -49.799 -56.794 -62.235 -66.579 -70.234 -73.249 -75.855 -77.995 -80.036 -81.784 -83.31 -84.688 -85.919 -87.008 -87.991 -89.008 -89.905 -90.674 -91.461 -92.255 -92.899 -93.558 -94.232 -94.735 -95.227 -95.739 -96.264 -96.775 -97.128 -97.504 -98.074 -98.455 -98.845 -99.056 -99.496 -99.935 -100.397 -100.633 -101.028 -101.332 -101.579 -101.848 -102.418 -102.712 -103.027 -103.397 -103.795 -104.214 -104.763 -106.272 -9 ,23907 ,TETRA ,17617566,Tue Nov 30 09:28:47 CET,Tue Nov 30 11:04:18 CET,0.0 0.695 0.874 0.976 1.053 1.13 1.18 1.204 1.228 1.236 1.244 1.183 1.239 1.228 1.211 1.19 1.148 1.119 1.051 0.98 0.872 0.791 0.709 0.573 0.425 0.279 0.124 -0.044 -0.266 -0.499 -0.739 -1.042 -1.355 -1.675 -2.073 -2.555 -3.042 -3.616 -4.281 -5.023 -5.86 -6.893 -8.207 -9.63 -11.419 -13.613 -16.401 -19.901 -24.551 -30.876 -40.172 -49.904 -57.117 -62.812 -67.314 -71.005 -73.995 -76.533 -78.658 -80.741 -82.484 -83.98 -85.37 -86.668 -87.858 -88.928 -89.996 -90.93 -91.742 -92.576 -93.436 -94.123 -94.82 -95.526 -96.054 -96.586 -97.128 -97.692 -98.27 -98.649 -99.032 -99.646 -100.078 -100.502 -100.712 -101.147 -101.599 -102.078 -102.323 -102.738 -103.096 -103.385 -103.691 -104.298 -104.628 -104.977 -105.348 -105.777 -106.247 -106.856 -108.553 -10 ,15132 ,TETRA ,17617567,Tue Nov 30 09:33:45 CET,Tue Nov 30 11:10:19 CET,0.0 0.828 1.103 1.219 1.3 1.394 1.472 1.523 1.604 1.615 1.619 1.565 1.623 1.611 1.589 1.556 1.501 1.466 1.394 1.32 1.203 1.117 1.033 0.879 0.707 0.55 0.402 0.242 0.014 -0.219 -0.454 -0.751 -1.07 -1.392 -1.789 -2.273 -2.766 -3.352 -4.035 -4.801 -5.641 -6.647 -7.912 -9.284 -11.033 -13.167 -15.872 -19.258 -23.746 -29.925 -38.986 -48.401 -55.312 -60.639 -64.855 -68.412 -71.345 -73.834 -75.895 -77.825 -79.417 -80.839 -82.169 -83.392 -84.478 -85.431 -86.405 -87.267 -88.021 -88.791 -89.557 -90.172 -90.799 -91.451 -91.937 -92.411 -92.903 -93.416 -93.94 -94.288 -94.647 -95.22 -95.593 -95.966 -96.166 -96.583 -97.016 -97.444 -97.655 -98.047 -98.391 -98.656 -98.915 -99.419 -99.696 -99.983 -100.288 -100.649 -101.063 -101.532 -102.734 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_35_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_35_54.txt deleted file mode 100644 index c4198c08..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_35_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20140 ,KEBNE ,17076743,Sat Dec 25 03:44:48 CET,Sat Dec 25 05:14:41 CET,0.0 0.954 1.378 1.64 1.829 1.966 2.086 2.214 2.425 2.495 2.549 2.576 2.668 2.702 2.773 2.812 2.827 2.827 2.818 2.806 2.76 2.722 2.688 2.636 2.572 2.481 2.384 2.291 2.153 2.014 1.88 1.694 1.47 1.212 0.863 0.464 0.09 -0.352 -0.888 -1.497 -2.227 -3.116 -4.22 -5.475 -7.057 -8.986 -11.458 -14.625 -18.893 -24.691 -33.296 -42.408 -49.131 -54.385 -58.562 -62.106 -65.017 -67.486 -69.586 -71.607 -73.246 -74.699 -76.082 -77.348 -78.506 -79.556 -80.607 -81.476 -82.208 -82.959 -83.737 -84.359 -84.995 -85.679 -86.212 -86.741 -87.279 -87.854 -88.431 -88.811 -89.198 -89.803 -90.223 -90.655 -90.871 -91.297 -91.753 -92.237 -92.482 -92.903 -93.301 -93.579 -93.849 -94.427 -94.758 -95.148 -95.55 -95.965 -96.434 -96.982 -98.371 -2 ,11862 ,KEBNE ,17076744,Sat Dec 25 03:44:47 CET,Sat Dec 25 05:13:45 CET,0.0 0.842 1.165 1.376 1.564 1.727 1.855 1.977 2.194 2.286 2.362 2.423 2.546 2.589 2.641 2.665 2.692 2.707 2.73 2.747 2.747 2.733 2.715 2.663 2.604 2.558 2.52 2.472 2.385 2.27 2.142 1.988 1.831 1.667 1.454 1.16 0.777 0.297 -0.253 -0.905 -1.627 -2.505 -3.677 -4.96 -6.564 -8.545 -11.082 -14.322 -18.651 -24.588 -33.337 -42.508 -49.206 -54.465 -58.752 -62.411 -65.388 -67.958 -70.168 -72.335 -74.112 -75.642 -77.055 -78.319 -79.47 -80.502 -81.559 -82.486 -83.27 -84.061 -84.858 -85.502 -86.153 -86.812 -87.326 -87.845 -88.371 -88.903 -89.445 -89.816 -90.197 -90.772 -91.169 -91.584 -91.796 -92.231 -92.688 -93.171 -93.419 -93.842 -94.208 -94.482 -94.751 -95.362 -95.686 -96.017 -96.39 -96.791 -97.269 -97.887 -99.393 -3 ,9823 ,KEBNE ,17076745,Sat Dec 25 03:44:48 CET,Sat Dec 25 05:15:29 CET,0.0 1.274 1.601 1.808 1.956 2.095 2.219 2.335 2.52 2.59 2.656 2.702 2.82 2.863 2.922 2.978 3.022 3.038 3.079 3.091 3.058 3.031 3.005 2.974 2.94 2.892 2.826 2.746 2.628 2.481 2.331 2.155 1.97 1.774 1.514 1.167 0.81 0.398 -0.097 -0.672 -1.307 -2.092 -3.136 -4.275 -5.785 -7.678 -10.038 -13.149 -17.395 -23.15 -31.714 -40.741 -47.343 -52.507 -56.768 -60.377 -63.361 -65.915 -68.014 -70.036 -71.701 -73.119 -74.45 -75.733 -76.898 -77.927 -78.998 -79.916 -80.673 -81.434 -82.199 -82.821 -83.412 -84.004 -84.486 -85.005 -85.539 -86.07 -86.61 -86.98 -87.366 -87.957 -88.349 -88.753 -88.957 -89.373 -89.805 -90.271 -90.518 -90.924 -91.286 -91.577 -91.876 -92.478 -92.796 -93.14 -93.514 -93.945 -94.446 -95.082 -96.559 -4 ,22514 ,KEBNE ,17076746,Sat Dec 25 03:44:47 CET,Sat Dec 25 05:14:56 CET,0.0 1.122 1.445 1.665 1.868 2.05 2.203 2.312 2.475 2.555 2.621 2.662 2.78 2.816 2.856 2.879 2.901 2.914 2.935 2.948 2.967 2.954 2.908 2.811 2.706 2.596 2.48 2.382 2.271 2.168 2.07 1.897 1.661 1.41 1.105 0.73 0.337 -0.124 -0.681 -1.345 -2.099 -2.985 -4.076 -5.314 -6.934 -8.906 -11.414 -14.595 -18.856 -24.715 -33.418 -42.552 -49.306 -54.596 -58.781 -62.3 -65.213 -67.723 -69.803 -71.855 -73.566 -74.993 -76.303 -77.493 -78.559 -79.521 -80.564 -81.532 -82.351 -83.19 -84.023 -84.695 -85.384 -86.061 -86.589 -87.122 -87.65 -88.2 -88.782 -89.173 -89.567 -90.2 -90.633 -91.054 -91.261 -91.686 -92.133 -92.617 -92.87 -93.289 -93.652 -93.93 -94.23 -94.896 -95.254 -95.602 -95.95 -96.358 -96.846 -97.443 -99.098 -5 ,32222 ,KEBNE ,17076747,Sat Dec 25 03:44:48 CET,Sat Dec 25 05:15:23 CET,0.0 1.324 1.673 1.915 2.088 2.246 2.382 2.488 2.69 2.78 2.85 2.889 3.006 3.064 3.169 3.242 3.281 3.299 3.334 3.353 3.371 3.385 3.388 3.361 3.325 3.278 3.226 3.145 2.998 2.842 2.683 2.465 2.23 2.008 1.738 1.369 0.977 0.542 0.036 -0.544 -1.218 -2.077 -3.193 -4.455 -6.116 -8.172 -10.799 -14.17 -18.756 -25.073 -34.462 -44.346 -51.654 -57.35 -61.85 -65.639 -68.824 -71.547 -73.784 -75.986 -77.817 -79.387 -80.825 -82.113 -83.326 -84.454 -85.591 -86.569 -87.39 -88.229 -89.062 -89.727 -90.415 -91.093 -91.612 -92.164 -92.74 -93.301 -93.863 -94.261 -94.673 -95.308 -95.726 -96.156 -96.38 -96.852 -97.341 -97.828 -98.087 -98.52 -98.893 -99.198 -99.503 -100.118 -100.445 -100.787 -101.158 -101.548 -101.98 -102.524 -103.877 -6 ,30444 ,KEBNE ,17076748,Sat Dec 25 03:44:48 CET,Sat Dec 25 05:15:54 CET,0.0 1.39 1.752 1.972 2.134 2.256 2.361 2.459 2.616 2.669 2.716 2.719 2.813 2.838 2.875 2.908 2.947 2.968 3.011 3.04 3.047 3.045 3.04 3.003 2.949 2.894 2.824 2.744 2.635 2.502 2.344 2.142 1.918 1.684 1.445 1.146 0.769 0.327 -0.145 -0.743 -1.5 -2.406 -3.525 -4.757 -6.342 -8.243 -10.647 -13.768 -17.982 -23.796 -32.423 -41.428 -47.996 -53.051 -57.092 -60.543 -63.434 -65.932 -68.062 -70.14 -71.857 -73.324 -74.66 -75.939 -77.15 -78.237 -79.287 -80.189 -80.983 -81.785 -82.592 -83.252 -83.916 -84.591 -85.12 -85.655 -86.188 -86.716 -87.264 -87.646 -88.035 -88.646 -89.076 -89.538 -89.773 -90.216 -90.671 -91.152 -91.395 -91.808 -92.168 -92.437 -92.72 -93.323 -93.634 -93.972 -94.342 -94.734 -95.183 -95.749 -97.277 -7 ,11953 ,KEBNE ,17076749,Sat Dec 25 03:44:47 CET,Sat Dec 25 05:14:55 CET,0.0 1.298 1.74 2.047 2.254 2.4 2.507 2.61 2.77 2.826 2.887 2.943 3.066 3.112 3.206 3.289 3.333 3.347 3.373 3.402 3.43 3.418 3.391 3.356 3.298 3.193 3.082 2.977 2.837 2.69 2.526 2.315 2.116 1.943 1.723 1.388 0.985 0.496 -0.07 -0.739 -1.511 -2.431 -3.577 -4.833 -6.445 -8.381 -10.805 -13.88 -18.061 -23.85 -32.456 -41.585 -48.281 -53.483 -57.674 -61.221 -64.166 -66.696 -68.804 -70.814 -72.479 -73.935 -75.296 -76.552 -77.696 -78.724 -79.761 -80.682 -81.457 -82.245 -83.05 -83.691 -84.377 -85.067 -85.576 -86.11 -86.664 -87.224 -87.774 -88.158 -88.54 -89.102 -89.502 -89.92 -90.137 -90.581 -91.024 -91.481 -91.734 -92.158 -92.527 -92.808 -93.088 -93.672 -93.987 -94.321 -94.658 -95.043 -95.554 -96.2 -98.179 -8 ,20669 ,KEBNE ,17076750,Sat Dec 25 03:45:50 CET,Sat Dec 25 05:16:29 CET,0.0 1.625 2.11 2.363 2.536 2.68 2.799 2.903 3.065 3.124 3.171 3.197 3.308 3.351 3.434 3.49 3.534 3.554 3.581 3.595 3.59 3.567 3.543 3.497 3.416 3.331 3.233 3.127 2.997 2.87 2.716 2.461 2.209 1.977 1.711 1.402 1.059 0.624 0.126 -0.398 -0.979 -1.788 -2.887 -4.104 -5.738 -7.758 -10.335 -13.589 -17.949 -24.006 -32.909 -42.205 -49.032 -54.305 -58.513 -62.04 -64.93 -67.45 -69.584 -71.61 -73.244 -74.642 -75.931 -77.11 -78.171 -79.13 -80.101 -80.945 -81.664 -82.379 -83.126 -83.732 -84.322 -84.913 -85.368 -85.834 -86.312 -86.796 -87.313 -87.681 -88.049 -88.603 -88.962 -89.334 -89.545 -89.978 -90.389 -90.807 -91.019 -91.413 -91.727 -91.974 -92.238 -92.766 -93.044 -93.341 -93.674 -94.052 -94.468 -95.005 -96.163 -9 ,28304 ,KEBNE ,17076751,Sat Dec 25 03:45:50 CET,Sat Dec 25 05:16:26 CET,0.0 1.102 1.44 1.696 1.886 2.037 2.154 2.232 2.363 2.416 2.469 2.491 2.586 2.622 2.691 2.73 2.759 2.767 2.75 2.732 2.712 2.71 2.706 2.668 2.618 2.569 2.492 2.383 2.256 2.13 1.968 1.754 1.559 1.348 1.053 0.666 0.257 -0.228 -0.799 -1.434 -2.162 -3.098 -4.282 -5.559 -7.183 -9.152 -11.626 -14.778 -18.994 -24.791 -33.494 -42.694 -49.426 -54.632 -58.752 -62.292 -65.391 -68.124 -70.31 -72.373 -74.158 -75.726 -77.131 -78.437 -79.632 -80.71 -81.816 -82.763 -83.579 -84.414 -85.263 -85.945 -86.627 -87.321 -87.865 -88.422 -88.973 -89.536 -90.137 -90.554 -90.973 -91.61 -92.03 -92.461 -92.687 -93.132 -93.581 -94.042 -94.288 -94.72 -95.109 -95.398 -95.684 -96.28 -96.591 -96.911 -97.278 -97.687 -98.162 -98.774 -100.727 -10 ,14141 ,KEBNE ,17076752,Sat Dec 25 03:45:50 CET,Sat Dec 25 05:16:09 CET,0.0 1.212 1.63 1.921 2.098 2.247 2.38 2.472 2.613 2.694 2.763 2.796 2.909 2.949 2.99 3.005 3.008 3.013 3.038 3.044 3.022 2.998 2.967 2.927 2.876 2.793 2.714 2.643 2.543 2.451 2.337 2.148 1.932 1.693 1.373 0.973 0.564 0.102 -0.439 -1.082 -1.823 -2.727 -3.861 -5.111 -6.7 -8.638 -11.178 -14.365 -18.616 -24.531 -33.223 -42.277 -48.969 -54.229 -58.436 -61.939 -64.787 -67.225 -69.276 -71.275 -72.969 -74.446 -75.791 -76.987 -78.057 -79.029 -80.056 -80.988 -81.777 -82.564 -83.357 -84.006 -84.682 -85.346 -85.845 -86.358 -86.89 -87.44 -87.991 -88.373 -88.768 -89.389 -89.819 -90.247 -90.464 -90.915 -91.372 -91.831 -92.068 -92.478 -92.822 -93.1 -93.379 -93.962 -94.274 -94.577 -94.907 -95.28 -95.716 -96.296 -97.916 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_41_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_41_54.txt deleted file mode 100644 index 17ff43b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_41_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17179 ,TETRA ,17617568,Tue Nov 30 09:33:45 CET,Tue Nov 30 11:20:39 CET,0.0 1.134 1.429 1.606 1.761 1.924 2.05 2.137 2.29 2.356 2.404 2.435 2.517 2.55 2.621 2.671 2.688 2.686 2.68 2.666 2.629 2.605 2.563 2.452 2.333 2.22 2.084 1.922 1.677 1.441 1.218 0.909 0.557 0.212 -0.169 -0.642 -1.149 -1.738 -2.432 -3.242 -4.182 -5.298 -6.698 -8.28 -10.269 -12.703 -15.773 -19.644 -24.81 -31.896 -42.208 -52.931 -60.872 -66.961 -71.788 -75.815 -79.222 -82.263 -84.76 -87.177 -89.198 -90.913 -92.462 -93.861 -95.117 -96.239 -97.386 -98.358 -99.178 -100.017 -100.849 -101.526 -102.263 -103.04 -103.612 -104.186 -104.783 -105.377 -105.983 -106.392 -106.798 -107.437 -107.874 -108.321 -108.547 -108.981 -109.432 -109.928 -110.196 -110.627 -110.978 -111.24 -111.518 -112.128 -112.467 -112.83 -113.215 -113.64 -114.14 -114.765 -116.186 -2 ,27226 ,TETRA ,17617569,Tue Nov 30 09:34:47 CET,Tue Nov 30 11:13:04 CET,0.0 1.05 1.463 1.71 1.89 2.041 2.159 2.259 2.416 2.47 2.506 2.549 2.646 2.674 2.721 2.748 2.749 2.73 2.684 2.661 2.62 2.582 2.536 2.456 2.38 2.303 2.202 2.076 1.877 1.639 1.386 1.061 0.746 0.459 0.113 -0.33 -0.783 -1.326 -1.961 -2.673 -3.537 -4.635 -6.023 -7.572 -9.544 -11.937 -14.994 -18.863 -23.893 -30.755 -41.019 -51.643 -59.336 -65.3 -70.082 -74.107 -77.414 -80.242 -82.61 -84.925 -86.805 -88.387 -89.828 -91.145 -92.341 -93.402 -94.471 -95.4 -96.188 -96.991 -97.834 -98.504 -99.181 -99.912 -100.461 -101.002 -101.579 -102.179 -102.782 -103.194 -103.619 -104.28 -104.735 -105.187 -105.401 -105.825 -106.288 -106.79 -107.052 -107.489 -107.889 -108.177 -108.467 -109.105 -109.446 -109.796 -110.179 -110.595 -111.025 -111.522 -113.402 -3 ,10529 ,TETRA ,17617570,Tue Nov 30 09:35:48 CET,Tue Nov 30 11:14:28 CET,0.0 1.326 1.654 1.852 1.982 2.088 2.186 2.288 2.431 2.471 2.505 2.503 2.562 2.564 2.588 2.599 2.586 2.582 2.548 2.507 2.469 2.441 2.393 2.285 2.157 2.022 1.889 1.754 1.569 1.363 1.116 0.813 0.534 0.252 -0.145 -0.647 -1.169 -1.753 -2.39 -3.171 -4.068 -5.172 -6.59 -8.107 -10.031 -12.432 -15.515 -19.399 -24.564 -31.562 -41.819 -52.634 -60.512 -66.677 -71.642 -75.703 -79.006 -81.918 -84.324 -86.606 -88.524 -90.155 -91.608 -92.95 -94.184 -95.299 -96.463 -97.491 -98.375 -99.244 -100.095 -100.79 -101.503 -102.25 -102.839 -103.433 -104.02 -104.595 -105.175 -105.571 -105.973 -106.601 -107.048 -107.518 -107.754 -108.234 -108.717 -109.208 -109.458 -109.877 -110.276 -110.571 -110.858 -111.461 -111.798 -112.154 -112.545 -112.972 -113.477 -114.156 -116.018 -4 ,22808 ,TETRA ,17617571,Tue Nov 30 09:35:48 CET,Tue Nov 30 11:21:25 CET,0.0 1.393 1.668 1.875 2.032 2.167 2.277 2.371 2.507 2.549 2.599 2.621 2.696 2.72 2.734 2.727 2.721 2.712 2.687 2.653 2.575 2.533 2.493 2.408 2.3 2.182 2.058 1.934 1.769 1.573 1.374 1.119 0.846 0.552 0.178 -0.283 -0.762 -1.321 -2.006 -2.786 -3.688 -4.811 -6.203 -7.693 -9.576 -11.911 -14.962 -18.82 -23.895 -30.834 -40.981 -51.53 -59.229 -65.197 -69.967 -74.024 -77.336 -80.099 -82.366 -84.523 -86.308 -87.85 -89.268 -90.577 -91.765 -92.807 -93.885 -94.838 -95.657 -96.476 -97.289 -97.963 -98.659 -99.378 -99.925 -100.483 -101.058 -101.646 -102.244 -102.646 -103.047 -103.657 -104.076 -104.514 -104.741 -105.201 -105.678 -106.163 -106.398 -106.807 -107.167 -107.439 -107.722 -108.319 -108.622 -108.941 -109.302 -109.723 -110.207 -110.823 -112.069 -5 ,696 ,TETRA ,17617572,Tue Nov 30 09:36:48 CET,Tue Nov 30 11:22:07 CET,0.0 1.372 1.777 2.046 2.215 2.346 2.449 2.527 2.641 2.688 2.719 2.699 2.764 2.778 2.799 2.798 2.795 2.791 2.764 2.737 2.687 2.653 2.607 2.503 2.403 2.273 2.116 1.974 1.771 1.55 1.323 1.025 0.712 0.377 -0.032 -0.512 -1.028 -1.64 -2.36 -3.199 -4.122 -5.229 -6.614 -8.112 -10.036 -12.424 -15.506 -19.415 -24.561 -31.591 -41.876 -52.676 -60.742 -66.923 -71.793 -75.906 -79.294 -82.299 -84.855 -87.256 -89.21 -90.878 -92.425 -93.869 -95.174 -96.347 -97.543 -98.562 -99.383 -100.199 -101.05 -101.758 -102.483 -103.234 -103.807 -104.386 -104.985 -105.599 -106.219 -106.634 -107.056 -107.71 -108.14 -108.565 -108.791 -109.251 -109.725 -110.226 -110.476 -110.894 -111.243 -111.511 -111.789 -112.376 -112.691 -113.03 -113.404 -113.796 -114.249 -114.884 -116.346 -6 ,4358 ,TETRA ,17617573,Tue Nov 30 09:36:48 CET,Tue Nov 30 11:23:14 CET,0.0 1.082 1.433 1.607 1.732 1.842 1.935 2.027 2.173 2.228 2.283 2.327 2.409 2.435 2.46 2.465 2.443 2.434 2.416 2.388 2.326 2.269 2.211 2.113 1.996 1.87 1.718 1.551 1.354 1.153 0.957 0.716 0.443 0.167 -0.185 -0.673 -1.199 -1.782 -2.467 -3.273 -4.193 -5.32 -6.733 -8.286 -10.253 -12.657 -15.732 -19.573 -24.671 -31.687 -41.966 -52.578 -60.355 -66.414 -71.198 -75.197 -78.52 -81.377 -83.74 -86.003 -87.867 -89.455 -90.911 -92.234 -93.425 -94.482 -95.549 -96.481 -97.275 -98.082 -98.9 -99.56 -100.223 -100.89 -101.407 -101.947 -102.502 -103.067 -103.661 -104.062 -104.44 -105.011 -105.42 -105.841 -106.052 -106.468 -106.882 -107.321 -107.544 -107.937 -108.251 -108.495 -108.749 -109.299 -109.587 -109.887 -110.223 -110.59 -111.012 -111.541 -112.778 -7 ,1685 ,TETRA ,17617574,Tue Nov 30 09:37:50 CET,Tue Nov 30 11:22:53 CET,0.0 1.24 1.585 1.792 1.901 1.993 2.096 2.189 2.337 2.377 2.394 2.377 2.451 2.469 2.471 2.455 2.439 2.429 2.402 2.365 2.299 2.25 2.193 2.083 1.965 1.852 1.725 1.583 1.381 1.17 0.952 0.661 0.352 0.036 -0.356 -0.859 -1.389 -2.005 -2.704 -3.493 -4.413 -5.529 -6.927 -8.496 -10.504 -12.886 -15.932 -19.875 -25.144 -32.444 -43.163 -54.168 -62.219 -68.471 -73.468 -77.627 -81.019 -83.912 -86.275 -88.548 -90.465 -92.118 -93.643 -95.035 -96.284 -97.403 -98.551 -99.536 -100.362 -101.232 -102.11 -102.799 -103.498 -104.212 -104.758 -105.323 -105.894 -106.475 -107.079 -107.493 -107.906 -108.514 -108.929 -109.36 -109.584 -110.044 -110.511 -110.985 -111.231 -111.648 -112.028 -112.313 -112.597 -113.22 -113.549 -113.896 -114.296 -114.732 -115.182 -115.74 -117.197 -8 ,1664 ,TETRA ,17617575,Tue Nov 30 09:37:50 CET,Tue Nov 30 11:24:45 CET,0.0 1.213 1.505 1.713 1.88 2.009 2.13 2.239 2.418 2.503 2.557 2.535 2.59 2.599 2.626 2.655 2.661 2.659 2.641 2.608 2.54 2.486 2.431 2.344 2.256 2.161 2.054 1.928 1.721 1.513 1.307 1.042 0.768 0.45 0.03 -0.47 -1.006 -1.645 -2.352 -3.159 -4.089 -5.223 -6.652 -8.178 -10.141 -12.54 -15.553 -19.366 -24.434 -31.417 -41.723 -52.369 -60.136 -66.348 -71.263 -75.426 -78.881 -81.821 -84.274 -86.588 -88.509 -90.161 -91.661 -92.984 -94.168 -95.223 -96.274 -97.213 -98.048 -98.902 -99.756 -100.464 -101.185 -101.909 -102.48 -103.073 -103.662 -104.26 -104.865 -105.271 -105.676 -106.288 -106.701 -107.126 -107.352 -107.808 -108.281 -108.78 -109.036 -109.458 -109.824 -110.104 -110.384 -110.974 -111.299 -111.634 -111.994 -112.4 -112.857 -113.409 -114.937 -9 ,10919 ,TETRA ,17617576,Tue Nov 30 09:37:50 CET,Tue Nov 30 11:24:59 CET,0.0 1.09 1.395 1.594 1.787 1.926 2.029 2.104 2.211 2.264 2.322 2.345 2.406 2.43 2.486 2.521 2.526 2.531 2.537 2.518 2.461 2.411 2.358 2.273 2.169 2.027 1.892 1.787 1.643 1.482 1.32 1.088 0.779 0.44 0.022 -0.502 -1.031 -1.628 -2.329 -3.108 -3.997 -5.13 -6.594 -8.191 -10.19 -12.615 -15.699 -19.619 -24.869 -32.114 -42.725 -53.661 -61.577 -67.674 -72.525 -76.628 -80.006 -82.931 -85.398 -87.78 -89.771 -91.471 -93.015 -94.412 -95.701 -96.863 -98.039 -99.081 -99.971 -100.869 -101.781 -102.519 -103.251 -104.014 -104.608 -105.189 -105.742 -106.29 -106.849 -107.228 -107.629 -108.285 -108.749 -109.216 -109.45 -109.921 -110.405 -110.911 -111.17 -111.6 -111.97 -112.243 -112.512 -113.117 -113.464 -113.831 -114.229 -114.676 -115.193 -115.775 -116.957 -10 ,7235 ,TETRA ,17617577,Tue Nov 30 09:37:50 CET,Tue Nov 30 11:25:34 CET,0.0 1.339 1.736 2.034 2.239 2.39 2.511 2.595 2.7 2.741 2.772 2.778 2.858 2.881 2.903 2.918 2.924 2.923 2.918 2.893 2.849 2.816 2.766 2.666 2.577 2.495 2.393 2.287 2.144 1.965 1.765 1.497 1.198 0.878 0.469 -0.04 -0.559 -1.168 -1.869 -2.649 -3.543 -4.631 -5.991 -7.48 -9.385 -11.692 -14.692 -18.522 -23.612 -30.572 -40.611 -51.043 -58.7 -64.636 -69.334 -73.226 -76.488 -79.289 -81.56 -83.745 -85.551 -87.142 -88.605 -89.919 -91.124 -92.23 -93.352 -94.318 -95.161 -96.024 -96.908 -97.638 -98.382 -99.126 -99.687 -100.257 -100.839 -101.45 -102.079 -102.492 -102.903 -103.541 -103.975 -104.413 -104.644 -105.131 -105.625 -106.133 -106.393 -106.819 -107.199 -107.492 -107.787 -108.398 -108.734 -109.08 -109.445 -109.856 -110.317 -110.904 -112.384 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_42_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_42_35.txt deleted file mode 100644 index 06507419..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_42_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5452 ,TETRA ,17617578,Tue Nov 30 09:37:53 CET,Tue Nov 30 11:25:58 CET,0.0 1.005 1.408 1.729 1.983 2.2 2.389 2.554 2.854 2.993 3.109 3.28 3.423 3.507 3.663 3.809 3.956 4.028 4.162 4.293 4.478 4.585 4.682 4.809 4.946 5.079 5.188 5.294 5.45 5.595 5.743 5.944 6.131 6.281 6.425 6.546 6.652 6.801 6.969 7.114 7.207 7.271 7.313 7.32 7.299 7.201 7.015 6.726 6.241 5.416 3.878 1.924 0.311 -1.034 -2.164 -3.152 -4.025 -4.823 -5.497 -6.17 -6.761 -7.287 -7.759 -8.189 -8.586 -8.952 -9.363 -9.757 -10.083 -10.382 -10.706 -10.989 -11.285 -11.606 -11.84 -12.058 -12.293 -12.545 -12.803 -12.993 -13.196 -13.502 -13.7 -13.895 -13.999 -14.225 -14.495 -14.763 -14.888 -15.101 -15.341 -15.486 -15.65 -16.061 -16.281 -16.496 -16.716 -16.975 -17.341 -17.924 -19.884 -2 ,23594 ,TETRA ,17617579,Tue Nov 30 09:41:52 CET,Tue Nov 30 11:30:52 CET,0.0 3.244 3.721 4.022 4.239 4.441 4.617 4.761 5.002 5.127 5.257 5.394 5.518 5.607 5.797 5.983 6.155 6.229 6.371 6.507 6.671 6.761 6.854 6.977 7.099 7.246 7.385 7.508 7.642 7.761 7.884 8.024 8.136 8.237 8.369 8.526 8.642 8.721 8.807 8.909 9.01 9.061 9.086 9.091 9.07 9.021 8.871 8.596 8.168 7.39 5.898 4.007 2.412 1.047 -0.117 -1.145 -2.04 -2.82 -3.48 -4.13 -4.692 -5.208 -5.706 -6.17 -6.598 -6.995 -7.399 -7.75 -8.061 -8.371 -8.698 -9.016 -9.347 -9.644 -9.861 -10.113 -10.38 -10.638 -10.92 -11.127 -11.317 -11.591 -11.798 -12.02 -12.129 -12.347 -12.62 -12.92 -13.063 -13.269 -13.493 -13.656 -13.835 -14.222 -14.43 -14.674 -14.932 -15.219 -15.602 -16.248 -18.78 -3 ,31373 ,TETRA ,17617580,Tue Nov 30 09:41:54 CET,Tue Nov 30 11:29:57 CET,0.0 1.508 1.931 2.207 2.467 2.67 2.838 3.011 3.324 3.453 3.568 3.728 3.876 3.972 4.143 4.315 4.474 4.546 4.706 4.85 5.025 5.132 5.228 5.381 5.541 5.677 5.791 5.885 6.001 6.145 6.275 6.391 6.515 6.641 6.776 6.921 7.023 7.133 7.264 7.37 7.456 7.525 7.57 7.589 7.591 7.546 7.379 7.072 6.575 5.71 4.134 2.186 0.595 -0.739 -1.924 -2.992 -3.879 -4.644 -5.301 -5.963 -6.525 -7.037 -7.535 -8.007 -8.442 -8.826 -9.223 -9.573 -9.859 -10.161 -10.497 -10.766 -11.064 -11.376 -11.606 -11.844 -12.105 -12.39 -12.66 -12.837 -13.033 -13.35 -13.558 -13.754 -13.854 -14.074 -14.314 -14.589 -14.73 -14.923 -15.119 -15.283 -15.468 -15.804 -15.996 -16.244 -16.518 -16.798 -17.134 -17.657 -19.325 -4 ,13302 ,TETRA ,17617581,Tue Nov 30 09:41:52 CET,Tue Nov 30 11:30:36 CET,0.0 2.414 2.816 3.095 3.344 3.575 3.763 3.912 4.164 4.287 4.41 4.574 4.717 4.812 5.003 5.182 5.335 5.41 5.562 5.704 5.893 6.008 6.12 6.256 6.36 6.487 6.628 6.763 6.933 7.064 7.186 7.318 7.401 7.484 7.615 7.764 7.893 8.007 8.092 8.165 8.228 8.366 8.621 8.85 9.082 9.333 9.358 9.058 8.599 7.79 6.214 4.296 2.717 1.299 0.036 -1.034 -1.882 -2.652 -3.342 -4.051 -4.664 -5.188 -5.676 -6.112 -6.512 -6.896 -7.321 -7.693 -7.997 -8.318 -8.654 -8.939 -9.236 -9.54 -9.781 -10.031 -10.268 -10.517 -10.789 -10.964 -11.147 -11.469 -11.693 -11.906 -12.013 -12.245 -12.507 -12.793 -12.93 -13.12 -13.354 -13.532 -13.722 -14.13 -14.334 -14.537 -14.78 -15.093 -15.496 -15.992 -17.818 -5 ,24080 ,TETRA ,17617582,Tue Nov 30 09:41:53 CET,Tue Nov 30 11:29:26 CET,0.0 1.781 2.259 2.62 2.857 3.035 3.23 3.428 3.735 3.861 3.986 4.156 4.298 4.395 4.591 4.77 4.929 5.007 5.156 5.299 5.501 5.62 5.738 5.893 6.018 6.135 6.253 6.366 6.508 6.665 6.797 6.925 7.068 7.195 7.332 7.486 7.594 7.72 7.863 7.964 8.032 8.079 8.105 8.111 8.091 8.01 7.85 7.571 7.033 6.168 4.66 2.817 1.298 0.011 -1.091 -2.057 -2.884 -3.668 -4.358 -5.024 -5.595 -6.116 -6.606 -7.035 -7.429 -7.813 -8.213 -8.532 -8.804 -9.1 -9.429 -9.72 -10.02 -10.332 -10.564 -10.795 -11.027 -11.256 -11.512 -11.695 -11.877 -12.191 -12.417 -12.637 -12.755 -13.003 -13.257 -13.519 -13.66 -13.877 -14.119 -14.268 -14.439 -14.828 -15.041 -15.273 -15.519 -15.782 -16.107 -16.595 -18.38 -6 ,23642 ,TETRA ,17617583,Tue Nov 30 09:42:54 CET,Tue Nov 30 11:35:20 CET,0.0 1.784 2.221 2.5 2.769 2.997 3.197 3.383 3.734 3.881 4.003 4.183 4.337 4.445 4.667 4.851 5.005 5.089 5.256 5.397 5.575 5.705 5.84 6.015 6.166 6.298 6.42 6.536 6.701 6.859 6.983 7.101 7.218 7.345 7.494 7.663 7.837 8.02 8.171 8.341 8.526 8.658 8.768 8.841 8.821 8.734 8.575 8.278 7.745 6.896 5.361 3.366 1.643 0.157 -1.055 -2.096 -3.017 -3.834 -4.514 -5.212 -5.828 -6.396 -6.944 -7.433 -7.895 -8.316 -8.719 -9.103 -9.451 -9.799 -10.144 -10.438 -10.757 -11.079 -11.318 -11.564 -11.833 -12.101 -12.366 -12.559 -12.761 -13.062 -13.283 -13.517 -13.635 -13.868 -14.11 -14.382 -14.532 -14.748 -14.976 -15.145 -15.34 -15.727 -15.942 -16.189 -16.449 -16.739 -17.087 -17.509 -19.082 -7 ,9295 ,TETRA ,17617584,Tue Nov 30 09:44:50 CET,Tue Nov 30 11:20:22 CET,0.0 1.482 1.898 2.184 2.43 2.646 2.836 2.997 3.27 3.389 3.505 3.689 3.834 3.921 4.087 4.261 4.435 4.506 4.641 4.77 4.964 5.091 5.209 5.371 5.529 5.665 5.776 5.887 6.04 6.181 6.289 6.409 6.537 6.673 6.814 6.933 7.034 7.138 7.234 7.345 7.418 7.47 7.55 7.598 7.603 7.584 7.472 7.167 6.715 5.906 4.279 2.251 0.631 -0.708 -1.836 -2.823 -3.676 -4.441 -5.092 -5.732 -6.305 -6.809 -7.257 -7.697 -8.123 -8.516 -8.92 -9.307 -9.64 -9.938 -10.224 -10.467 -10.727 -10.995 -11.212 -11.441 -11.673 -11.916 -12.175 -12.369 -12.57 -12.852 -13.059 -13.282 -13.392 -13.617 -13.863 -14.143 -14.282 -14.473 -14.71 -14.889 -15.068 -15.467 -15.683 -15.929 -16.215 -16.535 -16.905 -17.375 -19.299 -8 ,10759 ,TETRA ,17617585,Tue Nov 30 09:45:52 CET,Tue Nov 30 11:32:01 CET,0.0 1.908 2.338 2.659 2.916 3.11 3.276 3.427 3.682 3.808 3.936 4.112 4.269 4.377 4.569 4.736 4.88 4.948 5.089 5.228 5.423 5.544 5.653 5.808 5.953 6.081 6.207 6.345 6.513 6.65 6.76 6.876 6.986 7.088 7.21 7.351 7.462 7.574 7.674 7.745 7.838 7.977 8.093 8.156 8.17 8.085 7.938 7.718 7.306 6.534 5.081 3.205 1.636 0.322 -0.81 -1.812 -2.699 -3.515 -4.206 -4.894 -5.475 -5.976 -6.479 -6.943 -7.363 -7.739 -8.122 -8.469 -8.767 -9.07 -9.392 -9.661 -9.927 -10.233 -10.5 -10.779 -11.046 -11.298 -11.568 -11.743 -11.915 -12.208 -12.431 -12.661 -12.78 -13.051 -13.326 -13.609 -13.744 -13.943 -14.184 -14.366 -14.55 -14.939 -15.15 -15.386 -15.669 -16.002 -16.433 -17.041 -19.765 -9 ,5213 ,TETRA ,17617586,Tue Nov 30 09:45:54 CET,Tue Nov 30 11:33:03 CET,0.0 1.719 2.213 2.529 2.764 2.967 3.177 3.362 3.652 3.78 3.895 4.072 4.232 4.348 4.567 4.749 4.895 4.956 5.067 5.187 5.387 5.5 5.598 5.751 5.882 6.006 6.137 6.26 6.389 6.489 6.611 6.752 6.854 6.974 7.113 7.231 7.343 7.453 7.551 7.675 7.773 7.838 7.919 7.998 8.027 7.964 7.817 7.496 6.976 6.085 4.477 2.58 0.983 -0.361 -1.423 -2.364 -3.224 -3.978 -4.611 -5.266 -5.841 -6.331 -6.798 -7.244 -7.639 -8.012 -8.422 -8.777 -9.085 -9.412 -9.735 -9.998 -10.271 -10.557 -10.788 -11.044 -11.306 -11.555 -11.81 -12.0 -12.203 -12.5 -12.71 -12.946 -13.065 -13.29 -13.517 -13.768 -13.919 -14.135 -14.368 -14.535 -14.71 -15.086 -15.292 -15.506 -15.742 -16.03 -16.438 -17.07 -19.466 -10 ,16270 ,TETRA ,17617587,Tue Nov 30 09:46:50 CET,Tue Nov 30 11:33:03 CET,0.0 1.247 1.688 1.975 2.2 2.396 2.576 2.751 3.068 3.218 3.342 3.506 3.65 3.736 3.92 4.092 4.227 4.302 4.473 4.621 4.809 4.927 5.042 5.207 5.363 5.499 5.624 5.756 5.898 6.011 6.153 6.31 6.422 6.54 6.691 6.863 6.994 7.092 7.206 7.352 7.48 7.557 7.615 7.679 7.707 7.648 7.484 7.234 6.718 5.777 4.195 2.331 0.787 -0.518 -1.58 -2.544 -3.434 -4.212 -4.849 -5.478 -6.028 -6.512 -6.967 -7.396 -7.779 -8.131 -8.505 -8.834 -9.114 -9.421 -9.773 -10.064 -10.348 -10.629 -10.862 -11.119 -11.381 -11.641 -11.899 -12.086 -12.29 -12.603 -12.808 -13.007 -13.108 -13.348 -13.611 -13.88 -14.03 -14.25 -14.481 -14.632 -14.806 -15.21 -15.442 -15.693 -15.97 -16.289 -16.634 -17.109 -18.54 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_42_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_42_41.txt deleted file mode 100644 index d4a85f5c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_42_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24053 ,TETRA ,17617588,Tue Nov 30 09:46:52 CET,Tue Nov 30 11:33:02 CET,0.0 1.178 1.589 1.884 2.133 2.358 2.566 2.726 2.986 3.113 3.239 3.433 3.581 3.684 3.891 4.092 4.292 4.389 4.572 4.733 4.95 5.096 5.243 5.447 5.648 5.833 5.991 6.124 6.302 6.486 6.666 6.898 7.092 7.258 7.472 7.707 7.898 8.091 8.306 8.541 8.788 9.083 9.408 9.698 9.995 10.289 10.637 10.972 11.289 11.559 11.64 11.4 10.987 10.503 10.031 9.561 9.165 8.817 8.455 8.062 7.679 7.317 6.989 6.699 6.433 6.187 5.92 5.687 5.506 5.313 5.099 4.912 4.714 4.484 4.313 4.136 3.946 3.773 3.609 3.478 3.305 3.04 2.874 2.709 2.622 2.424 2.208 1.971 1.844 1.669 1.463 1.325 1.178 0.867 0.689 0.487 0.271 0.039 -0.216 -0.65 -2.407 -2 ,12610 ,TETRA ,17617589,Tue Nov 30 09:46:50 CET,Tue Nov 30 11:29:20 CET,0.0 1.451 1.826 2.098 2.345 2.555 2.739 2.9 3.215 3.36 3.496 3.717 3.87 3.959 4.13 4.312 4.5 4.59 4.743 4.898 5.132 5.274 5.406 5.581 5.749 5.927 6.107 6.271 6.472 6.675 6.876 7.073 7.241 7.424 7.64 7.864 8.077 8.318 8.562 8.803 9.071 9.357 9.674 9.971 10.269 10.574 10.89 11.236 11.567 11.837 11.91 11.54 11.02 10.534 10.116 9.684 9.261 8.859 8.478 8.101 7.771 7.477 7.219 6.975 6.733 6.494 6.229 6.006 5.813 5.601 5.388 5.21 5.016 4.806 4.644 4.48 4.292 4.102 3.917 3.777 3.63 3.421 3.269 3.094 2.999 2.791 2.587 2.376 2.254 2.086 1.877 1.74 1.609 1.286 1.105 0.909 0.678 0.408 0.058 -0.465 -2.332 -3 ,1695 ,TETRA ,17617590,Tue Nov 30 09:46:52 CET,Tue Nov 30 11:31:07 CET,0.0 1.48 1.959 2.248 2.452 2.647 2.822 2.997 3.315 3.451 3.586 3.794 3.963 4.07 4.263 4.456 4.636 4.722 4.887 5.05 5.295 5.456 5.607 5.787 5.965 6.154 6.328 6.497 6.703 6.902 7.094 7.297 7.506 7.73 7.979 8.246 8.5 8.785 9.043 9.312 9.576 9.842 10.14 10.404 10.71 11.04 11.38 11.709 12.09 12.423 12.496 12.219 11.756 11.262 10.788 10.333 9.915 9.492 9.111 8.717 8.334 8.013 7.719 7.39 7.084 6.825 6.54 6.29 6.086 5.87 5.64 5.421 5.164 4.896 4.694 4.501 4.305 4.097 3.875 3.717 3.555 3.294 3.109 2.924 2.832 2.615 2.371 2.128 2.008 1.831 1.582 1.413 1.23 0.884 0.69 0.465 0.213 -0.073 -0.437 -0.941 -2.898 -4 ,16731 ,TETRA ,17617591,Tue Nov 30 09:46:50 CET,Tue Nov 30 11:33:06 CET,0.0 1.357 1.78 2.085 2.363 2.58 2.768 2.941 3.222 3.346 3.46 3.628 3.781 3.87 4.056 4.247 4.414 4.494 4.651 4.797 5.006 5.141 5.261 5.437 5.601 5.755 5.916 6.062 6.236 6.431 6.643 6.879 7.081 7.248 7.441 7.667 7.864 8.075 8.318 8.576 8.827 9.106 9.399 9.677 10.019 10.343 10.685 11.03 11.355 11.567 11.545 11.089 10.525 10.033 9.528 9.071 8.669 8.271 7.905 7.495 7.13 6.827 6.547 6.272 6.009 5.78 5.556 5.347 5.146 4.92 4.685 4.494 4.282 4.045 3.862 3.682 3.517 3.357 3.155 2.998 2.851 2.644 2.484 2.316 2.222 2.013 1.811 1.594 1.479 1.306 1.107 0.98 0.846 0.571 0.412 0.243 0.044 -0.227 -0.542 -0.972 -2.432 -5 ,10278 ,TETRA ,17617592,Tue Nov 30 09:46:52 CET,Tue Nov 30 11:33:04 CET,0.0 1.294 1.786 2.141 2.376 2.588 2.792 3.001 3.357 3.504 3.647 3.872 4.04 4.152 4.362 4.563 4.763 4.855 5.02 5.19 5.428 5.568 5.705 5.916 6.114 6.288 6.441 6.582 6.789 7.023 7.256 7.525 7.75 7.936 8.127 8.339 8.545 8.778 9.035 9.279 9.53 9.788 10.069 10.343 10.639 10.969 11.304 11.619 11.94 12.201 12.263 11.946 11.533 11.053 10.501 9.964 9.505 9.072 8.675 8.294 7.98 7.706 7.422 7.121 6.818 6.557 6.277 6.009 5.81 5.598 5.331 5.111 4.917 4.706 4.527 4.331 4.108 3.897 3.704 3.559 3.393 3.14 2.971 2.789 2.698 2.514 2.327 2.136 2.027 1.864 1.669 1.522 1.358 0.983 0.779 0.554 0.319 0.061 -0.312 -0.799 -2.699 -6 ,7261 ,TETRA ,17617593,Tue Nov 30 09:48:44 CET,Tue Nov 30 11:35:30 CET,0.0 1.11 1.502 1.807 2.064 2.296 2.522 2.704 2.976 3.116 3.247 3.424 3.58 3.686 3.881 4.068 4.266 4.358 4.527 4.677 4.878 5.013 5.14 5.319 5.507 5.678 5.828 5.991 6.206 6.401 6.593 6.83 7.039 7.217 7.432 7.695 7.922 8.163 8.429 8.691 9.002 9.329 9.642 9.947 10.306 10.678 11.028 11.36 11.674 11.905 11.906 11.491 10.997 10.551 10.042 9.522 9.124 8.758 8.375 8.004 7.697 7.408 7.085 6.707 6.357 6.045 5.75 5.523 5.331 5.132 4.924 4.752 4.557 4.346 4.169 3.987 3.811 3.609 3.399 3.269 3.125 2.887 2.731 2.568 2.48 2.279 2.07 1.866 1.749 1.575 1.358 1.228 1.093 0.715 0.499 0.284 0.034 -0.256 -0.599 -1.059 -2.731 -7 ,3216 ,TETRA ,17617594,Tue Nov 30 09:48:46 CET,Tue Nov 30 11:34:57 CET,0.0 1.531 1.973 2.249 2.475 2.69 2.896 3.084 3.398 3.527 3.648 3.835 3.985 4.09 4.308 4.517 4.702 4.784 4.944 5.109 5.362 5.518 5.665 5.865 6.057 6.24 6.396 6.549 6.773 6.973 7.157 7.395 7.594 7.765 7.955 8.166 8.373 8.595 8.846 9.132 9.433 9.718 9.997 10.285 10.583 10.87 11.193 11.532 11.857 12.092 12.066 11.649 11.086 10.499 9.962 9.487 9.063 8.612 8.168 7.746 7.383 7.07 6.792 6.517 6.237 5.983 5.704 5.453 5.254 5.04 4.794 4.577 4.361 4.128 3.95 3.75 3.531 3.325 3.105 2.955 2.815 2.592 2.42 2.233 2.135 1.954 1.757 1.529 1.413 1.242 1.021 0.875 0.723 0.404 0.233 0.03 -0.221 -0.46 -0.74 -1.197 -3.449 -8 ,31552 ,TETRA ,17617595,Tue Nov 30 09:48:45 CET,Tue Nov 30 11:34:14 CET,0.0 1.882 2.284 2.593 2.839 3.047 3.23 3.412 3.754 3.906 4.048 4.258 4.423 4.545 4.768 4.961 5.145 5.236 5.425 5.6 5.842 6.001 6.157 6.363 6.56 6.755 6.926 7.075 7.28 7.476 7.664 7.898 8.097 8.314 8.598 8.889 9.12 9.346 9.577 9.852 10.134 10.418 10.776 11.108 11.445 11.797 12.184 12.553 12.839 13.073 13.135 12.795 12.316 11.808 11.334 10.901 10.486 10.059 9.666 9.28 8.949 8.632 8.304 8.001 7.725 7.469 7.187 6.924 6.684 6.442 6.211 5.996 5.744 5.478 5.282 5.084 4.885 4.678 4.459 4.304 4.126 3.835 3.648 3.462 3.359 3.138 2.9 2.648 2.52 2.347 2.124 1.971 1.816 1.48 1.274 1.054 0.809 0.529 0.22 -0.219 -1.846 -9 ,16115 ,TETRA ,17617596,Tue Nov 30 09:50:46 CET,Tue Nov 30 11:35:28 CET,0.0 1.185 1.574 1.865 2.124 2.355 2.546 2.727 3.063 3.212 3.338 3.517 3.675 3.785 3.987 4.175 4.338 4.415 4.591 4.76 4.97 5.094 5.216 5.396 5.573 5.744 5.912 6.074 6.263 6.435 6.613 6.83 7.035 7.237 7.456 7.683 7.893 8.106 8.352 8.617 8.879 9.164 9.491 9.814 10.145 10.46 10.783 11.092 11.384 11.605 11.685 11.398 10.97 10.53 10.069 9.609 9.159 8.737 8.374 7.978 7.609 7.292 7.012 6.764 6.533 6.278 5.997 5.762 5.543 5.287 5.056 4.88 4.664 4.417 4.239 4.068 3.9 3.746 3.568 3.424 3.265 3.022 2.859 2.691 2.602 2.402 2.173 1.956 1.843 1.657 1.42 1.283 1.134 0.804 0.635 0.441 0.219 -0.025 -0.352 -0.786 -2.888 -10 ,28975 ,TETRA ,17617597,Tue Nov 30 09:51:44 CET,Tue Nov 30 11:37:05 CET,0.0 1.335 1.734 2.075 2.325 2.525 2.72 2.893 3.195 3.335 3.477 3.679 3.834 3.94 4.139 4.334 4.534 4.629 4.809 4.973 5.194 5.345 5.493 5.699 5.875 6.047 6.212 6.363 6.549 6.74 6.934 7.169 7.406 7.639 7.924 8.25 8.53 8.783 9.028 9.272 9.502 9.729 10.031 10.345 10.689 11.03 11.369 11.689 11.992 12.2 12.221 11.916 11.462 11.039 10.593 10.144 9.771 9.406 9.025 8.62 8.301 8.024 7.747 7.478 7.22 6.99 6.748 6.499 6.259 6.007 5.755 5.543 5.323 5.102 4.933 4.757 4.569 4.356 4.124 3.96 3.779 3.513 3.353 3.202 3.116 2.933 2.745 2.533 2.407 2.235 2.036 1.915 1.781 1.416 1.209 1.001 0.77 0.486 0.131 -0.342 -1.826 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_42_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_42_43.txt deleted file mode 100644 index ac569764..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_42_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22683 ,TETRA ,17617598,Tue Nov 30 09:51:45 CET,Tue Nov 30 11:41:04 CET,0.0 1.259 1.667 1.98 2.246 2.467 2.642 2.804 3.116 3.254 3.393 3.61 3.778 3.894 4.112 4.349 4.586 4.704 4.935 5.153 5.466 5.661 5.85 6.123 6.375 6.612 6.848 7.082 7.372 7.644 7.9 8.238 8.572 8.882 9.234 9.64 10.035 10.447 10.927 11.462 12.006 12.601 13.276 13.966 14.817 15.764 16.868 18.13 19.594 21.375 23.664 25.599 26.72 27.396 27.835 28.129 28.276 28.36 28.419 28.419 28.368 28.29 28.22 28.15 28.06 27.963 27.853 27.748 27.66 27.568 27.459 27.364 27.252 27.114 27.013 26.912 26.792 26.663 26.526 26.431 26.341 26.182 26.055 25.924 25.855 25.711 25.553 25.391 25.31 25.204 25.038 24.919 24.8 24.558 24.407 24.242 24.057 23.85 23.62 23.284 22.412 -2 ,32447 ,TETRA ,17617599,Tue Nov 30 09:51:45 CET,Tue Nov 30 11:37:23 CET,0.0 1.147 1.526 1.797 2.009 2.211 2.422 2.613 2.925 3.075 3.214 3.437 3.616 3.743 4.008 4.257 4.49 4.602 4.808 4.998 5.267 5.437 5.608 5.879 6.133 6.373 6.61 6.833 7.127 7.411 7.682 8.042 8.386 8.693 9.045 9.431 9.805 10.214 10.651 11.124 11.627 12.198 12.886 13.613 14.493 15.483 16.618 17.913 19.411 21.205 23.47 25.371 26.484 27.155 27.561 27.845 28.025 28.11 28.151 28.179 28.189 28.178 28.118 28.02 27.931 27.841 27.742 27.665 27.563 27.441 27.341 27.26 27.163 27.04 26.922 26.785 26.661 26.544 26.407 26.321 26.246 26.105 25.986 25.858 25.789 25.638 25.489 25.351 25.272 25.148 24.943 24.828 24.713 24.454 24.315 24.164 23.967 23.754 23.491 23.142 21.913 -3 ,28830 ,TETRA ,17617600,Tue Nov 30 09:51:44 CET,Tue Nov 30 11:36:49 CET,0.0 0.948 1.286 1.591 1.86 2.081 2.276 2.461 2.83 3.0 3.152 3.394 3.585 3.712 3.936 4.153 4.375 4.488 4.701 4.892 5.171 5.354 5.53 5.794 6.047 6.291 6.535 6.771 7.083 7.399 7.693 8.038 8.36 8.658 9.014 9.414 9.802 10.242 10.733 11.249 11.781 12.416 13.148 13.845 14.644 15.589 16.709 17.96 19.455 21.3 23.613 25.553 26.702 27.442 27.934 28.234 28.426 28.554 28.605 28.633 28.617 28.547 28.449 28.334 28.25 28.184 28.089 27.997 27.904 27.807 27.72 27.64 27.544 27.438 27.347 27.24 27.125 26.981 26.806 26.69 26.583 26.409 26.275 26.141 26.07 25.939 25.794 25.607 25.505 25.378 25.204 25.103 24.998 24.755 24.613 24.446 24.263 24.029 23.726 23.345 22.021 -4 ,12452 ,TETRA ,17617601,Tue Nov 30 09:52:45 CET,Tue Nov 30 11:39:35 CET,0.0 1.07 1.411 1.694 1.95 2.188 2.397 2.575 2.875 3.023 3.178 3.42 3.599 3.727 3.976 4.207 4.434 4.542 4.747 4.956 5.254 5.442 5.63 5.895 6.149 6.384 6.597 6.82 7.116 7.393 7.656 8.005 8.343 8.648 9.009 9.422 9.81 10.23 10.721 11.24 11.777 12.417 13.176 13.936 14.782 15.689 16.756 18.011 19.549 21.344 23.535 25.395 26.524 27.256 27.712 28.041 28.245 28.361 28.424 28.443 28.416 28.365 28.309 28.266 28.18 28.064 27.961 27.849 27.737 27.646 27.547 27.441 27.329 27.225 27.14 27.035 26.915 26.78 26.648 26.55 26.436 26.264 26.157 26.045 25.982 25.843 25.698 25.552 25.475 25.363 25.173 25.056 24.944 24.691 24.538 24.364 24.185 23.965 23.635 23.211 21.8 -5 ,7874 ,TETRA ,17617602,Tue Nov 30 09:52:47 CET,Tue Nov 30 11:39:38 CET,0.0 1.014 1.375 1.623 1.831 2.04 2.233 2.407 2.735 2.879 3.016 3.223 3.394 3.528 3.79 4.03 4.255 4.356 4.538 4.715 4.993 5.186 5.37 5.628 5.884 6.138 6.373 6.589 6.896 7.186 7.478 7.848 8.163 8.466 8.846 9.305 9.754 10.226 10.708 11.193 11.703 12.286 12.986 13.7 14.539 15.487 16.591 17.88 19.406 21.243 23.523 25.377 26.496 27.232 27.716 28.008 28.156 28.248 28.297 28.314 28.288 28.253 28.198 28.142 28.09 28.032 27.954 27.869 27.796 27.698 27.59 27.497 27.375 27.238 27.123 26.988 26.849 26.7 26.551 26.463 26.361 26.178 26.047 25.915 25.846 25.682 25.505 25.333 25.252 25.139 24.96 24.844 24.714 24.411 24.253 24.075 23.868 23.627 23.365 23.048 21.959 -6 ,30246 ,TETRA ,17617603,Tue Nov 30 09:52:45 CET,Tue Nov 30 11:38:52 CET,0.0 1.079 1.436 1.73 1.994 2.22 2.409 2.589 2.942 3.096 3.241 3.487 3.666 3.784 4.024 4.259 4.474 4.578 4.768 4.946 5.224 5.416 5.607 5.877 6.117 6.359 6.59 6.806 7.093 7.385 7.682 8.036 8.374 8.696 9.058 9.461 9.845 10.246 10.699 11.196 11.706 12.267 12.943 13.659 14.482 15.414 16.513 17.772 19.3 21.104 23.32 25.185 26.347 27.088 27.554 27.878 28.076 28.196 28.233 28.196 28.166 28.154 28.11 28.059 28.006 27.935 27.833 27.728 27.64 27.56 27.446 27.348 27.263 27.135 27.034 26.949 26.846 26.739 26.614 26.521 26.426 26.264 26.166 26.065 26.006 25.879 25.75 25.596 25.502 25.386 25.204 25.087 24.971 24.719 24.574 24.416 24.244 24.018 23.737 23.357 22.08 -7 ,20963 ,TETRA ,17617604,Tue Nov 30 09:52:45 CET,Tue Nov 30 11:37:54 CET,0.0 1.233 1.645 1.959 2.216 2.417 2.6 2.771 3.112 3.272 3.423 3.668 3.849 3.968 4.203 4.413 4.601 4.705 4.906 5.1 5.407 5.611 5.8 6.067 6.342 6.587 6.813 7.042 7.334 7.618 7.879 8.195 8.524 8.845 9.201 9.597 9.969 10.364 10.808 11.297 11.8 12.397 13.127 13.853 14.688 15.596 16.688 17.968 19.475 21.339 23.706 25.674 26.819 27.561 28.067 28.419 28.635 28.761 28.804 28.785 28.768 28.764 28.72 28.674 28.598 28.492 28.39 28.278 28.193 28.115 28.013 27.92 27.815 27.694 27.587 27.463 27.346 27.221 27.099 27.022 26.932 26.787 26.667 26.538 26.473 26.329 26.194 26.061 25.983 25.876 25.73 25.641 25.548 25.357 25.252 25.12 24.968 24.788 24.551 24.256 23.222 -8 ,599 ,TETRA ,17617605,Tue Nov 30 09:52:47 CET,Tue Nov 30 11:38:06 CET,0.0 1.362 1.743 1.997 2.213 2.416 2.597 2.771 3.118 3.285 3.444 3.693 3.874 3.998 4.232 4.449 4.654 4.76 4.967 5.151 5.417 5.586 5.755 6.001 6.243 6.494 6.741 6.966 7.248 7.555 7.852 8.17 8.469 8.775 9.147 9.547 9.919 10.36 10.845 11.339 11.857 12.46 13.155 13.879 14.747 15.703 16.836 18.133 19.626 21.421 23.708 25.648 26.814 27.51 27.944 28.238 28.362 28.437 28.469 28.477 28.497 28.488 28.458 28.4 28.335 28.277 28.2 28.082 27.964 27.845 27.729 27.639 27.544 27.429 27.321 27.209 27.087 26.947 26.798 26.697 26.601 26.436 26.313 26.197 26.133 25.995 25.846 25.689 25.616 25.505 25.312 25.209 25.101 24.843 24.704 24.548 24.363 24.138 23.877 23.557 22.714 -9 ,9787 ,TETRA ,17617606,Tue Nov 30 09:53:45 CET,Tue Nov 30 11:40:29 CET,0.0 1.403 1.804 2.112 2.375 2.608 2.805 2.969 3.271 3.424 3.586 3.839 4.027 4.155 4.397 4.629 4.84 4.947 5.161 5.355 5.636 5.826 6.003 6.251 6.52 6.783 7.022 7.251 7.548 7.843 8.134 8.472 8.778 9.088 9.451 9.846 10.249 10.685 11.122 11.62 12.162 12.738 13.394 14.086 14.921 15.858 16.946 18.178 19.726 21.592 23.74 25.512 26.512 27.143 27.579 27.879 28.053 28.118 28.14 28.129 28.068 27.991 27.924 27.858 27.807 27.739 27.623 27.499 27.386 27.277 27.163 27.07 26.962 26.853 26.769 26.666 26.539 26.385 26.228 26.125 26.034 25.895 25.796 25.694 25.627 25.481 25.347 25.189 25.105 25.012 24.838 24.718 24.596 24.326 24.187 24.023 23.819 23.596 23.318 22.936 21.91 -10 ,7 ,TETRA ,17617607,Tue Nov 30 09:53:45 CET,Tue Nov 30 11:42:53 CET,0.0 1.422 1.779 2.052 2.284 2.49 2.675 2.85 3.177 3.318 3.455 3.677 3.849 3.965 4.191 4.427 4.664 4.77 4.977 5.177 5.458 5.651 5.834 6.069 6.305 6.546 6.772 7.007 7.314 7.607 7.876 8.182 8.481 8.775 9.12 9.531 9.921 10.314 10.791 11.334 11.882 12.478 13.167 13.909 14.753 15.67 16.793 18.046 19.547 21.451 23.81 25.835 27.043 27.779 28.258 28.605 28.815 28.934 29.003 29.042 29.057 29.058 29.03 28.96 28.877 28.794 28.681 28.583 28.522 28.437 28.308 28.195 28.077 27.967 27.896 27.797 27.671 27.558 27.451 27.377 27.29 27.141 27.035 26.919 26.854 26.7 26.54 26.377 26.292 26.174 25.983 25.872 25.762 25.515 25.358 25.189 25.005 24.795 24.525 24.141 22.981 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_43_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_43_31.txt deleted file mode 100644 index 1c6ac995..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_43_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18729 ,TETRA ,17617608,Tue Nov 30 09:53:46 CET,Tue Nov 30 11:41:50 CET,0.0 1.205 1.518 1.781 1.982 2.138 2.266 2.385 2.617 2.709 2.788 2.918 3.013 3.08 3.217 3.344 3.444 3.489 3.578 3.66 3.778 3.848 3.913 4.013 4.105 4.183 4.249 4.31 4.379 4.431 4.477 4.524 4.567 4.601 4.635 4.674 4.696 4.706 4.702 4.67 4.618 4.552 4.451 4.293 4.05 3.728 3.295 2.693 1.795 0.378 -1.974 -4.721 -6.918 -8.723 -10.199 -11.472 -12.59 -13.57 -14.389 -15.197 -15.901 -16.524 -17.088 -17.622 -18.108 -18.539 -18.986 -19.38 -19.721 -20.079 -20.471 -20.796 -21.13 -21.459 -21.709 -21.979 -22.248 -22.504 -22.786 -22.998 -23.207 -23.524 -23.741 -23.955 -24.065 -24.305 -24.552 -24.825 -24.976 -25.166 -25.417 -25.578 -25.743 -26.106 -26.302 -26.506 -26.749 -27.05 -27.369 -27.766 -29.196 -2 ,3452 ,TETRA ,17617609,Tue Nov 30 09:53:46 CET,Tue Nov 30 11:41:07 CET,0.0 1.245 1.634 1.912 2.126 2.29 2.438 2.572 2.783 2.862 2.938 3.054 3.137 3.197 3.317 3.422 3.519 3.565 3.653 3.728 3.829 3.902 3.972 4.063 4.144 4.215 4.279 4.345 4.422 4.481 4.541 4.594 4.636 4.684 4.744 4.805 4.837 4.852 4.874 4.894 4.866 4.79 4.685 4.567 4.381 4.091 3.686 3.071 2.116 0.7 -1.666 -4.409 -6.588 -8.437 -9.982 -11.302 -12.478 -13.518 -14.384 -15.264 -16.02 -16.699 -17.311 -17.859 -18.356 -18.804 -19.264 -19.669 -20.026 -20.394 -20.789 -21.116 -21.432 -21.748 -22.013 -22.287 -22.556 -22.84 -23.135 -23.335 -23.541 -23.858 -24.08 -24.316 -24.432 -24.663 -24.917 -25.183 -25.32 -25.518 -25.788 -25.959 -26.138 -26.542 -26.759 -26.987 -27.229 -27.504 -27.839 -28.233 -29.963 -3 ,4648 ,TETRA ,17617610,Tue Nov 30 09:54:42 CET,Tue Nov 30 11:41:39 CET,0.0 1.139 1.488 1.713 1.902 2.08 2.241 2.38 2.601 2.701 2.796 2.927 3.024 3.105 3.254 3.372 3.485 3.536 3.625 3.717 3.842 3.914 3.985 4.082 4.167 4.252 4.327 4.4 4.49 4.553 4.608 4.666 4.713 4.771 4.827 4.858 4.875 4.892 4.905 4.892 4.856 4.809 4.724 4.583 4.393 4.14 3.736 3.148 2.249 0.863 -1.39 -4.035 -6.195 -8.013 -9.502 -10.813 -11.957 -12.968 -13.856 -14.75 -15.473 -16.081 -16.646 -17.135 -17.588 -18.025 -18.511 -18.959 -19.328 -19.701 -20.1 -20.416 -20.728 -21.049 -21.298 -21.568 -21.847 -22.129 -22.439 -22.656 -22.862 -23.169 -23.394 -23.629 -23.748 -24.005 -24.268 -24.538 -24.688 -24.901 -25.177 -25.34 -25.522 -25.906 -26.106 -26.345 -26.613 -26.899 -27.219 -27.6 -28.745 -4 ,15369 ,TETRA ,17617611,Tue Nov 30 09:54:43 CET,Tue Nov 30 11:42:16 CET,0.0 1.055 1.428 1.721 1.931 2.098 2.239 2.351 2.543 2.633 2.715 2.838 2.921 2.988 3.129 3.235 3.329 3.376 3.466 3.551 3.664 3.736 3.808 3.897 3.972 4.041 4.096 4.161 4.253 4.331 4.395 4.455 4.518 4.584 4.641 4.688 4.723 4.743 4.749 4.719 4.654 4.564 4.417 4.235 3.975 3.619 3.136 2.459 1.447 -0.084 -2.573 -5.411 -7.723 -9.658 -11.287 -12.726 -13.905 -14.914 -15.759 -16.58 -17.312 -17.979 -18.584 -19.129 -19.66 -20.143 -20.614 -21.018 -21.357 -21.722 -22.09 -22.397 -22.726 -23.052 -23.311 -23.562 -23.808 -24.074 -24.343 -24.531 -24.734 -25.06 -25.273 -25.494 -25.62 -25.875 -26.126 -26.382 -26.518 -26.72 -26.99 -27.155 -27.334 -27.708 -27.9 -28.12 -28.386 -28.67 -28.979 -29.407 -30.547 -5 ,4961 ,TETRA ,17617612,Tue Nov 30 09:54:43 CET,Tue Nov 30 11:41:00 CET,0.0 1.016 1.371 1.602 1.769 1.92 2.058 2.174 2.391 2.482 2.567 2.69 2.777 2.848 2.973 3.082 3.201 3.251 3.322 3.391 3.495 3.565 3.643 3.759 3.856 3.943 4.027 4.1 4.173 4.228 4.284 4.347 4.403 4.454 4.495 4.538 4.563 4.569 4.568 4.567 4.545 4.476 4.353 4.183 3.931 3.621 3.212 2.594 1.668 0.28 -2.061 -4.786 -6.983 -8.791 -10.245 -11.556 -12.711 -13.694 -14.504 -15.341 -16.061 -16.686 -17.282 -17.822 -18.341 -18.812 -19.296 -19.75 -20.121 -20.475 -20.844 -21.165 -21.493 -21.821 -22.076 -22.329 -22.592 -22.875 -23.181 -23.403 -23.618 -23.935 -24.142 -24.355 -24.481 -24.763 -25.046 -25.316 -25.458 -25.654 -25.903 -26.072 -26.259 -26.676 -26.9 -27.13 -27.388 -27.684 -28.055 -28.546 -29.785 -6 ,12150 ,TETRA ,17617613,Tue Nov 30 09:54:44 CET,Tue Nov 30 11:42:34 CET,0.0 1.087 1.543 1.817 2.016 2.196 2.348 2.467 2.694 2.802 2.897 3.042 3.136 3.198 3.324 3.436 3.535 3.588 3.685 3.763 3.87 3.944 4.019 4.132 4.225 4.293 4.354 4.407 4.478 4.553 4.629 4.702 4.747 4.796 4.857 4.884 4.903 4.939 4.971 4.985 4.952 4.869 4.759 4.666 4.503 4.215 3.802 3.202 2.286 0.89 -1.44 -4.304 -6.5 -8.224 -9.668 -10.943 -12.116 -13.157 -13.981 -14.774 -15.453 -16.061 -16.622 -17.158 -17.692 -18.176 -18.658 -19.074 -19.416 -19.779 -20.167 -20.482 -20.813 -21.16 -21.428 -21.712 -22.004 -22.302 -22.606 -22.816 -23.03 -23.343 -23.559 -23.772 -23.879 -24.118 -24.369 -24.631 -24.77 -24.969 -25.244 -25.408 -25.578 -25.949 -26.146 -26.377 -26.636 -26.917 -27.261 -27.655 -28.538 -7 ,18145 ,TETRA ,17617614,Tue Nov 30 09:54:44 CET,Tue Nov 30 11:41:51 CET,0.0 1.23 1.53 1.77 1.965 2.11 2.238 2.372 2.591 2.686 2.789 2.931 3.023 3.084 3.201 3.326 3.445 3.494 3.575 3.641 3.736 3.808 3.881 3.984 4.075 4.162 4.244 4.317 4.41 4.484 4.529 4.579 4.639 4.694 4.746 4.784 4.829 4.851 4.839 4.838 4.833 4.793 4.69 4.535 4.304 3.969 3.503 2.924 2.081 0.696 -1.687 -4.458 -6.638 -8.446 -9.932 -11.162 -12.242 -13.248 -14.105 -14.921 -15.629 -16.301 -16.949 -17.553 -18.087 -18.545 -19.021 -19.44 -19.799 -20.16 -20.528 -20.851 -21.19 -21.522 -21.78 -22.057 -22.332 -22.626 -22.944 -23.137 -23.325 -23.642 -23.878 -24.123 -24.237 -24.471 -24.719 -24.995 -25.142 -25.342 -25.625 -25.787 -25.947 -26.306 -26.504 -26.723 -26.987 -27.323 -27.668 -28.098 -29.241 -8 ,27032 ,TETRA ,17617615,Tue Nov 30 09:54:44 CET,Tue Nov 30 11:41:08 CET,0.0 1.302 1.592 1.781 1.947 2.1 2.254 2.398 2.637 2.729 2.815 2.967 3.07 3.142 3.27 3.384 3.501 3.553 3.66 3.758 3.874 3.945 4.016 4.114 4.199 4.27 4.331 4.384 4.452 4.526 4.597 4.675 4.748 4.799 4.855 4.913 4.936 4.95 4.95 4.929 4.883 4.804 4.689 4.518 4.265 3.937 3.461 2.808 1.88 0.436 -1.959 -4.865 -7.13 -8.934 -10.439 -11.748 -12.9 -13.914 -14.744 -15.537 -16.229 -16.85 -17.436 -17.994 -18.51 -18.984 -19.474 -19.888 -20.229 -20.568 -20.917 -21.216 -21.532 -21.883 -22.149 -22.4 -22.664 -22.943 -23.243 -23.444 -23.65 -23.983 -24.206 -24.433 -24.55 -24.791 -25.042 -25.299 -25.431 -25.615 -25.861 -26.026 -26.199 -26.588 -26.807 -27.026 -27.254 -27.505 -27.807 -28.322 -29.44 -9 ,26412 ,TETRA ,17617616,Tue Nov 30 09:55:43 CET,Tue Nov 30 11:42:44 CET,0.0 1.045 1.372 1.608 1.812 1.998 2.155 2.283 2.5 2.597 2.681 2.824 2.927 3.001 3.142 3.255 3.348 3.398 3.492 3.578 3.7 3.777 3.855 3.964 4.061 4.141 4.21 4.27 4.343 4.416 4.495 4.576 4.635 4.684 4.728 4.767 4.781 4.78 4.767 4.752 4.743 4.69 4.577 4.442 4.21 3.862 3.382 2.666 1.608 0.072 -2.474 -5.45 -7.824 -9.703 -11.262 -12.639 -13.85 -14.931 -15.798 -16.612 -17.323 -17.956 -18.542 -19.114 -19.664 -20.147 -20.617 -21.026 -21.374 -21.749 -22.133 -22.444 -22.794 -23.151 -23.41 -23.692 -23.974 -24.239 -24.511 -24.71 -24.922 -25.239 -25.461 -25.685 -25.794 -26.023 -26.268 -26.523 -26.655 -26.85 -27.091 -27.247 -27.409 -27.785 -27.99 -28.205 -28.447 -28.733 -29.067 -29.485 -30.659 -10 ,16563 ,TETRA ,17617617,Tue Nov 30 09:54:44 CET,Tue Nov 30 11:31:35 CET,0.0 1.686 2.1 2.342 2.545 2.727 2.863 2.975 3.169 3.253 3.337 3.465 3.561 3.628 3.729 3.821 3.917 3.969 4.072 4.153 4.255 4.314 4.373 4.466 4.546 4.606 4.675 4.743 4.806 4.869 4.917 4.972 5.03 5.078 5.109 5.126 5.147 5.164 5.157 5.141 5.105 5.034 4.938 4.797 4.573 4.243 3.773 3.146 2.27 0.936 -1.429 -4.218 -6.446 -8.272 -9.764 -11.087 -12.223 -13.209 -14.058 -14.932 -15.646 -16.232 -16.778 -17.293 -17.77 -18.207 -18.651 -19.053 -19.414 -19.772 -20.124 -20.439 -20.776 -21.103 -21.345 -21.59 -21.845 -22.13 -22.442 -22.645 -22.848 -23.161 -23.378 -23.618 -23.734 -23.932 -24.147 -24.394 -24.525 -24.717 -24.964 -25.126 -25.294 -25.665 -25.872 -26.07 -26.29 -26.554 -26.88 -27.344 -28.831 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_54_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_54_50.txt deleted file mode 100644 index 2bf0487d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_54_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27529 ,TETRA ,17617618,Tue Nov 30 09:54:44 CET,Tue Nov 30 11:40:47 CET,0.0 1.039 1.374 1.618 1.838 2.028 2.196 2.364 2.692 2.839 2.963 3.022 3.299 3.393 3.567 3.74 3.915 4.002 4.177 4.331 4.529 4.644 4.758 4.941 5.118 5.292 5.455 5.6 5.791 5.994 6.196 6.421 6.633 6.837 7.07 7.35 7.614 7.891 8.176 8.449 8.701 8.968 9.28 9.57 9.871 10.192 10.536 10.864 11.141 11.309 11.27 10.894 10.289 9.604 9.014 8.485 7.975 7.466 7.015 6.533 6.084 5.702 5.316 4.933 4.59 4.24 3.853 3.506 3.199 2.878 2.548 2.28 1.99 1.695 1.465 1.225 0.975 0.705 0.407 0.2 0.0 -0.299 -0.505 -0.723 -0.835 -1.077 -1.324 -1.584 -1.73 -2.046 -2.188 -2.346 -2.527 -2.948 -3.183 -3.45 -3.732 -4.034 -4.384 -4.887 -6.535 -2 ,1370 ,TETRA ,17617619,Tue Nov 30 09:54:44 CET,Tue Nov 30 11:37:47 CET,0.0 1.022 1.375 1.649 1.873 2.05 2.199 2.342 2.601 2.721 2.842 2.905 3.173 3.274 3.448 3.616 3.779 3.854 3.986 4.115 4.309 4.432 4.551 4.741 4.921 5.069 5.207 5.34 5.511 5.676 5.841 6.054 6.251 6.432 6.636 6.858 7.056 7.264 7.494 7.719 7.941 8.191 8.454 8.72 9.037 9.35 9.656 9.959 10.292 10.515 10.326 9.73 9.048 8.35 7.697 7.011 6.328 5.712 5.122 4.523 4.026 3.536 3.083 2.704 2.348 1.983 1.58 1.246 0.967 0.658 0.35 0.107 -0.154 -0.446 -0.669 -0.882 -1.101 -1.34 -1.621 -1.813 -1.992 -2.283 -2.49 -2.697 -2.803 -3.032 -3.286 -3.552 -3.699 -4.033 -4.237 -4.43 -4.625 -5.032 -5.262 -5.525 -5.801 -6.127 -6.562 -7.109 -8.647 -3 ,20536 ,TETRA ,17617620,Tue Nov 30 09:55:43 CET,Tue Nov 30 11:42:59 CET,0.0 1.02 1.397 1.674 1.9 2.079 2.238 2.391 2.685 2.817 2.938 2.996 3.278 3.376 3.556 3.741 3.915 3.995 4.153 4.303 4.519 4.66 4.797 4.98 5.148 5.32 5.48 5.636 5.843 6.039 6.217 6.415 6.611 6.805 7.022 7.26 7.504 7.762 8.018 8.289 8.564 8.89 9.269 9.599 9.959 10.391 10.818 11.195 11.57 11.817 11.767 11.27 10.649 9.952 9.254 8.628 8.06 7.508 7.035 6.58 6.2 5.849 5.477 5.125 4.801 4.476 4.135 3.834 3.556 3.269 2.984 2.728 2.452 2.159 1.934 1.715 1.468 1.203 0.936 0.757 0.562 0.244 0.022 -0.207 -0.326 -0.566 -0.804 -1.067 -1.216 -1.538 -1.723 -1.914 -2.105 -2.538 -2.759 -3.007 -3.28 -3.575 -3.942 -4.403 -6.221 -4 ,25294 ,TETRA ,17617621,Tue Nov 30 09:55:43 CET,Tue Nov 30 11:42:35 CET,0.0 1.211 1.601 1.893 2.122 2.308 2.486 2.649 2.935 3.06 3.174 3.233 3.505 3.601 3.793 3.97 4.134 4.215 4.368 4.513 4.716 4.836 4.948 5.123 5.294 5.448 5.596 5.73 5.888 6.037 6.19 6.388 6.601 6.806 7.011 7.236 7.459 7.696 7.952 8.204 8.433 8.682 8.962 9.259 9.606 9.925 10.229 10.525 10.741 10.863 10.725 10.24 9.731 9.118 8.518 7.97 7.463 6.967 6.457 5.9 5.442 5.023 4.601 4.217 3.864 3.541 3.172 2.815 2.496 2.164 1.825 1.54 1.252 0.966 0.752 0.507 0.232 -0.035 -0.297 -0.487 -0.684 -0.972 -1.178 -1.423 -1.552 -1.795 -2.055 -2.315 -2.448 -2.761 -2.903 -3.075 -3.259 -3.677 -3.915 -4.175 -4.44 -4.731 -5.101 -5.574 -7.036 -5 ,16692 ,TETRA ,17617622,Tue Nov 30 09:55:43 CET,Tue Nov 30 11:42:58 CET,0.0 1.03 1.424 1.696 1.909 2.09 2.248 2.39 2.644 2.773 2.907 2.961 3.227 3.34 3.553 3.728 3.898 3.982 4.134 4.268 4.463 4.588 4.707 4.879 5.048 5.207 5.36 5.513 5.696 5.857 6.014 6.208 6.399 6.577 6.787 7.028 7.253 7.492 7.746 8.0 8.234 8.468 8.734 8.993 9.282 9.589 9.885 10.166 10.446 10.616 10.556 10.12 9.562 8.971 8.39 7.81 7.22 6.686 6.233 5.718 5.235 4.764 4.312 3.895 3.496 3.15 2.793 2.439 2.115 1.79 1.457 1.207 0.951 0.656 0.421 0.188 -0.049 -0.309 -0.592 -0.793 -1.003 -1.32 -1.542 -1.775 -1.892 -2.122 -2.372 -2.666 -2.823 -3.16 -3.351 -3.539 -3.734 -4.139 -4.368 -4.634 -4.926 -5.241 -5.62 -6.158 -7.611 -6 ,13827 ,TETRA ,17617623,Tue Nov 30 09:55:42 CET,Tue Nov 30 11:42:55 CET,0.0 0.88 1.218 1.485 1.711 1.895 2.05 2.185 2.437 2.558 2.663 2.693 2.957 3.045 3.217 3.387 3.54 3.617 3.78 3.94 4.155 4.277 4.397 4.573 4.731 4.882 5.036 5.185 5.36 5.53 5.694 5.878 6.055 6.217 6.397 6.607 6.801 7.004 7.226 7.47 7.716 7.965 8.237 8.487 8.759 9.028 9.31 9.651 9.959 10.154 10.091 9.594 8.963 8.279 7.627 7.022 6.473 5.965 5.489 4.989 4.592 4.256 3.936 3.602 3.275 2.971 2.645 2.356 2.101 1.821 1.532 1.275 0.994 0.707 0.487 0.282 0.046 -0.221 -0.471 -0.634 -0.812 -1.113 -1.325 -1.54 -1.655 -1.898 -2.164 -2.455 -2.606 -2.929 -3.088 -3.276 -3.474 -3.879 -4.105 -4.368 -4.671 -5.013 -5.408 -5.921 -7.471 -7 ,17856 ,TETRA ,17617624,Tue Nov 30 09:55:44 CET,Tue Nov 30 11:41:53 CET,0.0 0.945 1.36 1.652 1.888 2.08 2.253 2.402 2.645 2.772 2.903 2.959 3.228 3.325 3.499 3.667 3.83 3.908 4.055 4.207 4.427 4.56 4.688 4.866 5.031 5.189 5.347 5.501 5.691 5.871 6.054 6.26 6.437 6.608 6.804 7.03 7.253 7.477 7.702 7.939 8.181 8.436 8.735 9.028 9.353 9.733 10.135 10.471 10.732 10.934 10.911 10.458 9.998 9.51 8.965 8.416 7.911 7.45 7.063 6.63 6.243 5.905 5.556 5.233 4.939 4.655 4.355 4.07 3.796 3.513 3.23 2.994 2.751 2.481 2.249 2.003 1.738 1.465 1.203 1.043 0.885 0.607 0.389 0.155 0.037 -0.197 -0.448 -0.718 -0.852 -1.153 -1.275 -1.435 -1.607 -1.983 -2.185 -2.412 -2.662 -2.939 -3.304 -3.815 -5.189 -8 ,12087 ,TETRA ,17617625,Tue Nov 30 09:55:44 CET,Tue Nov 30 11:43:40 CET,0.0 1.105 1.433 1.69 1.914 2.105 2.277 2.425 2.688 2.809 2.917 2.938 3.202 3.309 3.51 3.698 3.865 3.941 4.084 4.214 4.407 4.539 4.667 4.854 5.026 5.179 5.316 5.447 5.631 5.808 5.968 6.156 6.346 6.521 6.727 6.973 7.18 7.388 7.597 7.801 8.007 8.24 8.489 8.703 8.937 9.17 9.398 9.621 9.806 9.884 9.68 9.106 8.417 7.759 7.225 6.686 6.165 5.64 5.142 4.675 4.285 3.899 3.499 3.145 2.813 2.491 2.181 1.896 1.652 1.384 1.045 0.767 0.493 0.202 -0.02 -0.243 -0.479 -0.743 -1.018 -1.207 -1.411 -1.742 -1.975 -2.198 -2.314 -2.569 -2.831 -3.104 -3.26 -3.586 -3.766 -3.952 -4.133 -4.533 -4.768 -5.034 -5.323 -5.63 -5.998 -6.457 -8.069 -9 ,26826 ,TETRA ,17617626,Tue Nov 30 09:56:45 CET,Tue Nov 30 11:38:12 CET,0.0 1.155 1.512 1.779 1.981 2.173 2.359 2.521 2.812 2.959 3.097 3.158 3.437 3.539 3.724 3.894 4.052 4.128 4.283 4.433 4.636 4.764 4.889 5.056 5.204 5.353 5.499 5.646 5.834 6.013 6.198 6.423 6.631 6.816 7.044 7.307 7.539 7.785 8.038 8.285 8.511 8.765 9.069 9.339 9.642 9.973 10.305 10.609 10.889 11.003 10.792 10.199 9.499 8.822 8.138 7.461 6.888 6.367 5.891 5.391 4.952 4.556 4.156 3.764 3.39 3.032 2.661 2.315 1.992 1.663 1.322 1.047 0.791 0.538 0.346 0.152 -0.08 -0.332 -0.602 -0.795 -0.98 -1.268 -1.472 -1.686 -1.804 -2.057 -2.305 -2.559 -2.691 -2.992 -3.119 -3.294 -3.474 -3.832 -4.044 -4.297 -4.586 -4.925 -5.271 -5.692 -7.21 -10 ,29251 ,TETRA ,17617627,Tue Nov 30 09:56:45 CET,Tue Nov 30 11:43:09 CET,0.0 1.045 1.414 1.696 1.923 2.108 2.277 2.427 2.709 2.836 2.949 2.982 3.244 3.336 3.51 3.675 3.828 3.904 4.054 4.204 4.411 4.528 4.645 4.815 4.967 5.108 5.249 5.388 5.574 5.759 5.935 6.136 6.326 6.51 6.733 6.991 7.22 7.462 7.708 7.937 8.166 8.415 8.694 8.977 9.291 9.632 10.041 10.413 10.708 10.918 10.961 10.531 9.817 9.126 8.522 7.924 7.346 6.791 6.265 5.741 5.321 4.945 4.601 4.269 3.911 3.537 3.128 2.773 2.492 2.216 1.914 1.661 1.406 1.136 0.925 0.71 0.475 0.225 -0.035 -0.211 -0.389 -0.678 -0.879 -1.112 -1.23 -1.464 -1.71 -1.946 -2.08 -2.392 -2.535 -2.702 -2.88 -3.291 -3.519 -3.769 -4.047 -4.35 -4.732 -5.292 -6.814 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_57_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_57_155.txt deleted file mode 100644 index c14a8038..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_57_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23572 ,TETRA ,17617628,Tue Nov 30 09:56:45 CET,Tue Nov 30 11:45:48 CET,0.0 0.567 0.808 0.97 1.096 1.186 1.254 1.324 1.456 1.507 1.549 1.617 1.667 1.706 1.788 1.859 1.92 1.949 1.995 2.029 2.066 2.072 2.075 2.109 2.13 2.115 2.112 2.127 2.122 2.08 2.031 1.968 1.894 1.814 1.716 1.599 1.46 1.269 1.056 0.828 0.555 0.204 -0.199 -0.659 -1.327 -2.135 -3.211 -4.67 -6.62 -9.355 -13.587 -18.135 -21.505 -24.133 -26.279 -28.099 -29.665 -31.036 -32.161 -33.316 -34.281 -35.054 -35.756 -36.416 -37.018 -37.548 -38.093 -38.572 -38.997 -39.414 -39.826 -40.198 -40.579 -40.957 -41.234 -41.52 -41.829 -42.137 -42.444 -42.658 -42.875 -43.197 -43.41 -43.62 -43.736 -43.982 -44.229 -44.486 -44.609 -44.795 -45.033 -45.196 -45.351 -45.683 -45.876 -46.072 -46.269 -46.48 -46.728 -47.046 -48.048 -2 ,3016 ,TETRA ,17617629,Tue Nov 30 09:56:45 CET,Tue Nov 30 11:45:17 CET,0.0 0.608 0.8 0.935 1.034 1.126 1.208 1.277 1.406 1.459 1.512 1.631 1.69 1.72 1.772 1.815 1.874 1.911 1.967 2.007 2.072 2.11 2.131 2.161 2.185 2.184 2.174 2.153 2.11 2.064 2.025 1.975 1.91 1.841 1.769 1.678 1.562 1.4 1.192 0.942 0.676 0.367 -0.029 -0.51 -1.176 -2.002 -3.066 -4.435 -6.339 -9.028 -13.046 -17.356 -20.614 -23.205 -25.309 -27.1 -28.585 -29.875 -30.941 -31.952 -32.871 -33.725 -34.505 -35.204 -35.795 -36.304 -36.83 -37.308 -37.74 -38.158 -38.565 -38.891 -39.233 -39.605 -39.895 -40.187 -40.48 -40.79 -41.119 -41.333 -41.544 -41.895 -42.139 -42.387 -42.509 -42.744 -42.982 -43.233 -43.363 -43.553 -43.784 -43.928 -44.081 -44.42 -44.591 -44.755 -44.944 -45.167 -45.427 -45.742 -46.469 -3 ,25937 ,TETRA ,17617630,Tue Nov 30 09:57:43 CET,Tue Nov 30 11:46:03 CET,0.0 0.659 0.887 1.06 1.188 1.285 1.365 1.445 1.57 1.619 1.671 1.759 1.81 1.843 1.917 1.999 2.067 2.096 2.158 2.212 2.276 2.312 2.343 2.386 2.43 2.456 2.448 2.428 2.409 2.389 2.378 2.357 2.304 2.237 2.142 2.047 1.965 1.828 1.626 1.402 1.144 0.83 0.407 -0.068 -0.674 -1.471 -2.514 -3.894 -5.825 -8.525 -12.596 -16.971 -20.279 -22.962 -25.109 -26.898 -28.384 -29.662 -30.717 -31.738 -32.633 -33.418 -34.109 -34.733 -35.323 -35.85 -36.37 -36.833 -37.23 -37.629 -38.044 -38.382 -38.73 -39.115 -39.416 -39.716 -40.031 -40.342 -40.661 -40.887 -41.12 -41.473 -41.706 -41.952 -42.075 -42.332 -42.602 -42.859 -42.983 -43.178 -43.453 -43.614 -43.769 -44.116 -44.308 -44.497 -44.705 -44.955 -45.225 -45.563 -46.377 -4 ,4338 ,TETRA ,17617631,Tue Nov 30 09:57:45 CET,Tue Nov 30 11:47:02 CET,0.0 0.76 1.008 1.174 1.289 1.394 1.508 1.613 1.76 1.816 1.856 1.922 1.98 2.02 2.084 2.154 2.237 2.28 2.352 2.421 2.507 2.561 2.604 2.65 2.687 2.708 2.713 2.699 2.696 2.709 2.713 2.704 2.674 2.658 2.618 2.531 2.422 2.263 2.062 1.8 1.494 1.13 0.681 0.174 -0.481 -1.281 -2.342 -3.742 -5.645 -8.353 -12.504 -16.939 -20.221 -22.817 -24.921 -26.693 -28.201 -29.525 -30.605 -31.637 -32.497 -33.242 -33.93 -34.551 -35.119 -35.664 -36.252 -36.777 -37.239 -37.697 -38.123 -38.46 -38.814 -39.175 -39.46 -39.764 -40.074 -40.39 -40.717 -40.936 -41.15 -41.49 -41.728 -41.968 -42.085 -42.33 -42.588 -42.85 -42.998 -43.205 -43.429 -43.574 -43.738 -44.131 -44.336 -44.546 -44.773 -45.001 -45.282 -45.61 -46.574 -5 ,3177 ,TETRA ,17617632,Tue Nov 30 09:57:45 CET,Tue Nov 30 11:46:59 CET,0.0 0.652 0.883 1.025 1.141 1.23 1.315 1.397 1.541 1.595 1.646 1.737 1.784 1.822 1.896 1.961 2.007 2.026 2.068 2.109 2.134 2.137 2.148 2.167 2.184 2.203 2.221 2.229 2.233 2.232 2.234 2.232 2.203 2.145 2.05 1.926 1.793 1.621 1.405 1.155 0.873 0.537 0.117 -0.389 -1.09 -1.974 -3.107 -4.535 -6.464 -9.226 -13.414 -17.891 -21.227 -23.894 -26.14 -28.027 -29.579 -30.942 -32.077 -33.158 -34.039 -34.778 -35.472 -36.139 -36.752 -37.285 -37.819 -38.277 -38.665 -39.071 -39.483 -39.818 -40.149 -40.473 -40.737 -41.012 -41.306 -41.616 -41.917 -42.132 -42.361 -42.7 -42.922 -43.14 -43.255 -43.498 -43.757 -44.017 -44.144 -44.33 -44.56 -44.711 -44.865 -45.18 -45.353 -45.537 -45.733 -45.946 -46.206 -46.52 -47.175 -6 ,16329 ,TETRA ,17617633,Tue Nov 30 09:57:47 CET,Tue Nov 30 11:47:37 CET,0.0 0.792 1.064 1.232 1.354 1.459 1.558 1.649 1.818 1.904 1.97 2.06 2.107 2.137 2.211 2.293 2.375 2.412 2.475 2.518 2.579 2.612 2.648 2.714 2.773 2.824 2.848 2.836 2.807 2.792 2.783 2.787 2.785 2.745 2.667 2.567 2.458 2.316 2.135 1.902 1.626 1.286 0.842 0.332 -0.344 -1.196 -2.31 -3.722 -5.615 -8.307 -12.457 -16.919 -20.249 -22.912 -25.021 -26.766 -28.237 -29.529 -30.598 -31.62 -32.48 -33.229 -33.911 -34.526 -35.1 -35.643 -36.196 -36.663 -37.079 -37.504 -37.924 -38.288 -38.68 -39.086 -39.392 -39.686 -39.962 -40.244 -40.548 -40.755 -40.964 -41.302 -41.554 -41.813 -41.94 -42.194 -42.462 -42.742 -42.881 -43.08 -43.339 -43.496 -43.654 -44.015 -44.21 -44.398 -44.59 -44.807 -45.072 -45.409 -46.234 -7 ,5619 ,TETRA ,17617634,Tue Nov 30 09:57:45 CET,Tue Nov 30 11:47:30 CET,0.0 0.903 1.14 1.307 1.457 1.596 1.698 1.777 1.901 1.954 2.007 2.112 2.181 2.237 2.335 2.416 2.487 2.519 2.56 2.587 2.614 2.632 2.659 2.674 2.67 2.677 2.675 2.661 2.645 2.627 2.605 2.573 2.541 2.508 2.442 2.354 2.274 2.139 1.942 1.706 1.502 1.27 0.901 0.484 -0.117 -0.949 -2.052 -3.453 -5.333 -8.001 -12.106 -16.507 -19.851 -22.484 -24.579 -26.364 -27.877 -29.181 -30.319 -31.455 -32.35 -33.086 -33.769 -34.41 -34.985 -35.498 -36.023 -36.481 -36.878 -37.303 -37.753 -38.121 -38.496 -38.85 -39.112 -39.406 -39.721 -40.04 -40.355 -40.554 -40.756 -41.078 -41.297 -41.53 -41.657 -41.94 -42.226 -42.504 -42.639 -42.827 -43.067 -43.225 -43.393 -43.742 -43.928 -44.139 -44.347 -44.561 -44.834 -45.232 -46.18 -8 ,13362 ,TETRA ,17617635,Tue Nov 30 09:57:45 CET,Tue Nov 30 11:47:34 CET,0.0 0.549 0.779 0.999 1.169 1.284 1.388 1.498 1.689 1.756 1.812 1.905 1.974 2.039 2.149 2.233 2.298 2.33 2.397 2.464 2.544 2.575 2.593 2.615 2.639 2.652 2.661 2.674 2.699 2.693 2.656 2.615 2.563 2.511 2.462 2.363 2.244 2.119 1.952 1.766 1.578 1.311 0.949 0.511 -0.166 -1.032 -2.126 -3.535 -5.48 -8.224 -12.319 -16.733 -20.062 -22.658 -24.744 -26.509 -27.996 -29.312 -30.388 -31.421 -32.282 -33.015 -33.703 -34.366 -34.971 -35.5 -36.051 -36.524 -36.934 -37.344 -37.758 -38.119 -38.486 -38.863 -39.158 -39.467 -39.784 -40.107 -40.417 -40.619 -40.838 -41.19 -41.419 -41.648 -41.779 -42.049 -42.313 -42.601 -42.754 -42.962 -43.221 -43.387 -43.56 -43.93 -44.132 -44.353 -44.6 -44.849 -45.127 -45.497 -46.465 -9 ,18684 ,TETRA ,17617636,Tue Nov 30 09:57:46 CET,Tue Nov 30 11:48:07 CET,0.0 0.737 0.983 1.161 1.299 1.426 1.544 1.637 1.798 1.871 1.926 1.996 2.053 2.111 2.219 2.312 2.393 2.43 2.5 2.56 2.625 2.657 2.685 2.73 2.769 2.799 2.842 2.878 2.892 2.927 2.939 2.886 2.83 2.772 2.693 2.575 2.437 2.301 2.157 1.938 1.658 1.33 0.903 0.412 -0.237 -1.064 -2.132 -3.502 -5.332 -7.957 -12.133 -16.64 -20.009 -22.64 -24.748 -26.53 -28.024 -29.379 -30.533 -31.63 -32.525 -33.278 -33.988 -34.66 -35.261 -35.785 -36.342 -36.833 -37.247 -37.669 -38.125 -38.491 -38.835 -39.207 -39.487 -39.773 -40.066 -40.376 -40.704 -40.915 -41.12 -41.434 -41.658 -41.894 -42.02 -42.292 -42.578 -42.862 -43.009 -43.221 -43.502 -43.662 -43.821 -44.184 -44.381 -44.589 -44.826 -45.091 -45.369 -45.713 -46.506 -10 ,21226 ,TETRA ,17617637,Tue Nov 30 09:57:46 CET,Tue Nov 30 11:48:13 CET,0.0 0.781 0.996 1.165 1.309 1.447 1.557 1.627 1.754 1.819 1.869 1.967 2.031 2.078 2.175 2.257 2.326 2.356 2.414 2.485 2.567 2.6 2.626 2.654 2.666 2.669 2.671 2.665 2.648 2.618 2.583 2.558 2.548 2.517 2.433 2.308 2.174 2.014 1.825 1.586 1.316 0.998 0.575 0.106 -0.493 -1.266 -2.291 -3.657 -5.589 -8.308 -12.405 -16.822 -20.128 -22.758 -24.903 -26.754 -28.282 -29.562 -30.621 -31.648 -32.504 -33.244 -34.001 -34.732 -35.387 -35.969 -36.573 -37.104 -37.528 -37.936 -38.372 -38.75 -39.13 -39.51 -39.793 -40.073 -40.358 -40.658 -40.963 -41.187 -41.422 -41.759 -41.991 -42.229 -42.358 -42.629 -42.901 -43.192 -43.336 -43.526 -43.756 -43.913 -44.075 -44.42 -44.609 -44.806 -45.016 -45.253 -45.535 -45.854 -46.705 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_1.txt deleted file mode 100644 index 43203c22..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30527 ,TETRA ,17617638,Tue Nov 30 09:58:43 CET,Tue Nov 30 11:46:23 CET,0.0 0.721 1.012 1.257 1.461 1.624 1.764 1.882 2.099 2.206 2.309 2.419 2.565 2.651 2.825 2.979 3.119 3.193 3.363 3.529 3.728 3.844 3.96 4.136 4.31 4.471 4.621 4.765 4.951 5.135 5.348 5.623 5.863 6.098 6.392 6.678 6.912 7.166 7.426 7.699 7.988 8.308 8.688 9.077 9.568 10.169 10.774 11.365 12.056 12.831 13.597 13.948 14.007 13.891 13.675 13.445 13.247 13.037 12.806 12.552 12.266 11.997 11.786 11.519 11.221 10.952 10.65 10.384 10.175 9.942 9.685 9.503 9.323 9.117 8.966 8.823 8.683 8.512 8.311 8.181 8.05 7.841 7.683 7.524 7.449 7.265 7.05 6.834 6.728 6.557 6.38 6.26 6.121 5.778 5.592 5.395 5.181 4.913 4.584 4.119 2.87 -2 ,18272 ,TETRA ,17617639,Tue Nov 30 09:58:45 CET,Tue Nov 30 11:46:30 CET,0.0 0.816 1.157 1.388 1.581 1.744 1.896 2.041 2.305 2.426 2.534 2.663 2.828 2.92 3.099 3.271 3.428 3.504 3.66 3.802 4.007 4.155 4.303 4.522 4.725 4.908 5.092 5.276 5.513 5.726 5.908 6.133 6.344 6.544 6.789 7.04 7.277 7.552 7.831 8.114 8.428 8.775 9.173 9.567 9.991 10.451 10.959 11.508 12.126 12.751 13.337 13.635 13.609 13.434 13.213 12.971 12.737 12.487 12.264 12.03 11.79 11.57 11.366 11.168 10.992 10.809 10.551 10.285 10.076 9.875 9.651 9.472 9.28 9.061 8.896 8.719 8.532 8.343 8.139 7.999 7.847 7.603 7.445 7.289 7.205 7.027 6.833 6.616 6.502 6.321 6.145 6.021 5.876 5.52 5.331 5.125 4.893 4.631 4.33 3.902 2.857 -3 ,13352 ,TETRA ,17617640,Tue Nov 30 09:58:43 CET,Tue Nov 30 11:49:37 CET,0.0 0.789 1.091 1.306 1.478 1.618 1.736 1.852 2.059 2.16 2.264 2.374 2.529 2.61 2.762 2.913 3.051 3.115 3.248 3.383 3.568 3.678 3.783 3.93 4.073 4.222 4.371 4.517 4.704 4.886 5.056 5.273 5.483 5.676 5.897 6.155 6.426 6.704 7.026 7.39 7.715 8.05 8.462 8.903 9.383 9.851 10.408 11.082 11.799 12.544 13.294 13.633 13.65 13.511 13.308 13.029 12.719 12.445 12.209 11.915 11.643 11.419 11.166 10.89 10.644 10.415 10.129 9.854 9.642 9.456 9.261 9.078 8.892 8.715 8.56 8.392 8.234 8.069 7.895 7.781 7.659 7.435 7.269 7.112 7.036 6.87 6.694 6.485 6.375 6.209 6.033 5.902 5.757 5.422 5.249 5.052 4.828 4.608 4.349 3.976 2.652 -4 ,8762 ,TETRA ,17617641,Tue Nov 30 09:58:43 CET,Tue Nov 30 11:47:42 CET,0.0 0.811 1.116 1.357 1.544 1.702 1.832 1.949 2.155 2.267 2.39 2.554 2.719 2.811 2.998 3.155 3.295 3.366 3.498 3.626 3.808 3.926 4.05 4.235 4.413 4.584 4.743 4.89 5.073 5.245 5.423 5.656 5.87 6.06 6.277 6.512 6.741 6.986 7.23 7.499 7.8 8.167 8.646 9.083 9.515 9.973 10.493 11.079 11.716 12.467 13.329 13.786 13.866 13.819 13.698 13.539 13.326 13.099 12.861 12.534 12.203 11.957 11.768 11.566 11.334 11.119 10.89 10.653 10.447 10.238 10.009 9.82 9.623 9.411 9.238 9.059 8.89 8.71 8.515 8.379 8.225 7.982 7.82 7.656 7.572 7.393 7.191 6.968 6.845 6.657 6.47 6.336 6.193 5.886 5.715 5.525 5.305 5.059 4.786 4.392 3.321 -5 ,3012 ,TETRA ,17617642,Tue Nov 30 09:58:43 CET,Tue Nov 30 11:49:42 CET,0.0 0.764 1.088 1.328 1.519 1.678 1.805 1.941 2.228 2.362 2.485 2.635 2.804 2.897 3.071 3.237 3.394 3.475 3.64 3.792 4.002 4.149 4.293 4.468 4.628 4.801 4.965 5.104 5.296 5.494 5.667 5.861 6.071 6.296 6.523 6.762 6.998 7.255 7.512 7.782 8.077 8.424 8.819 9.188 9.64 10.181 10.807 11.438 12.134 12.886 13.636 14.13 14.287 14.239 14.071 13.871 13.684 13.486 13.308 13.102 12.897 12.698 12.495 12.278 12.046 11.85 11.649 11.455 11.284 11.081 10.852 10.679 10.513 10.313 10.143 9.987 9.835 9.673 9.514 9.398 9.27 9.079 8.942 8.777 8.686 8.505 8.329 8.143 8.045 7.883 7.718 7.591 7.45 7.143 6.98 6.809 6.605 6.375 6.119 5.797 4.699 -6 ,4514 ,TETRA ,17617643,Tue Nov 30 09:59:43 CET,Tue Nov 30 11:50:39 CET,0.0 0.83 1.14 1.353 1.535 1.715 1.873 2.018 2.293 2.409 2.509 2.635 2.8 2.895 3.076 3.24 3.387 3.461 3.601 3.717 3.908 4.044 4.175 4.372 4.549 4.727 4.898 5.069 5.288 5.475 5.651 5.855 6.044 6.234 6.466 6.736 7.022 7.337 7.646 7.934 8.226 8.58 9.035 9.509 10.0 10.531 11.152 11.804 12.568 13.367 14.02 14.245 14.27 14.181 14.024 13.821 13.566 13.292 12.997 12.639 12.344 12.116 11.873 11.618 11.402 11.193 10.936 10.726 10.563 10.385 10.177 9.986 9.782 9.58 9.424 9.269 9.11 8.926 8.729 8.593 8.443 8.184 7.999 7.823 7.736 7.559 7.355 7.135 7.018 6.833 6.637 6.499 6.361 6.057 5.891 5.711 5.515 5.296 5.006 4.557 3.339 -7 ,2521 ,TETRA ,17617644,Tue Nov 30 09:59:43 CET,Tue Nov 30 11:47:18 CET,0.0 0.767 1.079 1.323 1.512 1.665 1.81 1.946 2.194 2.311 2.417 2.547 2.704 2.796 2.988 3.174 3.352 3.438 3.592 3.726 3.913 4.033 4.166 4.375 4.585 4.771 4.92 5.067 5.264 5.471 5.669 5.895 6.115 6.318 6.545 6.8 7.034 7.256 7.495 7.768 8.086 8.448 8.811 9.159 9.565 10.043 10.657 11.318 11.947 12.584 13.328 13.782 13.794 13.634 13.444 13.233 13.008 12.755 12.517 12.246 11.972 11.723 11.486 11.252 11.032 10.834 10.591 10.334 10.117 9.921 9.727 9.559 9.393 9.212 9.045 8.856 8.659 8.453 8.235 8.074 7.919 7.682 7.522 7.375 7.299 7.132 6.957 6.77 6.651 6.467 6.279 6.15 6.022 5.722 5.544 5.349 5.142 4.915 4.618 4.19 3.082 -8 ,5262 ,TETRA ,17617645,Tue Nov 30 09:59:45 CET,Tue Nov 30 11:46:54 CET,0.0 0.996 1.257 1.463 1.635 1.789 1.947 2.093 2.324 2.443 2.566 2.722 2.898 2.989 3.16 3.345 3.529 3.612 3.764 3.912 4.121 4.246 4.365 4.541 4.71 4.861 5.013 5.164 5.34 5.517 5.685 5.88 6.096 6.301 6.513 6.747 6.988 7.25 7.52 7.802 8.093 8.433 8.841 9.271 9.754 10.285 10.871 11.461 12.126 12.872 13.57 14.005 14.153 14.148 14.109 14.016 13.823 13.598 13.359 13.129 12.967 12.792 12.577 12.372 12.196 12.032 11.852 11.682 11.541 11.37 11.146 10.961 10.775 10.58 10.424 10.261 10.1 9.924 9.748 9.62 9.47 9.242 9.095 8.936 8.852 8.679 8.496 8.318 8.235 8.08 7.896 7.748 7.583 7.254 7.085 6.913 6.712 6.434 6.107 5.719 4.428 -9 ,29037 ,TETRA ,17617646,Tue Nov 30 09:59:44 CET,Tue Nov 30 11:53:15 CET,0.0 0.758 1.062 1.278 1.485 1.653 1.8 1.928 2.147 2.25 2.349 2.483 2.655 2.76 2.96 3.149 3.33 3.415 3.575 3.713 3.907 4.057 4.203 4.401 4.597 4.791 4.962 5.115 5.316 5.496 5.659 5.838 6.011 6.193 6.397 6.626 6.866 7.118 7.385 7.69 8.014 8.362 8.741 9.158 9.637 10.128 10.677 11.268 11.947 12.665 13.443 13.908 14.02 13.984 13.832 13.621 13.402 13.169 12.911 12.619 12.381 12.169 11.933 11.709 11.479 11.271 11.074 10.891 10.733 10.547 10.353 10.202 10.025 9.822 9.652 9.467 9.283 9.106 8.92 8.773 8.621 8.403 8.245 8.081 8.001 7.841 7.658 7.446 7.326 7.137 6.937 6.79 6.625 6.284 6.11 5.925 5.708 5.463 5.169 4.769 3.709 -10 ,2042 ,TETRA ,17617647,Tue Nov 30 09:59:44 CET,Tue Nov 30 11:49:09 CET,0.0 0.695 0.969 1.185 1.376 1.538 1.681 1.813 2.066 2.181 2.285 2.434 2.613 2.72 2.913 3.09 3.257 3.347 3.524 3.674 3.892 4.043 4.168 4.337 4.502 4.648 4.793 4.934 5.127 5.354 5.58 5.831 6.091 6.345 6.612 6.901 7.162 7.419 7.669 7.946 8.252 8.587 8.97 9.351 9.792 10.289 10.858 11.483 12.159 12.85 13.608 14.013 14.116 14.075 13.898 13.707 13.535 13.326 13.116 12.859 12.565 12.334 12.147 11.952 11.741 11.529 11.315 11.132 10.97 10.793 10.58 10.4 10.224 10.035 9.891 9.727 9.55 9.375 9.202 9.08 8.939 8.704 8.529 8.331 8.235 8.057 7.864 7.671 7.577 7.421 7.269 7.146 7.014 6.738 6.577 6.375 6.125 5.854 5.547 5.14 4.097 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_41.txt deleted file mode 100644 index 0f7b7d19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25622 ,TETRA ,17617648,Tue Nov 30 10:05:00 CET,Tue Nov 30 11:51:41 CET,0.0 1.056 1.438 1.71 1.955 2.176 2.369 2.544 2.871 3.025 3.162 3.347 3.543 3.673 3.921 4.163 4.398 4.514 4.73 4.92 5.179 5.362 5.555 5.829 6.092 6.333 6.55 6.758 7.027 7.302 7.574 7.916 8.249 8.558 8.944 9.383 9.784 10.22 10.679 11.179 11.705 12.297 12.99 13.705 14.556 15.474 16.525 17.713 19.121 20.825 22.917 24.694 25.717 26.306 26.674 26.938 27.066 27.113 27.132 27.101 27.015 26.852 26.653 26.493 26.368 26.261 26.14 26.021 25.905 25.766 25.585 25.43 25.292 25.158 25.055 24.934 24.795 24.647 24.483 24.371 24.251 24.04 23.905 23.77 23.698 23.548 23.374 23.165 23.049 22.892 22.704 22.573 22.45 22.2 22.041 21.859 21.676 21.452 21.175 20.786 19.526 -2 ,14383 ,TETRA ,17617649,Tue Nov 30 10:03:59 CET,Tue Nov 30 11:50:33 CET,0.0 1.173 1.633 1.913 2.135 2.326 2.513 2.684 2.98 3.12 3.266 3.501 3.706 3.842 4.088 4.314 4.545 4.651 4.855 5.062 5.348 5.525 5.694 5.936 6.177 6.428 6.679 6.912 7.209 7.49 7.761 8.09 8.393 8.692 9.042 9.439 9.822 10.233 10.69 11.187 11.708 12.308 13.018 13.715 14.531 15.48 16.581 17.813 19.242 20.93 22.977 24.695 25.668 26.205 26.498 26.651 26.744 26.767 26.739 26.697 26.65 26.584 26.46 26.303 26.172 26.073 25.968 25.863 25.766 25.661 25.551 25.448 25.328 25.199 25.107 25.011 24.902 24.772 24.626 24.525 24.417 24.225 24.078 23.944 23.875 23.732 23.571 23.365 23.254 23.102 22.94 22.81 22.665 22.379 22.214 22.029 21.838 21.612 21.321 20.945 19.445 -3 ,26657 ,TETRA ,17617650,Tue Nov 30 10:04:01 CET,Tue Nov 30 11:50:50 CET,0.0 0.997 1.357 1.636 1.891 2.099 2.268 2.426 2.722 2.861 2.998 3.195 3.397 3.529 3.763 3.965 4.168 4.269 4.467 4.661 4.943 5.122 5.305 5.585 5.852 6.088 6.32 6.548 6.809 7.064 7.358 7.722 8.032 8.305 8.618 8.985 9.363 9.79 10.225 10.666 11.154 11.754 12.447 13.149 13.998 14.942 15.998 17.134 18.498 20.192 22.277 23.999 24.948 25.471 25.785 25.972 26.047 26.062 26.006 25.917 25.841 25.76 25.631 25.455 25.303 25.163 25.009 24.876 24.753 24.625 24.504 24.396 24.263 24.125 24.03 23.922 23.79 23.662 23.522 23.415 23.3 23.114 22.975 22.819 22.735 22.561 22.373 22.173 22.069 21.904 21.698 21.551 21.383 21.067 20.903 20.697 20.467 20.21 19.882 19.412 17.995 -4 ,30155 ,TETRA ,17617651,Tue Nov 30 10:04:00 CET,Tue Nov 30 11:49:42 CET,0.0 0.737 1.087 1.34 1.572 1.789 1.991 2.162 2.461 2.621 2.781 3.005 3.226 3.371 3.64 3.91 4.171 4.282 4.487 4.703 5.012 5.193 5.382 5.66 5.923 6.17 6.384 6.609 6.913 7.19 7.465 7.828 8.167 8.476 8.836 9.215 9.6 10.03 10.452 10.908 11.411 11.997 12.692 13.379 14.243 15.237 16.367 17.612 19.022 20.763 22.996 24.854 25.868 26.475 26.83 27.043 27.187 27.283 27.325 27.325 27.282 27.216 27.147 27.06 26.962 26.858 26.701 26.535 26.386 26.225 26.057 25.921 25.788 25.63 25.487 25.34 25.183 25.022 24.876 24.789 24.693 24.508 24.353 24.181 24.092 23.919 23.75 23.558 23.447 23.281 23.076 22.928 22.766 22.432 22.238 22.023 21.806 21.569 21.227 20.799 19.548 -5 ,20203 ,TETRA ,17617652,Tue Nov 30 10:04:00 CET,Tue Nov 30 11:54:30 CET,0.0 0.963 1.347 1.632 1.862 2.072 2.269 2.452 2.782 2.933 3.075 3.27 3.472 3.608 3.855 4.098 4.326 4.433 4.635 4.829 5.11 5.307 5.49 5.727 5.963 6.221 6.475 6.701 6.996 7.275 7.559 7.91 8.211 8.492 8.842 9.255 9.625 9.998 10.421 10.892 11.413 12.003 12.664 13.323 14.086 14.994 16.043 17.225 18.669 20.364 22.398 24.118 25.124 25.691 26.031 26.2 26.277 26.319 26.25 26.162 26.087 25.983 25.87 25.762 25.67 25.579 25.459 25.338 25.224 25.099 24.967 24.846 24.714 24.565 24.427 24.272 24.115 23.962 23.791 23.669 23.548 23.363 23.234 23.101 23.031 22.869 22.685 22.488 22.385 22.235 22.084 21.967 21.831 21.523 21.363 21.177 20.959 20.717 20.426 20.005 18.758 -6 ,19035 ,TETRA ,17617653,Tue Nov 30 10:04:00 CET,Tue Nov 30 11:51:08 CET,0.0 0.952 1.264 1.505 1.75 1.967 2.141 2.302 2.61 2.751 2.885 3.073 3.26 3.372 3.596 3.832 4.063 4.172 4.364 4.536 4.794 4.967 5.133 5.373 5.6 5.812 6.037 6.262 6.548 6.82 7.071 7.385 7.684 7.977 8.319 8.713 9.095 9.515 9.983 10.457 10.963 11.563 12.236 12.913 13.765 14.702 15.723 16.88 18.308 20.033 22.09 23.689 24.56 25.047 25.347 25.53 25.622 25.666 25.635 25.59 25.525 25.44 25.337 25.169 24.996 24.859 24.694 24.54 24.42 24.271 24.104 23.956 23.782 23.633 23.537 23.43 23.318 23.202 23.081 22.99 22.883 22.72 22.611 22.496 22.44 22.3 22.118 21.93 21.836 21.685 21.514 21.405 21.279 20.983 20.826 20.663 20.462 20.223 19.963 19.561 18.23 -7 ,8655 ,TETRA ,17617654,Tue Nov 30 10:04:02 CET,Tue Nov 30 11:50:49 CET,0.0 1.353 1.739 2.055 2.321 2.533 2.732 2.919 3.284 3.449 3.59 3.787 3.981 4.11 4.357 4.584 4.813 4.931 5.165 5.388 5.709 5.91 6.102 6.377 6.639 6.913 7.194 7.451 7.773 8.078 8.354 8.712 9.082 9.414 9.794 10.249 10.708 11.184 11.665 12.171 12.703 13.282 13.961 14.673 15.508 16.419 17.47 18.654 20.051 21.748 23.8 25.554 26.533 27.055 27.331 27.515 27.629 27.675 27.686 27.641 27.529 27.425 27.347 27.233 27.099 26.939 26.735 26.572 26.452 26.322 26.176 26.049 25.925 25.777 25.631 25.482 25.34 25.199 25.045 24.943 24.847 24.681 24.554 24.401 24.316 24.138 23.972 23.824 23.742 23.6 23.427 23.309 23.175 22.869 22.699 22.518 22.327 22.108 21.862 21.465 19.897 -8 ,26202 ,TETRA ,17617655,Tue Nov 30 10:04:01 CET,Tue Nov 30 11:51:22 CET,0.0 0.923 1.296 1.621 1.901 2.146 2.346 2.527 2.853 3.001 3.145 3.353 3.556 3.687 3.932 4.154 4.354 4.452 4.663 4.885 5.193 5.37 5.551 5.831 6.103 6.35 6.578 6.811 7.101 7.386 7.66 7.984 8.307 8.608 8.96 9.376 9.766 10.2 10.647 11.147 11.716 12.319 13.024 13.757 14.639 15.599 16.671 17.92 19.424 21.143 23.279 25.149 26.206 26.864 27.27 27.495 27.598 27.619 27.619 27.616 27.573 27.495 27.43 27.347 27.234 27.123 26.973 26.805 26.678 26.545 26.381 26.255 26.118 25.965 25.84 25.683 25.537 25.421 25.292 25.196 25.104 24.959 24.851 24.733 24.663 24.506 24.344 24.181 24.089 23.946 23.803 23.706 23.586 23.343 23.214 23.046 22.85 22.603 22.305 21.906 20.696 -9 ,30622 ,TETRA ,17617656,Tue Nov 30 10:04:03 CET,Tue Nov 30 11:51:09 CET,0.0 1.08 1.455 1.75 1.996 2.211 2.414 2.609 2.95 3.109 3.27 3.509 3.721 3.85 4.091 4.313 4.527 4.628 4.834 5.034 5.295 5.466 5.632 5.868 6.092 6.329 6.574 6.792 7.056 7.315 7.565 7.883 8.208 8.511 8.858 9.249 9.633 10.067 10.509 10.991 11.513 12.096 12.77 13.424 14.231 15.152 16.204 17.403 18.834 20.514 22.587 24.363 25.36 26.0 26.395 26.587 26.683 26.734 26.765 26.776 26.745 26.687 26.603 26.522 26.466 26.394 26.284 26.161 26.047 25.916 25.74 25.583 25.408 25.227 25.101 24.97 24.819 24.651 24.486 24.382 24.275 24.098 23.959 23.787 23.702 23.556 23.41 23.242 23.142 22.982 22.812 22.7 22.556 22.226 22.047 21.841 21.614 21.349 20.983 20.515 18.934 -10 ,25814 ,TETRA ,17617657,Tue Nov 30 10:04:01 CET,Tue Nov 30 11:57:18 CET,0.0 1.445 1.833 2.112 2.354 2.577 2.773 2.954 3.274 3.413 3.559 3.775 3.979 4.115 4.358 4.579 4.786 4.89 5.102 5.304 5.597 5.79 5.974 6.227 6.47 6.723 6.977 7.209 7.486 7.78 8.096 8.447 8.762 9.066 9.43 9.842 10.227 10.655 11.118 11.593 12.078 12.662 13.38 14.1 14.929 15.823 16.863 18.073 19.511 21.245 23.374 25.102 26.14 26.808 27.213 27.447 27.555 27.577 27.544 27.508 27.463 27.325 27.118 26.966 26.842 26.703 26.569 26.42 26.26 26.094 25.918 25.771 25.642 25.522 25.421 25.319 25.222 25.107 24.961 24.858 24.745 24.576 24.474 24.36 24.298 24.159 23.987 23.806 23.704 23.542 23.363 23.262 23.156 22.876 22.728 22.56 22.347 22.126 21.864 21.408 19.905 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_1.txt deleted file mode 100644 index cc761f77..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27188 ,TETRA ,17617658,Tue Nov 30 10:05:03 CET,Tue Nov 30 11:55:05 CET,0.0 0.869 1.252 1.475 1.661 1.823 1.954 2.089 2.362 2.486 2.6 2.725 2.874 2.96 3.117 3.283 3.438 3.513 3.652 3.781 3.973 4.097 4.22 4.378 4.513 4.653 4.803 4.95 5.145 5.343 5.508 5.696 5.88 6.047 6.231 6.44 6.653 6.88 7.129 7.393 7.659 7.968 8.312 8.634 8.991 9.401 9.827 10.263 10.78 11.209 11.511 11.446 11.052 10.615 10.193 9.812 9.407 8.965 8.576 8.155 7.79 7.454 7.12 6.813 6.506 6.205 5.898 5.625 5.369 5.091 4.807 4.573 4.325 4.079 3.91 3.74 3.552 3.343 3.114 2.952 2.786 2.538 2.356 2.154 2.047 1.84 1.641 1.427 1.298 1.107 0.917 0.769 0.608 0.219 -0.018 -0.275 -0.559 -0.865 -1.249 -1.791 -3.481 -2 ,16672 ,TETRA ,17617659,Tue Nov 30 10:04:02 CET,Tue Nov 30 11:51:50 CET,0.0 0.775 1.132 1.378 1.581 1.745 1.904 2.058 2.34 2.472 2.596 2.749 2.905 3.0 3.176 3.337 3.496 3.568 3.692 3.82 4.01 4.139 4.26 4.411 4.57 4.73 4.882 5.037 5.251 5.449 5.627 5.822 6.001 6.19 6.41 6.666 6.908 7.157 7.4 7.646 7.917 8.203 8.517 8.848 9.198 9.486 9.761 10.057 10.321 10.556 10.6 10.28 9.885 9.445 8.967 8.446 7.961 7.512 7.117 6.709 6.343 6.007 5.648 5.281 4.937 4.623 4.299 3.983 3.709 3.439 3.141 2.892 2.645 2.392 2.185 1.963 1.719 1.445 1.178 0.999 0.816 0.528 0.316 0.087 -0.028 -0.259 -0.491 -0.758 -0.917 -1.144 -1.422 -1.594 -1.761 -2.119 -2.341 -2.576 -2.813 -3.101 -3.446 -3.842 -4.968 -3 ,15310 ,TETRA ,17617660,Tue Nov 30 10:04:02 CET,Tue Nov 30 11:56:37 CET,0.0 0.818 1.109 1.355 1.535 1.688 1.838 1.972 2.175 2.269 2.373 2.512 2.658 2.737 2.889 3.021 3.148 3.214 3.354 3.49 3.671 3.789 3.91 4.089 4.251 4.396 4.543 4.696 4.879 5.046 5.226 5.451 5.665 5.855 6.058 6.296 6.535 6.775 7.033 7.309 7.584 7.906 8.319 8.724 9.148 9.586 10.085 10.632 11.175 11.785 12.292 12.299 12.069 11.631 11.177 10.751 10.337 9.923 9.502 8.995 8.495 8.059 7.665 7.31 6.975 6.683 6.399 6.118 5.866 5.588 5.289 5.048 4.793 4.544 4.352 4.161 3.966 3.752 3.509 3.326 3.135 2.864 2.68 2.481 2.382 2.184 1.972 1.74 1.621 1.426 1.175 1.005 0.822 0.436 0.218 -0.03 -0.286 -0.574 -0.947 -1.399 -2.731 -4 ,16756 ,TETRA ,17617661,Tue Nov 30 10:04:02 CET,Tue Nov 30 11:55:14 CET,0.0 0.846 1.186 1.399 1.579 1.741 1.903 2.06 2.329 2.445 2.546 2.678 2.831 2.924 3.097 3.263 3.433 3.512 3.657 3.791 3.983 4.102 4.222 4.409 4.596 4.773 4.94 5.093 5.275 5.45 5.613 5.794 5.978 6.161 6.377 6.609 6.808 7.025 7.259 7.489 7.723 7.984 8.256 8.531 8.816 9.105 9.479 9.874 10.252 10.563 10.735 10.388 9.71 8.913 8.23 7.616 7.003 6.418 5.878 5.343 4.91 4.522 4.155 3.829 3.53 3.25 2.96 2.693 2.455 2.191 1.914 1.69 1.461 1.237 1.062 0.875 0.662 0.418 0.154 -0.03 -0.209 -0.499 -0.718 -0.934 -1.047 -1.288 -1.546 -1.823 -1.978 -2.202 -2.467 -2.629 -2.796 -3.182 -3.429 -3.672 -3.89 -4.176 -4.541 -5.008 -6.435 -5 ,31160 ,TETRA ,17617662,Tue Nov 30 10:05:01 CET,Tue Nov 30 11:54:13 CET,0.0 0.912 1.231 1.434 1.626 1.791 1.939 2.07 2.3 2.414 2.521 2.644 2.787 2.868 3.027 3.175 3.314 3.382 3.525 3.656 3.831 3.948 4.057 4.21 4.384 4.555 4.702 4.832 4.994 5.167 5.349 5.56 5.764 5.96 6.175 6.403 6.619 6.884 7.154 7.429 7.742 8.074 8.443 8.806 9.269 9.779 10.305 10.888 11.473 12.071 12.645 12.861 12.824 12.628 12.324 11.877 11.375 10.968 10.687 10.375 10.058 9.778 9.483 9.183 8.918 8.635 8.323 8.065 7.828 7.558 7.259 7.01 6.769 6.501 6.266 6.033 5.799 5.569 5.333 5.154 4.971 4.683 4.486 4.297 4.19 3.934 3.662 3.388 3.254 3.063 2.855 2.709 2.54 2.169 1.972 1.739 1.46 1.178 0.849 0.398 -0.849 -6 ,16873 ,TETRA ,17617663,Tue Nov 30 10:05:02 CET,Tue Nov 30 11:58:51 CET,0.0 0.739 0.993 1.189 1.363 1.509 1.633 1.752 1.959 2.066 2.183 2.323 2.469 2.54 2.692 2.843 2.968 3.034 3.177 3.319 3.517 3.631 3.74 3.927 4.112 4.283 4.44 4.586 4.778 4.951 5.11 5.289 5.454 5.623 5.837 6.078 6.303 6.536 6.769 7.0 7.254 7.555 7.868 8.188 8.529 8.876 9.23 9.485 9.689 9.817 9.7 9.209 8.669 8.109 7.511 6.869 6.289 5.753 5.269 4.79 4.348 3.942 3.57 3.213 2.879 2.566 2.237 1.94 1.666 1.389 1.111 0.876 0.631 0.364 0.127 -0.128 -0.38 -0.644 -0.928 -1.137 -1.349 -1.672 -1.897 -2.132 -2.253 -2.495 -2.752 -3.066 -3.238 -3.468 -3.779 -3.974 -4.17 -4.586 -4.794 -5.028 -5.308 -5.626 -6.0 -6.516 -7.967 -7 ,18677 ,TETRA ,17617664,Tue Nov 30 10:05:02 CET,Tue Nov 30 11:54:41 CET,0.0 0.898 1.189 1.436 1.64 1.814 1.977 2.122 2.381 2.506 2.626 2.787 2.949 3.043 3.205 3.357 3.51 3.584 3.717 3.83 4.002 4.117 4.219 4.357 4.5 4.646 4.79 4.932 5.107 5.269 5.426 5.61 5.79 5.982 6.207 6.453 6.681 6.9 7.142 7.431 7.725 8.033 8.411 8.771 9.124 9.503 9.964 10.371 10.635 10.763 10.598 10.044 9.32 8.637 8.044 7.539 7.079 6.578 6.112 5.664 5.27 4.901 4.547 4.185 3.846 3.542 3.21 2.893 2.604 2.304 1.999 1.758 1.506 1.251 1.066 0.867 0.65 0.404 0.114 -0.083 -0.265 -0.552 -0.778 -1.027 -1.149 -1.4 -1.671 -1.957 -2.106 -2.324 -2.591 -2.767 -2.959 -3.374 -3.603 -3.854 -4.15 -4.487 -4.868 -5.388 -6.74 -8 ,959 ,TETRA ,17617665,Tue Nov 30 10:05:02 CET,Tue Nov 30 11:57:36 CET,0.0 0.831 1.082 1.294 1.48 1.618 1.748 1.878 2.117 2.231 2.345 2.481 2.623 2.702 2.863 3.016 3.172 3.256 3.412 3.558 3.757 3.879 4.004 4.181 4.339 4.488 4.645 4.794 4.951 5.095 5.243 5.434 5.602 5.745 5.933 6.165 6.402 6.655 6.887 7.131 7.402 7.724 8.09 8.437 8.814 9.201 9.623 10.031 10.433 10.72 10.626 10.261 9.815 9.184 8.466 7.748 7.147 6.61 6.117 5.643 5.213 4.813 4.448 4.096 3.764 3.469 3.161 2.881 2.639 2.395 2.15 1.94 1.696 1.431 1.23 1.021 0.802 0.581 0.353 0.19 0.016 -0.266 -0.449 -0.636 -0.753 -0.997 -1.22 -1.447 -1.579 -1.775 -1.971 -2.119 -2.296 -2.681 -2.887 -3.119 -3.384 -3.695 -4.045 -4.533 -5.836 -9 ,3116 ,TETRA ,17617666,Tue Nov 30 10:05:02 CET,Tue Nov 30 11:53:58 CET,0.0 0.897 1.201 1.393 1.571 1.736 1.874 1.999 2.225 2.323 2.423 2.551 2.705 2.8 2.967 3.121 3.27 3.345 3.497 3.638 3.828 3.943 4.049 4.211 4.361 4.511 4.666 4.804 4.98 5.141 5.295 5.498 5.698 5.87 6.057 6.272 6.472 6.683 6.933 7.215 7.512 7.841 8.209 8.573 8.953 9.338 9.772 10.225 10.555 10.703 10.58 10.105 9.572 9.002 8.448 7.916 7.377 6.843 6.394 5.964 5.604 5.255 4.894 4.543 4.213 3.877 3.494 3.186 2.967 2.742 2.487 2.273 2.04 1.783 1.589 1.394 1.177 0.933 0.683 0.511 0.341 0.064 -0.14 -0.347 -0.447 -0.662 -0.899 -1.136 -1.249 -1.427 -1.635 -1.79 -1.963 -2.333 -2.531 -2.759 -3.017 -3.292 -3.59 -4.02 -5.454 -10 ,15086 ,TETRA ,17617667,Tue Nov 30 10:05:02 CET,Tue Nov 30 11:54:59 CET,0.0 1.015 1.34 1.554 1.73 1.888 2.039 2.168 2.404 2.518 2.625 2.764 2.926 3.021 3.201 3.36 3.506 3.573 3.71 3.861 4.078 4.223 4.371 4.571 4.741 4.899 5.057 5.2 5.376 5.559 5.745 5.95 6.146 6.345 6.568 6.784 6.982 7.206 7.462 7.735 8.008 8.321 8.669 9.011 9.393 9.778 10.189 10.524 10.715 10.743 10.406 9.664 8.957 8.325 7.707 7.083 6.508 6.004 5.568 5.107 4.682 4.311 3.95 3.605 3.291 3.002 2.699 2.427 2.186 1.916 1.641 1.407 1.163 0.934 0.767 0.583 0.388 0.193 -0.01 -0.148 -0.291 -0.542 -0.728 -0.922 -1.021 -1.217 -1.419 -1.631 -1.738 -1.918 -2.183 -2.353 -2.512 -2.864 -3.079 -3.322 -3.574 -3.853 -4.22 -4.678 -6.175 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_41.txt deleted file mode 100644 index 9bb60bd7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21099 ,TETRA ,17617668,Tue Nov 30 10:05:03 CET,Tue Nov 30 11:52:20 CET,0.0 0.986 1.334 1.607 1.852 2.051 2.233 2.402 2.706 2.846 2.978 3.17 3.353 3.468 3.701 3.937 4.167 4.272 4.46 4.638 4.902 5.077 5.248 5.479 5.705 5.94 6.162 6.388 6.694 6.975 7.246 7.572 7.886 8.203 8.56 8.931 9.282 9.666 10.097 10.521 10.93 11.441 12.017 12.577 13.27 14.048 14.956 15.868 16.823 17.911 18.957 19.48 19.66 19.714 19.578 19.31 19.02 18.727 18.425 18.096 17.844 17.615 17.376 17.151 16.93 16.733 16.506 16.296 16.139 15.975 15.786 15.632 15.467 15.29 15.143 14.954 14.754 14.552 14.329 14.173 14.009 13.756 13.572 13.39 13.297 13.103 12.894 12.681 12.576 12.41 12.197 12.056 11.891 11.532 11.347 11.131 10.876 10.575 10.241 9.785 8.398 -2 ,20209 ,TETRA ,17617669,Tue Nov 30 10:05:45 CET,Tue Nov 30 11:52:43 CET,0.0 1.024 1.391 1.673 1.892 2.115 2.302 2.463 2.776 2.915 3.048 3.259 3.445 3.558 3.806 4.051 4.25 4.345 4.55 4.766 5.055 5.214 5.372 5.613 5.844 6.066 6.28 6.494 6.776 7.028 7.275 7.594 7.898 8.167 8.463 8.832 9.2 9.606 10.054 10.542 11.039 11.568 12.17 12.773 13.515 14.359 15.365 16.48 17.644 18.88 20.385 21.234 21.349 21.316 21.201 20.965 20.674 20.405 20.178 19.908 19.632 19.359 19.098 18.872 18.658 18.465 18.247 18.023 17.821 17.602 17.391 17.231 17.064 16.894 16.752 16.604 16.443 16.262 16.058 15.907 15.767 15.559 15.413 15.242 15.141 14.934 14.726 14.517 14.399 14.217 14.005 13.864 13.717 13.405 13.228 13.033 12.809 12.522 12.122 11.674 10.15 -3 ,16352 ,TETRA ,17617670,Tue Nov 30 10:05:47 CET,Tue Nov 30 11:52:35 CET,0.0 1.229 1.596 1.894 2.154 2.378 2.589 2.778 3.128 3.294 3.445 3.664 3.85 3.979 4.214 4.435 4.666 4.778 4.994 5.201 5.491 5.672 5.851 6.129 6.387 6.63 6.871 7.094 7.384 7.684 7.969 8.292 8.608 8.933 9.3 9.697 10.095 10.513 10.94 11.408 11.912 12.488 13.129 13.755 14.49 15.329 16.256 17.213 18.359 19.656 20.915 21.641 21.849 21.889 21.881 21.825 21.675 21.438 21.197 20.97 20.766 20.542 20.307 20.089 19.872 19.656 19.438 19.245 19.075 18.903 18.723 18.547 18.338 18.124 17.966 17.813 17.658 17.494 17.317 17.19 17.055 16.832 16.684 16.533 16.451 16.278 16.089 15.9 15.801 15.653 15.482 15.353 15.199 14.877 14.712 14.525 14.291 13.989 13.627 13.15 11.87 -4 ,11444 ,TETRA ,17617671,Tue Nov 30 10:05:47 CET,Tue Nov 30 11:53:59 CET,0.0 1.04 1.401 1.667 1.899 2.106 2.315 2.501 2.811 2.964 3.114 3.304 3.474 3.582 3.803 4.02 4.214 4.307 4.507 4.706 4.969 5.128 5.284 5.517 5.754 5.972 6.192 6.42 6.712 7.0 7.267 7.586 7.911 8.24 8.59 8.967 9.33 9.709 10.129 10.573 11.029 11.533 12.139 12.766 13.509 14.352 15.275 16.308 17.499 18.773 20.288 21.542 22.134 22.459 22.604 22.58 22.479 22.314 22.15 21.934 21.708 21.507 21.279 21.041 20.783 20.542 20.303 20.103 19.939 19.733 19.494 19.304 19.122 18.906 18.733 18.58 18.416 18.234 18.035 17.879 17.72 17.503 17.349 17.189 17.105 16.926 16.735 16.526 16.41 16.239 16.002 15.857 15.716 15.359 15.15 14.919 14.654 14.368 13.999 13.53 12.104 -5 ,21245 ,TETRA ,17617672,Tue Nov 30 10:05:47 CET,Tue Nov 30 11:52:35 CET,0.0 1.128 1.506 1.825 2.093 2.313 2.502 2.672 2.982 3.12 3.245 3.44 3.622 3.736 3.951 4.158 4.365 4.471 4.674 4.86 5.131 5.304 5.468 5.692 5.905 6.125 6.348 6.556 6.819 7.085 7.347 7.685 8.003 8.289 8.636 9.039 9.408 9.796 10.206 10.644 11.098 11.645 12.303 12.93 13.696 14.501 15.41 16.406 17.526 18.825 20.141 20.868 21.101 21.093 20.902 20.675 20.435 20.196 19.973 19.717 19.493 19.267 19.028 18.811 18.607 18.396 18.144 17.902 17.696 17.488 17.278 17.107 16.942 16.773 16.626 16.478 16.332 16.174 15.999 15.88 15.749 15.517 15.355 15.184 15.096 14.906 14.7 14.504 14.399 14.235 14.036 13.905 13.754 13.437 13.273 13.09 12.872 12.623 12.3 11.81 10.326 -6 ,18703 ,TETRA ,17617673,Tue Nov 30 10:05:48 CET,Tue Nov 30 11:55:37 CET,0.0 1.257 1.676 1.965 2.221 2.443 2.624 2.791 3.114 3.26 3.401 3.605 3.795 3.922 4.145 4.358 4.578 4.686 4.887 5.095 5.379 5.543 5.708 5.937 6.174 6.416 6.645 6.854 7.113 7.358 7.602 7.907 8.188 8.456 8.772 9.145 9.503 9.875 10.281 10.723 11.17 11.681 12.306 12.906 13.585 14.295 15.037 15.882 16.83 17.869 19.014 19.851 20.194 20.176 20.049 19.9 19.669 19.406 19.156 18.878 18.574 18.261 17.981 17.721 17.494 17.301 17.069 16.845 16.641 16.403 16.158 15.971 15.764 15.535 15.359 15.161 14.962 14.781 14.604 14.473 14.325 14.084 13.927 13.779 13.698 13.515 13.319 13.085 12.957 12.782 12.547 12.39 12.231 11.87 11.683 11.473 11.214 10.917 10.585 10.161 8.641 -7 ,20908 ,TETRA ,17617674,Tue Nov 30 10:05:47 CET,Tue Nov 30 11:53:24 CET,0.0 1.039 1.424 1.694 1.901 2.082 2.266 2.439 2.74 2.879 3.005 3.183 3.37 3.483 3.705 3.92 4.108 4.203 4.404 4.597 4.865 5.032 5.2 5.442 5.665 5.876 6.079 6.281 6.549 6.804 7.054 7.358 7.659 7.962 8.296 8.694 9.096 9.504 9.961 10.426 10.884 11.444 12.11 12.8 13.578 14.346 15.192 16.074 17.049 18.155 19.336 20.093 20.37 20.439 20.411 20.285 20.057 19.76 19.491 19.228 18.987 18.764 18.511 18.263 18.05 17.852 17.651 17.456 17.267 17.067 16.839 16.644 16.453 16.249 16.071 15.877 15.682 15.472 15.236 15.07 14.912 14.697 14.535 14.342 14.245 14.036 13.802 13.549 13.412 13.222 12.979 12.828 12.669 12.319 12.125 11.907 11.625 11.283 10.918 10.48 8.741 -8 ,18733 ,TETRA ,17617675,Tue Nov 30 10:05:47 CET,Tue Nov 30 11:51:09 CET,0.0 0.899 1.205 1.483 1.72 1.911 2.077 2.224 2.512 2.65 2.782 2.975 3.153 3.264 3.483 3.698 3.91 4.012 4.203 4.396 4.673 4.836 4.995 5.244 5.47 5.663 5.858 6.069 6.345 6.597 6.851 7.162 7.452 7.73 8.045 8.393 8.746 9.141 9.555 9.972 10.423 11.003 11.727 12.456 13.246 14.038 14.955 16.022 17.233 18.618 20.207 21.313 21.741 21.857 21.723 21.407 21.103 20.838 20.579 20.306 20.051 19.783 19.531 19.317 19.105 18.914 18.696 18.471 18.283 18.08 17.867 17.695 17.505 17.312 17.166 17.019 16.855 16.665 16.465 16.335 16.188 15.965 15.814 15.635 15.553 15.392 15.191 14.936 14.786 14.582 14.331 14.177 14.014 13.638 13.437 13.234 12.999 12.717 12.335 11.769 9.952 -9 ,1556 ,TETRA ,17617676,Tue Nov 30 10:06:45 CET,Tue Nov 30 11:54:37 CET,0.0 1.403 1.797 2.125 2.366 2.557 2.746 2.921 3.215 3.357 3.489 3.686 3.868 3.992 4.239 4.466 4.669 4.768 4.962 5.143 5.426 5.614 5.786 6.03 6.281 6.519 6.735 6.954 7.243 7.533 7.814 8.125 8.404 8.675 9.006 9.366 9.717 10.127 10.574 11.032 11.488 11.996 12.612 13.256 14.005 14.802 15.669 16.566 17.665 19.015 20.498 21.431 21.684 21.656 21.492 21.302 21.042 20.697 20.372 20.038 19.768 19.545 19.33 19.1 18.868 18.644 18.387 18.167 17.972 17.779 17.6 17.418 17.216 17.023 16.882 16.743 16.598 16.417 16.224 16.099 15.961 15.76 15.622 15.466 15.388 15.223 15.038 14.833 14.727 14.572 14.387 14.258 14.126 13.838 13.664 13.46 13.222 12.943 12.622 12.213 10.925 -10 ,23930 ,TETRA ,17617677,Tue Nov 30 10:06:47 CET,Tue Nov 30 11:55:32 CET,0.0 1.154 1.493 1.77 1.995 2.183 2.353 2.504 2.785 2.923 3.067 3.277 3.46 3.585 3.809 4.007 4.199 4.29 4.47 4.65 4.93 5.117 5.283 5.52 5.759 5.977 6.189 6.416 6.697 6.967 7.239 7.557 7.847 8.131 8.499 8.923 9.3 9.691 10.095 10.526 11.003 11.556 12.195 12.82 13.539 14.334 15.253 16.279 17.471 18.793 20.238 21.306 21.658 21.708 21.629 21.437 21.22 20.962 20.722 20.492 20.294 20.07 19.838 19.643 19.457 19.252 18.995 18.767 18.557 18.319 18.072 17.87 17.67 17.444 17.264 17.093 16.92 16.728 16.538 16.41 16.27 16.046 15.891 15.732 15.644 15.455 15.224 14.978 14.866 14.686 14.419 14.255 14.074 13.67 13.454 13.213 12.953 12.645 12.25 11.8 10.621 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_84_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_84_41.txt deleted file mode 100644 index b39755fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/protein/Summary_FEP_84_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29527 ,TETRA ,17617678,Tue Nov 30 10:06:51 CET,Tue Nov 30 11:52:46 CET,0.0 1.162 1.537 1.847 2.149 2.413 2.665 2.905 3.321 3.521 3.709 3.942 4.169 4.322 4.626 4.905 5.161 5.286 5.525 5.767 6.134 6.359 6.581 6.902 7.214 7.529 7.827 8.102 8.467 8.827 9.183 9.618 10.017 10.42 10.911 11.445 11.955 12.551 13.197 13.876 14.616 15.451 16.428 17.418 18.557 19.841 21.399 23.288 25.566 28.299 31.81 34.957 36.888 38.228 39.161 39.789 40.247 40.606 40.874 41.11 41.286 41.426 41.536 41.614 41.681 41.736 41.777 41.801 41.824 41.842 41.843 41.835 41.82 41.802 41.782 41.761 41.732 41.69 41.644 41.614 41.579 41.514 41.475 41.439 41.41 41.321 41.225 41.131 41.086 40.998 40.962 40.902 40.831 40.693 40.609 40.509 40.395 40.258 40.098 39.832 38.826 -2 ,22401 ,TETRA ,17617679,Tue Nov 30 10:06:47 CET,Tue Nov 30 11:52:25 CET,0.0 0.979 1.376 1.673 1.926 2.17 2.385 2.591 2.987 3.157 3.326 3.583 3.825 3.978 4.261 4.549 4.836 4.968 5.207 5.442 5.819 6.062 6.285 6.614 6.928 7.228 7.513 7.795 8.183 8.551 8.91 9.35 9.766 10.184 10.663 11.205 11.741 12.303 12.902 13.572 14.297 15.127 16.099 17.081 18.191 19.474 21.085 22.867 24.972 27.614 30.992 33.954 35.79 37.039 37.938 38.581 39.047 39.428 39.713 39.95 40.139 40.294 40.409 40.496 40.566 40.606 40.633 40.651 40.661 40.661 40.648 40.635 40.613 40.584 40.558 40.539 40.512 40.472 40.432 40.401 40.359 40.291 40.239 40.183 40.153 40.078 39.995 39.914 39.872 39.771 39.703 39.643 39.574 39.415 39.316 39.211 39.064 38.879 38.684 38.442 37.582 -3 ,8569 ,TETRA ,17617680,Tue Nov 30 10:07:45 CET,Tue Nov 30 11:54:09 CET,0.0 1.175 1.599 1.919 2.208 2.46 2.682 2.9 3.313 3.507 3.69 3.938 4.186 4.339 4.637 4.937 5.212 5.345 5.604 5.853 6.222 6.46 6.685 7.004 7.312 7.611 7.913 8.214 8.583 8.935 9.293 9.721 10.141 10.554 11.035 11.576 12.105 12.709 13.353 14.039 14.762 15.597 16.644 17.658 18.801 20.124 21.616 23.354 25.519 28.16 31.559 34.618 36.463 37.689 38.574 39.242 39.759 40.169 40.456 40.673 40.835 40.97 41.081 41.173 41.248 41.292 41.32 41.347 41.362 41.353 41.338 41.333 41.329 41.316 41.297 41.268 41.226 41.179 41.127 41.095 41.059 40.995 40.954 40.9 40.873 40.813 40.731 40.646 40.601 40.499 40.44 40.378 40.298 40.105 39.997 39.89 39.773 39.634 39.425 39.17 38.383 -4 ,27084 ,TETRA ,17617681,Tue Nov 30 10:07:48 CET,Tue Nov 30 11:52:28 CET,0.0 1.034 1.429 1.703 1.928 2.157 2.385 2.606 2.996 3.168 3.34 3.556 3.783 3.932 4.229 4.515 4.774 4.902 5.177 5.438 5.779 6.005 6.231 6.542 6.854 7.177 7.487 7.786 8.163 8.523 8.862 9.275 9.686 10.081 10.554 11.097 11.617 12.188 12.823 13.539 14.295 15.151 16.142 17.129 18.325 19.639 21.184 23.034 25.218 27.938 31.619 34.917 36.949 38.32 39.269 39.958 40.469 40.86 41.133 41.369 41.563 41.711 41.814 41.908 41.991 42.046 42.085 42.115 42.129 42.129 42.131 42.128 42.127 42.12 42.103 42.075 42.036 42.001 41.968 41.944 41.917 41.865 41.822 41.761 41.723 41.643 41.56 41.479 41.433 41.33 41.259 41.194 41.131 41.005 40.925 40.827 40.716 40.573 40.399 40.139 39.374 -5 ,11587 ,TETRA ,17617682,Tue Nov 30 10:07:48 CET,Tue Nov 30 11:52:53 CET,0.0 1.257 1.683 2.047 2.356 2.608 2.855 3.079 3.462 3.648 3.824 4.061 4.297 4.45 4.748 5.043 5.314 5.445 5.704 5.946 6.281 6.494 6.707 7.013 7.325 7.635 7.931 8.233 8.608 8.965 9.31 9.721 10.125 10.52 10.982 11.494 11.986 12.55 13.202 13.894 14.584 15.39 16.398 17.407 18.587 19.908 21.421 23.216 25.405 28.093 31.482 34.483 36.377 37.642 38.532 39.213 39.73 40.11 40.383 40.619 40.793 40.927 41.022 41.095 41.156 41.196 41.228 41.242 41.247 41.259 41.259 41.246 41.224 41.21 41.207 41.198 41.175 41.141 41.112 41.091 41.047 40.961 40.915 40.863 40.83 40.774 40.716 40.635 40.585 40.476 40.379 40.299 40.219 40.025 39.909 39.805 39.68 39.536 39.379 39.134 38.445 -6 ,13707 ,TETRA ,17617684,Tue Nov 30 10:07:49 CET,Tue Nov 30 11:53:05 CET,0.0 1.045 1.456 1.795 2.057 2.288 2.501 2.718 3.149 3.329 3.502 3.756 3.994 4.141 4.417 4.684 4.936 5.057 5.297 5.539 5.889 6.116 6.337 6.648 6.961 7.26 7.545 7.818 8.164 8.502 8.829 9.25 9.669 10.071 10.551 11.1 11.624 12.191 12.809 13.506 14.239 15.07 16.076 17.069 18.237 19.594 21.148 22.922 25.049 27.577 30.779 33.593 35.406 36.655 37.538 38.213 38.722 39.137 39.436 39.661 39.818 39.933 40.029 40.108 40.168 40.216 40.245 40.265 40.266 40.256 40.235 40.214 40.193 40.17 40.155 40.129 40.1 40.063 40.019 39.991 39.953 39.889 39.834 39.769 39.736 39.661 39.567 39.466 39.41 39.302 39.213 39.137 39.06 38.89 38.787 38.665 38.52 38.368 38.191 37.89 36.823 -7 ,14159 ,TETRA ,17617686,Tue Nov 30 10:07:47 CET,Tue Nov 30 11:55:25 CET,0.0 1.033 1.438 1.745 2.019 2.266 2.494 2.702 3.081 3.269 3.445 3.665 3.902 4.05 4.327 4.594 4.859 4.987 5.226 5.467 5.803 6.012 6.229 6.555 6.864 7.151 7.433 7.716 8.078 8.417 8.757 9.186 9.62 10.048 10.543 11.117 11.653 12.235 12.916 13.626 14.355 15.236 16.262 17.297 18.524 19.905 21.512 23.341 25.508 28.102 31.503 34.574 36.536 37.874 38.835 39.563 40.097 40.511 40.82 41.075 41.251 41.387 41.491 41.581 41.647 41.686 41.723 41.742 41.752 41.752 41.741 41.737 41.719 41.699 41.683 41.658 41.636 41.6 41.546 41.512 41.485 41.439 41.402 41.355 41.326 41.256 41.189 41.116 41.071 40.973 40.9 40.839 40.78 40.642 40.532 40.416 40.284 40.106 39.91 39.615 38.822 -8 ,22696 ,TETRA ,17617687,Tue Nov 30 10:08:48 CET,Tue Nov 30 11:56:11 CET,0.0 1.149 1.534 1.86 2.16 2.421 2.643 2.858 3.253 3.44 3.616 3.859 4.107 4.263 4.532 4.792 5.054 5.183 5.439 5.691 6.046 6.27 6.482 6.783 7.095 7.411 7.709 8.0 8.379 8.753 9.121 9.572 10.017 10.444 10.932 11.484 12.048 12.658 13.279 13.937 14.669 15.536 16.541 17.552 18.723 20.03 21.574 23.394 25.542 28.111 31.429 34.439 36.415 37.759 38.705 39.418 39.949 40.361 40.674 40.954 41.152 41.304 41.438 41.535 41.6 41.656 41.711 41.751 41.782 41.809 41.826 41.827 41.815 41.782 41.755 41.73 41.698 41.661 41.61 41.574 41.538 41.48 41.424 41.361 41.332 41.276 41.22 41.144 41.105 41.018 40.957 40.897 40.839 40.7 40.61 40.497 40.382 40.256 40.115 39.926 39.389 -9 ,14889 ,TETRA ,17617688,Tue Nov 30 10:08:51 CET,Tue Nov 30 11:54:39 CET,0.0 0.994 1.419 1.765 2.047 2.292 2.517 2.725 3.136 3.326 3.496 3.718 3.954 4.101 4.386 4.667 4.931 5.057 5.305 5.55 5.904 6.141 6.375 6.706 7.018 7.312 7.594 7.881 8.27 8.64 8.988 9.431 9.868 10.297 10.785 11.313 11.85 12.457 13.09 13.75 14.451 15.246 16.19 17.157 18.339 19.704 21.272 23.085 25.287 27.928 31.299 34.363 36.306 37.633 38.527 39.172 39.672 40.075 40.368 40.597 40.781 40.929 41.045 41.115 41.154 41.199 41.241 41.259 41.268 41.276 41.288 41.293 41.287 41.27 41.251 41.215 41.181 41.16 41.124 41.091 41.054 41.002 40.956 40.894 40.868 40.813 40.749 40.669 40.618 40.516 40.446 40.387 40.329 40.16 40.055 39.948 39.813 39.646 39.476 39.231 38.445 -10 ,10045 ,TETRA ,17617689,Tue Nov 30 10:08:47 CET,Tue Nov 30 11:57:21 CET,0.0 1.072 1.509 1.822 2.086 2.328 2.543 2.745 3.135 3.316 3.48 3.718 3.963 4.122 4.426 4.691 4.94 5.068 5.325 5.573 5.923 6.156 6.391 6.713 7.0 7.289 7.585 7.869 8.229 8.591 8.945 9.376 9.805 10.231 10.727 11.259 11.749 12.3 12.932 13.633 14.374 15.223 16.265 17.273 18.405 19.736 21.297 23.023 25.069 27.618 30.89 33.764 35.582 36.835 37.752 38.434 38.918 39.291 39.554 39.782 39.965 40.108 40.209 40.29 40.362 40.406 40.429 40.448 40.465 40.466 40.461 40.465 40.46 40.443 40.43 40.412 40.381 40.332 40.283 40.254 40.221 40.164 40.109 40.046 40.018 39.958 39.892 39.817 39.773 39.674 39.602 39.542 39.476 39.304 39.208 39.109 38.978 38.826 38.647 38.389 37.652 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_124_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_124_41.txt deleted file mode 100644 index 2e8cc7a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_124_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24688 ,TETRA ,17617690,Tue Nov 30 10:08:50 CET,Tue Nov 30 11:55:22 CET,0.0 1.425 1.899 2.233 2.513 2.747 2.948 3.131 3.427 3.565 3.704 3.937 4.037 4.125 4.283 4.433 4.57 4.643 4.783 4.9 5.061 5.16 5.252 5.383 5.52 5.652 5.762 5.867 5.998 6.109 6.212 6.328 6.422 6.522 6.642 6.753 6.845 6.924 7.007 7.07 7.087 7.085 7.055 6.997 6.912 6.747 6.462 5.978 5.122 3.798 1.371 -1.604 -3.871 -5.81 -7.524 -9.005 -10.218 -11.305 -12.252 -13.168 -13.93 -14.595 -15.209 -15.773 -16.301 -16.777 -17.259 -17.686 -18.045 -18.411 -18.787 -19.094 -19.411 -19.738 -19.988 -20.249 -20.519 -20.784 -21.062 -21.261 -21.47 -21.793 -22.017 -22.24 -22.349 -22.578 -22.828 -23.101 -23.242 -23.411 -23.647 -23.809 -23.969 -24.301 -24.493 -24.694 -24.907 -25.161 -25.458 -25.86 -27.187 -2 ,4662 ,TETRA ,17617691,Tue Nov 30 10:08:50 CET,Tue Nov 30 11:54:28 CET,0.0 1.658 2.06 2.341 2.592 2.81 2.977 3.137 3.444 3.583 3.707 3.918 4.025 4.131 4.314 4.47 4.601 4.67 4.814 4.945 5.134 5.255 5.373 5.523 5.647 5.782 5.902 5.991 6.113 6.246 6.356 6.478 6.589 6.69 6.814 6.918 6.991 7.072 7.149 7.206 7.242 7.262 7.271 7.229 7.116 6.895 6.503 5.895 4.883 3.327 0.814 -2.122 -4.463 -6.42 -8.084 -9.559 -10.832 -11.925 -12.825 -13.726 -14.493 -15.144 -15.757 -16.333 -16.847 -17.318 -17.797 -18.205 -18.557 -18.924 -19.303 -19.613 -19.921 -20.233 -20.486 -20.747 -21.013 -21.292 -21.568 -21.757 -21.96 -22.273 -22.481 -22.7 -22.815 -23.048 -23.285 -23.536 -23.661 -23.831 -24.081 -24.227 -24.375 -24.688 -24.858 -25.044 -25.236 -25.471 -25.788 -26.215 -27.504 -3 ,965 ,TETRA ,17617692,Tue Nov 30 10:08:51 CET,Tue Nov 30 11:54:02 CET,0.0 1.705 2.123 2.425 2.665 2.876 3.065 3.227 3.51 3.646 3.776 4.006 4.114 4.214 4.398 4.565 4.71 4.78 4.911 5.023 5.191 5.304 5.402 5.523 5.632 5.742 5.844 5.953 6.107 6.231 6.33 6.447 6.556 6.65 6.747 6.843 6.924 6.996 7.049 7.1 7.163 7.22 7.201 7.12 7.015 6.848 6.564 6.064 5.19 3.757 1.306 -1.667 -4.13 -6.113 -7.784 -9.26 -10.497 -11.568 -12.48 -13.385 -14.135 -14.778 -15.386 -15.971 -16.49 -16.955 -17.441 -17.856 -18.208 -18.567 -18.948 -19.267 -19.59 -19.915 -20.17 -20.438 -20.707 -20.982 -21.268 -21.466 -21.671 -21.986 -22.209 -22.437 -22.554 -22.79 -23.021 -23.271 -23.4 -23.575 -23.845 -24.005 -24.166 -24.515 -24.701 -24.899 -25.118 -25.373 -25.688 -26.095 -27.707 -4 ,26838 ,TETRA ,17617693,Tue Nov 30 10:08:50 CET,Tue Nov 30 11:56:44 CET,0.0 1.388 1.82 2.156 2.426 2.656 2.85 3.018 3.324 3.461 3.592 3.824 3.926 4.023 4.196 4.351 4.493 4.558 4.682 4.805 4.975 5.075 5.168 5.291 5.415 5.544 5.657 5.747 5.871 5.998 6.105 6.226 6.342 6.449 6.556 6.665 6.759 6.848 6.937 7.017 7.063 7.072 7.047 6.974 6.858 6.684 6.365 5.889 5.104 3.767 1.421 -1.381 -3.714 -5.775 -7.491 -8.957 -10.192 -11.284 -12.215 -13.106 -13.848 -14.501 -15.109 -15.679 -16.199 -16.663 -17.133 -17.545 -17.897 -18.257 -18.642 -18.965 -19.297 -19.632 -19.885 -20.146 -20.418 -20.695 -20.985 -21.181 -21.379 -21.693 -21.906 -22.123 -22.237 -22.48 -22.739 -23.017 -23.153 -23.335 -23.599 -23.749 -23.91 -24.269 -24.455 -24.652 -24.867 -25.099 -25.368 -25.735 -27.161 -5 ,20518 ,TETRA ,17617694,Tue Nov 30 10:08:50 CET,Tue Nov 30 11:54:09 CET,0.0 1.79 2.266 2.577 2.822 3.035 3.234 3.419 3.717 3.836 3.943 4.158 4.258 4.354 4.532 4.689 4.834 4.903 5.036 5.163 5.332 5.437 5.55 5.705 5.846 5.967 6.078 6.193 6.332 6.456 6.565 6.678 6.781 6.874 6.968 7.067 7.16 7.241 7.297 7.337 7.359 7.368 7.386 7.342 7.214 7.011 6.628 6.061 5.223 3.836 1.277 -1.713 -4.031 -5.998 -7.67 -9.141 -10.382 -11.468 -12.388 -13.264 -13.985 -14.618 -15.232 -15.822 -16.36 -16.83 -17.298 -17.703 -18.056 -18.433 -18.827 -19.149 -19.473 -19.794 -20.04 -20.3 -20.561 -20.826 -21.102 -21.292 -21.495 -21.805 -22.005 -22.212 -22.325 -22.563 -22.802 -23.047 -23.18 -23.355 -23.608 -23.768 -23.935 -24.287 -24.479 -24.697 -24.929 -25.187 -25.498 -25.884 -27.016 -6 ,15312 ,TETRA ,17617695,Tue Nov 30 10:09:47 CET,Tue Nov 30 12:02:23 CET,0.0 1.838 2.279 2.593 2.869 3.113 3.319 3.5 3.811 3.938 4.058 4.294 4.401 4.5 4.674 4.826 4.977 5.045 5.174 5.298 5.463 5.569 5.664 5.798 5.935 6.064 6.188 6.295 6.411 6.517 6.618 6.742 6.845 6.944 7.078 7.204 7.3 7.405 7.498 7.572 7.637 7.675 7.678 7.635 7.534 7.356 7.037 6.521 5.681 4.219 1.725 -1.247 -3.695 -5.724 -7.392 -8.843 -10.081 -11.139 -12.039 -12.924 -13.662 -14.31 -14.922 -15.492 -16.016 -16.481 -16.961 -17.383 -17.746 -18.126 -18.515 -18.834 -19.158 -19.489 -19.744 -20.019 -20.293 -20.574 -20.869 -21.055 -21.239 -21.543 -21.765 -21.987 -22.099 -22.33 -22.567 -22.814 -22.948 -23.126 -23.375 -23.528 -23.683 -24.045 -24.252 -24.459 -24.678 -24.925 -25.202 -25.589 -27.222 -7 ,30460 ,TETRA ,17617696,Tue Nov 30 10:09:49 CET,Tue Nov 30 11:59:01 CET,0.0 1.57 1.996 2.348 2.622 2.842 3.037 3.203 3.522 3.672 3.799 4.003 4.103 4.21 4.411 4.599 4.748 4.812 4.941 5.059 5.235 5.35 5.462 5.612 5.758 5.896 6.005 6.093 6.225 6.351 6.463 6.594 6.693 6.788 6.897 6.988 7.059 7.137 7.212 7.261 7.293 7.314 7.321 7.271 7.134 6.874 6.392 5.687 4.666 3.092 0.517 -2.397 -4.74 -6.716 -8.359 -9.794 -11.022 -12.102 -13.038 -13.939 -14.68 -15.342 -15.966 -16.541 -17.068 -17.534 -18.018 -18.44 -18.798 -19.169 -19.542 -19.844 -20.164 -20.512 -20.779 -21.048 -21.315 -21.585 -21.861 -22.053 -22.248 -22.542 -22.75 -22.973 -23.086 -23.315 -23.563 -23.826 -23.964 -24.147 -24.398 -24.544 -24.702 -25.056 -25.238 -25.449 -25.684 -25.923 -26.217 -26.693 -28.486 -8 ,945 ,TETRA ,17617697,Tue Nov 30 10:10:47 CET,Tue Nov 30 11:51:57 CET,0.0 1.599 2.036 2.372 2.68 2.913 3.103 3.264 3.542 3.673 3.797 4.019 4.123 4.224 4.422 4.592 4.738 4.81 4.945 5.064 5.226 5.336 5.447 5.597 5.725 5.83 5.94 6.054 6.184 6.302 6.405 6.523 6.634 6.732 6.828 6.915 6.991 7.057 7.117 7.175 7.191 7.199 7.218 7.183 7.052 6.831 6.514 5.996 5.166 3.831 1.429 -1.388 -3.758 -5.753 -7.437 -8.888 -10.091 -11.168 -12.097 -12.995 -13.725 -14.366 -14.992 -15.583 -16.131 -16.62 -17.105 -17.519 -17.878 -18.257 -18.652 -18.977 -19.312 -19.643 -19.897 -20.164 -20.426 -20.695 -20.973 -21.163 -21.358 -21.665 -21.886 -22.109 -22.224 -22.461 -22.7 -22.955 -23.087 -23.267 -23.518 -23.683 -23.849 -24.183 -24.376 -24.589 -24.825 -25.083 -25.384 -25.769 -27.239 -9 ,25487 ,TETRA ,17617698,Tue Nov 30 10:10:46 CET,Tue Nov 30 11:55:13 CET,0.0 1.586 2.034 2.366 2.643 2.87 3.043 3.199 3.502 3.633 3.749 3.967 4.071 4.163 4.314 4.454 4.608 4.682 4.819 4.957 5.146 5.252 5.353 5.487 5.601 5.715 5.824 5.921 6.036 6.16 6.275 6.38 6.47 6.566 6.675 6.776 6.87 6.968 7.045 7.074 7.101 7.142 7.141 7.1 7.039 6.858 6.47 5.895 4.944 3.436 0.951 -1.965 -4.297 -6.287 -7.955 -9.38 -10.555 -11.603 -12.507 -13.376 -14.124 -14.766 -15.354 -15.906 -16.42 -16.891 -17.365 -17.785 -18.146 -18.505 -18.875 -19.179 -19.494 -19.826 -20.081 -20.343 -20.615 -20.888 -21.177 -21.376 -21.566 -21.867 -22.085 -22.3 -22.407 -22.633 -22.872 -23.119 -23.247 -23.425 -23.676 -23.825 -23.981 -24.326 -24.521 -24.722 -24.922 -25.172 -25.485 -25.892 -27.211 -10 ,16539 ,TETRA ,17617699,Tue Nov 30 10:10:48 CET,Tue Nov 30 11:55:48 CET,0.0 1.394 1.831 2.186 2.474 2.708 2.884 3.044 3.366 3.506 3.636 3.875 3.977 4.071 4.249 4.413 4.566 4.635 4.755 4.872 5.053 5.166 5.256 5.382 5.514 5.647 5.765 5.862 5.991 6.103 6.193 6.297 6.403 6.502 6.597 6.685 6.763 6.847 6.92 6.985 7.022 7.024 7.022 6.968 6.836 6.584 6.101 5.43 4.414 2.781 0.075 -3.121 -5.63 -7.582 -9.153 -10.557 -11.811 -12.913 -13.833 -14.744 -15.513 -16.171 -16.779 -17.362 -17.904 -18.384 -18.883 -19.33 -19.693 -20.055 -20.449 -20.783 -21.114 -21.444 -21.707 -21.969 -22.23 -22.503 -22.796 -22.992 -23.184 -23.491 -23.711 -23.93 -24.037 -24.266 -24.506 -24.751 -24.887 -25.067 -25.315 -25.466 -25.624 -25.986 -26.185 -26.388 -26.613 -26.887 -27.194 -27.584 -28.549 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_124_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_124_54.txt deleted file mode 100644 index c9ca7539..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_124_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28244 ,TETRA ,17617700,Tue Nov 30 10:10:46 CET,Tue Nov 30 11:57:01 CET,0.0 1.317 1.61 1.783 1.888 1.953 2.024 2.075 2.135 2.154 2.179 2.216 2.214 2.204 2.178 2.132 2.068 2.037 1.97 1.892 1.744 1.623 1.508 1.346 1.161 0.955 0.737 0.513 0.204 -0.13 -0.467 -0.892 -1.34 -1.823 -2.431 -3.144 -3.867 -4.716 -5.697 -6.815 -8.061 -9.553 -11.425 -13.433 -15.967 -19.083 -23.004 -27.908 -34.439 -43.386 -56.488 -70.098 -79.996 -87.61 -93.68 -98.714 -102.835 -106.36 -109.233 -111.957 -114.232 -116.196 -117.983 -119.599 -121.041 -122.299 -123.571 -124.689 -125.638 -126.594 -127.575 -128.371 -129.152 -129.959 -130.572 -131.171 -131.789 -132.426 -133.076 -133.522 -133.971 -134.639 -135.09 -135.549 -135.779 -136.259 -136.74 -137.228 -137.485 -137.899 -138.269 -138.545 -138.829 -139.389 -139.677 -139.975 -140.316 -140.722 -141.181 -141.691 -142.679 -2 ,16658 ,TETRA ,17617701,Tue Nov 30 10:12:49 CET,Tue Nov 30 11:58:52 CET,0.0 1.106 1.379 1.567 1.693 1.772 1.807 1.83 1.868 1.902 1.939 1.965 1.976 1.983 1.95 1.899 1.842 1.809 1.732 1.643 1.513 1.418 1.302 1.115 0.911 0.688 0.45 0.203 -0.105 -0.414 -0.76 -1.221 -1.687 -2.163 -2.743 -3.458 -4.207 -5.047 -5.994 -7.087 -8.322 -9.819 -11.694 -13.722 -16.273 -19.391 -23.369 -28.367 -34.917 -43.757 -56.758 -70.287 -80.17 -87.805 -93.829 -98.813 -102.905 -106.409 -109.281 -112.001 -114.253 -116.188 -117.961 -119.589 -121.04 -122.306 -123.6 -124.711 -125.639 -126.6 -127.574 -128.351 -129.124 -129.903 -130.499 -131.108 -131.732 -132.355 -132.982 -133.41 -133.855 -134.528 -134.978 -135.43 -135.654 -136.112 -136.595 -137.104 -137.358 -137.764 -138.121 -138.387 -138.66 -139.235 -139.54 -139.847 -140.164 -140.502 -140.861 -141.308 -142.42 -3 ,5285 ,TETRA ,17617702,Tue Nov 30 10:12:51 CET,Tue Nov 30 12:02:07 CET,0.0 1.406 1.74 1.948 2.073 2.159 2.216 2.255 2.311 2.318 2.314 2.279 2.251 2.225 2.143 2.042 1.947 1.896 1.793 1.688 1.522 1.389 1.241 1.005 0.761 0.51 0.263 0.011 -0.351 -0.729 -1.112 -1.596 -2.064 -2.52 -3.105 -3.798 -4.494 -5.327 -6.302 -7.412 -8.655 -10.159 -12.021 -14.061 -16.632 -19.711 -23.658 -28.633 -35.189 -44.112 -57.084 -70.57 -80.519 -88.179 -94.18 -99.191 -103.291 -106.775 -109.656 -112.395 -114.645 -116.563 -118.335 -119.964 -121.411 -122.682 -123.966 -125.076 -126.012 -126.967 -127.939 -128.711 -129.497 -130.298 -130.896 -131.514 -132.136 -132.753 -133.379 -133.806 -134.236 -134.898 -135.367 -135.85 -136.091 -136.57 -137.065 -137.586 -137.85 -138.261 -138.63 -138.9 -139.169 -139.754 -140.059 -140.364 -140.711 -141.083 -141.494 -142.007 -143.112 -4 ,10526 ,TETRA ,17617703,Tue Nov 30 10:12:49 CET,Tue Nov 30 11:58:17 CET,0.0 1.453 1.723 1.902 2.034 2.123 2.201 2.274 2.34 2.343 2.347 2.334 2.316 2.293 2.231 2.154 2.065 2.014 1.892 1.753 1.544 1.401 1.257 1.04 0.806 0.572 0.329 0.083 -0.238 -0.58 -0.926 -1.362 -1.818 -2.3 -2.882 -3.579 -4.317 -5.165 -6.1 -7.178 -8.389 -9.788 -11.515 -13.471 -16.035 -19.111 -22.983 -27.906 -34.447 -43.367 -56.484 -70.114 -80.105 -87.778 -93.768 -98.755 -102.883 -106.371 -109.196 -111.909 -114.163 -116.107 -117.92 -119.557 -121.01 -122.295 -123.588 -124.698 -125.633 -126.581 -127.531 -128.302 -129.08 -129.868 -130.468 -131.072 -131.687 -132.314 -132.944 -133.367 -133.802 -134.463 -134.915 -135.378 -135.605 -136.064 -136.551 -137.044 -137.298 -137.713 -138.082 -138.355 -138.627 -139.209 -139.519 -139.84 -140.178 -140.529 -140.949 -141.473 -142.581 -5 ,2060 ,TETRA ,17617704,Tue Nov 30 10:12:50 CET,Tue Nov 30 11:58:26 CET,0.0 1.756 2.08 2.275 2.407 2.49 2.554 2.599 2.657 2.672 2.666 2.635 2.621 2.604 2.534 2.437 2.318 2.263 2.169 2.055 1.853 1.708 1.557 1.307 1.067 0.832 0.574 0.311 -0.044 -0.4 -0.756 -1.194 -1.648 -2.13 -2.721 -3.432 -4.162 -4.989 -5.941 -7.054 -8.287 -9.775 -11.686 -13.736 -16.28 -19.373 -23.272 -28.199 -34.798 -43.789 -56.839 -70.367 -80.329 -88.053 -94.108 -99.092 -103.191 -106.698 -109.559 -112.305 -114.566 -116.489 -118.25 -119.862 -121.329 -122.631 -123.911 -125.009 -125.946 -126.895 -127.859 -128.634 -129.427 -130.215 -130.809 -131.424 -132.039 -132.659 -133.299 -133.739 -134.18 -134.838 -135.28 -135.733 -135.955 -136.403 -136.876 -137.377 -137.641 -138.06 -138.42 -138.689 -138.97 -139.549 -139.849 -140.17 -140.527 -140.922 -141.361 -141.858 -143.099 -6 ,29504 ,TETRA ,17617705,Tue Nov 30 10:13:49 CET,Tue Nov 30 11:59:40 CET,0.0 1.09 1.401 1.629 1.793 1.881 1.924 1.944 1.961 1.965 1.97 1.962 1.951 1.943 1.926 1.892 1.849 1.819 1.746 1.675 1.544 1.446 1.338 1.143 0.936 0.707 0.461 0.209 -0.116 -0.436 -0.785 -1.203 -1.637 -2.124 -2.73 -3.446 -4.153 -4.973 -5.935 -7.041 -8.277 -9.749 -11.598 -13.623 -16.198 -19.325 -23.27 -28.2 -34.749 -43.708 -56.75 -70.308 -80.305 -88.014 -94.077 -99.136 -103.292 -106.785 -109.632 -112.348 -114.596 -116.539 -118.319 -119.929 -121.37 -122.665 -123.979 -125.105 -126.052 -127.002 -127.965 -128.75 -129.559 -130.367 -130.973 -131.605 -132.246 -132.882 -133.513 -133.932 -134.358 -135.022 -135.477 -135.943 -136.174 -136.637 -137.109 -137.582 -137.823 -138.232 -138.602 -138.871 -139.139 -139.722 -140.051 -140.385 -140.709 -141.069 -141.458 -141.914 -142.949 -7 ,15503 ,TETRA ,17617706,Tue Nov 30 10:13:51 CET,Tue Nov 30 11:59:18 CET,0.0 1.233 1.555 1.734 1.875 1.989 2.071 2.115 2.15 2.147 2.136 2.101 2.077 2.056 2.009 1.937 1.842 1.785 1.663 1.54 1.351 1.215 1.062 0.809 0.542 0.279 0.012 -0.264 -0.621 -0.973 -1.332 -1.793 -2.287 -2.782 -3.342 -4.032 -4.76 -5.575 -6.53 -7.631 -8.856 -10.341 -12.213 -14.273 -16.846 -19.964 -23.956 -28.928 -35.446 -44.339 -57.366 -70.957 -80.85 -88.529 -94.592 -99.568 -103.686 -107.204 -110.065 -112.801 -115.07 -116.999 -118.757 -120.362 -121.8 -123.059 -124.342 -125.46 -126.406 -127.356 -128.327 -129.116 -129.9 -130.715 -131.335 -131.944 -132.549 -133.179 -133.825 -134.245 -134.665 -135.314 -135.76 -136.213 -136.447 -136.919 -137.396 -137.881 -138.125 -138.54 -138.938 -139.214 -139.486 -140.063 -140.367 -140.677 -141.011 -141.397 -141.814 -142.308 -143.486 -8 ,10474 ,TETRA ,17617707,Tue Nov 30 10:13:50 CET,Tue Nov 30 11:59:48 CET,0.0 1.797 2.115 2.303 2.449 2.56 2.62 2.647 2.684 2.693 2.687 2.629 2.6 2.569 2.505 2.45 2.365 2.318 2.216 2.094 1.928 1.819 1.7 1.522 1.32 1.112 0.903 0.672 0.344 -0.009 -0.365 -0.822 -1.278 -1.74 -2.326 -3.019 -3.738 -4.598 -5.571 -6.674 -7.904 -9.39 -11.299 -13.368 -15.957 -19.094 -23.05 -28.019 -34.572 -43.47 -56.49 -70.05 -79.978 -87.662 -93.712 -98.735 -102.854 -106.349 -109.22 -111.967 -114.23 -116.148 -117.91 -119.536 -120.996 -122.288 -123.594 -124.714 -125.664 -126.622 -127.59 -128.374 -129.154 -129.946 -130.551 -131.164 -131.787 -132.42 -133.06 -133.494 -133.938 -134.602 -135.041 -135.491 -135.722 -136.201 -136.689 -137.171 -137.414 -137.813 -138.158 -138.421 -138.687 -139.261 -139.567 -139.877 -140.208 -140.544 -140.924 -141.421 -142.388 -9 ,32408 ,TETRA ,17617708,Tue Nov 30 10:13:51 CET,Tue Nov 30 12:01:27 CET,0.0 1.418 1.694 1.886 2.018 2.126 2.194 2.229 2.28 2.293 2.295 2.284 2.266 2.245 2.207 2.16 2.104 2.068 1.985 1.897 1.751 1.655 1.556 1.38 1.199 0.995 0.759 0.528 0.221 -0.089 -0.416 -0.865 -1.331 -1.798 -2.376 -3.096 -3.813 -4.642 -5.611 -6.709 -7.951 -9.433 -11.282 -13.321 -15.88 -18.951 -22.882 -27.805 -34.322 -43.305 -56.442 -69.98 -79.848 -87.469 -93.511 -98.562 -102.672 -106.163 -109.028 -111.77 -114.031 -115.946 -117.728 -119.371 -120.834 -122.128 -123.42 -124.532 -125.474 -126.436 -127.411 -128.183 -128.96 -129.762 -130.375 -130.989 -131.62 -132.252 -132.877 -133.306 -133.75 -134.405 -134.842 -135.295 -135.522 -135.98 -136.453 -136.937 -137.179 -137.581 -137.923 -138.184 -138.456 -139.051 -139.374 -139.708 -140.047 -140.398 -140.789 -141.3 -142.46 -10 ,5936 ,TETRA ,17617709,Tue Nov 30 10:13:49 CET,Tue Nov 30 11:59:34 CET,0.0 1.41 1.759 1.971 2.096 2.193 2.283 2.318 2.353 2.36 2.339 2.31 2.293 2.259 2.179 2.088 1.99 1.936 1.81 1.681 1.48 1.344 1.203 0.987 0.782 0.582 0.356 0.103 -0.244 -0.59 -0.944 -1.397 -1.858 -2.327 -2.909 -3.609 -4.321 -5.141 -6.084 -7.172 -8.364 -9.819 -11.708 -13.757 -16.33 -19.44 -23.351 -28.251 -34.762 -43.663 -56.731 -70.303 -80.23 -87.932 -94.005 -99.004 -103.07 -106.538 -109.401 -112.132 -114.383 -116.294 -118.043 -119.661 -121.097 -122.364 -123.656 -124.767 -125.704 -126.652 -127.622 -128.411 -129.21 -130.027 -130.63 -131.235 -131.853 -132.477 -133.123 -133.557 -133.986 -134.641 -135.09 -135.535 -135.759 -136.213 -136.687 -137.176 -137.42 -137.824 -138.218 -138.514 -138.797 -139.365 -139.661 -139.966 -140.296 -140.667 -141.09 -141.603 -142.759 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_1.txt deleted file mode 100644 index 456fbcd1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,864 ,TETRA ,17617710,Tue Nov 30 10:13:50 CET,Tue Nov 30 12:02:11 CET,0.0 1.285 1.619 1.857 2.053 2.217 2.363 2.495 2.751 2.868 2.969 3.11 3.246 3.334 3.502 3.67 3.821 3.889 4.014 4.141 4.32 4.426 4.539 4.707 4.855 4.992 5.121 5.234 5.38 5.523 5.651 5.8 5.945 6.072 6.211 6.351 6.492 6.669 6.855 7.009 7.161 7.347 7.545 7.717 7.854 7.952 8.015 8.053 8.01 7.737 7.035 6.037 5.125 4.342 3.651 2.994 2.413 1.892 1.432 0.982 0.593 0.217 -0.143 -0.491 -0.836 -1.125 -1.413 -1.672 -1.896 -2.158 -2.428 -2.622 -2.822 -3.053 -3.256 -3.467 -3.685 -3.897 -4.104 -4.262 -4.431 -4.677 -4.837 -4.989 -5.066 -5.238 -5.435 -5.662 -5.785 -5.955 -6.149 -6.29 -6.443 -6.765 -6.941 -7.117 -7.318 -7.571 -7.884 -8.296 -9.771 -2 ,12805 ,TETRA ,17617711,Tue Nov 30 10:15:21 CET,Tue Nov 30 12:02:58 CET,0.0 1.092 1.473 1.741 1.961 2.143 2.296 2.438 2.708 2.84 2.961 3.142 3.288 3.378 3.548 3.709 3.855 3.92 4.056 4.185 4.362 4.476 4.58 4.731 4.866 5.015 5.161 5.288 5.458 5.619 5.77 5.922 6.067 6.213 6.383 6.54 6.678 6.823 6.971 7.151 7.368 7.562 7.728 7.873 7.994 8.119 8.228 8.29 8.262 8.009 7.33 6.316 5.408 4.585 3.841 3.156 2.563 2.029 1.575 1.129 0.731 0.389 0.06 -0.308 -0.648 -0.927 -1.226 -1.483 -1.693 -1.91 -2.148 -2.357 -2.59 -2.851 -3.054 -3.254 -3.449 -3.639 -3.84 -3.981 -4.125 -4.358 -4.527 -4.7 -4.788 -4.977 -5.169 -5.37 -5.482 -5.651 -5.847 -5.966 -6.093 -6.383 -6.535 -6.711 -6.904 -7.105 -7.36 -7.71 -9.225 -3 ,16153 ,TETRA ,17617712,Tue Nov 30 10:15:24 CET,Tue Nov 30 12:03:04 CET,0.0 0.917 1.228 1.471 1.68 1.852 2.011 2.17 2.443 2.555 2.653 2.807 2.958 3.057 3.24 3.41 3.559 3.633 3.782 3.922 4.111 4.231 4.348 4.514 4.666 4.821 4.977 5.109 5.261 5.4 5.523 5.696 5.871 6.019 6.201 6.396 6.545 6.684 6.824 6.95 7.085 7.241 7.415 7.578 7.753 7.907 8.019 8.082 8.016 7.693 6.986 5.948 4.988 4.147 3.415 2.749 2.177 1.673 1.216 0.769 0.35 -0.046 -0.398 -0.725 -1.056 -1.387 -1.7 -1.955 -2.174 -2.396 -2.624 -2.809 -3.012 -3.259 -3.461 -3.649 -3.823 -4.003 -4.227 -4.392 -4.551 -4.801 -4.98 -5.166 -5.262 -5.468 -5.686 -5.929 -6.058 -6.233 -6.447 -6.589 -6.747 -7.075 -7.236 -7.415 -7.626 -7.859 -8.124 -8.478 -9.777 -4 ,23490 ,TETRA ,17617713,Tue Nov 30 10:16:20 CET,Tue Nov 30 12:04:25 CET,0.0 1.055 1.414 1.654 1.85 2.038 2.199 2.34 2.622 2.743 2.852 3.017 3.159 3.254 3.434 3.602 3.752 3.82 3.938 4.059 4.246 4.367 4.481 4.634 4.804 4.975 5.107 5.212 5.356 5.494 5.616 5.755 5.896 6.028 6.168 6.337 6.487 6.633 6.819 7.051 7.249 7.404 7.577 7.725 7.868 8.003 8.111 8.139 8.046 7.806 7.189 6.217 5.302 4.477 3.762 3.089 2.489 1.916 1.412 0.918 0.514 0.149 -0.247 -0.6 -0.909 -1.197 -1.498 -1.765 -1.986 -2.232 -2.488 -2.679 -2.883 -3.134 -3.346 -3.544 -3.746 -3.973 -4.211 -4.364 -4.513 -4.744 -4.919 -5.113 -5.209 -5.388 -5.57 -5.789 -5.914 -6.091 -6.317 -6.473 -6.623 -6.919 -7.075 -7.247 -7.445 -7.648 -7.891 -8.288 -9.568 -5 ,21422 ,TETRA ,17617714,Tue Nov 30 10:16:21 CET,Tue Nov 30 12:04:29 CET,0.0 1.523 1.882 2.115 2.318 2.503 2.658 2.796 3.024 3.134 3.242 3.363 3.486 3.564 3.725 3.895 4.049 4.114 4.242 4.377 4.565 4.683 4.798 4.95 5.096 5.256 5.413 5.556 5.746 5.915 6.05 6.199 6.341 6.467 6.622 6.828 6.994 7.139 7.328 7.501 7.633 7.787 7.96 8.098 8.246 8.399 8.523 8.574 8.495 8.227 7.541 6.508 5.602 4.81 4.072 3.389 2.803 2.279 1.819 1.35 0.918 0.504 0.137 -0.223 -0.579 -0.869 -1.186 -1.498 -1.749 -2.009 -2.272 -2.47 -2.685 -2.923 -3.127 -3.339 -3.535 -3.726 -3.929 -4.079 -4.235 -4.454 -4.614 -4.791 -4.879 -5.069 -5.28 -5.498 -5.604 -5.759 -5.921 -6.044 -6.196 -6.51 -6.657 -6.816 -6.992 -7.216 -7.508 -7.89 -8.96 -6 ,11972 ,TETRA ,17617715,Tue Nov 30 10:17:30 CET,Tue Nov 30 12:06:23 CET,0.0 1.139 1.471 1.737 1.975 2.165 2.325 2.456 2.683 2.802 2.924 3.1 3.238 3.33 3.522 3.683 3.801 3.865 4.014 4.159 4.339 4.444 4.551 4.718 4.873 5.027 5.174 5.309 5.483 5.625 5.779 5.975 6.138 6.265 6.4 6.556 6.7 6.872 7.043 7.206 7.373 7.543 7.734 7.891 8.034 8.169 8.269 8.28 8.19 7.911 7.275 6.31 5.38 4.579 3.875 3.217 2.617 2.076 1.616 1.139 0.721 0.376 0.051 -0.267 -0.56 -0.83 -1.106 -1.343 -1.566 -1.804 -2.046 -2.256 -2.476 -2.724 -2.922 -3.111 -3.316 -3.528 -3.735 -3.87 -4.011 -4.247 -4.423 -4.618 -4.717 -4.895 -5.076 -5.283 -5.384 -5.533 -5.72 -5.847 -5.973 -6.259 -6.422 -6.588 -6.781 -7.012 -7.296 -7.675 -8.926 -7 ,20100 ,TETRA ,17617716,Tue Nov 30 10:18:27 CET,Tue Nov 30 12:10:26 CET,0.0 1.104 1.452 1.695 1.898 2.065 2.223 2.381 2.661 2.771 2.868 3.013 3.148 3.237 3.404 3.558 3.705 3.78 3.926 4.062 4.248 4.367 4.475 4.617 4.743 4.869 5.01 5.148 5.314 5.461 5.609 5.784 5.933 6.062 6.209 6.378 6.533 6.69 6.835 6.99 7.129 7.262 7.402 7.513 7.638 7.773 7.878 7.917 7.828 7.524 6.851 5.814 4.855 4.005 3.271 2.606 2.018 1.502 1.041 0.574 0.166 -0.19 -0.526 -0.871 -1.196 -1.47 -1.737 -1.984 -2.213 -2.44 -2.693 -2.931 -3.176 -3.407 -3.587 -3.773 -3.966 -4.171 -4.379 -4.529 -4.683 -4.93 -5.11 -5.292 -5.39 -5.6 -5.813 -6.025 -6.134 -6.295 -6.488 -6.61 -6.741 -7.061 -7.245 -7.446 -7.656 -7.884 -8.143 -8.48 -9.641 -8 ,24235 ,TETRA ,17617717,Tue Nov 30 10:18:27 CET,Tue Nov 30 12:08:21 CET,0.0 1.317 1.653 1.871 2.052 2.218 2.391 2.553 2.822 2.935 3.042 3.193 3.325 3.416 3.593 3.757 3.903 3.976 4.123 4.26 4.429 4.534 4.648 4.802 4.95 5.094 5.215 5.328 5.475 5.63 5.8 5.994 6.165 6.315 6.463 6.618 6.762 6.914 7.071 7.247 7.413 7.581 7.773 7.91 8.031 8.157 8.251 8.29 8.255 8.03 7.427 6.477 5.542 4.707 3.966 3.291 2.713 2.207 1.772 1.319 0.918 0.559 0.231 -0.062 -0.35 -0.625 -0.947 -1.257 -1.501 -1.74 -1.978 -2.175 -2.375 -2.597 -2.787 -2.983 -3.199 -3.44 -3.684 -3.832 -3.97 -4.176 -4.325 -4.486 -4.565 -4.746 -4.938 -5.118 -5.217 -5.383 -5.579 -5.712 -5.857 -6.163 -6.321 -6.487 -6.672 -6.901 -7.191 -7.537 -8.517 -9 ,20253 ,TETRA ,17617718,Tue Nov 30 11:01:36 CET,Tue Nov 30 12:34:36 CET,0.0 1.286 1.629 1.889 2.104 2.301 2.486 2.638 2.9 3.044 3.183 3.364 3.507 3.599 3.772 3.923 4.056 4.121 4.236 4.347 4.514 4.633 4.751 4.912 5.062 5.198 5.335 5.459 5.632 5.813 5.951 6.09 6.223 6.375 6.559 6.733 6.891 7.054 7.224 7.386 7.535 7.704 7.888 8.038 8.156 8.25 8.339 8.407 8.384 8.131 7.417 6.372 5.417 4.57 3.842 3.171 2.593 2.08 1.623 1.189 0.805 0.44 0.103 -0.23 -0.547 -0.845 -1.157 -1.42 -1.644 -1.876 -2.135 -2.368 -2.588 -2.814 -3.023 -3.241 -3.445 -3.641 -3.844 -3.987 -4.139 -4.383 -4.556 -4.734 -4.827 -5.025 -5.23 -5.447 -5.56 -5.723 -5.911 -6.044 -6.194 -6.509 -6.669 -6.856 -7.065 -7.303 -7.591 -7.956 -9.159 -10 ,30850 ,TETRA ,17617719,Tue Nov 30 11:01:37 CET,Tue Nov 30 12:55:39 CET,0.0 1.175 1.51 1.782 2.02 2.21 2.372 2.519 2.801 2.933 3.048 3.2 3.331 3.407 3.557 3.721 3.885 3.956 4.086 4.21 4.369 4.462 4.562 4.73 4.905 5.049 5.173 5.311 5.501 5.676 5.824 5.983 6.13 6.282 6.458 6.627 6.77 6.917 7.071 7.225 7.375 7.513 7.673 7.842 7.991 8.091 8.183 8.241 8.192 7.962 7.256 6.154 5.207 4.368 3.647 2.976 2.378 1.841 1.385 0.944 0.558 0.182 -0.199 -0.526 -0.805 -1.075 -1.374 -1.647 -1.89 -2.152 -2.415 -2.616 -2.834 -3.048 -3.199 -3.365 -3.541 -3.731 -3.939 -4.097 -4.264 -4.492 -4.645 -4.812 -4.896 -5.076 -5.263 -5.458 -5.568 -5.74 -5.945 -6.078 -6.21 -6.518 -6.701 -6.888 -7.083 -7.325 -7.603 -7.959 -9.166 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_156.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_156.txt deleted file mode 100644 index d913fa13..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_156.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32545 ,TETRA ,17617720,Tue Nov 30 11:05:38 CET,Tue Nov 30 12:53:08 CET,0.0 0.83 1.169 1.416 1.613 1.787 1.983 2.178 2.499 2.638 2.766 2.965 3.128 3.241 3.442 3.648 3.854 3.948 4.127 4.298 4.536 4.684 4.831 5.047 5.254 5.455 5.646 5.841 6.106 6.37 6.632 6.928 7.2 7.454 7.755 8.107 8.476 8.901 9.303 9.693 10.115 10.604 11.184 11.767 12.412 13.107 13.901 14.814 15.895 17.148 18.636 19.744 20.344 20.692 20.867 20.912 20.88 20.838 20.77 20.667 20.56 20.454 20.353 20.258 20.159 20.063 19.956 19.843 19.71 19.566 19.44 19.319 19.191 19.061 18.94 18.818 18.707 18.582 18.431 18.332 18.233 18.071 17.954 17.825 17.754 17.61 17.468 17.31 17.223 17.098 16.914 16.796 16.671 16.404 16.267 16.117 15.935 15.736 15.479 15.141 13.984 -2 ,9201 ,TETRA ,17617721,Tue Nov 30 11:11:25 CET,Tue Nov 30 12:53:12 CET,0.0 0.892 1.253 1.516 1.746 1.951 2.127 2.288 2.564 2.699 2.825 3.003 3.162 3.276 3.503 3.714 3.903 3.993 4.166 4.325 4.556 4.717 4.872 5.095 5.323 5.529 5.708 5.884 6.121 6.344 6.55 6.789 7.024 7.258 7.529 7.858 8.191 8.536 8.887 9.27 9.694 10.231 10.844 11.385 12.04 12.788 13.611 14.553 15.647 16.869 18.337 19.495 20.089 20.41 20.577 20.633 20.628 20.584 20.516 20.408 20.277 20.158 20.046 19.928 19.804 19.687 19.546 19.409 19.298 19.181 19.026 18.896 18.779 18.636 18.514 18.401 18.292 18.172 18.016 17.898 17.79 17.617 17.496 17.356 17.281 17.136 16.984 16.823 16.739 16.627 16.482 16.371 16.258 16.012 15.855 15.683 15.499 15.279 15.012 14.646 13.234 -3 ,6384 ,TETRA ,17617722,Tue Nov 30 11:12:26 CET,Tue Nov 30 13:02:15 CET,0.0 1.292 1.673 1.968 2.239 2.473 2.684 2.866 3.153 3.286 3.428 3.647 3.811 3.919 4.113 4.295 4.467 4.552 4.728 4.907 5.171 5.336 5.497 5.731 5.943 6.143 6.343 6.538 6.77 6.994 7.214 7.49 7.745 7.993 8.288 8.593 8.888 9.253 9.642 10.012 10.483 11.025 11.572 12.127 12.769 13.507 14.381 15.336 16.39 17.65 19.158 20.286 20.834 21.133 21.301 21.35 21.319 21.26 21.199 21.083 20.975 20.856 20.736 20.612 20.426 20.276 20.133 20.003 19.886 19.75 19.629 19.531 19.419 19.294 19.195 19.074 18.929 18.775 18.629 18.543 18.446 18.274 18.154 18.025 17.961 17.829 17.694 17.541 17.458 17.349 17.197 17.095 16.993 16.761 16.621 16.47 16.301 16.104 15.851 15.519 14.545 -4 ,7751 ,TETRA ,17617723,Tue Nov 30 11:12:27 CET,Tue Nov 30 13:00:03 CET,0.0 1.101 1.446 1.729 1.972 2.181 2.364 2.534 2.844 2.981 3.112 3.312 3.471 3.589 3.805 4.004 4.204 4.303 4.475 4.624 4.844 4.989 5.131 5.342 5.558 5.777 5.974 6.154 6.398 6.638 6.876 7.187 7.507 7.806 8.136 8.507 8.837 9.184 9.564 9.951 10.359 10.828 11.361 11.884 12.503 13.219 14.041 14.98 16.12 17.405 18.883 20.025 20.626 20.933 21.077 21.138 21.163 21.141 21.064 20.961 20.859 20.76 20.651 20.52 20.376 20.255 20.141 20.009 19.85 19.68 19.515 19.385 19.25 19.089 18.956 18.836 18.721 18.592 18.442 18.335 18.225 18.057 17.942 17.809 17.743 17.613 17.465 17.304 17.222 17.11 16.978 16.878 16.757 16.5 16.352 16.189 16.018 15.81 15.538 15.188 13.763 -5 ,13413 ,TETRA ,17617724,Tue Nov 30 11:13:28 CET,Tue Nov 30 12:54:03 CET,0.0 1.351 1.744 2.059 2.312 2.513 2.682 2.83 3.112 3.258 3.397 3.598 3.756 3.868 4.076 4.272 4.473 4.565 4.735 4.9 5.125 5.27 5.417 5.617 5.803 6.008 6.22 6.407 6.628 6.846 7.099 7.431 7.717 7.97 8.286 8.659 9.0 9.351 9.72 10.162 10.631 11.093 11.627 12.164 12.785 13.48 14.3 15.224 16.309 17.565 19.019 20.153 20.698 20.977 21.16 21.214 21.194 21.144 21.056 20.953 20.854 20.755 20.633 20.487 20.36 20.237 20.098 19.989 19.877 19.724 19.565 19.429 19.294 19.163 19.047 18.916 18.781 18.654 18.522 18.425 18.326 18.163 18.045 17.922 17.856 17.717 17.557 17.382 17.286 17.157 17.001 16.906 16.798 16.558 16.419 16.26 16.095 15.897 15.649 15.286 14.045 -6 ,2981 ,TETRA ,17617725,Tue Nov 30 11:15:27 CET,Tue Nov 30 12:54:09 CET,0.0 1.136 1.505 1.718 1.914 2.104 2.28 2.441 2.719 2.85 2.985 3.208 3.369 3.479 3.695 3.904 4.091 4.178 4.358 4.547 4.83 4.999 5.144 5.349 5.551 5.761 5.96 6.128 6.338 6.55 6.753 7.02 7.292 7.528 7.798 8.106 8.393 8.74 9.133 9.538 9.948 10.394 10.922 11.441 12.054 12.759 13.559 14.468 15.534 16.769 18.251 19.39 20.008 20.334 20.494 20.525 20.483 20.421 20.363 20.247 20.118 20.011 19.889 19.749 19.603 19.47 19.35 19.252 19.144 18.993 18.819 18.7 18.568 18.4 18.283 18.189 18.084 17.954 17.794 17.68 17.584 17.437 17.316 17.198 17.14 16.994 16.833 16.65 16.557 16.45 16.3 16.185 16.065 15.816 15.657 15.47 15.285 15.084 14.839 14.549 13.772 -7 ,1908 ,TETRA ,17617726,Tue Nov 30 11:31:30 CET,Tue Nov 30 13:20:56 CET,0.0 1.078 1.492 1.771 2.001 2.208 2.4 2.579 2.906 3.049 3.175 3.365 3.522 3.633 3.836 4.026 4.21 4.301 4.481 4.651 4.873 5.014 5.168 5.397 5.619 5.833 6.037 6.235 6.499 6.761 7.012 7.289 7.541 7.814 8.156 8.548 8.909 9.26 9.606 9.966 10.353 10.814 11.378 11.964 12.643 13.358 14.166 15.087 16.157 17.405 18.902 20.028 20.585 20.888 21.053 21.103 21.046 20.925 20.845 20.786 20.715 20.626 20.461 20.292 20.163 20.034 19.893 19.753 19.624 19.477 19.323 19.216 19.099 18.959 18.857 18.737 18.594 18.459 18.324 18.236 18.144 17.97 17.837 17.694 17.614 17.453 17.293 17.115 17.016 16.883 16.704 16.599 16.49 16.277 16.147 15.997 15.815 15.586 15.312 14.917 13.599 -8 ,20655 ,TETRA ,17617727,Tue Nov 30 11:31:31 CET,Tue Nov 30 13:20:59 CET,0.0 0.976 1.345 1.612 1.808 1.988 2.166 2.342 2.648 2.78 2.909 3.145 3.32 3.441 3.677 3.89 4.084 4.176 4.353 4.529 4.769 4.916 5.057 5.264 5.468 5.669 5.875 6.072 6.333 6.6 6.869 7.186 7.447 7.673 7.934 8.227 8.518 8.847 9.212 9.604 10.05 10.542 11.071 11.611 12.253 12.987 13.805 14.751 15.823 17.031 18.499 19.646 20.245 20.56 20.703 20.774 20.806 20.755 20.659 20.56 20.461 20.375 20.277 20.156 19.984 19.833 19.69 19.535 19.409 19.272 19.125 18.998 18.868 18.716 18.584 18.469 18.356 18.218 18.064 17.95 17.828 17.647 17.522 17.39 17.325 17.189 17.013 16.832 16.755 16.645 16.49 16.384 16.272 16.018 15.866 15.697 15.519 15.298 15.016 14.679 13.735 -9 ,26681 ,TETRA ,17617728,Tue Nov 30 11:32:26 CET,Tue Nov 30 13:20:10 CET,0.0 1.257 1.671 1.935 2.151 2.34 2.517 2.7 3.005 3.145 3.276 3.482 3.652 3.772 4.005 4.219 4.422 4.521 4.694 4.856 5.11 5.279 5.44 5.675 5.901 6.103 6.296 6.485 6.716 6.978 7.237 7.512 7.784 8.037 8.317 8.643 8.962 9.325 9.71 10.099 10.515 10.983 11.527 12.08 12.694 13.381 14.192 15.079 16.144 17.409 18.885 20.079 20.695 20.998 21.162 21.254 21.273 21.212 21.132 21.074 20.97 20.849 20.717 20.578 20.462 20.312 20.115 19.958 19.828 19.706 19.602 19.513 19.406 19.278 19.17 19.065 18.956 18.811 18.661 18.554 18.431 18.26 18.152 18.038 17.967 17.805 17.642 17.484 17.394 17.27 17.102 16.996 16.888 16.647 16.504 16.34 16.16 15.926 15.648 15.308 14.402 -10 ,3639 ,TETRA ,17617729,Tue Nov 30 11:32:26 CET,Tue Nov 30 13:14:31 CET,0.0 1.068 1.429 1.694 1.916 2.12 2.301 2.457 2.728 2.862 2.994 3.178 3.328 3.434 3.638 3.826 4.022 4.119 4.305 4.49 4.737 4.891 5.047 5.258 5.466 5.672 5.875 6.072 6.305 6.527 6.763 7.067 7.345 7.596 7.875 8.191 8.497 8.863 9.309 9.79 10.301 10.833 11.388 11.932 12.55 13.239 14.059 14.984 16.053 17.304 18.777 19.921 20.501 20.768 20.916 20.969 20.916 20.86 20.811 20.732 20.634 20.523 20.403 20.287 20.167 20.057 19.896 19.719 19.584 19.458 19.342 19.228 19.092 18.965 18.85 18.714 18.587 18.474 18.353 18.259 18.162 17.979 17.847 17.724 17.659 17.514 17.358 17.191 17.103 16.974 16.784 16.661 16.536 16.285 16.144 15.991 15.824 15.645 15.42 15.09 14.263 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_23.txt deleted file mode 100644 index cde2f915..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4426 ,TETRA ,17617730,Tue Nov 30 11:32:28 CET,Tue Nov 30 13:12:06 CET,0.0 1.381 1.719 1.995 2.223 2.406 2.587 2.748 3.008 3.123 3.234 3.424 3.58 3.679 3.865 4.035 4.202 4.285 4.441 4.581 4.762 4.882 5.014 5.209 5.404 5.591 5.761 5.916 6.099 6.275 6.452 6.641 6.8 6.952 7.138 7.346 7.525 7.719 7.956 8.208 8.437 8.668 8.909 9.112 9.318 9.535 9.735 9.854 9.834 9.71 9.109 7.974 6.932 5.978 5.101 4.239 3.462 2.804 2.232 1.655 1.161 0.749 0.366 -0.014 -0.376 -0.699 -1.058 -1.412 -1.715 -2.019 -2.344 -2.629 -2.904 -3.149 -3.344 -3.577 -3.815 -4.056 -4.303 -4.46 -4.624 -4.903 -5.094 -5.279 -5.37 -5.57 -5.822 -6.09 -6.225 -6.416 -6.62 -6.765 -6.929 -7.29 -7.489 -7.696 -7.931 -8.17 -8.454 -8.922 -10.492 -2 ,16238 ,TETRA ,17617731,Tue Nov 30 11:33:20 CET,Tue Nov 30 13:21:49 CET,0.0 1.257 1.631 1.881 2.103 2.311 2.499 2.677 2.967 3.097 3.221 3.383 3.527 3.628 3.817 3.99 4.155 4.233 4.385 4.532 4.741 4.878 5.02 5.224 5.412 5.592 5.746 5.879 6.068 6.24 6.392 6.562 6.708 6.86 7.059 7.315 7.549 7.748 7.926 8.1 8.29 8.513 8.765 8.999 9.232 9.45 9.669 9.81 9.856 9.676 8.939 7.83 6.837 5.914 5.087 4.292 3.577 2.946 2.359 1.796 1.345 0.926 0.479 0.046 -0.332 -0.671 -0.996 -1.294 -1.58 -1.895 -2.205 -2.443 -2.695 -2.961 -3.165 -3.372 -3.586 -3.799 -4.01 -4.162 -4.327 -4.592 -4.775 -4.968 -5.066 -5.26 -5.47 -5.708 -5.844 -6.043 -6.287 -6.442 -6.594 -6.912 -7.091 -7.31 -7.544 -7.817 -8.146 -8.555 -10.494 -3 ,17489 ,TETRA ,17617732,Tue Nov 30 11:33:22 CET,Tue Nov 30 13:21:50 CET,0.0 1.01 1.345 1.61 1.832 2.018 2.185 2.333 2.571 2.685 2.798 2.968 3.117 3.223 3.421 3.614 3.813 3.902 4.069 4.224 4.426 4.552 4.665 4.822 4.979 5.122 5.296 5.472 5.67 5.851 6.001 6.183 6.389 6.605 6.824 7.064 7.341 7.603 7.805 8.004 8.197 8.405 8.623 8.818 8.987 9.133 9.306 9.438 9.492 9.358 8.706 7.537 6.427 5.419 4.541 3.796 3.111 2.44 1.876 1.343 0.881 0.456 0.055 -0.335 -0.701 -1.042 -1.426 -1.781 -2.076 -2.371 -2.68 -2.934 -3.191 -3.475 -3.699 -3.912 -4.124 -4.355 -4.623 -4.802 -4.986 -5.285 -5.49 -5.711 -5.821 -6.041 -6.277 -6.538 -6.673 -6.858 -7.075 -7.221 -7.371 -7.697 -7.891 -8.105 -8.324 -8.554 -8.837 -9.26 -10.92 -4 ,8 ,TETRA ,17617733,Tue Nov 30 11:33:19 CET,Tue Nov 30 13:21:26 CET,0.0 1.004 1.376 1.638 1.868 2.064 2.252 2.426 2.698 2.82 2.949 3.151 3.3 3.397 3.596 3.792 3.966 4.047 4.203 4.349 4.566 4.697 4.806 4.956 5.112 5.279 5.426 5.553 5.724 5.89 6.048 6.236 6.427 6.613 6.811 7.001 7.17 7.368 7.56 7.749 7.942 8.164 8.426 8.631 8.816 9.01 9.16 9.228 9.235 9.018 8.282 7.122 6.035 5.062 4.137 3.255 2.501 1.837 1.28 0.731 0.272 -0.144 -0.549 -0.934 -1.308 -1.639 -1.984 -2.288 -2.55 -2.839 -3.14 -3.392 -3.644 -3.888 -4.098 -4.332 -4.576 -4.831 -5.077 -5.225 -5.381 -5.656 -5.863 -6.062 -6.151 -6.359 -6.609 -6.868 -7.005 -7.202 -7.427 -7.569 -7.722 -8.054 -8.219 -8.418 -8.669 -8.934 -9.228 -9.658 -11.152 -5 ,6751 ,TETRA ,17617734,Tue Nov 30 11:34:22 CET,Tue Nov 30 13:22:55 CET,0.0 1.154 1.514 1.807 2.072 2.283 2.447 2.594 2.868 2.994 3.114 3.296 3.45 3.556 3.761 3.949 4.106 4.179 4.333 4.477 4.673 4.797 4.913 5.07 5.219 5.367 5.511 5.643 5.795 5.939 6.078 6.249 6.411 6.57 6.778 7.004 7.182 7.379 7.579 7.788 8.003 8.216 8.431 8.612 8.829 9.027 9.171 9.282 9.297 9.125 8.534 7.412 6.298 5.258 4.29 3.44 2.737 2.079 1.516 0.967 0.488 0.046 -0.385 -0.757 -1.108 -1.447 -1.772 -2.079 -2.351 -2.616 -2.896 -3.129 -3.37 -3.632 -3.847 -4.069 -4.285 -4.514 -4.776 -4.962 -5.148 -5.425 -5.614 -5.815 -5.921 -6.151 -6.395 -6.633 -6.758 -6.95 -7.187 -7.345 -7.504 -7.837 -8.022 -8.216 -8.417 -8.649 -8.964 -9.434 -10.568 -6 ,6826 ,TETRA ,17617735,Tue Nov 30 11:34:24 CET,Tue Nov 30 13:23:36 CET,0.0 1.103 1.467 1.74 1.971 2.166 2.327 2.492 2.789 2.91 3.037 3.237 3.388 3.493 3.697 3.883 4.041 4.114 4.251 4.381 4.572 4.69 4.8 4.961 5.132 5.291 5.426 5.552 5.724 5.895 6.043 6.202 6.367 6.561 6.785 6.989 7.15 7.329 7.572 7.793 7.958 8.161 8.371 8.577 8.816 9.0 9.137 9.236 9.283 9.141 8.481 7.336 6.23 5.185 4.277 3.492 2.759 2.09 1.54 0.971 0.484 0.033 -0.406 -0.788 -1.142 -1.458 -1.785 -2.078 -2.324 -2.585 -2.876 -3.137 -3.403 -3.669 -3.881 -4.092 -4.301 -4.527 -4.753 -4.906 -5.062 -5.301 -5.473 -5.655 -5.75 -5.951 -6.162 -6.386 -6.511 -6.697 -6.932 -7.087 -7.237 -7.587 -7.783 -7.974 -8.182 -8.442 -8.802 -9.279 -10.758 -7 ,24932 ,TETRA ,17617736,Tue Nov 30 11:34:26 CET,Tue Nov 30 13:12:17 CET,0.0 1.172 1.513 1.755 1.987 2.173 2.352 2.515 2.797 2.92 3.045 3.246 3.4 3.512 3.7 3.865 4.038 4.122 4.294 4.459 4.665 4.79 4.912 5.096 5.273 5.443 5.604 5.764 5.978 6.174 6.362 6.572 6.762 6.949 7.156 7.355 7.528 7.695 7.885 8.105 8.319 8.564 8.842 9.106 9.358 9.563 9.734 9.787 9.746 9.561 8.871 7.68 6.648 5.747 4.893 4.1 3.419 2.78 2.211 1.678 1.227 0.802 0.401 0.015 -0.343 -0.675 -1.051 -1.366 -1.618 -1.891 -2.209 -2.504 -2.782 -3.038 -3.241 -3.463 -3.69 -3.922 -4.164 -4.327 -4.488 -4.737 -4.914 -5.107 -5.216 -5.443 -5.683 -5.947 -6.085 -6.278 -6.5 -6.654 -6.819 -7.188 -7.393 -7.603 -7.832 -8.094 -8.418 -8.846 -10.363 -8 ,12887 ,TETRA ,17617737,Tue Nov 30 11:35:25 CET,Tue Nov 30 13:23:32 CET,0.0 1.492 1.838 2.158 2.386 2.555 2.704 2.844 3.109 3.241 3.366 3.545 3.699 3.803 3.986 4.157 4.325 4.407 4.555 4.692 4.882 5.018 5.162 5.338 5.501 5.668 5.839 5.992 6.15 6.318 6.491 6.684 6.847 7.021 7.241 7.469 7.688 7.913 8.136 8.371 8.574 8.78 9.021 9.234 9.425 9.589 9.747 9.85 9.854 9.679 9.04 7.899 6.86 5.919 5.079 4.282 3.507 2.839 2.264 1.705 1.243 0.811 0.4 0.023 -0.323 -0.648 -0.998 -1.325 -1.598 -1.871 -2.161 -2.398 -2.642 -2.893 -3.11 -3.335 -3.559 -3.813 -4.098 -4.275 -4.436 -4.701 -4.893 -5.105 -5.211 -5.419 -5.652 -5.893 -6.01 -6.19 -6.405 -6.548 -6.693 -7.021 -7.205 -7.419 -7.664 -7.935 -8.288 -8.772 -10.652 -9 ,15119 ,TETRA ,17617738,Tue Nov 30 11:35:27 CET,Tue Nov 30 13:07:38 CET,0.0 1.231 1.621 1.873 2.068 2.264 2.438 2.593 2.865 2.981 3.087 3.251 3.402 3.499 3.681 3.866 4.032 4.109 4.263 4.416 4.619 4.748 4.886 5.063 5.219 5.37 5.512 5.659 5.855 6.024 6.171 6.34 6.495 6.656 6.839 7.033 7.211 7.383 7.586 7.808 7.995 8.166 8.38 8.611 8.844 9.051 9.203 9.303 9.363 9.202 8.481 7.329 6.317 5.413 4.56 3.754 3.049 2.414 1.853 1.292 0.794 0.364 -0.06 -0.468 -0.82 -1.135 -1.456 -1.747 -1.99 -2.271 -2.609 -2.892 -3.164 -3.417 -3.614 -3.816 -4.034 -4.26 -4.492 -4.676 -4.863 -5.127 -5.315 -5.507 -5.604 -5.814 -6.047 -6.29 -6.422 -6.609 -6.795 -6.932 -7.099 -7.473 -7.673 -7.89 -8.121 -8.399 -8.77 -9.268 -11.154 -10 ,14700 ,TETRA ,17617739,Tue Nov 30 11:35:27 CET,Tue Nov 30 13:25:18 CET,0.0 1.16 1.577 1.881 2.113 2.311 2.495 2.661 2.934 3.055 3.159 3.304 3.447 3.547 3.738 3.905 4.07 4.157 4.319 4.476 4.717 4.853 4.96 5.111 5.251 5.393 5.537 5.681 5.856 6.009 6.153 6.314 6.466 6.626 6.83 7.044 7.215 7.43 7.662 7.879 8.107 8.325 8.537 8.719 8.93 9.167 9.358 9.44 9.454 9.324 8.757 7.76 6.721 5.726 4.9 4.128 3.432 2.846 2.32 1.767 1.3 0.868 0.443 0.055 -0.299 -0.635 -0.982 -1.288 -1.552 -1.817 -2.102 -2.355 -2.644 -2.95 -3.165 -3.379 -3.6 -3.829 -4.078 -4.248 -4.436 -4.728 -4.915 -5.118 -5.22 -5.419 -5.627 -5.867 -5.998 -6.18 -6.408 -6.553 -6.714 -7.076 -7.255 -7.433 -7.651 -7.908 -8.227 -8.669 -10.072 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_30.txt deleted file mode 100644 index 78fe4bbf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8940 ,TETRA ,17617740,Tue Nov 30 11:36:20 CET,Tue Nov 30 13:06:25 CET,0.0 0.676 0.961 1.178 1.368 1.54 1.698 1.838 2.095 2.217 2.324 2.477 2.613 2.695 2.832 2.966 3.093 3.15 3.257 3.353 3.497 3.598 3.691 3.824 3.949 4.059 4.158 4.259 4.395 4.516 4.632 4.756 4.87 4.991 5.131 5.28 5.401 5.519 5.643 5.768 5.887 6.002 6.117 6.216 6.31 6.336 6.305 6.183 5.855 5.162 3.718 1.694 -0.023 -1.476 -2.757 -3.914 -4.895 -5.782 -6.553 -7.271 -7.858 -8.387 -8.909 -9.394 -9.836 -10.231 -10.641 -11.014 -11.329 -11.651 -11.99 -12.257 -12.539 -12.834 -13.047 -13.274 -13.521 -13.78 -14.046 -14.233 -14.417 -14.696 -14.899 -15.103 -15.209 -15.441 -15.676 -15.917 -16.04 -16.228 -16.459 -16.612 -16.767 -17.123 -17.313 -17.494 -17.692 -17.939 -18.228 -18.605 -19.912 -2 ,32206 ,TETRA ,17617741,Tue Nov 30 11:36:21 CET,Tue Nov 30 13:23:44 CET,0.0 1.21 1.53 1.748 1.931 2.088 2.238 2.375 2.592 2.692 2.788 2.913 3.041 3.125 3.274 3.419 3.568 3.636 3.759 3.879 4.042 4.14 4.23 4.361 4.492 4.611 4.726 4.846 4.998 5.128 5.249 5.393 5.523 5.642 5.77 5.9 6.017 6.139 6.265 6.38 6.492 6.588 6.682 6.773 6.849 6.917 6.879 6.655 6.221 5.382 3.888 2.012 0.27 -1.204 -2.419 -3.507 -4.488 -5.34 -6.054 -6.786 -7.403 -7.942 -8.452 -8.938 -9.392 -9.783 -10.178 -10.554 -10.886 -11.215 -11.549 -11.831 -12.12 -12.422 -12.652 -12.879 -13.112 -13.354 -13.608 -13.786 -13.97 -14.259 -14.462 -14.662 -14.763 -14.97 -15.19 -15.417 -15.533 -15.721 -15.944 -16.095 -16.256 -16.595 -16.775 -16.983 -17.215 -17.479 -17.799 -18.187 -19.355 -3 ,17156 ,TETRA ,17617742,Tue Nov 30 11:36:21 CET,Tue Nov 30 13:28:04 CET,0.0 0.842 1.168 1.4 1.579 1.715 1.841 1.969 2.199 2.304 2.405 2.545 2.676 2.758 2.916 3.07 3.216 3.28 3.396 3.509 3.665 3.764 3.861 3.998 4.123 4.241 4.357 4.47 4.612 4.752 4.881 5.018 5.133 5.239 5.365 5.509 5.632 5.763 5.899 6.007 6.111 6.225 6.347 6.441 6.501 6.522 6.459 6.237 5.857 5.248 3.815 1.775 0.162 -1.241 -2.508 -3.602 -4.515 -5.347 -6.074 -6.805 -7.45 -8.018 -8.541 -9.018 -9.452 -9.853 -10.271 -10.633 -10.944 -11.276 -11.616 -11.9 -12.195 -12.485 -12.722 -12.964 -13.204 -13.46 -13.713 -13.88 -14.055 -14.338 -14.54 -14.753 -14.86 -15.059 -15.274 -15.522 -15.653 -15.852 -16.083 -16.226 -16.373 -16.699 -16.877 -17.088 -17.321 -17.571 -17.874 -18.335 -19.892 -4 ,18185 ,TETRA ,17617743,Tue Nov 30 11:36:21 CET,Tue Nov 30 13:23:13 CET,0.0 1.051 1.314 1.527 1.724 1.89 2.029 2.167 2.436 2.56 2.662 2.784 2.915 2.995 3.129 3.266 3.4 3.465 3.592 3.713 3.88 3.991 4.096 4.232 4.348 4.461 4.573 4.668 4.782 4.901 5.022 5.16 5.286 5.403 5.525 5.65 5.773 5.916 6.057 6.186 6.314 6.43 6.531 6.6 6.627 6.617 6.566 6.449 6.199 5.57 4.087 2.089 0.451 -0.998 -2.298 -3.448 -4.437 -5.32 -6.071 -6.797 -7.417 -7.961 -8.47 -8.967 -9.42 -9.803 -10.193 -10.556 -10.878 -11.211 -11.543 -11.806 -12.094 -12.404 -12.639 -12.869 -13.103 -13.361 -13.629 -13.806 -13.979 -14.257 -14.475 -14.704 -14.818 -15.058 -15.305 -15.561 -15.695 -15.893 -16.116 -16.261 -16.407 -16.744 -16.939 -17.137 -17.366 -17.615 -17.918 -18.356 -19.62 -5 ,24805 ,TETRA ,17617744,Tue Nov 30 11:36:22 CET,Tue Nov 30 13:16:39 CET,0.0 0.674 0.967 1.195 1.409 1.581 1.721 1.854 2.078 2.171 2.259 2.379 2.498 2.58 2.727 2.846 2.974 3.038 3.161 3.279 3.442 3.556 3.662 3.802 3.926 4.037 4.137 4.235 4.361 4.466 4.565 4.693 4.818 4.928 5.049 5.19 5.299 5.408 5.544 5.687 5.829 5.964 6.088 6.168 6.235 6.288 6.228 6.045 5.765 5.058 3.474 1.521 -0.146 -1.59 -2.836 -3.95 -4.905 -5.741 -6.478 -7.234 -7.858 -8.374 -8.865 -9.346 -9.786 -10.179 -10.596 -10.996 -11.329 -11.649 -11.987 -12.265 -12.54 -12.824 -13.048 -13.279 -13.52 -13.763 -14.015 -14.198 -14.382 -14.664 -14.865 -15.088 -15.2 -15.409 -15.623 -15.88 -16.014 -16.202 -16.412 -16.559 -16.719 -17.05 -17.229 -17.432 -17.675 -17.944 -18.278 -18.705 -20.425 -6 ,27493 ,TETRA ,17617745,Tue Nov 30 11:36:23 CET,Tue Nov 30 13:12:19 CET,0.0 0.858 1.172 1.425 1.649 1.826 1.965 2.084 2.319 2.43 2.529 2.662 2.791 2.875 3.035 3.183 3.315 3.381 3.513 3.641 3.814 3.907 3.998 4.132 4.262 4.389 4.5 4.592 4.712 4.834 4.946 5.073 5.195 5.307 5.439 5.581 5.705 5.833 5.961 6.089 6.216 6.352 6.488 6.607 6.7 6.705 6.62 6.429 6.046 5.234 3.631 1.698 0.116 -1.358 -2.695 -3.834 -4.841 -5.719 -6.474 -7.229 -7.84 -8.389 -8.918 -9.42 -9.879 -10.28 -10.697 -11.064 -11.373 -11.697 -12.035 -12.311 -12.595 -12.893 -13.122 -13.359 -13.606 -13.856 -14.107 -14.284 -14.475 -14.761 -14.964 -15.178 -15.282 -15.499 -15.733 -15.991 -16.121 -16.311 -16.534 -16.685 -16.84 -17.191 -17.395 -17.603 -17.825 -18.081 -18.363 -18.761 -19.994 -7 ,13748 ,TETRA ,17617746,Tue Nov 30 11:36:22 CET,Tue Nov 30 13:06:48 CET,0.0 0.974 1.297 1.529 1.72 1.881 2.022 2.138 2.38 2.494 2.593 2.725 2.846 2.917 3.063 3.199 3.322 3.378 3.496 3.618 3.776 3.872 3.968 4.117 4.265 4.393 4.496 4.597 4.736 4.866 4.979 5.115 5.249 5.375 5.514 5.655 5.799 5.946 6.075 6.198 6.323 6.454 6.566 6.647 6.701 6.724 6.699 6.536 6.147 5.376 3.747 1.579 -0.153 -1.566 -2.811 -3.952 -4.945 -5.829 -6.567 -7.294 -7.918 -8.463 -8.981 -9.47 -9.925 -10.333 -10.768 -11.15 -11.464 -11.781 -12.116 -12.388 -12.658 -12.931 -13.146 -13.382 -13.621 -13.867 -14.122 -14.299 -14.483 -14.762 -14.958 -15.152 -15.249 -15.466 -15.708 -15.963 -16.093 -16.286 -16.512 -16.667 -16.821 -17.162 -17.351 -17.551 -17.773 -18.031 -18.346 -18.776 -20.213 -8 ,13528 ,TETRA ,17617747,Tue Nov 30 11:37:19 CET,Tue Nov 30 13:23:31 CET,0.0 0.955 1.296 1.538 1.729 1.895 2.047 2.186 2.431 2.54 2.635 2.772 2.899 2.977 3.13 3.263 3.383 3.445 3.574 3.689 3.848 3.955 4.056 4.194 4.315 4.431 4.539 4.636 4.759 4.876 4.975 5.103 5.238 5.358 5.48 5.608 5.717 5.82 5.942 6.051 6.142 6.237 6.348 6.461 6.553 6.603 6.571 6.432 6.125 5.429 3.98 2.032 0.322 -1.098 -2.346 -3.517 -4.513 -5.398 -6.153 -6.85 -7.447 -7.999 -8.522 -9.008 -9.44 -9.826 -10.247 -10.626 -10.941 -11.256 -11.567 -11.836 -12.12 -12.405 -12.625 -12.857 -13.103 -13.364 -13.635 -13.819 -14.004 -14.285 -14.488 -14.697 -14.807 -15.047 -15.275 -15.49 -15.605 -15.79 -16.002 -16.152 -16.309 -16.614 -16.783 -16.991 -17.226 -17.49 -17.803 -18.203 -19.133 -9 ,5890 ,TETRA ,17617748,Tue Nov 30 11:37:21 CET,Tue Nov 30 13:07:27 CET,0.0 0.866 1.185 1.422 1.614 1.761 1.89 2.019 2.246 2.346 2.44 2.574 2.704 2.783 2.927 3.06 3.195 3.258 3.374 3.483 3.63 3.723 3.82 3.964 4.099 4.22 4.319 4.407 4.543 4.678 4.785 4.908 5.031 5.154 5.285 5.41 5.531 5.666 5.795 5.931 6.068 6.172 6.254 6.319 6.371 6.373 6.296 6.154 5.844 5.183 3.909 2.021 0.256 -1.169 -2.375 -3.538 -4.56 -5.445 -6.189 -6.925 -7.556 -8.096 -8.598 -9.082 -9.524 -9.936 -10.373 -10.74 -11.039 -11.358 -11.692 -11.956 -12.245 -12.547 -12.779 -13.018 -13.256 -13.506 -13.773 -13.955 -14.136 -14.409 -14.6 -14.801 -14.907 -15.119 -15.336 -15.576 -15.697 -15.882 -16.095 -16.241 -16.401 -16.752 -16.949 -17.17 -17.401 -17.657 -17.977 -18.396 -19.786 -10 ,21911 ,TETRA ,17617749,Tue Nov 30 11:37:21 CET,Tue Nov 30 13:24:12 CET,0.0 0.974 1.303 1.53 1.714 1.864 2.004 2.141 2.38 2.488 2.586 2.709 2.831 2.908 3.062 3.21 3.347 3.407 3.521 3.631 3.771 3.861 3.95 4.081 4.218 4.35 4.476 4.587 4.716 4.843 4.966 5.098 5.218 5.333 5.47 5.606 5.715 5.837 5.968 6.103 6.238 6.357 6.453 6.51 6.539 6.558 6.539 6.346 5.888 5.157 3.622 1.545 -0.152 -1.601 -2.857 -3.942 -4.88 -5.73 -6.462 -7.168 -7.79 -8.36 -8.886 -9.361 -9.794 -10.2 -10.608 -10.965 -11.27 -11.578 -11.896 -12.165 -12.445 -12.733 -12.962 -13.197 -13.43 -13.666 -13.912 -14.084 -14.263 -14.56 -14.774 -14.988 -15.099 -15.338 -15.577 -15.81 -15.929 -16.113 -16.327 -16.474 -16.619 -16.936 -17.118 -17.321 -17.549 -17.814 -18.103 -18.422 -19.598 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_42.txt deleted file mode 100644 index 1dd27569..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7676 ,KEBNE ,17076753,Sat Dec 25 03:46:55 CET,Sat Dec 25 05:20:55 CET,0.0 0.859 1.245 1.533 1.782 2.023 2.258 2.449 2.78 2.945 3.099 3.325 3.489 3.613 3.851 4.069 4.28 4.385 4.586 4.761 5.021 5.193 5.354 5.591 5.81 6.018 6.219 6.416 6.669 6.902 7.124 7.386 7.637 7.871 8.155 8.469 8.754 9.086 9.444 9.823 10.243 10.69 11.16 11.611 12.168 12.77 13.388 14.103 14.927 15.761 16.607 17.091 17.169 17.077 16.88 16.627 16.394 16.167 15.948 15.721 15.502 15.3 15.118 14.931 14.74 14.544 14.323 14.129 13.963 13.782 13.582 13.424 13.261 13.073 12.922 12.766 12.594 12.424 12.252 12.129 11.994 11.778 11.639 11.498 11.428 11.279 11.116 10.923 10.815 10.663 10.48 10.364 10.229 9.942 9.788 9.609 9.4 9.146 8.834 8.427 7.209 -2 ,5831 ,KEBNE ,17076754,Sat Dec 25 04:24:41 CET,Sat Dec 25 05:56:14 CET,0.0 1.096 1.514 1.831 2.102 2.321 2.54 2.746 3.088 3.246 3.399 3.634 3.801 3.922 4.164 4.388 4.59 4.687 4.88 5.067 5.332 5.504 5.673 5.917 6.164 6.388 6.598 6.808 7.054 7.286 7.527 7.832 8.136 8.419 8.728 9.058 9.348 9.67 10.008 10.339 10.729 11.183 11.679 12.174 12.761 13.412 14.099 14.795 15.553 16.428 17.344 17.791 17.827 17.745 17.595 17.371 17.123 16.869 16.632 16.354 16.116 15.902 15.665 15.447 15.258 15.084 14.893 14.687 14.479 14.283 14.101 13.938 13.754 13.548 13.379 13.226 13.078 12.899 12.704 12.583 12.458 12.236 12.086 11.936 11.858 11.71 11.552 11.38 11.28 11.134 10.959 10.837 10.718 10.479 10.317 10.13 9.918 9.675 9.379 9.004 7.926 -3 ,27074 ,KEBNE ,17076755,Sat Dec 25 04:26:46 CET,Sat Dec 25 05:57:58 CET,0.0 1.109 1.515 1.826 2.106 2.335 2.534 2.733 3.094 3.261 3.415 3.645 3.808 3.92 4.159 4.399 4.614 4.717 4.917 5.112 5.386 5.555 5.726 5.984 6.228 6.461 6.668 6.855 7.113 7.373 7.635 7.94 8.203 8.464 8.786 9.157 9.52 9.896 10.256 10.627 10.997 11.395 11.859 12.329 12.88 13.469 14.099 14.777 15.533 16.328 17.116 17.512 17.565 17.469 17.296 17.063 16.823 16.6 16.379 16.12 15.904 15.704 15.486 15.281 15.096 14.92 14.69 14.488 14.322 14.138 13.928 13.749 13.589 13.417 13.281 13.145 13.0 12.824 12.642 12.527 12.399 12.198 12.065 11.923 11.843 11.677 11.496 11.301 11.194 11.047 10.844 10.711 10.576 10.256 10.074 9.899 9.727 9.537 9.311 8.974 7.934 -4 ,23078 ,KEBNE ,17076756,Sat Dec 25 04:27:48 CET,Sat Dec 25 06:00:47 CET,0.0 1.22 1.631 1.941 2.2 2.434 2.647 2.844 3.22 3.399 3.57 3.818 3.984 4.11 4.348 4.548 4.736 4.833 5.033 5.218 5.472 5.65 5.819 6.064 6.305 6.516 6.72 6.921 7.161 7.394 7.643 7.935 8.186 8.429 8.728 9.071 9.429 9.813 10.162 10.512 10.883 11.306 11.784 12.258 12.853 13.508 14.2 14.908 15.624 16.426 17.285 17.712 17.767 17.639 17.472 17.295 17.065 16.789 16.543 16.303 16.019 15.756 15.507 15.261 15.056 14.874 14.685 14.502 14.333 14.145 13.923 13.743 13.592 13.439 13.309 13.174 13.023 12.86 12.676 12.547 12.421 12.216 12.056 11.876 11.789 11.627 11.456 11.271 11.178 11.045 10.875 10.756 10.626 10.356 10.207 10.014 9.79 9.562 9.276 8.823 7.473 -5 ,5264 ,KEBNE ,17076757,Sat Dec 25 04:29:53 CET,Sat Dec 25 06:02:52 CET,0.0 1.053 1.487 1.804 2.074 2.28 2.481 2.672 2.989 3.138 3.286 3.533 3.709 3.834 4.064 4.286 4.509 4.609 4.798 4.98 5.256 5.439 5.612 5.855 6.082 6.288 6.484 6.699 6.962 7.193 7.434 7.739 8.039 8.335 8.648 8.996 9.346 9.718 10.128 10.523 10.904 11.336 11.821 12.308 12.834 13.418 14.095 14.786 15.573 16.457 17.31 17.66 17.69 17.602 17.417 17.226 17.041 16.827 16.596 16.332 16.088 15.871 15.647 15.437 15.262 15.079 14.868 14.667 14.483 14.305 14.132 13.992 13.848 13.673 13.522 13.354 13.159 12.98 12.822 12.713 12.597 12.402 12.261 12.115 12.039 11.874 11.681 11.484 11.379 11.225 11.039 10.922 10.799 10.543 10.39 10.212 10.015 9.788 9.511 9.128 8.058 -6 ,15595 ,KEBNE ,17076758,Sat Dec 25 04:33:02 CET,Sat Dec 25 06:04:21 CET,0.0 0.867 1.261 1.555 1.789 1.982 2.188 2.388 2.732 2.885 3.024 3.263 3.441 3.567 3.795 4.002 4.203 4.306 4.503 4.709 5.009 5.192 5.374 5.621 5.836 6.037 6.233 6.433 6.691 6.963 7.231 7.54 7.836 8.093 8.384 8.726 9.052 9.392 9.744 10.109 10.483 10.905 11.42 11.911 12.426 12.965 13.623 14.387 15.216 16.069 16.844 17.285 17.373 17.278 17.138 16.946 16.648 16.343 16.124 15.895 15.652 15.419 15.209 14.996 14.789 14.612 14.413 14.228 14.068 13.905 13.743 13.584 13.407 13.23 13.097 12.96 12.805 12.635 12.449 12.312 12.178 11.992 11.851 11.685 11.599 11.433 11.256 11.043 10.929 10.78 10.591 10.474 10.349 10.087 9.932 9.755 9.566 9.346 9.064 8.68 7.537 -7 ,13134 ,KEBNE ,17076759,Sat Dec 25 04:33:02 CET,Sat Dec 25 06:04:19 CET,0.0 1.568 2.012 2.322 2.594 2.82 3.018 3.2 3.499 3.637 3.788 4.041 4.216 4.343 4.582 4.805 5.016 5.123 5.329 5.52 5.801 5.967 6.12 6.352 6.58 6.806 7.025 7.226 7.491 7.753 7.995 8.283 8.565 8.843 9.171 9.547 9.893 10.249 10.637 11.008 11.396 11.864 12.359 12.84 13.399 13.999 14.642 15.349 16.161 16.979 17.804 18.311 18.418 18.344 18.168 17.926 17.655 17.4 17.175 16.925 16.701 16.476 16.26 16.069 15.88 15.69 15.494 15.331 15.187 15.025 14.853 14.707 14.556 14.385 14.228 14.057 13.888 13.726 13.562 13.445 13.318 13.114 12.977 12.835 12.756 12.575 12.377 12.18 12.074 11.929 11.748 11.632 11.506 11.218 11.072 10.91 10.7 10.447 10.117 9.666 8.518 -8 ,10946 ,KEBNE ,17076760,Sat Dec 25 04:41:23 CET,Sat Dec 25 06:12:33 CET,0.0 1.102 1.587 1.922 2.167 2.396 2.61 2.807 3.157 3.318 3.463 3.699 3.884 4.016 4.277 4.518 4.738 4.845 5.049 5.242 5.507 5.689 5.869 6.122 6.361 6.576 6.791 6.992 7.251 7.507 7.746 8.019 8.281 8.556 8.866 9.215 9.575 9.946 10.298 10.645 11.031 11.464 11.936 12.412 12.964 13.549 14.21 14.939 15.742 16.607 17.438 17.861 17.956 17.865 17.648 17.438 17.231 16.978 16.76 16.539 16.329 16.109 15.882 15.678 15.488 15.322 15.138 14.966 14.816 14.633 14.422 14.257 14.092 13.916 13.764 13.603 13.439 13.27 13.101 12.986 12.859 12.639 12.479 12.312 12.234 12.07 11.877 11.674 11.574 11.444 11.27 11.155 11.035 10.73 10.573 10.406 10.21 9.993 9.734 9.379 8.321 -9 ,24553 ,KEBNE ,17076761,Sat Dec 25 04:41:24 CET,Sat Dec 25 06:12:59 CET,0.0 1.3 1.724 2.08 2.371 2.595 2.788 2.969 3.305 3.468 3.622 3.858 4.034 4.164 4.419 4.652 4.863 4.965 5.159 5.343 5.615 5.785 5.955 6.206 6.456 6.69 6.894 7.1 7.365 7.602 7.832 8.1 8.356 8.621 8.944 9.278 9.584 9.93 10.293 10.664 11.047 11.481 11.968 12.454 13.015 13.577 14.247 15.0 15.743 16.543 17.346 17.784 17.846 17.71 17.53 17.342 17.119 16.87 16.618 16.334 16.098 15.886 15.679 15.462 15.245 15.052 14.844 14.659 14.492 14.317 14.14 13.995 13.824 13.608 13.455 13.308 13.151 13.004 12.843 12.731 12.622 12.438 12.303 12.165 12.087 11.903 11.713 11.528 11.437 11.303 11.122 11.002 10.878 10.602 10.442 10.257 10.058 9.865 9.607 9.199 8.049 -10 ,23257 ,KEBNE ,17076762,Sat Dec 25 04:42:27 CET,Sat Dec 25 06:14:02 CET,0.0 0.991 1.361 1.655 1.898 2.121 2.321 2.508 2.863 3.039 3.203 3.436 3.603 3.726 3.954 4.174 4.404 4.513 4.707 4.894 5.168 5.35 5.527 5.783 6.04 6.28 6.505 6.722 6.997 7.268 7.544 7.86 8.135 8.396 8.696 9.057 9.404 9.753 10.125 10.519 10.934 11.416 11.949 12.445 13.016 13.607 14.272 15.024 15.834 16.671 17.469 17.897 18.026 17.952 17.772 17.575 17.354 17.14 16.921 16.662 16.448 16.263 16.065 15.867 15.655 15.423 15.19 14.986 14.808 14.639 14.465 14.316 14.134 13.924 13.763 13.594 13.428 13.276 13.107 12.972 12.83 12.625 12.487 12.329 12.242 12.07 11.881 11.677 11.572 11.425 11.234 11.116 10.984 10.683 10.53 10.365 10.15 9.881 9.591 9.26 8.165 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_61.txt deleted file mode 100644 index 1a1fbf3b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_155_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16004 ,TETRA ,17617750,Tue Nov 30 11:38:20 CET,Tue Nov 30 13:25:33 CET,0.0 1.167 1.433 1.626 1.794 1.933 2.039 2.134 2.296 2.362 2.411 2.447 2.53 2.571 2.636 2.675 2.723 2.749 2.799 2.838 2.856 2.865 2.88 2.911 2.952 2.978 2.98 2.954 2.915 2.889 2.834 2.737 2.649 2.556 2.418 2.23 2.016 1.777 1.535 1.262 0.92 0.467 -0.113 -0.763 -1.606 -2.646 -3.983 -5.705 -8.118 -11.568 -16.742 -22.272 -26.391 -29.618 -32.243 -34.466 -36.284 -37.892 -39.24 -40.518 -41.604 -42.527 -43.369 -44.161 -44.89 -45.557 -46.23 -46.824 -47.315 -47.79 -48.296 -48.702 -49.117 -49.545 -49.871 -50.202 -50.54 -50.909 -51.289 -51.54 -51.797 -52.193 -52.46 -52.735 -52.875 -53.163 -53.474 -53.795 -53.96 -54.224 -54.468 -54.647 -54.843 -55.279 -55.508 -55.754 -56.017 -56.306 -56.653 -57.118 -58.976 -2 ,16372 ,TETRA ,17617751,Tue Nov 30 11:38:22 CET,Tue Nov 30 13:25:10 CET,0.0 1.13 1.404 1.583 1.721 1.84 1.954 2.055 2.204 2.26 2.322 2.402 2.498 2.539 2.601 2.673 2.735 2.755 2.781 2.81 2.849 2.853 2.863 2.897 2.92 2.916 2.895 2.87 2.827 2.782 2.721 2.628 2.544 2.446 2.306 2.16 2.023 1.814 1.528 1.218 0.86 0.386 -0.217 -0.881 -1.734 -2.778 -4.153 -5.95 -8.407 -11.82 -16.917 -22.352 -26.39 -29.587 -32.158 -34.339 -36.177 -37.772 -39.1 -40.384 -41.435 -42.35 -43.211 -43.991 -44.71 -45.351 -46.015 -46.601 -47.083 -47.571 -48.091 -48.52 -48.942 -49.363 -49.682 -50.037 -50.394 -50.75 -51.145 -51.409 -51.658 -52.042 -52.311 -52.589 -52.728 -53.011 -53.32 -53.65 -53.831 -54.122 -54.397 -54.582 -54.771 -55.192 -55.42 -55.645 -55.898 -56.185 -56.523 -56.951 -58.287 -3 ,6897 ,TETRA ,17617752,Tue Nov 30 11:38:21 CET,Tue Nov 30 13:27:10 CET,0.0 0.903 1.199 1.422 1.589 1.721 1.837 1.947 2.138 2.21 2.269 2.335 2.424 2.46 2.536 2.603 2.646 2.666 2.703 2.736 2.783 2.812 2.832 2.837 2.846 2.853 2.83 2.792 2.745 2.712 2.69 2.653 2.6 2.514 2.414 2.294 2.13 1.927 1.677 1.38 1.017 0.55 -0.039 -0.704 -1.576 -2.653 -4.03 -5.792 -8.161 -11.503 -16.633 -22.078 -26.185 -29.508 -32.171 -34.362 -36.19 -37.799 -39.129 -40.391 -41.458 -42.38 -43.222 -44.034 -44.785 -45.414 -46.046 -46.609 -47.096 -47.591 -48.09 -48.51 -48.95 -49.404 -49.754 -50.106 -50.45 -50.81 -51.216 -51.491 -51.749 -52.131 -52.398 -52.69 -52.835 -53.118 -53.42 -53.731 -53.895 -54.16 -54.419 -54.613 -54.81 -55.24 -55.473 -55.708 -55.971 -56.296 -56.646 -57.058 -58.462 -4 ,15133 ,TETRA ,17617753,Tue Nov 30 11:38:21 CET,Tue Nov 30 13:22:17 CET,0.0 1.175 1.472 1.685 1.821 1.921 2.017 2.116 2.306 2.386 2.448 2.516 2.619 2.672 2.761 2.84 2.907 2.931 2.97 3.02 3.106 3.152 3.182 3.199 3.191 3.183 3.171 3.153 3.138 3.101 3.035 2.956 2.859 2.735 2.592 2.429 2.273 2.108 1.921 1.705 1.415 0.991 0.371 -0.322 -1.17 -2.23 -3.633 -5.408 -7.764 -11.127 -16.249 -21.69 -25.813 -29.041 -31.638 -33.835 -35.655 -37.236 -38.533 -39.79 -40.845 -41.751 -42.605 -43.395 -44.114 -44.746 -45.386 -45.985 -46.503 -47.004 -47.506 -47.914 -48.329 -48.762 -49.095 -49.435 -49.787 -50.157 -50.546 -50.815 -51.082 -51.483 -51.761 -52.049 -52.192 -52.492 -52.8 -53.111 -53.271 -53.538 -53.798 -53.978 -54.172 -54.611 -54.852 -55.1 -55.362 -55.653 -56.005 -56.5 -57.944 -5 ,25570 ,TETRA ,17617754,Tue Nov 30 11:39:21 CET,Tue Nov 30 13:28:20 CET,0.0 0.989 1.263 1.471 1.638 1.776 1.906 2.024 2.219 2.291 2.355 2.43 2.521 2.571 2.658 2.737 2.808 2.838 2.883 2.91 2.942 2.96 2.974 2.986 2.983 2.967 2.944 2.914 2.864 2.816 2.777 2.712 2.603 2.478 2.325 2.156 1.976 1.758 1.515 1.21 0.844 0.395 -0.188 -0.817 -1.64 -2.715 -4.103 -5.88 -8.289 -11.61 -16.613 -22.128 -26.264 -29.476 -32.124 -34.364 -36.22 -37.831 -39.156 -40.413 -41.464 -42.364 -43.204 -43.993 -44.705 -45.332 -45.978 -46.57 -47.091 -47.627 -48.165 -48.589 -49.018 -49.453 -49.775 -50.102 -50.458 -50.842 -51.23 -51.478 -51.742 -52.157 -52.43 -52.709 -52.851 -53.145 -53.449 -53.784 -53.955 -54.214 -54.448 -54.634 -54.826 -55.203 -55.431 -55.716 -56.016 -56.36 -56.786 -57.257 -58.902 -6 ,4837 ,TETRA ,17617755,Tue Nov 30 11:39:21 CET,Tue Nov 30 13:27:39 CET,0.0 1.09 1.384 1.589 1.747 1.882 1.994 2.087 2.241 2.31 2.371 2.427 2.515 2.556 2.632 2.699 2.755 2.774 2.819 2.861 2.9 2.931 2.955 2.974 2.973 2.966 2.957 2.943 2.944 2.927 2.865 2.765 2.658 2.56 2.435 2.257 2.057 1.83 1.598 1.302 0.925 0.458 -0.14 -0.8 -1.664 -2.725 -4.083 -5.836 -8.235 -11.643 -16.74 -22.198 -26.349 -29.636 -32.241 -34.431 -36.267 -37.89 -39.277 -40.571 -41.624 -42.528 -43.365 -44.17 -44.889 -45.52 -46.184 -46.773 -47.265 -47.76 -48.28 -48.702 -49.142 -49.603 -49.953 -50.309 -50.674 -51.045 -51.414 -51.664 -51.917 -52.315 -52.601 -52.891 -53.035 -53.328 -53.64 -53.956 -54.109 -54.369 -54.612 -54.807 -55.033 -55.502 -55.741 -56.005 -56.294 -56.589 -56.937 -57.405 -58.535 -7 ,19694 ,TETRA ,17617756,Tue Nov 30 11:40:22 CET,Tue Nov 30 13:29:12 CET,0.0 1.057 1.416 1.622 1.767 1.891 1.996 2.095 2.271 2.338 2.396 2.461 2.551 2.597 2.692 2.789 2.86 2.884 2.918 2.945 2.972 2.981 2.99 2.988 2.985 2.977 2.961 2.941 2.912 2.877 2.827 2.752 2.673 2.611 2.534 2.429 2.33 2.166 1.91 1.61 1.243 0.779 0.191 -0.485 -1.316 -2.298 -3.606 -5.323 -7.691 -11.073 -16.218 -21.716 -25.791 -29.014 -31.622 -33.831 -35.696 -37.287 -38.603 -39.898 -41.009 -41.985 -42.855 -43.613 -44.298 -44.929 -45.586 -46.188 -46.708 -47.209 -47.73 -48.152 -48.574 -49.024 -49.367 -49.709 -50.048 -50.404 -50.785 -51.041 -51.303 -51.71 -51.988 -52.281 -52.43 -52.72 -53.023 -53.355 -53.519 -53.786 -54.063 -54.256 -54.457 -54.889 -55.131 -55.403 -55.674 -55.947 -56.293 -56.761 -58.269 -8 ,532 ,TETRA ,17617757,Tue Nov 30 11:40:23 CET,Tue Nov 30 13:29:10 CET,0.0 1.257 1.574 1.802 1.977 2.123 2.256 2.357 2.502 2.569 2.629 2.687 2.774 2.817 2.896 2.96 3.024 3.056 3.112 3.154 3.192 3.213 3.237 3.254 3.241 3.218 3.197 3.176 3.131 3.07 3.016 2.97 2.911 2.814 2.669 2.505 2.33 2.122 1.877 1.574 1.256 0.857 0.291 -0.375 -1.224 -2.228 -3.546 -5.314 -7.729 -11.112 -16.204 -21.67 -25.77 -29.037 -31.65 -33.863 -35.723 -37.311 -38.624 -39.91 -40.979 -41.89 -42.727 -43.494 -44.189 -44.816 -45.484 -46.07 -46.557 -47.059 -47.589 -48.009 -48.445 -48.895 -49.257 -49.636 -49.997 -50.357 -50.724 -50.978 -51.243 -51.653 -51.936 -52.238 -52.388 -52.676 -52.994 -53.328 -53.492 -53.753 -53.989 -54.17 -54.372 -54.821 -55.054 -55.278 -55.508 -55.772 -56.098 -56.568 -57.616 -9 ,18983 ,TETRA ,17617758,Tue Nov 30 11:40:23 CET,Tue Nov 30 13:28:53 CET,0.0 1.048 1.378 1.622 1.794 1.929 2.039 2.134 2.302 2.382 2.461 2.555 2.648 2.681 2.738 2.795 2.849 2.865 2.893 2.926 2.98 2.999 3.002 2.998 2.991 2.979 2.958 2.932 2.885 2.831 2.757 2.655 2.558 2.449 2.306 2.148 2.01 1.824 1.553 1.244 0.885 0.433 -0.156 -0.787 -1.597 -2.666 -4.056 -5.829 -8.184 -11.516 -16.645 -22.118 -26.238 -29.474 -32.087 -34.306 -36.133 -37.703 -39.013 -40.26 -41.306 -42.217 -43.046 -43.819 -44.556 -45.21 -45.876 -46.475 -46.966 -47.473 -48.031 -48.48 -48.924 -49.38 -49.729 -50.084 -50.433 -50.801 -51.189 -51.456 -51.738 -52.171 -52.461 -52.742 -52.887 -53.195 -53.505 -53.842 -54.012 -54.284 -54.556 -54.737 -54.916 -55.314 -55.543 -55.775 -56.015 -56.303 -56.644 -57.095 -58.225 -10 ,11950 ,TETRA ,17617759,Tue Nov 30 11:40:24 CET,Tue Nov 30 13:29:43 CET,0.0 1.204 1.495 1.698 1.863 2.014 2.147 2.243 2.388 2.453 2.517 2.588 2.682 2.727 2.802 2.864 2.913 2.934 2.967 2.986 3.021 3.044 3.064 3.089 3.095 3.081 3.072 3.056 3.011 2.969 2.921 2.835 2.746 2.651 2.516 2.331 2.117 1.877 1.593 1.258 0.887 0.428 -0.157 -0.812 -1.651 -2.683 -4.078 -5.875 -8.284 -11.68 -16.788 -22.274 -26.359 -29.561 -32.176 -34.396 -36.258 -37.886 -39.246 -40.538 -41.632 -42.565 -43.393 -44.154 -44.883 -45.561 -46.235 -46.808 -47.296 -47.815 -48.329 -48.757 -49.21 -49.658 -49.985 -50.333 -50.703 -51.064 -51.407 -51.642 -51.9 -52.292 -52.552 -52.825 -52.97 -53.278 -53.59 -53.898 -54.057 -54.33 -54.604 -54.793 -54.993 -55.42 -55.66 -55.903 -56.155 -56.443 -56.783 -57.216 -58.492 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_156_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_156_1.txt deleted file mode 100644 index 78de6d8f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_156_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6867 ,TETRA ,17617760,Tue Nov 30 11:41:21 CET,Tue Nov 30 13:30:50 CET,0.0 1.135 1.502 1.791 2.03 2.247 2.446 2.614 2.912 3.048 3.163 3.318 3.424 3.49 3.662 3.849 4.0 4.061 4.18 4.295 4.44 4.523 4.6 4.727 4.858 4.978 5.093 5.201 5.348 5.485 5.579 5.672 5.758 5.866 5.999 6.091 6.15 6.209 6.254 6.276 6.27 6.24 6.208 6.162 6.05 5.878 5.585 5.127 4.404 3.26 1.278 -1.089 -2.92 -4.465 -5.797 -6.943 -7.904 -8.743 -9.461 -10.19 -10.802 -11.325 -11.818 -12.269 -12.675 -13.079 -13.496 -13.834 -14.132 -14.436 -14.749 -15.009 -15.293 -15.598 -15.82 -16.055 -16.309 -16.558 -16.796 -16.973 -17.164 -17.44 -17.639 -17.842 -17.942 -18.153 -18.388 -18.644 -18.768 -18.951 -19.199 -19.354 -19.513 -19.83 -20.001 -20.207 -20.444 -20.707 -21.025 -21.428 -22.83 -2 ,2725 ,TETRA ,17617761,Tue Nov 30 11:41:21 CET,Tue Nov 30 13:30:34 CET,0.0 1.543 1.91 2.155 2.385 2.597 2.757 2.898 3.16 3.286 3.398 3.533 3.634 3.707 3.864 4.002 4.126 4.192 4.325 4.45 4.605 4.692 4.782 4.899 5.005 5.116 5.222 5.324 5.452 5.558 5.64 5.728 5.837 5.96 6.079 6.209 6.325 6.38 6.405 6.419 6.416 6.383 6.345 6.269 6.112 5.903 5.576 5.085 4.339 3.162 1.205 -1.155 -3.068 -4.666 -5.964 -7.073 -8.032 -8.861 -9.583 -10.303 -10.907 -11.426 -11.909 -12.364 -12.785 -13.173 -13.596 -13.97 -14.294 -14.637 -14.992 -15.276 -15.554 -15.841 -16.063 -16.298 -16.535 -16.774 -17.029 -17.213 -17.408 -17.709 -17.91 -18.116 -18.229 -18.473 -18.713 -18.952 -19.082 -19.268 -19.524 -19.689 -19.858 -20.218 -20.411 -20.615 -20.829 -21.074 -21.392 -21.798 -23.852 -3 ,29419 ,TETRA ,17617762,Tue Nov 30 11:07:28 CET,Tue Nov 30 12:47:15 CET,0.0 2.089 2.48 2.754 2.971 3.141 3.304 3.461 3.715 3.818 3.92 4.09 4.212 4.292 4.451 4.602 4.716 4.776 4.911 5.032 5.214 5.331 5.422 5.523 5.618 5.711 5.796 5.885 6.001 6.108 6.22 6.336 6.448 6.54 6.604 6.678 6.752 6.818 6.868 6.901 6.914 6.909 6.86 6.787 6.682 6.509 6.201 5.742 5.049 3.954 2.074 -0.212 -2.082 -3.666 -4.978 -6.081 -7.028 -7.875 -8.59 -9.341 -9.997 -10.553 -11.066 -11.525 -11.939 -12.32 -12.721 -13.072 -13.366 -13.69 -14.06 -14.365 -14.661 -14.949 -15.184 -15.431 -15.688 -15.972 -16.268 -16.459 -16.644 -16.911 -17.086 -17.276 -17.381 -17.617 -17.859 -18.096 -18.219 -18.4 -18.631 -18.78 -18.934 -19.272 -19.456 -19.647 -19.868 -20.125 -20.43 -20.82 -22.081 -4 ,31792 ,TETRA ,17617763,Tue Nov 30 11:41:21 CET,Tue Nov 30 13:31:36 CET,0.0 1.516 1.912 2.155 2.36 2.531 2.68 2.814 3.069 3.187 3.296 3.458 3.585 3.682 3.844 3.99 4.108 4.161 4.267 4.377 4.541 4.626 4.706 4.818 4.912 5.015 5.109 5.198 5.306 5.399 5.476 5.552 5.624 5.694 5.773 5.861 5.925 5.979 6.021 6.028 6.025 6.019 5.988 5.917 5.797 5.58 5.206 4.735 4.038 2.842 0.862 -1.467 -3.38 -4.942 -6.22 -7.331 -8.292 -9.148 -9.861 -10.555 -11.147 -11.674 -12.216 -12.728 -13.191 -13.605 -14.037 -14.439 -14.771 -15.098 -15.448 -15.748 -16.032 -16.322 -16.573 -16.836 -17.077 -17.31 -17.575 -17.749 -17.916 -18.189 -18.38 -18.591 -18.704 -18.919 -19.134 -19.369 -19.499 -19.695 -19.96 -20.116 -20.271 -20.61 -20.802 -21.014 -21.231 -21.457 -21.762 -22.174 -23.358 -5 ,24636 ,TETRA ,17617764,Tue Nov 30 11:41:21 CET,Tue Nov 30 13:35:51 CET,0.0 1.476 1.831 2.11 2.346 2.537 2.691 2.846 3.121 3.229 3.326 3.467 3.569 3.644 3.792 3.914 4.043 4.113 4.246 4.364 4.521 4.613 4.695 4.819 4.95 5.06 5.137 5.224 5.349 5.447 5.521 5.605 5.701 5.817 5.938 6.032 6.106 6.166 6.257 6.333 6.326 6.308 6.277 6.216 6.135 5.956 5.621 5.162 4.41 3.227 1.236 -1.065 -2.914 -4.467 -5.741 -6.849 -7.792 -8.621 -9.334 -10.03 -10.631 -11.194 -11.752 -12.276 -12.729 -13.115 -13.524 -13.882 -14.186 -14.528 -14.886 -15.155 -15.419 -15.702 -15.927 -16.171 -16.423 -16.668 -16.929 -17.121 -17.319 -17.635 -17.855 -18.061 -18.163 -18.374 -18.612 -18.876 -19.005 -19.184 -19.418 -19.575 -19.733 -20.059 -20.244 -20.451 -20.66 -20.888 -21.171 -21.607 -23.137 -6 ,16460 ,TETRA ,17617765,Tue Nov 30 11:41:21 CET,Tue Nov 30 13:30:37 CET,0.0 1.518 1.891 2.162 2.397 2.584 2.746 2.912 3.177 3.286 3.391 3.543 3.652 3.73 3.873 4.003 4.123 4.185 4.3 4.396 4.534 4.626 4.715 4.825 4.921 5.01 5.108 5.228 5.368 5.468 5.558 5.684 5.787 5.856 5.919 5.99 6.056 6.124 6.192 6.231 6.242 6.237 6.205 6.144 6.003 5.788 5.498 5.036 4.248 3.003 0.966 -1.346 -3.221 -4.821 -6.13 -7.281 -8.272 -9.137 -9.86 -10.556 -11.154 -11.69 -12.199 -12.68 -13.13 -13.533 -13.931 -14.289 -14.591 -14.906 -15.259 -15.527 -15.807 -16.11 -16.33 -16.557 -16.79 -17.026 -17.273 -17.439 -17.609 -17.886 -18.078 -18.297 -18.411 -18.626 -18.859 -19.113 -19.24 -19.418 -19.657 -19.807 -19.967 -20.315 -20.494 -20.702 -20.933 -21.188 -21.495 -21.898 -23.441 -7 ,30110 ,TETRA ,17617766,Tue Nov 30 11:41:22 CET,Tue Nov 30 13:29:47 CET,0.0 1.1 1.477 1.77 1.984 2.168 2.338 2.489 2.746 2.857 2.971 3.136 3.252 3.339 3.489 3.631 3.758 3.813 3.932 4.061 4.249 4.361 4.472 4.608 4.7 4.808 4.933 5.05 5.174 5.269 5.343 5.45 5.581 5.687 5.789 5.891 5.979 6.044 6.088 6.12 6.137 6.168 6.15 6.054 5.893 5.686 5.375 4.894 4.149 2.909 0.856 -1.539 -3.454 -5.029 -6.328 -7.424 -8.358 -9.195 -9.92 -10.659 -11.269 -11.812 -12.34 -12.843 -13.323 -13.731 -14.145 -14.531 -14.866 -15.185 -15.505 -15.777 -16.043 -16.306 -16.511 -16.745 -17.003 -17.249 -17.495 -17.665 -17.853 -18.148 -18.339 -18.541 -18.641 -18.841 -19.062 -19.295 -19.422 -19.609 -19.844 -20.005 -20.162 -20.512 -20.708 -20.904 -21.13 -21.387 -21.685 -22.079 -23.824 -8 ,5488 ,TETRA ,17617767,Tue Nov 30 11:41:24 CET,Tue Nov 30 13:25:38 CET,0.0 1.585 1.946 2.245 2.503 2.708 2.876 3.027 3.317 3.438 3.549 3.724 3.836 3.909 4.051 4.188 4.33 4.39 4.506 4.629 4.788 4.878 4.958 5.079 5.189 5.29 5.384 5.457 5.548 5.632 5.705 5.801 5.891 5.966 6.038 6.116 6.198 6.292 6.35 6.362 6.371 6.355 6.299 6.209 6.064 5.848 5.502 5.001 4.25 3.045 0.998 -1.404 -3.329 -4.889 -6.201 -7.4 -8.413 -9.255 -9.969 -10.712 -11.343 -11.912 -12.44 -12.905 -13.326 -13.708 -14.104 -14.463 -14.783 -15.108 -15.455 -15.759 -16.075 -16.383 -16.602 -16.828 -17.069 -17.333 -17.615 -17.798 -17.976 -18.245 -18.424 -18.619 -18.726 -18.954 -19.186 -19.422 -19.544 -19.725 -19.95 -20.105 -20.273 -20.621 -20.817 -21.038 -21.254 -21.483 -21.76 -22.113 -23.727 -9 ,26160 ,TETRA ,17617768,Tue Nov 30 11:41:21 CET,Tue Nov 30 13:30:49 CET,0.0 1.599 2.024 2.305 2.513 2.679 2.817 2.947 3.184 3.297 3.403 3.56 3.687 3.787 3.955 4.104 4.242 4.303 4.428 4.549 4.72 4.82 4.901 5.043 5.189 5.299 5.403 5.505 5.626 5.734 5.828 5.92 5.997 6.058 6.12 6.181 6.244 6.343 6.432 6.468 6.482 6.478 6.424 6.315 6.156 5.951 5.632 5.152 4.419 3.255 1.277 -1.119 -3.062 -4.621 -5.903 -7.018 -7.988 -8.824 -9.527 -10.234 -10.838 -11.377 -11.9 -12.386 -12.822 -13.215 -13.617 -13.974 -14.296 -14.618 -14.939 -15.205 -15.484 -15.794 -16.045 -16.303 -16.564 -16.813 -17.056 -17.22 -17.38 -17.653 -17.864 -18.065 -18.164 -18.386 -18.628 -18.885 -19.012 -19.191 -19.425 -19.574 -19.72 -20.059 -20.256 -20.458 -20.668 -20.918 -21.208 -21.622 -23.093 -10 ,22013 ,TETRA ,17617769,Tue Nov 30 11:42:21 CET,Tue Nov 30 13:32:15 CET,0.0 1.722 2.07 2.345 2.572 2.765 2.917 3.048 3.291 3.412 3.516 3.693 3.827 3.928 4.112 4.251 4.389 4.469 4.608 4.725 4.895 4.988 5.071 5.206 5.339 5.457 5.572 5.679 5.808 5.921 6.013 6.107 6.183 6.278 6.395 6.482 6.549 6.644 6.749 6.822 6.858 6.853 6.791 6.706 6.581 6.391 6.084 5.621 4.87 3.688 1.76 -0.535 -2.441 -4.021 -5.298 -6.417 -7.398 -8.276 -9.003 -9.701 -10.294 -10.804 -11.276 -11.75 -12.195 -12.586 -12.998 -13.375 -13.712 -14.04 -14.362 -14.631 -14.903 -15.218 -15.472 -15.722 -15.986 -16.246 -16.486 -16.65 -16.827 -17.097 -17.282 -17.489 -17.598 -17.827 -18.054 -18.277 -18.395 -18.579 -18.791 -18.937 -19.089 -19.388 -19.566 -19.764 -19.984 -20.231 -20.506 -20.941 -22.846 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_156_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_156_31.txt deleted file mode 100644 index 9c8ed5fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_156_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5832 ,TETRA ,17617770,Tue Nov 30 11:42:21 CET,Tue Nov 30 13:32:01 CET,0.0 1.425 1.806 2.078 2.317 2.52 2.699 2.861 3.145 3.27 3.379 3.541 3.663 3.756 3.922 4.078 4.239 4.315 4.449 4.578 4.769 4.887 4.998 5.158 5.307 5.451 5.593 5.729 5.898 6.063 6.206 6.367 6.523 6.676 6.85 7.031 7.191 7.362 7.555 7.757 7.955 8.139 8.339 8.515 8.693 8.891 9.03 9.111 9.111 8.767 7.743 6.26 4.833 3.55 2.491 1.525 0.657 -0.147 -0.848 -1.528 -2.106 -2.6 -3.073 -3.53 -3.946 -4.337 -4.731 -5.06 -5.352 -5.647 -5.946 -6.195 -6.456 -6.731 -6.942 -7.161 -7.397 -7.636 -7.878 -8.054 -8.236 -8.519 -8.712 -8.907 -9.007 -9.222 -9.448 -9.686 -9.811 -9.975 -10.196 -10.338 -10.484 -10.8 -10.98 -11.175 -11.4 -11.664 -11.963 -12.302 -13.328 -2 ,14584 ,TETRA ,17617771,Tue Nov 30 11:42:21 CET,Tue Nov 30 13:31:40 CET,0.0 1.039 1.362 1.607 1.792 1.967 2.143 2.295 2.546 2.659 2.772 2.954 3.083 3.178 3.348 3.507 3.66 3.729 3.865 3.999 4.192 4.314 4.434 4.601 4.756 4.905 5.038 5.165 5.33 5.492 5.637 5.79 5.94 6.082 6.252 6.439 6.618 6.821 7.021 7.199 7.369 7.574 7.797 7.978 8.146 8.292 8.399 8.364 8.194 7.788 6.71 5.024 3.47 2.116 0.997 0.02 -0.827 -1.592 -2.261 -2.929 -3.493 -3.986 -4.45 -4.892 -5.311 -5.692 -6.088 -6.424 -6.706 -7.004 -7.312 -7.579 -7.854 -8.127 -8.337 -8.553 -8.771 -9.002 -9.253 -9.428 -9.609 -9.875 -10.059 -10.258 -10.362 -10.586 -10.823 -11.07 -11.195 -11.362 -11.587 -11.738 -11.901 -12.258 -12.448 -12.663 -12.901 -13.179 -13.528 -14.024 -15.6 -3 ,13364 ,TETRA ,17617772,Tue Nov 30 11:42:21 CET,Tue Nov 30 13:30:36 CET,0.0 1.026 1.362 1.638 1.85 2.006 2.156 2.312 2.589 2.706 2.822 3.011 3.139 3.229 3.403 3.577 3.739 3.814 3.965 4.107 4.288 4.405 4.52 4.676 4.829 4.971 5.091 5.206 5.363 5.507 5.648 5.82 5.987 6.144 6.297 6.462 6.627 6.795 6.963 7.133 7.308 7.494 7.679 7.841 8.014 8.176 8.333 8.414 8.267 7.756 6.735 5.27 3.822 2.551 1.41 0.359 -0.523 -1.32 -1.992 -2.62 -3.155 -3.645 -4.133 -4.601 -5.016 -5.385 -5.76 -6.098 -6.396 -6.694 -6.997 -7.259 -7.532 -7.809 -8.034 -8.267 -8.504 -8.738 -8.975 -9.138 -9.313 -9.59 -9.776 -9.973 -10.075 -10.282 -10.502 -10.747 -10.874 -11.044 -11.262 -11.401 -11.545 -11.858 -12.053 -12.277 -12.5 -12.747 -13.075 -13.535 -14.928 -4 ,22331 ,TETRA ,17617773,Tue Nov 30 11:43:20 CET,Tue Nov 30 13:32:41 CET,0.0 1.311 1.676 1.926 2.139 2.332 2.505 2.659 2.954 3.088 3.196 3.359 3.487 3.576 3.741 3.907 4.06 4.128 4.261 4.388 4.586 4.702 4.805 4.972 5.131 5.275 5.409 5.539 5.704 5.857 6.004 6.176 6.341 6.488 6.655 6.841 6.995 7.166 7.353 7.533 7.712 7.897 8.095 8.282 8.498 8.686 8.786 8.813 8.742 8.425 7.46 5.941 4.439 3.07 1.904 0.871 0.024 -0.713 -1.339 -1.957 -2.528 -3.035 -3.506 -3.954 -4.375 -4.748 -5.112 -5.438 -5.729 -6.035 -6.35 -6.604 -6.871 -7.148 -7.362 -7.586 -7.809 -8.042 -8.283 -8.453 -8.631 -8.886 -9.05 -9.227 -9.324 -9.528 -9.75 -9.995 -10.118 -10.29 -10.517 -10.649 -10.793 -11.121 -11.312 -11.506 -11.712 -11.966 -12.315 -12.781 -14.286 -5 ,15088 ,TETRA ,17617774,Tue Nov 30 11:43:22 CET,Tue Nov 30 13:33:30 CET,0.0 1.059 1.429 1.709 1.921 2.105 2.29 2.463 2.75 2.869 2.981 3.164 3.292 3.385 3.549 3.692 3.832 3.905 4.042 4.168 4.352 4.468 4.586 4.759 4.914 5.067 5.205 5.337 5.527 5.706 5.865 6.052 6.224 6.372 6.536 6.721 6.891 7.083 7.284 7.47 7.653 7.854 8.054 8.219 8.412 8.601 8.745 8.762 8.57 8.099 7.015 5.452 4.062 2.766 1.631 0.636 -0.234 -1.007 -1.665 -2.353 -2.944 -3.42 -3.865 -4.288 -4.696 -5.078 -5.464 -5.806 -6.101 -6.405 -6.715 -6.972 -7.234 -7.495 -7.701 -7.92 -8.156 -8.407 -8.65 -8.815 -8.997 -9.283 -9.468 -9.663 -9.767 -9.981 -10.206 -10.438 -10.556 -10.732 -10.97 -11.122 -11.279 -11.624 -11.821 -12.025 -12.255 -12.546 -12.924 -13.361 -14.502 -6 ,2226 ,TETRA ,17617775,Tue Nov 30 11:43:19 CET,Tue Nov 30 13:30:47 CET,0.0 1.192 1.559 1.84 2.053 2.22 2.396 2.573 2.851 2.966 3.085 3.274 3.403 3.498 3.683 3.846 3.994 4.068 4.217 4.362 4.559 4.684 4.804 4.962 5.106 5.254 5.396 5.524 5.685 5.839 5.986 6.158 6.321 6.471 6.637 6.807 6.97 7.158 7.341 7.524 7.713 7.902 8.086 8.276 8.471 8.618 8.732 8.764 8.662 8.283 7.275 5.725 4.359 3.136 2.054 1.101 0.223 -0.569 -1.242 -1.94 -2.508 -2.99 -3.445 -3.871 -4.269 -4.641 -5.024 -5.343 -5.625 -5.924 -6.236 -6.489 -6.75 -7.027 -7.238 -7.457 -7.705 -7.959 -8.204 -8.369 -8.538 -8.815 -9.004 -9.192 -9.294 -9.503 -9.716 -9.951 -10.075 -10.235 -10.46 -10.607 -10.752 -11.06 -11.244 -11.459 -11.668 -11.91 -12.196 -12.54 -13.457 -7 ,29136 ,TETRA ,17617776,Tue Nov 30 11:43:19 CET,Tue Nov 30 13:32:32 CET,0.0 1.027 1.385 1.657 1.89 2.086 2.26 2.42 2.698 2.812 2.925 3.116 3.244 3.344 3.54 3.717 3.882 3.964 4.113 4.237 4.41 4.525 4.641 4.809 4.959 5.102 5.238 5.364 5.531 5.681 5.816 5.983 6.141 6.29 6.462 6.643 6.814 6.99 7.175 7.389 7.61 7.82 8.035 8.23 8.398 8.576 8.704 8.712 8.586 8.121 6.969 5.36 3.901 2.585 1.449 0.445 -0.4 -1.16 -1.839 -2.498 -3.053 -3.556 -4.034 -4.478 -4.888 -5.268 -5.665 -6.01 -6.287 -6.563 -6.864 -7.127 -7.403 -7.675 -7.887 -8.114 -8.346 -8.581 -8.82 -8.986 -9.16 -9.436 -9.626 -9.812 -9.919 -10.147 -10.369 -10.61 -10.746 -10.929 -11.189 -11.348 -11.516 -11.873 -12.053 -12.253 -12.496 -12.783 -13.107 -13.581 -15.517 -8 ,7499 ,TETRA ,17617777,Tue Nov 30 11:43:20 CET,Tue Nov 30 13:31:45 CET,0.0 0.78 1.099 1.366 1.573 1.736 1.893 2.044 2.309 2.427 2.536 2.717 2.846 2.941 3.125 3.297 3.457 3.528 3.668 3.806 3.984 4.098 4.219 4.391 4.544 4.685 4.82 4.951 5.118 5.283 5.435 5.598 5.764 5.925 6.101 6.296 6.477 6.669 6.856 7.049 7.241 7.438 7.619 7.754 7.926 8.101 8.253 8.283 8.133 7.75 6.732 5.232 3.772 2.407 1.243 0.22 -0.655 -1.446 -2.105 -2.738 -3.299 -3.798 -4.262 -4.702 -5.106 -5.483 -5.881 -6.213 -6.494 -6.796 -7.118 -7.381 -7.644 -7.932 -8.158 -8.376 -8.602 -8.836 -9.084 -9.26 -9.433 -9.689 -9.87 -10.066 -10.175 -10.393 -10.623 -10.874 -11.002 -11.187 -11.444 -11.595 -11.745 -12.082 -12.278 -12.494 -12.747 -13.019 -13.337 -13.78 -15.077 -9 ,10710 ,TETRA ,17617778,Tue Nov 30 11:43:20 CET,Tue Nov 30 13:37:11 CET,0.0 0.998 1.383 1.651 1.861 2.04 2.208 2.36 2.634 2.764 2.876 3.048 3.168 3.259 3.445 3.602 3.75 3.829 3.98 4.117 4.303 4.418 4.535 4.695 4.844 4.984 5.117 5.253 5.429 5.589 5.736 5.903 6.066 6.236 6.424 6.611 6.77 6.955 7.142 7.297 7.458 7.638 7.832 8.023 8.2 8.34 8.475 8.542 8.432 8.063 7.029 5.488 4.105 2.835 1.77 0.806 -0.1 -0.937 -1.62 -2.285 -2.839 -3.325 -3.794 -4.229 -4.637 -5.002 -5.361 -5.69 -5.98 -6.272 -6.58 -6.846 -7.124 -7.408 -7.627 -7.85 -8.073 -8.303 -8.541 -8.701 -8.864 -9.149 -9.349 -9.54 -9.642 -9.851 -10.064 -10.29 -10.408 -10.571 -10.804 -10.946 -11.093 -11.418 -11.593 -11.8 -12.035 -12.284 -12.607 -13.097 -14.269 -10 ,19613 ,TETRA ,17617779,Tue Nov 30 11:43:20 CET,Tue Nov 30 13:30:15 CET,0.0 0.971 1.338 1.591 1.804 1.972 2.117 2.264 2.572 2.709 2.828 3.033 3.171 3.267 3.445 3.612 3.769 3.849 4.007 4.156 4.35 4.465 4.571 4.734 4.89 5.033 5.177 5.314 5.469 5.618 5.774 5.946 6.103 6.255 6.429 6.616 6.789 6.971 7.153 7.341 7.538 7.733 7.915 8.091 8.282 8.46 8.58 8.565 8.406 7.961 6.888 5.425 4.156 2.901 1.749 0.742 -0.141 -0.927 -1.589 -2.234 -2.785 -3.258 -3.725 -4.194 -4.622 -4.994 -5.369 -5.716 -6.014 -6.315 -6.628 -6.879 -7.143 -7.421 -7.628 -7.843 -8.074 -8.308 -8.55 -8.721 -8.892 -9.145 -9.324 -9.527 -9.639 -9.867 -10.085 -10.305 -10.427 -10.604 -10.85 -10.995 -11.154 -11.52 -11.722 -11.932 -12.174 -12.461 -12.823 -13.284 -14.506 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_15_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_15_163.txt deleted file mode 100644 index 0ff6d442..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_15_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3001 ,TETRA ,17617780,Tue Nov 30 11:43:20 CET,Tue Nov 30 13:32:30 CET,0.0 0.533 0.681 0.77 0.825 0.86 0.879 0.886 0.89 0.887 0.881 0.832 0.873 0.881 0.882 0.874 0.858 0.848 0.826 0.793 0.717 0.669 0.618 0.528 0.438 0.343 0.254 0.161 0.03 -0.113 -0.269 -0.466 -0.668 -0.887 -1.155 -1.492 -1.856 -2.312 -2.876 -3.503 -4.202 -5.051 -6.123 -7.307 -8.829 -10.67 -13.015 -16.003 -19.943 -25.342 -33.304 -41.678 -47.843 -52.631 -56.479 -59.693 -62.371 -64.681 -66.556 -68.368 -69.861 -71.157 -72.342 -73.395 -74.362 -75.217 -76.09 -76.863 -77.514 -78.172 -78.821 -79.343 -79.887 -80.448 -80.872 -81.323 -81.791 -82.245 -82.696 -82.999 -83.319 -83.825 -84.159 -84.495 -84.664 -85.022 -85.41 -85.802 -85.996 -86.324 -86.626 -86.851 -87.086 -87.598 -87.878 -88.171 -88.457 -88.753 -89.12 -89.592 -90.559 -2 ,21301 ,TETRA ,17617781,Tue Nov 30 11:44:21 CET,Tue Nov 30 13:32:46 CET,0.0 0.394 0.503 0.562 0.587 0.61 0.625 0.623 0.604 0.59 0.581 0.518 0.533 0.506 0.454 0.391 0.325 0.293 0.242 0.194 0.088 0.003 -0.077 -0.212 -0.355 -0.495 -0.629 -0.765 -0.974 -1.195 -1.434 -1.738 -2.041 -2.358 -2.709 -3.09 -3.468 -3.893 -4.412 -5.002 -5.68 -6.546 -7.626 -8.793 -10.283 -12.119 -14.471 -17.465 -21.406 -26.778 -34.736 -43.088 -49.219 -54.0 -57.819 -61.022 -63.641 -65.861 -67.697 -69.457 -70.919 -72.169 -73.314 -74.375 -75.322 -76.163 -77.038 -77.825 -78.482 -79.127 -79.787 -80.327 -80.887 -81.461 -81.883 -82.318 -82.78 -83.223 -83.677 -84.003 -84.344 -84.859 -85.187 -85.519 -85.693 -86.073 -86.461 -86.829 -87.025 -87.361 -87.651 -87.871 -88.104 -88.58 -88.826 -89.099 -89.407 -89.713 -90.031 -90.445 -91.402 -3 ,10254 ,TETRA ,17617782,Tue Nov 30 11:44:20 CET,Tue Nov 30 13:33:47 CET,0.0 0.494 0.594 0.672 0.732 0.77 0.795 0.813 0.828 0.825 0.815 0.751 0.776 0.761 0.717 0.66 0.594 0.563 0.506 0.432 0.315 0.239 0.162 0.036 -0.102 -0.253 -0.41 -0.567 -0.773 -0.978 -1.196 -1.484 -1.777 -2.072 -2.439 -2.893 -3.35 -3.877 -4.463 -5.118 -5.849 -6.726 -7.82 -8.969 -10.428 -12.259 -14.617 -17.587 -21.515 -26.856 -34.695 -42.921 -48.95 -53.708 -57.554 -60.754 -63.363 -65.567 -67.402 -69.164 -70.611 -71.853 -73.005 -74.046 -74.987 -75.839 -76.711 -77.474 -78.116 -78.759 -79.435 -79.999 -80.566 -81.13 -81.559 -81.99 -82.412 -82.856 -83.32 -83.638 -83.97 -84.458 -84.779 -85.1 -85.274 -85.651 -86.013 -86.401 -86.611 -86.946 -87.251 -87.474 -87.709 -88.214 -88.492 -88.775 -89.049 -89.365 -89.754 -90.226 -91.405 -4 ,24174 ,TETRA ,17617783,Tue Nov 30 11:46:21 CET,Tue Nov 30 13:34:42 CET,0.0 0.388 0.49 0.549 0.593 0.618 0.634 0.663 0.689 0.681 0.67 0.609 0.632 0.615 0.574 0.542 0.509 0.478 0.41 0.332 0.198 0.109 0.016 -0.106 -0.2 -0.302 -0.425 -0.561 -0.731 -0.901 -1.1 -1.356 -1.63 -1.923 -2.282 -2.717 -3.162 -3.656 -4.188 -4.81 -5.547 -6.428 -7.544 -8.762 -10.236 -12.028 -14.342 -17.24 -21.086 -26.361 -34.22 -42.525 -48.656 -53.445 -57.245 -60.404 -63.0 -65.243 -67.124 -68.905 -70.353 -71.598 -72.758 -73.815 -74.756 -75.611 -76.499 -77.26 -77.886 -78.513 -79.159 -79.696 -80.248 -80.805 -81.224 -81.649 -82.089 -82.546 -83.007 -83.33 -83.662 -84.152 -84.487 -84.833 -85.011 -85.382 -85.777 -86.17 -86.367 -86.697 -86.997 -87.237 -87.485 -87.987 -88.241 -88.502 -88.795 -89.122 -89.517 -89.979 -90.912 -5 ,2997 ,TETRA ,17617784,Tue Nov 30 11:46:21 CET,Tue Nov 30 13:35:34 CET,0.0 0.63 0.764 0.851 0.912 0.964 1.009 1.049 1.114 1.126 1.125 1.09 1.131 1.141 1.157 1.158 1.149 1.138 1.103 1.074 1.03 0.98 0.918 0.814 0.701 0.587 0.463 0.336 0.153 -0.04 -0.23 -0.468 -0.713 -0.951 -1.242 -1.619 -2.04 -2.545 -3.113 -3.743 -4.407 -5.225 -6.274 -7.425 -8.943 -10.785 -13.096 -15.952 -19.789 -25.134 -32.979 -41.188 -47.239 -51.96 -55.695 -58.847 -61.452 -63.653 -65.516 -67.322 -68.769 -70.024 -71.205 -72.284 -73.252 -74.095 -74.948 -75.705 -76.338 -76.977 -77.64 -78.179 -78.734 -79.317 -79.757 -80.206 -80.665 -81.124 -81.587 -81.901 -82.224 -82.725 -83.079 -83.451 -83.636 -83.998 -84.37 -84.751 -84.946 -85.278 -85.593 -85.8 -86.005 -86.467 -86.715 -86.984 -87.257 -87.546 -87.919 -88.393 -89.33 -6 ,28076 ,TETRA ,17617785,Tue Nov 30 11:46:21 CET,Tue Nov 30 13:34:55 CET,0.0 0.397 0.516 0.588 0.636 0.677 0.709 0.729 0.76 0.772 0.78 0.743 0.779 0.777 0.78 0.766 0.735 0.72 0.698 0.665 0.605 0.572 0.528 0.448 0.363 0.28 0.188 0.082 -0.073 -0.221 -0.386 -0.606 -0.818 -1.068 -1.41 -1.826 -2.25 -2.745 -3.306 -3.949 -4.684 -5.557 -6.569 -7.619 -9.051 -10.87 -13.212 -16.182 -20.138 -25.592 -33.58 -42.023 -48.23 -52.969 -56.734 -59.893 -62.514 -64.777 -66.614 -68.364 -69.834 -71.096 -72.266 -73.358 -74.372 -75.288 -76.202 -76.974 -77.612 -78.255 -78.901 -79.425 -79.972 -80.532 -80.955 -81.384 -81.822 -82.271 -82.711 -83.003 -83.316 -83.821 -84.161 -84.493 -84.66 -85.018 -85.398 -85.794 -85.991 -86.314 -86.604 -86.829 -87.066 -87.567 -87.85 -88.143 -88.417 -88.707 -89.033 -89.448 -90.275 -7 ,18582 ,TETRA ,17617786,Tue Nov 30 11:47:21 CET,Tue Nov 30 13:36:17 CET,0.0 0.638 0.811 0.92 1.001 1.071 1.127 1.169 1.228 1.256 1.288 1.265 1.289 1.271 1.248 1.223 1.197 1.184 1.149 1.105 1.028 0.978 0.919 0.815 0.705 0.585 0.462 0.347 0.195 0.022 -0.164 -0.377 -0.589 -0.844 -1.17 -1.556 -1.974 -2.469 -3.018 -3.645 -4.362 -5.229 -6.307 -7.461 -8.937 -10.742 -13.047 -15.982 -19.904 -25.315 -33.353 -41.749 -47.873 -52.645 -56.452 -59.626 -62.223 -64.437 -66.29 -68.088 -69.544 -70.786 -71.977 -73.103 -74.16 -75.071 -75.952 -76.747 -77.402 -78.053 -78.748 -79.319 -79.879 -80.45 -80.893 -81.333 -81.785 -82.254 -82.736 -83.054 -83.374 -83.869 -84.213 -84.571 -84.746 -85.098 -85.464 -85.832 -86.031 -86.358 -86.656 -86.893 -87.13 -87.642 -87.919 -88.197 -88.498 -88.838 -89.238 -89.733 -90.745 -8 ,26133 ,TETRA ,17617787,Tue Nov 30 11:47:21 CET,Tue Nov 30 13:36:24 CET,0.0 0.444 0.52 0.572 0.604 0.626 0.641 0.644 0.635 0.625 0.607 0.529 0.543 0.518 0.465 0.407 0.367 0.352 0.314 0.279 0.207 0.135 0.052 -0.091 -0.235 -0.367 -0.485 -0.602 -0.769 -0.927 -1.085 -1.319 -1.589 -1.873 -2.22 -2.624 -3.04 -3.516 -4.042 -4.641 -5.341 -6.208 -7.287 -8.483 -9.992 -11.815 -14.171 -17.166 -21.119 -26.506 -34.451 -42.827 -48.948 -53.649 -57.421 -60.576 -63.178 -65.432 -67.275 -69.022 -70.477 -71.733 -72.906 -73.989 -74.954 -75.826 -76.711 -77.468 -78.113 -78.755 -79.428 -79.997 -80.584 -81.186 -81.63 -82.078 -82.524 -82.959 -83.422 -83.74 -84.069 -84.569 -84.903 -85.263 -85.444 -85.8 -86.172 -86.551 -86.742 -87.073 -87.389 -87.615 -87.846 -88.346 -88.626 -88.918 -89.218 -89.52 -89.843 -90.251 -91.317 -9 ,29927 ,TETRA ,17617788,Tue Nov 30 10:22:30 CET,Tue Nov 30 12:06:34 CET,0.0 0.61 0.75 0.86 0.942 0.994 1.016 1.033 1.066 1.084 1.096 1.05 1.083 1.076 1.059 1.041 1.0 0.968 0.903 0.825 0.693 0.611 0.532 0.415 0.297 0.19 0.089 -0.026 -0.181 -0.356 -0.558 -0.833 -1.093 -1.346 -1.68 -2.076 -2.484 -2.967 -3.516 -4.142 -4.842 -5.69 -6.787 -7.989 -9.494 -11.296 -13.602 -16.542 -20.44 -25.774 -33.65 -41.954 -48.039 -52.741 -56.51 -59.658 -62.246 -64.477 -66.318 -68.081 -69.53 -70.818 -72.036 -73.126 -74.138 -75.054 -75.959 -76.744 -77.409 -78.091 -78.797 -79.354 -79.92 -80.513 -80.958 -81.389 -81.811 -82.245 -82.717 -83.032 -83.346 -83.842 -84.187 -84.547 -84.726 -85.085 -85.445 -85.827 -86.029 -86.366 -86.681 -86.903 -87.135 -87.657 -87.926 -88.21 -88.507 -88.83 -89.236 -89.687 -90.854 -10 ,29272 ,TETRA ,17617789,Tue Nov 30 10:22:29 CET,Tue Nov 30 12:12:48 CET,0.0 0.611 0.758 0.837 0.882 0.909 0.924 0.931 0.937 0.935 0.936 0.898 0.922 0.902 0.845 0.781 0.728 0.707 0.655 0.586 0.462 0.374 0.285 0.144 0.012 -0.122 -0.275 -0.432 -0.655 -0.879 -1.103 -1.397 -1.69 -1.997 -2.38 -2.824 -3.266 -3.774 -4.343 -4.944 -5.606 -6.434 -7.523 -8.738 -10.252 -12.129 -14.524 -17.499 -21.46 -26.891 -34.891 -43.292 -49.431 -54.199 -57.986 -61.115 -63.704 -65.959 -67.846 -69.65 -71.148 -72.475 -73.683 -74.764 -75.741 -76.607 -77.5 -78.265 -78.912 -79.578 -80.247 -80.804 -81.373 -81.951 -82.4 -82.849 -83.288 -83.75 -84.243 -84.559 -84.873 -85.371 -85.711 -86.066 -86.249 -86.606 -86.965 -87.341 -87.539 -87.864 -88.14 -88.371 -88.608 -89.113 -89.379 -89.645 -89.941 -90.293 -90.692 -91.145 -91.968 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_15_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_15_25.txt deleted file mode 100644 index 8977c11e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_15_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26512 ,TETRA ,17617790,Tue Nov 30 10:22:29 CET,Tue Nov 30 12:10:20 CET,0.0 1.42 1.848 2.164 2.449 2.714 2.94 3.148 3.528 3.691 3.836 4.084 4.271 4.422 4.706 4.968 5.219 5.341 5.575 5.804 6.148 6.365 6.569 6.866 7.143 7.425 7.722 8.004 8.367 8.706 9.036 9.449 9.847 10.23 10.657 11.147 11.623 12.164 12.741 13.323 13.959 14.711 15.612 16.544 17.664 18.957 20.485 22.222 24.334 26.95 30.271 33.203 35.07 36.362 37.242 37.878 38.337 38.669 38.852 39.005 39.12 39.171 39.195 39.188 39.172 39.148 39.093 39.047 39.023 38.974 38.873 38.76 38.644 38.51 38.415 38.319 38.199 38.09 37.992 37.92 37.829 37.664 37.529 37.385 37.319 37.174 37.006 36.825 36.74 36.652 36.456 36.343 36.228 35.957 35.803 35.649 35.449 35.191 34.876 34.427 32.595 -2 ,24458 ,TETRA ,17617791,Tue Nov 30 10:22:32 CET,Tue Nov 30 12:08:57 CET,0.0 1.301 1.695 2.005 2.279 2.531 2.753 2.948 3.327 3.505 3.667 3.94 4.128 4.278 4.555 4.809 5.055 5.177 5.41 5.631 5.949 6.154 6.355 6.661 6.969 7.257 7.545 7.836 8.187 8.513 8.84 9.258 9.674 10.069 10.514 11.018 11.498 12.018 12.586 13.198 13.866 14.656 15.565 16.47 17.565 18.818 20.301 22.038 24.183 26.815 30.222 33.211 35.05 36.275 37.136 37.771 38.163 38.446 38.668 38.834 38.923 38.981 39.015 39.008 38.972 38.932 38.9 38.876 38.818 38.737 38.671 38.597 38.519 38.439 38.376 38.307 38.227 38.137 38.031 37.944 37.851 37.729 37.641 37.524 37.456 37.311 37.162 37.031 36.96 36.876 36.67 36.574 36.471 36.204 36.052 35.864 35.627 35.365 35.064 34.619 32.939 -3 ,3911 ,TETRA ,17617792,Tue Nov 30 10:23:33 CET,Tue Nov 30 12:18:19 CET,0.0 1.906 2.347 2.658 2.906 3.134 3.342 3.524 3.856 4.022 4.206 4.534 4.731 4.873 5.142 5.398 5.645 5.761 5.987 6.216 6.526 6.731 6.945 7.268 7.58 7.869 8.141 8.406 8.768 9.132 9.457 9.863 10.3 10.708 11.158 11.643 12.103 12.626 13.204 13.798 14.432 15.195 16.091 16.995 18.069 19.324 20.819 22.536 24.649 27.293 30.7 33.574 35.335 36.573 37.403 38.04 38.529 38.879 39.082 39.22 39.32 39.37 39.412 39.454 39.462 39.44 39.39 39.312 39.252 39.202 39.137 39.081 39.001 38.907 38.837 38.751 38.662 38.558 38.428 38.344 38.25 38.077 37.954 37.834 37.78 37.675 37.548 37.395 37.31 37.222 37.024 36.913 36.785 36.49 36.322 36.157 35.978 35.757 35.466 35.043 33.39 -4 ,18364 ,TETRA ,17617793,Tue Nov 30 10:25:26 CET,Tue Nov 30 12:12:03 CET,0.0 1.659 2.091 2.389 2.654 2.897 3.112 3.307 3.658 3.816 3.971 4.24 4.426 4.572 4.822 5.051 5.276 5.39 5.613 5.824 6.132 6.338 6.547 6.843 7.116 7.371 7.624 7.889 8.238 8.563 8.893 9.3 9.704 10.091 10.518 11.03 11.514 12.024 12.582 13.205 13.873 14.625 15.526 16.448 17.57 18.866 20.366 22.095 24.229 26.878 30.208 33.069 34.797 35.985 36.861 37.497 37.904 38.184 38.405 38.6 38.717 38.794 38.856 38.897 38.91 38.89 38.855 38.83 38.795 38.733 38.653 38.55 38.419 38.301 38.212 38.099 37.983 37.863 37.727 37.628 37.523 37.362 37.254 37.137 37.072 36.94 36.777 36.599 36.524 36.449 36.236 36.116 36.01 35.75 35.598 35.442 35.243 34.997 34.691 34.262 32.896 -5 ,14431 ,TETRA ,17617794,Tue Nov 30 10:25:27 CET,Tue Nov 30 12:16:03 CET,0.0 1.383 1.799 2.124 2.395 2.631 2.819 2.992 3.32 3.484 3.642 3.881 4.053 4.186 4.449 4.697 4.961 5.09 5.328 5.562 5.875 6.078 6.283 6.558 6.827 7.101 7.378 7.647 7.971 8.287 8.599 8.982 9.355 9.712 10.163 10.688 11.163 11.691 12.275 12.907 13.599 14.387 15.272 16.168 17.293 18.597 20.084 21.799 23.917 26.56 29.976 32.891 34.678 35.865 36.652 37.264 37.763 38.115 38.342 38.52 38.643 38.716 38.753 38.774 38.773 38.745 38.634 38.533 38.489 38.431 38.359 38.283 38.177 38.076 38.015 37.941 37.838 37.723 37.596 37.502 37.402 37.253 37.146 37.027 36.966 36.827 36.675 36.51 36.415 36.317 36.125 36.02 35.902 35.619 35.449 35.265 35.039 34.77 34.477 34.095 32.451 -6 ,1560 ,TETRA ,17617795,Tue Nov 30 10:28:24 CET,Tue Nov 30 12:19:45 CET,0.0 1.351 1.766 2.104 2.387 2.629 2.842 3.038 3.389 3.549 3.71 3.978 4.163 4.309 4.584 4.84 5.075 5.195 5.439 5.673 6.015 6.238 6.447 6.746 7.048 7.343 7.619 7.903 8.29 8.66 9.021 9.431 9.819 10.203 10.624 11.095 11.562 12.088 12.669 13.286 13.923 14.661 15.553 16.48 17.556 18.772 20.262 22.02 24.183 26.844 30.228 33.247 35.125 36.344 37.164 37.744 38.136 38.43 38.637 38.776 38.888 38.978 39.03 39.022 38.982 38.947 38.893 38.85 38.824 38.785 38.714 38.653 38.596 38.518 38.442 38.359 38.271 38.17 38.064 37.985 37.893 37.743 37.632 37.507 37.445 37.312 37.161 36.992 36.896 36.808 36.621 36.51 36.382 36.078 35.908 35.72 35.515 35.3 35.001 34.579 32.468 -7 ,23778 ,TETRA ,17617796,Tue Nov 30 10:29:24 CET,Tue Nov 30 12:28:21 CET,0.0 2.101 2.536 2.861 3.169 3.443 3.671 3.876 4.241 4.414 4.584 4.863 5.05 5.199 5.492 5.763 6.004 6.114 6.342 6.571 6.896 7.104 7.305 7.604 7.896 8.177 8.462 8.755 9.133 9.494 9.832 10.223 10.602 10.964 11.366 11.826 12.288 12.807 13.384 14.011 14.67 15.427 16.35 17.282 18.353 19.577 21.064 22.832 24.961 27.639 31.036 33.974 35.832 37.085 37.961 38.583 38.997 39.291 39.512 39.716 39.848 39.918 39.964 39.981 39.993 40.008 40.005 39.963 39.907 39.842 39.753 39.667 39.591 39.526 39.47 39.41 39.342 39.253 39.142 39.051 38.95 38.819 38.729 38.604 38.534 38.414 38.29 38.119 38.03 37.938 37.727 37.615 37.488 37.188 37.02 36.826 36.605 36.372 36.075 35.681 33.589 -8 ,23285 ,TETRA ,17617797,Tue Nov 30 10:29:24 CET,Tue Nov 30 12:15:52 CET,0.0 1.352 1.823 2.152 2.428 2.658 2.852 3.056 3.421 3.576 3.728 3.987 4.167 4.306 4.561 4.805 5.055 5.186 5.426 5.641 5.955 6.16 6.361 6.656 6.937 7.209 7.48 7.754 8.1 8.421 8.77 9.215 9.632 10.055 10.522 10.993 11.442 11.96 12.531 13.171 13.872 14.667 15.605 16.541 17.631 18.864 20.336 22.079 24.207 26.852 30.237 33.176 35.001 36.287 37.201 37.788 38.161 38.448 38.631 38.721 38.796 38.878 38.945 38.99 38.999 38.987 38.966 38.919 38.873 38.811 38.717 38.649 38.571 38.466 38.388 38.313 38.218 38.119 38.017 37.939 37.847 37.716 37.628 37.521 37.466 37.331 37.164 36.995 36.905 36.808 36.602 36.488 36.369 36.111 35.967 35.793 35.585 35.333 35.017 34.61 32.639 -9 ,1372 ,TETRA ,17617798,Tue Nov 30 10:30:23 CET,Tue Nov 30 12:27:10 CET,0.0 1.784 2.23 2.562 2.841 3.089 3.325 3.549 3.924 4.091 4.265 4.547 4.72 4.863 5.155 5.421 5.65 5.767 6.005 6.228 6.556 6.775 6.982 7.289 7.598 7.903 8.199 8.478 8.839 9.193 9.525 9.911 10.31 10.681 11.097 11.581 12.037 12.55 13.108 13.727 14.428 15.231 16.138 17.043 18.121 19.361 20.856 22.625 24.775 27.379 30.703 33.702 35.602 36.845 37.703 38.329 38.803 39.173 39.413 39.569 39.685 39.73 39.735 39.743 39.739 39.707 39.653 39.629 39.605 39.554 39.48 39.414 39.317 39.2 39.131 39.047 38.93 38.808 38.684 38.597 38.512 38.371 38.258 38.124 38.055 37.926 37.782 37.619 37.533 37.44 37.238 37.137 37.025 36.739 36.569 36.365 36.127 35.875 35.584 35.175 33.507 -10 ,5047 ,TETRA ,17617799,Tue Nov 30 10:33:25 CET,Tue Nov 30 12:20:03 CET,0.0 1.352 1.736 2.041 2.3 2.531 2.743 2.929 3.272 3.442 3.609 3.891 4.078 4.228 4.501 4.747 5.003 5.127 5.354 5.572 5.891 6.099 6.296 6.572 6.849 7.134 7.407 7.666 7.998 8.328 8.66 9.045 9.419 9.796 10.225 10.722 11.223 11.762 12.325 12.937 13.618 14.407 15.305 16.216 17.319 18.6 20.135 21.899 24.007 26.632 30.018 32.957 34.766 35.972 36.828 37.449 37.891 38.229 38.437 38.577 38.687 38.73 38.759 38.796 38.761 38.69 38.622 38.575 38.536 38.481 38.401 38.34 38.253 38.13 38.061 38.012 37.944 37.856 37.762 37.695 37.603 37.413 37.288 37.163 37.091 36.943 36.812 36.685 36.598 36.5 36.296 36.197 36.096 35.845 35.706 35.558 35.369 35.123 34.809 34.39 32.748 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_15_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_15_252.txt deleted file mode 100644 index 2936d81f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_15_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9981 ,TETRA ,17617800,Tue Nov 30 10:33:26 CET,Tue Nov 30 12:20:02 CET,0.0 0.761 0.907 0.987 1.028 1.04 1.032 1.01 0.935 0.895 0.842 0.643 0.59 0.504 0.335 0.155 -0.038 -0.133 -0.325 -0.511 -0.793 -1.009 -1.237 -1.581 -1.948 -2.319 -2.693 -3.066 -3.535 -4.025 -4.538 -5.211 -5.897 -6.555 -7.377 -8.374 -9.355 -10.523 -11.907 -13.465 -15.178 -17.204 -19.725 -22.437 -25.85 -29.987 -35.217 -41.706 -50.192 -61.703 -78.39 -95.64 -108.14 -117.724 -125.326 -131.623 -136.765 -141.151 -144.774 -148.266 -151.124 -153.557 -155.814 -157.841 -159.66 -161.277 -162.929 -164.39 -165.608 -166.832 -168.072 -169.075 -170.085 -171.101 -171.879 -172.671 -173.457 -174.248 -175.078 -175.655 -176.235 -177.117 -177.727 -178.333 -178.625 -179.22 -179.838 -180.453 -180.773 -181.349 -181.828 -182.195 -182.565 -183.326 -183.74 -184.184 -184.661 -185.176 -185.823 -186.67 -188.575 -2 ,7031 ,TETRA ,17617801,Tue Nov 30 10:33:27 CET,Tue Nov 30 12:19:55 CET,0.0 0.824 1.024 1.12 1.152 1.16 1.144 1.101 0.97 0.899 0.822 0.629 0.602 0.53 0.347 0.158 -0.039 -0.137 -0.311 -0.485 -0.791 -1.012 -1.232 -1.566 -1.912 -2.26 -2.618 -2.99 -3.476 -3.988 -4.507 -5.174 -5.87 -6.568 -7.435 -8.463 -9.464 -10.624 -11.99 -13.536 -15.229 -17.254 -19.818 -22.577 -26.018 -30.161 -35.38 -41.888 -50.428 -61.986 -78.662 -95.823 -108.267 -117.8 -125.361 -131.675 -136.821 -141.208 -144.827 -148.292 -151.13 -153.549 -155.77 -157.762 -159.568 -161.179 -162.792 -164.198 -165.404 -166.664 -167.962 -168.991 -170.029 -171.083 -171.868 -172.664 -173.483 -174.308 -175.139 -175.694 -176.25 -177.116 -177.708 -178.305 -178.611 -179.259 -179.908 -180.564 -180.896 -181.464 -181.97 -182.414 -182.885 -183.802 -184.273 -184.801 -185.379 -185.992 -186.7 -187.55 -190.114 -3 ,14193 ,TETRA ,17617802,Tue Nov 30 10:33:27 CET,Tue Nov 30 12:20:26 CET,0.0 0.787 0.919 1.015 1.062 1.051 1.028 0.998 0.895 0.834 0.765 0.577 0.544 0.471 0.289 0.078 -0.12 -0.216 -0.415 -0.623 -0.939 -1.155 -1.392 -1.754 -2.114 -2.48 -2.838 -3.209 -3.718 -4.226 -4.763 -5.456 -6.155 -6.842 -7.645 -8.593 -9.563 -10.725 -12.086 -13.605 -15.294 -17.309 -19.856 -22.631 -26.072 -30.229 -35.463 -41.952 -50.451 -61.945 -78.557 -95.704 -108.191 -117.807 -125.403 -131.703 -136.898 -141.377 -145.057 -148.528 -151.367 -153.793 -156.012 -158.016 -159.824 -161.432 -163.121 -164.574 -165.777 -167.002 -168.232 -169.231 -170.216 -171.205 -171.952 -172.73 -173.535 -174.336 -175.166 -175.729 -176.298 -177.197 -177.819 -178.433 -178.742 -179.376 -180.008 -180.644 -180.981 -181.599 -182.161 -182.627 -183.094 -184.02 -184.51 -185.019 -185.569 -186.154 -186.87 -187.776 -189.773 -4 ,704 ,TETRA ,17617803,Tue Nov 30 10:33:29 CET,Tue Nov 30 12:20:19 CET,0.0 0.533 0.616 0.642 0.653 0.639 0.616 0.582 0.465 0.413 0.374 0.22 0.186 0.103 -0.071 -0.235 -0.403 -0.484 -0.672 -0.89 -1.232 -1.465 -1.698 -2.032 -2.377 -2.743 -3.121 -3.504 -4.013 -4.536 -5.078 -5.753 -6.438 -7.139 -7.984 -8.978 -9.99 -11.207 -12.587 -14.123 -15.832 -17.868 -20.417 -23.171 -26.632 -30.782 -35.967 -42.455 -51.012 -62.583 -79.364 -96.556 -108.993 -118.54 -126.059 -132.339 -137.488 -141.835 -145.493 -149.018 -151.843 -154.255 -156.478 -158.533 -160.405 -162.05 -163.73 -165.223 -166.489 -167.74 -168.987 -169.99 -171.013 -172.042 -172.81 -173.595 -174.39 -175.199 -176.051 -176.631 -177.218 -178.126 -178.735 -179.418 -179.802 -180.567 -181.341 -182.138 -182.555 -183.276 -183.827 -184.242 -184.684 -185.658 -186.165 -186.685 -187.262 -187.887 -188.529 -189.303 -190.954 -5 ,12198 ,TETRA ,17617804,Tue Nov 30 10:34:23 CET,Tue Nov 30 12:26:40 CET,0.0 0.553 0.658 0.682 0.705 0.712 0.707 0.694 0.643 0.596 0.531 0.366 0.328 0.247 0.067 -0.105 -0.268 -0.36 -0.555 -0.772 -1.095 -1.32 -1.561 -1.922 -2.279 -2.628 -2.98 -3.353 -3.88 -4.426 -4.973 -5.664 -6.366 -7.081 -7.951 -8.927 -9.916 -11.115 -12.506 -14.056 -15.775 -17.833 -20.381 -23.138 -26.577 -30.726 -35.99 -42.483 -50.93 -62.403 -79.071 -96.206 -108.69 -118.345 -125.96 -132.228 -137.38 -141.759 -145.332 -148.747 -151.612 -154.102 -156.375 -158.417 -160.237 -161.834 -163.455 -164.907 -166.161 -167.395 -168.626 -169.65 -170.682 -171.724 -172.541 -173.339 -174.116 -174.931 -175.773 -176.35 -176.955 -177.886 -178.5 -179.107 -179.423 -180.141 -180.933 -181.773 -182.191 -182.885 -183.45 -183.9 -184.349 -185.309 -185.819 -186.33 -186.884 -187.497 -188.193 -189.055 -190.807 -6 ,28131 ,TETRA ,17617805,Tue Nov 30 10:34:25 CET,Tue Nov 30 12:25:35 CET,0.0 0.964 1.11 1.151 1.187 1.21 1.218 1.203 1.135 1.096 1.049 0.878 0.835 0.76 0.603 0.414 0.232 0.147 -0.04 -0.256 -0.613 -0.835 -1.062 -1.424 -1.786 -2.157 -2.524 -2.909 -3.446 -3.98 -4.499 -5.141 -5.831 -6.549 -7.416 -8.436 -9.469 -10.677 -12.068 -13.595 -15.273 -17.309 -19.848 -22.587 -26.047 -30.212 -35.408 -41.936 -50.501 -62.008 -78.663 -95.826 -108.36 -118.088 -125.721 -132.008 -137.167 -141.554 -145.152 -148.582 -151.434 -153.849 -156.044 -158.062 -159.889 -161.505 -163.17 -164.625 -165.825 -167.043 -168.319 -169.332 -170.305 -171.307 -172.071 -172.856 -173.646 -174.428 -175.268 -175.936 -176.676 -177.752 -178.472 -179.231 -179.632 -180.445 -181.261 -182.081 -182.503 -183.213 -183.749 -184.182 -184.628 -185.556 -186.071 -186.624 -187.204 -187.831 -188.528 -189.355 -191.449 -7 ,15465 ,TETRA ,17617806,Tue Nov 30 10:36:27 CET,Tue Nov 30 12:24:48 CET,0.0 0.564 0.781 0.921 0.966 0.96 0.943 0.919 0.816 0.747 0.689 0.557 0.524 0.454 0.319 0.166 -0.008 -0.11 -0.309 -0.508 -0.827 -1.064 -1.321 -1.678 -2.046 -2.442 -2.835 -3.235 -3.787 -4.353 -4.901 -5.548 -6.217 -6.931 -7.803 -8.792 -9.814 -11.037 -12.419 -13.956 -15.663 -17.732 -20.311 -23.062 -26.486 -30.622 -35.83 -42.294 -50.769 -62.334 -79.058 -96.19 -108.699 -118.382 -126.027 -132.289 -137.386 -141.789 -145.418 -148.894 -151.775 -154.241 -156.518 -158.595 -160.458 -162.099 -163.75 -165.182 -166.394 -167.626 -168.859 -169.841 -170.832 -171.823 -172.587 -173.376 -174.176 -174.998 -175.836 -176.394 -176.946 -177.816 -178.427 -179.04 -179.343 -179.962 -180.62 -181.287 -181.616 -182.181 -182.633 -182.989 -183.356 -184.172 -184.591 -185.027 -185.493 -185.968 -186.544 -187.272 -189.652 -8 ,22966 ,TETRA ,17617807,Tue Nov 30 10:36:30 CET,Tue Nov 30 12:23:55 CET,0.0 0.629 0.765 0.794 0.795 0.777 0.736 0.684 0.562 0.498 0.418 0.205 0.163 0.09 -0.069 -0.233 -0.405 -0.501 -0.712 -0.929 -1.239 -1.443 -1.662 -2.015 -2.378 -2.747 -3.129 -3.524 -4.073 -4.625 -5.17 -5.869 -6.584 -7.263 -8.098 -9.137 -10.174 -11.37 -12.726 -14.252 -15.961 -18.001 -20.539 -23.283 -26.703 -30.8 -35.933 -42.382 -50.893 -62.405 -79.138 -96.265 -108.629 -118.256 -125.883 -132.189 -137.372 -141.785 -145.396 -148.822 -151.644 -154.044 -156.256 -158.303 -160.132 -161.732 -163.392 -164.839 -166.042 -167.26 -168.495 -169.495 -170.503 -171.528 -172.318 -173.129 -173.93 -174.728 -175.578 -176.161 -176.74 -177.61 -178.182 -178.766 -179.063 -179.679 -180.333 -180.997 -181.362 -182.049 -182.612 -183.04 -183.489 -184.421 -184.911 -185.419 -185.957 -186.518 -187.168 -187.976 -189.936 -9 ,15180 ,TETRA ,17617808,Tue Nov 30 10:36:27 CET,Tue Nov 30 12:23:39 CET,0.0 0.748 0.897 0.963 0.987 0.986 0.984 0.952 0.859 0.817 0.777 0.621 0.575 0.497 0.348 0.164 -0.042 -0.142 -0.351 -0.568 -0.89 -1.122 -1.358 -1.705 -2.076 -2.443 -2.815 -3.18 -3.654 -4.164 -4.705 -5.393 -6.093 -6.811 -7.684 -8.711 -9.754 -10.977 -12.345 -13.855 -15.551 -17.623 -20.229 -22.978 -26.408 -30.565 -35.777 -42.256 -50.755 -62.321 -79.08 -96.242 -108.706 -118.218 -125.743 -132.04 -137.139 -141.46 -145.011 -148.434 -151.313 -153.744 -155.998 -158.138 -160.052 -161.694 -163.372 -164.805 -165.973 -167.19 -168.438 -169.448 -170.489 -171.526 -172.3 -173.088 -173.862 -174.64 -175.444 -176.006 -176.635 -177.692 -178.435 -179.193 -179.578 -180.359 -181.133 -181.927 -182.341 -183.046 -183.619 -184.074 -184.541 -185.487 -185.964 -186.463 -187.006 -187.599 -188.258 -189.072 -190.963 -10 ,32655 ,TETRA ,17617809,Tue Nov 30 10:36:30 CET,Tue Nov 30 12:23:32 CET,0.0 0.786 0.926 0.966 0.98 0.992 1.003 0.988 0.908 0.857 0.785 0.583 0.543 0.461 0.294 0.136 -0.03 -0.123 -0.297 -0.464 -0.742 -0.944 -1.159 -1.505 -1.883 -2.267 -2.659 -3.063 -3.587 -4.1 -4.636 -5.345 -6.043 -6.757 -7.631 -8.618 -9.603 -10.788 -12.154 -13.686 -15.378 -17.394 -19.966 -22.697 -26.083 -30.23 -35.464 -41.972 -50.521 -62.05 -78.708 -95.907 -108.431 -118.06 -125.656 -131.944 -137.113 -141.526 -145.151 -148.601 -151.438 -153.87 -156.099 -158.129 -159.993 -161.674 -163.333 -164.732 -165.9 -167.087 -168.322 -169.348 -170.366 -171.363 -172.13 -172.921 -173.724 -174.539 -175.363 -175.939 -176.529 -177.407 -177.987 -178.569 -178.871 -179.501 -180.139 -180.866 -181.289 -182.004 -182.597 -183.052 -183.508 -184.47 -184.965 -185.473 -186.048 -186.666 -187.386 -188.281 -190.106 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_164.txt deleted file mode 100644 index ba8ce119..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16076 ,TETRA ,17617810,Tue Nov 30 10:37:26 CET,Tue Nov 30 12:31:12 CET,0.0 1.205 1.553 1.835 2.074 2.286 2.467 2.626 2.908 3.037 3.163 3.266 3.511 3.627 3.843 4.03 4.221 4.322 4.52 4.704 4.951 5.101 5.248 5.473 5.697 5.921 6.137 6.335 6.588 6.834 7.077 7.385 7.688 7.983 8.337 8.729 9.101 9.518 9.975 10.472 11.001 11.608 12.328 13.076 13.931 14.853 15.977 17.245 18.71 20.483 22.608 24.306 25.19 25.67 25.897 25.999 26.027 25.982 25.944 25.852 25.719 25.614 25.507 25.382 25.253 25.148 25.049 24.932 24.811 24.687 24.565 24.459 24.34 24.203 24.088 23.978 23.866 23.751 23.623 23.526 23.43 23.275 23.161 23.04 22.975 22.841 22.687 22.528 22.45 22.264 22.189 22.092 21.979 21.731 21.608 21.473 21.296 21.068 20.817 20.509 19.641 -2 ,14938 ,TETRA ,17617811,Tue Nov 30 10:38:24 CET,Tue Nov 30 12:25:59 CET,0.0 0.761 1.048 1.259 1.428 1.579 1.719 1.857 2.111 2.229 2.347 2.436 2.665 2.765 2.963 3.143 3.318 3.405 3.57 3.736 3.983 4.136 4.285 4.511 4.715 4.909 5.106 5.307 5.583 5.847 6.096 6.402 6.721 7.01 7.315 7.681 8.051 8.452 8.875 9.332 9.814 10.374 11.077 11.8 12.67 13.638 14.711 15.945 17.353 18.965 20.981 22.625 23.439 23.894 24.134 24.213 24.196 24.154 24.087 23.972 23.854 23.732 23.625 23.536 23.427 23.303 23.187 23.1 23.013 22.906 22.783 22.671 22.544 22.419 22.324 22.22 22.117 22.001 21.878 21.794 21.7 21.553 21.451 21.347 21.295 21.189 21.077 20.943 20.876 20.703 20.653 20.567 20.478 20.294 20.19 20.068 19.929 19.78 19.603 19.327 18.621 -3 ,11305 ,TETRA ,17617812,Tue Nov 30 10:39:24 CET,Tue Nov 30 12:27:25 CET,0.0 0.871 1.128 1.354 1.57 1.792 1.998 2.178 2.497 2.641 2.776 2.879 3.1 3.197 3.406 3.603 3.773 3.854 4.015 4.171 4.408 4.572 4.722 4.929 5.129 5.328 5.532 5.726 5.965 6.195 6.429 6.725 7.002 7.265 7.592 7.976 8.326 8.697 9.111 9.565 10.031 10.566 11.209 11.88 12.664 13.534 14.579 15.786 17.209 18.938 20.998 22.632 23.525 23.961 24.074 24.061 24.018 23.95 23.878 23.766 23.645 23.522 23.402 23.279 23.137 23.001 22.872 22.743 22.62 22.498 22.365 22.248 22.128 22.004 21.901 21.795 21.684 21.572 21.449 21.35 21.241 21.081 20.975 20.85 20.784 20.645 20.505 20.36 20.279 20.093 20.001 19.899 19.798 19.556 19.417 19.252 19.057 18.856 18.619 18.274 17.344 -4 ,15301 ,TETRA ,17617813,Tue Nov 30 10:39:23 CET,Tue Nov 30 12:29:22 CET,0.0 0.602 0.882 1.126 1.339 1.53 1.698 1.841 2.097 2.225 2.356 2.474 2.717 2.82 3.022 3.219 3.408 3.501 3.694 3.885 4.15 4.317 4.479 4.72 4.969 5.214 5.44 5.663 5.97 6.267 6.546 6.875 7.181 7.46 7.791 8.185 8.551 8.954 9.411 9.903 10.416 10.984 11.642 12.322 13.13 14.037 15.071 16.191 17.601 19.353 21.319 22.851 23.634 23.979 24.18 24.265 24.254 24.261 24.247 24.133 24.009 23.91 23.796 23.689 23.588 23.491 23.364 23.242 23.138 22.995 22.844 22.723 22.593 22.461 22.364 22.259 22.138 22.022 21.91 21.831 21.747 21.602 21.501 21.404 21.348 21.22 21.094 20.961 20.891 20.713 20.668 20.577 20.481 20.284 20.159 20.024 19.88 19.724 19.559 19.331 18.545 -5 ,16673 ,TETRA ,17617814,Tue Nov 30 10:40:22 CET,Tue Nov 30 12:30:22 CET,0.0 0.719 0.975 1.193 1.387 1.568 1.728 1.877 2.135 2.257 2.379 2.465 2.691 2.792 2.981 3.17 3.355 3.442 3.619 3.804 4.054 4.206 4.358 4.577 4.795 5.014 5.239 5.467 5.747 6.021 6.29 6.6 6.906 7.214 7.572 7.967 8.347 8.777 9.262 9.775 10.292 10.869 11.55 12.265 13.121 14.108 15.255 16.502 17.908 19.587 21.601 23.208 24.099 24.508 24.73 24.837 24.847 24.79 24.685 24.589 24.491 24.377 24.246 24.099 23.958 23.829 23.671 23.528 23.417 23.302 23.166 23.049 22.917 22.776 22.657 22.532 22.412 22.28 22.141 22.047 21.956 21.809 21.694 21.588 21.531 21.403 21.28 21.146 21.077 20.903 20.85 20.75 20.648 20.423 20.304 20.176 20.027 19.872 19.692 19.446 18.759 -6 ,6282 ,TETRA ,17617815,Tue Nov 30 10:39:24 CET,Tue Nov 30 12:27:47 CET,0.0 0.929 1.217 1.432 1.594 1.74 1.877 2.011 2.263 2.379 2.493 2.584 2.82 2.919 3.103 3.283 3.458 3.54 3.707 3.89 4.17 4.353 4.514 4.721 4.922 5.125 5.324 5.522 5.768 5.994 6.218 6.492 6.765 7.031 7.331 7.688 8.065 8.495 8.948 9.447 9.96 10.536 11.26 11.978 12.805 13.731 14.837 16.09 17.527 19.224 21.277 22.814 23.615 24.006 24.134 24.148 24.158 24.144 24.081 23.989 23.874 23.759 23.643 23.519 23.397 23.272 23.121 22.988 22.89 22.778 22.639 22.53 22.426 22.322 22.234 22.132 22.024 21.901 21.756 21.661 21.566 21.405 21.293 21.187 21.136 21.027 20.916 20.798 20.734 20.57 20.556 20.486 20.406 20.224 20.128 20.029 19.906 19.738 19.533 19.275 18.665 -7 ,11974 ,TETRA ,17617816,Tue Nov 30 10:39:24 CET,Tue Nov 30 12:29:01 CET,0.0 1.145 1.522 1.816 2.065 2.276 2.455 2.605 2.868 2.998 3.117 3.202 3.431 3.534 3.729 3.905 4.08 4.168 4.341 4.503 4.742 4.892 5.029 5.238 5.442 5.632 5.836 6.055 6.341 6.618 6.884 7.195 7.484 7.773 8.107 8.472 8.839 9.25 9.688 10.17 10.68 11.272 11.985 12.69 13.521 14.45 15.518 16.748 18.204 19.893 21.843 23.367 24.188 24.608 24.794 24.903 24.97 24.995 24.942 24.832 24.73 24.61 24.487 24.371 24.252 24.128 23.978 23.832 23.702 23.578 23.45 23.344 23.235 23.105 23.002 22.905 22.789 22.653 22.528 22.448 22.352 22.187 22.073 21.945 21.882 21.764 21.624 21.456 21.374 21.188 21.098 20.988 20.869 20.636 20.498 20.356 20.2 20.013 19.791 19.518 18.763 -8 ,13911 ,TETRA ,17617817,Tue Nov 30 10:40:22 CET,Tue Nov 30 12:28:47 CET,0.0 1.139 1.449 1.67 1.846 2.01 2.168 2.316 2.591 2.713 2.819 2.887 3.114 3.215 3.412 3.6 3.779 3.867 4.036 4.197 4.43 4.578 4.722 4.932 5.15 5.378 5.578 5.763 6.017 6.268 6.511 6.81 7.097 7.385 7.729 8.133 8.536 8.98 9.457 9.958 10.48 11.052 11.708 12.368 13.163 14.06 15.108 16.29 17.629 19.334 21.305 22.772 23.617 24.021 24.187 24.234 24.188 24.114 24.036 23.913 23.815 23.745 23.631 23.481 23.363 23.249 23.098 22.962 22.839 22.7 22.566 22.458 22.345 22.238 22.156 22.061 21.952 21.822 21.689 21.604 21.504 21.344 21.242 21.15 21.096 20.98 20.859 20.718 20.645 20.461 20.402 20.324 20.243 20.032 19.915 19.81 19.674 19.502 19.297 19.025 18.164 -9 ,20783 ,TETRA ,17617818,Tue Nov 30 10:40:22 CET,Tue Nov 30 12:28:49 CET,0.0 0.601 0.84 1.025 1.198 1.357 1.509 1.651 1.897 2.009 2.117 2.189 2.414 2.509 2.697 2.877 3.052 3.134 3.29 3.453 3.688 3.832 3.974 4.176 4.378 4.58 4.772 4.95 5.178 5.403 5.634 5.923 6.184 6.447 6.767 7.122 7.472 7.859 8.286 8.743 9.225 9.771 10.402 11.057 11.831 12.727 13.786 14.933 16.318 17.959 19.77 21.21 22.02 22.382 22.539 22.608 22.62 22.59 22.546 22.473 22.366 22.238 22.093 21.952 21.819 21.683 21.548 21.418 21.289 21.149 20.998 20.876 20.749 20.611 20.488 20.368 20.247 20.118 19.988 19.89 19.787 19.641 19.544 19.435 19.366 19.226 19.09 18.941 18.867 18.688 18.603 18.5 18.386 18.128 17.998 17.866 17.708 17.51 17.26 16.968 16.316 -10 ,25420 ,TETRA ,17617819,Tue Nov 30 10:40:23 CET,Tue Nov 30 12:31:58 CET,0.0 0.455 0.686 0.905 1.111 1.285 1.428 1.564 1.813 1.94 2.069 2.174 2.421 2.529 2.716 2.902 3.113 3.216 3.402 3.588 3.858 4.026 4.194 4.455 4.703 4.936 5.158 5.373 5.657 5.931 6.198 6.547 6.889 7.208 7.565 7.955 8.328 8.758 9.231 9.739 10.287 10.902 11.627 12.336 13.179 14.188 15.337 16.568 17.975 19.66 21.713 23.289 24.103 24.521 24.727 24.833 24.838 24.752 24.644 24.525 24.404 24.292 24.204 24.098 23.972 23.864 23.761 23.66 23.545 23.402 23.262 23.15 23.027 22.898 22.794 22.678 22.542 22.397 22.259 22.161 22.062 21.926 21.822 21.705 21.642 21.502 21.36 21.218 21.151 20.978 20.938 20.855 20.77 20.598 20.496 20.377 20.243 20.079 19.884 19.616 18.772 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_165.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_165.txt deleted file mode 100644 index 50a3a63d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_165.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3505 ,TETRA ,17617820,Tue Nov 30 10:40:22 CET,Tue Nov 30 12:30:20 CET,0.0 0.785 1.056 1.249 1.423 1.574 1.714 1.843 2.065 2.176 2.283 2.339 2.55 2.636 2.811 2.981 3.14 3.217 3.366 3.51 3.718 3.851 3.985 4.191 4.38 4.56 4.736 4.902 5.115 5.325 5.542 5.793 6.038 6.29 6.572 6.894 7.195 7.529 7.913 8.308 8.718 9.194 9.763 10.315 10.915 11.61 12.455 13.419 14.513 15.738 17.235 18.438 19.053 19.394 19.548 19.61 19.61 19.558 19.512 19.479 19.436 19.369 19.305 19.236 19.14 19.026 18.908 18.805 18.702 18.592 18.489 18.403 18.315 18.232 18.16 18.074 17.975 17.885 17.791 17.726 17.668 17.574 17.506 17.428 17.38 17.264 17.147 17.036 16.973 16.793 16.763 16.68 16.583 16.375 16.254 16.118 15.987 15.837 15.639 15.424 14.856 -2 ,12152 ,TETRA ,17617821,Tue Nov 30 10:40:23 CET,Tue Nov 30 12:30:32 CET,0.0 0.948 1.182 1.355 1.518 1.679 1.83 1.964 2.208 2.323 2.435 2.507 2.734 2.839 3.043 3.239 3.419 3.508 3.688 3.864 4.101 4.251 4.399 4.624 4.843 5.047 5.251 5.44 5.683 5.932 6.177 6.452 6.703 6.957 7.255 7.587 7.899 8.227 8.594 9.009 9.442 9.911 10.456 11.016 11.665 12.37 13.173 14.067 15.135 16.398 17.818 18.935 19.524 19.797 19.922 19.97 19.959 19.925 19.876 19.782 19.651 19.538 19.451 19.342 19.196 19.075 18.944 18.811 18.696 18.579 18.467 18.371 18.283 18.194 18.109 18.023 17.942 17.838 17.719 17.648 17.572 17.433 17.343 17.261 17.216 17.124 17.033 16.931 16.877 16.7 16.671 16.602 16.528 16.374 16.284 16.181 16.067 15.938 15.727 15.444 14.628 -3 ,6992 ,TETRA ,17617822,Tue Nov 30 10:41:21 CET,Tue Nov 30 12:31:40 CET,0.0 0.745 0.975 1.153 1.311 1.456 1.593 1.721 1.951 2.067 2.175 2.236 2.458 2.552 2.749 2.936 3.118 3.208 3.377 3.549 3.795 3.95 4.091 4.293 4.497 4.699 4.888 5.066 5.299 5.522 5.747 6.021 6.276 6.522 6.813 7.142 7.443 7.769 8.125 8.503 8.905 9.364 9.879 10.401 11.049 11.788 12.652 13.611 14.684 15.973 17.493 18.575 19.146 19.478 19.667 19.718 19.674 19.615 19.538 19.448 19.365 19.278 19.189 19.1 19.005 18.896 18.774 18.67 18.561 18.434 18.288 18.166 18.059 17.96 17.88 17.783 17.665 17.543 17.422 17.332 17.234 17.088 16.987 16.869 16.809 16.687 16.543 16.373 16.298 16.122 16.105 16.035 15.946 15.74 15.626 15.496 15.345 15.178 14.984 14.71 14.029 -4 ,7234 ,TETRA ,17617823,Tue Nov 30 10:41:21 CET,Tue Nov 30 12:31:08 CET,0.0 0.549 0.787 0.979 1.13 1.269 1.4 1.522 1.731 1.832 1.944 2.04 2.267 2.349 2.522 2.7 2.863 2.946 3.115 3.289 3.538 3.69 3.834 4.05 4.27 4.478 4.68 4.882 5.125 5.349 5.573 5.851 6.126 6.383 6.671 6.999 7.328 7.711 8.114 8.513 8.929 9.426 9.994 10.549 11.187 11.873 12.687 13.622 14.732 16.093 17.651 18.752 19.337 19.628 19.746 19.781 19.773 19.749 19.7 19.61 19.498 19.377 19.264 19.156 19.045 18.913 18.763 18.642 18.537 18.43 18.308 18.212 18.105 17.985 17.907 17.823 17.73 17.632 17.528 17.442 17.346 17.192 17.091 16.994 16.941 16.832 16.717 16.582 16.502 16.311 16.268 16.184 16.093 15.898 15.779 15.643 15.496 15.307 15.094 14.845 14.106 -5 ,20272 ,TETRA ,17617824,Tue Nov 30 10:43:18 CET,Tue Nov 30 12:33:32 CET,0.0 0.851 1.134 1.383 1.595 1.772 1.929 2.065 2.302 2.406 2.499 2.546 2.757 2.836 3.003 3.171 3.335 3.409 3.549 3.682 3.866 3.981 4.097 4.286 4.479 4.654 4.817 4.983 5.192 5.392 5.602 5.858 6.096 6.322 6.592 6.912 7.212 7.532 7.876 8.252 8.64 9.093 9.632 10.154 10.769 11.464 12.274 13.184 14.289 15.618 17.132 18.289 18.892 19.234 19.388 19.462 19.462 19.414 19.338 19.221 19.123 19.052 18.969 18.87 18.781 18.675 18.541 18.414 18.305 18.199 18.073 17.961 17.847 17.722 17.613 17.489 17.36 17.231 17.089 16.989 16.898 16.756 16.653 16.546 16.491 16.378 16.249 16.104 16.037 15.867 15.852 15.784 15.718 15.562 15.459 15.336 15.202 15.06 14.888 14.632 14.013 -6 ,7945 ,TETRA ,17617825,Tue Nov 30 10:44:21 CET,Tue Nov 30 12:36:11 CET,0.0 0.755 1.035 1.293 1.498 1.682 1.855 2.015 2.336 2.482 2.606 2.727 2.97 3.08 3.286 3.456 3.607 3.679 3.831 3.985 4.209 4.345 4.473 4.673 4.87 5.047 5.22 5.402 5.64 5.87 6.108 6.386 6.627 6.88 7.186 7.52 7.837 8.185 8.574 8.984 9.418 9.891 10.446 10.994 11.615 12.333 13.201 14.185 15.288 16.507 17.94 19.029 19.576 19.841 19.971 20.065 20.094 20.07 20.008 19.908 19.81 19.727 19.621 19.476 19.354 19.264 19.165 19.067 18.981 18.897 18.811 18.745 18.668 18.587 18.526 18.461 18.391 18.301 18.199 18.134 18.068 17.949 17.867 17.79 17.748 17.667 17.584 17.48 17.418 17.242 17.228 17.165 17.103 16.97 16.894 16.8 16.686 16.555 16.394 16.168 15.59 -7 ,22363 ,TETRA ,17617826,Tue Nov 30 10:44:22 CET,Tue Nov 30 12:36:57 CET,0.0 1.098 1.508 1.817 2.068 2.284 2.477 2.66 2.986 3.122 3.25 3.366 3.596 3.699 3.918 4.125 4.304 4.388 4.55 4.705 4.93 5.078 5.225 5.441 5.64 5.828 6.011 6.195 6.442 6.676 6.906 7.192 7.478 7.746 8.048 8.41 8.746 9.108 9.496 9.902 10.333 10.811 11.374 11.94 12.57 13.269 14.084 14.976 16.019 17.253 18.648 19.725 20.401 20.808 21.003 21.117 21.179 21.16 21.088 20.992 20.909 20.83 20.753 20.666 20.577 20.489 20.391 20.307 20.226 20.141 20.067 20.005 19.924 19.834 19.761 19.672 19.573 19.468 19.363 19.3 19.234 19.114 19.015 18.907 18.857 18.767 18.678 18.581 18.527 18.352 18.332 18.27 18.209 18.057 17.96 17.848 17.71 17.551 17.396 17.215 16.764 -8 ,11061 ,TETRA ,17617827,Tue Nov 30 10:45:22 CET,Tue Nov 30 12:35:41 CET,0.0 0.593 0.827 1.018 1.202 1.38 1.54 1.681 1.923 2.041 2.165 2.241 2.454 2.548 2.753 2.949 3.131 3.213 3.354 3.484 3.683 3.822 3.96 4.156 4.35 4.54 4.737 4.943 5.187 5.411 5.637 5.905 6.158 6.401 6.684 7.01 7.318 7.661 8.038 8.458 8.906 9.4 9.997 10.613 11.303 12.051 12.921 13.855 14.915 16.185 17.642 18.762 19.373 19.7 19.869 19.953 19.924 19.811 19.68 19.508 19.373 19.281 19.186 19.084 18.982 18.882 18.768 18.648 18.522 18.384 18.235 18.105 17.972 17.85 17.771 17.692 17.614 17.538 17.454 17.393 17.328 17.221 17.14 17.048 17.002 16.909 16.808 16.697 16.639 16.472 16.472 16.413 16.351 16.202 16.119 16.032 15.93 15.814 15.672 15.479 14.972 -9 ,20148 ,TETRA ,17617828,Tue Nov 30 10:45:23 CET,Tue Nov 30 12:34:07 CET,0.0 0.809 1.127 1.354 1.535 1.69 1.843 1.995 2.247 2.343 2.437 2.504 2.719 2.812 2.996 3.154 3.306 3.381 3.531 3.673 3.873 3.996 4.122 4.31 4.486 4.662 4.834 4.998 5.232 5.457 5.647 5.89 6.137 6.363 6.617 6.907 7.192 7.507 7.845 8.22 8.628 9.094 9.631 10.163 10.804 11.536 12.362 13.283 14.367 15.657 17.32 18.712 19.424 19.772 19.897 19.927 19.915 19.899 19.854 19.778 19.718 19.662 19.578 19.479 19.359 19.233 19.088 18.965 18.881 18.773 18.661 18.581 18.496 18.403 18.326 18.241 18.139 18.029 17.913 17.822 17.723 17.582 17.494 17.412 17.372 17.277 17.18 17.087 17.039 16.878 16.876 16.815 16.743 16.566 16.476 16.378 16.264 16.137 15.978 15.776 15.144 -10 ,30510 ,TETRA ,17617829,Tue Nov 30 10:47:20 CET,Tue Nov 30 12:37:18 CET,0.0 0.837 1.125 1.332 1.508 1.668 1.822 1.95 2.175 2.275 2.367 2.442 2.677 2.777 2.947 3.104 3.26 3.341 3.497 3.642 3.873 4.016 4.151 4.353 4.542 4.733 4.917 5.085 5.316 5.554 5.775 6.036 6.279 6.515 6.799 7.118 7.43 7.778 8.141 8.51 8.918 9.396 9.96 10.539 11.218 11.993 12.864 13.793 14.875 16.171 17.631 18.647 19.148 19.473 19.662 19.732 19.729 19.673 19.616 19.523 19.415 19.324 19.224 19.109 18.982 18.86 18.749 18.625 18.513 18.407 18.286 18.189 18.091 17.963 17.856 17.752 17.646 17.542 17.43 17.356 17.283 17.175 17.098 17.013 16.963 16.849 16.734 16.612 16.551 16.384 16.376 16.306 16.236 16.096 16.021 15.925 15.812 15.685 15.532 15.302 14.182 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_231.txt deleted file mode 100644 index 7597a6cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18425 ,KEBNE ,17027943,Wed Dec 22 18:43:21 CET,Wed Dec 22 20:17:17 CET,0.0 0.87 1.136 1.329 1.502 1.672 1.836 2.003 2.303 2.427 2.541 2.634 2.862 2.964 3.157 3.326 3.459 3.524 3.66 3.784 3.961 4.079 4.186 4.322 4.464 4.61 4.728 4.831 4.959 5.08 5.213 5.367 5.502 5.648 5.839 6.032 6.193 6.349 6.482 6.633 6.829 7.043 7.224 7.36 7.491 7.616 7.762 7.859 7.846 7.665 7.125 6.29 5.483 4.729 4.071 3.487 2.988 2.518 2.074 1.627 1.258 0.957 0.696 0.447 0.206 -0.009 -0.246 -0.457 -0.641 -0.852 -1.063 -1.231 -1.401 -1.585 -1.738 -1.894 -2.042 -2.19 -2.348 -2.46 -2.58 -2.764 -2.894 -3.034 -3.107 -3.25 -3.4 -3.565 -3.654 -3.884 -3.94 -4.042 -4.146 -4.361 -4.482 -4.615 -4.764 -4.96 -5.199 -5.497 -6.559 -2 ,28317 ,KEBNE ,17027944,Wed Dec 22 18:43:21 CET,Wed Dec 22 20:15:25 CET,0.0 0.66 0.907 1.094 1.26 1.397 1.522 1.641 1.854 1.949 2.038 2.075 2.284 2.362 2.501 2.624 2.734 2.783 2.883 2.978 3.108 3.196 3.295 3.43 3.541 3.673 3.799 3.91 4.07 4.21 4.323 4.476 4.628 4.754 4.888 5.036 5.17 5.301 5.442 5.604 5.746 5.873 6.032 6.172 6.311 6.495 6.706 6.825 6.82 6.688 6.15 5.285 4.501 3.79 3.134 2.511 1.974 1.495 1.065 0.627 0.243 -0.106 -0.443 -0.76 -1.063 -1.336 -1.627 -1.903 -2.12 -2.343 -2.601 -2.817 -3.028 -3.254 -3.43 -3.594 -3.776 -3.986 -4.197 -4.333 -4.477 -4.706 -4.858 -5.013 -5.097 -5.265 -5.447 -5.644 -5.744 -5.981 -6.054 -6.172 -6.299 -6.579 -6.717 -6.859 -7.033 -7.222 -7.424 -7.724 -8.726 -3 ,18710 ,KEBNE ,17027945,Wed Dec 22 18:43:20 CET,Wed Dec 22 20:17:26 CET,0.0 0.809 1.074 1.293 1.461 1.611 1.743 1.87 2.116 2.238 2.362 2.476 2.716 2.813 2.981 3.125 3.266 3.336 3.461 3.593 3.794 3.907 4.002 4.127 4.251 4.389 4.519 4.638 4.812 4.978 5.135 5.318 5.474 5.599 5.734 5.913 6.124 6.348 6.527 6.676 6.828 7.075 7.377 7.556 7.696 7.835 7.971 8.026 8.02 7.865 7.309 6.423 5.621 4.909 4.264 3.653 3.107 2.618 2.217 1.795 1.417 1.067 0.735 0.451 0.148 -0.142 -0.443 -0.728 -0.952 -1.182 -1.424 -1.63 -1.869 -2.102 -2.282 -2.47 -2.647 -2.822 -2.999 -3.123 -3.247 -3.427 -3.556 -3.692 -3.756 -3.892 -4.061 -4.252 -4.351 -4.593 -4.687 -4.803 -4.917 -5.175 -5.313 -5.455 -5.604 -5.772 -5.977 -6.232 -6.866 -4 ,1874 ,KEBNE ,17027946,Wed Dec 22 18:43:20 CET,Wed Dec 22 20:15:26 CET,0.0 0.57 0.821 0.999 1.151 1.285 1.393 1.485 1.648 1.727 1.817 1.858 2.06 2.134 2.284 2.424 2.552 2.619 2.748 2.873 3.051 3.167 3.28 3.42 3.558 3.703 3.843 3.979 4.152 4.311 4.464 4.646 4.836 5.021 5.223 5.454 5.659 5.866 6.087 6.275 6.423 6.649 6.897 7.036 7.179 7.307 7.439 7.555 7.571 7.384 6.834 6.038 5.273 4.523 3.864 3.279 2.742 2.241 1.809 1.402 1.029 0.689 0.377 0.08 -0.208 -0.497 -0.808 -1.087 -1.324 -1.584 -1.868 -2.109 -2.356 -2.605 -2.803 -2.989 -3.163 -3.347 -3.553 -3.693 -3.841 -4.095 -4.27 -4.444 -4.535 -4.733 -4.928 -5.14 -5.251 -5.494 -5.586 -5.715 -5.847 -6.097 -6.259 -6.46 -6.689 -6.942 -7.235 -7.649 -8.625 -5 ,30521 ,KEBNE ,17027947,Wed Dec 22 18:43:19 CET,Wed Dec 22 20:15:24 CET,0.0 0.613 0.861 1.066 1.236 1.377 1.5 1.612 1.817 1.917 2.01 2.037 2.238 2.313 2.468 2.611 2.746 2.814 2.941 3.063 3.231 3.33 3.429 3.597 3.749 3.903 4.067 4.209 4.385 4.563 4.721 4.885 5.052 5.202 5.356 5.519 5.662 5.837 6.017 6.178 6.34 6.515 6.672 6.861 7.101 7.254 7.359 7.424 7.393 7.226 6.697 5.778 4.916 4.17 3.518 2.864 2.283 1.785 1.356 0.933 0.583 0.254 -0.073 -0.386 -0.692 -0.956 -1.26 -1.548 -1.792 -2.021 -2.226 -2.41 -2.602 -2.793 -2.937 -3.078 -3.226 -3.387 -3.554 -3.671 -3.792 -3.976 -4.107 -4.246 -4.316 -4.465 -4.608 -4.752 -4.832 -5.055 -5.102 -5.201 -5.306 -5.531 -5.656 -5.784 -5.928 -6.103 -6.309 -6.583 -7.522 -6 ,8763 ,KEBNE ,17027948,Wed Dec 22 18:43:21 CET,Wed Dec 22 20:15:23 CET,0.0 0.547 0.758 0.917 1.068 1.212 1.351 1.475 1.716 1.821 1.91 1.952 2.161 2.232 2.359 2.491 2.621 2.688 2.811 2.896 3.021 3.102 3.176 3.29 3.386 3.474 3.565 3.651 3.8 3.98 4.124 4.282 4.437 4.564 4.692 4.853 5.019 5.192 5.36 5.503 5.64 5.792 5.951 6.109 6.279 6.443 6.606 6.672 6.659 6.522 5.971 5.127 4.298 3.58 2.949 2.353 1.826 1.317 0.862 0.414 -0.009 -0.393 -0.728 -1.057 -1.353 -1.6 -1.868 -2.123 -2.355 -2.596 -2.852 -3.076 -3.299 -3.53 -3.7 -3.87 -4.05 -4.245 -4.445 -4.572 -4.71 -4.931 -5.084 -5.245 -5.336 -5.521 -5.705 -5.924 -6.038 -6.278 -6.375 -6.51 -6.663 -6.969 -7.128 -7.319 -7.529 -7.751 -8.004 -8.369 -9.633 -7 ,768 ,KEBNE ,17027949,Wed Dec 22 18:43:20 CET,Wed Dec 22 20:15:22 CET,0.0 0.82 1.066 1.233 1.359 1.477 1.585 1.685 1.871 1.944 2.01 2.027 2.236 2.311 2.467 2.624 2.776 2.848 2.969 3.067 3.191 3.271 3.356 3.473 3.571 3.67 3.763 3.856 4.009 4.169 4.31 4.456 4.582 4.708 4.856 5.015 5.159 5.305 5.473 5.649 5.805 5.967 6.162 6.37 6.594 6.774 6.888 6.936 6.89 6.673 6.108 5.288 4.448 3.658 3.025 2.44 1.897 1.38 0.925 0.483 0.107 -0.234 -0.563 -0.874 -1.179 -1.467 -1.761 -2.021 -2.261 -2.492 -2.717 -2.916 -3.146 -3.383 -3.564 -3.771 -3.992 -4.199 -4.389 -4.52 -4.666 -4.902 -5.068 -5.225 -5.298 -5.449 -5.601 -5.759 -5.843 -6.061 -6.103 -6.2 -6.302 -6.534 -6.658 -6.789 -6.946 -7.125 -7.317 -7.569 -8.614 -8 ,12374 ,KEBNE ,17027950,Wed Dec 22 18:43:19 CET,Wed Dec 22 20:15:20 CET,0.0 0.55 0.822 1.056 1.268 1.452 1.617 1.777 2.074 2.195 2.299 2.348 2.569 2.677 2.876 3.038 3.177 3.247 3.384 3.508 3.667 3.775 3.892 4.044 4.169 4.29 4.408 4.539 4.726 4.902 5.051 5.198 5.329 5.462 5.621 5.774 5.916 6.082 6.27 6.515 6.747 6.949 7.161 7.338 7.511 7.649 7.752 7.816 7.817 7.65 7.116 6.264 5.432 4.702 4.051 3.415 2.861 2.368 1.946 1.53 1.143 0.733 0.318 -0.001 -0.258 -0.502 -0.76 -1.01 -1.254 -1.515 -1.755 -1.934 -2.123 -2.359 -2.553 -2.73 -2.925 -3.124 -3.321 -3.469 -3.608 -3.803 -3.944 -4.105 -4.192 -4.371 -4.55 -4.739 -4.841 -5.073 -5.103 -5.202 -5.311 -5.538 -5.665 -5.796 -5.955 -6.14 -6.332 -6.588 -7.377 -9 ,9284 ,KEBNE ,17027951,Wed Dec 22 18:43:21 CET,Wed Dec 22 20:15:13 CET,0.0 0.587 0.788 0.963 1.111 1.243 1.359 1.477 1.709 1.82 1.918 1.939 2.136 2.204 2.354 2.496 2.623 2.681 2.793 2.904 3.077 3.194 3.302 3.447 3.588 3.728 3.865 3.993 4.147 4.311 4.455 4.636 4.832 4.993 5.147 5.293 5.44 5.608 5.758 5.913 6.075 6.265 6.514 6.744 6.964 7.127 7.249 7.319 7.287 7.124 6.589 5.655 4.817 4.096 3.423 2.764 2.188 1.667 1.242 0.82 0.446 0.09 -0.253 -0.561 -0.86 -1.163 -1.489 -1.753 -1.963 -2.194 -2.457 -2.652 -2.833 -3.037 -3.186 -3.325 -3.473 -3.629 -3.815 -3.954 -4.092 -4.312 -4.472 -4.635 -4.718 -4.901 -5.092 -5.289 -5.397 -5.642 -5.717 -5.82 -5.923 -6.134 -6.248 -6.367 -6.509 -6.689 -6.882 -7.131 -7.902 -10 ,22425 ,KEBNE ,17027952,Wed Dec 22 18:43:20 CET,Wed Dec 22 20:15:11 CET,0.0 0.373 0.576 0.742 0.896 1.041 1.173 1.29 1.502 1.601 1.687 1.724 1.925 1.993 2.117 2.242 2.364 2.421 2.529 2.628 2.761 2.833 2.902 2.996 3.08 3.168 3.258 3.345 3.459 3.588 3.709 3.822 3.932 4.042 4.161 4.287 4.409 4.539 4.701 4.88 5.062 5.272 5.459 5.593 5.727 5.852 5.972 6.048 6.04 5.856 5.317 4.473 3.633 2.856 2.174 1.584 1.063 0.562 0.111 -0.344 -0.729 -1.071 -1.411 -1.733 -2.023 -2.283 -2.579 -2.87 -3.123 -3.363 -3.591 -3.801 -4.026 -4.248 -4.429 -4.62 -4.826 -5.047 -5.261 -5.406 -5.554 -5.759 -5.882 -6.014 -6.085 -6.235 -6.396 -6.572 -6.663 -6.882 -6.94 -7.046 -7.153 -7.387 -7.522 -7.664 -7.814 -7.995 -8.189 -8.419 -9.128 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_234.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_234.txt deleted file mode 100644 index e41dc0c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_234.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16760 ,TETRA ,17617830,Tue Nov 30 10:48:26 CET,Tue Nov 30 12:34:14 CET,0.0 1.214 1.53 1.798 2.025 2.182 2.322 2.468 2.722 2.832 2.933 2.991 3.205 3.28 3.42 3.553 3.682 3.746 3.871 3.997 4.186 4.304 4.408 4.552 4.695 4.834 4.97 5.101 5.262 5.42 5.578 5.788 6.026 6.242 6.462 6.706 6.942 7.206 7.49 7.793 8.115 8.456 8.832 9.221 9.692 10.201 10.741 11.35 11.99 12.657 13.33 13.702 13.794 13.753 13.644 13.461 13.244 13.03 12.843 12.652 12.479 12.328 12.188 12.044 11.896 11.75 11.602 11.458 11.321 11.16 10.98 10.843 10.701 10.54 10.414 10.287 10.157 10.015 9.845 9.713 9.572 9.379 9.269 9.137 9.057 8.905 8.751 8.581 8.494 8.276 8.202 8.097 7.983 7.736 7.604 7.459 7.303 7.156 6.991 6.758 6.27 -2 ,26195 ,TETRA ,17617831,Tue Nov 30 10:48:28 CET,Tue Nov 30 12:27:00 CET,0.0 0.945 1.258 1.474 1.64 1.782 1.914 2.038 2.254 2.352 2.446 2.502 2.722 2.811 2.971 3.117 3.26 3.329 3.462 3.604 3.822 3.959 4.095 4.288 4.476 4.64 4.782 4.914 5.081 5.258 5.432 5.639 5.831 6.006 6.202 6.429 6.67 6.944 7.245 7.56 7.867 8.196 8.597 9.013 9.447 9.923 10.48 11.055 11.673 12.371 13.124 13.481 13.524 13.469 13.327 13.139 12.953 12.776 12.598 12.398 12.221 12.045 11.891 11.73 11.541 11.372 11.203 11.05 10.885 10.707 10.556 10.434 10.297 10.118 9.972 9.851 9.733 9.592 9.416 9.296 9.173 8.975 8.847 8.71 8.636 8.472 8.301 8.137 8.059 7.861 7.82 7.729 7.633 7.449 7.351 7.237 7.111 6.983 6.813 6.594 6.081 -3 ,4991 ,TETRA ,17617832,Tue Nov 30 10:56:25 CET,Tue Nov 30 12:38:48 CET,0.0 0.653 0.912 1.129 1.309 1.452 1.582 1.701 1.905 1.995 2.08 2.123 2.34 2.428 2.59 2.735 2.867 2.931 3.057 3.184 3.376 3.507 3.635 3.822 4.023 4.213 4.395 4.576 4.814 5.041 5.236 5.456 5.668 5.865 6.086 6.332 6.573 6.83 7.105 7.433 7.781 8.131 8.505 8.868 9.285 9.746 10.276 10.863 11.52 12.205 12.823 13.153 13.206 13.136 13.022 12.862 12.683 12.497 12.243 11.915 11.651 11.453 11.285 11.126 10.962 10.806 10.642 10.478 10.313 10.117 9.909 9.757 9.626 9.488 9.358 9.216 9.07 8.933 8.804 8.705 8.589 8.398 8.281 8.17 8.106 7.973 7.828 7.671 7.587 7.378 7.329 7.248 7.165 6.972 6.861 6.732 6.59 6.443 6.271 6.008 5.296 -4 ,29021 ,TETRA ,17617834,Tue Nov 30 10:55:25 CET,Tue Nov 30 12:28:16 CET,0.0 0.783 1.025 1.211 1.367 1.519 1.669 1.818 2.084 2.203 2.32 2.411 2.649 2.75 2.933 3.12 3.301 3.379 3.528 3.682 3.908 4.046 4.168 4.341 4.508 4.679 4.871 5.051 5.242 5.418 5.59 5.824 6.058 6.266 6.505 6.783 7.06 7.338 7.612 7.899 8.211 8.556 8.932 9.307 9.765 10.241 10.733 11.284 11.91 12.567 13.218 13.581 13.677 13.646 13.519 13.332 13.143 12.962 12.784 12.59 12.419 12.275 12.114 11.938 11.775 11.606 11.424 11.269 11.127 10.962 10.799 10.644 10.464 10.301 10.185 10.059 9.923 9.793 9.675 9.594 9.51 9.385 9.293 9.192 9.136 9.024 8.912 8.795 8.735 8.544 8.515 8.436 8.352 8.173 8.076 7.963 7.831 7.64 7.386 7.035 5.702 -5 ,25261 ,TETRA ,17617835,Tue Nov 30 10:56:27 CET,Tue Nov 30 12:43:26 CET,0.0 0.79 1.034 1.235 1.416 1.572 1.708 1.829 2.059 2.165 2.277 2.37 2.596 2.686 2.862 3.032 3.194 3.274 3.433 3.573 3.754 3.867 4.006 4.215 4.38 4.547 4.718 4.893 5.139 5.356 5.538 5.762 5.969 6.175 6.426 6.682 6.907 7.166 7.465 7.791 8.114 8.45 8.847 9.224 9.653 10.137 10.663 11.251 11.921 12.623 13.291 13.597 13.682 13.627 13.476 13.301 13.113 12.893 12.695 12.489 12.311 12.137 11.93 11.733 11.582 11.472 11.338 11.206 11.098 10.981 10.858 10.755 10.642 10.53 10.445 10.352 10.245 10.132 10.021 9.941 9.855 9.719 9.63 9.534 9.482 9.373 9.245 9.11 9.041 8.846 8.817 8.739 8.659 8.476 8.367 8.254 8.131 7.983 7.798 7.565 6.507 -6 ,23310 ,TETRA ,17617836,Tue Nov 30 10:58:27 CET,Tue Nov 30 13:09:39 CET,0.0 1.271 1.616 1.864 2.064 2.242 2.403 2.542 2.782 2.903 3.026 3.123 3.355 3.452 3.64 3.818 3.997 4.082 4.232 4.371 4.569 4.708 4.845 5.055 5.257 5.433 5.591 5.747 5.965 6.187 6.394 6.616 6.833 7.047 7.287 7.539 7.758 7.996 8.286 8.657 9.005 9.349 9.785 10.2 10.633 11.074 11.574 12.129 12.742 13.405 14.038 14.356 14.431 14.395 14.275 14.083 13.885 13.698 13.507 13.289 13.098 12.937 12.778 12.625 12.487 12.363 12.234 12.116 12.006 11.888 11.766 11.658 11.543 11.426 11.342 11.258 11.161 11.052 10.934 10.851 10.767 10.625 10.525 10.418 10.363 10.251 10.122 9.985 9.915 9.718 9.699 9.622 9.54 9.355 9.242 9.129 9.013 8.869 8.679 8.41 7.341 -7 ,730 ,TETRA ,17617837,Tue Nov 30 10:58:27 CET,Tue Nov 30 12:29:25 CET,0.0 1.139 1.385 1.569 1.738 1.893 2.045 2.198 2.483 2.614 2.738 2.828 3.057 3.157 3.339 3.515 3.684 3.767 3.919 4.063 4.291 4.437 4.581 4.797 5.014 5.231 5.415 5.576 5.79 6.012 6.218 6.439 6.658 6.861 7.094 7.356 7.607 7.877 8.139 8.422 8.752 9.135 9.567 9.964 10.438 10.969 11.507 12.095 12.721 13.357 13.985 14.33 14.404 14.333 14.211 14.066 13.907 13.713 13.525 13.255 12.993 12.771 12.566 12.389 12.216 12.072 11.924 11.755 11.575 11.367 11.183 11.05 10.91 10.761 10.636 10.525 10.412 10.281 10.137 10.025 9.904 9.727 9.609 9.476 9.399 9.231 9.053 8.865 8.763 8.539 8.431 8.313 8.188 7.92 7.778 7.617 7.435 7.207 6.933 6.612 5.744 -8 ,13856 ,TETRA ,17617838,Tue Nov 30 10:58:27 CET,Tue Nov 30 12:48:34 CET,0.0 0.534 0.752 0.924 1.079 1.223 1.343 1.447 1.653 1.761 1.86 1.899 2.106 2.182 2.327 2.473 2.614 2.687 2.832 2.968 3.152 3.265 3.386 3.564 3.721 3.867 4.015 4.16 4.334 4.495 4.646 4.827 4.994 5.159 5.374 5.631 5.911 6.205 6.475 6.758 7.072 7.429 7.797 8.134 8.534 8.997 9.525 10.106 10.711 11.32 11.979 12.369 12.443 12.379 12.236 12.034 11.81 11.589 11.402 11.208 11.026 10.859 10.681 10.491 10.307 10.161 10.009 9.832 9.669 9.492 9.315 9.179 9.037 8.872 8.746 8.624 8.485 8.34 8.195 8.101 8.004 7.841 7.732 7.611 7.54 7.389 7.224 7.041 6.949 6.737 6.684 6.591 6.5 6.311 6.204 6.088 5.936 5.761 5.562 5.292 4.401 -9 ,19861 ,TETRA ,17617839,Tue Nov 30 10:58:29 CET,Tue Nov 30 12:47:58 CET,0.0 0.751 0.993 1.21 1.405 1.588 1.763 1.914 2.172 2.297 2.416 2.479 2.691 2.777 2.955 3.124 3.283 3.352 3.494 3.636 3.814 3.925 4.038 4.21 4.365 4.518 4.69 4.844 5.026 5.206 5.386 5.641 5.891 6.102 6.326 6.567 6.786 7.043 7.348 7.663 7.971 8.315 8.702 9.078 9.527 10.042 10.608 11.189 11.806 12.481 13.163 13.516 13.532 13.416 13.275 13.114 12.949 12.766 12.587 12.404 12.227 12.031 11.85 11.672 11.473 11.287 11.103 10.953 10.829 10.692 10.536 10.404 10.26 10.111 9.984 9.839 9.687 9.519 9.358 9.256 9.155 8.996 8.869 8.73 8.651 8.505 8.364 8.181 8.08 7.866 7.812 7.714 7.619 7.429 7.323 7.211 7.095 6.952 6.785 6.574 5.996 -10 ,2848 ,TETRA ,17617840,Tue Nov 30 11:47:21 CET,Tue Nov 30 13:34:39 CET,0.0 0.699 0.981 1.195 1.377 1.535 1.679 1.81 2.06 2.178 2.288 2.345 2.559 2.644 2.798 2.947 3.095 3.161 3.292 3.425 3.602 3.714 3.835 4.003 4.153 4.303 4.441 4.575 4.747 4.916 5.081 5.293 5.51 5.713 5.957 6.251 6.51 6.763 7.03 7.317 7.629 7.956 8.328 8.727 9.176 9.648 10.179 10.733 11.349 12.013 12.673 13.028 13.079 13.003 12.869 12.68 12.469 12.267 12.093 11.888 11.646 11.439 11.265 11.102 10.953 10.801 10.627 10.477 10.353 10.212 10.019 9.835 9.659 9.486 9.365 9.24 9.074 8.894 8.739 8.64 8.511 8.303 8.173 8.028 7.952 7.809 7.657 7.494 7.407 7.191 7.116 7.006 6.885 6.603 6.467 6.345 6.207 6.034 5.85 5.628 4.788 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_252.txt deleted file mode 100644 index bdff51cc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_163_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15187 ,TETRA ,17617841,Tue Nov 30 11:47:21 CET,Tue Nov 30 13:34:27 CET,0.0 0.738 0.988 1.17 1.303 1.426 1.53 1.597 1.702 1.749 1.783 1.688 1.822 1.839 1.881 1.893 1.883 1.879 1.847 1.805 1.739 1.682 1.619 1.518 1.421 1.333 1.221 1.087 0.901 0.706 0.501 0.248 -0.015 -0.309 -0.675 -1.119 -1.534 -2.023 -2.598 -3.232 -3.983 -4.919 -6.098 -7.348 -8.941 -10.891 -13.362 -16.515 -20.735 -26.533 -35.136 -44.295 -51.067 -56.291 -60.461 -63.957 -66.834 -69.337 -71.428 -73.42 -75.056 -76.463 -77.762 -78.973 -80.091 -81.09 -82.129 -83.038 -83.792 -84.572 -85.371 -85.99 -86.596 -87.248 -87.769 -88.295 -88.823 -89.352 -89.87 -90.217 -90.578 -91.134 -91.511 -91.891 -92.09 -92.491 -92.91 -93.351 -93.579 -94.052 -94.314 -94.571 -94.832 -95.427 -95.739 -96.041 -96.422 -96.881 -97.399 -98.003 -99.196 -2 ,19978 ,TETRA ,17617842,Tue Nov 30 11:47:22 CET,Tue Nov 30 13:34:26 CET,0.0 1.039 1.364 1.595 1.74 1.831 1.925 2.012 2.129 2.168 2.206 2.149 2.291 2.288 2.303 2.314 2.302 2.297 2.267 2.221 2.152 2.106 2.059 1.964 1.859 1.764 1.667 1.541 1.363 1.199 1.035 0.815 0.55 0.255 -0.093 -0.506 -0.947 -1.45 -2.037 -2.721 -3.442 -4.314 -5.472 -6.747 -8.374 -10.386 -12.92 -16.081 -20.265 -26.021 -34.559 -43.615 -50.353 -55.574 -59.797 -63.319 -66.214 -68.735 -70.814 -72.822 -74.484 -75.908 -77.231 -78.413 -79.471 -80.443 -81.441 -82.34 -83.11 -83.873 -84.656 -85.309 -85.961 -86.63 -87.135 -87.647 -88.165 -88.681 -89.231 -89.6 -89.952 -90.492 -90.863 -91.232 -91.428 -91.838 -92.247 -92.692 -92.926 -93.396 -93.649 -93.898 -94.146 -94.68 -94.971 -95.27 -95.651 -96.095 -96.562 -97.154 -98.533 -3 ,18273 ,TETRA ,17617845,Tue Nov 30 11:47:22 CET,Tue Nov 30 13:37:42 CET,0.0 0.777 1.077 1.267 1.387 1.482 1.566 1.643 1.758 1.821 1.871 1.809 1.963 1.977 1.983 1.975 1.978 1.973 1.946 1.91 1.829 1.768 1.711 1.614 1.497 1.361 1.221 1.097 0.933 0.764 0.58 0.34 0.105 -0.149 -0.469 -0.857 -1.281 -1.8 -2.395 -3.075 -3.861 -4.771 -5.901 -7.182 -8.809 -10.78 -13.274 -16.425 -20.645 -26.47 -35.096 -44.199 -50.952 -56.229 -60.467 -64.04 -67.03 -69.609 -71.728 -73.781 -75.509 -76.978 -78.313 -79.556 -80.675 -81.65 -82.639 -83.483 -84.204 -84.96 -85.731 -86.364 -87.023 -87.813 -88.507 -89.212 -89.906 -90.609 -91.328 -91.831 -92.356 -93.126 -93.654 -94.213 -94.49 -95.045 -95.624 -96.217 -96.511 -97.101 -97.439 -97.772 -98.119 -98.837 -99.217 -99.618 -100.042 -100.496 -101.012 -101.624 -103.108 -4 ,9282 ,TETRA ,17617846,Tue Nov 30 11:47:25 CET,Tue Nov 30 13:36:57 CET,0.0 1.385 1.7 1.887 2.018 2.103 2.163 2.22 2.343 2.389 2.402 2.287 2.425 2.431 2.435 2.433 2.437 2.434 2.41 2.366 2.297 2.245 2.182 2.077 1.961 1.833 1.717 1.603 1.407 1.209 1.035 0.798 0.534 0.257 -0.091 -0.476 -0.895 -1.365 -1.915 -2.561 -3.263 -4.178 -5.358 -6.639 -8.266 -10.233 -12.754 -15.947 -20.138 -25.899 -34.452 -43.465 -50.15 -55.408 -59.628 -63.196 -66.164 -68.737 -70.836 -72.806 -74.444 -75.864 -77.175 -78.382 -79.482 -80.471 -81.493 -82.39 -83.126 -83.86 -84.614 -85.239 -85.874 -86.526 -87.04 -87.572 -88.101 -88.637 -89.171 -89.528 -89.893 -90.447 -90.834 -91.238 -91.448 -91.878 -92.322 -92.782 -93.011 -93.474 -93.718 -93.963 -94.223 -94.783 -95.064 -95.374 -95.733 -96.174 -96.711 -97.347 -98.902 -5 ,8497 ,TETRA ,17617847,Tue Nov 30 11:48:21 CET,Tue Nov 30 13:37:47 CET,0.0 0.806 1.089 1.272 1.393 1.5 1.595 1.683 1.822 1.849 1.874 1.82 1.988 2.016 2.013 2.01 1.999 1.987 1.976 1.947 1.86 1.8 1.746 1.672 1.578 1.452 1.319 1.199 1.04 0.855 0.65 0.392 0.114 -0.184 -0.538 -0.957 -1.382 -1.892 -2.502 -3.178 -3.928 -4.84 -6.009 -7.314 -8.961 -10.99 -13.56 -16.749 -20.979 -26.804 -35.515 -44.629 -51.332 -56.599 -60.813 -64.343 -67.284 -69.827 -71.939 -73.977 -75.678 -77.12 -78.446 -79.723 -80.85 -81.793 -82.772 -83.663 -84.419 -85.166 -85.917 -86.525 -87.143 -87.798 -88.315 -88.827 -89.333 -89.838 -90.38 -90.741 -91.088 -91.629 -92.006 -92.406 -92.617 -93.041 -93.465 -93.894 -94.118 -94.595 -94.849 -95.085 -95.338 -95.89 -96.229 -96.632 -97.072 -97.549 -98.033 -98.621 -100.357 -6 ,5041 ,TETRA ,17617848,Tue Nov 30 11:48:21 CET,Tue Nov 30 13:35:12 CET,0.0 0.718 0.962 1.134 1.261 1.366 1.436 1.503 1.601 1.63 1.665 1.59 1.746 1.777 1.818 1.825 1.793 1.768 1.714 1.676 1.654 1.614 1.546 1.437 1.311 1.2 1.084 0.947 0.772 0.577 0.376 0.13 -0.121 -0.36 -0.63 -0.99 -1.375 -1.85 -2.468 -3.158 -3.911 -4.817 -5.976 -7.238 -8.831 -10.782 -13.262 -16.393 -20.579 -26.361 -35.001 -44.106 -50.851 -56.138 -60.346 -63.896 -66.881 -69.414 -71.47 -73.482 -75.174 -76.617 -77.941 -79.184 -80.292 -81.272 -82.285 -83.157 -83.88 -84.637 -85.438 -86.099 -86.766 -87.412 -87.89 -88.379 -88.991 -89.735 -90.495 -91.017 -91.554 -92.353 -92.885 -93.436 -93.712 -94.252 -94.814 -95.41 -95.719 -96.322 -96.662 -97.001 -97.348 -98.03 -98.402 -98.805 -99.236 -99.695 -100.219 -100.876 -102.438 -7 ,14025 ,TETRA ,17617849,Tue Nov 30 11:48:21 CET,Tue Nov 30 13:36:37 CET,0.0 0.844 1.111 1.271 1.388 1.46 1.51 1.557 1.628 1.673 1.715 1.609 1.733 1.754 1.791 1.788 1.793 1.797 1.798 1.775 1.698 1.649 1.603 1.516 1.433 1.347 1.223 1.081 0.887 0.674 0.467 0.203 -0.056 -0.325 -0.682 -1.09 -1.509 -2.02 -2.615 -3.306 -4.079 -5.004 -6.169 -7.434 -9.047 -11.058 -13.63 -16.837 -21.105 -26.977 -35.572 -44.581 -51.29 -56.577 -60.818 -64.416 -67.342 -69.835 -71.918 -73.884 -75.509 -76.911 -78.208 -79.422 -80.517 -81.491 -82.495 -83.365 -84.093 -84.84 -85.603 -86.214 -86.842 -87.492 -88.003 -88.529 -89.062 -89.611 -90.173 -90.539 -90.899 -91.451 -91.838 -92.24 -92.44 -92.85 -93.281 -93.709 -93.924 -94.378 -94.604 -94.856 -95.131 -95.693 -95.974 -96.275 -96.598 -96.938 -97.387 -98.064 -99.516 -8 ,18936 ,TETRA ,17617850,Tue Nov 30 11:48:21 CET,Tue Nov 30 13:40:18 CET,0.0 0.763 0.997 1.152 1.281 1.376 1.462 1.536 1.63 1.674 1.709 1.642 1.792 1.807 1.838 1.848 1.856 1.855 1.824 1.784 1.736 1.694 1.644 1.584 1.52 1.435 1.336 1.212 1.037 0.876 0.714 0.502 0.263 -0.017 -0.381 -0.815 -1.263 -1.771 -2.341 -3.014 -3.773 -4.698 -5.893 -7.167 -8.749 -10.676 -13.174 -16.375 -20.586 -26.321 -34.835 -43.863 -50.493 -55.641 -59.806 -63.323 -66.213 -68.711 -70.78 -72.775 -74.495 -75.988 -77.306 -78.524 -79.82 -81.183 -82.622 -83.905 -85.0 -86.086 -87.203 -88.113 -89.026 -89.942 -90.645 -91.36 -92.074 -92.804 -93.555 -94.071 -94.582 -95.34 -95.87 -96.425 -96.71 -97.269 -97.822 -98.395 -98.69 -99.277 -99.62 -99.955 -100.299 -100.978 -101.341 -101.737 -102.147 -102.563 -103.046 -103.653 -104.669 -9 ,7940 ,TETRA ,17617851,Tue Nov 30 11:48:21 CET,Tue Nov 30 13:38:04 CET,0.0 0.948 1.213 1.404 1.524 1.615 1.677 1.713 1.806 1.852 1.887 1.814 1.949 1.957 1.97 1.977 1.968 1.96 1.945 1.906 1.85 1.81 1.758 1.661 1.537 1.408 1.287 1.163 0.975 0.777 0.593 0.361 0.11 -0.116 -0.416 -0.844 -1.277 -1.779 -2.347 -3.01 -3.798 -4.734 -5.897 -7.19 -8.824 -10.803 -13.337 -16.502 -20.704 -26.466 -34.958 -43.946 -50.646 -55.929 -60.184 -63.742 -66.656 -69.135 -71.216 -73.262 -74.949 -76.38 -77.715 -78.942 -80.049 -81.031 -82.02 -82.915 -83.69 -84.456 -85.235 -86.008 -86.91 -87.83 -88.557 -89.302 -90.042 -90.796 -91.582 -92.118 -92.649 -93.423 -93.939 -94.481 -94.765 -95.322 -95.879 -96.479 -96.785 -97.378 -97.717 -98.039 -98.362 -99.027 -99.382 -99.779 -100.219 -100.722 -101.289 -101.987 -104.038 -10 ,13340 ,TETRA ,17617852,Tue Nov 30 11:48:21 CET,Tue Nov 30 13:36:55 CET,0.0 1.2 1.508 1.705 1.86 1.983 2.067 2.141 2.314 2.391 2.436 2.361 2.503 2.509 2.508 2.502 2.517 2.515 2.463 2.412 2.351 2.296 2.229 2.127 2.021 1.929 1.83 1.696 1.514 1.336 1.158 0.949 0.705 0.445 0.116 -0.319 -0.768 -1.266 -1.841 -2.519 -3.27 -4.179 -5.355 -6.66 -8.283 -10.246 -12.758 -15.918 -20.145 -25.937 -34.507 -43.657 -50.41 -55.732 -60.03 -63.69 -66.675 -69.153 -71.244 -73.245 -74.889 -76.324 -77.655 -78.882 -80.01 -81.015 -82.017 -82.884 -83.624 -84.373 -85.126 -85.743 -86.375 -87.038 -87.555 -88.08 -88.597 -89.107 -89.628 -89.982 -90.345 -90.923 -91.337 -91.754 -91.963 -92.379 -92.794 -93.231 -93.462 -93.938 -94.207 -94.471 -94.736 -95.274 -95.573 -95.895 -96.235 -96.614 -97.086 -97.697 -99.281 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_164_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_164_231.txt deleted file mode 100644 index 23965ad7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_164_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24681 ,KEBNE ,17076763,Sat Dec 25 04:42:27 CET,Sat Dec 25 06:16:12 CET,0.0 0.743 0.99 1.185 1.35 1.474 1.582 1.687 1.879 1.963 2.045 2.08 2.247 2.309 2.43 2.542 2.644 2.692 2.787 2.87 2.957 3.008 3.066 3.16 3.245 3.329 3.398 3.46 3.548 3.619 3.688 3.78 3.853 3.929 4.026 4.112 4.187 4.271 4.343 4.397 4.441 4.472 4.481 4.468 4.409 4.257 3.95 3.501 2.849 1.744 -0.465 -3.25 -5.355 -7.129 -8.667 -10.042 -11.217 -12.261 -13.13 -13.951 -14.675 -15.322 -15.917 -16.465 -16.958 -17.415 -17.91 -18.346 -18.711 -19.078 -19.466 -19.797 -20.133 -20.471 -20.735 -21.005 -21.287 -21.578 -21.856 -22.046 -22.245 -22.55 -22.763 -22.997 -23.125 -23.382 -23.638 -23.921 -24.066 -24.335 -24.465 -24.61 -24.775 -25.138 -25.325 -25.516 -25.706 -25.932 -26.236 -26.609 -27.454 -2 ,9119 ,KEBNE ,17076764,Sat Dec 25 04:42:27 CET,Sat Dec 25 06:15:01 CET,0.0 1.161 1.491 1.743 1.931 2.09 2.249 2.395 2.635 2.734 2.816 2.872 3.054 3.132 3.269 3.398 3.52 3.576 3.68 3.778 3.914 3.993 4.069 4.187 4.301 4.403 4.496 4.592 4.722 4.832 4.922 5.022 5.107 5.183 5.288 5.406 5.492 5.571 5.632 5.683 5.737 5.771 5.798 5.804 5.767 5.647 5.4 4.978 4.332 3.224 1.044 -1.526 -3.667 -5.522 -7.108 -8.492 -9.625 -10.68 -11.557 -12.359 -13.045 -13.627 -14.17 -14.682 -15.154 -15.589 -16.074 -16.519 -16.88 -17.23 -17.577 -17.872 -18.199 -18.545 -18.809 -19.077 -19.357 -19.64 -19.916 -20.107 -20.303 -20.589 -20.78 -20.982 -21.096 -21.334 -21.564 -21.797 -21.923 -22.192 -22.35 -22.502 -22.662 -23.002 -23.187 -23.391 -23.612 -23.865 -24.15 -24.473 -25.282 -3 ,27279 ,KEBNE ,17076765,Sat Dec 25 04:42:27 CET,Sat Dec 25 06:16:03 CET,0.0 1.186 1.506 1.74 1.905 2.035 2.155 2.261 2.44 2.531 2.626 2.676 2.857 2.927 3.062 3.185 3.304 3.359 3.467 3.575 3.712 3.796 3.866 3.965 4.067 4.154 4.235 4.305 4.399 4.508 4.604 4.706 4.792 4.878 4.985 5.078 5.151 5.241 5.312 5.37 5.421 5.453 5.497 5.537 5.512 5.397 5.182 4.805 4.191 3.137 1.243 -1.097 -3.234 -5.136 -6.731 -8.077 -9.217 -10.223 -11.066 -11.866 -12.541 -13.158 -13.728 -14.25 -14.739 -15.182 -15.641 -16.048 -16.392 -16.75 -17.115 -17.413 -17.725 -18.051 -18.306 -18.564 -18.824 -19.091 -19.348 -19.523 -19.718 -20.021 -20.225 -20.437 -20.549 -20.778 -21.001 -21.239 -21.365 -21.632 -21.768 -21.914 -22.067 -22.387 -22.565 -22.757 -22.963 -23.219 -23.498 -23.819 -24.514 -4 ,22853 ,KEBNE ,17076766,Sat Dec 25 04:46:41 CET,Sat Dec 25 06:20:23 CET,0.0 0.653 0.887 1.076 1.216 1.326 1.431 1.522 1.667 1.741 1.812 1.832 2.0 2.061 2.172 2.264 2.355 2.4 2.484 2.575 2.693 2.759 2.824 2.92 3.015 3.092 3.158 3.21 3.268 3.33 3.402 3.509 3.607 3.688 3.787 3.889 3.972 4.079 4.173 4.209 4.241 4.239 4.163 4.057 3.93 3.823 3.629 3.227 2.576 1.421 -0.766 -3.387 -5.53 -7.378 -8.942 -10.303 -11.494 -12.551 -13.435 -14.282 -14.981 -15.611 -16.215 -16.743 -17.219 -17.685 -18.189 -18.62 -18.964 -19.298 -19.657 -19.967 -20.275 -20.584 -20.822 -21.063 -21.307 -21.558 -21.832 -22.024 -22.21 -22.502 -22.711 -22.927 -23.029 -23.229 -23.453 -23.704 -23.832 -24.099 -24.242 -24.391 -24.545 -24.882 -25.066 -25.251 -25.45 -25.689 -25.969 -26.342 -27.177 -5 ,26853 ,KEBNE ,17076767,Sat Dec 25 04:58:21 CET,Sat Dec 25 06:22:43 CET,0.0 0.889 1.119 1.317 1.478 1.593 1.707 1.828 2.024 2.102 2.18 2.227 2.392 2.445 2.545 2.646 2.74 2.785 2.88 2.962 3.084 3.163 3.231 3.337 3.445 3.548 3.642 3.728 3.831 3.92 4.007 4.114 4.201 4.277 4.36 4.433 4.505 4.583 4.68 4.778 4.841 4.888 4.908 4.891 4.806 4.649 4.409 3.979 3.276 2.12 0.091 -2.393 -4.441 -6.258 -7.911 -9.345 -10.504 -11.52 -12.351 -13.142 -13.835 -14.466 -15.078 -15.66 -16.18 -16.624 -17.081 -17.463 -17.768 -18.094 -18.45 -18.756 -19.08 -19.413 -19.661 -19.899 -20.142 -20.4 -20.663 -20.837 -21.014 -21.29 -21.47 -21.656 -21.756 -21.975 -22.217 -22.47 -22.606 -22.883 -23.035 -23.184 -23.341 -23.68 -23.859 -24.052 -24.26 -24.499 -24.785 -25.155 -25.977 -6 ,27052 ,KEBNE ,17076768,Sat Dec 25 05:00:23 CET,Sat Dec 25 06:32:39 CET,0.0 0.835 1.062 1.225 1.376 1.507 1.616 1.707 1.875 1.965 2.047 2.071 2.24 2.299 2.412 2.523 2.614 2.655 2.743 2.836 2.967 3.045 3.114 3.209 3.303 3.39 3.467 3.542 3.635 3.714 3.79 3.879 3.966 4.052 4.148 4.261 4.354 4.417 4.466 4.521 4.558 4.572 4.554 4.499 4.411 4.213 3.882 3.354 2.534 1.355 -0.791 -3.439 -5.561 -7.376 -8.925 -10.244 -11.339 -12.296 -13.129 -13.947 -14.637 -15.264 -15.822 -16.304 -16.765 -17.186 -17.597 -17.976 -18.32 -18.67 -19.027 -19.313 -19.601 -19.889 -20.114 -20.353 -20.601 -20.861 -21.12 -21.299 -21.485 -21.784 -21.987 -22.193 -22.304 -22.538 -22.771 -23.018 -23.146 -23.404 -23.544 -23.698 -23.856 -24.178 -24.349 -24.529 -24.728 -24.949 -25.194 -25.492 -26.18 -7 ,26103 ,KEBNE ,17076769,Sat Dec 25 05:01:25 CET,Sat Dec 25 06:33:50 CET,0.0 0.629 0.838 0.996 1.125 1.234 1.331 1.423 1.586 1.659 1.724 1.754 1.928 1.991 2.102 2.201 2.299 2.345 2.438 2.519 2.62 2.694 2.769 2.879 2.997 3.112 3.207 3.293 3.404 3.485 3.563 3.656 3.73 3.798 3.871 3.952 4.034 4.125 4.215 4.288 4.321 4.327 4.347 4.344 4.264 4.101 3.846 3.429 2.691 1.469 -0.569 -3.122 -5.327 -7.125 -8.653 -9.966 -11.045 -12.035 -12.898 -13.707 -14.348 -14.89 -15.415 -15.917 -16.392 -16.812 -17.214 -17.566 -17.873 -18.209 -18.565 -18.856 -19.151 -19.465 -19.723 -19.971 -20.198 -20.435 -20.681 -20.862 -21.061 -21.372 -21.584 -21.786 -21.889 -22.115 -22.369 -22.646 -22.786 -23.062 -23.218 -23.373 -23.54 -23.893 -24.082 -24.287 -24.52 -24.778 -25.065 -25.447 -26.419 -8 ,13280 ,KEBNE ,17076770,Sat Dec 25 05:02:28 CET,Sat Dec 25 06:36:21 CET,0.0 0.822 1.086 1.282 1.449 1.581 1.674 1.756 1.901 1.966 2.027 2.023 2.183 2.24 2.344 2.437 2.52 2.561 2.65 2.742 2.868 2.943 3.013 3.106 3.196 3.278 3.354 3.428 3.528 3.622 3.701 3.778 3.837 3.898 3.973 4.046 4.111 4.178 4.225 4.271 4.311 4.333 4.343 4.326 4.268 4.092 3.713 3.175 2.41 1.198 -0.901 -3.467 -5.575 -7.35 -8.898 -10.25 -11.404 -12.424 -13.268 -14.104 -14.81 -15.403 -15.956 -16.494 -16.994 -17.429 -17.877 -18.287 -18.625 -18.963 -19.305 -19.581 -19.872 -20.171 -20.406 -20.65 -20.897 -21.153 -21.406 -21.588 -21.792 -22.098 -22.301 -22.507 -22.615 -22.842 -23.081 -23.33 -23.457 -23.721 -23.852 -23.998 -24.154 -24.473 -24.651 -24.842 -25.053 -25.297 -25.57 -25.912 -26.739 -9 ,30872 ,KEBNE ,17076771,Sat Dec 25 05:05:42 CET,Sat Dec 25 06:32:49 CET,0.0 0.623 0.826 0.983 1.115 1.223 1.32 1.41 1.553 1.62 1.681 1.67 1.824 1.887 2.029 2.164 2.276 2.329 2.431 2.515 2.644 2.733 2.809 2.911 3.01 3.107 3.21 3.292 3.369 3.435 3.522 3.628 3.715 3.798 3.886 3.969 4.048 4.138 4.222 4.292 4.336 4.365 4.356 4.283 4.142 3.934 3.626 3.131 2.303 1.072 -1.042 -3.733 -6.002 -7.889 -9.388 -10.694 -11.833 -12.848 -13.71 -14.537 -15.247 -15.89 -16.49 -17.028 -17.51 -17.948 -18.397 -18.795 -19.139 -19.486 -19.842 -20.136 -20.443 -20.76 -21.001 -21.249 -21.497 -21.751 -22.019 -22.199 -22.381 -22.668 -22.864 -23.059 -23.16 -23.375 -23.597 -23.813 -23.93 -24.198 -24.333 -24.481 -24.632 -24.948 -25.127 -25.316 -25.526 -25.77 -26.044 -26.398 -27.217 -10 ,635 ,KEBNE ,17076772,Sat Dec 25 05:05:44 CET,Sat Dec 25 06:32:36 CET,0.0 0.852 1.099 1.276 1.424 1.549 1.666 1.767 1.953 2.049 2.147 2.217 2.4 2.472 2.6 2.707 2.811 2.87 2.989 3.09 3.221 3.302 3.391 3.516 3.627 3.721 3.807 3.894 3.994 4.09 4.182 4.271 4.358 4.434 4.508 4.593 4.659 4.713 4.78 4.851 4.877 4.88 4.844 4.761 4.682 4.504 4.184 3.807 3.147 1.938 -0.217 -2.741 -4.828 -6.607 -8.176 -9.522 -10.627 -11.615 -12.455 -13.325 -14.085 -14.759 -15.364 -15.914 -16.427 -16.906 -17.395 -17.808 -18.173 -18.562 -18.961 -19.286 -19.611 -19.936 -20.196 -20.456 -20.713 -20.975 -21.237 -21.418 -21.61 -21.904 -22.094 -22.296 -22.408 -22.64 -22.883 -23.142 -23.277 -23.552 -23.692 -23.843 -24.001 -24.334 -24.516 -24.709 -24.925 -25.169 -25.456 -25.836 -26.812 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_167_234.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_167_234.txt deleted file mode 100644 index afd6a04c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_167_234.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31227 ,TETRA ,17617853,Tue Nov 30 11:49:19 CET,Tue Nov 30 13:39:11 CET,0.0 0.305 0.462 0.594 0.692 0.777 0.865 0.95 1.092 1.153 1.227 1.284 1.406 1.452 1.534 1.616 1.669 1.694 1.754 1.809 1.882 1.922 1.964 2.025 2.084 2.113 2.104 2.101 2.083 2.056 2.041 1.988 1.91 1.826 1.715 1.577 1.421 1.269 1.119 0.909 0.627 0.271 -0.179 -0.688 -1.362 -2.209 -3.323 -4.767 -6.757 -9.592 -13.847 -18.465 -21.962 -24.716 -26.948 -28.834 -30.387 -31.751 -32.875 -33.937 -34.849 -35.643 -36.364 -37.033 -37.648 -38.185 -38.75 -39.265 -39.702 -40.141 -40.614 -41.025 -41.421 -41.81 -42.128 -42.473 -42.821 -43.168 -43.506 -43.74 -43.989 -44.359 -44.607 -44.857 -44.979 -45.242 -45.536 -45.833 -45.985 -46.277 -46.546 -46.741 -46.925 -47.341 -47.565 -47.793 -48.067 -48.358 -48.682 -49.073 -49.917 -2 ,25344 ,TETRA ,17617854,Tue Nov 30 11:50:21 CET,Tue Nov 30 13:40:26 CET,0.0 0.695 0.892 1.022 1.118 1.194 1.254 1.304 1.423 1.485 1.538 1.551 1.661 1.702 1.767 1.818 1.86 1.868 1.883 1.901 1.908 1.919 1.924 1.9 1.862 1.827 1.791 1.755 1.717 1.667 1.599 1.511 1.429 1.342 1.218 1.098 0.972 0.777 0.551 0.319 0.048 -0.316 -0.779 -1.289 -1.952 -2.779 -3.844 -5.241 -7.214 -10.028 -14.323 -19.002 -22.507 -25.268 -27.486 -29.319 -30.835 -32.194 -33.374 -34.514 -35.43 -36.207 -36.931 -37.617 -38.25 -38.797 -39.336 -39.83 -40.262 -40.699 -41.153 -41.528 -41.913 -42.311 -42.619 -42.934 -43.269 -43.614 -43.944 -44.167 -44.406 -44.794 -45.057 -45.313 -45.452 -45.752 -46.036 -46.306 -46.449 -46.719 -46.906 -47.069 -47.247 -47.639 -47.865 -48.138 -48.406 -48.648 -48.929 -49.312 -50.363 -3 ,7179 ,TETRA ,17617855,Tue Nov 30 11:50:21 CET,Tue Nov 30 13:41:57 CET,0.0 0.662 0.877 1.026 1.137 1.222 1.299 1.368 1.486 1.539 1.586 1.593 1.703 1.74 1.796 1.855 1.906 1.928 1.968 1.993 2.006 2.007 2.005 2.006 2.004 1.988 1.965 1.936 1.885 1.821 1.752 1.685 1.637 1.57 1.459 1.308 1.131 0.91 0.661 0.38 0.093 -0.256 -0.738 -1.268 -1.942 -2.765 -3.859 -5.322 -7.318 -10.128 -14.394 -18.987 -22.476 -25.248 -27.48 -29.369 -30.969 -32.34 -33.456 -34.568 -35.5 -36.28 -37.005 -37.676 -38.282 -38.83 -39.395 -39.904 -40.35 -40.787 -41.228 -41.598 -41.966 -42.334 -42.616 -42.924 -43.257 -43.581 -43.91 -44.144 -44.382 -44.753 -45.015 -45.284 -45.414 -45.66 -45.927 -46.23 -46.379 -46.641 -46.836 -47.011 -47.187 -47.542 -47.737 -47.959 -48.204 -48.469 -48.774 -49.211 -50.237 -4 ,11925 ,TETRA ,17617856,Tue Nov 30 11:50:21 CET,Tue Nov 30 13:41:07 CET,0.0 0.45 0.689 0.838 0.924 0.988 1.039 1.08 1.158 1.19 1.218 1.188 1.278 1.299 1.345 1.39 1.413 1.417 1.429 1.437 1.45 1.455 1.46 1.462 1.432 1.396 1.385 1.387 1.359 1.319 1.278 1.215 1.166 1.137 1.116 1.064 0.95 0.778 0.547 0.277 -0.001 -0.353 -0.834 -1.327 -1.962 -2.814 -3.943 -5.408 -7.412 -10.222 -14.466 -19.082 -22.546 -25.273 -27.489 -29.394 -30.974 -32.345 -33.503 -34.604 -35.552 -36.378 -37.113 -37.822 -38.472 -39.019 -39.579 -40.071 -40.499 -40.938 -41.402 -41.807 -42.193 -42.558 -42.856 -43.16 -43.449 -43.765 -44.108 -44.345 -44.582 -44.945 -45.208 -45.455 -45.577 -45.843 -46.124 -46.425 -46.586 -46.875 -47.093 -47.262 -47.441 -47.834 -48.06 -48.31 -48.547 -48.813 -49.135 -49.53 -50.508 -5 ,23526 ,TETRA ,17617857,Tue Nov 30 11:50:21 CET,Tue Nov 30 13:39:58 CET,0.0 0.485 0.664 0.788 0.887 0.982 1.054 1.114 1.231 1.28 1.32 1.307 1.403 1.423 1.454 1.485 1.512 1.52 1.531 1.54 1.536 1.526 1.518 1.503 1.486 1.482 1.48 1.458 1.423 1.401 1.397 1.363 1.29 1.217 1.13 1.025 0.903 0.74 0.579 0.393 0.124 -0.226 -0.694 -1.232 -1.943 -2.767 -3.799 -5.23 -7.24 -10.045 -14.299 -18.874 -22.345 -25.135 -27.356 -29.209 -30.793 -32.171 -33.303 -34.4 -35.325 -36.119 -36.857 -37.564 -38.236 -38.801 -39.383 -39.915 -40.351 -40.809 -41.293 -41.683 -42.077 -42.488 -42.8 -43.099 -43.402 -43.72 -44.043 -44.27 -44.497 -44.836 -45.077 -45.341 -45.471 -45.732 -46.006 -46.28 -46.429 -46.711 -46.919 -47.08 -47.252 -47.625 -47.842 -48.092 -48.361 -48.627 -48.921 -49.325 -50.278 -6 ,26794 ,TETRA ,17617858,Tue Nov 30 11:51:20 CET,Tue Nov 30 13:42:09 CET,0.0 0.39 0.554 0.682 0.788 0.871 0.949 1.012 1.098 1.127 1.144 1.087 1.18 1.198 1.224 1.25 1.267 1.271 1.275 1.278 1.272 1.258 1.244 1.215 1.181 1.162 1.147 1.125 1.092 1.047 0.997 0.939 0.876 0.79 0.668 0.533 0.397 0.234 0.041 -0.189 -0.46 -0.803 -1.275 -1.811 -2.49 -3.35 -4.47 -5.915 -7.941 -10.759 -14.958 -19.519 -23.004 -25.787 -28.031 -29.932 -31.523 -32.884 -34.0 -35.1 -36.057 -36.875 -37.608 -38.29 -38.927 -39.482 -40.045 -40.561 -40.992 -41.424 -41.871 -42.252 -42.662 -43.073 -43.371 -43.665 -43.968 -44.296 -44.649 -44.888 -45.134 -45.502 -45.738 -45.974 -46.095 -46.353 -46.633 -46.929 -47.082 -47.359 -47.569 -47.735 -47.895 -48.274 -48.49 -48.743 -49.01 -49.259 -49.529 -49.988 -51.251 -7 ,26346 ,TETRA ,17617859,Tue Nov 30 11:51:21 CET,Tue Nov 30 13:38:16 CET,0.0 0.525 0.715 0.839 0.923 0.99 1.049 1.109 1.229 1.284 1.332 1.342 1.458 1.495 1.536 1.553 1.563 1.569 1.58 1.582 1.577 1.572 1.572 1.57 1.558 1.564 1.583 1.587 1.584 1.577 1.56 1.528 1.485 1.422 1.327 1.225 1.103 0.949 0.77 0.554 0.295 -0.031 -0.454 -0.954 -1.606 -2.426 -3.539 -5.004 -7.021 -9.84 -14.075 -18.711 -22.23 -25.007 -27.231 -29.109 -30.688 -32.086 -33.252 -34.387 -35.326 -36.117 -36.865 -37.571 -38.24 -38.82 -39.407 -39.942 -40.382 -40.827 -41.301 -41.693 -42.064 -42.42 -42.707 -43.031 -43.373 -43.713 -44.052 -44.292 -44.543 -44.924 -45.165 -45.413 -45.549 -45.807 -46.078 -46.389 -46.551 -46.837 -47.051 -47.224 -47.424 -47.865 -48.091 -48.331 -48.584 -48.878 -49.236 -49.631 -50.79 -8 ,3808 ,TETRA ,17617860,Tue Nov 30 11:51:23 CET,Tue Nov 30 13:38:35 CET,0.0 0.587 0.796 0.936 1.058 1.157 1.233 1.316 1.466 1.514 1.562 1.574 1.68 1.715 1.791 1.856 1.906 1.926 1.96 1.986 2.02 2.043 2.059 2.076 2.091 2.103 2.122 2.143 2.169 2.187 2.178 2.15 2.113 2.07 2.023 1.938 1.804 1.629 1.44 1.225 0.999 0.697 0.253 -0.257 -0.931 -1.773 -2.902 -4.335 -6.308 -9.099 -13.34 -17.988 -21.484 -24.232 -26.466 -28.362 -29.929 -31.261 -32.381 -33.486 -34.404 -35.186 -35.903 -36.56 -37.18 -37.752 -38.339 -38.85 -39.28 -39.729 -40.185 -40.558 -40.954 -41.364 -41.656 -41.952 -42.268 -42.6 -42.949 -43.184 -43.424 -43.809 -44.065 -44.327 -44.458 -44.718 -45.006 -45.3 -45.446 -45.707 -45.904 -46.077 -46.252 -46.598 -46.786 -47.004 -47.237 -47.508 -47.819 -48.191 -49.104 -9 ,14899 ,TETRA ,17617861,Tue Nov 30 11:52:19 CET,Tue Nov 30 13:35:48 CET,0.0 0.638 0.858 0.998 1.108 1.201 1.266 1.312 1.402 1.449 1.494 1.488 1.596 1.626 1.661 1.705 1.759 1.783 1.824 1.857 1.887 1.906 1.928 1.959 1.975 1.964 1.942 1.925 1.9 1.867 1.833 1.793 1.752 1.708 1.66 1.59 1.465 1.296 1.105 0.895 0.655 0.325 -0.138 -0.688 -1.375 -2.216 -3.349 -4.782 -6.723 -9.468 -13.651 -18.234 -21.696 -24.453 -26.674 -28.573 -30.144 -31.474 -32.6 -33.699 -34.615 -35.409 -36.147 -36.827 -37.428 -37.977 -38.548 -39.028 -39.459 -39.917 -40.377 -40.772 -41.171 -41.571 -41.878 -42.178 -42.476 -42.777 -43.098 -43.32 -43.535 -43.864 -44.108 -44.362 -44.487 -44.744 -45.009 -45.306 -45.465 -45.745 -45.926 -46.08 -46.258 -46.647 -46.873 -47.13 -47.387 -47.66 -47.969 -48.313 -49.23 -10 ,3879 ,TETRA ,17617862,Tue Nov 30 11:52:19 CET,Tue Nov 30 13:39:38 CET,0.0 0.494 0.643 0.748 0.848 0.948 1.035 1.105 1.225 1.283 1.326 1.331 1.446 1.484 1.547 1.608 1.662 1.693 1.773 1.834 1.893 1.939 1.98 2.04 2.089 2.118 2.136 2.15 2.141 2.099 2.056 2.019 1.984 1.952 1.894 1.779 1.648 1.466 1.245 0.982 0.677 0.304 -0.162 -0.673 -1.351 -2.192 -3.302 -4.757 -6.76 -9.597 -13.914 -18.561 -22.049 -24.825 -27.047 -28.922 -30.48 -31.82 -32.948 -34.055 -34.989 -35.786 -36.528 -37.218 -37.864 -38.435 -38.973 -39.481 -39.958 -40.454 -40.935 -41.305 -41.678 -42.067 -42.361 -42.651 -42.945 -43.247 -43.59 -43.828 -44.062 -44.422 -44.663 -44.917 -45.047 -45.303 -45.568 -45.849 -46.006 -46.294 -46.505 -46.679 -46.868 -47.252 -47.463 -47.703 -47.961 -48.234 -48.551 -48.938 -49.911 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_1_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_1_61.txt deleted file mode 100644 index 78e23102..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_1_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7810 ,TETRA ,17617863,Tue Nov 30 11:52:20 CET,Tue Nov 30 13:39:27 CET,0.0 0.86 1.1 1.274 1.437 1.566 1.684 1.797 1.958 2.032 2.112 2.213 2.317 2.354 2.431 2.513 2.584 2.622 2.696 2.754 2.827 2.866 2.897 2.937 2.984 3.012 3.015 3.008 3.001 2.989 2.949 2.885 2.822 2.76 2.699 2.623 2.496 2.332 2.155 1.948 1.701 1.374 0.897 0.356 -0.319 -1.171 -2.283 -3.746 -5.766 -8.555 -12.774 -17.374 -20.808 -23.54 -25.753 -27.621 -29.205 -30.585 -31.71 -32.789 -33.689 -34.477 -35.261 -36.006 -36.671 -37.233 -37.799 -38.309 -38.724 -39.154 -39.596 -39.953 -40.34 -40.736 -41.035 -41.344 -41.657 -41.976 -42.299 -42.528 -42.769 -43.136 -43.389 -43.65 -43.781 -44.048 -44.338 -44.625 -44.765 -45.01 -45.237 -45.422 -45.607 -46.003 -46.225 -46.451 -46.69 -46.975 -47.295 -47.678 -48.66 -2 ,2010 ,TETRA ,17617864,Tue Nov 30 11:52:22 CET,Tue Nov 30 13:39:26 CET,0.0 0.904 1.198 1.402 1.556 1.686 1.801 1.907 2.073 2.144 2.206 2.258 2.358 2.406 2.493 2.556 2.61 2.635 2.67 2.705 2.76 2.791 2.819 2.855 2.871 2.87 2.876 2.905 2.919 2.895 2.859 2.82 2.774 2.708 2.617 2.487 2.373 2.233 2.05 1.838 1.562 1.199 0.709 0.175 -0.512 -1.387 -2.525 -3.973 -5.963 -8.805 -13.062 -17.653 -21.157 -23.97 -26.227 -28.112 -29.715 -31.086 -32.217 -33.383 -34.357 -35.162 -35.887 -36.543 -37.154 -37.719 -38.286 -38.784 -39.208 -39.633 -40.088 -40.462 -40.824 -41.186 -41.472 -41.772 -42.081 -42.409 -42.751 -42.988 -43.227 -43.582 -43.834 -44.087 -44.213 -44.47 -44.727 -44.997 -45.15 -45.404 -45.605 -45.78 -45.964 -46.348 -46.561 -46.786 -47.037 -47.32 -47.644 -48.023 -49.002 -3 ,22690 ,TETRA ,17617865,Tue Nov 30 11:52:20 CET,Tue Nov 30 13:39:01 CET,0.0 0.848 1.084 1.252 1.387 1.525 1.657 1.759 1.92 1.99 2.059 2.137 2.244 2.304 2.407 2.483 2.553 2.586 2.633 2.668 2.726 2.756 2.768 2.786 2.793 2.78 2.791 2.813 2.821 2.815 2.812 2.81 2.796 2.754 2.656 2.537 2.417 2.287 2.126 1.882 1.602 1.263 0.813 0.309 -0.359 -1.219 -2.349 -3.836 -5.836 -8.639 -12.921 -17.558 -21.074 -23.839 -26.054 -27.925 -29.492 -30.828 -31.946 -33.059 -33.998 -34.853 -35.637 -36.316 -36.935 -37.48 -38.053 -38.556 -38.976 -39.435 -39.929 -40.337 -40.746 -41.145 -41.452 -41.768 -42.092 -42.412 -42.733 -42.97 -43.215 -43.594 -43.855 -44.117 -44.242 -44.503 -44.786 -45.082 -45.239 -45.501 -45.751 -45.925 -46.105 -46.484 -46.691 -46.918 -47.169 -47.432 -47.736 -48.117 -49.011 -4 ,25409 ,TETRA ,17617866,Tue Nov 30 11:52:22 CET,Tue Nov 30 13:39:23 CET,0.0 0.685 0.915 1.095 1.248 1.382 1.499 1.595 1.759 1.84 1.916 1.977 2.072 2.119 2.196 2.239 2.274 2.296 2.341 2.387 2.462 2.498 2.524 2.557 2.572 2.575 2.579 2.578 2.563 2.545 2.528 2.474 2.39 2.319 2.231 2.116 1.986 1.817 1.62 1.382 1.097 0.759 0.327 -0.175 -0.829 -1.673 -2.792 -4.231 -6.205 -9.023 -13.315 -17.947 -21.382 -24.097 -26.305 -28.174 -29.711 -31.031 -32.147 -33.251 -34.201 -35.001 -35.71 -36.363 -36.967 -37.521 -38.101 -38.606 -39.035 -39.474 -39.921 -40.283 -40.648 -41.039 -41.353 -41.676 -42.005 -42.346 -42.694 -42.919 -43.148 -43.489 -43.73 -43.993 -44.121 -44.382 -44.668 -44.962 -45.111 -45.363 -45.596 -45.774 -45.951 -46.339 -46.554 -46.79 -47.049 -47.348 -47.683 -48.022 -48.809 -5 ,10853 ,TETRA ,17617867,Tue Nov 30 11:52:20 CET,Tue Nov 30 13:33:53 CET,0.0 1.363 1.647 1.826 1.953 2.067 2.184 2.292 2.448 2.516 2.59 2.657 2.75 2.792 2.87 2.927 2.973 3.009 3.076 3.11 3.152 3.186 3.22 3.265 3.288 3.282 3.269 3.259 3.232 3.201 3.184 3.156 3.116 3.057 2.955 2.838 2.708 2.549 2.411 2.259 2.008 1.627 1.142 0.624 -0.064 -0.931 -2.072 -3.556 -5.561 -8.359 -12.59 -17.159 -20.639 -23.439 -25.677 -27.567 -29.185 -30.572 -31.708 -32.77 -33.691 -34.523 -35.284 -35.975 -36.589 -37.15 -37.729 -38.244 -38.679 -39.096 -39.516 -39.881 -40.262 -40.653 -40.964 -41.273 -41.569 -41.888 -42.246 -42.491 -42.739 -43.121 -43.394 -43.668 -43.792 -44.044 -44.309 -44.594 -44.752 -45.008 -45.234 -45.414 -45.602 -45.98 -46.175 -46.381 -46.618 -46.917 -47.293 -47.772 -48.855 -6 ,3365 ,TETRA ,17617868,Tue Nov 30 11:52:20 CET,Tue Nov 30 13:39:45 CET,0.0 0.84 1.124 1.293 1.455 1.585 1.701 1.8 1.95 2.009 2.073 2.144 2.24 2.284 2.384 2.464 2.511 2.534 2.576 2.62 2.683 2.722 2.753 2.787 2.803 2.811 2.809 2.792 2.771 2.746 2.712 2.649 2.575 2.504 2.423 2.311 2.188 2.024 1.828 1.65 1.42 1.07 0.597 0.061 -0.623 -1.477 -2.605 -4.055 -6.005 -8.752 -13.018 -17.618 -21.066 -23.787 -26.015 -27.943 -29.551 -30.915 -32.056 -33.211 -34.184 -35.026 -35.814 -36.529 -37.18 -37.752 -38.302 -38.802 -39.236 -39.668 -40.125 -40.5 -40.875 -41.261 -41.564 -41.878 -42.204 -42.545 -42.897 -43.139 -43.387 -43.758 -44.014 -44.273 -44.402 -44.679 -44.969 -45.276 -45.435 -45.687 -45.899 -46.071 -46.25 -46.608 -46.806 -47.022 -47.264 -47.544 -47.857 -48.305 -49.8 -7 ,21866 ,TETRA ,17617869,Tue Nov 30 11:52:21 CET,Tue Nov 30 13:40:08 CET,0.0 1.122 1.363 1.577 1.764 1.921 2.041 2.134 2.307 2.387 2.453 2.506 2.612 2.665 2.755 2.83 2.883 2.908 2.948 2.976 3.01 3.049 3.084 3.122 3.155 3.178 3.202 3.213 3.194 3.167 3.134 3.067 3.004 2.94 2.842 2.722 2.602 2.464 2.293 2.043 1.741 1.395 0.97 0.471 -0.204 -1.071 -2.197 -3.677 -5.735 -8.616 -12.904 -17.412 -20.844 -23.647 -25.932 -27.831 -29.401 -30.746 -31.87 -32.981 -33.902 -34.7 -35.445 -36.123 -36.74 -37.303 -37.875 -38.373 -38.813 -39.267 -39.709 -40.062 -40.456 -40.866 -41.158 -41.442 -41.745 -42.073 -42.402 -42.614 -42.839 -43.182 -43.413 -43.666 -43.793 -44.053 -44.323 -44.593 -44.731 -44.981 -45.216 -45.409 -45.609 -46.01 -46.224 -46.438 -46.667 -46.93 -47.234 -47.642 -48.646 -8 ,13911 ,TETRA ,17617870,Tue Nov 30 11:52:23 CET,Tue Nov 30 13:40:14 CET,0.0 0.849 1.103 1.326 1.494 1.613 1.727 1.821 1.946 2.005 2.062 2.117 2.223 2.277 2.37 2.449 2.528 2.561 2.603 2.629 2.669 2.698 2.715 2.73 2.739 2.744 2.725 2.709 2.695 2.665 2.632 2.569 2.516 2.476 2.379 2.242 2.112 1.967 1.779 1.549 1.312 0.974 0.479 -0.038 -0.71 -1.581 -2.719 -4.191 -6.183 -9.007 -13.319 -17.957 -21.424 -24.161 -26.392 -28.286 -29.879 -31.239 -32.38 -33.509 -34.432 -35.222 -35.944 -36.615 -37.229 -37.792 -38.378 -38.883 -39.315 -39.753 -40.215 -40.608 -41.001 -41.399 -41.718 -42.042 -42.365 -42.699 -43.028 -43.242 -43.462 -43.81 -44.048 -44.306 -44.444 -44.713 -44.98 -45.272 -45.424 -45.677 -45.915 -46.083 -46.259 -46.654 -46.867 -47.082 -47.312 -47.598 -47.915 -48.263 -49.218 -9 ,20135 ,TETRA ,17617871,Tue Nov 30 11:52:21 CET,Tue Nov 30 13:40:06 CET,0.0 1.001 1.251 1.419 1.565 1.693 1.792 1.877 2.065 2.154 2.224 2.281 2.383 2.432 2.516 2.585 2.635 2.663 2.719 2.75 2.802 2.836 2.87 2.925 2.956 2.967 2.964 2.959 2.949 2.919 2.88 2.841 2.804 2.75 2.677 2.575 2.439 2.295 2.121 1.885 1.622 1.285 0.839 0.315 -0.384 -1.225 -2.351 -3.813 -5.766 -8.53 -12.752 -17.36 -20.875 -23.64 -25.842 -27.716 -29.311 -30.694 -31.826 -32.918 -33.837 -34.675 -35.471 -36.178 -36.788 -37.35 -37.942 -38.43 -38.843 -39.265 -39.693 -40.051 -40.44 -40.85 -41.162 -41.469 -41.779 -42.096 -42.426 -42.66 -42.893 -43.246 -43.498 -43.764 -43.895 -44.141 -44.403 -44.699 -44.847 -45.09 -45.298 -45.461 -45.636 -46.015 -46.208 -46.42 -46.664 -46.907 -47.18 -47.567 -48.754 -10 ,17424 ,TETRA ,17617873,Tue Nov 30 11:52:23 CET,Tue Nov 30 13:39:57 CET,0.0 0.747 1.038 1.249 1.401 1.524 1.627 1.73 1.917 1.995 2.064 2.135 2.24 2.29 2.366 2.425 2.487 2.522 2.588 2.632 2.689 2.726 2.76 2.797 2.822 2.848 2.862 2.866 2.863 2.835 2.796 2.749 2.702 2.629 2.535 2.441 2.313 2.13 1.907 1.662 1.418 1.102 0.655 0.144 -0.531 -1.376 -2.513 -3.985 -5.974 -8.789 -13.108 -17.756 -21.21 -23.963 -26.215 -28.087 -29.622 -30.982 -32.14 -33.257 -34.158 -34.928 -35.66 -36.346 -36.968 -37.531 -38.097 -38.568 -38.99 -39.444 -39.914 -40.309 -40.712 -41.115 -41.42 -41.725 -42.046 -42.382 -42.708 -42.933 -43.182 -43.567 -43.828 -44.095 -44.228 -44.495 -44.776 -45.077 -45.232 -45.487 -45.711 -45.885 -46.068 -46.442 -46.653 -46.886 -47.137 -47.406 -47.725 -48.218 -49.421 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_1_84.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_1_84.txt deleted file mode 100644 index 5af65a9d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_1_84.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7081 ,TETRA ,17617874,Tue Nov 30 11:53:20 CET,Tue Nov 30 13:39:41 CET,0.0 0.747 1.004 1.212 1.393 1.541 1.656 1.762 1.964 2.057 2.146 2.239 2.354 2.422 2.548 2.662 2.771 2.823 2.918 3.005 3.132 3.213 3.29 3.402 3.507 3.604 3.693 3.776 3.878 3.97 4.053 4.149 4.236 4.313 4.393 4.472 4.553 4.635 4.702 4.765 4.821 4.853 4.872 4.875 4.832 4.709 4.449 3.986 3.289 2.13 -0.122 -2.965 -5.397 -7.446 -9.091 -10.479 -11.705 -12.824 -13.741 -14.617 -15.373 -16.035 -16.65 -17.214 -17.715 -18.17 -18.663 -19.098 -19.461 -19.833 -20.204 -20.511 -20.85 -21.21 -21.488 -21.779 -22.06 -22.345 -22.656 -22.861 -23.061 -23.372 -23.594 -23.827 -23.947 -24.193 -24.44 -24.718 -24.876 -25.1 -25.318 -25.479 -25.645 -25.981 -26.174 -26.399 -26.649 -26.92 -27.238 -27.693 -28.876 -2 ,22682 ,TETRA ,17617875,Tue Nov 30 11:53:21 CET,Tue Nov 30 13:39:41 CET,0.0 0.782 1.035 1.214 1.368 1.52 1.656 1.771 1.972 2.066 2.149 2.237 2.359 2.428 2.556 2.673 2.79 2.845 2.944 3.047 3.203 3.294 3.37 3.486 3.603 3.7 3.786 3.871 3.969 4.062 4.162 4.273 4.363 4.444 4.523 4.61 4.687 4.761 4.821 4.871 4.926 4.972 4.997 4.989 4.932 4.794 4.554 4.166 3.534 2.379 0.302 -2.301 -4.46 -6.309 -7.934 -9.367 -10.596 -11.679 -12.594 -13.481 -14.238 -14.9 -15.509 -16.075 -16.605 -17.097 -17.613 -18.054 -18.437 -18.829 -19.22 -19.54 -19.869 -20.223 -20.492 -20.766 -21.043 -21.325 -21.621 -21.829 -22.052 -22.393 -22.619 -22.848 -22.964 -23.193 -23.453 -23.727 -23.866 -24.095 -24.333 -24.496 -24.666 -25.033 -25.224 -25.439 -25.68 -25.984 -26.324 -26.735 -27.81 -3 ,31386 ,TETRA ,17617876,Tue Nov 30 11:53:20 CET,Tue Nov 30 13:39:35 CET,0.0 0.849 1.147 1.355 1.518 1.656 1.783 1.907 2.121 2.207 2.294 2.408 2.535 2.607 2.74 2.858 2.955 3.006 3.11 3.191 3.29 3.36 3.435 3.54 3.634 3.732 3.822 3.901 4.002 4.101 4.189 4.295 4.399 4.485 4.579 4.665 4.728 4.793 4.857 4.901 4.945 4.972 4.984 5.001 4.951 4.822 4.612 4.217 3.415 1.95 -0.329 -2.925 -5.141 -7.058 -8.648 -10.02 -11.234 -12.288 -13.171 -14.071 -14.844 -15.498 -16.099 -16.667 -17.192 -17.668 -18.15 -18.598 -18.994 -19.385 -19.782 -20.111 -20.454 -20.808 -21.081 -21.355 -21.637 -21.929 -22.237 -22.452 -22.668 -22.997 -23.227 -23.466 -23.585 -23.831 -24.089 -24.36 -24.5 -24.716 -24.936 -25.097 -25.275 -25.677 -25.885 -26.094 -26.316 -26.576 -26.889 -27.272 -28.411 -4 ,31365 ,TETRA ,17617877,Tue Nov 30 11:21:22 CET,Tue Nov 30 12:56:50 CET,0.0 0.828 1.099 1.314 1.482 1.621 1.754 1.87 2.078 2.175 2.262 2.365 2.486 2.553 2.684 2.795 2.907 2.966 3.065 3.148 3.272 3.352 3.426 3.53 3.627 3.722 3.81 3.887 3.991 4.081 4.158 4.267 4.361 4.434 4.513 4.591 4.673 4.763 4.839 4.899 4.939 4.968 4.98 4.957 4.879 4.72 4.462 4.08 3.406 2.227 0.162 -2.551 -4.831 -6.72 -8.305 -9.72 -10.97 -12.071 -12.979 -13.871 -14.621 -15.274 -15.891 -16.475 -17.015 -17.499 -17.979 -18.393 -18.752 -19.136 -19.543 -19.864 -20.191 -20.559 -20.841 -21.113 -21.395 -21.681 -21.975 -22.177 -22.387 -22.71 -22.934 -23.165 -23.282 -23.537 -23.808 -24.088 -24.229 -24.455 -24.715 -24.887 -25.064 -25.441 -25.648 -25.871 -26.127 -26.429 -26.779 -27.225 -28.466 -5 ,24670 ,TETRA ,17617878,Tue Nov 30 11:21:23 CET,Tue Nov 30 13:07:47 CET,0.0 0.933 1.188 1.389 1.568 1.724 1.852 1.963 2.171 2.259 2.339 2.447 2.57 2.64 2.763 2.86 2.951 3.001 3.096 3.176 3.3 3.379 3.46 3.581 3.685 3.782 3.873 3.951 4.047 4.134 4.222 4.337 4.445 4.539 4.621 4.706 4.794 4.89 4.979 5.05 5.111 5.156 5.18 5.165 5.112 5.017 4.784 4.278 3.471 2.255 0.035 -2.811 -5.193 -7.255 -8.97 -10.371 -11.56 -12.652 -13.587 -14.492 -15.248 -15.916 -16.546 -17.14 -17.69 -18.178 -18.663 -19.099 -19.482 -19.882 -20.288 -20.6 -20.917 -21.263 -21.528 -21.803 -22.094 -22.39 -22.696 -22.901 -23.103 -23.413 -23.624 -23.849 -23.975 -24.237 -24.494 -24.747 -24.881 -25.097 -25.307 -25.464 -25.636 -26.024 -26.236 -26.469 -26.726 -27.01 -27.326 -27.733 -29.033 -6 ,19276 ,TETRA ,17617879,Tue Nov 30 11:21:25 CET,Tue Nov 30 13:07:48 CET,0.0 0.705 0.951 1.137 1.295 1.445 1.564 1.668 1.864 1.949 2.03 2.144 2.27 2.341 2.474 2.596 2.708 2.758 2.854 2.944 3.076 3.158 3.236 3.342 3.433 3.526 3.618 3.699 3.797 3.893 3.988 4.08 4.166 4.252 4.34 4.441 4.529 4.609 4.697 4.774 4.84 4.898 4.893 4.856 4.812 4.685 4.45 4.082 3.421 2.303 0.15 -2.56 -4.773 -6.748 -8.467 -9.972 -11.232 -12.342 -13.261 -14.142 -14.894 -15.543 -16.152 -16.741 -17.289 -17.788 -18.301 -18.742 -19.119 -19.501 -19.888 -20.212 -20.555 -20.901 -21.163 -21.436 -21.71 -21.98 -22.275 -22.486 -22.697 -23.038 -23.275 -23.509 -23.631 -23.889 -24.144 -24.397 -24.534 -24.756 -24.988 -25.149 -25.313 -25.67 -25.861 -26.071 -26.327 -26.625 -26.953 -27.358 -28.559 -7 ,6522 ,TETRA ,17617880,Tue Nov 30 11:21:23 CET,Tue Nov 30 13:09:00 CET,0.0 1.033 1.317 1.495 1.649 1.808 1.948 2.075 2.293 2.388 2.482 2.599 2.733 2.81 2.943 3.064 3.162 3.213 3.32 3.413 3.55 3.642 3.731 3.845 3.938 4.024 4.102 4.177 4.274 4.37 4.465 4.571 4.655 4.742 4.844 4.944 5.019 5.087 5.162 5.236 5.31 5.37 5.399 5.405 5.402 5.265 4.958 4.543 3.857 2.599 0.338 -2.524 -4.954 -6.932 -8.595 -10.068 -11.327 -12.414 -13.318 -14.233 -14.988 -15.641 -16.267 -16.851 -17.398 -17.892 -18.397 -18.841 -19.224 -19.609 -19.984 -20.287 -20.613 -20.959 -21.228 -21.497 -21.784 -22.085 -22.379 -22.579 -22.787 -23.112 -23.33 -23.559 -23.682 -23.924 -24.166 -24.41 -24.544 -24.767 -24.997 -25.151 -25.325 -25.708 -25.911 -26.139 -26.379 -26.64 -26.935 -27.324 -28.336 -8 ,5512 ,TETRA ,17617881,Tue Nov 30 11:22:22 CET,Tue Nov 30 13:08:31 CET,0.0 0.762 1.049 1.258 1.442 1.604 1.745 1.86 2.043 2.132 2.219 2.339 2.462 2.531 2.661 2.77 2.881 2.935 3.037 3.135 3.265 3.351 3.434 3.539 3.65 3.745 3.825 3.908 4.012 4.111 4.209 4.328 4.433 4.53 4.635 4.74 4.834 4.916 5.008 5.11 5.163 5.187 5.22 5.211 5.137 5.019 4.765 4.284 3.541 2.439 0.319 -2.454 -4.747 -6.729 -8.428 -9.907 -11.143 -12.216 -13.108 -14.001 -14.755 -15.396 -16.014 -16.589 -17.128 -17.634 -18.13 -18.565 -18.937 -19.313 -19.709 -20.042 -20.382 -20.716 -20.976 -21.246 -21.527 -21.818 -22.117 -22.321 -22.52 -22.844 -23.075 -23.304 -23.422 -23.663 -23.919 -24.176 -24.305 -24.523 -24.748 -24.909 -25.08 -25.429 -25.617 -25.824 -26.069 -26.348 -26.661 -27.057 -28.294 -9 ,32576 ,TETRA ,17617882,Tue Nov 30 11:22:22 CET,Tue Nov 30 13:08:15 CET,0.0 0.878 1.203 1.425 1.586 1.716 1.835 1.945 2.162 2.265 2.352 2.462 2.591 2.664 2.797 2.921 3.024 3.073 3.18 3.28 3.415 3.505 3.588 3.694 3.787 3.881 3.969 4.043 4.137 4.238 4.341 4.45 4.536 4.612 4.692 4.801 4.897 4.989 5.084 5.169 5.23 5.254 5.28 5.288 5.226 5.093 4.785 4.268 3.54 2.408 0.31 -2.465 -4.808 -6.785 -8.459 -9.849 -11.044 -12.144 -13.057 -13.942 -14.722 -15.412 -16.03 -16.606 -17.141 -17.612 -18.106 -18.542 -18.918 -19.319 -19.729 -20.067 -20.416 -20.767 -21.038 -21.316 -21.597 -21.887 -22.196 -22.411 -22.624 -22.944 -23.163 -23.399 -23.517 -23.755 -24.019 -24.303 -24.45 -24.67 -24.887 -25.051 -25.222 -25.572 -25.773 -25.992 -26.224 -26.487 -26.805 -27.212 -28.399 -10 ,16105 ,TETRA ,17617884,Tue Nov 30 11:22:23 CET,Tue Nov 30 13:09:18 CET,0.0 0.753 1.022 1.241 1.431 1.584 1.721 1.848 2.085 2.186 2.267 2.378 2.509 2.576 2.694 2.803 2.907 2.959 3.052 3.139 3.263 3.338 3.413 3.524 3.619 3.707 3.793 3.875 3.98 4.074 4.164 4.264 4.352 4.433 4.521 4.619 4.694 4.763 4.841 4.907 4.94 4.955 4.969 4.969 4.952 4.859 4.642 4.244 3.606 2.513 0.39 -2.373 -4.759 -6.686 -8.273 -9.691 -10.893 -11.936 -12.836 -13.738 -14.489 -15.148 -15.798 -16.4 -16.94 -17.418 -17.899 -18.332 -18.706 -19.092 -19.488 -19.823 -20.175 -20.527 -20.789 -21.064 -21.343 -21.622 -21.912 -22.103 -22.3 -22.612 -22.835 -23.066 -23.181 -23.43 -23.695 -23.962 -24.105 -24.33 -24.576 -24.737 -24.899 -25.257 -25.454 -25.668 -25.905 -26.187 -26.509 -26.882 -28.025 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_206_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_206_163.txt deleted file mode 100644 index 571eaa9f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_206_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,287 ,TETRA ,17617885,Tue Nov 30 11:22:24 CET,Tue Nov 30 13:10:10 CET,0.0 0.742 0.935 1.08 1.212 1.329 1.433 1.516 1.648 1.72 1.796 1.826 1.996 2.053 2.149 2.236 2.312 2.348 2.436 2.523 2.636 2.709 2.764 2.828 2.888 2.943 2.981 3.009 3.061 3.115 3.161 3.211 3.26 3.298 3.321 3.35 3.379 3.423 3.528 3.612 3.61 3.584 3.542 3.479 3.379 3.211 2.928 2.506 1.834 0.754 -1.043 -3.138 -4.831 -6.203 -7.364 -8.372 -9.248 -10.079 -10.777 -11.448 -12.056 -12.585 -13.058 -13.511 -13.928 -14.311 -14.711 -15.078 -15.394 -15.71 -16.054 -16.337 -16.597 -16.877 -17.128 -17.389 -17.652 -17.918 -18.192 -18.373 -18.561 -18.863 -19.065 -19.285 -19.398 -19.625 -19.872 -20.131 -20.267 -20.541 -20.732 -20.896 -21.06 -21.404 -21.613 -21.833 -22.061 -22.355 -22.719 -23.161 -24.255 -2 ,9808 ,TETRA ,17617886,Tue Nov 30 11:23:28 CET,Tue Nov 30 13:11:26 CET,0.0 0.6 0.783 0.943 1.074 1.181 1.275 1.366 1.532 1.6 1.67 1.704 1.882 1.947 2.066 2.156 2.224 2.256 2.327 2.391 2.479 2.539 2.588 2.651 2.723 2.791 2.846 2.887 2.934 2.985 3.032 3.074 3.115 3.153 3.177 3.209 3.241 3.269 3.273 3.248 3.215 3.152 3.036 2.905 2.741 2.5 2.163 1.695 1.004 -0.006 -1.705 -3.738 -5.347 -6.666 -7.794 -8.796 -9.665 -10.467 -11.139 -11.797 -12.368 -12.875 -13.343 -13.782 -14.202 -14.574 -14.965 -15.338 -15.668 -15.998 -16.346 -16.633 -16.904 -17.18 -17.396 -17.615 -17.847 -18.107 -18.37 -18.542 -18.725 -19.01 -19.218 -19.446 -19.563 -19.804 -20.047 -20.315 -20.465 -20.748 -20.942 -21.116 -21.283 -21.641 -21.853 -22.062 -22.297 -22.577 -22.892 -23.313 -24.591 -3 ,22946 ,TETRA ,17617887,Tue Nov 30 11:23:28 CET,Tue Nov 30 13:13:09 CET,0.0 0.762 0.985 1.158 1.316 1.459 1.578 1.669 1.813 1.873 1.927 1.929 2.095 2.156 2.275 2.39 2.5 2.544 2.621 2.699 2.811 2.888 2.963 3.079 3.202 3.309 3.4 3.478 3.582 3.66 3.704 3.746 3.77 3.796 3.834 3.855 3.873 3.887 3.879 3.876 3.864 3.834 3.806 3.761 3.673 3.497 3.2 2.799 2.192 1.182 -0.541 -2.62 -4.351 -5.783 -6.946 -7.974 -8.846 -9.677 -10.422 -11.111 -11.688 -12.21 -12.687 -13.169 -13.661 -14.085 -14.505 -14.863 -15.186 -15.521 -15.844 -16.117 -16.421 -16.745 -16.977 -17.205 -17.463 -17.719 -17.959 -18.132 -18.322 -18.62 -18.825 -19.027 -19.141 -19.397 -19.655 -19.91 -20.039 -20.298 -20.446 -20.586 -20.745 -21.118 -21.321 -21.543 -21.786 -22.074 -22.413 -22.829 -23.873 -4 ,5504 ,TETRA ,17617889,Tue Nov 30 11:23:31 CET,Tue Nov 30 13:02:49 CET,0.0 0.678 0.893 1.05 1.174 1.286 1.381 1.456 1.604 1.668 1.726 1.732 1.889 1.942 2.038 2.113 2.18 2.213 2.276 2.33 2.411 2.466 2.518 2.585 2.645 2.701 2.759 2.812 2.868 2.929 2.982 3.034 3.085 3.131 3.18 3.232 3.267 3.277 3.271 3.245 3.21 3.166 3.082 2.969 2.795 2.555 2.198 1.691 0.961 -0.116 -1.86 -3.897 -5.535 -6.873 -8.029 -9.059 -9.925 -10.704 -11.382 -12.104 -12.739 -13.263 -13.753 -14.253 -14.689 -15.055 -15.436 -15.808 -16.158 -16.5 -16.864 -17.173 -17.469 -17.785 -18.049 -18.304 -18.552 -18.812 -19.078 -19.273 -19.465 -19.734 -19.917 -20.107 -20.207 -20.421 -20.656 -20.907 -21.032 -21.286 -21.442 -21.594 -21.77 -22.165 -22.356 -22.565 -22.812 -23.08 -23.397 -23.82 -25.012 -5 ,4239 ,TETRA ,17617890,Tue Nov 30 11:24:22 CET,Tue Nov 30 13:12:20 CET,0.0 0.678 0.907 1.083 1.229 1.337 1.433 1.523 1.663 1.721 1.779 1.793 1.958 2.004 2.087 2.165 2.239 2.276 2.355 2.442 2.559 2.618 2.664 2.721 2.776 2.835 2.89 2.938 2.999 3.059 3.11 3.166 3.209 3.243 3.283 3.346 3.403 3.45 3.513 3.545 3.542 3.541 3.548 3.518 3.398 3.23 2.961 2.522 1.862 0.829 -0.918 -2.97 -4.662 -6.113 -7.321 -8.375 -9.303 -10.132 -10.812 -11.492 -12.079 -12.59 -13.073 -13.514 -13.942 -14.364 -14.809 -15.157 -15.434 -15.766 -16.135 -16.42 -16.702 -17.006 -17.25 -17.489 -17.732 -18.011 -18.299 -18.487 -18.677 -18.964 -19.176 -19.397 -19.513 -19.75 -19.997 -20.269 -20.414 -20.689 -20.841 -20.989 -21.144 -21.496 -21.704 -21.927 -22.176 -22.442 -22.751 -23.128 -24.486 -6 ,11964 ,TETRA ,17617891,Tue Nov 30 11:25:25 CET,Tue Nov 30 13:13:55 CET,0.0 0.57 0.778 0.943 1.082 1.218 1.333 1.427 1.581 1.649 1.707 1.709 1.883 1.942 2.035 2.108 2.192 2.245 2.349 2.427 2.513 2.574 2.652 2.785 2.893 2.986 3.078 3.169 3.301 3.435 3.547 3.669 3.769 3.845 3.943 4.082 4.203 4.297 4.367 4.414 4.435 4.404 4.379 4.351 4.224 4.025 3.748 3.347 2.686 1.664 -0.019 -2.076 -3.789 -5.166 -6.29 -7.275 -8.165 -8.973 -9.621 -10.248 -10.818 -11.36 -11.846 -12.286 -12.713 -13.089 -13.471 -13.837 -14.159 -14.485 -14.816 -15.104 -15.404 -15.687 -15.905 -16.141 -16.378 -16.628 -16.922 -17.133 -17.339 -17.672 -17.91 -18.14 -18.261 -18.505 -18.743 -18.991 -19.122 -19.385 -19.546 -19.699 -19.862 -20.209 -20.413 -20.649 -20.902 -21.179 -21.497 -21.88 -23.038 -7 ,16084 ,TETRA ,17617892,Tue Nov 30 11:25:25 CET,Tue Nov 30 13:14:36 CET,0.0 0.883 1.098 1.261 1.412 1.545 1.659 1.761 1.931 2.013 2.092 2.111 2.263 2.304 2.389 2.471 2.541 2.577 2.652 2.711 2.796 2.854 2.907 2.975 3.043 3.094 3.137 3.181 3.244 3.318 3.385 3.442 3.489 3.535 3.599 3.661 3.722 3.836 3.924 4.007 4.081 4.097 4.099 4.06 3.972 3.831 3.605 3.222 2.558 1.481 -0.312 -2.413 -4.084 -5.533 -6.747 -7.822 -8.752 -9.534 -10.186 -10.814 -11.371 -11.888 -12.362 -12.825 -13.262 -13.65 -14.06 -14.408 -14.695 -15.005 -15.333 -15.589 -15.872 -16.163 -16.379 -16.604 -16.834 -17.114 -17.416 -17.599 -17.782 -18.093 -18.319 -18.548 -18.666 -18.91 -19.165 -19.426 -19.553 -19.817 -20.007 -20.171 -20.344 -20.723 -20.933 -21.176 -21.431 -21.698 -22.044 -22.528 -24.293 -8 ,6670 ,TETRA ,17617893,Tue Nov 30 11:26:29 CET,Tue Nov 30 13:14:14 CET,0.0 0.568 0.757 0.912 1.043 1.154 1.259 1.36 1.535 1.602 1.658 1.667 1.832 1.891 2.003 2.108 2.21 2.256 2.335 2.405 2.497 2.551 2.599 2.661 2.722 2.782 2.824 2.864 2.916 2.958 3.008 3.054 3.074 3.102 3.139 3.164 3.172 3.178 3.183 3.165 3.13 3.083 3.014 2.914 2.754 2.541 2.225 1.76 1.079 0.048 -1.698 -3.755 -5.463 -6.872 -8.014 -9.016 -9.896 -10.71 -11.406 -12.084 -12.675 -13.193 -13.689 -14.174 -14.63 -15.021 -15.41 -15.747 -16.025 -16.321 -16.639 -16.899 -17.184 -17.501 -17.74 -17.998 -18.269 -18.549 -18.841 -19.048 -19.261 -19.571 -19.79 -20.025 -20.143 -20.366 -20.582 -20.814 -20.942 -21.203 -21.369 -21.532 -21.709 -22.069 -22.262 -22.466 -22.691 -22.964 -23.291 -23.701 -24.796 -9 ,20501 ,TETRA ,17617894,Tue Nov 30 11:26:29 CET,Tue Nov 30 13:13:59 CET,0.0 0.787 1.04 1.229 1.385 1.508 1.605 1.705 1.898 1.979 2.057 2.092 2.265 2.33 2.463 2.585 2.683 2.73 2.817 2.891 2.994 3.07 3.145 3.226 3.29 3.342 3.377 3.414 3.463 3.496 3.533 3.578 3.624 3.664 3.698 3.719 3.726 3.734 3.729 3.711 3.672 3.598 3.499 3.388 3.242 3.027 2.68 2.198 1.532 0.501 -1.31 -3.407 -5.122 -6.562 -7.783 -8.855 -9.751 -10.54 -11.214 -11.905 -12.529 -13.051 -13.56 -14.042 -14.448 -14.807 -15.191 -15.548 -15.867 -16.207 -16.552 -16.843 -17.126 -17.415 -17.647 -17.894 -18.166 -18.445 -18.729 -18.931 -19.14 -19.449 -19.668 -19.891 -20.008 -20.256 -20.499 -20.762 -20.904 -21.173 -21.356 -21.519 -21.681 -22.033 -22.241 -22.476 -22.734 -23.015 -23.339 -23.765 -24.822 -10 ,31319 ,TETRA ,17617895,Tue Nov 30 11:26:29 CET,Tue Nov 30 13:15:26 CET,0.0 0.943 1.198 1.366 1.491 1.605 1.713 1.817 2.009 2.086 2.155 2.171 2.331 2.386 2.499 2.608 2.714 2.763 2.856 2.952 3.09 3.173 3.235 3.302 3.36 3.422 3.489 3.555 3.624 3.675 3.74 3.812 3.858 3.897 3.929 3.949 3.965 3.975 3.985 3.998 4.04 4.086 4.073 4.063 4.011 3.857 3.591 3.156 2.532 1.56 -0.191 -2.253 -3.903 -5.316 -6.529 -7.607 -8.501 -9.279 -9.939 -10.619 -11.22 -11.73 -12.194 -12.655 -13.071 -13.424 -13.795 -14.176 -14.507 -14.821 -15.141 -15.414 -15.708 -15.98 -16.185 -16.408 -16.64 -16.875 -17.115 -17.287 -17.469 -17.755 -17.961 -18.186 -18.293 -18.503 -18.751 -19.022 -19.161 -19.433 -19.612 -19.775 -19.948 -20.31 -20.516 -20.743 -20.978 -21.256 -21.617 -22.1 -23.531 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_206_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_206_252.txt deleted file mode 100644 index 3bedcb2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_206_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14722 ,KEBNE ,17076773,Sat Dec 25 05:06:43 CET,Sat Dec 25 06:41:16 CET,0.0 0.956 1.194 1.357 1.482 1.56 1.616 1.669 1.739 1.747 1.764 1.726 1.849 1.843 1.82 1.796 1.751 1.723 1.654 1.574 1.464 1.382 1.288 1.131 0.963 0.783 0.611 0.429 0.157 -0.105 -0.368 -0.732 -1.107 -1.478 -1.924 -2.47 -3.025 -3.681 -4.454 -5.33 -6.308 -7.474 -8.935 -10.551 -12.583 -15.021 -18.132 -22.025 -27.095 -34.071 -44.406 -55.302 -63.339 -69.569 -74.61 -78.806 -82.205 -85.141 -87.548 -89.871 -91.831 -93.537 -95.157 -96.617 -97.914 -99.08 -100.276 -101.324 -102.228 -103.147 -104.051 -104.765 -105.516 -106.299 -106.878 -107.478 -108.096 -108.725 -109.386 -109.827 -110.262 -110.941 -111.411 -111.897 -112.146 -112.639 -113.146 -113.678 -113.953 -114.46 -114.779 -115.067 -115.377 -116.027 -116.378 -116.764 -117.185 -117.654 -118.213 -119.014 -121.284 -2 ,5158 ,KEBNE ,17076774,Sat Dec 25 05:07:48 CET,Sat Dec 25 06:36:17 CET,0.0 0.638 0.832 0.927 1.009 1.086 1.154 1.208 1.259 1.266 1.273 1.17 1.265 1.263 1.247 1.188 1.121 1.091 1.021 0.956 0.862 0.789 0.71 0.572 0.418 0.253 0.082 -0.08 -0.283 -0.511 -0.796 -1.177 -1.555 -1.942 -2.412 -2.94 -3.476 -4.112 -4.833 -5.692 -6.687 -7.891 -9.37 -10.973 -13.027 -15.494 -18.58 -22.492 -27.723 -34.879 -45.344 -56.257 -64.34 -70.612 -75.603 -79.802 -83.283 -86.267 -88.691 -91.053 -93.028 -94.692 -96.201 -97.595 -98.879 -100.006 -101.187 -102.264 -103.166 -104.1 -105.039 -105.789 -106.541 -107.294 -107.89 -108.489 -109.084 -109.695 -110.309 -110.743 -111.204 -112.04 -112.68 -113.292 -113.599 -114.241 -114.914 -115.62 -115.976 -116.621 -117.068 -117.467 -117.919 -118.871 -119.336 -119.816 -120.346 -120.944 -121.614 -122.49 -124.981 -3 ,14229 ,KEBNE ,17076775,Sat Dec 25 05:07:50 CET,Sat Dec 25 06:37:29 CET,0.0 0.911 1.091 1.196 1.26 1.313 1.37 1.434 1.555 1.591 1.596 1.483 1.582 1.559 1.521 1.48 1.415 1.386 1.326 1.257 1.145 1.051 0.96 0.816 0.656 0.47 0.275 0.108 -0.124 -0.386 -0.648 -0.983 -1.34 -1.713 -2.158 -2.702 -3.273 -3.925 -4.661 -5.499 -6.433 -7.582 -9.086 -10.698 -12.721 -15.178 -18.303 -22.279 -27.555 -34.741 -45.228 -56.173 -64.187 -70.413 -75.401 -79.612 -83.103 -86.087 -88.545 -90.894 -92.852 -94.555 -96.109 -97.538 -98.86 -100.021 -101.211 -102.275 -103.194 -104.119 -105.045 -105.785 -106.551 -107.33 -107.911 -108.519 -109.137 -109.777 -110.441 -110.952 -111.545 -112.461 -113.084 -113.738 -114.077 -114.731 -115.394 -116.132 -116.502 -117.159 -117.654 -118.056 -118.46 -119.3 -119.738 -120.219 -120.736 -121.316 -121.989 -122.811 -125.007 -4 ,30489 ,KEBNE ,17076776,Sat Dec 25 05:08:48 CET,Sat Dec 25 06:41:09 CET,0.0 0.964 1.254 1.396 1.485 1.551 1.591 1.648 1.772 1.813 1.834 1.729 1.827 1.817 1.78 1.716 1.645 1.611 1.543 1.471 1.348 1.261 1.175 1.03 0.886 0.735 0.557 0.362 0.096 -0.161 -0.432 -0.802 -1.184 -1.554 -2.006 -2.556 -3.114 -3.765 -4.529 -5.404 -6.366 -7.516 -8.953 -10.48 -12.432 -14.871 -18.01 -21.932 -27.119 -34.259 -44.77 -55.798 -63.771 -69.899 -74.845 -79.031 -82.471 -85.385 -87.795 -90.145 -92.116 -93.82 -95.407 -96.87 -98.21 -99.374 -100.542 -101.576 -102.441 -103.335 -104.262 -105.013 -105.749 -106.503 -107.099 -107.677 -108.266 -108.915 -109.587 -110.026 -110.454 -111.124 -111.615 -112.131 -112.393 -112.924 -113.449 -113.988 -114.277 -114.804 -115.162 -115.46 -115.772 -116.44 -116.789 -117.196 -117.652 -118.2 -118.889 -119.827 -123.385 -5 ,28361 ,KEBNE ,17076777,Sat Dec 25 05:09:52 CET,Sat Dec 25 06:43:56 CET,0.0 0.908 1.115 1.28 1.401 1.475 1.547 1.631 1.721 1.712 1.707 1.603 1.707 1.694 1.647 1.604 1.565 1.54 1.473 1.402 1.296 1.201 1.102 0.962 0.806 0.642 0.468 0.286 0.037 -0.224 -0.488 -0.828 -1.19 -1.554 -1.996 -2.543 -3.111 -3.762 -4.516 -5.403 -6.366 -7.518 -8.998 -10.609 -12.641 -15.125 -18.286 -22.212 -27.374 -34.465 -44.988 -56.034 -64.027 -70.15 -75.113 -79.311 -82.702 -85.613 -88.078 -90.45 -92.389 -94.078 -95.624 -97.048 -98.406 -99.632 -100.883 -101.962 -102.857 -103.769 -104.684 -105.422 -106.206 -107.031 -107.643 -108.241 -108.834 -109.437 -110.133 -110.68 -111.251 -112.139 -112.779 -113.433 -113.753 -114.418 -115.108 -115.805 -116.155 -116.791 -117.254 -117.661 -118.062 -118.918 -119.366 -119.837 -120.355 -120.917 -121.601 -122.515 -125.141 -6 ,21418 ,KEBNE ,17076778,Sat Dec 25 05:09:52 CET,Sat Dec 25 06:42:23 CET,0.0 1.111 1.352 1.535 1.639 1.739 1.833 1.907 1.98 1.985 1.987 1.89 1.996 1.999 1.988 1.939 1.889 1.866 1.813 1.741 1.622 1.534 1.431 1.285 1.136 0.968 0.79 0.624 0.412 0.159 -0.104 -0.421 -0.772 -1.138 -1.583 -2.096 -2.651 -3.34 -4.134 -5.028 -6.004 -7.165 -8.631 -10.239 -12.262 -14.72 -17.832 -21.749 -26.921 -33.965 -44.39 -55.365 -63.424 -69.693 -74.672 -78.876 -82.379 -85.373 -87.873 -90.285 -92.273 -93.98 -95.541 -96.966 -98.297 -99.503 -100.712 -101.771 -102.649 -103.517 -104.424 -105.187 -105.968 -106.747 -107.338 -107.941 -108.547 -109.172 -109.833 -110.286 -110.739 -111.444 -111.91 -112.378 -112.625 -113.132 -113.749 -114.482 -114.847 -115.498 -115.938 -116.324 -116.721 -117.519 -117.971 -118.495 -119.03 -119.583 -120.211 -120.967 -124.232 -7 ,1675 ,KEBNE ,17076779,Sat Dec 25 05:09:52 CET,Sat Dec 25 06:42:31 CET,0.0 1.055 1.295 1.419 1.567 1.696 1.765 1.794 1.82 1.853 1.889 1.812 1.912 1.916 1.932 1.909 1.837 1.797 1.735 1.68 1.568 1.468 1.367 1.217 1.042 0.857 0.68 0.502 0.247 -0.003 -0.278 -0.656 -1.029 -1.373 -1.788 -2.349 -2.925 -3.582 -4.347 -5.202 -6.166 -7.341 -8.827 -10.436 -12.418 -14.829 -17.964 -21.914 -27.117 -34.205 -44.596 -55.434 -63.366 -69.57 -74.558 -78.738 -82.206 -85.156 -87.593 -89.95 -91.899 -93.611 -95.207 -96.631 -97.89 -99.064 -100.274 -101.315 -102.234 -103.177 -104.118 -104.865 -105.656 -106.483 -107.071 -107.666 -108.294 -108.897 -109.507 -109.941 -110.395 -111.105 -111.601 -112.1 -112.347 -112.847 -113.362 -113.896 -114.168 -114.675 -115.027 -115.33 -115.634 -116.338 -116.716 -117.085 -117.495 -117.984 -118.575 -119.311 -121.41 -8 ,2146 ,KEBNE ,17076780,Sat Dec 25 05:10:56 CET,Sat Dec 25 06:43:14 CET,0.0 0.666 0.844 0.939 1.031 1.119 1.204 1.257 1.282 1.28 1.283 1.21 1.317 1.307 1.279 1.231 1.171 1.133 1.047 0.969 0.859 0.784 0.704 0.584 0.448 0.291 0.112 -0.087 -0.341 -0.599 -0.885 -1.265 -1.647 -2.004 -2.418 -2.942 -3.51 -4.183 -4.956 -5.822 -6.783 -7.91 -9.347 -10.971 -12.982 -15.418 -18.509 -22.371 -27.51 -34.545 -44.884 -55.743 -63.729 -69.896 -74.799 -78.933 -82.367 -85.32 -87.767 -90.115 -92.071 -93.756 -95.305 -96.727 -97.997 -99.122 -100.332 -101.43 -102.32 -103.2 -104.124 -104.869 -105.62 -106.384 -106.962 -107.581 -108.213 -108.833 -109.469 -109.91 -110.366 -111.055 -111.517 -111.987 -112.223 -112.767 -113.43 -114.119 -114.467 -115.122 -115.587 -115.984 -116.412 -117.279 -117.744 -118.267 -118.786 -119.313 -119.939 -120.72 -123.355 -9 ,32366 ,KEBNE ,17076781,Sat Dec 25 05:10:56 CET,Sat Dec 25 06:45:15 CET,0.0 0.737 0.904 1.042 1.165 1.263 1.342 1.398 1.483 1.503 1.515 1.425 1.519 1.503 1.469 1.4 1.326 1.3 1.258 1.221 1.131 1.052 0.967 0.838 0.698 0.539 0.371 0.2 -0.024 -0.257 -0.477 -0.759 -1.07 -1.42 -1.886 -2.433 -2.97 -3.574 -4.279 -5.094 -6.051 -7.22 -8.651 -10.212 -12.207 -14.677 -17.83 -21.717 -26.846 -33.975 -44.46 -55.377 -63.346 -69.553 -74.575 -78.774 -82.188 -85.139 -87.598 -89.97 -91.92 -93.578 -95.132 -96.567 -97.876 -99.031 -100.226 -101.309 -102.221 -103.14 -104.055 -104.783 -105.537 -106.318 -106.904 -107.472 -108.057 -108.676 -109.321 -109.764 -110.224 -110.952 -111.5 -112.12 -112.449 -113.111 -113.765 -114.46 -114.834 -115.505 -115.986 -116.389 -116.799 -117.629 -118.063 -118.525 -119.031 -119.613 -120.323 -121.2 -124.006 -10 ,29972 ,KEBNE ,17076782,Sat Dec 25 05:10:55 CET,Sat Dec 25 06:45:09 CET,0.0 0.695 0.962 1.165 1.291 1.359 1.401 1.437 1.5 1.514 1.517 1.409 1.52 1.517 1.491 1.455 1.408 1.374 1.285 1.198 1.085 1.008 0.915 0.763 0.588 0.409 0.24 0.059 -0.202 -0.461 -0.704 -1.026 -1.402 -1.81 -2.304 -2.864 -3.436 -4.107 -4.824 -5.643 -6.62 -7.801 -9.233 -10.788 -12.796 -15.247 -18.347 -22.215 -27.309 -34.313 -44.645 -55.47 -63.45 -69.673 -74.678 -78.881 -82.344 -85.289 -87.723 -90.132 -92.107 -93.777 -95.333 -96.775 -98.11 -99.284 -100.454 -101.488 -102.389 -103.304 -104.234 -105.001 -105.776 -106.555 -107.131 -107.708 -108.303 -108.906 -109.54 -109.987 -110.44 -111.112 -111.568 -112.04 -112.286 -112.794 -113.3 -113.824 -114.092 -114.599 -114.952 -115.261 -115.559 -116.201 -116.574 -116.966 -117.403 -117.906 -118.473 -119.167 -121.401 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_215_167.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_215_167.txt deleted file mode 100644 index a2df6dd7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_215_167.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18341 ,TETRA ,17617896,Tue Nov 30 11:26:30 CET,Tue Nov 30 13:15:26 CET,0.0 0.962 1.277 1.561 1.791 1.989 2.187 2.385 2.743 2.903 3.047 3.202 3.425 3.554 3.823 4.083 4.328 4.441 4.665 4.883 5.196 5.388 5.564 5.825 6.093 6.372 6.639 6.9 7.262 7.595 7.909 8.28 8.622 8.961 9.361 9.811 10.255 10.762 11.302 11.886 12.508 13.198 14.038 14.889 15.877 17.002 18.329 19.916 21.846 24.184 27.199 29.896 31.562 32.675 33.445 34.015 34.421 34.713 34.89 35.044 35.153 35.207 35.243 35.266 35.259 35.251 35.211 35.161 35.137 35.094 35.018 34.933 34.844 34.756 34.699 34.622 34.503 34.415 34.35 34.28 34.193 34.05 33.928 33.798 33.734 33.591 33.446 33.289 33.199 33.039 32.942 32.843 32.71 32.417 32.261 32.088 31.905 31.677 31.404 31.082 30.016 -2 ,29090 ,TETRA ,17617897,Tue Nov 30 11:28:25 CET,Tue Nov 30 13:43:09 CET,0.0 0.978 1.334 1.616 1.876 2.107 2.335 2.541 2.866 3.031 3.191 3.385 3.632 3.768 4.039 4.299 4.542 4.653 4.859 5.072 5.404 5.617 5.825 6.119 6.407 6.684 6.938 7.184 7.512 7.847 8.161 8.529 8.905 9.282 9.698 10.155 10.608 11.102 11.628 12.213 12.85 13.554 14.388 15.269 16.301 17.453 18.804 20.388 22.263 24.562 27.598 30.308 31.967 33.094 33.894 34.42 34.768 35.061 35.286 35.444 35.557 35.646 35.685 35.676 35.675 35.685 35.683 35.667 35.63 35.571 35.49 35.412 35.341 35.263 35.188 35.109 35.026 34.933 34.838 34.768 34.682 34.543 34.455 34.36 34.301 34.184 34.067 33.944 33.872 33.709 33.572 33.475 33.378 33.14 32.996 32.822 32.632 32.425 32.208 31.907 31.053 -3 ,26073 ,TETRA ,17617898,Tue Nov 30 11:28:25 CET,Tue Nov 30 13:15:41 CET,0.0 0.837 1.195 1.5 1.763 1.988 2.21 2.411 2.769 2.935 3.087 3.269 3.51 3.637 3.888 4.152 4.389 4.498 4.729 4.953 5.258 5.45 5.635 5.913 6.196 6.465 6.711 6.946 7.283 7.619 7.931 8.296 8.657 9.022 9.429 9.878 10.317 10.824 11.375 11.966 12.599 13.312 14.171 15.018 16.0 17.143 18.528 20.102 21.993 24.347 27.362 29.94 31.565 32.688 33.445 33.951 34.285 34.554 34.745 34.849 34.908 34.967 34.997 35.007 34.988 34.953 34.912 34.863 34.801 34.723 34.653 34.593 34.516 34.416 34.333 34.251 34.151 34.04 33.923 33.848 33.781 33.654 33.554 33.452 33.392 33.253 33.104 32.942 32.863 32.713 32.629 32.541 32.426 32.165 32.027 31.879 31.711 31.497 31.237 30.851 29.463 -4 ,28060 ,TETRA ,17617899,Tue Nov 30 11:28:26 CET,Tue Nov 30 13:15:59 CET,0.0 0.916 1.242 1.555 1.867 2.115 2.334 2.538 2.906 3.079 3.241 3.437 3.685 3.826 4.091 4.342 4.584 4.702 4.929 5.155 5.487 5.697 5.905 6.214 6.498 6.772 7.042 7.285 7.59 7.917 8.246 8.637 9.028 9.399 9.798 10.244 10.665 11.142 11.729 12.384 13.026 13.715 14.526 15.378 16.399 17.532 18.889 20.48 22.381 24.749 27.79 30.398 32.027 33.1 33.815 34.373 34.76 35.041 35.24 35.351 35.418 35.471 35.522 35.558 35.558 35.554 35.532 35.493 35.453 35.401 35.322 35.249 35.163 35.081 35.036 34.973 34.874 34.77 34.667 34.591 34.506 34.357 34.245 34.122 34.062 33.926 33.77 33.621 33.546 33.389 33.288 33.188 33.067 32.818 32.677 32.518 32.308 32.064 31.799 31.414 29.997 -5 ,6842 ,TETRA ,17617900,Tue Nov 30 11:28:27 CET,Tue Nov 30 13:07:49 CET,0.0 1.588 1.997 2.352 2.626 2.85 3.052 3.235 3.556 3.723 3.885 4.071 4.316 4.456 4.713 4.971 5.228 5.345 5.571 5.789 6.109 6.323 6.531 6.818 7.096 7.375 7.637 7.896 8.239 8.552 8.841 9.199 9.566 9.922 10.315 10.768 11.208 11.684 12.21 12.788 13.406 14.135 14.988 15.84 16.872 18.012 19.321 20.89 22.819 25.156 28.131 30.793 32.427 33.506 34.276 34.844 35.249 35.529 35.709 35.866 35.975 35.994 35.952 35.924 35.93 35.926 35.859 35.804 35.756 35.676 35.62 35.584 35.511 35.436 35.383 35.313 35.222 35.109 35.003 34.932 34.841 34.686 34.58 34.45 34.382 34.253 34.112 33.952 33.874 33.717 33.597 33.501 33.394 33.138 32.991 32.798 32.57 32.342 32.104 31.83 30.813 -6 ,3227 ,TETRA ,17617901,Tue Nov 30 11:29:25 CET,Tue Nov 30 13:16:30 CET,0.0 1.496 1.92 2.237 2.503 2.734 2.949 3.141 3.505 3.668 3.816 4.007 4.255 4.388 4.646 4.885 5.107 5.222 5.439 5.648 5.957 6.157 6.362 6.699 7.032 7.327 7.603 7.858 8.161 8.452 8.753 9.138 9.494 9.831 10.229 10.677 11.109 11.6 12.129 12.688 13.289 13.987 14.823 15.67 16.659 17.799 19.165 20.751 22.661 25.006 27.996 30.639 32.26 33.341 34.087 34.639 35.029 35.32 35.544 35.696 35.776 35.839 35.873 35.884 35.882 35.834 35.793 35.796 35.796 35.776 35.719 35.673 35.628 35.538 35.46 35.376 35.263 35.155 35.055 34.983 34.898 34.754 34.654 34.546 34.489 34.359 34.219 34.068 33.985 33.826 33.713 33.612 33.504 33.259 33.119 32.952 32.761 32.566 32.329 31.963 30.951 -7 ,568 ,TETRA ,17617902,Tue Nov 30 11:29:27 CET,Tue Nov 30 13:09:31 CET,0.0 1.486 1.931 2.23 2.507 2.758 2.98 3.175 3.523 3.685 3.838 4.03 4.281 4.424 4.696 4.941 5.161 5.27 5.506 5.751 6.094 6.298 6.489 6.767 7.026 7.284 7.552 7.813 8.134 8.447 8.765 9.138 9.498 9.881 10.302 10.747 11.221 11.746 12.269 12.82 13.434 14.175 15.058 15.968 17.017 18.153 19.549 21.176 23.093 25.436 28.424 31.093 32.751 33.854 34.615 35.168 35.545 35.789 35.952 36.129 36.269 36.326 36.34 36.306 36.259 36.235 36.202 36.169 36.141 36.113 36.048 35.962 35.863 35.752 35.67 35.594 35.505 35.378 35.238 35.159 35.087 34.94 34.821 34.693 34.634 34.53 34.399 34.236 34.144 33.971 33.841 33.749 33.641 33.373 33.228 33.065 32.854 32.626 32.386 32.069 30.828 -8 ,26436 ,TETRA ,17617903,Tue Nov 30 11:30:26 CET,Tue Nov 30 13:17:54 CET,0.0 1.292 1.726 2.073 2.356 2.591 2.845 3.106 3.501 3.659 3.816 3.994 4.225 4.361 4.613 4.852 5.095 5.222 5.453 5.66 5.985 6.2 6.397 6.673 6.936 7.203 7.47 7.714 8.03 8.353 8.667 9.046 9.421 9.766 10.142 10.605 11.077 11.583 12.122 12.688 13.317 14.048 14.857 15.665 16.697 17.906 19.29 20.872 22.804 25.179 28.197 30.835 32.451 33.546 34.306 34.879 35.288 35.596 35.814 35.975 36.103 36.184 36.222 36.257 36.265 36.244 36.215 36.174 36.132 36.1 36.057 35.998 35.904 35.786 35.689 35.584 35.481 35.395 35.302 35.222 35.135 34.989 34.882 34.76 34.694 34.552 34.418 34.31 34.237 34.075 33.981 33.894 33.786 33.532 33.386 33.222 33.038 32.831 32.584 32.226 31.264 -9 ,870 ,TETRA ,17617904,Tue Nov 30 11:30:26 CET,Tue Nov 30 13:20:39 CET,0.0 0.976 1.382 1.664 1.905 2.113 2.314 2.5 2.838 3.005 3.172 3.395 3.647 3.776 4.027 4.28 4.527 4.65 4.885 5.09 5.374 5.563 5.754 6.048 6.335 6.614 6.899 7.151 7.442 7.748 8.06 8.455 8.873 9.265 9.688 10.14 10.568 11.055 11.588 12.156 12.787 13.54 14.401 15.249 16.255 17.392 18.713 20.264 22.183 24.549 27.576 30.232 31.859 32.995 33.786 34.362 34.766 35.05 35.253 35.422 35.553 35.63 35.648 35.649 35.612 35.565 35.55 35.528 35.48 35.393 35.31 35.248 35.17 35.091 35.025 34.952 34.857 34.73 34.598 34.517 34.426 34.275 34.176 34.075 34.018 33.906 33.777 33.608 33.516 33.355 33.214 33.094 32.974 32.721 32.577 32.421 32.22 31.98 31.726 31.371 30.172 -10 ,22511 ,TETRA ,17617905,Tue Nov 30 11:30:26 CET,Tue Nov 30 13:18:34 CET,0.0 1.337 1.748 2.037 2.277 2.508 2.704 2.884 3.226 3.387 3.545 3.74 3.972 4.101 4.376 4.647 4.883 5.001 5.242 5.444 5.725 5.921 6.128 6.411 6.693 6.979 7.246 7.509 7.824 8.141 8.467 8.856 9.208 9.538 9.937 10.395 10.833 11.317 11.847 12.423 13.077 13.832 14.701 15.571 16.565 17.676 19.025 20.618 22.508 24.858 27.883 30.518 32.208 33.354 34.115 34.691 35.134 35.466 35.705 35.871 35.971 36.047 36.1 36.125 36.099 36.072 36.063 36.03 35.984 35.933 35.865 35.79 35.715 35.644 35.58 35.514 35.448 35.359 35.235 35.146 35.051 34.886 34.757 34.623 34.559 34.427 34.298 34.167 34.094 33.941 33.856 33.762 33.655 33.378 33.217 33.042 32.861 32.64 32.342 32.006 31.147 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_215_206.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_215_206.txt deleted file mode 100644 index 95db5bab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_215_206.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15804 ,TETRA ,17617906,Tue Nov 30 13:46:06 CET,Tue Nov 30 15:37:24 CET,0.0 1.775 2.191 2.49 2.713 2.893 3.066 3.231 3.523 3.65 3.777 3.92 4.139 4.254 4.472 4.663 4.846 4.931 5.077 5.219 5.429 5.568 5.709 5.911 6.086 6.243 6.396 6.539 6.751 6.981 7.184 7.398 7.595 7.764 7.974 8.24 8.479 8.761 9.032 9.267 9.506 9.765 10.057 10.34 10.68 11.051 11.464 11.825 12.107 12.309 12.238 11.74 11.204 10.711 10.243 9.809 9.41 9.011 8.649 8.313 7.998 7.692 7.407 7.126 6.858 6.624 6.387 6.149 5.934 5.724 5.482 5.266 5.039 4.779 4.591 4.42 4.241 4.072 3.89 3.763 3.644 3.453 3.318 3.162 3.071 2.885 2.688 2.442 2.317 2.101 1.965 1.837 1.719 1.456 1.277 1.066 0.852 0.606 0.3 -0.049 -0.87 -2 ,12656 ,TETRA ,17617907,Tue Nov 30 13:46:09 CET,Tue Nov 30 15:35:48 CET,0.0 1.172 1.506 1.793 2.045 2.245 2.417 2.576 2.887 3.026 3.162 3.331 3.553 3.668 3.875 4.077 4.278 4.364 4.513 4.666 4.915 5.074 5.207 5.391 5.581 5.769 5.942 6.093 6.282 6.467 6.641 6.834 6.997 7.167 7.39 7.634 7.865 8.099 8.317 8.547 8.812 9.103 9.402 9.682 9.984 10.293 10.596 10.913 11.238 11.448 11.385 10.994 10.523 10.02 9.504 9.007 8.566 8.136 7.744 7.361 7.049 6.768 6.479 6.175 5.895 5.659 5.393 5.132 4.918 4.687 4.442 4.267 4.085 3.883 3.72 3.538 3.347 3.167 2.977 2.837 2.688 2.451 2.281 2.103 2.01 1.821 1.619 1.394 1.283 1.06 0.884 0.741 0.604 0.31 0.167 0.015 -0.186 -0.41 -0.667 -1.009 -2.085 -3 ,23253 ,TETRA ,17617908,Tue Nov 30 13:46:05 CET,Tue Nov 30 15:36:19 CET,0.0 0.929 1.302 1.622 1.868 2.072 2.254 2.42 2.709 2.839 2.959 3.099 3.316 3.419 3.616 3.783 3.934 4.025 4.21 4.375 4.613 4.759 4.893 5.083 5.283 5.457 5.6 5.763 5.967 6.137 6.317 6.53 6.714 6.903 7.134 7.372 7.565 7.765 8.002 8.276 8.543 8.817 9.133 9.425 9.728 10.051 10.381 10.718 11.039 11.252 11.214 10.815 10.309 9.748 9.221 8.753 8.344 7.956 7.608 7.219 6.86 6.552 6.268 6.006 5.75 5.512 5.271 5.058 4.882 4.689 4.47 4.289 4.103 3.911 3.762 3.592 3.407 3.199 2.965 2.811 2.651 2.38 2.204 2.041 1.958 1.787 1.6 1.396 1.279 1.068 0.959 0.818 0.674 0.385 0.226 0.051 -0.148 -0.369 -0.636 -0.975 -1.933 -4 ,5347 ,TETRA ,17617909,Tue Nov 30 13:46:07 CET,Tue Nov 30 15:30:13 CET,0.0 0.887 1.26 1.545 1.757 1.951 2.145 2.316 2.611 2.753 2.886 3.01 3.213 3.319 3.521 3.695 3.869 3.96 4.119 4.255 4.474 4.624 4.766 4.958 5.132 5.3 5.46 5.607 5.801 6.006 6.209 6.446 6.648 6.828 7.022 7.246 7.454 7.678 7.962 8.254 8.519 8.842 9.225 9.59 9.949 10.253 10.566 10.871 11.148 11.357 11.344 10.947 10.452 9.952 9.484 9.027 8.608 8.232 7.903 7.539 7.206 6.924 6.66 6.391 6.123 5.881 5.609 5.348 5.152 4.962 4.742 4.568 4.37 4.137 3.963 3.793 3.622 3.427 3.213 3.06 2.899 2.668 2.512 2.346 2.261 2.087 1.887 1.664 1.541 1.31 1.174 1.037 0.894 0.574 0.402 0.226 0.037 -0.162 -0.445 -0.823 -1.86 -5 ,31965 ,TETRA ,17617910,Tue Nov 30 13:46:05 CET,Tue Nov 30 15:35:22 CET,0.0 0.982 1.324 1.617 1.882 2.103 2.296 2.474 2.765 2.901 3.014 3.134 3.349 3.462 3.658 3.828 4.011 4.094 4.248 4.392 4.582 4.718 4.845 5.028 5.221 5.4 5.567 5.732 5.927 6.116 6.313 6.545 6.764 6.973 7.203 7.46 7.679 7.905 8.191 8.477 8.755 9.042 9.34 9.627 9.994 10.364 10.7 11.037 11.301 11.484 11.407 11.017 10.534 10.002 9.516 9.051 8.632 8.253 7.893 7.517 7.178 6.855 6.565 6.273 5.971 5.713 5.454 5.215 4.997 4.785 4.573 4.395 4.207 4.009 3.846 3.664 3.47 3.253 3.038 2.896 2.743 2.51 2.346 2.164 2.071 1.876 1.654 1.438 1.338 1.127 1.003 0.87 0.723 0.434 0.28 0.096 -0.119 -0.366 -0.677 -1.036 -1.994 -6 ,30148 ,TETRA ,17617911,Tue Nov 30 13:46:04 CET,Tue Nov 30 15:35:02 CET,0.0 1.82 2.226 2.523 2.798 3.029 3.219 3.385 3.676 3.82 3.952 4.065 4.262 4.367 4.581 4.783 4.975 5.071 5.247 5.408 5.643 5.792 5.926 6.1 6.272 6.439 6.599 6.751 6.941 7.144 7.326 7.514 7.695 7.865 8.09 8.344 8.571 8.841 9.121 9.402 9.654 9.92 10.243 10.525 10.865 11.238 11.601 11.974 12.338 12.595 12.643 12.305 11.807 11.299 10.82 10.346 9.875 9.44 9.057 8.67 8.355 8.072 7.793 7.517 7.256 7.021 6.735 6.459 6.243 6.028 5.792 5.581 5.359 5.142 4.965 4.76 4.574 4.392 4.189 4.051 3.915 3.702 3.541 3.376 3.296 3.121 2.931 2.738 2.627 2.405 2.278 2.149 2.01 1.72 1.547 1.36 1.16 0.943 0.674 0.331 -0.627 -7 ,15773 ,TETRA ,17617912,Tue Nov 30 13:46:06 CET,Tue Nov 30 15:34:47 CET,0.0 1.087 1.459 1.713 1.916 2.112 2.299 2.47 2.772 2.9 3.009 3.131 3.348 3.454 3.673 3.888 4.093 4.194 4.372 4.52 4.709 4.828 4.944 5.109 5.265 5.42 5.567 5.722 5.923 6.094 6.262 6.494 6.727 6.924 7.131 7.368 7.611 7.873 8.139 8.405 8.651 8.916 9.225 9.535 9.852 10.17 10.501 10.85 11.206 11.465 11.454 11.0 10.474 10.007 9.553 9.113 8.744 8.363 8.003 7.617 7.279 6.97 6.633 6.297 5.96 5.687 5.447 5.225 5.036 4.835 4.615 4.43 4.226 4.02 3.865 3.684 3.496 3.323 3.119 2.96 2.801 2.575 2.431 2.285 2.21 2.056 1.875 1.65 1.527 1.293 1.129 0.995 0.849 0.521 0.351 0.176 -0.019 -0.219 -0.468 -0.831 -1.777 -8 ,21149 ,TETRA ,17617913,Tue Nov 30 13:46:08 CET,Tue Nov 30 15:34:37 CET,0.0 1.259 1.647 1.915 2.142 2.342 2.534 2.691 2.941 3.067 3.19 3.32 3.535 3.637 3.836 4.041 4.236 4.332 4.513 4.683 4.94 5.101 5.246 5.443 5.633 5.809 5.962 6.104 6.272 6.455 6.631 6.833 7.028 7.215 7.433 7.645 7.861 8.12 8.376 8.634 8.878 9.147 9.471 9.823 10.191 10.489 10.859 11.195 11.46 11.653 11.6 11.264 10.77 10.246 9.743 9.252 8.819 8.41 8.052 7.684 7.346 7.048 6.786 6.539 6.277 6.005 5.733 5.485 5.257 5.027 4.777 4.552 4.332 4.124 3.948 3.769 3.598 3.416 3.208 3.049 2.883 2.658 2.512 2.355 2.272 2.102 1.926 1.727 1.617 1.385 1.246 1.127 0.994 0.688 0.519 0.329 0.097 -0.147 -0.446 -0.875 -2.071 -9 ,7086 ,TETRA ,17617914,Tue Nov 30 13:46:06 CET,Tue Nov 30 15:35:29 CET,0.0 1.457 1.865 2.149 2.391 2.604 2.794 2.963 3.27 3.408 3.532 3.634 3.829 3.925 4.118 4.307 4.479 4.554 4.71 4.877 5.115 5.26 5.395 5.58 5.753 5.949 6.133 6.283 6.464 6.636 6.805 6.994 7.171 7.352 7.564 7.778 7.991 8.269 8.542 8.78 9.032 9.312 9.642 9.954 10.24 10.536 10.858 11.166 11.464 11.672 11.679 11.338 10.858 10.342 9.851 9.425 9.03 8.654 8.326 7.96 7.627 7.324 7.013 6.74 6.521 6.307 6.031 5.775 5.57 5.35 5.096 4.886 4.67 4.433 4.266 4.088 3.906 3.724 3.531 3.391 3.236 3.009 2.849 2.672 2.579 2.398 2.189 1.965 1.865 1.663 1.513 1.372 1.226 0.902 0.723 0.533 0.343 0.121 -0.159 -0.53 -1.706 -10 ,12959 ,TETRA ,17617915,Tue Nov 30 13:46:06 CET,Tue Nov 30 15:35:41 CET,0.0 1.359 1.73 1.998 2.225 2.42 2.592 2.761 3.074 3.223 3.359 3.483 3.69 3.8 4.02 4.214 4.392 4.479 4.64 4.794 5.01 5.142 5.278 5.486 5.68 5.85 6.006 6.168 6.389 6.599 6.802 7.036 7.259 7.47 7.691 7.922 8.139 8.378 8.623 8.902 9.19 9.484 9.814 10.078 10.374 10.713 11.052 11.361 11.593 11.748 11.69 11.277 10.785 10.275 9.796 9.347 8.91 8.479 8.083 7.688 7.371 7.084 6.774 6.48 6.201 5.936 5.659 5.385 5.177 4.994 4.76 4.55 4.343 4.131 3.975 3.792 3.598 3.422 3.237 3.091 2.924 2.704 2.563 2.401 2.319 2.151 1.964 1.753 1.639 1.416 1.277 1.156 1.024 0.727 0.554 0.342 0.136 -0.049 -0.298 -0.683 -1.885 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_215_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_215_252.txt deleted file mode 100644 index c9a50d6f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_215_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18273 ,TETRA ,17617916,Tue Nov 30 13:47:05 CET,Tue Nov 30 15:36:31 CET,0.0 0.545 0.798 0.965 1.073 1.172 1.242 1.275 1.296 1.301 1.315 1.233 1.326 1.313 1.277 1.207 1.137 1.108 1.051 0.994 0.885 0.807 0.712 0.536 0.369 0.21 0.029 -0.177 -0.439 -0.682 -0.933 -1.3 -1.707 -2.095 -2.54 -3.082 -3.627 -4.251 -5.002 -5.888 -6.887 -8.102 -9.63 -11.276 -13.364 -15.914 -19.132 -23.211 -28.629 -35.896 -46.494 -57.606 -65.72 -72.013 -77.093 -81.302 -84.754 -87.748 -90.203 -92.545 -94.488 -96.201 -97.79 -99.218 -100.534 -101.71 -102.891 -103.928 -104.78 -105.667 -106.606 -107.364 -108.125 -108.865 -109.439 -110.055 -110.674 -111.301 -111.961 -112.408 -112.844 -113.521 -113.993 -114.546 -114.86 -115.512 -116.197 -116.89 -117.247 -117.899 -118.377 -118.759 -119.127 -119.903 -120.343 -120.828 -121.309 -121.817 -122.415 -123.265 -125.746 -2 ,29832 ,TETRA ,17617917,Tue Nov 30 13:47:05 CET,Tue Nov 30 15:34:17 CET,0.0 0.595 0.738 0.818 0.857 0.887 0.908 0.93 0.961 0.965 0.969 0.875 0.968 0.963 0.953 0.942 0.923 0.898 0.816 0.719 0.591 0.514 0.425 0.261 0.105 -0.054 -0.226 -0.399 -0.649 -0.916 -1.184 -1.539 -1.904 -2.277 -2.756 -3.345 -3.946 -4.65 -5.447 -6.348 -7.337 -8.522 -10.032 -11.675 -13.773 -16.309 -19.482 -23.431 -28.694 -35.973 -46.724 -57.895 -66.101 -72.533 -77.66 -81.893 -85.376 -88.375 -90.823 -93.188 -95.155 -96.9 -98.508 -99.936 -101.225 -102.378 -103.567 -104.607 -105.492 -106.384 -107.332 -108.116 -108.854 -109.6 -110.174 -110.752 -111.362 -111.994 -112.614 -113.021 -113.432 -114.053 -114.485 -114.926 -115.163 -115.674 -116.182 -116.718 -116.991 -117.499 -117.849 -118.153 -118.481 -119.212 -119.603 -120.003 -120.424 -120.879 -121.399 -122.026 -124.083 -3 ,30291 ,TETRA ,17617918,Tue Nov 30 13:47:06 CET,Tue Nov 30 15:37:14 CET,0.0 0.723 0.874 0.993 1.097 1.182 1.241 1.264 1.264 1.271 1.285 1.187 1.276 1.26 1.244 1.208 1.155 1.13 1.086 1.027 0.903 0.82 0.747 0.603 0.415 0.225 0.041 -0.132 -0.395 -0.672 -0.937 -1.291 -1.65 -2.037 -2.535 -3.103 -3.693 -4.388 -5.17 -6.076 -7.095 -8.324 -9.87 -11.53 -13.577 -16.047 -19.197 -23.203 -28.58 -35.921 -46.563 -57.645 -65.776 -72.056 -77.05 -81.232 -84.681 -87.638 -90.118 -92.502 -94.432 -96.144 -97.735 -99.187 -100.5 -101.658 -102.838 -103.873 -104.75 -105.6 -106.484 -107.222 -107.973 -108.753 -109.367 -109.987 -110.587 -111.182 -111.792 -112.228 -112.681 -113.39 -113.874 -114.354 -114.595 -115.093 -115.607 -116.117 -116.37 -116.861 -117.164 -117.461 -117.787 -118.447 -118.794 -119.175 -119.58 -120.063 -120.645 -121.362 -123.321 -4 ,3491 ,TETRA ,17617919,Tue Nov 30 13:47:06 CET,Tue Nov 30 15:37:50 CET,0.0 0.694 0.929 1.067 1.147 1.213 1.274 1.324 1.364 1.374 1.388 1.278 1.356 1.324 1.252 1.188 1.135 1.105 1.029 0.939 0.815 0.724 0.607 0.462 0.326 0.15 -0.042 -0.246 -0.53 -0.81 -1.085 -1.448 -1.824 -2.186 -2.643 -3.21 -3.784 -4.46 -5.236 -6.127 -7.126 -8.313 -9.832 -11.477 -13.521 -16.039 -19.28 -23.267 -28.523 -35.818 -46.588 -57.737 -65.863 -72.207 -77.3 -81.533 -84.978 -87.948 -90.424 -92.774 -94.687 -96.368 -97.939 -99.368 -100.655 -101.828 -103.1 -104.216 -105.104 -105.972 -106.871 -107.639 -108.442 -109.241 -109.84 -110.456 -111.075 -111.677 -112.299 -112.733 -113.167 -113.882 -114.385 -114.871 -115.111 -115.608 -116.131 -116.672 -116.945 -117.458 -117.795 -118.087 -118.398 -119.089 -119.462 -119.873 -120.308 -120.763 -121.28 -121.995 -124.2 -5 ,8056 ,TETRA ,17617920,Tue Nov 30 13:47:06 CET,Tue Nov 30 15:32:54 CET,0.0 0.884 1.089 1.202 1.283 1.338 1.372 1.394 1.42 1.429 1.433 1.297 1.373 1.351 1.307 1.262 1.207 1.175 1.101 1.04 0.937 0.847 0.759 0.609 0.468 0.314 0.116 -0.096 -0.364 -0.648 -0.96 -1.341 -1.694 -2.052 -2.513 -3.05 -3.619 -4.307 -5.091 -5.978 -6.986 -8.197 -9.659 -11.283 -13.41 -15.944 -19.099 -23.071 -28.402 -35.694 -46.408 -57.554 -65.689 -72.04 -77.097 -81.299 -84.803 -87.779 -90.207 -92.574 -94.556 -96.225 -97.749 -99.169 -100.464 -101.631 -102.84 -103.88 -104.746 -105.65 -106.598 -107.375 -108.171 -108.951 -109.521 -110.107 -110.705 -111.339 -111.987 -112.413 -112.848 -113.529 -113.99 -114.459 -114.704 -115.212 -115.727 -116.267 -116.539 -117.05 -117.402 -117.699 -118.015 -118.732 -119.105 -119.48 -119.894 -120.362 -120.885 -121.512 -123.081 -6 ,27214 ,TETRA ,17617921,Tue Nov 30 13:47:07 CET,Tue Nov 30 15:34:06 CET,0.0 0.768 1.039 1.225 1.385 1.466 1.509 1.552 1.579 1.563 1.547 1.405 1.481 1.466 1.442 1.385 1.321 1.297 1.24 1.166 1.057 0.977 0.885 0.738 0.577 0.398 0.207 0.012 -0.266 -0.544 -0.829 -1.187 -1.54 -1.917 -2.398 -2.991 -3.6 -4.27 -5.021 -5.925 -6.946 -8.136 -9.631 -11.28 -13.384 -15.938 -19.156 -23.199 -28.547 -35.818 -46.409 -57.46 -65.588 -71.934 -77.059 -81.316 -84.805 -87.781 -90.245 -92.716 -94.791 -96.485 -98.017 -99.418 -100.691 -101.827 -102.989 -104.05 -104.962 -105.875 -106.802 -107.558 -108.315 -109.069 -109.657 -110.273 -110.911 -111.556 -112.19 -112.619 -113.044 -113.714 -114.193 -114.663 -114.9 -115.422 -115.969 -116.52 -116.843 -117.501 -117.961 -118.333 -118.721 -119.588 -120.04 -120.509 -121.02 -121.592 -122.259 -123.055 -125.231 -7 ,27015 ,TETRA ,17617922,Tue Nov 30 13:47:06 CET,Tue Nov 30 15:38:15 CET,0.0 0.595 0.843 0.991 1.05 1.089 1.122 1.15 1.184 1.19 1.189 1.082 1.178 1.17 1.135 1.057 0.976 0.942 0.868 0.792 0.684 0.595 0.492 0.325 0.146 -0.015 -0.179 -0.36 -0.625 -0.898 -1.138 -1.434 -1.784 -2.176 -2.663 -3.223 -3.798 -4.485 -5.263 -6.152 -7.151 -8.36 -9.901 -11.563 -13.671 -16.215 -19.421 -23.426 -28.719 -36.021 -46.732 -57.908 -66.133 -72.545 -77.682 -81.95 -85.431 -88.416 -90.88 -93.276 -95.266 -96.958 -98.556 -100.054 -101.39 -102.588 -103.826 -104.909 -105.812 -106.671 -107.548 -108.308 -109.095 -109.873 -110.471 -111.089 -111.696 -112.312 -112.96 -113.402 -113.846 -114.518 -114.964 -115.418 -115.657 -116.144 -116.628 -117.134 -117.411 -117.937 -118.298 -118.616 -118.93 -119.555 -119.913 -120.311 -120.734 -121.189 -121.838 -122.771 -125.228 -8 ,5093 ,TETRA ,17617923,Tue Nov 30 13:47:06 CET,Tue Nov 30 15:35:14 CET,0.0 0.493 0.698 0.87 0.999 1.075 1.133 1.167 1.223 1.243 1.243 1.116 1.207 1.185 1.15 1.123 1.064 1.029 0.962 0.876 0.731 0.643 0.565 0.457 0.328 0.192 0.068 -0.082 -0.346 -0.624 -0.908 -1.291 -1.685 -2.099 -2.597 -3.188 -3.791 -4.464 -5.218 -6.1 -7.12 -8.338 -9.872 -11.541 -13.627 -16.102 -19.216 -23.22 -28.578 -35.904 -46.664 -57.821 -65.956 -72.282 -77.311 -81.507 -84.961 -87.917 -90.347 -92.699 -94.651 -96.325 -97.9 -99.328 -100.616 -101.764 -102.945 -104.001 -104.896 -105.809 -106.724 -107.463 -108.228 -108.989 -109.565 -110.161 -110.761 -111.372 -111.987 -112.41 -112.848 -113.51 -113.965 -114.432 -114.67 -115.157 -115.651 -116.21 -116.543 -117.189 -117.621 -118.02 -118.43 -119.268 -119.722 -120.217 -120.723 -121.243 -121.885 -122.695 -124.781 -9 ,20134 ,TETRA ,17617924,Tue Nov 30 13:47:09 CET,Tue Nov 30 15:34:21 CET,0.0 0.786 1.005 1.126 1.205 1.271 1.303 1.329 1.387 1.399 1.402 1.271 1.356 1.352 1.316 1.257 1.204 1.178 1.119 1.052 0.926 0.838 0.742 0.577 0.397 0.213 0.024 -0.181 -0.46 -0.737 -1.011 -1.34 -1.669 -2.026 -2.489 -3.043 -3.606 -4.25 -5.011 -5.903 -6.91 -8.134 -9.691 -11.385 -13.481 -16.019 -19.211 -23.222 -28.595 -35.964 -46.79 -58.018 -66.259 -72.618 -77.651 -81.92 -85.476 -88.5 -90.957 -93.297 -95.222 -96.88 -98.436 -99.902 -101.269 -102.467 -103.655 -104.668 -105.521 -106.413 -107.308 -108.038 -108.817 -109.583 -110.153 -110.776 -111.414 -112.043 -112.696 -113.125 -113.558 -114.262 -114.731 -115.193 -115.427 -115.923 -116.461 -116.999 -117.273 -117.792 -118.2 -118.595 -119.022 -119.92 -120.378 -120.862 -121.389 -121.981 -122.601 -123.406 -125.665 -10 ,9086 ,TETRA ,17617925,Tue Nov 30 13:48:04 CET,Tue Nov 30 15:36:17 CET,0.0 0.917 1.204 1.373 1.481 1.54 1.586 1.635 1.709 1.733 1.743 1.638 1.742 1.732 1.684 1.623 1.557 1.528 1.463 1.38 1.258 1.165 1.061 0.899 0.705 0.501 0.307 0.113 -0.165 -0.458 -0.726 -1.065 -1.446 -1.825 -2.301 -2.909 -3.5 -4.168 -4.937 -5.809 -6.818 -8.031 -9.563 -11.227 -13.298 -15.797 -18.986 -23.031 -28.379 -35.741 -46.573 -57.872 -66.035 -72.334 -77.399 -81.599 -85.05 -88.029 -90.507 -92.912 -94.907 -96.6 -98.152 -99.583 -100.903 -102.085 -103.278 -104.353 -105.267 -106.164 -107.042 -107.797 -108.602 -109.402 -109.987 -110.566 -111.186 -111.824 -112.445 -112.872 -113.314 -113.999 -114.453 -114.902 -115.146 -115.647 -116.134 -116.715 -117.063 -117.699 -118.14 -118.545 -118.952 -119.78 -120.231 -120.701 -121.203 -121.745 -122.389 -123.278 -125.609 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_227_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_227_231.txt deleted file mode 100644 index d14b5734..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_227_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30994 ,TETRA ,17617926,Tue Nov 30 13:48:06 CET,Tue Nov 30 15:35:11 CET,0.0 0.488 0.558 0.598 0.594 0.564 0.531 0.492 0.387 0.328 0.266 0.124 0.038 -0.037 -0.198 -0.37 -0.53 -0.608 -0.782 -0.959 -1.228 -1.414 -1.603 -1.898 -2.203 -2.515 -2.832 -3.155 -3.569 -3.981 -4.413 -4.966 -5.53 -6.102 -6.794 -7.592 -8.4 -9.339 -10.406 -11.619 -12.964 -14.508 -16.423 -18.535 -21.194 -24.426 -28.465 -33.522 -40.169 -49.128 -62.002 -75.154 -84.749 -92.148 -98.019 -102.854 -106.798 -110.17 -112.912 -115.528 -117.705 -119.574 -121.306 -122.887 -124.298 -125.548 -126.821 -127.938 -128.886 -129.82 -130.749 -131.508 -132.286 -133.076 -133.69 -134.332 -134.974 -135.601 -136.219 -136.653 -137.099 -137.778 -138.232 -138.683 -138.918 -139.396 -139.884 -140.389 -140.65 -141.054 -141.457 -141.729 -142.005 -142.592 -142.912 -143.268 -143.626 -143.975 -144.387 -144.929 -146.146 -2 ,11870 ,TETRA ,17617928,Tue Nov 30 13:48:04 CET,Tue Nov 30 15:38:06 CET,0.0 0.383 0.437 0.445 0.444 0.433 0.41 0.384 0.307 0.261 0.218 0.13 0.063 0.007 -0.13 -0.291 -0.459 -0.534 -0.691 -0.873 -1.16 -1.353 -1.545 -1.83 -2.125 -2.433 -2.745 -3.063 -3.491 -3.924 -4.37 -4.921 -5.477 -6.045 -6.726 -7.522 -8.333 -9.29 -10.376 -11.592 -12.948 -14.581 -16.588 -18.695 -21.323 -24.522 -28.544 -33.533 -40.101 -48.977 -61.86 -75.14 -84.802 -92.244 -98.116 -102.982 -106.981 -110.408 -113.226 -115.93 -118.13 -119.989 -121.699 -123.263 -124.716 -126.009 -127.268 -128.345 -129.27 -130.209 -131.177 -131.978 -132.789 -133.612 -134.238 -134.838 -135.441 -136.083 -136.734 -137.182 -137.626 -138.313 -138.783 -139.252 -139.486 -139.958 -140.451 -140.957 -141.22 -141.615 -142.021 -142.312 -142.606 -143.202 -143.529 -143.889 -144.25 -144.63 -145.083 -145.591 -146.616 -3 ,31885 ,TETRA ,17617929,Tue Nov 30 13:48:04 CET,Tue Nov 30 15:40:28 CET,0.0 0.563 0.667 0.715 0.718 0.705 0.68 0.647 0.559 0.513 0.464 0.363 0.293 0.23 0.102 -0.028 -0.168 -0.237 -0.384 -0.549 -0.798 -0.968 -1.139 -1.416 -1.722 -2.034 -2.35 -2.668 -3.101 -3.536 -3.965 -4.509 -5.067 -5.631 -6.316 -7.132 -7.952 -8.889 -9.964 -11.163 -12.478 -14.036 -15.977 -18.08 -20.718 -23.888 -27.865 -32.85 -39.326 -48.049 -60.862 -74.117 -83.738 -91.141 -97.026 -101.898 -105.849 -109.234 -112.036 -114.722 -116.931 -118.83 -120.561 -122.165 -123.61 -124.87 -126.154 -127.273 -128.222 -129.178 -130.148 -130.934 -131.732 -132.523 -133.118 -133.721 -134.331 -134.978 -135.636 -136.071 -136.52 -137.211 -137.672 -138.129 -138.363 -138.85 -139.336 -139.849 -140.111 -140.505 -140.902 -141.171 -141.452 -142.049 -142.372 -142.719 -143.089 -143.516 -143.996 -144.613 -145.978 -4 ,13163 ,TETRA ,17617930,Tue Nov 30 13:48:05 CET,Tue Nov 30 15:39:38 CET,0.0 0.406 0.478 0.497 0.467 0.422 0.365 0.305 0.185 0.116 0.043 -0.086 -0.169 -0.244 -0.398 -0.572 -0.747 -0.836 -1.024 -1.208 -1.471 -1.657 -1.857 -2.164 -2.473 -2.772 -3.074 -3.389 -3.782 -4.154 -4.531 -5.048 -5.603 -6.15 -6.806 -7.565 -8.35 -9.277 -10.32 -11.464 -12.732 -14.283 -16.226 -18.314 -20.935 -24.099 -28.1 -33.09 -39.658 -48.535 -61.362 -74.622 -84.23 -91.614 -97.453 -102.344 -106.356 -109.736 -112.512 -115.18 -117.381 -119.274 -121.013 -122.591 -124.011 -125.255 -126.521 -127.637 -128.565 -129.492 -130.431 -131.193 -131.967 -132.732 -133.303 -133.896 -134.506 -135.13 -135.769 -136.213 -136.659 -137.327 -137.783 -138.245 -138.483 -138.982 -139.487 -139.994 -140.25 -140.648 -141.078 -141.366 -141.667 -142.308 -142.661 -143.021 -143.389 -143.798 -144.24 -144.727 -145.975 -5 ,27765 ,TETRA ,17617931,Tue Nov 30 13:48:04 CET,Tue Nov 30 15:39:03 CET,0.0 0.652 0.795 0.845 0.858 0.859 0.851 0.828 0.775 0.736 0.689 0.593 0.521 0.453 0.302 0.139 -0.042 -0.131 -0.307 -0.486 -0.753 -0.939 -1.131 -1.425 -1.729 -2.037 -2.339 -2.651 -3.091 -3.529 -3.961 -4.51 -5.071 -5.632 -6.31 -7.125 -7.956 -8.909 -9.997 -11.194 -12.499 -14.073 -16.036 -18.129 -20.741 -23.896 -27.879 -32.84 -39.351 -48.197 -61.081 -74.326 -83.954 -91.388 -97.277 -102.171 -106.171 -109.555 -112.324 -114.986 -117.179 -119.055 -120.762 -122.305 -123.685 -124.916 -126.195 -127.319 -128.258 -129.191 -130.137 -130.906 -131.674 -132.468 -133.093 -133.708 -134.313 -134.93 -135.581 -136.022 -136.451 -137.102 -137.563 -138.041 -138.276 -138.742 -139.229 -139.74 -140.005 -140.403 -140.793 -141.059 -141.331 -141.92 -142.257 -142.624 -143.007 -143.418 -143.826 -144.328 -145.416 -6 ,1516 ,TETRA ,17617932,Tue Nov 30 13:48:05 CET,Tue Nov 30 15:38:36 CET,0.0 0.391 0.44 0.445 0.436 0.414 0.386 0.344 0.231 0.164 0.091 -0.05 -0.137 -0.215 -0.37 -0.535 -0.71 -0.795 -0.947 -1.099 -1.362 -1.551 -1.739 -2.026 -2.325 -2.636 -2.945 -3.257 -3.687 -4.13 -4.575 -5.128 -5.698 -6.262 -6.937 -7.74 -8.546 -9.468 -10.517 -11.719 -13.055 -14.637 -16.6 -18.71 -21.366 -24.531 -28.491 -33.466 -39.951 -48.742 -61.609 -74.87 -84.491 -91.963 -97.854 -102.69 -106.686 -110.087 -112.868 -115.495 -117.661 -119.547 -121.257 -122.813 -124.217 -125.445 -126.73 -127.863 -128.822 -129.797 -130.781 -131.581 -132.389 -133.209 -133.831 -134.455 -135.092 -135.734 -136.369 -136.801 -137.234 -137.902 -138.364 -138.824 -139.052 -139.537 -140.037 -140.544 -140.803 -141.195 -141.598 -141.896 -142.202 -142.815 -143.155 -143.508 -143.872 -144.27 -144.726 -145.33 -146.569 -7 ,21850 ,TETRA ,17617933,Tue Nov 30 13:49:05 CET,Tue Nov 30 15:32:33 CET,0.0 0.546 0.616 0.676 0.698 0.724 0.763 0.762 0.718 0.686 0.649 0.582 0.527 0.475 0.347 0.214 0.078 0.004 -0.165 -0.321 -0.558 -0.736 -0.922 -1.192 -1.46 -1.745 -2.026 -2.294 -2.649 -3.028 -3.42 -3.916 -4.449 -4.997 -5.664 -6.463 -7.268 -8.197 -9.259 -10.449 -11.759 -13.292 -15.186 -17.24 -19.837 -23.0 -26.952 -31.918 -38.483 -47.378 -60.275 -73.571 -83.24 -90.735 -96.621 -101.467 -105.453 -108.86 -111.666 -114.347 -116.526 -118.396 -120.173 -121.768 -123.175 -124.438 -125.728 -126.846 -127.771 -128.71 -129.655 -130.412 -131.176 -131.97 -132.569 -133.158 -133.761 -134.393 -135.052 -135.485 -135.914 -136.579 -137.031 -137.494 -137.732 -138.221 -138.723 -139.251 -139.524 -139.917 -140.308 -140.579 -140.872 -141.493 -141.805 -142.141 -142.504 -142.886 -143.297 -143.854 -145.144 -8 ,16086 ,TETRA ,17617934,Tue Nov 30 13:49:05 CET,Tue Nov 30 15:37:16 CET,0.0 0.358 0.439 0.451 0.433 0.4 0.363 0.329 0.257 0.2 0.129 0.007 -0.076 -0.156 -0.317 -0.488 -0.678 -0.765 -0.915 -1.063 -1.299 -1.463 -1.629 -1.878 -2.136 -2.421 -2.722 -3.042 -3.473 -3.901 -4.342 -4.907 -5.475 -6.042 -6.72 -7.522 -8.337 -9.276 -10.338 -11.534 -12.879 -14.488 -16.485 -18.626 -21.288 -24.5 -28.553 -33.595 -40.179 -49.075 -61.998 -75.218 -84.764 -92.121 -97.917 -102.771 -106.803 -110.257 -113.055 -115.686 -117.869 -119.722 -121.445 -123.094 -124.541 -125.803 -127.117 -128.227 -129.152 -130.097 -131.038 -131.786 -132.549 -133.341 -133.934 -134.521 -135.117 -135.737 -136.372 -136.802 -137.238 -137.906 -138.355 -138.818 -139.052 -139.511 -139.999 -140.522 -140.784 -141.174 -141.577 -141.864 -142.166 -142.777 -143.099 -143.441 -143.814 -144.228 -144.683 -145.258 -146.512 -9 ,6605 ,TETRA ,17617935,Tue Nov 30 13:49:06 CET,Tue Nov 30 15:35:58 CET,0.0 0.375 0.471 0.507 0.516 0.51 0.494 0.459 0.372 0.324 0.262 0.14 0.077 0.021 -0.106 -0.246 -0.373 -0.44 -0.599 -0.774 -1.061 -1.254 -1.452 -1.76 -2.075 -2.396 -2.715 -3.033 -3.461 -3.902 -4.352 -4.913 -5.487 -6.061 -6.747 -7.547 -8.36 -9.308 -10.379 -11.573 -12.898 -14.466 -16.409 -18.505 -21.105 -24.25 -28.221 -33.157 -39.668 -48.538 -61.423 -74.693 -84.402 -91.836 -97.694 -102.583 -106.57 -109.982 -112.801 -115.491 -117.687 -119.531 -121.225 -122.794 -124.212 -125.479 -126.751 -127.853 -128.806 -129.776 -130.751 -131.525 -132.284 -133.055 -133.647 -134.236 -134.853 -135.486 -136.116 -136.539 -136.976 -137.638 -138.078 -138.531 -138.764 -139.231 -139.722 -140.253 -140.512 -140.91 -141.333 -141.622 -141.923 -142.53 -142.849 -143.213 -143.612 -144.056 -144.556 -145.164 -146.379 -10 ,18826 ,TETRA ,17617936,Tue Nov 30 13:49:06 CET,Tue Nov 30 15:52:14 CET,0.0 0.499 0.592 0.642 0.67 0.666 0.649 0.632 0.587 0.563 0.529 0.446 0.382 0.325 0.2 0.075 -0.06 -0.138 -0.296 -0.451 -0.675 -0.829 -0.993 -1.244 -1.51 -1.78 -2.045 -2.317 -2.71 -3.12 -3.513 -3.99 -4.506 -5.063 -5.737 -6.525 -7.31 -8.185 -9.195 -10.375 -11.684 -13.242 -15.153 -17.2 -19.819 -22.998 -26.97 -31.94 -38.485 -47.34 -60.18 -73.398 -83.008 -90.443 -96.316 -101.153 -105.121 -108.512 -111.288 -113.926 -116.104 -117.978 -119.684 -121.234 -122.631 -123.875 -125.133 -126.231 -127.17 -128.108 -129.042 -129.806 -130.597 -131.412 -132.033 -132.654 -133.291 -133.926 -134.569 -135.02 -135.463 -136.111 -136.557 -137.02 -137.253 -137.72 -138.216 -138.729 -138.992 -139.4 -139.821 -140.104 -140.397 -141.0 -141.323 -141.672 -142.043 -142.437 -142.902 -143.468 -144.81 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_227_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_227_57.txt deleted file mode 100644 index e4fdd3cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_227_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27232 ,TETRA ,17617937,Tue Nov 30 13:49:08 CET,Tue Nov 30 15:39:27 CET,0.0 0.705 0.977 1.174 1.352 1.518 1.664 1.783 2.006 2.122 2.239 2.463 2.543 2.636 2.833 3.005 3.154 3.228 3.369 3.508 3.7 3.814 3.918 4.079 4.251 4.407 4.548 4.678 4.84 5.003 5.156 5.311 5.474 5.663 5.877 6.085 6.298 6.526 6.724 6.923 7.105 7.313 7.56 7.766 7.984 8.205 8.397 8.531 8.613 8.54 8.105 7.321 6.535 5.8 5.118 4.458 3.894 3.396 2.949 2.509 2.118 1.741 1.341 0.95 0.601 0.303 0.007 -0.279 -0.534 -0.788 -1.055 -1.289 -1.537 -1.797 -1.982 -2.174 -2.385 -2.607 -2.824 -2.962 -3.11 -3.365 -3.543 -3.723 -3.819 -4.016 -4.217 -4.431 -4.542 -4.648 -4.873 -5.007 -5.156 -5.442 -5.598 -5.769 -5.963 -6.188 -6.468 -6.796 -7.72 -2 ,27142 ,TETRA ,17617938,Tue Nov 30 13:49:10 CET,Tue Nov 30 15:37:08 CET,0.0 0.851 1.123 1.374 1.594 1.771 1.933 2.083 2.35 2.478 2.603 2.852 2.957 3.063 3.237 3.392 3.538 3.606 3.729 3.849 4.043 4.165 4.271 4.426 4.583 4.721 4.865 5.02 5.192 5.346 5.512 5.708 5.899 6.08 6.254 6.429 6.592 6.777 6.992 7.211 7.41 7.631 7.91 8.156 8.413 8.677 8.929 9.114 9.23 9.235 8.885 8.161 7.358 6.561 5.849 5.238 4.676 4.118 3.665 3.246 2.889 2.511 2.116 1.752 1.418 1.107 0.809 0.576 0.335 0.066 -0.21 -0.435 -0.654 -0.89 -1.066 -1.237 -1.415 -1.614 -1.852 -2.007 -2.157 -2.4 -2.557 -2.708 -2.793 -2.979 -3.18 -3.393 -3.513 -3.635 -3.876 -3.998 -4.141 -4.479 -4.661 -4.871 -5.111 -5.348 -5.573 -5.846 -6.75 -3 ,6186 ,TETRA ,17617939,Tue Nov 30 13:50:06 CET,Tue Nov 30 15:32:51 CET,0.0 0.639 0.968 1.217 1.407 1.564 1.715 1.86 2.126 2.245 2.349 2.563 2.657 2.758 2.954 3.142 3.298 3.369 3.501 3.628 3.811 3.918 4.015 4.173 4.345 4.496 4.634 4.767 4.937 5.113 5.28 5.483 5.683 5.843 6.014 6.216 6.388 6.569 6.771 6.999 7.266 7.55 7.838 8.09 8.353 8.6 8.86 9.109 9.291 9.34 9.005 8.282 7.476 6.7 6.031 5.431 4.868 4.348 3.895 3.419 2.993 2.605 2.249 1.911 1.613 1.348 1.027 0.71 0.47 0.24 -0.018 -0.227 -0.44 -0.675 -0.863 -1.054 -1.259 -1.465 -1.683 -1.83 -1.967 -2.191 -2.357 -2.532 -2.623 -2.821 -3.032 -3.255 -3.367 -3.479 -3.753 -3.878 -3.996 -4.3 -4.491 -4.696 -4.9 -5.102 -5.337 -5.667 -6.516 -4 ,10613 ,TETRA ,17617940,Tue Nov 30 13:50:06 CET,Tue Nov 30 15:37:06 CET,0.0 1.004 1.328 1.575 1.765 1.929 2.076 2.215 2.47 2.577 2.687 2.91 2.993 3.086 3.261 3.44 3.603 3.674 3.81 3.94 4.131 4.254 4.371 4.542 4.705 4.864 5.009 5.137 5.292 5.434 5.589 5.776 5.962 6.143 6.341 6.546 6.719 6.91 7.107 7.312 7.538 7.793 8.081 8.342 8.588 8.807 9.035 9.269 9.407 9.383 9.025 8.265 7.473 6.736 6.109 5.546 5.028 4.524 4.083 3.647 3.236 2.867 2.534 2.222 1.937 1.649 1.352 1.106 0.89 0.659 0.429 0.234 0.005 -0.237 -0.436 -0.654 -0.852 -1.027 -1.224 -1.367 -1.52 -1.76 -1.916 -2.082 -2.161 -2.329 -2.541 -2.768 -2.889 -3.014 -3.278 -3.416 -3.559 -3.849 -4.016 -4.21 -4.417 -4.629 -4.86 -5.161 -5.789 -5 ,6800 ,TETRA ,17617941,Tue Nov 30 13:50:08 CET,Tue Nov 30 15:37:02 CET,0.0 0.843 1.128 1.344 1.535 1.715 1.867 2.01 2.287 2.403 2.497 2.68 2.753 2.84 3.003 3.16 3.309 3.38 3.514 3.628 3.79 3.895 3.999 4.151 4.285 4.416 4.556 4.687 4.849 5.012 5.172 5.371 5.551 5.694 5.852 6.032 6.221 6.431 6.634 6.834 7.05 7.303 7.575 7.809 8.044 8.274 8.499 8.673 8.784 8.762 8.353 7.532 6.718 5.957 5.261 4.648 4.087 3.576 3.141 2.708 2.313 1.929 1.545 1.184 0.849 0.55 0.264 -0.012 -0.259 -0.493 -0.729 -0.946 -1.171 -1.41 -1.612 -1.81 -2.015 -2.219 -2.41 -2.55 -2.699 -2.926 -3.099 -3.289 -3.383 -3.581 -3.794 -4.017 -4.128 -4.238 -4.486 -4.618 -4.751 -5.028 -5.191 -5.387 -5.6 -5.827 -6.087 -6.397 -7.131 -6 ,21462 ,TETRA ,17617942,Tue Nov 30 13:50:06 CET,Tue Nov 30 15:36:12 CET,0.0 0.589 0.89 1.116 1.329 1.523 1.684 1.822 2.082 2.199 2.306 2.546 2.64 2.729 2.888 3.043 3.194 3.274 3.437 3.59 3.815 3.942 4.054 4.208 4.352 4.498 4.64 4.792 5.002 5.172 5.309 5.481 5.64 5.797 5.973 6.16 6.334 6.515 6.712 6.913 7.118 7.332 7.57 7.792 8.022 8.274 8.543 8.74 8.834 8.823 8.523 7.761 6.967 6.264 5.561 4.905 4.35 3.849 3.424 2.993 2.567 2.145 1.781 1.487 1.214 0.938 0.639 0.388 0.177 -0.061 -0.306 -0.5 -0.719 -0.951 -1.146 -1.351 -1.565 -1.798 -2.021 -2.176 -2.338 -2.59 -2.761 -2.937 -3.034 -3.23 -3.431 -3.641 -3.749 -3.851 -4.106 -4.235 -4.363 -4.708 -4.901 -5.093 -5.317 -5.547 -5.78 -6.09 -6.922 -7 ,24271 ,TETRA ,17617943,Tue Nov 30 13:50:06 CET,Tue Nov 30 15:40:37 CET,0.0 0.967 1.276 1.518 1.727 1.905 2.063 2.218 2.494 2.598 2.692 2.911 3.004 3.096 3.262 3.419 3.561 3.626 3.765 3.916 4.124 4.246 4.362 4.533 4.693 4.831 4.971 5.116 5.294 5.454 5.61 5.797 5.963 6.107 6.296 6.524 6.712 6.907 7.097 7.291 7.487 7.708 7.962 8.2 8.471 8.746 9.001 9.197 9.292 9.274 8.999 8.324 7.559 6.839 6.2 5.586 5.054 4.569 4.122 3.67 3.293 2.958 2.604 2.209 1.866 1.601 1.314 1.055 0.831 0.593 0.351 0.15 -0.068 -0.3 -0.481 -0.678 -0.88 -1.096 -1.34 -1.503 -1.671 -1.94 -2.123 -2.309 -2.403 -2.592 -2.768 -2.96 -3.07 -3.172 -3.395 -3.524 -3.646 -3.91 -4.084 -4.277 -4.468 -4.665 -4.901 -5.2 -6.311 -8 ,20679 ,TETRA ,17617944,Tue Nov 30 13:50:06 CET,Tue Nov 30 15:38:08 CET,0.0 0.865 1.166 1.39 1.58 1.751 1.896 2.033 2.269 2.364 2.459 2.675 2.757 2.842 3.014 3.192 3.358 3.429 3.564 3.709 3.909 4.02 4.124 4.296 4.471 4.629 4.777 4.919 5.101 5.264 5.426 5.626 5.794 5.932 6.088 6.285 6.47 6.651 6.853 7.069 7.262 7.49 7.771 8.007 8.233 8.458 8.706 8.93 9.059 8.96 8.497 7.713 6.907 6.179 5.545 4.936 4.364 3.837 3.371 2.888 2.46 2.093 1.755 1.422 1.099 0.827 0.561 0.308 0.056 -0.236 -0.523 -0.726 -0.918 -1.13 -1.31 -1.5 -1.687 -1.89 -2.118 -2.289 -2.464 -2.713 -2.894 -3.086 -3.177 -3.353 -3.54 -3.738 -3.842 -3.952 -4.192 -4.319 -4.465 -4.792 -4.959 -5.121 -5.314 -5.566 -5.874 -6.226 -6.839 -9 ,15266 ,TETRA ,17617945,Tue Nov 30 13:50:08 CET,Tue Nov 30 15:53:09 CET,0.0 0.851 1.202 1.449 1.646 1.849 2.036 2.186 2.431 2.541 2.645 2.839 2.93 3.027 3.176 3.322 3.472 3.547 3.688 3.806 3.988 4.117 4.244 4.419 4.573 4.733 4.893 5.032 5.204 5.364 5.524 5.714 5.883 6.065 6.277 6.473 6.646 6.838 7.043 7.251 7.47 7.728 7.991 8.192 8.427 8.692 8.926 9.153 9.319 9.281 8.916 8.102 7.275 6.534 5.879 5.255 4.674 4.148 3.691 3.252 2.868 2.479 2.115 1.791 1.486 1.22 0.934 0.658 0.418 0.175 -0.063 -0.274 -0.511 -0.74 -0.913 -1.106 -1.303 -1.503 -1.718 -1.867 -2.025 -2.279 -2.449 -2.61 -2.691 -2.868 -3.073 -3.292 -3.406 -3.525 -3.797 -3.928 -4.068 -4.38 -4.551 -4.729 -4.936 -5.182 -5.448 -5.79 -6.778 -10 ,25442 ,TETRA ,17617946,Tue Nov 30 13:50:09 CET,Tue Nov 30 15:52:00 CET,0.0 0.862 1.183 1.381 1.569 1.76 1.913 2.037 2.284 2.399 2.5 2.718 2.805 2.895 3.074 3.243 3.391 3.462 3.611 3.76 3.963 4.102 4.242 4.417 4.563 4.707 4.844 4.978 5.156 5.32 5.485 5.677 5.83 5.982 6.17 6.36 6.527 6.719 6.951 7.209 7.46 7.696 7.946 8.172 8.396 8.623 8.82 8.96 9.032 8.993 8.635 7.912 7.184 6.462 5.791 5.198 4.643 4.128 3.69 3.25 2.809 2.405 2.055 1.716 1.375 1.057 0.751 0.491 0.274 0.026 -0.259 -0.503 -0.76 -1.009 -1.185 -1.372 -1.596 -1.838 -2.068 -2.215 -2.361 -2.61 -2.799 -2.986 -3.074 -3.249 -3.43 -3.647 -3.768 -3.882 -4.141 -4.28 -4.425 -4.73 -4.892 -5.07 -5.263 -5.487 -5.757 -6.109 -7.172 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_235_167.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_235_167.txt deleted file mode 100644 index bbef19fe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_235_167.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9586 ,TETRA ,17617947,Tue Nov 30 13:50:11 CET,Tue Nov 30 15:38:17 CET,0.0 1.398 1.743 2.024 2.212 2.345 2.467 2.573 2.727 2.794 2.857 2.994 2.985 2.994 3.018 3.027 3.04 3.047 3.041 3.018 2.97 2.94 2.908 2.835 2.751 2.655 2.544 2.435 2.283 2.103 1.921 1.675 1.404 1.117 0.755 0.335 -0.108 -0.629 -1.198 -1.83 -2.563 -3.487 -4.685 -6.019 -7.727 -9.797 -12.425 -15.753 -20.169 -26.273 -35.289 -44.734 -51.688 -57.097 -61.444 -65.079 -68.053 -70.604 -72.711 -74.718 -76.356 -77.773 -79.096 -80.302 -81.399 -82.363 -83.357 -84.224 -84.945 -85.699 -86.46 -87.054 -87.669 -88.294 -88.762 -89.246 -89.749 -90.242 -90.738 -91.091 -91.456 -92.013 -92.386 -92.767 -92.959 -93.346 -93.76 -94.186 -94.397 -94.68 -95.041 -95.264 -95.497 -96.009 -96.279 -96.563 -96.861 -97.184 -97.54 -97.979 -98.964 -2 ,22724 ,TETRA ,17617948,Tue Nov 30 13:51:04 CET,Tue Nov 30 15:43:06 CET,0.0 1.819 2.173 2.387 2.589 2.756 2.855 2.948 3.124 3.19 3.243 3.361 3.368 3.39 3.438 3.463 3.464 3.468 3.464 3.45 3.413 3.386 3.352 3.286 3.201 3.105 3.013 2.915 2.759 2.591 2.413 2.157 1.906 1.642 1.293 0.871 0.436 -0.065 -0.645 -1.326 -2.106 -3.055 -4.269 -5.598 -7.265 -9.312 -11.932 -15.235 -19.706 -25.879 -34.997 -44.494 -51.439 -56.86 -61.186 -64.808 -67.749 -70.247 -72.307 -74.307 -76.005 -77.476 -78.817 -80.03 -81.151 -82.157 -83.152 -83.998 -84.726 -85.478 -86.229 -86.834 -87.43 -88.04 -88.531 -89.04 -89.553 -90.068 -90.592 -90.944 -91.3 -91.847 -92.228 -92.615 -92.804 -93.199 -93.621 -94.057 -94.271 -94.556 -94.921 -95.155 -95.412 -95.95 -96.219 -96.505 -96.811 -97.138 -97.516 -98.004 -99.193 -3 ,12302 ,TETRA ,17617949,Tue Nov 30 13:51:05 CET,Tue Nov 30 15:44:33 CET,0.0 1.189 1.5 1.728 1.883 2.024 2.152 2.247 2.388 2.453 2.504 2.618 2.625 2.647 2.674 2.683 2.692 2.698 2.694 2.678 2.643 2.627 2.611 2.542 2.462 2.379 2.275 2.146 1.963 1.779 1.582 1.355 1.127 0.868 0.524 0.088 -0.365 -0.888 -1.492 -2.196 -3.003 -3.981 -5.226 -6.548 -8.162 -10.161 -12.808 -16.178 -20.628 -26.802 -35.878 -45.323 -52.337 -57.831 -62.167 -65.76 -68.725 -71.257 -73.374 -75.41 -77.053 -78.453 -79.757 -80.96 -82.03 -82.968 -83.941 -84.792 -85.513 -86.251 -87.003 -87.604 -88.206 -88.829 -89.29 -89.769 -90.282 -90.794 -91.313 -91.658 -92.007 -92.545 -92.901 -93.266 -93.456 -93.836 -94.215 -94.603 -94.807 -95.087 -95.448 -95.677 -95.912 -96.415 -96.681 -96.978 -97.312 -97.662 -98.042 -98.519 -99.919 -4 ,17769 ,TETRA ,17617950,Tue Nov 30 13:52:06 CET,Tue Nov 30 15:41:11 CET,0.0 1.616 1.948 2.19 2.349 2.476 2.602 2.688 2.838 2.903 2.94 3.024 3.008 3.008 3.011 3.029 3.046 3.048 3.02 2.987 2.916 2.854 2.793 2.698 2.602 2.493 2.367 2.25 2.114 1.956 1.768 1.511 1.239 0.954 0.597 0.19 -0.217 -0.727 -1.348 -2.02 -2.775 -3.728 -4.926 -6.256 -7.923 -9.973 -12.583 -15.851 -20.215 -26.293 -35.361 -44.857 -51.842 -57.282 -61.593 -65.157 -68.107 -70.726 -72.874 -74.87 -76.519 -77.962 -79.323 -80.568 -81.689 -82.698 -83.723 -84.595 -85.323 -86.05 -86.799 -87.418 -88.032 -88.667 -89.149 -89.624 -90.125 -90.636 -91.159 -91.511 -91.87 -92.419 -92.798 -93.183 -93.372 -93.758 -94.155 -94.574 -94.79 -95.087 -95.482 -95.713 -95.956 -96.513 -96.807 -97.109 -97.438 -97.798 -98.198 -98.721 -100.196 -5 ,15610 ,TETRA ,17617951,Tue Nov 30 13:52:08 CET,Tue Nov 30 15:41:18 CET,0.0 2.078 2.48 2.747 2.946 3.112 3.25 3.369 3.567 3.631 3.675 3.778 3.763 3.782 3.827 3.842 3.837 3.83 3.838 3.855 3.829 3.785 3.73 3.632 3.548 3.447 3.337 3.215 3.042 2.856 2.651 2.418 2.179 1.915 1.563 1.13 0.694 0.164 -0.453 -1.153 -1.942 -2.868 -4.062 -5.401 -7.112 -9.196 -11.849 -15.234 -19.71 -25.835 -34.901 -44.412 -51.385 -56.817 -61.135 -64.71 -67.665 -70.18 -72.227 -74.197 -75.859 -77.289 -78.612 -79.839 -80.93 -81.891 -82.865 -83.737 -84.478 -85.202 -85.946 -86.568 -87.208 -87.856 -88.334 -88.795 -89.254 -89.728 -90.229 -90.571 -90.912 -91.454 -91.835 -92.22 -92.413 -92.796 -93.2 -93.612 -93.823 -94.108 -94.475 -94.699 -94.942 -95.463 -95.736 -96.034 -96.345 -96.663 -97.046 -97.492 -98.475 -6 ,21852 ,TETRA ,17617952,Tue Nov 30 13:53:05 CET,Tue Nov 30 15:39:35 CET,0.0 2.231 2.665 2.923 3.084 3.193 3.304 3.41 3.554 3.601 3.642 3.754 3.757 3.78 3.789 3.79 3.789 3.781 3.751 3.73 3.692 3.644 3.595 3.507 3.432 3.368 3.286 3.202 3.059 2.87 2.663 2.396 2.116 1.82 1.468 1.056 0.629 0.128 -0.464 -1.16 -1.954 -2.896 -4.098 -5.436 -7.123 -9.175 -11.81 -15.154 -19.607 -25.717 -34.75 -44.314 -51.316 -56.753 -61.085 -64.676 -67.642 -70.196 -72.27 -74.283 -75.969 -77.401 -78.736 -79.951 -81.043 -81.999 -82.967 -83.834 -84.56 -85.273 -86.01 -86.604 -87.194 -87.814 -88.289 -88.775 -89.284 -89.791 -90.293 -90.651 -91.014 -91.567 -91.939 -92.315 -92.513 -92.907 -93.293 -93.703 -93.932 -94.227 -94.606 -94.853 -95.095 -95.581 -95.861 -96.172 -96.506 -96.857 -97.23 -97.704 -99.366 -7 ,15076 ,TETRA ,17617953,Tue Nov 30 13:54:06 CET,Tue Nov 30 15:44:44 CET,0.0 1.959 2.32 2.601 2.817 2.978 3.089 3.181 3.339 3.397 3.453 3.572 3.574 3.608 3.67 3.697 3.703 3.707 3.71 3.705 3.66 3.603 3.536 3.432 3.325 3.21 3.087 2.981 2.83 2.648 2.466 2.21 1.936 1.674 1.369 0.982 0.555 0.032 -0.552 -1.217 -1.998 -2.903 -4.017 -5.297 -6.944 -8.964 -11.568 -14.86 -19.323 -25.496 -34.624 -44.185 -51.194 -56.632 -60.942 -64.531 -67.495 -70.045 -72.131 -74.123 -75.767 -77.196 -78.52 -79.715 -80.791 -81.759 -82.77 -83.654 -84.405 -85.169 -85.941 -86.551 -87.182 -87.829 -88.303 -88.793 -89.288 -89.804 -90.339 -90.683 -91.032 -91.583 -91.965 -92.348 -92.536 -92.916 -93.32 -93.745 -93.966 -94.265 -94.647 -94.874 -95.113 -95.62 -95.894 -96.182 -96.496 -96.827 -97.2 -97.703 -98.79 -8 ,23436 ,TETRA ,17617954,Tue Nov 30 13:54:07 CET,Tue Nov 30 15:49:17 CET,0.0 1.617 1.989 2.218 2.416 2.575 2.708 2.806 2.936 2.976 3.017 3.146 3.154 3.185 3.225 3.231 3.224 3.218 3.215 3.213 3.184 3.149 3.096 3.001 2.884 2.764 2.646 2.521 2.362 2.194 2.0 1.725 1.436 1.145 0.785 0.366 -0.064 -0.599 -1.228 -1.918 -2.693 -3.639 -4.848 -6.179 -7.867 -9.965 -12.62 -15.947 -20.351 -26.388 -35.33 -44.744 -51.691 -57.12 -61.427 -65.001 -67.945 -70.458 -72.54 -74.569 -76.247 -77.703 -79.043 -80.23 -81.351 -82.377 -83.405 -84.304 -85.059 -85.812 -86.583 -87.211 -87.821 -88.441 -88.925 -89.398 -89.878 -90.367 -90.876 -91.23 -91.584 -92.139 -92.5 -92.858 -93.045 -93.427 -93.83 -94.256 -94.477 -94.769 -95.132 -95.359 -95.601 -96.1 -96.354 -96.62 -96.917 -97.228 -97.588 -98.085 -98.991 -9 ,19333 ,TETRA ,17617955,Tue Nov 30 13:54:07 CET,Tue Nov 30 15:41:03 CET,0.0 1.661 2.012 2.247 2.421 2.565 2.664 2.734 2.852 2.91 2.956 3.04 3.036 3.064 3.096 3.117 3.144 3.152 3.166 3.174 3.156 3.105 3.045 2.966 2.874 2.778 2.671 2.552 2.374 2.186 1.992 1.753 1.509 1.253 0.919 0.49 0.079 -0.402 -0.983 -1.672 -2.458 -3.433 -4.684 -6.032 -7.736 -9.773 -12.373 -15.704 -20.162 -26.345 -35.473 -44.962 -51.94 -57.376 -61.65 -65.209 -68.141 -70.64 -72.718 -74.72 -76.36 -77.779 -79.116 -80.36 -81.49 -82.464 -83.44 -84.31 -85.062 -85.811 -86.547 -87.167 -87.823 -88.456 -88.927 -89.433 -89.953 -90.476 -90.995 -91.338 -91.693 -92.258 -92.636 -93.008 -93.204 -93.599 -93.999 -94.425 -94.639 -94.925 -95.305 -95.532 -95.774 -96.296 -96.577 -96.894 -97.238 -97.595 -97.977 -98.456 -99.589 -10 ,7872 ,TETRA ,17617956,Tue Nov 30 13:54:08 CET,Tue Nov 30 15:41:49 CET,0.0 2.037 2.452 2.688 2.852 2.987 3.101 3.194 3.321 3.362 3.394 3.501 3.497 3.529 3.577 3.573 3.556 3.544 3.517 3.488 3.452 3.411 3.358 3.293 3.227 3.131 3.021 2.91 2.76 2.59 2.392 2.155 1.894 1.624 1.288 0.854 0.43 -0.089 -0.717 -1.419 -2.177 -3.099 -4.309 -5.635 -7.329 -9.409 -12.052 -15.357 -19.777 -25.934 -35.008 -44.506 -51.511 -56.973 -61.312 -64.909 -67.897 -70.458 -72.543 -74.535 -76.17 -77.606 -78.953 -80.179 -81.271 -82.229 -83.237 -84.135 -84.895 -85.643 -86.372 -86.966 -87.577 -88.194 -88.661 -89.141 -89.636 -90.132 -90.63 -90.979 -91.334 -91.882 -92.261 -92.642 -92.837 -93.246 -93.678 -94.122 -94.351 -94.658 -95.087 -95.34 -95.589 -96.144 -96.442 -96.758 -97.094 -97.457 -97.876 -98.39 -99.917 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_235_224.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_235_224.txt deleted file mode 100644 index a03e171f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_235_224.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24619 ,TETRA ,17617957,Tue Nov 30 13:55:06 CET,Tue Nov 30 15:44:13 CET,0.0 1.237 1.564 1.825 2.049 2.268 2.491 2.703 3.048 3.174 3.291 3.567 3.656 3.76 3.957 4.153 4.327 4.406 4.557 4.711 4.936 5.077 5.207 5.396 5.577 5.772 5.97 6.134 6.329 6.533 6.732 6.98 7.237 7.477 7.746 8.03 8.308 8.591 8.865 9.175 9.496 9.869 10.319 10.708 11.088 11.506 11.961 12.373 12.774 13.143 13.265 12.891 12.334 11.753 11.193 10.665 10.154 9.658 9.227 8.787 8.391 8.025 7.687 7.381 7.096 6.836 6.527 6.216 5.963 5.686 5.371 5.106 4.846 4.599 4.417 4.231 4.02 3.793 3.537 3.356 3.186 2.933 2.757 2.579 2.477 2.245 2.01 1.761 1.632 1.527 1.212 1.058 0.896 0.532 0.323 0.097 -0.147 -0.429 -0.795 -1.257 -3.416 -2 ,732 ,TETRA ,17617958,Tue Nov 30 13:57:06 CET,Tue Nov 30 15:50:07 CET,0.0 1.16 1.536 1.79 2.011 2.229 2.42 2.585 2.893 3.035 3.17 3.452 3.536 3.652 3.85 4.02 4.199 4.291 4.455 4.601 4.82 4.966 5.099 5.289 5.48 5.676 5.873 6.045 6.243 6.413 6.569 6.761 6.941 7.113 7.31 7.53 7.739 7.979 8.255 8.544 8.836 9.163 9.534 9.918 10.337 10.711 11.139 11.622 12.101 12.458 12.592 12.276 11.736 11.182 10.626 10.08 9.584 9.11 8.693 8.227 7.817 7.462 7.122 6.799 6.501 6.218 5.929 5.693 5.443 5.149 4.846 4.604 4.37 4.114 3.909 3.697 3.484 3.267 3.042 2.889 2.709 2.422 2.238 2.053 1.96 1.761 1.528 1.277 1.15 1.055 0.761 0.594 0.42 0.056 -0.159 -0.384 -0.615 -0.92 -1.32 -1.869 -3.907 -3 ,14379 ,TETRA ,17617959,Tue Nov 30 13:57:07 CET,Tue Nov 30 15:54:31 CET,0.0 1.448 1.826 2.142 2.407 2.665 2.892 3.06 3.347 3.477 3.595 3.869 3.947 4.041 4.228 4.416 4.59 4.673 4.846 5.013 5.235 5.36 5.491 5.687 5.873 6.067 6.257 6.425 6.619 6.802 6.97 7.178 7.384 7.58 7.811 8.081 8.325 8.592 8.905 9.214 9.525 9.895 10.3 10.663 11.1 11.565 12.051 12.53 12.933 13.312 13.513 13.217 12.721 12.12 11.482 10.864 10.318 9.808 9.372 8.925 8.541 8.214 7.874 7.544 7.218 6.91 6.614 6.331 6.085 5.845 5.583 5.372 5.133 4.858 4.65 4.437 4.217 3.998 3.777 3.627 3.461 3.186 2.992 2.784 2.682 2.487 2.279 2.039 1.905 1.798 1.479 1.329 1.176 0.854 0.672 0.452 0.208 -0.063 -0.409 -0.89 -3.102 -4 ,5461 ,TETRA ,17617960,Tue Nov 30 13:57:07 CET,Tue Nov 30 15:45:09 CET,0.0 0.98 1.381 1.651 1.863 2.091 2.309 2.49 2.822 2.975 3.125 3.431 3.527 3.65 3.865 4.076 4.267 4.357 4.526 4.685 4.911 5.053 5.205 5.424 5.639 5.86 6.042 6.193 6.396 6.609 6.822 7.075 7.296 7.504 7.74 7.975 8.198 8.445 8.714 8.998 9.281 9.57 9.912 10.25 10.612 11.015 11.482 11.96 12.424 12.802 12.952 12.662 12.119 11.523 10.967 10.428 9.883 9.388 8.963 8.523 8.067 7.645 7.299 6.975 6.671 6.385 6.076 5.782 5.508 5.252 4.979 4.74 4.52 4.296 4.112 3.916 3.693 3.459 3.218 3.051 2.882 2.624 2.426 2.191 2.076 1.854 1.592 1.308 1.177 1.08 0.772 0.611 0.43 0.044 -0.176 -0.422 -0.669 -0.947 -1.286 -1.865 -5.311 -5 ,24582 ,TETRA ,17617961,Tue Nov 30 13:58:05 CET,Tue Nov 30 15:47:46 CET,0.0 1.316 1.763 2.117 2.382 2.637 2.852 3.026 3.361 3.506 3.648 3.982 4.07 4.175 4.394 4.605 4.8 4.89 5.064 5.226 5.463 5.625 5.761 5.934 6.112 6.297 6.475 6.634 6.844 7.053 7.245 7.471 7.699 7.905 8.16 8.461 8.706 8.948 9.197 9.445 9.7 10.01 10.369 10.714 11.154 11.659 12.166 12.654 13.1 13.429 13.571 13.24 12.688 12.119 11.548 10.966 10.429 9.937 9.523 9.045 8.588 8.23 7.887 7.546 7.226 6.9 6.545 6.255 6.027 5.785 5.522 5.31 5.093 4.857 4.657 4.45 4.239 4.004 3.766 3.601 3.42 3.145 2.95 2.75 2.644 2.409 2.173 1.935 1.812 1.71 1.391 1.23 1.069 0.737 0.548 0.334 0.054 -0.254 -0.583 -1.04 -2.782 -6 ,27769 ,TETRA ,17617962,Tue Nov 30 13:58:07 CET,Tue Nov 30 15:48:17 CET,0.0 1.589 1.93 2.197 2.486 2.748 2.97 3.164 3.466 3.593 3.711 3.957 4.036 4.139 4.343 4.545 4.733 4.819 4.987 5.146 5.368 5.513 5.659 5.882 6.1 6.29 6.453 6.603 6.824 7.048 7.24 7.457 7.655 7.84 8.08 8.34 8.575 8.86 9.198 9.566 9.915 10.26 10.62 10.986 11.413 11.842 12.243 12.613 12.975 13.329 13.417 13.051 12.549 11.981 11.402 10.831 10.304 9.828 9.447 9.037 8.632 8.288 7.949 7.572 7.222 6.945 6.662 6.397 6.176 5.941 5.676 5.455 5.229 4.992 4.814 4.618 4.39 4.154 3.934 3.786 3.622 3.344 3.134 2.919 2.812 2.589 2.355 2.103 1.97 1.845 1.492 1.333 1.171 0.809 0.588 0.346 0.089 -0.208 -0.611 -1.179 -3.425 -7 ,10651 ,TETRA ,17617963,Tue Nov 30 13:58:07 CET,Tue Nov 30 15:46:44 CET,0.0 0.959 1.347 1.645 1.901 2.109 2.278 2.435 2.717 2.839 2.967 3.267 3.368 3.489 3.69 3.88 4.063 4.151 4.311 4.454 4.669 4.817 4.956 5.162 5.347 5.525 5.721 5.916 6.151 6.36 6.564 6.809 7.023 7.215 7.429 7.672 7.906 8.185 8.52 8.835 9.099 9.394 9.733 10.056 10.443 10.854 11.272 11.685 12.063 12.391 12.491 12.106 11.56 11.006 10.492 9.983 9.48 8.968 8.526 8.105 7.73 7.373 7.026 6.704 6.386 6.072 5.748 5.468 5.202 4.891 4.59 4.358 4.12 3.866 3.642 3.405 3.168 2.943 2.725 2.565 2.404 2.152 1.972 1.788 1.681 1.465 1.252 1.019 0.886 0.789 0.489 0.321 0.158 -0.189 -0.404 -0.64 -0.896 -1.212 -1.619 -2.154 -5.11 -8 ,6447 ,TETRA ,17617964,Tue Nov 30 13:58:07 CET,Tue Nov 30 15:46:43 CET,0.0 1.932 2.437 2.745 2.979 3.208 3.4 3.567 3.869 4.0 4.116 4.379 4.458 4.566 4.785 5.004 5.203 5.294 5.473 5.637 5.856 5.992 6.139 6.359 6.541 6.724 6.898 7.056 7.284 7.515 7.728 7.955 8.159 8.362 8.593 8.854 9.109 9.37 9.642 9.954 10.28 10.6 10.956 11.312 11.679 12.068 12.483 12.912 13.357 13.752 13.879 13.463 12.875 12.275 11.722 11.181 10.662 10.141 9.684 9.209 8.811 8.483 8.155 7.82 7.508 7.234 6.95 6.665 6.413 6.135 5.851 5.633 5.409 5.167 4.949 4.732 4.506 4.256 4.004 3.828 3.649 3.38 3.194 2.997 2.898 2.699 2.482 2.246 2.12 2.023 1.715 1.558 1.393 1.029 0.823 0.606 0.344 0.04 -0.292 -0.778 -2.349 -9 ,18039 ,TETRA ,17617966,Tue Nov 30 13:58:07 CET,Tue Nov 30 15:42:16 CET,0.0 1.474 1.77 2.011 2.243 2.443 2.609 2.755 3.047 3.194 3.324 3.579 3.644 3.739 3.942 4.14 4.321 4.408 4.579 4.731 4.94 5.07 5.197 5.394 5.588 5.775 5.952 6.126 6.345 6.559 6.775 7.032 7.248 7.421 7.611 7.842 8.057 8.301 8.584 8.843 9.102 9.418 9.791 10.16 10.54 10.944 11.39 11.812 12.242 12.578 12.72 12.417 11.871 11.205 10.576 10.017 9.508 9.022 8.575 8.12 7.734 7.389 7.058 6.75 6.46 6.198 5.925 5.647 5.407 5.18 4.934 4.724 4.476 4.187 3.987 3.787 3.575 3.367 3.146 2.985 2.809 2.532 2.342 2.145 2.046 1.834 1.62 1.392 1.266 1.161 0.842 0.677 0.51 0.172 -0.021 -0.234 -0.474 -0.746 -1.05 -1.489 -4.118 -10 ,4797 ,TETRA ,17617967,Tue Nov 30 14:00:06 CET,Tue Nov 30 15:49:58 CET,0.0 1.495 1.884 2.145 2.337 2.524 2.717 2.908 3.233 3.373 3.497 3.748 3.824 3.921 4.109 4.307 4.48 4.559 4.711 4.86 5.085 5.222 5.351 5.534 5.711 5.881 6.038 6.192 6.377 6.569 6.77 7.005 7.238 7.479 7.755 8.051 8.319 8.591 8.887 9.209 9.546 9.893 10.257 10.614 11.008 11.429 11.865 12.321 12.778 13.149 13.249 12.861 12.341 11.815 11.228 10.658 10.176 9.722 9.339 8.92 8.529 8.135 7.768 7.463 7.147 6.839 6.531 6.222 5.956 5.699 5.414 5.178 4.932 4.652 4.421 4.216 4.024 3.813 3.609 3.462 3.299 3.039 2.871 2.699 2.592 2.348 2.095 1.846 1.719 1.61 1.293 1.144 0.975 0.558 0.318 0.069 -0.204 -0.514 -0.887 -1.394 -3.75 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_155.txt deleted file mode 100644 index 82d04581..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12593 ,TETRA ,17617968,Tue Nov 30 14:00:06 CET,Tue Nov 30 15:47:49 CET,0.0 0.86 1.127 1.325 1.482 1.623 1.764 1.904 2.153 2.266 2.378 2.546 2.656 2.735 2.885 3.033 3.176 3.242 3.364 3.48 3.657 3.774 3.877 4.01 4.144 4.276 4.398 4.509 4.648 4.793 4.924 5.081 5.236 5.364 5.512 5.678 5.814 5.966 6.119 6.251 6.388 6.53 6.697 6.858 6.974 7.071 7.138 7.145 6.966 6.28 4.883 3.053 1.483 0.136 -1.017 -2.028 -2.966 -3.845 -4.589 -5.287 -5.881 -6.452 -6.998 -7.492 -7.94 -8.327 -8.723 -9.093 -9.411 -9.734 -10.088 -10.388 -10.681 -10.972 -11.202 -11.437 -11.682 -11.94 -12.199 -12.392 -12.591 -12.876 -13.084 -13.294 -13.399 -13.616 -13.839 -14.08 -14.202 -14.377 -14.639 -14.809 -14.984 -15.352 -15.547 -15.766 -16.032 -16.316 -16.653 -17.086 -18.141 -2 ,12501 ,TETRA ,17617969,Tue Nov 30 14:01:13 CET,Tue Nov 30 15:48:52 CET,0.0 1.459 1.792 2.016 2.212 2.392 2.538 2.667 2.869 2.962 3.066 3.224 3.332 3.421 3.575 3.693 3.808 3.871 3.985 4.087 4.243 4.349 4.451 4.596 4.74 4.877 4.998 5.108 5.256 5.389 5.51 5.654 5.784 5.905 6.051 6.208 6.363 6.537 6.721 6.914 7.09 7.259 7.409 7.528 7.62 7.682 7.698 7.637 7.406 6.831 5.677 3.984 2.398 0.977 -0.221 -1.288 -2.231 -3.083 -3.807 -4.509 -5.13 -5.706 -6.23 -6.707 -7.15 -7.536 -7.939 -8.298 -8.61 -8.935 -9.265 -9.544 -9.84 -10.139 -10.371 -10.622 -10.89 -11.171 -11.438 -11.609 -11.799 -12.118 -12.329 -12.546 -12.662 -12.896 -13.136 -13.396 -13.534 -13.716 -13.964 -14.122 -14.283 -14.612 -14.799 -14.992 -15.195 -15.456 -15.775 -16.18 -17.283 -3 ,13009 ,TETRA ,17617970,Tue Nov 30 14:03:08 CET,Tue Nov 30 15:49:59 CET,0.0 0.808 1.115 1.336 1.501 1.65 1.786 1.912 2.131 2.227 2.323 2.49 2.601 2.668 2.809 2.955 3.094 3.159 3.281 3.403 3.582 3.706 3.815 3.948 4.079 4.203 4.33 4.456 4.606 4.743 4.873 5.034 5.183 5.316 5.469 5.634 5.783 5.938 6.105 6.259 6.386 6.507 6.657 6.824 6.955 7.036 7.119 7.124 7.022 6.545 5.373 3.94 2.614 1.389 0.285 -0.767 -1.734 -2.577 -3.274 -3.965 -4.561 -5.095 -5.632 -6.161 -6.629 -7.033 -7.435 -7.792 -8.105 -8.428 -8.77 -9.06 -9.354 -9.665 -9.909 -10.152 -10.395 -10.655 -10.931 -11.117 -11.314 -11.615 -11.824 -12.039 -12.152 -12.389 -12.641 -12.907 -13.039 -13.22 -13.473 -13.624 -13.782 -14.139 -14.329 -14.522 -14.746 -15.018 -15.354 -15.762 -16.88 -4 ,7467 ,TETRA ,17617971,Tue Nov 30 14:03:11 CET,Tue Nov 30 15:50:37 CET,0.0 0.728 1.006 1.239 1.437 1.598 1.742 1.858 2.06 2.169 2.281 2.497 2.638 2.73 2.897 3.042 3.171 3.237 3.366 3.488 3.658 3.763 3.86 4.01 4.157 4.289 4.416 4.544 4.702 4.838 4.956 5.088 5.208 5.334 5.488 5.643 5.784 5.941 6.095 6.239 6.403 6.579 6.746 6.882 7.016 7.103 7.123 7.072 6.886 6.46 5.41 3.765 2.187 0.731 -0.565 -1.661 -2.558 -3.354 -4.039 -4.715 -5.319 -5.859 -6.344 -6.803 -7.234 -7.633 -8.048 -8.402 -8.707 -9.033 -9.357 -9.618 -9.9 -10.201 -10.429 -10.664 -10.918 -11.166 -11.417 -11.603 -11.807 -12.128 -12.334 -12.542 -12.653 -12.896 -13.136 -13.374 -13.501 -13.674 -13.899 -14.047 -14.217 -14.583 -14.761 -14.945 -15.161 -15.421 -15.735 -16.12 -17.093 -5 ,23151 ,TETRA ,17617972,Tue Nov 30 14:03:14 CET,Tue Nov 30 15:50:46 CET,0.0 1.073 1.436 1.673 1.859 2.024 2.163 2.29 2.509 2.615 2.723 2.9 3.006 3.079 3.233 3.384 3.521 3.587 3.712 3.823 3.974 4.074 4.176 4.321 4.457 4.582 4.697 4.804 4.938 5.055 5.173 5.319 5.451 5.583 5.734 5.901 6.042 6.169 6.31 6.47 6.636 6.785 6.888 6.985 7.067 7.092 7.104 7.031 6.813 6.376 5.365 3.827 2.422 1.042 -0.222 -1.343 -2.313 -3.149 -3.856 -4.552 -5.157 -5.683 -6.183 -6.668 -7.112 -7.511 -7.943 -8.331 -8.646 -8.973 -9.327 -9.602 -9.888 -10.204 -10.431 -10.654 -10.895 -11.148 -11.419 -11.6 -11.786 -12.083 -12.28 -12.479 -12.587 -12.819 -13.058 -13.289 -13.408 -13.598 -13.86 -14.008 -14.172 -14.562 -14.771 -14.987 -15.222 -15.476 -15.765 -16.127 -17.363 -6 ,25872 ,TETRA ,17617973,Tue Nov 30 14:04:09 CET,Tue Nov 30 15:35:20 CET,0.0 1.349 1.663 1.866 2.052 2.224 2.366 2.495 2.716 2.817 2.908 3.043 3.155 3.238 3.388 3.522 3.655 3.719 3.842 3.964 4.13 4.236 4.342 4.487 4.617 4.749 4.881 4.998 5.15 5.285 5.406 5.562 5.701 5.812 5.952 6.118 6.262 6.438 6.618 6.78 6.924 7.078 7.241 7.363 7.468 7.509 7.462 7.368 7.133 6.588 5.439 3.76 2.19 0.73 -0.567 -1.666 -2.591 -3.41 -4.131 -4.891 -5.52 -6.071 -6.594 -7.074 -7.516 -7.908 -8.314 -8.684 -9.01 -9.34 -9.692 -9.984 -10.282 -10.591 -10.835 -11.081 -11.324 -11.584 -11.866 -12.056 -12.241 -12.534 -12.734 -12.944 -13.053 -13.28 -13.527 -13.793 -13.921 -14.093 -14.329 -14.483 -14.651 -14.989 -15.16 -15.361 -15.604 -15.867 -16.148 -16.554 -17.776 -7 ,21726 ,TETRA ,17617974,Tue Nov 30 14:04:08 CET,Tue Nov 30 15:54:18 CET,0.0 0.97 1.256 1.494 1.703 1.86 2.006 2.144 2.368 2.477 2.593 2.775 2.889 2.975 3.14 3.291 3.427 3.493 3.621 3.744 3.919 4.018 4.115 4.248 4.375 4.498 4.614 4.731 4.881 5.026 5.153 5.291 5.421 5.563 5.713 5.852 6.003 6.154 6.293 6.426 6.568 6.75 6.951 7.108 7.229 7.318 7.366 7.295 7.058 6.595 5.509 3.834 2.269 0.887 -0.333 -1.422 -2.357 -3.206 -3.917 -4.608 -5.19 -5.737 -6.269 -6.755 -7.204 -7.619 -8.05 -8.431 -8.756 -9.089 -9.423 -9.699 -9.986 -10.294 -10.551 -10.804 -11.048 -11.304 -11.575 -11.766 -11.956 -12.253 -12.46 -12.673 -12.789 -13.035 -13.293 -13.544 -13.665 -13.838 -14.077 -14.239 -14.414 -14.784 -15.001 -15.23 -15.451 -15.694 -15.998 -16.374 -17.365 -8 ,17867 ,TETRA ,17617975,Tue Nov 30 14:04:09 CET,Tue Nov 30 15:53:14 CET,0.0 0.822 1.171 1.444 1.627 1.791 1.937 2.067 2.292 2.401 2.501 2.646 2.75 2.826 2.957 3.088 3.225 3.288 3.408 3.535 3.713 3.821 3.918 4.045 4.173 4.31 4.443 4.562 4.704 4.84 4.987 5.159 5.297 5.431 5.59 5.756 5.902 6.061 6.234 6.393 6.539 6.701 6.872 7.013 7.154 7.246 7.278 7.285 7.063 6.421 5.079 3.196 1.566 0.122 -1.163 -2.316 -3.279 -4.141 -4.876 -5.607 -6.23 -6.762 -7.274 -7.789 -8.257 -8.651 -9.06 -9.426 -9.746 -10.081 -10.436 -10.723 -11.015 -11.332 -11.572 -11.813 -12.066 -12.324 -12.604 -12.802 -12.996 -13.294 -13.495 -13.705 -13.817 -14.042 -14.282 -14.537 -14.661 -14.835 -15.076 -15.232 -15.401 -15.74 -15.926 -16.147 -16.383 -16.637 -16.946 -17.369 -18.852 -9 ,29749 ,TETRA ,17617976,Tue Nov 30 14:04:11 CET,Tue Nov 30 15:47:59 CET,0.0 0.826 1.086 1.31 1.502 1.671 1.812 1.94 2.174 2.284 2.388 2.542 2.656 2.751 2.92 3.064 3.192 3.256 3.384 3.499 3.674 3.788 3.891 4.036 4.182 4.323 4.445 4.557 4.695 4.823 4.946 5.105 5.255 5.389 5.537 5.682 5.818 5.974 6.145 6.307 6.437 6.597 6.772 6.898 7.039 7.147 7.184 7.108 6.876 6.382 5.161 3.389 1.858 0.429 -0.803 -1.858 -2.757 -3.554 -4.278 -5.014 -5.626 -6.155 -6.658 -7.146 -7.608 -8.015 -8.434 -8.821 -9.131 -9.443 -9.802 -10.098 -10.384 -10.7 -10.954 -11.198 -11.444 -11.697 -11.958 -12.145 -12.347 -12.658 -12.866 -13.083 -13.196 -13.409 -13.629 -13.883 -14.018 -14.193 -14.42 -14.568 -14.736 -15.087 -15.268 -15.462 -15.679 -15.944 -16.256 -16.641 -17.724 -10 ,3338 ,TETRA ,17617977,Tue Nov 30 14:05:08 CET,Tue Nov 30 15:56:53 CET,0.0 0.802 1.072 1.281 1.475 1.638 1.781 1.917 2.154 2.249 2.34 2.495 2.611 2.7 2.868 3.028 3.177 3.244 3.37 3.484 3.643 3.749 3.845 3.969 4.088 4.203 4.307 4.409 4.547 4.675 4.798 4.949 5.1 5.242 5.382 5.532 5.69 5.866 6.033 6.195 6.362 6.538 6.696 6.81 6.921 6.985 7.007 6.966 6.756 6.268 5.102 3.369 1.724 0.251 -0.951 -2.032 -2.996 -3.891 -4.657 -5.355 -5.96 -6.51 -7.018 -7.492 -7.947 -8.362 -8.784 -9.156 -9.47 -9.805 -10.14 -10.405 -10.677 -10.949 -11.16 -11.407 -11.677 -11.951 -12.22 -12.393 -12.583 -12.878 -13.091 -13.32 -13.428 -13.644 -13.879 -14.141 -14.275 -14.453 -14.711 -14.878 -15.052 -15.422 -15.616 -15.826 -16.051 -16.296 -16.587 -16.96 -18.304 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_163.txt deleted file mode 100644 index a9469c35..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3231 ,TETRA ,17617978,Tue Nov 30 14:05:07 CET,Tue Nov 30 15:39:20 CET,0.0 1.285 1.498 1.623 1.705 1.764 1.811 1.846 1.88 1.895 1.904 1.87 1.894 1.881 1.85 1.813 1.763 1.737 1.68 1.617 1.516 1.447 1.37 1.241 1.104 0.975 0.854 0.719 0.516 0.313 0.116 -0.147 -0.431 -0.728 -1.086 -1.482 -1.878 -2.361 -2.947 -3.637 -4.377 -5.274 -6.424 -7.687 -9.303 -11.24 -13.703 -16.831 -21.066 -26.975 -35.739 -44.953 -51.767 -57.067 -61.342 -65.005 -68.044 -70.644 -72.754 -74.755 -76.422 -77.838 -79.138 -80.332 -81.434 -82.427 -83.407 -84.247 -84.961 -85.687 -86.436 -87.043 -87.667 -88.293 -88.762 -89.25 -89.753 -90.268 -90.78 -91.12 -91.473 -92.027 -92.402 -92.784 -92.978 -93.366 -93.751 -94.144 -94.348 -94.674 -94.974 -95.197 -95.425 -95.908 -96.172 -96.46 -96.761 -97.109 -97.525 -98.064 -99.352 -2 ,16411 ,TETRA ,17617979,Tue Nov 30 14:05:08 CET,Tue Nov 30 15:52:54 CET,0.0 0.568 0.723 0.811 0.88 0.931 0.965 0.984 1.019 1.027 1.024 0.987 1.018 1.008 0.972 0.936 0.894 0.871 0.826 0.772 0.68 0.615 0.549 0.447 0.348 0.252 0.144 0.023 -0.143 -0.316 -0.5 -0.753 -1.02 -1.281 -1.604 -2.005 -2.437 -2.931 -3.508 -4.191 -4.943 -5.841 -6.962 -8.193 -9.79 -11.737 -14.217 -17.378 -21.618 -27.511 -36.253 -45.448 -52.306 -57.618 -61.861 -65.517 -68.574 -71.144 -73.241 -75.234 -76.888 -78.329 -79.654 -80.858 -81.937 -82.88 -83.845 -84.691 -85.404 -86.129 -86.869 -87.47 -88.07 -88.691 -89.175 -89.656 -90.137 -90.631 -91.143 -91.497 -91.856 -92.401 -92.778 -93.149 -93.332 -93.719 -94.132 -94.565 -94.786 -95.131 -95.451 -95.685 -95.923 -96.442 -96.732 -97.036 -97.358 -97.736 -98.163 -98.627 -100.042 -3 ,30083 ,TETRA ,17617980,Tue Nov 30 14:06:09 CET,Tue Nov 30 16:06:54 CET,0.0 0.577 0.745 0.815 0.876 0.942 0.983 0.999 1.015 1.014 1.006 0.96 0.975 0.971 0.969 0.957 0.934 0.917 0.869 0.8 0.686 0.616 0.552 0.46 0.355 0.235 0.103 -0.035 -0.209 -0.388 -0.583 -0.83 -1.079 -1.351 -1.703 -2.148 -2.599 -3.101 -3.653 -4.286 -5.036 -5.923 -7.042 -8.293 -9.852 -11.716 -14.144 -17.281 -21.496 -27.378 -36.132 -45.416 -52.227 -57.631 -61.949 -65.47 -68.44 -71.026 -73.15 -75.212 -76.919 -78.348 -79.641 -80.807 -81.857 -82.813 -83.81 -84.669 -85.37 -86.084 -86.834 -87.456 -88.086 -88.729 -89.225 -89.722 -90.217 -90.706 -91.207 -91.552 -91.891 -92.419 -92.785 -93.144 -93.334 -93.71 -94.087 -94.489 -94.693 -95.033 -95.367 -95.599 -95.833 -96.363 -96.645 -96.94 -97.259 -97.617 -98.014 -98.515 -100.098 -4 ,18023 ,TETRA ,17617981,Tue Nov 30 14:06:10 CET,Tue Nov 30 15:54:26 CET,0.0 0.741 0.956 1.092 1.191 1.258 1.31 1.35 1.398 1.401 1.406 1.395 1.424 1.426 1.414 1.401 1.387 1.374 1.333 1.282 1.216 1.179 1.132 1.039 0.934 0.83 0.711 0.57 0.376 0.188 0.01 -0.247 -0.539 -0.823 -1.161 -1.572 -2.016 -2.545 -3.12 -3.772 -4.52 -5.432 -6.599 -7.852 -9.432 -11.434 -13.961 -17.096 -21.337 -27.218 -35.94 -45.21 -51.992 -57.291 -61.564 -65.112 -68.046 -70.565 -72.641 -74.653 -76.309 -77.727 -79.042 -80.247 -81.331 -82.281 -83.238 -84.068 -84.782 -85.517 -86.262 -86.866 -87.461 -88.055 -88.533 -89.023 -89.509 -90.008 -90.51 -90.85 -91.212 -91.76 -92.116 -92.479 -92.662 -93.047 -93.461 -93.881 -94.085 -94.422 -94.724 -94.941 -95.171 -95.68 -95.962 -96.275 -96.606 -96.936 -97.347 -97.841 -99.034 -5 ,20530 ,TETRA ,17617982,Tue Nov 30 14:06:12 CET,Tue Nov 30 15:52:30 CET,0.0 0.902 1.103 1.188 1.241 1.294 1.345 1.369 1.39 1.401 1.407 1.386 1.421 1.427 1.414 1.41 1.41 1.396 1.355 1.302 1.21 1.149 1.089 0.992 0.879 0.761 0.639 0.509 0.332 0.15 -0.037 -0.282 -0.534 -0.787 -1.112 -1.525 -1.97 -2.482 -3.069 -3.724 -4.455 -5.365 -6.492 -7.713 -9.304 -11.282 -13.807 -16.991 -21.228 -27.069 -35.864 -45.165 -52.082 -57.484 -61.732 -65.273 -68.216 -70.745 -72.83 -74.858 -76.528 -77.94 -79.262 -80.466 -81.533 -82.47 -83.45 -84.324 -85.041 -85.758 -86.481 -87.079 -87.696 -88.322 -88.801 -89.3 -89.82 -90.341 -90.853 -91.196 -91.542 -92.067 -92.437 -92.82 -93.017 -93.423 -93.829 -94.233 -94.447 -94.804 -95.152 -95.389 -95.628 -96.134 -96.396 -96.671 -97.004 -97.37 -97.775 -98.322 -99.735 -6 ,28162 ,TETRA ,17617983,Tue Nov 30 14:08:09 CET,Tue Nov 30 15:47:19 CET,0.0 0.627 0.805 0.908 0.973 1.005 1.033 1.052 1.064 1.064 1.06 1.004 1.018 1.003 0.966 0.918 0.857 0.827 0.765 0.698 0.598 0.518 0.424 0.274 0.127 -0.016 -0.154 -0.293 -0.488 -0.686 -0.886 -1.149 -1.418 -1.703 -2.057 -2.456 -2.877 -3.394 -3.985 -4.662 -5.423 -6.353 -7.544 -8.793 -10.351 -12.331 -14.924 -18.178 -22.4 -28.152 -36.978 -46.537 -53.623 -59.032 -63.29 -66.899 -69.863 -72.336 -74.386 -76.398 -78.056 -79.475 -80.809 -82.03 -83.111 -84.053 -84.994 -85.814 -86.523 -87.249 -87.978 -88.563 -89.176 -89.817 -90.297 -90.774 -91.268 -91.78 -92.288 -92.63 -92.974 -93.514 -93.894 -94.271 -94.462 -94.864 -95.274 -95.68 -95.893 -96.237 -96.567 -96.823 -97.084 -97.589 -97.866 -98.175 -98.528 -98.907 -99.304 -99.826 -101.122 -7 ,675 ,TETRA ,17617984,Tue Nov 30 14:08:09 CET,Tue Nov 30 15:58:08 CET,0.0 0.745 1.009 1.146 1.248 1.322 1.387 1.456 1.561 1.591 1.613 1.621 1.652 1.655 1.661 1.642 1.597 1.569 1.504 1.445 1.361 1.298 1.225 1.104 0.987 0.877 0.762 0.633 0.452 0.261 0.053 -0.204 -0.452 -0.715 -1.047 -1.443 -1.86 -2.347 -2.9 -3.555 -4.327 -5.268 -6.43 -7.668 -9.253 -11.209 -13.715 -16.902 -21.161 -27.084 -35.853 -45.138 -52.008 -57.397 -61.69 -65.265 -68.242 -70.802 -72.903 -74.895 -76.537 -77.952 -79.262 -80.449 -81.527 -82.499 -83.481 -84.322 -85.026 -85.762 -86.514 -87.107 -87.691 -88.285 -88.761 -89.264 -89.761 -90.252 -90.779 -91.138 -91.495 -92.047 -92.421 -92.799 -92.988 -93.365 -93.76 -94.178 -94.387 -94.73 -95.06 -95.312 -95.561 -96.054 -96.323 -96.62 -96.936 -97.3 -97.714 -98.185 -99.126 -8 ,16781 ,TETRA ,17617985,Tue Nov 30 14:08:12 CET,Tue Nov 30 15:58:18 CET,0.0 0.962 1.205 1.334 1.428 1.493 1.526 1.547 1.582 1.586 1.578 1.521 1.539 1.526 1.494 1.459 1.415 1.389 1.327 1.252 1.119 1.025 0.929 0.793 0.663 0.54 0.413 0.275 0.076 -0.152 -0.386 -0.671 -0.951 -1.209 -1.528 -1.951 -2.396 -2.902 -3.472 -4.119 -4.87 -5.792 -6.931 -8.15 -9.704 -11.66 -14.136 -17.302 -21.649 -27.585 -36.324 -45.507 -52.371 -57.751 -62.006 -65.587 -68.558 -71.102 -73.183 -75.181 -76.825 -78.231 -79.546 -80.769 -81.846 -82.785 -83.759 -84.604 -85.328 -86.074 -86.835 -87.454 -88.068 -88.67 -89.143 -89.618 -90.088 -90.572 -91.058 -91.389 -91.733 -92.285 -92.658 -93.022 -93.212 -93.611 -94.018 -94.421 -94.628 -94.97 -95.298 -95.531 -95.782 -96.326 -96.6 -96.893 -97.219 -97.565 -97.972 -98.502 -99.737 -9 ,22058 ,TETRA ,17617986,Tue Nov 30 14:09:08 CET,Tue Nov 30 15:56:04 CET,0.0 0.623 0.817 0.925 1.0 1.064 1.115 1.162 1.235 1.26 1.286 1.279 1.314 1.325 1.327 1.32 1.305 1.293 1.264 1.211 1.104 1.032 0.959 0.852 0.756 0.652 0.532 0.402 0.205 0.0 -0.2 -0.459 -0.742 -1.031 -1.378 -1.793 -2.218 -2.715 -3.28 -3.939 -4.701 -5.649 -6.805 -8.053 -9.651 -11.519 -13.931 -17.096 -21.396 -27.262 -35.897 -45.072 -51.925 -57.376 -61.735 -65.379 -68.345 -70.872 -72.976 -74.971 -76.627 -78.066 -79.405 -80.634 -81.745 -82.739 -83.756 -84.642 -85.388 -86.141 -86.893 -87.511 -88.142 -88.782 -89.268 -89.761 -90.268 -90.77 -91.276 -91.606 -91.933 -92.452 -92.8 -93.157 -93.339 -93.711 -94.094 -94.51 -94.736 -95.081 -95.372 -95.6 -95.842 -96.333 -96.604 -96.905 -97.238 -97.588 -97.967 -98.45 -99.733 -10 ,7677 ,TETRA ,17617987,Tue Nov 30 14:09:08 CET,Tue Nov 30 15:56:08 CET,0.0 0.584 0.755 0.847 0.9 0.946 0.978 0.983 0.993 0.998 0.993 0.94 0.947 0.928 0.884 0.83 0.778 0.751 0.697 0.649 0.564 0.492 0.417 0.296 0.164 0.022 -0.125 -0.267 -0.453 -0.658 -0.877 -1.154 -1.431 -1.712 -2.084 -2.524 -2.967 -3.487 -4.08 -4.754 -5.527 -6.49 -7.718 -9.032 -10.64 -12.622 -15.219 -18.409 -22.601 -28.588 -37.556 -46.975 -53.91 -59.291 -63.65 -67.302 -70.256 -72.822 -74.992 -77.049 -78.746 -80.194 -81.502 -82.706 -83.781 -84.739 -85.732 -86.595 -87.328 -88.074 -88.83 -89.432 -90.056 -90.715 -91.211 -91.701 -92.189 -92.691 -93.221 -93.583 -93.95 -94.498 -94.853 -95.222 -95.416 -95.811 -96.206 -96.609 -96.82 -97.16 -97.485 -97.73 -97.981 -98.493 -98.753 -99.036 -99.348 -99.684 -100.05 -100.488 -101.283 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_164.txt deleted file mode 100644 index a6811d74..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6105 ,KEBNE ,17076783,Sat Dec 25 05:11:58 CET,Sat Dec 25 06:44:02 CET,0.0 0.535 0.704 0.797 0.88 0.964 1.022 1.065 1.132 1.153 1.171 1.171 1.211 1.218 1.22 1.192 1.148 1.125 1.077 1.038 0.966 0.907 0.863 0.805 0.736 0.658 0.556 0.435 0.285 0.126 -0.047 -0.264 -0.491 -0.736 -1.036 -1.391 -1.764 -2.189 -2.68 -3.204 -3.729 -4.417 -5.384 -6.443 -7.781 -9.43 -11.493 -14.08 -17.598 -22.452 -29.583 -37.076 -42.622 -46.892 -50.322 -53.206 -55.587 -57.611 -59.289 -60.904 -62.219 -63.394 -64.487 -65.473 -66.375 -67.19 -68.008 -68.705 -69.294 -69.899 -70.514 -71.008 -71.512 -72.026 -72.426 -72.833 -73.246 -73.677 -74.128 -74.444 -74.76 -75.21 -75.506 -75.815 -75.979 -76.316 -76.663 -77.037 -77.221 -77.503 -77.767 -77.966 -78.168 -78.612 -78.86 -79.105 -79.349 -79.635 -80.008 -80.499 -81.421 -2 ,8562 ,KEBNE ,17076784,Sat Dec 25 05:13:02 CET,Sat Dec 25 06:46:45 CET,0.0 0.68 0.861 0.963 1.04 1.114 1.172 1.209 1.242 1.251 1.258 1.221 1.245 1.24 1.228 1.201 1.166 1.148 1.116 1.075 0.994 0.936 0.877 0.782 0.683 0.576 0.461 0.348 0.213 0.071 -0.083 -0.275 -0.485 -0.695 -0.952 -1.269 -1.608 -2.013 -2.48 -3.025 -3.637 -4.374 -5.322 -6.33 -7.596 -9.195 -11.201 -13.686 -17.041 -21.689 -28.628 -35.986 -41.457 -45.732 -49.19 -52.112 -54.538 -56.652 -58.379 -60.02 -61.392 -62.574 -63.682 -64.694 -65.592 -66.37 -67.154 -67.866 -68.468 -69.068 -69.695 -70.209 -70.719 -71.25 -71.658 -72.061 -72.472 -72.875 -73.316 -73.628 -73.932 -74.416 -74.747 -75.08 -75.25 -75.597 -75.976 -76.359 -76.547 -76.852 -77.149 -77.361 -77.584 -78.056 -78.306 -78.569 -78.862 -79.183 -79.578 -80.136 -81.199 -3 ,27342 ,KEBNE ,17076785,Sat Dec 25 05:13:02 CET,Sat Dec 25 06:45:34 CET,0.0 0.533 0.7 0.814 0.891 0.942 0.989 1.03 1.094 1.117 1.122 1.082 1.107 1.104 1.082 1.041 0.997 0.973 0.928 0.891 0.826 0.764 0.696 0.607 0.505 0.393 0.274 0.148 -0.021 -0.19 -0.354 -0.564 -0.793 -1.04 -1.333 -1.68 -2.033 -2.439 -2.917 -3.47 -4.097 -4.873 -5.848 -6.893 -8.246 -9.885 -11.959 -14.535 -17.949 -22.746 -29.889 -37.377 -42.948 -47.337 -50.825 -53.762 -56.177 -58.235 -59.935 -61.604 -62.994 -64.175 -65.262 -66.248 -67.116 -67.9 -68.723 -69.446 -70.063 -70.684 -71.309 -71.819 -72.346 -72.867 -73.259 -73.672 -74.094 -74.51 -74.951 -75.257 -75.565 -76.04 -76.362 -76.685 -76.849 -77.179 -77.524 -77.872 -78.048 -78.332 -78.633 -78.848 -79.044 -79.451 -79.686 -79.933 -80.194 -80.477 -80.796 -81.2 -82.13 -4 ,2985 ,KEBNE ,17076786,Sat Dec 25 05:13:02 CET,Sat Dec 25 06:45:50 CET,0.0 0.571 0.749 0.862 0.951 1.018 1.07 1.123 1.208 1.229 1.251 1.282 1.346 1.37 1.363 1.332 1.298 1.279 1.241 1.2 1.132 1.085 1.034 0.95 0.867 0.788 0.695 0.587 0.443 0.279 0.106 -0.11 -0.336 -0.568 -0.862 -1.225 -1.579 -2.003 -2.508 -3.08 -3.7 -4.439 -5.401 -6.454 -7.756 -9.344 -11.388 -13.988 -17.466 -22.189 -29.289 -36.841 -42.423 -46.791 -50.271 -53.194 -55.593 -57.654 -59.372 -61.004 -62.368 -63.558 -64.64 -65.616 -66.516 -67.315 -68.125 -68.851 -69.455 -70.047 -70.662 -71.167 -71.667 -72.176 -72.566 -72.961 -73.383 -73.83 -74.277 -74.575 -74.873 -75.315 -75.625 -75.942 -76.097 -76.451 -76.829 -77.172 -77.345 -77.631 -77.901 -78.1 -78.308 -78.742 -78.985 -79.247 -79.531 -79.832 -80.148 -80.567 -81.686 -5 ,23657 ,KEBNE ,17076787,Sat Dec 25 05:14:06 CET,Sat Dec 25 06:46:04 CET,0.0 0.373 0.496 0.59 0.663 0.716 0.752 0.783 0.831 0.841 0.846 0.81 0.836 0.84 0.847 0.833 0.794 0.77 0.726 0.681 0.596 0.551 0.517 0.438 0.335 0.219 0.1 -0.024 -0.188 -0.34 -0.495 -0.714 -0.928 -1.125 -1.381 -1.706 -2.042 -2.424 -2.828 -3.236 -3.719 -4.338 -5.176 -6.187 -7.486 -9.067 -11.089 -13.642 -17.014 -21.711 -28.836 -36.308 -41.818 -46.194 -49.735 -52.678 -55.086 -57.186 -58.922 -60.573 -61.908 -63.061 -64.14 -65.118 -66.019 -66.838 -67.652 -68.351 -68.947 -69.54 -70.147 -70.649 -71.159 -71.685 -72.087 -72.492 -72.902 -73.321 -73.767 -74.086 -74.406 -74.861 -75.161 -75.474 -75.636 -75.961 -76.284 -76.624 -76.801 -77.081 -77.323 -77.509 -77.71 -78.151 -78.384 -78.626 -78.895 -79.186 -79.546 -80.037 -81.044 -6 ,2260 ,KEBNE ,17076788,Sat Dec 25 05:14:06 CET,Sat Dec 25 06:45:52 CET,0.0 0.551 0.687 0.775 0.854 0.914 0.947 0.973 1.021 1.033 1.033 0.996 1.013 1.013 1.009 0.99 0.965 0.947 0.897 0.849 0.775 0.72 0.664 0.573 0.477 0.376 0.277 0.18 0.038 -0.119 -0.281 -0.502 -0.739 -0.974 -1.255 -1.589 -1.921 -2.287 -2.72 -3.244 -3.842 -4.561 -5.462 -6.456 -7.747 -9.342 -11.371 -13.911 -17.317 -22.016 -29.05 -36.586 -42.211 -46.548 -49.989 -52.914 -55.331 -57.397 -59.097 -60.715 -62.054 -63.215 -64.287 -65.26 -66.153 -66.941 -67.763 -68.5 -69.108 -69.714 -70.332 -70.83 -71.332 -71.861 -72.268 -72.668 -73.075 -73.484 -73.902 -74.187 -74.476 -74.916 -75.223 -75.544 -75.701 -76.039 -76.391 -76.756 -76.943 -77.228 -77.513 -77.735 -77.98 -78.493 -78.757 -79.017 -79.307 -79.627 -79.963 -80.386 -81.506 -7 ,10066 ,KEBNE ,17076789,Sat Dec 25 05:14:06 CET,Sat Dec 25 06:46:34 CET,0.0 0.526 0.686 0.767 0.819 0.862 0.887 0.91 0.971 1.013 1.04 1.024 1.064 1.073 1.087 1.089 1.068 1.049 0.998 0.948 0.872 0.815 0.754 0.664 0.569 0.463 0.348 0.237 0.084 -0.084 -0.258 -0.476 -0.702 -0.946 -1.239 -1.572 -1.923 -2.345 -2.835 -3.406 -4.057 -4.822 -5.795 -6.857 -8.185 -9.848 -11.976 -14.63 -18.147 -22.955 -30.097 -37.613 -43.153 -47.481 -50.933 -53.819 -56.244 -58.349 -60.064 -61.733 -63.119 -64.288 -65.379 -66.366 -67.247 -68.034 -68.835 -69.538 -70.145 -70.764 -71.381 -71.88 -72.379 -72.894 -73.289 -73.696 -74.12 -74.555 -74.995 -75.29 -75.596 -76.057 -76.37 -76.702 -76.867 -77.189 -77.517 -77.864 -78.039 -78.321 -78.619 -78.822 -79.036 -79.514 -79.788 -80.078 -80.367 -80.66 -80.963 -81.36 -82.521 -8 ,29098 ,KEBNE ,17076790,Sat Dec 25 05:14:06 CET,Sat Dec 25 06:46:06 CET,0.0 0.567 0.732 0.834 0.921 0.981 1.019 1.049 1.083 1.091 1.095 1.068 1.099 1.101 1.096 1.08 1.074 1.072 1.042 1.001 0.932 0.881 0.833 0.746 0.643 0.546 0.441 0.325 0.183 0.034 -0.126 -0.305 -0.486 -0.679 -0.919 -1.224 -1.548 -1.915 -2.344 -2.849 -3.439 -4.16 -5.064 -6.047 -7.302 -8.843 -10.83 -13.406 -16.863 -21.616 -28.694 -36.207 -41.735 -46.055 -49.53 -52.471 -54.916 -56.971 -58.646 -60.254 -61.584 -62.729 -63.787 -64.79 -65.7 -66.484 -67.282 -67.983 -68.574 -69.168 -69.805 -70.33 -70.841 -71.374 -71.781 -72.186 -72.599 -73.017 -73.438 -73.73 -74.025 -74.479 -74.795 -75.104 -75.259 -75.568 -75.897 -76.251 -76.437 -76.72 -76.986 -77.185 -77.394 -77.83 -78.054 -78.281 -78.53 -78.823 -79.17 -79.661 -80.613 -9 ,12282 ,KEBNE ,17076791,Sat Dec 25 05:14:05 CET,Sat Dec 25 06:45:51 CET,0.0 1.015 1.182 1.274 1.343 1.404 1.454 1.497 1.554 1.568 1.571 1.54 1.566 1.559 1.539 1.501 1.458 1.437 1.393 1.351 1.275 1.222 1.164 1.06 0.949 0.831 0.716 0.606 0.448 0.275 0.093 -0.136 -0.37 -0.604 -0.897 -1.259 -1.624 -2.054 -2.54 -3.083 -3.691 -4.414 -5.338 -6.396 -7.749 -9.353 -11.383 -14.003 -17.476 -22.211 -29.311 -36.895 -42.527 -46.895 -50.328 -53.21 -55.619 -57.669 -59.364 -60.996 -62.349 -63.511 -64.578 -65.548 -66.439 -67.243 -68.063 -68.796 -69.412 -70.016 -70.621 -71.132 -71.67 -72.208 -72.613 -73.016 -73.429 -73.865 -74.307 -74.609 -74.916 -75.386 -75.702 -76.023 -76.195 -76.54 -76.866 -77.202 -77.385 -77.687 -77.989 -78.202 -78.406 -78.814 -79.046 -79.307 -79.592 -79.915 -80.281 -80.713 -81.853 -10 ,7496 ,KEBNE ,17076792,Sat Dec 25 05:14:05 CET,Sat Dec 25 06:46:01 CET,0.0 0.643 0.819 0.928 1.013 1.072 1.116 1.158 1.208 1.22 1.229 1.213 1.25 1.258 1.261 1.244 1.209 1.187 1.147 1.098 1.009 0.963 0.935 0.891 0.826 0.74 0.633 0.511 0.345 0.181 0.001 -0.24 -0.485 -0.742 -1.049 -1.396 -1.754 -2.191 -2.684 -3.223 -3.845 -4.621 -5.6 -6.668 -8.005 -9.628 -11.697 -14.316 -17.802 -22.567 -29.697 -37.233 -42.762 -47.087 -50.579 -53.509 -55.928 -58.026 -59.731 -61.358 -62.719 -63.89 -64.981 -65.972 -66.861 -67.648 -68.442 -69.135 -69.723 -70.329 -70.95 -71.446 -71.95 -72.455 -72.84 -73.256 -73.684 -74.097 -74.512 -74.799 -75.1 -75.548 -75.841 -76.141 -76.298 -76.631 -76.979 -77.344 -77.532 -77.829 -78.107 -78.312 -78.531 -78.956 -79.175 -79.413 -79.648 -79.91 -80.218 -80.588 -81.537 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_215.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_215.txt deleted file mode 100644 index 95b6e10c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_215.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6045 ,TETRA ,17668007,Fri Dec 3 06:14:44 CET,Fri Dec 3 08:01:02 CET,0.0 1.278 1.575 1.752 1.915 2.047 2.171 2.292 2.481 2.555 2.621 2.693 2.759 2.8 2.867 2.933 2.988 3.009 3.044 3.062 3.062 3.059 3.049 3.028 3.01 2.987 2.951 2.906 2.838 2.758 2.687 2.589 2.453 2.311 2.123 1.893 1.652 1.334 0.96 0.522 0.036 -0.53 -1.228 -2.014 -3.102 -4.44 -6.197 -8.561 -11.739 -16.246 -22.948 -29.974 -35.267 -39.475 -42.876 -45.741 -48.133 -50.204 -51.921 -53.569 -54.96 -56.189 -57.316 -58.334 -59.254 -60.073 -60.914 -61.643 -62.255 -62.887 -63.528 -64.034 -64.533 -65.047 -65.447 -65.866 -66.307 -66.757 -67.214 -67.511 -67.809 -68.272 -68.576 -68.871 -69.024 -69.353 -69.693 -70.054 -70.243 -70.528 -70.79 -70.992 -71.199 -71.61 -71.828 -72.069 -72.34 -72.623 -72.968 -73.436 -74.582 -2 ,17933 ,TETRA ,17668008,Fri Dec 3 06:15:45 CET,Fri Dec 3 08:02:25 CET,0.0 1.276 1.602 1.829 1.983 2.096 2.202 2.313 2.504 2.583 2.646 2.722 2.793 2.825 2.889 2.951 2.999 3.02 3.058 3.081 3.103 3.116 3.122 3.116 3.093 3.065 3.026 2.98 2.916 2.846 2.778 2.67 2.535 2.397 2.217 2.015 1.819 1.547 1.192 0.78 0.296 -0.303 -1.076 -1.917 -2.978 -4.292 -6.018 -8.285 -11.3 -15.611 -22.266 -29.426 -34.785 -38.947 -42.321 -45.194 -47.608 -49.7 -51.392 -53.017 -54.38 -55.55 -56.624 -57.612 -58.508 -59.302 -60.113 -60.801 -61.387 -61.995 -62.623 -63.15 -63.668 -64.174 -64.565 -64.971 -65.394 -65.827 -66.251 -66.533 -66.828 -67.296 -67.624 -67.963 -68.13 -68.464 -68.817 -69.174 -69.354 -69.65 -69.956 -70.166 -70.373 -70.823 -71.083 -71.36 -71.637 -71.938 -72.277 -72.684 -74.022 -3 ,20818 ,TETRA ,17668009,Fri Dec 3 06:15:44 CET,Fri Dec 3 08:02:40 CET,0.0 1.148 1.515 1.768 1.957 2.111 2.247 2.355 2.514 2.573 2.634 2.711 2.771 2.808 2.878 2.94 2.996 3.021 3.056 3.069 3.088 3.097 3.091 3.083 3.073 3.044 3.004 2.956 2.874 2.799 2.727 2.605 2.474 2.339 2.155 1.914 1.657 1.376 1.07 0.693 0.24 -0.306 -1.036 -1.852 -2.94 -4.352 -6.183 -8.511 -11.613 -15.974 -22.607 -29.794 -35.144 -39.338 -42.728 -45.584 -47.92 -49.906 -51.59 -53.242 -54.608 -55.797 -56.884 -57.866 -58.763 -59.579 -60.405 -61.13 -61.757 -62.376 -63.011 -63.532 -64.061 -64.611 -65.019 -65.431 -65.859 -66.279 -66.706 -67.006 -67.314 -67.791 -68.119 -68.445 -68.607 -68.936 -69.277 -69.63 -69.812 -70.095 -70.362 -70.573 -70.8 -71.264 -71.507 -71.765 -72.066 -72.411 -72.807 -73.34 -74.757 -4 ,28241 ,TETRA ,17668010,Fri Dec 3 06:15:47 CET,Fri Dec 3 08:02:28 CET,0.0 1.202 1.567 1.802 1.993 2.156 2.274 2.364 2.533 2.621 2.689 2.772 2.842 2.871 2.915 2.956 3.003 3.021 3.032 3.031 3.021 3.013 3.008 2.998 2.969 2.944 2.909 2.85 2.781 2.712 2.641 2.539 2.423 2.285 2.093 1.879 1.666 1.385 1.068 0.676 0.183 -0.421 -1.198 -2.051 -3.134 -4.5 -6.279 -8.56 -11.697 -16.127 -22.846 -30.017 -35.415 -39.603 -42.977 -45.92 -48.334 -50.361 -52.03 -53.623 -54.979 -56.16 -57.252 -58.25 -59.147 -59.926 -60.702 -61.397 -61.986 -62.585 -63.206 -63.7 -64.19 -64.698 -65.09 -65.491 -65.911 -66.348 -66.798 -67.085 -67.368 -67.818 -68.134 -68.464 -68.626 -68.953 -69.275 -69.607 -69.792 -70.092 -70.392 -70.606 -70.826 -71.254 -71.497 -71.761 -72.03 -72.319 -72.682 -73.189 -74.493 -5 ,10288 ,TETRA ,17668011,Fri Dec 3 06:15:44 CET,Fri Dec 3 08:04:38 CET,0.0 1.097 1.499 1.715 1.884 2.012 2.121 2.21 2.362 2.425 2.48 2.565 2.635 2.667 2.721 2.781 2.84 2.862 2.885 2.897 2.925 2.939 2.933 2.914 2.911 2.889 2.852 2.814 2.734 2.655 2.586 2.473 2.356 2.235 2.058 1.821 1.581 1.318 0.969 0.528 0.055 -0.495 -1.217 -2.041 -3.163 -4.602 -6.379 -8.64 -11.765 -16.18 -22.931 -30.199 -35.688 -40.01 -43.454 -46.318 -48.695 -50.742 -52.412 -54.029 -55.391 -56.558 -57.61 -58.583 -59.466 -60.236 -61.052 -61.764 -62.352 -62.957 -63.587 -64.094 -64.615 -65.163 -65.575 -65.982 -66.395 -66.814 -67.259 -67.574 -67.886 -68.365 -68.687 -68.991 -69.147 -69.489 -69.825 -70.155 -70.331 -70.613 -70.909 -71.121 -71.331 -71.783 -72.04 -72.305 -72.602 -72.927 -73.291 -73.777 -74.911 -6 ,1956 ,TETRA ,17668012,Fri Dec 3 06:15:44 CET,Fri Dec 3 08:04:11 CET,0.0 1.987 2.268 2.484 2.671 2.835 2.972 3.081 3.256 3.316 3.357 3.411 3.477 3.516 3.571 3.61 3.643 3.656 3.686 3.707 3.727 3.735 3.74 3.738 3.721 3.687 3.641 3.598 3.543 3.479 3.401 3.285 3.148 2.993 2.798 2.563 2.319 2.048 1.733 1.322 0.866 0.318 -0.412 -1.256 -2.376 -3.758 -5.529 -7.722 -10.687 -14.981 -21.61 -28.839 -34.234 -38.441 -41.762 -44.532 -46.833 -48.85 -50.578 -52.23 -53.588 -54.785 -55.875 -56.84 -57.708 -58.505 -59.323 -60.019 -60.604 -61.204 -61.819 -62.314 -62.827 -63.364 -63.777 -64.186 -64.605 -65.041 -65.484 -65.786 -66.09 -66.563 -66.895 -67.231 -67.395 -67.74 -68.105 -68.479 -68.669 -68.964 -69.273 -69.491 -69.722 -70.21 -70.458 -70.706 -70.971 -71.298 -71.687 -72.189 -73.467 -7 ,16033 ,TETRA ,17668013,Fri Dec 3 06:15:44 CET,Fri Dec 3 08:02:53 CET,0.0 1.185 1.46 1.67 1.868 2.015 2.123 2.225 2.402 2.472 2.546 2.661 2.729 2.769 2.846 2.914 2.971 2.99 3.016 3.044 3.071 3.083 3.092 3.077 3.057 3.023 2.976 2.919 2.839 2.765 2.679 2.561 2.431 2.279 2.096 1.877 1.621 1.314 0.969 0.563 0.092 -0.473 -1.217 -2.063 -3.147 -4.556 -6.365 -8.62 -11.69 -15.978 -22.479 -29.589 -34.966 -39.208 -42.551 -45.367 -47.785 -49.887 -51.596 -53.22 -54.565 -55.71 -56.785 -57.77 -58.672 -59.486 -60.296 -60.991 -61.583 -62.206 -62.854 -63.369 -63.878 -64.403 -64.805 -65.203 -65.618 -66.046 -66.457 -66.734 -67.029 -67.476 -67.785 -68.109 -68.268 -68.58 -68.896 -69.231 -69.422 -69.714 -69.969 -70.167 -70.384 -70.824 -71.052 -71.31 -71.598 -71.881 -72.171 -72.591 -73.55 -8 ,11540 ,TETRA ,17668014,Fri Dec 3 06:15:43 CET,Fri Dec 3 08:04:05 CET,0.0 1.039 1.374 1.62 1.774 1.894 2.023 2.118 2.254 2.326 2.4 2.492 2.557 2.592 2.65 2.7 2.736 2.755 2.791 2.815 2.833 2.826 2.821 2.825 2.816 2.794 2.749 2.695 2.635 2.56 2.475 2.364 2.23 2.09 1.924 1.691 1.431 1.133 0.785 0.378 -0.089 -0.642 -1.366 -2.22 -3.354 -4.726 -6.47 -8.711 -11.772 -16.189 -22.926 -30.173 -35.593 -39.837 -43.239 -46.084 -48.436 -50.464 -52.155 -53.789 -55.142 -56.296 -57.346 -58.34 -59.25 -60.05 -60.868 -61.569 -62.154 -62.751 -63.366 -63.867 -64.395 -64.94 -65.338 -65.737 -66.149 -66.57 -67.01 -67.316 -67.618 -68.065 -68.372 -68.689 -68.85 -69.193 -69.55 -69.913 -70.094 -70.379 -70.677 -70.878 -71.073 -71.499 -71.729 -71.969 -72.233 -72.552 -72.905 -73.341 -74.958 -9 ,23676 ,TETRA ,17668015,Fri Dec 3 06:15:46 CET,Fri Dec 3 08:03:49 CET,0.0 0.958 1.356 1.627 1.844 2.005 2.118 2.208 2.358 2.424 2.491 2.577 2.641 2.669 2.716 2.773 2.83 2.849 2.866 2.878 2.886 2.882 2.868 2.84 2.815 2.784 2.741 2.701 2.63 2.543 2.45 2.31 2.188 2.071 1.895 1.654 1.411 1.117 0.753 0.348 -0.126 -0.721 -1.462 -2.221 -3.255 -4.686 -6.574 -8.862 -11.865 -16.213 -22.834 -30.015 -35.453 -39.677 -43.062 -45.95 -48.321 -50.338 -52.036 -53.675 -55.026 -56.194 -57.268 -58.242 -59.128 -59.919 -60.744 -61.469 -62.079 -62.711 -63.33 -63.829 -64.338 -64.854 -65.248 -65.643 -66.051 -66.468 -66.893 -67.187 -67.481 -67.929 -68.238 -68.561 -68.725 -69.062 -69.421 -69.795 -69.983 -70.28 -70.6 -70.815 -71.031 -71.491 -71.76 -72.048 -72.338 -72.646 -72.99 -73.463 -74.89 -10 ,25218 ,TETRA ,17668016,Fri Dec 3 06:16:44 CET,Fri Dec 3 08:04:10 CET,0.0 1.043 1.331 1.565 1.733 1.871 2.005 2.113 2.288 2.354 2.399 2.455 2.521 2.561 2.626 2.675 2.716 2.738 2.777 2.805 2.818 2.816 2.813 2.794 2.761 2.73 2.708 2.678 2.619 2.547 2.458 2.347 2.227 2.091 1.922 1.708 1.475 1.172 0.81 0.399 -0.078 -0.668 -1.438 -2.314 -3.407 -4.727 -6.491 -8.763 -11.904 -16.429 -23.138 -30.315 -35.812 -40.08 -43.465 -46.338 -48.713 -50.758 -52.46 -54.121 -55.502 -56.686 -57.794 -58.813 -59.727 -60.522 -61.35 -62.059 -62.625 -63.202 -63.806 -64.307 -64.817 -65.337 -65.733 -66.142 -66.555 -66.966 -67.377 -67.666 -67.978 -68.447 -68.753 -69.074 -69.251 -69.605 -69.965 -70.349 -70.539 -70.831 -71.127 -71.329 -71.535 -71.979 -72.201 -72.437 -72.711 -73.016 -73.37 -73.803 -75.03 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_235.txt deleted file mode 100644 index f005ff5f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31212 ,KEBNE ,17076793,Sat Dec 25 05:14:07 CET,Sat Dec 25 06:45:32 CET,0.0 1.374 1.883 2.275 2.592 2.868 3.122 3.364 3.811 4.015 4.215 4.566 4.767 4.938 5.267 5.584 5.891 6.044 6.344 6.63 7.04 7.307 7.569 7.953 8.331 8.703 9.065 9.423 9.893 10.335 10.778 11.327 11.854 12.369 12.996 13.719 14.421 15.221 16.085 16.997 17.977 19.112 20.47 21.895 23.641 25.601 27.873 30.538 33.812 38.025 43.572 48.445 51.475 53.598 55.137 56.29 57.146 57.79 58.29 58.745 59.08 59.332 59.537 59.712 59.852 59.954 60.028 60.086 60.12 60.13 60.147 60.152 60.125 60.074 60.045 60.024 59.986 59.948 59.911 59.859 59.785 59.683 59.627 59.575 59.541 59.452 59.339 59.233 59.188 59.164 58.986 58.891 58.772 58.482 58.332 58.175 57.986 57.754 57.46 57.079 55.657 -2 ,10782 ,KEBNE ,17076794,Sat Dec 25 05:14:06 CET,Sat Dec 25 06:46:16 CET,0.0 1.699 2.174 2.559 2.857 3.118 3.365 3.609 4.057 4.26 4.468 4.825 5.03 5.21 5.547 5.86 6.158 6.306 6.593 6.874 7.296 7.56 7.816 8.212 8.59 8.974 9.359 9.713 10.185 10.654 11.099 11.633 12.155 12.669 13.278 13.963 14.623 15.375 16.207 17.129 18.143 19.331 20.774 22.222 23.933 25.904 28.258 30.984 34.263 38.363 43.799 48.642 51.663 53.809 55.328 56.466 57.357 58.071 58.572 58.978 59.306 59.572 59.777 59.939 60.062 60.152 60.233 60.285 60.306 60.303 60.29 60.285 60.269 60.229 60.19 60.147 60.084 60.014 59.948 59.906 59.862 59.771 59.698 59.62 59.576 59.474 59.349 59.202 59.127 59.074 58.845 58.743 58.634 58.363 58.215 58.065 57.895 57.681 57.377 56.913 55.315 -3 ,27166 ,KEBNE ,17076795,Sat Dec 25 05:15:08 CET,Sat Dec 25 06:47:49 CET,0.0 1.101 1.582 1.943 2.236 2.508 2.76 2.988 3.431 3.641 3.836 4.189 4.398 4.574 4.921 5.242 5.559 5.714 6.011 6.306 6.729 6.994 7.254 7.65 8.046 8.429 8.79 9.134 9.594 10.053 10.492 11.014 11.528 12.048 12.656 13.344 14.034 14.809 15.661 16.583 17.571 18.72 20.07 21.451 23.11 25.018 27.32 29.995 33.341 37.62 43.031 47.906 51.05 53.142 54.672 55.886 56.792 57.52 58.057 58.491 58.799 59.029 59.232 59.412 59.56 59.65 59.717 59.773 59.807 59.827 59.84 59.839 59.841 59.846 59.833 59.791 59.743 59.704 59.649 59.607 59.555 59.449 59.383 59.313 59.271 59.181 59.075 58.934 58.858 58.816 58.616 58.508 58.401 58.167 58.028 57.871 57.692 57.492 57.238 56.846 54.911 -4 ,20434 ,KEBNE ,17076796,Sat Dec 25 05:15:08 CET,Sat Dec 25 06:46:46 CET,0.0 1.54 1.996 2.37 2.696 2.978 3.224 3.451 3.871 4.075 4.272 4.62 4.825 4.991 5.3 5.633 5.956 6.105 6.414 6.724 7.136 7.387 7.642 8.03 8.411 8.778 9.145 9.507 9.966 10.411 10.857 11.395 11.927 12.455 13.054 13.747 14.438 15.188 16.03 16.968 17.973 19.136 20.512 21.897 23.547 25.477 27.784 30.499 33.843 37.912 43.202 48.166 51.326 53.498 55.05 56.159 57.003 57.702 58.2 58.637 58.962 59.207 59.417 59.594 59.731 59.816 59.879 59.925 59.96 59.981 59.979 59.963 59.943 59.915 59.891 59.861 59.821 59.776 59.715 59.662 59.619 59.538 59.464 59.394 59.353 59.258 59.152 59.044 58.983 58.945 58.744 58.65 58.541 58.275 58.126 57.949 57.756 57.545 57.276 56.926 55.337 -5 ,25291 ,KEBNE ,17076797,Sat Dec 25 05:15:08 CET,Sat Dec 25 06:46:54 CET,0.0 1.445 1.933 2.262 2.536 2.803 3.034 3.251 3.671 3.856 4.032 4.37 4.575 4.747 5.068 5.376 5.68 5.829 6.139 6.444 6.867 7.135 7.405 7.816 8.213 8.594 8.954 9.297 9.758 10.213 10.65 11.19 11.718 12.245 12.868 13.587 14.267 15.0 15.813 16.707 17.685 18.837 20.25 21.711 23.42 25.372 27.7 30.401 33.74 37.866 43.184 48.085 51.193 53.21 54.599 55.663 56.536 57.218 57.707 58.149 58.478 58.72 58.895 59.016 59.115 59.193 59.243 59.282 59.325 59.363 59.391 59.389 59.377 59.361 59.332 59.291 59.251 59.201 59.128 59.075 59.019 58.93 58.866 58.789 58.742 58.632 58.513 58.379 58.299 58.246 58.038 57.934 57.836 57.627 57.501 57.354 57.151 56.913 56.651 56.258 54.294 -6 ,19404 ,KEBNE ,17076798,Sat Dec 25 05:15:08 CET,Sat Dec 25 06:48:01 CET,0.0 1.176 1.609 1.971 2.286 2.548 2.782 3.003 3.427 3.628 3.821 4.161 4.353 4.529 4.878 5.209 5.516 5.664 5.958 6.239 6.65 6.908 7.163 7.564 7.954 8.327 8.68 9.022 9.494 9.97 10.441 10.996 11.52 12.046 12.657 13.34 14.01 14.776 15.636 16.546 17.542 18.723 20.14 21.566 23.225 25.136 27.505 30.298 33.565 37.698 43.183 48.136 51.387 53.614 55.147 56.341 57.197 57.82 58.292 58.662 58.947 59.182 59.362 59.52 59.66 59.776 59.864 59.914 59.954 59.98 59.976 59.943 59.899 59.875 59.853 59.821 59.779 59.712 59.642 59.595 59.535 59.451 59.395 59.322 59.282 59.192 59.098 58.98 58.91 58.866 58.648 58.551 58.451 58.214 58.072 57.907 57.712 57.514 57.269 56.909 55.225 -7 ,21562 ,KEBNE ,17076799,Sat Dec 25 05:15:08 CET,Sat Dec 25 06:47:22 CET,0.0 0.992 1.419 1.806 2.141 2.452 2.732 2.974 3.427 3.632 3.829 4.182 4.383 4.567 4.914 5.247 5.571 5.725 6.038 6.337 6.773 7.059 7.334 7.738 8.12 8.493 8.876 9.246 9.71 10.176 10.634 11.185 11.731 12.271 12.909 13.619 14.291 15.06 15.891 16.779 17.743 18.864 20.211 21.578 23.227 25.161 27.478 30.213 33.582 37.782 43.336 48.357 51.48 53.646 55.185 56.339 57.225 57.914 58.454 58.92 59.244 59.499 59.7 59.848 59.975 60.081 60.179 60.247 60.279 60.284 60.266 60.252 60.23 60.188 60.137 60.088 60.054 60.004 59.944 59.894 59.834 59.75 59.693 59.625 59.582 59.492 59.389 59.257 59.177 59.124 58.917 58.812 58.708 58.501 58.376 58.22 58.021 57.779 57.476 57.094 56.031 -8 ,15110 ,KEBNE ,17076800,Sat Dec 25 05:15:08 CET,Sat Dec 25 06:48:05 CET,0.0 0.948 1.37 1.713 2.03 2.336 2.597 2.826 3.267 3.479 3.683 4.034 4.242 4.417 4.76 5.091 5.401 5.55 5.841 6.126 6.546 6.827 7.105 7.519 7.91 8.274 8.63 8.988 9.464 9.921 10.365 10.918 11.455 11.968 12.566 13.267 13.956 14.704 15.532 16.453 17.449 18.599 19.964 21.375 23.076 24.987 27.24 29.966 33.363 37.543 42.92 47.808 50.871 52.888 54.349 55.468 56.309 56.936 57.438 57.877 58.147 58.34 58.528 58.71 58.859 58.954 59.025 59.093 59.141 59.174 59.181 59.178 59.166 59.129 59.087 59.05 59.017 58.967 58.896 58.846 58.789 58.704 58.652 58.589 58.555 58.459 58.353 58.244 58.183 58.149 57.947 57.857 57.778 57.569 57.439 57.303 57.148 56.951 56.704 56.385 55.373 -9 ,20751 ,KEBNE ,17076801,Sat Dec 25 05:15:08 CET,Sat Dec 25 06:46:50 CET,0.0 1.945 2.442 2.806 3.121 3.386 3.637 3.901 4.361 4.555 4.744 5.087 5.29 5.463 5.798 6.117 6.416 6.569 6.885 7.188 7.625 7.909 8.181 8.573 8.958 9.35 9.745 10.13 10.63 11.11 11.57 12.126 12.677 13.203 13.815 14.526 15.215 15.982 16.819 17.712 18.692 19.838 21.205 22.616 24.287 26.196 28.501 31.217 34.519 38.604 43.942 48.813 51.889 54.023 55.552 56.702 57.587 58.276 58.792 59.251 59.577 59.816 60.021 60.185 60.303 60.406 60.502 60.578 60.632 60.653 60.647 60.638 60.647 60.654 60.638 60.606 60.576 60.536 60.474 60.436 60.397 60.293 60.212 60.127 60.074 59.96 59.832 59.688 59.62 59.586 59.396 59.29 59.176 58.931 58.789 58.627 58.43 58.174 57.849 57.429 55.862 -10 ,32440 ,KEBNE ,17076802,Sat Dec 25 05:16:11 CET,Sat Dec 25 06:47:42 CET,0.0 1.369 1.813 2.146 2.45 2.726 2.959 3.18 3.63 3.826 4.005 4.355 4.563 4.733 5.064 5.379 5.683 5.831 6.117 6.39 6.794 7.057 7.308 7.679 8.054 8.426 8.786 9.142 9.607 10.077 10.534 11.078 11.614 12.14 12.758 13.472 14.176 14.96 15.818 16.742 17.734 18.876 20.262 21.698 23.405 25.36 27.676 30.365 33.662 37.743 43.03 47.814 50.909 53.035 54.568 55.744 56.61 57.28 57.777 58.24 58.596 58.87 59.082 59.224 59.34 59.418 59.456 59.484 59.504 59.503 59.497 59.493 59.487 59.46 59.423 59.386 59.342 59.284 59.216 59.167 59.124 59.058 58.994 58.913 58.873 58.793 58.698 58.597 58.541 58.506 58.323 58.237 58.139 57.948 57.838 57.702 57.541 57.361 57.133 56.784 55.359 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_25.txt deleted file mode 100644 index f89c7f3d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25289 ,TETRA ,17617988,Tue Nov 30 14:09:10 CET,Tue Nov 30 15:55:36 CET,0.0 1.262 1.722 2.099 2.402 2.653 2.882 3.081 3.417 3.595 3.777 4.064 4.217 4.351 4.633 4.891 5.129 5.245 5.484 5.718 6.053 6.262 6.453 6.72 6.981 7.231 7.479 7.733 8.066 8.394 8.69 9.05 9.426 9.788 10.212 10.716 11.193 11.708 12.287 12.894 13.533 14.289 15.158 16.02 17.087 18.32 19.783 21.42 23.269 25.441 28.08 30.206 31.403 32.052 32.337 32.476 32.546 32.563 32.527 32.442 32.366 32.278 32.168 32.051 31.905 31.77 31.646 31.523 31.405 31.258 31.099 30.963 30.834 30.708 30.585 30.452 30.32 30.185 30.033 29.915 29.799 29.629 29.505 29.388 29.327 29.182 29.013 28.82 28.727 28.636 28.416 28.291 28.158 27.864 27.685 27.466 27.232 26.962 26.631 26.192 23.427 -2 ,24901 ,TETRA ,17617989,Tue Nov 30 14:10:08 CET,Tue Nov 30 15:43:50 CET,0.0 2.122 2.548 2.861 3.117 3.355 3.579 3.789 4.167 4.34 4.496 4.758 4.931 5.074 5.328 5.56 5.784 5.9 6.137 6.357 6.674 6.893 7.106 7.402 7.669 7.934 8.201 8.461 8.795 9.109 9.431 9.829 10.207 10.586 11.031 11.499 11.944 12.459 13.005 13.561 14.172 14.919 15.816 16.704 17.711 18.824 20.182 21.723 23.479 25.585 28.184 30.301 31.428 32.068 32.485 32.727 32.802 32.795 32.758 32.686 32.571 32.449 32.337 32.217 32.091 31.949 31.799 31.666 31.524 31.357 31.172 31.043 30.918 30.768 30.645 30.512 30.368 30.219 30.064 29.947 29.826 29.638 29.494 29.347 29.275 29.122 28.941 28.738 28.636 28.529 28.306 28.184 28.052 27.777 27.613 27.436 27.238 26.974 26.667 26.21 24.874 -3 ,25005 ,TETRA ,17617990,Tue Nov 30 14:11:08 CET,Tue Nov 30 15:53:46 CET,0.0 1.76 2.196 2.508 2.776 3.034 3.262 3.463 3.827 3.99 4.149 4.44 4.605 4.739 4.986 5.224 5.459 5.568 5.777 5.991 6.306 6.501 6.688 6.964 7.226 7.48 7.728 7.974 8.302 8.609 8.913 9.31 9.691 10.043 10.442 10.908 11.371 11.874 12.419 13.017 13.655 14.353 15.169 16.026 17.049 18.196 19.577 21.22 23.12 25.251 27.755 29.745 30.889 31.544 31.865 32.045 32.1 32.079 32.072 32.066 32.026 31.949 31.873 31.786 31.684 31.589 31.473 31.35 31.218 31.068 30.918 30.788 30.646 30.487 30.366 30.251 30.125 29.99 29.843 29.729 29.597 29.389 29.254 29.116 29.042 28.885 28.708 28.501 28.389 28.274 28.016 27.883 27.737 27.39 27.186 26.979 26.756 26.498 26.169 25.663 23.873 -4 ,10298 ,TETRA ,17617991,Tue Nov 30 14:10:09 CET,Tue Nov 30 15:56:54 CET,0.0 1.792 2.274 2.617 2.916 3.157 3.367 3.557 3.883 4.021 4.161 4.443 4.618 4.752 4.986 5.211 5.43 5.542 5.769 5.982 6.284 6.473 6.659 6.937 7.217 7.492 7.75 7.998 8.321 8.643 8.955 9.34 9.736 10.114 10.527 11.002 11.475 12.011 12.585 13.167 13.776 14.451 15.248 16.081 17.068 18.228 19.606 21.132 22.899 25.038 27.607 29.683 30.779 31.364 31.674 31.829 31.906 31.909 31.87 31.776 31.67 31.57 31.449 31.334 31.234 31.118 30.954 30.809 30.691 30.568 30.437 30.319 30.181 30.028 29.911 29.78 29.632 29.462 29.291 29.184 29.078 28.907 28.772 28.626 28.549 28.382 28.204 28.015 27.913 27.798 27.56 27.444 27.309 27.002 26.832 26.641 26.43 26.164 25.807 25.333 23.761 -5 ,5016 ,TETRA ,17617992,Tue Nov 30 14:10:11 CET,Tue Nov 30 15:56:37 CET,0.0 1.575 2.059 2.417 2.708 2.958 3.189 3.402 3.807 3.994 4.159 4.417 4.577 4.713 4.994 5.273 5.531 5.646 5.869 6.08 6.389 6.596 6.797 7.084 7.35 7.61 7.869 8.115 8.444 8.76 9.069 9.466 9.851 10.221 10.646 11.121 11.577 12.096 12.661 13.24 13.874 14.595 15.445 16.294 17.274 18.439 19.794 21.329 23.141 25.236 27.751 29.672 30.723 31.402 31.769 31.937 31.988 31.99 31.991 31.949 31.862 31.77 31.671 31.562 31.449 31.335 31.21 31.084 30.956 30.815 30.652 30.526 30.4 30.26 30.134 29.986 29.836 29.672 29.485 29.369 29.26 29.07 28.936 28.787 28.702 28.518 28.337 28.149 28.042 27.926 27.662 27.526 27.393 27.095 26.939 26.756 26.522 26.249 25.907 25.476 23.836 -6 ,10343 ,TETRA ,17617993,Tue Nov 30 14:12:09 CET,Tue Nov 30 15:56:42 CET,0.0 1.671 2.105 2.445 2.752 3.005 3.225 3.43 3.763 3.918 4.071 4.337 4.519 4.672 4.943 5.183 5.425 5.545 5.774 6.011 6.349 6.555 6.75 7.026 7.288 7.554 7.823 8.091 8.447 8.774 9.075 9.437 9.788 10.141 10.552 11.008 11.476 11.974 12.506 13.11 13.747 14.484 15.345 16.241 17.308 18.477 19.852 21.431 23.296 25.459 27.99 29.972 31.034 31.668 32.027 32.185 32.222 32.19 32.141 32.064 31.968 31.825 31.664 31.538 31.417 31.305 31.169 31.028 30.9 30.749 30.601 30.479 30.339 30.181 30.042 29.917 29.802 29.657 29.486 29.361 29.222 29.02 28.89 28.758 28.687 28.528 28.375 28.228 28.138 28.031 27.766 27.619 27.466 27.115 26.917 26.696 26.455 26.202 25.865 25.35 22.774 -7 ,31663 ,TETRA ,17617994,Tue Nov 30 14:11:08 CET,Tue Nov 30 16:03:58 CET,0.0 1.504 1.969 2.297 2.571 2.822 3.033 3.215 3.566 3.734 3.891 4.17 4.345 4.483 4.743 4.985 5.217 5.333 5.578 5.806 6.091 6.274 6.469 6.765 7.039 7.301 7.572 7.839 8.185 8.511 8.8 9.17 9.56 9.949 10.378 10.84 11.297 11.816 12.411 13.053 13.716 14.461 15.352 16.212 17.199 18.342 19.641 21.145 23.019 25.221 27.805 29.801 30.783 31.45 31.86 32.044 32.119 32.134 32.122 32.055 31.971 31.884 31.771 31.614 31.467 31.347 31.181 31.008 30.853 30.706 30.558 30.429 30.295 30.142 30.011 29.876 29.719 29.558 29.414 29.298 29.166 28.974 28.844 28.686 28.597 28.427 28.259 28.08 27.981 27.868 27.629 27.505 27.365 27.053 26.893 26.707 26.48 26.203 25.875 25.402 23.309 -8 ,17223 ,TETRA ,17617995,Tue Nov 30 14:11:08 CET,Tue Nov 30 15:57:34 CET,0.0 1.556 2.025 2.37 2.653 2.892 3.111 3.315 3.686 3.843 3.986 4.257 4.435 4.579 4.842 5.098 5.342 5.461 5.688 5.899 6.199 6.391 6.588 6.876 7.147 7.411 7.668 7.925 8.279 8.619 8.929 9.297 9.67 10.045 10.498 10.998 11.469 11.986 12.527 13.11 13.76 14.514 15.358 16.209 17.208 18.299 19.528 20.921 22.683 24.868 27.526 29.689 30.922 31.63 31.991 32.158 32.23 32.253 32.216 32.12 32.027 31.937 31.832 31.718 31.603 31.478 31.329 31.188 31.046 30.896 30.74 30.598 30.441 30.283 30.165 30.042 29.895 29.729 29.559 29.439 29.319 29.127 28.982 28.826 28.742 28.57 28.391 28.184 28.076 27.963 27.74 27.618 27.468 27.136 26.954 26.764 26.557 26.306 25.967 25.488 23.827 -9 ,13014 ,TETRA ,17617996,Tue Nov 30 14:11:10 CET,Tue Nov 30 15:57:59 CET,0.0 2.307 2.747 3.105 3.41 3.637 3.853 4.073 4.44 4.611 4.775 5.046 5.212 5.348 5.618 5.881 6.137 6.26 6.496 6.71 7.005 7.202 7.39 7.663 7.924 8.175 8.429 8.685 9.018 9.34 9.648 10.017 10.389 10.746 11.16 11.622 12.056 12.555 13.093 13.68 14.322 15.053 15.934 16.852 17.93 19.104 20.469 21.977 23.838 26.131 28.841 30.984 32.061 32.627 32.924 33.086 33.181 33.228 33.24 33.22 33.174 33.085 32.975 32.857 32.722 32.601 32.482 32.349 32.223 32.112 31.97 31.835 31.708 31.563 31.441 31.316 31.189 31.049 30.887 30.768 30.645 30.42 30.254 30.108 30.029 29.838 29.642 29.433 29.316 29.202 28.954 28.815 28.667 28.348 28.175 27.961 27.719 27.457 27.12 26.678 24.448 -10 ,19122 ,TETRA ,17617997,Tue Nov 30 14:11:08 CET,Tue Nov 30 15:58:02 CET,0.0 1.521 1.987 2.344 2.638 2.902 3.135 3.331 3.671 3.834 3.997 4.279 4.452 4.585 4.85 5.114 5.356 5.475 5.706 5.929 6.254 6.458 6.656 6.942 7.232 7.51 7.776 8.044 8.383 8.691 8.992 9.37 9.74 10.081 10.477 10.939 11.376 11.871 12.446 13.079 13.714 14.403 15.231 16.093 17.141 18.332 19.698 21.265 23.082 25.19 27.718 29.656 30.766 31.373 31.692 31.86 31.955 31.994 31.936 31.832 31.733 31.627 31.502 31.364 31.235 31.114 30.977 30.832 30.689 30.547 30.407 30.276 30.142 30.008 29.887 29.747 29.596 29.456 29.316 29.218 29.11 28.933 28.799 28.64 28.555 28.375 28.193 28.003 27.896 27.776 27.522 27.381 27.237 26.922 26.728 26.526 26.306 26.047 25.716 25.18 23.208 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_252.txt deleted file mode 100644 index 02eb336f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_237_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12059 ,TETRA ,17617998,Tue Nov 30 14:11:10 CET,Tue Nov 30 15:58:26 CET,0.0 1.199 1.379 1.498 1.581 1.601 1.588 1.56 1.462 1.405 1.351 1.2 1.149 1.064 0.908 0.753 0.585 0.486 0.263 0.03 -0.334 -0.567 -0.8 -1.168 -1.558 -1.972 -2.379 -2.771 -3.291 -3.82 -4.367 -5.068 -5.763 -6.463 -7.312 -8.331 -9.381 -10.585 -11.971 -13.544 -15.284 -17.378 -20.006 -22.82 -26.307 -30.558 -35.955 -42.665 -51.462 -63.462 -81.118 -99.449 -112.799 -123.089 -131.205 -137.927 -143.453 -148.145 -151.957 -155.618 -158.654 -161.219 -163.585 -165.753 -167.698 -169.425 -171.166 -172.666 -173.946 -175.241 -176.536 -177.586 -178.651 -179.74 -180.568 -181.392 -182.216 -183.053 -183.914 -184.504 -185.096 -185.996 -186.603 -187.215 -187.525 -188.154 -188.797 -189.468 -189.811 -190.39 -190.875 -191.248 -191.635 -192.563 -193.101 -193.641 -194.215 -194.848 -195.541 -196.415 -198.659 -2 ,27022 ,TETRA ,17617999,Tue Nov 30 11:53:22 CET,Tue Nov 30 13:40:23 CET,0.0 0.773 0.958 1.066 1.106 1.112 1.092 1.057 0.957 0.893 0.825 0.642 0.585 0.494 0.318 0.142 -0.052 -0.15 -0.338 -0.534 -0.861 -1.089 -1.318 -1.661 -2.005 -2.363 -2.74 -3.136 -3.677 -4.209 -4.731 -5.38 -6.085 -6.83 -7.715 -8.725 -9.752 -10.977 -12.357 -13.935 -15.733 -17.848 -20.462 -23.294 -26.814 -31.069 -36.43 -43.032 -51.803 -63.921 -81.582 -99.826 -113.155 -123.383 -131.372 -138.076 -143.668 -148.369 -152.19 -155.881 -158.902 -161.463 -163.845 -166.015 -167.948 -169.674 -171.422 -172.926 -174.186 -175.473 -176.778 -177.828 -178.889 -179.952 -180.765 -181.585 -182.422 -183.281 -184.143 -184.724 -185.318 -186.246 -186.874 -187.503 -187.822 -188.48 -189.15 -189.812 -190.147 -190.719 -191.185 -191.553 -191.939 -192.762 -193.182 -193.601 -194.046 -194.577 -195.248 -196.135 -198.647 -3 ,31329 ,TETRA ,17618000,Tue Nov 30 11:53:20 CET,Tue Nov 30 13:40:16 CET,0.0 1.208 1.409 1.503 1.551 1.556 1.532 1.489 1.415 1.368 1.295 1.128 1.086 1.007 0.839 0.657 0.457 0.356 0.166 -0.03 -0.34 -0.553 -0.776 -1.135 -1.508 -1.883 -2.262 -2.647 -3.176 -3.698 -4.229 -4.937 -5.669 -6.403 -7.294 -8.351 -9.414 -10.618 -11.971 -13.512 -15.264 -17.339 -19.927 -22.766 -26.292 -30.529 -35.92 -42.645 -51.433 -63.471 -81.017 -99.075 -112.278 -122.498 -130.591 -137.328 -142.847 -147.511 -151.338 -154.978 -157.983 -160.559 -162.928 -165.102 -167.035 -168.739 -170.479 -172.002 -173.263 -174.537 -175.843 -176.892 -177.958 -179.037 -179.858 -180.681 -181.509 -182.352 -183.21 -183.793 -184.39 -185.366 -186.076 -186.835 -187.235 -188.047 -188.873 -189.713 -190.143 -190.872 -191.497 -191.967 -192.448 -193.426 -193.96 -194.554 -195.159 -195.847 -196.614 -197.528 -199.824 -4 ,9898 ,TETRA ,17618001,Tue Nov 30 11:53:20 CET,Tue Nov 30 13:40:29 CET,0.0 0.683 0.882 0.973 1.005 1.022 1.015 0.984 0.879 0.824 0.77 0.621 0.572 0.478 0.263 0.063 -0.106 -0.193 -0.375 -0.552 -0.844 -1.061 -1.293 -1.652 -2.013 -2.374 -2.75 -3.131 -3.649 -4.197 -4.742 -5.433 -6.15 -6.845 -7.699 -8.75 -9.808 -11.038 -12.442 -14.002 -15.721 -17.773 -20.375 -23.199 -26.719 -31.008 -36.448 -43.259 -52.125 -64.073 -81.661 -99.796 -113.057 -123.367 -131.488 -138.219 -143.741 -148.432 -152.31 -156.05 -159.11 -161.713 -164.106 -166.286 -168.224 -169.919 -171.651 -173.155 -174.417 -175.695 -176.988 -178.069 -179.179 -180.261 -181.064 -181.885 -182.723 -183.568 -184.414 -185.063 -185.792 -186.876 -187.615 -188.36 -188.737 -189.525 -190.337 -191.162 -191.576 -192.28 -192.848 -193.281 -193.725 -194.666 -195.165 -195.671 -196.216 -196.793 -197.416 -198.158 -199.864 -5 ,28330 ,TETRA ,17618002,Tue Nov 30 11:53:20 CET,Tue Nov 30 13:40:30 CET,0.0 1.162 1.403 1.525 1.582 1.602 1.608 1.6 1.555 1.507 1.438 1.246 1.184 1.097 0.923 0.715 0.485 0.371 0.161 -0.041 -0.374 -0.61 -0.859 -1.24 -1.619 -1.986 -2.358 -2.757 -3.305 -3.855 -4.401 -5.103 -5.837 -6.581 -7.481 -8.538 -9.615 -10.855 -12.244 -13.81 -15.574 -17.708 -20.334 -23.145 -26.694 -31.015 -36.454 -43.159 -51.995 -64.064 -81.786 -100.11 -113.282 -123.403 -131.484 -138.232 -143.747 -148.433 -152.312 -156.045 -159.102 -161.679 -164.035 -166.222 -168.199 -169.925 -171.655 -173.153 -174.417 -175.694 -176.991 -178.058 -179.137 -180.207 -181.079 -182.043 -183.067 -184.151 -185.23 -185.929 -186.655 -187.765 -188.498 -189.255 -189.631 -190.382 -191.16 -191.946 -192.362 -193.076 -193.672 -194.132 -194.591 -195.555 -196.075 -196.625 -197.216 -197.853 -198.564 -199.443 -201.501 -6 ,11151 ,TETRA ,17618003,Tue Nov 30 11:53:20 CET,Tue Nov 30 13:42:34 CET,0.0 0.669 0.823 0.911 0.916 0.899 0.871 0.827 0.734 0.681 0.62 0.474 0.438 0.362 0.186 -0.004 -0.202 -0.302 -0.517 -0.734 -1.067 -1.303 -1.552 -1.929 -2.313 -2.723 -3.129 -3.527 -4.073 -4.63 -5.183 -5.891 -6.621 -7.353 -8.256 -9.316 -10.381 -11.619 -12.993 -14.513 -16.241 -18.344 -20.929 -23.725 -27.246 -31.487 -36.852 -43.529 -52.294 -64.325 -81.907 -100.064 -113.313 -123.526 -131.613 -138.418 -143.992 -148.675 -152.522 -156.22 -159.289 -161.912 -164.304 -166.495 -168.454 -170.181 -171.943 -173.46 -174.734 -176.033 -177.325 -178.36 -179.437 -180.534 -181.359 -182.191 -183.018 -183.847 -184.721 -185.316 -185.912 -186.827 -187.448 -188.081 -188.395 -189.032 -189.692 -190.352 -190.693 -191.293 -191.818 -192.203 -192.589 -193.396 -193.841 -194.358 -194.951 -195.621 -196.359 -197.242 -199.6 -7 ,6606 ,TETRA ,17618004,Tue Nov 30 11:53:21 CET,Tue Nov 30 13:40:51 CET,0.0 0.782 0.944 1.002 1.035 1.057 1.056 1.043 0.976 0.915 0.843 0.669 0.604 0.521 0.359 0.174 -0.026 -0.125 -0.324 -0.548 -0.885 -1.11 -1.355 -1.718 -2.079 -2.429 -2.777 -3.137 -3.664 -4.232 -4.806 -5.512 -6.201 -6.904 -7.755 -8.741 -9.771 -10.994 -12.372 -13.95 -15.709 -17.799 -20.415 -23.206 -26.729 -30.996 -36.379 -43.078 -51.923 -64.04 -81.623 -99.794 -113.012 -123.311 -131.468 -138.173 -143.65 -148.311 -152.121 -155.786 -158.802 -161.366 -163.758 -165.943 -167.911 -169.643 -171.362 -172.861 -174.134 -175.417 -176.72 -177.789 -178.872 -179.975 -180.8 -181.619 -182.45 -183.31 -184.178 -184.767 -185.37 -186.267 -186.863 -187.469 -187.786 -188.497 -189.292 -190.106 -190.52 -191.242 -191.846 -192.3 -192.784 -193.81 -194.336 -194.893 -195.503 -196.15 -196.809 -197.598 -200.379 -8 ,30940 ,TETRA ,17618005,Tue Nov 30 11:53:22 CET,Tue Nov 30 13:41:41 CET,0.0 0.767 0.914 0.976 1.001 1.008 1.004 0.979 0.872 0.821 0.774 0.607 0.551 0.468 0.287 0.095 -0.114 -0.224 -0.441 -0.671 -1.015 -1.228 -1.447 -1.812 -2.197 -2.595 -2.985 -3.379 -3.936 -4.482 -5.014 -5.705 -6.43 -7.16 -8.019 -9.027 -10.069 -11.285 -12.671 -14.231 -15.997 -18.109 -20.717 -23.55 -27.142 -31.481 -36.885 -43.579 -52.454 -64.539 -82.225 -100.512 -113.779 -124.038 -132.126 -138.847 -144.386 -149.051 -152.883 -156.569 -159.549 -162.104 -164.495 -166.686 -168.636 -170.344 -172.072 -173.568 -174.839 -176.129 -177.436 -178.488 -179.543 -180.638 -181.491 -182.347 -183.192 -184.03 -184.991 -185.716 -186.438 -187.535 -188.289 -189.048 -189.433 -190.214 -191.0 -191.797 -192.224 -192.963 -193.582 -194.035 -194.488 -195.438 -195.96 -196.494 -197.026 -197.609 -198.283 -199.113 -201.48 -9 ,9265 ,TETRA ,17618006,Tue Nov 30 11:53:20 CET,Tue Nov 30 13:40:58 CET,0.0 0.724 0.86 0.903 0.917 0.926 0.904 0.88 0.787 0.716 0.637 0.44 0.389 0.306 0.103 -0.099 -0.278 -0.372 -0.579 -0.779 -1.088 -1.321 -1.57 -1.949 -2.32 -2.699 -3.105 -3.523 -4.082 -4.644 -5.214 -5.944 -6.687 -7.436 -8.316 -9.354 -10.428 -11.646 -13.008 -14.546 -16.253 -18.326 -20.944 -23.773 -27.287 -31.496 -36.86 -43.635 -52.622 -64.806 -82.409 -100.568 -113.801 -123.977 -132.052 -138.823 -144.372 -149.055 -152.876 -156.526 -159.51 -162.08 -164.462 -166.625 -168.583 -170.329 -172.104 -173.616 -174.871 -176.151 -177.463 -178.532 -179.581 -180.633 -181.443 -182.257 -183.084 -183.924 -184.789 -185.37 -185.944 -186.818 -187.422 -188.042 -188.383 -189.147 -189.967 -190.814 -191.236 -191.955 -192.534 -192.986 -193.467 -194.423 -194.928 -195.478 -196.049 -196.652 -197.381 -198.239 -200.311 -10 ,12880 ,TETRA ,17618007,Tue Nov 30 11:54:24 CET,Tue Nov 30 13:42:45 CET,0.0 0.931 1.049 1.099 1.122 1.128 1.104 1.086 1.046 0.994 0.927 0.754 0.7 0.625 0.476 0.303 0.11 0.009 -0.191 -0.394 -0.727 -0.95 -1.179 -1.555 -1.928 -2.285 -2.657 -3.044 -3.578 -4.13 -4.682 -5.378 -6.081 -6.797 -7.66 -8.677 -9.728 -10.965 -12.339 -13.866 -15.605 -17.734 -20.426 -23.307 -26.866 -31.118 -36.462 -43.187 -52.082 -63.992 -81.292 -99.411 -112.728 -123.011 -131.097 -137.805 -143.316 -148.037 -151.942 -155.62 -158.648 -161.249 -163.621 -165.796 -167.757 -169.481 -171.219 -172.735 -174.018 -175.315 -176.622 -177.66 -178.707 -179.782 -180.598 -181.429 -182.283 -183.161 -184.047 -184.634 -185.226 -186.149 -186.775 -187.394 -187.705 -188.343 -188.999 -189.672 -190.014 -190.598 -191.062 -191.421 -191.795 -192.585 -193.004 -193.437 -193.902 -194.404 -195.065 -196.018 -198.787 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_23_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_23_1.txt deleted file mode 100644 index af9a2703..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_23_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27003 ,TETRA ,17618008,Tue Nov 30 11:54:24 CET,Tue Nov 30 13:40:02 CET,0.0 1.21 1.55 1.811 2.051 2.264 2.449 2.607 2.886 3.03 3.16 3.349 3.533 3.653 3.877 4.081 4.289 4.389 4.564 4.732 4.954 5.079 5.21 5.421 5.634 5.823 5.996 6.162 6.393 6.609 6.809 7.048 7.261 7.47 7.713 7.978 8.238 8.524 8.818 9.112 9.402 9.723 10.108 10.491 10.928 11.409 11.94 12.486 13.003 13.461 13.718 13.54 13.137 12.672 12.221 11.795 11.409 11.007 10.648 10.272 9.946 9.63 9.318 9.049 8.817 8.565 8.296 8.092 7.91 7.699 7.469 7.279 7.084 6.884 6.729 6.579 6.423 6.242 6.043 5.905 5.754 5.507 5.332 5.166 5.089 4.916 4.735 4.532 4.417 4.242 4.023 3.891 3.762 3.479 3.331 3.176 3.009 2.802 2.518 2.12 0.674 -2 ,27055 ,TETRA ,17618009,Tue Nov 30 11:54:24 CET,Tue Nov 30 13:45:55 CET,0.0 1.007 1.335 1.626 1.86 2.061 2.234 2.379 2.607 2.718 2.832 2.984 3.149 3.25 3.445 3.642 3.827 3.913 4.081 4.246 4.476 4.638 4.794 4.992 5.19 5.412 5.614 5.784 5.985 6.179 6.392 6.636 6.862 7.091 7.363 7.658 7.924 8.214 8.506 8.828 9.186 9.572 9.985 10.383 10.829 11.265 11.734 12.22 12.713 13.14 13.364 13.256 12.866 12.408 11.943 11.49 11.083 10.703 10.372 10.027 9.713 9.361 8.999 8.699 8.42 8.141 7.842 7.604 7.393 7.148 6.889 6.68 6.492 6.299 6.135 5.944 5.736 5.535 5.334 5.2 5.049 4.818 4.66 4.477 4.396 4.244 4.069 3.875 3.768 3.607 3.444 3.327 3.197 2.915 2.759 2.561 2.333 2.096 1.814 1.477 0.394 -3 ,3832 ,TETRA ,17618010,Tue Nov 30 11:54:24 CET,Tue Nov 30 13:41:44 CET,0.0 1.351 1.774 2.069 2.324 2.524 2.714 2.886 3.16 3.298 3.432 3.597 3.758 3.87 4.08 4.271 4.453 4.535 4.712 4.886 5.101 5.237 5.364 5.575 5.782 5.963 6.151 6.331 6.55 6.756 6.937 7.155 7.381 7.586 7.806 8.05 8.291 8.556 8.822 9.122 9.453 9.796 10.186 10.578 11.02 11.454 11.886 12.372 12.929 13.449 13.752 13.533 13.118 12.664 12.2 11.778 11.396 11.043 10.747 10.434 10.129 9.797 9.472 9.21 8.973 8.724 8.44 8.191 7.999 7.8 7.586 7.411 7.233 7.053 6.914 6.765 6.608 6.444 6.263 6.136 6.011 5.811 5.663 5.508 5.425 5.245 5.063 4.865 4.758 4.603 4.417 4.281 4.143 3.842 3.678 3.502 3.308 3.088 2.804 2.423 1.469 -4 ,28920 ,TETRA ,17618011,Tue Nov 30 11:54:24 CET,Tue Nov 30 13:41:58 CET,0.0 1.263 1.588 1.83 2.032 2.235 2.425 2.597 2.91 3.052 3.186 3.398 3.583 3.696 3.923 4.149 4.348 4.436 4.602 4.766 5.006 5.161 5.316 5.543 5.75 5.939 6.125 6.298 6.501 6.697 6.899 7.141 7.358 7.57 7.807 8.072 8.338 8.608 8.907 9.236 9.562 9.927 10.318 10.689 11.108 11.537 12.041 12.568 13.059 13.476 13.664 13.411 12.99 12.525 12.035 11.546 11.101 10.714 10.375 9.999 9.674 9.412 9.147 8.889 8.659 8.428 8.179 7.955 7.734 7.479 7.235 7.036 6.816 6.582 6.392 6.209 6.036 5.84 5.629 5.498 5.357 5.124 4.971 4.797 4.702 4.501 4.295 4.097 3.998 3.841 3.635 3.494 3.337 2.992 2.815 2.618 2.401 2.145 1.831 1.49 0.44 -5 ,7199 ,TETRA ,17618012,Tue Nov 30 11:55:21 CET,Tue Nov 30 13:41:16 CET,0.0 1.458 1.82 2.086 2.322 2.525 2.701 2.862 3.132 3.249 3.361 3.543 3.724 3.842 4.043 4.223 4.395 4.487 4.673 4.839 5.085 5.229 5.362 5.551 5.738 5.94 6.137 6.326 6.548 6.745 6.936 7.166 7.388 7.596 7.84 8.137 8.411 8.685 8.974 9.302 9.639 9.982 10.36 10.694 11.096 11.532 11.987 12.464 12.975 13.452 13.748 13.604 13.274 12.922 12.541 12.144 11.735 11.354 11.048 10.711 10.414 10.153 9.864 9.588 9.353 9.136 8.907 8.703 8.523 8.326 8.119 7.951 7.746 7.532 7.376 7.202 7.008 6.817 6.639 6.505 6.346 6.083 5.913 5.748 5.66 5.482 5.281 5.057 4.944 4.777 4.59 4.455 4.306 3.964 3.788 3.611 3.389 3.15 2.886 2.458 0.953 -6 ,31817 ,TETRA ,17618013,Tue Nov 30 11:55:21 CET,Tue Nov 30 13:42:54 CET,0.0 1.196 1.524 1.775 1.988 2.176 2.351 2.511 2.791 2.928 3.063 3.265 3.442 3.548 3.75 3.961 4.149 4.239 4.434 4.622 4.88 5.044 5.201 5.412 5.601 5.767 5.926 6.077 6.273 6.492 6.729 7.01 7.27 7.505 7.763 8.039 8.286 8.551 8.821 9.107 9.428 9.795 10.217 10.599 10.996 11.446 11.934 12.419 12.882 13.27 13.51 13.347 12.921 12.411 11.936 11.466 11.046 10.68 10.34 9.965 9.662 9.396 9.111 8.832 8.57 8.34 8.096 7.858 7.651 7.433 7.21 7.023 6.821 6.635 6.486 6.301 6.105 5.901 5.686 5.54 5.404 5.218 5.075 4.917 4.84 4.666 4.457 4.231 4.123 3.97 3.796 3.682 3.558 3.283 3.124 2.927 2.711 2.48 2.189 1.804 0.523 -7 ,6194 ,TETRA ,17618014,Tue Nov 30 11:55:21 CET,Tue Nov 30 13:43:16 CET,0.0 1.277 1.696 1.984 2.218 2.426 2.627 2.8 3.087 3.219 3.348 3.532 3.693 3.795 4.0 4.193 4.379 4.469 4.638 4.791 5.007 5.143 5.283 5.51 5.72 5.908 6.09 6.267 6.497 6.705 6.906 7.167 7.416 7.65 7.894 8.153 8.421 8.716 8.998 9.28 9.577 9.907 10.27 10.623 11.036 11.502 12.002 12.486 13.019 13.558 13.841 13.54 13.043 12.585 12.137 11.686 11.27 10.877 10.508 10.147 9.829 9.546 9.27 8.972 8.706 8.491 8.245 8.012 7.811 7.603 7.401 7.229 7.048 6.86 6.698 6.532 6.375 6.212 6.026 5.892 5.759 5.546 5.395 5.228 5.133 4.936 4.745 4.551 4.456 4.301 4.112 3.997 3.87 3.59 3.434 3.256 3.054 2.829 2.552 2.207 1.113 -8 ,25782 ,TETRA ,17618015,Tue Nov 30 11:55:21 CET,Tue Nov 30 13:43:54 CET,0.0 1.32 1.702 2.013 2.252 2.451 2.636 2.811 3.089 3.201 3.313 3.483 3.661 3.784 4.001 4.207 4.409 4.501 4.672 4.845 5.087 5.247 5.401 5.61 5.823 6.035 6.221 6.387 6.6 6.806 7.003 7.236 7.443 7.641 7.884 8.179 8.457 8.749 9.075 9.398 9.707 10.042 10.439 10.834 11.254 11.702 12.194 12.669 13.153 13.602 13.859 13.695 13.359 12.917 12.435 11.984 11.565 11.144 10.713 10.279 9.941 9.656 9.39 9.125 8.851 8.608 8.355 8.127 7.933 7.744 7.546 7.354 7.147 6.921 6.741 6.58 6.432 6.261 6.058 5.906 5.75 5.527 5.368 5.194 5.111 4.938 4.749 4.543 4.439 4.291 4.125 3.997 3.856 3.539 3.372 3.185 2.965 2.718 2.425 2.08 0.946 -9 ,20327 ,TETRA ,17618016,Tue Nov 30 11:55:21 CET,Tue Nov 30 13:46:56 CET,0.0 1.29 1.692 1.962 2.182 2.392 2.579 2.747 3.049 3.185 3.318 3.521 3.698 3.802 3.978 4.149 4.309 4.393 4.562 4.713 4.929 5.065 5.204 5.406 5.587 5.784 5.978 6.153 6.373 6.562 6.735 6.952 7.165 7.37 7.597 7.856 8.118 8.384 8.647 8.94 9.256 9.617 10.05 10.446 10.876 11.341 11.804 12.259 12.736 13.18 13.384 13.185 12.805 12.349 11.871 11.413 10.994 10.612 10.271 9.909 9.58 9.288 8.993 8.733 8.506 8.274 7.996 7.745 7.551 7.335 7.118 6.942 6.754 6.552 6.375 6.191 5.999 5.813 5.638 5.51 5.375 5.165 5.004 4.823 4.733 4.565 4.395 4.197 4.084 3.916 3.732 3.6 3.458 3.158 3.002 2.847 2.681 2.484 2.239 1.834 0.511 -10 ,6205 ,TETRA ,17618017,Tue Nov 30 11:55:21 CET,Tue Nov 30 13:45:34 CET,0.0 1.233 1.625 1.922 2.156 2.35 2.523 2.685 2.979 3.114 3.237 3.407 3.574 3.682 3.885 4.066 4.227 4.31 4.49 4.664 4.893 5.038 5.172 5.349 5.52 5.7 5.882 6.069 6.288 6.484 6.687 6.939 7.174 7.387 7.623 7.887 8.128 8.4 8.695 8.985 9.278 9.618 10.016 10.377 10.749 11.15 11.627 12.156 12.613 12.977 13.276 13.23 12.892 12.513 12.131 11.741 11.385 11.015 10.674 10.32 9.994 9.711 9.45 9.195 8.953 8.73 8.442 8.156 7.953 7.763 7.553 7.363 7.159 6.95 6.773 6.588 6.419 6.262 6.088 5.963 5.816 5.553 5.379 5.203 5.123 4.973 4.79 4.584 4.487 4.342 4.168 4.037 3.895 3.562 3.385 3.205 3.01 2.782 2.474 2.09 0.737 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_251_256.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_251_256.txt deleted file mode 100644 index c863c2d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_251_256.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25069 ,TETRA ,17618018,Tue Nov 30 11:56:23 CET,Tue Nov 30 13:45:20 CET,0.0 1.013 1.299 1.527 1.725 1.874 2.001 2.097 2.239 2.307 2.367 2.305 2.553 2.614 2.717 2.799 2.859 2.9 2.989 3.059 3.132 3.163 3.188 3.232 3.28 3.313 3.326 3.322 3.318 3.324 3.315 3.29 3.239 3.209 3.177 3.062 2.932 2.787 2.612 2.374 2.085 1.693 1.215 0.694 -0.012 -0.9 -2.081 -3.591 -5.678 -8.726 -13.403 -18.603 -22.578 -25.749 -28.367 -30.595 -32.482 -34.149 -35.549 -36.928 -38.077 -39.07 -40.011 -40.857 -41.62 -42.314 -43.04 -43.697 -44.267 -44.859 -45.451 -45.931 -46.425 -46.921 -47.309 -47.705 -48.118 -48.545 -48.972 -49.247 -49.534 -50.008 -50.316 -50.631 -50.802 -51.141 -51.471 -51.852 -52.058 -52.505 -52.69 -52.914 -53.146 -53.659 -53.932 -54.24 -54.598 -55.01 -55.484 -56.164 -58.905 -2 ,10011 ,TETRA ,17618019,Tue Nov 30 11:55:21 CET,Tue Nov 30 13:45:15 CET,0.0 1.124 1.465 1.689 1.86 2.004 2.127 2.252 2.489 2.591 2.671 2.603 2.828 2.869 2.963 3.047 3.103 3.129 3.177 3.219 3.296 3.338 3.376 3.419 3.431 3.444 3.457 3.449 3.433 3.417 3.385 3.352 3.323 3.274 3.196 3.093 2.981 2.844 2.666 2.433 2.147 1.809 1.379 0.859 0.142 -0.775 -1.967 -3.512 -5.628 -8.678 -13.37 -18.466 -22.412 -25.585 -28.182 -30.434 -32.329 -33.958 -35.307 -36.606 -37.715 -38.679 -39.579 -40.452 -41.249 -41.924 -42.624 -43.264 -43.791 -44.329 -44.878 -45.346 -45.834 -46.326 -46.707 -47.191 -47.789 -48.413 -49.061 -49.498 -49.952 -50.64 -51.095 -51.554 -51.791 -52.275 -52.779 -53.316 -53.595 -54.18 -54.485 -54.79 -55.113 -55.785 -56.144 -56.519 -56.905 -57.334 -57.889 -58.613 -60.739 -3 ,30798 ,TETRA ,17618020,Tue Nov 30 11:55:22 CET,Tue Nov 30 13:43:18 CET,0.0 0.929 1.18 1.359 1.52 1.665 1.813 1.958 2.206 2.301 2.372 2.323 2.565 2.625 2.739 2.816 2.872 2.907 2.974 3.033 3.09 3.113 3.129 3.164 3.201 3.222 3.231 3.242 3.281 3.289 3.276 3.258 3.197 3.127 3.065 2.976 2.852 2.712 2.549 2.333 2.072 1.774 1.354 0.807 0.093 -0.773 -1.914 -3.424 -5.476 -8.431 -13.017 -18.007 -21.843 -24.91 -27.396 -29.516 -31.284 -32.872 -34.214 -35.52 -36.621 -37.592 -38.529 -39.43 -40.262 -40.983 -41.737 -42.377 -42.905 -43.446 -44.011 -44.507 -45.031 -45.569 -45.982 -46.406 -46.826 -47.236 -47.664 -47.961 -48.253 -48.69 -48.998 -49.328 -49.501 -49.872 -50.265 -50.65 -50.852 -51.308 -51.511 -51.749 -51.99 -52.471 -52.722 -53.01 -53.348 -53.782 -54.324 -55.027 -57.385 -4 ,3100 ,TETRA ,17618021,Tue Nov 30 11:55:22 CET,Tue Nov 30 13:44:00 CET,0.0 0.778 1.074 1.319 1.516 1.681 1.81 1.909 2.079 2.164 2.253 2.229 2.474 2.532 2.637 2.728 2.8 2.826 2.868 2.906 2.947 2.972 2.998 3.035 3.081 3.112 3.125 3.126 3.114 3.082 3.037 2.978 2.927 2.873 2.776 2.631 2.479 2.314 2.115 1.932 1.71 1.346 0.859 0.318 -0.384 -1.259 -2.411 -3.928 -6.012 -8.925 -13.411 -18.371 -22.208 -25.274 -27.768 -29.922 -31.736 -33.304 -34.642 -35.952 -37.11 -38.141 -39.04 -39.866 -40.641 -41.317 -41.995 -42.579 -43.097 -43.651 -44.235 -44.702 -45.156 -45.615 -45.971 -46.361 -46.759 -47.175 -47.594 -47.881 -48.2 -48.668 -48.979 -49.309 -49.475 -49.812 -50.18 -50.583 -50.783 -51.296 -51.608 -51.921 -52.255 -52.972 -53.355 -53.791 -54.296 -54.818 -55.377 -56.121 -58.648 -5 ,17111 ,TETRA ,17618022,Tue Nov 30 11:56:23 CET,Tue Nov 30 13:43:00 CET,0.0 1.006 1.391 1.637 1.825 1.963 2.066 2.161 2.363 2.46 2.54 2.5 2.743 2.794 2.9 2.996 3.067 3.089 3.122 3.166 3.238 3.28 3.307 3.325 3.341 3.353 3.361 3.355 3.358 3.361 3.339 3.304 3.263 3.198 3.099 2.985 2.859 2.686 2.477 2.283 2.041 1.686 1.22 0.708 0.022 -0.875 -2.058 -3.627 -5.744 -8.725 -13.316 -18.339 -22.273 -25.493 -28.132 -30.368 -32.235 -33.836 -35.153 -36.457 -37.545 -38.487 -39.394 -40.241 -41.013 -41.709 -42.433 -43.059 -43.584 -44.144 -44.703 -45.135 -45.599 -46.08 -46.468 -46.894 -47.319 -47.734 -48.153 -48.433 -48.714 -49.165 -49.487 -49.832 -49.998 -50.316 -50.67 -51.071 -51.316 -51.889 -52.183 -52.502 -52.837 -53.546 -53.9 -54.263 -54.681 -55.166 -55.728 -56.399 -57.908 -6 ,2025 ,TETRA ,17618023,Tue Nov 30 11:55:21 CET,Tue Nov 30 13:42:07 CET,0.0 1.12 1.482 1.748 1.949 2.102 2.223 2.329 2.51 2.589 2.668 2.633 2.878 2.943 3.093 3.224 3.318 3.367 3.463 3.54 3.626 3.683 3.743 3.804 3.866 3.932 3.985 4.036 4.069 4.083 4.097 4.09 4.073 4.052 4.029 3.968 3.885 3.775 3.589 3.398 3.223 2.997 2.611 2.128 1.575 0.885 -0.128 -1.555 -3.548 -6.432 -11.015 -16.049 -19.849 -23.027 -25.715 -27.977 -29.785 -31.372 -32.767 -34.125 -35.245 -36.187 -37.077 -37.915 -38.657 -39.327 -40.021 -40.618 -41.136 -41.682 -42.249 -42.7 -43.16 -43.652 -44.041 -44.426 -44.917 -45.57 -46.223 -46.668 -47.149 -47.86 -48.336 -48.831 -49.073 -49.569 -50.108 -50.643 -50.916 -51.5 -51.804 -52.111 -52.448 -53.149 -53.512 -53.93 -54.361 -54.812 -55.335 -56.041 -58.219 -7 ,26623 ,TETRA ,17618024,Tue Nov 30 11:56:26 CET,Tue Nov 30 13:43:12 CET,0.0 0.954 1.26 1.481 1.67 1.822 1.941 2.032 2.196 2.275 2.343 2.297 2.554 2.615 2.703 2.781 2.854 2.89 2.971 3.036 3.1 3.133 3.16 3.197 3.227 3.261 3.296 3.314 3.306 3.31 3.331 3.31 3.262 3.203 3.109 2.991 2.862 2.718 2.534 2.321 2.062 1.719 1.279 0.733 0.015 -0.877 -2.069 -3.597 -5.696 -8.761 -13.422 -18.525 -22.476 -25.677 -28.287 -30.508 -32.353 -33.961 -35.322 -36.689 -37.849 -38.816 -39.697 -40.525 -41.296 -41.971 -42.702 -43.355 -43.884 -44.438 -45.014 -45.476 -45.945 -46.442 -46.811 -47.186 -47.566 -47.933 -48.339 -48.632 -48.915 -49.352 -49.652 -49.968 -50.143 -50.506 -50.87 -51.263 -51.467 -51.908 -52.086 -52.305 -52.539 -53.044 -53.322 -53.625 -53.955 -54.308 -54.742 -55.346 -57.31 -8 ,14307 ,TETRA ,17618025,Tue Nov 30 11:56:23 CET,Tue Nov 30 13:46:25 CET,0.0 0.835 1.104 1.303 1.463 1.618 1.755 1.866 2.058 2.15 2.235 2.202 2.445 2.511 2.64 2.737 2.824 2.871 2.944 3.001 3.091 3.14 3.173 3.236 3.308 3.36 3.406 3.44 3.446 3.458 3.463 3.469 3.46 3.388 3.302 3.219 3.137 3.041 2.896 2.682 2.422 2.088 1.629 1.109 0.409 -0.481 -1.635 -3.127 -5.208 -8.245 -12.978 -18.112 -22.089 -25.356 -28.0 -30.211 -32.089 -33.779 -35.154 -36.47 -37.597 -38.563 -39.463 -40.305 -41.081 -41.774 -42.462 -43.068 -43.599 -44.159 -44.754 -45.251 -45.759 -46.267 -46.649 -47.033 -47.44 -47.833 -48.208 -48.488 -48.791 -49.253 -49.586 -49.951 -50.141 -50.604 -51.156 -51.714 -51.995 -52.581 -52.876 -53.197 -53.52 -54.183 -54.552 -54.925 -55.331 -55.837 -56.419 -57.121 -59.261 -9 ,21186 ,TETRA ,17618026,Tue Nov 30 11:56:23 CET,Tue Nov 30 13:44:35 CET,0.0 0.945 1.279 1.481 1.629 1.751 1.852 1.958 2.144 2.218 2.285 2.225 2.469 2.52 2.616 2.711 2.798 2.837 2.913 2.959 2.984 3.003 3.029 3.065 3.107 3.139 3.144 3.141 3.132 3.097 3.048 3.009 2.971 2.902 2.802 2.682 2.566 2.42 2.243 2.042 1.811 1.53 1.1 0.564 -0.147 -1.023 -2.162 -3.655 -5.757 -8.801 -13.487 -18.657 -22.588 -25.649 -28.189 -30.419 -32.295 -33.939 -35.324 -36.651 -37.775 -38.753 -39.684 -40.554 -41.325 -42.034 -42.787 -43.445 -43.993 -44.558 -45.131 -45.611 -46.105 -46.599 -46.964 -47.32 -47.7 -48.098 -48.514 -48.807 -49.111 -49.582 -49.899 -50.216 -50.378 -50.72 -51.069 -51.45 -51.69 -52.251 -52.523 -52.823 -53.14 -53.844 -54.226 -54.626 -55.057 -55.521 -56.081 -56.774 -58.967 -10 ,30049 ,TETRA ,17618027,Tue Nov 30 11:56:24 CET,Tue Nov 30 13:46:45 CET,0.0 0.886 1.29 1.492 1.645 1.77 1.885 2.013 2.211 2.295 2.387 2.359 2.585 2.634 2.721 2.793 2.868 2.897 2.942 2.981 3.053 3.117 3.164 3.205 3.222 3.244 3.278 3.296 3.296 3.266 3.22 3.171 3.114 3.055 2.981 2.883 2.783 2.654 2.46 2.212 1.946 1.615 1.144 0.605 -0.075 -0.923 -2.045 -3.495 -5.514 -8.433 -12.929 -17.857 -21.616 -24.679 -27.23 -29.444 -31.247 -32.744 -34.022 -35.306 -36.379 -37.351 -38.286 -39.11 -39.859 -40.544 -41.236 -41.867 -42.425 -42.976 -43.544 -44.02 -44.51 -44.997 -45.373 -45.773 -46.164 -46.552 -47.018 -47.388 -47.794 -48.467 -48.924 -49.398 -49.636 -50.111 -50.601 -51.125 -51.403 -51.987 -52.299 -52.601 -52.905 -53.544 -53.89 -54.276 -54.686 -55.115 -55.611 -56.305 -58.218 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_155.txt deleted file mode 100644 index 0cb25df9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7509 ,TETRA ,17618028,Tue Nov 30 11:56:26 CET,Tue Nov 30 13:46:59 CET,0.0 2.314 3.135 3.794 4.371 4.903 5.419 5.912 6.836 7.306 7.767 8.326 9.024 9.433 10.156 10.78 11.385 11.678 12.264 12.85 13.703 14.253 14.797 15.607 16.369 17.108 17.86 18.613 19.624 20.634 21.639 22.867 24.062 25.239 26.625 28.231 29.811 31.597 33.587 35.768 38.125 40.896 44.272 47.76 52.012 57.02 63.18 70.55 79.789 91.696 108.056 124.061 135.091 143.199 149.339 154.267 158.179 161.432 164.022 166.428 168.363 169.975 171.429 172.703 173.815 174.792 175.754 176.544 177.193 177.837 178.465 178.969 179.459 179.94 180.289 180.627 180.95 181.259 181.586 181.782 181.978 182.289 182.483 182.667 182.76 182.94 183.08 183.209 183.266 183.262 183.37 183.409 183.456 183.519 183.527 183.521 183.464 183.369 183.254 183.009 181.75 -2 ,14101 ,TETRA ,17618029,Tue Nov 30 11:56:23 CET,Tue Nov 30 13:43:27 CET,0.0 1.755 2.599 3.324 3.96 4.543 5.094 5.569 6.344 6.713 7.07 7.518 8.08 8.398 9.022 9.641 10.252 10.554 11.136 11.717 12.577 13.13 13.675 14.485 15.293 16.085 16.863 17.626 18.609 19.584 20.554 21.741 22.907 24.055 25.422 27.032 28.634 30.421 32.403 34.596 36.935 39.619 42.919 46.431 50.698 55.644 61.712 69.041 78.253 90.186 106.629 122.598 133.517 141.562 147.723 152.668 156.576 159.764 162.309 164.684 166.605 168.232 169.673 170.934 172.013 172.959 173.932 174.744 175.393 176.023 176.624 177.098 177.581 178.035 178.356 178.699 179.029 179.343 179.666 179.876 180.075 180.337 180.507 180.686 180.776 180.952 181.103 181.241 181.316 181.337 181.497 181.547 181.582 181.608 181.591 181.556 181.52 181.432 181.256 180.999 180.091 -3 ,23052 ,TETRA ,17618030,Tue Nov 30 11:56:26 CET,Tue Nov 30 13:33:53 CET,0.0 2.483 3.367 4.097 4.752 5.317 5.784 6.202 6.972 7.321 7.663 8.08 8.632 8.945 9.571 10.213 10.852 11.164 11.762 12.335 13.176 13.726 14.272 15.087 15.89 16.667 17.438 18.195 19.19 20.184 21.154 22.34 23.521 24.71 26.131 27.749 29.331 31.102 33.086 35.289 37.684 40.447 43.757 47.238 51.536 56.602 62.713 69.984 79.184 91.206 107.771 123.789 134.773 142.867 149.028 153.971 157.878 161.105 163.698 166.109 167.987 169.534 170.949 172.223 173.333 174.288 175.216 176.017 176.697 177.359 178.0 178.481 178.948 179.427 179.775 180.109 180.422 180.712 181.0 181.185 181.369 181.639 181.797 181.961 182.051 182.188 182.32 182.484 182.565 182.585 182.735 182.784 182.832 182.901 182.915 182.898 182.844 182.789 182.674 182.403 181.305 -4 ,11591 ,TETRA ,17618031,Tue Nov 30 11:56:24 CET,Tue Nov 30 13:44:55 CET,0.0 2.029 2.846 3.538 4.148 4.707 5.168 5.565 6.328 6.687 7.034 7.472 8.029 8.342 8.977 9.595 10.196 10.493 11.067 11.631 12.471 13.021 13.563 14.373 15.181 15.975 16.762 17.549 18.577 19.594 20.581 21.755 22.916 24.081 25.475 27.102 28.723 30.54 32.543 34.753 37.138 39.902 43.253 46.749 51.057 56.098 62.2 69.544 78.825 90.886 107.456 123.455 134.425 142.542 148.733 153.706 157.643 160.888 163.453 165.849 167.805 169.449 170.868 172.109 173.215 174.159 175.096 175.876 176.495 177.111 177.723 178.205 178.681 179.126 179.442 179.767 180.091 180.416 180.754 180.972 181.168 181.433 181.596 181.754 181.832 181.981 182.115 182.242 182.307 182.326 182.485 182.504 182.507 182.518 182.507 182.499 182.477 182.436 182.326 182.097 181.122 -5 ,30996 ,TETRA ,17618032,Tue Nov 30 11:56:24 CET,Tue Nov 30 13:46:52 CET,0.0 2.114 2.915 3.558 4.131 4.675 5.186 5.669 6.579 7.007 7.434 7.995 8.712 9.128 9.921 10.677 11.411 11.786 12.521 13.233 14.275 14.978 15.68 16.673 17.648 18.628 19.596 20.482 21.506 22.476 23.453 24.669 25.843 27.002 28.376 29.947 31.539 33.343 35.309 37.47 39.834 42.634 46.036 49.558 53.832 58.838 64.933 72.184 81.35 93.389 110.009 126.049 137.031 145.087 151.217 156.163 160.072 163.318 165.923 168.354 170.249 171.804 173.222 174.488 175.593 176.535 177.472 178.259 178.886 179.505 180.135 180.633 181.127 181.6 181.923 182.243 182.572 182.886 183.163 183.332 183.518 183.799 183.978 184.149 184.225 184.362 184.512 184.665 184.729 184.75 184.926 184.978 185.008 185.055 185.069 185.057 185.027 184.969 184.855 184.657 183.711 -6 ,29558 ,TETRA ,17618033,Tue Nov 30 11:57:22 CET,Tue Nov 30 13:45:38 CET,0.0 2.182 3.015 3.685 4.278 4.807 5.297 5.76 6.679 7.113 7.523 8.057 8.742 9.133 9.921 10.706 11.471 11.84 12.571 13.278 14.208 14.757 15.29 16.09 16.891 17.676 18.452 19.243 20.274 21.255 22.226 23.441 24.626 25.767 27.124 28.687 30.226 31.993 33.976 36.17 38.583 41.388 44.763 48.261 52.492 57.472 63.537 70.864 80.145 92.125 108.634 124.618 135.554 143.607 149.789 154.764 158.679 161.936 164.519 166.895 168.775 170.331 171.727 172.937 174.015 174.966 175.895 176.659 177.278 177.89 178.481 178.945 179.411 179.889 180.236 180.552 180.868 181.182 181.483 181.66 181.832 182.129 182.316 182.47 182.537 182.69 182.858 183.03 183.111 183.132 183.273 183.314 183.337 183.358 183.367 183.372 183.35 183.317 183.258 183.113 182.442 -7 ,8029 ,TETRA ,17618034,Tue Nov 30 11:57:22 CET,Tue Nov 30 13:46:44 CET,0.0 2.127 2.936 3.627 4.256 4.801 5.304 5.775 6.656 7.097 7.551 8.093 8.769 9.178 9.974 10.715 11.445 11.816 12.559 13.291 14.386 15.095 15.788 16.818 17.7 18.456 19.226 20.0 21.006 22.0 22.977 24.175 25.377 26.549 27.921 29.525 31.086 32.825 34.782 36.935 39.284 42.061 45.469 49.059 53.43 58.456 64.509 71.864 81.149 93.12 109.525 125.541 136.587 144.71 150.91 155.87 159.768 163.012 165.626 168.039 169.937 171.473 172.867 174.132 175.231 176.205 177.189 178.005 178.648 179.27 179.894 180.403 180.912 181.402 181.749 182.056 182.346 182.651 182.968 183.167 183.348 183.619 183.814 183.998 184.083 184.247 184.382 184.5 184.553 184.562 184.693 184.729 184.756 184.738 184.712 184.681 184.628 184.564 184.447 184.182 183.099 -8 ,529 ,TETRA ,17618035,Tue Nov 30 11:57:23 CET,Tue Nov 30 13:47:15 CET,0.0 1.815 2.609 3.26 3.875 4.435 4.957 5.463 6.398 6.838 7.263 7.826 8.534 8.926 9.686 10.448 11.205 11.576 12.284 12.969 13.99 14.667 15.326 16.301 17.291 18.276 19.152 19.93 20.942 21.907 22.863 24.062 25.224 26.376 27.767 29.379 30.981 32.806 34.82 36.971 39.317 42.107 45.504 49.034 53.335 58.403 64.487 71.817 81.129 93.274 109.875 125.746 136.669 144.772 150.911 155.794 159.674 162.899 165.48 167.88 169.809 171.422 172.859 174.145 175.291 176.262 177.201 177.996 178.666 179.332 179.972 180.462 180.943 181.41 181.755 182.11 182.466 182.8 183.09 183.293 183.5 183.772 183.943 184.105 184.185 184.345 184.472 184.573 184.629 184.629 184.743 184.769 184.787 184.812 184.808 184.79 184.751 184.645 184.48 184.316 183.422 -9 ,17835 ,TETRA ,17618036,Tue Nov 30 11:57:23 CET,Tue Nov 30 13:50:27 CET,0.0 1.771 2.567 3.219 3.786 4.314 4.817 5.29 6.203 6.663 7.101 7.617 8.308 8.718 9.528 10.322 11.086 11.453 12.195 12.915 13.955 14.637 15.314 16.324 17.323 18.319 19.309 20.303 21.582 22.695 23.685 24.913 26.127 27.307 28.703 30.316 31.914 33.703 35.661 37.824 40.215 43.058 46.458 49.97 54.224 59.171 65.211 72.51 81.801 93.749 110.184 126.235 137.256 145.33 151.451 156.389 160.329 163.583 166.145 168.503 170.404 171.965 173.366 174.653 175.801 176.787 177.748 178.561 179.228 179.895 180.561 181.041 181.481 181.923 182.262 182.604 182.937 183.246 183.54 183.738 183.935 184.219 184.385 184.548 184.634 184.817 185.001 185.143 185.2 185.205 185.329 185.35 185.374 185.415 185.421 185.417 185.391 185.339 185.225 184.989 184.172 -10 ,5191 ,TETRA ,17618037,Tue Nov 30 11:58:21 CET,Tue Nov 30 13:47:31 CET,0.0 1.72 2.419 3.023 3.574 4.045 4.482 4.903 5.675 6.026 6.369 6.824 7.392 7.717 8.351 8.976 9.567 9.85 10.439 11.039 11.903 12.467 13.015 13.819 14.608 15.382 16.153 16.914 17.905 18.883 19.865 21.081 22.296 23.495 24.868 26.431 27.998 29.762 31.739 33.914 36.256 38.989 42.377 45.943 50.193 55.172 61.236 68.497 77.824 89.966 106.42 122.401 133.341 141.369 147.477 152.385 156.295 159.537 162.13 164.555 166.494 168.099 169.551 170.832 171.955 172.922 173.855 174.655 175.303 175.953 176.606 177.109 177.585 178.046 178.399 178.733 179.052 179.369 179.685 179.887 180.077 180.369 180.537 180.672 180.738 180.859 180.967 181.079 181.138 181.142 181.26 181.292 181.322 181.349 181.336 181.318 181.296 181.249 181.109 180.847 179.716 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_164.txt deleted file mode 100644 index c20cea6c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23473 ,KEBNE ,17076803,Sat Dec 25 05:16:11 CET,Sat Dec 25 06:49:54 CET,0.0 1.975 2.655 3.214 3.708 4.176 4.612 5.01 5.779 6.164 6.536 6.938 7.532 7.803 8.275 8.728 9.162 9.379 9.815 10.242 10.863 11.272 11.69 12.282 12.855 13.447 14.03 14.616 15.38 16.109 16.845 17.761 18.632 19.479 20.489 21.654 22.798 24.082 25.513 27.086 28.799 30.772 33.164 35.652 38.663 42.193 46.398 51.408 57.695 65.753 76.729 87.225 94.335 99.449 103.269 106.297 108.655 110.529 111.982 113.348 114.455 115.379 116.207 116.928 117.534 118.061 118.583 118.995 119.324 119.67 119.991 120.219 120.455 120.692 120.861 121.024 121.174 121.308 121.437 121.517 121.592 121.72 121.797 121.854 121.882 121.941 121.992 122.035 122.057 121.962 122.079 122.068 122.05 121.97 121.907 121.838 121.753 121.669 121.546 121.339 120.465 -2 ,11991 ,KEBNE ,17076804,Sat Dec 25 05:16:11 CET,Sat Dec 25 06:50:06 CET,0.0 1.464 2.236 2.815 3.28 3.634 3.956 4.273 4.84 5.117 5.401 5.703 6.193 6.443 6.925 7.37 7.809 8.029 8.46 8.899 9.533 9.928 10.322 10.916 11.487 12.048 12.605 13.158 13.892 14.621 15.336 16.209 17.063 17.904 18.919 20.087 21.24 22.552 23.986 25.544 27.234 29.188 31.593 34.124 37.154 40.731 45.143 50.307 56.644 64.769 75.686 86.013 93.043 98.194 101.99 104.961 107.306 109.176 110.644 112.016 113.122 114.016 114.802 115.513 116.123 116.632 117.133 117.554 117.892 118.224 118.538 118.774 119.001 119.219 119.371 119.519 119.673 119.803 119.919 120.002 120.088 120.209 120.281 120.353 120.382 120.434 120.468 120.464 120.459 120.356 120.47 120.456 120.432 120.373 120.328 120.263 120.184 120.077 119.884 119.577 118.956 -3 ,20670 ,KEBNE ,17076805,Sat Dec 25 05:16:11 CET,Sat Dec 25 06:48:56 CET,0.0 1.526 2.211 2.755 3.237 3.69 4.114 4.516 5.279 5.662 6.047 6.467 7.102 7.437 8.084 8.733 9.377 9.692 10.299 10.886 11.752 12.318 12.876 13.709 14.522 15.318 15.995 16.548 17.271 17.995 18.712 19.591 20.467 21.346 22.38 23.562 24.739 26.069 27.509 29.058 30.733 32.681 35.025 37.47 40.486 44.014 48.278 53.383 59.797 68.018 79.14 89.633 96.585 101.617 105.415 108.425 110.788 112.716 114.226 115.593 116.684 117.58 118.36 119.087 119.741 120.255 120.733 121.148 121.475 121.791 122.116 122.366 122.62 122.858 123.003 123.149 123.294 123.429 123.556 123.637 123.721 123.81 123.849 123.898 123.925 123.961 123.981 123.986 123.989 123.889 123.973 123.951 123.923 123.849 123.803 123.736 123.647 123.541 123.37 123.109 122.398 -4 ,10798 ,KEBNE ,17076806,Sat Dec 25 05:16:11 CET,Sat Dec 25 06:50:02 CET,0.0 1.539 2.289 2.916 3.439 3.868 4.27 4.681 5.487 5.865 6.23 6.651 7.282 7.617 8.275 8.901 9.496 9.792 10.385 10.966 11.808 12.372 12.926 13.727 14.52 15.295 16.069 16.811 17.659 18.388 19.094 19.981 20.851 21.702 22.706 23.861 25.008 26.301 27.727 29.276 30.965 32.922 35.275 37.764 40.777 44.307 48.618 53.717 60.026 68.084 79.076 89.457 96.42 101.505 105.342 108.357 110.697 112.607 114.08 115.446 116.553 117.467 118.29 118.981 119.57 120.096 120.615 121.053 121.41 121.702 121.984 122.232 122.475 122.721 122.879 123.037 123.195 123.337 123.482 123.57 123.647 123.739 123.778 123.814 123.836 123.87 123.884 123.885 123.886 123.775 123.83 123.788 123.739 123.644 123.59 123.542 123.49 123.398 123.25 122.989 121.828 -5 ,27658 ,KEBNE ,17076807,Sat Dec 25 05:16:11 CET,Sat Dec 25 06:49:34 CET,0.0 1.603 2.268 2.847 3.354 3.805 4.24 4.664 5.444 5.806 6.109 6.409 6.909 7.159 7.628 8.062 8.483 8.7 9.151 9.593 10.224 10.63 11.039 11.655 12.249 12.83 13.407 13.973 14.714 15.451 16.171 17.069 17.949 18.82 19.861 21.051 22.229 23.542 24.958 26.511 28.201 30.136 32.495 34.974 37.975 41.455 45.687 50.78 57.155 65.34 76.317 86.598 93.486 98.49 102.316 105.335 107.699 109.658 111.185 112.557 113.638 114.51 115.284 115.975 116.57 117.077 117.575 117.981 118.303 118.628 118.951 119.208 119.454 119.678 119.845 120.005 120.146 120.27 120.381 120.45 120.524 120.645 120.718 120.771 120.79 120.833 120.852 120.845 120.839 120.722 120.78 120.76 120.732 120.606 120.534 120.448 120.334 120.207 120.025 119.725 118.792 -6 ,19730 ,KEBNE ,17076808,Sat Dec 25 05:16:11 CET,Sat Dec 25 06:49:56 CET,0.0 1.949 2.667 3.22 3.72 4.188 4.633 5.055 5.825 6.19 6.544 6.92 7.546 7.886 8.538 9.168 9.777 10.082 10.683 11.253 12.106 12.69 13.261 14.098 14.936 15.748 16.537 17.211 17.951 18.675 19.396 20.302 21.186 22.043 23.065 24.245 25.392 26.67 28.113 29.701 31.415 33.399 35.776 38.274 41.329 44.905 49.204 54.261 60.538 68.591 79.54 90.024 97.064 102.059 105.828 108.815 111.134 113.039 114.502 115.855 116.962 117.888 118.699 119.403 120.011 120.524 121.016 121.425 121.744 122.036 122.331 122.569 122.801 123.03 123.178 123.33 123.484 123.612 123.735 123.819 123.899 124.001 124.066 124.128 124.153 124.189 124.226 124.275 124.294 124.2 124.287 124.253 124.222 124.178 124.134 124.063 123.979 123.852 123.696 123.473 122.692 -7 ,28668 ,KEBNE ,17076809,Sat Dec 25 05:17:14 CET,Sat Dec 25 06:50:59 CET,0.0 1.634 2.305 2.873 3.346 3.799 4.25 4.676 5.451 5.822 6.191 6.598 7.211 7.541 8.182 8.781 9.39 9.698 10.298 10.899 11.777 12.342 12.888 13.684 14.477 15.258 15.952 16.529 17.266 17.99 18.691 19.56 20.429 21.294 22.312 23.477 24.635 25.926 27.328 28.894 30.609 32.583 34.956 37.45 40.451 43.904 48.088 53.151 59.504 67.543 78.507 88.948 95.938 100.991 104.774 107.794 110.149 112.074 113.582 114.943 116.053 116.946 117.728 118.436 119.033 119.561 120.085 120.505 120.855 121.186 121.481 121.71 121.932 122.138 122.286 122.427 122.557 122.696 122.821 122.888 122.962 123.075 123.135 123.175 123.195 123.237 123.273 123.282 123.281 123.168 123.213 123.176 123.148 123.104 123.058 122.98 122.882 122.754 122.606 122.344 121.465 -8 ,9793 ,KEBNE ,17076810,Sat Dec 25 05:17:15 CET,Sat Dec 25 06:50:59 CET,0.0 1.421 2.083 2.633 3.152 3.618 4.056 4.464 5.238 5.614 5.978 6.333 6.83 7.082 7.561 8.044 8.515 8.734 9.164 9.592 10.224 10.648 11.072 11.683 12.276 12.855 13.412 13.96 14.69 15.407 16.114 16.989 17.862 18.729 19.751 20.924 22.056 23.327 24.754 26.312 27.976 29.887 32.244 34.748 37.781 41.287 45.521 50.642 56.995 65.012 75.966 86.492 93.553 98.586 102.279 105.241 107.61 109.528 111.02 112.4 113.491 114.376 115.195 115.923 116.525 117.036 117.537 117.949 118.287 118.61 118.931 119.181 119.413 119.641 119.816 119.981 120.132 120.276 120.418 120.505 120.575 120.672 120.724 120.768 120.788 120.816 120.826 120.831 120.834 120.727 120.822 120.792 120.751 120.694 120.633 120.556 120.49 120.391 120.213 119.955 119.135 -9 ,1787 ,KEBNE ,17076811,Sat Dec 25 05:17:14 CET,Sat Dec 25 06:50:35 CET,0.0 2.314 3.004 3.575 4.091 4.581 5.014 5.422 6.205 6.575 6.945 7.368 7.993 8.325 8.971 9.61 10.261 10.585 11.217 11.825 12.703 13.282 13.86 14.71 15.45 16.07 16.656 17.224 17.96 18.674 19.376 20.255 21.132 21.996 23.016 24.209 25.39 26.715 28.174 29.764 31.49 33.473 35.873 38.381 41.381 44.879 49.138 54.195 60.508 68.643 79.721 90.246 97.341 102.48 106.343 109.404 111.82 113.806 115.375 116.803 117.907 118.81 119.612 120.329 120.956 121.487 122.019 122.457 122.812 123.165 123.48 123.723 123.97 124.212 124.387 124.549 124.708 124.844 124.947 125.028 125.123 125.238 125.299 125.35 125.375 125.428 125.454 125.449 125.436 125.318 125.377 125.344 125.308 125.225 125.181 125.135 125.073 124.986 124.836 124.575 123.696 -10 ,20277 ,KEBNE ,17076812,Sat Dec 25 05:21:27 CET,Sat Dec 25 06:55:58 CET,0.0 1.717 2.406 2.986 3.491 3.942 4.375 4.784 5.568 5.941 6.309 6.748 7.381 7.722 8.375 8.982 9.591 9.895 10.49 11.084 11.967 12.538 13.048 13.684 14.275 14.861 15.434 15.997 16.737 17.469 18.192 19.083 19.97 20.83 21.836 22.982 24.111 25.394 26.82 28.383 30.075 32.046 34.483 37.033 40.071 43.576 47.752 52.766 59.101 67.223 78.211 88.537 95.457 100.542 104.324 107.297 109.646 111.526 113.007 114.38 115.465 116.342 117.114 117.803 118.39 118.887 119.388 119.809 120.145 120.463 120.774 121.015 121.251 121.478 121.628 121.779 121.92 122.054 122.199 122.29 122.377 122.488 122.555 122.608 122.629 122.678 122.724 122.739 122.739 122.633 122.723 122.709 122.691 122.649 122.594 122.526 122.461 122.349 122.168 121.86 120.84 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_256.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_256.txt deleted file mode 100644 index 99c24a2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_256.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,247 ,TETRA ,17618038,Tue Nov 30 11:58:22 CET,Tue Nov 30 13:56:30 CET,0.0 1.427 1.941 2.267 2.497 2.726 2.921 3.085 3.381 3.518 3.654 3.671 4.02 4.137 4.36 4.561 4.754 4.842 4.999 5.148 5.349 5.468 5.588 5.768 5.932 6.083 6.257 6.451 6.695 6.902 7.085 7.321 7.549 7.739 7.924 8.148 8.368 8.581 8.807 9.035 9.275 9.547 9.835 10.063 10.288 10.517 10.71 10.799 10.753 10.469 9.669 8.411 7.203 6.089 5.117 4.257 3.482 2.742 2.109 1.49 0.972 0.523 0.074 -0.36 -0.755 -1.141 -1.552 -1.886 -2.169 -2.481 -2.829 -3.122 -3.407 -3.708 -3.95 -4.183 -4.422 -4.682 -4.946 -5.139 -5.342 -5.636 -5.838 -6.065 -6.186 -6.419 -6.711 -7.094 -7.299 -7.815 -8.024 -8.301 -8.571 -9.109 -9.424 -9.761 -10.09 -10.444 -10.898 -11.534 -13.145 -2 ,774 ,TETRA ,17618039,Tue Nov 30 11:58:23 CET,Tue Nov 30 13:49:02 CET,0.0 1.032 1.427 1.723 1.974 2.192 2.376 2.535 2.817 2.942 3.068 3.063 3.403 3.513 3.733 3.934 4.103 4.173 4.317 4.484 4.72 4.85 4.978 5.182 5.391 5.59 5.756 5.909 6.102 6.276 6.443 6.632 6.828 7.028 7.251 7.484 7.703 7.913 8.118 8.343 8.56 8.757 8.979 9.204 9.426 9.643 9.821 9.927 9.952 9.757 9.011 7.771 6.587 5.49 4.52 3.629 2.865 2.158 1.542 0.936 0.396 -0.078 -0.51 -0.914 -1.289 -1.636 -1.991 -2.327 -2.624 -2.924 -3.254 -3.534 -3.84 -4.16 -4.398 -4.643 -4.872 -5.115 -5.4 -5.598 -5.806 -6.119 -6.328 -6.552 -6.67 -6.927 -7.216 -7.495 -7.634 -8.036 -8.13 -8.344 -8.6 -9.115 -9.406 -9.726 -10.08 -10.498 -10.985 -11.602 -13.387 -3 ,31045 ,TETRA ,17618040,Tue Nov 30 11:58:22 CET,Tue Nov 30 13:46:32 CET,0.0 1.605 2.085 2.452 2.756 3.017 3.267 3.521 3.998 4.217 4.423 4.514 4.978 5.155 5.501 5.856 6.204 6.37 6.698 7.021 7.469 7.682 7.832 8.027 8.199 8.37 8.542 8.706 8.89 9.073 9.261 9.467 9.653 9.851 10.091 10.324 10.519 10.746 11.036 11.315 11.54 11.77 12.03 12.283 12.51 12.735 12.981 13.159 13.24 13.07 12.328 11.069 9.89 8.806 7.836 6.917 6.114 5.403 4.765 4.136 3.609 3.139 2.687 2.271 1.894 1.514 1.098 0.75 0.459 0.154 -0.165 -0.429 -0.713 -1.034 -1.302 -1.573 -1.826 -2.087 -2.389 -2.599 -2.82 -3.171 -3.406 -3.626 -3.733 -3.96 -4.195 -4.44 -4.58 -4.98 -5.062 -5.237 -5.425 -5.916 -6.209 -6.519 -6.851 -7.2 -7.612 -8.205 -10.405 -4 ,29549 ,TETRA ,17618041,Tue Nov 30 11:58:25 CET,Tue Nov 30 13:46:22 CET,0.0 1.128 1.528 1.825 2.087 2.299 2.476 2.633 2.924 3.066 3.207 3.237 3.599 3.72 3.957 4.167 4.337 4.413 4.565 4.713 4.933 5.074 5.214 5.421 5.601 5.76 5.914 6.072 6.276 6.488 6.672 6.851 7.019 7.18 7.401 7.673 7.921 8.156 8.378 8.624 8.885 9.133 9.379 9.579 9.769 9.948 10.124 10.258 10.247 10.012 9.244 7.972 6.811 5.748 4.775 3.913 3.14 2.434 1.84 1.217 0.682 0.206 -0.234 -0.644 -1.051 -1.412 -2.011 -2.773 -3.443 -4.119 -4.806 -5.374 -5.963 -6.546 -6.984 -7.441 -7.915 -8.412 -8.931 -9.276 -9.633 -10.192 -10.578 -10.99 -11.198 -11.613 -12.046 -12.485 -12.706 -13.226 -13.434 -13.702 -13.965 -14.53 -14.843 -15.19 -15.58 -15.977 -16.417 -17.027 -18.598 -5 ,11090 ,TETRA ,17618042,Tue Nov 30 11:59:21 CET,Tue Nov 30 13:45:51 CET,0.0 0.927 1.369 1.727 2.08 2.395 2.673 2.94 3.427 3.652 3.877 4.02 4.526 4.734 5.141 5.525 5.878 6.056 6.418 6.762 7.191 7.383 7.516 7.696 7.877 8.069 8.257 8.403 8.559 8.72 8.882 9.077 9.259 9.427 9.612 9.821 10.025 10.236 10.451 10.692 10.974 11.329 11.68 11.908 12.125 12.334 12.528 12.659 12.651 12.404 11.691 10.455 9.258 8.164 7.206 6.36 5.609 4.918 4.297 3.679 3.169 2.706 2.257 1.849 1.479 1.137 0.757 0.408 0.082 -0.249 -0.551 -0.802 -1.089 -1.38 -1.593 -1.845 -2.108 -2.366 -2.621 -2.788 -2.968 -3.259 -3.456 -3.689 -3.823 -4.064 -4.3 -4.566 -4.714 -5.103 -5.171 -5.337 -5.51 -5.888 -6.095 -6.319 -6.581 -6.878 -7.248 -7.761 -9.114 -6 ,1895 ,TETRA ,17618043,Tue Nov 30 11:59:21 CET,Tue Nov 30 13:45:52 CET,0.0 1.261 1.779 2.187 2.556 2.892 3.198 3.487 4.016 4.27 4.509 4.675 5.175 5.349 5.614 5.837 6.038 6.127 6.295 6.439 6.651 6.792 6.926 7.118 7.282 7.432 7.578 7.72 7.904 8.088 8.283 8.52 8.749 8.951 9.134 9.332 9.548 9.783 10.0 10.231 10.457 10.681 10.907 11.104 11.325 11.514 11.678 11.82 11.799 11.526 10.724 9.439 8.209 7.123 6.178 5.322 4.518 3.774 3.143 2.523 1.998 1.521 1.07 0.643 0.239 -0.113 -0.514 -0.923 -1.253 -1.606 -2.002 -2.288 -2.558 -2.86 -3.09 -3.32 -3.552 -3.78 -4.031 -4.213 -4.403 -4.701 -4.905 -5.129 -5.25 -5.483 -5.727 -5.997 -6.14 -6.534 -6.601 -6.772 -6.968 -7.367 -7.571 -7.794 -8.036 -8.352 -8.715 -9.157 -10.725 -7 ,17521 ,TETRA ,17618044,Tue Nov 30 11:59:23 CET,Tue Nov 30 13:45:48 CET,0.0 1.488 1.969 2.35 2.691 3.01 3.306 3.57 4.029 4.238 4.442 4.572 5.052 5.236 5.588 5.925 6.287 6.473 6.817 7.136 7.607 7.917 8.198 8.506 8.714 8.908 9.099 9.284 9.488 9.669 9.845 10.047 10.246 10.425 10.633 10.857 11.054 11.286 11.524 11.782 12.019 12.218 12.427 12.621 12.855 13.103 13.288 13.398 13.416 13.224 12.492 11.253 10.1 9.044 8.091 7.196 6.415 5.717 5.098 4.471 3.924 3.453 2.999 2.57 2.153 1.741 1.295 0.903 0.6 0.302 -0.017 -0.283 -0.555 -0.849 -1.091 -1.344 -1.615 -1.897 -2.186 -2.394 -2.606 -2.924 -3.146 -3.397 -3.532 -3.763 -3.99 -4.26 -4.41 -4.803 -4.861 -5.028 -5.196 -5.562 -5.772 -6.018 -6.28 -6.544 -6.869 -7.307 -8.777 -8 ,5538 ,TETRA ,17618045,Tue Nov 30 11:59:22 CET,Tue Nov 30 13:53:26 CET,0.0 1.25 1.624 1.91 2.161 2.377 2.556 2.727 3.063 3.198 3.32 3.349 3.72 3.842 4.037 4.219 4.406 4.498 4.669 4.849 5.121 5.273 5.407 5.606 5.781 5.943 6.114 6.266 6.445 6.623 6.781 6.964 7.149 7.349 7.565 7.807 8.058 8.301 8.534 8.776 9.015 9.25 9.487 9.7 9.963 10.257 10.467 10.602 10.626 10.42 9.754 8.567 7.398 6.325 5.379 4.515 3.763 3.086 2.488 1.876 1.324 0.794 0.322 -0.102 -0.521 -0.901 -1.278 -1.607 -1.894 -2.211 -2.546 -2.803 -3.065 -3.349 -3.588 -3.844 -4.093 -4.342 -4.716 -5.047 -5.382 -5.896 -6.255 -6.644 -6.85 -7.269 -7.708 -8.177 -8.422 -8.963 -9.185 -9.46 -9.737 -10.323 -10.643 -10.961 -11.319 -11.719 -12.176 -12.867 -15.182 -9 ,3164 ,TETRA ,17618046,Tue Nov 30 11:59:21 CET,Tue Nov 30 13:50:33 CET,0.0 1.558 2.063 2.458 2.805 3.116 3.35 3.498 3.752 3.873 3.995 4.003 4.364 4.48 4.685 4.882 5.05 5.124 5.269 5.412 5.64 5.786 5.922 6.104 6.265 6.406 6.549 6.696 6.894 7.113 7.325 7.555 7.747 7.936 8.154 8.359 8.538 8.733 8.943 9.165 9.374 9.586 9.864 10.109 10.343 10.591 10.79 10.921 10.977 10.81 10.057 8.778 7.535 6.403 5.416 4.532 3.772 3.08 2.491 1.891 1.365 0.909 0.462 0.035 -0.368 -0.736 -1.094 -1.413 -1.717 -2.046 -2.389 -2.688 -2.998 -3.279 -3.489 -3.731 -3.987 -4.227 -4.481 -4.672 -4.86 -5.133 -5.34 -5.562 -5.67 -5.9 -6.161 -6.437 -6.577 -6.962 -7.029 -7.201 -7.381 -7.795 -8.024 -8.247 -8.502 -8.846 -9.272 -9.84 -11.274 -10 ,1918 ,TETRA ,17618047,Tue Nov 30 12:00:22 CET,Tue Nov 30 13:47:25 CET,0.0 1.746 2.109 2.374 2.608 2.823 2.994 3.15 3.45 3.58 3.702 3.712 4.066 4.171 4.349 4.54 4.738 4.824 4.986 5.152 5.383 5.522 5.653 5.837 6.026 6.226 6.412 6.573 6.77 6.962 7.131 7.321 7.517 7.691 7.913 8.185 8.393 8.585 8.774 8.979 9.193 9.428 9.691 9.914 10.133 10.361 10.554 10.661 10.692 10.468 9.672 8.422 7.23 6.124 5.18 4.325 3.532 2.825 2.231 1.639 1.131 0.667 0.205 -0.229 -0.618 -0.972 -1.375 -1.754 -2.081 -2.422 -2.776 -3.048 -3.326 -3.624 -3.848 -4.077 -4.336 -4.62 -4.9 -5.094 -5.299 -5.615 -5.834 -6.054 -6.168 -6.388 -6.614 -6.877 -7.023 -7.412 -7.452 -7.613 -7.791 -8.283 -8.587 -8.904 -9.273 -9.689 -10.14 -10.694 -12.161 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_336.txt deleted file mode 100644 index 175b3730..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5760 ,TETRA ,17618048,Tue Nov 30 12:00:22 CET,Tue Nov 30 13:47:17 CET,0.0 1.418 1.928 2.32 2.666 2.95 3.212 3.485 4.013 4.25 4.468 4.581 5.055 5.203 5.404 5.577 5.752 5.846 6.025 6.195 6.45 6.599 6.734 6.947 7.151 7.355 7.544 7.699 7.895 8.094 8.28 8.498 8.713 8.897 9.095 9.313 9.526 9.767 10.021 10.271 10.501 10.776 11.101 11.363 11.628 11.91 12.192 12.46 12.66 12.614 12.021 10.884 9.742 8.715 7.793 6.94 6.182 5.465 4.852 4.273 3.776 3.314 2.886 2.498 2.124 1.747 1.327 0.968 0.666 0.348 -0.012 -0.317 -0.625 -0.921 -1.138 -1.366 -1.599 -1.839 -2.077 -2.249 -2.441 -2.751 -2.962 -3.178 -3.291 -3.518 -3.75 -4.069 -4.276 -4.794 -4.968 -5.213 -5.468 -6.008 -6.304 -6.629 -6.971 -7.347 -7.781 -8.351 -9.714 -2 ,13791 ,TETRA ,17618049,Tue Nov 30 12:00:21 CET,Tue Nov 30 13:48:03 CET,0.0 1.098 1.586 2.006 2.381 2.699 2.969 3.212 3.58 3.718 3.842 3.828 4.174 4.292 4.506 4.679 4.846 4.93 5.111 5.295 5.512 5.653 5.8 6.03 6.235 6.402 6.57 6.729 6.937 7.113 7.264 7.458 7.648 7.837 8.049 8.304 8.549 8.819 9.098 9.337 9.581 9.846 10.136 10.407 10.735 11.02 11.215 11.388 11.529 11.482 10.908 9.775 8.648 7.621 6.699 5.832 5.033 4.311 3.706 3.112 2.589 2.107 1.646 1.222 0.827 0.454 0.057 -0.293 -0.594 -0.9 -1.233 -1.506 -1.772 -2.048 -2.257 -2.492 -2.75 -3.015 -3.276 -3.45 -3.628 -3.963 -4.276 -4.633 -4.823 -5.219 -5.634 -6.081 -6.308 -6.827 -6.975 -7.205 -7.449 -7.997 -8.309 -8.65 -8.992 -9.329 -9.715 -10.24 -11.637 -3 ,28935 ,TETRA ,17618050,Tue Nov 30 12:00:21 CET,Tue Nov 30 13:48:09 CET,0.0 1.314 1.864 2.24 2.559 2.851 3.126 3.398 3.936 4.173 4.397 4.544 5.034 5.229 5.629 6.03 6.41 6.595 6.973 7.349 7.902 8.163 8.302 8.511 8.727 8.907 9.063 9.226 9.463 9.675 9.852 10.063 10.27 10.471 10.704 10.978 11.221 11.439 11.69 11.965 12.225 12.495 12.803 13.077 13.366 13.669 13.976 14.227 14.344 14.227 13.622 12.502 11.423 10.415 9.482 8.636 7.86 7.122 6.513 5.926 5.406 4.93 4.489 4.088 3.709 3.321 2.92 2.585 2.271 1.933 1.576 1.297 1.026 0.722 0.48 0.233 -0.029 -0.302 -0.567 -0.74 -0.912 -1.177 -1.376 -1.579 -1.679 -1.876 -2.1 -2.37 -2.519 -2.929 -3.014 -3.168 -3.33 -3.717 -3.917 -4.128 -4.403 -4.744 -5.153 -5.665 -6.942 -4 ,18556 ,TETRA ,17618051,Tue Nov 30 12:01:20 CET,Tue Nov 30 13:43:55 CET,0.0 1.37 1.845 2.215 2.5 2.745 2.967 3.144 3.453 3.596 3.732 3.733 4.085 4.201 4.406 4.617 4.82 4.907 5.062 5.215 5.457 5.629 5.797 6.002 6.173 6.35 6.524 6.694 6.902 7.111 7.346 7.629 7.891 8.115 8.348 8.607 8.845 9.095 9.326 9.573 9.824 10.129 10.509 10.829 11.136 11.428 11.726 11.932 12.0 11.918 11.399 10.308 9.111 8.0 7.039 6.159 5.424 4.764 4.161 3.555 3.052 2.598 2.157 1.742 1.329 0.954 0.378 -0.375 -1.061 -1.75 -2.452 -3.027 -3.609 -4.217 -4.695 -5.175 -5.661 -6.157 -6.656 -6.994 -7.351 -7.902 -8.265 -8.638 -8.833 -9.227 -9.641 -10.086 -10.313 -10.841 -11.01 -11.261 -11.518 -12.023 -12.284 -12.561 -12.869 -13.217 -13.646 -14.217 -15.524 -5 ,11772 ,TETRA ,17618052,Tue Nov 30 12:01:22 CET,Tue Nov 30 13:43:05 CET,0.0 1.217 1.635 1.917 2.149 2.343 2.521 2.686 3.029 3.189 3.321 3.352 3.715 3.826 4.019 4.195 4.354 4.437 4.608 4.783 5.019 5.16 5.309 5.514 5.704 5.881 6.054 6.234 6.451 6.655 6.863 7.088 7.281 7.48 7.749 8.037 8.253 8.493 8.763 9.026 9.329 9.655 9.961 10.241 10.559 10.875 11.16 11.352 11.461 11.362 10.717 9.638 8.521 7.404 6.433 5.599 4.862 4.145 3.514 2.934 2.422 1.951 1.509 1.08 0.68 0.308 -0.063 -0.394 -0.688 -0.99 -1.345 -1.662 -1.97 -2.25 -2.453 -2.682 -2.932 -3.199 -3.473 -3.654 -3.865 -4.197 -4.407 -4.629 -4.746 -4.982 -5.213 -5.46 -5.587 -5.961 -6.005 -6.166 -6.335 -6.712 -6.948 -7.253 -7.609 -8.018 -8.468 -9.029 -10.507 -6 ,18749 ,TETRA ,17618053,Tue Nov 30 12:02:22 CET,Tue Nov 30 13:51:33 CET,0.0 1.024 1.557 2.007 2.391 2.731 3.028 3.293 3.802 4.066 4.342 4.572 5.091 5.306 5.728 6.119 6.484 6.662 7.016 7.345 7.779 8.056 8.34 8.728 8.985 9.167 9.346 9.509 9.72 9.936 10.133 10.361 10.572 10.767 10.996 11.231 11.44 11.676 11.956 12.23 12.466 12.729 13.016 13.277 13.56 13.863 14.211 14.488 14.632 14.554 14.002 12.914 11.807 10.756 9.796 8.923 8.142 7.411 6.779 6.167 5.649 5.176 4.728 4.312 3.908 3.533 3.128 2.77 2.491 2.211 1.898 1.627 1.333 1.027 0.802 0.558 0.294 0.022 -0.256 -0.519 -0.877 -1.448 -1.831 -2.213 -2.417 -2.858 -3.304 -3.759 -3.995 -4.532 -4.727 -4.984 -5.237 -5.803 -6.112 -6.41 -6.733 -7.118 -7.573 -8.142 -9.654 -7 ,24777 ,TETRA ,17618054,Tue Nov 30 12:02:22 CET,Tue Nov 30 13:51:17 CET,0.0 1.324 1.834 2.263 2.661 2.979 3.253 3.521 4.018 4.239 4.451 4.573 5.067 5.274 5.666 6.043 6.393 6.56 6.901 7.245 7.722 8.024 8.306 8.608 8.836 9.068 9.262 9.432 9.631 9.841 10.066 10.301 10.501 10.692 10.926 11.205 11.484 11.746 11.994 12.276 12.551 12.856 13.173 13.423 13.703 14.03 14.367 14.592 14.696 14.607 13.987 12.822 11.678 10.655 9.725 8.867 8.062 7.323 6.701 6.05 5.5 5.023 4.588 4.181 3.79 3.441 3.087 2.76 2.456 2.13 1.784 1.497 1.207 0.895 0.651 0.434 0.218 -0.046 -0.35 -0.538 -0.722 -1.024 -1.236 -1.465 -1.582 -1.808 -2.036 -2.293 -2.427 -2.811 -2.887 -3.056 -3.228 -3.606 -3.793 -3.983 -4.216 -4.498 -4.82 -5.262 -6.45 -8 ,29928 ,TETRA ,17618055,Tue Nov 30 12:02:22 CET,Tue Nov 30 13:52:01 CET,0.0 1.096 1.567 1.908 2.222 2.528 2.808 3.072 3.574 3.82 4.061 4.229 4.729 4.937 5.372 5.777 6.15 6.336 6.663 6.958 7.373 7.662 7.981 8.449 8.886 9.323 9.782 10.237 10.806 11.347 11.902 12.585 13.185 13.709 14.288 14.754 15.015 15.277 15.538 15.799 16.097 16.426 16.787 17.104 17.359 17.63 17.888 18.076 18.154 18.026 17.48 16.369 15.258 14.23 13.303 12.427 11.676 11.023 10.456 9.859 9.336 8.881 8.448 8.007 7.572 7.199 6.783 6.408 6.119 5.798 5.457 5.186 4.896 4.593 4.358 4.129 3.868 3.575 3.196 2.882 2.562 2.051 1.678 1.265 1.054 0.641 0.204 -0.256 -0.487 -1.024 -1.187 -1.42 -1.675 -2.242 -2.555 -2.884 -3.23 -3.606 -4.061 -4.616 -6.105 -9 ,2414 ,TETRA ,17618056,Tue Nov 30 12:02:22 CET,Tue Nov 30 13:52:24 CET,0.0 1.377 1.914 2.342 2.72 3.044 3.334 3.601 4.068 4.285 4.491 4.61 5.105 5.314 5.701 6.042 6.374 6.544 6.856 7.09 7.34 7.494 7.625 7.803 7.998 8.195 8.381 8.557 8.761 8.973 9.19 9.393 9.593 9.801 10.031 10.296 10.566 10.836 11.072 11.305 11.542 11.821 12.125 12.428 12.768 13.045 13.294 13.545 13.692 13.625 13.033 11.923 10.919 9.968 9.051 8.218 7.483 6.782 6.158 5.552 5.035 4.54 4.05 3.604 3.186 2.799 2.396 2.053 1.774 1.471 1.162 0.911 0.634 0.345 0.116 -0.113 -0.355 -0.604 -0.848 -1.019 -1.231 -1.703 -2.085 -2.487 -2.691 -3.11 -3.541 -3.976 -4.196 -4.71 -4.857 -5.086 -5.33 -5.851 -6.118 -6.403 -6.725 -7.09 -7.488 -8.02 -9.3 -10 ,32142 ,TETRA ,17618057,Tue Nov 30 12:02:22 CET,Tue Nov 30 13:49:36 CET,0.0 1.029 1.422 1.713 1.953 2.163 2.347 2.516 2.82 2.961 3.088 3.08 3.422 3.526 3.734 3.917 4.076 4.152 4.303 4.479 4.768 4.936 5.077 5.266 5.442 5.625 5.806 5.972 6.177 6.369 6.549 6.755 6.959 7.163 7.412 7.672 7.889 8.121 8.353 8.605 8.869 9.141 9.457 9.729 10.011 10.32 10.625 10.855 10.988 10.947 10.351 9.234 8.111 7.089 6.202 5.369 4.616 3.935 3.344 2.771 2.267 1.823 1.415 1.009 0.626 0.276 -0.092 -0.446 -0.753 -1.051 -1.374 -1.641 -1.92 -2.225 -2.465 -2.686 -2.904 -3.143 -3.389 -3.565 -3.821 -4.356 -4.727 -5.112 -5.322 -5.753 -6.204 -6.663 -6.89 -7.423 -7.601 -7.865 -8.143 -8.657 -8.946 -9.266 -9.606 -9.995 -10.446 -11.007 -11.986 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_67.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_67.txt deleted file mode 100644 index 502d4048..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_252_67.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10841 ,TETRA ,17618058,Tue Nov 30 12:02:22 CET,Tue Nov 30 13:38:37 CET,0.0 0.967 1.398 1.769 2.109 2.418 2.723 3.015 3.577 3.856 4.132 4.434 4.926 5.173 5.663 6.158 6.63 6.868 7.365 7.854 8.543 8.981 9.411 10.055 10.703 11.348 12.001 12.644 13.472 14.298 15.132 16.175 17.214 18.247 19.456 20.844 22.26 23.891 25.687 27.627 29.716 32.167 35.145 38.272 42.069 46.476 51.854 58.372 66.57 77.125 91.636 105.47 114.87 121.722 126.821 130.864 134.065 136.69 138.774 140.697 142.223 143.499 144.64 145.647 146.51 147.24 147.926 148.489 148.973 149.43 149.857 150.215 150.56 150.875 151.111 151.328 151.519 151.705 151.893 152.016 152.135 152.317 152.429 152.524 152.568 152.66 152.736 152.777 152.779 152.711 152.749 152.744 152.733 152.649 152.57 152.473 152.362 152.207 151.958 151.559 147.709 -2 ,16022 ,TETRA ,17618059,Tue Nov 30 12:03:19 CET,Tue Nov 30 13:56:28 CET,0.0 1.456 2.068 2.566 2.993 3.387 3.759 4.107 4.778 5.108 5.436 5.81 6.433 6.76 7.404 8.042 8.675 8.987 9.601 10.212 11.096 11.66 12.217 13.042 13.869 14.709 15.543 16.36 17.409 18.461 19.509 20.79 22.086 23.383 24.853 26.38 27.807 29.394 31.123 33.052 35.16 37.624 40.626 43.771 47.617 52.082 57.441 63.852 71.93 82.361 96.749 110.524 119.767 126.553 131.68 135.717 138.902 141.529 143.62 145.546 147.065 148.319 149.425 150.393 151.255 151.966 152.644 153.26 153.78 154.272 154.732 155.091 155.425 155.749 155.982 156.184 156.393 156.593 156.797 156.937 157.038 157.161 157.259 157.334 157.359 157.403 157.44 157.475 157.485 157.435 157.481 157.449 157.403 157.254 157.169 157.065 156.936 156.764 156.542 156.148 154.315 -3 ,13292 ,TETRA ,17618060,Tue Nov 30 12:03:19 CET,Tue Nov 30 13:49:09 CET,0.0 0.919 1.459 1.945 2.365 2.757 3.147 3.531 4.222 4.542 4.832 5.113 5.597 5.846 6.353 6.862 7.358 7.599 8.068 8.529 9.212 9.67 10.13 10.798 11.449 12.106 12.768 13.414 14.282 15.149 15.973 16.989 17.996 18.987 20.176 21.56 22.938 24.515 26.26 28.138 30.191 32.617 35.56 38.669 42.483 46.941 52.396 58.901 67.143 77.859 92.561 106.482 115.856 122.735 127.925 132.082 135.309 137.886 139.945 141.877 143.369 144.611 145.735 146.714 147.57 148.322 149.033 149.612 150.092 150.548 150.985 151.334 151.666 151.977 152.208 152.429 152.651 152.877 153.098 153.235 153.358 153.519 153.603 153.676 153.711 153.762 153.797 153.81 153.806 153.748 153.786 153.763 153.73 153.631 153.557 153.461 153.33 153.131 152.847 152.413 150.269 -4 ,7760 ,TETRA ,17618061,Tue Nov 30 12:03:21 CET,Tue Nov 30 13:49:02 CET,0.0 1.309 1.813 2.26 2.687 3.08 3.459 3.815 4.482 4.822 5.167 5.553 6.17 6.49 7.129 7.763 8.361 8.654 9.241 9.821 10.678 11.238 11.794 12.627 13.368 14.03 14.708 15.39 16.282 17.166 18.025 19.077 20.108 21.123 22.339 23.754 25.143 26.692 28.432 30.354 32.461 34.923 37.917 41.044 44.816 49.275 54.713 61.246 69.471 79.994 94.527 108.464 117.863 124.75 129.907 133.952 137.099 139.659 141.678 143.531 145.038 146.299 147.419 148.402 149.242 149.984 150.715 151.305 151.767 152.224 152.694 153.054 153.399 153.716 153.929 154.143 154.34 154.511 154.673 154.793 154.928 155.092 155.177 155.242 155.267 155.327 155.37 155.397 155.408 155.354 155.393 155.384 155.367 155.25 155.162 155.067 154.956 154.784 154.54 154.158 151.748 -5 ,9310 ,TETRA ,17618062,Tue Nov 30 12:03:19 CET,Tue Nov 30 13:49:19 CET,0.0 1.608 2.175 2.636 3.054 3.446 3.821 4.195 4.899 5.227 5.543 5.882 6.487 6.794 7.408 8.001 8.571 8.836 9.312 9.768 10.446 10.901 11.353 12.019 12.675 13.321 13.962 14.601 15.436 16.27 17.114 18.148 19.18 20.194 21.368 22.742 24.111 25.666 27.402 29.309 31.386 33.795 36.736 39.875 43.742 48.228 53.639 60.126 68.275 78.789 93.122 106.987 116.386 123.194 128.274 132.304 135.472 138.059 140.122 142.056 143.591 144.84 145.947 146.934 147.792 148.508 149.18 149.752 150.249 150.738 151.209 151.579 151.942 152.278 152.514 152.741 152.961 153.176 153.35 153.452 153.565 153.725 153.815 153.893 153.931 154.006 154.057 154.088 154.099 154.051 154.112 154.103 154.071 153.918 153.803 153.681 153.56 153.418 153.179 152.674 149.59 -6 ,17692 ,TETRA ,17618063,Tue Nov 30 12:06:19 CET,Tue Nov 30 13:48:11 CET,0.0 1.61 2.234 2.705 3.134 3.544 3.93 4.298 5.007 5.354 5.706 6.113 6.734 7.057 7.69 8.308 8.92 9.228 9.839 10.43 11.308 11.887 12.448 13.289 14.122 14.935 15.75 16.547 17.477 18.303 19.134 20.165 21.171 22.184 23.393 24.791 26.184 27.747 29.465 31.379 33.493 35.917 38.875 41.988 45.742 50.179 55.603 62.131 70.396 81.114 95.755 109.654 119.144 126.067 131.163 135.184 138.401 141.03 143.075 144.937 146.422 147.679 148.829 149.842 150.704 151.432 152.154 152.758 153.242 153.709 154.174 154.535 154.847 155.137 155.36 155.574 155.76 155.96 156.153 156.266 156.377 156.527 156.618 156.688 156.722 156.795 156.849 156.875 156.88 156.824 156.861 156.847 156.823 156.743 156.678 156.602 156.499 156.319 156.067 155.719 154.045 -7 ,8534 ,TETRA ,17618064,Tue Nov 30 12:06:22 CET,Tue Nov 30 13:53:46 CET,0.0 1.772 2.356 2.836 3.274 3.669 4.035 4.403 5.119 5.463 5.802 6.169 6.783 7.102 7.72 8.334 8.951 9.256 9.801 10.266 10.935 11.388 11.846 12.525 13.185 13.831 14.463 15.092 15.943 16.8 17.641 18.671 19.69 20.702 21.921 23.337 24.73 26.324 28.084 29.982 32.078 34.524 37.481 40.608 44.4 48.841 54.224 60.656 68.773 79.31 93.815 107.671 117.065 123.939 129.067 133.093 136.266 138.881 140.949 142.86 144.366 145.588 146.681 147.672 148.528 149.248 149.955 150.564 151.076 151.574 152.056 152.429 152.765 153.073 153.285 153.486 153.701 153.912 154.113 154.241 154.36 154.519 154.61 154.691 154.725 154.797 154.852 154.864 154.859 154.787 154.808 154.786 154.754 154.675 154.624 154.545 154.416 154.217 153.945 153.512 151.565 -8 ,2718 ,TETRA ,17618065,Tue Nov 30 12:06:19 CET,Tue Nov 30 13:51:59 CET,0.0 1.679 2.288 2.766 3.203 3.612 4.0 4.371 5.061 5.406 5.744 6.107 6.708 7.025 7.654 8.26 8.857 9.151 9.727 10.293 11.147 11.718 12.285 13.124 13.94 14.751 15.567 16.373 17.444 18.518 19.573 20.761 21.79 22.767 23.962 25.369 26.75 28.306 30.052 31.979 34.044 36.436 39.361 42.466 46.279 50.7 56.04 62.509 70.665 81.204 95.569 109.173 118.442 125.249 130.376 134.445 137.603 140.163 142.172 144.061 145.635 146.928 148.021 148.984 149.845 150.548 151.228 151.804 152.273 152.746 153.199 153.553 153.888 154.203 154.436 154.66 154.88 155.077 155.238 155.342 155.439 155.579 155.684 155.793 155.838 155.894 155.922 155.935 155.94 155.877 155.916 155.894 155.864 155.761 155.67 155.565 155.42 155.228 154.993 154.618 152.961 -9 ,25956 ,TETRA ,17618066,Tue Nov 30 12:06:22 CET,Tue Nov 30 13:42:09 CET,0.0 1.495 2.035 2.502 2.913 3.289 3.659 4.031 4.745 5.083 5.421 5.801 6.422 6.749 7.38 7.97 8.509 8.757 9.23 9.686 10.364 10.811 11.261 11.93 12.588 13.244 13.895 14.541 15.394 16.229 17.058 18.075 19.079 20.092 21.291 22.689 24.097 25.671 27.382 29.286 31.388 33.825 36.78 39.904 43.731 48.198 53.654 60.282 68.593 79.122 93.479 107.308 116.705 123.496 128.593 132.631 135.791 138.413 140.495 142.399 143.892 145.133 146.238 147.213 148.081 148.823 149.538 150.129 150.597 151.039 151.476 151.842 152.187 152.485 152.702 152.931 153.17 153.399 153.598 153.716 153.847 154.01 154.105 154.192 154.232 154.327 154.388 154.404 154.41 154.362 154.41 154.39 154.365 154.272 154.191 154.099 153.989 153.849 153.637 153.276 151.689 -10 ,14316 ,TETRA ,17618067,Tue Nov 30 12:07:19 CET,Tue Nov 30 13:49:35 CET,0.0 1.331 1.881 2.33 2.742 3.145 3.547 3.931 4.645 4.986 5.316 5.687 6.31 6.626 7.244 7.85 8.437 8.723 9.299 9.877 10.735 11.299 11.857 12.687 13.497 14.297 15.101 15.907 16.973 18.03 19.072 20.385 21.702 22.992 24.515 26.144 27.584 29.161 30.908 32.835 34.94 37.389 40.389 43.517 47.277 51.74 57.176 63.62 71.863 82.644 97.315 111.238 120.587 127.356 132.434 136.466 139.655 142.265 144.314 146.15 147.608 148.838 149.926 150.893 151.73 152.438 153.135 153.714 154.191 154.674 155.142 155.5 155.843 156.185 156.434 156.648 156.849 157.048 157.237 157.363 157.486 157.655 157.755 157.842 157.881 157.95 157.987 157.999 158.01 157.963 158.014 157.995 157.966 157.882 157.806 157.702 157.579 157.417 157.193 156.861 155.387 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_254_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_254_163.txt deleted file mode 100644 index 700dd679..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_254_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6922 ,TETRA ,17618068,Tue Nov 30 12:07:18 CET,Tue Nov 30 13:56:39 CET,0.0 1.105 1.434 1.701 1.927 2.123 2.32 2.514 2.901 3.079 3.242 3.373 3.698 3.85 4.142 4.418 4.696 4.829 5.087 5.343 5.71 5.937 6.159 6.47 6.781 7.102 7.42 7.749 8.158 8.531 8.897 9.357 9.796 10.221 10.758 11.362 11.922 12.555 13.263 14.032 14.829 15.748 16.845 17.943 19.261 20.798 22.672 24.868 27.533 30.899 35.34 39.37 41.996 43.832 45.072 45.986 46.697 47.236 47.659 48.034 48.298 48.493 48.643 48.76 48.852 48.937 48.972 48.959 48.966 48.994 48.991 48.972 48.936 48.885 48.859 48.815 48.761 48.697 48.601 48.544 48.493 48.397 48.314 48.206 48.145 48.02 47.888 47.738 47.659 47.455 47.411 47.32 47.224 47.011 46.888 46.744 46.579 46.389 46.128 45.752 44.281 -2 ,7832 ,TETRA ,17618069,Tue Nov 30 12:08:19 CET,Tue Nov 30 13:57:13 CET,0.0 1.165 1.511 1.758 1.961 2.154 2.335 2.505 2.816 2.962 3.107 3.222 3.55 3.694 3.97 4.231 4.484 4.61 4.861 5.114 5.476 5.701 5.927 6.269 6.602 6.929 7.259 7.578 7.988 8.388 8.793 9.276 9.707 10.141 10.669 11.249 11.804 12.43 13.121 13.895 14.727 15.652 16.755 17.865 19.207 20.793 22.68 24.901 27.624 30.978 35.282 39.243 41.847 43.689 45.039 46.029 46.774 47.361 47.793 48.16 48.439 48.655 48.838 49.0 49.116 49.189 49.239 49.281 49.328 49.366 49.367 49.325 49.271 49.247 49.229 49.202 49.172 49.133 49.075 49.022 48.963 48.871 48.797 48.717 48.681 48.598 48.498 48.404 48.353 48.158 48.139 48.05 47.952 47.753 47.638 47.493 47.322 47.112 46.825 46.42 45.161 -3 ,8749 ,TETRA ,17618070,Tue Nov 30 12:08:21 CET,Tue Nov 30 13:57:12 CET,0.0 0.703 0.994 1.229 1.428 1.613 1.805 1.995 2.331 2.487 2.639 2.742 3.061 3.205 3.481 3.742 4.003 4.131 4.373 4.611 4.968 5.21 5.45 5.792 6.127 6.453 6.76 7.066 7.475 7.891 8.305 8.758 9.173 9.573 10.041 10.595 11.127 11.71 12.351 13.048 13.801 14.699 15.779 16.912 18.268 19.842 21.788 24.027 26.712 30.061 34.447 38.469 41.081 42.872 44.141 45.131 45.896 46.474 46.894 47.282 47.586 47.813 47.996 48.143 48.266 48.341 48.404 48.456 48.494 48.517 48.492 48.461 48.423 48.361 48.298 48.228 48.168 48.101 48.016 47.969 47.922 47.843 47.769 47.67 47.62 47.521 47.415 47.309 47.25 47.052 47.017 46.925 46.81 46.557 46.415 46.262 46.106 45.915 45.652 45.305 43.752 -4 ,4705 ,TETRA ,17618071,Tue Nov 30 12:09:18 CET,Tue Nov 30 13:59:28 CET,0.0 0.908 1.304 1.625 1.907 2.169 2.404 2.617 3.016 3.196 3.37 3.526 3.858 4.011 4.31 4.591 4.873 5.015 5.28 5.526 5.887 6.123 6.351 6.695 7.046 7.385 7.704 8.013 8.411 8.793 9.171 9.622 10.042 10.458 10.975 11.581 12.17 12.812 13.522 14.292 15.107 16.068 17.247 18.434 19.868 21.525 23.484 25.735 28.464 31.896 36.319 40.328 42.902 44.676 45.928 46.893 47.613 48.165 48.587 48.969 49.26 49.474 49.647 49.808 49.946 50.033 50.086 50.099 50.11 50.139 50.128 50.082 50.036 50.0 49.973 49.929 49.88 49.826 49.747 49.684 49.617 49.503 49.408 49.29 49.228 49.106 48.981 48.846 48.769 48.56 48.538 48.463 48.368 48.11 47.955 47.784 47.627 47.442 47.214 46.929 45.735 -5 ,32143 ,TETRA ,17618072,Tue Nov 30 12:09:18 CET,Tue Nov 30 13:56:47 CET,0.0 0.712 1.007 1.267 1.485 1.67 1.868 2.052 2.369 2.528 2.691 2.817 3.135 3.275 3.552 3.822 4.079 4.201 4.433 4.668 5.037 5.267 5.481 5.814 6.147 6.468 6.781 7.083 7.469 7.846 8.197 8.641 9.115 9.589 10.125 10.707 11.272 11.894 12.59 13.358 14.142 15.026 16.121 17.252 18.609 20.193 22.084 24.305 27.051 30.546 35.062 39.145 41.764 43.582 44.926 45.934 46.664 47.227 47.656 48.048 48.343 48.555 48.731 48.881 48.963 49.03 49.099 49.127 49.144 49.152 49.15 49.143 49.132 49.1 49.055 48.994 48.931 48.879 48.809 48.751 48.697 48.591 48.521 48.457 48.413 48.311 48.202 48.074 48.005 47.809 47.762 47.661 47.556 47.335 47.197 47.041 46.873 46.681 46.455 46.151 44.765 -6 ,24175 ,TETRA ,17618073,Tue Nov 30 12:11:18 CET,Tue Nov 30 14:02:48 CET,0.0 0.718 0.992 1.214 1.405 1.571 1.727 1.882 2.203 2.351 2.487 2.58 2.889 3.022 3.298 3.571 3.851 3.987 4.239 4.491 4.868 5.097 5.318 5.644 5.986 6.316 6.624 6.933 7.324 7.713 8.119 8.6 9.058 9.519 10.044 10.661 11.276 11.914 12.599 13.36 14.186 15.157 16.321 17.477 18.856 20.455 22.346 24.53 27.197 30.548 34.917 38.903 41.461 43.221 44.485 45.45 46.191 46.733 47.119 47.459 47.728 47.954 48.126 48.24 48.336 48.405 48.466 48.525 48.557 48.576 48.591 48.6 48.6 48.582 48.564 48.55 48.534 48.499 48.444 48.406 48.354 48.244 48.154 48.07 48.03 47.947 47.843 47.714 47.648 47.449 47.423 47.335 47.238 47.02 46.887 46.744 46.578 46.332 46.039 45.632 44.39 -7 ,29167 ,TETRA ,17618074,Tue Nov 30 12:11:18 CET,Tue Nov 30 13:59:42 CET,0.0 0.785 1.111 1.432 1.723 1.968 2.188 2.393 2.797 3.003 3.19 3.35 3.684 3.839 4.144 4.442 4.727 4.855 5.117 5.382 5.76 6.012 6.244 6.553 6.879 7.214 7.522 7.831 8.246 8.655 9.054 9.505 9.978 10.498 11.082 11.684 12.252 12.861 13.53 14.285 15.115 16.083 17.202 18.297 19.64 21.249 23.116 25.308 28.028 31.377 35.761 39.725 42.309 44.133 45.446 46.414 47.129 47.676 48.086 48.445 48.706 48.917 49.083 49.214 49.328 49.403 49.469 49.489 49.488 49.509 49.504 49.493 49.487 49.477 49.455 49.412 49.356 49.28 49.214 49.167 49.106 49.033 48.988 48.941 48.919 48.84 48.729 48.617 48.55 48.34 48.295 48.204 48.106 47.882 47.762 47.63 47.457 47.232 46.957 46.585 45.542 -8 ,22976 ,TETRA ,17618075,Tue Nov 30 12:12:18 CET,Tue Nov 30 14:00:08 CET,0.0 0.72 1.008 1.244 1.465 1.662 1.835 1.997 2.308 2.449 2.585 2.677 2.99 3.117 3.369 3.614 3.853 3.969 4.185 4.396 4.694 4.885 5.09 5.399 5.711 6.048 6.382 6.692 7.083 7.464 7.83 8.297 8.791 9.261 9.791 10.413 10.99 11.638 12.363 13.143 13.969 14.904 16.068 17.272 18.731 20.403 22.386 24.723 27.51 30.973 35.419 39.33 41.843 43.585 44.829 45.724 46.419 47.029 47.488 47.873 48.16 48.396 48.546 48.613 48.686 48.766 48.818 48.838 48.85 48.84 48.812 48.775 48.74 48.701 48.673 48.654 48.629 48.587 48.506 48.437 48.371 48.284 48.226 48.168 48.137 48.046 47.934 47.817 47.757 47.57 47.555 47.486 47.383 47.09 46.948 46.789 46.604 46.387 46.124 45.748 44.519 -9 ,5726 ,TETRA ,17618076,Tue Nov 30 12:13:19 CET,Tue Nov 30 14:04:05 CET,0.0 0.7 1.02 1.257 1.47 1.68 1.866 2.037 2.364 2.523 2.68 2.788 3.113 3.254 3.522 3.764 3.981 4.085 4.293 4.504 4.81 5.01 5.213 5.535 5.844 6.122 6.395 6.67 7.027 7.365 7.704 8.121 8.545 8.99 9.523 10.092 10.608 11.186 11.845 12.595 13.394 14.321 15.444 16.583 17.95 19.519 21.358 23.535 26.228 29.535 33.913 37.991 40.641 42.491 43.838 44.861 45.613 46.153 46.564 46.969 47.26 47.469 47.629 47.738 47.838 47.933 47.991 48.026 48.039 48.032 48.009 47.98 47.956 47.929 47.901 47.854 47.785 47.708 47.631 47.583 47.535 47.443 47.359 47.268 47.225 47.136 47.045 46.941 46.885 46.682 46.595 46.471 46.354 46.124 45.994 45.842 45.659 45.461 45.212 44.835 43.432 -10 ,573 ,TETRA ,17618077,Tue Nov 30 12:16:19 CET,Tue Nov 30 14:04:16 CET,0.0 0.705 1.034 1.292 1.527 1.759 1.983 2.19 2.566 2.751 2.935 3.099 3.433 3.578 3.87 4.156 4.443 4.593 4.873 5.116 5.461 5.698 5.933 6.247 6.567 6.906 7.228 7.533 7.927 8.327 8.716 9.193 9.664 10.114 10.646 11.251 11.83 12.464 13.163 13.912 14.729 15.669 16.763 17.892 19.247 20.8 22.675 24.942 27.667 30.969 35.252 39.133 41.572 43.261 44.475 45.372 46.025 46.515 46.887 47.246 47.537 47.764 47.937 48.063 48.167 48.226 48.263 48.283 48.29 48.286 48.278 48.276 48.276 48.238 48.181 48.135 48.093 48.045 47.998 47.967 47.917 47.836 47.768 47.678 47.628 47.523 47.417 47.287 47.208 46.997 46.941 46.854 46.755 46.528 46.381 46.21 46.052 45.874 45.598 45.237 43.778 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_254_251.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_254_251.txt deleted file mode 100644 index 4a0b7cb2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_254_251.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28684 ,TETRA ,17618078,Tue Nov 30 12:16:19 CET,Tue Nov 30 14:07:07 CET,0.0 1.475 1.837 2.101 2.332 2.534 2.717 2.889 3.155 3.269 3.373 3.395 3.688 3.791 3.98 4.159 4.32 4.397 4.549 4.692 4.903 5.038 5.159 5.324 5.478 5.626 5.755 5.876 6.059 6.24 6.407 6.594 6.761 6.928 7.105 7.305 7.491 7.693 7.915 8.124 8.335 8.599 8.883 9.084 9.328 9.603 9.801 9.93 10.022 9.891 9.266 8.267 7.32 6.448 5.663 4.927 4.278 3.721 3.205 2.644 2.185 1.796 1.43 1.086 0.746 0.433 0.114 -0.191 -0.454 -0.754 -1.075 -1.319 -1.587 -1.868 -2.066 -2.273 -2.496 -2.732 -2.979 -3.143 -3.331 -3.631 -3.821 -4.012 -4.111 -4.311 -4.531 -4.771 -4.901 -5.22 -5.325 -5.481 -5.638 -5.964 -6.158 -6.381 -6.623 -6.88 -7.18 -7.561 -9.098 -2 ,10764 ,TETRA ,17618079,Tue Nov 30 12:19:20 CET,Tue Nov 30 14:14:29 CET,0.0 1.204 1.627 1.942 2.194 2.407 2.596 2.756 3.057 3.198 3.324 3.385 3.683 3.795 4.003 4.206 4.396 4.488 4.665 4.831 5.06 5.208 5.356 5.554 5.733 5.896 6.064 6.235 6.451 6.674 6.901 7.138 7.345 7.566 7.808 8.109 8.408 8.666 8.891 9.09 9.312 9.551 9.792 10.044 10.3 10.531 10.709 10.818 10.839 10.667 10.118 9.206 8.278 7.431 6.647 5.928 5.313 4.733 4.165 3.59 3.139 2.718 2.323 1.96 1.575 1.242 0.894 0.543 0.231 -0.098 -0.448 -0.746 -1.076 -1.419 -1.666 -1.911 -2.158 -2.432 -2.745 -2.952 -3.167 -3.497 -3.713 -3.956 -4.079 -4.296 -4.524 -4.784 -4.923 -5.252 -5.378 -5.544 -5.721 -6.1 -6.323 -6.573 -6.834 -7.14 -7.523 -8.05 -9.814 -3 ,3434 ,TETRA ,17618080,Tue Nov 30 12:20:21 CET,Tue Nov 30 14:12:02 CET,0.0 1.061 1.412 1.67 1.901 2.09 2.257 2.408 2.693 2.83 2.961 3.055 3.367 3.487 3.694 3.879 4.065 4.159 4.351 4.515 4.72 4.864 5.021 5.249 5.457 5.635 5.798 5.96 6.187 6.4 6.591 6.835 7.056 7.239 7.445 7.657 7.843 8.058 8.263 8.472 8.684 8.894 9.141 9.397 9.653 9.898 10.109 10.238 10.325 10.245 9.682 8.662 7.699 6.831 6.047 5.336 4.698 4.08 3.533 2.954 2.478 2.087 1.697 1.324 0.979 0.639 0.292 -0.003 -0.253 -0.513 -0.805 -1.053 -1.31 -1.596 -1.821 -2.034 -2.255 -2.491 -2.722 -2.877 -3.053 -3.346 -3.542 -3.744 -3.85 -4.049 -4.256 -4.489 -4.614 -4.927 -5.009 -5.145 -5.294 -5.643 -5.828 -6.037 -6.296 -6.627 -6.995 -7.451 -8.667 -4 ,20579 ,TETRA ,17618081,Tue Nov 30 12:20:21 CET,Tue Nov 30 14:11:00 CET,0.0 1.114 1.513 1.781 1.989 2.18 2.363 2.539 2.852 2.987 3.114 3.174 3.477 3.596 3.81 3.998 4.186 4.29 4.478 4.63 4.854 5.003 5.139 5.358 5.575 5.746 5.888 6.017 6.2 6.38 6.551 6.757 6.923 7.073 7.257 7.47 7.706 7.972 8.213 8.443 8.664 8.889 9.151 9.409 9.655 9.867 10.038 10.189 10.267 10.119 9.558 8.585 7.637 6.734 5.936 5.232 4.56 3.875 3.284 2.736 2.286 1.905 1.53 1.155 0.806 0.49 0.107 -0.266 -0.577 -0.915 -1.237 -1.49 -1.758 -2.019 -2.235 -2.457 -2.666 -2.879 -3.113 -3.285 -3.471 -3.776 -4.007 -4.253 -4.369 -4.603 -4.858 -5.133 -5.288 -5.632 -5.744 -5.91 -6.1 -6.523 -6.763 -7.019 -7.27 -7.553 -7.942 -8.388 -10.33 -5 ,14574 ,TETRA ,17618082,Tue Nov 30 12:20:21 CET,Tue Nov 30 14:08:13 CET,0.0 1.011 1.354 1.671 1.915 2.108 2.28 2.43 2.714 2.854 2.975 3.005 3.279 3.384 3.589 3.767 3.933 4.017 4.193 4.373 4.633 4.795 4.941 5.151 5.343 5.527 5.721 5.92 6.15 6.349 6.55 6.814 7.085 7.333 7.611 7.917 8.153 8.344 8.523 8.715 8.93 9.168 9.411 9.63 9.866 10.079 10.278 10.454 10.529 10.393 9.817 8.836 7.833 6.925 6.134 5.41 4.746 4.106 3.566 3.017 2.539 2.115 1.708 1.336 0.973 0.629 0.25 -0.079 -0.342 -0.632 -0.984 -1.294 -1.59 -1.878 -2.118 -2.38 -2.635 -2.884 -3.166 -3.371 -3.58 -3.918 -4.156 -4.4 -4.519 -4.752 -4.993 -5.236 -5.371 -5.7 -5.798 -5.948 -6.115 -6.491 -6.693 -6.898 -7.126 -7.424 -7.796 -8.274 -9.874 -6 ,22733 ,TETRA ,17618083,Tue Nov 30 12:20:21 CET,Tue Nov 30 14:08:01 CET,0.0 0.996 1.312 1.581 1.845 2.058 2.235 2.396 2.7 2.854 2.996 3.086 3.384 3.496 3.718 3.92 4.132 4.23 4.39 4.561 4.815 4.983 5.137 5.348 5.554 5.741 5.913 6.08 6.325 6.554 6.745 6.966 7.196 7.444 7.742 7.998 8.212 8.456 8.692 8.932 9.119 9.32 9.573 9.814 10.078 10.321 10.522 10.672 10.737 10.625 10.056 9.061 8.118 7.17 6.338 5.607 4.946 4.338 3.815 3.309 2.827 2.374 1.969 1.587 1.216 0.891 0.581 0.3 0.039 -0.236 -0.53 -0.772 -1.035 -1.348 -1.587 -1.821 -2.071 -2.334 -2.597 -2.779 -2.969 -3.269 -3.496 -3.75 -3.881 -4.15 -4.426 -4.711 -4.855 -5.179 -5.307 -5.478 -5.657 -6.058 -6.271 -6.487 -6.719 -6.987 -7.334 -7.816 -9.444 -7 ,23445 ,TETRA ,17618084,Tue Nov 30 12:20:23 CET,Tue Nov 30 14:08:01 CET,0.0 1.262 1.651 1.96 2.189 2.371 2.557 2.74 3.05 3.192 3.313 3.37 3.671 3.783 4.011 4.238 4.44 4.532 4.693 4.857 5.122 5.287 5.439 5.662 5.868 6.044 6.227 6.398 6.614 6.849 7.088 7.361 7.565 7.731 7.91 8.12 8.335 8.553 8.752 8.949 9.162 9.4 9.662 9.879 10.1 10.333 10.611 10.847 10.927 10.826 10.247 9.197 8.152 7.202 6.373 5.624 4.971 4.383 3.882 3.325 2.825 2.409 2.012 1.641 1.297 0.98 0.631 0.284 -0.009 -0.32 -0.663 -0.935 -1.247 -1.573 -1.811 -2.056 -2.302 -2.55 -2.805 -2.991 -3.196 -3.515 -3.72 -3.917 -4.02 -4.243 -4.489 -4.739 -4.865 -5.198 -5.367 -5.537 -5.696 -6.027 -6.217 -6.449 -6.699 -6.999 -7.365 -7.844 -9.327 -8 ,24887 ,TETRA ,17618085,Tue Nov 30 12:21:20 CET,Tue Nov 30 14:09:07 CET,0.0 1.153 1.524 1.802 2.041 2.262 2.464 2.652 2.974 3.122 3.265 3.346 3.647 3.764 3.975 4.152 4.325 4.417 4.585 4.739 4.98 5.135 5.271 5.471 5.683 5.902 6.111 6.3 6.535 6.773 6.985 7.211 7.43 7.64 7.877 8.099 8.274 8.485 8.744 8.983 9.183 9.427 9.734 9.984 10.263 10.555 10.8 10.986 11.031 10.902 10.357 9.376 8.462 7.594 6.749 5.94 5.235 4.62 4.084 3.567 3.123 2.699 2.301 1.924 1.567 1.244 0.916 0.61 0.34 0.061 -0.244 -0.487 -0.739 -1.044 -1.296 -1.548 -1.816 -2.093 -2.405 -2.621 -2.819 -3.127 -3.353 -3.582 -3.697 -3.936 -4.19 -4.457 -4.6 -4.934 -5.066 -5.234 -5.416 -5.815 -6.034 -6.287 -6.554 -6.83 -7.19 -7.706 -8.922 -9 ,19283 ,TETRA ,17618086,Tue Nov 30 12:21:22 CET,Tue Nov 30 14:09:06 CET,0.0 1.202 1.591 1.882 2.118 2.336 2.527 2.706 3.044 3.204 3.366 3.461 3.757 3.866 4.077 4.285 4.485 4.583 4.777 4.943 5.144 5.283 5.423 5.603 5.79 5.981 6.173 6.359 6.606 6.862 7.075 7.315 7.523 7.692 7.89 8.097 8.279 8.47 8.678 8.898 9.166 9.461 9.702 9.904 10.145 10.391 10.6 10.773 10.896 10.823 10.292 9.35 8.406 7.478 6.571 5.612 4.747 3.948 3.251 2.58 2.015 1.498 0.969 0.486 0.076 -0.286 -0.677 -1.029 -1.324 -1.599 -1.866 -2.107 -2.369 -2.636 -2.837 -3.034 -3.229 -3.426 -3.637 -3.794 -3.978 -4.278 -4.471 -4.666 -4.772 -4.988 -5.213 -5.46 -5.59 -5.914 -6.044 -6.192 -6.353 -6.721 -6.945 -7.166 -7.39 -7.66 -7.973 -8.389 -9.66 -10 ,24688 ,TETRA ,17618087,Tue Nov 30 12:23:21 CET,Tue Nov 30 14:13:27 CET,0.0 1.413 1.82 2.133 2.42 2.654 2.846 3.02 3.324 3.459 3.587 3.638 3.927 4.045 4.253 4.435 4.615 4.705 4.88 5.034 5.239 5.379 5.51 5.666 5.827 6.023 6.214 6.389 6.617 6.831 7.015 7.204 7.38 7.536 7.71 7.894 8.065 8.28 8.503 8.701 8.915 9.145 9.381 9.634 9.916 10.161 10.392 10.572 10.606 10.453 9.939 9.03 8.045 7.126 6.352 5.6 4.942 4.337 3.803 3.277 2.809 2.4 1.999 1.619 1.245 0.895 0.542 0.198 -0.121 -0.456 -0.825 -1.128 -1.437 -1.753 -1.999 -2.262 -2.509 -2.767 -3.044 -3.242 -3.461 -3.791 -4.015 -4.242 -4.35 -4.557 -4.805 -5.117 -5.275 -5.596 -5.715 -5.881 -6.053 -6.45 -6.667 -6.897 -7.143 -7.438 -7.795 -8.225 -9.59 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_254_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_254_252.txt deleted file mode 100644 index 95924f1c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_254_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23544 ,KEBNE ,17076813,Sat Dec 25 05:56:20 CET,Sat Dec 25 07:29:14 CET,0.0 0.876 1.177 1.383 1.519 1.668 1.812 1.935 2.133 2.211 2.285 2.243 2.488 2.55 2.635 2.714 2.799 2.845 2.913 2.979 3.099 3.159 3.209 3.29 3.367 3.427 3.473 3.525 3.581 3.608 3.618 3.611 3.581 3.533 3.473 3.403 3.312 3.177 3.032 2.86 2.673 2.457 2.099 1.654 1.09 0.415 -0.493 -1.759 -3.618 -6.379 -10.74 -15.545 -19.184 -22.144 -24.549 -26.604 -28.399 -29.933 -31.212 -32.517 -33.607 -34.538 -35.406 -36.228 -36.984 -37.644 -38.317 -38.921 -39.472 -40.059 -40.64 -41.093 -41.546 -42.025 -42.403 -42.789 -43.182 -43.635 -44.212 -44.643 -45.089 -45.791 -46.264 -46.748 -47.0 -47.513 -48.028 -48.576 -48.852 -49.421 -49.759 -50.089 -50.431 -51.137 -51.514 -51.926 -52.354 -52.808 -53.349 -54.066 -56.282 -2 ,32067 ,KEBNE ,17076814,Sat Dec 25 05:58:28 CET,Sat Dec 25 07:30:31 CET,0.0 0.966 1.327 1.58 1.759 1.926 2.082 2.2 2.431 2.54 2.626 2.589 2.829 2.883 2.997 3.131 3.238 3.285 3.374 3.455 3.558 3.603 3.648 3.726 3.792 3.824 3.864 3.9 3.905 3.904 3.912 3.913 3.884 3.84 3.787 3.748 3.678 3.569 3.421 3.242 3.031 2.724 2.323 1.855 1.205 0.368 -0.764 -2.23 -4.2 -7.049 -11.532 -16.434 -20.174 -23.176 -25.673 -27.873 -29.776 -31.439 -32.791 -34.08 -35.158 -36.104 -37.014 -37.867 -38.661 -39.38 -40.107 -40.732 -41.259 -41.792 -42.331 -42.782 -43.234 -43.697 -44.09 -44.504 -44.904 -45.308 -45.71 -45.983 -46.27 -46.729 -47.052 -47.39 -47.571 -47.939 -48.317 -48.719 -48.919 -49.362 -49.581 -49.827 -50.121 -50.815 -51.209 -51.625 -52.058 -52.548 -53.114 -53.778 -55.847 -3 ,26682 ,KEBNE ,17076815,Sat Dec 25 06:01:37 CET,Sat Dec 25 07:35:45 CET,0.0 0.972 1.294 1.508 1.658 1.802 1.935 2.044 2.22 2.297 2.36 2.281 2.507 2.555 2.637 2.713 2.785 2.818 2.903 2.987 3.07 3.125 3.168 3.187 3.207 3.231 3.251 3.251 3.252 3.284 3.3 3.27 3.218 3.164 3.112 3.043 2.932 2.793 2.664 2.47 2.219 1.942 1.538 1.022 0.344 -0.474 -1.574 -3.015 -5.002 -7.91 -12.374 -17.307 -21.11 -24.18 -26.664 -28.758 -30.555 -32.139 -33.481 -34.82 -35.974 -36.956 -37.836 -38.656 -39.41 -40.076 -40.779 -41.413 -41.95 -42.487 -43.044 -43.504 -43.958 -44.455 -44.851 -45.258 -45.676 -46.082 -46.493 -46.79 -47.098 -47.601 -48.028 -48.522 -48.771 -49.276 -49.792 -50.32 -50.6 -51.186 -51.512 -51.824 -52.173 -52.886 -53.232 -53.619 -54.054 -54.529 -55.035 -55.659 -57.741 -4 ,4942 ,KEBNE ,17076816,Sat Dec 25 06:03:42 CET,Sat Dec 25 07:38:23 CET,0.0 1.036 1.403 1.662 1.873 2.043 2.202 2.332 2.512 2.591 2.671 2.675 2.934 2.988 3.09 3.197 3.293 3.337 3.407 3.469 3.544 3.586 3.637 3.707 3.762 3.796 3.816 3.823 3.826 3.814 3.808 3.818 3.823 3.839 3.826 3.744 3.639 3.511 3.36 3.183 2.956 2.649 2.214 1.719 1.088 0.275 -0.817 -2.202 -4.081 -6.822 -11.054 -15.786 -19.423 -22.34 -24.846 -26.965 -28.742 -30.333 -31.643 -32.898 -33.944 -34.883 -35.766 -36.586 -37.335 -38.019 -38.722 -39.327 -39.856 -40.39 -40.936 -41.39 -41.85 -42.345 -42.739 -43.142 -43.546 -43.944 -44.34 -44.609 -44.9 -45.389 -45.741 -46.086 -46.251 -46.599 -46.969 -47.357 -47.561 -48.003 -48.183 -48.409 -48.653 -49.178 -49.487 -49.83 -50.184 -50.579 -51.017 -51.614 -53.438 -5 ,30252 ,KEBNE ,17076817,Sat Dec 25 06:04:45 CET,Sat Dec 25 07:37:28 CET,0.0 0.849 1.127 1.357 1.554 1.705 1.849 2.004 2.247 2.348 2.442 2.428 2.675 2.734 2.833 2.929 3.026 3.065 3.128 3.19 3.276 3.323 3.36 3.425 3.496 3.545 3.575 3.601 3.652 3.697 3.729 3.748 3.715 3.669 3.606 3.512 3.432 3.371 3.278 3.122 2.952 2.728 2.378 1.948 1.356 0.585 -0.472 -1.851 -3.764 -6.534 -10.841 -15.615 -19.335 -22.363 -24.895 -27.126 -28.991 -30.616 -31.991 -33.294 -34.371 -35.331 -36.281 -37.165 -37.931 -38.628 -39.342 -39.947 -40.48 -41.054 -41.646 -42.124 -42.606 -43.089 -43.458 -43.852 -44.285 -44.729 -45.161 -45.454 -45.757 -46.22 -46.537 -46.851 -47.006 -47.336 -47.687 -48.067 -48.267 -48.703 -48.911 -49.141 -49.368 -49.86 -50.139 -50.446 -50.774 -51.159 -51.624 -52.209 -53.86 -6 ,18708 ,KEBNE ,17076818,Sat Dec 25 06:04:45 CET,Sat Dec 25 07:37:16 CET,0.0 0.895 1.173 1.425 1.615 1.754 1.875 2.004 2.23 2.3 2.352 2.272 2.51 2.58 2.701 2.79 2.862 2.899 2.987 3.064 3.15 3.19 3.224 3.278 3.332 3.388 3.442 3.479 3.501 3.51 3.508 3.488 3.454 3.411 3.346 3.248 3.127 2.962 2.765 2.537 2.286 1.969 1.576 1.127 0.499 -0.33 -1.446 -2.895 -4.946 -7.838 -12.202 -17.093 -20.876 -23.89 -26.355 -28.472 -30.298 -31.891 -33.224 -34.516 -35.606 -36.577 -37.461 -38.273 -39.027 -39.711 -40.419 -41.036 -41.553 -42.095 -42.668 -43.147 -43.626 -44.093 -44.448 -44.813 -45.199 -45.606 -46.029 -46.316 -46.61 -47.074 -47.386 -47.713 -47.892 -48.242 -48.601 -48.991 -49.185 -49.619 -49.796 -50.017 -50.254 -50.741 -51.015 -51.325 -51.673 -52.055 -52.489 -53.093 -55.104 -7 ,20749 ,KEBNE ,17076819,Sat Dec 25 06:13:08 CET,Sat Dec 25 07:45:21 CET,0.0 1.01 1.331 1.573 1.756 1.891 2.007 2.106 2.262 2.336 2.411 2.373 2.602 2.655 2.778 2.884 2.966 3.002 3.076 3.145 3.229 3.269 3.292 3.336 3.378 3.405 3.425 3.435 3.448 3.46 3.457 3.411 3.368 3.345 3.307 3.243 3.145 2.992 2.814 2.597 2.356 2.086 1.702 1.231 0.62 -0.174 -1.288 -2.746 -4.7 -7.516 -11.899 -16.662 -20.428 -23.531 -26.105 -28.332 -30.121 -31.673 -33.0 -34.275 -35.362 -36.299 -37.184 -38.038 -38.787 -39.456 -40.156 -40.777 -41.306 -41.867 -42.466 -42.923 -43.399 -43.92 -44.317 -44.708 -45.093 -45.47 -45.837 -46.101 -46.379 -46.836 -47.156 -47.478 -47.649 -47.996 -48.363 -48.737 -48.93 -49.38 -49.602 -49.836 -50.093 -50.613 -50.873 -51.173 -51.583 -52.097 -52.646 -53.341 -55.541 -8 ,16183 ,KEBNE ,17076820,Sat Dec 25 06:13:08 CET,Sat Dec 25 07:45:25 CET,0.0 0.841 1.121 1.336 1.518 1.687 1.857 1.997 2.207 2.3 2.391 2.379 2.643 2.719 2.857 2.976 3.073 3.119 3.197 3.26 3.339 3.393 3.445 3.525 3.601 3.668 3.739 3.799 3.852 3.868 3.884 3.927 3.973 4.0 3.98 3.943 3.906 3.857 3.783 3.667 3.526 3.356 3.113 2.803 2.363 1.671 0.66 -0.605 -2.38 -5.005 -9.302 -14.19 -17.942 -21.016 -23.473 -25.524 -27.27 -28.748 -29.984 -31.225 -32.287 -33.225 -34.146 -35.063 -35.908 -36.661 -37.402 -38.031 -38.581 -39.143 -39.717 -40.216 -40.854 -41.605 -42.186 -42.801 -43.448 -44.106 -44.753 -45.188 -45.626 -46.303 -46.756 -47.214 -47.458 -47.97 -48.503 -49.042 -49.314 -49.88 -50.185 -50.481 -50.783 -51.476 -51.865 -52.272 -52.686 -53.142 -53.654 -54.256 -55.82 -9 ,19068 ,KEBNE ,17076821,Sat Dec 25 06:14:11 CET,Sat Dec 25 07:48:16 CET,0.0 0.787 1.05 1.288 1.488 1.633 1.752 1.871 2.061 2.132 2.201 2.161 2.403 2.448 2.531 2.625 2.692 2.722 2.789 2.86 2.987 3.057 3.096 3.124 3.139 3.157 3.184 3.218 3.263 3.304 3.312 3.294 3.262 3.211 3.149 3.081 3.016 2.912 2.764 2.59 2.351 2.04 1.628 1.145 0.545 -0.196 -1.204 -2.578 -4.486 -7.18 -11.417 -16.193 -19.87 -22.823 -25.251 -27.327 -29.08 -30.601 -31.912 -33.191 -34.242 -35.173 -36.034 -36.818 -37.552 -38.248 -38.967 -39.591 -40.129 -40.698 -41.295 -41.758 -42.24 -42.76 -43.155 -43.539 -43.927 -44.338 -44.775 -45.074 -45.366 -45.839 -46.188 -46.534 -46.707 -47.069 -47.434 -47.792 -47.977 -48.412 -48.605 -48.805 -49.025 -49.555 -49.828 -50.108 -50.417 -50.768 -51.163 -51.753 -53.56 -10 ,31337 ,KEBNE ,17076822,Sat Dec 25 06:14:10 CET,Sat Dec 25 07:46:30 CET,0.0 0.706 0.965 1.167 1.316 1.453 1.574 1.693 1.931 2.042 2.149 2.149 2.402 2.485 2.632 2.749 2.851 2.892 2.967 3.054 3.186 3.258 3.319 3.387 3.439 3.485 3.521 3.56 3.605 3.628 3.63 3.607 3.566 3.499 3.426 3.344 3.244 3.116 2.95 2.738 2.501 2.18 1.721 1.216 0.537 -0.295 -1.364 -2.792 -4.807 -7.673 -12.074 -16.893 -20.699 -23.765 -26.286 -28.518 -30.372 -31.919 -33.243 -34.595 -35.73 -36.729 -37.684 -38.562 -39.347 -40.019 -40.709 -41.339 -41.869 -42.408 -42.99 -43.487 -43.986 -44.482 -44.854 -45.239 -45.637 -46.047 -46.467 -46.806 -47.244 -47.953 -48.423 -48.926 -49.182 -49.696 -50.219 -50.754 -51.04 -51.639 -51.992 -52.302 -52.613 -53.285 -53.656 -54.066 -54.517 -55.023 -55.552 -56.207 -58.323 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_256_67.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_256_67.txt deleted file mode 100644 index 57c9631f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_256_67.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18538 ,TETRA ,17618088,Tue Nov 30 12:23:22 CET,Tue Nov 30 14:12:18 CET,0.0 1.209 1.738 2.245 2.706 3.117 3.503 3.887 4.617 4.958 5.294 5.661 6.28 6.603 7.251 7.881 8.486 8.782 9.359 9.938 10.791 11.345 11.85 12.531 13.211 13.884 14.557 15.237 16.134 17.005 17.857 18.916 19.965 20.999 22.239 23.692 25.135 26.768 28.588 30.604 32.805 35.362 38.452 41.706 45.723 50.415 56.139 63.016 71.624 82.853 98.29 113.11 123.244 130.624 136.192 140.657 144.179 147.061 149.356 151.495 153.213 154.629 155.869 156.969 157.912 158.704 159.505 160.171 160.709 161.26 161.801 162.222 162.634 163.028 163.312 163.589 163.852 164.122 164.376 164.53 164.686 164.897 165.023 165.138 165.195 165.302 165.386 165.457 165.495 165.464 165.557 165.57 165.575 165.532 165.485 165.434 165.363 165.249 165.066 164.773 163.535 -2 ,23671 ,TETRA ,17618089,Tue Nov 30 12:23:22 CET,Tue Nov 30 14:10:51 CET,0.0 1.09 1.652 2.119 2.543 2.955 3.335 3.693 4.394 4.732 5.064 5.429 6.043 6.367 7.021 7.66 8.283 8.585 9.183 9.767 10.551 11.027 11.501 12.221 12.935 13.627 14.305 14.965 15.846 16.755 17.65 18.718 19.785 20.855 22.111 23.563 25.004 26.618 28.398 30.375 32.545 35.069 38.144 41.402 45.406 50.077 55.738 62.602 71.266 82.377 97.491 112.009 121.964 129.294 134.854 139.302 142.812 145.685 148.0 150.175 151.888 153.269 154.52 155.642 156.601 157.424 158.22 158.894 159.449 159.998 160.525 160.917 161.311 161.706 162.004 162.288 162.557 162.822 163.063 163.222 163.382 163.596 163.729 163.874 163.944 164.042 164.115 164.167 164.193 164.169 164.276 164.298 164.31 164.218 164.151 164.091 164.01 163.889 163.726 163.438 161.999 -3 ,23010 ,TETRA ,17618090,Tue Nov 30 12:23:23 CET,Tue Nov 30 14:10:49 CET,0.0 1.302 1.881 2.375 2.789 3.187 3.589 3.971 4.688 5.036 5.377 5.742 6.373 6.702 7.344 7.98 8.614 8.924 9.529 10.121 10.983 11.564 12.145 12.997 13.834 14.667 15.499 16.326 17.411 18.505 19.57 20.732 21.794 22.857 24.122 25.6 27.068 28.705 30.513 32.495 34.649 37.191 40.312 43.585 47.555 52.182 57.826 64.69 73.462 84.803 100.251 115.148 125.292 132.688 138.205 142.581 146.071 148.958 151.215 153.328 155.036 156.442 157.719 158.858 159.85 160.715 161.57 162.278 162.846 163.399 163.944 164.371 164.804 165.233 165.525 165.793 166.065 166.321 166.569 166.743 166.909 167.15 167.297 167.429 167.491 167.6 167.701 167.791 167.828 167.797 167.906 167.939 167.966 167.971 167.935 167.881 167.828 167.731 167.558 167.26 166.183 -4 ,32222 ,TETRA ,17618091,Tue Nov 30 12:24:21 CET,Tue Nov 30 14:09:57 CET,0.0 1.044 1.553 1.991 2.405 2.814 3.205 3.576 4.273 4.605 4.939 5.3 5.912 6.24 6.895 7.523 8.135 8.435 9.026 9.609 10.483 11.059 11.58 12.28 12.98 13.685 14.375 15.041 15.929 16.821 17.686 18.744 19.789 20.828 22.08 23.519 24.958 26.613 28.427 30.402 32.566 35.114 38.232 41.561 45.58 50.234 55.954 62.845 71.529 82.636 97.726 112.261 122.195 129.499 135.043 139.496 143.023 145.935 148.266 150.39 152.057 153.429 154.664 155.778 156.724 157.512 158.275 158.925 159.487 160.066 160.616 161.043 161.459 161.852 162.149 162.44 162.711 162.964 163.21 163.364 163.502 163.695 163.834 163.972 164.036 164.152 164.238 164.33 164.377 164.348 164.446 164.463 164.465 164.429 164.404 164.362 164.279 164.166 164.02 163.746 161.84 -5 ,20038 ,TETRA ,17618092,Tue Nov 30 12:24:21 CET,Tue Nov 30 14:10:03 CET,0.0 1.296 1.849 2.328 2.78 3.185 3.562 3.934 4.64 4.976 5.31 5.7 6.342 6.669 7.301 7.927 8.55 8.859 9.466 10.064 10.959 11.552 12.139 13.001 13.836 14.67 15.504 16.329 17.338 18.23 19.1 20.183 21.261 22.332 23.617 25.078 26.497 28.11 29.914 31.9 34.057 36.588 39.675 42.93 46.933 51.595 57.249 64.102 72.762 84.017 99.528 114.329 124.414 131.858 137.465 141.907 145.398 148.225 150.476 152.574 154.266 155.694 156.929 158.001 158.939 159.729 160.525 161.215 161.775 162.341 162.898 163.31 163.7 164.095 164.384 164.655 164.912 165.156 165.395 165.558 165.718 165.952 166.096 166.22 166.28 166.396 166.492 166.569 166.613 166.6 166.722 166.752 166.759 166.744 166.712 166.64 166.56 166.442 166.243 165.906 164.461 -6 ,775 ,TETRA ,17618093,Tue Nov 30 12:24:21 CET,Tue Nov 30 14:10:01 CET,0.0 1.571 2.127 2.592 3.014 3.418 3.81 4.203 4.955 5.302 5.635 5.998 6.621 6.948 7.575 8.197 8.816 9.119 9.718 10.317 11.206 11.793 12.375 13.243 14.1 14.939 15.791 16.638 17.659 18.56 19.412 20.459 21.498 22.539 23.781 25.242 26.701 28.341 30.2 32.229 34.403 36.952 40.026 43.24 47.182 51.847 57.564 64.444 73.051 84.225 99.738 114.581 124.654 132.031 137.622 142.076 145.6 148.5 150.8 152.894 154.542 155.903 157.147 158.274 159.243 160.082 160.904 161.604 162.18 162.742 163.285 163.685 164.079 164.48 164.77 165.036 165.306 165.572 165.82 165.985 166.146 166.35 166.476 166.61 166.675 166.788 166.872 166.948 166.977 166.939 167.037 167.046 167.033 166.97 166.934 166.893 166.844 166.752 166.58 166.293 165.161 -7 ,12161 ,TETRA ,17618094,Tue Nov 30 12:24:22 CET,Tue Nov 30 14:10:11 CET,0.0 1.203 1.765 2.246 2.686 3.088 3.489 3.891 4.637 4.988 5.334 5.703 6.314 6.635 7.282 7.905 8.512 8.817 9.428 10.017 10.886 11.472 12.048 12.913 13.776 14.591 15.304 15.953 16.819 17.69 18.561 19.641 20.709 21.775 23.047 24.539 26.025 27.654 29.449 31.448 33.628 36.202 39.344 42.603 46.562 51.237 56.946 63.856 72.583 83.816 99.262 114.153 124.303 131.751 137.413 141.885 145.394 148.337 150.686 152.796 154.457 155.848 157.116 158.238 159.184 159.987 160.792 161.438 161.946 162.47 162.995 163.413 163.823 164.238 164.535 164.806 165.075 165.336 165.576 165.724 165.879 166.12 166.264 166.401 166.465 166.581 166.679 166.76 166.793 166.758 166.875 166.903 166.909 166.883 166.861 166.826 166.747 166.585 166.384 166.053 164.237 -8 ,609 ,TETRA ,17618095,Tue Nov 30 12:24:24 CET,Tue Nov 30 14:10:11 CET,0.0 1.263 1.78 2.239 2.65 3.044 3.431 3.807 4.532 4.881 5.219 5.587 6.205 6.526 7.173 7.796 8.4 8.7 9.302 9.882 10.684 11.172 11.635 12.321 13.011 13.7 14.38 15.061 15.956 16.836 17.721 18.817 19.884 20.931 22.2 23.664 25.123 26.786 28.618 30.655 32.863 35.421 38.522 41.798 45.839 50.519 56.191 63.105 71.798 82.946 98.363 113.259 123.378 130.867 136.503 140.974 144.524 147.431 149.729 151.865 153.58 154.989 156.186 157.236 158.207 159.057 159.883 160.587 161.174 161.744 162.29 162.695 163.091 163.466 163.734 163.997 164.238 164.478 164.732 164.903 165.074 165.313 165.448 165.57 165.631 165.731 165.817 165.897 165.933 165.907 166.017 166.034 166.033 166.003 165.97 165.922 165.834 165.722 165.57 165.253 163.503 -9 ,17014 ,TETRA ,17618096,Tue Nov 30 12:25:21 CET,Tue Nov 30 14:11:44 CET,0.0 1.271 1.815 2.287 2.702 3.092 3.437 3.761 4.392 4.685 4.961 5.266 5.784 6.05 6.577 7.082 7.578 7.825 8.299 8.77 9.478 9.944 10.404 11.088 11.761 12.425 13.093 13.756 14.634 15.49 16.334 17.386 18.435 19.476 20.723 22.186 23.628 25.25 27.075 29.096 31.277 33.817 36.932 40.209 44.219 48.911 54.664 61.571 70.278 81.675 97.163 111.958 122.074 129.411 134.897 139.233 142.724 145.639 147.918 149.985 151.666 153.08 154.289 155.359 156.325 157.158 157.971 158.63 159.174 159.728 160.27 160.683 161.088 161.485 161.774 162.063 162.332 162.583 162.828 162.991 163.15 163.373 163.499 163.628 163.696 163.822 163.92 164.005 164.033 163.985 164.097 164.112 164.101 164.061 164.048 164.021 163.958 163.855 163.652 163.244 161.668 -10 ,28443 ,TETRA ,17618097,Tue Nov 30 12:26:22 CET,Tue Nov 30 14:13:01 CET,0.0 1.035 1.576 2.037 2.488 2.914 3.317 3.7 4.428 4.778 5.12 5.502 6.122 6.408 6.921 7.417 7.905 8.149 8.632 9.121 9.828 10.288 10.763 11.473 12.165 12.836 13.498 14.169 15.066 15.934 16.794 17.879 18.947 19.999 21.265 22.729 24.173 25.798 27.599 29.597 31.77 34.3 37.406 40.678 44.635 49.294 55.033 61.934 70.655 82.016 97.553 112.423 122.563 129.999 135.636 140.101 143.618 146.49 148.753 150.891 152.636 154.07 155.34 156.431 157.332 158.098 158.87 159.541 160.105 160.659 161.2 161.631 162.037 162.406 162.692 162.992 163.281 163.538 163.764 163.923 164.092 164.339 164.495 164.629 164.689 164.781 164.874 164.978 165.013 164.984 165.085 165.089 165.092 165.092 165.058 165.006 164.929 164.811 164.646 164.341 162.512 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_266_224.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_266_224.txt deleted file mode 100644 index 63c5c83e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_266_224.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30177 ,TETRA ,17618098,Tue Nov 30 12:26:24 CET,Tue Nov 30 14:15:06 CET,0.0 1.294 1.667 1.958 2.206 2.421 2.607 2.78 3.08 3.204 3.332 3.607 3.684 3.781 3.96 4.124 4.262 4.327 4.459 4.591 4.796 4.927 5.047 5.215 5.378 5.53 5.678 5.829 6.023 6.218 6.402 6.616 6.836 7.059 7.343 7.647 7.908 8.233 8.57 8.909 9.273 9.635 10.032 10.414 10.824 11.263 11.749 12.183 12.536 12.79 12.782 12.266 11.574 10.858 10.225 9.582 8.919 8.318 7.804 7.227 6.722 6.297 5.896 5.495 5.099 4.731 4.355 4.03 3.752 3.46 3.169 2.915 2.626 2.337 2.115 1.872 1.602 1.322 1.048 0.86 0.673 0.385 0.172 -0.055 -0.187 -0.455 -0.696 -0.969 -1.118 -1.24 -1.604 -1.779 -1.953 -2.328 -2.554 -2.836 -3.157 -3.541 -4.004 -4.657 -8.521 -2 ,27221 ,TETRA ,17618099,Tue Nov 30 12:26:22 CET,Tue Nov 30 14:17:27 CET,0.0 1.402 1.855 2.124 2.357 2.573 2.757 2.926 3.214 3.339 3.468 3.746 3.821 3.922 4.13 4.364 4.581 4.674 4.839 4.989 5.222 5.387 5.541 5.745 5.928 6.098 6.258 6.425 6.672 6.91 7.142 7.411 7.66 7.899 8.15 8.413 8.701 9.016 9.329 9.687 10.025 10.355 10.75 11.171 11.632 12.08 12.541 12.986 13.439 13.773 13.78 13.27 12.466 11.655 10.965 10.322 9.71 9.167 8.659 8.065 7.557 7.146 6.746 6.322 5.904 5.524 5.146 4.805 4.505 4.194 3.839 3.539 3.254 2.982 2.753 2.492 2.211 1.896 1.565 1.35 1.141 0.826 0.607 0.363 0.244 0.015 -0.254 -0.534 -0.67 -0.798 -1.184 -1.372 -1.586 -2.078 -2.335 -2.576 -2.86 -3.24 -3.742 -4.499 -6.886 -3 ,22678 ,TETRA ,17618100,Tue Nov 30 12:26:22 CET,Tue Nov 30 14:13:54 CET,0.0 1.823 2.152 2.383 2.584 2.749 2.874 3.004 3.261 3.367 3.468 3.687 3.746 3.84 4.026 4.213 4.385 4.46 4.604 4.74 4.96 5.099 5.215 5.388 5.567 5.752 5.926 6.097 6.321 6.531 6.73 6.949 7.17 7.413 7.688 8.002 8.301 8.6 8.911 9.253 9.62 9.989 10.361 10.7 11.133 11.608 12.072 12.547 13.002 13.347 13.342 12.84 12.113 11.358 10.63 9.974 9.407 8.816 8.253 7.648 7.141 6.733 6.327 5.934 5.558 5.173 4.757 4.397 4.074 3.743 3.441 3.165 2.848 2.54 2.304 2.06 1.796 1.521 1.255 1.068 0.867 0.578 0.375 0.133 0.003 -0.264 -0.531 -0.79 -0.934 -1.069 -1.45 -1.624 -1.8 -2.238 -2.479 -2.733 -3.036 -3.429 -3.916 -4.579 -7.387 -4 ,22248 ,TETRA ,17618101,Tue Nov 30 12:27:19 CET,Tue Nov 30 14:15:18 CET,0.0 1.857 2.193 2.452 2.659 2.825 3.004 3.171 3.421 3.538 3.67 3.945 4.025 4.125 4.31 4.493 4.667 4.748 4.901 5.048 5.267 5.415 5.559 5.755 5.944 6.135 6.32 6.493 6.703 6.917 7.11 7.306 7.501 7.701 7.949 8.256 8.539 8.841 9.196 9.536 9.856 10.229 10.628 10.998 11.449 11.904 12.354 12.814 13.186 13.427 13.407 12.896 12.099 11.175 10.372 9.688 9.074 8.507 8.02 7.5 6.978 6.469 5.975 5.55 5.191 4.869 4.518 4.189 3.894 3.591 3.251 2.953 2.646 2.327 2.101 1.86 1.604 1.34 1.068 0.881 0.682 0.381 0.16 -0.076 -0.198 -0.444 -0.729 -1.038 -1.193 -1.32 -1.687 -1.872 -2.047 -2.44 -2.678 -2.949 -3.241 -3.559 -3.944 -4.536 -7.973 -5 ,8628 ,TETRA ,17618102,Tue Nov 30 12:27:21 CET,Tue Nov 30 14:16:38 CET,0.0 1.592 1.941 2.204 2.422 2.608 2.771 2.912 3.168 3.289 3.408 3.672 3.74 3.82 3.984 4.138 4.276 4.341 4.472 4.596 4.779 4.911 5.045 5.242 5.412 5.564 5.717 5.875 6.087 6.28 6.469 6.68 6.86 7.04 7.25 7.475 7.73 8.011 8.255 8.507 8.781 9.079 9.434 9.801 10.184 10.571 10.954 11.364 11.851 12.218 12.254 11.809 11.163 10.408 9.662 8.96 8.333 7.757 7.229 6.668 6.2 5.779 5.351 4.936 4.562 4.238 3.855 3.483 3.191 2.9 2.561 2.263 1.951 1.648 1.426 1.188 0.934 0.665 0.386 0.189 -0.005 -0.304 -0.53 -0.789 -0.925 -1.198 -1.478 -1.757 -1.911 -2.031 -2.396 -2.584 -2.778 -3.214 -3.463 -3.742 -4.042 -4.392 -4.846 -5.438 -8.006 -6 ,5173 ,TETRA ,17618103,Tue Nov 30 12:27:19 CET,Tue Nov 30 14:19:32 CET,0.0 1.181 1.534 1.795 2.014 2.201 2.365 2.522 2.778 2.883 2.978 3.195 3.256 3.342 3.494 3.63 3.778 3.862 4.037 4.199 4.435 4.6 4.755 4.965 5.151 5.318 5.5 5.676 5.893 6.108 6.29 6.505 6.736 6.95 7.206 7.532 7.838 8.129 8.413 8.711 9.031 9.397 9.805 10.214 10.675 11.108 11.511 11.947 12.418 12.755 12.793 12.228 11.512 10.796 10.096 9.466 8.873 8.271 7.728 7.161 6.696 6.306 5.921 5.53 5.12 4.748 4.374 4.054 3.761 3.435 3.122 2.86 2.579 2.274 2.048 1.817 1.552 1.286 1.018 0.812 0.588 0.253 0.038 -0.193 -0.317 -0.559 -0.808 -1.083 -1.239 -1.363 -1.706 -1.883 -2.084 -2.512 -2.74 -3.015 -3.317 -3.67 -4.121 -4.744 -7.44 -7 ,30855 ,TETRA ,17618104,Tue Nov 30 12:27:18 CET,Tue Nov 30 14:07:14 CET,0.0 1.718 2.072 2.328 2.545 2.719 2.875 3.035 3.303 3.405 3.507 3.754 3.836 3.949 4.178 4.389 4.583 4.671 4.833 4.998 5.242 5.402 5.538 5.715 5.895 6.086 6.279 6.461 6.703 6.933 7.142 7.4 7.649 7.867 8.134 8.426 8.674 8.967 9.299 9.612 9.942 10.309 10.683 11.057 11.498 11.981 12.481 13.009 13.524 13.806 13.866 13.466 12.788 12.055 11.329 10.659 10.064 9.461 8.891 8.345 7.9 7.473 7.061 6.7 6.365 6.035 5.657 5.301 4.994 4.685 4.35 4.078 3.792 3.502 3.295 3.075 2.829 2.544 2.252 2.054 1.847 1.521 1.283 1.036 0.918 0.675 0.405 0.121 -0.041 -0.175 -0.514 -0.688 -0.89 -1.294 -1.52 -1.769 -2.041 -2.401 -2.837 -3.435 -5.658 -8 ,593 ,TETRA ,17618105,Tue Nov 30 12:28:18 CET,Tue Nov 30 14:17:07 CET,0.0 1.047 1.418 1.65 1.864 2.09 2.295 2.476 2.813 2.959 3.082 3.356 3.45 3.556 3.748 3.938 4.126 4.219 4.401 4.582 4.834 4.982 5.116 5.319 5.511 5.687 5.853 6.028 6.263 6.491 6.711 6.946 7.157 7.36 7.609 7.896 8.181 8.473 8.738 9.012 9.302 9.628 9.991 10.325 10.68 11.073 11.559 12.041 12.458 12.755 12.711 12.207 11.55 10.821 10.183 9.589 9.028 8.539 8.067 7.556 7.113 6.674 6.242 5.868 5.526 5.178 4.792 4.419 4.088 3.789 3.482 3.204 2.918 2.612 2.36 2.108 1.856 1.573 1.276 1.08 0.868 0.526 0.288 0.056 -0.066 -0.341 -0.632 -0.942 -1.099 -1.232 -1.589 -1.768 -1.967 -2.397 -2.658 -2.947 -3.275 -3.659 -4.08 -4.65 -7.234 -9 ,5280 ,TETRA ,17618106,Tue Nov 30 12:28:19 CET,Tue Nov 30 14:25:54 CET,0.0 1.239 1.644 1.935 2.171 2.365 2.532 2.687 2.967 3.104 3.233 3.512 3.609 3.723 3.925 4.104 4.268 4.348 4.519 4.691 4.915 5.062 5.21 5.415 5.617 5.821 6.012 6.174 6.376 6.59 6.813 7.077 7.327 7.566 7.823 8.088 8.321 8.57 8.846 9.183 9.57 9.922 10.285 10.667 11.102 11.528 11.987 12.463 12.872 13.163 13.147 12.588 11.859 11.126 10.414 9.748 9.118 8.499 7.976 7.464 7.013 6.595 6.206 5.828 5.427 5.074 4.722 4.355 4.02 3.691 3.342 3.05 2.769 2.475 2.243 2.017 1.791 1.55 1.263 1.062 0.864 0.549 0.325 0.093 -0.028 -0.299 -0.593 -0.914 -1.086 -1.22 -1.593 -1.788 -1.995 -2.415 -2.666 -2.941 -3.24 -3.605 -4.067 -4.719 -7.022 -10 ,26136 ,TETRA ,17618107,Tue Nov 30 12:28:19 CET,Tue Nov 30 14:16:20 CET,0.0 1.97 2.266 2.468 2.663 2.839 2.997 3.142 3.384 3.487 3.584 3.799 3.859 3.955 4.139 4.292 4.429 4.497 4.634 4.775 4.98 5.116 5.261 5.459 5.626 5.78 5.93 6.075 6.253 6.421 6.59 6.78 6.966 7.159 7.387 7.642 7.868 8.108 8.376 8.656 8.958 9.31 9.703 10.076 10.486 10.904 11.333 11.799 12.241 12.571 12.691 12.207 11.515 10.82 10.144 9.49 8.879 8.322 7.834 7.33 6.852 6.443 6.046 5.625 5.242 4.899 4.542 4.216 3.945 3.657 3.33 3.046 2.733 2.406 2.184 1.979 1.736 1.467 1.193 0.995 0.798 0.489 0.255 0.007 -0.124 -0.39 -0.657 -0.95 -1.111 -1.249 -1.633 -1.822 -2.02 -2.452 -2.681 -2.95 -3.249 -3.604 -4.089 -4.771 -7.523 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_266_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_266_235.txt deleted file mode 100644 index c8f175d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_266_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5227 ,TETRA ,17618108,Tue Nov 30 12:29:21 CET,Tue Nov 30 14:18:06 CET,0.0 1.614 2.134 2.481 2.75 2.988 3.21 3.412 3.767 3.912 4.046 4.331 4.412 4.532 4.781 5.029 5.251 5.348 5.539 5.714 5.945 6.097 6.255 6.497 6.725 6.939 7.149 7.351 7.615 7.86 8.075 8.319 8.55 8.776 9.054 9.352 9.65 9.988 10.314 10.637 10.989 11.382 11.806 12.226 12.784 13.374 13.905 14.417 14.876 15.228 15.244 14.683 13.909 13.158 12.523 11.886 11.247 10.653 10.112 9.554 9.049 8.593 8.2 7.817 7.431 7.07 6.698 6.361 6.049 5.73 5.417 5.162 4.88 4.567 4.334 4.095 3.832 3.564 3.294 3.099 2.889 2.582 2.383 2.185 2.082 1.843 1.582 1.301 1.154 1.035 0.681 0.517 0.343 -0.062 -0.291 -0.54 -0.826 -1.153 -1.535 -2.024 -3.56 -2 ,31251 ,TETRA ,17618109,Tue Nov 30 12:29:21 CET,Tue Nov 30 14:16:49 CET,0.0 1.643 2.086 2.403 2.671 2.921 3.139 3.325 3.656 3.817 3.979 4.284 4.362 4.478 4.719 4.943 5.14 5.231 5.424 5.624 5.91 6.074 6.232 6.483 6.698 6.895 7.104 7.321 7.58 7.803 8.03 8.3 8.556 8.796 9.088 9.412 9.701 10.021 10.357 10.721 11.073 11.46 11.917 12.368 12.878 13.359 13.863 14.342 14.74 15.1 15.216 14.858 14.221 13.468 12.76 12.12 11.554 10.993 10.506 10.047 9.604 9.184 8.807 8.443 8.102 7.779 7.427 7.117 6.844 6.543 6.208 5.934 5.677 5.413 5.204 4.98 4.722 4.44 4.156 3.974 3.799 3.516 3.31 3.087 2.967 2.721 2.455 2.172 2.026 1.905 1.548 1.375 1.203 0.828 0.62 0.383 0.109 -0.207 -0.583 -1.089 -2.691 -3 ,28816 ,TETRA ,17618110,Tue Nov 30 12:29:21 CET,Tue Nov 30 14:03:56 CET,0.0 1.799 2.267 2.642 2.942 3.206 3.429 3.635 3.989 4.138 4.289 4.603 4.703 4.828 5.051 5.269 5.483 5.58 5.775 5.968 6.232 6.399 6.565 6.807 7.034 7.262 7.47 7.663 7.913 8.147 8.386 8.676 8.916 9.138 9.42 9.737 10.029 10.36 10.71 11.057 11.396 11.76 12.198 12.606 13.023 13.495 14.008 14.522 15.084 15.476 15.502 15.006 14.359 13.682 13.02 12.373 11.764 11.194 10.68 10.148 9.677 9.259 8.864 8.478 8.12 7.805 7.461 7.128 6.832 6.527 6.196 5.917 5.643 5.351 5.131 4.91 4.688 4.475 4.222 4.04 3.851 3.541 3.344 3.135 3.022 2.79 2.542 2.268 2.131 2.031 1.719 1.563 1.408 1.036 0.816 0.579 0.316 0.041 -0.313 -0.805 -2.655 -4 ,6253 ,TETRA ,17618111,Tue Nov 30 12:29:21 CET,Tue Nov 30 14:29:27 CET,0.0 2.263 2.676 3.007 3.313 3.564 3.779 3.97 4.328 4.5 4.663 4.971 5.064 5.191 5.437 5.67 5.88 5.976 6.159 6.331 6.576 6.726 6.878 7.116 7.326 7.536 7.765 7.991 8.277 8.543 8.778 9.045 9.318 9.581 9.873 10.185 10.476 10.781 11.105 11.46 11.865 12.305 12.759 13.155 13.565 14.029 14.51 14.959 15.407 15.802 15.913 15.41 14.694 13.987 13.305 12.621 11.967 11.36 10.85 10.324 9.868 9.448 9.052 8.681 8.312 7.957 7.582 7.244 6.963 6.664 6.325 6.062 5.815 5.551 5.335 5.118 4.885 4.624 4.333 4.143 3.976 3.716 3.518 3.303 3.181 2.915 2.663 2.41 2.268 2.153 1.788 1.615 1.445 1.072 0.865 0.644 0.379 0.056 -0.299 -0.773 -2.528 -5 ,25378 ,TETRA ,17618112,Tue Nov 30 12:29:21 CET,Tue Nov 30 14:19:04 CET,0.0 2.082 2.586 2.95 3.222 3.434 3.64 3.825 4.158 4.322 4.473 4.757 4.845 4.964 5.199 5.41 5.598 5.692 5.88 6.065 6.338 6.517 6.696 6.941 7.166 7.382 7.58 7.775 8.035 8.283 8.507 8.773 9.034 9.274 9.532 9.815 10.105 10.415 10.724 11.088 11.47 11.845 12.288 12.709 13.151 13.61 14.102 14.563 14.975 15.356 15.557 15.205 14.581 13.916 13.272 12.649 12.074 11.482 10.923 10.385 9.918 9.461 9.014 8.619 8.249 7.917 7.587 7.265 6.951 6.634 6.321 6.057 5.793 5.524 5.309 5.085 4.851 4.595 4.343 4.17 3.981 3.686 3.479 3.257 3.135 2.879 2.621 2.358 2.219 2.104 1.763 1.601 1.433 1.051 0.831 0.594 0.324 0.032 -0.328 -0.86 -3.187 -6 ,1290 ,TETRA ,17618113,Tue Nov 30 12:30:20 CET,Tue Nov 30 14:03:20 CET,0.0 1.909 2.355 2.68 2.931 3.157 3.373 3.57 3.937 4.113 4.28 4.599 4.697 4.827 5.074 5.298 5.501 5.596 5.784 5.969 6.229 6.394 6.553 6.772 6.977 7.19 7.386 7.567 7.833 8.081 8.292 8.55 8.811 9.066 9.335 9.645 9.948 10.247 10.591 10.998 11.417 11.839 12.312 12.755 13.188 13.624 14.111 14.622 15.078 15.403 15.314 14.832 14.227 13.51 12.81 12.115 11.486 10.934 10.457 9.927 9.459 9.072 8.703 8.336 7.966 7.634 7.283 6.963 6.684 6.362 6.039 5.802 5.555 5.301 5.089 4.86 4.638 4.408 4.162 3.986 3.8 3.487 3.265 3.04 2.927 2.708 2.468 2.189 2.046 1.933 1.594 1.417 1.221 0.824 0.607 0.354 0.061 -0.252 -0.607 -1.118 -2.95 -7 ,17006 ,TETRA ,17618114,Tue Nov 30 12:30:20 CET,Tue Nov 30 14:19:17 CET,0.0 1.707 2.163 2.506 2.788 3.043 3.268 3.47 3.794 3.931 4.071 4.359 4.451 4.57 4.799 5.021 5.22 5.319 5.508 5.684 5.965 6.143 6.294 6.499 6.693 6.884 7.064 7.243 7.478 7.694 7.921 8.198 8.444 8.699 9.02 9.325 9.572 9.86 10.164 10.483 10.819 11.187 11.608 12.029 12.52 13.021 13.515 14.003 14.479 14.857 14.847 14.337 13.696 13.016 12.315 11.647 11.062 10.479 9.955 9.435 8.967 8.548 8.165 7.796 7.42 7.056 6.695 6.384 6.111 5.828 5.538 5.295 5.027 4.72 4.48 4.249 3.998 3.739 3.489 3.313 3.129 2.856 2.662 2.457 2.354 2.141 1.908 1.649 1.515 1.409 1.073 0.91 0.748 0.392 0.19 -0.051 -0.299 -0.579 -0.966 -1.473 -3.047 -8 ,30256 ,TETRA ,17618115,Tue Nov 30 12:31:26 CET,Tue Nov 30 14:21:41 CET,0.0 2.828 3.242 3.543 3.796 4.032 4.254 4.448 4.788 4.932 5.067 5.374 5.478 5.607 5.842 6.065 6.276 6.371 6.563 6.746 6.989 7.152 7.313 7.537 7.74 7.942 8.135 8.316 8.561 8.806 9.069 9.375 9.626 9.866 10.132 10.429 10.724 11.052 11.429 11.793 12.128 12.512 12.951 13.366 13.877 14.427 14.959 15.485 16.034 16.521 16.708 16.32 15.68 15.0 14.362 13.75 13.184 12.644 12.151 11.614 11.143 10.747 10.323 9.893 9.534 9.236 8.934 8.649 8.39 8.13 7.854 7.602 7.344 7.072 6.859 6.652 6.442 6.199 5.925 5.755 5.58 5.272 5.051 4.824 4.719 4.515 4.276 4.022 3.886 3.77 3.41 3.227 3.04 2.617 2.39 2.17 1.92 1.614 1.248 0.746 -1.034 -9 ,12693 ,TETRA ,17618116,Tue Nov 30 12:31:26 CET,Tue Nov 30 14:20:26 CET,0.0 1.481 1.944 2.308 2.614 2.863 3.083 3.288 3.655 3.808 3.956 4.269 4.367 4.496 4.724 4.931 5.13 5.23 5.426 5.616 5.869 6.021 6.185 6.441 6.673 6.884 7.098 7.317 7.596 7.837 8.048 8.296 8.541 8.777 9.04 9.35 9.66 9.997 10.343 10.703 11.08 11.48 11.936 12.35 12.78 13.268 13.817 14.328 14.731 15.012 14.939 14.342 13.654 12.943 12.282 11.689 11.125 10.558 10.05 9.546 9.088 8.655 8.249 7.849 7.473 7.126 6.748 6.426 6.154 5.879 5.597 5.342 5.067 4.784 4.56 4.328 4.101 3.875 3.625 3.449 3.264 2.96 2.742 2.514 2.401 2.17 1.92 1.659 1.517 1.391 1.003 0.828 0.641 0.201 -0.016 -0.246 -0.514 -0.808 -1.191 -1.699 -3.75 -10 ,22404 ,TETRA ,17618117,Tue Nov 30 12:31:26 CET,Tue Nov 30 14:21:08 CET,0.0 2.218 2.644 2.975 3.258 3.517 3.756 3.977 4.369 4.548 4.717 5.045 5.146 5.278 5.528 5.753 5.955 6.06 6.263 6.449 6.714 6.875 7.027 7.274 7.502 7.716 7.925 8.115 8.348 8.568 8.779 9.019 9.26 9.504 9.798 10.121 10.406 10.701 11.007 11.341 11.69 12.059 12.525 12.973 13.42 13.883 14.365 14.838 15.278 15.671 15.834 15.557 15.069 14.435 13.766 13.126 12.537 11.96 11.455 10.967 10.503 10.033 9.577 9.172 8.813 8.482 8.125 7.792 7.492 7.182 6.851 6.577 6.299 6.001 5.766 5.538 5.314 5.059 4.78 4.579 4.379 4.093 3.892 3.685 3.577 3.337 3.072 2.793 2.646 2.529 2.196 2.026 1.847 1.452 1.224 0.979 0.721 0.439 0.067 -0.403 -1.835 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_289_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_289_231.txt deleted file mode 100644 index 81c7240a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_289_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5482 ,TETRA ,17618118,Tue Nov 30 12:31:26 CET,Tue Nov 30 14:20:58 CET,0.0 0.495 0.725 0.946 1.125 1.278 1.429 1.572 1.804 1.902 2.003 2.065 2.323 2.425 2.599 2.742 2.876 2.95 3.107 3.244 3.436 3.562 3.679 3.849 4.027 4.23 4.438 4.643 4.931 5.176 5.375 5.631 5.884 6.124 6.42 6.747 7.04 7.393 7.785 8.183 8.61 9.115 9.702 10.272 10.917 11.651 12.529 13.496 14.624 15.971 17.586 18.831 19.517 19.909 20.116 20.223 20.274 20.281 20.266 20.231 20.191 20.122 20.019 19.937 19.868 19.788 19.667 19.552 19.459 19.359 19.246 19.126 19.001 18.874 18.77 18.673 18.576 18.479 18.383 18.318 18.249 18.143 18.075 18.01 17.974 17.894 17.814 17.722 17.669 17.473 17.485 17.423 17.361 17.229 17.15 17.051 16.948 16.829 16.669 16.454 15.688 -2 ,7234 ,TETRA ,17618119,Tue Nov 30 12:32:21 CET,Tue Nov 30 14:21:07 CET,0.0 0.663 0.932 1.143 1.328 1.499 1.651 1.784 2.024 2.139 2.253 2.317 2.572 2.675 2.877 3.069 3.251 3.335 3.512 3.698 3.953 4.104 4.246 4.452 4.66 4.859 5.042 5.221 5.451 5.681 5.914 6.182 6.436 6.681 6.967 7.321 7.67 8.036 8.406 8.804 9.249 9.745 10.31 10.873 11.518 12.248 13.115 14.1 15.267 16.645 18.269 19.555 20.255 20.675 20.901 20.987 21.022 21.05 21.051 21.012 20.922 20.825 20.74 20.657 20.565 20.467 20.348 20.216 20.099 19.966 19.838 19.745 19.639 19.532 19.439 19.312 19.168 19.029 18.893 18.793 18.691 18.542 18.428 18.314 18.255 18.126 17.991 17.85 17.777 17.564 17.548 17.464 17.376 17.193 17.088 16.972 16.831 16.683 16.512 16.245 15.527 -3 ,30415 ,TETRA ,17618120,Tue Nov 30 12:32:21 CET,Tue Nov 30 14:26:00 CET,0.0 0.425 0.647 0.827 0.992 1.16 1.311 1.449 1.698 1.803 1.893 1.906 2.146 2.234 2.396 2.555 2.704 2.776 2.924 3.066 3.26 3.381 3.498 3.685 3.872 4.042 4.199 4.348 4.542 4.735 4.927 5.158 5.378 5.586 5.836 6.157 6.484 6.855 7.262 7.647 8.064 8.553 9.093 9.651 10.318 11.09 11.978 12.947 14.076 15.426 17.049 18.323 19.013 19.419 19.659 19.822 19.895 19.898 19.888 19.832 19.764 19.705 19.617 19.529 19.432 19.33 19.235 19.151 19.057 18.945 18.837 18.745 18.644 18.513 18.417 18.331 18.232 18.129 18.019 17.946 17.873 17.749 17.653 17.555 17.505 17.397 17.295 17.19 17.134 16.938 16.934 16.862 16.787 16.627 16.523 16.394 16.266 16.135 15.978 15.748 15.217 -4 ,20338 ,TETRA ,17618121,Tue Nov 30 12:32:21 CET,Tue Nov 30 14:23:50 CET,0.0 0.701 0.941 1.13 1.304 1.459 1.607 1.741 1.974 2.077 2.181 2.228 2.475 2.568 2.735 2.894 3.041 3.109 3.244 3.381 3.588 3.715 3.831 4.034 4.23 4.396 4.557 4.702 4.889 5.082 5.291 5.588 5.888 6.17 6.471 6.807 7.137 7.464 7.814 8.214 8.667 9.176 9.727 10.261 10.885 11.597 12.434 13.401 14.548 15.899 17.54 18.833 19.534 19.927 20.151 20.293 20.357 20.369 20.328 20.246 20.179 20.076 19.961 19.863 19.768 19.682 19.569 19.468 19.386 19.286 19.159 19.056 18.946 18.806 18.693 18.57 18.441 18.309 18.17 18.08 17.988 17.837 17.724 17.608 17.549 17.419 17.286 17.142 17.07 16.862 16.852 16.763 16.667 16.468 16.352 16.219 16.082 15.927 15.722 15.43 14.776 -5 ,3282 ,TETRA ,17618122,Tue Nov 30 12:32:22 CET,Tue Nov 30 14:19:56 CET,0.0 0.469 0.708 0.864 1.006 1.138 1.255 1.373 1.589 1.686 1.785 1.814 2.046 2.123 2.302 2.49 2.67 2.758 2.913 3.075 3.331 3.495 3.646 3.86 4.076 4.269 4.44 4.604 4.805 4.992 5.188 5.428 5.642 5.858 6.145 6.476 6.773 7.11 7.494 7.907 8.338 8.83 9.4 9.954 10.595 11.321 12.154 13.108 14.251 15.602 17.205 18.585 19.344 19.762 20.032 20.18 20.244 20.268 20.264 20.208 20.121 20.022 19.921 19.819 19.711 19.603 19.48 19.368 19.266 19.156 19.034 18.932 18.839 18.751 18.684 18.614 18.545 18.445 18.318 18.238 18.147 17.99 17.886 17.774 17.711 17.601 17.503 17.399 17.343 17.145 17.139 17.059 16.986 16.827 16.716 16.582 16.451 16.305 16.103 15.849 15.212 -6 ,22141 ,TETRA ,17618123,Tue Nov 30 12:32:24 CET,Tue Nov 30 14:20:35 CET,0.0 0.559 0.816 1.008 1.173 1.317 1.438 1.554 1.792 1.9 2.001 2.052 2.306 2.397 2.553 2.704 2.854 2.926 3.072 3.228 3.436 3.562 3.684 3.873 4.074 4.25 4.418 4.61 4.864 5.094 5.306 5.556 5.814 6.076 6.391 6.726 7.016 7.353 7.724 8.118 8.573 9.069 9.599 10.165 10.841 11.599 12.455 13.404 14.544 15.882 17.475 18.725 19.42 19.8 19.979 20.081 20.144 20.154 20.109 20.067 20.014 19.953 19.898 19.839 19.754 19.657 19.569 19.483 19.392 19.29 19.188 19.088 18.944 18.776 18.642 18.498 18.354 18.207 18.064 17.969 17.858 17.686 17.582 17.473 17.411 17.284 17.149 16.981 16.882 16.655 16.602 16.508 16.416 16.191 16.057 15.923 15.787 15.629 15.428 15.173 14.453 -7 ,4271 ,TETRA ,17618124,Tue Nov 30 12:33:20 CET,Tue Nov 30 14:22:11 CET,0.0 0.827 1.109 1.343 1.546 1.7 1.822 1.936 2.145 2.248 2.359 2.422 2.682 2.783 2.973 3.153 3.328 3.413 3.571 3.729 3.96 4.105 4.241 4.437 4.619 4.791 4.972 5.168 5.435 5.67 5.883 6.14 6.387 6.635 6.934 7.266 7.569 7.9 8.275 8.687 9.097 9.542 10.098 10.664 11.294 12.008 12.84 13.79 14.921 16.247 17.835 19.148 19.869 20.265 20.484 20.586 20.62 20.625 20.604 20.572 20.537 20.487 20.415 20.309 20.203 20.097 19.967 19.854 19.75 19.603 19.423 19.287 19.157 19.021 18.923 18.824 18.718 18.6 18.471 18.382 18.272 18.083 17.959 17.84 17.782 17.652 17.51 17.349 17.261 17.045 16.991 16.885 16.757 16.482 16.339 16.162 15.96 15.749 15.53 15.281 14.569 -8 ,12707 ,TETRA ,17618125,Tue Nov 30 12:33:22 CET,Tue Nov 30 14:22:15 CET,0.0 0.659 0.896 1.091 1.25 1.393 1.525 1.646 1.871 1.982 2.108 2.224 2.495 2.624 2.88 3.097 3.306 3.398 3.55 3.703 3.937 4.102 4.265 4.483 4.685 4.89 5.096 5.304 5.585 5.839 6.046 6.296 6.562 6.811 7.102 7.459 7.781 8.095 8.447 8.845 9.276 9.777 10.371 10.933 11.574 12.265 13.075 14.058 15.223 16.608 18.226 19.444 20.159 20.611 20.871 21.021 21.037 20.997 20.962 20.907 20.841 20.769 20.673 20.571 20.464 20.36 20.234 20.082 19.957 19.848 19.727 19.617 19.496 19.351 19.237 19.138 19.021 18.871 18.692 18.564 18.446 18.268 18.156 18.048 17.994 17.87 17.706 17.538 17.461 17.257 17.265 17.193 17.112 16.904 16.771 16.613 16.454 16.291 16.076 15.792 15.002 -9 ,5429 ,TETRA ,17618126,Tue Nov 30 12:34:21 CET,Tue Nov 30 14:23:59 CET,0.0 0.832 1.131 1.333 1.503 1.654 1.795 1.93 2.174 2.291 2.407 2.487 2.743 2.839 3.033 3.213 3.389 3.477 3.649 3.809 4.041 4.197 4.347 4.553 4.752 4.958 5.16 5.342 5.58 5.821 6.056 6.346 6.629 6.899 7.223 7.603 7.918 8.225 8.591 8.965 9.346 9.772 10.252 10.742 11.345 12.052 12.868 13.817 14.933 16.242 17.813 19.093 19.819 20.234 20.462 20.612 20.691 20.717 20.723 20.69 20.633 20.552 20.453 20.365 20.285 20.194 20.092 20.003 19.922 19.808 19.672 19.563 19.454 19.339 19.248 19.168 19.088 19.01 18.934 18.874 18.804 18.697 18.626 18.544 18.497 18.406 18.315 18.211 18.158 17.964 17.966 17.902 17.829 17.658 17.569 17.475 17.368 17.234 17.084 16.909 16.361 -10 ,424 ,TETRA ,17618127,Tue Nov 30 12:34:21 CET,Tue Nov 30 14:22:53 CET,0.0 0.662 0.91 1.114 1.275 1.416 1.542 1.66 1.867 1.967 2.069 2.105 2.345 2.432 2.603 2.762 2.903 2.969 3.109 3.25 3.445 3.568 3.697 3.903 4.097 4.286 4.46 4.613 4.823 5.059 5.307 5.605 5.858 6.112 6.427 6.752 7.056 7.383 7.766 8.186 8.592 9.039 9.58 10.13 10.791 11.527 12.395 13.407 14.55 15.893 17.573 19.016 19.785 20.158 20.341 20.447 20.503 20.517 20.502 20.439 20.351 20.269 20.192 20.127 20.052 19.964 19.839 19.695 19.587 19.489 19.374 19.289 19.181 19.056 18.963 18.858 18.746 18.633 18.501 18.399 18.3 18.142 18.03 17.921 17.863 17.73 17.597 17.462 17.39 17.179 17.148 17.06 16.974 16.807 16.71 16.596 16.464 16.309 16.138 15.904 15.243 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_289_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_289_336.txt deleted file mode 100644 index 7d10e375..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_289_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14884 ,TETRA ,17618128,Tue Nov 30 12:35:19 CET,Tue Nov 30 14:09:12 CET,0.0 1.163 1.489 1.694 1.832 1.941 2.045 2.143 2.293 2.348 2.391 2.315 2.495 2.527 2.571 2.605 2.646 2.659 2.69 2.7 2.674 2.664 2.644 2.585 2.539 2.505 2.438 2.342 2.225 2.127 2.013 1.833 1.63 1.428 1.168 0.832 0.507 0.118 -0.351 -0.893 -1.523 -2.282 -3.247 -4.287 -5.605 -7.232 -9.332 -11.976 -15.517 -20.416 -27.687 -35.428 -41.182 -45.761 -49.435 -52.574 -55.2 -57.459 -59.334 -61.117 -62.601 -63.915 -65.1 -66.147 -67.09 -67.936 -68.829 -69.635 -70.304 -70.966 -71.648 -72.198 -72.769 -73.365 -73.829 -74.314 -74.818 -75.323 -75.832 -76.172 -76.516 -77.056 -77.427 -77.794 -77.977 -78.358 -78.765 -79.214 -79.443 -79.906 -80.111 -80.349 -80.597 -81.105 -81.374 -81.692 -82.049 -82.482 -83.039 -83.668 -85.137 -2 ,23658 ,TETRA ,17618129,Tue Nov 30 12:35:21 CET,Tue Nov 30 14:22:18 CET,0.0 0.877 1.14 1.328 1.469 1.608 1.706 1.777 1.921 1.979 2.03 1.949 2.114 2.134 2.182 2.215 2.236 2.241 2.247 2.261 2.256 2.231 2.196 2.13 2.06 1.99 1.925 1.866 1.777 1.662 1.527 1.33 1.101 0.873 0.604 0.296 -0.014 -0.41 -0.902 -1.448 -2.02 -2.656 -3.467 -4.445 -5.763 -7.418 -9.51 -12.157 -15.71 -20.591 -27.912 -35.844 -41.698 -46.2 -49.845 -52.922 -55.465 -57.647 -59.482 -61.269 -62.785 -64.093 -65.283 -66.369 -67.382 -68.331 -69.297 -70.097 -70.773 -71.469 -72.161 -72.756 -73.376 -74.006 -74.457 -74.893 -75.348 -75.815 -76.316 -76.651 -76.985 -77.516 -77.889 -78.262 -78.45 -78.848 -79.265 -79.7 -79.921 -80.391 -80.602 -80.845 -81.092 -81.587 -81.852 -82.159 -82.495 -82.85 -83.283 -83.828 -85.1 -3 ,16978 ,TETRA ,17618130,Tue Nov 30 12:35:24 CET,Tue Nov 30 14:22:17 CET,0.0 1.053 1.361 1.555 1.706 1.798 1.876 1.96 2.091 2.131 2.178 2.113 2.294 2.324 2.356 2.368 2.394 2.405 2.412 2.415 2.402 2.376 2.343 2.283 2.212 2.149 2.1 2.037 1.899 1.747 1.587 1.366 1.138 0.913 0.68 0.409 0.073 -0.339 -0.816 -1.347 -1.956 -2.726 -3.689 -4.743 -6.06 -7.678 -9.795 -12.461 -15.985 -20.911 -28.343 -36.144 -41.838 -46.312 -49.912 -52.957 -55.499 -57.689 -59.522 -61.351 -62.905 -64.202 -65.37 -66.442 -67.436 -68.329 -69.228 -70.015 -70.689 -71.403 -72.132 -72.704 -73.289 -73.893 -74.348 -74.806 -75.278 -75.781 -76.296 -76.626 -76.962 -77.497 -77.863 -78.226 -78.413 -78.799 -79.188 -79.612 -79.836 -80.298 -80.481 -80.708 -80.938 -81.444 -81.71 -81.993 -82.316 -82.684 -83.092 -83.604 -84.963 -4 ,10381 ,TETRA ,17618131,Tue Nov 30 12:35:21 CET,Tue Nov 30 14:23:59 CET,0.0 0.83 1.134 1.336 1.468 1.562 1.644 1.732 1.904 1.973 2.023 1.967 2.163 2.205 2.252 2.286 2.288 2.29 2.309 2.321 2.328 2.317 2.292 2.246 2.2 2.14 2.079 2.011 1.914 1.808 1.69 1.527 1.305 1.092 0.853 0.562 0.249 -0.156 -0.647 -1.209 -1.83 -2.6 -3.559 -4.585 -5.897 -7.476 -9.532 -12.194 -15.765 -20.78 -28.199 -35.965 -41.752 -46.335 -49.988 -53.074 -55.651 -57.889 -59.775 -61.598 -63.094 -64.349 -65.5 -66.592 -67.598 -68.495 -69.42 -70.224 -70.898 -71.592 -72.296 -72.867 -73.44 -74.009 -74.456 -74.915 -75.389 -75.887 -76.383 -76.713 -77.059 -77.601 -77.958 -78.321 -78.513 -78.923 -79.344 -79.842 -80.13 -80.721 -81.04 -81.357 -81.701 -82.449 -82.842 -83.238 -83.639 -84.07 -84.572 -85.288 -87.322 -5 ,10027 ,TETRA ,17618132,Tue Nov 30 12:36:19 CET,Tue Nov 30 14:25:26 CET,0.0 1.046 1.353 1.581 1.724 1.804 1.886 1.97 2.1 2.158 2.227 2.192 2.369 2.382 2.403 2.434 2.478 2.507 2.542 2.55 2.531 2.508 2.485 2.428 2.355 2.267 2.185 2.103 1.987 1.855 1.698 1.486 1.275 1.064 0.814 0.521 0.205 -0.179 -0.649 -1.197 -1.802 -2.527 -3.443 -4.477 -5.816 -7.45 -9.531 -12.192 -15.734 -20.599 -27.855 -35.622 -41.397 -45.94 -49.607 -52.662 -55.202 -57.387 -59.242 -61.057 -62.534 -63.839 -65.067 -66.161 -67.155 -68.041 -68.932 -69.713 -70.384 -71.086 -71.806 -72.391 -72.983 -73.583 -74.03 -74.471 -74.933 -75.421 -75.939 -76.282 -76.643 -77.327 -77.849 -78.364 -78.633 -79.175 -79.702 -80.246 -80.53 -81.116 -81.437 -81.77 -82.093 -82.748 -83.106 -83.488 -83.905 -84.363 -84.871 -85.521 -87.082 -6 ,2247 ,TETRA ,17618133,Tue Nov 30 12:36:21 CET,Tue Nov 30 14:26:15 CET,0.0 1.217 1.548 1.737 1.877 1.989 2.086 2.168 2.275 2.324 2.382 2.318 2.511 2.548 2.611 2.655 2.654 2.654 2.659 2.655 2.648 2.639 2.622 2.591 2.577 2.532 2.441 2.362 2.241 2.096 1.947 1.77 1.578 1.358 1.09 0.778 0.433 0.018 -0.431 -0.94 -1.54 -2.3 -3.27 -4.321 -5.65 -7.271 -9.326 -11.963 -15.505 -20.401 -27.8 -35.679 -41.503 -46.045 -49.663 -52.748 -55.293 -57.471 -59.277 -61.064 -62.567 -63.86 -65.057 -66.165 -67.171 -68.061 -68.975 -69.771 -70.457 -71.162 -71.866 -72.417 -72.983 -73.563 -74.008 -74.486 -74.966 -75.428 -75.916 -76.263 -76.618 -77.16 -77.528 -77.91 -78.098 -78.469 -78.839 -79.222 -79.435 -79.903 -80.105 -80.328 -80.619 -81.332 -81.691 -82.066 -82.471 -82.931 -83.441 -84.018 -85.143 -7 ,31863 ,TETRA ,17618134,Tue Nov 30 12:36:23 CET,Tue Nov 30 14:26:26 CET,0.0 0.961 1.259 1.416 1.531 1.646 1.779 1.884 2.045 2.113 2.174 2.11 2.293 2.322 2.367 2.409 2.442 2.454 2.438 2.426 2.427 2.41 2.397 2.368 2.323 2.265 2.207 2.141 2.014 1.871 1.717 1.537 1.364 1.176 0.936 0.62 0.324 -0.026 -0.484 -1.02 -1.613 -2.326 -3.254 -4.287 -5.623 -7.259 -9.336 -11.945 -15.462 -20.369 -27.636 -35.345 -41.085 -45.636 -49.339 -52.433 -55.011 -57.233 -59.062 -60.856 -62.314 -63.572 -64.774 -65.87 -66.856 -67.738 -68.631 -69.437 -70.152 -70.847 -71.552 -72.15 -72.755 -73.364 -73.816 -74.267 -74.741 -75.235 -75.757 -76.119 -76.472 -77.002 -77.372 -77.753 -77.941 -78.325 -78.722 -79.146 -79.361 -79.811 -80.006 -80.242 -80.5 -81.125 -81.477 -81.857 -82.285 -82.743 -83.232 -83.834 -85.162 -8 ,8891 ,TETRA ,17618135,Tue Nov 30 12:37:19 CET,Tue Nov 30 14:27:49 CET,0.0 1.0 1.324 1.533 1.688 1.81 1.903 1.975 2.104 2.154 2.192 2.117 2.304 2.337 2.406 2.457 2.493 2.51 2.521 2.513 2.501 2.497 2.482 2.429 2.366 2.289 2.201 2.114 1.989 1.843 1.677 1.502 1.367 1.191 0.933 0.621 0.302 -0.046 -0.471 -1.017 -1.649 -2.368 -3.27 -4.306 -5.615 -7.234 -9.338 -12.009 -15.568 -20.485 -27.787 -35.524 -41.307 -45.864 -49.567 -52.681 -55.264 -57.516 -59.352 -61.119 -62.607 -63.89 -65.102 -66.211 -67.211 -68.111 -69.015 -69.787 -70.446 -71.129 -71.811 -72.371 -72.963 -73.566 -74.015 -74.47 -74.933 -75.41 -75.915 -76.275 -76.635 -77.161 -77.53 -77.903 -78.087 -78.466 -78.858 -79.305 -79.577 -80.182 -80.501 -80.833 -81.194 -81.901 -82.274 -82.655 -83.034 -83.447 -83.918 -84.53 -85.816 -9 ,28967 ,TETRA ,17618136,Tue Nov 30 12:37:20 CET,Tue Nov 30 14:24:25 CET,0.0 1.045 1.392 1.615 1.769 1.892 2.006 2.098 2.217 2.262 2.303 2.225 2.404 2.427 2.469 2.507 2.538 2.555 2.573 2.58 2.59 2.585 2.555 2.481 2.401 2.332 2.254 2.152 2.017 1.884 1.739 1.533 1.339 1.158 0.9 0.563 0.213 -0.196 -0.666 -1.212 -1.835 -2.601 -3.574 -4.623 -5.932 -7.558 -9.658 -12.303 -15.853 -20.769 -28.077 -35.779 -41.595 -46.113 -49.681 -52.778 -55.392 -57.586 -59.389 -61.151 -62.645 -63.955 -65.167 -66.271 -67.275 -68.176 -69.055 -69.823 -70.516 -71.246 -71.979 -72.572 -73.193 -73.82 -74.273 -74.716 -75.187 -75.698 -76.226 -76.569 -76.924 -77.472 -77.834 -78.213 -78.403 -78.78 -79.175 -79.593 -79.814 -80.279 -80.509 -80.757 -81.011 -81.533 -81.788 -82.073 -82.405 -82.824 -83.353 -84.044 -85.46 -10 ,3281 ,TETRA ,17618137,Tue Nov 30 12:38:20 CET,Tue Nov 30 14:27:16 CET,0.0 0.68 0.944 1.132 1.292 1.415 1.485 1.565 1.746 1.82 1.874 1.797 1.968 1.992 2.061 2.124 2.166 2.179 2.164 2.124 2.08 2.065 2.047 1.99 1.935 1.861 1.762 1.674 1.568 1.441 1.321 1.159 0.935 0.715 0.472 0.153 -0.187 -0.584 -1.069 -1.626 -2.216 -2.895 -3.802 -4.834 -6.16 -7.776 -9.867 -12.514 -16.01 -20.891 -28.206 -35.952 -41.736 -46.27 -49.933 -53.004 -55.527 -57.758 -59.641 -61.445 -62.927 -64.201 -65.369 -66.458 -67.468 -68.345 -69.223 -69.996 -70.652 -71.352 -72.088 -72.673 -73.282 -73.906 -74.397 -74.995 -75.684 -76.387 -77.101 -77.583 -78.072 -78.809 -79.3 -79.806 -80.066 -80.587 -81.128 -81.696 -81.986 -82.577 -82.905 -83.234 -83.555 -84.209 -84.573 -84.96 -85.351 -85.774 -86.275 -86.99 -88.904 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_164.txt deleted file mode 100644 index f0c47d3c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28941 ,TETRA ,17618138,Tue Nov 30 12:38:21 CET,Tue Nov 30 14:26:02 CET,0.0 0.544 0.677 0.742 0.786 0.807 0.81 0.792 0.73 0.694 0.652 0.582 0.498 0.442 0.326 0.207 0.08 0.011 -0.122 -0.25 -0.467 -0.626 -0.793 -1.041 -1.287 -1.541 -1.804 -2.064 -2.402 -2.765 -3.149 -3.649 -4.151 -4.643 -5.242 -5.96 -6.697 -7.549 -8.51 -9.584 -10.781 -12.23 -14.045 -15.977 -18.407 -21.434 -25.283 -30.034 -36.314 -44.965 -57.558 -70.529 -79.919 -87.101 -92.789 -97.529 -101.456 -104.783 -107.462 -110.056 -112.243 -114.1 -115.791 -117.326 -118.715 -119.956 -121.24 -122.37 -123.298 -124.238 -125.194 -125.958 -126.738 -127.531 -128.137 -128.75 -129.359 -129.978 -130.611 -131.04 -131.476 -132.148 -132.609 -133.078 -133.32 -133.815 -134.316 -134.816 -135.067 -135.432 -135.884 -136.171 -136.47 -137.094 -137.43 -137.779 -138.12 -138.515 -138.975 -139.566 -140.867 -2 ,24514 ,TETRA ,17618139,Tue Nov 30 12:39:21 CET,Tue Nov 30 14:27:23 CET,0.0 0.729 0.901 0.981 1.027 1.049 1.04 1.025 0.993 0.963 0.921 0.87 0.798 0.746 0.63 0.513 0.389 0.328 0.204 0.077 -0.128 -0.274 -0.418 -0.644 -0.886 -1.133 -1.388 -1.646 -2.001 -2.36 -2.73 -3.201 -3.673 -4.163 -4.744 -5.414 -6.095 -6.892 -7.803 -8.832 -10.005 -11.449 -13.216 -15.105 -17.51 -20.423 -24.112 -28.729 -34.799 -43.139 -55.524 -68.399 -77.828 -85.185 -91.035 -95.901 -99.891 -103.273 -106.034 -108.697 -110.893 -112.756 -114.465 -116.014 -117.402 -118.644 -119.915 -121.022 -121.947 -122.872 -123.809 -124.574 -125.361 -126.152 -126.757 -127.38 -128.017 -128.653 -129.288 -129.715 -130.148 -130.816 -131.273 -131.74 -131.977 -132.458 -132.945 -133.463 -133.731 -134.093 -134.538 -134.828 -135.124 -135.73 -136.05 -136.378 -136.727 -137.122 -137.539 -138.115 -139.659 -3 ,6853 ,TETRA ,17618140,Tue Nov 30 12:39:21 CET,Tue Nov 30 14:22:03 CET,0.0 0.875 1.052 1.131 1.176 1.2 1.214 1.218 1.19 1.16 1.132 1.088 1.003 0.949 0.834 0.725 0.609 0.543 0.41 0.274 0.051 -0.103 -0.259 -0.5 -0.734 -0.974 -1.23 -1.496 -1.845 -2.197 -2.568 -3.045 -3.528 -4.015 -4.615 -5.32 -6.027 -6.865 -7.837 -8.936 -10.141 -11.558 -13.345 -15.26 -17.648 -20.536 -24.192 -28.808 -34.862 -43.108 -55.255 -67.957 -77.228 -84.407 -90.133 -94.873 -98.752 -102.08 -104.804 -107.453 -109.652 -111.508 -113.226 -114.807 -116.232 -117.511 -118.798 -119.894 -120.829 -121.777 -122.745 -123.527 -124.31 -125.102 -125.698 -126.296 -126.902 -127.529 -128.175 -128.607 -129.042 -129.724 -130.188 -130.651 -130.886 -131.369 -131.863 -132.377 -132.632 -133.0 -133.465 -133.74 -134.021 -134.6 -134.913 -135.255 -135.62 -136.042 -136.524 -137.162 -138.883 -4 ,8717 ,TETRA ,17618141,Tue Nov 30 12:40:22 CET,Tue Nov 30 14:29:31 CET,0.0 0.674 0.818 0.887 0.929 0.951 0.953 0.951 0.918 0.887 0.845 0.77 0.68 0.621 0.513 0.395 0.269 0.206 0.072 -0.069 -0.297 -0.458 -0.622 -0.882 -1.142 -1.401 -1.652 -1.897 -2.239 -2.603 -2.987 -3.473 -3.972 -4.476 -5.058 -5.743 -6.454 -7.284 -8.23 -9.294 -10.49 -11.941 -13.781 -15.775 -18.285 -21.332 -25.13 -29.855 -36.094 -44.638 -57.225 -70.285 -79.778 -87.076 -92.832 -97.542 -101.409 -104.733 -107.455 -110.039 -112.145 -113.952 -115.636 -117.197 -118.6 -119.835 -121.085 -122.186 -123.128 -124.051 -124.972 -125.731 -126.5 -127.272 -127.858 -128.453 -129.063 -129.698 -130.323 -130.737 -131.16 -131.806 -132.261 -132.722 -132.95 -133.418 -133.895 -134.378 -134.627 -134.984 -135.419 -135.692 -135.97 -136.594 -136.939 -137.301 -137.673 -138.073 -138.538 -139.092 -140.319 -5 ,16273 ,TETRA ,17618142,Tue Nov 30 12:40:24 CET,Tue Nov 30 14:28:51 CET,0.0 0.664 0.807 0.871 0.888 0.89 0.88 0.857 0.789 0.755 0.725 0.661 0.581 0.538 0.439 0.328 0.205 0.139 0.005 -0.134 -0.359 -0.513 -0.677 -0.938 -1.194 -1.449 -1.716 -1.982 -2.336 -2.709 -3.085 -3.558 -4.045 -4.538 -5.146 -5.87 -6.598 -7.44 -8.382 -9.444 -10.653 -12.109 -13.922 -15.884 -18.371 -21.36 -25.106 -29.82 -36.121 -44.748 -57.278 -70.124 -79.492 -86.659 -92.325 -97.038 -100.917 -104.254 -106.997 -109.616 -111.758 -113.602 -115.301 -116.825 -118.196 -119.43 -120.695 -121.799 -122.728 -123.675 -124.644 -125.421 -126.21 -127.012 -127.619 -128.226 -128.839 -129.465 -130.101 -130.53 -130.962 -131.621 -132.062 -132.514 -132.75 -133.243 -133.748 -134.283 -134.556 -134.93 -135.368 -135.65 -135.945 -136.569 -136.909 -137.261 -137.62 -138.007 -138.466 -139.013 -140.328 -6 ,2919 ,TETRA ,17618143,Tue Nov 30 12:41:21 CET,Tue Nov 30 14:29:29 CET,0.0 0.668 0.798 0.877 0.921 0.944 0.967 0.981 0.982 0.959 0.92 0.863 0.787 0.743 0.638 0.509 0.383 0.326 0.206 0.074 -0.143 -0.298 -0.467 -0.728 -0.967 -1.211 -1.478 -1.744 -2.093 -2.452 -2.834 -3.31 -3.781 -4.278 -4.881 -5.585 -6.312 -7.167 -8.138 -9.217 -10.388 -11.767 -13.522 -15.463 -17.892 -20.837 -24.563 -29.201 -35.339 -43.708 -55.982 -68.644 -77.954 -85.209 -90.894 -95.643 -99.54 -102.825 -105.506 -108.097 -110.24 -112.081 -113.791 -115.344 -116.752 -118.007 -119.278 -120.386 -121.313 -122.231 -123.159 -123.921 -124.699 -125.492 -126.097 -126.705 -127.317 -127.939 -128.572 -128.998 -129.433 -130.1 -130.545 -131.0 -131.237 -131.707 -132.181 -132.67 -132.924 -133.291 -133.712 -133.979 -134.265 -134.866 -135.183 -135.52 -135.878 -136.282 -136.776 -137.438 -138.875 -7 ,2743 ,TETRA ,17618144,Tue Nov 30 12:41:23 CET,Tue Nov 30 14:29:16 CET,0.0 0.458 0.539 0.564 0.558 0.537 0.519 0.496 0.458 0.44 0.405 0.343 0.261 0.208 0.087 -0.033 -0.148 -0.214 -0.353 -0.488 -0.689 -0.832 -0.977 -1.205 -1.456 -1.713 -1.971 -2.24 -2.611 -2.989 -3.376 -3.869 -4.368 -4.871 -5.472 -6.171 -6.878 -7.715 -8.678 -9.756 -10.958 -12.402 -14.187 -16.101 -18.501 -21.417 -25.14 -29.807 -35.986 -44.436 -56.941 -70.109 -79.623 -86.875 -92.611 -97.38 -101.253 -104.533 -107.265 -109.87 -112.006 -113.848 -115.569 -117.128 -118.509 -119.725 -120.96 -122.029 -122.938 -123.882 -124.838 -125.601 -126.371 -127.16 -127.748 -128.345 -128.971 -129.609 -130.253 -130.684 -131.119 -131.778 -132.231 -132.705 -132.946 -133.425 -133.915 -134.432 -134.694 -135.054 -135.506 -135.793 -136.082 -136.686 -137.01 -137.375 -137.767 -138.181 -138.64 -139.216 -140.406 -8 ,27327 ,TETRA ,17618145,Tue Nov 30 12:41:21 CET,Tue Nov 30 14:28:53 CET,0.0 0.54 0.622 0.679 0.721 0.738 0.727 0.696 0.617 0.574 0.538 0.492 0.413 0.367 0.272 0.145 0.009 -0.056 -0.187 -0.332 -0.568 -0.735 -0.903 -1.149 -1.405 -1.669 -1.933 -2.203 -2.571 -2.945 -3.325 -3.813 -4.305 -4.796 -5.389 -6.096 -6.816 -7.647 -8.603 -9.676 -10.876 -12.31 -14.108 -16.062 -18.503 -21.46 -25.161 -29.824 -36.106 -44.622 -56.99 -69.89 -79.245 -86.445 -92.215 -97.063 -101.025 -104.374 -107.11 -109.716 -111.885 -113.766 -115.524 -117.121 -118.546 -119.839 -121.135 -122.232 -123.157 -124.095 -125.044 -125.799 -126.562 -127.35 -127.955 -128.561 -129.169 -129.79 -130.422 -130.853 -131.293 -131.969 -132.431 -132.894 -133.128 -133.613 -134.117 -134.626 -134.892 -135.267 -135.686 -135.953 -136.231 -136.827 -137.156 -137.509 -137.881 -138.272 -138.714 -139.316 -140.981 -9 ,31786 ,TETRA ,17618146,Tue Nov 30 12:41:23 CET,Tue Nov 30 14:30:59 CET,0.0 0.662 0.8 0.886 0.964 1.013 1.042 1.063 1.077 1.065 1.033 0.979 0.903 0.855 0.747 0.62 0.492 0.427 0.286 0.136 -0.105 -0.268 -0.428 -0.672 -0.924 -1.186 -1.455 -1.725 -2.092 -2.465 -2.84 -3.318 -3.809 -4.308 -4.917 -5.627 -6.332 -7.165 -8.139 -9.236 -10.434 -11.864 -13.669 -15.628 -18.131 -21.126 -24.825 -29.501 -35.753 -44.352 -56.884 -69.89 -79.369 -86.576 -92.268 -97.035 -100.956 -104.263 -106.974 -109.593 -111.758 -113.598 -115.299 -116.869 -118.284 -119.551 -120.836 -121.962 -122.893 -123.815 -124.776 -125.568 -126.356 -127.141 -127.734 -128.342 -128.96 -129.568 -130.187 -130.616 -131.055 -131.712 -132.161 -132.637 -132.877 -133.352 -133.824 -134.307 -134.559 -134.928 -135.374 -135.656 -135.951 -136.581 -136.918 -137.285 -137.665 -138.054 -138.516 -139.101 -140.369 -10 ,32732 ,TETRA ,17618147,Tue Nov 30 12:42:20 CET,Tue Nov 30 14:31:42 CET,0.0 0.917 1.11 1.236 1.321 1.363 1.386 1.401 1.4 1.379 1.341 1.278 1.192 1.141 1.05 0.943 0.813 0.749 0.618 0.476 0.261 0.121 -0.03 -0.268 -0.512 -0.76 -1.005 -1.257 -1.613 -1.973 -2.325 -2.782 -3.259 -3.732 -4.307 -5.001 -5.716 -6.55 -7.493 -8.559 -9.734 -11.151 -12.947 -14.887 -17.297 -20.233 -23.957 -28.596 -34.78 -43.35 -55.865 -68.8 -78.296 -85.658 -91.453 -96.297 -100.325 -103.721 -106.477 -109.09 -111.247 -113.108 -114.823 -116.387 -117.796 -119.067 -120.35 -121.434 -122.35 -123.293 -124.263 -125.058 -125.856 -126.659 -127.265 -127.867 -128.484 -129.123 -129.772 -130.208 -130.648 -131.314 -131.767 -132.236 -132.473 -132.938 -133.427 -133.948 -134.215 -134.595 -135.047 -135.339 -135.642 -136.246 -136.574 -136.934 -137.321 -137.749 -138.231 -138.821 -140.168 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_165.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_165.txt deleted file mode 100644 index 8ea7dd1b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_165.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23054 ,TETRA ,17618148,Tue Nov 30 12:42:22 CET,Tue Nov 30 14:31:13 CET,0.0 0.482 0.556 0.585 0.574 0.555 0.529 0.491 0.407 0.363 0.316 0.238 0.142 0.071 -0.084 -0.245 -0.407 -0.489 -0.656 -0.831 -1.105 -1.295 -1.487 -1.775 -2.064 -2.364 -2.667 -2.976 -3.41 -3.845 -4.282 -4.834 -5.385 -5.934 -6.602 -7.401 -8.202 -9.127 -10.182 -11.353 -12.646 -14.205 -16.157 -18.275 -20.917 -24.086 -28.08 -33.037 -39.501 -48.27 -61.043 -74.171 -83.669 -90.982 -96.76 -101.603 -105.571 -108.908 -111.636 -114.242 -116.37 -118.186 -119.859 -121.393 -122.806 -124.085 -125.382 -126.496 -127.441 -128.4 -129.339 -130.079 -130.828 -131.592 -132.177 -132.777 -133.383 -133.981 -134.585 -134.994 -135.414 -136.046 -136.461 -136.894 -137.121 -137.58 -138.049 -138.533 -138.779 -139.146 -139.557 -139.825 -140.103 -140.674 -140.981 -141.302 -141.636 -141.997 -142.46 -143.052 -144.167 -2 ,10791 ,TETRA ,17618149,Tue Nov 30 12:43:21 CET,Tue Nov 30 14:31:09 CET,0.0 0.421 0.471 0.473 0.471 0.455 0.418 0.388 0.299 0.235 0.168 0.055 -0.051 -0.127 -0.291 -0.461 -0.627 -0.71 -0.89 -1.074 -1.337 -1.509 -1.682 -1.949 -2.214 -2.482 -2.764 -3.049 -3.431 -3.827 -4.247 -4.789 -5.336 -5.885 -6.552 -7.342 -8.135 -9.06 -10.111 -11.277 -12.567 -14.103 -16.025 -18.11 -20.713 -23.844 -27.783 -32.716 -39.193 -47.954 -60.668 -73.803 -83.34 -90.659 -96.471 -101.309 -105.268 -108.655 -111.416 -114.048 -116.232 -118.092 -119.793 -121.323 -122.681 -123.893 -125.139 -126.213 -127.101 -128.003 -128.928 -129.673 -130.431 -131.202 -131.79 -132.387 -132.984 -133.582 -134.182 -134.584 -134.994 -135.63 -136.071 -136.514 -136.731 -137.175 -137.64 -138.115 -138.357 -138.711 -139.099 -139.365 -139.642 -140.241 -140.554 -140.87 -141.223 -141.616 -142.063 -142.597 -143.863 -3 ,22482 ,TETRA ,17618150,Tue Nov 30 12:43:23 CET,Tue Nov 30 14:31:55 CET,0.0 0.472 0.56 0.599 0.597 0.58 0.551 0.502 0.387 0.327 0.264 0.168 0.069 0.005 -0.137 -0.302 -0.478 -0.564 -0.731 -0.897 -1.165 -1.355 -1.554 -1.851 -2.148 -2.451 -2.756 -3.067 -3.478 -3.894 -4.324 -4.871 -5.428 -5.989 -6.657 -7.439 -8.216 -9.125 -10.171 -11.318 -12.573 -14.097 -16.038 -18.115 -20.703 -23.837 -27.761 -32.651 -39.116 -47.882 -60.66 -73.821 -83.339 -90.694 -96.487 -101.276 -105.219 -108.573 -111.306 -113.909 -116.061 -117.909 -119.608 -121.149 -122.531 -123.75 -124.996 -126.072 -126.982 -127.912 -128.846 -129.61 -130.387 -131.18 -131.781 -132.388 -133.002 -133.626 -134.257 -134.688 -135.138 -135.808 -136.256 -136.721 -136.96 -137.441 -137.926 -138.427 -138.693 -139.075 -139.521 -139.811 -140.102 -140.71 -141.019 -141.329 -141.649 -141.99 -142.386 -142.902 -144.125 -4 ,5086 ,TETRA ,17618151,Tue Nov 30 12:43:21 CET,Tue Nov 30 14:31:54 CET,0.0 0.266 0.323 0.341 0.364 0.395 0.4 0.369 0.272 0.236 0.191 0.101 0.013 -0.051 -0.189 -0.334 -0.488 -0.567 -0.719 -0.872 -1.123 -1.295 -1.463 -1.719 -1.995 -2.291 -2.582 -2.867 -3.251 -3.649 -4.071 -4.612 -5.154 -5.706 -6.381 -7.18 -7.976 -8.877 -9.913 -11.107 -12.441 -14.027 -16.001 -18.115 -20.754 -23.936 -27.928 -32.92 -39.469 -48.286 -61.098 -74.315 -83.914 -91.411 -97.396 -102.354 -106.427 -109.881 -112.731 -115.48 -117.723 -119.63 -121.373 -122.967 -124.407 -125.674 -126.973 -128.093 -129.022 -129.971 -130.925 -131.685 -132.457 -133.235 -133.829 -134.433 -135.04 -135.649 -136.281 -136.709 -137.145 -137.824 -138.275 -138.736 -138.971 -139.44 -139.923 -140.426 -140.683 -141.048 -141.456 -141.732 -142.015 -142.599 -142.909 -143.233 -143.577 -143.966 -144.411 -144.93 -145.927 -5 ,9971 ,TETRA ,17618152,Tue Nov 30 12:44:18 CET,Tue Nov 30 14:31:29 CET,0.0 0.451 0.496 0.492 0.477 0.448 0.407 0.372 0.291 0.238 0.184 0.085 -0.013 -0.074 -0.19 -0.305 -0.43 -0.502 -0.653 -0.815 -1.074 -1.245 -1.417 -1.679 -1.941 -2.214 -2.507 -2.805 -3.202 -3.604 -4.004 -4.513 -5.025 -5.548 -6.187 -6.945 -7.702 -8.573 -9.615 -10.806 -12.089 -13.601 -15.472 -17.445 -19.913 -22.875 -26.594 -31.318 -37.672 -46.41 -59.123 -72.213 -81.72 -89.058 -94.843 -99.631 -103.555 -106.919 -109.736 -112.406 -114.545 -116.357 -118.032 -119.576 -120.968 -122.202 -123.444 -124.514 -125.411 -126.32 -127.235 -127.969 -128.719 -129.492 -130.081 -130.674 -131.259 -131.853 -132.469 -132.884 -133.32 -133.987 -134.418 -134.848 -135.069 -135.527 -135.996 -136.49 -136.747 -137.106 -137.496 -137.761 -138.037 -138.615 -138.911 -139.241 -139.615 -140.053 -140.536 -141.063 -142.178 -6 ,13130 ,TETRA ,17618153,Tue Nov 30 12:44:19 CET,Tue Nov 30 14:34:05 CET,0.0 0.479 0.569 0.597 0.601 0.598 0.576 0.534 0.439 0.388 0.329 0.221 0.116 0.042 -0.107 -0.261 -0.43 -0.518 -0.693 -0.874 -1.151 -1.34 -1.535 -1.827 -2.125 -2.425 -2.725 -3.031 -3.456 -3.895 -4.332 -4.874 -5.419 -5.964 -6.616 -7.373 -8.139 -9.039 -10.069 -11.215 -12.49 -14.033 -15.978 -18.069 -20.669 -23.803 -27.751 -32.684 -39.151 -47.914 -60.712 -73.892 -83.438 -90.8 -96.572 -101.357 -105.296 -108.631 -111.364 -113.986 -116.144 -117.979 -119.672 -121.223 -122.624 -123.866 -125.14 -126.259 -127.193 -128.132 -129.102 -129.89 -130.681 -131.484 -132.082 -132.68 -133.285 -133.906 -134.537 -134.95 -135.36 -135.996 -136.432 -136.891 -137.13 -137.604 -138.067 -138.535 -138.78 -139.155 -139.608 -139.884 -140.163 -140.734 -141.046 -141.385 -141.744 -142.126 -142.544 -143.037 -144.082 -7 ,17833 ,TETRA ,17618154,Tue Nov 30 12:44:19 CET,Tue Nov 30 14:22:19 CET,0.0 0.409 0.473 0.49 0.487 0.477 0.453 0.431 0.374 0.322 0.251 0.124 0.018 -0.059 -0.209 -0.37 -0.545 -0.633 -0.81 -0.987 -1.258 -1.446 -1.632 -1.923 -2.228 -2.534 -2.842 -3.159 -3.598 -4.046 -4.493 -5.055 -5.625 -6.188 -6.86 -7.651 -8.446 -9.347 -10.364 -11.529 -12.82 -14.37 -16.334 -18.42 -21.027 -24.194 -28.17 -33.098 -39.552 -48.321 -61.107 -74.257 -83.812 -91.167 -96.967 -101.799 -105.751 -109.128 -111.891 -114.511 -116.673 -118.519 -120.209 -121.746 -123.122 -124.339 -125.568 -126.641 -127.552 -128.46 -129.378 -130.124 -130.875 -131.64 -132.217 -132.802 -133.394 -133.996 -134.611 -135.037 -135.471 -136.102 -136.537 -136.993 -137.219 -137.679 -138.141 -138.622 -138.867 -139.218 -139.61 -139.864 -140.128 -140.695 -141.014 -141.34 -141.671 -142.054 -142.466 -142.974 -143.964 -8 ,16611 ,TETRA ,17618155,Tue Nov 30 12:45:20 CET,Tue Nov 30 14:33:44 CET,0.0 0.329 0.391 0.422 0.431 0.427 0.415 0.392 0.331 0.289 0.233 0.15 0.063 0.005 -0.12 -0.257 -0.402 -0.478 -0.634 -0.792 -1.032 -1.194 -1.359 -1.619 -1.89 -2.16 -2.439 -2.724 -3.109 -3.498 -3.888 -4.375 -4.878 -5.392 -6.006 -6.737 -7.481 -8.317 -9.297 -10.427 -11.674 -13.171 -15.031 -17.048 -19.641 -22.83 -26.812 -31.739 -38.208 -46.951 -59.703 -72.905 -82.446 -89.768 -95.558 -100.354 -104.266 -107.608 -110.421 -113.129 -115.357 -117.276 -119.039 -120.621 -122.011 -123.228 -124.468 -125.545 -126.463 -127.412 -128.386 -129.189 -129.998 -130.804 -131.414 -132.033 -132.655 -133.289 -133.927 -134.35 -134.783 -135.454 -135.908 -136.347 -136.569 -137.027 -137.486 -137.975 -138.229 -138.585 -138.998 -139.268 -139.542 -140.108 -140.418 -140.756 -141.103 -141.468 -141.898 -142.424 -143.552 -9 ,12743 ,TETRA ,17618156,Tue Nov 30 12:48:19 CET,Tue Nov 30 14:37:09 CET,0.0 0.408 0.492 0.513 0.515 0.499 0.474 0.439 0.338 0.28 0.219 0.117 0.017 -0.054 -0.2 -0.359 -0.53 -0.615 -0.787 -0.959 -1.23 -1.422 -1.618 -1.904 -2.182 -2.475 -2.777 -3.091 -3.522 -3.943 -4.363 -4.9 -5.435 -5.989 -6.669 -7.456 -8.26 -9.208 -10.279 -11.47 -12.805 -14.394 -16.365 -18.481 -21.114 -24.293 -28.29 -33.257 -39.777 -48.59 -61.38 -74.529 -84.041 -91.396 -97.194 -102.011 -105.981 -109.35 -112.109 -114.713 -116.855 -118.677 -120.346 -121.939 -123.393 -124.665 -125.949 -127.046 -127.99 -128.955 -129.914 -130.687 -131.461 -132.245 -132.838 -133.426 -134.025 -134.645 -135.259 -135.679 -136.1 -136.721 -137.152 -137.598 -137.822 -138.273 -138.737 -139.217 -139.463 -139.821 -140.261 -140.556 -140.849 -141.444 -141.749 -142.07 -142.401 -142.763 -143.193 -143.699 -145.027 -10 ,4892 ,TETRA ,17618157,Tue Nov 30 12:48:21 CET,Tue Nov 30 14:37:09 CET,0.0 0.471 0.55 0.558 0.54 0.507 0.465 0.433 0.374 0.328 0.284 0.22 0.133 0.062 -0.094 -0.258 -0.424 -0.501 -0.666 -0.848 -1.12 -1.299 -1.487 -1.776 -2.075 -2.379 -2.68 -2.993 -3.421 -3.841 -4.258 -4.806 -5.378 -5.951 -6.633 -7.442 -8.257 -9.177 -10.202 -11.35 -12.621 -14.122 -16.003 -18.042 -20.582 -23.671 -27.625 -32.566 -39.055 -47.853 -60.642 -73.796 -83.337 -90.71 -96.52 -101.337 -105.292 -108.653 -111.401 -114.02 -116.166 -118.001 -119.707 -121.262 -122.663 -123.9 -125.138 -126.205 -127.109 -128.033 -128.959 -129.715 -130.484 -131.26 -131.857 -132.46 -133.056 -133.654 -134.267 -134.669 -135.074 -135.716 -136.148 -136.585 -136.809 -137.27 -137.75 -138.238 -138.484 -138.84 -139.231 -139.498 -139.776 -140.352 -140.653 -140.965 -141.314 -141.701 -142.154 -142.664 -143.579 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_227.txt deleted file mode 100644 index f48d09ea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11749 ,TETRA ,17668017,Fri Dec 3 06:18:42 CET,Fri Dec 3 08:05:12 CET,0.0 0.823 1.114 1.303 1.479 1.627 1.759 1.882 2.104 2.203 2.299 2.519 2.573 2.659 2.804 2.94 3.083 3.151 3.273 3.386 3.56 3.675 3.775 3.911 4.026 4.124 4.23 4.333 4.468 4.585 4.676 4.788 4.907 5.026 5.152 5.272 5.389 5.518 5.641 5.768 5.887 5.958 6.01 6.057 6.062 6.015 5.882 5.571 4.963 3.929 2.118 -0.177 -2.094 -3.691 -4.996 -6.121 -7.103 -7.977 -8.7 -9.41 -10.088 -10.759 -11.351 -11.845 -12.319 -12.756 -13.197 -13.594 -13.934 -14.292 -14.678 -14.998 -15.325 -15.653 -15.891 -16.135 -16.389 -16.653 -16.924 -17.105 -17.294 -17.596 -17.792 -17.984 -18.086 -18.306 -18.549 -18.798 -18.928 -19.056 -19.359 -19.515 -19.684 -20.024 -20.2 -20.396 -20.622 -20.886 -21.173 -21.556 -23.131 -2 ,4088 ,TETRA ,17668018,Fri Dec 3 06:17:43 CET,Fri Dec 3 08:03:02 CET,0.0 0.823 1.117 1.349 1.537 1.699 1.836 1.965 2.167 2.257 2.357 2.586 2.636 2.716 2.871 3.016 3.155 3.22 3.332 3.426 3.576 3.67 3.755 3.885 4.002 4.11 4.226 4.329 4.446 4.558 4.656 4.785 4.929 5.063 5.19 5.292 5.386 5.491 5.591 5.687 5.775 5.843 5.897 5.927 5.909 5.784 5.556 5.188 4.518 3.475 1.634 -0.655 -2.481 -4.004 -5.306 -6.438 -7.422 -8.315 -9.061 -9.807 -10.447 -10.997 -11.522 -12.034 -12.542 -13.034 -13.544 -13.955 -14.282 -14.648 -15.022 -15.311 -15.602 -15.894 -16.13 -16.383 -16.635 -16.903 -17.194 -17.393 -17.584 -17.859 -18.055 -18.253 -18.354 -18.578 -18.811 -19.042 -19.176 -19.31 -19.59 -19.737 -19.902 -20.245 -20.421 -20.608 -20.82 -21.042 -21.307 -21.721 -22.917 -3 ,29370 ,TETRA ,17668019,Fri Dec 3 06:18:45 CET,Fri Dec 3 08:05:06 CET,0.0 0.802 1.115 1.352 1.527 1.679 1.824 1.956 2.214 2.328 2.428 2.651 2.707 2.782 2.92 3.053 3.184 3.245 3.359 3.476 3.647 3.757 3.864 4.017 4.152 4.277 4.396 4.495 4.631 4.776 4.902 5.032 5.143 5.252 5.38 5.519 5.651 5.779 5.878 5.98 6.086 6.181 6.246 6.273 6.271 6.224 6.078 5.749 5.237 4.455 2.943 0.929 -0.858 -2.418 -3.734 -4.915 -5.898 -6.776 -7.526 -8.262 -8.897 -9.439 -9.958 -10.453 -10.912 -11.329 -11.745 -12.107 -12.419 -12.737 -13.081 -13.364 -13.661 -13.992 -14.257 -14.529 -14.786 -15.04 -15.303 -15.476 -15.647 -15.93 -16.132 -16.342 -16.448 -16.666 -16.915 -17.189 -17.329 -17.453 -17.742 -17.893 -18.047 -18.354 -18.524 -18.724 -18.951 -19.19 -19.497 -19.906 -20.897 -4 ,28383 ,TETRA ,17668020,Fri Dec 3 06:18:48 CET,Fri Dec 3 08:05:45 CET,0.0 0.69 0.996 1.254 1.447 1.623 1.774 1.893 2.143 2.255 2.35 2.577 2.629 2.704 2.85 2.985 3.112 3.175 3.306 3.419 3.573 3.668 3.749 3.866 3.996 4.129 4.251 4.372 4.528 4.663 4.769 4.884 4.986 5.084 5.195 5.31 5.417 5.527 5.645 5.743 5.847 5.964 6.081 6.138 6.127 6.093 6.045 5.855 5.397 4.578 2.85 0.639 -1.191 -2.737 -4.046 -5.215 -6.213 -7.08 -7.817 -8.544 -9.152 -9.691 -10.226 -10.732 -11.176 -11.568 -11.985 -12.357 -12.665 -12.99 -13.333 -13.623 -13.922 -14.232 -14.478 -14.723 -14.964 -15.219 -15.491 -15.675 -15.863 -16.144 -16.335 -16.549 -16.66 -16.895 -17.136 -17.362 -17.482 -17.604 -17.876 -18.017 -18.178 -18.536 -18.719 -18.918 -19.155 -19.403 -19.695 -20.102 -21.722 -5 ,26225 ,TETRA ,17668021,Fri Dec 3 06:18:46 CET,Fri Dec 3 08:05:28 CET,0.0 0.874 1.178 1.422 1.636 1.813 1.973 2.13 2.409 2.524 2.626 2.842 2.894 2.97 3.117 3.253 3.375 3.434 3.548 3.658 3.811 3.898 3.983 4.118 4.247 4.371 4.489 4.586 4.702 4.824 4.94 5.07 5.18 5.294 5.425 5.559 5.679 5.81 5.94 6.071 6.188 6.242 6.275 6.335 6.362 6.32 6.206 5.969 5.518 4.639 3.021 0.949 -0.79 -2.253 -3.503 -4.635 -5.617 -6.564 -7.428 -8.243 -8.945 -9.535 -10.044 -10.52 -10.964 -11.37 -11.811 -12.218 -12.547 -12.879 -13.228 -13.525 -13.846 -14.187 -14.448 -14.705 -14.947 -15.187 -15.442 -15.62 -15.808 -16.1 -16.301 -16.519 -16.636 -16.883 -17.137 -17.404 -17.541 -17.659 -17.95 -18.104 -18.281 -18.649 -18.827 -19.018 -19.226 -19.477 -19.776 -20.165 -21.097 -6 ,19462 ,TETRA ,17668022,Fri Dec 3 06:18:43 CET,Fri Dec 3 08:05:31 CET,0.0 0.882 1.186 1.417 1.608 1.757 1.891 2.019 2.261 2.378 2.478 2.674 2.712 2.785 2.939 3.102 3.247 3.316 3.452 3.574 3.738 3.836 3.935 4.085 4.212 4.328 4.438 4.528 4.639 4.744 4.848 4.972 5.095 5.227 5.342 5.436 5.548 5.672 5.78 5.892 5.995 6.099 6.173 6.186 6.209 6.195 6.082 5.813 5.292 4.419 2.7 0.44 -1.483 -3.067 -4.361 -5.516 -6.53 -7.435 -8.195 -8.919 -9.525 -10.064 -10.57 -11.044 -11.486 -11.898 -12.322 -12.686 -13.004 -13.339 -13.69 -13.98 -14.268 -14.558 -14.783 -15.021 -15.258 -15.493 -15.751 -15.943 -16.141 -16.448 -16.645 -16.829 -16.935 -17.159 -17.385 -17.641 -17.774 -17.897 -18.189 -18.337 -18.489 -18.816 -19.001 -19.195 -19.418 -19.674 -19.983 -20.424 -21.569 -7 ,8636 ,TETRA ,17668023,Fri Dec 3 06:18:43 CET,Fri Dec 3 08:05:36 CET,0.0 1.117 1.39 1.603 1.799 1.974 2.122 2.267 2.525 2.631 2.736 2.959 3.01 3.091 3.228 3.374 3.517 3.577 3.681 3.784 3.945 4.039 4.131 4.265 4.38 4.474 4.556 4.635 4.759 4.888 4.998 5.134 5.282 5.433 5.584 5.709 5.815 5.936 6.061 6.166 6.249 6.35 6.464 6.53 6.537 6.48 6.306 6.009 5.443 4.343 2.519 0.337 -1.446 -2.937 -4.219 -5.336 -6.304 -7.19 -7.942 -8.658 -9.275 -9.843 -10.369 -10.856 -11.31 -11.706 -12.135 -12.527 -12.849 -13.163 -13.505 -13.797 -14.095 -14.399 -14.623 -14.862 -15.122 -15.39 -15.663 -15.845 -16.031 -16.328 -16.53 -16.746 -16.855 -17.076 -17.313 -17.56 -17.688 -17.803 -18.072 -18.22 -18.385 -18.729 -18.934 -19.156 -19.384 -19.638 -19.923 -20.338 -21.912 -8 ,21511 ,TETRA ,17668024,Fri Dec 3 06:18:46 CET,Fri Dec 3 08:05:40 CET,0.0 0.897 1.231 1.468 1.643 1.814 1.976 2.107 2.355 2.474 2.584 2.804 2.86 2.949 3.109 3.25 3.389 3.448 3.563 3.689 3.852 3.932 4.008 4.141 4.278 4.407 4.518 4.617 4.748 4.859 4.97 5.099 5.204 5.312 5.42 5.529 5.621 5.721 5.853 5.973 6.054 6.139 6.215 6.266 6.334 6.341 6.176 5.858 5.348 4.462 2.798 0.675 -1.072 -2.515 -3.741 -4.878 -5.864 -6.715 -7.456 -8.188 -8.804 -9.345 -9.87 -10.365 -10.829 -11.25 -11.677 -12.057 -12.388 -12.743 -13.102 -13.385 -13.677 -13.965 -14.199 -14.463 -14.728 -14.988 -15.255 -15.44 -15.626 -15.919 -16.121 -16.328 -16.439 -16.676 -16.919 -17.175 -17.312 -17.433 -17.712 -17.864 -18.039 -18.394 -18.584 -18.791 -19.01 -19.269 -19.578 -19.962 -20.882 -9 ,5383 ,TETRA ,17668025,Fri Dec 3 06:18:47 CET,Fri Dec 3 08:05:46 CET,0.0 0.872 1.199 1.447 1.654 1.83 1.976 2.109 2.341 2.439 2.536 2.756 2.805 2.885 3.027 3.158 3.283 3.338 3.445 3.55 3.707 3.807 3.898 4.01 4.123 4.24 4.346 4.451 4.592 4.74 4.868 4.996 5.12 5.238 5.394 5.569 5.683 5.789 5.889 5.953 5.998 6.011 5.993 5.994 6.013 5.976 5.827 5.562 5.118 4.265 2.552 0.292 -1.599 -3.145 -4.442 -5.581 -6.543 -7.399 -8.124 -8.842 -9.475 -10.03 -10.544 -11.018 -11.434 -11.83 -12.264 -12.638 -12.965 -13.305 -13.65 -13.926 -14.201 -14.489 -14.735 -14.992 -15.237 -15.478 -15.728 -15.907 -16.094 -16.386 -16.591 -16.802 -16.916 -17.165 -17.424 -17.693 -17.828 -17.955 -18.256 -18.405 -18.559 -18.899 -19.094 -19.327 -19.574 -19.825 -20.158 -20.581 -21.617 -10 ,4925 ,TETRA ,17668026,Fri Dec 3 06:18:44 CET,Fri Dec 3 08:04:00 CET,0.0 0.862 1.166 1.409 1.595 1.748 1.894 2.025 2.231 2.326 2.422 2.628 2.681 2.761 2.906 3.049 3.193 3.26 3.374 3.487 3.64 3.737 3.834 3.966 4.075 4.17 4.268 4.378 4.522 4.641 4.741 4.856 4.973 5.094 5.229 5.36 5.473 5.573 5.663 5.759 5.849 5.942 6.043 6.089 6.09 6.073 5.948 5.663 5.148 4.307 2.687 0.606 -1.081 -2.543 -3.812 -4.923 -5.886 -6.759 -7.506 -8.242 -8.875 -9.442 -9.981 -10.462 -10.897 -11.311 -11.744 -12.12 -12.432 -12.751 -13.09 -13.376 -13.676 -13.981 -14.211 -14.442 -14.682 -14.938 -15.204 -15.393 -15.583 -15.862 -16.061 -16.272 -16.381 -16.614 -16.863 -17.106 -17.227 -17.342 -17.617 -17.766 -17.933 -18.301 -18.495 -18.697 -18.92 -19.161 -19.49 -19.937 -21.055 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_235.txt deleted file mode 100644 index eb73f5e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23619 ,TETRA ,17618158,Tue Nov 30 12:48:19 CET,Tue Nov 30 14:28:38 CET,0.0 1.339 1.702 1.948 2.142 2.318 2.484 2.651 2.962 3.107 3.238 3.489 3.549 3.646 3.839 4.019 4.179 4.246 4.381 4.526 4.729 4.854 4.964 5.131 5.308 5.467 5.613 5.751 5.957 6.167 6.359 6.587 6.787 6.962 7.139 7.335 7.553 7.793 8.048 8.34 8.647 8.983 9.384 9.751 10.138 10.533 10.989 11.473 11.925 12.282 12.375 11.928 11.298 10.665 10.079 9.511 8.994 8.499 8.056 7.636 7.257 6.919 6.606 6.301 5.996 5.712 5.417 5.16 4.943 4.717 4.463 4.254 4.054 3.846 3.669 3.469 3.267 3.054 2.834 2.682 2.525 2.277 2.11 1.945 1.858 1.668 1.467 1.255 1.145 1.06 0.766 0.622 0.46 0.116 -0.077 -0.279 -0.495 -0.761 -1.079 -1.438 -2.271 -2 ,19983 ,TETRA ,17618159,Tue Nov 30 12:48:19 CET,Tue Nov 30 14:37:34 CET,0.0 1.545 1.936 2.204 2.409 2.573 2.721 2.847 3.087 3.208 3.315 3.558 3.64 3.741 3.91 4.059 4.203 4.277 4.413 4.547 4.756 4.901 5.037 5.217 5.39 5.56 5.722 5.875 6.086 6.303 6.506 6.724 6.92 7.102 7.31 7.551 7.784 8.027 8.281 8.549 8.819 9.116 9.48 9.843 10.25 10.67 11.101 11.563 12.009 12.387 12.612 12.405 11.918 11.379 10.86 10.356 9.873 9.399 8.974 8.544 8.167 7.816 7.439 7.08 6.767 6.492 6.214 5.956 5.73 5.497 5.252 5.034 4.805 4.585 4.422 4.251 4.06 3.859 3.639 3.479 3.325 3.086 2.92 2.754 2.667 2.473 2.25 2.012 1.897 1.805 1.518 1.388 1.253 0.971 0.809 0.62 0.4 0.13 -0.15 -0.519 -1.967 -3 ,21135 ,TETRA ,17618160,Tue Nov 30 12:48:21 CET,Tue Nov 30 14:37:31 CET,0.0 1.026 1.398 1.697 1.936 2.128 2.29 2.437 2.714 2.84 2.958 3.204 3.273 3.383 3.593 3.771 3.932 4.011 4.163 4.319 4.545 4.686 4.823 5.013 5.189 5.355 5.521 5.674 5.848 6.017 6.184 6.4 6.617 6.824 7.068 7.326 7.585 7.857 8.108 8.372 8.656 8.987 9.351 9.705 10.088 10.506 10.937 11.351 11.811 12.255 12.473 12.15 11.628 11.111 10.611 10.051 9.537 9.101 8.706 8.302 7.96 7.643 7.303 6.938 6.584 6.257 5.949 5.692 5.477 5.265 5.003 4.758 4.51 4.248 4.037 3.826 3.637 3.463 3.27 3.129 2.977 2.737 2.573 2.401 2.311 2.113 1.897 1.665 1.539 1.439 1.129 0.987 0.829 0.458 0.263 0.062 -0.148 -0.417 -0.771 -1.245 -2.945 -4 ,30906 ,TETRA ,17618161,Tue Nov 30 12:48:19 CET,Tue Nov 30 14:38:16 CET,0.0 0.738 1.004 1.228 1.424 1.597 1.77 1.936 2.213 2.337 2.447 2.685 2.758 2.859 3.052 3.237 3.405 3.487 3.637 3.778 3.971 4.095 4.214 4.383 4.548 4.709 4.887 5.065 5.266 5.439 5.602 5.822 6.051 6.267 6.497 6.727 6.948 7.197 7.467 7.759 8.051 8.336 8.611 8.921 9.328 9.706 10.114 10.586 11.03 11.415 11.684 11.455 10.915 10.342 9.796 9.288 8.829 8.398 8.013 7.606 7.232 6.889 6.575 6.262 5.964 5.694 5.416 5.173 4.95 4.707 4.453 4.24 4.029 3.822 3.655 3.485 3.293 3.084 2.88 2.73 2.573 2.339 2.174 1.996 1.899 1.69 1.494 1.294 1.182 1.092 0.794 0.656 0.505 0.165 0.002 -0.19 -0.42 -0.679 -0.976 -1.403 -2.858 -5 ,2267 ,TETRA ,17618162,Tue Nov 30 12:49:22 CET,Tue Nov 30 14:38:38 CET,0.0 1.093 1.464 1.733 1.937 2.113 2.295 2.469 2.738 2.862 2.975 3.21 3.267 3.361 3.537 3.695 3.87 3.958 4.121 4.267 4.464 4.585 4.713 4.918 5.103 5.256 5.411 5.572 5.766 5.948 6.13 6.345 6.543 6.729 6.96 7.233 7.478 7.739 7.995 8.245 8.529 8.846 9.185 9.553 9.993 10.403 10.833 11.303 11.783 12.174 12.359 12.119 11.672 11.168 10.627 10.06 9.556 9.089 8.7 8.301 7.928 7.58 7.231 6.916 6.637 6.374 6.097 5.848 5.624 5.385 5.122 4.899 4.655 4.395 4.203 4.01 3.823 3.636 3.442 3.312 3.168 2.92 2.75 2.578 2.48 2.272 2.064 1.853 1.745 1.662 1.36 1.218 1.077 0.785 0.619 0.436 0.246 0.011 -0.299 -0.725 -2.018 -6 ,15927 ,TETRA ,17618163,Tue Nov 30 12:49:20 CET,Tue Nov 30 14:39:01 CET,0.0 0.733 1.077 1.348 1.541 1.691 1.84 1.983 2.228 2.342 2.458 2.711 2.784 2.879 3.047 3.217 3.385 3.461 3.617 3.78 4.011 4.156 4.297 4.49 4.66 4.824 4.991 5.144 5.333 5.512 5.686 5.9 6.106 6.304 6.534 6.78 7.012 7.273 7.551 7.862 8.184 8.509 8.873 9.226 9.625 10.026 10.452 10.893 11.319 11.659 11.734 11.443 11.002 10.495 9.953 9.376 8.849 8.396 7.999 7.585 7.227 6.889 6.562 6.245 5.936 5.655 5.356 5.095 4.872 4.641 4.388 4.169 3.949 3.73 3.554 3.373 3.191 2.996 2.786 2.63 2.47 2.228 2.06 1.89 1.799 1.598 1.384 1.15 1.025 0.925 0.641 0.507 0.363 0.048 -0.135 -0.335 -0.558 -0.815 -1.111 -1.515 -3.001 -7 ,362 ,TETRA ,17618164,Tue Nov 30 12:49:20 CET,Tue Nov 30 14:39:40 CET,0.0 1.076 1.421 1.652 1.857 2.058 2.244 2.403 2.681 2.805 2.928 3.209 3.294 3.396 3.573 3.741 3.911 3.992 4.139 4.27 4.454 4.581 4.707 4.899 5.095 5.264 5.405 5.543 5.736 5.932 6.122 6.345 6.559 6.755 6.967 7.195 7.427 7.712 7.996 8.268 8.554 8.861 9.216 9.581 9.99 10.411 10.87 11.317 11.765 12.14 12.243 11.951 11.461 10.898 10.367 9.859 9.358 8.899 8.489 8.07 7.702 7.372 7.057 6.733 6.427 6.158 5.868 5.597 5.354 5.1 4.845 4.638 4.428 4.206 4.026 3.832 3.644 3.445 3.226 3.084 2.925 2.663 2.493 2.325 2.229 2.007 1.797 1.586 1.476 1.398 1.111 0.961 0.799 0.471 0.305 0.128 -0.076 -0.324 -0.654 -1.12 -2.179 -8 ,2579 ,TETRA ,17618165,Tue Nov 30 12:51:21 CET,Tue Nov 30 14:38:33 CET,0.0 0.701 1.016 1.27 1.468 1.631 1.796 1.959 2.257 2.385 2.5 2.76 2.832 2.924 3.108 3.306 3.49 3.569 3.712 3.847 4.049 4.177 4.308 4.507 4.709 4.897 5.067 5.23 5.44 5.637 5.816 6.015 6.205 6.403 6.662 6.97 7.238 7.497 7.743 7.997 8.253 8.531 8.868 9.207 9.607 10.048 10.524 10.987 11.406 11.749 11.963 11.779 11.38 10.834 10.307 9.805 9.301 8.85 8.437 8.023 7.661 7.303 6.974 6.662 6.347 6.072 5.798 5.534 5.295 5.059 4.828 4.637 4.424 4.168 3.954 3.743 3.536 3.307 3.066 2.903 2.74 2.503 2.338 2.159 2.058 1.848 1.634 1.412 1.295 1.199 0.894 0.746 0.602 0.288 0.108 -0.093 -0.325 -0.601 -0.933 -1.368 -3.521 -9 ,9841 ,TETRA ,17618166,Tue Nov 30 12:51:23 CET,Tue Nov 30 14:39:12 CET,0.0 0.879 1.214 1.446 1.65 1.847 2.029 2.172 2.423 2.547 2.666 2.918 2.993 3.096 3.276 3.456 3.624 3.7 3.852 3.992 4.19 4.318 4.437 4.615 4.798 4.972 5.136 5.286 5.467 5.644 5.816 6.026 6.245 6.471 6.714 6.992 7.247 7.492 7.764 8.064 8.365 8.69 9.082 9.452 9.851 10.264 10.72 11.172 11.608 12.038 12.223 11.887 11.368 10.784 10.215 9.704 9.212 8.745 8.372 7.975 7.614 7.29 6.972 6.659 6.353 6.066 5.782 5.531 5.297 5.065 4.823 4.612 4.401 4.181 4.005 3.829 3.639 3.425 3.21 3.069 2.929 2.703 2.533 2.357 2.263 2.068 1.873 1.668 1.56 1.471 1.157 1.022 0.888 0.587 0.421 0.228 0.019 -0.232 -0.531 -0.894 -2.047 -10 ,16914 ,TETRA ,17618167,Tue Nov 30 12:51:24 CET,Tue Nov 30 14:38:50 CET,0.0 0.887 1.172 1.43 1.648 1.843 2.004 2.145 2.426 2.563 2.693 2.965 3.038 3.136 3.315 3.497 3.673 3.755 3.927 4.099 4.335 4.48 4.611 4.799 4.982 5.137 5.287 5.434 5.621 5.816 5.994 6.204 6.407 6.599 6.832 7.085 7.299 7.534 7.789 8.076 8.372 8.694 9.071 9.421 9.843 10.284 10.692 11.068 11.463 11.844 12.043 11.821 11.363 10.856 10.33 9.793 9.3 8.843 8.429 8.013 7.662 7.364 7.063 6.746 6.45 6.178 5.882 5.61 5.379 5.146 4.885 4.669 4.455 4.231 4.055 3.855 3.646 3.419 3.166 3.003 2.837 2.562 2.374 2.186 2.081 1.857 1.622 1.379 1.26 1.165 0.864 0.718 0.565 0.229 0.033 -0.176 -0.396 -0.65 -0.984 -1.454 -2.799 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_252.txt deleted file mode 100644 index 262ced30..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31622 ,TETRA ,17618168,Tue Nov 30 12:53:21 CET,Tue Nov 30 14:41:23 CET,0.0 0.646 0.711 0.714 0.658 0.571 0.492 0.406 0.174 0.05 -0.085 -0.359 -0.553 -0.712 -1.017 -1.325 -1.65 -1.816 -2.156 -2.502 -3.028 -3.391 -3.754 -4.292 -4.836 -5.405 -5.978 -6.552 -7.337 -8.128 -8.926 -9.937 -10.943 -11.952 -13.197 -14.673 -16.159 -17.851 -19.775 -21.955 -24.34 -27.192 -30.761 -34.539 -39.255 -45.009 -52.221 -61.157 -72.873 -88.632 -111.483 -134.756 -151.461 -164.347 -174.519 -182.914 -189.795 -195.667 -200.499 -205.088 -208.839 -212.059 -215.016 -217.705 -220.118 -222.256 -224.418 -226.286 -227.849 -229.406 -230.991 -232.301 -233.61 -234.918 -235.91 -236.906 -237.925 -238.951 -239.983 -240.684 -241.442 -242.697 -243.587 -244.489 -244.935 -245.828 -246.744 -247.685 -248.159 -248.939 -249.667 -250.169 -250.678 -251.769 -252.36 -252.967 -253.613 -254.33 -255.157 -256.074 -258.204 -2 ,26090 ,TETRA ,17618169,Tue Nov 30 12:53:22 CET,Tue Nov 30 14:41:08 CET,0.0 0.502 0.569 0.597 0.567 0.49 0.384 0.265 0.039 -0.089 -0.22 -0.457 -0.639 -0.782 -1.079 -1.387 -1.692 -1.85 -2.185 -2.54 -3.093 -3.463 -3.834 -4.383 -4.915 -5.464 -6.04 -6.622 -7.397 -8.184 -8.994 -10.008 -11.009 -11.995 -13.186 -14.607 -16.068 -17.764 -19.691 -21.82 -24.191 -27.078 -30.657 -34.491 -39.248 -44.931 -52.072 -60.977 -72.627 -88.403 -111.188 -134.489 -151.381 -164.332 -174.563 -183.023 -189.974 -195.927 -200.787 -205.397 -209.195 -212.452 -215.409 -218.089 -220.514 -222.656 -224.813 -226.67 -228.263 -229.893 -231.514 -232.798 -234.087 -235.412 -236.442 -237.492 -238.523 -239.564 -240.633 -241.335 -242.045 -243.135 -243.869 -244.616 -244.998 -245.857 -246.793 -247.735 -248.21 -248.993 -249.729 -250.248 -250.776 -251.89 -252.482 -253.084 -253.718 -254.44 -255.273 -256.272 -258.95 -3 ,24037 ,TETRA ,17618170,Tue Nov 30 12:53:21 CET,Tue Nov 30 14:40:52 CET,0.0 0.414 0.498 0.475 0.411 0.346 0.253 0.147 -0.073 -0.194 -0.323 -0.547 -0.713 -0.856 -1.155 -1.456 -1.775 -1.949 -2.303 -2.659 -3.188 -3.543 -3.914 -4.478 -5.045 -5.627 -6.208 -6.792 -7.568 -8.314 -9.093 -10.122 -11.152 -12.169 -13.375 -14.812 -16.289 -17.996 -19.942 -22.113 -24.488 -27.332 -30.901 -34.701 -39.421 -45.089 -52.205 -61.05 -72.597 -88.171 -110.718 -133.9 -150.691 -163.596 -173.826 -182.303 -189.207 -195.082 -199.886 -204.45 -208.216 -211.449 -214.415 -217.07 -219.443 -221.567 -223.718 -225.572 -227.128 -228.707 -230.315 -231.625 -232.962 -234.301 -235.312 -236.34 -237.385 -238.439 -239.5 -240.211 -240.918 -241.992 -242.723 -243.467 -243.846 -244.629 -245.426 -246.244 -246.658 -247.302 -247.94 -248.39 -248.845 -249.882 -250.461 -251.061 -251.717 -252.425 -253.219 -254.142 -256.438 -4 ,16182 ,TETRA ,17618171,Tue Nov 30 12:54:21 CET,Tue Nov 30 14:35:31 CET,0.0 0.522 0.583 0.577 0.53 0.449 0.347 0.228 -0.017 -0.149 -0.289 -0.557 -0.753 -0.902 -1.176 -1.483 -1.82 -1.991 -2.355 -2.722 -3.253 -3.618 -3.977 -4.516 -5.096 -5.685 -6.269 -6.852 -7.636 -8.418 -9.184 -10.141 -11.14 -12.178 -13.413 -14.843 -16.313 -18.006 -19.896 -22.031 -24.431 -27.297 -30.849 -34.641 -39.388 -45.146 -52.348 -61.259 -72.892 -88.561 -111.278 -134.499 -151.291 -164.243 -174.414 -182.844 -189.729 -195.579 -200.411 -205.023 -208.803 -212.05 -215.026 -217.699 -220.099 -222.247 -224.438 -226.337 -227.927 -229.525 -231.139 -232.447 -233.764 -235.095 -236.091 -237.105 -238.17 -239.238 -240.309 -241.038 -241.76 -242.846 -243.596 -244.368 -244.761 -245.562 -246.428 -247.385 -247.88 -248.673 -249.428 -249.954 -250.498 -251.663 -252.253 -252.883 -253.568 -254.296 -255.114 -256.095 -258.149 -5 ,31906 ,TETRA ,17618172,Tue Nov 30 12:54:22 CET,Tue Nov 30 14:36:24 CET,0.0 0.513 0.585 0.572 0.516 0.43 0.342 0.266 0.055 -0.071 -0.207 -0.472 -0.658 -0.812 -1.115 -1.421 -1.734 -1.899 -2.233 -2.565 -3.058 -3.406 -3.777 -4.347 -4.916 -5.487 -6.059 -6.637 -7.426 -8.223 -9.027 -10.037 -11.053 -12.076 -13.327 -14.773 -16.207 -17.89 -19.815 -21.954 -24.342 -27.192 -30.73 -34.538 -39.269 -44.98 -52.136 -60.966 -72.504 -88.196 -111.022 -134.355 -151.216 -164.191 -174.406 -182.863 -189.778 -195.656 -200.458 -205.056 -208.85 -212.057 -214.969 -217.613 -220.012 -222.152 -224.298 -226.147 -227.707 -229.308 -230.931 -232.244 -233.579 -234.936 -235.96 -236.977 -238.015 -239.059 -240.089 -240.798 -241.527 -242.63 -243.368 -244.117 -244.502 -245.256 -246.03 -246.861 -247.292 -247.961 -248.588 -249.047 -249.529 -250.493 -251.004 -251.547 -252.091 -252.674 -253.368 -254.222 -257.0 -6 ,197 ,TETRA ,17618173,Tue Nov 30 12:54:21 CET,Tue Nov 30 14:41:18 CET,0.0 0.783 0.859 0.866 0.824 0.763 0.679 0.565 0.303 0.17 0.039 -0.218 -0.393 -0.534 -0.821 -1.11 -1.409 -1.563 -1.892 -2.243 -2.776 -3.133 -3.494 -4.05 -4.613 -5.188 -5.766 -6.345 -7.117 -7.895 -8.708 -9.742 -10.783 -11.821 -13.058 -14.504 -15.967 -17.647 -19.561 -21.708 -24.085 -26.928 -30.464 -34.274 -38.992 -44.661 -51.807 -60.678 -72.384 -88.212 -110.944 -134.183 -151.011 -163.976 -174.227 -182.693 -189.6 -195.478 -200.277 -204.864 -208.647 -211.89 -214.88 -217.596 -220.043 -222.193 -224.367 -226.267 -227.87 -229.485 -231.099 -232.389 -233.693 -235.019 -236.021 -237.029 -238.056 -239.102 -240.152 -240.856 -241.563 -242.65 -243.393 -244.146 -244.531 -245.314 -246.104 -246.905 -247.322 -247.983 -248.603 -249.058 -249.531 -250.52 -251.026 -251.552 -252.106 -252.725 -253.523 -254.469 -256.73 -7 ,15966 ,TETRA ,17618174,Tue Nov 30 12:55:19 CET,Tue Nov 30 14:35:04 CET,0.0 0.51 0.54 0.534 0.481 0.379 0.258 0.135 -0.082 -0.187 -0.304 -0.533 -0.712 -0.871 -1.2 -1.518 -1.832 -2.0 -2.357 -2.708 -3.228 -3.585 -3.957 -4.51 -5.051 -5.616 -6.203 -6.783 -7.558 -8.362 -9.179 -10.196 -11.204 -12.233 -13.463 -14.881 -16.346 -18.042 -19.962 -22.126 -24.521 -27.366 -30.869 -34.617 -39.369 -45.135 -52.359 -61.264 -72.91 -88.644 -111.41 -134.754 -151.545 -164.404 -174.553 -183.029 -189.968 -195.848 -200.693 -205.293 -209.057 -212.288 -215.228 -217.906 -220.319 -222.445 -224.622 -226.509 -228.076 -229.649 -231.278 -232.631 -233.977 -235.32 -236.338 -237.37 -238.387 -239.395 -240.419 -241.119 -241.835 -242.927 -243.675 -244.424 -244.799 -245.634 -246.569 -247.557 -248.059 -248.839 -249.563 -250.091 -250.618 -251.714 -252.307 -252.927 -253.571 -254.277 -255.086 -256.076 -258.414 -8 ,5839 ,TETRA ,17618175,Tue Nov 30 12:56:20 CET,Tue Nov 30 14:51:06 CET,0.0 0.794 0.906 0.898 0.833 0.761 0.692 0.607 0.356 0.217 0.077 -0.188 -0.372 -0.528 -0.844 -1.164 -1.48 -1.642 -1.978 -2.318 -2.848 -3.215 -3.577 -4.129 -4.698 -5.273 -5.847 -6.426 -7.207 -7.985 -8.787 -9.82 -10.843 -11.875 -13.116 -14.559 -16.018 -17.695 -19.605 -21.741 -24.113 -26.94 -30.47 -34.288 -39.023 -44.684 -51.841 -60.725 -72.287 -87.948 -110.622 -133.877 -150.691 -163.547 -173.693 -182.128 -189.041 -194.953 -199.788 -204.373 -208.154 -211.422 -214.422 -217.122 -219.545 -221.683 -223.84 -225.722 -227.3 -228.896 -230.517 -231.817 -233.152 -234.498 -235.498 -236.503 -237.518 -238.556 -239.593 -240.296 -241.015 -242.088 -242.819 -243.559 -243.931 -244.693 -245.472 -246.272 -246.678 -247.326 -247.986 -248.498 -249.047 -250.195 -250.798 -251.44 -252.133 -252.913 -253.763 -254.706 -256.859 -9 ,437 ,TETRA ,17618176,Tue Nov 30 12:56:20 CET,Tue Nov 30 14:45:51 CET,0.0 0.979 1.034 0.971 0.907 0.833 0.74 0.651 0.453 0.328 0.198 -0.03 -0.205 -0.348 -0.647 -0.971 -1.291 -1.451 -1.784 -2.123 -2.631 -2.984 -3.359 -3.936 -4.508 -5.067 -5.641 -6.245 -7.05 -7.83 -8.605 -9.601 -10.61 -11.621 -12.849 -14.318 -15.809 -17.493 -19.389 -21.543 -23.952 -26.793 -30.306 -34.136 -38.927 -44.638 -51.757 -60.597 -72.215 -87.955 -110.713 -133.972 -150.779 -163.711 -173.924 -182.362 -189.243 -195.153 -200.005 -204.588 -208.338 -211.539 -214.491 -217.18 -219.57 -221.688 -223.822 -225.664 -227.231 -228.812 -230.4 -231.694 -233.007 -234.344 -235.364 -236.388 -237.416 -238.435 -239.458 -240.148 -240.851 -241.95 -242.691 -243.426 -243.794 -244.534 -245.307 -246.123 -246.533 -247.187 -247.819 -248.26 -248.701 -249.6 -250.068 -250.56 -251.138 -251.781 -252.512 -253.543 -255.734 -10 ,514 ,TETRA ,17618177,Tue Nov 30 12:56:22 CET,Tue Nov 30 14:49:11 CET,0.0 0.542 0.592 0.604 0.566 0.51 0.433 0.341 0.132 0.006 -0.124 -0.355 -0.53 -0.688 -1.003 -1.315 -1.625 -1.78 -2.1 -2.427 -2.938 -3.293 -3.663 -4.237 -4.804 -5.362 -5.93 -6.512 -7.3 -8.097 -8.897 -9.901 -10.918 -11.949 -13.199 -14.681 -16.177 -17.882 -19.807 -21.959 -24.337 -27.134 -30.573 -34.329 -39.051 -44.737 -51.918 -60.841 -72.442 -88.105 -110.774 -134.036 -150.837 -163.743 -173.954 -182.387 -189.254 -195.142 -199.968 -204.564 -208.37 -211.607 -214.559 -217.24 -219.639 -221.758 -223.922 -225.804 -227.36 -228.918 -230.517 -231.813 -233.128 -234.441 -235.436 -236.461 -237.496 -238.528 -239.567 -240.268 -240.982 -242.071 -242.822 -243.599 -243.993 -244.779 -245.575 -246.41 -246.826 -247.483 -248.132 -248.576 -249.027 -249.998 -250.521 -251.055 -251.638 -252.328 -253.137 -254.157 -256.563 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_57.txt deleted file mode 100644 index 1652bd43..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_290_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18949 ,TETRA ,17618178,Tue Nov 30 12:56:20 CET,Tue Nov 30 14:45:22 CET,0.0 0.609 0.815 0.971 1.106 1.234 1.354 1.46 1.637 1.728 1.816 1.979 2.011 2.074 2.204 2.32 2.421 2.466 2.55 2.631 2.737 2.801 2.873 2.984 3.078 3.163 3.255 3.344 3.441 3.52 3.599 3.683 3.752 3.823 3.91 3.996 4.059 4.096 4.127 4.166 4.182 4.192 4.196 4.12 3.995 3.834 3.481 2.853 1.87 0.452 -1.703 -4.377 -6.699 -8.702 -10.407 -11.824 -13.024 -14.091 -14.961 -15.808 -16.586 -17.312 -17.987 -18.609 -19.193 -19.72 -20.236 -20.695 -21.091 -21.485 -21.887 -22.219 -22.561 -22.906 -23.182 -23.498 -23.808 -24.099 -24.397 -24.601 -24.796 -25.091 -25.294 -25.512 -25.629 -25.873 -26.122 -26.386 -26.533 -26.674 -26.983 -27.15 -27.326 -27.725 -27.941 -28.158 -28.385 -28.641 -28.969 -29.415 -30.571 -2 ,12278 ,TETRA ,17618179,Tue Nov 30 12:56:22 CET,Tue Nov 30 14:49:20 CET,0.0 0.738 1.027 1.214 1.371 1.507 1.617 1.718 1.919 2.021 2.114 2.314 2.354 2.419 2.541 2.659 2.766 2.812 2.903 2.98 3.086 3.158 3.225 3.322 3.418 3.52 3.61 3.681 3.778 3.861 3.939 4.038 4.116 4.162 4.201 4.257 4.31 4.355 4.39 4.42 4.469 4.522 4.509 4.428 4.285 4.075 3.702 3.133 2.355 1.107 -1.008 -3.559 -5.722 -7.558 -9.084 -10.368 -11.452 -12.416 -13.23 -14.05 -14.769 -15.412 -16.03 -16.589 -17.091 -17.553 -18.035 -18.478 -18.86 -19.255 -19.656 -19.974 -20.3 -20.63 -20.873 -21.124 -21.386 -21.663 -21.966 -22.168 -22.374 -22.697 -22.922 -23.158 -23.274 -23.512 -23.752 -23.994 -24.127 -24.262 -24.557 -24.713 -24.875 -25.248 -25.46 -25.673 -25.891 -26.148 -26.465 -26.858 -27.709 -3 ,28927 ,TETRA ,17618180,Tue Nov 30 12:57:20 CET,Tue Nov 30 14:37:30 CET,0.0 0.867 1.157 1.348 1.506 1.639 1.74 1.841 2.029 2.105 2.182 2.364 2.402 2.47 2.593 2.704 2.809 2.861 2.961 3.049 3.166 3.238 3.308 3.412 3.514 3.6 3.669 3.737 3.824 3.913 3.978 4.053 4.129 4.184 4.247 4.322 4.393 4.457 4.526 4.582 4.588 4.59 4.585 4.529 4.415 4.208 3.879 3.368 2.51 1.189 -0.968 -3.581 -5.705 -7.478 -8.982 -10.308 -11.45 -12.479 -13.344 -14.166 -14.861 -15.448 -16.022 -16.577 -17.069 -17.514 -17.981 -18.398 -18.754 -19.109 -19.481 -19.786 -20.091 -20.42 -20.681 -20.944 -21.214 -21.49 -21.778 -21.971 -22.157 -22.459 -22.674 -22.9 -23.012 -23.239 -23.503 -23.771 -23.904 -24.042 -24.351 -24.508 -24.674 -25.031 -25.213 -25.411 -25.649 -25.915 -26.235 -26.69 -28.042 -4 ,328 ,TETRA ,17618181,Tue Nov 30 12:59:21 CET,Tue Nov 30 14:49:23 CET,0.0 0.87 1.14 1.363 1.537 1.67 1.787 1.903 2.126 2.229 2.31 2.476 2.51 2.573 2.692 2.798 2.905 2.953 3.036 3.106 3.214 3.295 3.365 3.457 3.546 3.625 3.693 3.76 3.853 3.937 4.014 4.107 4.19 4.257 4.318 4.389 4.459 4.519 4.544 4.537 4.545 4.536 4.523 4.501 4.373 4.127 3.814 3.373 2.555 1.259 -0.927 -3.597 -5.743 -7.497 -8.984 -10.282 -11.364 -12.334 -13.158 -13.947 -14.622 -15.251 -15.858 -16.404 -16.918 -17.396 -17.871 -18.285 -18.637 -18.992 -19.369 -19.687 -20.012 -20.34 -20.588 -20.853 -21.133 -21.407 -21.693 -21.885 -22.077 -22.39 -22.608 -22.835 -22.952 -23.209 -23.485 -23.76 -23.912 -24.065 -24.378 -24.536 -24.711 -25.122 -25.353 -25.587 -25.81 -26.056 -26.366 -26.756 -27.636 -5 ,29534 ,TETRA ,17618182,Tue Nov 30 12:59:23 CET,Tue Nov 30 14:50:06 CET,0.0 0.864 1.097 1.303 1.472 1.606 1.726 1.832 2.028 2.111 2.187 2.368 2.408 2.479 2.62 2.747 2.851 2.9 2.998 3.084 3.195 3.267 3.336 3.443 3.529 3.604 3.689 3.767 3.858 3.932 3.999 4.075 4.136 4.192 4.249 4.291 4.331 4.382 4.427 4.482 4.52 4.509 4.453 4.363 4.229 4.014 3.663 3.154 2.377 1.122 -1.084 -3.78 -5.921 -7.736 -9.269 -10.583 -11.719 -12.72 -13.585 -14.43 -15.131 -15.734 -16.302 -16.848 -17.343 -17.804 -18.304 -18.714 -19.051 -19.408 -19.771 -20.069 -20.384 -20.725 -20.994 -21.266 -21.532 -21.789 -22.059 -22.253 -22.448 -22.764 -22.988 -23.221 -23.345 -23.587 -23.823 -24.067 -24.193 -24.329 -24.657 -24.816 -24.98 -25.342 -25.538 -25.756 -25.998 -26.262 -26.567 -26.976 -27.913 -6 ,21298 ,TETRA ,17618184,Tue Nov 30 13:00:19 CET,Tue Nov 30 14:47:27 CET,0.0 0.673 0.992 1.226 1.4 1.544 1.657 1.75 1.938 2.034 2.115 2.292 2.327 2.398 2.521 2.626 2.725 2.771 2.873 2.972 3.084 3.141 3.198 3.294 3.381 3.459 3.528 3.586 3.662 3.731 3.802 3.887 3.956 4.037 4.115 4.163 4.209 4.256 4.297 4.324 4.346 4.381 4.381 4.317 4.17 3.903 3.505 2.935 2.087 0.799 -1.482 -4.221 -6.44 -8.281 -9.824 -11.178 -12.333 -13.345 -14.204 -15.037 -15.755 -16.405 -17.029 -17.623 -18.173 -18.655 -19.132 -19.54 -19.882 -20.243 -20.614 -20.914 -21.225 -21.538 -21.794 -22.069 -22.341 -22.62 -22.916 -23.112 -23.308 -23.618 -23.832 -24.071 -24.197 -24.439 -24.687 -24.947 -25.073 -25.201 -25.475 -25.619 -25.783 -26.149 -26.349 -26.557 -26.789 -27.045 -27.344 -27.711 -28.8 -7 ,21195 ,TETRA ,17618185,Tue Nov 30 13:02:24 CET,Tue Nov 30 14:50:30 CET,0.0 0.725 0.981 1.186 1.343 1.491 1.641 1.76 1.963 2.053 2.132 2.311 2.344 2.407 2.514 2.623 2.729 2.775 2.866 2.955 3.059 3.119 3.187 3.272 3.359 3.456 3.542 3.623 3.721 3.8 3.869 3.955 4.022 4.077 4.128 4.177 4.229 4.276 4.31 4.332 4.386 4.427 4.392 4.323 4.2 3.977 3.592 3.063 2.295 1.006 -1.364 -4.296 -6.587 -8.514 -10.096 -11.383 -12.472 -13.444 -14.298 -15.143 -15.84 -16.447 -17.024 -17.585 -18.091 -18.539 -19.019 -19.448 -19.798 -20.148 -20.53 -20.835 -21.144 -21.471 -21.72 -21.971 -22.234 -22.514 -22.816 -23.022 -23.217 -23.526 -23.75 -23.974 -24.081 -24.297 -24.531 -24.781 -24.907 -25.041 -25.336 -25.486 -25.645 -26.014 -26.221 -26.428 -26.653 -26.926 -27.286 -27.697 -28.791 -8 ,14050 ,TETRA ,17618186,Tue Nov 30 13:02:24 CET,Tue Nov 30 14:50:08 CET,0.0 0.664 0.95 1.165 1.347 1.513 1.66 1.781 1.975 2.06 2.149 2.348 2.381 2.444 2.565 2.676 2.779 2.826 2.917 3.002 3.104 3.177 3.259 3.359 3.437 3.514 3.589 3.665 3.768 3.852 3.916 3.984 4.038 4.094 4.179 4.257 4.305 4.366 4.424 4.463 4.498 4.511 4.467 4.376 4.212 3.993 3.682 3.139 2.19 0.769 -1.557 -4.275 -6.394 -8.206 -9.745 -11.066 -12.188 -13.179 -14.022 -14.835 -15.526 -16.125 -16.701 -17.25 -17.755 -18.208 -18.669 -19.069 -19.401 -19.771 -20.145 -20.434 -20.748 -21.084 -21.343 -21.603 -21.856 -22.125 -22.411 -22.611 -22.812 -23.12 -23.335 -23.55 -23.662 -23.913 -24.185 -24.471 -24.616 -24.754 -25.074 -25.245 -25.414 -25.79 -25.974 -26.147 -26.359 -26.61 -26.896 -27.256 -28.455 -9 ,26246 ,TETRA ,17618187,Tue Nov 30 13:03:29 CET,Tue Nov 30 14:42:46 CET,0.0 0.685 0.989 1.221 1.388 1.531 1.648 1.756 1.934 2.015 2.089 2.251 2.275 2.328 2.443 2.549 2.642 2.691 2.782 2.863 2.983 3.063 3.137 3.252 3.363 3.446 3.524 3.602 3.689 3.77 3.857 3.956 4.028 4.086 4.141 4.187 4.229 4.273 4.303 4.321 4.321 4.298 4.266 4.201 4.075 3.875 3.51 2.952 2.131 0.834 -1.382 -4.052 -6.187 -7.975 -9.47 -10.754 -11.853 -12.809 -13.612 -14.428 -15.148 -15.767 -16.326 -16.86 -17.372 -17.824 -18.269 -18.663 -19.011 -19.362 -19.727 -20.04 -20.362 -20.685 -20.927 -21.173 -21.424 -21.687 -21.961 -22.157 -22.364 -22.677 -22.881 -23.103 -23.226 -23.468 -23.725 -23.99 -24.119 -24.242 -24.518 -24.665 -24.829 -25.201 -25.387 -25.598 -25.843 -26.096 -26.364 -26.725 -27.649 -10 ,26992 ,TETRA ,17618188,Tue Nov 30 13:03:29 CET,Tue Nov 30 14:52:00 CET,0.0 0.816 1.065 1.253 1.424 1.567 1.685 1.787 1.978 2.073 2.16 2.339 2.372 2.441 2.576 2.697 2.813 2.87 2.978 3.075 3.191 3.258 3.332 3.428 3.505 3.579 3.658 3.732 3.814 3.896 3.973 4.048 4.105 4.17 4.248 4.308 4.357 4.406 4.442 4.463 4.472 4.452 4.366 4.245 4.121 3.935 3.604 3.131 2.379 1.121 -1.068 -3.785 -5.989 -7.779 -9.27 -10.55 -11.647 -12.647 -13.469 -14.262 -14.981 -15.614 -16.173 -16.699 -17.207 -17.693 -18.171 -18.581 -18.938 -19.314 -19.744 -20.099 -20.467 -20.859 -21.15 -21.438 -21.742 -22.061 -22.39 -22.622 -22.847 -23.173 -23.4 -23.627 -23.738 -23.961 -24.196 -24.456 -24.593 -24.736 -25.06 -25.216 -25.385 -25.743 -25.936 -26.159 -26.415 -26.693 -27.036 -27.507 -28.588 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_30_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_30_42.txt deleted file mode 100644 index 68e3bd81..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_30_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28428 ,TETRA ,17618189,Tue Nov 30 13:07:20 CET,Tue Nov 30 14:42:35 CET,0.0 1.738 2.168 2.489 2.775 3.01 3.238 3.458 3.851 4.024 4.191 4.451 4.666 4.817 5.099 5.365 5.622 5.742 5.964 6.191 6.532 6.742 6.951 7.269 7.569 7.857 8.137 8.4 8.735 9.062 9.377 9.758 10.119 10.483 10.903 11.367 11.827 12.327 12.876 13.467 14.074 14.755 15.596 16.477 17.503 18.679 20.068 21.588 23.315 25.421 27.981 30.042 31.256 31.966 32.34 32.603 32.77 32.848 32.911 32.94 32.926 32.872 32.8 32.744 32.659 32.573 32.478 32.377 32.298 32.211 32.1 31.999 31.902 31.8 31.721 31.639 31.545 31.439 31.325 31.244 31.164 31.027 30.921 30.807 30.753 30.646 30.525 30.393 30.324 30.202 30.048 29.954 29.844 29.603 29.486 29.356 29.202 29.025 28.795 28.444 27.056 -2 ,18275 ,TETRA ,17618190,Tue Nov 30 13:07:21 CET,Tue Nov 30 14:45:34 CET,0.0 1.529 2.0 2.339 2.615 2.848 3.068 3.282 3.679 3.861 4.026 4.274 4.492 4.639 4.914 5.174 5.41 5.53 5.775 6.001 6.325 6.539 6.746 7.037 7.318 7.606 7.88 8.134 8.463 8.796 9.129 9.52 9.881 10.225 10.64 11.116 11.568 12.073 12.637 13.231 13.852 14.565 15.42 16.316 17.342 18.454 19.773 21.335 23.233 25.496 28.086 30.124 31.291 32.008 32.427 32.697 32.844 32.929 32.978 32.973 32.946 32.916 32.887 32.834 32.746 32.661 32.581 32.51 32.437 32.337 32.235 32.165 32.086 31.985 31.895 31.795 31.685 31.574 31.47 31.391 31.308 31.189 31.101 30.996 30.941 30.827 30.705 30.578 30.509 30.398 30.279 30.19 30.084 29.853 29.717 29.571 29.428 29.255 29.034 28.7 26.919 -3 ,18885 ,TETRA ,17618191,Tue Nov 30 13:08:18 CET,Tue Nov 30 14:38:17 CET,0.0 1.488 1.911 2.273 2.582 2.85 3.097 3.335 3.746 3.937 4.119 4.373 4.584 4.743 5.034 5.294 5.545 5.67 5.912 6.145 6.478 6.682 6.885 7.192 7.495 7.783 8.052 8.322 8.664 8.988 9.308 9.687 10.04 10.381 10.79 11.253 11.712 12.226 12.777 13.368 14.003 14.741 15.587 16.428 17.458 18.632 19.991 21.514 23.356 25.618 28.31 30.385 31.529 32.248 32.686 32.929 33.086 33.199 33.249 33.276 33.261 33.23 33.186 33.113 33.042 32.967 32.881 32.801 32.729 32.653 32.566 32.49 32.402 32.307 32.237 32.15 32.052 31.948 31.844 31.769 31.69 31.57 31.477 31.376 31.322 31.208 31.086 30.956 30.884 30.777 30.654 30.556 30.462 30.243 30.105 29.953 29.8 29.617 29.388 29.084 28.196 -4 ,5585 ,TETRA ,17618192,Tue Nov 30 13:08:18 CET,Tue Nov 30 14:50:07 CET,0.0 1.573 2.039 2.422 2.733 2.992 3.218 3.433 3.85 4.021 4.185 4.445 4.648 4.793 5.071 5.332 5.593 5.718 5.95 6.164 6.47 6.675 6.88 7.173 7.439 7.717 7.998 8.255 8.576 8.888 9.198 9.586 9.979 10.351 10.767 11.253 11.734 12.26 12.836 13.45 14.09 14.81 15.674 16.578 17.643 18.807 20.149 21.693 23.515 25.791 28.478 30.503 31.672 32.389 32.811 33.097 33.285 33.348 33.342 33.335 33.304 33.246 33.189 33.125 33.036 32.959 32.87 32.766 32.686 32.601 32.503 32.42 32.334 32.244 32.164 32.08 31.987 31.866 31.744 31.664 31.577 31.44 31.346 31.249 31.196 31.078 30.945 30.815 30.746 30.633 30.501 30.407 30.311 30.081 29.946 29.806 29.648 29.46 29.234 28.92 27.457 -5 ,2897 ,TETRA ,17618193,Tue Nov 30 13:08:19 CET,Tue Nov 30 14:47:32 CET,0.0 1.172 1.605 1.976 2.298 2.56 2.787 3.011 3.412 3.585 3.75 4.013 4.222 4.373 4.677 4.954 5.213 5.339 5.573 5.797 6.126 6.337 6.54 6.838 7.118 7.394 7.672 7.936 8.286 8.622 8.934 9.31 9.687 10.05 10.481 10.982 11.463 11.975 12.531 13.136 13.745 14.45 15.321 16.231 17.3 18.43 19.754 21.326 23.129 25.256 27.915 30.036 31.195 31.902 32.363 32.624 32.757 32.851 32.903 32.896 32.843 32.8 32.766 32.72 32.673 32.61 32.534 32.459 32.379 32.285 32.176 32.089 32.001 31.892 31.799 31.705 31.602 31.499 31.395 31.311 31.221 31.092 31.001 30.901 30.849 30.731 30.599 30.47 30.406 30.301 30.176 30.085 29.983 29.738 29.608 29.473 29.31 29.106 28.873 28.531 27.376 -6 ,24545 ,TETRA ,17618194,Tue Nov 30 13:08:20 CET,Tue Nov 30 14:52:52 CET,0.0 1.831 2.336 2.698 3.0 3.24 3.469 3.688 4.073 4.245 4.411 4.663 4.868 5.014 5.284 5.542 5.792 5.914 6.155 6.383 6.709 6.919 7.131 7.44 7.726 8.013 8.284 8.541 8.889 9.224 9.534 9.899 10.274 10.651 11.074 11.571 12.052 12.552 13.082 13.664 14.288 14.99 15.822 16.688 17.726 18.924 20.288 21.768 23.601 25.837 28.514 30.645 31.908 32.724 33.193 33.493 33.692 33.773 33.774 33.745 33.711 33.658 33.582 33.518 33.459 33.383 33.29 33.201 33.126 33.034 32.929 32.844 32.738 32.629 32.547 32.455 32.358 32.251 32.138 32.066 31.985 31.846 31.745 31.635 31.576 31.461 31.343 31.207 31.132 31.014 30.864 30.771 30.681 30.479 30.353 30.198 30.031 29.842 29.615 29.307 28.362 -7 ,20997 ,TETRA ,17618195,Tue Nov 30 13:08:22 CET,Tue Nov 30 14:52:17 CET,0.0 1.539 1.994 2.343 2.638 2.931 3.205 3.439 3.842 4.024 4.196 4.453 4.66 4.804 5.078 5.338 5.586 5.709 5.953 6.172 6.491 6.698 6.885 7.16 7.432 7.702 7.964 8.217 8.562 8.896 9.211 9.593 9.976 10.344 10.764 11.238 11.686 12.196 12.755 13.351 13.986 14.672 15.477 16.31 17.288 18.378 19.648 21.168 23.018 25.126 27.602 29.594 30.689 31.353 31.799 32.09 32.257 32.355 32.432 32.473 32.448 32.388 32.321 32.266 32.205 32.125 32.033 31.952 31.876 31.795 31.699 31.625 31.547 31.447 31.36 31.261 31.164 31.079 30.992 30.922 30.846 30.725 30.63 30.529 30.477 30.36 30.239 30.103 30.027 29.911 29.76 29.664 29.576 29.361 29.235 29.101 28.955 28.791 28.585 28.27 27.303 -8 ,7523 ,TETRA ,17618196,Tue Nov 30 13:09:21 CET,Tue Nov 30 14:53:49 CET,0.0 1.569 2.055 2.421 2.736 3.012 3.273 3.493 3.853 4.031 4.207 4.477 4.689 4.838 5.126 5.383 5.626 5.754 6.007 6.242 6.572 6.788 6.995 7.294 7.582 7.864 8.152 8.418 8.75 9.077 9.399 9.789 10.156 10.516 10.938 11.409 11.865 12.381 12.95 13.577 14.231 14.943 15.786 16.646 17.683 18.878 20.253 21.767 23.598 25.746 28.244 30.441 31.779 32.488 32.861 33.125 33.294 33.384 33.421 33.424 33.421 33.397 33.345 33.284 33.21 33.14 33.071 32.999 32.918 32.825 32.728 32.642 32.545 32.446 32.37 32.289 32.199 32.097 31.991 31.918 31.829 31.686 31.591 31.484 31.43 31.319 31.199 31.059 30.981 30.87 30.745 30.65 30.545 30.325 30.205 30.06 29.88 29.676 29.439 29.137 27.523 -9 ,12372 ,TETRA ,17618197,Tue Nov 30 13:09:21 CET,Tue Nov 30 14:54:18 CET,0.0 1.846 2.333 2.67 2.965 3.225 3.449 3.658 4.029 4.206 4.379 4.646 4.87 5.022 5.293 5.551 5.81 5.932 6.156 6.37 6.684 6.888 7.087 7.377 7.654 7.927 8.21 8.484 8.829 9.167 9.488 9.874 10.264 10.639 11.051 11.526 12.001 12.523 13.094 13.722 14.389 15.121 15.946 16.794 17.835 18.981 20.29 21.796 23.591 25.719 28.306 30.4 31.61 32.378 32.826 33.099 33.248 33.342 33.383 33.379 33.35 33.302 33.253 33.201 33.135 33.074 33.006 32.916 32.83 32.748 32.652 32.572 32.497 32.405 32.317 32.222 32.128 32.032 31.928 31.854 31.776 31.655 31.563 31.463 31.413 31.302 31.184 31.043 30.966 30.853 30.731 30.646 30.553 30.346 30.228 30.086 29.912 29.711 29.48 29.145 27.961 -10 ,10671 ,TETRA ,17618198,Tue Nov 30 13:09:22 CET,Tue Nov 30 14:56:02 CET,0.0 1.204 1.669 2.004 2.29 2.538 2.756 2.974 3.367 3.543 3.708 3.961 4.17 4.316 4.594 4.854 5.107 5.229 5.463 5.69 6.016 6.232 6.438 6.736 7.035 7.321 7.59 7.834 8.136 8.452 8.778 9.161 9.526 9.888 10.315 10.793 11.259 11.791 12.352 12.942 13.583 14.314 15.148 15.991 17.002 18.169 19.514 20.976 22.655 24.633 27.11 29.22 30.357 31.049 31.485 31.74 31.891 31.972 32.014 32.02 31.994 31.957 31.898 31.834 31.764 31.677 31.581 31.497 31.427 31.341 31.242 31.16 31.07 30.972 30.893 30.799 30.697 30.603 30.497 30.411 30.325 30.199 30.099 29.989 29.934 29.818 29.696 29.567 29.496 29.388 29.274 29.177 29.069 28.863 28.745 28.605 28.445 28.278 28.052 27.721 26.558 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_338_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_338_252.txt deleted file mode 100644 index 6985199b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_338_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30989 ,TETRA ,17618199,Tue Nov 30 13:10:21 CET,Tue Nov 30 15:20:35 CET,0.0 1.052 1.598 2.01 2.346 2.642 2.925 3.188 3.674 3.9 4.122 4.282 4.773 4.979 5.394 5.768 6.129 6.314 6.675 7.016 7.517 7.846 8.17 8.635 9.088 9.53 9.978 10.423 10.995 11.551 12.081 12.721 13.305 13.768 14.109 14.388 14.651 14.941 15.249 15.544 15.861 16.206 16.594 16.989 17.406 17.832 18.256 18.662 19.089 19.433 19.542 19.176 18.568 17.914 17.295 16.703 16.173 15.678 15.216 14.759 14.354 13.968 13.607 13.282 12.967 12.683 12.388 12.116 11.883 11.618 11.312 11.048 10.805 10.573 10.375 10.173 9.954 9.715 9.47 9.311 9.144 8.873 8.675 8.451 8.341 8.126 7.889 7.633 7.515 7.127 7.04 6.827 6.599 6.112 5.842 5.561 5.251 4.909 4.537 4.048 2.59 -2 ,8755 ,TETRA ,17618200,Tue Nov 30 13:10:19 CET,Tue Nov 30 14:49:58 CET,0.0 1.13 1.668 2.074 2.425 2.768 3.092 3.394 3.922 4.166 4.386 4.539 5.053 5.258 5.634 6.01 6.389 6.564 6.828 7.001 7.22 7.378 7.527 7.731 7.938 8.134 8.307 8.485 8.737 8.974 9.182 9.425 9.665 9.88 10.14 10.419 10.659 10.929 11.227 11.54 11.853 12.196 12.579 12.963 13.404 13.861 14.355 14.848 15.322 15.704 15.827 15.407 14.819 14.217 13.609 13.028 12.499 11.956 11.478 11.04 10.578 10.153 9.756 9.344 9.014 8.745 8.436 8.142 7.894 7.653 7.4 7.171 6.942 6.71 6.503 6.279 6.048 5.801 5.555 5.4 5.252 4.973 4.747 4.525 4.421 4.209 3.987 3.76 3.636 3.261 3.244 3.121 2.987 2.654 2.456 2.264 2.024 1.663 1.202 0.691 -0.34 -3 ,24238 ,TETRA ,17618201,Tue Nov 30 13:10:21 CET,Tue Nov 30 14:59:59 CET,0.0 1.076 1.586 2.008 2.387 2.719 3.035 3.33 3.829 4.051 4.264 4.376 4.872 5.088 5.52 5.927 6.308 6.49 6.848 7.178 7.642 7.967 8.265 8.585 8.8 8.986 9.161 9.328 9.549 9.758 9.947 10.183 10.412 10.621 10.864 11.13 11.368 11.64 11.942 12.243 12.573 12.947 13.342 13.707 14.138 14.578 15.027 15.48 15.888 16.251 16.343 15.968 15.42 14.795 14.199 13.639 13.105 12.587 12.146 11.671 11.265 10.928 10.584 10.255 9.953 9.674 9.363 9.078 8.839 8.571 8.289 8.066 7.829 7.598 7.411 7.188 6.966 6.758 6.533 6.364 6.19 5.932 5.76 5.551 5.432 5.221 5.025 4.809 4.696 4.335 4.281 4.112 3.939 3.608 3.433 3.235 3.022 2.766 2.468 2.078 1.199 -4 ,25926 ,TETRA ,17618202,Tue Nov 30 13:10:22 CET,Tue Nov 30 14:58:09 CET,0.0 0.988 1.461 1.857 2.206 2.544 2.856 3.142 3.659 3.894 4.12 4.257 4.739 4.933 5.31 5.676 6.031 6.166 6.36 6.534 6.754 6.897 7.041 7.259 7.493 7.721 7.903 8.066 8.304 8.549 8.766 9.004 9.281 9.586 9.883 10.161 10.448 10.77 11.078 11.376 11.682 12.021 12.391 12.757 13.192 13.648 14.124 14.61 15.072 15.449 15.571 15.232 14.709 14.057 13.373 12.775 12.28 11.789 11.337 10.885 10.494 10.146 9.824 9.518 9.183 8.875 8.566 8.271 8.027 7.757 7.463 7.251 7.035 6.787 6.584 6.354 6.101 5.876 5.674 5.529 5.372 5.132 4.949 4.751 4.656 4.444 4.116 3.695 3.484 2.976 2.816 2.583 2.32 1.732 1.42 1.077 0.69 0.284 -0.158 -0.682 -1.747 -5 ,28808 ,TETRA ,17618203,Tue Nov 30 13:11:20 CET,Tue Nov 30 14:58:18 CET,0.0 0.736 1.085 1.361 1.586 1.801 2.022 2.212 2.543 2.7 2.816 2.804 3.168 3.295 3.531 3.728 3.929 4.03 4.225 4.424 4.671 4.819 4.979 5.215 5.442 5.652 5.84 6.009 6.201 6.399 6.62 6.895 7.154 7.379 7.615 7.877 8.153 8.439 8.721 9.033 9.336 9.668 10.056 10.443 10.874 11.319 11.79 12.273 12.771 13.137 13.172 12.778 12.229 11.643 11.087 10.516 9.981 9.492 9.072 8.613 8.173 7.798 7.465 7.105 6.743 6.442 6.122 5.833 5.561 5.276 5.002 4.769 4.532 4.306 4.11 3.889 3.676 3.453 3.227 3.069 2.903 2.66 2.495 2.32 2.226 2.01 1.792 1.565 1.432 0.986 0.794 0.548 0.298 -0.219 -0.495 -0.784 -1.085 -1.455 -1.912 -2.44 -3.537 -6 ,7836 ,TETRA ,17618204,Tue Nov 30 13:11:23 CET,Tue Nov 30 14:58:35 CET,0.0 0.933 1.287 1.571 1.825 2.048 2.254 2.438 2.774 2.926 3.052 3.062 3.407 3.514 3.737 3.937 4.104 4.19 4.384 4.568 4.798 4.946 5.096 5.31 5.526 5.756 5.972 6.144 6.354 6.564 6.753 6.988 7.241 7.476 7.722 8.022 8.303 8.602 8.915 9.204 9.52 9.866 10.255 10.608 10.994 11.445 11.955 12.461 12.913 13.284 13.416 13.038 12.449 11.829 11.258 10.68 10.159 9.677 9.211 8.694 8.257 7.904 7.559 7.2 6.87 6.59 6.289 6.02 5.782 5.528 5.264 5.049 4.837 4.606 4.417 4.22 4.015 3.821 3.619 3.454 3.275 3.012 2.842 2.67 2.566 2.344 2.121 1.883 1.768 1.425 1.399 1.203 0.961 0.459 0.207 -0.064 -0.373 -0.707 -1.088 -1.539 -2.546 -7 ,1730 ,TETRA ,17618205,Tue Nov 30 13:12:19 CET,Tue Nov 30 14:59:07 CET,0.0 1.2 1.672 2.051 2.386 2.706 3.018 3.3 3.796 4.033 4.269 4.436 4.935 5.145 5.559 5.953 6.324 6.485 6.711 6.89 7.173 7.358 7.526 7.733 7.918 8.092 8.264 8.431 8.639 8.861 9.081 9.316 9.528 9.738 9.987 10.248 10.484 10.77 11.111 11.455 11.781 12.142 12.584 12.99 13.398 13.838 14.322 14.789 15.238 15.603 15.723 15.362 14.723 14.061 13.467 12.913 12.408 11.908 11.457 10.993 10.595 10.239 9.885 9.554 9.253 8.956 8.621 8.315 8.057 7.806 7.538 7.313 7.077 6.83 6.626 6.388 6.148 5.918 5.668 5.422 5.103 4.623 4.289 3.931 3.737 3.339 2.936 2.501 2.27 1.756 1.579 1.331 1.075 0.517 0.242 -0.037 -0.354 -0.69 -1.076 -1.598 -2.835 -8 ,10860 ,TETRA ,17618206,Tue Nov 30 13:12:20 CET,Tue Nov 30 14:51:38 CET,0.0 1.063 1.548 1.976 2.347 2.669 2.958 3.224 3.741 3.986 4.225 4.392 4.895 5.106 5.501 5.863 6.217 6.393 6.758 7.112 7.608 7.939 8.261 8.609 8.809 8.981 9.149 9.31 9.524 9.729 9.946 10.223 10.452 10.664 10.92 11.206 11.479 11.801 12.149 12.472 12.762 13.11 13.543 13.935 14.339 14.782 15.279 15.746 16.192 16.528 16.537 16.062 15.421 14.773 14.152 13.564 13.007 12.49 12.037 11.575 11.183 10.83 10.5 10.179 9.837 9.53 9.225 8.949 8.718 8.48 8.23 8.021 7.8 7.557 7.368 7.172 6.967 6.752 6.527 6.369 6.205 5.93 5.673 5.357 5.191 4.829 4.42 4.002 3.793 3.283 3.142 2.929 2.711 2.208 1.934 1.662 1.335 0.962 0.514 -0.032 -1.179 -9 ,2117 ,TETRA ,17618207,Tue Nov 30 13:13:19 CET,Tue Nov 30 15:03:40 CET,0.0 1.26 1.763 2.186 2.583 2.921 3.215 3.522 4.068 4.32 4.549 4.696 5.208 5.403 5.78 6.168 6.545 6.728 7.088 7.439 7.942 8.261 8.554 8.869 9.07 9.267 9.464 9.644 9.855 10.047 10.242 10.512 10.789 11.031 11.281 11.551 11.804 12.084 12.37 12.653 12.961 13.294 13.687 14.067 14.485 14.921 15.383 15.9 16.427 16.837 16.905 16.433 15.839 15.244 14.641 14.089 13.585 13.048 12.578 12.121 11.718 11.34 10.953 10.607 10.268 9.946 9.624 9.31 9.042 8.79 8.52 8.29 8.05 7.802 7.612 7.412 7.112 6.694 6.242 5.937 5.631 5.137 4.799 4.463 4.285 3.898 3.485 3.058 2.836 2.331 2.134 1.875 1.615 1.071 0.796 0.498 0.188 -0.163 -0.612 -1.135 -2.374 -10 ,31914 ,TETRA ,17618208,Tue Nov 30 13:13:21 CET,Tue Nov 30 15:04:35 CET,0.0 0.833 1.175 1.452 1.712 1.923 2.12 2.313 2.645 2.791 2.922 2.94 3.297 3.417 3.659 3.869 4.061 4.147 4.317 4.483 4.726 4.883 5.031 5.256 5.481 5.696 5.9 6.087 6.303 6.501 6.725 7.017 7.266 7.505 7.786 8.085 8.389 8.732 9.05 9.363 9.689 10.038 10.424 10.801 11.226 11.645 12.096 12.553 12.989 13.322 13.418 13.085 12.533 11.921 11.298 10.713 10.174 9.666 9.206 8.737 8.341 7.965 7.603 7.27 6.97 6.7 6.406 6.138 5.904 5.665 5.399 5.172 4.944 4.684 4.473 4.25 4.016 3.778 3.543 3.394 3.236 2.969 2.77 2.53 2.405 2.189 1.974 1.738 1.615 1.258 1.236 1.089 0.945 0.632 0.454 0.262 0.051 -0.218 -0.549 -0.95 -2.024 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_338_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_338_336.txt deleted file mode 100644 index 3c80d682..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_338_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9377 ,TETRA ,17618209,Tue Nov 30 13:13:19 CET,Tue Nov 30 14:58:54 CET,0.0 1.017 1.489 1.876 2.236 2.569 2.857 3.122 3.643 3.88 4.084 4.199 4.705 4.919 5.314 5.7 6.081 6.256 6.589 6.913 7.366 7.661 7.947 8.241 8.435 8.639 8.817 8.975 9.175 9.388 9.576 9.765 9.944 10.109 10.328 10.575 10.808 11.035 11.231 11.44 11.672 11.91 12.146 12.374 12.608 12.864 13.092 13.227 13.275 13.045 12.274 11.017 9.802 8.697 7.732 6.827 5.99 5.249 4.635 4.03 3.487 2.962 2.466 2.052 1.644 1.259 0.896 0.571 0.264 -0.06 -0.376 -0.627 -0.895 -1.173 -1.388 -1.618 -1.866 -2.12 -2.394 -2.581 -2.764 -3.068 -3.281 -3.487 -3.592 -3.817 -4.042 -4.288 -4.416 -4.797 -4.868 -5.087 -5.347 -5.884 -6.162 -6.474 -6.833 -7.256 -7.745 -8.336 -9.706 -2 ,4277 ,TETRA ,17618210,Tue Nov 30 13:13:19 CET,Tue Nov 30 14:50:13 CET,0.0 1.03 1.502 1.92 2.291 2.616 2.889 3.129 3.563 3.787 4.01 4.148 4.642 4.837 5.225 5.612 5.906 6.006 6.203 6.385 6.637 6.807 6.973 7.178 7.352 7.525 7.677 7.812 7.986 8.165 8.381 8.62 8.806 9.003 9.218 9.437 9.647 9.87 10.107 10.355 10.613 10.899 11.219 11.497 11.767 12.034 12.24 12.347 12.326 12.069 11.256 9.974 8.759 7.686 6.752 5.895 5.119 4.399 3.789 3.181 2.658 2.182 1.72 1.28 0.868 0.497 0.108 -0.242 -0.537 -0.887 -1.253 -1.517 -1.786 -2.093 -2.334 -2.564 -2.812 -3.063 -3.319 -3.511 -3.698 -3.998 -4.22 -4.439 -4.551 -4.793 -5.049 -5.305 -5.433 -5.808 -5.85 -6.021 -6.196 -6.557 -6.75 -6.96 -7.191 -7.46 -7.767 -8.185 -9.579 -3 ,23655 ,TETRA ,17618211,Tue Nov 30 13:13:19 CET,Tue Nov 30 15:00:53 CET,0.0 1.199 1.608 1.899 2.12 2.317 2.487 2.65 2.976 3.122 3.242 3.21 3.549 3.659 3.881 4.087 4.275 4.364 4.531 4.696 4.937 5.098 5.235 5.439 5.664 5.864 6.045 6.194 6.359 6.54 6.721 6.943 7.15 7.311 7.495 7.709 7.936 8.204 8.464 8.695 8.89 9.106 9.375 9.62 9.862 10.084 10.276 10.421 10.485 10.261 9.464 8.227 7.033 5.936 4.94 4.075 3.324 2.62 1.968 1.303 0.74 0.258 -0.186 -0.615 -1.009 -1.387 -1.798 -2.141 -2.445 -2.791 -3.123 -3.379 -3.673 -3.969 -4.18 -4.428 -4.689 -4.921 -5.177 -5.356 -5.525 -5.823 -6.031 -6.256 -6.379 -6.596 -6.821 -7.082 -7.227 -7.625 -7.681 -7.852 -8.031 -8.388 -8.582 -8.785 -9.014 -9.271 -9.577 -10.002 -10.955 -4 ,5409 ,TETRA ,17618212,Tue Nov 30 13:15:21 CET,Tue Nov 30 14:58:09 CET,0.0 1.188 1.668 2.058 2.402 2.711 2.992 3.257 3.63 3.755 3.871 3.854 4.201 4.308 4.51 4.707 4.883 4.964 5.121 5.268 5.457 5.572 5.706 5.912 6.093 6.257 6.406 6.551 6.752 6.934 7.088 7.304 7.549 7.753 7.962 8.187 8.372 8.57 8.774 8.957 9.155 9.395 9.65 9.865 10.1 10.324 10.465 10.522 10.512 10.299 9.5 8.181 6.981 5.904 4.899 3.984 3.197 2.501 1.897 1.273 0.698 0.192 -0.255 -0.68 -1.066 -1.434 -1.877 -2.317 -2.67 -3.006 -3.378 -3.673 -3.956 -4.234 -4.457 -4.711 -4.974 -5.244 -5.507 -5.701 -5.914 -6.25 -6.484 -6.712 -6.82 -7.024 -7.251 -7.499 -7.623 -8.001 -8.1 -8.337 -8.599 -9.157 -9.455 -9.77 -10.121 -10.518 -10.978 -11.567 -12.834 -5 ,24572 ,TETRA ,17618213,Tue Nov 30 13:14:20 CET,Tue Nov 30 15:04:04 CET,0.0 1.137 1.659 2.074 2.399 2.7 3.008 3.295 3.791 4.019 4.247 4.414 4.916 5.115 5.513 5.894 6.234 6.397 6.737 7.067 7.532 7.843 8.135 8.535 8.817 8.967 9.118 9.27 9.458 9.634 9.794 9.985 10.16 10.34 10.543 10.759 10.973 11.179 11.398 11.636 11.859 12.094 12.346 12.59 12.829 13.005 13.157 13.296 13.311 13.06 12.286 10.998 9.798 8.673 7.656 6.723 5.89 5.183 4.583 3.955 3.4 2.901 2.443 2.011 1.585 1.174 0.75 0.407 0.101 -0.219 -0.545 -0.816 -1.107 -1.417 -1.649 -1.887 -2.122 -2.38 -2.652 -2.829 -3.076 -3.583 -3.954 -4.337 -4.533 -4.945 -5.383 -5.842 -6.078 -6.611 -6.809 -7.066 -7.329 -7.89 -8.188 -8.507 -8.849 -9.193 -9.611 -10.193 -11.426 -6 ,31431 ,TETRA ,17618214,Tue Nov 30 13:14:20 CET,Tue Nov 30 15:01:53 CET,0.0 1.104 1.594 2.004 2.362 2.673 2.963 3.241 3.741 3.979 4.208 4.338 4.839 5.032 5.414 5.796 6.161 6.337 6.65 6.975 7.369 7.541 7.683 7.858 8.035 8.2 8.365 8.559 8.81 9.035 9.224 9.433 9.635 9.804 9.991 10.206 10.415 10.648 10.885 11.166 11.446 11.696 11.947 12.173 12.43 12.644 12.798 12.949 13.007 12.783 11.995 10.757 9.674 8.632 7.613 6.72 5.98 5.28 4.655 3.982 3.416 2.951 2.49 2.04 1.644 1.291 0.912 0.558 0.221 -0.106 -0.431 -0.71 -0.988 -1.273 -1.492 -1.72 -1.981 -2.25 -2.495 -2.662 -2.848 -3.146 -3.353 -3.572 -3.684 -3.908 -4.156 -4.442 -4.58 -4.964 -5.046 -5.249 -5.484 -6.009 -6.296 -6.591 -6.927 -7.308 -7.728 -8.256 -9.283 -7 ,29929 ,TETRA ,17618215,Tue Nov 30 13:15:21 CET,Tue Nov 30 15:03:47 CET,0.0 1.163 1.68 2.046 2.351 2.636 2.911 3.157 3.619 3.844 4.067 4.203 4.614 4.736 4.954 5.142 5.336 5.431 5.59 5.732 5.966 6.113 6.257 6.478 6.677 6.863 7.029 7.181 7.368 7.561 7.759 7.996 8.249 8.5 8.764 9.02 9.226 9.45 9.71 9.939 10.154 10.406 10.649 10.852 11.075 11.274 11.446 11.605 11.643 11.388 10.659 9.462 8.328 7.294 6.336 5.439 4.641 3.902 3.255 2.615 2.089 1.611 1.158 0.762 0.38 0.013 -0.376 -0.738 -1.04 -1.331 -1.648 -1.931 -2.212 -2.512 -2.765 -3.028 -3.306 -3.598 -3.882 -4.071 -4.274 -4.605 -4.842 -5.076 -5.183 -5.398 -5.636 -5.917 -6.104 -6.625 -6.806 -7.04 -7.29 -7.856 -8.157 -8.48 -8.833 -9.204 -9.636 -10.184 -11.489 -8 ,8880 ,TETRA ,17618216,Tue Nov 30 13:16:19 CET,Tue Nov 30 15:05:04 CET,0.0 0.941 1.398 1.752 2.089 2.411 2.691 2.958 3.456 3.623 3.735 3.729 4.073 4.167 4.327 4.509 4.69 4.772 4.935 5.093 5.29 5.426 5.556 5.716 5.883 6.048 6.198 6.34 6.54 6.744 6.943 7.161 7.371 7.59 7.8 8.015 8.225 8.433 8.636 8.872 9.117 9.358 9.672 9.961 10.216 10.429 10.604 10.702 10.702 10.469 9.67 8.444 7.292 6.203 5.225 4.345 3.567 2.854 2.179 1.493 0.915 0.398 -0.067 -0.488 -0.871 -1.265 -1.68 -2.023 -2.333 -2.651 -2.985 -3.272 -3.551 -3.813 -4.022 -4.278 -4.623 -5.077 -5.603 -5.967 -6.332 -6.885 -7.258 -7.635 -7.831 -8.253 -8.694 -9.16 -9.403 -9.954 -10.167 -10.426 -10.699 -11.325 -11.651 -11.96 -12.293 -12.674 -13.1 -13.639 -14.933 -9 ,23942 ,TETRA ,17618217,Tue Nov 30 13:16:21 CET,Tue Nov 30 15:05:27 CET,0.0 1.322 1.817 2.2 2.522 2.809 3.089 3.358 3.854 4.096 4.328 4.483 4.981 5.179 5.564 5.932 6.263 6.406 6.612 6.741 6.94 7.078 7.205 7.377 7.528 7.677 7.823 7.956 8.117 8.269 8.429 8.651 8.853 9.03 9.233 9.441 9.637 9.861 10.105 10.352 10.572 10.785 11.003 11.21 11.479 11.74 11.906 11.994 11.988 11.781 11.042 9.777 8.593 7.523 6.55 5.629 4.789 4.062 3.438 2.807 2.26 1.782 1.333 0.866 0.436 0.07 -0.311 -0.656 -0.962 -1.271 -1.618 -1.921 -2.233 -2.552 -2.783 -3.01 -3.252 -3.512 -3.798 -3.996 -4.179 -4.471 -4.684 -4.902 -5.01 -5.21 -5.418 -5.717 -5.917 -6.443 -6.667 -6.935 -7.199 -7.764 -8.077 -8.387 -8.73 -9.132 -9.602 -10.16 -11.346 -10 ,14918 ,TETRA ,17618218,Tue Nov 30 13:16:20 CET,Tue Nov 30 15:04:20 CET,0.0 1.622 2.085 2.458 2.787 3.091 3.379 3.641 4.125 4.354 4.571 4.709 5.205 5.409 5.78 6.129 6.485 6.656 6.995 7.324 7.647 7.765 7.89 8.068 8.22 8.381 8.567 8.749 8.928 9.092 9.263 9.505 9.756 9.981 10.23 10.485 10.7 10.95 11.232 11.478 11.698 11.923 12.206 12.472 12.729 12.969 13.178 13.31 13.308 13.108 12.385 11.131 9.866 8.709 7.69 6.771 5.973 5.239 4.595 3.943 3.362 2.847 2.36 1.902 1.482 1.112 0.743 0.404 0.107 -0.216 -0.592 -0.886 -1.174 -1.495 -1.741 -1.993 -2.253 -2.509 -2.781 -2.974 -3.173 -3.468 -3.667 -3.877 -3.982 -4.213 -4.464 -4.718 -4.877 -5.384 -5.6 -5.882 -6.171 -6.739 -7.035 -7.361 -7.723 -8.11 -8.574 -9.176 -10.369 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_35_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_35_41.txt deleted file mode 100644 index 7611960b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_35_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26614 ,TETRA ,17618219,Tue Nov 30 13:16:21 CET,Tue Nov 30 15:03:59 CET,0.0 1.175 1.624 1.951 2.228 2.47 2.68 2.868 3.235 3.399 3.544 3.768 3.968 4.102 4.346 4.58 4.814 4.939 5.182 5.397 5.692 5.879 6.07 6.351 6.608 6.866 7.109 7.325 7.617 7.895 8.154 8.48 8.808 9.132 9.512 9.93 10.322 10.735 11.178 11.69 12.242 12.848 13.547 14.234 14.985 15.789 16.701 17.697 18.868 20.262 21.872 23.063 23.652 23.915 24.025 24.02 23.955 23.845 23.703 23.57 23.428 23.263 23.092 22.948 22.779 22.591 22.383 22.202 22.049 21.883 21.697 21.534 21.357 21.181 21.04 20.872 20.706 20.545 20.355 20.209 20.055 19.822 19.663 19.499 19.419 19.248 19.059 18.851 18.738 18.588 18.39 18.254 18.113 17.807 17.631 17.43 17.201 16.945 16.633 16.258 15.026 -2 ,8584 ,TETRA ,17618220,Tue Nov 30 13:17:19 CET,Tue Nov 30 14:56:19 CET,0.0 1.416 1.87 2.216 2.521 2.779 2.985 3.169 3.499 3.657 3.817 4.079 4.278 4.417 4.696 4.954 5.2 5.315 5.525 5.731 6.045 6.253 6.462 6.752 7.014 7.269 7.506 7.747 8.087 8.404 8.687 9.017 9.32 9.604 9.948 10.356 10.749 11.175 11.64 12.135 12.647 13.21 13.878 14.555 15.329 16.192 17.171 18.239 19.431 20.832 22.505 23.732 24.351 24.654 24.769 24.752 24.679 24.58 24.41 24.138 23.937 23.801 23.624 23.455 23.3 23.132 22.943 22.737 22.551 22.369 22.194 22.06 21.906 21.727 21.581 21.424 21.25 21.069 20.875 20.748 20.62 20.384 20.218 20.058 19.974 19.789 19.583 19.38 19.277 19.121 18.915 18.795 18.664 18.337 18.135 17.92 17.715 17.464 17.121 16.655 15.096 -3 ,31236 ,TETRA ,17618221,Tue Nov 30 13:17:21 CET,Tue Nov 30 15:04:10 CET,0.0 1.336 1.794 2.091 2.369 2.615 2.857 3.074 3.448 3.626 3.796 4.048 4.249 4.388 4.666 4.929 5.185 5.307 5.535 5.759 6.068 6.27 6.468 6.733 6.998 7.271 7.531 7.774 8.077 8.38 8.685 9.039 9.354 9.669 10.058 10.473 10.835 11.21 11.653 12.14 12.645 13.236 13.899 14.531 15.254 16.056 16.99 18.08 19.334 20.751 22.372 23.575 24.128 24.403 24.516 24.536 24.454 24.342 24.215 24.051 23.901 23.761 23.608 23.435 23.263 23.088 22.913 22.752 22.591 22.417 22.238 22.084 21.923 21.751 21.609 21.452 21.288 21.119 20.923 20.792 20.659 20.44 20.274 20.091 20.011 19.85 19.649 19.425 19.308 19.152 18.943 18.807 18.674 18.378 18.211 18.03 17.828 17.59 17.293 16.889 15.355 -4 ,6999 ,TETRA ,17618222,Tue Nov 30 13:17:24 CET,Tue Nov 30 15:04:12 CET,0.0 1.264 1.674 1.978 2.247 2.496 2.726 2.928 3.28 3.448 3.616 3.873 4.076 4.226 4.51 4.752 4.983 5.099 5.327 5.535 5.811 5.995 6.173 6.443 6.719 6.972 7.202 7.427 7.734 8.049 8.336 8.665 8.998 9.332 9.717 10.122 10.512 10.954 11.433 11.933 12.431 13.002 13.653 14.289 15.032 15.858 16.818 17.925 19.207 20.638 22.3 23.507 24.1 24.392 24.498 24.494 24.418 24.322 24.235 24.099 23.917 23.765 23.629 23.481 23.326 23.152 22.954 22.782 22.612 22.429 22.24 22.073 21.903 21.719 21.557 21.381 21.222 21.058 20.87 20.75 20.621 20.403 20.249 20.084 19.997 19.825 19.63 19.418 19.312 19.164 18.969 18.844 18.709 18.39 18.202 18.001 17.783 17.524 17.231 16.77 15.516 -5 ,4142 ,TETRA ,17618223,Tue Nov 30 13:17:21 CET,Tue Nov 30 15:03:07 CET,0.0 1.366 1.873 2.253 2.527 2.755 2.99 3.208 3.581 3.777 3.969 4.236 4.437 4.578 4.839 5.103 5.363 5.484 5.711 5.926 6.224 6.403 6.574 6.838 7.091 7.335 7.59 7.825 8.105 8.381 8.657 9.004 9.343 9.648 9.99 10.378 10.742 11.147 11.591 12.065 12.546 13.069 13.68 14.315 15.077 15.907 16.898 18.036 19.283 20.66 22.229 23.405 23.998 24.305 24.425 24.422 24.374 24.282 24.16 24.012 23.858 23.696 23.489 23.261 23.045 22.867 22.683 22.488 22.306 22.126 21.934 21.762 21.609 21.46 21.322 21.16 21.002 20.838 20.658 20.535 20.386 20.154 19.985 19.815 19.731 19.545 19.356 19.14 19.023 18.858 18.615 18.481 18.351 18.05 17.876 17.671 17.425 17.164 16.883 16.53 15.223 -6 ,25728 ,TETRA ,17618224,Tue Nov 30 13:18:20 CET,Tue Nov 30 15:04:10 CET,0.0 1.602 2.019 2.347 2.655 2.913 3.129 3.316 3.669 3.849 4.021 4.273 4.473 4.615 4.883 5.131 5.366 5.478 5.7 5.93 6.258 6.455 6.642 6.922 7.206 7.469 7.709 7.946 8.258 8.567 8.844 9.172 9.489 9.788 10.146 10.535 10.888 11.295 11.732 12.203 12.716 13.258 13.873 14.496 15.235 16.051 16.97 17.993 19.205 20.591 22.199 23.438 24.04 24.311 24.391 24.383 24.328 24.238 24.128 23.98 23.853 23.71 23.542 23.39 23.237 23.085 22.907 22.733 22.572 22.391 22.215 22.05 21.856 21.662 21.512 21.35 21.198 21.047 20.859 20.724 20.591 20.39 20.239 20.067 19.979 19.805 19.618 19.396 19.28 19.123 18.901 18.763 18.612 18.283 18.112 17.909 17.672 17.429 17.15 16.749 15.483 -7 ,24106 ,TETRA ,17618225,Tue Nov 30 13:19:19 CET,Tue Nov 30 15:06:09 CET,0.0 1.417 1.853 2.156 2.406 2.632 2.86 3.071 3.434 3.613 3.789 4.031 4.218 4.358 4.628 4.875 5.128 5.25 5.472 5.678 5.986 6.187 6.379 6.657 6.91 7.173 7.429 7.666 7.972 8.264 8.555 8.918 9.277 9.632 10.008 10.395 10.79 11.229 11.685 12.163 12.642 13.184 13.84 14.482 15.234 16.092 17.076 18.174 19.446 20.872 22.427 23.582 24.226 24.553 24.614 24.579 24.515 24.387 24.264 24.137 23.989 23.824 23.654 23.476 23.282 23.126 22.962 22.777 22.603 22.416 22.23 22.087 21.939 21.771 21.623 21.474 21.315 21.151 20.997 20.88 20.755 20.561 20.409 20.253 20.171 19.983 19.788 19.587 19.476 19.316 19.104 18.97 18.82 18.477 18.292 18.101 17.891 17.626 17.299 16.883 15.93 -8 ,5439 ,TETRA ,17618226,Tue Nov 30 13:21:21 CET,Tue Nov 30 15:08:30 CET,0.0 1.359 1.822 2.2 2.466 2.702 2.923 3.118 3.489 3.661 3.813 4.038 4.235 4.37 4.619 4.872 5.096 5.199 5.423 5.636 5.931 6.141 6.344 6.602 6.855 7.12 7.356 7.565 7.859 8.156 8.438 8.792 9.148 9.49 9.841 10.226 10.608 11.007 11.444 11.904 12.378 12.931 13.57 14.166 14.873 15.667 16.587 17.659 18.899 20.302 21.874 23.039 23.61 23.893 23.991 23.978 23.921 23.813 23.693 23.555 23.403 23.248 23.087 22.941 22.783 22.609 22.432 22.259 22.101 21.909 21.686 21.501 21.306 21.113 20.978 20.834 20.672 20.498 20.321 20.196 20.058 19.833 19.671 19.505 19.416 19.237 19.061 18.867 18.757 18.604 18.409 18.285 18.145 17.829 17.653 17.444 17.205 16.941 16.622 16.205 14.885 -9 ,14164 ,TETRA ,17618227,Tue Nov 30 13:21:23 CET,Tue Nov 30 15:08:56 CET,0.0 1.361 1.799 2.123 2.395 2.629 2.846 3.07 3.471 3.648 3.808 4.047 4.247 4.388 4.644 4.879 5.117 5.237 5.461 5.681 5.994 6.189 6.382 6.664 6.938 7.193 7.43 7.667 7.98 8.287 8.582 8.936 9.265 9.597 9.969 10.351 10.736 11.15 11.612 12.095 12.574 13.128 13.76 14.402 15.159 15.953 16.863 17.926 19.137 20.563 22.229 23.466 24.052 24.335 24.452 24.452 24.355 24.215 24.106 23.97 23.808 23.659 23.503 23.322 23.126 22.937 22.757 22.604 22.47 22.313 22.127 21.962 21.791 21.638 21.518 21.366 21.193 21.018 20.832 20.698 20.565 20.368 20.213 20.037 19.943 19.759 19.575 19.373 19.263 19.105 18.879 18.745 18.611 18.312 18.127 17.921 17.705 17.439 17.106 16.687 15.508 -10 ,32743 ,TETRA ,17618228,Tue Nov 30 13:21:20 CET,Tue Nov 30 15:07:05 CET,0.0 1.166 1.58 1.912 2.188 2.434 2.652 2.855 3.24 3.405 3.558 3.821 4.037 4.178 4.429 4.656 4.892 5.017 5.245 5.455 5.761 5.955 6.135 6.404 6.676 6.924 7.151 7.383 7.68 7.957 8.25 8.608 8.94 9.281 9.659 10.038 10.414 10.837 11.296 11.777 12.263 12.788 13.394 14.024 14.805 15.666 16.609 17.648 18.865 20.257 21.848 23.106 23.742 24.004 24.093 24.125 24.079 23.969 23.849 23.718 23.57 23.411 23.235 23.057 22.897 22.737 22.569 22.405 22.234 22.077 21.911 21.756 21.606 21.459 21.334 21.186 21.027 20.861 20.686 20.564 20.438 20.23 20.068 19.896 19.81 19.619 19.416 19.223 19.119 18.963 18.749 18.607 18.459 18.141 17.957 17.748 17.513 17.25 16.955 16.583 15.321 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_35_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_35_50.txt deleted file mode 100644 index 112bebdd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_35_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8706 ,TETRA ,17618229,Tue Nov 30 13:21:20 CET,Tue Nov 30 15:10:14 CET,0.0 0.814 0.972 1.073 1.125 1.158 1.18 1.193 1.2 1.193 1.19 1.132 1.185 1.185 1.181 1.157 1.116 1.09 1.032 0.964 0.854 0.77 0.68 0.543 0.399 0.241 0.089 -0.07 -0.301 -0.541 -0.788 -1.102 -1.425 -1.755 -2.152 -2.623 -3.104 -3.671 -4.354 -5.139 -6.016 -7.049 -8.353 -9.804 -11.619 -13.804 -16.577 -20.07 -24.754 -31.245 -40.861 -50.91 -58.326 -64.129 -68.722 -72.605 -75.817 -78.555 -80.815 -82.973 -84.751 -86.285 -87.704 -88.99 -90.16 -91.205 -92.262 -93.169 -93.931 -94.706 -95.497 -96.148 -96.806 -97.473 -97.985 -98.5 -99.028 -99.583 -100.152 -100.526 -100.908 -101.494 -101.886 -102.293 -102.5 -102.912 -103.329 -103.761 -103.992 -104.394 -104.733 -105.003 -105.29 -105.894 -106.221 -106.55 -106.886 -107.26 -107.715 -108.29 -109.796 -2 ,18215 ,TETRA ,17618230,Tue Nov 30 13:22:20 CET,Tue Nov 30 15:08:55 CET,0.0 0.93 1.107 1.216 1.276 1.316 1.333 1.348 1.382 1.382 1.373 1.29 1.329 1.307 1.26 1.201 1.127 1.09 1.01 0.917 0.772 0.672 0.568 0.405 0.238 0.072 -0.099 -0.275 -0.515 -0.766 -1.032 -1.375 -1.722 -2.074 -2.495 -2.988 -3.486 -4.066 -4.737 -5.5 -6.365 -7.417 -8.75 -10.212 -12.076 -14.35 -17.19 -20.755 -25.464 -31.911 -41.491 -51.601 -59.082 -64.832 -69.39 -73.273 -76.5 -79.252 -81.504 -83.664 -85.476 -87.04 -88.469 -89.782 -90.967 -92.011 -93.061 -93.961 -94.723 -95.503 -96.3 -96.956 -97.619 -98.293 -98.81 -99.331 -99.871 -100.422 -100.968 -101.343 -101.726 -102.308 -102.711 -103.119 -103.32 -103.734 -104.17 -104.622 -104.858 -105.261 -105.623 -105.884 -106.146 -106.72 -107.032 -107.357 -107.72 -108.129 -108.609 -109.179 -110.483 -3 ,32274 ,TETRA ,17618231,Tue Nov 30 13:22:23 CET,Tue Nov 30 15:08:56 CET,0.0 0.74 0.921 1.022 1.074 1.106 1.121 1.12 1.103 1.099 1.087 0.99 1.027 1.0 0.939 0.87 0.805 0.778 0.726 0.661 0.536 0.449 0.363 0.226 0.084 -0.067 -0.221 -0.372 -0.594 -0.84 -1.086 -1.406 -1.744 -2.079 -2.488 -2.971 -3.483 -4.095 -4.789 -5.567 -6.431 -7.486 -8.811 -10.242 -12.063 -14.286 -17.069 -20.606 -25.364 -31.852 -41.38 -51.374 -58.816 -64.662 -69.351 -73.218 -76.393 -79.153 -81.423 -83.588 -85.396 -86.935 -88.339 -89.653 -90.85 -91.895 -92.956 -93.888 -94.673 -95.467 -96.284 -96.954 -97.625 -98.299 -98.813 -99.344 -99.883 -100.42 -100.967 -101.343 -101.729 -102.307 -102.699 -103.112 -103.325 -103.747 -104.182 -104.652 -104.896 -105.311 -105.688 -105.969 -106.255 -106.832 -107.141 -107.472 -107.84 -108.245 -108.666 -109.173 -110.36 -4 ,7451 ,TETRA ,17618232,Tue Nov 30 13:22:20 CET,Tue Nov 30 15:08:25 CET,0.0 0.543 0.68 0.754 0.811 0.865 0.903 0.922 0.918 0.907 0.893 0.795 0.834 0.81 0.748 0.677 0.598 0.557 0.468 0.377 0.231 0.125 0.021 -0.144 -0.322 -0.5 -0.681 -0.864 -1.11 -1.366 -1.631 -1.972 -2.332 -2.693 -3.119 -3.629 -4.152 -4.765 -5.453 -6.209 -7.073 -8.137 -9.484 -10.925 -12.715 -14.901 -17.667 -21.153 -25.878 -32.419 -42.036 -52.134 -59.464 -65.219 -69.873 -73.775 -77.002 -79.748 -82.018 -84.215 -86.025 -87.589 -89.051 -90.368 -91.538 -92.588 -93.655 -94.573 -95.354 -96.143 -96.939 -97.59 -98.259 -98.932 -99.445 -99.973 -100.499 -101.035 -101.593 -101.972 -102.349 -102.936 -103.339 -103.746 -103.959 -104.389 -104.839 -105.294 -105.524 -105.93 -106.295 -106.561 -106.823 -107.367 -107.663 -107.997 -108.357 -108.757 -109.213 -109.777 -111.185 -5 ,26468 ,TETRA ,17618233,Tue Nov 30 13:23:21 CET,Tue Nov 30 15:10:17 CET,0.0 0.734 0.903 1.006 1.091 1.163 1.213 1.256 1.302 1.304 1.303 1.248 1.31 1.308 1.288 1.262 1.223 1.197 1.133 1.061 0.951 0.867 0.772 0.619 0.458 0.289 0.111 -0.063 -0.287 -0.518 -0.762 -1.073 -1.388 -1.721 -2.142 -2.644 -3.152 -3.74 -4.423 -5.208 -6.085 -7.137 -8.481 -9.953 -11.798 -14.029 -16.854 -20.452 -25.228 -31.706 -41.214 -51.263 -58.725 -64.499 -69.072 -72.907 -76.086 -78.819 -81.083 -83.278 -85.084 -86.62 -88.039 -89.335 -90.509 -91.558 -92.626 -93.55 -94.334 -95.132 -95.928 -96.579 -97.25 -97.943 -98.464 -98.986 -99.513 -100.046 -100.59 -100.963 -101.344 -101.935 -102.346 -102.768 -102.98 -103.42 -103.871 -104.32 -104.554 -104.952 -105.311 -105.577 -105.847 -106.44 -106.765 -107.121 -107.487 -107.858 -108.278 -108.778 -110.13 -6 ,12204 ,TETRA ,17618234,Tue Nov 30 13:23:21 CET,Tue Nov 30 15:07:41 CET,0.0 0.75 0.897 1.001 1.057 1.092 1.119 1.126 1.107 1.097 1.082 0.972 1.004 0.973 0.903 0.84 0.774 0.73 0.642 0.555 0.409 0.308 0.203 0.043 -0.11 -0.266 -0.427 -0.59 -0.822 -1.052 -1.287 -1.595 -1.929 -2.285 -2.716 -3.234 -3.759 -4.369 -5.071 -5.858 -6.747 -7.811 -9.14 -10.582 -12.384 -14.599 -17.434 -21.002 -25.731 -32.249 -41.928 -51.958 -59.353 -65.151 -69.78 -73.657 -76.853 -79.596 -81.876 -84.041 -85.836 -87.396 -88.818 -90.12 -91.301 -92.346 -93.405 -94.32 -95.087 -95.892 -96.717 -97.368 -98.031 -98.71 -99.23 -99.76 -100.3 -100.858 -101.427 -101.806 -102.185 -102.768 -103.172 -103.59 -103.797 -104.212 -104.65 -105.102 -105.335 -105.745 -106.092 -106.347 -106.616 -107.189 -107.505 -107.845 -108.225 -108.653 -109.126 -109.655 -110.963 -7 ,1409 ,TETRA ,17618235,Tue Nov 30 13:24:20 CET,Tue Nov 30 15:09:38 CET,0.0 0.574 0.747 0.85 0.9 0.934 0.961 0.977 0.993 0.994 1.006 0.964 1.016 1.01 0.98 0.931 0.885 0.864 0.809 0.739 0.603 0.51 0.423 0.281 0.141 -0.006 -0.163 -0.324 -0.548 -0.783 -1.031 -1.356 -1.695 -2.034 -2.447 -2.932 -3.435 -4.035 -4.703 -5.467 -6.338 -7.373 -8.668 -10.09 -11.888 -14.092 -16.948 -20.552 -25.271 -31.738 -41.372 -51.383 -58.809 -64.612 -69.253 -73.191 -76.436 -79.215 -81.486 -83.649 -85.43 -86.96 -88.38 -89.679 -90.845 -91.875 -92.93 -93.855 -94.625 -95.4 -96.206 -96.856 -97.495 -98.149 -98.658 -99.175 -99.698 -100.238 -100.794 -101.168 -101.556 -102.173 -102.584 -102.987 -103.196 -103.615 -104.034 -104.494 -104.737 -105.148 -105.511 -105.774 -106.052 -106.633 -106.945 -107.277 -107.618 -108.001 -108.499 -109.086 -110.406 -8 ,19387 ,TETRA ,17618236,Tue Nov 30 13:24:20 CET,Tue Nov 30 15:11:48 CET,0.0 0.96 1.142 1.221 1.284 1.333 1.356 1.369 1.389 1.392 1.382 1.291 1.333 1.306 1.24 1.181 1.119 1.085 1.008 0.917 0.788 0.69 0.581 0.424 0.264 0.103 -0.069 -0.245 -0.47 -0.7 -0.94 -1.248 -1.574 -1.912 -2.324 -2.815 -3.313 -3.894 -4.561 -5.314 -6.154 -7.179 -8.452 -9.862 -11.694 -13.899 -16.717 -20.265 -24.965 -31.455 -41.013 -51.014 -58.368 -64.091 -68.65 -72.504 -75.688 -78.394 -80.626 -82.779 -84.587 -86.131 -87.537 -88.829 -90.013 -91.073 -92.142 -93.072 -93.861 -94.649 -95.427 -96.073 -96.749 -97.418 -97.921 -98.439 -98.981 -99.525 -100.076 -100.466 -100.856 -101.435 -101.845 -102.272 -102.484 -102.911 -103.345 -103.792 -104.021 -104.42 -104.767 -105.031 -105.302 -105.865 -106.164 -106.495 -106.849 -107.241 -107.696 -108.241 -109.562 -9 ,29384 ,TETRA ,17618237,Tue Nov 30 13:24:19 CET,Tue Nov 30 15:10:32 CET,0.0 0.652 0.794 0.88 0.942 0.981 1.0 1.007 1.018 1.016 1.009 0.922 0.957 0.929 0.863 0.781 0.697 0.657 0.57 0.472 0.312 0.2 0.089 -0.078 -0.25 -0.424 -0.594 -0.756 -0.978 -1.219 -1.469 -1.788 -2.104 -2.417 -2.808 -3.293 -3.792 -4.376 -5.052 -5.832 -6.719 -7.783 -9.119 -10.562 -12.366 -14.564 -17.367 -20.936 -25.694 -32.15 -41.66 -51.766 -59.187 -64.987 -69.649 -73.515 -76.723 -79.502 -81.77 -83.921 -85.725 -87.288 -88.725 -90.025 -91.195 -92.238 -93.288 -94.198 -94.97 -95.749 -96.543 -97.202 -97.863 -98.548 -99.074 -99.596 -100.129 -100.666 -101.224 -101.604 -101.987 -102.579 -102.979 -103.379 -103.586 -104.011 -104.452 -104.928 -105.171 -105.576 -105.919 -106.174 -106.442 -107.035 -107.352 -107.678 -108.051 -108.481 -108.966 -109.569 -111.056 -10 ,18728 ,TETRA ,17618238,Tue Nov 30 13:25:18 CET,Tue Nov 30 15:12:52 CET,0.0 0.636 0.768 0.85 0.908 0.951 0.978 1.004 1.028 1.023 1.012 0.924 0.969 0.948 0.888 0.818 0.747 0.712 0.644 0.582 0.465 0.378 0.291 0.159 0.019 -0.138 -0.294 -0.449 -0.673 -0.905 -1.131 -1.433 -1.774 -2.125 -2.558 -3.086 -3.611 -4.212 -4.909 -5.684 -6.552 -7.609 -8.93 -10.357 -12.163 -14.386 -17.202 -20.711 -25.426 -31.983 -41.538 -51.49 -58.941 -64.771 -69.408 -73.334 -76.571 -79.3 -81.562 -83.741 -85.541 -87.075 -88.501 -89.808 -90.975 -92.032 -93.128 -94.081 -94.872 -95.665 -96.481 -97.14 -97.793 -98.453 -98.966 -99.491 -100.013 -100.55 -101.114 -101.499 -101.89 -102.472 -102.862 -103.267 -103.475 -103.907 -104.346 -104.803 -105.044 -105.439 -105.772 -106.028 -106.286 -106.85 -107.165 -107.496 -107.874 -108.293 -108.731 -109.263 -110.636 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_35_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_35_54.txt deleted file mode 100644 index 0e895662..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_35_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,800 ,KEBNE ,17076823,Sat Dec 25 06:15:14 CET,Sat Dec 25 07:46:36 CET,0.0 0.876 1.115 1.272 1.397 1.503 1.593 1.664 1.786 1.839 1.881 1.881 1.959 1.989 2.045 2.085 2.13 2.149 2.175 2.2 2.223 2.226 2.209 2.153 2.093 2.027 1.956 1.889 1.784 1.646 1.488 1.292 1.091 0.882 0.625 0.317 -0.008 -0.413 -0.916 -1.531 -2.206 -3.025 -4.154 -5.394 -6.994 -8.991 -11.531 -14.784 -19.147 -25.175 -34.185 -43.666 -50.734 -56.271 -60.642 -64.318 -67.369 -70.009 -72.186 -74.275 -76.034 -77.535 -78.901 -80.156 -81.295 -82.323 -83.404 -84.352 -85.144 -85.959 -86.773 -87.417 -88.091 -88.791 -89.322 -89.867 -90.418 -90.957 -91.513 -91.899 -92.291 -92.893 -93.291 -93.697 -93.909 -94.327 -94.759 -95.218 -95.458 -95.866 -96.214 -96.471 -96.755 -97.368 -97.674 -98.002 -98.358 -98.729 -99.166 -99.757 -101.188 -2 ,32328 ,KEBNE ,17076824,Sat Dec 25 06:16:17 CET,Sat Dec 25 07:48:48 CET,0.0 1.116 1.398 1.602 1.766 1.898 2.024 2.151 2.369 2.463 2.536 2.581 2.676 2.701 2.75 2.801 2.836 2.845 2.857 2.88 2.892 2.898 2.902 2.895 2.873 2.825 2.759 2.674 2.553 2.44 2.322 2.158 1.966 1.756 1.465 1.108 0.766 0.323 -0.167 -0.712 -1.418 -2.294 -3.388 -4.599 -6.164 -8.148 -10.734 -13.988 -18.298 -24.32 -33.378 -42.998 -50.117 -55.633 -60.048 -63.738 -66.786 -69.441 -71.633 -73.725 -75.467 -76.952 -78.325 -79.589 -80.751 -81.792 -82.812 -83.709 -84.487 -85.282 -86.081 -86.734 -87.4 -88.061 -88.573 -89.086 -89.611 -90.158 -90.719 -91.093 -91.47 -92.057 -92.452 -92.847 -93.05 -93.464 -93.903 -94.375 -94.611 -95.007 -95.351 -95.614 -95.888 -96.453 -96.758 -97.087 -97.436 -97.813 -98.243 -98.808 -100.069 -3 ,16442 ,KEBNE ,17076825,Sat Dec 25 06:17:20 CET,Sat Dec 25 07:49:59 CET,0.0 0.975 1.242 1.42 1.521 1.602 1.689 1.755 1.832 1.872 1.913 1.92 2.002 2.021 2.037 2.028 2.02 2.017 2.0 1.976 1.923 1.881 1.836 1.752 1.645 1.531 1.429 1.328 1.2 1.051 0.894 0.701 0.487 0.264 -0.044 -0.434 -0.817 -1.255 -1.8 -2.438 -3.148 -4.02 -5.149 -6.387 -7.966 -9.947 -12.461 -15.672 -20.003 -26.045 -35.113 -44.593 -51.6 -57.092 -61.493 -65.23 -68.287 -70.896 -73.085 -75.172 -76.897 -78.404 -79.803 -81.056 -82.202 -83.241 -84.296 -85.221 -86.01 -86.812 -87.616 -88.272 -88.941 -89.612 -90.133 -90.668 -91.194 -91.729 -92.281 -92.655 -93.038 -93.623 -94.006 -94.399 -94.606 -95.045 -95.491 -95.946 -96.187 -96.585 -96.925 -97.184 -97.447 -98.018 -98.33 -98.653 -98.991 -99.346 -99.771 -100.312 -101.903 -4 ,27423 ,KEBNE ,17076826,Sat Dec 25 06:21:30 CET,Sat Dec 25 07:54:16 CET,0.0 0.816 1.104 1.312 1.446 1.558 1.655 1.74 1.873 1.925 1.972 1.978 2.069 2.11 2.188 2.255 2.306 2.325 2.352 2.361 2.349 2.334 2.327 2.313 2.271 2.223 2.173 2.111 2.012 1.885 1.737 1.552 1.344 1.134 0.866 0.516 0.168 -0.259 -0.773 -1.367 -2.073 -2.955 -4.084 -5.335 -6.913 -8.845 -11.35 -14.572 -18.929 -25.024 -34.124 -43.637 -50.662 -56.217 -60.64 -64.329 -67.412 -70.065 -72.249 -74.333 -76.061 -77.556 -78.933 -80.185 -81.326 -82.351 -83.388 -84.289 -85.058 -85.843 -86.628 -87.272 -87.946 -88.619 -89.129 -89.667 -90.205 -90.752 -91.325 -91.707 -92.091 -92.683 -93.08 -93.481 -93.685 -94.095 -94.526 -94.978 -95.218 -95.619 -95.95 -96.211 -96.494 -97.09 -97.39 -97.698 -98.039 -98.415 -98.843 -99.391 -100.814 -5 ,4886 ,KEBNE ,17076827,Sat Dec 25 06:23:40 CET,Sat Dec 25 07:49:10 CET,0.0 1.194 1.533 1.72 1.845 1.942 2.029 2.108 2.212 2.254 2.285 2.267 2.335 2.342 2.355 2.349 2.335 2.319 2.291 2.271 2.227 2.19 2.163 2.148 2.137 2.095 2.036 1.976 1.868 1.733 1.593 1.413 1.197 0.963 0.682 0.35 0.013 -0.408 -0.892 -1.471 -2.188 -3.083 -4.23 -5.481 -7.076 -9.09 -11.68 -14.95 -19.337 -25.379 -34.377 -43.915 -51.05 -56.583 -60.945 -64.678 -67.796 -70.459 -72.629 -74.687 -76.394 -77.88 -79.252 -80.507 -81.653 -82.664 -83.668 -84.544 -85.312 -86.106 -86.911 -87.549 -88.2 -88.879 -89.397 -89.931 -90.478 -91.035 -91.589 -91.949 -92.332 -92.929 -93.329 -93.745 -93.957 -94.382 -94.828 -95.296 -95.541 -95.937 -96.246 -96.501 -96.783 -97.372 -97.668 -97.984 -98.331 -98.727 -99.205 -99.82 -101.406 -6 ,26983 ,KEBNE ,17076828,Sat Dec 25 06:33:03 CET,Sat Dec 25 08:04:14 CET,0.0 1.002 1.34 1.611 1.814 1.965 2.093 2.211 2.393 2.468 2.539 2.602 2.713 2.745 2.796 2.859 2.915 2.938 2.97 2.985 3.008 3.014 3.006 2.976 2.93 2.891 2.852 2.793 2.676 2.547 2.417 2.228 2.04 1.84 1.55 1.176 0.793 0.327 -0.209 -0.796 -1.484 -2.337 -3.442 -4.674 -6.229 -8.199 -10.772 -14.041 -18.44 -24.526 -33.528 -43.013 -50.082 -55.664 -60.121 -63.844 -66.934 -69.599 -71.816 -73.911 -75.618 -77.093 -78.439 -79.671 -80.798 -81.825 -82.863 -83.764 -84.54 -85.332 -86.134 -86.779 -87.442 -88.109 -88.626 -89.163 -89.712 -90.257 -90.808 -91.186 -91.58 -92.191 -92.598 -92.997 -93.195 -93.625 -94.078 -94.539 -94.785 -95.198 -95.544 -95.794 -96.049 -96.603 -96.907 -97.23 -97.555 -97.938 -98.398 -98.954 -100.393 -7 ,25002 ,KEBNE ,17076829,Sat Dec 25 06:33:05 CET,Sat Dec 25 07:59:33 CET,0.0 1.029 1.306 1.508 1.659 1.774 1.883 1.971 2.071 2.109 2.148 2.161 2.242 2.26 2.305 2.331 2.338 2.341 2.36 2.363 2.334 2.309 2.265 2.186 2.101 2.0 1.902 1.796 1.629 1.468 1.306 1.093 0.88 0.653 0.352 0.002 -0.353 -0.804 -1.34 -1.981 -2.696 -3.546 -4.654 -5.917 -7.539 -9.505 -12.041 -15.275 -19.626 -25.69 -34.771 -44.373 -51.48 -57.046 -61.439 -65.087 -68.133 -70.771 -72.963 -75.052 -76.776 -78.245 -79.598 -80.854 -81.989 -83.008 -84.066 -84.981 -85.734 -86.513 -87.32 -87.971 -88.625 -89.293 -89.798 -90.314 -90.851 -91.394 -91.957 -92.345 -92.731 -93.321 -93.724 -94.133 -94.349 -94.781 -95.213 -95.681 -95.932 -96.35 -96.725 -96.997 -97.269 -97.868 -98.174 -98.472 -98.8 -99.176 -99.659 -100.288 -101.663 -8 ,2501 ,KEBNE ,17076830,Sat Dec 25 06:33:07 CET,Sat Dec 25 07:58:39 CET,0.0 1.196 1.592 1.877 2.075 2.233 2.392 2.521 2.726 2.808 2.882 2.938 3.038 3.084 3.178 3.253 3.287 3.298 3.325 3.35 3.362 3.365 3.367 3.345 3.3 3.235 3.163 3.089 2.984 2.864 2.718 2.513 2.293 2.07 1.81 1.487 1.137 0.729 0.241 -0.353 -1.03 -1.826 -2.865 -4.056 -5.593 -7.512 -10.062 -13.344 -17.688 -23.733 -32.763 -42.324 -49.396 -54.933 -59.346 -63.043 -66.134 -68.797 -70.997 -73.114 -74.866 -76.341 -77.734 -79.021 -80.144 -81.156 -82.221 -83.138 -83.912 -84.691 -85.485 -86.144 -86.807 -87.488 -88.002 -88.524 -89.06 -89.6 -90.138 -90.505 -90.888 -91.473 -91.88 -92.293 -92.508 -92.946 -93.374 -93.836 -94.074 -94.471 -94.833 -95.095 -95.365 -95.926 -96.215 -96.528 -96.875 -97.255 -97.718 -98.359 -100.051 -9 ,28554 ,KEBNE ,17076831,Sat Dec 25 06:34:08 CET,Sat Dec 25 08:05:27 CET,0.0 1.243 1.711 2.047 2.265 2.435 2.578 2.684 2.881 2.963 3.034 3.108 3.224 3.284 3.364 3.423 3.475 3.485 3.504 3.533 3.546 3.529 3.501 3.47 3.436 3.388 3.314 3.229 3.113 2.979 2.855 2.681 2.475 2.266 2.004 1.685 1.33 0.901 0.401 -0.232 -0.975 -1.861 -2.984 -4.246 -5.857 -7.827 -10.353 -13.595 -17.902 -23.859 -32.772 -42.157 -49.172 -54.741 -59.219 -62.989 -66.086 -68.694 -70.835 -72.874 -74.567 -76.04 -77.403 -78.689 -79.847 -80.872 -81.915 -82.793 -83.539 -84.326 -85.132 -85.776 -86.432 -87.114 -87.642 -88.18 -88.727 -89.276 -89.828 -90.202 -90.591 -91.189 -91.585 -91.997 -92.21 -92.651 -93.111 -93.57 -93.81 -94.216 -94.555 -94.816 -95.083 -95.622 -95.926 -96.262 -96.612 -97.0 -97.454 -97.998 -99.438 -10 ,30964 ,KEBNE ,17076832,Sat Dec 25 06:37:18 CET,Sat Dec 25 08:10:36 CET,0.0 0.823 1.045 1.186 1.292 1.397 1.497 1.572 1.681 1.719 1.748 1.728 1.801 1.818 1.844 1.853 1.857 1.855 1.839 1.813 1.759 1.72 1.676 1.586 1.477 1.387 1.318 1.229 1.083 0.918 0.733 0.489 0.227 -0.044 -0.38 -0.775 -1.131 -1.542 -2.062 -2.694 -3.416 -4.27 -5.387 -6.625 -8.182 -10.139 -12.69 -15.952 -20.36 -26.46 -35.5 -45.012 -52.051 -57.611 -62.068 -65.742 -68.793 -71.44 -73.62 -75.674 -77.368 -78.859 -80.261 -81.554 -82.719 -83.75 -84.78 -85.686 -86.476 -87.281 -88.087 -88.733 -89.395 -90.068 -90.575 -91.085 -91.604 -92.138 -92.697 -93.072 -93.447 -94.033 -94.435 -94.858 -95.072 -95.495 -95.943 -96.41 -96.646 -97.048 -97.414 -97.689 -97.972 -98.544 -98.859 -99.197 -99.553 -99.969 -100.438 -100.999 -102.487 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_41_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_41_54.txt deleted file mode 100644 index 0b60b642..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_41_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13993 ,TETRA ,17618239,Tue Nov 30 13:26:20 CET,Tue Nov 30 15:15:02 CET,0.0 1.257 1.542 1.713 1.828 1.927 2.0 2.04 2.106 2.131 2.142 2.11 2.157 2.156 2.152 2.136 2.107 2.088 2.046 2.022 1.979 1.929 1.888 1.816 1.727 1.625 1.51 1.376 1.16 0.935 0.734 0.464 0.162 -0.132 -0.502 -0.939 -1.418 -2.014 -2.689 -3.488 -4.412 -5.518 -6.918 -8.436 -10.342 -12.739 -15.775 -19.602 -24.73 -31.782 -42.225 -53.115 -61.106 -67.326 -72.313 -76.488 -79.916 -82.834 -85.236 -87.557 -89.493 -91.156 -92.692 -94.088 -95.337 -96.478 -97.639 -98.64 -99.499 -100.357 -101.201 -101.876 -102.585 -103.327 -103.875 -104.435 -105.015 -105.601 -106.194 -106.599 -107.003 -107.627 -108.057 -108.48 -108.7 -109.161 -109.632 -110.114 -110.367 -110.776 -111.13 -111.404 -111.684 -112.279 -112.585 -112.91 -113.285 -113.712 -114.156 -114.708 -116.633 -2 ,30190 ,TETRA ,17618240,Tue Nov 30 13:26:20 CET,Tue Nov 30 15:12:53 CET,0.0 1.141 1.431 1.608 1.737 1.845 1.936 2.016 2.142 2.195 2.236 2.239 2.295 2.315 2.34 2.337 2.323 2.311 2.285 2.242 2.162 2.108 2.047 1.942 1.835 1.719 1.58 1.437 1.238 1.029 0.804 0.51 0.182 -0.156 -0.537 -1.003 -1.506 -2.099 -2.772 -3.553 -4.436 -5.517 -6.881 -8.386 -10.326 -12.658 -15.66 -19.524 -24.651 -31.718 -42.207 -53.146 -61.24 -67.519 -72.454 -76.554 -79.946 -82.899 -85.331 -87.638 -89.546 -91.193 -92.7 -94.059 -95.304 -96.43 -97.588 -98.604 -99.439 -100.28 -101.152 -101.877 -102.614 -103.344 -103.897 -104.471 -105.067 -105.676 -106.271 -106.67 -107.082 -107.698 -108.114 -108.552 -108.776 -109.234 -109.704 -110.18 -110.424 -110.833 -111.219 -111.5 -111.787 -112.385 -112.719 -113.06 -113.392 -113.778 -114.269 -114.93 -116.696 -3 ,19718 ,TETRA ,17618241,Tue Nov 30 13:27:18 CET,Tue Nov 30 15:13:09 CET,0.0 1.402 1.833 2.114 2.324 2.509 2.661 2.772 2.956 3.034 3.104 3.154 3.224 3.256 3.293 3.317 3.317 3.308 3.296 3.278 3.219 3.166 3.111 3.025 2.933 2.827 2.71 2.585 2.382 2.154 1.919 1.645 1.381 1.076 0.688 0.238 -0.237 -0.787 -1.419 -2.169 -3.05 -4.14 -5.521 -7.052 -9.02 -11.45 -14.518 -18.369 -23.482 -30.514 -40.956 -51.935 -59.962 -66.178 -71.138 -75.26 -78.643 -81.548 -83.974 -86.34 -88.312 -89.982 -91.497 -92.864 -94.137 -95.28 -96.403 -97.4 -98.27 -99.122 -99.97 -100.676 -101.378 -102.103 -102.668 -103.236 -103.798 -104.353 -104.932 -105.319 -105.719 -106.357 -106.783 -107.222 -107.447 -107.899 -108.37 -108.858 -109.105 -109.519 -109.911 -110.191 -110.479 -111.107 -111.435 -111.771 -112.123 -112.502 -112.935 -113.453 -114.95 -4 ,29567 ,TETRA ,17618242,Tue Nov 30 13:27:21 CET,Tue Nov 30 15:13:29 CET,0.0 1.473 1.871 2.128 2.317 2.49 2.647 2.773 2.969 3.049 3.11 3.167 3.25 3.278 3.309 3.338 3.353 3.354 3.347 3.319 3.259 3.224 3.185 3.102 3.009 2.907 2.791 2.664 2.475 2.285 2.102 1.828 1.522 1.221 0.84 0.363 -0.102 -0.656 -1.307 -2.029 -2.905 -4.041 -5.466 -6.969 -8.886 -11.259 -14.286 -18.164 -23.368 -30.48 -40.897 -51.757 -59.764 -66.03 -71.001 -75.122 -78.513 -81.424 -83.834 -86.14 -88.059 -89.717 -91.228 -92.608 -93.884 -95.036 -96.204 -97.212 -98.037 -98.885 -99.755 -100.449 -101.176 -101.935 -102.49 -103.038 -103.617 -104.204 -104.784 -105.184 -105.599 -106.227 -106.66 -107.103 -107.326 -107.783 -108.25 -108.747 -109.004 -109.417 -109.774 -110.039 -110.325 -110.919 -111.217 -111.554 -111.922 -112.325 -112.789 -113.338 -114.724 -5 ,31998 ,TETRA ,17618243,Tue Nov 30 13:27:21 CET,Tue Nov 30 15:13:29 CET,0.0 0.834 1.046 1.215 1.344 1.434 1.513 1.576 1.685 1.72 1.744 1.774 1.84 1.856 1.88 1.902 1.901 1.895 1.886 1.865 1.817 1.77 1.715 1.632 1.531 1.419 1.293 1.156 0.962 0.767 0.564 0.286 -0.004 -0.314 -0.713 -1.213 -1.751 -2.344 -3.018 -3.833 -4.749 -5.848 -7.251 -8.793 -10.726 -13.101 -16.16 -20.009 -25.137 -32.225 -42.69 -53.695 -61.777 -67.999 -72.973 -77.121 -80.531 -83.448 -85.866 -88.193 -90.099 -91.77 -93.346 -94.772 -96.029 -97.141 -98.26 -99.243 -100.087 -100.937 -101.803 -102.505 -103.214 -103.942 -104.502 -105.077 -105.664 -106.25 -106.85 -107.257 -107.66 -108.292 -108.727 -109.155 -109.366 -109.811 -110.291 -110.782 -111.029 -111.437 -111.789 -112.052 -112.324 -112.902 -113.217 -113.56 -113.936 -114.339 -114.811 -115.422 -116.9 -6 ,22036 ,TETRA ,17618244,Tue Nov 30 13:28:20 CET,Tue Nov 30 15:14:58 CET,0.0 1.226 1.558 1.77 1.911 2.03 2.144 2.226 2.317 2.346 2.363 2.346 2.389 2.379 2.354 2.329 2.298 2.283 2.25 2.219 2.155 2.106 2.052 1.958 1.86 1.751 1.645 1.539 1.376 1.188 0.966 0.68 0.394 0.09 -0.283 -0.747 -1.24 -1.81 -2.474 -3.246 -4.124 -5.219 -6.656 -8.221 -10.168 -12.543 -15.574 -19.427 -24.57 -31.626 -42.08 -53.0 -60.978 -67.192 -72.197 -76.391 -79.815 -82.723 -85.125 -87.447 -89.351 -90.973 -92.492 -93.881 -95.134 -96.249 -97.366 -98.357 -99.208 -100.064 -100.928 -101.63 -102.357 -103.107 -103.67 -104.228 -104.784 -105.36 -105.978 -106.394 -106.799 -107.423 -107.853 -108.285 -108.496 -108.94 -109.411 -109.89 -110.136 -110.544 -110.906 -111.181 -111.475 -112.058 -112.358 -112.679 -113.039 -113.44 -113.891 -114.462 -115.81 -7 ,20952 ,TETRA ,17618245,Tue Nov 30 13:28:19 CET,Tue Nov 30 15:20:13 CET,0.0 1.011 1.267 1.461 1.606 1.707 1.781 1.839 1.921 1.953 1.989 2.023 2.091 2.098 2.078 2.047 2.014 2.0 1.963 1.915 1.83 1.751 1.653 1.52 1.39 1.257 1.122 0.986 0.8 0.605 0.407 0.141 -0.169 -0.497 -0.87 -1.323 -1.789 -2.344 -3.013 -3.771 -4.641 -5.72 -7.101 -8.625 -10.557 -12.935 -15.995 -19.87 -25.047 -32.158 -42.603 -53.51 -61.512 -67.789 -72.797 -76.959 -80.4 -83.311 -85.688 -87.993 -89.886 -91.51 -93.029 -94.408 -95.662 -96.781 -97.906 -98.89 -99.731 -100.58 -101.451 -102.175 -102.899 -103.633 -104.185 -104.734 -105.3 -105.867 -106.44 -106.845 -107.261 -107.892 -108.321 -108.76 -108.983 -109.435 -109.896 -110.373 -110.624 -111.031 -111.376 -111.642 -111.918 -112.501 -112.813 -113.139 -113.505 -113.912 -114.378 -114.937 -116.362 -8 ,10632 ,TETRA ,17618246,Tue Nov 30 13:28:21 CET,Tue Nov 30 15:15:33 CET,0.0 1.463 1.879 2.167 2.368 2.518 2.642 2.742 2.917 2.986 3.047 3.078 3.148 3.179 3.221 3.26 3.283 3.282 3.268 3.255 3.214 3.172 3.132 3.049 2.944 2.836 2.726 2.612 2.439 2.235 2.02 1.748 1.453 1.166 0.807 0.339 -0.156 -0.741 -1.417 -2.194 -3.077 -4.164 -5.56 -7.106 -9.079 -11.483 -14.539 -18.415 -23.592 -30.743 -41.201 -52.113 -60.197 -66.485 -71.488 -75.683 -79.138 -82.104 -84.543 -86.846 -88.733 -90.359 -91.861 -93.246 -94.493 -95.607 -96.733 -97.713 -98.558 -99.402 -100.241 -100.93 -101.637 -102.342 -102.882 -103.437 -103.996 -104.562 -105.139 -105.54 -105.952 -106.576 -106.99 -107.418 -107.647 -108.104 -108.561 -109.057 -109.314 -109.726 -110.083 -110.353 -110.631 -111.222 -111.548 -111.902 -112.273 -112.649 -113.081 -113.619 -114.988 -9 ,27496 ,TETRA ,17618247,Tue Nov 30 13:29:19 CET,Tue Nov 30 15:16:23 CET,0.0 1.831 2.094 2.262 2.386 2.474 2.544 2.602 2.701 2.737 2.77 2.77 2.816 2.821 2.836 2.832 2.809 2.79 2.761 2.739 2.689 2.646 2.598 2.519 2.425 2.331 2.222 2.105 1.933 1.74 1.54 1.283 1.026 0.745 0.381 -0.078 -0.552 -1.107 -1.763 -2.513 -3.382 -4.484 -5.895 -7.441 -9.4 -11.79 -14.817 -18.642 -23.816 -30.917 -41.3 -52.195 -60.215 -66.415 -71.374 -75.542 -78.95 -81.863 -84.288 -86.584 -88.498 -90.159 -91.653 -93.015 -94.273 -95.387 -96.496 -97.457 -98.292 -99.153 -100.013 -100.717 -101.429 -102.147 -102.704 -103.264 -103.818 -104.399 -104.998 -105.396 -105.794 -106.397 -106.827 -107.274 -107.494 -107.936 -108.395 -108.87 -109.118 -109.53 -109.899 -110.17 -110.449 -111.023 -111.326 -111.645 -112.0 -112.38 -112.764 -113.325 -114.781 -10 ,7016 ,TETRA ,17618248,Tue Nov 30 13:29:21 CET,Tue Nov 30 15:16:39 CET,0.0 1.346 1.574 1.735 1.852 1.935 1.996 2.044 2.089 2.103 2.121 2.101 2.138 2.133 2.119 2.109 2.099 2.09 2.062 2.028 1.967 1.936 1.899 1.811 1.709 1.601 1.485 1.35 1.178 1.009 0.818 0.567 0.305 -0.004 -0.419 -0.911 -1.389 -1.919 -2.546 -3.3 -4.154 -5.21 -6.555 -8.03 -9.982 -12.398 -15.445 -19.295 -24.444 -31.553 -42.024 -52.926 -60.917 -67.163 -72.164 -76.273 -79.671 -82.595 -84.996 -87.326 -89.263 -90.927 -92.473 -93.893 -95.166 -96.294 -97.458 -98.438 -99.225 -100.052 -100.92 -101.624 -102.345 -103.078 -103.628 -104.187 -104.767 -105.361 -105.967 -106.388 -106.804 -107.438 -107.887 -108.316 -108.536 -108.993 -109.445 -109.929 -110.174 -110.588 -110.96 -111.22 -111.494 -112.067 -112.374 -112.715 -113.083 -113.487 -113.942 -114.477 -115.583 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_42_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_42_35.txt deleted file mode 100644 index 78398b1e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_42_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27154 ,TETRA ,17618249,Tue Nov 30 13:30:22 CET,Tue Nov 30 15:15:44 CET,0.0 1.301 1.75 2.069 2.325 2.53 2.731 2.908 3.213 3.362 3.504 3.72 3.882 3.999 4.202 4.391 4.579 4.666 4.809 4.943 5.169 5.326 5.465 5.644 5.812 5.972 6.123 6.266 6.444 6.583 6.721 6.89 7.014 7.154 7.318 7.468 7.619 7.775 7.924 8.082 8.232 8.367 8.525 8.66 8.738 8.754 8.672 8.481 8.116 7.354 5.882 4.029 2.366 0.936 -0.256 -1.335 -2.28 -3.13 -3.885 -4.645 -5.311 -5.884 -6.393 -6.873 -7.322 -7.742 -8.166 -8.546 -8.898 -9.249 -9.592 -9.891 -10.202 -10.522 -10.785 -11.057 -11.34 -11.627 -11.914 -12.117 -12.339 -12.692 -12.921 -13.146 -13.272 -13.555 -13.831 -14.105 -14.251 -14.455 -14.709 -14.89 -15.087 -15.49 -15.704 -15.943 -16.204 -16.516 -16.903 -17.372 -18.967 -2 ,29101 ,TETRA ,17618250,Tue Nov 30 13:30:24 CET,Tue Nov 30 15:15:54 CET,0.0 1.39 1.823 2.147 2.415 2.667 2.886 3.076 3.397 3.541 3.674 3.887 4.051 4.157 4.359 4.564 4.74 4.82 4.982 5.138 5.372 5.517 5.638 5.807 5.951 6.082 6.222 6.362 6.552 6.722 6.858 7.044 7.244 7.432 7.638 7.857 8.057 8.232 8.393 8.552 8.678 8.802 8.94 9.038 9.097 9.085 8.991 8.787 8.39 7.641 6.155 4.27 2.676 1.288 0.089 -1.0 -1.958 -2.801 -3.562 -4.334 -4.966 -5.517 -6.008 -6.487 -6.957 -7.39 -7.842 -8.223 -8.558 -8.919 -9.305 -9.616 -9.922 -10.257 -10.531 -10.804 -11.079 -11.351 -11.635 -11.84 -12.041 -12.368 -12.612 -12.859 -12.983 -13.241 -13.5 -13.782 -13.937 -14.144 -14.416 -14.59 -14.762 -15.136 -15.353 -15.582 -15.814 -16.089 -16.444 -16.965 -18.977 -3 ,20928 ,TETRA ,17618251,Tue Nov 30 13:30:21 CET,Tue Nov 30 15:16:23 CET,0.0 1.777 2.221 2.539 2.808 3.043 3.24 3.42 3.745 3.887 4.021 4.259 4.426 4.537 4.75 4.959 5.154 5.24 5.415 5.574 5.781 5.905 6.017 6.193 6.385 6.571 6.725 6.866 7.063 7.239 7.381 7.551 7.732 7.89 8.05 8.224 8.393 8.571 8.736 8.896 9.034 9.138 9.224 9.3 9.367 9.395 9.325 9.125 8.692 7.833 6.245 4.225 2.502 1.108 -0.064 -1.114 -2.044 -2.888 -3.637 -4.4 -5.021 -5.544 -6.043 -6.524 -6.973 -7.394 -7.812 -8.187 -8.522 -8.864 -9.227 -9.541 -9.874 -10.215 -10.475 -10.74 -11.006 -11.274 -11.551 -11.747 -11.952 -12.279 -12.502 -12.722 -12.846 -13.103 -13.358 -13.645 -13.798 -14.001 -14.255 -14.429 -14.611 -15.0 -15.235 -15.487 -15.746 -16.05 -16.423 -16.96 -18.469 -4 ,26775 ,TETRA ,17618252,Tue Nov 30 13:31:23 CET,Tue Nov 30 15:20:05 CET,0.0 1.512 1.958 2.311 2.59 2.799 2.99 3.178 3.498 3.64 3.778 3.993 4.146 4.264 4.492 4.689 4.868 4.954 5.114 5.268 5.49 5.634 5.77 5.955 6.139 6.316 6.467 6.602 6.775 6.933 7.088 7.271 7.427 7.578 7.767 7.949 8.106 8.272 8.419 8.559 8.687 8.811 8.92 8.989 9.035 9.035 8.956 8.762 8.405 7.646 6.131 4.196 2.548 1.145 -0.05 -1.09 -2.029 -2.91 -3.671 -4.402 -5.011 -5.585 -6.127 -6.619 -7.061 -7.476 -7.919 -8.294 -8.634 -8.986 -9.321 -9.604 -9.899 -10.208 -10.469 -10.749 -11.028 -11.317 -11.625 -11.829 -12.032 -12.362 -12.597 -12.831 -12.948 -13.212 -13.498 -13.771 -13.912 -14.12 -14.39 -14.562 -14.748 -15.154 -15.377 -15.615 -15.891 -16.202 -16.569 -17.015 -18.49 -5 ,6545 ,TETRA ,17618253,Tue Nov 30 13:31:23 CET,Tue Nov 30 15:18:35 CET,0.0 1.489 1.924 2.247 2.518 2.754 2.949 3.122 3.436 3.587 3.726 3.944 4.113 4.227 4.429 4.62 4.804 4.89 5.053 5.228 5.479 5.628 5.762 5.957 6.131 6.277 6.419 6.558 6.729 6.896 7.044 7.187 7.316 7.467 7.65 7.836 8.012 8.178 8.318 8.441 8.561 8.692 8.815 8.903 8.991 9.029 8.976 8.775 8.413 7.692 6.181 4.291 2.668 1.287 0.101 -0.988 -1.928 -2.772 -3.514 -4.241 -4.844 -5.408 -5.958 -6.456 -6.898 -7.3 -7.726 -8.11 -8.437 -8.782 -9.153 -9.463 -9.774 -10.095 -10.346 -10.609 -10.868 -11.139 -11.429 -11.629 -11.837 -12.161 -12.39 -12.617 -12.731 -12.973 -13.251 -13.525 -13.661 -13.871 -14.144 -14.32 -14.499 -14.888 -15.112 -15.357 -15.629 -15.934 -16.299 -16.797 -18.238 -6 ,25003 ,TETRA ,17618254,Tue Nov 30 13:31:23 CET,Tue Nov 30 15:21:41 CET,0.0 1.417 1.915 2.283 2.559 2.777 2.988 3.2 3.573 3.726 3.849 4.036 4.188 4.296 4.499 4.697 4.873 4.957 5.133 5.302 5.507 5.633 5.76 5.923 6.084 6.232 6.365 6.507 6.696 6.88 7.059 7.266 7.439 7.594 7.802 8.011 8.163 8.295 8.404 8.529 8.654 8.782 8.911 9.008 9.081 9.075 8.986 8.781 8.352 7.563 6.06 4.149 2.489 1.018 -0.22 -1.35 -2.378 -3.274 -4.007 -4.729 -5.35 -5.923 -6.478 -6.969 -7.423 -7.863 -8.326 -8.718 -9.041 -9.376 -9.73 -10.033 -10.36 -10.716 -10.99 -11.273 -11.565 -11.863 -12.165 -12.359 -12.545 -12.85 -13.079 -13.323 -13.446 -13.696 -13.966 -14.239 -14.381 -14.597 -14.863 -15.026 -15.209 -15.587 -15.805 -16.035 -16.27 -16.549 -16.884 -17.365 -18.884 -7 ,10574 ,TETRA ,17618255,Tue Nov 30 13:31:23 CET,Tue Nov 30 15:18:35 CET,0.0 1.325 1.737 2.072 2.359 2.597 2.807 2.979 3.308 3.462 3.607 3.826 3.978 4.09 4.304 4.497 4.683 4.774 4.941 5.096 5.313 5.46 5.604 5.797 5.981 6.151 6.301 6.437 6.604 6.76 6.909 7.092 7.265 7.424 7.584 7.736 7.876 8.039 8.195 8.328 8.46 8.586 8.716 8.827 8.889 8.893 8.842 8.675 8.259 7.472 6.003 4.016 2.31 0.898 -0.297 -1.365 -2.29 -3.141 -3.863 -4.557 -5.167 -5.739 -6.29 -6.814 -7.282 -7.691 -8.108 -8.48 -8.817 -9.182 -9.563 -9.881 -10.2 -10.506 -10.761 -11.057 -11.347 -11.631 -11.947 -12.172 -12.401 -12.73 -12.945 -13.17 -13.292 -13.551 -13.815 -14.089 -14.237 -14.447 -14.71 -14.87 -15.043 -15.434 -15.647 -15.881 -16.129 -16.423 -16.768 -17.215 -18.966 -8 ,15883 ,TETRA ,17618256,Tue Nov 30 13:31:23 CET,Tue Nov 30 15:18:35 CET,0.0 1.395 1.852 2.17 2.425 2.658 2.866 3.055 3.38 3.52 3.655 3.874 4.036 4.159 4.385 4.594 4.785 4.866 5.03 5.185 5.381 5.502 5.63 5.817 5.975 6.122 6.279 6.44 6.634 6.805 6.963 7.149 7.313 7.467 7.629 7.795 7.947 8.094 8.241 8.39 8.525 8.652 8.793 8.902 8.953 8.953 8.874 8.687 8.331 7.583 6.075 4.135 2.511 1.113 -0.097 -1.158 -2.076 -2.904 -3.627 -4.345 -4.968 -5.51 -6.02 -6.512 -6.973 -7.401 -7.873 -8.299 -8.659 -9.033 -9.403 -9.704 -10.023 -10.349 -10.598 -10.859 -11.118 -11.375 -11.674 -11.881 -12.071 -12.376 -12.602 -12.829 -12.945 -13.195 -13.466 -13.755 -13.903 -14.116 -14.413 -14.603 -14.8 -15.201 -15.416 -15.641 -15.892 -16.206 -16.572 -17.079 -18.318 -9 ,4866 ,TETRA ,17618257,Tue Nov 30 13:31:23 CET,Tue Nov 30 15:19:14 CET,0.0 1.408 1.853 2.18 2.445 2.66 2.855 3.028 3.34 3.484 3.623 3.841 4.003 4.126 4.354 4.551 4.727 4.815 4.979 5.129 5.342 5.47 5.588 5.768 5.952 6.112 6.249 6.377 6.54 6.699 6.864 7.071 7.261 7.425 7.592 7.753 7.886 8.048 8.228 8.37 8.496 8.62 8.784 8.905 8.938 8.96 8.937 8.777 8.385 7.621 6.19 4.262 2.599 1.23 0.022 -1.051 -1.956 -2.771 -3.513 -4.266 -4.89 -5.444 -5.96 -6.437 -6.881 -7.298 -7.734 -8.125 -8.463 -8.828 -9.218 -9.52 -9.832 -10.166 -10.437 -10.694 -10.939 -11.205 -11.492 -11.7 -11.913 -12.253 -12.502 -12.737 -12.847 -13.098 -13.363 -13.637 -13.786 -13.993 -14.259 -14.437 -14.624 -15.015 -15.236 -15.487 -15.759 -16.05 -16.415 -16.912 -18.884 -10 ,27450 ,TETRA ,17618258,Tue Nov 30 13:32:24 CET,Tue Nov 30 15:20:29 CET,0.0 1.36 1.795 2.128 2.392 2.632 2.843 3.033 3.364 3.502 3.641 3.868 4.035 4.158 4.38 4.595 4.797 4.888 5.057 5.211 5.427 5.557 5.693 5.902 6.078 6.239 6.39 6.523 6.691 6.857 7.005 7.168 7.335 7.492 7.662 7.829 7.974 8.14 8.294 8.444 8.586 8.727 8.874 8.985 9.066 9.092 9.034 8.862 8.511 7.769 6.265 4.329 2.69 1.281 0.091 -0.958 -1.903 -2.746 -3.437 -4.126 -4.752 -5.302 -5.835 -6.378 -6.87 -7.285 -7.712 -8.095 -8.421 -8.767 -9.154 -9.463 -9.763 -10.071 -10.315 -10.592 -10.874 -11.147 -11.436 -11.644 -11.855 -12.18 -12.415 -12.65 -12.768 -13.026 -13.296 -13.585 -13.739 -13.954 -14.232 -14.408 -14.607 -15.024 -15.225 -15.446 -15.699 -15.975 -16.295 -16.765 -18.113 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_42_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_42_41.txt deleted file mode 100644 index ea961eaf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_42_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24276 ,TETRA ,17618259,Tue Nov 30 13:32:24 CET,Tue Nov 30 15:20:26 CET,0.0 1.026 1.392 1.66 1.926 2.146 2.341 2.539 2.899 3.052 3.195 3.432 3.596 3.715 3.941 4.153 4.357 4.453 4.644 4.83 5.088 5.252 5.413 5.62 5.804 5.991 6.156 6.313 6.548 6.775 6.963 7.185 7.398 7.579 7.79 8.041 8.281 8.508 8.73 8.985 9.283 9.596 9.934 10.259 10.587 10.92 11.263 11.612 11.935 12.141 12.031 11.525 10.919 10.298 9.666 9.061 8.525 8.037 7.588 7.11 6.712 6.344 5.982 5.662 5.351 5.027 4.694 4.409 4.145 3.852 3.552 3.326 3.116 2.875 2.667 2.461 2.244 2.015 1.785 1.622 1.441 1.171 0.991 0.791 0.682 0.453 0.229 0.007 -0.109 -0.277 -0.533 -0.694 -0.865 -1.217 -1.402 -1.598 -1.816 -2.068 -2.386 -2.815 -4.259 -2 ,8255 ,TETRA ,17618260,Tue Nov 30 13:32:24 CET,Tue Nov 30 15:18:47 CET,0.0 1.278 1.734 2.063 2.318 2.558 2.774 2.972 3.321 3.476 3.628 3.877 4.045 4.158 4.367 4.587 4.795 4.889 5.071 5.255 5.515 5.68 5.838 6.061 6.278 6.483 6.677 6.849 7.058 7.273 7.491 7.77 8.02 8.232 8.471 8.759 9.045 9.33 9.63 9.95 10.235 10.521 10.855 11.173 11.535 11.916 12.298 12.661 12.968 13.156 12.996 12.452 11.883 11.294 10.72 10.168 9.666 9.131 8.653 8.226 7.846 7.497 7.137 6.767 6.438 6.156 5.857 5.569 5.308 5.008 4.695 4.462 4.212 3.937 3.722 3.497 3.278 3.066 2.837 2.677 2.498 2.218 2.037 1.844 1.744 1.527 1.291 1.036 0.896 0.712 0.439 0.278 0.114 -0.252 -0.44 -0.641 -0.865 -1.136 -1.5 -1.984 -3.653 -3 ,6395 ,TETRA ,17618261,Tue Nov 30 13:32:24 CET,Tue Nov 30 15:20:51 CET,0.0 1.53 2.004 2.318 2.569 2.79 2.994 3.183 3.536 3.683 3.812 4.024 4.179 4.305 4.56 4.798 5.005 5.107 5.314 5.488 5.731 5.895 6.042 6.25 6.454 6.649 6.828 6.992 7.2 7.399 7.605 7.851 8.087 8.326 8.603 8.874 9.083 9.333 9.629 9.938 10.244 10.554 10.901 11.226 11.598 12.003 12.381 12.732 13.047 13.266 13.225 12.764 12.133 11.453 10.811 10.229 9.699 9.181 8.724 8.271 7.885 7.518 7.143 6.8 6.477 6.186 5.894 5.632 5.397 5.14 4.884 4.673 4.447 4.199 4.009 3.807 3.579 3.343 3.095 2.921 2.745 2.466 2.276 2.085 1.987 1.777 1.546 1.32 1.205 1.039 0.81 0.658 0.496 0.15 -0.052 -0.276 -0.528 -0.826 -1.157 -1.574 -3.301 -4 ,23880 ,TETRA ,17618262,Tue Nov 30 13:33:22 CET,Tue Nov 30 15:20:47 CET,0.0 1.461 1.905 2.222 2.493 2.735 2.946 3.127 3.447 3.594 3.74 3.982 4.146 4.27 4.505 4.707 4.893 4.989 5.175 5.357 5.608 5.771 5.928 6.151 6.373 6.584 6.759 6.924 7.143 7.343 7.555 7.829 8.079 8.32 8.602 8.873 9.083 9.323 9.589 9.915 10.252 10.551 10.877 11.207 11.578 11.928 12.27 12.618 12.965 13.17 13.091 12.627 11.979 11.319 10.701 10.139 9.647 9.184 8.772 8.342 7.951 7.597 7.248 6.889 6.529 6.202 5.888 5.621 5.387 5.134 4.861 4.634 4.39 4.151 3.97 3.786 3.597 3.376 3.134 2.967 2.798 2.534 2.361 2.176 2.075 1.861 1.623 1.367 1.239 1.069 0.833 0.683 0.525 0.197 0.01 -0.204 -0.451 -0.734 -1.077 -1.491 -2.914 -5 ,22769 ,TETRA ,17618263,Tue Nov 30 13:33:22 CET,Tue Nov 30 15:21:14 CET,0.0 1.178 1.592 1.901 2.14 2.334 2.541 2.743 3.063 3.205 3.345 3.577 3.745 3.869 4.104 4.328 4.529 4.618 4.781 4.943 5.181 5.334 5.481 5.699 5.927 6.144 6.327 6.503 6.726 6.95 7.168 7.401 7.644 7.866 8.089 8.335 8.576 8.853 9.15 9.458 9.767 10.086 10.437 10.797 11.191 11.565 11.933 12.264 12.578 12.826 12.846 12.451 11.877 11.303 10.696 10.07 9.541 9.056 8.609 8.132 7.706 7.345 7.001 6.652 6.3 5.965 5.605 5.276 5.023 4.76 4.478 4.258 4.033 3.787 3.573 3.346 3.121 2.887 2.648 2.481 2.298 2.019 1.83 1.625 1.525 1.33 1.104 0.854 0.725 0.553 0.299 0.135 -0.044 -0.411 -0.606 -0.829 -1.089 -1.374 -1.704 -2.161 -3.361 -6 ,23073 ,TETRA ,17618264,Tue Nov 30 13:33:22 CET,Tue Nov 30 15:21:29 CET,0.0 1.176 1.62 1.979 2.241 2.448 2.639 2.817 3.134 3.277 3.413 3.643 3.811 3.926 4.162 4.392 4.591 4.681 4.856 5.033 5.298 5.469 5.625 5.848 6.065 6.265 6.461 6.653 6.888 7.103 7.289 7.499 7.709 7.915 8.137 8.389 8.626 8.865 9.126 9.427 9.732 10.029 10.359 10.693 11.057 11.401 11.785 12.192 12.52 12.77 12.763 12.281 11.639 11.001 10.433 9.87 9.325 8.835 8.413 7.976 7.604 7.262 6.921 6.606 6.258 5.885 5.523 5.224 4.958 4.691 4.429 4.206 3.976 3.727 3.522 3.313 3.108 2.88 2.615 2.432 2.255 1.972 1.777 1.58 1.476 1.263 1.039 0.804 0.68 0.507 0.268 0.122 -0.039 -0.368 -0.57 -0.821 -1.084 -1.39 -1.745 -2.197 -4.319 -7 ,2198 ,TETRA ,17618265,Tue Nov 30 13:33:22 CET,Tue Nov 30 15:20:49 CET,0.0 1.606 2.036 2.385 2.669 2.901 3.105 3.291 3.623 3.779 3.929 4.163 4.333 4.452 4.671 4.873 5.071 5.169 5.36 5.542 5.791 5.954 6.104 6.31 6.51 6.698 6.877 7.051 7.263 7.472 7.699 7.955 8.183 8.407 8.644 8.891 9.127 9.368 9.613 9.89 10.158 10.453 10.79 11.102 11.445 11.813 12.206 12.515 12.775 13.023 13.009 12.506 11.864 11.184 10.567 10.027 9.536 9.059 8.644 8.228 7.838 7.475 7.118 6.769 6.447 6.127 5.809 5.542 5.278 4.998 4.716 4.486 4.235 3.97 3.765 3.556 3.345 3.116 2.86 2.683 2.516 2.258 2.069 1.872 1.77 1.558 1.342 1.112 0.988 0.815 0.551 0.395 0.227 -0.137 -0.334 -0.551 -0.782 -1.036 -1.35 -1.76 -3.219 -8 ,19077 ,TETRA ,17618266,Tue Nov 30 13:33:22 CET,Tue Nov 30 15:22:03 CET,0.0 1.491 1.919 2.212 2.475 2.69 2.882 3.071 3.408 3.552 3.687 3.884 4.037 4.154 4.384 4.608 4.829 4.933 5.109 5.284 5.558 5.723 5.886 6.105 6.301 6.51 6.716 6.899 7.12 7.336 7.557 7.819 8.054 8.262 8.508 8.789 9.033 9.291 9.567 9.86 10.152 10.47 10.813 11.131 11.485 11.829 12.2 12.597 12.933 13.121 13.025 12.501 11.869 11.247 10.656 10.066 9.519 9.009 8.568 8.122 7.729 7.375 7.012 6.649 6.303 5.994 5.697 5.439 5.21 4.966 4.698 4.485 4.254 3.982 3.773 3.562 3.337 3.11 2.887 2.724 2.549 2.263 2.058 1.838 1.728 1.514 1.293 1.058 0.932 0.764 0.529 0.373 0.206 -0.155 -0.351 -0.558 -0.816 -1.133 -1.501 -1.971 -3.399 -9 ,25906 ,TETRA ,17618267,Tue Nov 30 13:34:24 CET,Tue Nov 30 15:22:25 CET,0.0 1.607 2.031 2.351 2.618 2.857 3.077 3.267 3.589 3.739 3.88 4.09 4.248 4.366 4.577 4.78 4.979 5.073 5.253 5.424 5.657 5.807 5.956 6.171 6.386 6.591 6.782 6.969 7.211 7.443 7.658 7.907 8.138 8.358 8.596 8.853 9.082 9.321 9.626 9.985 10.315 10.607 10.927 11.259 11.619 11.999 12.409 12.82 13.187 13.418 13.36 12.823 12.163 11.483 10.836 10.246 9.694 9.189 8.763 8.308 7.894 7.528 7.161 6.805 6.496 6.205 5.874 5.577 5.329 5.068 4.801 4.581 4.337 4.102 3.907 3.685 3.483 3.268 3.031 2.866 2.69 2.413 2.21 2.002 1.902 1.696 1.468 1.216 1.083 0.906 0.646 0.489 0.321 -0.034 -0.218 -0.422 -0.66 -0.943 -1.273 -1.705 -3.129 -10 ,6403 ,TETRA ,17618268,Tue Nov 30 13:34:24 CET,Tue Nov 30 15:11:01 CET,0.0 1.498 1.982 2.365 2.642 2.863 3.073 3.273 3.599 3.75 3.894 4.118 4.285 4.406 4.63 4.843 5.045 5.138 5.32 5.501 5.75 5.909 6.069 6.3 6.511 6.692 6.868 7.045 7.247 7.429 7.624 7.863 8.079 8.299 8.553 8.815 9.074 9.346 9.61 9.888 10.155 10.475 10.892 11.236 11.581 11.945 12.293 12.623 12.93 13.183 13.196 12.756 12.151 11.518 10.92 10.364 9.821 9.322 8.898 8.454 8.074 7.726 7.365 7.019 6.701 6.397 6.078 5.795 5.551 5.306 5.05 4.84 4.611 4.347 4.147 3.934 3.701 3.468 3.227 3.062 2.896 2.632 2.435 2.217 2.109 1.903 1.682 1.442 1.316 1.148 0.916 0.756 0.589 0.207 0.001 -0.211 -0.443 -0.73 -1.118 -1.604 -2.862 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_42_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_42_43.txt deleted file mode 100644 index 07e5a4e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_42_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11515 ,TETRA ,17618269,Tue Nov 30 13:34:24 CET,Tue Nov 30 15:19:59 CET,0.0 1.125 1.564 1.881 2.121 2.343 2.561 2.772 3.152 3.338 3.524 3.834 4.027 4.159 4.421 4.687 4.94 5.054 5.276 5.503 5.822 6.031 6.242 6.533 6.816 7.093 7.346 7.583 7.89 8.196 8.492 8.838 9.178 9.511 9.906 10.375 10.821 11.289 11.815 12.377 12.952 13.626 14.414 15.175 16.099 17.146 18.322 19.612 21.151 23.044 25.38 27.292 28.334 28.971 29.402 29.645 29.766 29.846 29.889 29.881 29.839 29.779 29.705 29.578 29.437 29.325 29.176 29.028 28.906 28.791 28.663 28.526 28.38 28.236 28.12 28.0 27.876 27.726 27.55 27.424 27.305 27.134 27.008 26.867 26.792 26.646 26.489 26.316 26.222 26.096 25.859 25.73 25.6 25.312 25.143 24.96 24.759 24.523 24.257 23.9 22.807 -2 ,7794 ,TETRA ,17618270,Tue Nov 30 13:35:26 CET,Tue Nov 30 15:21:21 CET,0.0 1.12 1.544 1.858 2.127 2.366 2.564 2.755 3.109 3.269 3.435 3.725 3.916 4.059 4.332 4.59 4.826 4.945 5.184 5.388 5.667 5.864 6.056 6.333 6.606 6.872 7.122 7.357 7.666 7.973 8.278 8.644 9.001 9.337 9.736 10.18 10.593 11.071 11.591 12.13 12.686 13.31 14.062 14.834 15.726 16.734 17.91 19.247 20.832 22.721 25.019 26.892 27.975 28.645 29.035 29.287 29.437 29.509 29.522 29.483 29.408 29.328 29.221 29.089 28.976 28.847 28.67 28.5 28.376 28.248 28.09 27.958 27.822 27.67 27.537 27.389 27.246 27.093 26.928 26.812 26.68 26.469 26.33 26.181 26.099 25.935 25.761 25.587 25.503 25.402 25.212 25.085 24.95 24.67 24.501 24.301 24.089 23.835 23.515 23.094 21.708 -3 ,22501 ,TETRA ,17618271,Tue Nov 30 13:35:28 CET,Tue Nov 30 15:21:18 CET,0.0 1.06 1.458 1.768 2.017 2.239 2.438 2.635 2.995 3.157 3.325 3.611 3.794 3.937 4.222 4.479 4.717 4.826 5.033 5.253 5.57 5.771 5.968 6.256 6.547 6.831 7.104 7.355 7.681 8.003 8.31 8.694 9.054 9.388 9.778 10.224 10.657 11.152 11.687 12.225 12.804 13.462 14.218 14.979 15.88 16.931 18.137 19.459 21.043 22.946 25.254 27.148 28.219 28.862 29.242 29.453 29.573 29.612 29.549 29.464 29.373 29.301 29.241 29.145 29.061 28.988 28.87 28.741 28.609 28.452 28.276 28.135 27.995 27.82 27.679 27.54 27.393 27.251 27.093 26.976 26.848 26.64 26.499 26.346 26.261 26.093 25.941 25.774 25.67 25.547 25.343 25.225 25.093 24.799 24.639 24.461 24.259 24.027 23.708 23.259 21.526 -4 ,8775 ,TETRA ,17618272,Tue Nov 30 13:35:25 CET,Tue Nov 30 15:22:04 CET,0.0 1.346 1.808 2.164 2.463 2.719 2.954 3.157 3.528 3.714 3.892 4.179 4.371 4.512 4.782 5.054 5.308 5.426 5.661 5.892 6.21 6.41 6.615 6.912 7.188 7.447 7.698 7.946 8.278 8.596 8.904 9.288 9.644 9.979 10.377 10.817 11.244 11.74 12.26 12.804 13.397 14.065 14.848 15.664 16.595 17.587 18.74 20.134 21.784 23.672 25.94 27.792 28.82 29.433 29.817 30.003 30.085 30.11 30.117 30.118 30.057 29.976 29.909 29.818 29.679 29.53 29.388 29.275 29.166 29.044 28.911 28.798 28.665 28.495 28.36 28.233 28.116 27.98 27.831 27.727 27.611 27.417 27.276 27.129 27.05 26.887 26.716 26.534 26.436 26.32 26.119 26.006 25.881 25.588 25.418 25.227 25.023 24.79 24.507 24.17 23.13 -5 ,30470 ,TETRA ,17618273,Tue Nov 30 13:35:26 CET,Tue Nov 30 15:35:47 CET,0.0 1.187 1.647 2.003 2.301 2.552 2.784 3.006 3.397 3.576 3.76 4.057 4.236 4.373 4.647 4.905 5.142 5.253 5.473 5.69 5.999 6.203 6.405 6.704 6.999 7.279 7.542 7.786 8.12 8.468 8.787 9.142 9.488 9.824 10.207 10.654 11.108 11.598 12.103 12.648 13.269 13.934 14.669 15.453 16.347 17.317 18.463 19.79 21.351 23.186 25.425 27.281 28.35 28.996 29.377 29.621 29.74 29.752 29.732 29.716 29.649 29.517 29.403 29.304 29.176 29.06 28.95 28.845 28.741 28.587 28.434 28.316 28.186 28.058 27.964 27.852 27.71 27.557 27.402 27.288 27.157 26.97 26.842 26.689 26.608 26.449 26.288 26.113 26.014 25.892 25.668 25.538 25.406 25.135 24.975 24.803 24.614 24.388 24.124 23.771 22.752 -6 ,5491 ,TETRA ,17618274,Tue Nov 30 13:36:23 CET,Tue Nov 30 15:17:46 CET,0.0 1.138 1.561 1.875 2.162 2.422 2.644 2.853 3.235 3.407 3.57 3.835 4.027 4.164 4.424 4.69 4.938 5.055 5.279 5.492 5.807 6.015 6.215 6.51 6.798 7.062 7.311 7.557 7.873 8.188 8.515 8.913 9.297 9.671 10.077 10.518 10.936 11.378 11.88 12.431 13.0 13.634 14.38 15.125 15.971 16.952 18.133 19.456 21.012 22.906 25.214 27.114 28.225 28.882 29.248 29.478 29.653 29.765 29.79 29.773 29.717 29.627 29.548 29.448 29.335 29.215 29.08 28.982 28.883 28.762 28.633 28.511 28.379 28.243 28.136 28.01 27.875 27.743 27.597 27.487 27.368 27.174 27.041 26.903 26.826 26.653 26.477 26.299 26.197 26.079 25.869 25.749 25.627 25.355 25.199 25.015 24.807 24.562 24.232 23.768 22.131 -7 ,4646 ,TETRA ,17618275,Tue Nov 30 13:36:23 CET,Tue Nov 30 15:29:54 CET,0.0 1.015 1.442 1.799 2.107 2.379 2.607 2.823 3.226 3.403 3.575 3.86 4.055 4.201 4.474 4.744 4.994 5.112 5.35 5.57 5.881 6.088 6.284 6.563 6.848 7.135 7.398 7.648 7.977 8.286 8.578 8.941 9.286 9.618 10.006 10.435 10.855 11.297 11.817 12.394 12.989 13.663 14.425 15.197 16.105 17.125 18.317 19.65 21.204 23.124 25.449 27.322 28.395 29.059 29.433 29.672 29.827 29.873 29.858 29.79 29.716 29.627 29.53 29.44 29.341 29.244 29.11 28.994 28.892 28.766 28.625 28.504 28.377 28.234 28.115 27.991 27.854 27.692 27.545 27.453 27.34 27.153 27.025 26.897 26.818 26.641 26.464 26.258 26.156 26.042 25.832 25.708 25.569 25.257 25.074 24.885 24.691 24.487 24.236 23.879 23.019 -8 ,1001 ,TETRA ,17618276,Tue Nov 30 13:36:23 CET,Tue Nov 30 15:21:56 CET,0.0 0.915 1.344 1.678 1.965 2.194 2.406 2.6 2.941 3.107 3.267 3.519 3.693 3.833 4.103 4.355 4.608 4.73 4.96 5.178 5.497 5.721 5.941 6.234 6.507 6.772 7.033 7.283 7.628 7.963 8.264 8.627 8.984 9.346 9.773 10.254 10.71 11.178 11.685 12.237 12.812 13.453 14.203 14.981 15.888 16.885 18.05 19.391 20.99 22.891 25.201 27.084 28.109 28.726 29.124 29.364 29.52 29.593 29.595 29.542 29.475 29.419 29.346 29.26 29.16 29.039 28.901 28.763 28.624 28.489 28.347 28.214 28.073 27.95 27.857 27.734 27.576 27.414 27.259 27.148 27.031 26.846 26.705 26.561 26.487 26.315 26.139 25.958 25.86 25.748 25.557 25.447 25.318 25.02 24.859 24.673 24.464 24.219 23.919 23.528 21.786 -9 ,27274 ,TETRA ,17618277,Tue Nov 30 13:36:26 CET,Tue Nov 30 15:22:11 CET,0.0 0.927 1.369 1.691 1.949 2.189 2.406 2.598 2.943 3.108 3.278 3.555 3.738 3.876 4.142 4.394 4.632 4.744 4.96 5.182 5.511 5.721 5.921 6.209 6.483 6.753 7.019 7.273 7.588 7.899 8.221 8.606 8.987 9.338 9.726 10.19 10.647 11.152 11.692 12.284 12.929 13.639 14.436 15.203 16.083 17.06 18.239 19.603 21.182 23.079 25.354 27.23 28.338 29.024 29.452 29.7 29.8 29.83 29.83 29.817 29.8 29.753 29.671 29.585 29.474 29.336 29.202 29.073 28.934 28.805 28.663 28.521 28.386 28.261 28.159 28.043 27.926 27.808 27.66 27.537 27.419 27.243 27.113 26.975 26.905 26.773 26.615 26.431 26.321 26.196 25.981 25.848 25.724 25.447 25.273 25.099 24.9 24.667 24.391 23.995 22.934 -10 ,3583 ,TETRA ,17618278,Tue Nov 30 13:36:24 CET,Tue Nov 30 15:23:39 CET,0.0 1.489 2.033 2.417 2.725 2.996 3.235 3.446 3.828 4.013 4.191 4.473 4.653 4.793 5.074 5.33 5.562 5.676 5.905 6.138 6.47 6.674 6.87 7.166 7.454 7.725 7.998 8.275 8.606 8.922 9.237 9.603 9.957 10.304 10.686 11.095 11.496 11.961 12.445 12.958 13.535 14.174 14.922 15.675 16.556 17.553 18.692 19.976 21.545 23.458 25.738 27.609 28.674 29.298 29.722 30.002 30.117 30.181 30.233 30.236 30.199 30.124 30.01 29.884 29.754 29.616 29.481 29.358 29.225 29.079 28.927 28.805 28.68 28.548 28.441 28.318 28.176 28.027 27.874 27.759 27.641 27.466 27.33 27.182 27.105 26.926 26.727 26.524 26.422 26.309 26.107 25.983 25.838 25.488 25.293 25.077 24.856 24.609 24.306 23.917 22.547 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_43_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_43_31.txt deleted file mode 100644 index 29c26a80..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_43_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23098 ,TETRA ,17618279,Tue Nov 30 13:36:26 CET,Tue Nov 30 15:22:41 CET,0.0 1.446 1.817 2.067 2.273 2.468 2.638 2.779 3.011 3.121 3.223 3.395 3.496 3.582 3.739 3.877 4.011 4.074 4.185 4.287 4.422 4.498 4.569 4.665 4.762 4.857 4.946 5.029 5.12 5.208 5.292 5.376 5.444 5.51 5.583 5.644 5.688 5.734 5.778 5.79 5.788 5.763 5.685 5.599 5.455 5.211 4.835 4.283 3.386 1.934 -0.546 -3.491 -5.81 -7.743 -9.447 -10.929 -12.163 -13.267 -14.211 -15.121 -15.899 -16.582 -17.217 -17.805 -18.352 -18.855 -19.364 -19.795 -20.163 -20.546 -20.951 -21.278 -21.603 -21.945 -22.21 -22.488 -22.783 -23.083 -23.396 -23.613 -23.826 -24.166 -24.414 -24.664 -24.79 -25.047 -25.329 -25.639 -25.791 -25.98 -26.242 -26.42 -26.614 -27.018 -27.241 -27.481 -27.734 -28.012 -28.345 -28.808 -30.219 -2 ,12336 ,TETRA ,17618280,Tue Nov 30 13:36:23 CET,Tue Nov 30 15:24:28 CET,0.0 1.187 1.483 1.733 1.948 2.124 2.27 2.406 2.639 2.74 2.84 3.003 3.105 3.185 3.314 3.439 3.548 3.598 3.702 3.796 3.937 4.026 4.091 4.186 4.282 4.372 4.456 4.531 4.623 4.711 4.777 4.853 4.927 4.987 5.048 5.107 5.159 5.202 5.228 5.231 5.206 5.188 5.161 5.064 4.883 4.617 4.195 3.556 2.595 1.096 -1.37 -4.281 -6.755 -8.768 -10.372 -11.786 -12.988 -14.026 -14.934 -15.849 -16.592 -17.225 -17.833 -18.422 -18.975 -19.469 -19.968 -20.409 -20.796 -21.193 -21.607 -21.941 -22.276 -22.632 -22.907 -23.183 -23.473 -23.776 -24.083 -24.296 -24.507 -24.826 -25.05 -25.29 -25.418 -25.689 -25.972 -26.246 -26.385 -26.574 -26.84 -27.01 -27.197 -27.591 -27.809 -28.048 -28.309 -28.596 -28.925 -29.35 -30.587 -3 ,23137 ,TETRA ,17618281,Tue Nov 30 13:36:25 CET,Tue Nov 30 15:25:48 CET,0.0 1.08 1.432 1.68 1.872 2.035 2.184 2.319 2.537 2.628 2.726 2.896 2.995 3.071 3.206 3.335 3.458 3.515 3.622 3.721 3.848 3.926 4.01 4.127 4.232 4.323 4.393 4.468 4.565 4.643 4.706 4.777 4.851 4.904 4.948 5.001 5.046 5.088 5.115 5.136 5.147 5.128 5.063 4.951 4.768 4.522 4.129 3.506 2.574 1.141 -1.301 -4.257 -6.65 -8.713 -10.451 -11.891 -13.094 -14.161 -15.061 -15.936 -16.678 -17.326 -17.932 -18.5 -19.035 -19.519 -20.002 -20.433 -20.805 -21.185 -21.584 -21.911 -22.25 -22.609 -22.881 -23.161 -23.458 -23.76 -24.067 -24.28 -24.494 -24.828 -25.069 -25.317 -25.439 -25.683 -25.955 -26.243 -26.388 -26.58 -26.846 -27.01 -27.191 -27.577 -27.794 -28.037 -28.305 -28.608 -28.961 -29.417 -30.617 -4 ,5773 ,TETRA ,17618282,Tue Nov 30 13:36:24 CET,Tue Nov 30 15:23:43 CET,0.0 1.251 1.596 1.864 2.072 2.26 2.412 2.54 2.773 2.871 2.957 3.116 3.217 3.291 3.416 3.531 3.635 3.683 3.783 3.878 4.02 4.112 4.19 4.294 4.393 4.495 4.586 4.665 4.766 4.858 4.945 5.027 5.095 5.165 5.236 5.3 5.353 5.407 5.442 5.467 5.48 5.459 5.375 5.248 5.072 4.814 4.408 3.782 2.859 1.405 -1.122 -4.031 -6.42 -8.431 -10.08 -11.547 -12.808 -13.891 -14.824 -15.747 -16.502 -17.169 -17.78 -18.339 -18.859 -19.338 -19.849 -20.301 -20.684 -21.069 -21.474 -21.825 -22.186 -22.543 -22.812 -23.086 -23.363 -23.66 -23.972 -24.181 -24.397 -24.746 -24.989 -25.23 -25.358 -25.618 -25.892 -26.19 -26.351 -26.557 -26.85 -27.014 -27.189 -27.588 -27.803 -28.036 -28.282 -28.566 -28.908 -29.369 -30.857 -5 ,12554 ,TETRA ,17618283,Tue Nov 30 13:37:25 CET,Tue Nov 30 15:24:45 CET,0.0 1.098 1.462 1.732 1.947 2.148 2.317 2.454 2.694 2.812 2.917 3.072 3.163 3.236 3.378 3.504 3.621 3.674 3.772 3.862 4.001 4.103 4.184 4.271 4.369 4.467 4.554 4.638 4.746 4.843 4.923 5.005 5.082 5.146 5.207 5.271 5.318 5.349 5.359 5.358 5.343 5.304 5.232 5.128 4.953 4.66 4.196 3.574 2.71 1.287 -1.181 -4.048 -6.453 -8.47 -10.063 -11.448 -12.631 -13.696 -14.627 -15.531 -16.296 -16.952 -17.568 -18.149 -18.691 -19.181 -19.679 -20.121 -20.491 -20.877 -21.286 -21.617 -21.964 -22.328 -22.602 -22.88 -23.165 -23.455 -23.753 -23.959 -24.175 -24.501 -24.728 -24.971 -25.093 -25.362 -25.646 -25.92 -26.057 -26.242 -26.51 -26.685 -26.876 -27.264 -27.462 -27.691 -27.948 -28.248 -28.636 -29.136 -30.494 -6 ,22809 ,TETRA ,17618284,Tue Nov 30 13:37:25 CET,Tue Nov 30 15:24:57 CET,0.0 1.07 1.421 1.679 1.878 2.048 2.198 2.332 2.591 2.697 2.784 2.935 3.024 3.094 3.229 3.36 3.473 3.524 3.626 3.722 3.843 3.918 4.0 4.12 4.222 4.308 4.385 4.464 4.564 4.637 4.699 4.786 4.874 4.946 5.011 5.073 5.123 5.167 5.209 5.237 5.232 5.201 5.123 5.002 4.82 4.555 4.17 3.561 2.611 1.15 -1.29 -4.184 -6.55 -8.506 -10.145 -11.586 -12.847 -13.934 -14.834 -15.736 -16.495 -17.161 -17.793 -18.382 -18.923 -19.404 -19.902 -20.358 -20.754 -21.151 -21.542 -21.867 -22.211 -22.562 -22.831 -23.099 -23.378 -23.679 -23.98 -24.192 -24.411 -24.744 -24.98 -25.222 -25.352 -25.617 -25.884 -26.17 -26.326 -26.53 -26.822 -26.994 -27.165 -27.536 -27.754 -28.006 -28.289 -28.609 -28.954 -29.366 -30.793 -7 ,26241 ,TETRA ,17618285,Tue Nov 30 13:37:25 CET,Tue Nov 30 15:24:17 CET,0.0 1.217 1.558 1.808 2.0 2.179 2.336 2.47 2.706 2.809 2.902 3.073 3.169 3.246 3.398 3.532 3.662 3.723 3.829 3.928 4.058 4.131 4.203 4.31 4.406 4.496 4.578 4.654 4.749 4.841 4.924 5.011 5.085 5.153 5.208 5.249 5.286 5.335 5.373 5.389 5.394 5.361 5.279 5.169 4.984 4.712 4.317 3.721 2.878 1.568 -0.813 -3.796 -6.183 -8.166 -9.835 -11.29 -12.541 -13.65 -14.571 -15.467 -16.231 -16.889 -17.508 -18.094 -18.624 -19.105 -19.616 -20.058 -20.432 -20.834 -21.235 -21.546 -21.878 -22.241 -22.52 -22.795 -23.08 -23.379 -23.685 -23.895 -24.117 -24.461 -24.692 -24.933 -25.057 -25.317 -25.594 -25.874 -26.013 -26.203 -26.476 -26.641 -26.825 -27.217 -27.423 -27.655 -27.889 -28.16 -28.515 -28.968 -30.275 -8 ,24012 ,TETRA ,17618286,Tue Nov 30 13:37:25 CET,Tue Nov 30 15:24:05 CET,0.0 0.921 1.244 1.485 1.684 1.857 1.994 2.128 2.365 2.467 2.562 2.718 2.804 2.872 2.996 3.118 3.24 3.298 3.397 3.492 3.634 3.721 3.801 3.91 4.001 4.089 4.174 4.246 4.339 4.426 4.499 4.575 4.634 4.687 4.754 4.824 4.887 4.932 4.956 4.972 4.977 4.965 4.902 4.794 4.634 4.363 3.969 3.394 2.459 1.04 -1.346 -4.317 -6.776 -8.796 -10.482 -11.901 -13.111 -14.253 -15.212 -16.106 -16.852 -17.515 -18.136 -18.704 -19.228 -19.699 -20.175 -20.601 -20.988 -21.396 -21.805 -22.142 -22.485 -22.841 -23.116 -23.395 -23.677 -23.968 -24.282 -24.499 -24.727 -25.076 -25.307 -25.55 -25.678 -25.932 -26.184 -26.463 -26.609 -26.806 -27.094 -27.272 -27.456 -27.84 -28.061 -28.303 -28.559 -28.863 -29.222 -29.69 -31.198 -9 ,10556 ,TETRA ,17618287,Tue Nov 30 13:37:25 CET,Tue Nov 30 15:24:31 CET,0.0 1.144 1.473 1.707 1.883 2.051 2.199 2.323 2.548 2.643 2.734 2.883 2.975 3.052 3.193 3.323 3.443 3.498 3.591 3.671 3.793 3.872 3.943 4.052 4.152 4.242 4.33 4.406 4.5 4.579 4.641 4.719 4.788 4.85 4.92 4.997 5.055 5.088 5.115 5.137 5.139 5.095 5.0 4.882 4.7 4.424 3.992 3.364 2.457 1.012 -1.501 -4.492 -6.924 -8.904 -10.577 -12.034 -13.287 -14.391 -15.3 -16.198 -16.961 -17.646 -18.285 -18.861 -19.402 -19.893 -20.384 -20.821 -21.201 -21.585 -21.974 -22.302 -22.643 -22.976 -23.246 -23.525 -23.801 -24.1 -24.411 -24.619 -24.835 -25.17 -25.4 -25.64 -25.766 -26.03 -26.304 -26.584 -26.728 -26.921 -27.197 -27.36 -27.541 -27.948 -28.169 -28.412 -28.674 -28.96 -29.302 -29.826 -31.411 -10 ,13638 ,TETRA ,17618288,Tue Nov 30 13:38:26 CET,Tue Nov 30 15:26:31 CET,0.0 1.051 1.388 1.655 1.865 2.037 2.199 2.344 2.574 2.684 2.788 2.953 3.045 3.129 3.285 3.41 3.524 3.578 3.673 3.763 3.906 3.992 4.069 4.177 4.287 4.382 4.455 4.53 4.625 4.702 4.773 4.865 4.938 4.997 5.063 5.138 5.197 5.246 5.28 5.284 5.285 5.263 5.189 5.077 4.907 4.647 4.241 3.668 2.772 1.326 -1.157 -4.165 -6.654 -8.719 -10.459 -11.932 -13.134 -14.212 -15.149 -16.041 -16.795 -17.483 -18.12 -18.701 -19.232 -19.704 -20.203 -20.642 -21.018 -21.413 -21.829 -22.166 -22.503 -22.854 -23.13 -23.418 -23.711 -23.999 -24.307 -24.526 -24.748 -25.087 -25.318 -25.56 -25.684 -25.93 -26.209 -26.51 -26.657 -26.854 -27.144 -27.319 -27.498 -27.886 -28.1 -28.339 -28.609 -28.908 -29.278 -29.777 -31.022 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_54_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_54_50.txt deleted file mode 100644 index abfe89a7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_54_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11353 ,TETRA ,17618289,Tue Nov 30 13:38:25 CET,Tue Nov 30 15:32:08 CET,0.0 0.962 1.276 1.494 1.665 1.806 1.929 2.047 2.262 2.364 2.459 2.476 2.724 2.802 2.95 3.099 3.241 3.312 3.462 3.601 3.789 3.911 4.029 4.199 4.369 4.535 4.691 4.837 5.017 5.184 5.337 5.529 5.729 5.914 6.127 6.364 6.564 6.792 7.049 7.303 7.553 7.834 8.145 8.433 8.755 9.062 9.369 9.66 9.887 9.94 9.451 8.517 7.61 6.7 5.872 5.117 4.436 3.78 3.16 2.529 2.007 1.553 1.098 0.654 0.239 -0.141 -0.519 -0.867 -1.189 -1.528 -1.875 -2.151 -2.434 -2.735 -2.969 -3.204 -3.459 -3.727 -4.006 -4.201 -4.394 -4.707 -4.929 -5.157 -5.27 -5.509 -5.778 -6.055 -6.197 -6.512 -6.672 -6.853 -7.047 -7.443 -7.665 -7.909 -8.166 -8.467 -8.84 -9.398 -11.207 -2 ,6234 ,TETRA ,17618290,Tue Nov 30 13:38:25 CET,Tue Nov 30 15:26:53 CET,0.0 0.913 1.204 1.428 1.615 1.772 1.906 2.029 2.246 2.337 2.424 2.429 2.672 2.755 2.907 3.04 3.181 3.258 3.399 3.524 3.712 3.846 3.972 4.149 4.333 4.509 4.662 4.798 4.972 5.146 5.311 5.502 5.683 5.858 6.056 6.276 6.49 6.727 6.971 7.228 7.501 7.798 8.107 8.392 8.71 9.009 9.332 9.639 9.862 9.948 9.597 8.701 7.759 6.884 6.09 5.309 4.61 4.001 3.458 2.86 2.321 1.855 1.39 0.93 0.504 0.134 -0.237 -0.589 -0.897 -1.202 -1.533 -1.808 -2.081 -2.369 -2.604 -2.864 -3.129 -3.399 -3.67 -3.846 -4.022 -4.304 -4.513 -4.733 -4.839 -5.042 -5.249 -5.476 -5.605 -5.903 -6.025 -6.166 -6.314 -6.662 -6.849 -7.041 -7.248 -7.5 -7.822 -8.304 -9.699 -3 ,696 ,TETRA ,17618291,Tue Nov 30 13:38:26 CET,Tue Nov 30 15:26:42 CET,0.0 1.031 1.287 1.489 1.658 1.804 1.939 2.075 2.317 2.427 2.537 2.581 2.837 2.944 3.147 3.319 3.48 3.559 3.715 3.847 4.034 4.157 4.274 4.45 4.61 4.761 4.912 5.06 5.262 5.447 5.613 5.811 5.999 6.176 6.381 6.619 6.849 7.087 7.325 7.582 7.835 8.081 8.33 8.602 8.945 9.279 9.626 9.924 10.12 10.176 9.808 9.003 8.086 7.157 6.331 5.566 4.831 4.141 3.558 2.999 2.505 2.045 1.587 1.157 0.763 0.397 0.025 -0.326 -0.635 -0.948 -1.276 -1.554 -1.848 -2.156 -2.399 -2.644 -2.88 -3.11 -3.346 -3.519 -3.694 -3.956 -4.141 -4.34 -4.446 -4.662 -4.874 -5.094 -5.222 -5.518 -5.617 -5.762 -5.916 -6.269 -6.468 -6.667 -6.906 -7.196 -7.506 -7.91 -9.609 -4 ,20585 ,TETRA ,17618292,Tue Nov 30 13:39:23 CET,Tue Nov 30 15:25:55 CET,0.0 1.302 1.638 1.875 2.075 2.271 2.44 2.585 2.853 2.969 3.066 3.087 3.333 3.423 3.613 3.776 3.918 3.991 4.127 4.262 4.464 4.591 4.713 4.891 5.069 5.231 5.377 5.523 5.716 5.904 6.076 6.28 6.48 6.67 6.877 7.097 7.307 7.536 7.78 8.026 8.26 8.515 8.831 9.133 9.438 9.719 10.041 10.36 10.564 10.583 10.267 9.434 8.474 7.589 6.8 6.049 5.357 4.717 4.15 3.585 3.098 2.619 2.165 1.751 1.346 0.976 0.602 0.265 -0.035 -0.338 -0.642 -0.901 -1.188 -1.497 -1.725 -1.959 -2.22 -2.481 -2.753 -2.943 -3.133 -3.42 -3.609 -3.798 -3.898 -4.117 -4.342 -4.578 -4.694 -4.971 -5.079 -5.225 -5.376 -5.698 -5.887 -6.111 -6.341 -6.595 -6.91 -7.313 -8.678 -5 ,13976 ,TETRA ,17618293,Tue Nov 30 13:39:25 CET,Tue Nov 30 15:26:14 CET,0.0 1.036 1.365 1.647 1.871 2.052 2.212 2.355 2.604 2.722 2.837 2.874 3.118 3.205 3.381 3.553 3.708 3.785 3.932 4.059 4.249 4.37 4.481 4.647 4.813 4.97 5.119 5.265 5.444 5.607 5.765 5.952 6.128 6.305 6.514 6.741 6.944 7.16 7.377 7.597 7.82 8.035 8.275 8.525 8.792 9.041 9.287 9.503 9.626 9.54 8.977 7.936 6.83 5.783 4.9 4.112 3.384 2.699 2.11 1.502 0.974 0.5 0.034 -0.4 -0.787 -1.152 -1.55 -1.884 -2.173 -2.481 -2.804 -3.076 -3.348 -3.649 -3.889 -4.127 -4.374 -4.643 -4.935 -5.128 -5.321 -5.634 -5.848 -6.078 -6.204 -6.467 -6.745 -7.023 -7.168 -7.495 -7.683 -7.862 -8.047 -8.439 -8.668 -8.929 -9.236 -9.598 -10.018 -10.608 -12.832 -6 ,30796 ,TETRA ,17618294,Tue Nov 30 13:39:23 CET,Tue Nov 30 15:25:11 CET,0.0 0.893 1.165 1.373 1.535 1.675 1.804 1.921 2.123 2.211 2.306 2.334 2.572 2.65 2.812 2.957 3.083 3.145 3.259 3.369 3.533 3.64 3.746 3.889 4.019 4.156 4.289 4.409 4.567 4.718 4.86 5.042 5.224 5.41 5.628 5.853 6.065 6.291 6.524 6.768 7.019 7.283 7.571 7.865 8.179 8.495 8.822 9.077 9.301 9.373 9.02 8.237 7.334 6.435 5.588 4.81 4.127 3.498 2.958 2.387 1.899 1.48 1.081 0.7 0.335 0.002 -0.355 -0.671 -0.941 -1.219 -1.509 -1.762 -2.026 -2.297 -2.506 -2.714 -2.93 -3.159 -3.411 -3.595 -3.778 -4.052 -4.24 -4.434 -4.537 -4.757 -4.979 -5.21 -5.339 -5.634 -5.745 -5.886 -6.032 -6.361 -6.563 -6.806 -7.094 -7.423 -7.816 -8.374 -9.853 -7 ,14612 ,TETRA ,17618295,Tue Nov 30 13:39:23 CET,Tue Nov 30 15:17:21 CET,0.0 1.035 1.323 1.532 1.692 1.839 1.973 2.101 2.326 2.425 2.527 2.556 2.801 2.88 3.031 3.173 3.3 3.359 3.474 3.589 3.75 3.85 3.947 4.101 4.248 4.383 4.511 4.627 4.779 4.933 5.083 5.257 5.443 5.628 5.829 6.064 6.292 6.53 6.764 7.015 7.277 7.557 7.858 8.14 8.453 8.771 9.093 9.396 9.592 9.62 9.282 8.463 7.61 6.771 5.956 5.193 4.516 3.889 3.322 2.742 2.256 1.829 1.406 0.995 0.608 0.252 -0.128 -0.469 -0.752 -1.063 -1.398 -1.664 -1.937 -2.204 -2.407 -2.629 -2.853 -3.079 -3.323 -3.486 -3.643 -3.898 -4.081 -4.271 -4.368 -4.566 -4.77 -5.0 -5.128 -5.424 -5.553 -5.695 -5.841 -6.171 -6.348 -6.545 -6.768 -7.023 -7.339 -7.739 -8.859 -8 ,12015 ,TETRA ,17618296,Tue Nov 30 13:40:21 CET,Tue Nov 30 15:26:17 CET,0.0 0.935 1.19 1.381 1.545 1.691 1.823 1.943 2.155 2.253 2.345 2.366 2.612 2.691 2.845 3.013 3.18 3.26 3.411 3.551 3.753 3.876 3.994 4.159 4.31 4.46 4.604 4.743 4.925 5.101 5.262 5.46 5.656 5.834 6.041 6.273 6.493 6.737 6.987 7.229 7.483 7.763 8.073 8.383 8.693 8.976 9.322 9.643 9.848 9.895 9.542 8.703 7.775 6.89 6.123 5.382 4.66 4.002 3.453 2.881 2.364 1.904 1.462 1.023 0.617 0.273 -0.082 -0.407 -0.688 -0.988 -1.301 -1.564 -1.839 -2.126 -2.357 -2.603 -2.854 -3.114 -3.392 -3.582 -3.78 -4.087 -4.302 -4.53 -4.647 -4.889 -5.141 -5.419 -5.57 -5.893 -6.062 -6.222 -6.404 -6.816 -7.047 -7.31 -7.61 -7.98 -8.396 -8.916 -10.378 -9 ,30405 ,TETRA ,17618297,Tue Nov 30 13:40:23 CET,Tue Nov 30 15:26:25 CET,0.0 0.768 1.052 1.265 1.418 1.562 1.706 1.854 2.127 2.248 2.365 2.41 2.661 2.755 2.931 3.09 3.239 3.314 3.453 3.585 3.788 3.912 4.029 4.196 4.359 4.526 4.678 4.822 5.02 5.203 5.37 5.577 5.773 5.947 6.138 6.37 6.586 6.82 7.071 7.309 7.567 7.858 8.182 8.506 8.844 9.186 9.547 9.803 9.974 10.039 9.74 8.943 7.951 7.003 6.18 5.401 4.697 4.086 3.535 2.926 2.399 1.932 1.476 1.045 0.646 0.278 -0.072 -0.379 -0.662 -0.978 -1.327 -1.601 -1.89 -2.189 -2.422 -2.663 -2.904 -3.157 -3.402 -3.568 -3.737 -3.994 -4.178 -4.381 -4.489 -4.706 -4.936 -5.182 -5.308 -5.598 -5.684 -5.82 -5.973 -6.309 -6.496 -6.695 -6.908 -7.141 -7.45 -7.912 -9.644 -10 ,5884 ,TETRA ,17618298,Tue Nov 30 13:40:21 CET,Tue Nov 30 15:26:35 CET,0.0 0.974 1.261 1.463 1.623 1.76 1.884 1.999 2.219 2.317 2.409 2.425 2.673 2.761 2.944 3.116 3.271 3.347 3.489 3.628 3.82 3.94 4.057 4.224 4.379 4.53 4.686 4.832 5.018 5.195 5.365 5.564 5.746 5.925 6.132 6.378 6.609 6.841 7.075 7.308 7.558 7.848 8.174 8.471 8.799 9.164 9.527 9.819 9.999 10.028 9.694 8.83 7.897 7.067 6.32 5.591 4.921 4.281 3.675 3.041 2.519 2.073 1.636 1.195 0.79 0.439 0.075 -0.247 -0.531 -0.844 -1.166 -1.426 -1.71 -2.013 -2.236 -2.472 -2.728 -3.0 -3.274 -3.45 -3.64 -3.96 -4.181 -4.408 -4.522 -4.738 -4.972 -5.233 -5.375 -5.688 -5.868 -6.049 -6.236 -6.664 -6.902 -7.15 -7.433 -7.758 -8.159 -8.701 -10.662 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_57_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_57_155.txt deleted file mode 100644 index 1fc5c415..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_57_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1754 ,TETRA ,17618299,Tue Nov 30 13:40:22 CET,Tue Nov 30 15:27:59 CET,0.0 0.678 0.963 1.173 1.339 1.468 1.558 1.641 1.807 1.881 1.951 2.091 2.14 2.187 2.284 2.379 2.458 2.494 2.557 2.604 2.663 2.693 2.715 2.742 2.771 2.788 2.774 2.765 2.788 2.809 2.796 2.738 2.678 2.628 2.547 2.448 2.339 2.181 1.974 1.744 1.474 1.119 0.683 0.225 -0.369 -1.159 -2.219 -3.592 -5.486 -8.205 -12.379 -16.901 -20.333 -23.026 -25.173 -27.019 -28.585 -29.946 -31.087 -32.193 -33.125 -33.942 -34.74 -35.495 -36.144 -36.696 -37.266 -37.768 -38.212 -38.688 -39.17 -39.546 -39.916 -40.306 -40.609 -40.922 -41.253 -41.579 -41.898 -42.123 -42.367 -42.717 -42.941 -43.187 -43.321 -43.602 -43.879 -44.155 -44.298 -44.492 -44.749 -44.897 -45.066 -45.454 -45.657 -45.873 -46.115 -46.385 -46.699 -47.065 -48.089 -2 ,31203 ,TETRA ,17618300,Tue Nov 30 13:40:22 CET,Tue Nov 30 15:27:23 CET,0.0 0.971 1.264 1.466 1.618 1.748 1.861 1.951 2.088 2.144 2.204 2.311 2.348 2.389 2.466 2.534 2.608 2.646 2.706 2.759 2.84 2.88 2.918 2.982 3.007 3.028 3.066 3.088 3.1 3.104 3.094 3.052 3.0 2.973 2.938 2.844 2.741 2.609 2.434 2.238 1.988 1.646 1.188 0.685 0.09 -0.627 -1.662 -3.068 -4.968 -7.629 -11.74 -16.344 -19.828 -22.517 -24.712 -26.598 -28.26 -29.701 -30.836 -31.956 -32.886 -33.664 -34.436 -35.199 -35.88 -36.471 -37.076 -37.584 -38.007 -38.449 -38.883 -39.23 -39.584 -39.951 -40.229 -40.514 -40.812 -41.117 -41.436 -41.666 -41.908 -42.258 -42.494 -42.736 -42.859 -43.111 -43.375 -43.673 -43.825 -44.015 -44.299 -44.462 -44.624 -44.971 -45.153 -45.346 -45.563 -45.822 -46.17 -46.608 -47.617 -3 ,14836 ,TETRA ,17618301,Tue Nov 30 13:40:22 CET,Tue Nov 30 15:27:54 CET,0.0 0.601 0.827 1.009 1.162 1.277 1.388 1.488 1.624 1.682 1.737 1.851 1.895 1.938 2.007 2.07 2.126 2.151 2.202 2.253 2.311 2.334 2.369 2.437 2.493 2.536 2.566 2.589 2.597 2.598 2.596 2.564 2.506 2.44 2.355 2.249 2.146 2.02 1.852 1.64 1.375 1.035 0.595 0.091 -0.563 -1.364 -2.419 -3.808 -5.695 -8.408 -12.586 -17.099 -20.473 -23.176 -25.379 -27.238 -28.788 -30.134 -31.274 -32.374 -33.28 -34.097 -34.862 -35.551 -36.179 -36.735 -37.315 -37.84 -38.299 -38.777 -39.254 -39.62 -39.993 -40.376 -40.681 -41.005 -41.323 -41.646 -41.966 -42.177 -42.395 -42.743 -42.993 -43.255 -43.395 -43.683 -43.974 -44.277 -44.433 -44.629 -44.892 -45.059 -45.229 -45.631 -45.854 -46.082 -46.318 -46.558 -46.844 -47.259 -48.382 -4 ,1572 ,TETRA ,17618302,Tue Nov 30 13:40:24 CET,Tue Nov 30 15:27:47 CET,0.0 0.762 1.054 1.275 1.445 1.601 1.73 1.827 1.969 2.035 2.111 2.267 2.318 2.368 2.459 2.523 2.579 2.606 2.647 2.675 2.729 2.763 2.78 2.819 2.855 2.862 2.854 2.837 2.805 2.772 2.73 2.68 2.628 2.557 2.483 2.385 2.274 2.143 1.987 1.796 1.564 1.257 0.823 0.345 -0.273 -1.094 -2.157 -3.512 -5.411 -8.163 -12.402 -16.943 -20.334 -23.053 -25.277 -27.189 -28.775 -30.142 -31.316 -32.472 -33.414 -34.215 -34.956 -35.635 -36.295 -36.875 -37.451 -37.976 -38.417 -38.852 -39.289 -39.647 -40.004 -40.384 -40.687 -40.999 -41.313 -41.619 -41.94 -42.16 -42.387 -42.747 -43.004 -43.279 -43.419 -43.707 -43.995 -44.298 -44.463 -44.669 -44.931 -45.089 -45.264 -45.674 -45.9 -46.124 -46.341 -46.582 -46.878 -47.275 -48.158 -5 ,8901 ,TETRA ,17618303,Tue Nov 30 13:40:22 CET,Tue Nov 30 15:28:03 CET,0.0 0.773 1.019 1.194 1.34 1.462 1.549 1.62 1.761 1.834 1.902 2.038 2.086 2.129 2.221 2.311 2.381 2.408 2.455 2.495 2.543 2.576 2.603 2.635 2.653 2.662 2.688 2.709 2.709 2.705 2.715 2.717 2.696 2.648 2.567 2.447 2.323 2.174 1.976 1.754 1.507 1.184 0.753 0.265 -0.368 -1.172 -2.253 -3.631 -5.514 -8.195 -12.324 -16.822 -20.186 -22.842 -24.997 -26.836 -28.389 -29.743 -30.869 -31.968 -32.875 -33.655 -34.384 -35.051 -35.662 -36.233 -36.815 -37.325 -37.794 -38.272 -38.762 -39.153 -39.531 -39.921 -40.223 -40.528 -40.843 -41.164 -41.484 -41.701 -41.928 -42.289 -42.546 -42.807 -42.937 -43.218 -43.511 -43.811 -43.964 -44.16 -44.452 -44.625 -44.794 -45.165 -45.373 -45.615 -45.876 -46.137 -46.431 -46.847 -47.904 -6 ,17866 ,TETRA ,17618304,Tue Nov 30 13:40:23 CET,Tue Nov 30 15:28:39 CET,0.0 0.774 1.032 1.215 1.371 1.516 1.641 1.736 1.888 1.949 2.0 2.1 2.147 2.204 2.305 2.389 2.463 2.493 2.555 2.608 2.66 2.695 2.728 2.768 2.799 2.839 2.876 2.885 2.885 2.88 2.872 2.884 2.863 2.801 2.72 2.607 2.467 2.303 2.142 1.944 1.69 1.364 0.961 0.506 -0.111 -0.892 -1.966 -3.342 -5.222 -7.926 -12.012 -16.421 -19.807 -22.53 -24.723 -26.57 -28.099 -29.444 -30.567 -31.651 -32.557 -33.351 -34.101 -34.784 -35.385 -35.924 -36.476 -36.953 -37.364 -37.787 -38.253 -38.639 -39.02 -39.417 -39.716 -40.014 -40.328 -40.646 -40.965 -41.181 -41.411 -41.797 -42.066 -42.323 -42.452 -42.735 -43.03 -43.334 -43.488 -43.687 -43.968 -44.146 -44.34 -44.763 -44.977 -45.19 -45.419 -45.694 -46.028 -46.42 -47.373 -7 ,31247 ,TETRA ,17618305,Tue Nov 30 13:40:23 CET,Tue Nov 30 15:30:16 CET,0.0 0.676 0.894 1.061 1.181 1.281 1.373 1.461 1.626 1.701 1.768 1.886 1.93 1.982 2.08 2.144 2.194 2.232 2.315 2.366 2.413 2.439 2.456 2.493 2.538 2.575 2.607 2.617 2.617 2.607 2.596 2.576 2.534 2.488 2.408 2.286 2.19 2.071 1.883 1.692 1.467 1.133 0.684 0.19 -0.451 -1.236 -2.276 -3.687 -5.61 -8.304 -12.451 -16.924 -20.309 -23.011 -25.225 -27.106 -28.683 -30.059 -31.211 -32.317 -33.23 -34.033 -34.779 -35.463 -36.08 -36.644 -37.24 -37.751 -38.173 -38.617 -39.061 -39.408 -39.772 -40.152 -40.44 -40.743 -41.059 -41.38 -41.702 -41.927 -42.164 -42.518 -42.768 -43.022 -43.142 -43.393 -43.664 -43.944 -44.087 -44.274 -44.535 -44.693 -44.867 -45.269 -45.494 -45.72 -45.941 -46.213 -46.553 -46.963 -48.01 -8 ,27395 ,TETRA ,17618306,Tue Nov 30 13:41:28 CET,Tue Nov 30 15:31:32 CET,0.0 0.964 1.241 1.419 1.559 1.701 1.82 1.916 2.085 2.158 2.221 2.348 2.395 2.434 2.492 2.549 2.615 2.649 2.713 2.771 2.832 2.87 2.904 2.932 2.944 2.963 2.987 3.01 3.046 3.08 3.11 3.111 3.063 2.994 2.903 2.775 2.638 2.496 2.331 2.125 1.851 1.494 1.051 0.562 -0.064 -0.794 -1.778 -3.127 -4.974 -7.652 -11.788 -16.293 -19.693 -22.358 -24.548 -26.466 -28.068 -29.424 -30.553 -31.693 -32.649 -33.483 -34.252 -34.918 -35.517 -36.074 -36.658 -37.167 -37.602 -38.041 -38.474 -38.829 -39.199 -39.604 -39.934 -40.248 -40.557 -40.873 -41.189 -41.407 -41.635 -41.993 -42.244 -42.508 -42.639 -42.906 -43.171 -43.431 -43.57 -43.764 -44.051 -44.227 -44.411 -44.804 -45.021 -45.255 -45.511 -45.779 -46.09 -46.478 -47.545 -9 ,5089 ,TETRA ,17618307,Tue Nov 30 13:40:23 CET,Tue Nov 30 15:37:17 CET,0.0 0.983 1.322 1.575 1.754 1.899 2.015 2.116 2.29 2.368 2.444 2.583 2.632 2.682 2.779 2.864 2.925 2.947 2.982 3.014 3.07 3.112 3.149 3.186 3.202 3.202 3.196 3.191 3.174 3.143 3.107 3.051 2.991 2.938 2.891 2.812 2.69 2.553 2.385 2.167 1.908 1.596 1.192 0.72 0.107 -0.694 -1.781 -3.199 -5.147 -7.882 -11.992 -16.489 -19.98 -22.77 -25.005 -26.879 -28.41 -29.754 -30.906 -32.002 -32.909 -33.686 -34.394 -35.069 -35.69 -36.238 -36.8 -37.299 -37.724 -38.151 -38.604 -38.98 -39.367 -39.762 -40.068 -40.394 -40.715 -41.049 -41.409 -41.648 -41.875 -42.235 -42.503 -42.77 -42.905 -43.184 -43.462 -43.749 -43.913 -44.122 -44.385 -44.534 -44.703 -45.101 -45.316 -45.535 -45.78 -46.058 -46.368 -46.744 -47.639 -10 ,19401 ,TETRA ,17618308,Tue Nov 30 13:40:25 CET,Tue Nov 30 15:56:19 CET,0.0 0.848 1.136 1.351 1.502 1.637 1.751 1.836 1.971 2.026 2.074 2.169 2.213 2.259 2.34 2.402 2.478 2.515 2.566 2.614 2.679 2.721 2.753 2.795 2.839 2.878 2.9 2.912 2.944 2.954 2.943 2.914 2.861 2.793 2.701 2.597 2.497 2.362 2.173 1.964 1.733 1.451 1.045 0.554 -0.064 -0.861 -1.96 -3.365 -5.263 -8.004 -12.176 -16.684 -20.089 -22.811 -25.045 -26.933 -28.497 -29.833 -30.959 -32.05 -32.964 -33.766 -34.498 -35.163 -35.776 -36.332 -36.921 -37.472 -37.921 -38.341 -38.768 -39.113 -39.499 -39.915 -40.211 -40.5 -40.805 -41.12 -41.431 -41.644 -41.875 -42.244 -42.509 -42.783 -42.918 -43.188 -43.459 -43.746 -43.898 -44.105 -44.397 -44.557 -44.719 -45.077 -45.287 -45.502 -45.71 -45.974 -46.328 -46.748 -47.599 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_7a_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_7a_1.txt deleted file mode 100644 index 0cfe4323..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_7a_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12194 ,TETRA ,17618309,Tue Nov 30 13:40:27 CET,Tue Nov 30 15:30:03 CET,0.0 0.942 1.282 1.511 1.706 1.883 2.049 2.206 2.463 2.583 2.706 2.856 3.0 3.095 3.291 3.469 3.639 3.723 3.891 4.046 4.261 4.394 4.515 4.689 4.855 5.013 5.171 5.329 5.524 5.705 5.882 6.106 6.342 6.555 6.785 7.045 7.296 7.563 7.872 8.236 8.594 8.969 9.397 9.82 10.322 10.875 11.458 12.07 12.76 13.501 14.269 14.688 14.782 14.725 14.588 14.428 14.255 14.033 13.826 13.598 13.381 13.193 12.996 12.799 12.585 12.37 12.163 11.987 11.817 11.615 11.41 11.236 11.029 10.823 10.67 10.506 10.332 10.145 9.96 9.826 9.684 9.474 9.313 9.147 9.063 8.867 8.666 8.454 8.347 8.194 8.006 7.878 7.743 7.432 7.257 7.069 6.873 6.647 6.385 6.005 5.023 -2 ,7290 ,TETRA ,17618310,Tue Nov 30 13:41:29 CET,Tue Nov 30 15:29:38 CET,0.0 0.755 1.1 1.346 1.552 1.737 1.902 2.053 2.329 2.46 2.573 2.723 2.88 2.975 3.154 3.318 3.478 3.56 3.733 3.9 4.119 4.268 4.418 4.616 4.796 4.969 5.142 5.304 5.495 5.685 5.893 6.168 6.406 6.606 6.832 7.087 7.353 7.657 7.951 8.248 8.571 8.93 9.351 9.761 10.234 10.747 11.302 11.92 12.641 13.452 14.282 14.731 14.839 14.805 14.632 14.378 14.139 13.93 13.737 13.511 13.295 13.085 12.885 12.686 12.477 12.286 12.075 11.884 11.721 11.53 11.332 11.183 11.015 10.818 10.639 10.449 10.279 10.106 9.924 9.803 9.676 9.443 9.286 9.132 9.047 8.879 8.71 8.504 8.387 8.218 7.99 7.842 7.697 7.358 7.155 6.938 6.71 6.482 6.155 5.702 4.481 -3 ,8283 ,TETRA ,17618311,Tue Nov 30 13:41:29 CET,Tue Nov 30 15:29:40 CET,0.0 0.918 1.252 1.496 1.693 1.873 2.038 2.189 2.462 2.583 2.694 2.856 3.023 3.127 3.318 3.502 3.684 3.773 3.933 4.07 4.271 4.417 4.565 4.771 4.944 5.116 5.285 5.432 5.621 5.802 5.978 6.215 6.469 6.687 6.919 7.187 7.435 7.711 7.991 8.288 8.61 8.963 9.374 9.784 10.25 10.752 11.351 12.05 12.792 13.579 14.407 14.842 14.966 14.94 14.806 14.6 14.348 14.101 13.876 13.642 13.446 13.264 13.057 12.821 12.573 12.337 12.12 11.919 11.733 11.548 11.344 11.179 11.013 10.822 10.673 10.53 10.377 10.217 10.054 9.937 9.82 9.621 9.466 9.31 9.227 9.054 8.873 8.677 8.579 8.424 8.249 8.119 7.971 7.643 7.467 7.269 7.051 6.823 6.545 6.161 4.886 -4 ,14336 ,TETRA ,17618312,Tue Nov 30 13:41:29 CET,Tue Nov 30 15:29:58 CET,0.0 0.771 1.078 1.319 1.541 1.748 1.939 2.12 2.451 2.582 2.707 2.88 3.033 3.131 3.318 3.484 3.648 3.736 3.899 4.045 4.273 4.426 4.561 4.737 4.917 5.105 5.274 5.452 5.679 5.872 6.065 6.299 6.5 6.691 6.916 7.154 7.387 7.653 7.972 8.305 8.63 9.004 9.454 9.911 10.425 10.978 11.549 12.171 12.925 13.723 14.562 15.048 15.123 15.019 14.84 14.682 14.444 14.153 13.951 13.747 13.516 13.299 13.104 12.905 12.708 12.512 12.295 12.107 11.96 11.775 11.55 11.38 11.216 11.021 10.862 10.71 10.562 10.404 10.223 10.115 10.008 9.79 9.625 9.457 9.371 9.195 9.009 8.81 8.707 8.558 8.373 8.242 8.102 7.776 7.592 7.392 7.19 6.965 6.674 6.245 5.071 -5 ,4781 ,TETRA ,17618313,Tue Nov 30 13:41:29 CET,Tue Nov 30 15:29:39 CET,0.0 1.032 1.388 1.624 1.807 1.992 2.169 2.31 2.547 2.666 2.784 2.94 3.103 3.217 3.422 3.593 3.756 3.833 3.986 4.133 4.333 4.468 4.595 4.768 4.959 5.158 5.355 5.54 5.752 5.949 6.147 6.381 6.602 6.815 7.058 7.344 7.626 7.911 8.203 8.516 8.839 9.206 9.63 10.036 10.475 10.97 11.533 12.124 12.865 13.706 14.496 14.934 15.034 14.962 14.828 14.652 14.454 14.263 14.036 13.75 13.48 13.249 13.037 12.818 12.603 12.399 12.178 11.986 11.816 11.629 11.43 11.264 11.097 10.923 10.784 10.625 10.439 10.24 10.042 9.905 9.763 9.541 9.39 9.226 9.134 8.948 8.759 8.554 8.442 8.272 8.063 7.936 7.803 7.53 7.378 7.192 6.993 6.78 6.496 6.065 4.89 -6 ,3740 ,TETRA ,17618314,Tue Nov 30 13:41:28 CET,Tue Nov 30 15:29:47 CET,0.0 0.835 1.16 1.398 1.601 1.788 1.965 2.127 2.404 2.529 2.654 2.841 3.007 3.109 3.307 3.483 3.641 3.723 3.894 4.055 4.273 4.41 4.534 4.715 4.91 5.092 5.249 5.395 5.598 5.806 6.005 6.236 6.462 6.674 6.921 7.201 7.468 7.754 8.054 8.369 8.691 9.061 9.528 9.981 10.45 10.972 11.582 12.271 12.987 13.741 14.58 15.068 15.172 15.127 15.013 14.851 14.627 14.366 14.115 13.855 13.626 13.426 13.222 13.004 12.795 12.586 12.371 12.167 11.965 11.772 11.59 11.426 11.254 11.072 10.927 10.787 10.625 10.44 10.242 10.103 9.967 9.768 9.626 9.456 9.362 9.177 8.973 8.747 8.636 8.477 8.311 8.195 8.059 7.761 7.596 7.391 7.167 6.908 6.573 6.168 4.728 -7 ,18487 ,TETRA ,17618315,Tue Nov 30 13:41:30 CET,Tue Nov 30 15:34:21 CET,0.0 0.956 1.274 1.531 1.761 1.956 2.132 2.282 2.561 2.686 2.799 2.971 3.14 3.252 3.454 3.646 3.835 3.921 4.085 4.25 4.493 4.645 4.792 4.995 5.17 5.329 5.504 5.695 5.913 6.108 6.294 6.51 6.727 6.94 7.185 7.449 7.687 7.958 8.256 8.575 8.936 9.324 9.734 10.158 10.663 11.192 11.774 12.448 13.211 14.011 14.811 15.268 15.418 15.368 15.243 15.074 14.833 14.585 14.369 14.113 13.839 13.564 13.305 13.091 12.886 12.677 12.459 12.259 12.089 11.906 11.708 11.55 11.387 11.221 11.081 10.929 10.783 10.625 10.454 10.34 10.221 10.018 9.868 9.709 9.62 9.429 9.233 9.036 8.927 8.761 8.571 8.436 8.287 7.959 7.79 7.6 7.377 7.14 6.879 6.494 5.262 -8 ,21758 ,TETRA ,17618316,Tue Nov 30 13:41:30 CET,Tue Nov 30 15:32:49 CET,0.0 0.825 1.145 1.378 1.573 1.764 1.944 2.117 2.423 2.546 2.665 2.825 2.987 3.088 3.276 3.451 3.607 3.689 3.861 4.023 4.245 4.382 4.501 4.672 4.835 5.01 5.195 5.351 5.538 5.728 5.927 6.159 6.367 6.569 6.837 7.162 7.468 7.785 8.077 8.362 8.699 9.106 9.543 9.949 10.456 11.016 11.624 12.306 13.004 13.726 14.473 14.944 15.101 15.08 14.951 14.751 14.514 14.299 14.087 13.841 13.608 13.389 13.166 12.943 12.759 12.589 12.382 12.175 11.985 11.797 11.617 11.447 11.261 11.089 10.961 10.818 10.646 10.456 10.257 10.132 9.993 9.748 9.598 9.439 9.351 9.178 9.005 8.806 8.689 8.52 8.323 8.207 8.087 7.809 7.63 7.422 7.203 6.975 6.713 6.344 5.334 -9 ,29927 ,TETRA ,17618317,Tue Nov 30 13:41:30 CET,Tue Nov 30 15:30:13 CET,0.0 0.833 1.171 1.4 1.591 1.772 1.927 2.073 2.365 2.499 2.619 2.789 2.94 3.032 3.228 3.409 3.557 3.63 3.786 3.937 4.146 4.288 4.431 4.63 4.823 5.011 5.201 5.392 5.624 5.834 6.033 6.247 6.459 6.669 6.888 7.145 7.402 7.709 8.057 8.376 8.68 9.028 9.414 9.803 10.256 10.771 11.398 12.06 12.78 13.568 14.384 14.858 14.999 14.963 14.857 14.666 14.427 14.187 13.97 13.749 13.529 13.321 13.077 12.818 12.596 12.408 12.23 12.059 11.876 11.672 11.47 11.308 11.144 10.95 10.794 10.644 10.491 10.324 10.135 10.006 9.88 9.681 9.534 9.357 9.259 9.071 8.883 8.69 8.579 8.405 8.207 8.063 7.912 7.609 7.438 7.248 7.047 6.822 6.526 6.141 5.108 -10 ,1033 ,TETRA ,17618318,Tue Nov 30 13:41:31 CET,Tue Nov 30 15:30:58 CET,0.0 0.894 1.209 1.448 1.629 1.792 1.951 2.096 2.382 2.504 2.614 2.797 2.965 3.072 3.267 3.449 3.618 3.692 3.846 4.008 4.238 4.372 4.5 4.687 4.857 5.03 5.219 5.405 5.635 5.835 6.029 6.292 6.542 6.778 7.08 7.381 7.628 7.905 8.2 8.503 8.813 9.155 9.534 9.938 10.39 10.851 11.401 12.033 12.741 13.485 14.171 14.517 14.598 14.527 14.367 14.171 13.983 13.783 13.554 13.294 13.071 12.885 12.712 12.535 12.347 12.168 11.998 11.826 11.668 11.518 11.357 11.207 11.041 10.837 10.659 10.484 10.319 10.149 9.977 9.849 9.702 9.481 9.331 9.169 9.08 8.899 8.717 8.526 8.409 8.239 8.051 7.917 7.788 7.495 7.319 7.133 6.929 6.687 6.41 6.053 4.892 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_7a_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_7a_41.txt deleted file mode 100644 index 6bd56d57..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_7a_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25658 ,TETRA ,17618319,Tue Nov 30 13:42:28 CET,Tue Nov 30 15:31:09 CET,0.0 1.205 1.631 1.946 2.207 2.446 2.66 2.853 3.222 3.393 3.557 3.807 4.006 4.144 4.411 4.663 4.897 5.002 5.203 5.406 5.699 5.887 6.075 6.364 6.636 6.885 7.131 7.376 7.698 8.016 8.306 8.64 8.973 9.3 9.687 10.113 10.507 10.928 11.402 11.931 12.457 13.033 13.739 14.455 15.275 16.21 17.274 18.43 19.805 21.476 23.488 25.158 26.086 26.608 26.926 27.057 27.087 27.1 27.052 26.972 26.882 26.776 26.667 26.551 26.407 26.255 26.088 25.935 25.809 25.668 25.523 25.391 25.245 25.103 24.979 24.836 24.672 24.509 24.362 24.264 24.153 23.96 23.829 23.683 23.592 23.414 23.243 23.029 22.911 22.762 22.589 22.458 22.31 22.01 21.841 21.649 21.423 21.154 20.817 20.344 18.538 -2 ,27238 ,TETRA ,17618320,Tue Nov 30 13:42:29 CET,Tue Nov 30 15:31:18 CET,0.0 1.227 1.595 1.892 2.144 2.359 2.565 2.768 3.153 3.317 3.465 3.697 3.896 4.033 4.29 4.532 4.77 4.886 5.11 5.317 5.616 5.808 5.994 6.278 6.543 6.794 7.031 7.27 7.582 7.864 8.147 8.489 8.823 9.151 9.519 9.944 10.355 10.788 11.265 11.791 12.326 12.911 13.59 14.264 15.06 15.979 17.036 18.191 19.556 21.222 23.233 24.747 25.582 26.108 26.415 26.585 26.653 26.643 26.587 26.509 26.39 26.262 26.145 26.015 25.847 25.692 25.532 25.366 25.214 25.016 24.8 24.643 24.486 24.318 24.175 24.017 23.86 23.714 23.569 23.452 23.315 23.102 22.955 22.81 22.738 22.575 22.388 22.199 22.103 21.959 21.764 21.634 21.5 21.225 21.062 20.871 20.648 20.382 20.038 19.597 18.122 -3 ,14656 ,TETRA ,17618321,Tue Nov 30 13:42:29 CET,Tue Nov 30 15:33:49 CET,0.0 1.168 1.567 1.875 2.12 2.347 2.556 2.758 3.146 3.323 3.49 3.737 3.936 4.071 4.318 4.562 4.79 4.894 5.102 5.314 5.635 5.85 6.046 6.337 6.618 6.896 7.164 7.402 7.691 7.992 8.294 8.65 9.0 9.34 9.735 10.165 10.569 11.041 11.561 12.1 12.681 13.362 14.18 14.987 15.862 16.777 17.853 19.028 20.375 22.034 24.038 25.642 26.496 26.98 27.278 27.449 27.502 27.465 27.4 27.325 27.217 27.115 26.999 26.868 26.738 26.6 26.452 26.32 26.216 26.085 25.916 25.786 25.653 25.485 25.365 25.25 25.109 24.943 24.746 24.619 24.49 24.279 24.136 23.972 23.886 23.716 23.53 23.328 23.225 23.078 22.849 22.701 22.566 22.266 22.098 21.913 21.674 21.387 21.036 20.608 18.975 -4 ,29092 ,TETRA ,17618322,Tue Nov 30 13:42:29 CET,Tue Nov 30 15:29:35 CET,0.0 1.005 1.371 1.669 1.929 2.147 2.351 2.537 2.88 3.049 3.218 3.493 3.693 3.827 4.099 4.364 4.616 4.735 4.96 5.171 5.473 5.66 5.842 6.112 6.391 6.676 6.945 7.198 7.521 7.832 8.112 8.436 8.747 9.072 9.452 9.837 10.223 10.667 11.13 11.608 12.119 12.69 13.351 14.058 14.924 15.86 16.877 18.022 19.418 21.126 23.209 24.812 25.675 26.195 26.512 26.698 26.768 26.773 26.759 26.661 26.523 26.376 26.229 26.084 25.948 25.82 25.663 25.504 25.348 25.177 24.996 24.866 24.738 24.591 24.47 24.328 24.175 24.045 23.915 23.794 23.643 23.424 23.287 23.136 23.053 22.87 22.674 22.471 22.358 22.204 22.006 21.879 21.743 21.434 21.274 21.1 20.894 20.621 20.271 19.839 18.413 -5 ,18060 ,TETRA ,17618323,Tue Nov 30 13:42:29 CET,Tue Nov 30 15:30:36 CET,0.0 1.078 1.461 1.758 2.041 2.298 2.517 2.715 3.063 3.219 3.374 3.609 3.804 3.943 4.205 4.456 4.679 4.794 5.041 5.269 5.598 5.808 5.987 6.246 6.515 6.763 6.999 7.246 7.574 7.887 8.186 8.55 8.888 9.196 9.559 9.969 10.376 10.842 11.327 11.819 12.378 13.011 13.725 14.429 15.197 16.109 17.194 18.362 19.745 21.413 23.386 24.909 25.785 26.323 26.612 26.761 26.825 26.8 26.715 26.594 26.488 26.358 26.143 25.928 25.765 25.629 25.47 25.313 25.195 25.088 24.945 24.809 24.686 24.527 24.389 24.255 24.097 23.929 23.75 23.622 23.499 23.309 23.162 23.005 22.929 22.754 22.558 22.37 22.269 22.117 21.903 21.772 21.655 21.385 21.2 20.979 20.739 20.47 20.164 19.751 18.401 -6 ,21693 ,TETRA ,17618324,Tue Nov 30 13:42:29 CET,Tue Nov 30 15:29:14 CET,0.0 1.126 1.511 1.817 2.069 2.3 2.52 2.718 3.087 3.257 3.412 3.66 3.856 3.985 4.246 4.498 4.732 4.841 5.061 5.276 5.577 5.764 5.948 6.225 6.482 6.735 6.979 7.204 7.494 7.793 8.075 8.41 8.764 9.123 9.518 9.908 10.288 10.734 11.223 11.724 12.252 12.86 13.561 14.245 15.046 15.944 16.992 18.229 19.682 21.374 23.402 24.977 25.804 26.312 26.626 26.77 26.831 26.826 26.74 26.637 26.54 26.438 26.313 26.175 26.05 25.91 25.757 25.627 25.486 25.338 25.188 25.043 24.891 24.733 24.613 24.49 24.341 24.174 23.99 23.856 23.714 23.503 23.364 23.207 23.128 22.966 22.786 22.577 22.462 22.31 22.114 21.987 21.836 21.49 21.305 21.105 20.893 20.636 20.253 19.743 17.958 -7 ,13224 ,TETRA ,17618325,Tue Nov 30 13:43:29 CET,Tue Nov 30 15:31:27 CET,0.0 1.112 1.522 1.836 2.101 2.338 2.57 2.783 3.142 3.306 3.464 3.712 3.908 4.048 4.322 4.58 4.819 4.932 5.156 5.367 5.669 5.867 6.052 6.332 6.608 6.856 7.094 7.326 7.625 7.901 8.166 8.492 8.813 9.124 9.491 9.902 10.285 10.713 11.173 11.654 12.164 12.755 13.449 14.13 14.926 15.831 16.862 18.037 19.441 21.105 23.148 24.815 25.659 26.14 26.448 26.617 26.704 26.716 26.655 26.555 26.47 26.356 26.236 26.128 26.004 25.877 25.727 25.581 25.442 25.302 25.163 25.027 24.876 24.729 24.613 24.492 24.347 24.187 24.042 23.939 23.829 23.654 23.511 23.336 23.257 23.1 22.93 22.752 22.651 22.507 22.299 22.177 22.05 21.727 21.542 21.331 21.085 20.805 20.463 19.982 17.922 -8 ,8363 ,TETRA ,17618326,Tue Nov 30 13:43:29 CET,Tue Nov 30 15:34:18 CET,0.0 0.97 1.388 1.687 1.93 2.147 2.35 2.551 2.917 3.078 3.229 3.457 3.653 3.775 3.994 4.205 4.427 4.539 4.754 4.965 5.256 5.435 5.623 5.903 6.16 6.412 6.664 6.915 7.219 7.495 7.784 8.161 8.527 8.863 9.226 9.617 10.028 10.493 10.974 11.484 12.013 12.619 13.302 13.985 14.778 15.649 16.685 17.912 19.358 21.022 22.983 24.528 25.299 25.739 26.037 26.226 26.318 26.325 26.271 26.141 26.017 25.932 25.837 25.724 25.615 25.507 25.351 25.204 25.05 24.889 24.735 24.588 24.454 24.306 24.171 24.045 23.917 23.769 23.609 23.49 23.358 23.156 23.017 22.869 22.796 22.63 22.455 22.274 22.167 22.014 21.812 21.68 21.539 21.209 21.01 20.791 20.555 20.292 19.954 19.511 18.014 -9 ,30155 ,TETRA ,17618327,Tue Nov 30 13:43:29 CET,Tue Nov 30 15:31:49 CET,0.0 1.447 1.925 2.234 2.47 2.694 2.902 3.099 3.465 3.623 3.771 4.007 4.204 4.337 4.595 4.844 5.069 5.18 5.41 5.627 5.96 6.185 6.396 6.679 6.937 7.182 7.413 7.644 7.961 8.269 8.56 8.902 9.208 9.514 9.888 10.305 10.703 11.124 11.577 12.091 12.633 13.219 13.918 14.646 15.473 16.361 17.422 18.634 20.007 21.638 23.624 25.248 26.148 26.638 26.922 27.085 27.162 27.186 27.152 27.103 27.046 26.964 26.857 26.73 26.607 26.497 26.361 26.211 26.082 25.958 25.809 25.673 25.532 25.375 25.245 25.108 24.939 24.771 24.605 24.476 24.351 24.156 24.009 23.865 23.797 23.647 23.46 23.247 23.144 22.985 22.762 22.635 22.494 22.172 21.985 21.777 21.551 21.293 20.953 20.452 18.544 -10 ,30997 ,TETRA ,17618328,Tue Nov 30 13:43:29 CET,Tue Nov 30 15:20:10 CET,0.0 1.058 1.448 1.742 1.992 2.231 2.451 2.647 3.002 3.166 3.319 3.551 3.748 3.886 4.151 4.393 4.637 4.761 4.99 5.209 5.523 5.723 5.913 6.207 6.51 6.795 7.056 7.288 7.576 7.88 8.191 8.55 8.895 9.228 9.591 10.009 10.443 10.932 11.445 11.957 12.469 13.056 13.771 14.473 15.243 16.118 17.198 18.437 19.883 21.614 23.58 25.093 25.964 26.489 26.824 26.998 27.059 27.06 27.01 26.912 26.799 26.665 26.511 26.348 26.16 25.983 25.809 25.665 25.531 25.375 25.208 25.056 24.892 24.724 24.596 24.469 24.337 24.193 24.02 23.896 23.776 23.572 23.411 23.257 23.187 23.029 22.85 22.648 22.544 22.396 22.173 22.026 21.882 21.574 21.391 21.185 20.96 20.697 20.386 19.948 18.845 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_7b_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_7b_1.txt deleted file mode 100644 index 0593583e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_7b_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15038 ,TETRA ,17618329,Tue Nov 30 13:43:30 CET,Tue Nov 30 15:30:03 CET,0.0 0.877 1.252 1.532 1.757 1.966 2.153 2.31 2.574 2.702 2.83 3.015 3.178 3.28 3.469 3.657 3.835 3.926 4.107 4.269 4.485 4.622 4.757 4.964 5.165 5.347 5.519 5.685 5.896 6.111 6.33 6.573 6.794 7.019 7.281 7.567 7.837 8.125 8.421 8.734 9.106 9.513 9.969 10.431 10.954 11.541 12.158 12.756 13.427 14.149 14.68 14.716 14.432 13.998 13.527 13.117 12.738 12.341 11.993 11.611 11.239 10.924 10.632 10.339 10.048 9.772 9.486 9.218 8.991 8.769 8.537 8.35 8.15 7.935 7.767 7.582 7.383 7.186 6.972 6.811 6.66 6.427 6.27 6.115 6.026 5.82 5.604 5.393 5.286 5.112 4.89 4.757 4.609 4.25 4.047 3.835 3.625 3.391 3.083 2.635 1.44 -2 ,5860 ,TETRA ,17618330,Tue Nov 30 13:43:30 CET,Tue Nov 30 15:26:39 CET,0.0 0.976 1.312 1.588 1.818 2.0 2.164 2.327 2.631 2.763 2.882 3.055 3.215 3.326 3.537 3.733 3.919 4.016 4.204 4.37 4.605 4.755 4.896 5.087 5.279 5.466 5.646 5.832 6.07 6.291 6.487 6.721 6.957 7.188 7.459 7.748 8.032 8.353 8.688 9.044 9.421 9.84 10.317 10.778 11.303 11.898 12.575 13.29 14.008 14.704 15.319 15.436 15.084 14.602 14.156 13.726 13.27 12.797 12.399 12.003 11.638 11.297 10.986 10.687 10.4 10.116 9.816 9.558 9.332 9.097 8.861 8.661 8.438 8.202 8.02 7.845 7.672 7.472 7.238 7.084 6.938 6.718 6.556 6.371 6.281 6.096 5.902 5.702 5.589 5.417 5.219 5.087 4.941 4.625 4.467 4.288 4.062 3.802 3.515 3.114 1.971 -3 ,12831 ,TETRA ,17618331,Tue Nov 30 13:43:30 CET,Tue Nov 30 15:49:26 CET,0.0 0.92 1.29 1.541 1.75 1.934 2.101 2.247 2.505 2.63 2.744 2.91 3.076 3.186 3.412 3.613 3.787 3.865 4.02 4.181 4.411 4.553 4.691 4.882 5.065 5.259 5.448 5.615 5.83 6.051 6.278 6.56 6.813 7.036 7.281 7.551 7.819 8.127 8.468 8.813 9.18 9.597 10.06 10.548 11.096 11.649 12.266 12.895 13.572 14.357 14.938 14.892 14.529 14.042 13.573 13.082 12.564 12.083 11.682 11.288 10.948 10.647 10.341 10.028 9.728 9.447 9.156 8.896 8.679 8.457 8.216 8.03 7.827 7.603 7.434 7.259 7.064 6.852 6.647 6.507 6.358 6.128 5.974 5.821 5.735 5.539 5.317 5.097 4.976 4.797 4.586 4.451 4.311 3.973 3.787 3.586 3.375 3.112 2.797 2.376 0.942 -4 ,27475 ,TETRA ,17618332,Tue Nov 30 13:43:33 CET,Tue Nov 30 15:35:04 CET,0.0 1.199 1.541 1.814 2.044 2.239 2.41 2.57 2.85 2.977 3.093 3.252 3.408 3.509 3.708 3.891 4.065 4.15 4.319 4.471 4.676 4.807 4.941 5.145 5.337 5.518 5.689 5.854 6.067 6.284 6.493 6.72 6.937 7.152 7.418 7.713 7.981 8.278 8.6 8.949 9.313 9.705 10.151 10.584 11.078 11.623 12.196 12.894 13.684 14.31 14.766 14.648 14.242 13.833 13.39 12.936 12.5 12.071 11.685 11.302 10.973 10.648 10.326 10.028 9.739 9.476 9.197 8.933 8.705 8.481 8.256 8.048 7.825 7.605 7.43 7.239 7.036 6.836 6.639 6.49 6.327 6.073 5.9 5.719 5.614 5.398 5.175 4.938 4.816 4.64 4.446 4.31 4.16 3.884 3.726 3.533 3.317 3.045 2.699 2.275 0.996 -5 ,14157 ,TETRA ,17618333,Tue Nov 30 13:43:31 CET,Tue Nov 30 15:33:09 CET,0.0 1.157 1.527 1.792 2.015 2.209 2.387 2.542 2.831 2.973 3.094 3.257 3.425 3.543 3.742 3.933 4.112 4.193 4.36 4.522 4.739 4.881 5.019 5.212 5.397 5.577 5.759 5.943 6.18 6.406 6.617 6.853 7.074 7.29 7.544 7.817 8.072 8.365 8.703 9.058 9.412 9.82 10.318 10.813 11.35 11.929 12.587 13.272 13.978 14.606 15.042 15.157 14.881 14.462 13.987 13.53 13.161 12.797 12.444 12.069 11.722 11.395 11.084 10.792 10.521 10.271 9.999 9.748 9.531 9.298 9.038 8.813 8.584 8.356 8.177 7.989 7.801 7.606 7.398 7.246 7.086 6.839 6.655 6.468 6.37 6.178 5.999 5.78 5.648 5.473 5.275 5.139 4.991 4.641 4.453 4.27 4.046 3.784 3.461 2.94 1.447 -6 ,29574 ,TETRA ,17618334,Tue Nov 30 13:44:32 CET,Tue Nov 30 16:01:52 CET,0.0 1.073 1.492 1.785 2.014 2.22 2.405 2.578 2.888 3.02 3.139 3.299 3.45 3.545 3.735 3.938 4.127 4.211 4.371 4.527 4.738 4.865 4.997 5.201 5.388 5.561 5.738 5.914 6.147 6.365 6.567 6.803 7.033 7.26 7.531 7.831 8.11 8.418 8.751 9.09 9.452 9.849 10.284 10.72 11.216 11.772 12.387 13.057 13.805 14.571 15.192 15.315 15.146 14.761 14.299 13.832 13.375 12.931 12.531 12.116 11.769 11.462 11.151 10.861 10.581 10.323 10.055 9.804 9.572 9.325 9.084 8.886 8.669 8.446 8.264 8.072 7.883 7.676 7.445 7.289 7.133 6.898 6.736 6.564 6.47 6.274 6.073 5.855 5.743 5.583 5.386 5.245 5.096 4.738 4.547 4.361 4.168 3.942 3.635 3.202 1.847 -7 ,8325 ,TETRA ,17618335,Tue Nov 30 13:44:31 CET,Tue Nov 30 15:32:10 CET,0.0 0.982 1.302 1.538 1.768 1.968 2.133 2.289 2.578 2.715 2.846 3.033 3.21 3.318 3.501 3.674 3.84 3.92 4.083 4.247 4.465 4.601 4.736 4.932 5.126 5.326 5.523 5.713 5.943 6.157 6.369 6.615 6.855 7.091 7.353 7.64 7.912 8.214 8.527 8.846 9.182 9.574 10.052 10.482 10.952 11.518 12.114 12.742 13.387 14.053 14.7 14.782 14.442 13.959 13.586 13.176 12.697 12.246 11.868 11.513 11.19 10.86 10.537 10.222 9.916 9.662 9.4 9.148 8.927 8.696 8.454 8.25 8.037 7.81 7.63 7.444 7.25 7.049 6.834 6.675 6.523 6.285 6.103 5.918 5.821 5.619 5.412 5.192 5.075 4.902 4.707 4.576 4.426 4.056 3.854 3.66 3.437 3.17 2.848 2.459 1.195 -8 ,10051 ,TETRA ,17618336,Tue Nov 30 13:44:33 CET,Tue Nov 30 15:33:38 CET,0.0 1.155 1.474 1.707 1.898 2.079 2.252 2.413 2.706 2.84 2.957 3.115 3.262 3.358 3.56 3.757 3.949 4.046 4.217 4.369 4.595 4.742 4.885 5.087 5.277 5.454 5.63 5.805 6.021 6.24 6.443 6.674 6.898 7.125 7.395 7.682 7.96 8.278 8.606 8.956 9.321 9.724 10.198 10.668 11.19 11.749 12.405 13.083 13.727 14.441 15.057 14.998 14.62 14.222 13.849 13.435 12.975 12.512 12.119 11.699 11.301 10.958 10.658 10.361 10.072 9.824 9.555 9.307 9.08 8.837 8.587 8.391 8.195 7.959 7.766 7.58 7.392 7.195 7.002 6.861 6.707 6.47 6.309 6.145 6.055 5.863 5.658 5.436 5.319 5.149 4.948 4.81 4.665 4.339 4.161 3.979 3.762 3.503 3.208 2.822 1.394 -9 ,6724 ,TETRA ,17618337,Tue Nov 30 13:44:33 CET,Tue Nov 30 15:31:34 CET,0.0 1.05 1.425 1.695 1.898 2.076 2.24 2.391 2.677 2.804 2.931 3.117 3.285 3.406 3.628 3.817 3.994 4.077 4.231 4.385 4.616 4.768 4.919 5.144 5.345 5.522 5.69 5.855 6.086 6.31 6.505 6.73 6.954 7.171 7.439 7.745 8.005 8.295 8.625 8.986 9.347 9.734 10.19 10.646 11.21 11.823 12.451 13.066 13.692 14.46 15.07 15.122 14.951 14.629 14.24 13.773 13.336 12.924 12.551 12.204 11.88 11.549 11.216 10.907 10.61 10.342 10.073 9.816 9.59 9.363 9.125 8.921 8.718 8.505 8.331 8.152 7.956 7.753 7.549 7.404 7.248 7.004 6.847 6.686 6.598 6.415 6.217 5.997 5.882 5.712 5.498 5.356 5.209 4.873 4.677 4.466 4.231 3.966 3.647 3.247 2.264 -10 ,19780 ,TETRA ,17618338,Tue Nov 30 13:44:34 CET,Tue Nov 30 15:31:28 CET,0.0 0.917 1.245 1.518 1.763 1.965 2.15 2.325 2.617 2.743 2.856 3.01 3.161 3.265 3.482 3.672 3.85 3.933 4.089 4.244 4.473 4.621 4.757 4.948 5.136 5.322 5.5 5.67 5.898 6.117 6.316 6.572 6.832 7.072 7.326 7.592 7.858 8.172 8.515 8.861 9.223 9.642 10.12 10.6 11.142 11.722 12.344 12.989 13.634 14.24 14.664 14.564 14.297 13.857 13.39 12.96 12.539 12.121 11.748 11.372 11.0 10.648 10.334 10.036 9.757 9.502 9.226 8.986 8.781 8.556 8.305 8.101 7.896 7.681 7.509 7.327 7.125 6.905 6.684 6.531 6.372 6.114 5.933 5.758 5.667 5.474 5.262 5.044 4.93 4.757 4.56 4.434 4.288 3.961 3.778 3.561 3.337 3.088 2.783 2.379 1.154 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_7b_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_7b_41.txt deleted file mode 100644 index 4034f614..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_7b_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30490 ,TETRA ,17618339,Tue Nov 30 13:44:33 CET,Tue Nov 30 15:32:25 CET,0.0 1.419 1.866 2.198 2.47 2.713 2.925 3.125 3.496 3.664 3.818 4.058 4.24 4.369 4.621 4.867 5.092 5.204 5.435 5.65 5.953 6.159 6.362 6.633 6.883 7.128 7.352 7.573 7.887 8.208 8.509 8.871 9.226 9.571 9.965 10.39 10.812 11.276 11.78 12.283 12.828 13.459 14.19 14.959 15.83 16.8 17.941 19.244 20.71 22.218 23.91 25.094 25.601 25.796 25.79 25.655 25.441 25.22 24.999 24.727 24.5 24.301 24.066 23.836 23.617 23.41 23.191 22.989 22.815 22.624 22.41 22.224 22.039 21.851 21.705 21.558 21.401 21.227 21.045 20.916 20.777 20.558 20.395 20.217 20.128 19.947 19.739 19.518 19.401 19.246 19.036 18.904 18.776 18.443 18.263 18.07 17.826 17.526 17.174 16.74 14.889 -2 ,11451 ,TETRA ,17618340,Tue Nov 30 13:44:33 CET,Tue Nov 30 15:31:27 CET,0.0 1.604 2.039 2.35 2.616 2.855 3.073 3.286 3.662 3.829 3.987 4.242 4.435 4.568 4.822 5.074 5.323 5.438 5.652 5.853 6.154 6.358 6.542 6.795 7.05 7.308 7.551 7.788 8.112 8.427 8.724 9.084 9.416 9.712 10.071 10.486 10.88 11.318 11.806 12.319 12.846 13.47 14.206 14.954 15.844 16.824 17.948 19.152 20.534 22.111 23.845 25.097 25.58 25.68 25.645 25.537 25.371 25.187 24.993 24.752 24.534 24.325 24.114 23.905 23.699 23.491 23.269 23.062 22.884 22.714 22.531 22.374 22.207 22.022 21.876 21.729 21.569 21.399 21.216 21.082 20.938 20.705 20.552 20.394 20.308 20.115 19.908 19.699 19.593 19.443 19.225 19.088 18.939 18.569 18.356 18.132 17.877 17.611 17.29 16.833 15.411 -3 ,28555 ,TETRA ,17618341,Tue Nov 30 13:44:34 CET,Tue Nov 30 15:29:25 CET,0.0 1.274 1.71 2.041 2.309 2.52 2.719 2.913 3.261 3.422 3.585 3.849 4.055 4.193 4.442 4.67 4.884 4.991 5.199 5.4 5.697 5.887 6.074 6.356 6.633 6.902 7.153 7.396 7.708 7.999 8.283 8.649 9.002 9.322 9.673 10.083 10.502 10.97 11.476 12.001 12.534 13.119 13.803 14.537 15.387 16.307 17.421 18.761 20.291 21.965 23.76 24.967 25.498 25.597 25.511 25.394 25.246 25.041 24.835 24.601 24.36 24.13 23.924 23.722 23.525 23.339 23.137 22.942 22.758 22.584 22.414 22.265 22.099 21.918 21.771 21.601 21.415 21.227 21.038 20.905 20.757 20.515 20.351 20.193 20.114 19.94 19.75 19.541 19.426 19.267 19.048 18.909 18.766 18.456 18.266 18.038 17.777 17.509 17.189 16.708 14.802 -4 ,7820 ,TETRA ,17618342,Tue Nov 30 13:44:33 CET,Tue Nov 30 15:33:03 CET,0.0 1.407 1.827 2.132 2.392 2.633 2.874 3.082 3.453 3.614 3.764 4.01 4.203 4.339 4.593 4.834 5.062 5.169 5.38 5.581 5.873 6.058 6.237 6.507 6.757 6.998 7.252 7.499 7.803 8.086 8.36 8.7 9.035 9.365 9.74 10.134 10.517 10.938 11.369 11.831 12.335 12.892 13.527 14.22 15.066 15.953 16.954 18.122 19.479 20.956 22.756 24.272 25.086 25.524 25.731 25.786 25.769 25.733 25.65 25.525 25.411 25.295 25.157 25.009 24.858 24.73 24.608 24.476 24.337 24.187 24.034 23.895 23.737 23.574 23.433 23.272 23.11 22.945 22.776 22.659 22.521 22.288 22.129 21.96 21.874 21.699 21.521 21.33 21.222 21.071 20.863 20.723 20.578 20.224 20.028 19.824 19.583 19.304 18.956 18.496 16.482 -5 ,15234 ,TETRA ,17618343,Tue Nov 30 14:12:10 CET,Tue Nov 30 15:52:38 CET,0.0 1.526 1.989 2.336 2.635 2.909 3.144 3.346 3.709 3.87 4.025 4.273 4.473 4.612 4.874 5.115 5.346 5.46 5.677 5.883 6.174 6.364 6.551 6.823 7.082 7.325 7.566 7.798 8.096 8.378 8.647 8.975 9.299 9.622 10.0 10.389 10.761 11.2 11.693 12.207 12.738 13.367 14.082 14.786 15.677 16.701 17.8 19.036 20.487 22.032 23.716 24.889 25.329 25.449 25.411 25.297 25.108 24.889 24.676 24.434 24.217 24.001 23.793 23.577 23.353 23.137 22.903 22.693 22.512 22.318 22.105 21.941 21.756 21.559 21.417 21.26 21.09 20.91 20.72 20.59 20.453 20.235 20.071 19.888 19.798 19.627 19.427 19.198 19.077 18.915 18.693 18.549 18.401 18.075 17.892 17.692 17.473 17.191 16.781 16.269 14.819 -6 ,31697 ,TETRA ,17618344,Tue Nov 30 14:12:11 CET,Tue Nov 30 16:04:34 CET,0.0 1.104 1.549 1.903 2.205 2.469 2.688 2.882 3.218 3.381 3.543 3.786 3.984 4.133 4.405 4.651 4.872 4.983 5.214 5.428 5.723 5.913 6.097 6.37 6.641 6.914 7.156 7.373 7.675 7.98 8.283 8.646 8.986 9.305 9.667 10.059 10.428 10.852 11.338 11.875 12.442 13.077 13.814 14.573 15.495 16.511 17.683 18.889 20.248 21.919 23.771 24.86 25.205 25.326 25.346 25.256 25.101 24.907 24.738 24.557 24.351 24.142 23.917 23.703 23.51 23.34 23.169 22.993 22.811 22.599 22.381 22.203 22.013 21.818 21.664 21.51 21.35 21.182 20.993 20.855 20.716 20.498 20.349 20.19 20.104 19.921 19.725 19.522 19.413 19.259 19.038 18.899 18.757 18.425 18.236 18.022 17.756 17.454 17.104 16.623 15.267 -7 ,6748 ,TETRA ,17618345,Tue Nov 30 14:13:09 CET,Tue Nov 30 16:04:37 CET,0.0 0.984 1.422 1.739 2.006 2.244 2.437 2.619 2.975 3.132 3.281 3.511 3.698 3.83 4.087 4.332 4.57 4.679 4.882 5.078 5.367 5.56 5.75 6.042 6.322 6.576 6.825 7.07 7.378 7.675 7.965 8.313 8.636 8.931 9.282 9.682 10.064 10.484 10.937 11.426 11.935 12.528 13.251 13.985 14.841 15.812 16.956 18.27 19.79 21.406 23.163 24.378 24.806 24.86 24.779 24.648 24.481 24.307 24.131 23.926 23.727 23.528 23.34 23.133 22.92 22.729 22.514 22.315 22.14 21.955 21.749 21.563 21.374 21.191 21.052 20.896 20.72 20.549 20.362 20.225 20.086 19.847 19.68 19.519 19.44 19.265 19.065 18.86 18.749 18.588 18.341 18.194 18.057 17.728 17.532 17.329 17.09 16.799 16.463 15.979 14.976 -8 ,29304 ,TETRA ,17618346,Tue Nov 30 14:13:09 CET,Tue Nov 30 16:05:54 CET,0.0 1.271 1.687 2.026 2.326 2.597 2.829 3.039 3.419 3.592 3.753 3.994 4.188 4.327 4.594 4.848 5.09 5.203 5.425 5.639 5.923 6.11 6.3 6.586 6.881 7.155 7.402 7.656 7.977 8.269 8.551 8.893 9.223 9.555 9.955 10.379 10.759 11.18 11.642 12.131 12.646 13.252 13.996 14.759 15.64 16.603 17.636 18.729 20.082 21.591 23.149 24.266 24.781 24.968 24.958 24.814 24.607 24.384 24.181 23.952 23.717 23.504 23.299 23.091 22.881 22.689 22.481 22.281 22.095 21.899 21.707 21.539 21.335 21.123 20.965 20.804 20.634 20.461 20.276 20.145 20.012 19.785 19.617 19.44 19.355 19.176 18.971 18.761 18.639 18.468 18.26 18.13 17.979 17.624 17.433 17.236 17.011 16.732 16.385 15.932 14.393 -9 ,23981 ,TETRA ,17618347,Tue Nov 30 14:14:07 CET,Tue Nov 30 15:59:00 CET,0.0 1.397 1.83 2.155 2.428 2.667 2.88 3.078 3.435 3.598 3.76 4.012 4.196 4.325 4.572 4.799 5.018 5.128 5.339 5.531 5.839 6.044 6.243 6.528 6.788 7.03 7.264 7.5 7.79 8.042 8.301 8.649 8.993 9.303 9.629 10.012 10.413 10.867 11.365 11.903 12.472 13.106 13.826 14.569 15.438 16.363 17.425 18.573 19.862 21.32 23.059 24.5 25.139 25.313 25.306 25.196 25.019 24.827 24.645 24.431 24.204 23.959 23.717 23.495 23.288 23.117 22.926 22.735 22.565 22.373 22.161 21.987 21.815 21.635 21.482 21.319 21.158 20.99 20.805 20.672 20.538 20.331 20.181 20.017 19.927 19.741 19.561 19.373 19.269 19.118 18.906 18.766 18.62 18.286 18.098 17.895 17.687 17.424 17.041 16.567 14.975 -10 ,17916 ,TETRA ,17618348,Tue Nov 30 14:14:08 CET,Tue Nov 30 16:05:23 CET,0.0 1.444 1.885 2.212 2.457 2.682 2.912 3.133 3.513 3.686 3.845 4.091 4.31 4.464 4.736 4.984 5.21 5.32 5.534 5.751 6.07 6.27 6.453 6.723 6.986 7.23 7.483 7.729 8.023 8.316 8.62 8.976 9.314 9.647 10.02 10.433 10.86 11.328 11.816 12.359 12.94 13.593 14.328 15.053 15.92 16.866 17.95 19.178 20.579 22.263 24.046 25.192 25.659 25.713 25.63 25.489 25.327 25.145 24.957 24.746 24.522 24.307 24.099 23.893 23.69 23.496 23.288 23.086 22.906 22.731 22.537 22.358 22.171 21.972 21.815 21.663 21.487 21.292 21.086 20.938 20.793 20.567 20.404 20.227 20.138 19.958 19.766 19.549 19.431 19.275 19.084 18.955 18.811 18.457 18.259 18.056 17.817 17.537 17.2 16.707 15.396 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_84_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_84_41.txt deleted file mode 100644 index c968d0c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/hif2a/water/Summary_FEP_84_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21592 ,TETRA ,17618349,Tue Nov 30 14:14:08 CET,Tue Nov 30 15:59:54 CET,0.0 1.352 1.801 2.183 2.506 2.776 3.031 3.278 3.706 3.906 4.099 4.394 4.645 4.813 5.134 5.442 5.749 5.891 6.16 6.438 6.816 7.049 7.292 7.648 7.987 8.308 8.619 8.937 9.361 9.773 10.157 10.63 11.106 11.569 12.099 12.693 13.268 13.897 14.583 15.342 16.189 17.141 18.261 19.403 20.746 22.282 24.047 26.076 28.577 31.675 35.493 38.795 40.816 42.15 43.077 43.725 44.201 44.571 44.856 45.079 45.214 45.308 45.355 45.384 45.413 45.428 45.437 45.431 45.418 45.4 45.382 45.365 45.33 45.285 45.24 45.19 45.138 45.077 45.012 44.966 44.915 44.826 44.766 44.699 44.66 44.583 44.502 44.41 44.361 44.271 44.183 44.108 44.029 43.834 43.719 43.599 43.461 43.292 43.089 42.792 41.807 -2 ,10240 ,TETRA ,17618350,Tue Nov 30 14:15:09 CET,Tue Nov 30 16:08:40 CET,0.0 1.466 1.938 2.257 2.558 2.826 3.055 3.279 3.711 3.906 4.095 4.383 4.63 4.792 5.108 5.419 5.72 5.864 6.133 6.391 6.777 7.02 7.252 7.602 7.937 8.248 8.549 8.851 9.252 9.656 10.048 10.516 10.992 11.448 11.973 12.591 13.176 13.835 14.577 15.355 16.166 17.087 18.182 19.315 20.675 22.239 24.075 26.146 28.685 31.866 35.702 38.888 40.897 42.305 43.245 43.883 44.332 44.627 44.856 45.058 45.168 45.26 45.343 45.371 45.375 45.391 45.411 45.424 45.426 45.409 45.365 45.329 45.299 45.252 45.201 45.152 45.098 45.04 44.982 44.937 44.888 44.79 44.71 44.638 44.602 44.531 44.457 44.348 44.285 44.191 44.103 44.022 43.941 43.769 43.659 43.536 43.407 43.234 43.001 42.728 41.925 -3 ,24667 ,TETRA ,17618351,Tue Nov 30 14:15:10 CET,Tue Nov 30 15:59:06 CET,0.0 1.615 2.046 2.383 2.693 2.962 3.219 3.455 3.862 4.056 4.254 4.541 4.792 4.955 5.262 5.561 5.847 5.987 6.256 6.515 6.908 7.158 7.393 7.74 8.08 8.404 8.715 9.023 9.421 9.81 10.205 10.683 11.13 11.566 12.096 12.698 13.27 13.91 14.614 15.377 16.19 17.083 18.166 19.304 20.657 22.208 24.005 26.15 28.782 31.878 35.607 38.806 40.79 42.049 42.914 43.564 44.026 44.38 44.61 44.786 44.923 45.039 45.134 45.199 45.239 45.251 45.257 45.264 45.254 45.239 45.227 45.203 45.166 45.118 45.078 45.03 44.969 44.895 44.816 44.754 44.69 44.589 44.519 44.45 44.409 44.312 44.201 44.083 44.024 43.93 43.857 43.787 43.706 43.535 43.439 43.321 43.182 43.026 42.825 42.56 41.481 -4 ,20937 ,TETRA ,17618352,Tue Nov 30 14:16:14 CET,Tue Nov 30 16:04:29 CET,0.0 1.56 2.049 2.402 2.696 2.965 3.22 3.465 3.925 4.139 4.341 4.632 4.889 5.067 5.4 5.696 5.966 6.099 6.371 6.631 6.989 7.23 7.473 7.812 8.137 8.46 8.784 9.101 9.498 9.884 10.265 10.718 11.16 11.597 12.115 12.732 13.339 14.01 14.726 15.481 16.302 17.222 18.284 19.374 20.712 22.24 23.999 26.015 28.498 31.626 35.465 38.667 40.596 41.877 42.808 43.522 44.01 44.354 44.589 44.765 44.886 44.98 45.053 45.096 45.117 45.119 45.122 45.111 45.085 45.056 45.023 44.992 44.957 44.916 44.883 44.834 44.777 44.719 44.656 44.61 44.557 44.469 44.411 44.349 44.309 44.224 44.14 44.044 43.987 43.887 43.796 43.723 43.639 43.454 43.352 43.24 43.102 42.926 42.732 42.456 41.555 -5 ,5541 ,TETRA ,17618353,Tue Nov 30 14:16:14 CET,Tue Nov 30 16:03:43 CET,0.0 1.196 1.629 1.978 2.28 2.566 2.833 3.095 3.569 3.775 3.969 4.259 4.506 4.667 4.989 5.309 5.62 5.771 6.055 6.322 6.718 6.979 7.228 7.582 7.926 8.268 8.594 8.919 9.34 9.734 10.125 10.6 11.046 11.479 11.983 12.567 13.151 13.793 14.493 15.253 16.045 16.944 18.022 19.138 20.494 22.061 23.923 26.069 28.534 31.496 35.322 38.538 40.47 41.767 42.654 43.268 43.697 44.007 44.257 44.485 44.644 44.761 44.842 44.9 44.937 44.961 44.971 44.962 44.951 44.925 44.897 44.866 44.817 44.763 44.722 44.669 44.615 44.561 44.483 44.428 44.376 44.295 44.229 44.145 44.102 44.017 43.914 43.797 43.741 43.633 43.529 43.462 43.389 43.213 43.111 43.006 42.892 42.741 42.552 42.29 41.278 -6 ,4673 ,TETRA ,17618354,Tue Nov 30 14:16:14 CET,Tue Nov 30 16:04:28 CET,0.0 1.291 1.744 2.062 2.344 2.618 2.885 3.13 3.567 3.769 3.961 4.254 4.508 4.683 5.033 5.365 5.657 5.791 6.048 6.305 6.676 6.916 7.15 7.495 7.838 8.177 8.501 8.814 9.209 9.593 9.973 10.449 10.912 11.355 11.889 12.489 13.047 13.663 14.36 15.135 15.957 16.891 18.024 19.2 20.576 22.097 23.821 25.83 28.372 31.596 35.608 38.919 40.951 42.266 43.155 43.848 44.359 44.741 44.991 45.176 45.331 45.458 45.563 45.655 45.712 45.732 45.736 45.732 45.724 45.709 45.678 45.637 45.593 45.551 45.51 45.464 45.414 45.35 45.286 45.244 45.194 45.118 45.065 45.0 44.965 44.881 44.788 44.693 44.64 44.539 44.443 44.372 44.289 44.107 44.005 43.889 43.759 43.613 43.448 43.178 42.361 -7 ,32365 ,TETRA ,17618355,Tue Nov 30 14:16:14 CET,Tue Nov 30 16:05:09 CET,0.0 1.366 1.81 2.195 2.515 2.792 3.048 3.287 3.721 3.908 4.089 4.368 4.616 4.78 5.093 5.391 5.679 5.824 6.101 6.36 6.732 6.978 7.229 7.591 7.92 8.242 8.559 8.865 9.271 9.651 10.024 10.493 10.959 11.429 11.972 12.583 13.188 13.846 14.543 15.297 16.096 17.015 18.112 19.268 20.656 22.198 24.047 26.24 28.864 31.953 35.702 38.946 40.866 42.095 42.993 43.724 44.232 44.56 44.799 45.001 45.135 45.235 45.308 45.34 45.353 45.366 45.368 45.355 45.35 45.334 45.301 45.279 45.248 45.206 45.174 45.138 45.095 45.031 44.958 44.912 44.862 44.777 44.714 44.646 44.608 44.531 44.447 44.35 44.296 44.19 44.081 44.004 43.917 43.712 43.603 43.489 43.362 43.215 43.044 42.797 42.015 -8 ,76 ,TETRA ,17618356,Tue Nov 30 14:17:07 CET,Tue Nov 30 16:05:03 CET,0.0 1.361 1.824 2.149 2.434 2.69 2.934 3.163 3.566 3.751 3.938 4.235 4.488 4.649 4.948 5.246 5.543 5.687 5.967 6.242 6.625 6.862 7.094 7.438 7.765 8.086 8.399 8.704 9.109 9.498 9.88 10.362 10.81 11.244 11.766 12.359 12.942 13.578 14.259 15.016 15.823 16.727 17.814 18.951 20.332 21.918 23.758 25.858 28.333 31.293 35.027 38.358 40.329 41.618 42.531 43.147 43.567 43.881 44.122 44.327 44.479 44.604 44.677 44.725 44.762 44.773 44.79 44.813 44.818 44.809 44.782 44.739 44.689 44.631 44.577 44.526 44.481 44.429 44.354 44.302 44.252 44.165 44.105 44.036 43.996 43.912 43.822 43.716 43.659 43.567 43.498 43.43 43.354 43.198 43.103 42.98 42.837 42.678 42.508 42.273 41.286 -9 ,11860 ,TETRA ,17618357,Tue Nov 30 14:17:06 CET,Tue Nov 30 16:05:57 CET,0.0 1.206 1.64 2.014 2.332 2.585 2.811 3.032 3.448 3.645 3.832 4.09 4.321 4.47 4.769 5.068 5.371 5.52 5.795 6.063 6.447 6.691 6.932 7.291 7.637 7.959 8.269 8.576 8.984 9.383 9.757 10.216 10.69 11.146 11.676 12.289 12.869 13.521 14.241 14.989 15.78 16.696 17.795 18.92 20.253 21.796 23.616 25.737 28.294 31.348 35.373 38.81 40.761 42.105 43.038 43.714 44.218 44.587 44.836 45.023 45.18 45.293 45.363 45.424 45.465 45.485 45.49 45.501 45.501 45.478 45.446 45.405 45.354 45.301 45.259 45.217 45.172 45.118 45.043 44.992 44.947 44.872 44.807 44.733 44.697 44.609 44.507 44.404 44.346 44.241 44.138 44.066 43.995 43.833 43.726 43.601 43.446 43.256 43.036 42.751 41.835 -10 ,22937 ,TETRA ,17618358,Tue Nov 30 14:17:08 CET,Tue Nov 30 15:59:57 CET,0.0 1.322 1.798 2.172 2.476 2.745 2.991 3.216 3.645 3.837 4.027 4.309 4.555 4.721 5.041 5.359 5.67 5.816 6.094 6.359 6.729 6.977 7.22 7.571 7.916 8.256 8.589 8.906 9.325 9.735 10.127 10.597 11.041 11.476 11.993 12.59 13.172 13.818 14.526 15.294 16.124 17.073 18.191 19.35 20.701 22.207 24.014 26.064 28.527 31.514 35.178 38.44 40.429 41.691 42.591 43.278 43.736 44.057 44.306 44.536 44.683 44.793 44.882 44.934 44.978 44.999 44.99 44.979 44.962 44.929 44.892 44.856 44.818 44.77 44.73 44.694 44.649 44.588 44.522 44.476 44.428 44.351 44.291 44.215 44.171 44.082 43.995 43.889 43.822 43.716 43.642 43.574 43.491 43.295 43.182 43.073 42.932 42.748 42.525 42.19 41.098 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt deleted file mode 100644 index bd649584..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19805 ,TETRA ,17603331,Sun Nov 28 16:34:20 CET,Sun Nov 28 18:52:05 CET,0.0 1.74 2.243 2.616 2.958 3.233 3.466 3.688 4.081 4.263 4.427 4.361 4.846 4.967 5.181 5.366 5.51 5.573 5.705 5.842 6.034 6.177 6.32 6.511 6.691 6.857 7.008 7.14 7.284 7.413 7.539 7.675 7.815 7.959 8.094 8.231 8.37 8.519 8.639 8.73 8.82 8.904 8.958 8.942 8.874 8.788 8.61 8.216 7.496 6.338 4.161 1.43 -0.775 -2.624 -4.173 -5.574 -6.789 -7.873 -8.801 -9.681 -10.433 -11.083 -11.669 -12.21 -12.724 -13.198 -13.682 -14.117 -14.479 -14.824 -15.191 -15.511 -15.834 -16.173 -16.438 -16.705 -16.982 -17.274 -17.583 -17.792 -18.001 -18.331 -18.552 -18.771 -18.882 -19.104 -19.339 -19.585 -19.708 -20.211 -20.136 -20.293 -20.454 -20.771 -20.947 -21.136 -21.338 -21.57 -21.853 -22.224 -23.395 -2 ,31209 ,TETRA ,17603118,Sun Nov 28 16:30:19 CET,Sun Nov 28 16:31:22 CET,0.0 1.192 1.625 1.943 2.181 2.399 2.614 2.801 3.107 3.24 3.38 3.333 3.834 3.954 4.157 4.361 4.556 4.653 4.832 4.98 5.163 5.275 5.384 5.549 5.722 5.87 6.01 6.144 6.282 6.404 6.518 6.651 6.788 6.919 7.076 7.242 7.367 7.505 7.63 7.728 7.811 7.878 7.984 8.046 8.011 7.896 7.684 7.348 6.751 5.643 3.608 1.117 -1.05 -2.941 -4.505 -5.845 -6.982 -8.003 -8.885 -9.715 -10.393 -10.985 -11.517 -12.001 -12.442 -12.845 -13.268 -13.643 -13.969 -14.297 -14.624 -14.904 -15.212 -15.533 -15.773 -16.019 -16.268 -16.516 -16.779 -16.969 -17.16 -17.461 -17.69 -17.925 -18.038 -18.271 -18.508 -18.737 -18.857 -19.356 -19.263 -19.408 -19.558 -19.885 -20.07 -20.281 -20.502 -20.742 -21.035 -21.495 -23.26 -3 ,23384 ,TETRA ,17603119,Sun Nov 28 16:30:42 CET,Sun Nov 28 16:31:38 CET,0.0 1.37 1.81 2.13 2.417 2.686 2.927 3.131 3.51 3.685 3.843 3.782 4.276 4.403 4.593 4.787 4.991 5.076 5.216 5.339 5.52 5.65 5.775 5.941 6.093 6.226 6.344 6.473 6.654 6.813 6.955 7.139 7.309 7.473 7.646 7.799 7.924 8.054 8.193 8.31 8.428 8.547 8.607 8.599 8.521 8.375 8.151 7.755 7.055 5.882 3.712 1.049 -1.174 -3.063 -4.639 -6.084 -7.285 -8.262 -9.077 -9.908 -10.623 -11.262 -11.86 -12.392 -12.872 -13.303 -13.759 -14.161 -14.497 -14.837 -15.196 -15.502 -15.825 -16.15 -16.394 -16.639 -16.886 -17.148 -17.425 -17.618 -17.813 -18.117 -18.32 -18.523 -18.626 -18.847 -19.087 -19.328 -19.455 -19.964 -19.9 -20.069 -20.243 -20.594 -20.774 -20.972 -21.2 -21.449 -21.747 -22.149 -23.663 -5 ,3202 ,TETRA ,17603335,Sun Nov 28 16:34:39 CET,Sun Nov 28 18:51:28 CET,0.0 1.885 2.398 2.773 3.084 3.353 3.597 3.816 4.174 4.331 4.485 4.429 4.917 5.042 5.279 5.482 5.663 5.739 5.867 5.989 6.162 6.281 6.395 6.561 6.718 6.846 6.979 7.111 7.284 7.454 7.601 7.807 8.016 8.154 8.277 8.408 8.534 8.683 8.81 8.878 8.958 9.072 9.148 9.157 9.131 9.025 8.736 8.235 7.433 6.16 3.924 1.095 -1.228 -3.097 -4.625 -5.963 -7.111 -8.126 -8.99 -9.832 -10.537 -11.137 -11.705 -12.246 -12.735 -13.189 -13.666 -14.08 -14.448 -14.83 -15.229 -15.558 -15.862 -16.164 -16.409 -16.659 -16.92 -17.191 -17.469 -17.66 -17.855 -18.172 -18.39 -18.624 -18.737 -18.953 -19.188 -19.453 -19.596 -20.122 -20.064 -20.224 -20.384 -20.735 -20.928 -21.127 -21.358 -21.62 -21.923 -22.322 -23.45 -6 ,26724 ,TETRA ,17603123,Sun Nov 28 16:30:42 CET,Sun Nov 28 16:31:39 CET,0.0 1.92 2.515 2.925 3.244 3.528 3.773 4.004 4.376 4.506 4.618 4.504 4.978 5.09 5.278 5.445 5.594 5.663 5.805 5.949 6.161 6.311 6.445 6.616 6.793 6.961 7.106 7.246 7.408 7.537 7.682 7.87 8.033 8.174 8.334 8.506 8.629 8.721 8.806 8.898 8.984 9.033 9.022 9.002 8.993 8.928 8.772 8.484 7.919 6.833 4.889 2.407 0.265 -1.522 -3.045 -4.404 -5.572 -6.587 -7.434 -8.29 -9.026 -9.681 -10.308 -10.872 -11.386 -11.852 -12.327 -12.762 -13.149 -13.527 -13.919 -14.249 -14.564 -14.889 -15.142 -15.402 -15.682 -15.979 -16.295 -16.511 -16.728 -17.052 -17.268 -17.485 -17.603 -17.847 -18.089 -18.35 -18.485 -18.99 -18.896 -19.035 -19.182 -19.513 -19.696 -19.885 -20.1 -20.36 -20.657 -21.016 -22.302 -8 ,25320 ,TETRA ,17603125,Sun Nov 28 16:30:42 CET,Sun Nov 28 16:31:37 CET,0.0 1.703 2.259 2.645 2.927 3.196 3.437 3.651 4.023 4.186 4.349 4.285 4.751 4.871 5.112 5.331 5.513 5.593 5.768 5.963 6.229 6.394 6.561 6.776 6.982 7.167 7.323 7.48 7.665 7.83 7.965 8.09 8.192 8.304 8.436 8.561 8.675 8.79 8.907 8.998 9.076 9.144 9.18 9.2 9.131 8.96 8.685 8.265 7.6 6.425 4.201 1.349 -0.919 -2.754 -4.303 -5.627 -6.751 -7.762 -8.652 -9.548 -10.3 -10.942 -11.522 -12.067 -12.59 -13.071 -13.574 -14.003 -14.359 -14.714 -15.075 -15.379 -15.691 -16.022 -16.276 -16.534 -16.795 -17.062 -17.348 -17.545 -17.742 -18.055 -18.274 -18.503 -18.618 -18.846 -19.088 -19.36 -19.501 -19.999 -19.903 -20.055 -20.206 -20.516 -20.685 -20.876 -21.087 -21.318 -21.621 -22.022 -23.109 -9 ,19379 ,TETRA ,17603339,Sun Nov 28 16:34:25 CET,Sun Nov 28 18:48:50 CET,0.0 1.688 2.202 2.534 2.782 3.017 3.273 3.513 3.938 4.118 4.276 4.181 4.645 4.762 4.977 5.178 5.354 5.43 5.59 5.751 5.963 6.086 6.208 6.386 6.549 6.718 6.903 7.089 7.301 7.475 7.65 7.858 8.048 8.222 8.38 8.523 8.645 8.768 8.891 9.016 9.112 9.187 9.254 9.253 9.207 9.135 8.922 8.476 7.716 6.381 4.034 1.285 -0.94 -2.799 -4.399 -5.775 -6.917 -7.971 -8.878 -9.759 -10.507 -11.158 -11.787 -12.408 -12.992 -13.481 -13.951 -14.385 -14.751 -15.115 -15.502 -15.815 -16.108 -16.421 -16.676 -16.93 -17.19 -17.451 -17.701 -17.88 -18.077 -18.381 -18.585 -18.785 -18.891 -19.112 -19.331 -19.57 -19.695 -20.192 -20.089 -20.241 -20.391 -20.701 -20.875 -21.066 -21.269 -21.493 -21.775 -22.183 -23.612 -10 ,226 ,TETRA ,17603127,Sun Nov 28 16:30:43 CET,Sun Nov 28 16:31:36 CET,0.0 1.238 1.727 2.087 2.353 2.565 2.765 2.944 3.27 3.416 3.561 3.486 3.948 4.071 4.312 4.522 4.713 4.791 4.929 5.07 5.272 5.397 5.525 5.705 5.87 6.012 6.139 6.254 6.395 6.536 6.68 6.849 6.986 7.098 7.224 7.359 7.476 7.598 7.712 7.809 7.883 7.945 7.988 7.978 7.931 7.826 7.563 7.132 6.377 5.007 2.607 -0.213 -2.55 -4.488 -6.065 -7.455 -8.639 -9.659 -10.539 -11.405 -12.105 -12.72 -13.331 -13.901 -14.397 -14.83 -15.278 -15.671 -16.005 -16.349 -16.691 -16.99 -17.311 -17.617 -17.868 -18.128 -18.373 -18.622 -18.884 -19.067 -19.258 -19.544 -19.739 -19.956 -20.071 -20.303 -20.539 -20.787 -20.918 -21.411 -21.305 -21.447 -21.584 -21.886 -22.057 -22.238 -22.429 -22.646 -22.915 -23.269 -25.037 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 30509dd5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24563 ,TETRA ,17603128,Sun Nov 28 16:30:42 CET,Sun Nov 28 16:31:35 CET,0.0 1.666 2.074 2.361 2.605 2.812 2.988 3.144 3.413 3.531 3.646 3.495 3.944 4.043 4.223 4.372 4.503 4.561 4.665 4.782 4.963 5.074 5.177 5.305 5.419 5.522 5.612 5.687 5.778 5.886 6.015 6.154 6.286 6.431 6.566 6.668 6.74 6.771 6.793 6.817 6.826 6.821 6.777 6.719 6.621 6.465 6.109 5.462 4.52 3.062 0.688 -2.078 -4.414 -6.407 -8.057 -9.5 -10.745 -11.882 -12.856 -13.788 -14.541 -15.167 -15.764 -16.324 -16.832 -17.291 -17.765 -18.18 -18.528 -18.905 -19.294 -19.596 -19.901 -20.219 -20.454 -20.715 -20.997 -21.274 -21.571 -21.78 -22.001 -22.355 -22.599 -22.839 -22.961 -23.212 -23.468 -23.742 -23.882 -24.398 -24.378 -24.566 -24.759 -25.198 -25.437 -25.713 -26.016 -26.341 -26.717 -27.271 -29.279 -2 ,1520 ,TETRA ,17603342,Sun Nov 28 16:34:31 CET,Sun Nov 28 18:46:58 CET,0.0 1.41 1.826 2.113 2.353 2.556 2.715 2.84 3.079 3.197 3.309 3.156 3.595 3.684 3.868 4.035 4.193 4.262 4.359 4.44 4.539 4.614 4.697 4.799 4.88 4.95 5.019 5.074 5.128 5.178 5.221 5.264 5.314 5.363 5.41 5.45 5.48 5.525 5.576 5.604 5.592 5.557 5.477 5.329 5.101 4.82 4.412 3.793 2.959 1.705 -0.563 -3.318 -5.543 -7.404 -9.017 -10.433 -11.628 -12.672 -13.564 -14.47 -15.232 -15.883 -16.48 -17.039 -17.553 -18.006 -18.485 -18.899 -19.268 -19.656 -20.039 -20.368 -20.704 -21.05 -21.317 -21.574 -21.836 -22.112 -22.39 -22.6 -22.838 -23.203 -23.455 -23.715 -23.848 -24.127 -24.411 -24.679 -24.814 -25.354 -25.377 -25.575 -25.768 -26.147 -26.389 -26.667 -26.947 -27.251 -27.634 -28.124 -30.499 -3 ,22294 ,TETRA ,17603343,Sun Nov 28 16:35:00 CET,Sun Nov 28 18:56:39 CET,0.0 2.522 2.88 3.156 3.412 3.612 3.776 3.9 4.119 4.235 4.338 4.182 4.608 4.673 4.827 5.001 5.145 5.21 5.324 5.403 5.519 5.593 5.669 5.787 5.891 5.982 6.072 6.154 6.258 6.348 6.418 6.485 6.536 6.582 6.622 6.654 6.684 6.738 6.792 6.813 6.798 6.738 6.662 6.573 6.396 6.114 5.731 5.131 4.114 2.633 0.348 -2.496 -4.912 -6.878 -8.452 -9.782 -10.939 -12.014 -12.911 -13.746 -14.437 -15.049 -15.657 -16.232 -16.747 -17.209 -17.695 -18.14 -18.518 -18.905 -19.306 -19.627 -19.95 -20.29 -20.555 -20.814 -21.07 -21.348 -21.636 -21.834 -22.039 -22.343 -22.555 -22.778 -22.904 -23.177 -23.468 -23.765 -23.909 -24.423 -24.366 -24.521 -24.7 -25.179 -25.443 -25.72 -26.037 -26.391 -26.786 -27.304 -29.332 -4 ,21682 ,TETRA ,17603131,Sun Nov 28 16:30:44 CET,Sun Nov 28 16:31:43 CET,0.0 1.701 2.095 2.381 2.601 2.766 2.917 3.048 3.268 3.373 3.46 3.247 3.656 3.719 3.865 4.009 4.125 4.179 4.284 4.379 4.503 4.577 4.648 4.76 4.868 4.963 5.043 5.146 5.295 5.39 5.465 5.55 5.615 5.682 5.765 5.845 5.91 5.972 6.013 6.035 6.059 6.053 5.99 5.921 5.808 5.61 5.262 4.68 3.676 2.09 -0.34 -3.103 -5.446 -7.443 -9.105 -10.544 -11.759 -12.817 -13.716 -14.6 -15.328 -15.971 -16.578 -17.14 -17.664 -18.164 -18.674 -19.109 -19.498 -19.895 -20.281 -20.578 -20.899 -21.265 -21.539 -21.795 -22.061 -22.343 -22.642 -22.856 -23.064 -23.383 -23.608 -23.826 -23.939 -24.191 -24.482 -24.793 -24.935 -25.449 -25.411 -25.577 -25.771 -26.241 -26.497 -26.781 -27.081 -27.395 -27.759 -28.267 -30.055 -5 ,10155 ,TETRA ,17603345,Sun Nov 28 16:34:38 CET,Sun Nov 28 18:47:08 CET,0.0 1.71 2.193 2.518 2.756 2.924 3.073 3.22 3.46 3.569 3.672 3.486 3.913 3.993 4.152 4.278 4.383 4.439 4.55 4.642 4.766 4.846 4.92 5.028 5.121 5.218 5.317 5.402 5.516 5.625 5.717 5.813 5.902 5.987 6.084 6.165 6.23 6.303 6.352 6.39 6.405 6.356 6.266 6.133 5.893 5.628 5.28 4.785 3.948 2.504 0.183 -2.676 -5.075 -7.105 -8.766 -10.218 -11.449 -12.481 -13.373 -14.252 -14.98 -15.639 -16.264 -16.843 -17.368 -17.843 -18.361 -18.817 -19.203 -19.594 -19.987 -20.305 -20.668 -21.058 -21.35 -21.662 -21.959 -22.253 -22.564 -22.778 -23.001 -23.337 -23.561 -23.81 -23.938 -24.187 -24.437 -24.697 -24.837 -25.358 -25.305 -25.474 -25.652 -26.025 -26.231 -26.456 -26.7 -27.009 -27.423 -28.015 -29.68 -7 ,9049 ,TETRA ,17603134,Sun Nov 28 16:30:44 CET,Sun Nov 28 16:31:50 CET,0.0 1.705 2.109 2.418 2.664 2.871 3.063 3.219 3.499 3.633 3.741 3.556 4.0 4.109 4.319 4.482 4.609 4.664 4.774 4.903 5.079 5.165 5.241 5.339 5.436 5.528 5.636 5.759 5.913 6.063 6.172 6.283 6.4 6.498 6.582 6.665 6.728 6.784 6.816 6.824 6.849 6.877 6.848 6.72 6.498 6.23 5.921 5.368 4.364 2.88 0.384 -2.621 -4.98 -6.901 -8.53 -9.987 -11.238 -12.326 -13.229 -14.086 -14.804 -15.472 -16.121 -16.706 -17.228 -17.699 -18.19 -18.628 -19.015 -19.414 -19.808 -20.144 -20.498 -20.858 -21.142 -21.421 -21.698 -22.001 -22.311 -22.515 -22.727 -23.079 -23.329 -23.574 -23.705 -23.973 -24.249 -24.534 -24.682 -25.225 -25.229 -25.427 -25.635 -26.045 -26.266 -26.54 -26.846 -27.175 -27.602 -28.177 -30.175 -8 ,9558 ,TETRA ,17603135,Sun Nov 28 16:30:44 CET,Sun Nov 28 16:31:41 CET,0.0 1.545 1.901 2.186 2.42 2.633 2.802 2.94 3.194 3.296 3.381 3.193 3.629 3.722 3.881 4.014 4.125 4.173 4.271 4.363 4.527 4.646 4.742 4.868 4.972 5.071 5.162 5.251 5.361 5.46 5.544 5.63 5.712 5.798 5.911 6.038 6.113 6.149 6.182 6.187 6.193 6.211 6.23 6.236 6.122 5.958 5.732 5.233 4.388 3.054 0.857 -1.85 -4.075 -5.943 -7.541 -8.941 -10.144 -11.167 -12.006 -12.821 -13.522 -14.14 -14.695 -15.223 -15.743 -16.207 -16.665 -17.059 -17.393 -17.748 -18.114 -18.41 -18.723 -19.07 -19.341 -19.602 -19.853 -20.118 -20.413 -20.607 -20.81 -21.124 -21.334 -21.555 -21.664 -21.884 -22.111 -22.375 -22.526 -23.065 -23.093 -23.293 -23.491 -23.957 -24.211 -24.461 -24.72 -25.001 -25.335 -25.84 -27.795 -9 ,11914 ,TETRA ,17603349,Sun Nov 28 16:34:33 CET,Sun Nov 28 18:50:50 CET,0.0 1.76 2.158 2.442 2.68 2.892 3.062 3.212 3.459 3.568 3.678 3.516 3.964 4.048 4.202 4.368 4.532 4.598 4.71 4.819 4.961 5.051 5.134 5.236 5.345 5.451 5.534 5.609 5.707 5.809 5.903 5.992 6.075 6.154 6.236 6.332 6.408 6.479 6.545 6.589 6.603 6.607 6.605 6.586 6.54 6.439 6.226 5.855 5.22 4.066 1.832 -0.99 -3.23 -5.05 -6.6 -7.99 -9.223 -10.314 -11.227 -12.133 -12.906 -13.577 -14.213 -14.823 -15.376 -15.873 -16.423 -16.929 -17.34 -17.736 -18.118 -18.435 -18.766 -19.098 -19.363 -19.634 -19.908 -20.195 -20.485 -20.682 -20.889 -21.248 -21.485 -21.702 -21.817 -22.077 -22.363 -22.666 -22.822 -23.34 -23.266 -23.422 -23.587 -23.956 -24.163 -24.406 -24.665 -24.933 -25.298 -25.818 -27.622 -10 ,1557 ,TETRA ,17603350,Sun Nov 28 16:35:37 CET,Sun Nov 28 18:48:00 CET,0.0 1.577 1.99 2.287 2.538 2.744 2.914 3.065 3.359 3.488 3.602 3.48 3.935 4.029 4.202 4.358 4.489 4.543 4.64 4.733 4.89 5.001 5.104 5.245 5.364 5.461 5.534 5.603 5.694 5.773 5.855 5.946 6.015 6.069 6.123 6.166 6.202 6.252 6.3 6.343 6.366 6.334 6.247 6.164 6.023 5.782 5.412 4.802 3.881 2.409 -0.085 -2.914 -5.235 -7.211 -8.901 -10.321 -11.487 -12.518 -13.414 -14.309 -15.033 -15.643 -16.236 -16.784 -17.265 -17.719 -18.216 -18.638 -19.012 -19.404 -19.774 -20.069 -20.385 -20.733 -21.002 -21.283 -21.568 -21.843 -22.121 -22.312 -22.515 -22.852 -23.09 -23.327 -23.452 -23.707 -23.962 -24.246 -24.393 -24.913 -24.868 -25.028 -25.19 -25.563 -25.763 -25.969 -26.221 -26.554 -27.005 -27.628 -29.66 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt deleted file mode 100644 index d237af81..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1070 ,TETRA ,17615966,Mon Nov 29 09:35:36 CET,Mon Nov 29 11:47:13 CET,0.0 3.206 4.016 4.575 5.011 5.407 5.76 6.089 6.735 7.044 7.327 7.368 8.13 8.394 8.9 9.39 9.863 10.087 10.527 10.96 11.596 12.016 12.435 13.049 13.663 14.276 14.875 15.455 16.228 17.003 17.76 18.686 19.588 20.477 21.537 22.759 23.96 25.316 26.834 28.493 30.282 32.386 34.954 37.618 40.873 44.756 49.457 54.993 61.972 70.877 82.891 94.402 102.293 108.061 112.309 115.648 118.248 120.381 122.055 123.541 124.698 125.628 126.477 127.243 127.906 128.496 129.084 129.573 129.962 130.336 130.71 130.993 131.251 131.506 131.677 131.829 132.001 132.173 132.315 132.4 132.48 132.584 132.628 132.651 132.661 132.681 132.701 132.693 132.677 132.285 132.542 132.492 132.444 132.288 132.18 132.061 131.918 131.731 131.47 131.064 129.385 -2 ,13480 ,TETRA ,17615967,Mon Nov 29 09:35:36 CET,Mon Nov 29 11:47:54 CET,0.0 2.652 3.363 3.89 4.311 4.685 5.019 5.327 5.931 6.229 6.52 6.561 7.312 7.565 8.073 8.549 8.997 9.226 9.685 10.128 10.757 11.171 11.582 12.195 12.801 13.402 13.99 14.569 15.333 16.095 16.854 17.796 18.713 19.617 20.686 21.91 23.122 24.484 26.002 27.668 29.465 31.54 34.062 36.729 39.954 43.731 48.354 53.911 60.841 69.765 81.985 93.624 101.377 106.872 110.986 114.224 116.792 118.921 120.597 122.146 123.362 124.385 125.306 126.1 126.779 127.343 127.877 128.321 128.677 129.012 129.349 129.622 129.875 130.124 130.302 130.456 130.596 130.736 130.862 130.937 131.008 131.093 131.144 131.203 131.224 131.249 131.274 131.275 131.266 130.893 131.22 131.187 131.135 131.008 130.93 130.833 130.702 130.521 130.285 129.896 127.483 -3 ,20557 ,TETRA ,17615968,Mon Nov 29 09:35:36 CET,Mon Nov 29 11:41:41 CET,0.0 1.82 2.403 2.866 3.28 3.679 4.046 4.378 4.965 5.245 5.52 5.567 6.327 6.584 7.08 7.55 8.015 8.246 8.703 9.155 9.818 10.254 10.69 11.332 11.959 12.578 13.191 13.799 14.596 15.378 16.166 17.156 18.134 19.083 20.165 21.389 22.623 24.031 25.576 27.278 29.13 31.281 33.898 36.663 39.997 43.847 48.583 54.306 61.512 70.618 82.944 94.774 102.654 108.313 112.609 116.022 118.658 120.808 122.464 123.97 125.198 126.213 127.126 127.916 128.59 129.177 129.733 130.19 130.561 130.936 131.308 131.587 131.847 132.083 132.232 132.363 132.509 132.658 132.801 132.882 132.958 133.064 133.119 133.163 133.181 133.202 133.199 133.173 133.149 132.761 133.068 133.029 132.989 132.873 132.786 132.686 132.556 132.382 132.114 131.671 128.635 -4 ,5614 ,TETRA ,17615969,Mon Nov 29 09:35:36 CET,Mon Nov 29 11:44:48 CET,0.0 2.212 2.884 3.399 3.834 4.19 4.51 4.825 5.413 5.699 5.987 6.065 6.855 7.133 7.671 8.172 8.633 8.864 9.317 9.749 10.38 10.792 11.198 11.802 12.416 13.022 13.616 14.206 14.967 15.723 16.483 17.452 18.416 19.345 20.433 21.678 22.912 24.297 25.816 27.475 29.267 31.352 33.889 36.531 39.715 43.484 48.16 53.724 60.663 69.606 81.791 93.274 100.99 106.55 110.725 114.092 116.716 118.844 120.523 122.076 123.275 124.236 125.109 125.878 126.544 127.126 127.665 128.114 128.482 128.841 129.203 129.477 129.751 130.004 130.168 130.328 130.462 130.583 130.694 130.758 130.83 130.928 130.973 131.009 131.031 131.076 131.094 131.091 131.074 130.683 130.965 130.913 130.844 130.695 130.61 130.5 130.325 130.086 129.8 129.35 126.916 -5 ,22517 ,TETRA ,17615970,Mon Nov 29 09:35:36 CET,Mon Nov 29 11:42:11 CET,0.0 2.936 3.433 3.845 4.216 4.564 4.912 5.226 5.797 6.071 6.337 6.351 7.1 7.355 7.852 8.34 8.823 9.057 9.531 10.0 10.665 11.093 11.511 12.135 12.747 13.347 13.937 14.509 15.259 16.012 16.757 17.682 18.598 19.505 20.573 21.796 23.01 24.362 25.846 27.495 29.284 31.353 33.85 36.444 39.632 43.396 47.969 53.449 60.345 69.264 81.354 92.962 100.815 106.429 110.674 114.067 116.689 118.804 120.467 121.992 123.204 124.229 125.142 125.91 126.556 127.101 127.645 128.112 128.48 128.842 129.182 129.442 129.699 129.944 130.126 130.294 130.445 130.59 130.718 130.788 130.847 130.928 130.984 131.024 131.039 131.071 131.097 131.095 131.078 130.705 131.025 130.99 130.936 130.784 130.716 130.634 130.496 130.282 129.97 129.455 127.186 -6 ,9609 ,TETRA ,17615971,Mon Nov 29 09:35:37 CET,Mon Nov 29 11:48:34 CET,0.0 2.862 3.567 4.056 4.456 4.801 5.115 5.417 5.999 6.279 6.555 6.597 7.356 7.615 8.11 8.598 9.081 9.313 9.765 10.209 10.86 11.285 11.708 12.336 12.953 13.56 14.16 14.757 15.538 16.309 17.072 18.008 18.933 19.863 20.968 22.21 23.459 24.899 26.521 28.319 30.253 32.491 35.171 37.974 41.346 45.238 49.949 55.517 62.525 71.602 83.921 95.58 103.293 108.834 112.986 116.254 118.804 120.875 122.476 123.937 125.091 126.048 126.928 127.692 128.363 128.95 129.509 129.951 130.304 130.64 130.956 131.216 131.478 131.732 131.91 132.081 132.237 132.378 132.519 132.602 132.672 132.778 132.837 132.864 132.876 132.911 132.927 132.921 132.915 132.543 132.879 132.849 132.817 132.701 132.614 132.528 132.389 132.176 131.93 131.544 129.512 -7 ,4595 ,TETRA ,17615972,Mon Nov 29 09:35:37 CET,Mon Nov 29 11:41:29 CET,0.0 4.383 5.048 5.567 5.975 6.345 6.695 7.025 7.631 7.916 8.205 8.257 9.004 9.254 9.763 10.279 10.773 11.006 11.456 11.906 12.578 13.009 13.417 14.032 14.652 15.26 15.87 16.475 17.254 18.018 18.767 19.69 20.605 21.506 22.58 23.828 25.086 26.493 27.993 29.625 31.439 33.576 36.196 38.943 42.242 46.109 50.802 56.387 63.475 72.644 85.007 96.716 104.62 110.426 114.857 118.379 121.068 123.222 124.931 126.48 127.704 128.705 129.592 130.362 131.016 131.562 132.066 132.483 132.83 133.158 133.469 133.702 133.911 134.131 134.289 134.436 134.573 134.686 134.788 134.855 134.914 134.971 135.01 135.057 135.058 135.034 135.019 134.98 134.956 134.572 134.843 134.788 134.711 134.458 134.294 134.11 133.875 133.597 133.274 132.777 130.503 -8 ,30674 ,TETRA ,17615973,Mon Nov 29 09:35:39 CET,Mon Nov 29 11:47:16 CET,0.0 2.677 3.339 3.838 4.254 4.618 4.959 5.289 5.911 6.201 6.487 6.548 7.308 7.576 8.092 8.576 9.028 9.25 9.702 10.15 10.792 11.191 11.58 12.169 12.759 13.361 13.956 14.535 15.312 16.076 16.828 17.768 18.715 19.657 20.751 21.998 23.226 24.62 26.158 27.815 29.626 31.757 34.321 37.01 40.281 44.094 48.737 54.241 61.13 70.039 82.184 93.89 101.874 107.606 111.896 115.257 117.841 119.969 121.647 123.176 124.397 125.394 126.272 127.048 127.733 128.335 128.921 129.384 129.742 130.086 130.405 130.639 130.879 131.123 131.287 131.442 131.599 131.749 131.877 131.942 131.995 132.059 132.092 132.132 132.15 132.165 132.17 132.167 132.151 131.773 132.079 132.027 131.965 131.834 131.76 131.649 131.485 131.279 131.032 130.621 128.521 -9 ,25844 ,TETRA ,17615974,Mon Nov 29 09:35:40 CET,Mon Nov 29 11:47:22 CET,0.0 2.55 3.158 3.642 4.094 4.512 4.861 5.169 5.782 6.081 6.351 6.36 7.104 7.35 7.846 8.321 8.783 9.014 9.478 9.947 10.639 11.088 11.532 12.189 12.814 13.418 14.015 14.612 15.402 16.167 16.93 17.87 18.796 19.719 20.813 22.076 23.316 24.713 26.276 28.003 29.887 32.103 34.786 37.554 40.894 44.804 49.584 55.312 62.527 71.671 83.974 95.758 103.663 109.372 113.632 117.107 119.875 122.054 123.713 125.26 126.495 127.521 128.449 129.267 129.969 130.569 131.159 131.619 131.99 132.356 132.704 132.988 133.239 133.468 133.657 133.836 133.997 134.142 134.292 134.393 134.483 134.594 134.649 134.698 134.717 134.754 134.776 134.781 134.785 134.425 134.772 134.763 134.734 134.645 134.571 134.474 134.367 134.213 133.973 133.586 131.102 -10 ,8240 ,TETRA ,17615975,Mon Nov 29 09:35:37 CET,Mon Nov 29 11:46:57 CET,0.0 2.48 3.179 3.709 4.107 4.46 4.8 5.12 5.729 6.028 6.313 6.348 7.109 7.369 7.881 8.372 8.857 9.098 9.557 10.004 10.662 11.091 11.514 12.14 12.769 13.396 14.0 14.595 15.373 16.131 16.88 17.831 18.768 19.666 20.748 21.99 23.213 24.62 26.206 27.932 29.782 31.944 34.559 37.315 40.681 44.599 49.406 55.158 62.289 71.457 83.965 95.805 103.671 109.293 113.409 116.6 119.116 121.191 122.825 124.3 125.467 126.438 127.273 127.997 128.633 129.194 129.754 130.208 130.567 130.92 131.271 131.543 131.808 132.054 132.221 132.381 132.531 132.668 132.786 132.854 132.922 133.027 133.097 133.15 133.168 133.201 133.227 133.232 133.214 132.821 133.147 133.121 133.075 132.989 132.931 132.823 132.677 132.499 132.255 131.894 130.351 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt deleted file mode 100644 index 54b26a20..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25045 ,TETRA ,17603362,Sun Nov 28 16:35:00 CET,Sun Nov 28 18:53:34 CET,0.0 1.311 1.653 1.908 2.11 2.286 2.447 2.588 2.829 2.945 3.056 2.872 3.34 3.427 3.599 3.767 3.93 4.004 4.139 4.268 4.446 4.565 4.682 4.846 5.002 5.146 5.288 5.425 5.584 5.73 5.875 6.063 6.259 6.444 6.646 6.868 7.084 7.315 7.551 7.783 8.013 8.266 8.544 8.824 9.15 9.484 9.822 10.161 10.509 10.821 10.934 10.742 10.45 10.078 9.712 9.369 9.023 8.709 8.457 8.213 7.984 7.766 7.56 7.372 7.191 7.014 6.821 6.644 6.495 6.339 6.168 6.029 5.881 5.741 5.632 5.505 5.367 5.208 5.04 4.926 4.806 4.634 4.504 4.37 4.305 4.168 4.022 3.857 3.764 3.286 3.47 3.362 3.24 3.008 2.891 2.749 2.586 2.395 2.148 1.822 0.581 -2 ,30530 ,TETRA ,17603149,Sun Nov 28 16:30:47 CET,Sun Nov 28 16:31:44 CET,0.0 2.097 2.436 2.655 2.838 2.994 3.135 3.271 3.529 3.654 3.764 3.567 4.039 4.128 4.293 4.451 4.593 4.652 4.78 4.906 5.073 5.186 5.296 5.45 5.59 5.729 5.87 6.002 6.17 6.327 6.472 6.634 6.788 6.937 7.102 7.281 7.447 7.636 7.838 8.033 8.24 8.461 8.704 8.944 9.23 9.568 9.913 10.205 10.448 10.624 10.701 10.43 10.019 9.565 9.085 8.664 8.282 7.933 7.632 7.299 7.004 6.745 6.479 6.213 5.967 5.754 5.533 5.327 5.161 4.99 4.797 4.643 4.495 4.33 4.194 4.053 3.899 3.748 3.593 3.485 3.375 3.183 3.05 2.924 2.856 2.71 2.566 2.408 2.315 1.829 2.012 1.909 1.798 1.552 1.419 1.28 1.106 0.904 0.676 0.346 -1.295 -3 ,20970 ,TETRA ,17603364,Sun Nov 28 16:35:02 CET,Sun Nov 28 18:58:09 CET,0.0 1.677 2.035 2.281 2.491 2.666 2.817 2.953 3.188 3.297 3.406 3.233 3.71 3.793 3.947 4.102 4.242 4.306 4.438 4.559 4.734 4.846 4.951 5.108 5.251 5.388 5.509 5.624 5.789 5.934 6.07 6.235 6.381 6.526 6.705 6.911 7.097 7.29 7.496 7.709 7.913 8.125 8.384 8.656 8.958 9.267 9.58 9.893 10.219 10.511 10.589 10.262 9.834 9.4 8.994 8.61 8.247 7.917 7.617 7.308 7.045 6.821 6.605 6.379 6.163 5.967 5.763 5.582 5.418 5.236 5.052 4.901 4.736 4.57 4.446 4.313 4.167 4.013 3.856 3.749 3.635 3.443 3.315 3.182 3.115 2.978 2.818 2.648 2.559 2.086 2.286 2.189 2.085 1.853 1.719 1.575 1.417 1.224 0.964 0.621 -0.857 -4 ,6195 ,TETRA ,17603365,Sun Nov 28 16:35:16 CET,Sun Nov 28 18:57:53 CET,0.0 1.373 1.683 1.917 2.117 2.297 2.464 2.611 2.855 2.956 3.063 2.892 3.366 3.452 3.611 3.761 3.907 3.976 4.123 4.257 4.444 4.564 4.673 4.822 4.956 5.079 5.201 5.325 5.486 5.644 5.804 5.985 6.143 6.293 6.464 6.654 6.84 7.041 7.252 7.477 7.703 7.959 8.258 8.521 8.817 9.155 9.522 9.905 10.334 10.7 10.738 10.413 10.021 9.617 9.238 8.864 8.509 8.179 7.891 7.604 7.36 7.127 6.893 6.671 6.455 6.253 6.037 5.834 5.656 5.468 5.281 5.128 4.956 4.771 4.636 4.512 4.387 4.255 4.112 4.012 3.902 3.716 3.593 3.466 3.397 3.26 3.105 2.942 2.862 2.394 2.591 2.502 2.403 2.17 2.043 1.901 1.742 1.553 1.313 1.001 -0.383 -5 ,13950 ,TETRA ,17603366,Sun Nov 28 16:35:41 CET,Sun Nov 28 18:53:34 CET,0.0 1.774 2.195 2.536 2.833 3.064 3.285 3.477 3.794 3.933 4.054 3.893 4.371 4.449 4.609 4.773 4.919 4.982 5.1 5.227 5.413 5.523 5.632 5.792 5.936 6.069 6.2 6.326 6.495 6.668 6.845 7.04 7.224 7.403 7.596 7.808 8.015 8.255 8.503 8.752 9.002 9.272 9.559 9.824 10.16 10.53 10.895 11.262 11.567 11.713 11.652 11.286 10.845 10.412 9.988 9.57 9.216 8.895 8.614 8.318 8.037 7.771 7.508 7.274 7.068 6.859 6.621 6.425 6.263 6.083 5.881 5.711 5.536 5.362 5.232 5.087 4.938 4.787 4.631 4.523 4.416 4.253 4.129 3.985 3.911 3.778 3.634 3.479 3.401 2.933 3.13 3.025 2.908 2.667 2.527 2.381 2.222 2.031 1.805 1.506 0.257 -6 ,2750 ,TETRA ,17603153,Sun Nov 28 16:31:17 CET,Sun Nov 28 16:32:19 CET,0.0 1.556 1.852 2.063 2.258 2.425 2.544 2.649 2.857 2.953 3.043 2.841 3.315 3.401 3.546 3.673 3.801 3.872 3.999 4.123 4.313 4.43 4.536 4.671 4.804 4.934 5.06 5.182 5.331 5.475 5.617 5.789 5.945 6.086 6.256 6.449 6.622 6.805 7.004 7.219 7.436 7.666 7.912 8.155 8.435 8.731 9.06 9.406 9.728 9.981 10.081 9.9 9.594 9.241 8.898 8.551 8.232 7.92 7.598 7.268 6.989 6.73 6.47 6.211 5.977 5.769 5.539 5.336 5.167 4.999 4.823 4.656 4.474 4.296 4.161 4.018 3.868 3.717 3.549 3.432 3.321 3.158 3.038 2.909 2.842 2.7 2.563 2.418 2.337 1.867 2.053 1.951 1.84 1.589 1.451 1.295 1.119 0.903 0.649 0.34 -0.978 -7 ,8676 ,TETRA ,17603154,Sun Nov 28 16:31:18 CET,Sun Nov 28 16:32:27 CET,0.0 1.36 1.628 1.823 1.983 2.132 2.267 2.389 2.607 2.705 2.8 2.591 3.051 3.124 3.258 3.379 3.502 3.57 3.698 3.812 3.986 4.086 4.179 4.318 4.446 4.566 4.686 4.802 4.948 5.087 5.216 5.382 5.541 5.676 5.825 5.992 6.15 6.33 6.526 6.719 6.908 7.135 7.407 7.655 7.921 8.208 8.524 8.826 9.089 9.278 9.314 9.09 8.672 8.182 7.749 7.363 7.011 6.682 6.377 6.065 5.796 5.559 5.313 5.072 4.854 4.656 4.438 4.229 4.058 3.891 3.714 3.563 3.402 3.244 3.125 2.989 2.846 2.695 2.537 2.426 2.3 2.111 1.994 1.878 1.813 1.666 1.51 1.333 1.242 0.767 0.96 0.855 0.741 0.488 0.353 0.204 0.045 -0.118 -0.338 -0.637 -1.758 -8 ,22678 ,TETRA ,17603155,Sun Nov 28 16:31:20 CET,Sun Nov 28 16:32:30 CET,0.0 1.397 1.749 2.016 2.217 2.386 2.543 2.674 2.894 2.993 3.09 2.9 3.371 3.451 3.612 3.765 3.9 3.963 4.08 4.185 4.353 4.468 4.575 4.735 4.887 5.025 5.152 5.27 5.418 5.561 5.695 5.855 6.004 6.151 6.317 6.494 6.665 6.843 7.036 7.241 7.441 7.663 7.943 8.2 8.475 8.77 9.084 9.397 9.72 9.956 9.968 9.719 9.307 8.896 8.517 8.155 7.79 7.438 7.138 6.831 6.57 6.337 6.103 5.874 5.66 5.452 5.224 5.02 4.846 4.671 4.478 4.311 4.153 4.004 3.873 3.734 3.593 3.423 3.25 3.138 3.023 2.82 2.663 2.507 2.43 2.268 2.085 1.902 1.817 1.339 1.524 1.413 1.279 0.998 0.857 0.711 0.554 0.368 0.136 -0.198 -1.91 -9 ,9091 ,TETRA ,17603370,Sun Nov 28 16:35:08 CET,Sun Nov 28 18:54:55 CET,0.0 1.915 2.253 2.505 2.72 2.902 3.063 3.201 3.434 3.54 3.642 3.452 3.928 4.021 4.184 4.333 4.464 4.527 4.663 4.792 4.978 5.094 5.21 5.384 5.542 5.684 5.818 5.946 6.1 6.246 6.393 6.575 6.74 6.9 7.091 7.306 7.503 7.697 7.907 8.138 8.369 8.623 8.897 9.144 9.407 9.672 9.969 10.292 10.645 10.946 11.061 10.869 10.541 10.126 9.728 9.353 8.988 8.643 8.328 8.003 7.731 7.499 7.261 7.024 6.809 6.6 6.38 6.185 6.01 5.84 5.666 5.51 5.357 5.207 5.083 4.956 4.822 4.668 4.499 4.382 4.261 4.078 3.938 3.791 3.723 3.573 3.406 3.229 3.143 2.679 2.861 2.756 2.66 2.427 2.29 2.137 1.977 1.789 1.545 1.24 0.222 -10 ,2708 ,TETRA ,17603371,Sun Nov 28 16:35:06 CET,Sun Nov 28 18:48:59 CET,0.0 1.996 2.461 2.801 3.043 3.245 3.413 3.564 3.843 3.973 4.09 3.907 4.389 4.477 4.644 4.808 4.948 5.009 5.144 5.282 5.466 5.587 5.7 5.854 6.012 6.163 6.311 6.457 6.637 6.811 6.975 7.166 7.342 7.496 7.676 7.903 8.117 8.319 8.533 8.788 9.048 9.306 9.572 9.855 10.182 10.501 10.846 11.196 11.582 11.941 12.086 11.874 11.421 10.914 10.46 10.026 9.641 9.29 8.984 8.653 8.366 8.124 7.882 7.657 7.439 7.231 7.007 6.805 6.628 6.444 6.26 6.11 5.95 5.779 5.641 5.495 5.348 5.194 5.037 4.932 4.832 4.663 4.532 4.398 4.331 4.176 4.015 3.855 3.771 3.295 3.485 3.376 3.258 3.012 2.873 2.72 2.55 2.336 2.05 1.713 0.491 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 4e19fc11..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20202 ,TETRA ,17603372,Sun Nov 28 16:35:02 CET,Sun Nov 28 18:55:02 CET,0.0 1.597 1.895 2.108 2.286 2.445 2.597 2.728 2.961 3.067 3.163 2.961 3.425 3.499 3.656 3.812 3.951 4.02 4.155 4.285 4.475 4.594 4.711 4.882 5.043 5.195 5.341 5.484 5.674 5.854 6.025 6.244 6.451 6.655 6.89 7.152 7.406 7.667 7.94 8.23 8.533 8.864 9.229 9.596 10.034 10.505 11.026 11.606 12.266 12.98 13.745 14.142 14.167 14.101 13.964 13.771 13.573 13.364 13.154 12.922 12.722 12.56 12.403 12.235 12.085 11.952 11.797 11.651 11.523 11.383 11.244 11.123 10.988 10.853 10.734 10.613 10.495 10.368 10.238 10.146 10.045 9.885 9.782 9.674 9.612 9.484 9.349 9.208 9.133 8.686 8.9 8.804 8.705 8.495 8.372 8.233 8.081 7.906 7.687 7.432 6.062 -2 ,4464 ,TETRA ,17603159,Sun Nov 28 16:31:18 CET,Sun Nov 28 16:32:28 CET,0.0 1.409 1.735 1.987 2.207 2.398 2.589 2.75 3.016 3.136 3.244 3.063 3.54 3.626 3.786 3.935 4.072 4.143 4.277 4.397 4.58 4.697 4.805 4.966 5.132 5.285 5.42 5.55 5.719 5.883 6.042 6.223 6.4 6.593 6.815 7.041 7.247 7.489 7.766 8.056 8.355 8.693 9.082 9.468 9.924 10.396 10.883 11.417 12.009 12.654 13.335 13.722 13.816 13.756 13.606 13.411 13.22 13.052 12.878 12.678 12.492 12.305 12.115 11.946 11.792 11.639 11.458 11.292 11.15 10.989 10.812 10.668 10.521 10.375 10.262 10.148 10.031 9.908 9.785 9.688 9.578 9.4 9.275 9.151 9.088 8.953 8.816 8.678 8.597 8.14 8.342 8.259 8.167 7.953 7.826 7.666 7.49 7.299 7.05 6.684 5.199 -4 ,12663 ,TETRA ,17603161,Sun Nov 28 16:31:20 CET,Sun Nov 28 16:32:29 CET,0.0 1.477 1.789 2.005 2.176 2.341 2.49 2.625 2.868 2.977 3.077 2.872 3.331 3.412 3.57 3.716 3.849 3.916 4.045 4.167 4.351 4.466 4.571 4.719 4.864 5.018 5.171 5.321 5.509 5.686 5.86 6.067 6.262 6.446 6.655 6.897 7.136 7.402 7.678 7.969 8.283 8.623 9.041 9.468 9.953 10.466 11.013 11.643 12.347 13.077 13.885 14.422 14.617 14.626 14.519 14.372 14.207 14.033 13.87 13.691 13.521 13.363 13.209 13.063 12.907 12.747 12.576 12.404 12.257 12.12 11.967 11.828 11.691 11.548 11.419 11.282 11.15 11.01 10.869 10.772 10.662 10.477 10.345 10.219 10.157 10.03 9.889 9.738 9.655 9.186 9.384 9.29 9.197 9.002 8.884 8.747 8.592 8.407 8.155 7.814 6.214 -5 ,21474 ,TETRA ,17603376,Sun Nov 28 16:35:14 CET,Sun Nov 28 18:51:42 CET,0.0 1.387 1.749 1.98 2.143 2.292 2.436 2.58 2.844 2.959 3.057 2.855 3.314 3.394 3.553 3.703 3.854 3.923 4.06 4.194 4.375 4.486 4.597 4.77 4.926 5.074 5.222 5.364 5.552 5.735 5.908 6.123 6.316 6.489 6.696 6.938 7.168 7.425 7.7 8.0 8.317 8.648 9.044 9.453 9.936 10.443 10.978 11.592 12.283 13.064 13.948 14.399 14.523 14.483 14.368 14.246 14.117 13.965 13.794 13.617 13.467 13.316 13.16 13.017 12.886 12.764 12.634 12.504 12.373 12.227 12.073 11.951 11.823 11.681 11.568 11.449 11.326 11.205 11.07 10.966 10.856 10.69 10.553 10.406 10.34 10.196 10.051 9.911 9.833 9.364 9.56 9.465 9.358 9.107 8.964 8.833 8.705 8.54 8.31 8.002 6.833 -6 ,22109 ,TETRA ,17603163,Sun Nov 28 16:31:20 CET,Sun Nov 28 16:32:49 CET,0.0 1.066 1.366 1.595 1.772 1.935 2.08 2.207 2.429 2.536 2.634 2.422 2.898 2.993 3.159 3.314 3.464 3.535 3.666 3.788 3.969 4.083 4.186 4.34 4.496 4.644 4.791 4.932 5.097 5.263 5.434 5.632 5.808 5.975 6.165 6.382 6.6 6.843 7.095 7.357 7.643 7.969 8.353 8.718 9.105 9.541 10.054 10.661 11.391 12.143 12.857 13.303 13.401 13.367 13.256 13.094 12.914 12.726 12.558 12.38 12.185 12.013 11.887 11.756 11.617 11.473 11.31 11.173 11.051 10.911 10.765 10.647 10.526 10.389 10.274 10.157 10.044 9.926 9.794 9.696 9.601 9.455 9.339 9.218 9.16 9.033 8.891 8.742 8.67 8.213 8.409 8.317 8.22 7.996 7.868 7.738 7.586 7.391 7.135 6.808 5.352 -7 ,5079 ,TETRA ,17603164,Sun Nov 28 16:31:21 CET,Sun Nov 28 16:32:53 CET,0.0 1.383 1.672 1.893 2.064 2.212 2.348 2.47 2.688 2.791 2.884 2.682 3.152 3.236 3.398 3.557 3.71 3.784 3.928 4.066 4.253 4.365 4.487 4.681 4.853 5.004 5.145 5.281 5.452 5.612 5.772 5.977 6.171 6.351 6.563 6.813 7.054 7.312 7.591 7.881 8.169 8.485 8.861 9.244 9.696 10.215 10.801 11.427 12.107 12.815 13.555 13.973 14.089 14.088 13.982 13.827 13.665 13.491 13.32 13.129 12.948 12.77 12.581 12.399 12.239 12.095 11.935 11.79 11.669 11.54 11.38 11.249 11.122 10.978 10.867 10.753 10.631 10.501 10.368 10.273 10.173 10.016 9.906 9.798 9.739 9.61 9.463 9.312 9.233 8.773 8.975 8.88 8.767 8.526 8.403 8.26 8.1 7.914 7.682 7.369 5.993 -8 ,19921 ,TETRA ,17603379,Sun Nov 28 16:35:09 CET,Sun Nov 28 18:52:26 CET,0.0 0.963 1.296 1.523 1.714 1.885 2.023 2.145 2.373 2.478 2.574 2.385 2.851 2.935 3.111 3.277 3.428 3.504 3.651 3.782 3.976 4.103 4.225 4.383 4.536 4.691 4.841 4.981 5.166 5.357 5.535 5.755 5.964 6.163 6.392 6.639 6.885 7.16 7.469 7.786 8.1 8.442 8.835 9.253 9.704 10.151 10.68 11.289 11.969 12.744 13.579 14.073 14.245 14.225 14.11 13.937 13.75 13.56 13.364 13.174 13.008 12.854 12.698 12.53 12.366 12.219 12.07 11.922 11.798 11.674 11.524 11.396 11.253 11.1 10.994 10.882 10.76 10.628 10.494 10.403 10.304 10.15 10.044 9.923 9.857 9.717 9.576 9.416 9.326 8.868 9.066 8.963 8.862 8.614 8.471 8.305 8.123 7.938 7.718 7.405 6.276 -9 ,19799 ,TETRA ,17603380,Sun Nov 28 16:35:38 CET,Sun Nov 28 18:51:45 CET,0.0 1.007 1.295 1.513 1.69 1.839 1.961 2.08 2.305 2.405 2.501 2.288 2.749 2.829 2.976 3.114 3.264 3.341 3.481 3.603 3.772 3.884 3.994 4.149 4.299 4.444 4.579 4.709 4.883 5.058 5.223 5.413 5.593 5.769 5.976 6.205 6.433 6.687 6.955 7.243 7.555 7.921 8.346 8.756 9.217 9.731 10.293 10.883 11.523 12.23 12.998 13.452 13.513 13.413 13.279 13.143 12.987 12.805 12.622 12.399 12.195 12.002 11.807 11.623 11.454 11.305 11.146 11.0 10.867 10.722 10.56 10.416 10.271 10.13 10.02 9.897 9.754 9.601 9.454 9.359 9.263 9.117 9.016 8.904 8.843 8.715 8.57 8.424 8.346 7.867 8.039 7.94 7.837 7.632 7.511 7.361 7.194 7.002 6.782 6.494 5.264 -10 ,7021 ,TETRA ,17603167,Sun Nov 28 16:31:19 CET,Sun Nov 28 16:32:49 CET,0.0 1.497 1.837 2.094 2.309 2.488 2.645 2.796 3.05 3.159 3.263 3.064 3.538 3.622 3.779 3.922 4.057 4.124 4.259 4.395 4.599 4.721 4.837 5.01 5.172 5.322 5.469 5.615 5.787 5.959 6.14 6.355 6.546 6.736 6.963 7.204 7.441 7.713 8.002 8.282 8.571 8.904 9.277 9.664 10.129 10.634 11.207 11.845 12.568 13.385 14.283 14.833 15.052 15.063 14.976 14.871 14.767 14.653 14.514 14.352 14.198 14.049 13.903 13.746 13.58 13.427 13.278 13.133 12.998 12.853 12.706 12.58 12.441 12.306 12.211 12.104 11.986 11.867 11.744 11.656 11.553 11.387 11.27 11.141 11.078 10.949 10.817 10.677 10.604 10.15 10.338 10.246 10.148 9.919 9.795 9.651 9.499 9.307 9.067 8.765 6.952 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt deleted file mode 100644 index 9e57e24a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17801 ,TETRA ,17603168,Sun Nov 28 16:31:21 CET,Sun Nov 28 16:32:49 CET,0.0 1.078 1.454 1.735 1.956 2.151 2.339 2.52 2.856 3.013 3.16 3.009 3.566 3.698 3.952 4.203 4.443 4.56 4.786 4.993 5.3 5.493 5.682 5.96 6.233 6.496 6.746 6.991 7.303 7.604 7.907 8.28 8.641 9.009 9.44 9.929 10.4 10.915 11.499 12.15 12.851 13.649 14.578 15.513 16.636 17.904 19.41 21.168 23.26 25.794 28.91 31.461 32.87 33.768 34.396 34.781 35.03 35.231 35.3 35.289 35.281 35.261 35.227 35.181 35.126 35.041 34.91 34.8 34.7 34.576 34.432 34.291 34.135 33.994 33.893 33.785 33.674 33.528 33.352 33.235 33.098 32.861 32.714 32.567 32.483 32.3 32.092 31.851 31.715 31.198 31.332 31.197 31.05 30.658 30.415 30.145 29.855 29.513 29.064 28.429 25.989 -2 ,17994 ,TETRA ,17603383,Sun Nov 28 16:35:08 CET,Sun Nov 28 18:44:40 CET,0.0 1.001 1.383 1.682 1.924 2.142 2.346 2.52 2.83 2.973 3.114 2.961 3.519 3.65 3.885 4.107 4.332 4.445 4.672 4.889 5.205 5.415 5.613 5.894 6.167 6.426 6.674 6.92 7.247 7.566 7.87 8.25 8.642 9.028 9.464 9.952 10.425 10.958 11.543 12.152 12.819 13.613 14.545 15.505 16.656 17.985 19.532 21.292 23.429 26.065 29.365 32.19 33.83 34.787 35.412 35.796 35.997 36.141 36.219 36.212 36.188 36.16 36.086 35.973 35.806 35.627 35.449 35.309 35.2 35.086 34.953 34.806 34.62 34.431 34.304 34.177 34.042 33.906 33.753 33.646 33.524 33.309 33.16 32.994 32.898 32.697 32.491 32.267 32.144 31.634 31.752 31.612 31.47 31.176 31.007 30.801 30.555 30.257 29.899 29.383 26.705 -3 ,28435 ,TETRA ,17603384,Sun Nov 28 16:35:09 CET,Sun Nov 28 18:43:47 CET,0.0 1.053 1.447 1.772 2.038 2.26 2.456 2.631 2.963 3.118 3.268 3.121 3.67 3.802 4.062 4.31 4.544 4.654 4.87 5.083 5.38 5.571 5.773 6.067 6.343 6.612 6.871 7.125 7.461 7.788 8.096 8.479 8.863 9.229 9.661 10.165 10.656 11.2 11.79 12.427 13.114 13.881 14.791 15.757 16.95 18.289 19.814 21.571 23.66 26.227 29.461 31.96 33.39 34.398 35.072 35.485 35.706 35.852 35.911 35.944 35.968 35.934 35.848 35.747 35.654 35.59 35.496 35.341 35.208 35.056 34.895 34.758 34.597 34.434 34.3 34.146 33.976 33.802 33.625 33.515 33.403 33.217 33.062 32.887 32.798 32.6 32.387 32.14 32.006 31.481 31.595 31.444 31.281 30.91 30.684 30.422 30.138 29.838 29.437 28.904 26.614 -4 ,1077 ,TETRA ,17603385,Sun Nov 28 16:35:15 CET,Sun Nov 28 18:44:34 CET,0.0 1.386 1.755 2.055 2.302 2.515 2.705 2.886 3.231 3.393 3.542 3.403 3.962 4.086 4.327 4.568 4.802 4.922 5.147 5.352 5.651 5.845 6.04 6.331 6.606 6.869 7.129 7.385 7.721 8.062 8.397 8.796 9.183 9.565 10.008 10.51 10.992 11.541 12.146 12.767 13.427 14.195 15.096 16.011 17.145 18.472 20.008 21.757 23.935 26.597 29.851 32.568 34.139 35.15 35.792 36.183 36.417 36.596 36.702 36.779 36.809 36.755 36.643 36.532 36.45 36.362 36.226 36.096 35.992 35.888 35.771 35.656 35.532 35.394 35.266 35.128 34.982 34.834 34.683 34.573 34.461 34.27 34.104 33.921 33.836 33.676 33.482 33.25 33.126 32.614 32.765 32.632 32.475 32.123 31.924 31.697 31.421 31.088 30.695 30.204 27.986 -5 ,25447 ,TETRA ,17603386,Sun Nov 28 16:35:40 CET,Sun Nov 28 18:41:52 CET,0.0 1.722 2.118 2.404 2.645 2.859 3.052 3.233 3.566 3.721 3.869 3.727 4.292 4.422 4.678 4.926 5.16 5.272 5.494 5.711 6.025 6.229 6.436 6.727 7.011 7.284 7.539 7.781 8.09 8.408 8.731 9.139 9.539 9.924 10.37 10.881 11.373 11.902 12.494 13.162 13.848 14.601 15.508 16.486 17.628 18.897 20.425 22.156 24.213 26.776 30.05 32.758 34.289 35.293 35.985 36.419 36.657 36.777 36.871 36.933 36.917 36.869 36.814 36.734 36.624 36.519 36.399 36.288 36.174 36.016 35.857 35.711 35.56 35.415 35.285 35.137 34.977 34.807 34.608 34.465 34.333 34.107 33.947 33.786 33.698 33.503 33.269 33.02 32.886 32.345 32.383 32.206 32.012 31.569 31.349 31.104 30.836 30.54 30.162 29.62 27.325 -6 ,24383 ,TETRA ,17603173,Sun Nov 28 16:31:23 CET,Sun Nov 28 16:32:57 CET,0.0 1.277 1.668 1.951 2.195 2.41 2.605 2.779 3.098 3.242 3.376 3.211 3.759 3.886 4.145 4.391 4.618 4.73 4.965 5.191 5.516 5.726 5.923 6.207 6.482 6.758 7.027 7.284 7.618 7.947 8.279 8.684 9.066 9.45 9.918 10.447 10.954 11.52 12.136 12.789 13.502 14.34 15.286 16.238 17.373 18.644 20.177 21.967 24.125 26.684 29.99 32.877 34.589 35.633 36.244 36.685 36.99 37.162 37.231 37.266 37.263 37.234 37.191 37.125 37.028 36.929 36.831 36.731 36.64 36.512 36.368 36.249 36.097 35.924 35.797 35.664 35.522 35.382 35.242 35.144 35.028 34.812 34.668 34.523 34.44 34.26 34.073 33.874 33.766 33.253 33.371 33.23 33.08 32.717 32.513 32.287 32.016 31.715 31.331 30.854 28.716 -7 ,19292 ,TETRA ,17603388,Sun Nov 28 16:35:38 CET,Sun Nov 28 18:43:02 CET,0.0 1.359 1.755 2.036 2.257 2.462 2.652 2.828 3.15 3.295 3.439 3.283 3.83 3.958 4.21 4.461 4.71 4.823 5.04 5.259 5.575 5.769 5.959 6.234 6.487 6.742 6.998 7.25 7.58 7.906 8.228 8.61 8.983 9.342 9.76 10.24 10.708 11.225 11.784 12.389 13.063 13.839 14.765 15.748 16.901 18.173 19.706 21.5 23.632 26.263 29.494 32.223 33.969 35.102 35.71 36.127 36.417 36.533 36.609 36.653 36.636 36.599 36.525 36.46 36.396 36.286 36.125 35.984 35.859 35.709 35.567 35.443 35.291 35.133 34.998 34.845 34.679 34.497 34.322 34.192 34.031 33.742 33.516 33.282 33.175 32.992 32.794 32.564 32.457 31.959 32.089 31.95 31.799 31.41 31.182 30.938 30.662 30.324 29.896 29.325 27.113 -8 ,15431 ,TETRA ,17603175,Sun Nov 28 16:31:20 CET,Sun Nov 28 16:32:47 CET,0.0 1.451 1.856 2.167 2.421 2.644 2.841 3.011 3.325 3.476 3.626 3.493 4.056 4.191 4.462 4.717 4.959 5.073 5.297 5.513 5.822 6.022 6.217 6.505 6.784 7.047 7.299 7.555 7.888 8.21 8.527 8.915 9.278 9.633 10.064 10.557 11.04 11.576 12.158 12.797 13.483 14.257 15.167 16.106 17.226 18.508 20.035 21.809 23.947 26.501 29.716 32.546 34.234 35.299 35.994 36.422 36.695 36.858 36.913 36.859 36.782 36.741 36.682 36.592 36.499 36.411 36.292 36.164 36.029 35.871 35.709 35.579 35.438 35.272 35.133 34.984 34.831 34.663 34.482 34.349 34.199 33.956 33.799 33.66 33.585 33.391 33.148 32.891 32.757 32.229 32.32 32.164 32.001 31.608 31.394 31.164 30.872 30.528 30.1 29.496 27.132 -9 ,21562 ,TETRA ,17603176,Sun Nov 28 16:31:20 CET,Sun Nov 28 16:32:29 CET,0.0 0.978 1.355 1.645 1.869 2.064 2.261 2.443 2.747 2.887 3.025 2.884 3.433 3.557 3.804 4.041 4.268 4.387 4.626 4.844 5.141 5.329 5.518 5.794 6.058 6.309 6.558 6.813 7.162 7.492 7.817 8.211 8.583 8.947 9.369 9.849 10.323 10.857 11.437 12.043 12.684 13.418 14.305 15.232 16.341 17.618 19.091 20.776 22.847 25.359 28.595 31.297 32.856 33.914 34.596 35.065 35.375 35.561 35.636 35.621 35.586 35.531 35.44 35.35 35.252 35.136 35.006 34.883 34.773 34.656 34.53 34.423 34.305 34.154 34.012 33.867 33.732 33.586 33.411 33.285 33.15 32.947 32.81 32.658 32.577 32.395 32.212 32.033 31.931 31.432 31.585 31.451 31.283 30.896 30.667 30.414 30.132 29.77 29.318 28.74 26.214 -10 ,18730 ,TETRA ,17603391,Sun Nov 28 16:35:41 CET,Sun Nov 28 18:42:58 CET,0.0 1.269 1.662 1.963 2.227 2.458 2.652 2.829 3.169 3.335 3.493 3.351 3.908 4.036 4.297 4.541 4.772 4.885 5.096 5.31 5.627 5.826 6.021 6.314 6.595 6.85 7.092 7.34 7.676 8.002 8.309 8.685 9.051 9.416 9.855 10.347 10.822 11.364 11.975 12.617 13.271 14.016 14.926 15.877 17.009 18.294 19.831 21.642 23.81 26.465 29.751 32.466 34.022 35.055 35.718 36.097 36.345 36.542 36.656 36.67 36.622 36.595 36.544 36.418 36.244 36.085 35.938 35.793 35.677 35.552 35.403 35.278 35.146 35.003 34.876 34.733 34.595 34.458 34.303 34.182 34.06 33.878 33.734 33.576 33.499 33.334 33.137 32.906 32.779 32.259 32.369 32.218 32.06 31.662 31.434 31.195 30.933 30.63 30.255 29.704 27.051 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 8f7c17f1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27936 ,TETRA ,17603392,Sun Nov 28 16:35:39 CET,Sun Nov 28 18:46:22 CET,0.0 2.112 2.65 3.072 3.403 3.667 3.89 4.1 4.468 4.641 4.818 4.709 5.27 5.415 5.716 6.02 6.295 6.415 6.657 6.919 7.274 7.483 7.694 8.004 8.318 8.623 8.908 9.182 9.537 9.887 10.236 10.656 11.052 11.441 11.915 12.465 13.007 13.609 14.24 14.902 15.621 16.459 17.459 18.494 19.7 21.056 22.697 24.696 27.129 30.042 33.68 36.734 38.576 39.763 40.469 40.928 41.241 41.394 41.472 41.561 41.644 41.69 41.667 41.598 41.553 41.517 41.438 41.335 41.222 41.103 40.971 40.848 40.713 40.568 40.458 40.346 40.22 40.07 39.904 39.785 39.646 39.406 39.244 39.075 38.99 38.812 38.619 38.382 38.256 37.764 37.876 37.702 37.48 36.961 36.696 36.416 36.099 35.717 35.182 34.371 31.674 -2 ,20596 ,TETRA ,17603179,Sun Nov 28 16:31:24 CET,Sun Nov 28 16:32:55 CET,0.0 1.36 1.81 2.147 2.429 2.662 2.872 3.085 3.487 3.665 3.829 3.723 4.298 4.44 4.722 4.988 5.235 5.366 5.612 5.831 6.164 6.381 6.59 6.9 7.195 7.476 7.751 8.021 8.387 8.749 9.095 9.521 9.943 10.36 10.844 11.397 11.934 12.514 13.168 13.887 14.648 15.519 16.549 17.61 18.867 20.326 22.061 24.074 26.545 29.546 33.282 36.518 38.531 39.766 40.527 41.07 41.462 41.684 41.779 41.801 41.786 41.769 41.766 41.714 41.613 41.504 41.371 41.264 41.171 41.086 40.999 40.877 40.712 40.548 40.422 40.283 40.125 39.942 39.755 39.63 39.485 39.234 39.057 38.874 38.788 38.598 38.375 38.166 38.059 37.541 37.573 37.368 37.161 36.754 36.502 36.207 35.833 35.39 34.919 34.283 30.744 -3 ,23978 ,TETRA ,17603394,Sun Nov 28 16:35:39 CET,Sun Nov 28 18:42:55 CET,0.0 1.547 2.076 2.494 2.798 3.079 3.365 3.623 4.041 4.213 4.382 4.304 4.897 5.043 5.313 5.575 5.831 5.956 6.216 6.47 6.811 7.04 7.279 7.61 7.92 8.223 8.514 8.796 9.156 9.511 9.862 10.309 10.747 11.167 11.66 12.216 12.746 13.331 13.98 14.693 15.452 16.316 17.348 18.398 19.624 21.016 22.713 24.749 27.152 29.992 33.704 36.86 38.776 40.029 40.77 41.278 41.661 41.936 42.126 42.264 42.344 42.376 42.336 42.267 42.225 42.173 42.087 41.981 41.848 41.7 41.55 41.408 41.263 41.108 40.956 40.79 40.614 40.429 40.23 40.088 39.936 39.666 39.49 39.312 39.213 39.027 38.815 38.568 38.448 37.936 37.995 37.81 37.598 37.179 36.953 36.68 36.363 35.926 35.359 34.624 31.549 -4 ,4982 ,TETRA ,17603181,Sun Nov 28 16:31:24 CET,Sun Nov 28 16:32:42 CET,0.0 1.573 2.06 2.396 2.69 2.999 3.277 3.494 3.889 4.063 4.231 4.13 4.715 4.867 5.133 5.42 5.713 5.852 6.116 6.349 6.691 6.918 7.131 7.446 7.753 8.047 8.33 8.604 8.98 9.35 9.686 10.09 10.494 10.885 11.351 11.89 12.398 12.968 13.59 14.271 15.024 15.879 16.879 17.931 19.218 20.691 22.45 24.496 26.928 29.926 33.831 37.21 39.163 40.369 41.134 41.663 42.094 42.402 42.584 42.736 42.838 42.878 42.894 42.878 42.826 42.766 42.659 42.532 42.426 42.291 42.108 41.977 41.87 41.749 41.639 41.509 41.37 41.2 41.019 40.899 40.777 40.585 40.443 40.288 40.195 39.975 39.72 39.466 39.332 38.817 38.924 38.752 38.553 38.091 37.817 37.494 37.148 36.78 36.352 35.755 32.65 -5 ,29560 ,TETRA ,17603182,Sun Nov 28 16:31:24 CET,Sun Nov 28 16:32:59 CET,0.0 1.938 2.423 2.755 3.02 3.259 3.484 3.69 4.069 4.252 4.42 4.302 4.881 5.044 5.365 5.667 5.942 6.065 6.31 6.545 6.886 7.107 7.317 7.624 7.932 8.234 8.526 8.811 9.192 9.568 9.929 10.357 10.776 11.201 11.691 12.245 12.786 13.385 14.054 14.764 15.522 16.392 17.439 18.528 19.823 21.315 23.05 25.027 27.405 30.267 33.983 37.295 39.151 40.33 41.068 41.488 41.775 41.921 41.984 42.015 41.996 41.953 41.916 41.902 41.873 41.838 41.785 41.696 41.586 41.478 41.33 41.155 40.982 40.816 40.685 40.54 40.388 40.233 40.051 39.918 39.79 39.545 39.345 39.152 39.052 38.814 38.562 38.315 38.188 37.671 37.765 37.606 37.437 37.065 36.81 36.494 36.114 35.669 35.104 34.329 28.357 -6 ,9185 ,TETRA ,17603183,Sun Nov 28 16:31:56 CET,Sun Nov 28 16:34:19 CET,0.0 1.694 2.189 2.55 2.849 3.126 3.426 3.674 4.042 4.215 4.384 4.275 4.851 5.003 5.28 5.545 5.817 5.949 6.202 6.442 6.779 7.002 7.215 7.533 7.843 8.132 8.411 8.682 9.044 9.406 9.751 10.176 10.604 11.017 11.486 12.02 12.557 13.148 13.784 14.46 15.167 15.984 16.995 18.057 19.304 20.75 22.486 24.444 26.85 29.811 33.479 36.693 38.614 39.732 40.447 40.947 41.23 41.448 41.585 41.662 41.707 41.705 41.687 41.657 41.606 41.535 41.452 41.368 41.281 41.195 41.102 41.0 40.869 40.724 40.591 40.428 40.271 40.123 39.954 39.834 39.709 39.5 39.346 39.168 39.079 38.895 38.69 38.464 38.336 37.821 37.906 37.759 37.594 37.24 37.035 36.752 36.389 35.977 35.457 34.616 30.776 -7 ,32133 ,TETRA ,17603184,Sun Nov 28 16:31:57 CET,Sun Nov 28 16:33:27 CET,0.0 1.701 2.17 2.55 2.86 3.144 3.393 3.603 3.983 4.16 4.334 4.232 4.811 4.957 5.239 5.504 5.761 5.892 6.138 6.376 6.721 6.944 7.162 7.477 7.775 8.058 8.342 8.627 9.008 9.38 9.733 10.152 10.573 10.985 11.442 11.972 12.493 13.066 13.692 14.365 15.086 15.917 16.902 17.927 19.161 20.551 22.256 24.269 26.704 29.73 33.612 36.877 38.784 40.012 40.836 41.444 41.787 42.04 42.272 42.435 42.531 42.599 42.607 42.583 42.545 42.468 42.376 42.288 42.205 42.118 42.012 41.914 41.81 41.711 41.613 41.475 41.305 41.138 40.977 40.852 40.735 40.557 40.431 40.287 40.201 40.022 39.83 39.618 39.49 38.96 39.054 38.912 38.743 38.307 38.075 37.841 37.555 37.18 36.655 35.974 30.092 -8 ,27270 ,TETRA ,17603185,Sun Nov 28 16:31:57 CET,Sun Nov 28 16:34:11 CET,0.0 1.688 2.206 2.592 2.909 3.189 3.429 3.637 3.998 4.18 4.357 4.248 4.826 4.975 5.259 5.535 5.794 5.912 6.153 6.413 6.807 7.043 7.249 7.562 7.859 8.146 8.433 8.699 9.052 9.409 9.76 10.181 10.586 10.991 11.459 11.972 12.485 13.064 13.694 14.394 15.151 15.987 16.979 18.022 19.257 20.689 22.378 24.326 26.777 29.754 33.538 36.952 38.868 40.067 40.958 41.571 41.926 42.173 42.342 42.425 42.44 42.444 42.404 42.342 42.297 42.224 42.129 42.043 41.953 41.853 41.744 41.634 41.511 41.371 41.25 41.132 41.009 40.865 40.692 40.571 40.441 40.223 40.077 39.911 39.824 39.654 39.456 39.251 39.121 38.601 38.692 38.528 38.362 37.939 37.695 37.438 37.139 36.775 36.245 35.472 31.78 -9 ,12276 ,TETRA ,17603186,Sun Nov 28 16:31:59 CET,Sun Nov 28 16:34:06 CET,0.0 1.913 2.457 2.857 3.168 3.439 3.69 3.911 4.291 4.462 4.633 4.549 5.141 5.292 5.556 5.813 6.065 6.191 6.44 6.675 7.007 7.226 7.436 7.75 8.054 8.339 8.619 8.896 9.257 9.615 9.962 10.374 10.777 11.166 11.625 12.173 12.717 13.327 14.007 14.733 15.482 16.363 17.44 18.514 19.766 21.234 23.01 25.054 27.467 30.385 34.136 37.408 39.437 40.778 41.744 42.384 42.711 42.916 43.037 43.091 43.142 43.192 43.199 43.159 43.102 43.049 42.983 42.894 42.805 42.71 42.611 42.525 42.423 42.314 42.209 42.086 41.969 41.823 41.657 41.559 41.451 41.243 41.074 40.908 40.82 40.629 40.44 40.226 40.1 39.589 39.649 39.46 39.271 38.874 38.665 38.415 38.111 37.729 37.197 36.401 33.246 -10 ,8242 ,TETRA ,17603401,Sun Nov 28 16:35:42 CET,Sun Nov 28 18:43:51 CET,0.0 1.789 2.273 2.633 2.934 3.199 3.424 3.63 4.019 4.217 4.392 4.272 4.848 4.988 5.255 5.518 5.77 5.897 6.142 6.384 6.737 6.943 7.15 7.484 7.81 8.108 8.393 8.673 9.034 9.39 9.739 10.162 10.57 10.971 11.438 11.963 12.476 13.05 13.693 14.388 15.124 15.98 17.014 18.074 19.319 20.736 22.41 24.375 26.733 29.555 33.175 36.252 38.1 39.349 40.127 40.59 40.86 41.017 41.131 41.213 41.236 41.253 41.251 41.219 41.157 41.074 40.961 40.85 40.75 40.637 40.533 40.431 40.301 40.151 40.014 39.873 39.726 39.558 39.37 39.231 39.098 38.893 38.745 38.591 38.491 38.299 38.15 37.945 37.819 37.323 37.429 37.254 37.072 36.628 36.381 36.135 35.782 35.365 34.957 34.34 31.077 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 1554f791..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21312 ,TETRA ,17603402,Sun Nov 28 16:35:44 CET,Sun Nov 28 18:52:12 CET,0.0 1.185 1.48 1.716 1.908 2.074 2.224 2.378 2.66 2.771 2.871 2.684 3.165 3.253 3.41 3.56 3.696 3.76 3.887 4.015 4.204 4.319 4.431 4.595 4.75 4.9 5.044 5.18 5.352 5.519 5.679 5.866 6.043 6.213 6.427 6.676 6.902 7.15 7.42 7.714 8.013 8.352 8.767 9.155 9.57 10.051 10.624 11.254 11.973 12.757 13.574 14.108 14.293 14.391 14.396 14.316 14.191 14.024 13.867 13.706 13.57 13.457 13.325 13.188 13.062 12.945 12.825 12.701 12.585 12.459 12.327 12.216 12.094 11.972 11.881 11.775 11.666 11.559 11.433 11.339 11.245 11.088 10.97 10.849 10.787 10.669 10.544 10.4 10.325 9.873 10.061 9.973 9.878 9.648 9.519 9.369 9.199 9.018 8.799 8.476 7.017 -2 ,20004 ,TETRA ,17603403,Sun Nov 28 16:35:39 CET,Sun Nov 28 18:53:53 CET,0.0 1.548 1.846 2.064 2.252 2.42 2.56 2.684 2.913 3.014 3.109 2.907 3.384 3.469 3.63 3.789 3.933 4.0 4.134 4.261 4.439 4.555 4.674 4.854 5.016 5.161 5.308 5.452 5.634 5.8 5.962 6.17 6.366 6.559 6.776 7.016 7.249 7.498 7.766 8.053 8.359 8.708 9.119 9.534 10.009 10.531 11.139 11.803 12.535 13.378 14.312 14.948 15.226 15.28 15.25 15.188 15.096 14.988 14.86 14.712 14.583 14.468 14.353 14.231 14.104 13.983 13.855 13.738 13.629 13.518 13.403 13.304 13.203 13.098 13.015 12.922 12.823 12.717 12.595 12.502 12.41 12.276 12.174 12.066 12.012 11.903 11.789 11.659 11.581 11.121 11.322 11.232 11.139 10.936 10.822 10.681 10.514 10.322 10.066 9.717 8.335 -3 ,17586 ,TETRA ,17603191,Sun Nov 28 16:32:00 CET,Sun Nov 28 16:33:46 CET,0.0 1.175 1.493 1.736 1.928 2.1 2.258 2.406 2.654 2.763 2.871 2.689 3.174 3.258 3.418 3.567 3.714 3.779 3.899 4.019 4.19 4.295 4.398 4.55 4.696 4.833 4.958 5.08 5.249 5.42 5.578 5.76 5.937 6.119 6.331 6.565 6.791 7.039 7.306 7.601 7.917 8.258 8.643 9.041 9.508 10.023 10.655 11.338 12.036 12.759 13.533 14.001 14.087 14.088 14.05 13.947 13.821 13.668 13.519 13.357 13.191 13.033 12.883 12.732 12.583 12.451 12.308 12.174 12.063 11.95 11.823 11.707 11.589 11.458 11.336 11.202 11.068 10.95 10.834 10.748 10.658 10.505 10.393 10.282 10.222 10.081 9.934 9.797 9.73 9.286 9.502 9.404 9.293 9.048 8.919 8.777 8.609 8.42 8.176 7.848 6.53 -4 ,15384 ,TETRA ,17603192,Sun Nov 28 16:31:57 CET,Sun Nov 28 16:33:45 CET,0.0 1.322 1.62 1.85 2.033 2.186 2.335 2.48 2.734 2.841 2.941 2.755 3.234 3.319 3.485 3.644 3.796 3.872 4.012 4.153 4.348 4.463 4.582 4.748 4.904 5.065 5.214 5.345 5.52 5.693 5.856 6.054 6.239 6.41 6.615 6.847 7.075 7.322 7.583 7.873 8.183 8.52 8.916 9.336 9.806 10.304 10.882 11.509 12.19 12.953 13.765 14.278 14.483 14.512 14.45 14.342 14.209 14.053 13.881 13.701 13.549 13.404 13.25 13.105 12.969 12.825 12.657 12.509 12.387 12.249 12.098 11.971 11.839 11.697 11.575 11.454 11.336 11.214 11.082 10.985 10.89 10.738 10.63 10.526 10.466 10.317 10.165 10.023 9.947 9.492 9.689 9.595 9.502 9.272 9.148 9.022 8.868 8.661 8.405 8.036 6.583 -5 ,18813 ,TETRA ,17603406,Sun Nov 28 16:35:40 CET,Sun Nov 28 18:52:39 CET,0.0 1.298 1.61 1.835 2.012 2.165 2.292 2.424 2.655 2.749 2.844 2.651 3.12 3.203 3.388 3.562 3.7 3.767 3.899 4.027 4.213 4.323 4.429 4.601 4.766 4.918 5.065 5.211 5.405 5.586 5.754 5.951 6.14 6.318 6.517 6.746 6.963 7.218 7.504 7.795 8.09 8.404 8.784 9.178 9.623 10.102 10.643 11.264 11.954 12.684 13.519 14.114 14.29 14.31 14.26 14.161 14.039 13.877 13.706 13.539 13.4 13.26 13.118 12.969 12.83 12.701 12.553 12.415 12.286 12.148 12.019 11.906 11.787 11.669 11.571 11.471 11.354 11.224 11.082 10.983 10.881 10.701 10.568 10.445 10.39 10.263 10.125 9.986 9.915 9.461 9.686 9.6 9.502 9.278 9.155 9.006 8.833 8.648 8.412 8.079 6.855 -6 ,22351 ,TETRA ,17603194,Sun Nov 28 16:31:58 CET,Sun Nov 28 16:33:27 CET,0.0 1.224 1.537 1.77 1.951 2.106 2.24 2.363 2.599 2.715 2.818 2.624 3.104 3.195 3.35 3.499 3.648 3.718 3.847 3.972 4.156 4.279 4.395 4.554 4.709 4.858 5.0 5.136 5.317 5.493 5.665 5.885 6.098 6.296 6.523 6.777 7.025 7.303 7.592 7.898 8.225 8.575 8.962 9.361 9.827 10.336 10.925 11.557 12.282 13.126 14.074 14.744 15.0 15.049 14.989 14.89 14.782 14.64 14.492 14.334 14.203 14.088 13.953 13.816 13.686 13.56 13.436 13.329 13.228 13.109 12.979 12.871 12.747 12.621 12.524 12.418 12.309 12.197 12.068 11.972 11.877 11.734 11.634 11.525 11.466 11.342 11.209 11.063 10.983 10.511 10.676 10.575 10.482 10.258 10.115 9.962 9.787 9.566 9.302 8.959 7.614 -7 ,5934 ,TETRA ,17603408,Sun Nov 28 16:35:45 CET,Sun Nov 28 18:52:01 CET,0.0 1.314 1.578 1.776 1.949 2.099 2.234 2.359 2.586 2.683 2.771 2.571 3.046 3.125 3.272 3.415 3.554 3.618 3.747 3.876 4.055 4.167 4.275 4.426 4.578 4.734 4.887 5.024 5.196 5.362 5.518 5.715 5.921 6.125 6.353 6.597 6.821 7.075 7.358 7.656 7.964 8.317 8.742 9.173 9.649 10.158 10.726 11.389 12.162 13.004 13.936 14.517 14.705 14.704 14.615 14.485 14.33 14.168 13.995 13.778 13.583 13.397 13.213 13.044 12.892 12.757 12.595 12.422 12.282 12.156 12.012 11.881 11.757 11.629 11.523 11.408 11.273 11.129 10.987 10.887 10.78 10.625 10.52 10.402 10.338 10.207 10.072 9.923 9.837 9.38 9.594 9.501 9.4 9.182 9.037 8.863 8.677 8.482 8.233 7.885 6.046 -8 ,19436 ,TETRA ,17603409,Sun Nov 28 16:36:14 CET,Sun Nov 28 18:52:41 CET,0.0 1.331 1.611 1.841 2.042 2.204 2.347 2.482 2.695 2.793 2.896 2.715 3.194 3.276 3.438 3.59 3.737 3.812 3.955 4.083 4.264 4.38 4.487 4.646 4.8 4.947 5.094 5.236 5.415 5.59 5.757 5.96 6.174 6.369 6.576 6.807 7.031 7.287 7.566 7.861 8.161 8.502 8.907 9.316 9.795 10.324 10.951 11.639 12.36 13.133 13.994 14.574 14.807 14.916 14.928 14.865 14.766 14.642 14.513 14.372 14.244 14.129 14.01 13.887 13.763 13.64 13.518 13.403 13.298 13.19 13.068 12.963 12.853 12.736 12.634 12.531 12.437 12.328 12.201 12.11 12.02 11.889 11.789 11.676 11.615 11.487 11.351 11.214 11.144 10.69 10.905 10.821 10.734 10.526 10.411 10.273 10.1 9.91 9.682 9.347 7.695 -9 ,16569 ,TETRA ,17603410,Sun Nov 28 16:35:41 CET,Sun Nov 28 18:53:17 CET,0.0 1.363 1.66 1.87 2.047 2.2 2.332 2.454 2.693 2.809 2.921 2.736 3.208 3.287 3.443 3.594 3.733 3.804 3.961 4.118 4.327 4.453 4.577 4.765 4.931 5.088 5.25 5.405 5.606 5.804 5.987 6.201 6.407 6.604 6.826 7.067 7.29 7.53 7.801 8.084 8.383 8.734 9.138 9.55 10.029 10.564 11.167 11.836 12.594 13.436 14.31 14.882 15.1 15.115 15.052 14.931 14.774 14.623 14.482 14.317 14.153 13.992 13.835 13.688 13.546 13.407 13.243 13.095 12.973 12.84 12.692 12.581 12.466 12.319 12.204 12.103 11.99 11.855 11.722 11.633 11.53 11.371 11.27 11.158 11.1 10.977 10.845 10.701 10.621 10.161 10.363 10.27 10.174 9.951 9.823 9.675 9.497 9.301 9.048 8.705 7.553 -10 ,15955 ,TETRA ,17603198,Sun Nov 28 16:32:01 CET,Sun Nov 28 16:34:05 CET,0.0 1.183 1.522 1.759 1.941 2.094 2.23 2.357 2.6 2.713 2.816 2.613 3.076 3.158 3.322 3.476 3.624 3.699 3.848 3.986 4.189 4.316 4.431 4.593 4.748 4.899 5.046 5.198 5.386 5.559 5.729 5.934 6.137 6.334 6.557 6.799 7.032 7.292 7.565 7.854 8.146 8.476 8.882 9.264 9.699 10.22 10.814 11.456 12.228 13.064 13.938 14.416 14.526 14.533 14.474 14.377 14.258 14.105 13.951 13.785 13.622 13.463 13.328 13.196 13.036 12.889 12.748 12.606 12.468 12.337 12.223 12.112 11.978 11.847 11.749 11.635 11.516 11.399 11.261 11.164 11.067 10.912 10.794 10.67 10.61 10.494 10.363 10.211 10.135 9.68 9.877 9.778 9.681 9.46 9.328 9.176 8.986 8.763 8.504 8.166 6.79 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 9de885a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29823 ,KEBNE ,17027501,Wed Dec 22 17:31:48 CET,Wed Dec 22 19:10:04 CET,0.0 0.919 1.245 1.507 1.73 1.925 2.105 2.263 2.541 2.675 2.806 2.673 3.186 3.303 3.53 3.751 3.966 4.069 4.268 4.461 4.739 4.921 5.108 5.392 5.669 5.926 6.174 6.417 6.724 7.027 7.328 7.693 8.051 8.394 8.79 9.254 9.697 10.196 10.778 11.42 12.099 12.875 13.784 14.707 15.825 17.114 18.651 20.541 22.842 25.605 29.246 32.409 34.183 35.305 36.09 36.635 37.015 37.308 37.513 37.651 37.707 37.726 37.738 37.724 37.706 37.674 37.613 37.557 37.497 37.411 37.32 37.237 37.129 37.003 36.9 36.794 36.676 36.526 36.347 36.216 36.065 35.796 35.625 35.468 35.385 35.155 34.862 34.56 34.43 33.957 34.032 33.903 33.766 33.395 33.15 32.881 32.529 32.034 31.415 30.668 26.892 -2 ,15002 ,KEBNE ,17027502,Wed Dec 22 17:31:48 CET,Wed Dec 22 19:10:14 CET,0.0 1.401 1.736 1.972 2.169 2.364 2.539 2.704 3.016 3.159 3.299 3.168 3.688 3.811 4.05 4.281 4.495 4.597 4.798 5.0 5.284 5.466 5.649 5.922 6.175 6.424 6.678 6.919 7.227 7.52 7.812 8.181 8.541 8.896 9.307 9.776 10.231 10.737 11.303 11.935 12.617 13.398 14.337 15.282 16.418 17.736 19.279 21.06 23.277 25.976 29.256 32.151 33.945 35.127 35.923 36.508 36.919 37.227 37.461 37.667 37.804 37.857 37.87 37.861 37.846 37.806 37.715 37.629 37.562 37.483 37.38 37.288 37.182 37.065 36.974 36.866 36.733 36.589 36.441 36.344 36.229 36.047 35.905 35.727 35.622 35.359 35.109 34.873 34.731 34.231 34.29 34.107 33.908 33.451 33.173 32.898 32.568 32.157 31.686 30.743 25.096 -3 ,15099 ,KEBNE ,17027503,Wed Dec 22 17:31:48 CET,Wed Dec 22 19:23:41 CET,0.0 1.2 1.56 1.831 2.068 2.292 2.475 2.631 2.921 3.059 3.192 3.047 3.56 3.683 3.924 4.162 4.385 4.493 4.712 4.92 5.217 5.406 5.59 5.866 6.131 6.384 6.626 6.869 7.196 7.503 7.798 8.168 8.527 8.867 9.276 9.765 10.247 10.779 11.373 12.014 12.681 13.463 14.397 15.343 16.48 17.779 19.333 21.173 23.416 26.114 29.528 32.592 34.524 35.767 36.594 37.229 37.685 38.033 38.293 38.477 38.566 38.614 38.639 38.621 38.555 38.457 38.316 38.196 38.115 38.034 37.951 37.866 37.758 37.65 37.566 37.466 37.33 37.146 36.958 36.838 36.71 36.475 36.299 36.134 36.037 35.809 35.592 35.361 35.229 34.742 34.698 34.503 34.303 33.841 33.593 33.274 32.905 32.429 31.841 30.992 21.728 -4 ,724 ,KEBNE ,17027504,Wed Dec 22 17:31:48 CET,Wed Dec 22 19:10:09 CET,0.0 1.075 1.406 1.645 1.853 2.042 2.222 2.388 2.681 2.822 2.968 2.835 3.334 3.446 3.667 3.881 4.094 4.203 4.41 4.605 4.897 5.094 5.283 5.555 5.821 6.08 6.326 6.569 6.884 7.191 7.489 7.85 8.218 8.58 9.001 9.489 9.961 10.479 11.048 11.673 12.36 13.136 14.072 15.043 16.187 17.485 19.006 20.821 23.05 25.787 29.266 32.304 34.247 35.549 36.441 37.057 37.473 37.786 38.022 38.226 38.373 38.486 38.546 38.566 38.564 38.547 38.533 38.523 38.493 38.461 38.388 38.284 38.192 38.115 38.036 37.941 37.856 37.773 37.652 37.562 37.469 37.299 37.17 37.004 36.92 36.775 36.609 36.426 36.336 35.896 36.016 35.882 35.72 35.346 35.105 34.757 34.368 33.898 33.251 32.3 27.31 -5 ,30172 ,KEBNE ,17027505,Wed Dec 22 17:31:44 CET,Wed Dec 22 19:18:28 CET,0.0 1.014 1.366 1.638 1.845 2.033 2.208 2.364 2.681 2.838 2.975 2.854 3.368 3.489 3.729 3.948 4.167 4.278 4.488 4.687 4.969 5.153 5.336 5.62 5.893 6.148 6.4 6.65 6.985 7.3 7.602 7.969 8.323 8.684 9.125 9.619 10.093 10.608 11.161 11.793 12.469 13.218 14.127 15.064 16.183 17.484 19.065 20.905 23.153 25.909 29.35 32.334 34.2 35.485 36.346 36.973 37.426 37.773 38.029 38.211 38.316 38.357 38.368 38.369 38.351 38.325 38.299 38.249 38.192 38.14 38.056 37.982 37.902 37.792 37.683 37.565 37.456 37.334 37.211 37.115 37.0 36.808 36.661 36.508 36.418 36.237 36.068 35.87 35.747 35.259 35.316 35.156 34.983 34.574 34.355 34.121 33.814 33.454 32.967 32.216 26.082 -6 ,7954 ,KEBNE ,17027506,Wed Dec 22 17:31:44 CET,Wed Dec 22 19:17:53 CET,0.0 1.112 1.459 1.718 1.931 2.113 2.282 2.434 2.728 2.87 3.001 2.861 3.379 3.503 3.741 3.97 4.19 4.293 4.482 4.667 4.956 5.155 5.348 5.614 5.872 6.125 6.367 6.609 6.928 7.245 7.557 7.935 8.302 8.657 9.064 9.539 10.011 10.54 11.122 11.741 12.395 13.159 14.069 15.016 16.186 17.522 19.109 20.951 23.137 25.813 29.269 32.362 34.256 35.559 36.446 37.102 37.581 37.914 38.175 38.409 38.551 38.652 38.743 38.786 38.816 38.834 38.833 38.8 38.757 38.718 38.665 38.598 38.514 38.411 38.33 38.244 38.145 38.045 37.925 37.824 37.709 37.516 37.353 37.181 37.095 36.892 36.663 36.418 36.279 35.781 35.814 35.661 35.511 35.148 34.902 34.599 34.28 33.927 33.365 32.48 28.69 -7 ,30944 ,KEBNE ,17027507,Wed Dec 22 17:31:44 CET,Wed Dec 22 19:18:21 CET,0.0 1.069 1.4 1.649 1.863 2.052 2.23 2.392 2.686 2.826 2.96 2.821 3.329 3.453 3.689 3.905 4.112 4.214 4.417 4.624 4.918 5.1 5.279 5.543 5.802 6.055 6.303 6.542 6.849 7.149 7.444 7.822 8.193 8.549 8.969 9.446 9.909 10.414 10.968 11.582 12.228 12.987 13.934 14.892 16.066 17.416 19.011 20.874 23.031 25.686 29.204 32.386 34.319 35.587 36.484 37.131 37.571 37.911 38.158 38.309 38.356 38.386 38.421 38.435 38.442 38.441 38.438 38.427 38.395 38.331 38.242 38.176 38.106 38.022 37.943 37.87 37.798 37.685 37.561 37.459 37.307 37.081 36.946 36.783 36.705 36.555 36.396 36.184 36.059 35.591 35.636 35.472 35.299 34.887 34.65 34.371 33.995 33.514 32.845 31.776 26.253 -8 ,615 ,KEBNE ,17027508,Wed Dec 22 17:31:44 CET,Wed Dec 22 19:18:21 CET,0.0 1.009 1.316 1.554 1.767 1.961 2.141 2.312 2.614 2.748 2.883 2.758 3.267 3.39 3.621 3.835 4.049 4.152 4.344 4.532 4.814 5.002 5.19 5.474 5.747 6.002 6.243 6.485 6.808 7.115 7.414 7.785 8.143 8.477 8.886 9.378 9.866 10.421 11.025 11.667 12.346 13.138 14.081 15.053 16.258 17.635 19.228 21.077 23.281 25.994 29.563 32.654 34.527 35.842 36.719 37.307 37.725 38.043 38.268 38.429 38.529 38.614 38.665 38.681 38.704 38.718 38.693 38.654 38.619 38.562 38.477 38.41 38.316 38.214 38.161 38.098 38.016 37.908 37.772 37.674 37.585 37.435 37.317 37.17 37.08 36.895 36.692 36.463 36.348 35.888 35.97 35.791 35.582 35.103 34.824 34.546 34.209 33.813 33.333 32.557 28.578 -9 ,28021 ,KEBNE ,17027509,Wed Dec 22 17:31:44 CET,Wed Dec 22 19:17:42 CET,0.0 1.854 2.214 2.505 2.766 2.995 3.187 3.354 3.649 3.786 3.924 3.807 4.323 4.441 4.669 4.888 5.095 5.198 5.403 5.6 5.877 6.061 6.245 6.506 6.75 6.985 7.217 7.46 7.788 8.104 8.403 8.771 9.142 9.506 9.923 10.401 10.866 11.376 11.943 12.561 13.214 13.973 14.907 15.883 17.051 18.359 19.89 21.7 23.939 26.739 30.292 33.405 35.377 36.675 37.586 38.265 38.73 39.049 39.298 39.522 39.659 39.746 39.797 39.809 39.807 39.808 39.772 39.715 39.662 39.604 39.533 39.459 39.338 39.196 39.109 39.029 38.941 38.828 38.678 38.57 38.474 38.256 38.078 37.894 37.79 37.586 37.389 37.156 37.019 36.526 36.597 36.462 36.29 35.83 35.551 35.197 34.8 34.349 33.756 33.021 27.268 -10 ,14634 ,KEBNE ,17027510,Wed Dec 22 17:31:44 CET,Wed Dec 22 19:18:20 CET,0.0 1.129 1.514 1.781 1.997 2.191 2.371 2.534 2.842 2.988 3.128 3.003 3.522 3.65 3.879 4.089 4.291 4.393 4.591 4.785 5.071 5.255 5.443 5.712 5.961 6.197 6.432 6.678 6.989 7.285 7.579 7.936 8.299 8.65 9.051 9.517 9.977 10.501 11.08 11.697 12.355 13.131 14.048 14.991 16.182 17.535 19.086 20.938 23.284 26.181 29.734 32.819 34.718 36.022 36.914 37.462 37.825 38.099 38.259 38.34 38.378 38.389 38.368 38.344 38.331 38.294 38.242 38.176 38.089 37.988 37.869 37.783 37.687 37.577 37.49 37.374 37.226 37.067 36.921 36.813 36.691 36.521 36.402 36.277 36.21 36.027 35.793 35.499 35.332 34.818 34.838 34.69 34.535 34.151 33.912 33.641 33.33 32.957 32.44 31.627 26.225 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 66f986db..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30333 ,TETRA ,17603199,Sun Nov 28 16:32:01 CET,Sun Nov 28 16:34:29 CET,0.0 1.305 1.671 1.976 2.228 2.434 2.656 2.868 3.195 3.337 3.482 3.36 3.859 3.967 4.17 4.36 4.538 4.622 4.798 4.974 5.21 5.364 5.511 5.71 5.896 6.076 6.259 6.43 6.625 6.817 7.008 7.247 7.487 7.721 7.994 8.29 8.562 8.854 9.177 9.513 9.858 10.238 10.691 11.137 11.646 12.289 12.996 13.637 14.384 15.177 15.69 15.806 15.683 15.451 15.175 14.875 14.587 14.29 14.023 13.74 13.479 13.237 12.997 12.767 12.534 12.313 12.078 11.866 11.687 11.502 11.3 11.128 10.957 10.766 10.618 10.473 10.311 10.15 9.983 9.855 9.716 9.511 9.379 9.239 9.159 8.99 8.81 8.616 8.516 8.028 8.182 8.059 7.925 7.634 7.442 7.235 7.013 6.748 6.446 5.961 4.057 -2 ,2044 ,TETRA ,17603200,Sun Nov 28 16:32:01 CET,Sun Nov 28 16:33:59 CET,0.0 1.175 1.553 1.834 2.052 2.255 2.45 2.623 2.94 3.081 3.221 3.089 3.583 3.684 3.89 4.101 4.28 4.365 4.521 4.651 4.858 5.004 5.143 5.334 5.508 5.685 5.865 6.039 6.261 6.471 6.67 6.898 7.118 7.351 7.616 7.914 8.209 8.53 8.858 9.197 9.567 9.976 10.42 10.867 11.426 12.045 12.687 13.368 14.132 14.982 15.803 16.094 16.093 15.933 15.647 15.349 15.086 14.8 14.54 14.276 14.024 13.771 13.53 13.316 13.079 12.847 12.614 12.407 12.229 12.047 11.843 11.674 11.508 11.32 11.168 11.011 10.829 10.636 10.433 10.29 10.139 9.896 9.738 9.586 9.508 9.336 9.152 8.952 8.832 8.314 8.374 8.198 8.036 7.698 7.51 7.314 7.07 6.763 6.44 6.038 4.405 -3 ,24387 ,TETRA ,17603201,Sun Nov 28 16:32:03 CET,Sun Nov 28 16:34:03 CET,0.0 1.265 1.734 2.066 2.338 2.576 2.775 2.949 3.246 3.388 3.521 3.371 3.868 3.967 4.167 4.347 4.522 4.607 4.769 4.934 5.175 5.326 5.464 5.661 5.861 6.06 6.252 6.432 6.655 6.871 7.078 7.326 7.571 7.804 8.068 8.363 8.653 8.986 9.335 9.696 10.071 10.503 11.048 11.598 12.204 12.847 13.535 14.237 15.048 15.968 16.711 16.86 16.756 16.547 16.261 15.948 15.625 15.316 15.03 14.695 14.391 14.128 13.893 13.654 13.419 13.218 13.001 12.784 12.586 12.394 12.199 12.031 11.856 11.68 11.537 11.375 11.212 11.051 10.874 10.745 10.613 10.407 10.242 10.07 9.983 9.789 9.597 9.41 9.302 8.805 8.939 8.824 8.705 8.4 8.225 8.03 7.8 7.542 7.228 6.823 5.416 -4 ,587 ,TETRA ,17603202,Sun Nov 28 16:31:59 CET,Sun Nov 28 16:34:31 CET,0.0 2.07 2.578 2.95 3.213 3.412 3.602 3.781 4.088 4.234 4.372 4.225 4.726 4.829 5.056 5.306 5.513 5.602 5.768 5.921 6.148 6.287 6.421 6.629 6.825 7.005 7.169 7.328 7.541 7.748 7.952 8.192 8.418 8.643 8.892 9.167 9.441 9.737 10.055 10.398 10.754 11.16 11.621 12.076 12.615 13.209 13.835 14.479 15.17 15.857 16.681 17.3 17.288 17.05 16.82 16.547 16.257 15.932 15.633 15.34 15.07 14.83 14.589 14.324 14.064 13.833 13.601 13.392 13.207 13.007 12.777 12.599 12.414 12.209 12.035 11.839 11.658 11.473 11.268 11.121 10.966 10.731 10.571 10.4 10.303 10.113 9.921 9.71 9.601 9.105 9.207 9.065 8.928 8.585 8.387 8.184 7.956 7.653 7.263 6.758 5.069 -5 ,21271 ,TETRA ,17603416,Sun Nov 28 16:36:12 CET,Sun Nov 28 18:46:14 CET,0.0 1.297 1.713 2.047 2.354 2.604 2.791 2.959 3.274 3.403 3.523 3.393 3.914 4.039 4.245 4.43 4.615 4.708 4.882 5.04 5.26 5.417 5.568 5.762 5.961 6.156 6.337 6.506 6.718 6.942 7.168 7.424 7.66 7.87 8.113 8.405 8.687 9.006 9.368 9.754 10.161 10.582 11.024 11.457 11.955 12.522 13.204 13.951 14.773 15.662 16.388 16.622 16.544 16.355 16.084 15.784 15.482 15.161 14.854 14.507 14.184 13.895 13.613 13.349 13.101 12.887 12.669 12.458 12.282 12.097 11.896 11.728 11.554 11.357 11.182 11.002 10.825 10.645 10.469 10.346 10.22 10.025 9.89 9.74 9.652 9.469 9.285 9.083 8.972 8.469 8.528 8.354 8.158 7.743 7.538 7.313 7.09 6.835 6.507 6.046 4.331 -6 ,22506 ,TETRA ,17603417,Sun Nov 28 16:35:41 CET,Sun Nov 28 18:50:11 CET,0.0 1.253 1.682 2.029 2.323 2.569 2.79 2.98 3.296 3.443 3.581 3.444 3.954 4.069 4.284 4.482 4.672 4.761 4.918 5.076 5.316 5.46 5.599 5.812 6.014 6.202 6.382 6.548 6.743 6.935 7.132 7.373 7.602 7.828 8.132 8.46 8.73 9.031 9.369 9.719 10.07 10.439 10.89 11.372 11.903 12.466 13.087 13.793 14.554 15.249 15.927 16.253 16.228 16.083 15.821 15.489 15.193 14.914 14.651 14.36 14.062 13.787 13.54 13.298 13.076 12.853 12.61 12.391 12.194 11.991 11.785 11.611 11.407 11.187 11.019 10.838 10.655 10.475 10.262 10.116 9.98 9.754 9.596 9.439 9.356 9.182 9.007 8.807 8.691 8.185 8.299 8.173 8.031 7.702 7.514 7.305 7.065 6.803 6.517 6.113 4.756 -7 ,26936 ,TETRA ,17603418,Sun Nov 28 16:36:14 CET,Sun Nov 28 18:45:20 CET,0.0 1.32 1.742 2.052 2.298 2.53 2.745 2.932 3.265 3.41 3.54 3.422 3.944 4.065 4.282 4.485 4.691 4.794 4.964 5.108 5.312 5.44 5.58 5.812 6.027 6.221 6.403 6.589 6.852 7.103 7.345 7.615 7.843 8.066 8.314 8.582 8.831 9.122 9.457 9.801 10.167 10.601 11.108 11.587 12.109 12.679 13.298 13.966 14.705 15.477 16.163 16.409 16.315 16.022 15.654 15.27 14.913 14.594 14.299 13.999 13.764 13.54 13.306 13.076 12.858 12.669 12.466 12.277 12.103 11.908 11.707 11.546 11.381 11.209 11.071 10.923 10.754 10.56 10.371 10.251 10.119 9.904 9.767 9.605 9.513 9.324 9.139 8.962 8.862 8.376 8.524 8.392 8.258 7.997 7.819 7.595 7.374 7.14 6.811 6.286 4.787 -8 ,26704 ,TETRA ,17603419,Sun Nov 28 16:36:14 CET,Sun Nov 28 18:47:41 CET,0.0 1.648 2.05 2.359 2.586 2.78 2.973 3.17 3.54 3.716 3.876 3.741 4.243 4.354 4.557 4.741 4.915 5.001 5.173 5.334 5.573 5.731 5.887 6.099 6.294 6.487 6.666 6.827 7.047 7.275 7.49 7.727 7.955 8.174 8.431 8.737 9.039 9.386 9.752 10.125 10.482 10.862 11.328 11.811 12.341 12.911 13.56 14.186 14.835 15.53 16.147 16.385 16.301 16.083 15.838 15.547 15.207 14.882 14.594 14.293 14.029 13.771 13.497 13.236 12.977 12.74 12.497 12.261 12.046 11.828 11.621 11.455 11.279 11.09 10.941 10.787 10.622 10.458 10.297 10.165 10.018 9.801 9.632 9.444 9.355 9.179 8.987 8.775 8.647 8.134 8.248 8.104 7.952 7.587 7.377 7.144 6.864 6.559 6.168 5.604 4.052 -9 ,4973 ,TETRA ,17603420,Sun Nov 28 16:36:14 CET,Sun Nov 28 18:47:35 CET,0.0 1.5 1.951 2.269 2.534 2.751 2.946 3.139 3.496 3.651 3.784 3.638 4.133 4.241 4.486 4.701 4.871 4.957 5.123 5.285 5.518 5.663 5.798 5.986 6.172 6.347 6.508 6.671 6.887 7.108 7.32 7.56 7.782 7.995 8.252 8.54 8.807 9.119 9.464 9.813 10.18 10.613 11.114 11.576 12.067 12.58 13.159 13.791 14.494 15.287 16.114 16.456 16.412 16.2 15.885 15.544 15.234 14.919 14.606 14.277 13.997 13.742 13.481 13.219 12.98 12.781 12.576 12.375 12.187 11.994 11.773 11.586 11.411 11.228 11.083 10.923 10.745 10.547 10.347 10.218 10.068 9.805 9.635 9.438 9.326 9.097 8.843 8.57 8.433 7.917 8.017 7.856 7.693 7.32 7.118 6.925 6.684 6.426 6.077 5.578 4.034 -10 ,2596 ,TETRA ,17603421,Sun Nov 28 16:36:15 CET,Sun Nov 28 18:47:54 CET,0.0 1.439 1.891 2.226 2.483 2.682 2.872 3.044 3.345 3.48 3.617 3.511 4.018 4.121 4.326 4.516 4.715 4.817 4.982 5.129 5.343 5.489 5.632 5.829 6.033 6.244 6.464 6.657 6.866 7.064 7.254 7.486 7.717 7.939 8.198 8.491 8.804 9.153 9.492 9.835 10.172 10.559 11.031 11.491 11.988 12.537 13.124 13.752 14.464 15.17 15.858 16.158 16.11 15.896 15.534 15.168 14.832 14.51 14.224 13.89 13.579 13.324 13.085 12.822 12.567 12.338 12.094 11.879 11.689 11.48 11.254 11.068 10.89 10.699 10.55 10.382 10.182 9.989 9.808 9.676 9.536 9.294 9.125 8.971 8.893 8.724 8.533 8.327 8.221 7.735 7.886 7.751 7.593 7.242 7.036 6.828 6.61 6.368 6.076 5.603 3.537 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt deleted file mode 100644 index 225c1694..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23603 ,KEBNE ,17027511,Wed Dec 22 17:33:48 CET,Wed Dec 22 19:30:02 CET,0.0 0.741 0.97 1.103 1.209 1.295 1.383 1.477 1.631 1.691 1.736 1.429 1.832 1.871 1.918 1.971 2.036 2.066 2.121 2.169 2.221 2.248 2.277 2.31 2.343 2.366 2.377 2.388 2.411 2.431 2.426 2.398 2.353 2.32 2.274 2.195 2.114 2.022 1.91 1.744 1.547 1.281 0.914 0.515 -0.014 -0.673 -1.557 -2.71 -4.319 -6.639 -10.135 -13.971 -16.863 -19.138 -20.965 -22.52 -23.845 -25.018 -25.993 -26.904 -27.658 -28.319 -28.938 -29.506 -30.029 -30.499 -30.968 -31.384 -31.744 -32.11 -32.473 -32.767 -33.083 -33.41 -33.659 -33.904 -34.149 -34.403 -34.657 -34.83 -35.005 -35.276 -35.472 -35.685 -35.79 -35.997 -36.212 -36.449 -36.576 -37.111 -36.965 -37.099 -37.238 -37.537 -37.703 -37.881 -38.069 -38.289 -38.543 -38.885 -40.515 -2 ,30740 ,KEBNE ,17027512,Wed Dec 22 17:33:48 CET,Wed Dec 22 19:29:01 CET,0.0 0.852 1.103 1.267 1.388 1.48 1.583 1.688 1.862 1.933 1.999 1.747 2.168 2.21 2.289 2.346 2.4 2.427 2.466 2.505 2.57 2.606 2.635 2.685 2.719 2.737 2.76 2.771 2.773 2.773 2.77 2.759 2.732 2.693 2.646 2.592 2.519 2.42 2.297 2.153 1.964 1.707 1.346 0.92 0.382 -0.293 -1.185 -2.358 -3.972 -6.274 -9.839 -13.744 -16.669 -18.964 -20.823 -22.404 -23.721 -24.874 -25.836 -26.758 -27.532 -28.195 -28.796 -29.356 -29.873 -30.332 -30.802 -31.207 -31.55 -31.908 -32.276 -32.573 -32.872 -33.17 -33.407 -33.666 -33.933 -34.189 -34.446 -34.63 -34.822 -35.11 -35.305 -35.505 -35.606 -35.814 -36.029 -36.258 -36.379 -36.914 -36.765 -36.897 -37.032 -37.33 -37.503 -37.694 -37.895 -38.111 -38.344 -38.669 -39.582 -3 ,23841 ,KEBNE ,17027513,Wed Dec 22 17:33:48 CET,Wed Dec 22 19:30:18 CET,0.0 0.491 0.721 0.872 0.977 1.069 1.139 1.201 1.312 1.364 1.423 1.144 1.549 1.586 1.673 1.746 1.797 1.824 1.863 1.881 1.913 1.943 1.972 2.018 2.068 2.098 2.114 2.128 2.119 2.086 2.049 2.01 1.968 1.918 1.858 1.77 1.671 1.559 1.402 1.203 0.994 0.727 0.368 -0.032 -0.575 -1.283 -2.189 -3.37 -5.005 -7.356 -10.905 -14.725 -17.65 -19.95 -21.795 -23.373 -24.695 -25.83 -26.775 -27.694 -28.449 -29.11 -29.733 -30.295 -30.791 -31.237 -31.703 -32.118 -32.484 -32.856 -33.233 -33.547 -33.869 -34.196 -34.446 -34.693 -34.942 -35.2 -35.461 -35.64 -35.826 -36.13 -36.339 -36.548 -36.657 -36.885 -37.118 -37.343 -37.46 -37.996 -37.849 -37.984 -38.128 -38.428 -38.597 -38.792 -38.993 -39.201 -39.46 -39.795 -40.839 -4 ,10899 ,KEBNE ,17027514,Wed Dec 22 17:33:52 CET,Wed Dec 22 19:26:38 CET,0.0 0.593 0.781 0.914 1.037 1.156 1.266 1.348 1.475 1.527 1.569 1.273 1.686 1.728 1.813 1.89 1.957 1.987 2.048 2.112 2.195 2.226 2.244 2.277 2.301 2.318 2.326 2.32 2.312 2.302 2.292 2.263 2.221 2.185 2.124 2.052 1.978 1.857 1.687 1.492 1.287 1.02 0.653 0.246 -0.287 -0.981 -1.892 -3.055 -4.649 -6.903 -10.438 -14.276 -17.125 -19.345 -21.139 -22.682 -23.978 -25.118 -26.061 -26.951 -27.688 -28.342 -28.944 -29.491 -29.994 -30.449 -30.918 -31.326 -31.676 -32.03 -32.379 -32.663 -32.961 -33.271 -33.518 -33.765 -34.007 -34.263 -34.525 -34.702 -34.88 -35.162 -35.356 -35.552 -35.654 -35.866 -36.077 -36.291 -36.406 -36.936 -36.783 -36.926 -37.079 -37.394 -37.553 -37.725 -37.917 -38.123 -38.369 -38.767 -40.035 -5 ,8603 ,KEBNE ,17027515,Wed Dec 22 17:33:51 CET,Wed Dec 22 19:25:20 CET,0.0 0.5 0.686 0.854 0.976 1.066 1.138 1.226 1.384 1.447 1.504 1.224 1.651 1.706 1.784 1.854 1.92 1.952 2.006 2.053 2.12 2.159 2.191 2.211 2.232 2.258 2.274 2.292 2.306 2.287 2.257 2.209 2.165 2.139 2.085 2.01 1.928 1.799 1.643 1.469 1.252 1.002 0.688 0.284 -0.263 -0.923 -1.782 -2.922 -4.536 -6.842 -10.392 -14.326 -17.313 -19.632 -21.496 -23.105 -24.441 -25.586 -26.534 -27.451 -28.216 -28.886 -29.506 -30.075 -30.604 -31.064 -31.528 -31.934 -32.29 -32.663 -33.016 -33.295 -33.59 -33.89 -34.119 -34.36 -34.602 -34.848 -35.102 -35.28 -35.464 -35.734 -35.924 -36.129 -36.233 -36.444 -36.662 -36.881 -36.989 -37.51 -37.359 -37.492 -37.624 -37.915 -38.08 -38.251 -38.438 -38.664 -38.943 -39.306 -40.56 -6 ,10572 ,KEBNE ,17027516,Wed Dec 22 17:33:51 CET,Wed Dec 22 19:26:59 CET,0.0 0.655 0.924 1.115 1.239 1.354 1.448 1.542 1.712 1.777 1.846 1.613 2.05 2.099 2.171 2.249 2.314 2.338 2.388 2.437 2.5 2.538 2.575 2.618 2.646 2.672 2.708 2.74 2.764 2.78 2.785 2.77 2.745 2.724 2.69 2.623 2.527 2.412 2.29 2.154 1.982 1.736 1.427 1.077 0.582 -0.07 -0.913 -2.011 -3.557 -5.771 -9.212 -12.965 -15.836 -18.153 -20.042 -21.653 -23.005 -24.163 -25.12 -26.051 -26.835 -27.527 -28.16 -28.73 -29.251 -29.715 -30.193 -30.621 -30.987 -31.359 -31.743 -32.047 -32.354 -32.668 -32.908 -33.155 -33.402 -33.652 -33.906 -34.079 -34.26 -34.55 -34.752 -34.955 -35.061 -35.279 -35.499 -35.727 -35.845 -36.37 -36.206 -36.344 -36.491 -36.791 -36.955 -37.134 -37.335 -37.575 -37.847 -38.182 -39.338 -7 ,22846 ,KEBNE ,17027517,Wed Dec 22 17:33:52 CET,Wed Dec 22 19:25:09 CET,0.0 0.565 0.758 0.922 1.044 1.137 1.227 1.309 1.44 1.502 1.561 1.312 1.725 1.767 1.841 1.911 1.967 1.986 2.024 2.071 2.148 2.191 2.23 2.285 2.327 2.363 2.389 2.408 2.448 2.484 2.485 2.468 2.452 2.425 2.383 2.326 2.25 2.141 2.006 1.859 1.691 1.46 1.131 0.748 0.244 -0.401 -1.277 -2.42 -3.968 -6.17 -9.58 -13.319 -16.206 -18.518 -20.369 -21.918 -23.2 -24.321 -25.26 -26.161 -26.924 -27.587 -28.2 -28.768 -29.274 -29.727 -30.196 -30.604 -30.946 -31.289 -31.637 -31.922 -32.216 -32.531 -32.779 -33.016 -33.247 -33.499 -33.762 -33.944 -34.125 -34.406 -34.605 -34.804 -34.911 -35.133 -35.361 -35.589 -35.707 -36.235 -36.079 -36.217 -36.367 -36.691 -36.862 -37.031 -37.213 -37.424 -37.686 -38.053 -38.989 -8 ,29059 ,KEBNE ,17027518,Wed Dec 22 17:34:50 CET,Wed Dec 22 19:30:13 CET,0.0 0.415 0.658 0.83 0.955 1.052 1.114 1.17 1.298 1.372 1.439 1.165 1.583 1.625 1.71 1.779 1.845 1.88 1.939 1.992 2.068 2.12 2.168 2.239 2.301 2.344 2.372 2.403 2.444 2.461 2.46 2.449 2.438 2.416 2.387 2.353 2.295 2.189 2.044 1.886 1.727 1.502 1.132 0.703 0.142 -0.58 -1.535 -2.801 -4.48 -6.789 -10.342 -14.15 -17.036 -19.358 -21.223 -22.816 -24.146 -25.313 -26.279 -27.208 -27.98 -28.625 -29.245 -29.826 -30.342 -30.798 -31.266 -31.686 -32.045 -32.405 -32.765 -33.056 -33.352 -33.663 -33.908 -34.156 -34.4 -34.649 -34.917 -35.1 -35.284 -35.568 -35.763 -35.97 -36.08 -36.303 -36.527 -36.762 -36.883 -37.421 -37.258 -37.385 -37.532 -37.874 -38.043 -38.223 -38.44 -38.686 -38.976 -39.331 -40.154 -9 ,21256 ,KEBNE ,17027519,Wed Dec 22 17:34:50 CET,Wed Dec 22 19:30:23 CET,0.0 0.558 0.728 0.892 1.039 1.147 1.236 1.323 1.482 1.543 1.589 1.297 1.696 1.73 1.809 1.88 1.939 1.966 2.019 2.051 2.094 2.128 2.158 2.187 2.204 2.222 2.228 2.223 2.198 2.17 2.145 2.119 2.093 2.037 1.966 1.898 1.812 1.697 1.562 1.391 1.186 0.929 0.591 0.199 -0.33 -0.986 -1.873 -3.035 -4.614 -6.836 -10.321 -14.153 -17.049 -19.382 -21.246 -22.815 -24.135 -25.287 -26.238 -27.156 -27.939 -28.634 -29.268 -29.846 -30.379 -30.861 -31.343 -31.765 -32.134 -32.499 -32.857 -33.145 -33.442 -33.747 -33.978 -34.216 -34.461 -34.709 -34.96 -35.127 -35.298 -35.576 -35.771 -35.973 -36.077 -36.288 -36.505 -36.73 -36.851 -37.387 -37.237 -37.365 -37.501 -37.823 -37.995 -38.168 -38.362 -38.591 -38.871 -39.24 -40.433 -10 ,15302 ,KEBNE ,17027520,Wed Dec 22 17:34:50 CET,Wed Dec 22 19:30:20 CET,0.0 0.497 0.672 0.788 0.884 0.964 1.017 1.075 1.19 1.237 1.284 1.011 1.417 1.448 1.513 1.601 1.665 1.688 1.733 1.779 1.835 1.862 1.886 1.927 1.968 1.986 2.0 2.017 2.047 2.065 2.063 2.042 2.019 1.99 1.937 1.865 1.792 1.674 1.512 1.334 1.117 0.853 0.535 0.147 -0.397 -1.069 -1.938 -3.104 -4.72 -6.983 -10.558 -14.496 -17.438 -19.749 -21.617 -23.196 -24.5 -25.635 -26.583 -27.512 -28.285 -28.937 -29.542 -30.094 -30.593 -31.043 -31.502 -31.902 -32.254 -32.626 -33.003 -33.308 -33.613 -33.921 -34.16 -34.407 -34.648 -34.893 -35.155 -35.331 -35.503 -35.774 -35.968 -36.171 -36.278 -36.494 -36.718 -36.947 -37.065 -37.59 -37.423 -37.556 -37.693 -37.978 -38.138 -38.309 -38.507 -38.736 -39.005 -39.365 -40.468 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt deleted file mode 100644 index 6a838c54..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15185 ,TETRA ,17603422,Sun Nov 28 16:36:14 CET,Sun Nov 28 18:47:56 CET,0.0 1.412 1.79 2.076 2.315 2.54 2.747 2.923 3.26 3.415 3.565 3.418 3.977 4.117 4.393 4.656 4.907 5.026 5.254 5.477 5.797 6.008 6.212 6.507 6.804 7.098 7.38 7.657 8.015 8.363 8.714 9.131 9.522 9.896 10.34 10.851 11.354 11.915 12.522 13.191 13.92 14.755 15.739 16.741 17.917 19.233 20.803 22.645 24.866 27.574 30.968 33.852 35.603 36.714 37.424 37.936 38.294 38.536 38.692 38.827 38.908 38.939 38.958 38.981 38.969 38.899 38.813 38.746 38.679 38.59 38.484 38.403 38.322 38.227 38.151 38.07 37.988 37.901 37.8 37.716 37.628 37.479 37.371 37.257 37.199 37.086 36.948 36.791 36.718 36.245 36.426 36.312 36.202 35.96 35.817 35.679 35.521 35.308 35.067 34.73 33.677 -2 ,29051 ,TETRA ,17603210,Sun Nov 28 16:32:03 CET,Sun Nov 28 16:34:09 CET,0.0 1.249 1.612 1.881 2.115 2.344 2.571 2.766 3.099 3.255 3.409 3.284 3.852 3.984 4.249 4.488 4.723 4.842 5.071 5.292 5.617 5.828 6.031 6.331 6.629 6.923 7.212 7.484 7.818 8.154 8.493 8.923 9.339 9.72 10.168 10.678 11.182 11.76 12.387 13.042 13.739 14.556 15.546 16.571 17.755 19.076 20.67 22.546 24.81 27.598 31.143 34.057 35.77 36.906 37.647 38.157 38.521 38.748 38.858 38.932 38.986 39.018 39.039 39.036 38.992 38.934 38.872 38.818 38.761 38.693 38.634 38.569 38.484 38.395 38.312 38.225 38.142 38.045 37.935 37.867 37.791 37.647 37.548 37.445 37.392 37.279 37.149 37.013 36.939 36.472 36.681 36.585 36.49 36.256 36.118 35.967 35.801 35.598 35.312 34.9 33.174 -3 ,22465 ,TETRA ,17603424,Sun Nov 28 16:36:15 CET,Sun Nov 28 18:49:11 CET,0.0 1.223 1.593 1.849 2.076 2.294 2.482 2.653 2.982 3.125 3.268 3.131 3.696 3.826 4.066 4.3 4.532 4.642 4.858 5.069 5.371 5.57 5.779 6.092 6.376 6.641 6.904 7.174 7.54 7.893 8.231 8.66 9.079 9.473 9.926 10.428 10.931 11.5 12.121 12.786 13.498 14.324 15.299 16.287 17.451 18.812 20.477 22.351 24.572 27.285 30.691 33.671 35.327 36.31 37.01 37.491 37.79 38.002 38.159 38.286 38.336 38.348 38.368 38.361 38.319 38.258 38.182 38.125 38.075 38.01 37.936 37.871 37.793 37.703 37.635 37.555 37.454 37.341 37.229 37.161 37.084 36.948 36.851 36.761 36.711 36.578 36.43 36.271 36.193 35.736 35.977 35.889 35.792 35.577 35.445 35.302 35.139 34.915 34.636 34.307 33.176 -4 ,15672 ,TETRA ,17603425,Sun Nov 28 16:36:18 CET,Sun Nov 28 18:49:31 CET,0.0 1.1 1.548 1.875 2.147 2.382 2.583 2.76 3.099 3.258 3.409 3.271 3.835 3.96 4.198 4.43 4.662 4.771 4.99 5.223 5.549 5.749 5.944 6.23 6.51 6.783 7.046 7.303 7.638 7.966 8.291 8.692 9.087 9.479 9.955 10.483 10.999 11.597 12.228 12.894 13.623 14.454 15.424 16.416 17.593 18.949 20.58 22.482 24.76 27.472 30.886 33.747 35.364 36.413 37.096 37.561 37.879 38.103 38.265 38.394 38.469 38.511 38.547 38.547 38.51 38.467 38.421 38.363 38.288 38.214 38.152 38.086 38.009 37.927 37.855 37.769 37.677 37.578 37.473 37.403 37.328 37.185 37.069 36.963 36.91 36.796 36.674 36.541 36.461 35.988 36.202 36.106 36.005 35.758 35.609 35.442 35.257 35.032 34.757 34.412 33.195 -5 ,30040 ,TETRA ,17603426,Sun Nov 28 16:36:14 CET,Sun Nov 28 18:51:51 CET,0.0 1.637 2.012 2.322 2.583 2.805 3.009 3.191 3.515 3.668 3.827 3.687 4.249 4.391 4.664 4.911 5.14 5.252 5.473 5.687 5.998 6.195 6.388 6.683 6.978 7.252 7.514 7.778 8.121 8.465 8.807 9.212 9.604 9.994 10.455 10.971 11.484 12.066 12.701 13.377 14.123 14.973 15.945 16.926 18.117 19.552 21.223 23.078 25.305 28.098 31.607 34.523 36.308 37.448 38.12 38.542 38.863 39.068 39.169 39.231 39.245 39.244 39.206 39.17 39.147 39.101 39.038 38.979 38.922 38.857 38.797 38.741 38.661 38.552 38.465 38.389 38.295 38.197 38.105 38.032 37.945 37.81 37.72 37.612 37.557 37.447 37.323 37.182 37.095 36.617 36.815 36.717 36.621 36.401 36.262 36.103 35.934 35.725 35.472 35.163 34.157 -6 ,15893 ,TETRA ,17603427,Sun Nov 28 16:36:14 CET,Sun Nov 28 18:45:32 CET,0.0 1.189 1.624 1.921 2.161 2.388 2.598 2.789 3.143 3.313 3.475 3.352 3.941 4.083 4.355 4.626 4.886 5.008 5.239 5.463 5.78 5.984 6.178 6.457 6.748 7.042 7.331 7.599 7.933 8.253 8.564 8.962 9.362 9.766 10.23 10.739 11.243 11.803 12.418 13.07 13.779 14.625 15.579 16.53 17.697 19.04 20.624 22.44 24.62 27.254 30.618 33.535 35.215 36.337 37.071 37.526 37.811 38.022 38.2 38.307 38.326 38.329 38.323 38.288 38.229 38.166 38.102 38.055 38.005 37.944 37.888 37.806 37.7 37.595 37.513 37.427 37.335 37.237 37.125 37.05 36.97 36.826 36.722 36.621 36.571 36.449 36.317 36.186 36.109 35.637 35.863 35.76 35.646 35.409 35.263 35.097 34.91 34.694 34.431 34.011 32.665 -7 ,16771 ,TETRA ,17603428,Sun Nov 28 16:36:43 CET,Sun Nov 28 18:47:09 CET,0.0 1.34 1.726 2.006 2.249 2.486 2.69 2.872 3.217 3.378 3.545 3.421 3.999 4.145 4.414 4.668 4.903 5.022 5.264 5.49 5.811 6.024 6.235 6.534 6.825 7.121 7.406 7.678 8.029 8.374 8.72 9.151 9.563 9.951 10.409 10.929 11.427 11.968 12.574 13.254 13.97 14.799 15.81 16.847 18.081 19.479 21.165 23.134 25.43 28.235 31.796 34.711 36.385 37.483 38.256 38.803 39.169 39.412 39.556 39.631 39.662 39.656 39.633 39.609 39.571 39.53 39.463 39.382 39.318 39.243 39.154 39.083 39.019 38.95 38.87 38.778 38.688 38.581 38.464 38.395 38.321 38.192 38.096 37.985 37.925 37.805 37.68 37.537 37.449 36.971 37.197 37.11 37.017 36.797 36.656 36.491 36.281 36.031 35.755 35.401 34.261 -8 ,4813 ,TETRA ,17603429,Sun Nov 28 16:36:14 CET,Sun Nov 28 18:47:57 CET,0.0 1.257 1.659 1.965 2.219 2.432 2.63 2.819 3.178 3.34 3.496 3.388 3.97 4.116 4.403 4.676 4.936 5.064 5.301 5.523 5.849 6.058 6.266 6.571 6.859 7.144 7.416 7.672 8.004 8.344 8.689 9.109 9.528 9.93 10.39 10.911 11.436 12.029 12.654 13.326 14.053 14.884 15.856 16.875 18.096 19.447 21.091 23.02 25.286 28.029 31.445 34.379 36.134 37.272 38.011 38.462 38.77 39.025 39.169 39.254 39.314 39.337 39.332 39.317 39.298 39.26 39.204 39.15 39.092 39.028 38.948 38.869 38.782 38.687 38.603 38.501 38.391 38.283 38.171 38.089 38.0 37.86 37.766 37.671 37.616 37.492 37.366 37.229 37.158 36.694 36.91 36.81 36.704 36.468 36.329 36.172 35.999 35.807 35.558 35.206 33.892 -9 ,10950 ,TETRA ,17603217,Sun Nov 28 16:32:28 CET,Sun Nov 28 16:34:48 CET,0.0 1.397 1.755 2.022 2.252 2.482 2.703 2.902 3.245 3.401 3.554 3.43 4.002 4.134 4.396 4.643 4.878 4.992 5.215 5.437 5.753 5.957 6.164 6.465 6.76 7.048 7.322 7.59 7.94 8.287 8.628 9.037 9.437 9.83 10.297 10.834 11.33 11.873 12.489 13.169 13.901 14.756 15.799 16.838 18.074 19.537 21.24 23.18 25.542 28.384 31.841 34.743 36.469 37.597 38.268 38.705 39.052 39.297 39.464 39.588 39.625 39.607 39.565 39.523 39.49 39.451 39.393 39.334 39.26 39.18 39.11 39.04 38.959 38.862 38.779 38.686 38.581 38.463 38.341 38.263 38.174 38.025 37.909 37.788 37.729 37.596 37.453 37.311 37.239 36.772 36.993 36.885 36.759 36.506 36.379 36.237 36.05 35.823 35.561 35.192 33.887 -10 ,24267 ,TETRA ,17603218,Sun Nov 28 16:32:28 CET,Sun Nov 28 16:35:07 CET,0.0 1.724 2.145 2.439 2.691 2.912 3.101 3.275 3.607 3.765 3.918 3.779 4.346 4.483 4.74 4.988 5.233 5.352 5.586 5.813 6.133 6.343 6.551 6.848 7.132 7.404 7.675 7.961 8.332 8.681 9.041 9.485 9.906 10.313 10.796 11.342 11.856 12.441 13.084 13.755 14.471 15.326 16.372 17.441 18.673 20.059 21.74 23.671 25.924 28.716 32.265 35.26 37.075 38.184 38.888 39.412 39.745 39.95 40.068 40.145 40.163 40.153 40.141 40.108 40.046 39.993 39.934 39.87 39.814 39.745 39.663 39.598 39.524 39.424 39.331 39.225 39.121 39.006 38.884 38.804 38.717 38.573 38.477 38.381 38.329 38.214 38.088 37.941 37.856 37.377 37.59 37.488 37.376 37.144 37.014 36.851 36.668 36.459 36.195 35.79 34.088 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index d142fa08..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6710 ,TETRA ,17603432,Sun Nov 28 16:36:17 CET,Sun Nov 28 18:49:33 CET,0.0 1.757 2.386 2.771 3.087 3.386 3.639 3.858 4.247 4.44 4.631 4.545 5.14 5.297 5.592 5.88 6.15 6.281 6.546 6.804 7.162 7.386 7.604 7.932 8.258 8.589 8.916 9.221 9.63 10.037 10.431 10.905 11.359 11.786 12.282 12.845 13.396 14.029 14.727 15.477 16.285 17.209 18.282 19.408 20.726 22.238 24.088 26.225 28.786 31.902 35.885 39.391 41.509 42.915 43.891 44.595 45.101 45.477 45.719 45.887 45.983 46.041 46.063 46.046 46.011 45.974 45.935 45.892 45.847 45.788 45.697 45.619 45.531 45.414 45.326 45.225 45.12 44.999 44.848 44.755 44.655 44.482 44.356 44.214 44.126 43.919 43.691 43.437 43.301 42.781 42.895 42.749 42.587 42.262 42.077 41.857 41.621 41.333 40.945 40.334 37.521 -2 ,25920 ,TETRA ,17603433,Sun Nov 28 16:36:15 CET,Sun Nov 28 18:48:25 CET,0.0 1.621 2.103 2.517 2.864 3.134 3.375 3.614 4.071 4.276 4.463 4.395 4.986 5.134 5.42 5.71 5.996 6.127 6.371 6.609 6.953 7.173 7.388 7.713 8.028 8.338 8.641 8.938 9.332 9.704 10.051 10.471 10.893 11.317 11.805 12.353 12.895 13.492 14.147 14.871 15.649 16.528 17.58 18.682 19.982 21.466 23.223 25.24 27.674 30.683 34.542 37.838 39.764 40.955 41.748 42.394 42.871 43.169 43.362 43.528 43.663 43.745 43.792 43.813 43.805 43.776 43.724 43.688 43.661 43.601 43.53 43.468 43.388 43.285 43.189 43.09 42.989 42.883 42.773 42.692 42.608 42.46 42.323 42.157 42.071 41.921 41.774 41.591 41.49 41.003 41.147 41.015 40.857 40.515 40.348 40.156 39.873 39.508 39.068 38.467 35.671 -3 ,20533 ,TETRA ,17603221,Sun Nov 28 16:32:30 CET,Sun Nov 28 16:34:08 CET,0.0 2.315 2.834 3.219 3.536 3.799 4.046 4.268 4.669 4.858 5.029 4.938 5.528 5.674 5.953 6.244 6.53 6.664 6.92 7.18 7.569 7.804 8.036 8.379 8.702 9.011 9.311 9.6 9.966 10.329 10.689 11.13 11.555 11.967 12.451 13.029 13.601 14.205 14.873 15.616 16.413 17.33 18.409 19.525 20.869 22.414 24.225 26.25 28.729 31.879 35.873 39.23 41.216 42.562 43.536 44.237 44.721 45.073 45.339 45.522 45.611 45.645 45.63 45.604 45.55 45.507 45.455 45.367 45.303 45.248 45.161 45.076 44.981 44.869 44.778 44.66 44.532 44.407 44.258 44.149 44.021 43.82 43.69 43.549 43.479 43.324 43.159 42.964 42.857 42.365 42.458 42.304 42.152 41.803 41.598 41.356 41.088 40.773 40.339 39.737 37.591 -4 ,9235 ,TETRA ,17603435,Sun Nov 28 16:36:15 CET,Sun Nov 28 18:46:40 CET,0.0 1.234 1.718 2.135 2.512 2.819 3.083 3.348 3.849 4.058 4.243 4.153 4.749 4.908 5.206 5.479 5.728 5.854 6.11 6.352 6.684 6.905 7.124 7.445 7.765 8.066 8.358 8.651 9.029 9.393 9.748 10.182 10.609 11.036 11.541 12.117 12.683 13.319 14.017 14.763 15.534 16.429 17.491 18.599 19.968 21.526 23.363 25.493 28.037 31.112 35.03 38.46 40.579 42.002 42.946 43.57 43.98 44.301 44.547 44.705 44.763 44.808 44.844 44.852 44.846 44.827 44.794 44.748 44.698 44.617 44.51 44.42 44.319 44.208 44.129 44.038 43.927 43.799 43.642 43.544 43.452 43.283 43.164 43.038 42.964 42.813 42.668 42.501 42.404 41.932 42.118 42.012 41.879 41.516 41.287 41.048 40.793 40.487 40.105 39.547 37.333 -5 ,10030 ,TETRA ,17603223,Sun Nov 28 16:32:28 CET,Sun Nov 28 16:34:55 CET,0.0 1.941 2.475 2.907 3.276 3.603 3.879 4.127 4.566 4.762 4.964 4.934 5.549 5.724 6.053 6.366 6.674 6.817 7.077 7.321 7.678 7.927 8.176 8.542 8.914 9.278 9.604 9.891 10.258 10.633 11.032 11.53 12.012 12.469 12.97 13.521 14.064 14.675 15.346 16.057 16.82 17.699 18.766 19.854 21.121 22.63 24.406 26.415 28.88 31.996 36.046 39.489 41.563 42.931 43.817 44.477 44.974 45.329 45.516 45.65 45.756 45.796 45.795 45.775 45.754 45.729 45.691 45.654 45.598 45.523 45.461 45.403 45.318 45.211 45.126 45.033 44.922 44.803 44.674 44.575 44.47 44.305 44.172 44.016 43.938 43.788 43.633 43.453 43.36 42.889 43.061 42.929 42.771 42.409 42.226 42.034 41.777 41.481 41.126 40.56 39.076 -7 ,18798 ,TETRA ,17603438,Sun Nov 28 16:36:17 CET,Sun Nov 28 18:48:40 CET,0.0 1.838 2.325 2.675 2.981 3.258 3.514 3.78 4.252 4.461 4.667 4.622 5.227 5.407 5.762 6.082 6.361 6.494 6.759 7.017 7.384 7.613 7.832 8.153 8.465 8.784 9.093 9.374 9.743 10.103 10.459 10.915 11.351 11.76 12.246 12.826 13.396 14.021 14.734 15.499 16.285 17.191 18.261 19.359 20.711 22.277 24.117 26.237 28.786 31.919 35.876 39.256 41.349 42.737 43.657 44.276 44.713 45.022 45.171 45.26 45.325 45.381 45.426 45.432 45.408 45.378 45.341 45.287 45.221 45.148 45.066 44.974 44.862 44.765 44.696 44.596 44.478 44.365 44.227 44.127 44.028 43.859 43.73 43.594 43.522 43.37 43.219 43.055 42.96 42.482 42.655 42.535 42.387 41.979 41.747 41.507 41.233 40.879 40.426 39.779 37.765 -8 ,1520 ,TETRA ,17603439,Sun Nov 28 16:36:19 CET,Sun Nov 28 18:49:19 CET,0.0 1.451 1.973 2.369 2.717 3.037 3.324 3.58 4.038 4.236 4.427 4.381 4.978 5.137 5.46 5.768 6.045 6.177 6.432 6.676 7.036 7.266 7.487 7.804 8.114 8.41 8.701 8.989 9.37 9.741 10.095 10.538 10.983 11.415 11.922 12.502 13.068 13.692 14.389 15.153 15.944 16.859 17.968 19.091 20.432 21.968 23.742 25.802 28.416 31.691 35.661 38.959 40.961 42.256 43.113 43.699 44.109 44.43 44.622 44.744 44.801 44.821 44.822 44.81 44.794 44.756 44.709 44.658 44.605 44.515 44.4 44.32 44.231 44.117 44.027 43.929 43.828 43.721 43.596 43.499 43.397 43.237 43.124 43.001 42.924 42.751 42.566 42.372 42.285 41.821 41.996 41.865 41.716 41.362 41.147 40.886 40.575 40.227 39.789 39.142 36.023 -9 ,5634 ,TETRA ,17603227,Sun Nov 28 16:32:30 CET,Sun Nov 28 16:35:11 CET,0.0 2.204 2.743 3.134 3.46 3.747 4.007 4.248 4.724 4.958 5.182 5.174 5.792 5.957 6.263 6.571 6.865 7.007 7.287 7.54 7.905 8.168 8.43 8.78 9.109 9.427 9.76 10.088 10.476 10.858 11.246 11.715 12.152 12.593 13.119 13.706 14.277 14.884 15.544 16.273 17.065 17.986 19.067 20.171 21.476 22.98 24.779 26.832 29.304 32.307 36.185 39.604 41.678 43.042 43.969 44.62 44.972 45.194 45.396 45.526 45.618 45.706 45.756 45.777 45.766 45.719 45.641 45.562 45.495 45.438 45.375 45.295 45.197 45.095 44.992 44.857 44.736 44.626 44.479 44.357 44.233 44.059 43.914 43.733 43.64 43.448 43.245 43.044 42.946 42.46 42.57 42.422 42.274 41.955 41.776 41.557 41.28 40.966 40.59 39.998 37.699 -10 ,19443 ,TETRA ,17603228,Sun Nov 28 16:32:29 CET,Sun Nov 28 16:35:07 CET,0.0 2.248 2.82 3.223 3.522 3.798 4.062 4.3 4.743 4.946 5.13 5.064 5.673 5.861 6.198 6.489 6.77 6.909 7.175 7.439 7.806 8.03 8.252 8.576 8.892 9.204 9.517 9.819 10.212 10.596 10.964 11.412 11.845 12.274 12.776 13.334 13.878 14.498 15.181 15.919 16.73 17.682 18.796 19.911 21.224 22.75 24.573 26.645 29.184 32.352 36.458 39.974 42.076 43.465 44.394 45.06 45.541 45.856 46.069 46.222 46.309 46.385 46.419 46.411 46.395 46.366 46.304 46.232 46.161 46.073 45.993 45.931 45.859 45.766 45.684 45.591 45.49 45.366 45.236 45.148 45.051 44.894 44.765 44.625 44.555 44.418 44.282 44.12 44.025 43.554 43.7 43.568 43.432 43.125 42.928 42.705 42.454 42.12 41.738 41.29 39.444 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt deleted file mode 100644 index 75a266aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30275 ,TETRA ,17603229,Sun Nov 28 16:32:31 CET,Sun Nov 28 16:35:01 CET,0.0 2.386 3.12 3.632 4.02 4.338 4.634 4.891 5.307 5.485 5.652 5.553 6.11 6.244 6.5 6.733 6.94 7.044 7.252 7.449 7.726 7.894 8.055 8.278 8.484 8.687 8.887 9.08 9.315 9.532 9.743 9.995 10.242 10.491 10.769 11.071 11.352 11.659 12.003 12.345 12.691 13.085 13.524 13.972 14.514 15.09 15.763 16.532 17.386 18.374 19.426 20.023 20.222 20.24 20.136 19.988 19.821 19.632 19.469 19.292 19.115 18.939 18.758 18.562 18.375 18.198 17.962 17.754 17.579 17.379 17.157 16.994 16.865 16.732 16.608 16.47 16.322 16.158 16.005 15.902 15.795 15.629 15.497 15.356 15.284 15.131 14.964 14.766 14.665 14.151 14.302 14.177 14.045 13.726 13.539 13.335 13.11 12.855 12.567 12.179 7.677 -3 ,1234 ,TETRA ,17603231,Sun Nov 28 16:32:32 CET,Sun Nov 28 16:35:13 CET,0.0 2.635 3.625 4.218 4.622 4.952 5.255 5.539 6.031 6.233 6.407 6.319 6.876 7.023 7.285 7.517 7.735 7.84 8.038 8.226 8.496 8.664 8.818 9.042 9.261 9.475 9.676 9.874 10.138 10.395 10.633 10.911 11.171 11.421 11.709 12.018 12.313 12.639 12.995 13.378 13.757 14.171 14.679 15.179 15.739 16.393 17.165 17.958 18.784 19.806 20.993 21.765 22.117 22.242 22.208 22.075 21.91 21.741 21.569 21.359 21.14 20.943 20.756 20.579 20.41 20.227 20.013 19.801 19.614 19.434 19.237 19.051 18.87 18.703 18.579 18.453 18.316 18.153 17.973 17.845 17.71 17.507 17.354 17.178 17.088 16.921 16.76 16.598 16.512 16.015 16.187 16.068 15.943 15.669 15.513 15.338 15.134 14.886 14.576 14.133 11.172 -5 ,1092 ,TETRA ,17603446,Sun Nov 28 16:36:43 CET,Sun Nov 28 18:51:54 CET,0.0 3.277 4.196 4.906 5.507 6.065 6.514 6.911 7.731 8.045 8.323 8.428 9.028 9.184 9.468 9.727 9.949 10.054 10.276 10.49 10.79 10.98 11.155 11.409 11.644 11.861 12.082 12.294 12.561 12.832 13.097 13.406 13.711 14.007 14.329 14.675 14.996 15.334 15.709 16.11 16.52 16.993 17.517 18.019 18.586 19.185 19.88 20.689 21.628 22.693 23.889 24.768 25.128 25.189 25.155 25.094 24.993 24.864 24.74 24.585 24.428 24.288 24.117 23.908 23.708 23.535 23.342 23.167 23.018 22.853 22.676 22.517 22.358 22.2 22.073 21.95 21.819 21.659 21.48 21.352 21.214 21.013 20.872 20.701 20.608 20.42 20.218 20.0 19.877 19.345 19.489 19.351 19.213 18.899 18.705 18.5 18.29 18.036 17.696 17.211 13.947 -6 ,14163 ,TETRA ,17603447,Sun Nov 28 16:36:43 CET,Sun Nov 28 18:53:11 CET,0.0 2.677 3.457 3.919 4.285 4.616 4.894 5.129 5.568 5.769 5.954 5.859 6.406 6.543 6.797 7.035 7.27 7.375 7.565 7.754 8.028 8.204 8.377 8.617 8.836 9.055 9.269 9.456 9.688 9.915 10.138 10.415 10.693 10.961 11.251 11.559 11.84 12.136 12.48 12.837 13.185 13.581 14.029 14.462 14.996 15.601 16.251 17.019 17.932 18.931 20.031 20.691 20.939 21.002 20.896 20.714 20.522 20.294 20.036 19.769 19.543 19.344 19.154 18.949 18.753 18.563 18.348 18.163 17.979 17.734 17.494 17.332 17.165 16.997 16.861 16.71 16.559 16.384 16.189 16.054 15.911 15.681 15.522 15.371 15.295 15.13 14.948 14.755 14.651 14.131 14.31 14.195 14.059 13.741 13.573 13.393 13.197 12.937 12.571 12.075 9.448 -7 ,30209 ,TETRA ,17603448,Sun Nov 28 16:36:43 CET,Sun Nov 28 18:52:31 CET,0.0 4.467 5.553 6.371 7.064 7.653 8.078 8.372 8.878 9.088 9.273 9.215 9.788 9.958 10.283 10.572 10.831 10.957 11.188 11.405 11.727 11.928 12.122 12.401 12.667 12.921 13.165 13.404 13.706 13.986 14.243 14.547 14.83 15.083 15.372 15.685 15.98 16.306 16.643 16.999 17.37 17.787 18.275 18.715 19.233 19.826 20.459 21.163 21.94 22.755 23.582 24.002 24.019 23.897 23.714 23.502 23.27 22.977 22.688 22.402 22.161 21.934 21.698 21.467 21.255 21.049 20.828 20.638 20.471 20.296 20.089 19.91 19.744 19.574 19.444 19.306 19.157 19.011 18.846 18.727 18.602 18.387 18.237 18.087 18.01 17.84 17.658 17.457 17.342 16.822 16.966 16.841 16.718 16.395 16.216 16.015 15.772 15.506 15.188 14.72 11.027 -8 ,19236 ,TETRA ,17603236,Sun Nov 28 16:32:31 CET,Sun Nov 28 16:35:02 CET,0.0 3.412 4.448 5.079 5.525 5.913 6.257 6.584 7.159 7.39 7.589 7.531 8.109 8.272 8.569 8.837 9.089 9.205 9.416 9.626 9.927 10.12 10.301 10.56 10.817 11.056 11.281 11.5 11.774 12.042 12.307 12.62 12.921 13.189 13.473 13.775 14.07 14.4 14.756 15.143 15.528 15.952 16.453 16.978 17.615 18.295 19.036 19.845 20.787 21.853 22.983 23.753 24.04 24.071 23.998 23.862 23.66 23.452 23.26 23.013 22.779 22.57 22.359 22.149 21.928 21.728 21.531 21.334 21.142 20.933 20.715 20.54 20.365 20.181 20.025 19.846 19.683 19.514 19.329 19.205 19.081 18.9 18.768 18.613 18.527 18.341 18.131 17.911 17.798 17.285 17.435 17.293 17.144 16.847 16.689 16.498 16.294 16.073 15.79 15.37 12.884 -9 ,9225 ,TETRA ,17603450,Sun Nov 28 16:36:43 CET,Sun Nov 28 18:52:44 CET,0.0 4.522 5.592 6.18 6.602 6.979 7.33 7.625 8.121 8.331 8.524 8.483 9.104 9.325 9.647 9.886 10.118 10.23 10.447 10.653 10.93 11.107 11.28 11.531 11.77 11.99 12.201 12.403 12.672 12.93 13.163 13.418 13.667 13.914 14.186 14.495 14.81 15.16 15.512 15.859 16.191 16.561 17.009 17.435 17.944 18.538 19.202 19.878 20.622 21.43 22.179 22.576 22.647 22.572 22.426 22.244 22.035 21.797 21.548 21.276 21.028 20.794 20.565 20.323 20.077 19.843 19.595 19.377 19.189 18.983 18.756 18.587 18.433 18.249 18.098 17.94 17.773 17.612 17.444 17.328 17.201 16.999 16.864 16.733 16.663 16.506 16.349 16.176 16.081 15.593 15.795 15.68 15.56 15.282 15.104 14.907 14.691 14.456 14.216 13.877 11.785 -10 ,26587 ,TETRA ,17603238,Sun Nov 28 16:32:46 CET,Sun Nov 28 16:35:18 CET,0.0 2.724 3.66 4.355 4.88 5.273 5.6 5.892 6.384 6.596 6.795 6.758 7.337 7.501 7.809 8.089 8.351 8.476 8.718 8.944 9.255 9.446 9.631 9.904 10.159 10.401 10.637 10.862 11.148 11.419 11.668 11.949 12.2 12.445 12.741 13.062 13.36 13.682 13.996 14.314 14.651 15.018 15.465 15.93 16.452 17.019 17.651 18.334 19.081 19.898 20.762 21.224 21.324 21.288 21.169 20.96 20.704 20.41 20.114 19.846 19.622 19.406 19.205 19.004 18.777 18.555 18.329 18.126 17.932 17.726 17.523 17.358 17.17 16.961 16.797 16.631 16.466 16.305 16.139 16.02 15.897 15.688 15.545 15.402 15.327 15.178 15.01 14.813 14.716 14.218 14.39 14.25 14.097 13.773 13.584 13.379 13.126 12.814 12.479 12.027 8.992 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt deleted file mode 100644 index 076ee3ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8441 ,TETRA ,17603239,Sun Nov 28 16:32:31 CET,Sun Nov 28 16:35:02 CET,0.0 0.48 0.654 0.754 0.854 0.965 1.059 1.146 1.315 1.382 1.45 1.18 1.633 1.691 1.804 1.914 2.005 2.044 2.12 2.189 2.297 2.373 2.45 2.549 2.626 2.699 2.777 2.853 2.941 3.041 3.138 3.236 3.325 3.393 3.467 3.552 3.613 3.666 3.718 3.757 3.796 3.83 3.844 3.831 3.769 3.662 3.537 3.325 2.89 2.184 0.945 -0.565 -1.783 -2.878 -3.801 -4.554 -5.217 -5.794 -6.261 -6.733 -7.127 -7.468 -7.803 -8.125 -8.4 -8.632 -8.881 -9.103 -9.306 -9.527 -9.756 -9.935 -10.111 -10.295 -10.441 -10.592 -10.748 -10.921 -11.102 -11.225 -11.344 -11.514 -11.629 -11.754 -11.821 -11.956 -12.089 -12.232 -12.306 -12.787 -12.545 -12.632 -12.711 -12.871 -12.957 -13.046 -13.146 -13.261 -13.415 -13.594 -13.861 -2 ,6697 ,TETRA ,17603453,Sun Nov 28 16:36:43 CET,Sun Nov 28 18:55:24 CET,0.0 0.435 0.668 0.81 0.923 1.038 1.142 1.222 1.364 1.44 1.514 1.255 1.709 1.762 1.868 1.975 2.078 2.126 2.217 2.295 2.399 2.459 2.52 2.603 2.677 2.747 2.806 2.866 2.944 3.012 3.074 3.15 3.221 3.288 3.366 3.447 3.525 3.608 3.691 3.758 3.811 3.858 3.913 3.956 3.956 3.919 3.805 3.569 3.165 2.483 1.28 -0.169 -1.374 -2.383 -3.255 -4.01 -4.647 -5.206 -5.676 -6.151 -6.552 -6.9 -7.234 -7.559 -7.852 -8.099 -8.357 -8.583 -8.773 -8.971 -9.188 -9.386 -9.582 -9.773 -9.92 -10.066 -10.214 -10.356 -10.505 -10.615 -10.721 -10.885 -11.012 -11.136 -11.192 -11.317 -11.46 -11.61 -11.688 -12.173 -11.907 -11.981 -12.08 -12.318 -12.418 -12.515 -12.621 -12.712 -12.806 -12.948 -13.147 -3 ,26933 ,TETRA ,17603454,Sun Nov 28 16:36:43 CET,Sun Nov 28 18:54:11 CET,0.0 0.582 0.79 0.957 1.076 1.181 1.275 1.369 1.526 1.575 1.641 1.39 1.838 1.889 1.994 2.087 2.174 2.219 2.296 2.363 2.453 2.507 2.569 2.666 2.739 2.804 2.878 2.955 3.056 3.153 3.249 3.349 3.44 3.514 3.582 3.663 3.737 3.81 3.878 3.948 4.014 4.089 4.13 4.121 4.114 4.09 3.993 3.807 3.467 2.824 1.681 0.271 -0.907 -1.932 -2.826 -3.615 -4.292 -4.875 -5.355 -5.832 -6.238 -6.598 -6.951 -7.276 -7.573 -7.841 -8.119 -8.362 -8.56 -8.771 -8.994 -9.172 -9.358 -9.547 -9.687 -9.831 -9.979 -10.139 -10.304 -10.42 -10.541 -10.72 -10.843 -10.982 -11.055 -11.197 -11.352 -11.501 -11.572 -12.06 -11.783 -11.865 -11.962 -12.148 -12.247 -12.354 -12.463 -12.568 -12.725 -12.943 -13.201 -4 ,32618 ,TETRA ,17603455,Sun Nov 28 16:36:44 CET,Sun Nov 28 18:58:03 CET,0.0 0.61 0.807 0.916 1.036 1.145 1.236 1.341 1.513 1.573 1.63 1.352 1.796 1.856 1.969 2.057 2.132 2.164 2.227 2.302 2.408 2.467 2.518 2.58 2.65 2.732 2.816 2.89 2.973 3.036 3.088 3.163 3.238 3.301 3.368 3.441 3.498 3.542 3.602 3.663 3.673 3.655 3.617 3.586 3.539 3.423 3.262 3.016 2.596 1.906 0.642 -0.945 -2.225 -3.291 -4.198 -5.009 -5.695 -6.277 -6.755 -7.239 -7.663 -8.021 -8.36 -8.69 -8.986 -9.25 -9.515 -9.737 -9.925 -10.129 -10.359 -10.544 -10.725 -10.924 -11.078 -11.231 -11.387 -11.559 -11.742 -11.855 -11.975 -12.168 -12.292 -12.421 -12.481 -12.594 -12.718 -12.843 -12.923 -13.422 -13.172 -13.247 -13.324 -13.503 -13.595 -13.697 -13.799 -13.919 -14.054 -14.217 -14.434 -5 ,31246 ,TETRA ,17603456,Sun Nov 28 16:36:46 CET,Sun Nov 28 18:53:54 CET,0.0 0.423 0.581 0.739 0.871 0.981 1.075 1.158 1.314 1.382 1.446 1.173 1.625 1.681 1.783 1.871 1.955 1.994 2.064 2.131 2.23 2.299 2.363 2.451 2.526 2.588 2.639 2.693 2.759 2.813 2.877 2.945 2.999 3.054 3.116 3.17 3.213 3.261 3.289 3.299 3.338 3.365 3.358 3.348 3.298 3.172 2.959 2.624 2.115 1.321 0.003 -1.561 -2.825 -3.884 -4.811 -5.632 -6.304 -6.88 -7.384 -7.881 -8.289 -8.65 -8.983 -9.295 -9.591 -9.856 -10.13 -10.373 -10.58 -10.781 -10.981 -11.141 -11.307 -11.481 -11.612 -11.747 -11.886 -12.041 -12.208 -12.307 -12.397 -12.552 -12.674 -12.797 -12.856 -12.972 -13.101 -13.246 -13.316 -13.801 -13.562 -13.651 -13.731 -13.861 -13.942 -14.029 -14.136 -14.274 -14.395 -14.519 -14.723 -6 ,4102 ,TETRA ,17603244,Sun Nov 28 16:32:42 CET,Sun Nov 28 16:35:15 CET,0.0 0.466 0.709 0.917 1.085 1.206 1.304 1.399 1.551 1.621 1.691 1.422 1.885 1.951 2.067 2.149 2.221 2.253 2.311 2.367 2.449 2.5 2.553 2.63 2.697 2.767 2.841 2.922 3.009 3.072 3.129 3.187 3.254 3.33 3.397 3.458 3.514 3.567 3.598 3.641 3.698 3.742 3.764 3.75 3.725 3.64 3.465 3.239 2.885 2.242 1.041 -0.462 -1.706 -2.723 -3.59 -4.35 -4.986 -5.537 -6.016 -6.488 -6.865 -7.209 -7.55 -7.856 -8.135 -8.387 -8.633 -8.845 -9.033 -9.225 -9.43 -9.618 -9.812 -9.997 -10.133 -10.266 -10.405 -10.554 -10.7 -10.798 -10.901 -11.066 -11.182 -11.306 -11.368 -11.496 -11.63 -11.772 -11.844 -12.327 -12.062 -12.138 -12.227 -12.403 -12.5 -12.592 -12.673 -12.77 -12.878 -13.049 -13.355 -7 ,5854 ,TETRA ,17603458,Sun Nov 28 16:36:46 CET,Sun Nov 28 18:56:34 CET,0.0 0.45 0.641 0.774 0.922 1.055 1.147 1.264 1.487 1.562 1.624 1.346 1.79 1.842 1.933 2.018 2.105 2.152 2.245 2.322 2.43 2.498 2.558 2.653 2.738 2.819 2.896 2.957 3.033 3.114 3.187 3.282 3.37 3.433 3.495 3.562 3.631 3.713 3.794 3.862 3.925 3.978 4.001 4.016 4.011 3.962 3.867 3.682 3.338 2.731 1.589 0.108 -1.073 -2.052 -2.937 -3.728 -4.366 -4.931 -5.41 -5.862 -6.27 -6.64 -6.961 -7.27 -7.561 -7.816 -8.094 -8.334 -8.529 -8.732 -8.94 -9.108 -9.282 -9.454 -9.58 -9.724 -9.888 -10.035 -10.174 -10.275 -10.379 -10.544 -10.659 -10.773 -10.832 -10.96 -11.096 -11.237 -11.31 -11.8 -11.551 -11.644 -11.761 -12.013 -12.12 -12.219 -12.318 -12.443 -12.603 -12.787 -13.214 -8 ,3914 ,TETRA ,17603246,Sun Nov 28 16:32:35 CET,Sun Nov 28 16:35:10 CET,0.0 0.473 0.687 0.823 0.94 1.062 1.194 1.302 1.463 1.534 1.595 1.311 1.758 1.799 1.887 1.992 2.092 2.139 2.24 2.328 2.446 2.514 2.581 2.67 2.749 2.824 2.89 2.956 3.051 3.137 3.194 3.245 3.292 3.33 3.378 3.436 3.487 3.543 3.606 3.661 3.693 3.709 3.699 3.671 3.613 3.515 3.354 3.076 2.634 1.944 0.716 -0.786 -2.07 -3.162 -4.046 -4.851 -5.561 -6.191 -6.725 -7.246 -7.697 -8.069 -8.406 -8.723 -9.031 -9.318 -9.599 -9.841 -10.046 -10.257 -10.463 -10.631 -10.814 -10.997 -11.138 -11.29 -11.453 -11.622 -11.772 -11.872 -11.976 -12.141 -12.268 -12.386 -12.441 -12.565 -12.705 -12.845 -12.916 -13.403 -13.16 -13.238 -13.319 -13.505 -13.608 -13.721 -13.832 -13.966 -14.151 -14.38 -14.694 -9 ,7638 ,TETRA ,17603460,Sun Nov 28 16:36:44 CET,Sun Nov 28 18:54:53 CET,0.0 0.667 0.886 1.048 1.167 1.27 1.388 1.496 1.625 1.684 1.746 1.464 1.905 1.949 2.03 2.103 2.173 2.206 2.283 2.363 2.469 2.522 2.565 2.634 2.71 2.781 2.838 2.904 2.982 3.043 3.1 3.178 3.271 3.334 3.386 3.448 3.487 3.527 3.576 3.624 3.666 3.69 3.694 3.703 3.691 3.65 3.543 3.284 2.879 2.233 1.056 -0.427 -1.671 -2.707 -3.559 -4.298 -4.917 -5.46 -5.934 -6.42 -6.821 -7.156 -7.477 -7.795 -8.084 -8.341 -8.605 -8.838 -9.04 -9.246 -9.478 -9.679 -9.87 -10.058 -10.206 -10.348 -10.489 -10.637 -10.789 -10.901 -11.016 -11.19 -11.308 -11.442 -11.512 -11.651 -11.786 -11.94 -12.025 -12.515 -12.281 -12.38 -12.465 -12.65 -12.764 -12.889 -13.021 -13.145 -13.29 -13.502 -14.066 -10 ,27287 ,TETRA ,17603248,Sun Nov 28 16:32:40 CET,Sun Nov 28 16:35:09 CET,0.0 0.587 0.796 0.946 1.053 1.148 1.242 1.324 1.46 1.525 1.585 1.307 1.761 1.809 1.9 1.975 2.045 2.084 2.157 2.238 2.372 2.462 2.551 2.649 2.721 2.793 2.871 2.944 3.015 3.084 3.149 3.229 3.315 3.392 3.471 3.556 3.644 3.724 3.79 3.856 3.913 3.963 3.999 4.028 4.047 4.013 3.89 3.647 3.242 2.587 1.365 -0.142 -1.326 -2.329 -3.202 -3.935 -4.55 -5.129 -5.638 -6.124 -6.533 -6.9 -7.238 -7.565 -7.877 -8.16 -8.457 -8.703 -8.91 -9.113 -9.312 -9.483 -9.651 -9.835 -9.998 -10.159 -10.305 -10.445 -10.592 -10.697 -10.808 -10.971 -11.08 -11.202 -11.269 -11.402 -11.533 -11.68 -11.755 -12.237 -11.968 -12.043 -12.125 -12.318 -12.429 -12.545 -12.662 -12.789 -12.951 -13.16 -13.671 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt deleted file mode 100644 index fdb840aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16728 ,TETRA ,17603462,Sun Nov 28 16:36:47 CET,Sun Nov 28 18:56:48 CET,0.0 0.394 0.579 0.721 0.827 0.949 1.064 1.156 1.343 1.423 1.491 1.219 1.694 1.768 1.923 2.078 2.203 2.257 2.376 2.502 2.674 2.773 2.877 3.044 3.206 3.359 3.516 3.66 3.836 4.008 4.169 4.357 4.552 4.753 4.97 5.212 5.451 5.716 5.99 6.275 6.584 6.925 7.347 7.771 8.255 8.822 9.509 10.288 11.215 12.357 13.684 14.763 15.33 15.61 15.708 15.744 15.752 15.694 15.624 15.567 15.499 15.417 15.334 15.25 15.175 15.105 15.016 14.942 14.882 14.802 14.704 14.625 14.538 14.446 14.384 14.32 14.243 14.164 14.092 14.043 13.983 13.873 13.802 13.722 13.682 13.611 13.534 13.438 13.378 12.923 13.204 13.132 13.04 12.876 12.807 12.729 12.639 12.522 12.393 12.281 11.839 -2 ,14205 ,TETRA ,17603250,Sun Nov 28 16:32:43 CET,Sun Nov 28 16:34:41 CET,0.0 0.449 0.639 0.761 0.865 0.977 1.085 1.175 1.312 1.377 1.441 1.162 1.635 1.7 1.825 1.947 2.062 2.122 2.251 2.373 2.531 2.629 2.731 2.878 3.023 3.169 3.304 3.44 3.614 3.782 3.947 4.145 4.332 4.51 4.729 4.979 5.213 5.474 5.759 6.049 6.355 6.718 7.146 7.585 8.1 8.673 9.354 10.105 10.983 12.013 13.238 14.224 14.733 15.007 15.158 15.225 15.218 15.161 15.095 15.021 14.952 14.87 14.766 14.668 14.574 14.479 14.37 14.268 14.19 14.11 14.011 13.919 13.829 13.748 13.689 13.618 13.538 13.46 13.385 13.33 13.27 13.175 13.103 13.028 12.988 12.894 12.804 12.711 12.653 12.192 12.455 12.395 12.33 12.176 12.082 11.981 11.898 11.8 11.665 11.487 11.241 -3 ,20250 ,TETRA ,17603464,Sun Nov 28 16:36:45 CET,Sun Nov 28 18:56:14 CET,0.0 0.46 0.631 0.759 0.877 0.98 1.068 1.153 1.31 1.391 1.473 1.181 1.641 1.704 1.829 1.939 2.044 2.1 2.229 2.351 2.5 2.608 2.722 2.874 3.032 3.194 3.333 3.464 3.624 3.777 3.93 4.113 4.304 4.501 4.713 4.949 5.191 5.454 5.73 6.025 6.355 6.726 7.155 7.593 8.088 8.661 9.358 10.12 11.032 12.123 13.331 14.236 14.669 14.87 14.967 15.021 15.056 15.048 15.002 14.938 14.869 14.795 14.709 14.617 14.536 14.445 14.347 14.278 14.212 14.122 14.009 13.923 13.839 13.743 13.654 13.568 13.502 13.424 13.32 13.253 13.195 13.101 13.024 12.939 12.904 12.825 12.738 12.667 12.627 12.176 12.465 12.413 12.339 12.16 12.076 12.011 11.937 11.85 11.732 11.561 11.075 -4 ,5360 ,TETRA ,17603252,Sun Nov 28 16:33:08 CET,Sun Nov 28 16:35:30 CET,0.0 0.239 0.408 0.579 0.72 0.844 0.948 1.047 1.244 1.346 1.439 1.183 1.669 1.739 1.854 1.975 2.115 2.182 2.299 2.406 2.566 2.668 2.767 2.923 3.055 3.177 3.307 3.449 3.634 3.809 3.979 4.174 4.357 4.53 4.732 4.959 5.181 5.425 5.691 5.979 6.305 6.682 7.096 7.518 8.025 8.582 9.243 10.018 10.874 11.844 13.024 13.999 14.531 14.832 14.943 14.946 14.929 14.897 14.842 14.766 14.693 14.618 14.537 14.447 14.361 14.27 14.175 14.1 14.026 13.938 13.83 13.744 13.658 13.561 13.483 13.397 13.314 13.232 13.139 13.063 12.978 12.867 12.792 12.704 12.665 12.599 12.522 12.43 12.381 11.931 12.223 12.169 12.108 11.964 11.876 11.766 11.652 11.526 11.362 11.203 10.73 -6 ,5163 ,TETRA ,17603254,Sun Nov 28 16:33:06 CET,Sun Nov 28 16:36:22 CET,0.0 0.276 0.462 0.603 0.706 0.802 0.895 0.985 1.153 1.238 1.33 1.093 1.586 1.663 1.806 1.95 2.085 2.146 2.269 2.388 2.544 2.649 2.758 2.913 3.059 3.215 3.364 3.507 3.685 3.851 4.02 4.229 4.428 4.621 4.848 5.102 5.353 5.626 5.924 6.243 6.564 6.92 7.335 7.751 8.244 8.808 9.48 10.242 11.12 12.212 13.526 14.448 14.894 15.124 15.197 15.226 15.225 15.18 15.109 15.037 14.982 14.893 14.791 14.721 14.658 14.579 14.475 14.386 14.318 14.239 14.14 14.051 13.969 13.898 13.84 13.766 13.671 13.555 13.449 13.386 13.314 13.2 13.125 13.043 12.995 12.899 12.807 12.718 12.67 12.232 12.52 12.452 12.378 12.222 12.15 12.046 11.928 11.805 11.627 11.423 11.099 -7 ,5687 ,TETRA ,17603255,Sun Nov 28 16:33:06 CET,Sun Nov 28 16:35:23 CET,0.0 0.274 0.481 0.633 0.77 0.886 0.99 1.089 1.308 1.418 1.52 1.307 1.792 1.869 2.026 2.162 2.292 2.352 2.459 2.566 2.736 2.843 2.942 3.09 3.246 3.386 3.505 3.624 3.799 3.99 4.171 4.37 4.556 4.743 4.97 5.22 5.46 5.738 6.032 6.358 6.717 7.121 7.6 8.069 8.605 9.216 9.936 10.774 11.765 12.974 14.425 15.543 16.111 16.401 16.528 16.533 16.48 16.395 16.309 16.213 16.117 16.031 15.94 15.858 15.783 15.691 15.574 15.481 15.405 15.316 15.214 15.124 15.031 14.93 14.854 14.781 14.704 14.62 14.532 14.476 14.415 14.317 14.243 14.159 14.111 14.003 13.888 13.762 13.69 13.222 13.471 13.412 13.351 13.201 13.108 12.986 12.848 12.735 12.629 12.467 12.169 -8 ,4548 ,TETRA ,17603256,Sun Nov 28 16:33:06 CET,Sun Nov 28 16:35:21 CET,0.0 0.255 0.463 0.61 0.708 0.801 0.896 0.99 1.15 1.225 1.294 1.019 1.491 1.554 1.675 1.798 1.922 1.984 2.115 2.24 2.404 2.509 2.613 2.755 2.888 3.021 3.158 3.299 3.478 3.647 3.804 3.992 4.185 4.363 4.572 4.821 5.063 5.336 5.626 5.927 6.25 6.6 7.003 7.429 7.936 8.51 9.176 9.94 10.858 11.991 13.37 14.469 14.995 15.258 15.406 15.474 15.477 15.458 15.425 15.339 15.254 15.186 15.12 15.047 14.974 14.905 14.827 14.757 14.694 14.624 14.547 14.486 14.413 14.327 14.254 14.169 14.089 13.995 13.892 13.829 13.763 13.638 13.544 13.462 13.423 13.344 13.252 13.166 13.128 12.691 12.985 12.935 12.88 12.745 12.671 12.606 12.522 12.393 12.218 12.002 11.804 -9 ,11003 ,TETRA ,17603257,Sun Nov 28 16:33:07 CET,Sun Nov 28 16:35:38 CET,0.0 0.272 0.443 0.587 0.7 0.81 0.919 1.015 1.209 1.303 1.391 1.15 1.624 1.69 1.813 1.933 2.039 2.098 2.224 2.337 2.482 2.581 2.682 2.82 2.949 3.074 3.2 3.323 3.484 3.65 3.803 3.98 4.158 4.34 4.561 4.796 5.024 5.284 5.563 5.859 6.177 6.538 6.972 7.43 7.977 8.604 9.327 10.142 11.08 12.142 13.421 14.417 14.911 15.164 15.327 15.409 15.407 15.378 15.334 15.287 15.24 15.197 15.123 15.032 14.956 14.89 14.82 14.75 14.688 14.615 14.55 14.494 14.424 14.344 14.274 14.192 14.101 14.008 13.909 13.846 13.785 13.69 13.621 13.542 13.496 13.41 13.318 13.214 13.171 12.735 13.006 12.926 12.845 12.692 12.603 12.5 12.388 12.276 12.163 12.042 11.597 -10 ,4857 ,TETRA ,17603471,Sun Nov 28 16:36:46 CET,Sun Nov 28 18:56:30 CET,0.0 0.176 0.343 0.5 0.6 0.696 0.791 0.87 1.036 1.113 1.194 0.946 1.42 1.493 1.636 1.769 1.903 1.97 2.099 2.23 2.415 2.52 2.623 2.78 2.934 3.077 3.212 3.341 3.531 3.711 3.872 4.086 4.3 4.499 4.731 5.011 5.278 5.55 5.851 6.194 6.539 6.896 7.322 7.767 8.296 8.875 9.52 10.275 11.23 12.384 13.716 14.696 15.148 15.419 15.591 15.666 15.679 15.65 15.598 15.531 15.467 15.394 15.322 15.245 15.157 15.089 15.009 14.934 14.869 14.784 14.693 14.611 14.524 14.434 14.36 14.285 14.201 14.104 14.002 13.931 13.86 13.74 13.662 13.588 13.544 13.461 13.372 13.266 13.209 12.761 13.03 12.946 12.855 12.72 12.656 12.583 12.491 12.354 12.164 11.945 11.712 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 6b348aa0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5360 ,TETRA ,17603259,Sun Nov 28 16:33:07 CET,Sun Nov 28 16:35:37 CET,0.0 1.728 2.139 2.451 2.702 2.901 3.073 3.241 3.574 3.719 3.84 3.699 4.2 4.3 4.477 4.657 4.832 4.922 5.1 5.263 5.499 5.634 5.758 5.936 6.111 6.279 6.436 6.609 6.836 7.037 7.235 7.479 7.702 7.92 8.167 8.426 8.679 8.972 9.291 9.604 9.95 10.354 10.811 11.264 11.776 12.349 13.019 13.774 14.647 15.621 16.694 17.489 17.829 17.908 17.898 17.86 17.761 17.586 17.418 17.264 17.089 16.916 16.755 16.583 16.413 16.248 16.074 15.914 15.758 15.586 15.413 15.275 15.125 14.905 14.701 14.536 14.383 14.214 14.045 13.928 13.814 13.622 13.473 13.316 13.238 13.081 12.913 12.723 12.622 12.136 12.279 12.152 12.003 11.685 11.507 11.286 11.035 10.77 10.372 9.756 7.051 -2 ,23728 ,TETRA ,17603260,Sun Nov 28 16:33:07 CET,Sun Nov 28 16:35:28 CET,0.0 1.612 2.076 2.392 2.693 2.975 3.206 3.396 3.695 3.825 3.959 3.857 4.378 4.509 4.771 5.012 5.23 5.325 5.517 5.691 5.919 6.076 6.228 6.429 6.618 6.796 6.965 7.134 7.344 7.547 7.742 7.978 8.216 8.454 8.714 9.004 9.291 9.587 9.893 10.231 10.602 11.026 11.535 12.037 12.577 13.171 13.882 14.681 15.579 16.597 17.776 18.619 19.006 19.173 19.193 19.114 18.99 18.87 18.731 18.565 18.427 18.28 18.108 17.927 17.754 17.587 17.408 17.251 17.111 16.953 16.785 16.633 16.463 16.293 16.16 16.015 15.863 15.706 15.536 15.41 15.283 15.084 14.941 14.788 14.71 14.529 14.33 14.139 14.036 13.538 13.656 13.521 13.382 12.988 12.737 12.463 12.176 11.863 11.395 10.699 8.925 -3 ,31721 ,TETRA ,17603261,Sun Nov 28 16:33:09 CET,Sun Nov 28 16:35:31 CET,0.0 1.777 2.273 2.622 2.853 3.038 3.231 3.427 3.774 3.918 4.041 3.879 4.381 4.485 4.671 4.858 5.032 5.111 5.269 5.428 5.662 5.805 5.951 6.171 6.362 6.533 6.711 6.884 7.091 7.306 7.519 7.763 8.006 8.249 8.512 8.787 9.051 9.362 9.701 10.046 10.419 10.856 11.345 11.835 12.408 13.015 13.715 14.53 15.471 16.537 17.678 18.446 18.818 18.932 18.904 18.835 18.714 18.534 18.335 18.154 17.983 17.807 17.608 17.362 17.119 16.897 16.701 16.545 16.399 16.259 16.11 15.962 15.796 15.62 15.459 15.295 15.15 14.984 14.808 14.685 14.551 14.336 14.186 14.034 13.959 13.786 13.59 13.375 13.252 12.761 12.907 12.786 12.647 12.243 12.015 11.776 11.508 11.18 10.76 10.207 7.672 -4 ,31998 ,TETRA ,17603262,Sun Nov 28 16:33:11 CET,Sun Nov 28 16:35:27 CET,0.0 1.565 1.962 2.293 2.569 2.798 3.017 3.198 3.55 3.717 3.872 3.738 4.229 4.335 4.547 4.737 4.915 5.006 5.191 5.361 5.595 5.736 5.867 6.066 6.258 6.448 6.639 6.817 7.03 7.235 7.435 7.672 7.9 8.124 8.397 8.695 8.968 9.264 9.579 9.928 10.311 10.755 11.259 11.733 12.273 12.902 13.626 14.42 15.327 16.303 17.339 18.095 18.466 18.56 18.507 18.453 18.343 18.19 18.023 17.815 17.619 17.434 17.229 17.053 16.899 16.729 16.536 16.356 16.21 16.043 15.852 15.693 15.53 15.367 15.233 15.088 14.932 14.764 14.586 14.471 14.34 14.099 13.937 13.786 13.705 13.508 13.286 13.061 12.941 12.427 12.534 12.382 12.225 11.866 11.659 11.423 11.146 10.824 10.392 9.763 6.995 -5 ,26278 ,TETRA ,17603476,Sun Nov 28 16:37:13 CET,Sun Nov 28 18:51:37 CET,0.0 2.031 2.561 2.943 3.235 3.481 3.672 3.833 4.132 4.265 4.392 4.238 4.729 4.826 5.017 5.208 5.385 5.472 5.648 5.808 6.058 6.225 6.38 6.619 6.858 7.079 7.294 7.508 7.772 7.996 8.191 8.432 8.665 8.868 9.109 9.388 9.642 9.926 10.234 10.563 10.917 11.319 11.791 12.267 12.847 13.482 14.172 14.954 15.862 16.874 18.028 18.879 19.231 19.333 19.36 19.291 19.144 18.983 18.809 18.649 18.498 18.345 18.182 18.004 17.839 17.678 17.495 17.316 17.16 17.01 16.852 16.717 16.574 16.416 16.29 16.154 16.008 15.851 15.667 15.529 15.384 15.165 15.007 14.826 14.73 14.522 14.323 14.114 13.993 13.508 13.673 13.555 13.412 13.006 12.767 12.523 12.247 11.901 11.48 10.948 8.855 -6 ,131 ,TETRA ,17603477,Sun Nov 28 16:37:13 CET,Sun Nov 28 18:52:27 CET,0.0 1.568 1.987 2.358 2.69 2.928 3.137 3.318 3.62 3.779 3.936 3.79 4.282 4.389 4.598 4.813 5.004 5.093 5.267 5.44 5.69 5.849 5.999 6.189 6.363 6.536 6.711 6.888 7.121 7.338 7.542 7.788 8.019 8.248 8.531 8.855 9.159 9.479 9.811 10.158 10.525 10.933 11.409 11.922 12.506 13.115 13.794 14.578 15.488 16.433 17.469 18.188 18.494 18.606 18.592 18.524 18.436 18.319 18.183 18.01 17.847 17.697 17.545 17.403 17.262 17.127 16.971 16.813 16.668 16.509 16.341 16.198 16.043 15.871 15.742 15.611 15.473 15.325 15.13 14.978 14.821 14.568 14.382 14.185 14.085 13.889 13.696 13.493 13.374 12.866 12.95 12.799 12.659 12.309 12.096 11.889 11.642 11.307 10.867 10.22 7.887 -7 ,27872 ,TETRA ,17603478,Sun Nov 28 16:37:43 CET,Sun Nov 28 18:52:18 CET,0.0 1.524 2.023 2.36 2.62 2.842 3.041 3.23 3.569 3.718 3.853 3.702 4.203 4.313 4.515 4.71 4.897 4.987 5.146 5.295 5.515 5.663 5.806 5.997 6.18 6.354 6.528 6.697 6.918 7.158 7.417 7.729 7.988 8.203 8.449 8.727 8.998 9.296 9.603 9.929 10.294 10.722 11.212 11.695 12.243 12.834 13.508 14.289 15.189 16.178 17.303 18.07 18.388 18.497 18.493 18.434 18.335 18.2 18.035 17.793 17.555 17.341 17.144 16.949 16.744 16.564 16.361 16.163 16.0 15.821 15.632 15.479 15.295 15.103 14.965 14.815 14.654 14.492 14.334 14.219 14.084 13.859 13.707 13.547 13.458 13.268 13.072 12.836 12.703 12.196 12.311 12.165 12.008 11.645 11.45 11.242 10.98 10.618 10.135 9.548 7.95 -8 ,23644 ,TETRA ,17603266,Sun Nov 28 16:33:11 CET,Sun Nov 28 16:35:44 CET,0.0 2.063 2.576 2.97 3.271 3.531 3.746 3.924 4.25 4.399 4.546 4.431 4.929 5.03 5.226 5.405 5.564 5.646 5.812 5.985 6.245 6.416 6.565 6.766 6.968 7.156 7.327 7.503 7.76 8.022 8.279 8.59 8.891 9.168 9.45 9.738 10.021 10.338 10.661 10.99 11.341 11.773 12.273 12.727 13.25 13.828 14.49 15.272 16.165 17.142 18.28 19.135 19.548 19.718 19.762 19.721 19.646 19.53 19.405 19.259 19.102 18.944 18.767 18.582 18.405 18.25 18.075 17.894 17.724 17.53 17.302 17.126 16.964 16.799 16.67 16.525 16.376 16.223 16.054 15.943 15.828 15.63 15.481 15.312 15.229 15.059 14.842 14.618 14.511 14.02 14.143 14.006 13.872 13.537 13.328 13.107 12.849 12.538 12.163 11.615 9.921 -9 ,5592 ,TETRA ,17603480,Sun Nov 28 16:37:13 CET,Sun Nov 28 18:49:20 CET,0.0 1.915 2.358 2.716 3.001 3.237 3.467 3.675 4.021 4.179 4.332 4.206 4.709 4.813 5.013 5.2 5.38 5.469 5.645 5.81 6.033 6.178 6.321 6.513 6.702 6.889 7.055 7.216 7.427 7.635 7.835 8.072 8.3 8.516 8.766 9.061 9.345 9.646 9.98 10.343 10.706 11.096 11.56 12.023 12.56 13.158 13.817 14.56 15.436 16.427 17.523 18.243 18.541 18.612 18.568 18.459 18.313 18.154 17.987 17.812 17.632 17.447 17.265 17.089 16.913 16.729 16.55 16.381 16.219 16.053 15.876 15.721 15.556 15.382 15.24 15.089 14.917 14.737 14.561 14.433 14.294 14.08 13.92 13.708 13.593 13.34 13.102 12.916 12.81 12.303 12.391 12.246 12.099 11.741 11.534 11.32 11.07 10.73 10.31 9.75 7.541 -10 ,24717 ,TETRA ,17603268,Sun Nov 28 16:33:08 CET,Sun Nov 28 16:35:28 CET,0.0 1.853 2.354 2.699 2.986 3.217 3.435 3.65 4.015 4.16 4.291 4.151 4.662 4.783 5.02 5.265 5.504 5.604 5.766 5.93 6.171 6.309 6.443 6.648 6.834 7.019 7.2 7.371 7.588 7.794 7.989 8.227 8.465 8.69 8.954 9.265 9.558 9.873 10.213 10.57 10.946 11.363 11.874 12.372 12.89 13.448 14.094 14.835 15.664 16.58 17.703 18.535 18.838 18.905 18.872 18.788 18.68 18.57 18.469 18.331 18.174 18.01 17.826 17.647 17.49 17.334 17.164 17.011 16.88 16.736 16.559 16.408 16.243 16.057 15.905 15.749 15.591 15.415 15.226 15.097 14.961 14.684 14.474 14.274 14.174 13.966 13.744 13.516 13.403 12.909 12.998 12.85 12.706 12.361 12.158 11.934 11.666 11.31 10.846 10.257 8.682 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt deleted file mode 100644 index 0ab104fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28943 ,TETRA ,17603269,Sun Nov 28 16:33:44 CET,Sun Nov 28 16:35:54 CET,0.0 0.902 1.17 1.346 1.484 1.616 1.723 1.807 1.948 2.003 2.047 1.754 2.167 2.197 2.259 2.319 2.359 2.373 2.417 2.469 2.519 2.54 2.548 2.548 2.553 2.551 2.542 2.522 2.487 2.449 2.404 2.34 2.276 2.198 2.1 1.982 1.852 1.699 1.506 1.259 0.972 0.634 0.218 -0.26 -0.898 -1.688 -2.699 -4.024 -5.861 -8.44 -12.454 -16.806 -20.057 -22.652 -24.769 -26.584 -28.082 -29.382 -30.493 -31.555 -32.446 -33.244 -33.97 -34.632 -35.235 -35.763 -36.312 -36.806 -37.215 -37.626 -38.049 -38.413 -38.793 -39.177 -39.473 -39.768 -40.068 -40.388 -40.733 -40.979 -41.229 -41.605 -41.876 -42.169 -42.321 -42.627 -42.933 -43.281 -43.468 -44.083 -44.078 -44.29 -44.517 -45.089 -45.427 -45.774 -46.138 -46.578 -47.151 -48.072 -51.985 -2 ,18896 ,TETRA ,17603270,Sun Nov 28 16:33:44 CET,Sun Nov 28 16:35:51 CET,0.0 1.066 1.33 1.528 1.675 1.784 1.871 1.948 2.097 2.162 2.212 1.916 2.325 2.359 2.416 2.46 2.508 2.535 2.587 2.63 2.673 2.681 2.689 2.707 2.719 2.722 2.722 2.72 2.703 2.679 2.645 2.585 2.508 2.426 2.335 2.23 2.107 1.942 1.743 1.52 1.263 0.932 0.506 0.034 -0.581 -1.355 -2.383 -3.703 -5.484 -8.027 -11.951 -16.226 -19.458 -22.022 -24.089 -25.861 -27.356 -28.646 -29.768 -30.826 -31.684 -32.435 -33.119 -33.779 -34.389 -34.937 -35.505 -36.001 -36.422 -36.853 -37.295 -37.675 -38.078 -38.481 -38.785 -39.092 -39.419 -39.753 -40.089 -40.322 -40.57 -40.99 -41.28 -41.556 -41.694 -41.983 -42.306 -42.671 -42.856 -43.459 -43.425 -43.643 -43.869 -44.338 -44.607 -44.9 -45.241 -45.691 -46.203 -46.789 -50.439 -3 ,5326 ,TETRA ,17603271,Sun Nov 28 16:33:44 CET,Sun Nov 28 16:35:53 CET,0.0 0.919 1.222 1.421 1.567 1.678 1.765 1.857 2.024 2.082 2.138 1.864 2.295 2.348 2.436 2.506 2.561 2.583 2.625 2.662 2.718 2.748 2.767 2.788 2.8 2.807 2.803 2.803 2.802 2.787 2.762 2.713 2.655 2.599 2.528 2.415 2.298 2.166 2.016 1.827 1.573 1.271 0.876 0.408 -0.204 -0.965 -1.975 -3.258 -5.02 -7.618 -11.662 -15.996 -19.229 -21.798 -23.924 -25.79 -27.359 -28.708 -29.828 -30.901 -31.781 -32.544 -33.277 -33.943 -34.535 -35.074 -35.643 -36.14 -36.578 -37.049 -37.534 -37.919 -38.294 -38.697 -39.003 -39.299 -39.61 -39.927 -40.254 -40.498 -40.758 -41.197 -41.509 -41.831 -41.997 -42.351 -42.746 -43.146 -43.345 -43.961 -43.962 -44.193 -44.448 -44.991 -45.276 -45.647 -46.066 -46.511 -47.039 -47.719 -50.37 -4 ,7505 ,TETRA ,17603272,Sun Nov 28 16:33:46 CET,Sun Nov 28 16:35:57 CET,0.0 1.036 1.309 1.498 1.633 1.758 1.871 1.951 2.08 2.141 2.198 1.909 2.319 2.357 2.426 2.468 2.511 2.535 2.567 2.59 2.622 2.642 2.661 2.671 2.669 2.674 2.678 2.665 2.637 2.612 2.585 2.538 2.471 2.394 2.309 2.198 2.065 1.91 1.726 1.5 1.234 0.91 0.491 0.019 -0.604 -1.401 -2.421 -3.741 -5.632 -8.372 -12.467 -16.793 -20.063 -22.66 -24.797 -26.595 -28.084 -29.383 -30.449 -31.485 -32.357 -33.132 -33.863 -34.522 -35.131 -35.71 -36.307 -36.803 -37.229 -37.673 -38.114 -38.479 -38.863 -39.248 -39.545 -39.861 -40.186 -40.5 -40.839 -41.066 -41.281 -41.682 -41.973 -42.301 -42.492 -42.878 -43.309 -43.794 -44.024 -44.641 -44.662 -44.916 -45.144 -45.642 -45.957 -46.335 -46.828 -47.421 -48.13 -49.1 -53.253 -5 ,19102 ,TETRA ,17603486,Sun Nov 28 16:37:15 CET,Sun Nov 28 18:45:59 CET,0.0 1.615 1.915 2.101 2.247 2.353 2.446 2.528 2.652 2.703 2.753 2.459 2.874 2.911 2.97 3.023 3.076 3.1 3.143 3.176 3.216 3.239 3.254 3.267 3.273 3.273 3.27 3.266 3.241 3.198 3.147 3.083 3.028 2.963 2.873 2.763 2.641 2.479 2.282 2.058 1.795 1.461 1.026 0.55 -0.057 -0.828 -1.863 -3.225 -5.077 -7.685 -11.7 -16.095 -19.431 -22.023 -24.116 -25.96 -27.503 -28.793 -29.89 -30.97 -31.843 -32.587 -33.314 -34.006 -34.619 -35.171 -35.748 -36.236 -36.65 -37.078 -37.518 -37.879 -38.236 -38.598 -38.879 -39.169 -39.477 -39.797 -40.13 -40.367 -40.635 -41.068 -41.377 -41.721 -41.893 -42.235 -42.608 -42.97 -43.147 -43.775 -43.776 -43.995 -44.227 -44.722 -44.954 -45.183 -45.469 -45.822 -46.345 -47.134 -52.325 -6 ,7648 ,TETRA ,17603487,Sun Nov 28 16:37:13 CET,Sun Nov 28 18:47:45 CET,0.0 1.107 1.372 1.567 1.725 1.842 1.926 2.012 2.159 2.216 2.274 1.995 2.419 2.47 2.543 2.604 2.664 2.688 2.731 2.77 2.805 2.822 2.836 2.844 2.853 2.851 2.841 2.842 2.833 2.807 2.783 2.753 2.716 2.672 2.597 2.481 2.361 2.224 2.064 1.865 1.617 1.311 0.907 0.443 -0.15 -0.922 -1.971 -3.326 -5.188 -7.802 -11.778 -16.105 -19.355 -21.924 -24.021 -25.806 -27.315 -28.643 -29.758 -30.838 -31.742 -32.525 -33.238 -33.892 -34.476 -34.988 -35.52 -35.999 -36.408 -36.83 -37.263 -37.613 -37.966 -38.349 -38.685 -39.04 -39.374 -39.699 -40.063 -40.33 -40.606 -41.017 -41.304 -41.639 -41.793 -42.061 -42.369 -42.715 -42.898 -43.52 -43.518 -43.721 -43.932 -44.392 -44.623 -44.875 -45.201 -45.713 -46.373 -47.137 -50.474 -7 ,5663 ,TETRA ,17603488,Sun Nov 28 16:37:15 CET,Sun Nov 28 18:48:33 CET,0.0 0.958 1.183 1.363 1.526 1.643 1.73 1.802 1.93 1.991 2.04 1.733 2.132 2.158 2.213 2.257 2.293 2.313 2.347 2.374 2.408 2.421 2.43 2.442 2.451 2.443 2.423 2.407 2.381 2.345 2.296 2.227 2.166 2.106 2.01 1.883 1.749 1.591 1.407 1.18 0.914 0.582 0.149 -0.334 -0.958 -1.727 -2.743 -4.058 -5.846 -8.419 -12.404 -16.69 -19.952 -22.546 -24.626 -26.398 -27.905 -29.235 -30.349 -31.415 -32.287 -33.037 -33.737 -34.393 -34.989 -35.53 -36.082 -36.556 -36.954 -37.352 -37.764 -38.108 -38.478 -38.879 -39.192 -39.523 -39.845 -40.152 -40.497 -40.741 -40.983 -41.395 -41.672 -41.941 -42.085 -42.43 -42.794 -43.122 -43.322 -43.985 -44.071 -44.326 -44.597 -45.255 -45.622 -46.014 -46.411 -46.848 -47.487 -48.314 -51.83 -8 ,27976 ,TETRA ,17603489,Sun Nov 28 16:37:14 CET,Sun Nov 28 18:51:05 CET,0.0 1.133 1.455 1.65 1.797 1.906 1.992 2.07 2.215 2.282 2.337 2.058 2.476 2.514 2.58 2.646 2.719 2.747 2.791 2.821 2.851 2.874 2.887 2.902 2.917 2.917 2.915 2.911 2.897 2.877 2.845 2.792 2.73 2.663 2.577 2.466 2.349 2.192 2.008 1.813 1.58 1.269 0.869 0.413 -0.19 -0.946 -1.964 -3.327 -5.183 -7.781 -11.74 -16.028 -19.305 -21.919 -24.012 -25.785 -27.281 -28.581 -29.664 -30.788 -31.741 -32.526 -33.291 -34.015 -34.641 -35.2 -35.771 -36.266 -36.707 -37.151 -37.594 -37.961 -38.351 -38.745 -39.059 -39.4 -39.728 -40.068 -40.437 -40.677 -40.929 -41.395 -41.716 -42.004 -42.145 -42.437 -42.748 -43.099 -43.285 -43.904 -43.916 -44.158 -44.454 -45.143 -45.518 -45.904 -46.316 -46.779 -47.364 -48.162 -51.531 -9 ,2052 ,TETRA ,17603277,Sun Nov 28 16:33:10 CET,Sun Nov 28 16:35:42 CET,0.0 0.963 1.197 1.36 1.497 1.61 1.709 1.805 1.945 2.004 2.058 1.761 2.182 2.221 2.284 2.336 2.376 2.396 2.431 2.452 2.462 2.465 2.471 2.483 2.492 2.494 2.498 2.484 2.458 2.441 2.416 2.372 2.313 2.241 2.14 2.016 1.886 1.726 1.526 1.284 1.006 0.676 0.261 -0.203 -0.815 -1.603 -2.636 -3.982 -5.811 -8.441 -12.49 -16.859 -20.079 -22.589 -24.64 -26.418 -27.937 -29.242 -30.298 -31.326 -32.188 -32.934 -33.648 -34.295 -34.868 -35.41 -35.982 -36.482 -36.914 -37.359 -37.801 -38.177 -38.568 -38.949 -39.24 -39.54 -39.864 -40.22 -40.577 -40.804 -41.024 -41.379 -41.645 -41.922 -42.057 -42.328 -42.639 -42.995 -43.212 -43.91 -44.073 -44.366 -44.65 -45.218 -45.539 -45.869 -46.183 -46.572 -47.151 -47.892 -49.679 -10 ,21837 ,TETRA ,17603278,Sun Nov 28 16:33:22 CET,Sun Nov 28 16:35:29 CET,0.0 1.523 1.807 2.014 2.149 2.273 2.373 2.445 2.565 2.612 2.66 2.362 2.772 2.807 2.881 2.942 2.98 3.003 3.042 3.064 3.099 3.115 3.123 3.136 3.148 3.146 3.133 3.116 3.088 3.052 3.008 2.945 2.87 2.787 2.682 2.555 2.428 2.278 2.09 1.857 1.584 1.256 0.825 0.355 -0.257 -1.053 -2.107 -3.453 -5.267 -7.857 -11.755 -16.01 -19.264 -21.811 -23.844 -25.58 -27.035 -28.309 -29.395 -30.457 -31.338 -32.095 -32.8 -33.44 -34.024 -34.561 -35.105 -35.574 -35.975 -36.391 -36.819 -37.172 -37.539 -37.904 -38.205 -38.566 -38.944 -39.307 -39.685 -39.949 -40.212 -40.594 -40.896 -41.239 -41.414 -41.783 -42.122 -42.425 -42.572 -43.145 -43.073 -43.26 -43.464 -43.882 -44.129 -44.417 -44.732 -45.213 -45.879 -46.882 -51.766 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 7b9b71e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15194 ,KEBNE ,17027521,Wed Dec 22 17:34:50 CET,Wed Dec 22 19:25:57 CET,0.0 1.445 1.843 2.131 2.392 2.581 2.726 2.864 3.1 3.209 3.308 3.09 3.535 3.612 3.76 3.896 4.023 4.087 4.215 4.322 4.471 4.57 4.655 4.767 4.87 4.966 5.066 5.165 5.279 5.376 5.47 5.587 5.705 5.821 5.941 6.055 6.146 6.234 6.327 6.405 6.47 6.524 6.587 6.621 6.61 6.586 6.517 6.358 6.009 5.358 4.177 2.716 1.451 0.346 -0.58 -1.375 -2.063 -2.695 -3.231 -3.758 -4.21 -4.622 -5.019 -5.386 -5.733 -6.053 -6.384 -6.675 -6.923 -7.178 -7.441 -7.663 -7.889 -8.113 -8.294 -8.487 -8.681 -8.877 -9.09 -9.252 -9.422 -9.669 -9.831 -10.009 -10.105 -10.294 -10.478 -10.684 -10.796 -11.311 -11.199 -11.338 -11.471 -11.748 -11.928 -12.125 -12.317 -12.545 -12.873 -13.383 -14.886 -2 ,21865 ,KEBNE ,17027522,Wed Dec 22 17:34:51 CET,Wed Dec 22 19:21:45 CET,0.0 1.238 1.609 1.856 2.07 2.242 2.403 2.56 2.797 2.895 2.993 2.818 3.285 3.373 3.528 3.66 3.78 3.84 3.966 4.101 4.278 4.378 4.473 4.613 4.74 4.866 4.976 5.059 5.177 5.29 5.389 5.502 5.594 5.677 5.768 5.868 5.965 6.065 6.174 6.266 6.328 6.393 6.455 6.494 6.514 6.484 6.398 6.238 5.887 5.258 4.153 2.757 1.517 0.373 -0.59 -1.43 -2.144 -2.766 -3.318 -3.861 -4.327 -4.757 -5.161 -5.535 -5.876 -6.185 -6.503 -6.795 -7.058 -7.334 -7.615 -7.838 -8.065 -8.312 -8.514 -8.715 -8.914 -9.108 -9.309 -9.446 -9.594 -9.829 -9.982 -10.154 -10.255 -10.468 -10.695 -10.927 -11.037 -11.535 -11.382 -11.511 -11.653 -11.956 -12.113 -12.294 -12.507 -12.786 -13.122 -13.558 -15.057 -3 ,26239 ,KEBNE ,17027523,Wed Dec 22 17:34:50 CET,Wed Dec 22 19:26:35 CET,0.0 1.893 2.25 2.507 2.72 2.905 3.088 3.242 3.463 3.565 3.666 3.491 3.971 4.058 4.211 4.359 4.511 4.583 4.716 4.829 4.971 5.06 5.14 5.264 5.382 5.482 5.582 5.676 5.792 5.913 6.025 6.145 6.261 6.38 6.522 6.665 6.777 6.9 7.026 7.129 7.212 7.299 7.39 7.447 7.467 7.447 7.365 7.229 6.972 6.386 5.228 3.755 2.473 1.372 0.456 -0.351 -1.059 -1.705 -2.255 -2.777 -3.233 -3.646 -4.036 -4.404 -4.763 -5.099 -5.444 -5.755 -6.024 -6.306 -6.59 -6.818 -7.061 -7.311 -7.506 -7.715 -7.929 -8.148 -8.384 -8.542 -8.7 -8.947 -9.126 -9.313 -9.41 -9.608 -9.818 -10.05 -10.169 -10.678 -10.534 -10.665 -10.8 -11.08 -11.25 -11.453 -11.68 -11.927 -12.224 -12.625 -14.401 -4 ,14828 ,KEBNE ,17027524,Wed Dec 22 17:34:51 CET,Wed Dec 22 19:26:10 CET,0.0 1.592 1.959 2.215 2.401 2.558 2.728 2.879 3.114 3.224 3.322 3.126 3.587 3.673 3.835 3.976 4.088 4.142 4.246 4.342 4.483 4.582 4.668 4.775 4.881 4.983 5.078 5.171 5.286 5.387 5.488 5.608 5.713 5.822 5.952 6.076 6.183 6.291 6.401 6.505 6.604 6.702 6.782 6.855 6.883 6.849 6.746 6.547 6.221 5.618 4.481 3.062 1.829 0.749 -0.171 -0.987 -1.689 -2.32 -2.864 -3.377 -3.815 -4.221 -4.613 -4.99 -5.352 -5.671 -6.001 -6.311 -6.565 -6.816 -7.076 -7.302 -7.541 -7.799 -7.992 -8.184 -8.397 -8.629 -8.879 -9.044 -9.208 -9.458 -9.639 -9.828 -9.917 -10.108 -10.311 -10.524 -10.635 -11.132 -10.961 -11.088 -11.225 -11.507 -11.678 -11.878 -12.109 -12.383 -12.696 -13.174 -14.897 -5 ,3986 ,KEBNE ,17027525,Wed Dec 22 17:34:51 CET,Wed Dec 22 19:26:20 CET,0.0 1.268 1.609 1.886 2.11 2.284 2.45 2.595 2.851 2.972 3.078 2.901 3.37 3.45 3.596 3.739 3.872 3.938 4.056 4.153 4.275 4.355 4.443 4.562 4.673 4.784 4.885 4.986 5.11 5.214 5.31 5.431 5.544 5.644 5.751 5.866 5.964 6.07 6.174 6.274 6.378 6.485 6.589 6.662 6.717 6.726 6.648 6.498 6.245 5.717 4.643 3.258 2.068 1.026 0.086 -0.75 -1.452 -2.08 -2.64 -3.188 -3.653 -4.072 -4.486 -4.886 -5.243 -5.555 -5.887 -6.185 -6.443 -6.716 -6.972 -7.192 -7.421 -7.653 -7.842 -8.031 -8.228 -8.45 -8.681 -8.84 -9.001 -9.235 -9.4 -9.569 -9.668 -9.891 -10.11 -10.347 -10.462 -10.953 -10.791 -10.924 -11.073 -11.41 -11.58 -11.747 -11.975 -12.268 -12.623 -13.125 -14.717 -6 ,18991 ,KEBNE ,17027526,Wed Dec 22 17:34:51 CET,Wed Dec 22 19:25:21 CET,0.0 1.778 2.114 2.357 2.556 2.717 2.848 2.978 3.218 3.32 3.411 3.231 3.689 3.761 3.918 4.068 4.192 4.254 4.382 4.49 4.642 4.736 4.816 4.933 5.036 5.126 5.217 5.316 5.44 5.543 5.622 5.713 5.81 5.901 6.006 6.112 6.197 6.285 6.413 6.534 6.619 6.706 6.775 6.824 6.865 6.857 6.774 6.597 6.269 5.723 4.594 3.097 1.873 0.808 -0.112 -0.915 -1.58 -2.154 -2.67 -3.179 -3.613 -4.006 -4.371 -4.72 -5.046 -5.343 -5.666 -5.967 -6.219 -6.476 -6.742 -6.953 -7.164 -7.376 -7.542 -7.713 -7.888 -8.075 -8.273 -8.411 -8.554 -8.789 -8.954 -9.129 -9.219 -9.395 -9.587 -9.802 -9.909 -10.406 -10.261 -10.392 -10.53 -10.86 -11.044 -11.228 -11.426 -11.651 -11.931 -12.371 -13.942 -7 ,16866 ,KEBNE ,17027527,Wed Dec 22 17:34:51 CET,Wed Dec 22 19:26:43 CET,0.0 1.891 2.268 2.537 2.747 2.895 3.033 3.156 3.369 3.472 3.576 3.384 3.84 3.913 4.053 4.188 4.314 4.371 4.481 4.594 4.753 4.847 4.931 5.044 5.143 5.244 5.349 5.444 5.558 5.663 5.764 5.89 6.008 6.107 6.216 6.333 6.437 6.55 6.664 6.776 6.87 6.953 7.027 7.078 7.109 7.11 7.02 6.839 6.528 5.956 4.875 3.475 2.306 1.262 0.359 -0.418 -1.11 -1.748 -2.277 -2.793 -3.266 -3.696 -4.093 -4.465 -4.793 -5.093 -5.424 -5.714 -5.972 -6.233 -6.484 -6.7 -6.946 -7.206 -7.401 -7.611 -7.828 -8.049 -8.301 -8.481 -8.65 -8.889 -9.062 -9.243 -9.341 -9.562 -9.785 -10.029 -10.167 -10.69 -10.589 -10.733 -10.868 -11.201 -11.384 -11.567 -11.787 -12.046 -12.374 -12.819 -14.648 -8 ,20481 ,KEBNE ,17027528,Wed Dec 22 17:34:51 CET,Wed Dec 22 19:25:57 CET,0.0 1.597 1.938 2.16 2.364 2.553 2.701 2.84 3.112 3.233 3.335 3.138 3.598 3.675 3.818 3.941 4.054 4.108 4.227 4.341 4.505 4.602 4.684 4.796 4.901 5.005 5.102 5.191 5.303 5.405 5.498 5.597 5.683 5.776 5.886 5.997 6.09 6.191 6.309 6.432 6.545 6.657 6.746 6.807 6.88 6.922 6.875 6.715 6.409 5.81 4.629 3.078 1.751 0.638 -0.281 -1.075 -1.742 -2.329 -2.842 -3.367 -3.823 -4.23 -4.618 -4.998 -5.354 -5.675 -6.008 -6.296 -6.544 -6.804 -7.075 -7.284 -7.492 -7.721 -7.897 -8.078 -8.279 -8.498 -8.709 -8.843 -9.002 -9.282 -9.467 -9.669 -9.777 -9.991 -10.225 -10.47 -10.595 -11.116 -11.016 -11.17 -11.326 -11.643 -11.844 -12.071 -12.312 -12.612 -12.962 -13.39 -14.865 -9 ,4001 ,KEBNE ,17027529,Wed Dec 22 17:34:51 CET,Wed Dec 22 19:25:52 CET,0.0 1.326 1.714 2.001 2.217 2.397 2.55 2.681 2.894 2.994 3.094 2.907 3.362 3.444 3.593 3.738 3.868 3.929 4.041 4.143 4.291 4.376 4.459 4.58 4.692 4.807 4.908 5.005 5.139 5.249 5.345 5.455 5.549 5.637 5.735 5.83 5.922 6.029 6.154 6.278 6.388 6.495 6.595 6.667 6.707 6.726 6.694 6.55 6.246 5.686 4.531 2.967 1.628 0.493 -0.484 -1.347 -2.083 -2.738 -3.317 -3.905 -4.412 -4.849 -5.265 -5.672 -6.049 -6.397 -6.747 -7.051 -7.321 -7.594 -7.883 -8.136 -8.388 -8.662 -8.89 -9.117 -9.345 -9.58 -9.815 -9.969 -10.121 -10.36 -10.531 -10.713 -10.811 -11.016 -11.218 -11.432 -11.546 -12.057 -11.94 -12.08 -12.224 -12.515 -12.692 -12.921 -13.184 -13.448 -13.719 -14.116 -15.638 -10 ,117 ,KEBNE ,17027530,Wed Dec 22 17:34:50 CET,Wed Dec 22 19:25:39 CET,0.0 1.694 2.033 2.252 2.446 2.633 2.793 2.925 3.129 3.224 3.326 3.154 3.622 3.716 3.887 4.036 4.163 4.216 4.309 4.396 4.531 4.625 4.72 4.838 4.943 5.05 5.154 5.254 5.37 5.468 5.561 5.669 5.777 5.877 5.986 6.111 6.221 6.325 6.425 6.511 6.591 6.694 6.813 6.91 6.978 6.968 6.922 6.816 6.524 5.931 4.807 3.362 2.127 1.058 0.139 -0.677 -1.371 -1.974 -2.526 -3.088 -3.555 -3.985 -4.4 -4.797 -5.165 -5.489 -5.828 -6.121 -6.365 -6.626 -6.896 -7.121 -7.352 -7.585 -7.758 -7.936 -8.13 -8.335 -8.563 -8.727 -8.881 -9.109 -9.283 -9.467 -9.56 -9.765 -9.979 -10.198 -10.312 -10.825 -10.689 -10.829 -10.978 -11.302 -11.494 -11.69 -11.895 -12.155 -12.483 -12.984 -14.727 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 61746494..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10664 ,TETRA ,17603492,Sun Nov 28 16:37:15 CET,Sun Nov 28 18:50:35 CET,0.0 1.928 2.342 2.616 2.827 3.027 3.203 3.376 3.665 3.798 3.943 3.848 4.355 4.472 4.685 4.867 5.027 5.104 5.239 5.362 5.552 5.674 5.781 5.927 6.069 6.202 6.334 6.469 6.641 6.809 6.958 7.134 7.307 7.484 7.68 7.861 8.035 8.24 8.455 8.671 8.894 9.139 9.405 9.623 9.874 10.164 10.427 10.64 10.848 10.963 10.87 10.489 9.927 9.35 8.796 8.255 7.788 7.374 6.994 6.582 6.193 5.84 5.509 5.221 4.962 4.668 4.32 3.986 3.671 3.36 3.04 2.802 2.568 2.301 2.102 1.901 1.716 1.528 1.317 1.166 1.005 0.711 0.496 0.302 0.208 0.008 -0.205 -0.43 -0.561 -1.095 -1.043 -1.194 -1.352 -1.75 -1.994 -2.274 -2.594 -2.965 -3.366 -3.878 -5.671 -2 ,8258 ,TETRA ,17603493,Sun Nov 28 16:37:16 CET,Sun Nov 28 18:50:17 CET,0.0 1.991 2.491 2.864 3.114 3.335 3.521 3.694 4.036 4.164 4.271 4.095 4.58 4.677 4.84 4.999 5.177 5.263 5.397 5.518 5.697 5.817 5.924 6.071 6.227 6.371 6.499 6.629 6.797 6.961 7.116 7.294 7.463 7.608 7.764 7.947 8.129 8.318 8.511 8.71 8.894 9.129 9.405 9.648 9.938 10.21 10.467 10.711 10.908 11.021 10.887 10.396 9.853 9.309 8.769 8.259 7.824 7.39 6.966 6.574 6.249 5.928 5.608 5.302 5.006 4.739 4.474 4.233 4.017 3.737 3.417 3.173 2.919 2.626 2.389 2.17 1.941 1.685 1.426 1.256 1.076 0.796 0.62 0.427 0.318 0.091 -0.181 -0.462 -0.608 -1.146 -1.097 -1.267 -1.47 -1.936 -2.177 -2.439 -2.732 -3.09 -3.574 -4.263 -6.804 -3 ,26112 ,TETRA ,17603281,Sun Nov 28 16:33:23 CET,Sun Nov 28 16:35:31 CET,0.0 1.413 1.826 2.12 2.371 2.582 2.757 2.919 3.243 3.398 3.527 3.372 3.873 4.006 4.21 4.362 4.507 4.576 4.71 4.834 5.018 5.142 5.258 5.425 5.585 5.74 5.887 6.03 6.204 6.356 6.504 6.687 6.864 7.04 7.23 7.424 7.614 7.823 8.047 8.282 8.523 8.773 9.039 9.299 9.574 9.846 10.123 10.424 10.711 10.849 10.7 10.205 9.622 9.066 8.58 8.105 7.65 7.235 6.864 6.466 6.093 5.754 5.415 5.076 4.773 4.471 4.134 3.856 3.624 3.364 3.081 2.838 2.577 2.289 2.074 1.874 1.687 1.497 1.291 1.144 0.988 0.718 0.513 0.304 0.184 -0.069 -0.326 -0.606 -0.747 -1.271 -1.208 -1.383 -1.564 -1.963 -2.2 -2.453 -2.749 -3.119 -3.561 -4.107 -6.683 -4 ,24379 ,TETRA ,17603495,Sun Nov 28 16:37:15 CET,Sun Nov 28 18:50:31 CET,0.0 1.93 2.336 2.592 2.84 3.075 3.267 3.439 3.765 3.912 4.051 3.945 4.441 4.54 4.701 4.847 4.988 5.058 5.203 5.347 5.545 5.662 5.772 5.932 6.086 6.231 6.37 6.502 6.68 6.853 7.012 7.192 7.371 7.543 7.723 7.922 8.108 8.306 8.526 8.76 8.979 9.219 9.479 9.725 10.007 10.282 10.553 10.829 11.114 11.315 11.258 10.762 10.124 9.525 8.996 8.49 8.022 7.571 7.161 6.741 6.365 6.033 5.712 5.418 5.143 4.875 4.597 4.346 4.114 3.849 3.557 3.324 3.09 2.838 2.639 2.44 2.241 2.027 1.802 1.658 1.514 1.273 1.072 0.83 0.699 0.44 0.202 -0.053 -0.192 -0.71 -0.635 -0.812 -1.008 -1.447 -1.674 -1.935 -2.268 -2.634 -3.07 -3.769 -6.518 -5 ,27758 ,TETRA ,17603283,Sun Nov 28 16:33:46 CET,Sun Nov 28 16:35:59 CET,0.0 2.053 2.595 2.979 3.255 3.457 3.661 3.845 4.128 4.274 4.413 4.26 4.743 4.839 5.011 5.172 5.345 5.428 5.569 5.71 5.959 6.14 6.304 6.53 6.753 6.935 7.072 7.197 7.364 7.531 7.679 7.846 8.011 8.169 8.335 8.509 8.682 8.867 9.059 9.263 9.5 9.748 9.988 10.245 10.528 10.797 11.089 11.395 11.65 11.787 11.674 11.193 10.639 10.069 9.526 9.0 8.508 8.031 7.61 7.205 6.851 6.532 6.239 5.951 5.661 5.405 5.14 4.877 4.628 4.367 4.087 3.848 3.612 3.397 3.214 2.968 2.711 2.462 2.223 2.065 1.898 1.629 1.43 1.224 1.112 0.845 0.581 0.336 0.206 -0.307 -0.244 -0.421 -0.593 -0.947 -1.147 -1.408 -1.727 -2.128 -2.629 -3.248 -5.461 -6 ,31538 ,TETRA ,17603497,Sun Nov 28 16:37:19 CET,Sun Nov 28 18:51:32 CET,0.0 1.658 2.083 2.403 2.658 2.846 3.048 3.244 3.583 3.737 3.86 3.694 4.162 4.265 4.471 4.63 4.775 4.852 4.996 5.126 5.313 5.431 5.547 5.709 5.855 6.0 6.157 6.315 6.499 6.646 6.788 6.966 7.129 7.275 7.439 7.623 7.789 7.977 8.179 8.374 8.598 8.864 9.144 9.401 9.657 9.887 10.139 10.364 10.534 10.665 10.606 10.143 9.527 8.909 8.371 7.874 7.382 6.936 6.54 6.115 5.747 5.403 5.069 4.783 4.516 4.251 3.982 3.75 3.545 3.324 3.085 2.873 2.656 2.434 2.252 2.048 1.833 1.626 1.429 1.292 1.125 0.864 0.68 0.462 0.352 0.145 -0.078 -0.361 -0.505 -1.03 -0.988 -1.147 -1.325 -1.767 -2.017 -2.289 -2.581 -2.916 -3.34 -3.938 -6.594 -7 ,14871 ,TETRA ,17603285,Sun Nov 28 16:33:44 CET,Sun Nov 28 16:35:48 CET,0.0 1.404 1.834 2.132 2.377 2.6 2.814 2.987 3.257 3.378 3.49 3.32 3.791 3.883 4.053 4.214 4.375 4.45 4.6 4.745 4.938 5.059 5.175 5.335 5.491 5.639 5.782 5.926 6.092 6.242 6.39 6.588 6.784 6.962 7.15 7.355 7.556 7.764 7.965 8.172 8.388 8.626 8.887 9.141 9.429 9.714 9.999 10.253 10.499 10.677 10.604 10.217 9.651 9.051 8.516 7.994 7.492 6.981 6.492 6.036 5.682 5.362 5.04 4.729 4.434 4.156 3.847 3.56 3.301 3.028 2.754 2.518 2.276 2.039 1.848 1.657 1.465 1.25 1.016 0.853 0.684 0.423 0.241 0.059 -0.031 -0.23 -0.474 -0.741 -0.9 -1.443 -1.414 -1.597 -1.788 -2.244 -2.491 -2.736 -2.998 -3.305 -3.698 -4.281 -6.401 -8 ,19604 ,TETRA ,17603286,Sun Nov 28 16:33:45 CET,Sun Nov 28 16:35:58 CET,0.0 1.208 1.597 1.916 2.206 2.423 2.623 2.8 3.073 3.205 3.326 3.151 3.634 3.749 3.938 4.099 4.261 4.342 4.5 4.635 4.842 5.007 5.17 5.382 5.572 5.739 5.885 6.024 6.205 6.384 6.55 6.74 6.908 7.061 7.245 7.436 7.607 7.798 7.995 8.202 8.41 8.632 8.903 9.171 9.447 9.718 9.995 10.264 10.479 10.643 10.63 10.215 9.745 9.264 8.753 8.26 7.791 7.373 7.018 6.627 6.278 5.965 5.663 5.376 5.094 4.838 4.574 4.326 4.103 3.863 3.621 3.409 3.18 2.939 2.752 2.559 2.358 2.147 1.895 1.69 1.491 1.226 1.034 0.806 0.689 0.474 0.231 -0.029 -0.154 -0.661 -0.587 -0.757 -0.93 -1.305 -1.547 -1.832 -2.112 -2.439 -2.867 -3.422 -5.395 -10 ,291 ,TETRA ,17603288,Sun Nov 28 16:33:47 CET,Sun Nov 28 16:35:56 CET,0.0 1.962 2.385 2.726 3.02 3.255 3.457 3.649 3.963 4.092 4.225 4.101 4.583 4.69 4.888 5.052 5.207 5.288 5.438 5.573 5.814 5.973 6.1 6.274 6.44 6.592 6.734 6.874 7.06 7.22 7.362 7.539 7.712 7.875 8.045 8.248 8.441 8.625 8.821 9.021 9.237 9.479 9.733 9.992 10.287 10.559 10.827 11.105 11.344 11.444 11.309 10.926 10.404 9.848 9.289 8.709 8.2 7.721 7.278 6.835 6.462 6.123 5.783 5.473 5.203 4.956 4.674 4.419 4.206 3.972 3.73 3.522 3.276 2.995 2.78 2.575 2.376 2.16 1.941 1.793 1.637 1.364 1.155 0.957 0.862 0.664 0.435 0.148 -0.004 -0.531 -0.488 -0.665 -0.853 -1.278 -1.519 -1.799 -2.111 -2.437 -2.82 -3.404 -6.004 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index b370aeb6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12419 ,KEBNE ,17027531,Wed Dec 22 17:34:51 CET,Wed Dec 22 19:26:55 CET,0.0 1.069 1.421 1.668 1.884 2.078 2.257 2.429 2.741 2.871 2.993 2.808 3.33 3.444 3.666 3.88 4.06 4.141 4.302 4.458 4.691 4.839 4.978 5.179 5.379 5.567 5.735 5.898 6.111 6.315 6.516 6.759 7.005 7.259 7.535 7.829 8.114 8.435 8.797 9.168 9.547 9.986 10.531 11.045 11.595 12.204 12.933 13.792 14.766 15.821 16.792 17.43 17.799 17.882 17.746 17.525 17.315 17.108 16.924 16.716 16.495 16.297 16.106 15.884 15.67 15.482 15.297 15.138 14.987 14.81 14.627 14.468 14.288 14.114 13.967 13.807 13.64 13.453 13.264 13.137 12.995 12.767 12.627 12.465 12.364 12.165 11.972 11.769 11.656 11.137 11.2 11.015 10.826 10.422 10.187 9.917 9.591 9.232 8.831 8.288 6.299 -2 ,9321 ,KEBNE ,17027532,Wed Dec 22 17:34:51 CET,Wed Dec 22 19:27:00 CET,0.0 1.285 1.661 1.936 2.148 2.34 2.516 2.684 3.005 3.141 3.267 3.089 3.587 3.685 3.866 4.055 4.241 4.324 4.48 4.623 4.835 4.969 5.097 5.277 5.45 5.627 5.805 5.99 6.229 6.455 6.662 6.907 7.153 7.39 7.665 7.977 8.264 8.553 8.858 9.199 9.549 9.93 10.384 10.855 11.447 12.057 12.678 13.417 14.261 15.162 16.034 16.521 16.651 16.518 16.315 16.093 15.847 15.606 15.382 15.117 14.86 14.635 14.437 14.239 14.025 13.828 13.617 13.413 13.241 13.045 12.819 12.643 12.467 12.292 12.157 12.006 11.841 11.672 11.514 11.405 11.281 11.076 10.928 10.769 10.678 10.495 10.318 10.125 10.005 9.491 9.626 9.496 9.351 9.066 8.913 8.73 8.523 8.284 8.009 7.63 5.814 -4 ,31 ,KEBNE ,17027534,Wed Dec 22 17:34:51 CET,Wed Dec 22 19:26:56 CET,0.0 1.042 1.38 1.637 1.83 2.011 2.18 2.327 2.595 2.713 2.822 2.629 3.135 3.226 3.4 3.571 3.746 3.836 4.008 4.165 4.384 4.53 4.67 4.871 5.066 5.25 5.43 5.606 5.833 6.062 6.288 6.552 6.788 7.025 7.293 7.586 7.896 8.227 8.561 8.925 9.313 9.745 10.271 10.797 11.38 12.067 12.81 13.572 14.472 15.434 16.434 16.985 17.118 17.04 16.797 16.539 16.337 16.088 15.805 15.504 15.243 15.023 14.816 14.589 14.338 14.108 13.843 13.598 13.379 13.14 12.907 12.714 12.506 12.296 12.127 11.939 11.761 11.574 11.364 11.223 11.081 10.88 10.741 10.574 10.488 10.328 10.153 9.946 9.845 9.347 9.497 9.369 9.225 8.888 8.698 8.491 8.263 7.984 7.591 7.042 5.076 -5 ,15764 ,KEBNE ,17027535,Wed Dec 22 17:34:50 CET,Wed Dec 22 19:27:15 CET,0.0 1.278 1.628 1.891 2.11 2.3 2.468 2.619 2.907 3.036 3.155 2.974 3.474 3.57 3.766 3.956 4.134 4.216 4.368 4.517 4.733 4.873 5.015 5.217 5.408 5.592 5.776 5.956 6.186 6.415 6.637 6.906 7.176 7.439 7.735 8.054 8.34 8.667 9.043 9.45 9.874 10.34 10.842 11.321 11.894 12.505 13.168 13.904 14.752 15.667 16.606 17.126 17.179 17.072 16.941 16.734 16.514 16.281 16.025 15.77 15.548 15.311 15.057 14.817 14.617 14.435 14.231 14.046 13.884 13.711 13.515 13.341 13.167 12.991 12.845 12.696 12.532 12.353 12.176 12.047 11.897 11.655 11.487 11.307 11.22 11.053 10.863 10.665 10.559 10.052 10.159 10.006 9.848 9.489 9.293 9.062 8.778 8.458 8.1 7.636 5.78 -6 ,28385 ,KEBNE ,17027536,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:28:48 CET,0.0 1.265 1.653 1.937 2.154 2.365 2.559 2.716 2.982 3.114 3.242 3.072 3.587 3.696 3.916 4.105 4.271 4.356 4.524 4.684 4.918 5.069 5.214 5.421 5.633 5.836 6.029 6.214 6.448 6.668 6.877 7.151 7.424 7.684 7.984 8.31 8.616 8.938 9.288 9.663 10.028 10.421 10.907 11.402 11.938 12.513 13.185 13.937 14.732 15.586 16.506 17.121 17.28 17.244 17.187 17.067 16.825 16.531 16.262 15.995 15.744 15.51 15.297 15.072 14.864 14.68 14.466 14.257 14.078 13.904 13.732 13.578 13.409 13.243 13.098 12.937 12.768 12.585 12.398 12.273 12.147 11.939 11.787 11.627 11.533 11.33 11.117 10.878 10.751 10.231 10.375 10.255 10.125 9.772 9.555 9.317 9.05 8.763 8.418 7.857 4.78 -7 ,3781 ,KEBNE ,17027537,Wed Dec 22 17:36:55 CET,Wed Dec 22 19:29:02 CET,0.0 1.519 1.925 2.192 2.4 2.584 2.767 2.941 3.251 3.387 3.512 3.326 3.837 3.943 4.149 4.349 4.547 4.642 4.816 4.967 5.187 5.334 5.477 5.689 5.893 6.079 6.255 6.434 6.664 6.877 7.094 7.36 7.602 7.837 8.115 8.423 8.709 9.029 9.395 9.799 10.216 10.675 11.205 11.749 12.375 12.986 13.65 14.427 15.291 16.225 17.211 17.826 17.969 17.917 17.752 17.475 17.19 16.936 16.712 16.455 16.189 15.936 15.697 15.46 15.238 15.026 14.796 14.592 14.388 14.169 13.965 13.786 13.601 13.404 13.232 13.05 12.866 12.68 12.487 12.359 12.216 11.995 11.857 11.718 11.647 11.486 11.309 11.118 11.015 10.516 10.642 10.506 10.377 10.087 9.905 9.71 9.5 9.248 8.933 8.498 6.8 -8 ,20453 ,KEBNE ,17027538,Wed Dec 22 17:36:55 CET,Wed Dec 22 19:29:42 CET,0.0 1.36 1.695 1.946 2.17 2.385 2.571 2.722 3.018 3.166 3.309 3.149 3.669 3.776 3.964 4.146 4.316 4.398 4.558 4.709 4.935 5.077 5.21 5.405 5.609 5.816 6.027 6.234 6.478 6.699 6.924 7.203 7.453 7.686 7.945 8.241 8.539 8.875 9.233 9.628 10.063 10.537 11.045 11.555 12.183 12.884 13.688 14.498 15.321 16.211 17.24 17.851 17.947 17.835 17.65 17.457 17.273 17.073 16.864 16.611 16.378 16.178 15.976 15.774 15.582 15.4 15.202 15.017 14.858 14.703 14.53 14.36 14.163 13.973 13.83 13.663 13.492 13.317 13.116 12.96 12.802 12.552 12.373 12.189 12.087 11.882 11.693 11.482 11.351 10.823 10.938 10.782 10.631 10.348 10.191 10.019 9.817 9.551 9.234 8.851 7.237 -9 ,22754 ,KEBNE ,17027539,Wed Dec 22 17:36:55 CET,Wed Dec 22 19:29:12 CET,0.0 1.068 1.397 1.667 1.886 2.084 2.271 2.44 2.732 2.855 2.964 2.772 3.275 3.378 3.579 3.752 3.924 4.015 4.183 4.333 4.556 4.704 4.847 5.06 5.262 5.463 5.654 5.827 6.057 6.284 6.498 6.749 7.0 7.233 7.507 7.822 8.114 8.445 8.803 9.188 9.602 10.081 10.647 11.211 11.881 12.615 13.482 14.393 15.32 16.332 17.377 17.932 17.968 17.758 17.507 17.248 16.983 16.709 16.424 16.163 15.953 15.74 15.543 15.358 15.168 14.991 14.8 14.626 14.481 14.327 14.157 14.008 13.848 13.671 13.533 13.395 13.249 13.101 12.945 12.823 12.699 12.514 12.378 12.233 12.159 12.009 11.832 11.622 11.514 11.017 11.157 11.02 10.881 10.598 10.434 10.237 10.006 9.755 9.44 8.97 7.203 -10 ,2480 ,KEBNE ,17027540,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:29:20 CET,0.0 1.478 1.832 2.109 2.354 2.563 2.728 2.881 3.174 3.306 3.425 3.237 3.744 3.846 4.035 4.208 4.374 4.457 4.632 4.796 5.026 5.175 5.311 5.516 5.715 5.903 6.086 6.257 6.471 6.691 6.914 7.175 7.44 7.711 8.018 8.367 8.717 9.08 9.407 9.736 10.111 10.535 11.037 11.557 12.136 12.772 13.5 14.292 15.213 16.161 17.106 17.7 17.855 17.796 17.627 17.387 17.161 16.948 16.739 16.501 16.288 16.104 15.911 15.726 15.561 15.394 15.196 14.996 14.822 14.652 14.448 14.267 14.089 13.893 13.734 13.576 13.407 13.23 13.048 12.919 12.785 12.563 12.401 12.234 12.147 11.965 11.779 11.582 11.476 10.971 11.08 10.918 10.756 10.422 10.225 10.02 9.792 9.513 9.152 8.67 7.114 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt deleted file mode 100644 index ac367eab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,16447 ,TETRA ,17603291,Sun Nov 28 16:33:49 CET,Sun Nov 28 16:36:06 CET,0.0 1.341 1.748 2.044 2.284 2.487 2.651 2.805 3.071 3.185 3.296 3.096 3.608 3.708 3.883 4.056 4.217 4.292 4.431 4.559 4.743 4.869 4.997 5.178 5.346 5.505 5.654 5.795 5.976 6.153 6.332 6.541 6.732 6.923 7.148 7.411 7.656 7.915 8.195 8.483 8.792 9.158 9.557 9.938 10.384 10.804 11.209 11.639 12.054 12.425 12.619 12.398 12.022 11.588 11.139 10.668 10.201 9.738 9.269 8.799 8.444 8.125 7.809 7.514 7.242 6.993 6.736 6.521 6.339 6.131 5.893 5.704 5.506 5.283 5.097 4.912 4.708 4.488 4.282 4.15 4.017 3.795 3.633 3.461 3.373 3.191 2.985 2.757 2.637 2.114 2.251 2.117 1.968 1.653 1.48 1.279 1.062 0.828 0.531 0.067 -1.772 -4 ,1596 ,TETRA ,17603505,Sun Nov 28 16:37:21 CET,Sun Nov 28 18:49:50 CET,0.0 2.062 2.409 2.638 2.857 3.058 3.24 3.401 3.656 3.769 3.891 3.715 4.215 4.302 4.483 4.668 4.842 4.927 5.087 5.239 5.439 5.559 5.677 5.86 6.039 6.191 6.346 6.51 6.711 6.9 7.087 7.309 7.515 7.722 7.964 8.238 8.496 8.765 9.04 9.334 9.642 9.957 10.314 10.682 11.104 11.582 12.137 12.731 13.386 14.1 14.63 14.676 14.492 14.188 13.795 13.366 12.962 12.569 12.207 11.81 11.454 11.139 10.833 10.541 10.261 10.001 9.726 9.459 9.23 9.021 8.796 8.588 8.372 8.142 7.943 7.748 7.552 7.344 7.116 6.943 6.769 6.509 6.339 6.167 6.074 5.866 5.645 5.43 5.318 4.799 4.929 4.789 4.652 4.341 4.155 3.941 3.69 3.414 3.079 2.593 0.831 -5 ,5207 ,TETRA ,17603293,Sun Nov 28 16:33:46 CET,Sun Nov 28 16:36:02 CET,0.0 1.272 1.612 1.842 2.035 2.216 2.396 2.565 2.855 2.977 3.092 2.911 3.425 3.53 3.709 3.866 4.029 4.111 4.26 4.4 4.606 4.745 4.881 5.066 5.238 5.397 5.546 5.687 5.866 6.048 6.241 6.489 6.727 6.95 7.209 7.5 7.767 8.062 8.359 8.642 8.952 9.302 9.708 10.118 10.54 10.956 11.464 12.045 12.615 13.132 13.439 13.361 13.102 12.695 12.259 11.817 11.376 10.914 10.473 10.033 9.64 9.27 8.923 8.633 8.362 8.068 7.742 7.459 7.2 6.924 6.637 6.402 6.171 5.91 5.719 5.547 5.351 5.153 4.957 4.796 4.62 4.349 4.156 3.961 3.866 3.682 3.476 3.227 3.079 2.536 2.641 2.491 2.33 1.945 1.738 1.52 1.263 0.969 0.641 0.168 -1.969 -6 ,19126 ,TETRA ,17603507,Sun Nov 28 16:37:20 CET,Sun Nov 28 18:49:47 CET,0.0 1.519 1.873 2.16 2.384 2.557 2.708 2.855 3.123 3.242 3.351 3.151 3.652 3.751 3.937 4.111 4.274 4.356 4.513 4.662 4.864 4.99 5.119 5.31 5.486 5.658 5.827 5.98 6.178 6.372 6.561 6.803 7.033 7.236 7.455 7.724 8.001 8.299 8.617 8.949 9.277 9.63 10.06 10.485 10.927 11.351 11.825 12.319 12.821 13.35 13.672 13.572 13.233 12.754 12.252 11.765 11.37 10.965 10.587 10.232 9.907 9.615 9.334 9.031 8.748 8.506 8.239 7.995 7.796 7.594 7.376 7.185 6.983 6.765 6.602 6.426 6.226 6.016 5.785 5.633 5.493 5.264 5.092 4.904 4.808 4.62 4.431 4.226 4.104 3.581 3.722 3.574 3.412 3.081 2.91 2.69 2.42 2.101 1.721 1.191 -0.975 -7 ,24213 ,TETRA ,17603295,Sun Nov 28 16:33:57 CET,Sun Nov 28 16:36:03 CET,0.0 1.329 1.723 2.008 2.208 2.397 2.581 2.74 3.039 3.166 3.27 3.082 3.601 3.701 3.886 4.062 4.215 4.286 4.433 4.575 4.779 4.908 5.036 5.222 5.395 5.568 5.735 5.89 6.084 6.288 6.496 6.736 6.96 7.181 7.427 7.692 7.954 8.252 8.557 8.871 9.21 9.571 9.952 10.34 10.811 11.328 11.852 12.375 12.937 13.429 13.754 13.589 13.133 12.627 12.122 11.635 11.191 10.784 10.42 10.039 9.677 9.327 8.996 8.686 8.399 8.138 7.864 7.606 7.377 7.143 6.903 6.692 6.472 6.27 6.114 5.939 5.738 5.532 5.347 5.198 5.032 4.786 4.61 4.428 4.337 4.162 3.976 3.769 3.656 3.134 3.253 3.113 2.969 2.63 2.443 2.237 2.018 1.765 1.386 0.869 -1.449 -8 ,20518 ,TETRA ,17603509,Sun Nov 28 16:37:43 CET,Sun Nov 28 18:50:55 CET,0.0 1.566 1.939 2.212 2.431 2.614 2.762 2.895 3.151 3.286 3.414 3.226 3.721 3.813 3.988 4.139 4.283 4.355 4.5 4.649 4.873 5.009 5.139 5.326 5.497 5.657 5.806 5.948 6.148 6.354 6.557 6.812 7.054 7.299 7.578 7.84 8.082 8.354 8.674 9.033 9.362 9.698 10.103 10.529 11.028 11.554 12.039 12.467 12.996 13.666 14.222 14.299 14.047 13.649 13.222 12.805 12.403 11.992 11.651 11.304 10.974 10.676 10.38 10.087 9.799 9.547 9.292 9.032 8.812 8.598 8.37 8.179 7.968 7.745 7.565 7.367 7.162 6.947 6.717 6.557 6.4 6.15 5.961 5.769 5.673 5.484 5.269 5.044 4.931 4.413 4.537 4.397 4.268 3.928 3.728 3.505 3.247 2.968 2.632 2.144 0.472 -9 ,31036 ,TETRA ,17603297,Sun Nov 28 16:33:50 CET,Sun Nov 28 16:35:49 CET,0.0 1.283 1.592 1.846 2.067 2.257 2.414 2.565 2.862 3.003 3.126 2.911 3.413 3.522 3.714 3.879 4.032 4.11 4.277 4.437 4.644 4.773 4.916 5.134 5.328 5.512 5.678 5.847 6.063 6.251 6.434 6.658 6.89 7.12 7.369 7.643 7.915 8.201 8.491 8.792 9.107 9.495 9.975 10.444 11.009 11.634 12.277 12.841 13.348 13.856 14.181 14.092 13.885 13.591 13.196 12.797 12.432 12.089 11.751 11.401 11.092 10.767 10.427 10.116 9.854 9.609 9.333 9.092 8.881 8.654 8.42 8.222 8.001 7.761 7.581 7.405 7.218 7.036 6.854 6.715 6.571 6.33 6.156 5.972 5.879 5.69 5.489 5.281 5.163 4.637 4.746 4.593 4.427 4.047 3.841 3.639 3.407 3.136 2.781 2.237 0.393 -10 ,12263 ,TETRA ,17603511,Sun Nov 28 16:37:46 CET,Sun Nov 28 18:51:31 CET,0.0 1.079 1.4 1.664 1.891 2.081 2.237 2.384 2.659 2.781 2.904 2.741 3.252 3.361 3.588 3.802 3.999 4.088 4.264 4.431 4.66 4.81 4.956 5.165 5.361 5.544 5.712 5.884 6.115 6.321 6.517 6.75 6.986 7.219 7.474 7.761 8.035 8.328 8.644 8.999 9.348 9.713 10.164 10.582 11.021 11.509 12.037 12.522 12.962 13.389 13.697 13.521 13.124 12.676 12.227 11.845 11.475 11.094 10.717 10.31 9.934 9.589 9.29 9.001 8.726 8.471 8.197 7.951 7.734 7.519 7.305 7.104 6.88 6.657 6.468 6.261 6.044 5.829 5.608 5.454 5.303 5.067 4.903 4.732 4.646 4.463 4.262 4.04 3.918 3.383 3.48 3.314 3.141 2.742 2.518 2.273 1.999 1.649 1.205 0.58 -1.463 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 481444c4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1648 ,TETRA ,17603299,Sun Nov 28 16:33:50 CET,Sun Nov 28 16:36:01 CET,0.0 1.21 1.675 2.048 2.375 2.679 2.983 3.282 3.851 4.1 4.322 4.255 4.987 5.198 5.624 6.042 6.45 6.651 7.043 7.432 8.005 8.379 8.748 9.303 9.873 10.42 10.947 11.484 12.203 12.918 13.614 14.452 15.275 16.086 17.054 18.163 19.244 20.46 21.826 23.329 24.955 26.87 29.184 31.594 34.523 37.895 42.021 46.996 53.228 61.329 72.422 83.102 90.293 95.439 99.215 102.182 104.531 106.489 108.048 109.475 110.62 111.567 112.377 113.053 113.607 114.067 114.523 114.904 115.213 115.522 115.824 116.075 116.311 116.5 116.625 116.726 116.816 116.9 116.993 117.069 117.134 117.188 117.2 117.2 117.208 117.22 117.177 117.116 117.098 116.695 116.992 116.937 116.884 116.709 116.575 116.404 116.186 115.941 115.583 115.005 112.379 -2 ,19543 ,TETRA ,17603513,Sun Nov 28 16:37:49 CET,Sun Nov 28 18:50:58 CET,0.0 1.198 1.684 2.083 2.446 2.77 3.059 3.349 3.886 4.122 4.353 4.293 5.026 5.242 5.668 6.077 6.485 6.69 7.098 7.492 8.07 8.456 8.838 9.393 9.937 10.483 11.032 11.571 12.258 12.923 13.589 14.431 15.249 16.046 16.992 18.1 19.226 20.496 21.884 23.391 25.022 26.924 29.22 31.624 34.525 37.933 42.159 47.245 53.574 61.595 72.521 83.012 90.075 95.206 99.077 102.175 104.583 106.519 108.042 109.442 110.536 111.417 112.203 112.89 113.49 114.012 114.506 114.901 115.211 115.498 115.745 115.951 116.163 116.345 116.477 116.607 116.73 116.835 116.887 116.905 116.932 116.95 116.955 116.947 116.941 116.913 116.814 116.691 116.644 116.216 116.484 116.406 116.312 116.057 115.898 115.712 115.494 115.236 114.83 114.134 111.327 -3 ,3091 ,TETRA ,17603514,Sun Nov 28 16:37:43 CET,Sun Nov 28 18:52:03 CET,0.0 1.398 1.862 2.223 2.543 2.823 3.087 3.349 3.846 4.084 4.319 4.266 5.003 5.21 5.63 6.039 6.433 6.636 7.036 7.422 7.995 8.369 8.735 9.259 9.768 10.285 10.804 11.317 12.0 12.675 13.334 14.147 14.965 15.771 16.709 17.787 18.858 20.068 21.412 22.877 24.493 26.424 28.741 31.138 34.067 37.51 41.711 46.713 52.971 61.048 72.072 82.512 89.575 94.751 98.598 101.621 104.016 105.949 107.461 108.841 109.917 110.819 111.642 112.322 112.908 113.433 113.936 114.357 114.686 114.991 115.287 115.523 115.743 115.949 116.11 116.257 116.381 116.478 116.56 116.611 116.655 116.702 116.726 116.755 116.763 116.779 116.8 116.779 116.754 116.334 116.625 116.567 116.465 116.215 116.11 116.0 115.821 115.556 115.244 114.716 111.606 -4 ,19531 ,TETRA ,17603515,Sun Nov 28 16:37:45 CET,Sun Nov 28 18:52:26 CET,0.0 1.625 2.106 2.496 2.829 3.129 3.425 3.71 4.234 4.478 4.712 4.653 5.385 5.597 6.012 6.41 6.812 7.018 7.418 7.802 8.385 8.766 9.134 9.681 10.224 10.757 11.276 11.793 12.478 13.151 13.845 14.728 15.578 16.397 17.376 18.522 19.672 20.963 22.388 23.972 25.654 27.554 29.856 32.312 35.292 38.723 42.917 47.966 54.26 62.315 73.283 83.779 90.921 96.083 99.947 103.011 105.427 107.41 108.98 110.422 111.533 112.425 113.223 113.929 114.533 115.035 115.5 115.863 116.163 116.463 116.739 116.949 117.15 117.323 117.455 117.589 117.694 117.78 117.861 117.92 117.964 117.994 117.995 117.979 117.974 117.954 117.888 117.831 117.806 117.364 117.606 117.535 117.473 117.26 117.117 116.921 116.692 116.458 116.108 115.585 112.172 -5 ,32729 ,TETRA ,17603516,Sun Nov 28 16:38:14 CET,Sun Nov 28 18:51:03 CET,0.0 2.326 2.843 3.29 3.68 4.007 4.307 4.575 5.13 5.399 5.643 5.589 6.342 6.568 7.006 7.434 7.844 8.052 8.472 8.895 9.511 9.902 10.292 10.867 11.441 12.009 12.562 13.113 13.833 14.538 15.225 16.077 16.901 17.694 18.656 19.766 20.869 22.139 23.538 25.075 26.775 28.768 31.188 33.717 36.766 40.274 44.521 49.56 55.821 63.87 74.77 85.088 92.032 97.114 100.915 103.959 106.36 108.308 109.838 111.204 112.275 113.145 113.899 114.565 115.143 115.628 116.086 116.473 116.787 117.074 117.358 117.576 117.792 118.005 118.155 118.3 118.429 118.569 118.694 118.755 118.804 118.868 118.904 118.91 118.907 118.92 118.904 118.832 118.776 118.325 118.6 118.546 118.469 118.279 118.17 118.017 117.8 117.498 117.134 116.605 111.914 -6 ,22488 ,TETRA ,17603517,Sun Nov 28 16:38:16 CET,Sun Nov 28 18:49:49 CET,0.0 1.156 1.612 2.003 2.357 2.67 2.949 3.217 3.729 3.976 4.216 4.151 4.89 5.107 5.523 5.915 6.302 6.498 6.879 7.248 7.811 8.194 8.566 9.103 9.641 10.176 10.693 11.201 11.88 12.557 13.237 14.08 14.893 15.697 16.664 17.773 18.852 20.062 21.42 22.92 24.559 26.466 28.73 31.103 34.0 37.355 41.437 46.392 52.564 60.463 71.291 81.61 88.65 93.815 97.675 100.736 103.128 105.068 106.606 108.029 109.165 110.087 110.897 111.609 112.237 112.768 113.255 113.651 113.964 114.274 114.562 114.778 114.992 115.192 115.34 115.465 115.559 115.642 115.708 115.755 115.799 115.848 115.868 115.872 115.857 115.819 115.796 115.748 115.711 115.284 115.563 115.476 115.385 115.132 114.945 114.714 114.454 114.117 113.68 113.13 108.332 -7 ,31531 ,TETRA ,17603518,Sun Nov 28 16:37:43 CET,Sun Nov 28 18:39:00 CET,0.0 1.463 1.935 2.317 2.642 2.951 3.23 3.495 4.024 4.269 4.505 4.451 5.189 5.406 5.847 6.281 6.699 6.905 7.32 7.721 8.299 8.679 9.053 9.618 10.165 10.692 11.218 11.738 12.419 13.099 13.77 14.579 15.378 16.18 17.13 18.22 19.302 20.526 21.9 23.419 25.049 26.962 29.283 31.698 34.64 38.076 42.284 47.384 53.758 61.877 73.001 83.702 90.86 96.021 99.901 102.959 105.372 107.325 108.828 110.19 111.266 112.166 112.927 113.579 114.144 114.609 115.069 115.468 115.796 116.093 116.376 116.61 116.846 117.057 117.179 117.287 117.384 117.471 117.549 117.594 117.632 117.669 117.702 117.713 117.703 117.669 117.608 117.537 117.51 117.096 117.38 117.298 117.206 117.02 116.856 116.631 116.377 116.085 115.754 115.197 111.659 -8 ,14259 ,TETRA ,17603519,Sun Nov 28 16:37:45 CET,Sun Nov 28 18:51:36 CET,0.0 1.224 1.691 2.073 2.398 2.709 3.012 3.295 3.834 4.084 4.334 4.288 5.031 5.251 5.687 6.118 6.534 6.737 7.15 7.573 8.17 8.545 8.918 9.459 9.996 10.538 11.06 11.575 12.274 12.952 13.614 14.457 15.296 16.142 17.135 18.26 19.366 20.599 21.976 23.501 25.16 27.073 29.392 31.812 34.722 38.091 42.194 47.117 53.331 61.311 72.226 82.765 89.888 95.073 99.001 102.103 104.486 106.43 107.97 109.366 110.481 111.412 112.207 112.887 113.465 113.944 114.365 114.673 114.918 115.179 115.464 115.682 115.881 116.081 116.227 116.344 116.454 116.541 116.608 116.651 116.685 116.723 116.732 116.735 116.731 116.688 116.622 116.536 116.485 116.04 116.273 116.171 116.059 115.889 115.822 115.712 115.548 115.344 114.942 114.309 110.31 -9 ,13054 ,TETRA ,17603307,Sun Nov 28 16:34:01 CET,Sun Nov 28 16:36:13 CET,0.0 1.474 1.945 2.313 2.638 2.946 3.244 3.535 4.049 4.279 4.505 4.442 5.184 5.405 5.824 6.23 6.637 6.834 7.203 7.579 8.145 8.505 8.87 9.418 9.948 10.462 10.965 11.468 12.136 12.8 13.459 14.271 15.077 15.882 16.825 17.927 19.013 20.221 21.593 23.11 24.738 26.598 28.86 31.232 34.123 37.55 41.763 46.81 53.132 61.209 72.096 82.451 89.489 94.586 98.376 101.428 103.811 105.767 107.332 108.75 109.844 110.749 111.56 112.27 112.899 113.45 113.978 114.397 114.738 115.079 115.4 115.655 115.885 116.089 116.247 116.381 116.51 116.637 116.745 116.813 116.864 116.898 116.91 116.916 116.911 116.9 116.869 116.815 116.79 116.374 116.705 116.681 116.637 116.5 116.382 116.181 115.941 115.627 115.262 114.828 111.008 -10 ,6538 ,TETRA ,17603521,Sun Nov 28 16:37:44 CET,Sun Nov 28 18:53:01 CET,0.0 1.233 1.695 2.066 2.392 2.682 2.954 3.22 3.737 3.99 4.227 4.16 4.897 5.119 5.549 5.972 6.377 6.582 6.987 7.378 7.949 8.32 8.69 9.242 9.782 10.321 10.858 11.386 12.108 12.837 13.546 14.406 15.243 16.059 17.036 18.165 19.277 20.514 21.87 23.354 24.961 26.83 29.091 31.485 34.424 37.866 42.038 47.008 53.315 61.503 72.475 82.952 89.974 95.03 98.873 101.931 104.335 106.311 107.855 109.246 110.337 111.252 112.046 112.744 113.347 113.859 114.367 114.793 115.146 115.486 115.807 116.045 116.273 116.5 116.636 116.739 116.853 116.972 117.071 117.116 117.142 117.185 117.194 117.165 117.155 117.128 117.07 116.967 116.913 116.48 116.768 116.694 116.593 116.395 116.267 116.099 115.893 115.598 115.163 114.526 111.804 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 907c8d47..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2028 ,KEBNE ,17027541,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:29:54 CET,0.0 1.282 1.735 2.105 2.453 2.761 3.036 3.301 3.808 4.045 4.275 4.208 4.939 5.156 5.577 5.979 6.377 6.573 6.956 7.332 7.894 8.258 8.623 9.173 9.719 10.263 10.784 11.287 11.942 12.588 13.234 14.061 14.878 15.666 16.591 17.656 18.712 19.897 21.214 22.684 24.296 26.192 28.471 30.789 33.53 36.731 40.657 45.398 51.333 58.824 69.024 78.722 85.124 89.785 93.218 95.834 97.882 99.555 100.857 102.055 102.988 103.739 104.426 105.029 105.509 105.889 106.259 106.569 106.81 107.047 107.285 107.466 107.628 107.763 107.856 107.951 108.025 108.072 108.104 108.117 108.133 108.149 108.146 108.131 108.118 108.074 108.009 107.929 107.873 107.413 107.659 107.557 107.461 107.235 107.116 106.98 106.77 106.5 106.136 105.523 102.874 -2 ,15773 ,KEBNE ,17027542,Wed Dec 22 17:37:01 CET,Wed Dec 22 19:26:16 CET,0.0 1.442 1.898 2.248 2.556 2.846 3.136 3.435 3.996 4.249 4.491 4.426 5.163 5.374 5.796 6.211 6.614 6.807 7.191 7.584 8.175 8.553 8.93 9.484 10.019 10.563 11.094 11.602 12.29 12.973 13.635 14.445 15.227 16.001 16.922 18.005 19.094 20.292 21.609 23.069 24.649 26.474 28.678 30.984 33.765 37.019 41.056 45.888 51.884 59.57 69.905 79.649 86.272 91.052 94.601 97.422 99.604 101.327 102.681 103.933 104.905 105.669 106.355 106.993 107.559 108.037 108.443 108.759 109.026 109.291 109.525 109.689 109.862 110.041 110.165 110.275 110.376 110.455 110.537 110.586 110.621 110.669 110.682 110.685 110.684 110.664 110.627 110.576 110.551 110.095 110.33 110.252 110.192 110.041 109.913 109.761 109.613 109.424 109.144 108.719 106.637 -3 ,14887 ,KEBNE ,17027543,Wed Dec 22 17:36:59 CET,Wed Dec 22 19:26:43 CET,0.0 1.68 2.144 2.52 2.85 3.154 3.45 3.743 4.281 4.522 4.751 4.675 5.414 5.633 6.063 6.483 6.902 7.109 7.515 7.922 8.513 8.881 9.24 9.788 10.319 10.838 11.354 11.879 12.56 13.216 13.866 14.665 15.474 16.284 17.226 18.293 19.353 20.545 21.845 23.275 24.834 26.618 28.763 31.03 33.803 37.09 41.092 45.883 51.918 59.58 69.899 79.518 85.849 90.433 93.905 96.662 98.735 100.373 101.726 103.012 104.022 104.828 105.514 106.093 106.549 106.934 107.337 107.656 107.889 108.113 108.328 108.474 108.62 108.773 108.872 108.978 109.081 109.16 109.205 109.222 109.241 109.278 109.286 109.262 109.249 109.22 109.191 109.141 109.096 108.624 108.869 108.795 108.729 108.496 108.345 108.206 108.039 107.838 107.56 107.067 105.174 -4 ,28068 ,KEBNE ,17027544,Wed Dec 22 17:36:55 CET,Wed Dec 22 19:29:36 CET,0.0 1.158 1.595 1.951 2.26 2.542 2.81 3.075 3.588 3.825 4.047 3.974 4.708 4.914 5.315 5.711 6.092 6.279 6.67 7.059 7.609 7.961 8.309 8.835 9.359 9.88 10.387 10.876 11.509 12.137 12.766 13.544 14.31 15.054 15.94 17.005 18.067 19.256 20.584 22.048 23.638 25.483 27.726 30.061 32.876 36.139 40.062 44.734 50.538 57.923 67.935 77.538 84.068 88.781 92.204 94.86 96.962 98.708 100.075 101.329 102.307 103.085 103.771 104.375 104.914 105.362 105.784 106.122 106.388 106.651 106.909 107.124 107.316 107.487 107.611 107.713 107.798 107.859 107.91 107.946 107.976 107.997 108.001 108.016 108.025 108.034 108.021 107.976 107.943 107.505 107.811 107.743 107.674 107.508 107.403 107.264 107.106 106.931 106.683 106.306 103.862 -5 ,19770 ,KEBNE ,17027545,Wed Dec 22 17:36:55 CET,Wed Dec 22 19:29:50 CET,0.0 1.509 1.966 2.336 2.658 2.959 3.251 3.531 4.045 4.294 4.546 4.504 5.247 5.462 5.876 6.287 6.684 6.881 7.279 7.675 8.251 8.613 8.959 9.478 9.989 10.488 10.979 11.47 12.125 12.778 13.427 14.204 14.96 15.717 16.606 17.636 18.661 19.824 21.103 22.488 23.985 25.724 27.868 30.136 32.93 36.157 40.039 44.708 50.573 58.082 68.135 77.694 84.154 88.833 92.305 95.02 97.162 98.904 100.267 101.511 102.491 103.306 104.02 104.643 105.185 105.625 106.014 106.325 106.586 106.843 107.105 107.308 107.485 107.644 107.736 107.814 107.909 108.004 108.101 108.156 108.189 108.222 108.239 108.251 108.254 108.252 108.219 108.171 108.148 107.721 108.02 107.952 107.879 107.697 107.603 107.483 107.314 107.126 106.89 106.491 104.504 -6 ,14753 ,KEBNE ,17027546,Wed Dec 22 17:36:55 CET,Wed Dec 22 19:29:18 CET,0.0 2.032 2.517 2.92 3.272 3.584 3.878 4.148 4.633 4.876 5.128 5.105 5.853 6.075 6.517 6.948 7.355 7.552 7.949 8.331 8.881 9.25 9.612 10.14 10.665 11.184 11.689 12.186 12.825 13.462 14.106 14.878 15.653 16.439 17.347 18.376 19.397 20.554 21.867 23.313 24.873 26.693 28.891 31.173 33.958 37.239 41.242 46.129 52.228 59.967 70.393 80.148 86.607 91.224 94.674 97.446 99.616 101.343 102.724 104.014 105.021 105.834 106.524 107.125 107.657 108.094 108.495 108.816 109.079 109.341 109.604 109.803 109.987 110.149 110.258 110.368 110.456 110.523 110.588 110.619 110.632 110.618 110.605 110.598 110.594 110.569 110.528 110.497 110.466 110.033 110.358 110.296 110.221 110.039 109.935 109.795 109.612 109.404 109.15 108.767 106.412 -7 ,23696 ,KEBNE ,17027547,Wed Dec 22 17:36:55 CET,Wed Dec 22 19:29:26 CET,0.0 2.014 2.515 2.928 3.28 3.582 3.855 4.126 4.635 4.869 5.094 5.013 5.748 5.961 6.38 6.781 7.165 7.354 7.724 8.086 8.636 8.998 9.351 9.862 10.367 10.87 11.361 11.853 12.505 13.138 13.773 14.56 15.334 16.118 17.053 18.133 19.21 20.405 21.719 23.17 24.719 26.481 28.617 30.878 33.649 36.863 40.764 45.494 51.397 58.84 69.038 78.85 85.468 90.191 93.723 96.534 98.686 100.39 101.717 102.96 103.947 104.75 105.437 106.045 106.59 107.041 107.446 107.797 108.092 108.357 108.591 108.77 108.951 109.109 109.214 109.307 109.385 109.473 109.551 109.577 109.586 109.599 109.606 109.604 109.591 109.549 109.508 109.474 109.452 109.007 109.296 109.228 109.151 108.949 108.817 108.676 108.464 108.211 107.97 107.513 105.345 -8 ,3395 ,KEBNE ,17027548,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:29:49 CET,0.0 1.185 1.661 2.044 2.369 2.691 2.996 3.275 3.787 4.029 4.272 4.228 4.975 5.212 5.662 6.097 6.532 6.749 7.162 7.544 8.122 8.503 8.883 9.444 9.996 10.544 11.068 11.577 12.248 12.91 13.571 14.389 15.182 15.951 16.872 17.97 19.059 20.258 21.591 23.054 24.603 26.42 28.662 30.973 33.771 37.013 40.862 45.434 51.233 58.799 69.108 78.93 85.524 90.158 93.611 96.373 98.54 100.331 101.744 103.011 103.975 104.735 105.412 106.025 106.586 107.026 107.402 107.729 107.998 108.256 108.522 108.735 108.933 109.115 109.248 109.369 109.478 109.589 109.686 109.723 109.749 109.782 109.782 109.784 109.78 109.735 109.672 109.604 109.587 109.181 109.53 109.491 109.435 109.245 109.119 108.949 108.728 108.472 108.213 107.877 106.121 -9 ,27519 ,KEBNE ,17027549,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:29:28 CET,0.0 1.428 1.922 2.303 2.644 2.957 3.23 3.493 3.999 4.241 4.477 4.406 5.144 5.356 5.765 6.155 6.543 6.738 7.123 7.505 8.063 8.426 8.785 9.33 9.873 10.378 10.867 11.36 12.014 12.658 13.294 14.088 14.885 15.671 16.596 17.663 18.721 19.913 21.241 22.675 24.198 25.993 28.191 30.489 33.27 36.546 40.522 45.221 51.076 58.584 68.8 78.488 85.069 89.75 93.171 95.889 97.974 99.705 101.108 102.366 103.333 104.131 104.849 105.475 106.018 106.475 106.901 107.251 107.532 107.782 108.017 108.203 108.383 108.557 108.671 108.775 108.869 108.948 109.031 109.092 109.14 109.181 109.183 109.171 109.168 109.135 109.071 109.019 109.002 108.584 108.921 108.861 108.786 108.608 108.509 108.373 108.211 108.056 107.821 107.422 104.741 -10 ,14874 ,KEBNE ,17027550,Wed Dec 22 17:36:55 CET,Wed Dec 22 19:29:12 CET,0.0 1.817 2.288 2.657 2.982 3.281 3.561 3.822 4.301 4.524 4.746 4.679 5.405 5.612 6.032 6.452 6.86 7.06 7.459 7.843 8.396 8.756 9.114 9.645 10.168 10.687 11.199 11.717 12.401 13.06 13.707 14.519 15.347 16.168 17.132 18.208 19.236 20.404 21.738 23.191 24.724 26.496 28.66 30.941 33.687 36.892 40.868 45.578 51.421 58.989 69.094 78.67 85.19 89.952 93.501 96.235 98.276 99.948 101.326 102.58 103.516 104.269 104.95 105.535 106.034 106.476 106.921 107.287 107.556 107.803 108.04 108.212 108.389 108.566 108.692 108.806 108.908 109.005 109.086 109.136 109.179 109.224 109.259 109.296 109.313 109.317 109.295 109.261 109.237 108.8 109.08 109.012 108.941 108.766 108.673 108.541 108.365 108.158 107.805 107.327 105.066 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 899771d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23347 ,TETRA ,17603522,Sun Nov 28 16:37:44 CET,Sun Nov 28 18:54:16 CET,0.0 1.554 1.952 2.268 2.553 2.821 3.071 3.31 3.753 3.964 4.175 4.083 4.775 4.971 5.344 5.701 6.042 6.21 6.54 6.867 7.355 7.676 8.006 8.49 8.934 9.367 9.805 10.235 10.791 11.343 11.881 12.537 13.197 13.854 14.644 15.543 16.405 17.375 18.453 19.64 20.962 22.478 24.249 26.065 28.264 30.904 34.125 37.923 42.55 48.307 55.866 62.946 67.754 71.111 73.482 75.291 76.652 77.732 78.585 79.335 79.869 80.275 80.621 80.915 81.145 81.311 81.481 81.634 81.719 81.768 81.832 81.869 81.875 81.854 81.84 81.837 81.791 81.732 81.684 81.644 81.609 81.526 81.445 81.362 81.319 81.212 81.075 80.88 80.769 80.255 80.363 80.204 80.033 79.65 79.455 79.224 78.93 78.559 78.105 77.439 74.165 -2 ,29715 ,TETRA ,17603523,Sun Nov 28 16:37:45 CET,Sun Nov 28 18:51:16 CET,0.0 1.298 1.739 2.07 2.35 2.616 2.873 3.117 3.594 3.822 4.031 3.938 4.634 4.827 5.184 5.546 5.904 6.075 6.414 6.738 7.21 7.522 7.823 8.281 8.737 9.166 9.591 10.018 10.581 11.128 11.674 12.358 13.026 13.675 14.435 15.314 16.193 17.169 18.25 19.446 20.737 22.236 24.045 25.932 28.218 30.874 34.047 37.8 42.483 48.407 56.236 63.681 68.744 72.341 74.883 76.846 78.453 79.783 80.783 81.649 82.276 82.765 83.19 83.537 83.849 84.151 84.428 84.609 84.704 84.775 84.854 84.892 84.919 84.932 84.931 84.923 84.901 84.851 84.793 84.758 84.687 84.573 84.487 84.383 84.321 84.177 84.017 83.852 83.77 83.262 83.411 83.268 83.125 82.848 82.684 82.46 82.153 81.822 81.405 80.715 77.224 -3 ,25647 ,TETRA ,17603524,Sun Nov 28 16:37:50 CET,Sun Nov 28 18:50:59 CET,0.0 2.148 2.647 3.031 3.371 3.684 3.976 4.243 4.741 4.984 5.217 5.174 5.888 6.096 6.493 6.87 7.236 7.425 7.786 8.13 8.637 8.97 9.298 9.78 10.255 10.716 11.171 11.625 12.22 12.803 13.378 14.104 14.819 15.502 16.306 17.23 18.128 19.155 20.289 21.506 22.844 24.41 26.253 28.123 30.382 32.995 36.043 39.732 44.487 50.419 58.218 65.549 70.382 73.745 76.202 78.045 79.425 80.544 81.425 82.21 82.772 83.177 83.482 83.714 83.915 84.08 84.244 84.359 84.451 84.541 84.597 84.628 84.642 84.646 84.628 84.595 84.544 84.499 84.431 84.348 84.258 84.101 83.952 83.809 83.753 83.624 83.452 83.266 83.164 82.634 82.74 82.595 82.43 81.954 81.682 81.373 81.009 80.591 80.069 79.339 75.195 -4 ,25698 ,TETRA ,17603525,Sun Nov 28 16:37:45 CET,Sun Nov 28 18:52:52 CET,0.0 1.786 2.224 2.615 2.964 3.25 3.506 3.763 4.266 4.502 4.723 4.631 5.307 5.492 5.856 6.218 6.568 6.741 7.09 7.421 7.892 8.204 8.516 8.981 9.432 9.877 10.326 10.763 11.321 11.874 12.415 13.077 13.73 14.37 15.135 16.026 16.907 17.9 19.004 20.211 21.568 23.127 24.934 26.834 29.151 31.81 34.966 38.738 43.417 49.326 57.36 64.789 69.478 72.798 75.295 77.186 78.485 79.487 80.235 80.914 81.458 81.871 82.225 82.532 82.766 82.903 83.038 83.155 83.235 83.292 83.33 83.345 83.34 83.305 83.269 83.238 83.206 83.159 83.057 82.988 82.919 82.783 82.702 82.604 82.547 82.448 82.319 82.156 82.059 81.556 81.763 81.637 81.496 81.173 80.989 80.775 80.53 80.251 79.871 79.276 76.135 -5 ,20019 ,TETRA ,17603526,Sun Nov 28 16:37:47 CET,Sun Nov 28 18:52:29 CET,0.0 1.368 1.854 2.229 2.551 2.843 3.109 3.356 3.832 4.05 4.252 4.153 4.85 5.043 5.418 5.782 6.145 6.32 6.648 6.97 7.457 7.782 8.1 8.567 9.027 9.484 9.928 10.358 10.927 11.49 12.04 12.713 13.375 14.026 14.806 15.72 16.621 17.626 18.743 19.955 21.224 22.705 24.503 26.346 28.55 31.143 34.305 38.079 42.728 48.537 56.378 63.775 68.657 72.069 74.521 76.394 77.81 78.935 79.801 80.54 81.051 81.478 81.874 82.206 82.469 82.672 82.86 82.974 83.06 83.117 83.156 83.192 83.204 83.194 83.184 83.162 83.128 83.099 83.066 83.03 82.977 82.897 82.837 82.736 82.672 82.541 82.376 82.179 82.068 81.547 81.682 81.519 81.343 80.968 80.751 80.486 80.188 79.848 79.425 78.815 76.355 -6 ,7103 ,TETRA ,17603527,Sun Nov 28 16:37:45 CET,Sun Nov 28 18:54:33 CET,0.0 1.293 1.767 2.173 2.513 2.807 3.079 3.323 3.789 4.02 4.24 4.164 4.866 5.06 5.419 5.781 6.141 6.312 6.662 7.006 7.504 7.833 8.152 8.617 9.082 9.545 10.005 10.444 11.009 11.579 12.135 12.804 13.468 14.135 14.925 15.841 16.73 17.681 18.712 19.852 21.121 22.587 24.333 26.166 28.384 30.98 34.11 37.844 42.529 48.43 56.396 63.847 68.784 72.229 74.642 76.525 77.923 79.045 79.949 80.707 81.302 81.813 82.23 82.542 82.8 83.025 83.254 83.418 83.525 83.617 83.679 83.726 83.777 83.808 83.802 83.771 83.717 83.62 83.51 83.438 83.346 83.185 83.061 82.936 82.875 82.753 82.625 82.444 82.346 81.848 82.032 81.903 81.735 81.353 81.136 80.893 80.597 80.171 79.663 79.051 75.511 -7 ,6611 ,TETRA ,17603528,Sun Nov 28 16:37:45 CET,Sun Nov 28 18:51:27 CET,0.0 1.294 1.725 2.091 2.422 2.705 2.971 3.225 3.711 3.943 4.159 4.082 4.78 4.968 5.339 5.696 6.032 6.199 6.527 6.854 7.352 7.675 7.984 8.446 8.902 9.347 9.784 10.225 10.803 11.364 11.902 12.55 13.202 13.868 14.679 15.619 16.525 17.533 18.647 19.851 21.145 22.647 24.487 26.417 28.712 31.355 34.539 38.319 43.05 49.036 57.11 64.744 69.668 73.026 75.442 77.3 78.69 79.809 80.661 81.393 81.957 82.411 82.804 83.147 83.427 83.63 83.781 83.863 83.905 83.985 84.064 84.083 84.096 84.085 84.05 84.02 83.981 83.888 83.769 83.694 83.631 83.52 83.414 83.321 83.277 83.158 83.007 82.827 82.722 82.203 82.38 82.253 82.097 81.734 81.513 81.238 80.917 80.527 79.986 79.181 76.268 -8 ,7867 ,TETRA ,17603529,Sun Nov 28 16:37:47 CET,Sun Nov 28 18:51:38 CET,0.0 1.192 1.609 1.943 2.239 2.508 2.753 2.989 3.445 3.656 3.857 3.742 4.423 4.609 4.976 5.316 5.644 5.808 6.137 6.462 6.932 7.241 7.553 8.037 8.498 8.931 9.365 9.795 10.361 10.927 11.492 12.194 12.877 13.543 14.325 15.228 16.129 17.131 18.213 19.371 20.609 22.044 23.795 25.646 27.95 30.673 33.93 37.761 42.527 48.53 56.56 63.995 68.825 72.22 74.611 76.389 77.727 78.808 79.655 80.373 80.887 81.326 81.686 81.991 82.243 82.428 82.576 82.665 82.748 82.805 82.823 82.84 82.853 82.857 82.847 82.831 82.804 82.741 82.653 82.592 82.537 82.459 82.362 82.217 82.147 81.997 81.81 81.592 81.473 80.952 81.114 80.965 80.781 80.372 80.125 79.855 79.563 79.192 78.637 77.908 74.575 -9 ,12450 ,TETRA ,17603530,Sun Nov 28 16:37:45 CET,Sun Nov 28 18:52:38 CET,0.0 1.344 1.782 2.121 2.412 2.686 2.957 3.211 3.681 3.903 4.117 4.032 4.717 4.903 5.28 5.638 5.972 6.136 6.469 6.805 7.288 7.594 7.891 8.342 8.801 9.25 9.689 10.122 10.686 11.243 11.801 12.476 13.136 13.798 14.582 15.477 16.363 17.366 18.46 19.638 20.931 22.441 24.268 26.165 28.444 31.1 34.331 38.177 42.917 48.956 56.982 64.373 69.246 72.75 75.407 77.367 78.762 79.878 80.741 81.555 82.212 82.741 83.174 83.518 83.792 84.026 84.274 84.46 84.593 84.706 84.779 84.825 84.864 84.885 84.907 84.933 84.949 84.922 84.869 84.82 84.755 84.664 84.594 84.498 84.438 84.308 84.157 83.99 83.902 83.407 83.609 83.485 83.353 83.022 82.807 82.572 82.317 82.003 81.599 80.951 78.582 -10 ,14095 ,TETRA ,17603531,Sun Nov 28 16:37:48 CET,Sun Nov 28 18:53:06 CET,0.0 1.187 1.601 1.935 2.23 2.511 2.784 3.042 3.503 3.711 3.917 3.831 4.52 4.712 5.089 5.443 5.799 5.983 6.336 6.663 7.143 7.453 7.755 8.193 8.618 9.056 9.499 9.924 10.464 10.993 11.526 12.183 12.826 13.459 14.177 15.006 15.841 16.795 17.865 19.032 20.312 21.793 23.577 25.495 27.803 30.479 33.711 37.49 42.197 48.147 56.125 63.575 68.41 71.774 74.191 75.981 77.316 78.386 79.211 79.949 80.525 81.022 81.44 81.752 81.997 82.21 82.391 82.477 82.534 82.603 82.682 82.719 82.734 82.727 82.695 82.663 82.622 82.561 82.468 82.386 82.312 82.202 82.083 81.925 81.839 81.679 81.506 81.279 81.146 80.594 80.708 80.548 80.351 79.879 79.594 79.292 78.96 78.553 77.973 77.161 74.038 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt deleted file mode 100644 index 265a8061..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8619 ,TETRA ,17603532,Sun Nov 28 16:37:47 CET,Sun Nov 28 18:52:24 CET,0.0 1.788 2.183 2.527 2.816 3.023 3.196 3.362 3.707 3.862 3.996 3.747 4.356 4.476 4.675 4.846 5.034 5.118 5.266 5.42 5.649 5.787 5.92 6.122 6.307 6.479 6.646 6.793 6.944 7.073 7.22 7.394 7.536 7.683 7.858 8.025 8.138 8.244 8.338 8.405 8.471 8.517 8.588 8.643 8.605 8.502 8.295 7.948 7.306 6.198 4.181 1.484 -0.74 -2.64 -4.258 -5.6 -6.76 -7.88 -8.838 -9.787 -10.61 -11.333 -12.03 -12.672 -13.246 -13.747 -14.264 -14.74 -15.16 -15.592 -16.032 -16.432 -16.851 -17.241 -17.528 -17.843 -18.171 -18.478 -18.783 -18.997 -19.223 -19.596 -19.878 -20.185 -20.346 -20.681 -21.017 -21.354 -21.529 -22.22 -22.094 -22.303 -22.531 -23.035 -23.315 -23.626 -23.953 -24.31 -24.782 -25.429 -28.377 -2 ,5446 ,TETRA ,17603533,Sun Nov 28 16:37:50 CET,Sun Nov 28 18:51:41 CET,0.0 1.678 2.116 2.432 2.699 2.914 3.089 3.246 3.523 3.645 3.762 3.484 4.076 4.168 4.355 4.531 4.679 4.751 4.892 5.024 5.219 5.337 5.44 5.615 5.785 5.936 6.088 6.24 6.424 6.573 6.709 6.884 7.06 7.207 7.325 7.42 7.5 7.596 7.703 7.765 7.8 7.843 7.865 7.851 7.79 7.623 7.3 6.816 6.02 4.746 2.607 -0.064 -2.351 -4.274 -5.927 -7.363 -8.557 -9.618 -10.537 -11.483 -12.277 -12.996 -13.677 -14.288 -14.867 -15.375 -15.871 -16.345 -16.783 -17.236 -17.709 -18.091 -18.475 -18.897 -19.251 -19.623 -20.007 -20.404 -20.823 -21.121 -21.428 -21.861 -22.142 -22.441 -22.603 -22.959 -23.327 -23.719 -23.918 -24.645 -24.59 -24.828 -25.084 -25.639 -25.922 -26.204 -26.503 -26.851 -27.293 -27.876 -29.73 -3 ,22652 ,TETRA ,17603534,Sun Nov 28 16:37:47 CET,Sun Nov 28 18:53:39 CET,0.0 1.987 2.421 2.729 2.967 3.2 3.397 3.561 3.848 3.986 4.131 3.891 4.483 4.578 4.774 4.956 5.113 5.193 5.352 5.5 5.699 5.809 5.925 6.083 6.208 6.353 6.485 6.597 6.744 6.881 7.018 7.196 7.351 7.476 7.609 7.759 7.951 8.162 8.292 8.384 8.495 8.616 8.75 8.844 8.879 8.863 8.73 8.445 7.883 6.876 5.035 2.545 0.344 -1.517 -3.083 -4.473 -5.702 -6.839 -7.78 -8.716 -9.53 -10.228 -10.885 -11.556 -12.178 -12.691 -13.216 -13.676 -14.067 -14.471 -14.885 -15.223 -15.573 -15.949 -16.26 -16.57 -16.866 -17.178 -17.503 -17.741 -18.02 -18.481 -18.779 -19.063 -19.211 -19.515 -19.847 -20.194 -20.353 -21.019 -20.836 -21.02 -21.214 -21.665 -21.921 -22.207 -22.56 -22.955 -23.409 -24.076 -27.69 -4 ,25389 ,TETRA ,17603535,Sun Nov 28 16:37:49 CET,Sun Nov 28 18:53:33 CET,0.0 3.127 3.638 3.969 4.244 4.484 4.679 4.867 5.206 5.337 5.474 5.262 5.874 5.976 6.153 6.321 6.487 6.573 6.714 6.844 7.027 7.14 7.254 7.436 7.64 7.816 7.987 8.145 8.314 8.488 8.675 8.9 9.126 9.299 9.397 9.497 9.584 9.658 9.747 9.852 9.92 9.943 9.958 9.919 9.795 9.619 9.331 8.838 8.026 6.688 4.429 1.736 -0.476 -2.454 -4.183 -5.679 -6.957 -8.085 -9.056 -10.014 -10.827 -11.567 -12.299 -12.983 -13.636 -14.27 -14.925 -15.46 -15.903 -16.376 -16.868 -17.304 -17.765 -18.24 -18.604 -18.949 -19.3 -19.665 -20.038 -20.291 -20.547 -20.95 -21.239 -21.536 -21.695 -22.013 -22.327 -22.671 -22.855 -23.569 -23.501 -23.736 -23.968 -24.464 -24.743 -25.055 -25.36 -25.696 -26.157 -26.777 -30.703 -5 ,17610 ,TETRA ,17603536,Sun Nov 28 16:37:46 CET,Sun Nov 28 18:50:22 CET,0.0 1.894 2.309 2.567 2.804 3.027 3.221 3.386 3.68 3.815 3.932 3.659 4.245 4.333 4.51 4.67 4.811 4.873 5.002 5.144 5.34 5.472 5.594 5.732 5.867 6.003 6.126 6.249 6.419 6.596 6.758 6.938 7.106 7.234 7.385 7.559 7.662 7.751 7.86 7.986 8.074 8.115 8.19 8.248 8.224 8.124 7.935 7.669 7.195 6.315 4.524 2.133 0.101 -1.628 -3.082 -4.43 -5.607 -6.594 -7.461 -8.395 -9.275 -10.084 -10.794 -11.452 -12.074 -12.631 -13.228 -13.792 -14.279 -14.77 -15.27 -15.669 -16.063 -16.466 -16.79 -17.12 -17.441 -17.768 -18.136 -18.403 -18.669 -19.111 -19.444 -19.788 -19.947 -20.243 -20.579 -20.975 -21.186 -21.912 -21.772 -21.972 -22.203 -22.688 -22.95 -23.26 -23.624 -24.065 -24.557 -25.211 -27.566 -6 ,11457 ,TETRA ,17603537,Sun Nov 28 16:37:46 CET,Sun Nov 28 18:52:00 CET,0.0 1.717 2.153 2.479 2.769 3.034 3.244 3.41 3.761 3.913 4.039 3.784 4.403 4.529 4.728 4.887 5.052 5.139 5.3 5.439 5.616 5.718 5.815 5.96 6.1 6.238 6.364 6.47 6.599 6.744 6.887 7.02 7.128 7.243 7.352 7.444 7.551 7.683 7.812 7.924 7.994 8.032 8.065 8.055 7.981 7.827 7.535 7.112 6.437 5.23 3.053 0.416 -1.835 -3.765 -5.351 -6.753 -7.989 -9.104 -10.042 -10.967 -11.751 -12.438 -13.119 -13.768 -14.365 -14.903 -15.447 -15.934 -16.361 -16.858 -17.367 -17.737 -18.121 -18.505 -18.823 -19.186 -19.549 -19.895 -20.228 -20.459 -20.701 -21.071 -21.336 -21.608 -21.754 -22.085 -22.428 -22.783 -22.964 -23.659 -23.53 -23.742 -23.973 -24.467 -24.732 -25.042 -25.413 -25.837 -26.339 -27.037 -30.329 -7 ,2660 ,TETRA ,17603538,Sun Nov 28 16:37:48 CET,Sun Nov 28 18:52:16 CET,0.0 1.897 2.298 2.623 2.891 3.096 3.293 3.478 3.791 3.929 4.061 3.826 4.43 4.524 4.688 4.855 5.022 5.099 5.228 5.35 5.533 5.643 5.757 5.931 6.086 6.233 6.37 6.491 6.634 6.766 6.895 7.049 7.199 7.357 7.5 7.579 7.677 7.821 7.94 8.003 8.04 8.047 8.023 7.968 7.864 7.716 7.426 6.914 6.108 4.784 2.492 -0.263 -2.54 -4.479 -6.137 -7.605 -8.876 -9.995 -10.946 -11.875 -12.646 -13.344 -14.042 -14.699 -15.302 -15.846 -16.427 -16.955 -17.405 -17.882 -18.376 -18.765 -19.143 -19.543 -19.87 -20.211 -20.56 -20.927 -21.306 -21.575 -21.845 -22.258 -22.551 -22.873 -23.054 -23.442 -23.834 -24.228 -24.438 -25.178 -25.101 -25.338 -25.589 -26.107 -26.373 -26.667 -27.005 -27.394 -27.882 -28.55 -30.872 -8 ,15551 ,TETRA ,17603539,Sun Nov 28 16:37:49 CET,Sun Nov 28 18:52:06 CET,0.0 1.375 1.811 2.15 2.43 2.678 2.891 3.089 3.436 3.585 3.72 3.48 4.089 4.199 4.409 4.578 4.741 4.828 5.003 5.165 5.367 5.493 5.623 5.804 5.975 6.132 6.291 6.437 6.59 6.734 6.897 7.108 7.254 7.347 7.454 7.569 7.671 7.783 7.891 7.989 8.043 8.063 8.078 8.066 8.017 7.838 7.474 6.953 6.135 4.841 2.64 -0.127 -2.392 -4.249 -5.826 -7.205 -8.466 -9.658 -10.642 -11.595 -12.41 -13.122 -13.795 -14.425 -15.022 -15.577 -16.134 -16.607 -17.031 -17.48 -17.947 -18.346 -18.764 -19.187 -19.501 -19.82 -20.159 -20.541 -20.958 -21.237 -21.498 -21.933 -22.25 -22.555 -22.717 -23.055 -23.395 -23.751 -23.948 -24.669 -24.584 -24.82 -25.055 -25.577 -25.899 -26.227 -26.581 -26.991 -27.464 -28.156 -31.529 -10 ,3462 ,TETRA ,17603541,Sun Nov 28 16:37:47 CET,Sun Nov 28 18:51:30 CET,0.0 1.492 1.947 2.261 2.512 2.721 2.927 3.111 3.416 3.56 3.69 3.433 4.057 4.177 4.384 4.582 4.763 4.845 5.009 5.182 5.395 5.522 5.669 5.887 6.075 6.229 6.405 6.6 6.808 6.955 7.116 7.333 7.478 7.583 7.705 7.822 7.926 8.033 8.096 8.147 8.271 8.451 8.521 8.435 8.309 8.113 7.799 7.289 6.431 5.094 2.795 0.0 -2.264 -4.16 -5.748 -7.136 -8.385 -9.575 -10.577 -11.511 -12.315 -13.054 -13.734 -14.349 -14.931 -15.457 -16.022 -16.533 -16.952 -17.365 -17.806 -18.197 -18.572 -18.94 -19.247 -19.567 -19.897 -20.24 -20.591 -20.832 -21.091 -21.518 -21.838 -22.166 -22.32 -22.63 -22.973 -23.354 -23.55 -24.264 -24.116 -24.326 -24.583 -25.192 -25.524 -25.889 -26.29 -26.73 -27.231 -27.995 -31.691 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt deleted file mode 100644 index 5d31b06a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,4671 ,TETRA ,17603543,Sun Nov 28 16:38:14 CET,Sun Nov 28 18:51:26 CET,0.0 1.707 2.188 2.591 2.941 3.22 3.483 3.744 4.2 4.409 4.619 4.544 5.197 5.38 5.744 6.124 6.514 6.697 7.039 7.372 7.876 8.207 8.529 8.997 9.444 9.892 10.334 10.765 11.331 11.892 12.438 13.1 13.737 14.366 15.127 15.994 16.859 17.853 18.941 20.119 21.418 22.934 24.744 26.636 28.942 31.661 34.902 38.703 43.446 49.369 57.124 64.458 69.329 72.725 75.303 77.277 78.73 79.902 80.763 81.494 82.063 82.544 82.939 83.26 83.557 83.813 84.038 84.176 84.244 84.311 84.392 84.447 84.487 84.497 84.485 84.482 84.459 84.405 84.369 84.322 84.258 84.13 84.003 83.881 83.805 83.632 83.429 83.186 83.062 82.545 82.583 82.418 82.246 81.752 81.469 81.189 80.874 80.46 79.892 78.883 74.81 -3 ,5186 ,TETRA ,17603544,Sun Nov 28 16:38:14 CET,Sun Nov 28 18:54:18 CET,0.0 1.573 2.084 2.483 2.82 3.105 3.352 3.607 4.12 4.351 4.564 4.511 5.189 5.395 5.786 6.167 6.523 6.693 7.033 7.362 7.842 8.161 8.477 8.926 9.359 9.782 10.202 10.622 11.178 11.731 12.277 12.941 13.602 14.27 15.077 16.006 16.906 17.899 18.994 20.203 21.511 23.007 24.815 26.74 29.081 31.754 34.882 38.585 43.222 49.189 57.205 64.523 69.225 72.571 75.075 76.968 78.37 79.485 80.325 81.062 81.635 82.089 82.448 82.729 82.981 83.194 83.381 83.533 83.641 83.719 83.765 83.79 83.8 83.786 83.756 83.709 83.657 83.588 83.503 83.446 83.377 83.273 83.195 83.093 83.041 82.897 82.718 82.552 82.459 81.968 82.046 81.876 81.692 81.25 80.989 80.664 80.28 79.742 79.042 78.119 73.568 -4 ,27271 ,TETRA ,17603545,Sun Nov 28 16:38:17 CET,Sun Nov 28 18:54:03 CET,0.0 1.527 1.967 2.345 2.703 3.008 3.259 3.499 3.926 4.131 4.339 4.267 4.928 5.114 5.495 5.872 6.222 6.395 6.724 7.047 7.548 7.875 8.186 8.657 9.131 9.599 10.057 10.501 11.078 11.647 12.202 12.884 13.557 14.209 14.97 15.858 16.76 17.765 18.86 20.06 21.38 22.942 24.795 26.702 29.001 31.717 34.986 38.837 43.737 49.982 58.131 65.63 70.565 74.016 76.509 78.408 79.849 81.006 81.906 82.698 83.324 83.83 84.225 84.576 84.875 85.085 85.285 85.469 85.591 85.663 85.695 85.704 85.708 85.673 85.637 85.635 85.618 85.566 85.5 85.448 85.392 85.289 85.217 85.118 85.059 84.951 84.812 84.588 84.469 83.992 84.087 83.92 83.74 83.313 83.077 82.824 82.492 82.025 81.453 80.614 75.406 -5 ,3030 ,TETRA ,17603546,Sun Nov 28 16:38:14 CET,Sun Nov 28 18:51:41 CET,0.0 1.839 2.373 2.763 3.095 3.391 3.652 3.88 4.32 4.538 4.744 4.679 5.348 5.539 5.9 6.26 6.616 6.789 7.122 7.449 7.95 8.267 8.58 9.043 9.502 9.962 10.422 10.875 11.447 12.008 12.553 13.227 13.898 14.571 15.353 16.24 17.136 18.153 19.265 20.463 21.758 23.29 25.156 27.067 29.35 31.974 35.146 38.962 43.726 49.574 57.254 64.26 68.842 72.076 74.367 76.2 77.66 78.833 79.727 80.494 81.084 81.557 81.962 82.308 82.596 82.826 83.023 83.174 83.286 83.377 83.432 83.48 83.516 83.536 83.556 83.571 83.561 83.507 83.437 83.389 83.315 83.161 83.044 82.906 82.827 82.673 82.515 82.327 82.225 81.742 81.815 81.628 81.404 80.838 80.521 80.23 79.825 79.241 78.605 77.856 75.588 -6 ,21183 ,TETRA ,17603547,Sun Nov 28 16:38:15 CET,Sun Nov 28 18:53:00 CET,0.0 1.325 1.784 2.128 2.43 2.705 2.959 3.206 3.692 3.936 4.168 4.126 4.808 5.014 5.398 5.765 6.147 6.333 6.688 7.044 7.569 7.913 8.253 8.752 9.231 9.701 10.163 10.615 11.198 11.766 12.334 13.043 13.74 14.429 15.248 16.169 17.058 18.057 19.162 20.389 21.716 23.221 25.045 26.942 29.241 31.862 35.025 38.865 43.618 49.579 57.481 64.85 69.697 73.069 75.483 77.342 78.727 79.78 80.597 81.354 81.931 82.39 82.759 83.032 83.276 83.494 83.693 83.824 83.904 83.997 84.088 84.139 84.167 84.18 84.165 84.107 84.022 83.963 83.92 83.867 83.802 83.692 83.601 83.489 83.428 83.287 83.108 82.92 82.821 82.341 82.455 82.285 82.099 81.635 81.37 81.076 80.679 80.22 79.6 78.684 73.896 -7 ,7341 ,TETRA ,17603548,Sun Nov 28 16:38:15 CET,Sun Nov 28 18:52:17 CET,0.0 1.815 2.341 2.744 3.076 3.383 3.672 3.943 4.449 4.677 4.884 4.814 5.481 5.674 6.051 6.42 6.781 6.958 7.308 7.642 8.124 8.44 8.751 9.218 9.672 10.127 10.591 11.04 11.618 12.199 12.764 13.433 14.095 14.769 15.564 16.476 17.374 18.377 19.488 20.697 21.994 23.508 25.343 27.226 29.459 32.06 35.281 39.193 44.01 50.057 57.979 65.151 69.95 73.328 75.799 77.69 79.113 80.273 81.18 81.963 82.553 83.04 83.453 83.789 84.048 84.25 84.462 84.636 84.741 84.811 84.864 84.891 84.913 84.943 84.945 84.915 84.869 84.824 84.767 84.712 84.631 84.471 84.358 84.251 84.2 84.077 83.911 83.694 83.575 83.082 83.203 83.028 82.805 82.275 81.966 81.642 81.244 80.766 80.216 79.435 75.858 -8 ,31962 ,TETRA ,17603549,Sun Nov 28 16:38:15 CET,Sun Nov 28 18:53:22 CET,0.0 1.264 1.759 2.096 2.422 2.722 2.969 3.195 3.62 3.828 4.034 3.97 4.63 4.817 5.184 5.547 5.89 6.066 6.433 6.783 7.271 7.593 7.92 8.4 8.874 9.341 9.817 10.281 10.843 11.401 11.951 12.627 13.295 13.95 14.739 15.641 16.505 17.478 18.554 19.725 21.002 22.495 24.316 26.205 28.511 31.223 34.468 38.257 42.897 48.836 56.934 64.318 69.113 72.508 74.948 76.849 78.314 79.473 80.361 81.154 81.755 82.253 82.689 83.04 83.323 83.551 83.739 83.884 83.985 84.054 84.139 84.207 84.247 84.247 84.24 84.245 84.242 84.217 84.163 84.114 84.073 83.999 83.921 83.78 83.7 83.545 83.359 83.169 83.063 82.561 82.608 82.407 82.209 81.801 81.55 81.247 80.936 80.576 80.076 79.398 76.475 -9 ,4100 ,TETRA ,17603550,Sun Nov 28 16:38:15 CET,Sun Nov 28 18:51:27 CET,0.0 1.583 2.044 2.395 2.721 3.02 3.274 3.515 3.973 4.185 4.401 4.35 5.015 5.211 5.609 5.994 6.367 6.549 6.896 7.23 7.724 8.035 8.349 8.822 9.276 9.717 10.145 10.577 11.161 11.736 12.291 12.976 13.663 14.343 15.129 16.026 16.908 17.899 19.003 20.215 21.541 23.059 24.891 26.817 29.132 31.823 35.056 38.827 43.485 49.538 57.551 64.845 69.63 72.979 75.471 77.446 78.919 80.06 80.941 81.723 82.34 82.824 83.22 83.588 83.916 84.172 84.409 84.584 84.705 84.799 84.851 84.878 84.921 84.967 84.967 84.952 84.935 84.898 84.857 84.829 84.762 84.645 84.583 84.505 84.451 84.319 84.174 84.011 83.914 83.423 83.507 83.335 83.14 82.683 82.432 82.097 81.676 81.18 80.632 79.897 77.102 -10 ,9700 ,TETRA ,17603551,Sun Nov 28 16:38:17 CET,Sun Nov 28 18:52:28 CET,0.0 1.532 1.974 2.337 2.658 2.922 3.164 3.394 3.804 3.998 4.198 4.124 4.782 4.988 5.37 5.721 6.074 6.247 6.591 6.93 7.407 7.717 8.026 8.48 8.931 9.371 9.81 10.251 10.822 11.379 11.934 12.616 13.285 13.959 14.738 15.628 16.508 17.479 18.567 19.769 21.059 22.567 24.392 26.283 28.603 31.282 34.533 38.447 43.236 49.234 57.288 64.754 69.574 72.981 75.43 77.305 78.766 79.961 80.874 81.629 82.179 82.619 83.0 83.335 83.577 83.776 84.004 84.166 84.264 84.324 84.377 84.418 84.458 84.493 84.512 84.504 84.47 84.437 84.378 84.323 84.228 84.038 83.919 83.791 83.739 83.636 83.484 83.307 83.21 82.723 82.827 82.673 82.507 82.1 81.857 81.579 81.237 80.806 80.235 79.369 76.034 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index fab92618..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31810 ,TETRA ,17603552,Sun Nov 28 16:38:19 CET,Sun Nov 28 18:52:12 CET,0.0 1.134 1.495 1.767 2.015 2.213 2.386 2.56 2.866 2.994 3.115 2.942 3.464 3.575 3.804 4.02 4.207 4.308 4.525 4.709 4.969 5.141 5.301 5.553 5.791 5.999 6.211 6.411 6.663 6.925 7.188 7.502 7.801 8.089 8.431 8.811 9.179 9.591 10.037 10.503 10.99 11.542 12.162 12.794 13.564 14.467 15.512 16.694 18.123 19.762 21.732 23.353 24.226 24.764 25.083 25.221 25.288 25.287 25.211 25.112 25.028 24.927 24.799 24.68 24.544 24.4 24.243 24.092 23.947 23.794 23.625 23.481 23.336 23.177 23.036 22.895 22.772 22.631 22.461 22.322 22.174 21.964 21.827 21.679 21.595 21.415 21.203 20.972 20.856 20.346 20.451 20.29 20.107 19.702 19.484 19.234 18.947 18.604 18.18 17.576 15.184 -2 ,20720 ,TETRA ,17603553,Sun Nov 28 16:38:15 CET,Sun Nov 28 18:52:18 CET,0.0 1.195 1.561 1.831 2.085 2.307 2.493 2.656 2.943 3.07 3.198 3.027 3.557 3.675 3.895 4.097 4.289 4.378 4.554 4.72 4.967 5.125 5.278 5.512 5.74 5.955 6.161 6.358 6.601 6.837 7.081 7.375 7.659 7.95 8.292 8.675 9.024 9.411 9.844 10.297 10.764 11.285 11.928 12.614 13.451 14.391 15.472 16.688 18.105 19.785 21.808 23.386 24.134 24.575 24.846 24.947 24.976 24.963 24.897 24.752 24.614 24.495 24.356 24.198 24.041 23.878 23.683 23.513 23.349 23.17 22.984 22.829 22.674 22.509 22.371 22.215 22.048 21.87 21.675 21.538 21.393 21.156 20.979 20.794 20.703 20.512 20.301 20.07 19.939 19.416 19.525 19.371 19.201 18.8 18.557 18.288 17.999 17.663 17.257 16.736 14.779 -3 ,16671 ,TETRA ,17603554,Sun Nov 28 16:38:17 CET,Sun Nov 28 18:52:45 CET,0.0 1.12 1.474 1.744 1.966 2.159 2.345 2.511 2.795 2.919 3.048 2.894 3.421 3.529 3.736 3.937 4.128 4.223 4.402 4.573 4.823 4.986 5.155 5.402 5.63 5.837 6.043 6.252 6.51 6.76 7.009 7.317 7.626 7.917 8.249 8.632 8.981 9.352 9.766 10.218 10.711 11.29 11.963 12.641 13.421 14.288 15.31 16.504 17.951 19.673 21.678 23.177 23.988 24.42 24.619 24.664 24.657 24.649 24.575 24.438 24.301 24.172 23.999 23.796 23.61 23.438 23.258 23.083 22.921 22.76 22.58 22.416 22.245 22.067 21.923 21.777 21.615 21.437 21.255 21.114 20.956 20.719 20.563 20.393 20.3 20.114 19.925 19.709 19.591 19.067 19.147 18.989 18.829 18.498 18.304 18.063 17.778 17.462 17.051 16.472 14.758 -4 ,28916 ,TETRA ,17603555,Sun Nov 28 16:38:20 CET,Sun Nov 28 18:53:43 CET,0.0 1.289 1.641 1.924 2.158 2.374 2.553 2.708 2.988 3.118 3.243 3.075 3.61 3.726 3.935 4.125 4.315 4.409 4.585 4.758 5.001 5.151 5.3 5.521 5.728 5.924 6.126 6.329 6.583 6.826 7.054 7.345 7.639 7.927 8.262 8.623 8.97 9.355 9.775 10.225 10.692 11.224 11.871 12.533 13.316 14.194 15.233 16.439 17.888 19.607 21.621 23.161 23.932 24.278 24.347 24.3 24.223 24.133 24.019 23.855 23.711 23.572 23.397 23.178 22.964 22.775 22.576 22.411 22.27 22.101 21.921 21.773 21.588 21.378 21.221 21.063 20.886 20.69 20.489 20.351 20.195 19.93 19.748 19.545 19.433 19.2 18.944 18.669 18.521 17.972 18.027 17.839 17.628 17.174 16.926 16.642 16.363 16.05 15.624 15.005 12.998 -5 ,24238 ,TETRA ,17603556,Sun Nov 28 16:38:21 CET,Sun Nov 28 18:52:29 CET,0.0 1.593 1.949 2.194 2.406 2.601 2.768 2.922 3.212 3.341 3.462 3.272 3.797 3.913 4.121 4.325 4.521 4.614 4.8 4.968 5.208 5.375 5.545 5.809 6.057 6.274 6.477 6.668 6.927 7.182 7.425 7.719 8.004 8.279 8.601 8.988 9.365 9.768 10.195 10.656 11.152 11.72 12.405 13.081 13.857 14.755 15.798 16.977 18.398 20.109 22.194 23.882 24.824 25.376 25.647 25.754 25.771 25.748 25.674 25.525 25.405 25.267 25.094 24.948 24.802 24.669 24.54 24.397 24.26 24.096 23.903 23.742 23.559 23.372 23.24 23.08 22.895 22.698 22.472 22.318 22.17 21.952 21.789 21.598 21.5 21.305 21.094 20.845 20.703 20.172 20.238 20.059 19.872 19.483 19.27 19.032 18.764 18.46 18.058 17.481 15.282 -6 ,11760 ,TETRA ,17603557,Sun Nov 28 16:38:17 CET,Sun Nov 28 18:57:23 CET,0.0 0.95 1.283 1.532 1.764 1.995 2.2 2.372 2.655 2.776 2.894 2.709 3.224 3.326 3.542 3.749 3.942 4.037 4.218 4.386 4.628 4.782 4.93 5.146 5.36 5.573 5.772 5.963 6.217 6.464 6.708 7.025 7.33 7.62 7.947 8.308 8.648 9.025 9.47 9.962 10.482 11.058 11.737 12.464 13.323 14.256 15.342 16.544 17.93 19.57 21.537 23.086 23.912 24.383 24.659 24.842 24.906 24.883 24.827 24.731 24.606 24.472 24.321 24.167 24.018 23.87 23.696 23.521 23.358 23.171 22.99 22.821 22.627 22.444 22.298 22.137 21.962 21.775 21.568 21.422 21.274 21.033 20.858 20.657 20.541 20.288 20.031 19.764 19.625 19.105 19.198 19.007 18.792 18.357 18.127 17.841 17.51 17.14 16.692 16.021 13.49 -8 ,5117 ,TETRA ,17603559,Sun Nov 28 16:38:18 CET,Sun Nov 28 18:53:35 CET,0.0 1.222 1.573 1.827 2.04 2.228 2.388 2.533 2.806 2.937 3.06 2.88 3.401 3.503 3.715 3.917 4.104 4.193 4.364 4.536 4.781 4.929 5.07 5.288 5.504 5.708 5.907 6.105 6.371 6.629 6.873 7.177 7.48 7.761 8.081 8.447 8.8 9.181 9.611 10.075 10.547 11.078 11.734 12.429 13.226 14.124 15.193 16.426 17.83 19.469 21.501 23.136 23.915 24.215 24.408 24.548 24.578 24.53 24.473 24.404 24.293 24.151 24.024 23.897 23.729 23.565 23.405 23.238 23.067 22.879 22.686 22.522 22.338 22.137 21.974 21.802 21.623 21.424 21.205 21.043 20.875 20.633 20.485 20.323 20.225 20.009 19.777 19.538 19.417 18.889 18.984 18.838 18.669 18.228 17.967 17.712 17.451 17.132 16.691 16.103 13.601 -9 ,20264 ,TETRA ,17603560,Sun Nov 28 16:38:20 CET,Sun Nov 28 18:52:30 CET,0.0 1.174 1.514 1.742 1.944 2.137 2.312 2.469 2.76 2.897 3.046 2.91 3.438 3.555 3.767 3.958 4.15 4.247 4.431 4.598 4.844 5.008 5.167 5.391 5.601 5.804 6.005 6.201 6.457 6.702 6.93 7.224 7.517 7.788 8.099 8.449 8.783 9.16 9.591 10.055 10.548 11.113 11.783 12.469 13.233 14.106 15.159 16.367 17.786 19.427 21.463 23.156 24.068 24.619 24.955 25.122 25.232 25.236 25.172 25.117 25.02 24.873 24.683 24.475 24.278 24.086 23.889 23.708 23.542 23.365 23.183 23.037 22.894 22.748 22.612 22.446 22.262 22.087 21.928 21.816 21.69 21.499 21.365 21.217 21.134 20.957 20.764 20.541 20.423 19.906 20.032 19.913 19.777 19.432 19.212 18.952 18.676 18.375 18.003 17.473 15.045 -10 ,27201 ,TETRA ,17603561,Sun Nov 28 16:38:17 CET,Sun Nov 28 18:52:30 CET,0.0 1.647 2.005 2.25 2.462 2.674 2.862 3.011 3.276 3.403 3.528 3.365 3.897 4.015 4.232 4.429 4.614 4.706 4.886 5.056 5.3 5.465 5.628 5.855 6.071 6.272 6.471 6.667 6.917 7.168 7.413 7.695 7.973 8.256 8.595 8.97 9.32 9.706 10.125 10.573 11.074 11.642 12.288 12.963 13.757 14.637 15.666 16.851 18.283 20.033 22.137 23.792 24.694 25.197 25.556 25.785 25.826 25.8 25.736 25.639 25.542 25.433 25.274 25.069 24.871 24.694 24.51 24.351 24.217 24.05 23.857 23.718 23.585 23.431 23.289 23.135 22.966 22.791 22.615 22.483 22.347 22.108 21.923 21.73 21.635 21.441 21.232 20.999 20.877 20.374 20.496 20.354 20.202 19.846 19.646 19.412 19.11 18.789 18.425 17.895 15.886 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index e009959e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10724 ,TETRA ,17603562,Sun Nov 28 16:38:20 CET,Sun Nov 28 18:53:17 CET,0.0 1.552 1.957 2.241 2.475 2.679 2.868 3.035 3.324 3.452 3.572 3.406 3.945 4.07 4.3 4.513 4.711 4.801 4.966 5.129 5.372 5.522 5.653 5.843 6.04 6.233 6.422 6.61 6.86 7.112 7.356 7.635 7.895 8.152 8.456 8.804 9.149 9.523 9.941 10.391 10.835 11.322 11.873 12.418 13.069 13.823 14.751 15.813 16.967 18.294 19.852 20.823 21.159 21.147 20.898 20.565 20.213 19.87 19.608 19.378 19.094 18.778 18.497 18.221 17.952 17.696 17.415 17.187 16.996 16.79 16.569 16.391 16.196 15.969 15.777 15.572 15.363 15.147 14.929 14.781 14.625 14.378 14.2 14.006 13.908 13.7 13.473 13.238 13.116 12.584 12.705 12.568 12.431 12.11 11.927 11.732 11.524 11.26 10.897 10.408 8.975 -2 ,17408 ,TETRA ,17603563,Sun Nov 28 16:38:22 CET,Sun Nov 28 18:54:57 CET,0.0 1.267 1.655 1.931 2.154 2.355 2.519 2.67 2.968 3.097 3.213 3.028 3.538 3.64 3.846 4.049 4.239 4.329 4.506 4.682 4.939 5.101 5.251 5.458 5.66 5.854 6.052 6.247 6.481 6.711 6.937 7.212 7.487 7.745 8.044 8.381 8.706 9.058 9.426 9.838 10.287 10.78 11.348 11.927 12.616 13.364 14.148 15.012 15.963 17.036 18.384 19.108 19.3 19.366 19.311 19.168 18.978 18.718 18.461 18.204 17.958 17.741 17.517 17.282 17.051 16.828 16.596 16.371 16.168 15.972 15.761 15.579 15.386 15.164 14.978 14.791 14.602 14.408 14.224 14.096 13.958 13.735 13.57 13.398 13.312 13.134 12.932 12.709 12.586 12.065 12.219 12.074 11.921 11.581 11.388 11.191 10.973 10.711 10.372 9.828 7.81 -3 ,15704 ,TETRA ,17603564,Sun Nov 28 16:38:24 CET,Sun Nov 28 18:54:24 CET,0.0 1.283 1.679 1.978 2.213 2.414 2.586 2.747 3.05 3.19 3.324 3.171 3.705 3.817 4.034 4.231 4.408 4.498 4.682 4.861 5.122 5.29 5.442 5.644 5.857 6.071 6.273 6.472 6.717 6.948 7.177 7.454 7.723 7.989 8.291 8.624 8.943 9.3 9.699 10.138 10.594 11.089 11.692 12.302 12.99 13.742 14.569 15.491 16.539 17.639 18.88 19.714 19.929 19.931 19.822 19.605 19.349 19.085 18.843 18.585 18.331 18.078 17.81 17.552 17.329 17.14 16.922 16.715 16.539 16.346 16.133 15.946 15.748 15.558 15.417 15.267 15.11 14.925 14.725 14.586 14.429 14.192 14.046 13.874 13.781 13.594 13.387 13.18 13.074 12.556 12.705 12.572 12.432 12.104 11.922 11.728 11.497 11.228 10.898 10.459 9.027 -4 ,29790 ,TETRA ,17603565,Sun Nov 28 16:39:13 CET,Sun Nov 28 18:53:43 CET,0.0 1.812 2.234 2.508 2.752 2.96 3.148 3.315 3.619 3.761 3.899 3.743 4.266 4.38 4.588 4.786 4.989 5.082 5.257 5.433 5.693 5.862 6.022 6.251 6.478 6.696 6.902 7.1 7.348 7.596 7.848 8.143 8.426 8.692 9.0 9.365 9.715 10.092 10.499 10.927 11.355 11.834 12.418 12.979 13.627 14.406 15.301 16.261 17.363 18.63 20.114 21.002 21.273 21.321 21.224 20.99 20.7 20.394 20.09 19.761 19.476 19.211 18.92 18.622 18.355 18.112 17.861 17.649 17.463 17.258 17.036 16.854 16.651 16.426 16.256 16.095 15.93 15.738 15.548 15.416 15.268 15.027 14.855 14.67 14.564 14.336 14.09 13.822 13.693 13.163 13.292 13.139 12.977 12.634 12.44 12.218 11.985 11.724 11.368 10.897 8.803 -5 ,3628 ,TETRA ,17603566,Sun Nov 28 16:39:14 CET,Sun Nov 28 18:58:02 CET,0.0 1.45 1.847 2.133 2.378 2.601 2.79 2.955 3.268 3.412 3.543 3.385 3.936 4.064 4.302 4.528 4.735 4.836 5.03 5.213 5.478 5.654 5.834 6.102 6.356 6.588 6.799 6.996 7.258 7.51 7.755 8.054 8.339 8.614 8.927 9.289 9.658 10.057 10.466 10.9 11.371 11.907 12.528 13.148 13.809 14.526 15.375 16.315 17.366 18.523 19.714 20.28 20.37 20.223 19.936 19.626 19.354 19.071 18.771 18.432 18.107 17.803 17.524 17.26 17.015 16.789 16.531 16.307 16.111 15.913 15.719 15.538 15.33 15.124 14.964 14.795 14.613 14.423 14.239 14.11 13.979 13.746 13.569 13.395 13.3 13.094 12.869 12.636 12.515 11.978 12.109 11.956 11.799 11.486 11.3 11.085 10.838 10.567 10.225 9.717 8.209 -6 ,29412 ,TETRA ,17603567,Sun Nov 28 16:39:16 CET,Sun Nov 28 18:58:02 CET,0.0 1.418 1.791 2.061 2.272 2.469 2.633 2.79 3.091 3.234 3.369 3.216 3.749 3.866 4.077 4.282 4.476 4.571 4.772 4.956 5.205 5.37 5.524 5.744 5.96 6.163 6.358 6.554 6.812 7.056 7.28 7.54 7.793 8.04 8.341 8.687 9.019 9.385 9.765 10.166 10.611 11.102 11.663 12.212 12.866 13.62 14.458 15.41 16.55 17.852 19.256 20.18 20.507 20.516 20.413 20.302 20.133 19.824 19.5 19.159 18.865 18.618 18.367 18.132 17.913 17.708 17.504 17.312 17.137 16.952 16.732 16.544 16.338 16.112 15.952 15.789 15.596 15.378 15.161 15.023 14.884 14.666 14.492 14.301 14.208 14.01 13.812 13.605 13.489 12.962 13.1 12.954 12.798 12.433 12.24 12.048 11.818 11.546 11.224 10.785 9.206 -7 ,18529 ,TETRA ,17603568,Sun Nov 28 16:39:14 CET,Sun Nov 28 18:54:44 CET,0.0 1.244 1.63 1.91 2.15 2.358 2.539 2.711 3.022 3.157 3.276 3.112 3.655 3.768 3.982 4.186 4.378 4.468 4.653 4.834 5.082 5.233 5.384 5.618 5.852 6.075 6.286 6.488 6.737 6.982 7.222 7.521 7.82 8.114 8.446 8.816 9.163 9.518 9.909 10.316 10.736 11.231 11.836 12.426 13.092 13.844 14.655 15.503 16.472 17.514 18.586 19.148 19.231 19.102 18.899 18.675 18.422 18.134 17.847 17.55 17.247 16.924 16.571 16.234 15.948 15.69 15.42 15.178 14.96 14.752 14.557 14.367 14.162 13.942 13.739 13.519 13.306 13.087 12.877 12.738 12.584 12.35 12.182 11.998 11.905 11.719 11.504 11.255 11.13 10.607 10.737 10.593 10.44 10.094 9.896 9.69 9.453 9.141 8.763 8.207 6.503 -8 ,8738 ,TETRA ,17603569,Sun Nov 28 16:39:16 CET,Sun Nov 28 18:54:07 CET,0.0 1.063 1.426 1.713 1.972 2.177 2.349 2.509 2.79 2.925 3.064 2.924 3.457 3.576 3.805 4.001 4.188 4.283 4.468 4.648 4.898 5.045 5.194 5.428 5.645 5.849 6.048 6.242 6.477 6.7 6.926 7.203 7.474 7.745 8.062 8.406 8.739 9.11 9.516 9.95 10.397 10.9 11.498 12.07 12.732 13.493 14.33 15.227 16.197 17.298 18.565 19.372 19.64 19.632 19.406 19.084 18.763 18.438 18.146 17.85 17.576 17.305 16.997 16.713 16.478 16.222 15.922 15.66 15.415 15.142 14.856 14.614 14.369 14.124 13.927 13.73 13.529 13.3 13.055 12.902 12.741 12.458 12.251 12.028 11.919 11.709 11.477 11.221 11.085 10.539 10.632 10.457 10.283 9.895 9.676 9.444 9.181 8.885 8.465 7.848 6.058 -9 ,27554 ,TETRA ,17603570,Sun Nov 28 16:39:14 CET,Sun Nov 28 18:54:45 CET,0.0 1.197 1.573 1.85 2.088 2.299 2.498 2.676 2.994 3.137 3.272 3.116 3.645 3.757 3.957 4.146 4.346 4.45 4.645 4.826 5.074 5.238 5.405 5.642 5.865 6.075 6.284 6.488 6.737 6.98 7.224 7.524 7.806 8.071 8.383 8.738 9.079 9.467 9.884 10.31 10.749 11.224 11.783 12.35 12.98 13.673 14.502 15.432 16.474 17.643 18.955 19.716 19.941 20.004 19.872 19.599 19.358 19.098 18.796 18.479 18.183 17.91 17.649 17.398 17.156 16.917 16.65 16.429 16.232 15.997 15.764 15.578 15.388 15.192 15.021 14.84 14.667 14.485 14.279 14.133 13.98 13.737 13.571 13.391 13.296 13.108 12.896 12.661 12.545 12.023 12.166 12.034 11.893 11.568 11.398 11.216 10.997 10.746 10.471 10.068 8.062 -10 ,5390 ,TETRA ,17603571,Sun Nov 28 16:39:14 CET,Sun Nov 28 18:54:39 CET,0.0 1.278 1.67 1.983 2.241 2.444 2.624 2.794 3.1 3.241 3.378 3.227 3.762 3.869 4.087 4.307 4.519 4.614 4.798 4.986 5.257 5.431 5.595 5.821 6.039 6.248 6.445 6.638 6.892 7.133 7.371 7.659 7.928 8.187 8.477 8.8 9.118 9.474 9.858 10.263 10.682 11.143 11.684 12.229 12.867 13.598 14.424 15.335 16.409 17.65 19.078 20.172 20.669 20.807 20.677 20.384 20.068 19.726 19.393 19.062 18.782 18.522 18.266 18.018 17.782 17.553 17.297 17.075 16.886 16.686 16.469 16.266 16.057 15.862 15.714 15.547 15.351 15.139 14.909 14.751 14.602 14.365 14.192 13.999 13.899 13.702 13.471 13.214 13.081 12.542 12.683 12.54 12.39 12.05 11.854 11.626 11.363 11.081 10.729 10.281 8.986 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 3ff67f21..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19324 ,TETRA ,17603572,Sun Nov 28 16:39:15 CET,Sun Nov 28 18:54:12 CET,0.0 1.033 1.36 1.612 1.822 2.017 2.177 2.316 2.573 2.698 2.823 2.636 3.123 3.217 3.371 3.519 3.664 3.745 3.908 4.049 4.239 4.36 4.469 4.62 4.775 4.928 5.072 5.206 5.366 5.524 5.681 5.87 6.057 6.232 6.419 6.618 6.809 7.005 7.204 7.411 7.613 7.847 8.134 8.376 8.605 8.849 9.097 9.302 9.418 9.4 9.086 8.216 7.283 6.476 5.641 4.857 4.219 3.629 3.093 2.552 2.071 1.602 1.16 0.792 0.446 0.117 -0.209 -0.494 -0.756 -1.044 -1.364 -1.641 -1.917 -2.197 -2.408 -2.614 -2.822 -3.046 -3.291 -3.454 -3.622 -3.897 -4.094 -4.312 -4.427 -4.669 -4.924 -5.18 -5.316 -5.855 -5.761 -5.907 -6.079 -6.483 -6.737 -7.027 -7.338 -7.698 -8.1 -8.574 -10.977 -2 ,20734 ,TETRA ,17603573,Sun Nov 28 16:40:13 CET,Sun Nov 28 18:53:52 CET,0.0 1.385 1.759 2.031 2.251 2.453 2.635 2.785 3.042 3.161 3.276 3.126 3.636 3.745 3.953 4.134 4.282 4.347 4.473 4.593 4.78 4.919 5.038 5.194 5.357 5.505 5.649 5.8 5.987 6.152 6.309 6.477 6.63 6.779 6.945 7.135 7.32 7.532 7.761 7.999 8.249 8.511 8.812 9.09 9.326 9.567 9.808 10.022 10.154 10.129 9.83 8.869 7.831 6.888 6.046 5.24 4.492 3.836 3.285 2.68 2.125 1.679 1.244 0.778 0.38 0.037 -0.328 -0.645 -0.92 -1.219 -1.537 -1.796 -2.075 -2.364 -2.587 -2.818 -3.057 -3.301 -3.554 -3.728 -3.91 -4.208 -4.42 -4.63 -4.738 -4.985 -5.264 -5.556 -5.716 -6.267 -6.213 -6.385 -6.564 -7.006 -7.243 -7.505 -7.797 -8.131 -8.549 -9.111 -11.086 -3 ,4405 ,TETRA ,17603574,Sun Nov 28 16:40:13 CET,Sun Nov 28 19:02:32 CET,0.0 1.688 2.046 2.314 2.513 2.684 2.837 2.969 3.216 3.334 3.445 3.258 3.748 3.851 4.035 4.196 4.347 4.422 4.567 4.698 4.872 4.98 5.09 5.249 5.399 5.542 5.678 5.809 5.982 6.167 6.338 6.534 6.739 6.926 7.111 7.302 7.485 7.69 7.926 8.163 8.381 8.618 8.879 9.099 9.36 9.624 9.855 10.02 10.069 9.888 9.293 8.379 7.5 6.691 5.858 5.056 4.418 3.819 3.233 2.625 2.089 1.618 1.179 0.758 0.386 0.057 -0.303 -0.614 -0.878 -1.186 -1.516 -1.79 -2.07 -2.355 -2.576 -2.8 -3.04 -3.289 -3.532 -3.7 -3.878 -4.168 -4.368 -4.565 -4.669 -4.909 -5.159 -5.405 -5.541 -6.088 -6.03 -6.194 -6.367 -6.76 -6.986 -7.255 -7.553 -7.859 -8.282 -8.897 -10.904 -4 ,20899 ,TETRA ,17603575,Sun Nov 28 16:40:13 CET,Sun Nov 28 18:56:17 CET,0.0 1.425 1.797 2.061 2.274 2.443 2.608 2.756 2.98 3.09 3.198 3.001 3.489 3.582 3.752 3.919 4.085 4.164 4.303 4.437 4.641 4.777 4.908 5.08 5.227 5.365 5.516 5.661 5.841 6.015 6.193 6.397 6.587 6.773 6.984 7.211 7.435 7.675 7.896 8.107 8.316 8.519 8.728 8.915 9.121 9.35 9.553 9.687 9.721 9.511 8.994 8.129 7.111 6.164 5.382 4.654 3.985 3.369 2.863 2.356 1.863 1.426 1.029 0.669 0.341 0.021 -0.315 -0.612 -0.878 -1.139 -1.396 -1.63 -1.885 -2.139 -2.331 -2.533 -2.745 -2.957 -3.18 -3.34 -3.51 -3.797 -3.998 -4.187 -4.29 -4.517 -4.753 -5.012 -5.149 -5.681 -5.615 -5.788 -5.961 -6.368 -6.599 -6.841 -7.102 -7.412 -7.772 -8.28 -10.261 -5 ,24418 ,TETRA ,17603576,Sun Nov 28 16:40:13 CET,Sun Nov 28 18:57:04 CET,0.0 1.209 1.53 1.787 1.994 2.158 2.312 2.454 2.7 2.809 2.917 2.737 3.221 3.312 3.487 3.66 3.835 3.918 4.065 4.21 4.411 4.527 4.646 4.813 4.959 5.101 5.25 5.396 5.578 5.751 5.912 6.101 6.28 6.447 6.628 6.813 6.974 7.162 7.382 7.583 7.786 8.039 8.317 8.572 8.854 9.145 9.425 9.717 9.982 10.052 9.688 8.892 8.06 7.245 6.467 5.715 5.059 4.438 3.875 3.309 2.79 2.322 1.89 1.496 1.168 0.866 0.515 0.195 -0.094 -0.386 -0.663 -0.906 -1.173 -1.453 -1.673 -1.909 -2.148 -2.387 -2.643 -2.818 -3.005 -3.301 -3.508 -3.731 -3.845 -4.085 -4.332 -4.598 -4.735 -5.26 -5.213 -5.411 -5.615 -6.111 -6.374 -6.618 -6.891 -7.219 -7.649 -8.212 -10.358 -7 ,7760 ,TETRA ,17603578,Sun Nov 28 16:40:14 CET,Sun Nov 28 18:51:29 CET,0.0 1.044 1.393 1.636 1.827 1.987 2.141 2.301 2.568 2.678 2.785 2.604 3.095 3.2 3.392 3.557 3.713 3.78 3.906 4.031 4.219 4.344 4.459 4.619 4.773 4.912 5.041 5.161 5.322 5.496 5.66 5.841 6.005 6.16 6.344 6.558 6.751 6.948 7.143 7.337 7.549 7.785 8.038 8.246 8.475 8.739 9.045 9.308 9.446 9.437 9.023 8.191 7.375 6.614 5.934 5.256 4.616 4.011 3.465 2.904 2.419 1.982 1.526 1.072 0.661 0.299 -0.073 -0.428 -0.734 -1.043 -1.36 -1.631 -1.932 -2.258 -2.518 -2.777 -3.038 -3.293 -3.547 -3.72 -3.89 -4.159 -4.359 -4.585 -4.699 -4.909 -5.13 -5.365 -5.495 -6.028 -5.952 -6.12 -6.293 -6.651 -6.85 -7.071 -7.317 -7.601 -7.947 -8.418 -10.105 -8 ,332 ,TETRA ,17603579,Sun Nov 28 16:40:15 CET,Sun Nov 28 18:51:39 CET,0.0 1.08 1.435 1.682 1.883 2.045 2.199 2.358 2.649 2.778 2.893 2.704 3.187 3.283 3.478 3.669 3.841 3.919 4.067 4.214 4.421 4.536 4.655 4.84 5.009 5.175 5.342 5.487 5.666 5.846 6.031 6.259 6.459 6.665 6.897 7.117 7.328 7.575 7.848 8.144 8.443 8.758 9.101 9.396 9.74 10.113 10.493 10.896 11.24 11.349 11.132 10.531 9.743 8.943 8.24 7.529 6.844 6.247 5.73 5.175 4.686 4.263 3.882 3.515 3.154 2.816 2.451 2.111 1.82 1.508 1.186 0.932 0.665 0.403 0.194 -0.038 -0.268 -0.508 -0.757 -0.917 -1.073 -1.325 -1.507 -1.704 -1.816 -2.042 -2.282 -2.539 -2.685 -3.238 -3.204 -3.389 -3.574 -3.951 -4.168 -4.407 -4.654 -4.922 -5.252 -5.731 -7.263 -9 ,1573 ,TETRA ,17603580,Sun Nov 28 16:40:13 CET,Sun Nov 28 18:54:23 CET,0.0 1.608 1.977 2.247 2.47 2.661 2.827 2.966 3.207 3.321 3.433 3.262 3.746 3.835 4.028 4.208 4.395 4.486 4.632 4.771 4.973 5.1 5.228 5.413 5.566 5.696 5.82 5.939 6.102 6.266 6.418 6.588 6.758 6.93 7.123 7.331 7.533 7.746 7.953 8.163 8.386 8.613 8.85 9.095 9.358 9.611 9.889 10.084 10.135 10.038 9.6 8.741 7.741 6.786 5.96 5.175 4.475 3.852 3.306 2.77 2.31 1.919 1.552 1.17 0.795 0.45 0.091 -0.228 -0.504 -0.784 -1.079 -1.348 -1.648 -1.951 -2.186 -2.422 -2.655 -2.892 -3.139 -3.321 -3.515 -3.828 -4.045 -4.255 -4.367 -4.62 -4.908 -5.187 -5.329 -5.876 -5.792 -5.952 -6.12 -6.551 -6.806 -7.068 -7.365 -7.71 -8.093 -8.573 -10.507 -10 ,1295 ,TETRA ,17603581,Sun Nov 28 16:40:13 CET,Sun Nov 28 18:53:51 CET,0.0 0.968 1.294 1.541 1.734 1.892 2.038 2.176 2.434 2.553 2.658 2.443 2.919 3.003 3.158 3.303 3.445 3.512 3.643 3.776 3.96 4.064 4.166 4.317 4.452 4.582 4.718 4.846 5.009 5.172 5.324 5.497 5.657 5.813 5.988 6.177 6.376 6.605 6.835 7.047 7.273 7.55 7.86 8.129 8.412 8.744 9.103 9.417 9.634 9.585 9.017 8.065 7.147 6.293 5.459 4.689 4.002 3.294 2.628 2.0 1.48 1.016 0.573 0.142 -0.245 -0.583 -0.926 -1.239 -1.524 -1.807 -2.082 -2.316 -2.576 -2.858 -3.076 -3.3 -3.531 -3.78 -4.032 -4.201 -4.386 -4.689 -4.901 -5.124 -5.238 -5.462 -5.719 -6.024 -6.181 -6.73 -6.668 -6.835 -7.008 -7.404 -7.631 -7.88 -8.151 -8.445 -8.807 -9.301 -11.332 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 16e5d12a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9848 ,TETRA ,17603582,Sun Nov 28 16:40:16 CET,Sun Nov 28 18:54:41 CET,0.0 1.449 1.819 2.116 2.353 2.548 2.697 2.825 3.067 3.182 3.292 3.097 3.575 3.666 3.825 3.959 4.08 4.133 4.237 4.346 4.492 4.582 4.666 4.779 4.899 5.018 5.124 5.22 5.358 5.489 5.61 5.744 5.871 5.997 6.144 6.322 6.506 6.677 6.808 6.931 7.069 7.237 7.374 7.485 7.606 7.658 7.663 7.578 7.27 6.525 5.064 3.244 1.703 0.385 -0.751 -1.833 -2.808 -3.649 -4.349 -5.045 -5.659 -6.192 -6.671 -7.111 -7.541 -7.949 -8.356 -8.73 -9.073 -9.419 -9.757 -10.015 -10.269 -10.542 -10.759 -10.98 -11.202 -11.428 -11.664 -11.833 -12.01 -12.286 -12.488 -12.7 -12.803 -13.011 -13.238 -13.483 -13.611 -14.15 -14.03 -14.19 -14.356 -14.711 -14.913 -15.119 -15.342 -15.618 -15.96 -16.429 -18.164 -2 ,27267 ,TETRA ,17603583,Sun Nov 28 16:40:17 CET,Sun Nov 28 18:54:59 CET,0.0 1.215 1.534 1.789 1.999 2.184 2.382 2.554 2.831 2.957 3.072 2.902 3.393 3.476 3.647 3.805 3.949 4.015 4.131 4.255 4.451 4.576 4.703 4.883 5.041 5.178 5.308 5.447 5.638 5.818 5.969 6.137 6.305 6.441 6.584 6.755 6.919 7.073 7.207 7.334 7.446 7.546 7.626 7.666 7.674 7.673 7.639 7.454 7.076 6.365 4.951 3.08 1.381 -0.013 -1.168 -2.251 -3.199 -4.04 -4.744 -5.442 -6.041 -6.572 -7.082 -7.516 -7.899 -8.262 -8.627 -8.951 -9.232 -9.523 -9.844 -10.121 -10.394 -10.689 -10.918 -11.135 -11.373 -11.636 -11.905 -12.08 -12.264 -12.56 -12.762 -12.982 -13.096 -13.333 -13.587 -13.845 -13.994 -14.558 -14.467 -14.636 -14.813 -15.151 -15.328 -15.528 -15.754 -16.027 -16.357 -16.785 -17.808 -3 ,30761 ,TETRA ,17603584,Sun Nov 28 16:40:19 CET,Sun Nov 28 18:55:11 CET,0.0 1.231 1.568 1.82 2.019 2.213 2.392 2.544 2.805 2.924 3.048 2.881 3.359 3.45 3.622 3.782 3.95 4.025 4.15 4.28 4.461 4.565 4.662 4.812 4.957 5.085 5.216 5.347 5.494 5.619 5.729 5.867 6.005 6.113 6.23 6.364 6.49 6.649 6.806 6.931 7.036 7.116 7.216 7.288 7.33 7.341 7.273 7.058 6.669 6.003 4.594 2.727 1.178 -0.179 -1.34 -2.377 -3.312 -4.149 -4.836 -5.501 -6.09 -6.612 -7.104 -7.564 -7.965 -8.343 -8.749 -9.107 -9.429 -9.76 -10.119 -10.427 -10.73 -11.023 -11.242 -11.47 -11.704 -11.945 -12.199 -12.39 -12.588 -12.882 -13.091 -13.3 -13.402 -13.617 -13.865 -14.113 -14.233 -14.758 -14.614 -14.762 -14.931 -15.305 -15.502 -15.71 -15.929 -16.16 -16.457 -16.883 -18.464 -4 ,5387 ,TETRA ,17603585,Sun Nov 28 16:40:15 CET,Sun Nov 28 18:51:28 CET,0.0 1.682 2.081 2.343 2.56 2.75 2.926 3.074 3.3 3.411 3.525 3.338 3.81 3.888 4.036 4.184 4.33 4.399 4.533 4.652 4.801 4.906 5.016 5.162 5.291 5.404 5.514 5.629 5.799 5.968 6.124 6.291 6.44 6.579 6.719 6.877 7.021 7.192 7.371 7.514 7.645 7.763 7.852 7.936 8.037 8.105 8.09 7.975 7.721 7.161 5.966 4.277 2.724 1.391 0.237 -0.769 -1.623 -2.387 -2.992 -3.624 -4.184 -4.679 -5.148 -5.559 -5.943 -6.301 -6.668 -7.018 -7.328 -7.631 -7.973 -8.264 -8.54 -8.806 -9.015 -9.257 -9.521 -9.801 -10.107 -10.301 -10.484 -10.769 -10.962 -11.162 -11.27 -11.502 -11.734 -11.963 -12.087 -12.629 -12.522 -12.683 -12.842 -13.163 -13.343 -13.546 -13.776 -14.027 -14.325 -14.762 -16.663 -5 ,2196 ,TETRA ,17603586,Sun Nov 28 16:40:16 CET,Sun Nov 28 18:52:17 CET,0.0 1.301 1.645 1.888 2.094 2.277 2.435 2.574 2.844 2.97 3.079 2.893 3.377 3.466 3.642 3.812 3.97 4.045 4.187 4.313 4.502 4.638 4.764 4.924 5.071 5.203 5.335 5.46 5.615 5.769 5.918 6.094 6.26 6.414 6.585 6.768 6.942 7.124 7.288 7.446 7.578 7.712 7.85 7.967 8.106 8.228 8.238 8.102 7.797 7.186 5.941 4.228 2.669 1.339 0.16 -0.888 -1.732 -2.484 -3.14 -3.792 -4.35 -4.859 -5.34 -5.805 -6.244 -6.637 -7.041 -7.389 -7.684 -7.996 -8.309 -8.559 -8.826 -9.094 -9.297 -9.501 -9.715 -9.963 -10.234 -10.416 -10.596 -10.866 -11.049 -11.244 -11.344 -11.553 -11.765 -11.988 -12.109 -12.636 -12.515 -12.664 -12.826 -13.171 -13.371 -13.6 -13.837 -14.092 -14.428 -14.897 -16.236 -6 ,26571 ,TETRA ,17603587,Sun Nov 28 16:40:43 CET,Sun Nov 28 18:59:50 CET,0.0 1.386 1.724 1.984 2.211 2.407 2.568 2.708 2.967 3.083 3.195 3.018 3.506 3.611 3.802 3.962 4.118 4.196 4.348 4.497 4.692 4.803 4.915 5.091 5.269 5.432 5.572 5.694 5.836 5.986 6.141 6.318 6.474 6.639 6.832 7.026 7.199 7.39 7.579 7.745 7.919 8.099 8.294 8.435 8.528 8.595 8.619 8.501 8.079 7.274 5.776 3.862 2.252 0.885 -0.293 -1.331 -2.179 -2.935 -3.606 -4.284 -4.879 -5.448 -5.998 -6.51 -6.975 -7.377 -7.786 -8.142 -8.473 -8.845 -9.203 -9.468 -9.735 -10.003 -10.244 -10.512 -10.785 -11.071 -11.354 -11.545 -11.75 -12.056 -12.262 -12.479 -12.582 -12.781 -12.985 -13.193 -13.311 -13.845 -13.726 -13.88 -14.03 -14.353 -14.551 -14.77 -15.001 -15.248 -15.526 -15.909 -17.172 -7 ,15240 ,TETRA ,17603588,Sun Nov 28 16:40:15 CET,Sun Nov 28 18:55:15 CET,0.0 1.136 1.508 1.782 2.011 2.221 2.396 2.544 2.8 2.918 3.026 2.827 3.306 3.398 3.573 3.73 3.876 3.948 4.076 4.181 4.347 4.45 4.532 4.659 4.803 4.927 5.032 5.135 5.258 5.384 5.506 5.629 5.742 5.844 5.964 6.109 6.257 6.414 6.55 6.657 6.744 6.831 6.917 6.99 7.06 7.06 6.955 6.748 6.338 5.633 4.245 2.376 0.747 -0.657 -1.827 -2.814 -3.637 -4.419 -5.113 -5.797 -6.387 -6.915 -7.425 -7.91 -8.351 -8.746 -9.152 -9.507 -9.822 -10.139 -10.458 -10.73 -11.009 -11.286 -11.496 -11.709 -11.931 -12.166 -12.407 -12.575 -12.754 -13.026 -13.213 -13.415 -13.517 -13.717 -13.935 -14.191 -14.334 -14.884 -14.782 -14.937 -15.096 -15.462 -15.663 -15.873 -16.091 -16.353 -16.729 -17.201 -18.342 -8 ,32728 ,TETRA ,17603589,Sun Nov 28 16:40:15 CET,Sun Nov 28 18:54:52 CET,0.0 1.473 1.802 2.056 2.269 2.442 2.599 2.741 2.995 3.11 3.224 3.068 3.579 3.688 3.889 4.099 4.288 4.371 4.522 4.67 4.886 5.025 5.166 5.361 5.527 5.67 5.803 5.927 6.087 6.251 6.429 6.645 6.836 7.001 7.185 7.386 7.57 7.789 8.026 8.244 8.461 8.69 8.871 8.996 9.157 9.276 9.294 9.218 8.886 8.128 6.704 4.911 3.366 2.035 0.924 -0.068 -0.966 -1.759 -2.466 -3.187 -3.772 -4.277 -4.736 -5.159 -5.572 -5.956 -6.357 -6.718 -7.047 -7.387 -7.733 -8.017 -8.303 -8.6 -8.831 -9.058 -9.299 -9.573 -9.849 -10.035 -10.226 -10.508 -10.711 -10.919 -11.021 -11.234 -11.463 -11.713 -11.851 -12.396 -12.266 -12.417 -12.575 -12.902 -13.099 -13.313 -13.535 -13.789 -14.094 -14.514 -15.761 -9 ,7572 ,TETRA ,17603590,Sun Nov 28 16:40:18 CET,Sun Nov 28 18:55:08 CET,0.0 1.16 1.472 1.703 1.898 2.064 2.216 2.345 2.585 2.695 2.797 2.61 3.091 3.18 3.34 3.493 3.636 3.707 3.849 3.984 4.158 4.27 4.387 4.536 4.682 4.821 4.935 5.046 5.196 5.327 5.428 5.548 5.669 5.794 5.961 6.118 6.232 6.354 6.483 6.629 6.767 6.88 6.969 7.007 7.036 7.06 7.007 6.813 6.431 5.696 4.328 2.549 0.999 -0.343 -1.52 -2.58 -3.518 -4.387 -5.127 -5.883 -6.562 -7.11 -7.605 -8.06 -8.47 -8.854 -9.243 -9.584 -9.875 -10.177 -10.514 -10.807 -11.094 -11.374 -11.585 -11.813 -12.055 -12.305 -12.566 -12.747 -12.951 -13.265 -13.474 -13.696 -13.802 -14.028 -14.257 -14.477 -14.595 -15.133 -15.031 -15.183 -15.351 -15.706 -15.904 -16.115 -16.339 -16.591 -16.894 -17.286 -18.573 -10 ,29609 ,TETRA ,17603591,Sun Nov 28 16:40:19 CET,Sun Nov 28 18:54:25 CET,0.0 1.503 1.88 2.142 2.352 2.549 2.756 2.946 3.224 3.336 3.441 3.25 3.741 3.833 4.013 4.182 4.344 4.427 4.566 4.685 4.863 4.975 5.07 5.212 5.362 5.5 5.622 5.737 5.876 6.009 6.145 6.296 6.434 6.578 6.747 6.938 7.113 7.274 7.436 7.585 7.757 7.955 8.125 8.27 8.418 8.492 8.501 8.438 8.092 7.345 6.054 4.356 2.855 1.565 0.455 -0.524 -1.397 -2.234 -2.959 -3.657 -4.228 -4.722 -5.231 -5.724 -6.159 -6.567 -7.011 -7.396 -7.721 -8.055 -8.375 -8.641 -8.938 -9.235 -9.477 -9.735 -9.992 -10.256 -10.524 -10.704 -10.897 -11.204 -11.409 -11.629 -11.746 -11.971 -12.194 -12.448 -12.58 -13.11 -12.98 -13.131 -13.291 -13.64 -13.84 -14.072 -14.354 -14.677 -15.021 -15.444 -16.843 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index f015de8c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25036 ,TETRA ,17603592,Sun Nov 28 16:40:15 CET,Sun Nov 28 19:00:30 CET,0.0 1.921 2.308 2.579 2.791 2.968 3.125 3.276 3.56 3.692 3.814 3.624 4.121 4.218 4.405 4.586 4.764 4.854 5.027 5.181 5.391 5.526 5.659 5.857 6.045 6.23 6.404 6.568 6.783 6.979 7.17 7.404 7.618 7.83 8.081 8.346 8.592 8.87 9.187 9.525 9.863 10.235 10.683 11.133 11.643 12.217 12.838 13.514 14.316 15.238 16.131 16.669 16.907 16.905 16.777 16.604 16.421 16.254 16.093 15.916 15.756 15.612 15.442 15.256 15.089 14.937 14.773 14.62 14.482 14.348 14.202 14.062 13.922 13.774 13.646 13.528 13.406 13.261 13.12 13.03 12.931 12.765 12.657 12.55 12.488 12.349 12.192 12.018 11.931 11.455 11.663 11.566 11.445 11.179 11.037 10.887 10.717 10.51 10.271 9.953 8.724 -3 ,23226 ,TETRA ,17603594,Sun Nov 28 16:40:21 CET,Sun Nov 28 18:56:01 CET,0.0 1.409 1.736 1.999 2.2 2.379 2.545 2.685 2.932 3.053 3.179 3.021 3.522 3.621 3.814 3.997 4.175 4.259 4.415 4.562 4.786 4.945 5.097 5.3 5.48 5.646 5.816 5.982 6.189 6.386 6.577 6.81 7.035 7.265 7.529 7.811 8.084 8.377 8.708 9.063 9.393 9.757 10.192 10.64 11.145 11.682 12.287 12.924 13.684 14.532 15.426 16.037 16.16 16.056 15.921 15.779 15.595 15.393 15.221 15.038 14.849 14.677 14.491 14.302 14.141 13.992 13.834 13.679 13.536 13.39 13.225 13.086 12.943 12.768 12.638 12.514 12.364 12.212 12.066 11.956 11.833 11.625 11.485 11.353 11.281 11.116 10.941 10.764 10.674 10.192 10.384 10.276 10.161 9.902 9.734 9.533 9.322 9.105 8.853 8.511 7.283 -4 ,15532 ,TETRA ,17603595,Sun Nov 28 16:40:16 CET,Sun Nov 28 18:54:42 CET,0.0 1.267 1.678 1.963 2.177 2.376 2.55 2.711 3.011 3.15 3.284 3.12 3.624 3.724 3.904 4.078 4.249 4.33 4.488 4.636 4.841 4.973 5.096 5.278 5.457 5.637 5.818 5.997 6.237 6.481 6.701 6.94 7.169 7.388 7.632 7.895 8.157 8.452 8.742 9.056 9.409 9.782 10.198 10.622 11.112 11.648 12.294 13.01 13.785 14.655 15.509 16.001 16.184 16.176 16.072 15.942 15.812 15.654 15.475 15.258 15.071 14.911 14.728 14.551 14.384 14.212 14.024 13.856 13.705 13.547 13.394 13.278 13.148 13.001 12.884 12.752 12.617 12.48 12.332 12.231 12.133 11.96 11.83 11.695 11.623 11.483 11.308 11.092 10.991 10.504 10.685 10.585 10.486 10.23 10.075 9.905 9.706 9.484 9.224 8.853 7.475 -5 ,1555 ,TETRA ,17603596,Sun Nov 28 16:40:19 CET,Sun Nov 28 18:54:32 CET,0.0 1.449 1.805 2.05 2.248 2.416 2.577 2.735 3.01 3.13 3.257 3.107 3.611 3.707 3.897 4.084 4.267 4.353 4.516 4.673 4.911 5.072 5.226 5.437 5.628 5.818 6.011 6.196 6.408 6.6 6.796 7.028 7.254 7.471 7.703 7.947 8.191 8.477 8.781 9.102 9.445 9.834 10.286 10.713 11.19 11.759 12.432 13.177 13.982 14.816 15.685 16.263 16.475 16.446 16.251 16.004 15.787 15.581 15.389 15.202 15.043 14.873 14.706 14.542 14.363 14.195 14.027 13.876 13.738 13.59 13.433 13.291 13.137 12.977 12.85 12.718 12.57 12.417 12.25 12.126 12.009 11.841 11.716 11.571 11.501 11.333 11.15 10.974 10.877 10.386 10.561 10.439 10.314 10.054 9.906 9.746 9.565 9.372 9.131 8.791 7.655 -6 ,23445 ,TETRA ,17603597,Sun Nov 28 16:40:16 CET,Sun Nov 28 18:52:56 CET,0.0 1.418 1.789 2.063 2.298 2.499 2.684 2.844 3.143 3.277 3.395 3.217 3.713 3.811 3.997 4.172 4.329 4.407 4.583 4.743 4.946 5.082 5.214 5.409 5.598 5.786 5.966 6.117 6.319 6.52 6.704 6.918 7.127 7.327 7.55 7.818 8.092 8.385 8.682 8.996 9.321 9.69 10.129 10.56 11.048 11.563 12.153 12.815 13.572 14.421 15.307 15.873 16.041 16.008 15.881 15.713 15.519 15.28 15.074 14.861 14.655 14.459 14.28 14.123 13.958 13.804 13.643 13.492 13.363 13.224 13.058 12.906 12.754 12.607 12.494 12.361 12.219 12.09 11.947 11.842 11.717 11.524 11.407 11.276 11.213 11.09 10.958 10.82 10.745 10.282 10.497 10.398 10.29 10.06 9.922 9.751 9.56 9.354 9.084 8.737 7.516 -7 ,9938 ,TETRA ,17603598,Sun Nov 28 16:40:18 CET,Sun Nov 28 18:53:13 CET,0.0 1.177 1.529 1.835 2.07 2.269 2.447 2.627 2.93 3.045 3.168 3.01 3.511 3.62 3.825 4.023 4.201 4.287 4.447 4.592 4.812 4.952 5.078 5.272 5.465 5.634 5.791 5.946 6.139 6.338 6.526 6.741 6.959 7.181 7.432 7.705 7.976 8.265 8.564 8.893 9.245 9.655 10.142 10.626 11.158 11.705 12.329 13.046 13.832 14.661 15.59 16.164 16.347 16.37 16.268 16.122 15.952 15.799 15.676 15.516 15.362 15.208 15.042 14.882 14.725 14.562 14.378 14.214 14.063 13.906 13.746 13.607 13.471 13.335 13.227 13.116 12.995 12.865 12.725 12.621 12.512 12.328 12.196 12.068 12.002 11.858 11.714 11.551 11.46 10.976 11.16 11.054 10.934 10.646 10.479 10.302 10.122 9.92 9.679 9.358 8.134 -8 ,30581 ,TETRA ,17603599,Sun Nov 28 16:40:21 CET,Sun Nov 28 18:53:31 CET,0.0 1.17 1.508 1.762 1.971 2.151 2.304 2.455 2.752 2.887 3.007 2.815 3.311 3.408 3.598 3.777 3.956 4.046 4.215 4.373 4.603 4.747 4.882 5.069 5.254 5.448 5.642 5.811 6.015 6.214 6.398 6.621 6.842 7.052 7.299 7.561 7.807 8.089 8.384 8.685 9.004 9.377 9.818 10.245 10.738 11.304 11.956 12.677 13.474 14.333 15.27 15.803 15.888 15.857 15.773 15.662 15.534 15.37 15.207 15.025 14.819 14.622 14.424 14.243 14.102 13.953 13.786 13.634 13.487 13.348 13.211 13.076 12.933 12.785 12.669 12.542 12.417 12.298 12.164 12.071 11.972 11.82 11.717 11.599 11.537 11.398 11.238 11.064 10.972 10.496 10.692 10.579 10.455 10.191 10.06 9.919 9.758 9.557 9.294 8.894 7.664 -9 ,19285 ,TETRA ,17603600,Sun Nov 28 16:40:22 CET,Sun Nov 28 18:53:57 CET,0.0 1.038 1.397 1.637 1.825 2.002 2.167 2.328 2.608 2.74 2.862 2.676 3.17 3.263 3.435 3.6 3.767 3.851 4.008 4.15 4.36 4.497 4.63 4.827 5.001 5.161 5.317 5.47 5.68 5.891 6.09 6.323 6.542 6.752 7.003 7.282 7.545 7.845 8.166 8.492 8.817 9.182 9.645 10.105 10.6 11.133 11.735 12.412 13.189 14.029 14.856 15.289 15.38 15.33 15.216 15.061 14.868 14.641 14.418 14.183 13.979 13.794 13.617 13.443 13.262 13.095 12.913 12.745 12.594 12.422 12.236 12.09 11.955 11.808 11.685 11.557 11.422 11.273 11.106 10.994 10.877 10.698 10.569 10.425 10.352 10.204 10.047 9.887 9.803 9.323 9.52 9.407 9.294 9.061 8.922 8.766 8.592 8.39 8.153 7.827 6.837 -10 ,27770 ,TETRA ,17603601,Sun Nov 28 16:40:16 CET,Sun Nov 28 18:54:14 CET,0.0 1.101 1.456 1.719 1.936 2.126 2.295 2.451 2.732 2.851 2.971 2.79 3.277 3.369 3.548 3.716 3.889 3.977 4.127 4.268 4.479 4.61 4.733 4.922 5.111 5.282 5.44 5.594 5.798 6.003 6.194 6.412 6.638 6.865 7.106 7.372 7.634 7.917 8.216 8.521 8.835 9.19 9.618 10.083 10.632 11.208 11.862 12.597 13.449 14.394 15.366 15.969 16.172 16.18 16.088 15.967 15.849 15.709 15.546 15.357 15.196 15.044 14.869 14.696 14.535 14.374 14.188 14.029 13.892 13.735 13.571 13.437 13.292 13.142 13.03 12.919 12.797 12.663 12.526 12.423 12.311 12.133 12.007 11.885 11.826 11.704 11.558 11.399 11.32 10.842 11.031 10.928 10.81 10.524 10.374 10.221 10.042 9.826 9.526 9.138 7.988 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt deleted file mode 100644 index 4bf55d25..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28158 ,TETRA ,17603602,Sun Nov 28 16:40:17 CET,Sun Nov 28 18:52:14 CET,0.0 1.392 1.956 2.455 2.871 3.253 3.605 3.92 4.535 4.83 5.106 5.112 5.92 6.177 6.704 7.235 7.744 7.996 8.477 8.946 9.652 10.125 10.597 11.299 11.995 12.672 13.327 13.965 14.811 15.658 16.5 17.542 18.573 19.593 20.791 22.175 23.564 25.136 26.883 28.784 30.845 33.262 36.241 39.413 43.277 47.767 53.204 59.736 67.962 78.617 93.27 107.272 116.662 123.549 128.722 132.774 135.941 138.53 140.567 142.414 143.851 145.023 146.078 147.009 147.807 148.484 149.122 149.647 150.081 150.507 150.904 151.189 151.465 151.737 151.92 152.087 152.245 152.399 152.55 152.616 152.667 152.72 152.721 152.738 152.752 152.718 152.646 152.554 152.496 152.045 152.199 152.066 151.917 151.52 151.247 150.904 150.526 150.029 149.295 148.185 141.507 -2 ,21847 ,TETRA ,17603603,Sun Nov 28 16:40:17 CET,Sun Nov 28 18:53:38 CET,0.0 1.551 2.137 2.579 2.979 3.363 3.707 4.024 4.645 4.947 5.238 5.256 6.059 6.321 6.843 7.358 7.847 8.084 8.551 9.015 9.699 10.148 10.598 11.264 11.922 12.57 13.209 13.845 14.69 15.529 16.36 17.382 18.399 19.419 20.63 22.063 23.488 25.054 26.796 28.714 30.794 33.21 36.183 39.306 43.101 47.558 53.042 59.671 67.95 78.583 93.008 106.86 116.415 123.35 128.483 132.529 135.687 138.289 140.37 142.245 143.704 144.911 145.944 146.846 147.649 148.324 148.955 149.472 149.896 150.321 150.758 151.086 151.352 151.585 151.75 151.91 152.07 152.199 152.316 152.395 152.461 152.534 152.565 152.595 152.603 152.599 152.58 152.523 152.471 152.034 152.252 152.139 152.004 151.63 151.366 151.07 150.733 150.329 149.731 148.8 140.059 -4 ,25710 ,TETRA ,17603605,Sun Nov 28 16:40:21 CET,Sun Nov 28 18:52:39 CET,0.0 1.378 1.974 2.454 2.851 3.197 3.532 3.867 4.491 4.768 5.037 5.036 5.834 6.095 6.617 7.118 7.601 7.839 8.303 8.773 9.482 9.947 10.406 11.065 11.712 12.373 13.034 13.684 14.534 15.37 16.195 17.221 18.23 19.229 20.43 21.826 23.21 24.776 26.519 28.428 30.501 32.922 35.853 38.918 42.628 46.965 52.276 58.671 66.761 77.247 91.626 105.419 114.743 121.522 126.6 130.62 133.757 136.357 138.442 140.347 141.832 143.037 144.113 145.069 145.89 146.6 147.289 147.835 148.286 148.721 149.136 149.453 149.739 150.017 150.214 150.41 150.615 150.781 150.883 150.932 150.989 151.076 151.098 151.103 151.087 151.021 150.963 150.843 150.767 150.32 150.545 150.477 150.371 150.076 149.838 149.542 149.206 148.742 148.096 147.039 135.86 -6 ,21155 ,TETRA ,17603607,Sun Nov 28 16:40:44 CET,Sun Nov 28 18:52:25 CET,0.0 1.5 2.057 2.523 2.924 3.281 3.63 3.986 4.643 4.938 5.227 5.265 6.082 6.348 6.881 7.409 7.926 8.176 8.662 9.147 9.865 10.338 10.801 11.485 12.166 12.828 13.486 14.14 15.001 15.847 16.677 17.697 18.702 19.712 20.912 22.289 23.667 25.228 26.952 28.852 30.941 33.395 36.364 39.465 43.253 47.711 53.122 59.614 67.891 78.52 92.853 106.533 115.818 122.575 127.672 131.693 134.837 137.429 139.464 141.336 142.799 144.003 145.082 146.025 146.834 147.507 148.152 148.707 149.158 149.59 150.011 150.328 150.646 150.968 151.187 151.364 151.506 151.627 151.753 151.834 151.916 152.025 152.051 152.074 152.086 152.086 152.033 151.942 151.876 151.412 151.597 151.482 151.363 151.14 150.967 150.712 150.431 150.076 149.649 148.965 141.84 -7 ,14589 ,TETRA ,17603608,Sun Nov 28 16:40:46 CET,Sun Nov 28 18:51:30 CET,0.0 1.462 2.011 2.489 2.919 3.299 3.656 3.983 4.577 4.861 5.138 5.117 5.902 6.159 6.676 7.18 7.678 7.922 8.409 8.895 9.595 10.048 10.509 11.197 11.867 12.523 13.16 13.802 14.662 15.508 16.348 17.377 18.394 19.414 20.628 22.028 23.414 24.963 26.683 28.582 30.66 33.104 36.048 39.106 42.89 47.369 52.815 59.399 67.724 78.556 93.381 107.443 116.942 123.922 129.193 133.331 136.546 139.171 141.241 143.122 144.61 145.824 146.894 147.872 148.737 149.46 150.146 150.688 151.116 151.527 151.916 152.215 152.497 152.759 152.936 153.115 153.287 153.412 153.485 153.522 153.564 153.61 153.622 153.588 153.555 153.449 153.27 153.08 153.008 152.588 152.807 152.676 152.527 152.191 151.975 151.729 151.439 151.041 150.486 149.672 144.777 -8 ,27615 ,TETRA ,17603609,Sun Nov 28 16:40:44 CET,Sun Nov 28 18:50:35 CET,0.0 1.795 2.288 2.72 3.117 3.497 3.846 4.157 4.739 5.017 5.291 5.311 6.112 6.367 6.867 7.346 7.822 8.064 8.523 8.967 9.643 10.095 10.544 11.208 11.851 12.495 13.146 13.79 14.636 15.463 16.285 17.306 18.314 19.316 20.506 21.867 23.226 24.772 26.483 28.37 30.442 32.869 35.805 38.91 42.708 47.155 52.596 59.161 67.417 78.036 92.563 106.524 116.011 123.004 128.282 132.381 135.585 138.195 140.26 142.171 143.679 144.911 145.979 146.9 147.703 148.398 149.068 149.618 150.064 150.513 150.934 151.253 151.577 151.87 152.08 152.279 152.458 152.625 152.757 152.839 152.914 153.006 153.052 153.034 152.996 152.929 152.881 152.795 152.711 152.239 152.46 152.384 152.284 152.004 151.839 151.648 151.411 151.07 150.559 149.773 143.284 -9 ,28653 ,TETRA ,17603610,Sun Nov 28 16:40:46 CET,Sun Nov 28 18:51:24 CET,0.0 1.511 2.051 2.494 2.874 3.249 3.604 3.92 4.509 4.805 5.107 5.152 5.973 6.243 6.784 7.311 7.826 8.08 8.575 9.058 9.776 10.253 10.72 11.399 12.071 12.74 13.397 14.043 14.891 15.738 16.583 17.619 18.65 19.706 20.941 22.312 23.678 25.244 26.976 28.853 30.913 33.338 36.267 39.348 43.158 47.631 53.105 59.705 67.963 78.646 93.291 107.203 116.512 123.293 128.424 132.435 135.539 138.06 140.021 141.838 143.274 144.424 145.443 146.37 147.168 147.844 148.496 149.009 149.402 149.794 150.199 150.487 150.764 151.031 151.212 151.4 151.551 151.674 151.812 151.875 151.91 152.003 152.066 152.083 152.08 152.025 151.909 151.826 151.768 151.317 151.558 151.451 151.329 150.968 150.707 150.43 150.112 149.722 149.144 148.141 135.598 -10 ,9279 ,TETRA ,17603611,Sun Nov 28 16:40:43 CET,Sun Nov 28 18:52:27 CET,0.0 1.453 2.011 2.487 2.888 3.253 3.606 3.942 4.564 4.851 5.135 5.148 5.956 6.225 6.755 7.257 7.75 7.997 8.485 8.959 9.649 10.107 10.568 11.247 11.913 12.572 13.228 13.883 14.74 15.585 16.428 17.471 18.495 19.517 20.74 22.15 23.546 25.122 26.878 28.794 30.887 33.333 36.294 39.417 43.224 47.669 53.107 59.659 67.972 78.7 93.147 107.069 116.567 123.409 128.523 132.516 135.653 138.252 140.282 142.101 143.528 144.724 145.802 146.754 147.572 148.272 148.939 149.481 149.92 150.34 150.733 151.044 151.345 151.618 151.81 151.996 152.176 152.335 152.484 152.559 152.597 152.658 152.695 152.727 152.735 152.693 152.609 152.52 152.471 152.049 152.281 152.186 152.049 151.716 151.499 151.243 150.908 150.431 149.798 148.933 144.679 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt deleted file mode 100644 index cdacae78..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17235 ,TETRA ,17603612,Sun Nov 28 16:40:46 CET,Sun Nov 28 18:55:23 CET,0.0 1.984 2.554 3.016 3.405 3.726 4.013 4.283 4.783 5.025 5.261 5.167 5.908 6.103 6.49 6.865 7.218 7.389 7.747 8.113 8.62 8.942 9.267 9.738 10.201 10.647 11.08 11.514 12.082 12.636 13.19 13.876 14.528 15.17 15.943 16.816 17.681 18.672 19.751 20.91 22.175 23.611 25.335 27.141 29.313 31.831 34.794 38.274 42.588 48.002 55.207 61.786 66.02 68.929 70.993 72.503 73.635 74.568 75.254 75.839 76.256 76.548 76.784 77.001 77.191 77.316 77.396 77.454 77.493 77.511 77.501 77.466 77.412 77.36 77.313 77.245 77.168 77.069 76.95 76.853 76.751 76.575 76.442 76.299 76.218 76.065 75.889 75.689 75.579 74.984 75.19 75.035 74.863 74.486 74.235 73.931 73.6 73.229 72.76 72.049 68.876 -2 ,21080 ,TETRA ,17603613,Sun Nov 28 16:40:44 CET,Sun Nov 28 18:55:01 CET,0.0 1.946 2.464 2.893 3.231 3.546 3.835 4.096 4.625 4.89 5.138 5.046 5.806 6.018 6.429 6.81 7.181 7.371 7.722 8.052 8.542 8.862 9.182 9.652 10.124 10.592 11.046 11.487 12.047 12.596 13.128 13.781 14.444 15.098 15.859 16.736 17.6 18.574 19.641 20.785 22.001 23.424 25.136 26.914 29.073 31.557 34.587 38.187 42.615 48.137 55.33 61.802 65.946 68.788 70.733 72.179 73.272 74.146 74.787 75.326 75.746 76.077 76.34 76.548 76.679 76.75 76.816 76.872 76.915 76.931 76.927 76.917 76.882 76.844 76.794 76.707 76.607 76.493 76.366 76.286 76.207 76.063 75.955 75.834 75.777 75.614 75.366 75.129 75.018 74.403 74.542 74.374 74.209 73.789 73.54 73.248 72.888 72.498 72.015 71.335 68.764 -3 ,19544 ,TETRA ,17603614,Sun Nov 28 16:40:45 CET,Sun Nov 28 19:01:07 CET,0.0 1.869 2.398 2.803 3.169 3.487 3.78 4.058 4.576 4.822 5.054 4.958 5.726 5.94 6.359 6.755 7.119 7.297 7.652 8.013 8.533 8.852 9.159 9.609 10.056 10.513 10.965 11.383 11.93 12.466 12.989 13.647 14.293 14.918 15.647 16.489 17.327 18.267 19.29 20.403 21.621 23.046 24.754 26.504 28.623 31.08 34.055 37.573 41.883 47.383 54.656 61.256 65.45 68.336 70.445 72.062 73.236 74.096 74.746 75.322 75.736 76.063 76.337 76.539 76.668 76.764 76.873 76.937 76.955 76.947 76.914 76.888 76.84 76.758 76.688 76.624 76.556 76.46 76.343 76.244 76.126 75.951 75.801 75.614 75.518 75.323 75.13 74.921 74.815 74.224 74.395 74.227 74.056 73.635 73.352 73.033 72.674 72.233 71.706 70.929 68.442 -4 ,11129 ,TETRA ,17603615,Sun Nov 28 16:40:45 CET,Sun Nov 28 18:54:42 CET,0.0 1.526 2.059 2.472 2.849 3.181 3.463 3.719 4.225 4.458 4.676 4.558 5.305 5.501 5.903 6.292 6.658 6.834 7.182 7.514 7.994 8.312 8.617 9.069 9.522 9.978 10.419 10.841 11.391 11.924 12.447 13.079 13.72 14.359 15.103 15.971 16.839 17.807 18.882 20.056 21.301 22.753 24.509 26.303 28.421 30.842 33.732 37.2 41.48 46.759 53.707 59.914 63.912 66.726 68.774 70.27 71.344 72.207 72.827 73.315 73.684 73.976 74.209 74.394 74.533 74.609 74.649 74.666 74.675 74.684 74.658 74.608 74.549 74.477 74.408 74.331 74.228 74.098 73.952 73.844 73.738 73.54 73.361 73.165 73.073 72.883 72.675 72.468 72.364 71.781 71.95 71.772 71.561 71.066 70.792 70.479 70.101 69.659 69.13 68.422 65.951 -5 ,15250 ,TETRA ,17603616,Sun Nov 28 16:40:47 CET,Sun Nov 28 18:54:39 CET,0.0 1.852 2.373 2.802 3.174 3.492 3.79 4.059 4.565 4.814 5.047 4.937 5.677 5.877 6.263 6.636 6.997 7.167 7.512 7.847 8.326 8.648 8.974 9.447 9.896 10.337 10.762 11.183 11.745 12.292 12.837 13.506 14.151 14.771 15.501 16.349 17.176 18.124 19.184 20.338 21.597 23.036 24.738 26.522 28.67 31.098 33.998 37.498 41.902 47.425 54.526 61.051 65.395 68.337 70.415 72.07 73.32 74.205 74.816 75.317 75.715 76.073 76.348 76.569 76.76 76.924 77.07 77.139 77.182 77.207 77.204 77.181 77.129 77.077 77.031 76.973 76.882 76.757 76.615 76.532 76.435 76.277 76.161 75.993 75.905 75.731 75.508 75.244 75.113 74.506 74.678 74.514 74.343 73.989 73.787 73.52 73.188 72.799 72.289 71.605 69.003 -6 ,6755 ,TETRA ,17603617,Sun Nov 28 16:40:45 CET,Sun Nov 28 18:54:23 CET,0.0 1.326 1.838 2.217 2.586 2.938 3.273 3.583 4.114 4.368 4.61 4.53 5.288 5.498 5.89 6.267 6.639 6.825 7.2 7.553 8.054 8.38 8.696 9.162 9.624 10.076 10.515 10.943 11.505 12.079 12.663 13.373 14.046 14.702 15.475 16.37 17.26 18.237 19.305 20.461 21.706 23.15 24.886 26.665 28.761 31.193 34.148 37.631 41.96 47.401 54.561 61.118 65.313 68.214 70.278 71.849 73.049 73.893 74.496 75.089 75.537 75.86 76.117 76.344 76.522 76.62 76.686 76.752 76.802 76.834 76.834 76.813 76.765 76.702 76.677 76.652 76.569 76.448 76.33 76.248 76.154 76.009 75.903 75.782 75.72 75.582 75.397 75.187 75.093 74.518 74.689 74.52 74.335 73.88 73.61 73.342 73.043 72.641 72.142 71.478 68.78 -7 ,3198 ,TETRA ,17603618,Sun Nov 28 16:41:42 CET,Sun Nov 28 19:00:51 CET,0.0 2.216 2.812 3.294 3.657 3.981 4.282 4.56 5.074 5.312 5.551 5.461 6.215 6.42 6.805 7.186 7.545 7.725 8.073 8.404 8.909 9.242 9.559 10.009 10.442 10.879 11.323 11.75 12.293 12.829 13.368 14.037 14.701 15.347 16.076 16.9 17.724 18.667 19.718 20.87 22.102 23.54 25.276 27.061 29.25 31.769 34.747 38.252 42.566 48.001 55.128 61.603 65.847 68.835 70.969 72.581 73.804 74.692 75.282 75.803 76.197 76.471 76.705 76.923 77.089 77.198 77.249 77.289 77.327 77.311 77.253 77.211 77.162 77.073 77.016 76.968 76.903 76.828 76.723 76.637 76.557 76.413 76.297 76.167 76.088 75.922 75.748 75.566 75.46 74.862 75.043 74.882 74.706 74.303 74.061 73.792 73.491 73.084 72.574 71.829 68.861 -8 ,14723 ,TETRA ,17603619,Sun Nov 28 16:41:44 CET,Sun Nov 28 19:00:25 CET,0.0 1.851 2.446 2.9 3.258 3.584 3.886 4.163 4.697 4.947 5.184 5.085 5.83 6.033 6.435 6.816 7.185 7.368 7.715 8.059 8.567 8.886 9.197 9.668 10.12 10.55 10.98 11.41 11.97 12.525 13.067 13.724 14.377 15.026 15.795 16.671 17.521 18.491 19.554 20.695 21.939 23.37 25.081 26.85 29.004 31.492 34.494 38.072 42.494 47.966 54.863 61.085 65.021 67.653 69.512 70.872 71.856 72.654 73.283 73.789 74.095 74.299 74.463 74.577 74.638 74.667 74.685 74.676 74.646 74.586 74.486 74.416 74.353 74.242 74.14 74.033 73.896 73.737 73.58 73.473 73.341 73.118 72.968 72.799 72.711 72.541 72.341 72.102 71.979 71.383 71.543 71.384 71.204 70.752 70.509 70.248 69.955 69.628 69.173 68.461 66.245 -9 ,16248 ,TETRA ,17603620,Sun Nov 28 16:41:44 CET,Sun Nov 28 18:58:02 CET,0.0 2.157 2.687 3.106 3.449 3.742 4.007 4.268 4.785 5.019 5.23 5.106 5.868 6.083 6.479 6.872 7.255 7.443 7.822 8.185 8.683 9.001 9.317 9.778 10.22 10.655 11.087 11.503 12.059 12.606 13.134 13.787 14.415 15.031 15.773 16.649 17.508 18.471 19.527 20.661 21.881 23.287 25.009 26.797 28.94 31.432 34.378 37.806 42.087 47.505 54.569 60.921 65.002 67.886 69.952 71.495 72.641 73.54 74.221 74.806 75.214 75.511 75.748 75.949 76.113 76.234 76.341 76.405 76.436 76.438 76.42 76.402 76.373 76.334 76.296 76.238 76.156 76.072 75.986 75.92 75.836 75.665 75.519 75.371 75.303 75.161 74.996 74.791 74.679 74.1 74.296 74.139 73.978 73.624 73.409 73.163 72.873 72.526 72.117 71.469 68.24 -10 ,30458 ,TETRA ,17603621,Sun Nov 28 16:41:44 CET,Sun Nov 28 18:54:50 CET,0.0 1.99 2.556 3.005 3.41 3.745 4.039 4.325 4.819 5.051 5.29 5.213 5.967 6.184 6.588 6.976 7.351 7.537 7.905 8.249 8.745 9.068 9.394 9.892 10.366 10.806 11.248 11.682 12.246 12.81 13.368 14.066 14.727 15.36 16.116 16.994 17.871 18.858 19.936 21.087 22.317 23.718 25.413 27.183 29.314 31.811 34.754 38.168 42.395 47.737 54.774 61.15 65.221 67.992 69.947 71.421 72.542 73.4 74.01 74.532 74.92 75.186 75.377 75.54 75.683 75.799 75.862 75.899 75.94 75.957 75.963 75.971 75.943 75.862 75.769 75.665 75.57 75.452 75.312 75.207 75.084 74.91 74.772 74.607 74.522 74.318 74.083 73.831 73.694 73.098 73.303 73.135 72.94 72.5 72.237 71.938 71.59 71.138 70.559 69.724 66.957 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt deleted file mode 100644 index 7629f9d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6502 ,TETRA ,17603622,Sun Nov 28 16:41:44 CET,Sun Nov 28 18:59:25 CET,0.0 2.216 2.711 3.106 3.432 3.698 3.956 4.151 4.483 4.639 4.773 4.658 5.115 5.217 5.412 5.584 5.751 5.831 5.969 6.103 6.309 6.437 6.559 6.738 6.912 7.069 7.213 7.354 7.508 7.654 7.792 7.957 8.123 8.27 8.426 8.58 8.716 8.865 9.012 9.15 9.295 9.476 9.665 9.802 9.932 10.038 10.088 10.006 9.733 9.126 7.955 6.511 5.315 4.258 3.309 2.465 1.702 1.046 0.531 -0.01 -0.525 -0.973 -1.368 -1.746 -2.113 -2.439 -2.784 -3.094 -3.347 -3.616 -3.894 -4.117 -4.354 -4.607 -4.8 -4.999 -5.209 -5.427 -5.659 -5.823 -5.989 -6.241 -6.42 -6.616 -6.719 -6.921 -7.133 -7.366 -7.491 -7.993 -7.933 -8.095 -8.252 -8.599 -8.805 -9.036 -9.331 -9.658 -10.037 -10.534 -12.341 -2 ,6172 ,TETRA ,17603623,Sun Nov 28 16:41:44 CET,Sun Nov 28 19:00:37 CET,0.0 2.289 2.826 3.212 3.508 3.755 3.958 4.142 4.5 4.648 4.771 4.647 5.113 5.214 5.399 5.578 5.731 5.801 5.941 6.068 6.241 6.366 6.497 6.66 6.813 6.97 7.118 7.247 7.406 7.553 7.718 7.94 8.124 8.286 8.475 8.659 8.818 8.978 9.137 9.31 9.467 9.634 9.839 10.012 10.126 10.213 10.287 10.286 10.124 9.689 8.755 7.401 6.152 4.981 3.984 3.079 2.28 1.583 1.011 0.446 -0.054 -0.519 -0.975 -1.379 -1.752 -2.094 -2.441 -2.761 -3.049 -3.345 -3.653 -3.902 -4.146 -4.396 -4.599 -4.817 -5.041 -5.265 -5.492 -5.645 -5.806 -6.062 -6.251 -6.453 -6.559 -6.789 -7.014 -7.247 -7.374 -7.882 -7.814 -7.964 -8.122 -8.499 -8.691 -8.877 -9.103 -9.392 -9.725 -10.158 -11.983 -3 ,28912 ,TETRA ,17603624,Sun Nov 28 16:41:44 CET,Sun Nov 28 19:00:19 CET,0.0 2.542 3.066 3.361 3.587 3.817 4.034 4.251 4.641 4.79 4.925 4.805 5.271 5.377 5.568 5.75 5.923 6.01 6.18 6.33 6.529 6.644 6.758 6.943 7.097 7.223 7.353 7.483 7.65 7.804 7.956 8.145 8.3 8.43 8.572 8.727 8.889 9.07 9.245 9.407 9.573 9.743 9.94 10.156 10.384 10.578 10.689 10.665 10.487 9.992 8.909 7.493 6.177 5.019 4.046 3.156 2.359 1.619 0.982 0.362 -0.169 -0.629 -1.047 -1.436 -1.812 -2.172 -2.531 -2.838 -3.097 -3.36 -3.632 -3.875 -4.132 -4.388 -4.593 -4.808 -5.024 -5.254 -5.502 -5.675 -5.842 -6.092 -6.276 -6.469 -6.568 -6.792 -7.023 -7.263 -7.396 -7.898 -7.789 -7.938 -8.099 -8.445 -8.645 -8.857 -9.063 -9.302 -9.623 -10.07 -12.066 -4 ,11129 ,TETRA ,17603625,Sun Nov 28 16:41:44 CET,Sun Nov 28 18:57:39 CET,0.0 1.897 2.419 2.767 3.023 3.207 3.386 3.573 3.883 4.015 4.14 3.991 4.438 4.526 4.69 4.852 5.021 5.097 5.229 5.35 5.537 5.666 5.783 5.941 6.09 6.234 6.379 6.52 6.692 6.843 6.978 7.126 7.282 7.428 7.58 7.756 7.923 8.092 8.245 8.389 8.548 8.703 8.835 8.958 9.079 9.137 9.146 9.137 8.977 8.442 7.21 5.505 4.061 2.912 1.943 1.014 0.177 -0.561 -1.198 -1.814 -2.317 -2.768 -3.199 -3.593 -3.954 -4.284 -4.621 -4.914 -5.163 -5.416 -5.683 -5.922 -6.17 -6.418 -6.613 -6.83 -7.061 -7.302 -7.56 -7.736 -7.912 -8.175 -8.367 -8.577 -8.682 -8.902 -9.131 -9.366 -9.485 -9.979 -9.891 -10.033 -10.185 -10.511 -10.689 -10.883 -11.121 -11.465 -11.904 -12.459 -14.745 -5 ,17320 ,TETRA ,17603626,Sun Nov 28 16:41:47 CET,Sun Nov 28 18:58:07 CET,0.0 1.558 1.97 2.286 2.535 2.747 2.931 3.094 3.402 3.549 3.688 3.56 4.019 4.115 4.285 4.436 4.591 4.674 4.819 4.958 5.156 5.28 5.392 5.56 5.722 5.859 5.997 6.133 6.302 6.451 6.584 6.752 6.912 7.048 7.183 7.34 7.491 7.643 7.816 7.983 8.142 8.307 8.465 8.62 8.759 8.81 8.816 8.719 8.428 7.932 6.942 5.475 4.178 3.089 2.131 1.273 0.529 -0.128 -0.694 -1.254 -1.724 -2.144 -2.565 -2.951 -3.3 -3.635 -3.983 -4.311 -4.595 -4.877 -5.175 -5.424 -5.679 -5.946 -6.145 -6.351 -6.568 -6.78 -7.004 -7.175 -7.358 -7.628 -7.806 -7.992 -8.095 -8.328 -8.567 -8.802 -8.925 -9.426 -9.327 -9.463 -9.607 -9.947 -10.132 -10.342 -10.578 -10.837 -11.176 -11.638 -12.989 -6 ,16108 ,TETRA ,17603627,Sun Nov 28 16:41:48 CET,Sun Nov 28 18:58:47 CET,0.0 2.961 3.477 3.838 4.127 4.374 4.591 4.782 5.099 5.238 5.373 5.266 5.739 5.848 6.033 6.198 6.363 6.438 6.579 6.716 6.901 7.025 7.144 7.321 7.496 7.637 7.755 7.891 8.1 8.286 8.46 8.647 8.799 8.93 9.084 9.271 9.409 9.534 9.694 9.878 10.046 10.204 10.348 10.465 10.611 10.706 10.721 10.686 10.492 9.956 8.782 7.153 5.792 4.676 3.725 2.865 2.121 1.48 0.944 0.399 -0.092 -0.536 -0.958 -1.341 -1.699 -2.065 -2.451 -2.777 -3.06 -3.369 -3.691 -3.967 -4.263 -4.542 -4.742 -4.961 -5.197 -5.434 -5.671 -5.836 -6.001 -6.244 -6.411 -6.584 -6.682 -6.907 -7.136 -7.368 -7.491 -7.983 -7.88 -8.018 -8.157 -8.464 -8.643 -8.83 -9.07 -9.393 -9.801 -10.356 -12.394 -7 ,21970 ,TETRA ,17603628,Sun Nov 28 16:41:44 CET,Sun Nov 28 18:59:47 CET,0.0 2.481 2.94 3.287 3.575 3.785 3.967 4.146 4.466 4.6 4.714 4.595 5.063 5.181 5.421 5.592 5.737 5.818 5.996 6.167 6.393 6.512 6.629 6.817 6.976 7.117 7.243 7.352 7.493 7.635 7.766 7.917 8.058 8.199 8.356 8.518 8.675 8.836 9.001 9.193 9.363 9.515 9.693 9.813 9.908 10.009 10.043 9.919 9.613 9.025 7.784 6.058 4.69 3.593 2.668 1.86 1.119 0.446 -0.128 -0.715 -1.23 -1.676 -2.093 -2.532 -2.952 -3.335 -3.741 -4.085 -4.38 -4.664 -4.935 -5.167 -5.411 -5.696 -5.926 -6.137 -6.356 -6.593 -6.853 -7.031 -7.2 -7.46 -7.635 -7.822 -7.928 -8.159 -8.387 -8.627 -8.756 -9.268 -9.186 -9.321 -9.466 -9.798 -9.97 -10.157 -10.392 -10.675 -11.014 -11.521 -13.302 -8 ,12175 ,TETRA ,17603629,Sun Nov 28 16:41:45 CET,Sun Nov 28 19:06:51 CET,0.0 1.623 2.12 2.489 2.738 2.955 3.169 3.343 3.599 3.715 3.83 3.707 4.163 4.26 4.465 4.647 4.806 4.878 5.01 5.139 5.331 5.459 5.582 5.746 5.898 6.032 6.162 6.291 6.446 6.591 6.724 6.878 7.015 7.155 7.31 7.462 7.62 7.793 7.965 8.162 8.361 8.541 8.695 8.826 8.992 9.124 9.168 9.102 8.867 8.42 7.435 5.908 4.606 3.527 2.614 1.816 1.141 0.505 -0.095 -0.671 -1.138 -1.567 -1.982 -2.376 -2.741 -3.077 -3.428 -3.741 -4.018 -4.303 -4.599 -4.849 -5.098 -5.361 -5.579 -5.808 -6.034 -6.261 -6.501 -6.673 -6.847 -7.127 -7.321 -7.509 -7.607 -7.814 -8.041 -8.284 -8.413 -8.917 -8.82 -8.961 -9.115 -9.451 -9.638 -9.851 -10.096 -10.358 -10.657 -11.104 -13.115 -9 ,18098 ,TETRA ,17603630,Sun Nov 28 16:41:44 CET,Sun Nov 28 19:00:43 CET,0.0 2.475 2.937 3.239 3.47 3.645 3.832 4.027 4.328 4.458 4.578 4.429 4.876 4.961 5.128 5.296 5.44 5.514 5.67 5.797 5.966 6.08 6.191 6.348 6.489 6.606 6.722 6.835 6.981 7.118 7.243 7.396 7.541 7.664 7.794 7.929 8.059 8.229 8.414 8.584 8.744 8.91 9.081 9.188 9.272 9.36 9.432 9.438 9.304 8.895 7.785 6.296 5.045 3.981 3.026 2.135 1.347 0.625 0.005 -0.608 -1.129 -1.603 -2.039 -2.411 -2.757 -3.069 -3.397 -3.7 -3.969 -4.249 -4.538 -4.779 -5.03 -5.284 -5.488 -5.697 -5.9 -6.121 -6.355 -6.523 -6.697 -6.98 -7.174 -7.35 -7.441 -7.63 -7.838 -8.079 -8.206 -8.706 -8.602 -8.737 -8.881 -9.2 -9.389 -9.598 -9.813 -10.07 -10.402 -10.884 -13.139 -10 ,7990 ,TETRA ,17603631,Sun Nov 28 16:41:45 CET,Sun Nov 28 19:00:54 CET,0.0 1.57 2.086 2.374 2.599 2.806 2.982 3.125 3.373 3.515 3.654 3.5 3.946 4.037 4.215 4.38 4.54 4.624 4.808 4.969 5.156 5.268 5.374 5.523 5.662 5.802 5.94 6.064 6.22 6.38 6.513 6.659 6.801 6.935 7.093 7.255 7.394 7.559 7.737 7.887 8.04 8.194 8.348 8.489 8.627 8.771 8.804 8.668 8.402 7.835 6.764 5.343 4.022 2.922 1.981 1.126 0.399 -0.245 -0.814 -1.432 -1.961 -2.424 -2.873 -3.288 -3.677 -4.028 -4.369 -4.675 -4.942 -5.222 -5.52 -5.771 -6.024 -6.281 -6.474 -6.667 -6.885 -7.121 -7.368 -7.536 -7.705 -7.978 -8.168 -8.361 -8.454 -8.661 -8.883 -9.118 -9.246 -9.736 -9.622 -9.765 -9.919 -10.277 -10.488 -10.729 -10.993 -11.28 -11.616 -12.09 -13.981 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index c363a361..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3981 ,TETRA ,17615987,Mon Nov 29 09:35:39 CET,Mon Nov 29 11:47:38 CET,0.0 0.875 1.165 1.376 1.558 1.741 1.912 2.068 2.338 2.459 2.576 2.435 2.896 2.997 3.187 3.354 3.519 3.598 3.748 3.895 4.112 4.245 4.372 4.57 4.755 4.928 5.104 5.274 5.486 5.689 5.885 6.097 6.294 6.506 6.77 7.068 7.339 7.631 7.938 8.257 8.589 8.962 9.398 9.819 10.318 10.862 11.451 12.091 12.847 13.753 14.745 15.33 15.435 15.349 15.204 15.029 14.79 14.534 14.323 14.086 13.872 13.668 13.452 13.231 13.002 12.822 12.626 12.407 12.175 11.901 11.639 11.441 11.228 11.012 10.865 10.707 10.508 10.307 10.103 9.942 9.781 9.536 9.359 9.177 9.083 8.873 8.625 8.361 8.23 7.754 7.795 7.622 7.417 6.953 6.717 6.442 6.128 5.733 5.265 4.653 1.673 -2 ,25742 ,TETRA ,17615988,Mon Nov 29 09:35:39 CET,Mon Nov 29 11:51:57 CET,0.0 1.158 1.489 1.72 1.9 2.061 2.215 2.352 2.605 2.714 2.813 2.664 3.125 3.222 3.399 3.563 3.721 3.799 3.937 4.078 4.287 4.417 4.547 4.743 4.931 5.099 5.248 5.398 5.599 5.79 5.976 6.208 6.427 6.635 6.877 7.134 7.381 7.664 7.965 8.283 8.622 9.003 9.44 9.88 10.391 10.908 11.502 12.183 12.965 13.843 14.775 15.3 15.398 15.319 15.147 14.965 14.739 14.474 14.242 13.999 13.757 13.532 13.282 13.034 12.839 12.657 12.413 12.156 11.949 11.754 11.542 11.362 11.184 10.984 10.83 10.682 10.511 10.336 10.146 9.979 9.811 9.562 9.348 9.119 9.005 8.745 8.444 8.141 7.995 7.504 7.522 7.329 7.124 6.701 6.457 6.186 5.899 5.538 5.072 4.376 1.544 -3 ,21913 ,TETRA ,17615989,Mon Nov 29 09:35:39 CET,Mon Nov 29 11:52:22 CET,0.0 1.178 1.485 1.703 1.891 2.059 2.215 2.36 2.609 2.725 2.834 2.674 3.13 3.221 3.389 3.546 3.692 3.765 3.907 4.037 4.22 4.342 4.467 4.664 4.858 5.036 5.209 5.373 5.578 5.786 5.989 6.23 6.458 6.687 6.948 7.236 7.522 7.833 8.178 8.545 8.928 9.375 9.915 10.452 11.069 11.74 12.489 13.305 14.199 15.2 16.286 17.051 17.287 17.219 17.045 16.829 16.597 16.344 16.118 15.859 15.587 15.339 15.096 14.849 14.611 14.383 14.126 13.876 13.65 13.421 13.206 13.035 12.826 12.583 12.417 12.255 12.058 11.849 11.641 11.508 11.374 11.154 10.965 10.747 10.64 10.406 10.164 9.918 9.78 9.289 9.345 9.199 9.043 8.672 8.453 8.224 7.962 7.664 7.265 6.626 3.966 -4 ,28821 ,TETRA ,17615990,Mon Nov 29 09:35:39 CET,Mon Nov 29 11:47:59 CET,0.0 0.883 1.194 1.434 1.638 1.81 1.98 2.143 2.397 2.505 2.613 2.458 2.905 2.996 3.174 3.337 3.495 3.57 3.712 3.855 4.054 4.178 4.297 4.474 4.653 4.834 5.009 5.173 5.386 5.598 5.801 6.035 6.261 6.473 6.715 6.98 7.218 7.496 7.812 8.134 8.477 8.865 9.304 9.757 10.291 10.901 11.58 12.315 13.127 13.988 14.874 15.44 15.698 15.768 15.692 15.502 15.283 15.056 14.832 14.594 14.388 14.193 13.989 13.76 13.519 13.318 13.095 12.885 12.707 12.509 12.264 12.031 11.791 11.519 11.301 11.088 10.855 10.625 10.41 10.259 10.098 9.862 9.692 9.486 9.377 9.15 8.901 8.633 8.495 8.002 8.015 7.848 7.679 7.272 7.027 6.737 6.415 6.049 5.521 4.749 1.627 -5 ,24463 ,TETRA ,17615991,Mon Nov 29 09:35:41 CET,Mon Nov 29 11:46:44 CET,0.0 1.492 1.811 2.036 2.238 2.417 2.566 2.694 2.92 3.038 3.152 2.988 3.441 3.532 3.718 3.892 4.056 4.142 4.298 4.442 4.653 4.783 4.909 5.103 5.286 5.469 5.647 5.816 6.045 6.259 6.463 6.708 6.935 7.149 7.397 7.681 7.957 8.279 8.623 8.973 9.35 9.777 10.254 10.752 11.356 12.028 12.816 13.644 14.466 15.442 16.585 17.242 17.432 17.483 17.449 17.325 17.204 17.065 16.879 16.659 16.456 16.266 16.056 15.848 15.664 15.468 15.271 15.105 14.951 14.798 14.601 14.43 14.269 14.066 13.896 13.734 13.567 13.381 13.187 13.058 12.92 12.703 12.555 12.394 12.303 12.08 11.834 11.576 11.447 10.981 11.011 10.82 10.635 10.233 10.024 9.817 9.542 9.216 8.876 8.27 5.079 -6 ,15107 ,TETRA ,17615992,Mon Nov 29 09:35:40 CET,Mon Nov 29 11:44:52 CET,0.0 0.939 1.253 1.496 1.71 1.889 2.044 2.182 2.414 2.524 2.63 2.468 2.926 3.027 3.201 3.367 3.539 3.619 3.764 3.896 4.092 4.221 4.344 4.528 4.711 4.895 5.067 5.218 5.412 5.609 5.814 6.072 6.315 6.55 6.832 7.141 7.433 7.768 8.123 8.485 8.862 9.286 9.763 10.204 10.699 11.234 11.825 12.504 13.323 14.217 15.162 15.77 15.958 15.97 15.92 15.836 15.677 15.46 15.26 15.053 14.845 14.613 14.402 14.212 14.019 13.832 13.63 13.444 13.273 13.113 12.941 12.786 12.636 12.474 12.332 12.187 12.048 11.883 11.702 11.587 11.473 11.302 11.167 11.005 10.916 10.73 10.528 10.31 10.199 9.739 9.83 9.672 9.488 9.056 8.827 8.601 8.316 7.944 7.484 7.0 4.764 -7 ,31709 ,TETRA ,17615993,Mon Nov 29 09:35:42 CET,Mon Nov 29 11:45:59 CET,0.0 0.918 1.199 1.42 1.613 1.783 1.931 2.071 2.331 2.44 2.546 2.4 2.859 2.955 3.141 3.316 3.483 3.565 3.721 3.864 4.074 4.21 4.341 4.554 4.753 4.93 5.104 5.259 5.451 5.646 5.843 6.072 6.279 6.485 6.729 7.009 7.264 7.532 7.831 8.161 8.5 8.866 9.293 9.725 10.237 10.81 11.485 12.225 13.036 13.924 14.819 15.417 15.69 15.752 15.715 15.626 15.477 15.298 15.097 14.864 14.629 14.409 14.208 14.014 13.818 13.62 13.418 13.226 13.036 12.843 12.659 12.516 12.363 12.197 12.071 11.93 11.771 11.611 11.436 11.297 11.142 10.891 10.725 10.557 10.472 10.298 10.093 9.856 9.721 9.233 9.292 9.135 8.965 8.614 8.425 8.232 8.013 7.722 7.379 6.938 4.565 -8 ,14361 ,TETRA ,17615994,Mon Nov 29 09:35:40 CET,Mon Nov 29 11:48:58 CET,0.0 1.198 1.532 1.769 1.958 2.124 2.277 2.417 2.674 2.79 2.901 2.748 3.207 3.305 3.486 3.652 3.805 3.875 4.019 4.166 4.37 4.494 4.609 4.783 4.959 5.124 5.286 5.447 5.663 5.877 6.077 6.327 6.563 6.787 7.069 7.385 7.668 7.973 8.319 8.704 9.102 9.553 10.09 10.631 11.259 11.96 12.758 13.6 14.502 15.558 16.73 17.424 17.601 17.562 17.361 17.095 16.88 16.662 16.431 16.147 15.894 15.668 15.441 15.199 14.951 14.732 14.481 14.223 14.006 13.789 13.53 13.322 13.134 12.93 12.758 12.584 12.387 12.174 11.968 11.823 11.662 11.366 11.163 10.949 10.839 10.624 10.378 10.11 9.955 9.427 9.424 9.241 9.044 8.587 8.315 8.025 7.712 7.306 6.802 6.05 2.44 -9 ,20092 ,TETRA ,17615995,Mon Nov 29 09:35:42 CET,Mon Nov 29 11:41:00 CET,0.0 1.308 1.638 1.88 2.089 2.271 2.416 2.55 2.795 2.906 3.019 2.876 3.337 3.43 3.617 3.799 3.975 4.062 4.223 4.377 4.603 4.745 4.878 5.075 5.265 5.443 5.615 5.785 6.003 6.198 6.381 6.62 6.855 7.069 7.306 7.569 7.826 8.116 8.413 8.716 9.034 9.392 9.804 10.192 10.669 11.22 11.846 12.571 13.385 14.293 15.307 15.951 16.128 16.12 16.021 15.835 15.615 15.392 15.167 14.9 14.659 14.419 14.139 13.873 13.653 13.455 13.206 12.988 12.826 12.638 12.414 12.211 11.983 11.763 11.605 11.43 11.219 10.986 10.75 10.6 10.458 10.188 9.984 9.791 9.693 9.495 9.283 9.046 8.908 8.399 8.392 8.219 8.033 7.601 7.354 7.035 6.685 6.278 5.744 5.056 2.286 -10 ,6486 ,TETRA ,17615996,Mon Nov 29 09:35:40 CET,Mon Nov 29 11:43:38 CET,0.0 1.32 1.607 1.832 2.023 2.19 2.343 2.481 2.714 2.826 2.937 2.783 3.236 3.329 3.505 3.683 3.842 3.911 4.047 4.18 4.376 4.498 4.613 4.798 4.983 5.153 5.319 5.483 5.686 5.882 6.08 6.328 6.567 6.798 7.065 7.337 7.583 7.857 8.151 8.469 8.81 9.204 9.684 10.152 10.678 11.265 11.903 12.558 13.328 14.186 15.118 15.62 15.657 15.623 15.525 15.339 15.102 14.845 14.602 14.342 14.1 13.876 13.666 13.455 13.245 13.065 12.87 12.678 12.513 12.333 12.149 11.99 11.817 11.662 11.545 11.401 11.23 11.043 10.863 10.742 10.617 10.422 10.25 10.056 9.963 9.752 9.497 9.195 9.044 8.546 8.534 8.359 8.164 7.719 7.483 7.187 6.8 6.364 5.822 5.111 1.953 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt deleted file mode 100644 index 9ab19fca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30916 ,TETRA ,17615977,Mon Nov 29 09:35:37 CET,Mon Nov 29 11:41:02 CET,0.0 1.791 2.405 2.83 3.134 3.419 3.672 3.892 4.294 4.467 4.629 4.61 5.107 5.246 5.495 5.724 5.922 6.019 6.227 6.429 6.699 6.868 7.029 7.26 7.492 7.715 7.921 8.119 8.367 8.574 8.781 9.058 9.309 9.534 9.806 10.106 10.346 10.582 10.831 11.076 11.332 11.596 11.832 12.043 12.301 12.541 12.736 12.809 12.662 12.279 11.244 9.587 8.114 6.819 5.663 4.651 3.694 2.743 1.956 1.23 0.604 0.014 -0.554 -1.087 -1.568 -1.992 -2.436 -2.835 -3.187 -3.54 -3.907 -4.225 -4.537 -4.86 -5.117 -5.403 -5.717 -6.026 -6.348 -6.575 -6.807 -7.163 -7.402 -7.651 -7.777 -8.037 -8.314 -8.61 -8.765 -9.274 -9.238 -9.416 -9.594 -10.032 -10.287 -10.557 -10.853 -11.197 -11.633 -12.27 -14.767 -2 ,27392 ,TETRA ,17615978,Mon Nov 29 09:35:39 CET,Mon Nov 29 11:46:20 CET,0.0 1.618 2.195 2.622 2.955 3.256 3.522 3.771 4.216 4.423 4.618 4.621 5.126 5.28 5.557 5.801 6.032 6.144 6.356 6.559 6.862 7.056 7.232 7.486 7.724 7.943 8.157 8.353 8.602 8.836 9.065 9.332 9.581 9.837 10.115 10.385 10.649 10.937 11.24 11.557 11.833 12.124 12.498 12.829 13.15 13.462 13.725 13.909 13.968 13.673 12.714 11.18 9.687 8.419 7.293 6.205 5.227 4.356 3.597 2.841 2.207 1.622 1.06 0.554 0.088 -0.328 -0.755 -1.15 -1.496 -1.852 -2.212 -2.502 -2.809 -3.138 -3.398 -3.668 -3.943 -4.22 -4.517 -4.718 -4.913 -5.231 -5.447 -5.668 -5.786 -6.018 -6.265 -6.544 -6.695 -7.205 -7.187 -7.383 -7.586 -8.031 -8.264 -8.516 -8.814 -9.185 -9.648 -10.277 -12.877 -3 ,30081 ,TETRA ,17615979,Mon Nov 29 09:35:38 CET,Mon Nov 29 11:49:47 CET,0.0 3.51 4.32 4.917 5.371 5.756 6.112 6.455 7.018 7.238 7.449 7.506 8.018 8.183 8.49 8.782 9.061 9.189 9.427 9.643 9.957 10.165 10.362 10.651 10.942 11.217 11.463 11.691 11.963 12.205 12.432 12.681 12.912 13.142 13.394 13.655 13.9 14.194 14.509 14.793 15.036 15.273 15.573 15.862 16.17 16.443 16.621 16.698 16.569 16.114 15.001 13.132 11.384 9.888 8.539 7.267 6.176 5.25 4.465 3.689 2.996 2.342 1.728 1.173 0.677 0.236 -0.207 -0.583 -0.955 -1.383 -1.807 -2.139 -2.472 -2.829 -3.12 -3.421 -3.714 -4.004 -4.321 -4.547 -4.764 -5.08 -5.297 -5.53 -5.657 -5.925 -6.187 -6.464 -6.617 -7.132 -7.081 -7.253 -7.442 -7.855 -8.089 -8.335 -8.604 -8.925 -9.331 -9.862 -11.715 -4 ,15878 ,TETRA ,17615980,Mon Nov 29 09:35:38 CET,Mon Nov 29 11:48:04 CET,0.0 2.167 2.837 3.328 3.71 4.015 4.284 4.532 5.007 5.223 5.418 5.42 5.911 6.055 6.35 6.627 6.889 7.026 7.303 7.551 7.861 8.047 8.222 8.471 8.726 8.968 9.173 9.37 9.629 9.882 10.133 10.42 10.671 10.893 11.146 11.447 11.731 12.002 12.278 12.569 12.861 13.18 13.539 13.894 14.203 14.451 14.691 14.812 14.717 14.225 13.16 11.428 9.693 8.189 6.862 5.677 4.661 3.778 3.044 2.323 1.672 1.093 0.565 0.066 -0.387 -0.788 -1.225 -1.63 -1.964 -2.3 -2.656 -2.959 -3.282 -3.598 -3.835 -4.095 -4.37 -4.649 -4.937 -5.136 -5.341 -5.676 -5.921 -6.185 -6.323 -6.594 -6.864 -7.151 -7.311 -7.844 -7.846 -8.032 -8.221 -8.661 -8.924 -9.206 -9.497 -9.836 -10.277 -10.898 -13.942 -5 ,10315 ,TETRA ,17615981,Mon Nov 29 09:35:40 CET,Mon Nov 29 11:47:26 CET,0.0 1.876 2.553 3.082 3.51 3.856 4.168 4.448 4.941 5.164 5.366 5.386 5.904 6.072 6.365 6.639 6.907 7.031 7.254 7.448 7.728 7.906 8.067 8.299 8.536 8.767 8.97 9.161 9.43 9.686 9.927 10.22 10.478 10.731 11.04 11.354 11.63 11.911 12.184 12.457 12.735 13.04 13.379 13.699 14.051 14.406 14.73 14.956 15.027 14.846 14.0 12.638 11.5 10.316 9.143 8.169 7.303 6.479 5.791 5.125 4.525 3.965 3.447 2.963 2.504 2.075 1.639 1.271 0.947 0.61 0.266 -0.021 -0.323 -0.645 -0.901 -1.162 -1.417 -1.684 -1.952 -2.136 -2.337 -2.655 -2.868 -3.098 -3.226 -3.48 -3.728 -4.012 -4.175 -4.692 -4.669 -4.858 -5.055 -5.447 -5.658 -5.911 -6.22 -6.577 -7.012 -7.655 -11.164 -6 ,18916 ,TETRA ,17615982,Mon Nov 29 09:35:40 CET,Mon Nov 29 11:45:41 CET,0.0 2.882 3.723 4.313 4.744 5.1 5.419 5.7 6.204 6.42 6.607 6.604 7.115 7.274 7.553 7.822 8.075 8.183 8.383 8.57 8.84 9.02 9.19 9.446 9.687 9.891 10.081 10.261 10.477 10.687 10.904 11.157 11.39 11.608 11.849 12.105 12.335 12.589 12.846 13.116 13.407 13.693 14.043 14.406 14.806 15.184 15.595 15.931 16.009 15.909 15.286 13.957 12.446 11.077 9.927 8.883 7.996 7.21 6.519 5.813 5.193 4.648 4.13 3.658 3.249 2.877 2.468 2.074 1.74 1.423 1.097 0.82 0.514 0.194 -0.047 -0.298 -0.555 -0.83 -1.139 -1.346 -1.56 -1.906 -2.139 -2.374 -2.496 -2.76 -3.064 -3.386 -3.544 -4.057 -4.016 -4.175 -4.342 -4.748 -4.984 -5.243 -5.564 -5.92 -6.354 -7.066 -9.815 -7 ,22242 ,TETRA ,17615983,Mon Nov 29 09:35:39 CET,Mon Nov 29 11:47:38 CET,0.0 2.021 2.628 3.108 3.497 3.814 4.088 4.331 4.78 4.995 5.208 5.27 5.8 5.972 6.27 6.548 6.814 6.94 7.183 7.404 7.716 7.91 8.097 8.379 8.632 8.868 9.099 9.303 9.535 9.742 9.944 10.201 10.436 10.657 10.935 11.223 11.468 11.739 12.024 12.291 12.538 12.83 13.186 13.511 13.847 14.181 14.527 14.851 14.985 14.769 14.018 12.797 11.568 10.359 9.301 8.39 7.587 6.835 6.17 5.447 4.787 4.221 3.676 3.173 2.711 2.264 1.811 1.421 1.076 0.723 0.359 0.043 -0.289 -0.608 -0.864 -1.138 -1.406 -1.669 -1.942 -2.136 -2.336 -2.655 -2.878 -3.127 -3.26 -3.521 -3.807 -4.112 -4.275 -4.803 -4.771 -4.945 -5.14 -5.579 -5.842 -6.113 -6.406 -6.756 -7.174 -7.809 -10.496 -8 ,28458 ,TETRA ,17615984,Mon Nov 29 09:35:39 CET,Mon Nov 29 11:47:14 CET,0.0 1.842 2.439 2.9 3.268 3.594 3.888 4.135 4.567 4.766 4.941 4.92 5.418 5.569 5.841 6.103 6.351 6.47 6.704 6.911 7.187 7.359 7.527 7.791 8.054 8.296 8.531 8.755 9.028 9.283 9.524 9.82 10.091 10.337 10.618 10.906 11.161 11.435 11.715 12.02 12.322 12.608 12.905 13.201 13.492 13.745 13.981 14.11 14.121 13.841 12.932 11.607 10.311 9.109 8.032 7.027 6.162 5.346 4.618 3.909 3.315 2.798 2.292 1.813 1.395 1.017 0.6 0.21 -0.137 -0.499 -0.878 -1.19 -1.491 -1.805 -2.061 -2.332 -2.59 -2.848 -3.142 -3.339 -3.539 -3.872 -4.099 -4.334 -4.46 -4.727 -5.002 -5.289 -5.437 -5.939 -5.887 -6.061 -6.235 -6.582 -6.788 -7.035 -7.328 -7.65 -8.02 -8.533 -19.254 -9 ,12070 ,TETRA ,17615985,Mon Nov 29 09:35:39 CET,Mon Nov 29 11:53:33 CET,0.0 2.037 2.635 3.053 3.379 3.664 3.912 4.148 4.589 4.763 4.924 4.901 5.391 5.539 5.813 6.058 6.289 6.4 6.627 6.84 7.114 7.292 7.465 7.704 7.959 8.203 8.412 8.614 8.889 9.16 9.401 9.657 9.871 10.077 10.326 10.588 10.821 11.057 11.313 11.584 11.842 12.103 12.396 12.674 12.993 13.284 13.472 13.623 13.658 13.424 12.645 11.393 10.038 8.685 7.543 6.58 5.777 5.004 4.328 3.693 3.141 2.65 2.16 1.671 1.201 0.775 0.353 -0.022 -0.346 -0.694 -1.071 -1.395 -1.736 -2.093 -2.367 -2.659 -2.969 -3.279 -3.607 -3.835 -4.072 -4.444 -4.694 -4.968 -5.114 -5.408 -5.713 -6.005 -6.158 -6.68 -6.689 -6.892 -7.111 -7.638 -7.913 -8.217 -8.576 -8.967 -9.465 -10.157 -12.716 -10 ,1840 ,TETRA ,17615986,Mon Nov 29 09:35:39 CET,Mon Nov 29 11:54:11 CET,0.0 1.885 2.683 3.265 3.742 4.158 4.502 4.788 5.293 5.512 5.702 5.706 6.208 6.359 6.65 6.945 7.211 7.333 7.562 7.772 8.103 8.309 8.489 8.741 8.972 9.199 9.423 9.625 9.884 10.144 10.379 10.67 10.943 11.185 11.489 11.806 12.069 12.372 12.683 12.988 13.308 13.641 13.988 14.314 14.67 15.024 15.349 15.567 15.651 15.591 14.873 13.393 12.141 11.02 9.988 9.064 8.24 7.46 6.783 6.121 5.548 5.039 4.524 4.008 3.527 3.126 2.712 2.319 1.99 1.651 1.28 0.983 0.675 0.369 0.131 -0.112 -0.35 -0.611 -0.888 -1.086 -1.284 -1.588 -1.805 -2.044 -2.167 -2.416 -2.69 -2.989 -3.153 -3.676 -3.657 -3.85 -4.058 -4.482 -4.709 -4.97 -5.268 -5.608 -5.987 -6.533 -8.593 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt deleted file mode 100644 index 62ae7839..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8851 ,TETRA ,17603652,Sun Nov 28 16:42:46 CET,Sun Nov 28 19:01:09 CET,0.0 1.467 1.771 1.999 2.184 2.347 2.496 2.624 2.841 2.946 3.047 2.843 3.311 3.396 3.556 3.705 3.844 3.905 4.021 4.138 4.304 4.413 4.523 4.678 4.833 4.983 5.118 5.251 5.419 5.577 5.747 5.93 6.08 6.207 6.349 6.524 6.679 6.831 6.979 7.109 7.238 7.404 7.596 7.772 7.967 8.167 8.391 8.58 8.69 8.703 8.429 7.875 7.284 6.736 6.238 5.732 5.27 4.837 4.465 4.082 3.745 3.463 3.195 2.939 2.699 2.472 2.227 2.012 1.824 1.629 1.434 1.274 1.09 0.892 0.745 0.595 0.443 0.294 0.138 0.024 -0.099 -0.302 -0.443 -0.587 -0.666 -0.83 -0.992 -1.163 -1.252 -1.721 -1.548 -1.665 -1.78 -2.036 -2.186 -2.351 -2.53 -2.73 -2.986 -3.348 -4.476 -2 ,28269 ,TETRA ,17603653,Sun Nov 28 16:42:49 CET,Sun Nov 28 19:02:17 CET,0.0 1.22 1.486 1.705 1.893 2.05 2.183 2.309 2.546 2.649 2.741 2.536 2.99 3.064 3.207 3.336 3.462 3.524 3.644 3.757 3.907 3.996 4.078 4.204 4.34 4.468 4.582 4.685 4.819 4.959 5.086 5.226 5.362 5.497 5.654 5.82 5.97 6.125 6.288 6.45 6.611 6.792 6.985 7.168 7.392 7.629 7.849 8.032 8.152 8.142 7.87 7.303 6.738 6.194 5.684 5.212 4.78 4.405 4.068 3.703 3.377 3.079 2.794 2.528 2.294 2.081 1.853 1.65 1.475 1.286 1.076 0.912 0.738 0.554 0.412 0.263 0.111 -0.046 -0.215 -0.345 -0.477 -0.67 -0.801 -0.936 -1.005 -1.147 -1.299 -1.464 -1.552 -2.029 -1.856 -1.966 -2.09 -2.366 -2.519 -2.677 -2.846 -3.05 -3.31 -3.702 -5.56 -3 ,9645 ,TETRA ,17603654,Sun Nov 28 16:42:51 CET,Sun Nov 28 19:02:35 CET,0.0 1.448 1.733 1.956 2.14 2.299 2.431 2.551 2.759 2.851 2.946 2.744 3.208 3.282 3.418 3.556 3.689 3.753 3.879 3.992 4.144 4.25 4.352 4.481 4.605 4.72 4.832 4.946 5.087 5.219 5.347 5.494 5.64 5.782 5.946 6.12 6.271 6.423 6.593 6.789 6.971 7.146 7.352 7.57 7.826 8.044 8.228 8.42 8.552 8.531 8.237 7.648 7.013 6.391 5.823 5.296 4.811 4.365 3.989 3.612 3.286 2.994 2.711 2.445 2.199 1.96 1.721 1.518 1.331 1.132 0.93 0.755 0.563 0.373 0.226 0.067 -0.092 -0.256 -0.423 -0.54 -0.662 -0.852 -0.989 -1.133 -1.21 -1.372 -1.541 -1.717 -1.805 -2.283 -2.109 -2.223 -2.338 -2.587 -2.733 -2.887 -3.071 -3.291 -3.548 -3.896 -5.144 -4 ,26172 ,TETRA ,17603655,Sun Nov 28 16:42:47 CET,Sun Nov 28 19:02:05 CET,0.0 1.183 1.452 1.662 1.841 1.986 2.115 2.237 2.444 2.539 2.632 2.418 2.873 2.945 3.082 3.215 3.34 3.397 3.503 3.609 3.758 3.85 3.943 4.076 4.194 4.309 4.424 4.528 4.661 4.795 4.924 5.077 5.231 5.378 5.539 5.713 5.877 6.051 6.216 6.382 6.561 6.754 6.963 7.157 7.367 7.587 7.787 7.951 8.072 8.031 7.712 7.136 6.51 5.879 5.328 4.837 4.402 3.991 3.624 3.276 2.97 2.685 2.413 2.156 1.904 1.671 1.428 1.202 0.999 0.795 0.599 0.429 0.247 0.063 -0.081 -0.244 -0.413 -0.578 -0.744 -0.873 -1.009 -1.195 -1.318 -1.456 -1.532 -1.68 -1.838 -2.009 -2.1 -2.576 -2.388 -2.492 -2.602 -2.861 -3.003 -3.158 -3.343 -3.555 -3.785 -4.114 -5.853 -5 ,27475 ,TETRA ,17603656,Sun Nov 28 16:42:46 CET,Sun Nov 28 19:00:26 CET,0.0 1.504 1.822 2.042 2.222 2.372 2.495 2.61 2.834 2.941 3.044 2.862 3.333 3.418 3.571 3.707 3.839 3.903 4.029 4.143 4.312 4.416 4.509 4.636 4.751 4.865 4.964 5.059 5.192 5.32 5.438 5.579 5.71 5.84 5.995 6.159 6.3 6.451 6.613 6.783 6.97 7.169 7.368 7.553 7.749 7.938 8.124 8.296 8.392 8.358 8.138 7.57 6.942 6.388 5.865 5.36 4.928 4.5 4.109 3.73 3.403 3.106 2.821 2.553 2.309 2.087 1.837 1.605 1.409 1.205 0.998 0.83 0.65 0.477 0.344 0.192 0.032 -0.122 -0.291 -0.419 -0.545 -0.739 -0.879 -1.023 -1.093 -1.233 -1.39 -1.56 -1.646 -2.12 -1.972 -2.099 -2.223 -2.505 -2.676 -2.871 -3.076 -3.276 -3.52 -3.912 -5.695 -7 ,30080 ,TETRA ,17603658,Sun Nov 28 16:43:47 CET,Sun Nov 28 19:02:17 CET,0.0 1.578 1.888 2.102 2.281 2.428 2.575 2.726 2.99 3.103 3.203 3.0 3.47 3.547 3.675 3.798 3.921 3.98 4.081 4.186 4.351 4.448 4.542 4.674 4.804 4.928 5.04 5.145 5.274 5.398 5.518 5.659 5.785 5.904 6.059 6.236 6.396 6.568 6.75 6.945 7.129 7.317 7.533 7.72 7.918 8.104 8.284 8.44 8.519 8.521 8.298 7.723 7.089 6.507 5.964 5.461 5.025 4.611 4.234 3.868 3.549 3.248 2.964 2.698 2.432 2.196 1.967 1.754 1.572 1.388 1.204 1.055 0.884 0.694 0.552 0.412 0.256 0.081 -0.108 -0.236 -0.362 -0.554 -0.691 -0.844 -0.924 -1.076 -1.227 -1.403 -1.498 -1.982 -1.806 -1.916 -2.032 -2.291 -2.433 -2.591 -2.783 -3.021 -3.314 -3.705 -5.578 -8 ,28810 ,TETRA ,17603659,Sun Nov 28 16:43:43 CET,Sun Nov 28 19:03:23 CET,0.0 1.472 1.774 1.984 2.158 2.314 2.442 2.57 2.795 2.89 2.982 2.767 3.219 3.293 3.439 3.575 3.694 3.753 3.869 3.978 4.13 4.223 4.311 4.435 4.568 4.694 4.805 4.909 5.029 5.148 5.266 5.405 5.539 5.668 5.818 5.987 6.143 6.313 6.493 6.665 6.842 7.051 7.311 7.54 7.759 7.978 8.178 8.349 8.463 8.453 8.209 7.713 7.166 6.598 6.068 5.597 5.185 4.804 4.466 4.113 3.815 3.55 3.28 3.024 2.792 2.578 2.335 2.113 1.92 1.711 1.489 1.307 1.125 0.942 0.794 0.633 0.464 0.277 0.086 -0.041 -0.172 -0.371 -0.506 -0.656 -0.743 -0.909 -1.057 -1.228 -1.332 -1.825 -1.649 -1.765 -1.886 -2.144 -2.285 -2.434 -2.61 -2.805 -3.06 -3.438 -4.645 -9 ,7933 ,TETRA ,17603660,Sun Nov 28 16:43:43 CET,Sun Nov 28 19:02:18 CET,0.0 1.17 1.484 1.719 1.902 2.066 2.197 2.308 2.52 2.622 2.718 2.518 2.982 3.054 3.202 3.345 3.465 3.523 3.64 3.754 3.909 3.997 4.08 4.204 4.323 4.431 4.543 4.659 4.799 4.935 5.062 5.201 5.331 5.455 5.615 5.782 5.921 6.074 6.243 6.423 6.603 6.792 6.995 7.171 7.35 7.538 7.732 7.913 8.035 8.023 7.74 7.131 6.505 5.921 5.389 4.889 4.453 4.032 3.659 3.284 2.964 2.683 2.403 2.138 1.891 1.67 1.442 1.221 1.034 0.841 0.628 0.46 0.292 0.118 -0.017 -0.154 -0.303 -0.468 -0.642 -0.76 -0.878 -1.065 -1.208 -1.358 -1.432 -1.589 -1.753 -1.932 -2.027 -2.516 -2.346 -2.451 -2.563 -2.811 -2.954 -3.112 -3.29 -3.53 -3.852 -4.236 -5.706 -10 ,20381 ,TETRA ,17603661,Sun Nov 28 16:43:43 CET,Sun Nov 28 19:01:58 CET,0.0 1.398 1.691 1.891 2.049 2.189 2.316 2.436 2.661 2.757 2.843 2.637 3.09 3.161 3.304 3.437 3.568 3.627 3.734 3.836 3.984 4.081 4.176 4.307 4.431 4.544 4.652 4.752 4.879 5.001 5.127 5.28 5.42 5.546 5.673 5.817 5.958 6.109 6.273 6.446 6.618 6.781 6.966 7.147 7.332 7.523 7.765 8.03 8.225 8.285 8.022 7.424 6.814 6.294 5.805 5.316 4.892 4.513 4.161 3.786 3.442 3.139 2.854 2.58 2.336 2.119 1.876 1.661 1.478 1.285 1.089 0.923 0.748 0.557 0.409 0.259 0.101 -0.067 -0.243 -0.356 -0.477 -0.673 -0.802 -0.955 -1.039 -1.197 -1.362 -1.543 -1.638 -2.121 -1.97 -2.085 -2.207 -2.493 -2.669 -2.863 -3.047 -3.245 -3.501 -3.862 -5.78 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt deleted file mode 100644 index b686ecdc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3509 ,TETRA ,17603662,Sun Nov 28 16:43:45 CET,Sun Nov 28 19:02:05 CET,0.0 1.243 1.557 1.789 1.999 2.183 2.351 2.508 2.78 2.908 3.021 2.859 3.339 3.426 3.59 3.754 3.922 4.005 4.168 4.325 4.546 4.69 4.824 5.02 5.209 5.386 5.557 5.717 5.918 6.119 6.325 6.578 6.807 7.015 7.259 7.535 7.797 8.081 8.393 8.723 9.074 9.474 9.946 10.415 10.943 11.523 12.211 13.007 13.902 14.922 16.082 16.883 17.239 17.377 17.367 17.276 17.162 17.031 16.887 16.737 16.593 16.441 16.284 16.119 15.966 15.833 15.684 15.537 15.419 15.299 15.154 15.031 14.9 14.758 14.639 14.517 14.39 14.242 14.094 13.997 13.899 13.746 13.636 13.51 13.444 13.318 13.167 12.989 12.904 12.443 12.594 12.482 12.382 12.148 12.008 11.855 11.69 11.496 11.25 10.899 9.773 -2 ,19146 ,TETRA ,17603663,Sun Nov 28 16:43:43 CET,Sun Nov 28 19:02:07 CET,0.0 1.392 1.697 1.925 2.122 2.286 2.429 2.562 2.805 2.921 3.028 2.843 3.311 3.404 3.575 3.725 3.878 3.954 4.099 4.237 4.435 4.567 4.692 4.877 5.068 5.249 5.422 5.598 5.815 6.012 6.198 6.422 6.653 6.873 7.11 7.385 7.662 7.96 8.27 8.607 8.98 9.378 9.843 10.323 10.832 11.372 12.013 12.764 13.622 14.571 15.597 16.313 16.62 16.706 16.711 16.635 16.511 16.397 16.288 16.157 16.019 15.875 15.721 15.577 15.444 15.312 15.157 15.006 14.889 14.772 14.637 14.52 14.385 14.24 14.129 14.021 13.901 13.763 13.624 13.53 13.435 13.275 13.158 13.046 12.984 12.855 12.716 12.543 12.459 12.002 12.188 12.091 11.988 11.738 11.602 11.469 11.304 11.111 10.88 10.526 9.104 -3 ,18024 ,TETRA ,17603664,Sun Nov 28 16:43:43 CET,Sun Nov 28 19:09:08 CET,0.0 2.222 2.562 2.816 3.007 3.183 3.344 3.482 3.74 3.86 3.966 3.783 4.269 4.367 4.542 4.701 4.86 4.936 5.082 5.224 5.424 5.553 5.678 5.859 6.029 6.198 6.368 6.532 6.742 6.944 7.14 7.363 7.583 7.807 8.053 8.332 8.598 8.895 9.215 9.545 9.895 10.29 10.731 11.151 11.66 12.23 12.856 13.552 14.364 15.298 16.323 16.99 17.263 17.352 17.327 17.234 17.136 17.029 16.914 16.787 16.666 16.552 16.414 16.265 16.126 15.996 15.831 15.686 15.577 15.448 15.297 15.164 15.039 14.912 14.801 14.682 14.556 14.421 14.287 14.191 14.089 13.932 13.817 13.695 13.629 13.488 13.331 13.16 13.077 12.616 12.798 12.701 12.6 12.369 12.243 12.095 11.917 11.731 11.503 11.181 9.897 -4 ,22813 ,TETRA ,17603665,Sun Nov 28 16:43:46 CET,Sun Nov 28 19:08:54 CET,0.0 1.314 1.639 1.89 2.106 2.289 2.436 2.567 2.809 2.916 3.018 2.84 3.315 3.405 3.579 3.732 3.873 3.946 4.089 4.226 4.431 4.557 4.673 4.845 5.009 5.169 5.316 5.453 5.644 5.834 6.006 6.199 6.394 6.601 6.838 7.1 7.355 7.628 7.917 8.22 8.547 8.922 9.36 9.789 10.292 10.866 11.5 12.194 12.983 13.88 14.912 15.607 15.892 15.977 15.975 15.924 15.836 15.741 15.63 15.492 15.347 15.181 15.009 14.848 14.7 14.565 14.411 14.266 14.14 14.018 13.89 13.781 13.659 13.513 13.403 13.292 13.165 13.028 12.893 12.804 12.706 12.546 12.441 12.335 12.278 12.149 12.008 11.844 11.759 11.305 11.502 11.404 11.3 11.09 10.967 10.827 10.668 10.485 10.236 9.892 8.905 -5 ,13177 ,TETRA ,17603666,Sun Nov 28 16:44:43 CET,Sun Nov 28 19:05:03 CET,0.0 1.075 1.392 1.632 1.834 2.007 2.151 2.289 2.532 2.637 2.732 2.551 3.017 3.107 3.291 3.458 3.609 3.685 3.827 3.958 4.142 4.261 4.377 4.547 4.708 4.867 5.032 5.188 5.387 5.578 5.759 5.978 6.192 6.398 6.633 6.895 7.143 7.425 7.724 8.042 8.377 8.764 9.223 9.678 10.242 10.859 11.543 12.289 13.117 14.037 15.042 15.682 15.893 15.911 15.86 15.784 15.659 15.488 15.316 15.133 14.965 14.808 14.635 14.463 14.307 14.156 13.987 13.84 13.713 13.585 13.459 13.344 13.216 13.078 12.967 12.855 12.738 12.603 12.461 12.374 12.282 12.116 12.01 11.901 11.837 11.704 11.568 11.415 11.333 10.88 11.084 10.983 10.87 10.637 10.511 10.366 10.204 10.002 9.737 9.401 8.067 -6 ,14883 ,TETRA ,17603667,Sun Nov 28 16:43:43 CET,Sun Nov 28 19:02:28 CET,0.0 1.723 2.066 2.352 2.57 2.736 2.884 3.021 3.283 3.403 3.523 3.367 3.834 3.923 4.095 4.258 4.407 4.479 4.62 4.756 4.957 5.083 5.202 5.381 5.559 5.731 5.886 6.044 6.271 6.49 6.684 6.898 7.117 7.336 7.576 7.843 8.103 8.397 8.715 9.052 9.396 9.777 10.247 10.71 11.233 11.819 12.506 13.266 14.102 15.046 16.089 16.793 17.052 17.138 17.15 17.064 16.896 16.716 16.567 16.435 16.317 16.167 15.996 15.84 15.687 15.536 15.392 15.259 15.132 15.004 14.861 14.736 14.614 14.48 14.376 14.273 14.153 14.025 13.892 13.798 13.699 13.529 13.41 13.288 13.223 13.095 12.954 12.785 12.699 12.248 12.415 12.301 12.192 11.938 11.799 11.649 11.47 11.268 11.013 10.693 9.541 -7 ,11454 ,TETRA ,17603668,Sun Nov 28 16:44:44 CET,Sun Nov 28 19:05:23 CET,0.0 1.09 1.414 1.644 1.852 2.038 2.2 2.352 2.625 2.743 2.859 2.694 3.181 3.28 3.471 3.646 3.811 3.887 4.029 4.171 4.372 4.498 4.622 4.807 4.989 5.159 5.32 5.473 5.68 5.889 6.082 6.302 6.503 6.696 6.931 7.226 7.5 7.788 8.123 8.47 8.837 9.244 9.703 10.168 10.686 11.247 11.877 12.582 13.428 14.436 15.504 16.267 16.59 16.724 16.753 16.681 16.574 16.446 16.305 16.148 16.0 15.851 15.704 15.555 15.404 15.259 15.109 14.968 14.829 14.667 14.504 14.377 14.231 14.079 13.967 13.851 13.73 13.598 13.459 13.361 13.257 13.095 12.984 12.869 12.809 12.67 12.524 12.365 12.273 11.813 11.995 11.893 11.783 11.525 11.391 11.236 11.051 10.842 10.588 10.263 8.985 -8 ,9361 ,TETRA ,17603669,Sun Nov 28 16:43:46 CET,Sun Nov 28 19:02:19 CET,0.0 1.284 1.592 1.833 2.037 2.204 2.359 2.513 2.788 2.909 3.022 2.845 3.336 3.441 3.618 3.78 3.935 4.011 4.164 4.31 4.506 4.628 4.747 4.925 5.102 5.275 5.438 5.583 5.767 5.958 6.143 6.363 6.569 6.765 7.012 7.295 7.558 7.84 8.14 8.465 8.809 9.198 9.666 10.129 10.67 11.278 11.948 12.691 13.504 14.4 15.405 16.059 16.311 16.388 16.363 16.28 16.169 16.031 15.904 15.773 15.614 15.436 15.258 15.093 14.94 14.805 14.656 14.509 14.375 14.231 14.081 13.959 13.824 13.677 13.554 13.425 13.301 13.181 13.05 12.946 12.836 12.668 12.546 12.425 12.369 12.248 12.117 11.975 11.894 11.442 11.627 11.53 11.433 11.227 11.105 10.962 10.802 10.625 10.385 10.041 9.051 -9 ,14 ,TETRA ,17603670,Sun Nov 28 16:44:43 CET,Sun Nov 28 19:05:05 CET,0.0 1.31 1.663 1.919 2.12 2.291 2.452 2.605 2.87 2.994 3.112 2.926 3.393 3.478 3.645 3.81 3.975 4.052 4.2 4.344 4.557 4.691 4.822 5.018 5.21 5.394 5.575 5.747 5.971 6.185 6.374 6.599 6.821 7.032 7.278 7.564 7.832 8.119 8.425 8.741 9.078 9.452 9.907 10.379 10.876 11.409 12.024 12.715 13.525 14.48 15.557 16.278 16.545 16.58 16.542 16.448 16.342 16.225 16.083 15.914 15.762 15.631 15.486 15.328 15.174 15.04 14.901 14.757 14.613 14.471 14.327 14.195 14.066 13.941 13.832 13.71 13.591 13.471 13.336 13.242 13.142 12.98 12.867 12.75 12.69 12.569 12.442 12.306 12.234 11.795 11.999 11.909 11.819 11.593 11.457 11.307 11.141 10.958 10.718 10.36 9.013 -10 ,22287 ,TETRA ,17603671,Sun Nov 28 16:44:44 CET,Sun Nov 28 19:05:23 CET,0.0 1.26 1.563 1.8 2.022 2.187 2.341 2.503 2.779 2.883 2.983 2.795 3.26 3.347 3.507 3.668 3.831 3.907 4.062 4.207 4.405 4.533 4.652 4.821 4.986 5.147 5.309 5.461 5.646 5.824 6.015 6.24 6.434 6.629 6.859 7.116 7.362 7.64 7.941 8.249 8.581 8.947 9.367 9.788 10.286 10.854 11.505 12.226 13.012 13.891 14.885 15.515 15.725 15.74 15.666 15.572 15.447 15.296 15.152 14.982 14.82 14.664 14.5 14.337 14.189 14.057 13.9 13.748 13.624 13.494 13.346 13.216 13.077 12.932 12.828 12.722 12.605 12.485 12.346 12.248 12.135 11.955 11.844 11.727 11.666 11.531 11.384 11.227 11.143 10.689 10.886 10.789 10.679 10.438 10.305 10.154 9.979 9.799 9.586 9.248 7.535 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt deleted file mode 100644 index 8bfb352d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16846 ,TETRA ,17603672,Sun Nov 28 16:44:43 CET,Sun Nov 28 19:04:10 CET,0.0 0.673 0.818 0.912 0.978 1.034 1.102 1.174 1.286 1.34 1.391 1.109 1.527 1.57 1.666 1.753 1.838 1.868 1.924 1.988 2.069 2.126 2.174 2.233 2.279 2.322 2.362 2.397 2.44 2.473 2.491 2.508 2.509 2.503 2.504 2.503 2.496 2.463 2.388 2.293 2.179 2.015 1.814 1.586 1.276 0.852 0.252 -0.528 -1.607 -3.182 -5.657 -8.401 -10.553 -12.3 -13.74 -14.995 -16.063 -16.981 -17.748 -18.503 -19.148 -19.704 -20.224 -20.711 -21.155 -21.543 -21.937 -22.295 -22.613 -22.934 -23.256 -23.523 -23.791 -24.064 -24.273 -24.485 -24.7 -24.917 -25.139 -25.29 -25.446 -25.702 -25.873 -26.039 -26.127 -26.309 -26.501 -26.716 -26.83 -27.346 -27.175 -27.305 -27.443 -27.765 -27.94 -28.12 -28.31 -28.55 -28.845 -29.23 -30.373 -2 ,5784 ,TETRA ,17603673,Sun Nov 28 16:44:45 CET,Sun Nov 28 19:04:07 CET,0.0 0.472 0.652 0.81 0.927 1.023 1.108 1.191 1.347 1.422 1.481 1.21 1.651 1.7 1.795 1.879 1.932 1.95 1.986 2.035 2.108 2.139 2.175 2.234 2.281 2.323 2.357 2.386 2.433 2.463 2.478 2.503 2.521 2.525 2.537 2.553 2.543 2.502 2.464 2.441 2.382 2.28 2.121 1.926 1.661 1.291 0.767 0.029 -1.061 -2.713 -5.304 -8.196 -10.456 -12.284 -13.782 -15.061 -16.121 -17.039 -17.813 -18.574 -19.209 -19.747 -20.252 -20.725 -21.159 -21.546 -21.938 -22.296 -22.603 -22.913 -23.234 -23.494 -23.756 -24.015 -24.221 -24.445 -24.661 -24.877 -25.107 -25.269 -25.43 -25.676 -25.856 -26.041 -26.13 -26.317 -26.525 -26.732 -26.837 -27.353 -27.216 -27.355 -27.496 -27.804 -27.966 -28.134 -28.329 -28.557 -28.824 -29.233 -30.349 -3 ,10022 ,TETRA ,17603674,Sun Nov 28 16:44:46 CET,Sun Nov 28 19:04:41 CET,0.0 0.528 0.717 0.896 1.002 1.07 1.134 1.198 1.33 1.397 1.461 1.176 1.598 1.637 1.695 1.763 1.824 1.851 1.901 1.942 1.992 2.025 2.062 2.108 2.143 2.18 2.231 2.285 2.345 2.389 2.403 2.415 2.44 2.456 2.462 2.467 2.46 2.432 2.378 2.308 2.217 2.098 1.944 1.742 1.453 1.071 0.566 -0.107 -1.108 -2.658 -5.132 -7.891 -9.964 -11.624 -13.018 -14.205 -15.198 -16.064 -16.802 -17.517 -18.109 -18.639 -19.146 -19.609 -20.025 -20.398 -20.777 -21.115 -21.408 -21.716 -22.024 -22.272 -22.532 -22.817 -23.04 -23.259 -23.477 -23.707 -23.956 -24.118 -24.277 -24.533 -24.711 -24.889 -24.982 -25.174 -25.368 -25.583 -25.696 -26.215 -26.053 -26.184 -26.313 -26.579 -26.719 -26.876 -27.064 -27.269 -27.495 -27.799 -29.359 -4 ,25773 ,TETRA ,17603675,Sun Nov 28 16:44:45 CET,Sun Nov 28 19:04:59 CET,0.0 0.381 0.582 0.705 0.805 0.929 1.039 1.129 1.292 1.365 1.43 1.168 1.614 1.669 1.752 1.839 1.922 1.963 2.032 2.093 2.177 2.234 2.28 2.329 2.391 2.465 2.521 2.574 2.643 2.686 2.732 2.791 2.82 2.815 2.794 2.778 2.758 2.731 2.695 2.653 2.591 2.475 2.312 2.119 1.857 1.46 0.851 0.054 -1.058 -2.663 -5.182 -7.985 -10.122 -11.854 -13.273 -14.47 -15.465 -16.366 -17.148 -17.875 -18.48 -19.034 -19.547 -20.004 -20.425 -20.806 -21.205 -21.558 -21.862 -22.181 -22.509 -22.771 -23.038 -23.315 -23.52 -23.722 -23.936 -24.161 -24.396 -24.554 -24.715 -24.97 -25.15 -25.338 -25.434 -25.642 -25.848 -26.046 -26.148 -26.659 -26.503 -26.638 -26.771 -27.049 -27.203 -27.392 -27.618 -27.851 -28.107 -28.47 -29.63 -5 ,1595 ,TETRA ,17603676,Sun Nov 28 16:44:45 CET,Sun Nov 28 19:08:12 CET,0.0 0.226 0.322 0.432 0.519 0.583 0.657 0.736 0.876 0.924 0.962 0.654 1.063 1.093 1.157 1.225 1.293 1.322 1.377 1.429 1.488 1.522 1.555 1.587 1.603 1.628 1.659 1.683 1.698 1.716 1.744 1.775 1.792 1.808 1.823 1.808 1.792 1.772 1.735 1.706 1.663 1.574 1.419 1.225 0.972 0.614 0.069 -0.69 -1.746 -3.276 -5.712 -8.468 -10.592 -12.311 -13.729 -14.956 -15.973 -16.814 -17.538 -18.251 -18.853 -19.392 -19.889 -20.346 -20.759 -21.127 -21.515 -21.869 -22.164 -22.463 -22.768 -23.012 -23.276 -23.555 -23.764 -23.975 -24.194 -24.417 -24.648 -24.805 -24.969 -25.221 -25.392 -25.58 -25.674 -25.852 -26.04 -26.256 -26.367 -26.887 -26.721 -26.842 -26.971 -27.251 -27.401 -27.563 -27.745 -27.963 -28.228 -28.528 -29.617 -6 ,22696 ,TETRA ,17603677,Sun Nov 28 16:44:45 CET,Sun Nov 28 19:08:56 CET,0.0 0.276 0.404 0.501 0.623 0.737 0.827 0.91 1.046 1.115 1.181 0.923 1.357 1.401 1.478 1.558 1.638 1.671 1.728 1.766 1.826 1.87 1.906 1.97 2.038 2.111 2.172 2.211 2.246 2.271 2.294 2.299 2.303 2.303 2.286 2.264 2.253 2.235 2.186 2.124 2.049 1.946 1.781 1.549 1.227 0.817 0.32 -0.361 -1.369 -2.766 -5.027 -7.704 -9.821 -11.563 -12.986 -14.194 -15.218 -16.111 -16.859 -17.562 -18.157 -18.701 -19.21 -19.69 -20.128 -20.517 -20.917 -21.279 -21.583 -21.892 -22.221 -22.477 -22.731 -23.001 -23.207 -23.423 -23.64 -23.85 -24.076 -24.231 -24.395 -24.652 -24.83 -25.014 -25.109 -25.303 -25.508 -25.721 -25.825 -26.337 -26.163 -26.291 -26.427 -26.727 -26.881 -27.056 -27.267 -27.501 -27.754 -28.111 -29.394 -7 ,25542 ,TETRA ,17603678,Sun Nov 28 16:44:48 CET,Sun Nov 28 19:03:26 CET,0.0 0.201 0.341 0.461 0.538 0.611 0.695 0.759 0.883 0.957 1.013 0.729 1.157 1.202 1.287 1.361 1.422 1.448 1.499 1.543 1.61 1.645 1.687 1.76 1.826 1.876 1.911 1.942 1.97 1.981 1.987 2.001 2.017 2.028 2.036 2.047 2.025 1.978 1.928 1.861 1.761 1.633 1.461 1.224 0.908 0.53 -0.034 -0.786 -1.815 -3.319 -5.717 -8.408 -10.491 -12.158 -13.528 -14.753 -15.793 -16.691 -17.445 -18.173 -18.78 -19.31 -19.823 -20.301 -20.73 -21.106 -21.485 -21.812 -22.097 -22.399 -22.712 -22.962 -23.205 -23.459 -23.66 -23.867 -24.085 -24.314 -24.551 -24.712 -24.87 -25.116 -25.287 -25.459 -25.549 -25.732 -25.931 -26.146 -26.26 -26.788 -26.627 -26.754 -26.878 -27.151 -27.303 -27.465 -27.634 -27.826 -28.076 -28.43 -29.372 -8 ,31765 ,TETRA ,17603679,Sun Nov 28 16:44:49 CET,Sun Nov 28 19:03:39 CET,0.0 0.388 0.566 0.689 0.795 0.88 0.95 1.02 1.158 1.213 1.272 1.01 1.438 1.483 1.562 1.632 1.698 1.723 1.763 1.821 1.899 1.941 1.992 2.073 2.149 2.21 2.26 2.299 2.345 2.393 2.43 2.459 2.486 2.521 2.566 2.597 2.604 2.614 2.647 2.649 2.575 2.455 2.318 2.178 1.977 1.677 1.168 0.407 -0.718 -2.351 -4.844 -7.696 -9.898 -11.629 -13.031 -14.243 -15.255 -16.135 -16.896 -17.621 -18.216 -18.747 -19.241 -19.691 -20.121 -20.505 -20.881 -21.216 -21.503 -21.793 -22.087 -22.334 -22.592 -22.861 -23.073 -23.289 -23.506 -23.726 -23.951 -24.104 -24.263 -24.512 -24.682 -24.858 -24.95 -25.142 -25.338 -25.543 -25.651 -26.172 -25.997 -26.123 -26.261 -26.559 -26.709 -26.869 -27.072 -27.3 -27.546 -27.892 -29.03 -9 ,6395 ,TETRA ,17603680,Sun Nov 28 16:44:46 CET,Sun Nov 28 19:03:20 CET,0.0 0.247 0.453 0.633 0.742 0.803 0.852 0.9 0.993 1.037 1.076 0.759 1.169 1.205 1.261 1.304 1.34 1.357 1.386 1.416 1.467 1.498 1.531 1.561 1.587 1.615 1.63 1.643 1.663 1.687 1.709 1.726 1.734 1.734 1.725 1.708 1.69 1.667 1.63 1.561 1.467 1.336 1.152 0.938 0.627 0.206 -0.358 -1.081 -2.078 -3.584 -6.13 -9.0 -11.152 -12.932 -14.409 -15.675 -16.744 -17.655 -18.41 -19.145 -19.768 -20.311 -20.807 -21.246 -21.652 -22.026 -22.414 -22.757 -23.052 -23.355 -23.664 -23.911 -24.162 -24.427 -24.632 -24.842 -25.064 -25.295 -25.538 -25.707 -25.881 -26.154 -26.33 -26.508 -26.606 -26.815 -27.025 -27.237 -27.345 -27.86 -27.699 -27.824 -27.946 -28.206 -28.351 -28.507 -28.691 -28.906 -29.162 -29.516 -30.931 -10 ,20833 ,TETRA ,17603681,Sun Nov 28 16:44:47 CET,Sun Nov 28 19:05:22 CET,0.0 0.297 0.459 0.595 0.706 0.799 0.888 0.967 1.106 1.171 1.234 0.964 1.388 1.427 1.504 1.572 1.659 1.706 1.762 1.799 1.85 1.889 1.926 1.973 2.02 2.064 2.112 2.163 2.216 2.271 2.314 2.334 2.346 2.346 2.346 2.334 2.308 2.292 2.242 2.149 2.069 1.99 1.841 1.626 1.316 0.879 0.301 -0.442 -1.477 -2.988 -5.42 -8.177 -10.309 -12.046 -13.469 -14.68 -15.734 -16.681 -17.451 -18.192 -18.805 -19.337 -19.84 -20.307 -20.73 -21.102 -21.487 -21.825 -22.121 -22.423 -22.732 -22.981 -23.224 -23.481 -23.688 -23.901 -24.115 -24.333 -24.55 -24.704 -24.871 -25.129 -25.302 -25.479 -25.568 -25.757 -25.95 -26.157 -26.273 -26.807 -26.654 -26.78 -26.913 -27.204 -27.356 -27.518 -27.703 -27.905 -28.132 -28.43 -29.307 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt deleted file mode 100644 index f08be0f1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14791 ,TETRA ,17603682,Sun Nov 28 16:44:45 CET,Sun Nov 28 19:02:06 CET,0.0 1.944 2.312 2.548 2.727 2.891 3.06 3.198 3.393 3.47 3.537 3.269 3.696 3.748 3.845 3.922 3.995 4.025 4.073 4.116 4.181 4.231 4.279 4.325 4.362 4.39 4.417 4.437 4.444 4.448 4.437 4.399 4.35 4.313 4.263 4.181 4.097 3.979 3.83 3.659 3.465 3.2 2.823 2.392 1.834 1.14 0.208 -1.025 -2.724 -5.13 -8.799 -12.77 -15.805 -18.3 -20.379 -22.095 -23.5 -24.747 -25.804 -26.854 -27.732 -28.487 -29.196 -29.823 -30.367 -30.846 -31.34 -31.787 -32.179 -32.592 -33.021 -33.365 -33.734 -34.12 -34.426 -34.768 -35.129 -35.494 -35.847 -36.075 -36.311 -36.671 -36.93 -37.217 -37.369 -37.702 -38.078 -38.431 -38.581 -39.17 -39.138 -39.345 -39.565 -40.078 -40.362 -40.66 -41.039 -41.509 -42.039 -42.703 -45.207 -2 ,7284 ,TETRA ,17603683,Sun Nov 28 16:45:43 CET,Sun Nov 28 19:01:05 CET,0.0 1.591 1.956 2.216 2.418 2.582 2.722 2.854 3.095 3.189 3.269 3.038 3.477 3.526 3.62 3.717 3.795 3.827 3.916 3.996 4.07 4.102 4.132 4.18 4.219 4.264 4.294 4.308 4.314 4.304 4.286 4.269 4.247 4.213 4.17 4.098 4.019 3.912 3.774 3.623 3.418 3.135 2.77 2.362 1.841 1.178 0.247 -0.952 -2.578 -4.984 -8.674 -12.681 -15.774 -18.269 -20.297 -21.993 -23.429 -24.699 -25.755 -26.795 -27.661 -28.392 -29.054 -29.672 -30.244 -30.763 -31.317 -31.79 -32.18 -32.616 -33.087 -33.452 -33.804 -34.179 -34.484 -34.794 -35.107 -35.422 -35.745 -35.986 -36.248 -36.658 -36.944 -37.233 -37.381 -37.706 -38.089 -38.46 -38.628 -39.226 -39.206 -39.46 -39.74 -40.304 -40.595 -40.896 -41.236 -41.613 -42.1 -42.864 -45.212 -3 ,16624 ,TETRA ,17603684,Sun Nov 28 16:44:46 CET,Sun Nov 28 19:00:11 CET,0.0 2.183 2.62 2.932 3.167 3.364 3.542 3.696 3.934 4.043 4.158 3.978 4.447 4.522 4.63 4.727 4.832 4.877 4.933 4.969 5.023 5.072 5.114 5.184 5.24 5.269 5.291 5.306 5.336 5.327 5.296 5.26 5.217 5.168 5.098 4.995 4.886 4.769 4.634 4.463 4.234 3.938 3.554 3.102 2.52 1.817 0.886 -0.342 -2.034 -4.451 -8.17 -12.218 -15.291 -17.744 -19.754 -21.459 -22.887 -24.134 -25.191 -26.233 -27.095 -27.84 -28.541 -29.23 -29.91 -30.53 -31.153 -31.724 -32.212 -32.666 -33.099 -33.453 -33.818 -34.191 -34.499 -34.814 -35.126 -35.443 -35.766 -35.998 -36.239 -36.609 -36.885 -37.164 -37.294 -37.581 -37.905 -38.245 -38.418 -39.047 -39.05 -39.281 -39.535 -40.049 -40.365 -40.722 -41.119 -41.573 -42.024 -42.632 -45.53 -4 ,2982 ,TETRA ,17603685,Sun Nov 28 16:44:47 CET,Sun Nov 28 19:03:09 CET,0.0 1.551 1.947 2.282 2.539 2.718 2.849 2.973 3.172 3.274 3.375 3.129 3.556 3.601 3.727 3.848 3.926 3.967 4.041 4.092 4.179 4.248 4.286 4.309 4.341 4.378 4.402 4.407 4.409 4.411 4.404 4.388 4.36 4.33 4.31 4.273 4.201 4.089 3.941 3.755 3.534 3.269 2.904 2.483 1.93 1.224 0.289 -0.932 -2.584 -4.994 -8.805 -12.941 -16.059 -18.544 -20.565 -22.293 -23.733 -24.964 -25.995 -27.022 -27.914 -28.703 -29.445 -30.096 -30.664 -31.193 -31.713 -32.157 -32.555 -32.994 -33.456 -33.825 -34.215 -34.613 -34.928 -35.274 -35.625 -35.978 -36.33 -36.567 -36.809 -37.178 -37.445 -37.72 -37.859 -38.157 -38.468 -38.811 -38.995 -39.605 -39.632 -39.889 -40.161 -40.739 -41.032 -41.361 -41.711 -42.109 -42.646 -43.432 -46.809 -5 ,627 ,TETRA ,17603686,Sun Nov 28 16:44:48 CET,Sun Nov 28 19:02:55 CET,0.0 1.266 1.651 1.922 2.126 2.291 2.442 2.569 2.752 2.836 2.915 2.687 3.128 3.182 3.287 3.378 3.468 3.505 3.566 3.622 3.697 3.742 3.776 3.805 3.833 3.857 3.866 3.865 3.875 3.88 3.864 3.847 3.823 3.79 3.75 3.696 3.615 3.494 3.345 3.159 2.928 2.631 2.255 1.833 1.274 0.583 -0.332 -1.55 -3.226 -5.652 -9.361 -13.374 -16.388 -18.772 -20.806 -22.557 -23.979 -25.184 -26.183 -27.145 -27.963 -28.703 -29.413 -30.103 -30.738 -31.291 -31.869 -32.369 -32.768 -33.178 -33.6 -33.955 -34.33 -34.709 -35.002 -35.318 -35.638 -35.945 -36.276 -36.517 -36.757 -37.161 -37.479 -37.809 -37.968 -38.288 -38.62 -38.962 -39.121 -39.704 -39.678 -39.903 -40.138 -40.705 -41.054 -41.416 -41.773 -42.19 -42.704 -43.363 -45.729 -6 ,29488 ,TETRA ,17603687,Sun Nov 28 16:44:52 CET,Sun Nov 28 19:00:55 CET,0.0 1.198 1.564 1.818 2.018 2.192 2.333 2.463 2.664 2.738 2.81 2.547 2.981 3.04 3.142 3.235 3.312 3.344 3.397 3.45 3.527 3.558 3.581 3.62 3.657 3.685 3.696 3.708 3.735 3.76 3.768 3.756 3.768 3.807 3.8 3.724 3.617 3.48 3.311 3.115 2.901 2.632 2.252 1.807 1.228 0.521 -0.405 -1.652 -3.385 -5.852 -9.632 -13.725 -16.828 -19.339 -21.41 -23.178 -24.648 -25.898 -26.964 -28.003 -28.867 -29.626 -30.331 -30.993 -31.586 -32.101 -32.64 -33.13 -33.556 -33.993 -34.436 -34.799 -35.177 -35.59 -35.914 -36.244 -36.593 -36.956 -37.333 -37.578 -37.809 -38.166 -38.411 -38.661 -38.797 -39.073 -39.386 -39.768 -39.974 -40.597 -40.603 -40.836 -41.081 -41.572 -41.845 -42.13 -42.461 -42.911 -43.439 -44.212 -46.777 -7 ,27498 ,TETRA ,17603688,Sun Nov 28 16:44:50 CET,Sun Nov 28 19:00:54 CET,0.0 1.875 2.208 2.471 2.677 2.844 2.995 3.125 3.308 3.384 3.46 3.209 3.645 3.709 3.829 3.913 3.98 4.011 4.066 4.118 4.2 4.238 4.267 4.314 4.343 4.371 4.393 4.421 4.455 4.469 4.463 4.436 4.412 4.391 4.359 4.274 4.19 4.09 3.94 3.756 3.553 3.293 2.916 2.472 1.893 1.174 0.233 -0.933 -2.564 -4.987 -8.695 -12.759 -15.872 -18.368 -20.399 -22.111 -23.552 -24.813 -25.871 -26.904 -27.773 -28.529 -29.226 -29.88 -30.498 -31.066 -31.646 -32.17 -32.627 -33.076 -33.521 -33.894 -34.289 -34.718 -35.072 -35.418 -35.761 -36.12 -36.478 -36.712 -36.954 -37.336 -37.592 -37.86 -38.001 -38.295 -38.613 -38.96 -39.145 -39.759 -39.748 -39.972 -40.216 -40.712 -40.97 -41.268 -41.704 -42.213 -42.742 -43.484 -46.68 -8 ,12953 ,TETRA ,17603689,Sun Nov 28 16:44:48 CET,Sun Nov 28 19:02:41 CET,0.0 1.63 2.001 2.252 2.452 2.628 2.77 2.895 3.116 3.209 3.276 3.037 3.491 3.568 3.682 3.768 3.878 3.925 3.993 4.088 4.239 4.296 4.331 4.37 4.392 4.415 4.438 4.451 4.457 4.457 4.448 4.425 4.389 4.347 4.301 4.217 4.103 3.985 3.859 3.722 3.537 3.283 2.951 2.567 2.042 1.335 0.48 -0.669 -2.355 -4.69 -8.257 -12.159 -15.169 -17.596 -19.548 -21.215 -22.622 -23.857 -24.887 -25.858 -26.67 -27.385 -28.05 -28.661 -29.229 -29.748 -30.265 -30.709 -31.095 -31.531 -31.982 -32.323 -32.665 -33.009 -33.29 -33.591 -33.887 -34.191 -34.535 -34.792 -35.08 -35.575 -35.929 -36.268 -36.424 -36.739 -37.072 -37.44 -37.626 -38.233 -38.216 -38.464 -38.769 -39.459 -39.819 -40.163 -40.528 -40.95 -41.427 -42.182 -45.403 -9 ,16915 ,TETRA ,17603690,Sun Nov 28 16:44:50 CET,Sun Nov 28 19:00:07 CET,0.0 1.855 2.263 2.539 2.759 2.984 3.16 3.282 3.494 3.589 3.671 3.429 3.9 3.991 4.15 4.27 4.352 4.4 4.537 4.668 4.828 4.9 4.938 4.977 5.022 5.104 5.199 5.284 5.382 5.484 5.586 5.685 5.76 5.832 5.919 5.929 5.838 5.718 5.59 5.467 5.288 5.021 4.666 4.238 3.664 2.961 2.093 0.912 -0.77 -3.144 -6.851 -10.948 -14.039 -16.457 -18.417 -20.111 -21.532 -22.768 -23.803 -24.806 -25.653 -26.381 -27.068 -27.724 -28.336 -28.922 -29.547 -30.051 -30.441 -30.852 -31.282 -31.627 -31.98 -32.373 -32.699 -33.032 -33.377 -33.712 -34.039 -34.265 -34.509 -34.906 -35.181 -35.446 -35.581 -35.859 -36.162 -36.516 -36.705 -37.324 -37.324 -37.551 -37.79 -38.297 -38.595 -38.981 -39.396 -39.837 -40.363 -41.029 -43.588 -10 ,27425 ,TETRA ,17603691,Sun Nov 28 16:45:45 CET,Sun Nov 28 19:00:41 CET,0.0 1.251 1.627 1.857 2.041 2.197 2.336 2.464 2.661 2.768 2.864 2.632 3.08 3.133 3.225 3.308 3.377 3.411 3.496 3.568 3.649 3.694 3.719 3.758 3.794 3.837 3.861 3.862 3.867 3.882 3.882 3.844 3.799 3.763 3.74 3.706 3.627 3.505 3.354 3.173 2.956 2.677 2.319 1.921 1.398 0.718 -0.217 -1.449 -3.155 -5.582 -9.27 -13.314 -16.364 -18.758 -20.706 -22.41 -23.856 -25.104 -26.143 -27.146 -27.988 -28.754 -29.493 -30.163 -30.773 -31.307 -31.845 -32.347 -32.795 -33.245 -33.703 -34.079 -34.474 -34.871 -35.178 -35.504 -35.84 -36.186 -36.534 -36.769 -37.002 -37.343 -37.582 -37.873 -38.027 -38.348 -38.68 -39.014 -39.2 -39.819 -39.8 -40.006 -40.216 -40.702 -41.005 -41.361 -41.727 -42.14 -42.711 -43.579 -46.211 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index cc307805..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5443 ,TETRA ,17603692,Sun Nov 28 16:45:47 CET,Sun Nov 28 18:59:30 CET,0.0 1.159 1.483 1.721 1.951 2.178 2.364 2.522 2.816 2.949 3.071 2.921 3.409 3.521 3.739 3.946 4.146 4.242 4.419 4.588 4.841 5.011 5.172 5.395 5.622 5.849 6.063 6.272 6.543 6.807 7.075 7.389 7.689 7.994 8.365 8.789 9.199 9.654 10.161 10.705 11.273 11.933 12.715 13.513 14.48 15.607 16.948 18.499 20.353 22.628 25.531 27.988 29.514 30.557 31.253 31.754 32.116 32.353 32.487 32.574 32.602 32.586 32.565 32.551 32.522 32.484 32.426 32.345 32.267 32.191 32.098 31.993 31.859 31.73 31.637 31.514 31.38 31.249 31.093 30.971 30.849 30.674 30.546 30.402 30.333 30.185 29.995 29.786 29.684 29.218 29.242 29.019 28.8 28.404 28.168 27.918 27.616 27.173 26.604 25.798 23.192 -2 ,19927 ,TETRA ,17603693,Sun Nov 28 16:45:48 CET,Sun Nov 28 18:58:56 CET,0.0 1.029 1.357 1.592 1.812 2.007 2.173 2.329 2.621 2.756 2.888 2.757 3.251 3.358 3.561 3.761 3.951 4.043 4.221 4.391 4.657 4.832 5.002 5.249 5.48 5.703 5.918 6.134 6.416 6.686 6.952 7.276 7.602 7.923 8.292 8.708 9.117 9.581 10.099 10.652 11.234 11.896 12.671 13.469 14.424 15.506 16.828 18.443 20.391 22.712 25.742 28.47 30.118 31.189 31.961 32.521 32.853 33.112 33.329 33.482 33.573 33.642 33.657 33.644 33.616 33.589 33.572 33.543 33.489 33.399 33.29 33.198 33.091 32.961 32.841 32.711 32.578 32.445 32.303 32.196 32.089 31.905 31.774 31.624 31.526 31.293 31.044 30.797 30.674 30.194 30.183 29.981 29.803 29.382 29.106 28.821 28.484 28.096 27.621 26.851 22.703 -3 ,26969 ,TETRA ,17603694,Sun Nov 28 16:45:43 CET,Sun Nov 28 18:59:09 CET,0.0 1.359 1.672 1.923 2.138 2.32 2.487 2.642 2.936 3.074 3.209 3.07 3.549 3.652 3.859 4.054 4.243 4.336 4.508 4.673 4.927 5.093 5.258 5.503 5.733 5.95 6.163 6.37 6.644 6.913 7.168 7.482 7.787 8.087 8.449 8.862 9.255 9.701 10.211 10.757 11.317 11.962 12.75 13.571 14.548 15.642 16.928 18.428 20.277 22.569 25.522 28.049 29.564 30.622 31.343 31.828 32.192 32.46 32.637 32.77 32.819 32.822 32.792 32.721 32.635 32.555 32.426 32.288 32.168 32.035 31.916 31.815 31.697 31.567 31.436 31.272 31.087 30.885 30.661 30.516 30.386 30.183 30.022 29.852 29.767 29.593 29.407 29.179 29.055 28.586 28.63 28.426 28.22 27.871 27.683 27.411 27.075 26.712 26.228 25.497 20.258 -4 ,12538 ,TETRA ,17603695,Sun Nov 28 16:45:42 CET,Sun Nov 28 19:01:16 CET,0.0 1.469 1.782 2.009 2.204 2.372 2.525 2.67 2.928 3.053 3.176 3.033 3.526 3.639 3.848 4.036 4.225 4.318 4.5 4.677 4.929 5.09 5.249 5.475 5.695 5.924 6.146 6.355 6.629 6.899 7.168 7.498 7.821 8.137 8.496 8.902 9.3 9.755 10.252 10.777 11.346 12.009 12.808 13.61 14.548 15.648 16.999 18.583 20.478 22.771 25.697 28.246 29.769 30.79 31.472 31.94 32.272 32.527 32.681 32.743 32.754 32.739 32.704 32.657 32.59 32.499 32.386 32.286 32.177 32.014 31.83 31.691 31.539 31.368 31.231 31.093 30.943 30.781 30.609 30.492 30.372 30.179 30.042 29.902 29.827 29.653 29.464 29.246 29.132 28.688 28.815 28.664 28.481 28.039 27.811 27.544 27.214 26.839 26.336 25.507 22.385 -5 ,4583 ,TETRA ,17603696,Sun Nov 28 16:45:44 CET,Sun Nov 28 18:59:46 CET,0.0 1.548 1.945 2.234 2.447 2.644 2.82 2.978 3.255 3.379 3.501 3.347 3.841 3.949 4.167 4.374 4.565 4.657 4.854 5.05 5.316 5.49 5.658 5.897 6.125 6.349 6.571 6.794 7.087 7.362 7.625 7.955 8.275 8.583 8.945 9.369 9.79 10.242 10.739 11.284 11.844 12.488 13.281 14.104 15.084 16.202 17.522 19.057 20.941 23.284 26.245 28.717 30.141 31.109 31.796 32.227 32.474 32.649 32.786 32.847 32.844 32.812 32.75 32.679 32.595 32.503 32.398 32.32 32.252 32.154 32.027 31.925 31.804 31.628 31.499 31.363 31.216 31.054 30.857 30.709 30.552 30.334 30.182 30.011 29.915 29.722 29.469 29.148 28.984 28.473 28.489 28.309 28.117 27.644 27.346 27.023 26.708 26.348 25.855 25.178 22.647 -6 ,28315 ,TETRA ,17603697,Sun Nov 28 16:45:43 CET,Sun Nov 28 18:58:58 CET,0.0 1.185 1.473 1.702 1.899 2.078 2.252 2.406 2.666 2.797 2.926 2.767 3.25 3.355 3.559 3.755 3.95 4.044 4.218 4.398 4.667 4.844 5.014 5.253 5.48 5.702 5.936 6.165 6.445 6.713 6.986 7.318 7.631 7.931 8.286 8.697 9.11 9.594 10.113 10.644 11.215 11.863 12.64 13.443 14.419 15.571 16.933 18.554 20.482 22.823 25.832 28.472 30.054 31.085 31.822 32.281 32.541 32.744 32.9 33.005 32.983 32.914 32.803 32.647 32.537 32.467 32.365 32.238 32.118 31.994 31.845 31.697 31.54 31.361 31.218 31.079 30.933 30.761 30.563 30.43 30.293 30.061 29.885 29.714 29.627 29.413 29.163 28.904 28.77 28.268 28.305 28.152 27.98 27.601 27.339 26.984 26.61 26.244 25.769 24.901 21.532 -7 ,21862 ,TETRA ,17603698,Sun Nov 28 16:45:45 CET,Sun Nov 28 18:58:56 CET,0.0 1.462 1.805 2.053 2.266 2.445 2.617 2.774 3.047 3.182 3.315 3.174 3.662 3.765 3.963 4.158 4.348 4.439 4.62 4.793 5.04 5.202 5.363 5.602 5.833 6.063 6.291 6.504 6.795 7.091 7.369 7.697 8.015 8.318 8.676 9.081 9.474 9.924 10.416 10.947 11.51 12.165 12.956 13.782 14.742 15.839 17.152 18.646 20.494 22.804 25.77 28.254 29.773 30.864 31.586 32.075 32.433 32.687 32.867 33.006 33.077 33.105 33.092 33.07 33.027 32.957 32.889 32.828 32.764 32.69 32.61 32.523 32.422 32.319 32.22 32.103 31.976 31.821 31.65 31.521 31.386 31.192 31.052 30.875 30.784 30.602 30.386 30.141 30.026 29.556 29.561 29.374 29.198 28.781 28.551 28.303 28.023 27.703 27.285 26.614 23.015 -8 ,22698 ,TETRA ,17603699,Sun Nov 28 16:45:43 CET,Sun Nov 28 18:59:07 CET,0.0 0.856 1.192 1.46 1.672 1.855 2.021 2.174 2.442 2.565 2.683 2.545 3.038 3.152 3.361 3.551 3.735 3.829 4.011 4.18 4.42 4.583 4.751 4.992 5.226 5.445 5.656 5.867 6.141 6.416 6.68 6.991 7.301 7.609 7.971 8.376 8.775 9.241 9.753 10.283 10.843 11.476 12.236 13.048 14.035 15.171 16.483 18.03 19.934 22.248 25.309 27.981 29.499 30.476 31.12 31.592 31.924 32.158 32.294 32.364 32.418 32.454 32.476 32.482 32.491 32.488 32.444 32.383 32.306 32.195 32.071 31.961 31.836 31.72 31.637 31.54 31.422 31.284 31.123 30.999 30.879 30.667 30.51 30.339 30.246 30.04 29.795 29.547 29.419 28.942 29.015 28.846 28.653 28.278 28.082 27.836 27.523 27.151 26.663 25.899 21.331 -9 ,12629 ,TETRA ,17603700,Sun Nov 28 16:45:43 CET,Sun Nov 28 19:01:08 CET,0.0 1.151 1.475 1.699 1.905 2.114 2.306 2.463 2.743 2.876 3.001 2.846 3.33 3.431 3.638 3.842 4.033 4.119 4.288 4.455 4.693 4.851 5.004 5.236 5.461 5.672 5.881 6.093 6.374 6.637 6.892 7.21 7.519 7.835 8.217 8.631 9.026 9.468 9.956 10.494 11.079 11.759 12.552 13.362 14.326 15.435 16.776 18.312 20.18 22.5 25.409 28.024 29.648 30.644 31.3 31.813 32.194 32.431 32.588 32.71 32.756 32.777 32.785 32.748 32.692 32.606 32.5 32.416 32.324 32.217 32.109 32.024 31.924 31.796 31.7 31.603 31.475 31.31 31.141 31.024 30.909 30.735 30.606 30.458 30.372 30.164 29.913 29.634 29.471 28.936 28.874 28.654 28.427 27.902 27.581 27.267 26.942 26.507 25.882 24.88 20.169 -10 ,235 ,TETRA ,17603701,Sun Nov 28 16:45:44 CET,Sun Nov 28 19:00:30 CET,0.0 1.05 1.371 1.611 1.819 2.003 2.163 2.313 2.607 2.742 2.866 2.708 3.188 3.293 3.499 3.693 3.888 3.981 4.161 4.342 4.595 4.757 4.92 5.16 5.391 5.618 5.836 6.048 6.328 6.599 6.868 7.192 7.504 7.806 8.165 8.592 8.994 9.433 9.92 10.446 11.02 11.691 12.512 13.351 14.348 15.484 16.798 18.342 20.255 22.61 25.619 28.277 29.877 30.896 31.602 32.134 32.508 32.752 32.923 33.059 33.102 33.103 33.089 33.051 32.995 32.953 32.91 32.848 32.798 32.746 32.666 32.568 32.431 32.291 32.202 32.107 31.998 31.888 31.742 31.613 31.491 31.3 31.154 31.003 30.913 30.714 30.485 30.23 30.097 29.619 29.731 29.604 29.472 29.129 28.899 28.647 28.338 27.934 27.401 26.591 21.992 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt deleted file mode 100644 index 3981c04f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4541 ,TETRA ,17603702,Sun Nov 28 16:45:43 CET,Sun Nov 28 19:02:21 CET,0.0 1.611 2.018 2.312 2.581 2.811 3.019 3.211 3.551 3.713 3.871 3.8 4.312 4.442 4.697 4.909 5.104 5.2 5.38 5.557 5.82 5.995 6.166 6.407 6.646 6.873 7.095 7.335 7.662 7.963 8.251 8.601 8.939 9.265 9.64 10.085 10.506 10.943 11.402 11.888 12.397 12.977 13.696 14.435 15.308 16.281 17.421 18.733 20.28 22.154 24.462 26.426 27.63 28.4 28.808 29.045 29.197 29.22 29.193 29.163 29.128 29.084 29.046 29.011 28.944 28.86 28.775 28.7 28.635 28.554 28.455 28.379 28.3 28.19 28.083 27.971 27.866 27.758 27.633 27.543 27.449 27.284 27.163 27.025 26.946 26.796 26.642 26.454 26.351 25.893 26.048 25.949 25.844 25.55 25.382 25.212 25.009 24.766 24.475 24.041 21.756 -2 ,9621 ,TETRA ,17603703,Sun Nov 28 16:45:45 CET,Sun Nov 28 19:02:22 CET,0.0 2.439 2.905 3.253 3.553 3.808 4.027 4.223 4.552 4.695 4.839 4.748 5.251 5.376 5.627 5.842 6.035 6.142 6.36 6.556 6.812 6.97 7.129 7.379 7.634 7.866 8.076 8.28 8.557 8.827 9.073 9.38 9.693 9.988 10.328 10.744 11.154 11.572 12.026 12.54 13.089 13.703 14.445 15.199 16.051 17.005 18.171 19.538 21.147 23.002 25.247 27.058 28.081 28.782 29.242 29.533 29.674 29.728 29.75 29.748 29.721 29.665 29.596 29.517 29.426 29.346 29.235 29.11 29.019 28.929 28.821 28.737 28.644 28.535 28.446 28.347 28.237 28.106 27.98 27.907 27.809 27.66 27.565 27.463 27.407 27.281 27.119 26.924 26.841 26.405 26.563 26.456 26.347 26.095 25.947 25.778 25.573 25.312 25.015 24.562 22.144 -3 ,15212 ,TETRA ,17603704,Sun Nov 28 16:45:44 CET,Sun Nov 28 19:03:50 CET,0.0 2.122 2.615 2.908 3.153 3.377 3.578 3.75 4.052 4.193 4.331 4.226 4.747 4.889 5.137 5.366 5.59 5.697 5.912 6.128 6.442 6.631 6.809 7.063 7.304 7.529 7.757 7.986 8.27 8.556 8.841 9.172 9.478 9.767 10.098 10.481 10.857 11.269 11.703 12.167 12.7 13.33 14.064 14.784 15.614 16.558 17.786 19.263 20.911 22.943 25.528 27.765 29.023 29.714 30.164 30.464 30.641 30.737 30.783 30.783 30.749 30.71 30.664 30.607 30.53 30.443 30.36 30.277 30.188 30.102 30.005 29.924 29.846 29.745 29.659 29.572 29.474 29.372 29.258 29.174 29.089 28.945 28.849 28.746 28.693 28.585 28.445 28.298 28.223 27.786 27.967 27.875 27.768 27.516 27.367 27.179 26.94 26.684 26.386 25.913 24.457 -4 ,29508 ,TETRA ,17603705,Sun Nov 28 16:46:43 CET,Sun Nov 28 19:03:05 CET,0.0 1.656 2.17 2.607 2.952 3.198 3.414 3.615 3.982 4.152 4.326 4.276 4.806 4.945 5.201 5.433 5.654 5.759 5.969 6.178 6.475 6.667 6.853 7.107 7.331 7.543 7.767 7.985 8.253 8.536 8.833 9.161 9.463 9.769 10.121 10.52 10.915 11.364 11.834 12.306 12.818 13.421 14.159 14.881 15.728 16.728 17.893 19.219 20.758 22.611 24.96 26.983 28.164 28.835 29.242 29.519 29.675 29.737 29.762 29.764 29.736 29.679 29.599 29.54 29.472 29.378 29.278 29.191 29.112 29.023 28.902 28.787 28.672 28.549 28.453 28.357 28.256 28.126 27.969 27.871 27.778 27.623 27.5 27.378 27.317 27.178 27.01 26.831 26.738 26.285 26.43 26.301 26.168 25.862 25.66 25.432 25.209 24.912 24.506 24.006 21.545 -5 ,20114 ,TETRA ,17603706,Sun Nov 28 16:46:43 CET,Sun Nov 28 19:02:19 CET,0.0 1.33 1.802 2.123 2.39 2.621 2.839 3.04 3.355 3.5 3.639 3.52 4.034 4.167 4.422 4.643 4.841 4.945 5.15 5.346 5.612 5.78 5.953 6.215 6.464 6.707 6.932 7.135 7.405 7.683 7.961 8.292 8.599 8.903 9.263 9.661 10.046 10.478 10.952 11.467 12.023 12.666 13.428 14.214 15.124 16.132 17.299 18.622 20.227 22.233 24.808 26.962 28.182 28.886 29.327 29.648 29.86 30.013 30.1 30.11 30.087 30.068 30.043 29.991 29.913 29.826 29.723 29.627 29.549 29.461 29.355 29.271 29.178 29.067 28.975 28.863 28.744 28.626 28.491 28.398 28.302 28.138 27.995 27.837 27.757 27.598 27.465 27.31 27.209 26.748 26.855 26.709 26.583 26.291 26.11 25.919 25.68 25.377 25.015 24.503 22.448 -6 ,2265 ,TETRA ,17603707,Sun Nov 28 16:46:45 CET,Sun Nov 28 19:02:18 CET,0.0 1.539 1.974 2.287 2.555 2.789 2.993 3.182 3.537 3.692 3.833 3.729 4.243 4.369 4.598 4.827 5.061 5.175 5.379 5.578 5.852 6.026 6.204 6.461 6.707 6.952 7.198 7.429 7.722 8.013 8.306 8.663 9.003 9.328 9.699 10.111 10.507 10.938 11.389 11.872 12.402 13.037 13.78 14.51 15.354 16.315 17.479 18.773 20.284 22.132 24.413 26.336 27.466 28.105 28.488 28.741 28.851 28.896 28.917 28.879 28.801 28.716 28.658 28.605 28.518 28.42 28.316 28.216 28.127 28.024 27.908 27.791 27.675 27.56 27.458 27.35 27.226 27.094 26.968 26.87 26.759 26.589 26.466 26.332 26.266 26.139 25.991 25.811 25.708 25.247 25.403 25.286 25.163 24.891 24.731 24.547 24.333 24.085 23.772 23.364 21.299 -7 ,7378 ,TETRA ,17603708,Sun Nov 28 16:46:44 CET,Sun Nov 28 19:03:34 CET,0.0 1.621 2.141 2.473 2.74 2.965 3.169 3.353 3.688 3.837 3.982 3.889 4.396 4.521 4.752 4.986 5.212 5.311 5.508 5.711 6.012 6.202 6.378 6.627 6.87 7.099 7.329 7.555 7.842 8.111 8.366 8.677 8.986 9.273 9.606 9.993 10.362 10.781 11.229 11.702 12.207 12.788 13.479 14.197 15.027 15.956 17.071 18.349 19.927 21.925 24.373 26.3 27.424 28.117 28.536 28.793 28.907 28.957 28.974 28.947 28.892 28.833 28.767 28.697 28.612 28.517 28.411 28.311 28.24 28.156 28.043 27.955 27.861 27.747 27.658 27.542 27.42 27.31 27.193 27.111 27.023 26.873 26.758 26.625 26.556 26.43 26.279 26.105 26.011 25.553 25.689 25.567 25.456 25.212 25.064 24.876 24.67 24.448 24.123 23.638 21.968 -8 ,22404 ,TETRA ,17603709,Sun Nov 28 16:46:44 CET,Sun Nov 28 19:02:05 CET,0.0 1.367 1.748 2.025 2.265 2.484 2.685 2.867 3.185 3.337 3.475 3.342 3.846 3.976 4.216 4.417 4.61 4.715 4.917 5.101 5.377 5.554 5.724 5.97 6.217 6.455 6.69 6.92 7.197 7.464 7.718 8.048 8.372 8.657 8.988 9.372 9.746 10.159 10.599 11.07 11.582 12.168 12.869 13.573 14.381 15.304 16.4 17.671 19.171 20.974 23.395 25.497 26.69 27.407 27.805 28.062 28.237 28.347 28.392 28.385 28.35 28.292 28.221 28.137 28.051 27.973 27.858 27.717 27.607 27.51 27.394 27.296 27.191 27.082 26.995 26.895 26.79 26.667 26.53 26.443 26.352 26.2 26.078 25.943 25.877 25.75 25.623 25.483 25.393 24.937 25.075 24.953 24.817 24.502 24.325 24.137 23.912 23.647 23.301 22.775 20.937 -9 ,4857 ,TETRA ,17603710,Sun Nov 28 16:46:46 CET,Sun Nov 28 19:02:17 CET,0.0 1.694 2.117 2.428 2.686 2.903 3.105 3.281 3.592 3.747 3.904 3.816 4.332 4.468 4.728 4.972 5.194 5.296 5.5 5.727 6.093 6.326 6.539 6.814 7.07 7.313 7.549 7.762 8.022 8.276 8.519 8.848 9.183 9.491 9.847 10.266 10.657 11.082 11.537 12.022 12.559 13.15 13.848 14.591 15.468 16.473 17.627 18.951 20.546 22.51 24.905 26.84 27.957 28.647 29.121 29.442 29.606 29.7 29.749 29.745 29.722 29.69 29.63 29.549 29.462 29.384 29.299 29.192 29.086 28.99 28.893 28.796 28.684 28.569 28.489 28.404 28.3 28.195 28.088 27.994 27.895 27.745 27.638 27.535 27.476 27.342 27.19 27.009 26.913 26.463 26.602 26.467 26.325 26.022 25.853 25.653 25.419 25.137 24.769 24.271 22.297 -10 ,16670 ,TETRA ,17603711,Sun Nov 28 16:46:48 CET,Sun Nov 28 19:01:43 CET,0.0 1.7 2.159 2.492 2.784 3.031 3.237 3.431 3.783 3.934 4.083 4.0 4.509 4.632 4.856 5.066 5.269 5.37 5.573 5.774 6.053 6.217 6.383 6.639 6.882 7.11 7.333 7.567 7.872 8.148 8.415 8.755 9.098 9.435 9.806 10.209 10.59 10.991 11.448 11.951 12.479 13.104 13.839 14.563 15.412 16.36 17.485 18.862 20.499 22.338 24.56 26.466 27.546 28.146 28.484 28.693 28.811 28.865 28.906 28.914 28.881 28.82 28.763 28.709 28.617 28.506 28.398 28.3 28.193 28.088 27.988 27.901 27.801 27.688 27.607 27.526 27.429 27.316 27.197 27.112 27.018 26.862 26.748 26.628 26.558 26.391 26.22 26.062 25.986 25.552 25.713 25.614 25.504 25.26 25.104 24.891 24.669 24.395 24.063 23.634 21.311 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 8feb6c10..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20333 ,KEBNE ,17070688,Fri Dec 24 22:58:38 CET,Sat Dec 25 00:52:58 CET,0.0 1.75 2.093 2.32 2.521 2.699 2.853 3.006 3.27 3.383 3.495 3.321 3.803 3.9 4.065 4.204 4.332 4.394 4.522 4.646 4.822 4.939 5.046 5.196 5.344 5.484 5.623 5.759 5.92 6.065 6.214 6.404 6.575 6.724 6.9 7.095 7.271 7.476 7.697 7.926 8.166 8.422 8.718 9.023 9.367 9.76 10.202 10.619 11.021 11.405 11.701 11.69 11.46 11.168 10.891 10.598 10.273 9.941 9.656 9.369 9.091 8.844 8.615 8.393 8.18 7.979 7.772 7.583 7.418 7.242 7.06 6.907 6.741 6.56 6.419 6.283 6.136 5.985 5.833 5.724 5.605 5.41 5.276 5.137 5.061 4.903 4.756 4.605 4.519 4.046 4.209 4.105 3.998 3.731 3.572 3.405 3.234 3.041 2.78 2.417 1.058 -2 ,20590 ,KEBNE ,17070689,Fri Dec 24 23:00:45 CET,Sat Dec 25 00:55:05 CET,0.0 1.167 1.49 1.698 1.869 2.035 2.183 2.3 2.506 2.607 2.703 2.511 2.978 3.059 3.21 3.352 3.494 3.564 3.699 3.827 4.012 4.137 4.258 4.425 4.577 4.729 4.874 5.007 5.176 5.338 5.485 5.655 5.83 6.002 6.198 6.407 6.601 6.808 7.027 7.268 7.513 7.77 8.076 8.385 8.744 9.141 9.6 10.085 10.562 11.035 11.4 11.421 11.247 10.962 10.584 10.196 9.855 9.532 9.228 8.926 8.67 8.421 8.184 7.937 7.694 7.49 7.277 7.07 6.892 6.715 6.534 6.379 6.199 6.01 5.869 5.731 5.577 5.42 5.272 5.165 5.05 4.859 4.717 4.552 4.47 4.307 4.137 3.969 3.878 3.408 3.569 3.438 3.31 3.032 2.877 2.7 2.508 2.308 2.047 1.681 -0.377 -3 ,31796 ,KEBNE ,17070690,Fri Dec 24 23:00:45 CET,Sat Dec 25 00:55:10 CET,0.0 1.43 1.732 1.958 2.142 2.288 2.418 2.544 2.752 2.848 2.946 2.75 3.215 3.304 3.471 3.623 3.776 3.849 3.978 4.104 4.292 4.407 4.518 4.674 4.811 4.951 5.108 5.256 5.433 5.594 5.746 5.932 6.112 6.274 6.458 6.675 6.868 7.073 7.295 7.541 7.808 8.097 8.42 8.73 9.079 9.454 9.854 10.277 10.736 11.174 11.539 11.605 11.456 11.238 10.988 10.711 10.432 10.166 9.914 9.648 9.406 9.171 8.941 8.73 8.54 8.369 8.188 8.019 7.857 7.683 7.507 7.363 7.22 7.065 6.937 6.802 6.667 6.521 6.363 6.251 6.138 5.955 5.814 5.669 5.589 5.417 5.245 5.059 4.96 4.476 4.635 4.531 4.42 4.175 4.043 3.886 3.679 3.45 3.194 2.806 1.546 -4 ,32172 ,KEBNE ,17070691,Fri Dec 24 23:01:48 CET,Sat Dec 25 00:56:47 CET,0.0 1.593 1.917 2.147 2.322 2.477 2.619 2.736 2.956 3.061 3.158 2.972 3.439 3.522 3.676 3.816 3.953 4.025 4.16 4.289 4.471 4.579 4.681 4.826 4.967 5.104 5.235 5.352 5.517 5.685 5.84 6.013 6.173 6.339 6.536 6.74 6.939 7.167 7.401 7.643 7.898 8.188 8.527 8.857 9.223 9.603 9.999 10.407 10.848 11.303 11.655 11.702 11.562 11.355 11.105 10.835 10.578 10.328 10.087 9.843 9.623 9.404 9.197 9.002 8.816 8.64 8.449 8.283 8.131 7.958 7.78 7.629 7.473 7.317 7.201 7.068 6.927 6.786 6.617 6.495 6.372 6.184 6.061 5.934 5.868 5.73 5.587 5.421 5.321 4.839 4.989 4.869 4.752 4.479 4.317 4.132 3.93 3.711 3.462 3.14 1.695 -5 ,11903 ,KEBNE ,17070692,Fri Dec 24 23:01:48 CET,Sat Dec 25 00:57:15 CET,0.0 1.617 2.015 2.296 2.497 2.661 2.798 2.926 3.187 3.308 3.414 3.215 3.688 3.774 3.935 4.087 4.23 4.306 4.455 4.591 4.782 4.899 5.011 5.169 5.323 5.489 5.651 5.788 5.959 6.126 6.294 6.494 6.668 6.835 7.026 7.237 7.438 7.651 7.889 8.161 8.427 8.704 9.024 9.347 9.74 10.161 10.607 11.064 11.579 12.11 12.504 12.51 12.319 12.085 11.833 11.545 11.247 10.963 10.712 10.451 10.192 9.947 9.715 9.492 9.285 9.095 8.88 8.681 8.518 8.354 8.188 8.043 7.885 7.718 7.583 7.445 7.303 7.164 7.011 6.891 6.775 6.611 6.5 6.375 6.301 6.148 5.986 5.816 5.729 5.263 5.413 5.293 5.167 4.894 4.748 4.58 4.376 4.147 3.893 3.497 1.992 -6 ,6484 ,KEBNE ,17070693,Fri Dec 24 23:04:57 CET,Sat Dec 25 01:00:16 CET,0.0 1.251 1.56 1.797 1.989 2.148 2.291 2.423 2.668 2.782 2.881 2.695 3.165 3.248 3.404 3.548 3.697 3.764 3.886 4.004 4.167 4.27 4.372 4.523 4.66 4.791 4.923 5.052 5.215 5.373 5.525 5.7 5.862 6.014 6.199 6.411 6.611 6.84 7.079 7.315 7.579 7.88 8.2 8.505 8.847 9.188 9.589 10.074 10.555 10.971 11.378 11.454 11.301 11.07 10.779 10.421 10.041 9.691 9.372 9.038 8.753 8.509 8.289 8.068 7.845 7.65 7.455 7.271 7.108 6.93 6.726 6.554 6.383 6.205 6.065 5.921 5.775 5.629 5.476 5.359 5.233 5.042 4.895 4.74 4.663 4.498 4.32 4.141 4.052 3.576 3.76 3.658 3.547 3.316 3.184 3.038 2.863 2.654 2.388 2.008 0.747 -7 ,6738 ,KEBNE ,17070694,Fri Dec 24 23:07:03 CET,Sat Dec 25 01:02:40 CET,0.0 1.49 1.825 2.049 2.229 2.382 2.523 2.654 2.873 2.97 3.065 2.877 3.339 3.419 3.563 3.7 3.829 3.891 4.011 4.127 4.303 4.418 4.526 4.673 4.812 4.956 5.095 5.224 5.384 5.546 5.701 5.871 6.03 6.189 6.374 6.582 6.782 6.988 7.22 7.48 7.74 8.027 8.362 8.699 9.098 9.511 9.946 10.388 10.848 11.317 11.72 11.85 11.742 11.506 11.218 10.927 10.656 10.402 10.162 9.901 9.666 9.446 9.23 9.023 8.822 8.623 8.413 8.228 8.062 7.893 7.71 7.554 7.392 7.212 7.068 6.916 6.754 6.591 6.427 6.313 6.194 6.002 5.873 5.741 5.673 5.526 5.362 5.2 5.114 4.631 4.79 4.668 4.548 4.295 4.151 3.981 3.776 3.555 3.298 2.927 1.404 -8 ,18537 ,KEBNE ,17070695,Fri Dec 24 23:06:00 CET,Sat Dec 25 01:00:55 CET,0.0 1.351 1.674 1.884 2.054 2.209 2.349 2.471 2.699 2.805 2.904 2.712 3.182 3.269 3.429 3.589 3.738 3.811 3.958 4.095 4.286 4.408 4.524 4.681 4.829 4.975 5.111 5.241 5.414 5.581 5.731 5.917 6.107 6.283 6.479 6.701 6.916 7.145 7.363 7.591 7.844 8.119 8.431 8.739 9.092 9.47 9.893 10.312 10.75 11.18 11.504 11.504 11.278 10.922 10.539 10.191 9.874 9.589 9.334 9.043 8.757 8.49 8.253 8.031 7.821 7.625 7.41 7.204 7.03 6.871 6.705 6.552 6.398 6.237 6.098 5.958 5.818 5.671 5.525 5.416 5.3 5.126 5.006 4.882 4.81 4.647 4.491 4.322 4.228 3.754 3.923 3.819 3.711 3.488 3.353 3.183 2.995 2.792 2.535 2.16 0.772 -9 ,8130 ,KEBNE ,17070696,Fri Dec 24 23:13:20 CET,Sat Dec 25 01:06:53 CET,0.0 1.575 1.873 2.099 2.283 2.438 2.58 2.708 2.933 3.042 3.15 2.965 3.432 3.515 3.674 3.828 3.98 4.052 4.188 4.316 4.49 4.606 4.717 4.864 5.006 5.149 5.297 5.434 5.602 5.764 5.917 6.099 6.273 6.445 6.637 6.844 7.045 7.258 7.485 7.738 8.031 8.375 8.718 9.005 9.352 9.728 10.135 10.578 11.027 11.459 11.783 11.799 11.64 11.403 11.131 10.848 10.556 10.273 10.022 9.746 9.511 9.291 9.056 8.823 8.611 8.437 8.266 8.107 7.961 7.801 7.607 7.449 7.295 7.116 6.986 6.862 6.718 6.563 6.413 6.305 6.189 6.02 5.898 5.763 5.699 5.556 5.396 5.223 5.12 4.649 4.824 4.702 4.58 4.32 4.168 3.995 3.799 3.582 3.34 3.004 1.13 -10 ,2438 ,KEBNE ,17070697,Fri Dec 24 23:31:11 CET,Sat Dec 25 01:26:11 CET,0.0 1.51 1.814 2.051 2.243 2.402 2.556 2.687 2.916 3.024 3.121 2.924 3.385 3.471 3.63 3.769 3.91 3.98 4.107 4.218 4.388 4.5 4.604 4.747 4.874 5.004 5.137 5.264 5.425 5.581 5.73 5.909 6.082 6.248 6.432 6.625 6.812 7.026 7.251 7.485 7.744 8.049 8.381 8.69 9.045 9.436 9.874 10.31 10.755 11.223 11.584 11.696 11.645 11.465 11.216 10.961 10.714 10.443 10.183 9.931 9.715 9.509 9.297 9.068 8.848 8.657 8.463 8.294 8.134 7.964 7.789 7.622 7.427 7.217 7.054 6.886 6.708 6.534 6.365 6.25 6.133 5.945 5.815 5.681 5.61 5.47 5.324 5.175 5.097 4.63 4.774 4.644 4.517 4.234 4.078 3.912 3.72 3.501 3.236 2.855 1.219 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt deleted file mode 100644 index 360887e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13 ,TETRA ,17603712,Sun Nov 28 16:46:50 CET,Sun Nov 28 19:00:13 CET,0.0 2.404 2.957 3.29 3.567 3.826 4.07 4.295 4.688 4.873 5.054 4.863 5.532 5.676 5.941 6.199 6.462 6.595 6.834 7.052 7.389 7.597 7.779 8.028 8.278 8.536 8.791 9.037 9.356 9.668 9.957 10.278 10.594 10.933 11.327 11.744 12.136 12.553 13.014 13.523 14.049 14.621 15.288 15.977 16.784 17.649 18.677 19.851 21.18 22.742 24.539 25.679 26.067 26.153 26.121 25.977 25.709 25.452 25.229 24.926 24.654 24.402 24.119 23.843 23.55 23.292 23.033 22.777 22.561 22.326 22.064 21.845 21.6 21.343 21.147 20.928 20.679 20.457 20.238 20.06 19.904 19.686 19.523 19.35 19.249 19.011 18.775 18.524 18.377 17.724 17.854 17.653 17.472 17.077 16.854 16.605 16.301 15.943 15.516 14.897 12.041 -2 ,11490 ,TETRA ,17603713,Sun Nov 28 16:46:43 CET,Sun Nov 28 19:04:19 CET,0.0 2.267 2.865 3.308 3.691 4.021 4.294 4.523 4.956 5.173 5.379 5.235 5.91 6.086 6.417 6.696 6.967 7.105 7.365 7.613 7.967 8.186 8.405 8.734 9.047 9.344 9.631 9.935 10.326 10.674 11.018 11.438 11.821 12.18 12.598 13.044 13.479 13.976 14.486 15.01 15.564 16.203 16.954 17.707 18.554 19.473 20.518 21.711 23.121 24.645 26.249 27.481 27.973 28.02 27.92 27.736 27.481 27.149 26.848 26.63 26.47 26.287 26.087 25.904 25.728 25.554 25.374 25.192 25.019 24.859 24.696 24.551 24.396 24.222 24.065 23.899 23.718 23.501 23.238 23.064 22.905 22.65 22.449 22.253 22.153 21.932 21.714 21.429 21.266 20.597 20.732 20.555 20.362 19.925 19.706 19.47 19.193 18.871 18.452 17.822 13.843 -3 ,11037 ,TETRA ,17603714,Sun Nov 28 16:46:45 CET,Sun Nov 28 19:04:56 CET,0.0 2.896 3.587 4.024 4.381 4.718 5.024 5.279 5.724 5.923 6.111 5.968 6.65 6.817 7.142 7.461 7.773 7.912 8.163 8.412 8.77 8.986 9.21 9.556 9.866 10.161 10.467 10.751 11.099 11.425 11.728 12.115 12.503 12.881 13.318 13.78 14.212 14.691 15.188 15.733 16.321 16.976 17.764 18.545 19.444 20.426 21.522 22.747 24.144 25.75 27.564 28.803 29.187 29.247 29.19 29.104 28.99 28.832 28.68 28.507 28.291 28.053 27.813 27.554 27.303 27.077 26.819 26.587 26.404 26.219 26.001 25.825 25.647 25.423 25.245 25.068 24.88 24.677 24.462 24.32 24.175 23.958 23.805 23.616 23.514 23.318 23.109 22.852 22.701 22.041 22.192 22.005 21.809 21.375 21.117 20.81 20.501 20.176 19.762 19.135 16.345 -4 ,31625 ,TETRA ,17603715,Sun Nov 28 16:46:44 CET,Sun Nov 28 19:00:29 CET,0.0 2.455 2.988 3.354 3.634 3.875 4.095 4.309 4.736 4.923 5.101 4.926 5.587 5.722 5.966 6.199 6.42 6.525 6.742 6.966 7.303 7.532 7.741 8.008 8.284 8.573 8.849 9.133 9.496 9.806 10.09 10.434 10.758 11.069 11.425 11.806 12.174 12.577 13.007 13.492 14.004 14.569 15.22 15.883 16.664 17.519 18.513 19.752 21.331 23.055 24.887 26.129 26.61 26.647 26.502 26.277 25.987 25.691 25.402 25.11 24.827 24.507 24.16 23.842 23.604 23.425 23.244 23.035 22.801 22.547 22.292 22.059 21.827 21.634 21.485 21.34 21.2 21.01 20.796 20.654 20.48 20.171 19.966 19.753 19.624 19.355 19.086 18.836 18.708 18.068 18.273 18.095 17.917 17.559 17.348 17.084 16.785 16.463 16.088 15.522 12.799 -5 ,1902 ,TETRA ,17603716,Sun Nov 28 16:46:46 CET,Sun Nov 28 19:00:33 CET,0.0 2.357 2.945 3.401 3.774 4.075 4.35 4.604 5.068 5.273 5.462 5.324 6.018 6.193 6.507 6.803 7.092 7.23 7.491 7.744 8.079 8.287 8.501 8.789 9.053 9.31 9.558 9.801 10.138 10.475 10.781 11.143 11.506 11.88 12.291 12.724 13.142 13.594 14.109 14.675 15.297 16.015 16.825 17.616 18.563 19.613 20.811 22.255 23.935 25.68 27.352 28.337 28.688 28.848 28.806 28.65 28.479 28.236 27.998 27.784 27.578 27.354 27.125 26.889 26.659 26.418 26.078 25.729 25.448 25.158 24.827 24.538 24.24 23.931 23.691 23.422 23.134 22.854 22.566 22.4 22.247 21.988 21.8 21.584 21.458 21.177 20.891 20.606 20.455 19.791 19.91 19.706 19.52 19.139 18.908 18.587 18.237 17.882 17.436 16.768 13.938 -6 ,26290 ,TETRA ,17603717,Sun Nov 28 16:46:45 CET,Sun Nov 28 19:00:48 CET,0.0 2.428 3.013 3.427 3.792 4.115 4.385 4.645 5.131 5.334 5.518 5.354 6.034 6.196 6.512 6.799 7.081 7.217 7.472 7.71 8.047 8.261 8.472 8.779 9.07 9.355 9.626 9.875 10.185 10.488 10.798 11.187 11.542 11.882 12.29 12.776 13.261 13.772 14.334 14.93 15.558 16.28 17.082 17.886 18.832 19.858 20.987 22.21 23.608 25.178 26.915 28.132 28.667 28.867 28.878 28.799 28.621 28.361 28.065 27.734 27.478 27.301 27.104 26.906 26.754 26.607 26.42 26.234 26.066 25.9 25.729 25.583 25.436 25.258 25.102 24.921 24.735 24.572 24.393 24.251 24.105 23.896 23.73 23.535 23.444 23.244 22.989 22.729 22.603 21.956 22.157 21.987 21.77 21.285 21.017 20.743 20.482 20.16 19.705 19.037 16.212 -7 ,30167 ,TETRA ,17603718,Sun Nov 28 16:47:42 CET,Sun Nov 28 19:02:18 CET,0.0 2.332 2.862 3.193 3.467 3.704 3.923 4.134 4.528 4.713 4.881 4.66 5.315 5.455 5.716 5.945 6.157 6.264 6.484 6.701 7.013 7.212 7.401 7.657 7.911 8.151 8.375 8.603 8.886 9.164 9.422 9.732 10.027 10.327 10.679 11.035 11.377 11.749 12.152 12.612 13.084 13.592 14.185 14.78 15.477 16.276 17.191 18.227 19.418 20.772 22.344 23.528 24.071 24.287 24.35 24.334 24.274 24.163 24.014 23.833 23.66 23.495 23.347 23.193 23.043 22.904 22.738 22.58 22.417 22.225 22.045 21.878 21.683 21.511 21.38 21.227 21.081 20.927 20.735 20.58 20.427 20.21 20.06 19.894 19.803 19.595 19.354 19.101 18.966 18.313 18.468 18.306 18.132 17.711 17.465 17.18 16.887 16.583 16.215 15.577 12.784 -8 ,26190 ,TETRA ,17603719,Sun Nov 28 16:47:45 CET,Sun Nov 28 19:02:18 CET,0.0 2.444 2.995 3.429 3.79 4.092 4.357 4.574 4.95 5.138 5.315 5.139 5.804 5.939 6.203 6.447 6.664 6.768 6.988 7.214 7.522 7.696 7.875 8.152 8.402 8.639 8.87 9.099 9.406 9.697 9.974 10.327 10.665 10.953 11.275 11.665 12.039 12.468 12.983 13.543 14.132 14.82 15.636 16.436 17.37 18.401 19.577 20.86 22.297 23.955 25.928 27.489 28.222 28.474 28.433 28.273 28.039 27.707 27.314 26.926 26.605 26.293 26.024 25.726 25.368 25.082 24.841 24.633 24.454 24.257 24.031 23.839 23.66 23.479 23.34 23.196 23.035 22.833 22.628 22.464 22.256 21.963 21.767 21.581 21.493 21.294 21.05 20.805 20.686 20.071 20.311 20.152 19.955 19.473 19.22 18.977 18.678 18.333 17.905 17.221 14.327 -9 ,18837 ,TETRA ,17603720,Sun Nov 28 16:47:42 CET,Sun Nov 28 19:01:00 CET,0.0 2.635 3.216 3.676 4.027 4.331 4.595 4.842 5.29 5.476 5.649 5.476 6.149 6.302 6.579 6.84 7.093 7.212 7.455 7.679 8.005 8.215 8.405 8.691 8.986 9.282 9.567 9.841 10.192 10.536 10.873 11.247 11.609 11.982 12.427 12.934 13.42 13.922 14.445 15.016 15.618 16.302 17.068 17.812 18.68 19.689 20.863 22.12 23.483 25.104 27.019 28.243 28.681 28.84 28.831 28.712 28.479 28.199 27.945 27.644 27.395 27.178 26.896 26.642 26.461 26.282 26.101 25.95 25.809 25.615 25.389 25.204 24.986 24.743 24.576 24.422 24.257 24.082 23.903 23.781 23.65 23.43 23.245 23.038 22.938 22.729 22.523 22.314 22.172 21.485 21.592 21.402 21.179 20.599 20.241 19.821 19.433 19.031 18.501 17.783 8.219 -10 ,32419 ,TETRA ,17603721,Sun Nov 28 16:47:44 CET,Sun Nov 28 19:02:17 CET,0.0 1.988 2.531 2.913 3.243 3.521 3.768 4.012 4.433 4.624 4.819 4.676 5.358 5.511 5.802 6.081 6.358 6.495 6.744 6.983 7.337 7.581 7.82 8.141 8.456 8.743 8.992 9.215 9.498 9.791 10.077 10.398 10.678 11.001 11.401 11.782 12.154 12.59 13.062 13.543 14.058 14.643 15.32 15.987 16.707 17.533 18.513 19.585 20.786 22.173 23.781 24.868 25.364 25.594 25.643 25.587 25.424 25.236 25.069 24.86 24.668 24.485 24.28 24.08 23.898 23.719 23.524 23.352 23.207 23.046 22.801 22.552 22.336 22.13 21.974 21.814 21.627 21.431 21.229 21.081 20.922 20.685 20.52 20.334 20.237 20.032 19.799 19.566 19.451 18.801 18.979 18.812 18.62 18.158 17.88 17.587 17.283 16.915 16.439 15.828 13.497 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 68a7f6d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8735 ,TETRA ,17603722,Sun Nov 28 16:47:45 CET,Sun Nov 28 19:00:46 CET,0.0 2.527 3.099 3.603 4.037 4.422 4.759 5.055 5.679 5.996 6.288 6.31 7.062 7.291 7.76 8.214 8.642 8.865 9.307 9.731 10.352 10.757 11.16 11.754 12.343 12.929 13.498 14.055 14.789 15.521 16.249 17.145 18.041 18.934 19.981 21.192 22.396 23.762 25.292 26.969 28.777 30.891 33.448 36.14 39.435 43.301 48.027 53.696 60.955 70.296 82.974 95.123 103.297 109.23 113.727 117.268 119.99 122.196 123.983 125.674 126.979 128.054 129.03 129.905 130.63 131.232 131.831 132.328 132.725 133.069 133.377 133.625 133.881 134.121 134.276 134.442 134.589 134.688 134.792 134.878 134.957 135.055 135.115 135.159 135.172 135.199 135.202 135.168 135.152 134.764 135.041 134.983 134.897 134.675 134.538 134.385 134.161 133.88 133.529 132.904 128.883 -2 ,14563 ,TETRA ,17603723,Sun Nov 28 16:47:48 CET,Sun Nov 28 18:59:57 CET,0.0 1.634 2.174 2.594 2.979 3.313 3.612 3.912 4.467 4.723 4.976 4.968 5.727 5.959 6.418 6.875 7.323 7.538 7.965 8.398 9.035 9.443 9.849 10.464 11.068 11.663 12.257 12.85 13.631 14.407 15.172 16.106 17.027 17.945 19.029 20.264 21.51 22.927 24.472 26.169 28.008 30.143 32.752 35.482 38.722 42.522 47.268 52.988 60.186 69.361 81.56 93.298 101.293 107.12 111.609 115.174 117.941 120.213 121.987 123.59 124.858 125.907 126.861 127.709 128.431 129.052 129.658 130.161 130.57 130.966 131.363 131.658 131.909 132.14 132.303 132.456 132.588 132.72 132.86 132.939 133.007 133.084 133.12 133.138 133.14 133.13 133.097 133.072 133.048 132.65 132.931 132.844 132.752 132.559 132.419 132.252 132.054 131.806 131.458 130.89 128.02 -3 ,5557 ,TETRA ,17603724,Sun Nov 28 16:47:44 CET,Sun Nov 28 18:56:37 CET,0.0 2.269 2.803 3.231 3.644 4.02 4.377 4.685 5.208 5.46 5.723 5.729 6.471 6.693 7.139 7.584 8.016 8.224 8.635 9.043 9.688 10.137 10.569 11.196 11.814 12.426 13.006 13.556 14.295 15.031 15.754 16.649 17.544 18.43 19.475 20.685 21.869 23.187 24.651 26.268 28.044 30.153 32.726 35.393 38.654 42.504 47.166 52.754 59.766 68.841 81.437 93.415 101.421 107.263 111.672 115.194 117.964 120.206 121.957 123.535 124.789 125.832 126.745 127.566 128.281 128.886 129.464 129.949 130.347 130.722 131.093 131.374 131.628 131.881 132.062 132.228 132.38 132.506 132.615 132.684 132.755 132.842 132.873 132.897 132.909 132.902 132.874 132.837 132.786 132.333 132.501 132.399 132.285 132.015 131.86 131.692 131.461 131.078 130.621 130.051 126.676 -4 ,8663 ,TETRA ,17603725,Sun Nov 28 16:47:44 CET,Sun Nov 28 19:02:23 CET,0.0 2.184 2.734 3.177 3.52 3.852 4.198 4.528 5.156 5.449 5.729 5.755 6.499 6.735 7.221 7.697 8.147 8.364 8.783 9.197 9.807 10.204 10.6 11.188 11.77 12.35 12.924 13.483 14.227 14.965 15.692 16.592 17.473 18.342 19.392 20.601 21.796 23.161 24.677 26.349 28.164 30.279 32.869 35.572 38.868 42.735 47.386 52.958 59.947 69.093 81.749 93.755 102.012 108.029 112.44 115.901 118.629 120.901 122.676 124.242 125.474 126.469 127.323 128.079 128.736 129.301 129.855 130.3 130.668 131.02 131.346 131.617 131.88 132.115 132.274 132.433 132.583 132.71 132.832 132.884 132.923 132.968 132.97 132.97 132.984 133.002 132.97 132.909 132.873 132.468 132.719 132.64 132.545 132.268 132.06 131.831 131.601 131.303 130.882 130.201 126.4 -5 ,11386 ,TETRA ,17603726,Sun Nov 28 16:49:42 CET,Sun Nov 28 19:02:23 CET,0.0 2.116 2.669 3.139 3.501 3.851 4.189 4.499 5.089 5.375 5.66 5.672 6.423 6.662 7.154 7.623 8.059 8.278 8.709 9.129 9.758 10.169 10.566 11.156 11.744 12.328 12.894 13.457 14.208 14.939 15.664 16.582 17.496 18.388 19.451 20.691 21.907 23.284 24.812 26.472 28.283 30.402 32.99 35.711 39.022 42.895 47.588 53.208 60.316 69.504 81.911 93.649 101.674 107.633 112.165 115.709 118.407 120.62 122.398 124.03 125.314 126.355 127.273 128.07 128.76 129.339 129.896 130.381 130.771 131.124 131.448 131.703 131.948 132.191 132.381 132.537 132.678 132.824 132.936 132.996 133.046 133.125 133.175 133.216 133.23 133.241 133.264 133.245 133.203 132.791 133.032 132.937 132.836 132.588 132.428 132.26 132.069 131.747 131.353 130.897 126.724 -6 ,16414 ,TETRA ,17603727,Sun Nov 28 16:48:43 CET,Sun Nov 28 19:01:16 CET,0.0 1.999 2.579 3.018 3.378 3.703 4.033 4.349 4.944 5.226 5.497 5.539 6.326 6.59 7.11 7.619 8.098 8.324 8.774 9.21 9.846 10.257 10.659 11.258 11.849 12.446 13.043 13.625 14.389 15.148 15.904 16.838 17.773 18.715 19.84 21.113 22.337 23.731 25.296 27.019 28.918 31.108 33.762 36.552 39.944 43.915 48.724 54.43 61.692 71.299 84.101 96.202 104.477 110.506 115.071 118.638 121.438 123.727 125.509 127.122 128.393 129.456 130.394 131.206 131.901 132.492 133.042 133.498 133.882 134.243 134.577 134.819 135.046 135.288 135.469 135.623 135.743 135.844 135.943 135.995 136.036 136.095 136.114 136.104 136.086 136.047 136.01 135.933 135.871 135.433 135.646 135.528 135.372 134.991 134.791 134.573 134.3 133.953 133.516 132.883 129.691 -8 ,8871 ,TETRA ,17603729,Sun Nov 28 16:48:43 CET,Sun Nov 28 19:03:31 CET,0.0 1.771 2.299 2.693 3.074 3.432 3.764 4.064 4.618 4.887 5.139 5.114 5.864 6.105 6.565 7.005 7.447 7.662 8.077 8.492 9.095 9.494 9.894 10.484 11.058 11.629 12.201 12.765 13.504 14.241 14.982 15.89 16.774 17.651 18.697 19.903 21.104 22.467 23.982 25.661 27.484 29.586 32.125 34.811 38.098 41.945 46.626 52.291 59.399 68.468 80.851 92.801 100.876 106.762 111.219 114.745 117.54 119.817 121.598 123.222 124.517 125.6 126.548 127.358 128.068 128.651 129.212 129.696 130.079 130.467 130.851 131.143 131.401 131.629 131.801 131.983 132.146 132.267 132.367 132.434 132.504 132.57 132.603 132.649 132.662 132.655 132.627 132.601 132.588 132.199 132.432 132.337 132.25 132.093 131.98 131.828 131.662 131.373 130.914 130.226 126.765 -9 ,12910 ,TETRA ,17603730,Sun Nov 28 16:48:46 CET,Sun Nov 28 19:02:52 CET,0.0 2.067 2.608 3.021 3.398 3.759 4.118 4.451 5.055 5.337 5.602 5.579 6.327 6.565 7.026 7.47 7.905 8.116 8.537 8.962 9.583 9.987 10.381 10.968 11.549 12.117 12.683 13.249 13.999 14.737 15.468 16.368 17.247 18.119 19.166 20.363 21.531 22.87 24.379 26.043 27.854 29.988 32.571 35.265 38.57 42.45 47.156 52.707 59.787 69.018 81.374 93.1 101.226 107.144 111.481 114.921 117.667 119.906 121.608 123.152 124.392 125.424 126.311 127.041 127.655 128.171 128.683 129.142 129.529 129.891 130.238 130.493 130.725 130.94 131.084 131.208 131.327 131.458 131.595 131.678 131.742 131.803 131.817 131.826 131.825 131.81 131.785 131.758 131.737 131.333 131.602 131.531 131.461 131.25 131.085 130.896 130.661 130.343 129.945 129.47 126.994 -10 ,20607 ,TETRA ,17603731,Sun Nov 28 16:48:43 CET,Sun Nov 28 19:02:19 CET,0.0 2.039 2.571 2.991 3.362 3.684 3.995 4.316 4.949 5.233 5.5 5.521 6.297 6.541 7.015 7.487 7.937 8.16 8.608 9.035 9.653 10.07 10.483 11.084 11.677 12.26 12.828 13.391 14.138 14.878 15.606 16.51 17.411 18.303 19.351 20.572 21.786 23.152 24.692 26.358 28.157 30.266 32.83 35.534 38.839 42.711 47.304 52.783 59.808 68.936 81.362 93.213 101.203 106.975 111.307 114.768 117.486 119.709 121.463 123.07 124.387 125.469 126.416 127.252 127.952 128.55 129.126 129.594 129.964 130.304 130.644 130.893 131.124 131.378 131.559 131.713 131.865 132.021 132.148 132.226 132.293 132.367 132.406 132.415 132.403 132.398 132.395 132.35 132.301 131.876 132.139 132.075 131.993 131.73 131.568 131.379 131.077 130.655 130.188 129.538 126.253 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt deleted file mode 100644 index 3d170805..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26542 ,TETRA ,17603732,Sun Nov 28 16:48:46 CET,Sun Nov 28 19:05:11 CET,0.0 1.826 2.368 2.726 3.06 3.37 3.636 3.869 4.271 4.472 4.659 4.626 5.209 5.37 5.682 5.997 6.334 6.505 6.814 7.107 7.546 7.833 8.099 8.477 8.85 9.213 9.574 9.928 10.389 10.838 11.267 11.801 12.35 12.903 13.537 14.254 14.965 15.745 16.599 17.512 18.487 19.643 21.041 22.514 24.289 26.257 28.641 31.535 34.975 39.209 44.757 49.777 52.85 54.753 56.042 56.984 57.726 58.268 58.585 58.859 59.028 59.127 59.209 59.268 59.307 59.313 59.285 59.241 59.189 59.124 59.04 58.949 58.839 58.767 58.731 58.671 58.595 58.496 58.385 58.294 58.19 58.003 57.851 57.697 57.62 57.461 57.295 57.099 56.991 56.537 56.655 56.536 56.398 56.082 55.89 55.698 55.465 55.156 54.797 54.305 52.463 -2 ,12232 ,TETRA ,17603733,Sun Nov 28 16:48:49 CET,Sun Nov 28 19:05:56 CET,0.0 1.901 2.411 2.815 3.177 3.502 3.806 4.075 4.523 4.732 4.937 4.942 5.526 5.693 6.006 6.303 6.619 6.794 7.117 7.404 7.811 8.083 8.35 8.717 9.077 9.44 9.804 10.178 10.689 11.164 11.599 12.132 12.655 13.179 13.808 14.501 15.171 15.958 16.814 17.709 18.707 19.895 21.308 22.762 24.47 26.465 28.926 31.746 35.089 39.113 44.273 48.805 51.508 53.243 54.505 55.519 56.2 56.644 56.94 57.176 57.346 57.502 57.625 57.714 57.762 57.747 57.717 57.684 57.636 57.602 57.577 57.532 57.448 57.34 57.245 57.131 57.038 56.966 56.841 56.744 56.66 56.505 56.373 56.231 56.167 56.042 55.905 55.755 55.677 55.233 55.351 55.238 55.105 54.751 54.53 54.302 54.076 53.825 53.526 53.04 49.924 -3 ,11059 ,TETRA ,17603734,Sun Nov 28 16:48:45 CET,Sun Nov 28 19:05:16 CET,0.0 1.843 2.339 2.748 3.104 3.415 3.68 3.929 4.374 4.588 4.806 4.8 5.386 5.565 5.928 6.249 6.541 6.692 6.991 7.286 7.713 7.994 8.275 8.684 9.076 9.458 9.833 10.189 10.65 11.123 11.594 12.168 12.718 13.264 13.918 14.65 15.364 16.166 17.05 17.995 19.005 20.155 21.535 22.984 24.705 26.597 28.861 31.594 34.915 39.04 44.298 48.937 51.719 53.523 54.871 55.952 56.749 57.321 57.673 57.938 58.129 58.258 58.364 58.439 58.468 58.456 58.425 58.37 58.293 58.231 58.188 58.137 58.061 57.978 57.906 57.807 57.683 57.566 57.443 57.336 57.218 57.043 56.912 56.768 56.699 56.547 56.396 56.261 56.182 55.743 55.884 55.766 55.59 55.108 54.864 54.599 54.299 53.968 53.574 52.96 50.346 -4 ,30368 ,TETRA ,17603735,Sun Nov 28 16:49:43 CET,Sun Nov 28 19:06:03 CET,0.0 1.751 2.254 2.648 2.948 3.19 3.434 3.665 4.067 4.254 4.431 4.385 4.957 5.117 5.433 5.744 6.054 6.198 6.463 6.727 7.126 7.383 7.627 7.993 8.366 8.728 9.068 9.401 9.849 10.302 10.757 11.282 11.787 12.304 12.92 13.631 14.313 15.054 15.861 16.751 17.697 18.762 20.085 21.501 23.215 25.218 27.621 30.397 33.824 37.982 43.121 47.784 50.66 52.443 53.632 54.571 55.268 55.753 56.099 56.369 56.534 56.631 56.697 56.756 56.798 56.803 56.763 56.713 56.683 56.635 56.542 56.454 56.36 56.249 56.165 56.096 56.032 55.945 55.843 55.778 55.709 55.602 55.512 55.42 55.371 55.256 55.117 54.957 54.872 54.423 54.513 54.364 54.222 53.93 53.759 53.552 53.282 52.941 52.528 51.952 48.52 -5 ,29012 ,TETRA ,17603736,Sun Nov 28 16:49:45 CET,Sun Nov 28 19:06:26 CET,0.0 1.739 2.247 2.64 2.946 3.213 3.464 3.733 4.238 4.441 4.641 4.624 5.205 5.388 5.751 6.096 6.417 6.569 6.851 7.119 7.525 7.8 8.065 8.466 8.874 9.25 9.614 9.988 10.469 10.952 11.426 11.97 12.509 13.04 13.652 14.348 15.03 15.786 16.629 17.554 18.53 19.657 21.056 22.484 24.156 26.077 28.351 31.024 34.277 38.248 43.424 48.26 51.205 53.071 54.378 55.358 56.101 56.659 57.06 57.393 57.597 57.727 57.854 57.926 57.931 57.907 57.893 57.886 57.865 57.823 57.745 57.69 57.639 57.577 57.524 57.423 57.306 57.233 57.174 57.126 57.072 56.966 56.865 56.754 56.702 56.594 56.476 56.342 56.262 55.83 55.974 55.869 55.742 55.455 55.278 55.031 54.738 54.409 53.998 53.498 51.171 -6 ,8176 ,TETRA ,17603737,Sun Nov 28 16:49:48 CET,Sun Nov 28 19:05:59 CET,0.0 1.721 2.191 2.586 2.912 3.179 3.412 3.64 4.076 4.28 4.481 4.432 4.998 5.164 5.483 5.796 6.107 6.258 6.548 6.836 7.257 7.531 7.81 8.212 8.594 8.962 9.331 9.689 10.149 10.616 11.067 11.613 12.155 12.696 13.33 14.027 14.713 15.481 16.306 17.234 18.251 19.425 20.846 22.273 23.999 25.995 28.236 30.823 34.136 38.183 43.133 47.52 50.273 52.212 53.516 54.455 55.169 55.665 56.017 56.313 56.554 56.729 56.828 56.909 56.963 57.01 57.038 57.042 57.042 57.019 56.984 56.936 56.86 56.77 56.699 56.633 56.567 56.48 56.374 56.309 56.244 56.134 56.062 55.982 55.933 55.814 55.685 55.557 55.487 55.055 55.17 55.027 54.858 54.481 54.285 54.063 53.819 53.562 53.197 52.609 49.362 -7 ,30803 ,TETRA ,17603738,Sun Nov 28 16:49:42 CET,Sun Nov 28 19:07:39 CET,0.0 1.511 1.999 2.385 2.73 3.007 3.251 3.482 3.89 4.079 4.256 4.208 4.777 4.954 5.31 5.623 5.925 6.079 6.375 6.657 7.07 7.345 7.621 8.044 8.452 8.836 9.213 9.564 10.017 10.471 10.907 11.449 11.992 12.514 13.149 13.893 14.595 15.346 16.185 17.121 18.127 19.274 20.688 22.156 23.833 25.749 28.048 30.734 34.037 38.139 43.207 47.622 50.457 52.374 53.656 54.583 55.269 55.744 56.036 56.245 56.37 56.469 56.521 56.519 56.514 56.494 56.45 56.403 56.334 56.23 56.074 55.909 55.767 55.653 55.536 55.407 55.297 55.173 55.021 54.892 54.757 54.552 54.405 54.241 54.15 53.98 53.809 53.629 53.535 53.087 53.19 53.042 52.87 52.468 52.209 51.927 51.632 51.27 50.788 49.972 46.477 -8 ,302 ,TETRA ,17603739,Sun Nov 28 16:49:44 CET,Sun Nov 28 19:07:13 CET,0.0 1.882 2.355 2.711 3.02 3.29 3.544 3.789 4.221 4.429 4.633 4.612 5.198 5.388 5.741 6.067 6.383 6.536 6.829 7.114 7.538 7.801 8.051 8.446 8.835 9.21 9.57 9.92 10.403 10.866 11.303 11.852 12.388 12.908 13.508 14.216 14.928 15.689 16.504 17.383 18.331 19.492 20.91 22.294 23.885 25.718 27.952 30.647 33.89 37.827 43.1 47.516 50.046 51.781 52.955 53.804 54.424 54.825 55.084 55.313 55.497 55.614 55.664 55.695 55.697 55.672 55.638 55.604 55.557 55.48 55.381 55.285 55.184 55.077 54.99 54.901 54.794 54.677 54.569 54.495 54.405 54.268 54.146 53.97 53.884 53.721 53.525 53.31 53.19 52.71 52.765 52.607 52.434 52.016 51.769 51.487 51.145 50.761 50.395 49.748 47.185 -9 ,10783 ,TETRA ,17603740,Sun Nov 28 16:49:43 CET,Sun Nov 28 19:07:03 CET,0.0 1.943 2.441 2.823 3.107 3.364 3.605 3.838 4.285 4.484 4.672 4.65 5.236 5.401 5.712 6.018 6.31 6.451 6.734 7.016 7.414 7.677 7.933 8.313 8.694 9.068 9.432 9.792 10.253 10.693 11.129 11.681 12.225 12.739 13.344 14.052 14.761 15.557 16.397 17.283 18.255 19.412 20.827 22.265 23.962 25.934 28.31 31.105 34.539 38.767 44.075 48.72 51.581 53.58 55.024 56.031 56.698 57.17 57.466 57.689 57.843 57.914 57.987 58.07 58.13 58.16 58.156 58.147 58.119 58.059 57.986 57.927 57.866 57.818 57.781 57.713 57.629 57.54 57.417 57.302 57.17 56.951 56.801 56.643 56.556 56.367 56.156 55.932 55.825 55.353 55.388 55.217 55.047 54.7 54.503 54.254 53.947 53.552 52.996 52.251 49.725 -10 ,22612 ,TETRA ,17603741,Sun Nov 28 16:48:45 CET,Sun Nov 28 19:11:05 CET,0.0 1.631 2.121 2.531 2.863 3.159 3.448 3.707 4.16 4.375 4.572 4.543 5.137 5.317 5.662 5.999 6.312 6.462 6.754 7.055 7.49 7.763 8.029 8.436 8.839 9.222 9.61 9.995 10.494 10.967 11.416 11.983 12.542 13.078 13.71 14.429 15.104 15.838 16.645 17.531 18.505 19.646 21.044 22.512 24.244 26.221 28.552 31.184 34.363 38.451 43.741 48.307 51.201 53.155 54.577 55.652 56.361 56.857 57.216 57.495 57.72 57.851 57.906 57.945 57.942 57.957 57.979 57.944 57.881 57.794 57.677 57.583 57.493 57.374 57.267 57.147 57.014 56.879 56.733 56.633 56.515 56.286 56.117 55.93 55.833 55.631 55.408 55.186 55.082 54.625 54.72 54.584 54.43 54.053 53.826 53.572 53.262 52.86 52.439 51.821 48.986 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 7cf9946d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31062 ,TETRA ,17603742,Sun Nov 28 16:49:44 CET,Sun Nov 28 19:06:00 CET,0.0 1.149 1.483 1.732 1.95 2.146 2.326 2.489 2.808 2.961 3.096 2.959 3.488 3.606 3.837 4.053 4.262 4.37 4.585 4.787 5.065 5.239 5.408 5.655 5.894 6.126 6.351 6.569 6.857 7.156 7.442 7.779 8.108 8.422 8.805 9.258 9.677 10.141 10.671 11.239 11.85 12.584 13.446 14.3 15.343 16.539 17.885 19.347 21.106 23.187 25.518 27.452 28.526 29.097 29.483 29.7 29.789 29.808 29.735 29.609 29.49 29.407 29.327 29.201 29.066 28.935 28.794 28.677 28.573 28.456 28.327 28.219 28.095 27.945 27.835 27.727 27.597 27.431 27.235 27.094 26.943 26.69 26.511 26.315 26.222 26.034 25.802 25.552 25.421 24.908 24.953 24.785 24.612 24.234 24.016 23.764 23.477 23.153 22.787 22.246 19.78 -2 ,32684 ,TETRA ,17603743,Sun Nov 28 16:49:46 CET,Sun Nov 28 19:07:13 CET,0.0 1.28 1.613 1.864 2.09 2.286 2.452 2.608 2.894 3.026 3.158 3.027 3.554 3.669 3.893 4.107 4.313 4.41 4.6 4.788 5.057 5.233 5.401 5.648 5.886 6.111 6.339 6.56 6.836 7.108 7.374 7.705 8.023 8.323 8.689 9.126 9.541 9.997 10.495 11.033 11.618 12.281 13.045 13.835 14.825 15.93 17.214 18.737 20.585 22.888 25.545 27.485 28.481 28.97 29.263 29.378 29.388 29.43 29.437 29.401 29.326 29.226 29.12 29.009 28.911 28.797 28.651 28.507 28.36 28.196 28.015 27.867 27.724 27.563 27.425 27.281 27.145 27.004 26.843 26.726 26.602 26.421 26.307 26.169 26.09 25.92 25.741 25.569 25.475 25.0 25.117 24.992 24.863 24.557 24.336 24.061 23.756 23.448 23.092 22.563 20.654 -3 ,15453 ,TETRA ,17603744,Sun Nov 28 16:49:47 CET,Sun Nov 28 19:07:02 CET,0.0 1.532 1.891 2.158 2.386 2.594 2.778 2.937 3.202 3.332 3.468 3.314 3.839 3.962 4.196 4.41 4.618 4.719 4.91 5.097 5.366 5.539 5.707 5.954 6.203 6.447 6.688 6.93 7.238 7.529 7.809 8.155 8.51 8.859 9.261 9.702 10.122 10.596 11.136 11.728 12.356 13.036 13.802 14.61 15.586 16.645 17.888 19.303 20.906 22.837 25.086 26.731 27.607 28.167 28.488 28.64 28.717 28.737 28.729 28.684 28.606 28.509 28.374 28.237 28.129 28.015 27.882 27.745 27.607 27.464 27.3 27.146 26.995 26.841 26.714 26.581 26.437 26.279 26.08 25.932 25.777 25.505 25.311 25.132 25.043 24.824 24.584 24.334 24.196 23.693 23.777 23.61 23.429 23.013 22.766 22.513 22.268 21.991 21.636 21.139 18.989 -4 ,28289 ,TETRA ,17603745,Sun Nov 28 16:49:43 CET,Sun Nov 28 19:06:36 CET,0.0 1.645 1.98 2.24 2.47 2.663 2.833 2.997 3.298 3.437 3.576 3.445 3.982 4.108 4.334 4.548 4.753 4.849 5.031 5.221 5.505 5.68 5.858 6.121 6.373 6.623 6.868 7.103 7.403 7.698 7.985 8.342 8.689 9.021 9.409 9.863 10.307 10.799 11.333 11.906 12.52 13.192 13.988 14.817 15.817 16.941 18.178 19.611 21.335 23.197 25.418 27.17 28.161 28.812 29.189 29.37 29.485 29.546 29.515 29.398 29.247 29.093 28.919 28.749 28.583 28.436 28.285 28.12 27.98 27.836 27.679 27.558 27.435 27.306 27.193 27.06 26.91 26.731 26.526 26.387 26.248 26.053 25.911 25.748 25.658 25.476 25.294 25.088 24.979 24.495 24.605 24.477 24.334 23.979 23.744 23.444 23.121 22.751 22.266 21.557 19.174 -5 ,25042 ,TETRA ,17603746,Sun Nov 28 16:49:47 CET,Sun Nov 28 19:05:42 CET,0.0 1.021 1.385 1.693 1.944 2.134 2.339 2.54 2.854 2.989 3.128 2.991 3.515 3.629 3.858 4.09 4.297 4.396 4.592 4.783 5.077 5.261 5.426 5.665 5.897 6.127 6.353 6.566 6.86 7.158 7.44 7.783 8.11 8.429 8.806 9.244 9.674 10.134 10.635 11.175 11.742 12.405 13.224 14.063 15.065 16.253 17.663 19.165 20.836 22.821 25.205 27.047 27.933 28.437 28.745 28.909 28.967 28.947 28.884 28.783 28.701 28.618 28.521 28.426 28.314 28.185 28.022 27.864 27.728 27.567 27.388 27.251 27.105 26.925 26.772 26.608 26.412 26.208 26.027 25.882 25.728 25.504 25.313 25.101 24.992 24.74 24.448 24.183 24.059 23.559 23.634 23.472 23.315 22.985 22.79 22.568 22.313 22.004 21.612 21.013 18.877 -6 ,15490 ,TETRA ,17603747,Sun Nov 28 16:49:48 CET,Sun Nov 28 19:06:53 CET,0.0 1.218 1.529 1.773 1.977 2.175 2.349 2.495 2.763 2.889 3.018 2.872 3.388 3.497 3.723 3.941 4.137 4.232 4.416 4.6 4.873 5.048 5.226 5.489 5.745 5.993 6.227 6.446 6.725 7.0 7.278 7.623 7.959 8.279 8.651 9.08 9.497 9.947 10.442 10.992 11.576 12.244 13.045 13.89 14.89 16.012 17.287 18.745 20.575 22.738 25.25 27.345 28.553 29.193 29.485 29.595 29.598 29.541 29.448 29.331 29.222 29.072 28.911 28.779 28.652 28.512 28.327 28.177 28.066 27.933 27.789 27.659 27.512 27.362 27.244 27.117 26.965 26.771 26.556 26.41 26.26 26.031 25.871 25.703 25.625 25.449 25.247 25.048 24.93 24.44 24.537 24.389 24.217 23.798 23.549 23.285 23.006 22.7 22.356 21.737 19.498 -7 ,22714 ,TETRA ,17603748,Sun Nov 28 16:49:45 CET,Sun Nov 28 19:06:54 CET,0.0 1.178 1.532 1.797 2.008 2.204 2.388 2.55 2.84 2.974 3.099 2.943 3.466 3.587 3.813 4.016 4.215 4.315 4.501 4.674 4.936 5.112 5.279 5.522 5.76 5.981 6.201 6.429 6.724 7.008 7.291 7.632 7.971 8.307 8.696 9.136 9.557 10.016 10.505 11.037 11.638 12.348 13.124 13.875 14.813 15.857 17.061 18.447 20.037 21.948 24.324 26.352 27.399 27.987 28.345 28.496 28.527 28.477 28.397 28.296 28.2 28.104 27.98 27.839 27.692 27.546 27.378 27.214 27.074 26.932 26.745 26.566 26.392 26.217 26.078 25.937 25.78 25.612 25.421 25.279 25.141 24.921 24.755 24.578 24.486 24.293 24.086 23.886 23.784 23.31 23.429 23.29 23.144 22.836 22.662 22.458 22.195 21.909 21.602 21.087 18.892 -8 ,26812 ,TETRA ,17603749,Sun Nov 28 16:49:44 CET,Sun Nov 28 19:08:22 CET,0.0 0.974 1.28 1.514 1.713 1.885 2.042 2.199 2.501 2.629 2.744 2.566 3.084 3.203 3.433 3.643 3.842 3.942 4.139 4.324 4.592 4.768 4.932 5.175 5.419 5.655 5.876 6.088 6.371 6.653 6.936 7.286 7.625 7.944 8.317 8.738 9.149 9.613 10.132 10.704 11.311 12.017 12.884 13.756 14.726 15.808 17.086 18.445 19.964 21.805 24.137 25.967 26.912 27.532 27.893 28.054 28.143 28.164 28.132 28.087 28.027 27.924 27.804 27.695 27.582 27.475 27.357 27.249 27.155 27.041 26.923 26.832 26.715 26.565 26.441 26.309 26.174 26.034 25.888 25.78 25.648 25.451 25.315 25.166 25.088 24.912 24.722 24.525 24.412 23.929 24.046 23.901 23.754 23.418 23.215 22.992 22.736 22.421 21.982 21.288 18.965 -9 ,11175 ,TETRA ,17603750,Sun Nov 28 16:49:46 CET,Sun Nov 28 19:07:42 CET,0.0 1.868 2.194 2.448 2.656 2.854 3.035 3.19 3.476 3.614 3.744 3.578 4.093 4.206 4.419 4.623 4.829 4.925 5.118 5.311 5.577 5.746 5.906 6.153 6.397 6.62 6.838 7.054 7.341 7.614 7.876 8.194 8.498 8.805 9.166 9.56 9.952 10.41 10.909 11.425 11.961 12.568 13.271 14.006 14.905 15.916 17.173 18.563 20.096 22.001 24.304 26.153 27.138 27.64 27.87 27.974 28.035 28.054 28.083 28.101 28.031 27.922 27.801 27.692 27.583 27.454 27.302 27.147 27.017 26.869 26.694 26.533 26.338 26.14 25.972 25.767 25.56 25.354 25.147 25.016 24.866 24.613 24.435 24.253 24.162 23.951 23.703 23.398 23.24 22.733 22.794 22.621 22.424 21.978 21.762 21.53 21.277 20.985 20.576 20.043 18.116 -10 ,23266 ,TETRA ,17603751,Sun Nov 28 16:49:48 CET,Sun Nov 28 19:07:02 CET,0.0 1.468 1.826 2.085 2.302 2.498 2.681 2.847 3.158 3.298 3.424 3.265 3.787 3.912 4.155 4.39 4.61 4.707 4.898 5.091 5.369 5.546 5.715 5.956 6.192 6.431 6.663 6.897 7.207 7.506 7.801 8.17 8.529 8.872 9.275 9.735 10.169 10.648 11.199 11.79 12.404 13.095 13.869 14.683 15.715 16.902 18.285 19.813 21.554 23.595 26.152 28.369 29.584 30.174 30.496 30.698 30.794 30.827 30.84 30.796 30.681 30.538 30.375 30.18 29.986 29.826 29.678 29.535 29.406 29.271 29.112 28.95 28.751 28.554 28.413 28.245 28.054 27.837 27.579 27.399 27.229 26.955 26.758 26.567 26.47 26.233 25.978 25.732 25.594 25.076 25.132 24.961 24.77 24.334 24.085 23.807 23.483 23.079 22.561 21.849 19.282 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index ab3f6da6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,16484 ,TETRA ,17603753,Sun Nov 28 16:49:45 CET,Sun Nov 28 19:04:53 CET,0.0 0.825 1.117 1.331 1.518 1.698 1.857 1.992 2.242 2.357 2.469 2.313 2.787 2.893 3.095 3.277 3.439 3.515 3.672 3.826 4.039 4.177 4.316 4.526 4.727 4.917 5.109 5.301 5.54 5.774 6.004 6.291 6.56 6.809 7.1 7.428 7.74 8.079 8.442 8.837 9.276 9.774 10.372 11.0 11.723 12.534 13.494 14.611 15.941 17.549 19.535 21.212 22.215 22.873 23.284 23.539 23.696 23.747 23.72 23.692 23.651 23.581 23.514 23.436 23.338 23.238 23.115 23.01 22.919 22.81 22.684 22.558 22.416 22.27 22.155 22.054 21.962 21.848 21.714 21.59 21.468 21.319 21.201 21.075 21.013 20.881 20.74 20.571 20.475 20.014 20.09 19.963 19.814 19.491 19.348 19.161 18.92 18.648 18.32 17.773 15.571 -3 ,16864 ,TETRA ,17603754,Sun Nov 28 16:49:47 CET,Sun Nov 28 19:05:16 CET,0.0 1.221 1.542 1.779 1.983 2.156 2.301 2.434 2.673 2.786 2.897 2.748 3.225 3.323 3.503 3.676 3.847 3.933 4.097 4.25 4.474 4.618 4.754 4.954 5.157 5.357 5.543 5.723 5.961 6.189 6.399 6.664 6.93 7.178 7.475 7.823 8.158 8.538 8.946 9.351 9.778 10.28 10.893 11.519 12.266 13.128 14.132 15.279 16.625 18.247 20.315 22.106 23.148 23.819 24.229 24.438 24.563 24.648 24.682 24.685 24.658 24.589 24.507 24.44 24.371 24.299 24.215 24.121 24.038 23.955 23.858 23.755 23.644 23.506 23.384 23.262 23.133 23.0 22.838 22.712 22.58 22.364 22.186 21.994 21.901 21.701 21.496 21.291 21.186 20.722 20.815 20.667 20.506 20.159 19.957 19.712 19.44 19.148 18.779 18.289 16.435 -5 ,27073 ,TETRA ,17603756,Sun Nov 28 16:49:49 CET,Sun Nov 28 19:02:42 CET,0.0 1.095 1.421 1.676 1.88 2.057 2.217 2.354 2.586 2.701 2.816 2.678 3.157 3.257 3.444 3.623 3.795 3.875 4.025 4.172 4.392 4.534 4.672 4.872 5.069 5.263 5.448 5.621 5.843 6.063 6.272 6.539 6.805 7.052 7.339 7.671 7.991 8.339 8.72 9.13 9.566 10.054 10.648 11.268 11.976 12.773 13.718 14.831 16.168 17.729 19.765 21.585 22.639 23.3 23.726 24.026 24.23 24.319 24.325 24.306 24.304 24.296 24.242 24.176 24.104 24.026 23.938 23.84 23.727 23.606 23.476 23.364 23.265 23.163 23.075 22.983 22.877 22.755 22.607 22.49 22.377 22.212 22.085 21.95 21.875 21.712 21.556 21.38 21.289 20.844 20.948 20.81 20.67 20.39 20.229 20.045 19.844 19.566 19.196 18.672 16.966 -6 ,1037 ,TETRA ,17603757,Sun Nov 28 16:49:45 CET,Sun Nov 28 19:03:22 CET,0.0 1.207 1.532 1.808 2.033 2.22 2.384 2.53 2.789 2.906 3.02 2.862 3.331 3.434 3.623 3.799 3.963 4.038 4.19 4.336 4.548 4.68 4.807 5.008 5.206 5.4 5.582 5.754 5.975 6.198 6.424 6.688 6.94 7.193 7.495 7.828 8.15 8.493 8.857 9.26 9.707 10.223 10.825 11.432 12.152 12.973 13.939 15.032 16.33 17.913 19.901 21.543 22.422 22.994 23.406 23.68 23.847 23.935 23.962 23.915 23.852 23.785 23.679 23.57 23.47 23.371 23.274 23.174 23.078 22.971 22.845 22.735 22.625 22.496 22.372 22.215 22.043 21.887 21.732 21.631 21.524 21.342 21.216 21.061 20.98 20.832 20.656 20.46 20.366 19.909 20.018 19.895 19.765 19.462 19.283 19.055 18.778 18.48 18.113 17.614 15.808 -7 ,23860 ,TETRA ,17603758,Sun Nov 28 16:49:47 CET,Sun Nov 28 19:03:40 CET,0.0 1.432 1.78 2.033 2.256 2.445 2.602 2.741 3.006 3.127 3.236 3.068 3.54 3.641 3.846 4.033 4.209 4.296 4.452 4.607 4.841 4.975 5.108 5.323 5.53 5.734 5.927 6.105 6.342 6.572 6.799 7.077 7.349 7.613 7.923 8.263 8.589 8.953 9.337 9.74 10.173 10.67 11.248 11.848 12.552 13.346 14.304 15.416 16.761 18.387 20.39 22.093 23.107 23.716 24.073 24.307 24.436 24.519 24.525 24.482 24.441 24.398 24.343 24.271 24.192 24.101 23.998 23.894 23.798 23.701 23.578 23.454 23.325 23.18 23.059 22.947 22.83 22.681 22.51 22.396 22.277 22.08 21.954 21.821 21.742 21.569 21.391 21.2 21.1 20.647 20.786 20.672 20.532 20.229 20.059 19.862 19.641 19.386 19.02 18.441 16.615 -8 ,26637 ,TETRA ,17603759,Sun Nov 28 16:49:45 CET,Sun Nov 28 19:02:46 CET,0.0 1.285 1.618 1.835 2.011 2.174 2.329 2.472 2.74 2.864 2.978 2.818 3.279 3.372 3.558 3.739 3.913 3.992 4.145 4.307 4.552 4.698 4.838 5.043 5.242 5.437 5.621 5.799 6.02 6.23 6.432 6.675 6.919 7.157 7.439 7.767 8.086 8.431 8.807 9.215 9.637 10.131 10.729 11.325 12.029 12.832 13.76 14.843 16.201 17.863 19.85 21.462 22.406 23.0 23.344 23.548 23.675 23.743 23.763 23.735 23.68 23.632 23.57 23.497 23.421 23.322 23.193 23.078 22.998 22.899 22.791 22.692 22.572 22.457 22.351 22.238 22.125 22.003 21.867 21.767 21.669 21.485 21.342 21.199 21.125 20.966 20.769 20.583 20.497 20.05 20.16 20.033 19.902 19.587 19.397 19.202 18.992 18.715 18.345 17.836 15.63 -9 ,17575 ,TETRA ,17603760,Sun Nov 28 16:49:49 CET,Sun Nov 28 19:03:15 CET,0.0 1.105 1.47 1.743 1.947 2.115 2.264 2.409 2.673 2.787 2.906 2.756 3.227 3.331 3.529 3.712 3.875 3.957 4.116 4.265 4.487 4.637 4.791 5.009 5.2 5.377 5.557 5.733 5.958 6.172 6.374 6.626 6.872 7.116 7.413 7.742 8.048 8.395 8.785 9.191 9.633 10.148 10.74 11.342 12.069 12.908 13.887 15.012 16.37 18.011 20.035 21.781 22.838 23.497 23.921 24.238 24.426 24.488 24.493 24.501 24.481 24.428 24.344 24.241 24.133 24.033 23.936 23.833 23.739 23.642 23.527 23.417 23.303 23.195 23.101 22.98 22.841 22.708 22.576 22.483 22.379 22.192 22.064 21.938 21.858 21.684 21.529 21.33 21.225 20.766 20.843 20.711 20.579 20.298 20.137 19.942 19.724 19.45 19.065 18.515 16.811 -10 ,18914 ,TETRA ,17603761,Sun Nov 28 16:49:47 CET,Sun Nov 28 19:04:35 CET,0.0 1.094 1.389 1.603 1.787 1.948 2.093 2.231 2.479 2.593 2.711 2.565 3.027 3.117 3.284 3.445 3.604 3.68 3.837 3.994 4.213 4.354 4.486 4.683 4.873 5.048 5.221 5.402 5.634 5.86 6.081 6.353 6.626 6.877 7.16 7.489 7.808 8.154 8.532 8.95 9.397 9.909 10.518 11.13 11.842 12.674 13.673 14.781 16.119 17.763 19.824 21.605 22.649 23.296 23.679 23.914 24.036 24.063 24.056 24.035 23.973 23.894 23.83 23.751 23.649 23.567 23.478 23.372 23.267 23.138 22.987 22.861 22.727 22.574 22.457 22.327 22.179 22.032 21.867 21.757 21.66 21.481 21.346 21.226 21.156 21.006 20.858 20.668 20.563 20.105 20.209 20.087 19.966 19.672 19.468 19.232 18.971 18.653 18.264 17.701 15.433 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt deleted file mode 100644 index ab6e4005..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1205 ,TETRA ,17603762,Sun Nov 28 16:49:48 CET,Sun Nov 28 19:05:15 CET,0.0 2.037 2.72 3.25 3.673 4.025 4.332 4.586 5.014 5.201 5.371 5.285 5.787 5.908 6.145 6.346 6.535 6.631 6.803 6.958 7.183 7.332 7.455 7.618 7.775 7.919 8.066 8.198 8.348 8.491 8.609 8.732 8.855 8.982 9.135 9.296 9.434 9.56 9.659 9.731 9.771 9.781 9.754 9.665 9.49 9.232 8.838 8.271 7.429 6.113 3.932 1.427 -0.562 -2.177 -3.542 -4.722 -5.679 -6.538 -7.284 -7.987 -8.574 -9.101 -9.602 -10.064 -10.504 -10.899 -11.287 -11.626 -11.922 -12.231 -12.566 -12.857 -13.148 -13.445 -13.674 -13.908 -14.161 -14.432 -14.71 -14.893 -15.073 -15.357 -15.555 -15.757 -15.866 -16.095 -16.341 -16.603 -16.739 -17.286 -17.184 -17.346 -17.52 -17.914 -18.118 -18.326 -18.596 -18.918 -19.28 -19.814 -22.425 -2 ,19826 ,TETRA ,17603763,Sun Nov 28 16:49:46 CET,Sun Nov 28 19:05:08 CET,0.0 3.572 4.311 4.822 5.211 5.524 5.799 6.028 6.386 6.537 6.694 6.597 7.092 7.211 7.424 7.623 7.808 7.889 8.041 8.178 8.355 8.468 8.58 8.733 8.877 9.007 9.115 9.221 9.365 9.5 9.611 9.712 9.814 9.923 10.028 10.127 10.205 10.263 10.323 10.382 10.401 10.395 10.355 10.252 10.109 9.922 9.617 9.186 8.531 7.422 5.385 2.939 1.002 -0.631 -1.993 -3.189 -4.231 -5.14 -5.879 -6.584 -7.177 -7.701 -8.197 -8.655 -9.071 -9.462 -9.883 -10.257 -10.586 -10.922 -11.257 -11.53 -11.821 -12.13 -12.356 -12.6 -12.867 -13.142 -13.442 -13.648 -13.853 -14.161 -14.379 -14.602 -14.716 -14.96 -15.211 -15.496 -15.641 -16.192 -16.121 -16.287 -16.47 -16.87 -17.086 -17.331 -17.599 -17.918 -18.318 -18.859 -21.66 -4 ,23749 ,TETRA ,17603765,Sun Nov 28 16:49:50 CET,Sun Nov 28 19:03:59 CET,0.0 3.596 4.661 5.242 5.682 6.02 6.313 6.577 7.013 7.198 7.371 7.3 7.816 7.944 8.201 8.443 8.643 8.739 8.94 9.103 9.296 9.431 9.551 9.699 9.846 9.971 10.074 10.184 10.333 10.465 10.581 10.701 10.805 10.899 11.011 11.139 11.216 11.252 11.279 11.292 11.279 11.224 11.129 10.994 10.776 10.481 10.065 9.51 8.659 7.265 5.004 2.471 0.51 -1.083 -2.436 -3.601 -4.555 -5.398 -6.127 -6.855 -7.469 -7.983 -8.465 -8.929 -9.35 -9.726 -10.119 -10.467 -10.748 -11.038 -11.351 -11.604 -11.872 -12.146 -12.353 -12.577 -12.815 -13.06 -13.299 -13.459 -13.622 -13.879 -14.064 -14.251 -14.347 -14.552 -14.769 -14.995 -15.114 -15.631 -15.485 -15.622 -15.766 -16.103 -16.295 -16.502 -16.719 -16.972 -17.277 -17.734 -25.391 -5 ,20754 ,TETRA ,17603766,Sun Nov 28 16:49:53 CET,Sun Nov 28 19:03:58 CET,0.0 4.446 5.187 5.683 6.038 6.311 6.546 6.748 7.094 7.242 7.377 7.251 7.743 7.847 8.033 8.197 8.364 8.445 8.586 8.71 8.876 8.973 9.062 9.192 9.3 9.402 9.498 9.591 9.693 9.767 9.841 9.924 9.988 10.042 10.106 10.162 10.197 10.231 10.243 10.238 10.227 10.186 10.088 9.946 9.726 9.418 9.035 8.481 7.565 6.184 3.96 1.425 -0.546 -2.149 -3.497 -4.657 -5.659 -6.574 -7.338 -8.066 -8.676 -9.209 -9.713 -10.183 -10.612 -10.993 -11.379 -11.715 -12.012 -12.327 -12.647 -12.927 -13.228 -13.52 -13.74 -13.964 -14.187 -14.408 -14.647 -14.822 -14.989 -15.247 -15.431 -15.608 -15.7 -15.891 -16.102 -16.346 -16.474 -17.01 -16.887 -17.035 -17.189 -17.544 -17.754 -17.991 -18.247 -18.522 -18.855 -19.353 -22.491 -6 ,20253 ,TETRA ,17603767,Sun Nov 28 16:50:42 CET,Sun Nov 28 19:07:01 CET,0.0 3.871 4.688 5.159 5.518 5.828 6.096 6.312 6.682 6.856 7.024 6.931 7.432 7.556 7.773 7.965 8.139 8.222 8.388 8.548 8.754 8.867 8.979 9.148 9.294 9.433 9.555 9.654 9.785 9.913 10.031 10.159 10.269 10.36 10.453 10.537 10.614 10.676 10.695 10.711 10.723 10.711 10.645 10.534 10.379 10.151 9.756 9.173 8.335 7.005 4.778 2.17 0.088 -1.58 -2.942 -4.12 -5.118 -5.983 -6.709 -7.43 -8.058 -8.604 -9.116 -9.589 -10.014 -10.396 -10.783 -11.13 -11.424 -11.723 -12.03 -12.289 -12.562 -12.845 -13.068 -13.29 -13.519 -13.759 -14.007 -14.18 -14.353 -14.609 -14.787 -14.979 -15.085 -15.308 -15.523 -15.758 -15.884 -16.413 -16.303 -16.446 -16.603 -16.949 -17.136 -17.332 -17.551 -17.817 -18.152 -18.635 -21.404 -7 ,19311 ,TETRA ,17603768,Sun Nov 28 16:50:12 CET,Sun Nov 28 19:06:50 CET,0.0 4.071 4.886 5.421 5.8 6.12 6.4 6.634 7.029 7.197 7.355 7.267 7.776 7.901 8.123 8.319 8.496 8.579 8.725 8.862 9.049 9.156 9.259 9.419 9.576 9.71 9.839 9.966 10.115 10.251 10.371 10.501 10.622 10.734 10.862 10.999 11.113 11.217 11.287 11.311 11.325 11.304 11.221 11.1 10.906 10.607 10.184 9.627 8.829 7.588 5.582 3.258 1.384 -0.115 -1.37 -2.455 -3.369 -4.202 -4.907 -5.615 -6.229 -6.751 -7.241 -7.697 -8.112 -8.515 -8.938 -9.305 -9.626 -9.955 -10.295 -10.571 -10.848 -11.143 -11.382 -11.625 -11.862 -12.091 -12.332 -12.505 -12.684 -12.975 -13.177 -13.379 -13.485 -13.703 -13.936 -14.192 -14.318 -14.849 -14.728 -14.885 -15.054 -15.439 -15.646 -15.879 -16.139 -16.412 -16.755 -17.332 -20.036 -8 ,13055 ,TETRA ,17603769,Sun Nov 28 16:50:13 CET,Sun Nov 28 19:06:58 CET,0.0 3.352 4.339 4.984 5.451 5.812 6.127 6.402 6.861 7.077 7.285 7.258 7.786 7.932 8.207 8.451 8.672 8.777 8.977 9.17 9.441 9.598 9.739 9.929 10.111 10.28 10.435 10.587 10.783 10.97 11.134 11.319 11.491 11.638 11.798 11.937 12.033 12.101 12.156 12.215 12.239 12.237 12.198 12.13 12.02 11.872 11.616 11.127 10.381 9.18 7.036 4.507 2.476 0.804 -0.564 -1.724 -2.685 -3.532 -4.253 -4.952 -5.561 -6.114 -6.618 -7.071 -7.49 -7.873 -8.272 -8.621 -8.926 -9.247 -9.575 -9.841 -10.112 -10.396 -10.62 -10.856 -11.098 -11.35 -11.627 -11.832 -12.042 -12.365 -12.594 -12.834 -12.957 -13.197 -13.458 -13.748 -13.889 -14.43 -14.327 -14.486 -14.649 -15.024 -15.253 -15.517 -15.807 -16.121 -16.507 -17.036 -21.078 -9 ,3467 ,TETRA ,17603770,Sun Nov 28 16:50:12 CET,Sun Nov 28 19:04:30 CET,0.0 2.485 3.244 3.696 4.014 4.274 4.494 4.712 5.128 5.289 5.427 5.307 5.794 5.901 6.093 6.259 6.408 6.483 6.632 6.768 6.959 7.07 7.17 7.303 7.418 7.526 7.619 7.702 7.807 7.901 7.986 8.078 8.165 8.25 8.34 8.418 8.473 8.521 8.55 8.57 8.583 8.579 8.54 8.457 8.356 8.229 7.994 7.519 6.705 5.473 3.383 0.929 -1.013 -2.571 -3.845 -4.948 -5.896 -6.739 -7.454 -8.157 -8.758 -9.299 -9.806 -10.267 -10.674 -11.03 -11.408 -11.754 -12.059 -12.377 -12.696 -12.953 -13.215 -13.498 -13.718 -13.937 -14.158 -14.386 -14.625 -14.787 -14.954 -15.22 -15.405 -15.595 -15.697 -15.908 -16.13 -16.369 -16.494 -17.027 -16.892 -17.023 -17.151 -17.458 -17.653 -17.856 -18.06 -18.318 -18.642 -19.108 -27.47 -10 ,24682 ,TETRA ,17603771,Sun Nov 28 16:50:15 CET,Sun Nov 28 19:04:49 CET,0.0 4.039 4.863 5.386 5.799 6.152 6.444 6.685 7.076 7.258 7.421 7.322 7.809 7.917 8.14 8.357 8.536 8.618 8.779 8.92 9.094 9.204 9.313 9.462 9.601 9.727 9.836 9.94 10.071 10.189 10.285 10.4 10.517 10.598 10.665 10.761 10.827 10.844 10.864 10.86 10.818 10.772 10.707 10.611 10.461 10.227 9.846 9.295 8.474 7.159 4.919 2.26 0.184 -1.477 -2.894 -4.168 -5.22 -6.119 -6.879 -7.63 -8.277 -8.825 -9.33 -9.793 -10.223 -10.63 -11.051 -11.403 -11.702 -12.01 -12.323 -12.583 -12.85 -13.117 -13.326 -13.552 -13.777 -14.005 -14.246 -14.419 -14.594 -14.864 -15.056 -15.252 -15.356 -15.565 -15.777 -16.023 -16.151 -16.66 -16.521 -16.665 -16.814 -17.121 -17.301 -17.496 -17.708 -17.954 -18.272 -18.699 -22.283 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt deleted file mode 100644 index 768fb930..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20695 ,TETRA ,17603772,Sun Nov 28 16:50:16 CET,Sun Nov 28 19:05:34 CET,0.0 3.827 4.395 4.736 5.003 5.175 5.287 5.387 5.526 5.595 5.676 5.415 5.841 5.876 5.93 5.958 5.96 5.956 5.942 5.92 5.865 5.82 5.776 5.691 5.594 5.48 5.351 5.209 5.0 4.788 4.564 4.278 3.963 3.629 3.258 2.813 2.345 1.792 1.114 0.303 -0.632 -1.777 -3.219 -4.798 -6.817 -9.309 -12.483 -16.51 -21.887 -29.343 -40.497 -52.361 -61.096 -67.93 -73.441 -78.058 -81.879 -85.13 -87.802 -90.362 -92.509 -94.355 -96.048 -97.6 -98.985 -100.203 -101.437 -102.515 -103.424 -104.342 -105.271 -106.04 -106.823 -107.616 -108.224 -108.854 -109.494 -110.132 -110.797 -111.262 -111.725 -112.419 -112.895 -113.38 -113.631 -114.151 -114.668 -115.198 -115.478 -116.295 -116.419 -116.736 -117.058 -117.709 -118.068 -118.464 -118.889 -119.372 -119.919 -120.596 -123.455 -2 ,4906 ,TETRA ,17603773,Sun Nov 28 16:50:18 CET,Sun Nov 28 19:04:48 CET,0.0 2.855 3.401 3.796 4.027 4.194 4.337 4.456 4.643 4.725 4.81 4.544 4.971 5.012 5.066 5.107 5.16 5.182 5.192 5.178 5.161 5.133 5.085 5.0 4.888 4.76 4.632 4.49 4.266 4.023 3.781 3.481 3.169 2.844 2.439 1.99 1.52 0.916 0.201 -0.598 -1.5 -2.607 -3.95 -5.455 -7.433 -9.873 -13.032 -16.994 -22.284 -29.734 -40.865 -52.61 -61.359 -68.289 -73.719 -78.138 -81.826 -85.024 -87.687 -90.245 -92.334 -94.127 -95.796 -97.315 -98.678 -99.896 -101.132 -102.201 -103.119 -104.066 -105.019 -105.791 -106.573 -107.366 -107.979 -108.602 -109.228 -109.887 -110.585 -111.049 -111.511 -112.236 -112.744 -113.255 -113.518 -114.048 -114.579 -115.15 -115.475 -116.333 -116.483 -116.806 -117.137 -117.868 -118.259 -118.677 -119.138 -119.674 -120.331 -121.227 -124.519 -3 ,13535 ,TETRA ,17603774,Sun Nov 28 16:50:13 CET,Sun Nov 28 19:03:23 CET,0.0 3.639 4.128 4.464 4.715 4.916 5.071 5.206 5.446 5.547 5.629 5.346 5.761 5.797 5.878 5.938 5.955 5.957 5.955 5.938 5.883 5.824 5.768 5.692 5.598 5.495 5.385 5.261 5.055 4.822 4.577 4.28 4.007 3.721 3.326 2.802 2.259 1.639 0.952 0.147 -0.8 -1.919 -3.316 -4.871 -6.852 -9.276 -12.367 -16.327 -21.698 -29.048 -39.726 -50.83 -59.205 -65.9 -71.315 -75.807 -79.483 -82.678 -85.364 -87.94 -90.068 -91.911 -93.61 -95.162 -96.574 -97.823 -99.086 -100.195 -101.142 -102.085 -103.032 -103.808 -104.581 -105.365 -105.969 -106.587 -107.201 -107.813 -108.462 -108.917 -109.38 -110.108 -110.594 -111.066 -111.309 -111.829 -112.367 -112.923 -113.202 -113.999 -114.093 -114.402 -114.738 -115.455 -115.819 -116.202 -116.643 -117.186 -117.955 -119.053 -123.572 -4 ,16099 ,TETRA ,17603775,Sun Nov 28 16:50:13 CET,Sun Nov 28 19:03:45 CET,0.0 2.822 3.437 3.815 4.172 4.448 4.652 4.825 5.074 5.17 5.241 5.006 5.469 5.531 5.617 5.669 5.694 5.706 5.711 5.688 5.634 5.596 5.559 5.493 5.412 5.321 5.212 5.085 4.906 4.726 4.538 4.288 4.025 3.718 3.325 2.87 2.382 1.847 1.218 0.436 -0.449 -1.542 -2.896 -4.392 -6.368 -8.783 -11.822 -15.712 -20.982 -28.354 -39.328 -50.852 -59.455 -66.092 -71.379 -75.863 -79.576 -82.794 -85.454 -87.969 -90.059 -91.873 -93.565 -95.118 -96.493 -97.701 -98.937 -100.019 -100.957 -101.912 -102.86 -103.632 -104.42 -105.236 -105.858 -106.475 -107.109 -107.747 -108.392 -108.837 -109.292 -109.976 -110.448 -110.935 -111.18 -111.691 -112.209 -112.749 -113.03 -113.821 -113.916 -114.229 -114.552 -115.295 -115.704 -116.125 -116.588 -117.093 -117.639 -118.378 -122.91 -5 ,24575 ,TETRA ,17603776,Sun Nov 28 16:50:13 CET,Sun Nov 28 19:05:42 CET,0.0 5.597 6.209 6.6 6.852 7.039 7.183 7.32 7.57 7.689 7.777 7.514 7.947 7.995 8.084 8.14 8.174 8.182 8.196 8.204 8.224 8.221 8.167 8.072 7.98 7.867 7.733 7.599 7.43 7.24 7.04 6.776 6.481 6.179 5.822 5.385 4.915 4.324 3.62 2.825 1.916 0.825 -0.564 -2.088 -4.044 -6.489 -9.641 -13.591 -18.87 -26.211 -37.091 -48.698 -57.482 -64.306 -69.682 -74.177 -77.877 -81.062 -83.701 -86.243 -88.345 -90.127 -91.767 -93.279 -94.637 -95.857 -97.105 -98.193 -99.113 -100.057 -101.031 -101.814 -102.605 -103.398 -103.989 -104.589 -105.205 -105.839 -106.48 -106.915 -107.382 -108.102 -108.571 -109.069 -109.326 -109.838 -110.351 -110.886 -111.17 -111.963 -112.061 -112.403 -112.748 -113.437 -113.8 -114.194 -114.663 -115.225 -115.842 -116.584 -119.598 -6 ,14804 ,TETRA ,17603777,Sun Nov 28 16:50:15 CET,Sun Nov 28 19:05:58 CET,0.0 2.29 2.794 3.104 3.331 3.5 3.64 3.751 3.922 4.007 4.087 3.824 4.249 4.293 4.352 4.384 4.418 4.431 4.453 4.463 4.428 4.387 4.339 4.258 4.166 4.061 3.935 3.791 3.587 3.395 3.203 2.942 2.67 2.365 1.965 1.494 1.027 0.497 -0.126 -0.879 -1.738 -2.753 -4.044 -5.511 -7.416 -9.775 -12.923 -16.88 -21.999 -29.252 -40.057 -51.419 -60.027 -66.858 -72.302 -76.77 -80.453 -83.671 -86.39 -88.982 -91.087 -92.929 -94.634 -96.169 -97.548 -98.782 -100.023 -101.102 -102.018 -102.983 -103.959 -104.718 -105.521 -106.349 -106.948 -107.562 -108.192 -108.822 -109.469 -109.913 -110.378 -111.099 -111.588 -112.086 -112.338 -112.863 -113.414 -113.962 -114.246 -115.053 -115.154 -115.474 -115.804 -116.495 -116.87 -117.29 -117.744 -118.314 -118.999 -119.753 -122.186 -7 ,17555 ,TETRA ,17603778,Sun Nov 28 16:50:17 CET,Sun Nov 28 19:06:47 CET,0.0 3.665 4.285 4.674 4.948 5.179 5.342 5.461 5.675 5.753 5.805 5.531 5.953 5.99 6.032 6.053 6.077 6.084 6.072 6.067 6.069 6.05 6.012 5.922 5.796 5.648 5.519 5.397 5.204 5.017 4.816 4.515 4.206 3.9 3.51 3.022 2.53 1.943 1.276 0.532 -0.363 -1.503 -2.921 -4.438 -6.396 -8.758 -11.772 -15.732 -21.091 -28.579 -39.608 -51.239 -59.958 -66.779 -72.254 -76.868 -80.66 -83.861 -86.5 -89.077 -91.205 -92.982 -94.624 -96.148 -97.523 -98.752 -100.005 -101.088 -101.986 -102.916 -103.882 -104.65 -105.433 -106.243 -106.866 -107.49 -108.131 -108.783 -109.42 -109.842 -110.28 -110.976 -111.459 -111.95 -112.201 -112.724 -113.289 -113.849 -114.123 -114.922 -115.001 -115.304 -115.625 -116.337 -116.755 -117.211 -117.675 -118.224 -118.818 -119.537 -124.112 -8 ,26867 ,TETRA ,17603779,Sun Nov 28 16:50:19 CET,Sun Nov 28 19:05:49 CET,0.0 7.808 8.409 8.791 9.056 9.261 9.384 9.5 9.712 9.821 9.922 9.67 10.12 10.179 10.22 10.248 10.257 10.256 10.265 10.268 10.25 10.206 10.137 10.018 9.911 9.806 9.686 9.56 9.385 9.191 8.979 8.692 8.391 8.081 7.666 7.143 6.609 5.984 5.263 4.452 3.538 2.417 0.989 -0.559 -2.577 -5.066 -8.185 -12.202 -17.62 -25.028 -36.037 -47.673 -56.284 -63.054 -68.537 -73.146 -76.915 -80.151 -82.859 -85.458 -87.556 -89.353 -91.024 -92.539 -93.888 -95.091 -96.328 -97.419 -98.362 -99.301 -100.238 -101.009 -101.782 -102.568 -103.176 -103.789 -104.412 -105.068 -105.76 -106.219 -106.671 -107.348 -107.814 -108.298 -108.546 -109.046 -109.542 -110.055 -110.332 -111.144 -111.271 -111.596 -111.915 -112.593 -112.964 -113.347 -113.792 -114.298 -114.884 -115.7 -119.132 -9 ,4599 ,TETRA ,17603780,Sun Nov 28 16:50:13 CET,Sun Nov 28 19:05:42 CET,0.0 2.678 3.211 3.592 3.93 4.191 4.368 4.498 4.66 4.718 4.768 4.476 4.904 4.946 5.01 5.04 5.047 5.038 5.001 4.959 4.873 4.807 4.741 4.657 4.599 4.524 4.409 4.272 4.106 3.943 3.775 3.546 3.259 2.931 2.523 2.022 1.478 0.828 0.097 -0.724 -1.671 -2.833 -4.226 -5.745 -7.76 -10.235 -13.337 -17.258 -22.614 -30.032 -41.117 -52.745 -61.44 -68.366 -73.904 -78.593 -82.486 -85.851 -88.629 -91.282 -93.487 -95.41 -97.194 -98.803 -100.235 -101.523 -102.844 -103.97 -104.906 -105.861 -106.85 -107.665 -108.491 -109.323 -109.948 -110.574 -111.222 -111.896 -112.59 -113.052 -113.519 -114.251 -114.741 -115.233 -115.481 -115.979 -116.516 -117.096 -117.393 -118.215 -118.339 -118.676 -119.027 -119.777 -120.18 -120.606 -121.043 -121.546 -122.22 -123.078 -127.95 -10 ,15220 ,TETRA ,17603781,Sun Nov 28 16:50:19 CET,Sun Nov 28 19:06:47 CET,0.0 2.828 3.43 3.783 4.018 4.221 4.427 4.602 4.828 4.927 5.009 4.719 5.139 5.17 5.208 5.213 5.21 5.207 5.201 5.2 5.188 5.173 5.136 5.067 4.987 4.905 4.806 4.68 4.498 4.286 4.058 3.756 3.43 3.127 2.773 2.305 1.79 1.185 0.463 -0.375 -1.302 -2.461 -3.913 -5.465 -7.396 -9.847 -13.094 -17.175 -22.657 -30.181 -41.271 -53.012 -61.796 -68.648 -74.068 -78.587 -82.381 -85.715 -88.44 -90.974 -93.063 -94.873 -96.522 -98.048 -99.448 -100.686 -101.948 -103.055 -103.993 -104.939 -105.887 -106.664 -107.476 -108.287 -108.897 -109.521 -110.155 -110.805 -111.465 -111.911 -112.372 -113.078 -113.559 -114.058 -114.308 -114.813 -115.359 -115.921 -116.199 -117.001 -117.114 -117.436 -117.755 -118.417 -118.784 -119.183 -119.616 -120.091 -120.623 -121.303 -124.392 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 0d08dcaf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17357 ,TETRA ,17603782,Sun Nov 28 16:50:15 CET,Sun Nov 28 19:03:24 CET,0.0 1.282 1.663 1.917 2.122 2.31 2.487 2.646 2.928 3.059 3.207 3.114 3.615 3.726 3.926 4.099 4.264 4.348 4.505 4.654 4.884 5.034 5.174 5.375 5.568 5.758 5.94 6.115 6.35 6.57 6.785 7.043 7.28 7.507 7.791 8.12 8.418 8.738 9.088 9.459 9.846 10.286 10.807 11.339 11.947 12.626 13.409 14.283 15.289 16.4 17.539 18.185 18.366 18.384 18.295 18.109 17.887 17.668 17.458 17.223 17.011 16.79 16.559 16.355 16.161 15.96 15.74 15.555 15.379 15.184 14.971 14.773 14.566 14.358 14.195 14.024 13.845 13.636 13.42 13.274 13.108 12.837 12.657 12.486 12.402 12.215 11.987 11.732 11.584 11.059 11.111 10.945 10.77 10.377 10.162 9.889 9.57 9.214 8.754 8.073 4.978 -2 ,30204 ,TETRA ,17603783,Sun Nov 28 16:50:18 CET,Sun Nov 28 19:02:56 CET,0.0 1.705 2.105 2.401 2.645 2.847 3.013 3.165 3.424 3.544 3.672 3.524 4.026 4.148 4.349 4.54 4.721 4.809 4.974 5.135 5.371 5.509 5.64 5.842 6.043 6.242 6.429 6.606 6.822 7.023 7.237 7.505 7.756 8.003 8.287 8.586 8.88 9.202 9.534 9.896 10.287 10.727 11.244 11.759 12.368 13.037 13.785 14.62 15.545 16.566 17.776 18.562 18.771 18.782 18.731 18.567 18.358 18.129 17.9 17.657 17.439 17.246 17.032 16.798 16.584 16.379 16.145 15.934 15.724 15.508 15.311 15.15 14.984 14.787 14.609 14.411 14.238 14.085 13.918 13.794 13.656 13.423 13.241 13.055 12.959 12.765 12.582 12.383 12.258 11.746 11.835 11.686 11.527 11.169 10.948 10.702 10.443 10.12 9.685 9.008 3.047 -3 ,20716 ,TETRA ,17603784,Sun Nov 28 16:50:14 CET,Sun Nov 28 19:03:03 CET,0.0 1.729 2.062 2.339 2.571 2.749 2.903 3.05 3.329 3.456 3.574 3.406 3.886 3.985 4.169 4.339 4.498 4.578 4.733 4.894 5.127 5.264 5.391 5.59 5.789 5.975 6.149 6.314 6.538 6.755 6.956 7.198 7.436 7.669 7.936 8.242 8.549 8.866 9.206 9.581 9.956 10.361 10.869 11.398 12.004 12.669 13.456 14.343 15.314 16.356 17.375 18.035 18.28 18.264 18.14 18.014 17.869 17.66 17.45 17.235 17.011 16.787 16.551 16.312 16.101 15.903 15.689 15.486 15.313 15.128 14.932 14.766 14.557 14.344 14.174 13.971 13.763 13.559 13.341 13.189 13.03 12.763 12.568 12.362 12.238 11.978 11.697 11.398 11.266 10.757 10.809 10.634 10.446 10.084 9.871 9.625 9.349 9.01 8.598 8.043 5.33 -4 ,30695 ,TETRA ,17603785,Sun Nov 28 16:50:16 CET,Sun Nov 28 19:02:37 CET,0.0 1.488 1.801 2.025 2.214 2.39 2.555 2.706 2.943 3.047 3.153 2.972 3.451 3.549 3.727 3.905 4.08 4.159 4.314 4.465 4.681 4.815 4.947 5.14 5.311 5.475 5.641 5.799 6.009 6.214 6.412 6.658 6.906 7.145 7.417 7.731 8.036 8.367 8.727 9.102 9.487 9.916 10.407 10.918 11.501 12.159 12.944 13.799 14.739 15.771 16.936 17.712 17.981 17.987 17.853 17.654 17.435 17.225 17.018 16.79 16.562 16.331 16.097 15.866 15.665 15.456 15.215 15.008 14.821 14.598 14.357 14.169 13.979 13.761 13.571 13.36 13.146 12.937 12.703 12.557 12.416 12.168 11.992 11.797 11.694 11.469 11.202 10.911 10.767 10.245 10.282 10.12 9.955 9.579 9.368 9.111 8.839 8.536 8.093 7.506 5.108 -5 ,30682 ,TETRA ,17603786,Sun Nov 28 16:50:18 CET,Sun Nov 28 19:02:56 CET,0.0 1.382 1.702 1.939 2.154 2.349 2.524 2.68 2.952 3.074 3.19 3.03 3.521 3.618 3.805 3.986 4.168 4.257 4.422 4.577 4.803 4.944 5.078 5.278 5.472 5.65 5.82 5.983 6.192 6.409 6.625 6.887 7.14 7.373 7.64 7.955 8.262 8.588 8.922 9.279 9.666 10.1 10.603 11.103 11.69 12.33 13.06 13.88 14.772 15.749 16.912 17.576 17.749 17.75 17.641 17.465 17.248 16.992 16.765 16.528 16.3 16.062 15.833 15.594 15.323 15.098 14.866 14.647 14.449 14.222 13.986 13.809 13.622 13.42 13.266 13.099 12.918 12.72 12.518 12.377 12.216 11.974 11.808 11.624 11.519 11.304 11.091 10.871 10.756 10.248 10.301 10.135 9.968 9.597 9.373 9.092 8.763 8.401 7.97 7.411 4.596 -6 ,17532 ,TETRA ,17603787,Sun Nov 28 16:50:20 CET,Sun Nov 28 19:03:05 CET,0.0 1.433 1.77 2.019 2.227 2.406 2.58 2.742 3.011 3.126 3.238 3.058 3.537 3.624 3.807 3.99 4.159 4.244 4.412 4.566 4.792 4.937 5.069 5.266 5.45 5.633 5.814 5.975 6.184 6.392 6.588 6.821 7.052 7.283 7.55 7.847 8.138 8.477 8.827 9.195 9.591 10.024 10.535 11.055 11.672 12.374 13.199 14.124 15.071 16.096 17.246 17.981 18.242 18.236 18.103 17.948 17.746 17.5 17.258 17.008 16.801 16.599 16.366 16.133 15.908 15.703 15.508 15.317 15.14 14.975 14.798 14.625 14.434 14.233 14.074 13.908 13.73 13.543 13.335 13.178 13.017 12.765 12.589 12.407 12.311 12.102 11.878 11.642 11.505 10.994 11.032 10.839 10.64 10.19 9.939 9.672 9.398 9.078 8.657 7.996 5.501 -7 ,22496 ,TETRA ,17603788,Sun Nov 28 16:50:14 CET,Sun Nov 28 19:03:32 CET,0.0 1.242 1.645 1.956 2.188 2.374 2.533 2.677 2.927 3.042 3.156 2.983 3.467 3.562 3.746 3.916 4.077 4.158 4.322 4.478 4.703 4.849 4.986 5.19 5.385 5.564 5.734 5.901 6.122 6.328 6.529 6.784 7.026 7.252 7.524 7.821 8.093 8.415 8.767 9.123 9.479 9.891 10.421 10.959 11.552 12.216 12.981 13.815 14.733 15.703 16.756 17.444 17.622 17.55 17.417 17.208 16.968 16.78 16.587 16.346 16.134 15.933 15.713 15.5 15.302 15.097 14.864 14.671 14.501 14.312 14.106 13.918 13.725 13.524 13.369 13.199 13.017 12.835 12.638 12.485 12.319 12.069 11.903 11.725 11.628 11.415 11.187 10.967 10.852 10.351 10.423 10.259 10.084 9.695 9.477 9.248 9.0 8.675 8.259 7.695 5.112 -8 ,24628 ,TETRA ,17603789,Sun Nov 28 16:50:15 CET,Sun Nov 28 19:03:31 CET,0.0 1.626 1.987 2.258 2.508 2.727 2.921 3.095 3.368 3.497 3.616 3.442 3.926 4.02 4.212 4.411 4.599 4.689 4.857 5.021 5.273 5.422 5.556 5.754 5.951 6.142 6.317 6.485 6.708 6.928 7.138 7.39 7.635 7.868 8.145 8.451 8.731 9.043 9.387 9.76 10.149 10.572 11.056 11.522 12.068 12.732 13.497 14.344 15.298 16.342 17.392 18.049 18.257 18.193 18.012 17.779 17.546 17.308 17.089 16.851 16.616 16.369 16.087 15.83 15.606 15.391 15.149 14.919 14.722 14.538 14.345 14.163 13.971 13.763 13.59 13.417 13.232 13.024 12.803 12.64 12.475 12.205 12.018 11.835 11.722 11.491 11.255 10.983 10.851 10.357 10.447 10.301 10.139 9.727 9.491 9.243 8.962 8.626 8.167 7.542 5.018 -9 ,22607 ,TETRA ,17603790,Sun Nov 28 16:50:18 CET,Sun Nov 28 19:03:31 CET,0.0 1.231 1.605 1.869 2.06 2.246 2.425 2.574 2.826 2.939 3.042 2.857 3.339 3.453 3.67 3.839 3.996 4.071 4.214 4.359 4.592 4.742 4.875 5.068 5.251 5.427 5.606 5.775 5.982 6.187 6.399 6.658 6.904 7.146 7.422 7.723 8.0 8.302 8.644 9.012 9.4 9.851 10.374 10.869 11.446 12.107 12.875 13.722 14.634 15.713 16.925 17.685 17.977 18.037 17.987 17.883 17.675 17.415 17.175 16.924 16.698 16.461 16.219 15.987 15.768 15.566 15.326 15.107 14.918 14.718 14.509 14.334 14.15 13.948 13.771 13.578 13.381 13.18 12.984 12.838 12.67 12.41 12.219 12.009 11.897 11.676 11.455 11.203 11.073 10.569 10.629 10.471 10.284 9.861 9.644 9.406 9.112 8.748 8.266 7.633 3.119 -10 ,13659 ,TETRA ,17603791,Sun Nov 28 16:50:19 CET,Sun Nov 28 19:03:28 CET,0.0 1.543 1.923 2.181 2.399 2.597 2.762 2.913 3.199 3.317 3.425 3.238 3.715 3.812 4.006 4.201 4.379 4.456 4.608 4.757 4.969 5.115 5.25 5.432 5.614 5.794 5.976 6.152 6.37 6.57 6.767 7.013 7.27 7.515 7.781 8.1 8.403 8.737 9.116 9.509 9.888 10.286 10.805 11.363 11.977 12.643 13.426 14.274 15.231 16.325 17.467 18.217 18.574 18.652 18.536 18.36 18.137 17.859 17.594 17.336 17.116 16.897 16.677 16.459 16.251 16.039 15.799 15.576 15.358 15.127 14.894 14.696 14.486 14.266 14.103 13.941 13.767 13.579 13.382 13.245 13.092 12.866 12.692 12.495 12.385 12.125 11.892 11.661 11.533 11.034 11.094 10.915 10.727 10.315 10.101 9.856 9.568 9.227 8.756 8.093 3.396 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt deleted file mode 100644 index 5f5d58fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30893 ,TETRA ,17603792,Sun Nov 28 16:50:16 CET,Sun Nov 28 19:08:32 CET,0.0 2.507 2.89 3.081 3.228 3.342 3.448 3.541 3.682 3.744 3.797 3.476 3.891 3.91 3.936 3.951 3.952 3.943 3.928 3.926 3.865 3.792 3.718 3.604 3.472 3.331 3.191 3.052 2.874 2.683 2.479 2.217 1.938 1.641 1.241 0.759 0.294 -0.287 -0.979 -1.749 -2.63 -3.705 -5.077 -6.572 -8.458 -10.808 -13.856 -17.691 -22.816 -29.951 -40.571 -51.64 -59.821 -66.207 -71.27 -75.466 -78.881 -81.796 -84.192 -86.516 -88.487 -90.181 -91.748 -93.182 -94.459 -95.603 -96.758 -97.741 -98.573 -99.424 -100.323 -101.049 -101.752 -102.463 -102.998 -103.55 -104.121 -104.697 -105.268 -105.66 -106.069 -106.689 -107.109 -107.536 -107.747 -108.179 -108.631 -109.097 -109.333 -110.078 -110.062 -110.325 -110.596 -111.166 -111.474 -111.79 -112.126 -112.525 -112.989 -113.61 -115.598 -2 ,15693 ,TETRA ,17603793,Sun Nov 28 16:50:19 CET,Sun Nov 28 19:08:09 CET,0.0 1.553 1.858 2.089 2.255 2.381 2.501 2.601 2.749 2.804 2.852 2.544 2.952 2.967 2.991 2.993 2.98 2.973 2.94 2.899 2.842 2.791 2.73 2.63 2.509 2.378 2.234 2.07 1.828 1.581 1.323 0.983 0.623 0.261 -0.14 -0.611 -1.126 -1.731 -2.415 -3.195 -4.089 -5.19 -6.589 -8.096 -9.977 -12.274 -15.257 -19.094 -24.179 -31.192 -41.732 -52.853 -61.015 -67.322 -72.313 -76.472 -79.926 -82.893 -85.311 -87.64 -89.579 -91.255 -92.803 -94.204 -95.462 -96.568 -97.674 -98.626 -99.44 -100.265 -101.078 -101.734 -102.42 -103.119 -103.647 -104.186 -104.737 -105.294 -105.856 -106.24 -106.636 -107.223 -107.615 -108.029 -108.235 -108.66 -109.114 -109.568 -109.8 -110.553 -110.536 -110.782 -111.027 -111.56 -111.861 -112.17 -112.498 -112.883 -113.329 -113.82 -115.549 -3 ,19471 ,TETRA ,17603794,Sun Nov 28 16:50:21 CET,Sun Nov 28 19:08:51 CET,0.0 2.519 2.96 3.251 3.444 3.575 3.705 3.808 3.938 3.996 4.028 3.68 4.089 4.107 4.118 4.12 4.121 4.113 4.074 4.029 3.975 3.934 3.891 3.81 3.707 3.594 3.47 3.323 3.103 2.878 2.644 2.347 2.047 1.737 1.354 0.868 0.354 -0.248 -0.958 -1.757 -2.634 -3.687 -5.031 -6.525 -8.455 -10.852 -13.895 -17.751 -22.922 -29.919 -40.329 -51.414 -59.541 -65.852 -70.884 -75.083 -78.553 -81.535 -83.982 -86.305 -88.218 -89.854 -91.371 -92.786 -94.083 -95.213 -96.349 -97.345 -98.18 -99.029 -99.89 -100.59 -101.296 -102.006 -102.547 -103.085 -103.63 -104.193 -104.777 -105.175 -105.569 -106.163 -106.573 -106.98 -107.183 -107.619 -108.059 -108.493 -108.72 -109.462 -109.43 -109.681 -109.938 -110.482 -110.774 -111.093 -111.445 -111.818 -112.261 -112.8 -114.771 -4 ,12678 ,TETRA ,17603795,Sun Nov 28 16:50:16 CET,Sun Nov 28 19:08:50 CET,0.0 1.746 2.061 2.317 2.517 2.666 2.79 2.905 3.078 3.15 3.205 2.877 3.28 3.285 3.301 3.294 3.285 3.285 3.28 3.254 3.175 3.12 3.064 2.957 2.84 2.73 2.606 2.469 2.267 2.039 1.799 1.499 1.211 0.895 0.501 0.05 -0.448 -1.071 -1.801 -2.637 -3.566 -4.708 -6.156 -7.721 -9.709 -12.117 -15.11 -18.896 -24.037 -31.007 -41.234 -51.953 -59.702 -65.808 -70.73 -74.803 -78.248 -81.245 -83.68 -86.0 -87.91 -89.568 -91.114 -92.52 -93.783 -94.889 -95.988 -96.947 -97.777 -98.633 -99.498 -100.19 -100.901 -101.619 -102.162 -102.706 -103.255 -103.822 -104.397 -104.787 -105.182 -105.793 -106.201 -106.618 -106.832 -107.25 -107.674 -108.124 -108.36 -109.115 -109.115 -109.382 -109.644 -110.193 -110.492 -110.808 -111.158 -111.538 -111.941 -112.45 -114.353 -5 ,15636 ,TETRA ,17603796,Sun Nov 28 16:50:15 CET,Sun Nov 28 19:08:17 CET,0.0 2.143 2.532 2.76 2.944 3.115 3.256 3.342 3.488 3.554 3.614 3.335 3.761 3.787 3.836 3.869 3.869 3.861 3.851 3.839 3.761 3.681 3.599 3.47 3.334 3.202 3.081 2.953 2.757 2.566 2.38 2.126 1.859 1.584 1.221 0.771 0.317 -0.244 -0.923 -1.693 -2.556 -3.608 -4.968 -6.439 -8.325 -10.702 -13.704 -17.39 -22.186 -28.985 -39.212 -50.049 -58.163 -64.526 -69.536 -73.613 -76.912 -79.8 -82.223 -84.543 -86.461 -88.066 -89.544 -90.917 -92.167 -93.264 -94.345 -95.291 -96.108 -96.937 -97.768 -98.427 -99.09 -99.755 -100.272 -100.806 -101.345 -101.899 -102.465 -102.843 -103.222 -103.821 -104.255 -104.679 -104.889 -105.321 -105.745 -106.186 -106.414 -107.153 -107.133 -107.374 -107.625 -108.148 -108.435 -108.761 -109.1 -109.458 -109.884 -110.421 -112.722 -6 ,12296 ,TETRA ,17603797,Sun Nov 28 16:50:17 CET,Sun Nov 28 19:07:35 CET,0.0 1.683 2.027 2.264 2.432 2.548 2.658 2.766 2.908 2.948 2.984 2.646 3.054 3.076 3.095 3.093 3.079 3.069 3.055 3.03 2.964 2.911 2.854 2.768 2.667 2.536 2.399 2.253 2.034 1.799 1.554 1.233 0.902 0.583 0.201 -0.277 -0.799 -1.428 -2.126 -2.888 -3.764 -4.875 -6.285 -7.836 -9.818 -12.208 -15.229 -19.022 -24.078 -31.067 -41.372 -52.246 -60.265 -66.572 -71.638 -75.777 -79.135 -82.05 -84.47 -86.808 -88.717 -90.329 -91.868 -93.282 -94.534 -95.651 -96.807 -97.816 -98.651 -99.49 -100.33 -101.009 -101.713 -102.429 -102.978 -103.534 -104.088 -104.644 -105.211 -105.599 -105.993 -106.614 -107.036 -107.454 -107.668 -108.107 -108.565 -109.04 -109.28 -110.038 -110.05 -110.323 -110.602 -111.167 -111.457 -111.789 -112.141 -112.534 -112.974 -113.46 -115.323 -7 ,23295 ,TETRA ,17603798,Sun Nov 28 16:50:17 CET,Sun Nov 28 19:09:45 CET,0.0 1.655 1.986 2.222 2.452 2.625 2.73 2.834 3.023 3.103 3.173 2.884 3.311 3.338 3.355 3.367 3.362 3.343 3.304 3.266 3.196 3.145 3.089 2.975 2.824 2.677 2.531 2.375 2.167 1.942 1.701 1.4 1.097 0.787 0.374 -0.137 -0.641 -1.241 -1.949 -2.742 -3.639 -4.757 -6.17 -7.698 -9.667 -12.063 -15.011 -18.707 -23.822 -30.961 -41.65 -53.037 -61.33 -67.74 -72.808 -77.049 -80.508 -83.414 -85.843 -88.197 -90.129 -91.796 -93.36 -94.765 -96.019 -97.142 -98.275 -99.252 -100.085 -100.938 -101.787 -102.463 -103.142 -103.836 -104.358 -104.881 -105.413 -105.957 -106.517 -106.888 -107.27 -107.865 -108.265 -108.668 -108.871 -109.294 -109.739 -110.201 -110.434 -111.175 -111.149 -111.404 -111.668 -112.233 -112.527 -112.835 -113.172 -113.544 -113.956 -114.5 -116.415 -8 ,29061 ,TETRA ,17603799,Sun Nov 28 16:50:19 CET,Sun Nov 28 19:09:45 CET,0.0 2.618 3.013 3.269 3.478 3.625 3.748 3.838 3.996 4.062 4.106 3.791 4.212 4.237 4.288 4.317 4.331 4.336 4.335 4.322 4.27 4.215 4.16 4.079 3.971 3.862 3.756 3.628 3.461 3.29 3.113 2.873 2.591 2.291 1.932 1.499 1.037 0.484 -0.141 -0.848 -1.683 -2.713 -3.988 -5.38 -7.178 -9.358 -12.145 -15.738 -20.599 -27.392 -37.517 -48.143 -55.971 -62.058 -66.944 -71.042 -74.41 -77.295 -79.643 -81.896 -83.83 -85.506 -86.997 -88.331 -89.527 -90.59 -91.661 -92.61 -93.437 -94.274 -95.123 -95.817 -96.52 -97.239 -97.795 -98.352 -98.891 -99.438 -100.005 -100.385 -100.768 -101.337 -101.723 -102.121 -102.321 -102.749 -103.202 -103.652 -103.879 -104.613 -104.586 -104.858 -105.138 -105.694 -105.995 -106.348 -106.733 -107.124 -107.531 -108.027 -109.848 -10 ,211 ,TETRA ,17603801,Sun Nov 28 16:50:42 CET,Sun Nov 28 19:09:34 CET,0.0 1.969 2.388 2.672 2.909 3.045 3.148 3.255 3.444 3.516 3.568 3.237 3.65 3.667 3.699 3.728 3.735 3.732 3.716 3.692 3.647 3.597 3.53 3.42 3.313 3.199 3.076 2.959 2.779 2.571 2.358 2.078 1.784 1.486 1.129 0.704 0.252 -0.32 -1.003 -1.756 -2.582 -3.616 -4.916 -6.284 -8.052 -10.298 -13.173 -16.757 -21.598 -28.424 -38.607 -49.307 -57.163 -63.334 -68.35 -72.582 -76.078 -79.014 -81.398 -83.681 -85.586 -87.237 -88.767 -90.156 -91.424 -92.557 -93.712 -94.722 -95.558 -96.386 -97.22 -97.902 -98.596 -99.305 -99.843 -100.395 -100.967 -101.543 -102.123 -102.506 -102.888 -103.478 -103.877 -104.28 -104.486 -104.911 -105.357 -105.813 -106.053 -106.805 -106.768 -107.018 -107.293 -107.846 -108.123 -108.419 -108.755 -109.143 -109.584 -110.129 -111.74 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 8bc079de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15605 ,TETRA ,17603802,Sun Nov 28 16:50:45 CET,Sun Nov 28 19:06:34 CET,0.0 1.326 1.747 2.068 2.322 2.545 2.762 2.956 3.282 3.428 3.565 3.444 3.96 4.071 4.295 4.513 4.727 4.824 5.003 5.183 5.45 5.622 5.794 6.042 6.26 6.47 6.669 6.865 7.142 7.438 7.712 7.995 8.271 8.546 8.857 9.208 9.561 9.959 10.38 10.836 11.315 11.851 12.476 13.113 13.855 14.693 15.673 16.75 18.038 19.611 21.407 22.698 23.43 23.831 24.012 24.105 24.107 24.025 23.931 23.83 23.717 23.597 23.466 23.355 23.232 23.083 22.924 22.785 22.659 22.515 22.371 22.241 22.086 21.93 21.813 21.68 21.537 21.385 21.226 21.101 20.963 20.748 20.592 20.423 20.333 20.145 19.961 19.742 19.623 19.143 19.278 19.158 19.002 18.572 18.302 18.026 17.756 17.418 16.982 16.319 12.617 -2 ,3080 ,TETRA ,17603803,Sun Nov 28 16:51:43 CET,Sun Nov 28 19:17:03 CET,0.0 1.601 2.011 2.289 2.545 2.762 2.944 3.116 3.447 3.615 3.771 3.646 4.149 4.263 4.477 4.681 4.879 4.977 5.162 5.342 5.627 5.809 5.977 6.235 6.497 6.738 6.955 7.159 7.418 7.669 7.915 8.228 8.523 8.791 9.097 9.458 9.823 10.225 10.649 11.095 11.566 12.111 12.78 13.459 14.238 15.095 16.107 17.214 18.475 20.003 21.817 23.181 23.871 24.218 24.298 24.295 24.277 24.204 24.089 23.935 23.793 23.618 23.439 23.294 23.148 22.987 22.797 22.617 22.473 22.325 22.159 22.015 21.839 21.662 21.533 21.398 21.245 21.092 20.954 20.846 20.71 20.491 20.333 20.16 20.065 19.871 19.678 19.484 19.384 18.901 18.985 18.835 18.694 18.388 18.187 17.939 17.641 17.34 17.029 16.511 12.962 -3 ,19327 ,TETRA ,17603804,Sun Nov 28 16:53:43 CET,Sun Nov 28 19:18:35 CET,0.0 2.023 2.378 2.7 2.979 3.184 3.367 3.547 3.852 3.981 4.111 3.988 4.489 4.598 4.822 5.041 5.26 5.367 5.571 5.751 5.996 6.151 6.306 6.547 6.783 7.003 7.207 7.398 7.642 7.88 8.108 8.376 8.648 8.924 9.247 9.622 9.985 10.381 10.795 11.235 11.698 12.216 12.829 13.442 14.175 14.995 15.968 17.09 18.424 20.001 21.887 23.36 24.147 24.546 24.669 24.65 24.593 24.477 24.35 24.217 24.083 23.979 23.872 23.741 23.603 23.446 23.264 23.112 22.987 22.846 22.68 22.536 22.375 22.205 22.078 21.95 21.81 21.667 21.534 21.424 21.286 21.067 20.907 20.736 20.648 20.448 20.227 19.996 19.882 19.411 19.541 19.407 19.276 19.001 18.832 18.627 18.383 18.124 17.773 17.239 14.364 -4 ,21513 ,TETRA ,17603805,Sun Nov 28 17:06:15 CET,Sun Nov 28 19:20:45 CET,0.0 1.77 2.235 2.567 2.824 3.043 3.221 3.409 3.77 3.921 4.067 3.944 4.457 4.578 4.8 5.024 5.241 5.347 5.542 5.722 5.997 6.184 6.363 6.615 6.872 7.124 7.342 7.535 7.784 8.023 8.255 8.55 8.85 9.128 9.438 9.788 10.145 10.523 10.915 11.339 11.79 12.309 12.919 13.545 14.304 15.136 16.079 17.217 18.6 20.112 21.831 23.254 24.032 24.427 24.615 24.665 24.593 24.47 24.329 24.156 24.0 23.847 23.69 23.519 23.341 23.188 23.016 22.835 22.672 22.495 22.317 22.172 22.021 21.85 21.708 21.561 21.401 21.22 21.001 20.847 20.698 20.476 20.313 20.118 20.019 19.798 19.529 19.217 19.046 18.523 18.56 18.374 18.188 17.79 17.531 17.239 16.913 16.478 15.974 15.224 12.056 -5 ,24211 ,TETRA ,17603806,Sun Nov 28 17:06:15 CET,Sun Nov 28 19:21:04 CET,0.0 1.341 1.777 2.125 2.418 2.67 2.896 3.121 3.53 3.688 3.834 3.72 4.232 4.349 4.569 4.789 5.006 5.107 5.305 5.505 5.787 5.967 6.122 6.346 6.578 6.784 6.983 7.187 7.447 7.698 7.937 8.23 8.509 8.782 9.086 9.418 9.759 10.142 10.551 10.988 11.465 12.014 12.646 13.296 14.072 14.949 15.941 17.029 18.325 19.871 21.694 23.055 23.71 24.064 24.274 24.361 24.363 24.308 24.245 24.143 23.993 23.876 23.771 23.624 23.468 23.329 23.191 23.057 22.938 22.805 22.646 22.512 22.377 22.223 22.096 21.946 21.789 21.651 21.503 21.402 21.297 21.101 20.945 20.789 20.714 20.553 20.378 20.193 20.1 19.61 19.625 19.414 19.204 18.76 18.519 18.265 17.957 17.597 17.156 16.548 12.05 -6 ,20708 ,TETRA ,17603807,Sun Nov 28 17:06:18 CET,Sun Nov 28 19:21:20 CET,0.0 1.49 1.975 2.347 2.646 2.9 3.095 3.259 3.558 3.687 3.811 3.673 4.169 4.271 4.47 4.667 4.883 4.998 5.211 5.406 5.701 5.873 6.025 6.245 6.463 6.704 6.928 7.131 7.382 7.608 7.834 8.122 8.402 8.674 8.985 9.343 9.694 10.076 10.474 10.926 11.417 11.954 12.586 13.204 13.913 14.725 15.731 16.886 18.257 19.84 21.622 23.03 23.79 24.238 24.508 24.618 24.602 24.523 24.391 24.239 24.104 23.97 23.84 23.704 23.562 23.419 23.278 23.143 23.003 22.851 22.704 22.578 22.434 22.279 22.147 22.0 21.843 21.678 21.499 21.378 21.252 21.03 20.891 20.754 20.668 20.495 20.312 20.104 19.999 19.514 19.643 19.527 19.393 19.093 18.93 18.728 18.511 18.254 17.933 17.484 14.599 -7 ,21782 ,TETRA ,17603808,Sun Nov 28 17:06:19 CET,Sun Nov 28 19:21:43 CET,0.0 1.343 1.81 2.154 2.406 2.628 2.819 2.995 3.328 3.483 3.634 3.546 4.074 4.191 4.408 4.623 4.823 4.914 5.094 5.271 5.544 5.724 5.894 6.138 6.364 6.578 6.782 6.98 7.245 7.501 7.745 8.061 8.385 8.695 9.061 9.471 9.858 10.293 10.77 11.287 11.814 12.377 13.015 13.658 14.466 15.375 16.383 17.497 18.834 20.42 22.301 23.803 24.589 25.023 25.278 25.378 25.383 25.335 25.251 25.114 24.942 24.791 24.661 24.509 24.351 24.197 24.01 23.825 23.674 23.517 23.347 23.216 23.079 22.913 22.766 22.618 22.476 22.324 22.166 22.046 21.909 21.701 21.56 21.412 21.33 21.152 20.976 20.798 20.692 20.214 20.36 20.223 20.084 19.74 19.51 19.28 19.041 18.763 18.407 17.839 14.873 -9 ,13277 ,TETRA ,17603810,Sun Nov 28 17:06:18 CET,Sun Nov 28 19:22:00 CET,0.0 1.312 1.741 2.064 2.322 2.535 2.716 2.882 3.19 3.324 3.455 3.306 3.805 3.916 4.131 4.34 4.541 4.636 4.82 4.987 5.223 5.387 5.549 5.785 6.012 6.216 6.415 6.614 6.875 7.125 7.357 7.642 7.918 8.183 8.509 8.87 9.2 9.567 9.971 10.403 10.875 11.428 12.055 12.662 13.396 14.262 15.272 16.423 17.764 19.32 21.17 22.465 23.062 23.408 23.598 23.67 23.668 23.637 23.579 23.484 23.376 23.244 23.097 22.94 22.755 22.586 22.394 22.2 22.021 21.803 21.575 21.407 21.244 21.07 20.921 20.765 20.599 20.436 20.247 20.11 19.983 19.762 19.59 19.41 19.328 19.166 18.988 18.768 18.632 18.131 18.219 18.071 17.938 17.628 17.443 17.19 16.864 16.491 15.944 15.185 11.662 -10 ,27579 ,TETRA ,17603811,Sun Nov 28 17:06:19 CET,Sun Nov 28 19:21:16 CET,0.0 1.308 1.696 1.954 2.185 2.413 2.622 2.816 3.149 3.288 3.416 3.259 3.763 3.882 4.111 4.317 4.506 4.593 4.765 4.933 5.181 5.339 5.486 5.711 5.926 6.142 6.349 6.541 6.795 7.035 7.268 7.548 7.816 8.079 8.375 8.716 9.056 9.42 9.81 10.234 10.694 11.231 11.857 12.475 13.212 14.076 15.063 16.187 17.52 19.062 20.874 22.289 23.082 23.51 23.712 23.759 23.741 23.71 23.66 23.576 23.474 23.35 23.219 23.089 22.963 22.837 22.64 22.45 22.313 22.171 22.023 21.883 21.724 21.556 21.428 21.303 21.161 21.02 20.884 20.782 20.651 20.438 20.322 20.204 20.13 19.967 19.79 19.59 19.489 19.023 19.177 19.064 18.903 18.502 18.303 18.09 17.81 17.456 17.069 16.55 14.72 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt deleted file mode 100644 index c2191afd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5447 ,TETRA ,17603308,Sun Nov 28 16:34:01 CET,Sun Nov 28 16:36:03 CET,0.0 1.373 1.795 2.094 2.341 2.578 2.783 2.964 3.281 3.42 3.567 3.497 3.966 4.089 4.294 4.479 4.665 4.756 4.927 5.079 5.273 5.409 5.55 5.747 5.929 6.109 6.292 6.451 6.64 6.812 6.955 7.119 7.274 7.427 7.58 7.739 7.893 8.039 8.176 8.324 8.477 8.588 8.697 8.756 8.772 8.743 8.537 8.139 7.469 6.288 4.11 1.287 -1.098 -2.979 -4.498 -5.798 -6.958 -8.036 -8.915 -9.778 -10.522 -11.178 -11.805 -12.394 -12.907 -13.363 -13.839 -14.26 -14.639 -15.042 -15.444 -15.776 -16.115 -16.464 -16.734 -17.008 -17.299 -17.587 -17.888 -18.092 -18.303 -18.658 -18.9 -19.13 -19.244 -19.479 -19.71 -19.939 -20.054 -20.532 -20.428 -20.562 -20.706 -21.017 -21.185 -21.366 -21.562 -21.78 -22.016 -22.353 -23.43 -2 ,18754 ,TETRA ,17603813,Sun Nov 28 17:06:16 CET,Sun Nov 28 18:55:45 CET,0.0 1.44 1.914 2.244 2.514 2.754 2.946 3.11 3.459 3.639 3.796 3.713 4.177 4.281 4.468 4.658 4.84 4.923 5.08 5.25 5.473 5.621 5.778 5.991 6.198 6.387 6.553 6.714 6.914 7.092 7.26 7.433 7.602 7.761 7.914 8.078 8.236 8.386 8.512 8.665 8.809 8.899 8.974 9.032 9.004 8.855 8.587 8.108 7.334 6.09 3.864 1.101 -1.137 -2.999 -4.602 -5.992 -7.16 -8.198 -9.098 -10.007 -10.773 -11.443 -12.07 -12.651 -13.19 -13.674 -14.15 -14.59 -14.98 -15.356 -15.748 -16.083 -16.432 -16.783 -17.053 -17.343 -17.639 -17.928 -18.22 -18.427 -18.647 -18.978 -19.194 -19.403 -19.51 -19.732 -19.953 -20.191 -20.317 -20.804 -20.719 -20.859 -20.998 -21.314 -21.483 -21.655 -21.846 -22.06 -22.314 -22.663 -23.741 -3 ,31646 ,TETRA ,17603310,Sun Nov 28 16:34:18 CET,Sun Nov 28 16:36:14 CET,0.0 1.267 1.667 1.973 2.217 2.422 2.601 2.769 3.065 3.197 3.32 3.216 3.67 3.792 4.024 4.21 4.383 4.467 4.614 4.746 4.936 5.066 5.191 5.378 5.568 5.747 5.908 6.052 6.234 6.41 6.59 6.809 7.008 7.175 7.354 7.581 7.808 8.022 8.213 8.38 8.512 8.571 8.617 8.675 8.696 8.646 8.495 8.131 7.371 6.149 3.978 1.236 -1.043 -2.981 -4.655 -6.12 -7.364 -8.473 -9.391 -10.278 -11.047 -11.717 -12.315 -12.885 -13.409 -13.866 -14.349 -14.784 -15.15 -15.509 -15.866 -16.166 -16.479 -16.797 -17.036 -17.288 -17.546 -17.803 -18.067 -18.246 -18.438 -18.753 -18.966 -19.18 -19.289 -19.508 -19.73 -19.958 -20.077 -20.565 -20.476 -20.62 -20.767 -21.089 -21.272 -21.458 -21.656 -21.881 -22.148 -22.518 -23.738 -4 ,13435 ,TETRA ,17603311,Sun Nov 28 16:35:00 CET,Sun Nov 28 16:36:22 CET,0.0 1.511 1.926 2.244 2.512 2.739 2.939 3.128 3.477 3.638 3.794 3.745 4.208 4.325 4.574 4.812 5.023 5.124 5.308 5.485 5.736 5.888 6.037 6.245 6.432 6.602 6.774 6.949 7.162 7.352 7.519 7.698 7.884 8.065 8.246 8.442 8.614 8.803 8.976 9.138 9.316 9.461 9.612 9.733 9.767 9.711 9.501 9.133 8.524 7.355 5.094 2.298 0.055 -1.838 -3.453 -4.873 -6.077 -7.114 -7.989 -8.874 -9.628 -10.302 -10.936 -11.515 -12.06 -12.547 -13.054 -13.49 -13.859 -14.259 -14.668 -14.999 -15.341 -15.703 -15.971 -16.239 -16.525 -16.812 -17.106 -17.317 -17.527 -17.848 -18.075 -18.307 -18.425 -18.656 -18.902 -19.18 -19.324 -19.822 -19.747 -19.894 -20.044 -20.375 -20.553 -20.745 -20.951 -21.187 -21.454 -21.804 -22.912 -5 ,13619 ,TETRA ,17603312,Sun Nov 28 16:34:18 CET,Sun Nov 28 16:36:19 CET,0.0 1.428 1.914 2.27 2.555 2.802 3.044 3.25 3.582 3.735 3.878 3.792 4.247 4.37 4.608 4.852 5.077 5.179 5.385 5.581 5.811 5.936 6.075 6.28 6.469 6.64 6.799 6.945 7.141 7.34 7.52 7.74 7.925 8.088 8.285 8.469 8.618 8.74 8.852 9.026 9.207 9.328 9.408 9.449 9.395 9.262 9.059 8.643 7.932 6.759 4.623 1.883 -0.439 -2.322 -3.868 -5.222 -6.378 -7.466 -8.382 -9.238 -9.985 -10.671 -11.306 -11.875 -12.405 -12.864 -13.355 -13.809 -14.176 -14.544 -14.943 -15.274 -15.593 -15.924 -16.183 -16.452 -16.731 -17.009 -17.296 -17.49 -17.687 -17.989 -18.189 -18.395 -18.507 -18.742 -18.989 -19.253 -19.386 -19.884 -19.806 -19.961 -20.121 -20.466 -20.662 -20.856 -21.06 -21.294 -21.6 -22.006 -23.159 -6 ,21225 ,TETRA ,17603313,Sun Nov 28 16:34:20 CET,Sun Nov 28 16:36:17 CET,0.0 1.773 2.348 2.735 3.042 3.332 3.585 3.819 4.252 4.428 4.574 4.521 4.984 5.103 5.339 5.563 5.779 5.876 6.045 6.226 6.493 6.648 6.798 6.997 7.183 7.366 7.531 7.685 7.865 8.023 8.187 8.382 8.555 8.729 8.931 9.138 9.308 9.464 9.624 9.779 9.915 10.059 10.197 10.295 10.362 10.319 10.143 9.81 9.163 8.049 5.925 3.215 0.967 -0.949 -2.615 -4.055 -5.235 -6.267 -7.15 -8.02 -8.756 -9.404 -10.004 -10.554 -11.066 -11.526 -11.998 -12.427 -12.813 -13.233 -13.659 -13.999 -14.348 -14.701 -14.965 -15.237 -15.514 -15.803 -16.106 -16.316 -16.54 -16.882 -17.098 -17.325 -17.442 -17.667 -17.898 -18.152 -18.28 -18.772 -18.697 -18.842 -18.986 -19.283 -19.444 -19.634 -19.838 -20.072 -20.372 -20.755 -21.915 -7 ,29533 ,TETRA ,17603314,Sun Nov 28 16:34:19 CET,Sun Nov 28 16:36:19 CET,0.0 1.336 1.815 2.182 2.492 2.747 2.951 3.132 3.477 3.637 3.787 3.742 4.211 4.33 4.534 4.717 4.897 4.97 5.11 5.258 5.455 5.565 5.671 5.847 6.018 6.187 6.35 6.508 6.728 6.913 7.066 7.268 7.471 7.646 7.836 8.023 8.166 8.353 8.541 8.679 8.789 8.874 8.941 8.951 8.896 8.809 8.595 8.178 7.451 6.175 3.911 1.18 -1.095 -2.984 -4.582 -5.972 -7.184 -8.271 -9.184 -10.129 -10.931 -11.636 -12.288 -12.868 -13.4 -13.869 -14.359 -14.806 -15.191 -15.586 -15.976 -16.283 -16.603 -16.951 -17.224 -17.496 -17.773 -18.059 -18.357 -18.555 -18.762 -19.085 -19.308 -19.55 -19.665 -19.89 -20.128 -20.386 -20.524 -21.021 -20.951 -21.102 -21.25 -21.579 -21.768 -21.971 -22.184 -22.404 -22.648 -22.969 -23.894 -8 ,1797 ,TETRA ,17603819,Sun Nov 28 17:06:18 CET,Sun Nov 28 18:56:19 CET,0.0 1.236 1.623 1.928 2.18 2.381 2.557 2.727 3.043 3.184 3.315 3.23 3.689 3.8 4.015 4.218 4.401 4.492 4.682 4.856 5.098 5.249 5.407 5.645 5.858 6.039 6.205 6.377 6.604 6.801 6.976 7.173 7.354 7.542 7.735 7.919 8.095 8.266 8.417 8.571 8.717 8.836 8.932 8.982 8.988 8.935 8.745 8.298 7.459 6.095 3.761 0.909 -1.526 -3.637 -5.381 -6.919 -8.265 -9.448 -10.432 -11.385 -12.17 -12.882 -13.591 -14.223 -14.783 -15.295 -15.861 -16.379 -16.814 -17.262 -17.699 -18.07 -18.475 -18.874 -19.177 -19.489 -19.814 -20.146 -20.487 -20.731 -20.992 -21.4 -21.69 -21.988 -22.128 -22.388 -22.656 -22.943 -23.103 -23.633 -23.59 -23.755 -23.923 -24.275 -24.479 -24.703 -24.963 -25.258 -25.577 -25.993 -27.232 -9 ,31141 ,TETRA ,17603316,Sun Nov 28 16:34:19 CET,Sun Nov 28 16:36:06 CET,0.0 1.661 2.147 2.48 2.741 2.973 3.16 3.323 3.64 3.783 3.921 3.867 4.336 4.457 4.688 4.909 5.124 5.224 5.395 5.556 5.805 5.955 6.1 6.295 6.485 6.666 6.814 6.964 7.171 7.356 7.521 7.712 7.878 8.031 8.203 8.378 8.547 8.708 8.854 8.992 9.114 9.231 9.305 9.356 9.387 9.309 9.065 8.677 8.066 6.963 4.781 1.967 -0.407 -2.399 -4.063 -5.545 -6.79 -7.863 -8.782 -9.671 -10.423 -11.11 -11.777 -12.375 -12.903 -13.397 -13.927 -14.386 -14.781 -15.175 -15.576 -15.919 -16.285 -16.662 -16.932 -17.198 -17.466 -17.729 -17.999 -18.192 -18.397 -18.716 -18.931 -19.144 -19.251 -19.472 -19.706 -19.954 -20.082 -20.574 -20.483 -20.623 -20.765 -21.071 -21.24 -21.429 -21.635 -21.857 -22.126 -22.462 -23.526 -10 ,27151 ,TETRA ,17603317,Sun Nov 28 16:34:19 CET,Sun Nov 28 16:36:17 CET,0.0 1.353 1.866 2.236 2.531 2.808 3.063 3.305 3.734 3.91 4.07 4.023 4.488 4.607 4.828 5.031 5.225 5.325 5.524 5.71 5.963 6.114 6.259 6.477 6.678 6.862 7.038 7.206 7.396 7.565 7.742 7.925 8.07 8.194 8.333 8.49 8.634 8.817 9.003 9.16 9.302 9.417 9.491 9.544 9.555 9.444 9.182 8.73 7.93 6.537 4.139 1.331 -0.985 -2.922 -4.521 -5.912 -7.143 -8.296 -9.239 -10.126 -10.87 -11.54 -12.174 -12.758 -13.292 -13.77 -14.256 -14.688 -15.058 -15.432 -15.826 -16.148 -16.491 -16.843 -17.111 -17.386 -17.661 -17.949 -18.229 -18.406 -18.6 -18.896 -19.092 -19.297 -19.406 -19.644 -19.881 -20.105 -20.222 -20.71 -20.601 -20.739 -20.885 -21.208 -21.388 -21.57 -21.77 -21.986 -22.225 -22.572 -23.668 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index c3269db0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22953 ,TETRA ,17603822,Sun Nov 28 17:06:20 CET,Sun Nov 28 18:54:48 CET,0.0 1.867 2.363 2.713 2.966 3.175 3.377 3.555 3.828 3.956 4.084 3.984 4.425 4.519 4.701 4.877 5.028 5.09 5.225 5.337 5.473 5.565 5.651 5.769 5.887 5.992 6.1 6.207 6.317 6.424 6.527 6.652 6.76 6.848 6.949 7.053 7.154 7.247 7.358 7.47 7.533 7.572 7.591 7.576 7.486 7.338 7.083 6.572 5.763 4.494 2.182 -0.548 -2.753 -4.628 -6.183 -7.544 -8.705 -9.755 -10.662 -11.562 -12.326 -13.001 -13.639 -14.217 -14.758 -15.239 -15.731 -16.173 -16.554 -16.952 -17.353 -17.669 -17.984 -18.303 -18.551 -18.813 -19.088 -19.374 -19.651 -19.844 -20.04 -20.335 -20.551 -20.778 -20.895 -21.127 -21.377 -21.633 -21.757 -22.257 -22.237 -22.408 -22.574 -22.94 -23.17 -23.427 -23.702 -24.023 -24.371 -24.794 -26.275 -2 ,22960 ,TETRA ,17603319,Sun Nov 28 16:34:19 CET,Sun Nov 28 16:36:07 CET,0.0 1.003 1.321 1.552 1.736 1.895 2.027 2.159 2.416 2.514 2.609 2.454 2.87 2.942 3.071 3.187 3.305 3.365 3.469 3.558 3.69 3.785 3.873 3.987 4.093 4.198 4.298 4.39 4.515 4.635 4.745 4.877 4.998 5.108 5.225 5.336 5.451 5.588 5.712 5.821 5.924 6.016 6.098 6.18 6.211 6.156 6.03 5.762 5.23 4.176 2.043 -0.628 -2.891 -4.888 -6.572 -8.019 -9.254 -10.34 -11.27 -12.189 -12.967 -13.655 -14.287 -14.859 -15.382 -15.844 -16.317 -16.744 -17.111 -17.49 -17.894 -18.223 -18.562 -18.926 -19.2 -19.475 -19.763 -20.044 -20.329 -20.54 -20.764 -21.107 -21.346 -21.595 -21.723 -21.998 -22.331 -22.685 -22.847 -23.357 -23.334 -23.526 -23.729 -24.148 -24.399 -24.664 -24.957 -25.336 -25.796 -26.425 -28.222 -3 ,5281 ,TETRA ,17603320,Sun Nov 28 16:34:20 CET,Sun Nov 28 16:36:04 CET,0.0 1.523 2.0 2.335 2.585 2.785 2.982 3.165 3.465 3.597 3.73 3.636 4.073 4.167 4.354 4.505 4.664 4.746 4.902 5.038 5.219 5.335 5.434 5.588 5.715 5.825 5.953 6.093 6.256 6.387 6.508 6.644 6.773 6.889 7.001 7.123 7.231 7.33 7.451 7.557 7.625 7.661 7.663 7.642 7.566 7.399 7.092 6.593 5.828 4.611 2.32 -0.563 -2.897 -4.83 -6.449 -7.87 -9.052 -10.084 -10.985 -11.862 -12.586 -13.216 -13.817 -14.393 -14.907 -15.367 -15.845 -16.259 -16.615 -16.982 -17.361 -17.68 -18.009 -18.334 -18.575 -18.824 -19.078 -19.34 -19.611 -19.798 -19.997 -20.295 -20.496 -20.709 -20.818 -21.038 -21.267 -21.516 -21.653 -22.149 -22.122 -22.318 -22.522 -22.92 -23.132 -23.357 -23.599 -23.87 -24.177 -24.685 -26.7 -4 ,21758 ,TETRA ,17603321,Sun Nov 28 16:35:00 CET,Sun Nov 28 16:36:26 CET,0.0 1.356 1.742 2.034 2.284 2.488 2.665 2.812 3.084 3.21 3.319 3.167 3.574 3.635 3.771 3.909 4.031 4.082 4.182 4.28 4.411 4.491 4.577 4.69 4.799 4.92 5.039 5.148 5.274 5.376 5.464 5.594 5.728 5.834 5.951 6.072 6.155 6.217 6.282 6.338 6.377 6.409 6.407 6.37 6.301 6.143 5.803 5.238 4.394 2.996 0.522 -2.412 -4.82 -6.835 -8.53 -9.996 -11.232 -12.306 -13.221 -14.139 -14.909 -15.547 -16.134 -16.679 -17.174 -17.634 -18.102 -18.52 -18.883 -19.246 -19.62 -19.927 -20.24 -20.56 -20.807 -21.06 -21.313 -21.587 -21.872 -22.053 -22.245 -22.551 -22.749 -22.955 -23.065 -23.292 -23.547 -23.807 -23.943 -24.442 -24.373 -24.531 -24.696 -25.064 -25.282 -25.507 -25.788 -26.161 -26.541 -27.042 -29.074 -5 ,15053 ,TETRA ,17603322,Sun Nov 28 16:34:20 CET,Sun Nov 28 16:36:20 CET,0.0 1.169 1.553 1.822 2.02 2.186 2.337 2.493 2.797 2.917 3.019 2.885 3.313 3.39 3.55 3.691 3.806 3.858 3.955 4.054 4.2 4.285 4.375 4.511 4.63 4.731 4.834 4.933 5.042 5.161 5.264 5.357 5.456 5.568 5.678 5.776 5.85 5.925 6.002 6.063 6.1 6.133 6.15 6.113 6.036 5.889 5.619 5.157 4.378 3.147 0.949 -1.777 -4.105 -6.145 -7.85 -9.364 -10.642 -11.731 -12.643 -13.529 -14.294 -14.973 -15.607 -16.179 -16.713 -17.207 -17.707 -18.151 -18.536 -18.936 -19.341 -19.659 -19.992 -20.342 -20.592 -20.837 -21.107 -21.394 -21.678 -21.865 -22.055 -22.35 -22.557 -22.773 -22.888 -23.124 -23.366 -23.63 -23.765 -24.264 -24.21 -24.36 -24.514 -24.87 -25.089 -25.337 -25.601 -25.907 -26.291 -26.756 -28.542 -6 ,12093 ,TETRA ,17603323,Sun Nov 28 16:34:23 CET,Sun Nov 28 16:36:17 CET,0.0 1.238 1.621 1.885 2.114 2.312 2.493 2.642 2.877 3.002 3.127 3.002 3.428 3.51 3.672 3.825 3.976 4.05 4.184 4.303 4.456 4.56 4.66 4.794 4.932 5.056 5.162 5.266 5.382 5.48 5.591 5.727 5.83 5.916 6.016 6.111 6.199 6.292 6.379 6.467 6.513 6.514 6.503 6.471 6.349 6.136 5.785 5.194 4.261 2.772 0.274 -2.678 -5.044 -7.001 -8.664 -10.132 -11.365 -12.449 -13.375 -14.275 -15.029 -15.698 -16.344 -16.923 -17.431 -17.895 -18.378 -18.809 -19.181 -19.56 -19.947 -20.269 -20.603 -20.943 -21.199 -21.464 -21.739 -22.009 -22.287 -22.481 -22.676 -22.977 -23.187 -23.41 -23.526 -23.763 -24.014 -24.273 -24.408 -24.907 -24.858 -25.011 -25.165 -25.522 -25.726 -25.944 -26.193 -26.479 -26.9 -27.431 -28.744 -7 ,19393 ,TETRA ,17603828,Sun Nov 28 17:06:21 CET,Sun Nov 28 18:54:48 CET,0.0 1.678 2.133 2.478 2.754 2.995 3.192 3.352 3.658 3.81 3.945 3.806 4.225 4.32 4.502 4.647 4.778 4.85 5.002 5.125 5.294 5.41 5.512 5.647 5.782 5.902 6.013 6.123 6.242 6.349 6.471 6.62 6.738 6.833 6.947 7.076 7.179 7.278 7.371 7.446 7.485 7.501 7.514 7.509 7.459 7.353 7.124 6.73 6.018 4.776 2.614 -0.131 -2.383 -4.252 -5.822 -7.172 -8.342 -9.398 -10.302 -11.194 -11.939 -12.598 -13.231 -13.799 -14.307 -14.779 -15.254 -15.668 -16.02 -16.381 -16.766 -17.081 -17.414 -17.775 -18.058 -18.348 -18.635 -18.929 -19.219 -19.402 -19.59 -19.885 -20.09 -20.302 -20.411 -20.65 -20.908 -21.178 -21.312 -21.807 -21.755 -21.91 -22.06 -22.378 -22.564 -22.777 -23.014 -23.268 -23.563 -24.063 -25.884 -8 ,7186 ,TETRA ,17603325,Sun Nov 28 16:34:20 CET,Sun Nov 28 16:36:12 CET,0.0 1.418 1.781 2.055 2.286 2.474 2.618 2.747 3.014 3.118 3.211 3.043 3.468 3.542 3.668 3.782 3.891 3.951 4.077 4.188 4.327 4.422 4.511 4.622 4.734 4.843 4.942 5.038 5.163 5.275 5.37 5.486 5.593 5.675 5.772 5.888 5.977 6.047 6.117 6.198 6.253 6.287 6.308 6.29 6.218 6.027 5.685 5.171 4.341 2.992 0.568 -2.431 -4.838 -6.82 -8.511 -9.951 -11.145 -12.209 -13.126 -14.032 -14.809 -15.474 -16.08 -16.65 -17.173 -17.654 -18.156 -18.585 -18.951 -19.338 -19.74 -20.068 -20.395 -20.727 -20.985 -21.251 -21.529 -21.814 -22.106 -22.311 -22.519 -22.81 -23.005 -23.216 -23.331 -23.573 -23.822 -24.078 -24.206 -24.69 -24.616 -24.776 -24.947 -25.311 -25.516 -25.768 -26.047 -26.318 -26.658 -27.164 -28.836 -9 ,13391 ,TETRA ,17603830,Sun Nov 28 17:06:20 CET,Sun Nov 28 18:54:46 CET,0.0 1.196 1.608 1.883 2.089 2.254 2.398 2.524 2.719 2.817 2.916 2.756 3.182 3.259 3.402 3.534 3.663 3.735 3.874 3.994 4.142 4.232 4.309 4.431 4.55 4.658 4.78 4.897 5.033 5.148 5.263 5.393 5.515 5.627 5.738 5.859 5.965 6.053 6.135 6.22 6.317 6.385 6.391 6.393 6.325 6.169 5.919 5.561 4.863 3.526 1.258 -1.576 -3.861 -5.732 -7.346 -8.779 -9.979 -11.003 -11.872 -12.738 -13.469 -14.121 -14.742 -15.308 -15.821 -16.281 -16.768 -17.201 -17.559 -17.928 -18.323 -18.662 -19.005 -19.36 -19.634 -19.905 -20.19 -20.479 -20.763 -20.954 -21.148 -21.461 -21.689 -21.918 -22.037 -22.285 -22.559 -22.853 -22.991 -23.482 -23.42 -23.577 -23.74 -24.075 -24.249 -24.451 -24.689 -24.971 -25.326 -25.801 -27.512 -10 ,30619 ,TETRA ,17603831,Sun Nov 28 17:06:45 CET,Sun Nov 28 18:55:09 CET,0.0 1.329 1.702 1.978 2.192 2.363 2.529 2.689 2.933 3.033 3.119 2.944 3.368 3.457 3.614 3.745 3.861 3.914 4.024 4.141 4.307 4.403 4.499 4.648 4.801 4.938 5.05 5.153 5.276 5.388 5.483 5.582 5.686 5.777 5.879 6.001 6.105 6.191 6.27 6.373 6.473 6.529 6.545 6.523 6.464 6.306 6.018 5.562 4.711 3.227 0.692 -2.315 -4.736 -6.735 -8.396 -9.855 -11.1 -12.199 -13.125 -14.027 -14.788 -15.444 -16.068 -16.646 -17.173 -17.656 -18.156 -18.605 -18.987 -19.372 -19.761 -20.079 -20.411 -20.757 -21.035 -21.323 -21.613 -21.904 -22.197 -22.401 -22.617 -22.945 -23.155 -23.378 -23.491 -23.714 -23.952 -24.199 -24.33 -24.82 -24.752 -24.906 -25.061 -25.415 -25.62 -25.826 -26.079 -26.412 -26.815 -27.298 -28.715 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt deleted file mode 100644 index 8c27aedf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,113 ,TETRA ,17603832,Sun Nov 28 17:06:46 CET,Sun Nov 28 18:55:47 CET,0.0 2.018 2.543 2.981 3.384 3.751 4.089 4.417 5.037 5.337 5.621 5.665 6.422 6.689 7.189 7.687 8.185 8.422 8.873 9.314 9.963 10.395 10.83 11.48 12.116 12.742 13.364 13.974 14.776 15.569 16.358 17.335 18.29 19.222 20.331 21.621 22.9 24.345 25.924 27.61 29.445 31.623 34.3 37.085 40.412 44.337 49.205 54.975 62.112 71.286 83.769 95.53 103.415 109.13 113.339 116.624 119.23 121.381 123.058 124.608 125.841 126.838 127.718 128.501 129.177 129.747 130.303 130.762 131.13 131.477 131.792 132.044 132.289 132.509 132.667 132.809 132.941 133.082 133.231 133.322 133.409 133.52 133.587 133.658 133.687 133.737 133.764 133.773 133.778 133.432 133.769 133.743 133.707 133.63 133.575 133.505 133.399 133.245 132.991 132.485 130.203 -2 ,26732 ,TETRA ,17603833,Sun Nov 28 17:06:45 CET,Sun Nov 28 18:57:03 CET,0.0 1.718 2.281 2.745 3.148 3.49 3.815 4.126 4.731 5.025 5.316 5.393 6.149 6.411 6.927 7.429 7.911 8.146 8.618 9.088 9.779 10.227 10.665 11.307 11.943 12.564 13.165 13.765 14.562 15.34 16.104 17.065 18.017 18.946 20.053 21.338 22.592 23.989 25.543 27.226 29.033 31.149 33.756 36.544 39.934 43.85 48.601 54.256 61.399 70.573 82.871 94.482 102.233 107.842 112.031 115.37 117.997 120.096 121.75 123.287 124.512 125.517 126.393 127.163 127.841 128.415 128.97 129.428 129.788 130.133 130.471 130.729 130.984 131.237 131.406 131.569 131.74 131.905 132.041 132.116 132.186 132.297 132.372 132.424 132.447 132.498 132.532 132.538 132.537 132.192 132.529 132.51 132.484 132.395 132.316 132.22 132.099 131.914 131.664 131.322 129.707 -3 ,31171 ,TETRA ,17603834,Sun Nov 28 17:06:49 CET,Sun Nov 28 18:57:05 CET,0.0 1.53 2.064 2.523 2.919 3.289 3.639 3.977 4.604 4.896 5.188 5.255 6.004 6.271 6.797 7.296 7.771 8.001 8.45 8.889 9.541 9.978 10.419 11.086 11.738 12.367 12.987 13.615 14.432 15.236 16.03 17.007 17.984 18.937 20.07 21.362 22.61 24.03 25.626 27.37 29.269 31.492 34.188 37.02 40.392 44.272 49.067 54.807 61.967 71.196 83.598 95.294 103.162 108.797 112.971 116.318 118.973 121.121 122.799 124.289 125.48 126.497 127.377 128.156 128.839 129.411 129.97 130.428 130.788 131.132 131.466 131.717 131.965 132.217 132.394 132.566 132.716 132.85 132.994 133.085 133.175 133.295 133.365 133.428 133.453 133.502 133.544 133.574 133.579 133.219 133.549 133.541 133.521 133.437 133.373 133.3 133.206 133.069 132.853 132.445 130.499 -4 ,10883 ,TETRA ,17603835,Sun Nov 28 17:06:46 CET,Sun Nov 28 18:57:04 CET,0.0 1.364 1.863 2.25 2.625 2.993 3.327 3.622 4.196 4.466 4.719 4.75 5.5 5.757 6.263 6.747 7.209 7.44 7.91 8.375 9.058 9.511 9.96 10.611 11.242 11.872 12.493 13.097 13.876 14.649 15.417 16.37 17.307 18.23 19.344 20.619 21.874 23.296 24.881 26.646 28.541 30.7 33.291 36.008 39.352 43.284 48.074 53.825 61.037 70.277 82.641 94.268 102.127 107.802 112.01 115.307 117.893 120.001 121.649 123.146 124.337 125.322 126.193 126.988 127.672 128.228 128.748 129.186 129.538 129.863 130.181 130.43 130.659 130.882 131.045 131.186 131.32 131.457 131.596 131.675 131.743 131.847 131.902 131.959 131.989 132.033 132.066 132.088 132.081 131.722 132.051 132.026 131.986 131.866 131.78 131.684 131.581 131.436 131.227 130.85 128.656 -5 ,27971 ,TETRA ,17603836,Sun Nov 28 17:06:47 CET,Sun Nov 28 18:56:52 CET,0.0 1.656 2.22 2.666 3.022 3.359 3.675 3.976 4.563 4.848 5.122 5.156 5.899 6.152 6.655 7.14 7.624 7.862 8.321 8.781 9.465 9.914 10.364 11.021 11.659 12.281 12.886 13.483 14.277 15.065 15.846 16.81 17.76 18.713 19.838 21.091 22.34 23.769 25.356 27.092 28.977 31.173 33.833 36.617 39.985 43.918 48.723 54.472 61.586 70.732 83.161 95.0 102.975 108.676 112.912 116.251 118.865 121.024 122.719 124.253 125.48 126.484 127.381 128.175 128.839 129.393 129.939 130.407 130.784 131.15 131.512 131.795 132.055 132.296 132.471 132.638 132.801 132.951 133.085 133.175 133.267 133.387 133.462 133.534 133.562 133.605 133.636 133.661 133.671 133.322 133.657 133.642 133.617 133.525 133.477 133.424 133.322 133.166 132.969 132.721 130.958 -6 ,1479 ,TETRA ,17603837,Sun Nov 28 17:06:48 CET,Sun Nov 28 18:57:06 CET,0.0 1.593 2.094 2.492 2.87 3.221 3.562 3.896 4.47 4.737 5.004 5.03 5.769 6.02 6.513 6.984 7.445 7.675 8.13 8.58 9.237 9.66 10.073 10.71 11.346 11.964 12.589 13.211 14.023 14.831 15.624 16.587 17.547 18.489 19.607 20.902 22.153 23.57 25.13 26.835 28.707 30.895 33.547 36.326 39.754 43.707 48.419 54.038 61.129 70.402 82.916 94.598 102.47 108.109 112.275 115.587 118.147 120.219 121.835 123.303 124.48 125.467 126.374 127.181 127.856 128.415 128.965 129.426 129.804 130.159 130.481 130.736 130.997 131.259 131.444 131.613 131.778 131.934 132.086 132.181 132.266 132.373 132.446 132.513 132.539 132.582 132.62 132.645 132.652 132.312 132.658 132.639 132.607 132.528 132.475 132.408 132.314 132.184 131.995 131.695 130.348 -7 ,27328 ,TETRA ,17603838,Sun Nov 28 17:06:45 CET,Sun Nov 28 18:57:03 CET,0.0 1.629 2.198 2.616 3.0 3.349 3.665 3.964 4.536 4.812 5.082 5.119 5.868 6.123 6.63 7.12 7.594 7.828 8.289 8.734 9.39 9.829 10.27 10.916 11.55 12.185 12.807 13.426 14.245 15.04 15.826 16.807 17.76 18.687 19.788 21.07 22.345 23.772 25.353 27.092 28.974 31.17 33.856 36.655 40.032 43.973 48.765 54.487 61.598 70.701 83.114 94.901 102.786 108.584 112.938 116.322 118.956 121.137 122.868 124.449 125.689 126.677 127.555 128.326 128.982 129.551 130.103 130.546 130.895 131.251 131.606 131.873 132.128 132.381 132.561 132.734 132.907 133.069 133.219 133.317 133.411 133.541 133.616 133.676 133.702 133.752 133.784 133.793 133.795 133.451 133.783 133.773 133.749 133.643 133.565 133.472 133.372 133.252 133.081 132.744 131.275 -8 ,16316 ,TETRA ,17603839,Sun Nov 28 17:07:17 CET,Sun Nov 28 18:57:56 CET,0.0 1.726 2.274 2.724 3.104 3.454 3.771 4.061 4.62 4.892 5.156 5.182 5.927 6.174 6.654 7.129 7.576 7.796 8.259 8.719 9.377 9.801 10.219 10.844 11.47 12.093 12.707 13.309 14.1 14.89 15.676 16.644 17.602 18.551 19.658 20.906 22.133 23.533 25.083 26.779 28.655 30.867 33.553 36.354 39.773 43.751 48.545 54.272 61.411 70.583 82.959 94.584 102.451 108.18 112.413 115.746 118.355 120.46 122.109 123.655 124.882 125.901 126.795 127.54 128.183 128.732 129.278 129.746 130.117 130.461 130.794 131.038 131.267 131.494 131.664 131.838 131.996 132.142 132.292 132.383 132.452 132.541 132.598 132.642 132.659 132.703 132.733 132.751 132.755 132.401 132.735 132.722 132.696 132.616 132.566 132.493 132.39 132.243 132.022 131.633 129.739 -9 ,20924 ,TETRA ,17603840,Sun Nov 28 17:06:47 CET,Sun Nov 28 18:57:09 CET,0.0 1.743 2.331 2.78 3.179 3.547 3.888 4.216 4.851 5.146 5.421 5.478 6.247 6.522 7.04 7.54 8.024 8.267 8.739 9.204 9.908 10.37 10.82 11.468 12.093 12.717 13.347 13.958 14.745 15.521 16.285 17.225 18.162 19.111 20.232 21.508 22.767 24.203 25.804 27.548 29.442 31.629 34.296 37.101 40.488 44.398 49.117 54.772 61.921 71.105 83.505 95.323 103.208 108.86 113.068 116.384 118.97 121.07 122.702 124.189 125.385 126.38 127.28 128.061 128.719 129.27 129.81 130.239 130.573 130.91 131.244 131.496 131.737 131.985 132.152 132.297 132.44 132.585 132.71 132.786 132.865 132.961 133.004 133.035 133.05 133.072 133.064 133.038 133.024 132.656 132.971 132.945 132.889 132.736 132.64 132.535 132.412 132.255 132.029 131.694 129.601 -10 ,14595 ,TETRA ,17603841,Sun Nov 28 17:06:51 CET,Sun Nov 28 18:57:02 CET,0.0 1.826 2.347 2.778 3.156 3.491 3.807 4.114 4.705 4.982 5.249 5.287 6.034 6.28 6.781 7.258 7.713 7.94 8.386 8.825 9.478 9.911 10.339 10.984 11.603 12.206 12.827 13.444 14.253 15.05 15.833 16.79 17.732 18.68 19.819 21.119 22.396 23.847 25.451 27.203 29.104 31.288 33.929 36.724 40.106 44.029 48.786 54.434 61.513 70.631 82.959 94.671 102.508 108.189 112.48 115.838 118.51 120.706 122.42 124.003 125.231 126.241 127.14 127.924 128.61 129.203 129.779 130.25 130.626 130.984 131.315 131.576 131.837 132.078 132.257 132.428 132.594 132.755 132.902 133.0 133.086 133.206 133.29 133.363 133.395 133.445 133.474 133.495 133.51 133.169 133.504 133.483 133.457 133.378 133.321 133.233 133.107 132.967 132.775 132.449 130.708 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt deleted file mode 100644 index 5398ebe0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13392 ,TETRA ,17603842,Sun Nov 28 17:06:47 CET,Sun Nov 28 18:56:52 CET,0.0 1.525 1.837 2.062 2.266 2.44 2.586 2.722 2.952 3.051 3.147 2.962 3.426 3.515 3.688 3.846 3.987 4.056 4.187 4.303 4.458 4.559 4.66 4.813 4.958 5.087 5.212 5.338 5.5 5.647 5.799 5.986 6.15 6.298 6.474 6.686 6.878 7.09 7.334 7.59 7.84 8.118 8.43 8.744 9.117 9.484 9.862 10.24 10.63 10.949 11.001 10.662 10.189 9.663 9.171 8.733 8.333 7.921 7.55 7.197 6.904 6.636 6.368 6.113 5.861 5.626 5.382 5.167 4.979 4.772 4.563 4.385 4.198 4.009 3.855 3.694 3.531 3.361 3.171 3.042 2.912 2.709 2.562 2.402 2.321 2.158 1.995 1.816 1.716 1.237 1.372 1.249 1.119 0.812 0.624 0.435 0.254 0.057 -0.197 -0.618 -2.192 -2 ,18936 ,TETRA ,17603843,Sun Nov 28 17:06:50 CET,Sun Nov 28 18:57:07 CET,0.0 1.167 1.493 1.705 1.873 2.03 2.18 2.313 2.548 2.648 2.744 2.558 3.015 3.101 3.263 3.402 3.529 3.594 3.727 3.86 4.045 4.158 4.267 4.42 4.564 4.711 4.849 4.979 5.166 5.336 5.494 5.7 5.896 6.073 6.271 6.503 6.725 6.952 7.199 7.461 7.721 8.007 8.331 8.658 9.014 9.374 9.745 10.094 10.423 10.698 10.773 10.445 9.954 9.448 8.946 8.477 8.075 7.701 7.355 6.993 6.689 6.403 6.127 5.882 5.661 5.441 5.194 4.97 4.773 4.566 4.342 4.165 3.997 3.816 3.669 3.526 3.379 3.225 3.07 2.962 2.848 2.672 2.542 2.399 2.327 2.174 2.019 1.852 1.763 1.3 1.479 1.376 1.272 1.029 0.894 0.748 0.587 0.405 0.171 -0.165 -1.373 -3 ,19940 ,TETRA ,17603844,Sun Nov 28 17:06:52 CET,Sun Nov 28 18:57:08 CET,0.0 1.498 1.81 2.044 2.23 2.389 2.536 2.675 2.923 3.037 3.14 2.953 3.417 3.505 3.663 3.817 3.965 4.035 4.171 4.303 4.492 4.613 4.725 4.882 5.04 5.188 5.326 5.462 5.642 5.813 5.969 6.155 6.328 6.479 6.666 6.893 7.108 7.341 7.585 7.834 8.085 8.375 8.704 9.009 9.345 9.693 10.048 10.441 10.885 11.217 11.276 10.972 10.519 10.018 9.526 9.054 8.631 8.239 7.902 7.545 7.23 6.953 6.678 6.421 6.182 5.952 5.707 5.497 5.324 5.142 4.949 4.791 4.627 4.462 4.337 4.2 4.039 3.875 3.715 3.599 3.479 3.29 3.159 3.03 2.959 2.803 2.639 2.464 2.371 1.904 2.092 1.996 1.893 1.64 1.497 1.352 1.182 0.98 0.747 0.445 -0.643 -4 ,22569 ,TETRA ,17603845,Sun Nov 28 17:06:47 CET,Sun Nov 28 18:56:43 CET,0.0 1.459 1.786 2.012 2.204 2.362 2.49 2.611 2.844 2.948 3.042 2.849 3.31 3.393 3.55 3.693 3.825 3.89 4.027 4.158 4.333 4.461 4.603 4.796 4.962 5.115 5.269 5.406 5.583 5.767 5.952 6.16 6.33 6.496 6.706 6.935 7.143 7.379 7.631 7.885 8.133 8.409 8.75 9.067 9.396 9.736 10.081 10.437 10.767 11.019 11.078 10.741 10.29 9.813 9.349 8.915 8.491 8.085 7.727 7.36 7.05 6.77 6.474 6.188 5.935 5.717 5.494 5.298 5.126 4.94 4.746 4.576 4.397 4.218 4.077 3.935 3.787 3.639 3.49 3.38 3.263 3.08 2.943 2.801 2.737 2.605 2.461 2.311 2.233 1.774 1.957 1.857 1.751 1.523 1.402 1.267 1.104 0.906 0.677 0.373 -0.881 -5 ,13253 ,TETRA ,17603846,Sun Nov 28 17:06:47 CET,Sun Nov 28 18:57:51 CET,0.0 1.356 1.671 1.888 2.074 2.238 2.376 2.5 2.724 2.831 2.929 2.76 3.228 3.311 3.468 3.612 3.748 3.812 3.938 4.06 4.23 4.333 4.439 4.597 4.754 4.913 5.06 5.206 5.394 5.568 5.731 5.931 6.117 6.286 6.486 6.708 6.922 7.158 7.399 7.652 7.913 8.19 8.503 8.799 9.125 9.48 9.869 10.226 10.568 10.847 10.901 10.58 10.109 9.657 9.194 8.733 8.314 7.913 7.551 7.182 6.867 6.583 6.301 6.024 5.775 5.551 5.312 5.093 4.896 4.69 4.475 4.292 4.104 3.911 3.754 3.59 3.422 3.254 3.076 2.956 2.83 2.612 2.462 2.315 2.241 2.082 1.898 1.695 1.588 1.111 1.28 1.156 1.03 0.776 0.637 0.487 0.311 0.119 -0.101 -0.438 -1.972 -6 ,16104 ,TETRA ,17603847,Sun Nov 28 17:06:50 CET,Sun Nov 28 18:58:01 CET,0.0 1.42 1.778 2.061 2.306 2.513 2.699 2.862 3.158 3.29 3.406 3.26 3.742 3.846 4.039 4.207 4.355 4.433 4.583 4.723 4.918 5.037 5.162 5.342 5.511 5.671 5.821 5.963 6.13 6.297 6.463 6.662 6.854 7.022 7.209 7.43 7.65 7.887 8.133 8.397 8.65 8.906 9.204 9.501 9.846 10.231 10.631 11.004 11.373 11.685 11.767 11.462 11.018 10.547 10.07 9.602 9.178 8.783 8.425 8.069 7.735 7.431 7.148 6.88 6.633 6.405 6.172 5.958 5.776 5.58 5.366 5.192 5.021 4.845 4.703 4.551 4.398 4.242 4.079 3.967 3.847 3.66 3.536 3.403 3.336 3.193 3.04 2.877 2.788 2.324 2.508 2.413 2.311 2.077 1.944 1.788 1.626 1.452 1.207 0.86 -0.304 -7 ,616 ,TETRA ,17603848,Sun Nov 28 17:06:51 CET,Sun Nov 28 18:58:14 CET,0.0 1.065 1.355 1.583 1.767 1.931 2.077 2.218 2.461 2.571 2.679 2.518 2.991 3.083 3.259 3.425 3.573 3.647 3.79 3.922 4.114 4.245 4.379 4.557 4.711 4.871 5.022 5.163 5.333 5.494 5.654 5.843 6.04 6.228 6.437 6.655 6.864 7.089 7.317 7.563 7.822 8.102 8.419 8.718 9.045 9.406 9.78 10.144 10.506 10.796 10.861 10.565 10.157 9.675 9.182 8.736 8.326 7.944 7.612 7.249 6.911 6.612 6.339 6.084 5.844 5.625 5.389 5.174 4.982 4.781 4.587 4.427 4.252 4.074 3.942 3.803 3.654 3.502 3.342 3.231 3.118 2.943 2.82 2.696 2.63 2.485 2.327 2.164 2.084 1.625 1.813 1.713 1.602 1.341 1.209 1.08 0.927 0.743 0.515 0.216 -1.354 -8 ,16051 ,TETRA ,17603849,Sun Nov 28 17:06:54 CET,Sun Nov 28 18:58:03 CET,0.0 1.786 2.091 2.319 2.497 2.652 2.797 2.936 3.192 3.305 3.417 3.284 3.763 3.866 4.065 4.24 4.402 4.481 4.633 4.776 4.979 5.117 5.243 5.406 5.575 5.742 5.9 6.047 6.217 6.386 6.551 6.746 6.928 7.098 7.292 7.515 7.742 7.979 8.226 8.481 8.722 8.992 9.306 9.598 9.933 10.279 10.632 10.998 11.362 11.669 11.731 11.418 11.0 10.564 10.125 9.676 9.242 8.829 8.456 8.092 7.769 7.473 7.194 6.933 6.693 6.465 6.214 5.99 5.798 5.596 5.397 5.235 5.072 4.901 4.768 4.63 4.482 4.329 4.179 4.072 3.958 3.785 3.661 3.531 3.463 3.316 3.17 3.015 2.93 2.469 2.654 2.561 2.462 2.231 2.097 1.952 1.803 1.631 1.41 1.082 -0.28 -9 ,18617 ,TETRA ,17603850,Sun Nov 28 17:06:48 CET,Sun Nov 28 18:57:17 CET,0.0 1.664 2.02 2.257 2.439 2.594 2.736 2.864 3.09 3.195 3.302 3.145 3.615 3.711 3.89 4.067 4.236 4.315 4.47 4.612 4.806 4.934 5.053 5.203 5.354 5.511 5.668 5.815 5.993 6.167 6.327 6.515 6.706 6.891 7.099 7.32 7.529 7.744 7.978 8.211 8.458 8.745 9.052 9.35 9.71 10.103 10.482 10.847 11.208 11.481 11.513 11.175 10.725 10.256 9.797 9.331 8.887 8.481 8.142 7.785 7.474 7.207 6.946 6.709 6.477 6.246 6.018 5.827 5.658 5.473 5.287 5.138 4.973 4.802 4.672 4.535 4.39 4.24 4.082 3.972 3.856 3.673 3.548 3.417 3.348 3.204 3.056 2.901 2.812 2.346 2.523 2.416 2.302 2.059 1.925 1.775 1.607 1.415 1.209 0.913 -0.33 -10 ,1051 ,TETRA ,17603851,Sun Nov 28 17:06:52 CET,Sun Nov 28 18:57:12 CET,0.0 1.18 1.525 1.779 1.975 2.129 2.27 2.404 2.64 2.746 2.847 2.67 3.133 3.222 3.386 3.531 3.675 3.742 3.874 4.01 4.204 4.323 4.429 4.577 4.724 4.859 4.981 5.106 5.273 5.436 5.6 5.795 5.984 6.158 6.358 6.597 6.812 7.044 7.288 7.526 7.777 8.04 8.34 8.646 8.969 9.336 9.738 10.12 10.492 10.777 10.874 10.575 10.099 9.609 9.111 8.639 8.242 7.874 7.53 7.168 6.847 6.569 6.306 6.045 5.796 5.564 5.315 5.098 4.908 4.709 4.498 4.314 4.126 3.93 3.778 3.62 3.456 3.287 3.113 2.989 2.862 2.666 2.522 2.37 2.297 2.155 2.01 1.853 1.773 1.315 1.519 1.423 1.308 1.061 0.942 0.806 0.647 0.454 0.227 -0.073 -1.456 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 440ac213..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29960 ,TETRA ,17603852,Sun Nov 28 17:06:49 CET,Sun Nov 28 18:57:28 CET,0.0 1.427 1.72 1.945 2.125 2.3 2.454 2.587 2.839 2.952 3.058 2.887 3.355 3.448 3.621 3.785 3.937 4.009 4.159 4.311 4.529 4.665 4.791 4.963 5.129 5.303 5.473 5.632 5.842 6.048 6.243 6.481 6.708 6.92 7.17 7.446 7.704 7.987 8.293 8.618 8.954 9.344 9.811 10.272 10.793 11.369 12.014 12.7 13.501 14.393 15.339 15.908 16.111 16.097 15.977 15.833 15.669 15.49 15.309 15.11 14.918 14.732 14.546 14.354 14.179 14.006 13.812 13.648 13.495 13.338 13.176 13.035 12.887 12.735 12.616 12.485 12.34 12.185 12.029 11.927 11.821 11.656 11.547 11.427 11.364 11.24 11.093 10.93 10.852 10.409 10.601 10.509 10.411 10.184 10.058 9.918 9.765 9.592 9.362 9.031 7.87 -2 ,1074 ,TETRA ,17603853,Sun Nov 28 17:06:51 CET,Sun Nov 28 18:57:16 CET,0.0 1.348 1.674 1.918 2.115 2.273 2.418 2.547 2.776 2.89 3.002 2.822 3.289 3.385 3.567 3.736 3.896 3.972 4.122 4.274 4.494 4.636 4.772 4.973 5.157 5.326 5.489 5.643 5.85 6.052 6.239 6.473 6.692 6.899 7.143 7.423 7.689 7.97 8.277 8.613 8.951 9.332 9.796 10.259 10.798 11.377 12.017 12.727 13.528 14.414 15.369 15.956 16.107 16.081 15.958 15.794 15.632 15.45 15.26 15.055 14.879 14.702 14.513 14.341 14.176 14.012 13.838 13.676 13.515 13.345 13.178 13.034 12.872 12.704 12.587 12.47 12.342 12.209 12.075 11.982 11.888 11.741 11.637 11.517 11.453 11.325 11.19 11.046 10.969 10.526 10.714 10.615 10.512 10.29 10.172 10.042 9.886 9.714 9.513 9.215 7.914 -3 ,25807 ,TETRA ,17603854,Sun Nov 28 17:06:49 CET,Sun Nov 28 18:57:17 CET,0.0 1.293 1.61 1.85 2.05 2.228 2.371 2.487 2.707 2.813 2.914 2.724 3.181 3.265 3.429 3.588 3.739 3.81 3.945 4.081 4.275 4.391 4.503 4.683 4.855 5.021 5.185 5.333 5.521 5.701 5.869 6.069 6.267 6.464 6.703 6.974 7.225 7.502 7.808 8.155 8.52 8.916 9.361 9.789 10.293 10.876 11.544 12.271 13.077 13.968 14.939 15.482 15.641 15.64 15.554 15.417 15.236 15.041 14.854 14.626 14.425 14.262 14.104 13.931 13.752 13.582 13.409 13.253 13.113 12.971 12.81 12.668 12.521 12.366 12.241 12.115 11.988 11.836 11.667 11.559 11.448 11.271 11.151 11.019 10.946 10.806 10.662 10.496 10.419 9.977 10.165 10.073 9.963 9.723 9.609 9.476 9.315 9.133 8.889 8.588 7.304 -4 ,10099 ,TETRA ,17603855,Sun Nov 28 17:06:51 CET,Sun Nov 28 18:57:12 CET,0.0 1.561 1.863 2.088 2.263 2.419 2.564 2.695 2.928 3.051 3.177 3.034 3.513 3.615 3.801 3.98 4.143 4.221 4.374 4.521 4.742 4.88 5.004 5.197 5.381 5.547 5.711 5.868 6.085 6.31 6.512 6.743 6.96 7.167 7.429 7.716 7.968 8.263 8.597 8.941 9.283 9.665 10.121 10.57 11.098 11.682 12.319 13.031 13.871 14.796 15.757 16.311 16.475 16.463 16.377 16.252 16.063 15.848 15.67 15.476 15.28 15.103 14.931 14.76 14.59 14.425 14.239 14.083 13.946 13.803 13.656 13.529 13.399 13.255 13.141 13.023 12.894 12.768 12.646 12.556 12.46 12.314 12.212 12.1 12.04 11.92 11.785 11.632 11.551 11.102 11.284 11.188 11.088 10.883 10.764 10.626 10.469 10.285 10.064 9.77 8.556 -5 ,5895 ,TETRA ,17603856,Sun Nov 28 17:06:54 CET,Sun Nov 28 18:57:12 CET,0.0 1.261 1.59 1.823 2.02 2.191 2.342 2.471 2.699 2.803 2.905 2.716 3.178 3.268 3.441 3.604 3.755 3.827 3.963 4.094 4.296 4.425 4.556 4.753 4.941 5.125 5.298 5.467 5.681 5.878 6.072 6.305 6.523 6.729 6.975 7.266 7.544 7.845 8.157 8.496 8.843 9.218 9.675 10.119 10.638 11.206 11.848 12.566 13.355 14.227 15.194 15.81 16.003 15.994 15.863 15.707 15.552 15.378 15.189 14.968 14.786 14.62 14.44 14.269 14.092 13.919 13.741 13.568 13.418 13.267 13.109 12.971 12.826 12.68 12.566 12.448 12.323 12.189 12.051 11.96 11.865 11.708 11.593 11.474 11.411 11.281 11.147 11.008 10.932 10.486 10.681 10.587 10.491 10.273 10.15 10.021 9.879 9.706 9.491 9.166 8.161 -6 ,24914 ,TETRA ,17603857,Sun Nov 28 17:06:50 CET,Sun Nov 28 18:56:48 CET,0.0 1.417 1.699 1.907 2.093 2.258 2.407 2.547 2.779 2.882 2.985 2.812 3.277 3.365 3.536 3.691 3.828 3.899 4.042 4.185 4.401 4.541 4.678 4.881 5.07 5.25 5.432 5.602 5.811 6.012 6.207 6.441 6.656 6.863 7.106 7.384 7.649 7.94 8.262 8.601 8.943 9.326 9.771 10.212 10.735 11.308 11.952 12.677 13.489 14.393 15.337 15.872 16.063 16.092 15.993 15.819 15.631 15.439 15.241 15.003 14.801 14.634 14.454 14.271 14.098 13.942 13.77 13.598 13.447 13.303 13.146 13.004 12.858 12.705 12.586 12.453 12.31 12.166 12.013 11.912 11.811 11.63 11.493 11.349 11.277 11.13 10.965 10.785 10.682 10.215 10.373 10.267 10.158 9.933 9.806 9.669 9.514 9.326 9.105 8.797 7.69 -7 ,7136 ,TETRA ,17603858,Sun Nov 28 17:06:49 CET,Sun Nov 28 18:56:48 CET,0.0 1.017 1.302 1.514 1.707 1.875 2.019 2.148 2.385 2.507 2.62 2.427 2.884 2.968 3.144 3.305 3.452 3.526 3.669 3.804 4.004 4.127 4.244 4.427 4.596 4.75 4.905 5.052 5.241 5.419 5.597 5.817 6.025 6.228 6.472 6.745 6.998 7.286 7.623 7.969 8.319 8.719 9.17 9.61 10.124 10.678 11.312 12.024 12.8 13.652 14.572 15.144 15.3 15.282 15.182 15.048 14.891 14.71 14.532 14.331 14.142 13.959 13.781 13.612 13.441 13.27 13.092 12.936 12.794 12.642 12.48 12.347 12.207 12.056 11.933 11.795 11.66 11.529 11.392 11.289 11.179 10.998 10.871 10.748 10.683 10.551 10.401 10.232 10.145 9.685 9.83 9.723 9.619 9.357 9.195 9.019 8.813 8.575 8.29 7.859 6.247 -8 ,11278 ,TETRA ,17603859,Sun Nov 28 17:06:51 CET,Sun Nov 28 18:57:02 CET,0.0 1.632 1.937 2.15 2.332 2.493 2.639 2.776 3.012 3.126 3.236 3.072 3.538 3.623 3.8 3.987 4.173 4.256 4.414 4.577 4.8 4.945 5.081 5.27 5.464 5.646 5.816 5.982 6.193 6.384 6.571 6.813 7.047 7.267 7.528 7.818 8.086 8.371 8.68 9.01 9.354 9.74 10.187 10.643 11.183 11.775 12.421 13.12 13.892 14.753 15.67 16.199 16.342 16.319 16.21 16.046 15.887 15.718 15.541 15.355 15.176 15.005 14.835 14.652 14.467 14.302 14.14 13.995 13.868 13.736 13.583 13.457 13.33 13.187 13.08 12.978 12.862 12.739 12.613 12.522 12.423 12.275 12.167 12.041 11.978 11.861 11.735 11.581 11.498 11.053 11.251 11.155 11.052 10.823 10.698 10.557 10.395 10.222 10.0 9.665 8.332 -9 ,1762 ,TETRA ,17603860,Sun Nov 28 17:06:53 CET,Sun Nov 28 18:57:08 CET,0.0 1.188 1.485 1.717 1.929 2.146 2.352 2.527 2.837 2.972 3.093 2.957 3.434 3.535 3.734 3.91 4.072 4.156 4.316 4.471 4.691 4.828 4.965 5.164 5.344 5.52 5.694 5.851 6.059 6.259 6.444 6.67 6.894 7.116 7.379 7.673 7.94 8.227 8.545 8.896 9.25 9.628 10.092 10.581 11.131 11.685 12.315 13.024 13.825 14.719 15.651 16.221 16.391 16.389 16.309 16.165 15.982 15.786 15.601 15.399 15.211 15.035 14.846 14.663 14.495 14.339 14.179 14.027 13.882 13.734 13.587 13.459 13.317 13.162 13.041 12.918 12.789 12.653 12.506 12.398 12.295 12.132 12.008 11.881 11.815 11.69 11.565 11.421 11.342 10.885 11.059 10.967 10.868 10.641 10.516 10.386 10.244 10.076 9.84 9.526 7.907 -10 ,10991 ,TETRA ,17603861,Sun Nov 28 17:06:55 CET,Sun Nov 28 18:57:06 CET,0.0 1.134 1.422 1.637 1.832 1.993 2.146 2.284 2.519 2.625 2.73 2.562 3.029 3.121 3.3 3.456 3.605 3.676 3.811 3.945 4.133 4.262 4.393 4.576 4.746 4.904 5.062 5.226 5.444 5.645 5.841 6.092 6.332 6.552 6.798 7.07 7.326 7.612 7.923 8.265 8.619 8.997 9.453 9.916 10.444 11.026 11.697 12.428 13.213 14.071 14.998 15.549 15.7 15.674 15.546 15.384 15.217 15.026 14.818 14.573 14.351 14.163 13.989 13.826 13.671 13.509 13.333 13.161 12.996 12.829 12.656 12.514 12.363 12.196 12.061 11.93 11.8 11.655 11.491 11.378 11.269 11.098 10.968 10.827 10.751 10.605 10.47 10.314 10.228 9.775 9.936 9.83 9.724 9.511 9.391 9.262 9.122 8.95 8.75 8.463 6.844 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt deleted file mode 100644 index 0c87f676..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24976 ,TETRA ,17603862,Sun Nov 28 17:06:50 CET,Sun Nov 28 18:58:23 CET,0.0 1.341 1.759 2.105 2.395 2.616 2.821 3.02 3.366 3.529 3.687 3.564 4.112 4.257 4.541 4.796 5.032 5.149 5.379 5.609 5.943 6.15 6.352 6.661 6.962 7.256 7.543 7.825 8.19 8.53 8.869 9.271 9.66 10.037 10.467 10.973 11.455 11.996 12.598 13.26 14.016 14.894 15.894 16.886 18.079 19.411 20.911 22.627 24.766 27.368 30.532 33.139 34.651 35.621 36.175 36.538 36.784 36.923 36.996 37.026 37.021 36.982 36.929 36.855 36.766 36.68 36.559 36.407 36.244 36.081 35.934 35.826 35.697 35.533 35.417 35.28 35.112 34.945 34.772 34.651 34.529 34.342 34.205 34.052 33.969 33.778 33.574 33.362 33.259 32.773 32.889 32.747 32.589 32.228 32.022 31.818 31.595 31.275 30.882 30.363 28.471 -2 ,18319 ,TETRA ,17603863,Sun Nov 28 17:06:52 CET,Sun Nov 28 18:58:42 CET,0.0 0.982 1.315 1.572 1.781 1.974 2.168 2.346 2.671 2.824 2.969 2.829 3.372 3.496 3.725 3.955 4.178 4.287 4.504 4.718 5.024 5.218 5.416 5.709 5.993 6.267 6.532 6.793 7.129 7.453 7.775 8.181 8.565 8.946 9.41 9.929 10.425 10.974 11.579 12.227 12.899 13.691 14.68 15.666 16.815 18.128 19.705 21.538 23.681 26.322 29.716 32.482 34.04 35.035 35.642 36.066 36.334 36.457 36.508 36.508 36.467 36.435 36.38 36.289 36.194 36.093 35.967 35.853 35.74 35.608 35.461 35.321 35.177 35.012 34.879 34.745 34.595 34.451 34.289 34.159 34.035 33.833 33.688 33.546 33.469 33.291 33.103 32.899 32.786 32.303 32.461 32.328 32.179 31.862 31.693 31.499 31.255 30.982 30.663 30.194 28.0 -3 ,7258 ,TETRA ,17603864,Sun Nov 28 17:07:18 CET,Sun Nov 28 18:59:52 CET,0.0 0.981 1.332 1.584 1.8 1.989 2.169 2.34 2.659 2.807 2.948 2.82 3.362 3.48 3.711 3.943 4.16 4.264 4.471 4.672 4.966 5.159 5.347 5.627 5.911 6.193 6.463 6.722 7.065 7.404 7.737 8.134 8.521 8.912 9.37 9.883 10.39 10.955 11.569 12.223 12.914 13.721 14.688 15.649 16.766 18.058 19.643 21.47 23.593 26.173 29.474 32.349 34.028 35.008 35.639 36.033 36.255 36.426 36.541 36.558 36.477 36.389 36.314 36.211 36.097 35.993 35.872 35.747 35.627 35.488 35.332 35.197 35.05 34.889 34.759 34.623 34.492 34.353 34.191 34.07 33.929 33.704 33.546 33.366 33.276 33.096 32.887 32.646 32.524 32.031 32.126 31.982 31.837 31.483 31.262 31.027 30.783 30.495 30.141 29.661 27.475 -4 ,9097 ,TETRA ,17603865,Sun Nov 28 17:07:20 CET,Sun Nov 28 19:00:38 CET,0.0 1.051 1.433 1.72 1.958 2.16 2.327 2.492 2.827 2.983 3.128 2.99 3.531 3.654 3.892 4.115 4.334 4.441 4.653 4.859 5.15 5.336 5.517 5.801 6.082 6.356 6.626 6.891 7.227 7.55 7.881 8.291 8.686 9.061 9.498 10.012 10.533 11.095 11.693 12.336 13.032 13.854 14.799 15.761 16.92 18.219 19.766 21.571 23.703 26.321 29.701 32.487 34.08 35.086 35.717 36.086 36.299 36.416 36.433 36.415 36.372 36.324 36.267 36.177 36.069 35.957 35.84 35.731 35.63 35.517 35.37 35.226 35.066 34.914 34.784 34.637 34.484 34.314 34.142 34.011 33.872 33.649 33.489 33.321 33.231 33.043 32.83 32.601 32.477 31.974 32.07 31.917 31.752 31.367 31.164 30.938 30.66 30.332 29.978 29.485 27.479 -5 ,20397 ,TETRA ,17603866,Sun Nov 28 17:07:23 CET,Sun Nov 28 19:00:18 CET,0.0 1.005 1.34 1.603 1.82 2.017 2.198 2.358 2.647 2.797 2.952 2.828 3.375 3.517 3.795 4.067 4.323 4.443 4.679 4.912 5.245 5.451 5.649 5.942 6.236 6.522 6.796 7.066 7.409 7.75 8.089 8.49 8.865 9.238 9.692 10.205 10.7 11.263 11.889 12.557 13.244 14.019 14.965 15.935 17.053 18.334 19.9 21.71 23.883 26.556 29.887 32.704 34.238 35.182 35.848 36.316 36.553 36.675 36.741 36.714 36.662 36.61 36.547 36.445 36.306 36.176 36.06 35.955 35.835 35.696 35.535 35.393 35.259 35.121 34.995 34.855 34.697 34.518 34.331 34.204 34.072 33.851 33.698 33.538 33.453 33.279 33.081 32.867 32.744 32.235 32.356 32.224 32.076 31.749 31.567 31.35 31.101 30.798 30.417 29.838 27.787 -6 ,8093 ,TETRA ,17603867,Sun Nov 28 17:07:17 CET,Sun Nov 28 18:59:15 CET,0.0 0.811 1.159 1.42 1.63 1.824 2.007 2.175 2.481 2.626 2.769 2.615 3.144 3.265 3.504 3.742 3.969 4.076 4.3 4.533 4.867 5.082 5.289 5.585 5.873 6.15 6.417 6.69 7.053 7.395 7.725 8.132 8.521 8.908 9.371 9.876 10.364 10.906 11.517 12.191 12.887 13.693 14.652 15.631 16.779 18.061 19.616 21.417 23.517 26.102 29.413 32.203 33.803 34.776 35.372 35.739 35.908 36.023 36.107 36.124 36.071 36.012 35.95 35.864 35.74 35.592 35.453 35.339 35.225 35.09 34.924 34.773 34.619 34.46 34.333 34.2 34.054 33.883 33.694 33.575 33.457 33.256 33.109 32.954 32.873 32.697 32.514 32.301 32.19 31.71 31.866 31.728 31.573 31.239 31.038 30.823 30.602 30.313 29.919 29.424 27.884 -7 ,21421 ,TETRA ,17603868,Sun Nov 28 17:07:17 CET,Sun Nov 28 18:58:45 CET,0.0 1.333 1.727 2.019 2.275 2.491 2.684 2.863 3.165 3.309 3.456 3.329 3.887 4.032 4.308 4.578 4.822 4.931 5.149 5.362 5.679 5.894 6.102 6.395 6.684 6.973 7.251 7.511 7.848 8.189 8.517 8.916 9.314 9.704 10.155 10.658 11.152 11.705 12.293 12.941 13.645 14.447 15.391 16.349 17.477 18.781 20.353 22.144 24.295 26.903 30.142 32.857 34.438 35.456 36.079 36.447 36.695 36.828 36.875 36.88 36.839 36.786 36.712 36.614 36.518 36.421 36.298 36.177 36.07 35.941 35.783 35.648 35.479 35.277 35.131 34.985 34.833 34.68 34.516 34.382 34.25 34.049 33.888 33.736 33.663 33.499 33.317 33.115 32.994 32.482 32.615 32.481 32.322 31.959 31.765 31.54 31.285 30.983 30.616 30.144 27.872 -8 ,4923 ,TETRA ,17603869,Sun Nov 28 17:07:18 CET,Sun Nov 28 18:59:13 CET,0.0 0.984 1.367 1.643 1.87 2.075 2.263 2.439 2.775 2.931 3.071 2.913 3.453 3.583 3.828 4.066 4.291 4.398 4.613 4.826 5.131 5.33 5.521 5.795 6.061 6.319 6.582 6.838 7.164 7.491 7.809 8.203 8.601 8.993 9.445 9.954 10.439 10.975 11.578 12.243 12.952 13.751 14.726 15.734 16.917 18.247 19.822 21.634 23.776 26.454 29.773 32.535 34.141 35.127 35.772 36.214 36.471 36.601 36.658 36.652 36.625 36.581 36.521 36.452 36.343 36.206 36.055 35.904 35.76 35.614 35.461 35.334 35.198 35.043 34.912 34.762 34.607 34.443 34.265 34.145 34.021 33.823 33.668 33.504 33.416 33.234 33.048 32.83 32.71 32.207 32.288 32.124 31.968 31.643 31.467 31.256 30.974 30.644 30.219 29.614 27.252 -9 ,1366 ,TETRA ,17603870,Sun Nov 28 17:07:19 CET,Sun Nov 28 18:59:13 CET,0.0 1.187 1.516 1.773 2.011 2.237 2.434 2.616 2.937 3.077 3.221 3.087 3.633 3.778 4.057 4.315 4.561 4.686 4.924 5.147 5.472 5.675 5.877 6.167 6.452 6.731 6.984 7.24 7.599 7.963 8.306 8.715 9.121 9.501 9.938 10.445 10.94 11.487 12.092 12.739 13.417 14.235 15.233 16.22 17.395 18.724 20.294 22.132 24.268 26.842 30.102 32.901 34.494 35.461 36.106 36.521 36.778 36.862 36.814 36.723 36.648 36.581 36.503 36.413 36.304 36.186 36.053 35.925 35.794 35.642 35.504 35.404 35.271 35.116 34.992 34.852 34.7 34.537 34.365 34.23 34.088 33.876 33.736 33.576 33.487 33.304 33.119 32.917 32.804 32.31 32.441 32.301 32.149 31.823 31.624 31.402 31.152 30.857 30.481 30.055 28.077 -10 ,13629 ,TETRA ,17603871,Sun Nov 28 17:07:22 CET,Sun Nov 28 18:59:19 CET,0.0 1.083 1.454 1.723 1.949 2.148 2.333 2.508 2.828 2.979 3.123 2.979 3.513 3.633 3.87 4.099 4.312 4.418 4.631 4.833 5.132 5.327 5.517 5.797 6.071 6.332 6.581 6.831 7.158 7.478 7.797 8.189 8.563 8.924 9.346 9.845 10.356 10.926 11.563 12.238 12.919 13.69 14.625 15.597 16.762 18.089 19.637 21.425 23.555 26.104 29.295 31.978 33.616 34.592 35.202 35.653 35.915 36.045 36.119 36.147 36.148 36.131 36.093 36.004 35.899 35.813 35.707 35.596 35.475 35.34 35.18 35.028 34.863 34.683 34.535 34.379 34.228 34.076 33.932 33.83 33.715 33.502 33.341 33.186 33.109 32.953 32.781 32.596 32.493 32.001 32.126 31.994 31.861 31.537 31.349 31.13 30.856 30.526 30.147 29.658 27.748 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index e2d8dd7f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14736 ,TETRA ,17603872,Sun Nov 28 17:07:23 CET,Sun Nov 28 18:58:45 CET,0.0 2.141 2.649 3.055 3.388 3.681 3.921 4.135 4.551 4.74 4.902 4.814 5.377 5.531 5.854 6.149 6.429 6.563 6.805 7.035 7.376 7.593 7.8 8.115 8.436 8.74 9.038 9.325 9.698 10.067 10.41 10.837 11.266 11.696 12.189 12.727 13.242 13.809 14.44 15.136 15.894 16.755 17.778 18.832 20.087 21.535 23.237 25.202 27.568 30.404 33.948 36.991 38.75 39.83 40.593 41.139 41.483 41.734 41.9 41.992 42.015 42.015 41.994 41.936 41.859 41.771 41.65 41.545 41.46 41.344 41.215 41.096 40.959 40.826 40.724 40.602 40.459 40.306 40.137 40.018 39.889 39.659 39.493 39.338 39.248 39.031 38.807 38.587 38.459 37.946 38.015 37.86 37.69 37.274 37.013 36.726 36.406 36.065 35.658 35.042 32.081 -2 ,3561 ,TETRA ,17603873,Sun Nov 28 17:07:18 CET,Sun Nov 28 18:59:07 CET,0.0 1.713 2.146 2.491 2.749 2.957 3.151 3.346 3.694 3.852 4.009 3.894 4.444 4.585 4.847 5.1 5.353 5.476 5.714 5.938 6.253 6.455 6.649 6.938 7.238 7.532 7.825 8.124 8.497 8.859 9.218 9.653 10.074 10.477 10.96 11.519 12.06 12.663 13.316 14.017 14.751 15.595 16.629 17.696 18.955 20.353 22.04 24.062 26.492 29.422 33.109 36.297 38.207 39.425 40.169 40.699 41.081 41.287 41.413 41.504 41.521 41.522 41.512 41.469 41.397 41.309 41.194 41.092 41.014 40.911 40.796 40.68 40.535 40.387 40.274 40.153 40.006 39.813 39.625 39.49 39.315 39.063 38.911 38.743 38.655 38.476 38.282 38.069 37.948 37.451 37.531 37.378 37.207 36.84 36.615 36.348 36.055 35.705 35.292 34.541 31.204 -3 ,19782 ,TETRA ,17603874,Sun Nov 28 17:07:19 CET,Sun Nov 28 18:59:57 CET,0.0 1.468 1.907 2.245 2.52 2.737 2.949 3.174 3.583 3.76 3.934 3.845 4.391 4.525 4.791 5.058 5.326 5.457 5.7 5.935 6.299 6.532 6.753 7.08 7.402 7.712 8.009 8.296 8.674 9.048 9.395 9.806 10.212 10.606 11.067 11.597 12.11 12.691 13.358 14.078 14.818 15.653 16.669 17.717 18.964 20.379 22.069 24.057 26.422 29.29 32.973 36.171 38.027 39.195 39.986 40.549 40.929 41.166 41.289 41.364 41.402 41.381 41.309 41.242 41.188 41.107 40.985 40.865 40.77 40.668 40.533 40.41 40.285 40.14 40.015 39.9 39.785 39.647 39.479 39.358 39.24 39.018 38.861 38.702 38.621 38.446 38.225 37.979 37.86 37.362 37.42 37.26 37.082 36.657 36.404 36.114 35.814 35.457 34.934 34.248 30.736 -4 ,19652 ,TETRA ,17603875,Sun Nov 28 17:07:21 CET,Sun Nov 28 18:59:04 CET,0.0 1.281 1.712 2.022 2.29 2.583 2.863 3.115 3.546 3.741 3.945 3.889 4.446 4.591 4.875 5.161 5.44 5.573 5.833 6.084 6.424 6.645 6.86 7.176 7.491 7.789 8.075 8.352 8.701 9.041 9.382 9.808 10.229 10.636 11.108 11.641 12.158 12.744 13.392 14.09 14.839 15.698 16.716 17.758 18.98 20.39 22.087 24.034 26.431 29.368 33.061 36.153 37.926 39.032 39.735 40.229 40.581 40.776 40.868 40.939 40.955 40.934 40.898 40.847 40.772 40.687 40.59 40.506 40.417 40.301 40.171 40.059 39.937 39.798 39.692 39.574 39.442 39.298 39.126 39.005 38.901 38.707 38.558 38.401 38.303 38.106 37.92 37.714 37.595 37.103 37.208 37.052 36.876 36.483 36.251 35.977 35.668 35.362 34.955 34.293 31.385 -5 ,18811 ,TETRA ,17603876,Sun Nov 28 17:07:23 CET,Sun Nov 28 18:58:58 CET,0.0 1.569 2.025 2.361 2.694 3.0 3.246 3.445 3.818 3.994 4.179 4.139 4.73 4.914 5.24 5.538 5.819 5.951 6.197 6.42 6.754 6.976 7.191 7.506 7.801 8.089 8.378 8.66 9.017 9.356 9.701 10.131 10.551 10.968 11.445 11.974 12.502 13.094 13.749 14.453 15.204 16.073 17.094 18.144 19.393 20.801 22.468 24.408 26.76 29.668 33.242 36.281 38.169 39.387 40.155 40.696 41.087 41.327 41.457 41.552 41.572 41.562 41.551 41.504 41.413 41.325 41.241 41.155 41.064 40.943 40.806 40.685 40.558 40.413 40.281 40.16 40.024 39.86 39.687 39.564 39.426 39.21 39.067 38.919 38.841 38.651 38.434 38.219 38.109 37.626 37.695 37.529 37.373 37.035 36.815 36.534 36.24 35.906 35.458 34.789 31.307 -6 ,21901 ,TETRA ,17603877,Sun Nov 28 17:07:19 CET,Sun Nov 28 18:59:12 CET,0.0 1.474 1.915 2.266 2.56 2.816 3.05 3.266 3.65 3.824 4.008 3.95 4.507 4.646 4.902 5.149 5.402 5.528 5.786 6.058 6.432 6.653 6.884 7.234 7.559 7.867 8.167 8.451 8.817 9.179 9.527 9.952 10.37 10.777 11.26 11.807 12.329 12.923 13.576 14.278 15.036 15.899 16.925 17.959 19.196 20.615 22.275 24.203 26.517 29.357 32.995 36.085 37.894 39.094 39.888 40.367 40.649 40.878 41.018 41.07 41.105 41.112 41.081 41.02 40.955 40.887 40.79 40.678 40.575 40.476 40.378 40.29 40.18 40.043 39.93 39.823 39.696 39.539 39.38 39.267 39.142 38.949 38.795 38.612 38.52 38.327 38.129 37.924 37.803 37.306 37.387 37.231 37.085 36.764 36.542 36.315 36.051 35.687 35.215 34.431 30.176 -7 ,31238 ,TETRA ,17603878,Sun Nov 28 17:07:23 CET,Sun Nov 28 18:59:00 CET,0.0 1.29 1.835 2.213 2.503 2.75 2.991 3.226 3.612 3.772 3.935 3.87 4.442 4.599 4.894 5.167 5.435 5.576 5.843 6.086 6.431 6.659 6.881 7.186 7.487 7.789 8.085 8.361 8.713 9.064 9.416 9.855 10.292 10.709 11.188 11.723 12.231 12.857 13.55 14.248 15.009 15.849 16.832 17.868 19.111 20.497 22.149 24.099 26.485 29.44 33.107 36.265 38.122 39.302 40.099 40.62 40.915 41.121 41.265 41.32 41.303 41.26 41.215 41.162 41.084 40.992 40.88 40.777 40.677 40.558 40.423 40.306 40.188 40.062 39.953 39.82 39.67 39.497 39.307 39.189 39.054 38.82 38.637 38.425 38.33 38.134 37.922 37.673 37.536 37.043 37.122 36.968 36.782 36.347 36.104 35.814 35.485 35.092 34.617 33.916 31.139 -8 ,2909 ,TETRA ,17603879,Sun Nov 28 17:07:20 CET,Sun Nov 28 18:59:09 CET,0.0 1.49 1.944 2.326 2.643 2.87 3.059 3.238 3.603 3.775 3.947 3.877 4.438 4.582 4.853 5.098 5.332 5.442 5.674 5.92 6.273 6.509 6.745 7.077 7.38 7.674 7.974 8.263 8.638 8.996 9.34 9.78 10.207 10.623 11.1 11.627 12.148 12.739 13.393 14.109 14.877 15.744 16.777 17.839 19.079 20.485 22.173 24.146 26.544 29.446 33.007 36.054 37.892 39.073 39.837 40.351 40.692 40.873 40.999 41.111 41.144 41.139 41.129 41.087 41.014 40.951 40.866 40.744 40.62 40.505 40.369 40.259 40.142 39.992 39.877 39.756 39.615 39.469 39.304 39.175 39.047 38.842 38.669 38.492 38.409 38.229 38.037 37.822 37.705 37.225 37.31 37.142 36.977 36.624 36.386 36.11 35.831 35.487 35.044 34.336 31.317 -9 ,26477 ,TETRA ,17603880,Sun Nov 28 17:07:21 CET,Sun Nov 28 18:58:44 CET,0.0 1.753 2.251 2.631 2.942 3.185 3.437 3.691 4.121 4.29 4.446 4.341 4.888 5.022 5.288 5.557 5.81 5.926 6.149 6.366 6.685 6.889 7.085 7.374 7.663 7.944 8.238 8.546 8.907 9.257 9.607 10.024 10.435 10.839 11.313 11.842 12.364 12.948 13.584 14.275 15.02 15.896 16.928 17.957 19.186 20.629 22.349 24.329 26.728 29.677 33.374 36.426 38.275 39.518 40.327 40.833 41.162 41.412 41.552 41.609 41.629 41.616 41.586 41.555 41.514 41.453 41.34 41.217 41.122 40.989 40.805 40.666 40.537 40.391 40.277 40.161 40.024 39.871 39.705 39.571 39.432 39.204 39.043 38.884 38.802 38.624 38.426 38.184 38.054 37.553 37.602 37.433 37.239 36.783 36.526 36.242 35.927 35.553 35.069 34.323 31.474 -10 ,3383 ,TETRA ,17603881,Sun Nov 28 17:07:20 CET,Sun Nov 28 18:58:53 CET,0.0 1.443 1.815 2.098 2.376 2.633 2.844 3.033 3.385 3.558 3.725 3.618 4.176 4.315 4.582 4.835 5.074 5.189 5.41 5.629 5.96 6.186 6.404 6.706 7.0 7.291 7.581 7.858 8.215 8.573 8.926 9.364 9.794 10.213 10.691 11.224 11.737 12.329 13.002 13.724 14.485 15.337 16.336 17.37 18.597 19.991 21.667 23.64 26.035 28.952 32.529 35.623 37.507 38.694 39.486 40.053 40.433 40.668 40.827 40.897 40.929 40.957 40.936 40.911 40.847 40.729 40.614 40.536 40.434 40.286 40.134 40.01 39.863 39.703 39.577 39.441 39.28 39.11 38.952 38.832 38.683 38.433 38.259 38.071 37.971 37.76 37.558 37.35 37.232 36.746 36.844 36.689 36.52 36.13 35.9 35.652 35.393 35.066 34.642 34.054 31.059 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 88a81bc6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9589 ,TETRA ,17603882,Sun Nov 28 17:07:22 CET,Sun Nov 28 18:57:47 CET,0.0 1.097 1.422 1.679 1.899 2.091 2.279 2.457 2.752 2.881 2.999 2.855 3.331 3.432 3.632 3.805 3.956 4.031 4.173 4.312 4.528 4.664 4.792 4.991 5.193 5.377 5.542 5.711 5.936 6.15 6.356 6.599 6.829 7.045 7.3 7.599 7.88 8.178 8.512 8.864 9.221 9.604 10.059 10.536 11.078 11.69 12.384 13.114 13.953 14.935 15.98 16.64 16.89 16.945 16.882 16.773 16.647 16.48 16.303 16.114 15.942 15.777 15.607 15.443 15.268 15.095 14.926 14.768 14.623 14.478 14.322 14.189 14.059 13.926 13.818 13.692 13.555 13.41 13.26 13.156 13.043 12.874 12.759 12.631 12.563 12.427 12.286 12.118 12.018 11.552 11.715 11.606 11.501 11.296 11.185 11.067 10.927 10.764 10.583 10.306 9.205 -2 ,8167 ,TETRA ,17603883,Sun Nov 28 17:07:23 CET,Sun Nov 28 19:02:53 CET,0.0 1.131 1.458 1.689 1.866 2.018 2.155 2.286 2.522 2.629 2.734 2.554 3.019 3.103 3.259 3.406 3.558 3.634 3.776 3.909 4.102 4.225 4.342 4.52 4.685 4.84 4.995 5.147 5.355 5.56 5.755 5.994 6.227 6.457 6.722 7.013 7.299 7.611 7.937 8.279 8.645 9.057 9.524 9.99 10.528 11.119 11.792 12.543 13.383 14.313 15.36 16.069 16.331 16.363 16.291 16.165 16.005 15.839 15.682 15.508 15.346 15.197 15.042 14.877 14.71 14.551 14.382 14.219 14.079 13.935 13.784 13.657 13.517 13.371 13.266 13.166 13.067 12.95 12.819 12.728 12.633 12.483 12.367 12.245 12.185 12.046 11.891 11.734 11.655 11.212 11.404 11.305 11.198 10.978 10.855 10.725 10.577 10.402 10.195 9.904 8.816 -3 ,20923 ,TETRA ,17603884,Sun Nov 28 17:07:26 CET,Sun Nov 28 19:02:39 CET,0.0 1.212 1.517 1.733 1.907 2.059 2.199 2.339 2.58 2.682 2.788 2.619 3.084 3.172 3.339 3.499 3.661 3.743 3.902 4.049 4.251 4.387 4.528 4.723 4.898 5.064 5.227 5.391 5.604 5.808 6.01 6.255 6.499 6.735 6.994 7.285 7.558 7.863 8.2 8.537 8.882 9.271 9.724 10.197 10.756 11.346 12.005 12.733 13.569 14.516 15.586 16.327 16.601 16.664 16.63 16.52 16.349 16.171 16.008 15.829 15.669 15.515 15.353 15.193 15.05 14.921 14.759 14.592 14.446 14.292 14.129 14.0 13.862 13.707 13.587 13.456 13.315 13.171 13.029 12.934 12.831 12.663 12.533 12.407 12.348 12.202 12.032 11.858 11.766 11.308 11.49 11.395 11.286 11.054 10.924 10.779 10.629 10.442 10.2 9.871 8.32 -4 ,8555 ,TETRA ,17603885,Sun Nov 28 17:07:20 CET,Sun Nov 28 18:58:05 CET,0.0 0.836 1.103 1.315 1.501 1.662 1.813 1.954 2.204 2.314 2.415 2.233 2.699 2.786 2.946 3.101 3.252 3.326 3.474 3.616 3.802 3.919 4.034 4.205 4.388 4.574 4.749 4.926 5.152 5.352 5.561 5.812 6.029 6.24 6.489 6.771 7.031 7.314 7.636 7.978 8.335 8.743 9.24 9.733 10.273 10.867 11.542 12.304 13.187 14.154 15.16 15.82 16.106 16.177 16.098 15.954 15.793 15.622 15.451 15.245 15.067 14.913 14.764 14.609 14.447 14.293 14.112 13.956 13.832 13.692 13.534 13.392 13.246 13.093 12.969 12.855 12.74 12.609 12.456 12.346 12.237 12.084 11.985 11.869 11.81 11.697 11.557 11.409 11.337 10.892 11.102 11.015 10.923 10.704 10.572 10.426 10.271 10.091 9.858 9.571 8.339 -5 ,369 ,TETRA ,17603886,Sun Nov 28 17:07:21 CET,Sun Nov 28 18:57:53 CET,0.0 1.273 1.666 1.961 2.199 2.417 2.603 2.754 3.029 3.162 3.286 3.145 3.625 3.728 3.928 4.12 4.312 4.405 4.586 4.752 4.979 5.115 5.248 5.441 5.622 5.803 5.974 6.141 6.364 6.577 6.785 7.03 7.255 7.463 7.706 7.982 8.252 8.563 8.885 9.229 9.599 10.006 10.48 10.952 11.478 12.062 12.749 13.51 14.377 15.341 16.353 16.965 17.188 17.242 17.199 17.096 16.965 16.809 16.653 16.482 16.315 16.157 15.985 15.809 15.641 15.488 15.324 15.169 15.023 14.875 14.73 14.596 14.451 14.303 14.191 14.07 13.932 13.785 13.637 13.529 13.412 13.236 13.114 12.987 12.924 12.787 12.635 12.479 12.395 11.939 12.109 12.0 11.881 11.632 11.488 11.343 11.184 10.988 10.764 10.478 9.359 -6 ,7312 ,TETRA ,17603887,Sun Nov 28 17:07:22 CET,Sun Nov 28 18:58:18 CET,0.0 1.257 1.564 1.792 1.983 2.145 2.278 2.411 2.663 2.775 2.883 2.718 3.184 3.272 3.448 3.617 3.769 3.84 3.975 4.112 4.31 4.432 4.565 4.768 4.966 5.16 5.339 5.503 5.718 5.926 6.12 6.357 6.583 6.807 7.063 7.331 7.589 7.881 8.21 8.543 8.876 9.272 9.728 10.174 10.705 11.311 11.969 12.694 13.554 14.51 15.517 16.145 16.385 16.433 16.349 16.227 16.087 15.917 15.755 15.592 15.424 15.249 15.086 14.916 14.733 14.56 14.379 14.222 14.091 13.943 13.795 13.682 13.55 13.401 13.283 13.165 13.04 12.916 12.785 12.681 12.57 12.41 12.301 12.181 12.114 11.966 11.803 11.633 11.546 11.091 11.247 11.141 11.021 10.75 10.599 10.433 10.247 10.04 9.783 9.42 7.874 -7 ,16692 ,TETRA ,17603888,Sun Nov 28 17:07:23 CET,Sun Nov 28 18:57:48 CET,0.0 1.334 1.626 1.84 2.022 2.181 2.325 2.455 2.68 2.788 2.888 2.701 3.172 3.265 3.435 3.6 3.757 3.828 3.972 4.11 4.308 4.443 4.574 4.755 4.92 5.089 5.261 5.424 5.646 5.864 6.069 6.311 6.542 6.764 7.021 7.32 7.603 7.907 8.235 8.582 8.952 9.371 9.836 10.309 10.839 11.41 12.097 12.86 13.727 14.679 15.673 16.376 16.676 16.762 16.769 16.71 16.557 16.381 16.222 16.055 15.895 15.74 15.572 15.399 15.25 15.107 14.946 14.801 14.667 14.511 14.348 14.22 14.076 13.929 13.821 13.697 13.566 13.433 13.287 13.183 13.074 12.921 12.812 12.689 12.629 12.5 12.362 12.217 12.134 11.682 11.875 11.787 11.692 11.462 11.337 11.202 11.053 10.891 10.682 10.393 9.234 -8 ,24633 ,TETRA ,17603889,Sun Nov 28 17:07:21 CET,Sun Nov 28 18:57:47 CET,0.0 1.252 1.545 1.764 1.941 2.094 2.238 2.384 2.665 2.78 2.882 2.697 3.154 3.237 3.402 3.566 3.727 3.803 3.942 4.077 4.28 4.417 4.548 4.735 4.916 5.095 5.273 5.446 5.663 5.865 6.05 6.285 6.521 6.737 6.993 7.292 7.568 7.876 8.205 8.538 8.883 9.274 9.744 10.232 10.795 11.413 12.12 12.894 13.788 14.791 15.854 16.492 16.735 16.823 16.804 16.718 16.583 16.438 16.292 16.109 15.923 15.753 15.599 15.444 15.286 15.121 14.93 14.769 14.628 14.477 14.317 14.183 14.045 13.899 13.784 13.651 13.506 13.37 13.223 13.112 12.998 12.819 12.694 12.571 12.504 12.356 12.208 12.057 11.982 11.542 11.744 11.649 11.547 11.336 11.197 11.036 10.865 10.676 10.458 10.123 8.752 -9 ,18875 ,TETRA ,17603890,Sun Nov 28 17:07:23 CET,Sun Nov 28 18:58:00 CET,0.0 1.06 1.358 1.585 1.754 1.913 2.063 2.199 2.443 2.552 2.658 2.473 2.942 3.038 3.21 3.371 3.53 3.607 3.751 3.887 4.074 4.194 4.311 4.482 4.653 4.815 4.968 5.116 5.302 5.49 5.669 5.874 6.091 6.315 6.588 6.878 7.142 7.442 7.752 8.08 8.448 8.87 9.345 9.82 10.36 10.95 11.656 12.439 13.327 14.312 15.362 16.006 16.194 16.209 16.128 15.99 15.828 15.658 15.488 15.294 15.112 14.935 14.757 14.589 14.425 14.272 14.109 13.954 13.825 13.692 13.532 13.394 13.261 13.123 13.004 12.874 12.744 12.611 12.469 12.366 12.258 12.089 11.966 11.834 11.763 11.621 11.466 11.292 11.206 10.759 10.931 10.832 10.741 10.532 10.412 10.274 10.106 9.905 9.659 9.326 7.621 -10 ,28514 ,TETRA ,17603891,Sun Nov 28 17:07:24 CET,Sun Nov 28 18:57:47 CET,0.0 1.211 1.502 1.712 1.887 2.034 2.174 2.311 2.541 2.646 2.75 2.569 3.032 3.113 3.268 3.413 3.557 3.63 3.772 3.905 4.088 4.206 4.332 4.521 4.688 4.847 5.009 5.164 5.36 5.547 5.723 5.935 6.146 6.36 6.617 6.911 7.196 7.5 7.818 8.161 8.517 8.921 9.382 9.844 10.389 10.992 11.705 12.472 13.315 14.252 15.226 15.879 16.154 16.198 16.125 16.008 15.878 15.717 15.551 15.371 15.19 15.018 14.843 14.682 14.537 14.396 14.248 14.095 13.941 13.788 13.638 13.513 13.377 13.223 13.103 12.979 12.841 12.698 12.542 12.428 12.314 12.142 12.018 11.877 11.805 11.658 11.503 11.34 11.246 10.77 10.902 10.785 10.658 10.38 10.233 10.08 9.917 9.745 9.535 9.221 7.778 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 4dcd744d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16377 ,KEBNE ,17027551,Wed Dec 22 17:36:57 CET,Wed Dec 22 19:11:48 CET,0.0 0.997 1.317 1.56 1.757 1.934 2.095 2.247 2.55 2.688 2.815 2.673 3.16 3.266 3.478 3.69 3.893 3.993 4.184 4.365 4.629 4.804 4.984 5.247 5.504 5.76 6.006 6.25 6.574 6.885 7.184 7.544 7.896 8.245 8.644 9.097 9.555 10.078 10.653 11.268 11.934 12.692 13.581 14.499 15.582 16.822 18.302 20.0 22.052 24.59 27.767 30.519 32.196 33.238 33.926 34.404 34.721 34.959 35.114 35.198 35.242 35.263 35.249 35.192 35.113 35.037 34.965 34.892 34.799 34.689 34.578 34.477 34.352 34.205 34.088 33.963 33.83 33.688 33.515 33.393 33.28 33.088 32.941 32.783 32.693 32.467 32.181 31.859 31.716 31.246 31.254 31.079 30.896 30.502 30.263 29.93 29.535 29.059 28.479 27.697 21.509 -2 ,9812 ,KEBNE ,17027552,Wed Dec 22 17:36:57 CET,Wed Dec 22 19:11:43 CET,0.0 1.002 1.266 1.472 1.657 1.826 1.981 2.127 2.395 2.521 2.643 2.5 2.991 3.101 3.312 3.515 3.707 3.803 3.987 4.166 4.433 4.603 4.772 5.017 5.253 5.484 5.713 5.938 6.23 6.526 6.816 7.171 7.543 7.905 8.305 8.763 9.225 9.732 10.289 10.901 11.555 12.3 13.201 14.114 15.192 16.464 17.996 19.785 21.852 24.341 27.525 30.272 31.896 32.937 33.638 34.105 34.409 34.604 34.712 34.788 34.829 34.845 34.822 34.777 34.725 34.675 34.617 34.543 34.468 34.374 34.265 34.168 34.051 33.907 33.78 33.663 33.507 33.332 33.187 33.068 32.916 32.694 32.538 32.344 32.234 32.013 31.789 31.554 31.433 30.962 30.989 30.802 30.606 30.167 29.883 29.565 29.2 28.79 28.251 27.574 22.335 -3 ,2677 ,KEBNE ,17027553,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:10:50 CET,0.0 0.865 1.165 1.391 1.59 1.761 1.911 2.05 2.309 2.433 2.551 2.396 2.885 2.995 3.205 3.398 3.584 3.679 3.87 4.056 4.315 4.482 4.654 4.907 5.148 5.386 5.621 5.848 6.152 6.454 6.746 7.107 7.458 7.801 8.207 8.666 9.113 9.618 10.182 10.793 11.444 12.193 13.086 14.007 15.113 16.353 17.783 19.473 21.569 24.13 27.28 29.996 31.648 32.74 33.465 33.952 34.26 34.447 34.579 34.666 34.689 34.708 34.696 34.636 34.576 34.515 34.441 34.368 34.302 34.221 34.115 34.019 33.915 33.79 33.668 33.546 33.428 33.284 33.142 33.047 32.923 32.708 32.553 32.393 32.311 32.14 31.954 31.718 31.587 31.129 31.184 31.029 30.868 30.409 30.134 29.8 29.415 29.037 28.518 27.459 23.453 -4 ,32486 ,KEBNE ,17027554,Wed Dec 22 17:36:55 CET,Wed Dec 22 19:10:15 CET,0.0 1.079 1.355 1.583 1.785 1.962 2.114 2.256 2.528 2.652 2.769 2.621 3.115 3.234 3.454 3.657 3.857 3.952 4.136 4.321 4.599 4.775 4.943 5.189 5.432 5.672 5.901 6.127 6.432 6.724 7.011 7.37 7.72 8.073 8.495 8.968 9.431 9.944 10.501 11.115 11.772 12.529 13.417 14.349 15.469 16.728 18.222 19.914 21.953 24.471 27.652 30.354 31.987 33.045 33.775 34.306 34.653 34.886 35.027 35.096 35.094 35.08 35.069 35.026 34.953 34.878 34.804 34.732 34.656 34.556 34.432 34.327 34.216 34.094 33.978 33.842 33.711 33.575 33.423 33.319 33.197 32.962 32.8 32.646 32.558 32.359 32.156 31.907 31.769 31.295 31.329 31.154 30.943 30.481 30.233 29.969 29.668 29.252 28.646 27.809 24.752 -5 ,31124 ,KEBNE ,17027555,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:10:06 CET,0.0 1.16 1.486 1.725 1.912 2.08 2.244 2.395 2.668 2.796 2.922 2.784 3.274 3.38 3.597 3.806 4.007 4.104 4.296 4.48 4.745 4.92 5.092 5.349 5.596 5.834 6.071 6.307 6.618 6.927 7.23 7.592 7.945 8.299 8.717 9.181 9.63 10.138 10.698 11.293 11.922 12.661 13.545 14.451 15.53 16.75 18.185 19.906 22.004 24.527 27.825 30.623 32.247 33.295 33.973 34.428 34.738 34.919 35.035 35.133 35.171 35.18 35.146 35.097 35.059 35.009 34.928 34.847 34.774 34.661 34.478 34.326 34.178 33.991 33.84 33.712 33.587 33.427 33.264 33.152 33.012 32.783 32.636 32.463 32.374 32.212 32.001 31.754 31.629 31.156 31.186 31.027 30.846 30.439 30.202 29.905 29.57 29.166 28.615 27.71 23.895 -6 ,3917 ,KEBNE ,17027556,Wed Dec 22 17:36:55 CET,Wed Dec 22 19:10:56 CET,0.0 1.293 1.612 1.862 2.062 2.236 2.397 2.54 2.801 2.935 3.068 2.925 3.416 3.532 3.757 3.966 4.164 4.262 4.449 4.626 4.887 5.057 5.228 5.481 5.72 5.95 6.185 6.417 6.72 7.024 7.317 7.661 8.01 8.366 8.776 9.237 9.696 10.211 10.763 11.379 12.03 12.755 13.624 14.501 15.556 16.768 18.237 19.964 22.055 24.624 27.816 30.529 32.208 33.267 33.943 34.439 34.796 35.014 35.126 35.209 35.251 35.251 35.255 35.251 35.217 35.165 35.092 35.015 34.921 34.799 34.666 34.553 34.436 34.306 34.189 34.062 33.934 33.791 33.63 33.523 33.397 33.181 33.038 32.887 32.808 32.656 32.488 32.299 32.195 31.743 31.803 31.642 31.473 31.081 30.85 30.598 30.263 29.812 29.198 28.203 23.856 -7 ,30598 ,KEBNE ,17027557,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:10:06 CET,0.0 1.051 1.328 1.549 1.739 1.905 2.058 2.196 2.453 2.584 2.713 2.572 3.061 3.172 3.38 3.58 3.777 3.871 4.058 4.242 4.503 4.673 4.844 5.097 5.339 5.57 5.803 6.032 6.329 6.631 6.924 7.288 7.658 8.007 8.417 8.887 9.344 9.863 10.44 11.059 11.714 12.482 13.394 14.321 15.415 16.638 18.094 19.751 21.758 24.259 27.445 30.238 31.916 32.995 33.708 34.198 34.554 34.788 34.904 34.982 35.025 35.018 34.988 34.95 34.89 34.82 34.746 34.671 34.591 34.498 34.366 34.248 34.127 33.996 33.886 33.765 33.638 33.478 33.303 33.196 33.077 32.863 32.704 32.55 32.477 32.297 32.088 31.854 31.721 31.24 31.249 31.076 30.881 30.402 30.15 29.896 29.569 29.143 28.579 27.61 23.235 -8 ,22481 ,KEBNE ,17027558,Wed Dec 22 17:36:57 CET,Wed Dec 22 19:10:18 CET,0.0 0.988 1.272 1.492 1.683 1.856 2.021 2.172 2.445 2.576 2.702 2.565 3.059 3.166 3.386 3.6 3.796 3.891 4.07 4.247 4.509 4.679 4.845 5.096 5.345 5.575 5.803 6.032 6.34 6.641 6.918 7.25 7.583 7.913 8.303 8.744 9.172 9.661 10.218 10.82 11.468 12.216 13.076 13.965 15.056 16.308 17.786 19.501 21.569 24.045 27.129 29.815 31.449 32.465 33.162 33.667 33.987 34.193 34.337 34.427 34.448 34.453 34.437 34.389 34.331 34.259 34.185 34.106 34.004 33.897 33.783 33.674 33.561 33.452 33.356 33.24 33.108 32.964 32.806 32.691 32.565 32.344 32.181 32.02 31.914 31.655 31.421 31.18 31.031 30.521 30.469 30.271 30.083 29.691 29.46 29.157 28.799 28.391 27.896 27.104 21.977 -9 ,31790 ,KEBNE ,17027559,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:10:43 CET,0.0 0.863 1.163 1.393 1.591 1.768 1.934 2.085 2.342 2.468 2.595 2.446 2.938 3.049 3.256 3.458 3.647 3.741 3.927 4.114 4.393 4.578 4.756 5.007 5.252 5.484 5.707 5.935 6.236 6.521 6.805 7.165 7.523 7.869 8.274 8.738 9.189 9.693 10.247 10.85 11.507 12.266 13.169 14.095 15.179 16.399 17.848 19.553 21.626 24.177 27.4 30.088 31.634 32.68 33.407 33.872 34.175 34.407 34.544 34.617 34.646 34.652 34.643 34.62 34.564 34.486 34.394 34.305 34.217 34.125 34.014 33.897 33.77 33.64 33.539 33.408 33.241 33.073 32.913 32.813 32.684 32.435 32.264 32.08 31.984 31.788 31.59 31.382 31.242 30.74 30.803 30.673 30.512 30.115 29.842 29.5 29.129 28.717 28.256 27.542 24.896 -10 ,24841 ,KEBNE ,17027560,Wed Dec 22 17:36:57 CET,Wed Dec 22 19:10:28 CET,0.0 0.991 1.332 1.6 1.816 1.998 2.154 2.3 2.571 2.697 2.82 2.686 3.178 3.288 3.498 3.698 3.894 3.987 4.165 4.345 4.621 4.801 4.975 5.224 5.466 5.702 5.927 6.16 6.466 6.755 7.048 7.405 7.755 8.102 8.507 8.976 9.438 9.949 10.511 11.12 11.762 12.497 13.351 14.226 15.319 16.591 18.089 19.818 21.851 24.346 27.581 30.346 32.003 33.066 33.757 34.243 34.585 34.841 35.012 35.124 35.17 35.174 35.174 35.155 35.121 35.083 35.005 34.913 34.826 34.733 34.628 34.535 34.438 34.301 34.192 34.075 33.922 33.751 33.573 33.456 33.331 33.112 32.965 32.793 32.704 32.523 32.311 32.071 31.947 31.483 31.527 31.372 31.184 30.74 30.496 30.182 29.806 29.417 28.901 28.004 23.774 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 51745393..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10422 ,TETRA ,17603892,Sun Nov 28 17:07:26 CET,Sun Nov 28 18:58:12 CET,0.0 1.529 1.961 2.274 2.527 2.746 2.932 3.1 3.386 3.522 3.65 3.507 3.993 4.088 4.273 4.46 4.639 4.721 4.877 5.022 5.222 5.361 5.511 5.733 5.94 6.132 6.313 6.497 6.722 6.93 7.125 7.363 7.618 7.857 8.115 8.399 8.688 9.0 9.322 9.677 10.05 10.49 11.006 11.493 12.031 12.631 13.315 14.051 14.832 15.584 16.231 16.469 16.389 16.102 15.738 15.377 15.005 14.639 14.3 13.936 13.619 13.328 13.04 12.778 12.524 12.278 12.032 11.799 11.586 11.365 11.129 10.931 10.729 10.522 10.367 10.202 10.03 9.85 9.655 9.518 9.377 9.154 8.988 8.808 8.727 8.568 8.385 8.17 8.057 7.578 7.698 7.562 7.408 7.08 6.904 6.703 6.472 6.197 5.869 5.438 3.851 -2 ,14580 ,TETRA ,17603893,Sun Nov 28 17:07:21 CET,Sun Nov 28 18:58:42 CET,0.0 1.67 2.075 2.36 2.62 2.846 3.018 3.179 3.495 3.649 3.792 3.678 4.169 4.281 4.498 4.7 4.886 4.979 5.16 5.336 5.599 5.749 5.888 6.11 6.331 6.54 6.74 6.926 7.162 7.393 7.61 7.872 8.127 8.362 8.629 8.925 9.21 9.514 9.871 10.266 10.651 11.09 11.581 12.036 12.551 13.12 13.724 14.396 15.144 15.851 16.484 16.728 16.629 16.325 15.975 15.63 15.285 14.933 14.609 14.286 13.993 13.69 13.38 13.083 12.814 12.563 12.285 12.055 11.842 11.61 11.384 11.192 10.973 10.738 10.561 10.364 10.144 9.932 9.735 9.597 9.451 9.217 9.053 8.883 8.791 8.593 8.387 8.161 8.048 7.562 7.643 7.491 7.34 7.03 6.83 6.6 6.368 6.083 5.717 5.246 3.899 -3 ,24980 ,TETRA ,17603894,Sun Nov 28 17:07:23 CET,Sun Nov 28 18:58:20 CET,0.0 1.755 2.192 2.529 2.811 3.06 3.283 3.485 3.808 3.953 4.105 3.998 4.488 4.604 4.853 5.074 5.269 5.37 5.55 5.712 5.956 6.12 6.269 6.477 6.679 6.875 7.061 7.244 7.474 7.689 7.909 8.163 8.397 8.628 8.896 9.192 9.466 9.771 10.105 10.457 10.823 11.225 11.681 12.134 12.67 13.257 13.877 14.556 15.284 16.0 16.638 16.903 16.803 16.501 16.144 15.806 15.464 15.096 14.745 14.371 14.048 13.746 13.437 13.132 12.844 12.591 12.307 12.03 11.809 11.604 11.376 11.173 10.969 10.763 10.597 10.417 10.233 10.043 9.82 9.653 9.503 9.279 9.119 8.963 8.873 8.677 8.462 8.226 8.115 7.637 7.743 7.61 7.477 7.143 6.942 6.722 6.485 6.241 5.937 5.479 3.843 -4 ,18079 ,TETRA ,17603895,Sun Nov 28 17:07:48 CET,Sun Nov 28 18:59:08 CET,0.0 1.106 1.485 1.776 2.015 2.234 2.461 2.653 2.957 3.094 3.219 3.066 3.549 3.652 3.832 3.99 4.145 4.218 4.36 4.505 4.722 4.873 5.03 5.254 5.451 5.637 5.826 6.005 6.233 6.458 6.678 6.942 7.178 7.407 7.682 7.981 8.257 8.559 8.887 9.231 9.585 9.985 10.449 10.907 11.413 11.966 12.657 13.4 14.138 14.849 15.467 15.674 15.536 15.279 14.94 14.507 14.061 13.666 13.324 12.962 12.652 12.363 12.065 11.752 11.464 11.219 10.954 10.72 10.522 10.311 10.079 9.874 9.664 9.452 9.28 9.1 8.924 8.738 8.543 8.409 8.269 8.039 7.871 7.692 7.597 7.408 7.214 6.982 6.848 6.343 6.445 6.309 6.163 5.84 5.655 5.429 5.143 4.848 4.497 4.021 2.351 -5 ,26782 ,TETRA ,17603896,Sun Nov 28 17:07:50 CET,Sun Nov 28 18:58:59 CET,0.0 1.484 1.882 2.143 2.372 2.574 2.745 2.918 3.219 3.338 3.449 3.293 3.789 3.903 4.1 4.284 4.444 4.523 4.696 4.871 5.106 5.246 5.379 5.57 5.752 5.933 6.121 6.305 6.526 6.746 6.961 7.2 7.432 7.67 7.936 8.216 8.497 8.824 9.166 9.502 9.852 10.253 10.695 11.142 11.688 12.248 12.867 13.563 14.287 15.035 15.638 15.706 15.517 15.228 14.898 14.54 14.167 13.792 13.433 13.072 12.758 12.478 12.222 11.96 11.698 11.441 11.176 10.933 10.706 10.457 10.197 9.983 9.75 9.52 9.351 9.17 8.986 8.796 8.592 8.447 8.301 8.068 7.884 7.688 7.59 7.392 7.175 6.932 6.804 6.309 6.379 6.223 6.063 5.723 5.54 5.325 5.08 4.819 4.496 4.023 2.238 -6 ,31592 ,TETRA ,17603897,Sun Nov 28 17:07:48 CET,Sun Nov 28 18:58:44 CET,0.0 1.52 1.919 2.232 2.478 2.698 2.906 3.094 3.432 3.594 3.75 3.654 4.146 4.26 4.478 4.697 4.903 4.993 5.168 5.334 5.565 5.711 5.85 6.043 6.227 6.411 6.587 6.762 6.989 7.204 7.405 7.653 7.894 8.126 8.39 8.689 8.979 9.298 9.64 9.992 10.356 10.763 11.228 11.678 12.187 12.779 13.5 14.241 14.967 15.698 16.388 16.565 16.413 16.129 15.782 15.449 15.13 14.805 14.485 14.143 13.832 13.53 13.221 12.942 12.687 12.447 12.199 11.977 11.78 11.559 11.326 11.138 10.942 10.737 10.573 10.398 10.212 10.024 9.839 9.711 9.578 9.365 9.213 9.052 8.97 8.798 8.619 8.425 8.317 7.847 7.984 7.852 7.717 7.386 7.195 6.99 6.751 6.486 6.172 5.734 4.045 -7 ,27681 ,TETRA ,17603898,Sun Nov 28 17:07:48 CET,Sun Nov 28 18:58:58 CET,0.0 1.415 1.796 2.095 2.321 2.532 2.74 2.938 3.258 3.4 3.539 3.399 3.875 3.975 4.163 4.344 4.514 4.595 4.746 4.886 5.099 5.238 5.375 5.569 5.754 5.939 6.131 6.348 6.612 6.844 7.078 7.35 7.606 7.85 8.114 8.41 8.691 8.988 9.318 9.674 10.046 10.451 10.913 11.374 11.875 12.415 13.038 13.718 14.46 15.194 15.891 16.189 16.023 15.675 15.282 14.912 14.588 14.259 13.947 13.622 13.309 12.994 12.681 12.408 12.176 11.939 11.68 11.459 11.25 11.028 10.811 10.62 10.417 10.214 10.05 9.872 9.683 9.479 9.262 9.114 8.963 8.724 8.556 8.385 8.298 8.091 7.854 7.611 7.485 6.981 7.047 6.882 6.699 6.285 6.07 5.844 5.573 5.273 4.949 4.492 2.895 -8 ,19419 ,TETRA ,17603899,Sun Nov 28 17:07:50 CET,Sun Nov 28 18:59:38 CET,0.0 1.362 1.772 2.07 2.274 2.455 2.634 2.784 3.041 3.162 3.282 3.139 3.63 3.739 3.94 4.124 4.291 4.38 4.549 4.697 4.911 5.049 5.179 5.372 5.568 5.746 5.914 6.084 6.306 6.512 6.719 6.968 7.208 7.443 7.715 8.038 8.344 8.675 9.034 9.396 9.77 10.179 10.672 11.165 11.702 12.299 12.951 13.648 14.366 15.093 15.749 15.975 15.883 15.615 15.294 14.942 14.56 14.193 13.876 13.527 13.211 12.909 12.616 12.328 12.048 11.813 11.566 11.332 11.128 10.905 10.677 10.486 10.28 10.052 9.879 9.707 9.521 9.321 9.1 8.948 8.794 8.519 8.313 8.115 8.022 7.818 7.582 7.355 7.239 6.734 6.782 6.622 6.46 6.066 5.844 5.639 5.405 5.127 4.825 4.398 2.617 -9 ,26280 ,TETRA ,17603900,Sun Nov 28 17:07:52 CET,Sun Nov 28 18:59:13 CET,0.0 1.874 2.266 2.539 2.787 3.004 3.176 3.353 3.658 3.794 3.939 3.867 4.376 4.506 4.75 4.969 5.171 5.263 5.445 5.614 5.854 6.017 6.162 6.355 6.545 6.746 6.943 7.124 7.368 7.599 7.811 8.066 8.314 8.554 8.826 9.141 9.443 9.75 10.075 10.422 10.772 11.164 11.634 12.088 12.602 13.197 13.877 14.575 15.304 16.065 16.702 16.921 16.768 16.435 16.079 15.716 15.345 14.974 14.618 14.222 13.892 13.622 13.354 13.092 12.853 12.614 12.335 12.09 11.882 11.659 11.421 11.21 10.991 10.766 10.591 10.406 10.212 10.01 9.804 9.66 9.501 9.247 9.074 8.888 8.794 8.579 8.325 8.033 7.89 7.405 7.508 7.344 7.174 6.783 6.542 6.319 6.103 5.849 5.499 5.003 2.918 -10 ,14477 ,TETRA ,17603901,Sun Nov 28 17:07:49 CET,Sun Nov 28 18:58:59 CET,0.0 1.257 1.655 1.954 2.199 2.405 2.59 2.753 3.02 3.151 3.279 3.144 3.629 3.731 3.932 4.121 4.297 4.379 4.538 4.696 4.922 5.062 5.199 5.405 5.595 5.78 5.978 6.163 6.386 6.618 6.847 7.099 7.339 7.577 7.842 8.147 8.429 8.733 9.064 9.42 9.794 10.193 10.64 11.07 11.591 12.175 12.804 13.461 14.128 14.847 15.582 15.786 15.637 15.382 15.044 14.671 14.287 13.905 13.555 13.199 12.889 12.603 12.321 12.042 11.781 11.531 11.262 11.03 10.824 10.591 10.351 10.153 9.949 9.75 9.592 9.418 9.23 9.023 8.8 8.652 8.502 8.266 8.093 7.906 7.813 7.617 7.4 7.16 7.027 6.522 6.596 6.455 6.305 5.964 5.79 5.612 5.416 5.189 4.882 4.424 2.986 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt deleted file mode 100644 index 9a8a5ed2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31039 ,KEBNE ,17027561,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:13:33 CET,0.0 0.497 0.677 0.801 0.895 0.985 1.051 1.105 1.213 1.262 1.307 1.024 1.415 1.444 1.478 1.509 1.556 1.577 1.6 1.616 1.656 1.686 1.707 1.737 1.756 1.765 1.786 1.801 1.801 1.799 1.783 1.745 1.705 1.661 1.611 1.538 1.445 1.32 1.169 0.997 0.786 0.516 0.163 -0.248 -0.785 -1.452 -2.349 -3.549 -5.217 -7.541 -11.092 -15.026 -18.03 -20.409 -22.375 -24.053 -25.435 -26.636 -27.639 -28.611 -29.419 -30.118 -30.764 -31.361 -31.892 -32.358 -32.838 -33.27 -33.643 -34.02 -34.424 -34.754 -35.078 -35.415 -35.672 -35.928 -36.197 -36.474 -36.753 -36.946 -37.147 -37.456 -37.663 -37.878 -37.99 -38.221 -38.464 -38.712 -38.846 -39.38 -39.275 -39.43 -39.584 -39.93 -40.116 -40.307 -40.515 -40.739 -41.032 -41.419 -42.211 -2 ,15282 ,KEBNE ,17027562,Wed Dec 22 17:36:57 CET,Wed Dec 22 19:11:37 CET,0.0 0.247 0.383 0.506 0.602 0.675 0.744 0.809 0.919 0.965 1.012 0.713 1.098 1.133 1.196 1.252 1.302 1.322 1.354 1.388 1.431 1.455 1.488 1.533 1.559 1.578 1.595 1.61 1.614 1.604 1.598 1.582 1.547 1.499 1.435 1.346 1.25 1.127 0.973 0.805 0.609 0.342 -0.002 -0.386 -0.901 -1.558 -2.447 -3.637 -5.279 -7.585 -11.158 -15.094 -18.082 -20.475 -22.405 -24.062 -25.464 -26.663 -27.649 -28.604 -29.403 -30.091 -30.73 -31.32 -31.861 -32.36 -32.865 -33.294 -33.649 -34.005 -34.363 -34.654 -34.952 -35.254 -35.491 -35.738 -35.986 -36.232 -36.494 -36.68 -36.865 -37.152 -37.342 -37.537 -37.64 -37.852 -38.074 -38.294 -38.41 -38.935 -38.8 -38.935 -39.076 -39.362 -39.516 -39.681 -39.852 -40.045 -40.274 -40.572 -41.397 -3 ,26358 ,KEBNE ,17027563,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:12:06 CET,0.0 0.366 0.528 0.655 0.745 0.837 0.928 1.004 1.12 1.161 1.201 0.939 1.342 1.389 1.463 1.519 1.571 1.606 1.67 1.71 1.766 1.801 1.824 1.846 1.859 1.871 1.892 1.911 1.915 1.901 1.887 1.872 1.845 1.809 1.744 1.658 1.569 1.462 1.322 1.148 0.955 0.689 0.325 -0.096 -0.622 -1.268 -2.17 -3.338 -4.944 -7.262 -10.793 -14.719 -17.738 -20.13 -22.047 -23.644 -25.003 -26.186 -27.156 -28.107 -28.895 -29.584 -30.234 -30.839 -31.386 -31.865 -32.367 -32.811 -33.18 -33.544 -33.916 -34.221 -34.533 -34.845 -35.08 -35.318 -35.565 -35.819 -36.073 -36.255 -36.439 -36.71 -36.895 -37.091 -37.195 -37.403 -37.616 -37.848 -37.965 -38.485 -38.37 -38.512 -38.647 -38.943 -39.112 -39.281 -39.471 -39.684 -39.919 -40.209 -40.969 -4 ,14562 ,KEBNE ,17027564,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:12:08 CET,0.0 0.376 0.499 0.585 0.676 0.761 0.838 0.906 1.001 1.038 1.071 0.778 1.175 1.218 1.288 1.332 1.366 1.388 1.426 1.455 1.487 1.5 1.513 1.522 1.516 1.519 1.524 1.525 1.513 1.488 1.459 1.42 1.39 1.361 1.309 1.253 1.189 1.09 0.947 0.773 0.572 0.304 -0.049 -0.455 -0.976 -1.64 -2.546 -3.729 -5.352 -7.681 -11.28 -15.211 -18.223 -20.666 -22.628 -24.291 -25.677 -26.851 -27.829 -28.797 -29.601 -30.284 -30.915 -31.519 -32.076 -32.565 -33.058 -33.478 -33.832 -34.2 -34.58 -34.902 -35.232 -35.554 -35.808 -36.077 -36.357 -36.636 -36.918 -37.117 -37.316 -37.61 -37.814 -38.027 -38.132 -38.343 -38.563 -38.783 -38.895 -39.409 -39.264 -39.402 -39.545 -39.838 -39.991 -40.159 -40.355 -40.579 -40.826 -41.121 -42.01 -5 ,8548 ,KEBNE ,17027565,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:12:06 CET,0.0 0.294 0.437 0.55 0.648 0.727 0.789 0.853 0.991 1.047 1.095 0.831 1.229 1.271 1.342 1.403 1.456 1.484 1.53 1.566 1.615 1.651 1.683 1.72 1.745 1.76 1.77 1.775 1.776 1.775 1.774 1.748 1.714 1.683 1.642 1.572 1.483 1.37 1.238 1.075 0.871 0.613 0.281 -0.098 -0.617 -1.284 -2.163 -3.322 -4.965 -7.334 -11.0 -14.994 -18.024 -20.379 -22.257 -23.899 -25.28 -26.472 -27.48 -28.447 -29.247 -29.942 -30.594 -31.192 -31.734 -32.213 -32.694 -33.126 -33.503 -33.883 -34.272 -34.602 -34.937 -35.271 -35.537 -35.811 -36.084 -36.363 -36.642 -36.836 -37.032 -37.324 -37.524 -37.724 -37.827 -38.048 -38.264 -38.479 -38.599 -39.118 -38.965 -39.093 -39.235 -39.544 -39.702 -39.871 -40.069 -40.277 -40.506 -40.82 -41.789 -6 ,17562 ,KEBNE ,17027566,Wed Dec 22 17:36:57 CET,Wed Dec 22 19:11:41 CET,0.0 0.368 0.511 0.642 0.735 0.793 0.846 0.905 1.023 1.077 1.121 0.838 1.227 1.258 1.31 1.368 1.424 1.45 1.505 1.548 1.608 1.642 1.666 1.692 1.702 1.706 1.717 1.721 1.707 1.692 1.683 1.659 1.629 1.594 1.531 1.452 1.368 1.245 1.107 0.944 0.741 0.48 0.129 -0.269 -0.782 -1.45 -2.363 -3.547 -5.15 -7.454 -11.036 -14.952 -17.896 -20.219 -22.138 -23.773 -25.132 -26.338 -27.339 -28.289 -29.094 -29.788 -30.425 -31.022 -31.559 -32.032 -32.518 -32.951 -33.326 -33.712 -34.102 -34.426 -34.764 -35.098 -35.346 -35.594 -35.852 -36.114 -36.377 -36.56 -36.745 -37.035 -37.232 -37.427 -37.526 -37.73 -37.946 -38.172 -38.288 -38.799 -38.659 -38.797 -38.932 -39.231 -39.396 -39.578 -39.761 -39.954 -40.203 -40.517 -42.097 -7 ,21593 ,KEBNE ,17027567,Wed Dec 22 17:36:57 CET,Wed Dec 22 19:11:42 CET,0.0 0.387 0.555 0.658 0.74 0.824 0.904 0.973 1.075 1.12 1.162 0.87 1.261 1.293 1.34 1.391 1.43 1.445 1.479 1.505 1.535 1.552 1.561 1.572 1.588 1.592 1.587 1.576 1.556 1.537 1.52 1.498 1.466 1.424 1.371 1.29 1.192 1.077 0.934 0.773 0.584 0.321 -0.047 -0.468 -0.999 -1.677 -2.59 -3.767 -5.402 -7.784 -11.423 -15.327 -18.289 -20.645 -22.569 -24.194 -25.584 -26.799 -27.791 -28.742 -29.538 -30.234 -30.882 -31.48 -32.015 -32.487 -32.969 -33.415 -33.795 -34.171 -34.571 -34.902 -35.243 -35.591 -35.847 -36.098 -36.36 -36.636 -36.91 -37.102 -37.304 -37.616 -37.832 -38.052 -38.162 -38.396 -38.638 -38.896 -39.032 -39.566 -39.46 -39.602 -39.758 -40.111 -40.305 -40.518 -40.751 -40.999 -41.291 -41.721 -42.977 -8 ,32268 ,KEBNE ,17027568,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:12:17 CET,0.0 0.393 0.533 0.66 0.767 0.843 0.9 0.95 1.045 1.084 1.125 0.861 1.263 1.319 1.417 1.494 1.569 1.599 1.641 1.674 1.731 1.762 1.788 1.823 1.852 1.872 1.885 1.892 1.895 1.904 1.898 1.856 1.816 1.776 1.713 1.617 1.514 1.409 1.273 1.106 0.909 0.655 0.318 -0.06 -0.567 -1.248 -2.14 -3.285 -4.901 -7.237 -10.801 -14.682 -17.678 -20.078 -21.985 -23.59 -24.966 -26.156 -27.143 -28.109 -28.901 -29.597 -30.246 -30.839 -31.386 -31.872 -32.372 -32.825 -33.211 -33.594 -33.976 -34.286 -34.603 -34.924 -35.171 -35.417 -35.668 -35.929 -36.191 -36.365 -36.547 -36.829 -37.015 -37.217 -37.326 -37.541 -37.754 -37.981 -38.098 -38.615 -38.471 -38.6 -38.725 -39.009 -39.169 -39.334 -39.509 -39.708 -39.954 -40.265 -41.112 -9 ,17990 ,KEBNE ,17027569,Wed Dec 22 17:36:56 CET,Wed Dec 22 19:11:54 CET,0.0 0.311 0.482 0.591 0.669 0.737 0.802 0.865 0.971 1.014 1.061 0.817 1.213 1.246 1.301 1.35 1.405 1.428 1.472 1.506 1.542 1.563 1.578 1.592 1.599 1.603 1.612 1.619 1.621 1.616 1.6 1.576 1.552 1.529 1.486 1.415 1.319 1.193 1.049 0.875 0.669 0.422 0.084 -0.313 -0.848 -1.533 -2.435 -3.618 -5.267 -7.605 -11.167 -15.054 -17.995 -20.349 -22.274 -23.91 -25.286 -26.483 -27.442 -28.371 -29.185 -29.892 -30.535 -31.126 -31.683 -32.191 -32.7 -33.137 -33.504 -33.883 -34.267 -34.579 -34.896 -35.209 -35.445 -35.689 -35.942 -36.192 -36.455 -36.647 -36.841 -37.132 -37.329 -37.53 -37.632 -37.831 -38.031 -38.254 -38.372 -38.886 -38.73 -38.862 -39.004 -39.294 -39.454 -39.623 -39.801 -40.014 -40.264 -40.577 -41.679 -10 ,30251 ,KEBNE ,17027570,Wed Dec 22 17:36:57 CET,Wed Dec 22 19:11:34 CET,0.0 0.394 0.547 0.658 0.746 0.828 0.9 0.96 1.08 1.14 1.191 0.903 1.291 1.32 1.382 1.428 1.456 1.469 1.492 1.513 1.535 1.551 1.569 1.586 1.597 1.597 1.594 1.59 1.589 1.586 1.558 1.504 1.451 1.402 1.338 1.261 1.182 1.078 0.946 0.762 0.533 0.259 -0.096 -0.497 -1.011 -1.663 -2.532 -3.684 -5.282 -7.581 -11.143 -15.158 -18.197 -20.558 -22.49 -24.132 -25.481 -26.662 -27.663 -28.619 -29.406 -30.092 -30.732 -31.32 -31.852 -32.337 -32.838 -33.269 -33.641 -34.027 -34.417 -34.738 -35.067 -35.402 -35.662 -35.928 -36.2 -36.478 -36.751 -36.931 -37.111 -37.385 -37.575 -37.781 -37.888 -38.103 -38.321 -38.543 -38.661 -39.183 -39.054 -39.194 -39.331 -39.621 -39.773 -39.93 -40.111 -40.317 -40.566 -40.908 -42.162 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt deleted file mode 100644 index dc738434..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14712 ,TETRA ,17603902,Sun Nov 28 17:07:51 CET,Sun Nov 28 18:59:11 CET,0.0 1.105 1.47 1.749 1.984 2.199 2.398 2.591 2.961 3.141 3.308 3.212 3.783 3.924 4.186 4.448 4.702 4.822 5.061 5.305 5.666 5.906 6.129 6.438 6.75 7.041 7.322 7.606 7.974 8.334 8.68 9.105 9.524 9.921 10.38 10.91 11.434 12.027 12.69 13.41 14.167 15.024 16.043 17.08 18.318 19.737 21.41 23.341 25.624 28.432 31.945 34.883 36.611 37.716 38.436 38.938 39.285 39.514 39.655 39.748 39.776 39.794 39.783 39.75 39.718 39.667 39.597 39.501 39.407 39.323 39.232 39.147 39.053 38.937 38.847 38.759 38.659 38.561 38.445 38.362 38.279 38.133 38.035 37.94 37.89 37.778 37.65 37.504 37.432 36.987 37.209 37.12 37.019 36.794 36.658 36.505 36.346 36.167 35.931 35.61 34.565 -2 ,3714 ,TETRA ,17603903,Sun Nov 28 17:07:52 CET,Sun Nov 28 18:59:43 CET,0.0 1.196 1.515 1.783 2.034 2.243 2.419 2.595 2.933 3.084 3.223 3.065 3.608 3.74 4.003 4.266 4.527 4.651 4.896 5.143 5.496 5.714 5.925 6.232 6.537 6.841 7.132 7.416 7.793 8.166 8.522 8.945 9.367 9.791 10.279 10.833 11.376 11.974 12.626 13.335 14.104 14.987 16.032 17.09 18.338 19.757 21.426 23.387 25.76 28.613 32.182 35.123 36.812 37.962 38.734 39.236 39.563 39.792 39.951 40.061 40.093 40.09 40.099 40.08 40.01 39.928 39.843 39.767 39.694 39.606 39.511 39.424 39.324 39.21 39.124 39.037 38.949 38.86 38.767 38.698 38.628 38.526 38.432 38.319 38.261 38.134 38.006 37.88 37.808 37.351 37.575 37.491 37.397 37.2 37.087 36.948 36.774 36.578 36.352 36.057 35.035 -3 ,5075 ,TETRA ,17603904,Sun Nov 28 17:07:54 CET,Sun Nov 28 18:59:25 CET,0.0 1.14 1.479 1.761 2.017 2.238 2.434 2.619 2.952 3.093 3.23 3.079 3.625 3.756 4.017 4.265 4.495 4.603 4.822 5.04 5.352 5.553 5.752 6.04 6.337 6.637 6.921 7.206 7.588 7.951 8.302 8.734 9.15 9.56 10.049 10.593 11.121 11.71 12.355 13.064 13.835 14.722 15.751 16.805 18.07 19.5 21.18 23.126 25.455 28.249 31.718 34.699 36.422 37.54 38.264 38.744 39.107 39.35 39.46 39.503 39.531 39.532 39.487 39.443 39.409 39.369 39.318 39.262 39.195 39.11 39.003 38.929 38.861 38.762 38.676 38.578 38.459 38.34 38.227 38.141 38.032 37.873 37.766 37.635 37.567 37.449 37.326 37.199 37.134 36.685 36.888 36.799 36.705 36.482 36.365 36.231 36.094 35.948 35.751 35.465 34.372 -4 ,1673 ,TETRA ,17603905,Sun Nov 28 17:07:49 CET,Sun Nov 28 19:00:03 CET,0.0 1.102 1.442 1.707 1.936 2.14 2.322 2.499 2.834 2.982 3.133 3.028 3.586 3.726 4.007 4.267 4.513 4.631 4.864 5.1 5.432 5.649 5.865 6.174 6.469 6.744 7.003 7.271 7.657 8.048 8.421 8.853 9.28 9.7 10.186 10.735 11.252 11.827 12.471 13.182 13.941 14.807 15.823 16.873 18.156 19.623 21.338 23.326 25.684 28.491 32.06 34.976 36.702 37.844 38.584 39.097 39.404 39.626 39.763 39.828 39.853 39.869 39.883 39.862 39.804 39.726 39.65 39.588 39.518 39.444 39.369 39.302 39.215 39.113 39.036 38.949 38.852 38.742 38.621 38.533 38.445 38.308 38.211 38.115 38.061 37.946 37.835 37.711 37.645 37.196 37.398 37.312 37.223 37.001 36.879 36.748 36.59 36.398 36.155 35.77 34.153 -5 ,30308 ,TETRA ,17603906,Sun Nov 28 17:07:49 CET,Sun Nov 28 19:00:16 CET,0.0 1.232 1.553 1.796 2.019 2.223 2.417 2.599 2.942 3.105 3.256 3.135 3.693 3.829 4.104 4.375 4.635 4.761 5.006 5.241 5.581 5.799 6.006 6.31 6.609 6.894 7.176 7.465 7.85 8.227 8.586 9.033 9.479 9.895 10.375 10.915 11.428 12.029 12.701 13.419 14.175 15.035 16.057 17.086 18.314 19.727 21.435 23.399 25.715 28.567 31.967 34.836 36.644 37.802 38.555 39.04 39.346 39.55 39.699 39.793 39.825 39.837 39.809 39.762 39.721 39.679 39.628 39.56 39.482 39.385 39.263 39.173 39.082 38.975 38.891 38.806 38.712 38.614 38.521 38.452 38.368 38.225 38.135 38.047 37.995 37.874 37.745 37.603 37.528 37.075 37.288 37.202 37.107 36.895 36.775 36.641 36.492 36.318 36.095 35.773 34.6 -6 ,4987 ,TETRA ,17603907,Sun Nov 28 17:07:52 CET,Sun Nov 28 18:59:38 CET,0.0 1.121 1.461 1.733 1.969 2.183 2.382 2.565 2.899 3.047 3.194 3.063 3.616 3.75 3.999 4.245 4.493 4.612 4.849 5.081 5.415 5.631 5.835 6.14 6.457 6.755 7.045 7.334 7.697 8.04 8.378 8.8 9.224 9.643 10.137 10.684 11.197 11.777 12.425 13.121 13.843 14.691 15.737 16.802 18.055 19.507 21.212 23.109 25.361 28.132 31.672 34.667 36.397 37.506 38.241 38.721 39.021 39.207 39.318 39.362 39.368 39.367 39.344 39.306 39.249 39.181 39.101 39.025 38.952 38.864 38.763 38.678 38.597 38.503 38.42 38.338 38.244 38.132 38.008 37.919 37.827 37.678 37.566 37.438 37.372 37.222 37.069 36.917 36.833 36.374 36.59 36.5 36.402 36.189 36.06 35.92 35.759 35.578 35.365 35.043 34.035 -7 ,7626 ,TETRA ,17603908,Sun Nov 28 17:07:54 CET,Sun Nov 28 18:59:12 CET,0.0 1.014 1.384 1.671 1.901 2.103 2.298 2.476 2.81 2.975 3.13 2.998 3.55 3.678 3.927 4.167 4.398 4.508 4.725 4.941 5.25 5.457 5.675 6.007 6.324 6.625 6.921 7.213 7.59 7.958 8.314 8.728 9.131 9.544 10.026 10.574 11.115 11.73 12.41 13.134 13.896 14.78 15.838 16.88 18.118 19.563 21.251 23.213 25.546 28.258 31.712 34.639 36.405 37.572 38.31 38.774 39.077 39.323 39.482 39.558 39.586 39.597 39.584 39.554 39.509 39.449 39.374 39.303 39.234 39.158 39.065 38.979 38.897 38.798 38.705 38.617 38.519 38.388 38.253 38.165 38.064 37.919 37.821 37.705 37.647 37.521 37.371 37.207 37.127 36.668 36.852 36.755 36.659 36.451 36.34 36.201 36.031 35.844 35.616 35.267 34.038 -8 ,10587 ,TETRA ,17603909,Sun Nov 28 17:07:50 CET,Sun Nov 28 18:59:43 CET,0.0 1.073 1.415 1.681 1.901 2.105 2.299 2.478 2.816 2.98 3.128 2.991 3.547 3.674 3.922 4.175 4.409 4.518 4.743 4.971 5.313 5.535 5.741 6.043 6.338 6.63 6.91 7.181 7.551 7.928 8.291 8.72 9.14 9.557 10.04 10.569 11.097 11.698 12.352 13.067 13.823 14.661 15.675 16.733 17.997 19.455 21.163 23.112 25.457 28.311 31.856 34.725 36.425 37.565 38.318 38.832 39.146 39.333 39.464 39.557 39.596 39.609 39.604 39.583 39.546 39.495 39.431 39.361 39.286 39.216 39.137 39.063 38.978 38.886 38.816 38.731 38.644 38.561 38.471 38.406 38.334 38.216 38.13 38.029 37.975 37.858 37.74 37.61 37.533 37.079 37.274 37.175 37.072 36.832 36.703 36.563 36.391 36.202 35.971 35.668 34.579 -9 ,7773 ,TETRA ,17603910,Sun Nov 28 17:07:55 CET,Sun Nov 28 18:59:44 CET,0.0 1.302 1.634 1.9 2.11 2.305 2.492 2.677 3.022 3.175 3.311 3.158 3.708 3.838 4.093 4.332 4.56 4.673 4.902 5.123 5.446 5.661 5.877 6.2 6.506 6.806 7.091 7.367 7.745 8.127 8.501 8.938 9.351 9.756 10.218 10.74 11.275 11.87 12.525 13.245 13.998 14.846 15.836 16.864 18.134 19.59 21.288 23.213 25.547 28.426 31.966 34.86 36.581 37.697 38.418 38.933 39.28 39.514 39.647 39.718 39.764 39.794 39.782 39.748 39.707 39.669 39.608 39.531 39.452 39.357 39.251 39.157 39.061 38.957 38.874 38.79 38.701 38.601 38.479 38.385 38.295 38.145 38.035 37.928 37.87 37.753 37.621 37.463 37.37 36.893 37.065 36.955 36.826 36.568 36.437 36.299 36.124 35.894 35.581 35.157 33.947 -10 ,23635 ,TETRA ,17603911,Sun Nov 28 17:07:51 CET,Sun Nov 28 18:59:06 CET,0.0 1.022 1.373 1.631 1.858 2.065 2.251 2.421 2.738 2.89 3.037 2.896 3.451 3.585 3.836 4.071 4.302 4.42 4.65 4.873 5.189 5.396 5.608 5.914 6.21 6.499 6.786 7.071 7.437 7.792 8.148 8.589 9.012 9.413 9.884 10.424 10.951 11.533 12.177 12.886 13.644 14.535 15.61 16.679 17.907 19.287 20.96 22.923 25.282 28.13 31.609 34.451 36.108 37.242 37.995 38.454 38.727 38.933 39.062 39.132 39.151 39.141 39.108 39.049 38.985 38.915 38.824 38.747 38.674 38.582 38.473 38.376 38.268 38.157 38.069 37.956 37.832 37.71 37.576 37.477 37.376 37.212 37.09 36.964 36.9 36.77 36.617 36.445 36.351 35.881 36.072 35.977 35.874 35.649 35.511 35.354 35.194 35.008 34.773 34.402 32.83 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index a30d3a21..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32280 ,TETRA ,17603913,Sun Nov 28 17:07:53 CET,Sun Nov 28 18:59:01 CET,0.0 1.738 2.253 2.631 2.944 3.251 3.518 3.739 4.133 4.341 4.548 4.49 5.06 5.222 5.564 5.878 6.16 6.296 6.563 6.826 7.205 7.442 7.671 8.007 8.332 8.67 9.004 9.31 9.708 10.107 10.501 10.966 11.417 11.862 12.389 12.989 13.56 14.187 14.861 15.6 16.429 17.381 18.458 19.545 20.864 22.384 24.181 26.287 28.846 31.97 36.022 39.499 41.557 42.923 43.803 44.425 44.9 45.248 45.466 45.635 45.735 45.782 45.812 45.81 45.783 45.725 45.608 45.478 45.36 45.24 45.108 44.994 44.867 44.738 44.648 44.558 44.46 44.348 44.227 44.137 44.037 43.872 43.754 43.626 43.56 43.422 43.24 43.036 42.943 42.476 42.581 42.429 42.281 41.963 41.777 41.525 41.194 40.853 40.426 39.843 37.96 -2 ,85 ,TETRA ,17603914,Sun Nov 28 17:07:51 CET,Sun Nov 28 18:59:43 CET,0.0 1.658 2.109 2.459 2.767 3.044 3.3 3.542 3.973 4.164 4.349 4.278 4.867 5.022 5.314 5.597 5.872 6.009 6.264 6.509 6.872 7.101 7.324 7.653 7.972 8.286 8.599 8.908 9.305 9.695 10.076 10.541 11.025 11.506 12.043 12.646 13.238 13.89 14.604 15.394 16.211 17.12 18.202 19.324 20.707 22.293 24.095 26.187 28.746 31.861 35.871 39.417 41.532 42.852 43.765 44.428 44.848 45.116 45.299 45.436 45.509 45.56 45.59 45.616 45.629 45.604 45.538 45.462 45.404 45.339 45.262 45.18 45.064 44.953 44.867 44.758 44.638 44.5 44.332 44.223 44.123 43.938 43.786 43.636 43.564 43.418 43.259 43.087 42.999 42.536 42.681 42.566 42.43 42.109 41.934 41.745 41.506 41.164 40.72 40.14 37.557 -3 ,9728 ,TETRA ,17603915,Sun Nov 28 17:07:53 CET,Sun Nov 28 18:59:58 CET,0.0 1.411 1.867 2.229 2.56 2.837 3.072 3.291 3.716 3.915 4.094 4.019 4.604 4.76 5.079 5.401 5.707 5.854 6.131 6.388 6.743 6.981 7.219 7.547 7.861 8.164 8.465 8.76 9.134 9.495 9.853 10.295 10.728 11.148 11.652 12.245 12.821 13.459 14.146 14.885 15.694 16.621 17.725 18.883 20.219 21.711 23.529 25.645 28.221 31.35 35.276 38.728 40.78 42.102 43.036 43.688 44.124 44.454 44.672 44.822 44.913 44.966 44.975 44.952 44.927 44.886 44.821 44.731 44.623 44.499 44.383 44.299 44.215 44.117 44.032 43.944 43.84 43.719 43.607 43.524 43.429 43.254 43.136 43.028 42.964 42.817 42.65 42.45 42.344 41.861 41.955 41.803 41.633 41.294 41.109 40.903 40.671 40.374 39.972 39.349 37.171 -4 ,23202 ,TETRA ,17603916,Sun Nov 28 17:07:54 CET,Sun Nov 28 18:58:58 CET,0.0 1.366 1.85 2.242 2.605 2.918 3.206 3.484 3.939 4.139 4.329 4.254 4.823 4.982 5.291 5.586 5.877 6.021 6.311 6.59 6.961 7.191 7.422 7.76 8.102 8.431 8.75 9.056 9.441 9.814 10.188 10.644 11.088 11.535 12.048 12.626 13.202 13.839 14.525 15.261 16.049 16.97 18.075 19.199 20.537 22.06 23.849 25.938 28.532 31.685 35.583 38.882 40.937 42.29 43.207 43.894 44.365 44.68 44.876 45.027 45.127 45.172 45.183 45.161 45.124 45.088 45.029 44.955 44.876 44.779 44.666 44.561 44.463 44.372 44.277 44.155 44.038 43.931 43.807 43.71 43.601 43.408 43.275 43.147 43.077 42.923 42.757 42.559 42.457 41.998 42.167 42.058 41.929 41.633 41.43 41.183 40.903 40.562 40.172 39.64 35.909 -5 ,13420 ,TETRA ,17603917,Sun Nov 28 17:07:56 CET,Sun Nov 28 18:58:44 CET,0.0 1.542 2.067 2.439 2.751 3.045 3.326 3.567 3.956 4.137 4.319 4.233 4.813 4.97 5.26 5.545 5.833 5.97 6.236 6.491 6.849 7.088 7.315 7.628 7.94 8.29 8.643 8.949 9.333 9.713 10.085 10.536 10.976 11.408 11.917 12.5 13.067 13.692 14.383 15.137 15.947 16.875 17.982 19.129 20.511 22.082 23.929 26.087 28.697 31.774 35.647 39.155 41.314 42.701 43.601 44.226 44.669 44.982 45.184 45.339 45.441 45.495 45.495 45.465 45.428 45.381 45.329 45.266 45.189 45.101 45.002 44.91 44.807 44.69 44.597 44.506 44.413 44.308 44.187 44.105 44.011 43.833 43.716 43.587 43.511 43.359 43.204 43.041 42.951 42.483 42.591 42.443 42.282 41.913 41.712 41.483 41.226 40.932 40.514 39.889 36.924 -6 ,11697 ,TETRA ,17603918,Sun Nov 28 17:07:51 CET,Sun Nov 28 18:58:25 CET,0.0 1.476 1.986 2.383 2.707 2.995 3.254 3.478 3.879 4.069 4.248 4.154 4.722 4.875 5.177 5.447 5.705 5.838 6.12 6.38 6.724 6.951 7.173 7.503 7.829 8.134 8.431 8.719 9.089 9.459 9.813 10.24 10.688 11.161 11.716 12.327 12.9 13.513 14.186 14.923 15.71 16.632 17.738 18.853 20.203 21.748 23.588 25.715 28.261 31.414 35.437 38.837 40.872 42.214 43.161 43.835 44.291 44.638 44.85 44.982 45.053 45.086 45.096 45.093 45.075 45.04 44.973 44.892 44.811 44.722 44.619 44.526 44.42 44.293 44.202 44.108 43.996 43.878 43.757 43.669 43.574 43.426 43.321 43.207 43.131 42.969 42.789 42.55 42.424 41.948 42.076 41.944 41.805 41.488 41.295 41.066 40.784 40.476 40.116 39.591 37.415 -7 ,13160 ,TETRA ,17603919,Sun Nov 28 17:07:51 CET,Sun Nov 28 18:59:44 CET,0.0 1.562 2.064 2.443 2.728 2.995 3.253 3.488 3.911 4.097 4.284 4.212 4.782 4.937 5.238 5.5 5.771 5.907 6.16 6.41 6.754 6.973 7.194 7.535 7.876 8.191 8.5 8.802 9.201 9.604 9.994 10.459 10.903 11.344 11.862 12.435 13.007 13.656 14.362 15.118 15.92 16.836 17.939 19.084 20.433 21.946 23.757 25.85 28.362 31.473 35.47 39.005 41.145 42.473 43.358 44.001 44.441 44.75 44.961 45.105 45.187 45.228 45.223 45.186 45.153 45.132 45.066 44.972 44.907 44.841 44.759 44.684 44.588 44.483 44.4 44.301 44.188 44.07 43.944 43.857 43.762 43.59 43.465 43.33 43.265 43.101 42.904 42.708 42.592 42.107 42.203 42.042 41.878 41.537 41.335 41.09 40.777 40.41 40.021 39.471 37.358 -8 ,12652 ,TETRA ,17603920,Sun Nov 28 17:07:54 CET,Sun Nov 28 19:01:03 CET,0.0 2.053 2.53 2.928 3.284 3.586 3.845 4.068 4.487 4.672 4.846 4.773 5.358 5.519 5.812 6.101 6.374 6.508 6.785 7.054 7.433 7.703 7.965 8.307 8.635 8.959 9.279 9.585 9.974 10.36 10.756 11.238 11.678 12.102 12.61 13.214 13.805 14.451 15.159 15.903 16.695 17.618 18.72 19.863 21.205 22.735 24.578 26.711 29.256 32.378 36.462 40.009 42.081 43.428 44.343 44.985 45.419 45.749 45.965 46.112 46.199 46.246 46.265 46.248 46.219 46.174 46.102 46.03 45.957 45.878 45.794 45.714 45.618 45.504 45.412 45.303 45.176 45.033 44.879 44.771 44.657 44.49 44.368 44.222 44.135 43.964 43.786 43.582 43.475 42.987 43.05 42.878 42.702 42.35 42.16 41.961 41.739 41.431 41.034 40.517 38.703 -9 ,19186 ,TETRA ,17603921,Sun Nov 28 17:07:55 CET,Sun Nov 28 19:00:02 CET,0.0 1.847 2.32 2.695 3.002 3.291 3.57 3.837 4.279 4.455 4.619 4.509 5.077 5.234 5.538 5.835 6.115 6.253 6.516 6.767 7.15 7.392 7.618 7.954 8.281 8.593 8.894 9.185 9.576 9.961 10.331 10.794 11.25 11.686 12.197 12.782 13.353 13.986 14.676 15.419 16.211 17.143 18.257 19.392 20.732 22.245 24.053 26.159 28.716 31.874 35.959 39.542 41.702 43.044 43.907 44.521 44.98 45.301 45.483 45.611 45.671 45.707 45.728 45.718 45.677 45.608 45.542 45.489 45.423 45.337 45.246 45.161 45.062 44.97 44.894 44.795 44.669 44.516 44.353 44.259 44.17 44.01 43.882 43.736 43.667 43.528 43.378 43.212 43.118 42.649 42.743 42.592 42.449 42.136 41.947 41.72 41.471 41.158 40.767 40.253 38.004 -10 ,1680 ,TETRA ,17603922,Sun Nov 28 17:07:52 CET,Sun Nov 28 18:58:55 CET,0.0 1.828 2.382 2.804 3.126 3.409 3.683 3.93 4.366 4.568 4.765 4.708 5.281 5.438 5.759 6.062 6.337 6.466 6.727 7.0 7.382 7.611 7.839 8.182 8.522 8.855 9.185 9.501 9.903 10.296 10.678 11.132 11.56 11.991 12.499 13.083 13.656 14.283 14.97 15.72 16.518 17.444 18.561 19.683 21.02 22.563 24.41 26.543 29.057 32.149 36.145 39.624 41.756 43.115 43.998 44.616 45.025 45.308 45.492 45.627 45.706 45.76 45.803 45.821 45.805 45.76 45.712 45.666 45.599 45.522 45.431 45.336 45.246 45.156 45.078 44.991 44.897 44.784 44.646 44.542 44.439 44.268 44.126 43.984 43.921 43.78 43.608 43.408 43.29 42.811 42.949 42.819 42.665 42.311 42.107 41.879 41.627 41.312 40.911 40.326 37.554 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt deleted file mode 100644 index d63105d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21863 ,TETRA ,17603923,Sun Nov 28 17:07:55 CET,Sun Nov 28 18:57:47 CET,0.0 2.349 3.057 3.545 3.947 4.306 4.619 4.895 5.382 5.594 5.799 5.788 6.363 6.543 6.856 7.122 7.396 7.529 7.769 8.0 8.37 8.604 8.815 9.131 9.43 9.712 9.976 10.215 10.524 10.824 11.106 11.449 11.791 12.091 12.45 12.877 13.237 13.619 14.057 14.503 14.926 15.43 16.038 16.601 17.249 18.0 18.851 19.738 20.766 21.861 22.944 23.646 23.834 23.792 23.641 23.421 23.209 22.973 22.717 22.49 22.314 22.141 21.945 21.731 21.525 21.329 21.109 20.922 20.76 20.594 20.408 20.245 20.085 19.915 19.781 19.648 19.505 19.346 19.177 19.057 18.934 18.751 18.619 18.48 18.41 18.254 18.07 17.893 17.8 17.304 17.464 17.328 17.184 16.886 16.709 16.507 16.3 16.078 15.788 15.381 12.136 -2 ,28315 ,TETRA ,17603924,Sun Nov 28 17:07:56 CET,Sun Nov 28 18:57:58 CET,0.0 2.264 2.898 3.382 3.815 4.184 4.499 4.779 5.268 5.502 5.727 5.709 6.28 6.463 6.795 7.099 7.395 7.534 7.805 8.042 8.346 8.547 8.754 9.054 9.335 9.601 9.855 10.087 10.379 10.655 10.908 11.231 11.546 11.846 12.202 12.587 12.941 13.319 13.719 14.14 14.583 15.071 15.624 16.172 16.833 17.582 18.38 19.195 20.155 21.266 22.397 23.018 23.174 23.211 23.131 22.924 22.731 22.545 22.346 22.139 21.924 21.705 21.491 21.306 21.134 20.954 20.75 20.568 20.407 20.231 20.05 19.885 19.717 19.551 19.41 19.245 19.064 18.883 18.692 18.566 18.441 18.237 18.078 17.911 17.825 17.64 17.451 17.262 17.161 16.666 16.84 16.724 16.606 16.376 16.25 16.119 15.974 15.779 15.504 15.122 13.198 -3 ,3497 ,TETRA ,17603925,Sun Nov 28 17:07:52 CET,Sun Nov 28 18:57:48 CET,0.0 3.182 3.952 4.503 4.954 5.345 5.67 5.967 6.484 6.687 6.862 6.791 7.338 7.479 7.751 8.005 8.243 8.357 8.573 8.786 9.093 9.275 9.447 9.716 9.976 10.205 10.421 10.629 10.915 11.209 11.492 11.828 12.152 12.461 12.812 13.197 13.55 13.922 14.342 14.794 15.249 15.752 16.313 16.872 17.548 18.293 19.093 19.923 20.853 21.924 23.062 23.656 23.803 23.779 23.657 23.484 23.274 23.059 22.855 22.605 22.382 22.197 21.975 21.74 21.551 21.379 21.197 21.031 20.889 20.744 20.582 20.437 20.27 20.099 19.977 19.843 19.691 19.521 19.347 19.235 19.115 18.924 18.783 18.622 18.54 18.38 18.199 18.015 17.926 17.446 17.62 17.503 17.362 17.0 16.815 16.649 16.469 16.229 15.887 15.4 13.421 -4 ,5287 ,TETRA ,17603926,Sun Nov 28 17:07:53 CET,Sun Nov 28 18:57:46 CET,0.0 1.778 2.509 3.031 3.433 3.759 4.047 4.311 4.808 5.04 5.256 5.261 5.82 5.973 6.279 6.555 6.811 6.938 7.181 7.394 7.679 7.86 8.049 8.335 8.606 8.861 9.104 9.324 9.604 9.876 10.138 10.451 10.746 11.011 11.312 11.663 12.006 12.394 12.798 13.206 13.659 14.192 14.79 15.352 15.998 16.695 17.471 18.367 19.359 20.393 21.522 22.263 22.476 22.448 22.329 22.157 21.954 21.701 21.454 21.222 20.999 20.795 20.59 20.366 20.159 19.982 19.831 19.689 19.544 19.397 19.253 19.121 18.977 18.816 18.688 18.566 18.438 18.302 18.154 18.056 17.947 17.769 17.661 17.545 17.476 17.341 17.194 17.017 16.928 16.449 16.658 16.556 16.43 16.151 16.001 15.835 15.655 15.45 15.204 14.807 12.733 -5 ,27577 ,TETRA ,17603927,Sun Nov 28 17:07:54 CET,Sun Nov 28 18:57:57 CET,0.0 1.854 2.539 3.02 3.402 3.739 4.059 4.347 4.831 5.047 5.259 5.258 5.812 5.97 6.29 6.592 6.88 7.017 7.283 7.526 7.866 8.099 8.318 8.628 8.907 9.164 9.41 9.644 9.941 10.227 10.498 10.811 11.121 11.405 11.714 12.086 12.463 12.877 13.308 13.748 14.228 14.767 15.362 15.935 16.625 17.355 18.157 19.038 19.972 20.962 21.931 22.576 22.779 22.748 22.608 22.438 22.24 22.011 21.828 21.636 21.409 21.174 20.962 20.77 20.583 20.396 20.208 20.039 19.878 19.7 19.526 19.381 19.205 19.002 18.839 18.677 18.517 18.355 18.197 18.086 17.966 17.787 17.65 17.493 17.415 17.25 17.064 16.872 16.773 16.288 16.456 16.33 16.213 15.941 15.758 15.555 15.32 15.052 14.727 14.306 12.473 -6 ,7111 ,TETRA ,17603928,Sun Nov 28 17:08:18 CET,Sun Nov 28 18:58:59 CET,0.0 2.321 2.975 3.473 3.905 4.268 4.59 4.885 5.389 5.62 5.84 5.847 6.422 6.596 6.912 7.218 7.51 7.647 7.909 8.154 8.503 8.725 8.943 9.23 9.493 9.756 9.996 10.217 10.507 10.788 11.056 11.356 11.66 11.967 12.286 12.629 12.968 13.334 13.736 14.182 14.649 15.201 15.826 16.391 17.048 17.744 18.502 19.34 20.342 21.471 22.526 23.182 23.392 23.343 23.273 23.152 22.989 22.788 22.585 22.353 22.12 21.924 21.728 21.532 21.348 21.168 20.953 20.75 20.572 20.397 20.211 20.062 19.921 19.769 19.657 19.535 19.404 19.265 19.113 19.01 18.897 18.713 18.583 18.444 18.374 18.234 18.084 17.904 17.811 17.337 17.541 17.434 17.31 17.031 16.879 16.692 16.458 16.202 15.888 15.453 13.69 -7 ,13850 ,TETRA ,17603929,Sun Nov 28 17:08:21 CET,Sun Nov 28 18:59:01 CET,0.0 2.818 3.602 4.137 4.547 4.884 5.186 5.467 5.968 6.179 6.362 6.288 6.84 6.987 7.267 7.516 7.756 7.885 8.135 8.369 8.692 8.893 9.094 9.389 9.644 9.892 10.13 10.348 10.634 10.914 11.184 11.498 11.834 12.159 12.505 12.874 13.213 13.601 14.01 14.428 14.866 15.372 15.963 16.524 17.145 17.81 18.581 19.491 20.543 21.615 22.628 23.235 23.401 23.419 23.355 23.188 23.009 22.806 22.577 22.325 22.103 21.913 21.731 21.541 21.345 21.168 20.971 20.786 20.628 20.464 20.275 20.105 19.921 19.732 19.6 19.47 19.337 19.199 19.043 18.932 18.822 18.644 18.523 18.393 18.316 18.156 17.999 17.835 17.746 17.271 17.454 17.329 17.198 16.918 16.766 16.612 16.431 16.207 15.938 15.571 13.844 -8 ,22472 ,TETRA ,17603930,Sun Nov 28 17:08:23 CET,Sun Nov 28 18:58:37 CET,0.0 2.087 2.784 3.288 3.686 4.046 4.368 4.664 5.187 5.406 5.617 5.609 6.172 6.343 6.677 7.0 7.309 7.452 7.703 7.929 8.266 8.481 8.674 8.938 9.195 9.459 9.718 9.957 10.255 10.553 10.843 11.184 11.502 11.799 12.135 12.507 12.858 13.236 13.655 14.116 14.571 15.057 15.627 16.2 16.866 17.584 18.357 19.165 20.057 21.105 22.271 23.003 23.207 23.151 22.993 22.798 22.569 22.323 22.079 21.813 21.576 21.364 21.166 20.969 20.776 20.592 20.39 20.199 20.019 19.818 19.612 19.454 19.31 19.159 19.024 18.874 18.724 18.574 18.408 18.286 18.154 17.935 17.792 17.661 17.592 17.449 17.309 17.152 17.07 16.606 16.813 16.71 16.594 16.305 16.137 15.964 15.783 15.561 15.276 14.819 12.237 -9 ,859 ,TETRA ,17603931,Sun Nov 28 17:08:18 CET,Sun Nov 28 18:57:57 CET,0.0 2.439 3.17 3.674 4.113 4.474 4.789 5.093 5.613 5.824 6.04 6.038 6.598 6.761 7.073 7.372 7.648 7.783 8.041 8.288 8.64 8.847 9.05 9.34 9.621 9.889 10.139 10.388 10.701 10.989 11.266 11.598 11.911 12.204 12.54 12.912 13.267 13.657 14.071 14.5 14.936 15.426 15.996 16.548 17.181 17.89 18.668 19.488 20.398 21.463 22.609 23.262 23.467 23.485 23.399 23.226 22.991 22.731 22.531 22.331 22.118 21.911 21.716 21.533 21.349 21.175 20.974 20.778 20.61 20.44 20.271 20.126 19.961 19.777 19.638 19.502 19.352 19.173 18.984 18.855 18.717 18.519 18.402 18.274 18.212 18.087 17.948 17.783 17.687 17.198 17.352 17.222 17.08 16.746 16.56 16.381 16.184 15.935 15.614 15.118 12.83 -10 ,23977 ,TETRA ,17603932,Sun Nov 28 17:08:18 CET,Sun Nov 28 18:59:01 CET,0.0 1.618 2.295 2.804 3.224 3.574 3.877 4.151 4.636 4.869 5.092 5.077 5.647 5.829 6.19 6.502 6.784 6.927 7.192 7.424 7.759 7.977 8.19 8.487 8.769 9.049 9.314 9.559 9.864 10.153 10.438 10.786 11.117 11.444 11.814 12.213 12.61 13.032 13.477 13.962 14.457 14.988 15.579 16.146 16.797 17.531 18.342 19.199 20.181 21.284 22.444 23.169 23.416 23.444 23.374 23.223 23.049 22.86 22.649 22.424 22.22 22.032 21.868 21.676 21.477 21.297 21.094 20.926 20.782 20.613 20.436 20.294 20.133 19.965 19.836 19.697 19.541 19.367 19.191 19.072 18.946 18.742 18.607 18.46 18.374 18.204 18.03 17.836 17.733 17.245 17.41 17.278 17.143 16.842 16.675 16.508 16.32 16.102 15.803 15.305 13.686 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt deleted file mode 100644 index 3a9ecfaa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20631 ,TETRA ,17603933,Sun Nov 28 17:08:20 CET,Sun Nov 28 18:59:41 CET,0.0 0.369 0.551 0.671 0.77 0.858 0.941 1.022 1.165 1.229 1.285 0.996 1.422 1.472 1.576 1.683 1.793 1.837 1.913 1.994 2.099 2.157 2.218 2.313 2.405 2.492 2.574 2.648 2.735 2.817 2.905 3.009 3.089 3.143 3.197 3.255 3.308 3.371 3.425 3.488 3.538 3.575 3.606 3.601 3.549 3.463 3.324 3.083 2.708 2.029 0.716 -0.849 -2.113 -3.236 -4.227 -5.052 -5.757 -6.401 -6.929 -7.454 -7.91 -8.313 -8.678 -9.006 -9.318 -9.602 -9.891 -10.153 -10.383 -10.62 -10.859 -11.05 -11.245 -11.448 -11.613 -11.775 -11.931 -12.106 -12.311 -12.448 -12.575 -12.765 -12.894 -13.033 -13.111 -13.269 -13.42 -13.571 -13.648 -14.125 -13.907 -13.999 -14.1 -14.346 -14.467 -14.6 -14.759 -14.91 -15.045 -15.199 -15.469 -2 ,19616 ,TETRA ,17603934,Sun Nov 28 17:08:19 CET,Sun Nov 28 18:59:25 CET,0.0 0.331 0.469 0.583 0.693 0.804 0.912 1.011 1.192 1.272 1.341 1.095 1.532 1.593 1.703 1.817 1.915 1.959 2.056 2.143 2.252 2.321 2.385 2.474 2.563 2.641 2.711 2.772 2.858 2.935 3.005 3.094 3.175 3.244 3.315 3.391 3.457 3.523 3.585 3.638 3.68 3.712 3.745 3.758 3.761 3.718 3.549 3.295 2.891 2.211 0.988 -0.583 -1.921 -3.04 -3.955 -4.786 -5.501 -6.13 -6.658 -7.168 -7.609 -7.984 -8.321 -8.654 -8.982 -9.272 -9.552 -9.804 -10.029 -10.263 -10.497 -10.69 -10.898 -11.106 -11.259 -11.414 -11.578 -11.738 -11.891 -11.994 -12.099 -12.26 -12.371 -12.491 -12.553 -12.675 -12.804 -12.933 -13.0 -13.472 -13.216 -13.287 -13.362 -13.525 -13.619 -13.72 -13.815 -13.922 -14.035 -14.173 -14.401 -3 ,1213 ,TETRA ,17603935,Sun Nov 28 17:08:22 CET,Sun Nov 28 18:59:58 CET,0.0 0.213 0.353 0.463 0.555 0.645 0.738 0.829 0.97 1.03 1.09 0.803 1.226 1.273 1.36 1.431 1.488 1.523 1.597 1.658 1.755 1.825 1.896 1.987 2.07 2.154 2.23 2.305 2.401 2.492 2.575 2.657 2.731 2.806 2.886 2.97 3.047 3.106 3.155 3.2 3.232 3.255 3.247 3.224 3.178 3.084 2.934 2.683 2.236 1.515 0.23 -1.407 -2.707 -3.827 -4.789 -5.628 -6.324 -6.916 -7.444 -7.958 -8.386 -8.759 -9.108 -9.448 -9.772 -10.064 -10.358 -10.614 -10.835 -11.059 -11.284 -11.464 -11.648 -11.845 -11.993 -12.137 -12.283 -12.441 -12.606 -12.712 -12.815 -12.983 -13.105 -13.221 -13.277 -13.402 -13.539 -13.672 -13.741 -14.211 -13.945 -14.009 -14.076 -14.233 -14.33 -14.422 -14.52 -14.654 -14.788 -14.948 -15.199 -4 ,9102 ,TETRA ,17603936,Sun Nov 28 17:08:24 CET,Sun Nov 28 18:59:16 CET,0.0 0.376 0.584 0.697 0.798 0.9 0.979 1.038 1.14 1.19 1.24 0.96 1.383 1.417 1.485 1.556 1.624 1.655 1.718 1.794 1.896 1.948 2.002 2.081 2.149 2.221 2.291 2.354 2.439 2.516 2.585 2.666 2.74 2.811 2.903 2.996 3.065 3.146 3.241 3.322 3.371 3.404 3.417 3.414 3.379 3.275 3.101 2.842 2.413 1.696 0.361 -1.283 -2.576 -3.668 -4.61 -5.43 -6.133 -6.741 -7.264 -7.785 -8.227 -8.625 -9.005 -9.358 -9.659 -9.916 -10.203 -10.457 -10.671 -10.905 -11.144 -11.335 -11.523 -11.719 -11.885 -12.053 -12.23 -12.405 -12.572 -12.693 -12.819 -13.016 -13.16 -13.303 -13.372 -13.527 -13.699 -13.872 -13.957 -14.44 -14.236 -14.336 -14.439 -14.66 -14.778 -14.911 -15.072 -15.269 -15.491 -15.738 -16.232 -5 ,5457 ,TETRA ,17603937,Sun Nov 28 17:08:20 CET,Sun Nov 28 18:59:55 CET,0.0 0.435 0.604 0.726 0.825 0.908 0.988 1.076 1.232 1.29 1.336 1.045 1.479 1.535 1.638 1.73 1.83 1.88 1.961 2.037 2.148 2.225 2.306 2.406 2.484 2.558 2.628 2.699 2.786 2.865 2.933 3.011 3.067 3.119 3.191 3.27 3.339 3.411 3.471 3.512 3.561 3.598 3.615 3.606 3.566 3.469 3.301 3.046 2.611 1.872 0.556 -1.036 -2.364 -3.53 -4.502 -5.335 -6.052 -6.697 -7.244 -7.781 -8.226 -8.625 -9.004 -9.344 -9.661 -9.941 -10.233 -10.491 -10.706 -10.943 -11.183 -11.376 -11.572 -11.766 -11.918 -12.077 -12.239 -12.403 -12.59 -12.725 -12.856 -13.049 -13.182 -13.331 -13.41 -13.573 -13.741 -13.902 -13.978 -14.459 -14.248 -14.353 -14.463 -14.704 -14.847 -14.991 -15.146 -15.305 -15.468 -15.668 -16.165 -6 ,3762 ,TETRA ,17603938,Sun Nov 28 17:08:20 CET,Sun Nov 28 18:59:15 CET,0.0 0.327 0.525 0.718 0.883 1.028 1.152 1.253 1.432 1.513 1.596 1.377 1.835 1.899 2.001 2.102 2.195 2.241 2.325 2.398 2.503 2.574 2.639 2.72 2.805 2.886 2.959 3.021 3.108 3.196 3.266 3.357 3.436 3.504 3.579 3.658 3.734 3.806 3.869 3.928 3.974 3.995 3.999 3.995 3.962 3.9 3.765 3.5 3.075 2.375 1.075 -0.52 -1.807 -2.914 -3.843 -4.662 -5.373 -5.979 -6.506 -7.026 -7.448 -7.826 -8.184 -8.515 -8.824 -9.107 -9.396 -9.664 -9.906 -10.141 -10.372 -10.559 -10.749 -10.95 -11.102 -11.268 -11.442 -11.61 -11.774 -11.888 -12.003 -12.167 -12.281 -12.399 -12.465 -12.59 -12.707 -12.831 -12.89 -13.349 -13.099 -13.183 -13.263 -13.416 -13.505 -13.604 -13.702 -13.801 -13.909 -14.051 -14.312 -7 ,18273 ,TETRA ,17603939,Sun Nov 28 17:08:21 CET,Sun Nov 28 18:59:00 CET,0.0 0.395 0.521 0.622 0.71 0.787 0.857 0.921 1.052 1.113 1.173 0.906 1.336 1.381 1.464 1.554 1.65 1.689 1.763 1.834 1.937 2.003 2.063 2.144 2.228 2.3 2.368 2.432 2.508 2.591 2.667 2.748 2.819 2.884 2.951 3.013 3.077 3.152 3.229 3.291 3.329 3.362 3.382 3.392 3.376 3.293 3.145 2.904 2.471 1.727 0.403 -1.193 -2.517 -3.637 -4.569 -5.363 -6.061 -6.694 -7.221 -7.734 -8.152 -8.549 -8.938 -9.283 -9.59 -9.874 -10.186 -10.444 -10.66 -10.881 -11.11 -11.293 -11.47 -11.655 -11.795 -11.931 -12.075 -12.233 -12.392 -12.497 -12.611 -12.781 -12.888 -13.0 -13.063 -13.187 -13.297 -13.421 -13.491 -13.961 -13.717 -13.797 -13.885 -14.067 -14.157 -14.248 -14.345 -14.462 -14.592 -14.717 -15.005 -8 ,5456 ,TETRA ,17603940,Sun Nov 28 17:08:24 CET,Sun Nov 28 18:59:01 CET,0.0 0.583 0.814 0.997 1.147 1.275 1.399 1.507 1.695 1.787 1.868 1.614 2.045 2.1 2.213 2.309 2.399 2.448 2.531 2.607 2.732 2.814 2.883 2.975 3.054 3.124 3.195 3.267 3.361 3.441 3.51 3.594 3.669 3.738 3.822 3.905 3.977 4.048 4.117 4.165 4.21 4.255 4.298 4.317 4.284 4.204 4.055 3.821 3.409 2.668 1.33 -0.281 -1.607 -2.769 -3.72 -4.502 -5.184 -5.796 -6.318 -6.829 -7.249 -7.639 -8.02 -8.367 -8.687 -8.98 -9.277 -9.523 -9.741 -9.968 -10.195 -10.395 -10.603 -10.825 -10.996 -11.153 -11.317 -11.495 -11.678 -11.808 -11.938 -12.115 -12.231 -12.349 -12.407 -12.531 -12.675 -12.827 -12.895 -13.368 -13.136 -13.214 -13.289 -13.453 -13.55 -13.653 -13.751 -13.85 -13.965 -14.107 -14.33 -9 ,26965 ,TETRA ,17603941,Sun Nov 28 17:08:25 CET,Sun Nov 28 18:59:16 CET,0.0 0.279 0.434 0.57 0.706 0.803 0.889 0.967 1.089 1.15 1.204 0.926 1.364 1.414 1.484 1.566 1.659 1.701 1.788 1.87 1.986 2.055 2.118 2.219 2.314 2.394 2.475 2.554 2.641 2.725 2.808 2.897 2.971 3.033 3.097 3.173 3.243 3.298 3.355 3.429 3.489 3.528 3.556 3.557 3.536 3.492 3.347 3.063 2.615 1.916 0.686 -0.903 -2.216 -3.325 -4.267 -5.079 -5.764 -6.379 -6.909 -7.426 -7.861 -8.248 -8.606 -8.932 -9.239 -9.508 -9.784 -10.034 -10.256 -10.484 -10.713 -10.903 -11.103 -11.313 -11.47 -11.634 -11.81 -11.983 -12.148 -12.263 -12.389 -12.582 -12.714 -12.854 -12.923 -13.06 -13.201 -13.348 -13.42 -13.892 -13.645 -13.721 -13.803 -13.982 -14.068 -14.15 -14.247 -14.371 -14.522 -14.693 -14.96 -10 ,25991 ,TETRA ,17603942,Sun Nov 28 17:08:20 CET,Sun Nov 28 18:59:04 CET,0.0 0.329 0.493 0.613 0.718 0.802 0.896 0.991 1.138 1.209 1.265 0.979 1.409 1.452 1.536 1.61 1.675 1.711 1.78 1.836 1.909 1.954 2.007 2.079 2.137 2.193 2.25 2.308 2.386 2.454 2.514 2.589 2.667 2.74 2.806 2.862 2.92 2.972 3.011 3.054 3.099 3.136 3.157 3.158 3.115 3.008 2.826 2.54 2.088 1.416 0.194 -1.353 -2.637 -3.752 -4.7 -5.523 -6.221 -6.845 -7.382 -7.898 -8.324 -8.714 -9.098 -9.445 -9.747 -10.009 -10.278 -10.516 -10.74 -10.98 -11.214 -11.394 -11.591 -11.805 -11.966 -12.134 -12.302 -12.479 -12.663 -12.79 -12.919 -13.125 -13.269 -13.395 -13.457 -13.587 -13.716 -13.862 -13.94 -14.407 -14.156 -14.236 -14.309 -14.478 -14.58 -14.675 -14.777 -14.907 -15.073 -15.252 -15.529 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt deleted file mode 100644 index e3158678..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17970 ,TETRA ,17603943,Sun Nov 28 17:08:24 CET,Sun Nov 28 18:59:37 CET,0.0 0.201 0.34 0.459 0.56 0.655 0.741 0.825 0.994 1.072 1.15 0.895 1.351 1.411 1.529 1.651 1.766 1.823 1.94 2.04 2.182 2.279 2.375 2.527 2.668 2.798 2.934 3.07 3.243 3.413 3.587 3.803 4.009 4.216 4.462 4.729 4.99 5.282 5.582 5.902 6.247 6.64 7.107 7.587 8.158 8.786 9.501 10.317 11.295 12.456 13.793 14.824 15.355 15.601 15.683 15.69 15.659 15.608 15.538 15.441 15.358 15.292 15.218 15.136 15.043 14.938 14.824 14.713 14.608 14.501 14.394 14.301 14.201 14.098 14.022 13.947 13.866 13.777 13.68 13.618 13.563 13.469 13.402 13.342 13.313 13.248 13.174 13.097 13.055 12.631 12.894 12.829 12.782 12.686 12.631 12.565 12.492 12.402 12.265 12.086 11.816 -2 ,12375 ,TETRA ,17603944,Sun Nov 28 17:08:20 CET,Sun Nov 28 18:59:40 CET,0.0 0.14 0.278 0.4 0.498 0.591 0.674 0.756 0.935 1.02 1.094 0.819 1.269 1.324 1.44 1.551 1.661 1.722 1.838 1.941 2.087 2.192 2.3 2.444 2.582 2.716 2.842 2.964 3.127 3.285 3.439 3.627 3.801 3.978 4.205 4.472 4.72 4.996 5.31 5.65 6.015 6.42 6.884 7.341 7.878 8.503 9.245 10.087 11.071 12.253 13.602 14.629 15.164 15.418 15.544 15.588 15.572 15.544 15.492 15.403 15.303 15.211 15.12 15.025 14.948 14.871 14.776 14.681 14.602 14.52 14.452 14.395 14.331 14.267 14.213 14.16 14.098 14.028 13.947 13.891 13.839 13.75 13.688 13.615 13.572 13.498 13.419 13.328 13.284 12.862 13.127 13.065 13.012 12.897 12.834 12.747 12.649 12.549 12.413 12.294 12.047 -3 ,11813 ,TETRA ,17603945,Sun Nov 28 17:08:23 CET,Sun Nov 28 18:59:21 CET,0.0 0.501 0.649 0.764 0.865 0.953 1.041 1.124 1.265 1.331 1.398 1.142 1.604 1.666 1.783 1.899 2.014 2.066 2.175 2.288 2.435 2.523 2.612 2.743 2.872 2.999 3.119 3.239 3.412 3.586 3.758 3.974 4.188 4.388 4.618 4.887 5.138 5.412 5.713 6.046 6.401 6.794 7.269 7.764 8.335 8.968 9.696 10.525 11.508 12.629 13.906 14.881 15.409 15.658 15.761 15.813 15.818 15.788 15.745 15.678 15.602 15.528 15.432 15.335 15.246 15.138 15.024 14.927 14.834 14.743 14.646 14.56 14.46 14.348 14.266 14.177 14.086 14.002 13.914 13.85 13.786 13.696 13.634 13.572 13.54 13.471 13.395 13.306 13.258 12.832 13.116 13.066 13.01 12.876 12.803 12.725 12.654 12.585 12.494 12.354 12.082 -4 ,7267 ,TETRA ,17603946,Sun Nov 28 17:08:21 CET,Sun Nov 28 18:59:20 CET,0.0 0.186 0.314 0.428 0.541 0.643 0.721 0.794 0.941 1.013 1.079 0.807 1.265 1.332 1.467 1.598 1.73 1.792 1.91 2.038 2.239 2.365 2.483 2.651 2.807 2.962 3.118 3.267 3.458 3.639 3.814 4.026 4.222 4.401 4.627 4.905 5.163 5.444 5.743 6.065 6.406 6.784 7.247 7.733 8.296 8.918 9.649 10.452 11.373 12.465 13.741 14.677 15.14 15.391 15.524 15.573 15.558 15.509 15.444 15.349 15.263 15.19 15.103 15.011 14.927 14.836 14.734 14.641 14.547 14.448 14.344 14.246 14.145 14.046 13.974 13.894 13.807 13.715 13.605 13.536 13.472 13.356 13.273 13.176 13.125 13.033 12.931 12.821 12.766 12.326 12.573 12.494 12.416 12.241 12.137 12.032 11.914 11.775 11.578 11.301 10.565 -5 ,21378 ,TETRA ,17603947,Sun Nov 28 17:08:22 CET,Sun Nov 28 18:59:57 CET,0.0 0.258 0.391 0.506 0.623 0.736 0.83 0.908 1.057 1.128 1.195 0.933 1.39 1.455 1.579 1.687 1.796 1.852 1.957 2.056 2.194 2.287 2.391 2.551 2.697 2.848 3.005 3.153 3.327 3.507 3.697 3.912 4.122 4.328 4.565 4.826 5.062 5.335 5.643 5.971 6.311 6.707 7.2 7.689 8.222 8.799 9.495 10.304 11.257 12.376 13.672 14.648 15.178 15.44 15.558 15.597 15.59 15.55 15.48 15.382 15.274 15.157 15.047 14.957 14.867 14.778 14.687 14.599 14.531 14.461 14.383 14.323 14.254 14.177 14.114 14.048 13.965 13.872 13.778 13.713 13.65 13.552 13.484 13.413 13.379 13.315 13.245 13.16 13.111 12.681 12.957 12.9 12.842 12.686 12.595 12.509 12.436 12.361 12.263 12.118 11.935 -6 ,15346 ,TETRA ,17603948,Sun Nov 28 17:08:24 CET,Sun Nov 28 18:59:39 CET,0.0 0.216 0.341 0.451 0.545 0.63 0.73 0.835 1.022 1.11 1.186 0.92 1.384 1.452 1.594 1.735 1.854 1.912 2.022 2.128 2.284 2.385 2.487 2.636 2.793 2.951 3.104 3.256 3.448 3.626 3.796 4.008 4.223 4.43 4.672 4.94 5.187 5.477 5.796 6.124 6.477 6.887 7.368 7.862 8.428 9.036 9.74 10.557 11.542 12.699 14.012 14.983 15.486 15.785 15.945 16.001 15.995 15.968 15.937 15.885 15.82 15.733 15.645 15.552 15.47 15.388 15.285 15.193 15.103 15.011 14.925 14.852 14.759 14.648 14.567 14.496 14.417 14.341 14.264 14.195 14.113 14.003 13.946 13.885 13.853 13.788 13.713 13.633 13.593 13.166 13.46 13.405 13.348 13.244 13.187 13.125 13.046 12.946 12.817 12.661 12.452 -7 ,16991 ,TETRA ,17603949,Sun Nov 28 17:08:26 CET,Sun Nov 28 18:59:19 CET,0.0 0.218 0.337 0.439 0.556 0.668 0.758 0.84 1.007 1.089 1.163 0.902 1.357 1.418 1.549 1.684 1.812 1.875 2.002 2.126 2.306 2.431 2.549 2.716 2.878 3.039 3.201 3.35 3.538 3.726 3.913 4.133 4.339 4.535 4.778 5.059 5.315 5.593 5.896 6.215 6.561 6.952 7.425 7.925 8.507 9.157 9.905 10.74 11.727 12.909 14.309 15.341 15.834 16.101 16.232 16.271 16.251 16.206 16.165 16.093 16.003 15.911 15.831 15.749 15.641 15.533 15.435 15.337 15.251 15.178 15.09 15.017 14.95 14.876 14.813 14.749 14.684 14.612 14.541 14.489 14.432 14.346 14.291 14.229 14.195 14.122 14.045 13.959 13.906 13.477 13.76 13.71 13.664 13.538 13.454 13.376 13.306 13.223 13.139 13.044 12.823 -8 ,10216 ,TETRA ,17603950,Sun Nov 28 17:08:21 CET,Sun Nov 28 18:59:25 CET,0.0 0.184 0.302 0.398 0.508 0.629 0.741 0.865 1.129 1.241 1.336 1.124 1.595 1.67 1.8 1.928 2.066 2.137 2.279 2.406 2.586 2.704 2.819 2.996 3.158 3.309 3.46 3.602 3.782 3.948 4.121 4.339 4.534 4.733 4.986 5.262 5.513 5.786 6.097 6.443 6.812 7.227 7.722 8.215 8.769 9.408 10.17 11.004 11.963 13.116 14.452 15.471 15.983 16.232 16.368 16.452 16.484 16.453 16.395 16.324 16.247 16.175 16.103 16.017 15.929 15.839 15.733 15.642 15.562 15.475 15.376 15.299 15.216 15.113 15.039 14.969 14.907 14.83 14.735 14.677 14.621 14.523 14.452 14.383 14.354 14.296 14.226 14.141 14.095 13.668 13.962 13.914 13.864 13.733 13.658 13.592 13.517 13.429 13.319 13.183 13.01 -9 ,20078 ,TETRA ,17603951,Sun Nov 28 17:08:22 CET,Sun Nov 28 18:59:19 CET,0.0 0.222 0.36 0.477 0.574 0.673 0.76 0.837 0.999 1.071 1.135 0.874 1.327 1.391 1.519 1.639 1.758 1.815 1.924 2.043 2.236 2.352 2.457 2.612 2.775 2.938 3.083 3.226 3.422 3.614 3.803 4.032 4.244 4.436 4.672 4.943 5.203 5.493 5.799 6.132 6.497 6.912 7.38 7.837 8.389 9.018 9.747 10.613 11.623 12.77 14.085 15.093 15.65 15.943 16.105 16.187 16.151 16.085 16.043 15.987 15.92 15.84 15.756 15.673 15.581 15.486 15.393 15.303 15.214 15.121 15.021 14.943 14.861 14.775 14.714 14.651 14.59 14.532 14.456 14.398 14.343 14.266 14.211 14.143 14.104 14.02 13.934 13.857 13.817 13.393 13.676 13.612 13.553 13.425 13.352 13.283 13.212 13.115 12.993 12.863 12.652 -10 ,15996 ,TETRA ,17603952,Sun Nov 28 17:08:25 CET,Sun Nov 28 18:59:53 CET,0.0 0.176 0.29 0.386 0.478 0.57 0.657 0.738 0.893 0.972 1.046 0.783 1.237 1.298 1.421 1.54 1.644 1.694 1.797 1.9 2.044 2.145 2.247 2.387 2.525 2.659 2.796 2.929 3.097 3.26 3.418 3.619 3.828 4.035 4.272 4.539 4.789 5.062 5.374 5.702 6.049 6.437 6.898 7.369 7.914 8.544 9.293 10.159 11.134 12.247 13.55 14.557 15.084 15.343 15.468 15.534 15.534 15.497 15.435 15.357 15.281 15.194 15.098 15.003 14.91 14.82 14.719 14.625 14.543 14.454 14.349 14.258 14.173 14.086 14.018 13.94 13.856 13.776 13.701 13.648 13.583 13.481 13.417 13.351 13.315 13.237 13.146 13.05 13.0 12.572 12.866 12.819 12.765 12.615 12.532 12.462 12.379 12.29 12.185 12.044 11.569 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 1468d1e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1843 ,TETRA ,17603953,Sun Nov 28 17:08:26 CET,Sun Nov 28 18:59:03 CET,0.0 1.443 1.855 2.196 2.46 2.67 2.866 3.026 3.299 3.425 3.542 3.386 3.876 4.002 4.214 4.391 4.595 4.692 4.845 4.986 5.182 5.309 5.439 5.623 5.796 5.962 6.125 6.303 6.552 6.786 7.002 7.256 7.493 7.716 7.975 8.281 8.583 8.899 9.232 9.625 10.053 10.5 10.987 11.462 12.006 12.612 13.28 14.021 14.902 15.867 16.828 17.404 17.617 17.639 17.602 17.487 17.291 17.067 16.863 16.641 16.408 16.169 15.956 15.753 15.541 15.345 15.145 14.964 14.802 14.637 14.446 14.277 14.107 13.93 13.792 13.626 13.449 13.271 13.067 12.921 12.77 12.529 12.358 12.198 12.114 11.927 11.723 11.489 11.364 10.862 10.902 10.733 10.563 10.202 9.991 9.748 9.453 9.09 8.664 8.115 5.477 -2 ,6395 ,TETRA ,17603954,Sun Nov 28 17:08:22 CET,Sun Nov 28 18:59:00 CET,0.0 1.418 1.885 2.198 2.453 2.676 2.864 3.045 3.361 3.493 3.618 3.477 3.969 4.092 4.301 4.487 4.671 4.756 4.916 5.069 5.276 5.405 5.536 5.734 5.93 6.106 6.274 6.434 6.63 6.833 7.04 7.278 7.502 7.727 8.008 8.319 8.596 8.904 9.229 9.575 9.96 10.384 10.857 11.324 11.866 12.466 13.151 13.903 14.705 15.589 16.607 17.295 17.55 17.597 17.509 17.357 17.22 17.059 16.874 16.65 16.424 16.188 15.951 15.751 15.558 15.356 15.126 14.904 14.697 14.478 14.249 14.07 13.893 13.704 13.553 13.39 13.228 13.047 12.846 12.714 12.579 12.344 12.167 11.979 11.881 11.687 11.467 11.213 11.082 10.576 10.614 10.446 10.282 9.912 9.673 9.396 9.085 8.726 8.302 7.681 5.322 -3 ,229 ,TETRA ,17603955,Sun Nov 28 17:08:25 CET,Sun Nov 28 18:59:03 CET,0.0 1.544 1.927 2.231 2.482 2.689 2.874 3.054 3.376 3.497 3.612 3.478 3.971 4.079 4.28 4.476 4.659 4.744 4.899 5.058 5.286 5.419 5.56 5.765 5.95 6.121 6.28 6.447 6.657 6.846 7.039 7.281 7.499 7.722 7.986 8.261 8.529 8.824 9.152 9.514 9.885 10.285 10.786 11.285 11.809 12.401 13.093 13.85 14.693 15.655 16.675 17.321 17.483 17.411 17.279 17.12 16.938 16.741 16.548 16.322 16.115 15.918 15.694 15.482 15.295 15.113 14.915 14.72 14.532 14.325 14.117 13.906 13.67 13.464 13.301 13.135 12.959 12.768 12.543 12.368 12.211 11.99 11.835 11.662 11.563 11.336 11.081 10.793 10.646 10.146 10.187 9.998 9.817 9.379 9.12 8.859 8.58 8.253 7.833 7.238 5.136 -4 ,3466 ,TETRA ,17603956,Sun Nov 28 17:08:26 CET,Sun Nov 28 18:59:17 CET,0.0 1.413 1.842 2.144 2.387 2.609 2.776 2.91 3.194 3.33 3.448 3.285 3.773 3.881 4.056 4.231 4.409 4.494 4.654 4.804 5.016 5.147 5.276 5.461 5.633 5.805 5.983 6.155 6.364 6.56 6.757 7.011 7.249 7.475 7.75 8.055 8.35 8.685 9.035 9.386 9.757 10.182 10.673 11.189 11.789 12.402 13.082 13.809 14.653 15.602 16.591 17.204 17.435 17.492 17.409 17.234 17.049 16.865 16.685 16.47 16.234 16.006 15.807 15.611 15.409 15.216 14.994 14.787 14.61 14.427 14.227 14.05 13.868 13.672 13.516 13.354 13.187 13.003 12.784 12.629 12.473 12.214 12.03 11.844 11.748 11.552 11.303 11.017 10.889 10.398 10.476 10.33 10.17 9.827 9.623 9.374 9.05 8.67 8.203 7.558 5.557 -5 ,20452 ,TETRA ,17603957,Sun Nov 28 17:08:23 CET,Sun Nov 28 18:59:00 CET,0.0 1.383 1.863 2.222 2.506 2.732 2.927 3.107 3.407 3.553 3.681 3.52 3.999 4.104 4.287 4.453 4.614 4.694 4.849 4.996 5.203 5.343 5.479 5.679 5.878 6.058 6.217 6.372 6.58 6.783 6.986 7.232 7.471 7.699 7.97 8.278 8.572 8.894 9.224 9.569 9.939 10.354 10.839 11.318 11.865 12.492 13.217 13.998 14.887 15.877 16.837 17.41 17.613 17.625 17.533 17.371 17.155 16.931 16.727 16.486 16.249 16.044 15.84 15.624 15.415 15.236 15.034 14.849 14.688 14.518 14.339 14.166 13.976 13.792 13.644 13.475 13.298 13.108 12.9 12.757 12.617 12.388 12.214 12.031 11.927 11.716 11.512 11.282 11.162 10.665 10.726 10.568 10.414 10.021 9.767 9.494 9.221 8.901 8.489 7.914 5.29 -6 ,25161 ,TETRA ,17603958,Sun Nov 28 17:08:22 CET,Sun Nov 28 18:59:56 CET,0.0 1.693 2.16 2.464 2.734 2.965 3.159 3.344 3.644 3.778 3.906 3.763 4.234 4.329 4.531 4.739 4.952 5.058 5.257 5.447 5.707 5.846 5.989 6.213 6.44 6.644 6.823 7.004 7.226 7.443 7.673 7.972 8.259 8.542 8.848 9.143 9.418 9.725 10.059 10.403 10.76 11.157 11.625 12.113 12.699 13.323 13.998 14.758 15.653 16.625 17.633 18.287 18.51 18.495 18.407 18.257 18.034 17.833 17.644 17.422 17.207 16.976 16.75 16.526 16.305 16.114 15.913 15.713 15.521 15.326 15.127 14.942 14.746 14.512 14.329 14.15 13.957 13.75 13.516 13.355 13.202 12.949 12.766 12.6 12.511 12.304 12.062 11.805 11.676 11.189 11.28 11.134 10.965 10.573 10.35 10.097 9.809 9.459 9.013 8.368 5.843 -7 ,30543 ,TETRA ,17603959,Sun Nov 28 17:08:24 CET,Sun Nov 28 18:59:34 CET,0.0 1.387 1.832 2.2 2.49 2.693 2.869 3.052 3.402 3.545 3.679 3.585 4.079 4.174 4.354 4.559 4.764 4.848 4.997 5.15 5.37 5.496 5.621 5.799 5.986 6.194 6.379 6.538 6.749 6.955 7.162 7.417 7.67 7.92 8.196 8.493 8.767 9.052 9.373 9.717 10.068 10.485 10.976 11.472 12.044 12.676 13.384 14.147 15.002 15.953 17.049 17.779 18.008 18.025 17.968 17.836 17.648 17.423 17.198 16.977 16.769 16.564 16.367 16.163 15.957 15.744 15.508 15.311 15.144 14.968 14.761 14.578 14.391 14.19 14.02 13.822 13.623 13.439 13.26 13.12 12.954 12.706 12.555 12.394 12.308 12.129 11.909 11.66 11.521 11.002 11.041 10.875 10.683 10.211 9.972 9.736 9.445 9.079 8.634 7.98 5.955 -8 ,18545 ,TETRA ,17603960,Sun Nov 28 17:08:49 CET,Sun Nov 28 19:00:36 CET,0.0 1.402 1.805 2.13 2.416 2.648 2.84 3.021 3.361 3.518 3.653 3.506 3.978 4.075 4.284 4.476 4.656 4.739 4.884 5.036 5.26 5.402 5.555 5.781 5.982 6.176 6.379 6.573 6.81 7.03 7.234 7.505 7.758 7.988 8.259 8.558 8.854 9.185 9.523 9.877 10.26 10.687 11.166 11.648 12.22 12.863 13.571 14.34 15.223 16.203 17.267 17.896 18.038 17.992 17.873 17.702 17.516 17.315 17.101 16.881 16.694 16.5 16.29 16.082 15.883 15.686 15.472 15.28 15.102 14.912 14.708 14.529 14.34 14.139 13.979 13.803 13.617 13.427 13.229 13.085 12.935 12.679 12.493 12.311 12.217 11.992 11.734 11.459 11.318 10.82 10.88 10.704 10.523 10.139 9.916 9.654 9.364 9.031 8.612 8.009 5.761 -9 ,16526 ,TETRA ,17603961,Sun Nov 28 17:08:52 CET,Sun Nov 28 19:00:00 CET,0.0 1.334 1.778 2.077 2.338 2.561 2.73 2.878 3.18 3.332 3.479 3.372 3.866 3.971 4.167 4.346 4.504 4.58 4.731 4.882 5.132 5.295 5.443 5.654 5.845 6.03 6.218 6.415 6.661 6.881 7.087 7.338 7.588 7.821 8.088 8.407 8.74 9.132 9.546 9.945 10.323 10.733 11.215 11.707 12.27 12.858 13.517 14.252 15.109 16.05 17.041 17.682 17.892 17.903 17.814 17.648 17.44 17.228 17.01 16.759 16.53 16.325 16.122 15.903 15.693 15.505 15.288 15.082 14.9 14.714 14.512 14.326 14.13 13.931 13.777 13.615 13.447 13.267 13.064 12.925 12.784 12.549 12.371 12.181 12.085 11.884 11.67 11.432 11.311 10.823 10.893 10.716 10.542 10.194 9.98 9.726 9.441 9.085 8.599 7.938 5.657 -10 ,18453 ,TETRA ,17603962,Sun Nov 28 17:08:49 CET,Sun Nov 28 19:00:35 CET,0.0 1.235 1.674 1.988 2.236 2.459 2.649 2.82 3.104 3.218 3.33 3.204 3.702 3.809 3.996 4.167 4.322 4.398 4.548 4.688 4.899 5.042 5.179 5.369 5.545 5.71 5.872 6.035 6.25 6.455 6.647 6.873 7.116 7.362 7.63 7.933 8.233 8.56 8.907 9.272 9.66 10.114 10.621 11.108 11.675 12.299 12.992 13.749 14.623 15.587 16.593 17.208 17.415 17.461 17.405 17.246 17.032 16.831 16.628 16.393 16.18 15.969 15.748 15.533 15.334 15.148 14.933 14.732 14.543 14.345 14.155 13.979 13.78 13.566 13.414 13.268 13.094 12.893 12.677 12.52 12.362 12.132 11.97 11.795 11.695 11.482 11.271 11.046 10.927 10.435 10.5 10.348 10.185 9.801 9.582 9.332 9.065 8.723 8.253 7.633 5.55 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt deleted file mode 100644 index 4b211a97..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29313 ,TETRA ,17603963,Sun Nov 28 17:08:49 CET,Sun Nov 28 18:59:59 CET,0.0 1.03 1.37 1.606 1.789 1.93 2.07 2.187 2.357 2.435 2.513 2.297 2.709 2.76 2.851 2.93 3.0 3.032 3.092 3.141 3.199 3.232 3.255 3.264 3.271 3.277 3.271 3.255 3.227 3.194 3.161 3.113 3.051 2.985 2.901 2.784 2.647 2.488 2.299 2.069 1.798 1.456 1.024 0.537 -0.121 -0.975 -2.083 -3.493 -5.424 -8.164 -12.346 -16.868 -20.304 -23.081 -25.328 -27.225 -28.847 -30.269 -31.472 -32.635 -33.599 -34.455 -35.256 -35.975 -36.641 -37.242 -37.857 -38.396 -38.841 -39.32 -39.828 -40.234 -40.657 -41.095 -41.445 -41.826 -42.204 -42.57 -42.954 -43.217 -43.485 -43.906 -44.205 -44.507 -44.667 -45.024 -45.383 -45.743 -45.936 -46.536 -46.543 -46.772 -47.03 -47.673 -48.037 -48.406 -48.798 -49.262 -49.86 -50.677 -55.625 -2 ,27234 ,TETRA ,17603964,Sun Nov 28 17:08:48 CET,Sun Nov 28 19:02:35 CET,0.0 1.071 1.369 1.585 1.75 1.883 1.993 2.088 2.238 2.296 2.348 2.093 2.502 2.543 2.605 2.654 2.705 2.735 2.792 2.826 2.867 2.888 2.902 2.917 2.929 2.937 2.929 2.92 2.897 2.869 2.838 2.779 2.715 2.651 2.559 2.431 2.302 2.155 1.965 1.727 1.447 1.113 0.676 0.159 -0.503 -1.316 -2.402 -3.818 -5.734 -8.454 -12.638 -17.234 -20.751 -23.524 -25.763 -27.677 -29.283 -30.699 -31.896 -33.073 -34.05 -34.938 -35.784 -36.517 -37.189 -37.791 -38.379 -38.905 -39.37 -39.842 -40.34 -40.758 -41.196 -41.64 -41.979 -42.325 -42.686 -43.064 -43.453 -43.725 -43.997 -44.405 -44.697 -45.013 -45.166 -45.467 -45.807 -46.187 -46.397 -47.02 -47.077 -47.317 -47.558 -48.15 -48.497 -48.867 -49.268 -49.771 -50.422 -51.381 -56.155 -3 ,17283 ,TETRA ,17603965,Sun Nov 28 17:08:51 CET,Sun Nov 28 19:02:14 CET,0.0 1.04 1.342 1.538 1.68 1.806 1.922 2.0 2.125 2.184 2.235 1.963 2.366 2.404 2.465 2.518 2.551 2.57 2.612 2.639 2.66 2.672 2.677 2.679 2.688 2.689 2.684 2.675 2.651 2.612 2.568 2.517 2.461 2.392 2.302 2.189 2.064 1.91 1.724 1.491 1.216 0.872 0.406 -0.115 -0.764 -1.594 -2.672 -4.062 -6.012 -8.76 -12.995 -17.638 -21.111 -23.843 -26.103 -28.05 -29.704 -31.113 -32.264 -33.432 -34.424 -35.268 -36.055 -36.8 -37.484 -38.096 -38.735 -39.292 -39.762 -40.247 -40.756 -41.179 -41.612 -42.059 -42.401 -42.753 -43.133 -43.51 -43.88 -44.145 -44.429 -44.87 -45.182 -45.49 -45.638 -45.961 -46.313 -46.69 -46.893 -47.526 -47.578 -47.782 -48.01 -48.629 -48.981 -49.346 -49.762 -50.221 -50.806 -51.785 -55.714 -4 ,24569 ,TETRA ,17603966,Sun Nov 28 17:08:49 CET,Sun Nov 28 18:59:04 CET,0.0 1.256 1.574 1.779 1.937 2.068 2.197 2.31 2.479 2.556 2.627 2.384 2.789 2.829 2.9 2.968 3.022 3.045 3.088 3.119 3.168 3.191 3.199 3.206 3.213 3.23 3.24 3.239 3.227 3.201 3.161 3.103 3.045 2.969 2.864 2.743 2.615 2.464 2.263 2.012 1.731 1.384 0.941 0.455 -0.183 -1.003 -2.091 -3.505 -5.445 -8.218 -12.462 -17.06 -20.55 -23.343 -25.626 -27.543 -29.154 -30.569 -31.731 -32.859 -33.82 -34.648 -35.442 -36.184 -36.841 -37.419 -38.029 -38.583 -39.053 -39.558 -40.058 -40.454 -40.87 -41.284 -41.605 -41.966 -42.344 -42.722 -43.1 -43.348 -43.626 -44.069 -44.364 -44.696 -44.866 -45.187 -45.531 -45.915 -46.114 -46.733 -46.819 -47.087 -47.344 -47.91 -48.23 -48.584 -48.995 -49.465 -50.093 -51.038 -55.654 -5 ,7093 ,TETRA ,17603967,Sun Nov 28 17:08:52 CET,Sun Nov 28 18:59:08 CET,0.0 1.097 1.439 1.629 1.781 1.917 2.035 2.133 2.273 2.329 2.376 2.121 2.534 2.577 2.646 2.696 2.739 2.76 2.795 2.816 2.835 2.839 2.841 2.849 2.865 2.873 2.868 2.852 2.825 2.803 2.782 2.738 2.679 2.62 2.537 2.419 2.291 2.144 1.97 1.755 1.49 1.148 0.688 0.175 -0.473 -1.285 -2.373 -3.78 -5.701 -8.428 -12.639 -17.275 -20.814 -23.613 -25.903 -27.851 -29.497 -30.918 -32.098 -33.239 -34.202 -35.075 -35.9 -36.646 -37.318 -37.934 -38.556 -39.126 -39.632 -40.118 -40.598 -40.996 -41.414 -41.862 -42.208 -42.555 -42.899 -43.247 -43.643 -43.933 -44.213 -44.635 -44.942 -45.246 -45.404 -45.759 -46.096 -46.434 -46.64 -47.27 -47.297 -47.54 -47.814 -48.384 -48.681 -49.031 -49.434 -49.913 -50.501 -51.307 -54.827 -6 ,30841 ,TETRA ,17603968,Sun Nov 28 17:08:53 CET,Sun Nov 28 18:59:36 CET,0.0 1.022 1.316 1.51 1.666 1.795 1.906 2.002 2.176 2.263 2.341 2.102 2.51 2.561 2.645 2.709 2.76 2.786 2.83 2.864 2.901 2.915 2.921 2.932 2.937 2.936 2.941 2.936 2.913 2.89 2.863 2.806 2.727 2.649 2.565 2.442 2.304 2.155 1.962 1.723 1.448 1.105 0.663 0.176 -0.474 -1.303 -2.38 -3.798 -5.771 -8.564 -12.819 -17.435 -20.895 -23.657 -25.928 -27.845 -29.463 -30.881 -32.087 -33.272 -34.247 -35.083 -35.841 -36.544 -37.202 -37.803 -38.419 -38.951 -39.422 -39.894 -40.374 -40.772 -41.176 -41.604 -41.948 -42.303 -42.666 -43.04 -43.431 -43.697 -43.97 -44.394 -44.698 -45.023 -45.191 -45.522 -45.868 -46.242 -46.432 -47.053 -47.102 -47.329 -47.562 -48.109 -48.442 -48.785 -49.162 -49.634 -50.266 -51.073 -54.966 -7 ,13434 ,TETRA ,17603969,Sun Nov 28 17:08:49 CET,Sun Nov 28 18:59:04 CET,0.0 0.974 1.222 1.394 1.541 1.669 1.784 1.875 2.024 2.09 2.157 1.919 2.319 2.355 2.414 2.457 2.489 2.507 2.544 2.574 2.61 2.635 2.653 2.675 2.691 2.691 2.683 2.671 2.649 2.619 2.582 2.526 2.466 2.394 2.287 2.169 2.039 1.87 1.685 1.459 1.181 0.831 0.384 -0.113 -0.766 -1.593 -2.681 -4.098 -6.066 -8.785 -12.932 -17.593 -21.07 -23.815 -26.123 -28.071 -29.655 -31.054 -32.255 -33.418 -34.36 -35.177 -35.971 -36.723 -37.393 -37.976 -38.585 -39.14 -39.599 -40.071 -40.589 -41.003 -41.428 -41.877 -42.203 -42.55 -42.934 -43.346 -43.746 -44.002 -44.269 -44.683 -44.973 -45.283 -45.444 -45.775 -46.13 -46.503 -46.7 -47.316 -47.376 -47.643 -47.947 -48.611 -48.958 -49.3 -49.684 -50.151 -50.805 -51.7 -55.909 -8 ,32226 ,TETRA ,17603970,Sun Nov 28 17:08:49 CET,Sun Nov 28 18:59:57 CET,0.0 0.954 1.245 1.437 1.574 1.696 1.799 1.881 2.014 2.082 2.147 1.891 2.299 2.343 2.421 2.483 2.526 2.548 2.588 2.616 2.66 2.687 2.706 2.716 2.719 2.725 2.729 2.72 2.698 2.676 2.644 2.592 2.524 2.453 2.37 2.262 2.148 1.989 1.792 1.574 1.305 0.956 0.516 0.033 -0.617 -1.445 -2.536 -3.976 -5.96 -8.734 -12.907 -17.429 -20.881 -23.678 -25.953 -27.86 -29.484 -30.899 -32.082 -33.245 -34.208 -35.048 -35.846 -36.581 -37.243 -37.829 -38.422 -38.963 -39.424 -39.896 -40.401 -40.818 -41.239 -41.678 -42.015 -42.353 -42.695 -43.051 -43.425 -43.706 -44.008 -44.434 -44.718 -45.016 -45.168 -45.478 -45.818 -46.196 -46.405 -47.02 -47.059 -47.308 -47.564 -48.118 -48.42 -48.788 -49.173 -49.614 -50.181 -51.078 -55.761 -9 ,21102 ,TETRA ,17603971,Sun Nov 28 17:08:51 CET,Sun Nov 28 18:59:54 CET,0.0 0.864 1.181 1.401 1.573 1.719 1.827 1.909 2.08 2.16 2.223 1.968 2.366 2.406 2.482 2.541 2.593 2.611 2.646 2.683 2.732 2.764 2.779 2.783 2.798 2.809 2.807 2.794 2.772 2.738 2.693 2.637 2.58 2.514 2.409 2.282 2.163 2.004 1.802 1.569 1.304 0.97 0.533 0.044 -0.597 -1.413 -2.519 -3.938 -5.847 -8.571 -12.754 -17.293 -20.778 -23.546 -25.782 -27.708 -29.337 -30.738 -31.908 -33.052 -34.02 -34.868 -35.651 -36.373 -37.03 -37.617 -38.228 -38.777 -39.286 -39.816 -40.331 -40.738 -41.145 -41.578 -41.914 -42.25 -42.596 -42.956 -43.327 -43.586 -43.842 -44.254 -44.551 -44.883 -45.054 -45.373 -45.702 -46.059 -46.252 -46.856 -46.856 -47.064 -47.3 -47.871 -48.225 -48.63 -49.05 -49.554 -50.251 -51.185 -56.047 -10 ,14610 ,TETRA ,17603972,Sun Nov 28 17:08:53 CET,Sun Nov 28 18:59:58 CET,0.0 1.006 1.243 1.411 1.55 1.684 1.804 1.899 2.058 2.119 2.171 1.915 2.319 2.352 2.413 2.472 2.531 2.558 2.595 2.629 2.683 2.707 2.721 2.733 2.747 2.756 2.741 2.728 2.717 2.704 2.688 2.643 2.583 2.515 2.416 2.286 2.151 1.985 1.776 1.546 1.275 0.91 0.437 -0.072 -0.728 -1.559 -2.657 -4.117 -6.076 -8.833 -13.08 -17.645 -21.135 -23.933 -26.18 -28.084 -29.674 -31.058 -32.262 -33.426 -34.387 -35.232 -36.037 -36.784 -37.456 -38.049 -38.658 -39.204 -39.675 -40.146 -40.61 -41.014 -41.45 -41.906 -42.251 -42.597 -42.958 -43.335 -43.718 -43.988 -44.278 -44.737 -45.052 -45.382 -45.565 -45.949 -46.342 -46.768 -46.997 -47.643 -47.723 -47.974 -48.24 -48.81 -49.105 -49.424 -49.812 -50.274 -50.839 -51.687 -55.514 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 8566c9c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18363 ,KEBNE ,17027571,Wed Dec 22 17:36:57 CET,Wed Dec 22 19:12:55 CET,0.0 1.26 1.627 1.951 2.225 2.445 2.62 2.778 3.065 3.187 3.297 3.155 3.607 3.698 3.891 4.057 4.198 4.269 4.404 4.52 4.686 4.799 4.908 5.051 5.183 5.308 5.421 5.531 5.675 5.804 5.919 6.05 6.18 6.314 6.468 6.633 6.78 6.929 7.068 7.188 7.302 7.419 7.543 7.672 7.783 7.817 7.791 7.691 7.422 6.864 5.745 4.244 2.951 1.779 0.765 -0.092 -0.827 -1.504 -2.095 -2.689 -3.184 -3.615 -4.017 -4.394 -4.757 -5.099 -5.459 -5.772 -6.037 -6.318 -6.611 -6.86 -7.138 -7.423 -7.639 -7.867 -8.104 -8.341 -8.578 -8.745 -8.918 -9.176 -9.356 -9.547 -9.647 -9.865 -10.102 -10.367 -10.504 -11.01 -10.916 -11.083 -11.274 -11.664 -11.883 -12.114 -12.393 -12.747 -13.151 -13.696 -15.542 -2 ,28409 ,KEBNE ,17027572,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:16:56 CET,0.0 1.38 1.837 2.14 2.369 2.597 2.785 2.935 3.182 3.293 3.399 3.236 3.687 3.777 3.939 4.086 4.234 4.31 4.452 4.567 4.727 4.826 4.922 5.066 5.196 5.312 5.423 5.543 5.705 5.858 6.003 6.15 6.273 6.386 6.507 6.632 6.751 6.879 7.008 7.136 7.242 7.351 7.453 7.546 7.63 7.673 7.657 7.515 7.219 6.65 5.522 3.991 2.729 1.654 0.719 -0.15 -0.922 -1.589 -2.16 -2.735 -3.258 -3.713 -4.128 -4.524 -4.885 -5.213 -5.559 -5.88 -6.162 -6.45 -6.754 -7.018 -7.309 -7.591 -7.786 -7.988 -8.224 -8.479 -8.726 -8.895 -9.068 -9.343 -9.535 -9.732 -9.831 -10.032 -10.26 -10.51 -10.653 -11.179 -11.129 -11.293 -11.449 -11.779 -11.97 -12.204 -12.477 -12.772 -13.152 -13.695 -15.417 -3 ,4438 ,KEBNE ,17027573,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:16:12 CET,0.0 1.168 1.551 1.872 2.153 2.38 2.587 2.775 3.056 3.167 3.278 3.135 3.595 3.697 3.859 3.992 4.132 4.205 4.35 4.479 4.648 4.771 4.894 5.06 5.205 5.327 5.438 5.548 5.698 5.831 5.943 6.087 6.229 6.351 6.478 6.614 6.738 6.873 6.992 7.118 7.257 7.379 7.516 7.624 7.684 7.702 7.683 7.551 7.223 6.639 5.521 4.015 2.691 1.564 0.608 -0.266 -1.006 -1.67 -2.266 -2.855 -3.336 -3.769 -4.185 -4.563 -4.913 -5.249 -5.613 -5.927 -6.191 -6.474 -6.767 -7.0 -7.241 -7.5 -7.712 -7.936 -8.157 -8.382 -8.621 -8.787 -8.964 -9.249 -9.443 -9.631 -9.729 -9.94 -10.17 -10.417 -10.541 -11.034 -10.914 -11.057 -11.217 -11.6 -11.823 -12.065 -12.321 -12.589 -12.938 -13.461 -14.99 -4 ,3248 ,KEBNE ,17027574,Wed Dec 22 17:40:04 CET,Wed Dec 22 19:12:58 CET,0.0 1.868 2.348 2.661 2.916 3.147 3.346 3.526 3.827 3.936 4.039 3.877 4.322 4.411 4.587 4.749 4.902 4.969 5.084 5.198 5.374 5.493 5.599 5.747 5.898 6.036 6.152 6.264 6.41 6.541 6.654 6.774 6.89 7.007 7.121 7.243 7.373 7.51 7.638 7.766 7.893 8.001 8.086 8.167 8.235 8.274 8.268 8.143 7.844 7.244 6.103 4.631 3.32 2.194 1.247 0.419 -0.302 -0.974 -1.552 -2.139 -2.649 -3.094 -3.513 -3.912 -4.282 -4.623 -4.978 -5.282 -5.547 -5.835 -6.135 -6.374 -6.632 -6.915 -7.136 -7.364 -7.599 -7.832 -8.066 -8.233 -8.423 -8.707 -8.891 -9.083 -9.178 -9.401 -9.658 -9.908 -10.028 -10.524 -10.428 -10.586 -10.749 -11.103 -11.325 -11.571 -11.829 -12.122 -12.487 -12.974 -14.397 -5 ,6292 ,KEBNE ,17027575,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:12:12 CET,0.0 1.276 1.701 1.992 2.219 2.423 2.603 2.767 3.041 3.157 3.275 3.13 3.58 3.682 3.876 4.032 4.185 4.251 4.368 4.485 4.65 4.748 4.843 4.988 5.121 5.25 5.363 5.469 5.597 5.709 5.838 5.993 6.127 6.268 6.431 6.584 6.716 6.854 6.994 7.12 7.231 7.337 7.439 7.515 7.575 7.603 7.552 7.411 7.151 6.638 5.546 4.027 2.691 1.539 0.536 -0.353 -1.112 -1.764 -2.314 -2.883 -3.389 -3.839 -4.246 -4.615 -4.976 -5.319 -5.673 -5.99 -6.257 -6.542 -6.848 -7.109 -7.379 -7.643 -7.853 -8.069 -8.285 -8.519 -8.761 -8.931 -9.1 -9.354 -9.534 -9.72 -9.823 -10.055 -10.311 -10.568 -10.704 -11.221 -11.129 -11.285 -11.466 -11.879 -12.115 -12.346 -12.621 -12.924 -13.237 -13.677 -15.507 -6 ,7274 ,KEBNE ,17027576,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:18:19 CET,0.0 1.189 1.588 1.873 2.1 2.317 2.488 2.642 2.932 3.059 3.175 3.041 3.497 3.583 3.75 3.919 4.064 4.122 4.251 4.389 4.594 4.708 4.799 4.929 5.068 5.21 5.336 5.444 5.563 5.676 5.793 5.935 6.062 6.191 6.34 6.487 6.602 6.712 6.842 6.991 7.112 7.21 7.337 7.434 7.492 7.517 7.483 7.349 7.019 6.397 5.246 3.736 2.443 1.327 0.334 -0.526 -1.241 -1.895 -2.459 -3.037 -3.518 -3.938 -4.363 -4.759 -5.132 -5.473 -5.821 -6.14 -6.408 -6.677 -6.97 -7.219 -7.465 -7.726 -7.939 -8.15 -8.367 -8.608 -8.868 -9.039 -9.206 -9.46 -9.639 -9.834 -9.936 -10.146 -10.371 -10.608 -10.732 -11.241 -11.142 -11.29 -11.444 -11.814 -12.031 -12.254 -12.488 -12.759 -13.116 -13.607 -14.812 -7 ,2414 ,KEBNE ,17027577,Wed Dec 22 17:40:00 CET,Wed Dec 22 19:17:25 CET,0.0 1.22 1.586 1.889 2.172 2.41 2.592 2.742 3.007 3.126 3.246 3.11 3.555 3.638 3.81 3.971 4.126 4.207 4.352 4.468 4.622 4.735 4.849 5.002 5.134 5.254 5.37 5.473 5.593 5.713 5.833 5.967 6.083 6.193 6.318 6.459 6.586 6.703 6.837 6.982 7.095 7.216 7.346 7.426 7.476 7.486 7.458 7.37 7.099 6.49 5.341 3.861 2.577 1.479 0.532 -0.311 -1.075 -1.758 -2.331 -2.915 -3.414 -3.843 -4.252 -4.662 -5.054 -5.41 -5.782 -6.105 -6.389 -6.686 -6.989 -7.241 -7.502 -7.768 -7.974 -8.206 -8.444 -8.664 -8.913 -9.092 -9.266 -9.533 -9.732 -9.948 -10.05 -10.243 -10.46 -10.703 -10.825 -11.32 -11.207 -11.358 -11.511 -11.864 -12.088 -12.326 -12.578 -12.852 -13.2 -13.716 -15.142 -8 ,21730 ,KEBNE ,17027578,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:16:09 CET,0.0 1.653 2.075 2.379 2.622 2.834 3.011 3.168 3.445 3.572 3.684 3.535 4.009 4.104 4.26 4.42 4.568 4.64 4.782 4.908 5.091 5.208 5.316 5.463 5.582 5.701 5.815 5.915 6.038 6.143 6.24 6.357 6.476 6.598 6.713 6.83 6.945 7.073 7.219 7.365 7.493 7.604 7.718 7.808 7.871 7.904 7.886 7.784 7.533 7.003 5.944 4.468 3.168 2.052 1.085 0.225 -0.507 -1.166 -1.744 -2.316 -2.813 -3.264 -3.689 -4.086 -4.459 -4.818 -5.202 -5.523 -5.792 -6.075 -6.369 -6.621 -6.875 -7.141 -7.342 -7.54 -7.743 -7.963 -8.237 -8.42 -8.585 -8.839 -9.018 -9.213 -9.322 -9.556 -9.785 -10.015 -10.146 -10.667 -10.585 -10.737 -10.894 -11.214 -11.408 -11.628 -11.896 -12.213 -12.579 -13.058 -14.831 -9 ,22413 ,KEBNE ,17027579,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:16:14 CET,0.0 1.509 1.909 2.202 2.433 2.639 2.818 2.958 3.22 3.335 3.441 3.307 3.781 3.889 4.076 4.24 4.375 4.437 4.561 4.688 4.858 4.964 5.065 5.201 5.321 5.428 5.527 5.632 5.775 5.905 6.035 6.196 6.341 6.457 6.569 6.699 6.819 6.951 7.092 7.214 7.327 7.455 7.6 7.708 7.801 7.859 7.833 7.71 7.421 6.867 5.8 4.336 3.032 1.917 0.97 0.111 -0.655 -1.347 -1.938 -2.522 -3.025 -3.477 -3.901 -4.292 -4.663 -5.006 -5.371 -5.706 -5.986 -6.273 -6.57 -6.816 -7.067 -7.324 -7.528 -7.74 -7.958 -8.192 -8.452 -8.638 -8.821 -9.079 -9.256 -9.446 -9.554 -9.792 -10.043 -10.307 -10.449 -10.958 -10.83 -10.968 -11.13 -11.488 -11.663 -11.851 -12.08 -12.375 -12.725 -13.269 -14.998 -10 ,12895 ,KEBNE ,17027580,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:16:37 CET,0.0 1.234 1.647 1.951 2.229 2.442 2.61 2.774 3.062 3.19 3.3 3.134 3.594 3.688 3.874 4.059 4.22 4.297 4.444 4.587 4.784 4.889 4.983 5.119 5.235 5.338 5.448 5.547 5.669 5.789 5.904 6.04 6.154 6.263 6.393 6.538 6.666 6.783 6.903 7.037 7.178 7.292 7.391 7.461 7.507 7.529 7.506 7.389 7.128 6.578 5.423 3.917 2.661 1.542 0.563 -0.265 -1.016 -1.683 -2.237 -2.814 -3.299 -3.744 -4.163 -4.533 -4.885 -5.219 -5.584 -5.899 -6.15 -6.408 -6.685 -6.921 -7.164 -7.416 -7.612 -7.818 -8.029 -8.241 -8.466 -8.634 -8.815 -9.081 -9.267 -9.469 -9.57 -9.79 -10.018 -10.251 -10.372 -10.88 -10.821 -10.973 -11.119 -11.479 -11.689 -11.914 -12.168 -12.475 -12.858 -13.367 -14.875 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 71f0664e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30512 ,TETRA ,17603973,Sun Nov 28 17:08:55 CET,Sun Nov 28 19:00:48 CET,0.0 1.321 1.71 1.985 2.223 2.433 2.605 2.751 3.029 3.175 3.294 3.125 3.569 3.667 3.872 4.038 4.195 4.272 4.411 4.551 4.777 4.927 5.053 5.214 5.365 5.536 5.691 5.821 6.002 6.19 6.371 6.558 6.742 6.923 7.113 7.313 7.5 7.707 7.922 8.155 8.395 8.659 8.949 9.194 9.436 9.676 9.968 10.235 10.439 10.568 10.373 9.719 8.985 8.281 7.677 7.072 6.511 6.02 5.574 5.076 4.624 4.248 3.89 3.535 3.2 2.89 2.545 2.227 1.947 1.627 1.297 1.05 0.798 0.531 0.315 0.074 -0.184 -0.449 -0.727 -0.907 -1.087 -1.4 -1.617 -1.84 -1.956 -2.193 -2.463 -2.747 -2.891 -3.406 -3.391 -3.576 -3.76 -4.207 -4.483 -4.802 -5.145 -5.555 -6.077 -6.818 -9.024 -2 ,26922 ,TETRA ,17603974,Sun Nov 28 17:08:50 CET,Sun Nov 28 19:00:54 CET,0.0 1.445 1.854 2.166 2.425 2.647 2.822 2.979 3.263 3.419 3.564 3.407 3.873 3.991 4.18 4.335 4.506 4.591 4.727 4.856 5.038 5.15 5.269 5.461 5.638 5.779 5.905 6.026 6.182 6.329 6.471 6.648 6.832 6.997 7.172 7.392 7.599 7.804 8.015 8.235 8.452 8.697 8.995 9.282 9.588 9.866 10.118 10.356 10.55 10.629 10.388 9.711 8.989 8.316 7.678 7.027 6.437 5.919 5.473 5.005 4.596 4.218 3.845 3.497 3.166 2.836 2.489 2.204 1.957 1.697 1.422 1.176 0.907 0.645 0.442 0.21 -0.041 -0.297 -0.557 -0.747 -0.937 -1.229 -1.439 -1.647 -1.756 -2.008 -2.298 -2.606 -2.766 -3.286 -3.237 -3.419 -3.601 -3.969 -4.229 -4.533 -4.876 -5.295 -5.804 -6.487 -8.402 -3 ,19689 ,TETRA ,17603975,Sun Nov 28 17:08:54 CET,Sun Nov 28 19:00:39 CET,0.0 1.53 2.019 2.364 2.635 2.878 3.116 3.332 3.719 3.882 4.021 3.92 4.403 4.517 4.746 4.948 5.139 5.236 5.402 5.551 5.759 5.877 5.989 6.159 6.323 6.484 6.636 6.766 6.928 7.097 7.267 7.465 7.637 7.808 8.005 8.208 8.402 8.613 8.818 9.038 9.271 9.518 9.785 10.025 10.294 10.553 10.808 11.058 11.276 11.357 11.061 10.372 9.652 8.932 8.285 7.675 7.121 6.637 6.137 5.61 5.186 4.791 4.418 4.05 3.696 3.376 3.066 2.783 2.519 2.242 1.96 1.721 1.476 1.218 1.008 0.809 0.598 0.364 0.119 -0.049 -0.236 -0.526 -0.731 -0.97 -1.096 -1.358 -1.635 -1.925 -2.073 -2.598 -2.618 -2.823 -3.029 -3.498 -3.761 -4.039 -4.413 -4.856 -5.349 -6.008 -8.001 -4 ,5395 ,TETRA ,17603976,Sun Nov 28 17:08:50 CET,Sun Nov 28 19:01:00 CET,0.0 1.589 2.017 2.281 2.512 2.73 2.922 3.09 3.372 3.483 3.582 3.42 3.882 3.994 4.203 4.373 4.519 4.578 4.698 4.828 5.042 5.184 5.304 5.467 5.623 5.776 5.919 6.063 6.26 6.455 6.63 6.81 6.982 7.138 7.31 7.502 7.69 7.893 8.101 8.319 8.554 8.799 9.048 9.286 9.543 9.81 10.09 10.347 10.543 10.603 10.327 9.603 8.852 8.132 7.455 6.782 6.178 5.626 5.132 4.641 4.231 3.881 3.524 3.164 2.827 2.522 2.202 1.922 1.674 1.395 1.09 0.83 0.551 0.269 0.066 -0.153 -0.405 -0.681 -0.96 -1.13 -1.288 -1.562 -1.766 -1.993 -2.119 -2.361 -2.601 -2.88 -3.037 -3.581 -3.587 -3.77 -3.975 -4.44 -4.71 -5.014 -5.35 -5.745 -6.305 -7.085 -9.42 -5 ,24519 ,TETRA ,17603977,Sun Nov 28 17:08:52 CET,Sun Nov 28 19:01:01 CET,0.0 1.475 1.903 2.206 2.425 2.589 2.742 2.875 3.129 3.251 3.355 3.176 3.623 3.725 3.941 4.108 4.257 4.33 4.478 4.621 4.794 4.908 5.013 5.153 5.307 5.453 5.59 5.717 5.867 6.016 6.163 6.334 6.488 6.646 6.822 7.011 7.2 7.41 7.64 7.875 8.113 8.357 8.626 8.896 9.171 9.406 9.643 9.872 10.03 10.088 9.794 9.103 8.404 7.699 7.052 6.449 5.864 5.324 4.858 4.402 3.982 3.594 3.22 2.856 2.52 2.208 1.901 1.634 1.397 1.147 0.87 0.624 0.355 0.066 -0.148 -0.364 -0.602 -0.857 -1.125 -1.306 -1.503 -1.832 -2.045 -2.264 -2.376 -2.625 -2.91 -3.205 -3.366 -3.897 -3.883 -4.073 -4.277 -4.736 -4.988 -5.272 -5.589 -5.948 -6.426 -7.109 -9.287 -6 ,22731 ,TETRA ,17603978,Sun Nov 28 17:08:52 CET,Sun Nov 28 19:00:36 CET,0.0 1.679 2.084 2.364 2.575 2.736 2.899 3.069 3.352 3.462 3.568 3.417 3.871 3.964 4.152 4.325 4.494 4.575 4.733 4.891 5.119 5.248 5.358 5.528 5.688 5.847 6.003 6.14 6.302 6.47 6.64 6.836 7.009 7.17 7.363 7.576 7.767 7.972 8.186 8.396 8.607 8.851 9.122 9.351 9.618 9.889 10.131 10.374 10.584 10.671 10.423 9.759 9.012 8.293 7.643 6.989 6.396 5.878 5.415 4.943 4.532 4.169 3.821 3.477 3.15 2.86 2.524 2.209 1.949 1.67 1.389 1.169 0.928 0.655 0.441 0.22 -0.004 -0.227 -0.47 -0.647 -0.843 -1.144 -1.33 -1.541 -1.657 -1.899 -2.155 -2.434 -2.58 -3.1 -3.115 -3.335 -3.562 -4.021 -4.293 -4.607 -4.955 -5.345 -5.885 -6.61 -8.853 -7 ,7465 ,TETRA ,17603979,Sun Nov 28 17:08:54 CET,Sun Nov 28 19:00:02 CET,0.0 1.752 2.144 2.407 2.592 2.779 2.979 3.157 3.473 3.605 3.708 3.539 4.003 4.108 4.285 4.44 4.593 4.669 4.818 4.962 5.135 5.235 5.327 5.47 5.618 5.755 5.88 6.005 6.176 6.334 6.485 6.67 6.841 7.009 7.22 7.441 7.629 7.836 8.053 8.268 8.496 8.76 9.038 9.269 9.516 9.787 10.048 10.263 10.457 10.556 10.306 9.618 8.877 8.202 7.613 7.021 6.45 5.926 5.458 4.989 4.586 4.214 3.844 3.486 3.17 2.879 2.558 2.278 2.034 1.765 1.483 1.26 1.037 0.766 0.539 0.308 0.054 -0.19 -0.442 -0.614 -0.789 -1.102 -1.327 -1.558 -1.674 -1.912 -2.18 -2.488 -2.645 -3.17 -3.14 -3.318 -3.512 -3.965 -4.235 -4.523 -4.817 -5.196 -5.723 -6.44 -8.789 -8 ,23076 ,TETRA ,17603980,Sun Nov 28 17:08:55 CET,Sun Nov 28 19:00:20 CET,0.0 1.596 2.007 2.277 2.475 2.638 2.794 2.95 3.239 3.356 3.455 3.281 3.733 3.832 4.021 4.18 4.313 4.381 4.55 4.707 4.899 5.024 5.155 5.37 5.564 5.72 5.862 6.005 6.19 6.36 6.513 6.698 6.88 7.042 7.229 7.452 7.662 7.881 8.109 8.333 8.559 8.818 9.103 9.342 9.591 9.852 10.098 10.339 10.57 10.642 10.361 9.684 8.931 8.239 7.609 6.984 6.408 5.891 5.423 4.922 4.475 4.06 3.667 3.284 2.939 2.637 2.279 1.943 1.671 1.403 1.123 0.882 0.636 0.369 0.145 -0.092 -0.329 -0.558 -0.789 -0.954 -1.137 -1.438 -1.656 -1.919 -2.059 -2.331 -2.663 -3.007 -3.162 -3.685 -3.672 -3.88 -4.106 -4.572 -4.81 -5.076 -5.405 -5.802 -6.301 -6.919 -9.192 -9 ,22730 ,TETRA ,17603981,Sun Nov 28 17:08:57 CET,Sun Nov 28 19:00:37 CET,0.0 1.236 1.636 1.924 2.143 2.305 2.457 2.618 2.906 3.033 3.169 3.065 3.531 3.625 3.799 3.948 4.096 4.168 4.301 4.418 4.585 4.697 4.8 4.94 5.076 5.206 5.332 5.451 5.595 5.733 5.894 6.094 6.27 6.435 6.622 6.825 7.016 7.229 7.454 7.677 7.887 8.119 8.386 8.633 8.912 9.199 9.487 9.723 9.871 9.887 9.577 8.902 8.169 7.498 6.893 6.295 5.71 5.151 4.649 4.15 3.733 3.355 2.994 2.63 2.283 1.962 1.622 1.326 1.069 0.796 0.49 0.233 -0.032 -0.32 -0.543 -0.769 -1.008 -1.24 -1.473 -1.655 -1.853 -2.173 -2.404 -2.63 -2.741 -2.99 -3.273 -3.572 -3.726 -4.251 -4.279 -4.496 -4.699 -5.173 -5.432 -5.689 -5.986 -6.365 -6.888 -7.595 -10.123 -10 ,1089 ,TETRA ,17603982,Sun Nov 28 17:08:52 CET,Sun Nov 28 19:01:16 CET,0.0 1.299 1.715 1.999 2.206 2.419 2.626 2.777 3.021 3.13 3.244 3.116 3.58 3.67 3.819 3.976 4.13 4.194 4.315 4.428 4.603 4.719 4.823 4.985 5.149 5.309 5.465 5.619 5.815 5.979 6.143 6.351 6.532 6.703 6.898 7.101 7.284 7.473 7.695 7.92 8.118 8.334 8.588 8.851 9.121 9.364 9.611 9.857 10.047 10.064 9.756 9.051 8.255 7.522 6.888 6.306 5.742 5.209 4.744 4.277 3.857 3.449 3.044 2.65 2.3 1.975 1.609 1.299 1.046 0.765 0.453 0.198 -0.062 -0.322 -0.526 -0.748 -0.984 -1.226 -1.497 -1.692 -1.878 -2.172 -2.414 -2.67 -2.791 -3.048 -3.332 -3.621 -3.768 -4.282 -4.289 -4.5 -4.717 -5.204 -5.494 -5.798 -6.133 -6.534 -7.015 -7.678 -10.558 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 1834a4f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31019 ,KEBNE ,17027581,Wed Dec 22 17:40:00 CET,Wed Dec 22 19:18:41 CET,0.0 1.457 1.903 2.229 2.482 2.697 2.895 3.076 3.407 3.557 3.687 3.532 4.036 4.156 4.375 4.574 4.783 4.881 5.057 5.225 5.459 5.613 5.772 6.018 6.24 6.435 6.626 6.813 7.05 7.28 7.517 7.79 8.039 8.277 8.555 8.872 9.185 9.525 9.864 10.23 10.628 11.078 11.614 12.135 12.723 13.422 14.218 15.098 16.057 16.96 17.804 18.295 18.326 18.079 17.737 17.386 17.06 16.712 16.363 16.034 15.724 15.423 15.144 14.875 14.616 14.372 14.116 13.861 13.645 13.421 13.187 13.0 12.793 12.59 12.433 12.253 12.063 11.844 11.609 11.457 11.298 11.049 10.878 10.7 10.604 10.404 10.197 9.957 9.827 9.321 9.414 9.261 9.102 8.707 8.475 8.255 7.99 7.671 7.309 6.825 4.895 -2 ,21988 ,KEBNE ,17027582,Wed Dec 22 17:40:00 CET,Wed Dec 22 19:17:21 CET,0.0 1.742 2.273 2.656 2.924 3.151 3.374 3.578 3.915 4.064 4.215 4.118 4.629 4.747 4.964 5.162 5.357 5.456 5.645 5.814 6.071 6.241 6.391 6.612 6.829 7.042 7.248 7.436 7.68 7.922 8.155 8.421 8.659 8.886 9.151 9.465 9.793 10.14 10.484 10.837 11.219 11.665 12.164 12.653 13.237 13.885 14.634 15.448 16.331 17.269 18.166 18.542 18.45 18.211 17.938 17.646 17.313 17.006 16.744 16.42 16.124 15.866 15.609 15.363 15.132 14.911 14.689 14.472 14.263 14.038 13.801 13.611 13.408 13.198 13.014 12.829 12.661 12.465 12.257 12.119 11.976 11.764 11.599 11.405 11.312 11.129 10.935 10.737 10.631 10.146 10.266 10.111 9.943 9.587 9.372 9.136 8.877 8.554 8.163 7.713 6.138 -3 ,24358 ,KEBNE ,17027583,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:18:47 CET,0.0 1.624 2.144 2.515 2.798 3.032 3.236 3.414 3.736 3.883 4.022 3.898 4.408 4.526 4.753 4.978 5.178 5.276 5.465 5.642 5.895 6.059 6.219 6.436 6.649 6.851 7.048 7.256 7.516 7.765 8.003 8.299 8.596 8.857 9.139 9.461 9.777 10.126 10.498 10.89 11.301 11.75 12.263 12.8 13.424 14.077 14.806 15.642 16.605 17.645 18.732 19.263 19.261 19.024 18.744 18.483 18.192 17.874 17.596 17.302 17.012 16.738 16.487 16.254 16.04 15.832 15.591 15.372 15.176 14.97 14.75 14.56 14.371 14.156 13.986 13.824 13.665 13.509 13.324 13.183 13.027 12.767 12.602 12.441 12.348 12.155 11.951 11.718 11.587 11.078 11.185 11.042 10.88 10.518 10.307 10.077 9.829 9.534 9.133 8.626 6.644 -4 ,11747 ,KEBNE ,17027584,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:18:58 CET,0.0 1.375 1.841 2.178 2.452 2.684 2.884 3.062 3.374 3.515 3.646 3.499 3.996 4.101 4.322 4.535 4.734 4.835 5.019 5.189 5.435 5.584 5.733 5.955 6.172 6.383 6.573 6.773 7.037 7.258 7.469 7.723 7.97 8.217 8.498 8.824 9.137 9.459 9.821 10.211 10.612 11.074 11.593 12.105 12.694 13.347 14.106 14.926 15.831 16.787 17.646 18.019 18.063 17.934 17.699 17.418 17.131 16.817 16.519 16.205 15.901 15.638 15.384 15.145 14.921 14.716 14.506 14.291 14.085 13.859 13.607 13.393 13.178 12.958 12.779 12.6 12.425 12.234 12.04 11.906 11.761 11.535 11.376 11.213 11.127 10.939 10.731 10.498 10.374 9.873 9.967 9.804 9.633 9.293 9.088 8.85 8.597 8.287 7.886 7.348 5.654 -5 ,4186 ,KEBNE ,17027585,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:19:12 CET,0.0 1.123 1.587 1.982 2.277 2.512 2.73 2.921 3.23 3.366 3.504 3.405 3.918 4.044 4.273 4.474 4.683 4.782 4.953 5.123 5.384 5.555 5.718 5.938 6.137 6.339 6.553 6.753 7.004 7.24 7.456 7.72 7.972 8.217 8.503 8.824 9.132 9.475 9.847 10.246 10.656 11.104 11.619 12.14 12.723 13.348 14.107 14.94 15.822 16.694 17.438 17.844 17.911 17.785 17.532 17.228 16.948 16.669 16.394 16.079 15.792 15.509 15.221 14.96 14.715 14.504 14.278 14.053 13.853 13.651 13.446 13.252 13.036 12.811 12.636 12.461 12.29 12.104 11.894 11.754 11.615 11.366 11.189 11.014 10.919 10.72 10.513 10.317 10.214 9.713 9.801 9.658 9.499 9.125 8.927 8.727 8.48 8.193 7.842 7.331 5.18 -6 ,14537 ,KEBNE ,17027586,Wed Dec 22 17:40:00 CET,Wed Dec 22 19:17:18 CET,0.0 1.272 1.665 1.984 2.251 2.498 2.719 2.92 3.247 3.392 3.529 3.378 3.876 3.984 4.187 4.39 4.594 4.692 4.88 5.049 5.281 5.44 5.599 5.834 6.046 6.238 6.431 6.623 6.878 7.119 7.344 7.61 7.866 8.121 8.409 8.705 9.001 9.347 9.711 10.099 10.51 10.953 11.455 11.977 12.576 13.223 13.952 14.711 15.576 16.444 17.288 17.716 17.682 17.503 17.296 17.033 16.742 16.451 16.179 15.892 15.638 15.395 15.148 14.906 14.664 14.435 14.191 13.959 13.748 13.522 13.291 13.107 12.911 12.691 12.511 12.336 12.166 11.981 11.766 11.626 11.487 11.258 11.099 10.914 10.817 10.619 10.398 10.165 10.033 9.517 9.629 9.493 9.335 9.005 8.828 8.611 8.35 8.029 7.61 7.09 5.548 -7 ,9026 ,KEBNE ,17027587,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:17:37 CET,0.0 1.012 1.356 1.632 1.896 2.148 2.354 2.528 2.855 2.999 3.139 3.024 3.532 3.647 3.87 4.062 4.237 4.33 4.502 4.663 4.903 5.048 5.192 5.406 5.607 5.802 5.987 6.167 6.403 6.634 6.853 7.109 7.36 7.602 7.874 8.186 8.499 8.836 9.198 9.589 9.981 10.419 10.949 11.484 12.075 12.702 13.437 14.248 15.158 16.162 17.082 17.472 17.459 17.331 17.105 16.803 16.53 16.253 15.962 15.645 15.379 15.141 14.912 14.683 14.457 14.248 14.007 13.777 13.589 13.392 13.159 12.966 12.773 12.557 12.371 12.156 11.928 11.703 11.456 11.285 11.109 10.824 10.609 10.379 10.27 10.036 9.773 9.512 9.373 8.865 8.966 8.813 8.637 8.205 7.96 7.704 7.436 7.091 6.606 5.978 3.921 -8 ,12399 ,KEBNE ,17027588,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:16:56 CET,0.0 1.201 1.662 2.051 2.351 2.585 2.79 2.96 3.266 3.413 3.553 3.431 3.94 4.054 4.264 4.464 4.647 4.738 4.92 5.09 5.341 5.503 5.659 5.869 6.07 6.265 6.446 6.63 6.869 7.096 7.307 7.556 7.81 8.051 8.325 8.643 8.955 9.3 9.647 10.015 10.427 10.885 11.406 11.937 12.562 13.246 14.041 14.905 15.777 16.606 17.41 17.83 17.856 17.702 17.452 17.17 16.872 16.559 16.283 16.009 15.76 15.525 15.298 15.07 14.835 14.621 14.39 14.184 13.996 13.789 13.584 13.407 13.217 13.032 12.897 12.745 12.566 12.379 12.18 12.049 11.919 11.698 11.538 11.364 11.272 11.09 10.896 10.689 10.576 10.077 10.156 9.99 9.819 9.453 9.245 9.006 8.736 8.387 7.982 7.435 4.896 -9 ,5844 ,KEBNE ,17027589,Wed Dec 22 17:40:00 CET,Wed Dec 22 19:16:47 CET,0.0 1.555 2.009 2.372 2.678 2.904 3.088 3.276 3.587 3.724 3.864 3.754 4.259 4.377 4.617 4.82 5.003 5.098 5.289 5.465 5.707 5.867 6.023 6.233 6.433 6.641 6.844 7.04 7.291 7.523 7.743 8.004 8.267 8.524 8.81 9.142 9.46 9.796 10.171 10.562 10.969 11.431 11.956 12.487 13.084 13.712 14.415 15.137 15.949 16.886 17.793 18.185 18.181 18.04 17.845 17.598 17.318 17.032 16.774 16.487 16.225 16.002 15.77 15.515 15.265 15.056 14.838 14.614 14.41 14.197 13.979 13.795 13.601 13.403 13.245 13.078 12.902 12.709 12.496 12.351 12.202 11.951 11.781 11.604 11.51 11.313 11.092 10.856 10.731 10.235 10.351 10.205 10.05 9.683 9.465 9.233 8.979 8.664 8.255 7.655 5.621 -10 ,17839 ,KEBNE ,17027590,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:18:30 CET,0.0 1.254 1.648 1.931 2.198 2.421 2.604 2.785 3.098 3.235 3.372 3.259 3.771 3.883 4.088 4.27 4.471 4.572 4.761 4.935 5.175 5.329 5.472 5.681 5.887 6.09 6.286 6.479 6.718 6.936 7.155 7.43 7.687 7.926 8.202 8.522 8.832 9.171 9.526 9.911 10.324 10.785 11.303 11.802 12.414 13.099 13.868 14.735 15.64 16.548 17.488 18.002 18.054 17.89 17.652 17.389 17.099 16.814 16.525 16.229 15.979 15.734 15.482 15.229 14.988 14.755 14.504 14.287 14.091 13.892 13.675 13.481 13.285 13.08 12.908 12.718 12.531 12.347 12.147 12.013 11.864 11.608 11.443 11.272 11.181 10.994 10.793 10.578 10.465 9.958 10.033 9.884 9.731 9.369 9.176 8.975 8.729 8.404 8.021 7.527 5.723 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt deleted file mode 100644 index 495773f4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5410 ,TETRA ,17603983,Sun Nov 28 17:08:54 CET,Sun Nov 28 19:01:56 CET,0.0 1.16 1.608 1.935 2.177 2.4 2.612 2.794 3.13 3.301 3.45 3.312 3.819 3.941 4.198 4.434 4.643 4.742 4.917 5.099 5.354 5.496 5.643 5.867 6.069 6.255 6.44 6.625 6.855 7.09 7.322 7.583 7.829 8.069 8.334 8.631 8.924 9.229 9.545 9.872 10.196 10.56 10.991 11.409 11.863 12.364 12.964 13.574 14.262 14.943 15.263 15.136 14.735 14.178 13.62 13.092 12.576 12.085 11.667 11.232 10.841 10.511 10.191 9.862 9.547 9.251 8.939 8.668 8.427 8.182 7.938 7.718 7.482 7.233 7.034 6.822 6.598 6.372 6.133 5.963 5.786 5.498 5.294 5.079 4.968 4.735 4.497 4.248 4.103 3.574 3.662 3.5 3.324 2.941 2.732 2.502 2.225 1.881 1.447 0.797 -1.888 -2 ,12568 ,TETRA ,17603984,Sun Nov 28 17:08:52 CET,Sun Nov 28 19:01:21 CET,0.0 1.474 1.972 2.324 2.599 2.869 3.138 3.347 3.646 3.788 3.927 3.787 4.277 4.38 4.593 4.782 4.965 5.064 5.267 5.454 5.703 5.855 5.999 6.211 6.415 6.606 6.784 6.954 7.184 7.411 7.63 7.885 8.12 8.344 8.61 8.911 9.193 9.488 9.782 10.103 10.437 10.8 11.206 11.619 12.116 12.638 13.179 13.744 14.351 14.931 15.313 15.126 14.699 14.194 13.664 13.155 12.652 12.182 11.786 11.379 11.004 10.637 10.278 9.943 9.633 9.326 9.011 8.751 8.512 8.254 7.976 7.754 7.533 7.287 7.088 6.874 6.659 6.441 6.202 6.028 5.852 5.595 5.41 5.215 5.12 4.908 4.669 4.412 4.279 3.757 3.837 3.672 3.49 3.124 2.919 2.681 2.392 2.072 1.7 1.163 -0.502 -3 ,25244 ,TETRA ,17603985,Sun Nov 28 17:08:55 CET,Sun Nov 28 19:01:08 CET,0.0 1.192 1.64 1.972 2.248 2.492 2.711 2.91 3.248 3.413 3.566 3.43 3.939 4.059 4.282 4.486 4.66 4.743 4.909 5.074 5.305 5.443 5.577 5.786 5.999 6.198 6.384 6.554 6.775 6.992 7.19 7.445 7.693 7.927 8.195 8.468 8.732 9.031 9.35 9.675 9.998 10.368 10.79 11.182 11.638 12.125 12.663 13.21 13.783 14.36 14.773 14.737 14.332 13.871 13.423 12.947 12.491 12.051 11.649 11.234 10.859 10.491 10.134 9.816 9.503 9.217 8.919 8.647 8.417 8.187 7.934 7.701 7.46 7.212 7.023 6.817 6.595 6.373 6.131 5.968 5.808 5.535 5.341 5.143 5.035 4.81 4.58 4.345 4.222 3.712 3.808 3.659 3.5 3.149 2.943 2.698 2.426 2.111 1.696 1.081 -1.197 -4 ,15872 ,TETRA ,17603986,Sun Nov 28 17:08:53 CET,Sun Nov 28 19:01:02 CET,0.0 1.298 1.724 1.996 2.235 2.452 2.654 2.827 3.134 3.272 3.398 3.247 3.744 3.861 4.083 4.297 4.493 4.576 4.732 4.884 5.118 5.275 5.418 5.627 5.838 6.023 6.184 6.347 6.567 6.787 6.993 7.236 7.491 7.727 7.972 8.25 8.525 8.813 9.127 9.464 9.831 10.236 10.675 11.104 11.563 12.068 12.631 13.204 13.841 14.402 14.725 14.626 14.29 13.904 13.454 12.985 12.533 12.047 11.595 11.148 10.76 10.432 10.138 9.84 9.538 9.234 8.91 8.659 8.454 8.216 7.947 7.71 7.466 7.218 7.018 6.802 6.588 6.374 6.143 5.973 5.791 5.485 5.275 5.07 4.963 4.73 4.493 4.252 4.113 3.583 3.659 3.5 3.331 2.945 2.711 2.461 2.179 1.828 1.444 0.902 -1.554 -5 ,580 ,TETRA ,17603987,Sun Nov 28 17:08:55 CET,Sun Nov 28 19:01:17 CET,0.0 1.187 1.582 1.923 2.22 2.462 2.68 2.873 3.195 3.341 3.474 3.336 3.842 3.954 4.179 4.391 4.569 4.654 4.83 4.994 5.218 5.37 5.522 5.723 5.904 6.078 6.247 6.418 6.652 6.872 7.068 7.309 7.541 7.761 8.022 8.307 8.56 8.835 9.14 9.469 9.82 10.192 10.59 10.992 11.484 12.007 12.536 13.085 13.656 14.176 14.472 14.334 13.956 13.477 12.954 12.436 11.938 11.463 11.024 10.582 10.222 9.905 9.6 9.311 9.032 8.761 8.46 8.194 7.958 7.69 7.408 7.176 6.936 6.694 6.484 6.261 6.055 5.845 5.61 5.442 5.284 5.027 4.837 4.636 4.529 4.31 4.081 3.815 3.669 3.148 3.218 3.058 2.888 2.497 2.282 2.025 1.74 1.416 1.016 0.429 -1.739 -6 ,7811 ,TETRA ,17603988,Sun Nov 28 17:08:56 CET,Sun Nov 28 19:01:35 CET,0.0 1.262 1.662 1.949 2.196 2.41 2.598 2.765 3.057 3.198 3.335 3.223 3.738 3.849 4.051 4.246 4.446 4.542 4.709 4.866 5.103 5.249 5.379 5.575 5.768 5.948 6.134 6.318 6.544 6.766 6.981 7.223 7.459 7.688 7.953 8.261 8.561 8.884 9.218 9.574 9.959 10.384 10.84 11.3 11.835 12.394 12.991 13.651 14.317 14.864 15.248 15.184 14.833 14.377 13.916 13.474 13.061 12.649 12.266 11.855 11.489 11.151 10.818 10.471 10.129 9.813 9.493 9.23 8.992 8.738 8.466 8.225 7.97 7.716 7.523 7.3 7.071 6.846 6.597 6.425 6.25 5.984 5.802 5.607 5.498 5.258 5.011 4.744 4.595 4.055 4.107 3.936 3.753 3.35 3.111 2.842 2.555 2.231 1.832 1.315 -0.783 -7 ,23555 ,TETRA ,17603989,Sun Nov 28 17:08:59 CET,Sun Nov 28 19:01:12 CET,0.0 1.464 2.0 2.308 2.559 2.785 2.963 3.124 3.414 3.549 3.691 3.56 4.064 4.184 4.41 4.62 4.81 4.892 5.036 5.191 5.43 5.572 5.701 5.889 6.073 6.254 6.438 6.605 6.823 7.061 7.272 7.503 7.731 7.944 8.182 8.448 8.717 9.006 9.3 9.615 9.947 10.326 10.759 11.196 11.714 12.229 12.737 13.25 13.786 14.333 14.668 14.467 14.046 13.569 13.041 12.52 12.036 11.556 11.152 10.759 10.413 10.091 9.763 9.416 9.091 8.807 8.51 8.238 8.009 7.771 7.512 7.301 7.071 6.811 6.611 6.423 6.226 5.999 5.743 5.572 5.398 5.13 4.939 4.725 4.618 4.385 4.129 3.877 3.743 3.23 3.327 3.166 2.992 2.592 2.368 2.136 1.876 1.57 1.228 0.727 -1.604 -8 ,29451 ,TETRA ,17603990,Sun Nov 28 17:08:53 CET,Sun Nov 28 19:00:40 CET,0.0 1.381 1.807 2.097 2.35 2.587 2.809 3.018 3.357 3.496 3.631 3.513 4.016 4.133 4.363 4.596 4.807 4.902 5.083 5.233 5.466 5.628 5.773 5.971 6.178 6.392 6.598 6.791 7.025 7.255 7.474 7.714 7.939 8.154 8.403 8.683 8.943 9.235 9.543 9.862 10.21 10.607 11.048 11.455 11.947 12.474 13.023 13.642 14.292 14.821 15.093 14.95 14.547 14.045 13.574 13.084 12.591 12.106 11.676 11.281 10.931 10.593 10.251 9.906 9.567 9.259 8.951 8.694 8.468 8.206 7.934 7.717 7.483 7.236 7.044 6.834 6.617 6.412 6.203 6.042 5.867 5.602 5.411 5.2 5.097 4.884 4.641 4.385 4.254 3.742 3.853 3.688 3.516 3.121 2.875 2.618 2.318 1.956 1.547 0.97 -1.624 -9 ,29192 ,TETRA ,17603991,Sun Nov 28 17:08:55 CET,Sun Nov 28 19:00:57 CET,0.0 1.509 2.037 2.391 2.662 2.898 3.111 3.293 3.644 3.804 3.947 3.815 4.314 4.431 4.65 4.832 5.009 5.098 5.274 5.45 5.695 5.854 6.009 6.226 6.422 6.611 6.809 6.995 7.235 7.458 7.656 7.898 8.132 8.359 8.607 8.886 9.166 9.46 9.775 10.116 10.477 10.87 11.299 11.71 12.189 12.698 13.256 13.844 14.418 14.896 15.149 15.05 14.676 14.182 13.713 13.262 12.792 12.345 11.963 11.547 11.184 10.814 10.433 10.067 9.727 9.417 9.086 8.778 8.514 8.255 7.988 7.769 7.536 7.28 7.083 6.877 6.651 6.428 6.217 6.063 5.884 5.604 5.408 5.198 5.09 4.858 4.621 4.379 4.255 3.736 3.8 3.639 3.458 3.043 2.806 2.536 2.251 1.953 1.584 1.061 -0.608 -10 ,3644 ,TETRA ,17603992,Sun Nov 28 17:09:21 CET,Sun Nov 28 19:02:01 CET,0.0 1.148 1.576 1.91 2.205 2.447 2.667 2.866 3.188 3.342 3.491 3.351 3.858 3.981 4.217 4.426 4.626 4.719 4.892 5.057 5.29 5.446 5.606 5.831 6.037 6.233 6.412 6.59 6.823 7.034 7.232 7.461 7.702 7.937 8.205 8.5 8.766 9.054 9.356 9.683 10.042 10.43 10.884 11.37 11.893 12.438 13.034 13.69 14.431 15.049 15.331 15.084 14.602 14.064 13.584 13.113 12.601 12.121 11.711 11.254 10.864 10.529 10.19 9.867 9.542 9.245 8.956 8.674 8.423 8.165 7.902 7.702 7.483 7.215 6.998 6.783 6.564 6.337 6.091 5.918 5.73 5.436 5.247 5.038 4.921 4.689 4.459 4.21 4.076 3.548 3.636 3.493 3.324 2.892 2.659 2.413 2.123 1.809 1.42 0.856 -0.905 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index cea59ef9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16721 ,TETRA ,17603993,Sun Nov 28 17:09:23 CET,Sun Nov 28 19:02:03 CET,0.0 1.498 2.099 2.534 2.882 3.213 3.552 3.865 4.429 4.692 4.947 4.933 5.682 5.928 6.389 6.825 7.248 7.454 7.858 8.26 8.834 9.212 9.594 10.158 10.716 11.272 11.819 12.357 13.069 13.772 14.462 15.318 16.157 16.985 17.983 19.141 20.266 21.528 22.93 24.463 26.148 28.127 30.522 33.012 36.034 39.58 43.88 49.019 55.475 63.696 74.811 85.361 92.334 97.371 101.165 104.175 106.527 108.42 109.932 111.318 112.406 113.292 114.067 114.758 115.359 115.87 116.352 116.737 117.045 117.332 117.598 117.832 118.069 118.258 118.387 118.515 118.609 118.691 118.783 118.83 118.871 118.919 118.939 118.939 118.935 118.925 118.888 118.843 118.816 118.407 118.666 118.583 118.475 118.247 118.105 117.889 117.623 117.304 116.893 116.246 113.025 -2 ,16733 ,TETRA ,17603994,Sun Nov 28 17:09:25 CET,Sun Nov 28 19:03:07 CET,0.0 1.352 1.824 2.225 2.606 2.928 3.216 3.508 4.052 4.297 4.545 4.532 5.27 5.509 5.983 6.428 6.852 7.066 7.495 7.902 8.486 8.876 9.259 9.816 10.381 10.951 11.511 12.047 12.762 13.463 14.144 14.979 15.801 16.629 17.62 18.748 19.86 21.124 22.52 24.058 25.739 27.681 30.023 32.503 35.554 39.136 43.46 48.579 54.959 63.145 74.223 84.69 91.657 96.683 100.471 103.488 105.859 107.782 109.299 110.676 111.773 112.68 113.465 114.149 114.714 115.171 115.596 115.95 116.257 116.549 116.823 117.03 117.218 117.411 117.554 117.669 117.771 117.865 117.956 118.005 118.034 118.076 118.092 118.083 118.076 118.059 118.038 117.999 117.959 117.536 117.802 117.735 117.64 117.419 117.257 117.08 116.897 116.62 116.244 115.535 112.041 -3 ,5729 ,TETRA ,17603995,Sun Nov 28 17:09:25 CET,Sun Nov 28 19:02:57 CET,0.0 1.334 1.891 2.343 2.73 3.077 3.391 3.689 4.285 4.557 4.808 4.808 5.552 5.789 6.243 6.674 7.103 7.311 7.721 8.12 8.691 9.07 9.454 10.012 10.561 11.12 11.672 12.215 12.925 13.621 14.302 15.137 15.962 16.775 17.745 18.879 20.012 21.299 22.712 24.239 25.904 27.88 30.248 32.677 35.676 39.206 43.479 48.629 55.025 63.245 74.362 84.856 91.954 97.043 100.814 103.789 106.139 108.034 109.512 110.87 111.915 112.773 113.554 114.213 114.766 115.251 115.726 116.124 116.435 116.73 117.026 117.248 117.464 117.663 117.795 117.917 118.029 118.125 118.211 118.263 118.307 118.37 118.388 118.378 118.363 118.329 118.315 118.301 118.269 117.857 118.147 118.091 118.02 117.781 117.616 117.438 117.228 116.97 116.544 115.93 112.821 -4 ,11454 ,TETRA ,17603996,Sun Nov 28 17:09:26 CET,Sun Nov 28 19:03:04 CET,0.0 1.399 1.924 2.357 2.715 3.037 3.354 3.661 4.221 4.473 4.723 4.705 5.428 5.654 6.1 6.535 6.961 7.167 7.571 7.974 8.571 8.956 9.334 9.891 10.449 11.014 11.558 12.086 12.79 13.494 14.187 15.035 15.871 16.708 17.686 18.802 19.919 21.19 22.609 24.146 25.81 27.77 30.149 32.607 35.597 39.112 43.414 48.572 54.957 63.18 74.311 84.852 91.915 96.991 100.778 103.737 106.048 107.948 109.444 110.799 111.88 112.773 113.545 114.212 114.786 115.259 115.716 116.089 116.398 116.697 116.962 117.181 117.383 117.561 117.701 117.834 117.952 118.058 118.144 118.185 118.218 118.265 118.289 118.301 118.305 118.307 118.281 118.23 118.187 117.745 117.969 117.898 117.805 117.556 117.391 117.167 116.912 116.632 116.267 115.663 111.349 -5 ,1070 ,TETRA ,17603997,Sun Nov 28 17:09:27 CET,Sun Nov 28 19:02:37 CET,0.0 1.056 1.56 1.948 2.279 2.596 2.901 3.184 3.719 3.983 4.237 4.211 4.955 5.197 5.662 6.122 6.552 6.754 7.168 7.58 8.164 8.546 8.929 9.504 10.064 10.619 11.173 11.711 12.4 13.086 13.768 14.601 15.431 16.261 17.245 18.383 19.515 20.794 22.21 23.753 25.448 27.415 29.792 32.294 35.347 38.899 43.175 48.315 54.757 63.072 74.261 84.758 91.83 96.908 100.702 103.698 105.995 107.833 109.257 110.564 111.63 112.515 113.272 113.932 114.482 114.941 115.408 115.782 116.085 116.376 116.637 116.837 117.039 117.221 117.346 117.453 117.539 117.622 117.696 117.748 117.788 117.798 117.794 117.792 117.785 117.75 117.683 117.607 117.553 117.119 117.381 117.295 117.159 116.874 116.712 116.526 116.313 116.055 115.675 115.051 112.412 -6 ,30202 ,TETRA ,17603998,Sun Nov 28 17:09:25 CET,Sun Nov 28 19:02:26 CET,0.0 1.173 1.738 2.182 2.534 2.854 3.172 3.479 4.043 4.311 4.56 4.53 5.261 5.487 5.927 6.364 6.799 7.016 7.44 7.846 8.432 8.815 9.206 9.792 10.359 10.913 11.464 12.01 12.712 13.404 14.101 14.971 15.82 16.651 17.655 18.811 19.942 21.221 22.637 24.173 25.829 27.756 30.101 32.572 35.572 39.089 43.398 48.548 54.975 63.186 74.316 84.848 91.841 96.912 100.718 103.696 106.057 107.977 109.461 110.792 111.828 112.676 113.435 114.119 114.706 115.197 115.666 116.044 116.355 116.658 116.935 117.139 117.349 117.565 117.7 117.816 117.929 118.027 118.112 118.159 118.21 118.272 118.293 118.298 118.296 118.275 118.253 118.206 118.16 117.75 118.04 117.974 117.892 117.71 117.594 117.42 117.191 116.915 116.556 116.014 113.391 -7 ,10011 ,TETRA ,17603999,Sun Nov 28 17:09:25 CET,Sun Nov 28 19:02:15 CET,0.0 1.065 1.567 1.99 2.37 2.708 3.007 3.294 3.837 4.084 4.319 4.291 5.025 5.25 5.692 6.121 6.537 6.743 7.162 7.578 8.192 8.586 8.977 9.553 10.116 10.677 11.229 11.764 12.462 13.152 13.848 14.713 15.556 16.382 17.336 18.448 19.578 20.864 22.279 23.809 25.477 27.415 29.777 32.276 35.31 38.872 43.241 48.412 54.814 63.067 74.174 84.619 91.598 96.623 100.434 103.429 105.713 107.595 109.099 110.476 111.548 112.415 113.185 113.872 114.456 114.933 115.386 115.77 116.07 116.338 116.608 116.835 117.039 117.227 117.358 117.483 117.596 117.695 117.79 117.845 117.887 117.93 117.961 117.983 117.98 117.965 117.961 117.935 117.904 117.487 117.71 117.625 117.548 117.348 117.194 116.987 116.761 116.489 116.138 115.615 112.854 -8 ,12079 ,TETRA ,17604000,Sun Nov 28 17:09:25 CET,Sun Nov 28 19:02:24 CET,0.0 1.267 1.793 2.195 2.539 2.863 3.171 3.453 3.973 4.232 4.488 4.482 5.227 5.461 5.922 6.378 6.813 7.029 7.454 7.863 8.448 8.837 9.228 9.79 10.341 10.883 11.417 11.947 12.638 13.324 14.017 14.882 15.737 16.58 17.571 18.7 19.814 21.086 22.507 24.053 25.73 27.701 30.081 32.571 35.603 39.129 43.405 48.557 55.044 63.365 74.439 84.985 92.1 97.158 100.95 103.954 106.318 108.213 109.694 111.083 112.179 113.079 113.869 114.536 115.102 115.581 116.053 116.454 116.763 117.049 117.329 117.53 117.711 117.883 118.008 118.135 118.256 118.363 118.452 118.499 118.543 118.592 118.603 118.618 118.629 118.632 118.596 118.526 118.485 118.07 118.339 118.285 118.224 118.012 117.868 117.679 117.421 117.106 116.746 116.26 114.079 -9 ,30647 ,TETRA ,17604001,Sun Nov 28 17:09:26 CET,Sun Nov 28 19:02:02 CET,0.0 1.246 1.756 2.128 2.475 2.805 3.13 3.436 3.987 4.24 4.491 4.48 5.204 5.438 5.903 6.34 6.759 6.963 7.37 7.785 8.393 8.794 9.187 9.76 10.328 10.886 11.43 11.965 12.663 13.354 14.037 14.885 15.726 16.565 17.563 18.702 19.83 21.105 22.522 24.077 25.749 27.688 30.058 32.529 35.51 39.031 43.353 48.501 54.959 63.242 74.446 85.003 92.021 97.095 100.906 103.908 106.242 108.145 109.618 110.974 112.046 112.92 113.698 114.384 114.975 115.471 115.949 116.346 116.661 116.954 117.239 117.451 117.655 117.861 118.001 118.126 118.239 118.332 118.416 118.484 118.546 118.582 118.574 118.57 118.57 118.558 118.543 118.503 118.463 118.044 118.287 118.218 118.117 117.826 117.668 117.488 117.271 116.955 116.497 115.835 112.458 -10 ,22230 ,TETRA ,17604002,Sun Nov 28 17:09:25 CET,Sun Nov 28 19:02:45 CET,0.0 1.088 1.571 2.0 2.373 2.695 3.001 3.304 3.847 4.102 4.353 4.325 5.059 5.29 5.734 6.16 6.578 6.789 7.207 7.621 8.227 8.622 9.016 9.589 10.146 10.685 11.215 11.741 12.441 13.152 13.86 14.73 15.58 16.412 17.392 18.523 19.642 20.913 22.329 23.864 25.532 27.48 29.845 32.308 35.297 38.823 43.134 48.303 54.758 63.044 74.347 84.971 92.078 97.188 100.943 103.918 106.244 108.152 109.659 111.022 112.079 112.952 113.735 114.417 114.988 115.47 115.927 116.294 116.591 116.882 117.159 117.356 117.551 117.741 117.859 117.971 118.079 118.168 118.234 118.268 118.304 118.346 118.369 118.388 118.387 118.342 118.282 118.201 118.143 117.723 117.97 117.869 117.761 117.498 117.336 117.152 116.972 116.648 116.19 115.552 112.26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 006b01ed..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1698 ,KEBNE ,17027591,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:19:57 CET,0.0 1.302 1.771 2.175 2.574 2.94 3.261 3.563 4.109 4.365 4.624 4.624 5.36 5.593 6.041 6.461 6.879 7.084 7.487 7.894 8.502 8.89 9.268 9.821 10.363 10.896 11.417 11.946 12.66 13.341 14.003 14.837 15.641 16.433 17.396 18.493 19.561 20.771 22.122 23.59 25.185 27.063 29.35 31.707 34.539 37.886 41.977 46.887 52.993 60.782 71.285 81.208 87.823 92.572 96.141 98.927 101.07 102.845 104.241 105.48 106.441 107.226 107.924 108.529 109.053 109.478 109.882 110.211 110.466 110.708 110.938 111.117 111.282 111.43 111.539 111.633 111.713 111.795 111.856 111.865 111.863 111.856 111.842 111.814 111.79 111.734 111.672 111.604 111.551 111.102 111.322 111.216 111.115 110.888 110.723 110.534 110.334 110.081 109.743 109.137 106.727 -2 ,15106 ,KEBNE ,17027592,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:19:57 CET,0.0 1.569 2.14 2.607 2.978 3.312 3.618 3.924 4.503 4.786 5.063 5.072 5.804 6.029 6.478 6.917 7.339 7.542 7.941 8.331 8.888 9.26 9.634 10.182 10.725 11.255 11.779 12.308 12.997 13.658 14.32 15.144 15.959 16.765 17.72 18.817 19.89 21.096 22.444 23.94 25.542 27.395 29.639 31.978 34.814 38.103 42.158 47.067 53.19 61.055 71.634 81.539 88.109 92.79 96.284 99.039 101.131 102.814 104.167 105.41 106.368 107.141 107.831 108.422 108.925 109.35 109.76 110.092 110.344 110.579 110.822 111.024 111.188 111.326 111.431 111.53 111.598 111.631 111.663 111.682 111.681 111.671 111.671 111.651 111.629 111.574 111.499 111.413 111.363 110.916 111.175 111.099 110.994 110.713 110.561 110.392 110.179 109.903 109.539 109.032 106.434 -3 ,4209 ,KEBNE ,17027593,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:18:07 CET,0.0 1.214 1.788 2.22 2.6 2.937 3.223 3.498 4.006 4.255 4.508 4.51 5.247 5.483 5.936 6.358 6.776 6.991 7.423 7.85 8.468 8.863 9.258 9.84 10.406 10.965 11.511 12.038 12.725 13.416 14.103 14.941 15.767 16.58 17.528 18.62 19.697 20.919 22.286 23.77 25.391 27.272 29.539 31.907 34.773 38.117 42.194 47.124 53.27 61.033 71.449 81.237 87.754 92.462 95.976 98.732 100.886 102.651 104.017 105.198 106.114 106.875 107.548 108.149 108.666 109.086 109.473 109.816 110.089 110.336 110.559 110.722 110.876 111.013 111.101 111.189 111.28 111.371 111.454 111.495 111.533 111.581 111.598 111.614 111.613 111.591 111.56 111.498 111.469 111.051 111.31 111.225 111.145 110.967 110.838 110.645 110.414 110.166 109.854 109.36 107.387 -4 ,29413 ,KEBNE ,17027594,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:19:22 CET,0.0 1.422 1.942 2.374 2.758 3.097 3.405 3.702 4.276 4.542 4.779 4.749 5.492 5.729 6.197 6.642 7.07 7.287 7.707 8.112 8.712 9.114 9.503 10.052 10.587 11.14 11.695 12.223 12.91 13.589 14.254 15.073 15.889 16.691 17.626 18.719 19.82 21.064 22.439 23.944 25.582 27.467 29.751 32.169 35.072 38.459 42.614 47.437 53.367 61.121 71.507 81.301 87.904 92.629 96.177 98.96 101.087 102.778 104.116 105.356 106.305 107.083 107.78 108.36 108.84 109.264 109.689 110.002 110.235 110.491 110.724 110.894 111.073 111.23 111.332 111.429 111.527 111.606 111.646 111.663 111.672 111.671 111.669 111.642 111.622 111.58 111.499 111.42 111.393 110.971 111.236 111.159 111.071 110.853 110.712 110.563 110.39 110.135 109.779 109.36 107.737 -5 ,26418 ,KEBNE ,17027595,Wed Dec 22 17:40:01 CET,Wed Dec 22 19:19:47 CET,0.0 1.337 1.917 2.339 2.695 3.033 3.354 3.648 4.206 4.479 4.747 4.751 5.48 5.704 6.14 6.57 7.018 7.236 7.631 8.015 8.592 8.974 9.352 9.906 10.455 10.988 11.506 12.025 12.715 13.386 14.05 14.885 15.698 16.508 17.477 18.578 19.664 20.894 22.268 23.78 25.39 27.251 29.506 31.864 34.742 38.112 42.217 47.086 53.156 60.978 71.516 81.477 88.171 92.96 96.476 99.21 101.359 103.145 104.528 105.752 106.742 107.533 108.212 108.812 109.312 109.741 110.145 110.48 110.743 110.984 111.23 111.409 111.571 111.734 111.835 111.915 111.986 112.035 112.088 112.12 112.145 112.178 112.18 112.164 112.144 112.098 112.044 111.957 111.895 111.449 111.706 111.634 111.54 111.304 111.173 111.036 110.847 110.561 110.231 109.808 108.168 -6 ,20332 ,KEBNE ,17027596,Wed Dec 22 17:40:00 CET,Wed Dec 22 19:18:15 CET,0.0 1.335 1.898 2.352 2.746 3.106 3.417 3.713 4.289 4.544 4.79 4.767 5.489 5.721 6.178 6.618 7.051 7.26 7.663 8.063 8.672 9.082 9.472 10.045 10.601 11.131 11.652 12.177 12.876 13.558 14.22 15.028 15.838 16.641 17.576 18.666 19.754 20.981 22.345 23.823 25.426 27.297 29.561 31.915 34.782 38.128 42.195 47.107 53.259 61.08 71.569 81.48 88.061 92.836 96.422 99.21 101.322 103.013 104.335 105.556 106.54 107.325 108.03 108.644 109.124 109.537 109.937 110.262 110.541 110.813 111.063 111.242 111.406 111.535 111.616 111.706 111.776 111.823 111.857 111.872 111.887 111.875 111.851 111.844 111.843 111.83 111.78 111.707 111.671 111.24 111.519 111.442 111.354 111.144 110.995 110.799 110.593 110.385 110.093 109.662 107.919 -7 ,20254 ,KEBNE ,17027597,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:18:27 CET,0.0 1.039 1.535 1.943 2.291 2.602 2.894 3.177 3.717 3.983 4.24 4.197 4.921 5.149 5.575 6.003 6.43 6.634 7.038 7.443 8.031 8.415 8.795 9.361 9.916 10.463 10.997 11.516 12.208 12.881 13.544 14.367 15.173 15.97 16.921 18.025 19.137 20.391 21.745 23.239 24.861 26.723 28.952 31.286 34.188 37.591 41.672 46.551 52.698 60.556 71.171 81.079 87.585 92.259 95.75 98.447 100.525 102.266 103.639 104.843 105.804 106.623 107.318 107.913 108.441 108.87 109.251 109.562 109.813 110.064 110.31 110.49 110.663 110.821 110.913 110.976 111.044 111.117 111.16 111.187 111.214 111.238 111.251 111.241 111.226 111.206 111.18 111.102 111.056 110.626 110.886 110.804 110.708 110.46 110.301 110.107 109.89 109.645 109.334 108.88 106.911 -8 ,1514 ,KEBNE ,17027598,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:17:39 CET,0.0 1.315 1.832 2.252 2.63 2.961 3.279 3.571 4.091 4.34 4.573 4.546 5.284 5.517 5.959 6.382 6.799 7.006 7.419 7.825 8.403 8.775 9.142 9.686 10.231 10.776 11.305 11.826 12.52 13.204 13.885 14.71 15.504 16.296 17.253 18.373 19.47 20.691 22.057 23.563 25.176 27.037 29.316 31.714 34.589 37.924 41.976 46.829 52.923 60.759 71.364 81.342 87.956 92.715 96.241 98.974 101.068 102.788 104.117 105.307 106.234 106.987 107.671 108.267 108.777 109.2 109.583 109.894 110.152 110.392 110.61 110.779 110.937 111.076 111.166 111.242 111.309 111.372 111.429 111.452 111.475 111.507 111.508 111.493 111.479 111.445 111.403 111.341 111.307 110.883 111.157 111.072 110.976 110.745 110.604 110.443 110.232 109.972 109.655 109.227 107.211 -9 ,23925 ,KEBNE ,17027599,Wed Dec 22 17:40:02 CET,Wed Dec 22 19:17:40 CET,0.0 1.477 1.981 2.406 2.786 3.123 3.447 3.753 4.315 4.574 4.82 4.796 5.525 5.75 6.21 6.651 7.054 7.259 7.677 8.081 8.664 9.042 9.419 9.975 10.533 11.069 11.578 12.084 12.754 13.432 14.109 14.948 15.769 16.567 17.513 18.59 19.662 20.879 22.226 23.699 25.303 27.17 29.422 31.764 34.588 37.9 41.926 46.751 52.803 60.579 71.127 81.064 87.633 92.353 95.919 98.703 100.839 102.558 103.918 105.14 106.074 106.842 107.509 108.075 108.569 109.004 109.428 109.774 110.055 110.335 110.563 110.719 110.886 111.036 111.14 111.228 111.288 111.354 111.417 111.441 111.451 111.458 111.467 111.461 111.449 111.418 111.383 111.337 111.3 110.872 111.156 111.09 111.0 110.799 110.653 110.472 110.296 110.096 109.816 109.364 107.321 -10 ,14164 ,KEBNE ,17027600,Wed Dec 22 17:40:03 CET,Wed Dec 22 19:17:39 CET,0.0 1.438 1.922 2.342 2.735 3.076 3.371 3.66 4.209 4.466 4.726 4.714 5.451 5.697 6.142 6.558 6.972 7.184 7.604 8.009 8.578 8.939 9.324 9.916 10.469 11.006 11.541 12.064 12.75 13.432 14.127 14.993 15.843 16.686 17.67 18.781 19.871 21.094 22.448 23.976 25.625 27.499 29.793 32.183 35.052 38.431 42.528 47.377 53.429 61.154 71.722 81.719 88.408 93.203 96.705 99.454 101.599 103.374 104.754 105.983 106.936 107.725 108.421 108.981 109.446 109.848 110.253 110.604 110.88 111.143 111.393 111.575 111.742 111.905 112.021 112.1 112.168 112.247 112.311 112.346 112.364 112.356 112.341 112.32 112.309 112.273 112.226 112.175 112.147 111.725 112.006 111.939 111.836 111.6 111.475 111.326 111.151 110.912 110.573 110.081 107.935 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 3ee4c6b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23520 ,TETRA ,17604003,Sun Nov 28 17:09:25 CET,Sun Nov 28 19:03:39 CET,0.0 1.213 1.625 1.972 2.282 2.573 2.842 3.106 3.62 3.846 4.062 4.026 4.729 4.942 5.332 5.727 6.116 6.298 6.635 6.961 7.467 7.808 8.144 8.615 9.075 9.545 10.013 10.481 11.085 11.66 12.228 12.937 13.649 14.358 15.167 16.072 16.977 17.999 19.125 20.364 21.704 23.252 25.125 27.029 29.306 31.982 35.237 39.12 43.918 50.005 58.008 65.26 70.136 73.671 76.173 78.045 79.506 80.641 81.479 82.227 82.78 83.21 83.583 83.904 84.141 84.326 84.517 84.636 84.712 84.794 84.845 84.868 84.883 84.877 84.855 84.817 84.769 84.683 84.578 84.516 84.448 84.347 84.272 84.161 84.086 83.923 83.745 83.528 83.416 82.904 83.009 82.871 82.726 82.319 82.043 81.742 81.423 81.028 80.544 79.901 74.557 -2 ,13975 ,TETRA ,17604004,Sun Nov 28 17:09:28 CET,Sun Nov 28 19:04:06 CET,0.0 1.224 1.736 2.147 2.504 2.81 3.107 3.387 3.912 4.162 4.395 4.349 5.038 5.238 5.633 6.018 6.39 6.57 6.928 7.279 7.788 8.122 8.448 8.926 9.404 9.867 10.32 10.769 11.366 11.969 12.544 13.227 13.885 14.523 15.293 16.193 17.093 18.109 19.23 20.465 21.788 23.326 25.208 27.112 29.409 32.123 35.364 39.23 43.999 50.07 58.215 65.573 70.409 73.669 75.981 77.814 79.19 80.321 81.214 82.035 82.651 83.122 83.517 83.842 84.123 84.346 84.558 84.736 84.861 84.943 85.008 85.056 85.079 85.087 85.074 85.049 85.03 84.987 84.924 84.852 84.759 84.612 84.496 84.361 84.286 84.138 83.982 83.792 83.678 83.19 83.36 83.245 83.121 82.771 82.536 82.271 81.975 81.626 81.155 80.525 77.76 -3 ,8198 ,TETRA ,17604005,Sun Nov 28 17:09:23 CET,Sun Nov 28 19:03:15 CET,0.0 1.548 2.1 2.535 2.923 3.244 3.55 3.835 4.333 4.569 4.795 4.745 5.43 5.627 6.006 6.389 6.764 6.946 7.3 7.641 8.16 8.505 8.839 9.325 9.796 10.258 10.707 11.146 11.709 12.268 12.844 13.557 14.246 14.919 15.729 16.648 17.53 18.52 19.61 20.815 22.142 23.693 25.526 27.418 29.734 32.431 35.665 39.552 44.457 50.587 58.653 66.0 70.648 73.914 76.353 78.214 79.626 80.81 81.75 82.578 83.201 83.681 84.086 84.429 84.717 84.937 85.128 85.261 85.346 85.403 85.436 85.482 85.528 85.56 85.554 85.516 85.468 85.419 85.365 85.318 85.261 85.174 85.105 85.013 84.963 84.84 84.706 84.548 84.449 83.966 84.129 84.0 83.859 83.505 83.297 83.056 82.759 82.372 81.804 80.936 76.401 -4 ,10049 ,TETRA ,17604006,Sun Nov 28 17:09:23 CET,Sun Nov 28 19:10:02 CET,0.0 0.988 1.491 1.898 2.251 2.571 2.879 3.183 3.754 4.013 4.255 4.214 4.899 5.1 5.514 5.933 6.338 6.532 6.902 7.248 7.755 8.088 8.415 8.903 9.372 9.83 10.296 10.76 11.357 11.937 12.512 13.21 13.897 14.576 15.366 16.274 17.188 18.209 19.338 20.575 21.89 23.409 25.27 27.188 29.512 32.26 35.545 39.43 44.185 50.169 58.109 65.385 70.131 73.419 75.821 77.648 79.001 80.044 80.848 81.551 82.063 82.484 82.854 83.134 83.349 83.509 83.641 83.756 83.849 83.915 83.935 83.936 83.925 83.912 83.893 83.857 83.826 83.792 83.734 83.668 83.591 83.461 83.354 83.223 83.156 83.014 82.862 82.69 82.58 82.082 82.256 82.115 81.94 81.52 81.296 81.062 80.754 80.312 79.753 78.996 75.099 -5 ,2288 ,TETRA ,17604007,Sun Nov 28 17:09:24 CET,Sun Nov 28 19:09:53 CET,0.0 1.362 1.863 2.266 2.645 3.001 3.302 3.577 4.076 4.323 4.564 4.535 5.226 5.433 5.819 6.195 6.58 6.761 7.107 7.449 7.949 8.277 8.608 9.091 9.562 10.03 10.491 10.939 11.517 12.097 12.675 13.376 14.051 14.715 15.523 16.455 17.376 18.413 19.548 20.78 22.075 23.574 25.415 27.338 29.663 32.387 35.672 39.581 44.386 50.408 58.498 66.036 71.034 74.504 76.917 78.775 80.277 81.476 82.328 83.073 83.65 84.115 84.526 84.83 85.058 85.25 85.416 85.552 85.659 85.742 85.782 85.786 85.789 85.771 85.737 85.687 85.609 85.541 85.464 85.401 85.347 85.236 85.141 85.029 84.963 84.834 84.703 84.547 84.459 83.974 84.153 84.017 83.857 83.546 83.343 83.07 82.764 82.42 81.955 81.262 78.203 -6 ,7777 ,TETRA ,17604008,Sun Nov 28 17:09:26 CET,Sun Nov 28 19:03:24 CET,0.0 1.22 1.667 2.079 2.46 2.77 3.053 3.321 3.781 4.002 4.223 4.179 4.874 5.083 5.481 5.851 6.216 6.399 6.748 7.103 7.629 7.967 8.294 8.777 9.255 9.72 10.189 10.65 11.246 11.817 12.374 13.059 13.718 14.377 15.173 16.081 16.984 18.006 19.141 20.392 21.725 23.257 25.105 27.03 29.348 32.036 35.281 39.136 43.944 49.982 58.058 65.532 70.372 73.794 76.261 78.112 79.458 80.523 81.372 82.175 82.814 83.297 83.708 84.052 84.321 84.522 84.707 84.834 84.931 85.022 85.069 85.117 85.151 85.142 85.139 85.123 85.091 85.049 84.989 84.939 84.878 84.769 84.67 84.558 84.497 84.364 84.213 84.035 83.943 83.455 83.581 83.439 83.276 82.882 82.67 82.45 82.172 81.813 81.38 80.777 78.099 -7 ,12296 ,TETRA ,17604009,Sun Nov 28 17:09:28 CET,Sun Nov 28 19:03:08 CET,0.0 1.522 2.028 2.41 2.768 3.081 3.348 3.618 4.154 4.401 4.638 4.639 5.346 5.563 5.978 6.363 6.726 6.907 7.259 7.603 8.112 8.453 8.797 9.298 9.81 10.328 10.817 11.286 11.888 12.479 13.058 13.763 14.456 15.137 15.967 16.932 17.867 18.897 20.025 21.267 22.594 24.141 26.021 27.952 30.274 32.985 36.266 40.158 45.07 51.23 59.246 66.675 71.489 74.853 77.314 79.226 80.625 81.686 82.506 83.192 83.718 84.153 84.492 84.762 84.989 85.19 85.391 85.551 85.654 85.724 85.787 85.834 85.868 85.886 85.878 85.865 85.841 85.812 85.771 85.718 85.661 85.569 85.475 85.36 85.312 85.208 85.072 84.892 84.787 84.285 84.385 84.229 84.066 83.646 83.41 83.162 82.854 82.484 82.037 81.353 78.676 -9 ,13771 ,TETRA ,17604011,Sun Nov 28 17:09:27 CET,Sun Nov 28 19:04:12 CET,0.0 1.062 1.598 2.042 2.426 2.788 3.127 3.427 3.959 4.206 4.446 4.423 5.12 5.337 5.747 6.137 6.514 6.704 7.084 7.458 8.015 8.377 8.718 9.218 9.725 10.213 10.688 11.16 11.773 12.375 12.949 13.654 14.365 15.07 15.894 16.831 17.744 18.762 19.874 21.112 22.498 24.107 26.006 27.963 30.315 33.04 36.38 40.326 45.141 51.233 59.26 66.656 71.544 75.046 77.577 79.465 80.872 81.98 82.814 83.539 84.116 84.553 84.923 85.236 85.48 85.704 85.917 86.054 86.123 86.165 86.223 86.283 86.309 86.273 86.245 86.222 86.195 86.166 86.109 86.055 85.974 85.837 85.752 85.652 85.603 85.51 85.377 85.213 85.128 84.649 84.845 84.731 84.579 84.191 83.971 83.754 83.493 83.172 82.734 82.054 78.802 -10 ,4071 ,TETRA ,17604012,Sun Nov 28 17:09:24 CET,Sun Nov 28 19:03:45 CET,0.0 1.482 1.979 2.37 2.731 3.077 3.406 3.709 4.3 4.58 4.861 4.915 5.618 5.817 6.206 6.602 7.0 7.191 7.56 7.916 8.438 8.776 9.107 9.589 10.056 10.52 10.997 11.467 12.069 12.658 13.241 13.957 14.658 15.352 16.164 17.104 18.027 19.05 20.165 21.376 22.673 24.195 26.096 28.088 30.434 33.115 36.392 40.278 45.038 51.053 59.038 66.47 71.317 74.759 77.253 79.144 80.638 81.828 82.739 83.564 84.187 84.683 85.096 85.413 85.662 85.85 86.005 86.121 86.2 86.253 86.28 86.289 86.272 86.244 86.217 86.171 86.12 86.056 85.97 85.897 85.817 85.67 85.552 85.436 85.38 85.258 85.105 84.92 84.826 84.347 84.499 84.345 84.192 83.873 83.669 83.421 83.146 82.821 82.413 81.812 79.103 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt deleted file mode 100644 index 7304ca4b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3387 ,TETRA ,17604013,Sun Nov 28 17:09:26 CET,Sun Nov 28 19:03:25 CET,0.0 1.717 2.15 2.463 2.734 2.984 3.202 3.382 3.713 3.874 4.023 3.806 4.401 4.511 4.725 4.925 5.122 5.217 5.394 5.567 5.82 5.975 6.104 6.286 6.472 6.648 6.811 6.955 7.133 7.308 7.48 7.691 7.9 8.092 8.289 8.48 8.641 8.786 8.94 9.107 9.242 9.36 9.486 9.594 9.604 9.513 9.389 9.07 8.393 7.161 4.804 1.823 -0.579 -2.543 -4.213 -5.67 -6.968 -8.224 -9.333 -10.414 -11.303 -12.083 -12.863 -13.587 -14.259 -14.904 -15.554 -16.11 -16.602 -17.113 -17.611 -18.019 -18.461 -18.924 -19.272 -19.621 -19.982 -20.348 -20.723 -20.982 -21.249 -21.68 -21.975 -22.268 -22.419 -22.736 -23.07 -23.428 -23.622 -24.318 -24.241 -24.468 -24.702 -25.23 -25.505 -25.824 -26.199 -26.631 -27.166 -27.821 -31.807 -2 ,27907 ,TETRA ,17604014,Sun Nov 28 17:09:25 CET,Sun Nov 28 19:04:17 CET,0.0 3.245 3.887 4.269 4.566 4.82 5.058 5.288 5.708 5.89 6.06 5.892 6.496 6.6 6.792 6.99 7.195 7.292 7.485 7.673 7.918 8.063 8.205 8.414 8.605 8.775 8.924 9.067 9.255 9.436 9.598 9.782 9.943 10.074 10.249 10.471 10.653 10.801 10.968 11.149 11.27 11.373 11.475 11.522 11.556 11.522 11.271 10.83 10.091 8.807 6.61 3.903 1.605 -0.4 -2.117 -3.604 -4.929 -6.097 -7.105 -8.13 -8.982 -9.732 -10.454 -11.144 -11.765 -12.367 -13.036 -13.62 -14.112 -14.641 -15.182 -15.599 -16.03 -16.482 -16.835 -17.192 -17.553 -17.928 -18.33 -18.614 -18.898 -19.362 -19.684 -20.017 -20.192 -20.559 -20.952 -21.359 -21.569 -22.269 -22.181 -22.408 -22.649 -23.167 -23.454 -23.785 -24.155 -24.567 -25.064 -25.734 -30.407 -3 ,17963 ,TETRA ,17604015,Sun Nov 28 17:09:27 CET,Sun Nov 28 19:04:15 CET,0.0 1.579 2.058 2.377 2.672 2.941 3.169 3.378 3.721 3.878 4.044 3.838 4.431 4.549 4.783 4.993 5.185 5.284 5.487 5.661 5.867 6.001 6.139 6.319 6.464 6.623 6.779 6.927 7.131 7.294 7.439 7.607 7.756 7.9 8.068 8.277 8.45 8.597 8.782 8.943 9.093 9.276 9.38 9.406 9.385 9.221 8.901 8.445 7.726 6.436 4.09 1.287 -1.052 -3.047 -4.744 -6.215 -7.507 -8.675 -9.612 -10.529 -11.351 -12.124 -12.875 -13.584 -14.249 -14.831 -15.43 -15.956 -16.399 -16.856 -17.327 -17.726 -18.182 -18.648 -18.969 -19.3 -19.664 -20.057 -20.467 -20.749 -21.033 -21.442 -21.736 -22.052 -22.217 -22.594 -22.977 -23.346 -23.54 -24.256 -24.186 -24.415 -24.664 -25.16 -25.441 -25.755 -26.063 -26.436 -26.959 -27.694 -29.908 -4 ,16772 ,TETRA ,17604016,Sun Nov 28 17:09:29 CET,Sun Nov 28 19:04:21 CET,0.0 2.101 2.616 2.926 3.193 3.466 3.696 3.881 4.234 4.427 4.627 4.509 5.147 5.298 5.58 5.836 6.08 6.183 6.353 6.508 6.711 6.85 6.992 7.183 7.356 7.525 7.678 7.835 8.032 8.204 8.359 8.525 8.673 8.819 9.012 9.212 9.333 9.447 9.61 9.769 9.876 9.955 10.031 10.105 10.151 10.105 9.905 9.524 8.808 7.57 5.344 2.503 0.141 -1.873 -3.55 -5.043 -6.346 -7.468 -8.465 -9.541 -10.523 -11.364 -12.09 -12.795 -13.454 -14.024 -14.634 -15.194 -15.652 -16.127 -16.624 -17.025 -17.433 -17.862 -18.197 -18.525 -18.867 -19.248 -19.643 -19.91 -20.19 -20.6 -20.883 -21.187 -21.346 -21.668 -22.011 -22.392 -22.604 -23.321 -23.275 -23.524 -23.779 -24.348 -24.667 -24.962 -25.283 -25.698 -26.238 -27.053 -29.916 -5 ,19102 ,TETRA ,17604017,Sun Nov 28 17:09:30 CET,Sun Nov 28 19:04:17 CET,0.0 1.404 1.904 2.257 2.517 2.736 2.935 3.119 3.433 3.569 3.698 3.478 4.077 4.193 4.417 4.626 4.816 4.907 5.076 5.243 5.49 5.655 5.8 5.978 6.133 6.278 6.426 6.575 6.779 6.966 7.118 7.312 7.492 7.634 7.83 8.029 8.147 8.271 8.405 8.554 8.655 8.78 8.951 9.002 8.976 8.853 8.627 8.229 7.501 6.25 4.009 1.226 -1.05 -2.947 -4.579 -6.088 -7.376 -8.502 -9.461 -10.449 -11.355 -12.19 -12.991 -13.704 -14.324 -14.871 -15.466 -16.03 -16.516 -16.99 -17.472 -17.904 -18.342 -18.78 -19.117 -19.459 -19.812 -20.174 -20.557 -20.817 -21.074 -21.484 -21.778 -22.084 -22.25 -22.596 -22.937 -23.297 -23.483 -24.182 -24.13 -24.358 -24.601 -25.133 -25.412 -25.723 -26.051 -26.416 -26.926 -27.647 -30.53 -6 ,32167 ,TETRA ,17604018,Sun Nov 28 17:09:25 CET,Sun Nov 28 19:04:16 CET,0.0 2.458 2.96 3.337 3.608 3.847 4.065 4.266 4.638 4.791 4.929 4.706 5.305 5.417 5.62 5.823 6.013 6.105 6.275 6.422 6.625 6.753 6.878 7.062 7.268 7.48 7.674 7.864 8.102 8.331 8.542 8.766 8.979 9.184 9.398 9.602 9.776 9.962 10.162 10.326 10.457 10.622 10.804 10.909 10.929 10.915 10.823 10.465 9.807 8.649 6.365 3.482 1.195 -0.778 -2.517 -4.003 -5.275 -6.41 -7.417 -8.466 -9.377 -10.225 -11.017 -11.697 -12.299 -12.871 -13.491 -14.055 -14.527 -15.003 -15.511 -15.928 -16.364 -16.809 -17.159 -17.519 -17.869 -18.239 -18.625 -18.892 -19.181 -19.63 -19.945 -20.273 -20.443 -20.793 -21.143 -21.522 -21.715 -22.407 -22.337 -22.565 -22.785 -23.275 -23.555 -23.839 -24.145 -24.489 -24.945 -25.656 -29.087 -7 ,3704 ,TETRA ,17604019,Sun Nov 28 17:09:25 CET,Sun Nov 28 19:04:16 CET,0.0 1.992 2.378 2.676 2.939 3.175 3.376 3.569 3.888 4.046 4.2 3.982 4.583 4.693 4.895 5.091 5.277 5.378 5.554 5.715 5.949 6.087 6.217 6.401 6.593 6.757 6.905 7.054 7.235 7.401 7.556 7.744 7.926 8.093 8.273 8.475 8.653 8.823 9.001 9.184 9.417 9.633 9.765 9.837 9.865 9.85 9.721 9.383 8.777 7.69 5.522 2.759 0.45 -1.518 -3.267 -4.916 -6.356 -7.658 -8.739 -9.782 -10.67 -11.427 -12.127 -12.755 -13.344 -13.944 -14.586 -15.149 -15.625 -16.109 -16.62 -17.051 -17.5 -17.932 -18.264 -18.613 -18.958 -19.316 -19.696 -19.96 -20.24 -20.706 -21.029 -21.352 -21.518 -21.843 -22.2 -22.578 -22.768 -23.463 -23.379 -23.614 -23.862 -24.372 -24.657 -24.982 -25.37 -25.803 -26.303 -27.0 -29.3 -8 ,7917 ,TETRA ,17604020,Sun Nov 28 17:09:28 CET,Sun Nov 28 19:05:50 CET,0.0 1.913 2.432 2.764 3.066 3.326 3.548 3.762 4.142 4.296 4.451 4.269 4.881 4.997 5.206 5.415 5.62 5.717 5.909 6.09 6.32 6.465 6.616 6.835 7.03 7.217 7.372 7.504 7.679 7.859 8.038 8.237 8.412 8.56 8.741 8.941 9.1 9.249 9.377 9.499 9.608 9.688 9.765 9.81 9.77 9.626 9.412 9.019 8.212 6.825 4.384 1.456 -0.871 -2.866 -4.563 -6.06 -7.384 -8.541 -9.551 -10.557 -11.38 -12.132 -12.892 -13.599 -14.227 -14.807 -15.429 -15.989 -16.464 -16.91 -17.364 -17.765 -18.185 -18.63 -18.987 -19.363 -19.728 -20.101 -20.522 -20.815 -21.1 -21.508 -21.782 -22.072 -22.228 -22.559 -22.918 -23.323 -23.534 -24.254 -24.239 -24.489 -24.744 -25.284 -25.58 -25.911 -26.28 -26.693 -27.241 -27.967 -30.818 -9 ,12084 ,TETRA ,17604021,Sun Nov 28 17:09:29 CET,Sun Nov 28 19:05:52 CET,0.0 2.382 2.974 3.344 3.649 3.911 4.136 4.316 4.643 4.804 4.952 4.756 5.357 5.477 5.703 5.903 6.113 6.215 6.402 6.559 6.762 6.895 7.017 7.202 7.388 7.545 7.677 7.808 7.991 8.169 8.332 8.517 8.705 8.874 9.037 9.225 9.423 9.606 9.743 9.875 10.006 10.106 10.181 10.279 10.348 10.301 10.15 9.926 9.399 8.279 6.09 3.19 0.817 -1.216 -2.949 -4.514 -5.887 -7.09 -8.098 -9.125 -10.036 -10.859 -11.613 -12.275 -12.894 -13.467 -14.069 -14.616 -15.077 -15.562 -16.065 -16.466 -16.893 -17.363 -17.746 -18.147 -18.538 -18.924 -19.314 -19.581 -19.852 -20.3 -20.644 -20.973 -21.131 -21.497 -21.907 -22.323 -22.522 -23.216 -23.131 -23.356 -23.6 -24.134 -24.42 -24.768 -25.167 -25.571 -26.009 -26.641 -29.095 -10 ,17856 ,TETRA ,17604022,Sun Nov 28 17:09:26 CET,Sun Nov 28 19:03:58 CET,0.0 1.504 1.979 2.326 2.592 2.827 3.028 3.221 3.58 3.733 3.872 3.646 4.241 4.362 4.613 4.848 5.059 5.155 5.329 5.481 5.687 5.826 5.955 6.149 6.35 6.528 6.684 6.852 7.065 7.234 7.384 7.585 7.794 7.977 8.175 8.36 8.512 8.686 8.864 9.002 9.068 9.142 9.219 9.246 9.244 9.115 8.83 8.347 7.58 6.365 4.079 1.174 -1.247 -3.286 -5.065 -6.637 -7.986 -9.203 -10.24 -11.251 -12.127 -12.934 -13.676 -14.383 -15.027 -15.611 -16.245 -16.805 -17.282 -17.777 -18.292 -18.703 -19.108 -19.533 -19.872 -20.234 -20.628 -21.021 -21.428 -21.721 -22.017 -22.466 -22.779 -23.115 -23.289 -23.65 -24.034 -24.449 -24.666 -25.394 -25.395 -25.642 -25.916 -26.491 -26.781 -27.105 -27.448 -27.821 -28.288 -28.943 -31.052 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt deleted file mode 100644 index 133571b8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26484 ,TETRA ,17604023,Sun Nov 28 17:09:27 CET,Sun Nov 28 19:03:14 CET,0.0 1.106 1.594 2.006 2.376 2.685 2.949 3.21 3.73 3.972 4.19 4.139 4.789 4.986 5.369 5.743 6.107 6.288 6.648 6.99 7.472 7.798 8.12 8.595 9.063 9.52 9.967 10.406 10.987 11.555 12.109 12.8 13.484 14.156 14.948 15.843 16.717 17.69 18.784 19.988 21.297 22.858 24.718 26.612 28.913 31.555 34.71 38.512 43.262 49.223 57.064 64.142 68.68 71.9 74.258 76.056 77.416 78.458 79.225 79.897 80.412 80.837 81.197 81.474 81.703 81.863 81.993 82.098 82.16 82.221 82.277 82.302 82.304 82.276 82.241 82.19 82.141 82.067 81.949 81.864 81.782 81.651 81.554 81.417 81.341 81.168 80.963 80.743 80.622 80.142 80.203 80.021 79.83 79.403 79.141 78.874 78.567 78.173 77.656 76.936 74.148 -2 ,7331 ,TETRA ,17604024,Sun Nov 28 17:09:52 CET,Sun Nov 28 19:05:34 CET,0.0 1.245 1.683 2.037 2.351 2.656 2.945 3.218 3.724 3.971 4.2 4.168 4.83 5.037 5.419 5.781 6.14 6.316 6.652 6.985 7.497 7.835 8.165 8.645 9.091 9.533 9.979 10.41 10.976 11.543 12.103 12.821 13.551 14.242 15.025 15.927 16.82 17.825 18.922 20.105 21.399 22.924 24.748 26.638 28.924 31.568 34.768 38.525 43.167 49.077 56.771 63.842 68.496 71.722 74.051 75.836 77.192 78.268 79.064 79.756 80.304 80.73 81.086 81.377 81.592 81.749 81.87 81.959 82.029 82.088 82.118 82.115 82.113 82.11 82.099 82.072 82.013 81.933 81.825 81.742 81.659 81.512 81.397 81.256 81.184 81.041 80.854 80.636 80.52 80.039 80.086 79.906 79.705 79.254 78.978 78.643 78.245 77.745 77.112 76.201 73.166 -3 ,16121 ,TETRA ,17604025,Sun Nov 28 17:09:53 CET,Sun Nov 28 19:05:20 CET,0.0 1.56 2.037 2.417 2.765 3.077 3.356 3.626 4.134 4.374 4.6 4.556 5.203 5.397 5.779 6.136 6.486 6.665 6.997 7.331 7.843 8.169 8.491 8.966 9.431 9.897 10.359 10.806 11.397 11.983 12.547 13.23 13.91 14.578 15.362 16.262 17.148 18.148 19.261 20.477 21.787 23.301 25.124 27.02 29.299 31.938 35.098 38.86 43.588 49.536 57.359 64.552 69.208 72.458 74.781 76.558 77.963 79.071 79.907 80.656 81.209 81.631 81.961 82.225 82.469 82.651 82.793 82.897 82.968 83.025 83.084 83.119 83.126 83.119 83.088 83.033 82.978 82.914 82.831 82.76 82.673 82.533 82.414 82.282 82.213 82.031 81.837 81.628 81.512 81.047 81.133 80.955 80.773 80.31 80.009 79.667 79.266 78.815 78.287 77.563 74.779 -4 ,22804 ,TETRA ,17604026,Sun Nov 28 17:09:52 CET,Sun Nov 28 19:04:14 CET,0.0 1.449 1.999 2.395 2.746 3.039 3.324 3.586 4.043 4.275 4.507 4.471 5.11 5.301 5.677 6.059 6.448 6.631 6.975 7.315 7.804 8.122 8.451 8.935 9.391 9.842 10.307 10.768 11.344 11.905 12.459 13.166 13.866 14.519 15.289 16.19 17.08 18.071 19.153 20.346 21.638 23.131 24.976 26.895 29.191 31.831 34.942 38.631 43.258 49.111 56.857 64.019 68.692 71.975 74.378 76.226 77.573 78.625 79.436 80.135 80.649 81.051 81.4 81.682 81.904 82.063 82.2 82.302 82.383 82.454 82.474 82.485 82.52 82.524 82.501 82.479 82.441 82.38 82.318 82.283 82.229 82.077 81.956 81.825 81.745 81.572 81.37 81.157 81.057 80.572 80.612 80.436 80.249 79.825 79.582 79.337 79.055 78.664 78.139 77.393 74.554 -5 ,5634 ,TETRA ,17604027,Sun Nov 28 17:09:53 CET,Sun Nov 28 19:04:15 CET,0.0 1.089 1.56 1.926 2.24 2.529 2.793 3.052 3.547 3.787 4.029 4.027 4.684 4.883 5.277 5.677 6.054 6.225 6.566 6.913 7.418 7.738 8.054 8.534 9.008 9.454 9.886 10.321 10.904 11.48 12.039 12.745 13.441 14.102 14.884 15.788 16.67 17.651 18.757 19.966 21.277 22.809 24.631 26.497 28.773 31.432 34.593 38.321 42.928 48.821 56.75 63.977 68.624 71.86 74.192 75.999 77.361 78.432 79.238 79.941 80.464 80.851 81.191 81.501 81.751 81.935 82.093 82.203 82.276 82.324 82.368 82.398 82.392 82.367 82.344 82.314 82.273 82.199 82.098 82.026 81.931 81.749 81.62 81.492 81.422 81.241 81.03 80.804 80.675 80.196 80.279 80.106 79.905 79.438 79.193 78.929 78.605 78.201 77.722 77.002 72.963 -6 ,18612 ,TETRA ,17604028,Sun Nov 28 17:09:57 CET,Sun Nov 28 19:04:14 CET,0.0 1.307 1.776 2.151 2.484 2.801 3.098 3.356 3.836 4.08 4.32 4.297 4.953 5.158 5.545 5.924 6.289 6.459 6.797 7.136 7.632 7.959 8.281 8.743 9.187 9.644 10.083 10.503 11.075 11.644 12.214 12.911 13.587 14.259 15.062 16.004 16.906 17.868 18.954 20.174 21.471 22.964 24.771 26.648 28.922 31.549 34.718 38.516 43.265 49.239 57.018 64.157 68.838 72.083 74.403 76.171 77.511 78.578 79.365 80.041 80.571 80.982 81.324 81.617 81.854 82.029 82.188 82.309 82.383 82.452 82.506 82.505 82.478 82.471 82.454 82.405 82.372 82.321 82.209 82.142 82.069 81.895 81.758 81.626 81.554 81.384 81.222 81.036 80.929 80.457 80.554 80.409 80.256 79.893 79.676 79.452 79.137 78.695 78.09 77.219 73.888 -7 ,31785 ,TETRA ,17604029,Sun Nov 28 17:09:54 CET,Sun Nov 28 19:04:06 CET,0.0 1.013 1.556 1.952 2.304 2.632 2.917 3.186 3.677 3.892 4.106 4.072 4.723 4.918 5.304 5.675 6.046 6.226 6.574 6.928 7.446 7.774 8.1 8.57 9.027 9.484 9.93 10.365 10.932 11.497 12.05 12.747 13.433 14.086 14.876 15.803 16.698 17.699 18.796 19.972 21.249 22.749 24.568 26.451 28.724 31.361 34.549 38.38 43.156 49.11 56.898 64.015 68.608 71.83 74.2 76.042 77.455 78.567 79.407 80.142 80.708 81.123 81.437 81.72 81.955 82.133 82.286 82.397 82.497 82.575 82.612 82.625 82.62 82.612 82.593 82.556 82.52 82.45 82.345 82.28 82.202 82.051 81.941 81.827 81.757 81.603 81.419 81.189 81.061 80.57 80.637 80.462 80.25 79.737 79.46 79.171 78.868 78.53 78.038 77.343 74.008 -8 ,3368 ,TETRA ,17604030,Sun Nov 28 17:09:53 CET,Sun Nov 28 19:03:19 CET,0.0 1.254 1.752 2.158 2.515 2.823 3.098 3.349 3.808 4.031 4.249 4.201 4.848 5.045 5.424 5.803 6.162 6.332 6.676 7.02 7.519 7.838 8.151 8.619 9.08 9.536 9.989 10.441 11.036 11.621 12.201 12.908 13.58 14.223 15.008 15.914 16.808 17.838 18.965 20.188 21.509 23.026 24.844 26.719 28.986 31.621 34.76 38.507 43.199 49.051 56.728 63.828 68.414 71.65 74.008 75.809 77.177 78.224 79.027 79.747 80.284 80.703 81.065 81.33 81.536 81.691 81.816 81.913 81.978 82.033 82.075 82.079 82.065 82.045 82.001 81.959 81.91 81.828 81.726 81.645 81.561 81.432 81.343 81.223 81.152 81.009 80.84 80.624 80.49 80.001 80.065 79.891 79.7 79.292 79.053 78.744 78.388 77.97 77.357 76.377 72.672 -9 ,16986 ,TETRA ,17604031,Sun Nov 28 17:09:54 CET,Sun Nov 28 19:03:37 CET,0.0 1.583 2.107 2.511 2.854 3.166 3.453 3.725 4.228 4.467 4.703 4.689 5.352 5.563 5.97 6.362 6.733 6.916 7.273 7.62 8.138 8.485 8.827 9.315 9.775 10.227 10.681 11.115 11.685 12.26 12.816 13.489 14.164 14.837 15.647 16.572 17.472 18.494 19.609 20.82 22.127 23.651 25.48 27.34 29.579 32.225 35.395 39.131 43.838 49.78 57.564 64.701 69.319 72.524 74.849 76.619 77.952 79.028 79.834 80.546 81.11 81.563 81.94 82.216 82.433 82.593 82.73 82.844 82.904 82.943 82.947 82.935 82.933 82.907 82.875 82.841 82.785 82.697 82.597 82.528 82.453 82.321 82.22 82.101 82.027 81.853 81.658 81.46 81.339 80.852 80.932 80.755 80.566 80.104 79.856 79.572 79.231 78.81 78.264 77.525 74.288 -10 ,2136 ,TETRA ,17604032,Sun Nov 28 17:09:56 CET,Sun Nov 28 19:03:59 CET,0.0 1.157 1.654 2.025 2.323 2.629 2.925 3.186 3.672 3.907 4.126 4.088 4.749 4.944 5.33 5.739 6.123 6.296 6.635 6.984 7.513 7.85 8.175 8.664 9.149 9.599 10.023 10.46 11.056 11.629 12.177 12.857 13.549 14.229 15.022 15.944 16.847 17.852 18.95 20.151 21.439 22.933 24.733 26.623 28.977 31.694 34.919 38.703 43.337 49.24 57.186 64.488 69.184 72.436 74.804 76.622 77.978 79.022 79.822 80.557 81.114 81.526 81.863 82.158 82.404 82.578 82.738 82.888 82.981 83.041 83.098 83.128 83.139 83.109 83.064 83.003 82.934 82.859 82.755 82.671 82.584 82.418 82.299 82.157 82.077 81.906 81.721 81.502 81.364 80.871 80.96 80.803 80.629 80.251 80.008 79.72 79.419 79.101 78.692 78.078 75.327 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 14ada615..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3814 ,TETRA ,17604033,Sun Nov 28 17:09:59 CET,Sun Nov 28 19:03:08 CET,0.0 1.074 1.536 1.874 2.16 2.394 2.599 2.775 3.099 3.249 3.392 3.26 3.787 3.916 4.168 4.415 4.638 4.745 4.961 5.178 5.474 5.648 5.822 6.088 6.329 6.561 6.797 7.022 7.298 7.563 7.833 8.164 8.494 8.809 9.153 9.539 9.92 10.36 10.831 11.336 11.883 12.501 13.232 13.933 14.744 15.689 16.753 17.928 19.361 21.074 23.021 24.486 25.222 25.556 25.63 25.594 25.518 25.401 25.244 25.05 24.858 24.664 24.451 24.245 24.045 23.854 23.645 23.445 23.252 23.037 22.811 22.614 22.405 22.177 21.997 21.81 21.614 21.418 21.219 21.076 20.926 20.696 20.516 20.315 20.213 20.015 19.811 19.563 19.429 18.935 19.037 18.881 18.711 18.294 18.045 17.804 17.533 17.174 16.672 16.004 13.046 -2 ,22330 ,TETRA ,17604034,Sun Nov 28 17:09:53 CET,Sun Nov 28 19:04:35 CET,0.0 1.289 1.675 1.984 2.247 2.492 2.708 2.891 3.237 3.405 3.569 3.472 4.014 4.156 4.421 4.66 4.871 4.967 5.161 5.352 5.632 5.821 6.004 6.274 6.517 6.738 6.964 7.193 7.485 7.754 8.002 8.309 8.623 8.942 9.313 9.712 10.098 10.519 10.983 11.472 11.986 12.6 13.302 13.971 14.776 15.728 16.842 18.063 19.425 21.025 22.957 24.326 24.925 25.184 25.28 25.264 25.134 24.97 24.808 24.6 24.368 24.146 23.936 23.725 23.525 23.315 23.075 22.86 22.666 22.452 22.215 22.004 21.799 21.597 21.432 21.255 21.069 20.882 20.671 20.523 20.372 20.117 19.94 19.749 19.651 19.447 19.225 19.0 18.87 18.345 18.393 18.237 18.082 17.727 17.507 17.255 16.972 16.628 16.175 15.512 13.139 -3 ,7609 ,TETRA ,17604035,Sun Nov 28 17:09:58 CET,Sun Nov 28 19:04:46 CET,0.0 1.365 1.745 2.021 2.283 2.533 2.761 2.947 3.278 3.443 3.603 3.479 4.005 4.123 4.347 4.583 4.805 4.915 5.133 5.333 5.604 5.781 5.947 6.193 6.447 6.684 6.905 7.131 7.43 7.72 7.998 8.321 8.621 8.919 9.294 9.704 10.079 10.501 10.971 11.468 11.991 12.579 13.274 13.995 14.825 15.75 16.858 18.124 19.522 21.039 22.752 23.99 24.57 24.814 24.893 24.875 24.77 24.592 24.409 24.208 24.013 23.819 23.621 23.415 23.211 23.022 22.805 22.6 22.422 22.22 21.984 21.792 21.602 21.417 21.278 21.114 20.936 20.753 20.543 20.39 20.236 19.984 19.795 19.598 19.499 19.286 19.04 18.789 18.661 18.146 18.173 17.986 17.788 17.352 17.128 16.879 16.601 16.276 15.863 15.249 13.112 -4 ,2275 ,TETRA ,17604036,Sun Nov 28 17:09:53 CET,Sun Nov 28 19:03:12 CET,0.0 1.459 1.888 2.201 2.474 2.71 2.927 3.113 3.435 3.593 3.758 3.668 4.211 4.346 4.578 4.774 4.972 5.075 5.26 5.448 5.74 5.926 6.107 6.354 6.591 6.831 7.062 7.288 7.573 7.843 8.108 8.44 8.76 9.066 9.426 9.84 10.238 10.644 11.099 11.61 12.123 12.713 13.436 14.15 14.967 15.887 16.947 18.155 19.604 21.286 23.288 24.748 25.39 25.704 25.784 25.728 25.631 25.477 25.299 25.112 24.933 24.747 24.55 24.36 24.164 23.97 23.775 23.571 23.387 23.216 23.017 22.833 22.645 22.439 22.275 22.101 21.909 21.693 21.46 21.307 21.156 20.927 20.756 20.55 20.444 20.236 20.018 19.785 19.642 19.116 19.153 18.973 18.781 18.323 18.078 17.816 17.519 17.197 16.781 16.179 13.762 -5 ,21723 ,TETRA ,17604037,Sun Nov 28 17:09:56 CET,Sun Nov 28 19:02:59 CET,0.0 1.13 1.591 1.959 2.256 2.512 2.728 2.909 3.245 3.4 3.553 3.443 3.966 4.081 4.31 4.529 4.737 4.836 5.03 5.213 5.482 5.66 5.826 6.072 6.302 6.528 6.753 6.971 7.249 7.518 7.785 8.108 8.412 8.703 9.051 9.458 9.845 10.264 10.713 11.202 11.724 12.31 13.041 13.76 14.563 15.483 16.547 17.761 19.147 20.707 22.585 24.027 24.654 24.962 25.077 25.03 24.914 24.731 24.538 24.328 24.097 23.87 23.66 23.453 23.245 23.064 22.865 22.658 22.473 22.281 22.07 21.897 21.709 21.504 21.347 21.183 21.008 20.812 20.601 20.439 20.271 20.03 19.861 19.668 19.557 19.335 19.122 18.874 18.738 18.225 18.295 18.13 17.956 17.559 17.327 17.065 16.756 16.394 15.971 15.287 12.083 -6 ,5523 ,TETRA ,17604038,Sun Nov 28 17:09:54 CET,Sun Nov 28 19:03:08 CET,0.0 1.262 1.65 1.945 2.21 2.452 2.661 2.849 3.197 3.362 3.51 3.407 3.947 4.079 4.336 4.579 4.795 4.895 5.093 5.281 5.539 5.705 5.873 6.113 6.34 6.566 6.801 7.041 7.33 7.605 7.872 8.192 8.499 8.792 9.129 9.51 9.887 10.297 10.741 11.227 11.748 12.342 13.04 13.766 14.608 15.526 16.596 17.839 19.279 20.885 22.741 24.071 24.644 24.879 24.989 25.01 24.934 24.805 24.648 24.452 24.269 24.082 23.878 23.672 23.462 23.264 23.051 22.842 22.656 22.46 22.258 22.076 21.864 21.639 21.459 21.273 21.088 20.896 20.677 20.519 20.367 20.128 19.942 19.751 19.653 19.445 19.226 18.98 18.853 18.349 18.407 18.247 18.071 17.6 17.316 17.022 16.717 16.317 15.791 15.052 12.282 -7 ,25087 ,TETRA ,17604039,Sun Nov 28 17:09:55 CET,Sun Nov 28 19:03:13 CET,0.0 0.909 1.262 1.574 1.867 2.108 2.319 2.506 2.816 2.962 3.113 3.017 3.544 3.661 3.894 4.107 4.298 4.391 4.593 4.79 5.078 5.269 5.439 5.683 5.93 6.172 6.405 6.641 6.94 7.207 7.466 7.784 8.096 8.405 8.772 9.188 9.578 9.993 10.443 10.926 11.439 12.035 12.738 13.428 14.246 15.198 16.318 17.527 18.927 20.604 22.424 23.715 24.372 24.696 24.784 24.74 24.645 24.531 24.396 24.215 24.029 23.826 23.626 23.435 23.219 23.009 22.776 22.559 22.381 22.196 21.998 21.826 21.63 21.428 21.273 21.097 20.905 20.702 20.507 20.366 20.21 19.968 19.801 19.61 19.504 19.297 19.07 18.824 18.695 18.182 18.262 18.102 17.929 17.544 17.317 17.057 16.755 16.405 15.984 15.388 12.774 -8 ,2503 ,TETRA ,17604040,Sun Nov 28 17:09:58 CET,Sun Nov 28 19:03:13 CET,0.0 1.254 1.648 1.939 2.213 2.454 2.674 2.878 3.233 3.39 3.532 3.385 3.895 4.015 4.259 4.499 4.722 4.819 5.005 5.189 5.455 5.628 5.803 6.061 6.305 6.543 6.777 7.0 7.295 7.583 7.846 8.159 8.465 8.781 9.161 9.564 9.949 10.379 10.839 11.324 11.821 12.396 13.093 13.803 14.644 15.538 16.563 17.817 19.324 21.02 22.887 24.148 24.659 24.888 24.967 24.9 24.776 24.62 24.475 24.293 24.107 23.926 23.728 23.527 23.319 23.125 22.906 22.697 22.501 22.28 22.059 21.882 21.7 21.489 21.312 21.141 20.959 20.76 20.545 20.394 20.239 19.984 19.802 19.608 19.505 19.295 19.07 18.819 18.674 18.15 18.21 18.038 17.855 17.481 17.275 17.04 16.759 16.428 16.038 15.443 13.168 -9 ,6835 ,TETRA ,17604041,Sun Nov 28 17:09:59 CET,Sun Nov 28 19:03:08 CET,0.0 1.367 1.853 2.211 2.481 2.691 2.875 3.06 3.417 3.567 3.698 3.553 4.076 4.203 4.447 4.665 4.869 4.97 5.176 5.373 5.634 5.8 5.97 6.222 6.472 6.724 6.962 7.18 7.458 7.725 7.99 8.336 8.67 8.981 9.332 9.71 10.077 10.504 10.985 11.477 11.987 12.558 13.216 13.891 14.688 15.59 16.636 17.859 19.337 21.049 23.031 24.425 24.965 25.183 25.276 25.263 25.16 24.999 24.802 24.582 24.4 24.224 24.031 23.835 23.654 23.462 23.25 23.053 22.866 22.678 22.462 22.275 22.1 21.91 21.759 21.599 21.414 21.213 21.012 20.864 20.694 20.425 20.229 20.017 19.909 19.698 19.474 19.225 19.089 18.562 18.601 18.43 18.248 17.845 17.605 17.336 17.005 16.597 16.102 15.447 12.87 -10 ,32282 ,TETRA ,17604042,Sun Nov 28 17:09:55 CET,Sun Nov 28 19:03:08 CET,0.0 1.07 1.529 1.866 2.135 2.368 2.592 2.786 3.092 3.238 3.397 3.284 3.81 3.938 4.163 4.39 4.605 4.7 4.89 5.086 5.368 5.556 5.733 5.97 6.193 6.42 6.654 6.874 7.159 7.433 7.697 8.021 8.337 8.654 9.012 9.407 9.803 10.248 10.729 11.234 11.768 12.388 13.099 13.803 14.626 15.528 16.564 17.765 19.241 20.881 22.652 23.93 24.495 24.705 24.732 24.69 24.629 24.505 24.343 24.152 23.94 23.728 23.514 23.309 23.113 22.931 22.745 22.548 22.367 22.19 21.986 21.797 21.587 21.388 21.236 21.068 20.899 20.712 20.503 20.356 20.202 19.966 19.796 19.601 19.497 19.29 19.053 18.782 18.644 18.128 18.186 18.019 17.85 17.466 17.242 17.0 16.705 16.338 15.896 15.249 12.915 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 2c6a2e44..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1524 ,TETRA ,17604043,Sun Nov 28 17:09:56 CET,Sun Nov 28 19:03:43 CET,0.0 1.287 1.726 2.052 2.331 2.579 2.796 2.987 3.319 3.474 3.619 3.49 4.016 4.139 4.374 4.603 4.821 4.93 5.137 5.342 5.661 5.85 6.027 6.284 6.527 6.751 6.962 7.181 7.467 7.737 7.997 8.316 8.614 8.894 9.227 9.595 9.943 10.338 10.765 11.204 11.676 12.236 12.876 13.55 14.382 15.256 16.194 17.212 18.309 19.509 20.796 21.482 21.611 21.476 21.232 20.943 20.607 20.259 19.935 19.552 19.198 18.89 18.618 18.339 18.05 17.777 17.481 17.22 16.998 16.779 16.534 16.325 16.103 15.862 15.669 15.465 15.25 15.032 14.804 14.639 14.465 14.188 13.999 13.804 13.7 13.493 13.271 13.007 12.862 12.341 12.444 12.288 12.112 11.691 11.465 11.203 10.916 10.54 10.081 9.499 7.209 -2 ,3076 ,TETRA ,17604044,Sun Nov 28 17:09:58 CET,Sun Nov 28 19:04:22 CET,0.0 2.026 2.61 3.016 3.341 3.609 3.852 4.073 4.479 4.657 4.813 4.701 5.232 5.369 5.641 5.902 6.146 6.259 6.473 6.687 7.009 7.211 7.411 7.696 7.968 8.236 8.485 8.719 9.038 9.356 9.643 9.972 10.291 10.591 10.934 11.318 11.679 12.074 12.521 13.028 13.551 14.134 14.819 15.469 16.232 17.043 17.882 18.806 19.928 21.193 22.418 23.165 23.288 23.104 22.855 22.564 22.25 21.902 21.569 21.218 20.909 20.636 20.348 20.071 19.81 19.544 19.256 19.006 18.789 18.565 18.335 18.138 17.922 17.676 17.476 17.27 17.063 16.854 16.638 16.485 16.321 16.06 15.881 15.686 15.586 15.378 15.155 14.913 14.789 14.263 14.335 14.174 14.002 13.614 13.389 13.135 12.854 12.54 12.143 11.583 9.664 -3 ,18326 ,TETRA ,17604045,Sun Nov 28 17:10:00 CET,Sun Nov 28 19:04:07 CET,0.0 1.253 1.692 2.002 2.257 2.505 2.722 2.93 3.327 3.512 3.69 3.6 4.125 4.258 4.523 4.779 5.03 5.153 5.388 5.613 5.92 6.111 6.297 6.558 6.81 7.062 7.308 7.537 7.822 8.082 8.34 8.661 8.955 9.252 9.617 10.019 10.39 10.784 11.23 11.729 12.255 12.821 13.477 14.128 14.855 15.649 16.565 17.547 18.695 20.029 21.352 22.02 22.106 21.995 21.81 21.545 21.226 20.872 20.509 20.12 19.771 19.453 19.164 18.877 18.61 18.353 18.048 17.796 17.591 17.365 17.117 16.905 16.681 16.444 16.247 16.04 15.816 15.585 15.363 15.198 15.016 14.753 14.567 14.35 14.234 13.993 13.752 13.516 13.383 12.855 12.966 12.812 12.655 12.304 12.095 11.854 11.566 11.235 10.798 10.11 7.495 -4 ,32527 ,TETRA ,17604046,Sun Nov 28 17:09:56 CET,Sun Nov 28 19:04:46 CET,0.0 1.102 1.5 1.797 2.051 2.304 2.535 2.723 3.043 3.183 3.324 3.212 3.736 3.852 4.095 4.351 4.602 4.722 4.934 5.127 5.399 5.57 5.745 6.006 6.25 6.489 6.723 6.942 7.218 7.477 7.727 8.042 8.357 8.654 8.991 9.361 9.715 10.106 10.527 10.978 11.448 11.976 12.606 13.229 13.933 14.704 15.58 16.599 17.751 18.899 20.022 20.606 20.711 20.597 20.358 20.067 19.744 19.386 19.037 18.646 18.274 17.945 17.628 17.319 17.037 16.767 16.472 16.206 15.969 15.72 15.47 15.263 15.044 14.806 14.604 14.398 14.199 13.989 13.749 13.584 13.418 13.146 12.952 12.747 12.642 12.429 12.189 11.935 11.805 11.278 11.352 11.183 11.019 10.632 10.392 10.129 9.813 9.449 8.994 8.27 5.808 -5 ,24443 ,TETRA ,17604047,Sun Nov 28 17:09:57 CET,Sun Nov 28 19:05:03 CET,0.0 1.515 1.984 2.296 2.546 2.785 3.0 3.197 3.556 3.722 3.872 3.759 4.296 4.434 4.71 4.977 5.224 5.342 5.564 5.765 6.046 6.241 6.437 6.715 6.955 7.176 7.391 7.601 7.885 8.157 8.428 8.761 9.076 9.377 9.724 10.114 10.503 10.93 11.368 11.859 12.383 12.928 13.555 14.188 14.932 15.741 16.632 17.607 18.673 19.858 21.084 21.798 21.968 21.886 21.658 21.371 21.074 20.758 20.461 20.098 19.754 19.463 19.18 18.901 18.584 18.252 17.914 17.607 17.327 17.04 16.739 16.481 16.211 15.942 15.73 15.492 15.235 14.972 14.716 14.535 14.334 14.017 13.793 13.559 13.443 13.197 12.927 12.64 12.486 11.942 12.016 11.85 11.671 11.24 11.014 10.777 10.492 10.158 9.728 9.112 7.489 -6 ,26811 ,TETRA ,17604048,Sun Nov 28 17:10:00 CET,Sun Nov 28 19:05:17 CET,0.0 1.514 2.095 2.515 2.816 3.076 3.317 3.525 3.892 4.063 4.22 4.111 4.642 4.778 5.026 5.252 5.469 5.571 5.775 5.982 6.273 6.444 6.602 6.827 7.056 7.296 7.538 7.757 8.024 8.276 8.518 8.82 9.122 9.419 9.756 10.146 10.524 10.929 11.38 11.863 12.355 12.898 13.517 14.131 14.851 15.601 16.426 17.402 18.565 19.794 21.0 21.744 21.887 21.727 21.452 21.156 20.88 20.571 20.227 19.85 19.51 19.184 18.866 18.568 18.293 18.033 17.759 17.523 17.301 17.055 16.804 16.593 16.356 16.088 15.884 15.683 15.48 15.281 15.058 14.89 14.708 14.416 14.213 14.012 13.909 13.701 13.479 13.243 13.116 12.592 12.697 12.537 12.331 11.806 11.519 11.215 10.859 10.471 10.014 9.373 7.419 -7 ,1231 ,TETRA ,17604049,Sun Nov 28 17:10:01 CET,Sun Nov 28 19:04:46 CET,0.0 1.652 2.064 2.39 2.659 2.908 3.137 3.349 3.707 3.864 4.029 3.923 4.463 4.622 4.92 5.157 5.372 5.478 5.685 5.89 6.171 6.342 6.509 6.743 6.975 7.209 7.432 7.646 7.925 8.202 8.469 8.779 9.088 9.38 9.708 10.094 10.452 10.84 11.259 11.697 12.168 12.692 13.315 13.939 14.61 15.436 16.424 17.444 18.628 19.855 20.969 21.573 21.645 21.512 21.322 21.055 20.74 20.411 20.057 19.663 19.323 19.042 18.768 18.478 18.187 17.928 17.646 17.372 17.125 16.867 16.61 16.387 16.145 15.893 15.701 15.501 15.296 15.086 14.862 14.712 14.555 14.293 14.094 13.889 13.792 13.582 13.356 13.099 12.96 12.439 12.542 12.389 12.21 11.812 11.605 11.365 11.098 10.824 10.468 9.938 7.938 -8 ,12212 ,TETRA ,17604050,Sun Nov 28 17:09:56 CET,Sun Nov 28 19:04:07 CET,0.0 1.164 1.581 1.869 2.092 2.294 2.499 2.69 3.044 3.212 3.365 3.243 3.768 3.888 4.127 4.359 4.571 4.676 4.89 5.093 5.373 5.556 5.723 5.968 6.205 6.439 6.684 6.919 7.202 7.469 7.735 8.05 8.347 8.646 8.994 9.366 9.729 10.146 10.593 11.035 11.485 12.022 12.672 13.3 14.013 14.823 15.695 16.657 17.752 18.834 19.81 20.242 20.206 20.009 19.743 19.396 19.001 18.604 18.248 17.864 17.53 17.237 16.947 16.666 16.393 16.126 15.836 15.566 15.325 15.081 14.827 14.611 14.386 14.142 13.939 13.716 13.48 13.248 13.018 12.853 12.67 12.397 12.212 12.013 11.91 11.694 11.459 11.205 11.074 10.545 10.628 10.464 10.292 9.916 9.7 9.441 9.14 8.827 8.461 7.973 6.225 -9 ,4240 ,TETRA ,17604051,Sun Nov 28 17:09:56 CET,Sun Nov 28 19:04:06 CET,0.0 1.854 2.388 2.76 3.053 3.314 3.529 3.705 4.073 4.253 4.42 4.328 4.861 4.997 5.249 5.468 5.674 5.783 5.999 6.203 6.493 6.68 6.857 7.12 7.371 7.617 7.851 8.06 8.34 8.623 8.898 9.228 9.532 9.825 10.176 10.558 10.904 11.293 11.715 12.145 12.604 13.128 13.764 14.419 15.169 16.006 16.983 18.059 19.267 20.497 21.78 22.638 22.807 22.688 22.441 22.16 21.888 21.538 21.185 20.835 20.527 20.246 19.933 19.615 19.34 19.082 18.796 18.535 18.312 18.062 17.785 17.556 17.306 17.047 16.85 16.638 16.427 16.219 15.986 15.814 15.646 15.387 15.19 14.979 14.874 14.656 14.409 14.157 14.023 13.495 13.553 13.375 13.209 12.871 12.672 12.432 12.159 11.841 11.437 10.913 8.876 -10 ,17540 ,TETRA ,17604052,Sun Nov 28 17:09:59 CET,Sun Nov 28 19:04:34 CET,0.0 1.454 1.905 2.232 2.496 2.736 2.953 3.178 3.633 3.81 3.961 3.854 4.378 4.501 4.74 4.967 5.166 5.264 5.456 5.644 5.926 6.104 6.278 6.528 6.765 7.005 7.239 7.472 7.788 8.085 8.357 8.673 8.974 9.271 9.625 10.026 10.416 10.842 11.268 11.701 12.171 12.713 13.33 13.944 14.688 15.508 16.417 17.448 18.672 20.045 21.414 22.177 22.34 22.231 21.99 21.688 21.347 21.017 20.681 20.293 19.955 19.638 19.337 19.05 18.756 18.475 18.192 17.937 17.711 17.454 17.175 16.946 16.71 16.461 16.261 16.064 15.847 15.599 15.356 15.191 15.002 14.702 14.509 14.302 14.191 13.964 13.719 13.451 13.314 12.792 12.864 12.694 12.515 12.127 11.924 11.691 11.433 11.16 10.78 10.247 8.494 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 91e6e720..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31620 ,TETRA ,17604053,Sun Nov 28 17:10:00 CET,Sun Nov 28 19:03:13 CET,0.0 1.531 2.008 2.336 2.61 2.836 3.026 3.197 3.497 3.628 3.756 3.63 4.124 4.235 4.449 4.639 4.805 4.886 5.05 5.202 5.417 5.548 5.676 5.887 6.097 6.293 6.463 6.619 6.817 7.013 7.209 7.44 7.654 7.847 8.061 8.308 8.561 8.825 9.11 9.43 9.756 10.064 10.389 10.699 11.032 11.413 11.799 12.118 12.343 12.357 11.927 10.936 9.823 8.728 7.76 6.913 6.155 5.441 4.807 4.189 3.64 3.118 2.645 2.206 1.795 1.44 1.08 0.748 0.446 0.137 -0.179 -0.45 -0.726 -1.012 -1.238 -1.458 -1.688 -1.925 -2.183 -2.365 -2.539 -2.818 -3.022 -3.246 -3.365 -3.619 -3.887 -4.175 -4.328 -4.85 -4.805 -4.98 -5.163 -5.58 -5.82 -6.074 -6.371 -6.733 -7.168 -7.747 -9.812 -2 ,23953 ,TETRA ,17604054,Sun Nov 28 17:09:57 CET,Sun Nov 28 19:02:37 CET,0.0 1.168 1.64 1.978 2.233 2.446 2.635 2.814 3.145 3.287 3.402 3.225 3.706 3.813 4.006 4.188 4.359 4.433 4.583 4.721 4.931 5.09 5.24 5.439 5.623 5.799 5.967 6.123 6.321 6.516 6.707 6.919 7.107 7.287 7.5 7.748 7.984 8.243 8.509 8.762 9.018 9.301 9.618 9.923 10.294 10.676 11.014 11.28 11.427 11.398 10.955 9.943 8.85 7.804 6.912 6.093 5.332 4.642 4.04 3.443 2.945 2.492 2.06 1.63 1.22 0.849 0.477 0.143 -0.172 -0.498 -0.849 -1.124 -1.383 -1.664 -1.887 -2.122 -2.375 -2.638 -2.91 -3.095 -3.284 -3.591 -3.822 -4.057 -4.172 -4.426 -4.719 -5.018 -5.173 -5.713 -5.684 -5.873 -6.069 -6.475 -6.717 -7.004 -7.306 -7.647 -8.043 -8.518 -10.091 -3 ,23270 ,TETRA ,17604055,Sun Nov 28 17:09:58 CET,Sun Nov 28 19:02:22 CET,0.0 1.327 1.743 2.061 2.335 2.546 2.734 2.92 3.226 3.37 3.509 3.365 3.841 3.934 4.11 4.292 4.468 4.55 4.708 4.859 5.072 5.204 5.327 5.524 5.713 5.877 6.039 6.192 6.393 6.593 6.785 7.002 7.197 7.378 7.606 7.884 8.136 8.383 8.639 8.918 9.198 9.474 9.793 10.101 10.404 10.724 11.016 11.259 11.502 11.489 10.917 9.925 8.905 7.899 7.005 6.227 5.555 4.915 4.32 3.705 3.15 2.665 2.217 1.78 1.361 0.991 0.61 0.262 -0.041 -0.356 -0.68 -0.959 -1.257 -1.563 -1.786 -2.011 -2.258 -2.515 -2.78 -2.964 -3.154 -3.471 -3.686 -3.902 -4.008 -4.218 -4.477 -4.772 -4.913 -5.434 -5.394 -5.576 -5.77 -6.215 -6.467 -6.741 -7.062 -7.44 -7.884 -8.55 -11.088 -4 ,30587 ,TETRA ,17604056,Sun Nov 28 17:10:27 CET,Sun Nov 28 19:04:10 CET,0.0 1.285 1.733 2.044 2.294 2.542 2.757 2.94 3.279 3.431 3.567 3.424 3.906 4.004 4.193 4.36 4.521 4.601 4.747 4.89 5.082 5.212 5.345 5.523 5.695 5.879 6.055 6.208 6.403 6.584 6.764 6.993 7.215 7.422 7.657 7.9 8.131 8.396 8.663 8.916 9.183 9.51 9.861 10.152 10.471 10.822 11.174 11.493 11.7 11.708 11.308 10.343 9.25 8.287 7.451 6.601 5.852 5.198 4.589 3.955 3.413 2.92 2.465 2.036 1.608 1.229 0.815 0.422 0.099 -0.224 -0.563 -0.862 -1.165 -1.455 -1.689 -1.939 -2.193 -2.448 -2.721 -2.91 -3.106 -3.424 -3.641 -3.876 -3.995 -4.231 -4.499 -4.801 -4.953 -5.477 -5.444 -5.626 -5.815 -6.269 -6.548 -6.885 -7.254 -7.657 -8.106 -8.673 -10.488 -5 ,12856 ,TETRA ,17604057,Sun Nov 28 17:10:28 CET,Sun Nov 28 19:03:20 CET,0.0 1.315 1.763 2.091 2.389 2.626 2.803 2.977 3.297 3.43 3.569 3.456 3.95 4.063 4.272 4.474 4.662 4.747 4.9 5.042 5.25 5.39 5.523 5.701 5.863 6.014 6.173 6.331 6.527 6.715 6.893 7.108 7.327 7.534 7.756 8.03 8.299 8.562 8.855 9.175 9.492 9.828 10.213 10.586 10.976 11.365 11.738 11.977 12.084 12.075 11.67 10.643 9.591 8.619 7.701 6.797 6.002 5.294 4.652 4.013 3.437 2.925 2.464 2.027 1.624 1.262 0.889 0.542 0.22 -0.109 -0.451 -0.728 -0.993 -1.286 -1.513 -1.736 -1.977 -2.256 -2.544 -2.727 -2.932 -3.258 -3.472 -3.713 -3.846 -4.117 -4.409 -4.71 -4.875 -5.422 -5.418 -5.613 -5.815 -6.268 -6.499 -6.731 -7.01 -7.364 -7.773 -8.334 -10.447 -6 ,10619 ,TETRA ,17604058,Sun Nov 28 17:10:33 CET,Sun Nov 28 19:08:22 CET,0.0 1.345 1.718 2.023 2.305 2.531 2.733 2.923 3.237 3.371 3.5 3.344 3.831 3.955 4.184 4.392 4.57 4.65 4.811 4.972 5.202 5.344 5.486 5.699 5.892 6.066 6.226 6.379 6.595 6.802 6.994 7.224 7.435 7.641 7.895 8.156 8.391 8.639 8.916 9.224 9.5 9.819 10.218 10.561 10.874 11.179 11.529 11.838 12.026 12.048 11.623 10.608 9.558 8.521 7.582 6.765 6.049 5.37 4.766 4.157 3.644 3.19 2.767 2.355 1.937 1.563 1.18 0.837 0.553 0.253 -0.055 -0.314 -0.609 -0.916 -1.152 -1.407 -1.662 -1.908 -2.162 -2.346 -2.536 -2.841 -3.063 -3.286 -3.397 -3.62 -3.863 -4.143 -4.292 -4.812 -4.75 -4.924 -5.112 -5.512 -5.738 -5.993 -6.325 -6.707 -7.134 -7.725 -10.404 -7 ,5343 ,TETRA ,17604059,Sun Nov 28 17:10:30 CET,Sun Nov 28 19:08:21 CET,0.0 1.184 1.648 2.008 2.289 2.534 2.762 2.944 3.261 3.401 3.529 3.38 3.86 3.963 4.155 4.351 4.533 4.621 4.786 4.939 5.153 5.282 5.421 5.628 5.821 6.015 6.191 6.348 6.551 6.747 6.924 7.129 7.329 7.527 7.755 7.992 8.212 8.473 8.744 9.004 9.277 9.589 9.952 10.266 10.593 10.94 11.255 11.512 11.709 11.752 11.351 10.442 9.465 8.51 7.567 6.715 5.99 5.299 4.68 4.033 3.49 3.021 2.567 2.127 1.715 1.343 0.956 0.613 0.316 0.011 -0.309 -0.571 -0.848 -1.155 -1.406 -1.668 -1.938 -2.216 -2.499 -2.707 -2.924 -3.259 -3.5 -3.737 -3.851 -4.091 -4.342 -4.597 -4.737 -5.269 -5.247 -5.429 -5.619 -6.072 -6.335 -6.604 -6.897 -7.262 -7.711 -8.235 -10.547 -8 ,28013 ,TETRA ,17604060,Sun Nov 28 17:10:27 CET,Sun Nov 28 19:03:13 CET,0.0 1.137 1.522 1.825 2.076 2.285 2.467 2.628 2.926 3.073 3.205 3.085 3.584 3.702 3.931 4.12 4.296 4.38 4.536 4.692 4.92 5.06 5.186 5.363 5.536 5.7 5.859 6.021 6.229 6.416 6.597 6.828 7.047 7.243 7.464 7.689 7.898 8.143 8.405 8.679 8.961 9.254 9.579 9.875 10.191 10.517 10.855 11.19 11.478 11.552 11.12 10.087 9.07 8.135 7.241 6.42 5.674 4.983 4.374 3.753 3.241 2.797 2.376 1.969 1.583 1.25 0.875 0.507 0.203 -0.108 -0.438 -0.712 -1.004 -1.306 -1.534 -1.774 -2.032 -2.293 -2.566 -2.751 -2.946 -3.271 -3.492 -3.713 -3.833 -4.085 -4.333 -4.603 -4.754 -5.284 -5.232 -5.385 -5.549 -5.959 -6.189 -6.421 -6.699 -7.034 -7.459 -8.111 -10.544 -9 ,7 ,TETRA ,17604061,Sun Nov 28 17:10:27 CET,Sun Nov 28 19:02:58 CET,0.0 1.389 1.784 2.062 2.3 2.513 2.691 2.853 3.153 3.299 3.443 3.31 3.801 3.921 4.133 4.32 4.503 4.586 4.746 4.911 5.127 5.265 5.407 5.601 5.772 5.94 6.104 6.269 6.487 6.686 6.877 7.099 7.299 7.494 7.713 7.965 8.227 8.481 8.724 8.996 9.3 9.629 9.983 10.336 10.714 11.064 11.406 11.722 12.023 12.225 11.856 10.781 9.689 8.737 7.868 7.046 6.325 5.621 5.005 4.431 3.908 3.405 2.941 2.511 2.11 1.74 1.36 1.027 0.723 0.38 0.017 -0.275 -0.57 -0.873 -1.106 -1.341 -1.582 -1.835 -2.107 -2.303 -2.51 -2.829 -3.039 -3.268 -3.399 -3.666 -3.928 -4.216 -4.381 -4.919 -4.868 -5.032 -5.201 -5.584 -5.805 -6.049 -6.325 -6.642 -7.042 -7.619 -9.85 -10 ,23657 ,TETRA ,17604062,Sun Nov 28 17:10:28 CET,Sun Nov 28 19:03:38 CET,0.0 1.577 1.998 2.313 2.568 2.795 3.004 3.184 3.481 3.62 3.751 3.616 4.11 4.22 4.411 4.591 4.774 4.865 5.036 5.186 5.414 5.56 5.692 5.883 6.065 6.237 6.417 6.593 6.794 6.978 7.159 7.368 7.569 7.775 8.004 8.239 8.47 8.721 8.983 9.254 9.543 9.868 10.215 10.539 10.896 11.279 11.668 12.058 12.355 12.431 12.168 11.281 10.224 9.267 8.341 7.461 6.692 5.981 5.353 4.701 4.168 3.695 3.225 2.784 2.366 1.992 1.579 1.195 0.882 0.56 0.23 -0.034 -0.315 -0.594 -0.811 -1.049 -1.305 -1.58 -1.87 -2.065 -2.264 -2.59 -2.824 -3.055 -3.176 -3.441 -3.696 -3.952 -4.092 -4.617 -4.596 -4.779 -4.957 -5.365 -5.604 -5.866 -6.161 -6.488 -6.886 -7.468 -9.81 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index b050757d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25321 ,TETRA ,17604063,Sun Nov 28 17:10:29 CET,Sun Nov 28 19:04:37 CET,0.0 1.876 2.36 2.698 2.991 3.234 3.427 3.608 3.936 4.089 4.224 4.066 4.552 4.657 4.841 5.012 5.18 5.262 5.423 5.581 5.79 5.928 6.072 6.251 6.403 6.564 6.71 6.849 7.046 7.241 7.414 7.615 7.813 7.985 8.196 8.445 8.665 8.854 9.031 9.252 9.513 9.774 10.067 10.359 10.603 10.784 10.937 10.956 10.766 10.246 8.971 7.352 5.871 4.484 3.251 2.151 1.178 0.276 -0.454 -1.171 -1.774 -2.297 -2.817 -3.309 -3.771 -4.183 -4.613 -5.029 -5.398 -5.77 -6.144 -6.454 -6.769 -7.095 -7.345 -7.594 -7.848 -8.108 -8.392 -8.607 -8.828 -9.157 -9.391 -9.63 -9.745 -9.979 -10.234 -10.506 -10.651 -11.186 -11.124 -11.305 -11.501 -11.931 -12.15 -12.399 -12.652 -12.922 -13.308 -13.758 -14.858 -3 ,14935 ,TETRA ,17604065,Sun Nov 28 17:10:34 CET,Sun Nov 28 19:04:08 CET,0.0 1.266 1.671 1.952 2.188 2.4 2.574 2.737 3.064 3.22 3.359 3.208 3.673 3.776 3.982 4.154 4.321 4.402 4.549 4.684 4.876 5.009 5.138 5.329 5.512 5.678 5.819 5.947 6.109 6.262 6.421 6.614 6.789 6.949 7.135 7.34 7.539 7.771 7.971 8.142 8.34 8.6 8.885 9.082 9.284 9.545 9.71 9.701 9.562 9.062 7.838 6.1 4.572 3.22 2.057 1.003 0.088 -0.723 -1.407 -2.104 -2.717 -3.229 -3.73 -4.244 -4.734 -5.175 -5.62 -6.009 -6.357 -6.721 -7.074 -7.359 -7.652 -7.958 -8.22 -8.479 -8.745 -9.03 -9.312 -9.518 -9.742 -10.094 -10.343 -10.598 -10.723 -10.983 -11.246 -11.532 -11.681 -12.206 -12.143 -12.319 -12.505 -12.896 -13.122 -13.364 -13.6 -13.874 -14.23 -14.775 -16.539 -4 ,16549 ,TETRA ,17604066,Sun Nov 28 17:10:28 CET,Sun Nov 28 19:04:21 CET,0.0 1.135 1.576 1.886 2.156 2.373 2.565 2.735 3.033 3.167 3.29 3.14 3.624 3.743 3.949 4.136 4.318 4.399 4.547 4.683 4.877 5.01 5.142 5.325 5.506 5.684 5.837 5.98 6.163 6.341 6.512 6.711 6.906 7.091 7.278 7.473 7.683 7.892 8.066 8.246 8.476 8.731 8.955 9.134 9.346 9.56 9.664 9.635 9.477 9.028 7.802 6.057 4.576 3.289 2.194 1.183 0.257 -0.556 -1.212 -1.88 -2.462 -2.973 -3.462 -3.913 -4.343 -4.761 -5.177 -5.557 -5.895 -6.232 -6.593 -6.894 -7.208 -7.51 -7.735 -7.968 -8.201 -8.458 -8.73 -8.914 -9.105 -9.418 -9.639 -9.869 -9.992 -10.256 -10.547 -10.845 -10.986 -11.519 -11.441 -11.607 -11.776 -12.121 -12.327 -12.571 -12.832 -13.124 -13.497 -13.975 -15.524 -5 ,3858 ,TETRA ,17604067,Sun Nov 28 17:10:29 CET,Sun Nov 28 19:05:13 CET,0.0 1.238 1.741 2.116 2.409 2.664 2.895 3.105 3.459 3.619 3.757 3.627 4.124 4.244 4.486 4.718 4.931 5.026 5.199 5.353 5.574 5.719 5.854 6.051 6.253 6.456 6.635 6.797 6.99 7.171 7.35 7.577 7.803 7.999 8.21 8.455 8.702 8.95 9.191 9.444 9.705 9.959 10.226 10.446 10.628 10.797 10.897 10.884 10.714 10.202 8.957 7.218 5.706 4.412 3.341 2.388 1.541 0.753 0.063 -0.63 -1.211 -1.721 -2.233 -2.716 -3.151 -3.567 -4.019 -4.415 -4.759 -5.114 -5.474 -5.762 -6.06 -6.404 -6.671 -6.922 -7.179 -7.444 -7.713 -7.899 -8.099 -8.42 -8.628 -8.841 -8.964 -9.215 -9.47 -9.746 -9.889 -10.424 -10.369 -10.547 -10.719 -11.081 -11.284 -11.496 -11.761 -12.094 -12.456 -12.936 -14.55 -6 ,27710 ,TETRA ,17604068,Sun Nov 28 17:10:29 CET,Sun Nov 28 19:05:22 CET,0.0 1.554 1.998 2.344 2.638 2.864 3.071 3.257 3.552 3.675 3.794 3.621 4.096 4.202 4.4 4.585 4.757 4.837 4.997 5.151 5.361 5.492 5.618 5.791 5.961 6.123 6.261 6.396 6.584 6.778 6.961 7.175 7.368 7.527 7.721 7.94 8.122 8.297 8.478 8.655 8.848 9.082 9.33 9.535 9.747 9.934 10.014 9.989 9.798 9.21 8.018 6.433 4.898 3.558 2.425 1.384 0.478 -0.378 -1.126 -1.851 -2.477 -3.024 -3.529 -4.0 -4.424 -4.812 -5.228 -5.626 -6.004 -6.407 -6.771 -7.033 -7.307 -7.601 -7.851 -8.119 -8.378 -8.644 -8.934 -9.121 -9.313 -9.628 -9.846 -10.069 -10.189 -10.446 -10.715 -10.996 -11.134 -11.662 -11.611 -11.79 -11.973 -12.366 -12.58 -12.816 -13.091 -13.438 -13.827 -14.248 -15.443 -7 ,17438 ,TETRA ,17604069,Sun Nov 28 17:10:32 CET,Sun Nov 28 19:05:20 CET,0.0 1.51 2.003 2.358 2.626 2.863 3.073 3.256 3.564 3.709 3.852 3.728 4.214 4.32 4.53 4.715 4.89 4.988 5.177 5.337 5.566 5.719 5.867 6.058 6.22 6.391 6.555 6.706 6.918 7.116 7.295 7.495 7.69 7.887 8.094 8.312 8.507 8.691 8.878 9.079 9.261 9.427 9.613 9.78 9.952 10.119 10.281 10.332 10.147 9.677 8.55 6.838 5.316 4.008 2.852 1.794 0.872 0.069 -0.651 -1.35 -1.955 -2.537 -3.077 -3.571 -3.996 -4.372 -4.777 -5.167 -5.526 -5.88 -6.23 -6.507 -6.814 -7.159 -7.42 -7.676 -7.943 -8.23 -8.514 -8.713 -8.913 -9.206 -9.422 -9.655 -9.772 -10.001 -10.24 -10.521 -10.666 -11.189 -11.114 -11.294 -11.49 -11.937 -12.17 -12.416 -12.686 -12.966 -13.274 -13.714 -15.169 -8 ,5904 ,TETRA ,17604070,Sun Nov 28 17:10:29 CET,Sun Nov 28 19:04:06 CET,0.0 1.362 1.796 2.166 2.444 2.656 2.871 3.09 3.442 3.576 3.703 3.574 4.072 4.189 4.398 4.594 4.786 4.875 5.034 5.188 5.406 5.548 5.69 5.902 6.096 6.279 6.45 6.609 6.829 7.039 7.222 7.417 7.581 7.747 7.931 8.1 8.279 8.509 8.733 8.931 9.158 9.422 9.654 9.833 10.014 10.215 10.435 10.536 10.389 9.818 8.572 6.893 5.305 3.874 2.663 1.641 0.746 -0.067 -0.724 -1.386 -2.002 -2.556 -3.085 -3.61 -4.098 -4.534 -4.981 -5.38 -5.731 -6.095 -6.466 -6.77 -7.081 -7.393 -7.638 -7.891 -8.155 -8.426 -8.692 -8.876 -9.06 -9.339 -9.544 -9.78 -9.905 -10.15 -10.41 -10.692 -10.853 -11.4 -11.313 -11.472 -11.637 -12.009 -12.213 -12.438 -12.707 -13.024 -13.438 -13.995 -15.586 -9 ,2659 ,TETRA ,17604071,Sun Nov 28 17:10:30 CET,Sun Nov 28 19:04:07 CET,0.0 1.425 1.84 2.154 2.435 2.696 2.919 3.125 3.46 3.594 3.72 3.574 4.076 4.203 4.421 4.624 4.826 4.916 5.1 5.266 5.473 5.602 5.727 5.915 6.091 6.256 6.417 6.573 6.777 6.959 7.134 7.345 7.547 7.749 7.978 8.202 8.386 8.581 8.772 8.956 9.174 9.396 9.575 9.764 10.012 10.254 10.452 10.484 10.308 9.898 8.839 7.22 5.776 4.463 3.269 2.196 1.257 0.429 -0.284 -1.015 -1.626 -2.164 -2.67 -3.158 -3.612 -4.02 -4.464 -4.849 -5.174 -5.51 -5.861 -6.166 -6.5 -6.841 -7.108 -7.384 -7.654 -7.931 -8.223 -8.421 -8.629 -8.966 -9.206 -9.45 -9.572 -9.828 -10.091 -10.38 -10.533 -11.067 -11.001 -11.181 -11.371 -11.799 -12.031 -12.269 -12.547 -12.878 -13.315 -13.909 -15.483 -10 ,22987 ,TETRA ,17604072,Sun Nov 28 17:10:33 CET,Sun Nov 28 19:04:44 CET,0.0 1.36 1.784 2.15 2.467 2.735 2.945 3.118 3.434 3.583 3.724 3.609 4.1 4.204 4.418 4.639 4.834 4.925 5.09 5.237 5.448 5.582 5.709 5.902 6.096 6.27 6.431 6.578 6.751 6.926 7.093 7.27 7.417 7.568 7.768 8.005 8.225 8.433 8.642 8.849 9.021 9.199 9.384 9.524 9.681 9.828 9.913 9.914 9.735 9.198 8.019 6.391 4.894 3.582 2.49 1.481 0.574 -0.225 -0.945 -1.681 -2.284 -2.811 -3.33 -3.841 -4.298 -4.702 -5.13 -5.525 -5.862 -6.193 -6.554 -6.856 -7.158 -7.472 -7.73 -8.001 -8.271 -8.559 -8.861 -9.057 -9.278 -9.642 -9.876 -10.12 -10.248 -10.494 -10.743 -11.012 -11.157 -11.697 -11.628 -11.81 -12.013 -12.416 -12.62 -12.837 -13.083 -13.395 -13.827 -14.407 -15.96 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 28055e2e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7260 ,TETRA ,17604073,Sun Nov 28 17:10:35 CET,Sun Nov 28 19:01:55 CET,0.0 1.472 1.938 2.271 2.546 2.789 3.018 3.211 3.527 3.673 3.81 3.706 4.218 4.332 4.53 4.722 4.924 5.025 5.227 5.412 5.641 5.788 5.936 6.147 6.349 6.546 6.74 6.928 7.158 7.357 7.55 7.794 8.039 8.271 8.528 8.823 9.101 9.416 9.765 10.123 10.474 10.875 11.356 11.825 12.365 12.939 13.564 14.258 15.009 15.853 16.741 17.159 17.189 17.044 16.833 16.573 16.281 15.992 15.736 15.482 15.26 15.065 14.856 14.63 14.419 14.217 13.998 13.795 13.626 13.468 13.283 13.119 12.952 12.765 12.622 12.472 12.311 12.164 12.011 11.897 11.771 11.567 11.412 11.249 11.17 11.007 10.831 10.641 10.542 10.058 10.174 10.039 9.907 9.616 9.445 9.25 9.048 8.809 8.464 7.98 6.307 -2 ,13097 ,TETRA ,17604074,Sun Nov 28 17:10:29 CET,Sun Nov 28 19:01:13 CET,0.0 1.439 1.866 2.143 2.389 2.641 2.857 3.041 3.376 3.528 3.678 3.577 4.084 4.207 4.431 4.627 4.815 4.907 5.084 5.261 5.515 5.667 5.811 6.016 6.221 6.432 6.626 6.804 7.038 7.266 7.485 7.732 7.974 8.212 8.474 8.777 9.079 9.397 9.733 10.099 10.485 10.898 11.374 11.856 12.422 13.02 13.674 14.437 15.237 16.033 16.805 17.181 17.218 17.094 16.874 16.632 16.395 16.133 15.902 15.663 15.439 15.213 14.978 14.76 14.548 14.349 14.134 13.941 13.762 13.568 13.375 13.207 13.04 12.868 12.725 12.583 12.435 12.275 12.107 11.99 11.858 11.628 11.472 11.312 11.231 11.071 10.891 10.704 10.603 10.114 10.224 10.101 9.979 9.685 9.52 9.328 9.097 8.828 8.491 8.045 6.816 -3 ,21152 ,TETRA ,17604075,Sun Nov 28 17:10:30 CET,Sun Nov 28 19:01:11 CET,0.0 1.089 1.458 1.746 1.99 2.192 2.392 2.584 2.912 3.058 3.198 3.088 3.591 3.699 3.889 4.083 4.281 4.381 4.563 4.729 4.967 5.125 5.273 5.473 5.672 5.858 6.036 6.235 6.488 6.704 6.923 7.194 7.44 7.665 7.931 8.236 8.517 8.825 9.149 9.503 9.888 10.292 10.761 11.236 11.768 12.345 12.984 13.698 14.464 15.297 16.156 16.532 16.531 16.382 16.16 15.889 15.627 15.386 15.153 14.907 14.689 14.473 14.242 14.003 13.792 13.609 13.404 13.213 13.033 12.835 12.64 12.483 12.327 12.157 12.006 11.849 11.69 11.523 11.353 11.228 11.08 10.851 10.703 10.56 10.483 10.316 10.135 9.941 9.838 9.35 9.471 9.347 9.21 8.89 8.725 8.55 8.329 8.059 7.752 7.332 5.928 -4 ,4302 ,TETRA ,17604076,Sun Nov 28 17:10:33 CET,Sun Nov 28 19:01:58 CET,0.0 1.312 1.729 2.05 2.314 2.546 2.732 2.897 3.202 3.339 3.47 3.343 3.848 3.965 4.191 4.392 4.579 4.674 4.857 5.029 5.281 5.43 5.571 5.781 5.986 6.189 6.375 6.543 6.759 6.989 7.207 7.452 7.697 7.934 8.202 8.506 8.801 9.117 9.452 9.823 10.217 10.633 11.081 11.521 12.046 12.642 13.315 14.049 14.851 15.676 16.483 16.851 16.871 16.753 16.526 16.24 15.968 15.697 15.431 15.182 14.97 14.754 14.543 14.332 14.115 13.917 13.719 13.543 13.384 13.202 13.008 12.843 12.671 12.493 12.343 12.177 12.01 11.837 11.645 11.522 11.408 11.21 11.065 10.913 10.835 10.674 10.507 10.348 10.256 9.774 9.938 9.82 9.677 9.343 9.152 8.962 8.761 8.497 8.181 7.713 6.269 -5 ,31701 ,TETRA ,17604077,Sun Nov 28 17:10:35 CET,Sun Nov 28 19:01:56 CET,0.0 1.339 1.801 2.144 2.395 2.626 2.825 3.005 3.348 3.506 3.652 3.523 4.015 4.125 4.366 4.599 4.812 4.908 5.085 5.25 5.491 5.65 5.808 6.049 6.283 6.474 6.638 6.804 7.021 7.231 7.438 7.687 7.923 8.143 8.4 8.698 8.997 9.344 9.72 10.086 10.454 10.876 11.338 11.787 12.329 12.933 13.599 14.339 15.164 16.016 16.818 17.185 17.187 17.008 16.775 16.552 16.308 16.038 15.795 15.527 15.287 15.065 14.837 14.627 14.426 14.227 14.012 13.824 13.655 13.462 13.265 13.107 12.943 12.77 12.628 12.488 12.335 12.144 11.953 11.838 11.719 11.534 11.402 11.256 11.181 11.036 10.876 10.698 10.601 10.121 10.234 10.083 9.935 9.605 9.407 9.192 8.963 8.697 8.372 7.917 6.291 -6 ,17317 ,TETRA ,17604078,Sun Nov 28 17:10:30 CET,Sun Nov 28 19:01:52 CET,0.0 1.541 1.983 2.28 2.535 2.783 3.005 3.194 3.485 3.632 3.79 3.678 4.176 4.29 4.51 4.715 4.895 4.993 5.195 5.377 5.622 5.775 5.931 6.149 6.353 6.55 6.727 6.898 7.117 7.332 7.545 7.795 8.029 8.266 8.546 8.856 9.138 9.428 9.747 10.098 10.462 10.876 11.352 11.826 12.391 13.014 13.705 14.433 15.202 16.045 16.911 17.366 17.419 17.258 17.057 16.82 16.527 16.232 15.969 15.707 15.476 15.257 15.041 14.825 14.625 14.436 14.201 13.981 13.799 13.615 13.424 13.26 13.086 12.906 12.769 12.623 12.451 12.273 12.1 11.974 11.848 11.661 11.524 11.382 11.312 11.17 10.993 10.808 10.703 10.207 10.347 10.22 10.076 9.729 9.528 9.301 9.068 8.805 8.477 8.013 6.704 -7 ,3469 ,TETRA ,17604079,Sun Nov 28 17:10:35 CET,Sun Nov 28 19:01:56 CET,0.0 1.266 1.794 2.185 2.5 2.777 3.009 3.209 3.556 3.707 3.844 3.718 4.222 4.339 4.548 4.756 4.952 5.04 5.215 5.404 5.651 5.792 5.932 6.143 6.346 6.538 6.722 6.887 7.106 7.349 7.585 7.834 8.059 8.294 8.574 8.876 9.153 9.456 9.777 10.115 10.486 10.907 11.381 11.848 12.386 12.965 13.619 14.315 15.065 15.86 16.597 16.882 16.839 16.666 16.461 16.213 15.961 15.694 15.434 15.182 14.962 14.749 14.523 14.299 14.09 13.889 13.653 13.447 13.277 13.096 12.903 12.732 12.557 12.366 12.208 12.055 11.902 11.743 11.561 11.44 11.327 11.151 11.02 10.867 10.784 10.612 10.435 10.233 10.125 9.645 9.75 9.607 9.471 9.16 8.97 8.773 8.546 8.272 7.929 7.373 6.02 -8 ,31424 ,TETRA ,17604080,Sun Nov 28 17:10:31 CET,Sun Nov 28 19:01:56 CET,0.0 1.204 1.621 1.955 2.232 2.448 2.641 2.818 3.136 3.268 3.393 3.273 3.771 3.883 4.103 4.303 4.499 4.592 4.764 4.93 5.177 5.341 5.488 5.701 5.91 6.105 6.299 6.49 6.715 6.923 7.142 7.401 7.643 7.871 8.131 8.437 8.733 9.04 9.355 9.69 10.055 10.461 10.918 11.379 11.904 12.466 13.107 13.829 14.64 15.485 16.305 16.718 16.777 16.642 16.408 16.146 15.858 15.583 15.335 15.064 14.829 14.618 14.408 14.198 13.976 13.761 13.54 13.346 13.173 12.995 12.808 12.642 12.457 12.271 12.121 11.958 11.79 11.615 11.433 11.302 11.163 10.962 10.828 10.679 10.6 10.435 10.263 10.084 9.986 9.508 9.665 9.541 9.396 9.093 8.93 8.745 8.53 8.273 7.951 7.497 6.001 -9 ,3763 ,TETRA ,17604081,Sun Nov 28 17:10:33 CET,Sun Nov 28 19:01:52 CET,0.0 1.481 1.935 2.291 2.583 2.829 3.054 3.23 3.527 3.674 3.809 3.661 4.166 4.289 4.509 4.717 4.915 5.007 5.184 5.362 5.622 5.784 5.93 6.131 6.327 6.514 6.69 6.878 7.13 7.359 7.577 7.829 8.072 8.309 8.572 8.859 9.15 9.472 9.799 10.142 10.508 10.919 11.391 11.846 12.366 12.986 13.677 14.369 15.121 15.92 16.638 16.944 16.971 16.852 16.64 16.367 16.076 15.823 15.588 15.323 15.089 14.878 14.667 14.437 14.187 13.969 13.752 13.557 13.394 13.215 13.029 12.876 12.714 12.538 12.389 12.238 12.081 11.919 11.761 11.652 11.533 11.318 11.156 10.995 10.913 10.739 10.571 10.397 10.298 9.826 9.97 9.826 9.668 9.334 9.164 8.976 8.768 8.531 8.209 7.762 6.159 -10 ,24263 ,TETRA ,17604082,Sun Nov 28 17:10:31 CET,Sun Nov 28 19:02:52 CET,0.0 1.331 1.742 2.037 2.311 2.566 2.777 2.968 3.315 3.476 3.631 3.504 3.994 4.114 4.351 4.56 4.738 4.821 4.991 5.158 5.404 5.557 5.702 5.913 6.109 6.295 6.483 6.669 6.898 7.112 7.321 7.578 7.823 8.052 8.316 8.607 8.885 9.189 9.515 9.864 10.222 10.619 11.082 11.562 12.12 12.704 13.371 14.116 14.907 15.66 16.337 16.676 16.683 16.542 16.343 16.11 15.86 15.584 15.322 15.045 14.794 14.554 14.333 14.136 13.933 13.731 13.502 13.307 13.158 13.0 12.823 12.663 12.493 12.32 12.181 12.029 11.882 11.73 11.558 11.441 11.316 11.1 10.949 10.786 10.703 10.538 10.369 10.194 10.095 9.618 9.775 9.655 9.521 9.212 9.037 8.835 8.613 8.371 8.087 7.696 6.497 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt deleted file mode 100644 index 5e1c2443..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,218 ,TETRA ,17604084,Sun Nov 28 17:10:34 CET,Sun Nov 28 19:06:45 CET,0.0 1.307 1.881 2.3 2.696 3.1 3.47 3.818 4.496 4.801 5.096 5.15 5.944 6.208 6.74 7.272 7.785 8.04 8.534 9.018 9.735 10.206 10.678 11.389 12.076 12.731 13.385 14.036 14.894 15.744 16.582 17.615 18.648 19.666 20.858 22.238 23.612 25.172 26.902 28.807 30.897 33.335 36.279 39.379 43.195 47.666 53.047 59.477 67.614 78.153 92.485 106.213 115.567 122.331 127.385 131.397 134.544 137.106 139.104 140.92 142.364 143.561 144.62 145.569 146.366 147.001 147.634 148.181 148.61 148.994 149.359 149.633 149.876 150.106 150.288 150.47 150.623 150.772 150.908 150.982 151.032 151.061 151.096 151.121 151.108 151.055 151.008 150.952 150.893 150.422 150.471 150.304 150.1 149.612 149.316 148.922 148.4 147.816 147.063 145.842 140.749 -4 ,19868 ,TETRA ,17604086,Sun Nov 28 17:10:31 CET,Sun Nov 28 19:06:50 CET,0.0 1.184 1.739 2.192 2.624 3.044 3.433 3.779 4.4 4.694 4.988 5.031 5.825 6.103 6.639 7.143 7.631 7.872 8.358 8.832 9.529 10.008 10.484 11.165 11.839 12.512 13.168 13.815 14.681 15.536 16.367 17.383 18.393 19.401 20.603 22.013 23.403 24.958 26.68 28.574 30.656 33.111 36.1 39.205 42.964 47.421 52.87 59.386 67.57 78.042 92.309 106.017 115.322 122.044 127.059 131.048 134.196 136.753 138.747 140.597 142.067 143.278 144.346 145.255 146.008 146.629 147.258 147.797 148.205 148.588 148.963 149.228 149.461 149.693 149.859 149.98 150.087 150.211 150.319 150.373 150.412 150.421 150.381 150.357 150.366 150.383 150.367 150.289 150.238 149.833 150.015 149.912 149.803 149.456 149.267 149.053 148.75 148.399 147.965 147.241 135.646 -5 ,16411 ,TETRA ,17604087,Sun Nov 28 17:10:31 CET,Sun Nov 28 19:06:41 CET,0.0 1.467 2.031 2.488 2.897 3.277 3.627 3.948 4.572 4.875 5.153 5.159 5.946 6.211 6.75 7.285 7.795 8.039 8.524 9.008 9.73 10.205 10.668 11.351 12.026 12.69 13.348 13.995 14.854 15.71 16.559 17.603 18.629 19.643 20.852 22.258 23.641 25.183 26.901 28.815 30.891 33.308 36.26 39.383 43.187 47.606 52.99 59.497 67.746 78.382 92.811 106.539 115.844 122.572 127.578 131.516 134.631 137.177 139.173 141.019 142.463 143.621 144.642 145.54 146.318 146.996 147.655 148.203 148.619 148.976 149.324 149.622 149.882 150.093 150.257 150.423 150.56 150.674 150.783 150.841 150.895 150.95 150.961 150.935 150.913 150.86 150.78 150.689 150.642 150.231 150.395 150.264 150.138 149.872 149.672 149.405 149.118 148.773 148.352 147.543 143.014 -6 ,13787 ,TETRA ,17604088,Sun Nov 28 17:10:57 CET,Sun Nov 28 19:06:21 CET,0.0 1.343 1.933 2.434 2.874 3.264 3.618 3.977 4.649 4.941 5.23 5.303 6.094 6.354 6.869 7.405 7.935 8.186 8.684 9.169 9.88 10.351 10.811 11.502 12.187 12.856 13.523 14.184 15.055 15.917 16.763 17.805 18.82 19.814 21.004 22.392 23.77 25.366 27.13 29.037 31.135 33.578 36.533 39.623 43.393 47.823 53.213 59.698 67.858 78.384 92.731 106.447 115.715 122.466 127.547 131.509 134.601 137.141 139.153 141.012 142.448 143.602 144.632 145.535 146.311 146.975 147.618 148.153 148.582 148.986 149.373 149.673 149.945 150.193 150.37 150.534 150.675 150.78 150.881 150.96 151.025 151.097 151.109 151.104 151.115 151.124 151.075 150.994 150.945 150.517 150.701 150.615 150.501 150.183 149.98 149.75 149.488 149.118 148.577 147.713 143.463 -7 ,2674 ,TETRA ,17604089,Sun Nov 28 17:10:58 CET,Sun Nov 28 19:05:49 CET,0.0 1.586 2.154 2.607 3.003 3.399 3.759 4.088 4.709 4.995 5.296 5.378 6.181 6.446 6.948 7.454 7.963 8.214 8.713 9.208 9.939 10.411 10.875 11.575 12.256 12.914 13.572 14.222 15.082 15.936 16.774 17.83 18.878 19.893 21.097 22.491 23.879 25.469 27.237 29.175 31.274 33.714 36.694 39.826 43.602 48.007 53.379 59.845 67.969 78.446 92.838 106.521 115.68 122.382 127.422 131.374 134.49 137.049 139.033 140.862 142.335 143.535 144.573 145.503 146.299 146.955 147.607 148.146 148.57 148.963 149.336 149.626 149.899 150.166 150.357 150.517 150.659 150.773 150.854 150.902 150.942 150.98 150.985 150.979 150.971 150.976 150.95 150.865 150.808 150.383 150.607 150.529 150.427 150.085 149.836 149.564 149.313 148.974 148.397 147.424 142.517 -9 ,23878 ,TETRA ,17604091,Sun Nov 28 17:10:57 CET,Sun Nov 28 19:05:36 CET,0.0 1.495 2.038 2.51 2.93 3.309 3.664 4.003 4.651 4.96 5.272 5.36 6.164 6.446 7.0 7.53 8.051 8.315 8.84 9.353 10.097 10.569 11.028 11.718 12.406 13.095 13.787 14.454 15.335 16.209 17.069 18.128 19.165 20.193 21.408 22.826 24.234 25.821 27.573 29.48 31.566 34.028 37.032 40.159 43.942 48.413 53.876 60.438 68.666 79.261 93.775 107.439 116.577 123.265 128.261 132.193 135.281 137.816 139.81 141.598 143.026 144.181 145.187 146.092 146.851 147.502 148.139 148.657 149.086 149.499 149.887 150.192 150.46 150.716 150.903 151.059 151.2 151.321 151.4 151.444 151.491 151.564 151.565 151.526 151.51 151.473 151.426 151.34 151.291 150.885 151.114 151.019 150.895 150.495 150.268 150.019 149.729 149.4 148.895 148.067 144.313 -10 ,15133 ,TETRA ,17604092,Sun Nov 28 17:10:59 CET,Sun Nov 28 19:05:48 CET,0.0 1.393 1.961 2.426 2.847 3.209 3.562 3.91 4.527 4.818 5.107 5.16 5.967 6.239 6.756 7.275 7.781 8.029 8.52 8.995 9.683 10.131 10.572 11.231 11.903 12.573 13.233 13.882 14.727 15.562 16.404 17.445 18.457 19.463 20.663 22.053 23.454 25.029 26.755 28.659 30.741 33.194 36.16 39.248 43.005 47.436 52.862 59.328 67.422 77.943 92.333 105.94 115.132 121.834 126.86 130.859 133.974 136.508 138.49 140.3 141.734 142.904 143.94 144.858 145.647 146.317 146.968 147.503 147.933 148.352 148.746 149.024 149.282 149.533 149.72 149.898 150.051 150.196 150.31 150.348 150.397 150.458 150.462 150.443 150.433 150.399 150.323 150.23 150.171 149.732 149.881 149.784 149.668 149.337 149.134 148.924 148.675 148.349 147.912 147.176 142.768 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt deleted file mode 100644 index c3f1ee9f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12896 ,TETRA ,17604093,Sun Nov 28 17:11:01 CET,Sun Nov 28 19:07:25 CET,0.0 1.759 2.344 2.798 3.174 3.523 3.844 4.145 4.685 4.934 5.171 5.114 5.861 6.078 6.498 6.901 7.286 7.47 7.827 8.178 8.697 9.039 9.382 9.885 10.37 10.85 11.312 11.753 12.339 12.921 13.481 14.163 14.825 15.473 16.255 17.147 18.004 18.957 20.025 21.233 22.522 23.994 25.758 27.557 29.705 32.202 35.216 38.736 43.032 48.421 55.561 61.971 66.019 68.871 70.913 72.432 73.521 74.359 75.003 75.537 75.923 76.213 76.462 76.671 76.821 76.915 76.959 76.971 76.977 76.988 76.979 76.944 76.897 76.837 76.788 76.717 76.613 76.489 76.364 76.286 76.198 76.046 75.926 75.789 75.723 75.581 75.391 75.171 75.054 74.472 74.601 74.432 74.254 73.799 73.513 73.216 72.908 72.537 72.054 71.398 68.893 -2 ,20395 ,TETRA ,17604094,Sun Nov 28 17:10:59 CET,Sun Nov 28 19:08:26 CET,0.0 1.749 2.36 2.849 3.238 3.577 3.914 4.235 4.799 5.052 5.299 5.229 5.961 6.162 6.558 6.948 7.333 7.516 7.873 8.234 8.763 9.102 9.444 9.94 10.415 10.902 11.372 11.818 12.397 12.962 13.514 14.19 14.859 15.519 16.297 17.174 18.028 18.984 20.05 21.234 22.48 23.917 25.651 27.435 29.602 32.08 35.023 38.504 42.856 48.369 55.489 61.806 65.901 68.792 70.834 72.34 73.445 74.268 74.853 75.368 75.756 76.046 76.29 76.446 76.55 76.632 76.677 76.696 76.688 76.625 76.536 76.475 76.399 76.294 76.21 76.123 76.022 75.887 75.726 75.615 75.502 75.303 75.139 74.977 74.896 74.707 74.509 74.286 74.16 73.586 73.753 73.589 73.414 73.004 72.738 72.43 72.079 71.699 71.227 70.475 67.818 -3 ,26146 ,TETRA ,17604095,Sun Nov 28 17:11:00 CET,Sun Nov 28 19:09:19 CET,0.0 1.509 2.089 2.527 2.897 3.237 3.542 3.83 4.376 4.625 4.86 4.79 5.53 5.745 6.174 6.574 6.957 7.148 7.516 7.87 8.388 8.727 9.062 9.563 10.039 10.49 10.94 11.381 11.973 12.547 13.085 13.764 14.438 15.092 15.884 16.809 17.682 18.64 19.714 20.87 22.109 23.561 25.299 27.08 29.224 31.715 34.697 38.228 42.595 48.048 55.197 61.699 65.793 68.581 70.516 71.967 73.073 73.93 74.527 75.029 75.378 75.597 75.785 75.935 76.037 76.105 76.149 76.165 76.155 76.135 76.11 76.063 75.981 75.882 75.801 75.703 75.595 75.476 75.34 75.234 75.114 74.917 74.764 74.601 74.508 74.301 74.091 73.861 73.74 73.17 73.337 73.155 72.961 72.578 72.344 72.066 71.746 71.342 70.79 70.075 67.52 -4 ,13169 ,TETRA ,17604096,Sun Nov 28 17:11:02 CET,Sun Nov 28 19:09:17 CET,0.0 1.783 2.383 2.839 3.214 3.569 3.883 4.158 4.683 4.929 5.162 5.081 5.825 6.051 6.475 6.868 7.244 7.426 7.787 8.141 8.658 8.985 9.317 9.816 10.291 10.759 11.218 11.666 12.248 12.826 13.389 14.055 14.722 15.373 16.128 17.009 17.871 18.823 19.874 21.031 22.285 23.733 25.478 27.294 29.476 31.992 34.985 38.518 42.906 48.41 55.577 62.023 66.107 68.877 70.855 72.35 73.451 74.297 74.929 75.461 75.817 76.074 76.284 76.446 76.572 76.666 76.729 76.772 76.789 76.777 76.757 76.723 76.64 76.541 76.474 76.408 76.324 76.205 76.077 75.991 75.892 75.73 75.617 75.484 75.4 75.225 75.028 74.781 74.652 74.066 74.207 74.03 73.835 73.42 73.175 72.887 72.535 72.064 71.465 70.691 68.485 -5 ,9736 ,TETRA ,17604097,Sun Nov 28 17:10:59 CET,Sun Nov 28 19:08:25 CET,0.0 1.591 2.227 2.7 3.088 3.45 3.775 4.084 4.67 4.945 5.203 5.162 5.914 6.125 6.513 6.891 7.275 7.462 7.826 8.174 8.692 9.023 9.345 9.822 10.283 10.743 11.189 11.627 12.2 12.763 13.33 14.026 14.689 15.352 16.14 17.027 17.903 18.875 19.939 21.075 22.305 23.749 25.472 27.228 29.359 31.854 34.843 38.347 42.692 48.156 55.2 61.548 65.637 68.494 70.477 71.978 73.113 73.955 74.591 75.126 75.52 75.811 76.036 76.223 76.385 76.506 76.573 76.603 76.618 76.626 76.612 76.552 76.466 76.394 76.353 76.299 76.203 76.092 75.976 75.892 75.803 75.668 75.549 75.396 75.306 75.109 74.912 74.693 74.561 73.961 74.105 73.942 73.745 73.296 73.027 72.696 72.331 71.938 71.501 70.794 67.578 -6 ,1303 ,TETRA ,17604098,Sun Nov 28 17:10:59 CET,Sun Nov 28 19:07:42 CET,0.0 1.686 2.333 2.824 3.234 3.577 3.889 4.2 4.767 5.031 5.292 5.237 5.978 6.188 6.576 6.964 7.334 7.519 7.894 8.246 8.744 9.071 9.397 9.872 10.337 10.797 11.242 11.673 12.24 12.792 13.337 14.021 14.692 15.342 16.112 16.991 17.855 18.834 19.912 21.074 22.307 23.731 25.446 27.247 29.397 31.831 34.81 38.355 42.716 48.219 55.331 61.662 65.679 68.436 70.412 71.897 73.005 73.849 74.482 75.037 75.407 75.694 75.924 76.094 76.239 76.328 76.362 76.353 76.323 76.277 76.214 76.146 76.065 75.973 75.881 75.774 75.667 75.546 75.401 75.295 75.185 75.0 74.861 74.699 74.616 74.448 74.263 74.026 73.883 73.303 73.456 73.279 73.075 72.629 72.38 72.094 71.758 71.37 70.865 70.135 67.947 -7 ,29820 ,TETRA ,17604099,Sun Nov 28 17:11:00 CET,Sun Nov 28 19:08:00 CET,0.0 1.813 2.402 2.881 3.294 3.659 4.006 4.325 4.866 5.112 5.344 5.275 6.021 6.234 6.651 7.033 7.401 7.591 7.967 8.333 8.856 9.192 9.518 9.989 10.458 10.93 11.395 11.845 12.433 13.014 13.572 14.281 14.98 15.665 16.46 17.339 18.2 19.141 20.181 21.341 22.596 24.041 25.762 27.546 29.722 32.219 35.188 38.695 43.022 48.454 55.545 61.921 66.024 68.904 70.965 72.464 73.537 74.36 74.976 75.494 75.869 76.133 76.346 76.492 76.58 76.643 76.665 76.659 76.631 76.592 76.545 76.481 76.404 76.323 76.248 76.158 76.059 75.953 75.845 75.76 75.666 75.509 75.361 75.192 75.108 74.922 74.714 74.489 74.369 73.794 73.974 73.816 73.622 73.186 72.93 72.631 72.294 71.907 71.445 70.779 68.359 -8 ,2253 ,TETRA ,17604100,Sun Nov 28 17:11:02 CET,Sun Nov 28 19:08:58 CET,0.0 1.968 2.528 2.979 3.346 3.712 4.074 4.392 4.954 5.209 5.443 5.363 6.096 6.296 6.706 7.11 7.5 7.689 8.041 8.377 8.891 9.235 9.568 10.039 10.49 10.948 11.406 11.846 12.411 12.978 13.532 14.196 14.864 15.517 16.287 17.179 18.049 19.024 20.104 21.267 22.497 23.921 25.657 27.473 29.64 32.117 35.108 38.648 42.983 48.414 55.475 61.94 66.167 69.013 70.992 72.512 73.676 74.558 75.19 75.738 76.14 76.434 76.68 76.853 76.975 77.065 77.128 77.142 77.115 77.098 77.088 77.056 77.002 76.918 76.826 76.714 76.597 76.464 76.326 76.23 76.112 75.895 75.732 75.568 75.479 75.281 75.047 74.79 74.656 74.062 74.221 74.067 73.885 73.437 73.172 72.873 72.514 72.127 71.668 70.952 68.088 -9 ,1228 ,TETRA ,17604101,Sun Nov 28 17:11:04 CET,Sun Nov 28 19:08:12 CET,0.0 1.849 2.588 3.037 3.446 3.795 4.097 4.397 4.933 5.187 5.433 5.367 6.109 6.322 6.734 7.146 7.548 7.735 8.094 8.451 8.976 9.303 9.625 10.107 10.571 11.026 11.475 11.908 12.482 13.053 13.603 14.277 14.945 15.583 16.332 17.201 18.052 19.003 20.056 21.204 22.435 23.837 25.522 27.302 29.461 31.948 34.936 38.459 42.805 48.237 55.292 61.651 65.741 68.571 70.581 72.075 73.192 74.089 74.753 75.322 75.727 76.02 76.25 76.422 76.571 76.68 76.763 76.822 76.838 76.831 76.806 76.769 76.721 76.654 76.578 76.495 76.421 76.337 76.237 76.161 76.068 75.904 75.779 75.621 75.527 75.323 75.093 74.856 74.733 74.144 74.318 74.173 73.992 73.532 73.263 72.954 72.588 72.157 71.603 70.856 68.722 -10 ,20417 ,TETRA ,17604102,Sun Nov 28 17:10:59 CET,Sun Nov 28 19:06:33 CET,0.0 1.65 2.268 2.748 3.131 3.5 3.846 4.172 4.749 5.016 5.262 5.2 5.934 6.136 6.527 6.916 7.296 7.481 7.834 8.185 8.702 9.031 9.357 9.842 10.318 10.777 11.214 11.648 12.224 12.783 13.346 14.027 14.689 15.344 16.104 16.986 17.839 18.771 19.83 21.004 22.246 23.688 25.419 27.227 29.389 31.867 34.819 38.334 42.719 48.207 55.343 61.694 65.767 68.634 70.686 72.192 73.292 74.144 74.777 75.301 75.672 75.956 76.171 76.367 76.535 76.646 76.715 76.744 76.764 76.77 76.771 76.756 76.71 76.673 76.632 76.574 76.488 76.378 76.259 76.175 76.087 75.894 75.74 75.575 75.485 75.312 75.134 74.934 74.806 74.222 74.419 74.262 74.074 73.61 73.358 73.082 72.76 72.365 71.84 71.123 68.547 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt deleted file mode 100644 index 697b186e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23999 ,TETRA ,17604103,Sun Nov 28 17:11:03 CET,Sun Nov 28 19:00:52 CET,0.0 1.562 1.993 2.333 2.636 2.867 3.069 3.237 3.521 3.671 3.816 3.697 4.155 4.26 4.464 4.658 4.811 4.887 5.033 5.168 5.357 5.477 5.583 5.737 5.893 6.031 6.149 6.262 6.417 6.56 6.689 6.857 7.026 7.186 7.37 7.552 7.695 7.851 8.036 8.23 8.418 8.591 8.75 8.893 9.038 9.176 9.256 9.24 9.048 8.56 7.443 5.839 4.463 3.285 2.218 1.281 0.52 -0.171 -0.774 -1.368 -1.864 -2.329 -2.783 -3.208 -3.591 -3.926 -4.279 -4.597 -4.861 -5.13 -5.413 -5.644 -5.886 -6.144 -6.345 -6.542 -6.739 -6.942 -7.153 -7.298 -7.448 -7.693 -7.859 -8.03 -8.123 -8.315 -8.517 -8.75 -8.88 -9.359 -9.264 -9.401 -9.534 -9.842 -10.027 -10.223 -10.434 -10.669 -10.93 -11.295 -12.708 -2 ,31180 ,TETRA ,17604104,Sun Nov 28 17:10:59 CET,Sun Nov 28 19:00:36 CET,0.0 2.078 2.563 2.895 3.2 3.462 3.678 3.857 4.162 4.307 4.448 4.381 4.846 4.966 5.172 5.345 5.516 5.597 5.751 5.887 6.076 6.21 6.339 6.523 6.696 6.838 6.978 7.122 7.301 7.467 7.626 7.8 7.965 8.129 8.305 8.494 8.668 8.851 9.044 9.231 9.404 9.57 9.752 9.898 10.019 10.132 10.194 10.207 10.079 9.625 8.613 7.135 5.827 4.666 3.64 2.738 1.978 1.308 0.724 0.128 -0.394 -0.843 -1.273 -1.694 -2.09 -2.433 -2.772 -3.08 -3.35 -3.636 -3.931 -4.173 -4.441 -4.727 -4.938 -5.16 -5.389 -5.613 -5.854 -6.033 -6.21 -6.466 -6.657 -6.876 -6.984 -7.193 -7.421 -7.653 -7.779 -8.273 -8.228 -8.395 -8.557 -8.906 -9.098 -9.304 -9.543 -9.848 -10.199 -10.608 -12.005 -3 ,18559 ,TETRA ,17604105,Sun Nov 28 17:11:02 CET,Sun Nov 28 19:00:47 CET,0.0 2.356 2.931 3.296 3.6 3.835 4.033 4.231 4.559 4.691 4.811 4.673 5.114 5.211 5.424 5.646 5.822 5.891 6.028 6.16 6.332 6.44 6.562 6.746 6.907 7.053 7.186 7.312 7.484 7.651 7.792 7.954 8.115 8.274 8.455 8.639 8.824 9.018 9.196 9.363 9.532 9.722 9.93 10.107 10.266 10.4 10.485 10.477 10.301 9.816 8.724 7.293 5.998 4.805 3.769 2.867 2.083 1.369 0.742 0.111 -0.417 -0.868 -1.286 -1.7 -2.094 -2.445 -2.798 -3.099 -3.361 -3.637 -3.93 -4.167 -4.417 -4.69 -4.899 -5.114 -5.345 -5.591 -5.856 -6.034 -6.2 -6.465 -6.66 -6.863 -6.961 -7.164 -7.378 -7.601 -7.726 -8.212 -8.11 -8.249 -8.394 -8.707 -8.884 -9.086 -9.293 -9.536 -9.871 -10.352 -11.869 -4 ,9870 ,TETRA ,17604106,Sun Nov 28 17:10:59 CET,Sun Nov 28 19:00:53 CET,0.0 1.508 2.055 2.388 2.629 2.842 3.047 3.224 3.541 3.686 3.808 3.666 4.106 4.201 4.379 4.534 4.69 4.766 4.908 5.047 5.25 5.372 5.482 5.648 5.8 5.946 6.092 6.234 6.405 6.553 6.687 6.847 7.025 7.204 7.391 7.592 7.779 7.957 8.154 8.36 8.56 8.773 8.949 9.083 9.247 9.396 9.449 9.412 9.225 8.675 7.55 6.056 4.694 3.503 2.467 1.582 0.803 0.088 -0.515 -1.12 -1.645 -2.115 -2.559 -2.966 -3.32 -3.645 -4.007 -4.339 -4.626 -4.912 -5.201 -5.448 -5.709 -5.981 -6.189 -6.403 -6.623 -6.84 -7.064 -7.224 -7.401 -7.692 -7.898 -8.107 -8.212 -8.443 -8.675 -8.908 -9.038 -9.523 -9.443 -9.591 -9.753 -10.09 -10.286 -10.517 -10.745 -10.999 -11.341 -11.809 -13.635 -5 ,1158 ,TETRA ,17604107,Sun Nov 28 17:11:01 CET,Sun Nov 28 19:00:50 CET,0.0 2.516 3.024 3.371 3.628 3.855 4.076 4.26 4.554 4.696 4.835 4.736 5.188 5.302 5.493 5.672 5.856 5.94 6.111 6.277 6.497 6.634 6.769 6.944 7.117 7.282 7.42 7.558 7.736 7.9 8.041 8.218 8.4 8.559 8.735 8.917 9.091 9.279 9.459 9.641 9.808 9.976 10.162 10.324 10.471 10.593 10.642 10.591 10.385 9.876 8.861 7.3 5.848 4.618 3.554 2.625 1.817 1.09 0.482 -0.102 -0.591 -1.029 -1.448 -1.85 -2.235 -2.585 -2.942 -3.256 -3.539 -3.843 -4.153 -4.408 -4.672 -4.944 -5.151 -5.359 -5.573 -5.798 -6.051 -6.229 -6.396 -6.679 -6.884 -7.079 -7.18 -7.384 -7.601 -7.843 -7.962 -8.444 -8.386 -8.532 -8.681 -9.026 -9.204 -9.395 -9.614 -9.849 -10.126 -10.528 -12.299 -6 ,3091 ,TETRA ,17604108,Sun Nov 28 17:11:03 CET,Sun Nov 28 19:00:59 CET,0.0 2.069 2.594 2.948 3.198 3.41 3.591 3.739 4.02 4.163 4.296 4.171 4.622 4.732 4.921 5.096 5.269 5.354 5.512 5.653 5.848 5.97 6.093 6.29 6.488 6.657 6.791 6.913 7.078 7.239 7.398 7.576 7.739 7.895 8.063 8.241 8.411 8.585 8.761 8.94 9.121 9.302 9.467 9.619 9.759 9.882 9.989 9.984 9.846 9.443 8.407 6.827 5.43 4.306 3.316 2.381 1.546 0.805 0.183 -0.441 -0.991 -1.475 -1.928 -2.351 -2.726 -3.058 -3.398 -3.714 -3.993 -4.285 -4.591 -4.835 -5.088 -5.349 -5.558 -5.784 -6.0 -6.22 -6.474 -6.659 -6.842 -7.118 -7.32 -7.517 -7.614 -7.822 -8.044 -8.279 -8.405 -8.891 -8.821 -8.976 -9.137 -9.486 -9.669 -9.856 -10.071 -10.332 -10.666 -11.092 -12.364 -7 ,1915 ,TETRA ,17604109,Sun Nov 28 17:11:05 CET,Sun Nov 28 19:00:53 CET,0.0 2.517 3.147 3.523 3.826 4.125 4.385 4.593 4.968 5.129 5.273 5.196 5.658 5.785 6.02 6.226 6.412 6.494 6.639 6.767 6.957 7.078 7.194 7.354 7.508 7.668 7.828 7.977 8.152 8.316 8.465 8.62 8.78 8.945 9.125 9.316 9.484 9.676 9.876 10.085 10.292 10.487 10.682 10.832 10.987 11.133 11.181 11.115 10.948 10.524 9.475 7.962 6.651 5.464 4.432 3.585 2.846 2.139 1.506 0.897 0.397 -0.036 -0.449 -0.851 -1.218 -1.547 -1.906 -2.234 -2.502 -2.775 -3.061 -3.307 -3.567 -3.835 -4.046 -4.268 -4.496 -4.722 -4.94 -5.092 -5.254 -5.495 -5.657 -5.831 -5.926 -6.128 -6.344 -6.572 -6.689 -7.168 -7.076 -7.208 -7.345 -7.647 -7.807 -7.991 -8.214 -8.496 -8.853 -9.286 -11.059 -8 ,10884 ,TETRA ,17604110,Sun Nov 28 17:11:00 CET,Sun Nov 28 19:00:54 CET,0.0 1.817 2.291 2.687 3.007 3.268 3.493 3.717 4.077 4.224 4.353 4.263 4.72 4.826 5.046 5.251 5.43 5.51 5.65 5.802 6.023 6.151 6.269 6.426 6.573 6.718 6.866 7.013 7.198 7.362 7.51 7.671 7.816 7.966 8.134 8.316 8.473 8.672 8.902 9.098 9.274 9.458 9.654 9.83 9.968 10.062 10.149 10.105 9.889 9.427 8.378 6.862 5.597 4.533 3.603 2.735 1.939 1.224 0.595 -0.028 -0.547 -1.006 -1.423 -1.81 -2.183 -2.528 -2.884 -3.194 -3.464 -3.736 -4.021 -4.26 -4.511 -4.782 -4.985 -5.187 -5.4 -5.638 -5.885 -6.058 -6.251 -6.548 -6.733 -6.916 -7.012 -7.206 -7.408 -7.618 -7.729 -8.205 -8.108 -8.235 -8.365 -8.671 -8.853 -9.066 -9.284 -9.528 -9.845 -10.266 -11.78 -9 ,12019 ,TETRA ,17604111,Sun Nov 28 17:11:00 CET,Sun Nov 28 19:00:52 CET,0.0 1.775 2.315 2.718 2.998 3.213 3.404 3.565 3.868 4.011 4.132 4.0 4.446 4.546 4.714 4.865 5.002 5.069 5.21 5.335 5.517 5.655 5.786 5.957 6.112 6.247 6.379 6.511 6.68 6.836 6.981 7.165 7.337 7.49 7.677 7.868 8.034 8.214 8.373 8.54 8.743 8.934 9.079 9.223 9.389 9.547 9.634 9.585 9.431 9.026 7.997 6.546 5.277 4.128 3.108 2.208 1.418 0.728 0.145 -0.437 -0.938 -1.394 -1.809 -2.201 -2.583 -2.937 -3.292 -3.602 -3.877 -4.162 -4.457 -4.702 -4.962 -5.233 -5.435 -5.643 -5.853 -6.071 -6.296 -6.45 -6.617 -6.88 -7.056 -7.247 -7.35 -7.553 -7.752 -7.955 -8.06 -8.531 -8.415 -8.542 -8.685 -8.996 -9.179 -9.381 -9.581 -9.842 -10.196 -10.671 -12.292 -10 ,8057 ,TETRA ,17604112,Sun Nov 28 17:11:02 CET,Sun Nov 28 19:03:13 CET,0.0 1.889 2.39 2.742 3.023 3.266 3.482 3.685 4.026 4.173 4.33 4.257 4.71 4.825 5.033 5.207 5.382 5.474 5.632 5.775 5.99 6.13 6.26 6.437 6.602 6.761 6.912 7.063 7.247 7.399 7.566 7.782 7.957 8.115 8.286 8.465 8.641 8.839 9.049 9.238 9.398 9.559 9.744 9.916 10.072 10.223 10.328 10.314 10.141 9.652 8.574 7.096 5.829 4.735 3.771 2.854 2.053 1.354 0.768 0.175 -0.335 -0.791 -1.233 -1.641 -2.03 -2.376 -2.726 -3.041 -3.307 -3.571 -3.84 -4.07 -4.307 -4.553 -4.739 -4.922 -5.127 -5.346 -5.563 -5.72 -5.89 -6.143 -6.308 -6.482 -6.576 -6.761 -6.959 -7.19 -7.312 -7.782 -7.664 -7.802 -7.947 -8.254 -8.434 -8.622 -8.832 -9.09 -9.387 -9.819 -11.586 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 27d1f992..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25498 ,TETRA ,17604113,Sun Nov 28 17:11:04 CET,Sun Nov 28 19:01:11 CET,0.0 1.033 1.326 1.542 1.708 1.842 1.964 2.089 2.324 2.427 2.521 2.346 2.782 2.864 3.028 3.18 3.319 3.386 3.52 3.65 3.835 3.959 4.081 4.254 4.416 4.58 4.742 4.892 5.088 5.274 5.464 5.721 5.959 6.174 6.419 6.699 6.988 7.294 7.624 8.004 8.409 8.836 9.307 9.789 10.365 10.984 11.677 12.49 13.404 14.4 15.415 15.795 15.747 15.532 15.24 14.939 14.623 14.306 14.022 13.723 13.452 13.188 12.901 12.599 12.306 12.049 11.771 11.506 11.28 11.041 10.802 10.616 10.41 10.187 10.012 9.838 9.662 9.472 9.261 9.122 8.98 8.744 8.571 8.377 8.269 8.042 7.81 7.558 7.433 6.966 7.011 6.845 6.65 6.219 5.974 5.674 5.324 4.912 4.446 3.761 -0.117 -2 ,16424 ,TETRA ,17604114,Sun Nov 28 17:11:01 CET,Sun Nov 28 18:58:50 CET,0.0 0.896 1.145 1.331 1.485 1.618 1.75 1.875 2.092 2.19 2.282 2.11 2.546 2.631 2.793 2.946 3.092 3.165 3.311 3.461 3.684 3.82 3.948 4.14 4.328 4.505 4.671 4.832 5.047 5.254 5.442 5.676 5.917 6.144 6.404 6.689 6.958 7.254 7.58 7.941 8.317 8.739 9.244 9.754 10.306 10.896 11.567 12.317 13.166 14.077 14.978 15.382 15.357 15.132 14.83 14.501 14.157 13.827 13.553 13.235 12.925 12.64 12.353 12.068 11.797 11.554 11.296 11.052 10.826 10.602 10.361 10.147 9.927 9.688 9.501 9.305 9.095 8.873 8.658 8.498 8.315 8.035 7.814 7.587 7.488 7.283 7.045 6.779 6.63 6.133 6.126 5.949 5.759 5.29 5.015 4.726 4.426 4.093 3.67 2.97 -0.433 -3 ,4242 ,TETRA ,17604115,Sun Nov 28 17:11:04 CET,Sun Nov 28 18:58:50 CET,0.0 0.942 1.25 1.46 1.629 1.772 1.904 2.025 2.247 2.353 2.46 2.317 2.757 2.845 3.018 3.202 3.369 3.443 3.595 3.746 3.955 4.09 4.226 4.417 4.596 4.774 4.95 5.12 5.34 5.553 5.757 6.005 6.236 6.452 6.707 7.002 7.287 7.593 7.931 8.294 8.674 9.106 9.599 10.094 10.687 11.331 12.04 12.806 13.619 14.488 15.391 15.84 15.862 15.725 15.465 15.155 14.84 14.525 14.228 13.914 13.615 13.309 13.004 12.718 12.455 12.209 11.939 11.679 11.451 11.23 10.998 10.792 10.575 10.353 10.181 10.0 9.796 9.567 9.308 9.123 8.929 8.608 8.407 8.215 8.105 7.885 7.667 7.415 7.276 6.798 6.807 6.631 6.442 6.004 5.738 5.426 5.094 4.695 4.238 3.627 0.812 -4 ,17011 ,TETRA ,17604116,Sun Nov 28 17:11:06 CET,Sun Nov 28 18:59:53 CET,0.0 0.904 1.163 1.348 1.495 1.64 1.782 1.908 2.14 2.248 2.35 2.19 2.63 2.718 2.879 3.024 3.164 3.237 3.373 3.501 3.693 3.813 3.928 4.111 4.286 4.459 4.632 4.797 5.011 5.218 5.409 5.65 5.891 6.111 6.36 6.637 6.909 7.207 7.521 7.873 8.252 8.677 9.154 9.63 10.192 10.806 11.489 12.241 13.058 13.904 14.694 15.006 14.982 14.786 14.492 14.191 13.898 13.567 13.265 12.936 12.626 12.343 12.059 11.788 11.548 11.318 11.053 10.816 10.598 10.357 10.112 9.904 9.673 9.412 9.216 9.01 8.781 8.555 8.331 8.167 7.99 7.708 7.524 7.335 7.235 7.03 6.792 6.529 6.392 5.9 5.889 5.699 5.522 5.158 4.903 4.598 4.267 3.865 3.329 2.638 -0.672 -5 ,24798 ,TETRA ,17604117,Sun Nov 28 17:11:01 CET,Sun Nov 28 18:59:37 CET,0.0 0.685 0.941 1.144 1.31 1.457 1.592 1.715 1.935 2.035 2.137 1.971 2.406 2.492 2.656 2.808 2.949 3.018 3.152 3.273 3.451 3.577 3.699 3.86 4.026 4.195 4.352 4.505 4.7 4.885 5.057 5.268 5.495 5.718 5.975 6.279 6.566 6.867 7.205 7.567 7.939 8.361 8.855 9.345 9.903 10.491 11.142 11.87 12.664 13.468 14.229 14.564 14.471 14.221 13.925 13.587 13.266 12.946 12.629 12.289 11.982 11.698 11.41 11.128 10.862 10.599 10.32 10.075 9.862 9.642 9.406 9.211 8.991 8.754 8.567 8.374 8.18 7.962 7.74 7.591 7.423 7.141 6.932 6.709 6.6 6.375 6.134 5.856 5.707 5.223 5.246 5.057 4.845 4.411 4.185 3.926 3.597 3.244 2.832 2.083 -1.232 -6 ,29476 ,TETRA ,17604118,Sun Nov 28 17:11:01 CET,Sun Nov 28 18:59:12 CET,0.0 0.916 1.197 1.414 1.578 1.709 1.833 1.961 2.199 2.305 2.406 2.242 2.677 2.76 2.921 3.074 3.218 3.293 3.451 3.606 3.812 3.94 4.076 4.279 4.474 4.655 4.83 5.0 5.209 5.41 5.61 5.856 6.089 6.317 6.587 6.877 7.157 7.471 7.802 8.134 8.492 8.91 9.386 9.882 10.472 11.121 11.815 12.548 13.378 14.272 15.14 15.45 15.367 15.147 14.836 14.495 14.156 13.834 13.52 13.179 12.874 12.576 12.298 12.055 11.804 11.562 11.302 11.046 10.82 10.59 10.348 10.152 9.945 9.702 9.519 9.335 9.136 8.912 8.675 8.516 8.351 8.081 7.871 7.651 7.535 7.306 7.068 6.793 6.65 6.162 6.141 5.944 5.742 5.296 5.031 4.724 4.358 3.927 3.422 2.713 -2.056 -7 ,26026 ,TETRA ,17604119,Sun Nov 28 17:11:03 CET,Sun Nov 28 18:58:47 CET,0.0 0.814 1.074 1.269 1.438 1.591 1.728 1.854 2.091 2.199 2.302 2.144 2.578 2.659 2.812 2.959 3.105 3.182 3.332 3.473 3.693 3.827 3.953 4.144 4.322 4.495 4.666 4.834 5.054 5.263 5.459 5.693 5.93 6.162 6.423 6.713 6.991 7.296 7.627 7.981 8.347 8.755 9.232 9.721 10.301 10.953 11.689 12.421 13.185 14.046 14.854 15.218 15.174 15.01 14.763 14.434 14.122 13.804 13.511 13.197 12.915 12.654 12.379 12.111 11.858 11.622 11.373 11.141 10.933 10.694 10.452 10.263 10.057 9.838 9.664 9.484 9.282 9.07 8.864 8.704 8.53 8.266 8.066 7.865 7.769 7.573 7.351 7.104 6.975 6.498 6.547 6.382 6.192 5.778 5.562 5.287 4.951 4.582 4.127 3.545 0.893 -8 ,27871 ,TETRA ,17604120,Sun Nov 28 17:12:01 CET,Sun Nov 28 19:00:04 CET,0.0 1.031 1.349 1.575 1.76 1.925 2.086 2.232 2.468 2.575 2.677 2.527 2.972 3.055 3.214 3.374 3.523 3.593 3.727 3.859 4.05 4.165 4.275 4.444 4.606 4.762 4.925 5.085 5.287 5.482 5.673 5.896 6.118 6.336 6.585 6.873 7.143 7.444 7.776 8.126 8.505 8.95 9.468 9.95 10.51 11.163 11.894 12.661 13.47 14.317 15.145 15.55 15.57 15.401 15.137 14.826 14.499 14.147 13.835 13.508 13.221 12.951 12.659 12.388 12.139 11.885 11.621 11.399 11.21 11.018 10.794 10.609 10.419 10.203 10.026 9.845 9.662 9.45 9.206 9.039 8.867 8.58 8.385 8.182 8.082 7.884 7.639 7.35 7.19 6.697 6.715 6.534 6.354 5.908 5.659 5.415 5.103 4.723 4.284 3.683 0.848 -9 ,31344 ,TETRA ,17604121,Sun Nov 28 17:11:28 CET,Sun Nov 28 18:59:47 CET,0.0 1.135 1.419 1.605 1.769 1.924 2.063 2.184 2.394 2.494 2.594 2.446 2.892 2.981 3.136 3.286 3.437 3.51 3.645 3.776 3.966 4.094 4.219 4.399 4.571 4.733 4.889 5.04 5.239 5.428 5.62 5.866 6.097 6.307 6.556 6.852 7.151 7.468 7.793 8.154 8.531 8.943 9.425 9.915 10.494 11.103 11.741 12.445 13.222 14.053 14.927 15.327 15.353 15.205 14.928 14.608 14.275 13.931 13.638 13.34 13.044 12.759 12.483 12.201 11.946 11.715 11.456 11.224 10.992 10.737 10.473 10.239 10.001 9.741 9.52 9.306 9.101 8.88 8.65 8.496 8.321 8.032 7.841 7.652 7.548 7.33 7.096 6.831 6.685 6.191 6.224 6.068 5.871 5.418 5.168 4.874 4.541 4.155 3.632 2.885 -0.601 -10 ,20839 ,TETRA ,17604122,Sun Nov 28 17:11:28 CET,Sun Nov 28 18:59:43 CET,0.0 0.966 1.231 1.429 1.596 1.745 1.878 1.995 2.215 2.323 2.42 2.237 2.675 2.76 2.916 3.066 3.212 3.288 3.433 3.566 3.757 3.876 3.992 4.159 4.325 4.481 4.637 4.797 4.998 5.184 5.36 5.577 5.789 5.999 6.259 6.55 6.82 7.125 7.459 7.81 8.177 8.584 9.071 9.593 10.167 10.762 11.418 12.158 13.079 14.045 14.858 15.14 15.028 14.775 14.498 14.175 13.798 13.405 13.077 12.758 12.46 12.178 11.883 11.594 11.331 11.074 10.787 10.527 10.289 10.037 9.78 9.577 9.371 9.14 8.956 8.747 8.533 8.318 8.061 7.899 7.741 7.473 7.271 7.045 6.927 6.678 6.447 6.196 6.046 5.558 5.592 5.428 5.253 4.864 4.634 4.374 4.053 3.673 3.212 2.421 -0.527 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt deleted file mode 100644 index b56578f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22990 ,TETRA ,17604123,Sun Nov 28 17:11:28 CET,Sun Nov 28 19:01:33 CET,0.0 1.94 2.515 2.922 3.219 3.478 3.72 3.945 4.374 4.569 4.748 4.744 5.238 5.376 5.642 5.888 6.126 6.24 6.45 6.648 6.916 7.089 7.261 7.492 7.717 7.934 8.131 8.326 8.572 8.8 9.017 9.263 9.487 9.702 9.956 10.224 10.463 10.733 11.004 11.263 11.538 11.862 12.236 12.518 12.77 13.058 13.303 13.444 13.442 13.218 12.532 11.332 10.109 9.07 8.206 7.395 6.663 5.965 5.354 4.748 4.218 3.733 3.246 2.773 2.335 1.945 1.548 1.175 0.838 0.498 0.15 -0.127 -0.399 -0.679 -0.902 -1.137 -1.374 -1.627 -1.902 -2.09 -2.274 -2.556 -2.761 -2.977 -3.087 -3.312 -3.547 -3.789 -3.911 -4.392 -4.269 -4.395 -4.544 -4.895 -5.075 -5.258 -5.473 -5.732 -6.038 -6.434 -8.054 -2 ,20229 ,TETRA ,17604124,Sun Nov 28 17:11:28 CET,Sun Nov 28 19:01:33 CET,0.0 1.728 2.291 2.668 2.944 3.193 3.433 3.657 4.033 4.196 4.357 4.307 4.793 4.925 5.155 5.385 5.591 5.681 5.859 6.031 6.267 6.407 6.54 6.755 6.984 7.201 7.403 7.587 7.821 8.039 8.244 8.486 8.711 8.914 9.138 9.396 9.624 9.869 10.148 10.426 10.687 10.951 11.274 11.594 11.914 12.224 12.495 12.704 12.769 12.602 11.943 10.769 9.692 8.664 7.707 6.868 6.14 5.466 4.885 4.289 3.768 3.26 2.746 2.28 1.863 1.492 1.122 0.808 0.538 0.258 -0.04 -0.302 -0.592 -0.889 -1.103 -1.319 -1.581 -1.859 -2.11 -2.278 -2.454 -2.726 -2.907 -3.086 -3.177 -3.374 -3.592 -3.829 -3.952 -4.439 -4.374 -4.526 -4.693 -5.081 -5.292 -5.516 -5.768 -6.034 -6.31 -6.711 -8.189 -3 ,18016 ,TETRA ,17604125,Sun Nov 28 17:11:29 CET,Sun Nov 28 19:02:49 CET,0.0 2.379 2.972 3.392 3.713 3.987 4.24 4.494 4.933 5.133 5.331 5.327 5.817 5.948 6.213 6.48 6.714 6.816 7.005 7.189 7.459 7.637 7.805 8.036 8.275 8.503 8.71 8.889 9.103 9.318 9.528 9.773 10.013 10.248 10.51 10.802 11.066 11.35 11.672 11.985 12.231 12.467 12.749 13.019 13.315 13.621 13.898 14.101 14.135 13.882 13.255 12.12 10.881 9.794 8.892 8.077 7.334 6.656 6.086 5.526 5.053 4.617 4.185 3.768 3.372 3.014 2.641 2.315 2.033 1.73 1.416 1.154 0.879 0.597 0.378 0.158 -0.066 -0.299 -0.534 -0.705 -0.892 -1.186 -1.383 -1.585 -1.687 -1.882 -2.095 -2.323 -2.438 -2.919 -2.82 -2.964 -3.121 -3.451 -3.623 -3.789 -3.986 -4.241 -4.553 -5.005 -6.532 -4 ,25427 ,TETRA ,17604126,Sun Nov 28 17:11:32 CET,Sun Nov 28 19:02:47 CET,0.0 1.167 1.673 2.055 2.376 2.649 2.869 3.053 3.402 3.551 3.683 3.587 4.054 4.174 4.388 4.577 4.748 4.834 5.008 5.165 5.385 5.539 5.696 5.926 6.149 6.366 6.57 6.759 7.0 7.221 7.43 7.679 7.907 8.122 8.376 8.651 8.896 9.143 9.393 9.677 9.986 10.297 10.605 10.87 11.132 11.354 11.527 11.663 11.686 11.498 10.823 9.696 8.596 7.506 6.528 5.648 4.847 4.143 3.534 2.917 2.394 1.934 1.507 1.103 0.725 0.369 -0.037 -0.41 -0.718 -1.04 -1.378 -1.656 -1.946 -2.235 -2.45 -2.67 -2.905 -3.155 -3.43 -3.63 -3.824 -4.106 -4.301 -4.501 -4.61 -4.86 -5.143 -5.422 -5.563 -6.063 -5.962 -6.097 -6.243 -6.574 -6.757 -6.947 -7.167 -7.406 -7.687 -8.103 -9.839 -5 ,6623 ,TETRA ,17604127,Sun Nov 28 17:11:28 CET,Sun Nov 28 19:02:27 CET,0.0 1.75 2.292 2.728 3.108 3.409 3.669 3.918 4.349 4.531 4.698 4.662 5.154 5.294 5.55 5.796 6.022 6.125 6.317 6.503 6.779 6.966 7.142 7.376 7.596 7.815 8.031 8.227 8.469 8.707 8.934 9.182 9.392 9.58 9.797 10.039 10.276 10.533 10.798 11.055 11.321 11.642 11.956 12.222 12.519 12.773 13.012 13.237 13.313 13.122 12.436 11.343 10.243 9.241 8.361 7.543 6.83 6.174 5.602 5.037 4.502 4.011 3.546 3.112 2.701 2.295 1.896 1.559 1.261 0.943 0.617 0.354 0.087 -0.185 -0.406 -0.641 -0.874 -1.108 -1.336 -1.498 -1.682 -1.967 -2.168 -2.376 -2.481 -2.692 -2.913 -3.134 -3.249 -3.733 -3.621 -3.758 -3.901 -4.187 -4.365 -4.576 -4.804 -5.048 -5.339 -5.73 -7.08 -6 ,1296 ,TETRA ,17604128,Sun Nov 28 17:11:30 CET,Sun Nov 28 19:02:03 CET,0.0 1.809 2.276 2.608 2.89 3.172 3.414 3.618 4.004 4.192 4.367 4.329 4.816 4.953 5.205 5.447 5.672 5.791 6.024 6.233 6.54 6.713 6.878 7.118 7.33 7.544 7.75 7.935 8.169 8.399 8.616 8.86 9.091 9.308 9.564 9.841 10.088 10.345 10.607 10.868 11.122 11.382 11.666 11.949 12.272 12.575 12.843 13.067 13.164 12.97 12.289 11.135 9.978 8.939 8.033 7.223 6.467 5.732 5.089 4.478 3.957 3.471 3.005 2.582 2.194 1.823 1.419 1.073 0.787 0.489 0.186 -0.071 -0.347 -0.618 -0.826 -1.052 -1.272 -1.487 -1.723 -1.895 -2.07 -2.328 -2.516 -2.723 -2.826 -3.038 -3.252 -3.474 -3.599 -4.088 -3.997 -4.134 -4.272 -4.565 -4.732 -4.926 -5.143 -5.391 -5.686 -6.084 -7.761 -7 ,13138 ,TETRA ,17604129,Sun Nov 28 17:11:33 CET,Sun Nov 28 19:01:34 CET,0.0 1.284 1.707 2.061 2.369 2.628 2.871 3.111 3.544 3.724 3.889 3.854 4.341 4.487 4.771 5.028 5.265 5.372 5.572 5.759 6.03 6.217 6.394 6.622 6.837 7.038 7.24 7.449 7.689 7.893 8.097 8.358 8.591 8.793 9.037 9.329 9.578 9.822 10.091 10.355 10.61 10.875 11.148 11.384 11.676 11.967 12.162 12.285 12.312 12.13 11.468 10.32 9.237 8.231 7.306 6.489 5.763 5.082 4.487 3.883 3.367 2.896 2.432 1.99 1.592 1.239 0.858 0.524 0.253 -0.017 -0.298 -0.547 -0.811 -1.091 -1.305 -1.527 -1.777 -2.03 -2.29 -2.468 -2.644 -2.92 -3.115 -3.317 -3.417 -3.61 -3.826 -4.058 -4.18 -4.673 -4.575 -4.718 -4.87 -5.173 -5.342 -5.525 -5.714 -5.964 -6.283 -6.729 -8.593 -8 ,23917 ,TETRA ,17604130,Sun Nov 28 17:11:29 CET,Sun Nov 28 19:01:23 CET,0.0 1.662 2.162 2.539 2.84 3.085 3.313 3.526 3.923 4.092 4.238 4.146 4.61 4.718 4.944 5.16 5.354 5.443 5.62 5.813 6.101 6.276 6.448 6.695 6.9 7.083 7.269 7.469 7.733 7.961 8.166 8.42 8.667 8.882 9.126 9.411 9.681 9.976 10.261 10.533 10.823 11.113 11.436 11.726 11.989 12.217 12.44 12.669 12.756 12.552 11.869 10.7 9.548 8.533 7.657 6.852 6.126 5.425 4.773 4.144 3.604 3.14 2.725 2.347 1.992 1.649 1.288 0.963 0.691 0.408 0.098 -0.167 -0.432 -0.708 -0.922 -1.132 -1.358 -1.606 -1.863 -2.026 -2.182 -2.429 -2.597 -2.765 -2.854 -3.042 -3.236 -3.441 -3.559 -4.041 -3.926 -4.058 -4.204 -4.533 -4.713 -4.898 -5.102 -5.354 -5.675 -6.06 -7.78 -9 ,1573 ,TETRA ,17604131,Sun Nov 28 17:11:28 CET,Sun Nov 28 19:02:21 CET,0.0 1.422 1.952 2.331 2.639 2.905 3.158 3.385 3.748 3.906 4.042 3.933 4.398 4.516 4.749 4.99 5.22 5.327 5.52 5.704 5.981 6.157 6.32 6.552 6.78 6.998 7.193 7.383 7.622 7.821 8.01 8.253 8.497 8.716 8.94 9.175 9.408 9.674 9.973 10.274 10.549 10.833 11.18 11.493 11.753 11.991 12.208 12.419 12.575 12.434 11.762 10.672 9.54 8.479 7.579 6.775 6.044 5.388 4.813 4.167 3.605 3.123 2.668 2.242 1.858 1.532 1.167 0.819 0.517 0.219 -0.094 -0.366 -0.639 -0.919 -1.146 -1.391 -1.641 -1.9 -2.164 -2.331 -2.509 -2.8 -3.004 -3.208 -3.309 -3.529 -3.758 -3.995 -4.12 -4.608 -4.511 -4.652 -4.795 -5.096 -5.259 -5.439 -5.656 -5.907 -6.185 -6.556 -8.064 -10 ,31853 ,TETRA ,17604132,Sun Nov 28 17:11:29 CET,Sun Nov 28 19:02:21 CET,0.0 1.848 2.387 2.763 3.067 3.329 3.585 3.82 4.192 4.359 4.513 4.441 4.921 5.045 5.277 5.503 5.706 5.807 6.01 6.204 6.481 6.655 6.821 7.047 7.264 7.476 7.666 7.837 8.053 8.269 8.486 8.744 8.971 9.173 9.424 9.702 9.944 10.212 10.505 10.777 11.026 11.317 11.63 11.903 12.226 12.506 12.727 12.883 12.925 12.736 12.053 10.933 9.858 8.798 7.849 7.029 6.276 5.566 4.939 4.323 3.799 3.339 2.886 2.449 2.043 1.666 1.274 0.925 0.63 0.321 0.005 -0.257 -0.517 -0.798 -1.027 -1.262 -1.507 -1.761 -2.029 -2.209 -2.389 -2.661 -2.845 -3.03 -3.126 -3.334 -3.55 -3.76 -3.866 -4.346 -4.241 -4.374 -4.52 -4.858 -5.043 -5.232 -5.441 -5.687 -6.003 -6.414 -7.675 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt deleted file mode 100644 index 90672050..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19946 ,TETRA ,17604133,Sun Nov 28 17:11:33 CET,Sun Nov 28 19:03:11 CET,0.0 1.052 1.336 1.55 1.721 1.864 1.998 2.116 2.312 2.4 2.485 2.274 2.716 2.788 2.931 3.056 3.165 3.221 3.338 3.45 3.594 3.687 3.774 3.898 4.024 4.15 4.275 4.398 4.561 4.701 4.822 4.975 5.125 5.267 5.43 5.605 5.764 5.947 6.156 6.369 6.568 6.765 6.986 7.2 7.45 7.7 7.909 8.084 8.222 8.195 7.779 7.028 6.351 5.704 5.102 4.552 4.052 3.588 3.183 2.784 2.443 2.124 1.821 1.53 1.252 1.011 0.762 0.539 0.352 0.151 -0.07 -0.268 -0.477 -0.685 -0.841 -0.994 -1.148 -1.308 -1.472 -1.588 -1.714 -1.906 -2.039 -2.174 -2.246 -2.406 -2.568 -2.738 -2.824 -3.285 -3.109 -3.207 -3.32 -3.575 -3.708 -3.845 -4.003 -4.197 -4.423 -4.709 -6.121 -2 ,15370 ,TETRA ,17604134,Sun Nov 28 17:11:32 CET,Sun Nov 28 19:02:21 CET,0.0 1.39 1.666 1.871 2.036 2.175 2.305 2.427 2.639 2.732 2.817 2.606 3.048 3.115 3.247 3.37 3.481 3.533 3.63 3.729 3.871 3.965 4.059 4.188 4.312 4.427 4.539 4.658 4.811 4.947 5.086 5.26 5.414 5.556 5.728 5.919 6.084 6.252 6.429 6.619 6.82 7.015 7.238 7.452 7.678 7.931 8.148 8.328 8.469 8.429 8.037 7.374 6.687 6.01 5.409 4.835 4.325 3.859 3.439 3.029 2.661 2.325 2.004 1.698 1.412 1.155 0.879 0.642 0.444 0.219 -0.01 -0.2 -0.4 -0.605 -0.767 -0.927 -1.087 -1.255 -1.432 -1.556 -1.678 -1.882 -2.031 -2.185 -2.261 -2.408 -2.558 -2.716 -2.802 -3.266 -3.082 -3.183 -3.293 -3.536 -3.67 -3.829 -4.006 -4.188 -4.432 -4.735 -5.786 -3 ,27595 ,TETRA ,17604135,Sun Nov 28 17:11:30 CET,Sun Nov 28 19:02:01 CET,0.0 1.311 1.603 1.816 1.987 2.15 2.287 2.408 2.632 2.73 2.818 2.614 3.054 3.12 3.253 3.391 3.515 3.574 3.693 3.8 3.942 4.032 4.119 4.246 4.367 4.483 4.603 4.714 4.854 4.993 5.123 5.279 5.434 5.579 5.748 5.93 6.092 6.267 6.452 6.649 6.841 7.031 7.268 7.496 7.723 7.936 8.134 8.32 8.447 8.411 8.06 7.398 6.681 5.975 5.338 4.77 4.252 3.758 3.336 2.908 2.54 2.215 1.91 1.622 1.355 1.109 0.858 0.623 0.408 0.195 -0.031 -0.224 -0.428 -0.644 -0.81 -0.972 -1.135 -1.309 -1.504 -1.642 -1.78 -2.003 -2.156 -2.303 -2.376 -2.523 -2.682 -2.86 -2.949 -3.414 -3.253 -3.367 -3.486 -3.749 -3.894 -4.048 -4.212 -4.385 -4.592 -4.912 -6.522 -4 ,1676 ,TETRA ,17604136,Sun Nov 28 17:11:32 CET,Sun Nov 28 19:03:18 CET,0.0 1.154 1.442 1.637 1.806 1.96 2.09 2.208 2.408 2.493 2.577 2.385 2.838 2.915 3.047 3.167 3.286 3.34 3.443 3.552 3.713 3.819 3.92 4.059 4.194 4.327 4.463 4.588 4.736 4.891 5.04 5.201 5.353 5.497 5.669 5.862 6.031 6.197 6.371 6.565 6.76 6.967 7.205 7.437 7.701 7.945 8.175 8.367 8.46 8.414 8.061 7.397 6.702 6.033 5.431 4.89 4.392 3.926 3.518 3.084 2.693 2.348 2.03 1.735 1.451 1.189 0.917 0.676 0.467 0.241 0.008 -0.185 -0.387 -0.596 -0.757 -0.921 -1.087 -1.257 -1.437 -1.56 -1.679 -1.867 -2.0 -2.136 -2.205 -2.347 -2.493 -2.658 -2.748 -3.205 -3.022 -3.13 -3.239 -3.479 -3.614 -3.759 -3.922 -4.108 -4.342 -4.669 -6.316 -5 ,29515 ,TETRA ,17604137,Sun Nov 28 17:11:33 CET,Sun Nov 28 19:03:22 CET,0.0 1.199 1.476 1.683 1.852 1.996 2.129 2.254 2.471 2.565 2.651 2.47 2.929 3.016 3.184 3.35 3.501 3.573 3.711 3.852 4.035 4.127 4.221 4.366 4.507 4.643 4.768 4.886 5.027 5.161 5.298 5.461 5.618 5.759 5.918 6.099 6.263 6.435 6.62 6.812 7.005 7.223 7.46 7.664 7.873 8.079 8.286 8.476 8.637 8.682 8.432 7.753 7.011 6.359 5.771 5.196 4.662 4.191 3.801 3.415 3.068 2.742 2.425 2.118 1.833 1.576 1.312 1.066 0.846 0.618 0.389 0.203 0.0 -0.216 -0.379 -0.538 -0.696 -0.85 -1.018 -1.134 -1.261 -1.468 -1.61 -1.761 -1.839 -2.001 -2.164 -2.349 -2.444 -2.912 -2.751 -2.864 -2.982 -3.243 -3.399 -3.57 -3.743 -3.931 -4.181 -4.525 -5.995 -6 ,19428 ,TETRA ,17604138,Sun Nov 28 17:11:35 CET,Sun Nov 28 19:02:43 CET,0.0 0.95 1.236 1.45 1.626 1.788 1.916 2.024 2.225 2.323 2.419 2.222 2.662 2.73 2.855 2.98 3.11 3.17 3.283 3.392 3.558 3.664 3.757 3.892 4.019 4.141 4.261 4.375 4.524 4.677 4.832 5.005 5.161 5.313 5.487 5.665 5.82 5.988 6.176 6.37 6.561 6.783 7.027 7.24 7.455 7.657 7.86 8.062 8.214 8.219 7.874 7.156 6.423 5.724 5.102 4.542 4.058 3.605 3.19 2.771 2.428 2.137 1.847 1.55 1.255 0.988 0.725 0.477 0.265 0.053 -0.176 -0.368 -0.563 -0.764 -0.934 -1.112 -1.299 -1.495 -1.685 -1.819 -1.96 -2.171 -2.322 -2.481 -2.564 -2.744 -2.931 -3.137 -3.247 -3.729 -3.601 -3.726 -3.86 -4.163 -4.322 -4.488 -4.667 -4.862 -5.117 -5.461 -7.034 -7 ,32379 ,TETRA ,17604139,Sun Nov 28 17:11:32 CET,Sun Nov 28 19:01:52 CET,0.0 0.924 1.226 1.438 1.615 1.771 1.913 2.038 2.247 2.342 2.431 2.222 2.663 2.734 2.874 3.01 3.134 3.195 3.309 3.418 3.578 3.675 3.779 3.931 4.064 4.195 4.323 4.441 4.589 4.74 4.888 5.046 5.199 5.357 5.53 5.709 5.874 6.048 6.224 6.406 6.598 6.825 7.066 7.265 7.482 7.715 7.944 8.123 8.258 8.245 7.874 7.125 6.352 5.648 5.065 4.547 4.058 3.591 3.181 2.755 2.393 2.078 1.764 1.463 1.187 0.928 0.662 0.421 0.217 0.009 -0.219 -0.409 -0.61 -0.819 -0.977 -1.139 -1.309 -1.486 -1.67 -1.803 -1.939 -2.172 -2.345 -2.52 -2.609 -2.792 -2.985 -3.182 -3.279 -3.752 -3.602 -3.71 -3.821 -4.066 -4.191 -4.331 -4.5 -4.707 -4.956 -5.275 -6.408 -8 ,3663 ,TETRA ,17604140,Sun Nov 28 17:11:33 CET,Sun Nov 28 19:02:10 CET,0.0 1.026 1.36 1.592 1.774 1.928 2.057 2.164 2.377 2.466 2.549 2.349 2.793 2.861 2.99 3.112 3.231 3.288 3.398 3.5 3.642 3.735 3.832 3.968 4.082 4.194 4.308 4.413 4.542 4.668 4.792 4.942 5.072 5.196 5.353 5.525 5.693 5.872 6.065 6.264 6.454 6.657 6.873 7.09 7.327 7.535 7.73 7.914 8.031 8.045 7.75 7.044 6.294 5.567 4.927 4.354 3.847 3.366 2.937 2.523 2.165 1.83 1.507 1.211 0.938 0.685 0.415 0.176 -0.028 -0.244 -0.463 -0.635 -0.823 -1.018 -1.174 -1.331 -1.483 -1.648 -1.82 -1.939 -2.053 -2.236 -2.375 -2.524 -2.603 -2.762 -2.924 -3.104 -3.196 -3.654 -3.462 -3.563 -3.675 -3.918 -4.058 -4.22 -4.405 -4.61 -4.823 -5.122 -6.328 -9 ,20591 ,TETRA ,17604141,Sun Nov 28 17:11:34 CET,Sun Nov 28 19:02:29 CET,0.0 1.575 1.947 2.233 2.454 2.615 2.756 2.897 3.148 3.252 3.355 3.207 3.676 3.771 3.928 4.071 4.223 4.296 4.432 4.563 4.734 4.847 4.96 5.121 5.27 5.401 5.528 5.658 5.832 5.988 6.125 6.291 6.446 6.589 6.761 6.948 7.123 7.307 7.496 7.697 7.91 8.145 8.399 8.634 8.891 9.13 9.325 9.516 9.674 9.673 9.323 8.621 7.926 7.297 6.705 6.124 5.585 5.093 4.662 4.215 3.829 3.487 3.16 2.856 2.573 2.315 2.039 1.793 1.58 1.349 1.119 0.933 0.729 0.512 0.334 0.145 -0.03 -0.214 -0.415 -0.557 -0.708 -0.937 -1.101 -1.271 -1.36 -1.544 -1.731 -1.939 -2.05 -2.529 -2.366 -2.474 -2.595 -2.861 -3.005 -3.165 -3.337 -3.515 -3.736 -4.071 -5.047 -10 ,20961 ,TETRA ,17604142,Sun Nov 28 17:11:36 CET,Sun Nov 28 19:02:01 CET,0.0 0.992 1.29 1.5 1.667 1.81 1.951 2.077 2.298 2.407 2.525 2.369 2.818 2.902 3.058 3.21 3.357 3.423 3.545 3.671 3.851 3.952 4.058 4.222 4.369 4.507 4.64 4.76 4.907 5.062 5.207 5.37 5.533 5.683 5.841 6.021 6.199 6.389 6.58 6.767 6.965 7.18 7.391 7.585 7.787 7.983 8.18 8.323 8.41 8.403 8.051 7.276 6.518 5.853 5.279 4.716 4.183 3.729 3.334 2.919 2.571 2.244 1.927 1.628 1.347 1.101 0.843 0.61 0.406 0.192 -0.04 -0.239 -0.447 -0.657 -0.825 -1.001 -1.182 -1.369 -1.546 -1.669 -1.813 -2.04 -2.184 -2.332 -2.409 -2.581 -2.769 -2.959 -3.063 -3.539 -3.403 -3.533 -3.674 -4.006 -4.19 -4.391 -4.61 -4.866 -5.186 -5.604 -7.733 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt deleted file mode 100644 index 6fdd9c76..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17434 ,TETRA ,17604143,Sun Nov 28 17:11:31 CET,Sun Nov 28 19:01:57 CET,0.0 1.512 1.951 2.284 2.554 2.772 2.947 3.098 3.354 3.481 3.604 3.469 3.948 4.056 4.244 4.412 4.572 4.651 4.814 4.975 5.207 5.349 5.482 5.675 5.857 6.046 6.229 6.397 6.616 6.819 7.008 7.248 7.48 7.696 7.945 8.227 8.507 8.817 9.133 9.46 9.821 10.228 10.704 11.183 11.711 12.3 12.985 13.752 14.636 15.672 16.878 17.683 17.99 18.083 18.067 17.972 17.847 17.709 17.577 17.429 17.277 17.122 16.967 16.814 16.654 16.502 16.349 16.207 16.078 15.945 15.795 15.675 15.561 15.43 15.314 15.198 15.084 14.957 14.82 14.724 14.623 14.467 14.353 14.229 14.164 14.026 13.881 13.711 13.624 13.18 13.318 13.21 13.102 12.862 12.718 12.53 12.317 12.094 11.83 11.439 10.341 -2 ,9919 ,TETRA ,17604144,Sun Nov 28 17:11:33 CET,Sun Nov 28 19:02:01 CET,0.0 1.212 1.582 1.858 2.116 2.321 2.487 2.646 2.942 3.072 3.195 3.053 3.52 3.622 3.806 3.981 4.154 4.236 4.387 4.534 4.753 4.893 5.032 5.24 5.439 5.629 5.808 5.977 6.195 6.401 6.591 6.827 7.056 7.284 7.554 7.838 8.116 8.423 8.742 9.08 9.46 9.889 10.367 10.847 11.403 12.023 12.733 13.531 14.395 15.33 16.422 17.184 17.498 17.583 17.562 17.479 17.372 17.239 17.104 16.972 16.843 16.715 16.576 16.419 16.269 16.13 15.973 15.827 15.697 15.559 15.417 15.302 15.179 15.037 14.91 14.778 14.658 14.539 14.401 14.297 14.187 14.014 13.895 13.771 13.705 13.564 13.421 13.26 13.17 12.731 12.9 12.805 12.713 12.507 12.384 12.248 12.112 11.951 11.736 11.424 10.33 -3 ,22002 ,TETRA ,17604145,Sun Nov 28 17:11:34 CET,Sun Nov 28 19:02:09 CET,0.0 1.093 1.381 1.593 1.77 1.918 2.05 2.176 2.425 2.545 2.65 2.477 2.941 3.031 3.195 3.346 3.489 3.563 3.711 3.859 4.07 4.205 4.335 4.514 4.69 4.857 5.015 5.18 5.411 5.63 5.833 6.074 6.308 6.543 6.805 7.089 7.363 7.665 7.989 8.34 8.723 9.157 9.64 10.129 10.713 11.34 12.055 12.833 13.679 14.661 15.754 16.479 16.787 16.877 16.858 16.774 16.654 16.501 16.351 16.187 16.022 15.869 15.709 15.539 15.383 15.248 15.103 14.956 14.824 14.682 14.524 14.393 14.253 14.108 14.011 13.901 13.773 13.651 13.513 13.414 13.32 13.182 13.084 12.973 12.914 12.794 12.674 12.535 12.46 12.028 12.232 12.146 12.054 11.853 11.723 11.584 11.444 11.28 11.087 10.831 9.753 -4 ,25952 ,TETRA ,17604146,Sun Nov 28 17:11:37 CET,Sun Nov 28 19:01:31 CET,0.0 1.012 1.288 1.523 1.715 1.862 2.006 2.144 2.406 2.535 2.667 2.549 3.011 3.102 3.284 3.456 3.64 3.737 3.91 4.069 4.305 4.449 4.58 4.782 4.986 5.173 5.35 5.522 5.746 5.957 6.158 6.416 6.66 6.879 7.129 7.423 7.714 8.021 8.354 8.708 9.072 9.483 9.959 10.43 10.961 11.569 12.269 13.055 13.994 15.016 16.122 16.904 17.216 17.329 17.315 17.22 17.081 16.906 16.738 16.572 16.417 16.264 16.109 15.946 15.792 15.654 15.509 15.37 15.237 15.089 14.935 14.809 14.678 14.542 14.43 14.306 14.176 14.053 13.93 13.838 13.752 13.615 13.517 13.418 13.361 13.241 13.105 12.967 12.89 12.447 12.643 12.557 12.461 12.261 12.154 12.03 11.884 11.715 11.519 11.263 10.383 -5 ,14436 ,TETRA ,17604147,Sun Nov 28 17:11:32 CET,Sun Nov 28 19:01:52 CET,0.0 0.828 1.101 1.329 1.523 1.674 1.807 1.932 2.184 2.305 2.41 2.226 2.677 2.759 2.926 3.101 3.258 3.33 3.468 3.602 3.807 3.929 4.044 4.221 4.39 4.547 4.707 4.865 5.066 5.275 5.479 5.718 5.948 6.177 6.442 6.732 7.005 7.305 7.637 7.984 8.343 8.762 9.255 9.749 10.319 10.947 11.641 12.402 13.286 14.29 15.392 16.121 16.416 16.511 16.5 16.413 16.281 16.121 15.949 15.766 15.624 15.491 15.342 15.192 15.042 14.904 14.752 14.591 14.447 14.298 14.144 14.023 13.897 13.755 13.636 13.516 13.395 13.265 13.125 13.018 12.902 12.733 12.613 12.479 12.411 12.286 12.15 11.997 11.914 11.472 11.642 11.537 11.411 11.143 10.982 10.788 10.595 10.381 10.091 9.687 8.193 -6 ,31788 ,TETRA ,17604148,Sun Nov 28 17:11:37 CET,Sun Nov 28 19:01:59 CET,0.0 0.99 1.289 1.5 1.666 1.819 1.973 2.113 2.353 2.461 2.566 2.403 2.864 2.955 3.138 3.306 3.469 3.548 3.694 3.83 4.035 4.164 4.286 4.462 4.619 4.766 4.911 5.059 5.256 5.448 5.642 5.877 6.103 6.322 6.582 6.877 7.153 7.459 7.794 8.151 8.532 8.958 9.427 9.906 10.471 11.074 11.785 12.608 13.522 14.522 15.625 16.364 16.674 16.758 16.758 16.701 16.565 16.399 16.252 16.095 15.947 15.807 15.652 15.488 15.332 15.183 15.021 14.875 14.755 14.616 14.466 14.348 14.233 14.114 14.016 13.922 13.823 13.707 13.585 13.501 13.414 13.267 13.164 13.059 12.998 12.875 12.753 12.625 12.557 12.126 12.32 12.235 12.146 11.941 11.823 11.689 11.541 11.361 11.146 10.875 10.032 -7 ,27730 ,TETRA ,17604149,Sun Nov 28 17:11:32 CET,Sun Nov 28 19:02:11 CET,0.0 1.249 1.662 1.98 2.242 2.442 2.61 2.773 3.07 3.202 3.335 3.203 3.663 3.757 3.939 4.11 4.281 4.365 4.529 4.693 4.919 5.054 5.183 5.377 5.57 5.754 5.93 6.094 6.315 6.526 6.725 6.972 7.201 7.416 7.677 7.977 8.256 8.552 8.875 9.222 9.591 10.006 10.477 10.953 11.509 12.139 12.848 13.627 14.556 15.585 16.659 17.345 17.622 17.731 17.739 17.665 17.538 17.391 17.254 17.09 16.911 16.76 16.609 16.458 16.309 16.164 16.016 15.869 15.733 15.591 15.441 15.311 15.175 15.039 14.932 14.814 14.688 14.55 14.406 14.302 14.194 14.027 13.903 13.779 13.717 13.589 13.448 13.274 13.182 12.737 12.892 12.778 12.659 12.413 12.275 12.129 11.971 11.776 11.519 11.134 10.014 -8 ,11980 ,TETRA ,17604150,Sun Nov 28 17:11:34 CET,Sun Nov 28 19:01:47 CET,0.0 1.36 1.673 1.885 2.047 2.196 2.336 2.463 2.682 2.795 2.914 2.744 3.195 3.279 3.433 3.587 3.74 3.812 3.944 4.078 4.28 4.404 4.52 4.688 4.864 5.039 5.194 5.339 5.53 5.715 5.891 6.109 6.328 6.54 6.785 7.073 7.349 7.65 7.975 8.323 8.692 9.104 9.583 10.078 10.653 11.282 12.001 12.817 13.743 14.747 15.839 16.56 16.844 16.915 16.898 16.841 16.709 16.559 16.421 16.26 16.109 15.962 15.818 15.676 15.533 15.391 15.228 15.073 14.935 14.785 14.636 14.499 14.35 14.211 14.104 13.984 13.857 13.712 13.55 13.446 13.337 13.158 13.038 12.919 12.853 12.704 12.549 12.382 12.284 11.833 12.003 11.906 11.813 11.607 11.49 11.364 11.221 11.066 10.876 10.593 9.728 -9 ,24183 ,TETRA ,17604151,Sun Nov 28 17:11:32 CET,Sun Nov 28 19:02:02 CET,0.0 0.989 1.318 1.553 1.757 1.939 2.12 2.289 2.589 2.72 2.847 2.729 3.205 3.305 3.501 3.687 3.856 3.938 4.1 4.249 4.452 4.579 4.708 4.907 5.101 5.283 5.458 5.641 5.87 6.07 6.258 6.491 6.717 6.936 7.193 7.479 7.74 8.036 8.382 8.744 9.121 9.537 10.021 10.5 11.032 11.643 12.351 13.132 14.046 15.093 16.225 16.969 17.268 17.366 17.37 17.294 17.166 16.993 16.819 16.644 16.48 16.337 16.188 16.035 15.877 15.718 15.559 15.422 15.291 15.154 15.031 14.922 14.799 14.672 14.574 14.47 14.358 14.247 14.125 14.034 13.948 13.806 13.699 13.593 13.538 13.417 13.29 13.146 13.068 12.634 12.81 12.719 12.632 12.43 12.308 12.171 12.026 11.856 11.644 11.352 10.305 -10 ,31849 ,TETRA ,17604152,Sun Nov 28 17:11:34 CET,Sun Nov 28 19:02:02 CET,0.0 1.07 1.367 1.589 1.784 1.956 2.104 2.242 2.503 2.618 2.72 2.548 3.004 3.086 3.241 3.395 3.545 3.618 3.754 3.883 4.075 4.205 4.336 4.511 4.667 4.825 4.988 5.146 5.34 5.528 5.724 5.968 6.201 6.431 6.702 6.998 7.263 7.557 7.901 8.264 8.628 9.048 9.525 10.012 10.597 11.231 11.938 12.737 13.678 14.717 15.851 16.613 16.933 17.061 17.053 16.95 16.81 16.675 16.562 16.418 16.257 16.094 15.924 15.739 15.561 15.41 15.244 15.086 14.96 14.838 14.693 14.567 14.427 14.285 14.189 14.08 13.952 13.804 13.643 13.541 13.434 13.275 13.172 13.065 13.007 12.886 12.763 12.628 12.556 12.129 12.327 12.236 12.146 11.933 11.806 11.67 11.517 11.351 11.159 10.888 9.812 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt deleted file mode 100644 index f5055dcc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24674 ,TETRA ,17604153,Sun Nov 28 17:12:03 CET,Sun Nov 28 19:03:14 CET,0.0 0.331 0.47 0.566 0.634 0.697 0.757 0.812 0.902 0.944 0.994 0.727 1.142 1.195 1.283 1.361 1.437 1.478 1.559 1.623 1.702 1.762 1.818 1.888 1.944 1.987 2.036 2.088 2.136 2.177 2.213 2.25 2.281 2.309 2.325 2.314 2.311 2.31 2.274 2.218 2.159 2.068 1.936 1.763 1.515 1.181 0.687 0.028 -0.935 -2.412 -4.795 -7.556 -9.752 -11.502 -12.924 -14.155 -15.212 -16.159 -16.95 -17.709 -18.341 -18.894 -19.407 -19.882 -20.31 -20.702 -21.109 -21.464 -21.776 -22.093 -22.414 -22.677 -22.95 -23.226 -23.443 -23.668 -23.894 -24.118 -24.347 -24.512 -24.687 -24.964 -25.157 -25.362 -25.463 -25.659 -25.869 -26.104 -26.229 -26.742 -26.602 -26.738 -26.876 -27.178 -27.353 -27.55 -27.772 -28.029 -28.339 -28.753 -30.582 -2 ,8720 ,TETRA ,17604154,Sun Nov 28 17:12:04 CET,Sun Nov 28 19:03:44 CET,0.0 0.249 0.352 0.437 0.517 0.593 0.661 0.721 0.825 0.869 0.909 0.608 1.008 1.045 1.11 1.173 1.237 1.268 1.318 1.349 1.384 1.419 1.452 1.494 1.545 1.607 1.655 1.693 1.74 1.783 1.818 1.854 1.889 1.914 1.934 1.942 1.947 1.945 1.909 1.851 1.774 1.662 1.51 1.348 1.137 0.847 0.383 -0.324 -1.318 -2.751 -5.091 -7.832 -10.008 -11.768 -13.204 -14.426 -15.467 -16.386 -17.138 -17.869 -18.502 -19.05 -19.557 -20.05 -20.514 -20.927 -21.345 -21.713 -22.024 -22.335 -22.652 -22.915 -23.187 -23.471 -23.695 -23.919 -24.139 -24.361 -24.595 -24.754 -24.918 -25.186 -25.372 -25.572 -25.681 -25.897 -26.111 -26.34 -26.456 -26.964 -26.83 -26.966 -27.1 -27.38 -27.539 -27.702 -27.869 -28.08 -28.32 -28.631 -30.076 -3 ,5222 ,TETRA ,17604155,Sun Nov 28 17:12:06 CET,Sun Nov 28 19:03:29 CET,0.0 0.343 0.509 0.63 0.713 0.792 0.863 0.923 1.044 1.098 1.144 0.858 1.264 1.303 1.368 1.426 1.481 1.501 1.533 1.573 1.629 1.661 1.69 1.732 1.779 1.819 1.852 1.881 1.915 1.941 1.955 1.97 1.979 1.99 2.004 2.005 1.98 1.956 1.95 1.916 1.869 1.803 1.669 1.479 1.214 0.875 0.401 -0.251 -1.222 -2.687 -5.052 -7.784 -9.897 -11.601 -13.032 -14.273 -15.33 -16.256 -17.018 -17.772 -18.407 -18.96 -19.487 -19.974 -20.41 -20.796 -21.192 -21.555 -21.868 -22.188 -22.525 -22.8 -23.076 -23.35 -23.564 -23.784 -24.01 -24.244 -24.478 -24.633 -24.79 -25.048 -25.225 -25.404 -25.492 -25.668 -25.863 -26.075 -26.183 -26.681 -26.519 -26.642 -26.769 -27.053 -27.203 -27.35 -27.514 -27.709 -27.933 -28.191 -29.086 -4 ,23907 ,TETRA ,17604156,Sun Nov 28 17:12:00 CET,Sun Nov 28 19:03:14 CET,0.0 0.273 0.404 0.488 0.555 0.62 0.691 0.759 0.887 0.94 0.988 0.706 1.107 1.141 1.211 1.275 1.325 1.351 1.398 1.437 1.494 1.529 1.562 1.6 1.634 1.663 1.685 1.702 1.734 1.773 1.804 1.835 1.867 1.901 1.913 1.906 1.891 1.869 1.836 1.773 1.69 1.572 1.434 1.264 1.009 0.687 0.216 -0.452 -1.427 -2.903 -5.314 -8.048 -10.173 -11.947 -13.433 -14.69 -15.735 -16.64 -17.395 -18.148 -18.78 -19.327 -19.856 -20.349 -20.798 -21.204 -21.627 -22.0 -22.312 -22.632 -22.961 -23.22 -23.475 -23.743 -23.95 -24.164 -24.397 -24.635 -24.869 -25.028 -25.192 -25.442 -25.615 -25.794 -25.883 -26.07 -26.269 -26.47 -26.573 -27.074 -26.903 -27.022 -27.146 -27.407 -27.56 -27.718 -27.882 -28.077 -28.313 -28.584 -29.26 -5 ,6711 ,TETRA ,17604157,Sun Nov 28 17:12:01 CET,Sun Nov 28 19:03:12 CET,0.0 0.283 0.442 0.55 0.627 0.702 0.767 0.83 0.945 0.995 1.049 0.761 1.152 1.186 1.268 1.335 1.381 1.406 1.458 1.494 1.543 1.584 1.623 1.675 1.708 1.753 1.803 1.846 1.907 1.958 2.003 2.048 2.083 2.114 2.137 2.147 2.156 2.161 2.147 2.123 2.072 1.984 1.863 1.702 1.448 1.094 0.641 -0.009 -0.989 -2.464 -4.887 -7.6 -9.723 -11.467 -12.906 -14.156 -15.189 -16.082 -16.878 -17.666 -18.308 -18.877 -19.411 -19.899 -20.341 -20.738 -21.145 -21.496 -21.785 -22.079 -22.381 -22.628 -22.887 -23.153 -23.358 -23.57 -23.793 -24.014 -24.234 -24.395 -24.558 -24.805 -24.979 -25.155 -25.246 -25.43 -25.616 -25.814 -25.919 -26.423 -26.262 -26.384 -26.505 -26.764 -26.908 -27.049 -27.203 -27.388 -27.636 -27.938 -28.705 -6 ,22375 ,TETRA ,17604158,Sun Nov 28 17:12:01 CET,Sun Nov 28 19:03:21 CET,0.0 0.241 0.408 0.53 0.631 0.707 0.777 0.843 0.951 0.992 1.027 0.763 1.182 1.245 1.365 1.452 1.527 1.563 1.631 1.695 1.781 1.829 1.874 1.926 1.984 2.041 2.087 2.135 2.187 2.236 2.289 2.332 2.352 2.363 2.376 2.388 2.386 2.376 2.35 2.3 2.239 2.137 1.969 1.779 1.541 1.206 0.697 0.018 -0.927 -2.376 -4.8 -7.535 -9.657 -11.376 -12.797 -14.03 -15.055 -15.96 -16.742 -17.512 -18.142 -18.696 -19.213 -19.687 -20.13 -20.53 -20.945 -21.297 -21.592 -21.902 -22.231 -22.495 -22.759 -23.037 -23.257 -23.487 -23.717 -23.945 -24.177 -24.343 -24.52 -24.79 -24.977 -25.168 -25.267 -25.48 -25.701 -25.928 -26.038 -26.536 -26.375 -26.506 -26.646 -26.963 -27.133 -27.324 -27.534 -27.761 -28.023 -28.36 -29.542 -7 ,4806 ,TETRA ,17604159,Sun Nov 28 17:12:03 CET,Sun Nov 28 19:03:11 CET,0.0 0.272 0.42 0.544 0.641 0.718 0.775 0.832 0.932 0.981 1.029 0.736 1.133 1.157 1.208 1.262 1.313 1.34 1.382 1.416 1.472 1.504 1.535 1.59 1.634 1.674 1.731 1.78 1.823 1.871 1.917 1.957 1.986 2.009 2.026 2.032 2.038 2.035 2.013 1.969 1.89 1.783 1.628 1.443 1.18 0.828 0.366 -0.271 -1.21 -2.664 -5.036 -7.799 -9.946 -11.629 -13.031 -14.256 -15.278 -16.174 -16.948 -17.695 -18.32 -18.89 -19.425 -19.906 -20.341 -20.74 -21.157 -21.527 -21.844 -22.164 -22.478 -22.727 -22.989 -23.252 -23.44 -23.636 -23.841 -24.06 -24.291 -24.452 -24.615 -24.867 -25.038 -25.207 -25.293 -25.48 -25.685 -25.892 -25.995 -26.498 -26.335 -26.459 -26.584 -26.848 -26.995 -27.16 -27.337 -27.53 -27.763 -28.054 -29.414 -8 ,22808 ,TETRA ,17604160,Sun Nov 28 17:12:05 CET,Sun Nov 28 19:02:50 CET,0.0 0.51 0.68 0.793 0.882 0.956 1.029 1.087 1.172 1.218 1.267 0.988 1.391 1.423 1.473 1.533 1.593 1.619 1.67 1.714 1.776 1.81 1.839 1.881 1.927 1.965 1.989 2.007 2.037 2.065 2.091 2.119 2.138 2.146 2.15 2.163 2.162 2.147 2.12 2.071 2.015 1.931 1.795 1.63 1.373 1.008 0.499 -0.196 -1.152 -2.572 -4.928 -7.65 -9.815 -11.588 -13.017 -14.247 -15.316 -16.242 -17.008 -17.768 -18.419 -18.979 -19.49 -19.963 -20.388 -20.782 -21.189 -21.544 -21.845 -22.148 -22.448 -22.683 -22.938 -23.198 -23.395 -23.601 -23.81 -24.024 -24.249 -24.404 -24.56 -24.801 -24.973 -25.154 -25.24 -25.42 -25.624 -25.84 -25.949 -26.448 -26.285 -26.407 -26.532 -26.806 -26.953 -27.109 -27.278 -27.466 -27.704 -28.018 -28.867 -9 ,23173 ,TETRA ,17604161,Sun Nov 28 17:12:08 CET,Sun Nov 28 19:02:34 CET,0.0 0.289 0.451 0.565 0.647 0.725 0.787 0.848 0.937 0.981 1.022 0.718 1.116 1.148 1.227 1.301 1.347 1.371 1.426 1.475 1.536 1.58 1.624 1.684 1.739 1.794 1.842 1.893 1.962 2.006 2.039 2.073 2.104 2.128 2.144 2.159 2.155 2.136 2.121 2.091 2.021 1.911 1.758 1.58 1.315 0.958 0.479 -0.174 -1.137 -2.622 -4.998 -7.717 -9.823 -11.52 -12.947 -14.173 -15.222 -16.164 -16.955 -17.724 -18.372 -18.951 -19.501 -20.0 -20.451 -20.862 -21.278 -21.641 -21.948 -22.249 -22.565 -22.83 -23.095 -23.358 -23.561 -23.772 -23.985 -24.202 -24.438 -24.599 -24.755 -24.994 -25.163 -25.35 -25.448 -25.643 -25.835 -26.034 -26.137 -26.638 -26.466 -26.578 -26.697 -26.958 -27.109 -27.27 -27.437 -27.629 -27.852 -28.141 -29.022 -10 ,30138 ,TETRA ,17604162,Sun Nov 28 17:12:02 CET,Sun Nov 28 19:03:01 CET,0.0 0.261 0.393 0.527 0.624 0.694 0.772 0.852 0.976 1.017 1.05 0.751 1.161 1.208 1.283 1.342 1.388 1.407 1.462 1.523 1.612 1.666 1.713 1.774 1.837 1.889 1.927 1.97 2.031 2.077 2.112 2.154 2.174 2.191 2.218 2.231 2.234 2.228 2.215 2.177 2.11 2.011 1.866 1.694 1.463 1.113 0.59 -0.074 -1.034 -2.486 -4.879 -7.632 -9.754 -11.487 -12.944 -14.208 -15.266 -16.187 -16.976 -17.731 -18.356 -18.937 -19.497 -19.991 -20.434 -20.837 -21.243 -21.595 -21.905 -22.222 -22.537 -22.804 -23.097 -23.403 -23.625 -23.845 -24.079 -24.323 -24.582 -24.751 -24.912 -25.177 -25.361 -25.547 -25.646 -25.842 -26.059 -26.297 -26.41 -26.912 -26.747 -26.868 -26.998 -27.287 -27.438 -27.598 -27.761 -27.945 -28.17 -28.441 -29.323 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt deleted file mode 100644 index aed702af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13052 ,TETRA ,17604163,Sun Nov 28 17:12:02 CET,Sun Nov 28 19:02:22 CET,0.0 1.529 1.961 2.241 2.46 2.629 2.777 2.911 3.139 3.246 3.324 3.118 3.567 3.65 3.797 3.915 4.023 4.069 4.148 4.232 4.328 4.382 4.429 4.476 4.516 4.544 4.577 4.602 4.609 4.607 4.615 4.612 4.585 4.555 4.516 4.439 4.334 4.218 4.082 3.911 3.706 3.441 3.084 2.68 2.138 1.42 0.463 -0.784 -2.503 -4.949 -8.71 -12.81 -15.959 -18.506 -20.557 -22.32 -23.817 -25.118 -26.222 -27.284 -28.164 -28.939 -29.652 -30.301 -30.901 -31.446 -32.024 -32.533 -32.966 -33.42 -33.886 -34.258 -34.66 -35.109 -35.444 -35.774 -36.112 -36.482 -36.885 -37.152 -37.418 -37.842 -38.124 -38.411 -38.565 -38.877 -39.195 -39.549 -39.734 -40.331 -40.363 -40.595 -40.825 -41.335 -41.621 -41.95 -42.318 -42.737 -43.314 -44.176 -46.968 -2 ,23747 ,TETRA ,17604164,Sun Nov 28 17:12:05 CET,Sun Nov 28 19:06:01 CET,0.0 1.485 1.965 2.291 2.525 2.706 2.86 3.017 3.267 3.36 3.447 3.27 3.716 3.781 3.886 3.991 4.084 4.119 4.194 4.256 4.325 4.383 4.431 4.473 4.517 4.55 4.585 4.614 4.632 4.674 4.719 4.737 4.725 4.689 4.641 4.563 4.467 4.354 4.216 4.033 3.81 3.534 3.171 2.773 2.258 1.585 0.635 -0.615 -2.331 -4.783 -8.563 -12.734 -15.96 -18.541 -20.651 -22.423 -23.89 -25.178 -26.272 -27.355 -28.263 -29.066 -29.839 -30.566 -31.221 -31.792 -32.36 -32.858 -33.299 -33.753 -34.217 -34.611 -35.01 -35.42 -35.741 -36.06 -36.383 -36.722 -37.082 -37.344 -37.609 -37.99 -38.265 -38.57 -38.727 -39.048 -39.375 -39.718 -39.906 -40.518 -40.521 -40.747 -41.001 -41.555 -41.885 -42.254 -42.651 -43.096 -43.632 -44.38 -46.919 -3 ,302 ,TETRA ,17604165,Sun Nov 28 17:12:06 CET,Sun Nov 28 19:05:32 CET,0.0 1.597 2.073 2.381 2.643 2.85 2.994 3.126 3.366 3.458 3.529 3.301 3.743 3.814 3.931 4.041 4.157 4.212 4.295 4.353 4.436 4.479 4.516 4.58 4.642 4.683 4.716 4.739 4.759 4.772 4.771 4.765 4.749 4.715 4.673 4.628 4.566 4.47 4.332 4.153 3.932 3.662 3.32 2.911 2.355 1.633 0.702 -0.506 -2.237 -4.691 -8.438 -12.629 -15.871 -18.463 -20.571 -22.336 -23.812 -25.124 -26.236 -27.316 -28.211 -28.967 -29.664 -30.338 -30.959 -31.496 -32.055 -32.558 -33.0 -33.459 -33.917 -34.295 -34.705 -35.125 -35.434 -35.793 -36.162 -36.504 -36.873 -37.126 -37.393 -37.796 -38.073 -38.379 -38.535 -38.844 -39.174 -39.533 -39.721 -40.322 -40.358 -40.602 -40.864 -41.434 -41.731 -42.054 -42.428 -42.843 -43.365 -44.088 -46.853 -4 ,12166 ,TETRA ,17604166,Sun Nov 28 17:12:02 CET,Sun Nov 28 19:01:11 CET,0.0 1.724 2.204 2.51 2.735 2.917 3.058 3.189 3.439 3.543 3.638 3.436 3.868 3.932 4.067 4.207 4.31 4.347 4.43 4.497 4.59 4.651 4.693 4.738 4.782 4.816 4.857 4.89 4.898 4.904 4.901 4.891 4.882 4.85 4.783 4.712 4.638 4.529 4.386 4.229 4.041 3.79 3.423 2.991 2.429 1.689 0.72 -0.532 -2.262 -4.724 -8.556 -12.705 -15.845 -18.397 -20.494 -22.259 -23.738 -25.038 -26.131 -27.197 -28.086 -28.854 -29.581 -30.257 -30.875 -31.438 -32.02 -32.535 -32.967 -33.401 -33.863 -34.249 -34.648 -35.048 -35.358 -35.684 -36.03 -36.373 -36.726 -36.987 -37.257 -37.663 -37.944 -38.231 -38.379 -38.706 -39.05 -39.421 -39.616 -40.227 -40.282 -40.531 -40.788 -41.353 -41.653 -41.97 -42.318 -42.715 -43.22 -43.934 -46.523 -5 ,898 ,TETRA ,17604167,Sun Nov 28 17:12:05 CET,Sun Nov 28 19:01:40 CET,0.0 1.645 2.084 2.38 2.592 2.758 2.911 3.046 3.261 3.364 3.462 3.282 3.718 3.788 3.941 4.064 4.155 4.196 4.264 4.315 4.391 4.439 4.48 4.536 4.587 4.623 4.645 4.662 4.677 4.677 4.669 4.663 4.638 4.589 4.528 4.454 4.36 4.247 4.112 3.936 3.716 3.422 3.061 2.663 2.098 1.387 0.462 -0.779 -2.494 -4.934 -8.73 -12.92 -16.136 -18.715 -20.787 -22.508 -23.992 -25.303 -26.401 -27.482 -28.379 -29.184 -29.936 -30.61 -31.228 -31.841 -32.53 -33.119 -33.579 -34.048 -34.528 -34.908 -35.301 -35.699 -36.017 -36.356 -36.703 -37.048 -37.406 -37.666 -37.926 -38.323 -38.605 -38.894 -39.039 -39.344 -39.678 -40.033 -40.229 -40.836 -40.844 -41.081 -41.322 -41.799 -42.085 -42.397 -42.72 -43.149 -43.703 -44.506 -47.385 -6 ,21188 ,TETRA ,17604168,Sun Nov 28 17:12:07 CET,Sun Nov 28 19:02:23 CET,0.0 1.474 1.887 2.198 2.441 2.633 2.784 2.932 3.224 3.353 3.476 3.296 3.735 3.808 3.954 4.081 4.173 4.213 4.276 4.356 4.467 4.519 4.577 4.64 4.683 4.719 4.738 4.754 4.817 4.858 4.851 4.831 4.816 4.805 4.779 4.724 4.633 4.513 4.373 4.207 4.008 3.738 3.371 2.963 2.414 1.69 0.735 -0.489 -2.218 -4.699 -8.481 -12.655 -15.852 -18.413 -20.491 -22.287 -23.803 -25.111 -26.225 -27.312 -28.231 -29.035 -29.75 -30.407 -31.021 -31.573 -32.18 -32.717 -33.161 -33.653 -34.151 -34.542 -34.946 -35.351 -35.666 -35.987 -36.31 -36.649 -37.005 -37.256 -37.54 -37.962 -38.245 -38.548 -38.703 -39.027 -39.362 -39.753 -39.958 -40.563 -40.579 -40.806 -41.044 -41.577 -41.862 -42.186 -42.592 -43.01 -43.494 -44.254 -47.74 -7 ,19138 ,TETRA ,17604169,Sun Nov 28 17:12:08 CET,Sun Nov 28 19:01:47 CET,0.0 1.293 1.668 1.928 2.158 2.361 2.534 2.668 2.861 2.951 3.039 2.82 3.243 3.29 3.389 3.499 3.6 3.649 3.747 3.821 3.889 3.932 3.972 4.019 4.062 4.098 4.13 4.16 4.187 4.2 4.217 4.226 4.203 4.173 4.142 4.1 4.031 3.928 3.798 3.632 3.434 3.172 2.813 2.406 1.869 1.169 0.245 -0.975 -2.702 -5.15 -8.886 -13.017 -16.213 -18.749 -20.823 -22.618 -24.104 -25.397 -26.502 -27.587 -28.496 -29.294 -30.037 -30.71 -31.326 -31.897 -32.468 -32.966 -33.408 -33.856 -34.312 -34.696 -35.101 -35.528 -35.847 -36.17 -36.512 -36.876 -37.249 -37.502 -37.782 -38.229 -38.535 -38.841 -38.996 -39.327 -39.694 -40.07 -40.256 -40.866 -40.889 -41.104 -41.329 -41.834 -42.111 -42.416 -42.751 -43.146 -43.673 -44.497 -47.474 -8 ,24183 ,TETRA ,17604170,Sun Nov 28 17:12:03 CET,Sun Nov 28 19:02:18 CET,0.0 1.575 2.017 2.362 2.605 2.793 2.969 3.118 3.358 3.45 3.55 3.388 3.85 3.937 4.046 4.135 4.227 4.266 4.342 4.408 4.481 4.526 4.576 4.684 4.766 4.801 4.829 4.853 4.874 4.878 4.876 4.862 4.85 4.844 4.811 4.746 4.669 4.559 4.408 4.223 4.011 3.738 3.359 2.929 2.368 1.656 0.713 -0.509 -2.194 -4.618 -8.4 -12.608 -15.821 -18.395 -20.496 -22.254 -23.745 -25.069 -26.174 -27.233 -28.103 -28.889 -29.666 -30.384 -30.992 -31.531 -32.117 -32.659 -33.125 -33.585 -34.044 -34.425 -34.813 -35.206 -35.517 -35.848 -36.195 -36.542 -36.896 -37.143 -37.405 -37.813 -38.093 -38.388 -38.54 -38.847 -39.171 -39.538 -39.727 -40.327 -40.334 -40.547 -40.784 -41.347 -41.662 -42.014 -42.373 -42.738 -43.205 -43.875 -46.422 -9 ,23485 ,TETRA ,17604171,Sun Nov 28 17:12:06 CET,Sun Nov 28 19:02:31 CET,0.0 1.626 2.006 2.297 2.545 2.749 2.914 3.041 3.262 3.363 3.447 3.24 3.67 3.732 3.86 3.959 4.032 4.069 4.137 4.21 4.31 4.351 4.385 4.424 4.46 4.497 4.525 4.539 4.565 4.579 4.572 4.558 4.54 4.515 4.464 4.401 4.327 4.232 4.103 3.947 3.757 3.494 3.149 2.738 2.17 1.432 0.486 -0.731 -2.439 -4.92 -8.713 -12.828 -15.974 -18.496 -20.583 -22.357 -23.87 -25.196 -26.284 -27.354 -28.27 -29.066 -29.808 -30.49 -31.117 -31.668 -32.231 -32.753 -33.189 -33.623 -34.083 -34.478 -34.875 -35.283 -35.601 -35.922 -36.256 -36.609 -36.987 -37.236 -37.481 -37.862 -38.13 -38.421 -38.579 -38.929 -39.277 -39.603 -39.786 -40.419 -40.493 -40.75 -41.004 -41.531 -41.819 -42.127 -42.519 -43.013 -43.556 -44.306 -47.265 -10 ,11225 ,TETRA ,17604172,Sun Nov 28 17:12:08 CET,Sun Nov 28 19:02:07 CET,0.0 2.04 2.551 2.861 3.086 3.283 3.442 3.589 3.852 3.953 4.037 3.836 4.271 4.333 4.44 4.543 4.656 4.7 4.771 4.833 4.916 4.962 5.005 5.055 5.103 5.161 5.21 5.239 5.246 5.243 5.24 5.229 5.208 5.167 5.112 5.037 4.954 4.849 4.713 4.54 4.332 4.078 3.724 3.309 2.775 2.085 1.139 -0.107 -1.826 -4.288 -8.105 -12.256 -15.423 -17.994 -20.11 -21.907 -23.43 -24.747 -25.853 -26.932 -27.838 -28.642 -29.385 -30.067 -30.679 -31.223 -31.786 -32.302 -32.755 -33.208 -33.661 -34.05 -34.446 -34.836 -35.143 -35.452 -35.774 -36.121 -36.492 -36.75 -37.011 -37.435 -37.725 -38.024 -38.181 -38.476 -38.789 -39.147 -39.341 -39.953 -39.969 -40.199 -40.439 -40.917 -41.168 -41.464 -41.826 -42.28 -42.839 -43.61 -45.925 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 06688c30..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23489 ,TETRA ,17604173,Sun Nov 28 17:12:09 CET,Sun Nov 28 18:59:44 CET,0.0 0.829 1.108 1.326 1.513 1.676 1.831 1.98 2.238 2.35 2.462 2.315 2.785 2.887 3.088 3.274 3.44 3.525 3.694 3.857 4.093 4.252 4.411 4.642 4.868 5.083 5.292 5.499 5.764 6.016 6.272 6.602 6.925 7.236 7.609 8.044 8.456 8.906 9.404 9.939 10.51 11.151 11.906 12.688 13.604 14.659 15.94 17.426 19.199 21.399 24.172 26.538 27.988 28.894 29.481 29.89 30.133 30.27 30.354 30.399 30.384 30.368 30.34 30.294 30.234 30.166 30.077 29.967 29.875 29.781 29.645 29.512 29.359 29.198 29.065 28.915 28.792 28.668 28.53 28.433 28.307 28.08 27.918 27.744 27.652 27.471 27.262 27.019 26.896 26.421 26.415 26.224 26.022 25.595 25.342 25.05 24.723 24.332 23.897 23.22 20.592 -2 ,15723 ,TETRA ,17604174,Sun Nov 28 17:12:04 CET,Sun Nov 28 19:01:15 CET,0.0 1.111 1.409 1.631 1.818 1.984 2.136 2.278 2.543 2.661 2.776 2.626 3.092 3.192 3.393 3.582 3.758 3.843 4.008 4.17 4.408 4.56 4.712 4.93 5.14 5.351 5.557 5.754 6.009 6.258 6.506 6.818 7.111 7.4 7.742 8.13 8.513 8.955 9.444 9.962 10.512 11.162 11.961 12.779 13.747 14.847 16.143 17.627 19.404 21.57 24.264 26.561 27.984 28.941 29.536 29.914 30.145 30.273 30.359 30.407 30.419 30.383 30.325 30.284 30.211 30.12 30.029 29.925 29.82 29.719 29.611 29.52 29.41 29.28 29.175 29.05 28.911 28.765 28.6 28.478 28.354 28.137 27.956 27.765 27.666 27.469 27.268 27.039 26.921 26.444 26.478 26.307 26.116 25.673 25.416 25.186 24.911 24.545 24.126 23.525 19.231 -3 ,19410 ,TETRA ,17604175,Sun Nov 28 17:12:09 CET,Sun Nov 28 19:01:30 CET,0.0 0.929 1.217 1.417 1.585 1.749 1.899 2.038 2.294 2.42 2.543 2.391 2.857 2.955 3.141 3.317 3.491 3.578 3.743 3.903 4.137 4.288 4.437 4.668 4.894 5.112 5.325 5.526 5.796 6.057 6.305 6.622 6.947 7.268 7.645 8.065 8.465 8.923 9.423 9.941 10.497 11.141 11.911 12.712 13.654 14.726 16.011 17.53 19.423 21.68 24.435 26.815 28.22 29.078 29.616 29.986 30.217 30.355 30.411 30.413 30.403 30.379 30.325 30.259 30.176 30.094 30.013 29.912 29.81 29.704 29.582 29.469 29.329 29.193 29.1 28.983 28.838 28.686 28.523 28.407 28.289 28.08 27.923 27.769 27.693 27.518 27.305 27.07 26.936 26.466 26.517 26.346 26.162 25.759 25.506 25.25 24.941 24.541 24.021 23.275 19.48 -4 ,8784 ,TETRA ,17604176,Sun Nov 28 17:12:05 CET,Sun Nov 28 19:01:30 CET,0.0 0.807 1.068 1.289 1.493 1.667 1.816 1.947 2.204 2.328 2.443 2.289 2.754 2.849 3.034 3.211 3.388 3.476 3.646 3.81 4.047 4.204 4.366 4.607 4.835 5.054 5.272 5.485 5.758 6.032 6.307 6.634 6.952 7.265 7.633 8.052 8.457 8.897 9.376 9.892 10.449 11.087 11.856 12.657 13.618 14.712 15.992 17.477 19.222 21.431 24.245 26.602 28.034 28.915 29.498 29.9 30.151 30.295 30.369 30.401 30.403 30.391 30.373 30.345 30.292 30.218 30.111 30.002 29.895 29.781 29.657 29.54 29.414 29.287 29.177 29.045 28.91 28.781 28.648 28.535 28.406 28.208 28.062 27.908 27.831 27.662 27.447 27.211 27.103 26.641 26.684 26.528 26.365 25.966 25.735 25.481 25.168 24.813 24.347 23.598 20.502 -5 ,29755 ,TETRA ,17604177,Sun Nov 28 17:12:06 CET,Sun Nov 28 19:01:19 CET,0.0 0.924 1.225 1.455 1.653 1.824 1.973 2.11 2.353 2.468 2.582 2.426 2.899 3.0 3.189 3.372 3.555 3.644 3.814 3.982 4.237 4.411 4.58 4.821 5.05 5.273 5.497 5.715 5.995 6.259 6.516 6.832 7.144 7.457 7.829 8.256 8.673 9.121 9.595 10.115 10.683 11.338 12.112 12.903 13.828 14.897 16.187 17.708 19.527 21.679 24.381 26.734 28.175 29.108 29.742 30.176 30.437 30.589 30.699 30.785 30.798 30.777 30.753 30.71 30.627 30.544 30.457 30.357 30.267 30.164 30.045 29.926 29.782 29.627 29.507 29.395 29.269 29.116 28.936 28.812 28.691 28.477 28.315 28.152 28.066 27.885 27.694 27.486 27.378 26.937 27.038 26.896 26.752 26.373 26.128 25.892 25.611 25.203 24.674 23.919 20.659 -6 ,23721 ,TETRA ,17604178,Sun Nov 28 17:12:05 CET,Sun Nov 28 19:00:01 CET,0.0 1.072 1.379 1.611 1.79 1.943 2.087 2.227 2.483 2.597 2.701 2.539 3.014 3.113 3.293 3.479 3.668 3.756 3.925 4.091 4.334 4.49 4.637 4.857 5.074 5.284 5.494 5.703 5.985 6.267 6.541 6.863 7.171 7.481 7.845 8.256 8.653 9.094 9.583 10.11 10.667 11.308 12.081 12.879 13.861 14.98 16.276 17.777 19.569 21.752 24.536 26.917 28.313 29.194 29.744 30.129 30.425 30.604 30.713 30.775 30.777 30.761 30.733 30.668 30.579 30.498 30.404 30.299 30.193 30.082 29.983 29.904 29.794 29.663 29.566 29.463 29.348 29.214 29.05 28.908 28.749 28.53 28.382 28.216 28.12 27.919 27.726 27.547 27.444 26.985 27.064 26.917 26.754 26.385 26.174 25.907 25.571 25.159 24.643 23.892 20.48 -7 ,28759 ,TETRA ,17604179,Sun Nov 28 17:12:06 CET,Sun Nov 28 19:00:31 CET,0.0 0.96 1.232 1.439 1.613 1.776 1.935 2.066 2.287 2.399 2.512 2.356 2.823 2.922 3.115 3.296 3.468 3.551 3.719 3.89 4.133 4.284 4.43 4.645 4.858 5.071 5.276 5.475 5.744 6.012 6.284 6.623 6.948 7.269 7.64 8.052 8.444 8.875 9.353 9.887 10.46 11.108 11.877 12.66 13.603 14.669 15.943 17.452 19.262 21.469 24.237 26.545 27.975 28.905 29.47 29.871 30.148 30.323 30.432 30.501 30.522 30.499 30.468 30.426 30.363 30.301 30.231 30.147 30.043 29.917 29.767 29.648 29.535 29.413 29.3 29.179 29.066 28.95 28.819 28.732 28.629 28.434 28.3 28.161 28.077 27.897 27.729 27.506 27.368 26.911 27.008 26.863 26.692 26.273 26.018 25.751 25.444 25.058 24.513 23.715 19.476 -8 ,23933 ,TETRA ,17604180,Sun Nov 28 17:12:09 CET,Sun Nov 28 19:00:24 CET,0.0 0.909 1.169 1.362 1.54 1.694 1.83 1.967 2.214 2.332 2.449 2.297 2.762 2.855 3.034 3.214 3.387 3.47 3.633 3.798 4.04 4.195 4.346 4.569 4.79 5.005 5.205 5.393 5.642 5.905 6.166 6.474 6.78 7.092 7.463 7.88 8.293 8.746 9.231 9.76 10.336 10.986 11.746 12.545 13.51 14.636 15.942 17.425 19.228 21.391 24.148 26.497 27.926 28.849 29.446 29.866 30.129 30.303 30.409 30.477 30.505 30.497 30.455 30.378 30.3 30.238 30.148 30.048 29.954 29.833 29.695 29.582 29.469 29.354 29.261 29.149 29.024 28.888 28.727 28.61 28.491 28.318 28.191 28.033 27.943 27.753 27.559 27.347 27.226 26.76 26.83 26.667 26.476 26.019 25.765 25.503 25.18 24.822 24.307 23.519 20.375 -9 ,11748 ,TETRA ,17604181,Sun Nov 28 17:12:10 CET,Sun Nov 28 19:00:24 CET,0.0 0.956 1.234 1.452 1.637 1.796 1.947 2.085 2.338 2.463 2.586 2.436 2.905 3.007 3.198 3.376 3.556 3.64 3.806 3.974 4.218 4.369 4.514 4.727 4.935 5.141 5.348 5.553 5.818 6.08 6.329 6.626 6.93 7.233 7.597 8.021 8.427 8.865 9.347 9.883 10.455 11.105 11.886 12.68 13.621 14.72 16.015 17.497 19.289 21.494 24.266 26.632 28.087 29.032 29.631 30.039 30.323 30.517 30.625 30.676 30.671 30.646 30.623 30.581 30.521 30.443 30.335 30.23 30.136 30.03 29.919 29.828 29.705 29.56 29.444 29.32 29.19 29.054 28.897 28.785 28.675 28.46 28.287 28.128 28.055 27.875 27.657 27.445 27.334 26.86 26.893 26.75 26.59 26.182 25.96 25.716 25.361 24.965 24.559 23.855 20.083 -10 ,13649 ,TETRA ,17604182,Sun Nov 28 17:12:30 CET,Sun Nov 28 19:00:34 CET,0.0 0.748 1.023 1.24 1.43 1.596 1.739 1.868 2.11 2.236 2.353 2.196 2.662 2.762 2.952 3.126 3.299 3.387 3.556 3.718 3.96 4.119 4.273 4.489 4.697 4.907 5.115 5.318 5.576 5.828 6.083 6.4 6.721 7.033 7.398 7.824 8.231 8.668 9.145 9.672 10.246 10.9 11.677 12.484 13.461 14.559 15.82 17.304 19.113 21.263 23.947 26.253 27.625 28.5 29.078 29.461 29.702 29.856 29.943 29.992 30.006 29.992 29.953 29.885 29.802 29.711 29.577 29.43 29.326 29.229 29.106 28.996 28.884 28.754 28.645 28.517 28.364 28.21 28.059 27.96 27.849 27.65 27.516 27.366 27.278 27.095 26.895 26.669 26.555 26.113 26.193 26.025 25.862 25.503 25.276 25.009 24.703 24.303 23.774 23.05 20.514 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt deleted file mode 100644 index 8fcf441b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30288 ,TETRA ,17604183,Sun Nov 28 17:12:32 CET,Sun Nov 28 19:02:08 CET,0.0 1.752 2.177 2.448 2.69 2.917 3.115 3.305 3.651 3.796 3.933 3.817 4.3 4.415 4.639 4.854 5.062 5.167 5.37 5.571 5.872 6.052 6.227 6.484 6.725 6.958 7.185 7.398 7.693 7.99 8.27 8.617 8.95 9.27 9.635 10.044 10.452 10.9 11.386 11.903 12.451 13.083 13.847 14.614 15.48 16.454 17.643 19.024 20.651 22.633 25.03 26.945 28.113 28.812 29.191 29.431 29.584 29.658 29.702 29.703 29.642 29.576 29.508 29.429 29.351 29.277 29.184 29.089 29.0 28.894 28.783 28.689 28.585 28.466 28.359 28.252 28.132 28.0 27.864 27.767 27.661 27.477 27.353 27.229 27.159 27.014 26.844 26.661 26.573 26.141 26.282 26.158 26.019 25.666 25.477 25.31 25.113 24.825 24.422 23.912 22.342 -2 ,18559 ,TETRA ,17604184,Sun Nov 28 17:12:34 CET,Sun Nov 28 19:04:45 CET,0.0 1.497 1.898 2.179 2.42 2.649 2.863 3.054 3.375 3.526 3.674 3.575 4.062 4.183 4.415 4.626 4.834 4.94 5.141 5.333 5.599 5.775 5.945 6.185 6.428 6.658 6.886 7.11 7.393 7.674 7.945 8.271 8.587 8.895 9.266 9.698 10.102 10.535 10.999 11.5 12.037 12.651 13.402 14.164 15.061 16.077 17.244 18.57 20.166 22.073 24.39 26.412 27.642 28.306 28.709 28.959 29.091 29.181 29.204 29.195 29.194 29.158 29.078 29.004 28.928 28.836 28.735 28.635 28.542 28.436 28.313 28.212 28.092 27.958 27.859 27.753 27.634 27.499 27.356 27.252 27.141 26.952 26.824 26.693 26.622 26.467 26.286 26.072 25.961 25.512 25.632 25.509 25.359 25.003 24.794 24.538 24.269 23.975 23.575 23.045 20.783 -3 ,18394 ,TETRA ,17604185,Sun Nov 28 17:12:35 CET,Sun Nov 28 19:04:27 CET,0.0 1.576 2.093 2.504 2.763 2.963 3.146 3.325 3.663 3.811 3.947 3.848 4.353 4.48 4.713 4.937 5.148 5.25 5.454 5.654 5.939 6.117 6.303 6.579 6.823 7.067 7.315 7.542 7.834 8.128 8.415 8.759 9.081 9.398 9.76 10.161 10.574 11.037 11.538 12.072 12.631 13.28 14.053 14.832 15.739 16.748 17.933 19.319 20.97 22.916 25.244 27.124 28.175 28.815 29.22 29.417 29.483 29.522 29.529 29.508 29.474 29.415 29.336 29.237 29.118 29.012 28.909 28.786 28.674 28.562 28.429 28.306 28.172 28.038 27.931 27.811 27.685 27.55 27.411 27.305 27.177 26.992 26.877 26.758 26.688 26.529 26.36 26.19 26.093 25.648 25.783 25.677 25.573 25.32 25.158 24.971 24.757 24.513 24.235 23.836 22.174 -4 ,15292 ,TETRA ,17604186,Sun Nov 28 17:12:31 CET,Sun Nov 28 19:02:28 CET,0.0 1.553 2.127 2.558 2.882 3.183 3.441 3.651 4.044 4.216 4.38 4.316 4.818 4.952 5.192 5.424 5.639 5.741 5.941 6.135 6.433 6.622 6.802 7.068 7.319 7.558 7.803 8.04 8.337 8.624 8.901 9.234 9.544 9.838 10.205 10.634 11.032 11.471 11.96 12.493 13.071 13.722 14.503 15.319 16.242 17.251 18.458 19.868 21.542 23.583 26.111 28.202 29.328 29.98 30.391 30.62 30.752 30.823 30.835 30.833 30.795 30.73 30.657 30.566 30.48 30.384 30.271 30.163 30.061 29.962 29.86 29.756 29.63 29.498 29.396 29.296 29.184 29.045 28.891 28.781 28.664 28.478 28.364 28.26 28.2 28.07 27.931 27.773 27.685 27.244 27.366 27.244 27.121 26.852 26.707 26.532 26.333 26.099 25.755 25.286 23.28 -5 ,7862 ,TETRA ,17604187,Sun Nov 28 17:12:34 CET,Sun Nov 28 19:02:18 CET,0.0 2.341 2.859 3.189 3.432 3.636 3.835 4.031 4.382 4.542 4.683 4.572 5.065 5.189 5.418 5.627 5.829 5.929 6.123 6.31 6.594 6.776 6.941 7.185 7.421 7.651 7.887 8.125 8.428 8.711 8.979 9.297 9.617 9.931 10.304 10.74 11.159 11.617 12.109 12.623 13.169 13.803 14.544 15.287 16.19 17.206 18.379 19.784 21.483 23.491 25.93 27.95 29.124 29.815 30.186 30.403 30.525 30.558 30.587 30.6 30.536 30.456 30.391 30.322 30.233 30.138 30.042 29.945 29.842 29.724 29.602 29.503 29.386 29.256 29.17 29.072 28.952 28.822 28.686 28.6 28.509 28.35 28.228 28.102 28.037 27.894 27.737 27.581 27.498 27.051 27.17 27.054 26.929 26.634 26.458 26.264 26.017 25.706 25.348 24.96 23.559 -6 ,16496 ,TETRA ,17604188,Sun Nov 28 17:12:35 CET,Sun Nov 28 19:02:32 CET,0.0 1.602 2.015 2.31 2.543 2.759 2.948 3.111 3.414 3.566 3.707 3.582 4.064 4.175 4.383 4.597 4.82 4.922 5.119 5.317 5.601 5.784 5.959 6.208 6.45 6.688 6.917 7.142 7.43 7.713 7.996 8.336 8.672 8.997 9.367 9.774 10.157 10.586 11.055 11.568 12.124 12.747 13.479 14.231 15.128 16.133 17.301 18.663 20.332 22.333 24.767 26.785 27.96 28.682 29.141 29.428 29.547 29.578 29.596 29.602 29.559 29.493 29.422 29.35 29.265 29.158 29.047 28.942 28.826 28.699 28.57 28.463 28.351 28.217 28.11 27.987 27.839 27.69 27.537 27.427 27.314 27.139 26.998 26.822 26.734 26.589 26.441 26.257 26.163 25.727 25.851 25.726 25.59 25.283 25.135 24.964 24.732 24.47 24.15 23.694 22.055 -7 ,2634 ,TETRA ,17604189,Sun Nov 28 17:12:32 CET,Sun Nov 28 19:02:27 CET,0.0 1.593 2.124 2.518 2.812 3.068 3.302 3.489 3.846 4.015 4.16 4.103 4.609 4.735 4.981 5.213 5.437 5.549 5.764 5.96 6.231 6.417 6.602 6.867 7.113 7.349 7.589 7.816 8.119 8.412 8.693 9.036 9.36 9.671 10.03 10.433 10.822 11.261 11.754 12.287 12.856 13.499 14.253 15.02 15.914 16.917 18.109 19.498 21.149 23.088 25.43 27.3 28.359 29.001 29.414 29.702 29.853 29.916 29.932 29.936 29.913 29.865 29.785 29.679 29.568 29.463 29.353 29.25 29.156 29.033 28.901 28.799 28.7 28.587 28.486 28.384 28.28 28.17 28.054 27.957 27.853 27.706 27.591 27.471 27.407 27.272 27.124 26.97 26.89 26.457 26.612 26.505 26.389 26.111 25.943 25.754 25.523 25.275 25.005 24.613 22.685 -8 ,12984 ,TETRA ,17604190,Sun Nov 28 17:12:31 CET,Sun Nov 28 19:02:53 CET,0.0 1.506 1.974 2.29 2.529 2.723 2.911 3.088 3.408 3.56 3.705 3.636 4.148 4.298 4.566 4.805 5.03 5.14 5.345 5.537 5.819 5.998 6.167 6.424 6.675 6.913 7.151 7.387 7.682 7.962 8.245 8.605 8.947 9.266 9.633 10.05 10.463 10.928 11.428 11.961 12.528 13.165 13.956 14.751 15.644 16.68 17.874 19.219 20.841 22.818 25.255 27.246 28.402 29.081 29.509 29.797 29.954 30.062 30.102 30.075 30.039 29.995 29.933 29.831 29.712 29.6 29.487 29.385 29.28 29.155 29.025 28.914 28.798 28.679 28.58 28.48 28.369 28.248 28.114 28.019 27.919 27.737 27.6 27.46 27.392 27.251 27.11 26.962 26.876 26.447 26.586 26.466 26.34 26.073 25.929 25.743 25.522 25.29 24.996 24.505 22.534 -9 ,29254 ,TETRA ,17604191,Sun Nov 28 17:12:33 CET,Sun Nov 28 19:02:58 CET,0.0 1.767 2.256 2.602 2.899 3.155 3.37 3.578 3.928 4.079 4.23 4.147 4.64 4.77 5.027 5.272 5.506 5.618 5.835 6.036 6.328 6.513 6.687 6.954 7.204 7.442 7.681 7.908 8.19 8.468 8.742 9.062 9.382 9.707 10.082 10.499 10.91 11.365 11.856 12.396 12.978 13.619 14.365 15.139 16.041 17.036 18.213 19.524 21.082 23.043 25.469 27.453 28.57 29.262 29.722 30.014 30.184 30.245 30.245 30.244 30.229 30.182 30.097 29.996 29.899 29.807 29.705 29.607 29.511 29.394 29.268 29.17 29.053 28.917 28.812 28.704 28.57 28.42 28.281 28.163 28.028 27.835 27.693 27.548 27.474 27.327 27.156 26.967 26.877 26.436 26.55 26.418 26.291 25.989 25.783 25.559 25.328 25.049 24.685 24.253 22.667 -10 ,27431 ,TETRA ,17604192,Sun Nov 28 17:12:35 CET,Sun Nov 28 19:02:47 CET,0.0 1.209 1.558 1.836 2.071 2.284 2.485 2.672 3.015 3.187 3.348 3.258 3.748 3.872 4.128 4.384 4.625 4.738 4.959 5.166 5.464 5.656 5.833 6.08 6.325 6.566 6.797 7.024 7.335 7.632 7.912 8.248 8.551 8.85 9.213 9.614 10.017 10.488 10.998 11.539 12.113 12.76 13.507 14.284 15.239 16.294 17.472 18.817 20.405 22.3 24.68 26.627 27.716 28.399 28.852 29.105 29.204 29.252 29.291 29.312 29.301 29.259 29.176 29.095 29.01 28.902 28.793 28.69 28.592 28.492 28.373 28.26 28.136 28.012 27.906 27.795 27.671 27.521 27.369 27.257 27.12 26.918 26.806 26.688 26.616 26.438 26.262 26.097 25.991 25.527 25.635 25.507 25.343 25.004 24.83 24.622 24.397 24.112 23.744 23.246 20.686 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 179acfb6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10037 ,KEBNE ,17070698,Fri Dec 24 23:31:11 CET,Sat Dec 25 01:06:03 CET,0.0 1.208 1.628 1.932 2.17 2.348 2.512 2.671 2.928 3.048 3.171 3.037 3.497 3.598 3.798 3.974 4.138 4.218 4.369 4.506 4.717 4.86 4.992 5.168 5.336 5.504 5.659 5.814 6.017 6.198 6.377 6.587 6.779 6.969 7.201 7.458 7.693 7.942 8.2 8.464 8.74 9.058 9.435 9.815 10.229 10.672 11.177 11.701 12.249 12.809 13.274 13.28 13.054 12.743 12.385 12.032 11.694 11.37 11.087 10.773 10.498 10.247 10.001 9.779 9.555 9.332 9.099 8.887 8.697 8.501 8.286 8.099 7.91 7.709 7.555 7.389 7.203 7.017 6.834 6.71 6.578 6.369 6.218 6.037 5.952 5.795 5.633 5.469 5.383 4.93 5.108 4.999 4.882 4.627 4.485 4.337 4.156 3.958 3.737 3.415 2.283 -2 ,10502 ,KEBNE ,17070699,Fri Dec 24 23:31:11 CET,Sat Dec 25 01:06:06 CET,0.0 1.189 1.481 1.701 1.872 2.023 2.174 2.309 2.529 2.628 2.725 2.541 2.987 3.064 3.217 3.365 3.514 3.585 3.719 3.843 4.012 4.119 4.219 4.375 4.539 4.698 4.857 5.007 5.195 5.374 5.545 5.755 5.946 6.13 6.355 6.602 6.828 7.071 7.344 7.631 7.924 8.26 8.638 9.018 9.462 9.923 10.395 10.902 11.455 11.981 12.399 12.438 12.236 11.914 11.571 11.231 10.905 10.601 10.318 10.01 9.73 9.49 9.253 9.012 8.78 8.567 8.341 8.14 7.967 7.781 7.574 7.401 7.223 7.027 6.878 6.733 6.585 6.417 6.23 6.103 5.975 5.772 5.635 5.5 5.434 5.299 5.142 4.975 4.893 4.442 4.621 4.522 4.409 4.158 4.028 3.878 3.71 3.513 3.254 2.907 1.733 -3 ,13334 ,KEBNE ,17070700,Fri Dec 24 23:32:15 CET,Sat Dec 25 01:07:14 CET,0.0 1.05 1.33 1.524 1.692 1.843 1.989 2.123 2.348 2.449 2.549 2.372 2.825 2.907 3.052 3.189 3.335 3.403 3.529 3.647 3.818 3.939 4.059 4.211 4.369 4.522 4.654 4.781 4.944 5.099 5.252 5.433 5.605 5.779 5.988 6.218 6.443 6.685 6.948 7.249 7.551 7.853 8.193 8.552 8.951 9.395 9.879 10.352 10.871 11.411 11.861 11.921 11.769 11.517 11.199 10.85 10.514 10.171 9.85 9.512 9.224 8.971 8.722 8.473 8.243 8.034 7.81 7.61 7.429 7.239 7.034 6.871 6.704 6.519 6.375 6.221 6.065 5.914 5.753 5.634 5.505 5.304 5.169 5.027 4.948 4.775 4.588 4.399 4.303 3.838 3.981 3.863 3.735 3.438 3.265 3.077 2.893 2.71 2.483 2.12 0.172 -4 ,3492 ,KEBNE ,17070701,Fri Dec 24 23:33:18 CET,Sat Dec 25 01:09:41 CET,0.0 1.168 1.446 1.666 1.85 2.008 2.131 2.238 2.44 2.536 2.63 2.452 2.905 2.987 3.151 3.305 3.45 3.518 3.649 3.78 3.975 4.105 4.234 4.418 4.586 4.741 4.884 5.027 5.225 5.412 5.582 5.781 5.982 6.173 6.386 6.62 6.853 7.122 7.408 7.694 7.982 8.31 8.679 9.022 9.423 9.879 10.368 10.871 11.42 11.942 12.346 12.356 12.115 11.814 11.45 11.057 10.71 10.386 10.09 9.785 9.52 9.274 9.025 8.789 8.582 8.383 8.162 7.952 7.762 7.573 7.378 7.214 7.045 6.86 6.708 6.549 6.387 6.222 6.043 5.918 5.792 5.582 5.429 5.274 5.192 5.014 4.832 4.637 4.533 4.056 4.171 4.044 3.912 3.64 3.495 3.338 3.163 2.971 2.733 2.391 1.129 -5 ,28708 ,KEBNE ,17070702,Fri Dec 24 23:51:13 CET,Sat Dec 25 01:26:15 CET,0.0 1.318 1.62 1.836 2.029 2.216 2.37 2.515 2.794 2.918 3.04 2.904 3.368 3.462 3.638 3.813 3.97 4.043 4.191 4.334 4.547 4.678 4.797 4.97 5.14 5.3 5.45 5.588 5.772 5.948 6.115 6.312 6.502 6.691 6.898 7.122 7.337 7.585 7.862 8.136 8.404 8.72 9.112 9.48 9.881 10.317 10.773 11.262 11.79 12.315 12.773 12.818 12.56 12.255 11.912 11.56 11.237 10.911 10.619 10.298 10.025 9.783 9.529 9.286 9.059 8.856 8.635 8.43 8.255 8.061 7.847 7.667 7.488 7.302 7.144 6.981 6.815 6.652 6.47 6.332 6.196 5.977 5.825 5.67 5.587 5.416 5.24 5.043 4.937 4.463 4.582 4.455 4.319 4.019 3.846 3.657 3.438 3.167 2.872 2.5 0.847 -6 ,18412 ,KEBNE ,17070703,Fri Dec 24 23:51:14 CET,Sat Dec 25 01:26:11 CET,0.0 1.267 1.55 1.75 1.914 2.075 2.218 2.345 2.58 2.681 2.78 2.598 3.055 3.14 3.301 3.462 3.62 3.698 3.844 3.976 4.173 4.302 4.416 4.574 4.735 4.898 5.059 5.209 5.389 5.57 5.745 5.96 6.165 6.36 6.577 6.814 7.04 7.283 7.553 7.858 8.176 8.517 8.9 9.283 9.691 10.127 10.629 11.169 11.713 12.207 12.624 12.598 12.367 12.061 11.708 11.365 11.051 10.729 10.43 10.116 9.83 9.564 9.303 9.068 8.844 8.63 8.402 8.192 8.004 7.809 7.605 7.428 7.249 7.062 6.905 6.738 6.578 6.414 6.24 6.124 6.004 5.799 5.652 5.511 5.443 5.302 5.132 4.934 4.834 4.371 4.511 4.397 4.276 4.005 3.86 3.703 3.519 3.307 3.057 2.734 1.227 -7 ,29233 ,KEBNE ,17070704,Fri Dec 24 23:53:19 CET,Sat Dec 25 01:29:54 CET,0.0 0.966 1.275 1.502 1.678 1.831 1.975 2.106 2.343 2.445 2.536 2.352 2.805 2.891 3.061 3.214 3.352 3.42 3.549 3.671 3.85 3.965 4.076 4.234 4.388 4.544 4.702 4.854 5.047 5.23 5.404 5.621 5.822 6.001 6.218 6.471 6.713 6.971 7.229 7.504 7.794 8.128 8.509 8.872 9.28 9.723 10.229 10.756 11.32 11.873 12.287 12.323 12.095 11.767 11.445 11.115 10.785 10.468 10.17 9.864 9.597 9.336 9.089 8.849 8.614 8.4 8.166 7.954 7.767 7.583 7.4 7.235 7.043 6.848 6.706 6.55 6.381 6.213 6.044 5.917 5.782 5.577 5.436 5.296 5.227 5.082 4.919 4.753 4.664 4.201 4.376 4.278 4.164 3.905 3.769 3.624 3.445 3.232 2.981 2.653 1.175 -8 ,14720 ,KEBNE ,17070705,Fri Dec 24 23:57:33 CET,Sat Dec 25 01:34:03 CET,0.0 1.158 1.448 1.662 1.859 2.029 2.161 2.287 2.523 2.632 2.732 2.546 3.001 3.09 3.261 3.422 3.58 3.656 3.796 3.929 4.128 4.255 4.37 4.528 4.688 4.857 5.012 5.154 5.344 5.527 5.709 5.927 6.126 6.323 6.552 6.79 7.011 7.261 7.536 7.813 8.086 8.391 8.757 9.122 9.523 9.953 10.426 10.925 11.458 12.025 12.46 12.455 12.233 11.924 11.597 11.247 10.884 10.537 10.237 9.926 9.633 9.356 9.102 8.863 8.644 8.443 8.219 8.024 7.847 7.658 7.458 7.285 7.103 6.915 6.77 6.619 6.456 6.261 6.057 5.928 5.793 5.563 5.398 5.235 5.156 4.998 4.819 4.627 4.534 4.074 4.218 4.089 3.947 3.653 3.506 3.357 3.189 2.997 2.754 2.425 0.524 -9 ,26804 ,KEBNE ,17070706,Fri Dec 24 23:58:38 CET,Sat Dec 25 01:35:17 CET,0.0 1.225 1.612 1.898 2.12 2.316 2.498 2.658 2.934 3.059 3.175 3.043 3.518 3.615 3.8 3.981 4.148 4.228 4.372 4.515 4.727 4.85 4.969 5.152 5.32 5.477 5.638 5.793 5.986 6.167 6.34 6.554 6.752 6.931 7.145 7.393 7.633 7.895 8.171 8.461 8.757 9.065 9.413 9.781 10.212 10.666 11.168 11.712 12.288 12.836 13.226 13.267 13.088 12.769 12.393 12.013 11.665 11.345 11.055 10.759 10.492 10.236 9.976 9.719 9.481 9.25 9.006 8.804 8.624 8.434 8.234 8.063 7.896 7.729 7.598 7.464 7.321 7.169 7.004 6.887 6.772 6.595 6.463 6.317 6.24 6.084 5.91 5.725 5.637 5.182 5.334 5.218 5.094 4.819 4.669 4.511 4.314 4.065 3.794 3.401 2.339 -10 ,8433 ,KEBNE ,17070707,Sat Dec 25 00:07:11 CET,Sat Dec 25 01:37:42 CET,0.0 0.985 1.313 1.571 1.787 1.988 2.162 2.32 2.603 2.718 2.825 2.661 3.121 3.22 3.397 3.564 3.729 3.809 3.958 4.09 4.287 4.421 4.546 4.718 4.878 5.027 5.169 5.307 5.501 5.695 5.871 6.077 6.276 6.467 6.687 6.922 7.147 7.399 7.671 7.96 8.266 8.598 8.955 9.306 9.724 10.187 10.673 11.171 11.74 12.316 12.729 12.772 12.571 12.258 11.888 11.521 11.209 10.893 10.582 10.273 9.974 9.688 9.433 9.195 8.961 8.743 8.526 8.34 8.165 7.96 7.746 7.572 7.392 7.206 7.066 6.924 6.777 6.619 6.459 6.354 6.25 6.076 5.946 5.813 5.742 5.589 5.428 5.251 5.156 4.701 4.87 4.768 4.654 4.397 4.257 4.096 3.912 3.714 3.47 3.134 1.755 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt deleted file mode 100644 index 42e62df9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25143 ,TETRA ,17604193,Sun Nov 28 17:12:37 CET,Sun Nov 28 19:02:23 CET,0.0 2.51 3.085 3.448 3.73 3.985 4.195 4.379 4.72 4.881 5.049 4.858 5.498 5.636 5.893 6.125 6.353 6.467 6.699 6.931 7.263 7.47 7.653 7.91 8.186 8.471 8.723 8.945 9.261 9.587 9.907 10.28 10.612 10.933 11.303 11.732 12.129 12.585 13.105 13.62 14.148 14.767 15.456 16.106 16.874 17.731 18.717 19.775 20.985 22.412 24.082 25.326 25.907 26.141 26.168 26.086 25.969 25.807 25.616 25.364 25.133 24.897 24.623 24.366 24.146 23.951 23.733 23.547 23.36 23.161 22.939 22.75 22.574 22.368 22.192 22.009 21.836 21.666 21.479 21.333 21.179 20.953 20.782 20.579 20.468 20.224 19.965 19.692 19.562 18.953 19.141 18.977 18.826 18.439 18.194 17.937 17.662 17.365 17.005 16.441 14.68 -2 ,27546 ,TETRA ,17604194,Sun Nov 28 17:12:32 CET,Sun Nov 28 19:02:13 CET,0.0 2.146 2.664 3.017 3.294 3.543 3.772 3.979 4.344 4.52 4.681 4.483 5.134 5.277 5.532 5.741 5.943 6.053 6.272 6.469 6.753 6.948 7.153 7.437 7.697 7.96 8.221 8.459 8.745 9.024 9.335 9.755 10.129 10.453 10.811 11.22 11.624 12.076 12.536 13.001 13.519 14.138 14.801 15.453 16.231 17.06 18.013 19.078 20.309 21.73 23.365 24.551 25.144 25.409 25.468 25.421 25.292 25.083 24.835 24.566 24.328 24.105 23.874 23.642 23.425 23.202 22.952 22.732 22.537 22.34 22.15 21.971 21.785 21.57 21.353 21.124 20.902 20.685 20.47 20.301 20.107 19.826 19.646 19.438 19.321 19.07 18.812 18.55 18.408 17.759 17.882 17.695 17.496 17.041 16.788 16.494 16.129 15.71 15.202 14.5 8.847 -3 ,18661 ,TETRA ,17604195,Sun Nov 28 17:12:32 CET,Sun Nov 28 19:02:28 CET,0.0 4.385 4.89 5.273 5.584 5.855 6.115 6.365 6.782 6.967 7.153 7.003 7.675 7.836 8.119 8.391 8.669 8.801 9.044 9.275 9.596 9.805 10.019 10.324 10.613 10.887 11.152 11.408 11.735 12.027 12.306 12.648 12.959 13.275 13.648 14.038 14.411 14.852 15.299 15.766 16.291 16.837 17.456 18.11 18.879 19.737 20.743 21.862 23.157 24.658 26.268 27.4 27.93 28.169 28.241 28.184 28.073 27.894 27.687 27.449 27.213 27.0 26.756 26.496 26.282 26.087 25.865 25.655 25.471 25.3 25.068 24.849 24.614 24.301 24.052 23.83 23.586 23.317 23.053 22.864 22.661 22.353 22.128 21.857 21.705 21.409 21.101 20.755 20.556 19.855 19.906 19.672 19.434 18.956 18.649 18.278 17.906 17.476 16.935 16.237 12.166 -4 ,30220 ,TETRA ,17604196,Sun Nov 28 17:12:35 CET,Sun Nov 28 19:02:28 CET,0.0 1.912 2.341 2.669 2.976 3.255 3.507 3.75 4.142 4.318 4.498 4.319 4.963 5.109 5.405 5.648 5.875 5.996 6.216 6.406 6.678 6.854 7.024 7.28 7.547 7.798 8.016 8.223 8.516 8.81 9.102 9.467 9.798 10.132 10.518 10.92 11.307 11.757 12.25 12.749 13.259 13.832 14.518 15.175 15.892 16.71 17.65 18.684 19.903 21.302 22.86 24.03 24.577 24.807 24.893 24.851 24.756 24.642 24.422 24.127 23.921 23.753 23.536 23.283 23.057 22.897 22.73 22.556 22.399 22.232 22.061 21.894 21.701 21.483 21.298 21.104 20.901 20.68 20.418 20.239 20.072 19.789 19.573 19.345 19.224 18.967 18.707 18.428 18.284 17.658 17.826 17.649 17.441 16.944 16.685 16.392 16.034 15.618 15.16 14.445 11.047 -5 ,31414 ,TETRA ,17604197,Sun Nov 28 17:12:36 CET,Sun Nov 28 19:02:23 CET,0.0 1.99 2.488 2.838 3.126 3.367 3.576 3.774 4.13 4.285 4.432 4.221 4.867 5.009 5.265 5.501 5.721 5.824 6.043 6.273 6.581 6.76 6.934 7.184 7.424 7.67 7.899 8.112 8.393 8.658 8.917 9.25 9.587 9.898 10.267 10.677 11.066 11.492 11.943 12.413 12.897 13.471 14.151 14.82 15.602 16.497 17.484 18.532 19.749 21.17 22.806 23.996 24.55 24.767 24.801 24.725 24.583 24.394 24.22 24.033 23.844 23.655 23.445 23.224 23.003 22.79 22.576 22.379 22.182 21.967 21.735 21.529 21.333 21.116 20.925 20.711 20.501 20.288 20.047 19.879 19.717 19.467 19.266 19.056 18.953 18.702 18.403 18.099 17.935 17.266 17.375 17.18 16.963 16.441 16.153 15.862 15.528 15.127 14.624 13.938 10.9 -6 ,10477 ,TETRA ,17604198,Sun Nov 28 17:12:32 CET,Sun Nov 28 19:02:21 CET,0.0 1.691 2.145 2.518 2.82 3.085 3.315 3.519 3.889 4.05 4.232 4.099 4.76 4.897 5.143 5.404 5.675 5.806 6.039 6.26 6.602 6.805 6.989 7.254 7.503 7.736 7.987 8.247 8.552 8.841 9.118 9.468 9.806 10.13 10.515 10.927 11.297 11.686 12.092 12.525 13.028 13.608 14.251 14.899 15.715 16.632 17.616 18.707 19.975 21.392 23.001 24.182 24.687 24.843 24.839 24.74 24.599 24.442 24.232 23.948 23.709 23.513 23.255 22.949 22.668 22.443 22.243 22.055 21.879 21.698 21.486 21.29 21.053 20.751 20.545 20.359 20.143 19.896 19.628 19.457 19.287 18.992 18.767 18.515 18.392 18.171 17.914 17.63 17.494 16.858 16.977 16.793 16.618 16.249 16.044 15.824 15.532 15.166 14.732 14.113 11.49 -7 ,26373 ,TETRA ,17604199,Sun Nov 28 17:12:34 CET,Sun Nov 28 19:03:11 CET,0.0 2.416 2.941 3.319 3.652 3.949 4.203 4.443 4.87 5.059 5.235 5.074 5.725 5.865 6.148 6.419 6.667 6.788 7.022 7.234 7.531 7.73 7.936 8.249 8.525 8.774 9.03 9.267 9.596 9.953 10.306 10.68 11.001 11.329 11.691 12.079 12.487 12.946 13.422 13.909 14.43 15.022 15.722 16.435 17.206 18.056 19.025 20.115 21.411 22.867 24.494 25.623 26.06 26.224 26.256 26.186 26.066 25.918 25.771 25.596 25.405 25.205 24.998 24.772 24.528 24.311 24.086 23.872 23.639 23.363 23.127 22.938 22.706 22.491 22.339 22.156 21.947 21.755 21.564 21.406 21.239 20.992 20.832 20.682 20.596 20.393 20.179 19.933 19.785 19.149 19.384 19.23 19.048 18.657 18.432 18.157 17.841 17.479 17.053 16.477 13.802 -8 ,2579 ,TETRA ,17604200,Sun Nov 28 17:12:36 CET,Sun Nov 28 19:03:10 CET,0.0 3.068 3.478 3.806 4.061 4.28 4.492 4.686 5.035 5.197 5.343 5.112 5.753 5.896 6.16 6.394 6.616 6.73 6.959 7.191 7.516 7.697 7.857 8.118 8.373 8.596 8.809 9.029 9.308 9.572 9.854 10.181 10.48 10.766 11.096 11.461 11.874 12.378 12.863 13.362 13.878 14.435 15.094 15.758 16.51 17.381 18.41 19.497 20.766 22.234 23.883 25.125 25.664 25.854 25.887 25.834 25.716 25.549 25.369 25.163 24.958 24.778 24.585 24.358 24.103 23.855 23.608 23.385 23.197 23.019 22.834 22.665 22.479 22.287 22.096 21.871 21.649 21.42 21.21 21.069 20.901 20.621 20.43 20.229 20.111 19.87 19.631 19.328 19.159 18.506 18.649 18.453 18.247 17.794 17.504 17.201 16.879 16.443 15.786 14.734 9.095 -9 ,21345 ,TETRA ,17604201,Sun Nov 28 17:12:37 CET,Sun Nov 28 19:02:21 CET,0.0 4.656 5.263 5.68 6.033 6.344 6.615 6.867 7.282 7.461 7.641 7.475 8.135 8.294 8.6 8.888 9.155 9.284 9.528 9.773 10.123 10.339 10.548 10.831 11.096 11.353 11.618 11.879 12.191 12.493 12.808 13.183 13.507 13.811 14.185 14.61 14.985 15.424 15.935 16.426 16.944 17.515 18.147 18.805 19.575 20.409 21.35 22.438 23.741 25.238 26.839 27.947 28.46 28.64 28.601 28.52 28.397 28.218 28.009 27.745 27.532 27.321 27.076 26.833 26.6 26.378 26.167 25.974 25.78 25.582 25.345 25.14 24.945 24.742 24.576 24.389 24.162 23.881 23.589 23.382 23.176 22.878 22.678 22.457 22.349 22.144 21.914 21.649 21.498 20.855 21.007 20.818 20.624 20.181 19.918 19.632 19.313 18.947 18.521 17.882 14.827 -10 ,32699 ,TETRA ,17604202,Sun Nov 28 17:12:33 CET,Sun Nov 28 19:02:36 CET,0.0 1.99 2.527 2.963 3.249 3.493 3.714 3.931 4.319 4.476 4.621 4.396 5.027 5.146 5.382 5.627 5.864 5.986 6.221 6.424 6.731 6.942 7.141 7.409 7.675 7.951 8.198 8.431 8.752 9.051 9.341 9.725 10.095 10.422 10.812 11.229 11.576 11.956 12.389 12.834 13.305 13.864 14.52 15.192 15.997 16.864 17.826 18.956 20.269 21.731 23.391 24.6 25.099 25.297 25.335 25.252 25.127 24.941 24.748 24.549 24.348 24.103 23.837 23.629 23.43 23.188 22.847 22.559 22.353 22.115 21.858 21.656 21.432 21.162 20.964 20.759 20.519 20.279 20.059 19.904 19.704 19.389 19.207 19.012 18.912 18.714 18.51 18.272 18.141 17.522 17.656 17.454 17.279 16.897 16.65 16.352 16.025 15.661 15.179 14.493 12.1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index e36684f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32353 ,TETRA ,17604203,Sun Nov 28 17:12:35 CET,Sun Nov 28 19:01:56 CET,0.0 2.206 2.795 3.229 3.576 3.904 4.206 4.488 5.039 5.307 5.572 5.604 6.359 6.61 7.093 7.555 7.998 8.218 8.662 9.122 9.815 10.241 10.648 11.254 11.855 12.45 13.044 13.643 14.431 15.191 15.941 16.88 17.813 18.718 19.792 21.055 22.298 23.701 25.27 26.975 28.826 30.994 33.619 36.403 39.791 43.714 48.508 54.329 61.668 71.073 83.857 95.988 104.057 109.882 114.272 117.763 120.507 122.729 124.476 126.082 127.328 128.325 129.209 129.997 130.673 131.234 131.789 132.269 132.625 132.948 133.258 133.491 133.714 133.927 134.077 134.219 134.356 134.476 134.59 134.656 134.711 134.77 134.792 134.806 134.804 134.769 134.708 134.63 134.582 134.161 134.343 134.27 134.204 133.995 133.817 133.599 133.371 133.057 132.625 132.032 128.94 -2 ,20884 ,TETRA ,17604204,Sun Nov 28 17:12:37 CET,Sun Nov 28 19:02:06 CET,0.0 1.592 2.157 2.576 2.962 3.301 3.61 3.922 4.529 4.816 5.093 5.115 5.858 6.084 6.538 6.992 7.428 7.641 8.066 8.491 9.123 9.545 9.968 10.592 11.209 11.814 12.406 12.989 13.745 14.5 15.252 16.191 17.122 18.039 19.134 20.385 21.615 23.023 24.609 26.353 28.242 30.434 33.083 35.843 39.185 43.117 47.931 53.758 61.087 70.404 82.968 94.959 103.074 109.004 113.429 116.888 119.607 121.834 123.595 125.198 126.434 127.457 128.354 129.134 129.82 130.385 130.911 131.362 131.736 132.087 132.435 132.694 132.927 133.148 133.289 133.415 133.535 133.636 133.716 133.761 133.781 133.787 133.79 133.751 133.72 133.661 133.591 133.494 133.43 133.005 133.17 133.069 132.961 132.707 132.548 132.314 132.039 131.735 131.27 130.497 126.712 -3 ,2832 ,TETRA ,17604205,Sun Nov 28 17:12:39 CET,Sun Nov 28 19:01:31 CET,0.0 9.746 10.312 10.746 11.162 11.554 11.894 12.194 12.769 13.061 13.343 13.346 14.094 14.34 14.798 15.245 15.688 15.904 16.323 16.742 17.367 17.781 18.193 18.798 19.399 20.011 20.618 21.213 21.983 22.755 23.559 24.543 25.496 26.428 27.53 28.807 30.051 31.435 32.972 34.691 36.577 38.737 41.348 44.089 47.417 51.355 56.184 61.924 69.108 78.375 90.987 102.981 111.085 116.984 121.399 124.86 127.57 129.791 131.532 133.162 134.453 135.501 136.424 137.232 137.925 138.512 139.073 139.506 139.856 140.213 140.548 140.8 141.044 141.275 141.438 141.589 141.73 141.85 141.968 142.029 142.076 142.13 142.144 142.16 142.169 142.15 142.106 142.047 142.018 141.632 141.868 141.784 141.662 141.352 141.175 140.964 140.72 140.41 139.971 139.336 136.172 -4 ,4326 ,TETRA ,17604206,Sun Nov 28 17:12:34 CET,Sun Nov 28 19:02:07 CET,0.0 2.082 2.589 3.049 3.432 3.747 4.035 4.315 4.848 5.126 5.407 5.468 6.257 6.525 7.032 7.512 7.986 8.225 8.675 9.106 9.784 10.254 10.704 11.341 11.962 12.571 13.178 13.79 14.612 15.427 16.216 17.184 18.125 19.046 20.141 21.393 22.627 24.023 25.577 27.299 29.185 31.371 34.011 36.761 40.098 44.017 48.777 54.501 61.711 70.977 83.587 95.492 103.444 109.239 113.597 117.021 119.683 121.843 123.548 125.142 126.425 127.477 128.404 129.206 129.892 130.487 131.056 131.505 131.864 132.218 132.562 132.838 133.095 133.319 133.488 133.635 133.776 133.9 133.983 134.019 134.053 134.094 134.107 134.115 134.108 134.071 134.014 133.942 133.901 133.508 133.747 133.676 133.572 133.191 132.977 132.785 132.515 132.134 131.689 130.976 126.953 -5 ,16308 ,TETRA ,17604207,Sun Nov 28 17:12:39 CET,Sun Nov 28 19:02:27 CET,0.0 2.01 2.614 3.119 3.548 3.913 4.255 4.584 5.188 5.471 5.766 5.819 6.571 6.828 7.316 7.788 8.257 8.484 8.94 9.401 10.058 10.483 10.908 11.532 12.148 12.757 13.351 13.94 14.714 15.475 16.22 17.148 18.071 18.978 20.051 21.284 22.508 23.91 25.483 27.21 29.092 31.242 33.85 36.612 39.969 43.914 48.724 54.453 61.624 70.943 83.568 95.607 103.748 109.612 113.97 117.419 120.114 122.33 124.074 125.624 126.849 127.884 128.807 129.592 130.264 130.837 131.378 131.829 132.182 132.517 132.851 133.113 133.364 133.586 133.736 133.88 134.002 134.088 134.154 134.188 134.195 134.199 134.217 134.22 134.215 134.202 134.171 134.114 134.073 133.676 133.926 133.859 133.779 133.524 133.37 133.125 132.807 132.502 132.058 131.283 127.493 -6 ,21760 ,TETRA ,17604208,Sun Nov 28 17:12:35 CET,Sun Nov 28 19:02:24 CET,0.0 2.006 2.547 2.972 3.334 3.645 3.951 4.243 4.786 5.052 5.307 5.291 6.033 6.267 6.726 7.182 7.632 7.848 8.279 8.72 9.365 9.776 10.179 10.788 11.401 12.007 12.603 13.188 13.948 14.692 15.422 16.34 17.261 18.165 19.238 20.481 21.713 23.094 24.624 26.34 28.206 30.348 32.966 35.766 39.173 43.124 47.879 53.571 60.772 70.001 82.558 94.455 102.495 108.337 112.673 116.135 118.84 121.027 122.749 124.309 125.533 126.564 127.502 128.322 129.008 129.559 130.082 130.524 130.887 131.235 131.556 131.801 132.035 132.237 132.389 132.526 132.649 132.77 132.863 132.919 132.968 133.017 133.043 133.049 133.032 132.982 132.893 132.79 132.719 132.28 132.505 132.432 132.318 132.079 131.94 131.736 131.458 131.098 130.6 129.895 126.295 -7 ,7750 ,TETRA ,17604209,Sun Nov 28 17:12:37 CET,Sun Nov 28 19:01:56 CET,0.0 1.771 2.288 2.72 3.119 3.474 3.775 4.05 4.588 4.851 5.106 5.093 5.838 6.088 6.567 7.025 7.472 7.687 8.123 8.559 9.187 9.6 10.011 10.609 11.193 11.786 12.379 12.955 13.704 14.457 15.209 16.136 17.047 17.939 19.01 20.254 21.496 22.912 24.47 26.177 28.033 30.213 32.871 35.634 39.006 42.936 47.699 53.43 60.656 69.877 82.353 94.322 102.384 108.216 112.593 116.058 118.743 120.945 122.694 124.286 125.533 126.577 127.5 128.274 128.945 129.524 130.064 130.502 130.85 131.188 131.524 131.778 132.025 132.267 132.441 132.602 132.749 132.866 132.95 132.992 133.028 133.067 133.072 133.078 133.081 133.066 133.027 132.955 132.919 132.521 132.764 132.698 132.601 132.355 132.2 131.973 131.675 131.307 130.85 130.074 123.367 -8 ,1752 ,TETRA ,17604210,Sun Nov 28 17:12:35 CET,Sun Nov 28 19:01:32 CET,0.0 1.472 2.023 2.488 2.85 3.179 3.496 3.804 4.391 4.654 4.908 4.911 5.662 5.901 6.369 6.811 7.242 7.461 7.897 8.33 8.958 9.362 9.766 10.395 11.023 11.617 12.21 12.799 13.556 14.313 15.082 16.026 16.95 17.869 18.953 20.206 21.449 22.85 24.409 26.12 27.962 30.104 32.718 35.468 38.847 42.8 47.555 53.22 60.423 69.739 82.276 94.275 102.392 108.23 112.615 116.107 118.821 121.017 122.714 124.293 125.554 126.569 127.478 128.252 128.894 129.441 130.002 130.485 130.853 131.206 131.553 131.81 132.035 132.241 132.402 132.563 132.708 132.802 132.875 132.935 132.982 133.023 133.037 133.046 133.057 133.063 133.026 132.955 132.905 132.491 132.718 132.635 132.505 132.223 132.069 131.864 131.627 131.275 130.755 130.036 126.288 -9 ,15651 ,TETRA ,17604211,Sun Nov 28 17:12:37 CET,Sun Nov 28 19:01:32 CET,0.0 2.023 2.525 2.943 3.368 3.78 4.152 4.49 5.113 5.401 5.687 5.736 6.495 6.76 7.27 7.741 8.216 8.447 8.884 9.33 9.998 10.429 10.849 11.472 12.09 12.692 13.282 13.869 14.642 15.411 16.17 17.099 18.02 18.942 20.023 21.261 22.495 23.884 25.427 27.137 28.995 31.168 33.796 36.535 39.87 43.768 48.489 54.227 61.488 70.763 83.322 95.272 103.354 109.199 113.553 116.97 119.625 121.781 123.5 125.068 126.295 127.326 128.234 129.031 129.722 130.309 130.856 131.297 131.672 132.031 132.363 132.608 132.836 133.074 133.233 133.364 133.488 133.609 133.721 133.781 133.83 133.874 133.894 133.901 133.89 133.855 133.816 133.752 133.703 133.271 133.418 133.314 133.206 132.898 132.703 132.511 132.269 131.928 131.491 130.781 127.344 -10 ,7982 ,TETRA ,17604212,Sun Nov 28 17:12:39 CET,Sun Nov 28 19:01:46 CET,0.0 2.466 2.987 3.394 3.786 4.134 4.453 4.785 5.385 5.64 5.894 5.886 6.634 6.885 7.345 7.792 8.235 8.454 8.91 9.378 10.042 10.469 10.898 11.528 12.138 12.73 13.333 13.937 14.709 15.477 16.249 17.188 18.108 19.026 20.131 21.397 22.632 24.028 25.57 27.266 29.138 31.318 33.961 36.733 40.057 43.942 48.696 54.432 61.595 70.806 83.461 95.431 103.413 109.194 113.545 117.018 119.737 121.96 123.706 125.276 126.524 127.559 128.455 129.225 129.917 130.516 131.07 131.514 131.877 132.221 132.537 132.787 133.04 133.281 133.447 133.596 133.742 133.893 134.014 134.083 134.144 134.222 134.265 134.289 134.304 134.321 134.313 134.289 134.247 133.833 134.065 133.982 133.86 133.529 133.37 133.192 132.989 132.766 132.383 131.711 128.412 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt deleted file mode 100644 index 8c2d3f02..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27372 ,TETRA ,17604213,Sun Nov 28 17:12:40 CET,Sun Nov 28 19:02:38 CET,0.0 1.228 1.726 2.086 2.395 2.668 2.926 3.182 3.653 3.869 4.071 4.073 4.658 4.844 5.202 5.562 5.884 6.021 6.293 6.562 6.937 7.186 7.445 7.838 8.224 8.597 8.961 9.316 9.777 10.237 10.7 11.266 11.811 12.358 12.991 13.693 14.389 15.167 16.023 16.955 17.953 19.09 20.429 21.809 23.444 25.315 27.496 30.038 33.187 37.073 42.016 46.169 48.864 50.697 51.777 52.521 53.068 53.437 53.666 53.841 53.95 53.976 53.955 53.936 53.889 53.791 53.649 53.542 53.433 53.261 53.067 52.914 52.741 52.56 52.418 52.247 52.077 51.909 51.736 51.621 51.498 51.274 51.103 50.927 50.835 50.633 50.403 50.107 49.938 49.423 49.377 49.176 48.96 48.48 48.213 47.925 47.618 47.273 46.83 46.193 43.513 -2 ,26256 ,TETRA ,17604214,Sun Nov 28 17:13:07 CET,Sun Nov 28 19:03:23 CET,0.0 1.512 1.986 2.356 2.679 2.971 3.22 3.454 3.892 4.084 4.273 4.255 4.813 4.973 5.272 5.566 5.866 6.011 6.287 6.549 6.928 7.177 7.427 7.799 8.178 8.555 8.917 9.277 9.751 10.21 10.664 11.23 11.779 12.321 12.942 13.639 14.333 15.118 15.995 16.918 17.901 19.077 20.489 21.933 23.649 25.585 27.852 30.547 33.849 37.919 43.187 47.691 50.428 52.242 53.412 54.257 54.846 55.243 55.528 55.71 55.812 55.892 55.916 55.896 55.864 55.822 55.754 55.667 55.579 55.482 55.35 55.233 55.138 55.03 54.93 54.825 54.7 54.544 54.384 54.279 54.158 53.956 53.805 53.629 53.539 53.344 53.119 52.871 52.732 52.253 52.223 52.039 51.873 51.482 51.251 50.966 50.652 50.259 49.693 48.812 45.063 -3 ,6995 ,TETRA ,17604215,Sun Nov 28 17:13:10 CET,Sun Nov 28 19:04:08 CET,0.0 1.658 2.133 2.517 2.848 3.141 3.394 3.639 4.079 4.27 4.457 4.433 5.001 5.18 5.538 5.888 6.238 6.402 6.701 6.998 7.431 7.701 7.956 8.329 8.699 9.069 9.42 9.762 10.216 10.661 11.102 11.654 12.193 12.714 13.322 14.022 14.71 15.465 16.29 17.166 18.104 19.216 20.566 21.976 23.674 25.589 27.838 30.535 33.768 37.648 42.609 46.967 49.72 51.513 52.645 53.438 53.96 54.255 54.416 54.524 54.603 54.666 54.686 54.678 54.656 54.591 54.482 54.365 54.273 54.183 54.082 53.995 53.88 53.756 53.663 53.563 53.455 53.323 53.178 53.073 52.962 52.79 52.667 52.531 52.459 52.303 52.11 51.917 51.814 51.345 51.374 51.194 50.99 50.558 50.328 50.067 49.76 49.404 48.98 48.412 44.824 -4 ,14386 ,TETRA ,17604216,Sun Nov 28 17:13:12 CET,Sun Nov 28 19:04:17 CET,0.0 1.521 1.98 2.326 2.608 2.876 3.104 3.318 3.709 3.892 4.086 4.062 4.614 4.77 5.07 5.362 5.655 5.799 6.074 6.355 6.792 7.094 7.398 7.855 8.311 8.712 9.068 9.421 9.885 10.33 10.778 11.329 11.863 12.39 13.013 13.752 14.47 15.239 16.068 16.954 17.914 19.009 20.346 21.764 23.431 25.334 27.631 30.383 33.635 37.522 42.487 46.852 49.534 51.25 52.35 53.125 53.648 54.069 54.368 54.521 54.576 54.635 54.688 54.674 54.605 54.536 54.463 54.376 54.266 54.13 53.998 53.888 53.768 53.634 53.517 53.388 53.24 53.09 52.922 52.791 52.654 52.429 52.269 52.1 52.021 51.849 51.641 51.404 51.272 50.801 50.834 50.665 50.502 50.157 49.942 49.675 49.352 48.877 48.288 47.549 45.429 -5 ,16181 ,TETRA ,17604217,Sun Nov 28 17:13:07 CET,Sun Nov 28 19:04:16 CET,0.0 1.283 1.789 2.154 2.452 2.743 3.03 3.284 3.762 3.982 4.183 4.18 4.744 4.911 5.236 5.543 5.842 5.989 6.271 6.549 6.961 7.232 7.496 7.88 8.245 8.604 8.979 9.341 9.801 10.26 10.704 11.248 11.782 12.317 12.947 13.644 14.339 15.149 16.024 16.941 17.944 19.086 20.391 21.742 23.421 25.383 27.635 30.276 33.572 37.597 42.7 46.997 49.523 51.193 52.306 53.083 53.665 54.074 54.309 54.485 54.601 54.635 54.626 54.582 54.511 54.447 54.367 54.272 54.183 54.085 53.982 53.878 53.732 53.578 53.465 53.319 53.13 52.936 52.732 52.581 52.436 52.202 52.022 51.842 51.747 51.54 51.325 51.085 50.948 50.446 50.393 50.176 49.946 49.454 49.18 48.911 48.647 48.332 47.845 47.113 44.438 -6 ,28103 ,TETRA ,17604218,Sun Nov 28 17:13:07 CET,Sun Nov 28 19:03:45 CET,0.0 1.737 2.264 2.667 2.957 3.21 3.467 3.74 4.302 4.545 4.756 4.768 5.346 5.546 5.923 6.26 6.578 6.73 7.027 7.331 7.779 8.058 8.33 8.73 9.126 9.51 9.873 10.221 10.68 11.135 11.58 12.129 12.676 13.192 13.79 14.504 15.218 16.012 16.863 17.788 18.801 19.95 21.326 22.752 24.433 26.388 28.707 31.352 34.588 38.693 43.759 48.05 50.729 52.417 53.516 54.284 54.799 55.163 55.387 55.515 55.569 55.604 55.618 55.585 55.533 55.47 55.373 55.273 55.195 55.103 54.977 54.874 54.76 54.615 54.484 54.332 54.174 54.028 53.87 53.753 53.627 53.421 53.274 53.096 53.005 52.83 52.654 52.449 52.32 51.844 51.911 51.77 51.604 51.244 51.019 50.785 50.526 50.211 49.862 49.371 45.29 -7 ,1081 ,TETRA ,17604219,Sun Nov 28 17:13:09 CET,Sun Nov 28 19:03:29 CET,0.0 1.281 1.846 2.246 2.61 2.955 3.265 3.518 3.964 4.183 4.393 4.414 4.988 5.166 5.507 5.854 6.211 6.382 6.708 7.015 7.433 7.7 7.98 8.39 8.776 9.168 9.547 9.907 10.38 10.834 11.269 11.79 12.32 12.874 13.519 14.231 14.921 15.702 16.588 17.548 18.557 19.709 21.078 22.472 24.153 26.105 28.455 31.191 34.491 38.48 43.596 48.153 50.913 52.612 53.737 54.52 55.089 55.55 55.825 55.985 56.051 56.077 56.105 56.121 56.096 56.031 55.938 55.842 55.76 55.688 55.575 55.447 55.305 55.146 55.035 54.911 54.739 54.579 54.418 54.284 54.147 53.913 53.736 53.536 53.432 53.236 53.016 52.755 52.596 52.085 52.05 51.846 51.627 51.121 50.866 50.566 50.221 49.847 49.362 48.57 45.388 -8 ,22845 ,TETRA ,17604220,Sun Nov 28 17:13:11 CET,Sun Nov 28 19:03:31 CET,0.0 1.629 2.027 2.331 2.597 2.829 3.031 3.224 3.603 3.782 3.952 3.896 4.441 4.592 4.876 5.151 5.426 5.561 5.828 6.088 6.473 6.732 6.984 7.35 7.73 8.117 8.488 8.839 9.291 9.729 10.154 10.692 11.228 11.753 12.362 13.039 13.699 14.456 15.292 16.204 17.215 18.384 19.762 21.154 22.854 24.848 27.188 29.961 33.291 37.263 42.321 46.675 49.173 50.792 51.975 52.834 53.392 53.758 53.986 54.155 54.275 54.35 54.373 54.331 54.242 54.165 54.078 54.002 53.934 53.824 53.665 53.509 53.363 53.22 53.097 52.979 52.847 52.697 52.507 52.363 52.226 51.986 51.811 51.631 51.528 51.307 51.08 50.813 50.672 50.188 50.2 50.01 49.801 49.351 49.077 48.787 48.471 48.101 47.671 47.067 45.226 -9 ,3275 ,TETRA ,17604221,Sun Nov 28 17:13:13 CET,Sun Nov 28 19:03:30 CET,0.0 1.896 2.4 2.703 2.953 3.176 3.39 3.589 3.948 4.119 4.284 4.223 4.771 4.927 5.227 5.506 5.764 5.894 6.161 6.415 6.786 7.026 7.262 7.604 7.927 8.257 8.59 8.921 9.357 9.78 10.194 10.696 11.184 11.692 12.289 12.944 13.597 14.324 15.124 15.993 16.937 18.019 19.32 20.66 22.276 24.162 26.413 29.032 32.236 36.244 41.443 46.076 48.872 50.675 51.867 52.646 53.131 53.474 53.725 53.887 53.982 54.073 54.094 54.077 54.049 53.996 53.916 53.826 53.734 53.62 53.462 53.32 53.2 53.055 52.92 52.788 52.649 52.511 52.351 52.222 52.069 51.813 51.635 51.432 51.321 51.12 50.894 50.635 50.52 50.067 50.076 49.881 49.706 49.331 49.062 48.774 48.473 48.138 47.723 47.037 44.271 -10 ,22325 ,TETRA ,17604222,Sun Nov 28 17:13:08 CET,Sun Nov 28 19:04:20 CET,0.0 1.433 1.913 2.284 2.611 2.898 3.148 3.386 3.835 4.042 4.238 4.2 4.759 4.933 5.27 5.59 5.883 6.016 6.277 6.542 6.931 7.18 7.42 7.776 8.12 8.453 8.793 9.126 9.567 10.001 10.42 10.954 11.479 11.987 12.579 13.25 13.917 14.663 15.46 16.306 17.248 18.353 19.675 21.064 22.696 24.529 26.712 29.293 32.454 36.381 41.419 45.684 48.333 50.081 51.185 51.933 52.453 52.813 53.034 53.196 53.322 53.396 53.355 53.259 53.195 53.131 53.032 52.923 52.814 52.711 52.584 52.463 52.342 52.202 52.065 51.887 51.701 51.507 51.302 51.153 50.995 50.738 50.541 50.337 50.235 50.035 49.814 49.552 49.423 48.95 48.977 48.813 48.638 48.21 47.966 47.672 47.281 46.845 46.335 45.6 42.878 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 74ca1d7c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7862 ,TETRA ,17604223,Sun Nov 28 17:13:12 CET,Sun Nov 28 19:03:26 CET,0.0 0.777 1.066 1.278 1.456 1.628 1.784 1.928 2.21 2.337 2.459 2.315 2.829 2.964 3.212 3.427 3.635 3.741 3.937 4.116 4.38 4.558 4.73 4.987 5.24 5.469 5.682 5.897 6.177 6.445 6.717 7.065 7.4 7.718 8.097 8.535 8.972 9.467 9.993 10.556 11.151 11.805 12.57 13.374 14.359 15.437 16.665 18.105 19.85 21.814 23.943 25.644 26.498 26.862 27.043 27.116 27.095 27.038 26.928 26.763 26.599 26.423 26.241 26.062 25.869 25.681 25.452 25.223 25.028 24.822 24.609 24.431 24.255 24.043 23.861 23.672 23.467 23.263 23.045 22.891 22.722 22.436 22.242 22.042 21.937 21.712 21.461 21.186 21.041 20.535 20.544 20.347 20.138 19.692 19.461 19.21 18.915 18.578 18.162 17.558 15.66 -2 ,8056 ,TETRA ,17604224,Sun Nov 28 17:13:09 CET,Sun Nov 28 19:03:54 CET,0.0 1.362 1.666 1.897 2.092 2.26 2.41 2.552 2.814 2.933 3.046 2.877 3.375 3.478 3.674 3.864 4.064 4.167 4.363 4.556 4.842 5.021 5.187 5.43 5.676 5.92 6.153 6.382 6.687 6.983 7.263 7.596 7.927 8.237 8.597 9.031 9.45 9.912 10.417 10.961 11.54 12.216 13.045 13.838 14.771 15.837 17.075 18.54 20.288 22.347 24.75 26.604 27.598 28.125 28.407 28.523 28.508 28.445 28.372 28.231 28.074 27.922 27.747 27.564 27.389 27.218 27.016 26.824 26.647 26.454 26.257 26.083 25.889 25.681 25.5 25.295 25.082 24.865 24.647 24.513 24.38 24.16 23.989 23.814 23.734 23.563 23.367 23.152 23.032 22.532 22.578 22.411 22.24 21.871 21.651 21.401 21.107 20.765 20.352 19.76 17.546 -3 ,11199 ,TETRA ,17604225,Sun Nov 28 17:13:11 CET,Sun Nov 28 19:03:46 CET,0.0 1.229 1.523 1.749 1.942 2.111 2.267 2.408 2.673 2.806 2.939 2.8 3.303 3.406 3.606 3.799 3.988 4.081 4.262 4.441 4.699 4.867 5.02 5.25 5.494 5.72 5.941 6.162 6.448 6.737 7.013 7.345 7.684 8.02 8.4 8.835 9.265 9.748 10.273 10.822 11.396 12.058 12.882 13.71 14.679 15.806 17.089 18.531 20.219 22.214 24.553 26.3 27.17 27.632 27.896 27.982 27.946 27.857 27.734 27.554 27.361 27.174 26.995 26.827 26.667 26.508 26.312 26.126 25.952 25.75 25.53 25.359 25.175 24.984 24.851 24.688 24.497 24.302 24.103 23.968 23.825 23.594 23.425 23.243 23.152 22.961 22.741 22.483 22.345 21.853 21.912 21.751 21.573 21.167 20.939 20.648 20.291 19.886 19.397 18.785 16.553 -4 ,28047 ,TETRA ,17604226,Sun Nov 28 17:13:09 CET,Sun Nov 28 19:03:27 CET,0.0 0.976 1.28 1.517 1.701 1.87 2.032 2.181 2.445 2.569 2.682 2.515 3.019 3.128 3.347 3.578 3.795 3.895 4.097 4.303 4.594 4.777 4.959 5.215 5.455 5.691 5.926 6.16 6.464 6.746 7.013 7.34 7.668 7.994 8.378 8.806 9.21 9.673 10.193 10.755 11.346 12.018 12.811 13.609 14.573 15.642 16.851 18.319 20.1 22.181 24.64 26.512 27.434 27.901 28.114 28.179 28.173 28.108 27.983 27.783 27.562 27.344 27.139 26.942 26.74 26.512 26.25 26.024 25.823 25.602 25.374 25.182 24.969 24.746 24.578 24.417 24.25 24.042 23.822 23.677 23.535 23.294 23.098 22.9 22.804 22.61 22.365 22.099 21.97 21.453 21.424 21.231 21.035 20.587 20.345 20.057 19.718 19.355 18.886 18.23 15.001 -5 ,23939 ,TETRA ,17604227,Sun Nov 28 17:13:11 CET,Sun Nov 28 19:03:20 CET,0.0 1.022 1.316 1.538 1.723 1.894 2.048 2.185 2.444 2.564 2.683 2.523 3.018 3.118 3.311 3.507 3.691 3.78 3.965 4.154 4.412 4.574 4.731 4.962 5.193 5.426 5.663 5.892 6.197 6.503 6.798 7.153 7.498 7.834 8.224 8.66 9.071 9.529 10.037 10.589 11.182 11.852 12.653 13.473 14.422 15.496 16.702 18.078 19.803 21.781 23.972 25.753 26.613 26.985 27.24 27.341 27.334 27.299 27.18 26.971 26.744 26.519 26.294 26.082 25.871 25.661 25.447 25.247 25.065 24.875 24.628 24.418 24.214 23.984 23.799 23.601 23.391 23.175 22.939 22.771 22.601 22.325 22.128 21.918 21.807 21.574 21.328 21.092 20.975 20.5 20.593 20.431 20.251 19.826 19.59 19.355 19.097 18.777 18.34 17.718 15.856 -6 ,1871 ,TETRA ,17604228,Sun Nov 28 17:13:13 CET,Sun Nov 28 19:03:48 CET,0.0 0.978 1.257 1.477 1.659 1.825 1.982 2.126 2.398 2.53 2.648 2.477 2.974 3.09 3.321 3.546 3.754 3.853 4.052 4.248 4.529 4.703 4.87 5.123 5.377 5.617 5.852 6.088 6.39 6.689 6.971 7.295 7.625 7.954 8.32 8.73 9.137 9.606 10.122 10.682 11.277 11.951 12.739 13.514 14.479 15.623 16.919 18.347 20.015 21.992 24.368 26.156 27.001 27.476 27.699 27.755 27.728 27.607 27.437 27.221 27.007 26.796 26.587 26.388 26.202 26.033 25.858 25.706 25.56 25.371 25.167 25.015 24.866 24.702 24.563 24.42 24.261 24.085 23.912 23.784 23.643 23.429 23.276 23.119 23.033 22.837 22.634 22.431 22.326 21.861 21.972 21.84 21.697 21.364 21.162 20.928 20.675 20.406 20.028 19.432 17.471 -7 ,4168 ,TETRA ,17604229,Sun Nov 28 17:13:15 CET,Sun Nov 28 19:03:48 CET,0.0 1.191 1.506 1.718 1.894 2.06 2.213 2.358 2.64 2.772 2.894 2.73 3.234 3.344 3.551 3.745 3.931 4.027 4.231 4.427 4.717 4.909 5.088 5.343 5.589 5.834 6.077 6.311 6.614 6.905 7.184 7.542 7.901 8.237 8.628 9.063 9.46 9.903 10.408 10.949 11.511 12.181 13.005 13.809 14.749 15.812 17.008 18.393 20.1 22.122 24.435 26.118 26.957 27.427 27.633 27.664 27.611 27.483 27.344 27.197 27.037 26.873 26.703 26.532 26.344 26.159 25.941 25.733 25.559 25.361 25.123 24.919 24.738 24.548 24.38 24.215 24.049 23.86 23.633 23.465 23.293 23.011 22.809 22.589 22.466 22.217 21.97 21.703 21.567 21.073 21.134 20.964 20.782 20.406 20.197 19.967 19.72 19.408 19.009 18.467 16.169 -8 ,1927 ,TETRA ,17604230,Sun Nov 28 17:13:09 CET,Sun Nov 28 19:03:25 CET,0.0 1.097 1.403 1.642 1.832 2.003 2.166 2.322 2.619 2.76 2.887 2.739 3.244 3.345 3.554 3.767 3.966 4.063 4.246 4.41 4.663 4.834 4.997 5.232 5.479 5.718 5.935 6.157 6.453 6.739 7.015 7.348 7.676 7.999 8.363 8.787 9.209 9.679 10.177 10.717 11.315 11.976 12.771 13.587 14.563 15.677 16.933 18.339 19.962 21.888 24.15 25.845 26.761 27.198 27.365 27.382 27.31 27.223 27.109 26.935 26.758 26.576 26.365 26.16 25.973 25.804 25.614 25.419 25.24 25.032 24.816 24.646 24.457 24.267 24.124 23.965 23.772 23.557 23.347 23.205 23.053 22.806 22.617 22.405 22.295 22.067 21.832 21.588 21.462 20.958 20.987 20.817 20.627 20.22 20.001 19.769 19.471 19.082 18.628 18.109 16.064 -9 ,26588 ,TETRA ,17604231,Sun Nov 28 17:13:11 CET,Sun Nov 28 19:03:28 CET,0.0 1.074 1.378 1.614 1.805 1.967 2.122 2.268 2.529 2.652 2.773 2.623 3.122 3.229 3.433 3.628 3.822 3.917 4.098 4.271 4.53 4.693 4.845 5.079 5.313 5.536 5.749 5.957 6.23 6.498 6.755 7.064 7.379 7.697 8.077 8.511 8.926 9.406 9.957 10.532 11.112 11.774 12.562 13.377 14.361 15.443 16.714 18.144 19.788 21.764 24.095 25.798 26.556 26.983 27.183 27.177 27.123 27.038 26.889 26.721 26.569 26.388 26.201 26.043 25.874 25.703 25.518 25.309 25.119 24.948 24.754 24.578 24.405 24.235 24.106 23.973 23.833 23.675 23.491 23.359 23.225 23.009 22.842 22.658 22.562 22.355 22.143 21.94 21.822 21.326 21.408 21.265 21.108 20.76 20.572 20.351 20.091 19.805 19.441 18.93 17.192 -10 ,14194 ,TETRA ,17604232,Sun Nov 28 17:13:13 CET,Sun Nov 28 19:05:34 CET,0.0 1.13 1.417 1.641 1.836 2.006 2.158 2.299 2.558 2.677 2.792 2.622 3.121 3.237 3.464 3.689 3.914 4.021 4.227 4.43 4.72 4.899 5.077 5.341 5.6 5.854 6.091 6.32 6.627 6.93 7.214 7.55 7.894 8.236 8.634 9.081 9.512 9.985 10.486 11.031 11.603 12.229 12.995 13.792 14.731 15.79 16.994 18.311 19.939 21.893 24.084 25.662 26.437 26.865 27.096 27.163 27.09 26.957 26.817 26.632 26.411 26.191 25.978 25.788 25.613 25.421 25.173 24.96 24.799 24.617 24.409 24.235 24.037 23.843 23.698 23.54 23.366 23.161 22.937 22.792 22.654 22.435 22.279 22.107 22.017 21.834 21.625 21.413 21.292 20.8 20.907 20.782 20.634 20.278 20.067 19.838 19.59 19.296 18.936 18.417 16.045 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 9c2b66ff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22412 ,TETRA ,17604233,Sun Nov 28 17:13:15 CET,Sun Nov 28 19:01:57 CET,0.0 0.909 1.177 1.379 1.55 1.704 1.846 1.977 2.21 2.317 2.419 2.253 2.698 2.788 2.961 3.136 3.316 3.395 3.538 3.678 3.894 4.036 4.166 4.345 4.525 4.706 4.882 5.049 5.268 5.489 5.705 5.969 6.219 6.462 6.76 7.103 7.417 7.764 8.145 8.549 8.984 9.484 10.061 10.649 11.36 12.156 13.076 14.138 15.468 17.052 18.899 20.434 21.308 21.836 22.188 22.408 22.499 22.529 22.495 22.435 22.366 22.275 22.177 22.061 21.961 21.865 21.739 21.622 21.505 21.364 21.205 21.07 20.92 20.77 20.647 20.514 20.381 20.23 20.081 19.979 19.861 19.668 19.544 19.412 19.336 19.175 18.982 18.786 18.693 18.241 18.322 18.2 18.07 17.77 17.608 17.404 17.13 16.841 16.486 15.976 13.805 -2 ,13594 ,TETRA ,17604234,Sun Nov 28 17:13:10 CET,Sun Nov 28 19:01:30 CET,0.0 0.831 1.094 1.29 1.462 1.613 1.742 1.865 2.089 2.194 2.299 2.136 2.582 2.668 2.841 3.008 3.163 3.241 3.389 3.529 3.724 3.846 3.972 4.163 4.357 4.54 4.708 4.873 5.092 5.302 5.503 5.748 5.988 6.235 6.53 6.855 7.17 7.524 7.906 8.311 8.751 9.244 9.82 10.423 11.137 11.944 12.903 13.997 15.301 16.883 18.799 20.372 21.253 21.765 22.051 22.212 22.309 22.327 22.293 22.231 22.15 22.062 21.977 21.884 21.771 21.654 21.528 21.418 21.316 21.182 21.019 20.887 20.744 20.593 20.487 20.373 20.238 20.087 19.925 19.816 19.698 19.496 19.364 19.225 19.143 18.971 18.786 18.581 18.479 18.029 18.101 17.98 17.858 17.573 17.4 17.195 16.953 16.676 16.345 15.842 13.782 -3 ,6858 ,TETRA ,17604235,Sun Nov 28 17:13:13 CET,Sun Nov 28 19:01:35 CET,0.0 0.862 1.138 1.347 1.51 1.652 1.787 1.917 2.148 2.249 2.345 2.17 2.615 2.699 2.855 3.005 3.157 3.237 3.388 3.527 3.732 3.86 3.979 4.158 4.334 4.511 4.681 4.835 5.041 5.256 5.466 5.708 5.946 6.188 6.466 6.771 7.078 7.434 7.812 8.216 8.65 9.141 9.727 10.339 11.06 11.863 12.795 13.855 15.138 16.681 18.57 20.139 21.049 21.575 21.893 22.083 22.16 22.156 22.106 22.044 21.979 21.902 21.798 21.671 21.547 21.449 21.335 21.21 21.085 20.962 20.837 20.729 20.611 20.481 20.374 20.263 20.14 20.0 19.854 19.739 19.617 19.435 19.313 19.19 19.127 18.973 18.789 18.593 18.497 18.057 18.136 17.997 17.859 17.54 17.357 17.158 16.931 16.668 16.314 15.812 14.068 -4 ,27185 ,TETRA ,17604236,Sun Nov 28 17:13:15 CET,Sun Nov 28 19:00:24 CET,0.0 0.787 1.071 1.277 1.437 1.574 1.708 1.836 2.059 2.163 2.265 2.09 2.536 2.619 2.778 2.932 3.082 3.158 3.307 3.44 3.632 3.758 3.885 4.069 4.239 4.406 4.571 4.738 4.96 5.174 5.379 5.626 5.869 6.119 6.409 6.731 7.049 7.401 7.794 8.209 8.635 9.127 9.718 10.316 11.028 11.827 12.757 13.821 15.065 16.587 18.486 20.02 20.878 21.401 21.7 21.863 21.954 21.998 21.983 21.923 21.85 21.794 21.732 21.646 21.555 21.469 21.363 21.247 21.144 21.022 20.888 20.787 20.668 20.519 20.409 20.289 20.145 19.977 19.811 19.715 19.611 19.436 19.303 19.162 19.086 18.926 18.751 18.544 18.431 17.98 18.097 17.98 17.843 17.524 17.348 17.165 16.959 16.711 16.387 15.847 13.817 -5 ,15426 ,TETRA ,17604237,Sun Nov 28 17:13:10 CET,Sun Nov 28 18:59:46 CET,0.0 0.997 1.279 1.494 1.661 1.799 1.928 2.055 2.307 2.42 2.522 2.356 2.801 2.892 3.065 3.224 3.381 3.459 3.606 3.746 3.945 4.081 4.213 4.395 4.571 4.743 4.913 5.077 5.289 5.495 5.694 5.936 6.175 6.408 6.691 7.022 7.332 7.686 8.078 8.478 8.906 9.411 10.01 10.608 11.291 12.07 12.985 14.037 15.311 16.854 18.769 20.271 21.121 21.632 21.917 22.08 22.162 22.199 22.196 22.157 22.092 22.001 21.899 21.805 21.709 21.587 21.441 21.319 21.206 21.086 20.962 20.844 20.707 20.552 20.432 20.294 20.142 19.989 19.83 19.722 19.601 19.378 19.224 19.075 18.992 18.805 18.618 18.392 18.262 17.8 17.898 17.777 17.625 17.286 17.106 16.886 16.637 16.326 15.939 15.432 13.691 -6 ,14254 ,TETRA ,17604238,Sun Nov 28 17:13:10 CET,Sun Nov 28 19:00:21 CET,0.0 0.919 1.177 1.366 1.533 1.683 1.821 1.952 2.191 2.3 2.395 2.215 2.666 2.754 2.921 3.077 3.225 3.299 3.442 3.574 3.775 3.91 4.038 4.229 4.417 4.607 4.792 4.976 5.215 5.436 5.654 5.917 6.177 6.431 6.719 7.037 7.352 7.705 8.093 8.51 8.957 9.459 10.034 10.629 11.328 12.106 13.046 14.129 15.438 17.031 18.963 20.543 21.382 21.876 22.186 22.382 22.471 22.484 22.458 22.38 22.293 22.205 22.118 22.022 21.91 21.803 21.688 21.574 21.471 21.348 21.203 21.078 20.941 20.798 20.691 20.571 20.445 20.323 20.19 20.089 19.972 19.787 19.666 19.533 19.456 19.301 19.143 18.956 18.847 18.392 18.483 18.347 18.214 17.914 17.723 17.5 17.241 16.946 16.575 16.059 14.503 -7 ,18602 ,TETRA ,17604239,Sun Nov 28 17:13:13 CET,Sun Nov 28 19:00:20 CET,0.0 1.133 1.404 1.598 1.775 1.924 2.06 2.192 2.424 2.528 2.628 2.457 2.9 2.989 3.159 3.323 3.488 3.562 3.704 3.847 4.057 4.19 4.322 4.505 4.677 4.847 5.014 5.177 5.392 5.595 5.796 6.039 6.279 6.515 6.787 7.103 7.411 7.756 8.138 8.563 9.01 9.509 10.092 10.676 11.366 12.162 13.102 14.173 15.464 16.997 18.835 20.34 21.213 21.715 22.032 22.239 22.313 22.329 22.323 22.266 22.194 22.115 22.019 21.911 21.792 21.673 21.541 21.406 21.283 21.154 21.014 20.906 20.779 20.635 20.522 20.407 20.281 20.15 20.022 19.922 19.788 19.576 19.446 19.314 19.25 19.115 18.945 18.755 18.658 18.211 18.308 18.173 18.026 17.711 17.532 17.315 17.088 16.827 16.465 15.945 14.155 -8 ,16967 ,TETRA ,17604240,Sun Nov 28 17:13:15 CET,Sun Nov 28 19:01:33 CET,0.0 0.905 1.153 1.366 1.549 1.703 1.839 1.967 2.208 2.32 2.427 2.262 2.707 2.797 2.967 3.122 3.262 3.332 3.475 3.614 3.817 3.947 4.069 4.245 4.421 4.6 4.769 4.931 5.15 5.363 5.562 5.804 6.042 6.271 6.547 6.879 7.202 7.551 7.932 8.338 8.772 9.281 9.882 10.469 11.156 11.952 12.911 14.004 15.253 16.77 18.671 20.174 20.93 21.294 21.457 21.498 21.485 21.422 21.325 21.188 21.061 20.97 20.887 20.795 20.682 20.565 20.43 20.295 20.174 20.049 19.914 19.793 19.66 19.514 19.393 19.254 19.11 18.969 18.817 18.713 18.608 18.388 18.221 18.055 17.97 17.8 17.624 17.44 17.343 16.893 16.979 16.859 16.714 16.342 16.153 15.97 15.75 15.487 15.098 14.506 12.578 -9 ,9529 ,TETRA ,17604241,Sun Nov 28 17:13:16 CET,Sun Nov 28 19:01:09 CET,0.0 1.195 1.468 1.667 1.83 1.975 2.11 2.234 2.469 2.579 2.68 2.503 2.953 3.044 3.213 3.373 3.535 3.616 3.765 3.905 4.109 4.24 4.374 4.564 4.741 4.913 5.073 5.231 5.445 5.657 5.863 6.112 6.352 6.587 6.858 7.151 7.448 7.803 8.182 8.589 9.033 9.531 10.11 10.703 11.413 12.235 13.204 14.291 15.561 17.131 19.1 20.652 21.519 22.03 22.328 22.516 22.602 22.594 22.554 22.496 22.42 22.331 22.219 22.105 21.999 21.902 21.774 21.635 21.512 21.371 21.196 21.062 20.936 20.789 20.671 20.519 20.337 20.157 19.96 19.822 19.679 19.444 19.295 19.148 19.068 18.904 18.729 18.544 18.44 17.993 18.122 17.992 17.85 17.559 17.377 17.167 16.931 16.667 16.302 15.734 13.899 -10 ,10153 ,TETRA ,17604242,Sun Nov 28 17:13:11 CET,Sun Nov 28 19:00:16 CET,0.0 0.99 1.287 1.485 1.659 1.817 1.954 2.078 2.302 2.407 2.512 2.35 2.8 2.885 3.055 3.214 3.365 3.44 3.581 3.723 3.939 4.074 4.199 4.382 4.557 4.735 4.927 5.108 5.329 5.545 5.758 6.017 6.279 6.535 6.831 7.167 7.481 7.815 8.199 8.635 9.09 9.606 10.197 10.783 11.47 12.256 13.199 14.277 15.559 17.14 19.031 20.556 21.427 21.954 22.257 22.399 22.477 22.49 22.405 22.239 22.111 22.029 21.919 21.804 21.691 21.571 21.425 21.279 21.162 21.033 20.873 20.733 20.593 20.441 20.322 20.195 20.051 19.906 19.752 19.646 19.534 19.33 19.177 19.029 18.949 18.764 18.557 18.352 18.252 17.81 17.943 17.835 17.701 17.365 17.195 17.008 16.769 16.5 16.144 15.602 13.995 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt deleted file mode 100644 index 9a44aa1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7559 ,TETRA ,17604243,Sun Nov 28 17:13:12 CET,Sun Nov 28 19:03:58 CET,0.0 1.642 2.304 2.782 3.174 3.544 3.868 4.124 4.531 4.727 4.933 4.942 5.473 5.617 5.845 6.06 6.255 6.349 6.546 6.721 6.931 7.062 7.187 7.363 7.522 7.667 7.791 7.901 8.055 8.21 8.346 8.499 8.644 8.778 8.915 9.055 9.183 9.315 9.441 9.544 9.625 9.688 9.758 9.761 9.673 9.548 9.323 8.895 8.184 7.049 5.021 2.638 0.757 -0.828 -2.209 -3.422 -4.448 -5.351 -6.103 -6.842 -7.472 -8.038 -8.564 -9.044 -9.504 -9.927 -10.347 -10.712 -11.032 -11.365 -11.717 -12.01 -12.314 -12.63 -12.877 -13.128 -13.381 -13.64 -13.906 -14.09 -14.293 -14.61 -14.824 -15.051 -15.168 -15.408 -15.647 -15.878 -16.003 -16.526 -16.43 -16.585 -16.761 -17.131 -17.323 -17.538 -17.781 -18.055 -18.385 -18.879 -21.852 -2 ,22682 ,TETRA ,17604244,Sun Nov 28 17:13:11 CET,Sun Nov 28 19:04:22 CET,0.0 1.806 2.532 3.001 3.383 3.709 3.992 4.261 4.732 4.91 5.055 4.969 5.465 5.59 5.828 6.047 6.246 6.345 6.524 6.665 6.853 6.971 7.101 7.276 7.44 7.612 7.745 7.868 8.042 8.179 8.299 8.451 8.583 8.691 8.819 8.957 9.07 9.177 9.255 9.324 9.411 9.491 9.517 9.512 9.496 9.371 9.065 8.576 7.802 6.581 4.435 1.905 -0.045 -1.675 -3.057 -4.263 -5.303 -6.238 -7.034 -7.82 -8.489 -9.053 -9.585 -10.096 -10.556 -10.98 -11.414 -11.793 -12.121 -12.453 -12.799 -13.086 -13.389 -13.704 -13.951 -14.2 -14.441 -14.696 -14.97 -15.147 -15.329 -15.618 -15.822 -16.033 -16.141 -16.367 -16.602 -16.844 -16.971 -17.492 -17.386 -17.549 -17.724 -18.083 -18.275 -18.48 -18.713 -18.993 -19.337 -19.869 -22.968 -3 ,23027 ,TETRA ,17604245,Sun Nov 28 17:13:15 CET,Sun Nov 28 19:04:14 CET,0.0 2.894 3.764 4.345 4.772 5.109 5.424 5.724 6.23 6.439 6.624 6.629 7.155 7.298 7.566 7.815 8.033 8.132 8.324 8.503 8.74 8.875 8.998 9.205 9.398 9.558 9.695 9.806 9.95 10.108 10.267 10.434 10.568 10.702 10.855 11.022 11.161 11.252 11.332 11.396 11.441 11.488 11.536 11.527 11.446 11.319 11.095 10.691 10.027 8.927 6.988 4.575 2.58 0.956 -0.395 -1.6 -2.675 -3.629 -4.405 -5.157 -5.793 -6.334 -6.839 -7.332 -7.805 -8.22 -8.655 -9.033 -9.341 -9.674 -10.041 -10.345 -10.641 -10.938 -11.172 -11.418 -11.677 -11.959 -12.249 -12.435 -12.625 -12.933 -13.139 -13.355 -13.471 -13.7 -13.94 -14.207 -14.339 -14.854 -14.756 -14.907 -15.077 -15.488 -15.716 -15.955 -16.225 -16.551 -16.92 -17.39 -20.095 -4 ,1215 ,TETRA ,17604246,Sun Nov 28 17:13:38 CET,Sun Nov 28 19:06:05 CET,0.0 1.688 2.308 2.798 3.2 3.539 3.821 4.071 4.495 4.68 4.859 4.825 5.324 5.46 5.732 5.973 6.189 6.279 6.463 6.639 6.864 7.017 7.173 7.377 7.562 7.719 7.85 7.978 8.138 8.304 8.454 8.61 8.77 8.912 9.052 9.187 9.28 9.365 9.438 9.518 9.608 9.689 9.715 9.686 9.617 9.456 9.185 8.795 8.155 6.988 4.926 2.511 0.532 -1.147 -2.506 -3.689 -4.734 -5.618 -6.374 -7.148 -7.791 -8.369 -8.916 -9.418 -9.872 -10.286 -10.714 -11.102 -11.438 -11.787 -12.15 -12.434 -12.724 -13.029 -13.269 -13.527 -13.794 -14.074 -14.361 -14.552 -14.745 -15.039 -15.239 -15.457 -15.573 -15.795 -16.03 -16.285 -16.416 -16.933 -16.835 -16.993 -17.154 -17.518 -17.726 -17.95 -18.206 -18.522 -18.918 -19.464 -22.293 -5 ,6583 ,TETRA ,17604247,Sun Nov 28 17:13:40 CET,Sun Nov 28 19:06:07 CET,0.0 1.78 2.507 3.045 3.488 3.814 4.117 4.385 4.835 5.031 5.198 5.143 5.643 5.768 6.034 6.276 6.483 6.594 6.803 6.962 7.193 7.35 7.485 7.678 7.868 8.029 8.173 8.302 8.468 8.619 8.739 8.874 9.014 9.147 9.267 9.403 9.509 9.6 9.693 9.77 9.839 9.873 9.895 9.883 9.788 9.649 9.383 8.937 8.268 7.115 5.055 2.564 0.575 -1.044 -2.41 -3.576 -4.602 -5.526 -6.304 -7.081 -7.735 -8.297 -8.828 -9.344 -9.812 -10.227 -10.663 -11.046 -11.368 -11.699 -12.042 -12.331 -12.628 -12.917 -13.153 -13.412 -13.665 -13.918 -14.185 -14.376 -14.583 -14.909 -15.128 -15.358 -15.472 -15.706 -15.955 -16.226 -16.374 -16.907 -16.827 -16.991 -17.165 -17.543 -17.764 -18.006 -18.265 -18.587 -19.007 -19.637 -22.231 -6 ,19959 ,TETRA ,17604248,Sun Nov 28 17:13:42 CET,Sun Nov 28 19:04:00 CET,0.0 1.517 2.165 2.662 3.068 3.389 3.677 3.949 4.417 4.606 4.788 4.741 5.238 5.371 5.62 5.842 6.05 6.152 6.35 6.533 6.788 6.943 7.081 7.264 7.427 7.577 7.717 7.846 7.995 8.138 8.271 8.428 8.559 8.661 8.776 8.895 8.992 9.098 9.22 9.328 9.393 9.438 9.475 9.492 9.431 9.257 8.958 8.544 7.9 6.771 4.803 2.399 0.448 -1.217 -2.621 -3.844 -4.854 -5.719 -6.465 -7.218 -7.857 -8.414 -8.925 -9.416 -9.886 -10.294 -10.718 -11.105 -11.439 -11.779 -12.13 -12.417 -12.705 -13.01 -13.255 -13.508 -13.755 -14.011 -14.279 -14.467 -14.662 -14.95 -15.148 -15.354 -15.468 -15.72 -15.974 -16.234 -16.382 -16.923 -16.86 -17.038 -17.226 -17.629 -17.887 -18.162 -18.452 -18.788 -19.158 -19.622 -22.491 -7 ,11302 ,TETRA ,17604249,Sun Nov 28 17:13:44 CET,Sun Nov 28 19:03:45 CET,0.0 1.942 2.653 3.127 3.515 3.864 4.157 4.405 4.836 5.028 5.198 5.134 5.635 5.769 6.026 6.259 6.469 6.563 6.755 6.943 7.197 7.341 7.462 7.626 7.785 7.94 8.072 8.212 8.405 8.572 8.713 8.881 9.03 9.139 9.264 9.412 9.543 9.652 9.744 9.803 9.837 9.88 9.879 9.846 9.786 9.667 9.465 9.085 8.36 7.181 5.201 2.835 0.918 -0.707 -2.094 -3.316 -4.357 -5.26 -6.012 -6.763 -7.423 -8.024 -8.57 -9.058 -9.511 -9.918 -10.34 -10.72 -11.038 -11.365 -11.703 -11.988 -12.293 -12.609 -12.842 -13.092 -13.359 -13.617 -13.882 -14.073 -14.271 -14.568 -14.777 -15.004 -15.113 -15.334 -15.578 -15.831 -15.967 -16.506 -16.44 -16.598 -16.765 -17.129 -17.333 -17.558 -17.825 -18.136 -18.499 -18.984 -21.169 -8 ,8849 ,TETRA ,17604250,Sun Nov 28 17:13:39 CET,Sun Nov 28 19:05:43 CET,0.0 2.172 2.827 3.292 3.662 3.998 4.297 4.543 4.937 5.108 5.272 5.214 5.709 5.829 6.076 6.306 6.525 6.63 6.808 6.954 7.156 7.286 7.421 7.601 7.741 7.87 7.996 8.107 8.247 8.386 8.513 8.667 8.809 8.925 9.045 9.166 9.263 9.357 9.434 9.523 9.596 9.644 9.68 9.655 9.6 9.461 9.167 8.791 8.14 6.966 4.888 2.419 0.439 -1.233 -2.642 -3.83 -4.83 -5.757 -6.549 -7.308 -7.941 -8.493 -9.034 -9.553 -10.019 -10.435 -10.871 -11.263 -11.595 -11.924 -12.277 -12.582 -12.89 -13.214 -13.463 -13.709 -13.968 -14.241 -14.516 -14.706 -14.901 -15.205 -15.426 -15.651 -15.763 -16.004 -16.258 -16.507 -16.634 -17.16 -17.052 -17.195 -17.347 -17.693 -17.897 -18.114 -18.362 -18.662 -19.051 -19.633 -23.541 -9 ,20872 ,TETRA ,17604251,Sun Nov 28 17:13:42 CET,Sun Nov 28 19:05:47 CET,0.0 1.915 2.578 3.058 3.439 3.795 4.095 4.349 4.816 5.027 5.216 5.159 5.659 5.78 6.023 6.243 6.424 6.521 6.704 6.86 7.056 7.171 7.292 7.469 7.641 7.827 7.988 8.113 8.271 8.417 8.543 8.681 8.813 8.945 9.092 9.243 9.363 9.468 9.574 9.672 9.747 9.812 9.839 9.823 9.75 9.585 9.314 8.858 8.115 6.893 4.764 2.205 0.16 -1.508 -2.893 -4.087 -5.104 -6.024 -6.804 -7.557 -8.182 -8.721 -9.236 -9.727 -10.19 -10.61 -11.039 -11.418 -11.737 -12.068 -12.411 -12.68 -12.954 -13.249 -13.488 -13.733 -13.983 -14.236 -14.491 -14.672 -14.867 -15.162 -15.363 -15.568 -15.673 -15.91 -16.159 -16.416 -16.553 -17.081 -16.997 -17.15 -17.308 -17.676 -17.886 -18.106 -18.34 -18.644 -19.032 -19.545 -22.48 -10 ,17480 ,TETRA ,17604252,Sun Nov 28 17:13:40 CET,Sun Nov 28 19:03:45 CET,0.0 2.286 2.997 3.529 3.964 4.333 4.619 4.869 5.3 5.478 5.646 5.564 6.063 6.194 6.438 6.656 6.856 6.955 7.146 7.318 7.552 7.716 7.864 8.047 8.215 8.38 8.519 8.636 8.797 8.954 9.09 9.225 9.359 9.487 9.601 9.712 9.844 9.99 10.107 10.197 10.257 10.282 10.323 10.328 10.233 10.081 9.803 9.332 8.624 7.514 5.526 3.072 1.093 -0.571 -2.001 -3.246 -4.286 -5.186 -5.943 -6.711 -7.383 -7.962 -8.529 -9.053 -9.511 -9.923 -10.346 -10.727 -11.057 -11.398 -11.76 -12.048 -12.338 -12.646 -12.879 -13.121 -13.382 -13.647 -13.913 -14.095 -14.288 -14.592 -14.799 -15.014 -15.131 -15.378 -15.613 -15.869 -16.008 -16.536 -16.44 -16.599 -16.765 -17.112 -17.301 -17.519 -17.783 -18.112 -18.507 -19.052 -22.486 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt deleted file mode 100644 index 5cf8ddf7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5406 ,TETRA ,17604253,Sun Nov 28 17:13:41 CET,Sun Nov 28 19:03:24 CET,0.0 3.758 4.364 4.739 4.993 5.207 5.39 5.556 5.842 5.937 6.022 5.801 6.228 6.278 6.346 6.383 6.41 6.414 6.433 6.441 6.423 6.414 6.379 6.279 6.192 6.107 5.993 5.887 5.746 5.579 5.403 5.168 4.884 4.576 4.196 3.734 3.291 2.769 2.119 1.361 0.495 -0.574 -1.893 -3.316 -5.19 -7.582 -10.669 -14.56 -19.716 -26.997 -38.193 -50.14 -59.027 -65.934 -71.427 -76.04 -79.881 -83.218 -85.986 -88.616 -90.787 -92.652 -94.368 -95.969 -97.417 -98.692 -100.003 -101.141 -102.101 -103.086 -104.071 -104.874 -105.698 -106.536 -107.172 -107.802 -108.444 -109.114 -109.809 -110.272 -110.752 -111.501 -112.007 -112.525 -112.787 -113.317 -113.87 -114.461 -114.762 -115.571 -115.723 -116.065 -116.422 -117.144 -117.526 -117.952 -118.424 -118.904 -119.457 -120.264 -124.171 -3 ,26693 ,TETRA ,17604255,Sun Nov 28 17:13:42 CET,Sun Nov 28 19:05:47 CET,0.0 3.321 3.882 4.19 4.446 4.665 4.835 4.978 5.177 5.251 5.323 5.042 5.461 5.518 5.592 5.664 5.717 5.732 5.755 5.763 5.759 5.738 5.699 5.649 5.59 5.495 5.384 5.267 5.095 4.916 4.714 4.434 4.153 3.86 3.478 2.987 2.49 1.927 1.267 0.517 -0.341 -1.407 -2.799 -4.333 -6.302 -8.712 -11.762 -15.65 -20.852 -28.121 -39.083 -50.811 -59.534 -66.353 -71.791 -76.411 -80.33 -83.705 -86.48 -89.134 -91.33 -93.226 -94.984 -96.58 -97.994 -99.254 -100.526 -101.641 -102.605 -103.568 -104.541 -105.34 -106.163 -106.988 -107.613 -108.261 -108.924 -109.585 -110.262 -110.725 -111.181 -111.878 -112.362 -112.855 -113.11 -113.629 -114.169 -114.744 -115.037 -115.838 -115.962 -116.283 -116.626 -117.454 -117.902 -118.334 -118.808 -119.289 -119.817 -120.597 -124.936 -4 ,7159 ,TETRA ,17604256,Sun Nov 28 17:13:44 CET,Sun Nov 28 19:05:41 CET,0.0 3.185 3.773 4.166 4.48 4.723 4.897 5.039 5.292 5.381 5.447 5.189 5.622 5.685 5.779 5.83 5.859 5.869 5.878 5.901 5.897 5.871 5.843 5.783 5.708 5.631 5.538 5.417 5.237 5.039 4.828 4.581 4.336 4.067 3.714 3.266 2.807 2.268 1.614 0.86 0.006 -1.042 -2.373 -3.859 -5.744 -8.091 -11.153 -15.036 -20.274 -27.688 -38.877 -50.652 -59.435 -66.345 -71.869 -76.504 -80.303 -83.529 -86.202 -88.758 -90.903 -92.754 -94.492 -96.108 -97.533 -98.774 -100.031 -101.129 -102.051 -102.988 -103.956 -104.767 -105.594 -106.433 -107.054 -107.685 -108.326 -108.959 -109.612 -110.069 -110.538 -111.269 -111.805 -112.344 -112.608 -113.147 -113.689 -114.273 -114.574 -115.36 -115.458 -115.778 -116.132 -116.91 -117.309 -117.734 -118.224 -118.812 -119.495 -120.397 -124.937 -5 ,3766 ,TETRA ,17604257,Sun Nov 28 17:13:45 CET,Sun Nov 28 19:05:41 CET,0.0 4.659 5.386 5.862 6.263 6.568 6.795 6.974 7.248 7.35 7.43 7.184 7.617 7.678 7.771 7.829 7.849 7.855 7.865 7.852 7.805 7.763 7.711 7.636 7.559 7.459 7.343 7.207 7.008 6.812 6.618 6.395 6.14 5.835 5.462 5.026 4.584 4.035 3.381 2.634 1.778 0.743 -0.555 -1.991 -3.849 -6.143 -9.144 -13.042 -18.298 -25.638 -36.791 -48.681 -57.42 -64.217 -69.68 -74.313 -78.115 -81.38 -84.074 -86.659 -88.833 -90.698 -92.463 -94.111 -95.555 -96.823 -98.125 -99.248 -100.172 -101.103 -102.081 -102.887 -103.705 -104.546 -105.171 -105.785 -106.441 -107.127 -107.822 -108.293 -108.762 -109.465 -109.946 -110.439 -110.697 -111.23 -111.75 -112.291 -112.568 -113.336 -113.419 -113.734 -114.06 -114.748 -115.123 -115.546 -115.988 -116.457 -117.054 -117.86 -121.533 -6 ,22274 ,TETRA ,17604258,Sun Nov 28 17:16:37 CET,Sun Nov 28 19:07:59 CET,0.0 3.063 3.789 4.262 4.534 4.728 4.899 5.045 5.246 5.338 5.446 5.253 5.684 5.729 5.792 5.838 5.873 5.877 5.884 5.896 5.885 5.869 5.839 5.755 5.646 5.522 5.402 5.277 5.098 4.942 4.781 4.536 4.27 3.983 3.635 3.21 2.757 2.215 1.55 0.793 -0.09 -1.193 -2.605 -4.158 -6.142 -8.609 -11.753 -15.733 -21.031 -28.321 -39.298 -51.021 -59.825 -66.828 -72.479 -77.184 -81.051 -84.47 -87.301 -89.906 -92.038 -93.916 -95.651 -97.222 -98.658 -99.935 -101.217 -102.332 -103.278 -104.229 -105.218 -106.024 -106.823 -107.639 -108.269 -108.904 -109.558 -110.23 -110.902 -111.366 -111.851 -112.599 -113.102 -113.615 -113.876 -114.397 -114.923 -115.461 -115.738 -116.524 -116.619 -116.938 -117.267 -117.998 -118.4 -118.832 -119.317 -119.884 -120.556 -121.366 -124.933 -7 ,29778 ,TETRA ,17604259,Sun Nov 28 17:16:38 CET,Sun Nov 28 19:06:55 CET,0.0 3.196 3.811 4.265 4.604 4.868 5.098 5.301 5.573 5.675 5.789 5.594 6.036 6.101 6.183 6.263 6.319 6.337 6.377 6.387 6.375 6.343 6.302 6.24 6.169 6.074 5.96 5.843 5.67 5.485 5.279 5.009 4.738 4.456 4.111 3.689 3.232 2.681 2.035 1.29 0.426 -0.668 -2.029 -3.485 -5.387 -7.752 -10.789 -14.774 -20.198 -27.604 -38.757 -50.582 -59.399 -66.284 -71.788 -76.429 -80.282 -83.57 -86.299 -88.948 -91.098 -92.956 -94.69 -96.263 -97.667 -98.92 -100.206 -101.34 -102.281 -103.227 -104.213 -105.007 -105.811 -106.629 -107.255 -107.88 -108.515 -109.167 -109.839 -110.298 -110.771 -111.497 -111.981 -112.487 -112.749 -113.267 -113.796 -114.359 -114.651 -115.44 -115.566 -115.898 -116.23 -116.947 -117.317 -117.686 -118.123 -118.666 -119.288 -120.021 -123.547 -8 ,1606 ,TETRA ,17604260,Sun Nov 28 17:17:36 CET,Sun Nov 28 19:09:20 CET,0.0 2.896 3.556 4.053 4.395 4.654 4.853 5.003 5.252 5.358 5.44 5.202 5.623 5.68 5.787 5.852 5.897 5.922 5.956 5.982 5.961 5.929 5.908 5.851 5.778 5.699 5.595 5.476 5.333 5.174 4.992 4.737 4.468 4.199 3.838 3.39 2.94 2.387 1.729 1.008 0.189 -0.844 -2.174 -3.635 -5.495 -7.818 -10.92 -14.963 -20.446 -28.024 -39.096 -50.754 -59.449 -66.308 -71.85 -76.471 -80.295 -83.637 -86.386 -88.996 -91.173 -93.068 -94.832 -96.433 -97.85 -99.1 -100.373 -101.496 -102.454 -103.429 -104.411 -105.215 -106.039 -106.858 -107.477 -108.106 -108.743 -109.395 -110.065 -110.511 -110.96 -111.646 -112.114 -112.592 -112.834 -113.341 -113.868 -114.407 -114.687 -115.472 -115.532 -115.836 -116.165 -116.82 -117.176 -117.57 -118.01 -118.508 -119.083 -119.826 -122.545 -9 ,11582 ,TETRA ,17604261,Sun Nov 28 17:17:39 CET,Sun Nov 28 19:07:29 CET,0.0 3.563 4.219 4.633 4.926 5.121 5.272 5.431 5.673 5.753 5.829 5.601 6.019 6.052 6.118 6.177 6.217 6.237 6.26 6.263 6.244 6.215 6.19 6.146 6.072 5.982 5.887 5.776 5.612 5.457 5.295 5.037 4.749 4.454 4.092 3.649 3.205 2.677 2.047 1.33 0.455 -0.612 -1.956 -3.494 -5.446 -7.859 -10.981 -14.939 -20.415 -28.034 -39.14 -50.819 -59.566 -66.537 -72.099 -76.773 -80.699 -84.033 -86.743 -89.367 -91.538 -93.387 -95.101 -96.688 -98.142 -99.425 -100.719 -101.836 -102.783 -103.765 -104.752 -105.547 -106.355 -107.179 -107.799 -108.427 -109.076 -109.735 -110.397 -110.841 -111.296 -112.013 -112.515 -113.026 -113.281 -113.798 -114.357 -114.937 -115.214 -116.001 -116.119 -116.433 -116.752 -117.46 -117.849 -118.265 -118.684 -119.16 -119.786 -120.603 -123.858 -10 ,25490 ,TETRA ,17604262,Sun Nov 28 17:20:37 CET,Sun Nov 28 19:10:28 CET,0.0 3.932 4.509 4.939 5.252 5.475 5.641 5.786 6.038 6.139 6.22 5.997 6.433 6.493 6.572 6.616 6.66 6.666 6.67 6.68 6.672 6.659 6.653 6.623 6.557 6.459 6.367 6.276 6.124 5.943 5.755 5.517 5.257 4.983 4.628 4.172 3.694 3.145 2.5 1.756 0.899 -0.164 -1.471 -2.924 -4.808 -7.165 -10.281 -14.223 -19.437 -26.703 -37.827 -49.778 -58.665 -65.649 -71.208 -75.854 -79.7 -83.018 -85.741 -88.345 -90.524 -92.393 -94.101 -95.657 -97.076 -98.344 -99.64 -100.777 -101.741 -102.718 -103.719 -104.545 -105.38 -106.21 -106.844 -107.502 -108.162 -108.821 -109.512 -109.999 -110.498 -111.248 -111.744 -112.235 -112.481 -112.976 -113.49 -114.028 -114.306 -115.095 -115.172 -115.474 -115.782 -116.415 -116.777 -117.173 -117.566 -118.01 -118.552 -119.297 -122.199 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 68c0a22a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11665 ,TETRA ,17604263,Sun Nov 28 17:20:40 CET,Sun Nov 28 19:10:28 CET,0.0 1.129 1.458 1.709 1.898 2.082 2.245 2.381 2.642 2.767 2.883 2.715 3.18 3.272 3.455 3.622 3.778 3.856 4.016 4.173 4.384 4.515 4.643 4.825 4.997 5.173 5.344 5.506 5.727 5.943 6.147 6.393 6.635 6.872 7.149 7.465 7.776 8.111 8.468 8.848 9.247 9.704 10.233 10.748 11.329 11.987 12.748 13.562 14.562 15.719 16.899 17.603 17.803 17.757 17.565 17.312 17.065 16.825 16.585 16.316 16.043 15.776 15.499 15.229 14.986 14.754 14.523 14.311 14.109 13.891 13.663 13.463 13.24 13.01 12.831 12.632 12.435 12.231 12.003 11.84 11.683 11.464 11.308 11.115 11.013 10.806 10.582 10.358 10.239 9.754 9.853 9.704 9.534 9.153 8.942 8.7 8.41 8.093 7.705 7.09 5.401 -2 ,18196 ,TETRA ,17604264,Sun Nov 28 17:21:37 CET,Sun Nov 28 19:11:02 CET,0.0 1.05 1.329 1.548 1.725 1.887 2.045 2.188 2.45 2.565 2.669 2.498 2.968 3.062 3.23 3.388 3.552 3.63 3.777 3.919 4.127 4.255 4.375 4.553 4.73 4.901 5.071 5.236 5.447 5.651 5.855 6.106 6.345 6.577 6.862 7.195 7.504 7.838 8.199 8.575 8.968 9.402 9.922 10.464 11.103 11.822 12.654 13.559 14.555 15.68 16.806 17.411 17.555 17.458 17.252 17.02 16.746 16.445 16.145 15.839 15.58 15.326 15.064 14.804 14.563 14.336 14.079 13.82 13.605 13.385 13.143 12.961 12.763 12.533 12.355 12.172 11.96 11.726 11.487 11.324 11.152 10.885 10.698 10.497 10.386 10.153 9.927 9.691 9.564 9.067 9.096 8.909 8.708 8.269 8.008 7.733 7.443 7.085 6.566 5.885 2.465 -3 ,23116 ,TETRA ,17604265,Sun Nov 28 17:21:38 CET,Sun Nov 28 19:10:26 CET,0.0 1.312 1.633 1.85 2.035 2.194 2.348 2.493 2.732 2.838 2.943 2.779 3.25 3.345 3.515 3.681 3.846 3.929 4.086 4.239 4.471 4.606 4.729 4.918 5.115 5.31 5.499 5.682 5.928 6.16 6.374 6.644 6.906 7.158 7.441 7.751 8.053 8.39 8.757 9.15 9.555 10.009 10.566 11.135 11.765 12.442 13.226 14.099 15.069 16.079 17.098 17.664 17.736 17.661 17.505 17.243 16.984 16.724 16.45 16.138 15.872 15.62 15.335 15.073 14.839 14.613 14.366 14.149 13.968 13.774 13.542 13.318 13.09 12.872 12.711 12.546 12.363 12.161 11.971 11.841 11.686 11.433 11.253 11.076 10.987 10.8 10.588 10.339 10.215 9.729 9.774 9.621 9.45 9.045 8.814 8.545 8.241 7.88 7.446 6.902 4.638 -4 ,4686 ,TETRA ,17604266,Sun Nov 28 17:30:37 CET,Sun Nov 28 19:19:44 CET,0.0 0.937 1.238 1.478 1.684 1.85 1.99 2.112 2.351 2.468 2.576 2.403 2.877 2.974 3.163 3.338 3.497 3.573 3.721 3.859 4.047 4.176 4.308 4.502 4.686 4.865 5.034 5.196 5.411 5.626 5.841 6.109 6.364 6.604 6.889 7.216 7.53 7.881 8.25 8.63 9.02 9.454 9.965 10.489 11.107 11.809 12.6 13.467 14.458 15.512 16.525 17.153 17.36 17.322 17.183 16.951 16.69 16.396 16.088 15.773 15.501 15.251 14.986 14.706 14.443 14.208 13.966 13.748 13.53 13.307 13.082 12.892 12.696 12.47 12.284 12.094 11.881 11.643 11.425 11.275 11.111 10.873 10.697 10.506 10.416 10.203 9.976 9.739 9.601 9.105 9.168 8.995 8.826 8.455 8.229 7.976 7.709 7.433 7.076 6.493 4.424 -5 ,20204 ,TETRA ,17604267,Sun Nov 28 17:30:40 CET,Sun Nov 28 19:20:03 CET,0.0 0.989 1.296 1.524 1.711 1.871 2.022 2.174 2.443 2.557 2.664 2.501 2.975 3.071 3.256 3.429 3.594 3.672 3.821 3.964 4.178 4.316 4.446 4.625 4.806 4.987 5.158 5.328 5.547 5.751 5.953 6.209 6.47 6.718 7.002 7.326 7.633 7.963 8.311 8.693 9.108 9.574 10.116 10.642 11.253 11.93 12.672 13.492 14.448 15.473 16.476 17.098 17.266 17.185 16.999 16.743 16.43 16.136 15.862 15.551 15.279 15.027 14.775 14.519 14.287 14.061 13.786 13.53 13.317 13.101 12.883 12.708 12.527 12.341 12.194 12.037 11.87 11.703 11.523 11.397 11.27 11.057 10.901 10.724 10.628 10.433 10.227 10.021 9.912 9.436 9.526 9.379 9.231 8.879 8.649 8.392 8.097 7.778 7.361 6.741 4.234 -6 ,18887 ,TETRA ,17604268,Sun Nov 28 17:38:37 CET,Sun Nov 28 19:19:21 CET,0.0 0.986 1.351 1.614 1.823 1.992 2.132 2.253 2.48 2.588 2.694 2.537 3.018 3.13 3.353 3.554 3.735 3.82 3.988 4.151 4.391 4.544 4.686 4.883 5.071 5.255 5.436 5.614 5.839 6.06 6.279 6.541 6.788 7.038 7.329 7.648 7.948 8.272 8.626 9.007 9.423 9.874 10.381 10.9 11.531 12.265 13.084 13.937 14.883 15.935 16.975 17.596 17.77 17.723 17.572 17.329 17.069 16.841 16.598 16.307 16.052 15.816 15.571 15.327 15.083 14.844 14.574 14.33 14.113 13.882 13.663 13.48 13.271 13.047 12.866 12.671 12.477 12.266 12.048 11.903 11.755 11.503 11.324 11.14 11.046 10.857 10.645 10.42 10.295 9.805 9.86 9.696 9.513 9.116 8.896 8.652 8.391 8.056 7.594 6.957 4.414 -7 ,32229 ,TETRA ,17604269,Sun Nov 28 17:40:37 CET,Sun Nov 28 19:16:57 CET,0.0 1.236 1.58 1.813 2.003 2.174 2.333 2.47 2.697 2.803 2.909 2.745 3.213 3.303 3.469 3.625 3.783 3.861 4.01 4.165 4.396 4.547 4.697 4.912 5.117 5.311 5.496 5.683 5.922 6.148 6.364 6.623 6.878 7.125 7.414 7.743 8.054 8.399 8.765 9.146 9.554 10.019 10.544 11.069 11.669 12.327 13.093 13.942 14.936 16.061 17.226 17.923 18.105 18.04 17.851 17.626 17.381 17.096 16.822 16.506 16.214 15.954 15.702 15.453 15.218 15.001 14.75 14.515 14.319 14.104 13.876 13.679 13.472 13.252 13.059 12.862 12.675 12.48 12.257 12.099 11.947 11.715 11.554 11.378 11.287 11.097 10.883 10.648 10.525 10.048 10.137 9.986 9.819 9.427 9.216 9.004 8.737 8.422 8.068 7.492 4.522 -8 ,29829 ,TETRA ,17604270,Sun Nov 28 17:42:37 CET,Sun Nov 28 19:17:29 CET,0.0 0.938 1.268 1.517 1.706 1.866 2.016 2.148 2.389 2.5 2.602 2.434 2.904 2.998 3.174 3.34 3.508 3.593 3.761 3.927 4.163 4.314 4.467 4.688 4.895 5.105 5.306 5.488 5.721 5.944 6.158 6.407 6.653 6.892 7.175 7.493 7.792 8.136 8.505 8.89 9.306 9.763 10.28 10.804 11.437 12.129 12.871 13.72 14.664 15.683 16.784 17.385 17.51 17.421 17.235 16.991 16.736 16.477 16.223 15.935 15.66 15.4 15.147 14.914 14.691 14.446 14.186 13.963 13.75 13.538 13.313 13.107 12.879 12.647 12.481 12.298 12.095 11.887 11.676 11.523 11.357 11.076 10.891 10.697 10.587 10.372 10.151 9.912 9.796 9.322 9.418 9.265 9.095 8.713 8.505 8.28 7.991 7.672 7.327 6.66 3.472 -9 ,19094 ,TETRA ,17604271,Sun Nov 28 17:42:37 CET,Sun Nov 28 19:27:22 CET,0.0 1.016 1.356 1.604 1.826 2.049 2.246 2.416 2.732 2.881 3.019 2.906 3.39 3.485 3.675 3.869 4.057 4.145 4.321 4.497 4.756 4.914 5.06 5.277 5.492 5.691 5.871 6.049 6.282 6.506 6.726 6.985 7.239 7.489 7.776 8.095 8.398 8.732 9.092 9.472 9.887 10.365 10.903 11.42 12.022 12.713 13.481 14.277 15.219 16.291 17.383 18.032 18.156 18.07 17.889 17.647 17.399 17.124 16.859 16.594 16.331 16.06 15.785 15.504 15.236 14.999 14.762 14.544 14.339 14.108 13.873 13.681 13.466 13.246 13.066 12.871 12.675 12.477 12.254 12.088 11.908 11.621 11.422 11.222 11.124 10.925 10.709 10.468 10.341 9.846 9.864 9.688 9.519 9.126 8.897 8.657 8.382 8.031 7.584 7.024 1.49 -10 ,26295 ,TETRA ,17604272,Sun Nov 28 17:47:39 CET,Sun Nov 28 19:30:28 CET,0.0 1.573 2.011 2.308 2.518 2.713 2.879 3.034 3.327 3.47 3.604 3.467 3.942 4.043 4.235 4.435 4.633 4.718 4.877 5.034 5.26 5.415 5.564 5.781 5.986 6.182 6.367 6.541 6.775 6.994 7.2 7.458 7.704 7.942 8.222 8.539 8.844 9.183 9.553 9.939 10.335 10.782 11.315 11.854 12.5 13.227 14.044 14.93 15.945 17.007 17.998 18.595 18.731 18.65 18.436 18.19 17.922 17.612 17.336 17.017 16.716 16.451 16.198 15.943 15.696 15.485 15.253 15.028 14.824 14.605 14.388 14.191 13.969 13.737 13.554 13.376 13.194 12.988 12.749 12.56 12.381 12.135 11.937 11.724 11.623 11.426 11.23 10.999 10.876 10.379 10.428 10.277 10.122 9.728 9.463 9.201 8.929 8.617 8.203 7.612 5.263 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt deleted file mode 100644 index b0e94bf8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10633 ,TETRA ,17604273,Sun Nov 28 17:47:39 CET,Sun Nov 28 19:31:48 CET,0.0 2.009 2.536 2.861 3.053 3.192 3.306 3.401 3.551 3.613 3.662 3.353 3.756 3.787 3.829 3.846 3.852 3.849 3.833 3.802 3.719 3.649 3.563 3.418 3.264 3.103 2.951 2.799 2.589 2.374 2.136 1.831 1.527 1.203 0.784 0.266 -0.259 -0.876 -1.584 -2.393 -3.316 -4.415 -5.811 -7.339 -9.261 -11.636 -14.679 -18.556 -23.771 -30.951 -41.674 -52.994 -61.398 -68.05 -73.384 -77.779 -81.357 -84.418 -86.931 -89.308 -91.277 -92.999 -94.595 -96.056 -97.376 -98.571 -99.764 -100.783 -101.659 -102.534 -103.412 -104.122 -104.835 -105.543 -106.078 -106.625 -107.184 -107.747 -108.31 -108.696 -109.089 -109.698 -110.106 -110.526 -110.746 -111.19 -111.638 -112.098 -112.338 -113.083 -113.075 -113.333 -113.594 -114.147 -114.453 -114.777 -115.115 -115.486 -115.911 -116.432 -118.202 -2 ,16571 ,TETRA ,17604274,Sun Nov 28 17:49:41 CET,Sun Nov 28 19:39:42 CET,0.0 1.5 1.879 2.134 2.318 2.488 2.624 2.731 2.894 2.96 3.022 2.737 3.144 3.164 3.175 3.186 3.191 3.179 3.146 3.114 3.038 2.978 2.915 2.811 2.7 2.586 2.448 2.308 2.136 1.931 1.691 1.392 1.094 0.791 0.413 -0.05 -0.572 -1.216 -1.929 -2.724 -3.634 -4.756 -6.172 -7.74 -9.741 -12.137 -15.209 -19.125 -24.369 -31.601 -42.423 -53.736 -62.02 -68.526 -73.727 -78.068 -81.629 -84.715 -87.275 -89.697 -91.683 -93.417 -95.008 -96.435 -97.73 -98.901 -100.109 -101.157 -102.037 -102.918 -103.805 -104.529 -105.271 -106.018 -106.575 -107.143 -107.717 -108.292 -108.882 -109.279 -109.686 -110.312 -110.738 -111.161 -111.37 -111.788 -112.215 -112.675 -112.919 -113.667 -113.672 -113.933 -114.193 -114.745 -115.034 -115.334 -115.669 -116.056 -116.501 -117.075 -119.08 -3 ,32343 ,TETRA ,17604275,Sun Nov 28 17:48:37 CET,Sun Nov 28 19:35:33 CET,0.0 3.095 3.574 3.867 4.068 4.242 4.392 4.503 4.68 4.754 4.827 4.572 4.992 5.033 5.097 5.147 5.161 5.153 5.128 5.088 5.03 4.98 4.911 4.805 4.68 4.552 4.429 4.283 4.072 3.868 3.661 3.397 3.11 2.811 2.446 1.984 1.489 0.899 0.229 -0.571 -1.518 -2.66 -4.074 -5.596 -7.55 -9.972 -13.046 -16.955 -22.168 -29.329 -40.033 -51.346 -59.737 -66.277 -71.449 -75.77 -79.352 -82.407 -84.898 -87.288 -89.277 -91.017 -92.635 -94.099 -95.399 -96.566 -97.757 -98.771 -99.626 -100.502 -101.386 -102.106 -102.846 -103.586 -104.138 -104.702 -105.279 -105.851 -106.436 -106.848 -107.268 -107.901 -108.337 -108.784 -109.013 -109.479 -109.938 -110.403 -110.648 -111.406 -111.453 -111.74 -112.019 -112.618 -112.946 -113.291 -113.66 -114.063 -114.531 -115.108 -117.917 -4 ,2221 ,TETRA ,17604276,Sun Nov 28 17:48:38 CET,Sun Nov 28 19:33:36 CET,0.0 2.239 2.619 2.864 3.06 3.24 3.389 3.509 3.692 3.765 3.831 3.554 3.956 3.991 4.053 4.073 4.081 4.082 4.078 4.054 3.983 3.926 3.861 3.76 3.646 3.516 3.378 3.234 3.047 2.855 2.655 2.38 2.074 1.766 1.382 0.908 0.396 -0.231 -0.957 -1.753 -2.652 -3.77 -5.177 -6.75 -8.743 -11.125 -14.143 -18.019 -23.291 -30.577 -41.328 -52.688 -61.088 -67.554 -72.72 -77.02 -80.559 -83.613 -86.105 -88.461 -90.411 -92.094 -93.649 -95.076 -96.349 -97.461 -98.596 -99.611 -100.457 -101.289 -102.124 -102.801 -103.485 -104.172 -104.705 -105.241 -105.778 -106.332 -106.891 -107.265 -107.651 -108.262 -108.681 -109.097 -109.304 -109.727 -110.175 -110.639 -110.869 -111.603 -111.576 -111.827 -112.085 -112.627 -112.92 -113.229 -113.574 -113.957 -114.365 -114.929 -117.257 -5 ,32268 ,TETRA ,17604277,Sun Nov 28 17:48:41 CET,Sun Nov 28 19:38:47 CET,0.0 2.393 2.806 3.07 3.273 3.425 3.531 3.618 3.753 3.803 3.841 3.519 3.914 3.925 3.93 3.914 3.892 3.885 3.853 3.808 3.74 3.688 3.633 3.537 3.429 3.317 3.189 3.049 2.852 2.631 2.389 2.082 1.769 1.437 1.028 0.55 0.046 -0.553 -1.265 -2.09 -2.975 -4.042 -5.423 -6.929 -8.868 -11.285 -14.363 -18.258 -23.441 -30.679 -41.439 -52.762 -61.127 -67.607 -72.772 -77.109 -80.67 -83.682 -86.164 -88.552 -90.525 -92.216 -93.774 -95.194 -96.494 -97.658 -98.809 -99.819 -100.71 -101.612 -102.513 -103.245 -103.982 -104.729 -105.297 -105.876 -106.445 -107.013 -107.607 -108.009 -108.417 -109.045 -109.475 -109.924 -110.153 -110.604 -111.085 -111.599 -111.844 -112.589 -112.616 -112.887 -113.177 -113.803 -114.141 -114.525 -114.938 -115.389 -115.881 -116.596 -119.021 -6 ,20800 ,TETRA ,17604278,Sun Nov 28 17:48:42 CET,Sun Nov 28 19:38:44 CET,0.0 2.356 2.761 3.045 3.272 3.425 3.544 3.65 3.855 3.937 3.994 3.685 4.084 4.103 4.122 4.139 4.146 4.141 4.134 4.118 4.063 4.014 3.969 3.877 3.757 3.632 3.489 3.332 3.124 2.917 2.707 2.425 2.113 1.802 1.403 0.9 0.39 -0.226 -0.946 -1.77 -2.702 -3.831 -5.247 -6.772 -8.733 -11.157 -14.252 -18.151 -23.36 -30.615 -41.343 -52.595 -60.88 -67.332 -72.471 -76.746 -80.283 -83.322 -85.807 -88.169 -90.133 -91.822 -93.403 -94.852 -96.146 -97.28 -98.427 -99.448 -100.309 -101.17 -102.044 -102.75 -103.464 -104.187 -104.745 -105.317 -105.886 -106.47 -107.081 -107.492 -107.918 -108.575 -109.013 -109.452 -109.677 -110.134 -110.61 -111.1 -111.344 -112.089 -112.086 -112.343 -112.597 -113.117 -113.416 -113.752 -114.088 -114.439 -114.845 -115.35 -117.387 -7 ,666 ,TETRA ,17604279,Sun Nov 28 17:48:38 CET,Sun Nov 28 19:25:25 CET,0.0 1.955 2.405 2.664 2.825 2.991 3.138 3.246 3.416 3.479 3.523 3.223 3.619 3.622 3.614 3.606 3.591 3.574 3.539 3.508 3.449 3.401 3.35 3.269 3.166 3.047 2.939 2.819 2.615 2.387 2.158 1.856 1.535 1.204 0.804 0.313 -0.189 -0.774 -1.476 -2.295 -3.224 -4.345 -5.747 -7.282 -9.237 -11.651 -14.742 -18.608 -23.835 -31.083 -41.835 -53.19 -61.529 -68.002 -73.177 -77.518 -81.085 -84.134 -86.647 -89.081 -91.089 -92.793 -94.362 -95.787 -97.073 -98.213 -99.376 -100.397 -101.245 -102.109 -102.99 -103.707 -104.455 -105.201 -105.762 -106.337 -106.924 -107.525 -108.133 -108.537 -108.945 -109.572 -110.006 -110.449 -110.669 -111.129 -111.598 -112.076 -112.325 -113.079 -113.103 -113.374 -113.653 -114.233 -114.551 -114.888 -115.24 -115.634 -116.091 -116.66 -118.545 -8 ,7993 ,TETRA ,17604280,Sun Nov 28 17:48:39 CET,Sun Nov 28 19:33:31 CET,0.0 2.053 2.448 2.703 2.947 3.136 3.272 3.388 3.571 3.642 3.694 3.38 3.785 3.826 3.861 3.875 3.874 3.871 3.854 3.819 3.738 3.671 3.599 3.493 3.389 3.263 3.112 2.96 2.779 2.59 2.374 2.085 1.767 1.432 1.022 0.531 0.014 -0.59 -1.269 -2.044 -2.962 -4.092 -5.483 -7.036 -9.047 -11.492 -14.586 -18.508 -23.762 -30.997 -41.701 -52.992 -61.386 -67.895 -73.094 -77.531 -81.2 -84.274 -86.77 -89.198 -91.214 -92.944 -94.518 -95.925 -97.214 -98.356 -99.482 -100.469 -101.312 -102.15 -103.006 -103.715 -104.43 -105.144 -105.676 -106.212 -106.769 -107.331 -107.89 -108.265 -108.653 -109.262 -109.669 -110.08 -110.287 -110.712 -111.16 -111.623 -111.856 -112.6 -112.597 -112.854 -113.115 -113.644 -113.917 -114.205 -114.511 -114.842 -115.265 -115.83 -117.533 -9 ,29167 ,TETRA ,17604281,Sun Nov 28 17:49:41 CET,Sun Nov 28 19:39:52 CET,0.0 2.753 3.184 3.478 3.695 3.864 3.997 4.106 4.277 4.326 4.368 4.079 4.482 4.512 4.557 4.58 4.595 4.594 4.57 4.533 4.452 4.394 4.348 4.258 4.136 3.997 3.854 3.713 3.499 3.272 3.043 2.75 2.436 2.124 1.738 1.232 0.72 0.13 -0.588 -1.412 -2.303 -3.386 -4.767 -6.259 -8.178 -10.543 -13.535 -17.355 -22.484 -29.567 -40.22 -51.575 -59.97 -66.504 -71.683 -75.974 -79.485 -82.463 -84.906 -87.249 -89.192 -90.866 -92.418 -93.864 -95.173 -96.321 -97.466 -98.443 -99.28 -100.147 -101.026 -101.735 -102.456 -103.187 -103.735 -104.293 -104.877 -105.465 -106.052 -106.452 -106.861 -107.48 -107.893 -108.311 -108.523 -108.945 -109.38 -109.824 -110.048 -110.783 -110.803 -111.069 -111.318 -111.848 -112.136 -112.453 -112.795 -113.167 -113.62 -114.221 -116.283 -10 ,17557 ,TETRA ,17604282,Sun Nov 28 17:48:39 CET,Sun Nov 28 19:26:19 CET,0.0 1.811 2.158 2.373 2.534 2.651 2.728 2.783 2.896 2.945 2.982 2.651 3.037 3.044 3.044 3.033 3.009 2.986 2.927 2.876 2.799 2.736 2.678 2.573 2.448 2.324 2.19 2.047 1.852 1.645 1.431 1.147 0.856 0.566 0.194 -0.268 -0.743 -1.315 -2.002 -2.804 -3.729 -4.85 -6.275 -7.839 -9.809 -12.21 -15.293 -19.214 -24.467 -31.767 -42.708 -54.113 -62.44 -68.972 -74.215 -78.594 -82.18 -85.301 -87.92 -90.379 -92.39 -94.1 -95.653 -97.081 -98.38 -99.533 -100.702 -101.741 -102.633 -103.534 -104.429 -105.149 -105.888 -106.627 -107.181 -107.748 -108.32 -108.902 -109.497 -109.895 -110.302 -110.937 -111.377 -111.823 -112.046 -112.501 -112.98 -113.469 -113.711 -114.452 -114.446 -114.711 -114.974 -115.518 -115.811 -116.14 -116.505 -116.907 -117.352 -117.921 -120.168 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 3cfa79d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14724 ,TETRA ,17604283,Sun Nov 28 17:48:40 CET,Sun Nov 28 19:34:40 CET,0.0 1.411 1.874 2.237 2.556 2.828 3.039 3.205 3.535 3.677 3.805 3.706 4.206 4.332 4.575 4.79 4.996 5.096 5.29 5.473 5.735 5.899 6.063 6.297 6.511 6.733 6.946 7.149 7.417 7.668 7.903 8.197 8.477 8.738 9.052 9.412 9.764 10.166 10.606 11.062 11.531 12.063 12.67 13.256 13.94 14.753 15.709 16.755 17.939 19.29 20.858 21.908 22.372 22.578 22.574 22.479 22.329 22.151 21.986 21.814 21.645 21.472 21.289 21.09 20.882 20.699 20.505 20.294 20.108 19.918 19.695 19.506 19.306 19.1 18.943 18.768 18.574 18.372 18.162 18.017 17.86 17.608 17.423 17.207 17.086 16.838 16.584 16.3 16.142 15.628 15.679 15.503 15.315 14.934 14.727 14.513 14.257 13.916 13.465 12.862 9.85 -2 ,11121 ,TETRA ,17604284,Sun Nov 28 17:48:40 CET,Sun Nov 28 19:32:56 CET,0.0 1.18 1.558 1.872 2.114 2.313 2.506 2.679 2.994 3.14 3.267 3.129 3.618 3.728 3.932 4.12 4.31 4.408 4.601 4.771 5.005 5.16 5.313 5.555 5.783 5.989 6.198 6.41 6.674 6.915 7.161 7.477 7.781 8.064 8.391 8.753 9.089 9.47 9.877 10.307 10.767 11.281 11.873 12.495 13.247 14.057 14.978 16.019 17.23 18.598 20.143 21.26 21.751 21.933 21.932 21.829 21.685 21.496 21.288 21.079 20.889 20.699 20.518 20.329 20.13 19.947 19.751 19.534 19.337 19.154 18.969 18.814 18.634 18.425 18.266 18.115 17.942 17.735 17.521 17.369 17.212 16.97 16.797 16.612 16.518 16.323 16.089 15.816 15.675 15.17 15.18 14.991 14.805 14.398 14.137 13.832 13.443 13.024 12.567 11.79 8.485 -3 ,6319 ,TETRA ,17604285,Sun Nov 28 17:48:40 CET,Sun Nov 28 19:37:50 CET,0.0 2.072 2.484 2.799 3.024 3.209 3.398 3.569 3.852 3.976 4.087 3.936 4.419 4.531 4.774 4.998 5.222 5.334 5.542 5.73 5.976 6.125 6.267 6.475 6.681 6.879 7.066 7.247 7.493 7.725 7.943 8.215 8.48 8.734 9.032 9.368 9.694 10.072 10.486 10.927 11.408 11.944 12.56 13.173 13.907 14.732 15.674 16.784 18.066 19.51 21.119 22.179 22.586 22.701 22.66 22.552 22.422 22.245 22.063 21.868 21.697 21.519 21.306 21.094 20.885 20.682 20.469 20.291 20.128 19.952 19.763 19.589 19.402 19.193 19.021 18.854 18.681 18.511 18.321 18.181 18.058 17.845 17.674 17.487 17.376 17.149 16.937 16.707 16.586 16.093 16.139 15.981 15.815 15.41 15.169 14.92 14.667 14.37 13.989 13.402 9.914 -4 ,8163 ,TETRA ,17604286,Sun Nov 28 17:48:41 CET,Sun Nov 28 19:37:34 CET,0.0 1.192 1.581 1.826 2.013 2.168 2.312 2.459 2.746 2.872 2.989 2.837 3.326 3.434 3.639 3.828 4.007 4.094 4.274 4.437 4.669 4.827 4.976 5.215 5.481 5.743 5.989 6.214 6.486 6.746 6.988 7.273 7.553 7.826 8.129 8.484 8.856 9.258 9.666 10.118 10.6 11.121 11.749 12.399 13.143 14.003 14.962 15.995 17.224 18.666 20.318 21.433 21.914 22.103 22.113 22.064 21.937 21.744 21.577 21.385 21.186 20.993 20.773 20.554 20.356 20.18 19.988 19.801 19.629 19.429 19.211 19.038 18.861 18.685 18.548 18.396 18.237 18.071 17.896 17.773 17.645 17.427 17.255 17.073 16.986 16.812 16.591 16.358 16.23 15.727 15.764 15.592 15.422 15.058 14.833 14.598 14.339 14.032 13.616 12.98 9.003 -5 ,13907 ,TETRA ,17604287,Sun Nov 28 17:48:40 CET,Sun Nov 28 19:30:30 CET,0.0 1.005 1.358 1.657 1.904 2.09 2.251 2.404 2.709 2.863 2.994 2.868 3.366 3.482 3.718 3.961 4.203 4.319 4.54 4.749 5.048 5.225 5.378 5.612 5.842 6.053 6.249 6.442 6.712 6.98 7.223 7.519 7.805 8.075 8.396 8.748 9.084 9.46 9.867 10.298 10.76 11.281 11.885 12.517 13.261 14.076 14.994 15.997 17.204 18.713 20.448 21.642 22.181 22.374 22.372 22.257 22.091 21.935 21.788 21.575 21.349 21.16 20.952 20.746 20.56 20.374 20.174 19.973 19.78 19.581 19.37 19.19 18.991 18.782 18.623 18.44 18.236 18.037 17.819 17.657 17.487 17.217 17.018 16.811 16.711 16.487 16.26 16.027 15.897 15.402 15.483 15.329 15.151 14.79 14.585 14.318 14.004 13.672 13.274 12.596 9.418 -6 ,21251 ,TETRA ,17604288,Sun Nov 28 17:49:43 CET,Sun Nov 28 19:38:51 CET,0.0 1.352 1.802 2.138 2.395 2.643 2.864 3.044 3.379 3.537 3.673 3.538 4.037 4.163 4.388 4.585 4.761 4.852 5.046 5.227 5.483 5.647 5.815 6.057 6.272 6.485 6.695 6.891 7.138 7.388 7.656 7.996 8.3 8.573 8.881 9.234 9.582 9.957 10.367 10.818 11.28 11.792 12.413 13.065 13.83 14.675 15.647 16.697 17.832 19.126 20.685 21.824 22.338 22.533 22.535 22.476 22.345 22.139 21.935 21.714 21.506 21.292 21.087 20.888 20.672 20.467 20.238 20.027 19.859 19.662 19.433 19.265 19.091 18.871 18.704 18.543 18.375 18.192 17.988 17.847 17.699 17.45 17.279 17.115 17.024 16.826 16.611 16.387 16.274 15.795 15.849 15.69 15.505 15.067 14.819 14.53 14.219 13.909 13.465 12.663 8.535 -7 ,26361 ,TETRA ,17604289,Sun Nov 28 17:49:39 CET,Sun Nov 28 19:39:12 CET,0.0 1.327 1.752 2.019 2.239 2.433 2.594 2.754 3.075 3.238 3.4 3.327 3.85 3.981 4.213 4.433 4.641 4.743 4.937 5.115 5.394 5.595 5.775 6.011 6.257 6.486 6.699 6.906 7.169 7.418 7.66 7.965 8.243 8.502 8.814 9.169 9.514 9.905 10.315 10.739 11.208 11.732 12.326 12.932 13.646 14.454 15.371 16.349 17.477 18.821 20.382 21.533 22.088 22.351 22.363 22.267 22.134 21.957 21.782 21.586 21.393 21.184 20.971 20.759 20.542 20.341 20.125 19.94 19.778 19.588 19.389 19.232 19.057 18.857 18.686 18.503 18.316 18.112 17.882 17.713 17.539 17.261 17.07 16.87 16.761 16.54 16.295 16.025 15.884 15.378 15.393 15.21 15.02 14.611 14.38 14.113 13.788 13.429 13.008 12.331 6.859 -8 ,9300 ,TETRA ,17604290,Sun Nov 28 17:49:41 CET,Sun Nov 28 19:38:56 CET,0.0 1.151 1.596 1.856 2.094 2.3 2.473 2.647 2.967 3.106 3.229 3.069 3.546 3.643 3.832 4.016 4.191 4.28 4.458 4.633 4.898 5.059 5.21 5.429 5.637 5.847 6.046 6.239 6.512 6.763 6.994 7.285 7.576 7.864 8.2 8.563 8.903 9.287 9.702 10.154 10.614 11.133 11.755 12.361 13.035 13.818 14.746 15.754 16.886 18.181 19.715 20.848 21.364 21.565 21.575 21.46 21.301 21.113 20.904 20.663 20.465 20.288 20.09 19.89 19.683 19.457 19.221 19.027 18.853 18.662 18.454 18.281 18.104 17.897 17.741 17.562 17.361 17.167 16.958 16.811 16.661 16.422 16.246 16.063 15.964 15.752 15.514 15.259 15.131 14.632 14.66 14.474 14.285 13.883 13.662 13.429 13.147 12.771 12.313 11.643 8.764 -9 ,23679 ,TETRA ,17604291,Sun Nov 28 17:49:39 CET,Sun Nov 28 19:39:06 CET,0.0 1.232 1.582 1.834 2.041 2.228 2.393 2.548 2.832 2.955 3.07 2.918 3.401 3.499 3.723 3.954 4.148 4.249 4.452 4.628 4.875 5.029 5.178 5.402 5.614 5.814 6.02 6.226 6.486 6.739 6.982 7.267 7.546 7.827 8.148 8.497 8.837 9.193 9.581 10.006 10.446 10.944 11.537 12.154 12.897 13.737 14.709 15.791 17.02 18.417 20.012 21.152 21.675 21.863 21.847 21.783 21.654 21.464 21.291 21.092 20.886 20.673 20.448 20.227 20.013 19.818 19.596 19.377 19.19 18.998 18.802 18.638 18.464 18.278 18.134 17.988 17.824 17.649 17.455 17.318 17.175 16.921 16.732 16.55 16.454 16.274 16.089 15.831 15.678 15.158 15.165 14.989 14.814 14.396 14.16 13.923 13.648 13.293 12.845 12.229 9.397 -10 ,11495 ,TETRA ,17604292,Sun Nov 28 17:49:41 CET,Sun Nov 28 19:39:00 CET,0.0 1.325 1.702 2.038 2.312 2.533 2.701 2.872 3.194 3.322 3.44 3.304 3.79 3.89 4.084 4.27 4.455 4.545 4.712 4.876 5.111 5.259 5.405 5.616 5.824 6.031 6.221 6.401 6.642 6.883 7.12 7.4 7.671 7.936 8.235 8.581 8.928 9.316 9.754 10.216 10.695 11.228 11.846 12.483 13.222 14.04 14.987 16.008 17.168 18.455 19.78 20.733 21.139 21.294 21.337 21.299 21.183 21.015 20.854 20.681 20.49 20.279 20.068 19.843 19.624 19.424 19.212 19.02 18.845 18.642 18.409 18.226 18.028 17.813 17.65 17.472 17.284 17.089 16.88 16.722 16.547 16.253 16.014 15.783 15.682 15.459 15.207 14.938 14.797 14.294 14.282 14.083 13.906 13.524 13.293 13.038 12.732 12.366 11.927 11.191 6.656 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_19_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_19_23.txt deleted file mode 100644 index cd9b2f92..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_19_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1128 ,TETRA ,17621016,Tue Nov 30 14:23:09 CET,Tue Nov 30 16:52:41 CET,0.0 2.734 3.363 3.818 4.194 4.52 4.792 5.031 5.496 5.714 5.909 6.198 6.412 6.567 6.864 7.137 7.384 7.5 7.74 7.968 8.284 8.49 8.689 8.971 9.237 9.5 9.755 9.996 10.3 10.592 10.877 11.226 11.563 11.888 12.26 12.668 13.062 13.492 13.956 14.455 14.992 15.612 16.348 17.108 18.004 19.01 20.156 21.453 23.062 25.031 27.579 29.873 31.27 32.206 32.829 33.254 33.51 33.657 33.743 33.786 33.79 33.757 33.7 33.638 33.566 33.483 33.374 33.277 33.203 33.127 33.014 32.894 32.774 32.644 32.532 32.416 32.29 32.149 32.0 31.893 31.782 31.591 31.452 31.313 31.241 31.085 30.902 30.688 30.577 30.431 30.205 30.066 29.917 29.549 29.337 29.102 28.827 28.493 28.051 27.427 24.855 -2 ,14140 ,TETRA ,17621017,Tue Nov 30 14:23:08 CET,Tue Nov 30 16:43:31 CET,0.0 2.972 3.574 4.015 4.385 4.709 4.994 5.244 5.662 5.853 6.04 6.332 6.546 6.698 6.991 7.266 7.523 7.642 7.877 8.117 8.459 8.667 8.865 9.154 9.431 9.702 9.959 10.196 10.5 10.798 11.089 11.442 11.78 12.1 12.465 12.876 13.281 13.722 14.193 14.709 15.262 15.895 16.642 17.395 18.268 19.26 20.462 21.881 23.576 25.579 28.069 30.247 31.651 32.545 33.065 33.394 33.571 33.736 33.908 34.039 34.111 34.153 34.169 34.147 34.099 34.036 33.955 33.863 33.759 33.662 33.565 33.468 33.367 33.256 33.161 33.058 32.962 32.859 32.72 32.619 32.51 32.326 32.195 32.058 31.983 31.811 31.632 31.447 31.342 31.194 30.962 30.815 30.655 30.295 30.078 29.83 29.539 29.192 28.757 28.152 25.247 -3 ,23421 ,TETRA ,17621018,Tue Nov 30 14:23:08 CET,Tue Nov 30 16:44:19 CET,0.0 2.788 3.378 3.821 4.187 4.484 4.758 5.011 5.467 5.677 5.864 6.138 6.356 6.509 6.804 7.092 7.364 7.491 7.725 7.959 8.306 8.516 8.725 9.024 9.297 9.556 9.816 10.069 10.381 10.692 10.989 11.34 11.686 12.015 12.387 12.814 13.226 13.688 14.18 14.69 15.221 15.834 16.583 17.354 18.27 19.285 20.484 21.916 23.7 25.876 28.517 30.868 32.309 33.245 33.921 34.398 34.723 34.951 35.095 35.179 35.204 35.209 35.191 35.139 35.066 35.004 34.931 34.843 34.749 34.643 34.52 34.407 34.282 34.139 34.021 33.891 33.756 33.618 33.455 33.331 33.209 33.009 32.859 32.696 32.609 32.421 32.22 32.0 31.88 31.712 31.45 31.296 31.125 30.752 30.537 30.289 30.016 29.678 29.238 28.593 25.368 -4 ,20094 ,TETRA ,17621019,Tue Nov 30 14:25:18 CET,Tue Nov 30 16:54:24 CET,0.0 2.27 2.89 3.318 3.68 3.974 4.235 4.478 4.899 5.088 5.268 5.554 5.767 5.921 6.214 6.474 6.724 6.849 7.087 7.308 7.629 7.833 8.031 8.315 8.587 8.847 9.094 9.329 9.641 9.943 10.23 10.579 10.918 11.244 11.617 12.041 12.446 12.885 13.364 13.903 14.496 15.14 15.871 16.617 17.515 18.52 19.683 21.029 22.62 24.498 26.944 29.124 30.382 31.1 31.479 31.697 31.836 31.902 31.903 31.897 31.877 31.828 31.749 31.664 31.575 31.468 31.334 31.198 31.077 30.958 30.83 30.723 30.6 30.456 30.336 30.204 30.058 29.908 29.758 29.654 29.54 29.342 29.196 29.04 28.955 28.781 28.603 28.403 28.293 28.141 27.915 27.764 27.593 27.221 27.003 26.759 26.49 26.167 25.714 25.084 23.299 -5 ,25818 ,TETRA ,17621020,Tue Nov 30 14:25:18 CET,Tue Nov 30 16:53:47 CET,0.0 4.224 4.869 5.317 5.675 5.99 6.263 6.492 6.895 7.088 7.276 7.568 7.783 7.942 8.235 8.502 8.766 8.895 9.146 9.378 9.695 9.894 10.085 10.364 10.635 10.893 11.146 11.398 11.723 12.036 12.34 12.701 13.048 13.387 13.78 14.222 14.636 15.094 15.59 16.113 16.679 17.316 18.045 18.802 19.722 20.753 21.961 23.366 25.075 27.138 29.783 32.079 33.469 34.397 35.028 35.479 35.794 36.017 36.139 36.167 36.128 36.058 35.973 35.887 35.806 35.728 35.625 35.506 35.397 35.293 35.18 35.074 34.958 34.82 34.702 34.585 34.459 34.313 34.161 34.048 33.922 33.705 33.555 33.402 33.316 33.125 32.929 32.726 32.616 32.476 32.255 32.11 31.962 31.617 31.416 31.199 30.944 30.618 30.15 29.498 25.999 -6 ,29975 ,TETRA ,17621021,Tue Nov 30 14:24:05 CET,Tue Nov 30 16:48:39 CET,0.0 2.529 3.143 3.625 4.021 4.349 4.626 4.874 5.316 5.524 5.72 6.011 6.227 6.385 6.679 6.95 7.204 7.33 7.586 7.831 8.157 8.358 8.555 8.846 9.129 9.396 9.646 9.881 10.183 10.486 10.784 11.138 11.472 11.795 12.173 12.604 13.02 13.489 13.995 14.522 15.077 15.695 16.434 17.209 18.119 19.132 20.334 21.695 23.33 25.394 28.04 30.413 31.926 32.911 33.534 33.928 34.194 34.404 34.554 34.669 34.737 34.778 34.794 34.773 34.724 34.648 34.565 34.5 34.423 34.326 34.23 34.155 34.055 33.926 33.823 33.719 33.602 33.47 33.335 33.233 33.111 32.914 32.763 32.598 32.515 32.336 32.142 31.931 31.815 31.658 31.426 31.276 31.108 30.751 30.534 30.278 30.001 29.668 29.216 28.591 26.15 -7 ,31608 ,TETRA ,17621022,Tue Nov 30 14:25:19 CET,Tue Nov 30 16:51:22 CET,0.0 2.608 3.226 3.735 4.135 4.433 4.7 4.932 5.365 5.574 5.767 6.067 6.29 6.441 6.725 6.993 7.247 7.371 7.611 7.837 8.155 8.36 8.561 8.847 9.12 9.393 9.659 9.907 10.223 10.528 10.815 11.168 11.51 11.822 12.187 12.608 13.005 13.434 13.904 14.413 14.951 15.569 16.308 17.049 17.911 18.888 20.034 21.35 22.95 24.884 27.352 29.459 30.665 31.389 31.799 32.077 32.232 32.29 32.322 32.359 32.373 32.351 32.31 32.243 32.16 32.073 31.962 31.84 31.72 31.602 31.483 31.369 31.248 31.112 30.993 30.873 30.748 30.602 30.44 30.332 30.218 30.025 29.883 29.735 29.657 29.483 29.292 29.088 28.978 28.831 28.589 28.432 28.259 27.875 27.656 27.411 27.117 26.765 26.343 25.678 21.97 -8 ,19467 ,TETRA ,17621023,Tue Nov 30 14:25:19 CET,Tue Nov 30 16:54:47 CET,0.0 2.837 3.541 4.023 4.415 4.733 5.001 5.25 5.691 5.888 6.074 6.359 6.576 6.726 7.015 7.296 7.556 7.679 7.916 8.135 8.45 8.659 8.866 9.15 9.411 9.678 9.938 10.184 10.503 10.817 11.121 11.473 11.815 12.148 12.52 12.948 13.362 13.818 14.31 14.824 15.374 16.007 16.751 17.506 18.396 19.412 20.623 21.998 23.623 25.615 28.181 30.423 31.735 32.553 33.077 33.396 33.646 33.861 33.977 34.04 34.062 34.052 34.03 34.005 33.986 33.96 33.902 33.823 33.744 33.663 33.569 33.475 33.368 33.246 33.138 33.018 32.899 32.767 32.609 32.495 32.373 32.176 32.03 31.864 31.776 31.588 31.393 31.187 31.073 30.924 30.7 30.552 30.396 30.052 29.848 29.606 29.309 28.959 28.539 27.924 25.088 -9 ,19192 ,TETRA ,17621024,Tue Nov 30 14:25:19 CET,Tue Nov 30 16:51:08 CET,0.0 2.608 3.227 3.636 3.977 4.297 4.589 4.831 5.273 5.474 5.655 5.935 6.15 6.299 6.58 6.841 7.086 7.205 7.439 7.664 7.984 8.183 8.375 8.653 8.922 9.178 9.431 9.679 9.996 10.303 10.588 10.937 11.275 11.602 11.983 12.411 12.825 13.275 13.749 14.265 14.818 15.445 16.19 16.918 17.779 18.783 19.959 21.324 23.007 25.044 27.636 29.953 31.335 32.212 32.813 33.256 33.591 33.839 33.982 34.092 34.137 34.115 34.062 34.002 33.953 33.91 33.846 33.76 33.673 33.585 33.482 33.383 33.275 33.154 33.041 32.915 32.79 32.664 32.533 32.433 32.321 32.137 32.001 31.846 31.76 31.567 31.364 31.144 31.019 30.855 30.603 30.456 30.306 29.97 29.772 29.521 29.226 28.895 28.489 27.874 25.669 -10 ,25308 ,TETRA ,17621025,Tue Nov 30 14:30:45 CET,Tue Nov 30 16:58:53 CET,0.0 2.475 3.104 3.548 3.903 4.22 4.494 4.733 5.17 5.368 5.547 5.82 6.037 6.187 6.487 6.762 7.007 7.129 7.37 7.603 7.941 8.153 8.348 8.627 8.892 9.151 9.397 9.64 9.956 10.253 10.532 10.864 11.189 11.517 11.893 12.313 12.721 13.166 13.661 14.192 14.742 15.363 16.09 16.808 17.651 18.622 19.766 21.086 22.673 24.631 27.111 29.229 30.404 31.061 31.526 31.888 32.115 32.233 32.296 32.317 32.293 32.261 32.221 32.163 32.077 31.985 31.892 31.796 31.693 31.57 31.423 31.303 31.181 31.044 30.932 30.808 30.675 30.537 30.387 30.271 30.143 29.945 29.8 29.646 29.567 29.384 29.179 28.963 28.848 28.692 28.457 28.314 28.16 27.796 27.586 27.353 27.079 26.761 26.348 25.768 23.683 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_19.txt deleted file mode 100644 index 97399b79..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27483 ,TETRA ,17621026,Tue Nov 30 14:30:48 CET,Tue Nov 30 16:58:56 CET,0.0 2.805 3.434 3.872 4.214 4.5 4.755 4.977 5.362 5.53 5.682 5.907 6.093 6.217 6.451 6.673 6.878 6.975 7.159 7.33 7.581 7.737 7.879 8.074 8.263 8.453 8.637 8.809 9.019 9.215 9.396 9.614 9.829 10.028 10.245 10.483 10.716 10.972 11.236 11.509 11.787 12.081 12.417 12.757 13.135 13.524 13.93 14.341 14.781 15.18 15.405 15.319 15.002 14.6 14.206 13.792 13.384 12.998 12.658 12.279 11.913 11.595 11.307 11.029 10.761 10.502 10.208 9.938 9.707 9.46 9.183 8.949 8.714 8.469 8.275 8.081 7.878 7.665 7.432 7.266 7.089 6.811 6.627 6.435 6.324 6.043 5.736 5.433 5.278 5.053 4.713 4.487 4.269 3.826 3.574 3.296 2.97 2.577 2.074 1.346 -1.472 -2 ,21615 ,TETRA ,17621027,Tue Nov 30 14:30:45 CET,Tue Nov 30 16:58:17 CET,0.0 2.91 3.497 3.886 4.197 4.456 4.688 4.91 5.303 5.47 5.623 5.866 6.053 6.182 6.427 6.64 6.848 6.948 7.128 7.301 7.546 7.703 7.855 8.075 8.284 8.479 8.666 8.834 9.042 9.249 9.452 9.683 9.892 10.094 10.318 10.558 10.79 11.049 11.327 11.608 11.884 12.187 12.538 12.876 13.227 13.6 14.008 14.403 14.799 15.117 15.286 15.115 14.719 14.299 13.863 13.418 13.007 12.623 12.281 11.916 11.587 11.283 10.992 10.715 10.448 10.186 9.882 9.599 9.363 9.116 8.84 8.615 8.387 8.144 7.953 7.76 7.552 7.325 7.086 6.915 6.735 6.439 6.23 5.997 5.875 5.626 5.353 5.064 4.913 4.704 4.43 4.256 4.057 3.587 3.316 3.021 2.68 2.275 1.78 1.096 -2.008 -3 ,11938 ,TETRA ,17621028,Tue Nov 30 14:30:48 CET,Tue Nov 30 16:59:54 CET,0.0 2.332 2.906 3.327 3.674 3.964 4.212 4.435 4.83 5.0 5.16 5.41 5.601 5.727 5.964 6.197 6.413 6.511 6.698 6.872 7.118 7.275 7.427 7.642 7.839 8.023 8.202 8.376 8.598 8.803 8.991 9.218 9.433 9.632 9.86 10.11 10.356 10.621 10.884 11.159 11.43 11.731 12.096 12.442 12.824 13.22 13.626 14.055 14.505 14.899 15.091 14.927 14.606 14.183 13.736 13.308 12.916 12.563 12.24 11.877 11.533 11.212 10.898 10.61 10.348 10.104 9.849 9.611 9.396 9.165 8.904 8.683 8.467 8.25 8.083 7.905 7.711 7.476 7.193 7.013 6.847 6.566 6.36 6.147 6.039 5.807 5.556 5.275 5.117 4.907 4.641 4.467 4.274 3.831 3.571 3.281 2.952 2.583 2.109 1.396 -1.471 -4 ,26690 ,TETRA ,17621029,Tue Nov 30 14:30:46 CET,Tue Nov 30 16:56:40 CET,0.0 2.843 3.415 3.815 4.133 4.411 4.657 4.865 5.24 5.423 5.59 5.815 6.009 6.139 6.38 6.598 6.797 6.891 7.074 7.244 7.488 7.64 7.786 7.991 8.18 8.365 8.541 8.705 8.908 9.104 9.3 9.533 9.757 9.968 10.197 10.448 10.678 10.915 11.177 11.45 11.713 11.994 12.31 12.616 12.972 13.341 13.726 14.119 14.503 14.884 15.127 14.929 14.556 14.116 13.663 13.242 12.834 12.447 12.096 11.718 11.386 11.097 10.82 10.525 10.237 9.973 9.686 9.435 9.228 9.007 8.764 8.552 8.326 8.093 7.916 7.719 7.506 7.281 7.023 6.853 6.672 6.371 6.169 5.955 5.834 5.576 5.305 5.001 4.84 4.621 4.308 4.103 3.893 3.449 3.209 2.921 2.598 2.202 1.663 0.9 -1.947 -5 ,7242 ,TETRA ,17621030,Tue Nov 30 14:30:47 CET,Tue Nov 30 16:59:02 CET,0.0 2.621 3.243 3.663 4.0 4.29 4.555 4.801 5.22 5.395 5.557 5.798 5.99 6.12 6.356 6.569 6.772 6.869 7.054 7.231 7.479 7.636 7.792 8.015 8.222 8.413 8.597 8.774 8.992 9.203 9.393 9.61 9.824 10.031 10.272 10.532 10.774 11.028 11.286 11.567 11.871 12.201 12.545 12.856 13.212 13.606 14.014 14.426 14.858 15.196 15.36 15.177 14.794 14.361 13.935 13.504 13.089 12.687 12.336 11.982 11.658 11.364 11.082 10.813 10.552 10.294 10.02 9.779 9.567 9.341 9.096 8.893 8.678 8.442 8.247 8.049 7.848 7.637 7.401 7.233 7.056 6.757 6.549 6.345 6.234 5.98 5.686 5.372 5.211 4.984 4.694 4.509 4.321 3.903 3.656 3.393 3.109 2.767 2.318 1.604 -1.287 -6 ,26242 ,TETRA ,17621031,Tue Nov 30 14:30:47 CET,Tue Nov 30 17:15:21 CET,0.0 2.936 3.508 3.935 4.28 4.558 4.802 5.02 5.439 5.622 5.773 5.987 6.168 6.291 6.524 6.739 6.938 7.033 7.22 7.404 7.651 7.801 7.945 8.152 8.353 8.537 8.703 8.865 9.076 9.278 9.465 9.687 9.892 10.081 10.293 10.53 10.751 10.977 11.217 11.479 11.748 12.039 12.356 12.656 12.989 13.343 13.727 14.08 14.426 14.736 14.877 14.701 14.344 13.898 13.453 13.05 12.68 12.29 11.924 11.551 11.221 10.923 10.638 10.369 10.112 9.86 9.601 9.377 9.138 8.864 8.598 8.38 8.153 7.921 7.742 7.553 7.341 7.111 6.865 6.695 6.525 6.262 6.074 5.869 5.753 5.503 5.235 4.948 4.799 4.592 4.295 4.104 3.893 3.443 3.212 2.932 2.598 2.237 1.788 1.12 -1.637 -7 ,29169 ,TETRA ,17621032,Tue Nov 30 14:31:41 CET,Tue Nov 30 17:03:01 CET,0.0 2.646 3.238 3.674 4.035 4.322 4.567 4.792 5.185 5.354 5.506 5.728 5.918 6.055 6.303 6.526 6.74 6.842 7.031 7.209 7.466 7.626 7.776 7.989 8.19 8.379 8.559 8.73 8.94 9.14 9.331 9.553 9.765 9.965 10.187 10.436 10.678 10.943 11.216 11.496 11.785 12.1 12.447 12.776 13.132 13.504 13.949 14.436 14.873 15.201 15.366 15.272 15.008 14.64 14.249 13.859 13.504 13.163 12.841 12.485 12.15 11.845 11.546 11.248 10.964 10.712 10.455 10.212 9.992 9.76 9.5 9.281 9.053 8.807 8.619 8.423 8.207 7.973 7.737 7.566 7.382 7.088 6.874 6.66 6.551 6.313 6.052 5.779 5.629 5.404 5.107 4.924 4.727 4.298 4.029 3.717 3.386 2.963 2.393 1.606 -1.791 -8 ,9081 ,TETRA ,17621033,Tue Nov 30 14:31:41 CET,Tue Nov 30 17:00:03 CET,0.0 2.499 3.098 3.515 3.853 4.138 4.396 4.63 5.033 5.203 5.364 5.619 5.808 5.937 6.175 6.402 6.621 6.726 6.923 7.1 7.348 7.506 7.656 7.864 8.068 8.27 8.457 8.631 8.851 9.066 9.268 9.495 9.716 9.929 10.166 10.435 10.69 10.947 11.216 11.499 11.789 12.103 12.447 12.801 13.196 13.579 13.985 14.385 14.768 15.108 15.255 14.944 14.443 13.953 13.46 12.966 12.525 12.093 11.717 11.327 10.979 10.669 10.354 10.054 9.783 9.535 9.258 8.999 8.778 8.551 8.301 8.083 7.854 7.617 7.431 7.235 7.031 6.808 6.567 6.394 6.217 5.948 5.755 5.546 5.438 5.219 4.981 4.713 4.566 4.361 4.068 3.889 3.703 3.279 3.038 2.753 2.423 2.059 1.573 0.857 -2.229 -9 ,4185 ,TETRA ,17621034,Tue Nov 30 14:32:43 CET,Tue Nov 30 17:04:29 CET,0.0 2.499 3.11 3.526 3.857 4.17 4.447 4.67 5.032 5.192 5.347 5.587 5.768 5.888 6.114 6.323 6.533 6.636 6.819 6.992 7.24 7.389 7.531 7.733 7.921 8.095 8.262 8.427 8.643 8.839 9.019 9.236 9.435 9.622 9.842 10.081 10.308 10.55 10.804 11.074 11.356 11.648 11.953 12.281 12.67 13.049 13.429 13.813 14.189 14.546 14.778 14.609 14.237 13.758 13.265 12.807 12.405 12.04 11.716 11.356 10.977 10.626 10.293 9.985 9.707 9.434 9.138 8.879 8.655 8.41 8.151 7.921 7.688 7.456 7.265 7.063 6.854 6.632 6.399 6.235 6.063 5.782 5.588 5.379 5.262 5.005 4.737 4.454 4.3 4.082 3.8 3.623 3.415 2.968 2.731 2.435 2.081 1.667 1.186 0.502 -2.807 -10 ,6592 ,TETRA ,17621035,Tue Nov 30 14:32:43 CET,Tue Nov 30 16:59:09 CET,0.0 2.668 3.26 3.671 3.998 4.259 4.485 4.697 5.087 5.261 5.42 5.642 5.819 5.945 6.177 6.383 6.582 6.685 6.877 7.049 7.297 7.451 7.599 7.807 8.011 8.211 8.385 8.544 8.751 8.948 9.134 9.361 9.574 9.775 10.007 10.264 10.507 10.77 11.049 11.33 11.614 11.915 12.238 12.545 12.883 13.269 13.695 14.12 14.557 14.924 15.093 14.855 14.476 14.038 13.58 13.116 12.668 12.276 11.921 11.52 11.158 10.834 10.53 10.248 9.975 9.705 9.403 9.133 8.899 8.655 8.393 8.175 7.932 7.666 7.46 7.236 6.982 6.716 6.444 6.254 6.061 5.752 5.537 5.308 5.183 4.919 4.638 4.346 4.188 3.958 3.65 3.447 3.22 2.731 2.461 2.149 1.797 1.404 0.906 0.228 -2.237 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_30.txt deleted file mode 100644 index 8f8b6e87..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_30.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21671 ,KEBNE ,17076833,Sat Dec 25 06:37:20 CET,Sat Dec 25 08:33:13 CET,0.0 5.37 6.312 6.965 7.476 7.908 8.295 8.655 9.282 9.555 9.812 10.239 10.515 10.722 11.106 11.458 11.789 11.949 12.255 12.538 12.941 13.211 13.474 13.844 14.197 14.521 14.827 15.121 15.493 15.854 16.206 16.618 17.009 17.396 17.838 18.316 18.78 19.293 19.843 20.416 21.011 21.684 22.47 23.266 24.175 25.184 26.379 27.714 29.24 31.038 33.154 34.73 35.588 36.138 36.445 36.596 36.659 36.656 36.609 36.518 36.421 36.337 36.237 36.123 36.003 35.874 35.735 35.608 35.481 35.334 35.177 35.038 34.888 34.733 34.605 34.454 34.284 34.102 33.915 33.776 33.633 33.4 33.222 33.042 32.942 32.706 32.451 32.205 32.072 31.885 31.55 31.349 31.138 30.659 30.381 30.077 29.741 29.35 28.855 28.082 23.857 -2 ,1490 ,KEBNE ,17076834,Sat Dec 25 06:38:24 CET,Sat Dec 25 08:37:09 CET,0.0 4.903 5.742 6.332 6.806 7.217 7.574 7.891 8.467 8.734 8.977 9.356 9.626 9.839 10.257 10.643 10.988 11.152 11.467 11.764 12.182 12.458 12.726 13.105 13.465 13.811 14.139 14.46 14.865 15.242 15.604 16.028 16.426 16.81 17.246 17.735 18.217 18.745 19.294 19.867 20.475 21.152 21.95 22.776 23.74 24.76 25.905 27.209 28.74 30.525 32.712 34.505 35.49 36.035 36.305 36.436 36.482 36.487 36.458 36.37 36.256 36.138 36.021 35.902 35.766 35.631 35.492 35.352 35.207 35.031 34.846 34.695 34.517 34.315 34.153 33.977 33.794 33.612 33.406 33.248 33.08 32.828 32.657 32.47 32.368 32.156 31.924 31.655 31.51 31.324 31.048 30.871 30.69 30.295 30.037 29.734 29.392 28.993 28.479 27.713 24.956 -3 ,23788 ,KEBNE ,17076835,Sat Dec 25 06:41:30 CET,Sat Dec 25 08:43:33 CET,0.0 9.917 10.825 11.461 11.972 12.398 12.763 13.1 13.677 13.934 14.177 14.582 14.847 15.043 15.421 15.783 16.12 16.285 16.592 16.88 17.283 17.534 17.779 18.13 18.457 18.767 19.073 19.372 19.751 20.113 20.46 20.869 21.267 21.653 22.097 22.601 23.084 23.615 24.179 24.761 25.395 26.104 26.906 27.708 28.626 29.627 30.742 32.049 33.598 35.345 37.363 38.968 39.879 40.37 40.63 40.805 40.91 40.936 40.916 40.872 40.807 40.728 40.638 40.535 40.404 40.279 40.163 40.055 39.936 39.795 39.642 39.508 39.363 39.201 39.057 38.898 38.741 38.58 38.404 38.278 38.128 37.887 37.719 37.534 37.439 37.233 37.019 36.767 36.623 36.453 36.177 36.01 35.837 35.447 35.222 34.967 34.643 34.276 33.828 33.142 29.978 -4 ,19117 ,KEBNE ,17076836,Sat Dec 25 06:41:30 CET,Sat Dec 25 08:41:58 CET,0.0 3.706 4.577 5.17 5.664 6.096 6.468 6.799 7.404 7.677 7.924 8.316 8.571 8.768 9.151 9.495 9.811 9.977 10.314 10.623 11.041 11.303 11.562 11.921 12.259 12.586 12.896 13.186 13.561 13.928 14.278 14.699 15.105 15.5 15.945 16.432 16.906 17.411 17.935 18.498 19.099 19.773 20.556 21.336 22.226 23.209 24.339 25.604 27.056 28.785 30.9 32.678 33.613 34.077 34.31 34.404 34.413 34.367 34.302 34.227 34.144 34.04 33.919 33.779 33.634 33.509 33.363 33.191 33.029 32.861 32.682 32.538 32.386 32.216 32.075 31.924 31.771 31.603 31.405 31.262 31.112 30.865 30.683 30.481 30.376 30.146 29.902 29.642 29.506 29.326 29.005 28.807 28.592 28.12 27.867 27.591 27.248 26.809 26.22 25.362 22.165 -5 ,1781 ,KEBNE ,17076837,Sat Dec 25 06:42:33 CET,Sat Dec 25 08:43:28 CET,0.0 4.768 5.694 6.388 6.937 7.414 7.838 8.215 8.875 9.164 9.441 9.879 10.156 10.372 10.773 11.159 11.53 11.702 12.02 12.318 12.747 13.028 13.302 13.688 14.035 14.361 14.665 14.949 15.328 15.702 16.059 16.484 16.886 17.27 17.707 18.18 18.649 19.165 19.718 20.306 20.911 21.575 22.341 23.135 24.057 25.072 26.274 27.623 29.187 31.04 33.237 34.996 35.994 36.581 36.915 37.084 37.127 37.103 37.059 37.0 36.93 36.851 36.756 36.649 36.54 36.415 36.256 36.111 35.975 35.819 35.641 35.491 35.33 35.148 34.993 34.827 34.663 34.485 34.283 34.142 34.007 33.781 33.609 33.425 33.328 33.122 32.888 32.634 32.499 32.316 32.016 31.833 31.636 31.149 30.865 30.564 30.235 29.82 29.266 28.446 24.217 -8 ,5483 ,KEBNE ,17076840,Sat Dec 25 06:44:40 CET,Sat Dec 25 08:46:24 CET,0.0 5.005 5.875 6.494 6.985 7.42 7.809 8.153 8.752 9.02 9.278 9.696 9.969 10.187 10.595 10.958 11.278 11.43 11.727 12.01 12.426 12.686 12.94 13.33 13.709 14.061 14.399 14.728 15.136 15.503 15.85 16.276 16.67 17.049 17.504 18.01 18.48 18.996 19.557 20.138 20.731 21.396 22.165 22.937 23.811 24.776 25.908 27.21 28.706 30.404 32.445 34.148 35.067 35.553 35.846 36.033 36.114 36.132 36.097 36.032 35.949 35.844 35.725 35.612 35.488 35.364 35.234 35.098 34.969 34.829 34.675 34.54 34.379 34.186 34.041 33.9 33.741 33.565 33.368 33.224 33.077 32.833 32.653 32.457 32.349 32.12 31.883 31.618 31.466 31.281 30.997 30.809 30.612 30.137 29.851 29.542 29.195 28.788 28.239 27.393 23.807 -9 ,23358 ,KEBNE ,17076841,Sat Dec 25 06:44:39 CET,Sat Dec 25 08:45:31 CET,0.0 5.281 6.349 7.059 7.608 8.061 8.447 8.794 9.408 9.679 9.944 10.379 10.646 10.856 11.253 11.615 11.954 12.119 12.44 12.747 13.193 13.477 13.753 14.139 14.497 14.842 15.16 15.462 15.875 16.279 16.668 17.123 17.538 17.931 18.389 18.894 19.364 19.872 20.419 21.005 21.644 22.359 23.166 23.973 24.911 25.942 27.108 28.414 29.963 31.829 33.984 35.726 36.718 37.285 37.64 37.834 37.926 37.977 37.968 37.926 37.869 37.774 37.668 37.571 37.461 37.343 37.197 37.059 36.929 36.761 36.57 36.404 36.236 36.056 35.901 35.736 35.571 35.396 35.205 35.068 34.919 34.668 34.491 34.315 34.223 34.016 33.775 33.512 33.368 33.175 32.867 32.671 32.466 32.027 31.767 31.456 31.067 30.617 30.077 29.241 25.23 -10 ,19800 ,KEBNE ,17076842,Sat Dec 25 06:45:43 CET,Sat Dec 25 08:45:32 CET,0.0 3.942 4.924 5.568 6.09 6.56 6.961 7.306 7.917 8.199 8.474 8.93 9.215 9.431 9.849 10.247 10.613 10.793 11.148 11.473 11.91 12.181 12.436 12.785 13.114 13.428 13.735 14.045 14.45 14.839 15.199 15.621 16.03 16.426 16.889 17.41 17.885 18.386 18.925 19.498 20.109 20.803 21.612 22.413 23.368 24.416 25.604 26.966 28.519 30.305 32.304 33.872 34.775 35.325 35.657 35.797 35.836 35.842 35.81 35.74 35.666 35.58 35.47 35.35 35.222 35.096 34.947 34.798 34.663 34.515 34.349 34.206 34.064 33.902 33.749 33.581 33.417 33.239 33.043 32.911 32.762 32.511 32.34 32.162 32.067 31.856 31.625 31.37 31.229 31.042 30.723 30.523 30.318 29.871 29.618 29.331 28.993 28.547 27.966 27.192 23.44 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_19.txt deleted file mode 100644 index b74a7929..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32764 ,TETRA ,17621036,Tue Nov 30 14:32:44 CET,Tue Nov 30 17:02:06 CET,0.0 2.646 3.318 3.84 4.286 4.683 5.055 5.398 6.031 6.319 6.598 6.958 7.387 7.639 8.135 8.614 9.067 9.286 9.719 10.138 10.745 11.144 11.538 12.105 12.661 13.213 13.764 14.312 15.027 15.719 16.399 17.227 18.04 18.854 19.829 20.963 22.057 23.275 24.659 26.16 27.771 29.643 31.912 34.274 37.142 40.557 44.685 49.596 55.749 63.737 74.642 84.944 91.964 97.08 100.911 103.947 106.33 108.295 109.834 111.217 112.293 113.168 113.938 114.62 115.224 115.735 116.212 116.582 116.867 117.139 117.397 117.595 117.773 117.908 117.994 118.098 118.194 118.253 118.287 118.306 118.311 118.281 118.222 118.148 118.115 118.037 117.945 117.831 117.763 117.62 117.475 117.355 117.232 116.919 116.689 116.439 116.133 115.731 115.233 114.486 110.506 -2 ,378 ,TETRA ,17621037,Tue Nov 30 14:32:44 CET,Tue Nov 30 17:04:48 CET,0.0 2.03 2.676 3.194 3.65 4.049 4.415 4.763 5.398 5.695 5.978 6.335 6.776 7.031 7.52 7.991 8.45 8.676 9.123 9.552 10.167 10.573 10.982 11.589 12.169 12.733 13.285 13.827 14.545 15.258 15.949 16.801 17.646 18.464 19.439 20.561 21.649 22.884 24.262 25.774 27.407 29.282 31.554 33.94 36.87 40.305 44.46 49.398 55.669 63.793 74.679 85.175 92.375 97.604 101.438 104.404 106.754 108.685 110.177 111.529 112.595 113.478 114.252 114.921 115.481 115.931 116.374 116.757 117.053 117.325 117.582 117.762 117.926 118.07 118.172 118.278 118.372 118.455 118.523 118.558 118.581 118.603 118.599 118.586 118.574 118.505 118.413 118.31 118.254 118.123 117.965 117.837 117.702 117.386 117.18 116.935 116.613 116.145 115.587 114.774 111.35 -3 ,3884 ,TETRA ,17621038,Tue Nov 30 14:32:44 CET,Tue Nov 30 16:57:04 CET,0.0 2.818 3.488 4.031 4.491 4.884 5.245 5.599 6.267 6.572 6.862 7.232 7.676 7.935 8.439 8.936 9.405 9.633 10.084 10.517 11.153 11.565 11.967 12.56 13.133 13.695 14.244 14.781 15.495 16.203 16.903 17.751 18.567 19.376 20.347 21.452 22.531 23.751 25.103 26.589 28.209 30.099 32.399 34.789 37.697 41.121 45.271 50.201 56.323 64.193 74.995 85.37 92.352 97.426 101.3 104.344 106.702 108.65 110.184 111.569 112.661 113.567 114.353 115.026 115.611 116.093 116.527 116.876 117.148 117.393 117.61 117.781 117.946 118.102 118.201 118.301 118.408 118.481 118.528 118.53 118.519 118.504 118.491 118.471 118.452 118.402 118.323 118.206 118.131 117.98 117.795 117.66 117.506 117.107 116.883 116.669 116.393 116.033 115.542 114.751 111.026 -4 ,15428 ,TETRA ,17621039,Tue Nov 30 14:32:44 CET,Tue Nov 30 17:03:41 CET,0.0 2.519 3.275 3.851 4.319 4.725 5.096 5.442 6.081 6.373 6.665 7.043 7.476 7.722 8.196 8.648 9.089 9.303 9.716 10.128 10.741 11.141 11.531 12.096 12.65 13.204 13.748 14.278 14.967 15.636 16.298 17.111 17.911 18.701 19.644 20.748 21.832 23.051 24.417 25.897 27.484 29.361 31.68 34.095 36.955 40.259 44.277 49.134 55.304 63.306 74.321 84.836 91.815 96.803 100.563 103.566 105.877 107.76 109.233 110.539 111.573 112.468 113.275 113.948 114.509 114.986 115.447 115.829 116.132 116.407 116.674 116.896 117.095 117.26 117.373 117.472 117.546 117.614 117.667 117.679 117.692 117.707 117.697 117.673 117.657 117.61 117.539 117.438 117.375 117.248 117.075 116.945 116.792 116.447 116.26 116.055 115.816 115.447 114.948 114.099 108.849 -5 ,29098 ,TETRA ,17621040,Tue Nov 30 14:38:29 CET,Tue Nov 30 16:58:19 CET,0.0 2.797 3.491 4.026 4.489 4.897 5.267 5.62 6.27 6.567 6.849 7.204 7.639 7.887 8.366 8.821 9.259 9.473 9.906 10.333 10.956 11.353 11.738 12.311 12.881 13.445 13.995 14.539 15.249 15.936 16.619 17.464 18.285 19.095 20.057 21.168 22.272 23.515 24.883 26.388 28.001 29.859 32.103 34.422 37.278 40.677 44.785 49.676 55.926 64.016 74.795 85.05 91.944 96.93 100.709 103.698 106.072 108.044 109.586 110.965 112.033 112.914 113.677 114.355 114.953 115.436 115.876 116.215 116.483 116.733 116.965 117.128 117.275 117.427 117.528 117.605 117.666 117.714 117.744 117.762 117.769 117.727 117.674 117.604 117.568 117.484 117.367 117.205 117.12 116.984 116.829 116.704 116.556 116.207 115.995 115.706 115.332 114.918 114.457 113.702 110.156 -6 ,27231 ,TETRA ,17621041,Tue Nov 30 14:33:54 CET,Tue Nov 30 17:05:08 CET,0.0 2.659 3.39 3.916 4.353 4.751 5.127 5.486 6.123 6.417 6.7 7.063 7.499 7.754 8.249 8.711 9.166 9.39 9.823 10.244 10.864 11.27 11.661 12.235 12.8 13.354 13.891 14.423 15.122 15.813 16.497 17.335 18.158 18.965 19.92 21.005 22.076 23.302 24.659 26.146 27.756 29.617 31.876 34.203 37.037 40.407 44.504 49.381 55.574 63.657 74.368 84.51 91.47 96.508 100.288 103.241 105.528 107.407 108.882 110.23 111.277 112.127 112.872 113.498 113.999 114.412 114.845 115.21 115.484 115.753 116.022 116.213 116.369 116.516 116.619 116.709 116.778 116.83 116.87 116.882 116.88 116.869 116.85 116.812 116.794 116.742 116.668 116.558 116.482 116.344 116.181 116.035 115.903 115.629 115.431 115.21 114.885 114.442 113.905 113.051 108.181 -7 ,7999 ,TETRA ,17621042,Tue Nov 30 14:33:58 CET,Tue Nov 30 17:05:59 CET,0.0 2.815 3.449 3.953 4.364 4.74 5.091 5.418 6.041 6.334 6.612 6.966 7.396 7.64 8.108 8.559 9.002 9.223 9.663 10.092 10.726 11.131 11.526 12.1 12.659 13.217 13.773 14.321 15.034 15.737 16.433 17.287 18.129 18.951 19.92 21.041 22.152 23.4 24.782 26.298 27.921 29.836 32.18 34.613 37.546 40.964 45.116 50.084 56.403 64.528 75.318 85.561 92.589 97.75 101.551 104.513 106.856 108.765 110.268 111.631 112.689 113.571 114.35 115.014 115.565 116.043 116.529 116.93 117.253 117.554 117.817 118.012 118.199 118.366 118.497 118.624 118.731 118.828 118.903 118.936 118.964 118.994 118.99 118.953 118.925 118.878 118.81 118.721 118.674 118.562 118.479 118.394 118.289 118.002 117.807 117.561 117.262 116.881 116.297 115.451 112.33 -8 ,26870 ,TETRA ,17621043,Tue Nov 30 14:39:18 CET,Tue Nov 30 17:08:48 CET,0.0 2.158 2.865 3.413 3.875 4.272 4.638 4.982 5.62 5.925 6.214 6.581 7.027 7.285 7.792 8.274 8.733 8.954 9.385 9.815 10.437 10.837 11.239 11.828 12.408 12.982 13.534 14.072 14.784 15.492 16.186 17.042 17.881 18.708 19.692 20.818 21.928 23.175 24.56 26.065 27.692 29.612 31.92 34.338 37.287 40.715 44.915 49.848 55.924 63.834 74.749 85.235 92.263 97.358 101.124 104.078 106.411 108.292 109.796 111.213 112.328 113.222 114.007 114.693 115.285 115.795 116.264 116.635 116.926 117.194 117.441 117.64 117.847 118.027 118.128 118.219 118.296 118.354 118.393 118.405 118.39 118.342 118.303 118.256 118.23 118.163 118.073 117.963 117.9 117.764 117.632 117.506 117.362 117.0 116.775 116.523 116.239 115.877 115.399 114.641 110.331 -9 ,4189 ,TETRA ,17621044,Tue Nov 30 14:26:13 CET,Tue Nov 30 16:56:08 CET,0.0 2.54 3.239 3.781 4.242 4.64 5.018 5.377 6.013 6.308 6.592 6.963 7.397 7.648 8.142 8.617 9.061 9.281 9.718 10.138 10.758 11.159 11.554 12.142 12.717 13.278 13.834 14.376 15.077 15.77 16.463 17.325 18.157 18.965 19.931 21.027 22.109 23.342 24.699 26.219 27.892 29.833 32.189 34.584 37.401 40.75 44.933 49.929 56.124 64.086 74.823 85.068 92.103 97.251 101.135 104.212 106.634 108.603 110.153 111.565 112.637 113.506 114.266 114.932 115.529 116.028 116.475 116.847 117.162 117.444 117.69 117.878 118.057 118.218 118.331 118.457 118.569 118.651 118.718 118.752 118.786 118.818 118.793 118.746 118.713 118.62 118.536 118.431 118.357 118.226 118.094 117.989 117.845 117.431 117.2 116.955 116.635 116.184 115.646 114.811 103.825 -10 ,32559 ,TETRA ,17621045,Tue Nov 30 14:27:14 CET,Tue Nov 30 17:10:45 CET,0.0 2.855 3.553 4.128 4.591 4.997 5.367 5.701 6.326 6.627 6.92 7.292 7.736 7.994 8.5 8.988 9.448 9.67 10.102 10.52 11.127 11.527 11.925 12.52 13.113 13.687 14.234 14.765 15.463 16.156 16.844 17.69 18.518 19.323 20.284 21.396 22.487 23.71 25.047 26.5 28.089 29.953 32.21 34.554 37.398 40.74 44.804 49.703 55.855 63.711 74.434 84.769 91.81 96.903 100.721 103.731 106.074 107.987 109.482 110.824 111.861 112.724 113.485 114.165 114.772 115.269 115.745 116.144 116.462 116.767 117.058 117.279 117.488 117.663 117.781 117.895 117.995 118.087 118.174 118.226 118.259 118.244 118.216 118.187 118.169 118.124 118.067 117.964 117.897 117.781 117.664 117.557 117.426 117.103 116.9 116.649 116.367 116.04 115.624 114.878 109.954 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_26.txt deleted file mode 100644 index 33ee42a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4580 ,TETRA ,17621046,Tue Nov 30 14:27:14 CET,Tue Nov 30 16:52:06 CET,0.0 2.224 2.874 3.381 3.829 4.212 4.538 4.839 5.418 5.689 5.933 6.21 6.608 6.818 7.229 7.612 7.969 8.141 8.473 8.785 9.239 9.536 9.826 10.25 10.649 11.045 11.443 11.817 12.289 12.747 13.189 13.728 14.261 14.775 15.377 16.066 16.74 17.492 18.3 19.177 20.119 21.191 22.459 23.71 25.201 26.955 29.068 31.538 34.464 38.001 42.494 46.478 48.987 50.636 51.789 52.602 53.178 53.622 53.936 54.208 54.362 54.456 54.527 54.554 54.549 54.542 54.516 54.473 54.425 54.368 54.289 54.206 54.113 53.997 53.903 53.807 53.699 53.56 53.406 53.284 53.139 52.907 52.737 52.55 52.451 52.25 52.037 51.81 51.683 51.419 51.241 51.052 50.849 50.399 50.154 49.87 49.533 49.143 48.599 47.821 44.648 -2 ,17055 ,TETRA ,17621047,Tue Nov 30 14:29:54 CET,Tue Nov 30 17:00:16 CET,0.0 2.9 3.557 4.057 4.476 4.84 5.167 5.464 6.008 6.255 6.493 6.785 7.159 7.354 7.727 8.09 8.445 8.613 8.939 9.257 9.71 10.002 10.281 10.676 11.066 11.453 11.825 12.189 12.665 13.126 13.577 14.139 14.687 15.211 15.81 16.5 17.172 17.895 18.698 19.589 20.534 21.616 22.886 24.145 25.64 27.382 29.492 31.963 34.959 38.626 43.223 47.306 49.891 51.651 52.897 53.819 54.513 55.041 55.418 55.753 55.987 56.128 56.222 56.273 56.28 56.271 56.26 56.246 56.201 56.106 55.993 55.91 55.83 55.71 55.586 55.454 55.317 55.174 55.022 54.909 54.788 54.585 54.437 54.276 54.187 53.99 53.784 53.544 53.408 53.141 52.975 52.806 52.618 52.179 51.914 51.612 51.256 50.843 50.328 49.53 46.29 -3 ,8433 ,TETRA ,17621048,Tue Nov 30 14:29:54 CET,Tue Nov 30 17:03:01 CET,0.0 2.613 3.274 3.736 4.13 4.489 4.815 5.116 5.684 5.944 6.176 6.436 6.829 7.036 7.444 7.819 8.172 8.338 8.657 8.973 9.437 9.731 10.019 10.431 10.824 11.212 11.592 11.96 12.428 12.887 13.349 13.918 14.46 14.972 15.579 16.267 16.936 17.678 18.471 19.325 20.242 21.286 22.513 23.771 25.294 27.033 29.081 31.448 34.331 37.848 42.374 46.419 48.916 50.642 51.867 52.71 53.276 53.706 54.022 54.276 54.458 54.589 54.692 54.763 54.801 54.805 54.793 54.776 54.755 54.716 54.65 54.571 54.469 54.348 54.256 54.161 54.041 53.909 53.766 53.671 53.577 53.398 53.257 53.109 53.031 52.87 52.686 52.471 52.351 52.083 51.902 51.716 51.536 51.102 50.82 50.534 50.235 49.87 49.412 48.795 46.52 -4 ,28215 ,TETRA ,17621049,Tue Nov 30 14:29:54 CET,Tue Nov 30 16:48:45 CET,0.0 2.832 3.498 3.999 4.414 4.775 5.101 5.405 5.946 6.186 6.422 6.697 7.09 7.292 7.688 8.061 8.409 8.577 8.899 9.215 9.681 9.987 10.281 10.698 11.1 11.486 11.861 12.237 12.718 13.186 13.652 14.209 14.743 15.26 15.854 16.508 17.132 17.834 18.621 19.486 20.413 21.428 22.635 23.905 25.372 27.02 29.025 31.376 34.229 37.781 42.371 46.335 48.724 50.379 51.582 52.455 53.079 53.562 53.914 54.215 54.438 54.597 54.712 54.771 54.777 54.752 54.705 54.642 54.577 54.506 54.429 54.364 54.299 54.228 54.145 54.031 53.899 53.758 53.591 53.481 53.369 53.163 52.999 52.81 52.718 52.548 52.375 52.178 52.062 51.801 51.633 51.454 51.263 50.847 50.599 50.292 49.93 49.499 48.948 48.164 44.864 -5 ,16411 ,TETRA ,17621050,Tue Nov 30 14:29:54 CET,Tue Nov 30 16:50:52 CET,0.0 2.552 3.224 3.755 4.18 4.527 4.843 5.136 5.681 5.934 6.172 6.426 6.812 7.017 7.412 7.786 8.139 8.314 8.66 8.988 9.454 9.746 10.03 10.452 10.855 11.238 11.619 11.99 12.461 12.922 13.383 13.951 14.498 15.026 15.644 16.346 17.019 17.765 18.581 19.451 20.382 21.461 22.741 24.041 25.569 27.332 29.39 31.748 34.632 38.176 42.613 46.588 49.118 50.785 51.971 52.89 53.554 54.043 54.377 54.631 54.794 54.899 54.953 54.976 54.992 55.022 55.036 55.009 54.964 54.908 54.847 54.78 54.685 54.567 54.471 54.363 54.234 54.087 53.922 53.803 53.682 53.487 53.345 53.188 53.099 52.916 52.721 52.505 52.381 52.112 51.939 51.764 51.579 51.16 50.915 50.624 50.281 49.89 49.392 48.6 45.508 -6 ,28251 ,TETRA ,17621051,Tue Nov 30 14:29:54 CET,Tue Nov 30 17:09:04 CET,0.0 3.408 4.082 4.572 4.979 5.34 5.665 5.963 6.503 6.744 6.972 7.227 7.615 7.825 8.221 8.593 8.951 9.128 9.472 9.787 10.245 10.549 10.836 11.257 11.66 12.049 12.439 12.816 13.284 13.748 14.204 14.76 15.303 15.827 16.447 17.142 17.801 18.52 19.312 20.183 21.121 22.18 23.431 24.728 26.247 27.967 30.021 32.403 35.287 38.868 43.515 47.626 50.074 51.694 52.83 53.685 54.32 54.792 55.106 55.357 55.526 55.651 55.762 55.822 55.834 55.838 55.823 55.788 55.728 55.661 55.595 55.512 55.398 55.271 55.158 55.031 54.895 54.751 54.597 54.472 54.348 54.145 53.994 53.833 53.745 53.549 53.326 53.076 52.928 52.634 52.426 52.237 52.051 51.63 51.378 51.102 50.785 50.402 49.855 49.105 45.739 -7 ,20165 ,TETRA ,17621052,Tue Nov 30 14:29:56 CET,Tue Nov 30 16:58:59 CET,0.0 2.577 3.254 3.729 4.123 4.488 4.826 5.131 5.66 5.897 6.122 6.377 6.77 6.975 7.362 7.731 8.086 8.257 8.587 8.908 9.369 9.661 9.944 10.353 10.738 11.117 11.506 11.896 12.382 12.844 13.291 13.826 14.371 14.9 15.496 16.173 16.832 17.57 18.375 19.241 20.178 21.24 22.502 23.777 25.281 26.997 29.02 31.417 34.294 37.79 42.36 46.498 49.107 50.84 51.968 52.753 53.324 53.758 54.064 54.325 54.519 54.652 54.745 54.807 54.839 54.845 54.831 54.801 54.77 54.709 54.602 54.505 54.409 54.303 54.21 54.111 54.004 53.872 53.737 53.634 53.506 53.308 53.167 52.999 52.909 52.73 52.527 52.295 52.169 51.907 51.743 51.572 51.383 50.946 50.69 50.403 50.085 49.693 49.182 48.437 45.406 -8 ,22035 ,TETRA ,17621053,Tue Nov 30 14:29:58 CET,Tue Nov 30 16:54:38 CET,0.0 2.424 3.082 3.565 3.986 4.367 4.715 5.039 5.608 5.864 6.111 6.389 6.777 6.977 7.364 7.733 8.091 8.261 8.584 8.9 9.354 9.642 9.921 10.333 10.736 11.129 11.514 11.9 12.402 12.876 13.339 13.898 14.451 14.994 15.611 16.308 16.977 17.712 18.509 19.403 20.377 21.449 22.706 23.998 25.528 27.3 29.449 31.896 34.794 38.345 42.871 46.835 49.374 51.138 52.301 53.106 53.673 54.096 54.37 54.587 54.724 54.801 54.862 54.902 54.898 54.867 54.824 54.758 54.676 54.58 54.475 54.371 54.257 54.122 54.007 53.905 53.794 53.649 53.495 53.4 53.282 53.07 52.918 52.765 52.682 52.498 52.287 52.014 51.858 51.56 51.339 51.157 50.956 50.484 50.224 49.915 49.559 49.146 48.581 47.753 45.019 -9 ,26493 ,TETRA ,17621054,Tue Nov 30 14:29:55 CET,Tue Nov 30 17:15:48 CET,0.0 2.387 3.062 3.581 4.009 4.382 4.713 5.02 5.563 5.806 6.032 6.282 6.659 6.862 7.241 7.6 7.95 8.118 8.449 8.772 9.23 9.531 9.826 10.249 10.662 11.074 11.46 11.826 12.318 12.802 13.267 13.831 14.376 14.892 15.479 16.162 16.837 17.58 18.38 19.235 20.152 21.195 22.452 23.766 25.316 27.07 29.113 31.461 34.329 38.025 42.807 46.852 49.396 51.095 52.224 53.036 53.658 54.163 54.531 54.829 55.016 55.16 55.271 55.322 55.345 55.341 55.311 55.266 55.21 55.141 55.045 54.939 54.83 54.722 54.632 54.521 54.396 54.266 54.099 53.968 53.843 53.663 53.519 53.332 53.229 53.016 52.768 52.501 52.358 52.051 51.8 51.592 51.385 50.934 50.649 50.338 49.991 49.562 48.988 48.161 45.091 -10 ,32177 ,TETRA ,17621055,Tue Nov 30 14:29:57 CET,Tue Nov 30 17:10:51 CET,0.0 2.967 3.702 4.234 4.646 4.997 5.322 5.627 6.184 6.442 6.694 6.972 7.352 7.549 7.94 8.31 8.663 8.835 9.169 9.484 9.929 10.22 10.509 10.926 11.332 11.726 12.103 12.464 12.933 13.399 13.856 14.412 14.954 15.478 16.082 16.768 17.418 18.141 18.958 19.836 20.773 21.843 23.104 24.389 25.91 27.653 29.743 32.195 35.171 38.777 43.213 47.121 49.613 51.299 52.451 53.285 53.875 54.313 54.641 54.915 55.088 55.197 55.257 55.287 55.296 55.269 55.216 55.145 55.06 54.968 54.866 54.768 54.657 54.524 54.389 54.249 54.122 53.978 53.807 53.687 53.562 53.353 53.189 53.012 52.915 52.698 52.468 52.222 52.093 51.823 51.657 51.489 51.289 50.823 50.563 50.275 49.911 49.452 48.902 48.177 45.513 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_30_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_30_19.txt deleted file mode 100644 index ceeed1a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_30_19.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22089 ,TETRA ,17621056,Tue Nov 30 14:29:59 CET,Tue Nov 30 16:57:32 CET,0.0 3.039 3.746 4.23 4.608 4.907 5.173 5.42 5.851 6.028 6.192 6.464 6.643 6.776 7.022 7.237 7.429 7.523 7.708 7.885 8.132 8.285 8.418 8.589 8.758 8.942 9.121 9.277 9.471 9.663 9.827 9.979 10.113 10.241 10.385 10.535 10.674 10.803 10.921 11.045 11.139 11.198 11.221 11.2 11.11 10.985 10.805 10.453 9.883 8.913 7.187 5.08 3.293 1.781 0.5 -0.674 -1.676 -2.562 -3.347 -4.124 -4.785 -5.382 -5.959 -6.501 -7.002 -7.455 -7.936 -8.377 -8.766 -9.167 -9.581 -9.943 -10.325 -10.723 -11.032 -11.339 -11.663 -12.011 -12.382 -12.645 -12.916 -13.33 -13.621 -13.934 -14.104 -14.451 -14.804 -15.188 -15.39 -15.661 -16.053 -16.295 -16.557 -17.145 -17.516 -17.943 -18.391 -18.91 -19.58 -20.523 -25.95 -2 ,13316 ,TETRA ,17621057,Tue Nov 30 14:38:30 CET,Tue Nov 30 17:09:08 CET,0.0 4.379 5.081 5.567 5.933 6.223 6.478 6.715 7.127 7.306 7.477 7.752 7.955 8.102 8.373 8.612 8.823 8.916 9.101 9.276 9.518 9.666 9.806 10.005 10.187 10.363 10.519 10.663 10.843 11.004 11.176 11.373 11.525 11.667 11.825 11.99 12.164 12.372 12.522 12.593 12.637 12.653 12.649 12.63 12.59 12.458 12.184 11.778 11.14 10.158 8.493 6.366 4.6 3.094 1.775 0.604 -0.439 -1.403 -2.241 -3.085 -3.821 -4.481 -5.101 -5.672 -6.206 -6.69 -7.193 -7.665 -8.091 -8.535 -8.991 -9.366 -9.762 -10.175 -10.488 -10.815 -11.159 -11.522 -11.907 -12.177 -12.453 -12.9 -13.214 -13.531 -13.701 -14.065 -14.46 -14.884 -15.103 -15.377 -15.786 -16.042 -16.313 -16.907 -17.267 -17.67 -18.103 -18.619 -19.274 -20.216 -26.065 -4 ,3482 ,TETRA ,17621059,Tue Nov 30 14:38:32 CET,Tue Nov 30 17:09:13 CET,0.0 3.068 3.769 4.209 4.538 4.822 5.065 5.283 5.659 5.824 5.971 6.201 6.353 6.462 6.673 6.872 7.039 7.117 7.265 7.397 7.583 7.704 7.817 7.973 8.122 8.259 8.383 8.503 8.659 8.801 8.925 9.062 9.191 9.317 9.448 9.561 9.656 9.744 9.827 9.895 9.938 9.954 9.937 9.899 9.812 9.639 9.341 8.923 8.27 7.156 5.261 3.03 1.15 -0.514 -1.935 -3.249 -4.39 -5.374 -6.204 -7.048 -7.809 -8.477 -9.102 -9.697 -10.247 -10.743 -11.26 -11.716 -12.109 -12.508 -12.92 -13.265 -13.63 -14.021 -14.341 -14.691 -15.049 -15.41 -15.801 -16.084 -16.369 -16.819 -17.143 -17.495 -17.681 -18.072 -18.472 -18.875 -19.097 -19.382 -19.831 -20.112 -20.4 -21.049 -21.433 -21.863 -22.353 -22.948 -23.758 -24.871 -34.693 -5 ,31578 ,TETRA ,17621060,Tue Nov 30 14:38:29 CET,Tue Nov 30 17:04:14 CET,0.0 3.134 3.805 4.295 4.661 4.953 5.206 5.426 5.83 6.001 6.149 6.381 6.536 6.647 6.84 7.025 7.196 7.275 7.426 7.573 7.774 7.89 8.002 8.163 8.308 8.443 8.579 8.708 8.856 8.99 9.123 9.277 9.407 9.523 9.65 9.789 9.89 9.982 10.094 10.201 10.276 10.307 10.301 10.253 10.157 10.013 9.766 9.387 8.757 7.712 5.924 3.776 1.995 0.436 -0.916 -2.095 -3.12 -4.059 -4.854 -5.64 -6.333 -6.963 -7.555 -8.098 -8.587 -9.048 -9.558 -10.011 -10.404 -10.814 -11.249 -11.619 -11.998 -12.401 -12.719 -13.033 -13.354 -13.689 -14.025 -14.264 -14.519 -14.935 -15.24 -15.562 -15.731 -16.091 -16.471 -16.877 -17.101 -17.392 -17.818 -18.07 -18.345 -19.008 -19.404 -19.821 -20.302 -20.871 -21.576 -22.649 -34.334 -6 ,4860 ,TETRA ,17621061,Tue Nov 30 14:39:21 CET,Tue Nov 30 17:09:02 CET,0.0 3.227 3.973 4.49 4.872 5.168 5.419 5.647 6.051 6.216 6.373 6.628 6.786 6.906 7.129 7.328 7.51 7.594 7.749 7.898 8.111 8.236 8.344 8.497 8.643 8.774 8.893 9.002 9.135 9.269 9.391 9.523 9.646 9.758 9.871 9.983 10.075 10.154 10.232 10.306 10.371 10.424 10.432 10.405 10.348 10.234 10.029 9.676 9.061 8.029 6.235 4.082 2.357 0.9 -0.36 -1.453 -2.432 -3.34 -4.106 -4.847 -5.478 -6.055 -6.622 -7.155 -7.646 -8.104 -8.59 -9.032 -9.414 -9.807 -10.221 -10.572 -10.932 -11.302 -11.597 -11.9 -12.236 -12.602 -12.97 -13.222 -13.484 -13.904 -14.2 -14.509 -14.674 -15.032 -15.425 -15.853 -16.07 -16.345 -16.787 -17.068 -17.367 -18.007 -18.36 -18.755 -19.221 -19.787 -20.507 -21.497 -28.153 -7 ,2854 ,TETRA ,17621062,Tue Nov 30 14:39:18 CET,Tue Nov 30 17:11:20 CET,0.0 2.442 3.013 3.423 3.748 4.015 4.252 4.468 4.86 5.036 5.201 5.452 5.613 5.726 5.936 6.126 6.295 6.381 6.545 6.691 6.905 7.041 7.17 7.348 7.516 7.666 7.797 7.926 8.084 8.241 8.394 8.561 8.709 8.848 9.004 9.161 9.297 9.431 9.564 9.659 9.699 9.746 9.793 9.803 9.769 9.65 9.411 9.018 8.424 7.488 5.773 3.657 1.927 0.344 -1.054 -2.234 -3.242 -4.18 -5.017 -5.817 -6.483 -7.089 -7.664 -8.2 -8.715 -9.184 -9.681 -10.131 -10.499 -10.88 -11.307 -11.675 -12.056 -12.468 -12.785 -13.104 -13.435 -13.776 -14.129 -14.375 -14.636 -15.056 -15.347 -15.662 -15.829 -16.164 -16.537 -16.96 -17.176 -17.452 -17.906 -18.18 -18.476 -19.135 -19.499 -19.892 -20.339 -20.874 -21.541 -22.53 -33.125 -8 ,3902 ,TETRA ,17621063,Tue Nov 30 14:40:19 CET,Tue Nov 30 17:13:52 CET,0.0 3.671 4.311 4.719 5.065 5.369 5.627 5.856 6.258 6.42 6.563 6.786 6.938 7.038 7.221 7.39 7.552 7.632 7.78 7.912 8.107 8.225 8.337 8.497 8.64 8.765 8.886 9.007 9.14 9.253 9.371 9.5 9.609 9.702 9.791 9.886 9.975 10.072 10.157 10.224 10.275 10.304 10.287 10.247 10.175 10.035 9.8 9.414 8.771 7.715 5.848 3.632 1.792 0.224 -1.062 -2.176 -3.169 -4.083 -4.854 -5.613 -6.27 -6.859 -7.41 -7.925 -8.419 -8.874 -9.338 -9.751 -10.117 -10.508 -10.916 -11.25 -11.607 -11.987 -12.289 -12.614 -12.952 -13.304 -13.676 -13.941 -14.214 -14.633 -14.919 -15.219 -15.382 -15.726 -16.096 -16.485 -16.687 -16.952 -17.356 -17.611 -17.882 -18.482 -18.821 -19.204 -19.652 -20.188 -20.836 -21.712 -26.105 -9 ,10443 ,TETRA ,17621064,Tue Nov 30 14:39:19 CET,Tue Nov 30 17:12:35 CET,0.0 3.308 3.997 4.473 4.84 5.172 5.466 5.695 6.097 6.276 6.43 6.678 6.84 6.959 7.178 7.367 7.54 7.624 7.795 7.959 8.173 8.301 8.42 8.582 8.729 8.863 9.002 9.148 9.333 9.495 9.628 9.759 9.875 9.977 10.081 10.199 10.304 10.405 10.487 10.545 10.6 10.654 10.668 10.651 10.635 10.591 10.447 10.127 9.545 8.55 6.813 4.679 2.849 1.341 0.09 -1.023 -2.025 -2.909 -3.65 -4.414 -5.077 -5.671 -6.237 -6.755 -7.269 -7.779 -8.327 -8.827 -9.221 -9.591 -9.976 -10.304 -10.668 -11.052 -11.342 -11.647 -11.968 -12.303 -12.663 -12.918 -13.187 -13.607 -13.897 -14.201 -14.361 -14.711 -15.1 -15.534 -15.774 -16.081 -16.571 -16.887 -17.243 -18.026 -18.442 -18.897 -19.426 -20.064 -20.863 -21.996 -29.966 -10 ,26329 ,TETRA ,17621065,Tue Nov 30 14:40:22 CET,Tue Nov 30 17:14:11 CET,0.0 3.398 4.06 4.532 4.922 5.242 5.511 5.743 6.126 6.291 6.446 6.676 6.843 6.964 7.187 7.393 7.576 7.666 7.835 7.981 8.18 8.298 8.412 8.569 8.714 8.849 8.976 9.101 9.254 9.381 9.492 9.617 9.726 9.814 9.904 10.001 10.084 10.171 10.245 10.298 10.333 10.355 10.345 10.29 10.184 10.03 9.776 9.39 8.785 7.789 6.03 3.944 2.266 0.814 -0.468 -1.609 -2.609 -3.514 -4.29 -5.071 -5.731 -6.312 -6.89 -7.436 -7.926 -8.375 -8.849 -9.267 -9.617 -9.982 -10.369 -10.707 -11.062 -11.425 -11.715 -12.02 -12.33 -12.66 -13.016 -13.262 -13.519 -13.947 -14.255 -14.577 -14.748 -15.101 -15.477 -15.87 -16.076 -16.347 -16.771 -17.038 -17.31 -17.944 -18.335 -18.751 -19.204 -19.718 -20.339 -21.206 -26.397 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_23.txt deleted file mode 100644 index 711a4af7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27986 ,TETRA ,17621066,Tue Nov 30 14:40:20 CET,Tue Nov 30 17:07:28 CET,0.0 2.939 3.559 3.997 4.357 4.672 4.947 5.196 5.627 5.822 6.005 6.287 6.506 6.664 6.967 7.236 7.485 7.609 7.848 8.068 8.388 8.594 8.792 9.076 9.342 9.592 9.832 10.073 10.389 10.686 10.965 11.302 11.626 11.945 12.33 12.759 13.158 13.598 14.09 14.606 15.137 15.753 16.484 17.215 18.08 19.08 20.221 21.511 23.059 24.932 27.28 29.255 30.396 31.14 31.641 31.936 32.075 32.141 32.142 32.074 31.981 31.901 31.805 31.687 31.571 31.448 31.287 31.127 30.98 30.812 30.613 30.436 30.247 30.026 29.835 29.635 29.439 29.239 29.035 28.896 28.713 28.388 28.176 27.949 27.82 27.544 27.232 26.881 26.684 26.443 26.027 25.78 25.524 24.981 24.677 24.309 23.888 23.382 22.741 21.836 17.978 -2 ,20490 ,TETRA ,17621067,Tue Nov 30 14:40:23 CET,Tue Nov 30 17:09:22 CET,0.0 2.352 2.948 3.377 3.734 4.047 4.316 4.563 4.999 5.188 5.359 5.619 5.832 5.983 6.263 6.523 6.766 6.884 7.117 7.335 7.643 7.841 8.038 8.319 8.581 8.839 9.086 9.323 9.642 9.945 10.23 10.584 10.929 11.249 11.61 12.013 12.403 12.843 13.321 13.818 14.356 14.982 15.691 16.415 17.3 18.301 19.459 20.804 22.424 24.353 26.797 28.905 30.107 30.814 31.262 31.565 31.706 31.754 31.757 31.716 31.645 31.567 31.499 31.409 31.287 31.165 31.025 30.889 30.765 30.595 30.399 30.235 30.026 29.769 29.568 29.34 29.077 28.809 28.549 28.372 28.178 27.873 27.653 27.419 27.294 27.018 26.723 26.422 26.259 26.058 25.707 25.482 25.241 24.747 24.472 24.139 23.772 23.345 22.788 21.957 18.708 -3 ,22944 ,TETRA ,17621068,Tue Nov 30 14:40:21 CET,Tue Nov 30 17:09:32 CET,0.0 1.772 2.355 2.773 3.118 3.42 3.691 3.932 4.356 4.544 4.721 4.992 5.214 5.361 5.641 5.906 6.153 6.274 6.51 6.734 7.055 7.259 7.46 7.754 8.021 8.276 8.522 8.758 9.065 9.358 9.64 9.984 10.315 10.629 10.985 11.404 11.82 12.263 12.725 13.223 13.765 14.399 15.131 15.861 16.753 17.758 18.917 20.247 21.829 23.722 26.081 28.113 29.308 30.033 30.466 30.746 30.92 30.977 30.937 30.859 30.751 30.64 30.538 30.432 30.325 30.206 30.071 29.939 29.814 29.671 29.514 29.376 29.234 29.073 28.931 28.786 28.606 28.388 28.173 28.02 27.869 27.641 27.461 27.258 27.148 26.924 26.68 26.408 26.263 26.072 25.767 25.573 25.365 24.927 24.689 24.414 24.082 23.713 23.25 22.472 19.715 -4 ,28881 ,TETRA ,17621069,Tue Nov 30 14:40:21 CET,Tue Nov 30 17:12:36 CET,0.0 2.889 3.488 3.908 4.252 4.552 4.818 5.065 5.521 5.729 5.916 6.193 6.414 6.574 6.87 7.14 7.397 7.518 7.754 7.981 8.3 8.502 8.696 8.978 9.25 9.511 9.764 10.004 10.313 10.614 10.898 11.239 11.57 11.885 12.251 12.678 13.094 13.549 14.033 14.554 15.098 15.697 16.411 17.148 18.021 19.011 20.16 21.488 23.142 25.111 27.483 29.498 30.671 31.393 31.855 32.165 32.332 32.404 32.43 32.412 32.368 32.31 32.215 32.104 31.984 31.852 31.707 31.556 31.415 31.269 31.081 30.907 30.742 30.563 30.404 30.226 30.038 29.828 29.576 29.408 29.231 28.944 28.753 28.531 28.402 28.137 27.868 27.58 27.427 27.238 26.906 26.695 26.471 25.967 25.671 25.333 24.944 24.532 24.0 23.213 20.204 -5 ,24139 ,TETRA ,17621070,Tue Nov 30 14:41:18 CET,Tue Nov 30 16:59:28 CET,0.0 2.142 2.759 3.178 3.521 3.829 4.106 4.361 4.822 5.022 5.199 5.475 5.695 5.849 6.143 6.422 6.682 6.803 7.031 7.246 7.563 7.767 7.96 8.238 8.507 8.768 9.015 9.25 9.554 9.842 10.114 10.444 10.761 11.063 11.429 11.84 12.24 12.683 13.153 13.656 14.189 14.795 15.509 16.22 17.071 18.044 19.174 20.488 22.05 23.966 26.399 28.428 29.639 30.364 30.79 31.076 31.23 31.301 31.334 31.317 31.262 31.193 31.099 30.977 30.828 30.68 30.525 30.385 30.261 30.115 29.962 29.841 29.702 29.524 29.369 29.211 29.038 28.835 28.612 28.458 28.284 27.984 27.767 27.523 27.392 27.126 26.824 26.477 26.288 26.04 25.579 25.323 25.059 24.459 24.105 23.704 23.249 22.709 22.021 21.04 17.058 -6 ,22932 ,TETRA ,17621071,Tue Nov 30 14:41:18 CET,Tue Nov 30 17:30:12 CET,0.0 2.176 2.778 3.213 3.558 3.855 4.126 4.383 4.85 5.048 5.224 5.504 5.722 5.876 6.165 6.439 6.701 6.827 7.069 7.301 7.63 7.83 8.024 8.31 8.575 8.834 9.094 9.336 9.637 9.933 10.218 10.56 10.888 11.201 11.573 11.997 12.409 12.861 13.348 13.875 14.431 15.058 15.779 16.498 17.359 18.351 19.503 20.829 22.426 24.379 26.813 28.857 30.08 30.833 31.301 31.594 31.749 31.811 31.836 31.822 31.779 31.717 31.619 31.493 31.364 31.239 31.087 30.929 30.759 30.588 30.424 30.267 30.086 29.874 29.697 29.53 29.371 29.203 29.008 28.854 28.685 28.401 28.193 27.96 27.835 27.571 27.284 26.98 26.818 26.627 26.329 26.134 25.919 25.464 25.211 24.915 24.561 24.138 23.63 22.932 20.09 -7 ,22230 ,TETRA ,17621073,Tue Nov 30 14:41:20 CET,Tue Nov 30 17:09:41 CET,0.0 2.89 3.498 3.916 4.269 4.583 4.851 5.091 5.522 5.722 5.908 6.186 6.403 6.557 6.853 7.127 7.376 7.495 7.728 7.944 8.253 8.451 8.641 8.914 9.179 9.436 9.682 9.917 10.214 10.496 10.774 11.113 11.436 11.758 12.14 12.562 12.959 13.392 13.878 14.414 14.972 15.593 16.319 17.042 17.901 18.878 19.999 21.294 22.888 24.803 27.17 29.168 30.333 31.055 31.511 31.811 31.967 32.022 32.022 31.983 31.928 31.866 31.775 31.638 31.47 31.308 31.138 30.963 30.806 30.656 30.498 30.341 30.165 29.971 29.811 29.659 29.481 29.264 29.024 28.848 28.662 28.373 28.158 27.931 27.818 27.584 27.339 27.054 26.897 26.688 26.331 26.121 25.885 25.343 25.073 24.777 24.428 24.018 23.477 22.638 18.575 -8 ,1297 ,TETRA ,17621074,Tue Nov 30 14:41:22 CET,Tue Nov 30 17:06:59 CET,0.0 2.385 3.04 3.484 3.84 4.147 4.422 4.682 5.133 5.35 5.552 5.832 6.054 6.208 6.499 6.772 7.024 7.144 7.377 7.598 7.921 8.131 8.328 8.61 8.882 9.15 9.41 9.658 9.967 10.252 10.517 10.848 11.181 11.49 11.842 12.258 12.665 13.112 13.588 14.102 14.654 15.272 15.998 16.722 17.575 18.538 19.662 20.958 22.48 24.331 26.69 28.734 29.964 30.736 31.226 31.538 31.664 31.676 31.653 31.612 31.545 31.447 31.317 31.16 31.003 30.858 30.696 30.542 30.41 30.273 30.124 29.971 29.786 29.597 29.448 29.281 29.101 28.906 28.685 28.525 28.369 28.115 27.936 27.752 27.65 27.427 27.198 26.92 26.756 26.56 26.235 26.036 25.83 25.399 25.143 24.831 24.476 24.039 23.49 22.674 18.63 -9 ,6410 ,TETRA ,17621075,Tue Nov 30 14:42:14 CET,Tue Nov 30 17:10:30 CET,0.0 2.543 3.175 3.607 3.947 4.237 4.497 4.728 5.145 5.338 5.523 5.804 6.016 6.16 6.433 6.696 6.948 7.067 7.304 7.536 7.863 8.062 8.252 8.524 8.784 9.044 9.293 9.526 9.835 10.131 10.413 10.756 11.083 11.397 11.752 12.167 12.581 13.026 13.501 14.005 14.535 15.121 15.805 16.519 17.373 18.352 19.496 20.791 22.349 24.277 26.697 28.738 29.944 30.724 31.227 31.53 31.689 31.769 31.772 31.69 31.59 31.495 31.388 31.245 31.091 30.958 30.783 30.596 30.417 30.243 30.079 29.917 29.738 29.551 29.38 29.203 29.042 28.866 28.678 28.54 28.386 28.125 27.918 27.703 27.593 27.342 27.071 26.784 26.626 26.421 26.061 25.848 25.634 25.166 24.888 24.574 24.231 23.795 23.242 22.529 18.801 -10 ,4764 ,TETRA ,17621076,Tue Nov 30 14:42:15 CET,Tue Nov 30 17:10:26 CET,0.0 2.114 2.701 3.132 3.517 3.848 4.114 4.347 4.77 4.956 5.127 5.395 5.613 5.767 6.045 6.312 6.57 6.694 6.928 7.143 7.459 7.664 7.855 8.131 8.395 8.648 8.888 9.12 9.433 9.742 10.043 10.39 10.719 11.047 11.43 11.85 12.264 12.733 13.228 13.752 14.302 14.93 15.67 16.429 17.329 18.33 19.492 20.81 22.385 24.301 26.719 28.718 29.82 30.512 30.933 31.16 31.295 31.356 31.334 31.293 31.254 31.201 31.136 31.052 30.935 30.799 30.651 30.509 30.372 30.227 30.072 29.927 29.748 29.538 29.37 29.212 29.056 28.884 28.706 28.571 28.42 28.175 27.989 27.781 27.671 27.461 27.24 26.96 26.801 26.611 26.325 26.148 25.954 25.497 25.221 24.919 24.587 24.17 23.596 22.882 19.688 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_30.txt deleted file mode 100644 index 34703911..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29927 ,TETRA ,17621077,Tue Nov 30 14:42:16 CET,Tue Nov 30 17:10:11 CET,0.0 7.985 9.048 9.793 10.392 10.906 11.373 11.792 12.537 12.868 13.176 13.679 13.985 14.21 14.632 15.048 15.46 15.646 15.982 16.287 16.689 16.963 17.241 17.648 18.036 18.394 18.73 19.056 19.474 19.876 20.267 20.718 21.13 21.54 22.027 22.562 23.048 23.577 24.144 24.729 25.357 26.038 26.814 27.599 28.486 29.464 30.59 31.861 33.331 35.023 37.021 38.548 39.326 39.735 39.924 40.007 40.039 39.999 39.896 39.736 39.575 39.404 39.214 39.018 38.84 38.668 38.481 38.312 38.143 37.96 37.75 37.566 37.375 37.159 36.99 36.82 36.617 36.373 36.099 35.898 35.69 35.357 35.119 34.852 34.707 34.413 34.097 33.756 33.562 33.314 32.915 32.679 32.41 31.82 31.494 31.124 30.704 30.21 29.582 28.666 23.987 -2 ,23733 ,TETRA ,17621078,Tue Nov 30 14:42:15 CET,Tue Nov 30 17:08:42 CET,0.0 4.011 5.061 5.842 6.442 6.949 7.377 7.761 8.455 8.75 9.02 9.496 9.797 10.017 10.437 10.829 11.201 11.384 11.725 12.055 12.541 12.853 13.151 13.571 13.973 14.322 14.639 14.954 15.351 15.754 16.153 16.632 17.08 17.467 17.882 18.341 18.798 19.293 19.818 20.382 20.994 21.699 22.509 23.294 24.159 25.125 26.31 27.712 29.349 31.125 33.038 34.537 35.39 35.913 36.173 36.245 36.228 36.158 36.042 35.904 35.753 35.57 35.382 35.207 35.03 34.846 34.657 34.479 34.274 34.031 33.802 33.616 33.429 33.246 33.082 32.898 32.698 32.481 32.244 32.079 31.91 31.623 31.42 31.219 31.116 30.886 30.615 30.329 30.184 29.996 29.691 29.501 29.284 28.762 28.452 28.134 27.77 27.283 26.69 25.878 22.458 -3 ,6055 ,TETRA ,17621079,Tue Nov 30 14:42:18 CET,Tue Nov 30 17:10:54 CET,0.0 5.246 6.195 6.843 7.361 7.804 8.218 8.617 9.309 9.608 9.885 10.326 10.61 10.824 11.226 11.595 11.937 12.103 12.437 12.777 13.262 13.565 13.872 14.31 14.716 15.083 15.42 15.738 16.138 16.535 16.917 17.375 17.805 18.203 18.659 19.152 19.652 20.242 20.826 21.403 22.02 22.699 23.472 24.263 25.203 26.221 27.352 28.63 30.148 31.893 33.954 35.646 36.51 36.949 37.151 37.207 37.179 37.103 36.986 36.814 36.641 36.464 36.304 36.138 35.954 35.776 35.58 35.402 35.235 35.036 34.82 34.647 34.469 34.27 34.09 33.894 33.699 33.488 33.253 33.087 32.916 32.651 32.45 32.227 32.115 31.871 31.592 31.298 31.149 30.946 30.597 30.389 30.181 29.729 29.441 29.122 28.778 28.341 27.772 27.017 23.85 -4 ,26694 ,TETRA ,17621080,Tue Nov 30 14:43:15 CET,Tue Nov 30 17:06:04 CET,0.0 3.727 4.581 5.202 5.706 6.135 6.509 6.851 7.482 7.766 8.026 8.435 8.713 8.927 9.331 9.703 10.053 10.224 10.564 10.893 11.344 11.632 11.91 12.315 12.708 13.072 13.4 13.695 14.054 14.4 14.738 15.15 15.542 15.912 16.339 16.808 17.258 17.753 18.276 18.827 19.402 20.043 20.788 21.52 22.356 23.3 24.383 25.601 27.05 28.748 30.689 32.189 33.035 33.561 33.787 33.839 33.858 33.778 33.656 33.518 33.358 33.176 32.967 32.767 32.577 32.378 32.17 31.993 31.825 31.629 31.425 31.242 31.024 30.801 30.64 30.466 30.28 30.093 29.89 29.744 29.589 29.321 29.112 28.893 28.777 28.521 28.252 27.954 27.792 27.59 27.257 27.055 26.823 26.288 25.987 25.657 25.286 24.834 24.223 23.393 20.165 -5 ,260 ,TETRA ,17621081,Tue Nov 30 14:43:15 CET,Tue Nov 30 17:13:41 CET,0.0 5.519 6.49 7.213 7.818 8.315 8.735 9.108 9.783 10.09 10.374 10.831 11.136 11.389 11.859 12.272 12.661 12.853 13.229 13.576 14.065 14.372 14.667 15.088 15.475 15.844 16.206 16.555 17.009 17.42 17.772 18.177 18.562 18.928 19.371 19.871 20.336 20.828 21.338 21.888 22.468 23.14 23.9 24.642 25.532 26.542 27.729 29.047 30.521 32.189 34.011 35.41 36.145 36.499 36.664 36.733 36.724 36.662 36.553 36.386 36.227 36.078 35.927 35.744 35.539 35.339 35.119 34.929 34.764 34.573 34.379 34.206 33.987 33.747 33.549 33.339 33.127 32.909 32.679 32.514 32.342 32.078 31.891 31.685 31.577 31.332 31.067 30.772 30.607 30.401 30.06 29.854 29.64 29.178 28.907 28.604 28.248 27.82 27.304 26.597 23.68 -6 ,14471 ,TETRA ,17621082,Tue Nov 30 14:43:16 CET,Tue Nov 30 17:11:45 CET,0.0 3.798 4.715 5.369 5.897 6.346 6.743 7.09 7.716 8.011 8.289 8.733 9.026 9.258 9.687 10.083 10.462 10.644 10.977 11.268 11.664 11.925 12.197 12.586 12.938 13.275 13.603 13.909 14.304 14.679 15.029 15.441 15.829 16.194 16.603 17.072 17.528 18.016 18.56 19.159 19.783 20.477 21.254 22.006 22.874 23.843 24.947 26.193 27.624 29.284 31.233 32.681 33.357 33.716 33.912 33.979 33.972 33.911 33.82 33.702 33.572 33.42 33.245 33.056 32.863 32.685 32.493 32.295 32.125 31.951 31.751 31.568 31.357 31.117 30.935 30.747 30.535 30.3 30.021 29.824 29.631 29.344 29.147 28.928 28.813 28.553 28.263 27.966 27.809 27.605 27.271 27.072 26.859 26.372 26.102 25.801 25.453 25.06 24.544 23.758 20.506 -7 ,1439 ,TETRA ,17621083,Tue Nov 30 14:43:15 CET,Tue Nov 30 17:09:25 CET,0.0 4.441 5.557 6.324 6.88 7.324 7.696 8.027 8.665 8.954 9.222 9.673 9.957 10.178 10.606 11.014 11.389 11.565 11.913 12.248 12.729 13.035 13.322 13.727 14.115 14.484 14.846 15.205 15.661 16.093 16.503 16.992 17.485 17.964 18.517 19.143 19.714 20.302 20.864 21.405 21.994 22.664 23.477 24.29 25.175 26.131 27.2 28.416 29.903 31.669 33.654 35.192 35.99 36.392 36.541 36.581 36.564 36.473 36.366 36.208 36.031 35.863 35.688 35.507 35.323 35.14 34.936 34.747 34.572 34.373 34.167 33.99 33.803 33.617 33.459 33.278 33.086 32.872 32.644 32.483 32.314 32.027 31.812 31.6 31.489 31.248 30.995 30.708 30.556 30.371 30.032 29.828 29.63 29.186 28.936 28.63 28.276 27.873 27.336 26.582 23.07 -8 ,7935 ,TETRA ,17621084,Tue Nov 30 14:43:15 CET,Tue Nov 30 17:06:58 CET,0.0 5.43 6.356 7.041 7.596 8.02 8.389 8.73 9.35 9.641 9.925 10.402 10.714 10.96 11.399 11.787 12.124 12.284 12.585 12.864 13.283 13.574 13.838 14.177 14.498 14.803 15.152 15.515 15.94 16.334 16.717 17.175 17.604 18.025 18.51 19.05 19.571 20.129 20.747 21.399 22.063 22.818 23.674 24.514 25.513 26.638 27.929 29.342 30.878 32.617 34.629 36.22 37.12 37.627 37.896 38.011 38.045 38.028 37.969 37.865 37.733 37.582 37.431 37.264 37.071 36.89 36.686 36.484 36.293 36.099 35.889 35.706 35.519 35.3 35.128 34.945 34.733 34.523 34.304 34.133 33.944 33.646 33.439 33.234 33.127 32.901 32.648 32.357 32.195 31.994 31.674 31.474 31.263 30.774 30.483 30.166 29.809 29.365 28.764 27.918 24.344 -9 ,31233 ,TETRA ,17621085,Tue Nov 30 14:43:15 CET,Tue Nov 30 16:59:47 CET,0.0 7.029 8.012 8.707 9.249 9.726 10.165 10.551 11.201 11.504 11.793 12.267 12.565 12.794 13.228 13.63 13.998 14.174 14.517 14.834 15.293 15.586 15.868 16.277 16.66 17.02 17.375 17.725 18.161 18.565 18.966 19.457 19.902 20.291 20.716 21.183 21.607 22.082 22.606 23.137 23.692 24.341 25.105 25.858 26.703 27.63 28.711 29.948 31.384 33.054 35.107 36.629 37.418 37.883 38.092 38.177 38.165 38.087 38.001 37.895 37.772 37.629 37.476 37.316 37.138 36.962 36.786 36.621 36.462 36.278 36.084 35.909 35.706 35.498 35.333 35.154 34.945 34.716 34.501 34.333 34.154 33.89 33.693 33.489 33.376 33.118 32.853 32.572 32.419 32.221 31.888 31.69 31.473 30.987 30.727 30.427 30.078 29.667 29.145 28.365 24.687 -10 ,14571 ,TETRA ,17621086,Tue Nov 30 14:46:14 CET,Tue Nov 30 17:05:15 CET,0.0 5.907 6.983 7.741 8.338 8.842 9.257 9.598 10.187 10.468 10.722 11.115 11.384 11.589 11.989 12.36 12.703 12.877 13.223 13.548 14.025 14.345 14.647 15.073 15.484 15.868 16.245 16.6 17.026 17.421 17.783 18.199 18.586 18.956 19.394 19.884 20.353 20.858 21.405 21.997 22.597 23.271 24.102 24.931 25.813 26.779 27.979 29.326 30.791 32.446 34.301 35.775 36.549 36.909 37.06 37.107 37.086 37.003 36.895 36.76 36.638 36.506 36.337 36.131 35.926 35.75 35.563 35.387 35.215 35.018 34.804 34.613 34.397 34.149 33.953 33.765 33.574 33.353 33.092 32.904 32.705 32.395 32.18 31.963 31.849 31.597 31.334 31.054 30.908 30.715 30.362 30.153 29.937 29.421 29.138 28.82 28.439 27.995 27.432 26.589 23.237 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_24.txt deleted file mode 100644 index 8d7b71d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27807 ,TETRA ,17621087,Tue Nov 30 14:46:16 CET,Tue Nov 30 17:17:28 CET,0.0 2.406 2.975 3.37 3.679 3.947 4.175 4.387 4.762 4.919 5.062 5.283 5.434 5.551 5.754 5.945 6.133 6.22 6.382 6.533 6.753 6.895 7.018 7.172 7.324 7.481 7.631 7.759 7.901 8.031 8.148 8.27 8.377 8.48 8.582 8.695 8.799 8.874 8.949 9.034 9.101 9.167 9.201 9.142 9.018 8.848 8.563 8.105 7.384 6.163 4.059 1.581 -0.418 -2.032 -3.385 -4.569 -5.577 -6.479 -7.242 -8.004 -8.654 -9.218 -9.737 -10.232 -10.71 -11.133 -11.561 -11.952 -12.29 -12.633 -12.99 -13.299 -13.62 -13.951 -14.201 -14.458 -14.73 -15.018 -15.316 -15.513 -15.718 -16.042 -16.28 -16.526 -16.65 -16.909 -17.184 -17.478 -17.629 -17.848 -18.121 -18.298 -18.494 -18.924 -19.165 -19.432 -19.738 -20.097 -20.537 -21.159 -23.717 -2 ,27270 ,TETRA ,17621088,Tue Nov 30 14:46:16 CET,Tue Nov 30 17:03:41 CET,0.0 2.723 3.372 3.831 4.186 4.486 4.725 4.941 5.322 5.481 5.63 5.865 6.02 6.138 6.364 6.567 6.757 6.849 7.023 7.174 7.37 7.48 7.574 7.714 7.851 7.97 8.068 8.152 8.258 8.357 8.454 8.56 8.646 8.729 8.799 8.854 8.895 8.918 8.923 8.905 8.862 8.796 8.685 8.547 8.357 8.065 7.616 6.971 6.014 4.564 2.207 -0.498 -2.566 -4.234 -5.625 -6.839 -7.893 -8.831 -9.64 -10.413 -11.075 -11.665 -12.202 -12.701 -13.162 -13.57 -14.0 -14.385 -14.713 -15.059 -15.414 -15.702 -16.006 -16.329 -16.582 -16.844 -17.118 -17.403 -17.697 -17.895 -18.101 -18.436 -18.669 -18.902 -19.026 -19.297 -19.575 -19.87 -20.026 -20.237 -20.517 -20.703 -20.897 -21.326 -21.564 -21.823 -22.112 -22.465 -22.931 -23.561 -25.824 -3 ,17412 ,TETRA ,17621089,Tue Nov 30 14:47:15 CET,Tue Nov 30 17:49:57 CET,0.0 2.741 3.31 3.713 4.026 4.284 4.518 4.726 5.072 5.223 5.368 5.612 5.78 5.903 6.12 6.306 6.468 6.546 6.7 6.851 7.054 7.182 7.306 7.488 7.652 7.792 7.922 8.043 8.191 8.325 8.458 8.613 8.722 8.802 8.888 8.969 9.036 9.087 9.124 9.157 9.165 9.143 9.089 9.001 8.851 8.561 8.095 7.441 6.508 5.097 2.796 0.199 -1.862 -3.54 -4.902 -6.105 -7.142 -8.039 -8.808 -9.578 -10.217 -10.769 -11.301 -11.801 -12.278 -12.71 -13.148 -13.528 -13.853 -14.195 -14.547 -14.843 -15.145 -15.457 -15.7 -15.948 -16.205 -16.473 -16.763 -16.97 -17.179 -17.507 -17.738 -17.975 -18.105 -18.371 -18.646 -18.937 -19.084 -19.3 -19.58 -19.766 -19.969 -20.425 -20.681 -20.962 -21.27 -21.619 -22.037 -22.619 -24.564 -4 ,8000 ,TETRA ,17621090,Tue Nov 30 14:48:18 CET,Tue Nov 30 17:08:12 CET,0.0 2.471 3.08 3.501 3.833 4.114 4.359 4.584 4.967 5.137 5.294 5.561 5.722 5.843 6.066 6.269 6.451 6.534 6.694 6.848 7.057 7.183 7.308 7.487 7.65 7.794 7.92 8.043 8.2 8.341 8.468 8.597 8.698 8.803 8.931 9.032 9.111 9.184 9.235 9.276 9.301 9.313 9.295 9.234 9.085 8.824 8.413 7.822 6.952 5.551 3.261 0.713 -1.283 -2.914 -4.261 -5.443 -6.477 -7.388 -8.124 -8.834 -9.452 -10.0 -10.521 -11.009 -11.456 -11.869 -12.295 -12.673 -13.0 -13.335 -13.682 -13.975 -14.282 -14.598 -14.847 -15.11 -15.378 -15.653 -15.935 -16.126 -16.326 -16.651 -16.887 -17.136 -17.265 -17.534 -17.833 -18.148 -18.308 -18.533 -18.842 -19.038 -19.245 -19.701 -19.964 -20.265 -20.592 -20.958 -21.429 -22.049 -24.424 -5 ,25402 ,TETRA ,17621091,Tue Nov 30 14:48:18 CET,Tue Nov 30 17:15:00 CET,0.0 2.729 3.392 3.823 4.163 4.441 4.681 4.898 5.269 5.427 5.582 5.829 5.983 6.102 6.327 6.53 6.708 6.791 6.949 7.101 7.308 7.421 7.528 7.687 7.839 7.979 8.105 8.215 8.35 8.481 8.589 8.711 8.827 8.921 9.028 9.151 9.237 9.309 9.384 9.429 9.442 9.407 9.348 9.244 9.03 8.736 8.362 7.832 6.922 5.457 3.073 0.376 -1.658 -3.304 -4.725 -5.95 -6.993 -7.927 -8.713 -9.493 -10.14 -10.693 -11.208 -11.684 -12.129 -12.535 -12.961 -13.346 -13.682 -14.031 -14.391 -14.689 -14.987 -15.296 -15.538 -15.788 -16.068 -16.358 -16.647 -16.848 -17.054 -17.375 -17.6 -17.834 -17.954 -18.205 -18.478 -18.774 -18.93 -19.144 -19.43 -19.622 -19.825 -20.259 -20.509 -20.788 -21.088 -21.437 -21.876 -22.505 -24.308 -6 ,31433 ,TETRA ,17621092,Tue Nov 30 14:51:19 CET,Tue Nov 30 17:17:31 CET,0.0 2.234 2.845 3.268 3.591 3.865 4.114 4.345 4.727 4.896 5.056 5.304 5.46 5.575 5.786 5.984 6.155 6.24 6.406 6.556 6.76 6.889 7.019 7.181 7.309 7.427 7.532 7.628 7.749 7.868 7.983 8.111 8.215 8.297 8.39 8.503 8.588 8.644 8.704 8.784 8.836 8.831 8.783 8.691 8.518 8.251 7.85 7.268 6.382 5.048 2.865 0.303 -1.752 -3.441 -4.852 -6.074 -7.076 -7.946 -8.702 -9.451 -10.077 -10.625 -11.145 -11.628 -12.078 -12.487 -12.913 -13.298 -13.625 -13.958 -14.312 -14.625 -14.954 -15.282 -15.525 -15.772 -16.031 -16.297 -16.58 -16.774 -16.982 -17.331 -17.567 -17.806 -17.932 -18.203 -18.485 -18.768 -18.92 -19.147 -19.479 -19.676 -19.881 -20.353 -20.626 -20.925 -21.249 -21.619 -22.04 -22.62 -24.936 -7 ,20932 ,TETRA ,17621093,Tue Nov 30 14:51:19 CET,Tue Nov 30 17:06:30 CET,0.0 2.566 3.247 3.675 4.022 4.321 4.577 4.8 5.161 5.326 5.482 5.752 5.924 6.042 6.26 6.449 6.612 6.691 6.836 6.978 7.197 7.33 7.455 7.63 7.785 7.928 8.065 8.191 8.328 8.444 8.546 8.667 8.788 8.896 8.993 9.075 9.146 9.221 9.3 9.38 9.423 9.446 9.456 9.41 9.278 9.033 8.661 8.09 7.194 5.799 3.469 0.741 -1.375 -3.08 -4.473 -5.687 -6.732 -7.654 -8.436 -9.193 -9.841 -10.406 -10.93 -11.429 -11.889 -12.306 -12.744 -13.134 -13.474 -13.826 -14.184 -14.482 -14.796 -15.12 -15.373 -15.632 -15.9 -16.175 -16.459 -16.663 -16.879 -17.22 -17.452 -17.687 -17.811 -18.061 -18.334 -18.632 -18.784 -19.005 -19.308 -19.498 -19.689 -20.125 -20.381 -20.656 -20.969 -21.317 -21.756 -22.391 -25.275 -8 ,28226 ,TETRA ,17621094,Tue Nov 30 14:51:20 CET,Tue Nov 30 17:18:57 CET,0.0 2.685 3.27 3.712 4.056 4.351 4.615 4.838 5.21 5.374 5.53 5.795 5.966 6.092 6.332 6.555 6.759 6.852 7.01 7.16 7.371 7.504 7.632 7.81 7.971 8.112 8.25 8.379 8.529 8.653 8.761 8.885 9.0 9.107 9.21 9.312 9.397 9.468 9.534 9.567 9.569 9.555 9.495 9.395 9.235 8.985 8.637 8.136 7.297 5.99 3.832 1.304 -0.694 -2.332 -3.685 -4.853 -5.82 -6.673 -7.412 -8.137 -8.783 -9.361 -9.897 -10.403 -10.87 -11.295 -11.733 -12.115 -12.455 -12.816 -13.183 -13.482 -13.784 -14.094 -14.343 -14.596 -14.852 -15.124 -15.411 -15.61 -15.818 -16.143 -16.376 -16.624 -16.747 -16.993 -17.257 -17.557 -17.713 -17.93 -18.216 -18.408 -18.617 -19.084 -19.342 -19.618 -19.936 -20.31 -20.748 -21.36 -24.299 -9 ,13950 ,TETRA ,17621095,Tue Nov 30 14:51:22 CET,Tue Nov 30 17:19:33 CET,0.0 2.476 3.098 3.516 3.85 4.131 4.373 4.582 4.941 5.104 5.252 5.491 5.636 5.743 5.952 6.148 6.329 6.411 6.563 6.707 6.904 7.034 7.163 7.335 7.489 7.639 7.766 7.868 8.007 8.139 8.246 8.37 8.478 8.572 8.69 8.83 8.947 9.041 9.094 9.136 9.179 9.195 9.164 9.086 8.953 8.77 8.47 7.979 7.252 5.988 3.626 0.928 -1.18 -2.883 -4.289 -5.509 -6.56 -7.509 -8.294 -9.059 -9.709 -10.275 -10.806 -11.295 -11.747 -12.173 -12.627 -13.021 -13.373 -13.736 -14.089 -14.379 -14.686 -15.004 -15.244 -15.496 -15.762 -16.039 -16.328 -16.532 -16.748 -17.088 -17.323 -17.563 -17.691 -17.962 -18.235 -18.518 -18.667 -18.884 -19.177 -19.36 -19.557 -19.985 -20.224 -20.494 -20.793 -21.155 -21.618 -22.232 -24.804 -10 ,26019 ,TETRA ,17621096,Tue Nov 30 14:51:21 CET,Tue Nov 30 17:25:09 CET,0.0 2.281 2.841 3.26 3.604 3.887 4.137 4.358 4.73 4.902 5.068 5.328 5.491 5.609 5.833 6.034 6.204 6.283 6.44 6.593 6.81 6.942 7.059 7.223 7.365 7.479 7.588 7.702 7.848 7.989 8.113 8.248 8.365 8.468 8.581 8.7 8.801 8.899 9.01 9.101 9.175 9.229 9.243 9.206 9.133 8.956 8.599 8.092 7.325 6.079 3.923 1.329 -0.767 -2.487 -3.903 -5.093 -6.119 -7.02 -7.764 -8.497 -9.119 -9.669 -10.194 -10.688 -11.137 -11.537 -11.947 -12.322 -12.657 -13.003 -13.356 -13.655 -13.96 -14.267 -14.511 -14.764 -15.026 -15.296 -15.572 -15.766 -15.968 -16.289 -16.516 -16.749 -16.872 -17.13 -17.396 -17.68 -17.834 -18.056 -18.356 -18.544 -18.742 -19.169 -19.41 -19.691 -20.013 -20.371 -20.791 -21.409 -23.828 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_31.txt deleted file mode 100644 index 80c8bc63..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4181 ,TETRA ,17621097,Tue Nov 30 14:51:21 CET,Tue Nov 30 17:26:42 CET,0.0 3.443 4.251 4.833 5.292 5.67 5.997 6.302 6.819 7.039 7.246 7.601 7.807 7.967 8.27 8.555 8.821 8.944 9.168 9.387 9.694 9.857 9.992 10.175 10.347 10.51 10.669 10.821 11.002 11.172 11.322 11.494 11.662 11.814 11.977 12.133 12.262 12.414 12.558 12.659 12.741 12.79 12.816 12.851 12.826 12.676 12.406 11.972 11.248 10.152 8.249 5.879 3.948 2.295 0.947 -0.219 -1.226 -2.097 -2.845 -3.594 -4.223 -4.779 -5.301 -5.784 -6.238 -6.644 -7.072 -7.466 -7.81 -8.163 -8.521 -8.817 -9.127 -9.452 -9.706 -9.966 -10.236 -10.522 -10.823 -11.03 -11.239 -11.562 -11.793 -12.038 -12.168 -12.441 -12.724 -13.033 -13.194 -13.416 -13.706 -13.893 -14.101 -14.552 -14.799 -15.076 -15.391 -15.747 -16.192 -16.813 -20.066 -2 ,20056 ,TETRA ,17621098,Tue Nov 30 14:51:20 CET,Tue Nov 30 17:10:10 CET,0.0 2.853 3.542 4.046 4.441 4.772 5.052 5.305 5.742 5.929 6.097 6.372 6.55 6.695 6.962 7.203 7.43 7.534 7.726 7.91 8.182 8.361 8.543 8.795 9.019 9.235 9.444 9.622 9.811 9.978 10.129 10.297 10.455 10.606 10.772 10.921 11.037 11.159 11.278 11.384 11.461 11.521 11.574 11.582 11.548 11.43 11.132 10.667 9.991 8.86 6.822 4.336 2.267 0.552 -0.843 -2.059 -3.106 -4.011 -4.776 -5.537 -6.191 -6.769 -7.307 -7.798 -8.248 -8.669 -9.105 -9.497 -9.834 -10.183 -10.546 -10.843 -11.155 -11.473 -11.723 -11.981 -12.244 -12.532 -12.841 -13.043 -13.248 -13.58 -13.817 -14.061 -14.183 -14.442 -14.724 -15.027 -15.185 -15.406 -15.7 -15.892 -16.099 -16.557 -16.812 -17.088 -17.391 -17.747 -18.188 -18.817 -21.681 -3 ,8898 ,TETRA ,17621099,Tue Nov 30 14:52:29 CET,Tue Nov 30 17:11:14 CET,0.0 2.554 3.281 3.793 4.214 4.571 4.855 5.101 5.55 5.737 5.907 6.202 6.384 6.532 6.799 7.037 7.268 7.382 7.589 7.779 8.046 8.197 8.331 8.523 8.708 8.885 9.046 9.195 9.38 9.554 9.709 9.882 10.045 10.188 10.357 10.541 10.681 10.797 10.904 11.002 11.081 11.157 11.227 11.259 11.232 11.127 10.907 10.438 9.697 8.574 6.518 3.973 1.923 0.271 -1.081 -2.264 -3.283 -4.186 -4.943 -5.681 -6.318 -6.886 -7.424 -7.922 -8.388 -8.814 -9.243 -9.627 -9.967 -10.321 -10.683 -10.983 -11.293 -11.616 -11.865 -12.133 -12.412 -12.692 -12.987 -13.192 -13.401 -13.724 -13.95 -14.195 -14.323 -14.593 -14.882 -15.183 -15.341 -15.561 -15.876 -16.077 -16.281 -16.721 -16.982 -17.289 -17.634 -18.013 -18.466 -19.125 -22.262 -4 ,26110 ,TETRA ,17621100,Tue Nov 30 14:52:30 CET,Tue Nov 30 17:14:46 CET,0.0 2.798 3.555 4.11 4.519 4.863 5.169 5.422 5.854 6.055 6.238 6.533 6.717 6.858 7.129 7.394 7.62 7.722 7.922 8.101 8.348 8.503 8.645 8.852 9.036 9.2 9.361 9.507 9.682 9.843 10.006 10.23 10.407 10.529 10.668 10.824 10.972 11.112 11.236 11.35 11.461 11.554 11.614 11.626 11.568 11.417 11.155 10.718 9.955 8.706 6.646 4.26 2.3 0.65 -0.737 -1.942 -2.947 -3.807 -4.549 -5.287 -5.916 -6.481 -7.02 -7.524 -7.983 -8.402 -8.833 -9.219 -9.555 -9.904 -10.265 -10.559 -10.879 -11.219 -11.48 -11.749 -12.027 -12.318 -12.623 -12.832 -13.046 -13.377 -13.625 -13.889 -14.02 -14.287 -14.558 -14.854 -15.017 -15.241 -15.531 -15.719 -15.917 -16.358 -16.609 -16.891 -17.208 -17.57 -18.05 -18.757 -22.098 -5 ,14413 ,TETRA ,17621101,Tue Nov 30 14:52:32 CET,Tue Nov 30 17:15:02 CET,0.0 4.108 4.963 5.539 5.958 6.304 6.606 6.861 7.305 7.504 7.678 7.958 8.139 8.287 8.551 8.786 9.004 9.102 9.284 9.466 9.725 9.883 10.027 10.221 10.414 10.598 10.764 10.915 11.108 11.282 11.43 11.597 11.753 11.898 12.043 12.198 12.337 12.451 12.552 12.653 12.741 12.809 12.852 12.837 12.761 12.62 12.345 11.913 11.239 10.043 7.942 5.471 3.434 1.757 0.368 -0.846 -1.885 -2.792 -3.542 -4.297 -4.946 -5.517 -6.068 -6.581 -7.052 -7.473 -7.909 -8.304 -8.646 -8.992 -9.363 -9.677 -9.992 -10.326 -10.581 -10.842 -11.12 -11.41 -11.704 -11.904 -12.114 -12.44 -12.672 -12.926 -13.057 -13.319 -13.602 -13.915 -14.083 -14.312 -14.616 -14.808 -15.001 -15.443 -15.708 -15.996 -16.313 -16.685 -17.163 -17.808 -20.561 -6 ,24178 ,TETRA ,17621102,Tue Nov 30 14:53:24 CET,Tue Nov 30 17:25:41 CET,0.0 2.952 3.666 4.188 4.599 4.947 5.245 5.497 5.928 6.122 6.293 6.564 6.744 6.886 7.132 7.352 7.562 7.664 7.849 8.021 8.251 8.391 8.53 8.73 8.927 9.108 9.266 9.4 9.556 9.709 9.864 10.038 10.206 10.357 10.508 10.672 10.813 10.941 11.062 11.186 11.299 11.384 11.424 11.422 11.357 11.218 10.939 10.486 9.778 8.623 6.638 4.235 2.277 0.653 -0.71 -1.92 -2.95 -3.851 -4.622 -5.39 -6.041 -6.614 -7.151 -7.638 -8.083 -8.496 -8.934 -9.324 -9.657 -9.998 -10.356 -10.654 -10.964 -11.289 -11.544 -11.813 -12.085 -12.358 -12.661 -12.88 -13.095 -13.426 -13.668 -13.918 -14.042 -14.304 -14.584 -14.876 -15.029 -15.25 -15.537 -15.718 -15.912 -16.344 -16.59 -16.864 -17.176 -17.544 -17.989 -18.605 -21.159 -7 ,24224 ,TETRA ,17621103,Tue Nov 30 14:53:26 CET,Tue Nov 30 17:26:39 CET,0.0 2.756 3.463 3.953 4.344 4.669 4.939 5.178 5.594 5.778 5.951 6.245 6.409 6.534 6.771 6.979 7.181 7.277 7.45 7.611 7.84 7.983 8.111 8.294 8.472 8.635 8.786 8.924 9.092 9.252 9.384 9.538 9.685 9.81 9.937 10.053 10.148 10.241 10.339 10.437 10.514 10.567 10.578 10.557 10.495 10.344 10.045 9.558 8.854 7.771 5.763 3.317 1.355 -0.279 -1.63 -2.795 -3.792 -4.697 -5.46 -6.208 -6.848 -7.419 -7.971 -8.483 -8.942 -9.37 -9.817 -10.207 -10.55 -10.9 -11.258 -11.56 -11.87 -12.194 -12.453 -12.712 -12.972 -13.251 -13.541 -13.741 -13.953 -14.274 -14.493 -14.728 -14.852 -15.113 -15.382 -15.666 -15.817 -16.038 -16.348 -16.544 -16.747 -17.187 -17.433 -17.708 -18.013 -18.37 -18.819 -19.422 -21.788 -8 ,20289 ,TETRA ,17621104,Tue Nov 30 14:53:25 CET,Tue Nov 30 17:21:47 CET,0.0 3.178 4.015 4.595 5.06 5.447 5.798 6.114 6.643 6.867 7.073 7.417 7.612 7.757 8.015 8.242 8.453 8.553 8.75 8.932 9.188 9.341 9.475 9.665 9.845 10.011 10.159 10.306 10.512 10.706 10.872 11.048 11.207 11.358 11.517 11.666 11.791 11.912 12.035 12.145 12.229 12.282 12.32 12.336 12.305 12.184 11.915 11.441 10.662 9.446 7.396 4.943 2.94 1.29 -0.083 -1.29 -2.354 -3.319 -4.133 -4.905 -5.544 -6.113 -6.664 -7.187 -7.661 -8.082 -8.51 -8.887 -9.22 -9.569 -9.93 -10.23 -10.54 -10.87 -11.125 -11.388 -11.663 -11.941 -12.235 -12.441 -12.65 -12.978 -13.208 -13.449 -13.577 -13.843 -14.122 -14.414 -14.568 -14.796 -15.09 -15.274 -15.48 -15.942 -16.193 -16.472 -16.787 -17.16 -17.628 -18.323 -20.964 -9 ,3861 ,TETRA ,17621105,Tue Nov 30 14:53:25 CET,Tue Nov 30 17:20:26 CET,0.0 3.06 3.87 4.38 4.778 5.127 5.421 5.686 6.185 6.385 6.559 6.88 7.068 7.212 7.479 7.721 7.939 8.041 8.236 8.41 8.659 8.818 8.963 9.167 9.349 9.524 9.696 9.855 10.051 10.224 10.382 10.566 10.738 10.886 11.033 11.184 11.318 11.452 11.568 11.685 11.794 11.885 11.968 12.002 11.963 11.867 11.641 11.206 10.5 9.357 7.322 4.856 2.903 1.284 -0.074 -1.271 -2.289 -3.159 -3.91 -4.678 -5.34 -5.917 -6.456 -6.972 -7.44 -7.86 -8.304 -8.7 -9.041 -9.392 -9.753 -10.054 -10.364 -10.686 -10.933 -11.189 -11.457 -11.738 -12.03 -12.237 -12.458 -12.79 -13.022 -13.271 -13.398 -13.656 -13.94 -14.256 -14.419 -14.634 -14.92 -15.119 -15.332 -15.804 -16.064 -16.343 -16.67 -17.051 -17.513 -18.155 -20.973 -10 ,25746 ,TETRA ,17621106,Tue Nov 30 14:53:27 CET,Tue Nov 30 17:20:00 CET,0.0 2.687 3.408 3.93 4.351 4.724 5.03 5.286 5.708 5.894 6.061 6.348 6.535 6.674 6.914 7.148 7.381 7.489 7.678 7.847 8.085 8.237 8.382 8.581 8.758 8.923 9.088 9.239 9.423 9.59 9.745 9.923 10.078 10.227 10.394 10.552 10.698 10.852 10.974 11.073 11.183 11.277 11.32 11.316 11.245 11.11 10.907 10.534 9.842 8.677 6.647 4.226 2.268 0.587 -0.833 -2.056 -3.088 -3.994 -4.762 -5.543 -6.229 -6.812 -7.333 -7.821 -8.285 -8.7 -9.126 -9.513 -9.85 -10.204 -10.584 -10.897 -11.223 -11.55 -11.795 -12.053 -12.324 -12.611 -12.905 -13.107 -13.315 -13.651 -13.877 -14.112 -14.236 -14.49 -14.771 -15.067 -15.219 -15.434 -15.71 -15.892 -16.085 -16.501 -16.735 -17.004 -17.319 -17.679 -18.129 -18.789 -21.665 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_34_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_34_26.txt deleted file mode 100644 index 4c02db9c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_34_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27429 ,TETRA ,17621107,Tue Nov 30 14:54:18 CET,Tue Nov 30 17:14:47 CET,0.0 1.986 2.556 2.947 3.258 3.525 3.761 3.968 4.322 4.475 4.614 4.771 4.972 5.082 5.279 5.457 5.619 5.697 5.843 5.976 6.146 6.247 6.351 6.497 6.624 6.734 6.841 6.947 7.074 7.192 7.294 7.384 7.457 7.526 7.599 7.662 7.684 7.692 7.704 7.696 7.662 7.591 7.436 7.189 6.787 6.243 5.506 4.523 3.144 1.096 -2.244 -6.065 -9.001 -11.427 -13.489 -15.267 -16.75 -18.061 -19.154 -20.203 -21.093 -21.88 -22.617 -23.286 -23.892 -24.448 -25.041 -25.571 -26.024 -26.488 -26.961 -27.353 -27.769 -28.194 -28.523 -28.867 -29.211 -29.57 -29.948 -30.203 -30.475 -30.906 -31.208 -31.532 -31.693 -32.022 -32.365 -32.712 -32.897 -33.23 -33.529 -33.752 -33.985 -34.501 -34.785 -35.098 -35.455 -35.848 -36.314 -36.946 -39.326 -2 ,10729 ,TETRA ,17621108,Tue Nov 30 14:54:19 CET,Tue Nov 30 17:21:51 CET,0.0 2.563 3.116 3.565 3.936 4.238 4.51 4.75 5.14 5.309 5.479 5.699 5.93 6.066 6.314 6.527 6.708 6.79 6.962 7.124 7.331 7.465 7.592 7.766 7.923 8.067 8.207 8.332 8.475 8.602 8.714 8.843 8.963 9.065 9.171 9.275 9.348 9.411 9.478 9.519 9.513 9.485 9.397 9.239 8.986 8.585 7.976 7.038 5.658 3.655 0.506 -3.178 -6.145 -8.569 -10.594 -12.346 -13.807 -15.102 -16.205 -17.25 -18.12 -18.882 -19.598 -20.264 -20.879 -21.444 -22.027 -22.546 -22.992 -23.442 -23.907 -24.294 -24.697 -25.114 -25.435 -25.765 -26.11 -26.475 -26.845 -27.095 -27.348 -27.732 -28.003 -28.288 -28.434 -28.732 -29.051 -29.406 -29.591 -29.907 -30.18 -30.408 -30.647 -31.132 -31.397 -31.698 -32.039 -32.439 -32.925 -33.581 -37.144 -3 ,11853 ,TETRA ,17621109,Tue Nov 30 14:55:16 CET,Tue Nov 30 17:25:23 CET,0.0 2.116 2.737 3.164 3.496 3.767 3.992 4.196 4.559 4.714 4.863 5.054 5.262 5.373 5.567 5.734 5.892 5.966 6.107 6.251 6.456 6.576 6.682 6.818 6.942 7.056 7.164 7.261 7.366 7.463 7.553 7.653 7.732 7.787 7.845 7.892 7.923 7.931 7.876 7.777 7.66 7.491 7.232 6.925 6.499 5.933 5.141 4.076 2.647 0.467 -3.227 -7.345 -10.486 -13.025 -15.147 -16.975 -18.529 -19.892 -21.057 -22.209 -23.174 -24.016 -24.797 -25.514 -26.169 -26.758 -27.359 -27.901 -28.364 -28.817 -29.281 -29.665 -30.051 -30.454 -30.774 -31.108 -31.45 -31.803 -32.178 -32.432 -32.692 -33.103 -33.387 -33.677 -33.825 -34.149 -34.499 -34.857 -35.043 -35.364 -35.636 -35.849 -36.082 -36.585 -36.859 -37.181 -37.554 -37.97 -38.454 -39.09 -41.745 -4 ,30474 ,TETRA ,17621110,Tue Nov 30 14:55:16 CET,Tue Nov 30 17:13:21 CET,0.0 2.248 2.835 3.253 3.577 3.848 4.089 4.312 4.715 4.883 5.028 5.182 5.377 5.485 5.682 5.84 6.001 6.091 6.265 6.417 6.62 6.743 6.859 7.037 7.204 7.348 7.487 7.617 7.758 7.871 7.964 8.065 8.149 8.216 8.269 8.309 8.363 8.423 8.473 8.51 8.515 8.487 8.4 8.194 7.831 7.319 6.584 5.556 4.089 1.964 -1.444 -5.351 -8.432 -10.933 -13.003 -14.773 -16.262 -17.541 -18.583 -19.633 -20.525 -21.301 -22.037 -22.729 -23.379 -23.953 -24.536 -25.05 -25.486 -25.95 -26.435 -26.819 -27.227 -27.664 -28.002 -28.353 -28.702 -29.068 -29.45 -29.706 -29.979 -30.399 -30.683 -30.988 -31.142 -31.465 -31.817 -32.182 -32.37 -32.697 -32.984 -33.202 -33.425 -33.9 -34.17 -34.461 -34.795 -35.205 -35.698 -36.373 -39.36 -5 ,22164 ,TETRA ,17621111,Tue Nov 30 14:55:18 CET,Tue Nov 30 17:24:45 CET,0.0 3.061 3.638 4.042 4.338 4.593 4.817 5.014 5.381 5.537 5.678 5.851 6.058 6.167 6.369 6.539 6.693 6.765 6.892 7.018 7.204 7.321 7.43 7.566 7.687 7.818 7.954 8.071 8.203 8.326 8.436 8.555 8.651 8.747 8.853 8.934 8.988 9.027 9.036 9.024 9.008 8.972 8.886 8.744 8.513 8.157 7.614 6.798 5.484 3.388 -0.072 -4.013 -7.044 -9.382 -11.333 -13.064 -14.516 -15.799 -16.862 -17.891 -18.766 -19.54 -20.274 -20.954 -21.572 -22.124 -22.699 -23.212 -23.657 -24.114 -24.581 -24.957 -25.334 -25.728 -26.037 -26.352 -26.676 -27.021 -27.377 -27.618 -27.873 -28.287 -28.571 -28.854 -28.999 -29.304 -29.627 -29.967 -30.14 -30.445 -30.702 -30.915 -31.144 -31.637 -31.905 -32.201 -32.536 -32.917 -33.376 -33.995 -36.176 -6 ,12495 ,TETRA ,17621112,Tue Nov 30 14:55:17 CET,Tue Nov 30 17:26:31 CET,0.0 2.215 2.844 3.276 3.611 3.9 4.148 4.373 4.777 4.96 5.12 5.299 5.52 5.641 5.88 6.104 6.298 6.384 6.537 6.671 6.846 6.966 7.088 7.246 7.388 7.524 7.648 7.766 7.898 8.002 8.098 8.208 8.301 8.385 8.493 8.582 8.643 8.702 8.762 8.798 8.783 8.719 8.582 8.384 8.065 7.639 7.075 6.253 4.982 3.051 -0.1 -3.764 -6.65 -8.993 -10.927 -12.616 -14.078 -15.356 -16.416 -17.415 -18.238 -18.979 -19.703 -20.365 -20.957 -21.505 -22.068 -22.557 -22.993 -23.441 -23.894 -24.275 -24.671 -25.077 -25.392 -25.724 -26.068 -26.419 -26.779 -27.023 -27.277 -27.673 -27.944 -28.233 -28.379 -28.677 -28.997 -29.332 -29.51 -29.815 -30.07 -30.278 -30.495 -30.98 -31.257 -31.573 -31.917 -32.303 -32.776 -33.408 -35.898 -7 ,5486 ,TETRA ,17621113,Tue Nov 30 14:55:16 CET,Tue Nov 30 17:22:48 CET,0.0 2.145 2.76 3.204 3.568 3.877 4.135 4.37 4.792 4.975 5.139 5.334 5.559 5.682 5.908 6.119 6.308 6.392 6.56 6.721 6.936 7.061 7.176 7.344 7.5 7.639 7.763 7.871 8.001 8.123 8.232 8.347 8.447 8.538 8.625 8.706 8.787 8.847 8.856 8.836 8.81 8.75 8.646 8.519 8.28 7.909 7.342 6.506 5.294 3.356 0.049 -3.675 -6.636 -9.095 -11.121 -12.869 -14.35 -15.645 -16.732 -17.798 -18.693 -19.472 -20.193 -20.859 -21.476 -22.033 -22.597 -23.09 -23.516 -23.956 -24.415 -24.79 -25.181 -25.588 -25.905 -26.248 -26.588 -26.924 -27.283 -27.533 -27.793 -28.194 -28.472 -28.759 -28.903 -29.212 -29.544 -29.892 -30.067 -30.376 -30.637 -30.846 -31.075 -31.568 -31.844 -32.158 -32.5 -32.887 -33.346 -33.979 -36.03 -8 ,7893 ,TETRA ,17621114,Tue Nov 30 14:57:18 CET,Tue Nov 30 17:17:23 CET,0.0 3.127 3.753 4.222 4.58 4.865 5.115 5.333 5.708 5.874 6.024 6.217 6.447 6.576 6.82 7.032 7.228 7.32 7.486 7.632 7.834 7.958 8.074 8.238 8.374 8.492 8.605 8.709 8.825 8.923 9.025 9.152 9.253 9.331 9.422 9.52 9.585 9.631 9.654 9.649 9.62 9.569 9.48 9.342 9.123 8.812 8.322 7.539 6.238 4.096 0.739 -3.039 -6.043 -8.473 -10.502 -12.222 -13.665 -14.941 -16.012 -17.051 -17.927 -18.719 -19.467 -20.163 -20.794 -21.355 -21.939 -22.465 -22.918 -23.379 -23.864 -24.27 -24.664 -25.054 -25.365 -25.698 -26.044 -26.398 -26.758 -27.007 -27.266 -27.67 -27.952 -28.239 -28.391 -28.711 -29.039 -29.376 -29.55 -29.865 -30.127 -30.343 -30.561 -31.035 -31.31 -31.618 -31.96 -32.334 -32.791 -33.438 -35.758 -9 ,6004 ,TETRA ,17621115,Tue Nov 30 15:00:01 CET,Tue Nov 30 17:25:32 CET,0.0 2.501 3.07 3.489 3.833 4.126 4.377 4.596 4.959 5.119 5.271 5.463 5.694 5.822 6.063 6.276 6.465 6.555 6.722 6.879 7.1 7.237 7.362 7.524 7.661 7.777 7.901 8.02 8.14 8.244 8.339 8.468 8.572 8.636 8.695 8.758 8.813 8.845 8.837 8.799 8.744 8.671 8.535 8.305 7.965 7.481 6.746 5.65 4.074 1.852 -1.651 -5.667 -8.793 -11.298 -13.353 -15.139 -16.632 -17.944 -19.06 -20.127 -21.013 -21.795 -22.522 -23.191 -23.81 -24.374 -24.976 -25.502 -25.939 -26.386 -26.836 -27.209 -27.601 -28.009 -28.329 -28.656 -28.981 -29.323 -29.686 -29.934 -30.184 -30.577 -30.855 -31.138 -31.284 -31.599 -31.946 -32.313 -32.499 -32.815 -33.067 -33.275 -33.494 -33.983 -34.262 -34.57 -34.913 -35.299 -35.771 -36.432 -39.146 -10 ,18320 ,TETRA ,17621116,Tue Nov 30 15:00:02 CET,Tue Nov 30 17:28:46 CET,0.0 1.703 2.282 2.713 3.079 3.384 3.638 3.869 4.253 4.427 4.59 4.778 4.995 5.11 5.328 5.528 5.715 5.805 5.968 6.12 6.333 6.463 6.578 6.724 6.871 7.008 7.122 7.23 7.363 7.479 7.583 7.693 7.784 7.869 7.965 8.057 8.134 8.193 8.215 8.196 8.155 8.073 7.906 7.67 7.32 6.848 6.158 5.198 3.882 1.885 -1.485 -5.305 -8.269 -10.705 -12.702 -14.448 -15.934 -17.206 -18.302 -19.403 -20.325 -21.112 -21.845 -22.53 -23.16 -23.723 -24.316 -24.85 -25.289 -25.731 -26.198 -26.586 -26.981 -27.388 -27.705 -28.028 -28.36 -28.713 -29.074 -29.323 -29.582 -29.985 -30.269 -30.571 -30.724 -31.031 -31.368 -31.728 -31.913 -32.233 -32.496 -32.712 -32.936 -33.41 -33.692 -34.006 -34.341 -34.711 -35.176 -35.841 -38.228 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_29.txt deleted file mode 100644 index af787911..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2303 ,TETRA ,17621117,Tue Nov 30 15:00:02 CET,Tue Nov 30 17:30:26 CET,0.0 2.346 2.941 3.357 3.654 3.902 4.13 4.325 4.633 4.759 4.877 4.984 5.184 5.264 5.403 5.529 5.637 5.684 5.758 5.819 5.893 5.936 5.972 6.006 6.018 6.014 6.004 5.982 5.945 5.899 5.857 5.792 5.688 5.574 5.425 5.21 4.977 4.69 4.322 3.889 3.395 2.784 2.01 1.164 0.067 -1.259 -3.053 -5.42 -8.504 -12.794 -19.231 -26.12 -31.267 -35.292 -38.546 -41.25 -43.478 -45.4 -46.986 -48.538 -49.837 -50.948 -51.968 -52.91 -53.772 -54.544 -55.336 -56.028 -56.608 -57.196 -57.813 -58.326 -58.846 -59.369 -59.772 -60.192 -60.625 -61.062 -61.515 -61.831 -62.153 -62.654 -62.999 -63.357 -63.538 -63.908 -64.29 -64.692 -64.904 -65.292 -65.574 -65.819 -66.072 -66.629 -66.935 -67.267 -67.647 -68.103 -68.625 -69.267 -71.14 -2 ,9336 ,TETRA ,17621118,Tue Nov 30 15:00:58 CET,Tue Nov 30 17:26:39 CET,0.0 2.822 3.393 3.8 4.144 4.416 4.625 4.802 5.103 5.231 5.351 5.452 5.648 5.73 5.874 6.003 6.127 6.185 6.282 6.362 6.452 6.5 6.542 6.584 6.609 6.624 6.628 6.622 6.6 6.561 6.513 6.452 6.386 6.31 6.19 6.007 5.791 5.523 5.214 4.844 4.405 3.859 3.179 2.386 1.298 -0.078 -1.914 -4.272 -7.427 -11.826 -18.396 -25.269 -30.342 -34.326 -37.597 -40.366 -42.589 -44.494 -46.09 -47.626 -48.906 -50.007 -51.033 -51.984 -52.845 -53.608 -54.394 -55.099 -55.703 -56.31 -56.932 -57.446 -57.965 -58.496 -58.907 -59.325 -59.756 -60.198 -60.646 -60.951 -61.265 -61.742 -62.078 -62.432 -62.613 -62.993 -63.386 -63.792 -64.012 -64.422 -64.722 -64.975 -65.245 -65.834 -66.149 -66.481 -66.856 -67.271 -67.77 -68.426 -70.417 -3 ,27445 ,TETRA ,17621119,Tue Nov 30 15:00:58 CET,Tue Nov 30 18:02:59 CET,0.0 2.154 2.748 3.175 3.512 3.755 3.947 4.122 4.408 4.525 4.628 4.706 4.894 4.964 5.101 5.229 5.331 5.381 5.476 5.554 5.634 5.668 5.703 5.748 5.772 5.779 5.782 5.786 5.771 5.72 5.654 5.567 5.471 5.357 5.196 4.989 4.763 4.479 4.119 3.704 3.24 2.669 1.893 1.017 -0.106 -1.541 -3.339 -5.635 -8.781 -13.248 -19.945 -26.961 -32.166 -36.2 -39.414 -42.139 -44.396 -46.328 -47.951 -49.522 -50.807 -51.909 -52.943 -53.903 -54.769 -55.54 -56.345 -57.043 -57.619 -58.22 -58.838 -59.335 -59.847 -60.374 -60.784 -61.2 -61.627 -62.079 -62.553 -62.875 -63.195 -63.688 -64.038 -64.403 -64.592 -64.979 -65.375 -65.791 -66.008 -66.408 -66.694 -66.944 -67.208 -67.774 -68.094 -68.445 -68.831 -69.295 -69.841 -70.538 -72.816 -4 ,12009 ,TETRA ,17621120,Tue Nov 30 15:01:52 CET,Tue Nov 30 17:32:28 CET,0.0 1.956 2.523 2.917 3.229 3.48 3.681 3.858 4.163 4.295 4.411 4.501 4.687 4.761 4.896 5.022 5.14 5.19 5.276 5.359 5.456 5.505 5.541 5.572 5.591 5.598 5.595 5.587 5.564 5.531 5.476 5.377 5.264 5.141 4.986 4.791 4.585 4.326 4.006 3.627 3.19 2.651 1.932 1.114 0.078 -1.256 -3.045 -5.31 -8.435 -12.856 -19.453 -26.44 -31.613 -35.638 -38.839 -41.547 -43.796 -45.724 -47.314 -48.864 -50.169 -51.303 -52.343 -53.291 -54.165 -54.95 -55.74 -56.429 -57.022 -57.631 -58.249 -58.752 -59.267 -59.805 -60.223 -60.647 -61.071 -61.502 -61.944 -62.243 -62.553 -63.043 -63.391 -63.751 -63.934 -64.312 -64.704 -65.101 -65.314 -65.714 -65.986 -66.231 -66.489 -67.042 -67.345 -67.677 -68.042 -68.457 -68.978 -69.696 -72.405 -5 ,28508 ,TETRA ,17621121,Tue Nov 30 15:01:51 CET,Tue Nov 30 17:23:57 CET,0.0 1.977 2.555 2.947 3.248 3.487 3.681 3.843 4.11 4.226 4.339 4.434 4.627 4.706 4.843 4.964 5.06 5.102 5.181 5.252 5.329 5.361 5.395 5.431 5.445 5.456 5.449 5.434 5.409 5.365 5.314 5.231 5.125 5.003 4.865 4.666 4.406 4.105 3.763 3.344 2.856 2.268 1.519 0.666 -0.448 -1.794 -3.529 -5.821 -9.04 -13.499 -19.957 -26.803 -31.955 -36.048 -39.339 -42.082 -44.358 -46.334 -47.957 -49.508 -50.802 -51.933 -52.995 -53.969 -54.842 -55.614 -56.409 -57.106 -57.698 -58.301 -58.922 -59.434 -59.952 -60.481 -60.881 -61.287 -61.711 -62.158 -62.616 -62.923 -63.241 -63.734 -64.07 -64.417 -64.598 -64.971 -65.354 -65.76 -65.978 -66.384 -66.683 -66.933 -67.192 -67.756 -68.061 -68.393 -68.77 -69.196 -69.706 -70.372 -73.065 -6 ,32061 ,TETRA ,17621122,Tue Nov 30 15:02:53 CET,Tue Nov 30 17:36:52 CET,0.0 2.22 2.77 3.141 3.448 3.704 3.915 4.101 4.409 4.549 4.689 4.819 5.018 5.098 5.235 5.346 5.44 5.479 5.554 5.62 5.696 5.733 5.77 5.814 5.832 5.836 5.838 5.831 5.805 5.772 5.726 5.639 5.532 5.394 5.217 4.981 4.714 4.417 4.051 3.608 3.077 2.396 1.543 0.618 -0.557 -2.04 -3.96 -6.348 -9.476 -13.875 -20.568 -27.615 -32.773 -36.812 -40.058 -42.812 -45.097 -47.026 -48.637 -50.215 -51.512 -52.627 -53.646 -54.593 -55.456 -56.217 -56.993 -57.673 -58.265 -58.877 -59.49 -59.988 -60.506 -61.044 -61.456 -61.873 -62.299 -62.733 -63.175 -63.482 -63.807 -64.317 -64.669 -65.029 -65.212 -65.586 -65.974 -66.389 -66.609 -67.016 -67.309 -67.563 -67.829 -68.41 -68.727 -69.077 -69.465 -69.902 -70.421 -71.108 -73.244 -7 ,14412 ,TETRA ,17621123,Tue Nov 30 15:02:55 CET,Tue Nov 30 17:33:07 CET,0.0 1.969 2.518 2.884 3.153 3.41 3.63 3.791 4.067 4.188 4.295 4.371 4.547 4.619 4.765 4.89 4.999 5.043 5.118 5.177 5.26 5.317 5.364 5.405 5.433 5.45 5.444 5.425 5.377 5.325 5.27 5.169 5.043 4.91 4.75 4.55 4.33 4.046 3.678 3.249 2.795 2.214 1.393 0.49 -0.687 -2.177 -4.084 -6.495 -9.699 -14.148 -20.824 -27.894 -33.079 -37.148 -40.381 -43.08 -45.321 -47.238 -48.826 -50.364 -51.659 -52.782 -53.829 -54.789 -55.665 -56.444 -57.236 -57.927 -58.518 -59.138 -59.768 -60.278 -60.793 -61.318 -61.721 -62.137 -62.564 -62.991 -63.431 -63.74 -64.062 -64.563 -64.91 -65.265 -65.443 -65.803 -66.192 -66.614 -66.828 -67.22 -67.494 -67.735 -67.985 -68.541 -68.847 -69.179 -69.546 -69.961 -70.469 -71.172 -73.43 -8 ,18328 ,TETRA ,17621124,Tue Nov 30 15:02:53 CET,Tue Nov 30 17:24:27 CET,0.0 2.234 2.753 3.125 3.418 3.649 3.827 3.971 4.219 4.325 4.421 4.474 4.659 4.738 4.853 4.956 5.053 5.091 5.14 5.181 5.231 5.269 5.303 5.328 5.337 5.338 5.323 5.303 5.264 5.214 5.175 5.105 4.998 4.884 4.731 4.527 4.305 4.029 3.693 3.282 2.795 2.177 1.396 0.547 -0.558 -1.968 -3.798 -6.137 -9.32 -13.749 -20.341 -27.328 -32.506 -36.587 -39.884 -42.641 -44.909 -46.832 -48.385 -49.895 -51.175 -52.289 -53.324 -54.281 -55.146 -55.904 -56.672 -57.343 -57.912 -58.501 -59.113 -59.607 -60.113 -60.639 -61.044 -61.456 -61.878 -62.315 -62.76 -63.062 -63.37 -63.855 -64.198 -64.554 -64.733 -65.096 -65.473 -65.875 -66.081 -66.47 -66.763 -67.009 -67.27 -67.828 -68.136 -68.468 -68.81 -69.212 -69.729 -70.416 -72.651 -9 ,10769 ,TETRA ,17621125,Tue Nov 30 15:03:51 CET,Tue Nov 30 17:27:24 CET,0.0 2.237 2.793 3.178 3.481 3.721 3.923 4.114 4.42 4.553 4.681 4.782 4.975 5.06 5.212 5.325 5.435 5.483 5.556 5.621 5.706 5.756 5.802 5.866 5.902 5.905 5.904 5.888 5.849 5.783 5.695 5.582 5.473 5.363 5.218 5.031 4.817 4.552 4.23 3.849 3.41 2.826 2.053 1.214 0.11 -1.312 -3.155 -5.458 -8.558 -12.918 -19.437 -26.361 -31.464 -35.43 -38.572 -41.229 -43.471 -45.409 -47.024 -48.569 -49.845 -50.931 -51.936 -52.87 -53.728 -54.495 -55.282 -55.984 -56.58 -57.187 -57.803 -58.294 -58.798 -59.328 -59.742 -60.167 -60.597 -61.037 -61.484 -61.784 -62.092 -62.565 -62.891 -63.228 -63.406 -63.786 -64.179 -64.578 -64.786 -65.181 -65.463 -65.711 -65.964 -66.495 -66.798 -67.141 -67.53 -67.962 -68.468 -69.117 -71.523 -10 ,28389 ,TETRA ,17621126,Tue Nov 30 15:03:52 CET,Tue Nov 30 17:23:46 CET,0.0 2.334 2.933 3.334 3.661 3.94 4.171 4.363 4.686 4.829 4.949 5.043 5.241 5.324 5.471 5.599 5.716 5.763 5.845 5.912 5.992 6.04 6.081 6.132 6.176 6.201 6.207 6.215 6.211 6.176 6.124 6.048 5.955 5.846 5.701 5.499 5.272 5.004 4.715 4.363 3.929 3.42 2.723 1.864 0.722 -0.663 -2.46 -4.788 -7.925 -12.317 -18.879 -25.815 -30.919 -34.913 -38.124 -40.822 -43.054 -44.98 -46.595 -48.152 -49.442 -50.546 -51.553 -52.484 -53.342 -54.112 -54.893 -55.572 -56.157 -56.751 -57.364 -57.869 -58.378 -58.901 -59.31 -59.728 -60.155 -60.59 -61.036 -61.341 -61.647 -62.115 -62.443 -62.784 -62.96 -63.32 -63.699 -64.093 -64.3 -64.695 -64.962 -65.204 -65.457 -65.999 -66.291 -66.618 -66.985 -67.408 -67.925 -68.601 -71.031 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_31.txt deleted file mode 100644 index ebf38b8a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5937 ,KEBNE ,17076843,Sat Dec 25 06:45:43 CET,Sat Dec 25 08:47:05 CET,0.0 4.536 5.342 5.888 6.335 6.746 7.109 7.426 7.984 8.236 8.481 8.83 9.153 9.363 9.751 10.113 10.468 10.639 10.966 11.285 11.755 12.05 12.331 12.749 13.155 13.539 13.904 14.272 14.755 15.216 15.668 16.225 16.761 17.277 17.873 18.539 19.196 19.915 20.716 21.593 22.486 23.506 24.742 25.981 27.424 29.083 31.058 33.302 35.92 39.169 43.392 47.14 49.524 51.059 52.14 52.947 53.528 53.934 54.218 54.482 54.644 54.741 54.811 54.85 54.874 54.876 54.852 54.826 54.784 54.727 54.665 54.582 54.468 54.354 54.264 54.156 54.029 53.9 53.765 53.653 53.517 53.305 53.149 52.967 52.876 52.672 52.451 52.244 52.135 51.957 51.737 51.586 51.417 50.996 50.746 50.474 50.154 49.763 49.25 48.5 45.642 -2 ,13268 ,KEBNE ,17076844,Sat Dec 25 06:45:43 CET,Sat Dec 25 08:47:57 CET,0.0 2.712 3.434 3.972 4.416 4.803 5.154 5.484 6.055 6.299 6.529 6.868 7.189 7.396 7.791 8.152 8.496 8.664 8.999 9.325 9.789 10.079 10.355 10.754 11.146 11.538 11.913 12.277 12.749 13.209 13.664 14.215 14.751 15.278 15.885 16.562 17.209 17.923 18.713 19.561 20.453 21.472 22.697 23.958 25.445 27.106 29.06 31.389 34.169 37.466 41.654 45.162 47.307 48.805 49.815 50.505 50.982 51.374 51.685 51.933 52.098 52.21 52.285 52.344 52.385 52.394 52.378 52.336 52.293 52.244 52.18 52.112 52.034 51.946 51.862 51.77 51.671 51.558 51.428 51.318 51.2 51.027 50.889 50.721 50.635 50.45 50.245 50.012 49.892 49.723 49.502 49.343 49.166 48.736 48.49 48.227 47.896 47.491 46.969 46.209 39.159 -3 ,24564 ,KEBNE ,17076845,Sat Dec 25 06:45:44 CET,Sat Dec 25 08:47:58 CET,0.0 2.405 3.113 3.64 4.099 4.503 4.851 5.174 5.755 6.017 6.269 6.622 6.941 7.143 7.512 7.867 8.231 8.412 8.755 9.08 9.538 9.829 10.121 10.547 10.956 11.357 11.747 12.126 12.611 13.072 13.523 14.072 14.603 15.112 15.701 16.37 17.028 17.76 18.568 19.443 20.348 21.356 22.54 23.755 25.219 26.889 28.871 31.168 33.895 37.153 41.302 45.085 47.493 49.101 50.245 51.146 51.769 52.189 52.491 52.726 52.895 52.996 53.077 53.15 53.183 53.194 53.183 53.154 53.109 53.036 52.961 52.899 52.818 52.723 52.634 52.542 52.456 52.336 52.189 52.1 52.001 51.813 51.678 51.537 51.465 51.297 51.1 50.87 50.738 50.541 50.32 50.165 49.989 49.6 49.375 49.088 48.748 48.33 47.788 47.038 43.085 -4 ,14179 ,KEBNE ,17076846,Sat Dec 25 06:46:46 CET,Sat Dec 25 08:47:39 CET,0.0 2.997 3.778 4.343 4.81 5.203 5.552 5.864 6.441 6.707 6.953 7.301 7.635 7.858 8.276 8.671 9.048 9.227 9.575 9.903 10.367 10.674 10.975 11.398 11.809 12.204 12.578 12.943 13.419 13.886 14.35 14.91 15.453 15.986 16.613 17.312 17.965 18.703 19.518 20.378 21.254 22.252 23.454 24.688 26.157 27.852 29.839 32.098 34.864 38.27 42.616 46.409 48.812 50.451 51.592 52.437 53.031 53.477 53.781 53.969 54.078 54.161 54.196 54.202 54.198 54.192 54.176 54.139 54.107 54.045 53.944 53.855 53.743 53.599 53.491 53.364 53.21 53.04 52.844 52.706 52.563 52.349 52.203 52.04 51.954 51.763 51.559 51.354 51.234 51.038 50.793 50.631 50.453 50.046 49.819 49.555 49.236 48.849 48.358 47.628 45.101 -5 ,4751 ,KEBNE ,17076847,Sat Dec 25 06:46:46 CET,Sat Dec 25 08:47:42 CET,0.0 3.229 4.062 4.685 5.182 5.603 5.982 6.323 6.896 7.157 7.409 7.765 8.085 8.287 8.667 9.039 9.395 9.564 9.899 10.227 10.699 11.0 11.294 11.71 12.109 12.501 12.882 13.248 13.713 14.175 14.617 15.136 15.637 16.13 16.718 17.388 18.041 18.758 19.517 20.333 21.223 22.22 23.399 24.655 26.127 27.798 29.735 31.931 34.595 37.894 42.161 45.841 48.083 49.693 50.875 51.713 52.253 52.592 52.835 53.017 53.121 53.193 53.229 53.242 53.227 53.193 53.144 53.073 53.002 52.919 52.82 52.72 52.589 52.453 52.357 52.255 52.127 51.976 51.804 51.672 51.519 51.257 51.084 50.922 50.84 50.672 50.467 50.222 50.095 49.901 49.648 49.475 49.288 48.835 48.59 48.324 48.01 47.654 47.186 46.518 43.454 -6 ,20621 ,KEBNE ,17076848,Sat Dec 25 06:46:46 CET,Sat Dec 25 08:47:58 CET,0.0 3.278 4.095 4.696 5.17 5.566 5.919 6.242 6.805 7.064 7.314 7.674 7.997 8.207 8.607 8.975 9.335 9.515 9.855 10.175 10.635 10.934 11.226 11.646 12.043 12.429 12.808 13.167 13.638 14.107 14.561 15.108 15.638 16.144 16.726 17.387 18.026 18.733 19.513 20.349 21.271 22.334 23.561 24.801 26.241 27.883 29.828 32.116 34.856 38.157 42.365 46.138 48.493 50.079 51.21 52.01 52.606 53.092 53.437 53.732 53.936 54.047 54.124 54.171 54.176 54.163 54.135 54.089 54.033 53.972 53.895 53.825 53.748 53.651 53.567 53.471 53.356 53.225 53.065 52.947 52.821 52.586 52.42 52.268 52.18 51.956 51.701 51.44 51.307 51.111 50.872 50.711 50.535 50.083 49.825 49.537 49.2 48.805 48.307 47.649 43.442 -7 ,1160 ,KEBNE ,17076849,Sat Dec 25 06:46:46 CET,Sat Dec 25 08:48:06 CET,0.0 2.148 2.845 3.369 3.827 4.221 4.557 4.858 5.424 5.686 5.934 6.292 6.615 6.822 7.229 7.607 7.96 8.128 8.449 8.767 9.222 9.519 9.812 10.225 10.633 11.041 11.425 11.78 12.242 12.7 13.136 13.653 14.161 14.666 15.245 15.911 16.557 17.258 18.031 18.86 19.728 20.699 21.852 23.038 24.457 26.091 28.005 30.242 32.926 36.161 40.234 43.765 45.967 47.445 48.518 49.304 49.818 50.152 50.401 50.642 50.796 50.898 50.963 50.995 51.006 50.982 50.942 50.887 50.817 50.734 50.635 50.552 50.47 50.368 50.267 50.145 50.01 49.871 49.7 49.554 49.403 49.171 48.999 48.811 48.709 48.5 48.286 48.054 47.936 47.75 47.52 47.356 47.161 46.717 46.466 46.176 45.835 45.459 45.02 44.367 41.151 -8 ,26753 ,KEBNE ,17076850,Sat Dec 25 06:46:46 CET,Sat Dec 25 08:46:46 CET,0.0 2.584 3.338 3.883 4.321 4.7 5.04 5.349 5.925 6.192 6.438 6.786 7.109 7.319 7.74 8.135 8.502 8.681 9.02 9.344 9.823 10.121 10.407 10.819 11.219 11.624 12.019 12.393 12.864 13.318 13.762 14.311 14.843 15.364 15.966 16.637 17.282 17.987 18.763 19.627 20.539 21.557 22.78 24.029 25.503 27.168 29.161 31.49 34.21 37.492 41.697 45.451 47.778 49.37 50.501 51.338 51.918 52.332 52.651 52.908 53.08 53.219 53.336 53.407 53.426 53.415 53.381 53.342 53.288 53.201 53.104 53.032 52.948 52.839 52.745 52.636 52.511 52.39 52.249 52.141 52.034 51.831 51.676 51.525 51.444 51.267 51.059 50.8 50.665 50.468 50.225 50.061 49.877 49.465 49.233 48.978 48.675 48.312 47.882 47.251 44.278 -9 ,13279 ,KEBNE ,17076851,Sat Dec 25 06:46:46 CET,Sat Dec 25 08:47:39 CET,0.0 2.996 3.679 4.192 4.625 5.003 5.332 5.63 6.175 6.436 6.687 7.02 7.334 7.55 7.958 8.323 8.665 8.833 9.164 9.489 9.954 10.242 10.521 10.921 11.298 11.663 12.022 12.369 12.824 13.268 13.715 14.256 14.765 15.259 15.843 16.523 17.189 17.909 18.669 19.458 20.286 21.252 22.408 23.618 25.092 26.78 28.716 30.983 33.682 36.847 40.894 44.564 46.848 48.397 49.5 50.307 50.876 51.257 51.499 51.704 51.861 51.967 52.041 52.074 52.06 52.032 51.992 51.962 51.941 51.88 51.775 51.678 51.573 51.442 51.339 51.237 51.118 50.993 50.842 50.724 50.605 50.396 50.24 50.08 49.992 49.782 49.533 49.299 49.182 48.986 48.733 48.574 48.416 48.042 47.794 47.516 47.202 46.794 46.27 45.55 42.682 -10 ,3329 ,KEBNE ,17076852,Sat Dec 25 06:46:46 CET,Sat Dec 25 08:46:54 CET,0.0 2.859 3.618 4.135 4.56 4.941 5.28 5.577 6.13 6.392 6.639 6.982 7.305 7.511 7.893 8.26 8.609 8.777 9.118 9.444 9.894 10.186 10.464 10.865 11.263 11.648 12.014 12.373 12.833 13.282 13.741 14.287 14.803 15.307 15.905 16.576 17.206 17.901 18.663 19.48 20.346 21.333 22.472 23.625 25.051 26.68 28.594 30.845 33.487 36.736 41.034 44.823 47.167 48.725 49.789 50.583 51.164 51.577 51.847 52.054 52.182 52.277 52.358 52.387 52.376 52.368 52.35 52.317 52.262 52.181 52.095 52.017 51.914 51.79 51.691 51.584 51.468 51.337 51.183 51.073 50.953 50.743 50.581 50.407 50.314 50.119 49.919 49.704 49.582 49.386 49.126 48.963 48.785 48.354 48.123 47.854 47.548 47.206 46.758 46.108 43.404 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_33.txt deleted file mode 100644 index 8a50f905..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11062 ,TETRA ,17621127,Tue Nov 30 15:04:55 CET,Tue Nov 30 17:30:08 CET,0.0 1.997 2.647 3.124 3.529 3.885 4.205 4.504 5.041 5.28 5.513 5.862 6.182 6.378 6.759 7.136 7.492 7.66 7.996 8.326 8.804 9.114 9.419 9.853 10.267 10.675 11.077 11.467 11.977 12.484 12.986 13.584 14.162 14.728 15.386 16.136 16.88 17.728 18.645 19.645 20.737 21.997 23.483 25.007 26.874 29.039 31.656 34.762 38.599 43.529 50.193 56.452 60.535 63.393 65.495 67.114 68.367 69.355 70.064 70.665 71.127 71.495 71.791 72.03 72.229 72.39 72.533 72.633 72.686 72.71 72.718 72.728 72.733 72.723 72.707 72.692 72.657 72.569 72.431 72.33 72.222 72.028 71.891 71.742 71.654 71.468 71.261 71.001 70.862 70.686 70.408 70.243 70.067 69.688 69.473 69.215 68.885 68.476 67.992 67.248 64.272 -2 ,22879 ,TETRA ,17621128,Tue Nov 30 15:04:55 CET,Tue Nov 30 17:37:15 CET,0.0 2.727 3.379 3.851 4.26 4.63 4.968 5.272 5.808 6.052 6.285 6.622 6.936 7.138 7.525 7.895 8.254 8.428 8.762 9.081 9.542 9.84 10.135 10.568 10.993 11.403 11.797 12.186 12.694 13.192 13.681 14.275 14.859 15.433 16.098 16.848 17.589 18.432 19.359 20.374 21.455 22.709 24.222 25.774 27.66 29.855 32.502 35.7 39.699 44.644 51.168 57.316 61.418 64.317 66.465 68.177 69.479 70.494 71.275 71.956 72.466 72.876 73.229 73.523 73.735 73.869 74.0 74.119 74.19 74.232 74.248 74.253 74.262 74.252 74.218 74.167 74.089 73.994 73.903 73.838 73.758 73.611 73.494 73.331 73.234 73.038 72.84 72.633 72.513 72.344 72.058 71.902 71.75 71.38 71.138 70.831 70.446 70.007 69.476 68.558 63.583 -3 ,21080 ,TETRA ,17621129,Tue Nov 30 15:04:55 CET,Tue Nov 30 17:31:20 CET,0.0 2.775 3.402 3.882 4.281 4.62 4.922 5.213 5.746 5.988 6.217 6.553 6.877 7.081 7.477 7.86 8.222 8.393 8.721 9.035 9.496 9.79 10.081 10.514 10.941 11.354 11.749 12.141 12.646 13.142 13.633 14.227 14.824 15.412 16.091 16.866 17.639 18.484 19.382 20.386 21.495 22.753 24.252 25.79 27.637 29.811 32.441 35.604 39.54 44.541 51.283 57.589 61.642 64.448 66.48 68.027 69.222 70.167 70.893 71.536 72.013 72.387 72.686 72.924 73.114 73.253 73.365 73.442 73.492 73.509 73.499 73.48 73.458 73.421 73.382 73.331 73.268 73.199 73.102 73.031 72.951 72.808 72.698 72.548 72.466 72.305 72.13 71.931 71.81 71.637 71.36 71.182 70.998 70.576 70.293 69.953 69.578 69.174 68.679 67.918 64.716 -4 ,6360 ,TETRA ,17621130,Tue Nov 30 15:04:55 CET,Tue Nov 30 17:33:32 CET,0.0 2.553 3.209 3.712 4.139 4.51 4.832 5.123 5.65 5.89 6.119 6.445 6.756 6.951 7.339 7.72 8.073 8.242 8.57 8.887 9.356 9.656 9.949 10.385 10.811 11.234 11.651 12.049 12.555 13.048 13.533 14.138 14.714 15.269 15.933 16.696 17.45 18.289 19.214 20.23 21.315 22.561 24.04 25.563 27.43 29.626 32.258 35.414 39.296 44.195 50.731 56.607 60.459 63.26 65.324 66.908 68.13 69.109 69.84 70.484 70.983 71.353 71.661 71.928 72.148 72.322 72.461 72.545 72.6 72.642 72.678 72.705 72.717 72.714 72.693 72.658 72.614 72.536 72.439 72.37 72.292 72.158 72.061 71.961 71.899 71.743 71.563 71.327 71.195 71.043 70.814 70.663 70.483 70.033 69.786 69.502 69.163 68.774 68.282 67.566 62.552 -5 ,31712 ,TETRA ,17621131,Tue Nov 30 15:04:56 CET,Tue Nov 30 17:33:25 CET,0.0 3.29 3.959 4.439 4.835 5.191 5.519 5.834 6.4 6.646 6.876 7.218 7.544 7.752 8.139 8.505 8.859 9.033 9.375 9.699 10.165 10.47 10.768 11.195 11.612 12.018 12.413 12.803 13.306 13.8 14.29 14.892 15.474 16.041 16.706 17.479 18.239 19.076 20.0 21.007 22.08 23.33 24.841 26.405 28.267 30.406 33.05 36.236 40.13 44.97 51.383 57.494 61.583 64.467 66.618 68.251 69.475 70.434 71.151 71.779 72.274 72.68 73.008 73.25 73.42 73.563 73.689 73.774 73.836 73.881 73.895 73.887 73.869 73.838 73.804 73.763 73.712 73.668 73.604 73.514 73.401 73.231 73.12 72.999 72.937 72.766 72.527 72.257 72.119 71.925 71.595 71.408 71.201 70.744 70.49 70.17 69.779 69.333 68.717 67.801 63.909 -6 ,17779 ,TETRA ,17621132,Tue Nov 30 15:04:56 CET,Tue Nov 30 17:34:02 CET,0.0 3.123 3.772 4.278 4.705 5.063 5.391 5.686 6.193 6.437 6.678 7.011 7.336 7.554 7.954 8.332 8.686 8.857 9.193 9.511 9.986 10.299 10.605 11.05 11.476 11.886 12.28 12.665 13.169 13.663 14.149 14.752 15.342 15.917 16.611 17.4 18.154 18.992 19.921 20.932 22.017 23.27 24.78 26.34 28.226 30.441 33.121 36.289 40.175 45.042 51.47 57.502 61.572 64.417 66.472 68.087 69.333 70.329 71.076 71.741 72.262 72.671 72.991 73.246 73.463 73.638 73.797 73.905 73.962 74.009 74.044 74.061 74.071 74.061 74.036 73.999 73.931 73.857 73.779 73.705 73.626 73.5 73.404 73.268 73.186 73.02 72.837 72.645 72.53 72.36 72.097 71.924 71.744 71.36 71.122 70.828 70.465 70.044 69.477 68.598 65.931 -7 ,32531 ,TETRA ,17621133,Tue Nov 30 15:04:56 CET,Tue Nov 30 17:28:33 CET,0.0 2.699 3.341 3.829 4.23 4.6 4.957 5.267 5.806 6.055 6.282 6.607 6.937 7.154 7.57 7.954 8.317 8.497 8.843 9.169 9.63 9.937 10.243 10.688 11.118 11.531 11.935 12.332 12.844 13.337 13.817 14.41 15.005 15.586 16.253 17.008 17.754 18.597 19.516 20.519 21.587 22.822 24.315 25.827 27.652 29.813 32.408 35.493 39.386 44.304 50.861 57.047 61.09 63.901 65.953 67.536 68.753 69.707 70.446 71.08 71.549 71.949 72.299 72.568 72.765 72.902 73.022 73.115 73.178 73.232 73.253 73.258 73.253 73.205 73.169 73.152 73.124 73.055 72.961 72.896 72.81 72.656 72.536 72.383 72.306 72.168 72.012 71.836 71.728 71.563 71.317 71.166 71.002 70.576 70.316 70.002 69.649 69.253 68.738 68.021 64.985 -8 ,11129 ,TETRA ,17621134,Tue Nov 30 15:04:58 CET,Tue Nov 30 17:27:03 CET,0.0 2.771 3.408 3.91 4.347 4.716 5.038 5.332 5.856 6.092 6.317 6.643 6.963 7.169 7.559 7.926 8.281 8.458 8.8 9.124 9.592 9.892 10.19 10.624 11.035 11.437 11.836 12.222 12.717 13.197 13.668 14.243 14.805 15.376 16.057 16.822 17.557 18.392 19.322 20.327 21.411 22.661 24.176 25.761 27.664 29.867 32.522 35.639 39.496 44.419 51.026 57.147 61.223 64.134 66.207 67.783 68.996 69.971 70.695 71.347 71.87 72.261 72.588 72.857 73.066 73.209 73.334 73.44 73.482 73.519 73.565 73.565 73.554 73.546 73.525 73.499 73.458 73.379 73.288 73.222 73.137 72.991 72.876 72.744 72.674 72.512 72.32 72.103 71.993 71.854 71.618 71.449 71.261 70.837 70.603 70.345 70.023 69.597 69.038 68.257 64.354 -9 ,32065 ,TETRA ,17621135,Tue Nov 30 15:05:56 CET,Tue Nov 30 17:39:51 CET,0.0 2.368 3.035 3.518 3.924 4.283 4.6 4.897 5.428 5.668 5.909 6.264 6.59 6.793 7.177 7.552 7.908 8.078 8.425 8.765 9.252 9.562 9.862 10.303 10.723 11.133 11.533 11.923 12.446 12.964 13.458 14.052 14.626 15.19 15.863 16.622 17.349 18.173 19.106 20.132 21.23 22.479 23.947 25.478 27.365 29.568 32.222 35.361 39.193 44.014 50.482 56.454 60.369 63.18 65.246 66.848 68.059 69.001 69.715 70.34 70.812 71.196 71.524 71.797 71.988 72.114 72.23 72.309 72.357 72.397 72.416 72.412 72.402 72.392 72.378 72.357 72.312 72.237 72.136 72.062 71.976 71.818 71.69 71.532 71.444 71.248 71.033 70.797 70.658 70.484 70.207 70.034 69.862 69.447 69.153 68.797 68.391 67.95 67.408 66.565 63.411 -10 ,1305 ,TETRA ,17621136,Tue Nov 30 15:05:58 CET,Tue Nov 30 17:41:54 CET,0.0 2.074 2.749 3.254 3.662 4.016 4.329 4.616 5.142 5.397 5.65 5.998 6.319 6.527 6.924 7.291 7.632 7.801 8.136 8.461 8.93 9.227 9.514 9.944 10.365 10.776 11.183 11.58 12.101 12.607 13.091 13.68 14.268 14.852 15.527 16.294 17.051 17.879 18.801 19.804 20.867 22.121 23.607 25.139 26.997 29.147 31.772 34.882 38.719 43.637 50.247 56.341 60.303 63.032 65.076 66.699 67.872 68.821 69.554 70.152 70.591 70.939 71.238 71.497 71.721 71.887 72.025 72.14 72.213 72.269 72.326 72.367 72.383 72.374 72.341 72.281 72.212 72.123 72.021 71.941 71.861 71.741 71.642 71.517 71.453 71.314 71.119 70.894 70.762 70.587 70.333 70.162 69.971 69.515 69.242 68.914 68.503 67.999 67.353 66.539 63.123 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_34.txt deleted file mode 100644 index be48ce8a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,303 ,TETRA ,17621137,Tue Nov 30 15:05:56 CET,Tue Nov 30 17:36:15 CET,0.0 1.977 2.583 3.038 3.421 3.746 4.032 4.286 4.717 4.916 5.115 5.366 5.639 5.807 6.134 6.424 6.696 6.827 7.073 7.313 7.671 7.899 8.108 8.414 8.718 9.001 9.275 9.539 9.869 10.187 10.502 10.9 11.285 11.636 12.02 12.446 12.869 13.35 13.867 14.404 14.942 15.558 16.264 16.945 17.756 18.655 19.669 20.803 22.081 23.453 24.809 25.643 25.895 25.872 25.769 25.597 25.335 25.062 24.813 24.534 24.271 24.006 23.746 23.497 23.251 23.021 22.773 22.55 22.353 22.12 21.851 21.62 21.369 21.125 20.935 20.712 20.486 20.249 19.991 19.82 19.645 19.346 19.114 18.881 18.767 18.521 18.246 17.929 17.764 17.501 17.216 17.013 16.793 16.319 16.042 15.714 15.336 14.907 14.376 13.608 10.935 -2 ,4077 ,TETRA ,17621138,Tue Nov 30 15:05:57 CET,Tue Nov 30 17:36:05 CET,0.0 2.089 2.738 3.188 3.546 3.872 4.157 4.415 4.879 5.085 5.285 5.547 5.832 6.004 6.312 6.592 6.855 6.986 7.254 7.512 7.87 8.097 8.32 8.63 8.92 9.208 9.494 9.767 10.094 10.401 10.705 11.072 11.434 11.774 12.146 12.577 12.979 13.425 13.93 14.449 14.984 15.6 16.284 16.943 17.734 18.571 19.481 20.473 21.614 22.913 24.348 25.349 25.723 25.758 25.624 25.456 25.253 25.006 24.773 24.487 24.19 23.91 23.651 23.401 23.115 22.801 22.492 22.238 22.015 21.781 21.526 21.313 21.096 20.847 20.638 20.425 20.212 19.988 19.729 19.537 19.326 18.974 18.728 18.491 18.365 18.087 17.787 17.448 17.271 16.995 16.677 16.449 16.222 15.761 15.489 15.153 14.77 14.314 13.759 12.969 10.324 -3 ,11720 ,TETRA ,17621139,Tue Nov 30 15:06:56 CET,Tue Nov 30 17:30:51 CET,0.0 2.334 2.989 3.442 3.787 4.095 4.377 4.641 5.133 5.352 5.556 5.824 6.109 6.284 6.603 6.887 7.156 7.293 7.551 7.785 8.126 8.348 8.559 8.869 9.171 9.458 9.74 10.004 10.342 10.671 10.982 11.35 11.7 12.033 12.414 12.856 13.272 13.726 14.223 14.744 15.295 15.916 16.639 17.371 18.209 19.097 20.091 21.189 22.442 23.893 25.603 26.677 26.994 27.058 26.984 26.837 26.614 26.369 26.106 25.74 25.406 25.114 24.818 24.558 24.302 24.036 23.772 23.534 23.309 23.068 22.816 22.605 22.383 22.14 21.944 21.745 21.54 21.312 21.06 20.88 20.7 20.404 20.194 19.977 19.853 19.588 19.303 18.985 18.822 18.565 18.306 18.103 17.888 17.414 17.148 16.837 16.461 16.042 15.534 14.722 10.988 -4 ,28898 ,TETRA ,17621140,Tue Nov 30 15:07:59 CET,Tue Nov 30 17:36:12 CET,0.0 2.347 2.987 3.43 3.782 4.097 4.381 4.637 5.106 5.317 5.523 5.791 6.058 6.223 6.537 6.819 7.101 7.238 7.508 7.759 8.101 8.325 8.547 8.87 9.176 9.475 9.759 10.032 10.388 10.723 11.039 11.405 11.764 12.118 12.524 12.966 13.404 13.893 14.382 14.912 15.499 16.14 16.856 17.547 18.328 19.242 20.268 21.331 22.526 23.885 25.401 26.226 26.446 26.401 26.199 26.023 25.86 25.626 25.371 25.073 24.764 24.483 24.207 23.917 23.646 23.404 23.138 22.879 22.638 22.38 22.122 21.903 21.665 21.416 21.217 21.005 20.776 20.534 20.274 20.103 19.921 19.598 19.37 19.136 19.013 18.73 18.427 18.116 17.952 17.69 17.411 17.203 16.984 16.48 16.184 15.869 15.509 15.078 14.534 13.768 11.313 -5 ,21157 ,TETRA ,17621141,Tue Nov 30 15:08:56 CET,Tue Nov 30 17:36:31 CET,0.0 2.556 3.187 3.631 3.998 4.33 4.621 4.893 5.38 5.588 5.79 6.058 6.338 6.502 6.81 7.103 7.381 7.511 7.775 8.025 8.37 8.596 8.809 9.117 9.424 9.712 9.979 10.243 10.577 10.892 11.197 11.562 11.915 12.259 12.641 13.063 13.479 13.915 14.381 14.883 15.417 16.024 16.711 17.389 18.161 19.033 20.037 21.08 22.263 23.564 24.997 25.93 26.199 26.182 26.065 25.865 25.618 25.376 25.124 24.833 24.553 24.281 24.018 23.744 23.462 23.198 22.92 22.673 22.442 22.188 21.925 21.697 21.45 21.184 20.989 20.776 20.549 20.317 20.043 19.845 19.643 19.318 19.094 18.859 18.739 18.486 18.194 17.869 17.693 17.421 17.144 16.933 16.712 16.222 15.907 15.573 15.218 14.785 14.279 13.564 10.811 -6 ,6055 ,TETRA ,17621142,Tue Nov 30 15:08:56 CET,Tue Nov 30 17:33:44 CET,0.0 2.02 2.607 3.035 3.402 3.716 3.994 4.249 4.717 4.934 5.135 5.394 5.683 5.856 6.166 6.454 6.734 6.871 7.129 7.382 7.747 7.971 8.186 8.508 8.798 9.068 9.336 9.594 9.922 10.235 10.535 10.903 11.262 11.6 11.999 12.442 12.873 13.346 13.824 14.346 14.93 15.58 16.309 17.029 17.893 18.827 19.801 20.879 22.121 23.457 24.865 25.755 26.107 26.218 26.178 26.049 25.775 25.394 25.045 24.692 24.392 24.108 23.832 23.57 23.307 23.062 22.794 22.54 22.324 22.104 21.865 21.65 21.419 21.179 20.97 20.742 20.53 20.292 20.027 19.829 19.62 19.305 19.072 18.824 18.691 18.412 18.097 17.757 17.578 17.277 16.938 16.716 16.483 15.966 15.668 15.344 14.988 14.567 14.041 13.261 10.23 -7 ,22998 ,TETRA ,17621143,Tue Nov 30 15:09:58 CET,Tue Nov 30 17:39:47 CET,0.0 2.666 3.259 3.706 4.073 4.397 4.686 4.948 5.434 5.65 5.843 6.094 6.372 6.537 6.858 7.15 7.42 7.551 7.811 8.063 8.418 8.642 8.857 9.174 9.486 9.783 10.05 10.303 10.625 10.925 11.224 11.598 11.953 12.294 12.683 13.113 13.542 13.994 14.453 14.95 15.476 16.069 16.784 17.518 18.318 19.169 20.106 21.125 22.311 23.609 24.956 25.871 26.163 26.179 26.074 25.868 25.655 25.421 25.151 24.84 24.574 24.329 24.069 23.797 23.522 23.262 22.995 22.749 22.514 22.254 21.953 21.706 21.462 21.178 20.943 20.705 20.46 20.191 19.915 19.725 19.504 19.148 18.912 18.677 18.55 18.263 17.962 17.648 17.486 17.234 16.969 16.768 16.574 16.135 15.86 15.545 15.185 14.761 14.249 13.577 11.226 -8 ,16461 ,TETRA ,17621144,Tue Nov 30 15:10:00 CET,Tue Nov 30 17:40:23 CET,0.0 2.558 3.152 3.569 3.932 4.267 4.558 4.822 5.303 5.526 5.738 6.019 6.315 6.483 6.796 7.102 7.388 7.526 7.801 8.06 8.415 8.64 8.854 9.163 9.469 9.76 10.031 10.287 10.599 10.902 11.204 11.57 11.919 12.242 12.616 13.04 13.456 13.907 14.383 14.89 15.415 15.993 16.675 17.428 18.324 19.249 20.275 21.352 22.506 23.871 25.263 26.064 26.486 26.551 26.392 26.164 25.877 25.555 25.244 24.932 24.676 24.433 24.175 23.924 23.701 23.494 23.248 23.001 22.78 22.548 22.296 22.089 21.867 21.607 21.396 21.173 20.927 20.662 20.392 20.201 19.988 19.64 19.406 19.174 19.054 18.802 18.532 18.234 18.066 17.792 17.479 17.243 17.008 16.517 16.233 15.918 15.566 15.152 14.616 13.856 11.061 -9 ,20643 ,TETRA ,17621145,Tue Nov 30 15:09:58 CET,Tue Nov 30 17:29:21 CET,0.0 2.408 3.046 3.532 3.939 4.269 4.56 4.814 5.272 5.478 5.664 5.916 6.206 6.389 6.736 7.042 7.31 7.436 7.687 7.931 8.276 8.502 8.724 9.033 9.321 9.591 9.859 10.122 10.448 10.754 11.045 11.394 11.732 12.059 12.437 12.858 13.263 13.722 14.228 14.758 15.291 15.857 16.514 17.198 17.976 18.804 19.789 20.879 22.073 23.358 24.714 25.725 26.151 26.194 26.084 25.881 25.629 25.367 25.1 24.787 24.498 24.251 23.997 23.738 23.479 23.235 22.97 22.731 22.517 22.279 22.019 21.794 21.564 21.322 21.14 20.937 20.714 20.494 20.245 20.051 19.848 19.538 19.324 19.093 18.973 18.72 18.439 18.126 17.964 17.692 17.382 17.172 16.95 16.46 16.158 15.807 15.42 14.988 14.443 13.68 10.824 -10 ,16358 ,TETRA ,17621146,Tue Nov 30 15:10:00 CET,Tue Nov 30 17:29:15 CET,0.0 2.337 2.965 3.43 3.803 4.121 4.395 4.655 5.126 5.326 5.515 5.755 6.027 6.186 6.491 6.779 7.053 7.183 7.437 7.687 8.036 8.261 8.479 8.788 9.079 9.36 9.632 9.889 10.237 10.568 10.877 11.263 11.648 12.015 12.426 12.863 13.271 13.72 14.205 14.734 15.282 15.892 16.61 17.326 18.118 18.986 19.981 21.089 22.367 23.772 25.229 26.142 26.47 26.504 26.351 26.089 25.783 25.506 25.262 24.962 24.677 24.4 24.122 23.847 23.559 23.301 23.031 22.784 22.561 22.303 22.034 21.819 21.593 21.338 21.137 20.928 20.71 20.482 20.215 20.015 19.811 19.464 19.208 18.947 18.818 18.562 18.296 17.986 17.819 17.559 17.276 17.072 16.859 16.372 16.087 15.772 15.406 14.942 14.365 13.558 10.028 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_49.txt deleted file mode 100644 index 9b049190..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15426 ,TETRA ,17621147,Tue Nov 30 15:09:59 CET,Tue Nov 30 17:40:15 CET,0.0 1.64 2.154 2.555 2.877 3.15 3.382 3.599 3.979 4.139 4.292 4.468 4.703 4.825 5.054 5.261 5.444 5.533 5.706 5.865 6.082 6.217 6.349 6.525 6.692 6.86 7.019 7.166 7.355 7.521 7.662 7.825 7.979 8.125 8.293 8.463 8.618 8.799 8.979 9.141 9.286 9.433 9.605 9.745 9.832 9.88 9.895 9.799 9.491 8.846 7.508 5.671 4.119 2.831 1.713 0.692 -0.204 -1.015 -1.694 -2.365 -2.983 -3.572 -4.144 -4.657 -5.132 -5.585 -6.057 -6.484 -6.847 -7.221 -7.619 -7.952 -8.295 -8.654 -8.942 -9.263 -9.589 -9.913 -10.251 -10.495 -10.763 -11.199 -11.507 -11.831 -11.996 -12.337 -12.693 -13.07 -13.285 -13.629 -13.956 -14.197 -14.451 -15.047 -15.393 -15.797 -16.277 -16.828 -17.457 -18.38 -22.058 -2 ,5525 ,TETRA ,17621148,Tue Nov 30 15:10:01 CET,Tue Nov 30 17:38:55 CET,0.0 1.818 2.4 2.836 3.188 3.482 3.758 3.995 4.395 4.576 4.74 4.935 5.182 5.313 5.568 5.816 6.049 6.153 6.335 6.505 6.746 6.896 7.038 7.234 7.415 7.583 7.733 7.874 8.053 8.222 8.382 8.555 8.713 8.859 9.011 9.188 9.346 9.5 9.646 9.794 9.97 10.123 10.241 10.341 10.424 10.42 10.334 10.141 9.732 8.993 7.61 5.844 4.303 2.947 1.801 0.791 -0.103 -0.934 -1.662 -2.4 -3.049 -3.606 -4.121 -4.617 -5.095 -5.556 -6.064 -6.504 -6.877 -7.258 -7.65 -7.988 -8.341 -8.711 -9.0 -9.295 -9.612 -9.952 -10.305 -10.554 -10.822 -11.231 -11.51 -11.805 -11.959 -12.299 -12.663 -13.055 -13.266 -13.62 -13.991 -14.258 -14.531 -15.165 -15.533 -15.942 -16.384 -16.892 -17.575 -18.524 -20.916 -3 ,22863 ,TETRA ,17621149,Tue Nov 30 16:13:53 CET,Tue Nov 30 18:39:58 CET,0.0 1.676 2.213 2.62 2.938 3.221 3.482 3.706 4.11 4.293 4.458 4.657 4.91 5.042 5.296 5.526 5.726 5.818 6.001 6.176 6.411 6.566 6.722 6.931 7.103 7.263 7.422 7.569 7.741 7.893 8.043 8.23 8.4 8.555 8.722 8.895 9.066 9.257 9.436 9.605 9.778 9.932 10.061 10.173 10.266 10.302 10.295 10.214 9.943 9.349 8.273 6.871 5.576 4.465 3.477 2.518 1.67 0.918 0.266 -0.402 -0.984 -1.504 -2.011 -2.498 -2.955 -3.375 -3.834 -4.232 -4.553 -4.928 -5.361 -5.736 -6.109 -6.456 -6.727 -7.032 -7.352 -7.674 -8.026 -8.272 -8.534 -8.959 -9.252 -9.554 -9.71 -10.038 -10.387 -10.773 -10.988 -11.333 -11.663 -11.924 -12.217 -12.819 -13.156 -13.541 -13.971 -14.483 -15.151 -16.162 -20.325 -4 ,2520 ,TETRA ,17621150,Tue Nov 30 16:13:52 CET,Tue Nov 30 18:29:18 CET,0.0 1.557 2.107 2.502 2.82 3.086 3.314 3.522 3.893 4.052 4.203 4.407 4.67 4.803 5.05 5.274 5.47 5.563 5.744 5.911 6.142 6.292 6.432 6.618 6.789 6.949 7.094 7.24 7.413 7.572 7.723 7.893 8.051 8.187 8.335 8.495 8.646 8.811 8.969 9.113 9.258 9.403 9.53 9.626 9.707 9.78 9.822 9.721 9.378 8.668 7.413 5.836 4.387 3.166 2.125 1.12 0.22 -0.575 -1.304 -2.043 -2.674 -3.253 -3.779 -4.259 -4.73 -5.182 -5.625 -5.992 -6.318 -6.678 -7.061 -7.388 -7.728 -8.062 -8.339 -8.657 -8.998 -9.342 -9.704 -9.959 -10.205 -10.578 -10.851 -11.164 -11.334 -11.672 -12.026 -12.434 -12.655 -12.999 -13.361 -13.628 -13.901 -14.489 -14.824 -15.209 -15.638 -16.156 -16.806 -17.655 -20.897 -5 ,3586 ,TETRA ,17621151,Tue Nov 30 16:13:54 CET,Tue Nov 30 18:44:31 CET,0.0 1.713 2.203 2.566 2.881 3.154 3.385 3.595 3.987 4.166 4.325 4.502 4.74 4.867 5.105 5.314 5.507 5.596 5.762 5.938 6.186 6.332 6.471 6.664 6.849 7.017 7.163 7.298 7.464 7.617 7.768 7.941 8.099 8.252 8.416 8.593 8.76 8.919 9.07 9.212 9.342 9.463 9.611 9.737 9.826 9.883 9.857 9.697 9.392 8.799 7.558 5.952 4.579 3.384 2.353 1.419 0.557 -0.25 -0.954 -1.636 -2.231 -2.782 -3.283 -3.793 -4.305 -4.75 -5.192 -5.602 -5.97 -6.329 -6.709 -7.045 -7.397 -7.774 -8.059 -8.334 -8.664 -9.026 -9.369 -9.611 -9.861 -10.236 -10.513 -10.819 -10.969 -11.3 -11.684 -12.096 -12.311 -12.659 -13.008 -13.253 -13.519 -14.151 -14.514 -14.902 -15.345 -15.873 -16.54 -17.481 -21.801 -6 ,4922 ,TETRA ,17621152,Tue Nov 30 16:13:54 CET,Tue Nov 30 18:46:17 CET,0.0 1.592 2.105 2.493 2.808 3.091 3.346 3.57 3.952 4.111 4.257 4.423 4.665 4.794 5.024 5.231 5.427 5.523 5.713 5.885 6.12 6.261 6.389 6.566 6.73 6.889 7.032 7.163 7.33 7.489 7.643 7.821 7.981 8.131 8.285 8.444 8.596 8.762 8.928 9.08 9.2 9.328 9.476 9.578 9.672 9.746 9.737 9.61 9.325 8.848 7.811 6.282 4.957 3.732 2.669 1.738 0.929 0.207 -0.444 -1.104 -1.71 -2.274 -2.779 -3.256 -3.698 -4.084 -4.5 -4.899 -5.248 -5.599 -5.979 -6.299 -6.618 -6.954 -7.217 -7.505 -7.817 -8.118 -8.431 -8.668 -8.926 -9.333 -9.613 -9.912 -10.066 -10.381 -10.718 -11.095 -11.298 -11.624 -11.966 -12.215 -12.479 -13.088 -13.463 -13.882 -14.416 -15.019 -15.652 -16.567 -20.99 -7 ,23372 ,TETRA ,17621153,Tue Nov 30 16:13:54 CET,Tue Nov 30 18:38:55 CET,0.0 1.675 2.196 2.566 2.877 3.155 3.401 3.613 4.005 4.182 4.341 4.538 4.787 4.912 5.158 5.375 5.568 5.66 5.821 5.966 6.174 6.308 6.432 6.609 6.771 6.914 7.058 7.199 7.369 7.526 7.674 7.841 7.995 8.137 8.281 8.435 8.582 8.737 8.894 9.046 9.187 9.308 9.42 9.505 9.583 9.629 9.586 9.408 9.057 8.435 7.204 5.63 4.298 3.149 2.106 1.162 0.363 -0.381 -1.025 -1.658 -2.211 -2.711 -3.189 -3.645 -4.085 -4.485 -4.895 -5.258 -5.58 -5.921 -6.281 -6.592 -6.924 -7.268 -7.533 -7.817 -8.12 -8.433 -8.769 -9.003 -9.242 -9.638 -9.916 -10.203 -10.355 -10.676 -11.015 -11.39 -11.597 -11.92 -12.236 -12.475 -12.727 -13.294 -13.626 -13.999 -14.432 -14.937 -15.523 -16.378 -19.349 -8 ,5881 ,TETRA ,17621154,Tue Nov 30 16:13:54 CET,Tue Nov 30 19:14:56 CET,0.0 1.841 2.404 2.796 3.12 3.387 3.627 3.854 4.243 4.409 4.562 4.744 4.976 5.1 5.335 5.54 5.731 5.823 5.988 6.14 6.36 6.496 6.623 6.797 6.961 7.117 7.254 7.383 7.546 7.702 7.859 8.033 8.18 8.327 8.48 8.638 8.789 8.931 9.067 9.216 9.364 9.491 9.605 9.693 9.763 9.788 9.721 9.522 9.167 8.562 7.394 5.848 4.482 3.328 2.324 1.419 0.656 -0.059 -0.688 -1.327 -1.886 -2.37 -2.825 -3.268 -3.696 -4.098 -4.539 -4.95 -5.3 -5.664 -6.055 -6.368 -6.709 -7.083 -7.377 -7.682 -7.999 -8.348 -8.726 -8.973 -9.227 -9.652 -9.946 -10.263 -10.43 -10.772 -11.126 -11.498 -11.706 -12.065 -12.435 -12.725 -13.035 -13.642 -14.006 -14.446 -14.917 -15.435 -16.073 -16.976 -20.287 -9 ,2956 ,TETRA ,17621155,Tue Nov 30 16:13:54 CET,Tue Nov 30 18:42:25 CET,0.0 1.527 2.037 2.415 2.698 2.947 3.199 3.431 3.828 4.006 4.17 4.362 4.609 4.733 4.947 5.145 5.341 5.434 5.604 5.763 5.988 6.129 6.265 6.455 6.638 6.804 6.958 7.114 7.291 7.445 7.598 7.782 7.956 8.118 8.293 8.465 8.62 8.79 8.961 9.121 9.267 9.399 9.523 9.631 9.712 9.746 9.721 9.599 9.309 8.734 7.591 5.94 4.558 3.386 2.337 1.392 0.523 -0.306 -1.022 -1.727 -2.346 -2.889 -3.402 -3.903 -4.368 -4.8 -5.265 -5.678 -6.035 -6.417 -6.836 -7.186 -7.564 -7.966 -8.248 -8.525 -8.833 -9.18 -9.532 -9.772 -10.019 -10.397 -10.661 -10.945 -11.104 -11.445 -11.809 -12.179 -12.367 -12.69 -12.975 -13.215 -13.477 -14.048 -14.382 -14.769 -15.222 -15.731 -16.381 -17.289 -20.288 -10 ,29825 ,TETRA ,17621156,Tue Nov 30 16:13:55 CET,Tue Nov 30 18:41:05 CET,0.0 1.48 1.993 2.361 2.672 2.934 3.165 3.378 3.753 3.916 4.073 4.262 4.505 4.642 4.881 5.079 5.264 5.35 5.516 5.682 5.914 6.05 6.168 6.334 6.491 6.638 6.775 6.909 7.087 7.251 7.394 7.555 7.71 7.855 8.014 8.169 8.295 8.432 8.573 8.711 8.843 8.977 9.117 9.21 9.26 9.267 9.211 9.073 8.816 8.289 7.237 5.827 4.542 3.413 2.419 1.493 0.678 -0.061 -0.718 -1.378 -1.949 -2.462 -2.935 -3.4 -3.854 -4.288 -4.743 -5.133 -5.476 -5.843 -6.231 -6.546 -6.865 -7.207 -7.476 -7.766 -8.072 -8.388 -8.737 -8.979 -9.218 -9.62 -9.921 -10.238 -10.41 -10.757 -11.101 -11.468 -11.665 -11.998 -12.362 -12.625 -12.907 -13.625 -14.033 -14.435 -14.894 -15.437 -16.103 -17.11 -21.585 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_63.txt deleted file mode 100644 index 48a4f6b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28528 ,KEBNE ,17076863,Sat Dec 25 06:49:54 CET,Sat Dec 25 08:50:49 CET,0.0 2.047 2.647 3.095 3.497 3.853 4.144 4.402 4.867 5.084 5.282 5.528 5.807 5.97 6.258 6.519 6.769 6.893 7.124 7.339 7.644 7.846 8.043 8.317 8.572 8.805 9.023 9.24 9.513 9.759 9.993 10.267 10.532 10.791 11.073 11.371 11.653 11.944 12.254 12.588 12.933 13.318 13.743 14.148 14.611 15.089 15.618 16.177 16.746 17.336 17.857 17.995 17.852 17.612 17.357 17.087 16.796 16.459 16.112 15.767 15.45 15.141 14.849 14.569 14.308 14.074 13.816 13.571 13.356 13.127 12.884 12.685 12.448 12.182 11.993 11.796 11.589 11.358 11.102 10.929 10.748 10.475 10.282 10.059 9.939 9.688 9.412 9.119 8.966 8.698 8.433 8.229 8.013 7.548 7.269 6.96 6.614 6.222 5.728 4.994 2.528 -2 ,1363 ,KEBNE ,17076864,Sat Dec 25 06:49:55 CET,Sat Dec 25 08:50:56 CET,0.0 1.766 2.353 2.816 3.206 3.533 3.82 4.063 4.489 4.684 4.86 5.105 5.365 5.505 5.779 6.029 6.259 6.368 6.58 6.779 7.057 7.234 7.408 7.654 7.888 8.121 8.336 8.535 8.785 9.029 9.262 9.529 9.781 10.016 10.288 10.585 10.868 11.18 11.494 11.812 12.152 12.528 12.972 13.402 13.848 14.329 14.858 15.426 16.082 16.738 17.334 17.538 17.394 17.139 16.821 16.463 16.1 15.754 15.468 15.181 14.895 14.61 14.338 14.085 13.836 13.601 13.343 13.104 12.898 12.659 12.387 12.164 11.93 11.688 11.501 11.304 11.097 10.87 10.632 10.469 10.295 10.011 9.811 9.603 9.497 9.262 8.989 8.712 8.567 8.317 8.09 7.906 7.693 7.233 6.98 6.696 6.364 5.968 5.464 4.803 2.478 -3 ,10038 ,KEBNE ,17076865,Sat Dec 25 06:49:55 CET,Sat Dec 25 08:50:35 CET,0.0 2.155 2.805 3.236 3.597 3.91 4.174 4.419 4.865 5.06 5.251 5.494 5.755 5.906 6.182 6.44 6.679 6.788 7.001 7.211 7.505 7.687 7.858 8.103 8.338 8.563 8.782 8.994 9.255 9.488 9.715 9.988 10.24 10.482 10.768 11.094 11.39 11.707 12.058 12.413 12.781 13.194 13.67 14.138 14.632 15.153 15.733 16.354 17.042 17.774 18.437 18.638 18.555 18.37 18.153 17.897 17.611 17.331 17.046 16.726 16.439 16.152 15.87 15.596 15.326 15.079 14.819 14.568 14.34 14.096 13.841 13.617 13.373 13.132 12.945 12.746 12.521 12.293 12.058 11.891 11.711 11.416 11.219 11.004 10.886 10.644 10.373 10.079 9.921 9.655 9.407 9.209 9.0 8.53 8.273 7.98 7.624 7.195 6.652 5.897 3.134 -4 ,26561 ,KEBNE ,17076866,Sat Dec 25 06:50:57 CET,Sat Dec 25 08:51:48 CET,0.0 2.077 2.705 3.157 3.573 3.951 4.256 4.515 4.965 5.17 5.352 5.572 5.829 5.976 6.249 6.492 6.721 6.83 7.037 7.246 7.537 7.708 7.876 8.125 8.357 8.584 8.797 8.996 9.255 9.495 9.713 9.967 10.225 10.476 10.746 11.04 11.329 11.636 11.946 12.281 12.623 12.985 13.407 13.812 14.255 14.739 15.266 15.786 16.312 16.816 17.231 17.274 17.0 16.67 16.369 16.038 15.712 15.377 15.056 14.726 14.429 14.15 13.87 13.582 13.308 13.08 12.83 12.603 12.403 12.173 11.92 11.71 11.479 11.212 11.004 10.79 10.561 10.322 10.071 9.895 9.712 9.414 9.207 8.994 8.867 8.584 8.293 7.989 7.835 7.57 7.319 7.128 6.917 6.423 6.141 5.828 5.462 5.042 4.51 3.69 0.914 -5 ,5300 ,KEBNE ,17076867,Sat Dec 25 06:50:57 CET,Sat Dec 25 08:51:55 CET,0.0 1.77 2.404 2.879 3.257 3.556 3.821 4.063 4.485 4.673 4.845 5.065 5.325 5.463 5.723 5.969 6.206 6.325 6.564 6.778 7.062 7.236 7.405 7.647 7.869 8.075 8.28 8.487 8.749 8.986 9.214 9.487 9.738 9.975 10.252 10.568 10.869 11.181 11.499 11.844 12.199 12.588 13.059 13.514 14.004 14.533 15.106 15.721 16.368 17.036 17.657 17.802 17.668 17.435 17.115 16.77 16.419 16.1 15.828 15.533 15.247 14.956 14.663 14.37 14.083 13.807 13.508 13.255 13.049 12.813 12.55 12.33 12.091 11.838 11.646 11.438 11.207 10.967 10.719 10.54 10.359 10.071 9.861 9.626 9.499 9.228 8.938 8.634 8.47 8.2 7.94 7.739 7.522 7.009 6.713 6.38 5.993 5.548 5.003 4.222 1.949 -6 ,32368 ,KEBNE ,17076868,Sat Dec 25 06:50:57 CET,Sat Dec 25 08:51:51 CET,0.0 1.717 2.356 2.812 3.183 3.51 3.791 4.04 4.47 4.657 4.831 5.047 5.299 5.436 5.685 5.924 6.154 6.265 6.469 6.667 6.957 7.131 7.293 7.528 7.759 7.972 8.171 8.361 8.603 8.837 9.059 9.324 9.584 9.826 10.094 10.391 10.664 10.955 11.258 11.571 11.889 12.235 12.638 13.037 13.5 13.995 14.527 15.085 15.687 16.283 16.772 16.917 16.826 16.654 16.407 16.076 15.718 15.381 15.055 14.705 14.407 14.11 13.814 13.527 13.244 12.996 12.736 12.499 12.299 12.078 11.837 11.64 11.418 11.162 10.958 10.756 10.558 10.339 10.099 9.925 9.735 9.436 9.222 8.993 8.869 8.627 8.374 8.066 7.903 7.643 7.402 7.197 6.963 6.458 6.167 5.847 5.51 5.122 4.616 3.893 0.989 -7 ,23855 ,KEBNE ,17076869,Sat Dec 25 06:50:57 CET,Sat Dec 25 08:52:09 CET,0.0 1.569 2.088 2.499 2.853 3.156 3.43 3.686 4.153 4.357 4.535 4.758 5.024 5.18 5.474 5.741 5.982 6.101 6.329 6.542 6.856 7.042 7.21 7.446 7.683 7.923 8.143 8.344 8.598 8.848 9.092 9.37 9.62 9.855 10.133 10.444 10.734 11.049 11.383 11.728 12.072 12.469 12.937 13.366 13.851 14.387 14.972 15.573 16.243 16.972 17.659 17.974 17.975 17.792 17.523 17.244 16.961 16.656 16.353 16.052 15.763 15.469 15.191 14.922 14.669 14.437 14.181 13.942 13.717 13.468 13.21 12.989 12.753 12.505 12.304 12.101 11.892 11.668 11.426 11.253 11.071 10.768 10.548 10.323 10.205 9.953 9.676 9.371 9.21 8.94 8.674 8.472 8.259 7.77 7.496 7.188 6.833 6.436 5.912 5.15 2.373 -8 ,10970 ,KEBNE ,17076870,Sat Dec 25 06:50:58 CET,Sat Dec 25 08:52:10 CET,0.0 1.767 2.349 2.775 3.129 3.442 3.728 3.97 4.383 4.573 4.755 4.984 5.244 5.389 5.653 5.896 6.129 6.248 6.473 6.679 6.96 7.143 7.32 7.564 7.795 8.027 8.246 8.441 8.699 8.944 9.174 9.462 9.737 9.984 10.265 10.575 10.864 11.167 11.483 11.816 12.164 12.552 13.009 13.466 13.962 14.501 15.109 15.755 16.444 17.174 17.92 18.261 18.212 17.989 17.685 17.331 16.993 16.695 16.425 16.1 15.775 15.499 15.246 14.99 14.75 14.515 14.238 13.978 13.764 13.527 13.259 13.041 12.816 12.566 12.356 12.151 11.949 11.732 11.499 11.333 11.148 10.849 10.64 10.426 10.309 10.053 9.784 9.484 9.318 9.052 8.818 8.623 8.399 7.924 7.658 7.359 7.022 6.595 6.085 5.42 2.904 -9 ,1250 ,KEBNE ,17076871,Sat Dec 25 06:52:00 CET,Sat Dec 25 08:52:04 CET,0.0 1.777 2.351 2.768 3.111 3.423 3.699 3.936 4.353 4.534 4.699 4.908 5.153 5.284 5.532 5.77 5.999 6.109 6.317 6.509 6.787 6.976 7.157 7.403 7.639 7.867 8.084 8.286 8.543 8.787 9.008 9.265 9.51 9.744 10.006 10.281 10.537 10.819 11.133 11.459 11.774 12.14 12.574 12.972 13.417 13.903 14.436 14.995 15.596 16.224 16.798 17.042 16.978 16.763 16.479 16.139 15.8 15.497 15.217 14.909 14.646 14.399 14.13 13.848 13.571 13.311 13.032 12.793 12.574 12.324 12.069 11.857 11.624 11.37 11.17 10.971 10.777 10.565 10.318 10.138 9.962 9.683 9.471 9.257 9.149 8.911 8.653 8.377 8.23 7.982 7.742 7.552 7.357 6.915 6.663 6.397 6.087 5.711 5.213 4.527 2.22 -10 ,3671 ,KEBNE ,17076872,Sat Dec 25 06:52:01 CET,Sat Dec 25 08:52:52 CET,0.0 1.8 2.326 2.724 3.052 3.34 3.608 3.857 4.271 4.455 4.629 4.863 5.133 5.287 5.572 5.825 6.062 6.179 6.403 6.615 6.898 7.077 7.256 7.503 7.741 7.969 8.174 8.371 8.632 8.873 9.097 9.36 9.613 9.848 10.112 10.411 10.702 11.021 11.343 11.674 12.02 12.399 12.839 13.258 13.719 14.222 14.731 15.268 15.902 16.616 17.342 17.682 17.649 17.457 17.17 16.86 16.549 16.248 15.986 15.689 15.405 15.124 14.82 14.518 14.239 13.982 13.706 13.462 13.245 13.011 12.761 12.534 12.29 12.025 11.818 11.606 11.387 11.163 10.926 10.765 10.593 10.323 10.13 9.92 9.81 9.568 9.297 8.997 8.841 8.576 8.314 8.126 7.925 7.482 7.234 6.946 6.625 6.26 5.785 5.132 2.612 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_29.txt deleted file mode 100644 index 75c4030f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25639 ,TETRA ,17621157,Tue Nov 30 16:13:58 CET,Tue Nov 30 18:42:59 CET,0.0 1.741 2.28 2.646 2.939 3.177 3.384 3.557 3.829 3.937 4.033 4.137 4.307 4.378 4.498 4.595 4.672 4.706 4.763 4.802 4.85 4.87 4.876 4.865 4.844 4.821 4.774 4.716 4.621 4.505 4.382 4.232 4.068 3.877 3.643 3.344 3.006 2.623 2.176 1.628 1.011 0.25 -0.741 -1.896 -3.459 -5.383 -7.873 -11.063 -15.273 -21.081 -29.85 -39.205 -46.2 -51.686 -56.038 -59.738 -62.866 -65.572 -67.862 -70.139 -72.063 -73.71 -75.228 -76.661 -77.962 -79.083 -80.222 -81.257 -82.142 -83.041 -83.983 -84.772 -85.586 -86.415 -87.047 -87.699 -88.377 -89.091 -89.828 -90.326 -90.838 -91.626 -92.17 -92.738 -93.027 -93.623 -94.246 -94.894 -95.246 -95.8 -96.428 -96.862 -97.325 -98.358 -98.926 -99.527 -100.191 -100.959 -101.924 -103.254 -108.228 -2 ,29081 ,TETRA ,17621158,Tue Nov 30 16:13:58 CET,Tue Nov 30 18:43:19 CET,0.0 2.169 2.69 3.04 3.313 3.54 3.722 3.879 4.175 4.289 4.383 4.454 4.604 4.667 4.786 4.887 4.973 5.014 5.09 5.139 5.181 5.19 5.184 5.165 5.133 5.091 5.037 4.974 4.882 4.785 4.684 4.539 4.374 4.193 3.943 3.597 3.214 2.761 2.252 1.662 0.969 0.144 -0.873 -2.014 -3.534 -5.407 -7.74 -10.675 -14.658 -20.198 -28.48 -37.238 -43.65 -48.667 -52.741 -56.191 -59.061 -61.537 -63.595 -65.624 -67.336 -68.792 -70.114 -71.342 -72.473 -73.487 -74.533 -75.468 -76.266 -77.092 -77.992 -78.769 -79.58 -80.424 -81.079 -81.751 -82.441 -83.135 -83.825 -84.298 -84.805 -85.612 -86.154 -86.704 -86.987 -87.586 -88.246 -88.937 -89.288 -89.831 -90.425 -90.839 -91.286 -92.275 -92.844 -93.462 -94.13 -94.911 -95.876 -97.177 -102.115 -3 ,18304 ,TETRA ,17621159,Tue Nov 30 16:13:58 CET,Tue Nov 30 18:43:37 CET,0.0 1.596 2.098 2.468 2.737 2.963 3.161 3.329 3.595 3.7 3.793 3.86 4.013 4.076 4.179 4.267 4.325 4.337 4.357 4.371 4.377 4.373 4.366 4.343 4.301 4.244 4.174 4.096 3.979 3.855 3.73 3.546 3.339 3.124 2.837 2.467 2.083 1.627 1.088 0.474 -0.221 -1.08 -2.199 -3.428 -4.993 -6.942 -9.415 -12.514 -16.705 -22.537 -31.082 -40.15 -46.911 -52.24 -56.603 -60.348 -63.513 -66.237 -68.481 -70.663 -72.529 -74.192 -75.713 -77.077 -78.343 -79.484 -80.638 -81.676 -82.566 -83.477 -84.417 -85.181 -85.968 -86.777 -87.402 -88.041 -88.695 -89.382 -90.096 -90.586 -91.098 -91.894 -92.446 -93.028 -93.327 -93.941 -94.581 -95.245 -95.593 -96.138 -96.752 -97.177 -97.611 -98.587 -99.13 -99.699 -100.338 -101.088 -102.015 -103.284 -107.824 -4 ,7579 ,TETRA ,17621160,Tue Nov 30 16:13:58 CET,Tue Nov 30 18:42:34 CET,0.0 2.273 2.925 3.322 3.625 3.866 4.075 4.255 4.548 4.672 4.78 4.865 5.023 5.089 5.205 5.298 5.368 5.397 5.451 5.502 5.568 5.597 5.609 5.597 5.571 5.536 5.49 5.431 5.338 5.237 5.123 4.961 4.78 4.592 4.357 4.055 3.734 3.36 2.902 2.368 1.77 0.999 -0.003 -1.084 -2.467 -4.196 -6.445 -9.318 -13.211 -18.801 -27.211 -36.048 -42.668 -47.906 -52.087 -55.701 -58.726 -61.272 -63.356 -65.359 -67.069 -68.628 -70.106 -71.448 -72.705 -73.868 -75.069 -76.126 -77.023 -77.967 -78.928 -79.697 -80.492 -81.324 -81.966 -82.614 -83.284 -83.968 -84.677 -85.175 -85.689 -86.481 -87.033 -87.604 -87.9 -88.512 -89.159 -89.867 -90.236 -90.783 -91.399 -91.818 -92.262 -93.255 -93.805 -94.393 -95.02 -95.764 -96.7 -97.994 -102.681 -5 ,16278 ,TETRA ,17621161,Tue Nov 30 16:13:54 CET,Tue Nov 30 18:48:31 CET,0.0 2.291 2.868 3.268 3.572 3.814 4.017 4.196 4.488 4.612 4.726 4.841 5.013 5.082 5.211 5.318 5.395 5.425 5.475 5.508 5.532 5.535 5.53 5.51 5.481 5.435 5.374 5.3 5.185 5.056 4.913 4.72 4.518 4.317 4.066 3.753 3.444 3.09 2.65 2.113 1.461 0.625 -0.465 -1.652 -3.159 -5.04 -7.46 -10.517 -14.634 -20.356 -28.843 -37.772 -44.362 -49.528 -53.627 -57.079 -60.003 -62.559 -64.649 -66.656 -68.351 -69.807 -71.155 -72.421 -73.598 -74.645 -75.711 -76.661 -77.478 -78.311 -79.159 -79.861 -80.598 -81.351 -81.931 -82.527 -83.139 -83.776 -84.436 -84.881 -85.336 -86.05 -86.544 -87.06 -87.334 -87.892 -88.475 -89.107 -89.434 -89.948 -90.486 -90.872 -91.284 -92.195 -92.694 -93.244 -93.875 -94.611 -95.484 -96.676 -101.277 -6 ,25125 ,TETRA ,17621162,Tue Nov 30 16:13:58 CET,Tue Nov 30 18:47:39 CET,0.0 1.661 2.19 2.579 2.89 3.158 3.367 3.554 3.874 3.999 4.112 4.23 4.394 4.465 4.584 4.672 4.747 4.779 4.825 4.864 4.896 4.905 4.916 4.908 4.879 4.835 4.778 4.714 4.619 4.509 4.378 4.198 4.019 3.817 3.545 3.216 2.863 2.437 1.942 1.358 0.692 -0.137 -1.237 -2.41 -3.915 -5.865 -8.403 -11.595 -15.799 -21.659 -30.572 -40.139 -47.234 -52.751 -57.256 -61.149 -64.418 -67.256 -69.597 -71.827 -73.685 -75.304 -76.8 -78.162 -79.401 -80.513 -81.675 -82.701 -83.599 -84.52 -85.43 -86.166 -86.949 -87.769 -88.392 -89.026 -89.675 -90.351 -91.053 -91.539 -92.047 -92.84 -93.392 -93.969 -94.267 -94.869 -95.503 -96.187 -96.539 -97.077 -97.677 -98.093 -98.53 -99.475 -99.999 -100.57 -101.214 -101.982 -102.911 -104.172 -108.359 -7 ,24622 ,TETRA ,17621163,Tue Nov 30 16:13:58 CET,Tue Nov 30 18:43:06 CET,0.0 2.085 2.677 3.097 3.403 3.654 3.864 4.036 4.317 4.438 4.545 4.626 4.791 4.862 4.996 5.101 5.176 5.213 5.276 5.316 5.366 5.383 5.389 5.402 5.399 5.381 5.347 5.275 5.151 5.023 4.878 4.687 4.474 4.237 3.943 3.597 3.234 2.799 2.265 1.63 0.938 0.093 -1.011 -2.214 -3.734 -5.618 -8.055 -11.133 -15.254 -20.958 -29.435 -38.381 -44.971 -50.206 -54.35 -57.765 -60.638 -63.157 -65.25 -67.261 -68.964 -70.442 -71.81 -73.077 -74.229 -75.257 -76.319 -77.277 -78.094 -78.907 -79.726 -80.401 -81.113 -81.851 -82.419 -83.015 -83.652 -84.335 -85.065 -85.571 -86.08 -86.871 -87.437 -88.019 -88.315 -88.928 -89.588 -90.309 -90.682 -91.238 -91.875 -92.304 -92.771 -93.79 -94.348 -94.973 -95.676 -96.457 -97.373 -98.626 -102.99 -8 ,3706 ,TETRA ,17621164,Tue Nov 30 16:13:58 CET,Tue Nov 30 18:24:43 CET,0.0 2.495 3.081 3.465 3.765 4.006 4.192 4.352 4.611 4.719 4.826 4.915 5.065 5.126 5.246 5.343 5.408 5.434 5.478 5.516 5.555 5.564 5.566 5.559 5.537 5.493 5.429 5.364 5.266 5.156 5.04 4.874 4.691 4.505 4.273 3.971 3.637 3.231 2.75 2.19 1.544 0.756 -0.256 -1.432 -2.975 -4.822 -7.155 -10.173 -14.326 -20.156 -28.863 -38.233 -45.268 -50.709 -54.956 -58.531 -61.621 -64.418 -66.79 -69.05 -70.879 -72.445 -73.927 -75.315 -76.596 -77.741 -78.902 -79.919 -80.782 -81.675 -82.601 -83.364 -84.161 -84.962 -85.562 -86.19 -86.838 -87.51 -88.227 -88.714 -89.2 -89.948 -90.473 -91.045 -91.343 -91.95 -92.579 -93.241 -93.599 -94.145 -94.738 -95.156 -95.599 -96.578 -97.13 -97.715 -98.338 -99.073 -99.988 -101.191 -106.272 -9 ,17975 ,TETRA ,17621165,Tue Nov 30 16:13:58 CET,Tue Nov 30 18:41:37 CET,0.0 2.007 2.544 2.9 3.164 3.38 3.568 3.732 4.001 4.105 4.184 4.231 4.373 4.43 4.521 4.588 4.64 4.662 4.698 4.725 4.745 4.751 4.755 4.758 4.755 4.721 4.653 4.573 4.465 4.377 4.271 4.086 3.883 3.67 3.383 3.032 2.675 2.232 1.718 1.146 0.479 -0.377 -1.471 -2.664 -4.225 -6.146 -8.573 -11.648 -15.761 -21.422 -29.878 -38.903 -45.548 -50.731 -55.01 -58.732 -61.93 -64.737 -67.077 -69.324 -71.172 -72.789 -74.305 -75.712 -77.02 -78.215 -79.43 -80.488 -81.401 -82.327 -83.266 -84.029 -84.817 -85.619 -86.225 -86.868 -87.537 -88.211 -88.92 -89.414 -89.919 -90.692 -91.225 -91.789 -92.084 -92.699 -93.345 -94.03 -94.393 -94.939 -95.578 -96.002 -96.434 -97.356 -97.853 -98.412 -99.055 -99.76 -100.639 -101.88 -106.75 -10 ,4861 ,TETRA ,17621166,Tue Nov 30 16:13:58 CET,Tue Nov 30 18:48:08 CET,0.0 1.965 2.484 2.814 3.08 3.312 3.489 3.632 3.868 3.977 4.083 4.171 4.325 4.391 4.489 4.566 4.624 4.649 4.679 4.7 4.715 4.71 4.71 4.701 4.656 4.586 4.515 4.45 4.353 4.245 4.128 3.97 3.783 3.561 3.302 2.995 2.661 2.262 1.789 1.246 0.619 -0.174 -1.194 -2.31 -3.769 -5.603 -7.99 -11.036 -15.074 -20.701 -29.128 -38.23 -45.254 -50.799 -55.245 -59.05 -62.25 -65.005 -67.247 -69.399 -71.239 -72.855 -74.369 -75.759 -77.018 -78.158 -79.31 -80.308 -81.159 -82.05 -82.982 -83.748 -84.543 -85.371 -86.009 -86.666 -87.349 -88.051 -88.782 -89.283 -89.796 -90.595 -91.15 -91.729 -92.028 -92.652 -93.313 -94.01 -94.367 -94.907 -95.52 -95.948 -96.404 -97.392 -97.927 -98.502 -99.167 -99.946 -100.907 -102.207 -106.141 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_35.txt deleted file mode 100644 index e7ef17d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_35.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10303 ,TETRA ,17621167,Tue Nov 30 16:13:57 CET,Tue Nov 30 18:47:59 CET,0.0 2.108 2.75 3.227 3.602 3.902 4.178 4.429 4.848 5.03 5.2 5.4 5.612 5.735 5.963 6.176 6.376 6.472 6.658 6.826 7.051 7.193 7.325 7.521 7.713 7.887 8.057 8.217 8.402 8.574 8.731 8.916 9.097 9.25 9.386 9.533 9.686 9.843 9.983 10.115 10.242 10.365 10.478 10.539 10.579 10.579 10.445 10.178 9.646 8.6 6.79 4.278 2.061 0.313 -1.117 -2.536 -3.865 -5.043 -6.038 -6.994 -7.868 -8.65 -9.348 -10.062 -10.7 -11.208 -11.774 -12.336 -12.838 -13.391 -13.991 -14.494 -15.017 -15.55 -15.96 -16.383 -16.837 -17.337 -17.875 -18.227 -18.59 -19.19 -19.613 -20.048 -20.271 -20.734 -21.214 -21.733 -22.006 -22.388 -22.906 -23.263 -23.643 -24.485 -24.961 -25.475 -26.062 -26.777 -27.67 -28.83 -33.051 -2 ,18865 ,TETRA ,17621168,Tue Nov 30 16:13:56 CET,Tue Nov 30 18:42:36 CET,0.0 2.101 2.706 3.136 3.474 3.768 4.022 4.236 4.623 4.805 4.971 5.194 5.414 5.543 5.768 5.974 6.183 6.285 6.468 6.643 6.893 7.042 7.189 7.392 7.571 7.748 7.91 8.06 8.252 8.425 8.575 8.755 8.919 9.066 9.232 9.396 9.553 9.716 9.863 10.02 10.185 10.332 10.426 10.484 10.527 10.509 10.399 10.142 9.611 8.706 7.12 5.033 3.201 1.64 0.269 -1.028 -2.159 -3.152 -4.06 -4.991 -5.777 -6.486 -7.155 -7.783 -8.405 -9.017 -9.661 -10.23 -10.71 -11.201 -11.723 -12.168 -12.635 -13.137 -13.55 -13.98 -14.424 -14.887 -15.389 -15.752 -16.12 -16.7 -17.117 -17.566 -17.8 -18.273 -18.759 -19.292 -19.569 -19.955 -20.453 -20.801 -21.198 -22.038 -22.5 -23.013 -23.589 -24.27 -25.139 -26.364 -31.505 -3 ,13851 ,TETRA ,17621169,Tue Nov 30 16:13:58 CET,Tue Nov 30 18:43:37 CET,0.0 1.94 2.507 2.959 3.36 3.671 3.928 4.162 4.559 4.736 4.905 5.136 5.362 5.499 5.754 5.98 6.173 6.262 6.437 6.604 6.827 6.973 7.113 7.296 7.47 7.642 7.793 7.924 8.087 8.244 8.386 8.547 8.715 8.864 9.023 9.19 9.331 9.475 9.624 9.772 9.884 9.989 10.088 10.138 10.177 10.141 10.009 9.757 9.265 8.314 6.538 4.338 2.529 0.893 -0.593 -1.925 -3.109 -4.149 -5.043 -5.965 -6.742 -7.439 -8.099 -8.728 -9.335 -9.881 -10.463 -10.995 -11.442 -11.893 -12.361 -12.744 -13.154 -13.584 -13.913 -14.258 -14.632 -15.031 -15.467 -15.793 -16.134 -16.641 -16.97 -17.316 -17.505 -17.913 -18.349 -18.843 -19.108 -19.485 -19.962 -20.268 -20.602 -21.342 -21.746 -22.211 -22.747 -23.369 -24.163 -25.303 -29.847 -4 ,17298 ,TETRA ,17621170,Tue Nov 30 16:14:00 CET,Tue Nov 30 18:41:46 CET,0.0 2.174 2.789 3.192 3.537 3.835 4.104 4.354 4.77 4.947 5.114 5.331 5.555 5.685 5.938 6.16 6.362 6.456 6.63 6.807 7.048 7.189 7.335 7.535 7.715 7.9 8.071 8.226 8.417 8.597 8.753 8.926 9.095 9.25 9.408 9.562 9.724 9.899 10.04 10.171 10.308 10.426 10.51 10.555 10.57 10.534 10.353 9.949 9.336 8.358 6.428 3.908 1.815 -0.074 -1.753 -3.208 -4.499 -5.73 -6.777 -7.79 -8.704 -9.567 -10.373 -11.115 -11.806 -12.449 -13.145 -13.783 -14.349 -14.936 -15.541 -16.045 -16.575 -17.104 -17.512 -17.948 -18.395 -18.875 -19.405 -19.774 -20.145 -20.719 -21.118 -21.536 -21.753 -22.223 -22.735 -23.269 -23.554 -23.962 -24.489 -24.823 -25.178 -25.999 -26.469 -27.008 -27.617 -28.285 -29.122 -30.322 -35.495 -5 ,7633 ,TETRA ,17621171,Tue Nov 30 16:13:56 CET,Tue Nov 30 18:59:02 CET,0.0 1.808 2.439 2.917 3.303 3.625 3.906 4.155 4.597 4.798 4.986 5.25 5.49 5.633 5.903 6.147 6.362 6.462 6.652 6.838 7.09 7.234 7.382 7.595 7.784 7.96 8.118 8.273 8.465 8.637 8.802 8.983 9.151 9.3 9.447 9.615 9.779 9.942 10.091 10.228 10.344 10.451 10.545 10.584 10.578 10.528 10.407 10.138 9.654 8.731 6.952 4.742 2.729 0.914 -0.637 -2.142 -3.536 -4.777 -5.878 -6.989 -7.9 -8.74 -9.534 -10.223 -10.84 -11.4 -11.996 -12.556 -13.089 -13.646 -14.221 -14.71 -15.215 -15.758 -16.191 -16.632 -17.073 -17.523 -17.993 -18.334 -18.691 -19.266 -19.682 -20.109 -20.332 -20.802 -21.309 -21.851 -22.134 -22.552 -23.085 -23.439 -23.816 -24.645 -25.106 -25.62 -26.216 -26.885 -27.696 -28.83 -33.487 -6 ,23769 ,TETRA ,17621172,Tue Nov 30 16:14:48 CET,Tue Nov 30 18:44:00 CET,0.0 2.232 2.941 3.388 3.759 4.085 4.366 4.629 5.112 5.32 5.509 5.76 5.996 6.129 6.373 6.593 6.793 6.894 7.092 7.272 7.52 7.677 7.821 8.016 8.203 8.383 8.562 8.721 8.903 9.083 9.246 9.429 9.604 9.768 9.945 10.122 10.298 10.479 10.656 10.822 10.957 11.09 11.23 11.345 11.387 11.338 11.142 10.844 10.394 9.504 7.968 6.049 4.271 2.733 1.384 0.086 -1.051 -2.073 -2.998 -3.968 -4.781 -5.451 -6.127 -6.838 -7.511 -8.14 -8.826 -9.449 -9.982 -10.517 -11.067 -11.522 -11.993 -12.514 -12.924 -13.369 -13.839 -14.316 -14.828 -15.175 -15.529 -16.072 -16.459 -16.875 -17.092 -17.559 -18.074 -18.619 -18.895 -19.282 -19.818 -20.165 -20.522 -21.322 -21.771 -22.273 -22.829 -23.483 -24.329 -25.547 -30.518 -7 ,11954 ,TETRA ,17621173,Tue Nov 30 16:14:48 CET,Tue Nov 30 18:46:42 CET,0.0 2.139 2.751 3.217 3.577 3.873 4.127 4.355 4.764 4.938 5.099 5.317 5.54 5.676 5.925 6.158 6.365 6.457 6.629 6.791 7.024 7.165 7.296 7.487 7.673 7.84 7.988 8.132 8.31 8.473 8.631 8.824 8.992 9.138 9.301 9.464 9.608 9.766 9.921 10.065 10.202 10.32 10.413 10.445 10.427 10.356 10.155 9.822 9.255 8.253 6.429 4.047 1.93 0.109 -1.381 -2.741 -3.929 -5.015 -6.002 -6.974 -7.798 -8.549 -9.302 -10.032 -10.707 -11.31 -11.932 -12.479 -12.963 -13.47 -13.977 -14.391 -14.829 -15.296 -15.658 -16.034 -16.433 -16.866 -17.324 -17.639 -17.975 -18.507 -18.886 -19.29 -19.496 -19.91 -20.349 -20.867 -21.156 -21.556 -22.076 -22.407 -22.771 -23.594 -24.054 -24.56 -25.139 -25.821 -26.649 -27.784 -31.842 -8 ,8471 ,TETRA ,17621174,Tue Nov 30 16:14:48 CET,Tue Nov 30 18:46:08 CET,0.0 2.027 2.639 3.095 3.46 3.77 4.032 4.26 4.666 4.853 5.021 5.249 5.47 5.593 5.832 6.061 6.266 6.361 6.54 6.716 6.958 7.107 7.254 7.446 7.635 7.817 7.978 8.128 8.321 8.5 8.658 8.834 9.005 9.171 9.352 9.543 9.71 9.884 10.052 10.189 10.319 10.462 10.622 10.739 10.812 10.84 10.761 10.556 10.162 9.412 7.732 5.523 3.803 2.331 1.015 -0.276 -1.487 -2.59 -3.507 -4.423 -5.258 -6.031 -6.761 -7.41 -8.007 -8.565 -9.162 -9.71 -10.185 -10.666 -11.167 -11.584 -12.009 -12.463 -12.827 -13.211 -13.617 -14.046 -14.508 -14.833 -15.17 -15.699 -16.066 -16.459 -16.668 -17.102 -17.554 -18.048 -18.323 -18.714 -19.219 -19.541 -19.879 -20.673 -21.138 -21.642 -22.19 -22.837 -23.612 -24.676 -28.467 -9 ,25620 ,TETRA ,17621175,Tue Nov 30 16:14:48 CET,Tue Nov 30 18:48:20 CET,0.0 1.88 2.477 2.931 3.302 3.596 3.844 4.06 4.444 4.626 4.797 5.024 5.257 5.394 5.653 5.887 6.087 6.18 6.373 6.564 6.826 6.976 7.121 7.326 7.509 7.69 7.852 8.0 8.196 8.371 8.529 8.719 8.889 9.045 9.215 9.39 9.563 9.739 9.911 10.085 10.244 10.383 10.495 10.553 10.575 10.549 10.451 10.264 9.891 9.145 7.566 5.407 3.455 1.735 0.159 -1.298 -2.594 -3.802 -4.865 -5.916 -6.791 -7.581 -8.355 -9.124 -9.845 -10.462 -11.123 -11.736 -12.264 -12.806 -13.353 -13.831 -14.36 -14.899 -15.31 -15.729 -16.162 -16.639 -17.148 -17.492 -17.849 -18.421 -18.823 -19.235 -19.451 -19.913 -20.409 -20.938 -21.212 -21.596 -22.107 -22.454 -22.826 -23.663 -24.13 -24.644 -25.228 -25.89 -26.713 -27.869 -31.982 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_34.txt deleted file mode 100644 index 6dd44cf3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_34.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,29881 ,TETRA ,17621179,Tue Nov 30 16:14:51 CET,Tue Nov 30 18:42:39 CET,0.0 2.269 2.87 3.301 3.656 3.969 4.244 4.485 4.913 5.111 5.292 5.51 5.769 5.923 6.214 6.483 6.721 6.84 7.077 7.296 7.598 7.789 7.978 8.256 8.518 8.76 8.998 9.235 9.536 9.822 10.093 10.416 10.719 11.004 11.338 11.717 12.082 12.457 12.845 13.243 13.652 14.097 14.591 15.097 15.683 16.247 16.86 17.502 18.124 18.813 19.441 19.535 19.26 18.823 18.312 17.822 17.347 16.865 16.407 15.959 15.554 15.139 14.722 14.291 13.886 13.531 13.147 12.785 12.451 12.102 11.752 11.447 11.098 10.738 10.455 10.13 9.793 9.444 9.051 8.793 8.557 8.172 7.88 7.549 7.366 6.997 6.624 6.16 5.874 5.506 5.077 4.791 4.454 3.708 3.351 2.897 2.275 1.566 0.649 -0.723 -8.516 -4 ,15403 ,TETRA ,17621180,Tue Nov 30 16:14:49 CET,Tue Nov 30 18:31:24 CET,0.0 1.765 2.363 2.812 3.179 3.486 3.749 3.99 4.416 4.605 4.789 5.019 5.274 5.417 5.686 5.941 6.189 6.31 6.544 6.763 7.066 7.262 7.449 7.718 7.965 8.199 8.433 8.652 8.929 9.192 9.442 9.742 10.031 10.309 10.634 11.002 11.343 11.71 12.105 12.515 12.93 13.379 13.891 14.42 15.051 15.719 16.445 17.224 18.027 18.794 19.403 19.542 19.376 19.057 18.62 18.165 17.728 17.274 16.854 16.432 16.025 15.602 15.187 14.784 14.404 14.066 13.7 13.366 13.074 12.731 12.332 12.018 11.697 11.333 11.066 10.802 10.502 10.145 9.774 9.525 9.235 8.792 8.507 8.181 7.992 7.602 7.221 6.806 6.571 6.237 5.787 5.488 5.176 4.465 4.046 3.572 3.034 2.397 1.501 0.043 -11.254 -8 ,21865 ,TETRA ,17621184,Tue Nov 30 16:14:51 CET,Tue Nov 30 18:44:27 CET,0.0 2.213 2.895 3.373 3.761 4.079 4.349 4.592 5.03 5.228 5.42 5.662 5.928 6.082 6.372 6.652 6.914 7.037 7.271 7.499 7.819 8.015 8.211 8.489 8.746 8.996 9.226 9.437 9.708 9.969 10.219 10.513 10.796 11.065 11.364 11.704 12.02 12.363 12.75 13.143 13.527 13.943 14.4 14.857 15.386 15.924 16.529 17.243 17.981 18.664 19.219 19.292 19.038 18.549 18.005 17.42 16.795 16.2 15.677 15.106 14.55 14.065 13.646 13.259 12.902 12.583 12.235 11.911 11.599 11.236 10.882 10.573 10.231 9.886 9.624 9.351 9.044 8.726 8.373 8.113 7.826 7.312 6.955 6.603 6.418 6.049 5.651 5.196 4.938 4.594 4.195 3.91 3.589 2.897 2.493 1.991 1.372 0.729 -0.068 -1.181 -11.539 -9 ,1473 ,TETRA ,17621185,Tue Nov 30 16:14:51 CET,Tue Nov 30 18:45:24 CET,0.0 2.104 2.707 3.157 3.487 3.774 4.04 4.267 4.64 4.821 4.993 5.193 5.437 5.58 5.839 6.083 6.32 6.432 6.646 6.846 7.134 7.317 7.496 7.77 8.017 8.235 8.452 8.668 8.937 9.19 9.434 9.721 9.995 10.275 10.592 10.938 11.277 11.623 11.986 12.391 12.818 13.282 13.828 14.412 15.033 15.614 16.277 17.033 17.813 18.568 19.177 19.305 19.04 18.599 18.186 17.746 17.317 16.885 16.467 16.025 15.611 15.242 14.88 14.504 14.096 13.703 13.309 12.941 12.598 12.226 11.833 11.49 11.147 10.794 10.5 10.182 9.833 9.467 9.113 8.887 8.65 8.244 7.941 7.627 7.465 7.134 6.759 6.33 6.106 5.78 5.357 5.034 4.673 3.874 3.429 2.954 2.344 1.576 0.701 -0.544 -12.714 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_35.txt deleted file mode 100644 index b1d33bf4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_35.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,28605 ,TETRA ,17621188,Tue Nov 30 16:14:50 CET,Tue Nov 30 18:49:44 CET,0.0 2.154 2.774 3.217 3.593 3.927 4.225 4.475 4.917 5.112 5.29 5.519 5.771 5.915 6.176 6.421 6.647 6.754 6.969 7.173 7.457 7.639 7.812 8.053 8.271 8.478 8.673 8.848 9.071 9.293 9.508 9.752 9.972 10.183 10.429 10.702 10.956 11.229 11.512 11.793 12.057 12.341 12.671 12.992 13.32 13.639 13.933 14.149 14.314 14.282 13.582 12.253 11.122 10.166 9.261 8.358 7.526 6.785 6.136 5.452 4.819 4.225 3.653 3.105 2.546 2.028 1.521 1.075 0.663 0.229 -0.213 -0.587 -0.993 -1.429 -1.763 -2.116 -2.477 -2.855 -3.334 -3.703 -4.057 -4.61 -5.005 -5.383 -5.576 -6.025 -6.491 -6.921 -7.139 -7.488 -7.941 -8.263 -8.601 -9.305 -9.77 -10.329 -10.915 -11.598 -12.388 -13.526 -18.824 -3 ,18703 ,TETRA ,17621189,Tue Nov 30 16:14:53 CET,Tue Nov 30 18:51:48 CET,0.0 2.154 2.749 3.197 3.592 3.943 4.23 4.483 4.925 5.125 5.317 5.6 5.912 6.123 6.451 6.709 6.973 7.103 7.342 7.564 7.871 8.059 8.233 8.484 8.726 8.952 9.167 9.372 9.631 9.876 10.11 10.389 10.64 10.868 11.129 11.425 11.72 12.044 12.364 12.676 12.981 13.323 13.702 14.036 14.365 14.646 14.911 15.144 15.259 15.168 14.645 13.596 12.46 11.389 10.412 9.501 8.643 7.832 7.142 6.453 5.82 5.237 4.692 4.163 3.643 3.15 2.608 2.124 1.722 1.293 0.851 0.493 0.098 -0.319 -0.63 -0.976 -1.401 -1.889 -2.401 -2.727 -3.042 -3.568 -3.928 -4.28 -4.459 -4.838 -5.23 -5.658 -5.911 -6.277 -6.742 -7.084 -7.441 -8.206 -8.608 -9.057 -9.589 -10.234 -11.185 -12.742 -21.541 -9 ,6187 ,TETRA ,17621195,Tue Nov 30 16:14:55 CET,Tue Nov 30 18:48:55 CET,0.0 2.116 2.764 3.263 3.675 4.004 4.278 4.532 4.985 5.193 5.394 5.652 5.904 6.049 6.313 6.558 6.789 6.9 7.12 7.327 7.609 7.794 7.973 8.226 8.456 8.661 8.849 9.041 9.297 9.53 9.747 9.999 10.226 10.421 10.634 10.888 11.144 11.433 11.738 12.036 12.32 12.593 12.854 13.128 13.457 13.761 14.038 14.246 14.433 14.599 14.268 13.239 12.258 11.249 10.21 9.274 8.41 7.567 6.832 6.102 5.464 4.879 4.311 3.755 3.219 2.737 2.235 1.778 1.381 0.956 0.496 0.116 -0.271 -0.704 -1.04 -1.369 -1.728 -2.11 -2.534 -2.827 -3.128 -3.605 -3.932 -4.269 -4.442 -4.819 -5.227 -5.663 -5.907 -6.263 -6.713 -7.035 -7.415 -8.26 -8.694 -9.171 -9.721 -10.332 -11.037 -12.131 -18.998 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_39.txt deleted file mode 100644 index 46d2de87..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16283 ,TETRA ,17621197,Tue Nov 30 16:14:54 CET,Tue Nov 30 18:41:43 CET,0.0 1.669 2.201 2.591 2.903 3.159 3.399 3.617 3.989 4.155 4.307 4.487 4.724 4.843 5.059 5.253 5.435 5.527 5.699 5.852 6.055 6.18 6.299 6.47 6.636 6.784 6.924 7.057 7.22 7.365 7.494 7.654 7.8 7.933 8.095 8.257 8.385 8.516 8.658 8.792 8.898 8.989 9.087 9.176 9.213 9.191 9.124 8.95 8.576 7.877 6.561 4.929 3.526 2.245 1.092 0.037 -0.868 -1.676 -2.382 -3.077 -3.711 -4.312 -4.885 -5.428 -5.921 -6.357 -6.809 -7.227 -7.589 -7.955 -8.344 -8.667 -9.005 -9.362 -9.656 -9.978 -10.299 -10.621 -10.961 -11.194 -11.438 -11.839 -12.129 -12.446 -12.607 -12.933 -13.286 -13.678 -13.89 -14.222 -14.549 -14.784 -15.045 -15.656 -16.014 -16.408 -16.838 -17.353 -18.024 -18.957 -21.881 -2 ,26760 ,TETRA ,17621198,Tue Nov 30 16:14:51 CET,Tue Nov 30 18:45:29 CET,0.0 1.626 2.164 2.532 2.841 3.117 3.368 3.594 3.961 4.117 4.267 4.439 4.678 4.802 5.024 5.225 5.404 5.491 5.654 5.806 6.022 6.155 6.278 6.445 6.612 6.767 6.897 7.026 7.189 7.35 7.502 7.66 7.804 7.94 8.094 8.26 8.399 8.537 8.67 8.795 8.914 9.021 9.117 9.198 9.257 9.244 9.146 8.966 8.63 7.959 6.638 4.936 3.428 2.129 1.032 0.038 -0.857 -1.688 -2.408 -3.159 -3.829 -4.416 -4.987 -5.532 -6.026 -6.494 -7.008 -7.471 -7.853 -8.238 -8.658 -9.016 -9.405 -9.822 -10.134 -10.44 -10.758 -11.1 -11.466 -11.709 -11.952 -12.332 -12.594 -12.884 -13.035 -13.374 -13.758 -14.149 -14.348 -14.667 -14.995 -15.248 -15.509 -16.094 -16.425 -16.802 -17.217 -17.664 -18.196 -18.963 -21.769 -3 ,13916 ,TETRA ,17621199,Tue Nov 30 16:14:54 CET,Tue Nov 30 18:47:05 CET,0.0 1.841 2.358 2.709 3.015 3.302 3.562 3.798 4.177 4.341 4.494 4.655 4.887 5.01 5.237 5.437 5.628 5.723 5.894 6.048 6.264 6.394 6.524 6.708 6.877 7.035 7.177 7.313 7.477 7.616 7.746 7.908 8.056 8.184 8.329 8.486 8.629 8.766 8.887 9.018 9.16 9.291 9.405 9.47 9.496 9.476 9.378 9.176 8.799 8.138 6.831 5.09 3.59 2.305 1.192 0.184 -0.732 -1.583 -2.305 -3.023 -3.637 -4.189 -4.737 -5.248 -5.72 -6.167 -6.636 -7.06 -7.432 -7.84 -8.271 -8.618 -8.984 -9.377 -9.685 -9.993 -10.312 -10.645 -11.014 -11.278 -11.546 -11.98 -12.284 -12.599 -12.767 -13.119 -13.499 -13.904 -14.108 -14.455 -14.846 -15.124 -15.411 -16.031 -16.411 -16.832 -17.292 -17.812 -18.374 -19.154 -22.0 -4 ,21163 ,TETRA ,17621200,Tue Nov 30 16:14:56 CET,Tue Nov 30 18:44:33 CET,0.0 1.325 1.837 2.214 2.505 2.764 2.999 3.205 3.574 3.739 3.893 4.066 4.298 4.417 4.632 4.83 5.019 5.114 5.3 5.457 5.666 5.799 5.921 6.098 6.267 6.416 6.55 6.676 6.833 6.982 7.118 7.273 7.424 7.565 7.723 7.885 8.029 8.188 8.34 8.471 8.594 8.708 8.808 8.882 8.954 8.98 8.905 8.708 8.332 7.627 6.256 4.506 3.05 1.779 0.665 -0.336 -1.238 -2.053 -2.759 -3.491 -4.132 -4.712 -5.252 -5.777 -6.291 -6.763 -7.256 -7.703 -8.094 -8.499 -8.928 -9.28 -9.649 -10.053 -10.364 -10.669 -10.988 -11.327 -11.688 -11.94 -12.192 -12.601 -12.893 -13.204 -13.379 -13.74 -14.115 -14.525 -14.743 -15.091 -15.463 -15.731 -16.006 -16.606 -16.944 -17.311 -17.732 -18.202 -18.767 -19.584 -22.361 -5 ,22931 ,TETRA ,17621201,Tue Nov 30 16:16:46 CET,Tue Nov 30 18:42:52 CET,0.0 1.339 1.812 2.192 2.52 2.795 3.045 3.263 3.636 3.8 3.959 4.136 4.363 4.481 4.708 4.915 5.102 5.188 5.36 5.518 5.735 5.872 6.005 6.19 6.355 6.509 6.65 6.783 6.956 7.109 7.242 7.404 7.556 7.693 7.838 7.992 8.139 8.283 8.42 8.549 8.663 8.779 8.887 8.963 9.014 8.992 8.892 8.698 8.349 7.724 6.547 4.95 3.509 2.22 1.107 0.117 -0.778 -1.598 -2.326 -3.058 -3.643 -4.15 -4.665 -5.179 -5.677 -6.145 -6.632 -7.058 -7.439 -7.861 -8.294 -8.652 -9.021 -9.408 -9.717 -10.039 -10.384 -10.747 -11.126 -11.382 -11.646 -12.068 -12.368 -12.683 -12.847 -13.194 -13.563 -13.965 -14.183 -14.525 -14.886 -15.145 -15.415 -16.043 -16.403 -16.795 -17.248 -17.763 -18.356 -19.244 -22.784 -6 ,1403 ,TETRA ,17621202,Tue Nov 30 16:16:46 CET,Tue Nov 30 18:48:45 CET,0.0 1.564 2.046 2.399 2.701 2.981 3.229 3.433 3.794 3.968 4.128 4.316 4.554 4.674 4.894 5.098 5.289 5.381 5.549 5.7 5.915 6.051 6.177 6.349 6.512 6.66 6.797 6.929 7.09 7.246 7.39 7.539 7.681 7.817 7.959 8.123 8.274 8.409 8.538 8.687 8.844 8.986 9.116 9.197 9.236 9.232 9.172 8.998 8.635 8.0 6.731 5.082 3.667 2.414 1.311 0.296 -0.611 -1.43 -2.122 -2.832 -3.493 -4.102 -4.652 -5.172 -5.679 -6.142 -6.626 -7.088 -7.486 -7.868 -8.272 -8.613 -8.969 -9.331 -9.604 -9.908 -10.248 -10.608 -10.965 -11.206 -11.457 -11.857 -12.153 -12.457 -12.612 -12.94 -13.33 -13.746 -13.946 -14.275 -14.609 -14.855 -15.116 -15.705 -16.03 -16.391 -16.812 -17.328 -18.008 -18.867 -21.595 -7 ,26019 ,TETRA ,17621203,Tue Nov 30 16:16:46 CET,Tue Nov 30 18:43:24 CET,0.0 2.089 2.591 2.969 3.297 3.571 3.817 4.043 4.435 4.609 4.765 4.93 5.165 5.284 5.514 5.723 5.915 6.007 6.182 6.344 6.565 6.7 6.83 7.013 7.185 7.345 7.491 7.625 7.784 7.94 8.076 8.235 8.401 8.555 8.72 8.878 9.01 9.159 9.308 9.427 9.541 9.678 9.79 9.848 9.891 9.886 9.809 9.618 9.25 8.615 7.324 5.641 4.253 2.99 1.866 0.876 -0.014 -0.853 -1.592 -2.317 -2.931 -3.502 -4.044 -4.541 -5.032 -5.499 -5.979 -6.404 -6.771 -7.149 -7.544 -7.88 -8.24 -8.625 -8.924 -9.24 -9.576 -9.918 -10.288 -10.561 -10.843 -11.251 -11.533 -11.85 -12.019 -12.376 -12.76 -13.142 -13.348 -13.699 -14.058 -14.325 -14.616 -15.234 -15.557 -15.913 -16.332 -16.856 -17.466 -18.296 -21.716 -8 ,28424 ,TETRA ,17621204,Tue Nov 30 16:16:46 CET,Tue Nov 30 18:45:15 CET,0.0 1.557 2.046 2.448 2.792 3.061 3.3 3.521 3.891 4.048 4.202 4.384 4.62 4.738 4.957 5.153 5.343 5.433 5.602 5.763 5.981 6.114 6.239 6.404 6.558 6.699 6.835 6.966 7.131 7.289 7.427 7.58 7.73 7.872 8.03 8.185 8.315 8.448 8.572 8.685 8.783 8.879 8.988 9.07 9.117 9.104 9.019 8.838 8.494 7.836 6.467 4.717 3.241 1.936 0.82 -0.219 -1.165 -1.985 -2.648 -3.338 -3.972 -4.544 -5.089 -5.599 -6.081 -6.552 -7.038 -7.469 -7.843 -8.222 -8.647 -9.004 -9.378 -9.786 -10.087 -10.387 -10.731 -11.128 -11.539 -11.807 -12.083 -12.537 -12.854 -13.187 -13.369 -13.763 -14.155 -14.596 -14.854 -15.232 -15.607 -15.862 -16.146 -16.853 -17.227 -17.638 -18.111 -18.696 -19.457 -20.413 -23.338 -9 ,26266 ,TETRA ,17621205,Tue Nov 30 16:16:47 CET,Tue Nov 30 18:44:47 CET,0.0 1.445 1.94 2.311 2.609 2.866 3.099 3.304 3.652 3.812 3.968 4.13 4.353 4.469 4.703 4.916 5.103 5.195 5.372 5.538 5.763 5.901 6.038 6.228 6.397 6.553 6.694 6.817 6.975 7.137 7.28 7.434 7.579 7.712 7.863 8.026 8.167 8.305 8.43 8.551 8.686 8.814 8.912 8.98 9.029 9.048 8.983 8.8 8.47 7.872 6.65 5.012 3.61 2.417 1.343 0.336 -0.528 -1.295 -1.958 -2.632 -3.237 -3.802 -4.341 -4.871 -5.376 -5.82 -6.286 -6.712 -7.092 -7.502 -7.918 -8.249 -8.606 -8.994 -9.297 -9.62 -9.956 -10.305 -10.675 -10.936 -11.201 -11.615 -11.93 -12.255 -12.417 -12.751 -13.097 -13.485 -13.694 -14.038 -14.398 -14.654 -14.937 -15.588 -15.95 -16.368 -16.851 -17.391 -18.056 -19.01 -23.102 -10 ,8817 ,TETRA ,17621206,Tue Nov 30 16:16:46 CET,Tue Nov 30 18:44:56 CET,0.0 1.505 2.019 2.382 2.681 2.952 3.201 3.427 3.786 3.939 4.092 4.281 4.52 4.641 4.873 5.078 5.262 5.351 5.52 5.68 5.901 6.036 6.162 6.334 6.503 6.665 6.805 6.934 7.098 7.251 7.394 7.558 7.702 7.833 7.989 8.15 8.291 8.431 8.569 8.693 8.805 8.914 9.028 9.12 9.175 9.186 9.134 8.956 8.575 7.874 6.59 4.909 3.407 2.111 0.992 -0.017 -0.915 -1.726 -2.43 -3.162 -3.802 -4.357 -4.895 -5.436 -5.937 -6.377 -6.853 -7.31 -7.726 -8.161 -8.599 -8.964 -9.329 -9.692 -9.983 -10.298 -10.633 -10.991 -11.373 -11.632 -11.908 -12.35 -12.654 -12.965 -13.123 -13.45 -13.805 -14.189 -14.396 -14.745 -15.094 -15.336 -15.588 -16.153 -16.507 -16.914 -17.355 -17.874 -18.499 -19.331 -22.215 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_43.txt deleted file mode 100644 index fb07cbc2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32006 ,TETRA ,17621207,Tue Nov 30 16:16:49 CET,Tue Nov 30 18:46:36 CET,0.0 2.669 3.404 3.889 4.275 4.604 4.873 5.108 5.541 5.736 5.915 6.149 6.414 6.567 6.829 7.077 7.311 7.425 7.637 7.843 8.157 8.348 8.525 8.774 9.009 9.245 9.468 9.674 9.948 10.227 10.491 10.798 11.095 11.374 11.698 12.063 12.401 12.773 13.175 13.608 14.06 14.564 15.154 15.719 16.339 16.991 17.784 18.74 19.815 21.028 22.456 23.441 23.871 24.051 24.014 23.867 23.718 23.535 23.335 23.122 22.896 22.666 22.456 22.237 21.987 21.745 21.484 21.236 20.978 20.665 20.37 20.127 19.837 19.514 19.261 19.023 18.783 18.538 18.297 18.121 17.927 17.614 17.398 17.156 17.022 16.758 16.466 16.117 15.93 15.657 15.354 15.123 14.86 14.279 13.945 13.571 13.15 12.642 12.025 11.167 6.84 -2 ,8091 ,TETRA ,17621208,Tue Nov 30 16:16:50 CET,Tue Nov 30 18:43:14 CET,0.0 3.12 3.956 4.502 4.919 5.271 5.589 5.864 6.307 6.509 6.697 6.934 7.209 7.365 7.647 7.914 8.17 8.289 8.517 8.742 9.061 9.254 9.432 9.686 9.937 10.183 10.42 10.644 10.907 11.164 11.421 11.738 12.044 12.324 12.639 12.992 13.33 13.705 14.126 14.57 15.028 15.553 16.168 16.769 17.442 18.182 19.044 20.028 21.121 22.355 23.743 24.737 25.194 25.317 25.256 25.128 24.925 24.714 24.537 24.315 24.096 23.874 23.645 23.407 23.167 22.941 22.698 22.446 22.22 21.992 21.748 21.548 21.328 21.076 20.883 20.683 20.461 20.241 20.011 19.828 19.629 19.312 19.052 18.755 18.598 18.267 17.916 17.535 17.347 17.074 16.756 16.521 16.277 15.714 15.375 14.982 14.533 14.02 13.387 12.511 9.514 -3 ,15157 ,TETRA ,17621209,Tue Nov 30 16:16:47 CET,Tue Nov 30 18:43:09 CET,0.0 2.93 3.688 4.207 4.612 4.931 5.222 5.488 5.957 6.165 6.362 6.612 6.884 7.038 7.319 7.576 7.824 7.945 8.175 8.392 8.704 8.91 9.108 9.381 9.638 9.888 10.128 10.358 10.655 10.934 11.198 11.503 11.795 12.083 12.414 12.777 13.136 13.525 13.927 14.351 14.798 15.299 15.872 16.458 17.136 17.878 18.728 19.638 20.662 21.85 23.173 24.142 24.531 24.584 24.515 24.385 24.233 24.024 23.76 23.471 23.184 22.904 22.657 22.421 22.183 21.918 21.625 21.374 21.155 20.932 20.69 20.477 20.242 19.982 19.769 19.533 19.291 19.04 18.772 18.6 18.416 18.078 17.818 17.543 17.406 17.11 16.786 16.445 16.271 16.004 15.722 15.52 15.299 14.811 14.52 14.167 13.764 13.303 12.734 11.91 8.444 -4 ,16571 ,TETRA ,17621210,Tue Nov 30 16:16:49 CET,Tue Nov 30 18:43:59 CET,0.0 2.426 3.177 3.66 4.049 4.385 4.671 4.926 5.385 5.594 5.785 6.04 6.313 6.474 6.761 7.037 7.297 7.415 7.638 7.854 8.159 8.342 8.516 8.778 9.03 9.263 9.49 9.704 9.971 10.226 10.466 10.76 11.039 11.298 11.598 11.939 12.263 12.607 12.98 13.356 13.723 14.15 14.666 15.171 15.757 16.401 17.126 17.953 18.86 19.859 20.969 21.623 21.882 21.97 21.923 21.774 21.592 21.419 21.244 21.016 20.794 20.579 20.319 20.049 19.804 19.572 19.323 19.089 18.876 18.644 18.366 18.11 17.846 17.564 17.335 17.111 16.89 16.643 16.361 16.165 15.951 15.614 15.383 15.132 15.0 14.73 14.441 14.097 13.903 13.609 13.29 13.066 12.811 12.241 11.922 11.543 11.119 10.659 10.077 9.159 5.342 -5 ,14720 ,TETRA ,17621211,Tue Nov 30 16:16:47 CET,Tue Nov 30 18:41:29 CET,0.0 2.512 3.134 3.583 3.964 4.292 4.577 4.847 5.312 5.513 5.705 5.944 6.207 6.357 6.635 6.893 7.149 7.269 7.496 7.718 8.025 8.221 8.404 8.658 8.916 9.173 9.413 9.637 9.917 10.187 10.451 10.77 11.068 11.341 11.669 12.045 12.394 12.775 13.186 13.623 14.082 14.588 15.173 15.757 16.431 17.18 18.043 19.006 20.122 21.37 22.762 23.701 24.072 24.189 24.14 24.001 23.82 23.6 23.379 23.114 22.857 22.63 22.398 22.162 21.911 21.661 21.371 21.089 20.859 20.588 20.271 20.016 19.767 19.522 19.309 19.075 18.814 18.51 18.197 17.99 17.767 17.377 17.088 16.799 16.655 16.355 16.039 15.697 15.516 15.239 14.912 14.658 14.374 13.756 13.399 13.002 12.541 11.974 11.272 10.337 7.24 -6 ,15121 ,TETRA ,17621212,Tue Nov 30 16:16:49 CET,Tue Nov 30 18:42:18 CET,0.0 2.608 3.454 4.031 4.47 4.846 5.171 5.437 5.906 6.124 6.334 6.591 6.859 7.02 7.315 7.597 7.854 7.976 8.21 8.43 8.742 8.945 9.14 9.416 9.675 9.917 10.151 10.378 10.66 10.927 11.187 11.497 11.792 12.069 12.392 12.759 13.097 13.475 13.882 14.301 14.74 15.247 15.841 16.415 17.089 17.839 18.682 19.57 20.552 21.638 22.852 23.731 24.136 24.321 24.301 24.179 24.033 23.852 23.652 23.407 23.161 22.919 22.675 22.424 22.168 21.93 21.653 21.394 21.174 20.958 20.742 20.547 20.33 20.096 19.913 19.723 19.516 19.29 19.054 18.885 18.678 18.325 18.079 17.802 17.652 17.349 17.05 16.699 16.51 16.233 15.893 15.652 15.401 14.851 14.533 14.184 13.812 13.387 12.821 11.985 9.12 -7 ,8645 ,TETRA ,17621213,Tue Nov 30 16:16:49 CET,Tue Nov 30 18:47:33 CET,0.0 2.236 2.981 3.528 3.97 4.354 4.709 5.023 5.568 5.818 6.055 6.364 6.648 6.82 7.149 7.447 7.723 7.857 8.111 8.347 8.689 8.904 9.099 9.383 9.652 9.901 10.134 10.352 10.636 10.905 11.16 11.473 11.774 12.065 12.401 12.764 13.098 13.466 13.879 14.313 14.738 15.207 15.76 16.323 16.973 17.665 18.497 19.481 20.628 21.931 23.393 24.412 24.842 25.023 25.089 25.036 24.874 24.696 24.52 24.268 24.031 23.822 23.596 23.36 23.117 22.89 22.637 22.397 22.181 21.955 21.722 21.519 21.315 21.087 20.906 20.717 20.509 20.29 20.02 19.811 19.603 19.271 19.029 18.787 18.664 18.397 18.103 17.793 17.626 17.354 17.016 16.775 16.525 15.981 15.68 15.365 15.006 14.564 13.97 13.112 9.727 -8 ,31260 ,TETRA ,17621214,Tue Nov 30 16:16:49 CET,Tue Nov 30 18:48:34 CET,0.0 2.493 3.149 3.623 3.992 4.31 4.598 4.852 5.294 5.496 5.687 5.942 6.204 6.359 6.657 6.928 7.17 7.291 7.522 7.731 8.022 8.207 8.386 8.647 8.907 9.15 9.375 9.596 9.892 10.174 10.425 10.72 11.001 11.273 11.595 11.955 12.302 12.668 13.048 13.455 13.876 14.35 14.941 15.531 16.172 16.889 17.706 18.607 19.622 20.662 21.763 22.602 23.032 23.112 22.992 22.823 22.666 22.471 22.233 21.981 21.722 21.48 21.249 21.002 20.755 20.524 20.275 20.043 19.828 19.595 19.327 19.054 18.771 18.514 18.296 18.058 17.821 17.564 17.303 17.128 16.932 16.604 16.367 16.112 15.982 15.713 15.42 15.097 14.923 14.644 14.312 14.081 13.836 13.281 12.968 12.607 12.182 11.678 11.062 10.207 6.867 -9 ,29901 ,TETRA ,17621215,Tue Nov 30 16:16:49 CET,Tue Nov 30 18:42:27 CET,0.0 3.757 4.598 5.152 5.586 5.945 6.268 6.551 7.046 7.259 7.459 7.715 7.995 8.157 8.463 8.749 9.015 9.138 9.368 9.584 9.893 10.092 10.282 10.551 10.805 11.06 11.314 11.554 11.849 12.131 12.402 12.732 13.051 13.349 13.681 14.043 14.387 14.76 15.161 15.597 16.047 16.54 17.139 17.746 18.436 19.203 20.075 21.04 22.187 23.477 24.86 25.852 26.304 26.492 26.556 26.52 26.401 26.223 26.019 25.731 25.456 25.195 24.921 24.682 24.45 24.224 23.969 23.734 23.531 23.316 23.09 22.887 22.664 22.404 22.197 21.989 21.751 21.49 21.208 21.015 20.817 20.498 20.265 20.022 19.897 19.619 19.336 19.051 18.882 18.604 18.321 18.119 17.898 17.399 17.114 16.798 16.416 15.977 15.458 14.719 12.288 -10 ,17133 ,TETRA ,17621216,Tue Nov 30 16:16:49 CET,Tue Nov 30 18:43:28 CET,0.0 2.665 3.349 3.833 4.209 4.532 4.823 5.07 5.493 5.678 5.857 6.098 6.362 6.516 6.789 7.056 7.311 7.427 7.652 7.865 8.159 8.357 8.549 8.802 9.043 9.283 9.51 9.726 10.004 10.264 10.524 10.848 11.152 11.437 11.762 12.125 12.482 12.862 13.263 13.686 14.124 14.607 15.159 15.726 16.398 17.138 17.999 18.987 20.107 21.319 22.663 23.636 24.033 24.161 24.149 24.042 23.893 23.721 23.535 23.28 23.027 22.778 22.506 22.257 22.027 21.798 21.555 21.324 21.105 20.867 20.617 20.398 20.173 19.946 19.753 19.549 19.328 19.082 18.831 18.663 18.475 18.146 17.912 17.674 17.549 17.293 17.022 16.725 16.564 16.302 16.023 15.826 15.597 15.051 14.746 14.424 14.065 13.635 13.08 12.317 9.782 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_20.txt deleted file mode 100644 index f1c385f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_20.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32069 ,TETRA ,17621217,Tue Nov 30 16:16:47 CET,Tue Nov 30 18:43:00 CET,0.0 1.624 2.149 2.535 2.853 3.125 3.367 3.589 3.985 4.167 4.343 4.571 4.814 4.954 5.215 5.453 5.671 5.776 5.987 6.194 6.481 6.651 6.813 7.052 7.285 7.508 7.711 7.903 8.145 8.37 8.589 8.853 9.09 9.317 9.575 9.859 10.127 10.409 10.707 11.011 11.324 11.677 12.082 12.456 12.888 13.32 13.709 14.084 14.43 14.704 14.741 14.296 13.681 13.029 12.419 11.822 11.246 10.703 10.205 9.664 9.191 8.781 8.379 7.981 7.591 7.228 6.862 6.514 6.209 5.889 5.535 5.242 4.936 4.613 4.368 4.113 3.834 3.557 3.267 3.047 2.8 2.433 2.189 1.929 1.795 1.497 1.172 0.84 0.666 0.385 0.09 -0.134 -0.374 -0.875 -1.17 -1.509 -1.869 -2.292 -2.839 -3.542 -5.744 -2 ,27808 ,TETRA ,17621218,Tue Nov 30 16:16:49 CET,Tue Nov 30 18:43:02 CET,0.0 1.717 2.281 2.694 3.036 3.317 3.558 3.784 4.195 4.384 4.56 4.772 5.01 5.148 5.42 5.673 5.899 6.005 6.211 6.405 6.677 6.843 7.003 7.236 7.456 7.658 7.85 8.043 8.295 8.536 8.768 9.035 9.283 9.517 9.775 10.055 10.316 10.6 10.91 11.24 11.583 11.947 12.338 12.709 13.11 13.544 13.975 14.372 14.769 15.097 15.127 14.724 14.223 13.613 12.951 12.337 11.785 11.233 10.747 10.243 9.79 9.391 8.99 8.591 8.211 7.853 7.479 7.145 6.842 6.529 6.203 5.924 5.629 5.317 5.068 4.806 4.521 4.217 3.892 3.667 3.437 3.076 2.819 2.552 2.416 2.119 1.796 1.462 1.284 0.999 0.709 0.482 0.241 -0.296 -0.587 -0.909 -1.277 -1.717 -2.24 -2.94 -5.67 -3 ,27038 ,TETRA ,17621219,Tue Nov 30 16:16:49 CET,Tue Nov 30 18:45:16 CET,0.0 1.394 1.943 2.359 2.682 2.967 3.239 3.481 3.896 4.085 4.257 4.486 4.738 4.882 5.143 5.398 5.652 5.772 6.001 6.217 6.522 6.715 6.904 7.177 7.415 7.645 7.874 8.083 8.345 8.595 8.824 9.077 9.32 9.546 9.817 10.131 10.412 10.704 11.001 11.311 11.632 11.976 12.356 12.718 13.12 13.537 13.984 14.405 14.795 15.123 15.245 14.867 14.247 13.686 13.178 12.654 12.17 11.716 11.278 10.815 10.393 9.998 9.597 9.197 8.812 8.439 8.035 7.651 7.33 7.012 6.665 6.362 6.035 5.688 5.419 5.133 4.842 4.544 4.218 3.988 3.738 3.342 3.073 2.791 2.64 2.311 1.973 1.622 1.426 1.108 0.736 0.484 0.23 -0.359 -0.686 -1.005 -1.363 -1.797 -2.35 -3.119 -6.485 -4 ,11663 ,TETRA ,17621220,Tue Nov 30 16:16:50 CET,Tue Nov 30 18:45:58 CET,0.0 2.349 2.975 3.429 3.783 4.1 4.399 4.658 5.096 5.293 5.485 5.744 6.009 6.166 6.451 6.713 6.956 7.07 7.291 7.503 7.801 7.99 8.167 8.406 8.634 8.861 9.095 9.317 9.58 9.826 10.054 10.32 10.565 10.801 11.08 11.393 11.697 11.992 12.289 12.613 12.928 13.277 13.678 14.055 14.488 14.967 15.495 15.986 16.463 16.871 17.027 16.768 16.319 15.78 15.228 14.675 14.168 13.681 13.201 12.71 12.275 11.869 11.472 11.083 10.706 10.357 9.982 9.642 9.344 9.034 8.7 8.411 8.104 7.795 7.563 7.305 7.037 6.768 6.477 6.277 6.062 5.718 5.468 5.196 5.058 4.776 4.471 4.141 3.975 3.697 3.399 3.193 2.97 2.468 2.176 1.84 1.475 1.043 0.47 -0.299 -3.241 -5 ,23420 ,TETRA ,17621221,Tue Nov 30 16:16:53 CET,Tue Nov 30 18:31:21 CET,0.0 1.443 1.96 2.358 2.685 2.965 3.226 3.464 3.889 4.071 4.236 4.456 4.712 4.853 5.12 5.365 5.6 5.714 5.932 6.136 6.415 6.59 6.762 7.012 7.24 7.445 7.64 7.832 8.068 8.287 8.505 8.762 9.002 9.241 9.515 9.812 10.085 10.382 10.707 11.035 11.36 11.717 12.112 12.475 12.883 13.309 13.772 14.233 14.65 14.95 15.025 14.647 14.091 13.499 12.87 12.281 11.749 11.223 10.741 10.221 9.761 9.341 8.936 8.569 8.21 7.856 7.478 7.138 6.843 6.532 6.201 5.914 5.615 5.291 5.038 4.782 4.506 4.217 3.919 3.706 3.481 3.121 2.866 2.603 2.458 2.158 1.848 1.506 1.33 1.049 0.751 0.533 0.306 -0.203 -0.498 -0.821 -1.166 -1.57 -2.088 -2.812 -5.71 -6 ,13746 ,TETRA ,17621222,Tue Nov 30 16:16:49 CET,Tue Nov 30 18:43:54 CET,0.0 1.659 2.221 2.65 3.031 3.38 3.669 3.914 4.359 4.546 4.718 4.957 5.212 5.362 5.646 5.905 6.144 6.26 6.485 6.7 7.0 7.188 7.368 7.623 7.867 8.099 8.325 8.53 8.778 9.014 9.235 9.502 9.748 9.978 10.233 10.512 10.776 11.059 11.36 11.681 12.017 12.369 12.744 13.105 13.513 13.949 14.428 14.942 15.449 15.833 15.947 15.687 15.26 14.698 14.08 13.483 12.925 12.373 11.849 11.322 10.853 10.404 9.978 9.58 9.211 8.865 8.481 8.136 7.842 7.539 7.212 6.928 6.634 6.329 6.089 5.84 5.558 5.258 4.946 4.727 4.511 4.171 3.924 3.664 3.532 3.249 2.929 2.595 2.431 2.154 1.845 1.618 1.387 0.889 0.615 0.324 0.004 -0.381 -0.889 -1.599 -3.805 -7 ,24376 ,TETRA ,17621223,Tue Nov 30 16:16:49 CET,Tue Nov 30 18:44:31 CET,0.0 1.84 2.386 2.754 3.068 3.364 3.619 3.845 4.262 4.446 4.614 4.828 5.085 5.231 5.5 5.747 5.971 6.085 6.312 6.503 6.77 6.942 7.1 7.324 7.549 7.762 7.957 8.144 8.376 8.602 8.817 9.058 9.291 9.52 9.774 10.054 10.327 10.619 10.917 11.237 11.578 11.932 12.315 12.697 13.113 13.526 13.972 14.38 14.72 14.992 15.027 14.57 13.911 13.259 12.64 12.027 11.448 10.89 10.397 9.896 9.421 8.974 8.545 8.132 7.743 7.387 6.999 6.633 6.318 5.992 5.638 5.339 5.038 4.701 4.432 4.151 3.851 3.554 3.255 3.046 2.83 2.504 2.264 1.993 1.856 1.576 1.278 0.941 0.753 0.46 0.139 -0.088 -0.323 -0.831 -1.132 -1.469 -1.831 -2.23 -2.715 -3.379 -5.867 -8 ,22677 ,TETRA ,17621224,Tue Nov 30 16:16:50 CET,Tue Nov 30 18:46:02 CET,0.0 2.499 3.082 3.522 3.885 4.179 4.435 4.665 5.074 5.265 5.444 5.657 5.909 6.053 6.314 6.554 6.778 6.887 7.089 7.278 7.552 7.733 7.904 8.136 8.353 8.563 8.78 8.991 9.247 9.474 9.69 9.953 10.197 10.434 10.715 11.01 11.279 11.564 11.869 12.2 12.535 12.897 13.286 13.661 14.073 14.482 14.889 15.24 15.585 15.876 15.847 15.364 14.765 14.151 13.555 12.977 12.421 11.859 11.36 10.857 10.416 10.018 9.625 9.252 8.884 8.53 8.165 7.824 7.518 7.198 6.849 6.569 6.285 5.968 5.71 5.44 5.161 4.879 4.575 4.36 4.139 3.78 3.521 3.248 3.109 2.809 2.482 2.133 1.94 1.651 1.362 1.137 0.904 0.393 0.093 -0.233 -0.595 -1.053 -1.633 -2.391 -4.546 -9 ,21024 ,TETRA ,17621225,Tue Nov 30 16:16:50 CET,Tue Nov 30 18:47:39 CET,0.0 1.722 2.284 2.7 3.046 3.326 3.578 3.803 4.188 4.359 4.524 4.741 4.99 5.135 5.413 5.663 5.891 5.999 6.202 6.397 6.672 6.844 7.014 7.274 7.526 7.759 7.975 8.164 8.404 8.642 8.867 9.126 9.36 9.584 9.851 10.147 10.427 10.732 11.047 11.372 11.702 12.051 12.431 12.795 13.204 13.611 14.028 14.442 14.818 15.084 14.965 14.423 13.774 13.087 12.409 11.743 11.094 10.495 9.981 9.448 8.98 8.542 8.1 7.675 7.285 6.913 6.504 6.152 5.853 5.522 5.169 4.876 4.567 4.231 3.972 3.713 3.436 3.136 2.827 2.612 2.387 2.024 1.761 1.476 1.329 1.033 0.722 0.392 0.213 -0.07 -0.355 -0.564 -0.795 -1.327 -1.628 -1.963 -2.343 -2.793 -3.352 -4.11 -6.649 -10 ,28502 ,TETRA ,17621226,Tue Nov 30 16:16:49 CET,Tue Nov 30 18:45:42 CET,0.0 1.592 2.131 2.543 2.872 3.161 3.415 3.634 4.017 4.197 4.362 4.567 4.809 4.951 5.217 5.456 5.692 5.806 6.018 6.228 6.532 6.715 6.881 7.114 7.333 7.534 7.717 7.898 8.135 8.364 8.586 8.844 9.087 9.321 9.6 9.905 10.168 10.433 10.722 11.036 11.344 11.681 12.068 12.418 12.794 13.195 13.591 13.964 14.342 14.618 14.621 14.177 13.617 13.02 12.407 11.782 11.206 10.692 10.232 9.76 9.333 8.925 8.52 8.115 7.724 7.382 7.035 6.719 6.445 6.147 5.817 5.532 5.238 4.944 4.713 4.469 4.211 3.94 3.654 3.439 3.215 2.879 2.639 2.383 2.249 1.959 1.639 1.302 1.124 0.834 0.548 0.326 0.079 -0.451 -0.751 -1.071 -1.412 -1.821 -2.357 -3.137 -6.371 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_43.txt deleted file mode 100644 index eeb478e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20055 ,TETRA ,17621227,Tue Nov 30 16:16:50 CET,Tue Nov 30 18:37:42 CET,0.0 2.302 3.03 3.54 3.96 4.307 4.588 4.836 5.271 5.472 5.661 5.89 6.139 6.288 6.573 6.822 7.054 7.169 7.388 7.6 7.903 8.091 8.276 8.538 8.781 9.01 9.232 9.443 9.723 9.989 10.229 10.505 10.77 11.034 11.34 11.667 11.967 12.297 12.643 13.003 13.378 13.786 14.259 14.728 15.249 15.803 16.448 17.133 17.851 18.595 19.345 19.698 19.657 19.462 19.188 18.849 18.495 18.148 17.81 17.437 17.099 16.768 16.434 16.096 15.771 15.461 15.106 14.797 14.526 14.233 13.915 13.652 13.374 13.055 12.798 12.54 12.273 11.982 11.673 11.461 11.242 10.906 10.669 10.395 10.245 9.934 9.602 9.229 9.026 8.728 8.384 8.145 7.889 7.316 6.996 6.644 6.247 5.779 5.153 4.21 -1.205 -2 ,29749 ,TETRA ,17621228,Tue Nov 30 16:16:52 CET,Tue Nov 30 18:47:05 CET,0.0 2.744 3.378 3.819 4.183 4.486 4.766 5.039 5.522 5.734 5.929 6.173 6.444 6.605 6.893 7.148 7.394 7.511 7.733 7.947 8.257 8.455 8.642 8.904 9.153 9.383 9.594 9.799 10.064 10.325 10.575 10.853 11.102 11.349 11.644 11.977 12.295 12.633 12.978 13.33 13.698 14.105 14.564 15.012 15.496 16.021 16.625 17.285 18.017 18.726 19.356 19.633 19.508 19.249 18.978 18.677 18.343 18.0 17.678 17.304 16.951 16.649 16.333 15.999 15.69 15.4 15.092 14.799 14.536 14.261 13.964 13.725 13.478 13.197 12.959 12.715 12.475 12.203 11.901 11.69 11.462 11.11 10.85 10.556 10.403 10.086 9.752 9.392 9.202 8.927 8.634 8.413 8.156 7.517 7.157 6.774 6.339 5.855 5.262 4.426 -0.298 -3 ,27641 ,TETRA ,17621229,Tue Nov 30 16:16:51 CET,Tue Nov 30 18:38:40 CET,0.0 2.025 2.654 3.129 3.51 3.83 4.107 4.358 4.787 4.974 5.153 5.387 5.637 5.78 6.051 6.308 6.55 6.664 6.873 7.077 7.363 7.534 7.7 7.935 8.156 8.377 8.593 8.79 9.036 9.278 9.507 9.779 10.036 10.291 10.582 10.896 11.205 11.521 11.846 12.199 12.559 12.969 13.45 13.906 14.417 14.988 15.621 16.302 17.08 17.86 18.56 18.901 18.846 18.6 18.274 17.945 17.622 17.278 16.95 16.608 16.272 15.918 15.567 15.256 14.963 14.674 14.363 14.075 13.814 13.532 13.247 13.003 12.732 12.446 12.215 11.965 11.697 11.42 11.125 10.915 10.693 10.342 10.09 9.811 9.665 9.352 9.002 8.625 8.436 8.152 7.849 7.634 7.395 6.844 6.528 6.184 5.79 5.297 4.689 3.855 0.459 -4 ,2419 ,TETRA ,17621230,Tue Nov 30 16:16:50 CET,Tue Nov 30 18:44:28 CET,0.0 2.355 3.047 3.549 3.948 4.27 4.548 4.8 5.224 5.407 5.581 5.812 6.062 6.205 6.48 6.734 6.963 7.07 7.278 7.484 7.775 7.943 8.105 8.343 8.562 8.765 8.964 9.16 9.396 9.617 9.841 10.102 10.347 10.589 10.861 11.152 11.439 11.76 12.104 12.451 12.785 13.15 13.572 13.988 14.475 14.995 15.545 16.122 16.775 17.497 18.218 18.596 18.661 18.513 18.238 17.929 17.608 17.281 16.928 16.528 16.174 15.844 15.531 15.21 14.88 14.557 14.216 13.928 13.68 13.409 13.117 12.878 12.616 12.318 12.085 11.856 11.611 11.339 11.055 10.861 10.66 10.336 10.109 9.859 9.727 9.453 9.142 8.808 8.63 8.349 8.023 7.801 7.56 7.017 6.713 6.367 5.954 5.441 4.804 3.932 -0.462 -5 ,27798 ,TETRA ,17621231,Tue Nov 30 16:16:53 CET,Tue Nov 30 18:44:24 CET,0.0 2.483 3.103 3.539 3.903 4.204 4.463 4.707 5.141 5.33 5.506 5.715 5.958 6.098 6.371 6.634 6.858 6.96 7.16 7.352 7.625 7.792 7.95 8.176 8.397 8.615 8.821 9.015 9.257 9.488 9.712 9.971 10.216 10.453 10.724 11.026 11.307 11.614 11.935 12.268 12.631 13.019 13.46 13.925 14.448 15.016 15.641 16.274 16.992 17.807 18.65 19.064 19.06 18.911 18.668 18.375 18.057 17.703 17.384 17.024 16.683 16.365 16.03 15.694 15.381 15.098 14.794 14.507 14.253 13.983 13.683 13.424 13.15 12.866 12.641 12.396 12.131 11.851 11.552 11.342 11.118 10.751 10.488 10.215 10.074 9.785 9.472 9.113 8.916 8.628 8.323 8.078 7.819 7.249 6.907 6.545 6.146 5.653 4.99 3.99 0.144 -6 ,9869 ,TETRA ,17621232,Tue Nov 30 16:16:54 CET,Tue Nov 30 18:44:17 CET,0.0 2.742 3.372 3.852 4.27 4.612 4.897 5.149 5.59 5.777 5.946 6.141 6.383 6.527 6.805 7.05 7.275 7.384 7.588 7.786 8.064 8.229 8.395 8.632 8.853 9.07 9.278 9.472 9.721 9.956 10.175 10.436 10.687 10.924 11.19 11.482 11.764 12.075 12.404 12.739 13.09 13.489 13.949 14.39 14.901 15.464 16.077 16.752 17.509 18.33 19.155 19.588 19.587 19.401 19.153 18.865 18.545 18.18 17.83 17.478 17.136 16.81 16.502 16.195 15.894 15.603 15.274 14.961 14.683 14.395 14.088 13.828 13.56 13.276 13.044 12.789 12.517 12.233 11.925 11.702 11.474 11.139 10.904 10.648 10.512 10.219 9.896 9.55 9.358 9.06 8.708 8.463 8.195 7.631 7.325 6.979 6.535 6.017 5.407 4.56 0.649 -7 ,31931 ,TETRA ,17621233,Tue Nov 30 16:17:44 CET,Tue Nov 30 18:46:30 CET,0.0 2.576 3.254 3.722 4.072 4.367 4.63 4.878 5.313 5.487 5.654 5.881 6.121 6.259 6.524 6.758 6.975 7.08 7.278 7.472 7.753 7.922 8.081 8.323 8.546 8.754 8.958 9.154 9.405 9.641 9.867 10.131 10.368 10.6 10.867 11.156 11.436 11.741 12.067 12.398 12.746 13.156 13.627 14.08 14.586 15.151 15.784 16.431 17.131 17.899 18.65 18.971 18.927 18.715 18.447 18.147 17.818 17.441 17.087 16.721 16.383 16.049 15.7 15.364 15.056 14.773 14.462 14.16 13.876 13.584 13.281 13.028 12.753 12.441 12.194 11.944 11.68 11.394 11.096 10.894 10.68 10.329 10.089 9.831 9.69 9.392 9.073 8.744 8.573 8.299 7.993 7.768 7.521 6.961 6.642 6.301 5.901 5.406 4.771 3.827 0.13 -8 ,18480 ,TETRA ,17621234,Tue Nov 30 16:17:45 CET,Tue Nov 30 18:47:30 CET,0.0 2.736 3.352 3.802 4.171 4.479 4.751 5.007 5.445 5.627 5.804 6.031 6.28 6.42 6.694 6.941 7.17 7.276 7.477 7.673 7.942 8.105 8.263 8.496 8.721 8.928 9.119 9.307 9.551 9.783 10.005 10.269 10.511 10.746 11.025 11.329 11.605 11.899 12.218 12.566 12.93 13.333 13.796 14.254 14.772 15.318 15.904 16.542 17.244 17.953 18.563 18.822 18.763 18.536 18.228 17.862 17.485 17.119 16.766 16.363 15.994 15.66 15.323 14.997 14.682 14.372 14.046 13.752 13.48 13.187 12.892 12.645 12.378 12.082 11.846 11.595 11.333 11.061 10.764 10.56 10.352 10.007 9.757 9.5 9.37 9.085 8.754 8.398 8.216 7.941 7.646 7.428 7.187 6.664 6.346 5.984 5.604 5.151 4.553 3.707 -0.49 -9 ,4498 ,TETRA ,17621235,Tue Nov 30 16:17:44 CET,Tue Nov 30 18:44:24 CET,0.0 2.635 3.296 3.751 4.119 4.432 4.703 4.943 5.35 5.528 5.694 5.918 6.172 6.315 6.59 6.839 7.071 7.182 7.393 7.59 7.88 8.067 8.238 8.481 8.709 8.928 9.142 9.351 9.608 9.851 10.079 10.343 10.591 10.826 11.106 11.427 11.728 12.043 12.38 12.721 13.065 13.458 13.923 14.388 14.909 15.49 16.15 16.836 17.582 18.4 19.267 19.672 19.684 19.564 19.345 19.064 18.777 18.45 18.108 17.757 17.452 17.16 16.837 16.499 16.179 15.878 15.566 15.278 15.022 14.757 14.458 14.201 13.929 13.629 13.372 13.099 12.834 12.559 12.255 12.032 11.8 11.445 11.192 10.921 10.781 10.487 10.162 9.813 9.635 9.362 9.05 8.823 8.587 8.004 7.658 7.298 6.889 6.389 5.755 4.782 0.852 -10 ,16880 ,TETRA ,17621236,Tue Nov 30 16:17:45 CET,Tue Nov 30 18:47:35 CET,0.0 2.553 3.199 3.628 3.968 4.254 4.505 4.74 5.154 5.333 5.501 5.719 5.965 6.114 6.391 6.639 6.866 6.972 7.175 7.369 7.644 7.817 7.98 8.208 8.419 8.625 8.831 9.027 9.268 9.499 9.73 10.006 10.264 10.507 10.795 11.113 11.401 11.714 12.049 12.388 12.738 13.147 13.617 14.098 14.64 15.194 15.822 16.49 17.21 18.048 18.927 19.406 19.425 19.217 18.944 18.63 18.313 17.958 17.602 17.229 16.894 16.591 16.294 16.004 15.716 15.426 15.117 14.832 14.569 14.285 13.981 13.714 13.428 13.132 12.897 12.645 12.38 12.111 11.832 11.626 11.409 11.044 10.773 10.497 10.348 10.015 9.674 9.322 9.132 8.847 8.531 8.303 8.063 7.503 7.172 6.825 6.434 5.968 5.357 4.518 0.638 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_39.txt deleted file mode 100644 index 5cbd0e1b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28912 ,TETRA ,17621237,Tue Nov 30 16:17:45 CET,Tue Nov 30 18:41:06 CET,0.0 1.896 2.434 2.843 3.177 3.458 3.708 3.932 4.326 4.503 4.655 4.816 5.034 5.152 5.387 5.591 5.765 5.848 6.01 6.183 6.422 6.563 6.687 6.842 6.996 7.138 7.262 7.379 7.524 7.654 7.769 7.896 8.018 8.128 8.236 8.357 8.462 8.549 8.614 8.661 8.705 8.731 8.737 8.706 8.607 8.412 8.093 7.597 6.772 5.54 3.518 1.085 -0.957 -2.689 -4.161 -5.505 -6.665 -7.67 -8.552 -9.438 -10.188 -10.854 -11.485 -12.09 -12.676 -13.213 -13.752 -14.231 -14.653 -15.088 -15.554 -15.922 -16.287 -16.69 -16.996 -17.306 -17.629 -17.959 -18.306 -18.554 -18.821 -19.261 -19.559 -19.857 -20.016 -20.356 -20.709 -21.074 -21.268 -21.599 -21.911 -22.157 -22.43 -23.038 -23.355 -23.704 -24.105 -24.554 -25.082 -25.826 -28.865 -2 ,14967 ,TETRA ,17621238,Tue Nov 30 16:17:48 CET,Tue Nov 30 18:42:11 CET,0.0 1.526 2.059 2.48 2.798 3.07 3.327 3.551 3.906 4.066 4.225 4.412 4.641 4.761 4.983 5.191 5.396 5.49 5.658 5.811 6.012 6.135 6.255 6.418 6.569 6.71 6.841 6.976 7.141 7.272 7.393 7.519 7.627 7.725 7.826 7.928 8.015 8.094 8.143 8.172 8.185 8.174 8.151 8.115 8.017 7.806 7.473 6.954 6.127 4.827 2.548 -0.162 -2.324 -4.149 -5.72 -7.085 -8.224 -9.219 -10.071 -10.917 -11.647 -12.27 -12.852 -13.419 -13.945 -14.431 -14.932 -15.371 -15.762 -16.189 -16.642 -17.016 -17.409 -17.831 -18.158 -18.478 -18.796 -19.142 -19.504 -19.747 -19.998 -20.403 -20.693 -20.999 -21.162 -21.495 -21.826 -22.191 -22.392 -22.728 -23.052 -23.283 -23.529 -24.087 -24.396 -24.714 -25.101 -25.579 -26.157 -27.095 -31.626 -3 ,261 ,TETRA ,17621239,Tue Nov 30 16:17:45 CET,Tue Nov 30 18:44:50 CET,0.0 1.823 2.435 2.879 3.25 3.569 3.83 4.052 4.457 4.636 4.794 4.982 5.211 5.333 5.547 5.751 5.945 6.036 6.215 6.38 6.594 6.727 6.855 7.023 7.182 7.332 7.461 7.584 7.743 7.879 7.991 8.111 8.221 8.315 8.406 8.491 8.56 8.635 8.711 8.766 8.787 8.783 8.749 8.665 8.511 8.249 7.813 7.205 6.311 4.946 2.665 -0.056 -2.264 -4.133 -5.709 -7.072 -8.216 -9.229 -10.133 -11.04 -11.805 -12.48 -13.117 -13.718 -14.285 -14.785 -15.287 -15.734 -16.115 -16.513 -16.932 -17.28 -17.64 -18.022 -18.333 -18.655 -18.981 -19.319 -19.667 -19.902 -20.152 -20.547 -20.827 -21.112 -21.256 -21.57 -21.899 -22.24 -22.421 -22.73 -23.014 -23.226 -23.452 -23.975 -24.282 -24.658 -25.077 -25.54 -26.091 -26.787 -30.147 -4 ,14081 ,TETRA ,17621240,Tue Nov 30 16:17:48 CET,Tue Nov 30 18:46:08 CET,0.0 1.567 2.125 2.553 2.908 3.206 3.446 3.663 4.049 4.223 4.396 4.607 4.85 4.987 5.232 5.44 5.635 5.731 5.907 6.067 6.282 6.411 6.542 6.728 6.898 7.053 7.197 7.33 7.478 7.61 7.737 7.874 7.993 8.099 8.195 8.288 8.37 8.45 8.53 8.594 8.645 8.66 8.622 8.549 8.403 8.182 7.818 7.27 6.461 5.14 2.882 0.241 -1.849 -3.542 -4.919 -6.109 -7.214 -8.215 -9.045 -9.874 -10.581 -11.212 -11.8 -12.352 -12.871 -13.327 -13.79 -14.202 -14.558 -14.939 -15.352 -15.706 -16.063 -16.43 -16.722 -17.016 -17.317 -17.625 -17.946 -18.187 -18.448 -18.843 -19.116 -19.407 -19.559 -19.873 -20.188 -20.537 -20.739 -21.072 -21.343 -21.568 -21.831 -22.416 -22.752 -23.095 -23.469 -23.939 -24.597 -25.573 -29.57 -5 ,32390 ,TETRA ,17621241,Tue Nov 30 16:17:49 CET,Tue Nov 30 18:39:07 CET,0.0 2.065 2.639 3.066 3.413 3.705 3.956 4.179 4.562 4.727 4.881 5.06 5.287 5.414 5.64 5.848 6.028 6.11 6.263 6.404 6.605 6.729 6.848 7.013 7.167 7.308 7.444 7.572 7.727 7.877 8.005 8.136 8.249 8.35 8.458 8.568 8.654 8.719 8.775 8.833 8.872 8.863 8.82 8.757 8.604 8.314 7.889 7.324 6.468 5.122 2.913 0.34 -1.74 -3.52 -5.12 -6.537 -7.725 -8.761 -9.638 -10.534 -11.319 -12.015 -12.664 -13.275 -13.838 -14.361 -14.91 -15.376 -15.782 -16.222 -16.676 -17.041 -17.414 -17.805 -18.1 -18.403 -18.722 -19.063 -19.426 -19.675 -19.94 -20.362 -20.649 -20.963 -21.137 -21.492 -21.865 -22.265 -22.473 -22.825 -23.179 -23.429 -23.71 -24.309 -24.625 -24.956 -25.338 -25.791 -26.376 -27.25 -31.143 -6 ,11497 ,TETRA ,17621242,Tue Nov 30 16:17:45 CET,Tue Nov 30 18:44:51 CET,0.0 2.099 2.713 3.122 3.43 3.691 3.921 4.119 4.477 4.649 4.817 5.03 5.259 5.378 5.594 5.794 5.977 6.065 6.228 6.37 6.554 6.671 6.786 6.951 7.095 7.227 7.348 7.458 7.599 7.72 7.83 7.955 8.062 8.155 8.245 8.34 8.424 8.5 8.566 8.62 8.656 8.652 8.586 8.485 8.321 8.065 7.697 7.184 6.446 5.232 2.906 0.042 -2.237 -4.094 -5.626 -6.988 -8.138 -9.165 -10.066 -10.946 -11.664 -12.291 -12.915 -13.516 -14.073 -14.588 -15.124 -15.594 -16.002 -16.429 -16.879 -17.265 -17.664 -18.067 -18.38 -18.7 -19.036 -19.389 -19.754 -20.014 -20.285 -20.714 -21.013 -21.318 -21.475 -21.796 -22.134 -22.51 -22.721 -23.048 -23.354 -23.605 -23.868 -24.417 -24.725 -25.072 -25.507 -26.022 -26.577 -27.322 -30.758 -7 ,13137 ,TETRA ,17621243,Tue Nov 30 16:17:48 CET,Tue Nov 30 18:46:56 CET,0.0 1.489 2.041 2.49 2.84 3.121 3.381 3.611 4.009 4.186 4.344 4.527 4.761 4.89 5.142 5.368 5.563 5.653 5.829 5.994 6.23 6.373 6.506 6.689 6.848 6.991 7.125 7.247 7.386 7.514 7.633 7.768 7.885 7.993 8.116 8.237 8.334 8.426 8.509 8.569 8.616 8.634 8.585 8.502 8.372 8.147 7.772 7.207 6.372 5.071 2.829 0.177 -1.977 -3.799 -5.339 -6.712 -7.886 -8.921 -9.812 -10.701 -11.447 -12.104 -12.741 -13.346 -13.9 -14.377 -14.865 -15.326 -15.735 -16.158 -16.589 -16.943 -17.323 -17.722 -18.03 -18.343 -18.661 -19.002 -19.36 -19.605 -19.859 -20.269 -20.571 -20.893 -21.057 -21.396 -21.745 -22.11 -22.306 -22.637 -22.957 -23.197 -23.472 -24.062 -24.381 -24.729 -25.105 -25.539 -26.13 -26.952 -32.017 -8 ,1180 ,TETRA ,17621244,Tue Nov 30 16:17:49 CET,Tue Nov 30 18:44:43 CET,0.0 1.733 2.277 2.694 3.028 3.306 3.558 3.778 4.133 4.296 4.449 4.631 4.854 4.968 5.177 5.368 5.546 5.628 5.793 5.942 6.147 6.276 6.394 6.552 6.695 6.819 6.929 7.036 7.166 7.277 7.378 7.507 7.626 7.72 7.816 7.919 8.002 8.084 8.164 8.237 8.289 8.315 8.312 8.265 8.157 7.936 7.573 7.051 6.202 4.846 2.537 -0.168 -2.242 -3.993 -5.561 -6.928 -8.044 -9.017 -9.872 -10.711 -11.42 -12.056 -12.669 -13.267 -13.82 -14.325 -14.85 -15.308 -15.708 -16.112 -16.544 -16.915 -17.289 -17.684 -17.992 -18.306 -18.634 -18.983 -19.34 -19.588 -19.852 -20.255 -20.547 -20.856 -21.007 -21.329 -21.67 -22.027 -22.225 -22.556 -22.863 -23.097 -23.355 -23.929 -24.238 -24.586 -24.993 -25.462 -26.057 -26.928 -30.41 -9 ,22824 ,TETRA ,17621245,Tue Nov 30 16:17:46 CET,Tue Nov 30 18:46:14 CET,0.0 2.253 2.846 3.293 3.647 3.939 4.197 4.413 4.783 4.947 5.098 5.277 5.495 5.618 5.846 6.058 6.26 6.35 6.508 6.649 6.86 6.992 7.108 7.269 7.421 7.554 7.676 7.784 7.919 8.053 8.174 8.305 8.424 8.527 8.637 8.742 8.819 8.877 8.927 8.967 8.976 8.965 8.937 8.879 8.728 8.453 8.03 7.429 6.513 5.147 2.923 0.293 -1.763 -3.46 -4.911 -6.222 -7.372 -8.378 -9.226 -10.11 -10.878 -11.542 -12.173 -12.769 -13.32 -13.824 -14.351 -14.83 -15.251 -15.687 -16.129 -16.497 -16.888 -17.296 -17.608 -17.94 -18.284 -18.642 -19.022 -19.285 -19.563 -19.995 -20.286 -20.59 -20.746 -21.062 -21.405 -21.793 -22.009 -22.354 -22.686 -22.925 -23.186 -23.756 -24.083 -24.439 -24.852 -25.316 -25.852 -26.664 -29.633 -10 ,26583 ,TETRA ,17621246,Tue Nov 30 16:17:48 CET,Tue Nov 30 18:51:38 CET,0.0 1.511 2.037 2.457 2.777 3.041 3.266 3.471 3.841 4.006 4.154 4.321 4.537 4.661 4.902 5.095 5.266 5.35 5.52 5.688 5.923 6.069 6.197 6.371 6.516 6.636 6.755 6.87 7.013 7.14 7.242 7.363 7.467 7.557 7.654 7.722 7.769 7.829 7.891 7.929 7.933 7.917 7.857 7.763 7.615 7.381 7.036 6.481 5.598 4.232 2.008 -0.54 -2.628 -4.366 -5.824 -7.116 -8.216 -9.21 -10.092 -10.983 -11.734 -12.374 -12.973 -13.537 -14.059 -14.546 -15.062 -15.526 -15.944 -16.387 -16.85 -17.248 -17.665 -18.088 -18.418 -18.767 -19.121 -19.471 -19.846 -20.12 -20.396 -20.804 -21.087 -21.388 -21.546 -21.875 -22.227 -22.6 -22.794 -23.128 -23.461 -23.711 -23.971 -24.538 -24.857 -25.218 -25.617 -26.068 -26.683 -27.521 -31.86 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_43.txt deleted file mode 100644 index 2179e2e2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2192 ,TETRA ,17621247,Tue Nov 30 16:17:46 CET,Tue Nov 30 18:44:26 CET,0.0 2.988 3.703 4.223 4.615 4.93 5.205 5.459 5.889 6.072 6.242 6.452 6.687 6.817 7.076 7.317 7.535 7.638 7.833 8.014 8.265 8.427 8.583 8.805 9.023 9.219 9.397 9.578 9.814 10.022 10.214 10.444 10.664 10.874 11.116 11.377 11.625 11.908 12.219 12.541 12.864 13.212 13.605 13.992 14.408 14.849 15.355 15.864 16.41 16.945 17.462 17.614 17.424 17.136 16.781 16.396 16.039 15.714 15.416 15.061 14.741 14.466 14.188 13.898 13.619 13.37 13.09 12.819 12.591 12.359 12.104 11.885 11.653 11.405 11.21 10.997 10.768 10.538 10.31 10.149 9.97 9.675 9.457 9.222 9.107 8.863 8.597 8.313 8.163 7.915 7.652 7.458 7.256 6.827 6.582 6.284 5.947 5.553 5.002 4.222 1.654 -2 ,13192 ,TETRA ,17621248,Tue Nov 30 16:17:48 CET,Tue Nov 30 18:47:05 CET,0.0 2.34 2.975 3.427 3.784 4.084 4.348 4.584 5.005 5.195 5.365 5.584 5.83 5.973 6.229 6.459 6.662 6.76 6.949 7.135 7.413 7.582 7.734 7.956 8.169 8.37 8.559 8.74 8.973 9.192 9.402 9.661 9.9 10.116 10.36 10.627 10.878 11.148 11.443 11.76 12.077 12.419 12.794 13.163 13.578 13.989 14.45 14.927 15.416 15.893 16.175 16.078 15.789 15.395 14.958 14.516 14.094 13.706 13.348 12.985 12.636 12.288 11.969 11.664 11.371 11.095 10.797 10.529 10.295 10.037 9.775 9.548 9.286 9.02 8.814 8.594 8.371 8.134 7.865 7.675 7.481 7.173 6.96 6.742 6.63 6.392 6.131 5.837 5.682 5.428 5.15 4.946 4.741 4.308 4.055 3.756 3.414 3.016 2.475 1.712 -1.144 -3 ,21340 ,TETRA ,17621249,Tue Nov 30 16:17:49 CET,Tue Nov 30 18:48:01 CET,0.0 2.927 3.676 4.134 4.465 4.746 5.008 5.251 5.683 5.87 6.036 6.238 6.47 6.607 6.875 7.112 7.321 7.423 7.62 7.802 8.065 8.231 8.386 8.611 8.821 9.02 9.211 9.386 9.614 9.828 10.025 10.264 10.495 10.715 10.968 11.245 11.502 11.771 12.063 12.373 12.685 13.041 13.452 13.854 14.291 14.774 15.331 15.852 16.312 16.695 16.919 16.784 16.493 16.216 15.943 15.594 15.232 14.893 14.567 14.221 13.899 13.605 13.309 13.008 12.743 12.495 12.213 11.963 11.737 11.485 11.212 10.979 10.745 10.5 10.306 10.101 9.887 9.652 9.394 9.216 9.027 8.728 8.522 8.309 8.191 7.945 7.698 7.432 7.288 7.037 6.782 6.588 6.386 5.933 5.672 5.376 5.032 4.623 4.096 3.346 0.563 -4 ,28645 ,TETRA ,17621250,Tue Nov 30 16:17:51 CET,Tue Nov 30 18:53:00 CET,0.0 1.966 2.602 3.068 3.422 3.717 3.985 4.229 4.644 4.818 4.985 5.206 5.442 5.574 5.831 6.069 6.285 6.387 6.576 6.765 7.038 7.204 7.37 7.614 7.828 8.019 8.199 8.383 8.618 8.835 9.047 9.297 9.534 9.753 9.996 10.269 10.535 10.805 11.077 11.372 11.677 12.009 12.38 12.746 13.156 13.595 14.091 14.608 15.164 15.725 16.095 16.098 15.867 15.532 15.16 14.75 14.375 14.018 13.676 13.319 12.999 12.695 12.406 12.117 11.82 11.553 11.279 11.031 10.801 10.544 10.269 10.029 9.788 9.547 9.35 9.137 8.91 8.67 8.42 8.243 8.051 7.755 7.555 7.344 7.229 6.991 6.736 6.439 6.28 6.023 5.752 5.571 5.378 4.919 4.663 4.379 4.04 3.646 3.114 2.422 -0.595 -5 ,15190 ,TETRA ,17621251,Tue Nov 30 16:17:46 CET,Tue Nov 30 18:53:36 CET,0.0 3.036 3.739 4.213 4.589 4.908 5.201 5.458 5.873 6.068 6.256 6.479 6.725 6.869 7.138 7.39 7.616 7.721 7.932 8.138 8.442 8.635 8.812 9.063 9.3 9.515 9.715 9.909 10.157 10.39 10.607 10.87 11.125 11.363 11.631 11.933 12.226 12.534 12.855 13.184 13.516 13.877 14.296 14.72 15.206 15.711 16.251 16.832 17.45 18.029 18.461 18.541 18.302 17.901 17.488 17.068 16.664 16.294 15.977 15.667 15.381 15.096 14.814 14.528 14.219 13.938 13.632 13.339 13.098 12.846 12.577 12.355 12.109 11.849 11.656 11.461 11.25 11.012 10.741 10.552 10.37 10.074 9.852 9.614 9.491 9.244 8.983 8.705 8.554 8.289 8.013 7.818 7.618 7.178 6.917 6.607 6.242 5.809 5.299 4.594 1.439 -6 ,20451 ,TETRA ,17621252,Tue Nov 30 16:17:49 CET,Tue Nov 30 18:43:34 CET,0.0 2.203 2.932 3.421 3.784 4.09 4.347 4.573 4.975 5.162 5.33 5.536 5.771 5.9 6.143 6.366 6.574 6.677 6.885 7.074 7.33 7.498 7.658 7.876 8.083 8.285 8.473 8.651 8.884 9.102 9.303 9.541 9.768 9.994 10.26 10.545 10.803 11.08 11.373 11.683 12.009 12.368 12.771 13.169 13.622 14.108 14.632 15.189 15.814 16.406 16.952 17.274 17.243 17.088 16.797 16.424 16.066 15.709 15.375 14.993 14.663 14.364 14.055 13.767 13.492 13.221 12.93 12.669 12.438 12.187 11.921 11.696 11.464 11.231 11.036 10.82 10.595 10.347 10.08 9.899 9.714 9.423 9.202 8.964 8.844 8.593 8.318 8.023 7.875 7.638 7.406 7.222 7.01 6.528 6.262 5.962 5.617 5.206 4.715 4.079 2.054 -7 ,5728 ,TETRA ,17621253,Tue Nov 30 16:17:49 CET,Tue Nov 30 18:45:35 CET,0.0 2.821 3.444 3.882 4.24 4.547 4.822 5.07 5.493 5.679 5.858 6.085 6.325 6.464 6.726 6.968 7.199 7.306 7.506 7.706 7.995 8.162 8.32 8.552 8.766 8.964 9.153 9.329 9.552 9.769 9.988 10.253 10.492 10.714 10.953 11.216 11.491 11.789 12.097 12.413 12.736 13.103 13.534 13.959 14.425 14.912 15.421 15.96 16.591 17.19 17.67 17.81 17.612 17.306 16.957 16.594 16.255 15.927 15.631 15.301 14.979 14.7 14.417 14.125 13.874 13.634 13.367 13.116 12.887 12.648 12.384 12.157 11.921 11.676 11.48 11.263 11.03 10.787 10.516 10.329 10.136 9.818 9.613 9.41 9.293 9.034 8.763 8.48 8.324 8.06 7.804 7.613 7.397 6.931 6.679 6.381 6.049 5.644 5.146 4.461 1.667 -8 ,20320 ,TETRA ,17621254,Tue Nov 30 16:17:51 CET,Tue Nov 30 18:45:58 CET,0.0 3.039 3.762 4.274 4.668 4.991 5.281 5.534 5.97 6.174 6.36 6.6 6.859 7.02 7.298 7.542 7.762 7.867 8.081 8.289 8.566 8.739 8.912 9.165 9.408 9.631 9.828 10.015 10.254 10.479 10.7 10.965 11.219 11.46 11.719 12.0 12.266 12.552 12.861 13.186 13.501 13.832 14.199 14.558 14.978 15.446 15.944 16.473 17.052 17.577 17.958 17.953 17.681 17.331 16.985 16.589 16.152 15.755 15.425 15.062 14.694 14.356 14.057 13.782 13.513 13.254 12.974 12.712 12.477 12.229 11.956 11.716 11.464 11.199 10.999 10.794 10.567 10.329 10.082 9.906 9.718 9.421 9.214 9.004 8.891 8.635 8.371 8.092 7.942 7.693 7.439 7.249 7.037 6.568 6.308 6.018 5.681 5.283 4.814 4.115 1.311 -9 ,3856 ,TETRA ,17621255,Tue Nov 30 16:17:49 CET,Tue Nov 30 18:56:22 CET,0.0 3.192 3.929 4.431 4.817 5.158 5.47 5.74 6.19 6.391 6.584 6.838 7.096 7.252 7.559 7.835 8.082 8.198 8.423 8.633 8.924 9.101 9.263 9.495 9.726 9.947 10.153 10.344 10.586 10.815 11.033 11.297 11.548 11.788 12.056 12.351 12.628 12.923 13.231 13.535 13.847 14.205 14.597 14.963 15.376 15.828 16.322 16.816 17.304 17.79 18.169 18.194 17.992 17.677 17.294 16.885 16.513 16.15 15.787 15.408 15.116 14.867 14.607 14.334 14.055 13.788 13.485 13.215 12.988 12.735 12.463 12.248 12.019 11.767 11.577 11.379 11.17 10.956 10.721 10.55 10.383 10.097 9.879 9.651 9.532 9.291 9.034 8.741 8.587 8.337 8.086 7.903 7.712 7.277 7.016 6.703 6.336 5.908 5.398 4.689 1.877 -10 ,26519 ,TETRA ,17621256,Tue Nov 30 16:17:47 CET,Tue Nov 30 18:45:01 CET,0.0 2.843 3.51 3.972 4.342 4.647 4.932 5.191 5.603 5.793 5.971 6.171 6.406 6.543 6.798 7.036 7.264 7.37 7.564 7.751 8.019 8.183 8.334 8.542 8.744 8.944 9.135 9.321 9.556 9.776 9.988 10.234 10.46 10.67 10.908 11.171 11.426 11.708 12.002 12.308 12.613 12.933 13.311 13.702 14.123 14.522 14.906 15.292 15.718 16.115 16.404 16.347 16.062 15.705 15.309 14.9 14.509 14.132 13.799 13.464 13.16 12.877 12.595 12.313 12.046 11.797 11.522 11.27 11.052 10.814 10.551 10.337 10.111 9.862 9.673 9.472 9.251 9.021 8.783 8.618 8.441 8.159 7.961 7.74 7.625 7.387 7.125 6.84 6.686 6.431 6.165 5.972 5.764 5.3 5.038 4.756 4.41 3.973 3.443 2.702 -0.15 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_43_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_43_39.txt deleted file mode 100644 index 30dbb4c3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_43_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23303 ,TETRA ,17621257,Tue Nov 30 16:17:48 CET,Tue Nov 30 18:41:39 CET,0.0 1.57 2.123 2.55 2.903 3.184 3.433 3.658 4.059 4.228 4.386 4.582 4.811 4.941 5.176 5.385 5.578 5.664 5.819 5.959 6.153 6.274 6.384 6.547 6.706 6.838 6.953 7.067 7.199 7.307 7.399 7.498 7.59 7.666 7.742 7.826 7.899 7.958 7.996 8.003 7.981 7.934 7.848 7.679 7.415 7.091 6.616 5.912 4.866 3.314 0.788 -2.171 -4.503 -6.385 -7.946 -9.294 -10.439 -11.465 -12.319 -13.152 -13.852 -14.458 -15.019 -15.538 -16.029 -16.48 -16.963 -17.402 -17.784 -18.168 -18.561 -18.887 -19.214 -19.562 -19.841 -20.124 -20.41 -20.712 -21.031 -21.256 -21.488 -21.839 -22.097 -22.366 -22.496 -22.781 -23.098 -23.436 -23.61 -23.914 -24.182 -24.388 -24.606 -25.103 -25.39 -25.702 -26.046 -26.472 -27.044 -27.86 -31.863 -2 ,32094 ,TETRA ,17621258,Tue Nov 30 16:17:49 CET,Tue Nov 30 18:42:09 CET,0.0 1.963 2.554 2.962 3.283 3.565 3.806 4.017 4.373 4.521 4.671 4.859 5.064 5.172 5.387 5.591 5.768 5.849 6.01 6.162 6.359 6.48 6.592 6.742 6.884 7.016 7.125 7.22 7.342 7.467 7.576 7.685 7.782 7.86 7.934 7.999 8.046 8.086 8.116 8.125 8.109 8.049 7.928 7.759 7.496 7.155 6.692 6.03 5.005 3.469 1.003 -1.947 -4.254 -6.087 -7.618 -8.971 -10.112 -11.09 -11.944 -12.8 -13.503 -14.108 -14.686 -15.222 -15.71 -16.157 -16.649 -17.081 -17.43 -17.789 -18.161 -18.474 -18.8 -19.137 -19.403 -19.683 -19.974 -20.275 -20.599 -20.824 -21.05 -21.404 -21.656 -21.921 -22.064 -22.355 -22.655 -22.971 -23.138 -23.443 -23.711 -23.915 -24.129 -24.61 -24.904 -25.222 -25.575 -26.004 -26.582 -27.471 -31.148 -3 ,25900 ,TETRA ,17621259,Tue Nov 30 16:17:51 CET,Tue Nov 30 18:28:13 CET,0.0 1.379 1.929 2.331 2.688 2.987 3.237 3.45 3.83 4.003 4.161 4.364 4.594 4.723 4.968 5.183 5.377 5.469 5.643 5.796 6.027 6.175 6.296 6.468 6.621 6.756 6.884 7.0 7.136 7.255 7.36 7.472 7.569 7.643 7.718 7.787 7.838 7.884 7.917 7.928 7.902 7.832 7.719 7.575 7.338 7.009 6.536 5.835 4.832 3.371 0.963 -1.81 -4.043 -5.88 -7.444 -8.851 -10.045 -11.115 -12.008 -12.855 -13.561 -14.169 -14.745 -15.307 -15.828 -16.296 -16.788 -17.237 -17.622 -18.015 -18.433 -18.78 -19.134 -19.496 -19.777 -20.067 -20.369 -20.696 -21.037 -21.273 -21.516 -21.883 -22.138 -22.413 -22.553 -22.845 -23.157 -23.496 -23.678 -23.991 -24.289 -24.512 -24.75 -25.341 -25.674 -26.035 -26.434 -26.898 -27.485 -28.349 -30.812 -4 ,30529 ,TETRA ,17621260,Tue Nov 30 16:17:49 CET,Tue Nov 30 18:37:14 CET,0.0 1.676 2.256 2.665 2.995 3.286 3.547 3.774 4.145 4.304 4.456 4.637 4.847 4.958 5.171 5.365 5.54 5.622 5.786 5.943 6.147 6.265 6.375 6.539 6.691 6.823 6.944 7.053 7.18 7.293 7.395 7.502 7.584 7.655 7.727 7.797 7.871 7.935 7.977 8.01 8.02 7.991 7.906 7.747 7.507 7.182 6.745 6.135 5.148 3.599 1.065 -1.833 -4.08 -5.947 -7.491 -8.835 -9.987 -10.988 -11.838 -12.661 -13.367 -13.999 -14.598 -15.158 -15.665 -16.115 -16.583 -17.006 -17.384 -17.778 -18.186 -18.528 -18.877 -19.241 -19.524 -19.814 -20.112 -20.42 -20.745 -20.975 -21.214 -21.587 -21.848 -22.112 -22.25 -22.538 -22.85 -23.187 -23.363 -23.68 -23.958 -24.177 -24.412 -24.945 -25.255 -25.585 -25.956 -26.372 -26.89 -27.645 -30.895 -5 ,2434 ,TETRA ,17621261,Tue Nov 30 16:17:50 CET,Tue Nov 30 18:30:14 CET,0.0 1.768 2.315 2.735 3.074 3.365 3.629 3.845 4.196 4.344 4.489 4.678 4.899 5.024 5.232 5.422 5.6 5.681 5.829 5.974 6.188 6.312 6.418 6.571 6.712 6.833 6.944 7.054 7.179 7.284 7.379 7.493 7.585 7.65 7.713 7.784 7.853 7.903 7.927 7.917 7.889 7.839 7.751 7.631 7.408 7.075 6.576 5.824 4.736 3.076 0.323 -2.721 -5.112 -7.082 -8.669 -10.029 -11.165 -12.155 -13.015 -13.854 -14.556 -15.183 -15.782 -16.335 -16.841 -17.302 -17.774 -18.186 -18.543 -18.922 -19.317 -19.647 -19.989 -20.343 -20.612 -20.893 -21.189 -21.49 -21.798 -22.013 -22.247 -22.624 -22.887 -23.152 -23.288 -23.578 -23.893 -24.223 -24.396 -24.702 -24.969 -25.172 -25.393 -25.866 -26.127 -26.429 -26.783 -27.189 -27.676 -28.333 -31.929 -6 ,14745 ,TETRA ,17621262,Tue Nov 30 16:17:49 CET,Tue Nov 30 18:45:10 CET,0.0 1.722 2.311 2.741 3.104 3.407 3.662 3.891 4.265 4.431 4.584 4.766 4.989 5.11 5.334 5.525 5.708 5.796 5.952 6.092 6.293 6.422 6.539 6.696 6.836 6.963 7.073 7.182 7.327 7.458 7.567 7.673 7.771 7.862 7.94 8.008 8.065 8.131 8.204 8.241 8.241 8.217 8.149 8.034 7.84 7.565 7.137 6.466 5.457 3.876 1.254 -1.662 -3.944 -5.845 -7.394 -8.712 -9.864 -10.883 -11.724 -12.558 -13.259 -13.866 -14.464 -15.047 -15.567 -16.028 -16.513 -16.95 -17.338 -17.72 -18.112 -18.443 -18.786 -19.148 -19.428 -19.718 -20.02 -20.334 -20.661 -20.894 -21.139 -21.513 -21.776 -22.059 -22.205 -22.507 -22.825 -23.163 -23.334 -23.633 -23.889 -24.094 -24.312 -24.78 -25.041 -25.349 -25.689 -26.08 -26.571 -27.238 -31.109 -7 ,27631 ,TETRA ,17621263,Tue Nov 30 16:21:44 CET,Tue Nov 30 18:46:09 CET,0.0 1.64 2.187 2.609 2.962 3.241 3.467 3.678 4.068 4.234 4.389 4.585 4.81 4.928 5.155 5.365 5.553 5.643 5.808 5.948 6.127 6.245 6.369 6.554 6.721 6.856 6.983 7.1 7.23 7.34 7.436 7.551 7.65 7.738 7.83 7.908 7.957 7.998 8.031 8.045 8.029 7.978 7.88 7.745 7.54 7.244 6.804 6.17 5.225 3.723 1.219 -1.538 -3.671 -5.47 -6.987 -8.29 -9.347 -10.302 -11.149 -11.967 -12.652 -13.278 -13.865 -14.413 -14.928 -15.371 -15.831 -16.243 -16.589 -16.947 -17.323 -17.639 -17.96 -18.289 -18.553 -18.829 -19.116 -19.414 -19.72 -19.931 -20.153 -20.517 -20.768 -21.02 -21.154 -21.438 -21.747 -22.082 -22.255 -22.551 -22.814 -23.019 -23.239 -23.762 -24.063 -24.383 -24.727 -25.138 -25.683 -26.454 -29.41 -8 ,27625 ,TETRA ,17621264,Tue Nov 30 16:21:44 CET,Tue Nov 30 18:47:37 CET,0.0 1.735 2.302 2.702 3.032 3.313 3.546 3.757 4.115 4.269 4.42 4.616 4.836 4.956 5.166 5.35 5.512 5.592 5.747 5.885 6.074 6.182 6.275 6.411 6.539 6.654 6.755 6.843 6.956 7.064 7.166 7.271 7.359 7.44 7.509 7.553 7.587 7.614 7.62 7.607 7.583 7.532 7.438 7.288 7.009 6.622 6.081 5.334 4.249 2.57 -0.082 -3.159 -5.628 -7.592 -9.206 -10.611 -11.827 -12.897 -13.799 -14.684 -15.418 -16.053 -16.666 -17.245 -17.772 -18.255 -18.754 -19.189 -19.556 -19.945 -20.346 -20.67 -21.009 -21.36 -21.636 -21.924 -22.217 -22.522 -22.85 -23.074 -23.299 -23.655 -23.905 -24.174 -24.316 -24.6 -24.892 -25.209 -25.384 -25.695 -25.944 -26.138 -26.357 -26.842 -27.111 -27.411 -27.754 -28.186 -28.717 -29.449 -32.844 -9 ,32749 ,TETRA ,17621266,Tue Nov 30 16:21:44 CET,Tue Nov 30 18:47:59 CET,0.0 1.438 1.982 2.363 2.676 2.953 3.201 3.42 3.784 3.948 4.101 4.297 4.52 4.64 4.854 5.047 5.227 5.31 5.461 5.605 5.799 5.918 6.03 6.19 6.338 6.473 6.592 6.695 6.825 6.936 7.034 7.14 7.236 7.343 7.44 7.522 7.588 7.637 7.671 7.68 7.657 7.606 7.532 7.417 7.192 6.853 6.387 5.692 4.663 3.153 0.644 -2.175 -4.374 -6.189 -7.665 -8.955 -10.084 -11.079 -11.913 -12.731 -13.415 -14.01 -14.594 -15.141 -15.635 -16.11 -16.598 -17.013 -17.371 -17.741 -18.134 -18.45 -18.774 -19.122 -19.393 -19.685 -19.986 -20.289 -20.611 -20.828 -21.048 -21.402 -21.649 -21.897 -22.028 -22.322 -22.632 -22.948 -23.121 -23.428 -23.69 -23.892 -24.114 -24.646 -24.942 -25.27 -25.659 -26.094 -26.639 -27.382 -30.421 -10 ,21043 ,TETRA ,17621267,Tue Nov 30 16:21:44 CET,Tue Nov 30 18:51:09 CET,0.0 1.773 2.301 2.676 2.983 3.241 3.471 3.677 4.04 4.205 4.356 4.53 4.745 4.859 5.082 5.291 5.471 5.55 5.7 5.838 6.012 6.118 6.216 6.349 6.479 6.605 6.717 6.823 6.956 7.072 7.185 7.307 7.413 7.51 7.604 7.688 7.743 7.801 7.854 7.875 7.859 7.807 7.714 7.561 7.309 6.977 6.505 5.813 4.765 3.124 0.48 -2.491 -4.755 -6.557 -8.07 -9.413 -10.592 -11.654 -12.56 -13.441 -14.184 -14.848 -15.454 -16.011 -16.523 -16.981 -17.453 -17.864 -18.222 -18.614 -19.025 -19.345 -19.667 -20.006 -20.275 -20.554 -20.848 -21.156 -21.475 -21.698 -21.925 -22.279 -22.524 -22.774 -22.911 -23.209 -23.515 -23.834 -24.01 -24.319 -24.577 -24.778 -24.987 -25.47 -25.751 -26.067 -26.438 -26.885 -27.45 -28.252 -32.036 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_44_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_44_43.txt deleted file mode 100644 index 95e9db86..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_44_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31739 ,TETRA ,17621268,Tue Nov 30 16:21:45 CET,Tue Nov 30 18:47:14 CET,0.0 2.873 3.526 4.023 4.426 4.738 5.012 5.25 5.668 5.865 6.041 6.277 6.521 6.658 6.921 7.165 7.38 7.488 7.687 7.866 8.126 8.286 8.436 8.648 8.858 9.057 9.237 9.408 9.615 9.803 9.99 10.216 10.421 10.602 10.825 11.08 11.319 11.576 11.823 12.085 12.36 12.644 12.947 13.238 13.576 13.942 14.341 14.732 15.062 15.234 15.091 14.53 13.826 13.114 12.424 11.761 11.171 10.622 10.129 9.61 9.13 8.704 8.314 7.932 7.571 7.241 6.883 6.55 6.257 5.936 5.588 5.315 5.034 4.722 4.477 4.225 3.949 3.655 3.358 3.154 2.937 2.584 2.334 2.072 1.938 1.653 1.339 0.996 0.809 0.526 0.207 -0.014 -0.248 -0.768 -1.069 -1.413 -1.789 -2.214 -2.704 -3.358 -5.568 -2 ,24489 ,TETRA ,17621269,Tue Nov 30 16:21:44 CET,Tue Nov 30 18:51:10 CET,0.0 2.594 3.281 3.74 4.085 4.379 4.65 4.887 5.266 5.448 5.624 5.86 6.084 6.218 6.477 6.713 6.919 7.016 7.208 7.394 7.658 7.819 7.972 8.196 8.408 8.611 8.79 8.955 9.182 9.404 9.604 9.83 10.033 10.228 10.467 10.736 10.99 11.267 11.566 11.863 12.157 12.494 12.876 13.217 13.556 13.89 14.28 14.647 14.938 15.167 15.131 14.698 14.165 13.605 13.084 12.551 11.99 11.429 10.934 10.443 10.039 9.675 9.324 8.989 8.665 8.365 8.038 7.728 7.444 7.139 6.814 6.538 6.263 5.986 5.744 5.483 5.23 4.959 4.658 4.454 4.252 3.929 3.687 3.419 3.283 3.008 2.71 2.385 2.214 1.944 1.625 1.403 1.168 0.662 0.389 0.096 -0.221 -0.607 -1.096 -1.728 -3.638 -3 ,25345 ,TETRA ,17621270,Tue Nov 30 16:21:44 CET,Tue Nov 30 18:48:21 CET,0.0 3.013 3.92 4.361 4.731 5.042 5.313 5.552 5.965 6.159 6.336 6.568 6.813 6.956 7.211 7.45 7.686 7.795 7.997 8.187 8.453 8.619 8.785 9.019 9.229 9.428 9.612 9.785 10.0 10.202 10.392 10.617 10.827 11.019 11.238 11.476 11.707 11.955 12.222 12.512 12.797 13.089 13.428 13.753 14.105 14.451 14.775 15.114 15.428 15.621 15.589 15.142 14.548 13.94 13.324 12.714 12.174 11.676 11.227 10.771 10.353 9.955 9.58 9.244 8.934 8.63 8.303 8.015 7.754 7.471 7.166 6.898 6.611 6.313 6.097 5.877 5.631 5.362 5.066 4.856 4.637 4.291 4.048 3.795 3.666 3.381 3.061 2.731 2.569 2.3 2.009 1.81 1.606 1.125 0.84 0.53 0.157 -0.271 -0.738 -1.343 -3.146 -4 ,29675 ,TETRA ,17621271,Tue Nov 30 16:21:45 CET,Tue Nov 30 18:47:24 CET,0.0 4.011 4.98 5.517 5.921 6.254 6.544 6.783 7.202 7.393 7.566 7.802 8.044 8.189 8.466 8.721 8.949 9.06 9.274 9.468 9.74 9.912 10.076 10.322 10.546 10.745 10.933 11.115 11.355 11.587 11.811 12.054 12.267 12.472 12.704 12.975 13.236 13.499 13.772 14.056 14.325 14.605 14.905 15.175 15.494 15.84 16.18 16.505 16.761 16.92 16.937 16.58 15.963 15.295 14.663 14.05 13.447 12.867 12.385 11.853 11.354 10.92 10.517 10.147 9.796 9.46 9.111 8.8 8.525 8.241 7.931 7.649 7.356 7.052 6.808 6.55 6.275 6.002 5.732 5.537 5.323 4.979 4.728 4.443 4.291 3.991 3.686 3.369 3.199 2.927 2.627 2.418 2.206 1.739 1.466 1.139 0.792 0.409 -0.095 -0.695 -2.236 -5 ,9315 ,TETRA ,17621272,Tue Nov 30 16:21:45 CET,Tue Nov 30 18:46:13 CET,0.0 3.154 3.899 4.371 4.774 5.114 5.387 5.64 6.069 6.247 6.414 6.634 6.889 7.045 7.309 7.552 7.786 7.9 8.12 8.327 8.609 8.783 8.95 9.183 9.404 9.616 9.807 9.986 10.215 10.423 10.627 10.874 11.095 11.298 11.536 11.816 12.085 12.362 12.643 12.928 13.208 13.529 13.917 14.27 14.652 15.071 15.489 15.897 16.332 16.677 16.812 16.565 16.046 15.442 14.812 14.171 13.608 13.116 12.664 12.197 11.798 11.432 11.071 10.713 10.348 10.007 9.661 9.357 9.091 8.792 8.472 8.203 7.934 7.655 7.421 7.183 6.933 6.654 6.367 6.166 5.945 5.606 5.371 5.118 4.995 4.735 4.443 4.137 3.972 3.707 3.454 3.265 3.054 2.586 2.329 2.035 1.673 1.259 0.761 0.111 -1.707 -6 ,30678 ,TETRA ,17621273,Tue Nov 30 16:21:46 CET,Tue Nov 30 18:44:52 CET,0.0 2.803 3.528 4.044 4.47 4.844 5.131 5.391 5.849 6.051 6.241 6.48 6.717 6.856 7.121 7.367 7.59 7.699 7.912 8.116 8.401 8.575 8.742 8.982 9.209 9.419 9.61 9.788 10.014 10.223 10.413 10.635 10.85 11.056 11.292 11.565 11.811 12.053 12.318 12.592 12.863 13.154 13.489 13.816 14.158 14.49 14.794 15.037 15.217 15.293 15.133 14.654 14.08 13.451 12.826 12.238 11.706 11.197 10.725 10.243 9.812 9.424 9.062 8.695 8.318 7.972 7.621 7.315 7.027 6.711 6.392 6.127 5.861 5.573 5.341 5.107 4.857 4.597 4.327 4.127 3.912 3.589 3.363 3.109 2.974 2.694 2.389 2.069 1.908 1.649 1.348 1.12 0.861 0.317 0.03 -0.309 -0.682 -1.087 -1.554 -2.205 -4.194 -7 ,7441 ,TETRA ,17621274,Tue Nov 30 16:21:45 CET,Tue Nov 30 18:47:45 CET,0.0 2.722 3.404 3.866 4.257 4.593 4.88 5.138 5.577 5.767 5.952 6.224 6.466 6.611 6.883 7.132 7.362 7.466 7.659 7.856 8.131 8.294 8.457 8.707 8.948 9.158 9.36 9.559 9.8 10.022 10.224 10.482 10.734 10.962 11.236 11.535 11.797 12.083 12.372 12.661 12.997 13.346 13.696 14.028 14.414 14.842 15.304 15.767 16.149 16.398 16.403 16.03 15.571 15.097 14.605 14.094 13.576 13.064 12.599 12.149 11.767 11.39 11.02 10.666 10.334 10.039 9.734 9.455 9.2 8.923 8.624 8.363 8.092 7.826 7.611 7.375 7.135 6.891 6.622 6.428 6.226 5.888 5.637 5.376 5.242 4.965 4.677 4.357 4.182 3.924 3.631 3.422 3.224 2.773 2.497 2.186 1.847 1.477 1.032 0.443 -1.16 -8 ,32608 ,TETRA ,17621275,Tue Nov 30 16:21:45 CET,Tue Nov 30 18:44:59 CET,0.0 2.806 3.548 4.052 4.437 4.756 5.035 5.288 5.715 5.906 6.091 6.35 6.596 6.741 7.014 7.286 7.533 7.644 7.863 8.067 8.34 8.514 8.685 8.926 9.137 9.331 9.521 9.701 9.932 10.145 10.345 10.606 10.863 11.092 11.347 11.629 11.889 12.174 12.478 12.794 13.131 13.498 13.873 14.212 14.587 14.963 15.349 15.706 16.005 16.178 15.94 15.25 14.514 13.797 13.117 12.504 11.961 11.43 10.916 10.362 9.9 9.523 9.154 8.794 8.444 8.117 7.78 7.462 7.164 6.829 6.474 6.187 5.896 5.595 5.351 5.077 4.796 4.5 4.168 3.946 3.717 3.346 3.11 2.872 2.743 2.457 2.148 1.838 1.663 1.384 1.071 0.848 0.605 0.089 -0.188 -0.524 -0.9 -1.322 -1.829 -2.495 -4.425 -9 ,30181 ,TETRA ,17621276,Tue Nov 30 16:21:45 CET,Tue Nov 30 18:46:46 CET,0.0 2.883 3.62 4.156 4.567 4.885 5.155 5.394 5.811 5.996 6.163 6.396 6.636 6.772 7.016 7.253 7.484 7.59 7.785 7.967 8.226 8.388 8.537 8.745 8.947 9.152 9.341 9.509 9.725 9.931 10.121 10.357 10.592 10.805 11.038 11.296 11.539 11.799 12.082 12.362 12.639 12.931 13.261 13.574 13.893 14.214 14.553 14.912 15.246 15.469 15.426 15.002 14.413 13.765 13.151 12.557 12.047 11.592 11.17 10.707 10.29 9.938 9.606 9.252 8.889 8.556 8.218 7.911 7.638 7.338 7.005 6.719 6.419 6.107 5.867 5.608 5.336 5.051 4.742 4.524 4.293 3.92 3.656 3.378 3.239 2.942 2.603 2.249 2.068 1.794 1.494 1.274 1.049 0.528 0.222 -0.107 -0.459 -0.864 -1.332 -1.964 -3.957 -10 ,8379 ,TETRA ,17621277,Tue Nov 30 16:21:45 CET,Tue Nov 30 18:45:44 CET,0.0 3.302 4.069 4.597 5.015 5.362 5.663 5.926 6.367 6.56 6.745 7.025 7.278 7.425 7.692 7.941 8.175 8.287 8.496 8.696 8.97 9.13 9.284 9.513 9.735 9.939 10.121 10.294 10.52 10.733 10.931 11.158 11.38 11.604 11.852 12.11 12.351 12.606 12.874 13.155 13.441 13.742 14.073 14.393 14.75 15.12 15.473 15.791 16.053 16.157 15.999 15.403 14.76 14.195 13.654 13.104 12.556 12.034 11.592 11.137 10.724 10.356 9.993 9.633 9.287 8.973 8.639 8.336 8.078 7.787 7.483 7.225 6.943 6.658 6.434 6.2 5.955 5.688 5.407 5.211 5.001 4.668 4.423 4.159 4.036 3.783 3.502 3.19 3.022 2.758 2.475 2.278 2.072 1.593 1.318 1.024 0.701 0.34 -0.103 -0.725 -2.607 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_44.txt deleted file mode 100644 index 74deb772..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16049 ,TETRA ,17621278,Tue Nov 30 16:21:47 CET,Tue Nov 30 18:49:16 CET,0.0 1.691 2.245 2.657 2.996 3.277 3.518 3.732 4.136 4.321 4.484 4.712 4.926 5.058 5.301 5.538 5.762 5.862 6.038 6.198 6.429 6.575 6.711 6.907 7.085 7.25 7.417 7.577 7.78 7.963 8.119 8.302 8.474 8.639 8.813 8.999 9.187 9.377 9.562 9.74 9.909 10.071 10.229 10.348 10.444 10.53 10.592 10.568 10.368 9.91 8.905 7.555 6.378 5.334 4.441 3.622 2.862 2.14 1.498 0.858 0.314 -0.177 -0.652 -1.091 -1.497 -1.88 -2.277 -2.65 -2.984 -3.318 -3.668 -3.96 -4.259 -4.573 -4.815 -5.07 -5.342 -5.623 -5.919 -6.128 -6.343 -6.688 -6.931 -7.189 -7.327 -7.619 -7.924 -8.236 -8.405 -8.662 -8.933 -9.131 -9.344 -9.827 -10.097 -10.407 -10.766 -11.162 -11.63 -12.218 -14.387 -2 ,24963 ,TETRA ,17621279,Tue Nov 30 16:21:48 CET,Tue Nov 30 18:49:18 CET,0.0 1.432 1.961 2.364 2.677 2.942 3.184 3.396 3.764 3.933 4.104 4.325 4.523 4.641 4.867 5.089 5.294 5.387 5.573 5.743 5.966 6.103 6.231 6.42 6.601 6.765 6.913 7.058 7.246 7.433 7.609 7.797 7.972 8.134 8.317 8.51 8.68 8.848 9.025 9.204 9.374 9.544 9.704 9.828 9.947 10.045 10.09 10.037 9.802 9.279 8.219 6.799 5.501 4.362 3.37 2.471 1.678 0.946 0.32 -0.309 -0.858 -1.349 -1.822 -2.278 -2.713 -3.105 -3.506 -3.868 -4.189 -4.524 -4.869 -5.164 -5.465 -5.765 -5.999 -6.249 -6.526 -6.812 -7.124 -7.339 -7.553 -7.919 -8.183 -8.439 -8.572 -8.875 -9.202 -9.521 -9.681 -9.936 -10.229 -10.434 -10.656 -11.152 -11.418 -11.709 -12.034 -12.42 -12.911 -13.581 -15.483 -3 ,20900 ,TETRA ,17621280,Tue Nov 30 16:21:45 CET,Tue Nov 30 18:49:48 CET,0.0 1.388 1.931 2.341 2.652 2.937 3.191 3.413 3.815 3.985 4.141 4.378 4.592 4.726 4.985 5.203 5.41 5.51 5.686 5.845 6.071 6.212 6.347 6.554 6.738 6.895 7.054 7.21 7.396 7.562 7.729 7.931 8.108 8.258 8.426 8.612 8.772 8.941 9.118 9.297 9.461 9.609 9.759 9.882 9.984 10.065 10.091 10.03 9.858 9.433 8.433 6.969 5.686 4.554 3.562 2.679 1.899 1.181 0.549 -0.091 -0.656 -1.174 -1.671 -2.144 -2.588 -2.998 -3.424 -3.797 -4.123 -4.46 -4.8 -5.087 -5.396 -5.719 -5.968 -6.234 -6.509 -6.79 -7.094 -7.31 -7.531 -7.878 -8.12 -8.366 -8.492 -8.765 -9.066 -9.383 -9.552 -9.814 -10.1 -10.303 -10.519 -11.008 -11.282 -11.583 -11.925 -12.322 -12.797 -13.444 -15.227 -4 ,26622 ,TETRA ,17621281,Tue Nov 30 16:21:47 CET,Tue Nov 30 18:51:57 CET,0.0 1.511 2.033 2.407 2.72 2.987 3.21 3.42 3.789 3.95 4.103 4.309 4.512 4.628 4.839 5.039 5.222 5.307 5.475 5.636 5.873 6.019 6.154 6.355 6.537 6.705 6.86 7.006 7.196 7.366 7.522 7.724 7.911 8.07 8.239 8.426 8.606 8.784 8.957 9.133 9.293 9.444 9.623 9.773 9.873 9.94 9.967 9.929 9.775 9.319 8.267 6.811 5.555 4.456 3.52 2.691 1.928 1.234 0.648 0.037 -0.501 -0.981 -1.446 -1.882 -2.275 -2.642 -3.05 -3.416 -3.73 -4.06 -4.398 -4.674 -4.956 -5.247 -5.475 -5.727 -5.998 -6.271 -6.562 -6.76 -6.965 -7.3 -7.543 -7.808 -7.946 -8.222 -8.493 -8.803 -8.981 -9.247 -9.529 -9.722 -9.929 -10.403 -10.665 -10.939 -11.246 -11.615 -12.05 -12.669 -14.356 -5 ,25437 ,TETRA ,17621282,Tue Nov 30 16:21:46 CET,Tue Nov 30 18:46:42 CET,0.0 1.417 1.945 2.34 2.669 2.976 3.241 3.47 3.86 4.031 4.197 4.428 4.643 4.773 5.023 5.252 5.459 5.553 5.739 5.918 6.15 6.289 6.42 6.603 6.783 6.95 7.104 7.254 7.427 7.585 7.744 7.927 8.087 8.242 8.42 8.605 8.769 8.938 9.113 9.265 9.421 9.596 9.777 9.925 10.047 10.118 10.11 10.031 9.804 9.343 8.443 7.128 5.924 4.86 3.935 3.12 2.399 1.711 1.112 0.517 -0.006 -0.465 -0.904 -1.32 -1.713 -2.082 -2.477 -2.83 -3.137 -3.465 -3.804 -4.08 -4.368 -4.673 -4.918 -5.179 -5.45 -5.736 -6.049 -6.261 -6.476 -6.812 -7.038 -7.278 -7.41 -7.691 -7.989 -8.298 -8.465 -8.735 -9.023 -9.228 -9.44 -9.911 -10.183 -10.479 -10.804 -11.176 -11.617 -12.184 -14.078 -6 ,28372 ,TETRA ,17621283,Tue Nov 30 16:21:46 CET,Tue Nov 30 18:45:50 CET,0.0 1.79 2.324 2.704 2.998 3.26 3.51 3.752 4.172 4.346 4.503 4.721 4.944 5.084 5.345 5.576 5.779 5.874 6.059 6.233 6.469 6.617 6.756 6.959 7.146 7.309 7.468 7.61 7.79 7.969 8.136 8.324 8.485 8.634 8.814 9.007 9.177 9.349 9.513 9.673 9.836 9.992 10.125 10.245 10.374 10.453 10.46 10.372 10.151 9.645 8.595 7.159 5.772 4.534 3.511 2.607 1.797 1.055 0.401 -0.232 -0.767 -1.263 -1.741 -2.199 -2.617 -2.994 -3.412 -3.795 -4.1 -4.412 -4.738 -5.011 -5.314 -5.639 -5.896 -6.156 -6.425 -6.715 -7.026 -7.247 -7.469 -7.815 -8.06 -8.309 -8.444 -8.725 -9.013 -9.32 -9.481 -9.737 -10.034 -10.236 -10.436 -10.885 -11.137 -11.416 -11.741 -12.112 -12.55 -13.141 -15.025 -7 ,16649 ,TETRA ,17621284,Tue Nov 30 16:21:46 CET,Tue Nov 30 18:47:09 CET,0.0 1.783 2.308 2.671 2.965 3.238 3.482 3.702 4.086 4.251 4.4 4.592 4.781 4.904 5.133 5.335 5.526 5.62 5.792 5.946 6.162 6.299 6.432 6.622 6.803 6.967 7.123 7.273 7.467 7.647 7.802 7.975 8.132 8.281 8.443 8.618 8.788 8.966 9.137 9.295 9.454 9.628 9.779 9.899 10.015 10.092 10.11 10.062 9.904 9.467 8.442 6.98 5.693 4.61 3.671 2.807 2.049 1.379 0.814 0.24 -0.278 -0.735 -1.161 -1.572 -1.957 -2.316 -2.701 -3.057 -3.36 -3.661 -3.982 -4.26 -4.559 -4.868 -5.109 -5.361 -5.634 -5.918 -6.207 -6.406 -6.611 -6.945 -7.186 -7.438 -7.567 -7.826 -8.109 -8.431 -8.604 -8.859 -9.145 -9.347 -9.55 -10.018 -10.284 -10.583 -10.909 -11.277 -11.745 -12.356 -14.221 -8 ,12129 ,TETRA ,17621285,Tue Nov 30 16:21:49 CET,Tue Nov 30 18:48:25 CET,0.0 1.518 2.069 2.479 2.813 3.09 3.333 3.56 3.933 4.098 4.258 4.471 4.685 4.816 5.064 5.292 5.503 5.603 5.784 5.954 6.203 6.356 6.494 6.688 6.869 7.034 7.185 7.325 7.499 7.661 7.825 8.015 8.183 8.341 8.513 8.694 8.855 9.024 9.186 9.332 9.49 9.652 9.794 9.906 10.001 10.08 10.078 9.945 9.687 9.167 8.091 6.682 5.415 4.286 3.316 2.464 1.707 1.013 0.419 -0.193 -0.722 -1.191 -1.642 -2.069 -2.48 -2.861 -3.255 -3.618 -3.943 -4.282 -4.637 -4.935 -5.252 -5.581 -5.825 -6.095 -6.387 -6.671 -6.96 -7.162 -7.366 -7.702 -7.946 -8.201 -8.335 -8.621 -8.935 -9.268 -9.444 -9.713 -10.007 -10.219 -10.446 -10.95 -11.234 -11.538 -11.88 -12.261 -12.728 -13.329 -15.258 -9 ,9490 ,TETRA ,17621286,Tue Nov 30 16:21:50 CET,Tue Nov 30 18:47:54 CET,0.0 1.667 2.215 2.636 2.957 3.235 3.493 3.719 4.1 4.268 4.42 4.637 4.841 4.961 5.186 5.394 5.59 5.682 5.865 6.036 6.27 6.416 6.553 6.742 6.926 7.092 7.238 7.378 7.561 7.727 7.873 8.043 8.205 8.361 8.526 8.697 8.854 9.014 9.186 9.356 9.492 9.637 9.814 9.963 10.085 10.167 10.189 10.115 9.9 9.457 8.453 7.076 5.902 4.861 3.938 3.082 2.308 1.611 1.008 0.405 -0.129 -0.624 -1.089 -1.532 -1.95 -2.332 -2.737 -3.103 -3.417 -3.737 -4.083 -4.376 -4.674 -4.992 -5.248 -5.516 -5.784 -6.062 -6.361 -6.569 -6.789 -7.131 -7.384 -7.645 -7.774 -8.063 -8.377 -8.702 -8.862 -9.116 -9.403 -9.6 -9.818 -10.301 -10.571 -10.877 -11.214 -11.58 -12.039 -12.676 -14.475 -10 ,14989 ,TETRA ,17621287,Tue Nov 30 16:21:46 CET,Tue Nov 30 18:50:42 CET,0.0 1.491 2.09 2.495 2.801 3.071 3.315 3.539 3.912 4.078 4.232 4.434 4.636 4.762 5.002 5.219 5.419 5.518 5.694 5.856 6.084 6.22 6.349 6.538 6.723 6.878 7.026 7.179 7.377 7.566 7.741 7.945 8.141 8.304 8.456 8.626 8.792 8.963 9.131 9.282 9.428 9.582 9.734 9.852 9.964 10.045 10.062 9.992 9.79 9.302 8.201 6.727 5.512 4.494 3.57 2.681 1.89 1.203 0.604 0.007 -0.505 -0.969 -1.414 -1.835 -2.223 -2.602 -3.006 -3.36 -3.685 -4.02 -4.359 -4.646 -4.946 -5.254 -5.489 -5.743 -6.009 -6.287 -6.59 -6.792 -7.0 -7.342 -7.578 -7.821 -7.953 -8.234 -8.524 -8.838 -9.01 -9.283 -9.578 -9.782 -10.0 -10.49 -10.777 -11.078 -11.399 -11.787 -12.251 -12.895 -14.563 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_49.txt deleted file mode 100644 index 86256af2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17060 ,TETRA ,17621288,Tue Nov 30 16:21:50 CET,Tue Nov 30 18:51:17 CET,0.0 1.391 1.832 2.163 2.438 2.675 2.882 3.074 3.385 3.523 3.654 3.804 3.981 4.075 4.247 4.407 4.554 4.621 4.734 4.831 4.964 5.039 5.109 5.201 5.277 5.349 5.419 5.483 5.544 5.58 5.605 5.628 5.638 5.635 5.616 5.569 5.504 5.42 5.311 5.161 4.979 4.74 4.381 3.95 3.394 2.683 1.696 0.413 -1.296 -3.79 -7.722 -12.09 -15.518 -18.307 -20.631 -22.66 -24.356 -25.872 -27.19 -28.478 -29.549 -30.477 -31.379 -32.231 -33.009 -33.707 -34.417 -35.054 -35.593 -36.147 -36.726 -37.204 -37.696 -38.193 -38.608 -39.066 -39.538 -40.049 -40.577 -40.901 -41.256 -41.835 -42.222 -42.633 -42.841 -43.282 -43.777 -44.318 -44.577 -44.943 -45.365 -45.642 -45.936 -46.596 -46.932 -47.286 -47.688 -48.168 -48.76 -49.487 -51.601 -2 ,1554 ,TETRA ,17621289,Tue Nov 30 16:21:47 CET,Tue Nov 30 18:49:21 CET,0.0 1.435 1.943 2.31 2.599 2.843 3.054 3.23 3.537 3.668 3.787 3.939 4.118 4.213 4.384 4.528 4.664 4.727 4.841 4.942 5.062 5.128 5.186 5.269 5.341 5.407 5.467 5.506 5.546 5.579 5.605 5.628 5.64 5.64 5.62 5.577 5.504 5.403 5.289 5.135 4.938 4.688 4.352 3.955 3.404 2.713 1.83 0.63 -1.11 -3.635 -7.599 -11.938 -15.26 -17.965 -20.178 -22.08 -23.729 -25.186 -26.376 -27.533 -28.524 -29.394 -30.237 -31.028 -31.734 -32.366 -33.016 -33.585 -34.068 -34.576 -35.125 -35.578 -36.037 -36.514 -36.887 -37.268 -37.663 -38.074 -38.496 -38.783 -39.085 -39.58 -39.923 -40.273 -40.454 -40.821 -41.199 -41.611 -41.834 -42.189 -42.573 -42.858 -43.162 -43.795 -44.141 -44.529 -44.949 -45.44 -46.017 -46.795 -49.84 -3 ,19066 ,TETRA ,17621290,Tue Nov 30 16:21:48 CET,Tue Nov 30 19:15:35 CET,0.0 1.516 2.015 2.372 2.65 2.876 3.08 3.27 3.578 3.7 3.817 3.966 4.142 4.236 4.408 4.563 4.705 4.763 4.868 4.964 5.09 5.166 5.234 5.324 5.401 5.459 5.509 5.577 5.653 5.691 5.724 5.751 5.776 5.791 5.776 5.74 5.679 5.586 5.471 5.333 5.138 4.865 4.532 4.145 3.591 2.865 1.898 0.616 -1.149 -3.678 -7.647 -12.059 -15.452 -18.112 -20.283 -22.178 -23.784 -25.192 -26.375 -27.539 -28.544 -29.454 -30.317 -31.119 -31.854 -32.5 -33.168 -33.769 -34.298 -34.848 -35.407 -35.854 -36.303 -36.759 -37.113 -37.503 -37.915 -38.322 -38.739 -39.038 -39.364 -39.874 -40.219 -40.586 -40.778 -41.17 -41.586 -42.02 -42.246 -42.637 -43.091 -43.39 -43.702 -44.389 -44.763 -45.13 -45.515 -45.961 -46.481 -47.165 -49.355 -4 ,8577 ,TETRA ,17621291,Tue Nov 30 16:21:48 CET,Tue Nov 30 18:49:16 CET,0.0 1.613 2.097 2.44 2.724 2.96 3.144 3.308 3.609 3.739 3.852 4.002 4.175 4.263 4.416 4.542 4.667 4.727 4.844 4.943 5.057 5.122 5.183 5.264 5.336 5.397 5.451 5.504 5.558 5.585 5.594 5.6 5.593 5.568 5.527 5.477 5.401 5.288 5.159 5.007 4.816 4.563 4.207 3.801 3.272 2.574 1.605 0.282 -1.559 -4.133 -8.025 -12.356 -15.806 -18.617 -20.933 -22.936 -24.612 -26.065 -27.305 -28.539 -29.584 -30.522 -31.406 -32.205 -32.952 -33.633 -34.318 -34.907 -35.421 -35.991 -36.568 -37.02 -37.49 -37.979 -38.357 -38.761 -39.197 -39.645 -40.106 -40.427 -40.755 -41.278 -41.642 -42.009 -42.193 -42.582 -43.012 -43.47 -43.707 -44.091 -44.564 -44.895 -45.227 -45.926 -46.292 -46.67 -47.103 -47.573 -48.141 -48.913 -50.936 -5 ,19258 ,TETRA ,17621292,Tue Nov 30 16:21:50 CET,Tue Nov 30 18:50:34 CET,0.0 1.788 2.299 2.65 2.932 3.178 3.403 3.589 3.885 4.015 4.139 4.277 4.439 4.524 4.685 4.827 4.948 5.005 5.115 5.214 5.337 5.414 5.482 5.576 5.665 5.727 5.775 5.822 5.868 5.894 5.917 5.945 5.952 5.934 5.901 5.855 5.793 5.697 5.553 5.363 5.157 4.887 4.515 4.098 3.532 2.794 1.807 0.504 -1.315 -3.957 -8.04 -12.559 -16.065 -18.927 -21.352 -23.451 -25.18 -26.671 -27.924 -29.144 -30.181 -31.121 -32.008 -32.804 -33.538 -34.203 -34.888 -35.499 -36.029 -36.581 -37.151 -37.634 -38.142 -38.645 -39.027 -39.429 -39.836 -40.256 -40.716 -41.035 -41.357 -41.84 -42.171 -42.531 -42.715 -43.086 -43.484 -43.919 -44.142 -44.491 -44.862 -45.117 -45.382 -46.009 -46.364 -46.74 -47.161 -47.632 -48.186 -48.848 -50.875 -6 ,25662 ,TETRA ,17621293,Tue Nov 30 16:21:48 CET,Tue Nov 30 18:48:34 CET,0.0 1.681 2.163 2.504 2.777 3.013 3.229 3.424 3.755 3.896 4.024 4.158 4.328 4.41 4.563 4.708 4.832 4.89 5.002 5.097 5.223 5.298 5.371 5.472 5.553 5.619 5.692 5.753 5.803 5.844 5.875 5.899 5.908 5.907 5.89 5.859 5.805 5.718 5.604 5.45 5.273 5.031 4.687 4.297 3.751 3.021 2.042 0.739 -1.086 -3.679 -7.677 -12.076 -15.466 -18.164 -20.385 -22.387 -24.078 -25.54 -26.778 -28.008 -29.064 -29.984 -30.83 -31.625 -32.369 -33.029 -33.688 -34.261 -34.752 -35.281 -35.859 -36.346 -36.854 -37.392 -37.811 -38.235 -38.67 -39.107 -39.551 -39.874 -40.215 -40.726 -41.067 -41.439 -41.638 -42.024 -42.421 -42.867 -43.101 -43.459 -43.856 -44.132 -44.428 -45.093 -45.462 -45.867 -46.318 -46.844 -47.507 -48.363 -50.693 -7 ,31249 ,TETRA ,17621294,Tue Nov 30 16:21:48 CET,Tue Nov 30 18:49:26 CET,0.0 1.563 2.015 2.351 2.647 2.893 3.095 3.288 3.61 3.738 3.851 3.989 4.156 4.245 4.406 4.547 4.679 4.738 4.844 4.941 5.069 5.141 5.207 5.294 5.367 5.437 5.491 5.534 5.587 5.631 5.662 5.679 5.682 5.673 5.653 5.611 5.553 5.469 5.341 5.184 5.002 4.731 4.355 3.94 3.392 2.68 1.71 0.448 -1.261 -3.792 -7.757 -12.113 -15.508 -18.313 -20.672 -22.689 -24.382 -25.865 -27.121 -28.387 -29.469 -30.393 -31.253 -32.075 -32.836 -33.502 -34.181 -34.796 -35.341 -35.902 -36.476 -36.946 -37.416 -37.92 -38.323 -38.733 -39.147 -39.585 -40.052 -40.363 -40.68 -41.2 -41.559 -41.933 -42.128 -42.522 -42.927 -43.348 -43.575 -43.932 -44.315 -44.589 -44.883 -45.534 -45.885 -46.273 -46.718 -47.212 -47.8 -48.567 -50.56 -8 ,30989 ,TETRA ,17621295,Tue Nov 30 16:21:48 CET,Tue Nov 30 18:50:49 CET,0.0 1.624 2.108 2.485 2.787 3.032 3.237 3.41 3.714 3.846 3.968 4.1 4.265 4.356 4.532 4.683 4.805 4.862 4.993 5.109 5.244 5.327 5.396 5.476 5.555 5.631 5.69 5.745 5.811 5.861 5.892 5.909 5.914 5.908 5.885 5.838 5.772 5.684 5.57 5.419 5.224 4.97 4.623 4.214 3.653 2.934 1.978 0.68 -1.166 -3.836 -7.95 -12.512 -16.059 -18.84 -21.074 -23.019 -24.696 -26.185 -27.427 -28.647 -29.669 -30.574 -31.43 -32.216 -32.96 -33.637 -34.334 -34.959 -35.492 -36.037 -36.596 -37.053 -37.542 -38.05 -38.441 -38.85 -39.266 -39.708 -40.167 -40.467 -40.786 -41.308 -41.66 -42.02 -42.21 -42.594 -42.991 -43.421 -43.641 -43.994 -44.393 -44.681 -44.976 -45.619 -45.973 -46.362 -46.79 -47.258 -47.825 -48.604 -51.247 -9 ,15519 ,TETRA ,17621296,Tue Nov 30 16:26:39 CET,Tue Nov 30 18:54:26 CET,0.0 1.431 1.913 2.259 2.547 2.787 2.992 3.168 3.459 3.584 3.706 3.853 4.024 4.114 4.292 4.448 4.58 4.644 4.758 4.859 4.997 5.08 5.149 5.234 5.309 5.372 5.43 5.483 5.539 5.585 5.615 5.629 5.627 5.614 5.59 5.554 5.501 5.405 5.285 5.147 4.951 4.658 4.264 3.83 3.257 2.519 1.539 0.237 -1.639 -4.356 -8.552 -13.219 -16.788 -19.648 -22.005 -24.034 -25.724 -27.169 -28.379 -29.578 -30.614 -31.543 -32.414 -33.213 -33.947 -34.595 -35.273 -35.906 -36.447 -37.004 -37.572 -38.044 -38.553 -39.103 -39.533 -39.953 -40.364 -40.803 -41.275 -41.604 -41.941 -42.458 -42.821 -43.197 -43.396 -43.812 -44.241 -44.701 -44.945 -45.305 -45.658 -45.921 -46.202 -46.824 -47.199 -47.602 -48.03 -48.524 -49.099 -49.807 -51.612 -10 ,3986 ,TETRA ,17621297,Tue Nov 30 16:26:39 CET,Tue Nov 30 18:59:23 CET,0.0 1.775 2.274 2.65 2.958 3.229 3.462 3.66 3.981 4.122 4.254 4.427 4.602 4.707 4.907 5.077 5.229 5.302 5.435 5.547 5.688 5.773 5.856 5.97 6.064 6.146 6.223 6.29 6.369 6.436 6.476 6.509 6.533 6.539 6.533 6.531 6.522 6.477 6.405 6.298 6.161 5.973 5.662 5.276 4.737 4.031 3.101 1.84 0.1 -2.365 -6.326 -10.782 -14.158 -16.912 -19.24 -21.261 -22.95 -24.42 -25.666 -26.903 -27.943 -28.861 -29.724 -30.529 -31.299 -31.995 -32.694 -33.304 -33.835 -34.388 -34.96 -35.435 -35.919 -36.412 -36.804 -37.228 -37.662 -38.11 -38.577 -38.901 -39.236 -39.765 -40.13 -40.504 -40.703 -41.112 -41.536 -41.977 -42.2 -42.549 -42.941 -43.224 -43.528 -44.2 -44.571 -44.957 -45.382 -45.887 -46.48 -47.259 -49.858 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_44.txt deleted file mode 100644 index 5cf157d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2771 ,TETRA ,17621298,Tue Nov 30 16:26:39 CET,Tue Nov 30 18:53:32 CET,0.0 1.713 2.294 2.715 3.064 3.37 3.639 3.888 4.31 4.491 4.671 4.917 5.152 5.301 5.582 5.833 6.064 6.173 6.376 6.577 6.858 7.03 7.201 7.454 7.685 7.887 8.073 8.255 8.486 8.696 8.9 9.152 9.384 9.606 9.873 10.146 10.386 10.66 10.947 11.242 11.551 11.875 12.226 12.577 12.972 13.38 13.815 14.241 14.645 14.969 15.085 14.81 14.372 13.874 13.342 12.825 12.337 11.872 11.464 11.013 10.614 10.28 9.949 9.618 9.309 9.019 8.713 8.432 8.167 7.881 7.578 7.324 7.051 6.757 6.539 6.315 6.075 5.821 5.558 5.371 5.171 4.836 4.589 4.337 4.211 3.95 3.66 3.33 3.159 2.893 2.597 2.395 2.169 1.656 1.369 1.047 0.691 0.277 -0.229 -0.879 -3.147 -2 ,18090 ,TETRA ,17621299,Tue Nov 30 16:26:40 CET,Tue Nov 30 18:54:39 CET,0.0 1.895 2.532 2.986 3.364 3.686 3.986 4.262 4.725 4.929 5.118 5.368 5.634 5.805 6.128 6.41 6.661 6.78 7.003 7.216 7.526 7.724 7.905 8.138 8.356 8.569 8.776 8.969 9.211 9.449 9.673 9.936 10.175 10.399 10.661 10.936 11.185 11.459 11.75 12.044 12.357 12.689 13.038 13.364 13.72 14.114 14.54 14.971 15.403 15.75 15.937 15.766 15.386 14.954 14.511 14.064 13.662 13.252 12.83 12.393 12.018 11.671 11.336 11.006 10.688 10.407 10.096 9.798 9.545 9.278 8.99 8.746 8.492 8.221 8.003 7.781 7.55 7.293 7.017 6.819 6.615 6.288 6.064 5.839 5.718 5.46 5.174 4.862 4.698 4.434 4.153 3.951 3.733 3.259 2.99 2.685 2.347 1.968 1.473 0.804 -1.047 -3 ,16718 ,TETRA ,17621300,Tue Nov 30 16:26:41 CET,Tue Nov 30 18:52:52 CET,0.0 1.61 2.159 2.589 2.935 3.228 3.491 3.738 4.174 4.362 4.54 4.782 5.033 5.173 5.428 5.684 5.924 6.032 6.24 6.439 6.726 6.904 7.071 7.308 7.529 7.739 7.94 8.133 8.375 8.604 8.828 9.083 9.311 9.539 9.796 10.06 10.308 10.58 10.858 11.135 11.439 11.778 12.154 12.513 12.883 13.262 13.666 14.083 14.482 14.818 15.02 14.806 14.402 13.955 13.501 13.029 12.589 12.185 11.828 11.442 11.09 10.776 10.46 10.134 9.829 9.536 9.212 8.92 8.664 8.392 8.111 7.872 7.617 7.346 7.133 6.912 6.674 6.419 6.139 5.947 5.76 5.456 5.236 5.009 4.888 4.624 4.351 4.062 3.905 3.644 3.363 3.161 2.95 2.484 2.221 1.936 1.584 1.183 0.74 0.142 -1.906 -4 ,20998 ,TETRA ,17621301,Tue Nov 30 16:26:41 CET,Tue Nov 30 18:54:30 CET,0.0 1.474 1.99 2.383 2.693 2.968 3.248 3.5 3.916 4.101 4.274 4.498 4.745 4.887 5.155 5.414 5.661 5.779 6.001 6.21 6.49 6.656 6.816 7.034 7.231 7.437 7.634 7.806 8.03 8.259 8.485 8.751 8.99 9.215 9.47 9.749 10.004 10.268 10.56 10.86 11.156 11.481 11.851 12.212 12.587 12.97 13.388 13.805 14.202 14.466 14.511 14.199 13.68 13.129 12.596 12.064 11.553 11.039 10.572 10.116 9.717 9.339 8.949 8.58 8.222 7.888 7.567 7.284 7.019 6.722 6.404 6.142 5.852 5.55 5.329 5.091 4.841 4.577 4.288 4.089 3.885 3.564 3.328 3.07 2.94 2.672 2.383 2.059 1.885 1.621 1.328 1.12 0.895 0.415 0.143 -0.167 -0.507 -0.926 -1.406 -2.025 -4.192 -5 ,1721 ,TETRA ,17621302,Tue Nov 30 16:26:41 CET,Tue Nov 30 18:53:34 CET,0.0 1.503 2.024 2.435 2.796 3.088 3.348 3.591 4.05 4.266 4.457 4.706 4.966 5.135 5.451 5.727 5.983 6.103 6.324 6.538 6.84 7.011 7.18 7.426 7.642 7.854 8.062 8.257 8.494 8.721 8.944 9.207 9.454 9.7 9.98 10.27 10.542 10.827 11.13 11.458 11.787 12.127 12.495 12.841 13.234 13.648 14.1 14.57 15.024 15.448 15.676 15.514 15.163 14.69 14.152 13.629 13.176 12.754 12.345 11.915 11.542 11.194 10.845 10.475 10.119 9.809 9.477 9.169 8.904 8.626 8.325 8.064 7.788 7.485 7.243 6.983 6.707 6.432 6.137 5.926 5.713 5.375 5.134 4.885 4.755 4.482 4.185 3.867 3.695 3.425 3.113 2.896 2.664 2.174 1.894 1.574 1.215 0.813 0.327 -0.37 -2.896 -6 ,543 ,TETRA ,17621303,Tue Nov 30 16:26:41 CET,Tue Nov 30 18:53:21 CET,0.0 1.923 2.482 2.945 3.327 3.635 3.9 4.126 4.55 4.746 4.927 5.16 5.402 5.543 5.824 6.083 6.314 6.427 6.649 6.851 7.124 7.298 7.456 7.67 7.882 8.083 8.264 8.447 8.682 8.898 9.1 9.337 9.566 9.778 10.011 10.273 10.528 10.801 11.076 11.358 11.659 12.003 12.377 12.741 13.153 13.571 13.986 14.361 14.759 15.119 15.241 14.976 14.603 14.204 13.724 13.209 12.741 12.281 11.847 11.425 11.06 10.705 10.35 10.003 9.679 9.392 9.092 8.804 8.548 8.281 7.992 7.739 7.47 7.182 6.965 6.746 6.512 6.268 6.004 5.818 5.621 5.295 5.073 4.853 4.728 4.464 4.197 3.902 3.746 3.48 3.189 2.986 2.775 2.284 2.008 1.707 1.378 1.008 0.534 -0.122 -2.179 -7 ,2264 ,TETRA ,17621304,Tue Nov 30 16:26:41 CET,Tue Nov 30 18:54:05 CET,0.0 1.562 2.133 2.538 2.874 3.165 3.413 3.652 4.076 4.261 4.442 4.676 4.92 5.078 5.377 5.641 5.875 5.984 6.2 6.398 6.669 6.845 7.021 7.265 7.496 7.716 7.91 8.101 8.343 8.567 8.774 9.013 9.246 9.473 9.736 10.02 10.288 10.579 10.861 11.139 11.439 11.772 12.136 12.488 12.878 13.261 13.634 14.008 14.385 14.705 14.863 14.594 14.099 13.579 13.079 12.6 12.114 11.609 11.184 10.76 10.379 10.011 9.643 9.293 8.957 8.631 8.266 7.95 7.694 7.424 7.147 6.905 6.639 6.356 6.134 5.905 5.658 5.389 5.118 4.932 4.728 4.393 4.154 3.917 3.796 3.526 3.217 2.889 2.72 2.458 2.195 2.004 1.787 1.263 0.958 0.623 0.248 -0.191 -0.694 -1.382 -3.856 -8 ,5621 ,TETRA ,17621305,Tue Nov 30 16:26:41 CET,Tue Nov 30 18:46:36 CET,0.0 1.571 2.107 2.529 2.886 3.196 3.473 3.721 4.167 4.369 4.556 4.791 5.015 5.152 5.419 5.662 5.901 6.014 6.222 6.424 6.698 6.866 7.032 7.261 7.469 7.669 7.862 8.041 8.281 8.52 8.74 8.989 9.211 9.426 9.67 9.938 10.203 10.482 10.764 11.063 11.385 11.736 12.114 12.467 12.856 13.249 13.654 14.1 14.578 14.937 15.035 14.711 14.189 13.645 13.15 12.691 12.255 11.827 11.455 11.066 10.706 10.366 10.021 9.682 9.361 9.07 8.763 8.487 8.243 7.99 7.696 7.432 7.15 6.863 6.648 6.416 6.183 5.929 5.651 5.461 5.262 4.922 4.682 4.418 4.268 3.969 3.641 3.284 3.102 2.822 2.516 2.313 2.1 1.601 1.307 0.989 0.63 0.193 -0.315 -0.952 -3.521 -9 ,19693 ,TETRA ,17621306,Tue Nov 30 16:26:41 CET,Tue Nov 30 18:57:04 CET,0.0 1.654 2.289 2.734 3.077 3.377 3.648 3.885 4.298 4.49 4.678 4.943 5.192 5.336 5.607 5.883 6.14 6.253 6.472 6.676 6.967 7.147 7.312 7.551 7.782 8.0 8.199 8.379 8.616 8.849 9.07 9.326 9.565 9.788 10.025 10.282 10.534 10.796 11.063 11.346 11.648 11.976 12.332 12.661 13.02 13.41 13.837 14.269 14.692 15.077 15.288 15.131 14.746 14.316 13.916 13.508 13.106 12.703 12.315 11.884 11.502 11.159 10.812 10.48 10.178 9.876 9.533 9.23 8.958 8.663 8.357 8.101 7.824 7.522 7.282 7.045 6.803 6.529 6.226 6.015 5.804 5.482 5.243 4.986 4.853 4.575 4.276 3.945 3.772 3.495 3.196 2.988 2.749 2.18 1.871 1.54 1.15 0.719 0.221 -0.525 -3.045 -10 ,4447 ,TETRA ,17621307,Tue Nov 30 16:26:41 CET,Tue Nov 30 18:55:42 CET,0.0 1.35 1.86 2.272 2.606 2.886 3.138 3.368 3.77 3.955 4.134 4.386 4.632 4.779 5.065 5.338 5.591 5.709 5.941 6.171 6.482 6.672 6.85 7.096 7.327 7.54 7.733 7.922 8.16 8.38 8.594 8.852 9.095 9.31 9.554 9.83 10.085 10.35 10.615 10.895 11.186 11.505 11.85 12.194 12.574 12.946 13.343 13.764 14.212 14.575 14.715 14.498 14.118 13.655 13.137 12.644 12.195 11.767 11.385 10.987 10.624 10.28 9.928 9.578 9.257 8.975 8.666 8.373 8.118 7.851 7.573 7.335 7.065 6.789 6.578 6.349 6.107 5.852 5.578 5.383 5.19 4.876 4.651 4.412 4.287 4.023 3.726 3.401 3.234 2.971 2.689 2.485 2.281 1.813 1.533 1.223 0.886 0.49 0.003 -0.638 -2.712 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_49.txt deleted file mode 100644 index 29a4b8c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14690 ,TETRA ,17621308,Tue Nov 30 16:26:40 CET,Tue Nov 30 18:53:19 CET,0.0 1.833 2.333 2.706 3.019 3.288 3.506 3.7 4.049 4.203 4.353 4.527 4.729 4.834 5.026 5.198 5.344 5.416 5.558 5.683 5.864 5.978 6.079 6.225 6.356 6.475 6.578 6.665 6.769 6.857 6.946 7.055 7.151 7.216 7.274 7.332 7.382 7.426 7.44 7.437 7.418 7.37 7.262 7.092 6.833 6.455 5.937 5.248 4.247 2.727 0.16 -2.919 -5.464 -7.616 -9.365 -10.85 -12.125 -13.253 -14.212 -15.154 -15.957 -16.658 -17.332 -17.984 -18.597 -19.155 -19.734 -20.25 -20.682 -21.126 -21.597 -21.988 -22.394 -22.831 -23.169 -23.509 -23.867 -24.263 -24.677 -24.954 -25.249 -25.718 -26.035 -26.379 -26.556 -26.915 -27.3 -27.71 -27.937 -28.3 -28.677 -28.943 -29.214 -29.843 -30.209 -30.591 -31.038 -31.576 -32.213 -33.069 -35.757 -2 ,30590 ,TETRA ,17621309,Tue Nov 30 16:26:42 CET,Tue Nov 30 18:50:27 CET,0.0 1.619 2.162 2.553 2.838 3.081 3.305 3.52 3.892 4.044 4.176 4.31 4.51 4.614 4.802 4.97 5.119 5.191 5.331 5.471 5.656 5.754 5.856 6.002 6.123 6.242 6.35 6.439 6.54 6.623 6.699 6.792 6.874 6.943 7.006 7.059 7.104 7.14 7.154 7.145 7.116 7.045 6.914 6.713 6.437 6.067 5.523 4.783 3.671 1.988 -0.711 -3.79 -6.296 -8.31 -9.943 -11.451 -12.801 -13.997 -15.023 -16.039 -16.905 -17.671 -18.401 -19.078 -19.709 -20.302 -20.918 -21.469 -21.937 -22.429 -22.957 -23.384 -23.831 -24.315 -24.691 -25.088 -25.5 -25.901 -26.33 -26.641 -26.949 -27.417 -27.748 -28.105 -28.292 -28.675 -29.072 -29.507 -29.75 -30.128 -30.534 -30.814 -31.117 -31.766 -32.126 -32.532 -32.992 -33.518 -34.132 -34.946 -38.238 -3 ,29296 ,TETRA ,17621310,Tue Nov 30 16:26:41 CET,Tue Nov 30 18:52:39 CET,0.0 1.321 1.818 2.23 2.544 2.798 3.017 3.218 3.569 3.726 3.88 4.063 4.271 4.375 4.576 4.763 4.936 5.013 5.154 5.293 5.472 5.57 5.667 5.811 5.927 6.024 6.108 6.183 6.283 6.377 6.452 6.526 6.59 6.649 6.713 6.77 6.794 6.809 6.822 6.827 6.8 6.728 6.604 6.431 6.158 5.779 5.234 4.475 3.374 1.713 -0.984 -4.13 -6.593 -8.655 -10.424 -11.988 -13.327 -14.514 -15.542 -16.571 -17.452 -18.243 -19.003 -19.703 -20.325 -20.897 -21.501 -22.034 -22.498 -22.987 -23.485 -23.89 -24.324 -24.788 -25.166 -25.561 -25.938 -26.331 -26.771 -27.079 -27.386 -27.86 -28.2 -28.572 -28.767 -29.168 -29.594 -30.028 -30.259 -30.632 -31.042 -31.343 -31.641 -32.301 -32.685 -33.097 -33.578 -34.114 -34.77 -35.647 -38.162 -4 ,8664 ,TETRA ,17621311,Tue Nov 30 16:26:41 CET,Tue Nov 30 18:51:41 CET,0.0 1.824 2.307 2.69 3.023 3.292 3.516 3.714 4.054 4.213 4.359 4.52 4.717 4.81 4.99 5.17 5.332 5.403 5.534 5.663 5.848 5.951 6.036 6.159 6.276 6.378 6.464 6.547 6.65 6.735 6.806 6.882 6.941 6.989 7.046 7.09 7.116 7.137 7.141 7.114 7.053 6.969 6.837 6.642 6.353 5.958 5.407 4.664 3.562 1.856 -0.915 -4.078 -6.644 -8.794 -10.539 -12.087 -13.428 -14.606 -15.605 -16.587 -17.433 -18.201 -18.928 -19.601 -20.231 -20.82 -21.425 -21.96 -22.437 -22.92 -23.407 -23.819 -24.258 -24.714 -25.068 -25.442 -25.825 -26.22 -26.646 -26.936 -27.238 -27.741 -28.093 -28.443 -28.625 -29.012 -29.441 -29.885 -30.117 -30.48 -30.871 -31.141 -31.422 -32.065 -32.432 -32.841 -33.304 -33.829 -34.472 -35.301 -38.622 -5 ,11845 ,TETRA ,17621312,Tue Nov 30 16:26:42 CET,Tue Nov 30 18:55:51 CET,0.0 1.271 1.725 2.059 2.333 2.588 2.806 2.992 3.328 3.479 3.617 3.782 3.978 4.084 4.283 4.469 4.641 4.723 4.872 5.006 5.184 5.288 5.388 5.525 5.654 5.774 5.874 5.963 6.075 6.168 6.24 6.311 6.381 6.45 6.516 6.575 6.614 6.643 6.654 6.638 6.607 6.533 6.385 6.21 5.971 5.64 5.151 4.434 3.362 1.755 -0.878 -3.978 -6.43 -8.41 -10.064 -11.53 -12.759 -13.838 -14.797 -15.775 -16.596 -17.319 -18.022 -18.695 -19.332 -19.935 -20.587 -21.155 -21.636 -22.139 -22.642 -23.053 -23.489 -23.952 -24.302 -24.66 -25.051 -25.465 -25.898 -26.192 -26.505 -27.008 -27.351 -27.717 -27.911 -28.314 -28.731 -29.166 -29.39 -29.741 -30.13 -30.411 -30.703 -31.381 -31.772 -32.177 -32.613 -33.13 -33.79 -34.664 -37.54 -6 ,24414 ,TETRA ,17621313,Tue Nov 30 16:26:41 CET,Tue Nov 30 18:53:03 CET,0.0 1.437 1.904 2.284 2.594 2.85 3.071 3.26 3.584 3.722 3.854 4.013 4.225 4.344 4.568 4.753 4.924 5.004 5.155 5.291 5.468 5.578 5.685 5.834 5.964 6.075 6.185 6.285 6.396 6.509 6.613 6.716 6.804 6.878 6.941 7.006 7.051 7.086 7.125 7.126 7.08 7.022 6.932 6.776 6.528 6.175 5.64 4.881 3.805 2.194 -0.452 -3.51 -5.976 -7.984 -9.617 -11.06 -12.315 -13.433 -14.386 -15.338 -16.141 -16.855 -17.543 -18.183 -18.775 -19.32 -19.897 -20.405 -20.839 -21.293 -21.766 -22.154 -22.547 -22.96 -23.297 -23.664 -24.035 -24.409 -24.805 -25.082 -25.379 -25.861 -26.201 -26.549 -26.727 -27.097 -27.493 -27.905 -28.116 -28.465 -28.847 -29.114 -29.396 -30.042 -30.399 -30.766 -31.166 -31.647 -32.199 -32.924 -35.656 -7 ,19292 ,TETRA ,17621314,Tue Nov 30 16:26:42 CET,Tue Nov 30 18:53:38 CET,0.0 1.627 2.159 2.511 2.8 3.042 3.247 3.433 3.76 3.906 4.034 4.171 4.364 4.461 4.65 4.817 4.965 5.037 5.173 5.291 5.456 5.561 5.65 5.778 5.903 6.007 6.107 6.205 6.317 6.422 6.514 6.596 6.659 6.709 6.766 6.818 6.854 6.876 6.867 6.844 6.795 6.7 6.535 6.323 6.045 5.675 5.134 4.374 3.255 1.576 -1.137 -4.282 -6.791 -8.846 -10.552 -12.009 -13.243 -14.363 -15.327 -16.285 -17.115 -17.87 -18.606 -19.305 -19.951 -20.539 -21.148 -21.694 -22.174 -22.668 -23.182 -23.605 -24.065 -24.594 -25.022 -25.47 -25.922 -26.383 -26.874 -27.209 -27.557 -28.122 -28.55 -28.988 -29.198 -29.611 -30.046 -30.516 -30.758 -31.149 -31.62 -31.938 -32.281 -33.081 -33.493 -33.924 -34.432 -34.998 -35.709 -36.779 -40.083 -8 ,5167 ,TETRA ,17621315,Tue Nov 30 16:26:42 CET,Tue Nov 30 18:53:00 CET,0.0 1.325 1.804 2.151 2.445 2.694 2.908 3.104 3.435 3.577 3.715 3.882 4.084 4.196 4.402 4.599 4.764 4.837 4.978 5.11 5.283 5.39 5.487 5.612 5.717 5.818 5.916 6.006 6.115 6.214 6.306 6.404 6.485 6.548 6.616 6.678 6.723 6.762 6.781 6.776 6.746 6.676 6.551 6.379 6.137 5.8 5.271 4.516 3.391 1.656 -1.052 -4.134 -6.636 -8.694 -10.404 -11.879 -13.16 -14.323 -15.301 -16.281 -17.119 -17.831 -18.52 -19.188 -19.803 -20.37 -20.96 -21.477 -21.925 -22.392 -22.883 -23.3 -23.73 -24.161 -24.487 -24.842 -25.219 -25.611 -26.045 -26.348 -26.651 -27.112 -27.44 -27.812 -28.013 -28.411 -28.808 -29.23 -29.461 -29.83 -30.238 -30.534 -30.853 -31.533 -31.913 -32.326 -32.79 -33.31 -33.946 -34.793 -38.051 -9 ,20575 ,TETRA ,17621316,Tue Nov 30 16:26:42 CET,Tue Nov 30 18:58:59 CET,0.0 2.43 2.991 3.356 3.633 3.865 4.075 4.261 4.584 4.729 4.872 5.049 5.262 5.369 5.567 5.755 5.927 6.013 6.18 6.323 6.496 6.605 6.709 6.848 6.979 7.107 7.216 7.308 7.425 7.539 7.64 7.753 7.842 7.913 7.991 8.051 8.086 8.126 8.163 8.173 8.151 8.091 7.971 7.809 7.587 7.27 6.784 6.093 5.027 3.366 0.778 -2.224 -4.619 -6.593 -8.259 -9.745 -11.044 -12.197 -13.185 -14.157 -14.988 -15.716 -16.384 -17.018 -17.626 -18.175 -18.753 -19.268 -19.709 -20.154 -20.61 -21.003 -21.416 -21.844 -22.186 -22.542 -22.907 -23.306 -23.729 -24.008 -24.291 -24.758 -25.092 -25.427 -25.597 -25.964 -26.358 -26.795 -27.031 -27.393 -27.778 -28.051 -28.353 -29.019 -29.392 -29.818 -30.266 -30.754 -31.4 -32.306 -35.118 -10 ,7857 ,TETRA ,17621317,Tue Nov 30 16:26:41 CET,Tue Nov 30 18:57:44 CET,0.0 1.591 2.061 2.431 2.731 2.976 3.197 3.395 3.738 3.896 4.049 4.219 4.415 4.518 4.713 4.899 5.072 5.151 5.302 5.433 5.603 5.709 5.806 5.928 6.032 6.136 6.236 6.323 6.434 6.534 6.622 6.725 6.813 6.894 6.984 7.059 7.105 7.124 7.137 7.138 7.112 7.052 6.941 6.782 6.522 6.155 5.616 4.858 3.77 2.129 -0.552 -3.64 -6.15 -8.298 -10.095 -11.612 -12.913 -14.093 -15.119 -16.145 -17.04 -17.822 -18.56 -19.257 -19.872 -20.433 -21.03 -21.561 -22.025 -22.51 -23.008 -23.434 -23.886 -24.329 -24.672 -25.034 -25.425 -25.847 -26.289 -26.599 -26.922 -27.454 -27.826 -28.193 -28.393 -28.819 -29.228 -29.686 -29.935 -30.299 -30.697 -30.973 -31.274 -31.929 -32.3 -32.695 -33.104 -33.588 -34.222 -35.051 -37.513 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_20.txt deleted file mode 100644 index 18497fc7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_20.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26240 ,TETRA ,17621318,Tue Nov 30 16:26:42 CET,Tue Nov 30 18:57:00 CET,0.0 3.761 4.464 4.97 5.374 5.707 6.001 6.263 6.721 6.934 7.139 7.407 7.671 7.836 8.135 8.404 8.651 8.769 8.998 9.215 9.523 9.721 9.918 10.186 10.434 10.678 10.908 11.127 11.402 11.67 11.925 12.227 12.514 12.78 13.066 13.385 13.697 14.02 14.365 14.744 15.114 15.494 15.939 16.359 16.85 17.379 17.891 18.416 18.903 19.17 18.919 18.176 17.378 16.614 15.903 15.241 14.628 14.034 13.476 12.887 12.396 11.967 11.553 11.158 10.793 10.452 10.078 9.728 9.424 9.117 8.78 8.494 8.201 7.877 7.623 7.359 7.071 6.772 6.462 6.248 6.013 5.6 5.306 5.01 4.858 4.529 4.156 3.755 3.538 3.215 2.86 2.608 2.323 1.682 1.312 0.898 0.425 -0.135 -0.831 -1.77 -4.292 -2 ,25982 ,TETRA ,17621319,Tue Nov 30 16:26:46 CET,Tue Nov 30 18:52:12 CET,0.0 3.836 4.685 5.2 5.607 5.933 6.234 6.509 6.998 7.217 7.42 7.696 7.958 8.107 8.397 8.678 8.937 9.053 9.277 9.497 9.805 10.0 10.184 10.443 10.683 10.915 11.146 11.366 11.643 11.902 12.145 12.44 12.718 12.975 13.261 13.576 13.865 14.179 14.517 14.865 15.22 15.61 16.031 16.405 16.811 17.224 17.666 18.145 18.583 18.883 19.001 18.656 18.121 17.518 16.894 16.297 15.7 15.131 14.627 14.089 13.637 13.229 12.82 12.43 12.055 11.699 11.31 10.948 10.635 10.318 9.985 9.713 9.422 9.098 8.841 8.573 8.299 8.003 7.682 7.458 7.223 6.846 6.578 6.291 6.141 5.824 5.477 5.09 4.89 4.581 4.236 3.986 3.715 3.14 2.816 2.442 1.991 1.488 0.883 0.058 -2.317 -3 ,20240 ,TETRA ,17621320,Tue Nov 30 16:26:43 CET,Tue Nov 30 18:55:54 CET,0.0 4.171 4.983 5.525 5.975 6.37 6.702 6.98 7.5 7.74 7.951 8.209 8.489 8.665 9.001 9.303 9.587 9.732 10.015 10.275 10.624 10.841 11.046 11.35 11.637 11.896 12.138 12.365 12.665 12.955 13.236 13.574 13.877 14.152 14.469 14.809 15.132 15.476 15.835 16.228 16.632 17.049 17.492 17.912 18.377 18.878 19.383 19.875 20.346 20.684 20.77 20.425 19.888 19.227 18.494 17.748 17.06 16.455 15.931 15.364 14.843 14.369 13.925 13.497 13.088 12.714 12.316 11.955 11.644 11.322 10.973 10.661 10.324 9.994 9.736 9.457 9.176 8.864 8.522 8.291 8.058 7.693 7.422 7.121 6.962 6.636 6.286 5.895 5.682 5.352 4.942 4.685 4.419 3.823 3.492 3.106 2.659 2.142 1.582 0.809 -1.848 -4 ,21620 ,TETRA ,17621321,Tue Nov 30 16:26:46 CET,Tue Nov 30 18:52:29 CET,0.0 5.174 5.926 6.485 6.931 7.297 7.617 7.912 8.43 8.66 8.876 9.151 9.415 9.574 9.887 10.164 10.413 10.53 10.764 10.993 11.299 11.496 11.689 11.952 12.197 12.436 12.666 12.89 13.184 13.461 13.717 14.006 14.279 14.545 14.841 15.159 15.452 15.762 16.087 16.42 16.777 17.181 17.622 18.024 18.46 18.902 19.367 19.837 20.272 20.621 20.625 20.172 19.57 18.945 18.335 17.713 17.127 16.561 16.072 15.503 14.993 14.585 14.188 13.811 13.45 13.1 12.739 12.426 12.148 11.844 11.508 11.236 10.964 10.665 10.422 10.176 9.922 9.652 9.359 9.157 8.96 8.644 8.409 8.155 8.023 7.747 7.464 7.157 6.987 6.71 6.445 6.234 6.008 5.508 5.225 4.905 4.543 4.102 3.553 2.807 -1.081 -5 ,1511 ,TETRA ,17621322,Tue Nov 30 16:26:43 CET,Tue Nov 30 18:53:55 CET,0.0 2.894 3.696 4.269 4.739 5.13 5.472 5.778 6.316 6.547 6.756 7.051 7.334 7.513 7.839 8.132 8.398 8.531 8.795 9.029 9.35 9.555 9.755 10.055 10.33 10.571 10.805 11.041 11.34 11.624 11.888 12.175 12.448 12.717 13.016 13.327 13.621 13.94 14.271 14.61 14.948 15.329 15.792 16.244 16.747 17.247 17.712 18.149 18.549 18.818 18.874 18.487 17.919 17.314 16.66 16.006 15.398 14.808 14.283 13.747 13.262 12.812 12.377 11.969 11.579 11.193 10.769 10.395 10.079 9.739 9.361 9.047 8.729 8.388 8.114 7.827 7.537 7.244 6.923 6.693 6.444 6.048 5.781 5.5 5.347 5.041 4.722 4.354 4.157 3.847 3.478 3.223 2.969 2.425 2.091 1.705 1.285 0.811 0.229 -0.615 -3.427 -6 ,14549 ,TETRA ,17621323,Tue Nov 30 16:26:46 CET,Tue Nov 30 18:52:37 CET,0.0 3.092 3.956 4.561 5.042 5.446 5.806 6.126 6.662 6.893 7.11 7.414 7.692 7.863 8.192 8.487 8.766 8.899 9.148 9.389 9.73 9.938 10.135 10.415 10.677 10.937 11.182 11.413 11.707 11.994 12.269 12.577 12.85 13.105 13.403 13.731 14.037 14.354 14.685 15.025 15.351 15.701 16.093 16.465 16.887 17.316 17.744 18.136 18.437 18.587 18.456 17.901 17.261 16.599 15.958 15.305 14.679 14.101 13.609 13.102 12.634 12.197 11.765 11.351 10.956 10.602 10.226 9.877 9.569 9.243 8.906 8.608 8.271 7.92 7.653 7.368 7.066 6.751 6.413 6.178 5.934 5.539 5.247 4.942 4.785 4.445 4.069 3.663 3.455 3.129 2.739 2.474 2.2 1.565 1.206 0.843 0.436 -0.078 -0.711 -1.614 -4.304 -7 ,29570 ,TETRA ,17621324,Tue Nov 30 16:26:44 CET,Tue Nov 30 18:39:11 CET,0.0 3.449 4.198 4.699 5.094 5.452 5.766 6.05 6.55 6.76 6.963 7.246 7.503 7.653 7.944 8.233 8.498 8.627 8.889 9.136 9.469 9.675 9.87 10.133 10.38 10.628 10.867 11.087 11.355 11.607 11.838 12.107 12.377 12.63 12.902 13.2 13.479 13.781 14.107 14.44 14.775 15.134 15.549 15.957 16.394 16.818 17.261 17.706 18.107 18.432 18.583 18.243 17.624 17.007 16.412 15.826 15.299 14.789 14.315 13.8 13.347 12.929 12.513 12.109 11.699 11.293 10.861 10.489 10.179 9.847 9.481 9.173 8.843 8.478 8.195 7.912 7.622 7.324 7.015 6.793 6.557 6.182 5.911 5.619 5.463 5.128 4.767 4.387 4.187 3.873 3.515 3.268 3.001 2.374 2.009 1.619 1.188 0.692 0.091 -0.72 -3.279 -8 ,11467 ,TETRA ,17621325,Tue Nov 30 16:26:46 CET,Tue Nov 30 18:29:51 CET,0.0 3.452 4.122 4.639 5.068 5.43 5.759 6.047 6.543 6.765 6.972 7.248 7.519 7.682 7.992 8.284 8.555 8.68 8.914 9.139 9.463 9.663 9.857 10.122 10.37 10.621 10.857 11.077 11.358 11.62 11.854 12.121 12.39 12.649 12.951 13.287 13.59 13.904 14.232 14.605 14.987 15.39 15.852 16.282 16.754 17.241 17.761 18.31 18.82 19.168 19.195 18.777 18.206 17.552 16.906 16.278 15.692 15.159 14.663 14.157 13.719 13.313 12.923 12.524 12.134 11.772 11.371 10.994 10.674 10.354 9.993 9.685 9.369 9.021 8.756 8.492 8.22 7.931 7.619 7.396 7.147 6.759 6.49 6.197 6.045 5.729 5.387 5.021 4.833 4.532 4.163 3.91 3.657 3.086 2.758 2.386 1.978 1.53 0.981 0.239 -1.713 -9 ,17329 ,TETRA ,17621326,Tue Nov 30 16:26:46 CET,Tue Nov 30 18:46:48 CET,0.0 2.963 3.645 4.144 4.562 4.909 5.214 5.486 5.955 6.173 6.385 6.666 6.928 7.085 7.388 7.662 7.92 8.046 8.276 8.492 8.793 8.982 9.166 9.437 9.698 9.961 10.215 10.434 10.713 10.979 11.226 11.511 11.768 12.024 12.322 12.632 12.923 13.236 13.548 13.871 14.207 14.559 14.94 15.307 15.724 16.157 16.564 16.947 17.367 17.74 17.755 17.249 16.618 15.956 15.33 14.756 14.203 13.662 13.166 12.638 12.165 11.738 11.326 10.918 10.54 10.199 9.832 9.505 9.223 8.91 8.572 8.276 7.966 7.65 7.4 7.138 6.855 6.563 6.265 6.054 5.826 5.456 5.202 4.943 4.805 4.493 4.152 3.8 3.611 3.31 2.976 2.741 2.501 1.983 1.685 1.359 1.0 0.566 0.054 -0.64 -2.311 -10 ,5654 ,TETRA ,17621327,Tue Nov 30 16:26:46 CET,Tue Nov 30 18:48:02 CET,0.0 2.292 3.069 3.623 4.067 4.435 4.765 5.057 5.53 5.742 5.947 6.214 6.474 6.632 6.938 7.215 7.467 7.59 7.821 8.042 8.347 8.533 8.709 8.97 9.219 9.443 9.662 9.87 10.126 10.366 10.599 10.882 11.152 11.413 11.714 12.041 12.348 12.677 13.02 13.367 13.705 14.049 14.421 14.781 15.175 15.592 16.04 16.514 16.952 17.234 17.3 16.928 16.32 15.689 15.077 14.474 13.9 13.352 12.855 12.338 11.882 11.465 11.088 10.742 10.4 10.077 9.751 9.441 9.166 8.888 8.588 8.325 8.032 7.688 7.411 7.145 6.881 6.606 6.315 6.109 5.859 5.428 5.138 4.83 4.66 4.309 3.96 3.592 3.392 3.066 2.656 2.375 2.09 1.466 1.11 0.708 0.248 -0.273 -0.93 -1.809 -4.55 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_49.txt deleted file mode 100644 index 975c9162..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3704 ,TETRA ,17621328,Tue Nov 30 16:27:31 CET,Tue Nov 30 18:54:28 CET,0.0 1.593 2.111 2.517 2.85 3.129 3.373 3.595 3.964 4.123 4.277 4.453 4.67 4.786 5.01 5.204 5.378 5.466 5.626 5.77 5.967 6.09 6.21 6.369 6.53 6.677 6.789 6.912 7.066 7.201 7.329 7.471 7.592 7.695 7.803 7.92 8.029 8.131 8.216 8.298 8.373 8.431 8.448 8.443 8.396 8.239 7.988 7.602 6.94 5.826 3.903 1.5 -0.487 -2.144 -3.554 -4.785 -5.861 -6.822 -7.659 -8.491 -9.189 -9.816 -10.418 -11.032 -11.612 -12.132 -12.7 -13.212 -13.643 -14.083 -14.531 -14.904 -15.32 -15.75 -16.082 -16.451 -16.838 -17.216 -17.61 -17.89 -18.19 -18.677 -19.009 -19.351 -19.526 -19.879 -20.26 -20.679 -20.905 -21.271 -21.671 -21.952 -22.253 -22.925 -23.305 -23.706 -24.126 -24.607 -25.164 -25.9 -27.684 -2 ,5469 ,TETRA ,17621329,Tue Nov 30 16:27:31 CET,Tue Nov 30 18:55:30 CET,0.0 1.611 2.132 2.51 2.814 3.073 3.299 3.501 3.865 4.03 4.185 4.392 4.626 4.746 4.959 5.152 5.341 5.433 5.596 5.736 5.942 6.073 6.191 6.354 6.507 6.649 6.773 6.891 7.038 7.168 7.286 7.415 7.534 7.647 7.762 7.882 7.981 8.066 8.148 8.227 8.288 8.314 8.301 8.253 8.153 8.002 7.756 7.364 6.729 5.631 3.605 1.127 -0.784 -2.348 -3.71 -4.946 -6.016 -6.966 -7.781 -8.58 -9.276 -9.922 -10.549 -11.141 -11.688 -12.199 -12.74 -13.223 -13.651 -14.084 -14.52 -14.893 -15.288 -15.696 -16.01 -16.341 -16.7 -17.077 -17.478 -17.768 -18.058 -18.505 -18.835 -19.195 -19.398 -19.823 -20.259 -20.734 -20.974 -21.328 -21.719 -22.003 -22.3 -22.952 -23.308 -23.705 -24.161 -24.674 -25.281 -26.118 -28.945 -3 ,16804 ,TETRA ,17621330,Tue Nov 30 16:27:34 CET,Tue Nov 30 18:54:08 CET,0.0 1.513 2.01 2.386 2.706 2.959 3.184 3.401 3.792 3.971 4.133 4.301 4.515 4.632 4.856 5.062 5.241 5.323 5.492 5.656 5.873 6.0 6.113 6.263 6.402 6.539 6.665 6.776 6.918 7.053 7.164 7.285 7.397 7.507 7.617 7.723 7.817 7.909 7.978 8.026 8.063 8.083 8.097 8.058 7.931 7.734 7.454 7.003 6.269 5.114 3.034 0.4 -1.766 -3.573 -5.075 -6.382 -7.509 -8.524 -9.412 -10.282 -11.002 -11.665 -12.321 -12.955 -13.548 -14.067 -14.607 -15.089 -15.5 -15.946 -16.411 -16.781 -17.178 -17.604 -17.944 -18.317 -18.703 -19.096 -19.512 -19.796 -20.079 -20.531 -20.85 -21.18 -21.352 -21.707 -22.08 -22.468 -22.673 -23.017 -23.384 -23.643 -23.923 -24.53 -24.857 -25.222 -25.629 -26.092 -26.687 -27.532 -30.638 -4 ,20951 ,TETRA ,17621331,Tue Nov 30 16:27:31 CET,Tue Nov 30 18:52:30 CET,0.0 1.725 2.241 2.627 2.924 3.18 3.413 3.62 3.993 4.168 4.325 4.517 4.744 4.868 5.094 5.285 5.461 5.546 5.709 5.855 6.044 6.165 6.28 6.441 6.587 6.722 6.851 6.973 7.123 7.254 7.371 7.507 7.625 7.725 7.849 7.979 8.082 8.192 8.304 8.401 8.476 8.534 8.548 8.491 8.385 8.216 7.927 7.459 6.712 5.49 3.431 1.017 -0.969 -2.638 -4.068 -5.362 -6.481 -7.474 -8.344 -9.206 -9.943 -10.602 -11.253 -11.871 -12.45 -12.984 -13.527 -14.009 -14.433 -14.881 -15.344 -15.728 -16.126 -16.551 -16.888 -17.229 -17.584 -17.96 -18.351 -18.628 -18.921 -19.372 -19.676 -19.991 -20.165 -20.535 -20.923 -21.343 -21.567 -21.922 -22.288 -22.553 -22.83 -23.473 -23.835 -24.213 -24.643 -25.167 -25.829 -26.707 -29.386 -5 ,12027 ,TETRA ,17621332,Tue Nov 30 16:27:33 CET,Tue Nov 30 18:54:18 CET,0.0 1.448 1.976 2.351 2.637 2.896 3.134 3.348 3.718 3.877 4.028 4.199 4.423 4.549 4.77 4.968 5.156 5.242 5.402 5.556 5.772 5.91 6.037 6.2 6.353 6.496 6.626 6.751 6.912 7.054 7.169 7.295 7.406 7.508 7.614 7.723 7.815 7.896 7.97 8.026 8.072 8.125 8.155 8.131 8.03 7.839 7.571 7.145 6.42 5.264 3.181 0.754 -1.256 -3.025 -4.489 -5.764 -6.892 -7.953 -8.881 -9.766 -10.499 -11.19 -11.873 -12.511 -13.113 -13.67 -14.232 -14.741 -15.208 -15.699 -16.195 -16.596 -17.009 -17.453 -17.812 -18.174 -18.558 -18.964 -19.386 -19.676 -19.959 -20.39 -20.712 -21.075 -21.267 -21.664 -22.082 -22.535 -22.768 -23.125 -23.51 -23.778 -24.063 -24.727 -25.093 -25.494 -25.971 -26.511 -27.146 -27.998 -30.477 -6 ,16709 ,TETRA ,17621333,Tue Nov 30 16:27:31 CET,Tue Nov 30 18:53:23 CET,0.0 1.536 2.053 2.449 2.763 3.023 3.253 3.462 3.831 3.994 4.158 4.355 4.579 4.7 4.927 5.129 5.316 5.4 5.557 5.718 5.943 6.069 6.182 6.343 6.49 6.624 6.751 6.867 7.005 7.136 7.254 7.386 7.508 7.617 7.74 7.873 7.98 8.074 8.17 8.264 8.347 8.407 8.405 8.39 8.338 8.223 8.005 7.586 6.887 5.754 3.692 1.172 -0.807 -2.481 -3.954 -5.273 -6.494 -7.628 -8.53 -9.376 -10.105 -10.744 -11.358 -11.948 -12.485 -12.97 -13.485 -13.953 -14.373 -14.821 -15.295 -15.687 -16.108 -16.557 -16.891 -17.24 -17.618 -18.021 -18.457 -18.755 -19.052 -19.515 -19.847 -20.211 -20.391 -20.755 -21.163 -21.596 -21.816 -22.164 -22.55 -22.823 -23.113 -23.759 -24.111 -24.483 -24.908 -25.406 -26.012 -26.839 -29.255 -7 ,8430 ,TETRA ,17621334,Tue Nov 30 16:27:31 CET,Tue Nov 30 18:57:52 CET,0.0 1.62 2.126 2.485 2.798 3.067 3.296 3.519 3.91 4.076 4.231 4.424 4.649 4.768 4.981 5.168 5.348 5.432 5.588 5.733 5.932 6.058 6.179 6.349 6.498 6.627 6.746 6.864 7.018 7.154 7.268 7.392 7.504 7.608 7.717 7.839 7.947 8.056 8.168 8.267 8.33 8.357 8.344 8.296 8.197 7.999 7.708 7.273 6.59 5.566 3.707 1.354 -0.603 -2.275 -3.714 -4.971 -6.053 -7.028 -7.837 -8.676 -9.422 -10.072 -10.699 -11.294 -11.848 -12.368 -12.914 -13.397 -13.829 -14.286 -14.75 -15.136 -15.539 -15.963 -16.287 -16.62 -16.988 -17.385 -17.804 -18.091 -18.39 -18.856 -19.181 -19.522 -19.693 -20.063 -20.463 -20.89 -21.115 -21.458 -21.801 -22.059 -22.33 -22.94 -23.281 -23.648 -24.053 -24.521 -25.101 -25.902 -29.657 -8 ,8395 ,TETRA ,17621335,Tue Nov 30 16:27:33 CET,Tue Nov 30 18:58:23 CET,0.0 1.706 2.238 2.633 2.959 3.243 3.482 3.694 4.077 4.252 4.412 4.588 4.804 4.916 5.123 5.313 5.485 5.565 5.728 5.881 6.094 6.231 6.356 6.522 6.667 6.801 6.932 7.059 7.205 7.363 7.515 7.662 7.791 7.899 8.015 8.138 8.239 8.345 8.438 8.512 8.573 8.609 8.596 8.555 8.477 8.339 8.098 7.691 7.083 6.126 4.358 2.146 0.267 -1.423 -2.851 -4.093 -5.183 -6.172 -7.054 -7.93 -8.662 -9.322 -9.946 -10.528 -11.082 -11.598 -12.154 -12.68 -13.142 -13.609 -14.092 -14.496 -14.923 -15.367 -15.726 -16.103 -16.467 -16.856 -17.265 -17.545 -17.841 -18.293 -18.608 -18.948 -19.128 -19.508 -19.912 -20.336 -20.559 -20.921 -21.33 -21.609 -21.907 -22.542 -22.887 -23.262 -23.67 -24.144 -24.736 -25.545 -28.355 -9 ,9855 ,TETRA ,17621336,Tue Nov 30 16:27:32 CET,Tue Nov 30 18:55:23 CET,0.0 1.554 2.084 2.497 2.834 3.126 3.372 3.585 3.969 4.143 4.298 4.487 4.712 4.828 5.053 5.256 5.436 5.52 5.677 5.823 6.018 6.149 6.287 6.465 6.625 6.781 6.924 7.05 7.191 7.321 7.445 7.594 7.728 7.844 7.961 8.086 8.2 8.29 8.357 8.414 8.472 8.518 8.527 8.493 8.402 8.243 7.971 7.551 6.861 5.713 3.692 1.248 -0.736 -2.413 -3.868 -5.211 -6.384 -7.435 -8.336 -9.217 -9.968 -10.639 -11.305 -11.931 -12.483 -12.997 -13.542 -14.023 -14.455 -14.902 -15.363 -15.755 -16.172 -16.619 -16.955 -17.298 -17.673 -18.054 -18.45 -18.742 -19.044 -19.506 -19.826 -20.151 -20.326 -20.699 -21.083 -21.505 -21.732 -22.087 -22.469 -22.733 -23.013 -23.632 -23.989 -24.417 -24.885 -25.393 -26.012 -26.828 -29.28 -10 ,5796 ,TETRA ,17621337,Tue Nov 30 16:27:34 CET,Tue Nov 30 18:52:59 CET,0.0 1.302 1.821 2.201 2.491 2.743 2.976 3.208 3.622 3.8 3.96 4.15 4.376 4.494 4.715 4.909 5.082 5.168 5.342 5.502 5.721 5.856 5.969 6.12 6.266 6.398 6.519 6.633 6.783 6.932 7.054 7.173 7.278 7.374 7.492 7.622 7.726 7.826 7.919 7.994 8.054 8.088 8.095 8.083 8.026 7.862 7.574 7.153 6.458 5.328 3.418 0.995 -1.0 -2.603 -3.996 -5.272 -6.383 -7.374 -8.214 -9.055 -9.794 -10.457 -11.092 -11.695 -12.251 -12.762 -13.287 -13.749 -14.151 -14.574 -15.026 -15.397 -15.776 -16.185 -16.502 -16.819 -17.153 -17.5 -17.875 -18.147 -18.422 -18.849 -19.154 -19.477 -19.646 -20.022 -20.414 -20.833 -21.07 -21.434 -21.803 -22.071 -22.358 -22.981 -23.336 -23.729 -24.163 -24.667 -25.305 -26.169 -28.64 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_39.txt deleted file mode 100644 index 6ec16642..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2438 ,TETRA ,17621338,Tue Nov 30 16:27:31 CET,Tue Nov 30 18:58:46 CET,0.0 1.791 2.431 2.858 3.187 3.459 3.722 3.985 4.452 4.643 4.81 4.985 5.256 5.4 5.663 5.91 6.149 6.271 6.514 6.751 7.084 7.286 7.48 7.758 8.013 8.255 8.486 8.711 8.998 9.273 9.534 9.836 10.127 10.408 10.708 11.033 11.351 11.692 12.057 12.411 12.717 13.034 13.388 13.763 14.221 14.663 15.075 15.495 15.94 16.325 16.556 16.397 16.011 15.543 15.113 14.678 14.252 13.844 13.498 13.151 12.811 12.504 12.216 11.918 11.634 11.379 11.115 10.884 10.664 10.431 10.184 9.97 9.752 9.517 9.329 9.137 8.923 8.697 8.463 8.29 8.113 7.825 7.608 7.392 7.283 7.05 6.805 6.537 6.396 6.132 5.952 5.779 5.591 5.164 4.927 4.67 4.38 4.043 3.631 3.067 1.546 -2 ,8391 ,TETRA ,17621339,Tue Nov 30 16:27:31 CET,Tue Nov 30 18:55:17 CET,0.0 1.927 2.473 2.888 3.259 3.577 3.85 4.105 4.562 4.768 4.958 5.172 5.452 5.602 5.875 6.126 6.367 6.484 6.703 6.906 7.187 7.365 7.543 7.793 8.025 8.237 8.44 8.632 8.869 9.099 9.321 9.592 9.855 10.108 10.374 10.645 10.902 11.187 11.479 11.76 12.047 12.362 12.717 13.064 13.479 13.929 14.378 14.843 15.317 15.717 15.97 15.846 15.496 15.103 14.706 14.282 13.853 13.443 13.082 12.726 12.411 12.113 11.83 11.556 11.291 11.046 10.775 10.517 10.278 10.027 9.781 9.565 9.333 9.096 8.905 8.711 8.506 8.291 8.07 7.901 7.723 7.446 7.244 7.02 6.903 6.66 6.404 6.134 5.984 5.694 5.475 5.302 5.119 4.685 4.43 4.166 3.865 3.519 3.117 2.558 0.707 -3 ,9879 ,TETRA ,17621340,Tue Nov 30 16:27:33 CET,Tue Nov 30 18:55:38 CET,0.0 1.901 2.504 2.945 3.31 3.625 3.894 4.134 4.555 4.743 4.927 5.142 5.42 5.574 5.856 6.108 6.339 6.449 6.662 6.865 7.145 7.316 7.486 7.734 7.962 8.177 8.38 8.578 8.834 9.061 9.273 9.528 9.775 10.008 10.26 10.544 10.821 11.101 11.402 11.717 12.017 12.341 12.702 13.053 13.438 13.841 14.273 14.73 15.241 15.719 15.935 15.741 15.43 15.064 14.663 14.264 13.889 13.516 13.173 12.816 12.501 12.21 11.923 11.646 11.393 11.138 10.86 10.61 10.375 10.116 9.836 9.602 9.358 9.1 8.899 8.687 8.46 8.221 7.978 7.812 7.631 7.335 7.131 6.917 6.807 6.564 6.298 6.025 5.884 5.606 5.391 5.211 5.016 4.562 4.307 4.018 3.701 3.328 2.877 2.286 0.527 -4 ,17703 ,TETRA ,17621341,Tue Nov 30 16:27:34 CET,Tue Nov 30 18:53:03 CET,0.0 2.236 2.913 3.361 3.723 4.046 4.327 4.579 5.045 5.245 5.425 5.622 5.888 6.032 6.323 6.578 6.811 6.92 7.135 7.342 7.625 7.804 7.976 8.209 8.427 8.637 8.842 9.032 9.277 9.508 9.731 9.999 10.233 10.451 10.71 10.998 11.263 11.545 11.835 12.133 12.451 12.796 13.165 13.521 13.934 14.384 14.865 15.323 15.792 16.22 16.496 16.379 16.012 15.633 15.253 14.847 14.456 14.118 13.807 13.471 13.163 12.866 12.594 12.329 12.06 11.805 11.536 11.287 11.066 10.833 10.576 10.363 10.145 9.91 9.722 9.521 9.312 9.097 8.866 8.703 8.537 8.268 8.062 7.847 7.739 7.513 7.269 7.008 6.864 6.583 6.38 6.204 6.008 5.585 5.353 5.085 4.774 4.427 4.021 3.451 1.626 -5 ,11232 ,TETRA ,17621342,Tue Nov 30 16:27:33 CET,Tue Nov 30 18:54:57 CET,0.0 2.014 2.62 3.089 3.477 3.803 4.094 4.356 4.801 4.994 5.166 5.352 5.628 5.782 6.049 6.304 6.552 6.67 6.886 7.081 7.365 7.541 7.707 7.938 8.156 8.366 8.57 8.763 8.995 9.214 9.422 9.672 9.923 10.16 10.422 10.702 10.955 11.223 11.503 11.799 12.107 12.432 12.794 13.157 13.566 13.969 14.394 14.85 15.302 15.683 15.843 15.665 15.407 15.108 14.778 14.436 14.079 13.723 13.413 13.061 12.728 12.434 12.148 11.875 11.625 11.38 11.109 10.858 10.638 10.408 10.159 9.961 9.747 9.517 9.344 9.154 8.954 8.75 8.539 8.378 8.193 7.9 7.699 7.489 7.385 7.17 6.937 6.68 6.545 6.291 6.097 5.918 5.733 5.309 5.065 4.807 4.518 4.182 3.787 3.255 1.408 -6 ,855 ,TETRA ,17621343,Tue Nov 30 16:27:33 CET,Tue Nov 30 18:55:58 CET,0.0 1.981 2.582 3.045 3.413 3.736 4.03 4.285 4.72 4.91 5.091 5.298 5.567 5.716 5.994 6.256 6.506 6.616 6.819 7.021 7.319 7.498 7.669 7.915 8.143 8.353 8.55 8.735 8.979 9.212 9.424 9.667 9.903 10.132 10.392 10.682 10.956 11.238 11.52 11.813 12.118 12.447 12.806 13.14 13.529 13.953 14.39 14.862 15.354 15.814 16.081 15.968 15.666 15.232 14.783 14.377 13.986 13.6 13.273 12.923 12.591 12.285 11.987 11.696 11.422 11.173 10.907 10.668 10.452 10.219 9.971 9.757 9.536 9.307 9.121 8.929 8.733 8.524 8.293 8.131 7.959 7.673 7.476 7.273 7.165 6.936 6.689 6.432 6.295 6.022 5.823 5.651 5.46 5.033 4.801 4.556 4.269 3.935 3.527 2.971 1.222 -7 ,32229 ,TETRA ,17621344,Tue Nov 30 16:27:35 CET,Tue Nov 30 18:57:25 CET,0.0 1.776 2.414 2.891 3.261 3.57 3.851 4.105 4.548 4.758 4.952 5.154 5.432 5.584 5.867 6.117 6.337 6.444 6.675 6.901 7.196 7.376 7.553 7.811 8.042 8.253 8.45 8.641 8.884 9.112 9.335 9.599 9.857 10.106 10.364 10.637 10.904 11.182 11.477 11.796 12.123 12.463 12.847 13.215 13.593 14.005 14.475 14.947 15.452 15.947 16.259 16.148 15.763 15.288 14.858 14.408 13.963 13.555 13.225 12.91 12.618 12.328 12.033 11.748 11.467 11.21 10.944 10.687 10.469 10.231 9.962 9.731 9.477 9.216 9.024 8.827 8.617 8.398 8.169 8.004 7.823 7.527 7.321 7.1 6.986 6.748 6.488 6.212 6.063 5.791 5.589 5.413 5.235 4.836 4.603 4.337 4.019 3.65 3.199 2.589 0.345 -8 ,28053 ,TETRA ,17621345,Tue Nov 30 16:27:33 CET,Tue Nov 30 19:02:42 CET,0.0 2.299 2.901 3.35 3.755 4.108 4.426 4.714 5.218 5.454 5.667 5.92 6.218 6.38 6.678 6.96 7.218 7.336 7.547 7.745 8.04 8.22 8.389 8.632 8.865 9.091 9.298 9.487 9.73 9.969 10.194 10.467 10.73 10.975 11.246 11.536 11.796 12.071 12.367 12.678 12.986 13.328 13.712 14.084 14.515 14.939 15.383 15.865 16.335 16.783 17.094 16.961 16.573 16.105 15.694 15.312 14.931 14.564 14.254 13.935 13.626 13.339 13.054 12.751 12.462 12.193 11.887 11.613 11.379 11.137 10.897 10.697 10.468 10.224 10.039 9.848 9.651 9.445 9.216 9.049 8.873 8.587 8.384 8.173 8.061 7.829 7.578 7.295 7.146 6.864 6.652 6.478 6.289 5.862 5.615 5.337 5.02 4.659 4.23 3.632 1.784 -9 ,17014 ,TETRA ,17621346,Tue Nov 30 16:27:34 CET,Tue Nov 30 19:04:19 CET,0.0 2.015 2.589 3.023 3.383 3.699 3.994 4.253 4.739 4.968 5.17 5.417 5.692 5.839 6.125 6.375 6.615 6.729 6.948 7.157 7.448 7.625 7.795 8.046 8.276 8.498 8.708 8.894 9.127 9.352 9.57 9.846 10.109 10.344 10.602 10.882 11.15 11.443 11.746 12.036 12.351 12.718 13.066 13.402 13.821 14.248 14.705 15.165 15.592 16.009 16.381 16.43 16.18 15.831 15.435 15.05 14.711 14.367 14.035 13.664 13.339 13.054 12.775 12.507 12.243 11.988 11.724 11.491 11.289 11.066 10.822 10.623 10.409 10.185 10.009 9.818 9.619 9.405 9.158 8.993 8.828 8.555 8.364 8.163 8.059 7.823 7.56 7.291 7.153 6.895 6.713 6.54 6.348 5.934 5.699 5.446 5.172 4.841 4.396 3.819 2.202 -10 ,7713 ,TETRA ,17621347,Tue Nov 30 16:27:34 CET,Tue Nov 30 18:50:03 CET,0.0 2.788 3.537 4.028 4.42 4.731 5.006 5.258 5.702 5.901 6.08 6.27 6.549 6.697 6.96 7.199 7.426 7.54 7.759 7.953 8.215 8.383 8.544 8.769 8.979 9.181 9.38 9.573 9.817 10.042 10.255 10.51 10.746 10.966 11.216 11.49 11.763 12.05 12.332 12.633 12.947 13.272 13.633 14.009 14.408 14.793 15.211 15.61 16.028 16.455 16.697 16.585 16.252 15.875 15.483 15.103 14.738 14.348 14.001 13.63 13.283 12.975 12.681 12.389 12.102 11.846 11.58 11.321 11.082 10.837 10.588 10.384 10.165 9.928 9.733 9.529 9.316 9.073 8.806 8.626 8.439 8.156 7.97 7.766 7.66 7.442 7.203 6.951 6.815 6.539 6.324 6.141 5.952 5.528 5.276 5.014 4.723 4.381 3.952 3.366 1.351 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_44.txt deleted file mode 100644 index 91389dcb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30682 ,TETRA ,17621348,Tue Nov 30 16:27:37 CET,Tue Nov 30 18:54:24 CET,0.0 1.763 2.462 2.979 3.366 3.717 4.044 4.339 4.886 5.139 5.377 5.676 5.995 6.19 6.566 6.923 7.254 7.415 7.726 8.022 8.44 8.712 8.96 9.305 9.64 9.963 10.285 10.595 10.988 11.374 11.738 12.167 12.584 13.001 13.486 14.016 14.527 15.082 15.671 16.31 17.005 17.803 18.723 19.639 20.723 21.927 23.318 24.95 26.926 29.372 32.502 35.215 36.912 38.041 38.764 39.269 39.63 39.906 40.093 40.234 40.321 40.371 40.4 40.408 40.405 40.391 40.363 40.309 40.241 40.163 40.069 39.997 39.92 39.814 39.719 39.624 39.524 39.408 39.272 39.175 39.069 38.872 38.736 38.595 38.512 38.336 38.144 37.942 37.837 37.637 37.461 37.322 37.172 36.815 36.615 36.385 36.125 35.843 35.476 34.975 33.198 -2 ,843 ,TETRA ,17621349,Tue Nov 30 16:27:33 CET,Tue Nov 30 18:50:52 CET,0.0 2.185 2.834 3.281 3.683 4.064 4.408 4.702 5.209 5.446 5.669 5.971 6.283 6.463 6.802 7.144 7.479 7.633 7.919 8.184 8.568 8.832 9.088 9.451 9.807 10.156 10.484 10.789 11.186 11.563 11.927 12.368 12.79 13.207 13.704 14.234 14.752 15.36 16.007 16.663 17.359 18.174 19.137 20.117 21.251 22.511 24.003 25.718 27.76 30.268 33.453 36.207 37.915 39.083 39.861 40.425 40.833 41.122 41.311 41.439 41.505 41.555 41.583 41.586 41.58 41.544 41.47 41.393 41.319 41.244 41.166 41.079 40.983 40.877 40.784 40.686 40.579 40.471 40.347 40.245 40.144 39.976 39.847 39.704 39.624 39.465 39.296 39.103 38.995 38.789 38.582 38.428 38.282 37.936 37.726 37.493 37.229 36.903 36.512 36.003 34.341 -3 ,4265 ,TETRA ,17621350,Tue Nov 30 16:27:37 CET,Tue Nov 30 18:53:44 CET,0.0 1.907 2.621 3.185 3.594 3.937 4.273 4.613 5.22 5.479 5.717 6.03 6.349 6.552 6.945 7.313 7.655 7.811 8.107 8.394 8.813 9.073 9.312 9.662 10.005 10.334 10.657 10.975 11.383 11.779 12.171 12.648 13.102 13.531 14.02 14.562 15.095 15.692 16.337 17.017 17.713 18.508 19.455 20.397 21.481 22.733 24.231 25.934 27.949 30.406 33.606 36.325 37.953 39.05 39.81 40.343 40.69 40.937 41.113 41.242 41.323 41.382 41.42 41.424 41.411 41.392 41.343 41.285 41.231 41.171 41.099 41.031 40.944 40.84 40.758 40.667 40.558 40.421 40.279 40.188 40.085 39.917 39.794 39.663 39.592 39.432 39.249 39.049 38.94 38.732 38.577 38.445 38.294 37.919 37.713 37.485 37.21 36.884 36.492 35.962 34.11 -4 ,12408 ,TETRA ,17621351,Tue Nov 30 16:27:37 CET,Tue Nov 30 18:52:35 CET,0.0 2.623 3.301 3.793 4.231 4.637 4.974 5.264 5.817 6.08 6.341 6.705 7.058 7.275 7.683 8.059 8.403 8.571 8.894 9.205 9.663 9.966 10.261 10.664 11.051 11.407 11.735 12.067 12.486 12.88 13.253 13.708 14.154 14.576 15.062 15.612 16.131 16.687 17.286 17.949 18.681 19.506 20.445 21.402 22.538 23.778 25.199 26.854 28.831 31.187 34.223 37.003 38.745 39.895 40.663 41.218 41.607 41.905 42.131 42.29 42.383 42.445 42.473 42.469 42.444 42.397 42.325 42.247 42.176 42.104 42.024 41.947 41.853 41.753 41.664 41.563 41.46 41.334 41.188 41.085 40.971 40.783 40.651 40.506 40.424 40.249 40.069 39.858 39.73 39.515 39.346 39.2 39.046 38.703 38.512 38.298 38.047 37.732 37.338 36.809 35.171 -5 ,18043 ,TETRA ,17621352,Tue Nov 30 16:27:37 CET,Tue Nov 30 18:33:12 CET,0.0 1.966 2.66 3.157 3.612 4.021 4.392 4.738 5.328 5.593 5.844 6.169 6.503 6.705 7.087 7.45 7.806 7.974 8.293 8.607 9.043 9.316 9.577 9.966 10.352 10.721 11.069 11.387 11.78 12.176 12.559 13.012 13.452 13.876 14.369 14.916 15.441 16.019 16.623 17.281 18.001 18.801 19.735 20.652 21.75 23.048 24.579 26.319 28.404 30.938 34.111 36.873 38.642 39.823 40.615 41.194 41.6 41.903 42.106 42.256 42.351 42.406 42.436 42.436 42.418 42.377 42.315 42.257 42.19 42.109 42.017 41.942 41.867 41.775 41.688 41.589 41.486 41.381 41.258 41.157 41.047 40.87 40.744 40.602 40.53 40.387 40.221 40.034 39.932 39.737 39.587 39.449 39.296 38.923 38.703 38.469 38.201 37.9 37.518 36.986 35.113 -6 ,9445 ,TETRA ,17621353,Tue Nov 30 16:27:37 CET,Tue Nov 30 18:54:37 CET,0.0 2.215 2.949 3.476 3.934 4.339 4.685 4.982 5.523 5.78 6.022 6.349 6.681 6.882 7.257 7.612 7.958 8.125 8.457 8.792 9.248 9.508 9.753 10.106 10.458 10.796 11.114 11.425 11.828 12.227 12.609 13.048 13.473 13.887 14.363 14.897 15.417 16.0 16.64 17.313 18.007 18.799 19.728 20.671 21.776 23.025 24.52 26.277 28.373 30.854 33.959 36.699 38.402 39.534 40.295 40.842 41.254 41.551 41.751 41.903 41.989 42.033 42.051 42.041 42.016 41.977 41.914 41.841 41.768 41.695 41.614 41.536 41.439 41.326 41.236 41.137 41.03 40.923 40.802 40.709 40.603 40.425 40.288 40.137 40.059 39.902 39.739 39.553 39.449 39.253 39.101 38.947 38.786 38.434 38.234 38.009 37.746 37.437 37.033 36.484 35.049 -7 ,7193 ,TETRA ,17621354,Tue Nov 30 16:27:37 CET,Tue Nov 30 18:53:06 CET,0.0 1.932 2.582 3.093 3.519 3.873 4.192 4.488 5.041 5.295 5.521 5.842 6.177 6.37 6.734 7.075 7.398 7.551 7.845 8.137 8.547 8.803 9.053 9.405 9.749 10.083 10.398 10.707 11.107 11.499 11.879 12.327 12.757 13.159 13.61 14.121 14.607 15.14 15.733 16.377 17.057 17.827 18.725 19.658 20.77 22.002 23.461 25.168 27.2 29.665 32.74 35.379 37.024 38.155 38.953 39.523 39.92 40.209 40.414 40.567 40.655 40.71 40.745 40.751 40.749 40.741 40.71 40.647 40.579 40.509 40.424 40.347 40.253 40.138 40.039 39.93 39.815 39.69 39.561 39.473 39.373 39.208 39.082 38.94 38.865 38.706 38.525 38.32 38.213 38.013 37.841 37.707 37.565 37.223 37.017 36.781 36.519 36.212 35.81 35.287 33.898 -8 ,28396 ,TETRA ,17621355,Tue Nov 30 16:27:37 CET,Tue Nov 30 18:53:15 CET,0.0 1.844 2.477 2.938 3.315 3.659 3.986 4.29 4.82 5.062 5.292 5.597 5.917 6.105 6.471 6.804 7.112 7.266 7.559 7.837 8.244 8.509 8.761 9.123 9.475 9.807 10.132 10.441 10.824 11.188 11.536 11.963 12.393 12.818 13.303 13.84 14.37 14.981 15.637 16.317 17.049 17.881 18.826 19.785 20.935 22.237 23.737 25.418 27.42 29.871 33.028 35.781 37.462 38.566 39.286 39.816 40.204 40.481 40.687 40.843 40.924 40.978 41.015 41.037 41.036 41.013 40.954 40.889 40.83 40.758 40.679 40.604 40.514 40.41 40.322 40.226 40.107 39.975 39.837 39.737 39.635 39.453 39.317 39.171 39.094 38.926 38.739 38.537 38.42 38.21 38.049 37.914 37.758 37.389 37.192 36.976 36.723 36.416 36.033 35.533 34.008 -9 ,31411 ,TETRA ,17621356,Tue Nov 30 16:27:37 CET,Tue Nov 30 18:52:23 CET,0.0 1.888 2.56 3.071 3.487 3.86 4.204 4.525 5.085 5.342 5.586 5.91 6.237 6.432 6.796 7.124 7.425 7.577 7.884 8.18 8.587 8.84 9.098 9.469 9.82 10.163 10.492 10.811 11.215 11.601 11.982 12.434 12.852 13.273 13.767 14.304 14.825 15.413 16.049 16.724 17.45 18.243 19.154 20.101 21.198 22.44 23.923 25.645 27.714 30.168 33.235 35.923 37.616 38.8 39.6 40.189 40.657 41.003 41.213 41.368 41.477 41.539 41.56 41.561 41.548 41.52 41.481 41.431 41.373 41.299 41.208 41.127 41.037 40.934 40.851 40.757 40.647 40.535 40.416 40.322 40.219 40.059 39.935 39.792 39.719 39.565 39.396 39.21 39.105 38.897 38.74 38.618 38.483 38.153 37.961 37.733 37.452 37.127 36.764 36.264 34.497 -10 ,4401 ,TETRA ,17621357,Tue Nov 30 16:27:37 CET,Tue Nov 30 18:51:56 CET,0.0 1.654 2.246 2.749 3.185 3.559 3.891 4.197 4.728 4.965 5.195 5.506 5.83 6.026 6.408 6.779 7.133 7.295 7.602 7.901 8.326 8.59 8.85 9.237 9.597 9.946 10.29 10.612 11.02 11.413 11.799 12.282 12.741 13.167 13.653 14.211 14.755 15.338 15.965 16.649 17.375 18.211 19.205 20.218 21.376 22.661 24.174 25.923 28.035 30.51 33.575 36.343 38.029 39.131 39.888 40.444 40.847 41.138 41.327 41.488 41.611 41.687 41.723 41.727 41.713 41.696 41.653 41.592 41.536 41.47 41.39 41.319 41.239 41.148 41.073 40.969 40.847 40.724 40.583 40.482 40.385 40.226 40.103 39.967 39.894 39.738 39.555 39.334 39.215 39.013 38.836 38.688 38.525 38.152 37.958 37.742 37.489 37.179 36.809 36.27 34.816 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_52_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_52_35.txt deleted file mode 100644 index 6cc64bb5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_52_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4972 ,TETRA ,17621358,Tue Nov 30 16:27:36 CET,Tue Nov 30 19:06:31 CET,0.0 1.949 2.558 2.989 3.32 3.608 3.85 4.073 4.473 4.652 4.819 5.013 5.262 5.4 5.647 5.877 6.091 6.19 6.383 6.563 6.828 7.002 7.159 7.379 7.587 7.774 7.953 8.129 8.359 8.588 8.802 9.04 9.265 9.49 9.743 10.02 10.281 10.558 10.841 11.133 11.442 11.787 12.148 12.468 12.821 13.217 13.64 14.058 14.507 14.894 15.003 14.738 14.385 13.905 13.37 12.834 12.343 11.88 11.45 11.033 10.677 10.319 9.933 9.57 9.243 8.927 8.57 8.261 8.014 7.736 7.436 7.191 6.942 6.681 6.464 6.23 5.979 5.713 5.439 5.251 5.053 4.736 4.512 4.276 4.154 3.923 3.686 3.409 3.255 3.0 2.792 2.615 2.421 1.985 1.715 1.419 1.079 0.65 0.167 -0.512 -3.394 -2 ,29802 ,TETRA ,17621359,Tue Nov 30 16:27:36 CET,Tue Nov 30 19:03:33 CET,0.0 1.771 2.381 2.786 3.122 3.422 3.674 3.906 4.316 4.492 4.656 4.845 5.088 5.217 5.464 5.696 5.917 6.021 6.215 6.404 6.672 6.833 6.988 7.211 7.425 7.628 7.819 7.998 8.235 8.467 8.676 8.91 9.136 9.359 9.614 9.893 10.159 10.453 10.748 11.052 11.358 11.684 12.041 12.369 12.739 13.146 13.558 13.958 14.371 14.695 14.831 14.636 14.208 13.693 13.183 12.641 12.131 11.675 11.258 10.824 10.451 10.105 9.755 9.406 9.069 8.76 8.42 8.117 7.866 7.613 7.337 7.093 6.848 6.583 6.366 6.125 5.865 5.588 5.296 5.096 4.893 4.568 4.336 4.114 3.996 3.748 3.482 3.169 3.003 2.722 2.43 2.216 1.998 1.533 1.269 0.946 0.581 0.162 -0.317 -0.984 -4.211 -3 ,13148 ,TETRA ,17621360,Tue Nov 30 16:58:33 CET,Tue Nov 30 19:31:46 CET,0.0 1.916 2.486 2.894 3.221 3.516 3.778 3.988 4.376 4.564 4.74 4.947 5.197 5.335 5.593 5.822 6.041 6.149 6.354 6.537 6.783 6.949 7.116 7.347 7.564 7.769 7.97 8.166 8.413 8.64 8.858 9.116 9.356 9.58 9.831 10.11 10.374 10.649 10.938 11.244 11.546 11.872 12.227 12.574 12.974 13.366 13.785 14.251 14.741 15.18 15.413 15.222 14.813 14.352 13.88 13.428 12.971 12.526 12.129 11.712 11.339 11.011 10.696 10.36 10.046 9.768 9.456 9.171 8.938 8.693 8.418 8.182 7.937 7.675 7.459 7.24 7.012 6.761 6.493 6.312 6.119 5.784 5.541 5.292 5.171 4.931 4.676 4.387 4.218 3.936 3.69 3.508 3.296 2.807 2.55 2.261 1.925 1.534 1.019 0.242 -2.799 -4 ,17089 ,TETRA ,17621361,Tue Nov 30 16:58:33 CET,Tue Nov 30 19:26:55 CET,0.0 2.044 2.646 3.063 3.39 3.68 3.944 4.175 4.573 4.749 4.913 5.097 5.347 5.491 5.767 6.006 6.228 6.335 6.541 6.746 7.045 7.221 7.385 7.626 7.842 8.043 8.23 8.408 8.644 8.865 9.067 9.326 9.573 9.796 10.056 10.324 10.559 10.82 11.098 11.389 11.681 12.009 12.364 12.685 13.048 13.454 13.906 14.306 14.654 14.97 15.105 14.897 14.524 14.057 13.608 13.153 12.698 12.257 11.848 11.452 11.096 10.732 10.369 10.027 9.694 9.375 9.044 8.743 8.481 8.217 7.942 7.704 7.457 7.187 6.965 6.736 6.5 6.246 5.983 5.808 5.633 5.346 5.131 4.904 4.783 4.533 4.258 3.948 3.786 3.512 3.267 3.08 2.863 2.37 2.079 1.753 1.404 0.979 0.478 -0.253 -2.98 -5 ,22343 ,TETRA ,17621362,Tue Nov 30 16:58:33 CET,Tue Nov 30 19:21:03 CET,0.0 1.56 2.12 2.53 2.849 3.116 3.35 3.56 3.946 4.121 4.284 4.474 4.721 4.853 5.094 5.325 5.536 5.638 5.841 6.027 6.284 6.449 6.61 6.842 7.062 7.266 7.457 7.637 7.858 8.061 8.257 8.482 8.7 8.921 9.165 9.42 9.666 9.926 10.197 10.479 10.762 11.069 11.417 11.751 12.104 12.463 12.852 13.246 13.686 14.122 14.36 14.22 13.833 13.373 12.86 12.312 11.811 11.347 10.936 10.495 10.092 9.724 9.362 9.014 8.688 8.386 8.06 7.758 7.481 7.189 6.886 6.631 6.362 6.085 5.871 5.628 5.354 5.066 4.779 4.584 4.38 4.068 3.845 3.602 3.472 3.209 2.937 2.614 2.426 2.119 1.789 1.554 1.311 0.742 0.422 0.068 -0.339 -0.786 -1.351 -2.165 -4.841 -6 ,17378 ,TETRA ,17621363,Tue Nov 30 16:58:33 CET,Tue Nov 30 19:27:10 CET,0.0 1.708 2.223 2.605 2.926 3.208 3.457 3.685 4.08 4.253 4.426 4.639 4.883 5.015 5.268 5.496 5.708 5.81 6.009 6.2 6.461 6.616 6.766 6.984 7.19 7.382 7.564 7.738 7.962 8.178 8.385 8.616 8.829 9.044 9.276 9.523 9.78 10.053 10.325 10.603 10.891 11.217 11.58 11.926 12.323 12.715 13.102 13.487 13.861 14.165 14.184 13.809 13.308 12.75 12.18 11.596 11.051 10.545 10.101 9.655 9.259 8.896 8.532 8.175 7.834 7.512 7.178 6.869 6.592 6.306 6.013 5.765 5.496 5.2 4.975 4.745 4.494 4.242 3.977 3.779 3.574 3.266 3.044 2.807 2.685 2.417 2.142 1.855 1.704 1.443 1.201 1.013 0.818 0.363 0.105 -0.173 -0.494 -0.879 -1.403 -2.17 -4.825 -7 ,26957 ,TETRA ,17621364,Tue Nov 30 16:58:33 CET,Tue Nov 30 19:26:46 CET,0.0 1.9 2.504 2.942 3.277 3.56 3.813 4.03 4.406 4.574 4.726 4.902 5.152 5.288 5.531 5.756 5.985 6.091 6.283 6.466 6.713 6.869 7.021 7.235 7.441 7.652 7.85 8.028 8.25 8.452 8.641 8.873 9.109 9.336 9.595 9.872 10.118 10.372 10.636 10.933 11.244 11.576 11.951 12.315 12.714 13.119 13.531 13.973 14.421 14.835 15.078 14.836 14.369 13.905 13.463 12.973 12.526 12.099 11.682 11.255 10.856 10.484 10.153 9.833 9.508 9.206 8.89 8.596 8.328 8.04 7.748 7.503 7.223 6.937 6.728 6.498 6.259 6.008 5.731 5.54 5.344 5.015 4.778 4.531 4.399 4.126 3.851 3.563 3.404 3.123 2.871 2.677 2.452 1.922 1.627 1.299 0.919 0.521 0.052 -0.647 -3.304 -8 ,17151 ,TETRA ,17621365,Tue Nov 30 17:00:33 CET,Tue Nov 30 19:28:02 CET,0.0 1.942 2.55 3.009 3.354 3.648 3.903 4.127 4.523 4.701 4.872 5.077 5.335 5.484 5.76 6.003 6.229 6.337 6.543 6.736 7.011 7.188 7.355 7.587 7.804 8.008 8.208 8.408 8.664 8.895 9.112 9.374 9.622 9.852 10.108 10.383 10.64 10.925 11.214 11.515 11.823 12.144 12.521 12.9 13.307 13.741 14.256 14.787 15.276 15.662 15.823 15.622 15.254 14.795 14.315 13.854 13.413 12.992 12.605 12.157 11.752 11.398 11.054 10.72 10.388 10.062 9.707 9.396 9.134 8.849 8.542 8.287 8.009 7.715 7.497 7.272 7.038 6.795 6.543 6.368 6.161 5.829 5.615 5.379 5.248 4.966 4.68 4.389 4.228 3.938 3.663 3.46 3.236 2.688 2.364 2.009 1.602 1.151 0.614 -0.17 -2.644 -9 ,31045 ,TETRA ,17621366,Tue Nov 30 16:58:34 CET,Tue Nov 30 19:24:57 CET,0.0 1.775 2.344 2.759 3.09 3.365 3.61 3.836 4.235 4.416 4.59 4.797 5.049 5.186 5.436 5.664 5.88 5.983 6.17 6.344 6.586 6.744 6.896 7.118 7.327 7.515 7.699 7.879 8.107 8.318 8.521 8.753 8.973 9.189 9.426 9.669 9.896 10.15 10.408 10.673 10.964 11.288 11.627 11.943 12.284 12.63 13.015 13.407 13.796 14.142 14.309 14.061 13.589 13.103 12.647 12.162 11.704 11.285 10.904 10.508 10.151 9.814 9.493 9.185 8.868 8.573 8.262 7.97 7.719 7.459 7.177 6.939 6.683 6.415 6.204 5.964 5.71 5.446 5.16 4.953 4.738 4.425 4.216 3.981 3.847 3.572 3.301 2.998 2.833 2.56 2.308 2.121 1.921 1.445 1.149 0.8 0.411 -0.011 -0.527 -1.261 -3.858 -10 ,27507 ,TETRA ,17621367,Tue Nov 30 16:58:35 CET,Tue Nov 30 19:25:37 CET,0.0 1.723 2.254 2.642 2.963 3.251 3.504 3.734 4.147 4.336 4.515 4.719 4.964 5.098 5.359 5.6 5.823 5.929 6.129 6.323 6.597 6.759 6.911 7.145 7.369 7.568 7.757 7.943 8.175 8.383 8.576 8.813 9.037 9.248 9.498 9.767 10.005 10.27 10.548 10.828 11.13 11.459 11.821 12.169 12.566 12.988 13.418 13.856 14.287 14.627 14.699 14.363 13.902 13.419 12.939 12.441 11.978 11.537 11.124 10.667 10.23 9.824 9.444 9.089 8.767 8.467 8.149 7.866 7.619 7.367 7.08 6.824 6.555 6.268 6.044 5.81 5.553 5.258 4.953 4.757 4.572 4.276 4.06 3.835 3.709 3.452 3.162 2.849 2.689 2.411 2.152 1.946 1.715 1.216 0.953 0.676 0.335 -0.083 -0.608 -1.412 -4.079 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_35.txt deleted file mode 100644 index c8944c6c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12006 ,TETRA ,17621368,Tue Nov 30 16:58:34 CET,Tue Nov 30 19:21:50 CET,0.0 1.633 2.151 2.565 2.886 3.153 3.386 3.589 3.964 4.145 4.321 4.535 4.775 4.905 5.15 5.37 5.578 5.676 5.871 6.062 6.341 6.516 6.676 6.887 7.091 7.29 7.481 7.67 7.917 8.145 8.35 8.583 8.81 9.028 9.267 9.538 9.799 10.078 10.376 10.68 10.984 11.32 11.684 12.025 12.433 12.889 13.356 13.839 14.308 14.697 15.018 14.867 14.474 14.07 13.675 13.224 12.719 12.182 11.689 11.181 10.724 10.298 9.865 9.417 9.004 8.634 8.235 7.844 7.477 7.096 6.705 6.38 6.045 5.678 5.381 5.066 4.726 4.38 4.012 3.747 3.484 3.072 2.778 2.467 2.305 1.955 1.553 1.108 0.87 0.516 0.104 -0.189 -0.511 -1.228 -1.613 -2.026 -2.505 -3.103 -3.831 -4.784 -7.847 -2 ,23373 ,TETRA ,17621369,Tue Nov 30 16:58:37 CET,Tue Nov 30 19:22:24 CET,0.0 1.886 2.447 2.858 3.196 3.488 3.737 3.952 4.345 4.535 4.711 4.905 5.151 5.28 5.528 5.754 5.967 6.068 6.255 6.43 6.683 6.853 7.013 7.237 7.45 7.651 7.849 8.035 8.26 8.475 8.678 8.922 9.159 9.384 9.655 9.947 10.207 10.487 10.781 11.093 11.405 11.735 12.116 12.482 12.887 13.309 13.759 14.245 14.771 15.267 15.675 15.647 15.289 14.826 14.316 13.82 13.339 12.865 12.439 12.004 11.618 11.242 10.865 10.51 10.122 9.724 9.307 8.915 8.569 8.203 7.808 7.487 7.145 6.787 6.511 6.21 5.875 5.52 5.155 4.89 4.606 4.161 3.858 3.535 3.363 3.007 2.631 2.212 1.979 1.624 1.22 0.949 0.65 -0.013 -0.394 -0.825 -1.331 -1.96 -2.722 -3.733 -7.358 -3 ,26134 ,TETRA ,17621370,Tue Nov 30 16:58:34 CET,Tue Nov 30 19:38:19 CET,0.0 1.778 2.356 2.788 3.117 3.4 3.645 3.87 4.275 4.452 4.622 4.813 5.057 5.185 5.426 5.64 5.84 5.941 6.135 6.313 6.56 6.717 6.866 7.077 7.281 7.471 7.654 7.838 8.065 8.28 8.479 8.704 8.918 9.128 9.367 9.62 9.861 10.114 10.38 10.663 10.95 11.252 11.598 11.939 12.325 12.742 13.178 13.606 14.047 14.507 14.826 14.688 14.299 13.865 13.403 12.893 12.359 11.788 11.266 10.733 10.248 9.793 9.379 9.0 8.616 8.26 7.891 7.529 7.186 6.824 6.448 6.135 5.784 5.404 5.108 4.808 4.501 4.169 3.823 3.58 3.316 2.889 2.587 2.273 2.102 1.75 1.376 0.963 0.747 0.412 0.031 -0.248 -0.549 -1.214 -1.604 -2.037 -2.528 -3.109 -3.821 -4.779 -8.435 -4 ,30945 ,TETRA ,17621371,Tue Nov 30 16:58:35 CET,Tue Nov 30 19:18:11 CET,0.0 1.685 2.264 2.685 3.009 3.282 3.519 3.734 4.114 4.287 4.449 4.633 4.877 5.009 5.253 5.482 5.691 5.789 5.976 6.156 6.412 6.57 6.715 6.922 7.115 7.302 7.49 7.672 7.902 8.119 8.325 8.563 8.787 9.008 9.26 9.522 9.761 10.013 10.265 10.535 10.834 11.162 11.541 11.92 12.329 12.751 13.223 13.697 14.109 14.431 14.534 14.165 13.607 12.965 12.288 11.645 11.068 10.487 9.948 9.41 8.93 8.468 8.008 7.544 7.092 6.669 6.226 5.835 5.473 5.077 4.66 4.312 3.946 3.562 3.261 2.957 2.637 2.284 1.915 1.668 1.432 1.042 0.739 0.419 0.251 -0.113 -0.494 -0.884 -1.095 -1.426 -1.831 -2.113 -2.408 -3.028 -3.371 -3.763 -4.214 -4.769 -5.479 -6.453 -9.949 -5 ,16988 ,TETRA ,17621372,Tue Nov 30 16:58:37 CET,Tue Nov 30 19:27:21 CET,0.0 2.17 2.746 3.143 3.45 3.725 3.972 4.189 4.561 4.73 4.888 5.064 5.308 5.439 5.691 5.93 6.152 6.261 6.453 6.628 6.891 7.058 7.221 7.459 7.689 7.896 8.082 8.261 8.494 8.715 8.923 9.179 9.42 9.642 9.896 10.179 10.445 10.724 11.018 11.331 11.638 11.96 12.338 12.725 13.131 13.545 14.01 14.498 14.96 15.321 15.472 15.195 14.763 14.253 13.715 13.173 12.628 12.097 11.586 11.032 10.577 10.161 9.705 9.28 8.919 8.59 8.226 7.86 7.525 7.171 6.78 6.452 6.114 5.749 5.468 5.188 4.869 4.513 4.169 3.926 3.66 3.226 2.906 2.576 2.408 2.048 1.653 1.236 1.008 0.66 0.252 -0.031 -0.33 -1.004 -1.387 -1.833 -2.357 -2.958 -3.739 -4.853 -9.41 -6 ,32000 ,TETRA ,17621373,Tue Nov 30 16:58:35 CET,Tue Nov 30 19:29:08 CET,0.0 1.972 2.528 2.924 3.251 3.53 3.778 3.997 4.386 4.564 4.727 4.921 5.173 5.294 5.526 5.737 5.941 6.04 6.227 6.408 6.658 6.811 6.965 7.187 7.395 7.605 7.809 7.991 8.22 8.432 8.633 8.875 9.096 9.305 9.549 9.822 10.088 10.371 10.67 10.989 11.307 11.649 12.027 12.391 12.805 13.239 13.698 14.166 14.667 15.096 15.225 14.9 14.376 13.848 13.323 12.795 12.343 11.938 11.577 11.185 10.797 10.419 10.035 9.63 9.198 8.782 8.352 7.956 7.604 7.252 6.873 6.536 6.178 5.801 5.499 5.163 4.796 4.415 4.038 3.81 3.592 3.241 2.989 2.71 2.572 2.294 1.968 1.608 1.401 1.05 0.659 0.411 0.149 -0.47 -0.846 -1.246 -1.693 -2.222 -2.859 -3.811 -7.981 -7 ,6596 ,TETRA ,17621374,Tue Nov 30 16:58:35 CET,Tue Nov 30 19:28:13 CET,0.0 2.014 2.571 2.96 3.262 3.539 3.795 4.018 4.402 4.575 4.733 4.919 5.162 5.295 5.54 5.762 5.972 6.075 6.27 6.444 6.699 6.862 7.011 7.21 7.399 7.589 7.769 7.95 8.185 8.403 8.596 8.814 9.03 9.24 9.479 9.741 9.986 10.243 10.518 10.802 11.084 11.388 11.734 12.064 12.43 12.837 13.268 13.71 14.174 14.617 14.98 14.949 14.633 14.217 13.764 13.313 12.893 12.472 12.068 11.648 11.266 10.913 10.576 10.246 9.914 9.619 9.307 9.009 8.761 8.473 8.125 7.832 7.511 7.156 6.87 6.582 6.291 5.979 5.651 5.404 5.124 4.681 4.375 4.051 3.878 3.504 3.115 2.706 2.492 2.161 1.726 1.424 1.121 0.421 0.009 -0.438 -0.928 -1.499 -2.195 -3.194 -7.56 -8 ,4496 ,TETRA ,17621375,Tue Nov 30 16:58:34 CET,Tue Nov 30 19:30:21 CET,0.0 2.154 2.741 3.166 3.507 3.792 4.046 4.282 4.697 4.871 5.039 5.235 5.484 5.613 5.865 6.108 6.333 6.442 6.652 6.848 7.111 7.279 7.442 7.673 7.897 8.109 8.309 8.498 8.737 8.96 9.171 9.41 9.641 9.871 10.126 10.399 10.653 10.927 11.222 11.524 11.822 12.152 12.524 12.877 13.268 13.671 14.089 14.533 15.014 15.469 15.756 15.624 15.255 14.83 14.44 14.041 13.636 13.249 12.853 12.391 11.975 11.584 11.19 10.801 10.423 10.058 9.684 9.35 9.047 8.734 8.386 8.068 7.725 7.388 7.147 6.901 6.639 6.348 6.03 5.806 5.572 5.173 4.871 4.551 4.382 4.019 3.64 3.218 2.989 2.651 2.261 1.986 1.7 1.056 0.677 0.226 -0.301 -0.9 -1.63 -2.618 -5.674 -9 ,29663 ,TETRA ,17621376,Tue Nov 30 16:58:35 CET,Tue Nov 30 19:28:32 CET,0.0 1.817 2.374 2.749 3.051 3.326 3.577 3.8 4.181 4.347 4.507 4.696 4.93 5.055 5.297 5.53 5.742 5.841 6.035 6.228 6.512 6.685 6.85 7.086 7.293 7.493 7.674 7.842 8.058 8.258 8.451 8.683 8.908 9.118 9.346 9.607 9.858 10.118 10.379 10.654 10.952 11.277 11.65 12.002 12.375 12.798 13.281 13.769 14.271 14.769 15.086 15.021 14.68 14.132 13.513 12.884 12.346 11.895 11.49 11.071 10.714 10.393 10.037 9.675 9.322 8.973 8.567 8.169 7.818 7.464 7.085 6.757 6.443 6.127 5.863 5.58 5.279 4.949 4.588 4.328 4.058 3.622 3.313 3.012 2.856 2.514 2.143 1.735 1.519 1.19 0.807 0.512 0.173 -0.58 -0.996 -1.488 -2.069 -2.723 -3.534 -4.594 -8.436 -10 ,17405 ,TETRA ,17621377,Tue Nov 30 16:58:37 CET,Tue Nov 30 19:29:50 CET,0.0 1.872 2.429 2.836 3.169 3.452 3.7 3.922 4.31 4.485 4.647 4.826 5.069 5.2 5.452 5.685 5.895 5.995 6.185 6.363 6.619 6.78 6.933 7.155 7.352 7.533 7.713 7.893 8.125 8.339 8.536 8.781 9.012 9.219 9.445 9.693 9.943 10.21 10.475 10.768 11.087 11.41 11.779 12.146 12.535 12.948 13.378 13.835 14.337 14.796 15.073 14.908 14.55 14.13 13.671 13.13 12.605 12.142 11.697 11.22 10.764 10.346 9.967 9.587 9.22 8.891 8.52 8.156 7.82 7.446 7.047 6.707 6.344 5.991 5.743 5.48 5.191 4.861 4.486 4.219 3.953 3.548 3.255 2.927 2.758 2.419 2.014 1.55 1.306 0.951 0.547 0.266 -0.045 -0.763 -1.179 -1.666 -2.2 -2.803 -3.589 -4.695 -9.132 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_52.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_52.txt deleted file mode 100644 index fe33ec9d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_52.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15134 ,TETRA ,17621378,Tue Nov 30 16:58:40 CET,Tue Nov 30 19:28:13 CET,0.0 2.268 2.962 3.421 3.791 4.104 4.377 4.619 5.035 5.242 5.436 5.658 5.921 6.063 6.348 6.625 6.879 6.995 7.216 7.428 7.726 7.918 8.111 8.391 8.641 8.871 9.087 9.289 9.552 9.787 10.007 10.278 10.536 10.78 11.057 11.359 11.642 11.941 12.252 12.582 12.923 13.284 13.688 14.081 14.49 14.887 15.325 15.787 16.245 16.655 16.914 16.758 16.433 16.056 15.645 15.244 14.845 14.37 13.881 13.383 13.014 12.71 12.39 12.092 11.823 11.565 11.279 11.014 10.761 10.47 10.158 9.898 9.64 9.379 9.179 8.956 8.714 8.476 8.218 8.029 7.824 7.501 7.295 7.077 6.964 6.738 6.482 6.196 6.038 5.763 5.497 5.284 5.071 4.63 4.378 4.073 3.7 3.284 2.823 2.133 -0.556 -2 ,31816 ,TETRA ,17621379,Tue Nov 30 16:58:35 CET,Tue Nov 30 19:27:08 CET,0.0 2.142 2.73 3.153 3.494 3.809 4.087 4.33 4.756 4.956 5.141 5.346 5.588 5.727 5.98 6.211 6.457 6.575 6.789 6.994 7.275 7.448 7.606 7.833 8.041 8.235 8.434 8.621 8.851 9.067 9.268 9.51 9.739 9.955 10.208 10.477 10.732 11.02 11.34 11.677 12.013 12.369 12.746 13.097 13.497 13.934 14.407 14.9 15.383 15.788 16.023 15.889 15.529 15.124 14.695 14.241 13.812 13.344 12.889 12.439 12.027 11.667 11.315 10.964 10.628 10.311 9.99 9.673 9.391 9.105 8.791 8.513 8.22 7.922 7.691 7.455 7.202 6.939 6.654 6.441 6.229 5.884 5.64 5.4 5.265 4.973 4.666 4.325 4.149 3.861 3.527 3.303 3.092 2.608 2.336 2.044 1.712 1.332 0.846 0.167 -2.14 -3 ,7709 ,TETRA ,17621380,Tue Nov 30 16:58:35 CET,Tue Nov 30 19:36:02 CET,0.0 2.545 3.178 3.625 3.991 4.3 4.558 4.785 5.219 5.417 5.587 5.806 6.073 6.211 6.466 6.708 6.931 7.031 7.23 7.429 7.72 7.905 8.083 8.331 8.558 8.759 8.949 9.139 9.37 9.586 9.797 10.068 10.336 10.586 10.864 11.16 11.421 11.703 12.002 12.3 12.605 12.936 13.299 13.648 14.031 14.445 14.923 15.425 15.911 16.339 16.591 16.451 16.068 15.643 15.229 14.803 14.402 14.024 13.67 13.279 12.913 12.574 12.219 11.883 11.606 11.293 10.896 10.525 10.193 9.846 9.479 9.178 8.87 8.555 8.299 8.02 7.729 7.438 7.134 6.908 6.656 6.257 5.981 5.68 5.527 5.202 4.826 4.429 4.221 3.893 3.554 3.314 3.058 2.48 2.152 1.799 1.403 0.923 0.284 -0.647 -3.57 -4 ,16810 ,TETRA ,17621381,Tue Nov 30 16:58:36 CET,Tue Nov 30 19:28:49 CET,0.0 1.937 2.534 2.984 3.335 3.619 3.875 4.109 4.525 4.718 4.896 5.125 5.375 5.517 5.784 6.019 6.245 6.36 6.581 6.787 7.077 7.257 7.422 7.651 7.877 8.09 8.286 8.478 8.719 8.948 9.173 9.437 9.694 9.942 10.203 10.477 10.731 11.008 11.308 11.598 11.889 12.219 12.576 12.912 13.295 13.696 14.142 14.585 14.998 15.364 15.591 15.477 15.127 14.728 14.317 13.867 13.399 12.93 12.508 12.051 11.625 11.246 10.882 10.537 10.215 9.883 9.477 9.108 8.794 8.479 8.169 7.908 7.621 7.294 7.019 6.73 6.438 6.13 5.803 5.569 5.319 4.919 4.623 4.318 4.166 3.841 3.483 3.081 2.87 2.542 2.198 1.95 1.69 1.088 0.738 0.336 -0.121 -0.629 -1.266 -2.147 -4.911 -5 ,1086 ,TETRA ,17621382,Tue Nov 30 16:58:36 CET,Tue Nov 30 19:29:29 CET,0.0 2.218 2.803 3.252 3.65 3.987 4.252 4.486 4.912 5.094 5.275 5.492 5.742 5.889 6.163 6.416 6.657 6.769 6.992 7.208 7.5 7.682 7.86 8.116 8.343 8.551 8.748 8.938 9.184 9.413 9.639 9.903 10.148 10.378 10.632 10.917 11.192 11.486 11.797 12.111 12.42 12.747 13.098 13.443 13.819 14.201 14.651 15.106 15.536 15.918 16.058 15.801 15.399 14.917 14.432 13.987 13.553 13.085 12.64 12.208 11.82 11.436 11.06 10.729 10.39 10.037 9.683 9.359 9.063 8.748 8.414 8.138 7.84 7.516 7.252 6.991 6.734 6.457 6.158 5.943 5.722 5.368 5.123 4.868 4.732 4.448 4.143 3.815 3.637 3.337 3.023 2.791 2.547 2.005 1.672 1.304 0.895 0.403 -0.205 -1.036 -3.975 -6 ,4142 ,TETRA ,17621383,Tue Nov 30 16:58:35 CET,Tue Nov 30 19:27:48 CET,0.0 1.84 2.468 2.908 3.26 3.555 3.8 4.036 4.466 4.662 4.849 5.069 5.33 5.474 5.758 6.026 6.266 6.375 6.577 6.771 7.058 7.235 7.398 7.626 7.849 8.072 8.282 8.479 8.727 8.961 9.176 9.419 9.665 9.9 10.149 10.426 10.707 11.02 11.327 11.631 11.935 12.243 12.598 12.964 13.365 13.788 14.269 14.731 15.159 15.529 15.712 15.552 15.134 14.612 14.116 13.677 13.272 12.851 12.447 12.027 11.658 11.325 10.977 10.633 10.29 9.934 9.554 9.218 8.919 8.605 8.265 7.97 7.664 7.335 7.071 6.79 6.489 6.173 5.852 5.626 5.395 5.04 4.786 4.521 4.385 4.112 3.815 3.481 3.299 3.002 2.686 2.462 2.224 1.695 1.41 1.08 0.684 0.217 -0.329 -1.093 -3.806 -7 ,7159 ,TETRA ,17621384,Tue Nov 30 16:58:40 CET,Tue Nov 30 19:31:44 CET,0.0 2.213 2.898 3.387 3.752 4.047 4.295 4.522 4.923 5.104 5.271 5.477 5.729 5.865 6.114 6.343 6.565 6.669 6.869 7.05 7.301 7.469 7.625 7.86 8.085 8.299 8.495 8.667 8.884 9.096 9.298 9.522 9.739 9.955 10.199 10.455 10.704 11.002 11.32 11.618 11.916 12.244 12.608 12.955 13.361 13.821 14.287 14.714 15.131 15.525 15.724 15.505 15.108 14.607 14.116 13.653 13.214 12.76 12.326 11.841 11.393 10.998 10.598 10.22 9.871 9.555 9.205 8.838 8.513 8.176 7.809 7.5 7.177 6.84 6.586 6.317 6.027 5.733 5.412 5.181 4.945 4.57 4.313 4.037 3.888 3.576 3.253 2.886 2.687 2.378 2.017 1.762 1.505 0.932 0.59 0.198 -0.229 -0.728 -1.403 -2.316 -4.758 -8 ,17325 ,TETRA ,17621385,Tue Nov 30 16:58:37 CET,Tue Nov 30 19:57:20 CET,0.0 1.974 2.603 3.032 3.37 3.676 3.944 4.181 4.625 4.831 5.022 5.249 5.522 5.668 5.921 6.171 6.408 6.518 6.732 6.938 7.232 7.417 7.589 7.843 8.082 8.317 8.532 8.719 8.955 9.176 9.393 9.653 9.917 10.161 10.404 10.669 10.923 11.192 11.472 11.766 12.055 12.392 12.825 13.233 13.628 14.034 14.452 14.858 15.294 15.644 15.794 15.616 15.195 14.725 14.236 13.692 13.171 12.62 12.079 11.538 11.07 10.617 10.187 9.799 9.423 9.068 8.699 8.383 8.112 7.81 7.456 7.145 6.831 6.517 6.27 6.004 5.711 5.404 5.087 4.863 4.639 4.273 4.003 3.716 3.571 3.262 2.913 2.535 2.338 2.029 1.689 1.443 1.177 0.584 0.247 -0.138 -0.592 -1.122 -1.724 -2.518 -5.489 -9 ,9803 ,TETRA ,17621386,Tue Nov 30 16:58:41 CET,Tue Nov 30 19:29:34 CET,0.0 2.303 2.921 3.361 3.729 4.053 4.33 4.575 5.011 5.21 5.405 5.65 5.913 6.056 6.326 6.581 6.806 6.909 7.105 7.298 7.582 7.751 7.91 8.152 8.376 8.595 8.812 9.02 9.286 9.535 9.77 10.03 10.271 10.5 10.752 11.022 11.269 11.536 11.828 12.13 12.438 12.768 13.118 13.448 13.821 14.253 14.744 15.231 15.703 16.103 16.34 16.255 15.92 15.444 14.984 14.515 14.023 13.586 13.224 12.839 12.498 12.178 11.876 11.589 11.28 10.947 10.573 10.22 9.887 9.528 9.157 8.852 8.531 8.191 7.911 7.6 7.274 6.951 6.614 6.371 6.131 5.771 5.52 5.253 5.105 4.792 4.474 4.141 3.955 3.644 3.287 3.001 2.704 2.11 1.779 1.403 0.955 0.432 -0.206 -1.044 -3.424 -10 ,17557 ,TETRA ,17621387,Tue Nov 30 16:58:40 CET,Tue Nov 30 19:43:28 CET,0.0 2.487 3.181 3.674 4.07 4.391 4.677 4.925 5.343 5.532 5.724 5.953 6.205 6.341 6.587 6.815 7.031 7.134 7.343 7.55 7.831 8.01 8.177 8.416 8.647 8.865 9.087 9.297 9.549 9.78 9.987 10.241 10.492 10.725 11.002 11.309 11.588 11.871 12.16 12.452 12.741 13.071 13.454 13.813 14.211 14.629 15.058 15.5 15.962 16.409 16.719 16.582 16.217 15.81 15.374 14.905 14.43 13.934 13.515 13.078 12.684 12.3 11.874 11.492 11.162 10.813 10.436 10.101 9.78 9.466 9.173 8.92 8.647 8.354 8.143 7.942 7.73 7.503 7.267 7.109 6.938 6.652 6.451 6.219 6.096 5.846 5.583 5.31 5.149 4.847 4.525 4.293 4.044 3.517 3.236 2.916 2.533 2.086 1.546 0.739 -2.044 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_35.txt deleted file mode 100644 index 06c09e1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6907 ,TETRA ,17621389,Tue Nov 30 16:58:40 CET,Tue Nov 30 19:28:04 CET,0.0 2.123 2.741 3.188 3.561 3.867 4.122 4.355 4.768 4.945 5.107 5.297 5.548 5.679 5.956 6.218 6.448 6.558 6.76 6.943 7.194 7.363 7.529 7.757 7.972 8.183 8.382 8.557 8.785 9.004 9.207 9.467 9.713 9.931 10.181 10.452 10.717 11.001 11.276 11.562 11.873 12.233 12.639 13.017 13.424 13.838 14.296 14.76 15.24 15.709 16.061 16.075 15.801 15.432 15.064 14.628 14.155 13.715 13.329 12.914 12.536 12.167 11.811 11.49 11.164 10.851 10.51 10.182 9.894 9.609 9.315 9.057 8.779 8.461 8.191 7.921 7.638 7.337 7.028 6.812 6.591 6.231 5.972 5.689 5.536 5.212 4.871 4.512 4.311 3.998 3.643 3.381 3.104 2.49 2.132 1.728 1.268 0.733 0.029 -0.952 -4.108 -2 ,27333 ,TETRA ,17621390,Tue Nov 30 16:58:40 CET,Tue Nov 30 19:24:46 CET,0.0 2.129 2.672 3.081 3.402 3.652 3.88 4.101 4.492 4.664 4.821 5.001 5.243 5.372 5.611 5.832 6.044 6.146 6.335 6.518 6.773 6.937 7.092 7.301 7.502 7.705 7.898 8.074 8.292 8.498 8.701 8.943 9.171 9.393 9.65 9.941 10.21 10.496 10.792 11.077 11.374 11.704 12.063 12.402 12.782 13.199 13.651 14.083 14.507 14.868 15.002 14.648 14.037 13.398 12.81 12.241 11.698 11.201 10.747 10.259 9.839 9.441 9.043 8.656 8.284 7.912 7.506 7.151 6.841 6.516 6.162 5.853 5.534 5.187 4.913 4.634 4.34 4.039 3.727 3.501 3.261 2.868 2.59 2.305 2.149 1.821 1.469 1.082 0.87 0.544 0.187 -0.05 -0.291 -0.883 -1.244 -1.654 -2.141 -2.693 -3.34 -4.252 -7.732 -3 ,11717 ,TETRA ,17621391,Tue Nov 30 16:58:40 CET,Tue Nov 30 19:27:37 CET,0.0 1.818 2.383 2.776 3.1 3.386 3.641 3.862 4.254 4.425 4.586 4.786 5.03 5.161 5.412 5.635 5.844 5.943 6.14 6.339 6.631 6.811 6.973 7.197 7.421 7.634 7.831 8.025 8.27 8.502 8.706 8.949 9.183 9.404 9.668 9.956 10.226 10.513 10.795 11.088 11.412 11.772 12.171 12.567 13.015 13.478 13.979 14.482 14.993 15.439 15.694 15.638 15.328 14.868 14.409 13.949 13.463 12.98 12.544 12.054 11.619 11.242 10.856 10.476 10.117 9.783 9.428 9.104 8.828 8.541 8.22 7.925 7.612 7.286 7.021 6.748 6.47 6.162 5.843 5.619 5.381 5.019 4.757 4.468 4.314 3.977 3.601 3.188 2.967 2.637 2.262 2.01 1.747 1.139 0.803 0.41 -0.045 -0.547 -1.176 -2.153 -5.994 -4 ,6146 ,TETRA ,17621392,Tue Nov 30 17:00:45 CET,Tue Nov 30 19:30:41 CET,0.0 2.154 2.711 3.126 3.469 3.741 3.98 4.196 4.593 4.772 4.938 5.138 5.392 5.527 5.772 6.005 6.229 6.336 6.533 6.709 6.964 7.131 7.286 7.509 7.724 7.925 8.118 8.314 8.567 8.801 9.019 9.268 9.49 9.699 9.937 10.193 10.431 10.672 10.921 11.198 11.495 11.811 12.144 12.486 12.875 13.276 13.683 14.05 14.43 14.767 14.863 14.515 14.01 13.396 12.747 12.13 11.558 11.012 10.521 9.998 9.527 9.083 8.651 8.247 7.867 7.515 7.137 6.792 6.492 6.166 5.821 5.533 5.227 4.888 4.613 4.339 4.044 3.73 3.401 3.161 2.916 2.539 2.26 1.971 1.821 1.495 1.143 0.741 0.528 0.205 -0.166 -0.431 -0.721 -1.353 -1.682 -2.036 -2.472 -3.007 -3.666 -4.633 -8.426 -5 ,13306 ,TETRA ,17621393,Tue Nov 30 17:00:45 CET,Tue Nov 30 19:41:15 CET,0.0 1.944 2.528 2.924 3.249 3.53 3.775 3.987 4.375 4.548 4.717 4.925 5.177 5.314 5.558 5.781 5.985 6.085 6.277 6.459 6.721 6.877 7.019 7.23 7.434 7.624 7.808 7.982 8.202 8.419 8.621 8.85 9.071 9.291 9.545 9.828 10.089 10.361 10.637 10.94 11.244 11.56 11.918 12.254 12.67 13.114 13.555 14.014 14.513 14.989 15.269 15.087 14.667 14.166 13.673 13.16 12.631 12.089 11.603 11.123 10.7 10.303 9.907 9.542 9.215 8.887 8.513 8.164 7.848 7.5 7.136 6.839 6.517 6.173 5.908 5.63 5.34 5.032 4.692 4.453 4.208 3.816 3.536 3.237 3.08 2.75 2.393 2.025 1.83 1.506 1.149 0.898 0.617 -0.006 -0.354 -0.742 -1.185 -1.714 -2.342 -3.199 -6.552 -6 ,3829 ,TETRA ,17621394,Tue Nov 30 17:00:45 CET,Tue Nov 30 19:40:59 CET,0.0 2.091 2.675 3.057 3.39 3.69 3.946 4.18 4.588 4.76 4.926 5.128 5.383 5.51 5.744 5.967 6.177 6.28 6.478 6.666 6.925 7.087 7.242 7.469 7.681 7.88 8.066 8.234 8.451 8.669 8.876 9.107 9.324 9.536 9.779 10.052 10.296 10.556 10.84 11.145 11.473 11.815 12.197 12.562 12.957 13.361 13.774 14.211 14.696 15.137 15.34 15.074 14.654 14.284 13.848 13.334 12.814 12.289 11.776 11.222 10.757 10.341 9.925 9.534 9.166 8.798 8.419 8.093 7.785 7.447 7.11 6.818 6.5 6.177 5.893 5.596 5.307 4.993 4.657 4.418 4.175 3.806 3.545 3.252 3.086 2.745 2.389 1.993 1.767 1.428 1.064 0.821 0.563 -0.062 -0.407 -0.749 -1.157 -1.645 -2.268 -3.163 -7.229 -7 ,18798 ,TETRA ,17621395,Tue Nov 30 17:00:45 CET,Tue Nov 30 19:32:56 CET,0.0 1.777 2.305 2.715 3.063 3.349 3.615 3.846 4.229 4.405 4.575 4.774 5.021 5.155 5.404 5.625 5.836 5.942 6.152 6.345 6.604 6.763 6.915 7.127 7.33 7.533 7.72 7.899 8.125 8.329 8.524 8.765 8.996 9.218 9.481 9.755 10.005 10.266 10.534 10.836 11.142 11.456 11.809 12.161 12.56 12.948 13.347 13.773 14.227 14.636 14.829 14.615 14.15 13.606 13.063 12.513 11.976 11.469 10.993 10.485 10.047 9.641 9.254 8.89 8.526 8.176 7.792 7.432 7.127 6.819 6.476 6.175 5.857 5.522 5.254 4.966 4.648 4.32 3.987 3.746 3.492 3.099 2.819 2.538 2.376 2.004 1.631 1.205 0.978 0.637 0.245 -0.016 -0.28 -0.874 -1.235 -1.65 -2.109 -2.693 -3.374 -4.313 -8.356 -8 ,789 ,TETRA ,17621396,Tue Nov 30 17:00:45 CET,Tue Nov 30 19:30:01 CET,0.0 1.859 2.425 2.811 3.116 3.387 3.632 3.848 4.245 4.422 4.584 4.784 5.022 5.142 5.383 5.623 5.839 5.943 6.149 6.332 6.589 6.752 6.907 7.128 7.337 7.539 7.722 7.894 8.121 8.333 8.536 8.771 8.986 9.198 9.437 9.698 9.95 10.218 10.497 10.777 11.071 11.395 11.732 12.066 12.438 12.824 13.287 13.767 14.203 14.606 14.836 14.552 14.011 13.429 12.837 12.246 11.706 11.176 10.691 10.198 9.774 9.394 9.018 8.632 8.267 7.929 7.551 7.186 6.875 6.554 6.202 5.906 5.594 5.276 5.019 4.74 4.435 4.084 3.728 3.501 3.265 2.888 2.611 2.303 2.146 1.823 1.456 1.063 0.865 0.55 0.207 -0.042 -0.315 -0.938 -1.279 -1.658 -2.082 -2.577 -3.2 -4.1 -8.899 -9 ,5385 ,TETRA ,17621397,Tue Nov 30 17:00:45 CET,Tue Nov 30 19:31:10 CET,0.0 1.867 2.385 2.781 3.1 3.372 3.615 3.834 4.26 4.451 4.618 4.821 5.067 5.19 5.433 5.669 5.874 5.97 6.158 6.338 6.594 6.756 6.909 7.124 7.33 7.527 7.712 7.882 8.104 8.319 8.521 8.761 8.984 9.2 9.437 9.696 9.95 10.212 10.486 10.772 11.054 11.374 11.739 12.09 12.486 12.908 13.345 13.781 14.222 14.563 14.716 14.504 14.111 13.592 12.984 12.358 11.788 11.294 10.849 10.356 9.889 9.466 9.058 8.661 8.28 7.916 7.53 7.182 6.872 6.546 6.204 5.925 5.637 5.32 5.065 4.796 4.507 4.198 3.874 3.643 3.4 3.019 2.748 2.462 2.308 1.986 1.643 1.255 1.049 0.739 0.414 0.178 -0.076 -0.691 -1.055 -1.446 -1.865 -2.359 -2.954 -3.838 -7.308 -10 ,6362 ,TETRA ,17621398,Tue Nov 30 17:00:45 CET,Tue Nov 30 19:25:42 CET,0.0 1.935 2.461 2.862 3.194 3.488 3.746 3.975 4.361 4.527 4.683 4.874 5.128 5.264 5.51 5.729 5.937 6.041 6.246 6.439 6.696 6.858 7.018 7.238 7.446 7.645 7.836 8.019 8.248 8.473 8.687 8.937 9.163 9.371 9.623 9.904 10.159 10.426 10.709 10.996 11.28 11.615 11.999 12.344 12.718 13.095 13.52 13.98 14.382 14.64 14.666 14.27 13.724 13.119 12.46 11.855 11.32 10.818 10.36 9.856 9.399 8.974 8.543 8.132 7.745 7.383 6.992 6.637 6.331 6.013 5.666 5.349 5.016 4.683 4.436 4.175 3.882 3.59 3.299 3.083 2.854 2.505 2.255 1.975 1.832 1.544 1.211 0.842 0.652 0.351 0.033 -0.219 -0.486 -1.072 -1.416 -1.798 -2.222 -2.683 -3.24 -4.08 -8.784 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_57.txt deleted file mode 100644 index 3c76cf44..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25107 ,TETRA ,17621399,Tue Nov 30 17:00:53 CET,Tue Nov 30 19:14:23 CET,0.0 2.285 2.855 3.276 3.62 3.913 4.168 4.395 4.801 4.989 5.159 5.373 5.633 5.775 6.047 6.303 6.544 6.656 6.865 7.07 7.355 7.525 7.708 7.972 8.223 8.469 8.696 8.915 9.196 9.453 9.677 9.931 10.176 10.435 10.73 11.051 11.368 11.728 12.1 12.472 12.878 13.332 13.842 14.344 14.908 15.488 16.095 16.727 17.415 18.133 18.776 18.903 18.756 18.457 18.091 17.655 17.229 16.857 16.488 16.083 15.693 15.335 15.01 14.688 14.355 14.04 13.713 13.431 13.191 12.941 12.665 12.41 12.134 11.855 11.641 11.402 11.15 10.883 10.594 10.4 10.193 9.851 9.61 9.36 9.23 8.951 8.654 8.34 8.166 7.877 7.592 7.383 7.161 6.648 6.334 5.983 5.6 5.138 4.547 3.744 0.5 -2 ,20827 ,TETRA ,17621400,Tue Nov 30 17:00:53 CET,Tue Nov 30 19:16:10 CET,0.0 1.806 2.372 2.78 3.128 3.419 3.682 3.937 4.368 4.547 4.722 4.944 5.212 5.369 5.654 5.932 6.197 6.323 6.558 6.769 7.072 7.26 7.435 7.696 7.949 8.19 8.407 8.614 8.889 9.148 9.397 9.687 9.957 10.22 10.511 10.815 11.096 11.401 11.726 12.071 12.449 12.893 13.395 13.869 14.415 14.997 15.621 16.279 16.939 17.624 18.191 18.345 18.258 17.915 17.499 17.046 16.573 16.15 15.779 15.373 15.011 14.665 14.332 14.013 13.689 13.381 13.041 12.728 12.456 12.163 11.839 11.566 11.283 10.981 10.739 10.493 10.226 9.945 9.669 9.469 9.246 8.875 8.625 8.357 8.211 7.899 7.566 7.192 6.985 6.677 6.33 6.084 5.829 5.25 4.903 4.521 4.121 3.647 3.024 2.152 -1.047 -3 ,24346 ,TETRA ,17621401,Tue Nov 30 17:00:53 CET,Tue Nov 30 19:34:46 CET,0.0 2.444 3.069 3.518 3.915 4.249 4.528 4.784 5.237 5.429 5.616 5.864 6.138 6.289 6.565 6.824 7.072 7.19 7.419 7.631 7.923 8.108 8.283 8.532 8.771 9.002 9.21 9.418 9.694 9.945 10.186 10.46 10.725 10.988 11.289 11.619 11.938 12.283 12.647 13.017 13.384 13.801 14.314 14.846 15.408 16.026 16.722 17.349 18.02 18.775 19.384 19.623 19.562 19.326 18.992 18.589 18.175 17.741 17.356 16.965 16.609 16.266 15.925 15.589 15.257 14.956 14.643 14.35 14.081 13.8 13.514 13.272 13.015 12.747 12.536 12.309 12.059 11.797 11.522 11.322 11.107 10.755 10.497 10.228 10.091 9.807 9.496 9.175 9.002 8.707 8.41 8.192 7.955 7.425 7.126 6.783 6.372 5.884 5.223 4.277 0.358 -4 ,18614 ,TETRA ,17621402,Tue Nov 30 17:00:53 CET,Tue Nov 30 19:30:48 CET,0.0 1.898 2.478 2.909 3.265 3.568 3.829 4.067 4.497 4.685 4.854 5.065 5.327 5.474 5.759 6.013 6.237 6.345 6.554 6.753 7.037 7.214 7.377 7.602 7.815 8.021 8.226 8.431 8.686 8.92 9.138 9.396 9.652 9.889 10.144 10.433 10.728 11.052 11.383 11.726 12.087 12.51 12.973 13.404 13.918 14.482 15.061 15.68 16.367 17.081 17.695 17.805 17.614 17.318 16.932 16.512 16.127 15.754 15.418 15.065 14.728 14.37 14.015 13.705 13.402 13.096 12.776 12.497 12.237 11.935 11.625 11.381 11.129 10.86 10.629 10.381 10.14 9.895 9.625 9.428 9.215 8.874 8.635 8.381 8.246 7.966 7.656 7.315 7.132 6.832 6.507 6.281 6.032 5.438 5.105 4.757 4.359 3.854 3.221 2.328 -1.059 -5 ,2766 ,TETRA ,17621403,Tue Nov 30 17:00:53 CET,Tue Nov 30 19:30:56 CET,0.0 2.147 2.791 3.264 3.678 4.016 4.301 4.563 4.999 5.188 5.361 5.566 5.82 5.961 6.236 6.496 6.736 6.855 7.091 7.311 7.614 7.798 7.981 8.243 8.488 8.722 8.94 9.147 9.409 9.652 9.884 10.168 10.429 10.683 10.989 11.317 11.626 11.954 12.301 12.678 13.066 13.497 13.987 14.446 14.941 15.486 16.14 16.857 17.604 18.378 19.154 19.581 19.631 19.439 19.173 18.914 18.606 18.243 17.918 17.549 17.186 16.853 16.501 16.158 15.832 15.51 15.164 14.865 14.612 14.336 14.046 13.809 13.556 13.295 13.087 12.857 12.608 12.315 11.986 11.765 11.532 11.151 10.874 10.566 10.401 10.062 9.712 9.33 9.122 8.807 8.446 8.198 7.937 7.362 7.034 6.663 6.249 5.798 5.217 4.306 0.333 -6 ,32734 ,TETRA ,17621404,Tue Nov 30 17:00:53 CET,Tue Nov 30 19:18:49 CET,0.0 2.217 2.764 3.185 3.54 3.836 4.09 4.317 4.715 4.899 5.077 5.299 5.553 5.697 5.971 6.226 6.456 6.564 6.771 6.966 7.252 7.444 7.629 7.886 8.126 8.355 8.572 8.776 9.028 9.265 9.495 9.773 10.032 10.266 10.546 10.866 11.165 11.493 11.838 12.212 12.615 13.045 13.555 14.045 14.569 15.152 15.82 16.511 17.199 17.904 18.561 18.865 18.779 18.421 17.966 17.548 17.205 16.852 16.502 16.113 15.73 15.386 15.049 14.714 14.393 14.097 13.791 13.518 13.271 13.003 12.726 12.493 12.241 11.964 11.738 11.496 11.238 10.977 10.704 10.489 10.257 9.899 9.636 9.361 9.226 8.943 8.631 8.29 8.104 7.809 7.491 7.254 6.987 6.403 6.057 5.666 5.229 4.704 4.076 3.289 0.258 -7 ,2603 ,TETRA ,17621405,Tue Nov 30 17:00:53 CET,Tue Nov 30 19:32:03 CET,0.0 1.908 2.533 2.99 3.351 3.646 3.914 4.152 4.586 4.786 4.964 5.197 5.47 5.622 5.914 6.168 6.41 6.53 6.752 6.962 7.259 7.439 7.608 7.847 8.076 8.293 8.498 8.7 8.969 9.224 9.47 9.759 10.026 10.284 10.58 10.916 11.241 11.596 11.986 12.384 12.752 13.158 13.628 14.082 14.599 15.154 15.794 16.49 17.216 17.925 18.617 18.935 18.837 18.568 18.261 17.952 17.615 17.257 16.93 16.566 16.214 15.9 15.61 15.319 15.016 14.735 14.446 14.166 13.913 13.649 13.355 13.111 12.859 12.593 12.36 12.107 11.857 11.59 11.309 11.109 10.91 10.578 10.34 10.086 9.956 9.698 9.402 9.075 8.898 8.587 8.255 8.019 7.769 7.265 6.993 6.681 6.248 5.709 5.104 4.277 1.373 -8 ,17408 ,TETRA ,17621406,Tue Nov 30 17:00:53 CET,Tue Nov 30 19:16:49 CET,0.0 2.092 2.671 3.094 3.436 3.727 3.982 4.211 4.624 4.812 4.981 5.186 5.439 5.58 5.855 6.12 6.367 6.479 6.682 6.88 7.166 7.35 7.528 7.782 8.032 8.264 8.472 8.674 8.947 9.21 9.449 9.736 10.014 10.267 10.558 10.877 11.181 11.511 11.868 12.237 12.61 13.035 13.503 13.954 14.455 15.002 15.619 16.278 16.944 17.621 18.341 18.66 18.575 18.338 18.048 17.721 17.401 17.07 16.738 16.383 16.063 15.763 15.458 15.163 14.855 14.545 14.231 13.938 13.681 13.402 13.097 12.852 12.596 12.32 12.093 11.841 11.576 11.306 11.016 10.811 10.603 10.274 10.029 9.761 9.629 9.361 9.062 8.734 8.548 8.251 7.961 7.726 7.468 6.94 6.644 6.309 5.907 5.429 4.788 3.902 0.299 -9 ,27025 ,TETRA ,17621407,Tue Nov 30 17:00:53 CET,Tue Nov 30 19:29:43 CET,0.0 1.721 2.263 2.657 3.01 3.333 3.616 3.871 4.311 4.506 4.694 4.938 5.213 5.365 5.657 5.927 6.174 6.295 6.524 6.735 7.04 7.238 7.423 7.686 7.941 8.182 8.413 8.629 8.895 9.143 9.381 9.658 9.926 10.189 10.487 10.821 11.149 11.502 11.886 12.303 12.724 13.195 13.732 14.261 14.853 15.497 16.197 16.869 17.617 18.472 19.298 19.69 19.648 19.399 19.061 18.684 18.325 17.983 17.655 17.272 16.901 16.548 16.209 15.885 15.573 15.28 14.964 14.666 14.397 14.124 13.833 13.568 13.279 12.976 12.739 12.49 12.235 11.966 11.679 11.48 11.268 10.918 10.665 10.399 10.259 9.954 9.627 9.284 9.107 8.828 8.536 8.318 8.09 7.569 7.278 6.96 6.586 6.126 5.49 4.63 1.644 -10 ,7061 ,TETRA ,17621408,Tue Nov 30 17:00:53 CET,Tue Nov 30 19:29:06 CET,0.0 1.932 2.48 2.915 3.299 3.628 3.915 4.191 4.681 4.884 5.072 5.314 5.592 5.75 6.039 6.312 6.569 6.695 6.934 7.157 7.465 7.657 7.849 8.114 8.357 8.588 8.808 9.024 9.3 9.562 9.805 10.102 10.391 10.663 10.963 11.288 11.601 11.943 12.31 12.688 13.073 13.508 14.012 14.516 15.087 15.741 16.489 17.278 18.176 19.12 20.089 20.709 20.856 20.768 20.5 20.228 19.978 19.653 19.352 19.062 18.786 18.518 18.222 17.918 17.636 17.372 17.084 16.811 16.563 16.298 16.029 15.799 15.552 15.297 15.097 14.879 14.627 14.358 14.088 13.902 13.7 13.365 13.126 12.876 12.747 12.47 12.167 11.831 11.654 11.358 11.047 10.823 10.575 10.006 9.688 9.35 8.974 8.518 7.911 6.968 2.819 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_55_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_55_35.txt deleted file mode 100644 index e9fc8d65..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_55_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17484 ,TETRA ,17621409,Tue Nov 30 17:00:50 CET,Tue Nov 30 19:26:54 CET,0.0 1.838 2.412 2.807 3.124 3.398 3.643 3.864 4.282 4.465 4.625 4.814 5.057 5.184 5.426 5.654 5.876 5.983 6.178 6.358 6.617 6.78 6.941 7.179 7.389 7.586 7.78 7.959 8.182 8.391 8.579 8.808 9.024 9.227 9.469 9.743 9.992 10.249 10.536 10.846 11.145 11.466 11.83 12.167 12.55 12.931 13.305 13.677 14.059 14.45 14.676 14.519 14.217 13.846 13.45 13.035 12.638 12.282 11.957 11.595 11.265 10.973 10.689 10.399 10.126 9.872 9.595 9.34 9.122 8.904 8.676 8.478 8.267 8.044 7.866 7.673 7.463 7.25 7.032 6.872 6.703 6.437 6.25 6.061 5.96 5.732 5.494 5.246 5.109 4.855 4.666 4.5 4.321 3.917 3.685 3.423 3.126 2.798 2.377 1.721 -0.552 -2 ,4630 ,TETRA ,17621410,Tue Nov 30 17:00:50 CET,Tue Nov 30 19:49:21 CET,0.0 2.004 2.586 3.029 3.367 3.647 3.904 4.14 4.542 4.721 4.889 5.081 5.326 5.461 5.722 5.966 6.188 6.29 6.483 6.672 6.935 7.102 7.262 7.483 7.686 7.871 8.047 8.219 8.431 8.644 8.855 9.096 9.314 9.515 9.745 10.0 10.247 10.502 10.768 11.056 11.35 11.669 12.028 12.378 12.773 13.178 13.591 14.008 14.441 14.817 15.016 14.926 14.616 14.188 13.749 13.335 12.951 12.601 12.288 11.95 11.64 11.347 11.052 10.775 10.519 10.273 10.021 9.788 9.577 9.356 9.119 8.924 8.711 8.475 8.298 8.107 7.899 7.688 7.462 7.298 7.124 6.844 6.647 6.446 6.347 6.136 5.906 5.65 5.516 5.266 5.051 4.874 4.678 4.232 3.985 3.717 3.431 3.104 2.689 2.079 0.001 -3 ,2296 ,TETRA ,17621411,Tue Nov 30 17:00:50 CET,Tue Nov 30 19:30:31 CET,0.0 2.223 2.798 3.213 3.549 3.835 4.093 4.315 4.697 4.876 5.045 5.269 5.512 5.643 5.89 6.12 6.339 6.449 6.653 6.84 7.105 7.27 7.427 7.655 7.869 8.076 8.271 8.45 8.669 8.879 9.084 9.333 9.557 9.765 10.01 10.269 10.513 10.772 11.043 11.33 11.611 11.908 12.244 12.58 12.94 13.301 13.692 14.102 14.525 14.909 15.105 14.932 14.616 14.243 13.881 13.512 13.15 12.803 12.489 12.146 11.847 11.577 11.299 11.034 10.784 10.543 10.285 10.051 9.839 9.619 9.386 9.184 8.976 8.752 8.57 8.383 8.191 7.977 7.746 7.591 7.437 7.205 7.037 6.854 6.753 6.53 6.303 6.062 5.93 5.69 5.501 5.338 5.156 4.763 4.532 4.264 3.966 3.633 3.199 2.572 0.215 -4 ,138 ,TETRA ,17621412,Tue Nov 30 17:00:50 CET,Tue Nov 30 19:28:04 CET,0.0 2.017 2.63 3.061 3.386 3.685 3.952 4.182 4.592 4.776 4.941 5.136 5.384 5.523 5.781 6.01 6.229 6.334 6.53 6.708 6.956 7.12 7.277 7.501 7.703 7.887 8.068 8.242 8.465 8.673 8.866 9.099 9.316 9.518 9.744 9.993 10.223 10.473 10.739 11.025 11.314 11.61 11.952 12.294 12.678 13.072 13.5 13.922 14.317 14.687 14.951 14.848 14.55 14.218 13.865 13.485 13.121 12.772 12.456 12.118 11.793 11.487 11.207 10.935 10.677 10.435 10.169 9.927 9.703 9.467 9.238 9.046 8.838 8.614 8.439 8.262 8.07 7.863 7.637 7.477 7.312 7.046 6.859 6.656 6.54 6.298 6.059 5.799 5.659 5.405 5.176 4.995 4.809 4.396 4.157 3.899 3.617 3.282 2.831 2.158 -0.041 -5 ,32259 ,TETRA ,17621413,Tue Nov 30 17:00:50 CET,Tue Nov 30 19:44:31 CET,0.0 1.767 2.407 2.829 3.155 3.418 3.665 3.905 4.306 4.483 4.651 4.84 5.086 5.224 5.481 5.707 5.92 6.024 6.224 6.411 6.666 6.831 6.992 7.217 7.422 7.619 7.814 7.994 8.22 8.44 8.64 8.864 9.07 9.272 9.512 9.771 10.015 10.285 10.581 10.877 11.154 11.471 11.832 12.164 12.524 12.898 13.313 13.74 14.174 14.516 14.677 14.574 14.312 13.974 13.599 13.187 12.789 12.42 12.101 11.774 11.478 11.206 10.936 10.678 10.423 10.173 9.904 9.658 9.45 9.229 8.991 8.792 8.585 8.369 8.203 8.018 7.823 7.625 7.417 7.262 7.089 6.829 6.642 6.424 6.311 6.087 5.857 5.598 5.46 5.217 5.026 4.855 4.671 4.282 4.044 3.758 3.453 3.088 2.636 2.044 0.291 -6 ,17272 ,TETRA ,17621414,Tue Nov 30 17:00:50 CET,Tue Nov 30 19:30:03 CET,0.0 2.164 2.691 3.094 3.435 3.73 3.986 4.208 4.59 4.766 4.929 5.117 5.362 5.487 5.731 5.967 6.189 6.291 6.495 6.69 6.957 7.128 7.294 7.523 7.733 7.931 8.125 8.311 8.55 8.777 8.977 9.209 9.43 9.647 9.888 10.14 10.38 10.637 10.902 11.171 11.45 11.765 12.128 12.478 12.854 13.218 13.586 13.972 14.353 14.676 14.869 14.725 14.388 14.028 13.655 13.263 12.893 12.529 12.206 11.874 11.571 11.292 11.017 10.749 10.492 10.252 9.99 9.742 9.515 9.282 9.048 8.852 8.641 8.406 8.218 8.023 7.818 7.605 7.378 7.211 7.041 6.781 6.592 6.395 6.288 6.065 5.828 5.559 5.414 5.152 4.952 4.788 4.617 4.215 3.987 3.737 3.443 3.096 2.655 2.04 -0.094 -7 ,31522 ,TETRA ,17621415,Tue Nov 30 17:01:22 CET,Tue Nov 30 19:30:51 CET,0.0 1.992 2.619 3.067 3.437 3.748 4.014 4.253 4.649 4.829 5.001 5.212 5.461 5.597 5.861 6.106 6.314 6.413 6.612 6.801 7.058 7.217 7.371 7.602 7.825 8.026 8.216 8.391 8.61 8.818 9.013 9.255 9.486 9.699 9.938 10.197 10.444 10.711 10.98 11.265 11.552 11.861 12.208 12.533 12.895 13.281 13.685 14.088 14.521 14.962 15.262 15.189 14.913 14.558 14.182 13.815 13.469 13.146 12.854 12.533 12.241 11.967 11.697 11.432 11.175 10.935 10.687 10.452 10.231 9.998 9.763 9.568 9.359 9.136 8.962 8.781 8.592 8.376 8.144 7.997 7.836 7.565 7.381 7.187 7.083 6.871 6.647 6.408 6.282 6.033 5.83 5.66 5.477 5.047 4.8 4.551 4.262 3.914 3.494 2.871 0.258 -8 ,19185 ,TETRA ,17621416,Tue Nov 30 17:01:22 CET,Tue Nov 30 19:32:02 CET,0.0 2.041 2.65 3.068 3.38 3.658 3.914 4.142 4.551 4.728 4.889 5.083 5.321 5.448 5.679 5.896 6.105 6.207 6.403 6.587 6.843 7.008 7.167 7.391 7.596 7.785 7.969 8.143 8.359 8.578 8.784 9.016 9.251 9.473 9.715 9.983 10.248 10.534 10.81 11.088 11.376 11.696 12.042 12.372 12.76 13.165 13.583 13.997 14.418 14.862 15.18 15.13 14.877 14.574 14.241 13.871 13.506 13.163 12.854 12.515 12.217 11.961 11.71 11.458 11.215 10.994 10.75 10.521 10.318 10.089 9.848 9.654 9.451 9.233 9.056 8.874 8.694 8.502 8.29 8.135 7.974 7.724 7.542 7.351 7.252 7.045 6.828 6.591 6.465 6.223 6.024 5.862 5.685 5.272 5.04 4.773 4.476 4.142 3.682 3.037 0.653 -9 ,11074 ,TETRA ,17621417,Tue Nov 30 17:01:27 CET,Tue Nov 30 19:29:55 CET,0.0 2.01 2.574 2.996 3.333 3.625 3.876 4.096 4.495 4.676 4.844 5.044 5.284 5.417 5.664 5.891 6.1 6.201 6.394 6.58 6.844 7.008 7.172 7.395 7.603 7.802 7.979 8.149 8.371 8.587 8.79 9.028 9.248 9.453 9.698 9.97 10.232 10.513 10.791 11.068 11.355 11.666 12.009 12.348 12.726 13.113 13.511 13.894 14.251 14.58 14.825 14.705 14.355 13.955 13.575 13.22 12.87 12.512 12.179 11.835 11.528 11.248 10.971 10.7 10.442 10.201 9.941 9.7 9.488 9.275 9.059 8.873 8.668 8.44 8.258 8.074 7.878 7.664 7.443 7.286 7.122 6.872 6.679 6.47 6.361 6.119 5.852 5.563 5.417 5.166 4.982 4.819 4.638 4.221 3.981 3.719 3.43 3.073 2.619 1.988 -0.108 -10 ,4897 ,TETRA ,17621418,Tue Nov 30 17:01:27 CET,Tue Nov 30 19:34:27 CET,0.0 2.015 2.626 3.051 3.378 3.67 3.931 4.161 4.564 4.744 4.914 5.114 5.356 5.495 5.751 5.976 6.195 6.297 6.486 6.666 6.929 7.097 7.252 7.476 7.688 7.882 8.072 8.251 8.476 8.692 8.893 9.126 9.34 9.541 9.77 10.024 10.271 10.536 10.8 11.078 11.369 11.674 12.01 12.331 12.679 13.068 13.505 13.935 14.381 14.825 15.075 14.978 14.699 14.333 13.956 13.572 13.204 12.863 12.558 12.215 11.925 11.673 11.384 11.096 10.853 10.634 10.396 10.169 9.967 9.758 9.529 9.325 9.117 8.898 8.726 8.556 8.368 8.163 7.948 7.796 7.638 7.376 7.189 6.99 6.885 6.674 6.439 6.181 6.043 5.791 5.599 5.428 5.243 4.829 4.587 4.314 3.998 3.64 3.2 2.559 0.429 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_35.txt deleted file mode 100644 index 5327fb3c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,619 ,TETRA ,17621419,Tue Nov 30 17:01:22 CET,Tue Nov 30 19:39:47 CET,0.0 2.161 2.769 3.217 3.565 3.846 4.087 4.311 4.707 4.88 5.036 5.216 5.469 5.61 5.87 6.115 6.342 6.448 6.644 6.833 7.097 7.262 7.421 7.638 7.848 8.059 8.268 8.461 8.701 8.932 9.151 9.41 9.65 9.869 10.121 10.405 10.688 10.99 11.298 11.634 11.992 12.368 12.795 13.222 13.685 14.195 14.754 15.317 15.95 16.656 17.269 17.519 17.503 17.363 17.138 16.874 16.622 16.357 16.076 15.764 15.49 15.24 14.99 14.746 14.504 14.273 14.044 13.835 13.643 13.437 13.209 13.012 12.808 12.596 12.428 12.245 12.053 11.854 11.646 11.507 11.356 11.103 10.927 10.739 10.642 10.44 10.218 9.968 9.84 9.606 9.414 9.247 9.063 8.644 8.405 8.133 7.819 7.458 7.03 6.387 3.932 -2 ,24640 ,TETRA ,17621420,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:32:43 CET,0.0 2.232 2.762 3.177 3.515 3.798 4.06 4.301 4.701 4.877 5.04 5.234 5.49 5.629 5.891 6.132 6.355 6.463 6.667 6.861 7.134 7.309 7.474 7.7 7.924 8.14 8.337 8.523 8.76 8.985 9.203 9.461 9.703 9.925 10.175 10.458 10.734 11.039 11.369 11.696 12.017 12.385 12.808 13.22 13.709 14.229 14.782 15.347 15.934 16.519 17.019 17.216 17.161 16.991 16.751 16.463 16.177 15.912 15.664 15.376 15.094 14.839 14.58 14.322 14.088 13.872 13.638 13.418 13.217 13.017 12.808 12.616 12.42 12.205 12.024 11.837 11.635 11.43 11.211 11.056 10.889 10.614 10.423 10.227 10.129 9.926 9.699 9.461 9.337 9.089 8.866 8.694 8.509 8.086 7.841 7.573 7.279 6.924 6.47 5.789 2.923 -3 ,27942 ,TETRA ,17621421,Tue Nov 30 17:01:27 CET,Tue Nov 30 19:30:53 CET,0.0 1.951 2.579 3.02 3.372 3.662 3.918 4.15 4.566 4.752 4.921 5.112 5.384 5.53 5.786 6.029 6.27 6.384 6.595 6.791 7.062 7.23 7.392 7.632 7.865 8.08 8.28 8.476 8.726 8.948 9.16 9.42 9.657 9.89 10.163 10.452 10.727 11.017 11.331 11.663 12.02 12.415 12.83 13.232 13.697 14.199 14.757 15.358 16.02 16.69 17.348 17.678 17.675 17.516 17.275 16.979 16.683 16.404 16.137 15.85 15.585 15.336 15.082 14.828 14.578 14.346 14.114 13.883 13.674 13.469 13.253 13.061 12.851 12.629 12.453 12.272 12.081 11.881 11.671 11.517 11.355 11.096 10.912 10.712 10.61 10.398 10.159 9.902 9.758 9.494 9.275 9.097 8.903 8.466 8.202 7.903 7.557 7.155 6.647 5.92 2.315 -4 ,22178 ,TETRA ,17621422,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:29:38 CET,0.0 2.166 2.77 3.184 3.528 3.82 4.064 4.274 4.652 4.831 5.004 5.217 5.477 5.619 5.874 6.112 6.334 6.448 6.669 6.87 7.154 7.325 7.489 7.728 7.957 8.179 8.387 8.579 8.818 9.046 9.267 9.529 9.791 10.039 10.308 10.606 10.886 11.187 11.5 11.822 12.152 12.526 12.948 13.377 13.88 14.394 14.954 15.561 16.241 16.925 17.577 17.957 18.001 17.835 17.569 17.276 17.008 16.747 16.503 16.242 15.996 15.774 15.554 15.324 15.099 14.885 14.64 14.413 14.218 14.011 13.802 13.627 13.435 13.215 13.04 12.869 12.695 12.502 12.286 12.134 11.975 11.721 11.537 11.343 11.244 11.041 10.83 10.59 10.452 10.208 10.022 9.865 9.688 9.283 9.052 8.785 8.465 8.082 7.602 6.931 3.363 -5 ,10122 ,TETRA ,17621423,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:45:22 CET,0.0 1.723 2.273 2.702 3.062 3.35 3.585 3.806 4.206 4.375 4.54 4.747 5.002 5.136 5.391 5.624 5.844 5.954 6.157 6.343 6.609 6.771 6.922 7.151 7.379 7.59 7.788 7.979 8.228 8.473 8.702 8.964 9.206 9.434 9.699 9.988 10.255 10.553 10.87 11.204 11.555 11.937 12.365 12.778 13.245 13.753 14.309 14.867 15.454 16.122 16.724 16.968 16.96 16.809 16.583 16.339 16.091 15.831 15.555 15.256 14.985 14.721 14.462 14.234 14.023 13.809 13.578 13.351 13.124 12.88 12.625 12.416 12.204 11.98 11.798 11.605 11.408 11.197 10.967 10.805 10.637 10.37 10.179 9.974 9.869 9.652 9.412 9.151 9.016 8.764 8.544 8.366 8.182 7.745 7.495 7.224 6.902 6.538 6.089 5.38 1.139 -6 ,15656 ,TETRA ,17621424,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:47:32 CET,0.0 2.067 2.713 3.173 3.52 3.812 4.067 4.295 4.7 4.883 5.056 5.253 5.509 5.645 5.898 6.141 6.377 6.487 6.689 6.883 7.169 7.347 7.517 7.75 7.967 8.179 8.388 8.594 8.855 9.098 9.323 9.601 9.86 10.1 10.383 10.693 10.976 11.279 11.599 11.949 12.315 12.705 13.138 13.555 14.017 14.502 15.01 15.561 16.193 16.86 17.458 17.703 17.65 17.427 17.12 16.821 16.527 16.221 15.904 15.532 15.204 14.907 14.615 14.338 14.091 13.859 13.602 13.361 13.143 12.915 12.67 12.46 12.242 12.024 11.847 11.659 11.469 11.254 11.012 10.849 10.686 10.426 10.24 10.045 9.944 9.722 9.471 9.19 9.041 8.78 8.557 8.376 8.18 7.747 7.509 7.231 6.91 6.527 6.043 5.313 2.126 -7 ,11307 ,TETRA ,17621425,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:30:31 CET,0.0 2.305 2.912 3.329 3.684 3.989 4.237 4.46 4.869 5.054 5.23 5.445 5.705 5.852 6.123 6.361 6.592 6.701 6.906 7.102 7.373 7.541 7.698 7.925 8.148 8.357 8.541 8.716 8.952 9.177 9.385 9.65 9.918 10.16 10.421 10.714 10.987 11.281 11.595 11.917 12.239 12.588 13.003 13.412 13.858 14.336 14.866 15.467 16.123 16.754 17.35 17.675 17.708 17.614 17.473 17.253 16.987 16.706 16.448 16.181 15.939 15.729 15.52 15.303 15.081 14.854 14.604 14.39 14.214 14.019 13.806 13.628 13.435 13.229 13.06 12.88 12.693 12.485 12.267 12.12 11.965 11.717 11.54 11.348 11.245 11.033 10.802 10.541 10.4 10.15 9.919 9.736 9.548 9.11 8.848 8.549 8.21 7.818 7.31 6.601 3.961 -8 ,3539 ,TETRA ,17621426,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:30:30 CET,0.0 1.955 2.501 2.915 3.252 3.549 3.806 4.03 4.429 4.612 4.781 4.981 5.235 5.372 5.623 5.849 6.066 6.17 6.367 6.558 6.831 7.008 7.179 7.417 7.637 7.848 8.049 8.236 8.478 8.707 8.927 9.191 9.432 9.666 9.943 10.249 10.528 10.813 11.12 11.444 11.777 12.168 12.609 13.038 13.518 14.015 14.554 15.109 15.739 16.366 16.92 17.168 17.155 16.991 16.774 16.546 16.284 16.015 15.76 15.481 15.235 15.001 14.763 14.524 14.306 14.108 13.881 13.659 13.471 13.279 13.057 12.865 12.673 12.467 12.299 12.125 11.935 11.743 11.536 11.386 11.237 10.988 10.806 10.614 10.514 10.293 10.035 9.767 9.63 9.367 9.149 8.967 8.776 8.383 8.141 7.845 7.523 7.153 6.66 5.915 2.262 -9 ,2171 ,TETRA ,17621427,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:48:08 CET,0.0 2.016 2.628 3.061 3.411 3.717 3.979 4.2 4.589 4.76 4.929 5.135 5.389 5.518 5.764 6.003 6.227 6.333 6.534 6.731 7.013 7.186 7.355 7.594 7.815 8.021 8.213 8.402 8.639 8.869 9.098 9.365 9.61 9.838 10.102 10.397 10.679 10.986 11.306 11.626 11.959 12.339 12.751 13.143 13.59 14.073 14.622 15.217 15.835 16.474 17.131 17.481 17.456 17.295 17.085 16.83 16.591 16.314 16.024 15.718 15.421 15.133 14.846 14.588 14.349 14.109 13.857 13.633 13.424 13.2 12.958 12.741 12.534 12.316 12.139 11.966 11.788 11.593 11.37 11.206 11.035 10.766 10.579 10.385 10.283 10.069 9.837 9.579 9.439 9.184 8.967 8.796 8.605 8.181 7.942 7.666 7.329 6.918 6.407 5.684 2.333 -10 ,18715 ,TETRA ,17621428,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:31:44 CET,0.0 1.542 2.127 2.56 2.906 3.197 3.458 3.693 4.114 4.31 4.486 4.687 4.954 5.108 5.391 5.648 5.89 6.003 6.214 6.412 6.696 6.877 7.05 7.311 7.547 7.771 7.987 8.176 8.426 8.671 8.89 9.145 9.38 9.612 9.881 10.174 10.449 10.756 11.093 11.429 11.779 12.177 12.622 13.055 13.516 14.014 14.579 15.187 15.86 16.523 17.094 17.315 17.231 17.058 16.81 16.518 16.235 15.959 15.7 15.416 15.171 14.919 14.648 14.396 14.15 13.906 13.641 13.402 13.192 12.968 12.735 12.539 12.329 12.099 11.914 11.718 11.508 11.289 11.056 10.895 10.728 10.455 10.258 10.053 9.947 9.72 9.472 9.203 9.059 8.802 8.588 8.413 8.224 7.79 7.546 7.262 6.931 6.539 6.053 5.352 2.322 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_55.txt deleted file mode 100644 index e775fd4d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25538 ,TETRA ,17621429,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:29:55 CET,0.0 2.314 2.901 3.313 3.653 3.947 4.202 4.434 4.846 5.026 5.192 5.386 5.631 5.765 6.022 6.263 6.488 6.594 6.788 6.966 7.234 7.409 7.572 7.806 8.023 8.224 8.43 8.623 8.843 9.066 9.297 9.572 9.816 10.046 10.318 10.624 10.898 11.183 11.49 11.813 12.146 12.506 12.927 13.345 13.805 14.296 14.809 15.327 15.909 16.526 17.069 17.253 17.164 16.977 16.739 16.466 16.203 15.918 15.637 15.332 15.058 14.809 14.54 14.271 14.028 13.795 13.546 13.319 13.125 12.922 12.703 12.513 12.314 12.107 11.933 11.733 11.519 11.309 11.08 10.917 10.749 10.481 10.287 10.082 9.974 9.743 9.496 9.235 9.097 8.858 8.657 8.483 8.302 7.901 7.662 7.39 7.097 6.758 6.333 5.725 3.372 -2 ,25318 ,TETRA ,17621430,Tue Nov 30 17:01:23 CET,Tue Nov 30 19:32:20 CET,0.0 1.84 2.415 2.854 3.216 3.507 3.751 3.979 4.394 4.582 4.759 4.966 5.21 5.34 5.595 5.833 6.058 6.161 6.36 6.558 6.837 7.003 7.159 7.386 7.597 7.802 8.001 8.186 8.418 8.635 8.841 9.095 9.334 9.552 9.795 10.054 10.303 10.58 10.888 11.203 11.511 11.863 12.282 12.697 13.159 13.64 14.175 14.725 15.28 15.872 16.474 16.739 16.652 16.44 16.194 15.897 15.58 15.282 15.016 14.741 14.484 14.231 13.984 13.752 13.513 13.278 13.053 12.852 12.657 12.455 12.246 12.06 11.853 11.634 11.46 11.278 11.083 10.868 10.634 10.474 10.311 10.056 9.877 9.674 9.564 9.349 9.108 8.84 8.703 8.453 8.25 8.073 7.879 7.444 7.199 6.927 6.618 6.246 5.756 5.072 1.933 -3 ,30272 ,TETRA ,17621431,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:29:36 CET,0.0 2.009 2.615 3.057 3.4 3.684 3.922 4.153 4.579 4.77 4.956 5.156 5.413 5.556 5.816 6.067 6.302 6.408 6.615 6.807 7.073 7.248 7.424 7.671 7.894 8.103 8.303 8.499 8.754 8.993 9.215 9.487 9.744 9.98 10.241 10.532 10.818 11.113 11.425 11.77 12.117 12.489 12.903 13.313 13.79 14.296 14.833 15.38 15.946 16.618 17.295 17.456 17.319 17.104 16.847 16.532 16.18 15.863 15.592 15.292 15.012 14.759 14.51 14.266 14.038 13.819 13.585 13.364 13.171 12.972 12.759 12.576 12.385 12.175 12.013 11.848 11.66 11.452 11.225 11.067 10.908 10.65 10.468 10.272 10.166 9.94 9.691 9.428 9.292 9.043 8.83 8.665 8.488 8.091 7.86 7.586 7.262 6.867 6.377 5.697 3.067 -4 ,5402 ,TETRA ,17621432,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:30:46 CET,0.0 2.258 2.836 3.237 3.557 3.847 4.099 4.332 4.753 4.934 5.1 5.286 5.539 5.678 5.942 6.172 6.379 6.484 6.685 6.875 7.14 7.308 7.471 7.707 7.927 8.137 8.339 8.531 8.78 9.026 9.247 9.502 9.742 9.963 10.221 10.511 10.771 11.044 11.353 11.677 11.986 12.341 12.758 13.177 13.657 14.166 14.732 15.283 15.825 16.388 16.903 17.091 17.048 16.847 16.549 16.269 16.001 15.713 15.45 15.142 14.863 14.613 14.357 14.11 13.878 13.661 13.422 13.182 12.963 12.743 12.516 12.326 12.131 11.914 11.733 11.54 11.343 11.152 10.952 10.809 10.657 10.406 10.222 10.029 9.927 9.712 9.482 9.245 9.116 8.872 8.67 8.504 8.327 7.917 7.692 7.446 7.145 6.804 6.363 5.667 2.772 -5 ,28412 ,TETRA ,17621433,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:30:46 CET,0.0 1.952 2.497 2.903 3.23 3.508 3.765 3.991 4.396 4.587 4.767 4.976 5.239 5.38 5.64 5.869 6.079 6.19 6.418 6.62 6.89 7.065 7.237 7.491 7.729 7.95 8.158 8.355 8.594 8.818 9.048 9.316 9.563 9.797 10.064 10.352 10.617 10.902 11.207 11.531 11.853 12.21 12.624 13.027 13.484 14.011 14.619 15.235 15.869 16.504 17.065 17.271 17.145 16.879 16.591 16.285 15.961 15.66 15.395 15.09 14.802 14.537 14.285 14.028 13.762 13.512 13.256 13.023 12.818 12.596 12.353 12.147 11.932 11.699 11.514 11.331 11.135 10.924 10.71 10.552 10.385 10.129 9.944 9.744 9.636 9.412 9.177 8.918 8.78 8.532 8.336 8.164 7.983 7.587 7.352 7.092 6.793 6.42 5.957 5.342 2.816 -6 ,2952 ,TETRA ,17621434,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:54:16 CET,0.0 2.159 2.757 3.166 3.488 3.78 4.045 4.284 4.707 4.892 5.059 5.257 5.514 5.656 5.913 6.141 6.357 6.465 6.672 6.863 7.131 7.299 7.461 7.689 7.899 8.102 8.305 8.507 8.758 9.002 9.237 9.499 9.75 9.984 10.252 10.543 10.808 11.102 11.428 11.763 12.098 12.465 12.882 13.291 13.763 14.289 14.86 15.453 16.099 16.743 17.266 17.374 17.21 16.983 16.737 16.466 16.182 15.887 15.613 15.314 15.016 14.732 14.472 14.24 14.026 13.818 13.586 13.365 13.177 12.974 12.751 12.565 12.362 12.149 11.987 11.815 11.635 11.448 11.235 11.07 10.903 10.651 10.477 10.295 10.195 9.989 9.774 9.526 9.39 9.151 8.971 8.803 8.617 8.209 7.976 7.715 7.406 7.043 6.615 6.005 3.112 -7 ,8773 ,TETRA ,17621435,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:50:59 CET,0.0 2.241 2.864 3.323 3.706 4.021 4.293 4.533 4.962 5.15 5.313 5.505 5.759 5.895 6.156 6.386 6.601 6.705 6.917 7.116 7.383 7.554 7.717 7.956 8.186 8.396 8.592 8.78 9.025 9.258 9.478 9.748 9.998 10.225 10.489 10.79 11.073 11.362 11.668 11.99 12.329 12.7 13.124 13.541 13.999 14.512 15.085 15.676 16.313 16.914 17.399 17.532 17.355 17.043 16.72 16.411 16.107 15.796 15.488 15.162 14.88 14.62 14.384 14.15 13.903 13.675 13.441 13.217 13.016 12.805 12.577 12.382 12.177 11.96 11.789 11.609 11.425 11.219 10.991 10.843 10.689 10.425 10.234 10.037 9.938 9.728 9.486 9.222 9.083 8.836 8.627 8.452 8.261 7.823 7.583 7.317 6.994 6.623 6.18 5.513 2.308 -8 ,17798 ,TETRA ,17621436,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:49:43 CET,0.0 1.949 2.512 2.939 3.274 3.568 3.827 4.064 4.489 4.682 4.865 5.072 5.314 5.45 5.722 5.962 6.181 6.286 6.488 6.69 6.974 7.148 7.316 7.557 7.782 7.998 8.209 8.408 8.648 8.875 9.095 9.355 9.608 9.853 10.121 10.411 10.69 10.986 11.297 11.627 11.965 12.33 12.728 13.108 13.558 14.051 14.605 15.178 15.746 16.335 16.877 17.096 17.028 16.819 16.541 16.22 15.92 15.619 15.334 15.038 14.771 14.53 14.292 14.064 13.839 13.63 13.412 13.203 13.02 12.823 12.592 12.39 12.176 11.949 11.773 11.595 11.41 11.201 10.972 10.818 10.656 10.383 10.195 9.999 9.891 9.669 9.436 9.181 9.042 8.789 8.574 8.396 8.212 7.802 7.565 7.302 6.994 6.618 6.094 5.349 2.525 -9 ,10862 ,TETRA ,17621437,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:28:41 CET,0.0 2.328 3.016 3.475 3.809 4.086 4.34 4.596 5.065 5.256 5.429 5.64 5.899 6.041 6.295 6.527 6.745 6.847 7.044 7.232 7.502 7.671 7.828 8.05 8.261 8.461 8.654 8.845 9.089 9.318 9.53 9.784 10.024 10.252 10.515 10.806 11.067 11.35 11.67 12.003 12.341 12.719 13.137 13.542 14.013 14.486 14.983 15.484 16.009 16.594 17.083 17.238 17.148 16.915 16.625 16.34 16.037 15.734 15.488 15.221 14.95 14.703 14.465 14.232 14.005 13.782 13.548 13.331 13.135 12.919 12.694 12.518 12.333 12.139 11.976 11.797 11.619 11.425 11.223 11.084 10.928 10.675 10.499 10.307 10.206 9.997 9.772 9.531 9.402 9.158 8.961 8.8 8.622 8.213 7.978 7.712 7.396 7.026 6.563 5.886 2.857 -10 ,6613 ,TETRA ,17621438,Tue Nov 30 17:01:41 CET,Tue Nov 30 19:52:19 CET,0.0 2.063 2.628 3.032 3.369 3.665 3.924 4.143 4.518 4.687 4.854 5.044 5.295 5.432 5.697 5.938 6.157 6.262 6.466 6.659 6.938 7.111 7.275 7.517 7.742 7.945 8.135 8.324 8.561 8.785 9.005 9.257 9.486 9.713 9.978 10.255 10.523 10.823 11.135 11.463 11.802 12.186 12.624 13.038 13.506 13.982 14.462 14.992 15.59 16.203 16.77 17.018 16.941 16.747 16.493 16.21 15.907 15.593 15.304 15.0 14.736 14.481 14.216 13.973 13.745 13.526 13.284 13.07 12.88 12.68 12.472 12.278 12.068 11.856 11.69 11.512 11.324 11.124 10.906 10.748 10.585 10.335 10.151 9.946 9.84 9.624 9.383 9.118 8.979 8.733 8.532 8.359 8.163 7.733 7.495 7.229 6.912 6.55 6.11 5.44 3.004 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_57_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_57_35.txt deleted file mode 100644 index 5a36096f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_57_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6629 ,TETRA ,17621439,Tue Nov 30 17:01:42 CET,Tue Nov 30 19:33:01 CET,0.0 1.868 2.425 2.841 3.199 3.483 3.731 3.954 4.358 4.539 4.698 4.885 5.122 5.244 5.47 5.68 5.888 5.985 6.171 6.346 6.583 6.74 6.891 7.106 7.31 7.5 7.674 7.833 8.037 8.232 8.419 8.647 8.857 9.056 9.278 9.504 9.704 9.91 10.114 10.313 10.528 10.764 11.016 11.23 11.451 11.673 11.885 12.044 12.131 12.033 11.465 10.553 9.708 8.886 8.147 7.471 6.859 6.302 5.791 5.241 4.76 4.334 3.948 3.594 3.244 2.896 2.545 2.257 1.997 1.713 1.408 1.148 0.886 0.606 0.383 0.148 -0.098 -0.356 -0.629 -0.82 -1.029 -1.358 -1.582 -1.825 -1.95 -2.211 -2.494 -2.806 -2.975 -3.255 -3.507 -3.694 -3.89 -4.336 -4.58 -4.867 -5.222 -5.619 -6.08 -6.669 -8.726 -2 ,9269 ,TETRA ,17621440,Tue Nov 30 17:01:42 CET,Tue Nov 30 19:28:38 CET,0.0 2.279 2.87 3.285 3.631 3.914 4.168 4.398 4.779 4.944 5.095 5.276 5.506 5.625 5.855 6.079 6.278 6.374 6.561 6.731 6.968 7.117 7.266 7.481 7.672 7.843 8.001 8.152 8.347 8.524 8.684 8.875 9.061 9.239 9.44 9.672 9.889 10.112 10.339 10.575 10.819 11.062 11.302 11.539 11.811 12.094 12.375 12.573 12.696 12.678 12.339 11.774 11.089 10.378 9.74 9.104 8.508 7.98 7.54 7.066 6.641 6.278 5.915 5.532 5.168 4.84 4.482 4.161 3.881 3.591 3.294 3.044 2.79 2.523 2.298 2.058 1.823 1.588 1.336 1.154 0.962 0.653 0.431 0.188 0.063 -0.191 -0.46 -0.755 -0.91 -1.182 -1.439 -1.64 -1.847 -2.312 -2.587 -2.903 -3.253 -3.623 -4.046 -4.596 -6.404 -3 ,21168 ,TETRA ,17621441,Tue Nov 30 17:01:42 CET,Tue Nov 30 19:28:41 CET,0.0 2.194 2.76 3.164 3.495 3.78 4.033 4.263 4.681 4.863 5.019 5.199 5.436 5.566 5.809 6.029 6.24 6.339 6.517 6.681 6.916 7.061 7.195 7.386 7.57 7.751 7.929 8.094 8.297 8.495 8.688 8.922 9.127 9.31 9.512 9.725 9.926 10.139 10.367 10.58 10.777 11.013 11.277 11.517 11.801 12.099 12.342 12.55 12.717 12.695 12.346 11.616 10.834 10.131 9.526 8.928 8.351 7.801 7.329 6.822 6.395 6.033 5.655 5.279 4.935 4.626 4.3 4.016 3.758 3.479 3.178 2.925 2.663 2.382 2.154 1.917 1.674 1.41 1.131 0.94 0.743 0.43 0.203 -0.04 -0.164 -0.415 -0.68 -0.973 -1.134 -1.412 -1.661 -1.855 -2.062 -2.53 -2.792 -3.083 -3.415 -3.808 -4.324 -5.053 -7.581 -4 ,28698 ,TETRA ,17621442,Tue Nov 30 17:01:39 CET,Tue Nov 30 19:30:47 CET,0.0 1.984 2.578 3.0 3.328 3.626 3.884 4.105 4.48 4.638 4.794 4.991 5.219 5.34 5.576 5.791 5.985 6.077 6.254 6.417 6.642 6.795 6.948 7.144 7.331 7.512 7.674 7.824 8.02 8.201 8.366 8.559 8.752 8.942 9.153 9.383 9.597 9.822 10.049 10.27 10.49 10.723 10.966 11.204 11.471 11.716 11.932 12.107 12.195 12.156 11.778 11.0 10.231 9.492 8.792 8.13 7.513 6.945 6.462 5.976 5.548 5.159 4.792 4.427 4.076 3.762 3.425 3.108 2.833 2.543 2.242 2.0 1.73 1.424 1.195 0.965 0.725 0.459 0.171 -0.018 -0.213 -0.524 -0.742 -0.972 -1.09 -1.341 -1.618 -1.924 -2.091 -2.368 -2.645 -2.845 -3.049 -3.516 -3.793 -4.118 -4.476 -4.89 -5.382 -6.029 -8.022 -5 ,25524 ,TETRA ,17621443,Tue Nov 30 17:02:18 CET,Tue Nov 30 19:30:43 CET,0.0 1.94 2.485 2.891 3.24 3.547 3.801 4.022 4.407 4.573 4.735 4.938 5.176 5.303 5.524 5.73 5.938 6.041 6.233 6.405 6.655 6.809 6.955 7.162 7.351 7.53 7.706 7.868 8.069 8.27 8.455 8.666 8.865 9.048 9.261 9.497 9.711 9.938 10.169 10.415 10.661 10.885 11.13 11.386 11.655 11.916 12.167 12.394 12.542 12.532 12.194 11.438 10.646 9.881 9.173 8.531 7.966 7.41 6.928 6.458 6.032 5.651 5.297 4.948 4.602 4.268 3.908 3.602 3.339 3.043 2.73 2.48 2.225 1.951 1.722 1.487 1.244 0.996 0.741 0.559 0.376 0.062 -0.172 -0.42 -0.548 -0.798 -1.069 -1.361 -1.516 -1.791 -2.037 -2.223 -2.422 -2.876 -3.132 -3.419 -3.734 -4.091 -4.544 -5.227 -7.659 -6 ,17282 ,TETRA ,17621444,Tue Nov 30 17:02:21 CET,Tue Nov 30 19:30:19 CET,0.0 1.866 2.42 2.803 3.116 3.396 3.648 3.865 4.237 4.404 4.569 4.775 5.016 5.142 5.367 5.582 5.784 5.883 6.081 6.267 6.51 6.656 6.804 7.018 7.224 7.419 7.593 7.75 7.941 8.126 8.303 8.501 8.682 8.858 9.061 9.279 9.482 9.693 9.917 10.155 10.39 10.626 10.873 11.11 11.354 11.578 11.813 12.022 12.115 12.071 11.71 10.902 10.087 9.352 8.684 8.044 7.491 6.969 6.478 5.971 5.524 5.126 4.739 4.366 4.014 3.688 3.343 3.026 2.744 2.456 2.158 1.903 1.635 1.361 1.143 0.912 0.681 0.434 0.176 -0.013 -0.216 -0.539 -0.772 -1.005 -1.122 -1.381 -1.656 -1.938 -2.093 -2.375 -2.615 -2.799 -3.009 -3.516 -3.799 -4.092 -4.426 -4.824 -5.337 -6.021 -8.053 -7 ,4492 ,TETRA ,17621445,Tue Nov 30 17:02:20 CET,Tue Nov 30 19:33:59 CET,0.0 1.777 2.381 2.806 3.141 3.415 3.649 3.873 4.277 4.45 4.611 4.796 5.034 5.17 5.41 5.634 5.844 5.942 6.125 6.296 6.537 6.691 6.838 7.026 7.205 7.381 7.543 7.692 7.881 8.067 8.249 8.464 8.661 8.847 9.047 9.257 9.471 9.684 9.876 10.086 10.303 10.548 10.81 11.05 11.3 11.529 11.733 11.882 11.991 12.019 11.7 10.926 10.165 9.379 8.609 7.881 7.233 6.676 6.192 5.689 5.257 4.873 4.508 4.162 3.805 3.479 3.157 2.866 2.613 2.328 2.015 1.758 1.502 1.246 1.041 0.806 0.557 0.29 0.021 -0.151 -0.339 -0.645 -0.866 -1.092 -1.207 -1.466 -1.76 -2.066 -2.219 -2.486 -2.736 -2.935 -3.15 -3.611 -3.886 -4.189 -4.513 -4.892 -5.343 -6.033 -8.628 -8 ,4193 ,TETRA ,17621446,Tue Nov 30 17:02:23 CET,Tue Nov 30 19:31:34 CET,0.0 2.269 2.85 3.244 3.584 3.856 4.08 4.287 4.658 4.82 4.98 5.199 5.437 5.562 5.794 6.01 6.216 6.314 6.5 6.671 6.9 7.043 7.182 7.384 7.582 7.765 7.925 8.073 8.272 8.466 8.656 8.883 9.093 9.286 9.496 9.723 9.936 10.159 10.38 10.609 10.858 11.104 11.363 11.624 11.907 12.175 12.427 12.623 12.744 12.759 12.428 11.708 10.941 10.208 9.552 8.929 8.336 7.793 7.33 6.838 6.409 6.022 5.629 5.254 4.909 4.592 4.259 3.95 3.664 3.369 3.072 2.813 2.536 2.245 2.006 1.755 1.507 1.248 0.961 0.754 0.538 0.182 -0.071 -0.322 -0.453 -0.727 -1.008 -1.32 -1.492 -1.788 -2.068 -2.272 -2.489 -2.998 -3.291 -3.607 -3.957 -4.367 -4.866 -5.551 -7.975 -9 ,20544 ,TETRA ,17621447,Tue Nov 30 17:02:20 CET,Tue Nov 30 19:30:36 CET,0.0 1.83 2.415 2.856 3.209 3.518 3.802 4.05 4.447 4.615 4.776 4.975 5.21 5.332 5.568 5.791 5.989 6.081 6.256 6.423 6.665 6.813 6.952 7.154 7.359 7.552 7.723 7.89 8.105 8.306 8.492 8.71 8.915 9.111 9.328 9.555 9.765 9.983 10.207 10.436 10.671 10.923 11.17 11.406 11.671 11.917 12.156 12.362 12.488 12.413 11.976 11.206 10.439 9.702 9.013 8.354 7.799 7.302 6.842 6.36 5.926 5.535 5.167 4.816 4.466 4.129 3.777 3.465 3.19 2.905 2.616 2.377 2.121 1.842 1.618 1.38 1.132 0.879 0.621 0.436 0.25 -0.039 -0.266 -0.505 -0.625 -0.878 -1.143 -1.429 -1.584 -1.851 -2.095 -2.285 -2.491 -2.971 -3.256 -3.551 -3.877 -4.288 -4.814 -5.544 -8.039 -10 ,15594 ,TETRA ,17621448,Tue Nov 30 17:03:21 CET,Tue Nov 30 19:35:00 CET,0.0 2.233 2.826 3.225 3.539 3.812 4.05 4.258 4.627 4.788 4.941 5.146 5.378 5.495 5.726 5.949 6.151 6.246 6.424 6.592 6.839 6.995 7.142 7.348 7.543 7.736 7.915 8.082 8.294 8.483 8.657 8.873 9.082 9.278 9.492 9.733 9.958 10.187 10.424 10.666 10.901 11.137 11.412 11.657 11.888 12.104 12.321 12.484 12.552 12.478 12.092 11.362 10.644 9.942 9.256 8.609 8.032 7.501 7.033 6.559 6.106 5.676 5.289 4.92 4.568 4.261 3.927 3.605 3.323 3.022 2.705 2.453 2.19 1.905 1.682 1.447 1.21 0.969 0.698 0.51 0.318 0.006 -0.215 -0.447 -0.57 -0.826 -1.105 -1.418 -1.58 -1.853 -2.126 -2.331 -2.534 -2.975 -3.22 -3.501 -3.817 -4.198 -4.689 -5.337 -7.823 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_58.txt deleted file mode 100644 index 7b77a414..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19662 ,TETRA ,17621449,Tue Nov 30 17:03:21 CET,Tue Nov 30 19:39:18 CET,0.0 1.743 2.29 2.701 3.027 3.298 3.545 3.79 4.229 4.415 4.579 4.781 5.006 5.138 5.385 5.605 5.809 5.901 6.073 6.245 6.486 6.632 6.772 6.978 7.173 7.348 7.501 7.646 7.824 7.987 8.151 8.337 8.509 8.675 8.855 9.049 9.229 9.411 9.588 9.759 9.915 10.081 10.272 10.438 10.579 10.663 10.689 10.622 10.436 9.999 8.99 7.596 6.346 5.26 4.334 3.481 2.713 2.017 1.416 0.811 0.293 -0.159 -0.596 -1.018 -1.412 -1.771 -2.15 -2.496 -2.807 -3.13 -3.462 -3.742 -4.034 -4.346 -4.59 -4.838 -5.1 -5.379 -5.669 -5.874 -6.088 -6.435 -6.685 -6.939 -7.066 -7.336 -7.643 -7.972 -8.147 -8.426 -8.738 -8.951 -9.171 -9.684 -9.986 -10.317 -10.66 -11.051 -11.533 -12.174 -14.152 -2 ,12382 ,TETRA ,17621450,Tue Nov 30 17:03:21 CET,Tue Nov 30 19:31:19 CET,0.0 1.743 2.273 2.655 2.981 3.272 3.505 3.709 4.105 4.283 4.446 4.661 4.899 5.032 5.264 5.48 5.667 5.756 5.937 6.107 6.344 6.5 6.644 6.825 6.994 7.167 7.324 7.465 7.641 7.811 7.969 8.144 8.309 8.462 8.629 8.814 8.98 9.15 9.329 9.499 9.651 9.8 9.957 10.088 10.217 10.333 10.362 10.291 10.08 9.539 8.478 7.154 5.949 4.852 3.939 3.115 2.361 1.667 1.057 0.44 -0.088 -0.549 -0.993 -1.416 -1.814 -2.186 -2.578 -2.928 -3.235 -3.549 -3.865 -4.153 -4.467 -4.776 -5.02 -5.275 -5.542 -5.829 -6.126 -6.333 -6.543 -6.878 -7.117 -7.372 -7.511 -7.801 -8.116 -8.448 -8.629 -8.931 -9.251 -9.462 -9.689 -10.231 -10.541 -10.871 -11.224 -11.627 -12.108 -12.792 -14.474 -3 ,6194 ,TETRA ,17621451,Tue Nov 30 17:04:23 CET,Tue Nov 30 19:36:51 CET,0.0 1.581 2.137 2.551 2.898 3.209 3.487 3.728 4.134 4.31 4.479 4.684 4.902 5.025 5.254 5.467 5.674 5.77 5.954 6.129 6.362 6.51 6.644 6.828 6.999 7.156 7.31 7.452 7.626 7.812 7.993 8.191 8.375 8.542 8.719 8.908 9.08 9.244 9.413 9.586 9.738 9.889 10.064 10.216 10.332 10.404 10.439 10.394 10.197 9.71 8.727 7.399 6.151 5.009 4.013 3.139 2.376 1.699 1.116 0.511 -0.009 -0.475 -0.949 -1.407 -1.834 -2.229 -2.659 -3.046 -3.361 -3.685 -4.026 -4.317 -4.611 -4.916 -5.169 -5.434 -5.707 -5.998 -6.304 -6.508 -6.726 -7.07 -7.314 -7.574 -7.707 -7.982 -8.275 -8.602 -8.779 -9.068 -9.355 -9.573 -9.804 -10.308 -10.6 -10.917 -11.287 -11.725 -12.215 -12.807 -14.5 -4 ,18588 ,TETRA ,17621452,Tue Nov 30 17:04:23 CET,Tue Nov 30 19:33:14 CET,0.0 2.209 2.79 3.208 3.533 3.816 4.057 4.264 4.641 4.822 4.997 5.21 5.436 5.558 5.783 5.995 6.196 6.291 6.467 6.635 6.872 7.018 7.162 7.357 7.526 7.688 7.84 7.982 8.16 8.333 8.498 8.684 8.841 8.987 9.162 9.35 9.516 9.688 9.878 10.048 10.198 10.398 10.624 10.761 10.86 10.931 10.952 10.879 10.664 10.267 9.417 8.192 7.051 5.963 5.021 4.216 3.518 2.858 2.272 1.703 1.198 0.727 0.274 -0.156 -0.557 -0.926 -1.321 -1.673 -1.968 -2.278 -2.622 -2.92 -3.227 -3.533 -3.768 -4.019 -4.282 -4.559 -4.848 -5.047 -5.262 -5.609 -5.863 -6.128 -6.262 -6.564 -6.888 -7.221 -7.391 -7.678 -7.974 -8.174 -8.386 -8.853 -9.12 -9.425 -9.762 -10.153 -10.644 -11.261 -12.88 -5 ,25643 ,TETRA ,17621453,Tue Nov 30 17:04:23 CET,Tue Nov 30 19:34:04 CET,0.0 1.645 2.189 2.583 2.912 3.189 3.427 3.646 4.051 4.228 4.395 4.621 4.842 4.976 5.23 5.449 5.64 5.731 5.9 6.064 6.31 6.464 6.607 6.812 7.002 7.17 7.331 7.48 7.671 7.851 8.008 8.19 8.354 8.497 8.669 8.856 9.011 9.167 9.332 9.49 9.633 9.781 9.915 10.004 10.076 10.122 10.127 10.068 9.858 9.425 8.477 7.071 5.829 4.705 3.709 2.841 2.084 1.392 0.8 0.196 -0.333 -0.8 -1.259 -1.689 -2.088 -2.463 -2.858 -3.2 -3.495 -3.815 -4.148 -4.425 -4.713 -5.021 -5.272 -5.532 -5.803 -6.09 -6.387 -6.584 -6.789 -7.111 -7.351 -7.606 -7.735 -8.002 -8.291 -8.604 -8.774 -9.056 -9.338 -9.54 -9.753 -10.234 -10.51 -10.81 -11.138 -11.523 -12.019 -12.663 -14.352 -6 ,5973 ,TETRA ,17621454,Tue Nov 30 17:04:23 CET,Tue Nov 30 19:40:27 CET,0.0 1.468 2.06 2.489 2.83 3.126 3.382 3.614 4.03 4.214 4.389 4.624 4.858 4.99 5.232 5.459 5.677 5.778 5.959 6.132 6.372 6.516 6.657 6.857 7.043 7.218 7.383 7.537 7.72 7.884 8.041 8.225 8.389 8.541 8.714 8.901 9.072 9.261 9.451 9.638 9.829 10.01 10.181 10.332 10.469 10.567 10.633 10.621 10.451 10.02 9.102 7.807 6.588 5.517 4.613 3.784 3.057 2.398 1.806 1.211 0.698 0.25 -0.179 -0.597 -0.993 -1.357 -1.73 -2.084 -2.403 -2.728 -3.073 -3.365 -3.655 -3.96 -4.209 -4.47 -4.743 -5.017 -5.326 -5.543 -5.75 -6.082 -6.322 -6.581 -6.723 -7.021 -7.325 -7.644 -7.818 -8.107 -8.418 -8.625 -8.842 -9.329 -9.605 -9.908 -10.255 -10.661 -11.168 -11.86 -14.197 -7 ,13138 ,TETRA ,17621455,Tue Nov 30 17:04:23 CET,Tue Nov 30 19:38:49 CET,0.0 1.283 1.815 2.203 2.521 2.803 3.059 3.282 3.659 3.834 4.002 4.234 4.472 4.603 4.856 5.101 5.311 5.408 5.601 5.772 6.002 6.165 6.315 6.504 6.682 6.843 6.998 7.149 7.339 7.514 7.668 7.85 8.02 8.175 8.348 8.541 8.745 8.932 9.096 9.286 9.461 9.629 9.792 9.937 10.086 10.191 10.237 10.19 9.962 9.469 8.462 7.018 5.813 4.749 3.8 2.967 2.224 1.555 0.978 0.396 -0.112 -0.57 -1.006 -1.427 -1.829 -2.202 -2.594 -2.96 -3.286 -3.608 -3.938 -4.218 -4.519 -4.842 -5.09 -5.352 -5.627 -5.918 -6.224 -6.437 -6.658 -7.004 -7.249 -7.508 -7.641 -7.917 -8.218 -8.548 -8.723 -8.996 -9.268 -9.474 -9.689 -10.183 -10.467 -10.771 -11.104 -11.492 -11.961 -12.585 -14.56 -8 ,24798 ,TETRA ,17621456,Tue Nov 30 17:04:23 CET,Tue Nov 30 19:33:26 CET,0.0 1.785 2.353 2.78 3.166 3.503 3.783 4.025 4.463 4.662 4.847 5.099 5.349 5.496 5.77 6.021 6.251 6.354 6.539 6.703 6.947 7.102 7.253 7.47 7.674 7.865 8.031 8.184 8.374 8.551 8.728 8.934 9.11 9.277 9.467 9.667 9.849 10.036 10.223 10.402 10.563 10.714 10.864 10.996 11.117 11.21 11.26 11.204 10.946 10.425 9.351 7.906 6.633 5.487 4.483 3.568 2.786 2.094 1.516 0.941 0.429 -0.037 -0.492 -0.912 -1.312 -1.697 -2.092 -2.438 -2.731 -3.043 -3.384 -3.67 -3.967 -4.279 -4.526 -4.787 -5.067 -5.36 -5.657 -5.856 -6.068 -6.439 -6.701 -6.963 -7.097 -7.378 -7.69 -8.044 -8.233 -8.523 -8.827 -9.055 -9.301 -9.826 -10.116 -10.438 -10.803 -11.221 -11.729 -12.457 -14.603 -9 ,25772 ,TETRA ,17621457,Tue Nov 30 17:04:23 CET,Tue Nov 30 19:37:49 CET,0.0 1.783 2.37 2.796 3.126 3.411 3.672 3.907 4.301 4.474 4.637 4.871 5.113 5.246 5.488 5.706 5.906 6.002 6.187 6.36 6.595 6.741 6.882 7.088 7.276 7.453 7.636 7.804 8.004 8.194 8.368 8.564 8.748 8.932 9.131 9.327 9.507 9.682 9.857 10.033 10.192 10.357 10.525 10.672 10.813 10.942 11.039 11.074 10.973 10.554 9.574 8.174 6.95 5.838 4.85 3.992 3.245 2.558 1.964 1.374 0.862 0.401 -0.069 -0.528 -0.939 -1.303 -1.692 -2.052 -2.371 -2.708 -3.046 -3.323 -3.615 -3.922 -4.17 -4.428 -4.693 -4.974 -5.258 -5.455 -5.679 -6.041 -6.293 -6.556 -6.687 -6.976 -7.291 -7.613 -7.785 -8.062 -8.331 -8.543 -8.774 -9.29 -9.584 -9.912 -10.294 -10.728 -11.217 -11.811 -13.791 -10 ,23012 ,TETRA ,17621458,Tue Nov 30 17:04:23 CET,Tue Nov 30 19:31:55 CET,0.0 1.629 2.224 2.648 2.969 3.233 3.461 3.665 4.014 4.179 4.345 4.547 4.766 4.89 5.125 5.35 5.55 5.64 5.805 5.966 6.197 6.337 6.477 6.67 6.845 7.014 7.162 7.299 7.472 7.629 7.794 7.992 8.16 8.313 8.479 8.65 8.821 8.999 9.165 9.341 9.528 9.719 9.891 10.038 10.191 10.32 10.38 10.325 10.13 9.731 8.73 7.275 6.075 4.989 4.016 3.153 2.378 1.685 1.103 0.504 -0.037 -0.536 -1.001 -1.432 -1.848 -2.222 -2.603 -2.95 -3.256 -3.575 -3.913 -4.199 -4.49 -4.792 -5.032 -5.284 -5.555 -5.826 -6.117 -6.333 -6.559 -6.919 -7.175 -7.444 -7.581 -7.864 -8.167 -8.489 -8.667 -8.966 -9.268 -9.483 -9.722 -10.252 -10.556 -10.895 -11.248 -11.678 -12.218 -12.86 -14.455 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_62.txt deleted file mode 100644 index 389fe692..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10148 ,TETRA ,17621459,Tue Nov 30 17:04:23 CET,Tue Nov 30 19:35:24 CET,0.0 1.384 1.909 2.329 2.672 2.962 3.217 3.457 3.867 4.049 4.222 4.453 4.684 4.817 5.07 5.305 5.529 5.632 5.817 6.0 6.264 6.426 6.579 6.799 6.999 7.19 7.377 7.557 7.773 7.963 8.143 8.354 8.553 8.746 8.969 9.204 9.427 9.678 9.943 10.202 10.457 10.763 11.09 11.366 11.688 12.037 12.377 12.676 12.873 12.955 12.842 12.262 11.549 10.919 10.34 9.749 9.187 8.671 8.218 7.756 7.342 6.942 6.55 6.179 5.829 5.508 5.161 4.828 4.535 4.245 3.944 3.683 3.402 3.104 2.87 2.634 2.389 2.115 1.82 1.62 1.408 1.05 0.797 0.538 0.404 0.124 -0.183 -0.528 -0.704 -0.977 -1.292 -1.511 -1.741 -2.278 -2.595 -2.942 -3.331 -3.783 -4.338 -5.112 -7.76 -2 ,20970 ,TETRA ,17621460,Tue Nov 30 17:04:24 CET,Tue Nov 30 19:31:06 CET,0.0 1.357 1.92 2.297 2.607 2.874 3.114 3.343 3.755 3.932 4.099 4.302 4.527 4.671 4.954 5.216 5.45 5.552 5.743 5.923 6.196 6.366 6.515 6.736 6.951 7.141 7.316 7.491 7.708 7.91 8.101 8.329 8.539 8.722 8.929 9.161 9.371 9.595 9.844 10.102 10.345 10.605 10.89 11.15 11.438 11.715 12.034 12.379 12.624 12.74 12.537 11.931 11.272 10.606 9.982 9.388 8.851 8.362 7.918 7.442 6.983 6.553 6.14 5.738 5.352 5.011 4.643 4.302 4.014 3.717 3.406 3.133 2.843 2.543 2.314 2.074 1.825 1.56 1.267 1.057 0.829 0.469 0.213 -0.062 -0.202 -0.497 -0.81 -1.155 -1.351 -1.653 -2.0 -2.242 -2.48 -3.02 -3.324 -3.646 -4.025 -4.492 -5.06 -5.828 -8.182 -3 ,10017 ,TETRA ,17621461,Tue Nov 30 17:04:24 CET,Tue Nov 30 19:46:51 CET,0.0 1.559 2.1 2.47 2.777 3.059 3.308 3.528 3.923 4.117 4.302 4.527 4.771 4.91 5.162 5.387 5.6 5.706 5.901 6.083 6.343 6.504 6.66 6.884 7.087 7.271 7.449 7.615 7.828 8.024 8.203 8.419 8.625 8.821 9.028 9.252 9.474 9.722 9.972 10.22 10.468 10.726 11.01 11.282 11.586 11.865 12.123 12.376 12.634 12.79 12.584 11.972 11.276 10.573 9.871 9.197 8.549 7.934 7.4 6.843 6.346 5.914 5.501 5.097 4.728 4.394 4.019 3.667 3.369 3.043 2.689 2.395 2.086 1.755 1.492 1.225 0.952 0.673 0.373 0.157 -0.061 -0.414 -0.671 -0.937 -1.077 -1.379 -1.706 -2.071 -2.271 -2.577 -2.937 -3.187 -3.443 -3.974 -4.281 -4.638 -5.032 -5.478 -6.026 -6.762 -8.902 -4 ,23216 ,TETRA ,17621462,Tue Nov 30 17:04:27 CET,Tue Nov 30 19:32:11 CET,0.0 1.791 2.324 2.74 3.099 3.404 3.677 3.926 4.371 4.563 4.733 4.957 5.189 5.325 5.579 5.807 6.017 6.12 6.318 6.502 6.753 6.914 7.072 7.293 7.487 7.673 7.852 8.013 8.222 8.415 8.593 8.812 9.022 9.224 9.445 9.692 9.919 10.15 10.398 10.647 10.885 11.155 11.461 11.718 12.009 12.318 12.611 12.909 13.135 13.136 12.783 12.072 11.328 10.61 9.869 9.176 8.605 8.063 7.555 7.032 6.56 6.118 5.713 5.324 4.937 4.578 4.192 3.833 3.522 3.211 2.885 2.6 2.311 2.0 1.753 1.509 1.252 0.975 0.672 0.462 0.245 -0.112 -0.369 -0.638 -0.773 -1.056 -1.369 -1.702 -1.875 -2.146 -2.466 -2.69 -2.929 -3.454 -3.748 -4.083 -4.466 -4.931 -5.52 -6.293 -8.54 -5 ,10216 ,TETRA ,17621463,Tue Nov 30 17:04:25 CET,Tue Nov 30 19:30:19 CET,0.0 1.925 2.456 2.864 3.238 3.55 3.818 4.065 4.462 4.641 4.832 5.089 5.331 5.474 5.732 5.951 6.144 6.241 6.433 6.62 6.904 7.078 7.229 7.445 7.655 7.85 8.036 8.216 8.434 8.632 8.818 9.042 9.256 9.452 9.675 9.909 10.116 10.348 10.582 10.818 11.066 11.326 11.619 11.88 12.131 12.407 12.688 12.895 13.053 13.071 12.714 11.927 11.052 10.242 9.517 8.813 8.154 7.545 7.009 6.45 5.965 5.549 5.146 4.757 4.389 4.034 3.649 3.302 3.0 2.688 2.359 2.072 1.766 1.446 1.192 0.932 0.669 0.394 0.094 -0.123 -0.358 -0.722 -0.976 -1.267 -1.415 -1.705 -2.004 -2.331 -2.518 -2.802 -3.126 -3.351 -3.583 -4.118 -4.436 -4.781 -5.152 -5.62 -6.245 -7.08 -10.135 -6 ,8139 ,TETRA ,17621464,Tue Nov 30 17:04:25 CET,Tue Nov 30 19:45:31 CET,0.0 1.361 1.915 2.342 2.705 3.016 3.292 3.534 3.942 4.12 4.296 4.53 4.769 4.917 5.188 5.43 5.648 5.745 5.93 6.111 6.373 6.531 6.687 6.914 7.117 7.317 7.509 7.684 7.896 8.104 8.309 8.546 8.759 8.96 9.181 9.416 9.65 9.882 10.128 10.407 10.689 10.982 11.299 11.602 11.89 12.159 12.442 12.673 12.834 12.879 12.675 12.106 11.438 10.747 10.041 9.379 8.768 8.179 7.672 7.158 6.691 6.263 5.846 5.44 5.059 4.713 4.348 4.015 3.704 3.375 3.036 2.756 2.475 2.155 1.902 1.654 1.384 1.104 0.806 0.587 0.362 -0.012 -0.294 -0.592 -0.741 -1.054 -1.383 -1.735 -1.921 -2.208 -2.521 -2.746 -2.997 -3.576 -3.896 -4.242 -4.622 -5.09 -5.674 -6.433 -8.883 -7 ,20478 ,TETRA ,17621465,Tue Nov 30 17:04:26 CET,Tue Nov 30 19:33:09 CET,0.0 1.598 2.211 2.659 3.003 3.296 3.557 3.778 4.15 4.33 4.502 4.719 4.957 5.1 5.356 5.603 5.845 5.954 6.162 6.367 6.647 6.81 6.964 7.189 7.417 7.614 7.783 7.953 8.171 8.369 8.556 8.777 8.981 9.179 9.408 9.661 9.89 10.121 10.363 10.607 10.841 11.104 11.428 11.729 12.023 12.314 12.589 12.816 12.99 13.056 12.812 12.21 11.513 10.754 10.058 9.429 8.849 8.31 7.824 7.309 6.863 6.466 6.067 5.682 5.335 5.011 4.654 4.325 4.038 3.729 3.397 3.117 2.831 2.538 2.303 2.064 1.802 1.514 1.214 1.001 0.784 0.444 0.194 -0.067 -0.205 -0.501 -0.812 -1.135 -1.313 -1.596 -1.909 -2.143 -2.391 -2.922 -3.213 -3.531 -3.887 -4.301 -4.815 -5.594 -8.263 -8 ,15887 ,TETRA ,17621466,Tue Nov 30 17:04:29 CET,Tue Nov 30 19:31:02 CET,0.0 1.605 2.099 2.476 2.785 3.057 3.322 3.568 3.983 4.159 4.324 4.544 4.776 4.915 5.155 5.378 5.599 5.705 5.901 6.085 6.341 6.495 6.644 6.855 7.052 7.241 7.425 7.613 7.84 8.037 8.238 8.476 8.695 8.898 9.111 9.34 9.548 9.765 10.006 10.272 10.538 10.814 11.116 11.385 11.661 11.935 12.206 12.415 12.534 12.515 12.159 11.42 10.681 9.992 9.27 8.553 7.95 7.379 6.851 6.33 5.862 5.423 5.002 4.605 4.221 3.873 3.509 3.168 2.871 2.553 2.213 1.937 1.649 1.33 1.075 0.811 0.534 0.251 -0.046 -0.259 -0.485 -0.846 -1.091 -1.357 -1.503 -1.8 -2.12 -2.495 -2.691 -2.982 -3.338 -3.569 -3.804 -4.354 -4.671 -5.008 -5.393 -5.856 -6.432 -7.195 -9.66 -9 ,30085 ,TETRA ,17621467,Tue Nov 30 17:05:20 CET,Tue Nov 30 19:33:55 CET,0.0 1.423 1.982 2.429 2.782 3.079 3.331 3.56 3.985 4.172 4.339 4.557 4.795 4.931 5.169 5.397 5.614 5.712 5.902 6.093 6.358 6.523 6.681 6.914 7.149 7.354 7.539 7.713 7.926 8.134 8.324 8.55 8.759 8.945 9.158 9.378 9.585 9.805 10.035 10.275 10.534 10.807 11.085 11.347 11.603 11.865 12.122 12.322 12.415 12.39 12.051 11.342 10.632 9.939 9.284 8.629 8.02 7.456 6.952 6.441 6.002 5.613 5.23 4.853 4.503 4.17 3.797 3.473 3.198 2.903 2.577 2.295 2.001 1.683 1.425 1.155 0.872 0.573 0.251 0.024 -0.203 -0.572 -0.852 -1.147 -1.293 -1.604 -1.939 -2.288 -2.474 -2.772 -3.138 -3.377 -3.624 -4.206 -4.525 -4.857 -5.255 -5.745 -6.319 -7.081 -9.827 -10 ,3471 ,TETRA ,17621468,Tue Nov 30 17:05:20 CET,Tue Nov 30 19:35:22 CET,0.0 1.63 2.256 2.699 3.037 3.324 3.579 3.811 4.204 4.371 4.525 4.728 4.955 5.095 5.37 5.618 5.849 5.953 6.141 6.32 6.581 6.75 6.9 7.117 7.333 7.533 7.709 7.87 8.083 8.285 8.478 8.709 8.923 9.116 9.327 9.562 9.775 9.997 10.242 10.504 10.772 11.043 11.328 11.614 11.906 12.162 12.412 12.621 12.786 12.83 12.495 11.689 10.84 10.036 9.287 8.615 8.004 7.426 6.927 6.431 5.999 5.598 5.2 4.815 4.443 4.102 3.747 3.42 3.145 2.844 2.508 2.227 1.942 1.643 1.405 1.16 0.898 0.613 0.31 0.098 -0.12 -0.463 -0.713 -0.981 -1.117 -1.412 -1.743 -2.101 -2.295 -2.601 -2.948 -3.176 -3.424 -3.982 -4.31 -4.689 -5.102 -5.584 -6.173 -6.94 -9.259 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_58.txt deleted file mode 100644 index d740b900..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11527 ,TETRA ,17621469,Tue Nov 30 17:05:21 CET,Tue Nov 30 19:34:43 CET,0.0 2.949 3.773 4.357 4.822 5.218 5.518 5.772 6.212 6.405 6.589 6.824 7.081 7.231 7.509 7.771 8.015 8.13 8.357 8.572 8.861 9.039 9.211 9.453 9.682 9.897 10.107 10.314 10.571 10.806 11.029 11.303 11.575 11.834 12.114 12.419 12.71 13.018 13.34 13.69 14.056 14.443 14.86 15.271 15.754 16.256 16.773 17.338 17.972 18.584 19.107 19.156 18.823 18.366 17.917 17.483 17.092 16.712 16.326 15.917 15.531 15.153 14.804 14.464 14.138 13.848 13.524 13.211 12.934 12.632 12.302 12.014 11.702 11.39 11.147 10.889 10.613 10.321 10.022 9.819 9.6 9.221 8.952 8.651 8.496 8.209 7.888 7.484 7.244 6.883 6.424 6.137 5.829 5.124 4.722 4.248 3.709 3.11 2.338 1.314 -3.044 -2 ,22328 ,TETRA ,17621470,Tue Nov 30 17:05:20 CET,Tue Nov 30 19:33:03 CET,0.0 2.392 3.057 3.499 3.86 4.183 4.478 4.751 5.259 5.507 5.749 6.091 6.402 6.6 6.982 7.292 7.527 7.637 7.85 8.055 8.34 8.518 8.688 8.938 9.187 9.412 9.616 9.819 10.086 10.323 10.543 10.818 11.072 11.311 11.579 11.871 12.159 12.476 12.815 13.165 13.522 13.926 14.37 14.793 15.306 15.84 16.403 17.015 17.655 18.258 18.795 18.918 18.72 18.361 17.915 17.434 16.971 16.516 16.097 15.658 15.232 14.849 14.453 14.054 13.687 13.343 12.994 12.687 12.413 12.119 11.805 11.536 11.261 10.966 10.718 10.473 10.221 9.935 9.624 9.402 9.168 8.788 8.525 8.266 8.137 7.864 7.556 7.214 7.015 6.691 6.311 6.055 5.776 5.13 4.759 4.357 3.89 3.347 2.656 1.647 -2.804 -3 ,22045 ,TETRA ,17621471,Tue Nov 30 17:06:22 CET,Tue Nov 30 19:33:17 CET,0.0 1.887 2.516 2.963 3.328 3.689 4.024 4.298 4.761 4.961 5.146 5.389 5.652 5.808 6.114 6.378 6.622 6.737 6.96 7.175 7.462 7.644 7.832 8.113 8.366 8.602 8.829 9.036 9.286 9.531 9.767 10.053 10.315 10.555 10.839 11.152 11.438 11.749 12.102 12.473 12.84 13.232 13.688 14.133 14.616 15.153 15.72 16.314 16.901 17.407 17.786 17.777 17.528 17.182 16.815 16.431 16.021 15.574 15.156 14.751 14.391 14.031 13.656 13.296 12.959 12.648 12.319 12.024 11.755 11.463 11.145 10.862 10.573 10.285 10.054 9.799 9.532 9.254 8.96 8.747 8.526 8.169 7.906 7.639 7.491 7.173 6.844 6.497 6.31 5.998 5.64 5.391 5.111 4.486 4.145 3.771 3.34 2.805 2.115 1.156 -2.043 -4 ,7963 ,TETRA ,17621472,Tue Nov 30 17:11:07 CET,Tue Nov 30 19:40:09 CET,0.0 2.942 3.56 4.026 4.393 4.707 4.989 5.237 5.696 5.921 6.12 6.363 6.624 6.779 7.07 7.329 7.565 7.684 7.918 8.128 8.408 8.584 8.753 8.993 9.229 9.457 9.669 9.874 10.131 10.365 10.594 10.873 11.133 11.385 11.666 11.966 12.239 12.528 12.834 13.154 13.496 13.886 14.341 14.843 15.463 16.139 16.88 17.625 18.405 19.165 19.641 19.504 19.107 18.692 18.314 17.927 17.523 17.125 16.765 16.381 16.005 15.66 15.326 14.986 14.66 14.347 14.022 13.74 13.483 13.21 12.922 12.667 12.386 12.088 11.86 11.616 11.355 11.072 10.754 10.525 10.279 9.906 9.644 9.371 9.227 8.922 8.585 8.188 7.979 7.672 7.346 7.118 6.836 6.116 5.699 5.251 4.749 4.147 3.377 2.292 -2.144 -5 ,2673 ,TETRA ,17621473,Tue Nov 30 17:08:25 CET,Tue Nov 30 19:34:01 CET,0.0 2.117 2.794 3.256 3.612 3.915 4.197 4.455 4.922 5.127 5.321 5.569 5.827 5.977 6.271 6.546 6.79 6.901 7.116 7.32 7.603 7.784 7.963 8.22 8.462 8.685 8.884 9.082 9.344 9.582 9.806 10.08 10.341 10.598 10.89 11.205 11.496 11.808 12.145 12.489 12.835 13.203 13.612 14.024 14.491 14.959 15.474 16.038 16.633 17.264 17.792 17.862 17.692 17.432 17.136 16.816 16.449 16.014 15.552 15.078 14.68 14.307 13.953 13.611 13.25 12.906 12.558 12.256 11.995 11.724 11.42 11.147 10.859 10.546 10.296 10.03 9.758 9.475 9.186 8.988 8.759 8.384 8.131 7.861 7.718 7.411 7.081 6.721 6.53 6.234 5.889 5.639 5.375 4.725 4.319 3.859 3.335 2.762 2.134 1.243 -1.807 -6 ,3698 ,TETRA ,17621474,Tue Nov 30 17:08:27 CET,Tue Nov 30 19:42:08 CET,0.0 1.979 2.58 3.038 3.424 3.775 4.096 4.354 4.792 5.002 5.206 5.478 5.757 5.911 6.196 6.462 6.71 6.827 7.059 7.286 7.603 7.797 7.983 8.237 8.468 8.688 8.897 9.101 9.358 9.595 9.83 10.112 10.378 10.627 10.911 11.23 11.531 11.851 12.177 12.518 12.875 13.265 13.72 14.171 14.669 15.212 15.802 16.415 17.059 17.68 18.198 18.216 17.929 17.547 17.052 16.516 16.045 15.557 15.101 14.641 14.242 13.898 13.555 13.202 12.851 12.511 12.14 11.804 11.507 11.195 10.859 10.563 10.269 9.959 9.7 9.433 9.155 8.865 8.54 8.311 8.051 7.63 7.348 7.058 6.908 6.572 6.211 5.8 5.571 5.237 4.84 4.585 4.327 3.742 3.38 2.948 2.487 1.896 1.035 -0.185 -6.517 -7 ,208 ,TETRA ,17621475,Tue Nov 30 17:08:29 CET,Tue Nov 30 19:42:33 CET,0.0 2.049 2.677 3.163 3.58 3.904 4.182 4.452 4.934 5.138 5.322 5.567 5.831 5.979 6.256 6.525 6.778 6.893 7.117 7.327 7.61 7.795 7.975 8.232 8.478 8.711 8.932 9.134 9.394 9.637 9.861 10.122 10.371 10.611 10.887 11.199 11.474 11.759 12.069 12.386 12.725 13.111 13.556 13.971 14.402 14.846 15.361 15.916 16.47 16.996 17.348 17.28 17.031 16.734 16.396 16.02 15.633 15.241 14.855 14.418 14.023 13.673 13.345 13.02 12.695 12.407 12.101 11.801 11.515 11.237 10.962 10.719 10.463 10.179 9.939 9.673 9.4 9.112 8.785 8.55 8.277 7.805 7.47 7.111 6.926 6.534 6.143 5.746 5.533 5.216 4.813 4.516 4.194 3.473 3.071 2.625 2.118 1.515 0.769 -0.241 -5.491 -8 ,28802 ,TETRA ,17621476,Tue Nov 30 17:08:27 CET,Tue Nov 30 19:37:58 CET,0.0 2.173 2.824 3.325 3.773 4.184 4.5 4.752 5.202 5.397 5.586 5.846 6.107 6.273 6.587 6.857 7.103 7.224 7.466 7.691 7.992 8.196 8.387 8.642 8.895 9.13 9.339 9.535 9.781 10.027 10.256 10.522 10.786 11.05 11.344 11.649 11.94 12.258 12.585 12.917 13.278 13.68 14.151 14.623 15.14 15.67 16.184 16.699 17.243 17.77 18.097 18.006 17.762 17.449 17.048 16.557 16.042 15.582 15.166 14.714 14.334 13.967 13.578 13.192 12.82 12.482 12.132 11.803 11.518 11.224 10.898 10.613 10.325 9.978 9.689 9.429 9.165 8.883 8.586 8.375 8.153 7.789 7.536 7.279 7.139 6.814 6.427 5.992 5.76 5.436 5.071 4.838 4.597 4.035 3.701 3.299 2.812 2.225 1.525 0.567 -2.803 -9 ,22276 ,TETRA ,17621477,Tue Nov 30 17:08:27 CET,Tue Nov 30 19:34:13 CET,0.0 2.125 2.752 3.191 3.565 3.894 4.17 4.42 4.875 5.076 5.269 5.513 5.76 5.899 6.167 6.421 6.665 6.778 6.985 7.188 7.476 7.664 7.849 8.093 8.308 8.521 8.729 8.922 9.17 9.414 9.653 9.937 10.198 10.444 10.72 11.02 11.301 11.603 11.914 12.253 12.611 13.003 13.443 13.874 14.35 14.822 15.345 15.928 16.538 17.083 17.498 17.539 17.253 16.827 16.415 15.981 15.563 15.131 14.714 14.154 13.537 13.044 12.661 12.318 11.994 11.676 11.339 11.041 10.755 10.44 10.126 9.863 9.574 9.264 9.02 8.768 8.509 8.223 7.915 7.698 7.464 7.09 6.824 6.547 6.401 6.092 5.769 5.42 5.224 4.902 4.49 4.22 3.956 3.4 3.084 2.71 2.175 1.501 0.711 -0.447 -5.029 -10 ,17780 ,TETRA ,17621478,Tue Nov 30 17:08:27 CET,Tue Nov 30 19:22:12 CET,0.0 1.928 2.6 3.095 3.488 3.838 4.154 4.413 4.866 5.082 5.28 5.53 5.788 5.94 6.236 6.513 6.762 6.879 7.11 7.321 7.602 7.776 7.951 8.214 8.456 8.684 8.907 9.123 9.393 9.659 9.915 10.196 10.465 10.729 11.024 11.339 11.634 11.946 12.266 12.612 12.979 13.371 13.806 14.243 14.722 15.226 15.786 16.385 17.02 17.651 18.221 18.426 18.303 17.998 17.646 17.28 16.925 16.531 16.119 15.657 15.217 14.83 14.463 14.116 13.801 13.498 13.134 12.774 12.458 12.134 11.793 11.505 11.2 10.886 10.641 10.378 10.102 9.812 9.502 9.285 9.058 8.679 8.417 8.156 8.014 7.694 7.348 6.971 6.77 6.469 6.125 5.872 5.575 4.888 4.498 4.053 3.545 2.927 2.161 1.19 -2.4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_59.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_59.txt deleted file mode 100644 index cc63f2b7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_59.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25001 ,TETRA ,17621479,Tue Nov 30 17:08:27 CET,Tue Nov 30 19:35:23 CET,0.0 2.079 2.735 3.243 3.665 4.037 4.37 4.645 5.12 5.358 5.599 5.94 6.241 6.43 6.78 7.104 7.408 7.556 7.85 8.14 8.522 8.754 8.989 9.316 9.622 9.918 10.2 10.466 10.815 11.156 11.475 11.848 12.213 12.572 12.989 13.443 13.867 14.34 14.844 15.385 15.95 16.561 17.276 17.987 18.813 19.746 20.792 21.902 23.122 24.555 26.307 27.69 28.398 28.696 28.73 28.7 28.653 28.528 28.371 28.209 28.049 27.864 27.672 27.49 27.314 27.126 26.9 26.696 26.493 26.26 26.014 25.806 25.593 25.366 25.178 24.964 24.725 24.474 24.209 24.009 23.797 23.488 23.278 23.045 22.91 22.634 22.339 22.023 21.853 21.589 21.333 21.121 20.893 20.389 20.08 19.736 19.363 18.919 18.312 17.393 13.283 -2 ,15185 ,TETRA ,17621480,Tue Nov 30 17:08:27 CET,Tue Nov 30 19:37:32 CET,0.0 2.236 2.965 3.497 3.965 4.374 4.718 5.029 5.597 5.872 6.152 6.518 6.817 7.004 7.331 7.631 7.914 8.049 8.325 8.59 8.967 9.207 9.433 9.755 10.061 10.35 10.612 10.862 11.194 11.525 11.849 12.24 12.611 12.963 13.366 13.818 14.258 14.743 15.255 15.792 16.343 16.958 17.668 18.384 19.217 20.115 21.174 22.366 23.74 25.296 26.999 28.211 28.68 28.824 28.792 28.637 28.424 28.223 28.056 27.852 27.636 27.386 27.121 26.874 26.633 26.4 26.142 25.874 25.641 25.414 25.144 24.906 24.649 24.372 24.162 23.937 23.713 23.495 23.256 23.066 22.852 22.471 22.181 21.858 21.667 21.286 20.903 20.476 20.251 19.923 19.495 19.202 18.895 18.235 17.866 17.434 16.936 16.369 15.674 14.728 10.681 -3 ,19256 ,TETRA ,17621481,Tue Nov 30 17:08:30 CET,Tue Nov 30 19:39:06 CET,0.0 2.379 3.08 3.587 4.008 4.409 4.782 5.122 5.738 5.997 6.224 6.53 6.812 6.987 7.322 7.623 7.911 8.054 8.331 8.592 8.953 9.178 9.397 9.712 10.024 10.325 10.598 10.86 11.194 11.509 11.815 12.187 12.535 12.867 13.257 13.688 14.095 14.55 15.034 15.535 16.067 16.64 17.301 17.98 18.756 19.603 20.61 21.764 23.079 24.599 26.34 27.545 28.12 28.426 28.553 28.562 28.476 28.331 28.169 27.975 27.771 27.579 27.367 27.114 26.868 26.636 26.389 26.165 25.961 25.688 25.375 25.126 24.866 24.601 24.367 24.128 23.905 23.665 23.394 23.179 22.925 22.501 22.201 21.877 21.704 21.353 20.983 20.57 20.352 20.056 19.706 19.464 19.219 18.622 18.235 17.83 17.372 16.828 16.15 15.258 12.346 -4 ,5658 ,TETRA ,17621482,Tue Nov 30 17:08:28 CET,Tue Nov 30 19:32:38 CET,0.0 4.545 5.344 5.862 6.292 6.673 6.989 7.272 7.779 7.997 8.201 8.492 8.784 8.962 9.297 9.607 9.89 10.028 10.295 10.539 10.877 11.096 11.317 11.636 11.924 12.191 12.461 12.734 13.072 13.397 13.719 14.104 14.468 14.803 15.195 15.638 16.061 16.515 16.989 17.49 18.031 18.631 19.309 19.997 20.792 21.664 22.651 23.737 24.993 26.49 28.269 29.592 30.185 30.419 30.497 30.506 30.461 30.309 30.11 29.859 29.616 29.403 29.189 28.984 28.768 28.555 28.318 28.086 27.871 27.632 27.378 27.154 26.914 26.654 26.448 26.247 26.043 25.806 25.539 25.348 25.146 24.83 24.615 24.395 24.275 24.019 23.751 23.452 23.274 22.994 22.676 22.431 22.172 21.584 21.197 20.732 20.231 19.692 19.065 18.173 14.749 -5 ,25682 ,TETRA ,17621483,Tue Nov 30 17:11:08 CET,Tue Nov 30 19:38:39 CET,0.0 2.072 2.79 3.322 3.73 4.097 4.456 4.776 5.326 5.566 5.778 6.064 6.359 6.544 6.882 7.196 7.509 7.654 7.913 8.153 8.51 8.745 8.965 9.294 9.609 9.898 10.182 10.449 10.786 11.106 11.406 11.779 12.135 12.465 12.845 13.267 13.673 14.125 14.596 15.077 15.578 16.131 16.783 17.451 18.21 19.053 20.004 21.069 22.295 23.688 25.29 26.477 27.103 27.454 27.586 27.563 27.459 27.299 27.128 26.922 26.717 26.519 26.319 26.109 25.889 25.672 25.435 25.217 25.01 24.782 24.545 24.344 24.126 23.883 23.69 23.471 23.229 22.978 22.717 22.543 22.356 22.038 21.806 21.546 21.402 21.065 20.676 20.266 20.051 19.746 19.4 19.174 18.939 18.395 18.075 17.717 17.31 16.784 16.037 14.972 11.125 -6 ,2009 ,TETRA ,17621484,Tue Nov 30 17:11:07 CET,Tue Nov 30 19:37:44 CET,0.0 2.007 2.685 3.182 3.601 3.971 4.29 4.591 5.117 5.359 5.589 5.882 6.168 6.345 6.662 6.954 7.227 7.362 7.629 7.876 8.231 8.454 8.662 8.975 9.28 9.573 9.849 10.102 10.433 10.744 11.035 11.395 11.743 12.076 12.465 12.888 13.297 13.75 14.225 14.719 15.237 15.818 16.49 17.148 17.89 18.698 19.63 20.691 21.944 23.355 24.818 25.67 25.842 25.867 25.874 25.839 25.754 25.61 25.455 25.273 25.076 24.873 24.652 24.43 24.225 24.017 23.741 23.481 23.256 22.999 22.746 22.536 22.314 22.095 21.898 21.672 21.444 21.209 20.942 20.754 20.568 20.261 20.042 19.802 19.663 19.353 18.977 18.546 18.333 18.017 17.616 17.357 17.108 16.582 16.272 15.913 15.477 14.975 14.35 13.451 9.779 -7 ,26249 ,TETRA ,17621485,Tue Nov 30 17:11:09 CET,Tue Nov 30 19:40:26 CET,0.0 2.428 3.139 3.65 4.072 4.438 4.8 5.154 5.801 6.092 6.363 6.769 7.109 7.33 7.748 8.142 8.46 8.594 8.854 9.1 9.453 9.686 9.907 10.224 10.525 10.808 11.073 11.325 11.651 11.966 12.272 12.633 12.974 13.293 13.655 14.068 14.479 14.947 15.439 15.947 16.476 17.066 17.753 18.445 19.252 20.132 21.149 22.304 23.59 25.056 26.849 28.122 28.677 28.927 29.004 28.96 28.855 28.7 28.5 28.253 28.039 27.844 27.65 27.444 27.24 27.038 26.78 26.532 26.308 26.077 25.849 25.654 25.445 25.217 25.025 24.809 24.583 24.364 24.146 23.974 23.775 23.472 23.257 23.022 22.9 22.647 22.366 22.038 21.861 21.597 21.283 21.029 20.754 20.216 19.911 19.553 19.138 18.665 18.113 17.282 14.214 -8 ,16017 ,TETRA ,17621486,Tue Nov 30 17:11:11 CET,Tue Nov 30 19:39:55 CET,0.0 2.227 2.881 3.368 3.761 4.11 4.427 4.711 5.205 5.433 5.637 5.917 6.204 6.375 6.696 7.017 7.32 7.455 7.706 7.953 8.315 8.542 8.772 9.165 9.525 9.807 10.065 10.313 10.634 10.929 11.214 11.571 11.913 12.232 12.598 13.02 13.424 13.844 14.291 14.784 15.293 15.848 16.482 17.114 17.869 18.729 19.697 20.736 21.941 23.347 24.936 26.068 26.576 26.803 26.879 26.86 26.774 26.616 26.429 26.207 25.988 25.8 25.617 25.415 25.222 25.028 24.798 24.589 24.406 24.199 23.963 23.754 23.538 23.308 23.125 22.939 22.737 22.519 22.27 22.086 21.89 21.571 21.342 21.1 20.975 20.71 20.424 20.106 19.936 19.666 19.345 19.104 18.81 18.124 17.736 17.285 16.813 16.337 15.691 14.637 10.246 -9 ,11075 ,TETRA ,17621487,Tue Nov 30 17:11:07 CET,Tue Nov 30 19:28:09 CET,0.0 2.434 3.108 3.612 4.05 4.414 4.737 5.051 5.645 5.904 6.137 6.479 6.781 6.977 7.345 7.711 8.062 8.229 8.543 8.808 9.178 9.41 9.629 9.958 10.292 10.621 10.936 11.244 11.642 12.026 12.41 12.878 13.319 13.725 14.185 14.726 15.237 15.793 16.403 17.03 17.678 18.399 19.254 20.107 21.078 22.109 23.271 24.632 26.236 27.926 29.53 30.354 30.358 30.051 29.759 29.37 28.894 28.547 28.317 28.081 27.862 27.667 27.486 27.291 27.073 26.847 26.603 26.382 26.189 25.971 25.721 25.509 25.296 25.06 24.87 24.681 24.473 24.25 24.006 23.826 23.637 23.34 23.131 22.909 22.785 22.521 22.25 21.942 21.751 21.443 21.095 20.859 20.581 19.951 19.593 19.192 18.763 18.275 17.642 16.691 12.705 -10 ,27139 ,TETRA ,17621488,Tue Nov 30 17:11:08 CET,Tue Nov 30 19:27:43 CET,0.0 2.512 3.172 3.657 4.072 4.434 4.725 4.992 5.473 5.68 5.882 6.165 6.455 6.629 6.955 7.263 7.553 7.685 7.938 8.186 8.533 8.755 8.975 9.288 9.592 9.887 10.154 10.414 10.752 11.075 11.375 11.723 12.064 12.39 12.758 13.181 13.598 14.049 14.519 15.0 15.496 16.076 16.763 17.431 18.205 19.059 20.039 21.111 22.326 23.761 25.422 26.661 27.28 27.572 27.65 27.657 27.602 27.521 27.389 27.213 27.049 26.845 26.62 26.403 26.19 25.989 25.784 25.572 25.372 25.163 24.917 24.71 24.484 24.226 24.034 23.838 23.624 23.384 23.113 22.92 22.722 22.398 22.169 21.911 21.759 21.455 21.133 20.783 20.591 20.269 19.784 19.446 19.107 18.374 17.94 17.467 16.986 16.422 15.639 14.467 10.253 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_33.txt deleted file mode 100644 index d9642afe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8327 ,KEBNE ,17027977,Wed Dec 22 18:44:23 CET,Wed Dec 22 20:42:23 CET,0.0 3.581 4.358 4.963 5.478 5.912 6.278 6.61 7.236 7.523 7.792 8.198 8.523 8.744 9.168 9.561 9.929 10.116 10.493 10.856 11.386 11.728 12.046 12.502 12.946 13.361 13.764 14.156 14.649 15.136 15.613 16.186 16.749 17.3 17.943 18.675 19.391 20.212 21.106 22.046 23.053 24.223 25.638 27.08 28.788 30.764 33.123 35.901 39.31 43.587 49.289 54.479 57.782 60.083 61.758 63.053 64.031 64.789 65.354 65.828 66.161 66.413 66.617 66.773 66.893 66.96 66.998 67.033 67.037 67.017 66.987 66.952 66.903 66.833 66.781 66.717 66.621 66.503 66.37 66.277 66.178 66.008 65.886 65.739 65.653 65.471 65.272 65.053 64.927 64.747 64.441 64.255 64.063 63.593 63.308 62.982 62.574 62.062 61.424 60.683 57.422 -2 ,4539 ,KEBNE ,17027978,Wed Dec 22 18:44:23 CET,Wed Dec 22 20:42:49 CET,0.0 3.948 4.724 5.273 5.719 6.135 6.507 6.825 7.427 7.715 7.97 8.362 8.696 8.919 9.339 9.745 10.128 10.31 10.663 11.002 11.494 11.812 12.117 12.564 12.998 13.424 13.839 14.231 14.734 15.228 15.716 16.299 16.873 17.447 18.114 18.877 19.616 20.41 21.271 22.228 23.262 24.436 25.837 27.29 29.052 31.053 33.385 36.085 39.479 43.774 49.436 54.691 58.014 60.283 61.88 63.092 64.019 64.713 65.219 65.684 66.021 66.247 66.447 66.631 66.741 66.815 66.902 66.958 66.976 66.964 66.925 66.872 66.816 66.751 66.693 66.626 66.531 66.416 66.286 66.174 66.049 65.86 65.719 65.559 65.477 65.303 65.107 64.872 64.732 64.566 64.302 64.139 63.968 63.523 63.252 62.949 62.595 62.16 61.626 60.847 57.393 -3 ,21999 ,KEBNE ,17027979,Wed Dec 22 18:44:23 CET,Wed Dec 22 20:41:55 CET,0.0 3.443 4.266 4.847 5.322 5.735 6.11 6.447 7.041 7.31 7.569 7.959 8.288 8.511 8.933 9.336 9.723 9.908 10.268 10.613 11.101 11.408 11.71 12.159 12.602 13.029 13.443 13.858 14.389 14.905 15.391 15.979 16.558 17.114 17.784 18.541 19.269 20.08 20.981 21.958 22.988 24.171 25.566 27.023 28.765 30.695 32.982 35.728 39.126 43.364 48.871 53.86 57.088 59.366 61.055 62.289 63.165 63.849 64.365 64.806 65.133 65.376 65.577 65.739 65.836 65.9 65.966 66.005 66.025 66.031 66.014 65.994 65.957 65.9 65.851 65.783 65.706 65.61 65.479 65.378 65.259 65.063 64.92 64.767 64.675 64.476 64.283 64.069 63.942 63.779 63.544 63.388 63.212 62.801 62.557 62.259 61.912 61.467 60.91 60.137 56.972 -4 ,26796 ,KEBNE ,17027980,Wed Dec 22 18:44:23 CET,Wed Dec 22 20:42:25 CET,0.0 4.155 5.02 5.674 6.185 6.613 6.99 7.338 7.988 8.281 8.555 8.961 9.28 9.497 9.917 10.298 10.659 10.841 11.21 11.566 12.073 12.397 12.708 13.156 13.583 14.004 14.407 14.792 15.326 15.834 16.316 16.922 17.503 18.066 18.71 19.441 20.155 20.941 21.806 22.749 23.768 24.932 26.3 27.72 29.412 31.373 33.782 36.601 40.016 44.349 50.203 55.514 58.86 61.235 62.978 64.332 65.347 66.081 66.643 67.134 67.47 67.745 67.971 68.146 68.28 68.373 68.461 68.522 68.537 68.536 68.527 68.48 68.402 68.312 68.234 68.154 68.056 67.932 67.796 67.689 67.584 67.426 67.297 67.133 67.047 66.868 66.638 66.367 66.21 66.01 65.693 65.499 65.298 64.875 64.637 64.335 63.919 63.382 62.799 62.047 58.571 -5 ,16864 ,KEBNE ,17027981,Wed Dec 22 18:44:23 CET,Wed Dec 22 20:41:50 CET,0.0 3.857 4.628 5.217 5.687 6.097 6.461 6.808 7.438 7.706 7.952 8.354 8.699 8.933 9.362 9.767 10.165 10.35 10.703 11.038 11.505 11.81 12.113 12.556 12.971 13.372 13.768 14.162 14.673 15.163 15.639 16.221 16.807 17.378 18.034 18.787 19.513 20.315 21.19 22.143 23.164 24.325 25.725 27.206 28.983 30.974 33.342 36.116 39.521 43.741 49.279 54.373 57.657 59.957 61.624 62.893 63.838 64.551 65.086 65.534 65.835 66.081 66.284 66.427 66.533 66.619 66.69 66.716 66.725 66.732 66.71 66.677 66.636 66.584 66.527 66.461 66.39 66.298 66.197 66.117 66.009 65.813 65.676 65.534 65.45 65.249 65.021 64.792 64.669 64.496 64.202 64.022 63.836 63.411 63.147 62.878 62.588 62.209 61.696 60.923 56.951 -6 ,31154 ,KEBNE ,17027982,Wed Dec 22 18:44:23 CET,Wed Dec 22 20:42:44 CET,0.0 4.226 5.187 5.872 6.389 6.827 7.214 7.568 8.217 8.51 8.793 9.216 9.541 9.768 10.198 10.602 10.999 11.19 11.551 11.896 12.393 12.717 13.04 13.501 13.928 14.344 14.76 15.171 15.696 16.202 16.686 17.281 17.865 18.44 19.109 19.874 20.639 21.469 22.363 23.331 24.349 25.492 26.851 28.245 29.952 31.994 34.481 37.418 40.894 45.136 50.827 56.085 59.436 61.748 63.415 64.713 65.691 66.446 67.01 67.506 67.897 68.183 68.398 68.567 68.688 68.743 68.772 68.801 68.807 68.79 68.769 68.737 68.688 68.641 68.579 68.492 68.406 68.314 68.201 68.104 67.997 67.784 67.616 67.457 67.374 67.187 66.987 66.766 66.645 66.478 66.196 66.022 65.845 65.422 65.133 64.81 64.444 64.038 63.529 62.773 60.372 -7 ,1151 ,KEBNE ,17027983,Wed Dec 22 18:44:23 CET,Wed Dec 22 20:41:51 CET,0.0 3.788 4.557 5.1 5.561 5.96 6.313 6.65 7.258 7.532 7.797 8.195 8.512 8.72 9.12 9.516 9.894 10.077 10.428 10.766 11.255 11.569 11.878 12.33 12.768 13.195 13.613 14.004 14.488 14.963 15.428 15.99 16.535 17.081 17.726 18.461 19.174 19.954 20.807 21.753 22.766 23.927 25.296 26.668 28.323 30.265 32.619 35.401 38.827 43.103 48.618 53.546 56.742 58.954 60.534 61.737 62.621 63.241 63.68 64.061 64.351 64.598 64.799 64.942 65.037 65.1 65.143 65.158 65.157 65.143 65.103 65.053 64.99 64.922 64.877 64.807 64.697 64.59 64.46 64.356 64.238 64.027 63.885 63.738 63.649 63.454 63.227 62.974 62.846 62.666 62.37 62.177 61.979 61.533 61.243 60.928 60.605 60.246 59.805 59.053 55.199 -8 ,19591 ,KEBNE ,17027984,Wed Dec 22 18:45:25 CET,Wed Dec 22 20:43:27 CET,0.0 3.602 4.495 5.123 5.638 6.073 6.455 6.793 7.416 7.698 7.973 8.405 8.746 8.981 9.42 9.827 10.226 10.415 10.764 11.101 11.575 11.882 12.183 12.616 13.034 13.437 13.828 14.213 14.713 15.202 15.676 16.241 16.783 17.323 17.972 18.713 19.431 20.22 21.085 22.019 23.022 24.165 25.509 26.878 28.523 30.474 32.815 35.527 38.934 43.248 48.962 54.203 57.438 59.704 61.359 62.584 63.448 64.118 64.636 65.063 65.367 65.582 65.762 65.903 66.013 66.104 66.161 66.15 66.103 66.068 66.042 66.01 65.964 65.91 65.865 65.794 65.695 65.57 65.425 65.326 65.216 65.028 64.896 64.759 64.673 64.478 64.269 64.024 63.893 63.729 63.488 63.331 63.154 62.752 62.504 62.218 61.903 61.518 60.989 60.26 57.791 -9 ,10366 ,KEBNE ,17027985,Wed Dec 22 18:45:25 CET,Wed Dec 22 20:42:59 CET,0.0 3.488 4.486 5.136 5.658 6.133 6.546 6.899 7.529 7.822 8.099 8.522 8.851 9.076 9.511 9.911 10.301 10.493 10.862 11.217 11.729 12.056 12.375 12.841 13.292 13.725 14.147 14.558 15.094 15.617 16.123 16.731 17.33 17.922 18.602 19.375 20.145 20.988 21.876 22.833 23.875 25.061 26.441 27.849 29.528 31.46 33.802 36.604 40.062 44.366 49.951 55.112 58.462 60.747 62.394 63.657 64.566 65.252 65.75 66.182 66.516 66.763 66.974 67.144 67.249 67.322 67.375 67.385 67.372 67.353 67.32 67.285 67.25 67.196 67.134 67.044 66.933 66.806 66.684 66.598 66.499 66.341 66.209 66.046 65.956 65.757 65.553 65.323 65.181 65.007 64.764 64.603 64.406 63.92 63.645 63.354 62.988 62.542 61.957 61.046 55.519 -10 ,22163 ,KEBNE ,17027986,Wed Dec 22 18:45:25 CET,Wed Dec 22 20:42:51 CET,0.0 3.471 4.525 5.232 5.728 6.161 6.548 6.894 7.509 7.781 8.041 8.44 8.774 9.009 9.452 9.857 10.242 10.423 10.763 11.094 11.581 11.896 12.205 12.656 13.082 13.498 13.902 14.296 14.811 15.299 15.77 16.344 16.906 17.463 18.123 18.861 19.577 20.376 21.251 22.202 23.234 24.412 25.773 27.18 28.865 30.805 33.103 35.798 39.208 43.462 49.068 54.162 57.376 59.679 61.335 62.57 63.475 64.164 64.682 65.132 65.47 65.726 65.92 66.061 66.158 66.232 66.267 66.274 66.287 66.278 66.248 66.217 66.164 66.089 66.022 65.94 65.844 65.747 65.635 65.545 65.441 65.257 65.104 64.916 64.817 64.605 64.376 64.155 64.034 63.863 63.556 63.37 63.174 62.708 62.45 62.167 61.839 61.421 60.863 60.112 57.117 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_49.txt deleted file mode 100644 index 2fee6307..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9068 ,TETRA ,17621489,Tue Nov 30 17:11:09 CET,Tue Nov 30 19:36:05 CET,0.0 1.553 2.052 2.425 2.723 2.981 3.22 3.421 3.777 3.937 4.08 4.271 4.493 4.607 4.812 5.007 5.186 5.267 5.423 5.575 5.783 5.901 6.01 6.159 6.295 6.422 6.537 6.636 6.755 6.874 6.972 7.084 7.191 7.279 7.377 7.472 7.544 7.605 7.647 7.666 7.656 7.631 7.573 7.456 7.306 7.061 6.657 6.083 5.205 3.873 1.686 -0.857 -2.917 -4.601 -6.012 -7.254 -8.342 -9.313 -10.133 -10.921 -11.583 -12.185 -12.749 -13.273 -13.764 -14.213 -14.68 -15.106 -15.475 -15.847 -16.232 -16.559 -16.892 -17.24 -17.526 -17.824 -18.128 -18.457 -18.804 -19.04 -19.284 -19.666 -19.934 -20.206 -20.344 -20.63 -20.954 -21.309 -21.491 -21.798 -22.082 -22.303 -22.537 -23.052 -23.377 -23.756 -24.136 -24.575 -25.097 -25.774 -27.671 -2 ,29002 ,TETRA ,17621490,Tue Nov 30 17:11:09 CET,Tue Nov 30 19:56:51 CET,0.0 1.839 2.355 2.722 3.028 3.282 3.5 3.687 4.026 4.185 4.334 4.506 4.722 4.843 5.061 5.242 5.413 5.495 5.646 5.788 5.968 6.083 6.199 6.351 6.478 6.591 6.701 6.805 6.921 7.025 7.128 7.239 7.338 7.437 7.536 7.615 7.683 7.755 7.805 7.836 7.855 7.851 7.801 7.686 7.508 7.254 6.862 6.284 5.38 3.954 1.711 -0.857 -2.95 -4.653 -6.12 -7.435 -8.522 -9.455 -10.233 -11.012 -11.698 -12.315 -12.889 -13.412 -13.903 -14.352 -14.827 -15.26 -15.656 -16.085 -16.526 -16.865 -17.193 -17.539 -17.818 -18.101 -18.385 -18.681 -18.988 -19.21 -19.443 -19.809 -20.079 -20.362 -20.505 -20.806 -21.131 -21.46 -21.629 -21.934 -22.203 -22.424 -22.665 -23.179 -23.473 -23.797 -24.163 -24.589 -25.078 -25.747 -27.89 -3 ,11479 ,TETRA ,17621491,Tue Nov 30 17:14:37 CET,Tue Nov 30 19:41:36 CET,0.0 1.573 2.085 2.475 2.792 3.053 3.298 3.513 3.863 4.017 4.156 4.325 4.546 4.667 4.884 5.067 5.23 5.307 5.457 5.598 5.798 5.922 6.036 6.192 6.343 6.489 6.616 6.725 6.86 6.988 7.104 7.217 7.309 7.406 7.511 7.602 7.669 7.719 7.768 7.815 7.819 7.794 7.756 7.668 7.499 7.248 6.856 6.266 5.414 4.163 2.049 -0.47 -2.473 -4.142 -5.512 -6.699 -7.728 -8.652 -9.44 -10.223 -10.891 -11.469 -12.031 -12.556 -13.033 -13.48 -13.966 -14.41 -14.781 -15.144 -15.518 -15.828 -16.155 -16.502 -16.779 -17.061 -17.348 -17.643 -17.939 -18.152 -18.383 -18.764 -19.036 -19.307 -19.445 -19.738 -20.05 -20.39 -20.578 -20.896 -21.18 -21.39 -21.611 -22.122 -22.413 -22.713 -23.054 -23.479 -23.95 -24.605 -26.933 -4 ,11307 ,TETRA ,17621492,Tue Nov 30 17:14:42 CET,Tue Nov 30 19:42:30 CET,0.0 1.344 1.854 2.225 2.532 2.797 3.012 3.219 3.592 3.742 3.886 4.065 4.277 4.392 4.606 4.794 4.974 5.055 5.197 5.334 5.52 5.636 5.742 5.889 6.024 6.14 6.25 6.357 6.495 6.629 6.739 6.85 6.95 7.032 7.115 7.203 7.275 7.337 7.397 7.447 7.475 7.48 7.426 7.313 7.156 6.933 6.565 6.003 5.17 3.817 1.545 -1.028 -3.019 -4.67 -6.091 -7.323 -8.383 -9.351 -10.188 -10.991 -11.665 -12.273 -12.841 -13.375 -13.877 -14.326 -14.792 -15.219 -15.594 -15.983 -16.375 -16.697 -17.036 -17.381 -17.65 -17.925 -18.204 -18.513 -18.858 -19.097 -19.333 -19.698 -19.96 -20.231 -20.372 -20.669 -20.987 -21.326 -21.503 -21.806 -22.065 -22.272 -22.496 -22.986 -23.273 -23.62 -24.002 -24.424 -24.93 -25.561 -27.513 -5 ,9046 ,TETRA ,17621493,Tue Nov 30 17:14:37 CET,Tue Nov 30 19:41:38 CET,0.0 1.658 2.181 2.563 2.896 3.171 3.404 3.618 3.986 4.148 4.301 4.488 4.712 4.829 5.042 5.242 5.437 5.523 5.684 5.831 6.023 6.136 6.246 6.398 6.54 6.674 6.79 6.901 7.033 7.145 7.256 7.383 7.488 7.572 7.652 7.734 7.801 7.865 7.914 7.947 7.961 7.93 7.835 7.709 7.543 7.273 6.859 6.272 5.4 4.041 1.799 -0.747 -2.777 -4.483 -5.904 -7.13 -8.199 -9.136 -9.925 -10.716 -11.407 -12.014 -12.601 -13.164 -13.662 -14.11 -14.576 -14.995 -15.354 -15.725 -16.119 -16.449 -16.803 -17.161 -17.435 -17.725 -18.028 -18.345 -18.681 -18.908 -19.142 -19.536 -19.814 -20.098 -20.247 -20.551 -20.873 -21.221 -21.41 -21.728 -22.023 -22.249 -22.486 -22.984 -23.275 -23.603 -23.971 -24.401 -24.908 -25.596 -27.764 -6 ,10448 ,TETRA ,17621494,Tue Nov 30 17:14:42 CET,Tue Nov 30 19:39:34 CET,0.0 1.476 1.975 2.338 2.626 2.874 3.103 3.316 3.675 3.835 3.989 4.169 4.383 4.492 4.69 4.872 5.048 5.132 5.289 5.449 5.66 5.769 5.877 6.035 6.169 6.284 6.387 6.479 6.602 6.707 6.795 6.892 6.978 7.056 7.146 7.229 7.298 7.362 7.401 7.42 7.428 7.395 7.311 7.202 7.018 6.73 6.281 5.65 4.739 3.381 1.099 -1.552 -3.66 -5.41 -6.868 -8.157 -9.302 -10.341 -11.19 -11.992 -12.673 -13.267 -13.831 -14.361 -14.855 -15.322 -15.813 -16.243 -16.603 -16.98 -17.397 -17.751 -18.121 -18.503 -18.799 -19.102 -19.405 -19.734 -20.077 -20.308 -20.549 -20.932 -21.207 -21.485 -21.629 -21.927 -22.242 -22.584 -22.765 -23.075 -23.368 -23.584 -23.813 -24.33 -24.614 -24.924 -25.276 -25.676 -26.149 -26.81 -28.441 -7 ,8803 ,TETRA ,17621495,Tue Nov 30 17:14:38 CET,Tue Nov 30 19:41:54 CET,0.0 1.615 2.131 2.528 2.846 3.11 3.332 3.525 3.865 4.023 4.168 4.325 4.543 4.661 4.864 5.043 5.206 5.283 5.435 5.583 5.79 5.91 6.016 6.175 6.324 6.451 6.571 6.673 6.785 6.885 6.974 7.077 7.169 7.241 7.316 7.395 7.458 7.503 7.534 7.556 7.562 7.55 7.51 7.408 7.193 6.882 6.427 5.814 4.936 3.55 1.288 -1.337 -3.389 -5.064 -6.521 -7.785 -8.838 -9.772 -10.568 -11.342 -11.996 -12.583 -13.156 -13.696 -14.194 -14.648 -15.123 -15.549 -15.923 -16.309 -16.7 -17.022 -17.35 -17.687 -17.953 -18.241 -18.554 -18.89 -19.232 -19.462 -19.706 -20.088 -20.354 -20.635 -20.776 -21.06 -21.361 -21.689 -21.864 -22.167 -22.442 -22.657 -22.884 -23.387 -23.692 -24.024 -24.378 -24.799 -25.305 -25.973 -28.091 -8 ,5452 ,TETRA ,17621496,Tue Nov 30 17:14:39 CET,Tue Nov 30 19:41:33 CET,0.0 1.421 1.892 2.205 2.468 2.703 2.924 3.127 3.472 3.627 3.776 3.963 4.182 4.295 4.52 4.711 4.876 4.954 5.107 5.26 5.466 5.581 5.682 5.814 5.939 6.06 6.167 6.253 6.358 6.471 6.578 6.695 6.793 6.89 7.0 7.091 7.154 7.216 7.27 7.302 7.315 7.296 7.234 7.168 7.044 6.809 6.451 5.875 4.967 3.551 1.238 -1.411 -3.548 -5.313 -6.747 -7.975 -9.012 -9.93 -10.746 -11.57 -12.265 -12.869 -13.416 -13.919 -14.404 -14.843 -15.286 -15.697 -16.061 -16.436 -16.817 -17.127 -17.459 -17.814 -18.084 -18.368 -18.669 -18.986 -19.313 -19.536 -19.773 -20.142 -20.396 -20.669 -20.811 -21.107 -21.425 -21.784 -21.97 -22.271 -22.537 -22.765 -23.015 -23.526 -23.801 -24.114 -24.485 -24.911 -25.396 -26.061 -28.375 -9 ,13311 ,TETRA ,17621497,Tue Nov 30 17:14:38 CET,Tue Nov 30 19:38:15 CET,0.0 1.493 1.999 2.365 2.667 2.92 3.135 3.346 3.709 3.86 4.003 4.167 4.38 4.49 4.696 4.884 5.051 5.128 5.28 5.424 5.612 5.727 5.829 5.971 6.104 6.222 6.334 6.437 6.566 6.684 6.79 6.908 7.0 7.087 7.186 7.277 7.346 7.399 7.441 7.467 7.476 7.464 7.419 7.324 7.131 6.862 6.488 5.919 5.055 3.744 1.577 -0.976 -3.075 -4.842 -6.269 -7.519 -8.572 -9.495 -10.288 -11.083 -11.8 -12.423 -12.996 -13.542 -14.051 -14.514 -14.99 -15.402 -15.756 -16.125 -16.513 -16.838 -17.178 -17.537 -17.817 -18.095 -18.37 -18.665 -18.982 -19.202 -19.431 -19.797 -20.063 -20.337 -20.484 -20.786 -21.088 -21.409 -21.577 -21.879 -22.161 -22.388 -22.627 -23.134 -23.417 -23.753 -24.124 -24.526 -25.069 -25.816 -28.008 -10 ,10400 ,TETRA ,17621498,Tue Nov 30 17:14:38 CET,Tue Nov 30 19:40:14 CET,0.0 1.76 2.304 2.725 3.041 3.296 3.527 3.738 4.107 4.259 4.396 4.561 4.772 4.891 5.105 5.289 5.464 5.555 5.722 5.853 6.038 6.156 6.261 6.403 6.532 6.646 6.748 6.848 6.967 7.071 7.164 7.272 7.36 7.432 7.513 7.594 7.655 7.704 7.745 7.779 7.792 7.764 7.694 7.581 7.407 7.149 6.724 6.135 5.333 4.001 1.724 -0.805 -2.831 -4.52 -5.973 -7.235 -8.318 -9.272 -10.099 -10.939 -11.643 -12.255 -12.837 -13.373 -13.866 -14.329 -14.8 -15.224 -15.593 -15.966 -16.352 -16.673 -17.011 -17.367 -17.635 -17.914 -18.207 -18.51 -18.835 -19.063 -19.297 -19.66 -19.927 -20.216 -20.364 -20.67 -20.985 -21.31 -21.489 -21.803 -22.079 -22.297 -22.523 -23.002 -23.278 -23.588 -23.932 -24.309 -24.767 -25.394 -27.181 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_62.txt deleted file mode 100644 index 96904e76..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14429 ,TETRA ,17621499,Tue Nov 30 17:14:39 CET,Tue Nov 30 19:42:06 CET,0.0 1.595 2.132 2.55 2.884 3.161 3.405 3.625 4.031 4.223 4.399 4.628 4.882 5.023 5.283 5.526 5.751 5.859 6.061 6.253 6.537 6.715 6.875 7.115 7.355 7.574 7.777 7.975 8.222 8.455 8.667 8.919 9.162 9.39 9.654 9.949 10.226 10.52 10.843 11.175 11.494 11.86 12.297 12.732 13.218 13.72 14.3 14.918 15.583 16.311 16.927 17.17 17.141 16.992 16.757 16.487 16.208 15.922 15.666 15.399 15.157 14.929 14.688 14.434 14.175 13.94 13.692 13.46 13.259 13.043 12.815 12.62 12.404 12.168 11.982 11.792 11.59 11.368 11.127 10.963 10.792 10.51 10.308 10.094 9.985 9.754 9.513 9.255 9.118 8.881 8.652 8.466 8.264 7.845 7.596 7.306 6.995 6.657 6.246 5.671 3.649 -2 ,10352 ,TETRA ,17621500,Tue Nov 30 17:14:39 CET,Tue Nov 30 19:41:08 CET,0.0 1.701 2.23 2.628 2.974 3.287 3.553 3.785 4.196 4.382 4.561 4.782 5.024 5.166 5.433 5.688 5.921 6.024 6.22 6.41 6.676 6.842 7.009 7.267 7.499 7.701 7.904 8.106 8.353 8.583 8.803 9.055 9.309 9.56 9.828 10.119 10.404 10.713 11.032 11.357 11.69 12.06 12.494 12.916 13.373 13.906 14.489 15.102 15.793 16.515 17.212 17.492 17.483 17.344 17.125 16.876 16.601 16.302 16.017 15.717 15.453 15.21 14.956 14.713 14.486 14.263 14.018 13.793 13.591 13.38 13.165 12.979 12.775 12.546 12.373 12.202 12.008 11.794 11.559 11.395 11.225 10.95 10.759 10.559 10.456 10.24 10.01 9.769 9.641 9.409 9.188 9.014 8.829 8.406 8.165 7.903 7.6 7.28 6.872 6.307 4.695 -3 ,11493 ,TETRA ,17621501,Tue Nov 30 17:14:39 CET,Tue Nov 30 19:50:51 CET,0.0 1.454 1.984 2.392 2.721 3.009 3.283 3.539 3.987 4.185 4.364 4.586 4.837 4.977 5.254 5.509 5.728 5.833 6.039 6.232 6.506 6.681 6.851 7.094 7.327 7.549 7.772 7.989 8.246 8.481 8.701 8.965 9.224 9.472 9.748 10.059 10.36 10.676 10.998 11.322 11.66 12.041 12.486 12.944 13.448 13.969 14.527 15.135 15.84 16.593 17.287 17.566 17.553 17.447 17.25 17.005 16.731 16.454 16.206 15.932 15.68 15.441 15.188 14.941 14.696 14.461 14.216 13.989 13.789 13.565 13.322 13.129 12.928 12.711 12.538 12.353 12.153 11.929 11.687 11.518 11.347 11.084 10.896 10.691 10.582 10.36 10.107 9.834 9.696 9.449 9.222 9.046 8.856 8.449 8.224 7.974 7.68 7.321 6.892 6.334 4.531 -4 ,22855 ,TETRA ,17621502,Tue Nov 30 17:14:39 CET,Tue Nov 30 19:39:57 CET,0.0 1.668 2.24 2.64 2.978 3.267 3.524 3.749 4.152 4.336 4.508 4.728 4.977 5.12 5.404 5.659 5.886 5.995 6.195 6.391 6.674 6.851 7.03 7.293 7.53 7.755 7.969 8.176 8.443 8.689 8.917 9.184 9.438 9.69 9.981 10.289 10.584 10.902 11.239 11.598 11.97 12.385 12.862 13.316 13.826 14.402 15.033 15.681 16.371 17.043 17.695 18.011 17.975 17.833 17.631 17.388 17.136 16.857 16.603 16.338 16.085 15.845 15.595 15.348 15.117 14.906 14.68 14.479 14.3 14.099 13.884 13.703 13.506 13.289 13.112 12.924 12.73 12.527 12.308 12.148 11.973 11.702 11.512 11.312 11.209 10.994 10.765 10.52 10.391 10.161 9.946 9.767 9.574 9.147 8.916 8.659 8.361 8.011 7.587 7.013 5.104 -5 ,466 ,TETRA ,17621503,Tue Nov 30 17:14:42 CET,Tue Nov 30 19:40:35 CET,0.0 1.756 2.315 2.713 3.035 3.317 3.568 3.797 4.212 4.396 4.562 4.782 5.038 5.186 5.456 5.693 5.918 6.035 6.261 6.464 6.751 6.932 7.097 7.331 7.554 7.759 7.957 8.153 8.404 8.631 8.839 9.092 9.336 9.564 9.828 10.128 10.416 10.731 11.064 11.427 11.797 12.19 12.652 13.096 13.594 14.153 14.778 15.419 16.117 16.822 17.437 17.713 17.724 17.581 17.326 17.02 16.732 16.491 16.242 15.947 15.69 15.447 15.204 14.97 14.742 14.522 14.289 14.073 13.875 13.657 13.42 13.222 13.018 12.798 12.612 12.427 12.246 12.04 11.823 11.67 11.511 11.251 11.056 10.855 10.754 10.543 10.312 10.057 9.921 9.683 9.446 9.261 9.066 8.652 8.407 8.138 7.859 7.521 7.089 6.494 4.635 -6 ,18680 ,TETRA ,17621504,Tue Nov 30 17:14:39 CET,Tue Nov 30 19:39:51 CET,0.0 1.476 1.994 2.379 2.689 2.972 3.219 3.439 3.848 4.03 4.2 4.426 4.676 4.814 5.068 5.308 5.54 5.65 5.862 6.062 6.329 6.496 6.658 6.896 7.119 7.326 7.535 7.733 7.972 8.205 8.434 8.697 8.942 9.178 9.45 9.747 10.027 10.33 10.635 10.96 11.307 11.684 12.106 12.529 13.024 13.545 14.125 14.749 15.453 16.166 16.756 17.014 16.94 16.719 16.463 16.176 15.875 15.565 15.286 15.0 14.729 14.468 14.202 13.928 13.667 13.433 13.179 12.944 12.748 12.543 12.322 12.128 11.917 11.697 11.52 11.324 11.12 10.901 10.674 10.521 10.358 10.092 9.901 9.694 9.581 9.337 9.089 8.834 8.697 8.459 8.242 8.069 7.878 7.439 7.19 6.916 6.61 6.26 5.858 5.321 3.634 -7 ,12318 ,TETRA ,17621505,Tue Nov 30 17:14:40 CET,Tue Nov 30 19:46:08 CET,0.0 1.628 2.253 2.7 3.032 3.323 3.584 3.824 4.262 4.459 4.639 4.89 5.143 5.277 5.535 5.776 6.003 6.113 6.326 6.523 6.791 6.96 7.131 7.372 7.599 7.82 8.027 8.219 8.471 8.704 8.926 9.199 9.45 9.691 9.968 10.265 10.551 10.869 11.202 11.552 11.925 12.335 12.784 13.198 13.659 14.118 14.598 15.138 15.742 16.409 16.994 17.25 17.286 17.172 16.974 16.732 16.472 16.17 15.873 15.574 15.309 15.044 14.771 14.498 14.238 13.995 13.735 13.506 13.308 13.091 12.852 12.648 12.44 12.221 12.044 11.863 11.674 11.466 11.234 11.068 10.892 10.606 10.407 10.196 10.081 9.849 9.609 9.33 9.181 8.936 8.706 8.535 8.35 7.907 7.656 7.4 7.086 6.712 6.261 5.657 3.86 -8 ,9505 ,TETRA ,17621506,Tue Nov 30 17:14:39 CET,Tue Nov 30 19:45:13 CET,0.0 1.837 2.418 2.86 3.245 3.556 3.815 4.055 4.466 4.643 4.818 5.052 5.309 5.45 5.718 5.969 6.197 6.301 6.511 6.72 7.004 7.178 7.349 7.588 7.807 8.019 8.232 8.435 8.69 8.925 9.149 9.432 9.697 9.947 10.226 10.535 10.825 11.125 11.458 11.82 12.172 12.55 13.004 13.454 13.945 14.454 15.053 15.74 16.466 17.161 17.873 18.286 18.301 18.16 17.983 17.787 17.558 17.304 17.061 16.798 16.559 16.325 16.097 15.875 15.644 15.41 15.156 14.931 14.732 14.519 14.297 14.111 13.909 13.694 13.52 13.337 13.145 12.938 12.724 12.572 12.403 12.13 11.942 11.741 11.634 11.397 11.149 10.89 10.746 10.501 10.273 10.101 9.917 9.48 9.229 8.966 8.666 8.326 7.893 7.28 5.303 -9 ,14948 ,TETRA ,17621507,Tue Nov 30 17:14:40 CET,Tue Nov 30 19:44:21 CET,0.0 1.93 2.508 2.935 3.288 3.578 3.845 4.093 4.504 4.685 4.86 5.079 5.334 5.481 5.736 5.97 6.199 6.305 6.512 6.727 7.019 7.191 7.358 7.6 7.829 8.041 8.245 8.436 8.668 8.895 9.108 9.361 9.613 9.85 10.119 10.43 10.721 11.034 11.37 11.711 12.055 12.419 12.832 13.25 13.741 14.294 14.911 15.571 16.304 17.01 17.614 17.908 17.873 17.703 17.489 17.23 16.944 16.666 16.411 16.116 15.844 15.589 15.339 15.094 14.852 14.628 14.386 14.167 13.981 13.778 13.54 13.336 13.129 12.906 12.727 12.551 12.366 12.156 11.929 11.765 11.598 11.323 11.126 10.921 10.809 10.585 10.346 10.075 9.936 9.7 9.462 9.282 9.098 8.698 8.463 8.19 7.89 7.549 7.122 6.553 4.783 -10 ,27365 ,TETRA ,17621508,Tue Nov 30 17:14:42 CET,Tue Nov 30 19:42:06 CET,0.0 1.455 1.991 2.381 2.716 3.0 3.252 3.485 3.885 4.066 4.249 4.483 4.726 4.873 5.166 5.424 5.651 5.759 5.966 6.174 6.467 6.64 6.804 7.046 7.274 7.497 7.711 7.906 8.162 8.406 8.626 8.889 9.152 9.4 9.677 9.981 10.269 10.577 10.905 11.255 11.598 11.965 12.41 12.866 13.373 13.914 14.505 15.145 15.893 16.69 17.423 17.735 17.767 17.661 17.446 17.181 16.92 16.654 16.407 16.142 15.886 15.629 15.385 15.159 14.92 14.701 14.476 14.258 14.06 13.845 13.618 13.437 13.245 13.041 12.878 12.698 12.497 12.294 12.086 11.933 11.769 11.508 11.33 11.141 11.043 10.833 10.601 10.343 10.2 9.957 9.75 9.576 9.383 8.939 8.677 8.38 8.053 7.681 7.24 6.578 4.741 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_64_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_64_63.txt deleted file mode 100644 index a3fdc76d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_64_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2948 ,TETRA ,17621509,Tue Nov 30 17:14:41 CET,Tue Nov 30 19:29:51 CET,0.0 1.825 2.449 2.889 3.242 3.556 3.825 4.06 4.472 4.659 4.838 5.061 5.306 5.446 5.716 5.973 6.206 6.317 6.525 6.709 6.979 7.158 7.325 7.551 7.757 7.956 8.143 8.314 8.538 8.762 8.979 9.219 9.443 9.671 9.934 10.21 10.464 10.738 11.028 11.314 11.607 11.936 12.301 12.646 13.025 13.42 13.818 14.242 14.697 15.091 15.255 15.079 14.738 14.32 13.879 13.438 13.049 12.696 12.351 11.968 11.62 11.287 10.973 10.696 10.429 10.16 9.868 9.616 9.399 9.164 8.9 8.675 8.433 8.175 7.979 7.774 7.558 7.324 7.08 6.911 6.727 6.436 6.223 6.003 5.886 5.635 5.374 5.091 4.938 4.678 4.428 4.237 4.03 3.567 3.313 3.022 2.697 2.343 1.919 1.328 -0.249 -2 ,25023 ,TETRA ,17621510,Tue Nov 30 17:14:40 CET,Tue Nov 30 19:43:22 CET,0.0 1.664 2.249 2.665 2.994 3.302 3.587 3.836 4.27 4.461 4.632 4.86 5.111 5.252 5.524 5.772 5.996 6.102 6.311 6.514 6.792 6.958 7.118 7.357 7.588 7.802 8.001 8.19 8.427 8.647 8.854 9.094 9.312 9.522 9.765 10.02 10.259 10.523 10.805 11.082 11.368 11.687 12.033 12.367 12.738 13.134 13.533 13.906 14.28 14.567 14.629 14.391 13.988 13.527 13.093 12.665 12.289 11.936 11.596 11.222 10.874 10.557 10.255 9.958 9.666 9.393 9.104 8.847 8.611 8.35 8.082 7.863 7.625 7.372 7.167 6.95 6.729 6.503 6.262 6.09 5.911 5.625 5.422 5.203 5.088 4.843 4.578 4.291 4.136 3.87 3.618 3.416 3.197 2.725 2.457 2.156 1.81 1.41 0.918 0.264 -1.739 -3 ,20470 ,TETRA ,17621511,Tue Nov 30 17:14:42 CET,Tue Nov 30 19:44:27 CET,0.0 1.636 2.263 2.688 3.017 3.316 3.593 3.835 4.237 4.427 4.612 4.846 5.092 5.234 5.502 5.744 5.971 6.076 6.282 6.474 6.731 6.898 7.063 7.312 7.551 7.76 7.956 8.141 8.372 8.58 8.777 9.017 9.25 9.471 9.702 9.952 10.195 10.451 10.721 11.014 11.321 11.643 12.009 12.364 12.758 13.183 13.6 13.997 14.422 14.811 15.06 14.947 14.662 14.284 13.84 13.389 12.978 12.585 12.232 11.872 11.532 11.221 10.916 10.615 10.334 10.07 9.79 9.538 9.313 9.072 8.815 8.592 8.366 8.13 7.934 7.727 7.509 7.286 7.049 6.871 6.687 6.4 6.201 5.999 5.889 5.657 5.405 5.129 4.981 4.72 4.496 4.324 4.132 3.672 3.402 3.101 2.783 2.428 1.979 1.366 -0.71 -4 ,21764 ,TETRA ,17621512,Tue Nov 30 17:14:40 CET,Tue Nov 30 19:41:00 CET,0.0 1.346 1.889 2.317 2.676 3.008 3.31 3.568 4.02 4.223 4.413 4.649 4.899 5.043 5.322 5.575 5.807 5.919 6.13 6.327 6.592 6.753 6.916 7.159 7.387 7.593 7.782 7.965 8.202 8.422 8.623 8.862 9.1 9.33 9.576 9.837 10.086 10.359 10.652 10.945 11.224 11.521 11.882 12.221 12.583 12.979 13.406 13.832 14.231 14.614 14.871 14.732 14.413 14.025 13.64 13.271 12.886 12.518 12.188 11.839 11.533 11.254 10.99 10.72 10.443 10.184 9.915 9.662 9.438 9.204 8.953 8.739 8.51 8.262 8.059 7.851 7.641 7.418 7.195 7.03 6.846 6.559 6.347 6.124 6.007 5.756 5.488 5.205 5.052 4.785 4.515 4.316 4.111 3.644 3.38 3.087 2.754 2.361 1.878 1.204 -0.783 -5 ,1371 ,TETRA ,17621514,Tue Nov 30 17:14:42 CET,Tue Nov 30 19:43:59 CET,0.0 1.503 1.997 2.374 2.703 2.979 3.218 3.451 3.873 4.061 4.236 4.465 4.717 4.855 5.114 5.356 5.581 5.689 5.889 6.072 6.337 6.504 6.652 6.879 7.106 7.306 7.488 7.673 7.918 8.165 8.383 8.606 8.816 9.021 9.253 9.509 9.746 9.994 10.26 10.549 10.849 11.163 11.519 11.864 12.231 12.602 12.99 13.399 13.841 14.247 14.443 14.299 14.007 13.633 13.251 12.859 12.471 12.102 11.771 11.431 11.133 10.848 10.554 10.268 10.003 9.757 9.49 9.233 9.003 8.766 8.515 8.311 8.089 7.84 7.648 7.454 7.241 7.004 6.768 6.606 6.421 6.127 5.922 5.701 5.586 5.349 5.102 4.838 4.694 4.444 4.213 4.03 3.845 3.427 3.163 2.867 2.538 2.158 1.708 1.114 -0.579 -6 ,9267 ,TETRA ,17621515,Tue Nov 30 17:14:42 CET,Tue Nov 30 19:50:36 CET,0.0 1.471 2.005 2.396 2.725 3.007 3.252 3.473 3.871 4.059 4.24 4.474 4.721 4.854 5.107 5.352 5.573 5.679 5.879 6.06 6.314 6.474 6.63 6.862 7.091 7.308 7.512 7.703 7.941 8.156 8.361 8.599 8.823 9.044 9.29 9.548 9.784 10.041 10.321 10.607 10.883 11.189 11.555 11.909 12.291 12.687 13.124 13.573 14.006 14.35 14.535 14.404 14.096 13.67 13.249 12.838 12.42 12.017 11.672 11.322 11.003 10.717 10.445 10.18 9.918 9.67 9.406 9.161 8.945 8.712 8.461 8.245 8.008 7.759 7.56 7.355 7.15 6.925 6.69 6.529 6.356 6.085 5.884 5.668 5.556 5.316 5.054 4.773 4.62 4.36 4.127 3.947 3.752 3.296 3.033 2.741 2.424 2.041 1.552 0.93 -1.014 -7 ,13099 ,TETRA ,17621516,Tue Nov 30 17:19:36 CET,Tue Nov 30 19:46:19 CET,0.0 1.695 2.255 2.681 3.029 3.327 3.582 3.82 4.272 4.477 4.671 4.925 5.19 5.344 5.625 5.861 6.073 6.172 6.373 6.582 6.866 7.031 7.189 7.419 7.648 7.853 8.034 8.22 8.458 8.677 8.883 9.128 9.371 9.6 9.846 10.115 10.363 10.641 10.931 11.212 11.492 11.812 12.186 12.524 12.876 13.246 13.649 14.014 14.347 14.616 14.695 14.37 13.86 13.323 12.83 12.39 12.008 11.647 11.302 10.934 10.591 10.271 9.97 9.68 9.401 9.142 8.864 8.617 8.393 8.136 7.87 7.651 7.413 7.162 6.968 6.763 6.537 6.297 6.053 5.877 5.681 5.366 5.154 4.929 4.813 4.581 4.308 3.991 3.828 3.565 3.322 3.14 2.942 2.455 2.183 1.907 1.59 1.22 0.762 0.15 -1.652 -8 ,17523 ,TETRA ,17621517,Tue Nov 30 17:19:36 CET,Tue Nov 30 19:45:18 CET,0.0 1.756 2.335 2.731 3.044 3.326 3.591 3.835 4.263 4.454 4.637 4.87 5.118 5.257 5.502 5.73 5.956 6.063 6.258 6.447 6.72 6.889 7.047 7.275 7.494 7.709 7.913 8.105 8.348 8.564 8.763 9.001 9.232 9.452 9.698 9.974 10.235 10.508 10.793 11.076 11.38 11.703 12.03 12.362 12.71 13.069 13.478 13.862 14.226 14.517 14.587 14.334 13.937 13.497 13.092 12.702 12.332 11.968 11.645 11.31 10.971 10.663 10.361 10.057 9.774 9.517 9.238 8.992 8.775 8.539 8.288 8.076 7.87 7.645 7.448 7.245 7.035 6.81 6.569 6.388 6.197 5.904 5.701 5.487 5.373 5.132 4.867 4.573 4.417 4.141 3.874 3.681 3.48 3.026 2.77 2.492 2.173 1.793 1.315 0.642 -1.122 -9 ,17203 ,TETRA ,17621518,Tue Nov 30 17:19:37 CET,Tue Nov 30 19:36:32 CET,0.0 1.411 1.958 2.367 2.697 2.978 3.217 3.445 3.874 4.061 4.228 4.428 4.672 4.812 5.076 5.322 5.539 5.644 5.848 6.032 6.296 6.471 6.635 6.854 7.053 7.235 7.411 7.592 7.827 8.047 8.247 8.478 8.694 8.898 9.131 9.395 9.639 9.903 10.177 10.462 10.768 11.091 11.44 11.774 12.137 12.488 12.856 13.245 13.631 13.897 13.898 13.616 13.174 12.699 12.238 11.775 11.35 10.938 10.579 10.221 9.903 9.594 9.291 9.007 8.73 8.47 8.198 7.951 7.729 7.499 7.258 7.043 6.814 6.58 6.396 6.198 5.996 5.779 5.543 5.383 5.218 4.949 4.743 4.522 4.408 4.169 3.909 3.632 3.486 3.236 3.016 2.831 2.626 2.175 1.918 1.64 1.334 0.967 0.507 -0.131 -2.245 -10 ,6984 ,TETRA ,17621519,Tue Nov 30 17:19:38 CET,Tue Nov 30 19:37:16 CET,0.0 1.611 2.224 2.658 3.007 3.316 3.59 3.846 4.289 4.467 4.626 4.824 5.071 5.206 5.453 5.701 5.929 6.034 6.24 6.436 6.708 6.876 7.04 7.274 7.478 7.664 7.852 8.03 8.246 8.451 8.656 8.906 9.132 9.337 9.575 9.841 10.096 10.366 10.64 10.937 11.236 11.544 11.887 12.225 12.588 12.976 13.392 13.797 14.169 14.507 14.738 14.604 14.279 13.884 13.457 13.052 12.673 12.295 11.951 11.597 11.281 10.953 10.61 10.285 9.965 9.685 9.406 9.14 8.894 8.628 8.36 8.137 7.91 7.674 7.484 7.278 7.058 6.825 6.575 6.397 6.208 5.915 5.702 5.475 5.36 5.109 4.835 4.547 4.394 4.123 3.855 3.659 3.451 2.975 2.695 2.383 2.04 1.654 1.19 0.533 -1.398 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_63.txt deleted file mode 100644 index a908dd7f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14396 ,TETRA ,17621520,Tue Nov 30 17:19:37 CET,Tue Nov 30 19:49:32 CET,0.0 1.796 2.385 2.794 3.135 3.445 3.708 3.945 4.359 4.541 4.707 4.933 5.189 5.333 5.6 5.843 6.076 6.191 6.409 6.615 6.898 7.065 7.225 7.451 7.667 7.868 8.047 8.23 8.465 8.676 8.88 9.124 9.348 9.563 9.81 10.071 10.296 10.523 10.764 11.008 11.244 11.505 11.805 12.127 12.476 12.799 13.11 13.394 13.664 13.85 13.763 13.274 12.701 12.174 11.671 11.186 10.737 10.306 9.931 9.531 9.168 8.837 8.505 8.191 7.906 7.638 7.342 7.067 6.823 6.561 6.291 6.07 5.833 5.572 5.369 5.156 4.93 4.691 4.433 4.257 4.076 3.783 3.58 3.366 3.254 3.016 2.759 2.491 2.348 2.075 1.795 1.603 1.405 0.972 0.724 0.437 0.134 -0.231 -0.721 -1.354 -3.124 -2 ,32544 ,TETRA ,17621521,Tue Nov 30 17:19:39 CET,Tue Nov 30 19:49:40 CET,0.0 1.894 2.542 2.995 3.363 3.691 3.976 4.216 4.64 4.824 4.991 5.204 5.448 5.586 5.834 6.07 6.298 6.412 6.623 6.817 7.092 7.258 7.418 7.647 7.865 8.066 8.247 8.418 8.636 8.853 9.058 9.284 9.49 9.687 9.923 10.186 10.426 10.671 10.921 11.178 11.429 11.703 12.014 12.307 12.617 12.937 13.291 13.619 13.934 14.128 13.985 13.584 13.144 12.626 12.11 11.59 11.101 10.673 10.292 9.886 9.519 9.196 8.895 8.595 8.299 8.02 7.73 7.467 7.235 6.983 6.704 6.476 6.251 6.006 5.8 5.584 5.365 5.143 4.902 4.733 4.549 4.251 4.044 3.822 3.707 3.464 3.188 2.882 2.729 2.47 2.237 2.058 1.861 1.412 1.173 0.892 0.556 0.193 -0.226 -0.804 -2.463 -3 ,12442 ,TETRA ,17621522,Tue Nov 30 17:19:38 CET,Tue Nov 30 19:47:12 CET,0.0 1.759 2.37 2.782 3.121 3.42 3.689 3.931 4.347 4.54 4.714 4.931 5.172 5.312 5.572 5.814 6.035 6.14 6.341 6.529 6.796 6.959 7.116 7.335 7.545 7.748 7.938 8.125 8.354 8.56 8.759 8.995 9.217 9.428 9.651 9.88 10.104 10.356 10.619 10.885 11.151 11.429 11.728 12.023 12.373 12.706 13.04 13.384 13.628 13.762 13.672 13.206 12.623 12.064 11.552 11.045 10.536 10.044 9.647 9.254 8.903 8.579 8.247 7.93 7.629 7.347 7.039 6.764 6.533 6.279 6.002 5.758 5.504 5.255 5.063 4.867 4.649 4.411 4.165 4.0 3.827 3.525 3.312 3.107 3.001 2.772 2.52 2.248 2.103 1.842 1.589 1.408 1.213 0.757 0.508 0.244 -0.063 -0.409 -0.812 -1.396 -3.185 -4 ,243 ,TETRA ,17621523,Tue Nov 30 17:19:39 CET,Tue Nov 30 19:44:54 CET,0.0 1.809 2.378 2.829 3.171 3.446 3.694 3.914 4.295 4.474 4.646 4.87 5.109 5.254 5.531 5.771 5.994 6.1 6.31 6.507 6.787 6.966 7.136 7.37 7.584 7.787 7.976 8.158 8.397 8.623 8.829 9.065 9.291 9.496 9.723 9.981 10.215 10.474 10.753 11.018 11.285 11.581 11.912 12.22 12.543 12.863 13.182 13.475 13.781 14.054 14.004 13.552 13.036 12.478 11.96 11.473 11.02 10.598 10.219 9.834 9.486 9.156 8.84 8.544 8.246 7.971 7.698 7.444 7.209 6.963 6.7 6.472 6.241 6.0 5.806 5.601 5.39 5.174 4.949 4.794 4.62 4.323 4.127 3.933 3.833 3.612 3.37 3.099 2.951 2.699 2.482 2.298 2.091 1.647 1.405 1.137 0.837 0.493 0.078 -0.492 -2.097 -5 ,18566 ,TETRA ,17621524,Tue Nov 30 17:19:38 CET,Tue Nov 30 19:36:51 CET,0.0 1.773 2.351 2.787 3.137 3.43 3.674 3.892 4.307 4.508 4.69 4.9 5.143 5.283 5.54 5.776 6.0 6.104 6.296 6.478 6.744 6.911 7.065 7.286 7.51 7.718 7.906 8.086 8.324 8.558 8.767 8.996 9.203 9.402 9.617 9.852 10.089 10.332 10.575 10.817 11.066 11.352 11.673 11.98 12.322 12.668 13.017 13.358 13.658 13.81 13.779 13.494 13.04 12.494 11.967 11.495 11.06 10.624 10.224 9.807 9.438 9.106 8.779 8.469 8.187 7.924 7.633 7.356 7.114 6.865 6.598 6.364 6.11 5.853 5.656 5.446 5.233 5.006 4.755 4.581 4.396 4.114 3.919 3.704 3.591 3.345 3.076 2.795 2.656 2.409 2.181 1.997 1.8 1.366 1.124 0.853 0.534 0.159 -0.285 -0.893 -2.693 -6 ,23421 ,TETRA ,17621525,Tue Nov 30 17:19:38 CET,Tue Nov 30 19:43:03 CET,0.0 1.504 2.043 2.434 2.771 3.068 3.326 3.559 3.962 4.149 4.326 4.556 4.805 4.948 5.208 5.449 5.677 5.784 5.982 6.165 6.424 6.59 6.753 6.983 7.191 7.385 7.566 7.739 7.959 8.161 8.347 8.577 8.802 9.01 9.252 9.523 9.777 10.048 10.331 10.598 10.858 11.14 11.442 11.741 12.049 12.35 12.685 12.979 13.202 13.317 13.163 12.726 12.193 11.629 11.092 10.593 10.128 9.673 9.26 8.842 8.478 8.147 7.831 7.529 7.247 6.981 6.698 6.436 6.196 5.946 5.686 5.455 5.21 4.961 4.767 4.56 4.337 4.105 3.863 3.697 3.525 3.245 3.039 2.815 2.695 2.457 2.222 1.958 1.807 1.546 1.308 1.121 0.92 0.484 0.237 -0.032 -0.344 -0.704 -1.123 -1.725 -3.366 -7 ,515 ,TETRA ,17621526,Tue Nov 30 17:19:40 CET,Tue Nov 30 19:40:48 CET,0.0 1.904 2.527 2.986 3.332 3.61 3.848 4.06 4.452 4.635 4.799 5.011 5.253 5.384 5.637 5.87 6.09 6.195 6.39 6.579 6.863 7.037 7.198 7.415 7.621 7.819 8.005 8.19 8.42 8.628 8.83 9.076 9.306 9.521 9.76 10.017 10.253 10.499 10.761 11.034 11.303 11.592 11.915 12.2 12.501 12.813 13.12 13.392 13.65 13.819 13.7 13.198 12.638 12.168 11.71 11.236 10.825 10.428 10.037 9.618 9.247 8.91 8.588 8.293 8.014 7.756 7.473 7.215 6.988 6.746 6.498 6.285 6.054 5.813 5.633 5.455 5.259 5.034 4.789 4.618 4.441 4.16 3.952 3.734 3.626 3.396 3.136 2.86 2.713 2.467 2.25 2.072 1.883 1.452 1.208 0.941 0.644 0.288 -0.149 -0.702 -2.157 -8 ,32469 ,TETRA ,17621527,Tue Nov 30 17:19:38 CET,Tue Nov 30 19:42:30 CET,0.0 1.778 2.359 2.768 3.1 3.383 3.643 3.896 4.35 4.537 4.715 4.942 5.179 5.315 5.561 5.788 6.003 6.109 6.313 6.509 6.788 6.956 7.117 7.349 7.572 7.786 7.979 8.148 8.351 8.549 8.742 8.977 9.198 9.409 9.649 9.914 10.168 10.43 10.7 10.967 11.233 11.525 11.842 12.143 12.471 12.782 13.093 13.426 13.723 13.845 13.682 13.272 12.779 12.255 11.764 11.298 10.87 10.463 10.079 9.683 9.338 9.016 8.704 8.413 8.136 7.866 7.578 7.314 7.076 6.832 6.596 6.395 6.176 5.937 5.741 5.539 5.329 5.104 4.864 4.699 4.522 4.239 4.044 3.831 3.714 3.455 3.186 2.901 2.75 2.485 2.235 2.048 1.85 1.424 1.196 0.941 0.638 0.279 -0.156 -0.752 -2.49 -9 ,7378 ,TETRA ,17621528,Tue Nov 30 17:19:39 CET,Tue Nov 30 19:47:27 CET,0.0 1.812 2.403 2.849 3.224 3.543 3.806 4.039 4.455 4.637 4.814 5.043 5.288 5.422 5.675 5.916 6.147 6.251 6.45 6.635 6.902 7.07 7.22 7.444 7.656 7.853 8.045 8.221 8.444 8.657 8.857 9.1 9.325 9.539 9.786 10.044 10.286 10.541 10.804 11.088 11.363 11.659 12.022 12.361 12.695 13.034 13.377 13.709 14.063 14.329 14.332 14.003 13.537 13.061 12.621 12.171 11.752 11.338 10.962 10.562 10.186 9.854 9.549 9.25 8.963 8.702 8.42 8.16 7.932 7.695 7.441 7.226 7.0 6.762 6.571 6.364 6.154 5.939 5.7 5.53 5.355 5.078 4.878 4.659 4.54 4.297 4.041 3.75 3.594 3.331 3.094 2.909 2.72 2.31 2.068 1.799 1.498 1.127 0.68 0.081 -1.681 -10 ,12300 ,TETRA ,17621529,Tue Nov 30 17:19:39 CET,Tue Nov 30 20:02:16 CET,0.0 1.654 2.228 2.629 2.947 3.226 3.475 3.698 4.116 4.317 4.497 4.724 4.969 5.104 5.362 5.601 5.826 5.936 6.153 6.362 6.647 6.821 6.98 7.2 7.406 7.606 7.8 7.982 8.2 8.403 8.602 8.837 9.047 9.242 9.47 9.712 9.932 10.183 10.466 10.728 10.987 11.293 11.621 11.928 12.262 12.59 12.928 13.269 13.566 13.744 13.711 13.3 12.805 12.319 11.834 11.35 10.902 10.485 10.117 9.726 9.378 9.07 8.769 8.476 8.178 7.903 7.631 7.374 7.147 6.913 6.663 6.44 6.198 5.948 5.75 5.545 5.332 5.108 4.857 4.683 4.512 4.212 3.997 3.789 3.684 3.461 3.209 2.938 2.797 2.55 2.313 2.136 1.94 1.47 1.211 0.935 0.622 0.269 -0.157 -0.808 -2.508 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_64.txt deleted file mode 100644 index 5b9ec81f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7600 ,TETRA ,17621530,Tue Nov 30 17:19:38 CET,Tue Nov 30 19:43:44 CET,0.0 2.232 2.904 3.39 3.759 4.077 4.378 4.647 5.1 5.309 5.509 5.759 6.016 6.171 6.454 6.707 6.946 7.064 7.285 7.491 7.785 7.956 8.115 8.352 8.577 8.787 8.983 9.171 9.418 9.657 9.879 10.134 10.379 10.615 10.875 11.145 11.395 11.659 11.932 12.236 12.556 12.868 13.186 13.506 13.898 14.286 14.652 15.04 15.382 15.57 15.459 14.946 14.27 13.608 13.048 12.508 12.022 11.573 11.163 10.752 10.393 10.061 9.728 9.409 9.121 8.84 8.535 8.265 8.025 7.781 7.528 7.307 7.067 6.814 6.615 6.412 6.193 5.95 5.7 5.53 5.357 5.082 4.872 4.642 4.525 4.285 4.027 3.75 3.598 3.329 3.058 2.866 2.668 2.241 1.994 1.71 1.376 1.005 0.593 0.032 -1.737 -2 ,28129 ,TETRA ,17621531,Tue Nov 30 17:19:39 CET,Tue Nov 30 19:59:16 CET,0.0 1.789 2.428 2.899 3.281 3.622 3.92 4.2 4.679 4.885 5.083 5.332 5.58 5.725 6.028 6.31 6.561 6.683 6.908 7.12 7.427 7.62 7.804 8.06 8.296 8.522 8.728 8.92 9.164 9.398 9.617 9.874 10.124 10.352 10.602 10.878 11.126 11.399 11.713 12.034 12.354 12.683 13.026 13.338 13.672 14.012 14.357 14.714 15.048 15.269 15.33 15.0 14.383 13.75 13.181 12.674 12.222 11.777 11.378 10.967 10.6 10.262 9.933 9.624 9.337 9.058 8.767 8.506 8.267 8.016 7.76 7.527 7.274 7.022 6.82 6.6 6.37 6.128 5.875 5.7 5.505 5.197 4.99 4.778 4.665 4.413 4.132 3.832 3.679 3.416 3.191 3.0 2.793 2.312 2.042 1.764 1.46 1.115 0.691 0.124 -1.339 -3 ,30651 ,TETRA ,17621532,Tue Nov 30 17:21:37 CET,Tue Nov 30 19:43:48 CET,0.0 1.688 2.347 2.836 3.209 3.537 3.838 4.097 4.528 4.724 4.91 5.153 5.407 5.563 5.863 6.141 6.392 6.51 6.731 6.948 7.255 7.435 7.607 7.853 8.093 8.313 8.525 8.726 8.957 9.167 9.372 9.639 9.893 10.12 10.389 10.677 10.925 11.202 11.522 11.84 12.125 12.442 12.801 13.134 13.481 13.829 14.196 14.551 14.849 15.0 14.855 14.411 13.93 13.43 12.92 12.412 11.942 11.508 11.112 10.707 10.359 10.046 9.735 9.422 9.133 8.864 8.579 8.307 8.069 7.83 7.568 7.335 7.08 6.819 6.625 6.412 6.183 5.943 5.697 5.529 5.349 5.05 4.838 4.618 4.502 4.264 4.012 3.73 3.579 3.328 3.11 2.929 2.739 2.305 2.047 1.765 1.445 1.042 0.529 -0.115 -2.164 -4 ,17490 ,TETRA ,17621533,Tue Nov 30 17:21:38 CET,Tue Nov 30 19:45:54 CET,0.0 1.964 2.599 3.046 3.432 3.768 4.06 4.312 4.751 4.957 5.155 5.413 5.671 5.834 6.143 6.417 6.661 6.778 7.01 7.222 7.526 7.722 7.884 8.101 8.323 8.546 8.749 8.933 9.178 9.413 9.637 9.902 10.144 10.377 10.623 10.873 11.106 11.369 11.667 11.957 12.237 12.546 12.911 13.251 13.574 13.894 14.224 14.554 14.892 15.131 15.103 14.708 14.163 13.625 13.114 12.604 12.135 11.698 11.288 10.875 10.522 10.186 9.861 9.553 9.255 8.981 8.701 8.441 8.209 7.966 7.707 7.491 7.259 7.023 6.832 6.627 6.415 6.195 5.963 5.798 5.62 5.335 5.134 4.922 4.811 4.573 4.312 4.038 3.895 3.637 3.381 3.191 2.998 2.56 2.305 2.029 1.713 1.342 0.909 0.297 -1.558 -5 ,31519 ,TETRA ,17621534,Tue Nov 30 17:21:40 CET,Tue Nov 30 19:45:32 CET,0.0 1.706 2.241 2.639 3.0 3.299 3.558 3.794 4.208 4.401 4.59 4.837 5.099 5.256 5.545 5.803 6.049 6.164 6.367 6.557 6.853 7.044 7.217 7.464 7.7 7.921 8.123 8.312 8.551 8.772 8.977 9.233 9.482 9.722 10.002 10.305 10.587 10.891 11.201 11.49 11.793 12.128 12.487 12.842 13.202 13.531 13.881 14.217 14.443 14.547 14.45 14.031 13.491 12.913 12.346 11.806 11.308 10.855 10.479 10.081 9.694 9.344 9.014 8.682 8.378 8.109 7.805 7.523 7.285 7.033 6.759 6.526 6.291 6.039 5.825 5.61 5.392 5.156 4.899 4.719 4.54 4.267 4.067 3.857 3.748 3.511 3.255 2.977 2.829 2.571 2.336 2.162 1.97 1.516 1.252 0.974 0.659 0.284 -0.166 -0.741 -2.301 -6 ,15458 ,TETRA ,17621535,Tue Nov 30 17:27:38 CET,Tue Nov 30 19:41:57 CET,0.0 1.986 2.619 3.093 3.477 3.794 4.087 4.356 4.831 5.03 5.218 5.478 5.74 5.894 6.194 6.466 6.709 6.831 7.064 7.283 7.589 7.784 7.973 8.234 8.474 8.703 8.921 9.121 9.36 9.587 9.82 10.102 10.364 10.597 10.848 11.113 11.361 11.615 11.895 12.191 12.469 12.768 13.091 13.396 13.763 14.156 14.557 14.941 15.237 15.42 15.336 14.851 14.292 13.745 13.223 12.716 12.257 11.816 11.429 11.05 10.705 10.382 10.061 9.754 9.468 9.181 8.871 8.609 8.381 8.133 7.872 7.652 7.421 7.185 6.998 6.802 6.592 6.368 6.13 5.957 5.778 5.483 5.269 5.048 4.936 4.702 4.448 4.159 4.0 3.744 3.528 3.358 3.158 2.708 2.465 2.19 1.875 1.49 1.025 0.441 -1.569 -7 ,8176 ,TETRA ,17621536,Tue Nov 30 17:27:38 CET,Tue Nov 30 19:54:53 CET,0.0 1.869 2.506 2.967 3.361 3.697 3.998 4.274 4.746 4.949 5.14 5.379 5.626 5.77 6.046 6.324 6.563 6.665 6.865 7.053 7.306 7.467 7.632 7.884 8.135 8.371 8.581 8.774 9.016 9.24 9.453 9.702 9.929 10.142 10.384 10.657 10.922 11.197 11.475 11.771 12.053 12.34 12.67 12.997 13.383 13.788 14.14 14.421 14.683 14.8 14.535 13.956 13.364 12.792 12.265 11.734 11.223 10.739 10.311 9.868 9.477 9.128 8.796 8.481 8.184 7.916 7.629 7.354 7.108 6.855 6.59 6.359 6.107 5.832 5.624 5.419 5.201 4.973 4.73 4.554 4.369 4.075 3.861 3.623 3.495 3.237 2.97 2.696 2.543 2.263 2.013 1.822 1.617 1.162 0.903 0.619 0.31 -0.044 -0.505 -1.158 -3.016 -8 ,8016 ,TETRA ,17621537,Tue Nov 30 17:27:38 CET,Tue Nov 30 19:55:03 CET,0.0 1.689 2.285 2.749 3.166 3.515 3.795 4.055 4.514 4.717 4.909 5.157 5.418 5.577 5.882 6.165 6.417 6.537 6.771 6.985 7.288 7.479 7.655 7.896 8.12 8.341 8.555 8.761 9.007 9.225 9.427 9.666 9.888 10.098 10.366 10.671 10.941 11.216 11.491 11.761 12.062 12.409 12.772 13.104 13.462 13.844 14.264 14.751 15.205 15.487 15.502 15.059 14.479 13.941 13.431 12.931 12.479 12.034 11.631 11.249 10.909 10.583 10.255 9.929 9.623 9.349 9.064 8.794 8.553 8.298 8.033 7.811 7.576 7.339 7.146 6.934 6.707 6.477 6.241 6.063 5.873 5.583 5.375 5.153 5.039 4.804 4.547 4.257 4.112 3.864 3.637 3.458 3.262 2.833 2.588 2.308 1.985 1.618 1.144 0.514 -1.173 -9 ,16869 ,TETRA ,17621538,Tue Nov 30 17:27:38 CET,Tue Nov 30 19:48:40 CET,0.0 2.119 2.789 3.243 3.619 3.959 4.25 4.521 5.005 5.216 5.415 5.68 5.942 6.097 6.378 6.643 6.889 6.996 7.198 7.383 7.642 7.819 7.987 8.225 8.459 8.67 8.873 9.07 9.311 9.55 9.789 10.065 10.303 10.513 10.768 11.052 11.307 11.584 11.874 12.166 12.461 12.765 13.075 13.39 13.781 14.201 14.644 15.031 15.284 15.378 15.249 14.802 14.266 13.711 13.151 12.6 12.081 11.611 11.205 10.791 10.409 10.054 9.713 9.382 9.073 8.785 8.485 8.21 7.965 7.717 7.457 7.227 6.971 6.711 6.518 6.319 6.108 5.882 5.637 5.457 5.264 4.962 4.76 4.555 4.444 4.204 3.95 3.682 3.541 3.286 3.023 2.829 2.623 2.162 1.904 1.642 1.358 1.013 0.566 -0.039 -1.698 -10 ,20223 ,TETRA ,17621539,Tue Nov 30 17:27:39 CET,Tue Nov 30 19:53:23 CET,0.0 2.275 2.898 3.366 3.758 4.094 4.385 4.659 5.128 5.335 5.528 5.775 6.046 6.21 6.5 6.753 6.996 7.115 7.328 7.531 7.815 7.99 8.158 8.4 8.627 8.833 9.038 9.24 9.499 9.737 9.941 10.178 10.428 10.664 10.909 11.177 11.436 11.73 12.022 12.304 12.611 12.935 13.294 13.655 14.035 14.454 14.857 15.182 15.489 15.688 15.606 15.136 14.524 13.923 13.376 12.84 12.341 11.871 11.465 11.042 10.661 10.333 10.008 9.689 9.385 9.111 8.828 8.563 8.334 8.083 7.807 7.579 7.341 7.086 6.889 6.684 6.464 6.227 5.982 5.819 5.648 5.366 5.158 4.937 4.823 4.575 4.295 3.982 3.826 3.571 3.319 3.136 2.937 2.499 2.249 1.975 1.662 1.29 0.841 0.237 -1.417 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_49.txt deleted file mode 100644 index 58e0c33b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17441 ,TETRA ,17621540,Tue Nov 30 17:27:41 CET,Tue Nov 30 19:53:10 CET,0.0 1.679 2.262 2.708 3.087 3.418 3.712 3.989 4.504 4.737 4.953 5.19 5.551 5.736 6.096 6.435 6.744 6.893 7.192 7.48 7.888 8.155 8.425 8.818 9.188 9.548 9.896 10.228 10.662 11.095 11.508 12.004 12.484 12.951 13.497 14.11 14.707 15.375 16.111 16.893 17.718 18.659 19.748 20.873 22.263 23.836 25.65 27.725 30.188 33.192 37.091 40.555 42.636 44.033 45.016 45.766 46.322 46.679 46.914 47.107 47.223 47.281 47.281 47.259 47.217 47.155 47.07 46.972 46.882 46.783 46.667 46.539 46.383 46.234 46.117 45.97 45.819 45.665 45.459 45.306 45.154 44.913 44.75 44.563 44.463 44.262 44.026 43.747 43.599 43.322 43.123 42.944 42.745 42.298 42.018 41.587 41.079 40.604 39.918 38.869 34.515 -2 ,3307 ,TETRA ,17621541,Tue Nov 30 17:27:40 CET,Tue Nov 30 20:00:51 CET,0.0 1.504 2.096 2.596 3.012 3.356 3.672 3.959 4.474 4.705 4.92 5.146 5.51 5.697 6.049 6.391 6.713 6.865 7.161 7.452 7.873 8.146 8.414 8.796 9.166 9.524 9.87 10.2 10.623 11.041 11.447 11.942 12.427 12.89 13.423 14.027 14.622 15.296 16.029 16.806 17.64 18.597 19.745 20.929 22.326 23.923 25.83 28.094 30.843 34.265 38.723 42.568 44.949 46.515 47.573 48.283 48.782 49.162 49.412 49.611 49.738 49.813 49.831 49.815 49.777 49.736 49.666 49.557 49.47 49.383 49.279 49.185 49.049 48.882 48.738 48.578 48.41 48.219 48.006 47.855 47.699 47.441 47.255 47.06 46.954 46.728 46.493 46.232 46.083 45.801 45.573 45.377 45.167 44.678 44.396 44.086 43.709 43.271 42.713 41.863 38.619 -3 ,9656 ,TETRA ,17621542,Tue Nov 30 17:27:40 CET,Tue Nov 30 19:52:41 CET,0.0 1.673 2.313 2.77 3.151 3.493 3.803 4.095 4.627 4.867 5.084 5.305 5.661 5.842 6.203 6.553 6.884 7.045 7.348 7.642 8.073 8.345 8.607 8.99 9.36 9.715 10.054 10.384 10.818 11.234 11.643 12.154 12.634 13.092 13.645 14.273 14.874 15.546 16.296 17.113 17.985 18.96 20.091 21.235 22.62 24.223 26.076 28.255 31.04 34.465 38.816 42.776 45.195 46.802 47.854 48.56 49.049 49.367 49.581 49.735 49.816 49.853 49.868 49.863 49.852 49.815 49.727 49.63 49.53 49.418 49.288 49.164 49.034 48.901 48.777 48.612 48.442 48.272 48.077 47.937 47.808 47.58 47.391 47.188 47.074 46.828 46.578 46.315 46.171 45.894 45.687 45.483 45.241 44.725 44.448 44.135 43.764 43.29 42.689 41.857 38.905 -4 ,28535 ,TETRA ,17621543,Tue Nov 30 17:27:42 CET,Tue Nov 30 19:54:53 CET,0.0 1.856 2.479 2.939 3.317 3.651 3.965 4.245 4.731 4.951 5.167 5.411 5.779 5.967 6.313 6.642 6.951 7.107 7.408 7.688 8.105 8.375 8.639 9.024 9.394 9.749 10.095 10.44 10.89 11.316 11.723 12.211 12.685 13.149 13.696 14.301 14.864 15.492 16.209 17.005 17.855 18.817 19.931 21.077 22.466 24.067 25.994 28.244 30.866 33.949 37.823 41.191 43.279 44.674 45.687 46.447 46.985 47.338 47.569 47.771 47.88 47.926 47.943 47.931 47.904 47.861 47.801 47.722 47.631 47.541 47.427 47.308 47.17 47.02 46.904 46.781 46.644 46.487 46.323 46.202 46.07 45.849 45.679 45.488 45.383 45.156 44.896 44.611 44.466 44.193 43.973 43.8 43.61 43.148 42.882 42.567 42.188 41.716 41.011 39.865 35.029 -5 ,28742 ,TETRA ,17621544,Tue Nov 30 17:27:39 CET,Tue Nov 30 19:55:33 CET,0.0 1.643 2.247 2.718 3.147 3.515 3.827 4.122 4.661 4.897 5.129 5.39 5.76 5.949 6.31 6.651 6.966 7.116 7.417 7.711 8.137 8.406 8.658 9.024 9.386 9.737 10.067 10.391 10.833 11.257 11.659 12.145 12.631 13.114 13.667 14.284 14.88 15.544 16.273 17.063 17.909 18.881 20.032 21.181 22.53 24.122 26.025 28.13 30.753 34.066 38.109 41.638 43.81 45.235 46.189 46.769 47.123 47.372 47.536 47.646 47.701 47.712 47.699 47.668 47.595 47.496 47.37 47.241 47.11 46.972 46.841 46.72 46.58 46.426 46.3 46.168 46.017 45.842 45.656 45.528 45.378 45.126 44.95 44.756 44.652 44.438 44.216 43.955 43.804 43.521 43.292 43.1 42.904 42.466 42.201 41.888 41.511 41.038 40.484 39.543 35.677 -6 ,26146 ,TETRA ,17621545,Tue Nov 30 17:27:41 CET,Tue Nov 30 19:53:56 CET,0.0 1.657 2.304 2.786 3.164 3.488 3.783 4.055 4.566 4.799 5.016 5.256 5.617 5.81 6.184 6.524 6.834 6.983 7.283 7.585 8.011 8.278 8.543 8.932 9.298 9.652 9.998 10.335 10.775 11.197 11.613 12.11 12.583 13.056 13.597 14.208 14.808 15.466 16.195 16.996 17.863 18.856 20.006 21.182 22.598 24.182 26.068 28.318 31.001 34.255 38.492 42.26 44.503 45.917 46.925 47.688 48.184 48.472 48.623 48.742 48.793 48.791 48.771 48.72 48.653 48.581 48.488 48.404 48.343 48.262 48.13 47.999 47.862 47.707 47.576 47.428 47.266 47.083 46.875 46.73 46.577 46.338 46.17 45.98 45.877 45.655 45.399 45.114 44.959 44.669 44.414 44.2 43.97 43.487 43.219 42.901 42.534 42.103 41.501 40.668 37.242 -7 ,9154 ,TETRA ,17621546,Tue Nov 30 17:27:40 CET,Tue Nov 30 19:52:09 CET,0.0 1.827 2.398 2.835 3.213 3.555 3.878 4.176 4.689 4.92 5.132 5.366 5.728 5.922 6.29 6.628 6.955 7.114 7.415 7.699 8.105 8.363 8.618 8.998 9.365 9.719 10.063 10.397 10.825 11.245 11.644 12.12 12.586 13.025 13.541 14.151 14.752 15.416 16.14 16.925 17.763 18.73 19.864 20.973 22.29 23.817 25.609 27.679 30.203 33.297 37.264 40.791 42.999 44.496 45.5 46.231 46.771 47.167 47.447 47.651 47.783 47.858 47.866 47.851 47.805 47.728 47.648 47.572 47.496 47.398 47.285 47.182 47.067 46.93 46.801 46.665 46.524 46.355 46.165 46.027 45.878 45.628 45.439 45.227 45.113 44.886 44.639 44.361 44.219 43.94 43.664 43.435 43.2 42.666 42.362 42.032 41.677 41.237 40.659 39.803 36.024 -8 ,5092 ,TETRA ,17621547,Tue Nov 30 17:27:41 CET,Tue Nov 30 19:59:02 CET,0.0 1.51 2.07 2.482 2.869 3.228 3.536 3.824 4.331 4.559 4.772 5.008 5.364 5.552 5.905 6.248 6.584 6.737 7.022 7.302 7.707 7.97 8.226 8.596 8.958 9.306 9.649 9.983 10.404 10.813 11.218 11.719 12.201 12.661 13.196 13.82 14.424 15.069 15.777 16.568 17.412 18.374 19.53 20.687 22.018 23.532 25.325 27.422 29.956 33.128 37.309 40.901 43.05 44.567 45.67 46.417 46.936 47.32 47.545 47.667 47.714 47.714 47.675 47.627 47.558 47.465 47.359 47.279 47.201 47.094 46.975 46.858 46.699 46.516 46.38 46.233 46.07 45.896 45.727 45.602 45.447 45.195 45.017 44.831 44.734 44.522 44.292 44.051 43.918 43.644 43.41 43.206 42.979 42.474 42.118 41.649 41.177 40.586 39.879 38.921 34.864 -9 ,32303 ,TETRA ,17621548,Tue Nov 30 17:27:40 CET,Tue Nov 30 19:55:32 CET,0.0 1.752 2.359 2.817 3.202 3.561 3.893 4.182 4.683 4.907 5.125 5.37 5.737 5.934 6.296 6.639 6.973 7.127 7.42 7.703 8.11 8.372 8.629 9.001 9.364 9.724 10.072 10.405 10.831 11.257 11.676 12.181 12.667 13.138 13.694 14.321 14.921 15.59 16.327 17.128 17.986 18.972 20.153 21.358 22.788 24.397 26.299 28.548 31.264 34.557 38.727 42.399 44.674 46.235 47.301 48.035 48.545 48.895 49.129 49.305 49.374 49.383 49.374 49.35 49.311 49.264 49.195 49.116 49.046 48.971 48.884 48.779 48.65 48.529 48.431 48.31 48.188 48.06 47.895 47.774 47.647 47.436 47.281 47.104 47.009 46.788 46.536 46.277 46.142 45.881 45.691 45.502 45.292 44.814 44.524 44.176 43.776 43.255 42.484 41.361 37.303 -10 ,29577 ,TETRA ,17621549,Tue Nov 30 17:27:43 CET,Tue Nov 30 19:57:28 CET,0.0 1.66 2.328 2.82 3.205 3.547 3.855 4.128 4.633 4.865 5.086 5.328 5.693 5.881 6.239 6.575 6.894 7.052 7.358 7.644 8.047 8.309 8.568 8.938 9.297 9.656 10.011 10.342 10.757 11.168 11.553 12.017 12.479 12.928 13.454 14.05 14.619 15.231 15.915 16.665 17.486 18.457 19.604 20.763 22.167 23.807 25.721 27.958 30.685 33.923 37.921 41.362 43.493 44.955 45.987 46.715 47.17 47.502 47.749 47.887 47.925 47.941 47.938 47.911 47.853 47.794 47.728 47.652 47.566 47.444 47.314 47.2 47.057 46.891 46.745 46.591 46.431 46.252 46.061 45.937 45.805 45.565 45.374 45.165 45.061 44.84 44.591 44.318 44.164 43.877 43.645 43.454 43.246 42.687 42.289 41.88 41.5 41.026 40.275 39.105 35.066 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_65.txt deleted file mode 100644 index 1672a865..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3739 ,TETRA ,17621550,Tue Nov 30 17:27:40 CET,Tue Nov 30 19:52:54 CET,0.0 1.938 2.568 3.064 3.47 3.819 4.124 4.413 4.962 5.217 5.459 5.739 6.116 6.321 6.717 7.081 7.436 7.613 7.959 8.286 8.764 9.073 9.371 9.811 10.224 10.623 11.021 11.417 11.933 12.427 12.903 13.483 14.056 14.614 15.263 15.997 16.712 17.509 18.395 19.362 20.398 21.6 23.036 24.538 26.35 28.43 30.938 33.91 37.581 42.195 48.359 54.169 58.037 60.787 62.742 64.263 65.45 66.385 67.111 67.751 68.236 68.616 68.929 69.183 69.394 69.569 69.737 69.87 69.948 70.013 70.083 70.108 70.107 70.098 70.08 70.047 69.994 69.939 69.889 69.839 69.786 69.692 69.605 69.512 69.465 69.344 69.194 69.021 68.922 68.712 68.579 68.451 68.302 67.96 67.75 67.498 67.209 66.869 66.456 65.888 64.048 -2 ,10161 ,TETRA ,17621551,Tue Nov 30 17:27:41 CET,Tue Nov 30 20:01:16 CET,0.0 1.693 2.318 2.791 3.213 3.579 3.891 4.177 4.719 4.971 5.209 5.482 5.864 6.064 6.447 6.817 7.177 7.347 7.672 7.993 8.462 8.762 9.047 9.46 9.859 10.245 10.633 11.028 11.534 12.019 12.483 13.049 13.608 14.146 14.8 15.564 16.311 17.136 18.027 18.985 20.012 21.222 22.654 24.103 25.865 27.921 30.401 33.375 37.066 41.726 48.022 53.903 57.772 60.489 62.465 63.934 65.042 65.963 66.666 67.298 67.783 68.159 68.469 68.726 68.914 69.045 69.188 69.315 69.404 69.461 69.508 69.544 69.567 69.582 69.594 69.591 69.564 69.528 69.464 69.409 69.347 69.229 69.129 68.996 68.924 68.795 68.658 68.493 68.399 68.204 68.074 67.953 67.818 67.483 67.274 67.022 66.725 66.369 65.91 65.263 63.589 -3 ,11536 ,TETRA ,17621552,Tue Nov 30 17:27:41 CET,Tue Nov 30 19:54:44 CET,0.0 1.786 2.44 2.939 3.348 3.71 4.029 4.32 4.862 5.112 5.351 5.627 6.008 6.213 6.608 6.978 7.337 7.513 7.853 8.177 8.644 8.95 9.245 9.678 10.091 10.482 10.87 11.248 11.73 12.202 12.671 13.241 13.792 14.332 14.99 15.74 16.449 17.238 18.105 19.06 20.092 21.268 22.694 24.163 25.924 27.991 30.458 33.404 37.102 41.804 48.134 54.163 58.156 60.973 63.052 64.655 65.89 66.879 67.637 68.301 68.788 69.162 69.49 69.772 69.998 70.163 70.292 70.391 70.47 70.532 70.58 70.614 70.63 70.63 70.608 70.578 70.554 70.521 70.465 70.419 70.367 70.267 70.176 70.068 70.0 69.856 69.719 69.56 69.467 69.276 69.146 69.008 68.856 68.492 68.254 67.979 67.679 67.308 66.846 66.243 64.548 -4 ,14728 ,TETRA ,17621553,Tue Nov 30 17:27:42 CET,Tue Nov 30 19:53:03 CET,0.0 1.662 2.336 2.854 3.264 3.608 3.929 4.233 4.767 5.019 5.259 5.53 5.908 6.111 6.504 6.868 7.221 7.391 7.718 8.033 8.501 8.815 9.118 9.554 9.971 10.371 10.77 11.163 11.665 12.157 12.639 13.222 13.794 14.348 14.994 15.738 16.465 17.268 18.151 19.105 20.132 21.33 22.766 24.239 26.032 28.117 30.611 33.527 37.151 41.831 48.069 53.902 57.791 60.584 62.608 64.142 65.324 66.255 66.969 67.627 68.13 68.518 68.856 69.146 69.379 69.552 69.685 69.769 69.839 69.896 69.921 69.924 69.911 69.894 69.87 69.838 69.79 69.724 69.652 69.598 69.537 69.424 69.326 69.213 69.154 69.036 68.899 68.717 68.608 68.388 68.225 68.079 67.94 67.619 67.414 67.161 66.878 66.534 66.06 65.395 63.162 -5 ,12610 ,TETRA ,17621554,Tue Nov 30 17:47:40 CET,Tue Nov 30 20:19:27 CET,0.0 1.707 2.356 2.849 3.285 3.654 3.974 4.279 4.836 5.099 5.352 5.632 6.015 6.219 6.622 7.003 7.362 7.537 7.883 8.221 8.716 9.029 9.328 9.764 10.175 10.576 10.973 11.368 11.889 12.395 12.881 13.45 14.007 14.568 15.235 15.992 16.719 17.535 18.431 19.393 20.432 21.648 23.095 24.559 26.323 28.379 30.854 33.816 37.507 42.154 48.423 54.307 58.155 60.895 62.874 64.38 65.576 66.548 67.284 67.946 68.461 68.863 69.197 69.465 69.669 69.84 69.999 70.111 70.191 70.256 70.294 70.313 70.324 70.317 70.305 70.289 70.261 70.225 70.171 70.128 70.082 69.981 69.885 69.753 69.676 69.523 69.364 69.177 69.079 68.883 68.757 68.622 68.475 68.129 67.914 67.672 67.389 67.039 66.59 65.899 63.349 -6 ,1957 ,TETRA ,17621555,Tue Nov 30 17:47:41 CET,Tue Nov 30 20:21:19 CET,0.0 1.494 2.133 2.616 3.022 3.383 3.695 3.997 4.565 4.813 5.048 5.334 5.735 5.955 6.373 6.761 7.131 7.311 7.658 7.993 8.474 8.776 9.068 9.494 9.913 10.327 10.725 11.107 11.6 12.083 12.563 13.143 13.701 14.248 14.886 15.611 16.319 17.108 17.984 18.957 20.006 21.194 22.624 24.11 25.871 27.882 30.3 33.215 36.862 41.47 47.652 53.494 57.374 60.139 62.173 63.731 64.909 65.86 66.607 67.26 67.752 68.143 68.467 68.727 68.932 69.103 69.261 69.369 69.441 69.493 69.531 69.555 69.561 69.547 69.533 69.516 69.477 69.421 69.356 69.299 69.227 69.101 69.014 68.922 68.864 68.735 68.594 68.428 68.335 68.128 67.977 67.823 67.663 67.286 67.054 66.796 66.511 66.163 65.686 65.079 62.704 -7 ,6313 ,TETRA ,17621556,Tue Nov 30 17:47:40 CET,Tue Nov 30 20:15:47 CET,0.0 1.429 2.015 2.479 2.882 3.24 3.55 3.837 4.366 4.618 4.86 5.127 5.502 5.706 6.107 6.479 6.833 7.005 7.346 7.681 8.16 8.458 8.747 9.167 9.578 9.986 10.376 10.756 11.257 11.738 12.208 12.787 13.362 13.921 14.577 15.332 16.054 16.852 17.743 18.712 19.745 20.948 22.389 23.867 25.645 27.738 30.26 33.195 36.818 41.391 47.578 53.475 57.367 60.108 62.073 63.6 64.783 65.699 66.395 67.022 67.509 67.85 68.127 68.401 68.63 68.804 68.949 69.055 69.127 69.181 69.228 69.25 69.256 69.243 69.213 69.166 69.11 69.052 68.984 68.924 68.857 68.728 68.621 68.512 68.455 68.324 68.172 67.994 67.888 67.658 67.488 67.33 67.161 66.805 66.577 66.302 66.004 65.639 65.206 64.609 62.505 -8 ,8061 ,TETRA ,17621557,Tue Nov 30 17:47:42 CET,Tue Nov 30 20:15:21 CET,0.0 1.686 2.329 2.812 3.21 3.583 3.922 4.23 4.765 5.008 5.238 5.498 5.872 6.071 6.451 6.812 7.164 7.336 7.672 8.0 8.462 8.757 9.048 9.474 9.896 10.31 10.716 11.109 11.606 12.096 12.575 13.155 13.729 14.289 14.943 15.684 16.402 17.201 18.071 19.016 20.053 21.255 22.69 24.167 25.938 28.001 30.484 33.444 37.122 41.764 48.052 53.969 57.83 60.595 62.68 64.3 65.513 66.478 67.227 67.878 68.374 68.77 69.098 69.37 69.584 69.754 69.913 70.031 70.097 70.149 70.203 70.236 70.254 70.258 70.245 70.222 70.181 70.124 70.061 70.002 69.922 69.777 69.674 69.562 69.493 69.347 69.183 68.992 68.889 68.682 68.535 68.394 68.252 67.93 67.718 67.469 67.152 66.778 66.328 65.712 63.754 -9 ,16832 ,TETRA ,17621558,Tue Nov 30 17:47:40 CET,Tue Nov 30 20:15:47 CET,0.0 1.951 2.572 3.069 3.486 3.839 4.161 4.45 4.972 5.216 5.442 5.7 6.071 6.271 6.651 7.019 7.385 7.562 7.899 8.217 8.667 8.965 9.254 9.683 10.102 10.507 10.903 11.28 11.779 12.265 12.727 13.3 13.878 14.437 15.078 15.807 16.536 17.353 18.223 19.158 20.178 21.373 22.813 24.308 26.107 28.181 30.669 33.613 37.251 41.881 48.054 53.837 57.713 60.52 62.588 64.176 65.362 66.29 67.006 67.624 68.082 68.456 68.782 69.055 69.283 69.461 69.605 69.709 69.782 69.835 69.871 69.887 69.9 69.896 69.878 69.856 69.819 69.762 69.688 69.631 69.567 69.435 69.333 69.236 69.187 69.075 68.931 68.75 68.656 68.458 68.33 68.196 68.045 67.711 67.506 67.272 66.983 66.637 66.224 65.648 63.349 -10 ,4050 ,TETRA ,17621559,Tue Nov 30 17:47:41 CET,Tue Nov 30 20:14:45 CET,0.0 1.868 2.455 2.924 3.338 3.696 4.027 4.337 4.898 5.156 5.397 5.685 6.077 6.285 6.68 7.057 7.411 7.585 7.916 8.232 8.705 9.012 9.307 9.745 10.165 10.565 10.962 11.349 11.843 12.337 12.817 13.395 13.958 14.509 15.159 15.899 16.622 17.416 18.281 19.232 20.269 21.48 22.933 24.418 26.187 28.252 30.748 33.685 37.311 41.961 48.191 53.97 57.81 60.562 62.617 64.203 65.423 66.378 67.109 67.769 68.257 68.639 68.961 69.221 69.426 69.597 69.746 69.834 69.882 69.923 69.961 69.979 69.982 69.971 69.952 69.914 69.858 69.802 69.736 69.682 69.616 69.474 69.352 69.227 69.166 69.03 68.872 68.704 68.616 68.421 68.269 68.122 67.984 67.636 67.403 67.135 66.831 66.458 65.988 65.347 63.477 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_68.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_68.txt deleted file mode 100644 index caf72beb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_68.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29499 ,TETRA ,17621560,Tue Nov 30 17:47:41 CET,Tue Nov 30 20:14:50 CET,0.0 2.304 3.034 3.55 3.967 4.359 4.705 5.004 5.556 5.811 6.052 6.334 6.714 6.924 7.327 7.683 8.033 8.206 8.536 8.866 9.326 9.614 9.903 10.32 10.711 11.094 11.465 11.829 12.298 12.75 13.189 13.721 14.242 14.737 15.298 15.928 16.531 17.193 17.917 18.719 19.603 20.615 21.821 23.003 24.34 25.843 27.644 29.751 32.196 35.21 39.127 42.684 44.955 46.505 47.614 48.452 49.063 49.525 49.873 50.154 50.327 50.452 50.553 50.628 50.666 50.68 50.686 50.662 50.625 50.582 50.528 50.478 50.425 50.345 50.269 50.188 50.095 49.998 49.885 49.801 49.711 49.556 49.439 49.313 49.247 49.111 48.951 48.766 48.664 48.429 48.298 48.152 47.996 47.632 47.438 47.238 47.005 46.7 46.279 45.693 43.46 -2 ,11101 ,TETRA ,17621561,Tue Nov 30 17:47:43 CET,Tue Nov 30 20:18:01 CET,0.0 1.913 2.613 3.138 3.559 3.949 4.312 4.635 5.195 5.439 5.675 5.967 6.341 6.541 6.91 7.247 7.573 7.734 8.051 8.356 8.781 9.049 9.322 9.716 10.077 10.436 10.789 11.133 11.594 12.027 12.435 12.935 13.414 13.872 14.402 15.0 15.58 16.224 16.927 17.676 18.469 19.371 20.431 21.537 22.838 24.31 26.103 28.147 30.602 33.653 37.637 41.191 43.451 45.009 46.06 46.816 47.38 47.803 48.112 48.373 48.543 48.672 48.777 48.843 48.88 48.895 48.89 48.867 48.838 48.803 48.751 48.691 48.61 48.526 48.46 48.378 48.286 48.182 48.067 47.976 47.877 47.717 47.59 47.457 47.39 47.242 47.07 46.877 46.772 46.535 46.423 46.279 46.12 45.773 45.568 45.338 45.075 44.765 44.339 43.755 41.873 -3 ,19337 ,TETRA ,17621562,Tue Nov 30 17:47:41 CET,Tue Nov 30 20:11:48 CET,0.0 2.417 3.138 3.659 4.103 4.494 4.834 5.148 5.699 5.943 6.181 6.444 6.819 7.03 7.431 7.798 8.153 8.323 8.651 8.959 9.412 9.697 9.963 10.347 10.713 11.063 11.402 11.741 12.196 12.638 13.078 13.613 14.117 14.592 15.114 15.72 16.328 16.986 17.697 18.456 19.263 20.216 21.416 22.652 24.08 25.658 27.433 29.476 31.987 35.118 39.234 42.889 45.132 46.68 47.813 48.659 49.285 49.773 50.134 50.428 50.625 50.763 50.871 50.951 51.001 51.026 51.028 51.016 50.998 50.958 50.901 50.849 50.788 50.716 50.652 50.58 50.493 50.394 50.279 50.192 50.1 49.933 49.805 49.67 49.601 49.461 49.304 49.127 49.03 48.801 48.682 48.543 48.391 48.046 47.853 47.624 47.347 47.03 46.641 46.085 44.391 -4 ,25263 ,TETRA ,17621563,Tue Nov 30 17:47:43 CET,Tue Nov 30 20:09:14 CET,0.0 2.476 3.193 3.7 4.098 4.47 4.827 5.145 5.711 5.967 6.216 6.524 6.913 7.121 7.509 7.885 8.249 8.427 8.769 9.086 9.543 9.833 10.109 10.502 10.873 11.222 11.576 11.924 12.353 12.773 13.183 13.678 14.155 14.621 15.15 15.729 16.289 16.9 17.571 18.293 19.08 20.012 21.095 22.187 23.466 24.897 26.592 28.589 31.036 34.101 38.091 41.7 44.005 45.577 46.666 47.46 48.045 48.512 48.86 49.14 49.346 49.488 49.568 49.619 49.65 49.669 49.681 49.669 49.632 49.567 49.494 49.437 49.365 49.268 49.186 49.096 48.999 48.889 48.762 48.664 48.555 48.384 48.269 48.147 48.071 47.898 47.7 47.489 47.382 47.151 47.008 46.868 46.721 46.381 46.173 45.943 45.683 45.337 44.883 44.232 41.441 -5 ,25567 ,TETRA ,17621564,Tue Nov 30 17:47:42 CET,Tue Nov 30 20:16:09 CET,0.0 2.261 2.948 3.511 3.979 4.356 4.723 5.06 5.63 5.881 6.107 6.376 6.76 6.964 7.369 7.757 8.114 8.285 8.618 8.93 9.379 9.674 9.95 10.35 10.737 11.118 11.499 11.863 12.332 12.785 13.228 13.761 14.269 14.756 15.325 15.967 16.587 17.286 18.032 18.838 19.686 20.648 21.784 22.937 24.371 26.018 27.92 30.097 32.658 35.773 39.766 43.292 45.553 47.042 48.078 48.866 49.448 49.884 50.193 50.457 50.649 50.774 50.86 50.936 50.978 50.984 50.973 50.958 50.936 50.882 50.814 50.76 50.69 50.605 50.537 50.464 50.376 50.277 50.177 50.092 49.994 49.829 49.701 49.56 49.483 49.321 49.144 48.942 48.837 48.608 48.489 48.348 48.2 47.872 47.671 47.439 47.168 46.825 46.397 45.838 44.019 -6 ,20103 ,TETRA ,17621565,Tue Nov 30 17:47:44 CET,Tue Nov 30 20:14:29 CET,0.0 1.698 2.401 2.911 3.327 3.692 4.008 4.295 4.842 5.094 5.326 5.592 5.973 6.182 6.568 6.919 7.266 7.437 7.759 8.076 8.527 8.811 9.089 9.486 9.878 10.27 10.642 11.009 11.497 11.952 12.386 12.915 13.419 13.911 14.49 15.131 15.753 16.447 17.202 18.016 18.881 19.869 21.057 22.291 23.728 25.305 27.191 29.38 31.949 35.117 39.124 42.683 44.976 46.531 47.622 48.448 49.058 49.501 49.812 50.07 50.25 50.392 50.485 50.553 50.611 50.639 50.645 50.634 50.617 50.574 50.513 50.457 50.393 50.315 50.243 50.158 50.06 49.96 49.853 49.774 49.69 49.537 49.417 49.287 49.218 49.068 48.906 48.729 48.627 48.39 48.263 48.125 47.978 47.628 47.417 47.188 46.914 46.587 46.215 45.667 43.968 -7 ,31633 ,TETRA ,17621566,Tue Nov 30 17:47:42 CET,Tue Nov 30 20:20:56 CET,0.0 2.043 2.705 3.18 3.586 3.954 4.284 4.581 5.118 5.366 5.601 5.882 6.251 6.445 6.829 7.195 7.529 7.69 8.009 8.322 8.763 9.037 9.31 9.71 10.087 10.433 10.759 11.074 11.507 11.96 12.379 12.861 13.321 13.773 14.305 14.899 15.489 16.164 16.916 17.736 18.584 19.499 20.551 21.65 22.997 24.564 26.433 28.619 31.258 34.479 38.666 42.378 44.692 46.249 47.326 48.158 48.774 49.204 49.506 49.798 50.007 50.124 50.206 50.247 50.263 50.279 50.28 50.26 50.228 50.18 50.11 50.042 49.972 49.878 49.788 49.698 49.601 49.496 49.374 49.273 49.165 48.996 48.874 48.734 48.659 48.504 48.324 48.12 48.013 47.786 47.656 47.515 47.361 47.002 46.787 46.526 46.228 45.903 45.518 44.956 43.296 -8 ,31791 ,TETRA ,17621567,Tue Nov 30 17:47:44 CET,Tue Nov 30 20:21:06 CET,0.0 2.332 3.039 3.546 3.991 4.39 4.743 5.067 5.596 5.838 6.072 6.341 6.72 6.926 7.315 7.679 8.022 8.193 8.523 8.823 9.255 9.535 9.81 10.21 10.589 10.951 11.309 11.666 12.118 12.553 12.992 13.524 14.035 14.538 15.123 15.777 16.401 17.099 17.855 18.653 19.518 20.534 21.733 22.929 24.323 25.917 27.756 29.792 32.249 35.312 39.398 42.968 45.134 46.619 47.676 48.46 49.011 49.413 49.676 49.894 50.068 50.168 50.23 50.287 50.321 50.333 50.334 50.326 50.304 50.262 50.204 50.137 50.047 49.95 49.88 49.798 49.698 49.58 49.446 49.358 49.266 49.118 48.998 48.859 48.783 48.609 48.427 48.231 48.128 47.897 47.787 47.652 47.507 47.186 46.995 46.768 46.502 46.178 45.769 45.194 43.682 -9 ,2835 ,TETRA ,17621568,Tue Nov 30 17:47:41 CET,Tue Nov 30 20:13:06 CET,0.0 1.868 2.553 3.061 3.497 3.876 4.206 4.514 5.074 5.315 5.538 5.79 6.161 6.357 6.741 7.113 7.465 7.635 7.97 8.298 8.754 9.041 9.321 9.723 10.119 10.509 10.88 11.234 11.704 12.174 12.626 13.16 13.673 14.173 14.752 15.385 15.994 16.681 17.436 18.256 19.13 20.109 21.297 22.529 23.973 25.612 27.51 29.626 32.086 35.156 39.139 42.733 45.005 46.552 47.668 48.492 49.082 49.511 49.805 50.036 50.209 50.328 50.39 50.434 50.467 50.485 50.489 50.468 50.434 50.393 50.34 50.276 50.198 50.121 50.06 49.988 49.896 49.783 49.654 49.563 49.47 49.318 49.201 49.069 48.998 48.845 48.663 48.455 48.345 48.104 47.979 47.841 47.688 47.345 47.143 46.91 46.636 46.311 45.918 45.365 43.361 -10 ,18536 ,TETRA ,17621569,Tue Nov 30 17:47:43 CET,Tue Nov 30 20:14:17 CET,0.0 2.188 2.852 3.344 3.778 4.155 4.484 4.785 5.324 5.572 5.809 6.093 6.473 6.676 7.066 7.441 7.785 7.951 8.276 8.578 9.01 9.296 9.564 9.948 10.32 10.687 11.055 11.414 11.889 12.351 12.788 13.298 13.774 14.233 14.791 15.449 16.083 16.767 17.503 18.287 19.096 20.014 21.13 22.264 23.602 25.135 26.935 29.003 31.494 34.549 38.388 41.844 44.084 45.604 46.671 47.433 47.993 48.441 48.763 49.011 49.179 49.313 49.411 49.471 49.497 49.503 49.503 49.489 49.465 49.423 49.362 49.294 49.21 49.12 49.039 48.946 48.85 48.747 48.629 48.536 48.431 48.255 48.124 47.981 47.903 47.727 47.531 47.316 47.202 46.964 46.82 46.667 46.505 46.14 45.932 45.692 45.413 45.077 44.653 44.052 42.214 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_49.txt deleted file mode 100644 index b9d8327b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13202 ,TETRA ,17621570,Tue Nov 30 17:47:44 CET,Tue Nov 30 20:16:32 CET,0.0 1.529 2.102 2.514 2.841 3.129 3.401 3.65 4.085 4.274 4.459 4.668 4.943 5.093 5.378 5.646 5.893 6.01 6.235 6.447 6.755 6.948 7.125 7.366 7.591 7.81 8.025 8.237 8.501 8.737 8.955 9.216 9.46 9.693 9.969 10.269 10.556 10.863 11.164 11.488 11.82 12.175 12.578 12.983 13.445 13.937 14.461 14.941 15.404 15.873 16.09 15.832 15.39 14.925 14.445 13.878 13.328 12.799 12.292 11.772 11.314 10.889 10.493 10.094 9.679 9.293 8.878 8.489 8.137 7.77 7.411 7.113 6.784 6.427 6.153 5.878 5.589 5.286 4.963 4.723 4.472 4.089 3.815 3.522 3.366 3.037 2.692 2.329 2.133 1.803 1.496 1.263 1.0 0.427 0.116 -0.239 -0.662 -1.218 -1.928 -2.849 -6.851 -2 ,11464 ,TETRA ,17621571,Tue Nov 30 17:47:42 CET,Tue Nov 30 20:13:39 CET,0.0 1.524 2.081 2.506 2.861 3.152 3.413 3.649 4.067 4.253 4.431 4.633 4.901 5.044 5.325 5.572 5.8 5.909 6.113 6.308 6.586 6.761 6.927 7.163 7.388 7.602 7.801 7.993 8.246 8.484 8.702 8.95 9.176 9.394 9.658 9.947 10.21 10.495 10.792 11.103 11.438 11.804 12.213 12.595 13.018 13.487 14.028 14.612 15.199 15.703 16.112 16.188 15.891 15.419 14.934 14.458 14.008 13.577 13.182 12.712 12.268 11.851 11.428 11.016 10.624 10.246 9.854 9.52 9.221 8.908 8.567 8.28 7.987 7.664 7.413 7.154 6.865 6.565 6.259 6.048 5.826 5.447 5.183 4.911 4.771 4.481 4.154 3.789 3.595 3.276 2.974 2.737 2.49 1.922 1.584 1.2 0.778 0.313 -0.315 -1.378 -6.01 -3 ,31296 ,TETRA ,17621572,Tue Nov 30 17:47:44 CET,Tue Nov 30 20:14:23 CET,0.0 1.812 2.381 2.788 3.126 3.417 3.683 3.929 4.36 4.555 4.727 4.909 5.187 5.334 5.598 5.836 6.058 6.167 6.38 6.577 6.856 7.029 7.19 7.422 7.643 7.852 8.044 8.224 8.456 8.688 8.907 9.163 9.415 9.661 9.944 10.245 10.522 10.82 11.138 11.46 11.79 12.159 12.587 13.009 13.464 13.932 14.463 15.019 15.556 16.068 16.329 16.12 15.78 15.333 14.816 14.285 13.769 13.248 12.792 12.345 11.945 11.574 11.192 10.796 10.427 10.097 9.74 9.402 9.108 8.811 8.479 8.19 7.896 7.592 7.338 7.06 6.77 6.473 6.17 5.961 5.747 5.4 5.143 4.877 4.738 4.445 4.125 3.778 3.593 3.263 2.935 2.679 2.385 1.719 1.38 1.036 0.646 0.125 -0.627 -1.738 -4.776 -4 ,26349 ,TETRA ,17621573,Tue Nov 30 17:47:42 CET,Tue Nov 30 20:14:11 CET,0.0 1.678 2.259 2.682 3.021 3.304 3.562 3.8 4.226 4.42 4.602 4.816 5.097 5.247 5.513 5.75 5.976 6.087 6.299 6.488 6.759 6.931 7.102 7.356 7.578 7.78 7.976 8.168 8.415 8.652 8.873 9.138 9.396 9.645 9.927 10.222 10.499 10.811 11.143 11.473 11.797 12.143 12.539 12.929 13.358 13.804 14.281 14.785 15.358 15.907 16.178 15.88 15.339 14.775 14.219 13.651 13.113 12.608 12.145 11.65 11.209 10.81 10.404 9.976 9.578 9.211 8.82 8.484 8.179 7.838 7.485 7.2 6.899 6.581 6.329 6.068 5.801 5.521 5.211 4.986 4.745 4.355 4.086 3.808 3.659 3.342 3.013 2.643 2.442 2.11 1.791 1.54 1.272 0.691 0.369 -0.006 -0.437 -0.936 -1.593 -2.527 -6.939 -5 ,30089 ,TETRA ,17621574,Tue Nov 30 17:47:42 CET,Tue Nov 30 20:15:19 CET,0.0 1.564 2.132 2.571 2.919 3.223 3.487 3.714 4.131 4.316 4.485 4.685 4.96 5.101 5.371 5.634 5.88 5.995 6.216 6.42 6.709 6.891 7.065 7.306 7.526 7.741 7.944 8.126 8.355 8.58 8.801 9.064 9.313 9.552 9.822 10.117 10.391 10.689 11.013 11.344 11.667 12.017 12.417 12.806 13.254 13.737 14.247 14.803 15.37 15.873 16.226 16.152 15.791 15.315 14.816 14.317 13.831 13.343 12.877 12.373 11.929 11.528 11.117 10.722 10.363 10.044 9.699 9.371 9.09 8.787 8.453 8.177 7.877 7.565 7.328 7.074 6.813 6.546 6.277 6.076 5.858 5.525 5.293 5.034 4.892 4.598 4.268 3.924 3.747 3.437 3.141 2.92 2.692 2.144 1.804 1.422 1.026 0.595 0.026 -0.834 -3.96 -6 ,13185 ,TETRA ,17621575,Tue Nov 30 17:47:45 CET,Tue Nov 30 20:14:59 CET,0.0 1.523 2.09 2.522 2.889 3.211 3.483 3.734 4.18 4.381 4.566 4.755 5.028 5.169 5.452 5.73 5.98 6.094 6.303 6.494 6.759 6.929 7.094 7.33 7.557 7.776 7.99 8.189 8.435 8.676 8.905 9.174 9.434 9.68 9.954 10.255 10.542 10.85 11.177 11.523 11.876 12.27 12.719 13.14 13.606 14.106 14.647 15.245 15.902 16.508 16.996 17.076 16.934 16.653 16.261 15.858 15.444 14.99 14.574 14.125 13.674 13.25 12.842 12.442 12.061 11.698 11.283 10.885 10.553 10.231 9.902 9.629 9.332 9.007 8.744 8.47 8.179 7.88 7.585 7.386 7.173 6.807 6.544 6.267 6.123 5.838 5.538 5.192 5.005 4.704 4.449 4.226 3.99 3.467 3.163 2.812 2.406 1.772 0.809 -0.364 -4.714 -7 ,2623 ,TETRA ,17621576,Tue Nov 30 17:47:43 CET,Tue Nov 30 20:13:17 CET,0.0 1.571 2.149 2.564 2.893 3.189 3.461 3.707 4.134 4.319 4.491 4.701 4.981 5.128 5.411 5.669 5.903 6.016 6.238 6.44 6.717 6.891 7.052 7.281 7.503 7.713 7.918 8.122 8.374 8.612 8.835 9.097 9.348 9.593 9.863 10.15 10.424 10.718 11.023 11.351 11.689 12.05 12.467 12.89 13.383 13.899 14.445 15.025 15.642 16.22 16.621 16.608 16.309 15.921 15.476 14.997 14.581 14.188 13.792 13.375 13.003 12.649 12.302 11.955 11.623 11.311 10.969 10.663 10.393 10.098 9.786 9.521 9.237 8.937 8.705 8.458 8.196 7.926 7.637 7.439 7.22 6.835 6.571 6.297 6.149 5.829 5.478 5.1 4.901 4.576 4.267 4.024 3.762 3.158 2.847 2.509 2.1 1.582 0.911 -0.138 -4.266 -8 ,19751 ,TETRA ,17621577,Tue Nov 30 17:47:44 CET,Tue Nov 30 20:09:03 CET,0.0 1.901 2.517 2.935 3.264 3.543 3.789 4.035 4.479 4.668 4.847 5.04 5.306 5.444 5.711 5.962 6.188 6.292 6.493 6.692 6.968 7.132 7.289 7.518 7.737 7.948 8.156 8.346 8.577 8.808 9.02 9.274 9.528 9.768 10.035 10.32 10.586 10.883 11.206 11.537 11.863 12.208 12.597 12.984 13.424 13.873 14.346 14.86 15.346 15.708 15.902 15.611 14.968 14.234 13.616 13.036 12.448 11.9 11.376 10.815 10.336 9.897 9.459 9.024 8.61 8.23 7.839 7.504 7.209 6.866 6.488 6.171 5.844 5.497 5.226 4.953 4.671 4.362 4.041 3.821 3.574 3.179 2.898 2.585 2.422 2.105 1.763 1.384 1.187 0.87 0.577 0.337 0.087 -0.464 -0.79 -1.177 -1.622 -2.128 -2.782 -3.771 -6.987 -9 ,18692 ,TETRA ,17621578,Tue Nov 30 17:47:44 CET,Tue Nov 30 20:33:51 CET,0.0 1.627 2.2 2.619 2.964 3.256 3.506 3.741 4.169 4.366 4.553 4.766 5.052 5.2 5.478 5.743 5.975 6.08 6.283 6.476 6.754 6.923 7.081 7.321 7.545 7.752 7.956 8.157 8.405 8.639 8.877 9.158 9.416 9.659 9.927 10.215 10.493 10.786 11.079 11.386 11.697 12.028 12.407 12.791 13.235 13.71 14.226 14.739 15.193 15.653 16.002 15.859 15.365 14.744 14.143 13.519 12.892 12.294 11.795 11.296 10.84 10.428 10.028 9.635 9.258 8.912 8.548 8.206 7.896 7.572 7.222 6.919 6.592 6.245 5.977 5.698 5.401 5.095 4.792 4.573 4.31 3.894 3.633 3.351 3.201 2.893 2.559 2.198 2.007 1.688 1.397 1.159 0.89 0.291 -0.085 -0.575 -1.146 -1.726 -2.429 -3.381 -6.475 -10 ,25993 ,TETRA ,17621579,Tue Nov 30 17:47:47 CET,Tue Nov 30 20:14:56 CET,0.0 1.71 2.309 2.746 3.087 3.375 3.65 3.905 4.338 4.538 4.726 4.934 5.216 5.365 5.645 5.897 6.118 6.222 6.435 6.642 6.925 7.097 7.265 7.509 7.731 7.941 8.146 8.344 8.593 8.832 9.056 9.309 9.537 9.755 10.016 10.312 10.581 10.862 11.154 11.454 11.773 12.133 12.526 12.901 13.323 13.784 14.294 14.813 15.334 15.824 16.031 15.782 15.301 14.702 14.136 13.625 13.151 12.656 12.191 11.715 11.275 10.874 10.488 10.105 9.74 9.393 9.005 8.659 8.371 8.065 7.723 7.436 7.143 6.824 6.575 6.322 6.049 5.743 5.428 5.221 4.995 4.613 4.352 4.083 3.947 3.666 3.354 3.01 2.819 2.504 2.204 1.971 1.724 1.175 0.86 0.502 0.114 -0.329 -1.107 -2.434 -6.957 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_65.txt deleted file mode 100644 index e63887d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17549 ,TETRA ,17621580,Tue Nov 30 17:47:45 CET,Tue Nov 30 20:12:24 CET,0.0 1.895 2.531 3.005 3.411 3.753 4.023 4.263 4.682 4.872 5.054 5.292 5.557 5.714 5.986 6.22 6.44 6.549 6.752 6.946 7.217 7.385 7.545 7.771 7.993 8.211 8.416 8.609 8.862 9.107 9.329 9.593 9.847 10.085 10.363 10.675 10.959 11.254 11.575 11.912 12.254 12.621 13.04 13.447 13.903 14.391 14.891 15.422 16.004 16.539 16.982 17.052 16.841 16.505 16.137 15.773 15.403 15.05 14.724 14.374 14.052 13.742 13.452 13.165 12.877 12.619 12.343 12.078 11.846 11.6 11.325 11.089 10.852 10.603 10.395 10.18 9.945 9.672 9.397 9.213 9.014 8.704 8.487 8.252 8.13 7.867 7.58 7.265 7.093 6.817 6.524 6.308 6.091 5.617 5.354 5.049 4.692 4.308 3.849 3.131 0.131 -2 ,20811 ,TETRA ,17621581,Tue Nov 30 17:47:46 CET,Tue Nov 30 20:11:56 CET,0.0 1.455 2.004 2.446 2.795 3.076 3.331 3.568 3.979 4.158 4.336 4.581 4.826 4.973 5.26 5.52 5.764 5.877 6.083 6.28 6.559 6.735 6.904 7.153 7.389 7.617 7.849 8.062 8.32 8.562 8.79 9.059 9.316 9.557 9.831 10.135 10.419 10.725 11.048 11.385 11.717 12.064 12.451 12.83 13.279 13.748 14.226 14.745 15.338 15.921 16.337 16.399 16.192 15.843 15.435 15.037 14.669 14.281 13.921 13.578 13.257 12.932 12.604 12.295 12.006 11.731 11.455 11.211 10.988 10.751 10.494 10.265 10.021 9.747 9.527 9.294 9.039 8.79 8.542 8.368 8.174 7.849 7.615 7.364 7.234 6.96 6.672 6.377 6.219 5.937 5.623 5.398 5.16 4.646 4.362 4.046 3.7 3.282 2.736 2.031 -0.375 -3 ,5618 ,TETRA ,17621582,Tue Nov 30 17:47:46 CET,Tue Nov 30 20:24:30 CET,0.0 1.818 2.459 2.915 3.28 3.573 3.839 4.088 4.519 4.708 4.883 5.118 5.37 5.509 5.779 6.032 6.261 6.37 6.589 6.789 7.058 7.243 7.421 7.662 7.896 8.12 8.32 8.516 8.771 9.006 9.229 9.492 9.735 9.971 10.25 10.547 10.822 11.12 11.429 11.747 12.079 12.468 12.899 13.306 13.783 14.287 14.875 15.511 16.142 16.772 17.302 17.473 17.377 17.18 16.932 16.626 16.318 16.018 15.721 15.399 15.114 14.834 14.536 14.235 13.945 13.674 13.382 13.112 12.881 12.621 12.309 12.056 11.813 11.544 11.331 11.115 10.879 10.628 10.356 10.166 9.982 9.685 9.454 9.192 9.054 8.775 8.475 8.138 7.965 7.691 7.389 7.168 6.944 6.458 6.186 5.865 5.496 5.093 4.593 3.867 0.976 -4 ,13742 ,TETRA ,17621583,Tue Nov 30 17:47:47 CET,Tue Nov 30 20:15:54 CET,0.0 1.822 2.389 2.807 3.142 3.43 3.688 3.925 4.365 4.573 4.765 4.985 5.231 5.37 5.635 5.886 6.125 6.239 6.454 6.661 6.96 7.143 7.309 7.541 7.765 7.977 8.176 8.367 8.609 8.845 9.079 9.351 9.596 9.829 10.086 10.365 10.638 10.937 11.255 11.593 11.938 12.302 12.723 13.135 13.601 14.08 14.559 15.076 15.601 16.086 16.501 16.575 16.431 16.191 15.902 15.57 15.221 14.904 14.654 14.368 14.086 13.828 13.541 13.243 12.953 12.688 12.393 12.112 11.876 11.625 11.32 11.05 10.78 10.511 10.3 10.074 9.827 9.575 9.329 9.155 8.96 8.622 8.387 8.147 8.013 7.746 7.48 7.188 7.028 6.755 6.48 6.275 6.049 5.537 5.229 4.878 4.498 4.073 3.581 2.922 0.039 -5 ,4910 ,TETRA ,17621584,Tue Nov 30 17:47:49 CET,Tue Nov 30 20:12:33 CET,0.0 1.755 2.346 2.798 3.154 3.461 3.736 3.974 4.381 4.566 4.744 4.982 5.245 5.395 5.659 5.905 6.14 6.249 6.454 6.643 6.902 7.072 7.238 7.462 7.675 7.886 8.088 8.278 8.519 8.75 8.965 9.221 9.472 9.708 9.961 10.238 10.519 10.817 11.115 11.426 11.746 12.102 12.489 12.861 13.312 13.816 14.351 14.923 15.542 16.191 16.751 16.875 16.713 16.473 16.188 15.835 15.481 15.136 14.831 14.509 14.225 13.958 13.665 13.368 13.071 12.795 12.503 12.234 12.0 11.757 11.5 11.272 11.036 10.759 10.538 10.329 10.1 9.852 9.593 9.411 9.224 8.936 8.706 8.465 8.348 8.096 7.82 7.527 7.37 7.107 6.838 6.631 6.41 5.903 5.631 5.327 4.959 4.553 4.095 3.448 0.812 -6 ,22392 ,TETRA ,17621585,Tue Nov 30 17:53:38 CET,Tue Nov 30 20:21:57 CET,0.0 1.643 2.217 2.625 2.98 3.289 3.557 3.795 4.226 4.413 4.582 4.815 5.073 5.224 5.521 5.789 6.027 6.143 6.365 6.564 6.838 7.017 7.189 7.424 7.655 7.882 8.092 8.289 8.54 8.781 9.011 9.28 9.52 9.751 10.026 10.331 10.614 10.917 11.244 11.579 11.921 12.288 12.694 13.099 13.556 14.051 14.581 15.1 15.685 16.306 16.83 16.946 16.791 16.54 16.182 15.799 15.437 15.072 14.726 14.354 14.04 13.746 13.47 13.2 12.911 12.632 12.335 12.066 11.827 11.578 11.315 11.092 10.837 10.562 10.364 10.148 9.915 9.678 9.429 9.248 9.066 8.793 8.582 8.333 8.204 7.951 7.668 7.343 7.176 6.902 6.606 6.383 6.146 5.66 5.382 5.075 4.731 4.315 3.826 3.147 0.767 -7 ,23342 ,TETRA ,17621586,Tue Nov 30 17:53:40 CET,Tue Nov 30 20:19:32 CET,0.0 1.657 2.255 2.719 3.116 3.424 3.687 3.936 4.36 4.543 4.711 4.92 5.167 5.306 5.574 5.833 6.072 6.186 6.406 6.609 6.892 7.066 7.232 7.465 7.686 7.894 8.088 8.275 8.517 8.745 8.962 9.227 9.484 9.726 9.992 10.278 10.546 10.831 11.135 11.455 11.783 12.147 12.566 12.974 13.424 13.91 14.468 15.042 15.624 16.226 16.829 17.04 16.926 16.685 16.408 16.104 15.72 15.357 15.035 14.711 14.435 14.173 13.872 13.55 13.24 12.901 12.519 12.203 11.949 11.683 11.402 11.163 10.916 10.638 10.405 10.164 9.922 9.675 9.4 9.203 9.001 8.695 8.465 8.193 8.055 7.783 7.485 7.172 7.0 6.71 6.392 6.165 5.929 5.403 5.122 4.806 4.428 4.0 3.446 2.642 0.122 -8 ,28048 ,TETRA ,17621587,Tue Nov 30 17:53:39 CET,Tue Nov 30 20:47:51 CET,0.0 2.096 2.687 3.134 3.489 3.787 4.06 4.301 4.715 4.907 5.083 5.308 5.561 5.706 5.973 6.224 6.456 6.564 6.765 6.962 7.229 7.394 7.56 7.79 8.007 8.211 8.41 8.603 8.844 9.068 9.275 9.528 9.773 10.012 10.288 10.587 10.866 11.165 11.472 11.787 12.117 12.483 12.906 13.312 13.782 14.281 14.824 15.402 16.005 16.648 17.19 17.341 17.196 16.901 16.529 16.151 15.795 15.438 15.128 14.817 14.544 14.303 14.05 13.785 13.504 13.218 12.925 12.672 12.452 12.199 11.922 11.695 11.459 11.203 10.999 10.762 10.502 10.257 10.005 9.82 9.619 9.286 9.055 8.81 8.683 8.422 8.143 7.84 7.673 7.402 7.133 6.937 6.713 6.197 5.931 5.637 5.285 4.87 4.409 3.776 1.624 -9 ,15757 ,TETRA ,17621588,Tue Nov 30 17:53:39 CET,Tue Nov 30 20:39:57 CET,0.0 1.948 2.54 2.982 3.348 3.648 3.906 4.14 4.542 4.722 4.895 5.131 5.389 5.534 5.801 6.043 6.28 6.393 6.603 6.801 7.084 7.265 7.444 7.694 7.931 8.147 8.348 8.541 8.785 9.028 9.253 9.5 9.736 9.968 10.238 10.53 10.796 11.087 11.406 11.737 12.086 12.459 12.874 13.283 13.731 14.214 14.765 15.355 15.978 16.6 17.1 17.266 17.133 16.843 16.48 16.11 15.767 15.458 15.166 14.799 14.47 14.183 13.866 13.491 13.138 12.867 12.59 12.321 12.082 11.816 11.536 11.307 11.066 10.815 10.617 10.384 10.128 9.885 9.634 9.452 9.263 8.956 8.736 8.504 8.381 8.132 7.854 7.548 7.383 7.094 6.775 6.553 6.333 5.853 5.589 5.281 4.926 4.507 3.967 3.269 0.932 -10 ,15052 ,TETRA ,17621589,Tue Nov 30 18:02:39 CET,Tue Nov 30 20:45:14 CET,0.0 1.458 2.01 2.433 2.789 3.087 3.348 3.577 3.999 4.192 4.374 4.605 4.858 5.01 5.298 5.561 5.805 5.921 6.134 6.323 6.587 6.755 6.916 7.152 7.375 7.593 7.808 8.013 8.273 8.507 8.728 8.992 9.233 9.466 9.739 10.041 10.327 10.642 10.971 11.306 11.666 12.058 12.493 12.908 13.373 13.871 14.413 15.004 15.637 16.294 16.912 17.122 16.979 16.7 16.404 16.098 15.76 15.401 15.057 14.675 14.316 13.991 13.708 13.435 13.164 12.914 12.64 12.388 12.17 11.931 11.646 11.393 11.136 10.877 10.672 10.463 10.238 9.967 9.68 9.491 9.293 8.987 8.766 8.517 8.387 8.117 7.835 7.521 7.35 7.086 6.826 6.62 6.397 5.908 5.633 5.33 5.007 4.625 4.117 3.424 1.073 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_70.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_70.txt deleted file mode 100644 index 24eba3ef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_70.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22451 ,TETRA ,17621590,Tue Nov 30 18:02:38 CET,Tue Nov 30 20:48:55 CET,0.0 2.377 2.982 3.364 3.699 3.997 4.264 4.506 4.918 5.097 5.254 5.453 5.693 5.828 6.075 6.302 6.508 6.604 6.796 6.983 7.241 7.401 7.553 7.769 7.967 8.155 8.333 8.501 8.721 8.929 9.127 9.362 9.582 9.79 10.025 10.276 10.506 10.761 11.033 11.307 11.593 11.901 12.238 12.553 12.875 13.221 13.577 13.909 14.245 14.489 14.487 14.14 13.652 13.154 12.674 12.213 11.793 11.364 10.973 10.585 10.241 9.928 9.62 9.313 9.017 8.749 8.473 8.218 7.981 7.726 7.465 7.24 6.998 6.743 6.543 6.333 6.114 5.886 5.642 5.469 5.283 4.983 4.771 4.548 4.429 4.163 3.887 3.596 3.442 3.182 2.945 2.764 2.564 2.136 1.895 1.627 1.331 0.982 0.546 -0.059 -1.964 -2 ,16165 ,TETRA ,17621591,Tue Nov 30 18:02:41 CET,Tue Nov 30 20:29:34 CET,0.0 2.073 2.689 3.115 3.477 3.802 4.073 4.306 4.721 4.896 5.055 5.254 5.496 5.622 5.861 6.091 6.303 6.406 6.605 6.792 7.051 7.213 7.368 7.594 7.81 8.008 8.195 8.38 8.608 8.804 9.0 9.241 9.461 9.67 9.9 10.146 10.368 10.602 10.858 11.136 11.406 11.668 11.959 12.246 12.586 12.921 13.253 13.596 13.94 14.233 14.327 14.038 13.625 13.171 12.724 12.277 11.852 11.432 11.04 10.652 10.301 9.976 9.682 9.4 9.112 8.833 8.535 8.276 8.056 7.822 7.566 7.345 7.103 6.85 6.653 6.444 6.231 6.008 5.773 5.608 5.438 5.171 4.979 4.774 4.664 4.44 4.206 3.932 3.782 3.528 3.285 3.094 2.892 2.443 2.203 1.935 1.613 1.225 0.756 0.102 -1.822 -3 ,21373 ,TETRA ,17621592,Tue Nov 30 18:03:35 CET,Tue Nov 30 21:09:03 CET,0.0 2.355 2.944 3.356 3.689 3.98 4.228 4.441 4.821 4.991 5.161 5.388 5.631 5.768 6.022 6.253 6.459 6.554 6.742 6.928 7.188 7.343 7.494 7.709 7.901 8.083 8.251 8.411 8.615 8.82 9.02 9.246 9.467 9.675 9.913 10.18 10.424 10.672 10.913 11.159 11.429 11.73 12.057 12.373 12.713 13.061 13.399 13.727 14.054 14.254 14.283 13.969 13.478 12.966 12.499 12.046 11.583 11.121 10.712 10.291 9.925 9.604 9.293 8.982 8.696 8.435 8.143 7.884 7.651 7.398 7.139 6.917 6.675 6.421 6.227 6.035 5.837 5.617 5.38 5.21 5.026 4.733 4.531 4.323 4.213 3.982 3.732 3.463 3.314 3.055 2.818 2.645 2.465 2.035 1.799 1.543 1.237 0.871 0.406 -0.238 -2.415 -4 ,22597 ,TETRA ,17621593,Tue Nov 30 18:10:36 CET,Tue Nov 30 20:54:56 CET,0.0 1.923 2.48 2.898 3.254 3.562 3.832 4.062 4.457 4.637 4.818 5.042 5.286 5.423 5.67 5.898 6.114 6.219 6.42 6.609 6.871 7.038 7.202 7.421 7.622 7.821 8.011 8.19 8.421 8.637 8.832 9.063 9.289 9.507 9.75 9.996 10.229 10.488 10.748 11.008 11.261 11.527 11.831 12.132 12.455 12.774 13.103 13.432 13.726 13.934 13.934 13.591 13.087 12.586 12.121 11.647 11.195 10.778 10.405 10.015 9.683 9.36 9.029 8.723 8.436 8.173 7.876 7.598 7.361 7.118 6.863 6.641 6.405 6.146 5.936 5.718 5.502 5.278 5.035 4.868 4.69 4.389 4.183 3.981 3.869 3.632 3.378 3.104 2.964 2.72 2.506 2.33 2.134 1.705 1.467 1.198 0.886 0.533 0.115 -0.466 -3.074 -5 ,26481 ,TETRA ,17621594,Tue Nov 30 18:10:37 CET,Tue Nov 30 20:53:59 CET,0.0 2.31 2.974 3.429 3.779 4.093 4.361 4.587 4.998 5.185 5.359 5.565 5.807 5.94 6.185 6.404 6.609 6.71 6.906 7.078 7.324 7.486 7.636 7.854 8.06 8.246 8.43 8.608 8.845 9.071 9.277 9.512 9.719 9.918 10.143 10.373 10.585 10.814 11.056 11.302 11.553 11.825 12.138 12.448 12.767 13.089 13.423 13.744 14.047 14.296 14.388 14.127 13.695 13.194 12.704 12.264 11.849 11.446 11.105 10.749 10.423 10.125 9.817 9.517 9.247 9.007 8.754 8.495 8.26 8.028 7.779 7.565 7.337 7.096 6.908 6.715 6.512 6.302 6.07 5.898 5.724 5.454 5.259 5.055 4.949 4.724 4.48 4.22 4.075 3.82 3.598 3.422 3.242 2.829 2.579 2.305 2.004 1.646 1.206 0.586 -1.903 -6 ,2436 ,TETRA ,17621595,Tue Nov 30 18:10:39 CET,Tue Nov 30 20:37:25 CET,0.0 1.924 2.525 2.969 3.331 3.657 3.926 4.151 4.554 4.732 4.907 5.135 5.382 5.519 5.765 5.992 6.215 6.322 6.523 6.717 6.984 7.151 7.307 7.523 7.731 7.93 8.116 8.296 8.518 8.727 8.929 9.164 9.381 9.585 9.813 10.058 10.302 10.566 10.818 11.062 11.309 11.593 11.899 12.176 12.484 12.811 13.15 13.454 13.723 13.943 13.934 13.547 13.045 12.541 12.078 11.648 11.234 10.825 10.447 10.061 9.738 9.453 9.17 8.872 8.579 8.31 8.021 7.749 7.507 7.267 7.013 6.792 6.56 6.317 6.121 5.909 5.688 5.459 5.214 5.035 4.853 4.57 4.367 4.152 4.035 3.781 3.513 3.224 3.067 2.805 2.554 2.373 2.182 1.74 1.498 1.247 0.929 0.524 0.066 -0.545 -2.979 -7 ,5571 ,TETRA ,17621596,Tue Nov 30 18:10:37 CET,Tue Nov 30 20:58:08 CET,0.0 2.093 2.742 3.199 3.553 3.856 4.131 4.367 4.769 4.954 5.131 5.332 5.577 5.711 5.958 6.208 6.438 6.545 6.75 6.942 7.199 7.359 7.51 7.73 7.948 8.149 8.329 8.497 8.706 8.898 9.087 9.324 9.543 9.741 9.973 10.23 10.465 10.723 10.994 11.261 11.534 11.837 12.173 12.486 12.804 13.125 13.469 13.799 14.128 14.444 14.586 14.375 13.966 13.529 13.065 12.572 12.134 11.715 11.33 10.93 10.576 10.248 9.932 9.638 9.355 9.08 8.786 8.527 8.296 8.046 7.779 7.549 7.312 7.057 6.851 6.634 6.401 6.16 5.911 5.737 5.548 5.251 5.04 4.825 4.716 4.475 4.21 3.919 3.769 3.508 3.267 3.078 2.887 2.47 2.239 1.965 1.646 1.274 0.809 0.135 -2.105 -8 ,3574 ,TETRA ,17621597,Tue Nov 30 18:10:39 CET,Tue Nov 30 20:40:46 CET,0.0 1.987 2.599 3.035 3.351 3.638 3.903 4.145 4.578 4.774 4.949 5.151 5.394 5.533 5.788 6.022 6.244 6.348 6.548 6.731 6.973 7.128 7.279 7.497 7.698 7.889 8.074 8.25 8.474 8.684 8.882 9.107 9.32 9.528 9.77 10.042 10.286 10.54 10.8 11.048 11.302 11.594 11.915 12.193 12.493 12.828 13.16 13.449 13.735 13.969 14.016 13.727 13.318 12.872 12.428 12.008 11.596 11.211 10.88 10.527 10.206 9.904 9.582 9.266 8.983 8.731 8.462 8.203 7.965 7.725 7.459 7.229 6.995 6.749 6.554 6.346 6.132 5.918 5.685 5.515 5.342 5.061 4.861 4.643 4.529 4.302 4.054 3.789 3.647 3.388 3.144 2.954 2.752 2.318 2.073 1.798 1.475 1.106 0.666 0.027 -2.393 -9 ,14372 ,TETRA ,17621598,Tue Nov 30 18:10:41 CET,Tue Nov 30 20:37:58 CET,0.0 2.364 2.961 3.394 3.755 4.06 4.32 4.558 4.963 5.151 5.338 5.571 5.816 5.947 6.196 6.452 6.698 6.806 7.016 7.212 7.47 7.629 7.786 8.015 8.226 8.415 8.593 8.766 8.981 9.183 9.377 9.599 9.799 9.988 10.208 10.457 10.694 10.949 11.211 11.483 11.752 12.029 12.34 12.642 12.966 13.289 13.625 13.945 14.243 14.461 14.425 14.069 13.661 13.232 12.794 12.359 11.967 11.59 11.236 10.869 10.539 10.219 9.909 9.61 9.327 9.077 8.808 8.561 8.349 8.111 7.853 7.632 7.401 7.165 6.973 6.771 6.558 6.337 6.104 5.931 5.75 5.48 5.287 5.084 4.978 4.742 4.479 4.199 4.049 3.801 3.587 3.419 3.237 2.812 2.568 2.293 1.967 1.587 1.096 0.455 -1.614 -10 ,14110 ,TETRA ,17621599,Tue Nov 30 18:27:37 CET,Tue Nov 30 20:34:53 CET,0.0 1.88 2.453 2.875 3.215 3.497 3.753 3.991 4.406 4.591 4.764 4.965 5.207 5.343 5.604 5.845 6.055 6.153 6.345 6.53 6.788 6.953 7.106 7.326 7.534 7.725 7.915 8.098 8.316 8.522 8.722 8.951 9.16 9.365 9.602 9.853 10.081 10.322 10.579 10.846 11.104 11.387 11.706 11.992 12.299 12.615 12.93 13.239 13.529 13.75 13.778 13.452 13.03 12.594 12.128 11.691 11.277 10.856 10.484 10.095 9.757 9.454 9.154 8.865 8.573 8.297 8.023 7.776 7.553 7.312 7.055 6.836 6.601 6.348 6.146 5.94 5.723 5.493 5.258 5.093 4.917 4.644 4.461 4.274 4.173 3.95 3.713 3.45 3.302 3.045 2.814 2.634 2.441 1.992 1.732 1.44 1.082 0.699 0.26 -0.379 -2.381 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_70_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_70_62.txt deleted file mode 100644 index 78cce069..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/protein/Summary_FEP_70_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15843 ,TETRA ,17621600,Tue Nov 30 18:27:36 CET,Tue Nov 30 20:31:26 CET,0.0 1.808 2.402 2.837 3.199 3.503 3.766 4.002 4.418 4.609 4.796 5.028 5.284 5.433 5.705 5.973 6.224 6.342 6.561 6.767 7.062 7.249 7.425 7.68 7.928 8.161 8.383 8.597 8.865 9.113 9.349 9.622 9.889 10.147 10.435 10.763 11.083 11.419 11.781 12.158 12.548 12.978 13.46 13.961 14.541 15.155 15.843 16.622 17.5 18.424 19.419 20.05 20.26 20.29 20.177 19.999 19.824 19.623 19.396 19.142 18.914 18.685 18.441 18.208 17.993 17.791 17.568 17.348 17.139 16.919 16.685 16.485 16.275 16.058 15.88 15.681 15.478 15.273 15.051 14.876 14.683 14.384 14.187 13.987 13.876 13.641 13.392 13.104 12.95 12.71 12.477 12.294 12.082 11.569 11.28 10.967 10.608 10.207 9.736 9.065 6.598 -2 ,3930 ,TETRA ,17621601,Tue Nov 30 18:27:36 CET,Tue Nov 30 20:55:38 CET,0.0 1.61 2.158 2.571 2.914 3.232 3.519 3.765 4.201 4.396 4.58 4.812 5.076 5.229 5.513 5.77 6.009 6.127 6.356 6.589 6.91 7.092 7.271 7.526 7.767 7.992 8.197 8.399 8.664 8.923 9.171 9.45 9.714 9.978 10.283 10.613 10.925 11.265 11.615 11.98 12.356 12.776 13.262 13.747 14.322 14.962 15.672 16.4 17.215 18.185 19.125 19.634 19.837 19.883 19.808 19.653 19.452 19.225 18.999 18.758 18.535 18.309 18.08 17.839 17.594 17.381 17.159 16.951 16.743 16.505 16.261 16.063 15.852 15.629 15.454 15.266 15.071 14.867 14.64 14.467 14.281 13.989 13.786 13.575 13.459 13.221 12.975 12.702 12.548 12.285 12.011 11.815 11.605 11.126 10.851 10.546 10.191 9.727 9.115 8.253 4.785 -3 ,29191 ,TETRA ,17621602,Tue Nov 30 18:27:37 CET,Tue Nov 30 21:05:40 CET,0.0 1.818 2.459 2.924 3.282 3.577 3.851 4.109 4.554 4.752 4.938 5.162 5.419 5.558 5.829 6.097 6.34 6.454 6.671 6.875 7.171 7.358 7.541 7.803 8.039 8.263 8.475 8.675 8.937 9.189 9.425 9.706 9.979 10.236 10.535 10.873 11.186 11.522 11.877 12.249 12.644 13.083 13.584 14.074 14.619 15.204 15.862 16.606 17.451 18.341 19.297 19.866 19.954 19.919 19.831 19.649 19.421 19.189 18.965 18.71 18.463 18.222 17.981 17.74 17.497 17.27 17.03 16.791 16.577 16.358 16.11 15.896 15.672 15.443 15.255 15.05 14.841 14.616 14.384 14.226 14.054 13.772 13.572 13.35 13.232 12.992 12.745 12.458 12.295 12.029 11.757 11.552 11.331 10.797 10.501 10.194 9.831 9.389 8.846 8.081 5.861 -4 ,2560 ,TETRA ,17621603,Tue Nov 30 18:27:37 CET,Tue Nov 30 21:00:12 CET,0.0 1.757 2.39 2.827 3.182 3.496 3.78 4.031 4.463 4.671 4.868 5.112 5.383 5.548 5.823 6.062 6.296 6.41 6.625 6.834 7.134 7.311 7.482 7.742 7.984 8.213 8.439 8.658 8.927 9.18 9.424 9.707 9.976 10.238 10.529 10.852 11.154 11.477 11.822 12.196 12.591 13.013 13.5 13.982 14.517 15.09 15.734 16.453 17.267 18.149 19.135 19.749 19.917 19.894 19.772 19.589 19.386 19.172 18.951 18.692 18.442 18.199 17.969 17.758 17.534 17.306 17.063 16.835 16.632 16.432 16.212 16.012 15.79 15.551 15.362 15.168 14.969 14.752 14.51 14.339 14.154 13.845 13.625 13.393 13.269 13.01 12.727 12.427 12.273 12.012 11.756 11.556 11.325 10.795 10.5 10.151 9.753 9.317 8.78 7.907 3.294 -5 ,17347 ,TETRA ,17621604,Tue Nov 30 18:27:39 CET,Tue Nov 30 20:55:24 CET,0.0 1.689 2.245 2.665 3.01 3.3 3.565 3.812 4.244 4.439 4.63 4.875 5.141 5.294 5.571 5.833 6.076 6.188 6.409 6.629 6.935 7.12 7.293 7.549 7.788 8.016 8.245 8.461 8.73 8.976 9.213 9.507 9.774 10.024 10.32 10.646 10.952 11.284 11.638 12.011 12.407 12.843 13.331 13.804 14.344 14.956 15.646 16.391 17.241 18.159 19.092 19.611 19.717 19.657 19.541 19.37 19.176 18.973 18.754 18.51 18.273 18.035 17.805 17.578 17.348 17.136 16.914 16.705 16.52 16.315 16.093 15.909 15.704 15.484 15.313 15.133 14.943 14.742 14.523 14.356 14.176 13.896 13.697 13.485 13.373 13.133 12.87 12.59 12.449 12.203 11.941 11.76 11.569 11.141 10.88 10.564 10.21 9.816 9.345 8.671 5.868 -6 ,8405 ,TETRA ,17621605,Tue Nov 30 18:28:34 CET,Tue Nov 30 20:57:37 CET,0.0 1.514 2.078 2.538 2.896 3.21 3.492 3.738 4.164 4.361 4.55 4.804 5.072 5.224 5.506 5.766 6.008 6.123 6.344 6.548 6.836 7.017 7.194 7.46 7.71 7.937 8.157 8.363 8.611 8.845 9.073 9.344 9.597 9.847 10.14 10.457 10.758 11.095 11.465 11.851 12.238 12.656 13.133 13.625 14.215 14.851 15.56 16.318 17.157 18.093 19.095 19.659 19.768 19.706 19.575 19.41 19.208 18.964 18.701 18.412 18.136 17.892 17.666 17.447 17.234 17.026 16.798 16.583 16.374 16.155 15.936 15.731 15.501 15.254 15.062 14.862 14.651 14.425 14.184 14.018 13.836 13.544 13.337 13.106 12.989 12.747 12.474 12.181 12.018 11.754 11.486 11.28 11.059 10.569 10.294 9.971 9.58 9.135 8.606 7.858 5.29 -7 ,14323 ,TETRA ,17621606,Tue Nov 30 18:32:36 CET,Tue Nov 30 20:49:23 CET,0.0 1.706 2.292 2.719 3.07 3.365 3.636 3.887 4.327 4.525 4.713 4.957 5.22 5.376 5.667 5.934 6.179 6.294 6.518 6.734 7.03 7.211 7.391 7.655 7.901 8.132 8.351 8.559 8.824 9.074 9.314 9.605 9.887 10.158 10.466 10.801 11.121 11.474 11.842 12.233 12.638 13.093 13.609 14.113 14.717 15.388 16.134 16.936 17.816 18.8 19.875 20.525 20.742 20.717 20.575 20.389 20.194 19.971 19.721 19.424 19.158 18.913 18.655 18.399 18.171 17.96 17.7 17.442 17.215 16.971 16.704 16.479 16.239 15.981 15.782 15.572 15.357 15.132 14.892 14.718 14.536 14.251 14.038 13.795 13.665 13.408 13.148 12.835 12.666 12.397 12.09 11.883 11.663 11.159 10.875 10.569 10.205 9.763 9.168 8.339 5.376 -8 ,16259 ,TETRA ,17621607,Tue Nov 30 18:32:38 CET,Tue Nov 30 20:49:57 CET,0.0 1.747 2.341 2.787 3.146 3.441 3.711 3.965 4.394 4.579 4.764 4.997 5.253 5.403 5.685 5.947 6.186 6.299 6.512 6.715 7.015 7.199 7.371 7.611 7.841 8.062 8.273 8.484 8.75 9.002 9.246 9.528 9.79 10.053 10.348 10.667 10.975 11.309 11.668 12.042 12.433 12.881 13.385 13.867 14.423 15.038 15.724 16.464 17.339 18.333 19.265 19.793 20.002 19.997 19.864 19.668 19.445 19.237 19.025 18.762 18.519 18.284 18.045 17.803 17.568 17.364 17.135 16.905 16.708 16.498 16.25 16.045 15.827 15.588 15.406 15.2 14.977 14.758 14.524 14.35 14.172 13.894 13.698 13.484 13.362 13.117 12.865 12.596 12.452 12.207 11.953 11.751 11.538 11.099 10.828 10.49 10.104 9.652 9.116 8.391 5.217 -9 ,1934 ,TETRA ,17621608,Tue Nov 30 18:32:37 CET,Tue Nov 30 20:42:55 CET,0.0 1.656 2.221 2.655 3.006 3.317 3.614 3.881 4.337 4.531 4.702 4.936 5.203 5.358 5.652 5.921 6.164 6.277 6.5 6.717 7.026 7.224 7.412 7.676 7.929 8.166 8.389 8.605 8.885 9.154 9.401 9.695 9.976 10.253 10.573 10.912 11.24 11.604 11.989 12.391 12.801 13.241 13.733 14.204 14.737 15.327 16.001 16.796 17.693 18.602 19.545 20.148 20.34 20.324 20.187 19.983 19.782 19.578 19.363 19.108 18.855 18.606 18.356 18.112 17.874 17.653 17.415 17.194 16.988 16.76 16.52 16.318 16.097 15.852 15.662 15.465 15.249 15.007 14.744 14.556 14.361 14.07 13.863 13.619 13.488 13.22 12.929 12.613 12.443 12.168 11.88 11.673 11.448 10.918 10.608 10.262 9.874 9.43 8.861 8.025 4.689 -10 ,30923 ,TETRA ,17621609,Tue Nov 30 18:32:37 CET,Tue Nov 30 20:45:00 CET,0.0 1.752 2.4 2.866 3.238 3.555 3.837 4.097 4.541 4.734 4.916 5.139 5.389 5.53 5.805 6.058 6.296 6.411 6.645 6.864 7.162 7.348 7.527 7.784 8.011 8.218 8.434 8.649 8.918 9.171 9.407 9.685 9.95 10.204 10.5 10.834 11.153 11.493 11.846 12.211 12.604 13.045 13.538 14.025 14.596 15.222 15.916 16.65 17.507 18.507 19.489 20.098 20.323 20.292 20.107 19.87 19.674 19.462 19.221 18.949 18.69 18.434 18.167 17.912 17.666 17.434 17.185 16.962 16.743 16.498 16.244 16.032 15.813 15.565 15.369 15.153 14.92 14.676 14.408 14.218 14.026 13.727 13.518 13.3 13.179 12.917 12.637 12.334 12.173 11.904 11.6 11.383 11.142 10.603 10.309 9.98 9.604 9.165 8.606 7.824 4.301 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_19_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_19_23.txt deleted file mode 100644 index 6052fd04..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_19_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19039 ,TETRA ,17621610,Tue Nov 30 18:32:38 CET,Tue Nov 30 20:13:09 CET,0.0 2.044 2.617 3.003 3.334 3.622 3.882 4.119 4.531 4.718 4.891 5.162 5.373 5.523 5.81 6.082 6.338 6.469 6.731 6.977 7.326 7.551 7.764 8.064 8.351 8.632 8.915 9.188 9.531 9.855 10.168 10.556 10.925 11.278 11.682 12.127 12.558 13.038 13.573 14.148 14.729 15.393 16.195 17.001 17.956 19.065 20.367 21.886 23.712 25.934 28.776 31.193 32.649 33.613 34.256 34.706 35.002 35.198 35.34 35.436 35.484 35.507 35.511 35.49 35.447 35.398 35.349 35.291 35.226 35.145 35.045 34.961 34.865 34.748 34.65 34.543 34.435 34.326 34.195 34.098 33.998 33.841 33.715 33.568 33.494 33.347 33.174 32.972 32.871 32.74 32.517 32.358 32.182 31.837 31.648 31.44 31.178 30.873 30.524 30.013 27.925 -2 ,12759 ,TETRA ,17621611,Tue Nov 30 18:32:38 CET,Tue Nov 30 20:05:46 CET,0.0 1.89 2.445 2.835 3.163 3.451 3.699 3.936 4.373 4.561 4.735 5.009 5.214 5.363 5.639 5.895 6.14 6.263 6.509 6.737 7.055 7.256 7.452 7.738 8.006 8.265 8.521 8.76 9.076 9.397 9.707 10.079 10.437 10.781 11.186 11.652 12.09 12.563 13.08 13.649 14.263 14.947 15.762 16.6 17.575 18.689 20.008 21.541 23.361 25.593 28.468 30.935 32.5 33.557 34.242 34.726 35.078 35.333 35.46 35.534 35.575 35.581 35.583 35.57 35.522 35.46 35.39 35.313 35.236 35.158 35.069 34.984 34.891 34.782 34.682 34.573 34.467 34.349 34.22 34.125 34.021 33.859 33.741 33.613 33.54 33.389 33.219 33.035 32.932 32.794 32.59 32.456 32.308 31.985 31.783 31.558 31.309 30.998 30.616 30.092 27.757 -3 ,11014 ,TETRA ,17621612,Tue Nov 30 18:32:38 CET,Tue Nov 30 20:12:36 CET,0.0 3.159 3.68 4.084 4.432 4.728 4.984 5.223 5.648 5.839 6.02 6.295 6.496 6.642 6.922 7.18 7.421 7.538 7.772 7.999 8.322 8.525 8.719 9.003 9.272 9.53 9.781 10.032 10.35 10.651 10.95 11.305 11.644 11.978 12.38 12.833 13.257 13.725 14.235 14.785 15.366 16.035 16.851 17.67 18.614 19.688 20.959 22.46 24.266 26.489 29.411 31.934 33.461 34.476 35.124 35.582 35.924 36.138 36.25 36.33 36.353 36.347 36.332 36.291 36.237 36.176 36.102 36.001 35.9 35.807 35.702 35.606 35.503 35.389 35.29 35.179 35.06 34.932 34.783 34.679 34.573 34.397 34.27 34.139 34.07 33.913 33.748 33.566 33.465 33.337 33.131 33.004 32.866 32.539 32.353 32.138 31.886 31.602 31.265 30.783 28.24 -4 ,3360 ,TETRA ,17621613,Tue Nov 30 18:34:38 CET,Tue Nov 30 20:09:14 CET,0.0 2.763 3.288 3.663 3.98 4.271 4.526 4.764 5.196 5.386 5.561 5.836 6.04 6.188 6.471 6.737 6.993 7.117 7.361 7.588 7.9 8.097 8.289 8.579 8.854 9.111 9.367 9.617 9.942 10.262 10.571 10.935 11.289 11.648 12.064 12.512 12.946 13.428 13.94 14.504 15.109 15.792 16.595 17.415 18.38 19.486 20.821 22.359 24.185 26.396 29.219 31.675 33.148 34.114 34.759 35.224 35.534 35.715 35.831 35.921 35.96 35.974 35.973 35.939 35.888 35.832 35.757 35.679 35.602 35.513 35.423 35.342 35.246 35.13 35.037 34.942 34.838 34.727 34.605 34.513 34.409 34.234 34.106 33.968 33.9 33.76 33.599 33.418 33.319 33.188 32.98 32.849 32.699 32.354 32.16 31.943 31.699 31.407 31.06 30.504 27.376 -5 ,23785 ,TETRA ,17621614,Tue Nov 30 18:38:38 CET,Tue Nov 30 20:30:48 CET,0.0 2.029 2.554 2.924 3.228 3.494 3.74 3.96 4.343 4.518 4.696 4.977 5.179 5.323 5.588 5.835 6.076 6.196 6.426 6.649 6.964 7.162 7.357 7.641 7.908 8.168 8.424 8.672 8.986 9.285 9.583 9.937 10.274 10.608 10.991 11.42 11.846 12.314 12.819 13.361 13.946 14.615 15.413 16.227 17.177 18.262 19.59 21.135 22.961 25.188 27.971 30.4 31.911 32.892 33.53 33.992 34.312 34.531 34.657 34.732 34.784 34.803 34.785 34.751 34.708 34.658 34.596 34.54 34.496 34.429 34.341 34.274 34.197 34.105 34.028 33.937 33.832 33.712 33.573 33.477 33.378 33.215 33.094 32.961 32.897 32.771 32.623 32.448 32.357 32.23 32.016 31.889 31.755 31.448 31.268 31.064 30.836 30.572 30.228 29.718 27.676 -6 ,28242 ,TETRA ,17621615,Tue Nov 30 18:39:34 CET,Tue Nov 30 20:24:42 CET,0.0 3.117 3.697 4.113 4.437 4.727 5.014 5.269 5.691 5.879 6.051 6.313 6.514 6.655 6.926 7.192 7.445 7.565 7.797 8.026 8.351 8.556 8.755 9.039 9.316 9.584 9.836 10.086 10.421 10.738 11.035 11.395 11.747 12.092 12.498 12.952 13.393 13.871 14.38 14.942 15.544 16.229 17.042 17.847 18.795 19.896 21.209 22.734 24.574 26.806 29.633 32.093 33.582 34.532 35.135 35.563 35.866 36.065 36.173 36.231 36.238 36.226 36.206 36.152 36.088 36.013 35.913 35.827 35.739 35.637 35.541 35.452 35.353 35.231 35.126 35.006 34.877 34.75 34.606 34.504 34.402 34.241 34.119 33.982 33.912 33.753 33.577 33.383 33.277 33.144 32.932 32.806 32.654 32.3 32.11 31.897 31.656 31.345 30.97 30.439 28.596 -7 ,3315 ,TETRA ,17621616,Tue Nov 30 18:39:35 CET,Tue Nov 30 20:25:29 CET,0.0 2.4 2.998 3.419 3.766 4.056 4.306 4.532 4.943 5.135 5.318 5.608 5.815 5.967 6.251 6.508 6.756 6.877 7.112 7.339 7.66 7.858 8.05 8.33 8.603 8.873 9.13 9.376 9.694 10.007 10.303 10.661 11.015 11.356 11.742 12.169 12.591 13.061 13.566 14.104 14.674 15.316 16.083 16.882 17.836 18.91 20.166 21.65 23.434 25.645 28.53 31.053 32.534 33.487 34.153 34.575 34.848 35.056 35.178 35.247 35.275 35.274 35.253 35.222 35.182 35.13 35.062 34.988 34.908 34.807 34.694 34.597 34.485 34.362 34.261 34.151 34.043 33.92 33.781 33.684 33.572 33.399 33.276 33.136 33.067 32.924 32.754 32.564 32.461 32.327 32.119 31.99 31.852 31.531 31.344 31.133 30.881 30.589 30.224 29.647 27.574 -8 ,3329 ,TETRA ,17621617,Tue Nov 30 18:39:34 CET,Tue Nov 30 20:27:30 CET,0.0 2.288 3.013 3.516 3.928 4.266 4.552 4.799 5.245 5.453 5.648 5.962 6.181 6.341 6.635 6.909 7.179 7.318 7.582 7.831 8.196 8.427 8.648 8.945 9.225 9.498 9.77 10.034 10.364 10.684 10.992 11.363 11.723 12.076 12.485 12.944 13.379 13.852 14.375 14.95 15.565 16.243 17.033 17.858 18.823 19.912 21.196 22.692 24.53 26.764 29.501 31.879 33.366 34.358 35.044 35.512 35.836 36.046 36.154 36.214 36.235 36.257 36.252 36.202 36.144 36.087 36.032 35.959 35.871 35.77 35.659 35.564 35.45 35.324 35.223 35.115 35.004 34.88 34.746 34.649 34.543 34.383 34.266 34.133 34.065 33.909 33.722 33.523 33.423 33.297 33.082 32.943 32.801 32.488 32.3 32.087 31.843 31.546 31.127 30.575 28.441 -9 ,20046 ,TETRA ,17621618,Tue Nov 30 18:40:35 CET,Tue Nov 30 20:25:17 CET,0.0 3.167 3.737 4.155 4.5 4.795 5.063 5.321 5.781 5.985 6.171 6.456 6.661 6.805 7.082 7.342 7.591 7.712 7.946 8.167 8.485 8.684 8.88 9.17 9.445 9.714 9.972 10.214 10.525 10.832 11.133 11.492 11.84 12.175 12.569 13.021 13.456 13.927 14.434 15.005 15.627 16.333 17.161 17.99 18.969 20.073 21.376 22.866 24.647 26.877 29.723 32.2 33.691 34.624 35.262 35.709 36.002 36.222 36.356 36.441 36.486 36.494 36.487 36.47 36.453 36.415 36.346 36.272 36.18 36.059 35.933 35.838 35.736 35.619 35.516 35.412 35.304 35.176 35.045 34.954 34.849 34.673 34.549 34.422 34.354 34.194 34.017 33.83 33.732 33.606 33.404 33.271 33.123 32.801 32.619 32.412 32.174 31.875 31.503 30.983 28.689 -10 ,12723 ,TETRA ,17621619,Tue Nov 30 18:40:35 CET,Tue Nov 30 20:27:29 CET,0.0 2.214 2.811 3.223 3.552 3.842 4.104 4.34 4.752 4.938 5.113 5.39 5.602 5.752 6.02 6.271 6.513 6.632 6.86 7.072 7.378 7.575 7.768 8.056 8.33 8.588 8.834 9.083 9.41 9.715 10.011 10.372 10.724 11.067 11.47 11.918 12.339 12.807 13.323 13.873 14.459 15.136 15.928 16.739 17.705 18.803 20.115 21.629 23.486 25.762 28.632 31.14 32.638 33.636 34.305 34.734 35.017 35.23 35.366 35.459 35.5 35.518 35.522 35.504 35.481 35.447 35.376 35.295 35.221 35.142 35.054 34.974 34.876 34.768 34.686 34.587 34.47 34.343 34.215 34.121 34.014 33.848 33.721 33.579 33.506 33.352 33.181 32.994 32.894 32.761 32.54 32.402 32.249 31.919 31.737 31.536 31.297 31.001 30.635 30.093 27.825 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_19.txt deleted file mode 100644 index cf3e9f6a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14314 ,TETRA ,17621620,Tue Nov 30 18:40:34 CET,Tue Nov 30 20:19:54 CET,0.0 2.408 2.887 3.247 3.54 3.778 3.994 4.199 4.547 4.695 4.835 5.043 5.213 5.332 5.554 5.747 5.927 6.014 6.179 6.339 6.572 6.72 6.855 7.042 7.218 7.388 7.547 7.698 7.896 8.089 8.299 8.579 8.82 9.022 9.245 9.497 9.747 10.02 10.297 10.572 10.852 11.169 11.511 11.845 12.226 12.603 13.01 13.427 13.804 14.109 14.27 14.044 13.64 13.14 12.616 12.116 11.671 11.258 10.882 10.498 10.156 9.854 9.536 9.223 8.942 8.682 8.401 8.131 7.901 7.67 7.412 7.202 6.986 6.737 6.543 6.345 6.144 5.935 5.707 5.544 5.369 5.081 4.885 4.676 4.559 4.327 4.075 3.814 3.68 3.481 3.225 3.059 2.88 2.475 2.242 1.973 1.661 1.326 0.925 0.324 -3.067 -2 ,29121 ,TETRA ,17621621,Tue Nov 30 18:40:35 CET,Tue Nov 30 20:29:07 CET,0.0 2.564 3.084 3.452 3.752 4.01 4.233 4.43 4.775 4.929 5.077 5.302 5.476 5.592 5.81 6.02 6.222 6.322 6.514 6.694 6.949 7.103 7.253 7.48 7.702 7.899 8.073 8.243 8.469 8.683 8.877 9.117 9.347 9.553 9.78 10.022 10.254 10.509 10.778 11.066 11.354 11.65 12.0 12.328 12.673 13.052 13.471 13.902 14.289 14.536 14.532 14.215 13.767 13.271 12.766 12.262 11.797 11.362 10.977 10.571 10.209 9.87 9.538 9.222 8.907 8.612 8.311 8.031 7.787 7.535 7.269 7.042 6.793 6.534 6.331 6.112 5.882 5.64 5.388 5.208 5.009 4.696 4.492 4.282 4.169 3.924 3.654 3.362 3.203 2.99 2.689 2.493 2.296 1.866 1.616 1.324 1.006 0.659 0.197 -0.475 -3.934 -3 ,15680 ,TETRA ,17621622,Tue Nov 30 18:51:15 CET,Tue Nov 30 20:42:23 CET,0.0 1.949 2.493 2.857 3.15 3.408 3.635 3.832 4.177 4.339 4.493 4.712 4.886 5.005 5.229 5.431 5.62 5.714 5.901 6.072 6.311 6.459 6.605 6.821 7.021 7.214 7.4 7.575 7.799 8.016 8.221 8.464 8.692 8.906 9.149 9.421 9.666 9.909 10.174 10.461 10.755 11.069 11.437 11.788 12.152 12.527 12.917 13.349 13.763 14.046 14.143 13.797 13.294 12.773 12.251 11.709 11.183 10.703 10.286 9.856 9.466 9.116 8.789 8.469 8.167 7.899 7.602 7.324 7.088 6.837 6.557 6.325 6.093 5.843 5.652 5.454 5.238 5.013 4.774 4.604 4.427 4.148 3.953 3.747 3.633 3.396 3.152 2.882 2.731 2.523 2.247 2.072 1.883 1.454 1.222 0.946 0.62 0.252 -0.236 -0.908 -4.687 -4 ,10243 ,TETRA ,17621623,Tue Nov 30 18:51:15 CET,Tue Nov 30 20:41:45 CET,0.0 2.616 3.199 3.549 3.83 4.063 4.271 4.467 4.814 4.973 5.123 5.324 5.489 5.606 5.829 6.036 6.218 6.302 6.468 6.627 6.847 6.99 7.131 7.323 7.5 7.67 7.84 8.002 8.196 8.376 8.547 8.752 8.951 9.151 9.38 9.631 9.889 10.174 10.457 10.747 11.032 11.339 11.679 11.989 12.351 12.756 13.177 13.604 14.01 14.349 14.451 14.06 13.543 13.039 12.528 12.021 11.56 11.122 10.729 10.315 9.942 9.604 9.282 8.982 8.687 8.4 8.088 7.797 7.553 7.305 7.048 6.827 6.586 6.327 6.125 5.919 5.695 5.445 5.17 4.989 4.798 4.485 4.279 4.069 3.957 3.719 3.459 3.176 3.027 2.819 2.521 2.331 2.137 1.704 1.466 1.188 0.877 0.534 0.101 -0.575 -3.61 -5 ,21679 ,TETRA ,17621624,Tue Nov 30 18:51:18 CET,Tue Nov 30 20:41:30 CET,0.0 2.283 2.813 3.184 3.488 3.747 3.975 4.176 4.53 4.686 4.831 5.062 5.242 5.362 5.586 5.792 5.981 6.074 6.252 6.42 6.653 6.793 6.926 7.119 7.306 7.485 7.647 7.801 8.0 8.191 8.375 8.602 8.815 9.003 9.226 9.49 9.735 9.989 10.252 10.514 10.799 11.113 11.45 11.761 12.119 12.53 12.962 13.354 13.715 14.021 14.093 13.792 13.345 12.843 12.331 11.819 11.372 10.959 10.585 10.199 9.842 9.525 9.225 8.924 8.638 8.385 8.112 7.853 7.619 7.368 7.102 6.877 6.638 6.388 6.188 5.975 5.764 5.545 5.301 5.122 4.942 4.663 4.457 4.241 4.133 3.91 3.667 3.397 3.253 3.039 2.748 2.569 2.38 1.989 1.755 1.476 1.156 0.777 0.321 -0.334 -3.315 -6 ,24448 ,TETRA ,17621625,Tue Nov 30 18:51:16 CET,Tue Nov 30 20:43:56 CET,0.0 1.884 2.381 2.732 3.023 3.272 3.484 3.671 3.998 4.14 4.276 4.48 4.647 4.761 4.987 5.192 5.38 5.472 5.637 5.788 6.011 6.152 6.287 6.483 6.67 6.843 7.001 7.149 7.341 7.526 7.704 7.913 8.104 8.294 8.51 8.74 8.964 9.213 9.47 9.719 9.985 10.292 10.634 10.952 11.293 11.667 12.07 12.444 12.793 13.073 13.177 12.922 12.418 11.902 11.391 10.866 10.401 9.95 9.563 9.169 8.805 8.473 8.144 7.834 7.547 7.281 6.988 6.727 6.501 6.26 6.003 5.781 5.541 5.294 5.109 4.902 4.68 4.463 4.228 4.059 3.883 3.597 3.398 3.2 3.088 2.846 2.598 2.329 2.182 1.974 1.689 1.506 1.316 0.887 0.633 0.325 -0.018 -0.429 -0.953 -1.638 -3.997 -7 ,19641 ,TETRA ,17621626,Tue Nov 30 18:51:16 CET,Tue Nov 30 20:42:03 CET,0.0 2.009 2.523 2.87 3.156 3.408 3.626 3.824 4.183 4.336 4.482 4.714 4.89 5.007 5.226 5.422 5.613 5.708 5.884 6.043 6.263 6.407 6.543 6.733 6.922 7.11 7.288 7.452 7.669 7.875 8.059 8.288 8.517 8.729 8.97 9.232 9.476 9.74 10.016 10.303 10.602 10.921 11.271 11.607 11.946 12.291 12.681 13.087 13.496 13.829 13.883 13.487 12.978 12.457 11.925 11.416 10.938 10.464 10.03 9.59 9.218 8.871 8.533 8.23 7.942 7.653 7.335 7.051 6.807 6.557 6.284 6.051 5.813 5.556 5.35 5.133 4.909 4.674 4.42 4.238 4.047 3.749 3.533 3.302 3.186 2.935 2.657 2.359 2.209 2.013 1.735 1.551 1.356 0.927 0.688 0.412 0.113 -0.247 -0.725 -1.409 -4.398 -8 ,12510 ,TETRA ,17621627,Tue Nov 30 18:51:17 CET,Tue Nov 30 20:43:59 CET,0.0 1.844 2.382 2.738 3.014 3.266 3.492 3.693 4.049 4.205 4.352 4.579 4.757 4.877 5.099 5.309 5.508 5.6 5.777 5.942 6.171 6.319 6.464 6.668 6.855 7.026 7.195 7.355 7.542 7.729 7.915 8.134 8.348 8.552 8.774 9.019 9.249 9.496 9.767 10.059 10.365 10.693 11.063 11.406 11.765 12.144 12.564 12.992 13.397 13.723 13.864 13.661 13.221 12.72 12.189 11.654 11.174 10.726 10.311 9.87 9.497 9.171 8.845 8.534 8.259 8.0 7.714 7.455 7.22 6.955 6.672 6.44 6.202 5.952 5.753 5.543 5.328 5.097 4.844 4.671 4.496 4.209 4.004 3.794 3.684 3.465 3.228 2.952 2.801 2.584 2.28 2.096 1.885 1.418 1.177 0.888 0.551 0.174 -0.288 -0.941 -3.734 -9 ,8433 ,TETRA ,17621628,Tue Nov 30 18:51:17 CET,Tue Nov 30 20:41:51 CET,0.0 2.206 2.72 3.087 3.384 3.631 3.844 4.036 4.382 4.535 4.681 4.907 5.082 5.2 5.428 5.643 5.844 5.939 6.12 6.286 6.521 6.669 6.805 7.001 7.188 7.368 7.538 7.697 7.896 8.088 8.278 8.512 8.732 8.939 9.18 9.43 9.66 9.92 10.198 10.486 10.762 11.058 11.412 11.753 12.118 12.495 12.897 13.296 13.671 13.966 13.997 13.673 13.209 12.664 12.133 11.619 11.134 10.677 10.263 9.851 9.492 9.162 8.85 8.555 8.257 7.983 7.7 7.431 7.192 6.954 6.7 6.483 6.261 6.026 5.838 5.63 5.41 5.188 4.95 4.785 4.616 4.337 4.138 3.923 3.81 3.579 3.319 3.029 2.882 2.683 2.41 2.224 2.028 1.602 1.357 1.084 0.754 0.364 -0.11 -0.772 -4.774 -10 ,31635 ,TETRA ,17621629,Tue Nov 30 18:51:17 CET,Tue Nov 30 20:43:34 CET,0.0 2.195 2.814 3.199 3.489 3.744 3.971 4.173 4.532 4.696 4.845 5.059 5.235 5.359 5.592 5.802 5.999 6.092 6.262 6.421 6.649 6.791 6.923 7.114 7.297 7.469 7.635 7.797 7.999 8.185 8.36 8.574 8.773 8.953 9.17 9.41 9.629 9.87 10.124 10.386 10.658 10.958 11.306 11.642 12.004 12.381 12.792 13.207 13.612 13.943 13.971 13.723 13.337 12.853 12.342 11.832 11.379 10.947 10.551 10.142 9.774 9.448 9.129 8.818 8.529 8.266 7.99 7.733 7.51 7.274 7.02 6.811 6.589 6.355 6.174 5.972 5.747 5.518 5.285 5.128 4.964 4.687 4.498 4.307 4.205 3.991 3.76 3.499 3.366 3.169 2.885 2.715 2.538 2.114 1.871 1.605 1.305 0.969 0.545 -0.067 -3.519 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_30.txt deleted file mode 100644 index 2bb2dcca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17032 ,KEBNE ,17076903,Sat Dec 25 08:45:32 CET,Sat Dec 25 10:20:57 CET,0.0 4.139 5.016 5.636 6.141 6.558 6.926 7.279 7.892 8.158 8.412 8.815 9.08 9.284 9.674 10.037 10.376 10.542 10.865 11.182 11.616 11.868 12.122 12.5 12.849 13.185 13.51 13.82 14.216 14.6 14.977 15.437 15.886 16.309 16.781 17.31 17.819 18.375 18.972 19.612 20.293 21.049 21.913 22.797 23.837 24.998 26.353 27.906 29.768 31.903 34.267 36.045 36.933 37.352 37.568 37.674 37.631 37.48 37.341 37.202 37.051 36.887 36.7 36.517 36.337 36.148 35.943 35.752 35.557 35.326 35.064 34.83 34.591 34.343 34.14 33.931 33.715 33.501 33.282 33.121 32.956 32.701 32.515 32.304 32.198 31.99 31.766 31.504 31.366 31.189 30.873 30.677 30.465 30.002 29.753 29.472 29.139 28.741 28.233 27.388 23.531 -2 ,29954 ,KEBNE ,17076904,Sat Dec 25 08:45:31 CET,Sat Dec 25 10:22:13 CET,0.0 5.256 6.14 6.757 7.247 7.67 8.039 8.376 8.973 9.236 9.492 9.911 10.179 10.392 10.774 11.118 11.451 11.61 11.91 12.203 12.629 12.896 13.151 13.525 13.885 14.218 14.532 14.837 15.239 15.622 15.982 16.425 16.856 17.275 17.774 18.326 18.847 19.43 20.047 20.688 21.365 22.143 23.056 23.973 25.039 26.214 27.543 29.047 30.871 32.972 35.413 37.309 38.329 38.857 39.078 39.14 39.162 39.111 38.973 38.798 38.604 38.418 38.236 38.041 37.843 37.668 37.471 37.27 37.083 36.877 36.658 36.469 36.275 36.076 35.909 35.72 35.522 35.324 35.098 34.928 34.767 34.515 34.332 34.134 34.029 33.81 33.566 33.287 33.133 32.929 32.59 32.393 32.194 31.762 31.517 31.239 30.854 30.381 29.89 29.174 25.964 -3 ,18374 ,KEBNE ,17076905,Sat Dec 25 08:45:35 CET,Sat Dec 25 10:15:02 CET,0.0 4.658 5.529 6.132 6.605 7.01 7.375 7.706 8.294 8.556 8.798 9.19 9.446 9.651 10.046 10.411 10.743 10.899 11.203 11.494 11.907 12.176 12.428 12.791 13.15 13.487 13.806 14.111 14.506 14.884 15.25 15.694 16.106 16.491 16.943 17.473 17.99 18.559 19.174 19.818 20.496 21.257 22.116 22.975 24.006 25.179 26.539 28.047 29.795 31.856 34.325 36.23 37.135 37.6 37.845 37.957 37.966 37.886 37.787 37.64 37.498 37.352 37.16 36.95 36.742 36.543 36.324 36.121 35.944 35.751 35.504 35.281 35.074 34.861 34.676 34.467 34.241 34.015 33.785 33.627 33.464 33.17 32.947 32.728 32.608 32.35 32.07 31.752 31.584 31.376 31.04 30.839 30.631 30.158 29.892 29.607 29.252 28.809 28.246 27.456 24.445 -4 ,4825 ,KEBNE ,17076906,Sat Dec 25 08:46:34 CET,Sat Dec 25 10:21:34 CET,0.0 9.907 10.736 11.369 11.876 12.298 12.676 13.003 13.559 13.818 14.06 14.47 14.739 14.941 15.316 15.676 16.024 16.186 16.49 16.785 17.205 17.477 17.744 18.127 18.497 18.833 19.151 19.458 19.848 20.232 20.607 21.054 21.488 21.887 22.333 22.858 23.374 23.942 24.562 25.232 25.919 26.69 27.613 28.514 29.542 30.693 32.025 33.5 35.222 37.264 39.657 41.506 42.458 42.905 43.084 43.159 43.162 43.112 43.036 42.919 42.743 42.548 42.363 42.186 42.008 41.824 41.624 41.452 41.281 41.095 40.899 40.725 40.54 40.335 40.17 40.0 39.824 39.633 39.415 39.261 39.103 38.841 38.642 38.437 38.335 38.114 37.872 37.608 37.471 37.301 36.979 36.776 36.568 36.079 35.792 35.484 35.146 34.733 34.188 33.353 30.03 -5 ,27193 ,KEBNE ,17076907,Sat Dec 25 08:46:34 CET,Sat Dec 25 10:24:12 CET,0.0 6.964 7.748 8.355 8.854 9.269 9.647 9.982 10.569 10.842 11.098 11.515 11.78 11.983 12.373 12.751 13.096 13.261 13.584 13.89 14.316 14.577 14.842 15.222 15.573 15.915 16.238 16.554 16.961 17.34 17.708 18.158 18.594 19.011 19.483 20.01 20.519 21.071 21.651 22.274 22.931 23.67 24.538 25.405 26.435 27.59 28.932 30.476 32.273 34.336 36.826 38.744 39.709 40.18 40.374 40.434 40.41 40.334 40.226 40.05 39.862 39.689 39.512 39.346 39.159 38.944 38.716 38.537 38.383 38.195 37.981 37.787 37.591 37.394 37.234 37.062 36.857 36.62 36.375 36.198 36.006 35.717 35.532 35.34 35.233 35.005 34.776 34.526 34.383 34.197 33.902 33.723 33.533 33.089 32.835 32.559 32.237 31.834 31.316 30.595 27.496 -6 ,30193 ,KEBNE ,17076908,Sat Dec 25 08:46:34 CET,Sat Dec 25 10:21:18 CET,0.0 7.507 8.375 8.991 9.482 9.909 10.285 10.606 11.166 11.436 11.691 12.113 12.381 12.583 12.964 13.318 13.655 13.822 14.138 14.433 14.848 15.107 15.357 15.711 16.058 16.404 16.743 17.074 17.501 17.914 18.301 18.751 19.178 19.598 20.088 20.624 21.136 21.707 22.329 22.99 23.68 24.447 25.351 26.259 27.292 28.458 29.82 31.334 33.089 35.142 37.496 39.297 40.271 40.79 41.013 41.089 41.094 41.028 40.918 40.771 40.634 40.491 40.298 40.073 39.841 39.625 39.421 39.243 39.072 38.871 38.659 38.479 38.281 38.061 37.878 37.69 37.497 37.287 37.063 36.911 36.758 36.503 36.316 36.113 36.006 35.776 35.52 35.25 35.114 34.927 34.618 34.438 34.224 33.722 33.437 33.123 32.753 32.315 31.78 30.979 28.036 -7 ,3858 ,KEBNE ,17076909,Sat Dec 25 08:46:34 CET,Sat Dec 25 10:21:49 CET,0.0 3.701 4.495 5.087 5.559 5.963 6.334 6.681 7.305 7.574 7.813 8.188 8.436 8.638 9.035 9.404 9.751 9.918 10.23 10.531 10.955 11.215 11.471 11.837 12.19 12.536 12.863 13.177 13.585 13.971 14.348 14.807 15.239 15.646 16.129 16.671 17.183 17.74 18.329 18.954 19.619 20.386 21.293 22.2 23.235 24.379 25.69 27.179 28.938 31.009 33.426 35.261 36.169 36.595 36.76 36.834 36.834 36.747 36.645 36.483 36.312 36.137 35.925 35.723 35.533 35.338 35.109 34.892 34.707 34.505 34.265 34.057 33.845 33.616 33.428 33.222 32.998 32.77 32.526 32.34 32.151 31.879 31.678 31.445 31.33 31.093 30.831 30.559 30.417 30.235 29.94 29.758 29.553 29.09 28.82 28.504 28.173 27.806 27.296 26.504 22.862 -8 ,16029 ,KEBNE ,17076910,Sat Dec 25 08:47:37 CET,Sat Dec 25 10:22:28 CET,0.0 9.157 10.033 10.657 11.158 11.578 11.962 12.31 12.909 13.18 13.445 13.872 14.132 14.343 14.743 15.102 15.451 15.616 15.93 16.233 16.649 16.909 17.166 17.538 17.878 18.208 18.536 18.852 19.258 19.649 20.026 20.464 20.886 21.304 21.773 22.291 22.791 23.347 23.965 24.616 25.28 26.018 26.876 27.764 28.817 30.002 31.392 32.937 34.694 36.707 39.076 40.941 41.908 42.465 42.73 42.825 42.838 42.773 42.678 42.526 42.332 42.15 41.953 41.736 41.518 41.319 41.111 40.917 40.734 40.529 40.314 40.133 39.943 39.745 39.589 39.423 39.246 39.053 38.828 38.65 38.458 38.157 37.937 37.706 37.593 37.363 37.114 36.842 36.701 36.524 36.243 36.069 35.869 35.4 35.134 34.839 34.492 34.072 33.555 32.732 28.94 -9 ,4422 ,KEBNE ,17076911,Sat Dec 25 08:47:36 CET,Sat Dec 25 10:22:18 CET,0.0 4.798 5.677 6.319 6.84 7.285 7.671 8.01 8.613 8.876 9.126 9.541 9.804 10.018 10.414 10.761 11.092 11.255 11.568 11.871 12.293 12.559 12.821 13.192 13.536 13.87 14.191 14.506 14.91 15.289 15.659 16.111 16.542 16.952 17.421 17.947 18.449 18.991 19.59 20.221 20.87 21.62 22.493 23.381 24.451 25.633 26.979 28.521 30.315 32.366 34.789 36.657 37.579 38.026 38.251 38.333 38.291 38.201 38.076 37.916 37.758 37.585 37.416 37.234 37.055 36.89 36.673 36.458 36.287 36.11 35.906 35.734 35.558 35.36 35.188 35.005 34.815 34.616 34.406 34.264 34.111 33.858 33.681 33.492 33.391 33.158 32.906 32.639 32.497 32.307 31.991 31.805 31.605 31.152 30.896 30.614 30.282 29.892 29.386 28.593 24.585 -10 ,1751 ,KEBNE ,17076912,Sat Dec 25 08:47:36 CET,Sat Dec 25 10:22:40 CET,0.0 4.304 5.132 5.74 6.233 6.653 7.032 7.379 7.982 8.235 8.471 8.877 9.139 9.352 9.76 10.12 10.452 10.617 10.938 11.235 11.657 11.926 12.185 12.555 12.9 13.24 13.57 13.877 14.283 14.678 15.048 15.496 15.926 16.338 16.808 17.332 17.834 18.388 18.978 19.607 20.28 21.019 21.894 22.777 23.797 24.934 26.261 27.799 29.616 31.713 34.151 36.015 36.874 37.284 37.492 37.582 37.588 37.477 37.34 37.205 37.053 36.881 36.665 36.451 36.268 36.092 35.9 35.725 35.562 35.377 35.166 34.975 34.786 34.606 34.456 34.273 34.053 33.82 33.598 33.454 33.293 33.003 32.786 32.562 32.459 32.254 32.015 31.738 31.59 31.399 31.102 30.926 30.731 30.27 29.994 29.695 29.366 28.98 28.47 27.738 24.131 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_19.txt deleted file mode 100644 index 22b7432b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4443 ,TETRA ,17621630,Tue Nov 30 18:51:17 CET,Tue Nov 30 20:45:21 CET,0.0 2.341 2.971 3.473 3.9 4.279 4.627 4.96 5.576 5.861 6.138 6.491 6.909 7.152 7.625 8.091 8.542 8.763 9.205 9.632 10.256 10.669 11.079 11.673 12.247 12.812 13.362 13.903 14.621 15.328 16.018 16.86 17.692 18.514 19.493 20.621 21.717 22.962 24.349 25.874 27.535 29.454 31.781 34.209 37.116 40.47 44.575 49.535 55.762 63.731 74.434 84.638 91.477 96.369 100.059 102.968 105.224 107.097 108.582 109.895 110.894 111.69 112.388 113.0 113.523 113.96 114.378 114.739 115.025 115.275 115.509 115.685 115.826 115.952 116.039 116.099 116.149 116.194 116.235 116.254 116.245 116.181 116.144 116.117 116.097 116.02 115.917 115.794 115.71 115.564 115.397 115.265 115.108 114.732 114.49 114.207 113.881 113.468 112.951 112.185 108.186 -2 ,13054 ,TETRA ,17621631,Tue Nov 30 18:51:16 CET,Tue Nov 30 20:36:16 CET,0.0 2.086 2.726 3.189 3.579 3.948 4.288 4.612 5.21 5.479 5.74 6.082 6.502 6.741 7.204 7.656 8.098 8.316 8.747 9.163 9.771 10.168 10.554 11.116 11.672 12.221 12.764 13.302 14.004 14.69 15.369 16.203 17.028 17.85 18.814 19.919 21.009 22.24 23.625 25.141 26.775 28.69 31.007 33.405 36.325 39.753 43.904 48.865 55.08 63.042 73.95 84.344 91.209 96.129 99.83 102.735 104.971 106.77 108.162 109.405 110.343 111.104 111.795 112.417 112.939 113.369 113.775 114.098 114.352 114.58 114.784 114.93 115.061 115.175 115.261 115.347 115.384 115.398 115.437 115.457 115.46 115.429 115.385 115.324 115.291 115.202 115.076 114.923 114.847 114.706 114.541 114.433 114.294 113.943 113.716 113.438 113.111 112.69 112.154 111.359 108.031 -3 ,26344 ,TETRA ,17621632,Tue Nov 30 18:51:16 CET,Tue Nov 30 20:47:27 CET,0.0 2.615 3.264 3.759 4.184 4.566 4.916 5.244 5.857 6.146 6.423 6.773 7.191 7.431 7.9 8.357 8.802 9.019 9.442 9.854 10.461 10.854 11.24 11.812 12.37 12.919 13.463 14.003 14.709 15.397 16.079 16.919 17.761 18.606 19.6 20.736 21.854 23.126 24.528 26.036 27.672 29.599 31.935 34.358 37.293 40.729 44.901 49.889 56.109 64.094 74.928 85.149 92.014 96.955 100.63 103.519 105.763 107.606 109.043 110.317 111.308 112.11 112.819 113.425 113.925 114.349 114.756 115.09 115.361 115.615 115.826 115.971 116.118 116.264 116.361 116.447 116.511 116.55 116.567 116.559 116.551 116.526 116.472 116.411 116.374 116.283 116.177 116.041 115.955 115.817 115.68 115.565 115.413 115.039 114.836 114.572 114.235 113.838 113.334 112.591 109.254 -4 ,29981 ,TETRA ,17621633,Tue Nov 30 18:51:19 CET,Tue Nov 30 20:46:03 CET,0.0 1.718 2.361 2.865 3.294 3.666 4.008 4.323 4.914 5.192 5.457 5.801 6.231 6.481 6.979 7.459 7.907 8.125 8.545 8.962 9.58 9.981 10.377 10.964 11.529 12.082 12.637 13.183 13.891 14.59 15.275 16.115 16.949 17.779 18.768 19.897 20.996 22.236 23.621 25.149 26.789 28.671 30.987 33.425 36.391 39.838 44.027 49.016 55.213 63.234 74.108 84.383 91.279 96.281 99.992 102.885 105.136 106.981 108.422 109.73 110.745 111.533 112.23 112.871 113.415 113.851 114.276 114.601 114.848 115.082 115.297 115.477 115.632 115.75 115.838 115.914 115.978 116.028 116.039 116.043 116.044 116.016 115.995 115.947 115.905 115.81 115.716 115.609 115.533 115.399 115.26 115.14 115.014 114.704 114.505 114.265 113.978 113.602 113.122 112.419 109.362 -5 ,23467 ,TETRA ,17621634,Tue Nov 30 18:51:16 CET,Tue Nov 30 20:44:40 CET,0.0 2.713 3.338 3.844 4.274 4.643 4.99 5.315 5.914 6.197 6.469 6.814 7.235 7.484 7.973 8.448 8.903 9.122 9.556 9.986 10.595 10.99 11.386 11.967 12.532 13.091 13.645 14.2 14.928 15.631 16.317 17.163 18.001 18.838 19.831 20.962 22.078 23.329 24.7 26.204 27.861 29.788 32.084 34.494 37.443 40.861 45.01 50.002 56.315 64.41 75.18 85.347 92.229 97.209 100.839 103.688 105.922 107.705 109.097 110.343 111.334 112.165 112.891 113.518 114.062 114.511 114.932 115.276 115.543 115.776 115.992 116.159 116.306 116.447 116.534 116.599 116.661 116.704 116.735 116.742 116.727 116.688 116.657 116.606 116.577 116.505 116.389 116.238 116.148 115.998 115.837 115.705 115.551 115.218 115.003 114.715 114.415 114.073 113.562 112.748 106.629 -6 ,10110 ,TETRA ,17621635,Tue Nov 30 18:51:16 CET,Tue Nov 30 20:47:07 CET,0.0 1.904 2.533 3.037 3.504 3.935 4.303 4.64 5.294 5.601 5.896 6.268 6.699 6.954 7.45 7.929 8.393 8.621 9.062 9.488 10.111 10.517 10.916 11.506 12.091 12.666 13.225 13.775 14.505 15.226 15.921 16.784 17.64 18.469 19.456 20.592 21.705 22.948 24.338 25.865 27.517 29.455 31.794 34.225 37.177 40.636 44.788 49.717 55.934 63.984 74.865 85.079 91.941 96.868 100.513 103.409 105.68 107.492 108.92 110.21 111.209 112.033 112.759 113.382 113.911 114.344 114.742 115.061 115.299 115.532 115.759 115.916 116.061 116.199 116.293 116.367 116.412 116.465 116.527 116.546 116.55 116.531 116.506 116.469 116.44 116.377 116.298 116.163 116.063 115.907 115.701 115.561 115.416 115.061 114.84 114.551 114.203 113.803 113.282 112.421 107.741 -7 ,29890 ,TETRA ,17621636,Tue Nov 30 18:51:16 CET,Tue Nov 30 20:43:56 CET,0.0 2.018 2.634 3.103 3.502 3.866 4.196 4.502 5.073 5.347 5.611 5.949 6.365 6.611 7.084 7.536 7.971 8.186 8.606 9.013 9.616 10.007 10.395 10.969 11.529 12.077 12.62 13.156 13.857 14.545 15.234 16.085 16.918 17.747 18.731 19.851 20.953 22.197 23.577 25.097 26.746 28.668 31.009 33.451 36.393 39.812 43.972 48.985 55.303 63.428 74.397 84.667 91.519 96.522 100.258 103.15 105.376 107.214 108.671 109.956 110.908 111.708 112.418 112.986 113.488 113.924 114.334 114.675 114.936 115.165 115.372 115.523 115.662 115.787 115.86 115.91 115.942 115.964 115.964 115.953 115.939 115.9 115.857 115.792 115.755 115.684 115.591 115.45 115.358 115.21 115.025 114.887 114.727 114.351 114.127 113.859 113.519 113.094 112.618 111.899 108.799 -8 ,24291 ,TETRA ,17621637,Tue Nov 30 18:51:18 CET,Tue Nov 30 20:44:37 CET,0.0 2.942 3.589 4.099 4.533 4.917 5.258 5.577 6.184 6.467 6.745 7.108 7.526 7.765 8.229 8.681 9.126 9.344 9.768 10.185 10.797 11.192 11.58 12.151 12.717 13.278 13.829 14.368 15.075 15.77 16.466 17.333 18.185 19.021 20.012 21.15 22.262 23.505 24.87 26.379 28.034 29.953 32.239 34.649 37.585 41.022 45.228 50.226 56.476 64.477 75.257 85.473 92.259 97.131 100.736 103.554 105.797 107.616 109.048 110.345 111.345 112.188 112.91 113.483 113.973 114.398 114.823 115.183 115.445 115.675 115.9 116.072 116.217 116.326 116.4 116.479 116.548 116.592 116.589 116.569 116.555 116.53 116.499 116.447 116.416 116.341 116.25 116.147 116.083 115.955 115.801 115.671 115.517 115.148 114.939 114.685 114.341 113.93 113.445 112.713 103.796 -9 ,22461 ,TETRA ,17621638,Tue Nov 30 18:51:17 CET,Tue Nov 30 20:49:46 CET,0.0 2.216 2.877 3.371 3.795 4.185 4.529 4.855 5.46 5.739 6.015 6.39 6.823 7.079 7.565 8.038 8.502 8.726 9.168 9.599 10.222 10.622 11.018 11.612 12.187 12.751 13.307 13.85 14.57 15.284 15.99 16.862 17.721 18.56 19.554 20.693 21.817 23.067 24.444 25.968 27.611 29.532 31.876 34.317 37.29 40.756 44.947 49.974 56.199 64.163 74.944 85.157 92.037 96.999 100.687 103.584 105.82 107.615 109.019 110.298 111.306 112.124 112.851 113.472 113.99 114.438 114.862 115.21 115.476 115.722 115.959 116.114 116.264 116.41 116.49 116.556 116.611 116.64 116.649 116.656 116.662 116.645 116.608 116.558 116.532 116.457 116.364 116.248 116.168 116.031 115.888 115.771 115.626 115.261 115.029 114.754 114.447 114.065 113.5 112.538 108.279 -10 ,30579 ,TETRA ,17621639,Tue Nov 30 18:51:17 CET,Tue Nov 30 20:43:55 CET,0.0 2.725 3.394 3.885 4.309 4.688 5.037 5.366 5.968 6.252 6.529 6.882 7.301 7.544 8.021 8.479 8.926 9.146 9.575 9.986 10.586 10.983 11.373 11.949 12.513 13.069 13.622 14.166 14.889 15.597 16.282 17.131 17.982 18.823 19.806 20.938 22.05 23.303 24.698 26.22 27.876 29.811 32.172 34.615 37.533 40.93 45.034 50.003 56.289 64.294 75.13 85.402 92.264 97.175 100.836 103.697 105.913 107.73 109.145 110.422 111.417 112.242 112.977 113.608 114.129 114.538 114.937 115.272 115.52 115.758 115.976 116.132 116.268 116.396 116.475 116.519 116.536 116.55 116.571 116.569 116.55 116.492 116.442 116.397 116.369 116.283 116.169 116.039 115.963 115.82 115.66 115.544 115.411 115.072 114.86 114.613 114.281 113.837 113.313 112.515 107.34 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_26.txt deleted file mode 100644 index f43c2036..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6454 ,TETRA ,17621640,Tue Nov 30 18:51:19 CET,Tue Nov 30 20:44:33 CET,0.0 2.235 2.813 3.243 3.597 3.904 4.18 4.432 4.893 5.111 5.331 5.569 5.928 6.117 6.484 6.843 7.177 7.329 7.627 7.925 8.356 8.637 8.921 9.339 9.741 10.13 10.508 10.873 11.345 11.81 12.269 12.826 13.359 13.877 14.49 15.187 15.848 16.583 17.395 18.265 19.203 20.284 21.555 22.832 24.364 26.122 28.226 30.644 33.517 37.078 41.644 45.651 48.104 49.769 50.911 51.767 52.41 52.875 53.2 53.446 53.594 53.703 53.782 53.825 53.826 53.804 53.772 53.735 53.702 53.652 53.569 53.474 53.343 53.195 53.094 52.979 52.848 52.717 52.583 52.486 52.368 52.185 52.065 51.918 51.833 51.658 51.48 51.266 51.151 50.917 50.761 50.598 50.427 50.032 49.794 49.532 49.236 48.887 48.39 47.74 45.413 -2 ,20447 ,TETRA ,17621641,Tue Nov 30 18:51:17 CET,Tue Nov 30 20:44:21 CET,0.0 2.491 3.14 3.611 3.983 4.326 4.646 4.933 5.437 5.671 5.895 6.143 6.51 6.7 7.072 7.44 7.788 7.952 8.264 8.569 9.017 9.31 9.596 10.01 10.413 10.809 11.191 11.563 12.042 12.497 12.937 13.48 14.013 14.528 15.142 15.849 16.531 17.281 18.102 18.999 19.954 21.015 22.268 23.602 25.21 27.011 29.134 31.581 34.522 38.135 42.695 46.668 49.157 50.786 51.92 52.787 53.402 53.815 54.1 54.359 54.526 54.603 54.643 54.678 54.697 54.675 54.615 54.558 54.499 54.428 54.337 54.251 54.152 54.034 53.934 53.826 53.712 53.577 53.4 53.266 53.139 52.929 52.768 52.599 52.509 52.314 52.103 51.858 51.724 51.46 51.255 51.085 50.908 50.491 50.263 49.998 49.692 49.329 48.835 48.168 45.835 -3 ,29278 ,TETRA ,17621642,Tue Nov 30 18:51:18 CET,Tue Nov 30 20:51:14 CET,0.0 2.189 2.838 3.306 3.676 3.998 4.299 4.582 5.091 5.33 5.563 5.825 6.194 6.389 6.771 7.141 7.495 7.668 7.995 8.306 8.751 9.035 9.316 9.737 10.152 10.545 10.918 11.277 11.749 12.222 12.678 13.229 13.746 14.252 14.859 15.538 16.193 16.934 17.75 18.614 19.543 20.621 21.906 23.208 24.729 26.449 28.51 30.93 33.828 37.379 41.854 45.718 48.092 49.73 50.911 51.73 52.29 52.709 52.991 53.222 53.354 53.411 53.45 53.476 53.485 53.476 53.44 53.385 53.322 53.244 53.157 53.074 52.975 52.863 52.772 52.675 52.56 52.431 52.293 52.182 52.055 51.863 51.729 51.579 51.5 51.332 51.14 50.914 50.794 50.544 50.382 50.212 50.029 49.626 49.394 49.149 48.853 48.505 48.06 47.406 45.024 -4 ,2234 ,TETRA ,17621643,Tue Nov 30 18:51:18 CET,Tue Nov 30 20:43:22 CET,0.0 2.36 2.955 3.4 3.778 4.116 4.43 4.724 5.239 5.469 5.697 5.967 6.338 6.539 6.926 7.287 7.653 7.83 8.165 8.488 8.958 9.273 9.572 9.995 10.412 10.809 11.186 11.56 12.044 12.506 12.965 13.518 14.057 14.593 15.231 15.954 16.658 17.438 18.268 19.139 20.083 21.201 22.513 23.824 25.406 27.217 29.303 31.711 34.64 38.23 42.756 46.693 49.16 50.808 51.949 52.769 53.359 53.781 54.066 54.312 54.479 54.567 54.625 54.66 54.653 54.621 54.567 54.511 54.442 54.353 54.246 54.144 54.026 53.895 53.785 53.666 53.549 53.407 53.243 53.127 52.998 52.791 52.638 52.459 52.366 52.175 51.978 51.755 51.629 51.365 51.178 51.014 50.841 50.471 50.256 49.996 49.704 49.359 48.937 48.308 46.135 -5 ,17176 ,TETRA ,17621644,Tue Nov 30 18:51:19 CET,Tue Nov 30 20:44:00 CET,0.0 1.968 2.591 3.048 3.424 3.751 4.061 4.346 4.843 5.076 5.304 5.548 5.911 6.106 6.49 6.855 7.208 7.38 7.705 8.024 8.491 8.796 9.099 9.538 9.944 10.335 10.724 11.114 11.616 12.092 12.557 13.123 13.673 14.215 14.839 15.54 16.221 16.975 17.808 18.71 19.665 20.758 22.026 23.316 24.865 26.634 28.735 31.144 34.029 37.564 42.135 46.208 48.682 50.284 51.413 52.208 52.787 53.261 53.573 53.812 53.983 54.087 54.145 54.183 54.207 54.211 54.193 54.16 54.126 54.075 53.994 53.911 53.817 53.707 53.616 53.519 53.404 53.275 53.132 53.025 52.908 52.722 52.588 52.444 52.368 52.204 52.018 51.793 51.665 51.405 51.229 51.062 50.884 50.507 50.277 50.007 49.709 49.341 48.886 48.241 45.429 -6 ,16565 ,TETRA ,17621645,Tue Nov 30 18:51:18 CET,Tue Nov 30 20:45:56 CET,0.0 2.27 2.935 3.44 3.832 4.157 4.462 4.758 5.303 5.552 5.781 6.022 6.391 6.583 6.953 7.296 7.623 7.789 8.115 8.428 8.886 9.178 9.455 9.854 10.245 10.633 11.013 11.381 11.85 12.301 12.744 13.287 13.819 14.335 14.926 15.615 16.308 17.065 17.889 18.773 19.702 20.77 22.06 23.355 24.875 26.655 28.781 31.223 34.14 37.702 42.269 46.317 48.83 50.493 51.65 52.478 53.055 53.483 53.792 54.046 54.18 54.252 54.31 54.325 54.316 54.305 54.277 54.227 54.16 54.08 54.004 53.944 53.862 53.753 53.662 53.567 53.462 53.338 53.2 53.1 52.984 52.786 52.646 52.499 52.422 52.244 52.044 51.815 51.693 51.442 51.28 51.121 50.94 50.528 50.299 50.029 49.73 49.38 48.903 48.208 45.372 -7 ,17928 ,TETRA ,17621646,Tue Nov 30 18:51:19 CET,Tue Nov 30 20:44:20 CET,0.0 2.567 3.154 3.606 3.996 4.342 4.645 4.918 5.424 5.661 5.885 6.134 6.503 6.697 7.07 7.415 7.744 7.909 8.231 8.554 9.034 9.331 9.616 10.046 10.458 10.837 11.2 11.558 12.044 12.518 12.966 13.52 14.068 14.587 15.184 15.861 16.503 17.218 18.024 18.906 19.828 20.878 22.154 23.452 25.005 26.844 29.009 31.439 34.348 37.913 42.471 46.456 48.893 50.544 51.698 52.527 53.108 53.519 53.819 54.079 54.229 54.33 54.402 54.432 54.444 54.427 54.381 54.331 54.271 54.195 54.095 53.987 53.87 53.746 53.636 53.519 53.392 53.247 53.083 52.951 52.815 52.606 52.455 52.29 52.2 52.017 51.814 51.574 51.447 51.191 51.004 50.838 50.648 50.192 49.93 49.629 49.294 48.922 48.444 47.798 45.034 -8 ,29454 ,TETRA ,17621647,Tue Nov 30 18:51:20 CET,Tue Nov 30 20:42:33 CET,0.0 2.115 2.715 3.172 3.544 3.872 4.175 4.444 4.933 5.162 5.381 5.63 6.003 6.192 6.56 6.923 7.272 7.433 7.738 8.045 8.492 8.771 9.051 9.471 9.871 10.262 10.639 11.0 11.466 11.922 12.376 12.925 13.454 13.959 14.545 15.21 15.886 16.689 17.55 18.439 19.384 20.465 21.754 23.094 24.678 26.463 28.584 31.026 33.969 37.553 42.052 45.98 48.499 50.196 51.303 52.088 52.653 53.069 53.374 53.623 53.785 53.904 53.982 54.027 54.052 54.054 54.036 54.001 53.947 53.871 53.786 53.707 53.611 53.501 53.412 53.309 53.185 53.046 52.899 52.795 52.687 52.5 52.362 52.216 52.125 51.927 51.734 51.496 51.367 51.129 50.975 50.803 50.602 50.16 49.931 49.664 49.353 48.997 48.574 47.973 45.262 -9 ,16722 ,TETRA ,17621648,Tue Nov 30 18:51:18 CET,Tue Nov 30 20:45:57 CET,0.0 2.34 2.958 3.399 3.778 4.124 4.445 4.74 5.267 5.497 5.713 5.972 6.347 6.541 6.905 7.257 7.593 7.752 8.066 8.365 8.799 9.087 9.362 9.773 10.182 10.563 10.933 11.295 11.756 12.201 12.645 13.2 13.757 14.317 14.947 15.656 16.349 17.105 17.943 18.833 19.764 20.844 22.135 23.454 25.047 26.861 28.98 31.465 34.436 38.06 42.724 46.781 49.206 50.793 51.906 52.712 53.31 53.756 54.058 54.301 54.471 54.592 54.669 54.718 54.742 54.744 54.726 54.687 54.647 54.592 54.515 54.436 54.331 54.218 54.13 54.026 53.91 53.789 53.642 53.538 53.437 53.26 53.123 52.98 52.899 52.711 52.519 52.299 52.17 51.915 51.751 51.602 51.439 51.043 50.814 50.56 50.251 49.895 49.453 48.769 46.598 -10 ,10173 ,TETRA ,17621649,Tue Nov 30 18:51:19 CET,Tue Nov 30 20:43:30 CET,0.0 2.174 2.809 3.282 3.646 3.973 4.284 4.568 5.069 5.299 5.522 5.768 6.137 6.342 6.742 7.134 7.508 7.685 8.041 8.373 8.826 9.122 9.416 9.848 10.261 10.658 11.054 11.437 11.934 12.42 12.895 13.47 14.017 14.555 15.192 15.897 16.586 17.355 18.189 19.09 20.05 21.129 22.415 23.774 25.362 27.155 29.29 31.736 34.652 38.234 42.795 46.732 49.171 50.799 51.923 52.72 53.273 53.69 53.99 54.234 54.405 54.518 54.571 54.591 54.588 54.552 54.509 54.456 54.395 54.326 54.239 54.164 54.073 53.965 53.87 53.761 53.648 53.522 53.381 53.276 53.17 52.999 52.862 52.714 52.634 52.457 52.247 52.011 51.891 51.646 51.496 51.343 51.169 50.779 50.556 50.297 50.01 49.668 49.224 48.552 46.06 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_30_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_30_19.txt deleted file mode 100644 index 37533051..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_30_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20888 ,TETRA ,17621650,Tue Nov 30 18:51:21 CET,Tue Nov 30 20:43:17 CET,0.0 3.42 4.034 4.428 4.735 4.998 5.23 5.433 5.769 5.913 6.062 6.316 6.485 6.612 6.853 7.066 7.254 7.339 7.495 7.637 7.835 7.975 8.113 8.289 8.436 8.581 8.715 8.839 9.0 9.161 9.319 9.486 9.632 9.768 9.936 10.129 10.282 10.407 10.529 10.634 10.712 10.771 10.794 10.821 10.814 10.721 10.541 10.179 9.498 8.327 6.205 3.682 1.693 -0.01 -1.493 -2.803 -3.906 -4.884 -5.725 -6.561 -7.297 -7.963 -8.593 -9.19 -9.733 -10.223 -10.734 -11.195 -11.606 -12.026 -12.467 -12.835 -13.221 -13.633 -13.96 -14.29 -14.621 -14.97 -15.337 -15.588 -15.856 -16.281 -16.572 -16.88 -17.036 -17.362 -17.713 -18.115 -18.332 -18.596 -19.002 -19.249 -19.508 -20.064 -20.385 -20.761 -21.197 -21.672 -22.285 -23.168 -26.482 -2 ,29881 ,TETRA ,17621651,Tue Nov 30 18:51:19 CET,Tue Nov 30 20:41:57 CET,0.0 2.264 2.832 3.242 3.571 3.854 4.107 4.329 4.709 4.875 5.036 5.313 5.482 5.604 5.835 6.043 6.232 6.331 6.528 6.697 6.933 7.082 7.226 7.437 7.626 7.782 7.93 8.073 8.25 8.416 8.555 8.716 8.873 9.013 9.169 9.367 9.553 9.712 9.824 9.932 10.041 10.11 10.15 10.164 10.129 10.033 9.807 9.433 8.847 7.804 5.849 3.327 1.222 -0.514 -1.995 -3.298 -4.409 -5.418 -6.285 -7.136 -7.866 -8.514 -9.135 -9.729 -10.274 -10.77 -11.286 -11.748 -12.152 -12.576 -13.026 -13.391 -13.765 -14.176 -14.493 -14.811 -15.136 -15.477 -15.842 -16.093 -16.348 -16.756 -17.047 -17.345 -17.5 -17.826 -18.173 -18.546 -18.744 -18.994 -19.392 -19.65 -19.929 -20.536 -20.87 -21.25 -21.678 -22.18 -22.792 -23.623 -29.332 -3 ,31651 ,TETRA ,17621652,Tue Nov 30 18:51:22 CET,Tue Nov 30 20:42:57 CET,0.0 2.433 3.005 3.384 3.688 3.964 4.214 4.442 4.824 4.983 5.135 5.368 5.517 5.634 5.862 6.061 6.24 6.324 6.486 6.637 6.838 6.959 7.066 7.223 7.377 7.514 7.642 7.77 7.927 8.058 8.183 8.327 8.447 8.572 8.715 8.854 8.981 9.112 9.221 9.311 9.396 9.473 9.512 9.501 9.422 9.279 9.047 8.659 8.018 6.944 4.954 2.461 0.398 -1.308 -2.743 -4.041 -5.147 -6.13 -6.995 -7.861 -8.605 -9.238 -9.837 -10.416 -10.942 -11.431 -11.949 -12.399 -12.786 -13.196 -13.62 -13.963 -14.311 -14.691 -14.996 -15.307 -15.641 -15.99 -16.344 -16.597 -16.871 -17.293 -17.579 -17.875 -18.038 -18.385 -18.735 -19.107 -19.313 -19.585 -20.011 -20.27 -20.538 -21.125 -21.448 -21.818 -22.269 -22.811 -23.486 -24.413 -28.599 -4 ,4436 ,TETRA ,17621653,Tue Nov 30 18:51:23 CET,Tue Nov 30 20:40:37 CET,0.0 2.479 3.134 3.56 3.884 4.16 4.397 4.612 4.992 5.162 5.308 5.533 5.698 5.823 6.053 6.276 6.483 6.57 6.73 6.881 7.09 7.214 7.327 7.486 7.637 7.783 7.926 8.065 8.248 8.422 8.566 8.705 8.819 8.928 9.04 9.157 9.275 9.385 9.489 9.581 9.659 9.724 9.766 9.774 9.727 9.615 9.383 8.985 8.315 7.207 5.329 2.918 0.872 -0.847 -2.337 -3.648 -4.793 -5.817 -6.678 -7.533 -8.277 -8.928 -9.534 -10.104 -10.63 -11.12 -11.64 -12.094 -12.488 -12.893 -13.311 -13.664 -14.028 -14.404 -14.697 -15.007 -15.335 -15.675 -16.046 -16.312 -16.579 -16.996 -17.291 -17.602 -17.763 -18.1 -18.459 -18.83 -19.023 -19.278 -19.678 -19.924 -20.185 -20.791 -21.143 -21.52 -21.923 -22.444 -23.099 -23.935 -32.228 -5 ,10193 ,TETRA ,17621654,Tue Nov 30 18:52:09 CET,Tue Nov 30 20:45:22 CET,0.0 2.075 2.652 3.066 3.382 3.652 3.892 4.101 4.445 4.607 4.77 5.008 5.168 5.291 5.512 5.722 5.906 5.991 6.152 6.298 6.497 6.625 6.743 6.897 7.039 7.169 7.295 7.415 7.559 7.697 7.827 7.969 8.091 8.201 8.314 8.426 8.515 8.615 8.721 8.823 8.912 8.957 8.999 9.0 8.95 8.852 8.603 8.215 7.576 6.432 4.376 1.839 -0.23 -1.949 -3.391 -4.667 -5.757 -6.737 -7.585 -8.404 -9.104 -9.742 -10.352 -10.921 -11.445 -11.924 -12.424 -12.872 -13.268 -13.681 -14.112 -14.471 -14.839 -15.225 -15.53 -15.849 -16.189 -16.542 -16.906 -17.159 -17.414 -17.826 -18.128 -18.441 -18.598 -18.92 -19.265 -19.641 -19.842 -20.104 -20.499 -20.743 -21.009 -21.595 -21.928 -22.312 -22.757 -23.252 -23.856 -24.757 -29.557 -6 ,20701 ,TETRA ,17621655,Tue Nov 30 18:52:09 CET,Tue Nov 30 20:44:05 CET,0.0 3.108 3.737 4.172 4.493 4.762 4.985 5.181 5.533 5.689 5.834 6.059 6.207 6.322 6.557 6.757 6.93 7.016 7.17 7.312 7.507 7.628 7.742 7.903 8.051 8.184 8.311 8.436 8.586 8.724 8.856 9.001 9.134 9.258 9.384 9.507 9.614 9.743 9.887 9.999 10.088 10.168 10.223 10.272 10.275 10.219 10.055 9.638 8.962 7.849 5.802 3.316 1.245 -0.504 -1.956 -3.223 -4.321 -5.314 -6.172 -7.032 -7.792 -8.458 -9.058 -9.63 -10.178 -10.672 -11.185 -11.644 -12.053 -12.489 -12.925 -13.278 -13.647 -14.041 -14.357 -14.677 -15.003 -15.351 -15.701 -15.953 -16.227 -16.634 -16.917 -17.212 -17.368 -17.705 -18.069 -18.454 -18.651 -18.907 -19.32 -19.562 -19.808 -20.377 -20.714 -21.089 -21.518 -22.028 -22.639 -23.461 -28.369 -7 ,4321 ,TETRA ,17621656,Tue Nov 30 18:52:09 CET,Tue Nov 30 20:43:41 CET,0.0 2.723 3.325 3.743 4.069 4.335 4.567 4.78 5.142 5.298 5.441 5.667 5.814 5.925 6.142 6.332 6.512 6.607 6.779 6.93 7.125 7.239 7.347 7.502 7.65 7.791 7.927 8.045 8.184 8.314 8.428 8.572 8.71 8.822 8.941 9.063 9.166 9.283 9.393 9.492 9.589 9.679 9.791 9.911 9.943 9.852 9.643 9.283 8.704 7.592 5.494 3.01 1.036 -0.644 -2.105 -3.418 -4.539 -5.513 -6.368 -7.249 -7.987 -8.626 -9.231 -9.795 -10.322 -10.804 -11.295 -11.748 -12.141 -12.544 -12.969 -13.317 -13.684 -14.075 -14.371 -14.678 -15.012 -15.359 -15.71 -15.964 -16.229 -16.635 -16.923 -17.226 -17.381 -17.715 -18.077 -18.454 -18.659 -18.931 -19.345 -19.591 -19.851 -20.409 -20.73 -21.106 -21.531 -22.005 -22.607 -23.477 -27.209 -8 ,14605 ,TETRA ,17621657,Tue Nov 30 18:52:09 CET,Tue Nov 30 20:44:56 CET,0.0 3.224 3.888 4.335 4.647 4.921 5.159 5.364 5.702 5.849 5.992 6.215 6.365 6.472 6.663 6.839 7.001 7.077 7.225 7.357 7.543 7.661 7.765 7.907 8.041 8.167 8.283 8.389 8.526 8.654 8.766 8.883 8.985 9.099 9.224 9.338 9.44 9.54 9.622 9.706 9.783 9.833 9.881 9.866 9.791 9.669 9.451 9.058 8.344 7.138 5.04 2.525 0.452 -1.278 -2.729 -4.022 -5.149 -6.141 -6.996 -7.851 -8.586 -9.249 -9.869 -10.447 -10.986 -11.496 -12.029 -12.488 -12.887 -13.285 -13.7 -14.059 -14.437 -14.835 -15.135 -15.445 -15.783 -16.14 -16.511 -16.776 -17.044 -17.451 -17.745 -18.056 -18.216 -18.54 -18.888 -19.256 -19.443 -19.698 -20.103 -20.353 -20.619 -21.197 -21.525 -21.881 -22.29 -22.77 -23.397 -24.364 -29.486 -9 ,27993 ,TETRA ,17621658,Tue Nov 30 18:52:10 CET,Tue Nov 30 20:43:31 CET,0.0 2.765 3.358 3.769 4.101 4.391 4.64 4.86 5.256 5.428 5.589 5.842 6.004 6.126 6.361 6.572 6.763 6.847 7.006 7.157 7.367 7.499 7.617 7.767 7.906 8.039 8.167 8.287 8.428 8.56 8.68 8.814 8.936 9.042 9.163 9.297 9.41 9.526 9.65 9.754 9.835 9.91 9.955 9.952 9.937 9.867 9.642 9.284 8.692 7.594 5.544 3.115 1.132 -0.576 -2.002 -3.228 -4.324 -5.315 -6.174 -7.052 -7.797 -8.442 -9.049 -9.635 -10.19 -10.7 -11.216 -11.669 -12.071 -12.495 -12.938 -13.293 -13.657 -14.034 -14.328 -14.644 -14.978 -15.319 -15.676 -15.926 -16.189 -16.605 -16.901 -17.215 -17.378 -17.732 -18.091 -18.463 -18.656 -18.902 -19.28 -19.527 -19.793 -20.374 -20.709 -21.089 -21.515 -22.01 -22.608 -23.398 -30.364 -10 ,9855 ,TETRA ,17621659,Tue Nov 30 18:52:10 CET,Tue Nov 30 20:42:46 CET,0.0 2.377 2.967 3.38 3.706 3.975 4.207 4.417 4.777 4.937 5.089 5.321 5.481 5.603 5.812 6.0 6.18 6.264 6.422 6.586 6.821 6.947 7.059 7.215 7.365 7.501 7.625 7.753 7.906 8.035 8.153 8.286 8.411 8.531 8.651 8.771 8.871 8.961 9.058 9.163 9.263 9.342 9.386 9.406 9.375 9.276 9.065 8.702 8.122 7.044 5.02 2.579 0.524 -1.208 -2.67 -3.948 -5.059 -6.076 -6.921 -7.76 -8.487 -9.138 -9.761 -10.336 -10.865 -11.354 -11.889 -12.38 -12.803 -13.235 -13.696 -14.076 -14.464 -14.875 -15.186 -15.506 -15.85 -16.212 -16.592 -16.851 -17.119 -17.542 -17.838 -18.146 -18.311 -18.664 -19.041 -19.452 -19.662 -19.922 -20.338 -20.588 -20.852 -21.447 -21.798 -22.17 -22.583 -23.089 -23.7 -24.571 -31.823 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_23.txt deleted file mode 100644 index 049985b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11772 ,TETRA ,17621660,Tue Nov 30 18:52:10 CET,Tue Nov 30 20:43:51 CET,0.0 1.425 1.947 2.328 2.646 2.921 3.161 3.387 3.788 3.963 4.127 4.384 4.578 4.719 4.985 5.238 5.473 5.584 5.796 5.999 6.296 6.493 6.683 6.942 7.195 7.439 7.669 7.892 8.182 8.47 8.754 9.098 9.435 9.759 10.129 10.546 10.951 11.388 11.865 12.378 12.902 13.493 14.187 14.89 15.708 16.634 17.741 18.971 20.385 22.086 24.191 25.954 26.907 27.44 27.725 27.862 27.912 27.906 27.857 27.751 27.661 27.576 27.461 27.328 27.195 27.052 26.881 26.715 26.556 26.394 26.221 26.071 25.903 25.73 25.59 25.439 25.287 25.108 24.906 24.77 24.624 24.384 24.205 24.009 23.91 23.697 23.469 23.21 23.064 22.895 22.604 22.424 22.231 21.776 21.521 21.244 20.922 20.531 20.05 19.35 16.838 -2 ,31937 ,TETRA ,17621661,Tue Nov 30 18:52:13 CET,Tue Nov 30 20:46:00 CET,0.0 2.222 2.775 3.147 3.451 3.729 3.974 4.191 4.587 4.77 4.937 5.19 5.376 5.511 5.772 6.029 6.278 6.392 6.606 6.813 7.118 7.307 7.489 7.745 7.986 8.223 8.454 8.68 8.962 9.239 9.511 9.844 10.168 10.471 10.82 11.206 11.576 11.992 12.435 12.906 13.416 13.996 14.692 15.401 16.215 17.132 18.203 19.429 20.888 22.651 24.827 26.533 27.459 28.0 28.324 28.509 28.583 28.58 28.538 28.457 28.348 28.239 28.12 27.989 27.843 27.689 27.515 27.343 27.194 27.03 26.839 26.673 26.496 26.296 26.126 25.956 25.769 25.572 25.366 25.224 25.086 24.854 24.687 24.512 24.422 24.218 23.98 23.722 23.582 23.411 23.104 22.918 22.726 22.281 22.021 21.735 21.415 21.033 20.544 19.858 16.503 -3 ,14271 ,TETRA ,17621662,Tue Nov 30 18:52:10 CET,Tue Nov 30 20:42:39 CET,0.0 2.486 3.058 3.459 3.8 4.095 4.352 4.578 4.981 5.164 5.331 5.598 5.796 5.942 6.211 6.449 6.676 6.789 7.003 7.211 7.506 7.689 7.87 8.144 8.403 8.64 8.871 9.096 9.384 9.665 9.937 10.269 10.591 10.892 11.244 11.658 12.062 12.502 12.978 13.474 13.997 14.582 15.262 15.955 16.777 17.697 18.768 20.01 21.48 23.254 25.418 27.109 28.064 28.611 28.903 29.049 29.108 29.117 29.084 29.008 28.903 28.791 28.656 28.509 28.37 28.237 28.075 27.933 27.811 27.661 27.502 27.369 27.212 27.033 26.893 26.74 26.571 26.391 26.195 26.054 25.908 25.671 25.498 25.319 25.224 25.012 24.785 24.532 24.393 24.223 23.929 23.748 23.555 23.144 22.886 22.591 22.264 21.902 21.447 20.776 17.249 -4 ,8795 ,TETRA ,17621663,Tue Nov 30 18:52:11 CET,Tue Nov 30 20:45:04 CET,0.0 2.162 2.666 3.034 3.346 3.621 3.852 4.059 4.441 4.615 4.78 5.045 5.241 5.384 5.652 5.901 6.135 6.244 6.455 6.664 6.969 7.16 7.34 7.606 7.868 8.124 8.371 8.608 8.906 9.197 9.482 9.826 10.154 10.476 10.837 11.237 11.639 12.083 12.555 13.052 13.572 14.161 14.857 15.561 16.385 17.3 18.358 19.583 21.069 22.836 24.987 26.719 27.631 28.149 28.432 28.597 28.668 28.661 28.6 28.492 28.377 28.26 28.133 27.975 27.81 27.663 27.466 27.272 27.119 26.952 26.765 26.592 26.405 26.207 26.047 25.879 25.702 25.518 25.313 25.166 25.017 24.767 24.589 24.397 24.294 24.05 23.742 23.397 23.211 23.001 22.624 22.388 22.135 21.572 21.244 20.876 20.463 19.958 19.3 18.392 13.584 -5 ,31226 ,TETRA ,17621664,Tue Nov 30 18:52:13 CET,Tue Nov 30 20:46:59 CET,0.0 1.838 2.396 2.792 3.133 3.439 3.734 3.999 4.439 4.641 4.826 5.12 5.32 5.471 5.771 6.063 6.324 6.445 6.687 6.917 7.226 7.421 7.609 7.883 8.151 8.418 8.675 8.917 9.233 9.535 9.819 10.155 10.483 10.803 11.17 11.579 11.975 12.403 12.862 13.356 13.869 14.449 15.134 15.836 16.659 17.571 18.645 19.892 21.367 23.111 25.261 27.018 27.982 28.499 28.775 28.955 29.047 29.046 28.99 28.876 28.751 28.624 28.481 28.338 28.176 28.012 27.837 27.672 27.518 27.344 27.158 26.993 26.8 26.591 26.436 26.264 26.064 25.859 25.641 25.488 25.328 25.068 24.87 24.659 24.553 24.341 24.111 23.856 23.719 23.55 23.247 23.065 22.876 22.453 22.215 21.928 21.584 21.206 20.73 20.047 16.864 -6 ,14278 ,TETRA ,17621665,Tue Nov 30 18:52:11 CET,Tue Nov 30 20:44:02 CET,0.0 2.61 3.16 3.527 3.831 4.104 4.341 4.554 4.937 5.109 5.273 5.539 5.735 5.877 6.145 6.391 6.623 6.739 6.962 7.173 7.467 7.65 7.827 8.091 8.357 8.611 8.86 9.102 9.405 9.704 9.987 10.321 10.648 10.971 11.345 11.752 12.145 12.587 13.062 13.562 14.088 14.687 15.389 16.098 16.933 17.864 18.934 20.16 21.597 23.345 25.462 27.137 28.093 28.665 28.997 29.168 29.241 29.261 29.233 29.161 29.056 28.943 28.809 28.665 28.53 28.379 28.195 28.026 27.875 27.708 27.525 27.356 27.184 27.01 26.862 26.707 26.553 26.379 26.181 26.044 25.902 25.659 25.48 25.3 25.208 25.006 24.774 24.52 24.388 24.224 23.931 23.754 23.565 23.122 22.875 22.614 22.278 21.883 21.381 20.636 18.15 -7 ,4835 ,TETRA ,17621666,Tue Nov 30 18:52:12 CET,Tue Nov 30 20:45:05 CET,0.0 2.27 2.769 3.143 3.466 3.748 3.997 4.22 4.62 4.799 4.968 5.232 5.42 5.556 5.818 6.062 6.293 6.404 6.619 6.826 7.127 7.317 7.498 7.766 8.028 8.291 8.547 8.788 9.097 9.397 9.687 10.02 10.339 10.657 11.021 11.435 11.836 12.263 12.734 13.232 13.744 14.336 15.025 15.722 16.558 17.491 18.569 19.774 21.216 22.953 25.064 26.78 27.703 28.243 28.569 28.728 28.779 28.779 28.739 28.645 28.539 28.431 28.301 28.156 28.011 27.876 27.723 27.568 27.416 27.253 27.089 26.946 26.784 26.606 26.463 26.317 26.152 25.97 25.775 25.632 25.479 25.246 25.079 24.891 24.789 24.569 24.34 24.089 23.948 23.777 23.498 23.336 23.152 22.699 22.43 22.154 21.85 21.474 20.973 20.278 17.267 -8 ,19200 ,TETRA ,17621667,Tue Nov 30 18:52:11 CET,Tue Nov 30 20:43:56 CET,0.0 2.058 2.584 2.966 3.274 3.547 3.793 4.015 4.402 4.585 4.757 5.02 5.212 5.355 5.618 5.864 6.099 6.211 6.427 6.632 6.922 7.109 7.297 7.564 7.815 8.056 8.291 8.518 8.804 9.079 9.352 9.689 10.003 10.306 10.656 11.058 11.465 11.907 12.373 12.867 13.396 13.978 14.661 15.356 16.169 17.094 18.174 19.41 20.853 22.569 24.641 26.344 27.308 27.88 28.216 28.387 28.447 28.444 28.407 28.341 28.227 28.096 27.964 27.794 27.626 27.48 27.31 27.141 26.989 26.834 26.667 26.519 26.356 26.179 26.029 25.862 25.686 25.508 25.316 25.17 25.018 24.782 24.614 24.427 24.325 24.116 23.896 23.644 23.505 23.335 23.055 22.888 22.709 22.295 22.048 21.772 21.455 21.053 20.57 19.898 16.873 -9 ,5746 ,TETRA ,17621668,Tue Nov 30 18:52:12 CET,Tue Nov 30 20:45:35 CET,0.0 2.461 2.995 3.385 3.696 3.971 4.221 4.451 4.848 5.03 5.205 5.478 5.673 5.812 6.076 6.321 6.546 6.654 6.87 7.084 7.385 7.576 7.761 8.023 8.268 8.509 8.747 8.974 9.269 9.549 9.812 10.13 10.432 10.726 11.077 11.483 11.871 12.3 12.761 13.246 13.769 14.358 15.059 15.775 16.581 17.492 18.607 19.887 21.354 23.09 25.167 26.818 27.74 28.268 28.547 28.715 28.777 28.748 28.7 28.639 28.56 28.457 28.325 28.188 28.052 27.916 27.771 27.623 27.491 27.351 27.182 27.032 26.874 26.703 26.551 26.384 26.216 26.038 25.839 25.692 25.538 25.305 25.132 24.939 24.836 24.625 24.403 24.155 24.021 23.854 23.559 23.392 23.21 22.791 22.548 22.27 21.944 21.555 21.075 20.374 17.481 -10 ,26678 ,TETRA ,17621669,Tue Nov 30 18:52:11 CET,Tue Nov 30 20:39:39 CET,0.0 1.97 2.498 2.887 3.21 3.491 3.75 3.977 4.353 4.522 4.685 4.95 5.142 5.283 5.549 5.798 6.027 6.137 6.353 6.566 6.87 7.061 7.24 7.5 7.753 7.993 8.225 8.452 8.738 9.013 9.283 9.616 9.924 10.216 10.571 10.97 11.365 11.808 12.259 12.741 13.273 13.87 14.543 15.223 16.052 16.992 18.064 19.258 20.662 22.347 24.44 26.135 27.069 27.636 27.968 28.136 28.211 28.211 28.171 28.092 27.969 27.836 27.714 27.6 27.462 27.307 27.148 27.008 26.87 26.711 26.533 26.391 26.24 26.062 25.918 25.754 25.575 25.385 25.173 25.026 24.876 24.642 24.469 24.288 24.186 23.961 23.722 23.453 23.316 23.158 22.883 22.709 22.528 22.115 21.867 21.59 21.279 20.93 20.447 19.713 16.639 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_30.txt deleted file mode 100644 index 34439989..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15711 ,TETRA ,17621670,Tue Nov 30 18:52:11 CET,Tue Nov 30 20:36:11 CET,0.0 2.934 3.78 4.362 4.831 5.217 5.536 5.848 6.431 6.684 6.922 7.32 7.573 7.764 8.119 8.466 8.787 8.938 9.233 9.518 9.917 10.172 10.418 10.775 11.112 11.423 11.709 11.994 12.374 12.732 13.065 13.464 13.844 14.225 14.67 15.15 15.606 16.099 16.626 17.167 17.733 18.373 19.113 19.867 20.73 21.707 22.817 23.968 25.303 26.791 28.461 29.648 30.142 30.326 30.329 30.23 30.084 29.899 29.675 29.379 29.123 28.894 28.651 28.42 28.184 27.938 27.67 27.434 27.22 26.978 26.725 26.512 26.278 26.021 25.825 25.615 25.398 25.178 24.932 24.762 24.579 24.279 24.068 23.83 23.704 23.441 23.152 22.85 22.69 22.487 22.154 21.949 21.706 21.087 20.737 20.37 19.943 19.429 18.799 17.924 12.159 -2 ,18663 ,TETRA ,17621671,Tue Nov 30 18:52:11 CET,Tue Nov 30 20:46:07 CET,0.0 4.232 5.049 5.675 6.184 6.603 6.982 7.318 7.915 8.188 8.446 8.893 9.163 9.379 9.784 10.145 10.485 10.645 10.949 11.253 11.685 11.949 12.193 12.553 12.9 13.219 13.537 13.849 14.237 14.605 14.949 15.36 15.766 16.152 16.589 17.077 17.55 18.073 18.619 19.189 19.773 20.413 21.195 21.962 22.833 23.809 24.882 26.071 27.416 28.904 30.601 31.75 32.263 32.468 32.509 32.473 32.32 32.121 31.938 31.719 31.496 31.272 31.038 30.784 30.521 30.272 30.008 29.766 29.562 29.355 29.136 28.94 28.724 28.503 28.323 28.125 27.918 27.701 27.475 27.304 27.123 26.843 26.632 26.406 26.291 26.046 25.776 25.485 25.332 25.139 24.829 24.636 24.437 23.983 23.728 23.437 23.088 22.695 22.164 21.363 18.518 -3 ,9538 ,TETRA ,17621672,Tue Nov 30 18:52:11 CET,Tue Nov 30 20:45:32 CET,0.0 2.509 3.303 3.867 4.304 4.699 5.048 5.36 5.949 6.211 6.452 6.867 7.119 7.315 7.682 8.02 8.339 8.49 8.78 9.062 9.475 9.728 9.96 10.311 10.657 10.973 11.264 11.543 11.908 12.269 12.618 13.045 13.45 13.816 14.239 14.724 15.181 15.66 16.179 16.753 17.354 18.015 18.762 19.499 20.365 21.334 22.425 23.64 25.046 26.65 28.409 29.596 30.153 30.395 30.427 30.297 30.103 29.893 29.689 29.443 29.192 28.944 28.69 28.44 28.202 27.983 27.734 27.503 27.289 27.034 26.757 26.548 26.316 26.059 25.872 25.685 25.485 25.264 25.027 24.856 24.671 24.359 24.133 23.914 23.805 23.579 23.334 23.054 22.9 22.7 22.394 22.172 21.905 21.309 20.959 20.573 20.163 19.672 19.002 18.055 14.257 -4 ,25956 ,TETRA ,17621673,Tue Nov 30 18:52:12 CET,Tue Nov 30 20:37:54 CET,0.0 3.528 4.372 4.973 5.442 5.833 6.19 6.511 7.075 7.324 7.565 7.954 8.199 8.398 8.764 9.099 9.422 9.574 9.87 10.153 10.563 10.825 11.075 11.436 11.781 12.121 12.449 12.764 13.157 13.511 13.851 14.27 14.68 15.064 15.493 15.969 16.417 16.901 17.428 18.004 18.608 19.261 20.007 20.772 21.67 22.633 23.717 24.896 26.227 27.8 29.566 30.715 31.223 31.422 31.365 31.173 30.948 30.708 30.462 30.212 29.996 29.789 29.555 29.31 29.067 28.826 28.572 28.331 28.116 27.884 27.636 27.43 27.218 26.99 26.802 26.587 26.365 26.134 25.892 25.731 25.559 25.288 25.098 24.889 24.777 24.543 24.295 24.015 23.866 23.684 23.371 23.176 22.967 22.498 22.228 21.94 21.619 21.197 20.65 19.878 15.918 -5 ,7565 ,TETRA ,17621674,Tue Nov 30 18:52:12 CET,Tue Nov 30 20:43:39 CET,0.0 3.095 3.931 4.516 5.013 5.449 5.828 6.167 6.743 7.004 7.268 7.706 7.969 8.178 8.577 8.948 9.284 9.438 9.729 10.018 10.435 10.692 10.944 11.308 11.65 11.977 12.294 12.598 12.993 13.368 13.708 14.119 14.518 14.889 15.312 15.785 16.244 16.757 17.314 17.902 18.511 19.189 19.97 20.744 21.617 22.555 23.634 24.861 26.274 27.831 29.562 30.715 31.185 31.349 31.313 31.191 31.016 30.817 30.609 30.33 30.055 29.797 29.55 29.318 29.085 28.851 28.592 28.354 28.139 27.914 27.658 27.429 27.199 26.957 26.765 26.571 26.377 26.155 25.901 25.73 25.56 25.279 25.07 24.84 24.716 24.466 24.198 23.898 23.737 23.525 23.114 22.881 22.656 22.125 21.804 21.469 21.126 20.728 20.175 19.324 15.051 -6 ,16104 ,TETRA ,17621675,Tue Nov 30 18:52:15 CET,Tue Nov 30 20:43:41 CET,0.0 3.038 3.801 4.356 4.793 5.177 5.527 5.862 6.446 6.698 6.935 7.335 7.588 7.777 8.131 8.452 8.769 8.93 9.229 9.505 9.891 10.138 10.374 10.729 11.071 11.39 11.69 11.981 12.358 12.714 13.058 13.455 13.825 14.183 14.599 15.07 15.536 16.054 16.598 17.182 17.8 18.475 19.228 19.984 20.89 21.883 22.995 24.213 25.547 27.054 28.761 29.9 30.44 30.678 30.701 30.583 30.415 30.203 29.971 29.744 29.531 29.296 29.054 28.839 28.649 28.464 28.227 27.986 27.79 27.576 27.331 27.126 26.909 26.675 26.485 26.281 26.06 25.829 25.592 25.422 25.246 24.973 24.776 24.568 24.462 24.234 23.97 23.671 23.517 23.322 23.011 22.822 22.622 22.149 21.879 21.577 21.241 20.859 20.344 19.635 16.477 -7 ,7653 ,TETRA ,17621676,Tue Nov 30 18:52:17 CET,Tue Nov 30 20:46:03 CET,0.0 4.722 5.545 6.123 6.604 7.019 7.356 7.667 8.237 8.494 8.734 9.131 9.387 9.591 9.963 10.299 10.625 10.781 11.08 11.368 11.767 12.014 12.254 12.602 12.94 13.27 13.576 13.854 14.208 14.58 14.956 15.392 15.795 16.171 16.607 17.104 17.574 18.08 18.619 19.175 19.769 20.446 21.207 21.957 22.839 23.825 24.897 26.044 27.424 29.033 30.82 32.038 32.51 32.635 32.59 32.456 32.285 32.048 31.779 31.481 31.207 30.957 30.698 30.435 30.189 29.97 29.733 29.514 29.319 29.107 28.878 28.677 28.468 28.25 28.066 27.867 27.669 27.458 27.229 27.056 26.856 26.503 26.265 26.049 25.935 25.679 25.414 25.14 24.99 24.792 24.484 24.289 24.084 23.641 23.386 23.081 22.731 22.332 21.851 21.128 17.609 -8 ,11325 ,TETRA ,17621677,Tue Nov 30 18:52:13 CET,Tue Nov 30 20:45:53 CET,0.0 3.315 4.153 4.774 5.257 5.669 6.032 6.358 6.936 7.193 7.428 7.825 8.07 8.257 8.623 8.967 9.295 9.457 9.772 10.05 10.438 10.695 10.936 11.278 11.607 11.927 12.245 12.544 12.908 13.262 13.598 13.981 14.357 14.731 15.15 15.61 16.045 16.534 17.073 17.622 18.195 18.855 19.62 20.372 21.231 22.188 23.271 24.411 25.706 27.236 28.892 30.041 30.584 30.797 30.779 30.644 30.497 30.317 30.114 29.872 29.641 29.434 29.211 28.973 28.761 28.557 28.31 28.089 27.895 27.666 27.419 27.213 27.009 26.807 26.633 26.443 26.245 26.03 25.804 25.641 25.471 25.21 25.022 24.812 24.696 24.449 24.178 23.885 23.728 23.535 23.221 23.024 22.816 22.351 22.089 21.799 21.462 21.071 20.602 19.943 16.653 -9 ,19324 ,TETRA ,17621678,Tue Nov 30 18:52:13 CET,Tue Nov 30 20:45:46 CET,0.0 5.368 6.208 6.784 7.241 7.622 7.972 8.301 8.877 9.13 9.369 9.773 10.024 10.22 10.588 10.921 11.232 11.387 11.695 11.992 12.396 12.651 12.888 13.213 13.546 13.858 14.152 14.457 14.851 15.211 15.551 15.97 16.374 16.761 17.204 17.684 18.147 18.659 19.205 19.774 20.362 21.018 21.788 22.535 23.374 24.329 25.456 26.702 28.102 29.591 31.18 32.36 32.878 33.087 33.126 33.027 32.866 32.662 32.438 32.195 31.956 31.713 31.474 31.226 30.987 30.76 30.493 30.25 30.051 29.843 29.604 29.386 29.159 28.925 28.738 28.544 28.336 28.111 27.879 27.716 27.538 27.269 27.081 26.875 26.764 26.524 26.26 25.977 25.836 25.652 25.375 25.203 25.008 24.578 24.34 24.057 23.737 23.37 22.88 22.205 19.563 -10 ,30038 ,TETRA ,17621679,Tue Nov 30 18:52:13 CET,Tue Nov 30 20:43:00 CET,0.0 3.375 4.157 4.749 5.231 5.629 6.006 6.334 6.857 7.102 7.346 7.745 7.997 8.194 8.563 8.899 9.223 9.376 9.666 9.944 10.349 10.609 10.853 11.204 11.523 11.824 12.119 12.41 12.793 13.162 13.507 13.902 14.28 14.644 15.066 15.548 16.004 16.503 17.047 17.613 18.191 18.844 19.608 20.378 21.261 22.214 23.348 24.649 26.09 27.714 29.472 30.678 31.233 31.388 31.35 31.244 31.052 30.778 30.529 30.287 30.066 29.842 29.594 29.343 29.096 28.861 28.612 28.371 28.156 27.928 27.685 27.49 27.284 27.047 26.85 26.648 26.43 26.191 25.947 25.781 25.6 25.313 25.116 24.9 24.785 24.557 24.306 24.02 23.872 23.683 23.369 23.18 22.98 22.488 22.209 21.915 21.566 21.16 20.674 19.966 16.698 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_24.txt deleted file mode 100644 index ef67bab5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16675 ,TETRA ,17621680,Tue Nov 30 18:52:14 CET,Tue Nov 30 20:42:49 CET,0.0 2.325 2.918 3.322 3.659 3.959 4.206 4.41 4.756 4.912 5.055 5.285 5.422 5.532 5.742 5.944 6.124 6.206 6.362 6.507 6.703 6.818 6.929 7.089 7.232 7.366 7.488 7.592 7.716 7.83 7.935 8.07 8.186 8.28 8.38 8.474 8.553 8.626 8.677 8.713 8.727 8.713 8.643 8.526 8.362 8.123 7.738 7.142 6.221 4.739 2.248 -0.574 -2.761 -4.567 -6.069 -7.378 -8.474 -9.455 -10.283 -11.073 -11.765 -12.378 -12.949 -13.497 -14.002 -14.448 -14.917 -15.337 -15.691 -16.048 -16.415 -16.719 -17.028 -17.351 -17.608 -17.867 -18.136 -18.408 -18.687 -18.879 -19.077 -19.404 -19.632 -19.865 -19.988 -20.245 -20.515 -20.792 -20.937 -21.138 -21.411 -21.586 -21.769 -22.176 -22.414 -22.672 -22.97 -23.314 -23.713 -24.26 -26.648 -2 ,32205 ,TETRA ,17621681,Tue Nov 30 18:52:13 CET,Tue Nov 30 20:43:38 CET,0.0 2.267 2.78 3.135 3.417 3.656 3.869 4.059 4.375 4.511 4.638 4.857 4.993 5.097 5.283 5.445 5.597 5.672 5.814 5.94 6.123 6.235 6.335 6.472 6.597 6.721 6.845 6.959 7.092 7.205 7.301 7.413 7.521 7.624 7.713 7.792 7.86 7.921 7.965 7.989 8.018 8.029 7.999 7.902 7.718 7.442 7.016 6.388 5.44 3.972 1.573 -1.212 -3.44 -5.269 -6.785 -8.089 -9.194 -10.172 -10.986 -11.777 -12.46 -13.067 -13.641 -14.18 -14.69 -15.154 -15.624 -16.041 -16.404 -16.776 -17.157 -17.476 -17.807 -18.146 -18.409 -18.689 -18.98 -19.277 -19.582 -19.794 -20.02 -20.377 -20.62 -20.872 -21.003 -21.276 -21.562 -21.86 -22.014 -22.22 -22.485 -22.654 -22.832 -23.233 -23.463 -23.713 -23.99 -24.308 -24.685 -25.202 -27.341 -3 ,28419 ,TETRA ,17621682,Tue Nov 30 18:52:16 CET,Tue Nov 30 20:45:11 CET,0.0 1.678 2.161 2.511 2.793 3.028 3.24 3.437 3.763 3.905 4.041 4.262 4.392 4.494 4.692 4.874 5.037 5.111 5.243 5.359 5.531 5.639 5.739 5.879 6.002 6.118 6.226 6.323 6.439 6.538 6.628 6.728 6.824 6.912 6.985 7.053 7.118 7.168 7.192 7.213 7.223 7.193 7.126 7.031 6.86 6.568 6.147 5.577 4.683 3.26 0.892 -1.893 -4.099 -5.92 -7.451 -8.76 -9.881 -10.882 -11.725 -12.559 -13.261 -13.873 -14.443 -14.973 -15.471 -15.917 -16.362 -16.761 -17.114 -17.478 -17.86 -18.178 -18.495 -18.824 -19.085 -19.354 -19.644 -19.947 -20.252 -20.461 -20.687 -21.042 -21.287 -21.549 -21.685 -21.957 -22.235 -22.537 -22.7 -22.917 -23.204 -23.383 -23.577 -24.006 -24.24 -24.498 -24.773 -25.08 -25.454 -25.988 -27.959 -4 ,9974 ,TETRA ,17621683,Tue Nov 30 18:52:18 CET,Tue Nov 30 20:43:56 CET,0.0 2.41 2.895 3.239 3.544 3.81 4.038 4.225 4.556 4.701 4.831 5.043 5.175 5.28 5.47 5.642 5.805 5.885 6.034 6.165 6.339 6.443 6.544 6.69 6.823 6.954 7.064 7.152 7.261 7.363 7.461 7.562 7.648 7.726 7.802 7.886 7.947 7.999 8.051 8.076 8.086 8.061 7.996 7.905 7.742 7.491 7.065 6.427 5.447 3.985 1.579 -1.205 -3.399 -5.244 -6.77 -8.081 -9.179 -10.139 -10.962 -11.765 -12.434 -13.019 -13.569 -14.084 -14.56 -14.988 -15.443 -15.848 -16.186 -16.539 -16.904 -17.2 -17.51 -17.833 -18.081 -18.333 -18.599 -18.878 -19.16 -19.356 -19.567 -19.902 -20.132 -20.364 -20.488 -20.749 -21.008 -21.284 -21.432 -21.634 -21.91 -22.091 -22.289 -22.716 -22.947 -23.189 -23.458 -23.796 -24.22 -24.763 -26.637 -5 ,5050 ,TETRA ,17621684,Tue Nov 30 18:53:03 CET,Tue Nov 30 20:51:56 CET,0.0 1.715 2.231 2.618 2.916 3.153 3.355 3.53 3.853 4.002 4.131 4.343 4.479 4.582 4.769 4.945 5.101 5.171 5.303 5.432 5.605 5.706 5.804 5.941 6.075 6.215 6.347 6.461 6.585 6.697 6.813 6.946 7.062 7.15 7.235 7.338 7.416 7.473 7.527 7.571 7.583 7.561 7.517 7.417 7.234 6.983 6.593 6.009 5.072 3.605 1.225 -1.595 -3.805 -5.628 -7.13 -8.429 -9.546 -10.522 -11.344 -12.155 -12.848 -13.456 -14.019 -14.553 -15.048 -15.482 -15.932 -16.344 -16.696 -17.047 -17.421 -17.728 -18.039 -18.36 -18.611 -18.871 -19.139 -19.417 -19.712 -19.916 -20.119 -20.44 -20.667 -20.904 -21.026 -21.279 -21.546 -21.833 -21.985 -22.187 -22.459 -22.637 -22.822 -23.221 -23.442 -23.69 -23.971 -24.292 -24.683 -25.199 -27.327 -6 ,25189 ,TETRA ,17621685,Tue Nov 30 18:53:03 CET,Tue Nov 30 20:43:13 CET,0.0 2.0 2.496 2.843 3.106 3.332 3.516 3.674 3.974 4.109 4.228 4.416 4.531 4.624 4.79 4.94 5.085 5.154 5.29 5.42 5.609 5.724 5.828 5.98 6.106 6.219 6.325 6.415 6.532 6.633 6.717 6.806 6.885 6.953 7.017 7.093 7.161 7.211 7.24 7.25 7.237 7.187 7.097 6.956 6.766 6.496 6.069 5.438 4.476 3.005 0.59 -2.211 -4.422 -6.226 -7.731 -9.029 -10.113 -11.061 -11.882 -12.697 -13.387 -13.996 -14.564 -15.08 -15.548 -15.977 -16.43 -16.832 -17.181 -17.542 -17.914 -18.215 -18.518 -18.824 -19.061 -19.308 -19.558 -19.815 -20.093 -20.281 -20.473 -20.779 -20.993 -21.218 -21.332 -21.571 -21.821 -22.08 -22.217 -22.411 -22.67 -22.832 -23.001 -23.374 -23.583 -23.818 -24.078 -24.367 -24.72 -25.198 -26.909 -7 ,6853 ,TETRA ,17621686,Tue Nov 30 18:53:03 CET,Tue Nov 30 20:46:26 CET,0.0 3.148 3.649 3.995 4.267 4.498 4.704 4.897 5.241 5.384 5.512 5.725 5.859 5.965 6.157 6.336 6.499 6.576 6.73 6.869 7.057 7.178 7.279 7.411 7.545 7.672 7.783 7.884 8.003 8.108 8.201 8.293 8.378 8.454 8.533 8.631 8.713 8.772 8.822 8.854 8.859 8.856 8.797 8.677 8.505 8.23 7.794 7.179 6.217 4.761 2.377 -0.418 -2.661 -4.487 -5.986 -7.278 -8.386 -9.379 -10.21 -11.021 -11.705 -12.303 -12.871 -13.414 -13.914 -14.362 -14.828 -15.244 -15.6 -15.964 -16.336 -16.644 -16.967 -17.305 -17.564 -17.84 -18.134 -18.427 -18.732 -18.938 -19.154 -19.492 -19.719 -19.97 -20.102 -20.374 -20.658 -20.955 -21.111 -21.318 -21.593 -21.768 -21.952 -22.356 -22.58 -22.832 -23.112 -23.431 -23.82 -24.356 -26.781 -8 ,11491 ,TETRA ,17621687,Tue Nov 30 18:53:05 CET,Tue Nov 30 20:43:30 CET,0.0 1.977 2.492 2.859 3.162 3.411 3.616 3.805 4.129 4.267 4.395 4.607 4.742 4.842 5.03 5.2 5.352 5.424 5.557 5.683 5.868 5.983 6.081 6.219 6.349 6.468 6.576 6.674 6.791 6.896 6.991 7.095 7.2 7.282 7.36 7.446 7.508 7.563 7.618 7.646 7.647 7.637 7.574 7.459 7.286 7.01 6.571 5.905 4.906 3.442 1.08 -1.737 -3.969 -5.747 -7.232 -8.526 -9.611 -10.556 -11.366 -12.179 -12.865 -13.454 -14.007 -14.522 -14.996 -15.423 -15.868 -16.275 -16.622 -16.967 -17.319 -17.619 -17.94 -18.264 -18.505 -18.756 -19.017 -19.284 -19.563 -19.763 -19.97 -20.284 -20.51 -20.747 -20.866 -21.107 -21.368 -21.653 -21.803 -22.012 -22.306 -22.492 -22.686 -23.098 -23.322 -23.57 -23.854 -24.181 -24.581 -25.146 -27.457 -9 ,6233 ,TETRA ,17621688,Tue Nov 30 18:53:03 CET,Tue Nov 30 20:46:30 CET,0.0 2.087 2.604 2.979 3.261 3.503 3.717 3.902 4.205 4.338 4.469 4.688 4.827 4.938 5.137 5.311 5.469 5.539 5.671 5.79 5.959 6.066 6.167 6.306 6.428 6.549 6.663 6.764 6.881 6.985 7.087 7.198 7.301 7.396 7.482 7.56 7.628 7.687 7.728 7.76 7.775 7.773 7.736 7.644 7.456 7.204 6.827 6.196 5.232 3.771 1.362 -1.474 -3.709 -5.548 -7.09 -8.419 -9.545 -10.547 -11.39 -12.21 -12.89 -13.482 -14.056 -14.609 -15.121 -15.571 -16.022 -16.407 -16.738 -17.087 -17.451 -17.755 -18.063 -18.383 -18.636 -18.901 -19.174 -19.444 -19.722 -19.917 -20.126 -20.452 -20.671 -20.901 -21.025 -21.286 -21.556 -21.831 -21.974 -22.179 -22.463 -22.647 -22.842 -23.258 -23.494 -23.754 -24.049 -24.406 -24.814 -25.326 -27.751 -10 ,32637 ,TETRA ,17621689,Tue Nov 30 18:53:06 CET,Tue Nov 30 20:48:36 CET,0.0 2.481 3.013 3.378 3.667 3.925 4.148 4.326 4.649 4.794 4.923 5.14 5.269 5.376 5.585 5.758 5.91 5.982 6.119 6.245 6.416 6.52 6.617 6.758 6.888 7.009 7.119 7.218 7.341 7.452 7.549 7.658 7.751 7.832 7.927 8.016 8.072 8.129 8.179 8.198 8.2 8.176 8.095 7.995 7.849 7.575 7.163 6.559 5.571 4.108 1.719 -1.038 -3.236 -5.066 -6.571 -7.875 -8.99 -9.956 -10.772 -11.596 -12.298 -12.9 -13.461 -13.995 -14.482 -14.913 -15.358 -15.754 -16.102 -16.458 -16.822 -17.119 -17.432 -17.76 -18.009 -18.263 -18.527 -18.8 -19.085 -19.288 -19.498 -19.817 -20.034 -20.266 -20.39 -20.643 -20.909 -21.195 -21.345 -21.554 -21.844 -22.019 -22.206 -22.63 -22.865 -23.118 -23.401 -23.73 -24.11 -24.641 -26.985 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_31.txt deleted file mode 100644 index 036c09ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7659 ,TETRA ,17621690,Tue Nov 30 18:53:04 CET,Tue Nov 30 20:51:24 CET,0.0 2.616 3.221 3.628 3.96 4.246 4.501 4.73 5.126 5.303 5.464 5.733 5.893 6.018 6.241 6.456 6.658 6.752 6.933 7.103 7.338 7.48 7.619 7.813 7.996 8.169 8.333 8.487 8.678 8.854 9.014 9.203 9.375 9.529 9.694 9.868 10.022 10.165 10.29 10.411 10.527 10.631 10.718 10.76 10.749 10.717 10.576 10.245 9.643 8.573 6.678 4.405 2.551 0.978 -0.356 -1.521 -2.523 -3.423 -4.202 -4.974 -5.624 -6.201 -6.744 -7.256 -7.741 -8.169 -8.617 -9.034 -9.391 -9.765 -10.155 -10.467 -10.777 -11.098 -11.35 -11.607 -11.883 -12.175 -12.471 -12.678 -12.898 -13.251 -13.496 -13.753 -13.89 -14.162 -14.443 -14.753 -14.917 -15.136 -15.448 -15.63 -15.817 -16.247 -16.489 -16.753 -17.067 -17.424 -17.847 -18.445 -21.193 -2 ,15104 ,TETRA ,17621691,Tue Nov 30 18:53:04 CET,Tue Nov 30 20:42:17 CET,0.0 3.18 3.759 4.161 4.497 4.794 5.034 5.237 5.625 5.799 5.949 6.201 6.352 6.472 6.699 6.907 7.101 7.189 7.348 7.501 7.729 7.872 7.993 8.163 8.336 8.499 8.644 8.784 8.962 9.124 9.28 9.468 9.634 9.777 9.937 10.101 10.243 10.378 10.514 10.648 10.749 10.858 10.969 11.017 11.005 10.922 10.75 10.464 9.932 8.966 7.18 4.934 3.07 1.513 0.206 -0.951 -1.958 -2.869 -3.639 -4.385 -5.035 -5.606 -6.148 -6.666 -7.145 -7.572 -8.007 -8.4 -8.741 -9.104 -9.488 -9.799 -10.116 -10.448 -10.708 -10.98 -11.267 -11.563 -11.875 -12.091 -12.302 -12.641 -12.889 -13.128 -13.243 -13.48 -13.739 -14.018 -14.164 -14.366 -14.649 -14.825 -15.014 -15.434 -15.676 -15.938 -16.231 -16.564 -16.96 -17.473 -19.629 -3 ,2917 ,TETRA ,17621692,Tue Nov 30 18:53:04 CET,Tue Nov 30 20:48:58 CET,0.0 2.18 2.797 3.225 3.567 3.875 4.151 4.375 4.761 4.935 5.097 5.363 5.514 5.641 5.882 6.096 6.294 6.386 6.553 6.72 6.958 7.097 7.232 7.426 7.596 7.747 7.89 8.025 8.199 8.359 8.509 8.679 8.836 8.982 9.144 9.315 9.468 9.638 9.805 9.944 10.065 10.167 10.257 10.308 10.311 10.27 10.117 9.817 9.266 8.257 6.421 4.144 2.258 0.641 -0.714 -1.883 -2.886 -3.778 -4.537 -5.294 -5.944 -6.515 -7.057 -7.568 -8.044 -8.485 -8.941 -9.325 -9.66 -10.014 -10.376 -10.681 -10.996 -11.309 -11.547 -11.795 -12.053 -12.328 -12.613 -12.809 -13.019 -13.346 -13.573 -13.809 -13.928 -14.182 -14.456 -14.747 -14.896 -15.094 -15.375 -15.549 -15.735 -16.152 -16.385 -16.648 -16.936 -17.271 -17.689 -18.239 -20.55 -4 ,23371 ,TETRA ,17621693,Tue Nov 30 18:53:04 CET,Tue Nov 30 20:45:07 CET,0.0 2.211 2.867 3.362 3.746 4.065 4.362 4.629 5.069 5.255 5.435 5.741 5.912 6.053 6.31 6.544 6.761 6.86 7.053 7.239 7.49 7.645 7.786 7.98 8.162 8.335 8.495 8.651 8.851 9.016 9.168 9.348 9.511 9.662 9.827 10.009 10.171 10.331 10.488 10.633 10.769 10.887 10.969 11.013 10.995 10.895 10.72 10.432 9.888 8.883 7.084 4.841 2.94 1.331 -0.009 -1.147 -2.135 -3.034 -3.806 -4.571 -5.205 -5.775 -6.327 -6.829 -7.294 -7.721 -8.161 -8.554 -8.903 -9.264 -9.617 -9.914 -10.229 -10.546 -10.786 -11.038 -11.302 -11.585 -11.881 -12.076 -12.271 -12.594 -12.823 -13.056 -13.179 -13.439 -13.708 -13.998 -14.151 -14.353 -14.64 -14.818 -15.005 -15.418 -15.642 -15.902 -16.208 -16.551 -16.949 -17.535 -19.608 -5 ,23391 ,TETRA ,17621694,Tue Nov 30 18:53:04 CET,Tue Nov 30 20:44:18 CET,0.0 3.058 3.618 4.027 4.367 4.653 4.892 5.114 5.517 5.68 5.829 6.079 6.229 6.354 6.571 6.771 6.964 7.05 7.211 7.373 7.592 7.723 7.849 8.033 8.207 8.358 8.49 8.619 8.779 8.926 9.068 9.228 9.367 9.493 9.63 9.777 9.906 10.03 10.132 10.221 10.323 10.412 10.489 10.546 10.554 10.499 10.341 10.035 9.471 8.475 6.645 4.384 2.518 0.937 -0.396 -1.563 -2.576 -3.498 -4.271 -5.015 -5.644 -6.218 -6.769 -7.262 -7.723 -8.151 -8.588 -8.976 -9.311 -9.665 -10.029 -10.332 -10.656 -10.99 -11.251 -11.517 -11.784 -12.053 -12.324 -12.519 -12.725 -13.048 -13.274 -13.508 -13.63 -13.886 -14.158 -14.451 -14.611 -14.823 -15.116 -15.297 -15.485 -15.907 -16.148 -16.408 -16.689 -17.025 -17.429 -17.979 -20.647 -6 ,14699 ,TETRA ,17621695,Tue Nov 30 18:53:06 CET,Tue Nov 30 20:44:48 CET,0.0 2.689 3.302 3.738 4.072 4.369 4.637 4.865 5.265 5.452 5.621 5.906 6.075 6.213 6.457 6.668 6.867 6.963 7.139 7.295 7.515 7.655 7.783 7.957 8.117 8.269 8.417 8.556 8.72 8.869 9.009 9.169 9.321 9.458 9.609 9.78 9.931 10.075 10.218 10.354 10.474 10.577 10.669 10.708 10.688 10.622 10.484 10.195 9.624 8.616 6.797 4.599 2.749 1.184 -0.169 -1.341 -2.313 -3.177 -3.938 -4.693 -5.326 -5.885 -6.424 -6.936 -7.407 -7.832 -8.272 -8.665 -8.997 -9.344 -9.714 -10.02 -10.337 -10.67 -10.939 -11.213 -11.489 -11.786 -12.102 -12.321 -12.544 -12.887 -13.127 -13.38 -13.512 -13.784 -14.074 -14.378 -14.531 -14.738 -15.037 -15.238 -15.454 -15.912 -16.188 -16.488 -16.804 -17.151 -17.55 -18.117 -20.453 -7 ,1572 ,TETRA ,17621696,Tue Nov 30 18:53:04 CET,Tue Nov 30 20:37:54 CET,0.0 2.593 3.221 3.649 3.998 4.298 4.566 4.805 5.228 5.441 5.658 6.026 6.228 6.398 6.71 6.995 7.256 7.385 7.633 7.864 8.169 8.334 8.48 8.71 8.916 9.094 9.26 9.41 9.602 9.777 9.947 10.137 10.307 10.457 10.612 10.782 10.93 11.071 11.213 11.342 11.451 11.566 11.682 11.759 11.789 11.743 11.576 11.24 10.676 9.755 7.976 5.707 3.834 2.258 0.954 -0.207 -1.198 -2.095 -2.875 -3.627 -4.273 -4.847 -5.382 -5.888 -6.36 -6.78 -7.207 -7.584 -7.918 -8.263 -8.612 -8.898 -9.191 -9.498 -9.74 -9.988 -10.248 -10.52 -10.801 -11.002 -11.207 -11.525 -11.749 -11.982 -12.102 -12.349 -12.623 -12.914 -13.063 -13.267 -13.563 -13.748 -13.938 -14.349 -14.579 -14.831 -15.12 -15.454 -15.856 -16.417 -19.073 -8 ,15969 ,TETRA ,17621697,Tue Nov 30 18:53:04 CET,Tue Nov 30 20:43:32 CET,0.0 2.275 2.885 3.324 3.665 3.952 4.208 4.435 4.836 5.009 5.167 5.452 5.613 5.742 5.989 6.217 6.448 6.568 6.793 6.984 7.222 7.373 7.522 7.73 7.915 8.08 8.24 8.393 8.58 8.742 8.898 9.102 9.297 9.457 9.618 9.791 9.942 10.093 10.237 10.367 10.488 10.606 10.716 10.783 10.797 10.725 10.565 10.254 9.682 8.734 6.966 4.724 2.881 1.346 0.032 -1.149 -2.19 -3.119 -3.879 -4.619 -5.279 -5.865 -6.4 -6.9 -7.36 -7.766 -8.194 -8.58 -8.903 -9.237 -9.591 -9.889 -10.189 -10.495 -10.74 -11.001 -11.272 -11.546 -11.827 -12.019 -12.223 -12.546 -12.772 -13.003 -13.123 -13.377 -13.639 -13.92 -14.068 -14.264 -14.555 -14.743 -14.937 -15.361 -15.592 -15.847 -16.138 -16.467 -16.857 -17.391 -20.253 -9 ,27440 ,TETRA ,17621698,Tue Nov 30 18:53:07 CET,Tue Nov 30 20:44:56 CET,0.0 2.208 2.833 3.267 3.629 3.938 4.205 4.441 4.828 4.994 5.153 5.427 5.588 5.713 5.945 6.166 6.369 6.463 6.64 6.801 7.027 7.172 7.302 7.484 7.66 7.825 7.976 8.108 8.279 8.443 8.587 8.745 8.881 9.012 9.158 9.307 9.442 9.575 9.707 9.832 9.934 10.016 10.088 10.151 10.186 10.137 9.959 9.645 9.095 8.106 6.291 4.037 2.173 0.62 -0.693 -1.89 -2.925 -3.814 -4.562 -5.3 -5.926 -6.469 -6.987 -7.474 -7.91 -8.317 -8.749 -9.119 -9.431 -9.754 -10.093 -10.378 -10.669 -10.97 -11.208 -11.453 -11.704 -11.973 -12.253 -12.44 -12.635 -12.95 -13.172 -13.404 -13.524 -13.756 -14.001 -14.271 -14.412 -14.606 -14.876 -15.039 -15.213 -15.615 -15.837 -16.068 -16.321 -16.621 -17.001 -17.563 -19.884 -10 ,32693 ,TETRA ,17621699,Tue Nov 30 18:53:08 CET,Tue Nov 30 20:45:21 CET,0.0 3.206 3.772 4.194 4.531 4.806 5.053 5.269 5.647 5.817 5.974 6.234 6.39 6.514 6.73 6.917 7.092 7.18 7.345 7.495 7.706 7.844 7.977 8.152 8.314 8.462 8.604 8.745 8.916 9.076 9.23 9.408 9.572 9.729 9.89 10.047 10.189 10.335 10.478 10.61 10.745 10.869 10.955 11.014 11.026 10.959 10.787 10.482 9.946 8.965 7.242 5.078 3.215 1.621 0.28 -0.886 -1.912 -2.816 -3.578 -4.346 -5.007 -5.592 -6.13 -6.636 -7.112 -7.536 -7.973 -8.37 -8.719 -9.074 -9.436 -9.736 -10.049 -10.375 -10.628 -10.89 -11.161 -11.439 -11.726 -11.925 -12.13 -12.455 -12.687 -12.926 -13.045 -13.292 -13.557 -13.844 -13.998 -14.206 -14.489 -14.672 -14.866 -15.282 -15.516 -15.773 -16.07 -16.419 -16.857 -17.449 -19.896 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_34_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_34_26.txt deleted file mode 100644 index a29f0237..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_34_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29959 ,TETRA ,17621700,Tue Nov 30 18:53:04 CET,Tue Nov 30 20:46:55 CET,0.0 2.206 2.756 3.139 3.45 3.695 3.901 4.089 4.409 4.548 4.682 4.846 5.032 5.128 5.302 5.454 5.595 5.665 5.811 5.953 6.153 6.277 6.386 6.527 6.659 6.787 6.9 6.998 7.119 7.225 7.326 7.43 7.501 7.566 7.63 7.683 7.715 7.718 7.705 7.68 7.632 7.525 7.351 7.13 6.758 6.211 5.473 4.482 3.024 0.778 -2.932 -7.175 -10.449 -13.13 -15.344 -17.208 -18.775 -20.144 -21.296 -22.431 -23.383 -24.209 -24.984 -25.711 -26.385 -26.982 -27.592 -28.141 -28.612 -29.088 -29.568 -29.956 -30.352 -30.763 -31.082 -31.402 -31.735 -32.081 -32.444 -32.693 -32.947 -33.348 -33.627 -33.914 -34.063 -34.374 -34.687 -35.018 -35.199 -35.503 -35.755 -35.949 -36.157 -36.632 -36.892 -37.165 -37.464 -37.803 -38.228 -38.803 -40.889 -2 ,23556 ,TETRA ,17621701,Tue Nov 30 18:53:08 CET,Tue Nov 30 20:48:21 CET,0.0 2.151 2.674 3.031 3.311 3.551 3.766 3.959 4.297 4.444 4.577 4.728 4.913 5.013 5.193 5.35 5.494 5.563 5.687 5.807 5.978 6.076 6.166 6.282 6.383 6.482 6.584 6.682 6.794 6.884 6.957 7.022 7.072 7.114 7.16 7.211 7.244 7.249 7.231 7.195 7.128 7.011 6.8 6.527 6.14 5.63 4.928 3.909 2.398 0.142 -3.607 -7.873 -11.165 -13.808 -15.96 -17.84 -19.433 -20.806 -21.944 -23.057 -24.001 -24.819 -25.589 -26.319 -26.992 -27.592 -28.201 -28.747 -29.227 -29.71 -30.209 -30.625 -31.045 -31.476 -31.812 -32.154 -32.504 -32.868 -33.232 -33.479 -33.739 -34.135 -34.41 -34.701 -34.85 -35.173 -35.549 -35.955 -36.17 -36.522 -36.866 -37.114 -37.376 -37.954 -38.266 -38.59 -38.939 -39.329 -39.801 -40.43 -42.484 -3 ,22766 ,TETRA ,17621702,Tue Nov 30 18:53:06 CET,Tue Nov 30 20:46:10 CET,0.0 2.254 2.793 3.168 3.472 3.722 3.932 4.124 4.467 4.609 4.741 4.896 5.08 5.178 5.361 5.522 5.661 5.73 5.863 5.981 6.148 6.252 6.345 6.47 6.585 6.691 6.782 6.866 6.971 7.063 7.144 7.228 7.29 7.334 7.373 7.399 7.412 7.414 7.398 7.352 7.284 7.173 6.967 6.701 6.299 5.761 5.018 3.96 2.41 0.09 -3.568 -7.671 -10.889 -13.496 -15.667 -17.533 -19.117 -20.509 -21.67 -22.809 -23.774 -24.615 -25.385 -26.085 -26.72 -27.294 -27.89 -28.412 -28.859 -29.332 -29.819 -30.212 -30.609 -31.012 -31.326 -31.659 -31.998 -32.343 -32.7 -32.939 -33.19 -33.589 -33.862 -34.142 -34.29 -34.594 -34.91 -35.245 -35.423 -35.735 -35.999 -36.206 -36.423 -36.9 -37.164 -37.439 -37.744 -38.095 -38.516 -39.078 -41.041 -4 ,17610 ,TETRA ,17621703,Tue Nov 30 18:53:06 CET,Tue Nov 30 20:50:26 CET,0.0 1.986 2.522 2.891 3.175 3.412 3.623 3.811 4.132 4.272 4.399 4.551 4.743 4.843 5.022 5.186 5.331 5.401 5.535 5.656 5.819 5.915 6.011 6.148 6.262 6.36 6.45 6.531 6.63 6.715 6.784 6.859 6.924 6.973 7.014 7.047 7.053 7.043 7.018 6.973 6.88 6.715 6.498 6.234 5.853 5.338 4.576 3.501 1.962 -0.328 -3.954 -8.127 -11.377 -13.972 -16.137 -18.009 -19.577 -20.946 -22.105 -23.241 -24.192 -25.032 -25.827 -26.556 -27.222 -27.829 -28.451 -28.989 -29.448 -29.929 -30.443 -30.866 -31.295 -31.733 -32.063 -32.413 -32.772 -33.129 -33.505 -33.773 -34.049 -34.466 -34.764 -35.079 -35.234 -35.552 -35.892 -36.274 -36.472 -36.789 -37.087 -37.306 -37.543 -38.092 -38.41 -38.744 -39.09 -39.482 -39.976 -40.632 -42.908 -5 ,26810 ,TETRA ,17621704,Tue Nov 30 18:53:06 CET,Tue Nov 30 20:40:45 CET,0.0 1.795 2.348 2.751 3.055 3.313 3.545 3.747 4.084 4.233 4.375 4.546 4.736 4.841 5.041 5.22 5.382 5.456 5.595 5.717 5.888 5.998 6.101 6.239 6.357 6.462 6.559 6.648 6.749 6.829 6.905 6.984 7.049 7.115 7.18 7.228 7.255 7.271 7.272 7.238 7.159 7.029 6.835 6.594 6.243 5.749 5.02 3.982 2.454 0.179 -3.527 -7.778 -11.027 -13.659 -15.848 -17.703 -19.267 -20.649 -21.817 -22.948 -23.867 -24.684 -25.48 -26.217 -26.876 -27.467 -28.087 -28.643 -29.113 -29.579 -30.067 -30.474 -30.892 -31.335 -31.675 -32.017 -32.364 -32.719 -33.086 -33.335 -33.59 -33.988 -34.263 -34.547 -34.695 -35.005 -35.323 -35.648 -35.827 -36.136 -36.396 -36.598 -36.805 -37.25 -37.499 -37.781 -38.095 -38.443 -38.863 -39.425 -41.415 -6 ,32131 ,TETRA ,17621705,Tue Nov 30 18:53:06 CET,Tue Nov 30 20:48:00 CET,0.0 1.71 2.216 2.584 2.878 3.12 3.328 3.526 3.877 4.018 4.14 4.279 4.469 4.571 4.764 4.929 5.073 5.146 5.279 5.404 5.568 5.66 5.75 5.885 6.009 6.125 6.226 6.312 6.41 6.498 6.582 6.669 6.741 6.809 6.872 6.927 6.959 6.974 6.97 6.941 6.878 6.753 6.559 6.314 5.947 5.434 4.696 3.677 2.218 -0.008 -3.657 -7.839 -11.09 -13.73 -15.905 -17.768 -19.354 -20.728 -21.882 -23.015 -23.957 -24.775 -25.532 -26.232 -26.871 -27.442 -28.048 -28.585 -29.029 -29.481 -29.942 -30.328 -30.738 -31.16 -31.475 -31.8 -32.14 -32.495 -32.861 -33.11 -33.368 -33.759 -34.028 -34.308 -34.454 -34.758 -35.071 -35.399 -35.574 -35.882 -36.148 -36.355 -36.568 -37.046 -37.317 -37.602 -37.899 -38.232 -38.678 -39.286 -41.359 -7 ,7670 ,TETRA ,17621706,Tue Nov 30 18:53:08 CET,Tue Nov 30 20:45:55 CET,0.0 2.705 3.225 3.597 3.877 4.12 4.342 4.53 4.839 4.973 5.103 5.263 5.458 5.561 5.762 5.938 6.088 6.159 6.296 6.419 6.585 6.685 6.772 6.885 6.995 7.096 7.189 7.279 7.382 7.468 7.539 7.625 7.698 7.746 7.802 7.866 7.919 7.951 7.939 7.898 7.821 7.696 7.513 7.26 6.86 6.308 5.557 4.556 3.105 0.869 -2.794 -6.927 -10.167 -12.819 -15.003 -16.893 -18.487 -19.87 -21.036 -22.164 -23.108 -23.933 -24.712 -25.44 -26.101 -26.695 -27.321 -27.879 -28.353 -28.841 -29.349 -29.765 -30.183 -30.612 -30.955 -31.321 -31.698 -32.085 -32.474 -32.727 -32.987 -33.387 -33.653 -33.93 -34.073 -34.375 -34.702 -35.049 -35.228 -35.535 -35.801 -36.009 -36.227 -36.695 -36.953 -37.222 -37.517 -37.861 -38.281 -38.853 -40.566 -8 ,32450 ,TETRA ,17621707,Tue Nov 30 18:53:06 CET,Tue Nov 30 20:36:53 CET,0.0 1.933 2.429 2.788 3.078 3.33 3.543 3.727 4.041 4.189 4.325 4.482 4.676 4.776 4.954 5.114 5.268 5.341 5.476 5.592 5.741 5.834 5.921 6.047 6.155 6.251 6.355 6.457 6.575 6.676 6.761 6.854 6.931 6.986 7.034 7.078 7.113 7.132 7.121 7.08 7.0 6.861 6.65 6.372 5.986 5.478 4.742 3.689 2.135 -0.199 -3.919 -8.132 -11.389 -14.028 -16.209 -18.057 -19.609 -20.961 -22.095 -23.199 -24.11 -24.911 -25.671 -26.371 -27.01 -27.589 -28.19 -28.722 -29.18 -29.642 -30.105 -30.488 -30.888 -31.311 -31.632 -31.955 -32.296 -32.641 -32.991 -33.237 -33.494 -33.889 -34.161 -34.448 -34.597 -34.903 -35.228 -35.574 -35.748 -36.047 -36.304 -36.514 -36.734 -37.216 -37.476 -37.753 -38.07 -38.42 -38.846 -39.412 -41.09 -9 ,31662 ,TETRA ,17621708,Tue Nov 30 18:53:06 CET,Tue Nov 30 20:42:11 CET,0.0 2.185 2.698 3.061 3.349 3.601 3.821 4.016 4.356 4.503 4.641 4.792 4.98 5.083 5.28 5.45 5.601 5.673 5.805 5.929 6.102 6.204 6.3 6.428 6.542 6.646 6.744 6.832 6.924 7.005 7.076 7.149 7.213 7.27 7.33 7.386 7.417 7.424 7.412 7.387 7.323 7.201 7.019 6.778 6.414 5.898 5.143 4.107 2.568 0.275 -3.446 -7.751 -11.054 -13.703 -15.903 -17.769 -19.302 -20.652 -21.775 -22.851 -23.759 -24.562 -25.327 -26.047 -26.697 -27.27 -27.856 -28.38 -28.835 -29.302 -29.782 -30.173 -30.564 -30.976 -31.301 -31.626 -31.959 -32.309 -32.667 -32.917 -33.174 -33.568 -33.849 -34.135 -34.28 -34.584 -34.903 -35.237 -35.413 -35.722 -35.99 -36.19 -36.403 -36.868 -37.121 -37.406 -37.724 -38.076 -38.503 -39.077 -41.175 -10 ,21336 ,TETRA ,17621709,Tue Nov 30 18:53:06 CET,Tue Nov 30 20:44:51 CET,0.0 2.143 2.677 3.048 3.344 3.603 3.819 4.019 4.368 4.503 4.628 4.778 4.967 5.067 5.244 5.407 5.562 5.635 5.77 5.895 6.063 6.162 6.254 6.381 6.499 6.608 6.716 6.821 6.943 7.062 7.169 7.26 7.34 7.418 7.485 7.553 7.602 7.628 7.638 7.606 7.53 7.394 7.173 6.908 6.549 6.054 5.319 4.301 2.835 0.612 -2.964 -7.084 -10.325 -12.954 -15.121 -16.984 -18.555 -19.913 -21.061 -22.189 -23.141 -23.978 -24.772 -25.508 -26.17 -26.762 -27.381 -27.933 -28.397 -28.869 -29.368 -29.787 -30.215 -30.654 -30.988 -31.32 -31.675 -32.051 -32.438 -32.701 -32.966 -33.383 -33.673 -33.973 -34.129 -34.459 -34.804 -35.161 -35.344 -35.659 -35.966 -36.193 -36.43 -36.937 -37.227 -37.551 -37.912 -38.335 -38.863 -39.541 -41.422 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_29.txt deleted file mode 100644 index 4c54695b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16872 ,TETRA ,17621710,Tue Nov 30 18:53:09 CET,Tue Nov 30 20:45:30 CET,0.0 2.252 2.694 3.01 3.268 3.465 3.621 3.756 3.984 4.082 4.172 4.245 4.408 4.466 4.571 4.67 4.764 4.799 4.851 4.892 4.935 4.953 4.963 4.967 4.953 4.927 4.898 4.863 4.817 4.76 4.671 4.537 4.392 4.244 4.074 3.866 3.615 3.29 2.924 2.495 1.994 1.373 0.586 -0.276 -1.441 -2.921 -4.828 -7.24 -10.52 -15.14 -22.006 -29.25 -34.643 -38.873 -42.241 -45.058 -47.395 -49.441 -51.132 -52.764 -54.136 -55.312 -56.408 -57.406 -58.31 -59.112 -59.918 -60.614 -61.212 -61.823 -62.446 -62.953 -63.466 -63.997 -64.4 -64.822 -65.264 -65.703 -66.144 -66.45 -66.77 -67.255 -67.58 -67.919 -68.095 -68.454 -68.826 -69.22 -69.427 -69.807 -70.074 -70.31 -70.559 -71.101 -71.395 -71.712 -72.071 -72.467 -72.934 -73.525 -75.21 -2 ,31480 ,TETRA ,17621711,Tue Nov 30 18:53:06 CET,Tue Nov 30 20:47:56 CET,0.0 2.312 2.811 3.153 3.396 3.592 3.757 3.903 4.141 4.24 4.334 4.41 4.579 4.641 4.742 4.821 4.89 4.919 4.972 5.017 5.068 5.093 5.116 5.13 5.119 5.097 5.074 5.04 4.975 4.908 4.83 4.701 4.557 4.406 4.211 3.968 3.715 3.421 3.072 2.652 2.155 1.547 0.763 -0.115 -1.27 -2.717 -4.604 -7.038 -10.328 -14.962 -21.877 -29.194 -34.638 -38.876 -42.248 -45.064 -47.387 -49.39 -51.04 -52.62 -53.932 -55.072 -56.136 -57.107 -57.986 -58.766 -59.569 -60.271 -60.866 -61.474 -62.087 -62.591 -63.11 -63.634 -64.044 -64.471 -64.897 -65.33 -65.777 -66.082 -66.397 -66.889 -67.227 -67.571 -67.746 -68.107 -68.49 -68.906 -69.121 -69.508 -69.782 -70.014 -70.255 -70.789 -71.084 -71.397 -71.742 -72.128 -72.581 -73.16 -74.968 -3 ,16181 ,TETRA ,17621712,Tue Nov 30 18:53:06 CET,Tue Nov 30 20:45:56 CET,0.0 2.103 2.525 2.82 3.068 3.275 3.451 3.602 3.852 3.956 4.049 4.115 4.28 4.342 4.451 4.552 4.635 4.669 4.723 4.763 4.802 4.822 4.837 4.841 4.832 4.811 4.781 4.747 4.693 4.619 4.523 4.393 4.255 4.108 3.923 3.663 3.394 3.086 2.717 2.3 1.816 1.197 0.392 -0.497 -1.66 -3.093 -4.936 -7.311 -10.523 -15.04 -21.883 -29.151 -34.577 -38.813 -42.239 -45.122 -47.467 -49.506 -51.191 -52.809 -54.167 -55.329 -56.409 -57.403 -58.293 -59.095 -59.908 -60.609 -61.202 -61.798 -62.415 -62.925 -63.436 -63.956 -64.366 -64.789 -65.213 -65.645 -66.083 -66.388 -66.701 -67.18 -67.511 -67.852 -68.034 -68.405 -68.785 -69.183 -69.387 -69.77 -70.053 -70.29 -70.536 -71.041 -71.311 -71.613 -71.956 -72.341 -72.794 -73.394 -75.222 -4 ,25233 ,TETRA ,17621713,Tue Nov 30 18:53:09 CET,Tue Nov 30 20:47:17 CET,0.0 2.001 2.485 2.817 3.084 3.299 3.472 3.62 3.853 3.947 4.038 4.097 4.254 4.315 4.421 4.505 4.573 4.601 4.658 4.698 4.738 4.76 4.77 4.771 4.771 4.762 4.729 4.687 4.629 4.563 4.492 4.397 4.284 4.155 3.98 3.753 3.529 3.251 2.891 2.449 1.954 1.353 0.553 -0.326 -1.477 -2.906 -4.752 -7.173 -10.48 -15.046 -21.846 -29.147 -34.603 -38.868 -42.298 -45.155 -47.491 -49.501 -51.156 -52.764 -54.133 -55.314 -56.394 -57.377 -58.265 -59.073 -59.899 -60.608 -61.214 -61.835 -62.451 -62.95 -63.475 -64.011 -64.415 -64.834 -65.254 -65.691 -66.144 -66.445 -66.756 -67.239 -67.571 -67.919 -68.099 -68.462 -68.839 -69.237 -69.446 -69.827 -70.101 -70.335 -70.576 -71.099 -71.38 -71.686 -72.018 -72.392 -72.85 -73.469 -75.352 -5 ,29877 ,TETRA ,17621714,Tue Nov 30 18:53:07 CET,Tue Nov 30 20:49:17 CET,0.0 1.558 1.965 2.251 2.47 2.662 2.821 2.944 3.131 3.212 3.289 3.324 3.473 3.523 3.607 3.679 3.734 3.755 3.788 3.812 3.835 3.843 3.842 3.834 3.811 3.776 3.733 3.687 3.622 3.544 3.457 3.341 3.21 3.061 2.875 2.64 2.372 2.051 1.668 1.22 0.712 0.082 -0.732 -1.632 -2.782 -4.232 -6.133 -8.571 -11.86 -16.477 -23.419 -30.703 -36.093 -40.356 -43.754 -46.554 -48.866 -50.869 -52.53 -54.131 -55.466 -56.609 -57.666 -58.642 -59.52 -60.308 -61.116 -61.811 -62.404 -63.009 -63.64 -64.173 -64.709 -65.254 -65.663 -66.073 -66.491 -66.912 -67.36 -67.676 -67.996 -68.491 -68.826 -69.169 -69.348 -69.724 -70.111 -70.509 -70.715 -71.096 -71.366 -71.605 -71.858 -72.395 -72.682 -72.983 -73.321 -73.706 -74.144 -74.747 -76.769 -6 ,15797 ,TETRA ,17621715,Tue Nov 30 18:53:07 CET,Tue Nov 30 20:51:48 CET,0.0 1.725 2.185 2.516 2.775 2.987 3.171 3.325 3.561 3.665 3.755 3.809 3.973 4.036 4.137 4.225 4.293 4.32 4.369 4.409 4.447 4.457 4.466 4.468 4.457 4.439 4.406 4.369 4.306 4.222 4.131 4.007 3.867 3.714 3.51 3.262 3.017 2.717 2.362 1.937 1.434 0.823 0.045 -0.83 -1.983 -3.438 -5.348 -7.777 -11.061 -15.674 -22.503 -29.749 -35.157 -39.421 -42.847 -45.697 -48.072 -50.129 -51.81 -53.411 -54.729 -55.873 -56.949 -57.938 -58.835 -59.63 -60.431 -61.137 -61.746 -62.366 -62.993 -63.509 -64.039 -64.584 -65.0 -65.419 -65.854 -66.293 -66.733 -67.04 -67.35 -67.827 -68.163 -68.509 -68.687 -69.052 -69.436 -69.841 -70.049 -70.43 -70.711 -70.943 -71.176 -71.703 -71.994 -72.302 -72.655 -73.053 -73.51 -74.104 -75.809 -7 ,9297 ,TETRA ,17621716,Tue Nov 30 18:53:58 CET,Tue Nov 30 20:46:51 CET,0.0 1.737 2.225 2.581 2.852 3.065 3.231 3.366 3.601 3.7 3.796 3.876 4.046 4.113 4.218 4.321 4.407 4.438 4.503 4.557 4.605 4.624 4.635 4.639 4.631 4.608 4.579 4.543 4.485 4.41 4.326 4.214 4.086 3.945 3.761 3.524 3.278 2.986 2.623 2.178 1.663 1.019 0.174 -0.753 -1.932 -3.386 -5.277 -7.708 -11.014 -15.617 -22.462 -29.683 -35.073 -39.293 -42.644 -45.451 -47.775 -49.766 -51.403 -52.978 -54.284 -55.417 -56.459 -57.416 -58.294 -59.073 -59.872 -60.571 -61.167 -61.782 -62.41 -62.923 -63.436 -63.95 -64.349 -64.764 -65.187 -65.622 -66.069 -66.373 -66.688 -67.182 -67.523 -67.868 -68.041 -68.407 -68.788 -69.175 -69.382 -69.765 -70.04 -70.279 -70.521 -71.042 -71.333 -71.639 -71.967 -72.352 -72.823 -73.425 -75.402 -8 ,14241 ,TETRA ,17621717,Tue Nov 30 18:53:58 CET,Tue Nov 30 20:47:39 CET,0.0 2.306 2.785 3.109 3.355 3.558 3.736 3.886 4.134 4.237 4.333 4.402 4.569 4.628 4.73 4.817 4.882 4.906 4.949 4.99 5.047 5.071 5.084 5.09 5.084 5.064 5.025 4.978 4.911 4.83 4.744 4.622 4.484 4.338 4.156 3.92 3.655 3.333 2.978 2.572 2.071 1.442 0.629 -0.268 -1.425 -2.893 -4.785 -7.191 -10.478 -15.093 -22.016 -29.376 -34.851 -39.087 -42.448 -45.281 -47.645 -49.706 -51.404 -53.028 -54.388 -55.555 -56.624 -57.599 -58.482 -59.272 -60.07 -60.769 -61.372 -61.981 -62.606 -63.123 -63.651 -64.191 -64.605 -65.022 -65.443 -65.873 -66.324 -66.631 -66.944 -67.429 -67.763 -68.1 -68.27 -68.629 -69.006 -69.41 -69.621 -70.001 -70.276 -70.512 -70.754 -71.266 -71.547 -71.867 -72.222 -72.619 -73.087 -73.724 -75.71 -9 ,17153 ,TETRA ,17621718,Tue Nov 30 18:53:59 CET,Tue Nov 30 20:39:01 CET,0.0 2.03 2.492 2.827 3.084 3.298 3.486 3.645 3.888 3.987 4.081 4.153 4.315 4.38 4.492 4.573 4.629 4.655 4.699 4.733 4.775 4.794 4.804 4.81 4.807 4.791 4.762 4.724 4.651 4.56 4.465 4.346 4.215 4.064 3.869 3.632 3.38 3.07 2.701 2.253 1.731 1.114 0.309 -0.612 -1.78 -3.249 -5.176 -7.628 -10.933 -15.546 -22.421 -29.66 -35.02 -39.258 -42.674 -45.537 -47.899 -49.919 -51.599 -53.223 -54.571 -55.733 -56.823 -57.82 -58.721 -59.528 -60.343 -61.05 -61.649 -62.26 -62.882 -63.386 -63.899 -64.432 -64.848 -65.273 -65.7 -66.127 -66.571 -66.876 -67.188 -67.671 -68.001 -68.348 -68.53 -68.898 -69.274 -69.662 -69.869 -70.257 -70.547 -70.786 -71.029 -71.559 -71.846 -72.155 -72.502 -72.893 -73.342 -73.911 -75.768 -10 ,15246 ,TETRA ,17621719,Tue Nov 30 18:54:00 CET,Tue Nov 30 20:38:27 CET,0.0 2.0 2.463 2.778 3.04 3.239 3.396 3.537 3.779 3.883 3.969 4.015 4.174 4.236 4.339 4.42 4.482 4.508 4.557 4.593 4.635 4.648 4.653 4.652 4.644 4.62 4.589 4.564 4.509 4.43 4.343 4.229 4.102 3.956 3.759 3.515 3.251 2.935 2.555 2.101 1.594 0.96 0.123 -0.801 -1.965 -3.419 -5.354 -7.818 -11.079 -15.619 -22.427 -29.64 -35.043 -39.314 -42.723 -45.587 -47.973 -50.006 -51.671 -53.259 -54.582 -55.729 -56.785 -57.752 -58.637 -59.424 -60.216 -60.912 -61.505 -62.108 -62.732 -63.248 -63.767 -64.293 -64.696 -65.111 -65.54 -65.983 -66.435 -66.741 -67.055 -67.536 -67.862 -68.199 -68.375 -68.736 -69.104 -69.493 -69.699 -70.083 -70.347 -70.576 -70.828 -71.389 -71.678 -71.979 -72.317 -72.697 -73.152 -73.756 -75.42 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_31.txt deleted file mode 100644 index c59ffcf6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30680 ,KEBNE ,17076913,Sat Dec 25 08:47:37 CET,Sat Dec 25 10:24:15 CET,0.0 3.108 3.762 4.263 4.677 5.044 5.366 5.649 6.2 6.457 6.686 7.013 7.306 7.505 7.893 8.265 8.624 8.8 9.145 9.469 9.918 10.204 10.488 10.913 11.327 11.727 12.121 12.503 12.99 13.465 13.917 14.455 14.986 15.506 16.103 16.8 17.499 18.257 19.062 19.932 20.866 21.928 23.202 24.482 25.963 27.652 29.657 32.033 34.89 38.337 42.695 46.507 48.864 50.403 51.389 52.068 52.565 52.883 53.053 53.18 53.277 53.336 53.34 53.318 53.271 53.192 53.114 53.041 52.962 52.875 52.767 52.659 52.536 52.398 52.279 52.147 51.999 51.841 51.668 51.549 51.418 51.191 51.032 50.851 50.756 50.56 50.339 50.108 49.984 49.797 49.527 49.355 49.171 48.75 48.512 48.233 47.916 47.568 47.097 46.437 43.681 -2 ,10076 ,KEBNE ,17076914,Sat Dec 25 08:48:39 CET,Sat Dec 25 10:24:52 CET,0.0 2.226 2.897 3.387 3.796 4.171 4.502 4.798 5.338 5.582 5.818 6.163 6.463 6.666 7.053 7.409 7.744 7.902 8.21 8.517 8.96 9.245 9.525 9.935 10.328 10.703 11.068 11.42 11.876 12.337 12.784 13.315 13.836 14.345 14.941 15.625 16.294 17.009 17.781 18.622 19.519 20.536 21.745 22.992 24.489 26.228 28.266 30.613 33.362 36.707 41.006 44.749 47.073 48.627 49.674 50.391 50.852 51.161 51.378 51.533 51.623 51.687 51.74 51.755 51.721 51.674 51.62 51.558 51.489 51.407 51.318 51.23 51.113 50.968 50.849 50.73 50.595 50.45 50.296 50.183 50.061 49.869 49.723 49.546 49.459 49.267 49.05 48.813 48.682 48.496 48.254 48.093 47.922 47.52 47.268 46.988 46.675 46.321 45.871 45.21 42.151 -3 ,15790 ,KEBNE ,17076915,Sat Dec 25 08:48:40 CET,Sat Dec 25 10:24:36 CET,0.0 2.957 3.609 4.079 4.484 4.856 5.195 5.507 6.049 6.295 6.536 6.909 7.223 7.421 7.805 8.173 8.519 8.683 9.009 9.327 9.78 10.068 10.344 10.751 11.15 11.527 11.888 12.243 12.721 13.187 13.629 14.174 14.709 15.238 15.846 16.52 17.181 17.908 18.701 19.56 20.479 21.521 22.753 24.029 25.559 27.266 29.227 31.505 34.335 37.83 42.125 45.823 48.131 49.616 50.617 51.322 51.816 52.206 52.493 52.728 52.875 52.957 53.013 53.029 53.007 52.977 52.919 52.857 52.796 52.718 52.634 52.548 52.44 52.318 52.215 52.094 51.95 51.8 51.636 51.506 51.377 51.181 51.02 50.838 50.742 50.551 50.342 50.099 49.967 49.772 49.515 49.354 49.165 48.746 48.505 48.21 47.879 47.525 47.069 46.412 43.579 -4 ,11425 ,KEBNE ,17076916,Sat Dec 25 08:48:40 CET,Sat Dec 25 10:24:52 CET,0.0 2.703 3.342 3.833 4.253 4.617 4.938 5.23 5.755 5.996 6.227 6.566 6.863 7.058 7.439 7.793 8.123 8.279 8.593 8.9 9.338 9.624 9.904 10.302 10.686 11.063 11.433 11.791 12.256 12.709 13.153 13.687 14.201 14.703 15.288 15.955 16.616 17.358 18.169 19.032 19.938 20.976 22.21 23.469 24.972 26.694 28.711 31.057 33.834 37.217 41.575 45.371 47.666 49.101 50.072 50.788 51.245 51.574 51.83 52.022 52.137 52.2 52.226 52.224 52.181 52.117 52.033 51.947 51.862 51.776 51.67 51.548 51.416 51.272 51.151 51.03 50.894 50.745 50.582 50.455 50.318 50.096 49.928 49.747 49.649 49.435 49.21 48.98 48.859 48.687 48.453 48.285 48.1 47.648 47.384 47.093 46.751 46.361 45.89 45.225 42.39 -5 ,23596 ,KEBNE ,17076917,Sat Dec 25 08:48:40 CET,Sat Dec 25 10:25:11 CET,0.0 3.325 3.984 4.457 4.851 5.198 5.495 5.766 6.276 6.514 6.743 7.08 7.378 7.575 7.951 8.305 8.643 8.807 9.127 9.439 9.887 10.173 10.451 10.858 11.251 11.619 11.97 12.321 12.786 13.236 13.683 14.233 14.767 15.287 15.884 16.563 17.228 17.979 18.802 19.688 20.637 21.698 22.927 24.177 25.649 27.315 29.286 31.563 34.385 37.856 42.21 45.961 48.287 49.845 50.901 51.679 52.217 52.582 52.832 53.005 53.083 53.122 53.126 53.109 53.078 53.021 52.941 52.853 52.774 52.668 52.532 52.427 52.314 52.186 52.076 51.95 51.806 51.644 51.476 51.359 51.214 50.985 50.821 50.642 50.555 50.36 50.121 49.871 49.744 49.558 49.277 49.092 48.889 48.435 48.175 47.882 47.538 47.137 46.649 45.92 43.084 -6 ,27498 ,KEBNE ,17076918,Sat Dec 25 08:48:40 CET,Sat Dec 25 10:24:42 CET,0.0 2.513 3.183 3.69 4.106 4.463 4.783 5.067 5.562 5.803 6.044 6.401 6.707 6.91 7.296 7.653 7.996 8.162 8.485 8.801 9.254 9.542 9.828 10.241 10.648 11.042 11.413 11.776 12.24 12.69 13.132 13.661 14.174 14.688 15.275 15.946 16.598 17.293 18.06 18.91 19.811 20.864 22.126 23.398 24.9 26.612 28.616 30.921 33.742 37.206 41.574 45.31 47.504 48.926 49.931 50.649 51.153 51.508 51.725 51.857 51.931 51.983 52.004 52.005 51.986 51.945 51.878 51.792 51.708 51.605 51.496 51.405 51.283 51.148 51.046 50.93 50.798 50.659 50.514 50.401 50.269 50.06 49.904 49.732 49.638 49.428 49.21 48.962 48.826 48.637 48.388 48.231 48.049 47.632 47.372 47.076 46.756 46.363 45.89 45.203 42.025 -7 ,14660 ,KEBNE ,17076919,Sat Dec 25 08:48:40 CET,Sat Dec 25 10:25:09 CET,0.0 2.559 3.168 3.629 4.022 4.368 4.678 4.96 5.464 5.696 5.93 6.265 6.561 6.748 7.112 7.47 7.814 7.977 8.286 8.586 9.028 9.309 9.581 9.986 10.374 10.746 11.102 11.451 11.915 12.355 12.77 13.286 13.809 14.324 14.917 15.588 16.241 16.96 17.764 18.641 19.564 20.607 21.814 23.056 24.551 26.268 28.288 30.625 33.491 36.961 41.243 44.967 47.287 48.762 49.738 50.461 50.978 51.346 51.56 51.712 51.814 51.873 51.884 51.849 51.812 51.775 51.714 51.646 51.573 51.479 51.369 51.266 51.152 51.022 50.911 50.794 50.667 50.517 50.34 50.211 50.078 49.862 49.705 49.537 49.44 49.23 49.012 48.761 48.622 48.436 48.183 48.018 47.838 47.413 47.173 46.908 46.585 46.174 45.64 44.905 41.884 -8 ,12075 ,KEBNE ,17076920,Sat Dec 25 08:48:40 CET,Sat Dec 25 10:25:09 CET,0.0 2.45 3.072 3.559 3.963 4.312 4.635 4.942 5.486 5.736 5.977 6.327 6.625 6.825 7.216 7.582 7.923 8.09 8.416 8.731 9.183 9.47 9.752 10.165 10.559 10.95 11.325 11.682 12.16 12.625 13.074 13.614 14.139 14.66 15.259 15.924 16.576 17.3 18.095 18.954 19.862 20.904 22.145 23.413 24.91 26.611 28.636 31.002 33.778 37.173 41.55 45.29 47.6 49.146 50.192 50.936 51.435 51.78 52.05 52.226 52.298 52.338 52.341 52.315 52.274 52.227 52.158 52.079 51.987 51.883 51.766 51.653 51.529 51.396 51.284 51.163 51.025 50.875 50.716 50.595 50.461 50.229 50.059 49.868 49.761 49.53 49.29 49.036 48.895 48.704 48.426 48.255 48.065 47.645 47.418 47.141 46.813 46.406 45.859 45.105 42.142 -9 ,10013 ,KEBNE ,17076921,Sat Dec 25 08:48:39 CET,Sat Dec 25 10:26:51 CET,0.0 3.521 4.29 4.864 5.337 5.752 6.149 6.512 7.169 7.454 7.702 8.087 8.407 8.622 9.026 9.408 9.768 9.945 10.308 10.658 11.138 11.443 11.741 12.173 12.573 12.952 13.326 13.698 14.182 14.659 15.132 15.693 16.23 16.748 17.359 18.05 18.713 19.462 20.271 21.138 22.057 23.096 24.322 25.587 27.089 28.766 30.761 33.104 35.912 39.335 43.684 47.512 49.899 51.43 52.397 53.059 53.525 53.869 54.105 54.294 54.391 54.417 54.428 54.427 54.397 54.351 54.276 54.185 54.099 53.994 53.873 53.773 53.663 53.54 53.434 53.315 53.193 53.055 52.879 52.757 52.635 52.429 52.267 52.097 52.009 51.8 51.579 51.356 51.231 51.047 50.791 50.631 50.445 50.024 49.794 49.525 49.194 48.799 48.341 47.644 43.404 -10 ,25974 ,KEBNE ,17076922,Sat Dec 25 08:48:39 CET,Sat Dec 25 10:25:21 CET,0.0 2.17 2.844 3.328 3.721 4.063 4.375 4.677 5.227 5.477 5.706 6.041 6.337 6.535 6.928 7.296 7.639 7.811 8.143 8.456 8.913 9.201 9.479 9.895 10.292 10.676 11.049 11.412 11.882 12.343 12.798 13.343 13.868 14.375 14.965 15.635 16.29 17.031 17.817 18.671 19.58 20.603 21.838 23.082 24.544 26.258 28.301 30.63 33.442 36.879 41.204 44.898 47.202 48.761 49.814 50.582 51.102 51.478 51.731 51.916 52.025 52.08 52.115 52.127 52.11 52.072 52.0 51.916 51.835 51.731 51.617 51.511 51.379 51.223 51.096 50.966 50.825 50.669 50.493 50.36 50.216 49.989 49.834 49.667 49.576 49.384 49.168 48.92 48.793 48.616 48.361 48.187 47.992 47.563 47.319 47.026 46.68 46.309 45.863 45.185 42.676 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_33.txt deleted file mode 100644 index 08f50966..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4498 ,TETRA ,17621720,Tue Nov 30 18:53:58 CET,Tue Nov 30 20:45:54 CET,0.0 2.063 2.655 3.096 3.459 3.789 4.093 4.362 4.843 5.07 5.297 5.634 5.931 6.126 6.499 6.852 7.191 7.358 7.679 7.994 8.459 8.761 9.053 9.481 9.895 10.293 10.688 11.073 11.577 12.074 12.552 13.132 13.708 14.281 14.949 15.709 16.457 17.292 18.197 19.191 20.272 21.519 23.006 24.559 26.441 28.599 31.176 34.23 38.04 42.901 49.349 55.257 59.149 61.836 63.775 65.278 66.404 67.271 67.922 68.518 68.975 69.327 69.623 69.862 70.045 70.178 70.295 70.381 70.432 70.473 70.483 70.467 70.441 70.423 70.395 70.334 70.268 70.187 70.088 70.021 69.942 69.799 69.696 69.579 69.516 69.348 69.154 68.952 68.839 68.696 68.461 68.305 68.131 67.749 67.512 67.244 66.948 66.584 66.089 65.35 62.606 -2 ,31542 ,TETRA ,17621721,Tue Nov 30 18:54:00 CET,Tue Nov 30 20:51:55 CET,0.0 2.264 2.869 3.311 3.69 4.04 4.348 4.627 5.131 5.354 5.57 5.893 6.182 6.375 6.742 7.092 7.435 7.602 7.928 8.24 8.696 8.988 9.271 9.688 10.095 10.491 10.874 11.245 11.733 12.219 12.699 13.285 13.862 14.427 15.094 15.865 16.608 17.418 18.329 19.342 20.427 21.686 23.199 24.776 26.67 28.841 31.468 34.576 38.45 43.391 49.939 55.876 59.709 62.434 64.432 65.939 67.082 67.995 68.67 69.24 69.656 69.986 70.266 70.486 70.652 70.774 70.87 70.922 70.955 70.976 70.969 70.96 70.916 70.859 70.818 70.75 70.659 70.569 70.47 70.378 70.29 70.165 70.058 69.929 69.864 69.721 69.553 69.377 69.274 69.132 68.898 68.748 68.583 68.205 67.97 67.701 67.39 67.018 66.56 65.906 62.236 -3 ,31112 ,TETRA ,17621722,Tue Nov 30 18:53:59 CET,Tue Nov 30 20:45:29 CET,0.0 2.785 3.378 3.824 4.2 4.553 4.868 5.15 5.662 5.89 6.108 6.428 6.72 6.913 7.283 7.639 7.976 8.142 8.472 8.785 9.235 9.531 9.82 10.232 10.632 11.032 11.427 11.819 12.324 12.808 13.281 13.851 14.414 14.97 15.632 16.388 17.127 17.962 18.871 19.86 20.937 22.192 23.678 25.228 27.137 29.34 31.943 35.019 38.807 43.606 50.048 55.982 59.876 62.646 64.658 66.166 67.303 68.181 68.803 69.358 69.79 70.118 70.381 70.576 70.715 70.823 70.915 70.966 71.003 71.023 71.006 70.979 70.956 70.923 70.883 70.825 70.753 70.675 70.572 70.49 70.41 70.272 70.161 70.033 69.965 69.814 69.638 69.455 69.359 69.235 69.013 68.864 68.704 68.328 68.107 67.854 67.546 67.185 66.72 65.99 60.008 -4 ,13674 ,TETRA ,17621723,Tue Nov 30 18:53:59 CET,Tue Nov 30 20:48:49 CET,0.0 2.33 2.95 3.415 3.796 4.132 4.428 4.708 5.212 5.446 5.677 6.017 6.312 6.504 6.874 7.228 7.569 7.734 8.054 8.36 8.82 9.127 9.415 9.835 10.258 10.666 11.055 11.442 11.95 12.44 12.918 13.51 14.093 14.664 15.341 16.114 16.858 17.703 18.658 19.672 20.759 22.025 23.532 25.11 27.005 29.181 31.805 34.916 38.805 43.689 50.113 56.035 59.861 62.588 64.565 66.055 67.199 68.108 68.787 69.373 69.786 70.098 70.375 70.592 70.746 70.857 70.957 71.019 71.064 71.092 71.077 71.049 71.004 70.951 70.916 70.872 70.817 70.746 70.65 70.569 70.477 70.335 70.231 70.097 70.023 69.881 69.719 69.518 69.4 69.258 69.031 68.895 68.746 68.376 68.143 67.865 67.553 67.17 66.675 65.957 63.157 -5 ,27355 ,TETRA ,17621724,Tue Nov 30 18:53:59 CET,Tue Nov 30 20:42:47 CET,0.0 2.126 2.744 3.211 3.596 3.932 4.226 4.498 5.003 5.237 5.466 5.798 6.092 6.283 6.653 7.009 7.347 7.511 7.837 8.15 8.594 8.884 9.173 9.601 10.02 10.432 10.834 11.227 11.727 12.201 12.668 13.253 13.839 14.414 15.083 15.845 16.607 17.486 18.438 19.45 20.539 21.791 23.316 24.899 26.785 29.001 31.649 34.767 38.682 43.571 49.932 55.929 59.921 62.673 64.652 66.146 67.27 68.14 68.79 69.362 69.776 70.098 70.367 70.562 70.699 70.809 70.92 70.998 71.038 71.064 71.083 71.083 71.072 71.041 71.002 70.958 70.897 70.803 70.695 70.628 70.557 70.417 70.31 70.195 70.124 69.989 69.863 69.7 69.599 69.464 69.215 69.051 68.887 68.528 68.305 68.056 67.758 67.386 66.93 66.2 62.797 -6 ,1390 ,TETRA ,17621725,Tue Nov 30 18:53:59 CET,Tue Nov 30 20:37:06 CET,0.0 2.269 2.917 3.392 3.778 4.12 4.441 4.739 5.285 5.531 5.765 6.113 6.418 6.623 7.016 7.397 7.758 7.929 8.266 8.597 9.09 9.409 9.712 10.15 10.582 11.004 11.407 11.809 12.332 12.835 13.334 13.934 14.511 15.075 15.753 16.538 17.302 18.162 19.101 20.127 21.223 22.478 23.998 25.559 27.436 29.634 32.287 35.442 39.322 44.183 50.7 56.689 60.591 63.349 65.336 66.856 67.984 68.846 69.495 70.081 70.517 70.834 71.081 71.283 71.463 71.589 71.685 71.754 71.792 71.797 71.778 71.762 71.751 71.731 71.695 71.631 71.549 71.465 71.37 71.291 71.205 71.058 70.937 70.794 70.715 70.551 70.372 70.167 70.049 69.898 69.652 69.498 69.325 68.934 68.688 68.415 68.114 67.691 67.103 66.214 63.194 -7 ,1414 ,TETRA ,17621726,Tue Nov 30 18:54:00 CET,Tue Nov 30 20:45:38 CET,0.0 2.591 3.173 3.632 4.007 4.322 4.624 4.91 5.427 5.661 5.886 6.217 6.515 6.707 7.071 7.423 7.762 7.931 8.259 8.57 9.028 9.325 9.612 10.031 10.441 10.846 11.241 11.621 12.124 12.624 13.119 13.731 14.328 14.914 15.592 16.367 17.127 17.965 18.898 19.912 20.995 22.235 23.741 25.325 27.219 29.413 32.072 35.204 39.081 44.006 50.508 56.482 60.345 63.063 65.01 66.424 67.466 68.275 68.885 69.426 69.838 70.149 70.395 70.606 70.79 70.924 71.024 71.078 71.107 71.138 71.167 71.168 71.141 71.101 71.058 70.998 70.941 70.857 70.737 70.663 70.587 70.451 70.34 70.215 70.149 70.012 69.851 69.654 69.552 69.418 69.18 69.036 68.868 68.483 68.254 67.992 67.682 67.325 66.884 66.289 63.496 -8 ,19459 ,TETRA ,17621727,Tue Nov 30 18:54:00 CET,Tue Nov 30 20:46:31 CET,0.0 2.193 2.794 3.242 3.619 3.946 4.239 4.506 5.008 5.239 5.458 5.781 6.072 6.265 6.633 6.983 7.323 7.488 7.81 8.125 8.58 8.874 9.16 9.582 9.993 10.394 10.785 11.168 11.674 12.158 12.623 13.211 13.784 14.339 15.008 15.774 16.515 17.348 18.267 19.256 20.335 21.593 23.098 24.678 26.58 28.778 31.404 34.467 38.266 43.09 49.502 55.451 59.297 61.994 63.935 65.401 66.514 67.407 68.076 68.636 69.033 69.348 69.618 69.831 70.005 70.149 70.263 70.325 70.365 70.396 70.415 70.406 70.373 70.342 70.321 70.279 70.217 70.134 70.039 69.979 69.908 69.766 69.655 69.538 69.476 69.329 69.165 68.985 68.878 68.745 68.517 68.377 68.222 67.808 67.56 67.303 66.99 66.615 66.118 65.375 61.288 -9 ,32351 ,TETRA ,17621728,Tue Nov 30 18:54:00 CET,Tue Nov 30 20:38:04 CET,0.0 2.276 2.885 3.313 3.682 4.013 4.32 4.602 5.094 5.324 5.545 5.863 6.158 6.354 6.733 7.087 7.427 7.596 7.923 8.236 8.69 8.982 9.265 9.685 10.096 10.496 10.886 11.274 11.779 12.269 12.752 13.353 13.944 14.507 15.164 15.918 16.664 17.498 18.421 19.442 20.534 21.787 23.289 24.85 26.731 28.91 31.534 34.62 38.466 43.374 49.904 55.867 59.713 62.42 64.343 65.82 66.938 67.799 68.456 69.061 69.506 69.836 70.12 70.349 70.516 70.626 70.72 70.789 70.844 70.883 70.892 70.89 70.883 70.851 70.809 70.76 70.703 70.63 70.547 70.486 70.412 70.275 70.169 70.039 69.965 69.827 69.671 69.475 69.375 69.247 69.021 68.877 68.706 68.288 68.056 67.805 67.517 67.172 66.725 66.025 63.226 -10 ,3365 ,TETRA ,17621729,Tue Nov 30 18:54:01 CET,Tue Nov 30 20:44:56 CET,0.0 2.241 2.82 3.262 3.645 3.981 4.279 4.558 5.058 5.286 5.506 5.821 6.114 6.311 6.69 7.046 7.397 7.568 7.899 8.215 8.664 8.957 9.251 9.679 10.086 10.481 10.873 11.26 11.764 12.25 12.725 13.306 13.878 14.447 15.116 15.875 16.634 17.488 18.42 19.44 20.549 21.834 23.339 24.905 26.792 28.955 31.577 34.679 38.515 43.361 49.831 55.841 59.774 62.528 64.502 65.979 67.067 67.906 68.537 69.087 69.489 69.799 70.041 70.214 70.36 70.478 70.574 70.644 70.677 70.693 70.694 70.673 70.639 70.597 70.544 70.479 70.42 70.345 70.247 70.171 70.084 69.932 69.81 69.672 69.6 69.442 69.25 69.024 68.902 68.752 68.494 68.341 68.154 67.71 67.461 67.187 66.867 66.465 65.97 65.272 62.324 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_34.txt deleted file mode 100644 index 1b38a5b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29053 ,TETRA ,17621730,Tue Nov 30 18:54:03 CET,Tue Nov 30 20:45:30 CET,0.0 1.914 2.5 2.948 3.338 3.68 3.965 4.227 4.699 4.91 5.114 5.395 5.659 5.824 6.139 6.431 6.708 6.842 7.099 7.353 7.711 7.934 8.167 8.506 8.814 9.101 9.374 9.644 9.996 10.341 10.674 11.056 11.415 11.755 12.16 12.643 13.1 13.559 14.041 14.57 15.14 15.783 16.504 17.22 18.036 18.918 19.916 21.018 22.252 23.592 25.027 25.883 26.14 26.139 26.014 25.799 25.528 25.235 24.939 24.616 24.314 24.037 23.774 23.52 23.273 23.036 22.779 22.541 22.319 22.067 21.823 21.632 21.424 21.178 20.977 20.777 20.565 20.338 20.101 19.931 19.75 19.455 19.23 18.999 18.878 18.623 18.357 18.066 17.91 17.663 17.376 17.177 16.973 16.521 16.279 16.015 15.701 15.326 14.848 14.207 11.695 -2 ,27109 ,TETRA ,17621731,Tue Nov 30 18:54:57 CET,Tue Nov 30 20:55:16 CET,0.0 1.849 2.379 2.756 3.078 3.365 3.621 3.851 4.26 4.452 4.634 4.863 5.112 5.264 5.547 5.809 6.055 6.177 6.422 6.652 6.971 7.167 7.361 7.651 7.92 8.173 8.415 8.652 8.966 9.268 9.557 9.91 10.251 10.573 10.942 11.369 11.788 12.262 12.776 13.32 13.868 14.458 15.145 15.828 16.598 17.454 18.477 19.611 20.858 22.155 23.46 24.271 24.525 24.547 24.423 24.185 23.893 23.577 23.295 22.996 22.697 22.402 22.112 21.822 21.532 21.275 20.997 20.724 20.48 20.235 19.978 19.754 19.516 19.247 19.036 18.819 18.581 18.334 18.075 17.89 17.693 17.38 17.153 16.908 16.779 16.522 16.257 15.959 15.8 15.548 15.263 15.057 14.834 14.338 14.044 13.74 13.39 12.96 12.401 11.568 7.276 -3 ,9023 ,TETRA ,17621732,Tue Nov 30 18:54:57 CET,Tue Nov 30 20:47:29 CET,0.0 2.032 2.593 3.0 3.326 3.614 3.882 4.135 4.578 4.778 4.964 5.213 5.474 5.63 5.924 6.199 6.46 6.588 6.827 7.056 7.385 7.595 7.803 8.116 8.418 8.705 8.976 9.224 9.542 9.861 10.181 10.558 10.916 11.264 11.661 12.099 12.519 12.959 13.428 13.95 14.501 15.126 15.866 16.589 17.379 18.189 19.133 20.219 21.451 22.824 24.318 25.277 25.59 25.614 25.472 25.243 24.98 24.684 24.411 24.104 23.81 23.539 23.253 22.972 22.701 22.431 22.151 21.903 21.674 21.422 21.155 20.923 20.67 20.403 20.192 19.976 19.741 19.496 19.248 19.067 18.876 18.571 18.347 18.121 18.005 17.755 17.485 17.193 17.043 16.793 16.512 16.323 16.119 15.655 15.385 15.091 14.751 14.355 13.847 13.084 10.261 -4 ,11590 ,TETRA ,17621733,Tue Nov 30 18:54:58 CET,Tue Nov 30 20:47:35 CET,0.0 2.749 3.324 3.794 4.16 4.454 4.723 4.961 5.363 5.549 5.728 5.975 6.228 6.386 6.689 6.973 7.242 7.371 7.614 7.844 8.173 8.387 8.593 8.888 9.178 9.462 9.738 9.997 10.32 10.634 10.95 11.317 11.659 12.0 12.389 12.808 13.204 13.647 14.152 14.701 15.252 15.859 16.562 17.272 18.095 18.993 20.004 21.13 22.382 23.746 25.156 25.982 26.288 26.314 26.172 25.941 25.646 25.333 25.037 24.722 24.428 24.144 23.879 23.612 23.346 23.094 22.806 22.537 22.3 22.044 21.77 21.547 21.311 21.042 20.835 20.626 20.404 20.181 19.936 19.762 19.59 19.305 19.094 18.859 18.745 18.519 18.262 17.987 17.839 17.598 17.329 17.136 16.936 16.482 16.204 15.899 15.573 15.182 14.678 13.992 10.798 -5 ,17434 ,TETRA ,17621734,Tue Nov 30 18:54:58 CET,Tue Nov 30 21:01:20 CET,0.0 2.261 2.771 3.136 3.446 3.723 3.969 4.195 4.599 4.786 4.96 5.196 5.449 5.609 5.91 6.188 6.454 6.58 6.829 7.08 7.434 7.652 7.858 8.151 8.437 8.714 8.984 9.245 9.575 9.891 10.196 10.56 10.91 11.251 11.642 12.072 12.479 12.951 13.466 13.966 14.472 15.065 15.799 16.546 17.367 18.222 19.213 20.315 21.521 22.819 24.222 25.187 25.512 25.513 25.368 25.114 24.819 24.553 24.307 24.042 23.8 23.539 23.245 22.97 22.719 22.465 22.188 21.938 21.714 21.479 21.224 21.004 20.767 20.516 20.311 20.095 19.876 19.642 19.393 19.221 19.038 18.742 18.526 18.298 18.179 17.928 17.665 17.399 17.259 17.02 16.761 16.577 16.37 15.895 15.634 15.337 15.011 14.632 14.151 13.471 11.245 -6 ,12035 ,TETRA ,17621735,Tue Nov 30 18:54:58 CET,Tue Nov 30 20:51:18 CET,0.0 1.981 2.576 2.98 3.306 3.593 3.849 4.093 4.529 4.719 4.898 5.138 5.4 5.56 5.858 6.136 6.402 6.53 6.776 7.013 7.348 7.561 7.774 8.083 8.38 8.673 8.949 9.212 9.553 9.871 10.18 10.563 10.932 11.284 11.687 12.137 12.579 13.064 13.569 14.111 14.686 15.302 16.006 16.705 17.499 18.362 19.333 20.436 21.694 23.032 24.403 25.286 25.576 25.568 25.442 25.245 24.983 24.695 24.412 24.117 23.849 23.582 23.304 23.019 22.745 22.485 22.223 21.983 21.754 21.498 21.229 21.005 20.761 20.501 20.285 20.065 19.84 19.598 19.357 19.197 19.023 18.753 18.569 18.362 18.253 18.017 17.759 17.475 17.323 17.091 16.844 16.66 16.475 16.086 15.864 15.605 15.312 14.973 14.559 13.991 11.782 -7 ,24050 ,TETRA ,17621736,Tue Nov 30 18:54:58 CET,Tue Nov 30 20:49:08 CET,0.0 2.497 3.066 3.476 3.824 4.12 4.377 4.616 5.049 5.242 5.423 5.663 5.914 6.071 6.377 6.658 6.923 7.049 7.297 7.529 7.867 8.088 8.293 8.593 8.883 9.155 9.412 9.661 9.977 10.292 10.625 11.023 11.396 11.739 12.126 12.565 12.982 13.453 13.958 14.487 15.041 15.642 16.35 17.077 17.891 18.753 19.76 20.909 22.23 23.644 25.068 25.957 26.229 26.223 26.118 25.922 25.657 25.389 25.105 24.764 24.448 24.152 23.875 23.613 23.353 23.105 22.83 22.571 22.349 22.118 21.877 21.664 21.409 21.14 20.933 20.705 20.46 20.204 19.938 19.749 19.551 19.214 18.975 18.744 18.624 18.369 18.086 17.772 17.607 17.356 17.07 16.861 16.638 16.154 15.863 15.545 15.168 14.705 14.112 13.277 10.191 -8 ,22116 ,TETRA ,17621737,Tue Nov 30 18:54:58 CET,Tue Nov 30 20:49:16 CET,0.0 2.854 3.426 3.847 4.185 4.472 4.73 4.958 5.38 5.581 5.769 6.023 6.289 6.446 6.747 7.035 7.306 7.435 7.688 7.934 8.272 8.487 8.699 9.002 9.277 9.555 9.842 10.113 10.44 10.75 11.061 11.447 11.814 12.151 12.536 12.96 13.372 13.828 14.325 14.891 15.493 16.138 16.866 17.608 18.46 19.373 20.396 21.469 22.662 24.029 25.49 26.397 26.668 26.612 26.426 26.186 25.937 25.678 25.405 25.105 24.846 24.606 24.364 24.123 23.902 23.691 23.445 23.228 23.023 22.785 22.528 22.317 22.106 21.88 21.696 21.505 21.306 21.092 20.865 20.713 20.553 20.284 20.081 19.866 19.751 19.512 19.262 18.989 18.848 18.624 18.367 18.184 18.0 17.573 17.31 17.02 16.706 16.353 15.95 15.357 12.311 -9 ,26945 ,TETRA ,17621738,Tue Nov 30 18:54:58 CET,Tue Nov 30 20:49:58 CET,0.0 2.514 3.084 3.498 3.835 4.125 4.384 4.63 5.071 5.273 5.463 5.708 5.961 6.124 6.441 6.728 6.988 7.114 7.362 7.604 7.952 8.169 8.376 8.682 8.973 9.247 9.508 9.76 10.088 10.398 10.69 11.037 11.38 11.715 12.111 12.577 13.031 13.517 14.018 14.567 15.145 15.773 16.491 17.218 18.068 18.987 20.005 21.155 22.433 23.805 25.273 26.054 26.248 26.211 26.045 25.798 25.488 25.142 24.841 24.522 24.213 23.923 23.641 23.36 23.077 22.812 22.53 22.28 22.065 21.828 21.573 21.359 21.132 20.891 20.698 20.498 20.278 20.026 19.761 19.583 19.399 19.099 18.891 18.665 18.544 18.304 18.048 17.748 17.588 17.341 17.081 16.892 16.684 16.213 15.944 15.648 15.328 14.957 14.458 13.808 11.232 -10 ,29024 ,TETRA ,17621739,Tue Nov 30 18:55:00 CET,Tue Nov 30 20:50:54 CET,0.0 2.044 2.555 2.938 3.274 3.572 3.823 4.056 4.496 4.696 4.883 5.132 5.384 5.535 5.836 6.136 6.419 6.553 6.806 7.047 7.396 7.604 7.806 8.108 8.39 8.66 8.935 9.198 9.52 9.823 10.114 10.486 10.855 11.215 11.631 12.096 12.527 12.97 13.454 13.994 14.553 15.167 15.891 16.635 17.483 18.388 19.416 20.565 21.842 23.203 24.638 25.509 25.807 25.841 25.686 25.425 25.14 24.845 24.53 24.178 23.863 23.564 23.263 22.973 22.699 22.443 22.17 21.922 21.689 21.421 21.154 20.926 20.68 20.426 20.218 19.999 19.781 19.542 19.278 19.101 18.92 18.642 18.438 18.225 18.113 17.857 17.576 17.28 17.129 16.891 16.621 16.428 16.234 15.787 15.522 15.23 14.904 14.52 14.003 13.289 10.784 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_49.txt deleted file mode 100644 index b13b6064..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15901 ,TETRA ,17621740,Tue Nov 30 18:55:01 CET,Tue Nov 30 20:46:21 CET,0.0 1.486 2.008 2.387 2.676 2.937 3.169 3.371 3.72 3.874 4.021 4.194 4.421 4.546 4.765 4.963 5.147 5.231 5.392 5.547 5.758 5.877 5.995 6.172 6.336 6.495 6.65 6.795 6.97 7.123 7.262 7.425 7.59 7.744 7.896 8.059 8.193 8.315 8.432 8.546 8.67 8.786 8.886 8.968 8.988 8.94 8.799 8.54 8.062 7.203 5.715 3.846 2.196 0.713 -0.553 -1.678 -2.674 -3.573 -4.338 -5.074 -5.717 -6.322 -6.915 -7.459 -7.954 -8.403 -8.883 -9.304 -9.665 -10.069 -10.493 -10.834 -11.189 -11.574 -11.878 -12.193 -12.529 -12.874 -13.248 -13.507 -13.757 -14.171 -14.446 -14.717 -14.868 -15.196 -15.55 -15.94 -16.152 -16.476 -16.786 -17.025 -17.303 -17.941 -18.283 -18.65 -19.077 -19.553 -20.174 -21.019 -24.06 -2 ,16789 ,TETRA ,17621741,Tue Nov 30 18:56:02 CET,Tue Nov 30 20:48:58 CET,0.0 1.713 2.235 2.603 2.906 3.157 3.379 3.573 3.921 4.085 4.236 4.405 4.618 4.733 4.947 5.143 5.32 5.404 5.568 5.723 5.935 6.069 6.19 6.35 6.501 6.644 6.785 6.915 7.073 7.214 7.335 7.478 7.608 7.735 7.885 8.028 8.143 8.253 8.381 8.501 8.576 8.627 8.672 8.705 8.718 8.666 8.509 8.226 7.773 6.967 5.382 3.396 1.72 0.297 -0.916 -1.999 -2.954 -3.83 -4.573 -5.317 -5.963 -6.524 -7.058 -7.582 -8.09 -8.552 -9.036 -9.487 -9.851 -10.211 -10.613 -10.946 -11.276 -11.629 -11.929 -12.259 -12.573 -12.889 -13.251 -13.501 -13.764 -14.161 -14.44 -14.752 -14.909 -15.227 -15.565 -15.918 -16.105 -16.408 -16.696 -16.929 -17.172 -17.707 -18.017 -18.36 -18.756 -19.267 -19.861 -20.678 -24.27 -3 ,31121 ,TETRA ,17621742,Tue Nov 30 18:56:01 CET,Tue Nov 30 20:47:08 CET,0.0 1.671 2.203 2.591 2.91 3.172 3.385 3.575 3.907 4.056 4.197 4.37 4.589 4.709 4.932 5.142 5.335 5.424 5.617 5.802 6.047 6.197 6.333 6.508 6.675 6.846 7.0 7.139 7.314 7.477 7.627 7.797 7.957 8.105 8.269 8.445 8.596 8.743 8.867 8.98 9.091 9.205 9.297 9.34 9.357 9.322 9.207 8.965 8.517 7.705 6.155 4.176 2.506 1.105 -0.097 -1.198 -2.153 -3.036 -3.82 -4.583 -5.241 -5.83 -6.402 -6.943 -7.412 -7.839 -8.321 -8.752 -9.121 -9.514 -9.901 -10.207 -10.552 -10.934 -11.233 -11.533 -11.843 -12.162 -12.519 -12.794 -13.068 -13.475 -13.749 -14.045 -14.211 -14.533 -14.871 -15.26 -15.474 -15.807 -16.143 -16.391 -16.646 -17.223 -17.565 -17.937 -18.341 -18.838 -19.559 -20.483 -23.503 -4 ,25771 ,TETRA ,17621743,Tue Nov 30 18:56:03 CET,Tue Nov 30 20:48:00 CET,0.0 1.87 2.371 2.731 3.026 3.279 3.502 3.702 4.042 4.195 4.341 4.511 4.725 4.838 5.05 5.255 5.446 5.526 5.673 5.815 6.012 6.132 6.256 6.429 6.579 6.719 6.85 6.977 7.13 7.273 7.408 7.554 7.684 7.801 7.927 8.066 8.204 8.346 8.497 8.646 8.779 8.892 8.988 9.04 9.037 8.997 8.879 8.638 8.144 7.264 5.72 3.732 2.072 0.646 -0.608 -1.689 -2.638 -3.53 -4.289 -5.038 -5.691 -6.296 -6.878 -7.412 -7.918 -8.394 -8.881 -9.322 -9.709 -10.082 -10.459 -10.789 -11.144 -11.509 -11.79 -12.079 -12.379 -12.704 -13.075 -13.326 -13.575 -13.989 -14.262 -14.546 -14.699 -15.023 -15.391 -15.79 -15.995 -16.317 -16.64 -16.871 -17.12 -17.718 -18.029 -18.38 -18.813 -19.299 -19.874 -20.704 -25.082 -5 ,4427 ,TETRA ,17621744,Tue Nov 30 18:56:05 CET,Tue Nov 30 20:46:21 CET,0.0 1.526 2.074 2.451 2.741 2.996 3.221 3.422 3.802 3.976 4.128 4.304 4.521 4.636 4.853 5.056 5.243 5.328 5.488 5.644 5.856 5.977 6.091 6.255 6.406 6.542 6.672 6.795 6.95 7.094 7.221 7.363 7.484 7.593 7.718 7.854 7.976 8.092 8.202 8.292 8.372 8.464 8.548 8.592 8.607 8.557 8.41 8.131 7.633 6.813 5.338 3.418 1.78 0.346 -0.873 -1.96 -2.959 -3.856 -4.629 -5.395 -6.022 -6.573 -7.121 -7.641 -8.126 -8.574 -9.046 -9.481 -9.861 -10.249 -10.632 -10.943 -11.281 -11.653 -11.955 -12.272 -12.597 -12.941 -13.299 -13.554 -13.827 -14.237 -14.526 -14.824 -14.977 -15.309 -15.676 -16.068 -16.26 -16.573 -16.899 -17.147 -17.408 -17.991 -18.325 -18.724 -19.189 -19.701 -20.271 -21.018 -23.881 -6 ,4486 ,TETRA ,17621745,Tue Nov 30 18:56:03 CET,Tue Nov 30 20:48:13 CET,0.0 1.564 2.064 2.418 2.709 2.952 3.167 3.372 3.74 3.908 4.061 4.249 4.476 4.597 4.825 5.038 5.245 5.346 5.528 5.687 5.902 6.038 6.166 6.343 6.503 6.66 6.807 6.951 7.138 7.3 7.446 7.612 7.755 7.888 8.042 8.19 8.319 8.443 8.579 8.727 8.86 8.976 9.058 9.088 9.101 9.063 8.908 8.608 8.112 7.266 5.681 3.666 1.95 0.488 -0.762 -1.859 -2.821 -3.704 -4.466 -5.214 -5.848 -6.427 -6.99 -7.498 -7.974 -8.437 -8.934 -9.385 -9.764 -10.152 -10.563 -10.907 -11.272 -11.652 -11.943 -12.251 -12.566 -12.9 -13.242 -13.473 -13.733 -14.165 -14.466 -14.773 -14.932 -15.269 -15.617 -15.987 -16.186 -16.513 -16.874 -17.127 -17.386 -17.972 -18.323 -18.689 -19.103 -19.605 -20.246 -21.172 -25.072 -7 ,12761 ,TETRA ,17621746,Tue Nov 30 18:56:04 CET,Tue Nov 30 20:48:07 CET,0.0 1.298 1.818 2.208 2.521 2.785 2.998 3.195 3.545 3.7 3.849 4.028 4.244 4.357 4.583 4.793 4.979 5.061 5.21 5.362 5.582 5.722 5.857 6.047 6.215 6.373 6.537 6.686 6.86 7.026 7.18 7.354 7.515 7.671 7.826 7.98 8.126 8.268 8.414 8.544 8.647 8.744 8.808 8.829 8.841 8.818 8.69 8.41 7.929 7.107 5.598 3.69 2.037 0.615 -0.617 -1.735 -2.731 -3.616 -4.346 -5.091 -5.759 -6.36 -6.938 -7.485 -7.98 -8.427 -8.919 -9.361 -9.738 -10.132 -10.549 -10.897 -11.265 -11.643 -11.935 -12.253 -12.58 -12.93 -13.321 -13.592 -13.888 -14.356 -14.677 -15.026 -15.191 -15.521 -15.904 -16.321 -16.54 -16.87 -17.203 -17.452 -17.72 -18.289 -18.613 -19.0 -19.409 -19.85 -20.388 -21.108 -23.786 -8 ,26302 ,TETRA ,17621747,Tue Nov 30 18:56:03 CET,Tue Nov 30 20:47:20 CET,0.0 1.324 1.791 2.14 2.428 2.672 2.883 3.072 3.399 3.544 3.685 3.849 4.065 4.173 4.365 4.552 4.727 4.806 4.953 5.097 5.305 5.438 5.553 5.707 5.868 6.024 6.162 6.3 6.484 6.645 6.79 6.964 7.114 7.254 7.403 7.549 7.681 7.82 7.973 8.102 8.201 8.294 8.366 8.404 8.401 8.344 8.19 7.926 7.475 6.628 5.112 3.23 1.602 0.16 -1.054 -2.119 -3.062 -3.901 -4.617 -5.347 -5.985 -6.573 -7.122 -7.626 -8.108 -8.547 -8.984 -9.391 -9.755 -10.114 -10.486 -10.798 -11.14 -11.503 -11.779 -12.079 -12.384 -12.679 -13.005 -13.242 -13.486 -13.867 -14.135 -14.411 -14.56 -14.884 -15.225 -15.614 -15.816 -16.128 -16.464 -16.72 -16.979 -17.522 -17.839 -18.211 -18.615 -19.101 -19.735 -20.573 -25.185 -9 ,28643 ,TETRA ,17621748,Tue Nov 30 18:56:03 CET,Tue Nov 30 20:40:33 CET,0.0 1.629 2.124 2.488 2.767 3.012 3.229 3.427 3.796 3.954 4.096 4.258 4.475 4.591 4.796 4.983 5.165 5.252 5.421 5.57 5.773 5.905 6.022 6.183 6.345 6.498 6.624 6.737 6.891 7.037 7.164 7.314 7.466 7.605 7.746 7.894 8.043 8.191 8.323 8.448 8.556 8.66 8.756 8.802 8.803 8.774 8.657 8.394 7.916 7.074 5.518 3.535 1.909 0.515 -0.704 -1.838 -2.834 -3.687 -4.424 -5.183 -5.827 -6.405 -6.976 -7.524 -8.032 -8.475 -8.942 -9.386 -9.765 -10.159 -10.589 -10.939 -11.288 -11.668 -11.985 -12.314 -12.656 -12.996 -13.345 -13.587 -13.848 -14.273 -14.559 -14.853 -15.014 -15.349 -15.706 -16.078 -16.265 -16.587 -16.929 -17.166 -17.415 -17.979 -18.304 -18.69 -19.1 -19.608 -20.251 -21.015 -24.528 -10 ,14618 ,TETRA ,17621749,Tue Nov 30 18:56:03 CET,Tue Nov 30 20:45:55 CET,0.0 1.564 2.019 2.344 2.628 2.875 3.084 3.273 3.619 3.777 3.921 4.084 4.3 4.422 4.647 4.834 5.006 5.086 5.243 5.396 5.607 5.735 5.853 6.013 6.161 6.313 6.473 6.626 6.806 6.974 7.13 7.304 7.464 7.608 7.757 7.914 8.054 8.193 8.315 8.428 8.537 8.627 8.701 8.742 8.73 8.695 8.62 8.395 7.922 7.063 5.54 3.648 1.977 0.529 -0.684 -1.747 -2.647 -3.465 -4.223 -4.97 -5.574 -6.118 -6.657 -7.154 -7.586 -7.989 -8.435 -8.837 -9.195 -9.578 -9.964 -10.292 -10.629 -10.983 -11.265 -11.552 -11.854 -12.176 -12.526 -12.765 -13.001 -13.373 -13.652 -13.94 -14.09 -14.407 -14.749 -15.122 -15.307 -15.613 -15.924 -16.174 -16.436 -16.985 -17.305 -17.685 -18.092 -18.545 -19.128 -19.938 -22.971 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_62.txt deleted file mode 100644 index d3214d9a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15466 ,KEBNE ,17076923,Sat Dec 25 08:48:40 CET,Sat Dec 25 10:26:14 CET,0.0 1.767 2.305 2.677 2.991 3.258 3.508 3.748 4.155 4.334 4.502 4.721 4.959 5.096 5.352 5.596 5.83 5.937 6.139 6.34 6.631 6.808 6.974 7.214 7.448 7.673 7.893 8.1 8.354 8.601 8.84 9.123 9.388 9.645 9.944 10.281 10.608 10.976 11.376 11.799 12.239 12.7 13.22 13.76 14.39 15.043 15.791 16.62 17.512 18.507 19.52 20.169 20.395 20.341 20.173 19.954 19.698 19.429 19.175 18.883 18.617 18.367 18.093 17.81 17.558 17.337 17.09 16.86 16.655 16.433 16.202 15.996 15.77 15.526 15.34 15.161 14.98 14.778 14.54 14.373 14.209 13.934 13.728 13.517 13.41 13.191 12.946 12.664 12.515 12.286 12.04 11.856 11.658 11.214 10.972 10.698 10.386 10.013 9.544 8.923 6.958 -2 ,15942 ,KEBNE ,17076924,Sat Dec 25 08:49:43 CET,Sat Dec 25 10:26:00 CET,0.0 1.621 2.139 2.544 2.88 3.153 3.402 3.632 4.032 4.208 4.368 4.572 4.818 4.962 5.225 5.48 5.72 5.826 6.025 6.223 6.507 6.682 6.852 7.098 7.335 7.572 7.801 8.016 8.29 8.55 8.803 9.111 9.411 9.695 10.011 10.364 10.703 11.069 11.46 11.862 12.27 12.712 13.235 13.796 14.425 15.081 15.785 16.544 17.404 18.368 19.409 20.031 20.205 20.169 20.033 19.809 19.547 19.281 19.034 18.735 18.445 18.186 17.946 17.71 17.46 17.223 16.98 16.742 16.518 16.292 16.051 15.84 15.615 15.371 15.174 14.969 14.752 14.517 14.276 14.112 13.942 13.672 13.472 13.254 13.146 12.914 12.652 12.371 12.22 11.986 11.748 11.566 11.368 10.909 10.649 10.352 10.016 9.65 9.199 8.511 5.693 -3 ,16007 ,KEBNE ,17076925,Sat Dec 25 08:49:43 CET,Sat Dec 25 10:26:19 CET,0.0 2.007 2.54 2.943 3.289 3.573 3.817 4.036 4.434 4.618 4.787 5.011 5.257 5.398 5.666 5.91 6.139 6.252 6.466 6.668 6.954 7.137 7.313 7.557 7.781 7.991 8.201 8.406 8.667 8.917 9.156 9.447 9.728 10.012 10.336 10.677 10.999 11.351 11.739 12.158 12.594 13.068 13.602 14.122 14.719 15.367 16.087 16.876 17.794 18.81 19.863 20.478 20.612 20.57 20.433 20.229 20.023 19.789 19.548 19.318 19.081 18.832 18.597 18.378 18.179 17.975 17.734 17.514 17.314 17.093 16.869 16.687 16.486 16.273 16.106 15.923 15.733 15.537 15.321 15.168 14.997 14.722 14.538 14.337 14.229 14.008 13.762 13.479 13.327 13.09 12.823 12.638 12.455 12.019 11.768 11.496 11.15 10.721 10.223 9.552 7.384 -4 ,20816 ,KEBNE ,17076926,Sat Dec 25 08:49:44 CET,Sat Dec 25 10:26:32 CET,0.0 1.627 2.14 2.538 2.862 3.132 3.381 3.605 3.998 4.179 4.351 4.574 4.813 4.952 5.222 5.472 5.701 5.813 6.029 6.234 6.514 6.688 6.862 7.112 7.358 7.581 7.784 7.989 8.251 8.497 8.735 9.014 9.281 9.543 9.843 10.174 10.488 10.829 11.189 11.577 12.007 12.494 13.028 13.565 14.172 14.782 15.472 16.26 17.14 18.094 19.119 19.769 19.982 19.974 19.843 19.663 19.448 19.19 18.945 18.683 18.453 18.245 18.032 17.805 17.57 17.333 17.084 16.863 16.669 16.476 16.266 16.082 15.88 15.65 15.464 15.277 15.078 14.874 14.652 14.488 14.319 14.057 13.867 13.657 13.548 13.316 13.062 12.786 12.638 12.402 12.15 11.964 11.767 11.333 11.08 10.779 10.426 10.032 9.578 8.962 6.951 -5 ,28108 ,KEBNE ,17076927,Sat Dec 25 08:49:43 CET,Sat Dec 25 10:25:42 CET,0.0 1.369 1.857 2.213 2.514 2.778 3.009 3.21 3.573 3.738 3.889 4.081 4.309 4.436 4.677 4.902 5.121 5.224 5.419 5.6 5.856 6.022 6.182 6.41 6.635 6.854 7.057 7.245 7.493 7.731 7.954 8.216 8.47 8.716 8.995 9.31 9.603 9.921 10.259 10.609 11.004 11.463 11.978 12.48 13.046 13.67 14.389 15.174 16.052 17.064 18.116 18.743 18.933 18.906 18.753 18.549 18.296 18.005 17.737 17.459 17.191 16.917 16.639 16.371 16.123 15.885 15.612 15.371 15.163 14.949 14.729 14.528 14.301 14.05 13.861 13.669 13.459 13.243 13.016 12.859 12.701 12.449 12.259 12.048 11.931 11.689 11.441 11.171 11.029 10.794 10.551 10.377 10.195 9.763 9.491 9.186 8.852 8.485 8.012 7.316 4.824 -6 ,2863 ,KEBNE ,17076928,Sat Dec 25 08:49:43 CET,Sat Dec 25 10:26:15 CET,0.0 1.71 2.306 2.739 3.074 3.378 3.66 3.907 4.342 4.542 4.728 4.974 5.231 5.393 5.698 5.977 6.244 6.371 6.608 6.83 7.15 7.354 7.548 7.819 8.073 8.315 8.548 8.772 9.051 9.319 9.58 9.885 10.182 10.462 10.769 11.117 11.459 11.829 12.225 12.64 13.062 13.526 14.047 14.562 15.162 15.805 16.534 17.343 18.239 19.239 20.308 20.957 21.113 21.057 20.936 20.734 20.487 20.227 19.984 19.717 19.441 19.165 18.89 18.619 18.379 18.155 17.928 17.738 17.551 17.333 17.089 16.887 16.679 16.461 16.291 16.105 15.915 15.719 15.499 15.339 15.18 14.931 14.743 14.534 14.425 14.198 13.949 13.662 13.504 13.258 12.978 12.79 12.594 12.154 11.919 11.657 11.348 10.972 10.489 9.823 7.585 -7 ,28258 ,KEBNE ,17076929,Sat Dec 25 08:50:45 CET,Sat Dec 25 10:26:18 CET,0.0 1.535 2.044 2.425 2.741 3.025 3.29 3.528 3.956 4.145 4.318 4.554 4.804 4.95 5.228 5.5 5.761 5.882 6.109 6.322 6.631 6.827 7.012 7.278 7.522 7.752 7.973 8.197 8.488 8.763 9.02 9.311 9.589 9.862 10.169 10.501 10.829 11.185 11.568 11.984 12.412 12.891 13.44 13.973 14.571 15.219 15.928 16.716 17.661 18.73 19.842 20.524 20.738 20.709 20.542 20.321 20.067 19.811 19.584 19.317 19.061 18.817 18.553 18.288 18.044 17.81 17.544 17.299 17.095 16.884 16.661 16.474 16.274 16.059 15.887 15.708 15.513 15.302 15.075 14.906 14.727 14.446 14.244 14.038 13.934 13.716 13.467 13.187 13.043 12.808 12.55 12.356 12.158 11.733 11.475 11.19 10.893 10.52 10.044 9.413 7.159 -8 ,11490 ,KEBNE ,17076930,Sat Dec 25 08:50:49 CET,Sat Dec 25 10:23:18 CET,0.0 1.619 2.14 2.524 2.835 3.113 3.38 3.625 4.053 4.237 4.407 4.637 4.875 5.014 5.28 5.531 5.767 5.88 6.092 6.295 6.589 6.776 6.955 7.201 7.439 7.67 7.89 8.105 8.379 8.639 8.878 9.151 9.42 9.683 9.982 10.31 10.626 10.969 11.338 11.725 12.123 12.568 13.071 13.576 14.168 14.818 15.555 16.357 17.233 18.144 19.11 19.753 19.932 19.897 19.741 19.514 19.275 19.032 18.799 18.542 18.285 18.024 17.767 17.527 17.271 17.011 16.743 16.488 16.264 16.033 15.789 15.58 15.365 15.138 14.958 14.778 14.588 14.383 14.151 13.985 13.821 13.553 13.358 13.154 13.049 12.824 12.568 12.293 12.145 11.899 11.649 11.473 11.269 10.809 10.551 10.248 9.904 9.512 9.056 8.375 6.181 -9 ,3711 ,KEBNE ,17076931,Sat Dec 25 08:51:47 CET,Sat Dec 25 10:28:37 CET,0.0 1.489 1.986 2.338 2.631 2.896 3.13 3.354 3.746 3.914 4.076 4.277 4.502 4.629 4.885 5.131 5.364 5.481 5.708 5.91 6.194 6.382 6.566 6.832 7.082 7.315 7.531 7.732 7.999 8.265 8.518 8.802 9.06 9.316 9.626 9.964 10.275 10.623 11.0 11.408 11.842 12.308 12.842 13.374 13.977 14.646 15.41 16.232 17.124 18.075 19.126 19.735 19.842 19.786 19.646 19.431 19.182 18.927 18.685 18.394 18.112 17.856 17.595 17.342 17.116 16.887 16.626 16.383 16.173 15.956 15.708 15.514 15.315 15.1 14.931 14.739 14.538 14.329 14.098 13.935 13.76 13.467 13.265 13.058 12.946 12.718 12.476 12.208 12.062 11.821 11.552 11.357 11.163 10.74 10.484 10.203 9.882 9.489 9.015 8.348 5.801 -10 ,19277 ,KEBNE ,17076932,Sat Dec 25 08:51:47 CET,Sat Dec 25 10:29:19 CET,0.0 1.573 2.103 2.482 2.801 3.073 3.309 3.529 3.931 4.11 4.277 4.5 4.748 4.888 5.152 5.41 5.642 5.751 5.965 6.169 6.457 6.641 6.82 7.078 7.328 7.561 7.778 7.988 8.254 8.501 8.738 9.025 9.295 9.555 9.85 10.19 10.522 10.877 11.252 11.642 12.055 12.516 13.048 13.571 14.16 14.83 15.565 16.369 17.311 18.283 19.246 19.868 20.026 19.989 19.873 19.675 19.431 19.181 18.971 18.707 18.45 18.222 17.965 17.706 17.483 17.271 17.022 16.781 16.564 16.339 16.096 15.874 15.64 15.404 15.214 15.017 14.817 14.594 14.341 14.159 13.979 13.694 13.484 13.261 13.143 12.903 12.637 12.351 12.203 11.956 11.692 11.506 11.311 10.878 10.619 10.328 10.0 9.608 9.107 8.423 5.912 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_63.txt deleted file mode 100644 index f9528f06..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18995 ,KEBNE ,17076933,Sat Dec 25 08:52:50 CET,Sat Dec 25 10:29:40 CET,0.0 1.774 2.305 2.698 3.046 3.339 3.578 3.795 4.181 4.351 4.514 4.719 4.951 5.09 5.352 5.594 5.818 5.925 6.132 6.328 6.601 6.771 6.935 7.169 7.389 7.594 7.785 7.975 8.213 8.436 8.652 8.912 9.171 9.42 9.713 10.037 10.331 10.648 10.994 11.367 11.735 12.136 12.598 13.028 13.52 14.045 14.607 15.243 15.938 16.606 17.144 17.285 17.144 16.857 16.501 16.11 15.741 15.36 15.004 14.642 14.328 14.034 13.724 13.42 13.144 12.886 12.599 12.329 12.092 11.864 11.627 11.413 11.172 10.913 10.71 10.498 10.282 10.059 9.818 9.646 9.467 9.195 8.998 8.79 8.683 8.446 8.181 7.908 7.766 7.52 7.262 7.082 6.89 6.447 6.197 5.907 5.589 5.223 4.762 4.1 1.943 -2 ,1944 ,KEBNE ,17076934,Sat Dec 25 08:52:50 CET,Sat Dec 25 10:30:09 CET,0.0 1.679 2.215 2.638 2.978 3.265 3.511 3.73 4.126 4.303 4.466 4.67 4.907 5.044 5.296 5.529 5.746 5.849 6.05 6.241 6.519 6.697 6.863 7.099 7.322 7.53 7.73 7.921 8.154 8.389 8.631 8.911 9.171 9.417 9.706 10.026 10.317 10.636 10.967 11.304 11.669 12.064 12.497 12.953 13.473 13.992 14.562 15.15 15.795 16.501 17.12 17.297 17.11 16.822 16.519 16.175 15.857 15.569 15.283 14.935 14.615 14.327 14.041 13.756 13.472 13.204 12.941 12.707 12.487 12.249 11.997 11.783 11.555 11.298 11.098 10.906 10.7 10.473 10.241 10.075 9.889 9.584 9.382 9.174 9.058 8.815 8.565 8.295 8.152 7.916 7.706 7.528 7.331 6.902 6.658 6.388 6.064 5.681 5.249 4.63 2.526 -3 ,3952 ,KEBNE ,17076935,Sat Dec 25 08:52:50 CET,Sat Dec 25 10:30:05 CET,0.0 1.96 2.482 2.88 3.201 3.49 3.76 4.005 4.419 4.594 4.758 4.961 5.194 5.326 5.581 5.817 6.036 6.14 6.337 6.527 6.795 6.961 7.126 7.367 7.591 7.805 8.011 8.212 8.468 8.714 8.956 9.236 9.494 9.749 10.038 10.339 10.631 10.968 11.317 11.667 12.016 12.395 12.845 13.285 13.786 14.33 14.902 15.51 16.168 16.819 17.367 17.518 17.354 17.066 16.722 16.36 15.997 15.6 15.209 14.821 14.481 14.159 13.852 13.558 13.277 13.029 12.78 12.551 12.339 12.103 11.845 11.631 11.405 11.154 10.959 10.769 10.573 10.355 10.114 9.943 9.755 9.446 9.225 9.001 8.885 8.643 8.397 8.123 7.972 7.729 7.5 7.319 7.115 6.646 6.398 6.129 5.815 5.453 5.009 4.403 2.147 -4 ,28984 ,KEBNE ,17076936,Sat Dec 25 08:52:50 CET,Sat Dec 25 10:29:45 CET,0.0 1.643 2.182 2.578 2.903 3.175 3.413 3.638 4.046 4.234 4.415 4.663 4.921 5.076 5.371 5.636 5.874 5.993 6.227 6.439 6.738 6.925 7.103 7.364 7.611 7.842 8.059 8.266 8.519 8.75 8.981 9.255 9.513 9.766 10.052 10.369 10.675 11.004 11.339 11.667 12.01 12.408 12.854 13.279 13.751 14.266 14.857 15.482 16.148 16.814 17.397 17.593 17.399 17.06 16.689 16.27 15.88 15.51 15.181 14.833 14.504 14.192 13.878 13.557 13.267 13.013 12.721 12.457 12.215 11.954 11.683 11.446 11.211 10.974 10.775 10.563 10.33 10.081 9.825 9.64 9.448 9.157 8.952 8.731 8.618 8.386 8.133 7.86 7.711 7.462 7.224 7.046 6.844 6.372 6.121 5.838 5.519 5.152 4.673 3.997 1.749 -5 ,25108 ,KEBNE ,17076937,Sat Dec 25 08:52:50 CET,Sat Dec 25 10:30:47 CET,0.0 1.646 2.174 2.563 2.881 3.154 3.398 3.612 4.0 4.178 4.345 4.553 4.788 4.926 5.186 5.43 5.652 5.754 5.95 6.146 6.433 6.604 6.757 6.979 7.2 7.406 7.602 7.795 8.039 8.272 8.488 8.734 8.97 9.212 9.485 9.779 10.055 10.354 10.671 10.989 11.322 11.709 12.156 12.616 13.122 13.637 14.213 14.799 15.415 16.077 16.697 16.866 16.679 16.386 16.055 15.69 15.315 14.96 14.651 14.302 13.947 13.616 13.284 12.972 12.671 12.379 12.09 11.826 11.59 11.348 11.081 10.854 10.626 10.384 10.189 9.972 9.757 9.545 9.312 9.14 8.964 8.694 8.499 8.284 8.168 7.925 7.669 7.4 7.258 7.008 6.752 6.568 6.369 5.904 5.651 5.397 5.093 4.716 4.248 3.548 1.167 -6 ,5425 ,KEBNE ,17076938,Sat Dec 25 08:52:50 CET,Sat Dec 25 10:29:36 CET,0.0 1.545 2.064 2.471 2.818 3.108 3.349 3.571 3.972 4.149 4.313 4.53 4.774 4.924 5.194 5.445 5.687 5.803 6.027 6.237 6.526 6.713 6.893 7.153 7.389 7.608 7.828 8.041 8.311 8.567 8.804 9.085 9.352 9.601 9.881 10.189 10.487 10.818 11.156 11.503 11.866 12.278 12.746 13.194 13.694 14.226 14.82 15.417 16.03 16.643 17.142 17.275 17.132 16.878 16.58 16.226 15.867 15.505 15.154 14.75 14.386 14.077 13.789 13.527 13.258 13.007 12.75 12.508 12.286 12.042 11.783 11.565 11.337 11.083 10.883 10.681 10.466 10.242 9.999 9.818 9.635 9.358 9.165 8.952 8.835 8.597 8.343 8.051 7.902 7.661 7.414 7.225 7.029 6.569 6.311 6.033 5.709 5.34 4.894 4.251 1.951 -7 ,24362 ,KEBNE ,17076939,Sat Dec 25 08:53:53 CET,Sat Dec 25 10:30:39 CET,0.0 1.747 2.292 2.683 3.004 3.296 3.553 3.781 4.186 4.365 4.532 4.744 4.98 5.109 5.361 5.608 5.833 5.936 6.135 6.337 6.623 6.793 6.954 7.182 7.398 7.603 7.8 7.986 8.231 8.468 8.691 8.96 9.21 9.443 9.702 9.978 10.247 10.547 10.88 11.238 11.592 11.969 12.4 12.831 13.324 13.853 14.423 15.033 15.681 16.327 16.852 16.952 16.828 16.579 16.259 15.936 15.622 15.288 14.983 14.672 14.372 14.095 13.823 13.544 13.28 13.032 12.758 12.497 12.265 12.038 11.807 11.604 11.385 11.149 10.966 10.767 10.555 10.345 10.116 9.95 9.782 9.515 9.324 9.11 8.994 8.76 8.508 8.225 8.075 7.829 7.575 7.383 7.177 6.731 6.486 6.214 5.9 5.522 5.064 4.406 1.798 -8 ,23061 ,KEBNE ,17076940,Sat Dec 25 08:54:56 CET,Sat Dec 25 10:32:15 CET,0.0 1.74 2.288 2.676 2.99 3.278 3.541 3.778 4.187 4.382 4.581 4.859 5.116 5.266 5.545 5.812 6.064 6.185 6.414 6.625 6.914 7.108 7.299 7.559 7.809 8.042 8.263 8.474 8.732 8.969 9.197 9.476 9.74 9.986 10.266 10.576 10.87 11.194 11.535 11.888 12.275 12.722 13.19 13.619 14.106 14.619 15.151 15.707 16.301 16.905 17.447 17.643 17.544 17.31 16.99 16.626 16.297 15.978 15.668 15.327 15.017 14.743 14.48 14.2 13.92 13.671 13.415 13.187 12.973 12.745 12.497 12.276 12.052 11.821 11.642 11.45 11.243 11.017 10.769 10.595 10.417 10.143 9.939 9.713 9.6 9.364 9.1 8.816 8.663 8.408 8.156 7.972 7.777 7.355 7.112 6.833 6.514 6.134 5.661 5.041 2.89 -9 ,31803 ,KEBNE ,17076941,Sat Dec 25 09:00:09 CET,Sat Dec 25 10:37:06 CET,0.0 1.794 2.326 2.724 3.034 3.304 3.551 3.778 4.18 4.355 4.528 4.774 5.024 5.165 5.429 5.664 5.878 5.987 6.197 6.389 6.654 6.819 6.98 7.216 7.441 7.657 7.855 8.039 8.273 8.494 8.714 8.983 9.239 9.485 9.764 10.07 10.362 10.676 11.005 11.346 11.705 12.096 12.542 12.988 13.481 14.015 14.619 15.249 15.883 16.525 17.093 17.192 17.063 16.815 16.476 16.097 15.709 15.326 14.973 14.588 14.236 13.91 13.593 13.289 12.999 12.738 12.45 12.191 11.974 11.745 11.506 11.284 11.051 10.818 10.631 10.435 10.218 9.988 9.749 9.574 9.396 9.109 8.905 8.691 8.578 8.33 8.063 7.772 7.611 7.364 7.125 6.942 6.755 6.342 6.099 5.826 5.506 5.093 4.606 3.994 1.663 -10 ,5412 ,KEBNE ,17076942,Sat Dec 25 09:21:01 CET,Sat Dec 25 10:56:16 CET,0.0 1.664 2.216 2.563 2.855 3.117 3.342 3.543 3.909 4.086 4.253 4.449 4.682 4.82 5.062 5.284 5.495 5.595 5.782 5.96 6.208 6.364 6.516 6.731 6.939 7.14 7.329 7.504 7.733 7.956 8.167 8.414 8.654 8.885 9.143 9.443 9.73 10.04 10.364 10.694 11.051 11.442 11.881 12.309 12.782 13.263 13.803 14.415 15.044 15.662 16.197 16.302 16.104 15.79 15.413 15.034 14.673 14.307 13.966 13.614 13.309 13.022 12.751 12.488 12.231 11.995 11.733 11.499 11.294 11.072 10.827 10.613 10.386 10.147 9.961 9.767 9.56 9.342 9.107 8.937 8.756 8.466 8.276 8.077 7.963 7.711 7.441 7.169 7.025 6.78 6.532 6.344 6.138 5.674 5.414 5.14 4.844 4.482 4.022 3.374 1.109 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_29.txt deleted file mode 100644 index cef4c924..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26333 ,TETRA ,17621750,Tue Nov 30 18:56:03 CET,Tue Nov 30 20:53:20 CET,0.0 1.514 2.003 2.322 2.562 2.761 2.92 3.051 3.28 3.379 3.466 3.542 3.683 3.74 3.836 3.909 3.958 3.975 4.0 4.018 4.024 4.013 3.997 3.967 3.926 3.871 3.805 3.732 3.614 3.484 3.355 3.188 2.998 2.774 2.487 2.142 1.799 1.406 0.926 0.359 -0.317 -1.164 -2.248 -3.455 -5.005 -6.917 -9.363 -12.469 -16.647 -22.416 -31.019 -40.124 -46.887 -52.17 -56.424 -60.032 -62.995 -65.538 -67.675 -69.75 -71.49 -73.001 -74.432 -75.731 -76.897 -77.961 -79.059 -80.021 -80.838 -81.679 -82.543 -83.25 -84.0 -84.773 -85.352 -85.956 -86.587 -87.238 -87.916 -88.373 -88.843 -89.589 -90.119 -90.67 -90.943 -91.512 -92.111 -92.742 -93.082 -93.612 -94.207 -94.61 -95.038 -95.975 -96.488 -97.039 -97.66 -98.379 -99.232 -100.436 -104.772 -2 ,21995 ,TETRA ,17621751,Tue Nov 30 18:59:01 CET,Tue Nov 30 20:49:10 CET,0.0 1.62 2.069 2.376 2.625 2.826 2.985 3.117 3.323 3.41 3.493 3.549 3.682 3.735 3.817 3.882 3.93 3.942 3.964 3.982 3.993 3.986 3.969 3.937 3.897 3.844 3.775 3.695 3.569 3.433 3.302 3.126 2.927 2.708 2.425 2.069 1.695 1.25 0.738 0.143 -0.545 -1.398 -2.48 -3.646 -5.139 -6.996 -9.43 -12.543 -16.663 -22.349 -30.853 -39.906 -46.606 -51.867 -56.226 -59.904 -62.893 -65.472 -67.634 -69.733 -71.491 -73.023 -74.457 -75.782 -76.984 -78.058 -79.151 -80.121 -80.958 -81.801 -82.666 -83.367 -84.075 -84.855 -85.476 -86.09 -86.716 -87.361 -88.036 -88.513 -89.006 -89.738 -90.247 -90.792 -91.07 -91.652 -92.255 -92.892 -93.232 -93.753 -94.351 -94.763 -95.202 -96.155 -96.688 -97.288 -97.97 -98.774 -99.762 -101.078 -105.19 -3 ,30485 ,TETRA ,17621752,Tue Nov 30 18:59:02 CET,Tue Nov 30 20:49:17 CET,0.0 1.493 2.015 2.336 2.586 2.802 2.978 3.119 3.337 3.431 3.515 3.577 3.714 3.767 3.859 3.94 3.993 4.014 4.049 4.082 4.119 4.12 4.112 4.089 4.049 3.994 3.922 3.834 3.71 3.577 3.435 3.259 3.062 2.836 2.54 2.181 1.81 1.373 0.869 0.298 -0.374 -1.235 -2.324 -3.515 -5.051 -6.934 -9.313 -12.383 -16.543 -22.343 -30.912 -39.895 -46.609 -51.885 -56.192 -59.844 -62.871 -65.441 -67.54 -69.596 -71.321 -72.831 -74.259 -75.566 -76.78 -77.891 -79.018 -79.984 -80.805 -81.664 -82.536 -83.243 -83.966 -84.716 -85.308 -85.914 -86.545 -87.198 -87.852 -88.31 -88.793 -89.541 -90.06 -90.612 -90.898 -91.497 -92.106 -92.74 -93.079 -93.593 -94.163 -94.559 -94.979 -95.897 -96.393 -96.933 -97.537 -98.259 -99.14 -100.31 -104.533 -4 ,5235 ,TETRA ,17621753,Tue Nov 30 18:59:02 CET,Tue Nov 30 20:52:35 CET,0.0 1.58 2.044 2.343 2.585 2.782 2.95 3.099 3.328 3.425 3.516 3.59 3.725 3.776 3.863 3.934 3.991 4.013 4.036 4.05 4.068 4.065 4.049 4.016 3.977 3.92 3.848 3.77 3.651 3.518 3.369 3.155 2.942 2.723 2.442 2.096 1.727 1.285 0.766 0.172 -0.504 -1.321 -2.373 -3.564 -5.113 -7.015 -9.452 -12.52 -16.666 -22.502 -31.083 -40.135 -46.862 -52.132 -56.352 -59.877 -62.809 -65.417 -67.631 -69.753 -71.493 -72.975 -74.348 -75.618 -76.79 -77.865 -78.98 -79.932 -80.744 -81.59 -82.455 -83.179 -83.931 -84.683 -85.25 -85.847 -86.467 -87.117 -87.786 -88.244 -88.718 -89.45 -89.975 -90.538 -90.834 -91.459 -92.098 -92.764 -93.116 -93.644 -94.241 -94.643 -95.066 -96.007 -96.527 -97.09 -97.706 -98.406 -99.266 -100.423 -104.565 -5 ,30318 ,TETRA ,17621754,Tue Nov 30 18:59:04 CET,Tue Nov 30 20:53:17 CET,0.0 1.317 1.689 1.947 2.145 2.306 2.424 2.527 2.697 2.764 2.821 2.845 2.962 2.994 3.04 3.079 3.102 3.108 3.106 3.098 3.071 3.044 3.006 2.934 2.851 2.763 2.667 2.565 2.418 2.26 2.093 1.871 1.639 1.386 1.066 0.686 0.287 -0.189 -0.732 -1.36 -2.088 -2.97 -4.079 -5.336 -6.964 -8.921 -11.389 -14.505 -18.652 -24.388 -32.947 -41.926 -48.599 -53.919 -58.235 -61.827 -64.763 -67.327 -69.482 -71.566 -73.283 -74.736 -76.095 -77.35 -78.513 -79.563 -80.62 -81.559 -82.363 -83.182 -84.018 -84.702 -85.418 -86.179 -86.757 -87.343 -87.964 -88.608 -89.278 -89.741 -90.213 -90.968 -91.491 -92.023 -92.304 -92.903 -93.524 -94.164 -94.503 -95.017 -95.58 -95.982 -96.401 -97.292 -97.799 -98.372 -98.998 -99.689 -100.542 -101.748 -105.615 -6 ,22232 ,TETRA ,17621755,Tue Nov 30 18:59:06 CET,Tue Nov 30 20:51:30 CET,0.0 1.46 1.975 2.337 2.589 2.777 2.935 3.072 3.295 3.392 3.481 3.549 3.678 3.725 3.804 3.876 3.925 3.945 3.985 4.011 4.041 4.048 4.036 3.994 3.955 3.917 3.862 3.801 3.701 3.579 3.451 3.265 3.056 2.833 2.548 2.203 1.839 1.403 0.907 0.328 -0.338 -1.151 -2.204 -3.38 -4.908 -6.791 -9.216 -12.311 -16.466 -22.195 -30.702 -39.891 -46.756 -52.157 -56.522 -60.143 -63.151 -65.738 -67.878 -69.937 -71.663 -73.175 -74.574 -75.863 -77.051 -78.115 -79.217 -80.182 -80.999 -81.877 -82.79 -83.509 -84.224 -84.967 -85.553 -86.163 -86.797 -87.445 -88.095 -88.549 -89.023 -89.763 -90.286 -90.841 -91.128 -91.715 -92.337 -92.993 -93.328 -93.832 -94.402 -94.812 -95.247 -96.216 -96.754 -97.33 -97.978 -98.763 -99.721 -100.999 -105.742 -7 ,16981 ,TETRA ,17621756,Tue Nov 30 18:59:07 CET,Tue Nov 30 20:55:11 CET,0.0 1.414 1.914 2.249 2.5 2.698 2.869 3.015 3.274 3.388 3.473 3.521 3.644 3.692 3.784 3.867 3.94 3.965 3.994 4.014 4.032 4.031 4.026 3.999 3.953 3.9 3.831 3.753 3.634 3.5 3.357 3.175 2.974 2.75 2.468 2.119 1.744 1.293 0.775 0.191 -0.477 -1.312 -2.387 -3.581 -5.108 -6.992 -9.43 -12.539 -16.709 -22.451 -31.012 -40.096 -46.791 -52.052 -56.32 -59.96 -62.95 -65.514 -67.622 -69.652 -71.399 -72.923 -74.34 -75.674 -76.896 -77.979 -79.089 -80.059 -80.886 -81.74 -82.629 -83.347 -84.096 -84.87 -85.452 -86.056 -86.669 -87.291 -87.938 -88.398 -88.877 -89.627 -90.151 -90.689 -90.969 -91.555 -92.175 -92.852 -93.214 -93.75 -94.334 -94.724 -95.151 -96.123 -96.661 -97.25 -97.89 -98.632 -99.57 -100.883 -105.097 -8 ,10587 ,TETRA ,17621757,Tue Nov 30 18:59:02 CET,Tue Nov 30 20:53:11 CET,0.0 1.763 2.213 2.523 2.763 2.961 3.134 3.283 3.54 3.64 3.727 3.803 3.934 3.981 4.067 4.13 4.183 4.207 4.233 4.249 4.265 4.261 4.248 4.22 4.175 4.12 4.061 3.99 3.873 3.748 3.617 3.437 3.241 3.028 2.744 2.401 2.039 1.605 1.115 0.527 -0.168 -0.992 -2.047 -3.248 -4.779 -6.64 -9.015 -12.069 -16.24 -21.989 -30.487 -39.558 -46.319 -51.651 -55.965 -59.61 -62.611 -65.175 -67.338 -69.432 -71.185 -72.716 -74.117 -75.398 -76.593 -77.674 -78.756 -79.716 -80.55 -81.411 -82.311 -83.048 -83.807 -84.613 -85.234 -85.856 -86.519 -87.208 -87.891 -88.344 -88.81 -89.587 -90.137 -90.685 -90.961 -91.522 -92.136 -92.803 -93.135 -93.644 -94.234 -94.629 -95.036 -95.947 -96.45 -96.996 -97.619 -98.338 -99.174 -100.33 -104.665 -9 ,22157 ,TETRA ,17621758,Tue Nov 30 18:59:03 CET,Tue Nov 30 20:54:20 CET,0.0 1.57 2.069 2.407 2.667 2.888 3.08 3.241 3.484 3.579 3.666 3.727 3.859 3.913 4.001 4.068 4.127 4.151 4.181 4.208 4.245 4.253 4.243 4.209 4.167 4.112 4.042 3.965 3.855 3.733 3.597 3.402 3.192 2.968 2.701 2.379 2.01 1.567 1.048 0.467 -0.175 -1.008 -2.08 -3.245 -4.777 -6.678 -9.131 -12.254 -16.428 -22.197 -30.843 -39.989 -46.718 -51.961 -56.172 -59.784 -62.809 -65.447 -67.65 -69.747 -71.481 -72.965 -74.361 -75.664 -76.855 -77.936 -79.025 -79.969 -80.794 -81.643 -82.5 -83.197 -83.935 -84.706 -85.297 -85.901 -86.514 -87.15 -87.818 -88.283 -88.77 -89.518 -90.027 -90.571 -90.851 -91.426 -92.049 -92.713 -93.049 -93.557 -94.121 -94.526 -94.958 -95.884 -96.399 -96.955 -97.587 -98.316 -99.165 -100.283 -104.977 -10 ,27048 ,TETRA ,17621759,Tue Nov 30 18:59:04 CET,Tue Nov 30 21:01:50 CET,0.0 1.699 2.147 2.461 2.721 2.936 3.116 3.283 3.55 3.649 3.734 3.802 3.938 3.986 4.068 4.128 4.177 4.195 4.219 4.244 4.261 4.259 4.251 4.216 4.172 4.121 4.047 3.964 3.844 3.711 3.562 3.381 3.192 2.984 2.719 2.391 2.036 1.606 1.103 0.522 -0.164 -1.016 -2.096 -3.289 -4.845 -6.773 -9.222 -12.355 -16.519 -22.213 -30.791 -39.944 -46.704 -51.935 -56.192 -59.855 -62.899 -65.494 -67.633 -69.688 -71.402 -72.915 -74.327 -75.625 -76.802 -77.858 -78.934 -79.867 -80.673 -81.511 -82.385 -83.109 -83.838 -84.588 -85.178 -85.77 -86.393 -87.058 -87.75 -88.227 -88.719 -89.48 -90.01 -90.571 -90.85 -91.42 -92.03 -92.691 -93.037 -93.55 -94.112 -94.514 -94.944 -95.876 -96.4 -96.969 -97.583 -98.291 -99.153 -100.323 -104.511 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_35.txt deleted file mode 100644 index 65fa271a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16214 ,TETRA ,17621760,Tue Nov 30 18:59:04 CET,Tue Nov 30 20:54:08 CET,0.0 1.972 2.551 2.976 3.299 3.577 3.813 4.028 4.396 4.554 4.71 4.927 5.135 5.265 5.509 5.73 5.933 6.023 6.2 6.371 6.602 6.743 6.876 7.062 7.236 7.397 7.547 7.687 7.854 8.019 8.183 8.377 8.542 8.69 8.862 9.031 9.169 9.315 9.452 9.573 9.693 9.811 9.916 9.974 9.988 9.988 9.922 9.696 9.279 8.447 6.853 4.846 3.18 1.7 0.396 -0.842 -1.979 -2.998 -3.867 -4.705 -5.456 -6.126 -6.781 -7.412 -7.985 -8.523 -9.092 -9.58 -10.01 -10.493 -11.003 -11.419 -11.851 -12.315 -12.675 -13.039 -13.427 -13.845 -14.282 -14.581 -14.911 -15.463 -15.832 -16.2 -16.397 -16.825 -17.274 -17.758 -18.025 -18.4 -18.893 -19.197 -19.51 -20.205 -20.6 -21.052 -21.58 -22.231 -22.997 -24.063 -28.351 -2 ,5507 ,TETRA ,17621761,Tue Nov 30 18:59:04 CET,Tue Nov 30 20:54:29 CET,0.0 1.818 2.399 2.805 3.121 3.407 3.65 3.872 4.266 4.44 4.601 4.806 5.009 5.133 5.368 5.583 5.777 5.866 6.037 6.205 6.441 6.582 6.712 6.894 7.071 7.236 7.385 7.526 7.702 7.868 8.027 8.216 8.384 8.536 8.688 8.837 8.985 9.148 9.309 9.463 9.584 9.676 9.762 9.8 9.788 9.732 9.592 9.376 8.961 8.075 6.458 4.445 2.716 1.259 -0.032 -1.228 -2.244 -3.194 -4.055 -4.915 -5.66 -6.343 -6.997 -7.614 -8.196 -8.725 -9.284 -9.807 -10.269 -10.752 -11.27 -11.707 -12.145 -12.6 -12.947 -13.313 -13.711 -14.125 -14.558 -14.865 -15.189 -15.72 -16.098 -16.479 -16.673 -17.067 -17.5 -17.993 -18.249 -18.599 -19.059 -19.361 -19.68 -20.448 -20.888 -21.357 -21.894 -22.536 -23.315 -24.364 -28.001 -3 ,11848 ,TETRA ,17621762,Tue Nov 30 18:59:04 CET,Tue Nov 30 20:54:59 CET,0.0 1.908 2.496 2.923 3.272 3.572 3.834 4.056 4.42 4.581 4.735 4.94 5.146 5.271 5.501 5.706 5.903 5.998 6.178 6.346 6.581 6.721 6.846 7.022 7.192 7.35 7.491 7.628 7.791 7.941 8.088 8.254 8.405 8.543 8.695 8.855 9.003 9.145 9.283 9.432 9.568 9.688 9.816 9.912 9.965 9.966 9.868 9.621 9.162 8.352 6.79 4.682 2.928 1.416 0.064 -1.139 -2.224 -3.226 -4.096 -4.963 -5.683 -6.311 -6.912 -7.477 -8.05 -8.601 -9.168 -9.683 -10.131 -10.616 -11.102 -11.52 -11.972 -12.423 -12.781 -13.151 -13.541 -13.951 -14.394 -14.704 -15.022 -15.533 -15.898 -16.27 -16.461 -16.868 -17.313 -17.791 -18.047 -18.408 -18.885 -19.191 -19.522 -20.283 -20.705 -21.177 -21.722 -22.37 -23.125 -24.148 -27.642 -4 ,30220 ,TETRA ,17621763,Tue Nov 30 18:59:04 CET,Tue Nov 30 20:52:52 CET,0.0 1.521 1.953 2.296 2.582 2.83 3.046 3.239 3.583 3.727 3.86 4.033 4.221 4.325 4.52 4.704 4.869 4.944 5.091 5.231 5.422 5.538 5.648 5.807 5.958 6.102 6.238 6.372 6.535 6.676 6.8 6.944 7.076 7.194 7.329 7.472 7.592 7.696 7.782 7.863 7.947 8.028 8.104 8.132 8.072 7.991 7.84 7.506 6.922 6.005 4.478 2.439 0.665 -0.822 -2.092 -3.192 -4.198 -5.184 -6.037 -6.871 -7.615 -8.291 -8.906 -9.52 -10.106 -10.613 -11.155 -11.67 -12.12 -12.59 -13.081 -13.476 -13.893 -14.346 -14.696 -15.056 -15.453 -15.879 -16.311 -16.61 -16.914 -17.398 -17.76 -18.138 -18.325 -18.728 -19.162 -19.63 -19.885 -20.241 -20.72 -21.034 -21.372 -22.135 -22.557 -23.017 -23.547 -24.158 -24.895 -25.912 -30.571 -5 ,16570 ,TETRA ,17621764,Tue Nov 30 18:59:04 CET,Tue Nov 30 20:52:33 CET,0.0 1.807 2.378 2.8 3.127 3.389 3.629 3.841 4.2 4.358 4.507 4.728 4.94 5.065 5.308 5.526 5.725 5.819 5.991 6.156 6.396 6.537 6.669 6.869 7.046 7.198 7.345 7.493 7.664 7.809 7.948 8.122 8.277 8.41 8.561 8.722 8.874 9.019 9.162 9.308 9.417 9.509 9.604 9.678 9.693 9.642 9.532 9.267 8.765 7.931 6.375 4.363 2.714 1.304 0.073 -1.037 -2.002 -2.912 -3.754 -4.571 -5.287 -5.953 -6.588 -7.202 -7.774 -8.309 -8.895 -9.431 -9.896 -10.374 -10.877 -11.313 -11.762 -12.214 -12.58 -12.987 -13.402 -13.802 -14.216 -14.54 -14.886 -15.408 -15.787 -16.187 -16.388 -16.816 -17.277 -17.757 -18.014 -18.382 -18.88 -19.197 -19.529 -20.293 -20.729 -21.206 -21.735 -22.328 -23.071 -24.119 -28.179 -6 ,22913 ,TETRA ,17621765,Tue Nov 30 18:59:06 CET,Tue Nov 30 20:52:26 CET,0.0 1.687 2.285 2.687 3.013 3.293 3.537 3.756 4.137 4.306 4.461 4.674 4.881 5.006 5.25 5.472 5.674 5.764 5.937 6.101 6.329 6.476 6.615 6.811 6.989 7.152 7.318 7.469 7.648 7.816 7.966 8.144 8.302 8.443 8.595 8.753 8.903 9.054 9.196 9.323 9.446 9.568 9.66 9.729 9.761 9.747 9.665 9.434 8.961 8.138 6.586 4.588 2.967 1.496 0.173 -1.022 -2.068 -3.006 -3.841 -4.7 -5.424 -6.071 -6.728 -7.341 -7.89 -8.406 -8.982 -9.498 -9.958 -10.457 -10.974 -11.386 -11.793 -12.25 -12.637 -13.035 -13.425 -13.84 -14.321 -14.664 -15.004 -15.524 -15.88 -16.264 -16.469 -16.898 -17.357 -17.869 -18.137 -18.499 -19.009 -19.343 -19.706 -20.499 -20.938 -21.446 -22.036 -22.717 -23.503 -24.606 -29.447 -7 ,8617 ,TETRA ,17621766,Tue Nov 30 18:59:04 CET,Tue Nov 30 20:53:50 CET,0.0 1.434 1.885 2.218 2.484 2.714 2.922 3.102 3.4 3.542 3.69 3.878 4.068 4.176 4.378 4.561 4.734 4.815 4.965 5.105 5.314 5.451 5.579 5.748 5.9 6.036 6.178 6.312 6.462 6.6 6.744 6.905 7.035 7.163 7.309 7.455 7.574 7.699 7.828 7.94 8.027 8.129 8.25 8.316 8.326 8.254 8.109 7.872 7.405 6.527 4.836 2.633 0.806 -0.722 -2.101 -3.348 -4.45 -5.458 -6.303 -7.142 -7.887 -8.553 -9.161 -9.725 -10.271 -10.785 -11.311 -11.782 -12.209 -12.674 -13.165 -13.565 -13.975 -14.426 -14.779 -15.142 -15.53 -15.941 -16.37 -16.68 -17.011 -17.518 -17.876 -18.268 -18.474 -18.88 -19.311 -19.78 -20.029 -20.39 -20.901 -21.211 -21.516 -22.2 -22.621 -23.102 -23.631 -24.241 -25.05 -26.187 -30.348 -8 ,1319 ,TETRA ,17621767,Tue Nov 30 18:59:07 CET,Tue Nov 30 20:55:13 CET,0.0 1.428 1.903 2.241 2.515 2.763 2.965 3.138 3.469 3.613 3.739 3.9 4.08 4.186 4.375 4.545 4.711 4.791 4.944 5.078 5.266 5.389 5.51 5.681 5.831 5.967 6.106 6.237 6.381 6.511 6.635 6.781 6.912 7.033 7.157 7.286 7.416 7.545 7.639 7.712 7.791 7.862 7.909 7.941 7.947 7.875 7.68 7.375 6.895 6.06 4.449 2.409 0.697 -0.79 -2.134 -3.313 -4.326 -5.271 -6.098 -6.912 -7.605 -8.247 -8.887 -9.496 -10.057 -10.562 -11.092 -11.598 -12.036 -12.481 -12.949 -13.334 -13.741 -14.173 -14.514 -14.866 -15.222 -15.591 -16.012 -16.309 -16.608 -17.085 -17.419 -17.776 -17.959 -18.333 -18.749 -19.208 -19.457 -19.806 -20.245 -20.548 -20.878 -21.61 -22.013 -22.448 -22.943 -23.519 -24.232 -25.272 -29.217 -9 ,27578 ,TETRA ,17621768,Tue Nov 30 18:59:05 CET,Tue Nov 30 21:10:17 CET,0.0 2.034 2.569 2.969 3.296 3.58 3.842 4.078 4.471 4.636 4.794 5.013 5.221 5.347 5.587 5.804 6.005 6.102 6.282 6.441 6.663 6.804 6.937 7.127 7.297 7.455 7.604 7.748 7.931 8.098 8.256 8.438 8.605 8.75 8.897 9.052 9.189 9.34 9.509 9.668 9.808 9.951 10.075 10.159 10.241 10.257 10.185 9.968 9.514 8.702 7.144 5.169 3.458 1.863 0.499 -0.667 -1.706 -2.668 -3.514 -4.38 -5.149 -5.845 -6.498 -7.097 -7.668 -8.186 -8.727 -9.22 -9.655 -10.099 -10.568 -10.991 -11.419 -11.872 -12.232 -12.579 -12.937 -13.328 -13.727 -13.999 -14.307 -14.801 -15.135 -15.5 -15.69 -16.081 -16.477 -16.903 -17.14 -17.485 -17.971 -18.285 -18.609 -19.309 -19.687 -20.113 -20.594 -21.156 -21.852 -22.781 -25.579 -10 ,32247 ,TETRA ,17621769,Tue Nov 30 18:59:05 CET,Tue Nov 30 20:55:05 CET,0.0 1.612 2.124 2.502 2.827 3.104 3.352 3.581 3.967 4.131 4.283 4.496 4.71 4.846 5.102 5.321 5.522 5.615 5.785 5.939 6.171 6.329 6.469 6.659 6.836 7.005 7.16 7.296 7.468 7.628 7.774 7.937 8.086 8.221 8.376 8.557 8.719 8.865 8.994 9.119 9.245 9.366 9.462 9.525 9.585 9.605 9.502 9.253 8.825 8.016 6.346 4.308 2.622 1.167 -0.151 -1.386 -2.456 -3.406 -4.211 -5.014 -5.718 -6.352 -6.978 -7.606 -8.223 -8.786 -9.379 -9.917 -10.379 -10.862 -11.355 -11.752 -12.179 -12.637 -12.988 -13.347 -13.735 -14.148 -14.563 -14.872 -15.211 -15.735 -16.097 -16.48 -16.683 -17.101 -17.548 -18.041 -18.296 -18.651 -19.103 -19.406 -19.741 -20.487 -20.909 -21.389 -21.934 -22.569 -23.336 -24.402 -28.419 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_34.txt deleted file mode 100644 index 78d98edb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_34.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,17504 ,TETRA ,17621771,Tue Nov 30 19:00:06 CET,Tue Nov 30 20:57:16 CET,0.0 2.379 2.974 3.386 3.72 4.011 4.276 4.528 4.959 5.145 5.32 5.566 5.798 5.942 6.215 6.461 6.692 6.809 7.031 7.23 7.517 7.706 7.884 8.131 8.374 8.613 8.832 9.04 9.311 9.566 9.808 10.099 10.378 10.628 10.916 11.245 11.548 11.863 12.185 12.518 12.88 13.289 13.743 14.181 14.652 15.145 15.672 16.224 16.881 17.422 17.624 17.314 16.714 16.086 15.464 14.857 14.288 13.74 13.211 12.673 12.228 11.808 11.388 10.974 10.582 10.201 9.787 9.421 9.1 8.773 8.433 8.128 7.787 7.442 7.17 6.89 6.608 6.316 6.001 5.766 5.516 5.116 4.824 4.519 4.352 4.015 3.687 3.326 3.121 2.818 2.42 2.161 1.891 1.252 0.867 0.428 -0.037 -0.586 -1.284 -2.329 -11.117 -4 ,12089 ,TETRA ,17621773,Tue Nov 30 19:00:07 CET,Tue Nov 30 21:00:11 CET,0.0 1.512 2.019 2.383 2.684 2.954 3.199 3.419 3.795 3.963 4.117 4.326 4.549 4.68 4.932 5.174 5.402 5.507 5.701 5.884 6.151 6.323 6.49 6.735 6.966 7.187 7.409 7.625 7.886 8.136 8.382 8.666 8.928 9.171 9.446 9.765 10.079 10.425 10.791 11.175 11.563 11.973 12.438 12.872 13.352 13.867 14.425 15.022 15.607 16.041 16.145 15.737 15.201 14.63 14.024 13.415 12.824 12.262 11.753 11.202 10.708 10.259 9.816 9.385 8.977 8.61 8.213 7.85 7.532 7.195 6.819 6.489 6.159 5.81 5.533 5.253 4.958 4.65 4.314 4.073 3.842 3.472 3.198 2.901 2.745 2.421 2.064 1.672 1.451 1.138 0.728 0.444 0.15 -0.49 -0.868 -1.301 -1.818 -2.437 -3.142 -4.203 -15.121 -6 ,4925 ,TETRA ,17621775,Tue Nov 30 19:05:00 CET,Tue Nov 30 20:59:19 CET,0.0 2.382 3.005 3.461 3.807 4.107 4.376 4.604 5.006 5.197 5.384 5.624 5.845 5.981 6.241 6.483 6.715 6.83 7.049 7.255 7.545 7.734 7.911 8.148 8.374 8.598 8.81 9.011 9.275 9.523 9.763 10.055 10.318 10.569 10.871 11.199 11.512 11.857 12.205 12.55 12.893 13.283 13.734 14.188 14.7 15.201 15.715 16.26 16.818 17.308 17.514 17.061 16.457 15.839 15.177 14.543 13.971 13.406 12.888 12.323 11.817 11.373 10.941 10.527 10.131 9.766 9.394 9.048 8.747 8.438 8.104 7.828 7.53 7.217 6.971 6.684 6.368 6.029 5.682 5.453 5.208 4.826 4.559 4.27 4.118 3.81 3.482 3.118 2.914 2.608 2.205 1.947 1.662 1.002 0.626 0.202 -0.276 -0.857 -1.633 -2.704 -10.254 -7 ,12694 ,TETRA ,17621776,Tue Nov 30 19:04:59 CET,Tue Nov 30 21:00:50 CET,0.0 1.891 2.404 2.772 3.067 3.326 3.568 3.784 4.169 4.348 4.507 4.707 4.928 5.063 5.311 5.545 5.764 5.868 6.068 6.25 6.514 6.688 6.858 7.092 7.308 7.515 7.715 7.902 8.14 8.375 8.606 8.884 9.15 9.412 9.721 10.048 10.347 10.667 11.001 11.353 11.712 12.102 12.57 13.066 13.615 14.137 14.709 15.316 15.919 16.471 16.732 16.428 15.859 15.219 14.557 13.926 13.341 12.768 12.262 11.736 11.275 10.852 10.408 9.976 9.569 9.178 8.766 8.401 8.08 7.745 7.395 7.095 6.78 6.442 6.163 5.858 5.53 5.183 4.822 4.582 4.341 3.944 3.663 3.371 3.211 2.864 2.486 2.083 1.869 1.559 1.137 0.869 0.575 -0.084 -0.487 -0.97 -1.476 -2.054 -2.843 -3.938 -14.467 -8 ,336 ,TETRA ,17621777,Tue Nov 30 19:05:01 CET,Tue Nov 30 20:59:01 CET,0.0 1.79 2.244 2.563 2.827 3.061 3.278 3.471 3.809 3.965 4.112 4.309 4.521 4.641 4.862 5.071 5.274 5.37 5.555 5.727 5.959 6.113 6.26 6.472 6.673 6.865 7.061 7.246 7.477 7.695 7.905 8.163 8.418 8.669 8.953 9.264 9.557 9.874 10.214 10.556 10.899 11.282 11.707 12.122 12.594 13.07 13.618 14.203 14.715 15.136 15.291 14.908 14.334 13.674 12.987 12.332 11.753 11.174 10.638 10.108 9.639 9.214 8.786 8.394 8.031 7.669 7.274 6.914 6.619 6.306 5.961 5.67 5.376 5.06 4.816 4.569 4.303 4.015 3.702 3.489 3.259 2.864 2.564 2.252 2.096 1.761 1.438 1.083 0.868 0.573 0.221 -0.009 -0.271 -0.877 -1.24 -1.648 -2.106 -2.66 -3.352 -4.414 -18.898 -9 ,28985 ,TETRA ,17621778,Tue Nov 30 19:04:59 CET,Tue Nov 30 21:05:37 CET,0.0 1.629 2.134 2.491 2.787 3.048 3.302 3.529 3.886 4.049 4.208 4.409 4.618 4.741 4.979 5.212 5.43 5.537 5.747 5.935 6.198 6.373 6.537 6.768 6.994 7.211 7.426 7.634 7.883 8.107 8.332 8.617 8.885 9.133 9.427 9.749 10.045 10.371 10.698 11.044 11.413 11.802 12.248 12.711 13.222 13.752 14.324 14.891 15.403 15.85 16.024 15.666 15.109 14.465 13.826 13.203 12.636 12.112 11.619 11.108 10.681 10.286 9.898 9.51 9.143 8.799 8.422 8.09 7.8 7.482 7.138 6.841 6.543 6.223 5.963 5.699 5.417 5.123 4.829 4.613 4.381 4.003 3.735 3.46 3.32 3.003 2.632 2.25 2.052 1.758 1.334 1.061 0.784 0.133 -0.24 -0.623 -1.086 -1.711 -2.553 -3.731 -11.442 -10 ,4414 ,TETRA ,17621779,Tue Nov 30 19:04:58 CET,Tue Nov 30 20:59:23 CET,0.0 1.769 2.305 2.697 3.009 3.278 3.521 3.733 4.098 4.265 4.424 4.643 4.87 5.008 5.272 5.524 5.771 5.89 6.116 6.325 6.627 6.82 6.996 7.251 7.506 7.741 7.963 8.177 8.444 8.695 8.944 9.236 9.503 9.749 10.031 10.346 10.653 10.993 11.354 11.713 12.082 12.509 12.981 13.427 13.906 14.421 15.008 15.618 16.203 16.64 16.769 16.446 15.829 15.106 14.437 13.789 13.172 12.619 12.124 11.588 11.109 10.641 10.161 9.709 9.253 8.827 8.402 8.024 7.691 7.348 6.987 6.698 6.4 6.085 5.842 5.575 5.284 4.957 4.59 4.349 4.126 3.776 3.516 3.225 3.057 2.681 2.319 1.955 1.756 1.455 0.998 0.712 0.429 -0.217 -0.593 -1.037 -1.54 -2.115 -2.859 -3.957 -16.033 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_35.txt deleted file mode 100644 index 941cd4f6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_35.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,5574 ,TETRA ,17621781,Tue Nov 30 19:04:59 CET,Tue Nov 30 21:11:51 CET,0.0 2.291 2.902 3.338 3.718 4.047 4.334 4.575 4.981 5.167 5.342 5.592 5.834 5.981 6.246 6.496 6.743 6.852 7.052 7.245 7.512 7.678 7.846 8.095 8.332 8.561 8.773 8.969 9.22 9.457 9.68 9.938 10.173 10.392 10.653 10.942 11.203 11.492 11.788 12.055 12.31 12.612 12.946 13.23 13.501 13.739 13.946 14.087 14.054 13.783 12.959 11.464 10.052 8.689 7.458 6.36 5.384 4.483 3.674 2.867 2.168 1.533 0.934 0.381 -0.133 -0.655 -1.216 -1.684 -2.06 -2.456 -2.921 -3.324 -3.742 -4.175 -4.508 -4.84 -5.174 -5.523 -5.881 -6.142 -6.423 -6.853 -7.161 -7.522 -7.713 -8.116 -8.55 -8.989 -9.223 -9.565 -10.011 -10.291 -10.59 -11.278 -11.68 -12.118 -12.609 -13.15 -13.845 -14.964 -22.82 -3 ,29077 ,TETRA ,17621782,Tue Nov 30 19:04:59 CET,Tue Nov 30 20:59:13 CET,0.0 2.022 2.635 3.085 3.433 3.73 3.994 4.244 4.689 4.884 5.06 5.294 5.528 5.676 5.943 6.181 6.413 6.521 6.717 6.913 7.19 7.358 7.53 7.775 7.999 8.222 8.434 8.621 8.854 9.084 9.29 9.534 9.756 9.959 10.221 10.507 10.751 10.985 11.238 11.531 11.818 12.12 12.432 12.699 12.99 13.275 13.544 13.741 13.761 13.504 12.639 11.132 9.674 8.374 7.23 6.175 5.243 4.408 3.64 2.816 2.134 1.548 0.966 0.408 -0.092 -0.533 -1.031 -1.491 -1.881 -2.286 -2.703 -3.068 -3.466 -3.874 -4.211 -4.58 -4.943 -5.324 -5.733 -6.005 -6.284 -6.733 -7.038 -7.354 -7.521 -7.869 -8.261 -8.699 -8.93 -9.261 -9.672 -9.953 -10.244 -10.914 -11.299 -11.725 -12.162 -12.694 -13.418 -14.515 -21.777 -4 ,11418 ,TETRA ,17621783,Tue Nov 30 19:05:01 CET,Tue Nov 30 20:59:21 CET,0.0 2.762 3.404 3.847 4.192 4.504 4.787 5.032 5.466 5.669 5.854 6.116 6.365 6.511 6.774 7.014 7.242 7.355 7.569 7.754 8.021 8.191 8.349 8.582 8.816 9.04 9.247 9.442 9.689 9.929 10.156 10.413 10.655 10.894 11.153 11.422 11.686 11.959 12.23 12.498 12.749 13.034 13.364 13.621 13.857 14.1 14.328 14.483 14.458 14.177 13.298 11.784 10.344 8.972 7.735 6.63 5.676 4.804 4.009 3.194 2.482 1.837 1.219 0.638 0.097 -0.401 -0.931 -1.404 -1.812 -2.237 -2.694 -3.089 -3.488 -3.908 -4.23 -4.552 -4.881 -5.229 -5.608 -5.863 -6.118 -6.545 -6.839 -7.165 -7.351 -7.7 -8.072 -8.507 -8.732 -9.04 -9.421 -9.686 -9.968 -10.627 -11.005 -11.416 -11.914 -12.482 -13.142 -14.297 -19.54 -5 ,18307 ,TETRA ,17621784,Tue Nov 30 19:04:59 CET,Tue Nov 30 21:02:16 CET,0.0 2.403 3.052 3.506 3.883 4.195 4.446 4.677 5.097 5.284 5.466 5.732 5.98 6.152 6.463 6.715 6.94 7.046 7.249 7.44 7.712 7.885 8.049 8.28 8.498 8.7 8.892 9.087 9.328 9.546 9.745 9.974 10.2 10.405 10.633 10.896 11.129 11.375 11.646 11.932 12.218 12.522 12.841 13.12 13.418 13.654 13.851 14.025 14.05 13.786 12.878 11.364 9.875 8.493 7.303 6.19 5.163 4.231 3.413 2.583 1.889 1.277 0.699 0.132 -0.429 -0.923 -1.435 -1.92 -2.341 -2.752 -3.177 -3.54 -3.921 -4.354 -4.714 -5.08 -5.457 -5.865 -6.29 -6.588 -6.885 -7.31 -7.632 -7.991 -8.174 -8.552 -8.959 -9.388 -9.609 -9.941 -10.378 -10.673 -10.968 -11.61 -12.006 -12.435 -12.874 -13.437 -14.183 -15.223 -24.288 -6 ,20773 ,TETRA ,17621785,Tue Nov 30 19:04:59 CET,Tue Nov 30 21:04:06 CET,0.0 2.767 3.438 3.88 4.257 4.575 4.861 5.119 5.547 5.747 5.939 6.186 6.418 6.562 6.836 7.099 7.342 7.457 7.67 7.865 8.135 8.3 8.465 8.702 8.925 9.134 9.328 9.521 9.766 9.98 10.18 10.432 10.668 10.887 11.13 11.379 11.624 11.902 12.179 12.452 12.717 13.007 13.352 13.636 13.919 14.171 14.362 14.54 14.62 14.407 13.506 12.079 10.697 9.394 8.254 7.236 6.308 5.432 4.656 3.872 3.18 2.561 1.976 1.43 0.919 0.438 -0.096 -0.615 -1.07 -1.539 -2.027 -2.416 -2.831 -3.299 -3.659 -4.015 -4.363 -4.713 -5.082 -5.334 -5.597 -6.023 -6.336 -6.677 -6.863 -7.263 -7.675 -8.101 -8.322 -8.667 -9.162 -9.464 -9.771 -10.443 -10.804 -11.218 -11.708 -12.249 -13.004 -14.149 -19.887 -8 ,9921 ,TETRA ,17621787,Tue Nov 30 19:05:01 CET,Tue Nov 30 21:07:11 CET,0.0 2.337 2.968 3.41 3.77 4.058 4.326 4.585 5.044 5.255 5.446 5.697 5.928 6.069 6.336 6.595 6.836 6.948 7.157 7.342 7.606 7.782 7.952 8.197 8.421 8.624 8.82 9.007 9.23 9.441 9.644 9.89 10.135 10.354 10.589 10.852 11.085 11.346 11.644 11.958 12.269 12.566 12.892 13.209 13.541 13.844 14.12 14.282 14.279 14.045 13.199 11.742 10.368 9.039 7.776 6.646 5.642 4.729 3.959 3.175 2.472 1.83 1.229 0.675 0.153 -0.322 -0.83 -1.304 -1.717 -2.158 -2.598 -2.952 -3.36 -3.79 -4.094 -4.421 -4.769 -5.121 -5.492 -5.765 -6.054 -6.505 -6.835 -7.166 -7.34 -7.716 -8.097 -8.519 -8.749 -9.084 -9.549 -9.846 -10.16 -10.931 -11.355 -11.791 -12.303 -12.926 -13.675 -14.689 -21.514 -10 ,19547 ,TETRA ,17621789,Tue Nov 30 19:05:54 CET,Tue Nov 30 21:01:00 CET,0.0 2.236 2.775 3.156 3.479 3.755 3.998 4.225 4.621 4.801 4.962 5.156 5.361 5.492 5.762 6.002 6.225 6.338 6.547 6.74 7.018 7.199 7.373 7.611 7.837 8.046 8.236 8.426 8.678 8.908 9.127 9.397 9.647 9.881 10.142 10.42 10.69 10.97 11.252 11.546 11.835 12.142 12.444 12.716 12.998 13.252 13.493 13.645 13.652 13.42 12.518 10.96 9.445 8.106 6.921 5.798 4.787 3.86 3.077 2.281 1.577 0.956 0.354 -0.236 -0.792 -1.284 -1.788 -2.244 -2.659 -3.097 -3.52 -3.882 -4.286 -4.703 -5.015 -5.366 -5.751 -6.144 -6.559 -6.843 -7.134 -7.568 -7.879 -8.22 -8.402 -8.774 -9.164 -9.591 -9.814 -10.142 -10.553 -10.816 -11.096 -11.773 -12.142 -12.536 -13.012 -13.592 -14.358 -15.48 -21.331 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_39.txt deleted file mode 100644 index 25fbab39..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17059 ,TETRA ,17621790,Tue Nov 30 19:05:53 CET,Tue Nov 30 20:58:48 CET,0.0 1.601 2.118 2.471 2.759 2.999 3.21 3.409 3.758 3.902 4.038 4.207 4.424 4.537 4.74 4.925 5.101 5.185 5.342 5.488 5.687 5.805 5.924 6.094 6.245 6.383 6.508 6.626 6.777 6.929 7.072 7.238 7.388 7.506 7.629 7.758 7.868 7.984 8.108 8.219 8.326 8.434 8.514 8.566 8.594 8.559 8.425 8.185 7.806 7.08 5.551 3.576 1.91 0.516 -0.684 -1.819 -2.802 -3.713 -4.518 -5.317 -5.988 -6.599 -7.212 -7.76 -8.258 -8.719 -9.203 -9.635 -10.016 -10.418 -10.834 -11.19 -11.553 -11.921 -12.216 -12.525 -12.855 -13.203 -13.574 -13.836 -14.108 -14.531 -14.827 -15.155 -15.323 -15.661 -16.025 -16.428 -16.64 -16.96 -17.311 -17.574 -17.846 -18.417 -18.745 -19.12 -19.554 -20.073 -20.74 -21.679 -25.128 -2 ,3430 ,TETRA ,17621791,Tue Nov 30 19:05:53 CET,Tue Nov 30 20:59:02 CET,0.0 1.984 2.465 2.819 3.105 3.364 3.584 3.771 4.115 4.267 4.411 4.579 4.796 4.912 5.12 5.305 5.478 5.558 5.713 5.858 6.061 6.192 6.312 6.475 6.631 6.776 6.908 7.03 7.181 7.317 7.442 7.584 7.71 7.823 7.951 8.088 8.205 8.337 8.466 8.584 8.715 8.839 8.961 9.044 9.086 9.084 9.009 8.82 8.415 7.65 6.18 4.299 2.68 1.264 0.034 -1.081 -2.054 -2.937 -3.735 -4.539 -5.22 -5.814 -6.383 -6.95 -7.481 -7.955 -8.451 -8.904 -9.287 -9.686 -10.114 -10.468 -10.851 -11.26 -11.57 -11.893 -12.248 -12.632 -13.038 -13.309 -13.58 -14.012 -14.321 -14.648 -14.822 -15.191 -15.573 -15.991 -16.213 -16.551 -16.949 -17.219 -17.496 -18.121 -18.486 -18.883 -19.291 -19.771 -20.402 -21.27 -24.319 -3 ,8363 ,TETRA ,17621792,Tue Nov 30 19:05:53 CET,Tue Nov 30 20:53:38 CET,0.0 2.097 2.565 2.932 3.24 3.495 3.709 3.895 4.232 4.382 4.528 4.696 4.91 5.019 5.215 5.402 5.584 5.673 5.837 5.972 6.16 6.288 6.406 6.575 6.738 6.884 7.015 7.132 7.279 7.417 7.547 7.694 7.83 7.948 8.082 8.235 8.367 8.505 8.639 8.783 8.929 9.062 9.19 9.271 9.298 9.282 9.199 8.992 8.593 7.843 6.367 4.473 2.85 1.438 0.221 -0.87 -1.842 -2.793 -3.594 -4.35 -5.022 -5.616 -6.178 -6.717 -7.229 -7.709 -8.206 -8.645 -9.019 -9.41 -9.833 -10.188 -10.55 -10.93 -11.232 -11.557 -11.897 -12.231 -12.581 -12.834 -13.104 -13.533 -13.83 -14.135 -14.3 -14.659 -15.03 -15.416 -15.629 -15.963 -16.314 -16.577 -16.863 -17.47 -17.819 -18.206 -18.616 -19.13 -19.824 -20.817 -24.47 -4 ,31618 ,TETRA ,17621793,Tue Nov 30 19:05:54 CET,Tue Nov 30 20:58:50 CET,0.0 1.615 2.136 2.505 2.774 3.013 3.231 3.44 3.811 3.963 4.099 4.257 4.467 4.577 4.777 4.962 5.133 5.212 5.368 5.513 5.706 5.832 5.956 6.12 6.271 6.423 6.571 6.708 6.873 7.017 7.148 7.31 7.462 7.597 7.746 7.916 8.065 8.218 8.367 8.493 8.613 8.714 8.798 8.865 8.914 8.909 8.805 8.569 8.107 7.27 5.748 3.842 2.164 0.74 -0.483 -1.6 -2.59 -3.5 -4.278 -5.056 -5.738 -6.369 -6.969 -7.521 -8.051 -8.541 -9.038 -9.494 -9.893 -10.304 -10.743 -11.106 -11.482 -11.878 -12.204 -12.542 -12.88 -13.235 -13.611 -13.875 -14.15 -14.599 -14.913 -15.231 -15.391 -15.739 -16.125 -16.538 -16.755 -17.09 -17.45 -17.697 -17.962 -18.572 -18.897 -19.255 -19.685 -20.195 -20.875 -21.831 -25.152 -5 ,1605 ,TETRA ,17621794,Tue Nov 30 19:05:54 CET,Tue Nov 30 20:58:21 CET,0.0 1.894 2.399 2.761 3.049 3.296 3.513 3.717 4.076 4.233 4.382 4.557 4.776 4.891 5.097 5.282 5.459 5.544 5.705 5.853 6.056 6.185 6.307 6.475 6.627 6.767 6.902 7.029 7.185 7.323 7.45 7.598 7.735 7.864 8.003 8.132 8.248 8.375 8.497 8.591 8.664 8.745 8.812 8.857 8.884 8.869 8.79 8.593 8.217 7.467 5.967 4.031 2.397 0.947 -0.338 -1.455 -2.427 -3.311 -4.095 -4.883 -5.55 -6.156 -6.724 -7.276 -7.801 -8.271 -8.768 -9.208 -9.592 -9.992 -10.399 -10.753 -11.106 -11.462 -11.759 -12.074 -12.418 -12.782 -13.136 -13.384 -13.655 -14.077 -14.367 -14.671 -14.838 -15.203 -15.572 -15.949 -16.156 -16.495 -16.864 -17.117 -17.385 -17.98 -18.311 -18.686 -19.106 -19.574 -20.21 -21.104 -24.17 -6 ,16607 ,TETRA ,17621795,Tue Nov 30 19:05:54 CET,Tue Nov 30 20:56:58 CET,0.0 1.709 2.173 2.52 2.808 3.061 3.294 3.496 3.84 3.995 4.144 4.317 4.531 4.64 4.844 5.049 5.239 5.321 5.469 5.612 5.824 5.953 6.067 6.23 6.395 6.545 6.683 6.825 6.998 7.144 7.281 7.443 7.594 7.736 7.894 8.054 8.189 8.327 8.469 8.608 8.742 8.86 8.968 9.055 9.093 9.073 8.977 8.767 8.363 7.56 6.024 4.089 2.422 0.944 -0.348 -1.485 -2.488 -3.388 -4.155 -4.957 -5.661 -6.286 -6.888 -7.458 -7.99 -8.478 -9.01 -9.49 -9.901 -10.31 -10.725 -11.077 -11.448 -11.832 -12.129 -12.438 -12.754 -13.07 -13.406 -13.646 -13.911 -14.335 -14.635 -14.954 -15.119 -15.472 -15.849 -16.247 -16.45 -16.782 -17.142 -17.371 -17.63 -18.251 -18.617 -19.049 -19.496 -19.987 -20.593 -21.451 -24.62 -7 ,32690 ,TETRA ,17621796,Tue Nov 30 19:07:02 CET,Tue Nov 30 20:59:24 CET,0.0 1.617 2.135 2.506 2.802 3.052 3.262 3.45 3.781 3.933 4.074 4.232 4.444 4.553 4.762 4.952 5.124 5.206 5.358 5.505 5.711 5.838 5.959 6.124 6.28 6.43 6.567 6.692 6.848 6.995 7.14 7.318 7.483 7.63 7.788 7.951 8.088 8.227 8.362 8.498 8.637 8.759 8.877 8.955 8.985 8.977 8.892 8.661 8.192 7.395 5.933 4.019 2.377 0.914 -0.366 -1.479 -2.444 -3.337 -4.121 -4.921 -5.626 -6.244 -6.83 -7.388 -7.912 -8.396 -8.906 -9.366 -9.75 -10.137 -10.546 -10.893 -11.252 -11.637 -11.935 -12.237 -12.563 -12.905 -13.266 -13.522 -13.783 -14.209 -14.507 -14.816 -14.975 -15.299 -15.658 -16.055 -16.259 -16.592 -16.961 -17.213 -17.478 -18.084 -18.427 -18.805 -19.236 -19.754 -20.396 -21.254 -24.732 -8 ,16718 ,TETRA ,17621797,Tue Nov 30 19:07:02 CET,Tue Nov 30 20:55:08 CET,0.0 1.685 2.179 2.531 2.822 3.092 3.33 3.535 3.879 4.032 4.177 4.332 4.55 4.659 4.851 5.03 5.19 5.266 5.422 5.574 5.788 5.922 6.05 6.234 6.397 6.532 6.66 6.782 6.93 7.068 7.193 7.327 7.453 7.573 7.696 7.83 7.946 8.054 8.16 8.267 8.377 8.482 8.583 8.66 8.698 8.674 8.563 8.334 7.908 7.135 5.669 3.783 2.137 0.719 -0.495 -1.596 -2.562 -3.428 -4.189 -4.948 -5.57 -6.13 -6.686 -7.216 -7.699 -8.138 -8.613 -9.044 -9.414 -9.801 -10.226 -10.579 -10.932 -11.312 -11.615 -11.936 -12.275 -12.611 -12.965 -13.233 -13.506 -13.907 -14.198 -14.508 -14.666 -15.001 -15.368 -15.774 -15.987 -16.318 -16.684 -16.945 -17.22 -17.824 -18.172 -18.565 -19.017 -19.538 -20.177 -21.108 -24.806 -9 ,14769 ,TETRA ,17621798,Tue Nov 30 19:07:02 CET,Tue Nov 30 20:59:40 CET,0.0 1.917 2.38 2.732 3.026 3.28 3.504 3.696 4.024 4.176 4.327 4.506 4.727 4.843 5.064 5.27 5.464 5.556 5.731 5.902 6.136 6.269 6.395 6.576 6.733 6.887 7.04 7.188 7.373 7.528 7.669 7.834 7.984 8.118 8.268 8.437 8.585 8.726 8.866 8.992 9.088 9.184 9.3 9.375 9.407 9.387 9.287 9.073 8.627 7.831 6.368 4.428 2.776 1.337 0.096 -1.017 -2.023 -2.932 -3.7 -4.484 -5.176 -5.79 -6.386 -6.951 -7.466 -7.927 -8.423 -8.872 -9.255 -9.666 -10.109 -10.484 -10.874 -11.288 -11.6 -11.911 -12.246 -12.599 -12.967 -13.22 -13.484 -13.898 -14.191 -14.499 -14.657 -15.006 -15.382 -15.768 -15.978 -16.317 -16.683 -16.934 -17.212 -17.845 -18.211 -18.606 -19.046 -19.554 -20.172 -21.035 -24.397 -10 ,1411 ,TETRA ,17621799,Tue Nov 30 19:07:02 CET,Tue Nov 30 20:59:40 CET,0.0 1.9 2.389 2.747 3.038 3.288 3.503 3.699 4.028 4.18 4.32 4.472 4.687 4.797 5.003 5.194 5.365 5.444 5.593 5.732 5.926 6.05 6.167 6.325 6.474 6.616 6.743 6.861 7.012 7.153 7.292 7.446 7.583 7.709 7.837 7.985 8.12 8.247 8.364 8.465 8.556 8.634 8.709 8.773 8.803 8.777 8.653 8.414 8.0 7.236 5.769 3.884 2.318 0.95 -0.287 -1.404 -2.389 -3.288 -4.073 -4.872 -5.566 -6.178 -6.779 -7.344 -7.849 -8.307 -8.791 -9.232 -9.628 -10.047 -10.481 -10.847 -11.235 -11.647 -11.967 -12.293 -12.632 -12.989 -13.376 -13.645 -13.929 -14.396 -14.722 -15.049 -15.215 -15.574 -15.963 -16.355 -16.561 -16.901 -17.261 -17.505 -17.769 -18.393 -18.739 -19.134 -19.583 -20.081 -20.688 -21.557 -24.785 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_43.txt deleted file mode 100644 index 1d5db571..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15119 ,TETRA ,17621800,Tue Nov 30 19:07:02 CET,Tue Nov 30 21:01:18 CET,0.0 2.534 3.189 3.7 4.136 4.486 4.785 5.058 5.549 5.763 5.966 6.251 6.529 6.709 7.034 7.318 7.583 7.723 7.998 8.244 8.598 8.827 9.036 9.334 9.624 9.893 10.154 10.415 10.751 11.057 11.34 11.685 12.031 12.383 12.791 13.212 13.627 14.103 14.573 15.067 15.602 16.189 16.86 17.517 18.286 19.114 19.955 20.838 21.875 23.068 24.378 25.213 25.442 25.452 25.399 25.241 25.017 24.786 24.561 24.279 24.007 23.752 23.485 23.201 22.929 22.672 22.385 22.143 21.925 21.692 21.451 21.234 20.991 20.743 20.536 20.313 20.085 19.844 19.595 19.411 19.215 18.919 18.715 18.484 18.357 18.089 17.813 17.502 17.329 17.062 16.715 16.483 16.243 15.714 15.413 15.077 14.675 14.24 13.711 12.946 8.195 -2 ,9679 ,TETRA ,17621801,Tue Nov 30 19:07:54 CET,Tue Nov 30 21:00:39 CET,0.0 2.07 2.722 3.229 3.636 3.977 4.277 4.554 5.079 5.31 5.513 5.788 6.062 6.238 6.574 6.872 7.147 7.283 7.553 7.808 8.16 8.391 8.621 8.949 9.259 9.545 9.816 10.094 10.443 10.762 11.074 11.451 11.819 12.181 12.583 13.023 13.443 13.884 14.359 14.868 15.394 15.976 16.655 17.307 18.008 18.755 19.608 20.561 21.635 22.891 24.233 25.114 25.385 25.347 25.199 24.962 24.683 24.375 24.082 23.77 23.491 23.219 22.924 22.655 22.398 22.136 21.852 21.597 21.362 21.091 20.799 20.559 20.304 20.033 19.809 19.565 19.321 19.074 18.823 18.66 18.468 18.14 17.926 17.692 17.571 17.323 17.044 16.725 16.553 16.314 16.04 15.851 15.647 15.174 14.898 14.583 14.232 13.819 13.298 12.462 9.534 -3 ,32110 ,TETRA ,17621802,Tue Nov 30 19:07:54 CET,Tue Nov 30 20:59:16 CET,0.0 2.67 3.289 3.76 4.161 4.509 4.805 5.08 5.554 5.76 5.97 6.276 6.552 6.728 7.037 7.329 7.608 7.741 8.0 8.24 8.591 8.811 9.019 9.329 9.623 9.906 10.174 10.427 10.745 11.045 11.337 11.677 12.013 12.343 12.702 13.087 13.475 13.914 14.373 14.847 15.341 15.9 16.542 17.206 17.983 18.795 19.712 20.716 21.814 22.987 24.249 25.098 25.378 25.384 25.259 25.023 24.765 24.508 24.236 23.912 23.613 23.325 23.03 22.74 22.452 22.184 21.9 21.626 21.383 21.152 20.9 20.68 20.445 20.182 19.972 19.764 19.556 19.327 19.049 18.856 18.67 18.365 18.14 17.902 17.784 17.522 17.224 16.91 16.743 16.487 16.182 15.965 15.725 15.193 14.91 14.574 14.18 13.742 13.179 12.466 9.749 -4 ,10285 ,TETRA ,17621803,Tue Nov 30 19:07:56 CET,Tue Nov 30 20:48:00 CET,0.0 2.094 2.753 3.24 3.615 3.936 4.248 4.515 4.976 5.196 5.401 5.674 5.932 6.1 6.424 6.727 7.017 7.147 7.397 7.657 8.022 8.24 8.457 8.771 9.057 9.325 9.582 9.836 10.168 10.485 10.795 11.192 11.568 11.907 12.295 12.729 13.14 13.587 14.064 14.56 15.074 15.656 16.318 16.973 17.749 18.59 19.495 20.515 21.659 22.879 24.285 25.145 25.424 25.434 25.285 25.079 24.816 24.531 24.256 23.937 23.636 23.356 23.072 22.809 22.549 22.293 22.028 21.785 21.55 21.31 21.084 20.873 20.629 20.378 20.182 19.964 19.744 19.513 19.256 19.069 18.861 18.533 18.313 18.074 17.946 17.7 17.412 17.08 16.915 16.661 16.338 16.131 15.925 15.431 15.123 14.788 14.402 13.946 13.401 12.627 8.906 -5 ,29978 ,TETRA ,17621804,Tue Nov 30 19:07:54 CET,Tue Nov 30 21:06:26 CET,0.0 3.137 3.817 4.299 4.711 5.078 5.4 5.68 6.16 6.369 6.565 6.854 7.137 7.312 7.631 7.922 8.195 8.33 8.591 8.842 9.199 9.421 9.628 9.919 10.206 10.485 10.753 11.01 11.326 11.606 11.87 12.198 12.526 12.842 13.209 13.626 14.01 14.411 14.847 15.329 15.835 16.388 17.004 17.608 18.346 19.149 19.988 20.953 22.048 23.223 24.474 25.262 25.518 25.513 25.366 25.158 24.928 24.662 24.411 24.149 23.867 23.593 23.322 23.037 22.768 22.529 22.267 21.99 21.72 21.44 21.149 20.904 20.663 20.383 20.151 19.918 19.668 19.381 19.071 18.862 18.638 18.277 18.019 17.759 17.625 17.331 17.018 16.692 16.515 16.236 15.881 15.651 15.389 14.805 14.506 14.192 13.819 13.357 12.741 11.946 8.094 -6 ,15024 ,TETRA ,17621805,Tue Nov 30 19:08:52 CET,Tue Nov 30 21:03:08 CET,0.0 2.188 2.941 3.47 3.896 4.227 4.535 4.826 5.331 5.575 5.814 6.119 6.383 6.547 6.88 7.195 7.47 7.597 7.859 8.129 8.504 8.725 8.936 9.234 9.515 9.783 10.044 10.302 10.62 10.92 11.22 11.581 11.91 12.212 12.574 12.982 13.361 13.774 14.216 14.701 15.206 15.737 16.361 16.97 17.661 18.473 19.392 20.423 21.559 22.761 24.115 24.901 25.132 25.088 24.946 24.73 24.447 24.178 23.912 23.619 23.338 23.05 22.765 22.468 22.152 21.862 21.558 21.286 21.05 20.786 20.523 20.31 20.074 19.812 19.602 19.391 19.173 18.939 18.695 18.519 18.317 17.999 17.774 17.544 17.428 17.163 16.876 16.556 16.384 16.129 15.822 15.606 15.381 14.873 14.551 14.185 13.789 13.355 12.822 12.022 9.013 -7 ,6297 ,TETRA ,17621806,Tue Nov 30 19:10:53 CET,Tue Nov 30 20:56:16 CET,0.0 2.202 2.905 3.404 3.82 4.174 4.462 4.725 5.231 5.456 5.666 5.947 6.207 6.373 6.695 6.983 7.248 7.376 7.623 7.867 8.21 8.426 8.633 8.939 9.236 9.518 9.792 10.049 10.372 10.689 10.993 11.369 11.726 12.048 12.424 12.844 13.235 13.655 14.105 14.598 15.136 15.743 16.405 17.038 17.766 18.564 19.481 20.499 21.612 22.868 24.22 25.043 25.331 25.332 25.19 24.961 24.692 24.401 24.118 23.812 23.531 23.258 22.943 22.626 22.358 22.122 21.836 21.557 21.338 21.107 20.855 20.64 20.405 20.17 19.988 19.79 19.572 19.336 19.075 18.882 18.681 18.366 18.134 17.892 17.775 17.53 17.253 16.94 16.77 16.52 16.202 15.98 15.758 15.258 14.966 14.658 14.293 13.815 13.258 12.563 8.314 -8 ,13117 ,TETRA ,17621807,Tue Nov 30 19:12:55 CET,Tue Nov 30 21:17:34 CET,0.0 2.859 3.503 3.969 4.373 4.724 5.043 5.316 5.781 6.013 6.234 6.521 6.793 6.961 7.283 7.593 7.887 8.022 8.279 8.519 8.852 9.073 9.291 9.595 9.886 10.159 10.42 10.674 10.982 11.275 11.563 11.904 12.232 12.553 12.928 13.353 13.761 14.202 14.665 15.147 15.654 16.215 16.853 17.474 18.203 19.02 19.937 20.933 22.01 23.194 24.433 25.17 25.361 25.321 25.15 24.919 24.673 24.386 24.085 23.74 23.429 23.14 22.849 22.563 22.298 22.04 21.727 21.44 21.214 20.979 20.718 20.499 20.262 20.013 19.823 19.618 19.393 19.136 18.859 18.681 18.495 18.183 17.965 17.733 17.612 17.357 17.06 16.723 16.551 16.303 15.995 15.789 15.567 15.079 14.778 14.427 14.067 13.652 13.092 12.216 8.337 -9 ,7523 ,TETRA ,17621808,Tue Nov 30 19:12:58 CET,Tue Nov 30 21:05:48 CET,0.0 2.317 2.983 3.489 3.917 4.261 4.548 4.812 5.315 5.541 5.742 6.021 6.289 6.462 6.793 7.093 7.378 7.526 7.811 8.055 8.396 8.619 8.829 9.134 9.428 9.704 9.968 10.221 10.54 10.846 11.138 11.491 11.839 12.176 12.568 13.006 13.423 13.868 14.358 14.871 15.382 15.938 16.582 17.243 17.995 18.825 19.736 20.709 21.823 23.018 24.25 25.037 25.303 25.368 25.286 25.117 24.937 24.724 24.498 24.236 23.973 23.724 23.465 23.221 23.005 22.771 22.5 22.253 22.018 21.766 21.495 21.274 21.043 20.785 20.584 20.372 20.138 19.896 19.622 19.426 19.242 18.968 18.769 18.534 18.404 18.139 17.854 17.552 17.392 17.14 16.832 16.622 16.388 15.852 15.551 15.218 14.837 14.39 13.844 13.029 9.14 -10 ,27803 ,TETRA ,17621809,Tue Nov 30 19:12:56 CET,Tue Nov 30 21:03:31 CET,0.0 2.843 3.556 4.051 4.436 4.784 5.097 5.363 5.824 6.047 6.258 6.564 6.86 7.046 7.394 7.709 7.997 8.131 8.395 8.644 8.993 9.217 9.426 9.727 10.026 10.304 10.566 10.817 11.127 11.419 11.705 12.051 12.386 12.69 13.038 13.443 13.834 14.256 14.702 15.156 15.649 16.2 16.812 17.463 18.182 18.957 19.877 20.88 21.998 23.194 24.345 25.059 25.327 25.279 25.06 24.796 24.542 24.288 24.015 23.687 23.394 23.139 22.853 22.559 22.289 22.031 21.725 21.428 21.188 20.951 20.703 20.494 20.266 20.018 19.824 19.606 19.375 19.136 18.851 18.656 18.476 18.174 17.947 17.7 17.564 17.29 17.002 16.677 16.509 16.249 15.922 15.719 15.511 15.031 14.747 14.415 14.04 13.619 13.068 12.257 8.936 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_20.txt deleted file mode 100644 index a85e231d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_20.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32227 ,TETRA ,17621810,Tue Nov 30 19:12:54 CET,Tue Nov 30 21:05:23 CET,0.0 1.447 2.039 2.464 2.754 3.005 3.241 3.46 3.849 4.03 4.201 4.41 4.626 4.761 5.043 5.288 5.495 5.596 5.788 5.968 6.235 6.397 6.549 6.78 7.0 7.2 7.399 7.586 7.804 8.024 8.255 8.521 8.748 8.953 9.187 9.455 9.707 10.003 10.324 10.611 10.905 11.247 11.639 12.028 12.45 12.892 13.376 13.859 14.301 14.631 14.63 14.105 13.418 12.726 12.067 11.421 10.818 10.224 9.656 9.105 8.628 8.17 7.722 7.278 6.857 6.477 6.075 5.694 5.37 5.036 4.667 4.355 4.03 3.686 3.425 3.152 2.86 2.554 2.224 1.998 1.767 1.388 1.13 0.874 0.739 0.441 0.122 -0.212 -0.388 -0.657 -0.966 -1.178 -1.41 -1.912 -2.188 -2.495 -2.857 -3.254 -3.727 -4.41 -7.505 -2 ,21927 ,TETRA ,17621811,Tue Nov 30 19:12:57 CET,Tue Nov 30 21:05:15 CET,0.0 1.331 1.806 2.17 2.465 2.713 2.933 3.154 3.561 3.738 3.895 4.081 4.288 4.414 4.653 4.865 5.069 5.168 5.355 5.533 5.783 5.945 6.108 6.321 6.533 6.735 6.933 7.146 7.407 7.637 7.867 8.161 8.424 8.673 8.98 9.309 9.605 9.911 10.218 10.527 10.86 11.237 11.644 12.024 12.455 12.904 13.381 13.825 14.197 14.538 14.643 14.175 13.503 12.781 12.063 11.393 10.776 10.161 9.61 9.051 8.533 8.058 7.597 7.183 6.799 6.426 6.046 5.701 5.39 5.067 4.718 4.43 4.134 3.818 3.565 3.31 3.034 2.741 2.457 2.242 1.997 1.632 1.381 1.11 0.973 0.68 0.363 0.04 -0.121 -0.379 -0.654 -0.856 -1.069 -1.533 -1.802 -2.103 -2.436 -2.83 -3.313 -3.97 -6.322 -3 ,10556 ,TETRA ,17621812,Tue Nov 30 19:14:54 CET,Tue Nov 30 20:54:48 CET,0.0 1.466 1.972 2.361 2.696 2.97 3.205 3.432 3.842 4.024 4.19 4.437 4.686 4.845 5.126 5.385 5.639 5.761 5.985 6.195 6.497 6.689 6.871 7.129 7.382 7.635 7.862 8.063 8.328 8.599 8.876 9.182 9.455 9.725 10.046 10.396 10.695 11.002 11.336 11.688 12.027 12.368 12.763 13.166 13.609 14.059 14.502 14.968 15.42 15.693 15.667 15.165 14.5 13.819 13.118 12.411 11.743 11.102 10.542 9.993 9.502 9.044 8.621 8.234 7.846 7.474 7.08 6.712 6.391 6.054 5.704 5.411 5.088 4.745 4.478 4.192 3.893 3.586 3.272 3.052 2.821 2.458 2.189 1.898 1.75 1.431 1.088 0.719 0.524 0.23 -0.125 -0.359 -0.609 -1.146 -1.467 -1.831 -2.209 -2.634 -3.157 -3.848 -6.479 -4 ,19711 ,TETRA ,17621813,Tue Nov 30 19:15:53 CET,Tue Nov 30 21:24:06 CET,0.0 1.986 2.479 2.856 3.159 3.41 3.641 3.865 4.259 4.441 4.621 4.854 5.093 5.242 5.509 5.757 5.999 6.111 6.327 6.535 6.808 6.975 7.143 7.382 7.603 7.811 8.009 8.199 8.446 8.678 8.899 9.171 9.445 9.703 9.994 10.296 10.556 10.854 11.179 11.51 11.864 12.263 12.712 13.142 13.616 14.072 14.52 14.95 15.363 15.644 15.573 15.049 14.332 13.59 12.857 12.154 11.548 11.006 10.53 10.02 9.564 9.15 8.747 8.338 7.944 7.591 7.207 6.865 6.569 6.243 5.909 5.634 5.335 5.032 4.797 4.529 4.251 3.982 3.695 3.48 3.25 2.898 2.653 2.4 2.266 1.976 1.68 1.358 1.182 0.913 0.629 0.423 0.199 -0.294 -0.577 -0.889 -1.223 -1.63 -2.113 -2.756 -5.02 -5 ,7441 ,TETRA ,17621814,Tue Nov 30 19:26:03 CET,Tue Nov 30 21:17:04 CET,0.0 1.515 2.013 2.402 2.73 3.005 3.244 3.466 3.872 4.044 4.204 4.431 4.66 4.8 5.062 5.311 5.54 5.647 5.863 6.073 6.346 6.518 6.691 6.935 7.163 7.385 7.595 7.796 8.057 8.298 8.52 8.776 9.03 9.295 9.601 9.927 10.244 10.585 10.915 11.257 11.612 11.986 12.423 12.835 13.257 13.72 14.187 14.593 14.967 15.217 15.166 14.596 13.875 13.14 12.418 11.705 11.025 10.404 9.865 9.326 8.855 8.404 7.958 7.519 7.096 6.701 6.287 5.908 5.575 5.226 4.867 4.578 4.275 3.944 3.669 3.377 3.07 2.748 2.415 2.186 1.943 1.558 1.291 0.996 0.841 0.506 0.151 -0.21 -0.399 -0.675 -0.983 -1.179 -1.384 -1.86 -2.126 -2.424 -2.77 -3.174 -3.651 -4.326 -7.528 -6 ,24167 ,TETRA ,17621815,Tue Nov 30 19:29:06 CET,Tue Nov 30 21:17:17 CET,0.0 1.534 2.018 2.392 2.7 2.964 3.209 3.416 3.771 3.938 4.103 4.321 4.542 4.676 4.936 5.173 5.384 5.485 5.692 5.906 6.231 6.424 6.608 6.874 7.109 7.327 7.547 7.756 8.018 8.277 8.519 8.799 9.055 9.31 9.594 9.887 10.174 10.484 10.798 11.124 11.481 11.861 12.265 12.657 13.073 13.485 13.906 14.33 14.721 14.989 14.97 14.464 13.78 13.047 12.33 11.642 11.019 10.406 9.849 9.276 8.773 8.313 7.862 7.446 7.058 6.691 6.278 5.908 5.593 5.262 4.907 4.606 4.285 3.947 3.679 3.394 3.106 2.804 2.489 2.265 2.02 1.625 1.344 1.048 0.892 0.568 0.23 -0.121 -0.312 -0.601 -0.944 -1.163 -1.393 -1.907 -2.203 -2.525 -2.861 -3.241 -3.689 -4.317 -6.484 -7 ,29983 ,TETRA ,17621816,Tue Nov 30 19:29:06 CET,Tue Nov 30 21:19:54 CET,0.0 1.773 2.278 2.66 2.975 3.245 3.489 3.72 4.132 4.306 4.476 4.724 4.957 5.097 5.365 5.618 5.844 5.948 6.151 6.346 6.622 6.791 6.949 7.18 7.406 7.62 7.827 8.029 8.304 8.562 8.794 9.071 9.348 9.607 9.891 10.207 10.494 10.808 11.15 11.512 11.851 12.201 12.627 13.032 13.464 13.886 14.32 14.783 15.254 15.573 15.515 14.937 14.242 13.513 12.792 12.093 11.466 10.89 10.39 9.874 9.388 8.941 8.527 8.136 7.755 7.404 7.028 6.691 6.39 6.075 5.743 5.46 5.165 4.843 4.589 4.317 4.036 3.755 3.449 3.232 3.006 2.638 2.382 2.12 1.989 1.708 1.406 1.089 0.924 0.661 0.364 0.152 -0.068 -0.541 -0.795 -1.075 -1.401 -1.793 -2.274 -2.901 -5.619 -8 ,21569 ,TETRA ,17621817,Tue Nov 30 19:29:06 CET,Tue Nov 30 21:20:57 CET,0.0 1.447 1.933 2.295 2.594 2.841 3.082 3.313 3.692 3.86 4.017 4.224 4.447 4.587 4.845 5.086 5.311 5.411 5.6 5.78 6.043 6.216 6.381 6.603 6.817 7.026 7.212 7.383 7.615 7.844 8.043 8.277 8.513 8.734 8.976 9.26 9.528 9.8 10.09 10.39 10.694 11.022 11.387 11.726 12.102 12.48 12.872 13.295 13.692 13.974 13.961 13.473 12.811 12.083 11.392 10.716 10.106 9.54 9.036 8.507 8.017 7.572 7.138 6.733 6.363 6.029 5.671 5.339 5.05 4.74 4.408 4.127 3.812 3.486 3.25 2.999 2.738 2.475 2.19 1.982 1.774 1.455 1.218 0.966 0.836 0.565 0.268 -0.055 -0.225 -0.481 -0.755 -0.953 -1.15 -1.628 -1.922 -2.247 -2.592 -2.961 -3.421 -4.081 -6.772 -9 ,9972 ,TETRA ,17621818,Tue Nov 30 19:30:04 CET,Tue Nov 30 21:17:53 CET,0.0 1.632 2.139 2.511 2.819 3.094 3.348 3.574 3.98 4.16 4.323 4.55 4.782 4.918 5.176 5.422 5.646 5.752 5.953 6.147 6.413 6.579 6.739 6.961 7.177 7.391 7.595 7.788 8.034 8.271 8.492 8.748 8.99 9.23 9.504 9.789 10.05 10.331 10.633 10.939 11.25 11.586 11.972 12.357 12.799 13.246 13.658 14.062 14.484 14.85 14.863 14.272 13.538 12.796 12.066 11.355 10.707 10.09 9.532 8.977 8.473 7.994 7.541 7.116 6.71 6.323 5.913 5.539 5.208 4.859 4.498 4.196 3.859 3.505 3.232 2.941 2.636 2.327 2.008 1.792 1.578 1.239 0.999 0.747 0.615 0.334 0.035 -0.279 -0.445 -0.707 -0.987 -1.189 -1.405 -1.911 -2.196 -2.497 -2.841 -3.243 -3.719 -4.338 -7.233 -10 ,32477 ,TETRA ,17621819,Tue Nov 30 19:31:02 CET,Tue Nov 30 21:21:14 CET,0.0 1.52 2.078 2.487 2.799 3.054 3.293 3.513 3.887 4.056 4.219 4.443 4.672 4.81 5.082 5.331 5.566 5.678 5.884 6.084 6.364 6.536 6.711 6.961 7.191 7.41 7.622 7.819 8.063 8.319 8.568 8.845 9.111 9.382 9.697 10.039 10.355 10.673 10.988 11.315 11.659 12.023 12.421 12.793 13.205 13.657 14.125 14.598 15.058 15.374 15.426 15.006 14.368 13.694 13.063 12.393 11.759 11.218 10.713 10.156 9.665 9.196 8.737 8.304 7.9 7.53 7.117 6.728 6.389 6.04 5.678 5.385 5.074 4.736 4.474 4.196 3.902 3.593 3.264 3.032 2.785 2.404 2.158 1.898 1.757 1.484 1.203 0.883 0.713 0.443 0.141 -0.055 -0.252 -0.732 -1.021 -1.323 -1.668 -2.075 -2.557 -3.262 -5.82 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_43.txt deleted file mode 100644 index e8134fe4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23971 ,TETRA ,17621820,Tue Nov 30 19:31:02 CET,Tue Nov 30 21:21:06 CET,0.0 1.785 2.288 2.639 2.934 3.195 3.437 3.657 4.043 4.229 4.404 4.624 4.851 4.983 5.225 5.465 5.693 5.797 5.996 6.188 6.472 6.647 6.808 7.041 7.258 7.476 7.696 7.912 8.189 8.455 8.708 9.002 9.29 9.568 9.878 10.219 10.531 10.865 11.227 11.609 11.999 12.43 12.906 13.354 13.883 14.487 15.143 15.855 16.657 17.458 18.199 18.549 18.476 18.21 17.857 17.457 17.091 16.74 16.379 15.986 15.628 15.297 14.99 14.678 14.364 14.071 13.749 13.445 13.18 12.9 12.6 12.349 12.078 11.798 11.579 11.345 11.097 10.836 10.567 10.382 10.183 9.864 9.638 9.382 9.249 8.982 8.687 8.36 8.191 7.945 7.634 7.421 7.206 6.713 6.442 6.133 5.768 5.356 4.859 4.169 0.876 -2 ,12173 ,TETRA ,17621821,Tue Nov 30 19:31:03 CET,Tue Nov 30 21:18:02 CET,0.0 2.053 2.571 2.967 3.29 3.574 3.833 4.068 4.465 4.64 4.806 5.02 5.25 5.397 5.674 5.918 6.145 6.254 6.471 6.674 6.952 7.133 7.305 7.553 7.789 8.007 8.215 8.412 8.666 8.906 9.132 9.428 9.719 9.982 10.279 10.602 10.914 11.254 11.638 12.054 12.451 12.879 13.38 13.867 14.41 14.998 15.68 16.393 17.132 17.959 18.776 19.158 19.139 18.916 18.607 18.24 17.846 17.446 17.081 16.7 16.345 16.022 15.689 15.356 15.052 14.758 14.417 14.105 13.837 13.55 13.246 12.987 12.716 12.413 12.161 11.901 11.63 11.352 11.054 10.837 10.613 10.266 10.015 9.745 9.609 9.335 9.043 8.725 8.555 8.298 7.985 7.779 7.563 7.055 6.756 6.437 6.085 5.657 5.13 4.342 1.523 -3 ,23883 ,TETRA ,17621822,Tue Nov 30 19:31:03 CET,Tue Nov 30 21:25:37 CET,0.0 1.767 2.309 2.759 3.103 3.377 3.63 3.857 4.255 4.439 4.618 4.861 5.094 5.235 5.5 5.735 5.961 6.074 6.285 6.482 6.759 6.932 7.105 7.348 7.572 7.786 7.995 8.197 8.458 8.709 8.949 9.248 9.534 9.803 10.113 10.453 10.784 11.156 11.534 11.909 12.312 12.772 13.279 13.77 14.339 14.927 15.56 16.27 17.057 17.844 18.554 18.84 18.714 18.439 18.123 17.793 17.44 17.088 16.762 16.413 16.094 15.797 15.491 15.192 14.898 14.607 14.302 14.03 13.794 13.544 13.282 13.06 12.806 12.531 12.327 12.114 11.883 11.643 11.386 11.199 10.998 10.684 10.472 10.244 10.118 9.844 9.545 9.222 9.052 8.796 8.497 8.282 8.048 7.549 7.258 6.921 6.549 6.123 5.555 4.808 2.361 -4 ,13920 ,TETRA ,17621823,Tue Nov 30 19:31:05 CET,Tue Nov 30 21:21:22 CET,0.0 2.007 2.537 2.921 3.229 3.51 3.771 4.001 4.402 4.583 4.752 4.982 5.211 5.356 5.634 5.887 6.122 6.23 6.441 6.647 6.937 7.119 7.292 7.539 7.778 8.002 8.215 8.426 8.696 8.945 9.171 9.433 9.684 9.934 10.225 10.537 10.831 11.172 11.549 11.923 12.305 12.742 13.235 13.735 14.284 14.87 15.542 16.219 16.981 17.809 18.505 18.774 18.713 18.499 18.184 17.783 17.375 16.979 16.617 16.227 15.867 15.525 15.182 14.872 14.567 14.269 13.939 13.618 13.328 13.025 12.72 12.462 12.191 11.9 11.674 11.437 11.174 10.898 10.596 10.375 10.147 9.788 9.534 9.266 9.116 8.808 8.488 8.137 7.959 7.705 7.384 7.163 6.938 6.471 6.187 5.868 5.502 5.058 4.539 3.823 0.717 -5 ,25690 ,TETRA ,17621824,Tue Nov 30 19:31:03 CET,Tue Nov 30 21:23:46 CET,0.0 1.964 2.509 2.921 3.266 3.528 3.765 3.996 4.403 4.589 4.766 4.99 5.221 5.357 5.62 5.869 6.089 6.197 6.402 6.594 6.87 7.041 7.209 7.458 7.689 7.911 8.121 8.315 8.561 8.8 9.041 9.334 9.629 9.921 10.224 10.54 10.848 11.2 11.57 11.926 12.289 12.701 13.181 13.667 14.212 14.784 15.423 16.102 16.846 17.661 18.437 18.753 18.697 18.477 18.141 17.742 17.362 16.975 16.613 16.242 15.892 15.565 15.24 14.907 14.584 14.298 13.993 13.692 13.421 13.141 12.838 12.575 12.302 12.008 11.776 11.534 11.286 11.024 10.742 10.539 10.325 9.995 9.748 9.49 9.366 9.099 8.776 8.42 8.237 7.976 7.662 7.441 7.201 6.704 6.429 6.086 5.705 5.28 4.747 4.03 0.736 -6 ,28405 ,TETRA ,17621825,Tue Nov 30 19:31:03 CET,Tue Nov 30 21:15:03 CET,0.0 1.666 2.164 2.556 2.888 3.177 3.44 3.678 4.108 4.299 4.472 4.712 4.95 5.096 5.366 5.617 5.847 5.959 6.187 6.403 6.685 6.86 7.031 7.274 7.503 7.729 7.951 8.164 8.435 8.694 8.947 9.25 9.544 9.822 10.131 10.477 10.806 11.168 11.544 11.927 12.308 12.741 13.264 13.787 14.403 15.032 15.671 16.365 17.126 17.915 18.656 18.912 18.775 18.482 18.132 17.759 17.391 17.025 16.668 16.284 15.905 15.544 15.203 14.881 14.574 14.292 13.992 13.722 13.488 13.223 12.94 12.701 12.443 12.171 11.962 11.739 11.495 11.221 10.939 10.749 10.537 10.203 9.982 9.742 9.607 9.328 9.042 8.731 8.558 8.297 7.974 7.761 7.542 7.028 6.733 6.416 6.049 5.614 5.092 4.353 1.549 -7 ,18708 ,TETRA ,17621826,Tue Nov 30 20:42:54 CET,Tue Nov 30 22:36:49 CET,0.0 2.435 2.975 3.371 3.679 3.957 4.216 4.444 4.84 5.018 5.187 5.413 5.642 5.778 6.032 6.269 6.497 6.608 6.818 7.017 7.305 7.494 7.673 7.926 8.163 8.379 8.583 8.773 9.015 9.244 9.47 9.749 10.007 10.252 10.539 10.87 11.199 11.556 11.932 12.312 12.703 13.151 13.665 14.171 14.768 15.405 16.099 16.822 17.588 18.35 19.02 19.349 19.357 19.132 18.782 18.434 18.079 17.687 17.305 16.904 16.546 16.213 15.889 15.568 15.237 14.924 14.594 14.287 14.018 13.716 13.408 13.166 12.889 12.593 12.355 12.104 11.854 11.585 11.289 11.084 10.871 10.536 10.303 10.065 9.943 9.669 9.374 9.053 8.879 8.626 8.325 8.112 7.878 7.328 7.036 6.736 6.37 5.921 5.373 4.597 2.352 -8 ,16618 ,TETRA ,17621827,Tue Nov 30 20:42:56 CET,Tue Nov 30 22:37:12 CET,0.0 2.366 2.97 3.368 3.677 3.951 4.209 4.439 4.848 5.03 5.207 5.446 5.683 5.824 6.086 6.333 6.562 6.674 6.89 7.089 7.367 7.544 7.721 7.975 8.209 8.426 8.636 8.845 9.132 9.419 9.684 9.981 10.255 10.52 10.823 11.157 11.479 11.81 12.168 12.553 12.934 13.357 13.871 14.395 14.989 15.635 16.376 17.162 17.959 18.751 19.483 19.773 19.71 19.492 19.146 18.786 18.443 18.083 17.741 17.359 17.001 16.664 16.33 15.996 15.676 15.368 15.045 14.757 14.494 14.228 13.961 13.727 13.482 13.231 13.019 12.796 12.569 12.309 12.016 11.819 11.625 11.299 11.065 10.83 10.701 10.42 10.126 9.8 9.627 9.379 9.08 8.868 8.644 8.133 7.836 7.519 7.156 6.73 6.204 5.459 2.401 -9 ,21273 ,TETRA ,17621828,Tue Nov 30 20:42:54 CET,Tue Nov 30 22:38:17 CET,0.0 2.048 2.601 2.976 3.316 3.6 3.846 4.076 4.481 4.664 4.834 5.07 5.309 5.46 5.738 5.991 6.226 6.338 6.552 6.762 7.063 7.252 7.422 7.654 7.891 8.123 8.336 8.536 8.794 9.039 9.27 9.557 9.823 10.068 10.359 10.692 11.002 11.329 11.679 12.058 12.459 12.9 13.396 13.874 14.422 15.054 15.769 16.46 17.158 17.91 18.67 18.98 18.896 18.687 18.387 18.007 17.619 17.248 16.902 16.501 16.142 15.832 15.517 15.201 14.881 14.576 14.249 13.959 13.705 13.437 13.152 12.907 12.646 12.365 12.161 11.952 11.707 11.44 11.161 10.966 10.763 10.442 10.214 9.961 9.826 9.557 9.27 8.935 8.75 8.491 8.189 7.976 7.755 7.27 7.001 6.695 6.335 5.929 5.407 4.686 1.449 -10 ,16921 ,TETRA ,17621829,Tue Nov 30 20:42:54 CET,Tue Nov 30 22:28:08 CET,0.0 2.124 2.627 3.023 3.334 3.61 3.861 4.079 4.477 4.663 4.844 5.082 5.313 5.455 5.728 5.978 6.206 6.32 6.537 6.74 7.055 7.263 7.45 7.717 7.97 8.205 8.425 8.638 8.91 9.167 9.407 9.699 9.986 10.259 10.566 10.899 11.208 11.541 11.907 12.3 12.7 13.122 13.598 14.096 14.693 15.307 15.959 16.695 17.51 18.358 19.146 19.455 19.4 19.165 18.867 18.533 18.169 17.791 17.433 17.066 16.732 16.406 16.064 15.709 15.382 15.085 14.743 14.426 14.163 13.886 13.586 13.34 13.089 12.827 12.617 12.393 12.157 11.91 11.644 11.444 11.235 10.916 10.694 10.456 10.333 10.074 9.779 9.47 9.306 9.056 8.767 8.563 8.349 7.855 7.571 7.267 6.915 6.498 5.954 5.17 1.466 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_39.txt deleted file mode 100644 index a03ffdef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4225 ,TETRA ,17621830,Tue Nov 30 20:42:55 CET,Tue Nov 30 22:24:17 CET,0.0 1.879 2.409 2.774 3.05 3.308 3.545 3.754 4.111 4.278 4.431 4.612 4.813 4.929 5.145 5.331 5.501 5.581 5.73 5.874 6.085 6.214 6.326 6.475 6.614 6.745 6.858 6.962 7.096 7.227 7.356 7.502 7.624 7.732 7.851 7.958 8.057 8.153 8.233 8.315 8.383 8.427 8.424 8.361 8.238 8.035 7.714 7.215 6.42 5.132 2.919 0.199 -2.096 -4.009 -5.597 -6.983 -8.187 -9.236 -10.14 -11.069 -11.863 -12.546 -13.186 -13.802 -14.374 -14.883 -15.42 -15.918 -16.361 -16.805 -17.259 -17.637 -18.021 -18.432 -18.749 -19.073 -19.429 -19.804 -20.18 -20.432 -20.691 -21.105 -21.4 -21.706 -21.866 -22.198 -22.546 -22.93 -23.136 -23.454 -23.762 -23.992 -24.249 -24.826 -25.14 -25.475 -25.872 -26.316 -26.86 -27.714 -30.354 -2 ,22521 ,TETRA ,17621831,Tue Nov 30 20:42:55 CET,Tue Nov 30 22:16:32 CET,0.0 1.677 2.207 2.549 2.827 3.089 3.319 3.514 3.856 4.015 4.167 4.357 4.565 4.679 4.89 5.081 5.254 5.337 5.49 5.631 5.822 5.94 6.052 6.206 6.352 6.498 6.634 6.758 6.925 7.087 7.225 7.378 7.525 7.642 7.759 7.871 7.962 8.049 8.118 8.179 8.219 8.23 8.207 8.149 8.047 7.866 7.547 7.033 6.225 4.973 2.872 0.289 -1.909 -3.716 -5.221 -6.608 -7.865 -8.999 -9.985 -10.96 -11.743 -12.424 -13.067 -13.674 -14.239 -14.739 -15.255 -15.721 -16.123 -16.546 -17.006 -17.395 -17.793 -18.214 -18.529 -18.847 -19.182 -19.541 -19.924 -20.18 -20.454 -20.883 -21.176 -21.484 -21.643 -21.975 -22.321 -22.692 -22.892 -23.216 -23.547 -23.788 -24.034 -24.591 -24.926 -25.281 -25.668 -26.108 -26.644 -27.441 -30.808 -3 ,4308 ,TETRA ,17621832,Tue Nov 30 20:44:51 CET,Tue Nov 30 22:41:26 CET,0.0 1.725 2.273 2.664 2.964 3.228 3.457 3.656 3.991 4.142 4.288 4.465 4.665 4.78 4.992 5.189 5.377 5.461 5.626 5.79 6.021 6.164 6.292 6.468 6.624 6.771 6.905 7.027 7.184 7.32 7.441 7.583 7.712 7.823 7.926 8.033 8.133 8.221 8.308 8.385 8.448 8.472 8.46 8.425 8.293 8.089 7.78 7.307 6.575 5.339 3.206 0.615 -1.586 -3.459 -5.036 -6.391 -7.582 -8.679 -9.595 -10.492 -11.264 -11.95 -12.603 -13.217 -13.795 -14.335 -14.893 -15.372 -15.804 -16.26 -16.722 -17.121 -17.543 -17.984 -18.315 -18.65 -19.007 -19.373 -19.757 -20.026 -20.304 -20.74 -21.035 -21.344 -21.502 -21.836 -22.192 -22.55 -22.746 -23.075 -23.425 -23.671 -23.928 -24.498 -24.816 -25.156 -25.546 -25.987 -26.529 -27.27 -31.581 -4 ,3418 ,TETRA ,17621833,Tue Nov 30 20:42:55 CET,Tue Nov 30 22:35:32 CET,0.0 1.554 2.116 2.506 2.842 3.113 3.331 3.526 3.867 4.025 4.182 4.405 4.623 4.757 5.006 5.223 5.429 5.522 5.695 5.855 6.074 6.21 6.343 6.521 6.681 6.827 6.955 7.076 7.225 7.363 7.492 7.633 7.762 7.882 8.0 8.113 8.21 8.291 8.366 8.443 8.5 8.536 8.537 8.503 8.41 8.248 7.948 7.443 6.644 5.364 3.221 0.629 -1.563 -3.44 -5.023 -6.41 -7.627 -8.741 -9.68 -10.587 -11.37 -12.099 -12.789 -13.408 -13.99 -14.537 -15.098 -15.587 -16.022 -16.46 -16.928 -17.331 -17.72 -18.121 -18.445 -18.791 -19.15 -19.512 -19.896 -20.163 -20.427 -20.829 -21.112 -21.415 -21.572 -21.902 -22.266 -22.658 -22.863 -23.194 -23.544 -23.801 -24.064 -24.639 -24.975 -25.334 -25.72 -26.173 -26.738 -27.547 -30.406 -5 ,3838 ,TETRA ,17621834,Tue Nov 30 20:42:56 CET,Tue Nov 30 22:34:33 CET,0.0 2.2 2.707 3.075 3.381 3.639 3.855 4.062 4.429 4.596 4.754 4.954 5.161 5.274 5.475 5.661 5.833 5.914 6.069 6.213 6.41 6.529 6.641 6.794 6.934 7.063 7.179 7.287 7.434 7.565 7.673 7.818 7.956 8.072 8.204 8.337 8.432 8.524 8.608 8.667 8.713 8.739 8.724 8.666 8.574 8.419 8.11 7.593 6.809 5.557 3.318 0.643 -1.554 -3.443 -5.018 -6.36 -7.535 -8.604 -9.496 -10.372 -11.143 -11.824 -12.459 -13.05 -13.621 -14.162 -14.725 -15.233 -15.66 -16.104 -16.572 -16.953 -17.348 -17.748 -18.048 -18.36 -18.693 -19.05 -19.419 -19.677 -19.943 -20.364 -20.662 -20.966 -21.123 -21.447 -21.778 -22.147 -22.348 -22.673 -23.029 -23.282 -23.537 -24.079 -24.378 -24.712 -25.114 -25.583 -26.116 -26.849 -29.795 -6 ,13076 ,TETRA ,17621835,Tue Nov 30 20:42:55 CET,Tue Nov 30 22:35:37 CET,0.0 1.657 2.179 2.563 2.876 3.125 3.343 3.552 3.921 4.078 4.22 4.378 4.58 4.699 4.918 5.109 5.291 5.379 5.527 5.666 5.869 5.992 6.107 6.267 6.417 6.558 6.687 6.816 6.977 7.117 7.246 7.386 7.513 7.636 7.772 7.909 8.015 8.106 8.194 8.265 8.307 8.343 8.366 8.338 8.25 8.067 7.743 7.221 6.413 5.171 3.029 0.418 -1.735 -3.534 -5.094 -6.49 -7.68 -8.765 -9.709 -10.657 -11.473 -12.176 -12.838 -13.464 -14.047 -14.577 -15.128 -15.614 -16.022 -16.441 -16.882 -17.258 -17.648 -18.063 -18.382 -18.698 -19.028 -19.393 -19.768 -20.011 -20.267 -20.691 -20.984 -21.284 -21.436 -21.75 -22.1 -22.481 -22.684 -23.009 -23.346 -23.583 -23.846 -24.471 -24.804 -25.146 -25.547 -26.053 -26.643 -27.419 -30.332 -7 ,25347 ,TETRA ,17621836,Tue Nov 30 20:42:56 CET,Tue Nov 30 22:36:06 CET,0.0 1.777 2.324 2.694 2.997 3.245 3.462 3.66 4.016 4.177 4.324 4.511 4.72 4.836 5.06 5.256 5.421 5.504 5.677 5.849 6.076 6.222 6.364 6.541 6.695 6.842 6.971 7.082 7.23 7.368 7.488 7.616 7.741 7.868 7.997 8.117 8.219 8.321 8.415 8.49 8.547 8.569 8.551 8.509 8.417 8.239 7.926 7.452 6.714 5.419 3.093 0.359 -1.879 -3.75 -5.355 -6.748 -7.91 -8.94 -9.867 -10.81 -11.608 -12.322 -12.985 -13.603 -14.173 -14.703 -15.269 -15.763 -16.182 -16.605 -17.045 -17.42 -17.82 -18.252 -18.588 -18.938 -19.302 -19.676 -20.076 -20.353 -20.647 -21.119 -21.438 -21.764 -21.934 -22.304 -22.682 -23.068 -23.269 -23.584 -23.894 -24.112 -24.359 -24.943 -25.265 -25.619 -26.023 -26.508 -27.123 -27.945 -31.142 -8 ,13419 ,TETRA ,17621837,Tue Nov 30 20:42:56 CET,Tue Nov 30 22:38:40 CET,0.0 1.666 2.184 2.547 2.823 3.071 3.297 3.507 3.882 4.04 4.184 4.36 4.562 4.678 4.89 5.084 5.263 5.349 5.501 5.635 5.824 5.935 6.036 6.184 6.332 6.462 6.574 6.676 6.796 6.918 7.044 7.179 7.302 7.431 7.564 7.688 7.794 7.892 7.974 8.048 8.102 8.121 8.113 8.065 7.963 7.803 7.539 7.084 6.309 4.997 2.751 0.043 -2.215 -4.076 -5.612 -6.997 -8.223 -9.288 -10.192 -11.101 -11.883 -12.584 -13.25 -13.871 -14.442 -14.962 -15.507 -15.985 -16.383 -16.799 -17.245 -17.611 -17.989 -18.385 -18.699 -19.02 -19.364 -19.718 -20.081 -20.345 -20.606 -21.013 -21.308 -21.628 -21.789 -22.118 -22.477 -22.863 -23.062 -23.386 -23.723 -23.958 -24.215 -24.814 -25.144 -25.519 -25.915 -26.341 -26.898 -27.654 -30.248 -9 ,12079 ,TETRA ,17621838,Tue Nov 30 20:42:55 CET,Tue Nov 30 22:33:47 CET,0.0 1.765 2.252 2.607 2.906 3.172 3.4 3.59 3.922 4.071 4.209 4.383 4.581 4.692 4.905 5.11 5.294 5.377 5.535 5.678 5.883 6.013 6.129 6.288 6.435 6.562 6.681 6.794 6.923 7.05 7.17 7.305 7.425 7.521 7.619 7.711 7.792 7.868 7.918 7.969 7.991 7.978 7.949 7.878 7.737 7.522 7.178 6.648 5.846 4.58 2.427 -0.197 -2.396 -4.22 -5.793 -7.196 -8.387 -9.477 -10.384 -11.28 -12.065 -12.763 -13.42 -14.018 -14.59 -15.116 -15.648 -16.111 -16.519 -16.951 -17.393 -17.756 -18.14 -18.55 -18.855 -19.17 -19.499 -19.848 -20.213 -20.464 -20.735 -21.153 -21.444 -21.763 -21.929 -22.261 -22.621 -23.008 -23.215 -23.547 -23.861 -24.091 -24.35 -24.935 -25.252 -25.612 -26.01 -26.474 -27.067 -27.818 -30.974 -10 ,12332 ,TETRA ,17621839,Tue Nov 30 20:42:58 CET,Tue Nov 30 22:33:38 CET,0.0 1.755 2.298 2.668 2.955 3.203 3.421 3.619 3.983 4.143 4.286 4.468 4.674 4.794 5.013 5.196 5.364 5.445 5.603 5.76 5.963 6.076 6.181 6.332 6.474 6.61 6.728 6.834 6.972 7.097 7.209 7.348 7.466 7.565 7.668 7.773 7.867 7.958 8.043 8.131 8.204 8.219 8.192 8.131 8.015 7.841 7.527 6.994 6.17 4.894 2.664 -0.093 -2.336 -4.227 -5.842 -7.237 -8.433 -9.524 -10.473 -11.399 -12.168 -12.853 -13.52 -14.146 -14.717 -15.236 -15.773 -16.254 -16.661 -17.07 -17.518 -17.899 -18.287 -18.69 -18.998 -19.32 -19.664 -20.03 -20.401 -20.658 -20.929 -21.347 -21.647 -21.955 -22.109 -22.441 -22.791 -23.166 -23.368 -23.698 -24.037 -24.275 -24.525 -25.091 -25.413 -25.762 -26.148 -26.596 -27.141 -27.864 -30.136 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_43.txt deleted file mode 100644 index c9ac891d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25625 ,TETRA ,17621840,Tue Nov 30 20:42:55 CET,Tue Nov 30 22:33:20 CET,0.0 1.855 2.413 2.804 3.111 3.369 3.591 3.809 4.209 4.378 4.541 4.758 4.977 5.105 5.359 5.615 5.847 5.943 6.126 6.31 6.583 6.76 6.922 7.153 7.371 7.571 7.777 7.982 8.24 8.487 8.723 9.0 9.247 9.479 9.773 10.099 10.384 10.693 11.012 11.33 11.659 12.024 12.458 12.891 13.388 13.903 14.447 15.032 15.692 16.375 16.941 17.188 17.166 16.936 16.626 16.299 15.966 15.624 15.288 14.929 14.622 14.337 14.038 13.757 13.486 13.224 12.952 12.701 12.472 12.227 11.972 11.752 11.509 11.252 11.051 10.836 10.61 10.361 10.108 9.932 9.736 9.427 9.212 8.978 8.859 8.62 8.367 8.097 7.947 7.724 7.501 7.328 7.131 6.694 6.449 6.175 5.872 5.514 5.071 4.482 2.242 -2 ,5482 ,TETRA ,17621841,Tue Nov 30 20:42:58 CET,Tue Nov 30 22:33:43 CET,0.0 1.716 2.249 2.655 2.992 3.298 3.562 3.793 4.213 4.394 4.555 4.789 5.022 5.17 5.445 5.692 5.912 6.013 6.213 6.41 6.685 6.855 7.026 7.273 7.504 7.723 7.919 8.104 8.354 8.607 8.847 9.123 9.398 9.665 9.961 10.282 10.583 10.916 11.259 11.603 11.974 12.391 12.858 13.303 13.814 14.371 14.999 15.664 16.339 17.023 17.722 17.999 17.926 17.69 17.361 16.988 16.637 16.287 15.948 15.594 15.285 14.992 14.688 14.391 14.104 13.845 13.586 13.347 13.136 12.901 12.646 12.44 12.206 11.946 11.751 11.556 11.354 11.145 10.925 10.766 10.594 10.32 10.121 9.906 9.795 9.568 9.323 9.052 8.905 8.678 8.431 8.256 8.065 7.623 7.383 7.121 6.817 6.46 6.032 5.456 3.327 -3 ,17261 ,TETRA ,17621842,Tue Nov 30 20:42:56 CET,Tue Nov 30 22:37:20 CET,0.0 2.021 2.583 2.953 3.252 3.524 3.781 4.014 4.422 4.607 4.779 5.002 5.224 5.367 5.644 5.89 6.116 6.22 6.427 6.622 6.886 7.054 7.215 7.445 7.661 7.862 8.061 8.255 8.504 8.735 8.95 9.222 9.483 9.719 9.988 10.29 10.571 10.874 11.201 11.56 11.958 12.4 12.861 13.308 13.842 14.395 14.974 15.6 16.254 16.904 17.478 17.638 17.498 17.251 16.963 16.622 16.273 15.93 15.601 15.223 14.862 14.553 14.278 14.015 13.761 13.523 13.272 13.036 12.823 12.602 12.363 12.163 11.946 11.703 11.513 11.315 11.104 10.885 10.658 10.491 10.31 10.032 9.838 9.632 9.526 9.281 9.013 8.735 8.585 8.351 8.092 7.907 7.701 7.254 7.015 6.763 6.476 6.121 5.652 5.02 2.671 -4 ,22915 ,TETRA ,17621843,Tue Nov 30 20:42:55 CET,Tue Nov 30 22:22:48 CET,0.0 2.172 2.68 3.043 3.351 3.618 3.845 4.05 4.438 4.617 4.774 4.976 5.191 5.32 5.571 5.814 6.041 6.147 6.341 6.521 6.777 6.94 7.098 7.335 7.568 7.789 8.004 8.208 8.464 8.709 8.941 9.218 9.479 9.719 9.991 10.297 10.583 10.892 11.221 11.577 11.952 12.342 12.779 13.203 13.693 14.24 14.848 15.454 16.062 16.691 17.233 17.441 17.329 17.062 16.744 16.412 16.091 15.757 15.446 15.101 14.792 14.501 14.197 13.913 13.631 13.363 13.113 12.884 12.661 12.433 12.201 12.013 11.801 11.568 11.385 11.188 10.987 10.783 10.56 10.404 10.241 9.975 9.788 9.589 9.483 9.252 9.017 8.766 8.626 8.405 8.14 7.952 7.762 7.367 7.146 6.893 6.612 6.266 5.799 5.201 2.646 -5 ,24423 ,TETRA ,17621844,Tue Nov 30 20:42:57 CET,Tue Nov 30 22:35:44 CET,0.0 1.464 1.94 2.343 2.687 2.977 3.237 3.467 3.886 4.07 4.248 4.485 4.712 4.855 5.127 5.38 5.618 5.728 5.934 6.135 6.422 6.61 6.782 7.023 7.271 7.503 7.716 7.928 8.206 8.469 8.712 8.998 9.271 9.521 9.795 10.112 10.427 10.763 11.119 11.481 11.844 12.243 12.69 13.136 13.64 14.145 14.725 15.365 16.007 16.656 17.304 17.629 17.607 17.384 17.075 16.726 16.385 16.041 15.718 15.375 15.046 14.742 14.447 14.152 13.861 13.601 13.333 13.094 12.89 12.666 12.427 12.227 12.004 11.756 11.557 11.361 11.158 10.94 10.718 10.564 10.398 10.123 9.917 9.704 9.598 9.386 9.151 8.874 8.729 8.51 8.268 8.082 7.888 7.473 7.246 6.989 6.698 6.368 5.931 5.34 3.506 -6 ,19405 ,TETRA ,17621845,Tue Nov 30 20:42:58 CET,Tue Nov 30 22:38:40 CET,0.0 1.897 2.435 2.823 3.149 3.432 3.692 3.931 4.337 4.519 4.69 4.934 5.182 5.334 5.599 5.84 6.069 6.181 6.395 6.603 6.91 7.105 7.281 7.532 7.766 7.988 8.201 8.402 8.662 8.901 9.128 9.411 9.676 9.917 10.197 10.523 10.832 11.157 11.499 11.848 12.204 12.597 13.035 13.468 13.954 14.466 15.037 15.647 16.265 16.923 17.561 17.739 17.623 17.369 17.045 16.691 16.349 15.996 15.664 15.336 15.03 14.727 14.427 14.143 13.882 13.641 13.391 13.165 12.957 12.732 12.497 12.298 12.092 11.879 11.705 11.523 11.34 11.146 10.926 10.769 10.603 10.328 10.134 9.924 9.813 9.579 9.346 9.113 8.979 8.755 8.52 8.347 8.161 7.766 7.545 7.305 7.028 6.687 6.245 5.669 2.441 -7 ,17084 ,TETRA ,17621846,Tue Nov 30 20:42:57 CET,Tue Nov 30 22:39:31 CET,0.0 1.81 2.335 2.755 3.087 3.365 3.624 3.867 4.271 4.443 4.607 4.837 5.066 5.209 5.481 5.736 5.98 6.095 6.306 6.51 6.819 7.011 7.184 7.426 7.66 7.891 8.118 8.334 8.608 8.859 9.093 9.374 9.638 9.897 10.199 10.528 10.828 11.158 11.499 11.848 12.199 12.584 13.018 13.433 13.928 14.452 15.013 15.623 16.259 16.89 17.439 17.524 17.382 17.149 16.845 16.506 16.137 15.766 15.442 15.095 14.766 14.472 14.181 13.89 13.617 13.366 13.082 12.813 12.583 12.347 12.083 11.853 11.616 11.351 11.15 10.944 10.725 10.488 10.225 10.042 9.855 9.572 9.368 9.152 9.045 8.807 8.545 8.258 8.109 7.879 7.626 7.443 7.252 6.827 6.576 6.305 6.005 5.647 5.175 4.562 2.498 -8 ,11692 ,TETRA ,17621847,Tue Nov 30 20:42:57 CET,Tue Nov 30 22:35:50 CET,0.0 2.233 2.726 3.105 3.43 3.708 3.946 4.162 4.564 4.746 4.914 5.148 5.381 5.521 5.789 6.038 6.261 6.367 6.58 6.778 7.062 7.24 7.404 7.647 7.868 8.072 8.266 8.446 8.679 8.914 9.139 9.399 9.637 9.864 10.12 10.389 10.66 10.95 11.257 11.586 11.92 12.281 12.724 13.179 13.661 14.187 14.798 15.437 16.089 16.721 17.333 17.612 17.588 17.405 17.155 16.889 16.58 16.278 16.006 15.694 15.409 15.141 14.863 14.591 14.343 14.101 13.838 13.6 13.386 13.161 12.912 12.704 12.498 12.283 12.104 11.911 11.707 11.484 11.245 11.08 10.911 10.633 10.438 10.236 10.129 9.892 9.629 9.356 9.213 8.982 8.737 8.563 8.377 7.959 7.715 7.441 7.139 6.789 6.365 5.8 3.984 -9 ,17748 ,TETRA ,17621848,Tue Nov 30 20:42:56 CET,Tue Nov 30 22:28:16 CET,0.0 2.45 2.997 3.354 3.669 3.967 4.225 4.448 4.852 5.039 5.214 5.442 5.666 5.807 6.065 6.314 6.548 6.656 6.871 7.067 7.34 7.514 7.676 7.9 8.115 8.331 8.533 8.728 8.982 9.218 9.44 9.706 9.966 10.211 10.489 10.809 11.11 11.433 11.772 12.116 12.487 12.912 13.395 13.853 14.367 14.89 15.464 16.099 16.752 17.406 18.023 18.224 18.045 17.736 17.398 17.035 16.696 16.35 16.009 15.65 15.331 15.032 14.725 14.428 14.146 13.891 13.632 13.384 13.158 12.92 12.663 12.449 12.23 11.999 11.813 11.607 11.393 11.182 10.958 10.794 10.617 10.322 10.115 9.9 9.791 9.567 9.325 9.058 8.913 8.692 8.447 8.267 8.084 7.68 7.446 7.173 6.861 6.503 6.062 5.457 2.057 -10 ,10477 ,TETRA ,17621849,Tue Nov 30 20:42:57 CET,Tue Nov 30 22:36:19 CET,0.0 2.531 3.103 3.521 3.855 4.14 4.387 4.618 5.045 5.226 5.394 5.625 5.852 5.992 6.251 6.497 6.739 6.851 7.052 7.242 7.514 7.681 7.838 8.072 8.305 8.529 8.741 8.937 9.191 9.427 9.66 9.936 10.186 10.429 10.701 11.001 11.292 11.612 11.95 12.308 12.68 13.082 13.53 13.946 14.414 14.951 15.522 16.092 16.714 17.38 17.996 18.22 18.162 17.95 17.641 17.301 16.948 16.575 16.244 15.908 15.593 15.276 14.961 14.671 14.384 14.114 13.853 13.613 13.401 13.181 12.938 12.74 12.521 12.283 12.102 11.903 11.691 11.467 11.234 11.074 10.902 10.629 10.435 10.226 10.119 9.879 9.609 9.336 9.194 8.962 8.716 8.553 8.373 7.949 7.702 7.412 7.097 6.75 6.304 5.672 3.747 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_43_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_43_39.txt deleted file mode 100644 index 8eab95e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_43_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22896 ,TETRA ,17621850,Tue Nov 30 20:42:58 CET,Tue Nov 30 22:33:08 CET,0.0 1.438 1.939 2.309 2.626 2.884 3.095 3.279 3.59 3.737 3.887 4.073 4.262 4.368 4.557 4.723 4.874 4.948 5.096 5.238 5.434 5.55 5.658 5.813 5.942 6.052 6.151 6.237 6.351 6.472 6.57 6.658 6.734 6.804 6.877 6.931 6.972 7.024 7.069 7.097 7.093 7.061 7.003 6.91 6.723 6.414 5.944 5.244 4.203 2.614 -0.023 -3.103 -5.591 -7.67 -9.404 -10.919 -12.222 -13.339 -14.28 -15.236 -16.055 -16.779 -17.474 -18.119 -18.712 -19.237 -19.792 -20.299 -20.718 -21.155 -21.615 -21.991 -22.385 -22.794 -23.102 -23.417 -23.753 -24.112 -24.476 -24.728 -24.998 -25.404 -25.674 -25.96 -26.112 -26.447 -26.807 -27.163 -27.353 -27.673 -27.989 -28.216 -28.461 -28.999 -29.295 -29.642 -30.015 -30.416 -30.926 -31.641 -33.865 -2 ,23738 ,TETRA ,17621851,Tue Nov 30 20:43:00 CET,Tue Nov 30 22:37:34 CET,0.0 1.581 2.067 2.429 2.738 2.999 3.235 3.457 3.849 4.016 4.169 4.382 4.598 4.725 4.972 5.203 5.405 5.496 5.665 5.813 6.012 6.143 6.26 6.418 6.557 6.689 6.807 6.908 7.036 7.148 7.251 7.368 7.463 7.548 7.629 7.697 7.75 7.802 7.843 7.869 7.871 7.83 7.736 7.585 7.338 6.985 6.503 5.824 4.798 3.234 0.677 -2.3 -4.695 -6.715 -8.441 -9.963 -11.284 -12.441 -13.419 -14.386 -15.205 -15.934 -16.631 -17.276 -17.874 -18.412 -18.958 -19.431 -19.832 -20.255 -20.709 -21.097 -21.495 -21.897 -22.213 -22.544 -22.894 -23.259 -23.634 -23.89 -24.151 -24.572 -24.875 -25.192 -25.351 -25.681 -26.038 -26.416 -26.601 -26.899 -27.179 -27.395 -27.629 -28.151 -28.435 -28.745 -29.1 -29.523 -30.006 -30.669 -33.007 -3 ,27108 ,TETRA ,17621852,Tue Nov 30 20:42:58 CET,Tue Nov 30 22:32:44 CET,0.0 1.762 2.271 2.644 2.935 3.2 3.456 3.686 4.081 4.251 4.41 4.627 4.829 4.957 5.216 5.432 5.625 5.72 5.892 6.031 6.218 6.342 6.463 6.628 6.777 6.916 7.034 7.143 7.28 7.4 7.516 7.645 7.754 7.855 7.973 8.071 8.132 8.193 8.234 8.245 8.243 8.223 8.143 8.008 7.784 7.466 7.031 6.379 5.315 3.684 1.072 -1.945 -4.405 -6.472 -8.217 -9.72 -10.978 -12.105 -13.068 -14.013 -14.798 -15.475 -16.126 -16.744 -17.334 -17.874 -18.42 -18.896 -19.309 -19.743 -20.182 -20.542 -20.923 -21.319 -21.631 -21.961 -22.297 -22.639 -22.99 -23.231 -23.479 -23.872 -24.143 -24.418 -24.562 -24.886 -25.219 -25.57 -25.76 -26.066 -26.356 -26.568 -26.795 -27.289 -27.556 -27.881 -28.253 -28.672 -29.191 -29.817 -31.806 -4 ,3687 ,TETRA ,17621853,Tue Nov 30 20:42:59 CET,Tue Nov 30 22:32:44 CET,0.0 1.825 2.299 2.654 2.953 3.218 3.443 3.632 3.967 4.111 4.249 4.429 4.622 4.729 4.923 5.104 5.272 5.349 5.498 5.632 5.815 5.92 6.014 6.162 6.302 6.426 6.535 6.627 6.735 6.837 6.926 7.02 7.097 7.158 7.21 7.264 7.31 7.333 7.349 7.365 7.341 7.278 7.174 7.017 6.781 6.465 6.029 5.393 4.346 2.737 0.148 -2.872 -5.319 -7.372 -9.08 -10.569 -11.846 -12.974 -13.938 -14.887 -15.696 -16.414 -17.085 -17.698 -18.267 -18.773 -19.324 -19.83 -20.254 -20.694 -21.155 -21.535 -21.933 -22.353 -22.674 -23.0 -23.344 -23.7 -24.074 -24.336 -24.594 -24.988 -25.279 -25.59 -25.741 -26.058 -26.409 -26.763 -26.944 -27.255 -27.565 -27.784 -28.014 -28.514 -28.788 -29.105 -29.475 -29.9 -30.46 -31.219 -33.691 -5 ,28162 ,TETRA ,17621854,Tue Nov 30 20:42:57 CET,Tue Nov 30 22:32:34 CET,0.0 1.578 2.049 2.423 2.729 2.995 3.221 3.412 3.752 3.905 4.051 4.234 4.427 4.534 4.72 4.888 5.041 5.114 5.248 5.368 5.544 5.648 5.748 5.891 6.026 6.153 6.26 6.351 6.461 6.564 6.674 6.802 6.9 6.973 7.047 7.13 7.206 7.27 7.317 7.343 7.342 7.296 7.204 7.081 6.872 6.566 6.115 5.437 4.407 2.822 0.18 -2.846 -5.304 -7.318 -8.971 -10.443 -11.726 -12.86 -13.831 -14.793 -15.617 -16.342 -17.007 -17.646 -18.243 -18.766 -19.306 -19.792 -20.219 -20.662 -21.134 -21.524 -21.929 -22.351 -22.662 -22.973 -23.299 -23.645 -24.01 -24.273 -24.534 -24.923 -25.209 -25.518 -25.674 -25.989 -26.32 -26.663 -26.839 -27.147 -27.469 -27.693 -27.924 -28.443 -28.737 -29.078 -29.46 -29.885 -30.425 -31.13 -33.525 -6 ,20592 ,TETRA ,17621855,Tue Nov 30 20:42:59 CET,Tue Nov 30 22:35:28 CET,0.0 1.65 2.14 2.481 2.764 3.019 3.252 3.45 3.777 3.93 4.07 4.253 4.449 4.569 4.805 5.013 5.192 5.279 5.451 5.606 5.806 5.922 6.041 6.204 6.33 6.445 6.558 6.676 6.823 6.948 7.073 7.221 7.334 7.425 7.519 7.598 7.651 7.713 7.778 7.804 7.789 7.744 7.655 7.52 7.309 7.0 6.552 5.905 4.888 3.316 0.73 -2.283 -4.691 -6.732 -8.432 -9.871 -11.149 -12.31 -13.281 -14.222 -15.033 -15.765 -16.464 -17.107 -17.696 -18.233 -18.778 -19.267 -19.686 -20.119 -20.582 -20.977 -21.393 -21.827 -22.157 -22.49 -22.851 -23.223 -23.598 -23.849 -24.107 -24.515 -24.795 -25.104 -25.261 -25.574 -25.916 -26.27 -26.457 -26.773 -27.099 -27.337 -27.582 -28.103 -28.395 -28.714 -29.071 -29.458 -29.875 -30.529 -32.805 -7 ,3561 ,TETRA ,17621856,Tue Nov 30 20:44:51 CET,Tue Nov 30 22:36:12 CET,0.0 1.532 1.992 2.329 2.623 2.882 3.094 3.299 3.673 3.829 3.976 4.156 4.353 4.46 4.658 4.838 5.005 5.086 5.231 5.371 5.57 5.674 5.767 5.901 6.019 6.137 6.245 6.336 6.451 6.545 6.628 6.726 6.809 6.881 6.949 7.0 7.035 7.078 7.098 7.085 7.063 7.0 6.891 6.744 6.495 6.141 5.646 4.924 3.863 2.261 -0.376 -3.381 -5.88 -7.989 -9.719 -11.235 -12.526 -13.639 -14.583 -15.541 -16.373 -17.112 -17.79 -18.406 -18.997 -19.553 -20.124 -20.623 -21.045 -21.483 -21.957 -22.351 -22.743 -23.158 -23.492 -23.834 -24.166 -24.504 -24.871 -25.133 -25.407 -25.828 -26.123 -26.439 -26.605 -26.95 -27.321 -27.701 -27.903 -28.223 -28.552 -28.791 -29.034 -29.575 -29.886 -30.231 -30.601 -31.024 -31.523 -32.155 -34.308 -8 ,30074 ,TETRA ,17621857,Tue Nov 30 20:44:53 CET,Tue Nov 30 22:38:07 CET,0.0 1.862 2.451 2.87 3.207 3.491 3.736 3.961 4.346 4.513 4.672 4.869 5.073 5.205 5.445 5.658 5.848 5.935 6.107 6.26 6.459 6.59 6.721 6.89 7.031 7.16 7.287 7.396 7.515 7.631 7.744 7.863 7.967 8.058 8.156 8.251 8.32 8.394 8.449 8.461 8.451 8.414 8.325 8.201 7.998 7.692 7.228 6.538 5.493 3.901 1.337 -1.681 -4.146 -6.173 -7.849 -9.311 -10.547 -11.637 -12.597 -13.579 -14.41 -15.127 -15.798 -16.425 -17.022 -17.556 -18.11 -18.61 -19.025 -19.467 -19.951 -20.351 -20.761 -21.181 -21.497 -21.82 -22.167 -22.526 -22.884 -23.128 -23.387 -23.801 -24.088 -24.394 -24.553 -24.891 -25.259 -25.639 -25.831 -26.152 -26.476 -26.702 -26.945 -27.463 -27.773 -28.119 -28.501 -28.933 -29.444 -30.127 -33.208 -9 ,29013 ,TETRA ,17621858,Tue Nov 30 20:44:51 CET,Tue Nov 30 22:34:20 CET,0.0 1.775 2.279 2.617 2.893 3.135 3.352 3.551 3.929 4.09 4.232 4.405 4.594 4.7 4.9 5.076 5.229 5.303 5.442 5.578 5.765 5.88 5.99 6.127 6.258 6.383 6.489 6.6 6.749 6.872 6.976 7.104 7.216 7.314 7.412 7.498 7.565 7.614 7.652 7.691 7.71 7.672 7.586 7.463 7.258 6.957 6.489 5.808 4.813 3.285 0.665 -2.414 -4.86 -6.892 -8.608 -10.069 -11.291 -12.437 -13.421 -14.371 -15.212 -15.937 -16.593 -17.223 -17.821 -18.363 -18.937 -19.445 -19.874 -20.33 -20.805 -21.198 -21.608 -22.042 -22.382 -22.732 -23.103 -23.475 -23.849 -24.117 -24.382 -24.788 -25.08 -25.381 -25.534 -25.86 -26.203 -26.56 -26.747 -27.058 -27.358 -27.58 -27.826 -28.38 -28.687 -29.029 -29.413 -29.82 -30.279 -30.983 -33.464 -10 ,32419 ,TETRA ,17621859,Tue Nov 30 20:44:52 CET,Tue Nov 30 22:37:05 CET,0.0 1.555 2.061 2.422 2.706 2.953 3.182 3.391 3.738 3.89 4.032 4.197 4.383 4.489 4.69 4.873 5.038 5.114 5.249 5.373 5.56 5.679 5.775 5.907 6.046 6.171 6.28 6.375 6.502 6.617 6.71 6.815 6.891 6.96 7.048 7.131 7.19 7.226 7.239 7.236 7.214 7.159 7.033 6.866 6.622 6.276 5.781 5.089 4.066 2.468 -0.165 -3.269 -5.706 -7.69 -9.402 -10.932 -12.229 -13.372 -14.358 -15.306 -16.081 -16.762 -17.418 -18.039 -18.603 -19.109 -19.654 -20.136 -20.541 -20.963 -21.402 -21.763 -22.142 -22.545 -22.862 -23.182 -23.496 -23.831 -24.193 -24.449 -24.719 -25.135 -25.418 -25.712 -25.859 -26.166 -26.517 -26.901 -27.101 -27.423 -27.769 -28.019 -28.266 -28.78 -29.072 -29.403 -29.767 -30.179 -30.691 -31.377 -33.903 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_44_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_44_43.txt deleted file mode 100644 index ead03966..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_44_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24818 ,TETRA ,17621860,Tue Nov 30 20:44:52 CET,Tue Nov 30 22:34:01 CET,0.0 2.207 2.791 3.222 3.585 3.937 4.237 4.483 4.92 5.117 5.294 5.552 5.783 5.927 6.206 6.46 6.693 6.808 7.029 7.24 7.532 7.711 7.886 8.129 8.348 8.563 8.767 8.955 9.207 9.441 9.661 9.938 10.194 10.436 10.723 11.037 11.323 11.634 11.953 12.274 12.608 12.968 13.365 13.746 14.177 14.631 15.126 15.63 16.119 16.559 16.774 16.595 16.266 15.85 15.391 14.929 14.5 14.095 13.725 13.33 12.979 12.671 12.374 12.08 11.807 11.55 11.246 10.971 10.737 10.484 10.211 9.977 9.741 9.503 9.311 9.1 8.879 8.646 8.393 8.218 8.032 7.733 7.518 7.293 7.177 6.934 6.678 6.403 6.245 5.993 5.701 5.507 5.308 4.857 4.594 4.318 4.016 3.661 3.208 2.61 0.588 -2 ,11989 ,TETRA ,17621861,Tue Nov 30 20:44:53 CET,Tue Nov 30 22:35:18 CET,0.0 1.944 2.602 3.102 3.481 3.807 4.104 4.372 4.828 5.024 5.214 5.469 5.7 5.847 6.12 6.384 6.648 6.773 6.993 7.188 7.473 7.656 7.832 8.08 8.314 8.537 8.741 8.94 9.193 9.428 9.644 9.884 10.123 10.362 10.642 10.961 11.239 11.509 11.819 12.159 12.485 12.818 13.198 13.564 13.963 14.393 14.817 15.257 15.745 16.161 16.353 16.086 15.637 15.172 14.708 14.233 13.778 13.341 12.944 12.511 12.131 11.806 11.493 11.197 10.921 10.643 10.342 10.08 9.838 9.586 9.322 9.097 8.853 8.59 8.395 8.201 7.982 7.75 7.522 7.346 7.154 6.868 6.668 6.451 6.33 6.076 5.812 5.52 5.359 5.115 4.825 4.624 4.424 3.999 3.754 3.475 3.147 2.746 2.27 1.632 -0.564 -3 ,7070 ,TETRA ,17621862,Tue Nov 30 20:44:52 CET,Tue Nov 30 22:40:54 CET,0.0 2.356 2.945 3.422 3.801 4.113 4.389 4.631 5.087 5.303 5.489 5.724 5.944 6.088 6.36 6.602 6.826 6.933 7.148 7.355 7.633 7.806 7.974 8.21 8.431 8.639 8.843 9.033 9.277 9.511 9.724 9.99 10.243 10.457 10.708 11.0 11.282 11.599 11.93 12.27 12.614 13.008 13.46 13.871 14.317 14.792 15.292 15.765 16.214 16.604 16.852 16.703 16.343 15.926 15.486 15.045 14.653 14.267 13.906 13.507 13.14 12.825 12.523 12.231 11.939 11.65 11.346 11.064 10.809 10.532 10.234 9.991 9.744 9.482 9.27 9.05 8.819 8.573 8.302 8.118 7.925 7.609 7.387 7.157 7.037 6.778 6.512 6.219 6.063 5.828 5.565 5.377 5.17 4.723 4.469 4.193 3.89 3.533 3.093 2.496 0.666 -4 ,21590 ,TETRA ,17621863,Tue Nov 30 20:44:53 CET,Tue Nov 30 22:25:57 CET,0.0 2.296 2.893 3.337 3.732 4.092 4.392 4.64 5.098 5.303 5.488 5.757 5.996 6.142 6.409 6.667 6.922 7.039 7.252 7.451 7.723 7.895 8.077 8.343 8.576 8.798 9.01 9.207 9.453 9.685 9.905 10.161 10.399 10.627 10.885 11.186 11.487 11.802 12.122 12.453 12.8 13.167 13.577 13.997 14.45 14.915 15.386 15.822 16.272 16.694 16.896 16.692 16.287 15.798 15.329 14.868 14.426 13.984 13.582 13.171 12.797 12.461 12.139 11.81 11.499 11.221 10.909 10.621 10.378 10.113 9.809 9.543 9.283 9.028 8.819 8.609 8.395 8.164 7.915 7.732 7.542 7.259 7.052 6.817 6.701 6.459 6.185 5.892 5.739 5.504 5.252 5.065 4.854 4.412 4.173 3.887 3.542 3.153 2.697 2.091 0.213 -5 ,12917 ,TETRA ,17621864,Tue Nov 30 20:44:51 CET,Tue Nov 30 22:34:31 CET,0.0 1.91 2.495 2.948 3.311 3.63 3.927 4.185 4.619 4.816 4.997 5.251 5.485 5.637 5.918 6.173 6.408 6.519 6.728 6.935 7.236 7.427 7.602 7.835 8.063 8.291 8.521 8.735 8.988 9.23 9.47 9.761 10.046 10.31 10.596 10.909 11.205 11.51 11.84 12.19 12.524 12.888 13.307 13.704 14.129 14.571 15.06 15.561 16.033 16.453 16.717 16.568 16.185 15.766 15.302 14.845 14.436 14.038 13.662 13.258 12.883 12.537 12.205 11.875 11.553 11.261 10.955 10.671 10.417 10.136 9.847 9.612 9.362 9.099 8.884 8.656 8.419 8.175 7.916 7.739 7.548 7.238 7.028 6.806 6.692 6.445 6.178 5.902 5.758 5.541 5.293 5.106 4.903 4.444 4.181 3.898 3.607 3.25 2.758 2.127 0.328 -6 ,657 ,TETRA ,17621865,Tue Nov 30 20:44:52 CET,Tue Nov 30 22:35:21 CET,0.0 1.986 2.678 3.156 3.532 3.876 4.183 4.431 4.868 5.071 5.255 5.503 5.732 5.891 6.184 6.438 6.672 6.776 6.97 7.158 7.427 7.616 7.803 8.063 8.303 8.523 8.727 8.923 9.167 9.398 9.628 9.904 10.166 10.407 10.686 10.982 11.246 11.535 11.841 12.207 12.59 12.955 13.362 13.745 14.163 14.627 15.115 15.61 16.105 16.538 16.809 16.684 16.288 15.834 15.394 14.949 14.507 14.064 13.695 13.309 12.929 12.59 12.273 11.95 11.634 11.335 11.014 10.725 10.47 10.2 9.922 9.696 9.45 9.172 8.958 8.747 8.517 8.27 8.005 7.824 7.648 7.35 7.138 6.929 6.817 6.561 6.286 5.994 5.841 5.612 5.364 5.169 4.952 4.472 4.203 3.923 3.618 3.247 2.796 2.161 0.082 -7 ,18160 ,TETRA ,17621866,Tue Nov 30 20:44:55 CET,Tue Nov 30 22:37:06 CET,0.0 2.279 2.953 3.418 3.779 4.082 4.355 4.608 5.035 5.23 5.416 5.667 5.901 6.056 6.362 6.634 6.863 6.975 7.197 7.409 7.714 7.891 8.058 8.303 8.537 8.754 8.967 9.17 9.424 9.667 9.896 10.158 10.399 10.636 10.909 11.199 11.468 11.773 12.087 12.406 12.747 13.129 13.541 13.928 14.388 14.87 15.389 15.905 16.363 16.746 16.916 16.736 16.368 15.939 15.499 15.026 14.585 14.177 13.82 13.444 13.089 12.779 12.482 12.187 11.919 11.651 11.351 11.081 10.849 10.603 10.332 10.109 9.868 9.611 9.409 9.192 8.962 8.722 8.472 8.287 8.099 7.817 7.606 7.384 7.269 7.03 6.764 6.479 6.33 6.086 5.814 5.63 5.419 4.951 4.693 4.39 4.061 3.693 3.239 2.601 0.475 -8 ,11173 ,TETRA ,17621867,Tue Nov 30 20:44:56 CET,Tue Nov 30 22:40:14 CET,0.0 2.327 2.892 3.3 3.652 3.951 4.224 4.47 4.899 5.082 5.254 5.497 5.733 5.89 6.179 6.449 6.694 6.807 7.023 7.24 7.552 7.736 7.907 8.148 8.369 8.584 8.798 9.011 9.268 9.495 9.718 9.999 10.274 10.538 10.835 11.156 11.453 11.756 12.088 12.439 12.78 13.159 13.582 13.984 14.43 14.883 15.372 15.845 16.289 16.715 16.995 16.81 16.415 15.961 15.525 15.092 14.654 14.221 13.837 13.436 13.062 12.729 12.397 12.061 11.752 11.461 11.145 10.864 10.615 10.339 10.046 9.812 9.552 9.26 9.036 8.815 8.578 8.314 8.047 7.872 7.687 7.379 7.155 6.919 6.796 6.548 6.299 6.012 5.851 5.612 5.329 5.13 4.94 4.503 4.249 3.958 3.64 3.288 2.853 2.243 0.333 -9 ,19814 ,TETRA ,17621868,Tue Nov 30 20:44:53 CET,Tue Nov 30 22:35:33 CET,0.0 2.782 3.48 3.904 4.26 4.562 4.833 5.1 5.564 5.764 5.951 6.216 6.454 6.604 6.879 7.13 7.363 7.474 7.683 7.883 8.172 8.35 8.521 8.766 9.001 9.224 9.431 9.633 9.893 10.125 10.353 10.628 10.883 11.132 11.416 11.729 12.018 12.329 12.672 13.027 13.371 13.739 14.165 14.559 14.993 15.445 15.89 16.351 16.864 17.318 17.587 17.501 17.163 16.745 16.313 15.863 15.411 14.968 14.573 14.154 13.788 13.45 13.105 12.782 12.479 12.202 11.904 11.62 11.367 11.084 10.791 10.558 10.317 10.061 9.862 9.65 9.414 9.17 8.921 8.747 8.562 8.265 8.053 7.834 7.719 7.466 7.194 6.917 6.766 6.52 6.244 6.055 5.85 5.387 5.125 4.834 4.514 4.128 3.661 3.057 0.963 -10 ,28569 ,TETRA ,17621869,Tue Nov 30 20:44:53 CET,Tue Nov 30 22:34:28 CET,0.0 1.731 2.322 2.787 3.185 3.514 3.787 4.031 4.456 4.656 4.84 5.089 5.324 5.479 5.781 6.057 6.313 6.434 6.65 6.859 7.147 7.335 7.52 7.762 7.988 8.201 8.398 8.594 8.836 9.07 9.297 9.566 9.812 10.05 10.314 10.585 10.861 11.165 11.463 11.773 12.11 12.475 12.876 13.237 13.643 14.078 14.536 15.006 15.48 15.918 16.168 16.006 15.618 15.176 14.727 14.247 13.772 13.326 12.92 12.515 12.166 11.823 11.492 11.177 10.872 10.597 10.315 10.046 9.797 9.535 9.257 9.025 8.787 8.524 8.321 8.115 7.889 7.654 7.396 7.212 7.025 6.735 6.527 6.295 6.179 5.933 5.663 5.373 5.216 4.977 4.709 4.519 4.313 3.841 3.577 3.302 3.018 2.671 2.204 1.585 -0.676 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_44.txt deleted file mode 100644 index 83467039..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25616 ,TETRA ,17621870,Tue Nov 30 20:44:54 CET,Tue Nov 30 22:36:40 CET,0.0 1.568 2.071 2.438 2.727 2.974 3.198 3.401 3.748 3.911 4.07 4.297 4.499 4.627 4.865 5.077 5.274 5.365 5.54 5.704 5.934 6.075 6.201 6.382 6.548 6.703 6.856 7.0 7.184 7.353 7.502 7.692 7.87 8.02 8.19 8.367 8.526 8.688 8.856 9.049 9.239 9.429 9.619 9.772 9.91 10.031 10.129 10.137 9.998 9.611 8.697 7.392 6.266 5.261 4.353 3.552 2.848 2.181 1.61 1.022 0.501 0.043 -0.405 -0.827 -1.221 -1.585 -1.957 -2.283 -2.567 -2.866 -3.173 -3.434 -3.72 -4.013 -4.225 -4.452 -4.703 -4.952 -5.219 -5.409 -5.6 -5.906 -6.121 -6.346 -6.465 -6.718 -6.984 -7.279 -7.442 -7.675 -7.923 -8.101 -8.297 -8.747 -8.988 -9.263 -9.575 -9.906 -10.291 -10.832 -12.358 -2 ,7230 ,TETRA ,17621871,Tue Nov 30 20:44:54 CET,Tue Nov 30 22:40:38 CET,0.0 1.814 2.323 2.699 2.998 3.266 3.509 3.737 4.137 4.314 4.477 4.7 4.896 5.022 5.257 5.467 5.663 5.755 5.928 6.097 6.335 6.479 6.617 6.817 6.991 7.149 7.298 7.443 7.63 7.793 7.933 8.092 8.252 8.41 8.573 8.733 8.886 9.051 9.223 9.385 9.531 9.688 9.852 10.005 10.151 10.273 10.354 10.363 10.261 9.894 8.993 7.7 6.514 5.438 4.504 3.671 2.93 2.256 1.669 1.09 0.593 0.136 -0.301 -0.72 -1.126 -1.488 -1.868 -2.219 -2.525 -2.842 -3.16 -3.424 -3.707 -4.002 -4.228 -4.46 -4.703 -4.971 -5.257 -5.452 -5.644 -5.942 -6.153 -6.371 -6.493 -6.759 -7.026 -7.309 -7.465 -7.701 -7.961 -8.146 -8.34 -8.772 -9.016 -9.272 -9.557 -9.897 -10.296 -10.818 -12.358 -3 ,17546 ,TETRA ,17621872,Tue Nov 30 20:44:54 CET,Tue Nov 30 22:34:39 CET,0.0 1.591 2.127 2.497 2.802 3.082 3.334 3.547 3.916 4.084 4.235 4.438 4.631 4.754 4.989 5.195 5.381 5.468 5.637 5.807 6.037 6.177 6.321 6.521 6.69 6.844 6.997 7.15 7.359 7.556 7.739 7.958 8.168 8.366 8.57 8.782 8.972 9.171 9.387 9.601 9.794 9.964 10.148 10.317 10.463 10.571 10.643 10.662 10.558 10.194 9.285 7.99 6.841 5.786 4.861 4.048 3.336 2.702 2.139 1.533 1.012 0.542 0.082 -0.355 -0.755 -1.107 -1.463 -1.769 -2.036 -2.331 -2.644 -2.897 -3.16 -3.432 -3.649 -3.876 -4.107 -4.35 -4.605 -4.78 -4.967 -5.273 -5.488 -5.717 -5.836 -6.079 -6.344 -6.634 -6.782 -7.016 -7.287 -7.473 -7.671 -8.107 -8.34 -8.595 -8.879 -9.207 -9.595 -10.114 -11.905 -4 ,5746 ,TETRA ,17621873,Tue Nov 30 20:44:56 CET,Tue Nov 30 22:35:03 CET,0.0 1.516 1.99 2.345 2.623 2.869 3.094 3.304 3.663 3.827 3.983 4.199 4.401 4.53 4.759 4.968 5.159 5.252 5.438 5.609 5.853 6.008 6.152 6.347 6.527 6.704 6.874 7.04 7.237 7.404 7.572 7.77 7.951 8.119 8.305 8.51 8.692 8.896 9.114 9.327 9.525 9.724 9.93 10.096 10.255 10.396 10.472 10.454 10.306 9.942 9.071 7.764 6.571 5.524 4.606 3.785 3.052 2.377 1.805 1.214 0.697 0.249 -0.172 -0.582 -0.959 -1.3 -1.659 -1.982 -2.271 -2.573 -2.885 -3.137 -3.404 -3.694 -3.916 -4.15 -4.399 -4.657 -4.93 -5.122 -5.331 -5.662 -5.888 -6.122 -6.239 -6.491 -6.765 -7.053 -7.204 -7.44 -7.704 -7.883 -8.083 -8.523 -8.753 -9.001 -9.279 -9.601 -9.997 -10.536 -12.005 -5 ,4317 ,TETRA ,17621874,Tue Nov 30 20:44:54 CET,Tue Nov 30 22:40:06 CET,0.0 1.485 1.965 2.302 2.593 2.854 3.079 3.278 3.634 3.796 3.944 4.17 4.375 4.502 4.741 4.958 5.156 5.248 5.421 5.587 5.819 5.963 6.107 6.306 6.482 6.648 6.801 6.941 7.115 7.274 7.419 7.594 7.771 7.943 8.134 8.328 8.498 8.7 8.913 9.113 9.311 9.501 9.684 9.847 10.008 10.155 10.261 10.297 10.181 9.808 8.98 7.719 6.576 5.561 4.649 3.834 3.106 2.424 1.833 1.232 0.728 0.288 -0.143 -0.564 -0.966 -1.328 -1.697 -2.036 -2.331 -2.618 -2.914 -3.173 -3.451 -3.733 -3.95 -4.186 -4.433 -4.691 -4.965 -5.158 -5.362 -5.679 -5.896 -6.13 -6.254 -6.504 -6.782 -7.089 -7.24 -7.479 -7.739 -7.915 -8.109 -8.545 -8.795 -9.055 -9.339 -9.677 -10.062 -10.578 -12.414 -6 ,29998 ,TETRA ,17621875,Tue Nov 30 20:44:53 CET,Tue Nov 30 22:34:58 CET,0.0 1.166 1.619 1.96 2.242 2.486 2.705 2.911 3.283 3.444 3.592 3.794 3.983 4.104 4.334 4.535 4.714 4.801 4.975 5.142 5.366 5.499 5.628 5.813 5.982 6.145 6.293 6.422 6.589 6.747 6.885 7.049 7.202 7.339 7.495 7.664 7.815 7.977 8.137 8.29 8.447 8.605 8.747 8.862 8.987 9.08 9.096 9.034 8.857 8.449 7.589 6.356 5.219 4.228 3.36 2.541 1.828 1.176 0.601 0.014 -0.501 -0.957 -1.402 -1.828 -2.225 -2.591 -2.979 -3.334 -3.646 -3.977 -4.322 -4.605 -4.895 -5.203 -5.451 -5.703 -5.967 -6.244 -6.53 -6.732 -6.944 -7.268 -7.49 -7.729 -7.854 -8.107 -8.375 -8.653 -8.798 -9.031 -9.305 -9.493 -9.684 -10.111 -10.35 -10.603 -10.879 -11.206 -11.593 -12.146 -13.898 -7 ,9300 ,TETRA ,17621876,Tue Nov 30 20:44:55 CET,Tue Nov 30 22:36:55 CET,0.0 1.701 2.214 2.583 2.872 3.113 3.335 3.539 3.895 4.062 4.22 4.443 4.635 4.763 5.013 5.226 5.411 5.502 5.683 5.854 6.086 6.225 6.361 6.558 6.734 6.893 7.044 7.185 7.364 7.526 7.677 7.859 8.024 8.173 8.333 8.495 8.645 8.803 8.964 9.136 9.32 9.513 9.696 9.864 10.039 10.171 10.252 10.236 10.095 9.727 8.83 7.525 6.34 5.294 4.382 3.554 2.816 2.153 1.557 0.951 0.441 -0.022 -0.466 -0.884 -1.283 -1.644 -2.015 -2.34 -2.612 -2.9 -3.204 -3.454 -3.715 -3.997 -4.218 -4.451 -4.704 -4.956 -5.216 -5.406 -5.603 -5.917 -6.136 -6.367 -6.488 -6.735 -6.994 -7.279 -7.434 -7.669 -7.937 -8.124 -8.317 -8.755 -8.995 -9.258 -9.554 -9.886 -10.292 -10.843 -12.558 -8 ,19567 ,TETRA ,17621877,Tue Nov 30 20:44:55 CET,Tue Nov 30 22:34:28 CET,0.0 1.763 2.257 2.612 2.914 3.179 3.416 3.614 3.978 4.154 4.312 4.529 4.727 4.865 5.128 5.366 5.588 5.69 5.885 6.063 6.32 6.489 6.646 6.855 7.064 7.264 7.444 7.612 7.815 8.003 8.185 8.395 8.587 8.782 8.996 9.211 9.405 9.588 9.773 9.984 10.188 10.374 10.575 10.736 10.897 11.047 11.116 11.093 10.938 10.563 9.653 8.295 7.108 6.061 5.133 4.302 3.572 2.899 2.317 1.728 1.233 0.774 0.319 -0.092 -0.466 -0.809 -1.184 -1.527 -1.823 -2.124 -2.435 -2.706 -2.995 -3.301 -3.546 -3.796 -4.059 -4.34 -4.638 -4.834 -5.021 -5.323 -5.542 -5.772 -5.893 -6.142 -6.395 -6.656 -6.8 -7.032 -7.274 -7.452 -7.654 -8.096 -8.335 -8.59 -8.897 -9.239 -9.598 -10.121 -11.843 -9 ,5662 ,TETRA ,17621878,Tue Nov 30 20:44:57 CET,Tue Nov 30 22:36:05 CET,0.0 1.917 2.38 2.749 3.049 3.302 3.533 3.741 4.105 4.272 4.435 4.672 4.874 4.997 5.225 5.434 5.631 5.727 5.915 6.091 6.324 6.465 6.593 6.771 6.943 7.104 7.26 7.407 7.603 7.794 7.968 8.177 8.381 8.568 8.756 8.965 9.163 9.353 9.54 9.733 9.921 10.105 10.294 10.462 10.609 10.741 10.847 10.853 10.742 10.373 9.414 8.096 6.953 5.894 4.96 4.136 3.425 2.78 2.216 1.654 1.182 0.757 0.335 -0.06 -0.425 -0.777 -1.151 -1.478 -1.76 -2.058 -2.372 -2.633 -2.903 -3.187 -3.408 -3.641 -3.884 -4.148 -4.431 -4.62 -4.814 -5.129 -5.345 -5.564 -5.682 -5.932 -6.209 -6.509 -6.661 -6.893 -7.153 -7.339 -7.535 -7.956 -8.184 -8.452 -8.753 -9.078 -9.476 -9.993 -11.793 -10 ,6831 ,TETRA ,17621879,Tue Nov 30 20:44:55 CET,Tue Nov 30 22:37:22 CET,0.0 1.474 2.007 2.4 2.708 2.954 3.182 3.391 3.764 3.936 4.092 4.313 4.522 4.656 4.888 5.087 5.27 5.361 5.537 5.703 5.94 6.094 6.239 6.442 6.643 6.837 7.02 7.193 7.396 7.591 7.771 7.964 8.145 8.314 8.507 8.704 8.883 9.077 9.277 9.473 9.655 9.841 10.034 10.203 10.375 10.5 10.545 10.544 10.422 10.033 9.152 7.904 6.763 5.748 4.859 4.045 3.328 2.667 2.093 1.51 0.991 0.522 0.078 -0.344 -0.75 -1.108 -1.481 -1.835 -2.147 -2.477 -2.827 -3.112 -3.402 -3.724 -3.982 -4.24 -4.51 -4.791 -5.08 -5.289 -5.511 -5.868 -6.131 -6.4 -6.535 -6.822 -7.132 -7.458 -7.629 -7.879 -8.179 -8.388 -8.615 -9.094 -9.35 -9.645 -9.993 -10.396 -10.839 -11.375 -12.978 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_49.txt deleted file mode 100644 index 586ad454..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12374 ,TETRA ,17621880,Tue Nov 30 20:44:57 CET,Tue Nov 30 22:38:48 CET,0.0 1.646 2.084 2.407 2.669 2.89 3.084 3.258 3.565 3.697 3.817 3.964 4.132 4.227 4.407 4.564 4.695 4.756 4.873 4.975 5.117 5.203 5.276 5.377 5.46 5.533 5.596 5.653 5.726 5.786 5.828 5.865 5.896 5.912 5.922 5.935 5.923 5.884 5.828 5.736 5.609 5.436 5.181 4.861 4.407 3.807 2.989 1.867 0.259 -2.089 -5.83 -10.119 -13.44 -16.083 -18.304 -20.251 -21.882 -23.323 -24.523 -25.697 -26.713 -27.606 -28.442 -29.232 -29.969 -30.611 -31.29 -31.896 -32.394 -32.92 -33.465 -33.907 -34.373 -34.86 -35.239 -35.634 -36.051 -36.478 -36.913 -37.211 -37.52 -38.002 -38.332 -38.682 -38.867 -39.246 -39.643 -40.075 -40.3 -40.642 -41.012 -41.28 -41.559 -42.17 -42.53 -42.908 -43.312 -43.782 -44.352 -45.147 -47.671 -2 ,18030 ,TETRA ,17621881,Tue Nov 30 20:44:55 CET,Tue Nov 30 22:38:22 CET,0.0 1.262 1.693 1.992 2.234 2.439 2.622 2.791 3.082 3.204 3.321 3.473 3.636 3.718 3.863 3.997 4.123 4.184 4.292 4.393 4.541 4.627 4.704 4.803 4.881 4.952 5.017 5.077 5.148 5.216 5.281 5.333 5.356 5.377 5.388 5.374 5.349 5.299 5.24 5.163 5.035 4.833 4.555 4.233 3.771 3.169 2.336 1.186 -0.427 -2.756 -6.436 -10.67 -13.953 -16.584 -18.751 -20.665 -22.354 -23.848 -25.077 -26.271 -27.284 -28.145 -28.963 -29.739 -30.448 -31.119 -31.801 -32.379 -32.885 -33.413 -33.955 -34.404 -34.862 -35.345 -35.722 -36.118 -36.528 -36.937 -37.367 -37.675 -37.991 -38.485 -38.829 -39.182 -39.367 -39.756 -40.161 -40.584 -40.807 -41.156 -41.54 -41.799 -42.084 -42.719 -43.076 -43.461 -43.887 -44.374 -44.927 -45.632 -48.215 -3 ,7528 ,TETRA ,17621882,Tue Nov 30 20:44:56 CET,Tue Nov 30 22:35:09 CET,0.0 1.562 2.013 2.325 2.586 2.815 3.019 3.202 3.503 3.63 3.751 3.907 4.072 4.166 4.331 4.479 4.61 4.671 4.791 4.901 5.044 5.13 5.214 5.32 5.398 5.472 5.541 5.599 5.676 5.73 5.774 5.815 5.832 5.839 5.843 5.841 5.821 5.765 5.673 5.543 5.372 5.15 4.871 4.563 4.121 3.531 2.722 1.626 0.071 -2.236 -5.88 -10.072 -13.409 -16.097 -18.272 -20.15 -21.77 -23.223 -24.461 -25.654 -26.657 -27.539 -28.371 -29.156 -29.88 -30.536 -31.229 -31.853 -32.39 -32.933 -33.477 -33.929 -34.405 -34.926 -35.335 -35.726 -36.134 -36.576 -37.038 -37.348 -37.668 -38.186 -38.544 -38.93 -39.13 -39.542 -39.965 -40.41 -40.651 -41.01 -41.422 -41.714 -42.019 -42.667 -43.027 -43.446 -43.905 -44.43 -45.051 -45.792 -47.977 -4 ,11121 ,TETRA ,17621883,Tue Nov 30 20:44:57 CET,Tue Nov 30 22:41:11 CET,0.0 1.495 1.917 2.228 2.481 2.704 2.895 3.055 3.335 3.46 3.57 3.697 3.858 3.948 4.101 4.245 4.374 4.43 4.541 4.646 4.777 4.844 4.905 4.996 5.076 5.148 5.208 5.263 5.323 5.364 5.398 5.423 5.444 5.463 5.467 5.45 5.428 5.392 5.338 5.256 5.123 4.918 4.64 4.324 3.872 3.25 2.38 1.249 -0.31 -2.659 -6.45 -10.725 -14.027 -16.65 -18.819 -20.695 -22.274 -23.655 -24.823 -25.982 -26.969 -27.825 -28.612 -29.357 -30.05 -30.668 -31.308 -31.879 -32.375 -32.892 -33.43 -33.872 -34.335 -34.82 -35.183 -35.566 -35.954 -36.346 -36.762 -37.059 -37.372 -37.861 -38.213 -38.57 -38.738 -39.097 -39.498 -39.924 -40.144 -40.483 -40.863 -41.131 -41.411 -42.045 -42.395 -42.77 -43.197 -43.697 -44.275 -45.054 -47.495 -5 ,18563 ,TETRA ,17621884,Tue Nov 30 20:44:58 CET,Tue Nov 30 22:35:42 CET,0.0 1.627 2.06 2.405 2.687 2.911 3.11 3.289 3.606 3.74 3.859 4.008 4.172 4.272 4.458 4.613 4.744 4.807 4.919 5.023 5.168 5.241 5.302 5.402 5.497 5.582 5.652 5.705 5.767 5.831 5.905 5.981 6.031 6.066 6.089 6.097 6.094 6.072 6.009 5.92 5.797 5.597 5.316 5.01 4.559 3.928 3.095 1.963 0.394 -1.926 -5.647 -9.792 -13.039 -15.7 -17.877 -19.731 -21.313 -22.741 -23.979 -25.196 -26.216 -27.102 -27.924 -28.689 -29.41 -30.054 -30.707 -31.295 -31.817 -32.342 -32.869 -33.317 -33.793 -34.264 -34.618 -34.996 -35.401 -35.83 -36.267 -36.567 -36.871 -37.34 -37.687 -38.062 -38.245 -38.618 -39.025 -39.451 -39.679 -40.036 -40.447 -40.731 -41.019 -41.645 -41.998 -42.391 -42.815 -43.291 -43.862 -44.577 -46.717 -6 ,21562 ,TETRA ,17621885,Tue Nov 30 20:45:00 CET,Tue Nov 30 22:35:04 CET,0.0 1.582 2.028 2.362 2.627 2.861 3.069 3.254 3.568 3.706 3.83 3.978 4.141 4.227 4.393 4.555 4.698 4.763 4.873 4.969 5.122 5.214 5.293 5.398 5.486 5.561 5.617 5.664 5.728 5.775 5.806 5.83 5.841 5.848 5.845 5.833 5.814 5.779 5.717 5.618 5.489 5.304 5.023 4.679 4.224 3.632 2.797 1.667 0.061 -2.285 -6.002 -10.198 -13.451 -16.124 -18.355 -20.284 -21.92 -23.33 -24.535 -25.752 -26.785 -27.686 -28.528 -29.313 -30.033 -30.684 -31.36 -31.958 -32.463 -32.977 -33.525 -33.983 -34.448 -34.928 -35.301 -35.687 -36.084 -36.486 -36.909 -37.211 -37.514 -37.985 -38.319 -38.666 -38.847 -39.226 -39.634 -40.086 -40.327 -40.684 -41.082 -41.357 -41.639 -42.278 -42.629 -43.008 -43.441 -43.939 -44.511 -45.27 -47.666 -7 ,18005 ,TETRA ,17621886,Tue Nov 30 20:44:56 CET,Tue Nov 30 22:35:09 CET,0.0 1.257 1.676 1.997 2.277 2.511 2.709 2.887 3.201 3.333 3.449 3.597 3.767 3.86 4.025 4.181 4.32 4.382 4.496 4.602 4.731 4.807 4.878 4.972 5.064 5.144 5.209 5.26 5.319 5.367 5.41 5.458 5.487 5.508 5.53 5.526 5.483 5.434 5.382 5.293 5.146 4.949 4.692 4.383 3.966 3.395 2.591 1.502 -0.059 -2.391 -6.112 -10.291 -13.569 -16.237 -18.439 -20.315 -21.942 -23.393 -24.589 -25.77 -26.777 -27.671 -28.516 -29.294 -30.016 -30.668 -31.326 -31.905 -32.406 -32.936 -33.476 -33.917 -34.388 -34.87 -35.238 -35.629 -36.033 -36.443 -36.887 -37.204 -37.522 -38.01 -38.353 -38.714 -38.898 -39.286 -39.711 -40.169 -40.402 -40.753 -41.154 -41.418 -41.689 -42.299 -42.639 -43.018 -43.441 -43.931 -44.507 -45.27 -47.396 -8 ,75 ,TETRA ,17621887,Tue Nov 30 20:45:47 CET,Tue Nov 30 22:39:46 CET,0.0 1.563 2.009 2.359 2.647 2.884 3.088 3.258 3.558 3.687 3.804 3.953 4.119 4.21 4.37 4.512 4.64 4.703 4.818 4.917 5.057 5.14 5.215 5.314 5.398 5.481 5.552 5.616 5.686 5.736 5.781 5.826 5.856 5.878 5.889 5.875 5.84 5.775 5.686 5.568 5.41 5.188 4.869 4.512 4.059 3.443 2.622 1.509 -0.123 -2.473 -6.225 -10.469 -13.773 -16.463 -18.683 -20.622 -22.277 -23.701 -24.909 -26.1 -27.104 -27.988 -28.806 -29.585 -30.32 -30.982 -31.674 -32.295 -32.834 -33.39 -33.971 -34.468 -34.969 -35.467 -35.848 -36.235 -36.65 -37.104 -37.584 -37.91 -38.234 -38.722 -39.059 -39.416 -39.597 -39.975 -40.382 -40.803 -41.029 -41.377 -41.77 -42.04 -42.319 -42.936 -43.286 -43.663 -44.06 -44.523 -45.101 -45.848 -48.134 -9 ,124 ,TETRA ,17621888,Tue Nov 30 20:45:49 CET,Tue Nov 30 22:40:04 CET,0.0 1.696 2.138 2.466 2.736 2.954 3.161 3.35 3.647 3.776 3.897 4.045 4.211 4.309 4.48 4.635 4.778 4.841 4.953 5.069 5.241 5.334 5.417 5.523 5.605 5.674 5.748 5.809 5.873 5.926 5.97 6.023 6.057 6.077 6.092 6.115 6.113 6.061 5.983 5.897 5.773 5.585 5.335 5.016 4.559 3.962 3.134 2.017 0.479 -1.78 -5.453 -9.665 -12.93 -15.584 -17.776 -19.648 -21.253 -22.679 -23.888 -25.061 -26.046 -26.905 -27.736 -28.522 -29.252 -29.92 -30.594 -31.189 -31.699 -32.231 -32.793 -33.267 -33.756 -34.244 -34.62 -35.018 -35.421 -35.841 -36.306 -36.624 -36.941 -37.441 -37.8 -38.171 -38.364 -38.762 -39.167 -39.592 -39.817 -40.168 -40.556 -40.826 -41.12 -41.788 -42.146 -42.506 -42.896 -43.384 -43.988 -44.767 -47.022 -10 ,6609 ,TETRA ,17621889,Tue Nov 30 20:45:47 CET,Tue Nov 30 22:38:57 CET,0.0 2.201 2.66 2.97 3.223 3.444 3.641 3.818 4.121 4.255 4.385 4.541 4.705 4.799 4.962 5.11 5.252 5.316 5.428 5.534 5.675 5.747 5.817 5.929 6.028 6.107 6.163 6.211 6.273 6.326 6.372 6.419 6.446 6.475 6.504 6.507 6.497 6.477 6.424 6.331 6.22 6.051 5.786 5.465 5.004 4.371 3.488 2.328 0.709 -1.692 -5.484 -9.671 -12.888 -15.509 -17.716 -19.633 -21.233 -22.659 -23.882 -25.1 -26.136 -27.027 -27.854 -28.632 -29.364 -30.033 -30.726 -31.313 -31.818 -32.359 -32.916 -33.386 -33.87 -34.374 -34.774 -35.178 -35.602 -36.048 -36.494 -36.802 -37.125 -37.634 -37.982 -38.337 -38.528 -38.931 -39.369 -39.82 -40.043 -40.383 -40.758 -41.033 -41.329 -41.977 -42.323 -42.681 -43.083 -43.553 -44.115 -44.864 -47.064 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_44.txt deleted file mode 100644 index d9b0175f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11315 ,TETRA ,17621890,Tue Nov 30 20:45:48 CET,Tue Nov 30 22:30:36 CET,0.0 1.625 2.166 2.597 2.928 3.209 3.47 3.705 4.108 4.304 4.487 4.738 4.973 5.129 5.421 5.699 5.959 6.08 6.315 6.537 6.848 7.038 7.214 7.467 7.704 7.937 8.17 8.381 8.638 8.892 9.135 9.408 9.666 9.906 10.166 10.458 10.73 11.023 11.348 11.673 11.999 12.351 12.735 13.119 13.556 14.0 14.456 14.912 15.398 15.871 16.192 16.118 15.827 15.448 15.031 14.601 14.171 13.742 13.351 12.941 12.586 12.267 11.944 11.641 11.349 11.076 10.809 10.57 10.35 10.11 9.855 9.636 9.416 9.17 8.962 8.761 8.555 8.331 8.091 7.921 7.75 7.481 7.277 7.056 6.94 6.692 6.434 6.165 6.021 5.796 5.552 5.377 5.177 4.723 4.483 4.218 3.937 3.606 3.187 2.617 0.58 -2 ,19981 ,TETRA ,17621891,Tue Nov 30 20:45:48 CET,Tue Nov 30 22:38:11 CET,0.0 1.399 1.915 2.309 2.624 2.924 3.21 3.46 3.883 4.071 4.249 4.493 4.72 4.868 5.141 5.379 5.601 5.708 5.919 6.111 6.381 6.556 6.725 6.961 7.175 7.376 7.576 7.765 7.991 8.212 8.428 8.673 8.917 9.158 9.427 9.736 10.034 10.34 10.654 10.968 11.296 11.661 12.045 12.406 12.804 13.234 13.704 14.181 14.657 15.104 15.369 15.191 14.801 14.354 13.898 13.437 13.01 12.607 12.224 11.789 11.409 11.09 10.779 10.455 10.135 9.848 9.561 9.284 9.027 8.764 8.483 8.237 7.977 7.72 7.524 7.305 7.064 6.814 6.552 6.375 6.204 5.935 5.735 5.522 5.404 5.146 4.885 4.616 4.465 4.225 3.98 3.81 3.618 3.185 2.95 2.7 2.422 2.075 1.642 1.072 -0.59 -3 ,175 ,TETRA ,17621892,Tue Nov 30 20:45:49 CET,Tue Nov 30 22:37:58 CET,0.0 1.593 2.141 2.535 2.851 3.127 3.394 3.633 4.031 4.215 4.399 4.642 4.867 5.005 5.253 5.48 5.698 5.807 6.017 6.213 6.492 6.665 6.828 7.062 7.285 7.494 7.687 7.874 8.109 8.329 8.537 8.786 9.03 9.272 9.556 9.863 10.142 10.437 10.746 11.067 11.394 11.752 12.157 12.545 12.954 13.378 13.86 14.378 14.908 15.405 15.7 15.568 15.188 14.756 14.324 13.872 13.442 13.035 12.676 12.271 11.887 11.555 11.233 10.909 10.607 10.32 9.999 9.715 9.48 9.241 8.997 8.797 8.573 8.335 8.155 7.968 7.763 7.543 7.301 7.13 6.955 6.663 6.462 6.261 6.147 5.908 5.663 5.399 5.256 5.031 4.776 4.595 4.404 3.98 3.739 3.47 3.157 2.797 2.392 1.861 0.039 -4 ,4685 ,TETRA ,17621893,Tue Nov 30 20:45:51 CET,Tue Nov 30 22:37:56 CET,0.0 1.998 2.559 2.941 3.258 3.579 3.882 4.126 4.534 4.716 4.896 5.158 5.395 5.539 5.793 6.025 6.239 6.341 6.548 6.746 7.004 7.176 7.35 7.584 7.794 8.001 8.205 8.391 8.623 8.838 9.041 9.279 9.502 9.716 9.961 10.233 10.486 10.752 11.036 11.334 11.649 11.998 12.381 12.758 13.19 13.67 14.171 14.678 15.207 15.652 15.914 15.821 15.502 15.099 14.687 14.284 13.883 13.466 13.097 12.707 12.339 12.008 11.683 11.359 11.054 10.767 10.468 10.206 9.975 9.728 9.453 9.214 8.96 8.688 8.485 8.275 8.03 7.76 7.489 7.301 7.098 6.788 6.572 6.326 6.193 5.927 5.648 5.34 5.18 4.938 4.643 4.447 4.241 3.803 3.576 3.329 3.037 2.693 2.285 1.729 -0.062 -5 ,25537 ,TETRA ,17621894,Tue Nov 30 20:45:47 CET,Tue Nov 30 22:38:38 CET,0.0 1.653 2.179 2.54 2.837 3.103 3.338 3.556 3.952 4.126 4.288 4.518 4.743 4.882 5.138 5.377 5.619 5.735 5.962 6.177 6.473 6.657 6.835 7.095 7.323 7.537 7.751 7.965 8.238 8.483 8.704 8.956 9.192 9.416 9.674 9.952 10.218 10.511 10.825 11.142 11.452 11.791 12.195 12.609 13.038 13.463 13.948 14.444 14.905 15.328 15.599 15.478 15.152 14.731 14.251 13.776 13.368 12.965 12.597 12.212 11.846 11.503 11.174 10.854 10.546 10.257 9.94 9.655 9.401 9.124 8.841 8.599 8.347 8.089 7.883 7.675 7.464 7.254 7.024 6.855 6.683 6.406 6.205 5.995 5.889 5.647 5.389 5.117 4.973 4.748 4.492 4.313 4.127 3.705 3.464 3.212 2.933 2.595 2.18 1.625 -0.257 -6 ,3383 ,TETRA ,17621895,Tue Nov 30 20:45:49 CET,Tue Nov 30 22:38:38 CET,0.0 1.748 2.345 2.805 3.187 3.513 3.803 4.049 4.491 4.698 4.891 5.161 5.395 5.54 5.837 6.126 6.37 6.482 6.707 6.932 7.243 7.432 7.617 7.881 8.122 8.348 8.557 8.757 9.013 9.256 9.491 9.759 10.009 10.255 10.538 10.836 11.112 11.404 11.705 12.025 12.342 12.691 13.085 13.449 13.869 14.316 14.777 15.248 15.763 16.207 16.445 16.314 16.01 15.663 15.226 14.773 14.369 13.956 13.573 13.192 12.843 12.507 12.184 11.877 11.581 11.299 10.991 10.717 10.471 10.204 9.923 9.694 9.47 9.22 9.019 8.819 8.613 8.394 8.16 8.002 7.836 7.567 7.383 7.187 7.08 6.846 6.597 6.343 6.206 5.979 5.733 5.563 5.384 4.988 4.751 4.481 4.186 3.857 3.454 2.872 1.105 -7 ,9877 ,TETRA ,17621896,Tue Nov 30 20:45:49 CET,Tue Nov 30 22:43:18 CET,0.0 2.366 2.874 3.252 3.577 3.852 4.094 4.316 4.71 4.885 5.043 5.266 5.501 5.642 5.905 6.143 6.353 6.457 6.664 6.861 7.145 7.318 7.469 7.678 7.887 8.101 8.298 8.479 8.723 8.962 9.177 9.41 9.624 9.843 10.092 10.354 10.614 10.905 11.223 11.554 11.879 12.239 12.672 13.091 13.524 13.958 14.447 14.946 15.413 15.838 16.118 16.048 15.755 15.348 14.929 14.491 14.056 13.644 13.275 12.877 12.5 12.164 11.831 11.491 11.185 10.915 10.626 10.359 10.131 9.894 9.647 9.432 9.193 8.945 8.752 8.551 8.342 8.125 7.885 7.717 7.539 7.251 7.049 6.832 6.716 6.47 6.205 5.919 5.767 5.532 5.276 5.092 4.891 4.458 4.224 3.965 3.667 3.33 2.932 2.397 0.451 -8 ,127 ,TETRA ,17621897,Tue Nov 30 20:45:49 CET,Tue Nov 30 22:38:33 CET,0.0 1.574 2.106 2.511 2.845 3.125 3.372 3.597 3.999 4.177 4.349 4.59 4.817 4.966 5.247 5.501 5.744 5.854 6.053 6.248 6.524 6.687 6.84 7.064 7.285 7.499 7.705 7.899 8.145 8.377 8.598 8.857 9.116 9.365 9.64 9.943 10.226 10.526 10.842 11.174 11.495 11.836 12.217 12.611 13.073 13.537 13.991 14.458 14.958 15.412 15.717 15.642 15.33 14.924 14.46 14.019 13.623 13.195 12.793 12.416 12.1 11.777 11.419 11.099 10.804 10.514 10.226 9.968 9.727 9.474 9.218 8.999 8.77 8.534 8.347 8.152 7.944 7.723 7.499 7.336 7.16 6.875 6.666 6.44 6.323 6.077 5.807 5.52 5.374 5.144 4.884 4.701 4.507 4.088 3.863 3.614 3.331 3.003 2.589 2.048 -0.245 -9 ,27895 ,TETRA ,17621898,Tue Nov 30 20:45:49 CET,Tue Nov 30 22:40:37 CET,0.0 1.641 2.128 2.503 2.833 3.119 3.367 3.604 4.012 4.191 4.363 4.599 4.827 4.964 5.217 5.455 5.681 5.793 6.001 6.191 6.466 6.641 6.808 7.048 7.26 7.451 7.642 7.823 8.049 8.265 8.465 8.701 8.955 9.207 9.482 9.791 10.074 10.376 10.69 11.017 11.352 11.705 12.094 12.469 12.91 13.399 13.881 14.347 14.829 15.243 15.515 15.427 15.122 14.744 14.329 13.901 13.501 13.106 12.751 12.356 11.985 11.662 11.366 11.079 10.784 10.52 10.256 10.016 9.797 9.568 9.331 9.127 8.912 8.682 8.492 8.29 8.084 7.871 7.64 7.474 7.299 7.032 6.835 6.625 6.52 6.282 6.021 5.744 5.605 5.383 5.138 4.961 4.772 4.362 4.128 3.868 3.578 3.253 2.864 2.323 0.259 -10 ,6823 ,TETRA ,17621899,Tue Nov 30 20:45:49 CET,Tue Nov 30 22:40:03 CET,0.0 1.565 2.109 2.484 2.79 3.065 3.317 3.54 3.916 4.09 4.262 4.512 4.742 4.879 5.134 5.373 5.598 5.703 5.903 6.09 6.363 6.538 6.707 6.942 7.155 7.355 7.547 7.729 7.965 8.195 8.408 8.652 8.886 9.108 9.357 9.633 9.889 10.155 10.438 10.74 11.047 11.386 11.768 12.126 12.521 12.939 13.393 13.851 14.306 14.747 15.069 14.92 14.59 14.23 13.831 13.414 13.009 12.601 12.235 11.865 11.528 11.219 10.915 10.633 10.362 10.092 9.797 9.533 9.31 9.072 8.818 8.6 8.371 8.122 7.914 7.712 7.496 7.258 7.013 6.846 6.678 6.395 6.192 5.986 5.879 5.649 5.401 5.144 5.007 4.788 4.544 4.369 4.189 3.772 3.53 3.256 2.95 2.613 2.213 1.7 -0.084 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_49.txt deleted file mode 100644 index b506999b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32740 ,TETRA ,17621900,Tue Nov 30 20:45:49 CET,Tue Nov 30 22:37:19 CET,0.0 1.289 1.778 2.142 2.419 2.65 2.861 3.048 3.364 3.508 3.643 3.804 3.993 4.094 4.281 4.448 4.591 4.657 4.79 4.917 5.093 5.201 5.3 5.433 5.556 5.668 5.765 5.857 5.961 6.044 6.122 6.204 6.284 6.37 6.454 6.522 6.572 6.619 6.647 6.65 6.639 6.581 6.473 6.344 6.128 5.805 5.331 4.641 3.601 1.976 -0.674 -3.787 -6.243 -8.227 -9.859 -11.283 -12.517 -13.587 -14.509 -15.445 -16.242 -16.939 -17.627 -18.282 -18.884 -19.433 -19.977 -20.465 -20.909 -21.374 -21.845 -22.235 -22.637 -23.051 -23.379 -23.715 -24.073 -24.452 -24.83 -25.085 -25.355 -25.801 -26.12 -26.464 -26.64 -26.986 -27.363 -27.76 -27.975 -28.313 -28.651 -28.908 -29.185 -29.784 -30.119 -30.482 -30.887 -31.343 -31.913 -32.759 -35.248 -2 ,26583 ,TETRA ,17621901,Tue Nov 30 20:45:50 CET,Tue Nov 30 22:37:37 CET,0.0 2.27 2.736 3.069 3.332 3.558 3.762 3.948 4.258 4.396 4.524 4.672 4.858 4.959 5.166 5.354 5.518 5.593 5.736 5.853 6.005 6.102 6.192 6.322 6.441 6.54 6.632 6.715 6.813 6.914 7.008 7.1 7.183 7.256 7.333 7.4 7.447 7.491 7.524 7.53 7.509 7.464 7.362 7.21 6.986 6.665 6.163 5.455 4.427 2.844 0.233 -2.796 -5.193 -7.186 -8.896 -10.369 -11.628 -12.769 -13.731 -14.656 -15.444 -16.165 -16.856 -17.492 -18.089 -18.638 -19.2 -19.698 -20.137 -20.604 -21.092 -21.481 -21.889 -22.335 -22.677 -23.028 -23.399 -23.786 -24.184 -24.468 -24.765 -25.23 -25.543 -25.86 -26.024 -26.373 -26.75 -27.149 -27.357 -27.694 -28.07 -28.326 -28.582 -29.166 -29.512 -29.877 -30.269 -30.726 -31.291 -32.048 -34.783 -3 ,28666 ,TETRA ,17621902,Tue Nov 30 20:45:51 CET,Tue Nov 30 22:32:05 CET,0.0 1.508 1.941 2.261 2.537 2.779 2.982 3.156 3.476 3.622 3.756 3.917 4.103 4.208 4.403 4.576 4.727 4.796 4.929 5.05 5.223 5.332 5.431 5.562 5.687 5.802 5.907 5.995 6.096 6.201 6.293 6.386 6.457 6.506 6.555 6.61 6.645 6.667 6.679 6.661 6.618 6.539 6.409 6.267 6.071 5.775 5.295 4.583 3.562 1.997 -0.535 -3.482 -5.839 -7.786 -9.433 -10.844 -12.073 -13.19 -14.163 -15.129 -15.952 -16.685 -17.365 -18.005 -18.601 -19.14 -19.706 -20.226 -20.673 -21.126 -21.608 -22.026 -22.45 -22.879 -23.229 -23.594 -23.963 -24.338 -24.733 -25.01 -25.291 -25.729 -26.028 -26.35 -26.528 -26.89 -27.262 -27.675 -27.894 -28.228 -28.587 -28.837 -29.11 -29.7 -30.017 -30.38 -30.764 -31.218 -31.777 -32.528 -35.817 -4 ,12036 ,TETRA ,17621903,Tue Nov 30 20:45:50 CET,Tue Nov 30 22:41:25 CET,0.0 1.677 2.151 2.502 2.786 3.026 3.233 3.415 3.735 3.88 4.021 4.181 4.362 4.458 4.643 4.813 4.964 5.034 5.168 5.293 5.467 5.573 5.667 5.794 5.904 6.008 6.109 6.209 6.326 6.42 6.499 6.594 6.681 6.756 6.828 6.905 6.968 7.0 7.008 7.008 6.99 6.931 6.816 6.654 6.411 6.082 5.612 4.91 3.856 2.315 -0.228 -3.245 -5.561 -7.466 -9.132 -10.586 -11.817 -12.928 -13.883 -14.814 -15.606 -16.343 -17.053 -17.698 -18.293 -18.839 -19.428 -19.964 -20.412 -20.862 -21.337 -21.738 -22.15 -22.583 -22.922 -23.28 -23.662 -24.052 -24.458 -24.746 -25.04 -25.492 -25.82 -26.161 -26.337 -26.719 -27.113 -27.529 -27.75 -28.099 -28.482 -28.748 -29.02 -29.606 -29.943 -30.306 -30.696 -31.14 -31.672 -32.382 -35.272 -5 ,29249 ,TETRA ,17621904,Tue Nov 30 20:45:50 CET,Tue Nov 30 22:38:57 CET,0.0 1.67 2.141 2.496 2.796 3.063 3.299 3.503 3.859 4.019 4.175 4.389 4.597 4.722 4.951 5.15 5.326 5.41 5.572 5.721 5.915 6.031 6.148 6.311 6.456 6.58 6.693 6.807 6.951 7.073 7.174 7.282 7.375 7.448 7.529 7.617 7.682 7.72 7.739 7.746 7.717 7.657 7.556 7.406 7.182 6.881 6.43 5.747 4.691 3.102 0.512 -2.536 -4.953 -6.914 -8.522 -9.985 -11.246 -12.334 -13.28 -14.234 -15.057 -15.783 -16.474 -17.119 -17.709 -18.255 -18.841 -19.368 -19.821 -20.293 -20.785 -21.188 -21.593 -22.022 -22.363 -22.716 -23.096 -23.493 -23.898 -24.183 -24.475 -24.931 -25.245 -25.566 -25.734 -26.077 -26.457 -26.879 -27.092 -27.414 -27.751 -28.0 -28.265 -28.885 -29.223 -29.581 -29.992 -30.46 -31.019 -31.737 -34.285 -6 ,17276 ,TETRA ,17621905,Tue Nov 30 20:45:54 CET,Tue Nov 30 22:39:53 CET,0.0 1.514 2.009 2.382 2.665 2.897 3.121 3.323 3.645 3.787 3.921 4.075 4.267 4.372 4.57 4.756 4.928 5.005 5.138 5.262 5.439 5.557 5.673 5.833 5.973 6.094 6.2 6.296 6.42 6.528 6.63 6.754 6.857 6.946 7.035 7.12 7.184 7.237 7.271 7.268 7.239 7.188 7.082 6.917 6.692 6.364 5.867 5.188 4.19 2.656 0.091 -2.918 -5.373 -7.365 -9.016 -10.482 -11.717 -12.804 -13.755 -14.691 -15.478 -16.175 -16.828 -17.439 -18.018 -18.553 -19.085 -19.559 -19.985 -20.417 -20.884 -21.28 -21.67 -22.08 -22.394 -22.712 -23.053 -23.415 -23.81 -24.085 -24.361 -24.808 -25.13 -25.467 -25.634 -25.957 -26.307 -26.726 -26.953 -27.298 -27.65 -27.902 -28.174 -28.752 -29.071 -29.446 -29.865 -30.346 -30.931 -31.7 -33.953 -7 ,18120 ,TETRA ,17621906,Tue Nov 30 20:45:50 CET,Tue Nov 30 22:38:56 CET,0.0 1.64 2.129 2.501 2.819 3.077 3.288 3.479 3.807 3.958 4.094 4.258 4.454 4.556 4.752 4.93 5.072 5.139 5.273 5.402 5.582 5.689 5.783 5.914 6.035 6.136 6.225 6.309 6.422 6.519 6.59 6.667 6.736 6.795 6.866 6.934 6.979 7.015 7.04 7.048 7.039 6.991 6.868 6.708 6.471 6.137 5.646 4.938 3.9 2.31 -0.288 -3.234 -5.629 -7.644 -9.27 -10.673 -11.928 -13.074 -14.051 -15.015 -15.868 -16.607 -17.267 -17.895 -18.484 -19.027 -19.596 -20.108 -20.55 -20.991 -21.437 -21.809 -22.206 -22.633 -22.97 -23.317 -23.67 -24.044 -24.431 -24.694 -24.969 -25.387 -25.682 -26.007 -26.169 -26.505 -26.895 -27.309 -27.52 -27.859 -28.224 -28.476 -28.755 -29.393 -29.731 -30.095 -30.496 -30.953 -31.508 -32.256 -34.776 -8 ,24980 ,TETRA ,17621907,Tue Nov 30 20:45:52 CET,Tue Nov 30 22:39:50 CET,0.0 1.395 1.857 2.234 2.564 2.826 3.051 3.255 3.625 3.787 3.936 4.129 4.328 4.448 4.666 4.86 5.039 5.122 5.285 5.431 5.628 5.748 5.853 6.013 6.159 6.28 6.389 6.486 6.604 6.706 6.801 6.912 7.009 7.088 7.159 7.232 7.319 7.387 7.412 7.431 7.431 7.394 7.314 7.184 6.973 6.642 6.158 5.498 4.488 2.91 0.31 -2.69 -5.115 -7.167 -8.862 -10.321 -11.588 -12.711 -13.649 -14.606 -15.431 -16.161 -16.864 -17.503 -18.089 -18.63 -19.192 -19.692 -20.144 -20.608 -21.073 -21.471 -21.894 -22.332 -22.666 -23.016 -23.391 -23.784 -24.185 -24.461 -24.745 -25.197 -25.527 -25.858 -26.023 -26.378 -26.76 -27.173 -27.386 -27.721 -28.079 -28.332 -28.606 -29.195 -29.515 -29.874 -30.291 -30.768 -31.337 -32.13 -34.724 -9 ,28656 ,TETRA ,17621908,Tue Nov 30 20:45:49 CET,Tue Nov 30 22:26:56 CET,0.0 1.53 1.994 2.322 2.589 2.812 3.008 3.197 3.53 3.672 3.801 3.943 4.125 4.226 4.402 4.557 4.711 4.786 4.913 5.029 5.195 5.299 5.392 5.506 5.617 5.721 5.806 5.892 5.986 6.061 6.14 6.222 6.291 6.356 6.424 6.488 6.532 6.571 6.592 6.582 6.555 6.495 6.375 6.22 5.993 5.647 5.139 4.428 3.366 1.787 -0.758 -3.743 -6.125 -8.071 -9.728 -11.211 -12.478 -13.562 -14.466 -15.395 -16.205 -16.927 -17.607 -18.234 -18.835 -19.379 -19.935 -20.451 -20.904 -21.366 -21.855 -22.275 -22.698 -23.136 -23.479 -23.833 -24.203 -24.589 -24.993 -25.273 -25.564 -26.03 -26.35 -26.687 -26.862 -27.215 -27.602 -28.026 -28.25 -28.609 -29.011 -29.28 -29.562 -30.168 -30.525 -30.918 -31.351 -31.88 -32.537 -33.379 -36.392 -10 ,2970 ,TETRA ,17621909,Tue Nov 30 20:45:51 CET,Tue Nov 30 22:41:35 CET,0.0 1.811 2.286 2.628 2.92 3.173 3.388 3.581 3.915 4.057 4.184 4.34 4.53 4.64 4.861 5.055 5.226 5.3 5.427 5.547 5.732 5.837 5.931 6.085 6.232 6.358 6.477 6.585 6.709 6.817 6.916 7.038 7.139 7.214 7.303 7.382 7.425 7.463 7.49 7.493 7.481 7.436 7.339 7.189 6.958 6.625 6.121 5.412 4.361 2.768 0.169 -2.854 -5.252 -7.226 -8.884 -10.35 -11.606 -12.734 -13.718 -14.654 -15.446 -16.154 -16.833 -17.471 -18.054 -18.579 -19.139 -19.638 -20.061 -20.506 -20.961 -21.343 -21.737 -22.141 -22.465 -22.807 -23.157 -23.519 -23.909 -24.18 -24.463 -24.909 -25.219 -25.538 -25.707 -26.065 -26.436 -26.819 -27.025 -27.361 -27.728 -27.99 -28.273 -28.887 -29.205 -29.592 -30.049 -30.544 -31.128 -31.877 -34.591 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_20.txt deleted file mode 100644 index 4d5ff44d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_20.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15764 ,TETRA ,17621910,Tue Nov 30 20:45:53 CET,Tue Nov 30 22:27:16 CET,0.0 2.84 3.55 4.088 4.505 4.868 5.176 5.445 5.918 6.14 6.344 6.619 6.878 7.045 7.389 7.702 7.978 8.116 8.366 8.594 8.914 9.107 9.301 9.581 9.86 10.157 10.423 10.65 10.957 11.26 11.532 11.861 12.163 12.437 12.751 13.133 13.5 13.884 14.274 14.671 15.086 15.523 16.006 16.452 16.942 17.457 17.974 18.488 18.989 19.389 19.568 19.295 18.729 18.051 17.382 16.737 16.111 15.509 14.976 14.431 13.94 13.5 13.078 12.674 12.294 11.946 11.566 11.214 10.905 10.579 10.234 9.944 9.633 9.303 9.061 8.809 8.542 8.266 7.971 7.754 7.535 7.203 6.966 6.71 6.573 6.293 5.987 5.65 5.47 5.187 4.854 4.625 4.385 3.836 3.53 3.203 2.847 2.421 1.865 1.166 -0.679 -2 ,11025 ,TETRA ,17621911,Tue Nov 30 20:45:51 CET,Tue Nov 30 22:43:47 CET,0.0 3.084 3.842 4.396 4.844 5.224 5.574 5.879 6.376 6.583 6.787 7.095 7.366 7.541 7.882 8.176 8.445 8.579 8.834 9.077 9.412 9.629 9.836 10.121 10.398 10.65 10.884 11.113 11.404 11.67 11.918 12.218 12.523 12.825 13.167 13.525 13.84 14.197 14.592 14.976 15.367 15.798 16.288 16.773 17.281 17.803 18.365 18.907 19.398 19.802 19.945 19.583 19.023 18.395 17.77 17.153 16.574 16.032 15.543 15.042 14.598 14.192 13.78 13.381 13.011 12.649 12.262 11.921 11.61 11.27 10.92 10.628 10.315 9.978 9.719 9.46 9.185 8.886 8.558 8.324 8.087 7.701 7.424 7.14 6.988 6.666 6.325 5.962 5.76 5.464 5.105 4.861 4.603 3.983 3.646 3.293 2.894 2.43 1.871 1.155 -1.097 -3 ,2472 ,TETRA ,17621912,Tue Nov 30 20:45:53 CET,Tue Nov 30 22:37:04 CET,0.0 2.251 2.807 3.239 3.594 3.91 4.213 4.489 4.962 5.154 5.332 5.607 5.868 6.036 6.359 6.647 6.916 7.047 7.305 7.551 7.903 8.13 8.337 8.632 8.914 9.187 9.439 9.675 9.987 10.275 10.549 10.884 11.196 11.491 11.832 12.201 12.54 12.908 13.297 13.69 14.1 14.556 15.062 15.555 16.088 16.652 17.254 17.822 18.376 18.865 19.025 18.643 18.048 17.376 16.74 16.114 15.534 14.983 14.482 13.978 13.536 13.142 12.732 12.343 11.992 11.641 11.273 10.936 10.64 10.324 9.97 9.683 9.389 9.073 8.83 8.582 8.315 8.028 7.724 7.508 7.291 6.932 6.666 6.394 6.25 5.921 5.575 5.219 5.026 4.731 4.397 4.179 3.927 3.392 3.103 2.774 2.402 1.973 1.485 0.816 -1.565 -4 ,23837 ,TETRA ,17621913,Tue Nov 30 20:45:52 CET,Tue Nov 30 22:37:06 CET,0.0 3.146 3.828 4.337 4.748 5.098 5.397 5.67 6.158 6.385 6.609 6.921 7.183 7.346 7.656 7.954 8.235 8.371 8.62 8.84 9.155 9.364 9.559 9.839 10.127 10.402 10.641 10.852 11.13 11.415 11.682 11.995 12.291 12.573 12.901 13.251 13.577 13.932 14.317 14.723 15.143 15.596 16.078 16.534 17.043 17.584 18.141 18.704 19.277 19.767 19.947 19.548 18.961 18.342 17.712 17.09 16.521 15.949 15.427 14.904 14.43 14.002 13.581 13.171 12.799 12.466 12.1 11.756 11.449 11.132 10.798 10.513 10.219 9.906 9.649 9.376 9.091 8.784 8.451 8.223 7.987 7.609 7.339 7.059 6.914 6.615 6.302 5.962 5.787 5.521 5.223 5.017 4.81 4.335 4.061 3.777 3.48 3.111 2.634 2.003 -0.335 -5 ,26300 ,TETRA ,17621914,Tue Nov 30 20:45:50 CET,Tue Nov 30 22:25:50 CET,0.0 2.56 3.294 3.828 4.248 4.609 4.93 5.22 5.722 5.953 6.159 6.435 6.695 6.868 7.183 7.472 7.741 7.869 8.128 8.382 8.705 8.919 9.132 9.424 9.696 9.947 10.182 10.397 10.675 10.942 11.195 11.508 11.794 12.064 12.385 12.734 13.053 13.4 13.783 14.175 14.57 15.006 15.489 15.946 16.45 17.001 17.589 18.164 18.723 19.179 19.37 19.096 18.593 17.994 17.41 16.805 16.213 15.674 15.196 14.706 14.231 13.757 13.327 12.939 12.563 12.192 11.807 11.465 11.162 10.854 10.525 10.239 9.942 9.619 9.35 9.085 8.806 8.505 8.191 7.965 7.743 7.412 7.178 6.926 6.789 6.504 6.21 5.89 5.721 5.456 5.161 4.957 4.738 4.245 3.964 3.647 3.283 2.843 2.326 1.632 -0.759 -6 ,4828 ,TETRA ,17621915,Tue Nov 30 20:45:53 CET,Tue Nov 30 22:19:48 CET,0.0 2.446 3.056 3.499 3.864 4.182 4.467 4.727 5.186 5.404 5.615 5.902 6.165 6.333 6.636 6.924 7.194 7.321 7.566 7.81 8.156 8.366 8.56 8.831 9.083 9.324 9.567 9.793 10.076 10.354 10.62 10.921 11.207 11.482 11.804 12.17 12.487 12.812 13.174 13.561 13.952 14.368 14.838 15.297 15.788 16.315 16.91 17.516 18.06 18.452 18.661 18.363 17.685 16.964 16.325 15.749 15.206 14.652 14.137 13.594 13.135 12.706 12.276 11.87 11.493 11.137 10.742 10.41 10.121 9.801 9.466 9.179 8.881 8.559 8.299 8.03 7.756 7.489 7.213 7.004 6.786 6.444 6.202 5.94 5.804 5.535 5.238 4.897 4.724 4.462 4.164 3.956 3.741 3.238 2.952 2.65 2.311 1.898 1.348 0.596 -1.602 -7 ,11623 ,TETRA ,17621916,Tue Nov 30 20:45:52 CET,Tue Nov 30 22:29:16 CET,0.0 2.195 2.882 3.374 3.818 4.207 4.519 4.793 5.287 5.498 5.687 5.966 6.245 6.422 6.719 6.994 7.257 7.386 7.635 7.875 8.23 8.456 8.662 8.959 9.26 9.548 9.818 10.067 10.369 10.67 10.962 11.296 11.612 11.907 12.249 12.633 12.974 13.327 13.704 14.105 14.516 14.956 15.472 15.973 16.491 17.005 17.555 18.094 18.583 18.997 19.136 18.785 18.237 17.621 16.96 16.312 15.751 15.22 14.727 14.199 13.75 13.34 12.902 12.493 12.128 11.793 11.437 11.106 10.808 10.504 10.173 9.891 9.616 9.332 9.098 8.854 8.597 8.316 8.028 7.828 7.613 7.277 7.041 6.79 6.657 6.377 6.093 5.786 5.623 5.357 5.057 4.851 4.636 4.144 3.852 3.536 3.196 2.811 2.349 1.712 -0.57 -8 ,5958 ,TETRA ,17621917,Tue Nov 30 20:45:53 CET,Tue Nov 30 22:30:11 CET,0.0 2.416 3.081 3.553 3.932 4.261 4.546 4.826 5.336 5.564 5.782 6.08 6.346 6.509 6.797 7.071 7.331 7.453 7.7 7.939 8.264 8.475 8.672 8.947 9.21 9.463 9.7 9.915 10.183 10.428 10.662 10.966 11.255 11.52 11.823 12.162 12.479 12.813 13.156 13.537 13.939 14.333 14.787 15.258 15.797 16.348 16.922 17.486 18.012 18.427 18.551 18.195 17.591 16.888 16.236 15.608 15.001 14.401 13.866 13.329 12.859 12.434 11.993 11.561 11.17 10.824 10.45 10.09 9.775 9.458 9.115 8.821 8.521 8.203 7.958 7.706 7.453 7.186 6.888 6.684 6.476 6.14 5.903 5.66 5.533 5.261 4.97 4.651 4.482 4.214 3.914 3.71 3.493 3.001 2.724 2.425 2.089 1.695 1.228 0.591 -1.86 -9 ,8358 ,TETRA ,17621918,Tue Nov 30 20:46:51 CET,Tue Nov 30 22:40:23 CET,0.0 1.989 2.68 3.189 3.611 3.94 4.241 4.523 5.001 5.219 5.424 5.71 5.981 6.155 6.475 6.782 7.076 7.208 7.454 7.694 8.023 8.224 8.419 8.701 8.978 9.246 9.501 9.749 10.07 10.381 10.661 10.979 11.277 11.565 11.894 12.243 12.577 12.949 13.349 13.768 14.17 14.625 15.135 15.582 16.095 16.631 17.187 17.726 18.24 18.652 18.786 18.4 17.842 17.239 16.62 16.013 15.407 14.821 14.32 13.793 13.317 12.889 12.455 12.037 11.645 11.284 10.915 10.589 10.31 10.006 9.687 9.436 9.169 8.88 8.644 8.393 8.134 7.861 7.574 7.381 7.18 6.852 6.619 6.366 6.237 5.969 5.665 5.334 5.164 4.899 4.615 4.42 4.203 3.686 3.416 3.135 2.806 2.412 1.897 1.208 -1.319 -10 ,1266 ,TETRA ,17621919,Tue Nov 30 20:46:45 CET,Tue Nov 30 22:41:19 CET,0.0 2.352 3.056 3.553 3.929 4.262 4.554 4.817 5.3 5.521 5.724 5.988 6.239 6.398 6.707 6.997 7.263 7.389 7.637 7.875 8.202 8.401 8.593 8.871 9.132 9.384 9.631 9.862 10.158 10.442 10.707 11.012 11.3 11.577 11.885 12.218 12.539 12.876 13.219 13.594 13.986 14.402 14.857 15.301 15.79 16.292 16.836 17.374 17.862 18.289 18.514 18.152 17.556 16.89 16.218 15.596 15.006 14.445 13.932 13.385 12.902 12.46 12.025 11.6 11.219 10.869 10.455 10.084 9.779 9.455 9.126 8.866 8.589 8.3 8.073 7.829 7.578 7.305 7.008 6.805 6.602 6.272 6.032 5.773 5.634 5.334 5.012 4.688 4.522 4.249 3.95 3.742 3.504 2.973 2.693 2.393 2.068 1.675 1.187 0.541 -1.429 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_49.txt deleted file mode 100644 index 7774ad51..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4253 ,TETRA ,17621920,Tue Nov 30 20:46:46 CET,Tue Nov 30 22:37:18 CET,0.0 1.772 2.253 2.594 2.883 3.139 3.368 3.57 3.899 4.047 4.182 4.343 4.553 4.672 4.892 5.087 5.268 5.352 5.507 5.649 5.847 5.973 6.1 6.27 6.426 6.571 6.699 6.814 6.948 7.073 7.197 7.336 7.46 7.576 7.7 7.83 7.932 8.019 8.107 8.176 8.212 8.229 8.216 8.179 8.101 7.942 7.635 7.136 6.375 5.147 3.055 0.516 -1.604 -3.342 -4.781 -6.103 -7.271 -8.306 -9.194 -10.09 -10.87 -11.559 -12.209 -12.828 -13.407 -13.939 -14.496 -14.982 -15.411 -15.885 -16.384 -16.783 -17.186 -17.603 -17.938 -18.28 -18.634 -19.029 -19.436 -19.714 -20.017 -20.481 -20.793 -21.123 -21.294 -21.659 -22.036 -22.434 -22.638 -22.958 -23.312 -23.57 -23.839 -24.442 -24.769 -25.126 -25.533 -26.017 -26.631 -27.409 -29.726 -2 ,22945 ,TETRA ,17621921,Tue Nov 30 20:46:46 CET,Tue Nov 30 22:38:03 CET,0.0 1.764 2.281 2.638 2.92 3.162 3.381 3.58 3.922 4.08 4.226 4.394 4.604 4.718 4.918 5.107 5.295 5.384 5.546 5.7 5.914 6.042 6.161 6.321 6.476 6.609 6.722 6.837 6.992 7.132 7.249 7.374 7.485 7.588 7.701 7.813 7.9 7.991 8.085 8.159 8.222 8.272 8.298 8.306 8.265 8.138 7.906 7.499 6.826 5.703 3.643 1.161 -0.906 -2.722 -4.263 -5.615 -6.82 -7.904 -8.795 -9.697 -10.476 -11.164 -11.821 -12.443 -13.033 -13.576 -14.146 -14.65 -15.083 -15.537 -16.017 -16.405 -16.811 -17.241 -17.57 -17.917 -18.292 -18.672 -19.054 -19.322 -19.602 -20.035 -20.347 -20.675 -20.841 -21.188 -21.559 -21.958 -22.171 -22.511 -22.868 -23.113 -23.373 -23.957 -24.29 -24.658 -25.065 -25.535 -26.086 -26.822 -29.451 -3 ,24179 ,TETRA ,17621922,Tue Nov 30 20:46:48 CET,Tue Nov 30 22:38:05 CET,0.0 1.605 2.094 2.453 2.746 2.997 3.228 3.43 3.769 3.917 4.059 4.229 4.433 4.545 4.761 4.95 5.124 5.21 5.37 5.521 5.746 5.878 5.992 6.149 6.295 6.437 6.568 6.681 6.819 6.951 7.077 7.234 7.385 7.505 7.636 7.777 7.887 8.008 8.146 8.249 8.315 8.37 8.397 8.386 8.327 8.186 7.9 7.478 6.819 5.717 3.724 1.233 -0.81 -2.524 -4.035 -5.408 -6.59 -7.627 -8.501 -9.39 -10.154 -10.837 -11.49 -12.108 -12.68 -13.204 -13.762 -14.253 -14.69 -15.15 -15.611 -15.993 -16.404 -16.837 -17.158 -17.483 -17.84 -18.214 -18.598 -18.86 -19.13 -19.578 -19.9 -20.223 -20.39 -20.732 -21.085 -21.491 -21.71 -22.048 -22.399 -22.648 -22.916 -23.517 -23.833 -24.185 -24.59 -25.074 -25.661 -26.387 -29.112 -4 ,31012 ,TETRA ,17621923,Tue Nov 30 20:46:46 CET,Tue Nov 30 22:45:35 CET,0.0 1.466 1.923 2.296 2.582 2.827 3.047 3.247 3.589 3.74 3.884 4.063 4.27 4.39 4.611 4.803 4.982 5.065 5.233 5.387 5.593 5.717 5.835 6.009 6.163 6.292 6.415 6.534 6.677 6.803 6.922 7.058 7.17 7.275 7.391 7.496 7.585 7.681 7.782 7.888 7.979 8.05 8.098 8.1 8.049 7.917 7.665 7.27 6.571 5.376 3.28 0.704 -1.41 -3.184 -4.674 -5.994 -7.176 -8.254 -9.166 -10.091 -10.886 -11.574 -12.216 -12.829 -13.417 -13.953 -14.507 -15.007 -15.441 -15.892 -16.365 -16.754 -17.163 -17.601 -17.935 -18.281 -18.644 -19.026 -19.428 -19.708 -20.003 -20.469 -20.8 -21.143 -21.316 -21.689 -22.105 -22.536 -22.758 -23.104 -23.487 -23.75 -24.015 -24.61 -24.946 -25.32 -25.732 -26.202 -26.767 -27.522 -30.275 -5 ,1689 ,TETRA ,17621924,Tue Nov 30 20:46:46 CET,Tue Nov 30 22:37:54 CET,0.0 1.677 2.188 2.55 2.85 3.134 3.386 3.618 4.04 4.221 4.383 4.584 4.803 4.93 5.163 5.389 5.6 5.698 5.876 6.034 6.257 6.399 6.544 6.735 6.893 7.04 7.189 7.332 7.499 7.649 7.788 7.945 8.087 8.213 8.35 8.504 8.645 8.769 8.862 8.943 9.015 9.071 9.116 9.102 9.028 8.91 8.679 8.273 7.584 6.427 4.395 1.868 -0.213 -1.987 -3.485 -4.792 -5.951 -7.002 -7.879 -8.764 -9.569 -10.29 -10.971 -11.605 -12.18 -12.706 -13.26 -13.76 -14.189 -14.635 -15.09 -15.464 -15.855 -16.255 -16.572 -16.906 -17.252 -17.629 -18.023 -18.283 -18.549 -18.973 -19.28 -19.607 -19.774 -20.122 -20.49 -20.876 -21.078 -21.411 -21.766 -22.014 -22.278 -22.885 -23.229 -23.595 -24.013 -24.504 -25.095 -25.851 -28.509 -6 ,26434 ,TETRA ,17621925,Tue Nov 30 20:46:46 CET,Tue Nov 30 22:40:46 CET,0.0 1.347 1.836 2.212 2.504 2.744 2.952 3.143 3.493 3.649 3.794 3.974 4.187 4.301 4.501 4.687 4.866 4.95 5.104 5.246 5.439 5.56 5.68 5.844 5.987 6.112 6.235 6.351 6.495 6.627 6.751 6.902 7.037 7.171 7.322 7.459 7.566 7.671 7.771 7.87 7.953 8.002 8.024 8.034 8.002 7.878 7.644 7.269 6.581 5.385 3.316 0.793 -1.254 -2.978 -4.481 -5.816 -6.968 -8.007 -8.892 -9.77 -10.543 -11.234 -11.883 -12.495 -13.069 -13.611 -14.174 -14.68 -15.125 -15.567 -16.017 -16.389 -16.795 -17.227 -17.561 -17.9 -18.246 -18.599 -18.959 -19.215 -19.485 -19.928 -20.235 -20.556 -20.721 -21.053 -21.406 -21.797 -21.998 -22.317 -22.669 -22.92 -23.184 -23.764 -24.091 -24.457 -24.853 -25.312 -25.868 -26.634 -28.936 -7 ,2383 ,TETRA ,17621926,Tue Nov 30 20:46:48 CET,Tue Nov 30 22:40:58 CET,0.0 1.445 1.912 2.257 2.545 2.79 3.008 3.208 3.552 3.703 3.841 4.003 4.21 4.323 4.535 4.727 4.899 4.984 5.144 5.29 5.495 5.624 5.742 5.896 6.04 6.178 6.306 6.421 6.562 6.697 6.827 6.978 7.115 7.246 7.389 7.54 7.661 7.765 7.872 7.967 8.053 8.124 8.166 8.163 8.099 7.959 7.688 7.253 6.544 5.355 3.26 0.702 -1.429 -3.192 -4.647 -5.962 -7.158 -8.244 -9.172 -10.1 -10.892 -11.597 -12.249 -12.864 -13.435 -13.959 -14.519 -15.024 -15.45 -15.882 -16.356 -16.762 -17.188 -17.635 -17.978 -18.327 -18.695 -19.081 -19.469 -19.738 -20.019 -20.446 -20.744 -21.062 -21.232 -21.589 -21.955 -22.333 -22.536 -22.876 -23.24 -23.495 -23.759 -24.359 -24.712 -25.094 -25.526 -26.02 -26.589 -27.351 -29.372 -8 ,7927 ,TETRA ,17621927,Tue Nov 30 20:46:46 CET,Tue Nov 30 22:38:10 CET,0.0 1.676 2.136 2.467 2.733 2.98 3.206 3.401 3.73 3.88 4.017 4.181 4.387 4.495 4.719 4.928 5.113 5.199 5.358 5.503 5.707 5.828 5.939 6.092 6.241 6.391 6.535 6.661 6.812 6.947 7.072 7.227 7.367 7.493 7.628 7.772 7.903 8.026 8.142 8.245 8.334 8.395 8.427 8.408 8.327 8.162 7.87 7.433 6.735 5.58 3.473 0.931 -1.121 -2.918 -4.468 -5.803 -6.968 -8.047 -8.964 -9.855 -10.641 -11.338 -12.002 -12.625 -13.198 -13.723 -14.28 -14.777 -15.21 -15.667 -16.13 -16.517 -16.922 -17.328 -17.638 -17.957 -18.288 -18.638 -19.004 -19.251 -19.513 -19.947 -20.249 -20.573 -20.746 -21.096 -21.471 -21.861 -22.069 -22.408 -22.777 -23.038 -23.302 -23.876 -24.198 -24.553 -24.953 -25.405 -25.959 -26.704 -29.634 -9 ,30410 ,TETRA ,17621928,Tue Nov 30 20:46:46 CET,Tue Nov 30 22:39:59 CET,0.0 1.788 2.256 2.613 2.899 3.134 3.35 3.551 3.912 4.065 4.206 4.378 4.587 4.705 4.914 5.11 5.288 5.368 5.533 5.685 5.887 6.019 6.149 6.338 6.517 6.683 6.835 6.976 7.144 7.305 7.45 7.604 7.738 7.858 8.005 8.165 8.289 8.399 8.494 8.578 8.662 8.738 8.77 8.742 8.666 8.53 8.282 7.848 7.115 5.903 3.793 1.298 -0.757 -2.534 -4.059 -5.424 -6.61 -7.667 -8.582 -9.5 -10.297 -10.998 -11.658 -12.282 -12.856 -13.383 -13.949 -14.44 -14.872 -15.331 -15.802 -16.201 -16.598 -17.011 -17.352 -17.701 -18.058 -18.453 -18.867 -19.143 -19.423 -19.868 -20.192 -20.524 -20.691 -21.028 -21.395 -21.804 -22.011 -22.352 -22.726 -22.992 -23.271 -23.86 -24.192 -24.551 -24.956 -25.416 -25.962 -26.745 -29.414 -10 ,26903 ,TETRA ,17621929,Tue Nov 30 20:46:47 CET,Tue Nov 30 22:44:33 CET,0.0 1.583 2.073 2.452 2.777 3.048 3.268 3.467 3.817 3.964 4.104 4.28 4.487 4.6 4.803 4.983 5.166 5.251 5.412 5.56 5.754 5.877 5.993 6.149 6.29 6.424 6.556 6.677 6.825 6.977 7.121 7.283 7.424 7.541 7.67 7.808 7.922 8.037 8.157 8.254 8.321 8.368 8.381 8.37 8.333 8.231 7.991 7.541 6.81 5.607 3.496 0.955 -1.12 -2.928 -4.502 -5.886 -7.087 -8.137 -9.028 -9.927 -10.704 -11.385 -12.017 -12.625 -13.208 -13.748 -14.314 -14.811 -15.234 -15.677 -16.159 -16.561 -16.974 -17.418 -17.756 -18.109 -18.482 -18.863 -19.265 -19.551 -19.844 -20.281 -20.597 -20.945 -21.121 -21.486 -21.879 -22.299 -22.516 -22.859 -23.242 -23.516 -23.818 -24.455 -24.798 -25.176 -25.605 -26.076 -26.631 -27.489 -30.219 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_39.txt deleted file mode 100644 index 02a8576d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25439 ,TETRA ,17621930,Tue Nov 30 20:46:46 CET,Tue Nov 30 22:38:56 CET,0.0 1.685 2.27 2.698 3.029 3.298 3.546 3.78 4.196 4.385 4.571 4.796 5.058 5.206 5.495 5.747 5.984 6.099 6.318 6.527 6.812 6.988 7.162 7.423 7.663 7.884 8.106 8.315 8.571 8.822 9.058 9.33 9.589 9.836 10.115 10.413 10.688 10.995 11.314 11.639 11.994 12.379 12.785 13.174 13.642 14.146 14.67 15.225 15.836 16.374 16.727 16.711 16.392 15.961 15.533 15.08 14.62 14.16 13.751 13.352 13.001 12.681 12.355 12.036 11.734 11.447 11.141 10.861 10.608 10.343 10.071 9.839 9.594 9.345 9.139 8.91 8.677 8.425 8.151 7.966 7.774 7.465 7.252 7.021 6.899 6.638 6.359 6.067 5.911 5.628 5.37 5.173 4.956 4.483 4.229 3.94 3.608 3.232 2.786 2.133 0.29 -2 ,31791 ,TETRA ,17621931,Tue Nov 30 20:46:46 CET,Tue Nov 30 22:42:00 CET,0.0 2.05 2.617 3.011 3.341 3.639 3.892 4.129 4.57 4.762 4.941 5.159 5.425 5.566 5.847 6.116 6.367 6.49 6.723 6.941 7.257 7.458 7.65 7.917 8.169 8.421 8.656 8.868 9.141 9.405 9.655 9.943 10.223 10.482 10.776 11.113 11.425 11.757 12.11 12.468 12.821 13.204 13.657 14.097 14.6 15.125 15.65 16.2 16.805 17.369 17.789 17.786 17.483 17.08 16.664 16.214 15.758 15.311 14.895 14.475 14.118 13.804 13.496 13.205 12.944 12.696 12.43 12.198 11.987 11.748 11.492 11.278 11.058 10.81 10.609 10.408 10.203 9.978 9.735 9.568 9.39 9.095 8.882 8.669 8.563 8.342 8.098 7.832 7.689 7.418 7.198 7.026 6.837 6.432 6.193 5.92 5.614 5.262 4.83 4.245 2.033 -3 ,26022 ,TETRA ,17621932,Tue Nov 30 20:46:48 CET,Tue Nov 30 22:39:59 CET,0.0 1.704 2.206 2.594 2.911 3.189 3.45 3.681 4.109 4.307 4.49 4.703 4.965 5.113 5.377 5.605 5.834 5.948 6.158 6.35 6.633 6.822 7.003 7.244 7.464 7.682 7.893 8.106 8.371 8.604 8.828 9.096 9.351 9.592 9.859 10.161 10.451 10.767 11.118 11.476 11.832 12.237 12.695 13.126 13.606 14.131 14.701 15.247 15.801 16.402 16.84 16.771 16.45 16.048 15.615 15.169 14.748 14.326 13.909 13.492 13.137 12.797 12.456 12.131 11.829 11.55 11.25 10.974 10.741 10.505 10.252 10.039 9.81 9.566 9.372 9.162 8.95 8.732 8.498 8.337 8.164 7.89 7.694 7.484 7.377 7.15 6.907 6.642 6.495 6.231 6.016 5.843 5.666 5.257 5.022 4.759 4.466 4.133 3.744 3.232 1.72 -4 ,11151 ,TETRA ,17621933,Tue Nov 30 20:46:48 CET,Tue Nov 30 22:39:12 CET,0.0 1.699 2.24 2.648 2.984 3.258 3.508 3.74 4.17 4.365 4.539 4.738 4.999 5.137 5.399 5.646 5.879 5.992 6.207 6.408 6.693 6.867 7.041 7.294 7.526 7.753 7.959 8.158 8.42 8.669 8.907 9.178 9.429 9.676 9.96 10.273 10.572 10.901 11.271 11.654 12.031 12.444 12.906 13.35 13.839 14.344 14.912 15.495 16.103 16.714 17.133 17.08 16.782 16.4 15.949 15.497 15.097 14.701 14.337 13.986 13.676 13.367 13.051 12.742 12.447 12.183 11.915 11.665 11.437 11.192 10.934 10.711 10.485 10.246 10.059 9.877 9.673 9.45 9.217 9.05 8.875 8.602 8.397 8.171 8.057 7.833 7.598 7.345 7.204 6.937 6.724 6.546 6.355 5.942 5.711 5.439 5.142 4.825 4.424 3.901 1.861 -5 ,10375 ,TETRA ,17621934,Tue Nov 30 20:46:48 CET,Tue Nov 30 22:41:59 CET,0.0 1.665 2.266 2.699 3.039 3.329 3.584 3.825 4.254 4.439 4.614 4.822 5.093 5.244 5.516 5.767 6.01 6.126 6.343 6.54 6.82 7.007 7.186 7.432 7.667 7.895 8.109 8.304 8.557 8.793 9.021 9.299 9.557 9.803 10.09 10.41 10.721 11.063 11.419 11.793 12.157 12.544 12.99 13.434 13.932 14.437 14.966 15.517 16.082 16.641 17.027 16.97 16.644 16.23 15.798 15.328 14.891 14.467 14.079 13.685 13.347 13.042 12.739 12.441 12.166 11.902 11.612 11.351 11.115 10.873 10.611 10.385 10.152 9.911 9.723 9.525 9.32 9.101 8.857 8.686 8.508 8.222 8.025 7.819 7.713 7.48 7.228 6.959 6.815 6.551 6.358 6.187 6.004 5.595 5.357 5.095 4.793 4.441 4.027 3.5 1.737 -6 ,29750 ,TETRA ,17621935,Tue Nov 30 20:46:47 CET,Tue Nov 30 22:38:05 CET,0.0 2.016 2.596 3.009 3.334 3.617 3.864 4.089 4.484 4.662 4.83 5.032 5.296 5.439 5.718 5.969 6.216 6.329 6.53 6.723 6.987 7.157 7.327 7.561 7.786 8.002 8.203 8.4 8.647 8.889 9.121 9.387 9.641 9.888 10.171 10.485 10.787 11.133 11.501 11.847 12.196 12.592 13.039 13.489 13.985 14.494 15.053 15.624 16.203 16.719 17.038 17.014 16.69 16.272 15.875 15.468 15.054 14.67 14.319 13.923 13.565 13.239 12.917 12.611 12.337 12.075 11.791 11.538 11.313 11.074 10.835 10.633 10.409 10.182 9.992 9.791 9.593 9.386 9.166 9.012 8.851 8.577 8.378 8.173 8.07 7.843 7.592 7.327 7.188 6.928 6.725 6.554 6.36 5.932 5.71 5.463 5.18 4.863 4.459 3.913 2.226 -7 ,20152 ,TETRA ,17621936,Tue Nov 30 20:46:48 CET,Tue Nov 30 22:36:22 CET,0.0 1.771 2.317 2.738 3.1 3.395 3.673 3.921 4.329 4.519 4.698 4.901 5.169 5.316 5.607 5.867 6.095 6.203 6.413 6.609 6.898 7.082 7.253 7.5 7.735 7.967 8.194 8.408 8.681 8.951 9.205 9.502 9.778 10.032 10.333 10.676 10.993 11.335 11.692 12.036 12.384 12.781 13.237 13.687 14.193 14.731 15.278 15.785 16.331 16.951 17.44 17.421 17.083 16.61 16.124 15.663 15.23 14.802 14.413 14.014 13.656 13.313 12.967 12.639 12.324 12.028 11.719 11.416 11.151 10.901 10.627 10.391 10.155 9.907 9.695 9.458 9.222 8.977 8.716 8.537 8.351 8.048 7.83 7.604 7.491 7.256 6.995 6.713 6.565 6.297 6.073 5.901 5.721 5.321 5.097 4.839 4.553 4.228 3.817 3.231 1.499 -8 ,16497 ,TETRA ,17621937,Tue Nov 30 20:46:48 CET,Tue Nov 30 22:38:05 CET,0.0 1.876 2.447 2.847 3.173 3.465 3.727 3.974 4.417 4.606 4.782 4.991 5.258 5.411 5.698 5.953 6.184 6.294 6.519 6.733 7.022 7.204 7.378 7.626 7.861 8.087 8.302 8.506 8.776 9.037 9.292 9.607 9.897 10.162 10.449 10.761 11.068 11.405 11.758 12.119 12.515 12.934 13.372 13.818 14.327 14.851 15.394 15.98 16.639 17.279 17.675 17.596 17.295 16.891 16.438 15.97 15.513 15.07 14.704 14.299 13.912 13.566 13.236 12.914 12.598 12.297 11.966 11.652 11.387 11.132 10.861 10.636 10.392 10.137 9.942 9.742 9.539 9.313 9.063 8.888 8.719 8.455 8.26 8.052 7.941 7.703 7.451 7.192 7.05 6.785 6.577 6.394 6.204 5.783 5.548 5.278 4.973 4.652 4.265 3.719 1.897 -9 ,10274 ,TETRA ,17621938,Tue Nov 30 20:46:51 CET,Tue Nov 30 22:38:29 CET,0.0 2.101 2.678 3.086 3.43 3.719 3.969 4.208 4.648 4.843 5.023 5.231 5.492 5.641 5.914 6.158 6.394 6.507 6.725 6.933 7.222 7.403 7.584 7.842 8.074 8.293 8.51 8.716 8.968 9.202 9.423 9.691 9.955 10.21 10.502 10.833 11.158 11.511 11.856 12.203 12.574 12.972 13.422 13.869 14.379 14.913 15.481 16.078 16.671 17.202 17.641 17.689 17.422 16.963 16.485 16.05 15.622 15.201 14.819 14.437 14.103 13.778 13.462 13.177 12.914 12.662 12.389 12.149 11.94 11.713 11.474 11.272 11.05 10.814 10.628 10.422 10.202 9.978 9.745 9.592 9.429 9.147 8.954 8.754 8.646 8.415 8.166 7.907 7.764 7.501 7.302 7.12 6.935 6.534 6.307 6.063 5.782 5.425 4.995 4.419 2.474 -10 ,2613 ,TETRA ,17621939,Tue Nov 30 20:46:49 CET,Tue Nov 30 22:41:25 CET,0.0 2.112 2.67 3.081 3.439 3.754 4.057 4.351 4.841 5.043 5.234 5.475 5.753 5.905 6.203 6.507 6.789 6.915 7.158 7.389 7.703 7.894 8.08 8.348 8.596 8.828 9.046 9.251 9.525 9.801 10.051 10.333 10.607 10.872 11.162 11.481 11.787 12.121 12.474 12.835 13.216 13.621 14.054 14.491 14.964 15.455 16.006 16.599 17.224 17.773 18.155 18.12 17.75 17.305 16.867 16.389 15.936 15.538 15.174 14.754 14.376 14.055 13.747 13.432 13.123 12.834 12.527 12.246 11.998 11.739 11.48 11.262 11.032 10.792 10.605 10.4 10.177 9.941 9.7 9.532 9.354 9.068 8.869 8.659 8.553 8.33 8.07 7.801 7.662 7.396 7.195 7.02 6.83 6.422 6.196 5.94 5.656 5.321 4.909 4.365 2.839 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_44.txt deleted file mode 100644 index 637bdd14..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28963 ,TETRA ,17621940,Tue Nov 30 20:46:49 CET,Tue Nov 30 22:37:10 CET,0.0 1.919 2.582 3.098 3.519 3.893 4.232 4.54 5.074 5.325 5.573 5.919 6.25 6.449 6.841 7.226 7.578 7.738 8.052 8.352 8.768 9.043 9.317 9.698 10.062 10.425 10.763 11.083 11.499 11.889 12.272 12.752 13.209 13.643 14.134 14.676 15.21 15.802 16.429 17.094 17.796 18.574 19.488 20.439 21.566 22.852 24.39 26.169 28.295 30.812 33.904 36.666 38.35 39.462 40.2 40.707 41.064 41.31 41.463 41.559 41.601 41.624 41.631 41.608 41.568 41.525 41.473 41.417 41.366 41.304 41.223 41.138 41.043 40.933 40.838 40.739 40.632 40.521 40.391 40.294 40.186 40.0 39.871 39.736 39.662 39.503 39.316 39.119 39.024 38.851 38.712 38.582 38.437 38.113 37.919 37.703 37.469 37.195 36.83 36.333 34.565 -2 ,26389 ,TETRA ,17621941,Tue Nov 30 20:46:49 CET,Tue Nov 30 22:37:34 CET,0.0 2.087 2.743 3.274 3.727 4.102 4.438 4.752 5.324 5.579 5.814 6.149 6.49 6.707 7.134 7.535 7.908 8.085 8.421 8.745 9.207 9.495 9.761 10.15 10.544 10.923 11.267 11.59 12.014 12.427 12.827 13.312 13.764 14.209 14.723 15.276 15.807 16.43 17.102 17.782 18.51 19.344 20.326 21.328 22.488 23.777 25.305 27.073 29.163 31.66 34.813 37.5 39.102 40.19 40.933 41.421 41.729 41.939 42.073 42.184 42.256 42.284 42.281 42.245 42.194 42.149 42.083 42.01 41.937 41.843 41.729 41.618 41.504 41.385 41.283 41.167 41.042 40.905 40.742 40.623 40.5 40.293 40.142 39.99 39.907 39.728 39.545 39.327 39.209 39.012 38.826 38.676 38.509 38.171 37.984 37.762 37.505 37.188 36.803 36.298 34.652 -3 ,1394 ,TETRA ,17621942,Tue Nov 30 20:46:50 CET,Tue Nov 30 22:37:18 CET,0.0 1.952 2.615 3.126 3.549 3.906 4.236 4.542 5.075 5.326 5.563 5.872 6.189 6.389 6.754 7.096 7.433 7.593 7.898 8.195 8.614 8.889 9.16 9.556 9.93 10.265 10.602 10.939 11.366 11.787 12.183 12.644 13.082 13.507 14.03 14.612 15.151 15.767 16.435 17.133 17.866 18.689 19.685 20.705 21.883 23.217 24.739 26.421 28.464 30.947 34.081 36.848 38.54 39.636 40.376 40.901 41.251 41.509 41.68 41.794 41.858 41.897 41.924 41.913 41.873 41.833 41.788 41.736 41.68 41.613 41.531 41.454 41.373 41.279 41.189 41.085 40.975 40.855 40.72 40.622 40.517 40.346 40.214 40.078 40.011 39.863 39.698 39.508 39.406 39.224 39.086 38.957 38.807 38.467 38.257 38.035 37.806 37.534 37.188 36.709 35.203 -4 ,29072 ,TETRA ,17621943,Tue Nov 30 20:46:49 CET,Tue Nov 30 22:40:01 CET,0.0 2.196 2.846 3.327 3.727 4.084 4.401 4.697 5.259 5.515 5.755 6.088 6.411 6.613 6.997 7.353 7.698 7.865 8.183 8.489 8.932 9.213 9.486 9.866 10.223 10.582 10.923 11.254 11.69 12.102 12.502 12.992 13.471 13.926 14.429 15.003 15.559 16.156 16.815 17.526 18.279 19.138 20.126 21.121 22.297 23.611 25.136 26.878 28.955 31.462 34.594 37.282 38.943 40.043 40.799 41.301 41.621 41.888 42.071 42.2 42.291 42.345 42.368 42.369 42.341 42.304 42.257 42.202 42.143 42.072 41.979 41.889 41.796 41.69 41.603 41.511 41.404 41.28 41.144 41.053 40.957 40.793 40.671 40.537 40.467 40.32 40.155 39.959 39.851 39.664 39.516 39.392 39.252 38.927 38.746 38.545 38.32 38.053 37.717 37.248 35.774 -5 ,19644 ,TETRA ,17621944,Tue Nov 30 20:46:50 CET,Tue Nov 30 22:36:11 CET,0.0 2.186 2.871 3.414 3.831 4.194 4.535 4.852 5.412 5.666 5.905 6.227 6.553 6.755 7.137 7.509 7.848 8.011 8.326 8.624 9.055 9.32 9.582 9.973 10.356 10.729 11.089 11.44 11.885 12.322 12.745 13.24 13.716 14.176 14.701 15.276 15.83 16.44 17.088 17.774 18.483 19.29 20.244 21.208 22.351 23.645 25.137 26.873 28.97 31.449 34.524 37.182 38.834 39.918 40.663 41.193 41.528 41.747 41.873 41.976 42.037 42.046 42.038 42.018 41.982 41.913 41.818 41.743 41.66 41.554 41.423 41.305 41.189 41.067 40.977 40.884 40.784 40.668 40.537 40.438 40.327 40.152 40.032 39.899 39.825 39.671 39.491 39.292 39.187 38.998 38.831 38.701 38.564 38.253 38.07 37.856 37.612 37.344 37.008 36.517 34.917 -6 ,12289 ,TETRA ,17621945,Tue Nov 30 20:46:50 CET,Tue Nov 30 22:39:35 CET,0.0 2.062 2.761 3.248 3.663 4.017 4.338 4.649 5.209 5.453 5.678 6.004 6.339 6.538 6.907 7.269 7.6 7.76 8.081 8.389 8.824 9.097 9.36 9.743 10.101 10.434 10.761 11.093 11.522 11.956 12.378 12.873 13.347 13.789 14.29 14.855 15.409 16.024 16.689 17.397 18.127 18.957 19.94 20.916 22.079 23.376 24.867 26.616 28.694 31.168 34.284 36.987 38.634 39.763 40.524 41.029 41.351 41.567 41.718 41.824 41.883 41.906 41.893 41.872 41.807 41.72 41.64 41.557 41.464 41.362 41.262 41.17 41.058 40.935 40.834 40.721 40.598 40.476 40.351 40.254 40.151 39.976 39.846 39.711 39.64 39.484 39.312 39.132 39.036 38.854 38.7 38.572 38.426 38.109 37.934 37.732 37.505 37.237 36.908 36.482 34.758 -7 ,24837 ,TETRA ,17621946,Tue Nov 30 20:46:50 CET,Tue Nov 30 22:41:43 CET,0.0 2.077 2.84 3.361 3.764 4.123 4.451 4.753 5.304 5.551 5.782 6.095 6.423 6.632 7.012 7.362 7.71 7.878 8.189 8.482 8.898 9.161 9.413 9.786 10.163 10.514 10.851 11.181 11.609 12.03 12.445 12.951 13.421 13.869 14.386 14.956 15.503 16.106 16.764 17.468 18.214 19.038 20.009 21.005 22.175 23.498 25.014 26.747 28.848 31.417 34.596 37.356 39.046 40.159 40.902 41.416 41.768 42.007 42.159 42.264 42.328 42.352 42.336 42.313 42.277 42.222 42.157 42.088 42.009 41.926 41.824 41.723 41.615 41.485 41.373 41.257 41.133 40.998 40.847 40.733 40.605 40.399 40.252 40.093 40.005 39.82 39.627 39.404 39.283 39.088 38.904 38.758 38.592 38.214 38.004 37.766 37.485 37.154 36.747 36.233 34.635 -8 ,16255 ,TETRA ,17621947,Tue Nov 30 20:46:52 CET,Tue Nov 30 22:39:42 CET,0.0 1.841 2.492 2.979 3.404 3.792 4.122 4.429 4.999 5.261 5.506 5.835 6.158 6.361 6.756 7.116 7.458 7.622 7.933 8.238 8.69 8.971 9.229 9.594 9.943 10.28 10.617 10.951 11.375 11.787 12.196 12.687 13.153 13.6 14.112 14.687 15.236 15.838 16.494 17.18 17.897 18.713 19.677 20.669 21.84 23.159 24.702 26.5 28.637 31.166 34.268 36.936 38.559 39.656 40.427 40.934 41.258 41.49 41.648 41.762 41.816 41.853 41.888 41.895 41.878 41.841 41.788 41.735 41.68 41.612 41.53 41.453 41.355 41.254 41.177 41.088 40.986 40.873 40.749 40.656 40.557 40.382 40.253 40.123 40.053 39.906 39.742 39.557 39.449 39.255 39.092 38.969 38.837 38.511 38.324 38.118 37.888 37.631 37.306 36.85 35.332 -9 ,1325 ,TETRA ,17621948,Tue Nov 30 20:46:50 CET,Tue Nov 30 22:37:05 CET,0.0 1.987 2.699 3.205 3.636 4.016 4.355 4.673 5.227 5.463 5.697 6.022 6.346 6.553 6.928 7.279 7.635 7.807 8.136 8.461 8.929 9.226 9.522 9.949 10.349 10.723 11.078 11.412 11.829 12.235 12.631 13.099 13.547 13.99 14.52 15.103 15.644 16.241 16.885 17.578 18.325 19.171 20.153 21.132 22.253 23.529 25.042 26.794 28.921 31.473 34.593 37.294 38.952 40.046 40.761 41.274 41.607 41.821 41.965 42.079 42.147 42.178 42.189 42.177 42.147 42.094 42.038 41.985 41.925 41.863 41.786 41.703 41.605 41.496 41.417 41.324 41.207 41.085 40.963 40.873 40.773 40.61 40.479 40.337 40.269 40.119 39.952 39.768 39.665 39.475 39.313 39.18 39.037 38.7 38.509 38.302 38.074 37.811 37.497 37.049 35.529 -10 ,27660 ,TETRA ,17621949,Tue Nov 30 20:46:52 CET,Tue Nov 30 22:36:48 CET,0.0 1.896 2.531 3.05 3.503 3.898 4.254 4.597 5.206 5.468 5.725 6.099 6.431 6.645 7.055 7.447 7.81 7.973 8.297 8.62 9.074 9.362 9.636 10.054 10.453 10.811 11.162 11.518 11.965 12.382 12.779 13.253 13.713 14.15 14.665 15.252 15.815 16.428 17.109 17.819 18.542 19.37 20.333 21.325 22.471 23.757 25.258 26.991 29.1 31.612 34.78 37.514 39.207 40.379 41.146 41.639 41.985 42.217 42.35 42.446 42.494 42.518 42.519 42.491 42.452 42.402 42.332 42.255 42.173 42.057 41.916 41.812 41.706 41.583 41.478 41.36 41.234 41.095 40.93 40.813 40.696 40.515 40.387 40.247 40.172 39.999 39.815 39.622 39.516 39.336 39.192 39.058 38.915 38.603 38.425 38.223 37.98 37.705 37.36 36.886 35.18 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_52_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_52_35.txt deleted file mode 100644 index 4c246ea5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_52_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5436 ,TETRA ,17621950,Tue Nov 30 20:48:41 CET,Tue Nov 30 22:43:01 CET,0.0 1.885 2.317 2.663 2.936 3.162 3.364 3.551 3.868 4.002 4.132 4.29 4.497 4.61 4.837 5.042 5.222 5.31 5.482 5.653 5.895 6.039 6.174 6.367 6.55 6.72 6.886 7.045 7.243 7.427 7.622 7.855 8.058 8.246 8.457 8.689 8.914 9.164 9.413 9.673 9.946 10.227 10.539 10.869 11.248 11.624 12.021 12.43 12.811 13.154 13.368 13.248 12.932 12.524 12.137 11.786 11.401 10.979 10.623 10.248 9.891 9.553 9.236 8.958 8.689 8.446 8.184 7.922 7.693 7.461 7.215 7.006 6.789 6.562 6.384 6.199 6.003 5.793 5.567 5.412 5.249 4.988 4.81 4.617 4.515 4.293 4.055 3.81 3.682 3.453 3.263 3.11 2.946 2.568 2.349 2.119 1.86 1.544 1.157 0.63 -1.315 -2 ,9496 ,TETRA ,17621951,Tue Nov 30 20:48:41 CET,Tue Nov 30 22:48:58 CET,0.0 1.765 2.299 2.669 2.968 3.243 3.499 3.721 4.098 4.264 4.416 4.604 4.832 4.961 5.207 5.427 5.624 5.72 5.902 6.073 6.32 6.484 6.637 6.842 7.039 7.225 7.399 7.572 7.803 8.021 8.221 8.46 8.682 8.889 9.124 9.381 9.628 9.896 10.161 10.433 10.719 11.041 11.416 11.772 12.158 12.553 12.986 13.402 13.803 14.19 14.426 14.326 14.031 13.631 13.206 12.777 12.366 11.987 11.66 11.301 10.961 10.657 10.353 10.056 9.786 9.528 9.242 8.971 8.732 8.475 8.196 7.955 7.707 7.452 7.241 7.02 6.798 6.564 6.304 6.12 5.932 5.633 5.41 5.166 5.043 4.799 4.54 4.253 4.096 3.84 3.583 3.387 3.174 2.689 2.404 2.09 1.746 1.344 0.853 0.175 -2.29 -3 ,1574 ,TETRA ,17621952,Tue Nov 30 20:48:41 CET,Tue Nov 30 22:45:46 CET,0.0 1.703 2.195 2.573 2.878 3.127 3.347 3.549 3.905 4.064 4.22 4.423 4.656 4.787 5.029 5.244 5.448 5.543 5.729 5.914 6.167 6.322 6.468 6.678 6.874 7.057 7.239 7.41 7.623 7.827 8.019 8.249 8.47 8.672 8.904 9.174 9.427 9.69 9.979 10.276 10.569 10.886 11.24 11.588 11.97 12.357 12.781 13.223 13.651 14.095 14.359 14.256 13.987 13.639 13.248 12.842 12.483 12.125 11.795 11.435 11.122 10.853 10.569 10.276 9.992 9.733 9.463 9.204 8.978 8.736 8.477 8.26 8.018 7.752 7.556 7.357 7.134 6.906 6.672 6.506 6.334 6.051 5.852 5.645 5.538 5.311 5.071 4.812 4.669 4.426 4.197 4.019 3.833 3.401 3.137 2.843 2.532 2.182 1.73 1.093 -1.006 -4 ,25929 ,TETRA ,17621953,Tue Nov 30 20:48:41 CET,Tue Nov 30 22:42:18 CET,0.0 1.885 2.399 2.763 3.056 3.313 3.533 3.735 4.094 4.256 4.41 4.605 4.84 4.973 5.213 5.439 5.643 5.738 5.923 6.1 6.354 6.511 6.657 6.875 7.086 7.282 7.466 7.641 7.858 8.061 8.254 8.48 8.7 8.905 9.128 9.381 9.612 9.864 10.15 10.443 10.725 11.014 11.351 11.697 12.087 12.489 12.925 13.354 13.774 14.163 14.425 14.339 14.029 13.65 13.267 12.905 12.525 12.136 11.774 11.387 11.053 10.742 10.422 10.098 9.793 9.529 9.259 8.993 8.742 8.472 8.195 7.96 7.711 7.461 7.262 7.045 6.818 6.571 6.322 6.155 5.974 5.681 5.472 5.234 5.11 4.861 4.586 4.295 4.146 3.898 3.647 3.461 3.259 2.768 2.49 2.203 1.882 1.515 1.089 0.501 -1.761 -5 ,13686 ,TETRA ,17621954,Tue Nov 30 20:48:44 CET,Tue Nov 30 22:42:50 CET,0.0 1.575 2.05 2.395 2.682 2.936 3.166 3.383 3.754 3.918 4.073 4.268 4.502 4.626 4.846 5.047 5.24 5.332 5.512 5.686 5.936 6.093 6.241 6.451 6.645 6.826 7.0 7.168 7.385 7.587 7.776 8.001 8.207 8.404 8.629 8.886 9.138 9.4 9.672 9.949 10.235 10.554 10.906 11.245 11.615 12.009 12.44 12.894 13.35 13.763 14.044 13.982 13.74 13.422 13.047 12.665 12.281 11.892 11.558 11.216 10.887 10.561 10.252 9.95 9.656 9.386 9.088 8.819 8.583 8.329 8.056 7.825 7.589 7.317 7.09 6.862 6.635 6.402 6.151 5.965 5.762 5.451 5.24 5.018 4.9 4.635 4.338 4.02 3.865 3.614 3.375 3.195 3.007 2.576 2.329 2.072 1.787 1.447 1.032 0.454 -2.07 -6 ,11658 ,TETRA ,17621955,Tue Nov 30 20:48:42 CET,Tue Nov 30 22:42:15 CET,0.0 1.685 2.177 2.525 2.802 3.046 3.274 3.482 3.838 3.998 4.145 4.328 4.554 4.677 4.905 5.125 5.331 5.427 5.615 5.79 6.034 6.195 6.347 6.556 6.761 6.954 7.13 7.301 7.518 7.72 7.917 8.149 8.37 8.571 8.806 9.062 9.294 9.553 9.819 10.08 10.353 10.653 11.002 11.351 11.723 12.084 12.493 12.957 13.425 13.82 14.048 13.964 13.676 13.312 12.934 12.545 12.172 11.778 11.399 10.997 10.647 10.327 10.008 9.706 9.408 9.123 8.835 8.572 8.35 8.117 7.858 7.648 7.424 7.177 6.973 6.761 6.553 6.335 6.116 5.966 5.809 5.564 5.389 5.206 5.107 4.899 4.682 4.446 4.316 4.082 3.884 3.733 3.565 3.184 2.977 2.748 2.491 2.185 1.821 1.313 -0.735 -7 ,14239 ,TETRA ,17621956,Tue Nov 30 20:48:42 CET,Tue Nov 30 22:43:41 CET,0.0 1.666 2.214 2.593 2.888 3.146 3.369 3.572 3.932 4.095 4.252 4.447 4.676 4.806 5.053 5.279 5.489 5.591 5.785 5.964 6.219 6.383 6.538 6.75 6.947 7.133 7.302 7.472 7.688 7.889 8.09 8.327 8.548 8.763 9.008 9.273 9.514 9.771 10.046 10.332 10.629 10.947 11.284 11.634 12.052 12.468 12.892 13.325 13.766 14.138 14.362 14.236 13.948 13.565 13.163 12.761 12.341 11.935 11.58 11.196 10.84 10.511 10.198 9.897 9.605 9.34 9.065 8.823 8.608 8.372 8.12 7.909 7.679 7.439 7.258 7.057 6.846 6.627 6.387 6.22 6.043 5.771 5.579 5.365 5.251 5.015 4.756 4.479 4.33 4.078 3.866 3.69 3.496 3.054 2.806 2.543 2.245 1.896 1.461 0.857 -1.152 -8 ,27969 ,TETRA ,17621957,Tue Nov 30 20:48:43 CET,Tue Nov 30 22:43:43 CET,0.0 2.16 2.657 3.017 3.314 3.569 3.79 3.987 4.351 4.513 4.664 4.849 5.074 5.2 5.437 5.655 5.867 5.968 6.146 6.317 6.56 6.715 6.864 7.07 7.267 7.453 7.62 7.781 7.991 8.19 8.387 8.628 8.863 9.086 9.337 9.603 9.849 10.109 10.374 10.645 10.932 11.253 11.6 11.935 12.316 12.721 13.182 13.6 13.982 14.397 14.718 14.695 14.454 14.114 13.737 13.318 12.904 12.521 12.168 11.792 11.453 11.137 10.814 10.496 10.211 9.949 9.669 9.421 9.199 8.959 8.711 8.51 8.298 8.057 7.862 7.669 7.469 7.255 7.034 6.88 6.717 6.441 6.231 6.011 5.897 5.663 5.423 5.171 5.039 4.804 4.593 4.426 4.263 3.923 3.715 3.471 3.218 2.901 2.466 1.923 -0.011 -9 ,13048 ,TETRA ,17621958,Tue Nov 30 20:48:42 CET,Tue Nov 30 22:50:29 CET,0.0 1.623 2.108 2.465 2.756 3.007 3.243 3.447 3.797 3.968 4.126 4.304 4.529 4.654 4.895 5.114 5.311 5.408 5.593 5.765 6.014 6.164 6.302 6.504 6.692 6.878 7.059 7.227 7.443 7.642 7.831 8.065 8.281 8.478 8.706 8.956 9.197 9.462 9.742 10.024 10.301 10.62 10.994 11.358 11.744 12.129 12.548 12.97 13.395 13.772 13.946 13.807 13.537 13.17 12.782 12.406 12.041 11.676 11.311 10.919 10.588 10.282 9.972 9.668 9.394 9.137 8.861 8.613 8.388 8.148 7.889 7.68 7.457 7.214 7.026 6.827 6.615 6.392 6.151 5.975 5.793 5.509 5.303 5.08 4.962 4.701 4.426 4.132 3.975 3.715 3.454 3.258 3.056 2.612 2.328 1.999 1.646 1.231 0.718 0.061 -2.06 -10 ,24946 ,TETRA ,17621959,Tue Nov 30 20:48:42 CET,Tue Nov 30 22:42:10 CET,0.0 1.353 1.818 2.153 2.449 2.721 2.95 3.155 3.537 3.709 3.867 4.066 4.291 4.418 4.658 4.879 5.092 5.192 5.381 5.551 5.782 5.933 6.08 6.292 6.498 6.694 6.881 7.056 7.264 7.464 7.663 7.902 8.126 8.339 8.577 8.836 9.09 9.355 9.624 9.906 10.188 10.509 10.864 11.191 11.557 11.951 12.368 12.783 13.198 13.569 13.839 13.771 13.468 13.092 12.703 12.283 11.871 11.483 11.137 10.782 10.444 10.111 9.788 9.477 9.183 8.903 8.606 8.334 8.089 7.831 7.554 7.319 7.078 6.825 6.612 6.393 6.178 5.945 5.678 5.491 5.309 5.029 4.823 4.607 4.497 4.259 4.004 3.737 3.596 3.354 3.127 2.948 2.767 2.334 2.062 1.79 1.494 1.143 0.741 0.184 -1.796 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_35.txt deleted file mode 100644 index bc828dcf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7500 ,TETRA ,17621960,Tue Nov 30 20:48:42 CET,Tue Nov 30 22:43:56 CET,0.0 1.632 2.095 2.461 2.769 3.03 3.263 3.466 3.815 3.976 4.129 4.317 4.546 4.676 4.922 5.137 5.338 5.439 5.633 5.815 6.078 6.238 6.384 6.595 6.806 7.008 7.198 7.376 7.602 7.82 8.022 8.266 8.492 8.697 8.935 9.202 9.452 9.724 10.001 10.274 10.575 10.922 11.292 11.619 11.991 12.402 12.833 13.292 13.79 14.252 14.592 14.604 14.342 13.951 13.538 13.133 12.749 12.372 12.02 11.625 11.277 10.967 10.654 10.334 10.027 9.758 9.468 9.207 8.969 8.71 8.438 8.184 7.921 7.648 7.419 7.185 6.953 6.719 6.459 6.26 6.046 5.72 5.495 5.262 5.133 4.848 4.553 4.236 4.067 3.79 3.504 3.293 3.072 2.597 2.32 2.012 1.662 1.25 0.724 0.01 -2.129 -2 ,12398 ,TETRA ,17621961,Tue Nov 30 20:48:43 CET,Tue Nov 30 22:39:35 CET,0.0 1.855 2.284 2.596 2.863 3.103 3.313 3.501 3.844 3.997 4.145 4.318 4.532 4.648 4.855 5.044 5.231 5.316 5.482 5.652 5.888 6.033 6.17 6.358 6.535 6.706 6.869 7.026 7.227 7.413 7.599 7.825 8.024 8.215 8.444 8.687 8.906 9.144 9.417 9.695 9.961 10.267 10.617 10.958 11.336 11.752 12.213 12.673 13.2 13.727 14.09 14.112 13.931 13.633 13.259 12.879 12.505 12.117 11.775 11.43 11.088 10.732 10.369 10.031 9.709 9.398 9.065 8.778 8.518 8.208 7.889 7.631 7.351 7.048 6.822 6.582 6.321 6.04 5.738 5.522 5.308 4.994 4.764 4.522 4.397 4.133 3.85 3.53 3.357 3.079 2.751 2.529 2.292 1.753 1.457 1.109 0.701 0.219 -0.375 -1.205 -4.262 -3 ,13938 ,TETRA ,17621962,Tue Nov 30 20:48:43 CET,Tue Nov 30 22:45:21 CET,0.0 1.74 2.224 2.593 2.905 3.16 3.382 3.582 3.942 4.105 4.257 4.434 4.651 4.771 4.996 5.207 5.406 5.499 5.676 5.849 6.096 6.254 6.41 6.632 6.836 7.028 7.211 7.383 7.599 7.798 7.99 8.229 8.453 8.669 8.918 9.183 9.43 9.7 9.991 10.293 10.6 10.938 11.32 11.688 12.094 12.512 12.964 13.441 13.951 14.439 14.779 14.763 14.485 14.098 13.689 13.283 12.883 12.508 12.179 11.834 11.508 11.191 10.86 10.526 10.195 9.872 9.527 9.223 8.959 8.678 8.388 8.144 7.891 7.626 7.405 7.168 6.914 6.657 6.401 6.221 6.024 5.702 5.482 5.245 5.121 4.87 4.594 4.301 4.144 3.878 3.597 3.388 3.161 2.696 2.427 2.121 1.774 1.336 0.809 0.073 -3.042 -4 ,20041 ,TETRA ,17621963,Tue Nov 30 20:48:43 CET,Tue Nov 30 22:46:21 CET,0.0 1.787 2.297 2.664 2.968 3.229 3.457 3.654 4.01 4.176 4.33 4.512 4.739 4.868 5.109 5.328 5.526 5.624 5.809 5.987 6.24 6.393 6.537 6.737 6.939 7.135 7.31 7.477 7.697 7.905 8.105 8.335 8.549 8.757 8.998 9.248 9.478 9.745 10.03 10.328 10.643 10.986 11.368 11.734 12.149 12.605 13.072 13.531 14.003 14.468 14.815 14.806 14.547 14.194 13.81 13.435 13.087 12.737 12.399 12.007 11.67 11.376 11.071 10.782 10.493 10.191 9.854 9.564 9.319 9.062 8.791 8.551 8.294 8.025 7.799 7.555 7.299 7.028 6.746 6.548 6.355 6.055 5.828 5.579 5.457 5.216 4.924 4.619 4.469 4.212 3.935 3.73 3.509 3.006 2.736 2.433 2.078 1.657 1.103 0.329 -2.722 -5 ,7070 ,TETRA ,17621964,Tue Nov 30 20:48:43 CET,Tue Nov 30 22:42:47 CET,0.0 1.666 2.165 2.522 2.808 3.063 3.276 3.466 3.827 3.993 4.147 4.335 4.559 4.68 4.925 5.159 5.369 5.466 5.654 5.829 6.072 6.224 6.367 6.573 6.778 6.97 7.155 7.335 7.554 7.76 7.954 8.181 8.404 8.618 8.856 9.118 9.36 9.617 9.889 10.169 10.471 10.8 11.169 11.54 11.954 12.402 12.878 13.364 13.864 14.329 14.718 14.738 14.477 14.122 13.75 13.392 13.039 12.675 12.344 11.976 11.62 11.265 10.915 10.597 10.267 9.934 9.604 9.329 9.086 8.827 8.552 8.32 8.07 7.787 7.559 7.325 7.084 6.82 6.541 6.354 6.154 5.828 5.592 5.349 5.221 4.958 4.699 4.414 4.253 3.983 3.704 3.516 3.311 2.811 2.537 2.237 1.902 1.515 1.01 0.262 -2.393 -6 ,212 ,TETRA ,17621965,Tue Nov 30 20:48:43 CET,Tue Nov 30 22:43:48 CET,0.0 1.975 2.482 2.86 3.18 3.446 3.67 3.872 4.225 4.387 4.538 4.722 4.954 5.083 5.314 5.522 5.727 5.826 6.014 6.191 6.432 6.58 6.724 6.936 7.138 7.33 7.51 7.694 7.927 8.137 8.338 8.572 8.786 8.992 9.234 9.506 9.756 10.027 10.323 10.613 10.907 11.245 11.632 11.997 12.399 12.825 13.296 13.805 14.322 14.764 15.063 15.042 14.74 14.37 14.053 13.68 13.269 12.885 12.545 12.175 11.839 11.534 11.23 10.918 10.593 10.276 9.956 9.646 9.369 9.082 8.77 8.505 8.222 7.942 7.724 7.493 7.247 6.974 6.69 6.494 6.29 5.968 5.727 5.474 5.346 5.074 4.781 4.461 4.291 4.022 3.735 3.526 3.296 2.756 2.461 2.166 1.828 1.415 0.873 0.147 -2.302 -7 ,8911 ,TETRA ,17621966,Tue Nov 30 20:48:43 CET,Tue Nov 30 22:47:01 CET,0.0 1.946 2.446 2.846 3.155 3.414 3.652 3.859 4.225 4.396 4.553 4.739 4.973 5.098 5.334 5.549 5.75 5.846 6.026 6.202 6.454 6.612 6.762 6.969 7.175 7.378 7.566 7.746 7.969 8.184 8.384 8.617 8.836 9.039 9.271 9.536 9.794 10.062 10.322 10.623 10.946 11.27 11.665 12.06 12.464 12.876 13.337 13.803 14.256 14.712 15.051 15.009 14.738 14.385 14.023 13.656 13.277 12.896 12.549 12.185 11.843 11.516 11.174 10.839 10.54 10.259 9.926 9.626 9.366 9.073 8.771 8.524 8.251 7.961 7.727 7.484 7.244 6.984 6.715 6.524 6.313 5.968 5.732 5.485 5.347 5.055 4.747 4.434 4.269 3.995 3.692 3.477 3.253 2.758 2.473 2.153 1.789 1.364 0.86 0.157 -2.312 -8 ,16120 ,TETRA ,17621967,Tue Nov 30 20:48:44 CET,Tue Nov 30 22:43:32 CET,0.0 1.935 2.433 2.797 3.089 3.336 3.556 3.757 4.127 4.289 4.441 4.63 4.862 4.99 5.239 5.467 5.679 5.777 5.957 6.125 6.368 6.527 6.68 6.896 7.095 7.286 7.469 7.635 7.84 8.046 8.253 8.492 8.708 8.919 9.163 9.426 9.667 9.927 10.209 10.508 10.825 11.158 11.51 11.86 12.276 12.71 13.152 13.608 14.081 14.511 14.822 14.761 14.479 14.135 13.746 13.311 12.896 12.513 12.136 11.722 11.367 11.038 10.701 10.373 10.06 9.783 9.488 9.18 8.908 8.64 8.353 8.103 7.837 7.556 7.337 7.102 6.851 6.587 6.297 6.085 5.863 5.52 5.277 5.011 4.871 4.584 4.276 3.947 3.778 3.509 3.218 3.009 2.786 2.305 2.036 1.731 1.378 0.963 0.486 -0.188 -3.084 -9 ,19424 ,TETRA ,17621968,Tue Nov 30 20:48:46 CET,Tue Nov 30 22:44:28 CET,0.0 1.756 2.243 2.585 2.886 3.155 3.398 3.613 3.974 4.134 4.285 4.464 4.694 4.822 5.063 5.295 5.51 5.612 5.81 5.991 6.236 6.396 6.546 6.757 6.965 7.155 7.34 7.522 7.742 7.949 8.142 8.369 8.592 8.805 9.051 9.321 9.563 9.826 10.109 10.408 10.704 11.027 11.405 11.765 12.173 12.609 13.068 13.545 14.021 14.42 14.692 14.653 14.415 14.106 13.75 13.385 13.046 12.683 12.331 11.961 11.63 11.329 11.019 10.713 10.417 10.129 9.816 9.531 9.286 9.021 8.743 8.505 8.237 7.95 7.738 7.515 7.263 7.01 6.737 6.537 6.328 5.982 5.741 5.485 5.349 5.072 4.791 4.507 4.347 4.089 3.823 3.621 3.41 2.944 2.676 2.385 2.044 1.614 1.078 0.371 -2.598 -10 ,21742 ,TETRA ,17621969,Tue Nov 30 20:48:43 CET,Tue Nov 30 22:44:40 CET,0.0 1.61 2.099 2.463 2.774 3.049 3.29 3.504 3.881 4.051 4.219 4.421 4.653 4.782 5.006 5.211 5.413 5.512 5.701 5.883 6.138 6.296 6.453 6.681 6.893 7.087 7.273 7.443 7.658 7.869 8.068 8.314 8.541 8.75 8.994 9.251 9.486 9.753 10.04 10.332 10.624 10.954 11.32 11.657 12.067 12.497 12.963 13.475 13.978 14.486 14.844 14.822 14.582 14.241 13.836 13.379 12.933 12.505 12.125 11.734 11.378 11.059 10.742 10.44 10.161 9.909 9.637 9.358 9.114 8.875 8.621 8.385 8.136 7.89 7.689 7.461 7.226 6.98 6.708 6.502 6.281 5.959 5.745 5.523 5.405 5.155 4.866 4.553 4.395 4.137 3.862 3.65 3.416 2.895 2.609 2.288 1.942 1.545 1.053 0.349 -2.527 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_52.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_52.txt deleted file mode 100644 index d241ed28..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_52.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19305 ,TETRA ,17621970,Tue Nov 30 20:48:46 CET,Tue Nov 30 22:43:09 CET,0.0 1.729 2.279 2.663 2.973 3.244 3.481 3.692 4.057 4.226 4.39 4.585 4.809 4.932 5.183 5.419 5.634 5.737 5.928 6.107 6.372 6.538 6.692 6.905 7.095 7.28 7.475 7.665 7.904 8.141 8.384 8.663 8.907 9.136 9.394 9.674 9.941 10.219 10.505 10.801 11.103 11.447 11.831 12.203 12.645 13.087 13.521 13.972 14.455 14.896 15.119 14.993 14.633 14.186 13.753 13.291 12.852 12.438 12.045 11.614 11.242 10.89 10.521 10.169 9.842 9.55 9.233 8.935 8.676 8.4 8.116 7.9 7.678 7.438 7.242 7.04 6.833 6.598 6.347 6.178 5.994 5.675 5.453 5.24 5.132 4.898 4.641 4.381 4.246 4.008 3.782 3.596 3.407 3.008 2.781 2.534 2.257 1.914 1.471 0.902 -0.795 -2 ,8931 ,TETRA ,17621971,Tue Nov 30 20:48:48 CET,Tue Nov 30 22:43:05 CET,0.0 1.281 1.673 1.952 2.192 2.401 2.585 2.752 3.065 3.21 3.346 3.501 3.709 3.812 4.007 4.2 4.385 4.469 4.624 4.769 4.993 5.147 5.298 5.504 5.699 5.887 6.063 6.244 6.466 6.661 6.856 7.09 7.309 7.515 7.75 8.024 8.272 8.52 8.772 9.03 9.315 9.645 10.012 10.348 10.704 11.084 11.497 11.913 12.345 12.718 12.849 12.564 12.113 11.654 11.162 10.693 10.273 9.821 9.42 9.019 8.668 8.339 8.018 7.727 7.444 7.172 6.859 6.587 6.369 6.129 5.89 5.698 5.486 5.258 5.079 4.896 4.706 4.506 4.296 4.142 3.974 3.71 3.536 3.358 3.26 3.048 2.828 2.595 2.468 2.232 1.99 1.826 1.673 1.324 1.131 0.886 0.584 0.227 -0.209 -0.767 -2.535 -3 ,11820 ,TETRA ,17621972,Tue Nov 30 20:48:43 CET,Tue Nov 30 22:43:59 CET,0.0 1.529 2.023 2.406 2.72 2.965 3.188 3.394 3.749 3.907 4.057 4.239 4.468 4.591 4.833 5.061 5.263 5.364 5.554 5.728 5.988 6.148 6.299 6.515 6.716 6.907 7.087 7.255 7.467 7.667 7.86 8.095 8.311 8.517 8.758 9.02 9.266 9.517 9.784 10.068 10.366 10.712 11.091 11.44 11.829 12.246 12.686 13.12 13.565 13.999 14.271 14.193 13.887 13.483 13.078 12.676 12.268 11.884 11.553 11.185 10.829 10.51 10.222 9.948 9.672 9.398 9.116 8.866 8.648 8.419 8.176 7.965 7.73 7.485 7.299 7.111 6.909 6.691 6.464 6.298 6.127 5.87 5.683 5.475 5.364 5.139 4.912 4.651 4.498 4.244 4.017 3.825 3.61 3.137 2.861 2.583 2.281 1.934 1.524 0.927 -1.162 -4 ,26500 ,TETRA ,17621973,Tue Nov 30 20:48:45 CET,Tue Nov 30 22:41:21 CET,0.0 1.877 2.406 2.766 3.066 3.334 3.558 3.765 4.152 4.315 4.468 4.675 4.913 5.046 5.283 5.492 5.692 5.789 5.98 6.156 6.406 6.57 6.73 6.952 7.153 7.343 7.538 7.72 7.928 8.14 8.356 8.597 8.826 9.06 9.324 9.615 9.9 10.201 10.501 10.804 11.115 11.464 11.871 12.261 12.677 13.102 13.553 14.003 14.456 14.856 15.059 14.877 14.503 14.064 13.628 13.172 12.769 12.384 12.022 11.648 11.325 11.044 10.767 10.492 10.226 9.972 9.697 9.443 9.223 9.004 8.763 8.549 8.334 8.107 7.927 7.74 7.539 7.332 7.104 6.939 6.764 6.486 6.281 6.067 5.96 5.729 5.489 5.225 5.075 4.822 4.596 4.416 4.226 3.794 3.539 3.265 2.979 2.645 2.209 1.601 -0.647 -5 ,23853 ,TETRA ,17621974,Tue Nov 30 20:48:45 CET,Tue Nov 30 22:43:00 CET,0.0 1.419 1.855 2.163 2.413 2.637 2.836 3.015 3.334 3.476 3.612 3.781 4.0 4.124 4.347 4.549 4.742 4.837 5.02 5.179 5.4 5.534 5.665 5.855 6.038 6.215 6.387 6.544 6.744 6.943 7.13 7.351 7.545 7.721 7.939 8.192 8.418 8.653 8.91 9.182 9.468 9.789 10.156 10.533 10.966 11.409 11.861 12.303 12.707 13.062 13.296 13.143 12.779 12.399 11.999 11.56 11.147 10.75 10.386 10.021 9.715 9.419 9.12 8.822 8.53 8.254 7.952 7.681 7.451 7.21 6.96 6.752 6.53 6.293 6.099 5.9 5.693 5.458 5.205 5.038 4.868 4.595 4.391 4.16 4.043 3.816 3.575 3.31 3.165 2.911 2.639 2.45 2.263 1.841 1.612 1.36 1.067 0.703 0.255 -0.341 -2.597 -6 ,22663 ,TETRA ,17621975,Tue Nov 30 20:48:47 CET,Tue Nov 30 22:42:48 CET,0.0 2.139 2.647 3.056 3.404 3.715 3.987 4.238 4.681 4.872 5.055 5.283 5.524 5.675 5.954 6.214 6.449 6.564 6.779 6.978 7.268 7.443 7.615 7.87 8.093 8.293 8.494 8.694 8.949 9.183 9.4 9.662 9.913 10.149 10.417 10.698 10.97 11.28 11.611 11.956 12.306 12.663 13.035 13.405 13.81 14.228 14.673 15.137 15.62 16.004 16.242 16.08 15.659 15.142 14.622 14.147 13.708 13.284 12.893 12.486 12.132 11.826 11.522 11.215 10.935 10.657 10.363 10.089 9.843 9.586 9.31 9.071 8.815 8.537 8.319 8.106 7.877 7.63 7.388 7.22 7.032 6.733 6.534 6.324 6.218 6.007 5.773 5.519 5.38 5.127 4.881 4.695 4.478 4.036 3.806 3.552 3.25 2.898 2.461 1.859 -0.347 -7 ,1958 ,TETRA ,17621976,Tue Nov 30 20:48:45 CET,Tue Nov 30 22:57:45 CET,0.0 1.964 2.519 2.924 3.246 3.521 3.756 3.962 4.325 4.486 4.64 4.828 5.054 5.174 5.396 5.606 5.806 5.903 6.089 6.262 6.502 6.656 6.806 7.024 7.229 7.425 7.616 7.796 8.01 8.209 8.399 8.615 8.836 9.06 9.297 9.539 9.774 10.019 10.268 10.537 10.827 11.149 11.497 11.837 12.223 12.629 13.061 13.509 13.962 14.366 14.577 14.409 14.016 13.543 13.052 12.576 12.128 11.681 11.249 10.806 10.453 10.128 9.784 9.44 9.105 8.777 8.435 8.148 7.904 7.655 7.394 7.177 6.951 6.704 6.506 6.309 6.104 5.872 5.625 5.458 5.286 5.01 4.81 4.599 4.486 4.245 3.991 3.725 3.586 3.339 3.119 2.943 2.754 2.348 2.109 1.834 1.536 1.199 0.79 0.253 -1.695 -8 ,15910 ,TETRA ,17621977,Tue Nov 30 20:48:45 CET,Tue Nov 30 22:46:45 CET,0.0 1.613 2.143 2.492 2.785 3.042 3.274 3.492 3.86 4.018 4.171 4.36 4.597 4.734 4.981 5.206 5.412 5.512 5.702 5.875 6.115 6.268 6.421 6.647 6.855 7.052 7.241 7.415 7.626 7.829 8.022 8.257 8.483 8.69 8.938 9.222 9.482 9.752 10.025 10.293 10.575 10.89 11.228 11.558 11.932 12.338 12.81 13.252 13.647 13.989 14.168 14.008 13.678 13.324 12.933 12.537 12.15 11.745 11.386 10.987 10.614 10.273 9.941 9.634 9.348 9.082 8.784 8.512 8.275 8.006 7.715 7.472 7.211 6.943 6.74 6.53 6.314 6.089 5.856 5.704 5.537 5.229 5.011 4.801 4.697 4.479 4.24 3.969 3.827 3.588 3.355 3.173 2.977 2.554 2.336 2.09 1.804 1.485 1.085 0.515 -1.317 -9 ,28165 ,TETRA ,17621978,Tue Nov 30 20:48:46 CET,Tue Nov 30 22:47:45 CET,0.0 1.976 2.505 2.876 3.202 3.484 3.713 3.911 4.263 4.43 4.589 4.78 5.007 5.138 5.381 5.6 5.81 5.915 6.119 6.303 6.547 6.702 6.855 7.078 7.287 7.482 7.667 7.849 8.091 8.327 8.546 8.821 9.085 9.324 9.603 9.89 10.159 10.461 10.765 11.081 11.408 11.749 12.129 12.508 12.938 13.387 13.861 14.319 14.792 15.198 15.346 15.098 14.699 14.26 13.815 13.375 12.932 12.483 12.093 11.69 11.322 10.978 10.648 10.342 10.056 9.777 9.453 9.165 8.921 8.649 8.351 8.113 7.88 7.64 7.451 7.249 7.034 6.807 6.574 6.407 6.23 5.942 5.736 5.518 5.401 5.173 4.939 4.683 4.551 4.312 4.052 3.854 3.659 3.224 2.985 2.717 2.368 1.945 1.462 0.85 -1.042 -10 ,6907 ,TETRA ,17621979,Tue Nov 30 20:48:45 CET,Tue Nov 30 22:42:53 CET,0.0 1.869 2.378 2.753 3.066 3.333 3.561 3.76 4.12 4.281 4.425 4.624 4.865 5.006 5.267 5.499 5.73 5.838 6.046 6.253 6.536 6.722 6.904 7.146 7.358 7.556 7.76 7.956 8.197 8.428 8.637 8.873 9.109 9.343 9.604 9.876 10.13 10.417 10.715 11.02 11.335 11.683 12.073 12.432 12.816 13.239 13.697 14.153 14.629 15.069 15.326 15.153 14.81 14.434 14.028 13.578 13.122 12.68 12.292 11.9 11.534 11.204 10.894 10.571 10.251 9.964 9.676 9.415 9.181 8.923 8.637 8.375 8.077 7.772 7.55 7.332 7.1 6.853 6.601 6.421 6.223 5.921 5.717 5.498 5.38 5.126 4.856 4.562 4.398 4.133 3.872 3.674 3.476 3.073 2.841 2.583 2.296 1.942 1.448 0.796 -1.152 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_35.txt deleted file mode 100644 index 671ab1ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21330 ,TETRA ,17621980,Tue Nov 30 20:49:35 CET,Tue Nov 30 22:47:38 CET,0.0 1.651 2.141 2.499 2.788 3.043 3.268 3.473 3.839 4.0 4.155 4.345 4.574 4.697 4.924 5.14 5.34 5.435 5.625 5.803 6.046 6.192 6.332 6.54 6.742 6.929 7.102 7.27 7.493 7.715 7.917 8.146 8.369 8.58 8.816 9.069 9.308 9.564 9.831 10.12 10.413 10.722 11.092 11.453 11.831 12.255 12.733 13.185 13.644 14.098 14.413 14.387 14.143 13.807 13.419 12.967 12.547 12.152 11.785 11.419 11.088 10.758 10.423 10.115 9.83 9.565 9.279 9.017 8.765 8.466 8.139 7.869 7.595 7.316 7.094 6.854 6.609 6.376 6.13 5.946 5.75 5.443 5.228 4.992 4.867 4.609 4.332 4.017 3.855 3.597 3.327 3.124 2.897 2.399 2.12 1.804 1.437 0.986 0.453 -0.259 -2.427 -2 ,27142 ,TETRA ,17621981,Tue Nov 30 20:49:35 CET,Tue Nov 30 22:51:15 CET,0.0 1.449 1.925 2.287 2.58 2.838 3.064 3.272 3.64 3.801 3.954 4.141 4.367 4.495 4.742 4.971 5.169 5.267 5.462 5.643 5.886 6.041 6.192 6.399 6.601 6.805 6.992 7.16 7.378 7.589 7.795 8.033 8.251 8.449 8.678 8.931 9.171 9.438 9.726 10.023 10.316 10.631 10.984 11.33 11.7 12.081 12.487 12.9 13.328 13.75 14.081 14.009 13.731 13.439 13.134 12.761 12.377 12.029 11.713 11.351 11.02 10.706 10.402 10.111 9.828 9.562 9.249 8.964 8.731 8.484 8.213 7.981 7.748 7.497 7.28 7.05 6.825 6.586 6.315 6.129 5.939 5.621 5.395 5.142 5.009 4.755 4.493 4.213 4.057 3.789 3.497 3.299 3.098 2.642 2.389 2.142 1.862 1.503 1.072 0.478 -2.079 -3 ,14197 ,TETRA ,17621982,Tue Nov 30 20:49:36 CET,Tue Nov 30 22:46:20 CET,0.0 1.57 2.052 2.417 2.746 3.022 3.242 3.449 3.822 3.989 4.14 4.317 4.548 4.68 4.925 5.149 5.353 5.448 5.634 5.814 6.063 6.219 6.372 6.589 6.798 7.001 7.191 7.37 7.596 7.801 8.0 8.242 8.467 8.673 8.907 9.165 9.414 9.679 9.954 10.236 10.51 10.808 11.153 11.5 11.9 12.337 12.807 13.278 13.741 14.173 14.479 14.401 14.128 13.763 13.356 12.939 12.526 12.116 11.738 11.348 10.988 10.639 10.295 9.979 9.681 9.397 9.087 8.805 8.568 8.308 8.013 7.76 7.505 7.225 7.004 6.795 6.568 6.31 6.043 5.859 5.653 5.322 5.087 4.833 4.697 4.406 4.106 3.79 3.626 3.353 3.022 2.807 2.592 2.12 1.858 1.568 1.234 0.839 0.305 -0.458 -2.792 -4 ,15813 ,TETRA ,17621983,Tue Nov 30 20:49:35 CET,Tue Nov 30 22:50:05 CET,0.0 1.377 1.798 2.095 2.33 2.548 2.743 2.927 3.268 3.416 3.549 3.699 3.909 4.02 4.238 4.439 4.621 4.708 4.872 5.032 5.261 5.397 5.526 5.719 5.903 6.075 6.243 6.403 6.597 6.78 6.957 7.17 7.381 7.59 7.818 8.058 8.29 8.545 8.799 9.055 9.331 9.634 9.963 10.283 10.657 11.068 11.522 11.997 12.512 13.021 13.359 13.268 12.982 12.59 12.179 11.763 11.375 11.022 10.68 10.306 9.939 9.603 9.307 9.011 8.708 8.422 8.124 7.852 7.613 7.364 7.089 6.843 6.583 6.31 6.089 5.861 5.642 5.397 5.105 4.904 4.694 4.344 4.092 3.836 3.698 3.419 3.123 2.772 2.585 2.307 2.006 1.775 1.544 1.051 0.774 0.466 0.11 -0.316 -0.881 -1.693 -4.04 -5 ,26451 ,TETRA ,17621984,Tue Nov 30 20:49:35 CET,Tue Nov 30 22:48:11 CET,0.0 1.512 2.01 2.367 2.655 2.908 3.142 3.347 3.705 3.865 4.012 4.195 4.424 4.544 4.774 4.994 5.2 5.298 5.489 5.669 5.922 6.088 6.245 6.456 6.66 6.864 7.053 7.228 7.443 7.65 7.841 8.065 8.293 8.519 8.765 9.027 9.284 9.573 9.888 10.214 10.533 10.869 11.272 11.667 12.095 12.53 12.99 13.487 14.013 14.5 14.78 14.618 14.266 13.842 13.416 12.995 12.593 12.193 11.818 11.424 11.089 10.762 10.394 10.005 9.655 9.349 9.006 8.708 8.449 8.163 7.854 7.59 7.314 7.023 6.793 6.554 6.314 6.066 5.8 5.62 5.426 5.102 4.884 4.656 4.531 4.269 3.994 3.712 3.558 3.287 2.996 2.782 2.56 2.062 1.78 1.472 1.128 0.738 0.249 -0.455 -3.122 -6 ,7026 ,TETRA ,17621985,Tue Nov 30 20:49:35 CET,Tue Nov 30 22:45:50 CET,0.0 1.861 2.342 2.704 2.995 3.235 3.458 3.664 4.034 4.201 4.353 4.534 4.762 4.888 5.12 5.331 5.536 5.634 5.813 5.983 6.229 6.383 6.529 6.749 6.953 7.145 7.336 7.523 7.759 7.974 8.181 8.42 8.642 8.86 9.104 9.369 9.614 9.876 10.15 10.422 10.718 11.054 11.434 11.793 12.178 12.576 12.999 13.44 13.912 14.365 14.695 14.61 14.314 13.956 13.521 13.053 12.631 12.226 11.852 11.461 11.103 10.761 10.439 10.136 9.84 9.561 9.248 8.961 8.705 8.437 8.163 7.929 7.691 7.441 7.224 6.983 6.741 6.493 6.233 6.04 5.829 5.501 5.268 5.023 4.898 4.62 4.317 4.008 3.832 3.536 3.203 2.978 2.747 2.204 1.874 1.507 1.127 0.683 0.164 -0.543 -3.161 -7 ,30552 ,TETRA ,17621986,Tue Nov 30 20:49:37 CET,Tue Nov 30 22:47:14 CET,0.0 1.332 1.748 2.062 2.322 2.55 2.741 2.912 3.239 3.386 3.521 3.668 3.875 3.984 4.192 4.391 4.573 4.657 4.83 4.994 5.211 5.347 5.476 5.666 5.85 6.022 6.179 6.34 6.552 6.744 6.924 7.14 7.366 7.591 7.837 8.103 8.354 8.634 8.926 9.222 9.524 9.844 10.215 10.586 10.996 11.42 11.87 12.345 12.822 13.26 13.551 13.399 12.972 12.51 12.045 11.568 11.151 10.745 10.372 9.978 9.594 9.246 8.915 8.589 8.252 7.925 7.597 7.289 7.001 6.711 6.416 6.153 5.9 5.646 5.418 5.171 4.912 4.64 4.349 4.15 3.945 3.622 3.399 3.149 3.015 2.731 2.443 2.15 1.984 1.713 1.438 1.238 1.037 0.593 0.32 0.008 -0.334 -0.734 -1.248 -1.981 -4.9 -8 ,31103 ,TETRA ,17621987,Tue Nov 30 20:49:40 CET,Tue Nov 30 22:45:17 CET,0.0 1.646 2.141 2.509 2.803 3.048 3.273 3.484 3.859 4.023 4.172 4.354 4.586 4.711 4.948 5.174 5.375 5.468 5.647 5.817 6.066 6.22 6.368 6.577 6.772 6.957 7.135 7.305 7.518 7.722 7.921 8.158 8.377 8.576 8.807 9.072 9.313 9.566 9.841 10.128 10.407 10.719 11.075 11.429 11.839 12.294 12.773 13.256 13.74 14.147 14.417 14.323 14.042 13.67 13.284 12.899 12.523 12.13 11.753 11.374 11.018 10.702 10.395 10.069 9.742 9.433 9.129 8.856 8.615 8.365 8.1 7.871 7.618 7.362 7.163 6.945 6.723 6.49 6.224 6.036 5.842 5.501 5.243 4.974 4.843 4.586 4.3 3.988 3.826 3.56 3.244 3.028 2.814 2.32 2.047 1.749 1.423 1.014 0.458 -0.302 -2.801 -9 ,10922 ,TETRA ,17621988,Tue Nov 30 20:49:35 CET,Tue Nov 30 22:48:52 CET,0.0 1.481 1.974 2.333 2.639 2.912 3.145 3.355 3.728 3.887 4.038 4.218 4.439 4.565 4.794 4.998 5.193 5.287 5.463 5.643 5.908 6.064 6.21 6.427 6.63 6.82 7.0 7.174 7.398 7.608 7.812 8.043 8.255 8.454 8.692 8.961 9.206 9.474 9.762 10.054 10.36 10.689 11.048 11.409 11.817 12.249 12.706 13.155 13.615 14.065 14.311 14.104 13.748 13.335 12.876 12.461 12.076 11.654 11.218 10.772 10.416 10.074 9.705 9.348 9.025 8.736 8.424 8.13 7.866 7.593 7.299 7.032 6.758 6.498 6.289 6.04 5.783 5.524 5.243 5.044 4.828 4.474 4.226 3.97 3.844 3.568 3.253 2.941 2.779 2.522 2.244 2.028 1.806 1.299 1.016 0.71 0.353 -0.071 -0.613 -1.314 -4.189 -10 ,12799 ,TETRA ,17621989,Tue Nov 30 20:49:35 CET,Tue Nov 30 22:45:07 CET,0.0 1.714 2.242 2.612 2.917 3.182 3.418 3.62 3.977 4.141 4.295 4.489 4.721 4.851 5.089 5.314 5.528 5.63 5.816 5.984 6.229 6.39 6.54 6.749 6.945 7.129 7.307 7.477 7.7 7.91 8.106 8.339 8.561 8.774 9.014 9.278 9.53 9.817 10.114 10.41 10.714 11.036 11.401 11.766 12.159 12.559 13.001 13.471 13.944 14.362 14.618 14.515 14.188 13.792 13.384 12.969 12.527 12.087 11.708 11.313 10.953 10.635 10.327 9.999 9.691 9.419 9.132 8.836 8.574 8.299 8.011 7.776 7.504 7.216 6.992 6.763 6.53 6.28 6.012 5.826 5.639 5.323 5.094 4.852 4.725 4.456 4.161 3.844 3.659 3.37 3.075 2.859 2.623 2.084 1.757 1.4 1.015 0.545 0.002 -0.744 -3.445 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_57.txt deleted file mode 100644 index cb8f1c54..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11406 ,TETRA ,17621990,Tue Nov 30 20:49:38 CET,Tue Nov 30 22:44:05 CET,0.0 1.958 2.478 2.883 3.229 3.53 3.797 4.025 4.413 4.582 4.739 4.937 5.173 5.309 5.569 5.816 6.055 6.169 6.374 6.569 6.848 7.026 7.198 7.44 7.685 7.933 8.169 8.396 8.681 8.951 9.205 9.498 9.784 10.067 10.38 10.71 11.037 11.402 11.782 12.177 12.574 13.031 13.578 14.08 14.629 15.264 16.005 16.794 17.646 18.561 19.529 20.003 20.03 19.849 19.58 19.283 18.971 18.662 18.395 18.09 17.788 17.514 17.255 17.012 16.767 16.532 16.278 16.017 15.782 15.559 15.328 15.123 14.906 14.662 14.468 14.269 14.065 13.852 13.612 13.447 13.275 12.995 12.791 12.575 12.463 12.222 11.957 11.661 11.505 11.259 11.005 10.812 10.606 10.144 9.887 9.618 9.297 8.918 8.441 7.731 5.293 -2 ,11667 ,TETRA ,17621991,Tue Nov 30 20:49:36 CET,Tue Nov 30 22:43:35 CET,0.0 1.59 2.079 2.478 2.805 3.073 3.319 3.541 3.936 4.125 4.305 4.551 4.799 4.945 5.23 5.512 5.768 5.885 6.122 6.342 6.661 6.875 7.069 7.34 7.6 7.838 8.06 8.276 8.558 8.825 9.076 9.373 9.653 9.93 10.232 10.568 10.904 11.264 11.64 12.026 12.415 12.849 13.379 13.911 14.511 15.155 15.862 16.602 17.404 18.286 19.186 19.614 19.63 19.473 19.218 18.927 18.612 18.287 17.981 17.657 17.355 17.085 16.832 16.583 16.338 16.106 15.851 15.609 15.396 15.173 14.944 14.738 14.504 14.261 14.074 13.876 13.667 13.441 13.211 13.051 12.87 12.561 12.341 12.114 11.996 11.748 11.487 11.212 11.069 10.815 10.523 10.316 10.102 9.674 9.424 9.125 8.791 8.413 7.931 7.242 4.534 -3 ,24623 ,TETRA ,17621992,Tue Nov 30 20:49:37 CET,Tue Nov 30 22:43:01 CET,0.0 1.907 2.435 2.832 3.159 3.436 3.675 3.888 4.286 4.468 4.633 4.836 5.081 5.228 5.498 5.739 5.961 6.07 6.279 6.476 6.748 6.919 7.091 7.337 7.568 7.788 7.992 8.189 8.445 8.691 8.932 9.211 9.468 9.717 9.994 10.303 10.606 10.937 11.296 11.661 12.036 12.449 12.914 13.391 13.977 14.599 15.262 15.996 16.815 17.705 18.55 18.98 19.111 19.047 18.798 18.474 18.17 17.872 17.579 17.275 16.986 16.69 16.426 16.191 15.949 15.706 15.434 15.188 14.982 14.774 14.544 14.333 14.1 13.854 13.662 13.472 13.274 13.057 12.827 12.666 12.492 12.212 12.013 11.804 11.698 11.48 11.231 10.95 10.8 10.555 10.292 10.093 9.875 9.397 9.138 8.861 8.546 8.138 7.623 6.99 4.792 -4 ,14072 ,TETRA ,17621993,Tue Nov 30 20:49:39 CET,Tue Nov 30 22:42:46 CET,0.0 1.751 2.256 2.63 2.927 3.191 3.429 3.65 4.04 4.217 4.38 4.585 4.826 4.956 5.217 5.464 5.685 5.791 6.0 6.205 6.481 6.651 6.825 7.074 7.311 7.545 7.761 7.966 8.231 8.482 8.717 8.985 9.252 9.526 9.84 10.186 10.52 10.877 11.252 11.654 12.06 12.502 13.013 13.524 14.117 14.748 15.439 16.191 17.031 17.888 18.738 19.201 19.186 18.99 18.762 18.478 18.15 17.829 17.531 17.205 16.889 16.594 16.319 16.041 15.761 15.497 15.211 14.938 14.689 14.438 14.189 13.977 13.755 13.479 13.254 13.046 12.82 12.57 12.315 12.124 11.913 11.597 11.373 11.129 11.002 10.747 10.475 10.187 10.045 9.81 9.558 9.371 9.178 8.747 8.512 8.237 7.891 7.494 7.012 6.343 4.111 -5 ,29714 ,TETRA ,17621994,Tue Nov 30 20:49:37 CET,Tue Nov 30 22:40:32 CET,0.0 1.788 2.342 2.708 3.01 3.279 3.521 3.739 4.11 4.279 4.443 4.655 4.895 5.032 5.289 5.532 5.762 5.874 6.091 6.297 6.582 6.763 6.952 7.23 7.479 7.716 7.949 8.173 8.46 8.738 8.992 9.286 9.576 9.852 10.16 10.506 10.832 11.186 11.569 11.956 12.355 12.802 13.298 13.784 14.378 15.033 15.742 16.505 17.32 18.171 19.069 19.502 19.478 19.325 19.122 18.856 18.52 18.162 17.836 17.483 17.16 16.837 16.533 16.251 15.971 15.7 15.41 15.144 14.91 14.661 14.391 14.16 13.926 13.684 13.482 13.272 13.048 12.819 12.597 12.443 12.274 11.997 11.799 11.592 11.486 11.249 10.984 10.689 10.53 10.278 10.018 9.828 9.618 9.149 8.877 8.568 8.202 7.78 7.298 6.638 4.077 -6 ,27649 ,TETRA ,17621995,Tue Nov 30 20:49:37 CET,Tue Nov 30 22:55:58 CET,0.0 1.936 2.462 2.839 3.151 3.423 3.671 3.886 4.26 4.44 4.61 4.819 5.055 5.199 5.466 5.706 5.934 6.046 6.255 6.458 6.775 6.971 7.154 7.419 7.667 7.902 8.125 8.344 8.623 8.894 9.144 9.436 9.718 9.983 10.29 10.633 10.959 11.331 11.732 12.151 12.574 13.028 13.56 14.092 14.678 15.286 15.979 16.765 17.582 18.422 19.283 19.669 19.728 19.614 19.375 19.055 18.727 18.426 18.152 17.839 17.528 17.243 16.972 16.684 16.392 16.131 15.852 15.582 15.34 15.087 14.817 14.589 14.344 14.091 13.897 13.675 13.448 13.237 13.009 12.828 12.644 12.383 12.189 11.98 11.872 11.64 11.368 11.049 10.892 10.649 10.393 10.204 10.005 9.556 9.309 9.041 8.725 8.349 7.88 7.207 5.018 -7 ,10607 ,TETRA ,17621996,Tue Nov 30 20:49:39 CET,Tue Nov 30 22:46:55 CET,0.0 1.686 2.204 2.606 2.93 3.188 3.425 3.65 4.051 4.231 4.4 4.607 4.843 4.984 5.25 5.49 5.714 5.826 6.045 6.245 6.532 6.718 6.902 7.164 7.414 7.668 7.908 8.123 8.393 8.665 8.929 9.234 9.52 9.796 10.117 10.465 10.803 11.173 11.56 11.969 12.403 12.874 13.395 13.892 14.469 15.119 15.845 16.6 17.408 18.261 19.093 19.489 19.448 19.276 19.026 18.728 18.394 18.033 17.701 17.345 17.015 16.718 16.417 16.112 15.838 15.571 15.29 15.037 14.795 14.555 14.313 14.089 13.85 13.588 13.361 13.134 12.893 12.647 12.409 12.238 12.054 11.764 11.554 11.329 11.22 10.995 10.76 10.528 10.396 10.17 9.966 9.808 9.632 9.22 9.0 8.76 8.471 8.131 7.719 7.124 5.133 -8 ,10324 ,TETRA ,17621997,Tue Nov 30 20:49:41 CET,Tue Nov 30 22:43:40 CET,0.0 1.803 2.358 2.757 3.084 3.382 3.657 3.903 4.316 4.499 4.672 4.894 5.143 5.304 5.605 5.875 6.124 6.245 6.481 6.701 7.004 7.2 7.386 7.648 7.898 8.137 8.361 8.582 8.861 9.119 9.368 9.675 9.975 10.255 10.56 10.895 11.226 11.591 11.979 12.394 12.826 13.281 13.799 14.327 14.923 15.541 16.23 16.984 17.808 18.664 19.412 19.767 19.752 19.579 19.34 19.052 18.74 18.409 18.11 17.772 17.445 17.133 16.817 16.528 16.268 16.022 15.739 15.464 15.235 14.996 14.73 14.502 14.254 13.987 13.773 13.561 13.348 13.102 12.824 12.633 12.437 12.129 11.908 11.674 11.547 11.283 11.024 10.757 10.606 10.348 10.061 9.87 9.665 9.172 8.903 8.626 8.292 7.896 7.406 6.69 3.562 -9 ,9620 ,TETRA ,17621998,Tue Nov 30 20:49:38 CET,Tue Nov 30 22:59:18 CET,0.0 1.543 2.036 2.454 2.78 3.041 3.277 3.487 3.875 4.051 4.21 4.407 4.648 4.784 5.046 5.304 5.548 5.673 5.922 6.144 6.447 6.646 6.837 7.098 7.342 7.574 7.808 8.036 8.314 8.58 8.834 9.128 9.414 9.69 9.994 10.33 10.652 11.014 11.406 11.793 12.216 12.701 13.225 13.751 14.35 14.992 15.699 16.473 17.334 18.266 19.162 19.615 19.632 19.453 19.211 18.923 18.586 18.258 17.964 17.64 17.336 17.037 16.733 16.426 16.141 15.881 15.6 15.334 15.081 14.814 14.545 14.32 14.076 13.824 13.632 13.419 13.188 12.929 12.645 12.438 12.229 11.917 11.701 11.478 11.352 11.069 10.771 10.451 10.272 9.997 9.681 9.468 9.239 8.728 8.442 8.129 7.794 7.386 6.877 6.242 3.879 -10 ,16237 ,TETRA ,17621999,Tue Nov 30 20:49:38 CET,Tue Nov 30 22:48:34 CET,0.0 2.396 2.916 3.29 3.599 3.862 4.1 4.312 4.686 4.857 5.013 5.222 5.466 5.603 5.854 6.1 6.34 6.455 6.675 6.898 7.206 7.392 7.578 7.851 8.112 8.361 8.591 8.803 9.071 9.314 9.552 9.849 10.126 10.392 10.693 11.024 11.342 11.692 12.069 12.455 12.861 13.311 13.824 14.329 14.921 15.567 16.276 17.017 17.79 18.622 19.476 19.909 19.958 19.803 19.531 19.199 18.851 18.528 18.237 17.894 17.564 17.272 16.982 16.709 16.445 16.176 15.889 15.624 15.378 15.109 14.829 14.612 14.386 14.146 13.963 13.768 13.558 13.339 13.12 12.956 12.765 12.465 12.251 12.02 11.906 11.681 11.427 11.141 10.986 10.744 10.494 10.312 10.122 9.678 9.425 9.135 8.804 8.413 7.944 7.305 4.518 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_55_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_55_35.txt deleted file mode 100644 index af9c543d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_55_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14225 ,TETRA ,17622000,Tue Nov 30 20:49:41 CET,Tue Nov 30 22:49:35 CET,0.0 1.868 2.357 2.706 3.009 3.275 3.517 3.728 4.085 4.252 4.402 4.585 4.809 4.933 5.165 5.385 5.588 5.683 5.867 6.046 6.296 6.443 6.585 6.794 6.988 7.17 7.344 7.514 7.734 7.936 8.123 8.347 8.546 8.736 8.969 9.24 9.498 9.758 10.03 10.322 10.619 10.933 11.273 11.615 11.994 12.361 12.733 13.121 13.501 13.809 13.88 13.478 13.009 12.561 12.078 11.587 11.154 10.742 10.345 9.934 9.587 9.28 8.973 8.677 8.393 8.12 7.823 7.55 7.306 7.059 6.805 6.584 6.355 6.111 5.917 5.714 5.499 5.283 5.061 4.909 4.747 4.482 4.3 4.11 4.008 3.795 3.572 3.33 3.201 2.969 2.771 2.604 2.43 2.052 1.832 1.586 1.309 0.994 0.619 0.095 -1.899 -2 ,28364 ,TETRA ,17622001,Tue Nov 30 20:49:39 CET,Tue Nov 30 22:39:16 CET,0.0 2.037 2.55 2.926 3.231 3.48 3.7 3.899 4.27 4.435 4.593 4.797 5.024 5.153 5.402 5.633 5.837 5.937 6.126 6.293 6.526 6.679 6.827 7.023 7.213 7.4 7.577 7.738 7.943 8.141 8.33 8.554 8.758 8.948 9.177 9.444 9.697 9.977 10.281 10.584 10.888 11.223 11.591 11.922 12.267 12.617 12.974 13.343 13.733 14.012 14.094 13.822 13.382 12.902 12.434 11.951 11.493 11.086 10.704 10.286 9.91 9.569 9.247 8.936 8.633 8.336 8.032 7.766 7.518 7.261 7.002 6.78 6.543 6.284 6.078 5.87 5.661 5.437 5.194 5.028 4.858 4.572 4.378 4.19 4.089 3.876 3.655 3.416 3.283 3.05 2.856 2.694 2.517 2.118 1.895 1.656 1.38 1.048 0.638 0.102 -2.132 -3 ,499 ,TETRA ,17622002,Tue Nov 30 20:49:39 CET,Tue Nov 30 22:48:43 CET,0.0 2.138 2.641 3.027 3.341 3.604 3.833 4.037 4.392 4.557 4.712 4.896 5.116 5.244 5.483 5.697 5.9 5.996 6.179 6.352 6.589 6.733 6.87 7.071 7.27 7.462 7.64 7.804 8.01 8.21 8.396 8.609 8.819 9.025 9.266 9.536 9.772 10.02 10.288 10.576 10.87 11.188 11.553 11.892 12.237 12.621 13.068 13.486 13.893 14.202 14.299 13.982 13.479 12.969 12.454 11.974 11.518 11.069 10.68 10.285 9.946 9.657 9.37 9.086 8.823 8.571 8.299 8.061 7.847 7.618 7.379 7.179 6.973 6.753 6.578 6.399 6.21 6.005 5.792 5.643 5.485 5.238 5.054 4.853 4.752 4.538 4.307 4.061 3.929 3.695 3.49 3.331 3.158 2.772 2.557 2.317 2.048 1.743 1.381 0.885 -0.997 -4 ,32488 ,TETRA ,17622003,Tue Nov 30 20:49:41 CET,Tue Nov 30 22:51:17 CET,0.0 1.598 2.096 2.466 2.761 3.012 3.232 3.441 3.819 3.98 4.134 4.328 4.55 4.679 4.912 5.118 5.311 5.406 5.595 5.765 5.995 6.149 6.298 6.505 6.701 6.893 7.067 7.234 7.446 7.643 7.829 8.038 8.232 8.421 8.641 8.879 9.104 9.342 9.595 9.864 10.149 10.465 10.823 11.19 11.576 11.955 12.369 12.761 13.137 13.443 13.494 13.19 12.727 12.217 11.738 11.304 10.909 10.516 10.169 9.8 9.474 9.185 8.897 8.623 8.362 8.114 7.84 7.584 7.364 7.132 6.885 6.683 6.477 6.262 6.089 5.903 5.709 5.505 5.291 5.137 4.973 4.713 4.528 4.338 4.242 4.032 3.807 3.562 3.428 3.195 2.975 2.804 2.639 2.283 2.068 1.814 1.53 1.196 0.795 0.265 -1.429 -5 ,1016 ,TETRA ,17622004,Tue Nov 30 20:49:43 CET,Tue Nov 30 22:42:41 CET,0.0 1.759 2.237 2.587 2.877 3.125 3.345 3.546 3.895 4.052 4.2 4.387 4.609 4.734 4.978 5.218 5.45 5.553 5.737 5.918 6.192 6.365 6.526 6.753 6.975 7.184 7.386 7.578 7.814 8.044 8.257 8.505 8.724 8.929 9.169 9.443 9.698 9.96 10.249 10.55 10.849 11.159 11.512 11.857 12.225 12.604 12.994 13.377 13.735 14.026 14.09 13.769 13.32 12.792 12.284 11.805 11.328 10.863 10.454 10.066 9.722 9.39 9.063 8.744 8.434 8.144 7.848 7.581 7.35 7.105 6.845 6.629 6.399 6.158 5.97 5.776 5.57 5.349 5.119 4.961 4.799 4.546 4.361 4.162 4.059 3.845 3.628 3.39 3.261 3.031 2.828 2.663 2.492 2.121 1.903 1.663 1.398 1.098 0.722 0.184 -1.852 -6 ,32396 ,TETRA ,17622005,Tue Nov 30 20:49:39 CET,Tue Nov 30 22:58:50 CET,0.0 1.61 2.092 2.445 2.742 2.998 3.22 3.422 3.798 3.964 4.106 4.276 4.498 4.622 4.855 5.074 5.277 5.375 5.564 5.734 5.974 6.125 6.263 6.464 6.664 6.856 7.036 7.203 7.415 7.614 7.796 8.008 8.206 8.395 8.618 8.86 9.098 9.369 9.666 9.966 10.248 10.557 10.916 11.273 11.661 12.035 12.448 12.864 13.246 13.538 13.6 13.296 12.818 12.294 11.799 11.332 10.893 10.463 10.086 9.696 9.328 8.988 8.663 8.359 8.081 7.817 7.529 7.281 7.072 6.848 6.607 6.407 6.205 5.982 5.793 5.594 5.384 5.173 4.959 4.808 4.648 4.389 4.211 4.026 3.927 3.714 3.488 3.245 3.117 2.888 2.692 2.532 2.36 1.982 1.772 1.534 1.27 0.959 0.559 0.036 -1.884 -7 ,5899 ,TETRA ,17622006,Tue Nov 30 20:49:40 CET,Tue Nov 30 22:50:58 CET,0.0 2.0 2.497 2.868 3.173 3.427 3.66 3.868 4.223 4.391 4.55 4.736 4.956 5.078 5.315 5.531 5.721 5.811 5.988 6.157 6.394 6.542 6.682 6.881 7.076 7.259 7.434 7.598 7.805 8.009 8.201 8.423 8.631 8.833 9.059 9.315 9.547 9.783 10.043 10.314 10.591 10.888 11.226 11.544 11.878 12.225 12.605 13.012 13.416 13.722 13.755 13.433 13.017 12.558 12.079 11.602 11.145 10.701 10.312 9.943 9.636 9.339 9.036 8.767 8.506 8.254 7.988 7.738 7.509 7.272 7.031 6.833 6.627 6.404 6.218 6.019 5.818 5.616 5.394 5.238 5.083 4.818 4.625 4.427 4.325 4.116 3.892 3.655 3.53 3.298 3.078 2.913 2.749 2.37 2.149 1.919 1.644 1.315 0.938 0.373 -1.994 -8 ,11387 ,TETRA ,17622007,Tue Nov 30 20:49:42 CET,Tue Nov 30 22:43:02 CET,0.0 1.858 2.346 2.718 3.023 3.272 3.484 3.681 4.051 4.215 4.37 4.559 4.776 4.896 5.128 5.341 5.533 5.63 5.822 5.997 6.248 6.407 6.55 6.757 6.954 7.133 7.298 7.454 7.659 7.864 8.068 8.309 8.518 8.715 8.944 9.192 9.421 9.661 9.913 10.177 10.455 10.756 11.079 11.381 11.716 12.076 12.45 12.835 13.205 13.496 13.574 13.257 12.775 12.263 11.787 11.32 10.882 10.443 10.038 9.65 9.312 9.009 8.723 8.446 8.188 7.949 7.678 7.423 7.208 6.985 6.747 6.542 6.323 6.097 5.917 5.73 5.536 5.329 5.113 4.96 4.793 4.533 4.352 4.16 4.061 3.851 3.631 3.397 3.268 3.036 2.833 2.675 2.502 2.094 1.869 1.615 1.332 1.011 0.626 0.118 -1.428 -9 ,63 ,TETRA ,17622008,Tue Nov 30 20:49:40 CET,Tue Nov 30 22:54:08 CET,0.0 1.56 2.079 2.458 2.74 2.975 3.212 3.426 3.781 3.942 4.09 4.277 4.499 4.623 4.857 5.081 5.29 5.388 5.569 5.739 5.983 6.133 6.273 6.477 6.672 6.857 7.032 7.193 7.403 7.6 7.787 8.016 8.233 8.444 8.672 8.911 9.146 9.396 9.645 9.91 10.196 10.503 10.859 11.19 11.545 11.937 12.33 12.687 13.026 13.29 13.372 13.131 12.73 12.302 11.91 11.508 11.096 10.706 10.348 9.98 9.654 9.344 9.053 8.777 8.516 8.272 8.002 7.752 7.538 7.315 7.068 6.849 6.631 6.415 6.238 6.045 5.833 5.612 5.396 5.246 5.088 4.84 4.657 4.466 4.366 4.154 3.933 3.691 3.561 3.325 3.109 2.948 2.777 2.377 2.154 1.911 1.646 1.344 0.957 0.403 -1.532 -10 ,30962 ,TETRA ,17622009,Tue Nov 30 20:49:42 CET,Tue Nov 30 22:54:45 CET,0.0 1.759 2.235 2.6 2.912 3.19 3.447 3.691 4.122 4.307 4.479 4.726 4.976 5.119 5.393 5.647 5.87 5.972 6.172 6.365 6.627 6.79 6.946 7.165 7.378 7.584 7.784 7.974 8.204 8.418 8.626 8.87 9.099 9.319 9.577 9.859 10.113 10.38 10.669 10.965 11.26 11.572 11.934 12.286 12.653 13.053 13.481 13.898 14.314 14.655 14.789 14.496 14.045 13.546 13.038 12.544 12.09 11.661 11.27 10.882 10.549 10.226 9.901 9.599 9.305 9.026 8.724 8.459 8.243 8.009 7.756 7.549 7.332 7.107 6.936 6.752 6.547 6.335 6.109 5.948 5.791 5.541 5.369 5.189 5.086 4.858 4.619 4.357 4.216 3.983 3.788 3.634 3.47 3.096 2.887 2.659 2.398 2.076 1.69 1.172 -0.527 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_35.txt deleted file mode 100644 index 2400df9a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12162 ,TETRA ,17622010,Tue Nov 30 20:49:44 CET,Tue Nov 30 22:44:12 CET,0.0 1.9 2.399 2.77 3.083 3.35 3.575 3.785 4.158 4.324 4.482 4.668 4.903 5.035 5.28 5.509 5.724 5.826 6.02 6.206 6.47 6.631 6.794 7.031 7.249 7.456 7.66 7.856 8.111 8.369 8.604 8.869 9.121 9.358 9.62 9.91 10.189 10.507 10.848 11.191 11.549 11.943 12.391 12.834 13.314 13.817 14.373 14.973 15.626 16.311 16.97 17.218 17.117 16.887 16.585 16.251 15.953 15.661 15.37 15.043 14.746 14.485 14.225 13.962 13.712 13.476 13.219 12.981 12.776 12.557 12.323 12.134 11.941 11.731 11.556 11.375 11.199 11.015 10.808 10.653 10.49 10.234 10.048 9.85 9.746 9.517 9.27 9.024 8.896 8.668 8.465 8.298 8.124 7.738 7.52 7.273 6.975 6.629 6.212 5.631 3.356 -2 ,52 ,TETRA ,17622011,Tue Nov 30 20:50:26 CET,Tue Nov 30 22:36:18 CET,0.0 1.221 1.65 1.974 2.249 2.467 2.663 2.846 3.189 3.34 3.467 3.61 3.829 3.949 4.164 4.374 4.574 4.668 4.842 4.997 5.218 5.362 5.506 5.715 5.918 6.113 6.294 6.469 6.691 6.89 7.079 7.315 7.539 7.768 8.045 8.35 8.624 8.903 9.207 9.529 9.868 10.249 10.667 11.078 11.547 12.049 12.612 13.22 13.869 14.527 15.152 15.369 15.263 15.029 14.772 14.497 14.194 13.882 13.591 13.272 12.991 12.726 12.444 12.171 11.931 11.703 11.441 11.214 11.015 10.802 10.58 10.399 10.199 9.969 9.793 9.613 9.425 9.212 8.978 8.822 8.661 8.409 8.227 8.032 7.925 7.687 7.438 7.186 7.056 6.826 6.63 6.471 6.295 5.907 5.687 5.423 5.121 4.808 4.402 3.789 1.614 -3 ,19581 ,TETRA ,17622012,Tue Nov 30 20:50:27 CET,Tue Nov 30 22:37:15 CET,0.0 1.943 2.427 2.798 3.108 3.353 3.567 3.773 4.137 4.305 4.47 4.669 4.901 5.027 5.266 5.498 5.715 5.814 6.005 6.192 6.455 6.618 6.78 7.012 7.231 7.436 7.632 7.814 8.044 8.272 8.494 8.767 9.022 9.261 9.532 9.822 10.104 10.416 10.752 11.109 11.465 11.842 12.271 12.701 13.198 13.713 14.286 14.893 15.555 16.242 16.805 17.008 16.942 16.725 16.478 16.176 15.822 15.507 15.223 14.898 14.609 14.355 14.106 13.865 13.631 13.419 13.201 12.991 12.802 12.602 12.387 12.204 12.002 11.777 11.593 11.403 11.209 11.007 10.782 10.622 10.462 10.209 10.015 9.794 9.682 9.458 9.227 8.976 8.84 8.608 8.411 8.247 8.071 7.665 7.432 7.177 6.886 6.542 6.106 5.477 3.1 -4 ,27589 ,TETRA ,17622013,Tue Nov 30 20:50:26 CET,Tue Nov 30 22:55:38 CET,0.0 1.67 2.194 2.588 2.901 3.18 3.421 3.632 4.0 4.163 4.315 4.501 4.734 4.859 5.108 5.352 5.578 5.681 5.874 6.053 6.296 6.45 6.61 6.843 7.052 7.249 7.441 7.636 7.891 8.131 8.354 8.619 8.87 9.115 9.399 9.715 10.019 10.338 10.671 11.023 11.384 11.784 12.223 12.653 13.151 13.676 14.245 14.846 15.504 16.178 16.8 17.04 16.967 16.759 16.477 16.181 15.89 15.592 15.306 15.005 14.741 14.486 14.225 13.956 13.687 13.448 13.176 12.933 12.738 12.521 12.28 12.075 11.868 11.649 11.481 11.305 11.118 10.923 10.696 10.541 10.389 10.139 9.957 9.757 9.654 9.439 9.206 8.96 8.828 8.588 8.368 8.198 8.012 7.617 7.403 7.154 6.854 6.506 6.095 5.517 3.429 -5 ,7945 ,TETRA ,17622014,Tue Nov 30 20:50:26 CET,Tue Nov 30 22:45:13 CET,0.0 1.803 2.34 2.723 3.032 3.3 3.535 3.745 4.102 4.265 4.417 4.589 4.822 4.96 5.218 5.443 5.656 5.764 5.971 6.151 6.401 6.558 6.709 6.939 7.157 7.362 7.554 7.733 7.962 8.181 8.395 8.646 8.886 9.115 9.367 9.643 9.912 10.222 10.549 10.895 11.265 11.653 12.101 12.545 13.037 13.546 14.064 14.642 15.337 16.048 16.682 16.973 16.924 16.712 16.447 16.12 15.815 15.53 15.244 14.945 14.658 14.387 14.13 13.86 13.597 13.348 13.092 12.859 12.639 12.405 12.167 11.967 11.764 11.556 11.385 11.214 11.033 10.834 10.614 10.453 10.291 10.041 9.865 9.667 9.56 9.342 9.099 8.834 8.703 8.47 8.255 8.078 7.885 7.485 7.266 7.016 6.745 6.421 5.984 5.371 3.178 -6 ,334 ,TETRA ,17622015,Tue Nov 30 20:50:28 CET,Tue Nov 30 22:46:14 CET,0.0 1.705 2.213 2.609 2.934 3.199 3.439 3.656 4.045 4.217 4.37 4.564 4.8 4.93 5.174 5.399 5.62 5.723 5.921 6.112 6.369 6.537 6.7 6.928 7.142 7.339 7.523 7.702 7.929 8.152 8.368 8.615 8.844 9.068 9.33 9.615 9.892 10.203 10.54 10.883 11.225 11.609 12.062 12.489 12.953 13.483 14.087 14.691 15.325 15.997 16.591 16.83 16.794 16.594 16.289 15.984 15.672 15.355 15.078 14.793 14.538 14.293 14.036 13.764 13.515 13.284 13.041 12.827 12.625 12.416 12.199 11.998 11.788 11.573 11.396 11.213 11.019 10.813 10.597 10.441 10.273 10.013 9.83 9.632 9.526 9.304 9.068 8.8 8.655 8.419 8.205 8.034 7.851 7.435 7.206 6.953 6.651 6.303 5.902 5.32 2.823 -7 ,21077 ,TETRA ,17622016,Tue Nov 30 20:50:26 CET,Tue Nov 30 22:45:40 CET,0.0 1.746 2.233 2.586 2.894 3.163 3.402 3.613 3.974 4.142 4.302 4.488 4.728 4.859 5.097 5.315 5.529 5.637 5.838 6.022 6.288 6.461 6.621 6.842 7.054 7.258 7.45 7.633 7.866 8.088 8.297 8.55 8.792 9.012 9.266 9.539 9.783 10.056 10.354 10.686 11.035 11.432 11.893 12.339 12.831 13.332 13.89 14.484 15.124 15.777 16.36 16.596 16.52 16.327 16.081 15.802 15.489 15.152 14.845 14.521 14.239 13.983 13.718 13.458 13.211 12.974 12.722 12.49 12.278 12.053 11.815 11.618 11.409 11.192 11.024 10.842 10.644 10.444 10.229 10.071 9.902 9.632 9.445 9.253 9.158 8.955 8.729 8.482 8.349 8.117 7.906 7.738 7.557 7.154 6.929 6.681 6.396 6.063 5.623 5.005 2.625 -8 ,18794 ,TETRA ,17622017,Tue Nov 30 20:50:27 CET,Tue Nov 30 22:51:09 CET,0.0 1.816 2.34 2.731 3.022 3.266 3.486 3.693 4.056 4.214 4.366 4.552 4.786 4.914 5.147 5.366 5.578 5.682 5.889 6.076 6.332 6.495 6.655 6.88 7.084 7.275 7.457 7.638 7.872 8.095 8.313 8.561 8.792 9.013 9.259 9.538 9.806 10.088 10.391 10.711 11.04 11.405 11.82 12.222 12.675 13.186 13.782 14.427 15.099 15.744 16.41 16.747 16.732 16.575 16.315 16.024 15.723 15.389 15.096 14.823 14.569 14.304 14.048 13.8 13.556 13.327 13.081 12.857 12.663 12.465 12.256 12.069 11.867 11.65 11.477 11.3 11.115 10.911 10.68 10.523 10.364 10.105 9.921 9.729 9.628 9.413 9.193 8.953 8.822 8.584 8.376 8.216 8.043 7.652 7.426 7.181 6.898 6.563 6.142 5.583 3.415 -9 ,16679 ,TETRA ,17622018,Tue Nov 30 20:50:28 CET,Tue Nov 30 22:49:58 CET,0.0 1.244 1.654 1.974 2.239 2.463 2.658 2.839 3.172 3.322 3.461 3.621 3.844 3.966 4.203 4.415 4.604 4.695 4.869 5.03 5.266 5.417 5.559 5.759 5.946 6.127 6.306 6.474 6.684 6.889 7.088 7.32 7.54 7.755 7.99 8.234 8.468 8.722 8.99 9.282 9.578 9.907 10.301 10.702 11.158 11.638 12.176 12.744 13.358 14.019 14.639 14.878 14.829 14.641 14.392 14.09 13.763 13.465 13.201 12.921 12.655 12.406 12.165 11.929 11.693 11.453 11.208 11.012 10.831 10.624 10.407 10.222 10.021 9.823 9.674 9.51 9.335 9.149 8.95 8.815 8.673 8.435 8.262 8.09 8.002 7.809 7.604 7.384 7.269 7.053 6.86 6.701 6.552 6.217 6.008 5.78 5.52 5.205 4.829 4.314 2.103 -10 ,14364 ,TETRA ,17622019,Tue Nov 30 20:50:28 CET,Tue Nov 30 22:46:30 CET,0.0 1.859 2.374 2.736 3.015 3.261 3.483 3.692 4.077 4.243 4.394 4.582 4.827 4.964 5.218 5.448 5.667 5.767 5.953 6.138 6.397 6.564 6.72 6.93 7.136 7.335 7.521 7.703 7.938 8.158 8.368 8.614 8.844 9.058 9.301 9.577 9.844 10.131 10.427 10.743 11.074 11.436 11.841 12.246 12.724 13.225 13.783 14.368 14.956 15.588 16.23 16.515 16.483 16.316 16.087 15.814 15.508 15.176 14.868 14.543 14.242 13.96 13.703 13.461 13.218 12.999 12.773 12.546 12.335 12.119 11.89 11.702 11.514 11.308 11.138 10.953 10.756 10.55 10.33 10.177 10.014 9.761 9.594 9.418 9.316 9.095 8.866 8.609 8.475 8.25 8.04 7.857 7.673 7.266 7.028 6.771 6.476 6.098 5.64 5.062 3.094 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_55.txt deleted file mode 100644 index 8f998153..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24965 ,TETRA ,17622020,Tue Nov 30 20:50:30 CET,Tue Nov 30 22:44:25 CET,0.0 1.757 2.259 2.634 2.941 3.208 3.455 3.67 4.037 4.203 4.358 4.538 4.77 4.904 5.148 5.378 5.591 5.693 5.887 6.067 6.338 6.515 6.687 6.935 7.166 7.389 7.594 7.784 8.034 8.272 8.501 8.775 9.04 9.291 9.564 9.871 10.175 10.505 10.857 11.222 11.594 12.01 12.484 12.972 13.517 14.054 14.655 15.299 15.959 16.619 17.27 17.624 17.65 17.502 17.254 16.984 16.686 16.384 16.113 15.804 15.511 15.251 15.007 14.76 14.51 14.279 14.029 13.8 13.601 13.376 13.122 12.916 12.714 12.488 12.309 12.13 11.938 11.726 11.504 11.351 11.192 10.932 10.743 10.534 10.417 10.175 9.928 9.657 9.511 9.261 8.982 8.797 8.609 8.162 7.894 7.601 7.277 6.918 6.49 5.917 3.835 -2 ,10137 ,TETRA ,17622021,Tue Nov 30 20:50:28 CET,Tue Nov 30 22:51:45 CET,0.0 1.666 2.184 2.556 2.865 3.123 3.352 3.567 3.939 4.108 4.278 4.489 4.728 4.863 5.118 5.345 5.556 5.66 5.86 6.042 6.297 6.457 6.608 6.831 7.044 7.241 7.433 7.626 7.878 8.113 8.325 8.567 8.802 9.027 9.281 9.565 9.843 10.146 10.469 10.82 11.193 11.6 12.065 12.524 13.02 13.541 14.124 14.768 15.486 16.227 16.937 17.285 17.322 17.182 16.948 16.679 16.389 16.087 15.816 15.516 15.234 14.972 14.711 14.445 14.195 13.967 13.711 13.467 13.249 13.028 12.787 12.583 12.374 12.145 11.964 11.777 11.584 11.378 11.163 11.022 10.869 10.597 10.402 10.193 10.081 9.847 9.589 9.33 9.207 8.984 8.792 8.64 8.471 8.082 7.862 7.618 7.349 7.045 6.65 6.07 3.371 -3 ,18723 ,TETRA ,17622022,Tue Nov 30 20:50:28 CET,Tue Nov 30 22:42:48 CET,0.0 1.573 2.051 2.386 2.66 2.892 3.094 3.277 3.614 3.775 3.924 4.107 4.339 4.467 4.72 4.958 5.179 5.283 5.48 5.664 5.924 6.09 6.252 6.492 6.727 6.947 7.154 7.348 7.591 7.824 8.049 8.317 8.565 8.801 9.076 9.385 9.679 9.993 10.314 10.649 11.003 11.389 11.832 12.262 12.754 13.269 13.835 14.489 15.205 15.937 16.635 16.883 16.838 16.667 16.398 16.138 15.917 15.673 15.418 15.167 14.938 14.697 14.458 14.234 14.025 13.826 13.581 13.351 13.157 12.958 12.752 12.581 12.414 12.232 12.087 11.939 11.776 11.6 11.407 11.271 11.128 10.903 10.75 10.59 10.507 10.324 10.117 9.896 9.78 9.569 9.412 9.282 9.144 8.828 8.639 8.418 8.173 7.887 7.547 7.032 4.973 -4 ,20140 ,TETRA ,17622023,Tue Nov 30 20:50:28 CET,Tue Nov 30 22:43:55 CET,0.0 1.707 2.228 2.624 2.932 3.192 3.43 3.641 4.007 4.173 4.329 4.523 4.761 4.892 5.134 5.354 5.56 5.658 5.855 6.053 6.328 6.498 6.66 6.883 7.098 7.305 7.51 7.707 7.967 8.227 8.467 8.753 9.023 9.277 9.56 9.867 10.165 10.49 10.827 11.18 11.55 11.945 12.395 12.845 13.364 13.944 14.56 15.203 15.938 16.709 17.46 17.831 17.842 17.725 17.525 17.255 16.997 16.718 16.452 16.201 15.974 15.76 15.536 15.304 15.079 14.875 14.651 14.432 14.24 14.038 13.825 13.648 13.449 13.232 13.067 12.892 12.714 12.537 12.342 12.2 12.05 11.816 11.651 11.476 11.383 11.177 10.965 10.719 10.58 10.355 10.173 10.022 9.853 9.469 9.254 9.014 8.749 8.445 8.046 7.504 5.511 -5 ,6154 ,TETRA ,17622024,Tue Nov 30 20:50:28 CET,Tue Nov 30 22:45:25 CET,0.0 1.524 1.997 2.348 2.646 2.914 3.153 3.374 3.753 3.918 4.073 4.262 4.495 4.625 4.876 5.11 5.324 5.426 5.62 5.802 6.066 6.23 6.385 6.606 6.827 7.039 7.226 7.407 7.655 7.889 8.103 8.36 8.599 8.834 9.112 9.428 9.731 10.049 10.381 10.734 11.11 11.522 12.007 12.468 12.957 13.495 14.089 14.741 15.466 16.222 16.927 17.221 17.227 17.058 16.818 16.547 16.251 15.966 15.705 15.408 15.145 14.89 14.63 14.384 14.147 13.925 13.69 13.465 13.255 13.034 12.8 12.598 12.394 12.187 12.023 11.856 11.685 11.504 11.308 11.166 11.011 10.764 10.59 10.409 10.314 10.105 9.876 9.637 9.517 9.298 9.112 8.964 8.807 8.448 8.237 8.003 7.738 7.42 7.016 6.469 4.127 -6 ,10862 ,TETRA ,17622025,Tue Nov 30 20:50:30 CET,Tue Nov 30 22:47:57 CET,0.0 1.999 2.505 2.877 3.183 3.447 3.686 3.902 4.265 4.432 4.596 4.787 5.019 5.142 5.381 5.624 5.84 5.935 6.122 6.301 6.553 6.719 6.88 7.11 7.327 7.531 7.729 7.914 8.153 8.38 8.598 8.871 9.134 9.382 9.669 9.991 10.294 10.615 10.942 11.304 11.682 12.086 12.544 13.006 13.527 14.052 14.639 15.271 15.959 16.715 17.461 17.778 17.745 17.56 17.292 16.99 16.687 16.392 16.136 15.864 15.586 15.319 15.077 14.837 14.583 14.344 14.103 13.891 13.699 13.497 13.291 13.115 12.915 12.701 12.532 12.352 12.167 11.98 11.781 11.638 11.484 11.227 11.051 10.876 10.783 10.588 10.38 10.149 10.017 9.781 9.599 9.458 9.303 8.952 8.76 8.522 8.246 7.938 7.538 6.99 4.668 -7 ,20751 ,TETRA ,17622026,Tue Nov 30 20:50:29 CET,Tue Nov 30 22:56:24 CET,0.0 2.205 2.715 3.105 3.426 3.699 3.93 4.145 4.53 4.7 4.862 5.062 5.299 5.426 5.68 5.923 6.145 6.246 6.437 6.628 6.902 7.076 7.232 7.445 7.658 7.853 8.034 8.21 8.434 8.65 8.856 9.102 9.336 9.56 9.819 10.118 10.397 10.689 11.011 11.352 11.698 12.082 12.526 12.971 13.5 14.063 14.703 15.399 16.108 16.837 17.56 17.904 17.908 17.744 17.49 17.188 16.895 16.598 16.314 16.029 15.776 15.518 15.252 14.996 14.747 14.522 14.285 14.056 13.848 13.62 13.384 13.191 12.981 12.759 12.591 12.421 12.245 12.065 11.876 11.736 11.58 11.329 11.156 10.976 10.884 10.687 10.471 10.237 10.106 9.877 9.683 9.524 9.357 8.992 8.778 8.546 8.295 7.992 7.598 7.01 4.419 -8 ,11342 ,TETRA ,17622027,Tue Nov 30 20:50:29 CET,Tue Nov 30 22:52:19 CET,0.0 2.102 2.654 3.038 3.338 3.604 3.849 4.067 4.433 4.606 4.771 4.972 5.209 5.341 5.595 5.826 6.046 6.151 6.354 6.54 6.794 6.959 7.116 7.334 7.538 7.75 7.959 8.148 8.377 8.599 8.813 9.066 9.309 9.54 9.813 10.126 10.417 10.746 11.1 11.452 11.82 12.235 12.7 13.18 13.7 14.224 14.822 15.457 16.163 16.917 17.582 17.898 17.914 17.757 17.534 17.262 16.974 16.686 16.431 16.146 15.861 15.614 15.389 15.167 14.955 14.75 14.53 14.324 14.134 13.931 13.713 13.529 13.338 13.128 12.957 12.787 12.613 12.431 12.228 12.083 11.935 11.704 11.543 11.364 11.266 11.059 10.832 10.584 10.455 10.228 10.032 9.877 9.708 9.316 9.098 8.858 8.591 8.292 7.93 7.412 5.464 -9 ,5048 ,TETRA ,17622028,Tue Nov 30 20:50:31 CET,Tue Nov 30 22:45:11 CET,0.0 1.695 2.157 2.53 2.858 3.147 3.399 3.616 3.991 4.16 4.318 4.517 4.762 4.906 5.159 5.382 5.605 5.712 5.898 6.069 6.317 6.48 6.638 6.858 7.073 7.279 7.477 7.667 7.893 8.106 8.319 8.572 8.809 9.041 9.31 9.62 9.923 10.239 10.573 10.936 11.302 11.688 12.142 12.595 13.091 13.636 14.265 14.945 15.674 16.413 17.135 17.48 17.454 17.252 17.01 16.744 16.456 16.157 15.849 15.537 15.273 15.019 14.763 14.505 14.261 14.035 13.793 13.567 13.355 13.137 12.919 12.74 12.554 12.363 12.213 12.044 11.865 11.672 11.457 11.309 11.163 10.929 10.76 10.586 10.49 10.284 10.063 9.822 9.689 9.452 9.244 9.092 8.929 8.555 8.342 8.112 7.852 7.555 7.189 6.668 3.86 -10 ,7807 ,TETRA ,17622029,Tue Nov 30 20:50:29 CET,Tue Nov 30 22:54:11 CET,0.0 1.839 2.393 2.81 3.126 3.396 3.641 3.867 4.26 4.433 4.598 4.8 5.037 5.166 5.406 5.627 5.836 5.934 6.121 6.306 6.564 6.729 6.889 7.111 7.322 7.522 7.717 7.907 8.149 8.384 8.617 8.89 9.148 9.393 9.664 9.966 10.263 10.596 10.952 11.323 11.694 12.103 12.577 13.043 13.575 14.13 14.706 15.295 15.982 16.741 17.433 17.738 17.702 17.559 17.334 17.036 16.754 16.477 16.212 15.946 15.695 15.453 15.216 14.986 14.77 14.565 14.348 14.152 13.978 13.793 13.574 13.379 13.182 12.972 12.807 12.639 12.473 12.284 12.076 11.933 11.781 11.526 11.347 11.166 11.073 10.88 10.666 10.426 10.3 10.08 9.904 9.754 9.592 9.225 9.018 8.792 8.522 8.204 7.828 7.288 5.703 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_57_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_57_35.txt deleted file mode 100644 index 476b6081..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_57_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3690 ,TETRA ,17622030,Tue Nov 30 20:50:28 CET,Tue Nov 30 22:54:37 CET,0.0 1.507 2.013 2.392 2.688 2.937 3.163 3.37 3.742 3.913 4.067 4.249 4.463 4.583 4.809 5.02 5.214 5.304 5.475 5.642 5.877 6.028 6.172 6.368 6.558 6.739 6.899 7.048 7.243 7.423 7.591 7.804 8.014 8.204 8.42 8.648 8.855 9.079 9.31 9.558 9.819 10.097 10.395 10.664 10.959 11.25 11.528 11.766 11.928 11.929 11.583 10.816 10.011 9.241 8.538 7.877 7.263 6.689 6.174 5.662 5.202 4.776 4.375 3.989 3.625 3.285 2.923 2.598 2.315 2.028 1.747 1.516 1.267 1.002 0.796 0.578 0.353 0.121 -0.129 -0.3 -0.476 -0.765 -0.97 -1.179 -1.289 -1.526 -1.773 -2.043 -2.192 -2.434 -2.656 -2.828 -3.007 -3.406 -3.634 -3.887 -4.177 -4.512 -4.924 -5.463 -7.634 -2 ,14693 ,TETRA ,17622031,Tue Nov 30 20:50:30 CET,Tue Nov 30 22:58:08 CET,0.0 1.586 2.092 2.459 2.742 2.982 3.2 3.405 3.766 3.927 4.081 4.272 4.485 4.601 4.818 5.023 5.22 5.313 5.487 5.65 5.877 6.019 6.157 6.355 6.542 6.717 6.888 7.052 7.259 7.448 7.618 7.822 8.018 8.202 8.404 8.619 8.821 9.045 9.26 9.481 9.718 9.964 10.231 10.464 10.701 10.957 11.248 11.491 11.63 11.618 11.203 10.374 9.572 8.834 8.14 7.445 6.793 6.22 5.706 5.164 4.709 4.309 3.932 3.574 3.229 2.898 2.535 2.211 1.931 1.647 1.363 1.132 0.885 0.622 0.408 0.186 -0.033 -0.261 -0.503 -0.675 -0.864 -1.157 -1.358 -1.573 -1.685 -1.922 -2.177 -2.463 -2.614 -2.868 -3.111 -3.298 -3.494 -3.905 -4.135 -4.39 -4.668 -4.996 -5.392 -5.904 -7.824 -3 ,3399 ,TETRA ,17622032,Tue Nov 30 20:50:32 CET,Tue Nov 30 22:46:13 CET,0.0 1.723 2.226 2.578 2.888 3.155 3.393 3.594 3.936 4.097 4.251 4.442 4.651 4.768 4.994 5.202 5.393 5.488 5.664 5.83 6.059 6.202 6.339 6.533 6.735 6.932 7.107 7.26 7.451 7.64 7.826 8.056 8.281 8.482 8.693 8.941 9.164 9.393 9.645 9.895 10.133 10.409 10.74 11.043 11.347 11.623 11.875 12.097 12.246 12.222 11.862 11.1 10.268 9.475 8.736 8.041 7.434 6.884 6.392 5.889 5.441 5.041 4.658 4.271 3.893 3.552 3.199 2.879 2.596 2.3 2.005 1.762 1.499 1.218 0.998 0.757 0.507 0.25 -0.012 -0.208 -0.419 -0.734 -0.957 -1.196 -1.319 -1.574 -1.86 -2.168 -2.323 -2.575 -2.823 -3.015 -3.225 -3.673 -3.921 -4.212 -4.556 -4.921 -5.358 -5.986 -8.126 -4 ,15147 ,TETRA ,17622033,Tue Nov 30 20:50:34 CET,Tue Nov 30 22:43:37 CET,0.0 1.54 2.012 2.387 2.693 2.944 3.18 3.39 3.735 3.889 4.035 4.217 4.441 4.563 4.784 4.989 5.18 5.269 5.443 5.607 5.838 5.986 6.129 6.323 6.509 6.684 6.847 7.01 7.218 7.404 7.578 7.788 7.982 8.156 8.347 8.562 8.764 8.981 9.206 9.421 9.638 9.865 10.116 10.365 10.615 10.849 11.106 11.348 11.494 11.455 11.132 10.393 9.592 8.834 8.109 7.396 6.772 6.208 5.707 5.2 4.73 4.314 3.936 3.573 3.223 2.897 2.57 2.268 1.988 1.694 1.386 1.124 0.857 0.583 0.37 0.154 -0.085 -0.342 -0.597 -0.776 -0.963 -1.252 -1.46 -1.678 -1.789 -2.029 -2.295 -2.572 -2.713 -2.954 -3.176 -3.347 -3.523 -3.917 -4.15 -4.414 -4.709 -5.048 -5.457 -6.011 -8.392 -5 ,11908 ,TETRA ,17622034,Tue Nov 30 20:50:31 CET,Tue Nov 30 22:56:02 CET,0.0 1.889 2.414 2.764 3.051 3.286 3.503 3.709 4.061 4.231 4.398 4.598 4.818 4.944 5.178 5.392 5.59 5.678 5.845 6.005 6.23 6.375 6.512 6.697 6.876 7.05 7.207 7.355 7.544 7.725 7.898 8.104 8.297 8.481 8.697 8.945 9.17 9.402 9.648 9.896 10.146 10.404 10.675 10.94 11.248 11.538 11.794 12.008 12.179 12.228 11.882 11.144 10.379 9.609 8.858 8.149 7.515 6.912 6.401 5.904 5.453 5.039 4.623 4.229 3.873 3.538 3.182 2.866 2.594 2.313 2.014 1.754 1.479 1.196 0.973 0.731 0.473 0.211 -0.058 -0.241 -0.423 -0.707 -0.912 -1.127 -1.239 -1.479 -1.737 -2.014 -2.155 -2.401 -2.631 -2.797 -2.98 -3.388 -3.617 -3.877 -4.174 -4.51 -4.925 -5.5 -7.474 -6 ,12722 ,TETRA ,17622035,Tue Nov 30 20:50:32 CET,Tue Nov 30 22:47:27 CET,0.0 1.477 1.987 2.368 2.676 2.935 3.16 3.364 3.724 3.885 4.038 4.224 4.44 4.566 4.783 4.977 5.162 5.251 5.422 5.584 5.813 5.959 6.103 6.318 6.513 6.683 6.845 6.995 7.171 7.344 7.51 7.708 7.9 8.076 8.277 8.5 8.701 8.918 9.146 9.37 9.592 9.826 10.094 10.359 10.626 10.888 11.144 11.351 11.495 11.481 11.124 10.342 9.448 8.627 7.937 7.293 6.728 6.204 5.733 5.244 4.795 4.4 4.007 3.619 3.276 2.966 2.644 2.354 2.104 1.847 1.569 1.33 1.075 0.808 0.599 0.378 0.155 -0.076 -0.32 -0.497 -0.689 -0.987 -1.199 -1.418 -1.534 -1.774 -2.023 -2.289 -2.428 -2.67 -2.896 -3.072 -3.257 -3.662 -3.883 -4.134 -4.414 -4.723 -5.123 -5.701 -7.556 -7 ,5550 ,TETRA ,17622036,Tue Nov 30 20:50:30 CET,Tue Nov 30 22:49:41 CET,0.0 1.844 2.319 2.672 2.953 3.213 3.458 3.663 4.004 4.162 4.321 4.515 4.729 4.852 5.08 5.286 5.483 5.577 5.755 5.924 6.162 6.317 6.46 6.652 6.834 7.003 7.167 7.33 7.534 7.715 7.887 8.094 8.283 8.458 8.666 8.895 9.114 9.36 9.607 9.858 10.117 10.395 10.682 10.948 11.226 11.503 11.813 12.08 12.231 12.205 11.762 10.884 10.059 9.307 8.612 7.937 7.319 6.773 6.293 5.779 5.332 4.914 4.503 4.129 3.781 3.458 3.124 2.832 2.577 2.306 2.026 1.791 1.54 1.278 1.079 0.866 0.641 0.412 0.157 -0.025 -0.206 -0.497 -0.702 -0.916 -1.031 -1.265 -1.508 -1.777 -1.926 -2.172 -2.394 -2.571 -2.755 -3.165 -3.39 -3.637 -3.923 -4.249 -4.648 -5.229 -7.167 -8 ,22545 ,TETRA ,17622037,Tue Nov 30 20:50:31 CET,Tue Nov 30 22:44:30 CET,0.0 1.878 2.402 2.756 3.05 3.305 3.528 3.721 4.09 4.261 4.408 4.591 4.808 4.929 5.155 5.36 5.558 5.652 5.824 5.991 6.225 6.367 6.498 6.682 6.861 7.033 7.2 7.356 7.549 7.732 7.911 8.122 8.31 8.486 8.691 8.904 9.093 9.297 9.519 9.748 9.97 10.227 10.515 10.776 11.058 11.316 11.55 11.753 11.878 11.872 11.498 10.688 9.855 9.059 8.329 7.636 7.012 6.428 5.911 5.38 4.927 4.533 4.139 3.764 3.413 3.081 2.728 2.405 2.119 1.823 1.519 1.264 1.007 0.736 0.513 0.276 0.034 -0.225 -0.494 -0.677 -0.872 -1.188 -1.418 -1.655 -1.775 -2.022 -2.282 -2.56 -2.708 -2.953 -3.189 -3.373 -3.566 -3.982 -4.214 -4.462 -4.74 -5.059 -5.464 -6.02 -8.742 -9 ,8944 ,TETRA ,17622038,Tue Nov 30 20:50:33 CET,Tue Nov 30 22:43:43 CET,0.0 1.132 1.561 1.875 2.127 2.342 2.529 2.699 3.015 3.157 3.29 3.449 3.647 3.75 3.943 4.127 4.308 4.396 4.565 4.73 4.959 5.102 5.243 5.44 5.623 5.801 5.973 6.136 6.342 6.537 6.725 6.946 7.139 7.335 7.557 7.774 7.983 8.211 8.434 8.667 8.915 9.172 9.442 9.698 9.946 10.155 10.383 10.602 10.734 10.717 10.372 9.618 8.826 8.062 7.375 6.728 6.149 5.628 5.161 4.693 4.29 3.916 3.554 3.201 2.865 2.55 2.218 1.92 1.658 1.388 1.106 0.877 0.646 0.402 0.206 0.01 -0.197 -0.411 -0.637 -0.802 -0.967 -1.214 -1.39 -1.582 -1.685 -1.895 -2.118 -2.36 -2.489 -2.723 -2.926 -3.081 -3.25 -3.645 -3.861 -4.095 -4.355 -4.646 -5.012 -5.488 -7.063 -10 ,20998 ,TETRA ,17622039,Tue Nov 30 20:50:31 CET,Tue Nov 30 22:59:02 CET,0.0 1.602 2.12 2.495 2.793 3.042 3.26 3.458 3.818 3.973 4.118 4.322 4.541 4.66 4.888 5.096 5.28 5.367 5.542 5.707 5.938 6.088 6.234 6.431 6.604 6.766 6.926 7.081 7.28 7.468 7.638 7.838 8.036 8.224 8.432 8.646 8.852 9.081 9.316 9.542 9.772 10.015 10.27 10.503 10.761 11.03 11.296 11.546 11.704 11.694 11.288 10.477 9.648 8.85 8.12 7.44 6.814 6.225 5.707 5.172 4.724 4.316 3.911 3.557 3.232 2.926 2.597 2.298 2.045 1.776 1.494 1.26 1.01 0.743 0.528 0.306 0.08 -0.147 -0.384 -0.555 -0.733 -1.005 -1.2 -1.412 -1.522 -1.755 -2.005 -2.276 -2.417 -2.657 -2.896 -3.072 -3.251 -3.651 -3.88 -4.133 -4.426 -4.76 -5.163 -5.722 -7.691 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_58.txt deleted file mode 100644 index 1fff8d19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25408 ,TETRA ,17622040,Tue Nov 30 20:50:33 CET,Tue Nov 30 22:47:40 CET,0.0 1.726 2.189 2.567 2.887 3.144 3.382 3.597 3.958 4.119 4.277 4.488 4.697 4.816 5.037 5.251 5.455 5.55 5.73 5.898 6.143 6.295 6.437 6.65 6.851 7.036 7.212 7.382 7.59 7.769 7.941 8.154 8.344 8.515 8.712 8.934 9.144 9.372 9.599 9.806 10.023 10.26 10.496 10.708 10.907 11.096 11.262 11.35 11.289 10.947 10.103 8.854 7.704 6.669 5.77 4.962 4.239 3.585 3.026 2.459 1.98 1.547 1.132 0.746 0.372 0.025 -0.341 -0.655 -0.933 -1.233 -1.541 -1.8 -2.066 -2.343 -2.566 -2.8 -3.042 -3.299 -3.571 -3.76 -3.956 -4.261 -4.475 -4.702 -4.823 -5.082 -5.365 -5.668 -5.824 -6.067 -6.301 -6.486 -6.684 -7.107 -7.339 -7.591 -7.879 -8.211 -8.595 -9.162 -10.913 -2 ,16795 ,TETRA ,17622041,Tue Nov 30 20:50:35 CET,Tue Nov 30 22:43:29 CET,0.0 1.905 2.443 2.814 3.109 3.375 3.617 3.844 4.228 4.385 4.533 4.735 4.944 5.071 5.313 5.532 5.721 5.815 5.999 6.169 6.409 6.557 6.702 6.899 7.071 7.242 7.412 7.563 7.749 7.928 8.101 8.303 8.485 8.659 8.859 9.074 9.281 9.497 9.718 9.935 10.145 10.375 10.589 10.759 10.953 11.124 11.235 11.246 11.125 10.826 10.079 8.898 7.774 6.751 5.849 5.02 4.299 3.657 3.09 2.51 2.004 1.55 1.094 0.669 0.282 -0.079 -0.454 -0.791 -1.082 -1.398 -1.733 -2.007 -2.309 -2.627 -2.872 -3.123 -3.385 -3.657 -3.935 -4.124 -4.322 -4.645 -4.868 -5.1 -5.224 -5.477 -5.742 -6.038 -6.191 -6.433 -6.685 -6.873 -7.06 -7.467 -7.703 -7.964 -8.252 -8.574 -8.941 -9.45 -11.363 -3 ,5214 ,TETRA ,17622042,Tue Nov 30 20:52:18 CET,Tue Nov 30 22:43:58 CET,0.0 1.601 2.13 2.509 2.817 3.086 3.318 3.527 3.907 4.086 4.261 4.524 4.761 4.904 5.158 5.387 5.603 5.706 5.899 6.078 6.322 6.49 6.65 6.876 7.088 7.27 7.444 7.612 7.823 8.024 8.211 8.418 8.605 8.783 8.978 9.178 9.358 9.558 9.763 9.969 10.175 10.384 10.603 10.793 10.96 11.099 11.213 11.266 11.189 10.85 10.0 8.759 7.609 6.562 5.642 4.799 4.048 3.367 2.781 2.187 1.66 1.194 0.764 0.362 -0.022 -0.382 -0.764 -1.11 -1.395 -1.687 -1.995 -2.259 -2.542 -2.828 -3.052 -3.285 -3.52 -3.768 -4.024 -4.204 -4.395 -4.701 -4.923 -5.159 -5.283 -5.538 -5.806 -6.098 -6.253 -6.506 -6.77 -6.953 -7.154 -7.605 -7.852 -8.137 -8.439 -8.769 -9.199 -9.761 -11.83 -4 ,5604 ,TETRA ,17622043,Tue Nov 30 20:51:21 CET,Tue Nov 30 22:53:52 CET,0.0 1.517 2.011 2.377 2.684 2.951 3.199 3.425 3.81 3.981 4.138 4.357 4.571 4.697 4.938 5.151 5.344 5.44 5.621 5.785 6.014 6.156 6.293 6.483 6.657 6.819 6.971 7.119 7.3 7.479 7.653 7.848 8.035 8.217 8.424 8.644 8.848 9.058 9.266 9.472 9.669 9.876 10.102 10.318 10.529 10.715 10.881 10.957 10.875 10.522 9.621 8.397 7.296 6.251 5.315 4.467 3.718 3.021 2.417 1.813 1.287 0.825 0.393 -0.019 -0.409 -0.761 -1.135 -1.478 -1.782 -2.096 -2.432 -2.725 -3.025 -3.341 -3.586 -3.836 -4.09 -4.349 -4.62 -4.8 -4.988 -5.292 -5.507 -5.742 -5.865 -6.121 -6.389 -6.665 -6.811 -7.053 -7.298 -7.489 -7.698 -8.159 -8.418 -8.699 -9.02 -9.387 -9.791 -10.334 -12.245 -5 ,24055 ,TETRA ,17622044,Tue Nov 30 20:51:21 CET,Tue Nov 30 23:04:35 CET,0.0 1.583 2.106 2.487 2.794 3.07 3.322 3.54 3.899 4.06 4.214 4.418 4.63 4.758 4.986 5.188 5.384 5.479 5.652 5.804 6.01 6.143 6.282 6.477 6.648 6.804 6.952 7.099 7.293 7.478 7.655 7.865 8.06 8.235 8.427 8.637 8.825 9.023 9.228 9.411 9.587 9.784 9.983 10.17 10.366 10.503 10.601 10.634 10.499 10.166 9.294 8.008 6.834 5.791 4.908 4.119 3.4 2.734 2.164 1.593 1.094 0.631 0.179 -0.243 -0.647 -1.022 -1.408 -1.759 -2.065 -2.384 -2.718 -2.993 -3.273 -3.553 -3.775 -4.01 -4.262 -4.526 -4.787 -4.968 -5.163 -5.47 -5.692 -5.924 -6.046 -6.311 -6.584 -6.875 -7.029 -7.286 -7.548 -7.734 -7.933 -8.378 -8.615 -8.869 -9.156 -9.48 -9.893 -10.465 -12.47 -6 ,21498 ,TETRA ,17622045,Tue Nov 30 20:51:21 CET,Tue Nov 30 23:00:13 CET,0.0 1.543 2.07 2.461 2.77 3.02 3.253 3.465 3.823 3.988 4.145 4.352 4.562 4.693 4.937 5.145 5.346 5.444 5.628 5.793 6.015 6.157 6.293 6.478 6.651 6.825 6.99 7.137 7.326 7.513 7.704 7.927 8.126 8.316 8.519 8.731 8.933 9.138 9.354 9.573 9.776 9.989 10.222 10.434 10.633 10.799 10.917 10.949 10.876 10.545 9.666 8.41 7.263 6.252 5.368 4.552 3.808 3.138 2.557 1.967 1.448 0.981 0.52 0.076 -0.329 -0.703 -1.1 -1.45 -1.747 -2.065 -2.416 -2.706 -2.994 -3.29 -3.526 -3.774 -4.028 -4.3 -4.58 -4.769 -4.971 -5.284 -5.495 -5.725 -5.844 -6.092 -6.368 -6.657 -6.808 -7.061 -7.324 -7.509 -7.708 -8.17 -8.415 -8.671 -8.975 -9.326 -9.753 -10.287 -11.779 -7 ,18991 ,TETRA ,17622046,Tue Nov 30 20:51:21 CET,Tue Nov 30 22:52:51 CET,0.0 1.597 2.149 2.552 2.87 3.149 3.401 3.624 4.03 4.214 4.375 4.58 4.804 4.938 5.178 5.408 5.62 5.715 5.89 6.053 6.282 6.43 6.574 6.778 6.969 7.14 7.298 7.455 7.647 7.82 7.988 8.193 8.384 8.562 8.745 8.951 9.176 9.416 9.631 9.821 10.016 10.218 10.442 10.647 10.844 11.027 11.161 11.201 11.106 10.779 9.933 8.692 7.525 6.456 5.541 4.733 4.019 3.353 2.774 2.192 1.674 1.203 0.75 0.318 -0.079 -0.441 -0.823 -1.167 -1.467 -1.776 -2.109 -2.403 -2.698 -2.997 -3.23 -3.474 -3.731 -4.008 -4.304 -4.505 -4.708 -5.034 -5.279 -5.533 -5.666 -5.955 -6.267 -6.598 -6.767 -7.028 -7.312 -7.525 -7.747 -8.217 -8.481 -8.755 -9.053 -9.398 -9.805 -10.366 -12.083 -8 ,22046 ,TETRA ,17622047,Tue Nov 30 20:51:22 CET,Tue Nov 30 22:50:44 CET,0.0 1.61 2.08 2.45 2.766 3.027 3.249 3.463 3.846 4.003 4.157 4.375 4.588 4.712 4.952 5.167 5.373 5.47 5.649 5.828 6.067 6.211 6.348 6.546 6.731 6.902 7.07 7.225 7.429 7.623 7.793 7.986 8.159 8.329 8.515 8.707 8.888 9.079 9.273 9.478 9.679 9.866 10.05 10.208 10.337 10.473 10.608 10.625 10.495 10.127 9.278 8.026 6.908 5.929 5.063 4.295 3.609 2.961 2.383 1.792 1.292 0.824 0.359 -0.083 -0.495 -0.857 -1.251 -1.612 -1.926 -2.257 -2.591 -2.861 -3.142 -3.443 -3.682 -3.933 -4.196 -4.475 -4.77 -4.975 -5.178 -5.505 -5.736 -5.973 -6.097 -6.339 -6.599 -6.882 -7.03 -7.278 -7.524 -7.703 -7.899 -8.326 -8.563 -8.837 -9.146 -9.478 -9.879 -10.439 -12.148 -9 ,14748 ,TETRA ,17622048,Tue Nov 30 20:52:18 CET,Tue Nov 30 22:52:35 CET,0.0 2.023 2.54 2.916 3.238 3.519 3.759 3.966 4.324 4.48 4.627 4.825 5.033 5.162 5.406 5.627 5.83 5.922 6.097 6.261 6.493 6.643 6.789 6.996 7.181 7.354 7.512 7.658 7.849 8.029 8.204 8.411 8.596 8.779 8.99 9.199 9.397 9.623 9.847 10.051 10.25 10.464 10.677 10.857 11.047 11.225 11.362 11.449 11.389 11.075 10.31 9.102 7.954 6.913 5.996 5.165 4.44 3.787 3.199 2.612 2.115 1.66 1.228 0.811 0.417 0.051 -0.35 -0.711 -1.018 -1.336 -1.662 -1.939 -2.23 -2.54 -2.784 -3.034 -3.29 -3.555 -3.842 -4.037 -4.236 -4.546 -4.752 -4.968 -5.086 -5.337 -5.607 -5.899 -6.049 -6.286 -6.53 -6.717 -6.908 -7.329 -7.575 -7.851 -8.157 -8.504 -8.909 -9.492 -11.251 -10 ,31263 ,TETRA ,17622049,Tue Nov 30 20:52:18 CET,Tue Nov 30 23:00:55 CET,0.0 2.143 2.673 3.05 3.367 3.635 3.867 4.081 4.45 4.616 4.775 4.972 5.173 5.287 5.504 5.728 5.941 6.033 6.213 6.385 6.615 6.761 6.898 7.091 7.28 7.454 7.609 7.751 7.926 8.097 8.26 8.457 8.64 8.8 8.976 9.18 9.363 9.542 9.735 9.928 10.112 10.318 10.541 10.734 10.935 11.105 11.211 11.24 11.131 10.79 9.983 8.749 7.585 6.556 5.61 4.746 4.008 3.33 2.724 2.106 1.591 1.139 0.697 0.274 -0.12 -0.48 -0.863 -1.208 -1.512 -1.823 -2.146 -2.423 -2.716 -3.019 -3.251 -3.489 -3.736 -3.993 -4.265 -4.459 -4.664 -4.982 -5.207 -5.445 -5.566 -5.815 -6.086 -6.382 -6.542 -6.794 -7.047 -7.231 -7.422 -7.855 -8.095 -8.348 -8.636 -8.993 -9.457 -10.045 -12.464 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_62.txt deleted file mode 100644 index 167c4ec8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6046 ,TETRA ,17622050,Tue Nov 30 20:52:18 CET,Tue Nov 30 22:49:22 CET,0.0 1.499 2.013 2.385 2.686 2.953 3.191 3.396 3.757 3.93 4.095 4.306 4.52 4.647 4.88 5.102 5.303 5.391 5.565 5.74 5.982 6.138 6.293 6.503 6.691 6.867 7.039 7.203 7.4 7.587 7.765 7.982 8.19 8.379 8.593 8.838 9.078 9.333 9.592 9.86 10.127 10.416 10.72 11.011 11.33 11.63 11.917 12.181 12.395 12.421 12.148 11.551 10.847 10.142 9.48 8.835 8.227 7.673 7.179 6.678 6.236 5.835 5.439 5.043 4.669 4.329 3.989 3.681 3.393 3.083 2.765 2.503 2.233 1.95 1.724 1.475 1.212 0.947 0.669 0.469 0.269 -0.034 -0.26 -0.505 -0.629 -0.873 -1.141 -1.46 -1.627 -1.875 -2.161 -2.358 -2.56 -3.038 -3.314 -3.612 -3.952 -4.35 -4.828 -5.475 -7.351 -2 ,15136 ,TETRA ,17622051,Tue Nov 30 20:52:19 CET,Tue Nov 30 22:50:06 CET,0.0 1.669 2.178 2.561 2.86 3.132 3.383 3.605 3.986 4.154 4.312 4.521 4.739 4.87 5.114 5.355 5.573 5.671 5.859 6.039 6.295 6.453 6.606 6.83 7.035 7.218 7.398 7.574 7.793 7.997 8.176 8.393 8.601 8.792 9.018 9.273 9.51 9.764 10.039 10.315 10.595 10.896 11.217 11.524 11.873 12.22 12.518 12.779 13.03 13.101 12.822 12.205 11.491 10.801 10.144 9.511 8.947 8.418 7.938 7.442 6.988 6.562 6.153 5.762 5.399 5.069 4.715 4.381 4.092 3.797 3.471 3.189 2.895 2.586 2.337 2.089 1.842 1.582 1.311 1.117 0.915 0.593 0.362 0.117 -0.006 -0.275 -0.564 -0.856 -1.014 -1.27 -1.56 -1.756 -1.957 -2.421 -2.699 -2.998 -3.309 -3.681 -4.133 -4.731 -6.599 -3 ,21120 ,TETRA ,17622052,Tue Nov 30 20:52:21 CET,Tue Nov 30 22:50:24 CET,0.0 2.188 2.673 3.05 3.358 3.627 3.875 4.102 4.503 4.672 4.828 5.041 5.257 5.385 5.628 5.854 6.065 6.165 6.352 6.533 6.791 6.951 7.104 7.326 7.535 7.739 7.933 8.116 8.359 8.593 8.804 9.048 9.284 9.496 9.735 9.998 10.228 10.471 10.731 11.001 11.266 11.548 11.851 12.122 12.442 12.762 13.07 13.382 13.638 13.757 13.537 12.901 12.212 11.47 10.71 10.014 9.444 8.92 8.427 7.92 7.468 7.061 6.673 6.287 5.931 5.603 5.249 4.929 4.648 4.359 4.037 3.758 3.469 3.165 2.933 2.687 2.435 2.18 1.918 1.732 1.53 1.203 0.977 0.742 0.624 0.386 0.122 -0.165 -0.322 -0.571 -0.848 -1.044 -1.253 -1.734 -2.007 -2.301 -2.64 -3.014 -3.455 -4.091 -6.473 -4 ,5011 ,TETRA ,17622053,Tue Nov 30 20:52:19 CET,Tue Nov 30 22:52:40 CET,0.0 1.627 2.155 2.562 2.884 3.162 3.415 3.634 4.018 4.191 4.352 4.575 4.789 4.923 5.202 5.458 5.684 5.789 5.994 6.192 6.459 6.633 6.807 7.047 7.277 7.494 7.699 7.885 8.114 8.338 8.544 8.796 9.037 9.251 9.499 9.773 10.011 10.263 10.527 10.796 11.068 11.375 11.72 12.029 12.363 12.71 13.046 13.337 13.53 13.577 13.301 12.595 11.829 11.095 10.43 9.822 9.239 8.67 8.175 7.67 7.209 6.799 6.399 6.011 5.672 5.367 5.037 4.721 4.437 4.16 3.89 3.666 3.418 3.142 2.927 2.705 2.471 2.225 1.97 1.8 1.627 1.345 1.14 0.92 0.801 0.554 0.286 -0.001 -0.151 -0.387 -0.634 -0.827 -1.042 -1.514 -1.767 -2.048 -2.367 -2.737 -3.19 -3.837 -6.095 -5 ,14572 ,TETRA ,17622054,Tue Nov 30 20:53:21 CET,Tue Nov 30 22:44:43 CET,0.0 1.401 1.893 2.253 2.555 2.828 3.078 3.308 3.713 3.882 4.038 4.238 4.446 4.576 4.831 5.061 5.278 5.379 5.573 5.76 6.014 6.166 6.313 6.526 6.729 6.916 7.084 7.243 7.451 7.651 7.84 8.069 8.288 8.484 8.699 8.943 9.172 9.412 9.665 9.921 10.167 10.453 10.778 11.059 11.368 11.706 12.064 12.39 12.642 12.748 12.515 11.844 11.116 10.425 9.759 9.103 8.506 7.959 7.481 6.999 6.549 6.134 5.731 5.343 4.969 4.618 4.242 3.909 3.625 3.329 3.021 2.762 2.483 2.19 1.962 1.726 1.485 1.232 0.952 0.762 0.575 0.27 0.046 -0.192 -0.318 -0.58 -0.848 -1.143 -1.301 -1.545 -1.82 -2.019 -2.234 -2.703 -2.956 -3.238 -3.55 -3.904 -4.375 -5.025 -7.39 -6 ,15696 ,TETRA ,17622055,Tue Nov 30 20:53:21 CET,Tue Nov 30 22:57:02 CET,0.0 1.444 1.964 2.353 2.665 2.945 3.197 3.414 3.798 3.974 4.136 4.346 4.565 4.702 4.958 5.187 5.388 5.49 5.684 5.866 6.135 6.294 6.44 6.654 6.851 7.035 7.214 7.385 7.607 7.83 8.036 8.276 8.508 8.721 8.965 9.223 9.465 9.729 9.994 10.264 10.548 10.855 11.187 11.497 11.812 12.136 12.482 12.78 12.986 13.076 12.85 12.146 11.368 10.625 9.96 9.328 8.763 8.233 7.743 7.241 6.792 6.386 6.008 5.632 5.279 4.956 4.595 4.267 4.0 3.736 3.44 3.187 2.933 2.665 2.448 2.22 1.991 1.752 1.495 1.306 1.106 0.785 0.553 0.315 0.192 -0.064 -0.344 -0.666 -0.835 -1.088 -1.374 -1.581 -1.792 -2.245 -2.513 -2.811 -3.12 -3.475 -3.925 -4.6 -6.47 -7 ,21801 ,TETRA ,17622056,Tue Nov 30 20:53:22 CET,Tue Nov 30 22:46:07 CET,0.0 1.341 1.861 2.24 2.553 2.83 3.081 3.304 3.701 3.876 4.033 4.239 4.455 4.582 4.826 5.069 5.287 5.385 5.574 5.753 6.001 6.158 6.309 6.523 6.721 6.91 7.085 7.259 7.484 7.693 7.89 8.11 8.315 8.513 8.745 9.004 9.24 9.506 9.791 10.067 10.334 10.625 10.96 11.268 11.586 11.88 12.171 12.459 12.674 12.76 12.569 11.959 11.243 10.493 9.8 9.151 8.544 7.993 7.507 6.983 6.513 6.096 5.703 5.323 4.95 4.604 4.247 3.915 3.625 3.326 2.994 2.715 2.434 2.141 1.897 1.649 1.404 1.142 0.862 0.67 0.468 0.144 -0.082 -0.315 -0.435 -0.686 -0.953 -1.261 -1.429 -1.678 -1.963 -2.168 -2.382 -2.836 -3.076 -3.347 -3.659 -4.036 -4.485 -5.084 -6.886 -8 ,2529 ,TETRA ,17622057,Tue Nov 30 20:53:22 CET,Tue Nov 30 22:44:52 CET,0.0 1.297 1.785 2.165 2.483 2.759 3.001 3.228 3.625 3.8 3.964 4.178 4.396 4.532 4.778 4.997 5.21 5.311 5.501 5.683 5.945 6.112 6.268 6.486 6.696 6.896 7.079 7.247 7.47 7.674 7.852 8.069 8.286 8.486 8.701 8.931 9.146 9.389 9.634 9.874 10.117 10.381 10.666 10.913 11.197 11.488 11.735 11.953 12.155 12.205 11.905 11.314 10.668 9.948 9.212 8.555 7.979 7.427 6.916 6.381 5.919 5.504 5.104 4.715 4.339 4.0 3.654 3.354 3.102 2.836 2.556 2.317 2.066 1.794 1.57 1.34 1.103 0.847 0.58 0.395 0.195 -0.121 -0.346 -0.586 -0.712 -0.975 -1.259 -1.558 -1.711 -1.963 -2.274 -2.473 -2.67 -3.108 -3.373 -3.665 -3.972 -4.335 -4.786 -5.39 -7.03 -9 ,26927 ,TETRA ,17622058,Tue Nov 30 20:53:25 CET,Tue Nov 30 22:44:36 CET,0.0 1.55 2.062 2.421 2.718 2.98 3.22 3.443 3.83 3.999 4.155 4.357 4.567 4.695 4.935 5.153 5.348 5.438 5.611 5.778 6.028 6.187 6.33 6.525 6.717 6.895 7.065 7.231 7.435 7.626 7.816 8.052 8.267 8.461 8.693 8.957 9.204 9.461 9.718 9.979 10.253 10.557 10.882 11.194 11.492 11.774 12.096 12.385 12.607 12.665 12.337 11.584 10.767 9.986 9.3 8.659 8.084 7.562 7.091 6.59 6.126 5.704 5.302 4.932 4.591 4.267 3.937 3.648 3.387 3.115 2.823 2.571 2.321 2.059 1.854 1.645 1.41 1.145 0.876 0.697 0.51 0.214 -0.006 -0.242 -0.36 -0.601 -0.861 -1.151 -1.305 -1.555 -1.823 -2.008 -2.207 -2.669 -2.92 -3.185 -3.501 -3.869 -4.291 -4.929 -6.91 -10 ,7788 ,TETRA ,17622059,Tue Nov 30 20:54:23 CET,Tue Nov 30 22:45:12 CET,0.0 1.596 2.08 2.445 2.74 2.99 3.218 3.427 3.813 3.987 4.146 4.363 4.578 4.71 4.965 5.2 5.411 5.512 5.707 5.885 6.138 6.299 6.451 6.664 6.866 7.052 7.228 7.395 7.61 7.825 8.039 8.285 8.508 8.724 8.975 9.244 9.492 9.763 10.05 10.35 10.648 10.967 11.307 11.593 11.918 12.259 12.561 12.856 13.124 13.24 13.018 12.348 11.629 10.932 10.274 9.637 9.063 8.531 8.031 7.517 7.073 6.663 6.262 5.878 5.512 5.167 4.805 4.489 4.21 3.912 3.603 3.35 3.085 2.797 2.563 2.309 2.044 1.771 1.486 1.296 1.107 0.795 0.569 0.334 0.206 -0.063 -0.342 -0.637 -0.792 -1.036 -1.324 -1.52 -1.726 -2.229 -2.505 -2.8 -3.159 -3.55 -3.983 -4.589 -6.95 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_58.txt deleted file mode 100644 index d513b58e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2205 ,TETRA ,17622060,Tue Nov 30 20:54:23 CET,Tue Nov 30 22:48:03 CET,0.0 1.649 2.177 2.57 2.892 3.162 3.399 3.61 3.99 4.173 4.344 4.567 4.798 4.932 5.175 5.395 5.62 5.731 5.931 6.123 6.403 6.575 6.739 6.982 7.21 7.424 7.634 7.838 8.095 8.343 8.583 8.866 9.139 9.398 9.68 9.984 10.256 10.549 10.878 11.226 11.58 11.971 12.408 12.814 13.265 13.751 14.285 14.813 15.376 15.935 16.337 16.334 16.078 15.727 15.345 14.943 14.55 14.164 13.804 13.435 13.108 12.794 12.486 12.176 11.865 11.564 11.23 10.932 10.679 10.414 10.134 9.885 9.617 9.341 9.129 8.917 8.679 8.427 8.176 7.992 7.801 7.528 7.329 7.111 6.998 6.741 6.417 6.054 5.874 5.604 5.262 5.005 4.741 4.167 3.826 3.471 3.109 2.665 2.047 1.148 -3.145 -2 ,18172 ,TETRA ,17622061,Tue Nov 30 20:54:25 CET,Tue Nov 30 22:46:43 CET,0.0 2.3 3.012 3.521 3.958 4.327 4.629 4.885 5.341 5.551 5.746 6.009 6.253 6.408 6.708 6.983 7.264 7.4 7.633 7.85 8.153 8.341 8.516 8.764 9.011 9.241 9.462 9.677 9.948 10.207 10.446 10.724 10.988 11.229 11.499 11.807 12.101 12.416 12.75 13.113 13.465 13.84 14.277 14.706 15.191 15.674 16.187 16.726 17.284 17.819 18.194 18.152 17.857 17.477 17.079 16.664 16.262 15.874 15.508 15.128 14.771 14.426 14.104 13.794 13.491 13.199 12.867 12.565 12.324 12.057 11.768 11.536 11.287 11.007 10.785 10.555 10.304 10.043 9.784 9.609 9.413 9.106 8.891 8.661 8.538 8.267 7.98 7.647 7.444 7.132 6.728 6.469 6.205 5.634 5.29 4.887 4.466 3.989 3.339 2.459 -1.385 -3 ,1201 ,TETRA ,17622062,Tue Nov 30 20:54:25 CET,Tue Nov 30 22:46:15 CET,0.0 2.376 3.075 3.565 3.974 4.321 4.625 4.91 5.429 5.659 5.874 6.176 6.442 6.624 6.945 7.19 7.404 7.509 7.71 7.899 8.163 8.326 8.484 8.709 8.924 9.125 9.318 9.506 9.751 9.991 10.23 10.513 10.761 11.004 11.296 11.601 11.879 12.178 12.505 12.836 13.164 13.522 13.908 14.292 14.756 15.251 15.771 16.29 16.816 17.348 17.756 17.735 17.447 17.05 16.631 16.214 15.834 15.441 15.061 14.668 14.319 13.997 13.671 13.362 13.064 12.776 12.46 12.16 11.899 11.624 11.337 11.114 10.87 10.601 10.389 10.162 9.925 9.665 9.4 9.219 9.02 8.688 8.46 8.239 8.106 7.785 7.442 7.057 6.848 6.552 6.189 5.936 5.662 5.078 4.75 4.361 3.907 3.396 2.807 2.022 -1.881 -4 ,28512 ,TETRA ,17622063,Tue Nov 30 20:54:25 CET,Tue Nov 30 22:48:30 CET,0.0 2.118 2.668 3.064 3.401 3.68 3.917 4.152 4.565 4.731 4.89 5.111 5.344 5.481 5.731 5.968 6.19 6.298 6.517 6.732 7.026 7.202 7.377 7.632 7.87 8.101 8.322 8.525 8.777 9.011 9.225 9.481 9.728 9.969 10.25 10.553 10.843 11.164 11.515 11.872 12.215 12.592 13.02 13.426 13.9 14.413 14.945 15.497 16.081 16.626 17.026 17.049 16.765 16.364 15.956 15.552 15.168 14.778 14.406 14.004 13.65 13.331 12.998 12.67 12.359 12.065 11.769 11.493 11.239 10.966 10.669 10.418 10.155 9.879 9.662 9.439 9.199 8.946 8.688 8.501 8.304 7.985 7.752 7.502 7.366 7.086 6.803 6.47 6.274 5.973 5.575 5.31 5.031 4.433 4.094 3.717 3.309 2.806 2.166 1.354 -0.769 -5 ,18416 ,TETRA ,17622064,Tue Nov 30 20:54:25 CET,Tue Nov 30 22:54:25 CET,0.0 2.783 3.545 4.073 4.513 4.868 5.18 5.475 6.012 6.253 6.473 6.798 7.08 7.263 7.607 7.924 8.199 8.321 8.58 8.85 9.214 9.449 9.66 9.919 10.157 10.391 10.645 10.889 11.174 11.439 11.674 11.949 12.22 12.468 12.743 13.053 13.345 13.664 13.998 14.343 14.705 15.095 15.526 15.933 16.405 16.917 17.442 17.966 18.571 19.167 19.525 19.479 19.154 18.714 18.28 17.832 17.406 17.013 16.629 16.182 15.793 15.43 15.068 14.728 14.39 14.073 13.732 13.433 13.16 12.847 12.532 12.268 12.001 11.713 11.471 11.235 10.981 10.7 10.409 10.185 9.95 9.586 9.323 9.053 8.914 8.623 8.288 7.92 7.734 7.453 7.126 6.905 6.659 6.116 5.803 5.419 4.951 4.4 3.739 2.866 -0.58 -6 ,12408 ,TETRA ,17622065,Tue Nov 30 20:56:23 CET,Tue Nov 30 22:52:40 CET,0.0 2.345 3.029 3.518 3.922 4.271 4.594 4.904 5.448 5.682 5.897 6.18 6.436 6.608 6.957 7.28 7.593 7.737 7.981 8.191 8.488 8.683 8.88 9.166 9.466 9.79 10.09 10.336 10.657 10.998 11.315 11.7 12.046 12.34 12.7 13.078 13.379 13.698 14.055 14.429 14.788 15.18 15.64 16.122 16.655 17.159 17.675 18.244 18.821 19.322 19.656 19.616 19.316 18.891 18.446 17.993 17.51 17.02 16.613 16.194 15.803 15.454 15.108 14.754 14.416 14.103 13.761 13.445 13.17 12.883 12.582 12.318 12.011 11.684 11.437 11.18 10.91 10.624 10.333 10.131 9.917 9.579 9.34 9.079 8.935 8.61 8.245 7.852 7.641 7.327 6.958 6.721 6.461 5.882 5.551 5.191 4.805 4.328 3.685 2.844 -0.053 -7 ,6996 ,TETRA ,17622066,Tue Nov 30 20:55:24 CET,Tue Nov 30 22:50:37 CET,0.0 1.963 2.463 2.847 3.161 3.429 3.666 3.878 4.255 4.435 4.611 4.827 5.055 5.21 5.534 5.832 6.1 6.227 6.449 6.635 6.899 7.063 7.215 7.434 7.639 7.839 8.035 8.222 8.468 8.689 8.894 9.139 9.377 9.619 9.885 10.172 10.445 10.741 11.052 11.385 11.735 12.121 12.554 12.978 13.443 13.923 14.417 14.918 15.488 16.069 16.534 16.593 16.348 15.987 15.597 15.237 14.888 14.521 14.213 13.844 13.489 13.179 12.863 12.554 12.279 12.009 11.706 11.448 11.211 10.962 10.716 10.502 10.269 10.018 9.812 9.592 9.377 9.158 8.928 8.764 8.572 8.247 8.032 7.822 7.71 7.469 7.214 6.941 6.785 6.53 6.27 6.073 5.866 5.406 5.137 4.826 4.464 4.0 3.394 2.572 -1.004 -8 ,19750 ,TETRA ,17622067,Tue Nov 30 20:55:23 CET,Tue Nov 30 22:36:48 CET,0.0 2.35 3.009 3.575 4.043 4.414 4.764 5.083 5.617 5.836 6.036 6.337 6.616 6.808 7.165 7.492 7.775 7.896 8.12 8.332 8.68 8.924 9.154 9.49 9.814 10.116 10.375 10.593 10.85 11.099 11.337 11.616 11.88 12.126 12.399 12.727 13.051 13.374 13.715 14.077 14.437 14.816 15.229 15.621 16.045 16.494 17.005 17.532 18.085 18.679 19.165 19.287 19.095 18.714 18.334 17.987 17.618 17.183 16.797 16.423 16.081 15.747 15.388 15.041 14.731 14.446 14.138 13.837 13.564 13.274 12.962 12.721 12.463 12.168 11.896 11.584 11.299 11.031 10.713 10.447 10.168 9.763 9.464 9.138 8.97 8.629 8.265 7.88 7.677 7.368 6.969 6.707 6.444 5.862 5.518 5.121 4.701 4.219 3.545 2.639 -0.24 -9 ,20235 ,TETRA ,17622068,Tue Nov 30 20:55:24 CET,Tue Nov 30 22:49:11 CET,0.0 2.12 2.735 3.2 3.586 3.914 4.217 4.502 5.017 5.245 5.456 5.752 6.028 6.207 6.507 6.747 6.968 7.075 7.291 7.498 7.785 7.962 8.135 8.382 8.604 8.816 9.012 9.204 9.462 9.704 9.941 10.22 10.476 10.723 11.026 11.367 11.67 11.992 12.34 12.683 13.032 13.426 13.865 14.304 14.792 15.3 15.841 16.582 17.446 18.034 18.331 18.115 17.541 16.823 16.07 15.327 14.745 14.293 13.912 13.513 13.137 12.8 12.459 12.137 11.829 11.518 11.191 10.9 10.655 10.394 10.099 9.84 9.579 9.307 9.08 8.836 8.584 8.318 8.037 7.828 7.603 7.259 7.023 6.782 6.649 6.339 5.979 5.567 5.343 5.031 4.636 4.372 4.1 3.51 3.149 2.74 2.295 1.785 1.181 0.328 -3.924 -10 ,811 ,TETRA ,17622069,Tue Nov 30 20:55:25 CET,Tue Nov 30 22:48:58 CET,0.0 2.413 3.159 3.691 4.114 4.471 4.795 5.098 5.637 5.872 6.092 6.414 6.69 6.862 7.169 7.437 7.674 7.788 8.01 8.224 8.525 8.714 8.897 9.162 9.419 9.656 9.878 10.092 10.371 10.634 10.871 11.15 11.421 11.671 11.951 12.259 12.549 12.872 13.221 13.57 13.915 14.285 14.707 15.11 15.571 16.072 16.568 17.07 17.638 18.19 18.532 18.459 18.154 17.801 17.377 16.943 16.541 16.13 15.744 15.324 14.96 14.639 14.301 13.964 13.643 13.34 13.029 12.736 12.476 12.202 11.916 11.681 11.409 11.094 10.853 10.612 10.357 10.081 9.776 9.558 9.333 8.994 8.755 8.493 8.36 8.101 7.816 7.502 7.334 7.066 6.748 6.499 6.232 5.674 5.349 4.964 4.517 4.04 3.454 2.561 -0.601 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_59.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_59.txt deleted file mode 100644 index 067f5acf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_59.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,362 ,TETRA ,17622070,Tue Nov 30 20:55:25 CET,Tue Nov 30 22:49:23 CET,0.0 1.761 2.386 2.825 3.201 3.525 3.811 4.054 4.476 4.679 4.875 5.15 5.412 5.575 5.888 6.191 6.48 6.612 6.856 7.085 7.409 7.617 7.82 8.107 8.369 8.62 8.869 9.106 9.412 9.713 10.0 10.345 10.676 10.999 11.367 11.768 12.158 12.589 13.05 13.52 14.009 14.57 15.234 15.909 16.649 17.432 18.332 19.333 20.461 21.767 23.345 24.434 24.875 25.034 25.049 24.987 24.848 24.693 24.51 24.295 24.074 23.838 23.606 23.36 23.126 22.906 22.651 22.4 22.176 21.945 21.694 21.485 21.261 21.025 20.836 20.632 20.415 20.181 19.924 19.746 19.57 19.277 19.068 18.849 18.733 18.485 18.215 17.892 17.709 17.433 17.071 16.851 16.611 16.047 15.728 15.373 14.913 14.384 13.758 12.882 9.224 -2 ,30566 ,TETRA ,17622071,Tue Nov 30 20:55:24 CET,Tue Nov 30 22:50:27 CET,0.0 2.192 2.954 3.546 4.018 4.431 4.795 5.119 5.674 5.933 6.18 6.529 6.826 7.03 7.442 7.826 8.177 8.345 8.654 8.923 9.288 9.511 9.734 10.057 10.345 10.614 10.885 11.146 11.461 11.764 12.063 12.416 12.755 13.085 13.463 13.873 14.25 14.67 15.129 15.603 16.11 16.686 17.339 17.991 18.736 19.579 20.705 22.015 23.389 24.947 26.554 27.353 27.449 27.24 26.926 26.579 26.174 25.736 25.334 24.926 24.644 24.445 24.227 24.004 23.765 23.533 23.307 23.084 22.867 22.633 22.366 22.142 21.9 21.62 21.398 21.167 20.904 20.617 20.326 20.116 19.9 19.576 19.338 19.063 18.921 18.634 18.29 17.896 17.686 17.388 17.02 16.777 16.527 15.962 15.624 15.264 14.857 14.346 13.727 12.85 9.279 -3 ,26810 ,TETRA ,17622072,Tue Nov 30 20:56:22 CET,Tue Nov 30 22:48:19 CET,0.0 2.277 2.865 3.287 3.653 3.971 4.249 4.501 4.961 5.174 5.379 5.658 5.911 6.066 6.364 6.643 6.902 7.026 7.266 7.492 7.813 8.014 8.212 8.502 8.776 9.028 9.27 9.506 9.799 10.087 10.36 10.687 10.997 11.294 11.648 12.051 12.434 12.835 13.263 13.722 14.209 14.766 15.42 16.058 16.774 17.555 18.461 19.508 20.675 21.956 23.423 24.469 24.936 25.14 25.127 24.999 24.861 24.691 24.5 24.286 24.072 23.821 23.567 23.335 23.089 22.857 22.619 22.388 22.167 21.876 21.528 21.27 21.035 20.799 20.62 20.427 20.209 19.974 19.721 19.524 19.284 18.879 18.581 18.25 18.083 17.758 17.435 17.103 16.905 16.607 16.219 15.96 15.684 15.035 14.666 14.3 13.879 13.341 12.701 11.735 6.486 -4 ,7587 ,TETRA ,17622073,Tue Nov 30 20:56:23 CET,Tue Nov 30 22:50:09 CET,0.0 1.914 2.557 3.036 3.47 3.86 4.194 4.516 5.085 5.331 5.573 5.938 6.238 6.443 6.814 7.166 7.493 7.636 7.907 8.166 8.527 8.753 8.995 9.371 9.735 10.094 10.436 10.725 11.053 11.365 11.655 12.019 12.375 12.709 13.087 13.498 13.892 14.333 14.804 15.3 15.821 16.396 17.044 17.695 18.427 19.23 20.174 21.196 22.375 23.728 25.189 26.205 26.625 26.746 26.701 26.587 26.383 26.098 25.872 25.616 25.357 25.101 24.836 24.576 24.327 24.094 23.849 23.618 23.409 23.189 22.941 22.716 22.486 22.246 22.036 21.81 21.575 21.317 21.043 20.854 20.659 20.341 20.116 19.854 19.696 19.357 19.0 18.606 18.396 18.093 17.706 17.458 17.209 16.677 16.376 16.045 15.631 15.141 14.573 13.78 10.79 -5 ,4690 ,TETRA ,17622074,Tue Nov 30 20:56:23 CET,Tue Nov 30 22:51:08 CET,0.0 2.128 2.709 3.167 3.564 3.9 4.191 4.45 4.9 5.094 5.275 5.525 5.775 5.928 6.228 6.51 6.771 6.898 7.149 7.396 7.738 7.948 8.15 8.443 8.717 8.981 9.231 9.469 9.78 10.077 10.359 10.696 11.026 11.351 11.714 12.12 12.513 12.934 13.384 13.854 14.346 14.899 15.525 16.152 16.887 17.714 18.648 19.658 20.832 22.201 23.714 24.757 25.22 25.371 25.37 25.247 25.081 24.933 24.737 24.49 24.288 24.092 23.879 23.658 23.456 23.256 23.013 22.793 22.604 22.408 22.193 21.979 21.752 21.531 21.345 21.135 20.927 20.714 20.469 20.296 20.121 19.831 19.613 19.365 19.233 18.965 18.678 18.374 18.211 17.957 17.621 17.388 17.156 16.615 16.292 15.935 15.509 15.026 14.427 13.468 9.187 -6 ,7563 ,TETRA ,17622075,Tue Nov 30 20:57:20 CET,Tue Nov 30 22:43:31 CET,0.0 3.165 3.949 4.483 4.908 5.274 5.598 5.874 6.339 6.552 6.738 6.993 7.248 7.399 7.686 7.962 8.226 8.355 8.598 8.823 9.157 9.366 9.558 9.835 10.1 10.346 10.589 10.832 11.142 11.438 11.712 12.026 12.329 12.628 12.981 13.375 13.741 14.149 14.595 15.074 15.586 16.155 16.811 17.468 18.207 19.02 19.935 20.941 22.109 23.466 24.985 26.047 26.555 26.742 26.772 26.691 26.505 26.27 26.044 25.798 25.555 25.312 25.061 24.809 24.551 24.308 24.053 23.819 23.606 23.376 23.134 22.925 22.68 22.421 22.225 22.01 21.782 21.534 21.263 21.062 20.856 20.503 20.244 19.995 19.866 19.603 19.328 19.028 18.867 18.619 18.319 18.109 17.88 17.327 16.985 16.589 16.131 15.618 14.964 14.054 8.886 -7 ,17938 ,TETRA ,17622076,Tue Nov 30 20:56:23 CET,Tue Nov 30 22:52:26 CET,0.0 2.569 3.252 3.774 4.22 4.603 4.937 5.25 5.83 6.088 6.316 6.646 6.934 7.138 7.515 7.86 8.199 8.352 8.632 8.892 9.243 9.469 9.687 9.997 10.3 10.585 10.861 11.151 11.519 11.851 12.165 12.535 12.891 13.255 13.652 14.058 14.472 14.986 15.593 16.187 16.728 17.295 17.952 18.594 19.299 20.093 21.028 22.061 23.234 24.56 26.021 27.055 27.517 27.666 27.628 27.463 27.241 27.015 26.765 26.489 26.239 25.957 25.671 25.4 25.12 24.85 24.58 24.332 24.104 23.852 23.586 23.346 23.068 22.783 22.563 22.332 22.084 21.814 21.537 21.348 21.145 20.819 20.597 20.362 20.236 19.972 19.676 19.349 19.162 18.889 18.592 18.385 18.149 17.602 17.287 16.945 16.553 16.104 15.524 14.581 11.164 -8 ,26261 ,TETRA ,17622077,Tue Nov 30 20:56:24 CET,Tue Nov 30 22:51:15 CET,0.0 2.253 2.999 3.546 3.951 4.286 4.566 4.818 5.277 5.476 5.659 5.915 6.168 6.332 6.641 6.921 7.193 7.321 7.563 7.8 8.148 8.361 8.557 8.849 9.115 9.364 9.619 9.871 10.184 10.473 10.749 11.078 11.396 11.707 12.075 12.503 12.909 13.329 13.787 14.28 14.793 15.367 16.029 16.689 17.455 18.293 19.236 20.303 21.489 22.831 24.366 25.435 25.894 26.037 26.026 25.923 25.77 25.583 25.37 25.127 24.882 24.627 24.399 24.169 23.917 23.666 23.401 23.161 22.939 22.706 22.463 22.247 22.015 21.781 21.594 21.391 21.182 20.957 20.708 20.53 20.343 20.04 19.822 19.567 19.423 19.147 18.872 18.55 18.383 18.137 17.854 17.654 17.42 16.851 16.505 16.13 15.674 15.125 14.418 13.411 8.524 -9 ,22889 ,TETRA ,17622078,Tue Nov 30 20:56:25 CET,Tue Nov 30 22:53:03 CET,0.0 2.483 3.162 3.692 4.142 4.499 4.806 5.108 5.652 5.895 6.122 6.42 6.673 6.833 7.141 7.418 7.663 7.78 8.014 8.236 8.555 8.756 8.955 9.258 9.538 9.796 10.042 10.269 10.567 10.863 11.143 11.503 11.853 12.168 12.528 12.918 13.295 13.715 14.154 14.625 15.121 15.68 16.318 16.932 17.637 18.433 19.348 20.345 21.469 22.793 24.218 25.005 25.392 25.572 25.599 25.531 25.383 25.21 25.029 24.819 24.634 24.468 24.283 24.08 23.882 23.686 23.452 23.236 23.048 22.834 22.596 22.399 22.185 21.957 21.749 21.494 21.205 20.908 20.605 20.388 20.157 19.762 19.509 19.275 19.151 18.895 18.586 18.243 18.083 17.856 17.536 17.288 17.032 16.451 16.11 15.717 15.29 14.774 14.16 13.368 9.585 -10 ,11495 ,TETRA ,17622079,Tue Nov 30 20:56:24 CET,Tue Nov 30 22:51:53 CET,0.0 2.784 3.363 3.792 4.149 4.459 4.741 4.994 5.463 5.67 5.864 6.125 6.38 6.542 6.848 7.151 7.432 7.559 7.804 8.041 8.386 8.597 8.797 9.084 9.364 9.63 9.869 10.105 10.421 10.752 11.073 11.428 11.764 12.083 12.437 12.837 13.229 13.653 14.1 14.588 15.099 15.655 16.3 16.95 17.712 18.549 19.472 20.513 21.729 23.066 24.548 25.627 26.098 26.224 26.244 26.173 26.028 25.869 25.688 25.473 25.226 24.969 24.726 24.472 24.214 23.979 23.724 23.495 23.278 23.027 22.747 22.507 22.261 22.019 21.839 21.643 21.435 21.212 20.95 20.752 20.533 20.172 19.932 19.669 19.516 19.2 18.881 18.56 18.396 18.145 17.825 17.601 17.348 16.723 16.356 15.951 15.479 14.945 14.331 13.344 8.929 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_33.txt deleted file mode 100644 index 45b7ee14..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13246 ,KEBNE ,17028037,Wed Dec 22 18:52:42 CET,Wed Dec 22 20:28:22 CET,0.0 2.451 3.27 3.881 4.363 4.778 5.147 5.495 6.144 6.424 6.686 7.101 7.419 7.646 8.068 8.474 8.867 9.054 9.397 9.722 10.211 10.531 10.844 11.302 11.742 12.178 12.598 12.997 13.514 14.024 14.526 15.138 15.733 16.314 17.0 17.773 18.534 19.373 20.27 21.238 22.286 23.48 24.891 26.37 28.13 30.15 32.612 35.507 39.037 43.431 49.103 54.16 57.351 59.503 61.014 62.136 62.957 63.57 64.017 64.394 64.658 64.87 65.028 65.133 65.213 65.252 65.261 65.246 65.22 65.192 65.149 65.097 65.035 64.945 64.845 64.739 64.636 64.527 64.399 64.296 64.185 64.008 63.871 63.705 63.616 63.425 63.209 62.972 62.851 62.692 62.405 62.242 62.053 61.619 61.347 61.02 60.642 60.218 59.682 58.859 56.058 -2 ,10156 ,KEBNE ,17028038,Wed Dec 22 18:52:42 CET,Wed Dec 22 20:27:57 CET,0.0 2.669 3.496 4.125 4.655 5.077 5.453 5.8 6.394 6.669 6.937 7.352 7.664 7.89 8.328 8.743 9.141 9.328 9.689 10.031 10.506 10.812 11.117 11.564 11.993 12.414 12.832 13.236 13.754 14.253 14.744 15.359 15.952 16.514 17.181 17.959 18.723 19.557 20.472 21.464 22.506 23.708 25.167 26.664 28.414 30.403 32.77 35.573 39.053 43.393 48.977 54.01 57.229 59.441 61.001 62.163 63.02 63.689 64.163 64.569 64.877 65.073 65.197 65.283 65.35 65.373 65.363 65.364 65.361 65.318 65.24 65.177 65.103 65.008 64.92 64.818 64.715 64.591 64.433 64.324 64.214 64.014 63.863 63.699 63.608 63.416 63.195 62.919 62.769 62.605 62.325 62.148 61.941 61.473 61.201 60.874 60.486 60.023 59.435 58.729 56.061 -3 ,3529 ,KEBNE ,17028039,Wed Dec 22 18:52:42 CET,Wed Dec 22 20:26:21 CET,0.0 2.803 3.586 4.186 4.671 5.086 5.458 5.803 6.432 6.708 6.963 7.343 7.637 7.857 8.277 8.683 9.077 9.266 9.631 9.971 10.457 10.776 11.081 11.511 11.931 12.351 12.763 13.166 13.671 14.165 14.657 15.243 15.812 16.374 17.038 17.788 18.534 19.354 20.234 21.182 22.212 23.413 24.849 26.34 28.138 30.213 32.638 35.438 38.865 43.16 48.876 54.001 57.243 59.514 61.112 62.304 63.162 63.812 64.292 64.657 64.935 65.16 65.31 65.402 65.45 65.485 65.511 65.493 65.476 65.46 65.41 65.346 65.267 65.181 65.103 65.004 64.886 64.759 64.625 64.514 64.38 64.175 64.023 63.855 63.766 63.565 63.336 63.096 62.963 62.784 62.468 62.293 62.102 61.653 61.397 61.107 60.769 60.351 59.835 59.048 55.415 -4 ,13934 ,KEBNE ,17028040,Wed Dec 22 18:52:41 CET,Wed Dec 22 20:26:49 CET,0.0 2.539 3.327 3.902 4.394 4.838 5.209 5.541 6.142 6.413 6.68 7.094 7.408 7.646 8.09 8.486 8.877 9.069 9.443 9.803 10.301 10.619 10.93 11.37 11.799 12.223 12.629 13.031 13.558 14.066 14.562 15.165 15.748 16.308 16.963 17.733 18.497 19.337 20.239 21.212 22.255 23.45 24.888 26.369 28.136 30.159 32.563 35.351 38.765 43.11 48.713 53.792 57.114 59.428 61.034 62.171 63.003 63.629 64.078 64.453 64.741 64.943 65.076 65.175 65.241 65.272 65.281 65.271 65.244 65.199 65.134 65.069 64.991 64.904 64.825 64.727 64.624 64.518 64.397 64.299 64.187 64.001 63.85 63.67 63.58 63.381 63.159 62.886 62.737 62.571 62.273 62.105 61.929 61.513 61.256 60.948 60.603 60.185 59.649 58.885 56.239 -5 ,25752 ,KEBNE ,17028041,Wed Dec 22 18:52:42 CET,Wed Dec 22 20:29:24 CET,0.0 2.429 3.197 3.765 4.243 4.679 5.064 5.402 5.968 6.238 6.505 6.928 7.255 7.493 7.938 8.334 8.707 8.891 9.247 9.593 10.088 10.404 10.723 11.19 11.634 12.057 12.459 12.848 13.358 13.86 14.353 14.957 15.547 16.122 16.797 17.552 18.272 19.075 19.96 20.935 21.976 23.165 24.587 26.05 27.819 29.859 32.243 35.0 38.439 42.853 48.583 53.77 57.131 59.398 60.98 62.172 63.04 63.66 64.113 64.535 64.816 64.997 65.139 65.234 65.295 65.348 65.369 65.354 65.331 65.293 65.23 65.16 65.081 64.981 64.886 64.781 64.672 64.538 64.375 64.271 64.16 63.959 63.815 63.65 63.552 63.347 63.132 62.89 62.758 62.593 62.301 62.134 61.939 61.481 61.212 60.897 60.522 60.077 59.503 58.721 56.071 -6 ,11017 ,KEBNE ,17028042,Wed Dec 22 18:52:42 CET,Wed Dec 22 20:29:18 CET,0.0 2.722 3.506 4.056 4.526 4.933 5.306 5.658 6.294 6.579 6.844 7.246 7.557 7.788 8.236 8.656 9.038 9.228 9.609 9.959 10.458 10.781 11.097 11.554 11.991 12.409 12.827 13.242 13.786 14.298 14.777 15.374 15.964 16.529 17.187 17.939 18.679 19.501 20.394 21.355 22.398 23.605 25.028 26.5 28.244 30.264 32.655 35.437 38.874 43.187 48.932 54.123 57.371 59.59 61.144 62.253 63.1 63.785 64.251 64.631 64.906 65.093 65.23 65.327 65.395 65.429 65.441 65.42 65.388 65.349 65.288 65.225 65.151 65.057 64.978 64.883 64.775 64.636 64.462 64.343 64.218 64.018 63.875 63.716 63.63 63.435 63.213 62.977 62.85 62.68 62.361 62.173 61.965 61.434 61.118 60.798 60.425 59.971 59.425 58.637 55.467 -7 ,3810 ,KEBNE ,17028043,Wed Dec 22 18:52:39 CET,Wed Dec 22 20:29:21 CET,0.0 2.833 3.606 4.191 4.688 5.118 5.494 5.841 6.452 6.725 6.989 7.412 7.732 7.96 8.394 8.804 9.172 9.351 9.705 10.043 10.535 10.863 11.181 11.634 12.072 12.488 12.895 13.303 13.826 14.322 14.807 15.408 15.996 16.565 17.214 17.961 18.691 19.495 20.392 21.369 22.415 23.609 25.027 26.514 28.299 30.307 32.68 35.482 38.952 43.309 48.882 53.977 57.245 59.476 61.051 62.201 63.077 63.769 64.254 64.628 64.882 65.074 65.237 65.333 65.383 65.412 65.429 65.431 65.421 65.389 65.319 65.249 65.162 65.062 64.989 64.905 64.789 64.654 64.513 64.402 64.278 64.069 63.914 63.756 63.665 63.468 63.247 62.992 62.864 62.699 62.381 62.191 61.986 61.545 61.288 60.98 60.614 60.188 59.659 58.948 56.213 -8 ,16878 ,KEBNE ,17028044,Wed Dec 22 18:52:42 CET,Wed Dec 22 20:28:37 CET,0.0 2.834 3.68 4.259 4.741 5.158 5.532 5.875 6.451 6.723 6.979 7.351 7.647 7.868 8.295 8.699 9.086 9.271 9.626 9.965 10.441 10.751 11.058 11.514 11.952 12.366 12.782 13.184 13.691 14.182 14.667 15.272 15.853 16.406 17.054 17.794 18.521 19.326 20.207 21.177 22.207 23.382 24.791 26.25 28.017 30.038 32.466 35.323 38.789 43.05 48.724 53.854 57.045 59.252 60.806 61.96 62.851 63.528 63.993 64.38 64.662 64.867 65.019 65.142 65.233 65.274 65.284 65.279 65.257 65.22 65.17 65.105 65.027 64.938 64.852 64.764 64.67 64.543 64.387 64.27 64.156 63.974 63.834 63.68 63.589 63.389 63.176 62.94 62.807 62.641 62.307 62.114 61.923 61.429 61.149 60.832 60.436 59.989 59.42 58.536 55.349 -9 ,28903 ,KEBNE ,17028045,Wed Dec 22 18:52:39 CET,Wed Dec 22 20:27:01 CET,0.0 2.762 3.564 4.122 4.589 5.0 5.364 5.703 6.324 6.591 6.839 7.242 7.554 7.775 8.198 8.614 9.0 9.18 9.532 9.873 10.369 10.689 10.993 11.444 11.895 12.323 12.727 13.117 13.625 14.114 14.584 15.164 15.738 16.296 16.945 17.681 18.391 19.179 20.049 21.005 22.03 23.213 24.643 26.115 27.872 29.881 32.267 35.077 38.567 42.95 48.602 53.692 56.922 59.137 60.722 61.885 62.756 63.391 63.806 64.154 64.411 64.598 64.748 64.869 64.932 64.978 65.003 64.991 64.969 64.933 64.883 64.826 64.752 64.663 64.581 64.48 64.36 64.224 64.072 63.958 63.844 63.67 63.533 63.366 63.278 63.096 62.887 62.646 62.508 62.349 62.071 61.887 61.685 61.213 60.935 60.652 60.328 59.903 59.366 58.58 55.188 -10 ,1650 ,KEBNE ,17028046,Wed Dec 22 18:52:46 CET,Wed Dec 22 20:22:08 CET,0.0 3.039 3.871 4.438 4.909 5.337 5.748 6.11 6.69 6.962 7.229 7.656 7.967 8.185 8.627 9.036 9.41 9.594 9.96 10.315 10.824 11.156 11.477 11.937 12.382 12.812 13.227 13.623 14.142 14.657 15.161 15.773 16.364 16.948 17.632 18.402 19.158 20.005 20.917 21.889 22.933 24.138 25.579 27.079 28.883 30.918 33.285 36.069 39.551 43.897 49.528 54.564 57.697 59.83 61.365 62.501 63.328 63.988 64.473 64.873 65.174 65.411 65.595 65.725 65.817 65.858 65.872 65.872 65.85 65.807 65.741 65.674 65.598 65.505 65.425 65.334 65.217 65.082 64.932 64.818 64.704 64.519 64.374 64.22 64.139 63.951 63.737 63.501 63.359 63.18 62.862 62.671 62.462 61.992 61.718 61.41 61.063 60.66 60.118 59.27 56.001 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_49.txt deleted file mode 100644 index cceca404..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17951 ,TETRA ,17622080,Tue Nov 30 20:56:26 CET,Tue Nov 30 22:47:02 CET,0.0 1.292 1.767 2.116 2.397 2.634 2.841 3.032 3.355 3.499 3.642 3.829 4.03 4.138 4.333 4.513 4.681 4.757 4.899 5.04 5.23 5.344 5.456 5.604 5.745 5.889 6.013 6.117 6.25 6.376 6.483 6.602 6.708 6.805 6.898 6.972 7.027 7.065 7.092 7.115 7.127 7.112 7.053 6.955 6.768 6.479 6.062 5.462 4.551 3.126 0.724 -2.118 -4.474 -6.453 -8.075 -9.465 -10.676 -11.761 -12.676 -13.592 -14.36 -15.028 -15.652 -16.229 -16.774 -17.27 -17.79 -18.251 -18.637 -19.046 -19.465 -19.803 -20.161 -20.539 -20.83 -21.147 -21.482 -21.812 -22.167 -22.415 -22.672 -23.072 -23.351 -23.636 -23.782 -24.095 -24.428 -24.779 -24.961 -25.258 -25.539 -25.761 -26.0 -26.506 -26.775 -27.087 -27.428 -27.793 -28.231 -28.854 -30.683 -2 ,3126 ,TETRA ,17622081,Tue Nov 30 20:56:24 CET,Tue Nov 30 22:54:12 CET,0.0 1.491 1.998 2.337 2.594 2.823 3.032 3.223 3.541 3.681 3.818 3.99 4.187 4.285 4.469 4.645 4.808 4.881 5.017 5.146 5.32 5.421 5.518 5.657 5.79 5.925 6.052 6.164 6.297 6.422 6.541 6.667 6.782 6.888 6.981 7.068 7.139 7.197 7.235 7.248 7.246 7.218 7.141 7.027 6.834 6.567 6.202 5.618 4.654 3.168 0.714 -2.164 -4.506 -6.444 -8.015 -9.407 -10.626 -11.697 -12.627 -13.547 -14.313 -14.982 -15.617 -16.207 -16.749 -17.253 -17.761 -18.209 -18.607 -19.006 -19.424 -19.773 -20.129 -20.516 -20.822 -21.13 -21.445 -21.766 -22.107 -22.343 -22.587 -22.986 -23.283 -23.596 -23.753 -24.068 -24.395 -24.747 -24.929 -25.232 -25.531 -25.755 -25.997 -26.521 -26.799 -27.126 -27.488 -27.871 -28.349 -28.976 -31.385 -3 ,22501 ,TETRA ,17622082,Tue Nov 30 20:56:26 CET,Tue Nov 30 22:52:47 CET,0.0 1.513 1.936 2.239 2.501 2.727 2.92 3.1 3.422 3.561 3.691 3.838 4.025 4.119 4.296 4.462 4.611 4.678 4.812 4.941 5.116 5.22 5.314 5.451 5.579 5.69 5.786 5.875 5.991 6.104 6.205 6.317 6.411 6.489 6.573 6.658 6.725 6.784 6.829 6.858 6.873 6.842 6.779 6.684 6.504 6.238 5.811 5.18 4.221 2.748 0.378 -2.426 -4.71 -6.64 -8.32 -9.809 -11.039 -12.097 -12.998 -13.888 -14.648 -15.326 -15.965 -16.576 -17.157 -17.672 -18.192 -18.665 -19.078 -19.503 -19.943 -20.303 -20.671 -21.058 -21.356 -21.665 -21.989 -22.32 -22.665 -22.907 -23.156 -23.542 -23.808 -24.077 -24.221 -24.537 -24.885 -25.273 -25.472 -25.791 -26.097 -26.32 -26.543 -27.032 -27.318 -27.637 -28.001 -28.402 -28.855 -29.458 -31.662 -4 ,15186 ,TETRA ,17622083,Tue Nov 30 20:58:20 CET,Tue Nov 30 22:46:48 CET,0.0 1.51 1.975 2.326 2.603 2.846 3.064 3.252 3.579 3.719 3.852 4.003 4.192 4.295 4.471 4.635 4.789 4.86 4.989 5.109 5.277 5.38 5.477 5.606 5.721 5.82 5.91 5.998 6.104 6.201 6.288 6.374 6.447 6.507 6.566 6.643 6.72 6.787 6.839 6.864 6.862 6.847 6.794 6.689 6.495 6.201 5.75 5.118 4.212 2.793 0.394 -2.402 -4.637 -6.482 -8.046 -9.425 -10.601 -11.655 -12.538 -13.395 -14.133 -14.775 -15.382 -15.934 -16.441 -16.923 -17.418 -17.844 -18.217 -18.618 -19.04 -19.388 -19.743 -20.097 -20.376 -20.679 -21.001 -21.332 -21.677 -21.914 -22.154 -22.535 -22.792 -23.05 -23.19 -23.486 -23.803 -24.135 -24.311 -24.621 -24.896 -25.102 -25.327 -25.812 -26.081 -26.386 -26.725 -27.091 -27.515 -28.093 -29.697 -5 ,11367 ,TETRA ,17622084,Tue Nov 30 20:58:22 CET,Tue Nov 30 22:51:11 CET,0.0 1.648 2.117 2.468 2.761 3.016 3.248 3.449 3.763 3.905 4.051 4.22 4.414 4.526 4.736 4.921 5.076 5.15 5.294 5.421 5.601 5.706 5.803 5.936 6.06 6.178 6.276 6.372 6.489 6.593 6.691 6.787 6.868 6.939 7.017 7.103 7.174 7.238 7.291 7.33 7.337 7.318 7.27 7.18 6.997 6.705 6.279 5.646 4.689 3.212 0.75 -2.115 -4.403 -6.284 -7.868 -9.249 -10.43 -11.461 -12.329 -13.2 -13.965 -14.655 -15.291 -15.895 -16.454 -16.952 -17.482 -17.946 -18.343 -18.758 -19.19 -19.543 -19.903 -20.285 -20.588 -20.897 -21.213 -21.54 -21.88 -22.12 -22.37 -22.756 -23.023 -23.3 -23.442 -23.745 -24.065 -24.405 -24.584 -24.887 -25.177 -25.395 -25.629 -26.135 -26.422 -26.74 -27.079 -27.456 -27.906 -28.481 -30.411 -6 ,18813 ,TETRA ,17622085,Tue Nov 30 20:58:24 CET,Tue Nov 30 22:52:55 CET,0.0 1.413 1.879 2.208 2.492 2.732 2.935 3.118 3.454 3.599 3.735 3.904 4.095 4.198 4.398 4.578 4.739 4.818 4.969 5.106 5.295 5.409 5.512 5.649 5.774 5.892 5.996 6.088 6.197 6.301 6.399 6.512 6.631 6.734 6.817 6.898 6.966 7.032 7.093 7.129 7.132 7.113 7.055 6.931 6.73 6.431 5.992 5.384 4.455 2.994 0.535 -2.346 -4.642 -6.51 -8.087 -9.47 -10.668 -11.734 -12.633 -13.521 -14.278 -14.945 -15.581 -16.183 -16.732 -17.24 -17.784 -18.26 -18.672 -19.102 -19.547 -19.913 -20.296 -20.687 -20.982 -21.283 -21.597 -21.929 -22.284 -22.535 -22.791 -23.185 -23.452 -23.73 -23.876 -24.18 -24.51 -24.864 -25.05 -25.363 -25.668 -25.888 -26.118 -26.615 -26.903 -27.221 -27.553 -27.935 -28.387 -28.986 -30.8 -7 ,32506 ,TETRA ,17622086,Tue Nov 30 20:58:22 CET,Tue Nov 30 22:51:19 CET,0.0 1.496 1.969 2.345 2.637 2.883 3.105 3.297 3.626 3.775 3.915 4.086 4.275 4.374 4.559 4.726 4.888 4.969 5.116 5.248 5.425 5.533 5.638 5.771 5.892 6.01 6.113 6.203 6.311 6.411 6.493 6.579 6.67 6.755 6.833 6.899 6.949 6.999 7.039 7.062 7.063 7.022 6.949 6.84 6.656 6.382 5.967 5.33 4.371 2.923 0.513 -2.315 -4.594 -6.479 -8.074 -9.495 -10.69 -11.73 -12.605 -13.495 -14.271 -14.937 -15.559 -16.137 -16.694 -17.212 -17.717 -18.168 -18.57 -18.982 -19.407 -19.755 -20.106 -20.479 -20.773 -21.074 -21.387 -21.718 -22.068 -22.311 -22.559 -22.953 -23.223 -23.51 -23.663 -23.975 -24.309 -24.659 -24.838 -25.141 -25.425 -25.636 -25.868 -26.387 -26.666 -26.973 -27.313 -27.702 -28.192 -28.857 -30.719 -8 ,30422 ,TETRA ,17622087,Tue Nov 30 20:58:21 CET,Tue Nov 30 22:50:18 CET,0.0 1.287 1.78 2.145 2.435 2.673 2.894 3.089 3.419 3.568 3.701 3.848 4.044 4.153 4.35 4.526 4.693 4.772 4.919 5.056 5.241 5.355 5.462 5.599 5.714 5.826 5.933 6.03 6.156 6.275 6.393 6.522 6.632 6.746 6.855 6.947 7.022 7.097 7.153 7.172 7.196 7.22 7.19 7.098 6.939 6.698 6.294 5.694 4.786 3.32 0.818 -2.094 -4.422 -6.357 -7.971 -9.385 -10.614 -11.689 -12.578 -13.473 -14.244 -14.925 -15.563 -16.161 -16.714 -17.219 -17.775 -18.257 -18.669 -19.095 -19.531 -19.895 -20.264 -20.648 -20.948 -21.253 -21.573 -21.9 -22.24 -22.482 -22.733 -23.115 -23.386 -23.674 -23.815 -24.117 -24.449 -24.807 -24.999 -25.307 -25.593 -25.815 -26.042 -26.547 -26.85 -27.183 -27.527 -27.912 -28.404 -29.064 -30.976 -9 ,6527 ,TETRA ,17622088,Tue Nov 30 20:59:22 CET,Tue Nov 30 22:50:05 CET,0.0 1.508 1.972 2.292 2.557 2.799 3.015 3.211 3.526 3.657 3.783 3.936 4.126 4.228 4.415 4.584 4.738 4.807 4.938 5.067 5.242 5.344 5.433 5.559 5.691 5.824 5.946 6.06 6.203 6.336 6.455 6.577 6.681 6.76 6.852 6.953 7.032 7.102 7.145 7.172 7.187 7.167 7.083 6.98 6.821 6.543 6.108 5.503 4.617 3.165 0.75 -2.073 -4.345 -6.22 -7.791 -9.134 -10.269 -11.266 -12.117 -12.975 -13.725 -14.374 -14.979 -15.572 -16.116 -16.599 -17.08 -17.5 -17.874 -18.269 -18.671 -19.002 -19.346 -19.707 -19.991 -20.288 -20.597 -20.914 -21.241 -21.466 -21.701 -22.077 -22.341 -22.616 -22.758 -23.054 -23.358 -23.681 -23.864 -24.169 -24.464 -24.683 -24.899 -25.373 -25.669 -25.984 -26.307 -26.673 -27.116 -27.736 -29.336 -10 ,2638 ,TETRA ,17622089,Tue Nov 30 21:00:19 CET,Tue Nov 30 22:49:58 CET,0.0 1.588 2.048 2.387 2.685 2.948 3.165 3.349 3.673 3.824 3.967 4.137 4.334 4.44 4.632 4.804 4.972 5.051 5.2 5.334 5.508 5.621 5.724 5.864 5.996 6.113 6.223 6.321 6.446 6.556 6.644 6.747 6.841 6.921 6.996 7.055 7.107 7.154 7.19 7.227 7.245 7.223 7.162 7.06 6.88 6.59 6.161 5.543 4.625 3.219 0.814 -2.081 -4.365 -6.25 -7.852 -9.215 -10.39 -11.435 -12.31 -13.187 -13.947 -14.605 -15.23 -15.826 -16.378 -16.88 -17.411 -17.877 -18.274 -18.692 -19.138 -19.508 -19.882 -20.281 -20.606 -20.932 -21.255 -21.609 -21.983 -22.226 -22.468 -22.852 -23.131 -23.434 -23.591 -23.914 -24.245 -24.591 -24.774 -25.076 -25.365 -25.594 -25.83 -26.327 -26.604 -26.905 -27.242 -27.622 -28.082 -28.698 -30.816 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_62.txt deleted file mode 100644 index c7b4acbb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12876 ,TETRA ,17622090,Tue Nov 30 20:59:22 CET,Tue Nov 30 22:49:46 CET,0.0 1.78 2.353 2.754 3.093 3.364 3.611 3.842 4.238 4.417 4.581 4.798 5.028 5.161 5.41 5.645 5.875 5.984 6.188 6.378 6.654 6.835 7.004 7.235 7.453 7.666 7.876 8.068 8.296 8.522 8.746 9.016 9.273 9.526 9.82 10.153 10.466 10.8 11.156 11.52 11.886 12.301 12.786 13.261 13.777 14.303 14.93 15.617 16.325 17.081 17.793 18.087 18.04 17.84 17.582 17.28 16.97 16.678 16.384 16.055 15.763 15.503 15.248 14.984 14.732 14.491 14.239 14.014 13.817 13.601 13.364 13.18 12.989 12.788 12.635 12.468 12.28 12.079 11.865 11.71 11.545 11.293 11.115 10.915 10.814 10.603 10.374 10.129 9.998 9.778 9.565 9.398 9.21 8.804 8.584 8.353 8.07 7.745 7.38 6.847 5.151 -2 ,28956 ,TETRA ,17622091,Tue Nov 30 20:59:23 CET,Tue Nov 30 23:03:04 CET,0.0 1.47 1.979 2.345 2.646 2.913 3.166 3.394 3.818 4.015 4.193 4.441 4.69 4.836 5.115 5.378 5.626 5.745 5.971 6.185 6.489 6.676 6.848 7.104 7.358 7.605 7.829 8.029 8.285 8.531 8.764 9.042 9.304 9.553 9.833 10.139 10.423 10.718 11.035 11.382 11.765 12.182 12.641 13.088 13.57 14.071 14.656 15.325 16.046 16.782 17.439 17.702 17.667 17.51 17.263 16.971 16.696 16.435 16.199 15.936 15.686 15.433 15.177 14.939 14.698 14.47 14.235 14.015 13.823 13.619 13.398 13.204 12.997 12.795 12.647 12.488 12.302 12.102 11.894 11.754 11.601 11.348 11.162 10.961 10.864 10.663 10.44 10.199 10.071 9.848 9.636 9.485 9.322 8.942 8.725 8.484 8.211 7.899 7.522 6.985 4.931 -3 ,28811 ,TETRA ,17622092,Tue Nov 30 21:00:20 CET,Tue Nov 30 22:58:11 CET,0.0 1.71 2.233 2.631 2.935 3.194 3.423 3.635 4.01 4.178 4.344 4.559 4.797 4.938 5.19 5.416 5.633 5.735 5.933 6.123 6.391 6.558 6.715 6.945 7.159 7.361 7.553 7.743 7.981 8.207 8.427 8.685 8.941 9.176 9.438 9.758 10.073 10.409 10.758 11.106 11.468 11.867 12.318 12.771 13.268 13.794 14.408 15.071 15.782 16.52 17.173 17.391 17.289 17.105 16.869 16.579 16.292 16.011 15.714 15.393 15.125 14.875 14.614 14.353 14.109 13.879 13.631 13.402 13.203 12.991 12.763 12.579 12.384 12.175 12.014 11.845 11.666 11.469 11.262 11.108 10.944 10.696 10.517 10.311 10.209 10.003 9.769 9.526 9.398 9.184 8.978 8.817 8.649 8.283 8.079 7.843 7.568 7.257 6.883 6.382 4.61 -4 ,17542 ,TETRA ,17622093,Tue Nov 30 21:00:19 CET,Tue Nov 30 22:51:10 CET,0.0 1.74 2.248 2.601 2.869 3.103 3.32 3.516 3.879 4.047 4.203 4.399 4.622 4.753 4.994 5.216 5.428 5.53 5.719 5.896 6.159 6.335 6.502 6.733 6.955 7.172 7.379 7.572 7.826 8.075 8.304 8.569 8.825 9.067 9.331 9.637 9.941 10.263 10.605 10.958 11.309 11.695 12.132 12.566 13.068 13.604 14.194 14.837 15.548 16.279 16.891 17.157 17.169 16.983 16.739 16.475 16.193 15.911 15.654 15.368 15.099 14.844 14.586 14.342 14.112 13.895 13.655 13.437 13.25 13.06 12.856 12.679 12.488 12.278 12.114 11.933 11.744 11.555 11.346 11.197 11.045 10.796 10.612 10.417 10.318 10.102 9.864 9.623 9.499 9.282 9.067 8.903 8.733 8.358 8.144 7.905 7.624 7.3 6.915 6.389 4.7 -5 ,11083 ,TETRA ,17622094,Tue Nov 30 21:00:20 CET,Tue Nov 30 22:54:13 CET,0.0 1.853 2.42 2.822 3.131 3.411 3.677 3.904 4.305 4.488 4.655 4.868 5.092 5.221 5.477 5.713 5.934 6.043 6.251 6.451 6.721 6.892 7.056 7.287 7.506 7.714 7.912 8.102 8.344 8.569 8.786 9.044 9.29 9.535 9.817 10.114 10.381 10.668 10.988 11.331 11.685 12.091 12.544 12.988 13.529 14.132 14.759 15.403 16.126 16.899 17.618 17.889 17.857 17.671 17.41 17.119 16.834 16.544 16.263 15.967 15.701 15.454 15.2 14.939 14.677 14.428 14.173 13.935 13.716 13.496 13.27 13.08 12.873 12.65 12.473 12.276 12.063 11.836 11.605 11.444 11.263 10.979 10.782 10.561 10.448 10.221 9.976 9.697 9.546 9.305 9.052 8.871 8.673 8.27 8.021 7.723 7.407 7.05 6.643 6.102 4.545 -6 ,18772 ,TETRA ,17622095,Tue Nov 30 21:00:20 CET,Tue Nov 30 22:48:25 CET,0.0 1.724 2.211 2.561 2.851 3.117 3.36 3.581 3.984 4.156 4.314 4.539 4.778 4.906 5.157 5.395 5.611 5.716 5.929 6.134 6.42 6.605 6.785 7.048 7.293 7.521 7.746 7.957 8.21 8.452 8.685 8.966 9.233 9.497 9.8 10.124 10.438 10.778 11.118 11.483 11.868 12.275 12.736 13.188 13.705 14.253 14.855 15.511 16.23 16.991 17.669 17.938 17.889 17.674 17.429 17.155 16.899 16.642 16.398 16.114 15.814 15.55 15.305 15.044 14.789 14.581 14.358 14.147 13.97 13.788 13.592 13.414 13.226 13.035 12.883 12.716 12.544 12.368 12.182 12.052 11.902 11.653 11.484 11.302 11.205 11.011 10.799 10.565 10.443 10.233 10.042 9.896 9.738 9.401 9.204 8.974 8.716 8.395 8.014 7.527 5.97 -7 ,22871 ,TETRA ,17622096,Tue Nov 30 21:00:22 CET,Tue Nov 30 22:53:40 CET,0.0 1.68 2.163 2.529 2.847 3.128 3.378 3.602 3.994 4.172 4.337 4.539 4.767 4.904 5.162 5.395 5.614 5.718 5.92 6.116 6.39 6.559 6.724 6.962 7.185 7.394 7.595 7.789 8.033 8.272 8.494 8.747 9.002 9.249 9.527 9.836 10.102 10.383 10.692 11.021 11.375 11.757 12.171 12.58 13.048 13.553 14.128 14.753 15.417 16.133 16.845 17.138 17.114 16.894 16.575 16.259 15.968 15.67 15.377 15.055 14.772 14.511 14.255 14.012 13.771 13.536 13.277 13.04 12.823 12.594 12.361 12.169 11.954 11.72 11.533 11.328 11.11 10.882 10.644 10.478 10.309 10.036 9.839 9.621 9.507 9.285 9.051 8.798 8.669 8.454 8.238 8.072 7.896 7.497 7.285 7.046 6.763 6.448 6.077 5.563 3.614 -8 ,5648 ,TETRA ,17622097,Tue Nov 30 21:00:21 CET,Tue Nov 30 22:48:57 CET,0.0 1.566 2.062 2.438 2.731 2.98 3.205 3.405 3.756 3.915 4.06 4.245 4.469 4.593 4.829 5.046 5.251 5.352 5.544 5.728 5.992 6.162 6.329 6.585 6.831 7.05 7.262 7.472 7.731 7.975 8.214 8.498 8.756 8.995 9.276 9.588 9.875 10.184 10.516 10.853 11.205 11.604 12.047 12.473 12.973 13.526 14.113 14.704 15.366 16.094 16.793 17.161 17.172 17.009 16.788 16.535 16.253 15.958 15.689 15.423 15.17 14.914 14.674 14.45 14.23 14.007 13.768 13.566 13.395 13.215 13.022 12.861 12.687 12.492 12.338 12.174 11.991 11.802 11.609 11.476 11.335 11.111 10.952 10.778 10.688 10.499 10.294 10.067 9.946 9.736 9.534 9.375 9.213 8.845 8.637 8.41 8.163 7.882 7.521 7.032 5.398 -9 ,12210 ,TETRA ,17622098,Tue Nov 30 21:00:22 CET,Tue Nov 30 22:49:45 CET,0.0 1.619 2.119 2.486 2.801 3.078 3.323 3.548 3.953 4.129 4.293 4.516 4.758 4.897 5.159 5.396 5.622 5.731 5.933 6.12 6.372 6.539 6.705 6.945 7.167 7.373 7.57 7.758 8.004 8.241 8.463 8.712 8.954 9.201 9.489 9.808 10.115 10.45 10.808 11.182 11.552 11.957 12.432 12.897 13.434 14.017 14.639 15.313 16.066 16.816 17.5 17.835 17.83 17.642 17.395 17.146 16.887 16.598 16.315 16.026 15.739 15.457 15.206 14.961 14.722 14.506 14.271 14.058 13.866 13.659 13.439 13.25 13.06 12.847 12.67 12.49 12.307 12.115 11.901 11.751 11.596 11.344 11.167 10.98 10.882 10.68 10.463 10.212 10.075 9.854 9.631 9.462 9.288 8.915 8.696 8.458 8.179 7.835 7.444 6.916 5.147 -10 ,21357 ,TETRA ,17622099,Tue Nov 30 21:00:23 CET,Tue Nov 30 22:49:51 CET,0.0 1.786 2.269 2.63 2.939 3.214 3.464 3.687 4.094 4.283 4.448 4.657 4.888 5.025 5.291 5.529 5.741 5.842 6.042 6.241 6.526 6.701 6.872 7.113 7.327 7.521 7.711 7.899 8.139 8.382 8.626 8.917 9.185 9.439 9.735 10.051 10.346 10.668 11.012 11.379 11.768 12.192 12.651 13.103 13.64 14.226 14.845 15.501 16.183 16.9 17.647 17.992 17.96 17.79 17.567 17.274 16.966 16.658 16.37 16.062 15.786 15.547 15.304 15.071 14.853 14.624 14.381 14.17 13.972 13.765 13.547 13.368 13.177 12.961 12.779 12.583 12.382 12.162 11.93 11.778 11.625 11.377 11.189 10.998 10.898 10.682 10.45 10.211 10.088 9.873 9.678 9.531 9.375 9.015 8.81 8.592 8.337 8.044 7.683 7.121 5.598 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_64_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_64_63.txt deleted file mode 100644 index abe6943a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_64_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,716 ,TETRA ,17622100,Tue Nov 30 21:00:21 CET,Tue Nov 30 22:50:56 CET,0.0 1.447 1.989 2.381 2.696 2.971 3.216 3.43 3.827 4.013 4.187 4.402 4.626 4.763 5.039 5.281 5.5 5.606 5.801 5.988 6.26 6.428 6.585 6.815 7.04 7.247 7.44 7.629 7.876 8.119 8.35 8.619 8.878 9.111 9.372 9.664 9.939 10.249 10.574 10.902 11.23 11.582 12.016 12.443 12.886 13.333 13.801 14.262 14.704 15.136 15.462 15.364 15.032 14.615 14.166 13.723 13.292 12.896 12.558 12.19 11.853 11.549 11.256 10.964 10.662 10.376 10.086 9.814 9.571 9.34 9.092 8.886 8.682 8.447 8.255 8.061 7.866 7.661 7.433 7.271 7.104 6.834 6.645 6.442 6.332 6.107 5.858 5.581 5.44 5.2 4.98 4.81 4.626 4.213 3.976 3.711 3.422 3.094 2.684 2.141 0.341 -2 ,31150 ,TETRA ,17622101,Tue Nov 30 21:01:25 CET,Tue Nov 30 22:52:22 CET,0.0 1.946 2.468 2.844 3.16 3.455 3.715 3.94 4.324 4.498 4.663 4.881 5.117 5.256 5.512 5.754 5.986 6.092 6.292 6.479 6.739 6.908 7.074 7.314 7.534 7.732 7.924 8.111 8.347 8.572 8.781 9.018 9.25 9.48 9.737 10.006 10.262 10.547 10.828 11.106 11.402 11.72 12.098 12.481 12.886 13.301 13.747 14.191 14.695 15.173 15.433 15.3 14.974 14.57 14.139 13.698 13.262 12.848 12.48 12.108 11.76 11.442 11.145 10.848 10.547 10.271 9.997 9.742 9.513 9.28 9.033 8.826 8.608 8.38 8.207 8.026 7.829 7.611 7.382 7.224 7.055 6.773 6.575 6.37 6.261 6.049 5.818 5.551 5.412 5.18 4.942 4.762 4.577 4.174 3.947 3.705 3.437 3.105 2.706 2.128 0.548 -3 ,27097 ,TETRA ,17622102,Tue Nov 30 21:01:26 CET,Tue Nov 30 22:51:29 CET,0.0 1.747 2.261 2.642 2.966 3.246 3.498 3.73 4.135 4.313 4.485 4.719 4.96 5.102 5.35 5.584 5.805 5.915 6.132 6.329 6.593 6.756 6.919 7.147 7.353 7.554 7.753 7.934 8.167 8.388 8.589 8.841 9.076 9.294 9.542 9.816 10.072 10.337 10.634 10.961 11.279 11.616 11.995 12.35 12.773 13.232 13.71 14.196 14.673 15.127 15.405 15.335 15.063 14.679 14.247 13.823 13.421 12.996 12.602 12.205 11.856 11.524 11.208 10.921 10.638 10.365 10.08 9.822 9.59 9.345 9.074 8.836 8.595 8.343 8.141 7.923 7.686 7.445 7.193 7.023 6.856 6.577 6.376 6.164 6.055 5.844 5.614 5.364 5.23 4.997 4.774 4.597 4.409 4.014 3.793 3.548 3.269 2.929 2.511 1.966 -0.165 -4 ,30567 ,TETRA ,17622103,Tue Nov 30 21:01:26 CET,Tue Nov 30 22:51:01 CET,0.0 1.562 2.124 2.539 2.864 3.141 3.398 3.632 4.045 4.22 4.383 4.6 4.833 4.969 5.223 5.463 5.69 5.797 6.004 6.201 6.49 6.675 6.85 7.102 7.341 7.566 7.785 7.988 8.248 8.51 8.755 9.024 9.27 9.511 9.78 10.07 10.344 10.642 10.953 11.263 11.586 11.945 12.36 12.751 13.177 13.626 14.081 14.557 15.038 15.483 15.738 15.546 15.174 14.755 14.294 13.798 13.337 12.916 12.56 12.205 11.899 11.62 11.336 11.057 10.786 10.54 10.292 10.062 9.841 9.593 9.337 9.124 8.903 8.668 8.483 8.282 8.07 7.853 7.616 7.445 7.273 7.006 6.814 6.6 6.487 6.262 6.03 5.774 5.634 5.402 5.191 5.024 4.831 4.399 4.166 3.898 3.587 3.234 2.83 2.292 0.484 -5 ,16922 ,TETRA ,17622104,Tue Nov 30 21:01:27 CET,Tue Nov 30 23:01:05 CET,0.0 1.532 2.03 2.391 2.698 2.976 3.227 3.458 3.878 4.054 4.208 4.395 4.618 4.748 4.991 5.208 5.418 5.525 5.732 5.917 6.173 6.335 6.486 6.709 6.925 7.124 7.304 7.47 7.678 7.875 8.071 8.312 8.547 8.779 9.047 9.335 9.596 9.873 10.179 10.503 10.816 11.148 11.511 11.858 12.264 12.71 13.168 13.635 14.139 14.554 14.731 14.544 14.188 13.753 13.311 12.871 12.45 12.051 11.688 11.31 10.986 10.689 10.385 10.072 9.77 9.497 9.196 8.913 8.671 8.416 8.139 7.911 7.681 7.43 7.221 7.007 6.777 6.532 6.281 6.109 5.923 5.614 5.396 5.159 5.037 4.791 4.524 4.244 4.103 3.868 3.645 3.477 3.302 2.913 2.689 2.429 2.119 1.765 1.345 0.762 -0.898 -6 ,25172 ,TETRA ,17622105,Tue Nov 30 21:01:26 CET,Tue Nov 30 22:56:39 CET,0.0 1.568 2.094 2.495 2.837 3.122 3.367 3.591 3.986 4.165 4.335 4.56 4.795 4.934 5.201 5.449 5.668 5.768 5.971 6.166 6.429 6.592 6.752 6.984 7.2 7.416 7.614 7.794 8.034 8.259 8.461 8.703 8.943 9.167 9.411 9.691 9.964 10.261 10.576 10.896 11.233 11.612 12.024 12.388 12.802 13.258 13.737 14.221 14.712 15.151 15.443 15.283 14.924 14.521 14.093 13.666 13.244 12.814 12.443 12.095 11.779 11.479 11.179 10.876 10.581 10.315 10.037 9.781 9.56 9.318 9.051 8.824 8.602 8.378 8.189 7.985 7.783 7.575 7.354 7.202 7.041 6.782 6.596 6.391 6.284 6.068 5.839 5.587 5.454 5.22 4.974 4.799 4.611 4.189 3.965 3.723 3.433 3.086 2.681 2.148 0.323 -7 ,19280 ,TETRA ,17622106,Tue Nov 30 21:01:27 CET,Tue Nov 30 23:02:13 CET,0.0 1.625 2.171 2.596 2.952 3.227 3.478 3.717 4.13 4.305 4.466 4.681 4.918 5.057 5.308 5.541 5.762 5.867 6.072 6.27 6.545 6.702 6.856 7.092 7.319 7.543 7.759 7.957 8.211 8.46 8.685 8.951 9.215 9.459 9.729 10.024 10.3 10.603 10.928 11.248 11.563 11.91 12.283 12.655 13.103 13.56 14.031 14.511 14.985 15.46 15.809 15.692 15.295 14.849 14.424 13.984 13.55 13.145 12.772 12.385 12.037 11.701 11.377 11.065 10.764 10.482 10.175 9.908 9.677 9.432 9.193 8.997 8.783 8.557 8.38 8.195 8.0 7.78 7.54 7.383 7.214 6.933 6.741 6.543 6.435 6.21 5.971 5.714 5.58 5.346 5.129 4.962 4.788 4.402 4.172 3.909 3.624 3.291 2.877 2.328 0.522 -8 ,26865 ,TETRA ,17622107,Tue Nov 30 21:01:27 CET,Tue Nov 30 23:03:38 CET,0.0 1.795 2.312 2.698 3.003 3.26 3.501 3.724 4.122 4.3 4.46 4.658 4.895 5.035 5.292 5.518 5.723 5.824 6.011 6.187 6.438 6.6 6.752 6.965 7.172 7.364 7.549 7.743 8.0 8.243 8.469 8.745 9.008 9.255 9.536 9.838 10.124 10.422 10.72 11.038 11.358 11.69 12.082 12.481 12.907 13.342 13.797 14.273 14.852 15.333 15.557 15.458 15.12 14.71 14.299 13.856 13.449 13.063 12.71 12.354 12.039 11.749 11.475 11.219 10.957 10.696 10.425 10.181 9.965 9.737 9.481 9.256 9.031 8.803 8.618 8.425 8.227 8.018 7.786 7.621 7.45 7.172 6.982 6.785 6.678 6.455 6.214 5.961 5.83 5.597 5.377 5.209 5.022 4.598 4.366 4.12 3.849 3.529 3.115 2.508 0.748 -9 ,4525 ,TETRA ,17622108,Tue Nov 30 21:05:26 CET,Tue Nov 30 23:06:27 CET,0.0 1.685 2.229 2.603 2.901 3.165 3.397 3.608 3.998 4.168 4.324 4.523 4.748 4.873 5.118 5.343 5.545 5.641 5.832 6.017 6.272 6.434 6.587 6.802 7.006 7.195 7.378 7.553 7.769 7.971 8.169 8.409 8.63 8.841 9.091 9.367 9.63 9.922 10.218 10.521 10.859 11.231 11.631 12.031 12.46 12.902 13.359 13.81 14.281 14.694 14.956 14.813 14.418 13.968 13.528 13.077 12.647 12.262 11.928 11.566 11.254 10.984 10.707 10.436 10.184 9.942 9.677 9.443 9.242 9.027 8.8 8.608 8.401 8.181 8.007 7.825 7.632 7.422 7.201 7.052 6.897 6.64 6.458 6.264 6.16 5.947 5.722 5.474 5.344 5.117 4.908 4.745 4.571 4.189 3.964 3.706 3.436 3.104 2.683 2.117 0.461 -10 ,16015 ,TETRA ,17622109,Tue Nov 30 21:05:27 CET,Tue Nov 30 22:55:51 CET,0.0 1.844 2.368 2.748 3.066 3.338 3.582 3.798 4.171 4.343 4.501 4.695 4.91 5.03 5.272 5.506 5.725 5.826 6.022 6.208 6.452 6.607 6.76 6.975 7.173 7.366 7.553 7.728 7.942 8.144 8.346 8.597 8.835 9.064 9.332 9.618 9.895 10.204 10.522 10.835 11.151 11.51 11.906 12.274 12.668 13.087 13.554 14.042 14.5 14.936 15.236 15.056 14.679 14.214 13.721 13.265 12.835 12.444 12.111 11.747 11.403 11.08 10.775 10.5 10.248 10.008 9.75 9.513 9.306 9.08 8.831 8.626 8.406 8.16 7.972 7.783 7.58 7.355 7.112 6.946 6.78 6.51 6.311 6.105 5.998 5.774 5.542 5.28 5.135 4.891 4.652 4.478 4.296 3.887 3.649 3.389 3.091 2.733 2.3 1.76 -0.131 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_63.txt deleted file mode 100644 index e9cbb857..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8973 ,TETRA ,17622110,Tue Nov 30 21:05:27 CET,Tue Nov 30 22:54:45 CET,0.0 1.492 2.012 2.409 2.735 3.005 3.239 3.453 3.849 4.027 4.191 4.415 4.646 4.774 5.008 5.224 5.44 5.545 5.741 5.921 6.171 6.332 6.485 6.713 6.933 7.14 7.335 7.504 7.715 7.922 8.117 8.343 8.557 8.769 9.016 9.28 9.517 9.778 10.067 10.365 10.671 11.014 11.395 11.735 12.083 12.44 12.857 13.256 13.611 13.896 13.936 13.568 13.043 12.507 11.983 11.46 11.002 10.563 10.145 9.706 9.326 8.985 8.646 8.317 8.005 7.734 7.457 7.189 6.956 6.717 6.46 6.24 6.012 5.777 5.587 5.379 5.161 4.93 4.683 4.516 4.345 4.07 3.878 3.677 3.57 3.346 3.103 2.833 2.686 2.443 2.227 2.06 1.884 1.478 1.251 0.999 0.711 0.384 -0.027 -0.578 -2.29 -2 ,28924 ,TETRA ,17622111,Tue Nov 30 21:05:29 CET,Tue Nov 30 22:55:14 CET,0.0 1.701 2.23 2.633 2.943 3.206 3.45 3.664 4.043 4.221 4.383 4.578 4.792 4.916 5.164 5.404 5.631 5.745 5.971 6.186 6.489 6.67 6.839 7.068 7.289 7.503 7.706 7.904 8.137 8.352 8.561 8.828 9.101 9.359 9.633 9.917 10.179 10.45 10.732 11.025 11.321 11.657 12.039 12.393 12.775 13.192 13.624 14.038 14.421 14.7 14.717 14.277 13.713 13.163 12.608 12.05 11.534 11.049 10.644 10.212 9.82 9.47 9.108 8.764 8.452 8.156 7.84 7.559 7.316 7.055 6.767 6.526 6.286 6.028 5.814 5.594 5.372 5.148 4.907 4.735 4.564 4.288 4.087 3.874 3.768 3.551 3.312 3.054 2.916 2.681 2.464 2.291 2.112 1.714 1.485 1.234 0.943 0.61 0.225 -0.292 -2.036 -3 ,32709 ,TETRA ,17622112,Tue Nov 30 21:05:27 CET,Tue Nov 30 23:01:45 CET,0.0 1.642 2.167 2.566 2.896 3.178 3.436 3.658 4.039 4.214 4.376 4.588 4.818 4.948 5.185 5.402 5.619 5.724 5.924 6.112 6.367 6.521 6.67 6.89 7.102 7.307 7.514 7.713 7.962 8.195 8.414 8.679 8.926 9.159 9.421 9.7 9.958 10.23 10.525 10.842 11.155 11.487 11.86 12.191 12.541 12.917 13.33 13.75 14.118 14.41 14.432 13.989 13.445 12.904 12.371 11.82 11.327 10.894 10.493 10.089 9.727 9.407 9.101 8.81 8.547 8.293 8.016 7.772 7.564 7.333 7.073 6.855 6.637 6.41 6.231 6.037 5.837 5.633 5.407 5.25 5.083 4.814 4.631 4.436 4.335 4.123 3.894 3.652 3.53 3.306 3.104 2.941 2.768 2.388 2.177 1.953 1.7 1.414 1.048 0.534 -0.807 -4 ,12062 ,TETRA ,17622113,Tue Nov 30 21:05:27 CET,Tue Nov 30 23:15:35 CET,0.0 1.895 2.472 2.87 3.169 3.431 3.685 3.925 4.345 4.536 4.712 4.95 5.19 5.342 5.629 5.892 6.131 6.239 6.443 6.637 6.904 7.078 7.251 7.496 7.729 7.948 8.156 8.347 8.581 8.807 9.018 9.26 9.494 9.724 9.984 10.265 10.541 10.828 11.109 11.415 11.731 12.067 12.454 12.801 13.164 13.547 13.943 14.34 14.692 14.913 14.925 14.578 14.069 13.541 13.025 12.516 12.05 11.585 11.165 10.746 10.364 10.015 9.676 9.34 9.022 8.732 8.429 8.158 7.923 7.688 7.438 7.223 7.0 6.765 6.576 6.374 6.163 5.947 5.71 5.544 5.38 5.107 4.902 4.685 4.577 4.354 4.121 3.863 3.721 3.483 3.262 3.093 2.914 2.52 2.304 2.063 1.787 1.466 1.079 0.578 -1.13 -5 ,25469 ,TETRA ,17622114,Tue Nov 30 21:05:29 CET,Tue Nov 30 22:56:18 CET,0.0 1.664 2.205 2.596 2.912 3.182 3.421 3.637 4.021 4.204 4.369 4.577 4.803 4.929 5.177 5.412 5.621 5.718 5.908 6.091 6.351 6.513 6.667 6.875 7.071 7.272 7.461 7.633 7.856 8.078 8.289 8.536 8.761 8.971 9.207 9.453 9.696 9.962 10.232 10.504 10.788 11.117 11.503 11.883 12.279 12.667 13.093 13.528 13.947 14.252 14.243 13.858 13.354 12.794 12.254 11.73 11.235 10.775 10.36 9.927 9.558 9.235 8.907 8.583 8.287 8.005 7.694 7.413 7.17 6.917 6.657 6.442 6.216 5.975 5.787 5.589 5.384 5.173 4.944 4.776 4.599 4.32 4.126 3.912 3.801 3.582 3.348 3.094 2.958 2.723 2.505 2.333 2.151 1.744 1.516 1.258 0.974 0.643 0.214 -0.341 -1.994 -6 ,1013 ,TETRA ,17622115,Tue Nov 30 21:05:28 CET,Tue Nov 30 23:04:42 CET,0.0 1.345 1.836 2.198 2.498 2.745 2.965 3.166 3.517 3.672 3.816 3.989 4.204 4.324 4.542 4.751 4.949 5.044 5.23 5.415 5.677 5.833 5.976 6.18 6.371 6.554 6.73 6.894 7.103 7.302 7.492 7.713 7.915 8.104 8.321 8.564 8.783 9.025 9.27 9.522 9.804 10.116 10.461 10.786 11.145 11.521 11.926 12.321 12.643 12.864 12.854 12.508 12.008 11.46 10.923 10.362 9.853 9.393 8.975 8.544 8.162 7.81 7.473 7.145 6.844 6.576 6.292 6.034 5.81 5.583 5.347 5.148 4.925 4.687 4.509 4.316 4.11 3.901 3.684 3.529 3.368 3.114 2.935 2.744 2.641 2.425 2.199 1.953 1.818 1.594 1.411 1.255 1.084 0.713 0.504 0.284 0.025 -0.291 -0.66 -1.18 -2.853 -7 ,18736 ,TETRA ,17622116,Tue Nov 30 21:05:28 CET,Tue Nov 30 22:59:13 CET,0.0 1.857 2.382 2.761 3.073 3.338 3.577 3.793 4.174 4.346 4.502 4.707 4.938 5.073 5.328 5.558 5.769 5.865 6.051 6.232 6.489 6.653 6.811 7.051 7.271 7.469 7.665 7.852 8.091 8.319 8.538 8.792 9.021 9.244 9.505 9.793 10.052 10.314 10.6 10.91 11.226 11.552 11.903 12.246 12.636 13.011 13.396 13.801 14.167 14.451 14.455 14.036 13.536 13.007 12.473 11.948 11.461 11.001 10.585 10.157 9.781 9.45 9.132 8.829 8.548 8.286 8.01 7.764 7.543 7.298 7.033 6.81 6.584 6.35 6.17 5.975 5.766 5.553 5.324 5.164 4.996 4.725 4.536 4.331 4.224 3.999 3.753 3.496 3.358 3.122 2.899 2.731 2.559 2.14 1.902 1.663 1.383 1.045 0.622 0.064 -1.519 -8 ,5295 ,TETRA ,17622117,Tue Nov 30 21:05:28 CET,Tue Nov 30 23:03:44 CET,0.0 1.577 2.07 2.452 2.771 3.041 3.291 3.526 3.946 4.136 4.314 4.551 4.787 4.936 5.217 5.48 5.718 5.832 6.053 6.258 6.542 6.721 6.889 7.126 7.359 7.578 7.789 7.988 8.239 8.466 8.681 8.955 9.207 9.434 9.695 9.976 10.224 10.488 10.775 11.081 11.396 11.733 12.108 12.476 12.855 13.231 13.657 14.044 14.4 14.686 14.645 14.244 13.746 13.202 12.672 12.151 11.674 11.22 10.787 10.335 9.943 9.597 9.258 8.917 8.591 8.307 8.004 7.724 7.483 7.236 6.984 6.768 6.529 6.286 6.097 5.888 5.665 5.434 5.196 5.029 4.852 4.572 4.384 4.186 4.08 3.859 3.619 3.363 3.227 2.992 2.774 2.595 2.4 1.993 1.769 1.515 1.227 0.867 0.449 -0.066 -1.859 -9 ,23051 ,TETRA ,17622118,Tue Nov 30 21:05:28 CET,Tue Nov 30 22:58:18 CET,0.0 1.66 2.176 2.568 2.892 3.173 3.409 3.624 4.015 4.185 4.349 4.558 4.775 4.909 5.174 5.41 5.621 5.722 5.915 6.094 6.341 6.498 6.659 6.891 7.103 7.313 7.526 7.745 7.999 8.228 8.451 8.707 8.951 9.175 9.426 9.694 9.94 10.222 10.532 10.832 11.143 11.499 11.874 12.218 12.6 12.997 13.425 13.83 14.183 14.449 14.484 14.121 13.598 13.045 12.494 11.984 11.498 11.026 10.629 10.214 9.838 9.501 9.173 8.866 8.584 8.323 8.047 7.8 7.58 7.342 7.098 6.89 6.661 6.415 6.225 6.033 5.828 5.611 5.386 5.227 5.061 4.797 4.611 4.414 4.309 4.08 3.831 3.563 3.421 3.184 2.966 2.794 2.6 2.174 1.938 1.684 1.397 1.065 0.663 0.142 -1.383 -10 ,32506 ,TETRA ,17622119,Tue Nov 30 21:05:30 CET,Tue Nov 30 22:57:55 CET,0.0 1.591 2.082 2.464 2.785 3.079 3.341 3.566 3.968 4.147 4.308 4.509 4.733 4.868 5.121 5.352 5.558 5.655 5.841 6.015 6.273 6.442 6.598 6.811 7.013 7.207 7.405 7.59 7.808 8.007 8.199 8.44 8.667 8.876 9.108 9.364 9.605 9.859 10.121 10.389 10.667 10.959 11.268 11.574 11.924 12.284 12.682 13.079 13.46 13.79 13.818 13.378 12.854 12.315 11.79 11.272 10.794 10.341 9.913 9.473 9.096 8.754 8.405 8.055 7.734 7.446 7.14 6.854 6.611 6.359 6.089 5.872 5.638 5.387 5.191 4.986 4.767 4.522 4.27 4.1 3.919 3.636 3.434 3.223 3.112 2.89 2.661 2.404 2.268 2.035 1.832 1.679 1.514 1.136 0.925 0.691 0.434 0.135 -0.229 -0.706 -2.117 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_64.txt deleted file mode 100644 index 05061193..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20605 ,TETRA ,17622120,Tue Nov 30 21:05:28 CET,Tue Nov 30 22:58:30 CET,0.0 2.192 2.776 3.202 3.539 3.833 4.093 4.32 4.715 4.893 5.061 5.283 5.521 5.656 5.911 6.164 6.394 6.502 6.698 6.885 7.158 7.328 7.491 7.73 7.949 8.143 8.339 8.53 8.776 9.011 9.23 9.491 9.731 9.958 10.234 10.548 10.824 11.113 11.418 11.729 12.06 12.431 12.854 13.234 13.621 14.052 14.51 14.912 15.299 15.653 15.726 15.274 14.655 14.062 13.466 12.876 12.349 11.843 11.381 10.911 10.498 10.134 9.811 9.486 9.159 8.862 8.553 8.273 8.023 7.767 7.501 7.277 7.046 6.806 6.614 6.412 6.206 5.985 5.753 5.594 5.424 5.157 4.957 4.741 4.628 4.392 4.147 3.89 3.753 3.512 3.283 3.12 2.949 2.564 2.346 2.088 1.793 1.468 1.082 0.588 -0.933 -2 ,7816 ,TETRA ,17622121,Tue Nov 30 21:05:29 CET,Tue Nov 30 22:54:27 CET,0.0 1.875 2.398 2.779 3.131 3.427 3.676 3.913 4.339 4.532 4.71 4.947 5.182 5.321 5.589 5.83 6.063 6.178 6.39 6.592 6.877 7.065 7.251 7.502 7.749 7.981 8.2 8.412 8.674 8.926 9.158 9.424 9.677 9.914 10.178 10.482 10.759 11.037 11.334 11.648 11.966 12.321 12.728 13.093 13.477 13.894 14.323 14.718 15.12 15.406 15.304 14.774 14.184 13.562 12.98 12.404 11.85 11.331 10.859 10.369 9.939 9.559 9.184 8.837 8.522 8.221 7.895 7.592 7.333 7.07 6.798 6.565 6.315 6.057 5.852 5.631 5.402 5.167 4.918 4.744 4.559 4.265 4.058 3.835 3.719 3.48 3.232 2.965 2.822 2.579 2.345 2.171 1.983 1.536 1.295 1.036 0.74 0.39 -0.028 -0.571 -2.135 -3 ,19743 ,TETRA ,17622122,Tue Nov 30 21:21:48 CET,Tue Nov 30 23:13:25 CET,0.0 1.705 2.279 2.683 3.037 3.348 3.631 3.89 4.337 4.549 4.747 5.007 5.254 5.408 5.685 5.947 6.199 6.319 6.556 6.772 7.076 7.273 7.453 7.713 7.954 8.18 8.392 8.588 8.837 9.075 9.302 9.573 9.827 10.068 10.357 10.673 10.961 11.263 11.569 11.874 12.199 12.562 12.96 13.33 13.746 14.172 14.621 15.112 15.549 15.774 15.657 15.128 14.477 13.817 13.22 12.659 12.127 11.63 11.184 10.719 10.3 9.916 9.551 9.193 8.843 8.514 8.176 7.866 7.583 7.305 7.03 6.793 6.542 6.279 6.07 5.857 5.635 5.39 5.131 4.952 4.772 4.492 4.29 4.076 3.961 3.714 3.453 3.173 3.024 2.771 2.534 2.367 2.181 1.759 1.526 1.269 0.977 0.644 0.244 -0.325 -2.473 -4 ,22492 ,TETRA ,17622123,Tue Nov 30 21:21:48 CET,Tue Nov 30 23:23:00 CET,0.0 1.603 2.152 2.586 2.94 3.244 3.5 3.728 4.161 4.354 4.527 4.759 4.986 5.119 5.373 5.611 5.845 5.957 6.16 6.354 6.618 6.783 6.949 7.188 7.405 7.601 7.789 7.975 8.213 8.438 8.646 8.89 9.129 9.348 9.585 9.853 10.116 10.414 10.727 11.039 11.347 11.682 12.059 12.423 12.812 13.226 13.694 14.105 14.47 14.745 14.662 14.164 13.564 12.958 12.38 11.75 11.154 10.623 10.156 9.671 9.232 8.836 8.45 8.057 7.699 7.394 7.065 6.756 6.491 6.219 5.939 5.712 5.476 5.2 4.985 4.77 4.542 4.304 4.053 3.882 3.704 3.421 3.222 3.015 2.901 2.661 2.404 2.128 1.983 1.741 1.507 1.333 1.144 0.729 0.496 0.231 -0.062 -0.405 -0.83 -1.361 -3.201 -5 ,5184 ,TETRA ,17622124,Tue Nov 30 21:21:47 CET,Tue Nov 30 23:33:44 CET,0.0 1.82 2.37 2.763 3.091 3.365 3.612 3.848 4.26 4.441 4.618 4.858 5.09 5.228 5.496 5.742 5.964 6.067 6.259 6.447 6.72 6.894 7.056 7.291 7.522 7.735 7.934 8.127 8.358 8.576 8.787 9.035 9.264 9.473 9.724 10.01 10.279 10.579 10.887 11.198 11.52 11.856 12.226 12.58 12.968 13.376 13.79 14.218 14.66 14.993 14.932 14.396 13.817 13.199 12.556 11.945 11.393 10.895 10.463 10.002 9.607 9.253 8.896 8.539 8.195 7.875 7.543 7.241 6.983 6.717 6.426 6.185 5.922 5.63 5.409 5.188 4.956 4.713 4.454 4.279 4.105 3.824 3.618 3.399 3.287 3.044 2.787 2.516 2.371 2.117 1.87 1.696 1.507 1.097 0.866 0.607 0.301 -0.055 -0.479 -1.03 -2.688 -6 ,5162 ,TETRA ,17622125,Tue Nov 30 21:21:48 CET,Tue Nov 30 23:13:14 CET,0.0 1.348 1.89 2.298 2.638 2.928 3.176 3.404 3.823 4.025 4.216 4.464 4.71 4.855 5.125 5.366 5.587 5.694 5.902 6.111 6.406 6.587 6.754 6.994 7.239 7.472 7.69 7.903 8.161 8.401 8.624 8.899 9.161 9.4 9.672 9.966 10.25 10.552 10.851 11.163 11.489 11.839 12.257 12.668 13.074 13.481 13.934 14.348 14.682 14.932 14.96 14.539 13.941 13.304 12.699 12.127 11.613 11.12 10.689 10.233 9.822 9.474 9.127 8.772 8.443 8.146 7.832 7.52 7.239 6.969 6.689 6.441 6.175 5.901 5.682 5.45 5.22 4.985 4.737 4.575 4.412 4.145 3.955 3.754 3.649 3.421 3.173 2.928 2.795 2.563 2.355 2.192 2.016 1.632 1.414 1.17 0.903 0.607 0.245 -0.259 -2.034 -7 ,7998 ,TETRA ,17622126,Tue Nov 30 21:21:49 CET,Tue Nov 30 23:26:02 CET,0.0 2.039 2.615 3.017 3.347 3.619 3.87 4.104 4.512 4.697 4.866 5.095 5.331 5.465 5.719 5.965 6.201 6.31 6.516 6.708 6.984 7.157 7.314 7.531 7.754 7.98 8.197 8.411 8.669 8.908 9.143 9.417 9.669 9.902 10.165 10.454 10.724 11.02 11.335 11.677 12.018 12.383 12.805 13.203 13.623 14.049 14.476 14.88 15.269 15.542 15.551 15.081 14.435 13.778 13.152 12.564 12.009 11.462 10.985 10.507 10.097 9.703 9.305 8.93 8.583 8.267 7.925 7.618 7.347 7.06 6.756 6.512 6.258 5.986 5.785 5.574 5.35 5.127 4.881 4.704 4.526 4.247 4.05 3.828 3.711 3.47 3.208 2.933 2.787 2.545 2.322 2.146 1.953 1.534 1.287 1.016 0.724 0.388 -0.018 -0.549 -2.333 -8 ,28754 ,TETRA ,17622127,Tue Nov 30 21:21:48 CET,Tue Nov 30 23:14:28 CET,0.0 1.537 2.084 2.496 2.83 3.117 3.359 3.581 3.99 4.171 4.34 4.553 4.782 4.92 5.164 5.396 5.62 5.726 5.924 6.119 6.409 6.582 6.74 6.959 7.165 7.367 7.558 7.731 7.952 8.163 8.369 8.62 8.848 9.057 9.285 9.538 9.781 10.043 10.333 10.626 10.908 11.249 11.647 12.019 12.417 12.816 13.238 13.628 13.975 14.215 14.197 13.819 13.264 12.663 12.11 11.587 11.113 10.646 10.221 9.787 9.391 9.027 8.681 8.359 8.05 7.748 7.414 7.098 6.836 6.567 6.284 6.057 5.804 5.537 5.331 5.111 4.865 4.599 4.335 4.142 3.942 3.641 3.438 3.238 3.136 2.911 2.67 2.42 2.286 2.052 1.847 1.685 1.507 1.119 0.901 0.663 0.393 0.074 -0.307 -0.79 -2.197 -9 ,3426 ,TETRA ,17622128,Tue Nov 30 21:21:51 CET,Tue Nov 30 23:14:08 CET,0.0 1.642 2.161 2.542 2.871 3.16 3.413 3.641 4.049 4.23 4.397 4.614 4.849 4.99 5.264 5.517 5.744 5.853 6.072 6.288 6.589 6.778 6.968 7.225 7.455 7.694 7.915 8.105 8.35 8.585 8.803 9.064 9.312 9.541 9.802 10.085 10.352 10.638 10.937 11.241 11.545 11.907 12.302 12.658 13.058 13.479 13.917 14.331 14.691 14.894 14.759 14.221 13.586 12.904 12.258 11.666 11.138 10.631 10.158 9.67 9.257 8.873 8.501 8.158 7.826 7.515 7.18 6.874 6.603 6.317 6.016 5.774 5.533 5.276 5.069 4.853 4.629 4.391 4.147 3.981 3.799 3.502 3.284 3.045 2.932 2.7 2.445 2.177 2.034 1.788 1.546 1.364 1.177 0.761 0.522 0.257 -0.043 -0.397 -0.805 -1.362 -2.982 -10 ,4104 ,TETRA ,17622129,Tue Nov 30 21:21:49 CET,Tue Nov 30 23:23:49 CET,0.0 1.97 2.537 2.927 3.24 3.517 3.756 3.971 4.361 4.536 4.699 4.916 5.149 5.283 5.533 5.766 5.98 6.083 6.275 6.459 6.736 6.914 7.074 7.299 7.517 7.728 7.922 8.095 8.307 8.508 8.711 8.955 9.184 9.398 9.639 9.92 10.175 10.442 10.731 11.028 11.336 11.686 12.063 12.407 12.789 13.197 13.658 14.103 14.461 14.719 14.739 14.283 13.681 13.144 12.64 12.077 11.525 11.021 10.57 10.106 9.71 9.353 8.994 8.657 8.365 8.098 7.808 7.544 7.304 7.048 6.792 6.584 6.354 6.104 5.911 5.708 5.505 5.295 5.058 4.885 4.714 4.445 4.252 4.051 3.948 3.731 3.494 3.246 3.109 2.872 2.664 2.508 2.336 1.942 1.728 1.495 1.239 0.936 0.551 0.024 -2.095 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_49.txt deleted file mode 100644 index 97faae14..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25821 ,TETRA ,17622130,Tue Nov 30 21:21:50 CET,Tue Nov 30 23:20:07 CET,0.0 1.655 2.214 2.633 2.993 3.321 3.616 3.885 4.369 4.591 4.805 5.052 5.396 5.577 5.938 6.281 6.596 6.748 7.042 7.321 7.723 7.981 8.234 8.613 8.976 9.316 9.648 9.97 10.375 10.774 11.169 11.643 12.103 12.556 13.094 13.705 14.296 14.973 15.714 16.473 17.289 18.239 19.338 20.453 21.785 23.3 25.077 27.123 29.569 32.447 36.054 39.168 41.017 42.179 42.891 43.361 43.689 43.92 44.059 44.142 44.167 44.167 44.103 43.997 43.891 43.787 43.671 43.545 43.443 43.343 43.219 43.093 42.943 42.795 42.67 42.525 42.367 42.188 41.975 41.824 41.661 41.388 41.203 41.016 40.928 40.718 40.465 40.189 40.038 39.761 39.528 39.336 39.115 38.605 38.329 38.054 37.721 37.267 36.679 35.932 33.597 -2 ,12257 ,TETRA ,17622131,Tue Nov 30 21:21:51 CET,Tue Nov 30 23:13:51 CET,0.0 1.842 2.412 2.845 3.209 3.529 3.809 4.066 4.532 4.756 4.974 5.227 5.577 5.76 6.103 6.434 6.754 6.906 7.201 7.485 7.881 8.135 8.385 8.75 9.102 9.438 9.764 10.084 10.497 10.896 11.29 11.772 12.236 12.696 13.23 13.822 14.402 15.029 15.696 16.423 17.228 18.172 19.288 20.425 21.781 23.331 25.109 27.138 29.678 32.8 36.558 39.61 41.341 42.468 43.22 43.733 44.084 44.314 44.436 44.489 44.492 44.477 44.438 44.353 44.248 44.138 44.007 43.887 43.766 43.629 43.487 43.357 43.2 43.011 42.859 42.699 42.528 42.337 42.12 41.966 41.799 41.532 41.351 41.141 41.026 40.788 40.518 40.22 40.058 39.771 39.534 39.355 39.145 38.633 38.366 38.05 37.672 37.282 36.764 35.945 33.355 -3 ,18032 ,TETRA ,17622132,Tue Nov 30 21:21:50 CET,Tue Nov 30 23:11:31 CET,0.0 1.522 2.026 2.42 2.772 3.087 3.361 3.609 4.067 4.279 4.479 4.703 5.038 5.211 5.553 5.885 6.189 6.335 6.623 6.901 7.304 7.561 7.812 8.169 8.506 8.839 9.169 9.486 9.896 10.302 10.699 11.165 11.614 12.062 12.585 13.175 13.749 14.383 15.079 15.842 16.66 17.587 18.702 19.862 21.224 22.751 24.514 26.578 29.082 32.069 35.726 38.759 40.618 41.806 42.515 43.001 43.349 43.565 43.688 43.761 43.794 43.787 43.713 43.614 43.513 43.403 43.273 43.159 43.047 42.904 42.746 42.601 42.431 42.245 42.096 41.932 41.758 41.571 41.355 41.182 41.004 40.76 40.583 40.377 40.268 40.041 39.782 39.485 39.332 39.058 38.809 38.623 38.433 38.012 37.771 37.481 37.133 36.7 36.177 35.428 31.262 -4 ,11511 ,TETRA ,17622133,Tue Nov 30 21:21:50 CET,Tue Nov 30 23:36:44 CET,0.0 1.605 2.157 2.593 2.969 3.291 3.573 3.845 4.345 4.566 4.772 5.003 5.345 5.53 5.878 6.205 6.52 6.671 6.969 7.258 7.676 7.949 8.22 8.625 9.011 9.37 9.715 10.052 10.493 10.922 11.333 11.819 12.29 12.758 13.304 13.924 14.521 15.174 15.891 16.645 17.445 18.377 19.47 20.622 21.998 23.537 25.346 27.382 29.873 32.927 36.678 39.85 41.719 42.911 43.67 44.193 44.554 44.787 44.895 44.963 44.986 44.97 44.924 44.837 44.738 44.645 44.544 44.423 44.294 44.156 43.983 43.838 43.682 43.493 43.356 43.214 43.06 42.884 42.682 42.532 42.376 42.132 41.949 41.755 41.65 41.41 41.146 40.872 40.732 40.472 40.252 40.053 39.843 39.335 39.043 38.749 38.407 37.985 37.426 36.635 34.112 -5 ,19439 ,TETRA ,17622134,Tue Nov 30 21:21:50 CET,Tue Nov 30 23:11:29 CET,0.0 1.553 2.157 2.621 2.998 3.324 3.623 3.912 4.441 4.684 4.918 5.205 5.563 5.769 6.16 6.508 6.843 7.01 7.334 7.639 8.071 8.351 8.626 9.022 9.4 9.771 10.126 10.458 10.891 11.315 11.719 12.211 12.697 13.172 13.732 14.358 14.962 15.634 16.358 17.123 17.935 18.883 19.99 21.12 22.48 24.011 25.788 27.854 30.414 33.534 37.251 40.419 42.294 43.443 44.154 44.583 44.894 45.118 45.225 45.3 45.322 45.277 45.213 45.13 45.037 44.93 44.795 44.665 44.529 44.377 44.21 44.063 43.919 43.775 43.65 43.504 43.342 43.165 42.974 42.833 42.685 42.436 42.258 42.078 41.977 41.75 41.504 41.218 41.055 40.775 40.546 40.354 40.145 39.658 39.373 39.05 38.673 38.252 37.721 36.957 34.001 -6 ,2766 ,TETRA ,17622135,Tue Nov 30 21:21:52 CET,Tue Nov 30 23:11:24 CET,0.0 1.204 1.668 2.047 2.384 2.693 2.98 3.232 3.67 3.877 4.075 4.295 4.636 4.811 5.144 5.462 5.765 5.907 6.184 6.466 6.883 7.149 7.406 7.777 8.133 8.468 8.786 9.101 9.508 9.902 10.289 10.77 11.238 11.686 12.207 12.809 13.4 14.07 14.808 15.584 16.395 17.344 18.466 19.576 20.91 22.451 24.265 26.334 28.775 31.687 35.393 38.696 40.62 41.803 42.586 43.108 43.428 43.643 43.755 43.794 43.798 43.792 43.744 43.69 43.619 43.506 43.384 43.275 43.165 43.037 42.897 42.776 42.639 42.479 42.347 42.205 42.037 41.854 41.68 41.562 41.422 41.159 40.972 40.79 40.698 40.503 40.291 40.053 39.918 39.642 39.392 39.215 39.024 38.556 38.28 37.995 37.681 37.285 36.776 36.052 32.811 -7 ,9169 ,TETRA ,17622136,Tue Nov 30 21:21:50 CET,Tue Nov 30 23:08:13 CET,0.0 1.513 2.077 2.49 2.853 3.189 3.483 3.747 4.233 4.459 4.678 4.938 5.284 5.462 5.798 6.13 6.451 6.599 6.888 7.165 7.559 7.821 8.08 8.45 8.795 9.127 9.446 9.763 10.19 10.595 10.984 11.464 11.928 12.37 12.895 13.499 14.082 14.712 15.423 16.209 17.022 17.945 19.064 20.21 21.53 23.026 24.803 26.872 29.374 32.395 36.069 39.179 40.944 42.007 42.72 43.22 43.534 43.743 43.882 43.951 43.955 43.93 43.854 43.755 43.659 43.557 43.428 43.284 43.153 43.029 42.891 42.736 42.564 42.406 42.275 42.121 41.957 41.768 41.559 41.423 41.285 41.06 40.895 40.709 40.616 40.412 40.173 39.898 39.751 39.492 39.273 39.067 38.843 38.359 38.095 37.783 37.371 36.93 36.412 35.648 32.802 -8 ,16490 ,TETRA ,17622137,Tue Nov 30 21:21:51 CET,Tue Nov 30 23:23:15 CET,0.0 1.484 2.007 2.439 2.821 3.156 3.45 3.709 4.18 4.408 4.624 4.856 5.203 5.385 5.728 6.055 6.364 6.513 6.805 7.087 7.491 7.746 7.993 8.355 8.701 9.048 9.393 9.715 10.115 10.5 10.888 11.397 11.896 12.37 12.922 13.534 14.134 14.788 15.5 16.273 17.08 18.031 19.168 20.302 21.616 23.125 24.922 27.001 29.437 32.3 35.901 38.998 40.86 42.009 42.773 43.29 43.605 43.798 43.921 44.015 44.048 44.038 44.009 43.967 43.894 43.802 43.678 43.551 43.448 43.338 43.189 43.046 42.908 42.743 42.606 42.469 42.311 42.14 41.958 41.823 41.674 41.438 41.275 41.101 41.0 40.797 40.58 40.323 40.189 39.93 39.681 39.481 39.27 38.785 38.505 38.184 37.809 37.354 36.796 35.998 33.815 -9 ,9688 ,TETRA ,17622138,Tue Nov 30 21:21:52 CET,Tue Nov 30 23:19:47 CET,0.0 1.583 2.098 2.487 2.811 3.103 3.372 3.62 4.077 4.28 4.475 4.702 5.052 5.227 5.554 5.871 6.174 6.321 6.605 6.895 7.324 7.595 7.851 8.221 8.589 8.954 9.294 9.614 10.043 10.473 10.885 11.366 11.832 12.291 12.838 13.46 14.05 14.718 15.45 16.221 17.038 17.954 19.029 20.176 21.559 23.08 24.872 26.954 29.491 32.574 36.283 39.324 41.126 42.246 42.944 43.406 43.703 43.901 44.004 44.068 44.083 44.07 44.038 43.991 43.92 43.836 43.729 43.609 43.494 43.351 43.196 43.062 42.89 42.695 42.561 42.418 42.258 42.092 41.91 41.763 41.603 41.348 41.16 40.964 40.861 40.643 40.394 40.113 39.955 39.673 39.444 39.268 39.085 38.66 38.404 38.091 37.716 37.247 36.696 35.886 32.803 -10 ,7292 ,TETRA ,17622139,Tue Nov 30 21:21:54 CET,Tue Nov 30 23:11:46 CET,0.0 1.601 2.18 2.624 3.001 3.317 3.615 3.887 4.361 4.576 4.785 5.026 5.37 5.553 5.903 6.229 6.539 6.689 6.984 7.274 7.688 7.95 8.196 8.557 8.918 9.26 9.588 9.913 10.345 10.762 11.152 11.622 12.08 12.519 13.023 13.61 14.201 14.852 15.555 16.314 17.121 18.045 19.131 20.216 21.514 23.012 24.796 26.852 29.309 32.332 36.205 39.388 41.21 42.392 43.182 43.714 44.067 44.323 44.491 44.579 44.615 44.62 44.59 44.526 44.452 44.391 44.296 44.177 44.056 43.918 43.78 43.652 43.506 43.351 43.211 43.054 42.874 42.694 42.492 42.329 42.17 41.927 41.752 41.536 41.415 41.186 40.946 40.664 40.516 40.237 39.991 39.801 39.605 39.156 38.874 38.561 38.21 37.787 37.267 36.535 33.745 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_65.txt deleted file mode 100644 index 87240b1a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27675 ,TETRA ,17622140,Tue Nov 30 21:21:51 CET,Tue Nov 30 23:19:47 CET,0.0 1.503 2.089 2.52 2.901 3.232 3.526 3.813 4.332 4.565 4.786 5.044 5.394 5.584 5.958 6.313 6.643 6.803 7.118 7.424 7.875 8.172 8.46 8.877 9.278 9.658 10.022 10.384 10.862 11.344 11.816 12.373 12.909 13.435 14.058 14.767 15.461 16.245 17.098 18.021 19.011 20.141 21.513 22.943 24.669 26.656 29.007 31.801 35.306 39.782 45.711 51.171 54.773 57.3 59.145 60.568 61.629 62.45 63.09 63.667 64.099 64.447 64.742 64.978 65.158 65.291 65.399 65.477 65.532 65.572 65.608 65.627 65.623 65.6 65.581 65.551 65.51 65.453 65.38 65.325 65.256 65.131 65.033 64.919 64.86 64.739 64.59 64.406 64.305 64.121 63.973 63.84 63.702 63.381 63.181 62.952 62.694 62.398 62.04 61.527 59.835 -2 ,4582 ,TETRA ,17622141,Tue Nov 30 21:21:52 CET,Tue Nov 30 23:06:33 CET,0.0 1.514 2.087 2.545 2.939 3.269 3.567 3.856 4.39 4.628 4.852 5.115 5.474 5.672 6.045 6.397 6.737 6.901 7.224 7.533 7.995 8.302 8.587 8.99 9.392 9.784 10.166 10.534 11.018 11.502 11.975 12.555 13.117 13.664 14.321 15.058 15.765 16.565 17.437 18.4 19.426 20.606 22.025 23.469 25.208 27.212 29.629 32.467 36.01 40.49 46.348 51.783 55.393 57.92 59.779 61.221 62.293 63.141 63.783 64.339 64.762 65.096 65.387 65.641 65.85 66.015 66.164 66.277 66.351 66.411 66.463 66.482 66.491 66.503 66.499 66.478 66.451 66.418 66.377 66.338 66.287 66.193 66.118 66.038 65.996 65.902 65.783 65.644 65.566 65.391 65.271 65.159 65.035 64.744 64.576 64.382 64.149 63.858 63.497 63.01 61.331 -3 ,15183 ,TETRA ,17622142,Tue Nov 30 21:23:46 CET,Tue Nov 30 23:14:34 CET,0.0 1.554 2.084 2.512 2.876 3.19 3.477 3.743 4.221 4.433 4.637 4.887 5.234 5.416 5.769 6.11 6.432 6.584 6.884 7.181 7.61 7.892 8.179 8.593 8.987 9.372 9.756 10.139 10.647 11.141 11.623 12.203 12.766 13.331 13.986 14.711 15.415 16.204 17.073 18.021 19.033 20.216 21.642 23.084 24.808 26.821 29.248 32.091 35.601 40.039 45.93 51.372 54.959 57.481 59.319 60.741 61.821 62.684 63.326 63.874 64.3 64.638 64.921 65.157 65.346 65.488 65.611 65.694 65.747 65.794 65.826 65.838 65.835 65.814 65.785 65.753 65.72 65.673 65.607 65.56 65.511 65.415 65.331 65.237 65.185 65.071 64.946 64.803 64.722 64.551 64.456 64.346 64.222 63.932 63.759 63.563 63.335 63.049 62.678 62.162 60.267 -4 ,12702 ,TETRA ,17622143,Tue Nov 30 21:24:38 CET,Tue Nov 30 23:22:59 CET,0.0 1.672 2.23 2.67 3.052 3.38 3.677 3.954 4.462 4.694 4.916 5.181 5.534 5.73 6.117 6.475 6.825 6.999 7.328 7.636 8.084 8.372 8.658 9.089 9.504 9.893 10.267 10.638 11.124 11.592 12.058 12.626 13.174 13.725 14.375 15.111 15.842 16.65 17.528 18.465 19.472 20.646 22.037 23.467 25.183 27.192 29.596 32.434 35.955 40.394 46.328 51.833 55.416 57.927 59.759 61.182 62.275 63.142 63.787 64.356 64.78 65.112 65.397 65.624 65.807 65.947 66.066 66.156 66.215 66.263 66.301 66.311 66.3 66.277 66.26 66.24 66.214 66.168 66.093 66.024 65.944 65.819 65.729 65.616 65.553 65.426 65.275 65.104 65.007 64.818 64.673 64.543 64.402 64.055 63.851 63.62 63.348 63.052 62.688 62.138 60.252 -5 ,443 ,TETRA ,17622144,Tue Nov 30 21:24:40 CET,Tue Nov 30 23:12:59 CET,0.0 1.678 2.311 2.809 3.22 3.587 3.931 4.231 4.747 4.997 5.24 5.544 5.923 6.139 6.558 6.953 7.316 7.489 7.824 8.15 8.625 8.924 9.221 9.654 10.067 10.474 10.874 11.263 11.759 12.248 12.731 13.319 13.888 14.429 15.058 15.796 16.513 17.301 18.174 19.118 20.131 21.311 22.711 24.161 25.904 27.898 30.297 33.141 36.665 41.124 47.036 52.51 56.108 58.655 60.512 61.944 63.008 63.833 64.475 65.059 65.511 65.855 66.134 66.364 66.55 66.696 66.836 66.929 66.982 67.039 67.087 67.109 67.104 67.075 67.05 67.021 66.984 66.937 66.881 66.846 66.805 66.709 66.634 66.558 66.508 66.399 66.295 66.165 66.09 65.917 65.81 65.693 65.568 65.279 65.103 64.914 64.688 64.401 64.057 63.596 61.814 -6 ,28662 ,TETRA ,17622145,Tue Nov 30 21:24:38 CET,Tue Nov 30 23:15:48 CET,0.0 1.351 1.876 2.274 2.618 2.923 3.202 3.466 3.942 4.163 4.374 4.618 4.969 5.151 5.496 5.834 6.161 6.322 6.634 6.936 7.374 7.655 7.927 8.322 8.721 9.115 9.493 9.87 10.361 10.844 11.308 11.864 12.417 12.955 13.582 14.306 15.015 15.807 16.659 17.578 18.579 19.73 21.115 22.556 24.292 26.3 28.689 31.503 35.0 39.46 45.318 50.728 54.347 56.901 58.767 60.201 61.28 62.144 62.799 63.392 63.852 64.21 64.507 64.754 64.946 65.109 65.265 65.389 65.485 65.559 65.608 65.639 65.661 65.667 65.668 65.665 65.654 65.641 65.613 65.568 65.515 65.435 65.367 65.291 65.251 65.173 65.081 64.966 64.899 64.729 64.639 64.546 64.437 64.179 64.025 63.84 63.623 63.374 63.052 62.607 61.044 -7 ,6068 ,TETRA ,17622146,Tue Nov 30 21:26:43 CET,Tue Nov 30 23:06:20 CET,0.0 2.014 2.58 3.019 3.395 3.737 4.046 4.325 4.827 5.061 5.292 5.565 5.923 6.119 6.495 6.856 7.191 7.351 7.667 7.98 8.428 8.719 9.005 9.413 9.806 10.19 10.568 10.938 11.434 11.921 12.387 12.955 13.511 14.053 14.7 15.438 16.159 16.964 17.839 18.783 19.801 20.97 22.354 23.79 25.526 27.55 30.009 32.92 36.474 40.906 46.834 52.304 55.866 58.391 60.223 61.631 62.714 63.564 64.198 64.774 65.206 65.533 65.81 66.035 66.212 66.35 66.477 66.565 66.625 66.673 66.694 66.691 66.669 66.639 66.617 66.587 66.548 66.496 66.423 66.359 66.285 66.156 66.061 65.954 65.89 65.752 65.604 65.453 65.363 65.176 65.053 64.933 64.803 64.491 64.3 64.086 63.863 63.599 63.245 62.705 60.791 -8 ,5160 ,TETRA ,17622147,Tue Nov 30 21:26:43 CET,Tue Nov 30 23:23:39 CET,0.0 1.618 2.18 2.627 3.018 3.364 3.675 3.961 4.473 4.716 4.948 5.22 5.583 5.779 6.15 6.503 6.846 7.011 7.33 7.636 8.076 8.364 8.643 9.049 9.452 9.842 10.223 10.593 11.073 11.541 11.99 12.541 13.085 13.625 14.266 14.992 15.694 16.476 17.33 18.26 19.259 20.399 21.776 23.199 24.883 26.866 29.272 32.093 35.605 40.015 45.893 51.368 54.941 57.455 59.283 60.697 61.784 62.644 63.294 63.858 64.268 64.585 64.856 65.077 65.251 65.39 65.524 65.622 65.689 65.741 65.766 65.768 65.759 65.724 65.699 65.679 65.634 65.576 65.511 65.463 65.416 65.339 65.27 65.187 65.144 65.043 64.913 64.766 64.688 64.517 64.407 64.287 64.157 63.863 63.696 63.501 63.277 63.024 62.674 62.153 60.467 -9 ,17230 ,TETRA ,17622148,Tue Nov 30 21:26:44 CET,Tue Nov 30 23:18:29 CET,0.0 1.812 2.373 2.811 3.185 3.527 3.839 4.121 4.627 4.858 5.08 5.34 5.694 5.891 6.272 6.633 6.977 7.144 7.469 7.777 8.221 8.506 8.786 9.198 9.598 9.989 10.372 10.748 11.249 11.753 12.24 12.833 13.4 13.947 14.599 15.347 16.069 16.877 17.763 18.718 19.738 20.906 22.311 23.751 25.488 27.509 29.928 32.751 36.218 40.641 46.54 52.028 55.604 58.098 59.908 61.306 62.394 63.263 63.898 64.46 64.882 65.212 65.494 65.721 65.904 66.043 66.18 66.282 66.345 66.388 66.408 66.416 66.42 66.428 66.432 66.415 66.379 66.345 66.305 66.267 66.218 66.127 66.055 65.967 65.918 65.813 65.686 65.544 65.466 65.289 65.172 65.051 64.93 64.655 64.493 64.303 64.071 63.802 63.483 62.992 61.119 -10 ,11703 ,TETRA ,17622149,Tue Nov 30 21:26:46 CET,Tue Nov 30 23:18:21 CET,0.0 1.802 2.34 2.77 3.141 3.472 3.776 4.053 4.556 4.789 5.018 5.303 5.665 5.858 6.23 6.593 6.931 7.097 7.428 7.751 8.222 8.528 8.831 9.274 9.701 10.107 10.502 10.889 11.389 11.872 12.352 12.941 13.506 14.054 14.7 15.444 16.164 16.971 17.859 18.802 19.814 21.011 22.443 23.922 25.711 27.736 30.14 32.978 36.494 40.972 46.877 52.298 55.907 58.437 60.292 61.738 62.844 63.724 64.385 64.965 65.424 65.808 66.127 66.377 66.574 66.735 66.886 66.998 67.065 67.123 67.177 67.205 67.227 67.235 67.226 67.215 67.199 67.17 67.134 67.099 67.053 66.983 66.936 66.879 66.84 66.747 66.649 66.54 66.471 66.31 66.237 66.147 66.044 65.787 65.641 65.482 65.279 65.03 64.719 64.287 62.594 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_68.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_68.txt deleted file mode 100644 index c638b3e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_68.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6856 ,TETRA ,17622150,Tue Nov 30 21:07:27 CET,Tue Nov 30 23:05:11 CET,0.0 1.848 2.497 2.979 3.369 3.716 4.031 4.315 4.83 5.07 5.312 5.602 5.952 6.139 6.501 6.841 7.165 7.322 7.622 7.917 8.341 8.616 8.886 9.276 9.644 9.996 10.342 10.682 11.12 11.54 11.943 12.435 12.915 13.38 13.915 14.525 15.124 15.798 16.53 17.307 18.144 19.081 20.176 21.317 22.679 24.227 26.067 28.214 30.807 33.985 38.077 41.73 43.914 45.348 46.415 47.224 47.809 48.25 48.551 48.791 48.971 49.109 49.215 49.284 49.327 49.36 49.371 49.368 49.358 49.328 49.277 49.231 49.178 49.108 49.04 48.967 48.883 48.783 48.675 48.595 48.51 48.368 48.254 48.131 48.071 47.941 47.79 47.621 47.53 47.318 47.207 47.081 46.94 46.618 46.431 46.218 45.971 45.668 45.275 44.752 42.964 -2 ,31266 ,TETRA ,17622151,Tue Nov 30 21:07:27 CET,Tue Nov 30 23:10:20 CET,0.0 2.195 2.827 3.3 3.688 4.028 4.333 4.623 5.149 5.392 5.631 5.905 6.264 6.457 6.826 7.181 7.504 7.656 7.96 8.256 8.689 8.972 9.239 9.62 9.986 10.339 10.69 11.025 11.456 11.871 12.272 12.769 13.243 13.695 14.231 14.849 15.453 16.123 16.846 17.619 18.438 19.369 20.465 21.6 22.967 24.524 26.346 28.444 30.974 34.098 38.19 41.808 44.033 45.574 46.666 47.42 47.937 48.312 48.592 48.831 48.981 49.074 49.137 49.175 49.188 49.179 49.15 49.115 49.069 49.014 48.943 48.867 48.781 48.68 48.587 48.485 48.384 48.281 48.168 48.074 47.958 47.76 47.624 47.477 47.39 47.229 47.074 46.898 46.799 46.575 46.45 46.327 46.199 45.9 45.712 45.501 45.262 44.98 44.642 44.154 42.331 -3 ,3367 ,TETRA ,17622152,Tue Nov 30 21:07:27 CET,Tue Nov 30 22:58:09 CET,0.0 1.627 2.191 2.636 3.012 3.32 3.598 3.86 4.345 4.566 4.775 5.005 5.333 5.499 5.837 6.163 6.473 6.62 6.911 7.198 7.622 7.896 8.163 8.563 8.935 9.292 9.633 9.949 10.368 10.784 11.194 11.692 12.173 12.639 13.184 13.799 14.395 15.048 15.772 16.566 17.411 18.375 19.53 20.71 22.09 23.648 25.465 27.598 30.201 33.341 37.33 40.84 43.038 44.526 45.543 46.31 46.887 47.28 47.526 47.73 47.884 48.011 48.096 48.144 48.178 48.19 48.166 48.118 48.073 48.023 47.965 47.898 47.81 47.708 47.615 47.51 47.401 47.29 47.17 47.078 46.983 46.834 46.725 46.601 46.535 46.402 46.247 46.072 45.973 45.753 45.637 45.509 45.366 45.046 44.862 44.652 44.421 44.137 43.783 43.324 41.491 -4 ,4239 ,TETRA ,17622153,Tue Nov 30 21:07:27 CET,Tue Nov 30 23:03:51 CET,0.0 2.434 3.059 3.53 3.913 4.249 4.564 4.853 5.358 5.59 5.818 6.091 6.449 6.639 6.996 7.33 7.655 7.816 8.122 8.413 8.842 9.115 9.375 9.753 10.118 10.479 10.837 11.184 11.624 12.038 12.445 12.933 13.407 13.885 14.44 15.048 15.65 16.339 17.084 17.891 18.742 19.706 20.857 22.036 23.415 24.982 26.826 28.923 31.484 34.658 38.723 42.316 44.613 46.18 47.263 48.013 48.546 48.956 49.24 49.47 49.617 49.716 49.777 49.809 49.821 49.808 49.778 49.734 49.679 49.627 49.572 49.508 49.428 49.328 49.244 49.15 49.042 48.919 48.787 48.697 48.589 48.41 48.29 48.173 48.11 47.975 47.823 47.644 47.549 47.341 47.23 47.104 46.97 46.665 46.49 46.288 46.053 45.788 45.438 44.906 43.105 -5 ,30032 ,TETRA ,17622154,Tue Nov 30 21:07:27 CET,Tue Nov 30 22:59:11 CET,0.0 1.847 2.461 2.922 3.311 3.653 3.963 4.255 4.775 5.012 5.236 5.498 5.846 6.033 6.395 6.722 7.028 7.181 7.485 7.782 8.214 8.479 8.737 9.135 9.516 9.872 10.216 10.551 10.97 11.372 11.777 12.284 12.779 13.259 13.82 14.447 15.048 15.725 16.468 17.27 18.131 19.107 20.266 21.477 22.909 24.493 26.361 28.508 31.091 34.313 38.345 41.904 44.151 45.663 46.708 47.46 47.99 48.391 48.688 48.93 49.1 49.204 49.276 49.32 49.335 49.351 49.343 49.314 49.286 49.252 49.21 49.167 49.11 49.028 48.952 48.87 48.785 48.693 48.59 48.506 48.415 48.266 48.15 48.033 47.969 47.817 47.661 47.48 47.383 47.177 47.064 46.937 46.797 46.478 46.296 46.089 45.85 45.571 45.223 44.739 43.094 -6 ,27955 ,TETRA ,17622155,Tue Nov 30 21:07:28 CET,Tue Nov 30 23:02:53 CET,0.0 2.043 2.65 3.102 3.48 3.809 4.101 4.377 4.909 5.161 5.393 5.662 6.025 6.225 6.586 6.933 7.262 7.42 7.723 8.015 8.438 8.71 8.973 9.358 9.724 10.071 10.424 10.778 11.225 11.648 12.062 12.552 13.028 13.511 14.079 14.713 15.334 16.02 16.761 17.555 18.388 19.352 20.502 21.674 23.058 24.63 26.517 28.701 31.315 34.488 38.487 42.021 44.274 45.799 46.872 47.675 48.237 48.671 48.997 49.26 49.43 49.534 49.619 49.679 49.717 49.749 49.759 49.74 49.718 49.686 49.628 49.571 49.502 49.422 49.36 49.286 49.191 49.096 49.005 48.929 48.834 48.688 48.587 48.474 48.41 48.275 48.119 47.944 47.852 47.639 47.511 47.381 47.241 46.922 46.738 46.538 46.301 46.001 45.629 45.126 43.189 -7 ,28341 ,TETRA ,17622156,Tue Nov 30 21:07:27 CET,Tue Nov 30 22:59:55 CET,0.0 1.768 2.387 2.865 3.251 3.607 3.922 4.206 4.727 4.964 5.186 5.459 5.811 5.999 6.364 6.707 7.042 7.207 7.525 7.834 8.27 8.549 8.819 9.217 9.611 9.978 10.328 10.672 11.124 11.57 12.006 12.525 13.015 13.499 14.078 14.728 15.349 16.042 16.807 17.622 18.469 19.431 20.571 21.744 23.115 24.669 26.562 28.767 31.344 34.45 38.467 42.039 44.254 45.719 46.762 47.526 48.057 48.421 48.691 48.937 49.095 49.21 49.265 49.281 49.295 49.286 49.256 49.216 49.169 49.112 49.051 48.995 48.933 48.866 48.807 48.73 48.637 48.54 48.443 48.368 48.282 48.142 48.035 47.916 47.853 47.717 47.561 47.392 47.301 47.091 46.984 46.856 46.712 46.397 46.228 46.028 45.797 45.533 45.2 44.727 43.119 -8 ,29546 ,TETRA ,17622157,Tue Nov 30 21:07:28 CET,Tue Nov 30 22:59:11 CET,0.0 1.859 2.457 2.92 3.317 3.668 3.976 4.267 4.801 5.051 5.282 5.535 5.883 6.069 6.421 6.753 7.076 7.234 7.543 7.84 8.265 8.536 8.798 9.178 9.551 9.904 10.239 10.566 10.998 11.425 11.841 12.346 12.831 13.302 13.845 14.453 15.055 15.728 16.454 17.222 18.026 18.957 20.066 21.187 22.536 24.053 25.835 27.936 30.514 33.701 37.746 41.319 43.564 45.094 46.18 46.98 47.549 47.957 48.234 48.458 48.617 48.721 48.792 48.835 48.857 48.857 48.839 48.814 48.78 48.734 48.666 48.591 48.502 48.407 48.332 48.242 48.128 48.002 47.86 47.766 47.676 47.525 47.417 47.301 47.238 47.105 46.958 46.785 46.688 46.476 46.363 46.239 46.106 45.785 45.604 45.406 45.166 44.882 44.51 43.995 42.176 -9 ,8423 ,TETRA ,17622158,Tue Nov 30 21:07:28 CET,Tue Nov 30 23:01:15 CET,0.0 2.071 2.655 3.113 3.503 3.845 4.162 4.45 4.956 5.184 5.415 5.728 6.1 6.301 6.686 7.061 7.423 7.596 7.936 8.254 8.71 9.002 9.281 9.694 10.079 10.463 10.834 11.184 11.634 12.069 12.492 13.005 13.504 13.977 14.526 15.157 15.77 16.448 17.178 17.961 18.796 19.77 20.944 22.129 23.523 25.118 26.999 29.126 31.71 34.907 38.961 42.55 44.796 46.337 47.386 48.14 48.709 49.133 49.42 49.668 49.831 49.932 49.998 50.028 50.042 50.053 50.032 49.985 49.938 49.881 49.808 49.74 49.654 49.554 49.478 49.397 49.321 49.232 49.12 49.038 48.95 48.804 48.696 48.586 48.526 48.386 48.228 48.049 47.951 47.738 47.619 47.496 47.363 47.057 46.874 46.675 46.444 46.169 45.826 45.321 43.727 -10 ,17136 ,TETRA ,17622159,Tue Nov 30 21:26:43 CET,Tue Nov 30 23:23:36 CET,0.0 2.009 2.65 3.129 3.521 3.852 4.139 4.412 4.933 5.173 5.394 5.661 6.018 6.208 6.565 6.897 7.23 7.394 7.695 7.976 8.384 8.648 8.903 9.275 9.637 9.985 10.331 10.679 11.141 11.584 12.008 12.529 13.033 13.52 14.076 14.693 15.291 15.948 16.677 17.47 18.32 19.297 20.457 21.653 23.056 24.614 26.456 28.622 31.239 34.434 38.525 42.144 44.439 45.967 47.021 47.795 48.344 48.754 49.037 49.257 49.398 49.511 49.588 49.62 49.629 49.615 49.583 49.543 49.509 49.458 49.367 49.283 49.195 49.087 48.997 48.901 48.798 48.673 48.534 48.442 48.347 48.191 48.077 47.946 47.878 47.739 47.581 47.41 47.32 47.107 46.988 46.857 46.716 46.422 46.248 46.05 45.824 45.538 45.169 44.67 42.721 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_49.txt deleted file mode 100644 index e4524939..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11378 ,TETRA ,17622160,Tue Nov 30 21:27:41 CET,Tue Nov 30 23:23:10 CET,0.0 1.607 2.093 2.498 2.824 3.092 3.323 3.527 3.905 4.077 4.243 4.439 4.69 4.827 5.078 5.303 5.519 5.625 5.825 6.006 6.261 6.425 6.581 6.804 7.021 7.224 7.407 7.588 7.825 8.043 8.248 8.492 8.718 8.924 9.148 9.406 9.666 9.938 10.192 10.455 10.747 11.061 11.384 11.675 12.021 12.378 12.714 13.046 13.359 13.54 13.346 12.701 11.92 11.081 10.269 9.519 8.849 8.229 7.686 7.121 6.603 6.14 5.71 5.29 4.89 4.536 4.151 3.782 3.462 3.13 2.758 2.441 2.133 1.816 1.554 1.288 1.033 0.743 0.415 0.19 -0.041 -0.428 -0.702 -1.005 -1.156 -1.447 -1.769 -2.112 -2.291 -2.596 -2.906 -3.163 -3.427 -4.001 -4.341 -4.682 -5.078 -5.546 -6.118 -6.899 -10.613 -2 ,4832 ,TETRA ,17622161,Tue Nov 30 21:27:42 CET,Tue Nov 30 23:19:18 CET,0.0 1.536 1.977 2.303 2.584 2.852 3.099 3.312 3.685 3.858 4.022 4.219 4.462 4.587 4.828 5.067 5.296 5.405 5.618 5.829 6.128 6.306 6.472 6.717 6.939 7.142 7.349 7.551 7.799 8.027 8.239 8.483 8.714 8.931 9.176 9.444 9.702 9.976 10.26 10.564 10.875 11.225 11.624 11.972 12.33 12.692 13.058 13.411 13.679 13.788 13.59 12.906 12.118 11.329 10.552 9.79 9.095 8.468 7.931 7.353 6.847 6.399 5.947 5.501 5.074 4.671 4.256 3.877 3.549 3.211 2.829 2.506 2.155 1.804 1.536 1.245 0.932 0.598 0.243 -0.017 -0.272 -0.654 -0.94 -1.241 -1.393 -1.694 -2.008 -2.341 -2.519 -2.817 -3.112 -3.344 -3.598 -4.165 -4.487 -4.85 -5.27 -5.788 -6.434 -7.31 -11.783 -3 ,12721 ,TETRA ,17622162,Tue Nov 30 21:27:45 CET,Tue Nov 30 23:18:02 CET,0.0 1.423 1.951 2.346 2.666 2.954 3.2 3.42 3.839 4.028 4.193 4.38 4.633 4.764 5.012 5.238 5.457 5.562 5.755 5.948 6.222 6.391 6.55 6.772 6.98 7.171 7.356 7.529 7.746 7.964 8.168 8.413 8.661 8.892 9.147 9.434 9.707 9.99 10.283 10.592 10.908 11.253 11.639 11.989 12.362 12.731 13.089 13.419 13.694 13.758 13.418 12.693 11.895 11.071 10.312 9.601 8.938 8.341 7.825 7.28 6.8 6.369 5.945 5.533 5.142 4.782 4.397 4.039 3.734 3.427 3.1 2.811 2.493 2.153 1.887 1.619 1.352 1.067 0.743 0.52 0.3 -0.04 -0.292 -0.571 -0.727 -1.045 -1.349 -1.712 -1.914 -2.228 -2.561 -2.806 -3.049 -3.582 -3.913 -4.286 -4.688 -5.157 -5.736 -6.508 -9.695 -4 ,12703 ,TETRA ,17622163,Tue Nov 30 21:28:37 CET,Tue Nov 30 23:22:10 CET,0.0 1.653 2.183 2.574 2.885 3.151 3.391 3.604 3.974 4.142 4.301 4.488 4.734 4.866 5.113 5.346 5.574 5.68 5.882 6.078 6.358 6.527 6.684 6.907 7.105 7.289 7.468 7.643 7.863 8.066 8.26 8.495 8.723 8.943 9.183 9.433 9.67 9.938 10.223 10.517 10.827 11.148 11.504 11.85 12.227 12.637 13.051 13.415 13.646 13.69 13.458 12.823 12.054 11.234 10.47 9.784 9.164 8.573 8.055 7.524 7.039 6.599 6.171 5.773 5.381 5.005 4.623 4.269 3.952 3.613 3.256 2.954 2.636 2.301 2.037 1.777 1.514 1.226 0.898 0.664 0.434 0.064 -0.198 -0.47 -0.611 -0.917 -1.253 -1.637 -1.838 -2.158 -2.501 -2.747 -3.01 -3.594 -3.914 -4.251 -4.635 -5.086 -5.675 -6.412 -9.474 -5 ,15451 ,TETRA ,17622164,Tue Nov 30 21:28:38 CET,Tue Nov 30 23:19:26 CET,0.0 1.676 2.215 2.597 2.921 3.203 3.447 3.665 4.052 4.225 4.386 4.566 4.809 4.939 5.195 5.438 5.664 5.767 5.958 6.146 6.407 6.572 6.728 6.962 7.182 7.379 7.571 7.75 7.981 8.202 8.402 8.633 8.856 9.075 9.33 9.62 9.889 10.158 10.428 10.719 11.037 11.369 11.743 12.106 12.47 12.842 13.225 13.592 13.913 14.079 13.903 13.229 12.428 11.656 10.929 10.223 9.59 8.982 8.43 7.856 7.353 6.919 6.497 6.099 5.707 5.344 4.974 4.622 4.312 3.991 3.644 3.348 3.042 2.71 2.447 2.172 1.881 1.591 1.278 1.057 0.833 0.456 0.2 -0.076 -0.225 -0.525 -0.853 -1.204 -1.392 -1.7 -2.006 -2.243 -2.493 -3.027 -3.347 -3.71 -4.114 -4.566 -5.142 -5.909 -8.738 -6 ,9614 ,TETRA ,17622165,Tue Nov 30 21:28:39 CET,Tue Nov 30 23:19:13 CET,0.0 1.528 2.038 2.405 2.715 2.995 3.251 3.487 3.895 4.07 4.232 4.428 4.683 4.814 5.059 5.288 5.503 5.605 5.802 5.995 6.268 6.434 6.593 6.824 7.037 7.235 7.438 7.638 7.893 8.128 8.34 8.597 8.85 9.083 9.334 9.611 9.88 10.178 10.48 10.775 11.08 11.411 11.775 12.114 12.476 12.832 13.175 13.522 13.866 14.023 13.708 13.001 12.266 11.468 10.683 9.946 9.287 8.692 8.159 7.603 7.11 6.669 6.25 5.843 5.451 5.073 4.675 4.318 3.999 3.647 3.267 2.954 2.63 2.285 2.019 1.739 1.434 1.118 0.785 0.558 0.336 -0.033 -0.291 -0.555 -0.692 -0.978 -1.296 -1.649 -1.843 -2.161 -2.479 -2.719 -2.982 -3.535 -3.835 -4.189 -4.588 -5.039 -5.656 -6.441 -9.224 -7 ,15105 ,TETRA ,17622166,Tue Nov 30 21:28:38 CET,Tue Nov 30 23:17:47 CET,0.0 1.539 2.062 2.43 2.733 2.99 3.22 3.433 3.81 3.984 4.142 4.326 4.579 4.717 4.971 5.214 5.436 5.536 5.732 5.925 6.194 6.359 6.517 6.749 6.965 7.154 7.337 7.517 7.76 7.995 8.21 8.465 8.713 8.945 9.197 9.477 9.74 10.026 10.331 10.628 10.919 11.248 11.598 11.929 12.306 12.67 13.054 13.42 13.685 13.783 13.486 12.712 11.849 11.003 10.256 9.543 8.886 8.283 7.754 7.22 6.747 6.319 5.904 5.505 5.136 4.798 4.421 4.083 3.789 3.462 3.123 2.823 2.5 2.19 1.939 1.662 1.381 1.086 0.765 0.541 0.297 -0.084 -0.331 -0.6 -0.741 -1.039 -1.36 -1.71 -1.9 -2.21 -2.515 -2.746 -3.01 -3.628 -3.95 -4.3 -4.718 -5.188 -5.764 -6.588 -9.415 -8 ,11105 ,TETRA ,17622167,Tue Nov 30 21:29:40 CET,Tue Nov 30 23:32:41 CET,0.0 1.466 2.01 2.422 2.763 3.04 3.284 3.513 3.92 4.097 4.263 4.464 4.72 4.856 5.101 5.339 5.566 5.669 5.868 6.052 6.307 6.469 6.624 6.847 7.049 7.244 7.439 7.617 7.835 8.057 8.269 8.508 8.728 8.929 9.164 9.431 9.697 9.986 10.282 10.585 10.875 11.195 11.574 11.927 12.292 12.65 12.995 13.325 13.651 13.835 13.567 12.917 12.189 11.378 10.599 9.874 9.214 8.584 8.038 7.487 6.994 6.518 6.059 5.642 5.235 4.849 4.45 4.079 3.749 3.396 3.032 2.732 2.412 2.086 1.831 1.563 1.292 0.999 0.69 0.472 0.233 -0.142 -0.404 -0.692 -0.835 -1.139 -1.475 -1.825 -2.021 -2.356 -2.679 -2.905 -3.161 -3.724 -4.043 -4.397 -4.786 -5.258 -5.841 -6.653 -10.874 -9 ,8935 ,TETRA ,17622168,Tue Nov 30 21:29:41 CET,Tue Nov 30 23:23:26 CET,0.0 1.499 1.977 2.355 2.683 2.961 3.199 3.413 3.8 3.972 4.137 4.345 4.599 4.739 4.986 5.21 5.426 5.529 5.726 5.917 6.187 6.353 6.504 6.719 6.932 7.131 7.319 7.496 7.729 7.955 8.158 8.397 8.619 8.827 9.071 9.34 9.595 9.894 10.212 10.526 10.83 11.138 11.461 11.746 12.064 12.404 12.734 13.02 13.233 13.323 13.042 12.285 11.404 10.582 9.823 9.123 8.501 7.912 7.385 6.825 6.334 5.885 5.453 5.047 4.667 4.293 3.886 3.521 3.212 2.9 2.553 2.261 1.956 1.639 1.391 1.12 0.821 0.494 0.144 -0.095 -0.336 -0.686 -0.936 -1.231 -1.387 -1.698 -2.026 -2.373 -2.559 -2.872 -3.175 -3.408 -3.661 -4.244 -4.561 -4.882 -5.279 -5.752 -6.325 -7.119 -9.726 -10 ,24358 ,TETRA ,17622169,Tue Nov 30 21:29:43 CET,Tue Nov 30 23:21:24 CET,0.0 1.362 1.845 2.203 2.51 2.784 3.023 3.234 3.628 3.811 3.977 4.157 4.399 4.526 4.771 4.995 5.211 5.316 5.506 5.69 5.962 6.131 6.292 6.513 6.721 6.919 7.103 7.278 7.498 7.708 7.909 8.15 8.376 8.591 8.854 9.14 9.394 9.677 9.979 10.264 10.562 10.9 11.25 11.603 11.985 12.328 12.697 13.046 13.299 13.431 13.305 12.618 11.745 10.924 10.17 9.439 8.758 8.144 7.576 6.978 6.455 5.974 5.523 5.111 4.726 4.36 3.962 3.6 3.278 2.929 2.564 2.272 1.99 1.685 1.433 1.165 0.876 0.588 0.263 0.031 -0.189 -0.548 -0.808 -1.078 -1.217 -1.516 -1.847 -2.196 -2.382 -2.694 -3.011 -3.255 -3.525 -4.101 -4.409 -4.763 -5.166 -5.623 -6.204 -7.04 -10.902 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_65.txt deleted file mode 100644 index 7c61c229..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2693 ,TETRA ,17622170,Tue Nov 30 21:30:44 CET,Tue Nov 30 23:31:06 CET,0.0 1.491 2.009 2.392 2.682 2.937 3.165 3.372 3.725 3.879 4.041 4.261 4.484 4.609 4.838 5.045 5.24 5.333 5.51 5.682 5.926 6.086 6.244 6.463 6.663 6.859 7.048 7.217 7.426 7.636 7.839 8.076 8.299 8.513 8.758 9.024 9.275 9.552 9.84 10.129 10.433 10.761 11.125 11.489 11.912 12.352 12.816 13.293 13.79 14.296 14.677 14.691 14.464 14.157 13.799 13.386 12.976 12.592 12.25 11.872 11.526 11.216 10.891 10.565 10.29 10.024 9.713 9.452 9.232 8.975 8.701 8.458 8.195 7.929 7.73 7.526 7.303 7.068 6.828 6.664 6.485 6.17 5.942 5.727 5.622 5.389 5.125 4.853 4.724 4.493 4.234 4.041 3.847 3.435 3.19 2.906 2.576 2.186 1.713 1.085 -1.279 -2 ,25930 ,TETRA ,17622171,Tue Nov 30 21:30:40 CET,Tue Nov 30 23:22:28 CET,0.0 1.811 2.322 2.702 3.023 3.292 3.544 3.773 4.161 4.337 4.502 4.711 4.935 5.068 5.318 5.54 5.756 5.864 6.07 6.263 6.533 6.705 6.869 7.097 7.315 7.519 7.716 7.905 8.146 8.381 8.604 8.861 9.098 9.33 9.602 9.891 10.152 10.43 10.732 11.043 11.356 11.7 12.109 12.52 12.973 13.448 13.979 14.573 15.199 15.787 16.241 16.311 16.109 15.79 15.408 14.994 14.59 14.17 13.808 13.432 13.067 12.755 12.458 12.151 11.836 11.55 11.266 10.995 10.751 10.489 10.21 9.983 9.75 9.508 9.307 9.089 8.87 8.634 8.383 8.211 8.032 7.726 7.498 7.258 7.141 6.915 6.668 6.398 6.253 6.009 5.753 5.567 5.376 4.943 4.674 4.369 4.028 3.646 3.142 2.422 0.081 -3 ,2934 ,TETRA ,17622172,Tue Nov 30 21:30:42 CET,Tue Nov 30 23:21:51 CET,0.0 1.867 2.359 2.714 3.015 3.285 3.499 3.694 4.059 4.228 4.386 4.589 4.816 4.945 5.181 5.402 5.607 5.71 5.907 6.085 6.351 6.523 6.682 6.9 7.112 7.318 7.503 7.675 7.891 8.1 8.299 8.531 8.754 8.973 9.219 9.483 9.74 10.014 10.308 10.618 10.95 11.326 11.738 12.136 12.572 13.025 13.543 14.11 14.701 15.247 15.674 15.796 15.635 15.352 15.009 14.625 14.271 13.914 13.571 13.194 12.868 12.588 12.298 12.005 11.715 11.426 11.129 10.867 10.623 10.377 10.124 9.897 9.646 9.395 9.207 8.998 8.776 8.54 8.286 8.108 7.92 7.62 7.409 7.172 7.049 6.786 6.496 6.209 6.06 5.815 5.53 5.311 5.091 4.65 4.402 4.117 3.769 3.343 2.862 2.237 -0.862 -4 ,595 ,TETRA ,17622173,Tue Nov 30 21:36:47 CET,Tue Nov 30 23:32:21 CET,0.0 1.629 2.156 2.541 2.859 3.133 3.383 3.613 3.995 4.17 4.338 4.547 4.775 4.907 5.15 5.378 5.592 5.695 5.89 6.076 6.345 6.513 6.678 6.91 7.124 7.323 7.516 7.713 7.968 8.204 8.443 8.73 8.997 9.245 9.516 9.831 10.132 10.451 10.785 11.141 11.504 11.901 12.346 12.763 13.243 13.769 14.329 14.903 15.499 16.085 16.571 16.597 16.355 15.968 15.544 15.119 14.705 14.314 13.961 13.561 13.176 12.851 12.551 12.244 11.943 11.662 11.37 11.117 10.894 10.654 10.4 10.181 9.951 9.705 9.507 9.295 9.083 8.864 8.612 8.428 8.241 7.962 7.749 7.517 7.4 7.148 6.881 6.606 6.458 6.208 5.948 5.757 5.561 5.117 4.861 4.579 4.239 3.831 3.338 2.635 0.126 -5 ,7979 ,TETRA ,17622174,Tue Nov 30 21:36:44 CET,Tue Nov 30 23:28:32 CET,0.0 1.402 1.912 2.294 2.606 2.877 3.115 3.328 3.705 3.872 4.03 4.237 4.467 4.609 4.862 5.084 5.304 5.409 5.612 5.798 6.051 6.216 6.378 6.611 6.833 7.033 7.214 7.397 7.636 7.863 8.081 8.35 8.616 8.864 9.13 9.422 9.705 10.004 10.314 10.655 11.023 11.404 11.831 12.267 12.748 13.268 13.832 14.387 14.964 15.515 15.889 15.91 15.682 15.359 15.045 14.667 14.292 13.958 13.671 13.362 13.051 12.741 12.438 12.149 11.883 11.631 11.353 11.106 10.876 10.619 10.338 10.109 9.889 9.652 9.456 9.257 9.044 8.813 8.576 8.402 8.219 7.94 7.743 7.532 7.419 7.175 6.91 6.621 6.459 6.209 5.946 5.75 5.554 5.123 4.874 4.616 4.306 3.929 3.451 2.799 -0.337 -6 ,21597 ,TETRA ,17622175,Tue Nov 30 21:36:45 CET,Tue Nov 30 23:28:18 CET,0.0 1.711 2.215 2.582 2.889 3.168 3.415 3.629 4.029 4.203 4.363 4.585 4.82 4.96 5.213 5.456 5.684 5.784 5.98 6.169 6.429 6.585 6.734 6.954 7.166 7.366 7.557 7.74 7.972 8.196 8.407 8.651 8.887 9.12 9.397 9.716 10.001 10.297 10.629 10.966 11.301 11.671 12.096 12.522 13.006 13.52 14.084 14.68 15.246 15.75 16.136 16.183 15.995 15.658 15.259 14.856 14.465 14.071 13.715 13.358 13.028 12.733 12.438 12.139 11.865 11.606 11.321 11.057 10.817 10.57 10.322 10.114 9.891 9.647 9.458 9.255 9.025 8.781 8.532 8.362 8.174 7.87 7.661 7.445 7.323 7.058 6.789 6.514 6.368 6.122 5.851 5.656 5.454 5.005 4.74 4.435 4.104 3.723 3.269 2.617 0.177 -7 ,13279 ,TETRA ,17622176,Tue Nov 30 21:36:44 CET,Tue Nov 30 23:30:59 CET,0.0 1.656 2.144 2.482 2.76 3.007 3.225 3.429 3.797 3.967 4.13 4.324 4.541 4.667 4.895 5.105 5.311 5.411 5.603 5.779 6.021 6.17 6.309 6.518 6.721 6.913 7.094 7.264 7.479 7.69 7.899 8.147 8.369 8.576 8.819 9.076 9.322 9.602 9.901 10.219 10.549 10.913 11.34 11.741 12.165 12.661 13.22 13.776 14.333 14.871 15.304 15.325 15.081 14.764 14.385 14.0 13.634 13.266 12.929 12.577 12.247 11.94 11.659 11.388 11.124 10.864 10.56 10.271 10.02 9.77 9.512 9.285 9.034 8.773 8.585 8.386 8.17 7.946 7.695 7.524 7.347 7.064 6.869 6.66 6.548 6.303 6.047 5.788 5.643 5.401 5.167 4.984 4.793 4.383 4.147 3.888 3.587 3.248 2.833 2.231 -0.258 -8 ,24689 ,TETRA ,17622177,Tue Nov 30 21:36:45 CET,Tue Nov 30 23:28:35 CET,0.0 1.454 1.969 2.33 2.601 2.836 3.059 3.261 3.608 3.768 3.918 4.108 4.327 4.448 4.675 4.885 5.084 5.181 5.374 5.556 5.808 5.965 6.114 6.326 6.532 6.743 6.958 7.16 7.412 7.658 7.889 8.157 8.408 8.638 8.887 9.163 9.43 9.715 10.023 10.351 10.686 11.056 11.479 11.898 12.381 12.88 13.405 13.965 14.583 15.183 15.593 15.652 15.461 15.134 14.775 14.425 14.086 13.732 13.401 13.027 12.68 12.372 12.069 11.784 11.514 11.258 10.983 10.718 10.484 10.248 10.003 9.792 9.551 9.291 9.089 8.878 8.652 8.405 8.142 7.949 7.751 7.457 7.255 7.022 6.901 6.671 6.423 6.141 5.979 5.712 5.417 5.221 5.012 4.55 4.301 4.022 3.69 3.305 2.833 2.139 -0.489 -9 ,3992 ,TETRA ,17622178,Tue Nov 30 21:36:47 CET,Tue Nov 30 23:27:55 CET,0.0 1.923 2.479 2.894 3.239 3.555 3.848 4.105 4.543 4.727 4.899 5.14 5.385 5.534 5.816 6.08 6.318 6.433 6.655 6.855 7.141 7.325 7.504 7.754 7.981 8.203 8.418 8.622 8.881 9.128 9.363 9.631 9.879 10.132 10.427 10.745 11.038 11.332 11.65 12.02 12.388 12.768 13.219 13.655 14.132 14.624 15.148 15.741 16.348 16.922 17.355 17.379 17.153 16.828 16.455 16.046 15.601 15.162 14.821 14.453 14.092 13.776 13.468 13.179 12.901 12.614 12.314 12.022 11.735 11.453 11.179 10.94 10.679 10.417 10.212 9.975 9.726 9.461 9.182 8.995 8.801 8.502 8.302 8.095 7.977 7.724 7.452 7.158 7.005 6.76 6.497 6.305 6.088 5.582 5.3 4.999 4.676 4.266 3.733 2.969 0.272 -10 ,17529 ,TETRA ,17622179,Tue Nov 30 21:36:46 CET,Tue Nov 30 23:31:29 CET,0.0 1.661 2.204 2.586 2.905 3.177 3.412 3.631 4.04 4.22 4.382 4.589 4.816 4.947 5.197 5.432 5.655 5.757 5.951 6.142 6.411 6.576 6.731 6.956 7.172 7.378 7.572 7.759 7.999 8.224 8.432 8.677 8.914 9.134 9.383 9.665 9.943 10.259 10.586 10.918 11.264 11.661 12.129 12.573 13.052 13.566 14.132 14.7 15.255 15.819 16.29 16.345 16.175 15.875 15.516 15.142 14.758 14.377 13.986 13.603 13.296 12.98 12.673 12.38 12.105 11.861 11.574 11.307 11.083 10.838 10.573 10.351 10.127 9.88 9.673 9.46 9.238 9.002 8.754 8.576 8.389 8.104 7.896 7.672 7.557 7.313 7.04 6.752 6.595 6.337 6.062 5.856 5.653 5.233 4.978 4.702 4.402 4.033 3.545 2.884 0.238 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_70.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_70.txt deleted file mode 100644 index e4dbf878..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_70.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28817 ,TETRA ,17622180,Tue Nov 30 21:36:45 CET,Tue Nov 30 23:28:31 CET,0.0 1.655 2.095 2.407 2.653 2.863 3.05 3.218 3.525 3.67 3.805 3.954 4.153 4.259 4.464 4.666 4.848 4.934 5.103 5.258 5.473 5.608 5.739 5.943 6.137 6.313 6.477 6.628 6.824 7.007 7.17 7.366 7.555 7.732 7.932 8.145 8.349 8.585 8.835 9.08 9.33 9.608 9.916 10.206 10.536 10.902 11.309 11.725 12.106 12.429 12.528 12.269 11.863 11.379 10.88 10.412 10.004 9.622 9.281 8.947 8.651 8.381 8.121 7.865 7.623 7.384 7.137 6.922 6.721 6.509 6.276 6.073 5.864 5.653 5.483 5.303 5.115 4.916 4.711 4.565 4.41 4.166 3.991 3.815 3.725 3.532 3.331 3.118 3.005 2.789 2.609 2.466 2.304 1.946 1.754 1.541 1.305 1.04 0.719 0.282 -1.196 -2 ,6629 ,TETRA ,17622181,Tue Nov 30 21:36:46 CET,Tue Nov 30 23:29:09 CET,0.0 1.642 2.147 2.516 2.808 3.056 3.289 3.5 3.869 4.04 4.209 4.426 4.642 4.765 5.0 5.219 5.422 5.517 5.697 5.868 6.099 6.255 6.405 6.609 6.802 6.978 7.147 7.306 7.503 7.699 7.89 8.133 8.365 8.576 8.821 9.093 9.347 9.607 9.887 10.172 10.45 10.761 11.127 11.473 11.84 12.218 12.61 13.006 13.388 13.684 13.799 13.521 13.058 12.534 12.055 11.614 11.181 10.746 10.357 9.959 9.604 9.294 8.99 8.668 8.339 8.048 7.761 7.494 7.263 7.032 6.781 6.566 6.341 6.115 5.946 5.762 5.564 5.359 5.131 4.969 4.81 4.557 4.371 4.173 4.069 3.846 3.61 3.354 3.224 3.007 2.819 2.663 2.493 2.118 1.892 1.642 1.368 1.049 0.652 0.104 -1.476 -3 ,28706 ,TETRA ,17622182,Tue Nov 30 21:36:47 CET,Tue Nov 30 23:27:46 CET,0.0 1.564 2.068 2.429 2.723 2.981 3.209 3.418 3.812 3.989 4.153 4.359 4.58 4.707 4.947 5.167 5.378 5.474 5.653 5.833 6.081 6.23 6.376 6.577 6.765 6.953 7.127 7.288 7.495 7.691 7.87 8.073 8.268 8.457 8.687 8.937 9.16 9.401 9.667 9.952 10.239 10.559 10.909 11.242 11.609 12.002 12.411 12.818 13.214 13.494 13.565 13.296 12.865 12.388 11.895 11.414 10.971 10.555 10.199 9.828 9.497 9.188 8.886 8.595 8.305 8.016 7.705 7.424 7.178 6.922 6.657 6.439 6.218 5.992 5.811 5.62 5.427 5.221 4.99 4.832 4.672 4.411 4.226 4.027 3.926 3.723 3.5 3.246 3.109 2.882 2.664 2.498 2.323 1.921 1.702 1.466 1.172 0.823 0.408 -0.133 -2.063 -4 ,22912 ,TETRA ,17622183,Tue Nov 30 21:36:46 CET,Tue Nov 30 23:30:36 CET,0.0 1.54 2.07 2.429 2.737 3.0 3.223 3.431 3.802 3.97 4.13 4.331 4.553 4.677 4.911 5.129 5.327 5.417 5.596 5.764 5.994 6.136 6.277 6.483 6.673 6.862 7.047 7.214 7.416 7.612 7.816 8.077 8.317 8.534 8.762 9.007 9.254 9.522 9.809 10.099 10.377 10.678 11.033 11.363 11.726 12.122 12.523 12.916 13.294 13.597 13.711 13.463 13.066 12.596 12.105 11.642 11.192 10.742 10.367 9.989 9.631 9.303 8.965 8.628 8.324 8.05 7.749 7.471 7.235 6.98 6.711 6.486 6.249 6.003 5.807 5.589 5.367 5.152 4.922 4.759 4.59 4.323 4.137 3.942 3.843 3.632 3.413 3.172 3.041 2.815 2.58 2.403 2.218 1.812 1.589 1.336 1.056 0.742 0.353 -0.188 -1.929 -5 ,10564 ,TETRA ,17622184,Tue Nov 30 21:36:47 CET,Tue Nov 30 23:31:19 CET,0.0 2.297 2.81 3.183 3.483 3.738 3.98 4.199 4.573 4.737 4.886 5.076 5.297 5.42 5.651 5.869 6.067 6.16 6.335 6.502 6.763 6.928 7.07 7.277 7.484 7.676 7.859 8.03 8.241 8.445 8.632 8.842 9.037 9.231 9.457 9.701 9.94 10.189 10.445 10.717 11.0 11.313 11.648 11.981 12.348 12.705 13.092 13.517 13.878 14.116 14.181 13.918 13.47 12.959 12.457 11.968 11.503 11.092 10.712 10.298 9.948 9.614 9.286 8.974 8.674 8.405 8.116 7.857 7.635 7.38 7.1 6.866 6.623 6.376 6.179 5.962 5.73 5.489 5.228 5.048 4.865 4.578 4.381 4.167 4.049 3.799 3.542 3.27 3.125 2.89 2.666 2.498 2.319 1.922 1.705 1.467 1.196 0.871 0.465 -0.112 -2.421 -6 ,22943 ,TETRA ,17622185,Tue Nov 30 21:36:50 CET,Tue Nov 30 23:18:49 CET,0.0 1.463 1.926 2.281 2.564 2.821 3.06 3.269 3.641 3.814 3.971 4.159 4.382 4.51 4.744 4.967 5.181 5.282 5.474 5.652 5.903 6.079 6.252 6.481 6.691 6.898 7.094 7.269 7.493 7.711 7.912 8.147 8.38 8.602 8.854 9.129 9.38 9.63 9.892 10.191 10.482 10.792 11.148 11.475 11.829 12.201 12.594 12.973 13.334 13.644 13.783 13.502 13.06 12.61 12.169 11.708 11.254 10.82 10.435 10.033 9.679 9.35 9.016 8.709 8.424 8.142 7.836 7.562 7.328 7.094 6.857 6.658 6.431 6.191 6.006 5.799 5.59 5.379 5.148 4.982 4.815 4.562 4.38 4.183 4.08 3.866 3.625 3.369 3.234 3.005 2.782 2.614 2.434 2.044 1.836 1.598 1.314 0.975 0.552 0.005 -1.646 -7 ,21987 ,TETRA ,17622186,Tue Nov 30 21:38:52 CET,Tue Nov 30 23:42:02 CET,0.0 1.832 2.253 2.559 2.809 3.019 3.214 3.394 3.707 3.847 3.983 4.152 4.353 4.458 4.657 4.84 5.017 5.105 5.274 5.43 5.643 5.779 5.907 6.085 6.252 6.411 6.571 6.728 6.921 7.092 7.251 7.441 7.626 7.815 8.03 8.261 8.48 8.713 8.953 9.202 9.48 9.794 10.122 10.439 10.792 11.158 11.547 11.924 12.261 12.529 12.616 12.319 11.901 11.423 10.927 10.436 9.982 9.568 9.195 8.81 8.465 8.126 7.801 7.495 7.197 6.921 6.633 6.365 6.114 5.855 5.611 5.409 5.187 4.959 4.789 4.614 4.42 4.211 3.998 3.848 3.685 3.421 3.234 3.037 2.93 2.71 2.481 2.229 2.09 1.859 1.654 1.498 1.333 0.931 0.695 0.444 0.167 -0.167 -0.584 -1.123 -3.41 -8 ,19169 ,TETRA ,17622187,Tue Nov 30 21:38:54 CET,Tue Nov 30 23:34:13 CET,0.0 1.129 1.541 1.848 2.093 2.307 2.497 2.666 2.973 3.111 3.241 3.394 3.593 3.696 3.892 4.086 4.272 4.357 4.525 4.683 4.9 5.039 5.165 5.349 5.534 5.717 5.89 6.039 6.224 6.413 6.592 6.807 7.019 7.219 7.449 7.708 7.96 8.222 8.477 8.742 9.016 9.312 9.637 9.959 10.335 10.735 11.134 11.512 11.9 12.217 12.28 11.974 11.55 11.064 10.561 10.074 9.643 9.248 8.888 8.508 8.145 7.802 7.469 7.144 6.852 6.58 6.292 6.024 5.785 5.544 5.286 5.071 4.838 4.591 4.406 4.216 4.019 3.808 3.572 3.403 3.229 2.962 2.774 2.572 2.468 2.248 2.016 1.777 1.647 1.414 1.2 1.039 0.865 0.484 0.264 0.004 -0.279 -0.59 -0.974 -1.524 -3.667 -9 ,15668 ,TETRA ,17622188,Tue Nov 30 21:38:56 CET,Tue Nov 30 23:32:34 CET,0.0 1.662 2.211 2.604 2.914 3.168 3.394 3.596 3.957 4.125 4.283 4.483 4.712 4.855 5.131 5.377 5.604 5.714 5.921 6.121 6.395 6.563 6.735 6.985 7.215 7.426 7.622 7.812 8.056 8.272 8.474 8.726 8.967 9.181 9.416 9.68 9.925 10.174 10.432 10.722 11.028 11.345 11.702 12.038 12.393 12.776 13.192 13.618 14.018 14.357 14.488 14.169 13.694 13.208 12.756 12.314 11.879 11.443 11.059 10.68 10.344 10.017 9.682 9.356 9.043 8.751 8.446 8.166 7.922 7.679 7.424 7.21 6.984 6.738 6.536 6.318 6.089 5.86 5.611 5.425 5.244 4.986 4.806 4.604 4.497 4.28 4.053 3.812 3.68 3.45 3.236 3.062 2.881 2.48 2.253 2.01 1.739 1.42 1.03 0.474 -1.482 -10 ,16165 ,TETRA ,17622189,Tue Nov 30 21:38:52 CET,Tue Nov 30 23:38:42 CET,0.0 1.32 1.817 2.185 2.475 2.734 2.955 3.146 3.498 3.663 3.821 4.018 4.233 4.351 4.567 4.772 4.972 5.071 5.253 5.418 5.656 5.809 5.952 6.16 6.365 6.553 6.727 6.893 7.097 7.289 7.467 7.677 7.882 8.077 8.287 8.525 8.764 9.007 9.25 9.503 9.762 10.047 10.361 10.654 10.983 11.337 11.704 12.068 12.385 12.624 12.709 12.455 12.066 11.657 11.226 10.757 10.297 9.842 9.448 9.059 8.705 8.377 8.049 7.735 7.443 7.165 6.874 6.621 6.389 6.122 5.842 5.62 5.391 5.153 4.968 4.761 4.528 4.296 4.048 3.869 3.691 3.415 3.211 2.998 2.883 2.629 2.36 2.088 1.952 1.726 1.526 1.367 1.199 0.811 0.589 0.345 0.059 -0.283 -0.7 -1.249 -3.283 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_70_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_70_62.txt deleted file mode 100644 index 878a2917..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/pfkfb3/water/Summary_FEP_70_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11419 ,TETRA ,17622190,Tue Nov 30 21:38:55 CET,Tue Nov 30 23:33:49 CET,0.0 1.692 2.231 2.658 2.989 3.269 3.537 3.775 4.201 4.389 4.564 4.795 5.036 5.182 5.463 5.738 5.985 6.098 6.324 6.549 6.866 7.061 7.244 7.51 7.762 7.988 8.202 8.407 8.671 8.919 9.163 9.47 9.766 10.034 10.323 10.646 10.968 11.323 11.692 12.06 12.434 12.854 13.343 13.86 14.416 14.998 15.641 16.322 17.095 17.934 18.769 19.205 19.235 19.067 18.826 18.579 18.29 17.974 17.703 17.399 17.113 16.842 16.56 16.294 16.043 15.81 15.562 15.327 15.11 14.865 14.601 14.368 14.122 13.88 13.698 13.514 13.31 13.092 12.873 12.714 12.543 12.273 12.075 11.865 11.757 11.532 11.287 11.014 10.869 10.636 10.384 10.2 10.005 9.561 9.313 9.03 8.701 8.305 7.802 7.084 4.409 -2 ,23686 ,TETRA ,17622191,Tue Nov 30 21:38:56 CET,Tue Nov 30 23:32:18 CET,0.0 2.008 2.536 2.921 3.255 3.541 3.794 4.024 4.411 4.593 4.767 4.998 5.238 5.375 5.646 5.905 6.136 6.241 6.437 6.63 6.904 7.076 7.243 7.487 7.716 7.936 8.147 8.342 8.591 8.825 9.043 9.302 9.549 9.789 10.074 10.39 10.695 11.034 11.388 11.749 12.133 12.567 13.056 13.53 14.051 14.64 15.278 15.932 16.693 17.516 18.321 18.69 18.738 18.596 18.354 18.113 17.865 17.607 17.344 17.046 16.768 16.494 16.214 15.95 15.694 15.442 15.17 14.926 14.719 14.49 14.232 14.018 13.796 13.562 13.369 13.157 12.934 12.703 12.448 12.274 12.095 11.799 11.583 11.352 11.232 10.962 10.67 10.366 10.209 9.972 9.704 9.516 9.324 8.886 8.624 8.317 7.98 7.596 7.099 6.405 3.486 -3 ,17508 ,TETRA ,17622192,Tue Nov 30 21:38:52 CET,Tue Nov 30 23:30:58 CET,0.0 1.933 2.465 2.842 3.169 3.465 3.729 3.959 4.368 4.553 4.724 4.957 5.199 5.343 5.603 5.832 6.062 6.176 6.385 6.584 6.873 7.047 7.208 7.444 7.669 7.883 8.089 8.291 8.546 8.781 9.004 9.275 9.533 9.77 10.047 10.371 10.675 10.992 11.314 11.647 11.991 12.393 12.891 13.376 13.918 14.514 15.194 15.933 16.69 17.497 18.351 18.801 18.87 18.719 18.451 18.144 17.858 17.599 17.329 17.013 16.725 16.461 16.204 15.945 15.685 15.429 15.15 14.886 14.652 14.411 14.16 13.946 13.714 13.461 13.248 13.031 12.814 12.583 12.329 12.149 11.966 11.675 11.468 11.256 11.141 10.899 10.649 10.376 10.227 9.985 9.714 9.52 9.308 8.791 8.516 8.233 7.903 7.519 7.021 6.341 3.597 -4 ,25282 ,TETRA ,17622193,Tue Nov 30 21:38:55 CET,Tue Nov 30 23:29:09 CET,0.0 1.76 2.31 2.715 3.036 3.316 3.569 3.797 4.19 4.371 4.546 4.773 5.013 5.154 5.419 5.679 5.919 6.026 6.226 6.419 6.702 6.878 7.045 7.291 7.532 7.766 7.978 8.171 8.428 8.67 8.902 9.188 9.457 9.719 10.019 10.345 10.659 11.0 11.357 11.745 12.157 12.583 13.064 13.537 14.067 14.654 15.294 15.993 16.797 17.655 18.48 18.874 18.929 18.837 18.62 18.326 18.062 17.807 17.537 17.223 16.918 16.63 16.349 16.069 15.803 15.55 15.271 15.023 14.805 14.571 14.318 14.105 13.884 13.651 13.467 13.263 13.033 12.787 12.538 12.364 12.18 11.892 11.693 11.476 11.356 11.095 10.819 10.522 10.359 10.11 9.837 9.644 9.45 9.012 8.767 8.484 8.144 7.75 7.274 6.597 4.388 -5 ,2863 ,TETRA ,17622194,Tue Nov 30 21:38:53 CET,Tue Nov 30 23:39:09 CET,0.0 1.699 2.218 2.602 2.914 3.201 3.459 3.693 4.108 4.295 4.471 4.708 4.952 5.094 5.356 5.601 5.827 5.934 6.136 6.332 6.626 6.809 6.975 7.209 7.441 7.662 7.871 8.077 8.336 8.583 8.822 9.102 9.354 9.596 9.875 10.183 10.48 10.795 11.139 11.52 11.917 12.342 12.836 13.356 13.934 14.517 15.156 15.817 16.518 17.27 18.036 18.443 18.481 18.374 18.207 17.993 17.739 17.478 17.227 16.956 16.709 16.467 16.223 15.997 15.766 15.547 15.31 15.088 14.895 14.678 14.434 14.233 14.025 13.791 13.602 13.407 13.2 12.982 12.748 12.579 12.398 12.106 11.898 11.69 11.584 11.346 11.085 10.805 10.655 10.413 10.15 9.967 9.763 9.279 9.005 8.717 8.391 7.974 7.46 6.817 3.936 -6 ,21938 ,TETRA ,17622195,Tue Nov 30 21:38:55 CET,Tue Nov 30 23:32:31 CET,0.0 1.786 2.346 2.754 3.074 3.355 3.606 3.831 4.231 4.415 4.591 4.832 5.075 5.21 5.465 5.697 5.913 6.021 6.234 6.434 6.725 6.907 7.073 7.315 7.545 7.758 7.969 8.169 8.41 8.634 8.866 9.143 9.395 9.646 9.94 10.262 10.574 10.93 11.292 11.661 12.05 12.485 12.979 13.433 13.952 14.537 15.201 15.915 16.662 17.45 18.291 18.711 18.692 18.524 18.284 18.013 17.713 17.404 17.123 16.795 16.507 16.232 15.937 15.668 15.428 15.202 14.948 14.714 14.507 14.269 14.013 13.81 13.583 13.341 13.158 12.959 12.738 12.502 12.265 12.1 11.932 11.66 11.447 11.217 11.102 10.867 10.605 10.328 10.18 9.93 9.668 9.481 9.28 8.823 8.562 8.283 7.961 7.582 7.079 6.352 4.109 -7 ,22379 ,TETRA ,17622196,Tue Nov 30 21:38:55 CET,Tue Nov 30 23:31:23 CET,0.0 1.644 2.16 2.544 2.865 3.153 3.408 3.629 4.049 4.243 4.417 4.649 4.883 5.02 5.28 5.528 5.765 5.874 6.081 6.286 6.585 6.762 6.925 7.162 7.384 7.598 7.799 7.984 8.234 8.471 8.691 8.951 9.202 9.442 9.713 10.023 10.32 10.643 10.982 11.32 11.671 12.074 12.539 12.986 13.511 14.08 14.714 15.44 16.236 17.068 17.873 18.23 18.245 18.102 17.892 17.628 17.349 17.072 16.777 16.444 16.149 15.875 15.596 15.312 15.044 14.783 14.488 14.231 14.005 13.754 13.486 13.266 13.04 12.803 12.615 12.414 12.195 11.96 11.725 11.566 11.392 11.108 10.915 10.711 10.595 10.343 10.086 9.803 9.644 9.398 9.134 8.941 8.737 8.283 8.025 7.754 7.436 7.063 6.592 5.901 2.777 -8 ,8172 ,TETRA ,17622197,Tue Nov 30 21:38:55 CET,Tue Nov 30 23:38:05 CET,0.0 1.835 2.334 2.695 2.996 3.265 3.522 3.775 4.218 4.402 4.57 4.787 5.026 5.169 5.436 5.674 5.897 6.007 6.23 6.458 6.762 6.932 7.102 7.351 7.582 7.799 8.008 8.217 8.474 8.71 8.942 9.224 9.485 9.728 10.026 10.376 10.695 11.033 11.406 11.788 12.165 12.603 13.124 13.61 14.132 14.7 15.349 16.059 16.861 17.713 18.529 18.924 18.98 18.896 18.683 18.413 18.136 17.841 17.568 17.276 16.983 16.695 16.412 16.149 15.889 15.635 15.369 15.125 14.912 14.689 14.459 14.261 14.055 13.841 13.662 13.481 13.289 13.085 12.855 12.683 12.509 12.234 12.036 11.831 11.726 11.493 11.236 10.979 10.845 10.609 10.354 10.164 9.955 9.498 9.243 8.959 8.623 8.218 7.745 7.058 4.105 -9 ,30000 ,TETRA ,17622198,Tue Nov 30 21:38:55 CET,Tue Nov 30 23:32:57 CET,0.0 1.508 2.056 2.437 2.754 3.044 3.294 3.511 3.915 4.107 4.288 4.522 4.758 4.901 5.164 5.408 5.638 5.745 5.952 6.164 6.47 6.652 6.82 7.063 7.288 7.495 7.693 7.891 8.153 8.394 8.619 8.895 9.165 9.431 9.739 10.064 10.366 10.705 11.064 11.436 11.812 12.229 12.712 13.181 13.713 14.303 14.974 15.676 16.426 17.245 18.11 18.553 18.553 18.373 18.166 17.913 17.641 17.343 17.042 16.733 16.473 16.234 15.986 15.743 15.502 15.256 15.003 14.771 14.56 14.33 14.066 13.848 13.617 13.357 13.15 12.928 12.702 12.476 12.242 12.073 11.881 11.585 11.381 11.154 11.035 10.79 10.54 10.275 10.127 9.889 9.635 9.45 9.249 8.793 8.521 8.225 7.902 7.515 7.029 6.39 4.389 -10 ,1750 ,TETRA ,17622199,Tue Nov 30 21:38:58 CET,Tue Nov 30 23:31:23 CET,0.0 1.631 2.172 2.563 2.889 3.169 3.413 3.635 4.034 4.22 4.393 4.612 4.843 4.978 5.232 5.475 5.704 5.81 6.022 6.224 6.5 6.674 6.842 7.082 7.309 7.527 7.745 7.951 8.2 8.443 8.672 8.952 9.224 9.475 9.752 10.064 10.357 10.665 11.003 11.358 11.745 12.181 12.655 13.127 13.681 14.275 14.915 15.599 16.372 17.202 17.988 18.377 18.382 18.234 18.009 17.764 17.509 17.21 16.912 16.585 16.276 15.978 15.697 15.438 15.198 14.977 14.735 14.517 14.326 14.113 13.885 13.68 13.465 13.241 13.063 12.879 12.675 12.454 12.224 12.057 11.887 11.624 11.427 11.22 11.111 10.876 10.619 10.342 10.195 9.954 9.674 9.479 9.278 8.817 8.556 8.274 7.943 7.557 7.063 6.341 3.877 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_11_10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_11_10.txt deleted file mode 100644 index a14efe6d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_11_10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2902 ,KEBNE ,16748565,Tue Nov 30 06:07:33 CET,Tue Nov 30 08:07:26 CET,0.0 0.941 1.397 1.749 2.02 2.259 2.486 2.705 3.089 3.253 3.415 3.643 3.874 4.022 4.295 4.543 4.781 4.898 5.128 5.359 5.689 5.901 6.106 6.39 6.659 6.921 7.178 7.437 7.767 8.082 8.398 8.774 9.125 9.472 9.887 10.369 10.828 11.326 11.861 12.408 12.983 13.635 14.381 15.151 16.063 17.08 18.317 19.715 21.353 23.353 25.755 27.719 28.783 29.453 29.872 30.072 30.144 30.137 30.091 29.994 29.886 29.783 29.651 29.478 29.3 29.14 28.97 28.823 28.706 28.575 28.433 28.309 28.15 27.968 27.823 27.674 27.527 27.359 27.155 27.008 26.862 26.631 26.473 26.301 26.206 26.007 25.794 25.555 25.432 25.249 25.031 24.866 24.679 24.273 24.055 23.795 23.5 23.15 22.706 22.083 19.103 -2 ,24302 ,KEBNE ,16748566,Tue Nov 30 06:07:33 CET,Tue Nov 30 08:07:35 CET,0.0 1.03 1.49 1.816 2.107 2.371 2.599 2.805 3.187 3.364 3.531 3.767 3.996 4.144 4.414 4.672 4.915 5.035 5.266 5.484 5.804 6.018 6.225 6.519 6.813 7.092 7.345 7.581 7.894 8.211 8.512 8.872 9.224 9.565 9.966 10.414 10.848 11.326 11.826 12.348 12.926 13.586 14.366 15.193 16.156 17.233 18.458 19.834 21.493 23.491 25.879 27.832 29.007 29.699 30.083 30.272 30.339 30.344 30.271 30.129 29.97 29.796 29.605 29.43 29.284 29.112 28.894 28.706 28.557 28.401 28.216 28.043 27.854 27.666 27.513 27.347 27.182 27.0 26.798 26.642 26.475 26.21 26.014 25.811 25.712 25.513 25.297 25.039 24.887 24.672 24.405 24.229 24.038 23.622 23.399 23.14 22.816 22.445 21.995 21.342 18.486 -3 ,29780 ,KEBNE ,16748567,Tue Nov 30 06:07:34 CET,Tue Nov 30 08:08:10 CET,0.0 0.9 1.349 1.688 1.998 2.296 2.571 2.783 3.142 3.315 3.481 3.696 3.923 4.073 4.366 4.63 4.867 4.982 5.202 5.412 5.725 5.924 6.119 6.403 6.675 6.941 7.194 7.445 7.767 8.072 8.37 8.734 9.075 9.408 9.804 10.247 10.678 11.153 11.675 12.229 12.8 13.47 14.29 15.102 15.999 17.009 18.222 19.614 21.223 23.153 25.525 27.334 28.337 28.933 29.296 29.496 29.595 29.668 29.7 29.645 29.549 29.444 29.33 29.214 29.077 28.929 28.759 28.598 28.456 28.292 28.091 27.922 27.765 27.583 27.419 27.257 27.09 26.891 26.686 26.563 26.429 26.211 26.047 25.869 25.783 25.602 25.411 25.196 25.071 24.863 24.587 24.403 24.213 23.779 23.534 23.252 22.927 22.589 22.164 21.515 19.343 -4 ,29118 ,KEBNE ,16748568,Tue Nov 30 06:08:35 CET,Tue Nov 30 08:12:07 CET,0.0 0.995 1.439 1.79 2.076 2.339 2.579 2.789 3.151 3.32 3.485 3.722 3.958 4.103 4.401 4.686 4.957 5.093 5.345 5.578 5.909 6.126 6.335 6.636 6.922 7.198 7.474 7.739 8.085 8.419 8.735 9.121 9.495 9.852 10.256 10.712 11.163 11.675 12.217 12.79 13.395 14.055 14.816 15.599 16.54 17.597 18.833 20.248 21.931 23.939 26.344 28.272 29.424 30.137 30.532 30.734 30.815 30.821 30.777 30.672 30.543 30.419 30.298 30.182 30.055 29.907 29.729 29.578 29.442 29.291 29.131 28.985 28.832 28.675 28.53 28.373 28.223 28.056 27.878 27.753 27.618 27.411 27.262 27.098 27.009 26.822 26.617 26.376 26.242 26.047 25.837 25.691 25.508 25.072 24.809 24.532 24.255 23.915 23.468 22.84 20.162 -5 ,15218 ,KEBNE ,16748569,Tue Nov 30 06:08:34 CET,Tue Nov 30 08:10:22 CET,0.0 0.894 1.354 1.681 1.956 2.21 2.433 2.641 3.034 3.203 3.355 3.572 3.808 3.965 4.249 4.516 4.772 4.893 5.122 5.346 5.672 5.876 6.076 6.375 6.664 6.931 7.19 7.443 7.775 8.103 8.417 8.781 9.112 9.442 9.83 10.261 10.7 11.188 11.704 12.266 12.876 13.57 14.386 15.196 16.124 17.165 18.406 19.846 21.491 23.406 25.764 27.786 28.924 29.546 29.9 30.064 30.082 30.043 30.005 29.938 29.826 29.701 29.574 29.43 29.256 29.065 28.877 28.724 28.582 28.413 28.213 28.032 27.836 27.651 27.512 27.356 27.193 27.017 26.832 26.703 26.563 26.336 26.182 26.023 25.931 25.727 25.481 25.225 25.101 24.911 24.708 24.55 24.379 23.993 23.763 23.518 23.26 22.932 22.508 21.873 19.132 -6 ,4376 ,KEBNE ,16748570,Tue Nov 30 06:08:34 CET,Tue Nov 30 08:07:45 CET,0.0 0.911 1.393 1.751 2.062 2.324 2.554 2.773 3.162 3.339 3.499 3.733 3.966 4.107 4.378 4.638 4.886 5.007 5.239 5.46 5.784 5.997 6.21 6.508 6.775 7.04 7.306 7.558 7.888 8.211 8.51 8.868 9.225 9.574 9.964 10.394 10.814 11.287 11.813 12.39 12.986 13.669 14.503 15.318 16.248 17.292 18.508 19.891 21.551 23.524 25.895 27.792 28.845 29.445 29.75 29.918 29.974 29.959 29.908 29.826 29.713 29.585 29.439 29.255 29.08 28.932 28.757 28.563 28.366 28.162 27.954 27.773 27.588 27.401 27.239 27.062 26.881 26.682 26.46 26.311 26.154 25.91 25.753 25.567 25.466 25.252 25.026 24.803 24.682 24.484 24.235 24.063 23.883 23.454 23.202 22.919 22.607 22.262 21.818 21.207 17.677 -7 ,26657 ,KEBNE ,16748571,Tue Nov 30 06:08:35 CET,Tue Nov 30 08:12:02 CET,0.0 0.832 1.309 1.643 1.908 2.158 2.387 2.588 2.951 3.119 3.283 3.531 3.766 3.902 4.172 4.44 4.695 4.816 5.049 5.277 5.618 5.83 6.019 6.297 6.558 6.805 7.056 7.304 7.631 7.945 8.255 8.629 8.98 9.323 9.724 10.173 10.609 11.086 11.6 12.149 12.734 13.4 14.189 14.986 15.905 16.967 18.233 19.627 21.245 23.284 25.838 27.921 29.081 29.705 30.032 30.196 30.237 30.189 30.102 29.973 29.834 29.687 29.543 29.406 29.254 29.108 28.95 28.799 28.658 28.511 28.351 28.198 28.04 27.862 27.708 27.545 27.364 27.186 26.992 26.841 26.673 26.427 26.274 26.107 26.023 25.854 25.665 25.452 25.334 25.145 24.921 24.761 24.58 24.124 23.861 23.593 23.274 22.914 22.503 21.916 18.753 -8 ,6641 ,KEBNE ,16748572,Tue Nov 30 06:08:35 CET,Tue Nov 30 08:09:20 CET,0.0 0.918 1.394 1.763 2.045 2.295 2.512 2.725 3.132 3.325 3.505 3.753 4.004 4.153 4.44 4.719 4.973 5.093 5.334 5.568 5.889 6.098 6.303 6.596 6.877 7.15 7.411 7.665 7.985 8.287 8.59 8.956 9.301 9.645 10.058 10.52 10.952 11.415 11.931 12.511 13.118 13.787 14.579 15.357 16.274 17.296 18.442 19.802 21.454 23.434 25.89 27.938 29.119 29.805 30.155 30.347 30.402 30.375 30.281 30.108 29.931 29.78 29.635 29.471 29.305 29.163 28.981 28.79 28.638 28.47 28.278 28.102 27.923 27.747 27.592 27.438 27.263 27.046 26.826 26.69 26.544 26.283 26.096 25.91 25.818 25.619 25.397 25.152 25.017 24.81 24.554 24.394 24.228 23.87 23.654 23.393 23.09 22.729 22.269 21.58 18.579 -9 ,5783 ,KEBNE ,16748573,Tue Nov 30 06:08:34 CET,Tue Nov 30 08:09:18 CET,0.0 0.896 1.385 1.778 2.119 2.403 2.642 2.859 3.254 3.442 3.631 3.92 4.171 4.325 4.626 4.9 5.158 5.282 5.514 5.732 6.056 6.267 6.468 6.758 7.035 7.303 7.566 7.823 8.153 8.466 8.77 9.139 9.499 9.846 10.252 10.713 11.159 11.649 12.156 12.696 13.272 13.935 14.724 15.507 16.437 17.5 18.725 20.137 21.785 23.688 26.093 28.145 29.268 29.893 30.213 30.373 30.458 30.462 30.425 30.324 30.185 30.063 29.93 29.792 29.646 29.501 29.337 29.162 29.006 28.862 28.721 28.595 28.446 28.271 28.125 27.972 27.805 27.619 27.422 27.295 27.158 26.929 26.772 26.601 26.507 26.305 26.09 25.84 25.702 25.509 25.266 25.1 24.913 24.506 24.279 24.015 23.713 23.33 22.893 22.3 20.285 -10 ,2466 ,KEBNE ,16748574,Tue Nov 30 06:08:35 CET,Tue Nov 30 08:09:56 CET,0.0 1.249 1.755 2.117 2.425 2.713 2.973 3.205 3.608 3.791 3.967 4.209 4.443 4.586 4.855 5.117 5.365 5.485 5.714 5.935 6.264 6.474 6.66 6.93 7.209 7.481 7.741 7.989 8.305 8.62 8.925 9.289 9.639 9.967 10.345 10.778 11.207 11.687 12.193 12.729 13.323 14.01 14.789 15.557 16.448 17.451 18.617 19.94 21.558 23.618 26.166 28.195 29.303 29.889 30.19 30.333 30.365 30.316 30.198 30.032 29.883 29.721 29.505 29.265 29.047 28.877 28.682 28.469 28.288 28.1 27.899 27.736 27.549 27.325 27.148 26.966 26.77 26.571 26.378 26.243 26.093 25.844 25.66 25.469 25.366 25.136 24.899 24.662 24.532 24.329 24.08 23.914 23.737 23.315 23.069 22.794 22.458 22.06 21.566 20.84 18.136 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index 938e3fb4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9110 ,KEBNE ,16748575,Tue Nov 30 06:09:35 CET,Tue Nov 30 08:10:51 CET,0.0 1.603 2.093 2.422 2.693 2.92 3.107 3.282 3.582 3.718 3.854 4.016 4.212 4.316 4.499 4.671 4.839 4.915 5.061 5.201 5.394 5.51 5.628 5.794 5.941 6.087 6.229 6.358 6.514 6.655 6.784 6.945 7.085 7.196 7.319 7.454 7.57 7.658 7.725 7.793 7.848 7.883 7.872 7.8 7.675 7.542 7.311 6.833 6.096 4.898 2.656 -0.065 -2.329 -4.393 -6.297 -7.898 -9.275 -10.563 -11.673 -12.778 -13.701 -14.525 -15.309 -16.031 -16.686 -17.27 -17.891 -18.46 -18.948 -19.44 -19.945 -20.365 -20.809 -21.266 -21.619 -21.996 -22.382 -22.763 -23.14 -23.377 -23.604 -24.007 -24.324 -24.658 -24.832 -25.209 -25.618 -26.049 -26.272 -26.616 -26.964 -27.223 -27.497 -28.084 -28.414 -28.772 -29.152 -29.617 -30.24 -31.101 -34.334 -2 ,22977 ,KEBNE ,16748576,Tue Nov 30 06:09:35 CET,Tue Nov 30 08:10:32 CET,0.0 2.576 3.091 3.433 3.687 3.891 4.071 4.245 4.559 4.7 4.827 4.971 5.163 5.26 5.427 5.58 5.726 5.794 5.941 6.079 6.257 6.364 6.464 6.6 6.722 6.845 6.968 7.079 7.228 7.362 7.467 7.586 7.692 7.79 7.892 8.007 8.105 8.187 8.275 8.358 8.423 8.47 8.485 8.47 8.375 8.212 8.012 7.66 6.998 5.851 3.773 1.157 -1.087 -2.984 -4.561 -5.956 -7.163 -8.241 -9.162 -10.077 -10.839 -11.5 -12.124 -12.722 -13.298 -13.813 -14.325 -14.786 -15.202 -15.629 -16.065 -16.433 -16.809 -17.208 -17.515 -17.843 -18.219 -18.608 -18.984 -19.221 -19.455 -19.831 -20.091 -20.358 -20.492 -20.767 -21.106 -21.509 -21.72 -22.047 -22.382 -22.634 -22.888 -23.458 -23.784 -24.135 -24.535 -25.005 -25.588 -26.378 -29.619 -3 ,11713 ,KEBNE ,16748577,Tue Nov 30 06:10:36 CET,Tue Nov 30 08:10:47 CET,0.0 1.451 1.921 2.266 2.54 2.756 2.935 3.101 3.395 3.526 3.656 3.806 3.989 4.083 4.265 4.422 4.564 4.633 4.762 4.875 5.041 5.149 5.245 5.379 5.513 5.644 5.766 5.886 6.041 6.176 6.296 6.44 6.565 6.67 6.793 6.917 7.004 7.092 7.195 7.293 7.368 7.415 7.419 7.394 7.31 7.161 6.914 6.444 5.714 4.547 2.407 -0.251 -2.401 -4.192 -5.688 -7.016 -8.235 -9.321 -10.25 -11.194 -12.006 -12.733 -13.412 -14.061 -14.679 -15.226 -15.782 -16.272 -16.699 -17.139 -17.589 -17.958 -18.341 -18.741 -19.061 -19.39 -19.719 -20.07 -20.452 -20.723 -21.001 -21.403 -21.692 -22.019 -22.182 -22.509 -22.853 -23.215 -23.41 -23.725 -24.019 -24.26 -24.516 -25.072 -25.386 -25.732 -26.12 -26.561 -27.113 -27.928 -30.632 -4 ,3657 ,KEBNE ,16748578,Tue Nov 30 06:11:38 CET,Tue Nov 30 08:12:29 CET,0.0 1.782 2.228 2.55 2.834 3.065 3.252 3.418 3.716 3.849 3.967 4.086 4.261 4.355 4.544 4.71 4.854 4.928 5.075 5.205 5.387 5.493 5.595 5.76 5.898 6.012 6.126 6.231 6.356 6.475 6.592 6.723 6.843 6.955 7.08 7.204 7.312 7.416 7.495 7.555 7.601 7.625 7.628 7.617 7.554 7.421 7.168 6.729 6.012 4.83 2.658 -0.114 -2.35 -4.227 -5.831 -7.197 -8.308 -9.302 -10.174 -11.051 -11.86 -12.588 -13.259 -13.886 -14.467 -14.978 -15.502 -16.003 -16.451 -16.91 -17.367 -17.735 -18.124 -18.544 -18.866 -19.183 -19.515 -19.853 -20.229 -20.505 -20.791 -21.239 -21.558 -21.898 -22.066 -22.403 -22.764 -23.145 -23.338 -23.656 -23.971 -24.194 -24.432 -24.952 -25.241 -25.566 -25.939 -26.362 -26.863 -27.614 -30.142 -5 ,2914 ,KEBNE ,16748579,Tue Nov 30 06:11:38 CET,Tue Nov 30 08:13:27 CET,0.0 1.457 1.923 2.261 2.552 2.778 2.969 3.153 3.479 3.617 3.748 3.888 4.073 4.172 4.356 4.53 4.691 4.767 4.909 5.044 5.225 5.334 5.444 5.605 5.751 5.89 6.016 6.128 6.275 6.414 6.543 6.695 6.839 6.976 7.131 7.292 7.435 7.566 7.697 7.838 7.956 8.064 8.14 8.167 8.153 8.022 7.729 7.302 6.613 5.401 3.214 0.475 -1.825 -3.803 -5.471 -6.919 -8.199 -9.382 -10.375 -11.314 -12.123 -12.846 -13.523 -14.152 -14.733 -15.27 -15.852 -16.372 -16.806 -17.245 -17.701 -18.079 -18.467 -18.874 -19.194 -19.522 -19.859 -20.212 -20.578 -20.825 -21.072 -21.467 -21.767 -22.095 -22.269 -22.634 -23.022 -23.435 -23.643 -23.977 -24.32 -24.554 -24.797 -25.335 -25.633 -25.947 -26.291 -26.705 -27.209 -27.91 -30.888 -6 ,17467 ,KEBNE ,16748580,Tue Nov 30 06:11:37 CET,Tue Nov 30 08:12:16 CET,0.0 2.423 2.898 3.213 3.467 3.701 3.917 4.107 4.418 4.548 4.67 4.812 5.007 5.109 5.288 5.454 5.605 5.675 5.816 5.949 6.125 6.229 6.321 6.453 6.591 6.72 6.823 6.922 7.056 7.178 7.296 7.428 7.547 7.667 7.784 7.886 7.98 8.083 8.172 8.241 8.293 8.314 8.291 8.227 8.096 7.913 7.647 7.177 6.341 5.063 2.929 0.138 -2.19 -4.131 -5.756 -7.34 -8.836 -10.119 -11.215 -12.32 -13.254 -14.068 -14.814 -15.518 -16.176 -16.77 -17.394 -17.939 -18.389 -18.87 -19.397 -19.837 -20.291 -20.776 -21.149 -21.511 -21.878 -22.263 -22.669 -22.95 -23.244 -23.725 -24.056 -24.397 -24.582 -24.972 -25.373 -25.786 -26.006 -26.362 -26.724 -26.982 -27.254 -27.851 -28.177 -28.555 -29.002 -29.532 -30.251 -31.155 -34.564 -7 ,26940 ,KEBNE ,16748581,Tue Nov 30 06:11:37 CET,Tue Nov 30 08:11:55 CET,0.0 2.204 2.682 3.015 3.273 3.501 3.699 3.89 4.209 4.333 4.448 4.575 4.758 4.852 5.041 5.201 5.335 5.398 5.522 5.646 5.818 5.919 6.017 6.164 6.305 6.422 6.525 6.625 6.755 6.88 6.999 7.126 7.239 7.347 7.452 7.553 7.635 7.712 7.796 7.872 7.933 7.996 8.043 8.024 7.927 7.785 7.544 7.114 6.397 5.224 3.142 0.392 -1.836 -3.691 -5.266 -6.654 -7.861 -8.947 -9.906 -10.84 -11.62 -12.322 -12.984 -13.598 -14.173 -14.742 -15.372 -15.932 -16.408 -16.878 -17.38 -17.805 -18.219 -18.621 -18.933 -19.254 -19.578 -19.911 -20.249 -20.487 -20.737 -21.142 -21.439 -21.763 -21.935 -22.306 -22.679 -23.058 -23.269 -23.619 -23.951 -24.191 -24.463 -25.071 -25.408 -25.767 -26.167 -26.645 -27.249 -28.083 -30.946 -8 ,10594 ,KEBNE ,16748582,Tue Nov 30 06:11:37 CET,Tue Nov 30 08:13:59 CET,0.0 2.086 2.567 2.892 3.163 3.413 3.649 3.846 4.157 4.295 4.429 4.591 4.771 4.857 5.014 5.174 5.335 5.412 5.561 5.699 5.884 5.996 6.102 6.245 6.373 6.493 6.607 6.717 6.852 6.976 7.084 7.2 7.296 7.375 7.466 7.562 7.648 7.745 7.817 7.88 7.921 7.933 7.942 7.892 7.767 7.593 7.325 6.821 5.983 4.719 2.549 -0.085 -2.223 -4.109 -5.709 -7.135 -8.443 -9.564 -10.54 -11.534 -12.351 -13.09 -13.801 -14.513 -15.218 -15.84 -16.449 -16.979 -17.453 -17.975 -18.52 -18.975 -19.465 -19.985 -20.364 -20.742 -21.167 -21.612 -22.067 -22.384 -22.714 -23.216 -23.566 -23.947 -24.14 -24.534 -24.969 -25.435 -25.668 -26.033 -26.475 -26.758 -27.053 -27.69 -28.052 -28.461 -28.915 -29.453 -30.137 -31.1 -34.408 -9 ,21947 ,KEBNE ,16748583,Tue Nov 30 06:11:38 CET,Tue Nov 30 08:14:02 CET,0.0 2.16 2.693 3.043 3.32 3.554 3.756 3.939 4.246 4.382 4.508 4.644 4.831 4.932 5.121 5.295 5.453 5.525 5.657 5.78 5.952 6.061 6.167 6.326 6.474 6.604 6.729 6.849 6.995 7.123 7.24 7.374 7.484 7.589 7.702 7.814 7.918 8.0 8.066 8.137 8.205 8.246 8.228 8.196 8.13 7.952 7.643 7.146 6.34 5.032 2.829 0.085 -2.277 -4.298 -6.027 -7.572 -8.872 -10.014 -11.011 -12.02 -12.875 -13.621 -14.332 -15.003 -15.62 -16.177 -16.755 -17.273 -17.737 -18.238 -18.748 -19.155 -19.572 -20.015 -20.365 -20.718 -21.096 -21.488 -21.891 -22.177 -22.48 -22.963 -23.291 -23.619 -23.79 -24.149 -24.521 -24.933 -25.144 -25.473 -25.851 -26.12 -26.388 -26.986 -27.31 -27.665 -28.08 -28.578 -29.169 -30.028 -33.2 -10 ,2904 ,KEBNE ,16748584,Tue Nov 30 06:11:38 CET,Tue Nov 30 08:15:20 CET,0.0 2.038 2.539 2.864 3.152 3.408 3.612 3.784 4.073 4.205 4.339 4.474 4.655 4.742 4.915 5.087 5.23 5.29 5.414 5.535 5.688 5.79 5.896 6.05 6.19 6.314 6.42 6.523 6.651 6.771 6.884 7.002 7.101 7.19 7.29 7.385 7.466 7.553 7.633 7.705 7.75 7.764 7.743 7.696 7.585 7.397 7.125 6.604 5.777 4.473 2.166 -0.625 -3.004 -5.009 -6.705 -8.22 -9.519 -10.696 -11.682 -12.638 -13.466 -14.166 -14.873 -15.602 -16.273 -16.869 -17.49 -18.031 -18.492 -18.975 -19.481 -19.913 -20.352 -20.783 -21.12 -21.482 -21.85 -22.218 -22.609 -22.891 -23.182 -23.641 -23.964 -24.294 -24.467 -24.832 -25.216 -25.625 -25.836 -26.176 -26.544 -26.812 -27.087 -27.71 -28.098 -28.515 -28.959 -29.446 -30.042 -30.867 -34.637 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_4_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_4_3.txt deleted file mode 100644 index c9631f5c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_4_3.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15716 ,KEBNE ,16748585,Tue Nov 30 06:12:39 CET,Tue Nov 30 08:15:52 CET,0.0 1.014 1.345 1.605 1.838 2.052 2.229 2.39 2.689 2.844 3.0 2.945 3.401 3.537 3.767 3.978 4.182 4.279 4.463 4.638 4.886 5.032 5.186 5.414 5.615 5.809 5.992 6.169 6.405 6.624 6.818 7.046 7.268 7.489 7.751 8.051 8.31 8.59 8.901 9.214 9.526 9.867 10.242 10.575 10.946 11.333 11.725 12.088 12.4 12.609 12.476 11.871 11.141 10.38 9.693 9.073 8.5 7.935 7.433 6.937 6.507 6.119 5.736 5.363 5.002 4.666 4.328 4.037 3.779 3.493 3.182 2.922 2.637 2.317 2.082 1.851 1.589 1.313 1.047 0.85 0.642 0.342 0.14 -0.081 -0.194 -0.426 -0.717 -1.029 -1.173 -1.652 -1.654 -1.832 -2.019 -2.457 -2.718 -2.99 -3.268 -3.569 -3.93 -4.42 -5.585 -2 ,16341 ,KEBNE ,16748586,Tue Nov 30 06:14:41 CET,Tue Nov 30 08:15:49 CET,0.0 0.889 1.203 1.455 1.678 1.87 2.028 2.181 2.484 2.627 2.759 2.677 3.109 3.218 3.424 3.643 3.86 3.953 4.112 4.266 4.492 4.644 4.797 4.998 5.199 5.387 5.561 5.736 5.963 6.176 6.373 6.606 6.826 7.039 7.289 7.554 7.799 8.058 8.334 8.62 8.918 9.267 9.63 9.957 10.313 10.668 11.05 11.405 11.72 11.926 11.861 11.359 10.71 10.034 9.372 8.747 8.174 7.673 7.247 6.769 6.342 5.969 5.608 5.269 4.93 4.602 4.274 3.981 3.706 3.419 3.129 2.891 2.636 2.376 2.173 1.961 1.728 1.459 1.189 1.004 0.802 0.468 0.238 -0.009 -0.131 -0.383 -0.664 -0.972 -1.145 -1.655 -1.735 -1.942 -2.167 -2.671 -2.946 -3.242 -3.557 -3.897 -4.296 -4.86 -7.075 -3 ,5448 ,KEBNE ,16748587,Tue Nov 30 06:16:43 CET,Tue Nov 30 08:17:12 CET,0.0 0.952 1.359 1.659 1.912 2.128 2.324 2.507 2.838 2.98 3.107 3.018 3.46 3.578 3.788 3.982 4.172 4.268 4.451 4.626 4.89 5.056 5.209 5.422 5.623 5.816 6.003 6.18 6.407 6.623 6.83 7.088 7.326 7.548 7.806 8.093 8.348 8.611 8.912 9.225 9.528 9.849 10.206 10.551 10.913 11.277 11.649 12.019 12.394 12.653 12.552 11.98 11.284 10.57 9.877 9.242 8.688 8.167 7.699 7.197 6.764 6.369 5.967 5.592 5.242 4.915 4.578 4.271 4.002 3.724 3.419 3.173 2.923 2.66 2.461 2.234 1.981 1.71 1.425 1.222 1.019 0.72 0.498 0.261 0.141 -0.083 -0.318 -0.58 -0.712 -1.172 -1.156 -1.317 -1.496 -1.881 -2.089 -2.309 -2.577 -2.871 -3.186 -3.622 -4.699 -4 ,22936 ,KEBNE ,16748588,Tue Nov 30 06:37:05 CET,Tue Nov 30 08:38:26 CET,0.0 0.987 1.375 1.653 1.882 2.099 2.284 2.449 2.756 2.9 3.036 2.965 3.407 3.526 3.769 3.984 4.178 4.281 4.464 4.628 4.859 5.002 5.141 5.337 5.532 5.726 5.9 6.064 6.276 6.476 6.678 6.93 7.165 7.401 7.667 7.938 8.192 8.454 8.73 9.029 9.335 9.649 9.981 10.307 10.677 11.038 11.402 11.74 12.005 12.145 12.009 11.348 10.658 10.067 9.502 8.968 8.465 7.975 7.542 7.104 6.689 6.301 5.923 5.57 5.255 4.954 4.625 4.324 4.063 3.789 3.493 3.248 2.995 2.72 2.508 2.293 2.078 1.847 1.599 1.434 1.269 1.0 0.809 0.611 0.502 0.264 0.017 -0.24 -0.376 -0.838 -0.816 -0.977 -1.143 -1.532 -1.744 -1.945 -2.203 -2.493 -2.792 -3.204 -4.399 -5 ,13680 ,KEBNE ,16748589,Tue Nov 30 06:38:06 CET,Tue Nov 30 08:42:18 CET,0.0 1.06 1.444 1.719 1.951 2.141 2.304 2.476 2.806 2.931 3.045 2.952 3.39 3.511 3.731 3.918 4.105 4.201 4.366 4.522 4.772 4.933 5.076 5.276 5.479 5.667 5.862 6.053 6.28 6.502 6.707 6.964 7.198 7.402 7.64 7.898 8.141 8.401 8.677 8.973 9.281 9.596 9.935 10.251 10.595 10.972 11.366 11.742 12.088 12.331 12.247 11.717 11.082 10.408 9.749 9.144 8.587 8.044 7.549 7.044 6.613 6.205 5.814 5.436 5.071 4.744 4.387 4.054 3.77 3.483 3.194 2.966 2.712 2.428 2.203 1.972 1.737 1.496 1.247 1.076 0.894 0.611 0.408 0.189 0.078 -0.151 -0.399 -0.667 -0.8 -1.265 -1.253 -1.404 -1.564 -1.921 -2.146 -2.4 -2.675 -2.978 -3.315 -3.725 -4.75 -6 ,2230 ,KEBNE ,16748590,Tue Nov 30 06:40:08 CET,Tue Nov 30 08:41:27 CET,0.0 0.973 1.384 1.706 1.954 2.166 2.352 2.523 2.847 3.004 3.138 3.051 3.502 3.627 3.858 4.072 4.269 4.366 4.558 4.737 4.985 5.138 5.295 5.524 5.734 5.937 6.124 6.294 6.51 6.727 6.933 7.16 7.376 7.581 7.81 8.062 8.297 8.537 8.8 9.09 9.372 9.678 10.034 10.371 10.719 11.075 11.433 11.758 12.005 12.08 11.825 11.158 10.366 9.555 8.826 8.148 7.539 6.982 6.476 5.969 5.535 5.112 4.687 4.29 3.922 3.571 3.206 2.882 2.592 2.301 2.001 1.733 1.447 1.153 0.926 0.693 0.452 0.207 -0.074 -0.273 -0.465 -0.765 -0.963 -1.163 -1.27 -1.492 -1.728 -1.98 -2.105 -2.554 -2.511 -2.668 -2.853 -3.249 -3.451 -3.667 -3.922 -4.247 -4.667 -5.158 -6.14 -7 ,1037 ,KEBNE ,16748591,Tue Nov 30 06:40:07 CET,Tue Nov 30 08:43:59 CET,0.0 1.138 1.528 1.81 2.031 2.24 2.429 2.598 2.913 3.054 3.199 3.152 3.591 3.705 3.917 4.103 4.283 4.376 4.566 4.751 4.994 5.145 5.284 5.483 5.688 5.887 6.084 6.265 6.485 6.707 6.929 7.188 7.418 7.635 7.885 8.16 8.429 8.722 9.008 9.28 9.572 9.904 10.261 10.591 10.96 11.345 11.714 12.065 12.386 12.612 12.557 12.036 11.324 10.562 9.861 9.252 8.696 8.114 7.616 7.13 6.692 6.299 5.913 5.53 5.175 4.861 4.526 4.226 3.972 3.703 3.422 3.187 2.939 2.683 2.495 2.308 2.095 1.862 1.62 1.454 1.278 0.98 0.772 0.573 0.471 0.252 0.011 -0.249 -0.376 -0.824 -0.788 -0.935 -1.103 -1.465 -1.652 -1.857 -2.118 -2.45 -2.836 -3.363 -4.444 -8 ,1207 ,KEBNE ,16748592,Tue Nov 30 06:41:08 CET,Tue Nov 30 08:45:07 CET,0.0 1.236 1.599 1.901 2.191 2.449 2.649 2.834 3.146 3.279 3.415 3.342 3.782 3.9 4.135 4.352 4.555 4.648 4.823 4.998 5.248 5.395 5.537 5.764 5.966 6.145 6.321 6.494 6.717 6.934 7.143 7.374 7.586 7.801 8.046 8.306 8.551 8.808 9.082 9.38 9.69 10.008 10.366 10.725 11.115 11.523 11.925 12.3 12.662 12.947 12.963 12.456 11.775 11.098 10.444 9.785 9.16 8.603 8.126 7.602 7.147 6.743 6.34 5.958 5.591 5.252 4.896 4.565 4.278 3.981 3.669 3.414 3.155 2.88 2.661 2.448 2.213 1.953 1.69 1.494 1.288 0.979 0.748 0.51 0.394 0.135 -0.136 -0.427 -0.581 -1.049 -1.008 -1.153 -1.306 -1.642 -1.82 -2.033 -2.289 -2.572 -2.919 -3.397 -4.579 -9 ,4868 ,KEBNE ,16748593,Tue Nov 30 06:41:08 CET,Tue Nov 30 08:44:04 CET,0.0 0.995 1.34 1.618 1.854 2.064 2.256 2.43 2.745 2.882 3.009 2.951 3.402 3.52 3.743 3.957 4.159 4.252 4.426 4.586 4.824 4.986 5.131 5.331 5.54 5.746 5.939 6.12 6.341 6.562 6.779 7.031 7.272 7.498 7.741 8.014 8.283 8.569 8.865 9.181 9.501 9.831 10.196 10.545 10.936 11.339 11.74 12.069 12.337 12.509 12.426 11.932 11.286 10.617 9.89 9.128 8.404 7.739 7.134 6.488 5.942 5.454 4.996 4.586 4.219 3.887 3.511 3.167 2.875 2.563 2.234 1.957 1.664 1.345 1.1 0.849 0.586 0.32 0.057 -0.129 -0.333 -0.645 -0.861 -1.093 -1.215 -1.465 -1.719 -1.971 -2.11 -2.583 -2.562 -2.741 -2.934 -3.321 -3.528 -3.751 -3.984 -4.272 -4.618 -5.071 -6.241 -10 ,17127 ,KEBNE ,16748594,Tue Nov 30 06:43:10 CET,Tue Nov 30 08:45:34 CET,0.0 1.215 1.601 1.897 2.141 2.346 2.535 2.704 2.991 3.124 3.257 3.197 3.643 3.76 3.988 4.195 4.389 4.474 4.634 4.794 5.031 5.175 5.311 5.509 5.69 5.878 6.058 6.219 6.428 6.618 6.799 7.049 7.3 7.519 7.754 8.005 8.245 8.499 8.767 9.061 9.348 9.65 9.995 10.305 10.644 11.002 11.351 11.704 12.048 12.262 12.077 11.476 10.848 10.217 9.613 9.015 8.458 7.957 7.535 7.08 6.673 6.305 5.931 5.578 5.245 4.932 4.603 4.31 4.059 3.783 3.489 3.241 2.977 2.703 2.477 2.241 2.014 1.781 1.504 1.297 1.061 0.689 0.449 0.201 0.074 -0.178 -0.45 -0.743 -0.892 -1.371 -1.386 -1.571 -1.752 -2.154 -2.382 -2.644 -2.935 -3.258 -3.64 -4.121 -5.304 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_7_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_7_6.txt deleted file mode 100644 index f2a65a8d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_7_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3673 ,KEBNE ,16748595,Tue Nov 30 06:43:11 CET,Tue Nov 30 08:43:58 CET,0.0 1.737 2.157 2.439 2.651 2.832 2.976 3.115 3.367 3.47 3.563 3.395 3.793 3.854 3.973 4.083 4.187 4.238 4.335 4.414 4.507 4.574 4.653 4.762 4.843 4.899 4.952 5.006 5.069 5.115 5.16 5.221 5.267 5.3 5.323 5.333 5.336 5.325 5.298 5.251 5.16 5.011 4.794 4.555 4.228 3.784 3.18 2.394 1.256 -0.481 -3.41 -6.984 -9.996 -12.487 -14.485 -16.273 -17.859 -19.321 -20.58 -21.751 -22.712 -23.572 -24.391 -25.146 -25.828 -26.468 -27.153 -27.762 -28.289 -28.833 -29.377 -29.835 -30.365 -30.942 -31.367 -31.788 -32.208 -32.634 -33.098 -33.413 -33.73 -34.26 -34.628 -34.992 -35.18 -35.588 -36.028 -36.481 -36.72 -37.335 -37.489 -37.769 -38.052 -38.657 -39.013 -39.409 -39.872 -40.404 -41.005 -41.852 -44.955 -2 ,19914 ,KEBNE ,16748596,Tue Nov 30 06:45:12 CET,Tue Nov 30 08:45:40 CET,0.0 1.882 2.308 2.603 2.834 3.028 3.199 3.343 3.592 3.701 3.794 3.612 4.016 4.099 4.241 4.336 4.429 4.474 4.562 4.638 4.734 4.794 4.845 4.917 4.979 5.031 5.082 5.116 5.146 5.18 5.202 5.207 5.22 5.233 5.23 5.217 5.186 5.133 5.068 4.981 4.857 4.679 4.449 4.185 3.799 3.282 2.572 1.635 0.362 -1.544 -4.668 -8.355 -11.323 -13.76 -15.788 -17.523 -18.988 -20.334 -21.483 -22.603 -23.581 -24.482 -25.349 -26.176 -26.949 -27.626 -28.321 -28.953 -29.488 -30.032 -30.592 -31.058 -31.555 -32.054 -32.422 -32.803 -33.199 -33.603 -34.037 -34.329 -34.65 -35.205 -35.579 -35.966 -36.175 -36.611 -37.06 -37.539 -37.785 -38.422 -38.629 -38.949 -39.274 -39.941 -40.329 -40.763 -41.241 -41.788 -42.468 -43.419 -47.42 -3 ,26244 ,KEBNE ,16748597,Tue Nov 30 06:47:14 CET,Tue Nov 30 08:46:13 CET,0.0 1.405 1.804 2.106 2.354 2.563 2.746 2.909 3.188 3.315 3.429 3.285 3.706 3.795 3.957 4.093 4.221 4.283 4.394 4.501 4.66 4.748 4.825 4.939 5.03 5.099 5.153 5.206 5.278 5.33 5.372 5.411 5.449 5.483 5.507 5.517 5.499 5.454 5.391 5.292 5.167 5.0 4.752 4.483 4.151 3.73 3.125 2.238 0.937 -0.924 -3.914 -7.469 -10.345 -12.741 -14.872 -16.867 -18.576 -20.127 -21.452 -22.727 -23.825 -24.806 -25.729 -26.571 -27.348 -28.055 -28.786 -29.432 -29.977 -30.549 -31.157 -31.655 -32.168 -32.692 -33.08 -33.471 -33.877 -34.309 -34.756 -35.054 -35.377 -35.89 -36.233 -36.589 -36.77 -37.146 -37.551 -37.969 -38.206 -38.834 -38.967 -39.238 -39.505 -40.112 -40.458 -40.843 -41.275 -41.774 -42.41 -43.415 -47.405 -4 ,23254 ,KEBNE ,16748598,Tue Nov 30 06:47:14 CET,Tue Nov 30 08:46:34 CET,0.0 1.678 2.102 2.395 2.613 2.796 2.961 3.119 3.399 3.51 3.609 3.474 3.896 3.973 4.098 4.197 4.292 4.339 4.426 4.506 4.618 4.689 4.763 4.884 4.986 5.062 5.13 5.192 5.264 5.328 5.383 5.425 5.449 5.471 5.485 5.495 5.498 5.461 5.394 5.307 5.171 4.985 4.753 4.5 4.151 3.673 3.022 2.195 0.956 -1.097 -4.578 -8.751 -12.043 -14.617 -16.699 -18.488 -20.092 -21.565 -22.792 -23.972 -24.947 -25.813 -26.647 -27.453 -28.21 -28.883 -29.58 -30.183 -30.687 -31.2 -31.734 -32.201 -32.712 -33.251 -33.653 -34.049 -34.446 -34.846 -35.317 -35.644 -35.952 -36.443 -36.802 -37.2 -37.402 -37.786 -38.157 -38.55 -38.764 -39.364 -39.472 -39.728 -40.008 -40.598 -40.926 -41.304 -41.73 -42.248 -42.886 -43.704 -46.926 -5 ,4619 ,KEBNE ,16748599,Tue Nov 30 06:48:16 CET,Tue Nov 30 08:46:22 CET,0.0 1.059 1.486 1.807 2.054 2.24 2.42 2.59 2.874 2.997 3.11 2.983 3.402 3.481 3.62 3.744 3.861 3.914 4.012 4.107 4.24 4.32 4.396 4.487 4.547 4.598 4.639 4.666 4.711 4.761 4.807 4.85 4.869 4.886 4.907 4.917 4.924 4.918 4.891 4.854 4.796 4.706 4.563 4.383 4.089 3.651 3.043 2.19 0.981 -0.707 -3.404 -6.605 -9.316 -11.573 -13.535 -15.374 -16.921 -18.224 -19.378 -20.665 -21.799 -22.755 -23.662 -24.525 -25.297 -25.986 -26.702 -27.359 -27.94 -28.563 -29.224 -29.755 -30.285 -30.835 -31.274 -31.709 -32.152 -32.615 -33.105 -33.443 -33.784 -34.321 -34.696 -35.079 -35.274 -35.673 -36.084 -36.527 -36.773 -37.411 -37.564 -37.832 -38.092 -38.649 -38.985 -39.422 -39.949 -40.55 -41.224 -42.103 -44.897 -6 ,2710 ,KEBNE ,16748600,Tue Nov 30 06:51:18 CET,Tue Nov 30 08:48:39 CET,0.0 1.388 1.836 2.14 2.403 2.628 2.812 2.985 3.293 3.42 3.536 3.418 3.849 3.929 4.072 4.21 4.345 4.41 4.525 4.619 4.75 4.839 4.917 5.011 5.102 5.179 5.242 5.297 5.37 5.435 5.473 5.506 5.551 5.588 5.618 5.63 5.621 5.605 5.579 5.556 5.497 5.343 5.11 4.849 4.534 4.119 3.499 2.676 1.466 -0.427 -3.559 -7.104 -9.946 -12.313 -14.355 -16.157 -17.686 -19.048 -20.185 -21.288 -22.204 -23.015 -23.814 -24.584 -25.323 -26.022 -26.737 -27.369 -27.925 -28.497 -29.074 -29.542 -30.032 -30.556 -30.972 -31.406 -31.844 -32.314 -32.816 -33.149 -33.51 -34.087 -34.45 -34.795 -34.98 -35.373 -35.788 -36.252 -36.515 -37.152 -37.299 -37.578 -37.86 -38.489 -38.836 -39.219 -39.687 -40.184 -40.752 -41.518 -44.244 -7 ,30085 ,KEBNE ,16748601,Tue Nov 30 06:51:19 CET,Tue Nov 30 08:48:23 CET,0.0 1.509 2.005 2.371 2.658 2.882 3.076 3.255 3.579 3.721 3.838 3.702 4.115 4.191 4.316 4.435 4.556 4.603 4.683 4.757 4.861 4.934 5.01 5.118 5.219 5.313 5.392 5.463 5.525 5.555 5.581 5.61 5.639 5.654 5.669 5.657 5.616 5.582 5.54 5.462 5.36 5.23 5.027 4.776 4.439 3.973 3.322 2.397 1.062 -0.845 -3.875 -7.416 -10.312 -12.763 -14.8 -16.558 -18.068 -19.411 -20.565 -21.699 -22.692 -23.585 -24.446 -25.279 -26.057 -26.757 -27.457 -28.093 -28.66 -29.219 -29.772 -30.251 -30.756 -31.254 -31.627 -32.022 -32.448 -32.917 -33.426 -33.765 -34.096 -34.6 -34.955 -35.314 -35.495 -35.878 -36.3 -36.766 -37.008 -37.632 -37.754 -38.011 -38.281 -38.898 -39.261 -39.678 -40.172 -40.715 -41.323 -42.145 -45.849 -8 ,24902 ,KEBNE ,16748602,Tue Nov 30 06:53:21 CET,Tue Nov 30 08:50:27 CET,0.0 1.933 2.346 2.601 2.793 2.956 3.112 3.262 3.508 3.606 3.7 3.537 3.95 4.028 4.163 4.266 4.359 4.412 4.516 4.601 4.723 4.799 4.859 4.928 5.001 5.07 5.131 5.179 5.239 5.303 5.352 5.404 5.448 5.482 5.513 5.527 5.518 5.491 5.445 5.382 5.302 5.161 4.965 4.779 4.517 4.169 3.651 2.863 1.742 0.134 -2.671 -6.208 -9.123 -11.49 -13.479 -15.216 -16.721 -18.113 -19.327 -20.593 -21.691 -22.649 -23.57 -24.41 -25.131 -25.761 -26.408 -27.009 -27.547 -28.097 -28.657 -29.098 -29.571 -30.087 -30.521 -31.008 -31.489 -31.977 -32.465 -32.78 -33.126 -33.677 -34.068 -34.49 -34.681 -35.064 -35.498 -35.933 -36.152 -36.76 -36.966 -37.291 -37.618 -38.304 -38.706 -39.151 -39.636 -40.182 -40.863 -41.777 -44.231 -9 ,15897 ,KEBNE ,16748603,Tue Nov 30 06:53:20 CET,Tue Nov 30 08:50:11 CET,0.0 0.961 1.39 1.688 1.89 2.059 2.214 2.366 2.632 2.748 2.856 2.706 3.126 3.197 3.339 3.485 3.605 3.658 3.763 3.872 4.01 4.082 4.147 4.235 4.321 4.407 4.49 4.563 4.642 4.709 4.778 4.853 4.905 4.948 4.997 5.026 5.029 5.022 5.007 4.976 4.917 4.817 4.661 4.432 4.09 3.649 2.996 2.087 0.839 -0.984 -3.912 -7.355 -10.155 -12.708 -14.951 -16.914 -18.661 -20.212 -21.563 -22.89 -23.984 -24.929 -25.838 -26.713 -27.477 -28.155 -28.87 -29.491 -30.051 -30.665 -31.302 -31.818 -32.331 -32.861 -33.264 -33.668 -34.101 -34.554 -35.028 -35.38 -35.747 -36.294 -36.688 -37.101 -37.312 -37.758 -38.196 -38.646 -38.897 -39.549 -39.728 -40.016 -40.338 -41.071 -41.491 -41.957 -42.478 -43.069 -43.8 -44.767 -48.969 -10 ,20156 ,KEBNE ,16748604,Tue Nov 30 06:53:23 CET,Tue Nov 30 08:42:13 CET,0.0 1.747 2.185 2.514 2.781 2.989 3.17 3.345 3.649 3.779 3.898 3.778 4.189 4.262 4.402 4.515 4.608 4.658 4.756 4.843 4.953 5.014 5.074 5.171 5.255 5.321 5.387 5.449 5.516 5.579 5.629 5.683 5.736 5.768 5.787 5.814 5.843 5.839 5.804 5.746 5.657 5.521 5.327 5.131 4.85 4.469 3.937 3.189 2.133 0.506 -2.263 -5.529 -8.117 -10.325 -12.26 -14.018 -15.515 -16.88 -18.074 -19.258 -20.293 -21.215 -22.064 -22.825 -23.522 -24.152 -24.855 -25.495 -26.055 -26.65 -27.23 -27.717 -28.247 -28.803 -29.221 -29.679 -30.174 -30.657 -31.162 -31.502 -31.845 -32.385 -32.757 -33.134 -33.315 -33.674 -34.069 -34.506 -34.752 -35.401 -35.57 -35.867 -36.183 -36.875 -37.254 -37.656 -38.134 -38.731 -39.475 -40.456 -43.59 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_7_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_7_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 722fa847..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_7_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22262 ,KEBNE ,16748605,Tue Nov 30 06:54:22 CET,Tue Nov 30 08:52:28 CET,0.0 2.797 3.422 3.841 4.143 4.386 4.585 4.76 5.073 5.201 5.306 5.143 5.566 5.651 5.81 5.962 6.096 6.145 6.228 6.297 6.388 6.449 6.495 6.543 6.568 6.57 6.57 6.573 6.555 6.521 6.49 6.426 6.351 6.265 6.149 6.019 5.862 5.657 5.393 5.081 4.704 4.209 3.548 2.782 1.781 0.53 -1.068 -3.07 -5.901 -10.034 -16.254 -23.057 -28.294 -32.439 -35.814 -38.698 -41.074 -43.106 -44.841 -46.561 -48.004 -49.27 -50.439 -51.521 -52.508 -53.38 -54.285 -55.074 -55.744 -56.436 -57.159 -57.76 -58.375 -58.994 -59.47 -59.97 -60.482 -60.999 -61.529 -61.892 -62.261 -62.822 -63.196 -63.575 -63.774 -64.183 -64.605 -65.074 -65.323 -65.972 -66.085 -66.358 -66.631 -67.216 -67.552 -67.914 -68.313 -68.811 -69.425 -70.235 -73.624 -2 ,16952 ,KEBNE ,16748606,Tue Nov 30 06:54:22 CET,Tue Nov 30 08:56:02 CET,0.0 1.388 1.928 2.276 2.54 2.763 2.947 3.115 3.42 3.558 3.696 3.596 4.024 4.104 4.238 4.35 4.454 4.511 4.623 4.727 4.873 4.95 5.016 5.09 5.145 5.19 5.212 5.213 5.196 5.167 5.127 5.04 4.925 4.801 4.639 4.444 4.24 3.991 3.694 3.32 2.878 2.38 1.777 1.113 0.213 -0.955 -2.52 -4.597 -7.479 -11.731 -18.252 -25.291 -30.567 -34.711 -38.138 -41.125 -43.706 -45.969 -47.859 -49.675 -51.177 -52.474 -53.653 -54.736 -55.734 -56.618 -57.496 -58.284 -58.959 -59.635 -60.331 -60.897 -61.482 -62.086 -62.537 -62.991 -63.445 -63.907 -64.395 -64.727 -65.068 -65.614 -65.983 -66.37 -66.58 -67.004 -67.43 -67.876 -68.106 -68.757 -68.864 -69.139 -69.427 -70.085 -70.447 -70.848 -71.304 -71.799 -72.435 -73.308 -76.77 -3 ,16751 ,KEBNE ,16748607,Tue Nov 30 06:55:23 CET,Tue Nov 30 08:53:09 CET,0.0 1.458 1.988 2.34 2.616 2.862 3.093 3.313 3.667 3.807 3.93 3.828 4.262 4.353 4.509 4.635 4.745 4.792 4.87 4.933 4.978 5.0 5.024 5.045 5.05 5.048 5.039 5.014 4.965 4.908 4.852 4.759 4.665 4.578 4.441 4.254 4.068 3.858 3.598 3.291 2.915 2.416 1.754 1.058 0.168 -0.984 -2.518 -4.525 -7.289 -11.199 -17.16 -23.784 -28.911 -33.123 -36.588 -39.515 -42.008 -44.183 -45.996 -47.756 -49.232 -50.521 -51.704 -52.799 -53.781 -54.636 -55.518 -56.297 -56.969 -57.662 -58.367 -58.94 -59.524 -60.119 -60.572 -61.04 -61.527 -62.037 -62.591 -62.971 -63.332 -63.887 -64.277 -64.669 -64.868 -65.272 -65.685 -66.119 -66.35 -67.002 -67.076 -67.334 -67.601 -68.198 -68.552 -68.944 -69.371 -69.853 -70.42 -71.192 -74.381 -4 ,12265 ,KEBNE ,16748608,Tue Nov 30 06:56:24 CET,Tue Nov 30 08:55:34 CET,0.0 2.603 3.247 3.685 4.035 4.293 4.49 4.652 4.983 5.155 5.303 5.228 5.677 5.777 5.949 6.102 6.244 6.314 6.452 6.572 6.715 6.805 6.894 7.019 7.127 7.18 7.207 7.246 7.277 7.292 7.308 7.344 7.374 7.349 7.275 7.142 6.978 6.778 6.516 6.18 5.8 5.354 4.779 4.142 3.331 2.275 0.79 -1.177 -3.899 -7.788 -13.701 -20.097 -24.909 -28.669 -31.782 -34.532 -36.848 -38.847 -40.54 -42.212 -43.615 -44.854 -46.048 -47.161 -48.156 -49.035 -49.938 -50.737 -51.417 -52.11 -52.807 -53.367 -53.938 -54.525 -54.978 -55.438 -55.909 -56.403 -56.912 -57.266 -57.626 -58.166 -58.541 -58.939 -59.14 -59.563 -60.015 -60.49 -60.746 -61.416 -61.564 -61.849 -62.163 -62.862 -63.236 -63.625 -64.052 -64.56 -65.146 -65.967 -69.889 -5 ,2993 ,KEBNE ,16748609,Tue Nov 30 06:58:26 CET,Tue Nov 30 09:00:53 CET,0.0 2.078 2.655 3.078 3.413 3.683 3.909 4.114 4.45 4.573 4.67 4.52 4.952 5.032 5.165 5.306 5.41 5.448 5.528 5.596 5.659 5.692 5.717 5.722 5.722 5.721 5.712 5.701 5.677 5.642 5.611 5.546 5.454 5.357 5.23 5.081 4.895 4.633 4.323 3.968 3.557 3.063 2.411 1.653 0.668 -0.537 -2.081 -4.1 -6.922 -10.952 -17.183 -24.021 -29.398 -33.839 -37.426 -40.427 -42.916 -45.098 -46.943 -48.772 -50.303 -51.609 -52.793 -53.869 -54.846 -55.724 -56.635 -57.439 -58.129 -58.818 -59.513 -60.087 -60.674 -61.275 -61.745 -62.214 -62.677 -63.162 -63.665 -64.016 -64.382 -64.935 -65.326 -65.732 -65.933 -66.348 -66.774 -67.215 -67.446 -68.093 -68.207 -68.487 -68.788 -69.45 -69.807 -70.19 -70.621 -71.12 -71.713 -72.494 -75.595 -6 ,28791 ,KEBNE ,16748610,Tue Nov 30 07:01:30 CET,Tue Nov 30 09:03:12 CET,0.0 2.366 2.911 3.281 3.56 3.8 3.995 4.153 4.414 4.524 4.632 4.494 4.901 4.958 5.079 5.206 5.314 5.361 5.443 5.518 5.603 5.638 5.672 5.699 5.708 5.703 5.682 5.662 5.638 5.601 5.555 5.502 5.438 5.35 5.216 5.02 4.806 4.557 4.263 3.923 3.535 3.039 2.372 1.618 0.636 -0.577 -2.169 -4.272 -7.151 -11.193 -17.376 -24.286 -29.607 -33.863 -37.345 -40.249 -42.711 -44.923 -46.778 -48.562 -50.04 -51.324 -52.529 -53.649 -54.658 -55.543 -56.439 -57.233 -57.914 -58.601 -59.31 -59.894 -60.49 -61.086 -61.541 -62.015 -62.499 -62.993 -63.508 -63.871 -64.24 -64.786 -65.153 -65.553 -65.77 -66.202 -66.667 -67.171 -67.434 -68.117 -68.278 -68.584 -68.912 -69.594 -69.969 -70.373 -70.845 -71.397 -72.114 -73.135 -76.737 -7 ,821 ,KEBNE ,16748611,Tue Nov 30 07:01:29 CET,Tue Nov 30 09:00:25 CET,0.0 2.561 3.099 3.454 3.738 3.971 4.183 4.366 4.652 4.771 4.877 4.724 5.14 5.218 5.351 5.464 5.565 5.605 5.681 5.749 5.823 5.868 5.909 5.962 5.99 6.008 6.036 6.049 6.043 6.024 5.984 5.915 5.831 5.749 5.656 5.531 5.397 5.22 4.994 4.708 4.352 3.895 3.282 2.542 1.548 0.358 -1.166 -3.195 -5.959 -9.874 -16.116 -23.097 -28.386 -32.527 -35.876 -38.687 -41.041 -43.113 -44.862 -46.56 -47.978 -49.211 -50.36 -51.406 -52.337 -53.178 -54.076 -54.882 -55.538 -56.184 -56.845 -57.395 -57.981 -58.589 -59.043 -59.504 -59.987 -60.472 -60.959 -61.305 -61.658 -62.18 -62.579 -63.026 -63.236 -63.637 -64.092 -64.632 -64.902 -65.569 -65.753 -66.056 -66.352 -66.998 -67.349 -67.75 -68.187 -68.653 -69.213 -69.989 -73.305 -8 ,31669 ,KEBNE ,16748612,Tue Nov 30 07:02:31 CET,Tue Nov 30 09:00:47 CET,0.0 2.275 2.785 3.141 3.429 3.663 3.86 4.023 4.307 4.444 4.556 4.392 4.796 4.862 4.999 5.126 5.227 5.269 5.351 5.417 5.517 5.58 5.621 5.667 5.701 5.736 5.762 5.777 5.778 5.753 5.72 5.657 5.581 5.496 5.373 5.222 5.079 4.904 4.662 4.37 4.017 3.548 2.949 2.267 1.387 0.297 -1.164 -3.089 -5.759 -9.529 -15.292 -21.846 -26.872 -30.762 -34.08 -37.114 -39.707 -41.983 -43.924 -45.787 -47.316 -48.636 -49.845 -50.957 -51.999 -52.92 -53.839 -54.67 -55.374 -56.09 -56.824 -57.436 -58.085 -58.74 -59.225 -59.711 -60.213 -60.723 -61.237 -61.598 -61.971 -62.532 -62.943 -63.384 -63.593 -64.028 -64.5 -64.971 -65.225 -65.896 -66.022 -66.311 -66.614 -67.284 -67.66 -68.12 -68.688 -69.314 -69.998 -70.927 -74.347 -9 ,25878 ,KEBNE ,16748613,Tue Nov 30 07:02:31 CET,Tue Nov 30 09:00:48 CET,0.0 1.442 1.946 2.371 2.677 2.915 3.145 3.346 3.679 3.821 3.947 3.823 4.254 4.358 4.541 4.677 4.778 4.823 4.922 5.0 5.085 5.126 5.166 5.23 5.291 5.327 5.337 5.342 5.317 5.279 5.249 5.193 5.11 5.015 4.891 4.752 4.62 4.423 4.149 3.813 3.439 2.977 2.343 1.62 0.691 -0.491 -2.05 -4.065 -6.823 -10.668 -16.582 -23.23 -28.505 -32.749 -36.09 -38.904 -41.287 -43.406 -45.212 -46.938 -48.382 -49.655 -50.83 -51.869 -52.791 -53.633 -54.512 -55.291 -55.956 -56.649 -57.356 -57.93 -58.522 -59.133 -59.606 -60.097 -60.596 -61.12 -61.658 -62.022 -62.397 -62.961 -63.353 -63.766 -63.969 -64.381 -64.812 -65.249 -65.482 -66.139 -66.237 -66.509 -66.797 -67.448 -67.8 -68.168 -68.579 -69.056 -69.629 -70.461 -73.486 -10 ,21034 ,KEBNE ,16748614,Tue Nov 30 07:04:33 CET,Tue Nov 30 09:04:01 CET,0.0 2.268 2.78 3.114 3.38 3.596 3.767 3.926 4.194 4.309 4.412 4.259 4.664 4.737 4.872 4.986 5.085 5.128 5.21 5.272 5.333 5.371 5.403 5.446 5.469 5.468 5.469 5.462 5.458 5.464 5.438 5.383 5.32 5.248 5.149 5.004 4.825 4.605 4.352 4.044 3.682 3.224 2.605 1.897 0.973 -0.188 -1.735 -3.764 -6.498 -10.375 -16.35 -22.819 -27.819 -31.9 -35.187 -38.064 -40.539 -42.669 -44.427 -46.148 -47.578 -48.796 -49.949 -51.027 -52.018 -52.921 -53.869 -54.697 -55.377 -56.064 -56.786 -57.349 -57.918 -58.532 -58.997 -59.473 -59.96 -60.463 -60.985 -61.33 -61.691 -62.254 -62.647 -63.052 -63.248 -63.663 -64.117 -64.594 -64.844 -65.51 -65.66 -65.941 -66.236 -66.882 -67.222 -67.583 -67.989 -68.445 -69.037 -69.925 -73.37 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_6.txt deleted file mode 100644 index 40e09b3d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16360 ,KEBNE ,16748615,Tue Nov 30 07:04:33 CET,Tue Nov 30 09:03:02 CET,0.0 2.261 2.815 3.228 3.562 3.852 4.097 4.318 4.684 4.84 4.993 4.891 5.438 5.571 5.83 6.074 6.311 6.426 6.656 6.88 7.206 7.415 7.61 7.891 8.163 8.426 8.678 8.923 9.235 9.54 9.856 10.245 10.616 10.972 11.375 11.823 12.278 12.81 13.368 13.928 14.543 15.271 16.111 16.964 17.977 19.094 20.428 22.004 23.904 26.273 29.308 31.926 33.532 34.553 35.204 35.659 35.984 36.194 36.316 36.366 36.355 36.326 36.285 36.224 36.142 36.048 35.919 35.801 35.708 35.605 35.475 35.353 35.214 35.054 34.92 34.785 34.648 34.498 34.324 34.207 34.088 33.902 33.777 33.628 33.536 33.339 33.141 32.916 32.785 32.269 32.352 32.19 32.019 31.642 31.431 31.213 30.938 30.578 30.125 29.453 25.953 -2 ,12749 ,KEBNE ,16748616,Tue Nov 30 07:07:37 CET,Tue Nov 30 09:10:23 CET,0.0 1.906 2.466 2.853 3.167 3.445 3.69 3.905 4.285 4.461 4.628 4.534 5.079 5.219 5.482 5.729 5.986 6.111 6.346 6.568 6.884 7.098 7.308 7.598 7.873 8.129 8.376 8.622 8.935 9.237 9.54 9.927 10.317 10.69 11.098 11.551 11.996 12.502 13.059 13.641 14.264 14.965 15.778 16.611 17.635 18.827 20.179 21.729 23.59 25.871 28.756 31.208 32.677 33.607 34.233 34.685 34.999 35.198 35.332 35.402 35.403 35.377 35.334 35.293 35.211 35.115 35.021 34.915 34.799 34.679 34.553 34.42 34.266 34.119 33.999 33.859 33.719 33.577 33.42 33.288 33.142 32.925 32.77 32.608 32.521 32.325 32.108 31.874 31.741 31.218 31.284 31.114 30.923 30.512 30.275 30.007 29.722 29.393 28.99 28.383 26.334 -3 ,16411 ,KEBNE ,16748617,Tue Nov 30 07:11:43 CET,Tue Nov 30 09:13:00 CET,0.0 1.549 2.117 2.526 2.846 3.117 3.361 3.581 3.962 4.14 4.297 4.175 4.734 4.876 5.144 5.402 5.672 5.801 6.051 6.29 6.616 6.835 7.052 7.356 7.637 7.903 8.158 8.416 8.751 9.063 9.368 9.741 10.105 10.468 10.888 11.362 11.819 12.323 12.89 13.487 14.111 14.843 15.709 16.576 17.583 18.709 20.057 21.591 23.383 25.632 28.49 30.967 32.524 33.509 34.128 34.546 34.8 34.965 35.064 35.121 35.144 35.127 35.078 35.032 34.97 34.887 34.791 34.702 34.603 34.49 34.39 34.308 34.199 34.074 33.98 33.87 33.741 33.597 33.456 33.352 33.231 33.042 32.892 32.731 32.652 32.469 32.269 32.056 31.924 31.402 31.497 31.326 31.151 30.779 30.563 30.307 30.025 29.705 29.269 28.608 26.737 -4 ,721 ,KEBNE ,16748618,Tue Nov 30 07:12:46 CET,Tue Nov 30 09:11:27 CET,0.0 1.921 2.439 2.805 3.075 3.315 3.557 3.768 4.154 4.335 4.499 4.407 4.957 5.103 5.379 5.63 5.874 5.99 6.203 6.409 6.719 6.922 7.112 7.399 7.68 7.942 8.194 8.436 8.754 9.063 9.369 9.731 10.097 10.451 10.847 11.289 11.72 12.213 12.754 13.336 13.927 14.591 15.387 16.207 17.178 18.292 19.617 21.166 23.044 25.28 28.111 30.652 32.197 33.254 33.979 34.434 34.74 34.938 35.016 35.084 35.138 35.136 35.094 35.032 34.957 34.868 34.784 34.721 34.644 34.53 34.397 34.283 34.147 34.005 33.9 33.785 33.658 33.522 33.38 33.286 33.171 32.971 32.839 32.679 32.587 32.403 32.204 31.998 31.884 31.38 31.499 31.355 31.183 30.775 30.539 30.264 29.966 29.639 29.257 28.703 26.201 -5 ,28202 ,KEBNE ,16748619,Tue Nov 30 07:13:47 CET,Tue Nov 30 09:13:33 CET,0.0 2.374 2.95 3.353 3.675 3.936 4.18 4.416 4.851 5.043 5.22 5.149 5.713 5.856 6.117 6.373 6.627 6.748 6.975 7.19 7.5 7.703 7.897 8.174 8.445 8.705 8.968 9.224 9.562 9.888 10.2 10.572 10.92 11.273 11.692 12.15 12.58 13.056 13.591 14.18 14.804 15.508 16.339 17.174 18.135 19.242 20.573 22.1 23.939 26.238 29.09 31.521 32.962 33.892 34.539 34.979 35.273 35.424 35.472 35.495 35.502 35.493 35.457 35.378 35.302 35.238 35.151 35.057 34.957 34.829 34.667 34.523 34.38 34.238 34.117 33.987 33.843 33.68 33.503 33.376 33.244 33.026 32.862 32.669 32.575 32.4 32.22 31.986 31.851 31.347 31.435 31.272 31.103 30.741 30.52 30.235 29.907 29.559 29.114 28.407 25.867 -6 ,22032 ,KEBNE ,16748620,Tue Nov 30 07:15:51 CET,Tue Nov 30 09:17:08 CET,0.0 2.164 2.649 2.981 3.26 3.515 3.741 3.952 4.324 4.495 4.652 4.527 5.073 5.2 5.45 5.68 5.91 6.029 6.264 6.496 6.809 6.995 7.177 7.438 7.69 7.937 8.178 8.419 8.725 9.022 9.318 9.677 10.02 10.347 10.733 11.17 11.599 12.075 12.585 13.151 13.773 14.478 15.296 16.136 17.134 18.272 19.61 21.126 22.946 25.182 28.047 30.518 32.005 32.951 33.573 34.039 34.307 34.441 34.517 34.568 34.577 34.547 34.505 34.453 34.365 34.259 34.151 34.055 33.967 33.861 33.729 33.6 33.475 33.335 33.213 33.088 32.951 32.818 32.691 32.588 32.473 32.282 32.146 32.015 31.948 31.812 31.648 31.457 31.341 30.83 30.974 30.845 30.711 30.406 30.215 29.987 29.726 29.403 28.993 28.429 26.047 -7 ,2487 ,KEBNE ,16748621,Tue Nov 30 07:16:52 CET,Tue Nov 30 09:17:52 CET,0.0 2.352 2.83 3.188 3.49 3.749 3.999 4.225 4.601 4.767 4.921 4.801 5.344 5.49 5.767 6.014 6.247 6.357 6.573 6.78 7.074 7.259 7.44 7.707 7.965 8.214 8.455 8.688 9.002 9.303 9.578 9.914 10.258 10.6 10.997 11.445 11.871 12.354 12.884 13.45 14.049 14.696 15.471 16.289 17.256 18.343 19.649 21.148 22.954 25.224 28.112 30.586 32.029 32.979 33.672 34.131 34.382 34.537 34.623 34.677 34.691 34.687 34.673 34.608 34.55 34.503 34.416 34.331 34.254 34.148 34.022 33.93 33.822 33.688 33.586 33.471 33.324 33.16 33.009 32.906 32.782 32.566 32.413 32.254 32.174 32.007 31.824 31.617 31.502 30.982 31.075 30.93 30.785 30.45 30.249 30.019 29.724 29.39 29.029 28.5 26.688 -8 ,17481 ,KEBNE ,16748622,Tue Nov 30 07:17:55 CET,Tue Nov 30 09:16:29 CET,0.0 1.655 2.182 2.542 2.856 3.133 3.385 3.612 4.0 4.176 4.34 4.242 4.808 4.96 5.259 5.533 5.786 5.909 6.156 6.382 6.69 6.897 7.089 7.369 7.642 7.907 8.166 8.417 8.741 9.046 9.348 9.717 10.074 10.424 10.847 11.311 11.744 12.222 12.747 13.328 13.952 14.656 15.481 16.308 17.29 18.403 19.693 21.216 23.064 25.349 28.249 30.765 32.36 33.416 34.052 34.426 34.664 34.845 34.97 35.019 35.027 35.022 35.006 34.966 34.904 34.83 34.726 34.63 34.545 34.443 34.299 34.164 34.038 33.895 33.782 33.668 33.527 33.362 33.212 33.118 33.009 32.815 32.67 32.495 32.402 32.218 32.016 31.818 31.714 31.211 31.325 31.175 31.023 30.712 30.535 30.308 30.027 29.71 29.316 28.752 26.511 -9 ,14911 ,KEBNE ,16748623,Tue Nov 30 07:19:00 CET,Tue Nov 30 09:09:10 CET,0.0 2.071 2.591 2.978 3.283 3.551 3.797 4.02 4.405 4.581 4.754 4.665 5.234 5.39 5.67 5.918 6.162 6.283 6.512 6.721 7.022 7.217 7.413 7.696 7.958 8.224 8.484 8.721 9.026 9.325 9.61 9.967 10.32 10.665 11.082 11.558 11.995 12.466 12.98 13.529 14.142 14.851 15.671 16.484 17.449 18.574 19.93 21.494 23.376 25.742 28.813 31.375 32.812 33.77 34.436 34.907 35.223 35.43 35.538 35.612 35.649 35.644 35.619 35.59 35.545 35.475 35.402 35.343 35.273 35.19 35.089 34.989 34.882 34.753 34.639 34.525 34.419 34.301 34.167 34.067 33.953 33.763 33.608 33.44 33.353 33.166 32.953 32.717 32.6 32.096 32.184 32.029 31.864 31.5 31.289 31.065 30.801 30.466 30.034 29.397 27.058 -10 ,9100 ,KEBNE ,16748624,Tue Nov 30 07:20:59 CET,Tue Nov 30 09:20:28 CET,0.0 2.078 2.612 2.979 3.269 3.513 3.738 3.948 4.333 4.521 4.69 4.571 5.113 5.251 5.526 5.774 6.011 6.118 6.328 6.54 6.841 7.044 7.238 7.508 7.773 8.046 8.302 8.53 8.833 9.136 9.426 9.78 10.135 10.482 10.89 11.346 11.777 12.245 12.759 13.34 13.958 14.662 15.495 16.328 17.317 18.446 19.788 21.337 23.208 25.484 28.271 30.642 32.057 33.027 33.736 34.193 34.462 34.628 34.732 34.797 34.808 34.76 34.704 34.661 34.576 34.469 34.363 34.272 34.179 34.061 33.928 33.799 33.636 33.463 33.336 33.204 33.065 32.919 32.751 32.627 32.489 32.27 32.099 31.887 31.781 31.595 31.412 31.206 31.098 30.603 30.69 30.534 30.367 29.96 29.722 29.479 29.19 28.824 28.381 27.758 24.952 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt deleted file mode 100644 index 76601a5f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7964 ,KEBNE ,16748625,Tue Nov 30 07:22:01 CET,Tue Nov 30 09:22:05 CET,0.0 2.261 2.809 3.174 3.483 3.749 3.981 4.193 4.574 4.743 4.894 4.773 5.317 5.444 5.683 5.909 6.112 6.209 6.401 6.586 6.85 7.005 7.151 7.355 7.561 7.766 7.961 8.148 8.389 8.624 8.848 9.119 9.381 9.631 9.927 10.256 10.575 10.92 11.266 11.617 11.953 12.334 12.794 13.24 13.732 14.27 14.861 15.519 16.228 16.892 17.452 17.633 17.492 17.187 16.863 16.525 16.168 15.844 15.561 15.246 14.953 14.676 14.41 14.143 13.882 13.667 13.448 13.242 13.057 12.861 12.654 12.479 12.291 12.085 11.917 11.735 11.547 11.353 11.142 11.005 10.865 10.62 10.458 10.29 10.201 10.012 9.815 9.606 9.497 8.975 9.099 8.948 8.788 8.429 8.231 8.021 7.787 7.504 7.13 6.61 4.296 -2 ,10083 ,KEBNE ,16748626,Tue Nov 30 07:25:07 CET,Tue Nov 30 09:26:26 CET,0.0 2.113 2.703 3.114 3.433 3.7 3.929 4.143 4.51 4.673 4.838 4.723 5.26 5.394 5.651 5.878 6.092 6.193 6.391 6.581 6.846 7.015 7.171 7.402 7.621 7.821 8.016 8.209 8.453 8.679 8.9 9.17 9.411 9.644 9.911 10.2 10.492 10.812 11.162 11.523 11.879 12.278 12.742 13.183 13.648 14.171 14.788 15.508 16.26 16.946 17.608 17.856 17.765 17.527 17.22 16.899 16.58 16.262 15.975 15.686 15.417 15.156 14.901 14.658 14.422 14.184 13.918 13.694 13.507 13.29 13.059 12.876 12.669 12.453 12.287 12.113 11.948 11.778 11.591 11.457 11.31 11.056 10.875 10.691 10.596 10.388 10.162 9.916 9.791 9.255 9.373 9.219 9.053 8.676 8.472 8.259 8.002 7.698 7.316 6.752 4.712 -3 ,7968 ,KEBNE ,16748627,Tue Nov 30 07:26:10 CET,Tue Nov 30 09:30:25 CET,0.0 2.264 2.788 3.178 3.491 3.75 3.988 4.207 4.58 4.742 4.904 4.813 5.374 5.505 5.752 5.987 6.223 6.333 6.527 6.72 6.992 7.161 7.327 7.572 7.802 8.02 8.218 8.395 8.622 8.845 9.071 9.35 9.611 9.859 10.145 10.452 10.714 11.002 11.328 11.679 12.053 12.473 12.955 13.422 13.913 14.439 15.004 15.606 16.331 17.006 17.512 17.677 17.488 17.154 16.826 16.491 16.14 15.815 15.531 15.246 14.993 14.747 14.502 14.248 14.004 13.773 13.504 13.256 13.054 12.839 12.606 12.421 12.237 12.045 11.887 11.72 11.555 11.362 11.142 10.996 10.85 10.617 10.454 10.281 10.188 10.001 9.805 9.595 9.476 8.947 9.091 8.944 8.792 8.42 8.211 7.999 7.762 7.496 7.187 6.703 4.585 -4 ,1342 ,KEBNE ,16748628,Tue Nov 30 07:37:30 CET,Tue Nov 30 09:38:32 CET,0.0 2.744 3.311 3.73 4.09 4.369 4.605 4.831 5.227 5.394 5.548 5.418 5.965 6.094 6.341 6.573 6.798 6.905 7.101 7.281 7.543 7.727 7.916 8.171 8.396 8.6 8.792 8.977 9.218 9.458 9.685 9.951 10.198 10.444 10.738 11.052 11.345 11.664 12.0 12.334 12.676 13.068 13.517 13.922 14.36 14.835 15.372 15.922 16.492 17.127 17.674 17.833 17.709 17.477 17.173 16.817 16.456 16.119 15.813 15.492 15.242 15.01 14.761 14.53 14.304 14.089 13.857 13.646 13.463 13.26 13.059 12.894 12.704 12.506 12.353 12.181 11.998 11.8 11.581 11.427 11.264 11.003 10.824 10.648 10.547 10.33 10.109 9.88 9.762 9.23 9.377 9.233 9.066 8.652 8.419 8.191 7.932 7.623 7.256 6.654 4.472 -5 ,30962 ,KEBNE ,16748629,Tue Nov 30 07:46:50 CET,Tue Nov 30 09:47:36 CET,0.0 1.962 2.524 2.902 3.199 3.481 3.739 3.965 4.328 4.484 4.633 4.509 5.054 5.196 5.468 5.706 5.924 6.025 6.226 6.414 6.656 6.814 6.975 7.214 7.435 7.641 7.841 8.042 8.314 8.559 8.782 9.048 9.283 9.515 9.791 10.095 10.39 10.715 11.065 11.417 11.763 12.149 12.64 13.126 13.607 14.106 14.679 15.273 15.951 16.701 17.346 17.522 17.323 16.961 16.573 16.187 15.851 15.54 15.237 14.892 14.576 14.281 14.012 13.741 13.477 13.248 12.998 12.765 12.568 12.358 12.136 11.947 11.75 11.556 11.408 11.255 11.088 10.9 10.702 10.564 10.411 10.173 10.012 9.832 9.736 9.533 9.332 9.141 9.036 8.509 8.657 8.515 8.373 8.062 7.888 7.694 7.447 7.138 6.77 6.275 4.275 -6 ,1311 ,KEBNE ,16748630,Tue Nov 30 07:53:07 CET,Tue Nov 30 09:55:26 CET,0.0 1.976 2.49 2.865 3.202 3.495 3.732 3.957 4.372 4.557 4.73 4.625 5.168 5.296 5.539 5.77 5.998 6.107 6.309 6.507 6.784 6.951 7.114 7.345 7.568 7.782 7.974 8.16 8.411 8.654 8.88 9.16 9.432 9.679 9.981 10.317 10.622 10.983 11.365 11.757 12.136 12.523 12.989 13.439 13.943 14.507 15.115 15.698 16.29 16.896 17.44 17.655 17.582 17.365 17.105 16.824 16.544 16.288 16.051 15.742 15.439 15.178 14.929 14.678 14.456 14.255 14.027 13.822 13.628 13.411 13.189 13.004 12.825 12.652 12.504 12.336 12.166 11.977 11.776 11.649 11.51 11.27 11.099 10.932 10.848 10.666 10.466 10.245 10.131 9.602 9.764 9.626 9.477 9.153 8.971 8.766 8.541 8.262 7.89 7.361 5.169 -7 ,16629 ,KEBNE ,16748631,Tue Nov 30 07:57:17 CET,Tue Nov 30 10:01:10 CET,0.0 2.051 2.513 2.845 3.126 3.364 3.585 3.806 4.178 4.326 4.467 4.323 4.866 4.988 5.212 5.441 5.659 5.755 5.938 6.114 6.351 6.498 6.645 6.856 7.053 7.243 7.42 7.587 7.813 8.045 8.273 8.53 8.778 9.035 9.308 9.597 9.896 10.226 10.563 10.9 11.255 11.649 12.089 12.517 13.007 13.552 14.129 14.704 15.353 16.004 16.43 16.474 16.345 16.102 15.824 15.495 15.142 14.794 14.441 14.064 13.73 13.447 13.174 12.883 12.621 12.38 12.116 11.881 11.68 11.468 11.245 11.064 10.877 10.674 10.514 10.348 10.174 9.993 9.793 9.653 9.506 9.262 9.083 8.894 8.798 8.602 8.405 8.202 8.096 7.575 7.701 7.557 7.397 7.036 6.835 6.619 6.38 6.105 5.735 5.193 2.626 -8 ,11417 ,KEBNE ,16748632,Tue Nov 30 07:58:19 CET,Tue Nov 30 09:59:07 CET,0.0 2.511 3.04 3.389 3.676 3.935 4.174 4.387 4.762 4.943 5.106 4.973 5.501 5.627 5.868 6.084 6.28 6.38 6.57 6.739 6.983 7.142 7.299 7.522 7.735 7.94 8.144 8.333 8.566 8.805 9.033 9.292 9.529 9.758 10.038 10.35 10.641 10.941 11.257 11.602 11.968 12.389 12.892 13.384 13.904 14.488 15.156 15.82 16.484 17.148 17.714 17.822 17.643 17.333 16.976 16.58 16.206 15.875 15.574 15.254 14.974 14.712 14.445 14.176 13.924 13.708 13.452 13.207 13.007 12.795 12.568 12.379 12.185 11.964 11.781 11.598 11.417 11.234 11.032 10.892 10.748 10.511 10.344 10.163 10.066 9.872 9.649 9.417 9.306 8.783 8.924 8.775 8.617 8.287 8.091 7.874 7.612 7.288 6.887 6.35 4.17 -9 ,27486 ,KEBNE ,16748633,Tue Nov 30 08:00:22 CET,Tue Nov 30 10:05:14 CET,0.0 2.603 3.121 3.494 3.8 4.078 4.339 4.556 4.885 5.038 5.197 5.075 5.618 5.751 5.982 6.203 6.425 6.532 6.738 6.919 7.17 7.345 7.51 7.729 7.93 8.127 8.332 8.523 8.741 8.954 9.158 9.397 9.652 9.89 10.147 10.445 10.745 11.075 11.418 11.777 12.137 12.528 12.983 13.44 13.962 14.477 14.997 15.563 16.185 16.866 17.485 17.728 17.612 17.297 16.946 16.626 16.316 15.978 15.657 15.342 15.056 14.78 14.524 14.287 14.056 13.842 13.621 13.42 13.237 13.04 12.847 12.679 12.484 12.276 12.12 11.967 11.798 11.621 11.438 11.294 11.137 10.92 10.774 10.601 10.505 10.313 10.115 9.897 9.78 9.244 9.365 9.207 9.047 8.691 8.499 8.285 8.024 7.702 7.311 6.774 4.477 -10 ,20454 ,KEBNE ,16748634,Tue Nov 30 08:00:22 CET,Tue Nov 30 10:01:55 CET,0.0 1.856 2.437 2.819 3.111 3.368 3.601 3.807 4.182 4.353 4.509 4.404 4.949 5.081 5.332 5.559 5.776 5.878 6.068 6.255 6.518 6.68 6.845 7.091 7.321 7.543 7.767 7.985 8.254 8.502 8.738 9.023 9.298 9.567 9.866 10.2 10.503 10.812 11.16 11.525 11.898 12.298 12.78 13.286 13.867 14.511 15.151 15.764 16.444 17.159 17.816 18.06 17.947 17.687 17.382 17.046 16.727 16.403 16.118 15.836 15.566 15.299 15.026 14.768 14.507 14.25 13.986 13.763 13.576 13.378 13.169 12.988 12.792 12.586 12.422 12.252 12.068 11.861 11.643 11.5 11.36 11.139 10.976 10.807 10.726 10.541 10.322 10.091 9.979 9.453 9.582 9.429 9.275 8.935 8.744 8.54 8.302 8.022 7.63 7.051 5.129 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt deleted file mode 100644 index b8f5631b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4648 ,KEBNE ,16748635,Tue Nov 30 08:08:37 CET,Tue Nov 30 10:07:02 CET,0.0 0.824 1.15 1.407 1.647 1.872 2.085 2.278 2.628 2.798 2.961 2.854 3.408 3.545 3.81 4.054 4.277 4.381 4.57 4.758 5.034 5.207 5.382 5.641 5.874 6.089 6.305 6.514 6.771 7.021 7.263 7.549 7.812 8.06 8.338 8.658 8.973 9.302 9.65 10.029 10.425 10.848 11.315 11.737 12.203 12.7 13.196 13.697 14.189 14.534 14.586 14.231 13.627 12.979 12.385 11.799 11.245 10.722 10.258 9.768 9.297 8.875 8.479 8.081 7.702 7.344 6.972 6.643 6.331 5.995 5.635 5.343 5.056 4.752 4.512 4.27 4.011 3.742 3.455 3.254 3.046 2.665 2.406 2.153 2.017 1.733 1.441 1.134 0.967 0.378 0.413 0.214 -0.018 -0.555 -0.839 -1.132 -1.492 -1.91 -2.395 -3.058 -6.076 -2 ,9611 ,KEBNE ,16748636,Tue Nov 30 08:08:37 CET,Tue Nov 30 10:06:58 CET,0.0 1.021 1.413 1.708 1.964 2.184 2.375 2.548 2.872 3.042 3.19 3.042 3.574 3.704 3.948 4.172 4.398 4.501 4.703 4.907 5.193 5.378 5.553 5.801 6.042 6.269 6.486 6.694 6.96 7.212 7.449 7.733 8.001 8.24 8.51 8.818 9.108 9.411 9.738 10.09 10.452 10.841 11.261 11.665 12.118 12.603 13.12 13.614 14.069 14.459 14.542 14.111 13.5 12.907 12.33 11.755 11.211 10.686 10.218 9.73 9.289 8.899 8.515 8.147 7.803 7.482 7.142 6.837 6.58 6.305 6.003 5.729 5.449 5.158 4.909 4.658 4.403 4.152 3.881 3.666 3.441 3.086 2.842 2.589 2.453 2.174 1.866 1.514 1.327 0.73 0.751 0.528 0.288 -0.212 -0.502 -0.817 -1.148 -1.544 -2.117 -2.924 -11.269 -3 ,29001 ,KEBNE ,16748637,Tue Nov 30 08:08:38 CET,Tue Nov 30 10:07:02 CET,0.0 0.929 1.26 1.535 1.785 2.03 2.257 2.474 2.867 3.042 3.21 3.103 3.668 3.821 4.09 4.341 4.582 4.691 4.897 5.088 5.363 5.546 5.709 5.944 6.182 6.412 6.637 6.847 7.096 7.333 7.552 7.824 8.081 8.319 8.604 8.919 9.218 9.553 9.909 10.258 10.613 11.007 11.467 11.928 12.398 12.852 13.36 13.857 14.299 14.684 14.842 14.402 13.827 13.255 12.63 12.015 11.45 10.868 10.299 9.713 9.221 8.806 8.419 8.045 7.685 7.354 7.021 6.729 6.465 6.173 5.852 5.585 5.306 5.008 4.759 4.5 4.23 3.943 3.654 3.452 3.239 2.911 2.69 2.455 2.333 2.065 1.764 1.445 1.284 0.715 0.741 0.529 0.322 -0.124 -0.379 -0.671 -1.02 -1.442 -1.945 -2.658 -5.681 -4 ,22905 ,KEBNE ,16748638,Tue Nov 30 08:09:41 CET,Tue Nov 30 10:08:03 CET,0.0 0.827 1.201 1.477 1.723 1.947 2.159 2.358 2.717 2.888 3.063 2.985 3.533 3.667 3.937 4.194 4.422 4.527 4.737 4.942 5.242 5.429 5.599 5.845 6.082 6.317 6.541 6.754 7.029 7.281 7.526 7.809 8.06 8.294 8.561 8.865 9.151 9.451 9.77 10.093 10.407 10.742 11.121 11.479 11.856 12.265 12.709 13.145 13.58 13.997 14.205 13.909 13.374 12.682 11.981 11.333 10.697 10.058 9.471 8.886 8.397 7.944 7.5 7.102 6.736 6.36 5.942 5.599 5.306 4.984 4.644 4.349 4.03 3.693 3.425 3.146 2.884 2.632 2.339 2.125 1.909 1.558 1.3 1.038 0.905 0.627 0.33 0.014 -0.155 -0.75 -0.733 -0.94 -1.142 -1.613 -1.887 -2.197 -2.544 -2.96 -3.516 -4.283 -8.372 -5 ,22656 ,KEBNE ,16748639,Tue Nov 30 08:09:40 CET,Tue Nov 30 10:09:20 CET,0.0 0.751 1.007 1.207 1.393 1.588 1.781 1.955 2.268 2.435 2.588 2.442 2.972 3.098 3.342 3.573 3.79 3.89 4.091 4.29 4.566 4.746 4.924 5.187 5.442 5.676 5.88 6.078 6.338 6.596 6.847 7.139 7.414 7.669 7.953 8.265 8.576 8.933 9.296 9.649 10.034 10.447 10.872 11.296 11.791 12.304 12.808 13.323 13.893 14.327 14.442 14.074 13.456 12.764 12.082 11.424 10.826 10.294 9.835 9.334 8.892 8.521 8.147 7.764 7.389 7.045 6.706 6.402 6.12 5.828 5.538 5.299 5.031 4.724 4.492 4.247 3.984 3.716 3.431 3.242 3.057 2.759 2.544 2.318 2.196 1.931 1.659 1.365 1.209 0.652 0.725 0.541 0.336 -0.114 -0.387 -0.7 -1.026 -1.412 -1.905 -2.563 -5.569 -6 ,19153 ,KEBNE ,16748640,Tue Nov 30 08:10:44 CET,Tue Nov 30 10:08:58 CET,0.0 0.506 0.812 1.063 1.265 1.458 1.62 1.767 2.074 2.222 2.356 2.2 2.725 2.838 3.053 3.265 3.462 3.559 3.741 3.928 4.211 4.395 4.57 4.814 5.044 5.251 5.454 5.647 5.892 6.144 6.389 6.679 6.951 7.205 7.501 7.84 8.143 8.458 8.799 9.143 9.5 9.898 10.346 10.762 11.203 11.668 12.168 12.666 13.092 13.299 13.187 12.631 11.972 11.239 10.504 9.847 9.257 8.724 8.261 7.813 7.425 7.055 6.682 6.328 6.011 5.711 5.39 5.105 4.856 4.58 4.286 4.05 3.811 3.559 3.367 3.159 2.921 2.677 2.424 2.245 2.061 1.765 1.554 1.338 1.227 0.998 0.752 0.495 0.359 -0.201 -0.079 -0.245 -0.418 -0.789 -1.023 -1.309 -1.629 -1.99 -2.41 -3.017 -5.276 -7 ,24478 ,KEBNE ,16748641,Tue Nov 30 08:10:43 CET,Tue Nov 30 10:10:12 CET,0.0 1.187 1.641 2.023 2.336 2.601 2.846 3.057 3.408 3.565 3.723 3.627 4.195 4.331 4.569 4.792 5.009 5.109 5.298 5.494 5.781 5.966 6.143 6.387 6.621 6.841 7.057 7.263 7.513 7.753 7.986 8.261 8.516 8.756 9.032 9.353 9.647 9.951 10.272 10.597 10.93 11.318 11.761 12.168 12.605 13.042 13.519 13.996 14.348 14.587 14.477 13.896 13.242 12.511 11.758 11.064 10.43 9.833 9.321 8.79 8.308 7.87 7.426 6.995 6.584 6.193 5.823 5.509 5.224 4.914 4.583 4.318 4.041 3.75 3.531 3.296 3.041 2.782 2.508 2.313 2.112 1.784 1.55 1.307 1.179 0.911 0.636 0.349 0.204 -0.367 -0.326 -0.53 -0.74 -1.232 -1.497 -1.779 -2.136 -2.567 -3.064 -3.748 -8.04 -8 ,18574 ,KEBNE ,16748642,Tue Nov 30 08:10:43 CET,Tue Nov 30 10:09:34 CET,0.0 1.238 1.706 2.029 2.329 2.588 2.803 3.001 3.356 3.515 3.648 3.487 4.015 4.143 4.385 4.602 4.817 4.919 5.11 5.299 5.592 5.771 5.927 6.149 6.351 6.54 6.743 6.937 7.174 7.41 7.631 7.908 8.187 8.447 8.727 9.026 9.301 9.587 9.883 10.193 10.504 10.854 11.275 11.663 12.076 12.49 12.901 13.269 13.567 13.743 13.549 12.862 12.149 11.404 10.639 9.913 9.277 8.687 8.15 7.57 7.052 6.585 6.134 5.693 5.278 4.893 4.473 4.093 3.756 3.391 2.992 2.66 2.329 1.996 1.723 1.427 1.121 0.806 0.485 0.272 0.059 -0.276 -0.53 -0.82 -0.963 -1.239 -1.552 -1.893 -2.068 -2.668 -2.658 -2.863 -3.083 -3.592 -3.872 -4.182 -4.528 -4.957 -5.514 -6.287 -9.374 -9 ,7743 ,KEBNE ,16748643,Tue Nov 30 08:11:45 CET,Tue Nov 30 10:12:12 CET,0.0 1.515 1.971 2.302 2.579 2.84 3.088 3.297 3.657 3.816 3.981 3.906 4.475 4.613 4.873 5.112 5.335 5.455 5.693 5.895 6.164 6.34 6.528 6.794 7.023 7.237 7.451 7.658 7.912 8.145 8.362 8.639 8.91 9.167 9.451 9.749 10.032 10.349 10.695 11.081 11.445 11.781 12.167 12.552 12.96 13.359 13.766 14.149 14.457 14.633 14.489 13.908 13.238 12.535 11.833 11.177 10.557 9.956 9.419 8.891 8.459 8.066 7.663 7.277 6.903 6.575 6.241 5.932 5.654 5.342 5.004 4.713 4.399 4.048 3.769 3.495 3.219 2.932 2.638 2.425 2.196 1.847 1.606 1.35 1.212 0.933 0.645 0.339 0.174 -0.409 -0.375 -0.589 -0.822 -1.377 -1.694 -2.035 -2.409 -2.835 -3.363 -4.13 -7.61 -10 ,10806 ,KEBNE ,16748644,Tue Nov 30 08:12:48 CET,Tue Nov 30 10:12:13 CET,0.0 0.775 1.068 1.327 1.531 1.71 1.888 2.07 2.399 2.54 2.672 2.516 3.045 3.164 3.378 3.593 3.81 3.904 4.073 4.235 4.461 4.603 4.744 4.962 5.164 5.356 5.561 5.76 5.999 6.229 6.455 6.739 7.004 7.252 7.538 7.854 8.15 8.459 8.785 9.124 9.464 9.824 10.224 10.627 11.115 11.617 12.091 12.533 12.914 13.21 13.378 13.007 12.365 11.744 11.11 10.472 9.88 9.295 8.784 8.285 7.841 7.461 7.088 6.718 6.393 6.1 5.756 5.432 5.171 4.906 4.62 4.376 4.128 3.872 3.665 3.454 3.25 3.036 2.806 2.644 2.476 2.213 2.018 1.798 1.68 1.437 1.192 0.942 0.811 0.256 0.337 0.158 -0.033 -0.436 -0.668 -0.92 -1.208 -1.57 -2.007 -2.648 -6.429 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt deleted file mode 100644 index 858114e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28476 ,KEBNE ,16748645,Tue Nov 30 08:12:49 CET,Tue Nov 30 10:15:48 CET,0.0 3.021 3.897 4.541 5.073 5.506 5.889 6.232 6.812 7.062 7.302 7.649 7.961 8.155 8.508 8.83 9.139 9.292 9.578 9.842 10.211 10.439 10.651 10.949 11.242 11.52 11.782 12.033 12.352 12.65 12.937 13.278 13.575 13.859 14.196 14.567 14.927 15.315 15.713 16.13 16.569 17.029 17.512 17.986 18.533 19.091 19.625 20.142 20.619 21.008 21.06 20.553 19.928 19.288 18.628 17.995 17.412 16.861 16.382 15.883 15.439 15.017 14.585 14.168 13.771 13.41 13.034 12.696 12.398 12.088 11.758 11.481 11.201 10.904 10.66 10.399 10.13 9.847 9.542 9.339 9.13 8.798 8.568 8.324 8.199 7.934 7.636 7.314 7.149 6.866 6.61 6.402 6.169 5.641 5.348 5.023 4.658 4.231 3.682 2.913 0.23 -2 ,21715 ,KEBNE ,16748646,Tue Nov 30 08:12:48 CET,Tue Nov 30 10:15:46 CET,0.0 3.898 4.8 5.426 5.929 6.363 6.729 7.047 7.608 7.861 8.099 8.426 8.728 8.918 9.289 9.632 9.946 10.091 10.368 10.638 11.023 11.26 11.475 11.773 12.063 12.343 12.607 12.86 13.192 13.503 13.796 14.15 14.495 14.809 15.136 15.489 15.83 16.201 16.572 16.925 17.285 17.703 18.146 18.544 19.001 19.521 20.051 20.559 21.05 21.4 21.384 20.786 20.062 19.315 18.611 17.94 17.298 16.688 16.183 15.71 15.295 14.907 14.521 14.099 13.698 13.372 13.02 12.682 12.383 12.083 11.776 11.51 11.233 10.953 10.722 10.469 10.205 9.931 9.645 9.443 9.233 8.885 8.635 8.381 8.246 7.956 7.656 7.338 7.17 6.885 6.615 6.403 6.168 5.651 5.357 5.021 4.631 4.169 3.602 2.828 0.258 -3 ,21707 ,KEBNE ,16748647,Tue Nov 30 08:12:48 CET,Tue Nov 30 10:12:57 CET,0.0 2.858 3.852 4.511 5.006 5.431 5.793 6.111 6.675 6.918 7.138 7.457 7.753 7.942 8.282 8.585 8.869 9.004 9.256 9.503 9.861 10.077 10.282 10.581 10.853 11.106 11.351 11.587 11.874 12.133 12.388 12.696 12.987 13.27 13.603 13.952 14.268 14.614 14.983 15.371 15.766 16.167 16.591 17.004 17.477 17.999 18.552 19.067 19.499 19.8 19.849 19.321 18.531 17.736 17.011 16.355 15.75 15.176 14.659 14.128 13.673 13.256 12.835 12.419 12.029 11.682 11.324 10.983 10.679 10.38 10.071 9.798 9.501 9.187 8.93 8.668 8.409 8.131 7.837 7.635 7.431 7.103 6.865 6.621 6.492 6.207 5.88 5.532 5.363 5.079 4.784 4.571 4.343 3.822 3.52 3.174 2.77 2.274 1.658 0.822 -1.684 -4 ,25028 ,KEBNE ,16748648,Tue Nov 30 08:12:48 CET,Tue Nov 30 10:12:23 CET,0.0 3.842 4.788 5.474 6.008 6.452 6.83 7.143 7.699 7.958 8.193 8.543 8.859 9.046 9.403 9.724 10.017 10.164 10.441 10.695 11.058 11.287 11.516 11.83 12.113 12.381 12.633 12.882 13.197 13.501 13.784 14.122 14.443 14.727 15.049 15.392 15.715 16.063 16.443 16.872 17.307 17.772 18.281 18.757 19.271 19.756 20.227 20.731 21.2 21.489 21.451 20.887 20.213 19.521 18.821 18.13 17.499 16.902 16.378 15.848 15.358 14.912 14.489 14.092 13.711 13.363 12.997 12.648 12.348 12.046 11.719 11.442 11.148 10.835 10.588 10.34 10.098 9.832 9.534 9.323 9.112 8.783 8.54 8.274 8.137 7.847 7.536 7.205 7.033 6.756 6.481 6.278 6.066 5.583 5.306 4.994 4.639 4.206 3.641 2.798 -0.517 -5 ,18100 ,KEBNE ,16748649,Tue Nov 30 08:12:48 CET,Tue Nov 30 10:15:50 CET,0.0 3.384 4.34 4.983 5.5 5.947 6.327 6.669 7.255 7.521 7.774 8.111 8.429 8.62 8.98 9.32 9.633 9.773 10.036 10.301 10.675 10.901 11.122 11.442 11.746 12.023 12.269 12.497 12.799 13.109 13.393 13.705 14.01 14.297 14.624 14.99 15.322 15.686 16.101 16.505 16.872 17.263 17.733 18.205 18.704 19.215 19.776 20.34 20.833 21.182 21.175 20.629 19.959 19.272 18.633 18.005 17.401 16.837 16.34 15.847 15.42 15.023 14.629 14.244 13.889 13.562 13.214 12.904 12.625 12.317 11.988 11.708 11.409 11.109 10.878 10.638 10.382 10.095 9.78 9.576 9.368 9.009 8.757 8.503 8.37 8.096 7.811 7.489 7.314 7.033 6.76 6.554 6.333 5.835 5.545 5.219 4.843 4.397 3.84 3.045 0.401 -6 ,21315 ,KEBNE ,16748650,Tue Nov 30 08:13:50 CET,Tue Nov 30 10:15:08 CET,0.0 3.038 3.992 4.654 5.174 5.594 5.962 6.298 6.868 7.126 7.382 7.728 8.038 8.227 8.563 8.871 9.17 9.315 9.588 9.849 10.218 10.45 10.673 10.976 11.26 11.529 11.787 12.044 12.365 12.665 12.95 13.296 13.624 13.918 14.267 14.653 14.993 15.36 15.757 16.158 16.56 17.003 17.544 18.046 18.542 19.093 19.688 20.238 20.777 21.203 21.289 20.815 20.119 19.435 18.759 18.07 17.427 16.856 16.356 15.827 15.348 14.89 14.458 14.071 13.711 13.372 12.996 12.649 12.342 12.03 11.711 11.439 11.145 10.844 10.617 10.37 10.119 9.861 9.592 9.407 9.214 8.899 8.654 8.395 8.261 7.965 7.644 7.31 7.139 6.849 6.575 6.372 6.152 5.634 5.338 5.018 4.662 4.25 3.721 2.905 -0.076 -8 ,1763 ,KEBNE ,16748652,Tue Nov 30 08:14:53 CET,Tue Nov 30 10:14:43 CET,0.0 4.466 5.366 6.016 6.55 6.988 7.336 7.648 8.226 8.485 8.721 9.043 9.35 9.545 9.893 10.211 10.518 10.672 10.955 11.207 11.561 11.789 12.007 12.318 12.618 12.904 13.165 13.415 13.739 14.053 14.354 14.696 15.016 15.32 15.665 16.056 16.452 16.884 17.315 17.757 18.231 18.728 19.234 19.705 20.244 20.798 21.365 21.966 22.573 23.031 23.009 22.362 21.622 20.941 20.295 19.636 18.991 18.416 17.92 17.373 16.877 16.438 16.001 15.574 15.16 14.782 14.422 14.113 13.84 13.549 13.227 12.953 12.656 12.337 12.097 11.843 11.577 11.301 10.99 10.778 10.568 10.248 10.017 9.767 9.638 9.358 9.051 8.73 8.56 8.28 7.983 7.772 7.544 7.049 6.765 6.43 6.049 5.598 5.03 4.23 1.743 -9 ,21434 ,KEBNE ,16748653,Tue Nov 30 08:15:56 CET,Tue Nov 30 10:19:22 CET,0.0 3.244 4.125 4.724 5.204 5.608 5.973 6.305 6.855 7.104 7.348 7.66 7.965 8.161 8.53 8.871 9.182 9.325 9.586 9.84 10.183 10.404 10.633 10.961 11.27 11.545 11.791 12.032 12.341 12.651 12.948 13.28 13.589 13.899 14.257 14.607 14.931 15.281 15.657 16.042 16.458 16.919 17.389 17.83 18.338 18.883 19.468 20.052 20.545 20.848 20.89 20.43 19.717 18.955 18.235 17.569 16.94 16.306 15.747 15.167 14.668 14.229 13.779 13.348 12.962 12.609 12.209 11.844 11.554 11.257 10.942 10.668 10.375 10.069 9.829 9.588 9.345 9.092 8.817 8.62 8.411 8.069 7.824 7.584 7.464 7.207 6.932 6.626 6.459 6.184 5.928 5.728 5.517 5.023 4.734 4.423 4.065 3.618 3.063 2.31 -0.623 -10 ,27917 ,KEBNE ,16748654,Tue Nov 30 08:17:00 CET,Tue Nov 30 10:18:29 CET,0.0 3.742 4.688 5.331 5.828 6.246 6.618 6.968 7.601 7.872 8.11 8.43 8.731 8.91 9.247 9.564 9.862 10.003 10.273 10.539 10.908 11.135 11.357 11.67 11.97 12.25 12.504 12.742 13.042 13.345 13.628 13.941 14.241 14.533 14.858 15.205 15.534 15.883 16.245 16.625 17.025 17.425 17.845 18.243 18.642 19.045 19.454 19.826 20.123 20.249 20.085 19.527 18.797 18.005 17.282 16.579 15.9 15.279 14.781 14.27 13.799 13.375 12.953 12.542 12.167 11.836 11.486 11.166 10.88 10.582 10.272 10.004 9.717 9.414 9.179 8.946 8.697 8.413 8.114 7.92 7.713 7.38 7.136 6.876 6.746 6.482 6.199 5.882 5.716 5.431 5.154 4.939 4.72 4.236 3.961 3.653 3.295 2.868 2.315 1.543 -1.189 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 64d70fe3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,15018 ,KEBNE ,16748656,Tue Nov 30 08:18:02 CET,Tue Nov 30 10:19:17 CET,0.0 4.446 5.269 5.851 6.319 6.702 7.044 7.348 7.853 8.077 8.293 8.559 8.835 9.004 9.31 9.6 9.88 10.011 10.26 10.493 10.808 11.006 11.189 11.451 11.71 11.967 12.205 12.416 12.673 12.913 13.152 13.435 13.708 13.961 14.223 14.531 14.813 15.094 15.392 15.687 16.006 16.355 16.714 17.049 17.385 17.672 17.914 18.097 18.134 17.954 17.33 16.212 15.16 14.217 13.276 12.397 11.618 10.893 10.249 9.572 8.994 8.467 7.947 7.46 7.017 6.611 6.189 5.815 5.489 5.152 4.796 4.499 4.192 3.869 3.614 3.335 3.049 2.764 2.454 2.241 2.018 1.657 1.413 1.153 1.02 0.748 0.454 0.121 -0.057 -0.354 -0.66 -0.882 -1.11 -1.654 -1.961 -2.286 -2.654 -3.08 -3.624 -4.417 -7.063 -4 ,12496 ,KEBNE ,16748658,Tue Nov 30 08:27:25 CET,Tue Nov 30 10:28:54 CET,0.0 2.574 3.382 3.939 4.369 4.747 5.089 5.398 5.916 6.136 6.344 6.631 6.924 7.089 7.39 7.665 7.921 8.049 8.295 8.522 8.847 9.043 9.228 9.49 9.738 9.967 10.189 10.403 10.662 10.904 11.136 11.422 11.701 11.96 12.227 12.516 12.794 13.073 13.352 13.647 13.938 14.237 14.569 14.881 15.212 15.537 15.851 16.1 16.202 16.048 15.517 14.458 13.355 12.333 11.41 10.578 9.805 9.09 8.452 7.79 7.217 6.716 6.255 5.796 5.35 4.962 4.547 4.163 3.833 3.489 3.12 2.807 2.486 2.14 1.857 1.567 1.276 0.975 0.66 0.435 0.195 -0.187 -0.463 -0.742 -0.881 -1.177 -1.502 -1.846 -2.031 -2.344 -2.645 -2.86 -3.09 -3.62 -3.92 -4.26 -4.625 -5.048 -5.616 -6.417 -8.955 -5 ,4111 ,KEBNE ,16748659,Tue Nov 30 08:38:53 CET,Tue Nov 30 10:41:41 CET,0.0 2.809 3.599 4.15 4.607 4.985 5.309 5.619 6.201 6.457 6.683 6.972 7.259 7.429 7.75 8.045 8.31 8.434 8.667 8.893 9.231 9.44 9.628 9.891 10.139 10.374 10.593 10.799 11.063 11.304 11.534 11.809 12.064 12.309 12.58 12.868 13.122 13.402 13.696 13.983 14.278 14.578 14.92 15.275 15.643 15.987 16.338 16.635 16.794 16.685 15.988 14.826 13.746 12.751 11.843 11.004 10.244 9.515 8.864 8.233 7.721 7.235 6.757 6.303 5.855 5.459 5.052 4.674 4.349 3.998 3.623 3.318 2.994 2.648 2.377 2.097 1.803 1.494 1.166 0.931 0.681 0.276 -0.018 -0.321 -0.467 -0.755 -1.057 -1.399 -1.587 -1.901 -2.197 -2.423 -2.669 -3.202 -3.489 -3.819 -4.21 -4.67 -5.252 -6.057 -9.173 -6 ,11281 ,KEBNE ,16748660,Tue Nov 30 08:42:01 CET,Tue Nov 30 10:43:47 CET,0.0 3.88 4.773 5.402 5.9 6.305 6.642 6.945 7.479 7.7 7.909 8.221 8.516 8.688 9.012 9.3 9.561 9.689 9.932 10.149 10.464 10.675 10.878 11.158 11.415 11.651 11.875 12.093 12.362 12.612 12.856 13.141 13.402 13.64 13.899 14.187 14.47 14.754 15.041 15.342 15.644 15.979 16.355 16.712 17.064 17.372 17.684 17.94 18.093 18.079 17.58 16.547 15.398 14.339 13.438 12.608 11.861 11.157 10.529 9.906 9.381 8.919 8.478 8.058 7.66 7.285 6.871 6.488 6.161 5.828 5.485 5.202 4.899 4.556 4.29 4.04 3.766 3.47 3.175 2.967 2.751 2.404 2.154 1.903 1.773 1.483 1.158 0.822 0.644 0.349 0.054 -0.164 -0.404 -0.945 -1.251 -1.602 -1.996 -2.44 -3.013 -3.839 -7.853 -7 ,15806 ,KEBNE ,16748661,Tue Nov 30 08:43:03 CET,Tue Nov 30 10:47:59 CET,0.0 4.148 5.002 5.593 6.046 6.433 6.774 7.073 7.581 7.812 8.022 8.302 8.578 8.738 9.045 9.34 9.623 9.754 10.003 10.245 10.559 10.748 10.926 11.17 11.4 11.619 11.839 12.049 12.294 12.531 12.77 13.049 13.312 13.558 13.827 14.116 14.384 14.659 14.952 15.259 15.525 15.787 16.076 16.35 16.652 16.949 17.249 17.476 17.574 17.494 16.89 15.726 14.56 13.515 12.537 11.554 10.766 10.093 9.49 8.854 8.278 7.775 7.304 6.871 6.457 6.07 5.65 5.264 4.944 4.625 4.288 3.981 3.645 3.298 3.03 2.751 2.465 2.166 1.848 1.632 1.405 1.039 0.781 0.497 0.344 0.041 -0.256 -0.579 -0.759 -1.052 -1.341 -1.551 -1.773 -2.281 -2.589 -2.938 -3.323 -3.771 -4.315 -5.094 -7.515 -8 ,2761 ,KEBNE ,16748662,Tue Nov 30 08:43:05 CET,Tue Nov 30 10:37:22 CET,0.0 3.493 4.354 4.953 5.412 5.794 6.124 6.423 6.962 7.192 7.403 7.678 7.946 8.117 8.452 8.755 9.018 9.144 9.386 9.609 9.92 10.111 10.296 10.557 10.803 11.036 11.26 11.482 11.758 12.017 12.264 12.544 12.792 13.041 13.331 13.632 13.916 14.208 14.52 14.833 15.11 15.381 15.68 15.963 16.279 16.599 16.879 17.111 17.227 17.091 16.416 15.266 14.147 13.075 12.136 11.244 10.421 9.698 9.097 8.481 7.941 7.457 6.984 6.542 6.133 5.747 5.332 4.962 4.628 4.27 3.907 3.605 3.298 2.974 2.714 2.455 2.181 1.885 1.572 1.35 1.114 0.739 0.471 0.182 0.031 -0.277 -0.591 -0.915 -1.088 -1.384 -1.686 -1.91 -2.147 -2.672 -2.971 -3.318 -3.731 -4.217 -4.795 -5.619 -8.563 -9 ,26600 ,KEBNE ,16748663,Tue Nov 30 08:44:06 CET,Tue Nov 30 10:49:14 CET,0.0 3.843 4.694 5.306 5.763 6.144 6.504 6.83 7.366 7.605 7.828 8.129 8.423 8.599 8.926 9.222 9.487 9.608 9.84 10.067 10.377 10.57 10.761 11.024 11.267 11.507 11.729 11.931 12.181 12.418 12.65 12.924 13.186 13.44 13.723 14.033 14.322 14.6 14.856 15.135 15.428 15.734 16.07 16.379 16.676 16.982 17.262 17.434 17.552 17.484 16.901 15.845 14.805 13.851 12.937 12.11 11.365 10.642 10.001 9.354 8.817 8.347 7.872 7.392 6.945 6.55 6.13 5.746 5.422 5.093 4.75 4.457 4.144 3.825 3.575 3.307 3.032 2.733 2.415 2.195 1.975 1.641 1.378 1.087 0.941 0.641 0.323 -0.024 -0.211 -0.517 -0.818 -1.041 -1.292 -1.885 -2.212 -2.559 -2.956 -3.404 -3.949 -4.746 -7.845 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt deleted file mode 100644 index a49d5663..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22345 ,KEBNE ,16748665,Tue Nov 30 08:45:08 CET,Tue Nov 30 10:46:52 CET,0.0 2.725 3.236 3.561 3.803 3.997 4.163 4.289 4.482 4.551 4.603 4.559 4.669 4.686 4.706 4.701 4.685 4.676 4.668 4.637 4.546 4.483 4.41 4.306 4.205 4.089 3.961 3.814 3.604 3.383 3.167 2.898 2.595 2.26 1.843 1.37 0.884 0.304 -0.373 -1.148 -2.03 -3.127 -4.489 -5.947 -7.812 -10.1 -13.045 -16.803 -21.775 -28.637 -38.841 -49.528 -57.438 -63.623 -68.523 -72.614 -76.015 -78.955 -81.398 -83.771 -85.767 -87.493 -89.105 -90.582 -91.917 -93.109 -94.306 -95.36 -96.264 -97.194 -98.142 -98.902 -99.675 -100.482 -101.105 -101.747 -102.41 -103.091 -103.811 -104.317 -104.827 -105.595 -106.117 -106.649 -106.922 -107.484 -108.091 -108.739 -109.063 -109.607 -110.081 -110.452 -110.837 -111.674 -112.139 -112.673 -113.268 -113.912 -114.645 -115.66 -119.099 -2 ,742 ,KEBNE ,16748666,Tue Nov 30 08:46:11 CET,Tue Nov 30 10:49:11 CET,0.0 1.647 2.037 2.309 2.509 2.653 2.765 2.85 2.982 3.029 3.074 3.057 3.177 3.192 3.215 3.214 3.202 3.197 3.173 3.139 3.072 3.008 2.943 2.839 2.723 2.593 2.452 2.293 2.068 1.857 1.636 1.339 1.022 0.684 0.288 -0.197 -0.736 -1.357 -2.06 -2.865 -3.792 -4.923 -6.328 -7.846 -9.744 -12.048 -15.022 -18.849 -23.907 -30.827 -41.202 -52.105 -60.073 -66.278 -71.341 -75.584 -78.983 -81.9 -84.337 -86.696 -88.661 -90.359 -91.942 -93.38 -94.682 -95.884 -97.116 -98.19 -99.106 -100.026 -100.951 -101.705 -102.477 -103.276 -103.895 -104.524 -105.169 -105.847 -106.56 -107.043 -107.541 -108.293 -108.791 -109.321 -109.6 -110.167 -110.748 -111.35 -111.667 -112.215 -112.671 -113.021 -113.385 -114.182 -114.646 -115.158 -115.73 -116.374 -117.107 -118.102 -121.684 -4 ,29405 ,KEBNE ,16748668,Tue Nov 30 08:46:11 CET,Tue Nov 30 10:48:58 CET,0.0 2.238 2.656 2.908 3.114 3.288 3.409 3.491 3.649 3.709 3.747 3.697 3.81 3.817 3.8 3.773 3.746 3.733 3.702 3.657 3.587 3.53 3.456 3.328 3.194 3.054 2.904 2.753 2.537 2.303 2.062 1.745 1.42 1.096 0.693 0.184 -0.314 -0.873 -1.546 -2.341 -3.241 -4.331 -5.703 -7.182 -9.072 -11.406 -14.388 -18.133 -23.064 -29.886 -40.088 -50.728 -58.575 -64.812 -69.848 -74.035 -77.484 -80.491 -82.981 -85.372 -87.379 -89.129 -90.735 -92.196 -93.524 -94.721 -95.97 -97.093 -98.078 -99.082 -100.078 -100.883 -101.684 -102.499 -103.142 -103.812 -104.509 -105.225 -105.967 -106.47 -106.97 -107.756 -108.292 -108.841 -109.129 -109.741 -110.38 -111.015 -111.341 -111.89 -112.41 -112.807 -113.205 -114.058 -114.534 -115.042 -115.616 -116.311 -117.245 -118.52 -121.92 -6 ,13361 ,KEBNE ,16748670,Tue Nov 30 08:49:18 CET,Tue Nov 30 10:48:38 CET,0.0 1.78 2.212 2.475 2.685 2.839 2.943 3.03 3.158 3.223 3.293 3.271 3.387 3.397 3.401 3.397 3.376 3.36 3.336 3.317 3.282 3.241 3.179 3.076 2.967 2.832 2.685 2.533 2.317 2.105 1.881 1.585 1.284 0.971 0.577 0.097 -0.401 -0.991 -1.67 -2.458 -3.343 -4.402 -5.742 -7.231 -9.153 -11.452 -14.341 -17.994 -22.838 -29.532 -39.459 -49.989 -57.815 -63.945 -68.832 -72.892 -76.261 -79.157 -81.56 -83.89 -85.794 -87.436 -88.987 -90.43 -91.768 -92.981 -94.227 -95.328 -96.276 -97.26 -98.285 -99.104 -99.935 -100.779 -101.399 -102.025 -102.668 -103.327 -104.012 -104.482 -104.96 -105.728 -106.264 -106.795 -107.064 -107.624 -108.224 -108.832 -109.14 -109.68 -110.151 -110.503 -110.861 -111.661 -112.1 -112.57 -113.098 -113.712 -114.486 -115.548 -119.165 -7 ,28309 ,KEBNE ,16748671,Tue Nov 30 08:50:20 CET,Tue Nov 30 10:49:40 CET,0.0 2.151 2.553 2.798 2.99 3.139 3.238 3.318 3.453 3.509 3.558 3.522 3.659 3.681 3.697 3.693 3.681 3.673 3.649 3.606 3.502 3.434 3.357 3.228 3.107 2.974 2.82 2.661 2.449 2.235 2.01 1.719 1.398 1.06 0.65 0.167 -0.323 -0.913 -1.63 -2.453 -3.354 -4.456 -5.864 -7.422 -9.366 -11.722 -14.744 -18.524 -23.516 -30.375 -40.522 -51.143 -58.974 -65.124 -70.058 -74.167 -77.556 -80.499 -82.944 -85.246 -87.141 -88.801 -90.333 -91.746 -93.039 -94.194 -95.383 -96.429 -97.319 -98.236 -99.181 -99.928 -100.682 -101.483 -102.104 -102.708 -103.316 -103.952 -104.613 -105.077 -105.552 -106.276 -106.767 -107.279 -107.541 -108.067 -108.609 -109.181 -109.484 -110.005 -110.434 -110.781 -111.15 -111.962 -112.425 -112.928 -113.47 -114.079 -114.823 -115.862 -118.534 -8 ,18117 ,KEBNE ,16748672,Tue Nov 30 08:51:23 CET,Tue Nov 30 10:51:44 CET,0.0 1.951 2.395 2.682 2.884 3.025 3.141 3.253 3.423 3.476 3.525 3.512 3.636 3.662 3.687 3.684 3.664 3.652 3.624 3.596 3.545 3.498 3.443 3.34 3.229 3.092 2.951 2.823 2.621 2.397 2.167 1.866 1.557 1.243 0.849 0.36 -0.148 -0.74 -1.427 -2.199 -3.063 -4.128 -5.492 -6.994 -8.912 -11.228 -14.158 -17.833 -22.731 -29.554 -39.63 -50.156 -58.047 -64.288 -69.241 -73.365 -76.761 -79.653 -82.051 -84.38 -86.314 -87.976 -89.515 -90.933 -92.219 -93.37 -94.582 -95.658 -96.558 -97.468 -98.395 -99.15 -99.94 -100.749 -101.347 -101.949 -102.573 -103.236 -103.909 -104.36 -104.819 -105.515 -106.004 -106.505 -106.755 -107.299 -107.87 -108.456 -108.766 -109.303 -109.793 -110.179 -110.577 -111.463 -111.927 -112.424 -112.982 -113.587 -114.283 -115.315 -119.007 -9 ,7982 ,KEBNE ,16748673,Tue Nov 30 08:53:28 CET,Tue Nov 30 10:53:48 CET,0.0 2.038 2.472 2.746 2.943 3.091 3.202 3.302 3.462 3.527 3.582 3.541 3.66 3.679 3.688 3.677 3.66 3.647 3.628 3.603 3.529 3.476 3.423 3.33 3.222 3.091 2.951 2.801 2.585 2.362 2.136 1.854 1.559 1.235 0.827 0.341 -0.169 -0.762 -1.44 -2.229 -3.125 -4.19 -5.542 -7.025 -8.935 -11.285 -14.24 -17.994 -22.99 -29.828 -39.958 -50.611 -58.454 -64.694 -69.785 -74.062 -77.594 -80.591 -83.077 -85.477 -87.452 -89.14 -90.701 -92.167 -93.5 -94.683 -95.901 -96.979 -97.881 -98.789 -99.732 -100.498 -101.284 -102.091 -102.719 -103.356 -103.998 -104.669 -105.351 -105.815 -106.3 -107.057 -107.585 -108.141 -108.431 -109.008 -109.611 -110.258 -110.593 -111.137 -111.586 -111.951 -112.336 -113.176 -113.655 -114.159 -114.713 -115.348 -116.154 -117.256 -120.086 -10 ,29916 ,KEBNE ,16748674,Tue Nov 30 08:53:28 CET,Tue Nov 30 10:52:59 CET,0.0 1.953 2.425 2.718 2.898 3.033 3.15 3.244 3.362 3.404 3.436 3.374 3.48 3.501 3.52 3.499 3.466 3.45 3.394 3.335 3.259 3.199 3.127 2.998 2.86 2.718 2.567 2.407 2.182 1.951 1.712 1.4 1.062 0.716 0.32 -0.164 -0.698 -1.317 -2.025 -2.831 -3.737 -4.829 -6.189 -7.679 -9.598 -11.976 -14.952 -18.619 -23.539 -30.4 -40.634 -51.388 -59.336 -65.594 -70.626 -74.849 -78.363 -81.377 -83.874 -86.275 -88.251 -89.962 -91.541 -92.987 -94.304 -95.489 -96.733 -97.857 -98.789 -99.724 -100.674 -101.432 -102.225 -103.044 -103.666 -104.295 -104.927 -105.577 -106.254 -106.728 -107.218 -107.96 -108.473 -109.015 -109.295 -109.87 -110.471 -111.093 -111.41 -111.954 -112.416 -112.774 -113.149 -113.948 -114.371 -114.831 -115.352 -115.944 -116.668 -117.675 -120.648 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt deleted file mode 100644 index d000383b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,840 ,KEBNE ,16748675,Tue Nov 30 08:55:33 CET,Tue Nov 30 10:58:42 CET,0.0 2.676 3.571 4.215 4.739 5.169 5.549 5.89 6.463 6.73 6.991 7.375 7.711 7.924 8.325 8.693 9.026 9.183 9.488 9.784 10.203 10.45 10.687 11.044 11.369 11.663 11.954 12.234 12.588 12.918 13.217 13.582 13.94 14.277 14.663 15.114 15.534 15.948 16.38 16.861 17.355 17.882 18.543 19.193 19.879 20.62 21.453 22.367 23.316 24.198 24.97 25.307 25.197 24.936 24.637 24.246 23.834 23.443 23.091 22.715 22.357 22.026 21.693 21.368 21.048 20.752 20.436 20.134 19.866 19.589 19.307 19.063 18.802 18.529 18.307 18.076 17.839 17.581 17.299 17.107 16.911 16.598 16.377 16.127 15.997 15.727 15.44 15.133 14.964 14.683 14.397 14.181 13.956 13.443 13.151 12.819 12.432 11.986 11.423 10.613 7.352 -2 ,4556 ,KEBNE ,16748676,Tue Nov 30 08:56:35 CET,Tue Nov 30 10:58:25 CET,0.0 2.787 3.725 4.365 4.875 5.284 5.648 5.974 6.532 6.789 7.026 7.356 7.68 7.872 8.236 8.583 8.906 9.056 9.341 9.605 9.976 10.216 10.444 10.778 11.098 11.397 11.686 11.952 12.281 12.601 12.916 13.306 13.681 14.031 14.433 14.882 15.285 15.712 16.201 16.761 17.312 17.868 18.501 19.116 19.828 20.622 21.489 22.366 23.331 24.361 25.308 25.653 25.489 25.195 24.876 24.523 24.131 23.686 23.271 22.843 22.498 22.222 21.919 21.591 21.279 20.988 20.68 20.4 20.148 19.872 19.581 19.329 19.042 18.743 18.515 18.271 18.022 17.765 17.491 17.298 17.098 16.757 16.501 16.236 16.1 15.814 15.499 15.159 14.974 14.663 14.356 14.129 13.892 13.372 13.068 12.7 12.273 11.789 11.228 10.439 7.162 -3 ,18982 ,KEBNE ,16748677,Tue Nov 30 08:56:35 CET,Tue Nov 30 11:00:44 CET,0.0 2.352 3.21 3.821 4.311 4.726 5.101 5.444 6.004 6.235 6.461 6.778 7.095 7.28 7.639 7.975 8.286 8.44 8.741 9.009 9.407 9.654 9.891 10.239 10.552 10.853 11.128 11.39 11.733 12.064 12.373 12.733 13.071 13.384 13.732 14.125 14.508 14.899 15.314 15.763 16.241 16.766 17.352 17.927 18.568 19.258 20.053 20.941 21.87 22.782 23.574 23.888 23.827 23.636 23.298 22.893 22.526 22.133 21.775 21.419 21.075 20.76 20.449 20.13 19.821 19.542 19.23 18.948 18.703 18.432 18.147 17.919 17.678 17.392 17.165 16.942 16.712 16.465 16.184 15.984 15.786 15.473 15.235 14.982 14.851 14.569 14.273 13.948 13.773 13.478 13.184 12.968 12.733 12.214 11.906 11.566 11.2 10.76 10.205 9.379 5.479 -5 ,11272 ,KEBNE ,16748679,Tue Nov 30 09:01:52 CET,Tue Nov 30 11:02:16 CET,0.0 2.772 3.691 4.339 4.839 5.262 5.63 5.962 6.541 6.802 7.05 7.37 7.677 7.874 8.244 8.589 8.902 9.05 9.34 9.608 9.984 10.229 10.473 10.826 11.139 11.435 11.725 11.996 12.34 12.673 13.001 13.385 13.725 14.068 14.463 14.882 15.286 15.713 16.163 16.628 17.081 17.587 18.203 18.795 19.461 20.187 20.976 21.83 22.817 23.822 24.715 25.087 24.942 24.626 24.325 24.021 23.7 23.337 22.974 22.602 22.258 21.932 21.586 21.26 20.965 20.683 20.38 20.084 19.814 19.531 19.234 18.994 18.73 18.443 18.227 18.004 17.767 17.505 17.22 17.031 16.832 16.506 16.267 16.009 15.88 15.599 15.28 14.959 14.8 14.514 14.23 14.015 13.786 13.274 12.983 12.647 12.266 11.812 11.222 10.374 7.13 -6 ,32590 ,KEBNE ,16748680,Tue Nov 30 09:01:52 CET,Tue Nov 30 11:03:21 CET,0.0 2.841 3.725 4.343 4.847 5.261 5.637 5.986 6.592 6.852 7.099 7.427 7.752 7.954 8.347 8.707 9.023 9.177 9.471 9.746 10.131 10.379 10.616 10.95 11.282 11.604 11.914 12.215 12.583 12.929 13.262 13.641 14.009 14.354 14.729 15.144 15.552 16.007 16.489 16.99 17.507 18.089 18.767 19.426 20.135 20.835 21.596 22.381 23.191 24.082 24.953 25.301 25.192 24.929 24.606 24.245 23.874 23.485 23.132 22.765 22.443 22.121 21.784 21.478 21.177 20.875 20.565 20.292 20.035 19.755 19.471 19.235 18.985 18.715 18.481 18.242 18.001 17.741 17.469 17.271 17.06 16.738 16.513 16.273 16.146 15.879 15.594 15.277 15.11 14.826 14.557 14.347 14.115 13.601 13.316 12.975 12.588 12.14 11.589 10.832 7.5 -7 ,27047 ,KEBNE ,16748681,Tue Nov 30 09:01:52 CET,Tue Nov 30 11:05:13 CET,0.0 3.431 4.31 4.921 5.389 5.809 6.18 6.512 7.11 7.36 7.593 7.915 8.234 8.439 8.818 9.15 9.462 9.624 9.939 10.219 10.607 10.862 11.106 11.448 11.783 12.103 12.408 12.703 13.069 13.412 13.749 14.141 14.488 14.816 15.205 15.653 16.075 16.52 16.978 17.447 17.939 18.48 19.122 19.775 20.473 21.203 22.048 22.929 23.819 24.72 25.532 25.812 25.664 25.32 24.868 24.425 24.029 23.621 23.226 22.794 22.421 22.086 21.757 21.446 21.135 20.841 20.532 20.252 20.009 19.745 19.469 19.237 18.982 18.695 18.47 18.246 18.002 17.73 17.425 17.215 17.01 16.692 16.46 16.209 16.079 15.812 15.507 15.171 14.996 14.701 14.416 14.208 13.99 13.5 13.217 12.893 12.516 12.081 11.517 10.702 6.378 -9 ,22994 ,KEBNE ,16748683,Tue Nov 30 09:03:57 CET,Tue Nov 30 11:05:12 CET,0.0 2.749 3.653 4.275 4.775 5.197 5.569 5.911 6.514 6.78 7.017 7.331 7.647 7.85 8.218 8.559 8.884 9.028 9.296 9.557 9.928 10.165 10.397 10.719 11.014 11.296 11.562 11.825 12.172 12.488 12.788 13.16 13.527 13.878 14.257 14.66 15.053 15.488 15.954 16.446 16.914 17.456 18.096 18.69 19.359 20.05 20.817 21.635 22.499 23.407 24.246 24.518 24.405 24.109 23.741 23.379 23.024 22.667 22.277 21.866 21.54 21.237 20.917 20.613 20.329 20.042 19.753 19.499 19.269 19.033 18.768 18.536 18.295 18.038 17.83 17.612 17.383 17.126 16.849 16.654 16.444 16.135 15.923 15.687 15.565 15.297 15.004 14.698 14.53 14.245 13.981 13.783 13.561 13.066 12.793 12.483 12.117 11.687 11.155 10.368 6.687 -10 ,14753 ,KEBNE ,16748684,Tue Nov 30 09:05:00 CET,Tue Nov 30 11:07:54 CET,0.0 3.483 4.443 5.089 5.603 6.027 6.38 6.691 7.249 7.501 7.75 8.078 8.387 8.571 8.933 9.267 9.557 9.706 10.004 10.278 10.66 10.899 11.12 11.436 11.739 12.022 12.287 12.545 12.897 13.234 13.542 13.905 14.246 14.555 14.916 15.338 15.734 16.153 16.613 17.093 17.597 18.144 18.741 19.358 20.049 20.822 21.656 22.431 23.221 24.053 24.895 25.23 25.166 24.938 24.596 24.2 23.828 23.466 23.11 22.734 22.376 22.029 21.686 21.364 21.06 20.772 20.465 20.177 19.908 19.627 19.342 19.095 18.834 18.559 18.341 18.114 17.87 17.606 17.333 17.139 16.939 16.621 16.385 16.132 15.997 15.717 15.422 15.095 14.917 14.617 14.311 14.094 13.858 13.335 13.023 12.679 12.312 11.867 11.306 10.474 6.577 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt deleted file mode 100644 index af8ee3da..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2990 ,KEBNE ,17028081,Wed Dec 22 18:56:52 CET,Wed Dec 22 20:57:08 CET,0.0 2.255 2.758 3.063 3.296 3.477 3.619 3.73 3.902 3.965 4.026 4.009 4.148 4.17 4.203 4.22 4.239 4.248 4.258 4.273 4.269 4.248 4.221 4.163 4.099 4.024 3.936 3.83 3.667 3.501 3.32 3.094 2.865 2.617 2.318 1.965 1.569 1.076 0.519 -0.131 -0.888 -1.826 -2.996 -4.286 -5.986 -8.065 -10.631 -13.903 -18.379 -24.528 -33.723 -43.526 -50.717 -56.336 -60.836 -64.649 -67.845 -70.589 -72.848 -75.043 -76.864 -78.478 -80.035 -81.46 -82.754 -83.906 -85.093 -86.152 -87.047 -87.94 -88.838 -89.58 -90.328 -91.065 -91.632 -92.227 -92.851 -93.502 -94.192 -94.66 -95.104 -95.766 -96.239 -96.739 -97.001 -97.576 -98.174 -98.782 -99.103 -99.651 -100.122 -100.494 -100.891 -101.762 -102.213 -102.71 -103.305 -103.993 -104.833 -106.018 -110.348 -2 ,10717 ,KEBNE ,17028082,Wed Dec 22 18:56:52 CET,Wed Dec 22 20:55:52 CET,0.0 1.125 1.482 1.753 1.992 2.198 2.368 2.515 2.732 2.833 2.933 2.987 3.164 3.227 3.315 3.347 3.36 3.369 3.376 3.378 3.38 3.358 3.321 3.265 3.204 3.128 3.046 2.955 2.818 2.663 2.494 2.289 2.053 1.782 1.449 1.073 0.673 0.161 -0.441 -1.141 -1.921 -2.878 -4.119 -5.452 -7.11 -9.135 -11.742 -15.079 -19.544 -25.689 -34.834 -44.42 -51.461 -57.056 -61.589 -65.373 -68.489 -71.198 -73.469 -75.63 -77.431 -78.989 -80.416 -81.716 -82.901 -83.976 -85.082 -86.035 -86.851 -87.685 -88.532 -89.243 -89.984 -90.743 -91.326 -91.924 -92.541 -93.175 -93.819 -94.269 -94.749 -95.507 -96.012 -96.523 -96.791 -97.341 -97.906 -98.504 -98.825 -99.373 -99.854 -100.219 -100.595 -101.44 -101.905 -102.401 -102.972 -103.639 -104.461 -105.621 -110.159 -3 ,21690 ,KEBNE ,17028083,Wed Dec 22 18:56:52 CET,Wed Dec 22 20:57:03 CET,0.0 3.48 3.98 4.297 4.537 4.742 4.913 5.044 5.259 5.343 5.42 5.427 5.582 5.633 5.712 5.769 5.824 5.84 5.857 5.862 5.843 5.817 5.781 5.711 5.65 5.583 5.494 5.4 5.247 5.066 4.888 4.663 4.42 4.16 3.813 3.388 2.967 2.465 1.872 1.2 0.42 -0.539 -1.729 -3.037 -4.729 -6.783 -9.363 -12.65 -17.047 -23.205 -32.431 -42.235 -49.501 -55.068 -59.552 -63.41 -66.623 -69.433 -71.78 -74.039 -75.946 -77.582 -79.096 -80.506 -81.791 -82.934 -84.101 -85.138 -86.026 -86.946 -87.903 -88.676 -89.463 -90.264 -90.879 -91.53 -92.211 -92.923 -93.657 -94.142 -94.635 -95.39 -95.909 -96.448 -96.729 -97.319 -97.937 -98.569 -98.892 -99.456 -99.979 -100.368 -100.769 -101.629 -102.103 -102.621 -103.206 -103.855 -104.617 -105.701 -110.571 -4 ,7026 ,KEBNE ,17028084,Wed Dec 22 18:57:59 CET,Wed Dec 22 20:53:14 CET,0.0 2.703 3.209 3.575 3.86 4.088 4.255 4.381 4.584 4.664 4.737 4.739 4.886 4.929 4.989 5.02 5.039 5.051 5.053 5.034 5.019 4.997 4.96 4.898 4.818 4.728 4.632 4.522 4.369 4.222 4.057 3.839 3.608 3.357 3.04 2.662 2.259 1.764 1.207 0.548 -0.219 -1.169 -2.362 -3.62 -5.252 -7.264 -9.855 -13.131 -17.468 -23.517 -32.443 -41.757 -48.707 -54.166 -58.555 -62.379 -65.592 -68.331 -70.618 -72.775 -74.587 -76.176 -77.679 -79.102 -80.383 -81.513 -82.677 -83.731 -84.631 -85.54 -86.457 -87.225 -88.016 -88.804 -89.407 -90.021 -90.661 -91.317 -91.997 -92.477 -92.957 -93.683 -94.19 -94.721 -94.994 -95.55 -96.137 -96.77 -97.095 -97.646 -98.136 -98.54 -98.979 -99.893 -100.385 -100.944 -101.561 -102.259 -103.112 -104.344 -109.617 -5 ,14704 ,KEBNE ,17028085,Wed Dec 22 19:08:13 CET,Wed Dec 22 21:06:26 CET,0.0 1.905 2.416 2.724 2.955 3.154 3.302 3.423 3.642 3.736 3.824 3.845 4.008 4.062 4.137 4.178 4.199 4.204 4.198 4.17 4.123 4.091 4.055 3.986 3.912 3.822 3.721 3.614 3.452 3.266 3.062 2.8 2.543 2.274 1.939 1.524 1.085 0.603 0.039 -0.626 -1.376 -2.304 -3.504 -4.825 -6.502 -8.572 -11.187 -14.471 -18.851 -24.906 -33.938 -43.507 -50.721 -56.416 -60.966 -64.843 -68.101 -70.894 -73.213 -75.449 -77.337 -79.008 -80.55 -81.961 -83.264 -84.426 -85.612 -86.642 -87.52 -88.446 -89.379 -90.128 -90.902 -91.705 -92.325 -92.947 -93.577 -94.24 -94.923 -95.391 -95.882 -96.63 -97.144 -97.678 -97.956 -98.517 -99.094 -99.716 -100.038 -100.585 -101.095 -101.483 -101.891 -102.753 -103.238 -103.776 -104.384 -105.073 -105.875 -107.017 -111.418 -6 ,23352 ,KEBNE ,17028086,Wed Dec 22 19:08:13 CET,Wed Dec 22 21:07:20 CET,0.0 3.141 3.595 3.928 4.186 4.384 4.549 4.687 4.918 5.022 5.113 5.141 5.282 5.315 5.375 5.408 5.43 5.442 5.455 5.467 5.452 5.416 5.379 5.309 5.228 5.143 5.051 4.932 4.757 4.588 4.415 4.197 3.951 3.668 3.313 2.882 2.446 1.936 1.333 0.628 -0.184 -1.15 -2.387 -3.74 -5.405 -7.421 -9.995 -13.27 -17.711 -23.934 -33.155 -42.792 -49.963 -55.56 -60.074 -63.934 -67.169 -69.978 -72.304 -74.552 -76.42 -78.0 -79.43 -80.763 -81.996 -83.087 -84.199 -85.187 -86.036 -86.907 -87.813 -88.547 -89.288 -90.052 -90.63 -91.226 -91.869 -92.535 -93.217 -93.691 -94.177 -94.925 -95.439 -95.977 -96.257 -96.848 -97.457 -98.082 -98.413 -98.967 -99.457 -99.829 -100.218 -101.074 -101.545 -102.05 -102.606 -103.241 -104.043 -105.174 -108.863 -7 ,13087 ,KEBNE ,17028087,Wed Dec 22 19:08:13 CET,Wed Dec 22 21:07:40 CET,0.0 2.945 3.429 3.722 3.922 4.091 4.245 4.358 4.522 4.588 4.648 4.635 4.795 4.836 4.895 4.938 4.972 4.985 4.994 4.987 4.959 4.932 4.899 4.841 4.773 4.677 4.563 4.454 4.292 4.116 3.94 3.713 3.463 3.189 2.859 2.448 2.024 1.554 0.987 0.306 -0.476 -1.443 -2.643 -3.918 -5.546 -7.552 -10.139 -13.448 -17.845 -23.919 -32.983 -42.583 -49.744 -55.362 -59.866 -63.67 -66.824 -69.568 -71.865 -74.11 -75.983 -77.589 -79.102 -80.499 -81.773 -82.897 -84.016 -84.976 -85.814 -86.687 -87.561 -88.274 -89.006 -89.799 -90.42 -91.031 -91.645 -92.286 -92.965 -93.434 -93.906 -94.642 -95.156 -95.688 -95.973 -96.572 -97.194 -97.855 -98.2 -98.778 -99.327 -99.729 -100.144 -101.037 -101.538 -102.055 -102.631 -103.338 -104.188 -105.28 -109.82 -8 ,2199 ,KEBNE ,17028088,Wed Dec 22 19:08:14 CET,Wed Dec 22 21:07:18 CET,0.0 2.265 2.834 3.216 3.465 3.637 3.777 3.9 4.085 4.16 4.226 4.235 4.395 4.431 4.497 4.545 4.568 4.583 4.61 4.616 4.606 4.591 4.569 4.524 4.459 4.378 4.302 4.22 4.09 3.941 3.775 3.557 3.336 3.085 2.744 2.321 1.881 1.362 0.775 0.1 -0.672 -1.591 -2.742 -3.997 -5.625 -7.625 -10.174 -13.437 -17.799 -23.752 -32.552 -41.775 -48.601 -53.997 -58.381 -62.056 -65.128 -67.795 -69.978 -72.11 -73.925 -75.518 -77.019 -78.391 -79.608 -80.719 -81.858 -82.845 -83.686 -84.536 -85.427 -86.159 -86.892 -87.643 -88.218 -88.795 -89.404 -90.053 -90.734 -91.197 -91.664 -92.392 -92.901 -93.429 -93.705 -94.298 -94.896 -95.501 -95.827 -96.381 -96.905 -97.292 -97.704 -98.611 -99.118 -99.691 -100.314 -101.014 -101.862 -103.066 -106.581 -9 ,2667 ,KEBNE ,17028089,Wed Dec 22 19:08:14 CET,Wed Dec 22 21:07:13 CET,0.0 1.74 2.18 2.472 2.706 2.884 3.029 3.162 3.382 3.466 3.541 3.553 3.715 3.763 3.822 3.892 3.954 3.966 3.99 3.996 3.971 3.945 3.92 3.866 3.776 3.665 3.553 3.448 3.293 3.131 2.96 2.728 2.485 2.226 1.902 1.511 1.094 0.586 -0.011 -0.7 -1.451 -2.368 -3.552 -4.818 -6.451 -8.487 -11.076 -14.37 -18.799 -24.88 -33.946 -43.654 -50.885 -56.627 -61.281 -65.163 -68.384 -71.214 -73.547 -75.761 -77.673 -79.326 -80.803 -82.184 -83.466 -84.606 -85.775 -86.793 -87.648 -88.55 -89.485 -90.244 -91.027 -91.83 -92.436 -93.033 -93.633 -94.267 -94.94 -95.389 -95.842 -96.561 -97.06 -97.566 -97.819 -98.324 -98.86 -99.443 -99.747 -100.284 -100.767 -101.154 -101.548 -102.37 -102.824 -103.295 -103.831 -104.448 -105.208 -106.285 -111.049 -10 ,24501 ,KEBNE ,17028090,Wed Dec 22 19:08:14 CET,Wed Dec 22 21:08:18 CET,0.0 1.831 2.348 2.665 2.884 3.056 3.212 3.361 3.569 3.649 3.715 3.715 3.891 3.946 4.032 4.099 4.145 4.162 4.187 4.199 4.188 4.173 4.154 4.106 4.051 3.987 3.906 3.808 3.672 3.525 3.364 3.147 2.903 2.629 2.289 1.889 1.468 0.963 0.401 -0.235 -0.975 -1.883 -3.065 -4.372 -5.999 -7.974 -10.58 -13.933 -18.362 -24.474 -33.653 -43.357 -50.478 -56.049 -60.528 -64.315 -67.502 -70.23 -72.514 -74.74 -76.587 -78.173 -79.672 -81.081 -82.319 -83.404 -84.533 -85.532 -86.381 -87.261 -88.198 -88.982 -89.777 -90.592 -91.22 -91.855 -92.504 -93.18 -93.872 -94.345 -94.827 -95.568 -96.098 -96.636 -96.901 -97.463 -98.062 -98.686 -99.007 -99.541 -100.042 -100.418 -100.813 -101.671 -102.16 -102.732 -103.343 -104.014 -104.849 -106.025 -109.5 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt deleted file mode 100644 index 7df5479a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,29615 ,KEBNE ,16748686,Tue Nov 30 09:11:11 CET,Tue Nov 30 11:15:50 CET,0.0 2.204 3.009 3.567 4.023 4.414 4.758 5.062 5.601 5.852 6.087 6.397 6.7 6.863 7.199 7.524 7.814 7.952 8.228 8.499 8.87 9.096 9.315 9.622 9.911 10.192 10.464 10.726 11.054 11.377 11.699 12.059 12.395 12.733 13.124 13.568 13.983 14.424 14.914 15.43 15.944 16.53 17.188 17.814 18.536 19.336 20.253 21.273 22.461 23.735 25.001 25.803 26.005 25.892 25.662 25.352 25.036 24.714 24.351 23.958 23.65 23.379 23.083 22.791 22.513 22.227 21.919 21.649 21.393 21.124 20.853 20.612 20.357 20.094 19.888 19.661 19.412 19.15 18.88 18.699 18.509 18.192 17.961 17.712 17.584 17.331 17.064 16.756 16.582 16.291 16.005 15.787 15.561 15.072 14.789 14.468 14.083 13.638 13.035 12.154 9.311 -4 ,31598 ,KEBNE ,16748688,Tue Nov 30 09:11:11 CET,Tue Nov 30 11:11:41 CET,0.0 3.558 4.371 4.943 5.396 5.779 6.112 6.406 6.954 7.205 7.436 7.739 8.058 8.248 8.618 8.955 9.26 9.41 9.707 9.98 10.366 10.608 10.835 11.155 11.466 11.77 12.051 12.318 12.673 13.021 13.35 13.737 14.096 14.435 14.836 15.292 15.721 16.16 16.625 17.131 17.658 18.229 18.863 19.505 20.26 21.079 22.014 23.069 24.321 25.738 27.104 27.798 27.958 27.917 27.733 27.455 27.118 26.769 26.427 26.023 25.699 25.415 25.099 24.778 24.496 24.248 23.969 23.68 23.411 23.151 22.868 22.615 22.359 22.08 21.858 21.625 21.367 21.107 20.838 20.632 20.417 20.089 19.846 19.579 19.441 19.167 18.882 18.559 18.382 18.098 17.813 17.596 17.359 16.84 16.549 16.21 15.811 15.342 14.785 13.99 10.541 -5 ,30300 ,KEBNE ,16748689,Tue Nov 30 09:11:11 CET,Tue Nov 30 11:12:55 CET,0.0 2.113 2.924 3.534 4.006 4.397 4.743 5.052 5.589 5.815 6.028 6.323 6.635 6.816 7.152 7.474 7.786 7.931 8.212 8.477 8.842 9.059 9.273 9.591 9.888 10.167 10.436 10.692 11.026 11.361 11.68 12.059 12.408 12.732 13.109 13.536 13.933 14.361 14.837 15.358 15.913 16.528 17.19 17.84 18.633 19.474 20.398 21.447 22.579 23.687 24.781 25.351 25.453 25.309 25.014 24.599 24.15 23.73 23.334 22.877 22.481 22.153 21.841 21.546 21.251 20.976 20.691 20.42 20.17 19.894 19.6 19.358 19.087 18.805 18.591 18.356 18.108 17.851 17.581 17.387 17.184 16.859 16.63 16.386 16.259 15.998 15.715 15.409 15.248 14.968 14.672 14.447 14.209 13.669 13.367 13.039 12.67 12.242 11.693 10.85 8.319 -7 ,11024 ,KEBNE ,16748691,Tue Nov 30 09:13:14 CET,Tue Nov 30 11:16:49 CET,0.0 3.339 4.122 4.64 5.067 5.429 5.736 6.02 6.534 6.757 6.965 7.244 7.537 7.704 8.023 8.323 8.602 8.736 8.992 9.236 9.595 9.816 10.029 10.333 10.622 10.909 11.183 11.445 11.789 12.131 12.448 12.812 13.156 13.495 13.901 14.337 14.732 15.174 15.66 16.17 16.685 17.278 18.006 18.722 19.513 20.348 21.292 22.278 23.38 24.66 25.933 26.545 26.543 26.336 26.018 25.629 25.241 24.838 24.447 24.017 23.594 23.189 22.807 22.457 22.16 21.891 21.553 21.231 20.971 20.698 20.395 20.137 19.871 19.589 19.374 19.146 18.894 18.633 18.361 18.177 17.969 17.622 17.389 17.139 17.008 16.723 16.42 16.103 15.934 15.657 15.37 15.148 14.913 14.425 14.123 13.773 13.37 12.91 12.36 11.54 8.923 -8 ,10697 ,KEBNE ,16748692,Tue Nov 30 09:14:16 CET,Tue Nov 30 11:15:24 CET,0.0 2.892 3.692 4.266 4.718 5.103 5.468 5.807 6.37 6.614 6.844 7.135 7.45 7.648 8.014 8.352 8.663 8.802 9.076 9.341 9.708 9.934 10.153 10.479 10.795 11.106 11.387 11.662 12.032 12.371 12.68 13.042 13.388 13.723 14.123 14.554 14.956 15.39 15.835 16.331 16.88 17.5 18.206 18.86 19.554 20.29 21.125 22.086 23.22 24.366 25.546 26.338 26.548 26.462 26.212 25.866 25.509 25.171 24.852 24.512 24.195 23.892 23.614 23.327 23.034 22.771 22.49 22.232 21.999 21.744 21.481 21.24 20.981 20.71 20.486 20.258 20.022 19.775 19.519 19.341 19.148 18.821 18.575 18.327 18.208 17.957 17.676 17.364 17.199 16.918 16.609 16.392 16.156 15.612 15.311 14.972 14.581 14.133 13.578 12.745 9.744 -9 ,6530 ,KEBNE ,16748693,Tue Nov 30 09:17:21 CET,Tue Nov 30 11:19:19 CET,0.0 2.655 3.511 4.114 4.584 4.965 5.3 5.602 6.117 6.349 6.57 6.843 7.14 7.315 7.648 7.95 8.235 8.377 8.645 8.889 9.237 9.471 9.695 9.999 10.293 10.579 10.846 11.106 11.435 11.733 12.022 12.39 12.744 13.082 13.471 13.883 14.269 14.715 15.191 15.658 16.174 16.788 17.461 18.091 18.788 19.552 20.42 21.365 22.432 23.637 24.966 25.785 25.966 25.853 25.627 25.342 25.036 24.706 24.397 24.061 23.734 23.418 23.091 22.774 22.478 22.211 21.952 21.693 21.437 21.177 20.9 20.666 20.406 20.118 19.898 19.674 19.438 19.176 18.908 18.723 18.524 18.207 17.977 17.729 17.603 17.343 17.066 16.771 16.613 16.346 16.061 15.855 15.633 15.127 14.849 14.526 14.132 13.674 13.114 12.282 9.678 -10 ,25639 ,KEBNE ,16748694,Tue Nov 30 09:18:22 CET,Tue Nov 30 11:19:05 CET,0.0 2.462 3.272 3.887 4.383 4.773 5.105 5.399 5.936 6.188 6.42 6.705 7.024 7.214 7.575 7.9 8.217 8.371 8.656 8.922 9.296 9.534 9.756 10.088 10.412 10.711 10.984 11.251 11.615 11.971 12.314 12.724 13.108 13.449 13.822 14.244 14.632 15.062 15.522 16.003 16.521 17.08 17.724 18.374 19.136 19.965 20.834 21.773 22.826 23.991 25.274 25.972 26.08 25.866 25.564 25.252 24.939 24.624 24.299 23.956 23.636 23.334 23.026 22.722 22.453 22.201 21.921 21.661 21.423 21.159 20.891 20.661 20.409 20.142 19.914 19.674 19.424 19.16 18.886 18.687 18.468 18.121 17.892 17.641 17.505 17.241 16.966 16.672 16.51 16.231 15.957 15.752 15.526 15.022 14.732 14.391 13.997 13.546 12.993 12.226 9.775 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 7b6e9262..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12371 ,KEBNE ,16748695,Tue Nov 30 09:18:23 CET,Tue Nov 30 11:22:08 CET,0.0 2.621 3.47 4.089 4.572 4.964 5.286 5.583 6.135 6.382 6.607 6.9 7.218 7.393 7.706 8.001 8.29 8.429 8.714 8.983 9.325 9.543 9.766 10.087 10.372 10.643 10.91 11.163 11.48 11.776 12.062 12.409 12.756 13.083 13.441 13.848 14.221 14.621 15.064 15.517 15.969 16.483 17.069 17.601 18.261 18.997 19.667 20.303 20.914 21.467 21.908 21.749 21.224 20.598 20.002 19.43 18.852 18.266 17.734 17.164 16.686 16.249 15.815 15.401 14.998 14.63 14.255 13.897 13.566 13.23 12.876 12.566 12.239 11.892 11.63 11.366 11.081 10.779 10.463 10.242 10.013 9.645 9.382 9.108 8.96 8.651 8.329 7.958 7.763 7.444 7.126 6.904 6.675 6.143 5.823 5.476 5.1 4.646 4.052 3.246 -0.221 -2 ,7032 ,KEBNE ,16748696,Tue Nov 30 09:21:28 CET,Tue Nov 30 11:23:32 CET,0.0 3.585 4.393 4.972 5.443 5.85 6.193 6.505 7.073 7.319 7.556 7.88 8.202 8.384 8.742 9.095 9.42 9.57 9.859 10.137 10.513 10.749 10.974 11.288 11.585 11.861 12.121 12.363 12.682 13.002 13.312 13.689 14.041 14.365 14.725 15.122 15.495 15.907 16.347 16.816 17.294 17.81 18.403 18.966 19.589 20.256 20.99 21.696 22.378 23.004 23.418 23.271 22.739 22.105 21.469 20.793 20.147 19.559 19.062 18.541 18.082 17.663 17.235 16.813 16.443 16.14 15.814 15.455 15.137 14.821 14.46 14.163 13.862 13.543 13.294 13.031 12.748 12.45 12.12 11.882 11.635 11.24 10.974 10.698 10.549 10.243 9.907 9.541 9.346 9.033 8.733 8.507 8.264 7.732 7.431 7.1 6.729 6.286 5.712 4.876 1.987 -3 ,15981 ,KEBNE ,16748697,Tue Nov 30 09:22:30 CET,Tue Nov 30 11:22:50 CET,0.0 2.86 3.706 4.275 4.733 5.152 5.527 5.847 6.384 6.622 6.839 7.116 7.426 7.61 7.963 8.298 8.603 8.745 9.024 9.284 9.652 9.873 10.071 10.359 10.641 10.916 11.182 11.454 11.811 12.128 12.42 12.781 13.122 13.425 13.761 14.145 14.519 14.922 15.359 15.828 16.3 16.833 17.438 18.008 18.635 19.317 20.072 20.873 21.7 22.326 22.669 22.414 21.79 21.126 20.503 19.864 19.226 18.657 18.19 17.67 17.161 16.72 16.305 15.888 15.509 15.173 14.818 14.484 14.191 13.88 13.548 13.273 12.987 12.682 12.446 12.193 11.924 11.65 11.354 11.142 10.924 10.565 10.303 10.045 9.918 9.648 9.351 9.03 8.858 8.559 8.294 8.081 7.842 7.316 7.016 6.676 6.29 5.829 5.273 4.504 1.841 -5 ,27720 ,KEBNE ,16748699,Tue Nov 30 09:30:39 CET,Tue Nov 30 11:32:09 CET,0.0 2.645 3.494 4.11 4.593 4.997 5.341 5.651 6.209 6.462 6.689 6.969 7.286 7.483 7.839 8.156 8.454 8.597 8.869 9.124 9.464 9.676 9.887 10.186 10.474 10.753 11.02 11.274 11.597 11.909 12.209 12.557 12.881 13.198 13.574 13.978 14.328 14.691 15.09 15.502 15.912 16.383 16.949 17.5 18.099 18.714 19.345 20.038 20.777 21.426 21.766 21.589 21.122 20.469 19.732 19.006 18.349 17.741 17.212 16.679 16.238 15.825 15.398 14.984 14.602 14.259 13.893 13.549 13.243 12.923 12.59 12.31 12.011 11.693 11.436 11.152 10.847 10.528 10.216 10.002 9.762 9.371 9.111 8.847 8.705 8.402 8.069 7.719 7.532 7.218 6.914 6.69 6.451 5.92 5.609 5.255 4.863 4.403 3.828 3.027 0.561 -6 ,20731 ,KEBNE ,16748700,Tue Nov 30 09:39:12 CET,Tue Nov 30 11:39:32 CET,0.0 3.119 4.033 4.602 5.053 5.459 5.819 6.122 6.647 6.874 7.085 7.367 7.681 7.866 8.217 8.542 8.836 8.978 9.241 9.486 9.845 10.068 10.284 10.606 10.895 11.156 11.406 11.653 11.968 12.275 12.56 12.883 13.188 13.483 13.83 14.225 14.595 14.987 15.4 15.828 16.276 16.762 17.303 17.851 18.475 19.132 19.819 20.476 21.128 21.724 22.058 21.77 21.188 20.563 19.923 19.267 18.615 18.004 17.503 16.999 16.544 16.107 15.658 15.239 14.86 14.51 14.123 13.795 13.522 13.23 12.914 12.629 12.327 12.003 11.746 11.475 11.187 10.89 10.574 10.349 10.123 9.769 9.51 9.235 9.096 8.807 8.496 8.158 7.988 7.703 7.419 7.198 6.963 6.45 6.158 5.84 5.472 5.021 4.466 3.663 0.965 -8 ,1968 ,KEBNE ,16748702,Tue Nov 30 09:47:32 CET,Tue Nov 30 11:48:50 CET,0.0 3.603 4.528 5.159 5.625 6.003 6.335 6.644 7.195 7.449 7.69 7.983 8.293 8.472 8.798 9.113 9.418 9.557 9.825 10.079 10.435 10.661 10.882 11.212 11.52 11.799 12.05 12.292 12.616 12.921 13.207 13.546 13.876 14.174 14.488 14.855 15.215 15.601 16.015 16.454 16.92 17.423 17.974 18.496 19.084 19.739 20.424 21.106 21.815 22.455 22.788 22.538 21.984 21.303 20.666 20.056 19.446 18.852 18.301 17.716 17.194 16.711 16.246 15.79 15.356 14.959 14.542 14.17 13.859 13.532 13.178 12.884 12.573 12.243 11.978 11.692 11.385 11.062 10.736 10.522 10.299 9.928 9.661 9.374 9.228 8.922 8.593 8.254 8.078 7.781 7.482 7.246 6.984 6.453 6.154 5.812 5.428 4.984 4.415 3.609 1.188 -9 ,5754 ,KEBNE ,16748703,Tue Nov 30 09:48:35 CET,Tue Nov 30 11:49:12 CET,0.0 3.014 3.876 4.46 4.912 5.298 5.637 5.942 6.471 6.717 6.947 7.242 7.557 7.742 8.073 8.379 8.668 8.807 9.079 9.336 9.676 9.889 10.098 10.404 10.69 10.96 11.225 11.486 11.81 12.098 12.386 12.731 13.053 13.37 13.725 14.117 14.487 14.883 15.29 15.692 16.14 16.627 17.168 17.714 18.316 18.984 19.717 20.467 21.222 21.831 22.214 22.006 21.376 20.654 19.996 19.363 18.727 18.128 17.593 17.015 16.52 16.077 15.65 15.246 14.862 14.493 14.095 13.737 13.418 13.073 12.697 12.391 12.077 11.753 11.496 11.218 10.924 10.615 10.305 10.09 9.86 9.491 9.216 8.926 8.779 8.477 8.147 7.792 7.609 7.302 6.987 6.766 6.542 6.01 5.703 5.372 4.999 4.576 4.055 3.309 1.156 -10 ,28964 ,KEBNE ,16748704,Tue Nov 30 09:55:56 CET,Tue Nov 30 11:57:01 CET,0.0 3.549 4.481 5.119 5.626 6.068 6.441 6.766 7.332 7.588 7.83 8.158 8.479 8.667 9.037 9.386 9.72 9.877 10.16 10.417 10.778 11.016 11.245 11.569 11.881 12.166 12.427 12.681 13.004 13.318 13.627 14.001 14.331 14.625 14.955 15.325 15.691 16.073 16.467 16.887 17.326 17.827 18.377 18.876 19.407 19.932 20.485 21.043 21.598 22.03 22.322 22.157 21.577 20.917 20.247 19.616 19.018 18.413 17.851 17.277 16.802 16.38 15.962 15.558 15.176 14.801 14.397 14.029 13.704 13.387 13.045 12.742 12.43 12.093 11.832 11.571 11.292 10.999 10.69 10.464 10.232 9.869 9.609 9.322 9.172 8.861 8.538 8.193 7.998 7.674 7.352 7.114 6.86 6.28 5.966 5.635 5.256 4.808 4.24 3.434 0.671 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt deleted file mode 100644 index 901702e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7425 ,KEBNE ,16748705,Tue Nov 30 10:02:58 CET,Tue Nov 30 12:08:42 CET,0.0 2.961 3.816 4.422 4.904 5.316 5.692 6.044 6.661 6.939 7.211 7.549 7.943 8.167 8.588 8.979 9.37 9.559 9.914 10.269 10.782 11.103 11.417 11.862 12.272 12.674 13.063 13.445 13.947 14.433 14.917 15.486 16.028 16.569 17.2 17.902 18.58 19.349 20.185 21.087 22.077 23.183 24.478 25.834 27.419 29.205 31.351 33.854 36.853 40.496 44.986 48.776 51.058 52.535 53.48 54.115 54.538 54.808 54.963 55.055 55.08 55.059 54.984 54.867 54.718 54.55 54.368 54.194 54.016 53.818 53.615 53.441 53.252 53.049 52.873 52.68 52.476 52.241 51.978 51.782 51.58 51.271 51.043 50.793 50.66 50.384 50.069 49.724 49.545 49.24 48.865 48.603 48.332 47.734 47.394 47.011 46.536 45.964 45.279 44.261 39.057 -2 ,582 ,KEBNE ,16748706,Tue Nov 30 10:02:59 CET,Tue Nov 30 12:06:05 CET,0.0 3.716 4.515 5.118 5.638 6.103 6.512 6.862 7.511 7.82 8.104 8.45 8.867 9.111 9.568 9.993 10.394 10.588 10.967 11.342 11.888 12.238 12.576 13.061 13.524 13.971 14.407 14.821 15.348 15.871 16.375 16.982 17.579 18.164 18.842 19.603 20.352 21.19 22.102 23.082 24.139 25.357 26.808 28.3 30.04 31.958 34.19 36.747 39.742 43.365 48.004 52.005 54.273 55.717 56.67 57.286 57.669 57.911 58.075 58.167 58.175 58.118 58.016 57.902 57.783 57.67 57.524 57.359 57.204 57.027 56.811 56.6 56.373 56.146 55.96 55.76 55.539 55.303 55.047 54.855 54.645 54.318 54.092 53.836 53.699 53.423 53.094 52.711 52.502 52.167 51.808 51.554 51.279 50.666 50.294 49.834 49.311 48.696 47.893 46.764 42.053 -4 ,18100 ,KEBNE ,16748708,Tue Nov 30 10:07:08 CET,Tue Nov 30 12:08:03 CET,0.0 2.767 3.626 4.232 4.714 5.127 5.511 5.869 6.511 6.799 7.083 7.432 7.839 8.076 8.529 8.944 9.343 9.536 9.905 10.266 10.78 11.098 11.406 11.875 12.335 12.759 13.173 13.586 14.114 14.631 15.139 15.76 16.363 16.959 17.671 18.468 19.245 20.112 21.023 21.963 22.957 24.094 25.44 26.818 28.501 30.432 32.72 35.397 38.582 42.303 46.872 50.65 52.731 53.91 54.582 55.048 55.275 55.305 55.274 55.189 55.085 54.978 54.822 54.631 54.459 54.291 54.094 53.93 53.762 53.552 53.318 53.109 52.889 52.669 52.49 52.294 52.084 51.838 51.571 51.386 51.192 50.868 50.625 50.38 50.25 49.961 49.653 49.314 49.136 48.837 48.507 48.258 47.994 47.378 47.025 46.633 46.191 45.681 44.937 43.842 35.501 -5 ,12798 ,KEBNE ,16748709,Tue Nov 30 10:07:08 CET,Tue Nov 30 12:08:48 CET,0.0 2.297 3.101 3.683 4.164 4.58 4.954 5.296 5.908 6.183 6.445 6.768 7.177 7.419 7.873 8.288 8.687 8.885 9.275 9.653 10.182 10.528 10.868 11.353 11.828 12.28 12.706 13.117 13.636 14.149 14.664 15.273 15.87 16.448 17.103 17.856 18.593 19.406 20.308 21.286 22.306 23.462 24.86 26.284 27.963 29.858 32.096 34.74 37.945 41.914 47.032 51.461 54.124 55.768 56.82 57.611 58.137 58.496 58.741 58.897 59.004 59.065 59.014 58.937 58.874 58.791 58.684 58.561 58.441 58.321 58.183 58.033 57.858 57.673 57.511 57.324 57.115 56.881 56.633 56.46 56.264 55.929 55.693 55.442 55.31 55.026 54.714 54.363 54.165 53.854 53.519 53.27 52.999 52.353 51.964 51.519 51.014 50.402 49.606 48.406 42.081 -8 ,19999 ,KEBNE ,16748712,Tue Nov 30 10:09:14 CET,Tue Nov 30 12:13:56 CET,0.0 3.576 4.412 4.999 5.463 5.858 6.218 6.555 7.159 7.435 7.707 8.045 8.435 8.661 9.087 9.485 9.874 10.063 10.425 10.776 11.292 11.623 11.937 12.379 12.803 13.22 13.628 14.037 14.573 15.082 15.57 16.167 16.757 17.326 17.975 18.702 19.415 20.247 21.161 22.125 23.151 24.318 25.72 27.177 28.919 30.915 33.266 35.978 39.242 43.259 48.434 52.919 55.691 57.563 58.78 59.499 59.929 60.193 60.329 60.439 60.472 60.41 60.313 60.21 60.078 59.943 59.781 59.606 59.444 59.258 59.03 58.837 58.648 58.451 58.287 58.113 57.927 57.706 57.456 57.286 57.098 56.771 56.539 56.284 56.15 55.881 55.582 55.235 55.044 54.75 54.43 54.2 53.953 53.39 53.07 52.704 52.267 51.724 51.002 49.945 45.564 -10 ,10893 ,KEBNE ,16748714,Tue Nov 30 10:10:18 CET,Tue Nov 30 12:15:56 CET,0.0 2.396 3.267 3.878 4.377 4.806 5.185 5.52 6.12 6.399 6.666 7.005 7.408 7.627 8.054 8.456 8.837 9.024 9.384 9.734 10.232 10.563 10.897 11.376 11.838 12.284 12.712 13.124 13.65 14.158 14.651 15.258 15.858 16.439 17.134 17.913 18.653 19.485 20.401 21.378 22.391 23.533 24.908 26.336 27.99 29.834 32.093 34.775 37.993 41.923 46.946 51.275 53.934 55.691 56.809 57.59 58.079 58.384 58.593 58.737 58.812 58.839 58.806 58.72 58.612 58.477 58.294 58.125 57.983 57.825 57.636 57.475 57.298 57.081 56.906 56.726 56.529 56.316 56.079 55.895 55.695 55.363 55.121 54.862 54.727 54.445 54.132 53.767 53.573 53.265 52.93 52.688 52.426 51.791 51.424 51.022 50.555 49.978 49.245 48.098 39.963 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt deleted file mode 100644 index d9b0fc17..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12939 ,KEBNE ,16748715,Tue Nov 30 10:12:26 CET,Tue Nov 30 12:17:32 CET,0.0 3.287 4.165 4.776 5.283 5.741 6.147 6.525 7.22 7.527 7.809 8.146 8.565 8.803 9.248 9.677 10.091 10.29 10.675 11.039 11.546 11.864 12.173 12.619 13.048 13.473 13.905 14.32 14.83 15.313 15.792 16.38 16.941 17.48 18.107 18.818 19.495 20.24 21.08 21.968 22.879 23.944 25.21 26.466 27.966 29.693 31.717 34.099 36.93 40.244 44.298 47.514 49.246 50.305 50.949 51.299 51.452 51.508 51.508 51.436 51.307 51.146 50.971 50.801 50.63 50.47 50.286 50.1 49.92 49.712 49.483 49.273 49.05 48.825 48.646 48.46 48.258 48.03 47.778 47.597 47.402 47.085 46.854 46.614 46.49 46.217 45.907 45.581 45.399 45.096 44.796 44.573 44.337 43.785 43.462 43.103 42.668 42.119 41.417 40.391 30.357 -2 ,8737 ,KEBNE ,16748716,Tue Nov 30 10:13:29 CET,Tue Nov 30 12:16:12 CET,0.0 3.108 3.993 4.616 5.136 5.645 6.094 6.446 7.039 7.313 7.577 7.903 8.298 8.523 8.955 9.347 9.724 9.911 10.275 10.619 11.095 11.408 11.722 12.162 12.565 12.952 13.343 13.713 14.174 14.631 15.076 15.619 16.143 16.649 17.258 17.953 18.608 19.321 20.105 20.972 21.894 22.926 24.206 25.541 27.081 28.818 30.804 33.047 35.762 39.06 43.132 46.604 48.584 49.846 50.708 51.228 51.535 51.707 51.774 51.79 51.776 51.744 51.668 51.548 51.409 51.25 51.06 50.872 50.696 50.51 50.298 50.104 49.893 49.662 49.48 49.286 49.083 48.859 48.594 48.401 48.206 47.891 47.657 47.407 47.271 46.984 46.68 46.354 46.168 45.858 45.553 45.333 45.099 44.544 44.204 43.815 43.361 42.819 42.17 41.174 34.154 -3 ,22281 ,KEBNE ,16748717,Tue Nov 30 10:13:28 CET,Tue Nov 30 12:16:01 CET,0.0 3.702 4.591 5.235 5.75 6.193 6.6 6.983 7.658 7.952 8.221 8.556 8.967 9.187 9.635 10.048 10.435 10.63 10.998 11.353 11.847 12.156 12.456 12.883 13.296 13.706 14.102 14.467 14.934 15.4 15.866 16.434 16.973 17.493 18.104 18.792 19.456 20.192 20.991 21.855 22.781 23.816 25.038 26.302 27.799 29.477 31.388 33.588 36.291 39.568 43.702 47.183 49.081 50.207 50.944 51.455 51.767 51.909 51.931 51.897 51.817 51.7 51.561 51.396 51.226 51.054 50.851 50.654 50.471 50.273 50.069 49.897 49.697 49.448 49.246 49.038 48.814 48.595 48.369 48.189 47.997 47.691 47.465 47.222 47.094 46.821 46.52 46.191 46.02 45.727 45.457 45.24 45.016 44.506 44.191 43.82 43.39 42.889 42.254 41.296 36.07 -4 ,4689 ,KEBNE ,16748718,Tue Nov 30 10:15:34 CET,Tue Nov 30 12:21:24 CET,0.0 2.881 3.741 4.367 4.876 5.295 5.675 6.032 6.663 6.947 7.214 7.542 7.952 8.183 8.607 9.008 9.396 9.579 9.929 10.276 10.785 11.104 11.407 11.853 12.284 12.694 13.085 13.468 13.964 14.438 14.906 15.47 15.999 16.509 17.108 17.785 18.449 19.203 20.014 20.856 21.729 22.716 23.905 25.127 26.612 28.317 30.285 32.59 35.358 38.651 42.712 46.046 47.908 48.938 49.483 49.802 50.027 50.129 50.107 50.028 49.935 49.801 49.641 49.5 49.328 49.132 48.938 48.756 48.585 48.391 48.169 47.985 47.785 47.552 47.36 47.15 46.933 46.706 46.451 46.263 46.065 45.763 45.549 45.303 45.163 44.868 44.553 44.211 44.034 43.74 43.446 43.219 42.975 42.43 42.116 41.747 41.311 40.784 40.116 39.106 28.831 -5 ,23082 ,KEBNE ,16748719,Tue Nov 30 10:15:34 CET,Tue Nov 30 12:18:37 CET,0.0 3.174 4.111 4.816 5.378 5.855 6.273 6.633 7.273 7.565 7.835 8.183 8.588 8.812 9.251 9.66 10.032 10.216 10.574 10.913 11.406 11.726 12.034 12.468 12.892 13.306 13.696 14.075 14.572 15.054 15.51 16.064 16.61 17.136 17.746 18.439 19.113 19.854 20.641 21.487 22.388 23.389 24.581 25.817 27.268 28.886 30.78 33.022 35.805 39.077 42.891 46.004 47.733 48.656 49.181 49.474 49.636 49.765 49.82 49.818 49.78 49.701 49.597 49.477 49.336 49.174 48.987 48.84 48.701 48.531 48.324 48.149 47.965 47.762 47.6 47.408 47.151 46.863 46.558 46.33 46.103 45.749 45.486 45.201 45.047 44.735 44.403 44.018 43.797 43.458 43.117 42.861 42.585 41.95 41.576 41.147 40.665 40.086 39.368 38.289 33.469 -6 ,15159 ,KEBNE ,16748720,Tue Nov 30 10:19:10 CET,Tue Nov 30 12:26:31 CET,0.0 4.05 4.954 5.578 6.07 6.488 6.877 7.231 7.846 8.123 8.377 8.685 9.076 9.291 9.705 10.09 10.453 10.627 10.944 11.244 11.698 11.986 12.264 12.684 13.094 13.493 13.892 14.267 14.723 15.181 15.642 16.211 16.762 17.282 17.883 18.562 19.214 19.928 20.73 21.617 22.556 23.603 24.828 26.111 27.611 29.29 31.331 33.676 36.429 39.792 43.934 47.21 49.028 50.151 50.87 51.359 51.617 51.706 51.69 51.604 51.501 51.369 51.197 50.987 50.772 50.589 50.388 50.181 50.001 49.796 49.56 49.353 49.116 48.859 48.658 48.438 48.203 47.955 47.688 47.502 47.298 46.961 46.722 46.462 46.321 46.028 45.718 45.388 45.207 44.883 44.555 44.324 44.078 43.501 43.145 42.733 42.29 41.778 41.11 40.075 31.545 -7 ,30955 ,KEBNE ,16748721,Tue Nov 30 10:19:10 CET,Tue Nov 30 12:21:38 CET,0.0 2.494 3.374 3.997 4.506 4.935 5.334 5.702 6.336 6.634 6.912 7.247 7.637 7.864 8.294 8.69 9.065 9.239 9.571 9.903 10.381 10.682 10.974 11.395 11.811 12.223 12.624 13.008 13.486 13.939 14.383 14.941 15.488 16.019 16.639 17.325 17.999 18.741 19.553 20.435 21.363 22.401 23.647 24.957 26.479 28.172 30.166 32.511 35.35 38.792 43.059 46.407 48.305 49.574 50.288 50.645 50.83 50.874 50.855 50.784 50.664 50.543 50.383 50.196 49.998 49.806 49.606 49.396 49.208 49.002 48.765 48.561 48.328 48.062 47.856 47.638 47.403 47.162 46.898 46.711 46.506 46.166 45.93 45.676 45.542 45.261 44.949 44.586 44.392 44.074 43.77 43.52 43.251 42.676 42.354 41.963 41.489 40.94 40.23 39.198 30.78 -9 ,19409 ,KEBNE ,16748723,Tue Nov 30 10:19:18 CET,Tue Nov 30 12:19:08 CET,0.0 2.929 3.769 4.38 4.871 5.314 5.716 6.084 6.722 7.0 7.272 7.622 8.033 8.266 8.714 9.14 9.536 9.722 10.079 10.441 10.976 11.31 11.619 12.047 12.47 12.876 13.277 13.681 14.185 14.666 15.134 15.691 16.213 16.719 17.317 17.993 18.63 19.345 20.138 20.982 21.868 22.866 24.063 25.288 26.706 28.301 30.199 32.367 34.941 38.032 41.819 45.063 46.922 48.008 48.694 49.127 49.334 49.426 49.434 49.383 49.285 49.169 49.055 48.91 48.759 48.599 48.382 48.168 47.973 47.762 47.538 47.339 47.121 46.876 46.68 46.475 46.251 46.004 45.734 45.544 45.337 44.985 44.731 44.469 44.334 44.044 43.723 43.37 43.184 42.869 42.549 42.301 42.031 41.433 41.086 40.694 40.232 39.654 38.921 37.857 33.262 -10 ,8765 ,KEBNE ,16748724,Tue Nov 30 10:20:15 CET,Tue Nov 30 12:23:37 CET,0.0 4.059 4.9 5.522 6.046 6.506 6.912 7.265 7.888 8.166 8.446 8.821 9.214 9.443 9.889 10.314 10.722 10.913 11.264 11.598 12.093 12.418 12.723 13.159 13.569 13.954 14.333 14.706 15.184 15.641 16.078 16.623 17.168 17.702 18.325 19.018 19.685 20.415 21.219 22.112 23.06 24.114 25.337 26.596 28.085 29.772 31.792 34.109 36.818 40.1 44.172 47.453 49.315 50.461 51.139 51.484 51.615 51.642 51.614 51.527 51.412 51.299 51.16 50.986 50.791 50.587 50.356 50.143 49.949 49.723 49.479 49.278 49.057 48.822 48.624 48.4 48.16 47.914 47.664 47.481 47.278 46.947 46.706 46.456 46.325 46.038 45.727 45.396 45.211 44.914 44.609 44.367 44.118 43.566 43.211 42.799 42.341 41.792 41.08 40.03 35.807 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt deleted file mode 100644 index 31ec7b5e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14696 ,KEBNE ,17028091,Wed Dec 22 19:08:13 CET,Wed Dec 22 21:06:52 CET,0.0 3.537 4.189 4.585 4.889 5.161 5.394 5.587 5.913 6.052 6.195 6.449 6.576 6.676 6.854 7.014 7.157 7.224 7.341 7.439 7.561 7.631 7.687 7.756 7.819 7.866 7.906 7.941 7.981 8.003 8.013 8.036 8.049 8.024 7.983 7.921 7.849 7.791 7.697 7.581 7.411 7.121 6.746 6.308 5.713 4.923 3.813 2.4 0.476 -2.403 -7.058 -12.302 -16.667 -20.611 -24.073 -27.082 -29.552 -31.628 -33.338 -35.01 -36.422 -37.651 -38.81 -39.881 -40.862 -41.75 -42.664 -43.476 -44.167 -44.876 -45.623 -46.236 -46.882 -47.559 -48.085 -48.637 -49.184 -49.703 -50.214 -50.576 -50.944 -51.535 -51.955 -52.371 -52.587 -53.035 -53.495 -54.005 -54.277 -54.645 -55.128 -55.433 -55.754 -56.396 -56.748 -57.151 -57.62 -58.196 -58.915 -59.982 -63.846 -2 ,10177 ,KEBNE ,17028092,Wed Dec 22 19:08:13 CET,Wed Dec 22 21:05:12 CET,0.0 2.949 3.589 4.014 4.31 4.549 4.76 4.952 5.252 5.372 5.482 5.641 5.732 5.814 5.948 6.061 6.188 6.246 6.339 6.429 6.56 6.634 6.692 6.777 6.863 6.946 7.027 7.095 7.164 7.227 7.262 7.284 7.31 7.35 7.389 7.4 7.406 7.395 7.366 7.314 7.186 6.985 6.747 6.434 5.913 5.196 4.228 2.852 0.807 -2.135 -6.691 -12.034 -16.427 -20.008 -22.934 -25.484 -27.705 -29.656 -31.25 -32.808 -34.147 -35.339 -36.476 -37.536 -38.492 -39.326 -40.184 -40.962 -41.645 -42.338 -43.06 -43.672 -44.287 -44.901 -45.365 -45.853 -46.356 -46.86 -47.385 -47.757 -48.143 -48.717 -49.105 -49.525 -49.741 -50.176 -50.663 -51.203 -51.474 -51.812 -52.323 -52.615 -52.912 -53.566 -53.938 -54.335 -54.774 -55.33 -56.074 -57.19 -61.255 -3 ,15027 ,KEBNE ,17028093,Wed Dec 22 19:08:13 CET,Wed Dec 22 21:05:53 CET,0.0 3.056 3.612 3.988 4.282 4.52 4.736 4.915 5.203 5.346 5.487 5.705 5.822 5.911 6.071 6.209 6.33 6.391 6.524 6.661 6.84 6.918 6.98 7.08 7.159 7.222 7.283 7.34 7.383 7.42 7.468 7.498 7.51 7.512 7.517 7.495 7.413 7.323 7.254 7.142 6.953 6.657 6.259 5.856 5.273 4.453 3.345 1.93 -0.013 -2.988 -7.866 -13.403 -17.763 -21.351 -24.292 -26.774 -28.853 -30.757 -32.439 -34.073 -35.436 -36.648 -37.786 -38.83 -39.784 -40.625 -41.477 -42.227 -42.885 -43.55 -44.243 -44.833 -45.416 -45.999 -46.46 -46.941 -47.429 -47.929 -48.45 -48.807 -49.168 -49.738 -50.143 -50.557 -50.766 -51.18 -51.613 -52.077 -52.313 -52.638 -53.079 -53.362 -53.656 -54.312 -54.666 -55.042 -55.461 -55.972 -56.635 -57.557 -62.046 -4 ,8916 ,KEBNE ,17028094,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:11:28 CET,0.0 3.163 3.73 4.118 4.425 4.662 4.881 5.077 5.384 5.517 5.644 5.862 5.984 6.065 6.208 6.338 6.439 6.483 6.577 6.66 6.776 6.84 6.889 6.962 7.019 7.062 7.098 7.124 7.149 7.171 7.192 7.185 7.153 7.134 7.124 7.108 7.044 6.933 6.791 6.606 6.369 6.054 5.626 5.123 4.486 3.653 2.519 1.03 -1.177 -4.358 -9.438 -15.415 -20.155 -23.991 -27.108 -29.824 -32.12 -34.148 -35.87 -37.498 -38.832 -40.02 -41.149 -42.187 -43.132 -43.99 -44.887 -45.683 -46.356 -47.033 -47.748 -48.335 -48.927 -49.55 -50.069 -50.661 -51.274 -51.884 -52.478 -52.863 -53.244 -53.826 -54.228 -54.66 -54.896 -55.37 -55.868 -56.389 -56.639 -56.984 -57.461 -57.759 -58.083 -58.813 -59.215 -59.647 -60.133 -60.649 -61.284 -62.228 -65.889 -5 ,19107 ,KEBNE ,17028095,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:11:19 CET,0.0 2.923 3.572 3.944 4.239 4.467 4.679 4.896 5.295 5.453 5.578 5.787 5.903 6.005 6.186 6.338 6.485 6.552 6.671 6.793 6.96 7.057 7.144 7.251 7.339 7.414 7.48 7.535 7.606 7.671 7.72 7.766 7.792 7.817 7.849 7.87 7.856 7.781 7.698 7.614 7.496 7.344 7.086 6.688 6.143 5.451 4.449 3.149 1.322 -1.404 -5.928 -11.452 -16.006 -19.973 -23.3 -26.077 -28.363 -30.357 -32.007 -33.592 -34.939 -36.133 -37.269 -38.312 -39.256 -40.141 -41.075 -41.889 -42.588 -43.299 -44.028 -44.638 -45.269 -45.933 -46.453 -46.979 -47.513 -48.066 -48.638 -49.023 -49.414 -50.02 -50.438 -50.869 -51.092 -51.575 -52.085 -52.589 -52.839 -53.188 -53.676 -53.974 -54.283 -55.025 -55.473 -55.986 -56.547 -57.212 -58.04 -59.076 -63.163 -6 ,17307 ,KEBNE ,17028096,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:09:43 CET,0.0 3.761 4.317 4.721 5.035 5.3 5.511 5.679 5.979 6.12 6.248 6.434 6.551 6.654 6.824 6.978 7.143 7.212 7.329 7.435 7.561 7.642 7.73 7.846 7.944 8.04 8.133 8.202 8.263 8.317 8.38 8.444 8.486 8.507 8.503 8.467 8.426 8.368 8.27 8.15 7.987 7.758 7.451 7.082 6.517 5.714 4.65 3.213 0.988 -2.352 -7.655 -13.693 -18.381 -22.266 -25.455 -28.131 -30.43 -32.48 -34.171 -35.794 -37.16 -38.382 -39.55 -40.61 -41.588 -42.491 -43.391 -44.174 -44.851 -45.549 -46.263 -46.854 -47.451 -48.05 -48.537 -49.05 -49.564 -50.099 -50.652 -51.033 -51.435 -52.048 -52.476 -52.913 -53.132 -53.588 -54.068 -54.569 -54.83 -55.187 -55.676 -55.971 -56.301 -57.03 -57.429 -57.874 -58.362 -58.923 -59.604 -60.552 -64.739 -7 ,25300 ,KEBNE ,17028097,Wed Dec 22 19:12:18 CET,Wed Dec 22 21:09:24 CET,0.0 2.864 3.479 3.875 4.168 4.427 4.659 4.838 5.152 5.284 5.399 5.587 5.686 5.78 5.963 6.12 6.244 6.292 6.379 6.465 6.592 6.663 6.726 6.82 6.903 6.983 7.051 7.108 7.17 7.205 7.213 7.213 7.205 7.185 7.159 7.109 7.037 6.929 6.787 6.626 6.438 6.191 5.877 5.511 4.979 4.193 3.07 1.589 -0.59 -3.912 -9.255 -15.258 -19.94 -23.818 -27.033 -29.829 -32.185 -34.208 -35.908 -37.549 -38.908 -40.103 -41.247 -42.308 -43.27 -44.139 -45.047 -45.867 -46.558 -47.265 -48.005 -48.611 -49.225 -49.85 -50.332 -50.827 -51.328 -51.841 -52.374 -52.75 -53.142 -53.723 -54.126 -54.564 -54.792 -55.266 -55.781 -56.322 -56.593 -56.946 -57.459 -57.775 -58.094 -58.794 -59.191 -59.628 -60.108 -60.664 -61.357 -62.233 -67.367 -8 ,29597 ,KEBNE ,17028098,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:08:54 CET,0.0 2.598 3.211 3.614 3.898 4.103 4.291 4.459 4.735 4.87 4.994 5.183 5.3 5.387 5.557 5.695 5.818 5.882 5.993 6.088 6.202 6.268 6.333 6.413 6.483 6.542 6.577 6.596 6.613 6.629 6.634 6.647 6.677 6.686 6.648 6.56 6.446 6.328 6.168 5.966 5.74 5.473 5.138 4.723 4.128 3.354 2.274 0.723 -1.552 -4.882 -10.293 -16.582 -21.643 -25.824 -29.23 -32.1 -34.498 -36.614 -38.381 -40.043 -41.437 -42.658 -43.801 -44.875 -45.851 -46.719 -47.602 -48.381 -49.033 -49.719 -50.444 -51.013 -51.599 -52.244 -52.752 -53.269 -53.805 -54.362 -54.904 -55.264 -55.648 -56.263 -56.685 -57.118 -57.35 -57.833 -58.308 -58.807 -59.066 -59.421 -59.896 -60.183 -60.488 -61.18 -61.552 -61.965 -62.428 -62.929 -63.534 -64.313 -67.559 -9 ,22612 ,KEBNE ,17028099,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:10:05 CET,0.0 7.75 8.327 8.746 9.068 9.347 9.573 9.753 10.115 10.286 10.429 10.66 10.793 10.897 11.088 11.277 11.431 11.487 11.585 11.674 11.819 11.904 11.982 12.112 12.232 12.347 12.472 12.589 12.701 12.776 12.823 12.872 12.911 12.939 12.951 12.919 12.852 12.768 12.671 12.507 12.315 12.097 11.773 11.339 10.717 9.928 8.9 7.526 5.455 2.361 -2.608 -8.41 -13.006 -16.779 -19.761 -22.31 -24.538 -26.531 -28.225 -29.867 -31.242 -32.438 -33.57 -34.635 -35.622 -36.497 -37.381 -38.171 -38.844 -39.547 -40.291 -40.878 -41.454 -42.037 -42.487 -42.948 -43.423 -43.926 -44.444 -44.795 -45.159 -45.728 -46.12 -46.524 -46.733 -47.18 -47.674 -48.188 -48.454 -48.818 -49.308 -49.621 -49.956 -50.643 -51.033 -51.48 -51.995 -52.58 -53.298 -54.282 -57.323 -10 ,17799 ,KEBNE ,17028100,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:09:13 CET,0.0 3.298 3.868 4.281 4.61 4.891 5.145 5.362 5.691 5.812 5.926 6.137 6.257 6.352 6.535 6.718 6.879 6.947 7.076 7.191 7.329 7.412 7.492 7.596 7.687 7.763 7.822 7.876 7.937 7.996 8.043 8.074 8.075 8.071 8.066 8.027 7.977 7.907 7.831 7.741 7.576 7.311 6.92 6.452 5.848 5.108 4.141 2.832 0.886 -2.045 -6.984 -12.737 -17.228 -20.857 -23.87 -26.488 -28.703 -30.658 -32.294 -33.89 -35.277 -36.499 -37.652 -38.75 -39.756 -40.67 -41.607 -42.437 -43.131 -43.81 -44.53 -45.137 -45.744 -46.353 -46.828 -47.318 -47.815 -48.315 -48.838 -49.215 -49.606 -50.219 -50.639 -51.063 -51.282 -51.753 -52.248 -52.766 -53.036 -53.412 -54.034 -54.42 -54.819 -55.642 -56.093 -56.611 -57.134 -57.703 -58.401 -59.414 -64.041 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt deleted file mode 100644 index a487ed82..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15609 ,KEBNE ,16748725,Tue Nov 30 10:20:15 CET,Tue Nov 30 12:29:37 CET,0.0 0.938 1.416 1.829 2.171 2.456 2.72 2.977 3.451 3.673 3.886 4.182 4.492 4.661 4.985 5.285 5.572 5.716 5.987 6.23 6.583 6.817 7.043 7.376 7.691 7.995 8.292 8.584 8.959 9.3 9.633 10.037 10.418 10.795 11.226 11.688 12.12 12.593 13.107 13.649 14.215 14.862 15.629 16.399 17.328 18.347 19.455 20.642 21.973 23.466 25.095 26.27 26.688 26.736 26.654 26.504 26.295 26.049 25.815 25.544 25.272 24.989 24.685 24.404 24.156 23.908 23.611 23.345 23.118 22.878 22.629 22.395 22.139 21.889 21.686 21.454 21.217 20.987 20.749 20.577 20.394 20.093 19.875 19.659 19.547 19.287 19.008 18.724 18.573 18.301 18.078 17.9 17.712 17.286 17.044 16.782 16.485 16.15 15.74 15.17 13.364 -2 ,5872 ,KEBNE ,16748726,Tue Nov 30 10:20:15 CET,Tue Nov 30 12:26:50 CET,0.0 1.135 1.63 2.017 2.345 2.642 2.901 3.147 3.623 3.837 4.033 4.276 4.578 4.733 5.04 5.344 5.62 5.75 6.012 6.271 6.629 6.846 7.059 7.376 7.696 8.017 8.31 8.589 8.947 9.288 9.627 10.021 10.389 10.748 11.181 11.677 12.131 12.636 13.178 13.746 14.344 14.996 15.747 16.489 17.364 18.342 19.443 20.644 21.983 23.44 25.065 26.268 26.77 26.881 26.812 26.656 26.428 26.144 25.871 25.6 25.322 25.046 24.777 24.493 24.213 23.949 23.658 23.39 23.158 22.926 22.679 22.456 22.229 21.99 21.8 21.602 21.382 21.132 20.885 20.722 20.546 20.262 20.047 19.821 19.702 19.439 19.167 18.889 18.741 18.483 18.243 18.067 17.885 17.472 17.235 16.948 16.606 16.234 15.789 15.191 12.98 -3 ,19951 ,KEBNE ,16748727,Tue Nov 30 10:23:25 CET,Tue Nov 30 12:30:03 CET,0.0 1.148 1.668 2.048 2.372 2.66 2.924 3.156 3.583 3.78 3.972 4.206 4.507 4.665 4.963 5.25 5.512 5.641 5.903 6.154 6.496 6.72 6.95 7.275 7.574 7.87 8.167 8.451 8.81 9.143 9.465 9.852 10.224 10.582 10.989 11.441 11.886 12.395 12.936 13.504 14.108 14.779 15.541 16.291 17.163 18.132 19.215 20.368 21.671 23.159 24.838 25.932 26.375 26.531 26.478 26.281 26.015 25.728 25.439 25.116 24.836 24.579 24.294 24.016 23.761 23.523 23.267 23.02 22.788 22.541 22.273 22.05 21.827 21.584 21.401 21.219 21.015 20.779 20.511 20.317 20.109 19.746 19.493 19.256 19.139 18.894 18.636 18.347 18.172 17.879 17.56 17.321 17.068 16.527 16.266 15.975 15.613 15.176 14.629 13.874 11.314 -4 ,1122 ,KEBNE ,16748728,Tue Nov 30 10:23:24 CET,Tue Nov 30 12:31:23 CET,0.0 1.204 1.619 1.959 2.286 2.59 2.852 3.097 3.542 3.746 3.944 4.197 4.479 4.629 4.917 5.195 5.457 5.58 5.831 6.067 6.391 6.6 6.808 7.122 7.431 7.73 8.009 8.276 8.62 8.961 9.296 9.682 10.059 10.418 10.828 11.294 11.731 12.207 12.718 13.27 13.828 14.446 15.166 15.866 16.679 17.583 18.587 19.682 20.943 22.372 23.948 25.027 25.491 25.622 25.571 25.443 25.241 24.978 24.74 24.503 24.274 24.037 23.795 23.553 23.304 23.051 22.79 22.576 22.382 22.162 21.905 21.688 21.471 21.24 21.053 20.867 20.672 20.448 20.199 20.026 19.852 19.576 19.374 19.155 19.032 18.754 18.458 18.147 17.977 17.691 17.421 17.228 17.018 16.532 16.266 16.019 15.773 15.454 15.049 14.52 12.547 -5 ,7948 ,KEBNE ,16748729,Tue Nov 30 10:29:39 CET,Tue Nov 30 12:36:23 CET,0.0 1.863 2.538 3.047 3.513 3.913 4.249 4.565 5.159 5.404 5.611 5.875 6.172 6.347 6.696 7.011 7.294 7.434 7.714 7.976 8.327 8.548 8.768 9.089 9.398 9.696 9.999 10.283 10.629 10.97 11.3 11.712 12.109 12.479 12.898 13.359 13.804 14.292 14.825 15.386 15.956 16.589 17.305 18.015 18.857 19.79 20.833 21.986 23.31 24.787 26.469 27.62 28.067 28.183 28.073 27.882 27.676 27.442 27.192 26.887 26.596 26.336 26.065 25.771 25.493 25.248 24.977 24.71 24.468 24.229 23.99 23.768 23.517 23.251 23.03 22.796 22.552 22.288 22.016 21.834 21.642 21.331 21.105 20.866 20.753 20.514 20.243 19.967 19.829 19.576 19.334 19.144 18.946 18.499 18.259 17.995 17.667 17.275 16.794 16.093 13.239 -6 ,26127 ,KEBNE ,16748730,Tue Nov 30 10:37:53 CET,Tue Nov 30 12:34:08 CET,0.0 1.295 1.735 2.065 2.368 2.657 2.933 3.186 3.641 3.835 4.008 4.241 4.543 4.701 5.013 5.309 5.59 5.724 5.983 6.229 6.575 6.797 7.016 7.329 7.631 7.929 8.212 8.496 8.854 9.188 9.512 9.895 10.261 10.619 11.05 11.534 11.998 12.511 13.054 13.605 14.172 14.803 15.522 16.229 17.028 17.931 18.949 20.057 21.361 22.832 24.365 25.396 25.799 25.901 25.872 25.728 25.487 25.226 24.98 24.671 24.378 24.121 23.873 23.634 23.404 23.17 22.917 22.675 22.433 22.174 21.892 21.654 21.423 21.176 20.988 20.783 20.557 20.333 20.087 19.911 19.736 19.463 19.259 19.042 18.935 18.706 18.453 18.196 18.051 17.79 17.58 17.408 17.22 16.816 16.602 16.346 16.067 15.775 15.412 14.934 13.209 -7 ,1590 ,KEBNE ,16748731,Tue Nov 30 10:38:53 CET,Tue Nov 30 12:43:11 CET,0.0 0.929 1.371 1.729 2.021 2.265 2.507 2.733 3.162 3.364 3.544 3.728 4.007 4.163 4.466 4.756 5.036 5.166 5.42 5.673 6.036 6.263 6.492 6.83 7.132 7.409 7.682 7.946 8.291 8.635 8.964 9.355 9.728 10.088 10.508 10.995 11.462 11.95 12.47 13.042 13.644 14.307 15.081 15.843 16.703 17.618 18.646 19.827 21.124 22.557 24.197 25.216 25.548 25.554 25.442 25.266 25.027 24.754 24.486 24.2 23.931 23.644 23.354 23.079 22.825 22.584 22.298 22.034 21.802 21.548 21.266 21.026 20.783 20.531 20.33 20.114 19.885 19.651 19.418 19.251 19.065 18.766 18.565 18.353 18.238 18.002 17.743 17.457 17.309 17.05 16.834 16.656 16.446 15.981 15.726 15.449 15.134 14.761 14.306 13.714 11.439 -8 ,24783 ,KEBNE ,16748732,Tue Nov 30 10:42:05 CET,Tue Nov 30 12:49:34 CET,0.0 1.172 1.62 1.983 2.284 2.55 2.811 3.054 3.505 3.711 3.902 4.131 4.408 4.566 4.867 5.155 5.427 5.564 5.834 6.087 6.452 6.683 6.903 7.226 7.533 7.818 8.099 8.366 8.702 9.033 9.352 9.761 10.164 10.537 10.952 11.403 11.855 12.366 12.897 13.442 14.01 14.646 15.395 16.16 17.021 17.961 19.048 20.25 21.666 23.285 25.043 26.16 26.596 26.697 26.627 26.481 26.229 25.941 25.698 25.394 25.116 24.864 24.591 24.324 24.063 23.817 23.544 23.288 23.061 22.825 22.576 22.364 22.144 21.902 21.71 21.506 21.291 21.077 20.84 20.66 20.473 20.17 19.949 19.713 19.593 19.347 19.074 18.783 18.629 18.359 18.157 17.984 17.791 17.394 17.161 16.892 16.605 16.274 15.814 15.173 12.961 -9 ,7037 ,KEBNE ,16748733,Tue Nov 30 10:44:09 CET,Tue Nov 30 12:48:43 CET,0.0 1.16 1.578 1.9 2.214 2.494 2.742 2.997 3.46 3.66 3.839 4.059 4.354 4.514 4.816 5.106 5.382 5.513 5.764 6.003 6.336 6.551 6.77 7.086 7.387 7.683 7.966 8.237 8.593 8.941 9.28 9.688 10.059 10.421 10.851 11.337 11.809 12.311 12.83 13.37 13.933 14.575 15.322 16.062 16.917 17.858 18.923 20.111 21.447 22.957 24.642 25.735 26.138 26.281 26.293 26.154 25.96 25.746 25.503 25.198 24.916 24.638 24.329 24.045 23.801 23.574 23.316 23.075 22.856 22.621 22.361 22.127 21.894 21.65 21.453 21.245 21.017 20.771 20.504 20.317 20.13 19.847 19.653 19.441 19.317 19.05 18.772 18.482 18.333 18.076 17.873 17.706 17.521 17.096 16.848 16.577 16.3 15.969 15.556 14.978 12.405 -10 ,18777 ,KEBNE ,16748734,Tue Nov 30 10:47:17 CET,Tue Nov 30 12:51:51 CET,0.0 0.998 1.504 1.906 2.23 2.521 2.812 3.069 3.507 3.72 3.927 4.201 4.5 4.665 4.969 5.258 5.538 5.675 5.945 6.201 6.572 6.811 7.037 7.357 7.663 7.959 8.251 8.544 8.911 9.246 9.566 9.961 10.339 10.703 11.137 11.619 12.072 12.565 13.099 13.676 14.299 14.989 15.799 16.598 17.458 18.364 19.386 20.528 21.871 23.483 25.215 26.265 26.638 26.733 26.686 26.533 26.308 26.075 25.814 25.489 25.185 24.89 24.608 24.349 24.088 23.832 23.566 23.334 23.119 22.881 22.631 22.407 22.163 21.91 21.702 21.486 21.26 21.021 20.775 20.603 20.423 20.125 19.896 19.646 19.518 19.257 18.988 18.706 18.551 18.289 18.071 17.899 17.715 17.3 17.068 16.801 16.496 16.171 15.802 15.252 13.143 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index 8cf543e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8712 ,KEBNE ,16748735,Tue Nov 30 10:47:17 CET,Tue Nov 30 12:51:56 CET,0.0 8.032 8.741 9.245 9.634 9.972 10.261 10.517 10.967 11.158 11.335 11.552 11.821 11.96 12.234 12.499 12.751 12.876 13.112 13.33 13.626 13.805 13.995 14.294 14.57 14.822 15.062 15.295 15.601 15.904 16.194 16.543 16.853 17.126 17.441 17.791 18.122 18.482 18.853 19.243 19.672 20.138 20.656 21.142 21.682 22.262 22.917 23.571 24.205 24.792 25.107 24.894 24.422 23.878 23.358 22.819 22.283 21.772 21.307 20.793 20.335 19.948 19.578 19.204 18.841 18.522 18.19 17.876 17.589 17.276 16.94 16.658 16.358 16.038 15.796 15.563 15.311 15.035 14.742 14.528 14.314 13.994 13.758 13.502 13.374 13.083 12.768 12.462 12.297 11.977 11.677 11.43 11.165 10.533 10.169 9.807 9.416 8.957 8.4 7.68 4.611 -2 ,26590 ,KEBNE ,16748736,Tue Nov 30 10:48:19 CET,Tue Nov 30 12:55:11 CET,0.0 4.207 4.922 5.425 5.841 6.179 6.448 6.691 7.158 7.37 7.56 7.812 8.099 8.258 8.551 8.814 9.074 9.201 9.437 9.659 9.973 10.174 10.371 10.643 10.886 11.12 11.356 11.579 11.854 12.12 12.376 12.692 13.01 13.328 13.669 14.034 14.421 14.848 15.298 15.771 16.263 16.811 17.406 17.965 18.567 19.204 19.909 20.643 21.4 22.077 22.648 22.78 22.543 22.123 21.589 21.085 20.644 20.201 19.779 19.319 18.919 18.567 18.212 17.869 17.556 17.255 16.928 16.632 16.372 16.086 15.793 15.563 15.32 15.059 14.845 14.61 14.356 14.09 13.799 13.592 13.374 13.038 12.812 12.577 12.45 12.165 11.853 11.514 11.35 11.072 10.818 10.617 10.411 9.98 9.747 9.487 9.152 8.745 8.309 7.774 5.751 -3 ,635 ,KEBNE ,16748737,Tue Nov 30 10:49:22 CET,Tue Nov 30 12:56:27 CET,0.0 3.256 3.979 4.493 4.92 5.254 5.542 5.808 6.266 6.47 6.658 6.869 7.146 7.306 7.613 7.9 8.167 8.297 8.543 8.787 9.14 9.362 9.566 9.839 10.12 10.389 10.63 10.861 11.176 11.485 11.771 12.12 12.458 12.771 13.12 13.508 13.886 14.288 14.698 15.144 15.636 16.151 16.722 17.305 17.982 18.733 19.522 20.285 21.097 21.874 22.47 22.568 22.278 21.834 21.321 20.813 20.337 19.876 19.474 19.054 18.664 18.293 17.928 17.573 17.23 16.915 16.573 16.253 15.97 15.677 15.375 15.124 14.86 14.579 14.357 14.134 13.906 13.64 13.345 13.161 12.971 12.64 12.415 12.16 12.021 11.762 11.495 11.204 11.047 10.765 10.491 10.278 10.06 9.6 9.342 9.065 8.759 8.423 8.018 7.465 5.272 -4 ,2036 ,KEBNE ,16748738,Tue Nov 30 10:49:22 CET,Tue Nov 30 12:54:49 CET,0.0 5.211 5.9 6.386 6.763 7.099 7.422 7.727 8.251 8.468 8.662 8.91 9.198 9.357 9.654 9.931 10.187 10.304 10.535 10.748 11.044 11.252 11.453 11.729 11.994 12.249 12.496 12.73 13.029 13.319 13.605 13.94 14.234 14.51 14.838 15.213 15.583 15.993 16.418 16.861 17.322 17.85 18.449 19.015 19.635 20.283 21.015 21.804 22.667 23.514 24.18 24.18 23.81 23.388 22.917 22.381 21.897 21.473 21.08 20.666 20.281 19.915 19.561 19.209 18.863 18.561 18.252 17.959 17.697 17.414 17.099 16.835 16.571 16.286 16.054 15.812 15.567 15.315 15.048 14.855 14.645 14.325 14.112 13.887 13.768 13.513 13.243 12.949 12.79 12.51 12.3 12.122 11.926 11.487 11.237 10.958 10.66 10.327 9.954 9.45 7.744 -5 ,17128 ,KEBNE ,16748739,Tue Nov 30 10:49:22 CET,Tue Nov 30 12:55:52 CET,0.0 3.734 4.492 4.988 5.34 5.641 5.904 6.144 6.56 6.751 6.929 7.138 7.41 7.555 7.823 8.076 8.324 8.446 8.681 8.894 9.203 9.4 9.593 9.87 10.125 10.379 10.631 10.868 11.183 11.505 11.805 12.157 12.504 12.843 13.249 13.691 14.083 14.496 14.935 15.396 15.857 16.353 16.912 17.47 18.127 18.776 19.47 20.267 21.128 21.886 22.443 22.552 22.27 21.872 21.408 20.891 20.382 19.902 19.478 19.041 18.645 18.293 17.973 17.652 17.333 17.03 16.699 16.398 16.139 15.872 15.588 15.332 15.061 14.789 14.573 14.353 14.133 13.901 13.651 13.472 13.275 12.962 12.747 12.501 12.371 12.099 11.807 11.509 11.361 11.089 10.871 10.683 10.487 10.067 9.845 9.571 9.225 8.838 8.325 7.564 5.044 -6 ,20170 ,KEBNE ,16748740,Tue Nov 30 10:50:24 CET,Tue Nov 30 12:54:34 CET,0.0 3.292 4.013 4.518 4.898 5.204 5.489 5.748 6.207 6.408 6.587 6.795 7.08 7.234 7.522 7.8 8.072 8.202 8.433 8.658 8.988 9.187 9.379 9.652 9.916 10.182 10.437 10.68 10.98 11.253 11.518 11.864 12.212 12.541 12.902 13.289 13.667 14.109 14.597 15.106 15.619 16.193 16.834 17.403 18.041 18.777 19.593 20.472 21.371 22.149 22.758 22.767 22.394 21.966 21.524 21.019 20.5 19.997 19.554 19.105 18.698 18.328 17.991 17.665 17.338 17.035 16.731 16.462 16.208 15.938 15.648 15.392 15.117 14.828 14.598 14.355 14.108 13.85 13.562 13.354 13.143 12.817 12.599 12.381 12.27 12.041 11.787 11.501 11.346 11.073 10.852 10.672 10.485 10.076 9.827 9.543 9.269 8.954 8.571 8.085 5.946 -7 ,26712 ,KEBNE ,16748741,Tue Nov 30 10:50:24 CET,Tue Nov 30 12:54:16 CET,0.0 2.733 3.463 3.965 4.36 4.679 4.951 5.206 5.672 5.893 6.098 6.312 6.598 6.753 7.055 7.343 7.613 7.736 7.966 8.188 8.501 8.703 8.903 9.181 9.427 9.669 9.913 10.153 10.442 10.702 10.966 11.29 11.605 11.904 12.222 12.562 12.892 13.252 13.623 14.034 14.471 14.934 15.449 15.962 16.554 17.161 17.805 18.509 19.282 20.051 20.714 20.851 20.535 20.078 19.555 19.06 18.604 18.127 17.688 17.245 16.86 16.488 16.112 15.755 15.389 15.052 14.722 14.414 14.141 13.851 13.545 13.3 13.032 12.752 12.549 12.326 12.085 11.831 11.561 11.379 11.195 10.898 10.692 10.48 10.364 10.119 9.858 9.582 9.434 9.157 8.938 8.747 8.543 8.106 7.87 7.622 7.324 6.968 6.532 5.931 2.87 -8 ,30825 ,KEBNE ,16748742,Tue Nov 30 10:52:35 CET,Tue Nov 30 12:54:14 CET,0.0 3.022 3.7 4.213 4.585 4.873 5.139 5.388 5.879 6.1 6.298 6.579 6.861 7.015 7.313 7.586 7.844 7.969 8.215 8.461 8.801 9.005 9.206 9.495 9.761 10.02 10.257 10.48 10.773 11.047 11.313 11.636 11.954 12.248 12.587 12.98 13.343 13.72 14.117 14.538 14.992 15.492 16.045 16.587 17.169 17.802 18.488 19.185 19.922 20.591 21.054 21.05 20.741 20.293 19.812 19.309 18.771 18.236 17.749 17.255 16.823 16.404 16.007 15.635 15.285 14.954 14.596 14.266 13.983 13.701 13.41 13.161 12.889 12.592 12.359 12.126 11.877 11.6 11.305 11.101 10.883 10.526 10.289 10.048 9.913 9.63 9.337 9.014 8.842 8.545 8.27 8.05 7.833 7.384 7.136 6.866 6.547 6.165 5.718 5.133 3.231 -9 ,23298 ,KEBNE ,16748743,Tue Nov 30 10:53:38 CET,Tue Nov 30 12:56:57 CET,0.0 4.044 4.762 5.243 5.615 5.952 6.252 6.501 6.915 7.107 7.29 7.512 7.786 7.935 8.219 8.478 8.741 8.871 9.105 9.313 9.611 9.815 10.011 10.279 10.531 10.777 11.004 11.234 11.542 11.805 12.046 12.34 12.641 12.938 13.267 13.651 14.006 14.381 14.774 15.172 15.57 16.005 16.529 17.052 17.62 18.227 18.902 19.568 20.265 20.932 21.477 21.522 21.114 20.577 20.078 19.583 19.099 18.623 18.189 17.733 17.323 16.953 16.592 16.241 15.894 15.575 15.253 14.958 14.698 14.423 14.141 13.91 13.653 13.374 13.162 12.939 12.7 12.445 12.16 11.955 11.753 11.424 11.196 10.965 10.841 10.578 10.29 9.996 9.847 9.566 9.347 9.153 8.937 8.462 8.206 7.923 7.612 7.268 6.841 6.222 4.066 -10 ,18473 ,KEBNE ,16748744,Tue Nov 30 10:54:40 CET,Tue Nov 30 13:01:25 CET,0.0 3.421 4.137 4.622 5.009 5.343 5.646 5.914 6.357 6.561 6.761 7.017 7.321 7.484 7.781 8.073 8.347 8.474 8.723 8.969 9.312 9.516 9.714 9.999 10.26 10.502 10.739 10.976 11.279 11.571 11.843 12.166 12.47 12.756 13.101 13.501 13.885 14.281 14.7 15.144 15.6 16.119 16.702 17.224 17.823 18.522 19.253 19.976 20.775 21.497 21.987 21.985 21.668 21.201 20.668 20.174 19.744 19.318 18.909 18.478 18.076 17.696 17.321 16.958 16.64 16.348 16.023 15.723 15.453 15.169 14.872 14.615 14.342 14.054 13.825 13.594 13.351 13.089 12.817 12.623 12.419 12.098 11.881 11.646 11.519 11.265 10.994 10.699 10.546 10.267 10.038 9.849 9.652 9.232 9.0 8.74 8.467 8.147 7.727 7.003 3.563 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt deleted file mode 100644 index b1daf0d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14307 ,KEBNE ,16748745,Tue Nov 30 10:54:42 CET,Tue Nov 30 12:56:33 CET,0.0 0.884 1.253 1.526 1.74 1.924 2.087 2.235 2.516 2.657 2.792 2.654 3.189 3.31 3.538 3.75 3.96 4.058 4.261 4.467 4.726 4.89 5.053 5.279 5.499 5.714 5.93 6.152 6.44 6.699 6.948 7.259 7.548 7.829 8.151 8.496 8.824 9.183 9.559 9.929 10.303 10.722 11.188 11.642 12.16 12.747 13.414 14.062 14.739 15.448 15.987 15.981 15.631 15.15 14.646 14.136 13.623 13.123 12.699 12.286 11.923 11.597 11.292 11.013 10.715 10.417 10.1 9.806 9.547 9.268 8.992 8.779 8.542 8.279 8.08 7.893 7.709 7.51 7.278 7.115 6.946 6.66 6.454 6.24 6.134 5.919 5.689 5.455 5.326 4.794 4.89 4.721 4.547 4.125 3.875 3.612 3.328 2.983 2.525 1.882 -1.023 -2 ,15656 ,KEBNE ,16748746,Tue Nov 30 10:55:46 CET,Tue Nov 30 12:57:55 CET,0.0 1.218 1.657 1.94 2.187 2.402 2.582 2.742 3.061 3.212 3.359 3.244 3.789 3.922 4.172 4.404 4.626 4.736 4.951 5.155 5.446 5.639 5.828 6.097 6.354 6.605 6.841 7.057 7.33 7.592 7.838 8.141 8.439 8.72 9.055 9.434 9.774 10.121 10.51 10.931 11.364 11.835 12.338 12.824 13.375 13.957 14.598 15.254 15.896 16.486 16.873 16.743 16.444 16.095 15.693 15.284 14.855 14.405 13.967 13.508 13.118 12.767 12.439 12.102 11.756 11.453 11.135 10.85 10.612 10.352 10.074 9.851 9.614 9.346 9.133 8.909 8.67 8.431 8.175 7.984 7.795 7.502 7.279 7.052 6.937 6.701 6.438 6.131 5.971 5.408 5.468 5.269 5.067 4.655 4.402 4.098 3.749 3.351 2.87 2.161 -5.579 -3 ,8430 ,KEBNE ,16748747,Tue Nov 30 10:56:52 CET,Tue Nov 30 12:57:46 CET,0.0 0.684 0.933 1.131 1.349 1.566 1.741 1.897 2.184 2.312 2.435 2.267 2.776 2.888 3.104 3.293 3.464 3.551 3.733 3.905 4.146 4.3 4.452 4.674 4.887 5.092 5.299 5.503 5.754 5.994 6.22 6.497 6.778 7.033 7.312 7.633 7.943 8.28 8.646 9.03 9.433 9.889 10.412 10.916 11.476 12.076 12.75 13.497 14.31 15.099 15.771 15.965 15.765 15.443 15.088 14.7 14.343 13.973 13.582 13.181 12.857 12.575 12.287 12.022 11.789 11.572 11.324 11.08 10.863 10.626 10.372 10.145 9.893 9.626 9.426 9.223 9.012 8.795 8.561 8.389 8.217 7.955 7.754 7.539 7.431 7.201 6.951 6.675 6.534 5.994 6.091 5.925 5.731 5.316 5.093 4.837 4.543 4.206 3.765 3.143 -0.082 -4 ,14082 ,KEBNE ,16748748,Tue Nov 30 10:57:59 CET,Tue Nov 30 12:59:28 CET,0.0 0.892 1.254 1.514 1.741 1.96 2.162 2.353 2.714 2.879 3.033 2.924 3.473 3.606 3.851 4.069 4.286 4.392 4.599 4.804 5.098 5.285 5.462 5.712 5.943 6.185 6.423 6.633 6.896 7.145 7.392 7.713 8.025 8.307 8.619 8.975 9.338 9.719 10.107 10.534 10.964 11.408 11.901 12.392 12.919 13.454 14.079 14.738 15.351 15.949 16.479 16.538 16.227 15.76 15.248 14.756 14.329 13.93 13.527 13.072 12.663 12.305 11.969 11.64 11.325 11.032 10.714 10.435 10.175 9.875 9.553 9.284 9.022 8.759 8.533 8.279 8.022 7.77 7.503 7.316 7.124 6.826 6.613 6.37 6.24 5.984 5.714 5.411 5.257 4.715 4.795 4.614 4.409 3.985 3.76 3.497 3.205 2.859 2.426 1.793 -1.713 -5 ,14871 ,KEBNE ,16748749,Tue Nov 30 10:59:04 CET,Tue Nov 30 13:04:59 CET,0.0 0.745 1.067 1.359 1.59 1.761 1.919 2.087 2.421 2.568 2.702 2.557 3.099 3.235 3.475 3.689 3.893 3.993 4.179 4.344 4.595 4.763 4.925 5.162 5.389 5.617 5.843 6.052 6.316 6.575 6.825 7.125 7.407 7.669 7.975 8.334 8.672 9.014 9.377 9.773 10.186 10.654 11.187 11.688 12.253 12.854 13.505 14.192 14.916 15.581 16.024 16.039 15.837 15.529 15.138 14.704 14.268 13.834 13.41 12.95 12.576 12.247 11.911 11.557 11.231 10.964 10.686 10.439 10.213 9.959 9.692 9.457 9.205 8.954 8.759 8.548 8.326 8.104 7.884 7.729 7.558 7.269 7.044 6.816 6.708 6.489 6.253 5.996 5.852 5.309 5.386 5.21 5.014 4.579 4.346 4.089 3.773 3.406 3.001 2.435 -0.105 -6 ,27224 ,KEBNE ,16748750,Tue Nov 30 10:59:04 CET,Tue Nov 30 13:01:03 CET,0.0 1.105 1.483 1.798 2.075 2.304 2.481 2.641 2.97 3.113 3.258 3.151 3.701 3.831 4.081 4.327 4.571 4.685 4.899 5.102 5.388 5.569 5.748 6.004 6.258 6.511 6.742 6.968 7.264 7.545 7.817 8.132 8.431 8.73 9.086 9.467 9.811 10.183 10.589 10.997 11.398 11.833 12.312 12.766 13.305 13.944 14.639 15.394 16.213 16.983 17.636 17.712 17.4 17.01 16.601 16.172 15.772 15.362 14.984 14.604 14.253 13.912 13.561 13.226 12.913 12.61 12.265 11.953 11.698 11.448 11.171 10.936 10.698 10.447 10.251 10.052 9.848 9.62 9.37 9.196 9.021 8.735 8.538 8.309 8.179 7.939 7.696 7.431 7.29 6.73 6.783 6.602 6.415 5.99 5.743 5.457 5.15 4.823 4.41 3.86 0.323 -7 ,18614 ,KEBNE ,16748751,Tue Nov 30 11:01:09 CET,Tue Nov 30 13:06:58 CET,0.0 0.96 1.318 1.604 1.846 2.068 2.267 2.442 2.788 2.955 3.116 3.013 3.549 3.673 3.903 4.123 4.344 4.458 4.666 4.858 5.141 5.324 5.487 5.725 5.964 6.189 6.416 6.641 6.926 7.194 7.458 7.788 8.103 8.393 8.718 9.077 9.421 9.798 10.197 10.613 11.037 11.514 12.08 12.632 13.244 13.896 14.55 15.175 15.842 16.502 16.957 16.95 16.704 16.33 15.855 15.358 14.934 14.527 14.118 13.704 13.362 13.045 12.717 12.407 12.118 11.845 11.553 11.276 11.029 10.761 10.473 10.236 9.989 9.731 9.531 9.308 9.076 8.834 8.579 8.406 8.227 7.944 7.739 7.526 7.417 7.193 6.951 6.689 6.552 6.016 6.14 5.983 5.803 5.403 5.177 4.926 4.663 4.342 3.901 3.255 0.679 -8 ,16829 ,KEBNE ,16748752,Tue Nov 30 11:03:19 CET,Tue Nov 30 13:05:45 CET,0.0 1.291 1.765 2.128 2.41 2.668 2.897 3.096 3.472 3.662 3.833 3.74 4.29 4.431 4.699 4.946 5.179 5.288 5.494 5.69 5.972 6.161 6.338 6.587 6.822 7.052 7.267 7.468 7.72 7.953 8.187 8.471 8.737 8.986 9.262 9.569 9.867 10.195 10.544 10.916 11.288 11.716 12.246 12.755 13.289 13.831 14.442 15.119 15.846 16.556 17.103 17.161 16.935 16.569 16.142 15.676 15.236 14.795 14.37 13.919 13.505 13.136 12.78 12.432 12.11 11.802 11.448 11.124 10.832 10.534 10.238 9.978 9.698 9.41 9.189 8.953 8.712 8.475 8.226 8.049 7.863 7.546 7.331 7.114 7.0 6.769 6.505 6.203 6.042 5.479 5.518 5.321 5.107 4.614 4.369 4.107 3.773 3.391 2.928 2.218 -1.128 -9 ,13746 ,KEBNE ,16748753,Tue Nov 30 11:04:24 CET,Tue Nov 30 13:05:11 CET,0.0 0.947 1.253 1.476 1.65 1.816 1.982 2.129 2.389 2.513 2.631 2.462 2.987 3.105 3.337 3.544 3.737 3.831 4.021 4.217 4.481 4.647 4.811 5.034 5.246 5.45 5.655 5.862 6.121 6.372 6.611 6.883 7.154 7.436 7.763 8.122 8.477 8.856 9.235 9.631 10.065 10.558 11.14 11.691 12.276 12.909 13.595 14.269 14.952 15.62 16.134 16.168 15.923 15.566 15.084 14.561 14.084 13.634 13.219 12.785 12.399 12.062 11.733 11.398 11.075 10.761 10.436 10.149 9.887 9.619 9.342 9.089 8.825 8.569 8.369 8.164 7.945 7.712 7.461 7.279 7.085 6.757 6.526 6.291 6.164 5.902 5.632 5.337 5.186 4.633 4.668 4.467 4.254 3.794 3.534 3.242 2.886 2.46 1.936 1.227 -2.105 -10 ,29903 ,KEBNE ,16748754,Tue Nov 30 11:05:26 CET,Tue Nov 30 13:10:10 CET,0.0 1.22 1.615 1.908 2.164 2.381 2.578 2.767 3.106 3.264 3.408 3.257 3.789 3.906 4.125 4.338 4.538 4.633 4.827 5.019 5.284 5.451 5.622 5.863 6.085 6.3 6.522 6.743 7.009 7.265 7.523 7.831 8.113 8.382 8.7 9.051 9.386 9.751 10.137 10.548 10.981 11.453 11.968 12.477 13.077 13.736 14.402 15.042 15.719 16.408 16.979 16.988 16.701 16.344 15.892 15.383 14.893 14.416 14.007 13.593 13.22 12.889 12.554 12.222 11.919 11.621 11.295 10.999 10.729 10.457 10.181 9.945 9.707 9.463 9.276 9.083 8.876 8.643 8.38 8.207 8.033 7.757 7.555 7.319 7.197 6.941 6.651 6.356 6.215 5.674 5.768 5.596 5.399 4.969 4.708 4.412 4.11 3.762 3.325 2.671 -0.406 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 124673d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27672 ,KEBNE ,16748755,Tue Nov 30 11:05:29 CET,Tue Nov 30 13:05:26 CET,0.0 1.995 2.322 2.508 2.628 2.708 2.75 2.762 2.745 2.719 2.677 2.352 2.5 2.43 2.276 2.099 1.919 1.826 1.617 1.399 1.068 0.836 0.607 0.257 -0.119 -0.51 -0.904 -1.304 -1.855 -2.411 -2.983 -3.706 -4.435 -5.185 -6.112 -7.208 -8.292 -9.543 -10.979 -12.611 -14.44 -16.624 -19.347 -22.277 -25.931 -30.345 -35.95 -42.964 -52.144 -64.512 -82.422 -100.959 -114.399 -124.613 -132.586 -139.155 -144.51 -149.084 -152.827 -156.398 -159.347 -161.858 -164.149 -166.23 -168.097 -169.739 -171.406 -172.857 -174.069 -175.276 -176.489 -177.483 -178.489 -179.501 -180.279 -181.062 -181.839 -182.62 -183.426 -183.969 -184.507 -185.336 -185.906 -186.493 -186.788 -187.381 -187.981 -188.592 -188.905 -189.637 -189.911 -190.259 -190.611 -191.348 -191.736 -192.142 -192.563 -193.029 -193.552 -194.221 -196.678 -2 ,24397 ,KEBNE ,16748756,Tue Nov 30 11:07:36 CET,Tue Nov 30 13:08:58 CET,0.0 2.262 2.637 2.846 2.992 3.077 3.122 3.131 3.112 3.091 3.054 2.74 2.902 2.837 2.688 2.521 2.327 2.221 2.013 1.793 1.455 1.23 0.989 0.614 0.233 -0.158 -0.554 -0.949 -1.487 -2.043 -2.609 -3.342 -4.101 -4.871 -5.809 -6.912 -8.012 -9.299 -10.807 -12.506 -14.385 -16.64 -19.462 -22.494 -26.3 -30.916 -36.699 -43.881 -53.23 -65.797 -84.003 -102.702 -116.179 -126.46 -134.572 -141.28 -146.729 -151.347 -155.117 -158.73 -161.705 -164.239 -166.543 -168.642 -170.539 -172.212 -173.911 -175.37 -176.584 -177.815 -179.052 -180.049 -181.066 -182.096 -182.866 -183.634 -184.429 -185.26 -186.087 -186.626 -187.172 -188.008 -188.58 -189.176 -189.479 -190.087 -190.703 -191.334 -191.657 -192.394 -192.666 -193.015 -193.376 -194.154 -194.569 -195.009 -195.464 -195.953 -196.511 -197.2 -199.396 -3 ,24703 ,KEBNE ,16748757,Tue Nov 30 11:11:49 CET,Tue Nov 30 13:10:13 CET,0.0 1.378 1.678 1.856 1.963 2.019 2.054 2.067 2.018 1.979 1.931 1.592 1.732 1.653 1.468 1.274 1.062 0.963 0.774 0.567 0.22 -0.023 -0.273 -0.664 -1.051 -1.45 -1.863 -2.275 -2.837 -3.413 -3.986 -4.718 -5.479 -6.246 -7.178 -8.292 -9.423 -10.714 -12.178 -13.829 -15.666 -17.9 -20.672 -23.632 -27.369 -31.88 -37.545 -44.58 -53.788 -66.228 -84.215 -102.813 -116.328 -126.655 -134.738 -141.402 -146.867 -151.487 -155.227 -158.784 -161.731 -164.243 -166.536 -168.624 -170.493 -172.133 -173.791 -175.237 -176.449 -177.661 -178.887 -179.89 -180.914 -181.951 -182.743 -183.54 -184.337 -185.145 -185.955 -186.498 -187.049 -187.889 -188.448 -189.029 -189.328 -189.922 -190.53 -191.161 -191.484 -192.216 -192.481 -192.821 -193.177 -193.946 -194.338 -194.73 -195.156 -195.642 -196.191 -196.856 -199.132 -4 ,20903 ,KEBNE ,16748758,Tue Nov 30 11:11:49 CET,Tue Nov 30 13:14:37 CET,0.0 1.562 1.873 2.035 2.137 2.199 2.22 2.222 2.207 2.179 2.14 1.834 1.988 1.912 1.754 1.601 1.426 1.333 1.145 0.954 0.646 0.42 0.184 -0.187 -0.577 -0.979 -1.378 -1.771 -2.316 -2.888 -3.468 -4.199 -4.944 -5.712 -6.65 -7.755 -8.868 -10.146 -11.588 -13.21 -15.036 -17.249 -20.008 -22.978 -26.685 -31.146 -36.75 -43.717 -52.838 -65.19 -83.044 -101.277 -114.423 -124.492 -132.424 -139.015 -144.407 -148.984 -152.727 -156.288 -159.221 -161.737 -164.043 -166.128 -168.001 -169.659 -171.336 -172.787 -174.001 -175.239 -176.504 -177.517 -178.527 -179.54 -180.312 -181.085 -181.86 -182.669 -183.503 -184.049 -184.599 -185.438 -185.997 -186.567 -186.851 -187.421 -188.022 -188.628 -188.925 -189.635 -189.867 -190.188 -190.524 -191.242 -191.632 -192.053 -192.488 -192.956 -193.52 -194.238 -196.295 -5 ,20021 ,KEBNE ,16748759,Tue Nov 30 11:11:49 CET,Tue Nov 30 13:12:41 CET,0.0 1.9 2.207 2.367 2.441 2.491 2.509 2.493 2.412 2.371 2.328 1.995 2.128 2.047 1.879 1.697 1.502 1.403 1.195 0.972 0.629 0.385 0.129 -0.247 -0.641 -1.054 -1.466 -1.88 -2.435 -2.994 -3.58 -4.337 -5.095 -5.867 -6.832 -7.965 -9.108 -10.438 -11.945 -13.632 -15.505 -17.751 -20.548 -23.609 -27.434 -31.951 -37.601 -44.733 -54.081 -66.69 -84.95 -103.598 -116.999 -127.254 -135.37 -142.056 -147.494 -152.111 -155.909 -159.522 -162.456 -164.96 -167.271 -169.367 -171.224 -172.858 -174.52 -175.956 -177.173 -178.404 -179.656 -180.669 -181.68 -182.695 -183.461 -184.248 -185.04 -185.849 -186.687 -187.241 -187.792 -188.643 -189.221 -189.794 -190.089 -190.698 -191.317 -191.96 -192.29 -193.023 -193.284 -193.633 -193.994 -194.763 -195.172 -195.592 -196.033 -196.522 -197.084 -197.765 -199.396 -6 ,27598 ,KEBNE ,16748760,Tue Nov 30 11:12:57 CET,Tue Nov 30 13:28:46 CET,0.0 1.859 2.238 2.439 2.546 2.598 2.621 2.628 2.586 2.55 2.501 2.148 2.277 2.201 2.037 1.844 1.633 1.529 1.315 1.102 0.755 0.507 0.254 -0.135 -0.527 -0.925 -1.331 -1.748 -2.319 -2.903 -3.496 -4.249 -5.023 -5.806 -6.744 -7.858 -9.0 -10.322 -11.828 -13.512 -15.376 -17.594 -20.362 -23.373 -27.138 -31.66 -37.3 -44.278 -53.466 -65.829 -83.739 -102.302 -115.705 -125.916 -133.953 -140.562 -145.953 -150.533 -154.275 -157.854 -160.793 -163.3 -165.612 -167.731 -169.632 -171.312 -172.984 -174.412 -175.621 -176.856 -178.095 -179.095 -180.121 -181.156 -181.93 -182.712 -183.497 -184.29 -185.091 -185.628 -186.181 -187.034 -187.599 -188.181 -188.48 -189.073 -189.674 -190.294 -190.616 -191.356 -191.613 -191.952 -192.312 -193.097 -193.502 -193.91 -194.359 -194.847 -195.396 -196.085 -198.1 -7 ,16878 ,KEBNE ,16748761,Tue Nov 30 11:16:01 CET,Tue Nov 30 13:16:46 CET,0.0 1.857 2.137 2.256 2.298 2.329 2.353 2.347 2.289 2.254 2.199 1.846 1.997 1.912 1.728 1.552 1.355 1.25 1.037 0.803 0.42 0.159 -0.1 -0.472 -0.852 -1.268 -1.694 -2.116 -2.681 -3.246 -3.835 -4.584 -5.337 -6.101 -7.019 -8.112 -9.244 -10.546 -12.033 -13.701 -15.538 -17.755 -20.523 -23.507 -27.251 -31.784 -37.52 -44.616 -53.914 -66.493 -84.59 -103.107 -116.48 -126.716 -134.788 -141.482 -146.928 -151.541 -155.336 -158.95 -161.896 -164.414 -166.743 -168.85 -170.75 -172.433 -174.11 -175.564 -176.782 -178.004 -179.246 -180.248 -181.256 -182.276 -183.046 -183.821 -184.62 -185.441 -186.254 -186.798 -187.342 -188.159 -188.722 -189.292 -189.577 -190.166 -190.776 -191.393 -191.706 -192.443 -192.693 -193.038 -193.396 -194.151 -194.553 -194.975 -195.417 -195.889 -196.415 -197.071 -198.84 -8 ,10459 ,KEBNE ,16748762,Tue Nov 30 11:16:01 CET,Tue Nov 30 13:23:06 CET,0.0 1.686 2.012 2.178 2.267 2.321 2.348 2.355 2.335 2.305 2.257 1.93 2.078 2.012 1.871 1.717 1.533 1.441 1.255 1.041 0.704 0.465 0.217 -0.145 -0.522 -0.911 -1.301 -1.699 -2.244 -2.8 -3.366 -4.1 -4.841 -5.589 -6.524 -7.635 -8.756 -10.055 -11.538 -13.206 -15.051 -17.247 -20.002 -22.988 -26.724 -31.246 -36.93 -43.954 -53.186 -65.612 -83.467 -101.886 -115.169 -125.313 -133.334 -139.967 -145.368 -149.948 -153.686 -157.253 -160.209 -162.736 -165.05 -167.145 -169.012 -170.68 -172.383 -173.84 -175.063 -176.286 -177.51 -178.497 -179.495 -180.53 -181.308 -182.078 -182.863 -183.649 -184.44 -184.975 -185.517 -186.335 -186.903 -187.491 -187.789 -188.409 -189.058 -189.74 -190.096 -190.867 -191.201 -191.583 -191.969 -192.806 -193.236 -193.683 -194.195 -194.753 -195.362 -196.149 -197.778 -9 ,6340 ,KEBNE ,16748763,Tue Nov 30 11:17:07 CET,Tue Nov 30 13:21:39 CET,0.0 1.852 2.22 2.434 2.565 2.637 2.678 2.72 2.739 2.718 2.68 2.356 2.509 2.453 2.297 2.121 1.942 1.846 1.646 1.434 1.097 0.871 0.638 0.278 -0.085 -0.472 -0.879 -1.288 -1.84 -2.401 -2.987 -3.734 -4.477 -5.217 -6.119 -7.217 -8.329 -9.601 -11.049 -12.697 -14.542 -16.75 -19.501 -22.425 -26.093 -30.548 -36.134 -43.112 -52.304 -64.761 -82.67 -100.89 -114.115 -124.274 -132.256 -138.878 -144.287 -148.874 -152.655 -156.279 -159.223 -161.715 -164.02 -166.118 -167.992 -169.638 -171.311 -172.762 -173.974 -175.194 -176.439 -177.451 -178.469 -179.502 -180.293 -181.096 -181.896 -182.723 -183.582 -184.163 -184.749 -185.619 -186.215 -186.834 -187.147 -187.784 -188.427 -189.083 -189.421 -190.172 -190.434 -190.796 -191.179 -192.003 -192.439 -192.891 -193.376 -193.881 -194.447 -195.141 -196.383 -10 ,12471 ,KEBNE ,16748764,Tue Nov 30 11:17:18 CET,Tue Nov 30 13:14:03 CET,0.0 1.625 1.948 2.156 2.282 2.345 2.374 2.38 2.344 2.312 2.279 1.982 2.14 2.074 1.931 1.774 1.588 1.487 1.282 1.073 0.733 0.495 0.254 -0.119 -0.506 -0.902 -1.304 -1.719 -2.291 -2.86 -3.432 -4.183 -4.949 -5.721 -6.673 -7.792 -8.91 -10.194 -11.646 -13.296 -15.169 -17.436 -20.241 -23.25 -27.036 -31.583 -37.246 -44.291 -53.566 -66.094 -84.191 -102.645 -115.998 -126.328 -134.403 -141.051 -146.514 -151.116 -154.85 -158.413 -161.35 -163.854 -166.143 -168.233 -170.119 -171.798 -173.489 -174.921 -176.122 -177.339 -178.561 -179.536 -180.516 -181.514 -182.279 -183.062 -183.856 -184.66 -185.464 -186.009 -186.568 -187.408 -187.969 -188.542 -188.835 -189.432 -190.031 -190.626 -190.935 -191.662 -191.902 -192.238 -192.584 -193.333 -193.725 -194.135 -194.579 -195.072 -195.631 -196.3 -198.714 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt deleted file mode 100644 index 5f3489ff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24144 ,KEBNE ,16748765,Tue Nov 30 11:17:18 CET,Tue Nov 30 13:06:34 CET,0.0 0.831 1.172 1.471 1.73 1.944 2.135 2.326 2.728 2.892 3.026 2.85 3.374 3.493 3.731 3.961 4.165 4.264 4.481 4.69 4.963 5.132 5.295 5.521 5.747 5.97 6.178 6.388 6.654 6.911 7.163 7.452 7.721 7.987 8.305 8.686 9.053 9.442 9.857 10.301 10.757 11.261 11.86 12.461 13.129 13.873 14.751 15.668 16.679 17.796 18.966 19.706 19.956 20.0 19.925 19.773 19.56 19.318 19.116 18.899 18.693 18.485 18.264 18.041 17.824 17.627 17.407 17.192 17.01 16.817 16.604 16.444 16.275 16.089 15.937 15.776 15.614 15.457 15.301 15.188 15.072 14.884 14.757 14.621 14.536 14.357 14.196 14.023 13.926 13.43 13.619 13.51 13.396 13.149 13.026 12.897 12.748 12.561 12.357 12.08 11.658 -2 ,17312 ,KEBNE ,16748766,Tue Nov 30 11:22:21 CET,Tue Nov 30 13:22:00 CET,0.0 0.431 0.713 0.961 1.158 1.342 1.522 1.693 1.983 2.118 2.258 2.149 2.687 2.791 2.977 3.164 3.355 3.452 3.635 3.801 4.056 4.229 4.397 4.637 4.862 5.068 5.269 5.47 5.728 5.973 6.204 6.487 6.759 7.02 7.317 7.648 7.966 8.333 8.725 9.143 9.593 10.061 10.609 11.165 11.778 12.447 13.247 14.123 15.073 16.132 17.246 17.922 18.156 18.159 17.998 17.772 17.555 17.342 17.148 16.941 16.724 16.518 16.31 16.079 15.862 15.664 15.46 15.271 15.095 14.895 14.686 14.525 14.348 14.143 13.989 13.838 13.667 13.484 13.29 13.156 13.025 12.821 12.672 12.517 12.438 12.281 12.124 11.958 11.859 11.366 11.552 11.437 11.326 11.082 10.919 10.754 10.597 10.42 10.133 9.811 9.483 -3 ,11948 ,KEBNE ,16748767,Tue Nov 30 11:25:31 CET,Tue Nov 30 13:22:05 CET,0.0 0.575 0.898 1.122 1.318 1.495 1.658 1.819 2.107 2.236 2.362 2.174 2.714 2.839 3.07 3.295 3.497 3.595 3.796 3.986 4.249 4.415 4.583 4.829 5.058 5.275 5.482 5.677 5.926 6.168 6.396 6.67 6.939 7.2 7.515 7.869 8.202 8.574 8.972 9.377 9.812 10.313 10.872 11.427 12.115 12.879 13.687 14.548 15.521 16.633 17.808 18.482 18.733 18.758 18.63 18.435 18.205 17.963 17.746 17.508 17.282 17.078 16.875 16.674 16.479 16.289 16.082 15.884 15.697 15.504 15.311 15.149 14.973 14.783 14.631 14.459 14.281 14.106 13.918 13.788 13.655 13.448 13.298 13.143 13.066 12.898 12.72 12.532 12.441 11.947 12.172 12.074 11.948 11.67 11.537 11.393 11.223 11.054 10.874 10.615 10.018 -4 ,3934 ,KEBNE ,16748768,Tue Nov 30 11:25:30 CET,Tue Nov 30 13:22:34 CET,0.0 0.593 0.913 1.169 1.385 1.592 1.765 1.924 2.235 2.366 2.49 2.337 2.852 2.965 3.2 3.419 3.625 3.723 3.914 4.105 4.379 4.553 4.721 4.957 5.185 5.401 5.611 5.817 6.072 6.321 6.572 6.878 7.158 7.42 7.719 8.057 8.393 8.765 9.177 9.613 10.066 10.579 11.151 11.719 12.416 13.162 13.977 14.88 15.836 16.879 17.983 18.579 18.744 18.714 18.554 18.338 18.151 17.932 17.693 17.426 17.189 16.984 16.777 16.567 16.355 16.165 15.948 15.739 15.568 15.381 15.178 15.004 14.822 14.631 14.482 14.331 14.169 13.983 13.787 13.653 13.51 13.286 13.133 12.968 12.879 12.701 12.517 12.334 12.243 11.748 11.951 11.856 11.753 11.497 11.365 11.228 11.092 10.942 10.739 10.505 10.109 -5 ,14741 ,KEBNE ,16748769,Tue Nov 30 11:38:01 CET,Tue Nov 30 13:36:34 CET,0.0 0.767 1.05 1.287 1.5 1.685 1.845 1.986 2.261 2.408 2.549 2.38 2.907 3.029 3.256 3.469 3.677 3.779 3.977 4.161 4.414 4.575 4.746 5.003 5.247 5.479 5.691 5.898 6.171 6.434 6.671 6.959 7.241 7.504 7.814 8.192 8.567 8.959 9.365 9.784 10.239 10.748 11.335 11.933 12.589 13.279 14.059 14.922 15.915 17.002 18.085 18.7 18.868 18.867 18.778 18.613 18.353 18.066 17.809 17.511 17.238 16.991 16.76 16.545 16.337 16.121 15.89 15.675 15.481 15.276 15.06 14.883 14.693 14.484 14.32 14.164 14.005 13.831 13.652 13.521 13.381 13.173 13.028 12.872 12.782 12.605 12.418 12.202 12.098 11.586 11.747 11.632 11.503 11.209 11.06 10.917 10.762 10.57 10.297 9.93 9.363 -6 ,8817 ,KEBNE ,16748770,Tue Nov 30 11:45:21 CET,Tue Nov 30 13:39:43 CET,0.0 0.513 0.888 1.226 1.49 1.717 1.903 2.055 2.329 2.454 2.586 2.436 2.978 3.109 3.342 3.554 3.758 3.862 4.064 4.25 4.506 4.668 4.83 5.061 5.289 5.502 5.706 5.907 6.172 6.437 6.693 6.999 7.287 7.563 7.894 8.267 8.624 9.02 9.425 9.85 10.296 10.784 11.348 11.92 12.578 13.291 14.097 14.966 15.938 17.013 18.186 18.908 19.12 19.155 19.045 18.869 18.677 18.449 18.203 17.939 17.704 17.458 17.205 16.956 16.715 16.479 16.235 16.033 15.869 15.694 15.504 15.348 15.19 15.024 14.89 14.751 14.6 14.431 14.257 14.133 14.013 13.835 13.706 13.565 13.487 13.311 13.134 12.962 12.87 12.381 12.567 12.445 12.324 12.071 11.926 11.768 11.604 11.404 11.167 10.855 10.294 -7 ,16465 ,KEBNE ,16748771,Tue Nov 30 11:45:22 CET,Tue Nov 30 13:41:32 CET,0.0 0.541 0.812 1.041 1.273 1.475 1.665 1.825 2.102 2.247 2.379 2.203 2.732 2.847 3.067 3.268 3.469 3.568 3.751 3.92 4.171 4.346 4.521 4.776 5.005 5.217 5.424 5.629 5.89 6.142 6.376 6.649 6.924 7.191 7.493 7.857 8.225 8.606 9.011 9.427 9.847 10.319 10.876 11.427 12.062 12.77 13.578 14.464 15.439 16.505 17.532 18.114 18.334 18.333 18.234 18.089 17.888 17.663 17.443 17.208 16.979 16.761 16.551 16.334 16.12 15.931 15.738 15.556 15.398 15.227 15.038 14.877 14.709 14.527 14.379 14.225 14.072 13.922 13.764 13.654 13.545 13.367 13.226 13.079 13.01 12.868 12.718 12.559 12.475 11.992 12.229 12.144 12.046 11.792 11.649 11.502 11.353 11.195 11.027 10.845 10.481 -8 ,31145 ,KEBNE ,16748772,Tue Nov 30 11:46:27 CET,Tue Nov 30 13:40:10 CET,0.0 0.354 0.542 0.734 0.901 1.048 1.201 1.371 1.673 1.8 1.917 1.728 2.252 2.363 2.59 2.804 2.997 3.094 3.291 3.475 3.73 3.892 4.05 4.287 4.517 4.737 4.956 5.163 5.417 5.663 5.908 6.218 6.506 6.792 7.116 7.465 7.804 8.164 8.558 8.99 9.454 9.962 10.544 11.134 11.82 12.567 13.394 14.287 15.295 16.367 17.488 18.241 18.498 18.519 18.433 18.299 18.143 17.923 17.689 17.43 17.187 16.975 16.758 16.53 16.316 16.106 15.874 15.677 15.503 15.307 15.082 14.896 14.712 14.522 14.37 14.213 14.064 13.906 13.731 13.603 13.471 13.278 13.133 12.983 12.91 12.752 12.589 12.418 12.33 11.844 12.041 11.927 11.802 11.535 11.399 11.271 11.125 10.958 10.752 10.47 9.758 -10 ,24005 ,KEBNE ,16748774,Tue Nov 30 11:48:31 CET,Tue Nov 30 13:42:16 CET,0.0 0.792 1.083 1.314 1.532 1.728 1.908 2.065 2.337 2.481 2.629 2.52 3.08 3.215 3.454 3.677 3.891 3.993 4.214 4.43 4.717 4.899 5.066 5.304 5.542 5.77 5.994 6.216 6.482 6.73 6.976 7.284 7.587 7.88 8.226 8.623 8.992 9.391 9.834 10.295 10.749 11.238 11.793 12.345 13.011 13.743 14.553 15.506 16.539 17.583 18.664 19.264 19.394 19.315 19.163 18.947 18.71 18.46 18.212 17.935 17.671 17.437 17.215 17.0 16.788 16.592 16.371 16.16 15.976 15.782 15.576 15.397 15.2 14.99 14.835 14.679 14.511 14.334 14.152 14.019 13.887 13.686 13.545 13.398 13.318 13.148 12.986 12.835 12.756 12.27 12.504 12.415 12.301 12.02 11.893 11.79 11.669 11.506 11.33 11.065 10.512 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt deleted file mode 100644 index a92f87e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7241 ,KEBNE ,16748775,Tue Nov 30 11:49:33 CET,Tue Nov 30 13:51:10 CET,0.0 2.29 2.896 3.299 3.615 3.877 4.124 4.346 4.748 4.943 5.136 5.052 5.636 5.786 6.069 6.33 6.581 6.703 6.946 7.196 7.557 7.792 8.013 8.313 8.615 8.908 9.185 9.454 9.796 10.122 10.445 10.833 11.202 11.567 11.995 12.475 12.938 13.454 14.005 14.594 15.234 15.976 16.827 17.696 18.75 19.925 21.327 22.965 24.837 27.02 29.739 31.948 32.985 33.444 33.667 33.753 33.746 33.67 33.55 33.406 33.255 33.08 32.897 32.713 32.508 32.307 32.11 31.905 31.696 31.471 31.238 31.032 30.809 30.565 30.369 30.158 29.933 29.676 29.397 29.206 28.997 28.659 28.437 28.215 28.087 27.825 27.564 27.279 27.123 26.542 26.554 26.352 26.126 25.6 25.293 24.953 24.564 24.094 23.531 22.761 18.779 -3 ,7209 ,KEBNE ,16748777,Tue Nov 30 11:57:54 CET,Tue Nov 30 13:59:58 CET,0.0 4.337 5.012 5.442 5.792 6.123 6.416 6.669 7.131 7.343 7.545 7.472 8.077 8.235 8.526 8.809 9.094 9.231 9.507 9.767 10.137 10.374 10.595 10.925 11.252 11.571 11.873 12.162 12.522 12.866 13.204 13.606 14.002 14.381 14.831 15.357 15.867 16.447 17.079 17.739 18.435 19.214 20.161 21.122 22.185 23.398 24.808 26.433 28.396 30.734 33.599 35.997 37.393 38.216 38.683 38.946 39.063 39.084 39.044 38.961 38.843 38.734 38.628 38.498 38.369 38.241 38.067 37.877 37.706 37.54 37.358 37.184 36.989 36.777 36.607 36.424 36.229 36.016 35.786 35.629 35.468 35.207 35.018 34.821 34.716 34.487 34.225 33.936 33.794 33.238 33.312 33.138 32.95 32.502 32.235 31.916 31.564 31.171 30.668 29.958 27.5 -4 ,24075 ,KEBNE ,16748778,Tue Nov 30 12:01:06 CET,Tue Nov 30 14:04:04 CET,0.0 1.682 2.225 2.631 2.959 3.243 3.507 3.755 4.182 4.363 4.537 4.428 5.018 5.168 5.466 5.745 6.001 6.123 6.37 6.61 6.962 7.192 7.406 7.718 8.023 8.313 8.584 8.848 9.19 9.515 9.844 10.249 10.623 10.983 11.394 11.852 12.32 12.831 13.377 13.981 14.641 15.397 16.256 17.122 18.147 19.301 20.664 22.266 24.167 26.47 29.381 31.692 33.031 33.885 34.358 34.598 34.686 34.662 34.553 34.372 34.177 33.967 33.722 33.498 33.284 33.067 32.818 32.591 32.39 32.178 31.962 31.777 31.58 31.371 31.214 31.042 30.853 30.635 30.379 30.2 30.009 29.7 29.47 29.236 29.119 28.883 28.645 28.356 28.186 27.596 27.61 27.404 27.172 26.65 26.36 26.032 25.642 25.218 24.659 23.869 20.79 -5 ,14582 ,KEBNE ,16748779,Tue Nov 30 12:05:15 CET,Tue Nov 30 14:05:33 CET,0.0 2.54 3.166 3.578 3.923 4.224 4.479 4.706 5.135 5.342 5.536 5.45 6.054 6.212 6.51 6.787 7.044 7.17 7.419 7.662 8.007 8.225 8.437 8.734 9.031 9.322 9.597 9.861 10.208 10.542 10.862 11.246 11.616 11.987 12.426 12.921 13.404 13.926 14.496 15.144 15.829 16.593 17.489 18.415 19.515 20.728 22.135 23.691 25.509 27.709 30.254 32.236 33.408 34.066 34.38 34.472 34.438 34.341 34.133 33.882 33.645 33.388 33.117 32.851 32.596 32.361 32.121 31.896 31.686 31.469 31.25 31.045 30.807 30.562 30.375 30.195 29.995 29.754 29.487 29.296 29.074 28.699 28.446 28.18 28.047 27.774 27.475 27.163 26.996 26.409 26.441 26.209 25.965 25.433 25.133 24.831 24.485 24.043 23.471 22.633 18.234 -7 ,27175 ,KEBNE ,16748781,Tue Nov 30 12:08:27 CET,Tue Nov 30 14:10:56 CET,0.0 2.638 3.292 3.752 4.14 4.477 4.777 5.038 5.495 5.689 5.878 5.802 6.42 6.58 6.886 7.184 7.466 7.6 7.859 8.113 8.478 8.717 8.948 9.262 9.566 9.854 10.128 10.396 10.754 11.104 11.428 11.809 12.186 12.553 12.973 13.466 13.955 14.493 15.081 15.708 16.359 17.091 17.961 18.851 19.909 21.088 22.464 24.058 25.891 28.066 30.816 33.06 34.233 34.847 35.177 35.314 35.325 35.292 35.217 35.097 34.959 34.8 34.607 34.404 34.19 33.972 33.702 33.425 33.209 32.994 32.746 32.535 32.295 32.023 31.83 31.629 31.402 31.166 30.889 30.687 30.497 30.201 29.991 29.758 29.636 29.38 29.06 28.716 28.549 27.97 27.998 27.778 27.527 26.992 26.692 26.38 26.045 25.611 25.063 24.308 21.308 -8 ,16376 ,KEBNE ,16748782,Tue Nov 30 12:09:25 CET,Tue Nov 30 14:09:55 CET,0.0 4.406 5.01 5.457 5.798 6.085 6.362 6.63 7.093 7.3 7.506 7.426 8.03 8.193 8.52 8.833 9.132 9.272 9.533 9.783 10.133 10.361 10.582 10.894 11.194 11.49 11.78 12.059 12.409 12.747 13.084 13.495 13.902 14.287 14.73 15.243 15.719 16.243 16.815 17.417 18.056 18.802 19.693 20.601 21.677 22.896 24.284 25.86 27.821 30.202 33.11 35.423 36.661 37.391 37.809 38.023 38.09 38.073 37.986 37.819 37.623 37.443 37.267 37.08 36.888 36.668 36.435 36.239 36.07 35.873 35.643 35.443 35.221 34.985 34.792 34.59 34.362 34.103 33.843 33.671 33.466 33.126 32.894 32.642 32.509 32.232 31.946 31.628 31.452 30.857 30.884 30.671 30.453 29.933 29.618 29.276 28.895 28.467 27.925 27.172 24.21 -9 ,31097 ,KEBNE ,16748783,Tue Nov 30 12:09:26 CET,Tue Nov 30 14:14:30 CET,0.0 2.46 3.029 3.435 3.761 4.039 4.292 4.515 4.937 5.137 5.327 5.241 5.845 6.005 6.314 6.609 6.892 7.024 7.284 7.548 7.92 8.155 8.387 8.715 9.03 9.333 9.61 9.874 10.22 10.555 10.897 11.326 11.734 12.137 12.624 13.153 13.642 14.189 14.764 15.39 16.079 16.811 17.642 18.516 19.592 20.795 22.145 23.681 25.528 27.843 30.614 32.846 34.049 34.749 35.177 35.368 35.378 35.317 35.242 35.11 34.938 34.741 34.514 34.296 34.078 33.86 33.641 33.441 33.25 33.035 32.806 32.601 32.377 32.153 31.975 31.786 31.573 31.313 31.031 30.835 30.645 30.332 30.112 29.911 29.801 29.57 29.314 29.0 28.841 28.26 28.27 28.059 27.843 27.377 27.104 26.785 26.412 25.968 25.403 24.596 20.328 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt deleted file mode 100644 index 0b1478a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,31333 ,KEBNE ,16748786,Tue Nov 30 12:16:43 CET,Tue Nov 30 14:17:08 CET,0.0 2.765 3.333 3.711 4.005 4.248 4.467 4.665 5.025 5.194 5.343 5.169 5.739 5.86 6.08 6.288 6.483 6.576 6.751 6.915 7.153 7.29 7.424 7.623 7.804 7.981 8.157 8.314 8.513 8.715 8.906 9.127 9.329 9.52 9.734 9.961 10.161 10.388 10.635 10.898 11.163 11.421 11.688 11.934 12.194 12.401 12.564 12.688 12.69 12.41 11.579 10.287 9.027 7.883 6.865 5.907 5.004 4.137 3.37 2.594 1.93 1.344 0.771 0.235 -0.249 -0.673 -1.087 -1.456 -1.788 -2.152 -2.558 -2.905 -3.267 -3.631 -3.903 -4.189 -4.496 -4.816 -5.159 -5.399 -5.637 -6.028 -6.306 -6.591 -6.742 -7.07 -7.402 -7.746 -7.929 -8.575 -8.546 -8.773 -9.013 -9.557 -9.858 -10.168 -10.531 -10.955 -11.457 -12.208 -15.604 -3 ,3199 ,KEBNE ,16748787,Tue Nov 30 12:16:43 CET,Tue Nov 30 14:18:17 CET,0.0 2.782 3.369 3.783 4.105 4.37 4.595 4.8 5.155 5.306 5.438 5.251 5.817 5.936 6.17 6.376 6.557 6.648 6.821 6.978 7.199 7.343 7.478 7.663 7.844 8.029 8.212 8.374 8.585 8.779 8.964 9.179 9.371 9.561 9.764 9.996 10.219 10.432 10.668 10.905 11.115 11.346 11.588 11.805 12.022 12.257 12.526 12.675 12.615 12.357 11.717 10.65 9.549 8.464 7.48 6.589 5.81 5.08 4.426 3.77 3.185 2.649 2.158 1.699 1.251 0.831 0.392 -0.006 -0.357 -0.715 -1.069 -1.368 -1.685 -2.013 -2.267 -2.531 -2.816 -3.122 -3.444 -3.678 -3.929 -4.303 -4.563 -4.854 -5.002 -5.324 -5.673 -6.029 -6.221 -6.867 -6.842 -7.072 -7.316 -7.864 -8.188 -8.547 -8.931 -9.417 -10.015 -10.865 -15.367 -4 ,1499 ,KEBNE ,16748788,Tue Nov 30 12:17:46 CET,Tue Nov 30 14:21:02 CET,0.0 3.168 3.784 4.175 4.491 4.764 4.999 5.192 5.527 5.692 5.849 5.697 6.264 6.384 6.602 6.804 6.99 7.083 7.259 7.426 7.657 7.795 7.931 8.135 8.318 8.503 8.69 8.857 9.065 9.247 9.414 9.625 9.826 10.012 10.216 10.45 10.681 10.927 11.213 11.528 11.855 12.19 12.488 12.729 12.987 13.21 13.39 13.523 13.556 13.365 12.557 11.112 9.721 8.553 7.547 6.569 5.713 4.991 4.343 3.642 3.036 2.506 1.991 1.485 0.995 0.541 0.052 -0.395 -0.77 -1.165 -1.599 -1.982 -2.385 -2.788 -3.089 -3.404 -3.725 -4.066 -4.445 -4.688 -4.927 -5.32 -5.594 -5.888 -6.045 -6.362 -6.688 -7.038 -7.241 -7.899 -7.884 -8.113 -8.341 -8.864 -9.15 -9.441 -9.802 -10.248 -10.8 -11.589 -16.791 -6 ,16571 ,KEBNE ,16748790,Tue Nov 30 12:19:51 CET,Tue Nov 30 14:25:10 CET,0.0 2.768 3.305 3.68 3.982 4.224 4.448 4.659 5.025 5.193 5.35 5.19 5.754 5.868 6.085 6.301 6.491 6.577 6.749 6.915 7.143 7.28 7.41 7.594 7.77 7.945 8.113 8.265 8.454 8.629 8.796 8.977 9.133 9.288 9.47 9.674 9.865 10.055 10.251 10.468 10.686 10.886 11.086 11.295 11.526 11.695 11.799 11.824 11.809 11.609 10.9 9.627 8.302 7.162 6.198 5.31 4.5 3.738 3.026 2.282 1.639 1.053 0.486 -0.039 -0.522 -0.95 -1.376 -1.765 -2.124 -2.52 -2.923 -3.26 -3.622 -3.986 -4.257 -4.521 -4.804 -5.115 -5.446 -5.683 -5.937 -6.33 -6.598 -6.867 -7.007 -7.308 -7.63 -7.982 -8.167 -8.809 -8.782 -9.002 -9.227 -9.767 -10.062 -10.386 -10.756 -11.197 -11.737 -12.478 -15.482 -7 ,20077 ,KEBNE ,16748791,Tue Nov 30 12:19:55 CET,Tue Nov 30 14:18:16 CET,0.0 2.348 2.904 3.263 3.55 3.796 4.017 4.221 4.58 4.734 4.878 4.717 5.29 5.409 5.636 5.845 6.026 6.11 6.269 6.427 6.66 6.798 6.925 7.113 7.298 7.464 7.614 7.763 7.945 8.114 8.281 8.492 8.691 8.873 9.076 9.276 9.468 9.675 9.887 10.105 10.346 10.592 10.811 11.003 11.198 11.404 11.56 11.631 11.603 11.318 10.483 9.195 8.026 6.933 5.929 5.007 4.169 3.378 2.694 2.004 1.388 0.844 0.341 -0.136 -0.604 -1.067 -1.562 -1.996 -2.368 -2.744 -3.146 -3.496 -3.866 -4.254 -4.546 -4.822 -5.101 -5.408 -5.738 -5.96 -6.185 -6.56 -6.83 -7.112 -7.268 -7.59 -7.918 -8.282 -8.474 -9.133 -9.102 -9.319 -9.553 -10.085 -10.384 -10.717 -11.106 -11.548 -12.071 -12.858 -18.296 -9 ,29729 ,KEBNE ,16748793,Tue Nov 30 12:25:03 CET,Tue Nov 30 14:27:01 CET,0.0 2.461 3.08 3.464 3.754 4.015 4.245 4.448 4.8 4.955 5.106 4.944 5.499 5.612 5.825 6.021 6.201 6.291 6.463 6.619 6.836 6.972 7.104 7.3 7.473 7.621 7.762 7.902 8.087 8.265 8.435 8.64 8.831 9.003 9.2 9.409 9.611 9.851 10.125 10.39 10.602 10.834 11.103 11.372 11.651 11.874 12.076 12.233 12.287 12.115 11.313 10.044 8.913 7.86 6.895 5.974 5.156 4.405 3.727 3.064 2.493 1.963 1.458 0.97 0.515 0.096 -0.34 -0.737 -1.09 -1.462 -1.847 -2.151 -2.496 -2.866 -3.146 -3.449 -3.779 -4.133 -4.503 -4.746 -5.009 -5.441 -5.736 -6.047 -6.209 -6.545 -6.904 -7.275 -7.47 -8.142 -8.155 -8.41 -8.664 -9.201 -9.515 -9.866 -10.266 -10.716 -11.27 -12.076 -15.496 -10 ,630 ,KEBNE ,16748794,Tue Nov 30 12:25:03 CET,Tue Nov 30 14:28:21 CET,0.0 2.254 2.827 3.218 3.539 3.826 4.069 4.285 4.668 4.832 4.993 4.86 5.442 5.567 5.811 6.05 6.269 6.37 6.562 6.745 7.007 7.173 7.328 7.547 7.752 7.952 8.133 8.299 8.506 8.699 8.889 9.095 9.278 9.459 9.676 9.923 10.151 10.392 10.649 10.908 11.152 11.408 11.676 11.943 12.262 12.547 12.73 12.858 12.816 12.333 11.206 9.507 7.975 6.67 5.569 4.653 3.895 3.147 2.46 1.781 1.204 0.696 0.209 -0.255 -0.706 -1.122 -1.579 -1.998 -2.339 -2.703 -3.087 -3.404 -3.733 -4.06 -4.31 -4.585 -4.879 -5.174 -5.492 -5.731 -5.977 -6.353 -6.663 -7.015 -7.197 -7.583 -8.002 -8.441 -8.663 -9.358 -9.396 -9.654 -9.929 -10.545 -10.92 -11.321 -11.764 -12.328 -13.041 -13.984 -18.576 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 8ff1d2e3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14928 ,KEBNE ,16748795,Tue Nov 30 12:25:03 CET,Tue Nov 30 14:25:45 CET,0.0 2.35 2.937 3.351 3.677 3.965 4.215 4.441 4.877 5.079 5.259 5.163 5.785 5.943 6.241 6.531 6.821 6.967 7.252 7.52 7.888 8.134 8.382 8.735 9.073 9.396 9.724 10.043 10.441 10.829 11.206 11.665 12.11 12.545 13.058 13.629 14.177 14.789 15.476 16.231 17.032 17.922 18.965 20.049 21.337 22.82 24.583 26.648 29.173 32.313 36.382 40.017 42.293 43.782 44.743 45.387 45.839 46.171 46.393 46.571 46.716 46.834 46.916 46.963 46.983 46.998 46.997 46.968 46.914 46.846 46.776 46.713 46.646 46.545 46.457 46.371 46.272 46.163 46.044 45.964 45.885 45.75 45.643 45.533 45.473 45.332 45.186 45.022 44.925 44.404 44.598 44.487 44.365 44.076 43.9 43.696 43.461 43.191 42.856 42.373 40.89 -2 ,17466 ,KEBNE ,16748796,Tue Nov 30 12:25:03 CET,Tue Nov 30 14:26:57 CET,0.0 2.276 2.786 3.159 3.471 3.74 3.982 4.226 4.664 4.855 5.045 4.956 5.577 5.739 6.054 6.333 6.596 6.733 7.017 7.288 7.65 7.878 8.102 8.431 8.766 9.086 9.387 9.688 10.075 10.453 10.828 11.285 11.722 12.142 12.633 13.197 13.743 14.339 15.0 15.729 16.498 17.375 18.417 19.489 20.771 22.247 23.99 26.006 28.471 31.507 35.394 38.829 40.984 42.449 43.494 44.264 44.803 45.216 45.54 45.802 45.967 46.065 46.139 46.191 46.233 46.262 46.26 46.232 46.193 46.158 46.123 46.082 46.022 45.946 45.894 45.833 45.753 45.66 45.557 45.482 45.392 45.252 45.161 45.056 45.002 44.88 44.736 44.58 44.495 43.999 44.194 44.079 43.95 43.659 43.494 43.285 43.028 42.724 42.352 41.835 39.664 -4 ,6703 ,KEBNE ,16748798,Tue Nov 30 12:25:03 CET,Tue Nov 30 14:25:36 CET,0.0 2.118 2.667 3.047 3.36 3.642 3.899 4.144 4.571 4.764 4.956 4.859 5.482 5.647 5.962 6.259 6.541 6.682 6.95 7.202 7.583 7.832 8.059 8.385 8.715 9.046 9.364 9.665 10.05 10.42 10.777 11.236 11.696 12.121 12.616 13.185 13.745 14.388 15.094 15.833 16.615 17.51 18.562 19.666 20.976 22.435 24.177 26.222 28.688 31.614 35.288 38.554 40.593 41.854 42.694 43.394 43.934 44.36 44.659 44.882 45.035 45.143 45.214 45.246 45.247 45.233 45.221 45.189 45.127 45.043 44.942 44.873 44.798 44.702 44.629 44.55 44.46 44.348 44.222 44.129 44.035 43.912 43.819 43.708 43.65 43.521 43.376 43.217 43.128 42.626 42.848 42.742 42.613 42.314 42.145 41.942 41.698 41.42 41.079 40.542 38.759 -5 ,6984 ,KEBNE ,16748799,Tue Nov 30 12:25:03 CET,Tue Nov 30 14:28:31 CET,0.0 1.653 2.218 2.652 3.011 3.307 3.563 3.809 4.244 4.43 4.618 4.549 5.173 5.337 5.665 5.97 6.252 6.393 6.671 6.941 7.326 7.578 7.825 8.18 8.53 8.861 9.185 9.503 9.898 10.283 10.665 11.146 11.605 12.043 12.573 13.162 13.71 14.329 15.02 15.76 16.532 17.419 18.469 19.566 20.906 22.415 24.188 26.284 28.803 31.853 35.798 39.341 41.515 42.914 43.878 44.523 44.992 45.378 45.64 45.849 45.997 46.091 46.136 46.163 46.157 46.135 46.106 46.052 46.004 45.964 45.923 45.873 45.788 45.708 45.658 45.587 45.507 45.418 45.309 45.228 45.145 44.988 44.85 44.71 44.642 44.493 44.335 44.173 44.084 43.568 43.762 43.632 43.498 43.216 43.045 42.837 42.605 42.342 42.018 41.5 39.219 -7 ,20128 ,KEBNE ,16748801,Tue Nov 30 12:25:03 CET,Tue Nov 30 14:27:47 CET,0.0 1.805 2.368 2.816 3.181 3.471 3.733 3.963 4.389 4.587 4.771 4.674 5.303 5.479 5.808 6.114 6.406 6.552 6.834 7.111 7.503 7.742 7.977 8.323 8.663 8.993 9.305 9.615 10.031 10.431 10.809 11.275 11.74 12.195 12.725 13.329 13.901 14.519 15.201 15.943 16.737 17.64 18.73 19.848 21.172 22.681 24.497 26.599 29.183 32.459 36.675 40.385 42.595 44.022 44.997 45.721 46.277 46.683 46.954 47.16 47.278 47.362 47.421 47.429 47.402 47.371 47.329 47.289 47.26 47.217 47.144 47.066 46.99 46.907 46.829 46.74 46.644 46.549 46.464 46.405 46.316 46.154 46.053 45.937 45.87 45.732 45.565 45.382 45.289 44.774 44.98 44.862 44.73 44.419 44.242 44.03 43.779 43.518 43.192 42.676 40.883 -8 ,10190 ,KEBNE ,16748802,Tue Nov 30 12:25:03 CET,Tue Nov 30 14:27:32 CET,0.0 2.39 2.892 3.256 3.558 3.825 4.069 4.309 4.748 4.934 5.101 4.982 5.612 5.773 6.082 6.368 6.647 6.792 7.069 7.329 7.702 7.944 8.185 8.529 8.856 9.173 9.487 9.786 10.171 10.555 10.932 11.395 11.854 12.292 12.798 13.38 13.949 14.591 15.279 16.011 16.815 17.737 18.871 20.04 21.397 22.936 24.737 26.833 29.336 32.417 36.34 39.825 42.114 43.673 44.72 45.49 46.056 46.438 46.694 46.908 47.054 47.156 47.228 47.284 47.325 47.341 47.331 47.296 47.238 47.143 47.046 46.948 46.835 46.708 46.591 46.478 46.364 46.228 46.097 46.017 45.921 45.773 45.667 45.543 45.474 45.324 45.17 44.993 44.901 44.396 44.601 44.478 44.335 44.035 43.869 43.664 43.422 43.137 42.784 42.272 40.11 -9 ,11149 ,KEBNE ,16748803,Tue Nov 30 12:25:03 CET,Tue Nov 30 14:26:04 CET,0.0 1.64 2.197 2.628 2.978 3.277 3.541 3.775 4.2 4.405 4.597 4.491 5.112 5.276 5.594 5.896 6.191 6.331 6.604 6.866 7.256 7.508 7.746 8.097 8.432 8.751 9.067 9.378 9.778 10.162 10.539 11.002 11.447 11.877 12.37 12.935 13.501 14.133 14.812 15.546 16.356 17.28 18.362 19.453 20.749 22.251 24.071 26.208 28.721 31.855 36.033 39.735 42.006 43.515 44.547 45.272 45.8 46.213 46.483 46.66 46.741 46.81 46.889 46.948 46.962 46.945 46.923 46.904 46.892 46.872 46.82 46.749 46.67 46.566 46.488 46.427 46.347 46.244 46.119 46.032 45.945 45.802 45.697 45.577 45.509 45.361 45.198 45.019 44.931 44.418 44.574 44.442 44.315 44.023 43.851 43.657 43.427 43.148 42.798 42.259 40.607 -10 ,32270 ,KEBNE ,16748804,Tue Nov 30 12:27:07 CET,Tue Nov 30 14:30:39 CET,0.0 1.974 2.55 2.981 3.344 3.657 3.931 4.186 4.63 4.831 5.033 4.954 5.584 5.751 6.067 6.37 6.655 6.792 7.058 7.319 7.712 7.967 8.21 8.554 8.894 9.244 9.58 9.892 10.28 10.66 11.045 11.497 11.928 12.353 12.859 13.446 14.027 14.68 15.384 16.126 16.912 17.837 18.963 20.087 21.412 22.935 24.671 26.683 29.268 32.496 36.536 40.138 42.467 44.05 45.114 45.934 46.568 47.055 47.391 47.631 47.784 47.867 47.92 47.966 47.979 47.977 47.962 47.935 47.911 47.87 47.824 47.79 47.732 47.656 47.585 47.495 47.403 47.303 47.19 47.105 47.013 46.865 46.759 46.642 46.582 46.454 46.292 46.098 45.994 45.486 45.673 45.539 45.397 45.096 44.912 44.684 44.446 44.197 43.87 43.358 41.529 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt deleted file mode 100644 index e7439ce4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21719 ,KEBNE ,17028101,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:12:51 CET,0.0 2.06 2.631 3.033 3.368 3.671 3.951 4.201 4.675 4.901 5.11 5.049 5.698 5.886 6.244 6.566 6.863 7.01 7.308 7.591 7.999 8.258 8.509 8.889 9.265 9.63 9.976 10.321 10.76 11.169 11.582 12.097 12.585 13.058 13.614 14.248 14.858 15.541 16.285 17.06 17.904 18.9 20.073 21.287 22.749 24.436 26.394 28.594 31.297 34.64 38.928 42.623 44.916 46.558 47.713 48.554 49.148 49.515 49.74 49.942 50.089 50.178 50.224 50.239 50.23 50.207 50.182 50.155 50.116 50.068 50.02 49.979 49.923 49.854 49.792 49.725 49.647 49.545 49.43 49.353 49.275 49.125 48.997 48.875 48.816 48.695 48.55 48.376 48.285 47.785 47.968 47.845 47.713 47.413 47.232 47.03 46.799 46.523 46.173 45.645 43.445 -2 ,15542 ,KEBNE ,17028102,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:13:03 CET,0.0 2.272 2.857 3.253 3.579 3.877 4.167 4.429 4.875 5.075 5.27 5.194 5.828 5.998 6.306 6.601 6.879 7.02 7.3 7.564 7.945 8.199 8.455 8.829 9.176 9.52 9.861 10.182 10.596 10.998 11.393 11.866 12.334 12.811 13.365 13.972 14.569 15.243 15.975 16.769 17.605 18.551 19.691 20.849 22.234 23.844 25.75 28.014 30.767 34.114 38.395 42.175 44.535 46.086 47.121 47.89 48.473 48.936 49.268 49.544 49.758 49.895 49.987 50.049 50.072 50.066 50.043 50.019 49.98 49.926 49.869 49.805 49.731 49.655 49.589 49.51 49.415 49.311 49.194 49.102 49.011 48.894 48.804 48.682 48.617 48.492 48.344 48.166 48.068 47.56 47.738 47.607 47.454 47.111 46.929 46.733 46.502 46.219 45.866 45.326 42.124 -3 ,9828 ,KEBNE ,17028104,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:13:32 CET,0.0 1.285 1.812 2.223 2.591 2.935 3.235 3.509 4.001 4.226 4.441 4.388 5.026 5.214 5.582 5.926 6.256 6.412 6.703 6.982 7.395 7.663 7.927 8.323 8.696 9.051 9.405 9.734 10.135 10.533 10.939 11.432 11.908 12.375 12.921 13.537 14.12 14.759 15.477 16.262 17.108 18.084 19.239 20.439 21.853 23.463 25.397 27.629 30.378 33.869 38.359 42.406 45.066 46.936 48.214 49.147 49.841 50.403 50.789 51.082 51.302 51.457 51.57 51.667 51.755 51.812 51.841 51.85 51.834 51.776 51.699 51.644 51.591 51.52 51.452 51.367 51.262 51.149 51.02 50.917 50.811 50.635 50.503 50.352 50.269 50.106 49.941 49.758 49.66 49.159 49.336 49.2 49.047 48.701 48.49 48.245 47.952 47.614 47.238 46.693 45.192 -4 ,25861 ,KEBNE ,17028105,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:12:25 CET,0.0 2.488 3.094 3.493 3.863 4.198 4.468 4.709 5.145 5.357 5.573 5.511 6.144 6.318 6.649 6.97 7.28 7.43 7.714 7.981 8.368 8.621 8.878 9.254 9.624 9.996 10.349 10.684 11.117 11.529 11.923 12.397 12.858 13.322 13.869 14.489 15.101 15.788 16.54 17.353 18.216 19.19 20.313 21.48 22.904 24.524 26.441 28.666 31.383 34.744 39.034 42.841 45.227 46.795 47.845 48.6 49.134 49.517 49.815 50.058 50.195 50.262 50.325 50.376 50.386 50.388 50.37 50.331 50.284 50.236 50.18 50.128 50.066 49.976 49.898 49.819 49.742 49.659 49.543 49.455 49.356 49.179 49.05 48.91 48.837 48.679 48.515 48.336 48.237 47.726 47.921 47.797 47.644 47.275 47.066 46.845 46.606 46.316 45.921 45.34 42.77 -5 ,30698 ,KEBNE ,17028106,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:13:18 CET,0.0 1.78 2.338 2.772 3.138 3.469 3.774 4.048 4.515 4.723 4.926 4.877 5.53 5.708 6.047 6.372 6.677 6.826 7.116 7.397 7.802 8.062 8.321 8.695 9.047 9.385 9.706 10.022 10.436 10.851 11.255 11.733 12.204 12.682 13.246 13.879 14.482 15.139 15.892 16.716 17.582 18.571 19.752 20.98 22.449 24.131 26.103 28.385 31.142 34.516 38.909 42.814 45.281 46.977 48.172 49.083 49.739 50.213 50.559 50.871 51.106 51.261 51.355 51.417 51.471 51.501 51.517 51.52 51.498 51.458 51.401 51.346 51.291 51.231 51.178 51.112 51.022 50.932 50.836 50.755 50.668 50.544 50.453 50.345 50.291 50.167 50.024 49.874 49.794 49.311 49.517 49.409 49.284 48.959 48.772 48.56 48.325 48.05 47.698 47.201 44.798 -6 ,18371 ,KEBNE ,17028107,Wed Dec 22 19:12:20 CET,Wed Dec 22 21:13:28 CET,0.0 2.49 3.175 3.687 4.118 4.468 4.776 5.065 5.596 5.827 6.051 6.036 6.689 6.875 7.226 7.567 7.9 8.055 8.343 8.621 9.039 9.305 9.563 9.933 10.29 10.636 10.969 11.298 11.726 12.147 12.557 13.052 13.532 13.982 14.496 15.098 15.708 16.399 17.135 17.897 18.726 19.711 20.881 22.062 23.442 25.015 26.938 29.212 32.009 35.435 39.785 43.575 45.875 47.451 48.582 49.392 49.983 50.419 50.653 50.82 50.973 51.095 51.182 51.226 51.217 51.194 51.173 51.122 51.071 51.034 50.974 50.912 50.852 50.773 50.706 50.634 50.547 50.447 50.329 50.247 50.16 50.008 49.899 49.768 49.695 49.544 49.384 49.206 49.113 48.595 48.785 48.66 48.519 48.203 48.028 47.844 47.62 47.338 46.961 46.369 44.117 -7 ,11119 ,KEBNE ,17028108,Wed Dec 22 19:12:20 CET,Wed Dec 22 21:12:53 CET,0.0 2.146 2.726 3.13 3.486 3.803 4.074 4.316 4.75 4.954 5.155 5.101 5.744 5.934 6.305 6.653 6.977 7.126 7.406 7.687 8.087 8.342 8.598 8.972 9.33 9.681 10.02 10.351 10.783 11.19 11.59 12.097 12.586 13.06 13.619 14.246 14.854 15.531 16.291 17.109 17.956 18.923 20.036 21.152 22.502 24.059 25.909 28.054 30.665 33.938 38.17 41.845 44.045 45.509 46.566 47.347 47.876 48.266 48.549 48.773 48.918 49.026 49.126 49.181 49.215 49.246 49.256 49.262 49.25 49.215 49.164 49.114 49.068 49.017 48.955 48.871 48.792 48.705 48.616 48.542 48.454 48.311 48.187 48.031 47.957 47.807 47.619 47.416 47.307 46.785 46.919 46.763 46.593 46.184 45.942 45.643 45.301 44.887 44.375 43.59 41.505 -8 ,24131 ,KEBNE ,17028109,Wed Dec 22 19:12:23 CET,Wed Dec 22 21:05:55 CET,0.0 2.58 3.192 3.599 3.943 4.272 4.581 4.854 5.357 5.586 5.798 5.717 6.358 6.532 6.87 7.196 7.513 7.664 7.941 8.207 8.612 8.88 9.134 9.505 9.862 10.212 10.561 10.886 11.316 11.749 12.156 12.655 13.138 13.6 14.151 14.782 15.39 16.07 16.818 17.616 18.441 19.4 20.561 21.714 23.089 24.686 26.584 28.787 31.493 34.968 39.385 43.232 45.727 47.44 48.58 49.38 50.005 50.507 50.834 51.117 51.326 51.45 51.552 51.612 51.626 51.638 51.634 51.603 51.561 51.513 51.457 51.387 51.315 51.237 51.152 51.064 50.966 50.858 50.757 50.677 50.584 50.424 50.31 50.198 50.13 49.996 49.866 49.681 49.573 49.066 49.252 49.131 48.992 48.648 48.453 48.236 47.992 47.69 47.317 46.797 44.511 -9 ,16424 ,KEBNE ,17028110,Wed Dec 22 19:13:26 CET,Wed Dec 22 21:11:02 CET,0.0 1.928 2.466 2.865 3.219 3.529 3.793 4.034 4.481 4.691 4.888 4.818 5.447 5.623 5.961 6.267 6.565 6.718 7.007 7.276 7.679 7.94 8.198 8.572 8.928 9.284 9.624 9.945 10.358 10.768 11.168 11.653 12.123 12.583 13.131 13.773 14.402 15.092 15.828 16.63 17.507 18.49 19.662 20.867 22.256 23.841 25.752 27.989 30.738 34.113 38.482 42.497 45.042 46.707 47.845 48.674 49.242 49.678 50.013 50.283 50.467 50.581 50.648 50.696 50.733 50.762 50.758 50.724 50.681 50.619 50.559 50.507 50.445 50.377 50.319 50.244 50.154 50.061 49.951 49.868 49.79 49.671 49.565 49.438 49.373 49.23 49.086 48.932 48.848 48.344 48.526 48.395 48.26 47.958 47.778 47.571 47.311 47.026 46.646 45.985 42.999 -10 ,12732 ,KEBNE ,17028111,Wed Dec 22 19:12:23 CET,Wed Dec 22 21:06:29 CET,0.0 2.489 3.115 3.574 3.928 4.237 4.524 4.791 5.25 5.451 5.657 5.587 6.212 6.388 6.732 7.05 7.363 7.514 7.8 8.083 8.496 8.756 9.012 9.395 9.772 10.125 10.461 10.794 11.219 11.615 12.02 12.533 13.036 13.536 14.113 14.758 15.38 16.055 16.782 17.566 18.432 19.441 20.639 21.868 23.33 24.995 26.982 29.291 32.052 35.453 39.725 43.592 46.107 47.844 49.095 50.033 50.685 51.153 51.477 51.706 51.89 52.029 52.105 52.129 52.149 52.167 52.146 52.128 52.106 52.073 52.023 51.969 51.906 51.822 51.758 51.697 51.617 51.504 51.386 51.317 51.241 51.105 51.007 50.892 50.826 50.688 50.546 50.378 50.273 49.763 49.961 49.848 49.721 49.433 49.269 49.076 48.851 48.563 48.178 47.63 45.137 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt deleted file mode 100644 index d7dcf53d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,23583 ,KEBNE ,16748806,Tue Nov 30 12:33:22 CET,Tue Nov 30 14:32:02 CET,0.0 2.135 2.605 2.897 3.125 3.329 3.513 3.681 3.986 4.124 4.259 4.446 4.611 4.715 4.897 5.069 5.248 5.334 5.486 5.63 5.844 5.98 6.113 6.292 6.457 6.617 6.763 6.903 7.086 7.263 7.441 7.647 7.825 7.991 8.198 8.437 8.637 8.844 9.088 9.34 9.593 9.879 10.158 10.398 10.686 10.941 11.161 11.386 11.506 11.417 10.898 9.818 8.611 7.408 6.321 5.245 4.129 3.08 2.159 1.235 0.465 -0.243 -0.948 -1.651 -2.337 -2.945 -3.533 -4.026 -4.461 -4.92 -5.386 -5.77 -6.171 -6.604 -6.963 -7.347 -7.757 -8.169 -8.579 -8.867 -9.157 -9.594 -9.901 -10.239 -10.409 -10.747 -11.103 -11.476 -11.68 -11.985 -12.42 -12.696 -12.975 -13.605 -13.934 -14.291 -14.687 -15.13 -15.688 -16.463 -19.535 -3 ,25275 ,KEBNE ,16748807,Tue Nov 30 12:33:22 CET,Tue Nov 30 14:31:20 CET,0.0 2.113 2.619 2.99 3.29 3.528 3.733 3.928 4.281 4.431 4.573 4.774 4.955 5.072 5.292 5.506 5.709 5.798 5.966 6.138 6.376 6.511 6.639 6.827 7.009 7.177 7.33 7.483 7.682 7.863 8.035 8.259 8.485 8.692 8.924 9.199 9.453 9.686 9.908 10.141 10.355 10.598 10.918 11.2 11.452 11.666 11.891 12.056 12.122 11.951 11.109 9.591 8.136 6.778 5.443 4.228 3.17 2.136 1.209 0.303 -0.448 -1.117 -1.772 -2.389 -3.004 -3.582 -4.126 -4.588 -5.006 -5.443 -5.901 -6.288 -6.688 -7.106 -7.448 -7.82 -8.196 -8.577 -8.978 -9.248 -9.522 -9.958 -10.255 -10.566 -10.735 -11.091 -11.444 -11.827 -12.032 -12.331 -12.724 -12.969 -13.221 -13.799 -14.114 -14.469 -14.89 -15.351 -15.95 -16.828 -19.872 -4 ,7782 ,KEBNE ,16748808,Tue Nov 30 12:33:23 CET,Tue Nov 30 14:29:48 CET,0.0 1.945 2.419 2.738 3.018 3.255 3.455 3.648 3.988 4.14 4.285 4.5 4.69 4.804 5.034 5.25 5.446 5.537 5.701 5.853 6.08 6.22 6.345 6.547 6.746 6.919 7.086 7.247 7.446 7.629 7.795 8.011 8.224 8.418 8.631 8.861 9.079 9.296 9.52 9.783 10.038 10.287 10.583 10.86 11.169 11.484 11.793 12.06 12.141 11.909 11.152 9.853 8.537 7.336 6.244 5.195 4.247 3.362 2.574 1.773 1.054 0.418 -0.187 -0.793 -1.36 -1.86 -2.38 -2.844 -3.248 -3.676 -4.102 -4.455 -4.832 -5.224 -5.537 -5.86 -6.189 -6.548 -6.925 -7.207 -7.507 -7.958 -8.271 -8.577 -8.735 -9.066 -9.408 -9.755 -9.938 -10.22 -10.556 -10.778 -11.017 -11.557 -11.884 -12.26 -12.655 -13.109 -13.672 -14.48 -17.215 -6 ,12691 ,KEBNE ,16748810,Tue Nov 30 12:33:22 CET,Tue Nov 30 14:32:43 CET,0.0 2.069 2.633 2.999 3.304 3.567 3.788 3.974 4.326 4.496 4.646 4.862 5.045 5.17 5.403 5.629 5.837 5.929 6.101 6.267 6.508 6.657 6.794 6.98 7.153 7.324 7.49 7.646 7.846 8.031 8.205 8.417 8.61 8.782 8.991 9.213 9.411 9.63 9.86 10.092 10.339 10.601 10.899 11.191 11.453 11.682 11.915 12.073 12.084 11.859 11.055 9.632 8.219 6.851 5.586 4.459 3.39 2.322 1.418 0.498 -0.301 -1.017 -1.715 -2.357 -2.964 -3.498 -4.01 -4.464 -4.853 -5.278 -5.787 -6.217 -6.634 -7.054 -7.389 -7.735 -8.09 -8.472 -8.887 -9.182 -9.483 -9.943 -10.254 -10.58 -10.75 -11.113 -11.51 -11.934 -12.136 -12.409 -12.785 -13.052 -13.328 -13.898 -14.22 -14.59 -15.048 -15.589 -16.242 -17.139 -21.172 -8 ,27686 ,KEBNE ,16748812,Tue Nov 30 12:34:29 CET,Tue Nov 30 14:22:49 CET,0.0 1.759 2.264 2.603 2.864 3.085 3.292 3.492 3.865 4.03 4.18 4.379 4.568 4.684 4.908 5.127 5.334 5.431 5.616 5.781 5.987 6.111 6.241 6.424 6.591 6.746 6.895 7.041 7.213 7.387 7.569 7.778 7.97 8.158 8.369 8.605 8.809 9.013 9.23 9.45 9.689 9.963 10.281 10.559 10.798 11.024 11.266 11.433 11.495 11.381 10.766 9.538 8.268 7.038 5.852 4.777 3.8 2.873 2.06 1.191 0.439 -0.221 -0.844 -1.413 -1.934 -2.429 -2.995 -3.501 -3.913 -4.336 -4.797 -5.185 -5.586 -6.018 -6.351 -6.709 -7.092 -7.47 -7.862 -8.151 -8.453 -8.9 -9.208 -9.539 -9.715 -10.083 -10.47 -10.875 -11.089 -11.387 -11.79 -12.046 -12.306 -12.881 -13.213 -13.604 -14.079 -14.644 -15.339 -16.256 -21.404 -9 ,5711 ,KEBNE ,16748813,Tue Nov 30 12:36:35 CET,Tue Nov 30 14:33:54 CET,0.0 2.937 3.451 3.777 4.043 4.265 4.451 4.617 4.93 5.076 5.21 5.391 5.579 5.694 5.88 6.05 6.222 6.305 6.464 6.609 6.818 6.958 7.09 7.271 7.441 7.598 7.759 7.925 8.124 8.304 8.474 8.668 8.852 9.028 9.224 9.444 9.667 9.908 10.153 10.413 10.69 10.973 11.249 11.489 11.715 11.92 12.069 12.165 12.161 11.843 10.734 8.836 7.134 5.652 4.308 3.08 2.002 1.019 0.138 -0.771 -1.543 -2.226 -2.847 -3.42 -3.968 -4.482 -5.039 -5.527 -5.93 -6.354 -6.807 -7.189 -7.583 -7.998 -8.339 -8.689 -9.032 -9.403 -9.8 -10.069 -10.349 -10.775 -11.086 -11.439 -11.623 -11.976 -12.355 -12.774 -12.988 -13.29 -13.663 -13.924 -14.22 -14.871 -15.217 -15.61 -16.046 -16.506 -17.065 -17.847 -20.833 -10 ,31238 ,KEBNE ,16748814,Tue Nov 30 12:40:45 CET,Tue Nov 30 14:37:59 CET,0.0 2.113 2.708 3.151 3.485 3.747 3.97 4.152 4.492 4.646 4.797 5.003 5.185 5.301 5.513 5.7 5.866 5.94 6.084 6.22 6.425 6.574 6.716 6.9 7.067 7.237 7.392 7.541 7.743 7.935 8.113 8.315 8.505 8.695 8.926 9.158 9.36 9.582 9.818 10.064 10.3 10.552 10.846 11.128 11.406 11.639 11.854 12.047 12.095 11.669 10.522 8.785 7.08 5.539 4.175 2.915 1.821 0.846 -0.021 -0.904 -1.668 -2.354 -2.988 -3.608 -4.222 -4.771 -5.319 -5.81 -6.243 -6.704 -7.179 -7.556 -7.935 -8.324 -8.625 -8.949 -9.294 -9.655 -10.044 -10.323 -10.605 -11.044 -11.364 -11.696 -11.863 -12.186 -12.539 -12.952 -13.167 -13.464 -13.819 -14.063 -14.337 -14.947 -15.285 -15.671 -16.098 -16.571 -17.151 -17.988 -21.304 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt deleted file mode 100644 index aca647f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15428 ,KEBNE ,17028112,Wed Dec 22 19:12:23 CET,Wed Dec 22 21:04:12 CET,0.0 2.817 3.367 3.731 3.997 4.245 4.449 4.628 4.952 5.085 5.218 5.407 5.595 5.704 5.882 6.056 6.224 6.303 6.456 6.585 6.758 6.87 6.983 7.144 7.286 7.409 7.51 7.606 7.732 7.842 7.935 8.036 8.122 8.19 8.256 8.303 8.32 8.316 8.292 8.245 8.145 8.005 7.787 7.49 7.053 6.39 5.483 4.235 2.396 -0.3 -4.692 -9.88 -14.099 -17.483 -20.225 -22.645 -24.71 -26.499 -28.023 -29.566 -30.899 -32.054 -33.113 -34.1 -35.02 -35.845 -36.655 -37.362 -37.979 -38.604 -39.251 -39.785 -40.339 -40.897 -41.322 -41.761 -42.234 -42.731 -43.242 -43.624 -44.015 -44.637 -45.083 -45.548 -45.779 -46.248 -46.767 -47.293 -47.548 -47.924 -48.339 -48.631 -48.94 -49.622 -49.993 -50.399 -50.849 -51.355 -51.985 -52.874 -57.36 -2 ,18374 ,KEBNE ,17028113,Wed Dec 22 19:12:20 CET,Wed Dec 22 21:10:49 CET,0.0 2.628 3.223 3.618 3.933 4.194 4.425 4.628 4.985 5.149 5.301 5.506 5.689 5.801 6.004 6.192 6.365 6.442 6.579 6.713 6.909 7.035 7.149 7.306 7.441 7.547 7.651 7.744 7.841 7.927 8.001 8.074 8.138 8.196 8.246 8.295 8.318 8.311 8.28 8.209 8.099 7.951 7.733 7.446 7.013 6.416 5.521 4.281 2.619 0.143 -3.965 -8.727 -12.667 -15.979 -18.783 -21.168 -23.153 -24.913 -26.378 -27.829 -29.087 -30.244 -31.349 -32.34 -33.253 -34.099 -34.974 -35.726 -36.351 -36.977 -37.621 -38.149 -38.685 -39.247 -39.675 -40.098 -40.532 -40.993 -41.477 -41.797 -42.123 -42.642 -42.999 -43.385 -43.584 -43.987 -44.408 -44.848 -45.1 -45.483 -45.897 -46.193 -46.531 -47.281 -47.681 -48.093 -48.573 -49.157 -49.857 -50.855 -55.013 -3 ,25709 ,KEBNE ,17028114,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:11:08 CET,0.0 2.212 2.748 3.181 3.486 3.752 3.971 4.145 4.477 4.644 4.808 5.05 5.254 5.382 5.606 5.813 6.012 6.106 6.272 6.427 6.65 6.783 6.901 7.064 7.208 7.329 7.441 7.541 7.659 7.768 7.871 7.982 8.074 8.153 8.217 8.28 8.317 8.314 8.294 8.242 8.144 7.983 7.746 7.47 7.043 6.432 5.585 4.42 2.739 0.06 -4.484 -9.595 -13.535 -17.026 -19.969 -22.432 -24.54 -26.424 -28.035 -29.594 -30.868 -31.99 -33.063 -34.028 -34.907 -35.713 -36.534 -37.236 -37.838 -38.467 -39.126 -39.664 -40.205 -40.769 -41.196 -41.637 -42.1 -42.587 -43.097 -43.436 -43.79 -44.349 -44.727 -45.117 -45.323 -45.763 -46.203 -46.636 -46.862 -47.215 -47.616 -47.901 -48.204 -48.862 -49.245 -49.688 -50.139 -50.644 -51.25 -52.135 -55.583 -4 ,10124 ,KEBNE ,17028115,Wed Dec 22 19:12:19 CET,Wed Dec 22 21:11:00 CET,0.0 1.994 2.458 2.83 3.13 3.382 3.597 3.777 4.113 4.269 4.413 4.619 4.801 4.918 5.125 5.299 5.45 5.524 5.678 5.817 5.995 6.099 6.212 6.376 6.499 6.606 6.708 6.806 6.925 7.032 7.127 7.213 7.288 7.354 7.404 7.432 7.437 7.432 7.412 7.359 7.248 7.084 6.867 6.575 6.106 5.504 4.68 3.482 1.715 -0.93 -5.308 -10.368 -14.315 -17.528 -20.143 -22.509 -24.602 -26.401 -27.942 -29.458 -30.708 -31.772 -32.745 -33.653 -34.507 -35.282 -36.08 -36.779 -37.376 -38.003 -38.651 -39.171 -39.715 -40.274 -40.708 -41.17 -41.643 -42.122 -42.611 -42.956 -43.313 -43.855 -44.226 -44.613 -44.816 -45.261 -45.72 -46.173 -46.414 -46.781 -47.204 -47.485 -47.775 -48.394 -48.742 -49.136 -49.604 -50.154 -50.848 -51.784 -55.818 -5 ,28727 ,KEBNE ,17028116,Wed Dec 22 19:12:20 CET,Wed Dec 22 21:10:46 CET,0.0 2.572 3.223 3.694 4.053 4.366 4.632 4.843 5.174 5.334 5.49 5.712 5.905 6.029 6.253 6.452 6.642 6.731 6.888 7.036 7.23 7.348 7.46 7.613 7.76 7.885 7.999 8.114 8.25 8.359 8.446 8.537 8.624 8.7 8.767 8.814 8.842 8.861 8.861 8.811 8.711 8.559 8.318 8.013 7.563 6.933 6.069 4.942 3.299 0.707 -3.659 -8.884 -13.117 -16.545 -19.359 -21.809 -23.866 -25.7 -27.276 -28.811 -30.117 -31.265 -32.362 -33.384 -34.304 -35.133 -35.982 -36.724 -37.35 -38.014 -38.727 -39.303 -39.884 -40.484 -40.948 -41.414 -41.881 -42.366 -42.899 -43.263 -43.617 -44.171 -44.556 -44.985 -45.23 -45.731 -46.22 -46.691 -46.927 -47.293 -47.705 -47.994 -48.297 -48.95 -49.305 -49.693 -50.14 -50.644 -51.244 -52.102 -55.885 -6 ,26457 ,KEBNE ,17028117,Wed Dec 22 19:13:23 CET,Wed Dec 22 21:08:31 CET,0.0 3.515 4.225 4.669 5.033 5.321 5.56 5.774 6.111 6.25 6.387 6.583 6.771 6.9 7.126 7.295 7.466 7.558 7.724 7.872 8.075 8.19 8.297 8.46 8.609 8.738 8.861 8.975 9.112 9.237 9.345 9.455 9.553 9.632 9.699 9.76 9.792 9.795 9.778 9.716 9.618 9.485 9.277 9.005 8.584 8.005 7.185 6.023 4.285 1.577 -2.652 -7.459 -11.234 -14.359 -17.026 -19.329 -21.325 -23.168 -24.771 -26.334 -27.64 -28.78 -29.842 -30.841 -31.768 -32.621 -33.485 -34.201 -34.816 -35.474 -36.174 -36.736 -37.302 -37.878 -38.311 -38.753 -39.224 -39.733 -40.254 -40.61 -40.984 -41.562 -41.965 -42.386 -42.608 -43.072 -43.542 -44.056 -44.327 -44.723 -45.185 -45.49 -45.816 -46.517 -46.922 -47.419 -47.975 -48.644 -49.509 -50.666 -57.411 -7 ,10094 ,KEBNE ,17028118,Wed Dec 22 19:13:22 CET,Wed Dec 22 21:12:28 CET,0.0 1.938 2.45 2.86 3.182 3.428 3.63 3.797 4.112 4.254 4.382 4.579 4.774 4.896 5.109 5.303 5.479 5.563 5.717 5.865 6.065 6.175 6.279 6.437 6.576 6.689 6.8 6.906 7.038 7.157 7.253 7.357 7.436 7.489 7.529 7.547 7.536 7.526 7.526 7.477 7.359 7.17 6.911 6.602 6.158 5.565 4.701 3.508 1.776 -0.878 -5.208 -10.2 -14.241 -17.589 -20.363 -22.764 -24.811 -26.603 -28.11 -29.633 -30.916 -32.002 -33.025 -33.987 -34.863 -35.636 -36.43 -37.135 -37.722 -38.332 -38.965 -39.467 -39.988 -40.532 -40.957 -41.401 -41.86 -42.332 -42.812 -43.146 -43.493 -44.048 -44.432 -44.807 -44.999 -45.399 -45.813 -46.272 -46.518 -46.885 -47.289 -47.579 -47.883 -48.52 -48.885 -49.297 -49.751 -50.289 -50.927 -51.785 -55.352 -8 ,4463 ,KEBNE ,17028119,Wed Dec 22 19:13:22 CET,Wed Dec 22 21:11:46 CET,0.0 1.842 2.378 2.748 3.052 3.313 3.541 3.769 4.166 4.321 4.459 4.649 4.826 4.927 5.13 5.333 5.51 5.596 5.758 5.901 6.119 6.25 6.36 6.514 6.653 6.791 6.907 6.997 7.108 7.226 7.331 7.426 7.513 7.591 7.641 7.661 7.682 7.69 7.667 7.639 7.565 7.392 7.132 6.836 6.418 5.822 5.005 3.936 2.264 -0.312 -4.4 -9.183 -13.155 -16.504 -19.281 -21.763 -23.887 -25.728 -27.268 -28.75 -30.007 -31.136 -32.2 -33.177 -34.086 -34.875 -35.667 -36.387 -37.004 -37.644 -38.309 -38.878 -39.464 -40.035 -40.466 -40.918 -41.388 -41.876 -42.382 -42.72 -43.065 -43.617 -44.0 -44.4 -44.607 -45.028 -45.466 -45.914 -46.143 -46.508 -46.934 -47.227 -47.537 -48.227 -48.602 -49.003 -49.443 -49.946 -50.576 -51.439 -55.03 -9 ,15451 ,KEBNE ,17028120,Wed Dec 22 19:18:34 CET,Wed Dec 22 21:17:30 CET,0.0 2.122 2.684 3.036 3.295 3.528 3.725 3.891 4.184 4.317 4.456 4.66 4.848 4.984 5.228 5.447 5.64 5.728 5.884 6.021 6.208 6.323 6.431 6.574 6.694 6.801 6.907 7.012 7.123 7.195 7.27 7.352 7.417 7.494 7.566 7.621 7.661 7.66 7.622 7.547 7.415 7.229 6.943 6.593 6.096 5.449 4.573 3.315 1.491 -1.173 -5.391 -10.209 -14.072 -17.358 -20.105 -22.444 -24.427 -26.208 -27.774 -29.308 -30.576 -31.687 -32.708 -33.649 -34.509 -35.279 -36.088 -36.826 -37.447 -38.082 -38.757 -39.323 -39.917 -40.524 -40.991 -41.468 -41.956 -42.461 -42.982 -43.337 -43.694 -44.273 -44.69 -45.106 -45.317 -45.78 -46.276 -46.803 -47.074 -47.467 -47.982 -48.333 -48.7 -49.522 -49.962 -50.436 -50.981 -51.629 -52.426 -53.439 -57.985 -10 ,14780 ,KEBNE ,17028121,Wed Dec 22 19:18:32 CET,Wed Dec 22 21:17:18 CET,0.0 1.713 2.21 2.567 2.885 3.166 3.39 3.583 3.918 4.061 4.201 4.41 4.599 4.719 4.926 5.107 5.288 5.378 5.534 5.669 5.848 5.958 6.067 6.221 6.369 6.493 6.595 6.704 6.836 6.935 7.024 7.125 7.207 7.281 7.36 7.427 7.465 7.488 7.49 7.443 7.353 7.209 6.978 6.688 6.279 5.7 4.832 3.61 1.889 -0.726 -5.13 -10.165 -14.236 -17.622 -20.392 -22.809 -24.823 -26.583 -28.103 -29.603 -30.858 -31.948 -32.97 -33.941 -34.835 -35.621 -36.428 -37.124 -37.71 -38.326 -38.975 -39.504 -40.042 -40.599 -41.032 -41.474 -41.917 -42.369 -42.847 -43.177 -43.522 -44.05 -44.403 -44.783 -44.987 -45.405 -45.856 -46.332 -46.584 -46.979 -47.415 -47.708 -48.01 -48.668 -49.049 -49.461 -49.923 -50.449 -51.053 -51.908 -57.218 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt deleted file mode 100644 index 709f1590..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7079 ,KEBNE ,16748815,Tue Nov 30 12:43:52 CET,Tue Nov 30 14:43:41 CET,0.0 1.428 1.902 2.253 2.522 2.747 2.961 3.155 3.48 3.625 3.775 3.999 4.183 4.299 4.529 4.741 4.928 5.02 5.2 5.364 5.596 5.758 5.926 6.149 6.345 6.523 6.697 6.872 7.094 7.302 7.493 7.724 7.945 8.163 8.414 8.69 8.945 9.213 9.509 9.818 10.138 10.488 10.902 11.3 11.706 12.124 12.572 12.988 13.361 13.627 13.594 13.029 12.309 11.577 10.834 10.151 9.524 8.89 8.323 7.781 7.311 6.865 6.434 6.024 5.644 5.31 4.92 4.559 4.258 3.935 3.603 3.333 3.023 2.669 2.401 2.128 1.827 1.509 1.19 0.96 0.716 0.361 0.105 -0.161 -0.3 -0.6 -0.896 -1.209 -1.373 -1.615 -1.979 -2.217 -2.478 -3.072 -3.382 -3.71 -4.059 -4.438 -4.902 -5.562 -7.805 -3 ,11297 ,KEBNE ,16748817,Tue Nov 30 12:50:19 CET,Tue Nov 30 14:49:02 CET,0.0 2.455 2.957 3.347 3.637 3.872 4.092 4.293 4.635 4.784 4.926 5.133 5.319 5.443 5.667 5.869 6.059 6.151 6.328 6.5 6.745 6.89 7.034 7.25 7.45 7.64 7.829 8.012 8.248 8.485 8.695 8.933 9.168 9.391 9.646 9.919 10.183 10.477 10.778 11.082 11.409 11.774 12.153 12.502 12.917 13.366 13.847 14.34 14.811 15.218 15.221 14.692 14.01 13.269 12.599 11.934 11.32 10.752 10.23 9.696 9.211 8.769 8.354 7.968 7.583 7.205 6.803 6.465 6.195 5.901 5.572 5.291 5.017 4.732 4.495 4.259 4.026 3.776 3.504 3.307 3.091 2.777 2.572 2.347 2.228 1.966 1.681 1.397 1.243 1.008 0.727 0.547 0.349 -0.127 -0.391 -0.67 -0.992 -1.388 -1.857 -2.472 -4.481 -4 ,29487 ,KEBNE ,16748818,Tue Nov 30 12:52:24 CET,Tue Nov 30 14:49:19 CET,0.0 1.719 2.226 2.61 2.916 3.168 3.393 3.609 3.964 4.129 4.288 4.495 4.685 4.805 5.031 5.25 5.439 5.526 5.692 5.851 6.102 6.265 6.422 6.638 6.836 7.031 7.213 7.387 7.619 7.836 8.039 8.288 8.531 8.753 9.012 9.31 9.585 9.881 10.197 10.523 10.872 11.255 11.667 12.065 12.512 12.972 13.47 13.966 14.373 14.641 14.647 14.159 13.459 12.673 11.938 11.297 10.708 10.146 9.652 9.149 8.699 8.299 7.914 7.542 7.173 6.819 6.473 6.16 5.879 5.561 5.222 4.951 4.664 4.376 4.149 3.904 3.651 3.4 3.126 2.921 2.714 2.4 2.187 1.962 1.841 1.609 1.354 1.06 0.912 0.687 0.391 0.196 0.004 -0.429 -0.679 -0.956 -1.279 -1.639 -2.112 -2.808 -5.083 -7 ,29516 ,KEBNE ,16748821,Tue Nov 30 12:54:29 CET,Tue Nov 30 14:51:59 CET,0.0 2.592 3.101 3.489 3.805 4.062 4.295 4.503 4.872 5.041 5.187 5.384 5.581 5.711 5.962 6.187 6.377 6.474 6.682 6.886 7.153 7.315 7.47 7.683 7.884 8.079 8.27 8.446 8.669 8.886 9.09 9.322 9.544 9.767 10.042 10.345 10.625 10.935 11.262 11.582 11.874 12.191 12.565 12.938 13.357 13.789 14.219 14.655 15.064 15.386 15.445 14.901 14.2 13.51 12.828 12.226 11.656 11.043 10.524 10.031 9.567 9.161 8.792 8.388 8.001 7.671 7.306 6.978 6.707 6.422 6.117 5.869 5.608 5.319 5.1 4.881 4.642 4.374 4.091 3.903 3.71 3.389 3.16 2.923 2.801 2.539 2.243 1.925 1.766 1.545 1.257 1.068 0.865 0.407 0.158 -0.126 -0.475 -0.858 -1.304 -1.955 -4.844 -9 ,29969 ,KEBNE ,16748823,Tue Nov 30 12:58:42 CET,Tue Nov 30 14:58:39 CET,0.0 2.352 2.887 3.256 3.554 3.794 3.996 4.184 4.541 4.703 4.841 5.041 5.227 5.346 5.559 5.755 5.942 6.034 6.221 6.397 6.634 6.787 6.935 7.135 7.316 7.507 7.699 7.882 8.118 8.342 8.556 8.815 9.071 9.306 9.55 9.82 10.084 10.364 10.668 10.979 11.293 11.633 12.05 12.478 12.905 13.317 13.773 14.274 14.741 15.031 15.003 14.498 13.854 13.147 12.424 11.715 11.082 10.512 9.981 9.419 8.933 8.493 8.068 7.654 7.266 6.919 6.563 6.248 5.956 5.641 5.308 5.038 4.767 4.496 4.277 4.031 3.765 3.49 3.212 3.023 2.823 2.501 2.281 2.042 1.907 1.654 1.419 1.14 0.987 0.774 0.527 0.359 0.167 -0.264 -0.501 -0.778 -1.101 -1.475 -1.922 -2.536 -4.512 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index 631a6302..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23919 ,KEBNE ,16748825,Tue Nov 30 12:58:42 CET,Tue Nov 30 14:56:32 CET,0.0 2.552 3.127 3.48 3.763 4.001 4.185 4.341 4.622 4.753 4.875 5.027 5.188 5.281 5.456 5.612 5.754 5.818 5.935 6.043 6.18 6.257 6.332 6.446 6.546 6.62 6.686 6.756 6.83 6.887 6.943 7.001 7.055 7.087 7.089 7.072 7.047 7.014 6.936 6.821 6.679 6.499 6.232 5.892 5.441 4.792 3.854 2.615 0.871 -1.701 -5.843 -10.783 -14.767 -17.879 -20.404 -22.642 -24.551 -26.175 -27.503 -28.837 -29.982 -30.962 -31.87 -32.718 -33.501 -34.205 -34.933 -35.59 -36.16 -36.747 -37.353 -37.847 -38.346 -38.866 -39.261 -39.655 -40.073 -40.503 -40.939 -41.242 -41.562 -42.055 -42.403 -42.774 -42.958 -43.332 -43.716 -44.115 -44.328 -44.669 -45.022 -45.266 -45.513 -46.075 -46.388 -46.717 -47.063 -47.457 -47.93 -48.566 -51.363 -2 ,7227 ,KEBNE ,16748826,Tue Nov 30 12:58:42 CET,Tue Nov 30 14:56:40 CET,0.0 2.232 2.701 3.033 3.277 3.481 3.666 3.831 4.12 4.243 4.362 4.514 4.651 4.729 4.876 5.019 5.144 5.204 5.325 5.439 5.589 5.672 5.747 5.859 5.965 6.053 6.133 6.199 6.285 6.359 6.406 6.479 6.538 6.578 6.623 6.64 6.631 6.603 6.555 6.5 6.404 6.217 5.96 5.661 5.237 4.67 3.882 2.812 1.262 -1.174 -5.138 -9.635 -13.214 -16.113 -18.52 -20.638 -22.465 -24.108 -25.502 -26.87 -28.067 -29.097 -30.02 -30.884 -31.68 -32.407 -33.161 -33.831 -34.415 -35.003 -35.582 -36.061 -36.563 -37.07 -37.446 -37.835 -38.247 -38.671 -39.101 -39.392 -39.699 -40.174 -40.502 -40.842 -41.014 -41.384 -41.777 -42.181 -42.404 -42.765 -43.193 -43.475 -43.774 -44.391 -44.724 -45.101 -45.53 -46.017 -46.579 -47.352 -49.992 -3 ,15275 ,KEBNE ,16748827,Tue Nov 30 12:58:42 CET,Tue Nov 30 15:00:17 CET,0.0 1.665 2.131 2.464 2.741 2.982 3.195 3.383 3.676 3.797 3.918 4.071 4.228 4.316 4.472 4.617 4.74 4.8 4.924 5.054 5.218 5.289 5.35 5.456 5.586 5.705 5.801 5.877 5.962 6.022 6.055 6.087 6.118 6.141 6.16 6.168 6.141 6.098 6.042 5.97 5.861 5.683 5.395 5.034 4.546 3.924 3.057 1.859 0.18 -2.248 -6.19 -10.771 -14.409 -17.405 -19.865 -22.017 -23.903 -25.61 -27.044 -28.419 -29.562 -30.591 -31.544 -32.399 -33.205 -33.927 -34.658 -35.309 -35.87 -36.454 -37.048 -37.53 -38.032 -38.538 -38.913 -39.288 -39.682 -40.127 -40.587 -40.885 -41.189 -41.653 -41.982 -42.315 -42.481 -42.84 -43.215 -43.631 -43.863 -44.218 -44.631 -44.906 -45.195 -45.815 -46.158 -46.54 -46.962 -47.435 -48.01 -48.841 -52.737 -4 ,31445 ,KEBNE ,16748828,Tue Nov 30 12:58:42 CET,Tue Nov 30 15:00:01 CET,0.0 2.369 2.918 3.314 3.598 3.824 4.019 4.191 4.48 4.615 4.741 4.881 5.038 5.131 5.293 5.425 5.549 5.618 5.755 5.889 6.054 6.135 6.213 6.321 6.412 6.493 6.567 6.633 6.703 6.753 6.793 6.828 6.851 6.875 6.889 6.885 6.861 6.807 6.727 6.624 6.5 6.294 5.993 5.657 5.168 4.519 3.667 2.476 0.682 -1.919 -6.01 -10.625 -14.308 -17.297 -19.822 -22.112 -24.051 -25.697 -27.078 -28.46 -29.596 -30.566 -31.477 -32.332 -33.111 -33.809 -34.527 -35.161 -35.724 -36.306 -36.896 -37.377 -37.861 -38.364 -38.759 -39.152 -39.55 -39.964 -40.402 -40.696 -40.991 -41.462 -41.808 -42.173 -42.357 -42.742 -43.129 -43.528 -43.742 -44.078 -44.406 -44.64 -44.899 -45.463 -45.771 -46.101 -46.471 -46.899 -47.42 -48.138 -51.434 -5 ,11058 ,KEBNE ,16748829,Tue Nov 30 12:58:42 CET,Tue Nov 30 14:56:09 CET,0.0 2.411 2.926 3.262 3.531 3.774 3.989 4.156 4.447 4.586 4.707 4.847 5.011 5.108 5.274 5.413 5.541 5.606 5.724 5.82 5.935 6.012 6.092 6.203 6.291 6.372 6.459 6.524 6.588 6.646 6.697 6.748 6.786 6.819 6.858 6.876 6.868 6.845 6.809 6.76 6.652 6.488 6.244 5.894 5.398 4.791 3.977 2.85 1.17 -1.419 -5.57 -10.257 -13.986 -17.066 -19.625 -21.81 -23.657 -25.333 -26.752 -28.144 -29.334 -30.355 -31.293 -32.172 -32.989 -33.717 -34.464 -35.137 -35.71 -36.279 -36.856 -37.351 -37.863 -38.384 -38.795 -39.204 -39.606 -40.021 -40.462 -40.767 -41.08 -41.569 -41.899 -42.232 -42.402 -42.764 -43.138 -43.537 -43.752 -44.088 -44.421 -44.66 -44.905 -45.479 -45.821 -46.209 -46.652 -47.144 -47.679 -48.381 -51.051 -7 ,32425 ,KEBNE ,16748831,Tue Nov 30 12:59:47 CET,Tue Nov 30 14:59:52 CET,0.0 2.496 2.972 3.325 3.635 3.89 4.1 4.278 4.581 4.712 4.833 4.991 5.154 5.244 5.399 5.543 5.674 5.734 5.842 5.941 6.083 6.169 6.247 6.349 6.447 6.537 6.617 6.685 6.76 6.819 6.862 6.913 6.96 6.998 7.01 6.992 6.955 6.9 6.826 6.738 6.627 6.443 6.171 5.909 5.557 4.998 4.199 3.107 1.466 -0.973 -5.011 -9.743 -13.387 -16.402 -18.922 -21.09 -22.959 -24.609 -25.993 -27.329 -28.46 -29.459 -30.404 -31.287 -32.087 -32.801 -33.541 -34.209 -34.788 -35.382 -35.994 -36.493 -37.003 -37.527 -37.933 -38.36 -38.794 -39.239 -39.7 -40.005 -40.312 -40.8 -41.151 -41.506 -41.699 -42.135 -42.569 -42.972 -43.169 -43.493 -43.863 -44.113 -44.377 -44.938 -45.239 -45.581 -45.96 -46.385 -46.935 -47.707 -49.952 -8 ,24879 ,KEBNE ,16748832,Tue Nov 30 13:07:07 CET,Tue Nov 30 15:05:49 CET,0.0 2.044 2.536 2.901 3.182 3.413 3.612 3.782 4.083 4.219 4.344 4.499 4.649 4.741 4.92 5.058 5.167 5.228 5.352 5.461 5.61 5.695 5.772 5.886 5.977 6.061 6.151 6.233 6.326 6.409 6.493 6.566 6.614 6.641 6.64 6.63 6.61 6.554 6.485 6.397 6.242 6.02 5.733 5.408 4.956 4.375 3.553 2.373 0.704 -1.814 -5.911 -10.474 -14.009 -16.96 -19.492 -21.799 -23.743 -25.414 -26.84 -28.195 -29.299 -30.261 -31.185 -32.061 -32.879 -33.625 -34.394 -35.078 -35.654 -36.243 -36.844 -37.334 -37.841 -38.357 -38.762 -39.187 -39.621 -40.065 -40.519 -40.836 -41.157 -41.647 -41.978 -42.327 -42.514 -42.901 -43.306 -43.727 -43.947 -44.296 -44.671 -44.943 -45.227 -45.813 -46.124 -46.448 -46.818 -47.26 -47.766 -48.461 -51.305 -9 ,29448 ,KEBNE ,16748833,Tue Nov 30 13:07:07 CET,Tue Nov 30 15:06:05 CET,0.0 2.695 3.173 3.502 3.742 3.941 4.112 4.268 4.535 4.647 4.744 4.855 5.003 5.087 5.229 5.358 5.482 5.537 5.629 5.726 5.865 5.94 6.016 6.118 6.202 6.277 6.343 6.397 6.456 6.5 6.536 6.574 6.607 6.633 6.652 6.658 6.63 6.578 6.51 6.411 6.271 6.074 5.797 5.47 5.017 4.384 3.484 2.274 0.535 -2.033 -6.047 -10.611 -14.195 -17.077 -19.487 -21.564 -23.339 -24.954 -26.305 -27.61 -28.733 -29.734 -30.664 -31.5 -32.288 -33.03 -33.771 -34.414 -34.974 -35.562 -36.161 -36.63 -37.109 -37.614 -38.008 -38.416 -38.834 -39.252 -39.684 -39.983 -40.282 -40.774 -41.12 -41.464 -41.637 -41.985 -42.358 -42.759 -42.96 -43.283 -43.604 -43.847 -44.113 -44.683 -44.977 -45.302 -45.678 -46.144 -46.736 -47.495 -51.081 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt deleted file mode 100644 index d73ba2b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,27416 ,KEBNE ,16748836,Tue Nov 30 13:07:11 CET,Tue Nov 30 14:59:00 CET,0.0 2.814 3.416 3.808 4.098 4.349 4.567 4.756 5.102 5.258 5.406 5.627 5.826 5.937 6.121 6.289 6.448 6.534 6.696 6.839 7.06 7.204 7.332 7.512 7.697 7.865 8.022 8.164 8.35 8.544 8.726 8.944 9.161 9.37 9.606 9.856 10.085 10.325 10.583 10.851 11.121 11.408 11.727 11.975 12.202 12.447 12.676 12.874 12.982 12.747 11.864 10.475 9.092 7.826 6.699 5.603 4.646 3.809 3.051 2.282 1.621 1.034 0.465 -0.101 -0.62 -1.098 -1.585 -2.012 -2.394 -2.774 -3.156 -3.472 -3.812 -4.192 -4.496 -4.833 -5.214 -5.622 -6.027 -6.274 -6.527 -6.971 -7.288 -7.607 -7.774 -8.122 -8.478 -8.857 -9.039 -9.31 -9.668 -9.902 -10.138 -10.712 -11.044 -11.383 -11.783 -12.278 -12.833 -13.607 -16.554 -3 ,2869 ,KEBNE ,16748837,Tue Nov 30 13:07:07 CET,Tue Nov 30 15:03:45 CET,0.0 3.247 3.841 4.235 4.538 4.8 5.029 5.233 5.59 5.75 5.899 6.11 6.296 6.42 6.641 6.847 7.035 7.121 7.283 7.441 7.665 7.805 7.942 8.152 8.363 8.579 8.772 8.933 9.128 9.294 9.454 9.662 9.863 10.048 10.258 10.477 10.694 10.931 11.167 11.431 11.704 12.026 12.399 12.699 12.995 13.281 13.559 13.796 13.946 13.915 13.507 12.424 10.968 9.537 8.334 7.344 6.481 5.689 4.964 4.172 3.478 2.827 2.21 1.643 1.109 0.637 0.145 -0.317 -0.711 -1.112 -1.544 -1.895 -2.247 -2.613 -2.894 -3.193 -3.499 -3.808 -4.136 -4.362 -4.597 -4.961 -5.22 -5.514 -5.674 -6.005 -6.36 -6.749 -6.956 -7.245 -7.584 -7.826 -8.09 -8.676 -9.002 -9.369 -9.775 -10.25 -10.865 -11.741 -15.678 -4 ,20192 ,KEBNE ,16748838,Tue Nov 30 13:07:07 CET,Tue Nov 30 15:04:31 CET,0.0 2.26 2.74 3.088 3.392 3.689 3.958 4.186 4.548 4.693 4.831 5.038 5.228 5.352 5.584 5.783 5.957 6.041 6.215 6.392 6.638 6.789 6.933 7.145 7.342 7.525 7.698 7.851 8.057 8.246 8.414 8.631 8.836 9.031 9.251 9.498 9.731 9.973 10.237 10.504 10.781 11.087 11.344 11.537 11.77 11.993 12.208 12.428 12.554 12.422 11.658 10.239 8.97 7.821 6.763 5.792 4.89 4.042 3.309 2.522 1.805 1.195 0.644 0.117 -0.363 -0.792 -1.247 -1.675 -2.045 -2.432 -2.856 -3.209 -3.576 -3.956 -4.26 -4.587 -4.913 -5.25 -5.609 -5.845 -6.076 -6.45 -6.718 -6.997 -7.135 -7.421 -7.736 -8.067 -8.246 -8.519 -8.848 -9.07 -9.302 -9.81 -10.098 -10.423 -10.833 -11.348 -11.956 -12.858 -16.474 -5 ,25552 ,KEBNE ,16748839,Tue Nov 30 13:07:07 CET,Tue Nov 30 15:05:38 CET,0.0 2.123 2.717 3.101 3.411 3.678 3.904 4.116 4.479 4.652 4.823 5.053 5.254 5.378 5.608 5.82 6.03 6.128 6.298 6.461 6.689 6.822 6.945 7.134 7.32 7.483 7.645 7.795 7.975 8.145 8.296 8.499 8.704 8.886 9.092 9.343 9.573 9.79 10.033 10.259 10.485 10.742 10.998 11.238 11.499 11.753 12.034 12.308 12.488 12.486 12.082 11.234 10.375 9.459 8.401 7.319 6.417 5.602 4.861 4.109 3.447 2.857 2.332 1.854 1.407 0.995 0.527 0.082 -0.296 -0.674 -1.046 -1.351 -1.697 -2.092 -2.403 -2.733 -3.104 -3.486 -3.859 -4.125 -4.406 -4.822 -5.11 -5.411 -5.561 -5.873 -6.221 -6.605 -6.803 -7.072 -7.369 -7.568 -7.784 -8.289 -8.581 -8.889 -9.221 -9.589 -10.054 -10.813 -13.7 -6 ,5022 ,KEBNE ,16748840,Tue Nov 30 13:07:07 CET,Tue Nov 30 15:04:27 CET,0.0 3.036 3.603 4.022 4.32 4.538 4.747 4.956 5.289 5.432 5.571 5.753 5.932 6.038 6.258 6.461 6.65 6.735 6.892 7.051 7.275 7.417 7.552 7.737 7.929 8.133 8.347 8.571 8.824 9.005 9.166 9.377 9.591 9.792 10.007 10.23 10.432 10.663 10.897 11.127 11.373 11.65 11.955 12.228 12.478 12.721 13.012 13.28 13.502 13.632 13.388 12.543 11.442 10.255 9.142 8.149 7.258 6.429 5.659 4.878 4.262 3.713 3.169 2.652 2.169 1.729 1.268 0.875 0.536 0.166 -0.232 -0.569 -0.906 -1.259 -1.533 -1.802 -2.082 -2.383 -2.71 -2.939 -3.177 -3.555 -3.813 -4.084 -4.218 -4.487 -4.798 -5.133 -5.294 -5.54 -5.818 -6.01 -6.232 -6.736 -6.994 -7.264 -7.589 -8.002 -8.498 -9.164 -12.053 -8 ,11064 ,KEBNE ,16748842,Tue Nov 30 13:07:08 CET,Tue Nov 30 15:05:13 CET,0.0 1.935 2.432 2.78 3.065 3.3 3.505 3.694 4.041 4.212 4.366 4.58 4.788 4.915 5.139 5.345 5.521 5.617 5.812 5.973 6.207 6.353 6.497 6.706 6.893 7.072 7.244 7.407 7.602 7.79 7.992 8.232 8.452 8.655 8.873 9.123 9.356 9.595 9.837 10.07 10.317 10.586 10.87 11.139 11.45 11.758 12.055 12.323 12.518 12.567 12.205 11.305 10.13 9.106 8.254 7.363 6.517 5.729 5.052 4.338 3.686 3.088 2.481 1.911 1.417 0.967 0.498 0.069 -0.313 -0.688 -1.08 -1.416 -1.758 -2.098 -2.364 -2.654 -2.953 -3.279 -3.64 -3.879 -4.111 -4.482 -4.75 -5.008 -5.144 -5.458 -5.815 -6.209 -6.417 -6.704 -7.08 -7.309 -7.552 -8.097 -8.411 -8.76 -9.139 -9.61 -10.184 -10.952 -13.834 -9 ,9441 ,KEBNE ,16748843,Tue Nov 30 13:07:08 CET,Tue Nov 30 15:09:12 CET,0.0 1.994 2.568 2.97 3.292 3.559 3.795 4.01 4.355 4.512 4.661 4.881 5.098 5.232 5.456 5.668 5.876 5.975 6.163 6.33 6.575 6.727 6.858 7.045 7.24 7.439 7.635 7.804 7.996 8.182 8.364 8.597 8.809 8.998 9.223 9.477 9.694 9.916 10.183 10.475 10.767 11.079 11.428 11.778 12.127 12.479 12.843 13.178 13.412 13.505 13.352 12.737 11.862 10.853 9.788 8.725 7.813 7.013 6.306 5.536 4.858 4.303 3.787 3.299 2.849 2.429 1.958 1.503 1.115 0.736 0.344 -0.015 -0.394 -0.761 -1.051 -1.352 -1.667 -2.004 -2.361 -2.613 -2.889 -3.32 -3.606 -3.893 -4.039 -4.342 -4.652 -4.984 -5.167 -5.457 -5.808 -6.038 -6.28 -6.817 -7.145 -7.518 -7.914 -8.357 -8.93 -9.749 -13.09 -10 ,9279 ,KEBNE ,16748844,Tue Nov 30 13:07:08 CET,Tue Nov 30 15:07:03 CET,0.0 2.22 2.745 3.139 3.44 3.7 3.937 4.129 4.459 4.606 4.749 4.944 5.127 5.241 5.472 5.692 5.908 6.013 6.19 6.353 6.599 6.751 6.894 7.101 7.293 7.478 7.652 7.809 8.02 8.231 8.413 8.625 8.829 9.015 9.224 9.427 9.619 9.838 10.043 10.26 10.476 10.715 11.026 11.32 11.644 11.979 12.293 12.596 12.85 12.91 12.622 11.869 10.972 10.026 9.111 8.247 7.433 6.657 5.977 5.301 4.717 4.138 3.557 3.012 2.488 1.996 1.471 1.012 0.622 0.194 -0.285 -0.688 -1.104 -1.526 -1.851 -2.195 -2.542 -2.899 -3.284 -3.541 -3.811 -4.26 -4.574 -4.896 -5.062 -5.407 -5.767 -6.159 -6.36 -6.647 -7.01 -7.26 -7.523 -8.081 -8.407 -8.776 -9.198 -9.698 -10.27 -10.976 -13.906 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt deleted file mode 100644 index 25be57fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7081 ,KEBNE ,16748845,Tue Nov 30 13:07:08 CET,Tue Nov 30 15:05:34 CET,0.0 1.084 1.572 1.992 2.372 2.684 2.953 3.207 3.683 3.916 4.137 4.414 4.728 4.912 5.268 5.6 5.917 6.075 6.373 6.663 7.087 7.355 7.617 8.01 8.389 8.745 9.083 9.409 9.859 10.319 10.755 11.281 11.784 12.277 12.85 13.486 14.101 14.784 15.55 16.418 17.359 18.434 19.703 21.005 22.587 24.389 26.523 29.044 32.121 36.015 41.202 45.984 49.09 51.281 52.888 54.076 54.957 55.641 56.138 56.551 56.847 57.079 57.282 57.445 57.563 57.667 57.764 57.815 57.835 57.852 57.853 57.829 57.802 57.767 57.728 57.686 57.647 57.597 57.518 57.46 57.397 57.287 57.212 57.12 57.067 56.958 56.834 56.683 56.6 56.46 56.308 56.193 56.072 55.785 55.613 55.422 55.222 54.974 54.649 54.162 50.649 -2 ,4882 ,KEBNE ,16748846,Tue Nov 30 13:09:15 CET,Tue Nov 30 15:10:27 CET,0.0 0.863 1.333 1.735 2.109 2.423 2.695 2.945 3.421 3.648 3.855 4.127 4.435 4.613 4.961 5.294 5.606 5.76 6.062 6.35 6.766 7.045 7.313 7.702 8.095 8.472 8.84 9.205 9.67 10.119 10.558 11.094 11.607 12.102 12.693 13.365 14.035 14.79 15.577 16.431 17.347 18.384 19.617 20.863 22.371 24.149 26.277 28.759 31.786 35.56 40.507 45.036 47.99 50.088 51.639 52.826 53.693 54.362 54.849 55.279 55.631 55.891 56.096 56.267 56.399 56.494 56.566 56.62 56.654 56.68 56.695 56.692 56.674 56.656 56.639 56.607 56.557 56.505 56.445 56.395 56.352 56.269 56.192 56.114 56.073 55.985 55.881 55.74 55.667 55.533 55.41 55.318 55.211 54.939 54.782 54.599 54.377 54.111 53.799 53.292 51.065 -5 ,32550 ,KEBNE ,16748849,Tue Nov 30 13:14:30 CET,Tue Nov 30 15:12:55 CET,0.0 1.008 1.561 2.011 2.392 2.722 3.003 3.257 3.725 3.936 4.144 4.43 4.743 4.931 5.297 5.655 5.999 6.158 6.457 6.749 7.171 7.449 7.73 8.133 8.511 8.878 9.231 9.578 10.028 10.469 10.893 11.404 11.913 12.422 13.021 13.667 14.296 15.009 15.772 16.591 17.465 18.475 19.692 20.975 22.522 24.265 26.342 28.768 31.73 35.492 40.522 45.141 48.059 50.063 51.498 52.588 53.409 54.077 54.607 55.051 55.383 55.651 55.867 56.044 56.194 56.305 56.387 56.435 56.461 56.476 56.48 56.474 56.468 56.457 56.433 56.391 56.355 56.317 56.263 56.213 56.15 56.059 55.998 55.927 55.885 55.784 55.672 55.544 55.471 55.333 55.227 55.117 54.99 54.725 54.569 54.382 54.169 53.924 53.607 53.113 50.727 -7 ,24 ,KEBNE ,16748851,Tue Nov 30 13:15:35 CET,Tue Nov 30 15:14:23 CET,0.0 1.11 1.711 2.119 2.469 2.777 3.081 3.37 3.886 4.126 4.35 4.653 4.966 5.16 5.539 5.901 6.233 6.39 6.696 6.986 7.408 7.681 7.947 8.329 8.704 9.094 9.472 9.825 10.277 10.701 11.126 11.67 12.188 12.689 13.275 13.925 14.56 15.289 16.11 16.974 17.885 18.921 20.152 21.421 22.924 24.687 26.833 29.364 32.467 36.348 41.464 46.098 49.104 51.24 52.765 53.9 54.762 55.454 55.965 56.415 56.733 56.977 57.202 57.383 57.522 57.617 57.685 57.728 57.746 57.758 57.773 57.768 57.75 57.736 57.718 57.678 57.624 57.567 57.504 57.449 57.382 57.269 57.187 57.101 57.056 56.965 56.845 56.691 56.61 56.467 56.358 56.275 56.179 55.928 55.774 55.595 55.379 55.138 54.818 54.314 51.824 -9 ,4673 ,KEBNE ,16748853,Tue Nov 30 13:22:00 CET,Tue Nov 30 15:24:26 CET,0.0 1.021 1.539 1.976 2.347 2.656 2.941 3.194 3.645 3.861 4.071 4.381 4.696 4.876 5.217 5.543 5.855 6.004 6.301 6.592 7.005 7.274 7.537 7.916 8.281 8.643 9.004 9.364 9.829 10.274 10.715 11.249 11.768 12.278 12.869 13.541 14.194 14.914 15.696 16.546 17.474 18.552 19.824 21.112 22.648 24.414 26.541 29.066 32.199 36.09 41.119 45.749 48.808 50.988 52.572 53.775 54.677 55.382 55.905 56.351 56.674 56.905 57.087 57.247 57.383 57.487 57.573 57.623 57.648 57.671 57.686 57.681 57.66 57.626 57.604 57.583 57.546 57.492 57.425 57.371 57.309 57.216 57.142 57.05 56.997 56.892 56.776 56.641 56.574 56.435 56.331 56.229 56.109 55.822 55.666 55.502 55.304 55.056 54.732 54.223 51.802 -10 ,19796 ,KEBNE ,16748854,Tue Nov 30 13:21:59 CET,Tue Nov 30 15:23:41 CET,0.0 0.907 1.37 1.75 2.088 2.388 2.676 2.965 3.469 3.696 3.91 4.174 4.481 4.671 5.023 5.355 5.674 5.826 6.121 6.415 6.856 7.14 7.408 7.807 8.199 8.561 8.912 9.265 9.724 10.169 10.598 11.113 11.627 12.136 12.736 13.42 14.074 14.807 15.618 16.48 17.403 18.477 19.74 21.049 22.632 24.444 26.589 29.079 32.152 36.097 41.272 45.893 48.86 50.942 52.443 53.567 54.377 54.992 55.444 55.802 56.059 56.285 56.479 56.62 56.708 56.781 56.852 56.886 56.886 56.866 56.848 56.83 56.794 56.751 56.707 56.664 56.623 56.562 56.489 56.435 56.371 56.268 56.187 56.086 56.034 55.932 55.819 55.677 55.595 55.455 55.339 55.237 55.121 54.837 54.667 54.473 54.256 54.006 53.674 53.154 51.124 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt deleted file mode 100644 index c6a52b82..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4636 ,KEBNE ,17028122,Wed Dec 22 19:18:33 CET,Wed Dec 22 21:18:00 CET,0.0 1.717 1.97 2.082 2.109 2.063 1.997 1.919 1.707 1.599 1.482 1.066 1.024 0.862 0.526 0.181 -0.176 -0.368 -0.761 -1.153 -1.749 -2.154 -2.57 -3.212 -3.86 -4.515 -5.18 -5.857 -6.772 -7.689 -8.626 -9.836 -11.041 -12.251 -13.731 -15.487 -17.255 -19.281 -21.589 -24.191 -27.092 -30.53 -34.808 -39.397 -45.109 -51.976 -60.555 -71.215 -85.105 -103.709 -130.412 -157.585 -177.093 -191.977 -203.668 -213.307 -221.148 -227.821 -233.274 -238.429 -242.638 -246.217 -249.499 -252.486 -255.167 -257.531 -259.927 -262.004 -263.745 -265.495 -267.248 -268.65 -270.066 -271.507 -272.599 -273.7 -274.809 -275.929 -277.083 -277.87 -278.674 -279.914 -280.748 -281.604 -282.037 -282.913 -283.815 -284.723 -285.177 -286.036 -286.576 -287.06 -287.545 -288.579 -289.121 -289.669 -290.291 -290.984 -291.717 -292.605 -294.582 -2 ,351 ,KEBNE ,17028123,Wed Dec 22 19:18:35 CET,Wed Dec 22 21:17:19 CET,0.0 2.058 2.312 2.415 2.479 2.476 2.413 2.342 2.149 2.024 1.896 1.492 1.451 1.286 0.952 0.604 0.232 0.042 -0.335 -0.72 -1.322 -1.739 -2.165 -2.82 -3.487 -4.156 -4.831 -5.534 -6.492 -7.441 -8.403 -9.631 -10.871 -12.117 -13.62 -15.411 -17.218 -19.271 -21.594 -24.203 -27.096 -30.54 -34.812 -39.39 -45.075 -51.896 -60.449 -71.017 -84.812 -103.409 -130.133 -157.277 -176.77 -191.663 -203.343 -212.944 -220.752 -227.42 -232.877 -238.042 -242.267 -245.851 -249.128 -252.089 -254.738 -257.076 -259.434 -261.474 -263.17 -264.887 -266.663 -268.11 -269.562 -271.025 -272.136 -273.265 -274.4 -275.547 -276.703 -277.472 -278.243 -279.404 -280.188 -280.978 -281.376 -282.184 -283.016 -283.867 -284.291 -285.125 -285.612 -286.076 -286.557 -287.542 -288.068 -288.623 -289.207 -289.833 -290.534 -291.41 -294.071 -3 ,25572 ,KEBNE ,17028124,Wed Dec 22 19:18:33 CET,Wed Dec 22 21:16:48 CET,0.0 1.764 2.001 2.083 2.09 2.076 2.048 1.985 1.764 1.622 1.467 1.03 0.982 0.816 0.5 0.164 -0.206 -0.4 -0.802 -1.215 -1.834 -2.25 -2.676 -3.318 -3.971 -4.647 -5.337 -6.041 -6.978 -7.917 -8.872 -10.075 -11.279 -12.494 -13.974 -15.734 -17.508 -19.551 -21.874 -24.469 -27.348 -30.772 -35.0 -39.546 -45.234 -51.998 -60.408 -70.856 -84.535 -102.885 -129.175 -155.97 -175.278 -190.062 -201.682 -211.325 -219.2 -225.832 -231.223 -236.354 -240.533 -244.113 -247.414 -250.391 -253.052 -255.41 -257.767 -259.801 -261.517 -263.246 -264.992 -266.403 -267.817 -269.229 -270.299 -271.387 -272.498 -273.607 -274.737 -275.512 -276.296 -277.5 -278.337 -279.191 -279.613 -280.469 -281.344 -282.254 -282.72 -283.604 -284.187 -284.698 -285.213 -286.292 -286.863 -287.445 -288.043 -288.694 -289.426 -290.253 -291.989 -4 ,14782 ,KEBNE ,17028125,Wed Dec 22 19:18:34 CET,Wed Dec 22 21:17:39 CET,0.0 1.256 1.468 1.529 1.527 1.488 1.426 1.339 1.121 1.005 0.882 0.496 0.468 0.31 -0.022 -0.372 -0.73 -0.918 -1.294 -1.678 -2.306 -2.724 -3.132 -3.778 -4.451 -5.122 -5.795 -6.484 -7.427 -8.377 -9.317 -10.508 -11.714 -12.914 -14.381 -16.119 -17.88 -19.918 -22.222 -24.792 -27.627 -31.006 -35.248 -39.824 -45.491 -52.316 -60.898 -71.542 -85.427 -104.089 -131.058 -158.608 -178.327 -193.381 -205.209 -214.967 -222.909 -229.659 -235.152 -240.328 -244.569 -248.202 -251.568 -254.609 -257.289 -259.661 -262.055 -264.127 -265.876 -267.637 -269.419 -270.853 -272.306 -273.79 -274.904 -276.027 -277.175 -278.344 -279.54 -280.354 -281.176 -282.428 -283.262 -284.098 -284.518 -285.355 -286.2 -287.064 -287.517 -288.392 -288.92 -289.402 -289.878 -290.846 -291.37 -291.907 -292.474 -293.075 -293.735 -294.541 -297.353 -5 ,19001 ,KEBNE ,17028126,Wed Dec 22 19:18:34 CET,Wed Dec 22 21:17:31 CET,0.0 1.814 2.091 2.173 2.205 2.185 2.13 2.053 1.822 1.684 1.545 1.142 1.11 0.942 0.579 0.203 -0.172 -0.362 -0.758 -1.16 -1.775 -2.192 -2.616 -3.277 -3.946 -4.614 -5.298 -5.993 -6.909 -7.843 -8.8 -10.008 -11.237 -12.478 -13.961 -15.699 -17.463 -19.508 -21.827 -24.418 -27.313 -30.786 -35.133 -39.774 -45.524 -52.437 -61.095 -71.809 -85.707 -104.337 -131.087 -158.269 -177.782 -192.673 -204.401 -214.089 -221.966 -228.729 -234.311 -239.564 -243.824 -247.439 -250.738 -253.743 -256.451 -258.849 -261.253 -263.312 -265.038 -266.776 -268.519 -269.924 -271.352 -272.793 -273.881 -274.969 -276.065 -277.178 -278.32 -279.096 -279.861 -281.009 -281.788 -282.589 -282.992 -283.788 -284.603 -285.458 -285.909 -286.774 -287.274 -287.737 -288.212 -289.181 -289.698 -290.229 -290.785 -291.383 -292.074 -292.918 -296.214 -6 ,10841 ,KEBNE ,17028127,Wed Dec 22 19:18:34 CET,Wed Dec 22 21:17:40 CET,0.0 2.187 2.381 2.47 2.505 2.482 2.436 2.357 2.129 2.006 1.875 1.466 1.422 1.258 0.901 0.527 0.147 -0.046 -0.445 -0.85 -1.469 -1.899 -2.324 -2.956 -3.618 -4.308 -5.007 -5.712 -6.639 -7.578 -8.538 -9.739 -10.957 -12.186 -13.676 -15.441 -17.232 -19.286 -21.6 -24.18 -27.047 -30.474 -34.732 -39.295 -44.984 -51.783 -60.303 -70.929 -84.872 -103.702 -130.78 -158.353 -178.144 -193.164 -204.925 -214.614 -222.515 -229.214 -234.656 -239.823 -244.078 -247.716 -251.041 -254.052 -256.734 -259.104 -261.492 -263.529 -265.25 -266.998 -268.782 -270.223 -271.649 -273.085 -274.18 -275.278 -276.381 -277.505 -278.628 -279.377 -280.147 -281.324 -282.113 -282.921 -283.334 -284.164 -284.998 -285.851 -286.283 -287.119 -287.607 -288.066 -288.541 -289.562 -290.079 -290.612 -291.205 -291.831 -292.509 -293.334 -295.992 -7 ,14615 ,KEBNE ,17028128,Wed Dec 22 19:18:35 CET,Wed Dec 22 21:17:13 CET,0.0 1.413 1.684 1.792 1.805 1.762 1.702 1.623 1.401 1.27 1.135 0.712 0.674 0.504 0.163 -0.203 -0.59 -0.782 -1.154 -1.533 -2.141 -2.566 -2.994 -3.644 -4.309 -4.965 -5.618 -6.28 -7.18 -8.1 -9.033 -10.2 -11.373 -12.551 -13.974 -15.676 -17.406 -19.386 -21.63 -24.146 -26.946 -30.273 -34.461 -39.035 -44.742 -51.597 -60.168 -70.816 -84.697 -103.337 -130.197 -157.469 -177.047 -191.975 -203.654 -213.271 -221.13 -227.787 -233.201 -238.369 -242.594 -246.182 -249.477 -252.471 -255.154 -257.517 -259.912 -261.981 -263.706 -265.437 -267.18 -268.575 -269.964 -271.383 -272.471 -273.564 -274.651 -275.75 -276.88 -277.641 -278.396 -279.545 -280.328 -281.132 -281.537 -282.34 -283.151 -283.976 -284.401 -285.238 -285.727 -286.178 -286.636 -287.593 -288.097 -288.628 -289.2 -289.827 -290.502 -291.355 -293.934 -8 ,22898 ,KEBNE ,17028129,Wed Dec 22 19:18:33 CET,Wed Dec 22 21:17:36 CET,0.0 2.497 2.714 2.819 2.874 2.869 2.818 2.745 2.554 2.436 2.303 1.89 1.857 1.704 1.394 1.073 0.711 0.522 0.135 -0.263 -0.859 -1.265 -1.686 -2.331 -2.989 -3.657 -4.317 -4.984 -5.897 -6.814 -7.751 -8.949 -10.161 -11.383 -12.846 -14.555 -16.287 -18.315 -20.642 -23.27 -26.156 -29.609 -33.953 -38.585 -44.338 -51.233 -59.892 -70.63 -84.636 -103.485 -130.512 -157.948 -177.661 -192.721 -204.492 -214.139 -221.967 -228.604 -234.03 -239.178 -243.376 -246.962 -250.248 -253.243 -255.933 -258.298 -260.697 -262.756 -264.473 -266.204 -267.959 -269.383 -270.832 -272.282 -273.353 -274.432 -275.54 -276.662 -277.768 -278.515 -279.273 -280.42 -281.197 -281.989 -282.399 -283.226 -284.063 -284.923 -285.358 -286.209 -286.703 -287.162 -287.623 -288.582 -289.086 -289.629 -290.194 -290.785 -291.452 -292.279 -294.65 -9 ,8338 ,KEBNE ,17028130,Wed Dec 22 19:18:33 CET,Wed Dec 22 21:17:39 CET,0.0 1.468 1.768 1.872 1.901 1.892 1.848 1.772 1.557 1.441 1.324 0.924 0.863 0.696 0.38 0.047 -0.312 -0.499 -0.867 -1.249 -1.864 -2.282 -2.697 -3.311 -3.949 -4.608 -5.269 -5.938 -6.848 -7.769 -8.699 -9.87 -11.057 -12.287 -13.799 -15.56 -17.305 -19.316 -21.603 -24.174 -27.063 -30.533 -34.838 -39.409 -45.088 -51.941 -60.501 -71.153 -85.227 -104.139 -131.167 -158.768 -178.676 -193.867 -205.719 -215.445 -223.421 -230.213 -235.687 -240.843 -245.063 -248.651 -251.968 -254.99 -257.678 -260.052 -262.442 -264.497 -266.244 -268.013 -269.772 -271.188 -272.609 -274.042 -275.134 -276.222 -277.324 -278.44 -279.573 -280.356 -281.152 -282.36 -283.173 -283.989 -284.401 -285.248 -286.104 -286.969 -287.414 -288.279 -288.776 -289.236 -289.713 -290.714 -291.24 -291.79 -292.377 -293.011 -293.707 -294.556 -296.601 -10 ,3780 ,KEBNE ,17028131,Wed Dec 22 19:18:33 CET,Wed Dec 22 21:17:21 CET,0.0 1.643 1.866 1.937 1.941 1.89 1.805 1.71 1.493 1.359 1.216 0.822 0.774 0.612 0.285 -0.057 -0.421 -0.611 -0.986 -1.378 -1.979 -2.381 -2.801 -3.442 -4.093 -4.761 -5.434 -6.119 -7.045 -7.975 -8.91 -10.101 -11.325 -12.569 -14.065 -15.796 -17.55 -19.595 -21.907 -24.493 -27.378 -30.829 -35.096 -39.635 -45.284 -52.112 -60.71 -71.395 -85.305 -103.967 -130.821 -158.178 -177.864 -192.89 -204.614 -214.275 -222.146 -228.805 -234.254 -239.41 -243.604 -247.189 -250.487 -253.47 -256.131 -258.495 -260.896 -262.953 -264.694 -266.473 -268.256 -269.694 -271.146 -272.595 -273.684 -274.791 -275.909 -277.035 -278.171 -278.926 -279.694 -280.91 -281.749 -282.586 -283.003 -283.847 -284.701 -285.58 -286.027 -286.882 -287.42 -287.902 -288.382 -289.382 -289.918 -290.462 -291.038 -291.676 -292.382 -293.287 -295.547 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt deleted file mode 100644 index 8e3a82a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23571 ,KEBNE ,17077004,Sat Dec 25 09:46:10 CET,Sat Dec 25 11:44:01 CET,0.0 2.831 3.535 4.041 4.424 4.731 5.007 5.264 5.728 5.943 6.138 6.371 6.664 6.837 7.18 7.504 7.804 7.948 8.217 8.455 8.808 9.047 9.267 9.576 9.883 10.169 10.451 10.735 11.099 11.454 11.803 12.234 12.654 13.057 13.499 13.979 14.464 15.005 15.611 16.266 16.981 17.791 18.733 19.706 20.828 22.117 23.651 25.502 27.885 30.872 34.505 37.308 38.889 39.974 40.686 41.156 41.472 41.71 41.872 41.952 41.948 41.918 41.89 41.811 41.691 41.541 41.349 41.185 41.057 40.922 40.776 40.66 40.502 40.302 40.143 39.967 39.768 39.555 39.347 39.194 39.028 38.766 38.574 38.368 38.247 37.984 37.729 37.478 37.348 37.113 36.867 36.682 36.473 36.016 35.762 35.469 35.131 34.729 34.198 33.474 31.564 -2 ,720 ,KEBNE ,17077005,Sat Dec 25 09:47:13 CET,Sat Dec 25 11:46:16 CET,0.0 2.785 3.389 3.816 4.159 4.452 4.702 4.926 5.351 5.546 5.728 5.986 6.265 6.419 6.744 7.063 7.363 7.515 7.798 8.061 8.454 8.691 8.918 9.278 9.615 9.924 10.213 10.495 10.881 11.252 11.618 12.073 12.525 12.967 13.454 14.013 14.585 15.219 15.911 16.656 17.437 18.317 19.342 20.403 21.679 23.096 24.735 26.625 28.964 31.842 35.142 37.809 39.485 40.462 41.028 41.395 41.58 41.658 41.683 41.632 41.535 41.448 41.334 41.169 40.985 40.818 40.631 40.441 40.274 40.088 39.888 39.707 39.496 39.278 39.081 38.851 38.626 38.404 38.176 38.008 37.829 37.522 37.282 37.04 36.926 36.689 36.407 36.095 35.936 35.684 35.407 35.214 34.995 34.503 34.229 33.936 33.613 33.226 32.719 31.926 29.162 -3 ,9664 ,KEBNE ,17077006,Sat Dec 25 09:47:13 CET,Sat Dec 25 11:45:10 CET,0.0 3.136 3.715 4.116 4.458 4.777 5.045 5.271 5.7 5.904 6.096 6.332 6.612 6.776 7.083 7.362 7.648 7.786 8.042 8.271 8.608 8.839 9.062 9.388 9.697 9.971 10.235 10.515 10.879 11.207 11.531 11.929 12.32 12.709 13.135 13.611 14.087 14.613 15.196 15.835 16.529 17.337 18.256 19.141 20.247 21.558 23.093 24.866 26.924 29.56 33.225 36.352 38.178 39.358 40.106 40.539 40.818 41.002 41.076 41.139 41.145 41.073 40.963 40.849 40.752 40.661 40.54 40.399 40.28 40.158 39.99 39.82 39.656 39.48 39.317 39.144 38.968 38.799 38.63 38.501 38.355 38.087 37.878 37.654 37.541 37.323 37.081 36.827 36.702 36.494 36.249 36.078 35.903 35.485 35.215 34.904 34.557 34.144 33.652 32.964 29.848 -4 ,12857 ,KEBNE ,17077007,Sat Dec 25 09:47:15 CET,Sat Dec 25 11:41:59 CET,0.0 1.973 2.59 3.017 3.392 3.735 4.014 4.247 4.652 4.851 5.044 5.299 5.573 5.725 6.012 6.296 6.571 6.705 6.954 7.191 7.542 7.77 8.001 8.347 8.671 8.969 9.26 9.549 9.932 10.314 10.69 11.139 11.562 11.984 12.462 12.993 13.524 14.108 14.736 15.431 16.189 17.052 18.09 19.145 20.387 21.827 23.479 25.34 27.56 30.22 33.504 36.286 37.926 38.924 39.488 39.798 40.007 40.108 40.099 40.01 39.892 39.755 39.605 39.49 39.38 39.266 39.153 39.048 38.931 38.791 38.659 38.539 38.377 38.207 38.07 37.911 37.727 37.517 37.306 37.161 36.995 36.714 36.511 36.306 36.2 35.965 35.701 35.386 35.222 34.959 34.673 34.479 34.274 33.816 33.548 33.245 32.918 32.517 32.039 31.314 28.409 -5 ,22241 ,KEBNE ,17077008,Sat Dec 25 09:47:18 CET,Sat Dec 25 11:43:08 CET,0.0 2.054 2.654 3.091 3.41 3.687 3.94 4.168 4.597 4.795 4.972 5.196 5.476 5.639 5.946 6.23 6.515 6.654 6.91 7.153 7.5 7.724 7.941 8.264 8.582 8.869 9.147 9.434 9.831 10.208 10.564 10.996 11.411 11.81 12.266 12.803 13.339 13.937 14.586 15.285 16.015 16.831 17.831 18.871 20.107 21.527 23.203 25.076 27.339 30.099 33.539 36.521 38.204 39.241 39.918 40.388 40.625 40.705 40.752 40.733 40.654 40.594 40.553 40.488 40.399 40.294 40.166 40.036 39.895 39.736 39.574 39.427 39.278 39.123 38.996 38.875 38.728 38.544 38.318 38.153 37.998 37.74 37.547 37.336 37.229 37.01 36.733 36.433 36.282 36.035 35.783 35.595 35.384 34.909 34.63 34.327 33.989 33.583 33.084 32.383 28.813 -6 ,9747 ,KEBNE ,17077009,Sat Dec 25 09:50:24 CET,Sat Dec 25 11:48:47 CET,0.0 2.867 3.405 3.797 4.165 4.5 4.77 5.006 5.481 5.709 5.913 6.146 6.427 6.598 6.942 7.271 7.588 7.739 8.007 8.26 8.621 8.843 9.063 9.392 9.713 10.017 10.307 10.594 10.978 11.339 11.667 12.085 12.51 12.912 13.357 13.861 14.36 14.93 15.572 16.293 17.067 17.916 18.915 19.944 21.177 22.585 24.261 26.204 28.551 31.509 35.326 38.446 40.175 41.272 42.013 42.528 42.827 43.031 43.138 43.149 43.101 43.035 42.966 42.872 42.755 42.617 42.442 42.276 42.147 42.005 41.835 41.69 41.516 41.328 41.202 41.075 40.924 40.751 40.559 40.437 40.307 40.068 39.914 39.753 39.658 39.448 39.216 38.965 38.838 38.618 38.368 38.189 37.999 37.576 37.33 37.063 36.76 36.384 35.907 35.222 31.8 -7 ,1086 ,KEBNE ,17077010,Sat Dec 25 09:50:24 CET,Sat Dec 25 11:49:10 CET,0.0 2.515 3.107 3.56 3.906 4.202 4.468 4.7 5.125 5.323 5.514 5.786 6.079 6.258 6.592 6.902 7.195 7.341 7.65 7.932 8.29 8.524 8.751 9.082 9.41 9.73 10.036 10.325 10.698 11.056 11.409 11.845 12.257 12.678 13.175 13.698 14.215 14.809 15.448 16.149 16.903 17.739 18.775 19.868 21.156 22.648 24.388 26.242 28.295 30.74 33.814 36.365 37.844 38.809 39.466 39.871 40.1 40.222 40.244 40.233 40.196 40.14 40.055 39.923 39.799 39.681 39.559 39.441 39.306 39.149 38.967 38.806 38.638 38.456 38.299 38.15 38.001 37.813 37.605 37.466 37.314 37.043 36.857 36.669 36.571 36.372 36.167 35.946 35.817 35.586 35.363 35.194 35.005 34.58 34.34 34.073 33.76 33.342 32.788 32.071 29.135 -8 ,29553 ,KEBNE ,17077011,Sat Dec 25 09:51:28 CET,Sat Dec 25 11:49:40 CET,0.0 2.505 3.182 3.602 3.943 4.246 4.531 4.796 5.251 5.456 5.65 5.897 6.18 6.347 6.656 6.953 7.248 7.387 7.66 7.918 8.279 8.516 8.729 9.048 9.38 9.686 9.981 10.279 10.652 11.019 11.387 11.821 12.244 12.665 13.155 13.708 14.257 14.857 15.493 16.194 16.956 17.823 18.855 19.923 21.185 22.613 24.307 26.217 28.45 31.189 34.709 37.783 39.619 40.699 41.418 41.974 42.345 42.57 42.649 42.661 42.647 42.603 42.512 42.381 42.25 42.125 41.972 41.809 41.641 41.454 41.263 41.093 40.895 40.686 40.538 40.392 40.232 40.044 39.866 39.738 39.591 39.352 39.18 39.009 38.913 38.704 38.496 38.275 38.147 37.926 37.704 37.521 37.329 36.882 36.605 36.313 35.982 35.611 35.163 34.525 32.052 -9 ,3737 ,KEBNE ,17077012,Sat Dec 25 09:53:34 CET,Sat Dec 25 11:51:05 CET,0.0 3.279 3.892 4.346 4.731 5.043 5.299 5.525 5.935 6.126 6.315 6.548 6.836 7.007 7.325 7.622 7.912 8.056 8.346 8.637 9.047 9.286 9.505 9.813 10.109 10.398 10.688 10.968 11.334 11.699 12.037 12.448 12.847 13.238 13.699 14.226 14.751 15.326 15.954 16.631 17.342 18.145 19.109 20.114 21.318 22.706 24.352 26.23 28.512 31.351 34.781 37.625 39.379 40.525 41.227 41.67 41.981 42.115 42.165 42.196 42.198 42.171 42.11 42.04 41.955 41.845 41.704 41.581 41.461 41.308 41.138 40.991 40.82 40.641 40.506 40.363 40.199 40.011 39.813 39.673 39.507 39.228 39.048 38.865 38.769 38.559 38.324 38.069 37.935 37.713 37.459 37.257 37.048 36.614 36.346 36.064 35.763 35.376 34.904 34.266 31.978 -10 ,32512 ,KEBNE ,17077013,Sat Dec 25 09:54:40 CET,Sat Dec 25 11:47:56 CET,0.0 2.926 3.519 3.921 4.248 4.554 4.835 5.079 5.55 5.764 5.957 6.206 6.499 6.665 6.984 7.299 7.598 7.736 8.014 8.281 8.646 8.87 9.089 9.421 9.758 10.076 10.363 10.663 11.068 11.462 11.842 12.284 12.707 13.12 13.645 14.241 14.782 15.382 16.035 16.747 17.515 18.368 19.376 20.414 21.648 23.087 24.765 26.668 28.964 31.716 35.129 37.99 39.731 40.844 41.497 41.982 42.324 42.517 42.59 42.567 42.522 42.492 42.436 42.357 42.266 42.167 42.044 41.938 41.839 41.711 41.544 41.391 41.236 41.073 40.933 40.774 40.617 40.431 40.217 40.064 39.896 39.628 39.433 39.213 39.098 38.872 38.623 38.351 38.213 37.973 37.691 37.495 37.287 36.765 36.463 36.146 35.792 35.378 34.857 34.146 31.273 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt deleted file mode 100644 index 40136e50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,31470 ,KEBNE ,16748857,Tue Nov 30 13:23:04 CET,Tue Nov 30 15:23:36 CET,0.0 2.81 3.533 4.089 4.565 4.995 5.394 5.767 6.488 6.81 7.098 7.559 7.957 8.238 8.786 9.304 9.811 10.054 10.512 10.963 11.643 12.089 12.538 13.192 13.814 14.42 15.006 15.564 16.283 16.999 17.729 18.627 19.482 20.312 21.294 22.416 23.508 24.726 26.086 27.554 29.098 30.9 33.103 35.391 38.152 41.308 45.111 49.587 55.1 62.112 71.302 79.8 85.319 89.107 91.861 93.971 95.602 96.891 97.86 98.682 99.22 99.618 99.952 100.203 100.377 100.551 100.734 100.863 100.97 101.036 101.038 101.013 100.97 100.9 100.839 100.789 100.724 100.611 100.478 100.39 100.297 100.127 99.986 99.827 99.734 99.526 99.291 99.035 98.901 98.742 98.456 98.283 98.091 97.683 97.43 97.119 96.739 96.281 95.698 94.795 88.03 -4 ,1759 ,KEBNE ,16748858,Tue Nov 30 13:24:10 CET,Tue Nov 30 15:30:41 CET,0.0 5.405 6.322 7.011 7.608 8.109 8.543 8.911 9.578 9.899 10.2 10.653 11.055 11.347 11.913 12.431 12.907 13.15 13.639 14.108 14.789 15.227 15.653 16.284 16.892 17.47 18.046 18.614 19.36 20.103 20.837 21.72 22.572 23.42 24.44 25.609 26.755 28.048 29.441 30.939 32.553 34.42 36.685 39.013 41.809 45.089 49.074 53.754 59.537 66.91 76.661 85.591 91.402 95.365 98.203 100.491 102.182 103.451 104.392 105.243 105.928 106.455 106.888 107.18 107.366 107.529 107.651 107.707 107.741 107.766 107.776 107.756 107.717 107.675 107.64 107.586 107.505 107.424 107.327 107.237 107.131 106.956 106.822 106.665 106.577 106.391 106.181 105.95 105.82 105.654 105.321 105.129 104.912 104.434 104.163 103.845 103.472 103.022 102.423 101.531 95.726 -5 ,30881 ,KEBNE ,16748859,Tue Nov 30 13:31:42 CET,Tue Nov 30 15:33:42 CET,0.0 2.757 3.517 4.073 4.556 4.994 5.384 5.737 6.401 6.72 7.022 7.476 7.854 8.113 8.622 9.099 9.57 9.809 10.268 10.715 11.355 11.775 12.195 12.793 13.358 13.916 14.468 15.019 15.758 16.469 17.176 18.064 18.921 19.761 20.752 21.9 23.035 24.282 25.65 27.127 28.744 30.628 32.908 35.333 38.215 41.497 45.49 50.284 56.246 63.828 73.857 82.991 88.848 92.904 95.88 98.215 100.075 101.564 102.677 103.686 104.464 105.045 105.512 105.905 106.23 106.487 106.719 106.904 107.043 107.156 107.241 107.308 107.369 107.421 107.451 107.462 107.472 107.467 107.439 107.416 107.375 107.291 107.231 107.148 107.099 106.996 106.876 106.729 106.646 106.542 106.309 106.191 106.058 105.725 105.534 105.306 105.034 104.709 104.255 103.557 98.77 -6 ,28423 ,KEBNE ,16748860,Tue Nov 30 13:31:46 CET,Tue Nov 30 15:46:46 CET,0.0 2.462 3.483 4.253 4.895 5.476 6.024 6.528 7.419 7.829 8.225 8.814 9.238 9.521 10.028 10.49 10.955 11.19 11.653 12.083 12.705 13.121 13.529 14.135 14.719 15.283 15.842 16.382 17.084 17.779 18.496 19.421 20.329 21.212 22.231 23.374 24.483 25.711 27.053 28.528 30.145 32.041 34.29 36.579 39.381 42.632 46.542 51.151 56.79 63.993 73.738 82.559 88.083 91.913 94.745 96.967 98.592 99.848 100.865 101.733 102.362 102.87 103.278 103.615 103.884 104.042 104.131 104.212 104.29 104.342 104.333 104.318 104.297 104.234 104.173 104.091 104.001 103.929 103.834 103.738 103.629 103.45 103.325 103.17 103.081 102.888 102.679 102.464 102.336 102.18 101.867 101.672 101.466 101.045 100.808 100.504 100.127 99.715 99.216 98.401 90.199 -7 ,29850 ,KEBNE ,16748861,Tue Nov 30 13:41:10 CET,Tue Nov 30 15:41:03 CET,0.0 3.066 3.918 4.558 5.103 5.569 5.982 6.367 7.067 7.406 7.734 8.234 8.636 8.93 9.49 10.007 10.5 10.74 11.212 11.671 12.312 12.73 13.14 13.744 14.331 14.884 15.442 16.005 16.736 17.44 18.12 18.948 19.771 20.577 21.534 22.644 23.742 24.982 26.349 27.859 29.489 31.363 33.631 35.961 38.749 42.031 46.079 50.812 56.562 63.926 73.854 83.039 88.911 93.049 96.066 98.442 100.26 101.643 102.687 103.586 104.272 104.855 105.35 105.725 106.029 106.286 106.53 106.719 106.827 106.911 107.01 107.08 107.119 107.142 107.161 107.149 107.081 106.998 106.918 106.85 106.788 106.701 106.641 106.551 106.489 106.361 106.229 106.073 105.977 105.865 105.646 105.517 105.374 105.054 104.854 104.602 104.32 103.982 103.558 102.921 98.793 -8 ,18011 ,KEBNE ,16748862,Tue Nov 30 13:41:10 CET,Tue Nov 30 15:40:53 CET,0.0 3.205 4.12 4.796 5.355 5.841 6.29 6.732 7.539 7.914 8.273 8.802 9.227 9.524 10.078 10.612 11.112 11.351 11.814 12.279 12.967 13.403 13.839 14.486 15.119 15.736 16.329 16.908 17.663 18.388 19.1 19.978 20.811 21.631 22.631 23.788 24.903 26.14 27.509 28.984 30.595 32.479 34.721 37.074 39.911 43.205 47.201 51.91 57.772 65.286 75.172 84.325 90.411 94.539 97.422 99.662 101.371 102.683 103.684 104.568 105.207 105.669 106.058 106.387 106.667 106.86 107.0 107.115 107.183 107.24 107.273 107.262 107.225 107.186 107.146 107.076 106.975 106.862 106.739 106.641 106.535 106.37 106.251 106.107 106.021 105.809 105.57 105.319 105.185 105.032 104.763 104.609 104.421 103.958 103.69 103.388 103.043 102.626 102.109 101.306 96.596 -9 ,16497 ,KEBNE ,16748863,Tue Nov 30 13:41:10 CET,Tue Nov 30 15:40:53 CET,0.0 3.154 4.039 4.633 5.126 5.623 6.075 6.463 7.186 7.512 7.807 8.292 8.717 9.008 9.56 10.095 10.617 10.862 11.311 11.766 12.457 12.891 13.316 13.934 14.556 15.182 15.764 16.329 17.07 17.787 18.479 19.299 20.101 20.903 21.843 22.919 24.001 25.234 26.57 28.025 29.62 31.464 33.677 35.933 38.659 41.912 45.863 50.455 56.025 63.119 72.673 81.443 87.117 91.107 94.001 96.128 97.739 99.024 100.017 100.905 101.539 102.036 102.421 102.748 103.025 103.207 103.355 103.467 103.527 103.554 103.557 103.537 103.498 103.447 103.378 103.284 103.187 103.093 102.999 102.912 102.816 102.665 102.529 102.359 102.28 102.134 101.957 101.725 101.598 101.462 101.195 101.005 100.776 100.295 100.026 99.707 99.298 98.803 98.216 97.377 92.281 -10 ,22193 ,KEBNE ,16748864,Tue Nov 30 13:41:10 CET,Tue Nov 30 15:42:28 CET,0.0 4.397 5.475 6.229 6.851 7.429 7.979 8.474 9.345 9.747 10.135 10.736 11.181 11.481 12.065 12.622 13.148 13.397 13.872 14.338 15.034 15.497 15.95 16.604 17.24 17.847 18.432 19.014 19.783 20.552 21.305 22.215 23.12 24.011 25.051 26.229 27.349 28.589 29.96 31.446 33.078 34.957 37.201 39.533 42.323 45.589 49.483 54.056 59.697 66.823 76.349 85.001 90.45 94.136 96.747 98.892 100.6 101.933 102.982 103.848 104.446 104.901 105.265 105.581 105.855 106.077 106.271 106.407 106.504 106.584 106.65 106.689 106.714 106.732 106.728 106.716 106.7 106.674 106.616 106.564 106.502 106.377 106.287 106.182 106.117 105.977 105.834 105.663 105.562 105.439 105.222 105.079 104.917 104.552 104.33 104.08 103.787 103.432 103.003 102.294 99.56 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt deleted file mode 100644 index c609cdfc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2146 ,KEBNE ,16748865,Tue Nov 30 13:41:11 CET,Tue Nov 30 15:41:11 CET,0.0 1.108 1.518 1.798 2.056 2.296 2.5 2.722 3.186 3.407 3.615 3.878 4.164 4.33 4.649 4.947 5.231 5.368 5.639 5.906 6.275 6.495 6.71 7.028 7.332 7.619 7.882 8.142 8.474 8.785 9.102 9.51 9.894 10.261 10.688 11.142 11.563 12.02 12.513 13.047 13.607 14.23 14.964 15.702 16.538 17.407 18.379 19.451 20.619 21.863 23.113 23.874 24.037 23.97 23.773 23.436 23.07 22.751 22.479 22.202 21.933 21.647 21.333 21.01 20.722 20.455 20.172 19.909 19.683 19.451 19.182 18.963 18.749 18.515 18.329 18.139 17.937 17.725 17.499 17.329 17.15 16.873 16.68 16.473 16.358 16.119 15.867 15.598 15.45 15.182 14.936 14.755 14.562 14.114 13.862 13.587 13.267 12.902 12.439 11.771 8.247 -2 ,20194 ,KEBNE ,16748866,Tue Nov 30 13:41:11 CET,Tue Nov 30 15:41:23 CET,0.0 0.993 1.366 1.71 2.008 2.258 2.484 2.697 3.09 3.265 3.437 3.647 3.914 4.073 4.38 4.651 4.904 5.028 5.26 5.47 5.77 5.968 6.158 6.432 6.696 6.946 7.177 7.41 7.722 8.014 8.293 8.636 8.976 9.303 9.679 10.108 10.515 10.962 11.468 11.989 12.524 13.119 13.797 14.501 15.318 16.196 17.185 18.261 19.504 20.876 22.284 23.15 23.371 23.394 23.353 23.212 23.026 22.833 22.6 22.332 22.097 21.828 21.543 21.282 21.024 20.771 20.502 20.265 20.054 19.838 19.617 19.424 19.222 19.007 18.835 18.656 18.472 18.271 18.043 17.88 17.71 17.448 17.259 17.047 16.937 16.715 16.479 16.219 16.07 15.824 15.594 15.415 15.228 14.777 14.531 14.26 13.932 13.525 13.017 12.313 8.736 -3 ,23244 ,KEBNE ,16748867,Tue Nov 30 13:41:11 CET,Tue Nov 30 15:41:08 CET,0.0 1.103 1.486 1.786 2.068 2.312 2.537 2.758 3.145 3.311 3.469 3.661 3.92 4.06 4.319 4.581 4.827 4.946 5.179 5.397 5.72 5.935 6.149 6.456 6.746 7.031 7.311 7.58 7.917 8.24 8.546 8.894 9.244 9.594 9.99 10.44 10.864 11.312 11.796 12.3 12.818 13.414 14.109 14.79 15.552 16.347 17.261 18.277 19.408 20.676 21.915 22.575 22.726 22.616 22.415 22.123 21.799 21.495 21.213 20.884 20.551 20.249 19.939 19.623 19.336 19.076 18.795 18.548 18.348 18.134 17.866 17.613 17.369 17.135 16.954 16.746 16.505 16.257 15.999 15.831 15.657 15.367 15.163 14.951 14.839 14.6 14.329 14.038 13.89 13.636 13.429 13.263 13.07 12.63 12.385 12.1 11.778 11.4 10.934 10.266 6.496 -4 ,26796 ,KEBNE ,16748868,Tue Nov 30 13:44:20 CET,Tue Nov 30 15:47:39 CET,0.0 1.382 1.835 2.168 2.468 2.743 2.986 3.217 3.645 3.856 4.059 4.304 4.597 4.759 5.074 5.368 5.642 5.775 6.028 6.262 6.595 6.815 7.035 7.361 7.678 7.978 8.256 8.524 8.872 9.193 9.502 9.875 10.234 10.579 10.953 11.358 11.741 12.167 12.637 13.134 13.636 14.193 14.856 15.52 16.276 17.099 18.038 19.062 20.205 21.413 22.611 23.382 23.618 23.552 23.325 23.055 22.781 22.469 22.159 21.843 21.555 21.263 20.955 20.651 20.345 20.063 19.768 19.505 19.28 19.031 18.784 18.578 18.356 18.12 17.936 17.742 17.52 17.281 17.016 16.824 16.643 16.362 16.146 15.931 15.828 15.601 15.353 15.086 14.935 14.671 14.45 14.264 14.071 13.654 13.41 13.138 12.836 12.473 11.979 11.253 7.85 -5 ,20651 ,KEBNE ,16748869,Tue Nov 30 13:44:21 CET,Tue Nov 30 15:44:49 CET,0.0 1.097 1.49 1.796 2.071 2.336 2.579 2.794 3.171 3.345 3.521 3.756 4.032 4.175 4.455 4.728 4.988 5.113 5.356 5.583 5.91 6.123 6.326 6.609 6.884 7.144 7.379 7.607 7.915 8.209 8.495 8.838 9.167 9.484 9.852 10.267 10.651 11.058 11.494 11.969 12.485 13.105 13.874 14.615 15.483 16.462 17.537 18.711 20.01 21.47 23.036 24.008 24.326 24.365 24.286 24.098 23.794 23.459 23.149 22.818 22.499 22.18 21.848 21.512 21.204 20.933 20.638 20.349 20.099 19.846 19.569 19.345 19.118 18.868 18.692 18.522 18.326 18.119 17.909 17.755 17.585 17.32 17.136 16.944 16.841 16.604 16.333 16.048 15.901 15.646 15.398 15.211 15.022 14.577 14.327 14.063 13.751 13.366 12.907 12.284 8.851 -6 ,17399 ,KEBNE ,16748870,Tue Nov 30 13:44:21 CET,Tue Nov 30 15:44:01 CET,0.0 1.445 1.971 2.365 2.702 3.023 3.313 3.586 4.081 4.307 4.517 4.77 5.066 5.247 5.585 5.884 6.161 6.296 6.561 6.81 7.165 7.396 7.616 7.927 8.227 8.516 8.785 9.054 9.4 9.71 10.019 10.399 10.737 11.053 11.433 11.859 12.257 12.7 13.183 13.685 14.187 14.74 15.397 16.067 16.834 17.645 18.547 19.596 20.781 22.028 23.368 24.171 24.395 24.344 24.12 23.806 23.444 23.062 22.719 22.403 22.105 21.796 21.471 21.123 20.784 20.467 20.122 19.803 19.533 19.263 18.977 18.734 18.493 18.246 18.038 17.839 17.649 17.436 17.206 17.046 16.875 16.596 16.404 16.206 16.105 15.883 15.637 15.369 15.223 14.964 14.739 14.566 14.383 13.977 13.734 13.456 13.145 12.79 12.323 11.665 8.78 -7 ,21404 ,KEBNE ,16748871,Tue Nov 30 13:46:31 CET,Tue Nov 30 15:48:12 CET,0.0 1.179 1.729 2.159 2.485 2.766 3.027 3.261 3.691 3.903 4.108 4.353 4.646 4.816 5.148 5.463 5.755 5.892 6.17 6.451 6.845 7.079 7.301 7.623 7.93 8.234 8.524 8.791 9.139 9.485 9.81 10.196 10.579 10.94 11.333 11.759 12.151 12.596 13.088 13.591 14.124 14.73 15.441 16.154 16.956 17.824 18.738 19.689 20.802 22.04 23.303 24.024 24.213 24.133 23.896 23.587 23.219 22.832 22.51 22.164 21.846 21.565 21.257 20.922 20.606 20.309 20.013 19.779 19.559 19.317 19.061 18.833 18.589 18.33 18.117 17.894 17.669 17.433 17.195 17.033 16.855 16.549 16.333 16.101 15.979 15.724 15.453 15.176 15.018 14.74 14.478 14.279 14.074 13.62 13.354 13.063 12.742 12.364 11.888 11.163 7.56 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt deleted file mode 100644 index b6da5a0e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5187 ,KEBNE ,17028132,Wed Dec 22 19:18:34 CET,Wed Dec 22 21:17:41 CET,0.0 2.469 3.112 3.543 3.86 4.118 4.345 4.555 4.908 5.045 5.161 5.079 5.522 5.619 5.791 5.939 6.081 6.16 6.303 6.43 6.612 6.713 6.803 6.927 7.03 7.119 7.208 7.285 7.371 7.448 7.512 7.587 7.639 7.665 7.679 7.674 7.672 7.667 7.631 7.521 7.337 7.101 6.804 6.465 5.992 5.322 4.337 2.982 0.955 -2.102 -6.95 -12.599 -16.96 -20.396 -23.238 -25.666 -27.709 -29.533 -31.066 -32.556 -33.806 -34.906 -35.931 -36.878 -37.745 -38.533 -39.352 -40.066 -40.683 -41.316 -41.957 -42.484 -43.007 -43.555 -43.995 -44.463 -44.966 -45.478 -46.017 -46.392 -46.776 -47.387 -47.813 -48.248 -48.471 -48.944 -49.44 -49.965 -50.243 -50.903 -51.123 -51.426 -51.726 -52.436 -52.844 -53.273 -53.749 -54.308 -54.977 -55.839 -58.786 -2 ,18285 ,KEBNE ,17028133,Wed Dec 22 19:18:33 CET,Wed Dec 22 21:17:24 CET,0.0 2.472 3.085 3.474 3.786 4.047 4.241 4.413 4.727 4.867 5.003 4.94 5.373 5.471 5.665 5.827 5.975 6.048 6.181 6.303 6.466 6.565 6.649 6.754 6.85 6.932 6.999 7.064 7.148 7.223 7.292 7.362 7.405 7.438 7.452 7.454 7.459 7.425 7.375 7.317 7.228 7.076 6.836 6.553 6.096 5.431 4.514 3.207 1.241 -1.789 -6.497 -11.873 -16.108 -19.514 -22.313 -24.7 -26.756 -28.574 -30.095 -31.567 -32.833 -33.951 -35.0 -35.983 -36.859 -37.622 -38.413 -39.112 -39.697 -40.286 -40.917 -41.453 -41.989 -42.554 -42.995 -43.432 -43.893 -44.382 -44.861 -45.188 -45.526 -46.05 -46.407 -46.76 -46.943 -47.333 -47.777 -48.253 -48.496 -49.127 -49.285 -49.556 -49.845 -50.485 -50.862 -51.288 -51.744 -52.235 -52.794 -53.532 -56.096 -3 ,28150 ,KEBNE ,17028134,Wed Dec 22 19:18:34 CET,Wed Dec 22 21:17:04 CET,0.0 2.596 3.202 3.626 3.965 4.229 4.46 4.66 4.978 5.116 5.248 5.163 5.583 5.67 5.812 5.944 6.069 6.128 6.247 6.363 6.516 6.616 6.706 6.814 6.912 7.0 7.076 7.145 7.214 7.263 7.313 7.357 7.38 7.386 7.381 7.369 7.353 7.324 7.267 7.163 7.017 6.821 6.521 6.167 5.703 5.052 4.065 2.6 0.423 -2.859 -8.058 -13.772 -18.309 -21.901 -24.755 -27.283 -29.437 -31.282 -32.805 -34.268 -35.521 -36.619 -37.628 -38.554 -39.427 -40.222 -41.024 -41.73 -42.34 -42.98 -43.642 -44.179 -44.712 -45.259 -45.712 -46.197 -46.704 -47.214 -47.723 -48.067 -48.415 -48.967 -49.333 -49.677 -49.851 -50.21 -50.586 -51.002 -51.23 -51.848 -51.965 -52.225 -52.499 -53.115 -53.443 -53.792 -54.197 -54.67 -55.24 -55.984 -58.35 -4 ,4469 ,KEBNE ,17028135,Wed Dec 22 19:18:34 CET,Wed Dec 22 21:17:11 CET,0.0 2.534 3.136 3.558 3.884 4.161 4.411 4.619 4.966 5.124 5.276 5.227 5.67 5.78 5.989 6.175 6.339 6.413 6.558 6.692 6.859 6.965 7.061 7.183 7.29 7.382 7.491 7.6 7.689 7.76 7.824 7.873 7.896 7.918 7.958 7.97 7.935 7.894 7.84 7.751 7.632 7.47 7.215 6.872 6.343 5.642 4.651 3.261 1.321 -1.508 -6.078 -11.286 -15.401 -18.786 -21.57 -23.917 -25.895 -27.677 -29.207 -30.705 -31.951 -33.029 -34.051 -35.017 -35.923 -36.731 -37.543 -38.252 -38.841 -39.444 -40.082 -40.608 -41.174 -41.772 -42.238 -42.732 -43.236 -43.724 -44.204 -44.531 -44.858 -45.389 -45.784 -46.201 -46.411 -46.832 -47.274 -47.733 -47.973 -48.593 -48.72 -49.003 -49.293 -49.89 -50.228 -50.624 -51.118 -51.719 -52.458 -53.486 -57.234 -5 ,9817 ,KEBNE ,17028136,Wed Dec 22 19:18:32 CET,Wed Dec 22 21:17:03 CET,0.0 2.364 2.963 3.36 3.675 3.93 4.131 4.295 4.573 4.704 4.834 4.74 5.161 5.26 5.424 5.565 5.683 5.74 5.84 5.921 6.033 6.101 6.17 6.262 6.335 6.409 6.48 6.546 6.619 6.678 6.736 6.796 6.838 6.865 6.88 6.865 6.815 6.758 6.683 6.563 6.391 6.154 5.839 5.434 4.873 4.175 3.181 1.719 -0.378 -3.337 -8.006 -13.38 -17.706 -21.211 -24.118 -26.618 -28.716 -30.553 -32.082 -33.614 -34.932 -36.06 -37.103 -38.072 -38.947 -39.75 -40.574 -41.281 -41.88 -42.494 -43.102 -43.605 -44.156 -44.741 -45.199 -45.668 -46.166 -46.653 -47.113 -47.431 -47.766 -48.304 -48.682 -49.086 -49.296 -49.721 -50.165 -50.635 -50.886 -51.522 -51.675 -51.953 -52.244 -52.892 -53.229 -53.582 -53.969 -54.429 -54.998 -55.783 -59.282 -6 ,29546 ,KEBNE ,17028137,Wed Dec 22 19:18:32 CET,Wed Dec 22 21:16:43 CET,0.0 3.503 4.109 4.545 4.876 5.12 5.324 5.497 5.806 5.938 6.059 5.968 6.38 6.476 6.638 6.784 6.923 6.981 7.1 7.211 7.34 7.415 7.486 7.563 7.625 7.677 7.719 7.768 7.838 7.897 7.941 7.976 7.985 7.987 7.976 7.933 7.89 7.838 7.748 7.619 7.442 7.164 6.807 6.414 5.885 5.189 4.234 2.918 0.987 -1.836 -6.327 -11.386 -15.446 -18.769 -21.465 -23.829 -25.854 -27.637 -29.126 -30.565 -31.786 -32.861 -33.885 -34.796 -35.623 -36.384 -37.164 -37.856 -38.451 -39.031 -39.603 -40.094 -40.592 -41.107 -41.51 -41.932 -42.371 -42.806 -43.26 -43.575 -43.895 -44.393 -44.73 -45.067 -45.246 -45.614 -45.989 -46.404 -46.62 -47.22 -47.362 -47.639 -47.919 -48.538 -48.874 -49.242 -49.653 -50.138 -50.739 -51.58 -54.789 -7 ,20615 ,KEBNE ,17028138,Wed Dec 22 19:18:34 CET,Wed Dec 22 21:17:03 CET,0.0 2.895 3.561 3.99 4.342 4.636 4.871 5.082 5.413 5.536 5.654 5.572 5.979 6.069 6.241 6.404 6.55 6.613 6.733 6.841 6.99 7.08 7.165 7.269 7.337 7.402 7.461 7.513 7.573 7.631 7.688 7.734 7.757 7.759 7.753 7.713 7.641 7.556 7.444 7.304 7.138 6.908 6.59 6.222 5.729 5.068 4.109 2.755 0.839 -1.982 -6.593 -11.693 -15.744 -19.12 -21.961 -24.435 -26.502 -28.303 -29.824 -31.299 -32.551 -33.655 -34.717 -35.713 -36.601 -37.384 -38.168 -38.865 -39.483 -40.121 -40.766 -41.308 -41.873 -42.444 -42.893 -43.369 -43.854 -44.338 -44.831 -45.175 -45.529 -46.083 -46.459 -46.847 -47.044 -47.445 -47.868 -48.321 -48.571 -49.222 -49.409 -49.679 -49.962 -50.626 -51.0 -51.393 -51.827 -52.336 -52.946 -53.771 -56.741 -8 ,8575 ,KEBNE ,17028139,Wed Dec 22 19:18:33 CET,Wed Dec 22 21:17:20 CET,0.0 2.282 2.889 3.317 3.632 3.875 4.087 4.263 4.571 4.713 4.846 4.752 5.156 5.236 5.408 5.583 5.732 5.795 5.898 5.981 6.099 6.17 6.24 6.332 6.4 6.472 6.534 6.578 6.645 6.701 6.735 6.785 6.833 6.854 6.852 6.843 6.827 6.796 6.736 6.621 6.459 6.265 5.96 5.57 5.05 4.358 3.363 1.915 -0.102 -2.979 -7.652 -13.022 -17.337 -20.853 -23.679 -26.089 -28.107 -29.887 -31.39 -32.862 -34.134 -35.242 -36.243 -37.13 -37.956 -38.74 -39.543 -40.215 -40.766 -41.344 -41.949 -42.449 -42.973 -43.528 -43.95 -44.372 -44.805 -45.245 -45.7 -46.026 -46.366 -46.897 -47.263 -47.647 -47.847 -48.261 -48.695 -49.13 -49.356 -49.988 -50.15 -50.438 -50.728 -51.373 -51.739 -52.121 -52.557 -53.099 -53.759 -54.612 -58.207 -9 ,28110 ,KEBNE ,17028140,Wed Dec 22 19:18:32 CET,Wed Dec 22 21:17:59 CET,0.0 3.219 3.833 4.262 4.575 4.839 5.064 5.279 5.665 5.82 5.962 5.904 6.347 6.455 6.656 6.824 6.965 7.031 7.155 7.256 7.378 7.456 7.535 7.651 7.753 7.843 7.924 7.988 8.075 8.166 8.256 8.334 8.367 8.399 8.423 8.436 8.45 8.432 8.372 8.279 8.121 7.9 7.627 7.294 6.789 6.101 5.183 3.837 1.885 -1.033 -5.821 -11.222 -15.49 -18.955 -21.812 -24.307 -26.34 -28.094 -29.615 -31.139 -32.45 -33.558 -34.572 -35.513 -36.381 -37.154 -37.938 -38.64 -39.279 -39.96 -40.64 -41.193 -41.776 -42.391 -42.866 -43.34 -43.834 -44.337 -44.843 -45.211 -45.59 -46.154 -46.546 -46.953 -47.155 -47.56 -47.989 -48.443 -48.692 -49.328 -49.507 -49.798 -50.089 -50.71 -51.049 -51.429 -51.876 -52.392 -53.03 -53.943 -57.058 -10 ,29551 ,KEBNE ,17028141,Wed Dec 22 19:18:34 CET,Wed Dec 22 21:16:59 CET,0.0 2.443 3.051 3.47 3.794 4.045 4.275 4.471 4.781 4.913 5.036 4.938 5.363 5.467 5.654 5.828 5.976 6.041 6.165 6.281 6.424 6.514 6.596 6.707 6.805 6.879 6.941 6.994 7.056 7.124 7.19 7.234 7.241 7.236 7.232 7.217 7.182 7.108 7.003 6.878 6.716 6.519 6.248 5.909 5.405 4.661 3.658 2.37 0.501 -2.441 -7.368 -12.99 -17.321 -20.783 -23.69 -26.196 -28.307 -30.184 -31.781 -33.344 -34.675 -35.818 -36.875 -37.878 -38.797 -39.613 -40.437 -41.152 -41.76 -42.405 -43.102 -43.649 -44.181 -44.734 -45.171 -45.622 -46.088 -46.58 -47.089 -47.442 -47.806 -48.367 -48.75 -49.142 -49.341 -49.733 -50.157 -50.611 -50.835 -51.457 -51.62 -51.918 -52.215 -52.853 -53.241 -53.697 -54.178 -54.733 -55.449 -56.4 -60.863 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_11_10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_11_10.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_11_10.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_4_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_4_3.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_4_3.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_7_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_7_6.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_7_6.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_7_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_7_Example-1.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_7_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_6.txt deleted file mode 100644 index 5fbbf523..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_6.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,17786 ,KEBNE ,16748967,Tue Nov 30 16:37:28 CET,Tue Nov 30 18:11:39 CET,0.0 1.171 1.631 2.004 2.297 2.529 2.734 2.926 3.286 3.456 3.611 3.441 4.033 4.168 4.428 4.678 4.919 5.036 5.262 5.488 5.839 6.059 6.265 6.573 6.863 7.144 7.414 7.686 8.043 8.366 8.684 9.095 9.489 9.857 10.285 10.758 11.228 11.76 12.327 12.939 13.598 14.355 15.243 16.126 17.123 18.264 19.653 21.236 23.14 25.467 28.356 30.706 32.058 32.955 33.551 33.949 34.188 34.307 34.326 34.304 34.262 34.194 34.107 34.0 33.879 33.764 33.635 33.502 33.373 33.25 33.103 32.96 32.785 32.591 32.466 32.339 32.188 32.014 31.827 31.691 31.55 31.322 31.159 30.996 30.907 30.704 30.492 30.281 30.175 29.625 29.755 29.605 29.449 29.111 28.917 28.697 28.453 28.161 27.783 27.252 25.735 -4 ,26918 ,KEBNE ,16748968,Tue Nov 30 16:43:48 CET,Tue Nov 30 18:21:56 CET,0.0 1.35 1.795 2.126 2.406 2.658 2.874 3.067 3.433 3.607 3.771 3.62 4.217 4.355 4.612 4.862 5.106 5.229 5.459 5.671 5.97 6.174 6.38 6.661 6.935 7.207 7.473 7.729 8.055 8.378 8.706 9.101 9.482 9.856 10.289 10.781 11.254 11.796 12.382 12.982 13.607 14.317 15.173 16.054 17.108 18.295 19.672 21.243 23.125 25.426 28.29 30.691 32.1 33.004 33.605 33.988 34.228 34.347 34.361 34.36 34.342 34.3 34.222 34.13 34.033 33.921 33.776 33.622 33.486 33.353 33.218 33.091 32.946 32.787 32.654 32.517 32.373 32.217 32.035 31.895 31.759 31.554 31.409 31.259 31.175 30.986 30.788 30.577 30.461 29.916 30.077 29.928 29.771 29.404 29.202 28.985 28.742 28.449 28.079 27.554 26.088 -5 ,30486 ,KEBNE ,16748969,Tue Nov 30 16:54:17 CET,Tue Nov 30 18:27:42 CET,0.0 1.379 1.87 2.281 2.617 2.892 3.146 3.38 3.822 4.019 4.194 4.084 4.699 4.857 5.161 5.441 5.697 5.82 6.066 6.309 6.653 6.864 7.061 7.345 7.632 7.914 8.187 8.453 8.803 9.136 9.455 9.851 10.227 10.588 11.017 11.497 11.945 12.448 13.002 13.589 14.206 14.909 15.748 16.625 17.666 18.832 20.193 21.76 23.626 25.886 28.732 31.133 32.55 33.411 33.887 34.204 34.43 34.552 34.585 34.597 34.572 34.494 34.394 34.274 34.147 34.039 33.913 33.785 33.67 33.54 33.407 33.299 33.172 33.027 32.903 32.773 32.639 32.497 32.339 32.218 32.088 31.893 31.756 31.592 31.507 31.33 31.128 30.922 30.809 30.261 30.415 30.264 30.107 29.761 29.563 29.344 29.097 28.797 28.436 27.938 26.547 -6 ,24057 ,KEBNE ,16748970,Tue Nov 30 16:54:17 CET,Tue Nov 30 18:28:45 CET,0.0 1.283 1.699 2.016 2.281 2.511 2.716 2.916 3.293 3.464 3.621 3.477 4.073 4.209 4.473 4.721 4.963 5.083 5.317 5.536 5.843 6.041 6.243 6.536 6.814 7.08 7.341 7.606 7.941 8.257 8.557 8.914 9.271 9.633 10.06 10.541 11.01 11.534 12.094 12.676 13.314 14.05 14.907 15.783 16.818 17.994 19.354 20.912 22.788 25.036 27.855 30.292 31.716 32.557 33.036 33.324 33.525 33.667 33.723 33.717 33.688 33.639 33.572 33.476 33.349 33.223 33.112 32.996 32.871 32.743 32.59 32.434 32.268 32.099 31.952 31.789 31.619 31.445 31.271 31.149 31.019 30.803 30.643 30.47 30.382 30.212 30.019 29.808 29.692 29.149 29.324 29.182 29.034 28.67 28.463 28.245 27.985 27.672 27.32 26.828 25.331 -7 ,2329 ,KEBNE ,16748971,Tue Nov 30 16:58:30 CET,Tue Nov 30 18:33:42 CET,0.0 1.154 1.598 1.956 2.23 2.472 2.695 2.896 3.278 3.455 3.618 3.464 4.054 4.191 4.463 4.725 4.97 5.091 5.327 5.553 5.871 6.067 6.258 6.549 6.84 7.12 7.393 7.649 7.973 8.295 8.606 8.975 9.331 9.677 10.075 10.54 11.013 11.529 12.07 12.655 13.287 14.03 14.888 15.758 16.802 17.968 19.305 20.853 22.728 24.976 27.832 30.27 31.678 32.517 33.08 33.473 33.687 33.791 33.804 33.765 33.727 33.672 33.582 33.48 33.369 33.265 33.133 32.988 32.864 32.727 32.557 32.406 32.25 32.078 31.945 31.813 31.667 31.503 31.333 31.217 31.093 30.882 30.729 30.578 30.498 30.32 30.14 29.935 29.816 29.271 29.446 29.298 29.137 28.793 28.605 28.404 28.17 27.857 27.45 26.971 25.548 -8 ,13687 ,KEBNE ,16748972,Tue Nov 30 17:30:16 CET,Tue Nov 30 19:04:15 CET,0.0 1.815 2.328 2.683 2.983 3.24 3.458 3.659 4.002 4.167 4.331 4.161 4.745 4.876 5.122 5.356 5.581 5.691 5.904 6.12 6.437 6.649 6.865 7.161 7.462 7.758 8.027 8.286 8.635 8.97 9.29 9.682 10.062 10.434 10.872 11.366 11.847 12.359 12.888 13.462 14.09 14.812 15.665 16.549 17.608 18.788 20.143 21.717 23.606 25.866 28.651 31.048 32.427 33.298 33.883 34.224 34.429 34.535 34.547 34.504 34.434 34.36 34.287 34.204 34.087 33.959 33.81 33.678 33.56 33.416 33.267 33.141 32.997 32.839 32.712 32.57 32.407 32.236 32.056 31.92 31.784 31.568 31.412 31.246 31.161 30.971 30.741 30.482 30.349 29.79 29.914 29.76 29.609 29.27 29.074 28.857 28.604 28.302 27.936 27.445 26.001 -9 ,7563 ,KEBNE ,16748973,Tue Nov 30 17:35:36 CET,Tue Nov 30 19:10:13 CET,0.0 1.157 1.601 1.936 2.199 2.426 2.635 2.837 3.213 3.383 3.544 3.4 3.995 4.13 4.388 4.636 4.877 4.992 5.227 5.463 5.789 5.996 6.2 6.501 6.794 7.076 7.354 7.618 7.944 8.257 8.569 8.97 9.36 9.732 10.166 10.643 11.089 11.571 12.09 12.653 13.275 14.005 14.883 15.778 16.823 17.994 19.331 20.84 22.675 24.944 27.763 30.111 31.506 32.373 32.934 33.342 33.584 33.688 33.71 33.709 33.675 33.611 33.525 33.421 33.31 33.191 33.047 32.91 32.774 32.619 32.456 32.321 32.174 31.999 31.866 31.724 31.562 31.381 31.183 31.046 30.902 30.66 30.472 30.287 30.2 30.001 29.782 29.547 29.419 28.868 29.038 28.9 28.741 28.4 28.215 27.995 27.734 27.414 27.011 26.461 24.118 -10 ,15206 ,KEBNE ,16748974,Tue Nov 30 18:04:56 CET,Tue Nov 30 19:38:18 CET,0.0 1.234 1.701 2.036 2.305 2.542 2.758 2.951 3.309 3.481 3.642 3.485 4.084 4.228 4.486 4.734 4.975 5.092 5.32 5.532 5.837 6.043 6.249 6.543 6.822 7.096 7.368 7.635 7.979 8.315 8.65 9.041 9.407 9.776 10.214 10.705 11.175 11.684 12.234 12.815 13.424 14.126 14.969 15.865 16.912 18.082 19.469 21.039 22.876 25.106 27.992 30.438 31.882 32.819 33.378 33.687 33.867 33.941 33.961 33.965 33.937 33.897 33.821 33.709 33.592 33.477 33.338 33.191 33.058 32.936 32.788 32.653 32.505 32.332 32.191 32.048 31.898 31.739 31.568 31.443 31.319 31.119 30.981 30.832 30.746 30.56 30.373 30.183 30.071 29.524 29.689 29.554 29.408 29.075 28.887 28.669 28.413 28.108 27.669 27.09 25.506 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt deleted file mode 100644 index fe70c739..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30817 ,KEBNE ,16748975,Tue Nov 30 18:36:17 CET,Tue Nov 30 20:15:13 CET,0.0 1.343 1.798 2.122 2.389 2.623 2.83 3.019 3.367 3.522 3.665 3.475 4.05 4.168 4.39 4.6 4.801 4.894 5.081 5.265 5.523 5.69 5.849 6.082 6.313 6.536 6.743 6.939 7.192 7.432 7.665 7.945 8.209 8.469 8.776 9.113 9.438 9.804 10.176 10.566 10.947 11.35 11.848 12.346 12.886 13.453 14.073 14.72 15.379 16.018 16.535 16.562 16.291 15.913 15.484 15.055 14.654 14.264 13.893 13.484 13.119 12.782 12.443 12.131 11.844 11.569 11.273 11.007 10.771 10.519 10.248 10.021 9.79 9.548 9.357 9.162 8.958 8.755 8.553 8.397 8.219 7.923 7.716 7.506 7.404 7.195 6.965 6.722 6.595 6.008 6.168 6.015 5.839 5.436 5.232 5.008 4.744 4.445 4.067 3.497 2.081 -2 ,30551 ,KEBNE ,16748976,Tue Nov 30 18:36:16 CET,Tue Nov 30 20:12:45 CET,0.0 1.158 1.596 1.908 2.169 2.417 2.631 2.814 3.157 3.318 3.471 3.302 3.883 4.006 4.245 4.484 4.703 4.808 5.012 5.198 5.464 5.633 5.793 6.022 6.252 6.474 6.68 6.87 7.119 7.378 7.635 7.93 8.205 8.46 8.762 9.11 9.43 9.78 10.15 10.527 10.916 11.34 11.852 12.389 12.951 13.51 14.114 14.752 15.4 16.012 16.48 16.424 16.109 15.691 15.229 14.77 14.336 13.914 13.536 13.148 12.788 12.448 12.121 11.813 11.523 11.248 10.962 10.71 10.49 10.26 10.014 9.808 9.59 9.364 9.185 8.999 8.812 8.612 8.396 8.234 8.066 7.824 7.652 7.475 7.38 7.168 6.955 6.732 6.615 6.05 6.242 6.094 5.941 5.605 5.417 5.213 4.981 4.698 4.34 3.877 2.723 -3 ,14163 ,KEBNE ,16748977,Tue Nov 30 18:36:16 CET,Tue Nov 30 20:13:08 CET,0.0 1.24 1.707 2.052 2.325 2.557 2.764 2.948 3.278 3.43 3.574 3.402 3.985 4.101 4.322 4.54 4.753 4.855 5.053 5.241 5.517 5.692 5.854 6.089 6.321 6.551 6.775 6.989 7.255 7.51 7.763 8.058 8.342 8.613 8.901 9.206 9.509 9.849 10.225 10.62 11.006 11.422 11.885 12.345 12.888 13.462 14.093 14.765 15.439 16.058 16.55 16.563 16.225 15.803 15.395 14.985 14.573 14.161 13.78 13.396 13.034 12.673 12.33 12.031 11.754 11.477 11.163 10.881 10.651 10.415 10.164 9.956 9.739 9.504 9.316 9.115 8.901 8.689 8.469 8.312 8.149 7.894 7.722 7.528 7.424 7.211 6.977 6.74 6.619 6.04 6.2 6.051 5.898 5.557 5.366 5.152 4.91 4.646 4.334 3.928 2.746 -4 ,17040 ,KEBNE ,16748978,Tue Nov 30 18:36:16 CET,Tue Nov 30 20:10:38 CET,0.0 1.44 1.899 2.245 2.53 2.774 2.986 3.17 3.489 3.644 3.79 3.603 4.183 4.309 4.553 4.774 4.977 5.075 5.265 5.441 5.695 5.854 6.009 6.239 6.452 6.653 6.847 7.05 7.318 7.562 7.786 8.055 8.318 8.568 8.856 9.166 9.472 9.82 10.181 10.547 10.92 11.34 11.823 12.293 12.839 13.413 14.051 14.717 15.36 15.998 16.443 16.378 16.089 15.732 15.289 14.817 14.381 13.958 13.572 13.164 12.817 12.506 12.16 11.832 11.549 11.294 11.019 10.76 10.524 10.268 9.995 9.764 9.531 9.293 9.105 8.91 8.706 8.496 8.292 8.144 7.986 7.735 7.561 7.384 7.291 7.096 6.882 6.654 6.539 5.965 6.127 5.975 5.826 5.505 5.334 5.144 4.926 4.679 4.364 3.922 2.641 -5 ,5900 ,KEBNE ,16748979,Tue Nov 30 18:36:16 CET,Tue Nov 30 20:12:08 CET,0.0 1.15 1.593 1.948 2.221 2.446 2.649 2.841 3.191 3.347 3.487 3.292 3.867 3.986 4.226 4.448 4.648 4.745 4.941 5.136 5.405 5.575 5.733 5.953 6.164 6.367 6.569 6.765 7.027 7.287 7.532 7.833 8.1 8.349 8.657 9.005 9.334 9.678 10.043 10.427 10.834 11.314 11.845 12.337 12.89 13.469 14.069 14.721 15.463 16.19 16.683 16.654 16.33 15.909 15.474 15.03 14.61 14.187 13.809 13.418 13.062 12.755 12.443 12.114 11.795 11.507 11.205 10.916 10.655 10.394 10.126 9.891 9.654 9.408 9.21 9.003 8.779 8.556 8.326 8.165 7.998 7.747 7.576 7.4 7.31 7.11 6.893 6.666 6.552 5.986 6.179 6.035 5.88 5.543 5.352 5.142 4.919 4.671 4.371 3.894 2.504 -6 ,17607 ,KEBNE ,16748980,Tue Nov 30 18:36:16 CET,Tue Nov 30 20:10:50 CET,0.0 1.266 1.726 2.072 2.366 2.596 2.8 2.999 3.353 3.502 3.641 3.448 4.023 4.139 4.362 4.582 4.785 4.882 5.076 5.278 5.569 5.746 5.921 6.172 6.419 6.652 6.875 7.097 7.363 7.61 7.844 8.135 8.416 8.673 8.957 9.284 9.606 9.953 10.322 10.706 11.105 11.522 11.985 12.449 12.986 13.566 14.18 14.846 15.572 16.235 16.707 16.637 16.32 15.886 15.439 15.012 14.586 14.16 13.776 13.389 13.033 12.709 12.389 12.095 11.821 11.558 11.283 11.02 10.796 10.565 10.318 10.108 9.889 9.654 9.464 9.268 9.065 8.852 8.641 8.502 8.343 8.084 7.907 7.728 7.635 7.437 7.233 7.014 6.895 6.32 6.515 6.382 6.235 5.895 5.706 5.504 5.277 5.003 4.671 4.207 3.035 -7 ,29958 ,KEBNE ,16748981,Tue Nov 30 18:36:16 CET,Tue Nov 30 20:11:49 CET,0.0 1.325 1.877 2.26 2.592 2.894 3.135 3.344 3.723 3.904 4.074 3.944 4.546 4.683 4.94 5.193 5.442 5.56 5.776 5.982 6.259 6.428 6.597 6.849 7.097 7.348 7.577 7.788 8.074 8.344 8.595 8.908 9.211 9.492 9.802 10.144 10.461 10.787 11.152 11.534 11.924 12.377 12.866 13.324 13.871 14.449 15.057 15.702 16.394 17.084 17.597 17.581 17.267 16.838 16.369 15.914 15.46 15.011 14.624 14.213 13.82 13.448 13.11 12.811 12.53 12.256 11.954 11.682 11.449 11.201 10.938 10.72 10.49 10.231 10.019 9.803 9.587 9.374 9.149 8.995 8.839 8.597 8.425 8.237 8.141 7.948 7.744 7.511 7.388 6.81 6.99 6.846 6.697 6.371 6.19 5.99 5.761 5.494 5.176 4.75 3.57 -8 ,22201 ,KEBNE ,16748982,Tue Nov 30 18:37:20 CET,Tue Nov 30 20:15:58 CET,0.0 1.822 2.345 2.691 2.959 3.198 3.418 3.623 3.953 4.099 4.252 4.08 4.66 4.785 5.023 5.238 5.44 5.538 5.724 5.898 6.133 6.291 6.447 6.659 6.865 7.072 7.271 7.464 7.7 7.922 8.143 8.412 8.677 8.932 9.226 9.545 9.836 10.151 10.511 10.902 11.299 11.749 12.241 12.702 13.246 13.817 14.424 15.057 15.73 16.357 16.828 16.852 16.546 16.152 15.735 15.292 14.837 14.403 14.026 13.64 13.299 12.976 12.647 12.332 12.027 11.732 11.432 11.172 10.947 10.697 10.434 10.218 9.986 9.745 9.556 9.359 9.162 8.966 8.759 8.606 8.449 8.205 8.031 7.848 7.754 7.564 7.354 7.116 6.99 6.41 6.588 6.451 6.311 5.994 5.808 5.598 5.362 5.088 4.78 4.375 3.101 -9 ,21649 ,KEBNE ,16748983,Tue Nov 30 19:12:56 CET,Tue Nov 30 20:48:42 CET,0.0 1.353 1.782 2.078 2.351 2.604 2.819 3.01 3.346 3.499 3.646 3.465 4.048 4.172 4.399 4.609 4.81 4.906 5.1 5.288 5.56 5.73 5.888 6.118 6.337 6.55 6.757 6.953 7.202 7.44 7.669 7.945 8.21 8.456 8.728 9.046 9.367 9.717 10.091 10.491 10.9 11.333 11.822 12.31 12.866 13.461 14.083 14.709 15.367 15.978 16.398 16.387 16.131 15.717 15.243 14.797 14.368 13.964 13.592 13.188 12.83 12.487 12.148 11.81 11.486 11.211 10.932 10.661 10.417 10.164 9.898 9.684 9.459 9.227 9.044 8.852 8.653 8.45 8.233 8.08 7.925 7.665 7.482 7.304 7.21 7.007 6.8 6.595 6.483 5.906 6.093 5.957 5.814 5.495 5.314 5.11 4.888 4.617 4.291 3.856 2.722 -10 ,1508 ,KEBNE ,16748984,Tue Nov 30 19:12:56 CET,Tue Nov 30 20:48:36 CET,0.0 1.444 1.932 2.303 2.623 2.893 3.136 3.357 3.734 3.904 4.067 3.938 4.536 4.672 4.942 5.203 5.437 5.543 5.74 5.925 6.205 6.386 6.552 6.797 7.036 7.263 7.486 7.701 7.966 8.219 8.452 8.72 9.003 9.275 9.573 9.905 10.214 10.562 10.925 11.298 11.684 12.125 12.621 13.072 13.604 14.174 14.801 15.523 16.21 16.854 17.404 17.446 17.12 16.695 16.256 15.797 15.357 14.928 14.534 14.11 13.749 13.431 13.1 12.785 12.502 12.232 11.927 11.656 11.433 11.192 10.943 10.726 10.485 10.243 10.059 9.867 9.663 9.452 9.241 9.096 8.949 8.719 8.545 8.36 8.27 8.078 7.868 7.644 7.516 6.924 7.103 6.956 6.792 6.428 6.236 6.041 5.82 5.556 5.231 4.742 3.555 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt deleted file mode 100644 index 7e4ac1ff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27275 ,KEBNE ,16748985,Tue Nov 30 19:12:56 CET,Tue Nov 30 20:47:04 CET,0.0 0.899 1.194 1.404 1.595 1.784 1.966 2.123 2.378 2.491 2.606 2.393 2.955 3.056 3.256 3.443 3.631 3.723 3.887 4.043 4.269 4.422 4.574 4.784 4.99 5.176 5.337 5.501 5.729 5.954 6.167 6.418 6.651 6.878 7.145 7.441 7.744 8.073 8.392 8.732 9.108 9.502 9.935 10.374 10.835 11.313 11.84 12.351 12.816 13.129 13.052 12.411 11.637 10.869 10.136 9.447 8.83 8.233 7.708 7.163 6.671 6.242 5.838 5.45 5.085 4.718 4.308 3.971 3.673 3.347 3.03 2.78 2.51 2.209 1.974 1.736 1.483 1.227 0.944 0.735 0.528 0.205 -0.043 -0.3 -0.427 -0.697 -0.986 -1.315 -1.491 -2.123 -2.048 -2.262 -2.482 -2.948 -3.211 -3.501 -3.833 -4.236 -4.731 -5.444 -8.403 -2 ,31874 ,KEBNE ,16748986,Tue Nov 30 19:12:56 CET,Tue Nov 30 20:47:36 CET,0.0 0.473 0.741 0.936 1.108 1.274 1.421 1.552 1.836 1.983 2.102 1.86 2.413 2.512 2.716 2.908 3.088 3.177 3.365 3.553 3.808 3.97 4.132 4.355 4.549 4.749 4.955 5.151 5.411 5.668 5.903 6.177 6.435 6.672 6.947 7.26 7.559 7.891 8.246 8.592 8.938 9.343 9.801 10.229 10.717 11.212 11.708 12.172 12.585 12.872 12.827 12.218 11.506 10.833 10.159 9.494 8.874 8.312 7.814 7.26 6.781 6.367 5.962 5.573 5.197 4.846 4.489 4.172 3.881 3.567 3.251 2.984 2.708 2.415 2.174 1.924 1.663 1.391 1.1 0.897 0.691 0.373 0.132 -0.118 -0.236 -0.483 -0.752 -1.045 -1.191 -1.802 -1.691 -1.867 -2.05 -2.449 -2.681 -2.957 -3.286 -3.682 -4.213 -4.928 -8.138 -3 ,5842 ,KEBNE ,16748987,Tue Nov 30 19:12:57 CET,Tue Nov 30 20:47:32 CET,0.0 0.926 1.241 1.464 1.642 1.801 1.95 2.101 2.364 2.494 2.62 2.392 2.95 3.058 3.266 3.461 3.63 3.711 3.876 4.041 4.274 4.417 4.562 4.778 4.981 5.178 5.363 5.546 5.777 5.989 6.206 6.459 6.69 6.922 7.199 7.502 7.79 8.112 8.462 8.812 9.181 9.599 10.061 10.524 10.995 11.468 11.984 12.464 12.884 13.229 13.248 12.652 11.924 11.224 10.538 9.872 9.261 8.68 8.154 7.607 7.14 6.732 6.326 5.927 5.547 5.181 4.788 4.433 4.116 3.796 3.458 3.178 2.903 2.632 2.422 2.194 1.945 1.683 1.433 1.247 1.047 0.745 0.528 0.287 0.164 -0.086 -0.351 -0.626 -0.768 -1.37 -1.258 -1.448 -1.643 -2.1 -2.368 -2.656 -2.978 -3.355 -3.839 -4.516 -7.982 -4 ,26413 ,KEBNE ,16748988,Tue Nov 30 19:12:56 CET,Tue Nov 30 20:46:23 CET,0.0 0.594 0.807 0.991 1.208 1.401 1.556 1.692 1.949 2.072 2.193 1.971 2.522 2.627 2.83 3.016 3.2 3.286 3.457 3.628 3.871 4.027 4.184 4.422 4.636 4.836 5.027 5.209 5.442 5.669 5.897 6.169 6.425 6.682 6.974 7.28 7.574 7.907 8.264 8.611 8.957 9.351 9.811 10.262 10.712 11.179 11.705 12.204 12.678 13.024 12.994 12.504 11.886 11.209 10.481 9.723 9.019 8.391 7.878 7.374 6.939 6.525 6.108 5.714 5.33 4.981 4.62 4.29 3.99 3.676 3.355 3.076 2.779 2.473 2.232 1.97 1.714 1.469 1.213 1.018 0.807 0.479 0.251 0.027 -0.088 -0.336 -0.594 -0.884 -1.041 -1.651 -1.551 -1.744 -1.927 -2.328 -2.568 -2.833 -3.127 -3.486 -3.966 -4.694 -8.919 -5 ,3791 ,KEBNE ,16748989,Tue Nov 30 19:12:56 CET,Tue Nov 30 20:50:40 CET,0.0 0.742 1.098 1.371 1.594 1.782 1.949 2.099 2.416 2.57 2.702 2.491 3.054 3.159 3.363 3.549 3.726 3.817 3.991 4.153 4.378 4.525 4.67 4.862 5.042 5.237 5.43 5.608 5.84 6.056 6.268 6.533 6.776 7.009 7.289 7.584 7.861 8.151 8.455 8.759 9.065 9.425 9.832 10.253 10.712 11.134 11.553 12.001 12.384 12.607 12.522 11.878 11.109 10.331 9.539 8.738 8.04 7.414 6.863 6.286 5.786 5.344 4.907 4.48 4.071 3.713 3.341 2.974 2.621 2.273 1.943 1.662 1.368 1.072 0.848 0.606 0.35 0.074 -0.219 -0.416 -0.629 -0.981 -1.219 -1.46 -1.598 -1.889 -2.183 -2.496 -2.654 -3.272 -3.161 -3.354 -3.585 -4.12 -4.4 -4.716 -5.093 -5.509 -5.987 -6.681 -8.687 -6 ,15779 ,KEBNE ,16748990,Tue Nov 30 19:48:38 CET,Tue Nov 30 21:22:06 CET,0.0 0.645 0.899 1.119 1.316 1.504 1.681 1.836 2.1 2.221 2.328 2.097 2.664 2.772 2.982 3.18 3.359 3.442 3.607 3.765 3.994 4.159 4.319 4.549 4.777 4.995 5.205 5.404 5.643 5.871 6.103 6.365 6.627 6.897 7.187 7.508 7.829 8.155 8.493 8.855 9.204 9.573 9.992 10.406 10.889 11.388 11.903 12.419 12.879 13.207 13.215 12.703 12.026 11.313 10.592 9.867 9.19 8.565 8.023 7.487 7.041 6.617 6.173 5.755 5.365 5.008 4.633 4.298 4.008 3.704 3.404 3.153 2.899 2.637 2.414 2.168 1.919 1.674 1.424 1.245 1.054 0.738 0.51 0.275 0.152 -0.106 -0.374 -0.661 -0.814 -1.425 -1.331 -1.53 -1.726 -2.19 -2.458 -2.764 -3.121 -3.504 -3.958 -4.603 -7.741 -7 ,12495 ,KEBNE ,16748991,Tue Nov 30 19:48:38 CET,Tue Nov 30 21:21:55 CET,0.0 1.12 1.461 1.704 1.894 2.073 2.25 2.403 2.666 2.782 2.902 2.677 3.225 3.333 3.558 3.761 3.946 4.026 4.189 4.352 4.59 4.746 4.883 5.09 5.305 5.496 5.662 5.823 6.039 6.256 6.47 6.731 6.988 7.23 7.506 7.817 8.095 8.378 8.685 8.999 9.334 9.706 10.117 10.501 10.916 11.364 11.828 12.293 12.682 12.908 12.791 12.153 11.362 10.515 9.703 8.97 8.276 7.598 7.0 6.405 5.913 5.487 5.077 4.689 4.304 3.941 3.568 3.223 2.91 2.589 2.259 1.978 1.685 1.374 1.129 0.87 0.59 0.299 0.0 -0.209 -0.427 -0.788 -1.035 -1.263 -1.382 -1.643 -1.932 -2.249 -2.402 -3.017 -2.903 -3.097 -3.302 -3.742 -3.993 -4.257 -4.554 -4.916 -5.343 -5.943 -7.628 -8 ,8867 ,KEBNE ,16748992,Tue Nov 30 20:06:26 CET,Tue Nov 30 21:39:42 CET,0.0 0.951 1.292 1.567 1.822 2.022 2.182 2.321 2.577 2.709 2.832 2.596 3.151 3.254 3.479 3.694 3.88 3.966 4.136 4.295 4.515 4.653 4.792 4.998 5.191 5.376 5.55 5.719 5.933 6.131 6.323 6.559 6.786 6.996 7.244 7.544 7.821 8.103 8.414 8.74 9.071 9.447 9.858 10.259 10.717 11.167 11.666 12.169 12.576 12.914 13.005 12.455 11.686 10.914 10.217 9.578 8.968 8.376 7.822 7.261 6.762 6.285 5.844 5.426 5.022 4.65 4.261 3.899 3.574 3.253 2.919 2.642 2.358 2.038 1.79 1.532 1.266 1.007 0.726 0.526 0.32 -0.008 -0.233 -0.458 -0.571 -0.816 -1.083 -1.371 -1.526 -2.143 -2.025 -2.216 -2.432 -2.904 -3.147 -3.405 -3.709 -4.091 -4.623 -5.307 -7.125 -9 ,22772 ,KEBNE ,16748993,Tue Nov 30 20:10:44 CET,Tue Nov 30 21:44:05 CET,0.0 0.622 0.912 1.178 1.414 1.611 1.786 1.944 2.241 2.375 2.491 2.259 2.822 2.929 3.131 3.317 3.497 3.579 3.738 3.896 4.131 4.286 4.441 4.649 4.835 5.019 5.195 5.37 5.617 5.848 6.054 6.305 6.551 6.789 7.056 7.34 7.613 7.939 8.292 8.633 8.973 9.315 9.708 10.143 10.615 11.098 11.59 12.032 12.459 12.798 12.764 12.202 11.478 10.751 10.061 9.395 8.756 8.104 7.511 6.911 6.415 5.984 5.527 5.07 4.657 4.287 3.894 3.536 3.235 2.915 2.579 2.302 1.996 1.686 1.454 1.211 0.968 0.716 0.45 0.263 0.057 -0.26 -0.483 -0.723 -0.847 -1.094 -1.348 -1.626 -1.768 -2.369 -2.234 -2.423 -2.616 -3.055 -3.301 -3.557 -3.853 -4.202 -4.625 -5.234 -7.017 -10 ,19297 ,KEBNE ,16748994,Tue Nov 30 20:11:46 CET,Tue Nov 30 21:45:00 CET,0.0 0.822 1.139 1.392 1.59 1.756 1.91 2.055 2.325 2.455 2.568 2.333 2.892 2.994 3.194 3.377 3.559 3.65 3.82 3.972 4.208 4.37 4.529 4.756 4.966 5.178 5.377 5.574 5.828 6.07 6.299 6.558 6.8 7.023 7.271 7.551 7.832 8.141 8.464 8.801 9.156 9.542 9.967 10.37 10.822 11.302 11.782 12.228 12.651 12.963 12.998 12.551 11.864 11.131 10.427 9.74 9.115 8.555 8.076 7.563 7.087 6.652 6.24 5.841 5.45 5.084 4.71 4.366 4.047 3.73 3.424 3.166 2.883 2.591 2.353 2.089 1.823 1.553 1.277 1.083 0.873 0.549 0.324 0.082 -0.043 -0.312 -0.609 -0.912 -1.063 -1.673 -1.553 -1.728 -1.918 -2.351 -2.607 -2.902 -3.226 -3.601 -4.068 -4.744 -6.712 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt deleted file mode 100644 index 35423d93..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5607 ,KEBNE ,16748995,Tue Nov 30 20:11:46 CET,Tue Nov 30 21:45:22 CET,0.0 3.243 4.087 4.683 5.164 5.56 5.892 6.205 6.793 7.051 7.29 7.591 7.932 8.113 8.503 8.896 9.272 9.45 9.776 10.089 10.539 10.814 11.081 11.456 11.81 12.146 12.473 12.779 13.146 13.484 13.797 14.16 14.502 14.828 15.199 15.618 16.012 16.438 16.867 17.29 17.683 18.106 18.59 19.028 19.511 20.045 20.64 21.157 21.552 21.757 21.586 20.831 19.859 18.9 18.072 17.336 16.641 15.945 15.321 14.698 14.164 13.657 13.121 12.601 12.131 11.664 11.147 10.705 10.346 9.954 9.515 9.15 8.768 8.378 8.063 7.723 7.372 7.015 6.655 6.415 6.154 5.721 5.421 5.118 4.964 4.635 4.269 3.881 3.678 3.309 3.018 2.786 2.538 1.971 1.647 1.292 0.889 0.43 -0.118 -0.861 -3.088 -2 ,30425 ,KEBNE ,16748996,Tue Nov 30 20:12:49 CET,Tue Nov 30 21:47:50 CET,0.0 3.495 4.526 5.293 5.863 6.328 6.757 7.14 7.796 8.087 8.354 8.676 9.034 9.232 9.61 9.977 10.334 10.506 10.819 11.108 11.497 11.74 11.985 12.341 12.671 12.968 13.248 13.533 13.89 14.217 14.528 14.883 15.227 15.552 15.911 16.322 16.7 17.085 17.468 17.877 18.297 18.719 19.205 19.691 20.219 20.762 21.294 21.766 22.189 22.426 22.271 21.51 20.625 19.762 18.923 18.055 17.223 16.437 15.742 15.049 14.472 13.949 13.449 12.991 12.56 12.172 11.77 11.364 10.976 10.572 10.201 9.916 9.584 9.198 8.886 8.561 8.22 7.87 7.503 7.25 6.982 6.567 6.286 5.982 5.823 5.503 5.154 4.767 4.561 4.191 3.886 3.644 3.39 2.839 2.536 2.19 1.801 1.344 0.771 -0.032 -2.302 -3 ,4401 ,KEBNE ,16748997,Tue Nov 30 20:12:48 CET,Tue Nov 30 21:47:45 CET,0.0 3.214 4.127 4.792 5.318 5.764 6.16 6.507 7.089 7.353 7.606 7.918 8.281 8.494 8.891 9.249 9.583 9.735 10.03 10.317 10.708 10.957 11.205 11.564 11.885 12.193 12.499 12.785 13.157 13.525 13.879 14.275 14.637 14.963 15.309 15.721 16.125 16.544 16.988 17.445 17.917 18.445 19.013 19.522 20.05 20.589 21.137 21.653 22.075 22.318 22.199 21.53 20.617 19.735 18.962 18.178 17.424 16.693 16.031 15.345 14.739 14.176 13.622 13.104 12.594 12.115 11.629 11.191 10.795 10.418 10.022 9.647 9.261 8.861 8.55 8.228 7.896 7.536 7.162 6.903 6.625 6.19 5.89 5.576 5.41 5.07 4.719 4.333 4.13 3.77 3.469 3.221 2.965 2.373 2.047 1.709 1.335 0.902 0.334 -0.46 -2.716 -4 ,13528 ,KEBNE ,16748998,Tue Nov 30 20:13:51 CET,Tue Nov 30 21:49:27 CET,0.0 3.072 4.014 4.662 5.184 5.597 5.961 6.305 6.942 7.216 7.464 7.771 8.137 8.345 8.732 9.093 9.423 9.581 9.893 10.193 10.609 10.865 11.116 11.484 11.827 12.144 12.443 12.707 13.023 13.325 13.631 13.999 14.35 14.68 15.022 15.386 15.761 16.181 16.622 17.079 17.5 17.947 18.466 18.979 19.517 19.998 20.508 20.997 21.404 21.635 21.473 20.758 19.808 18.866 18.058 17.326 16.603 15.895 15.273 14.65 14.095 13.567 13.047 12.539 12.032 11.585 11.162 10.794 10.482 10.155 9.806 9.49 9.133 8.757 8.456 8.138 7.809 7.462 7.103 6.856 6.602 6.188 5.874 5.539 5.374 5.042 4.697 4.329 4.131 3.767 3.478 3.24 2.984 2.4 2.071 1.714 1.313 0.855 0.304 -0.45 -2.875 -5 ,29286 ,KEBNE ,16748999,Tue Nov 30 20:13:51 CET,Tue Nov 30 21:49:53 CET,0.0 3.477 4.418 5.089 5.602 6.055 6.438 6.759 7.33 7.591 7.86 8.199 8.556 8.757 9.146 9.508 9.84 10.004 10.306 10.585 11.021 11.3 11.559 11.919 12.265 12.602 12.902 13.199 13.579 13.924 14.241 14.621 14.981 15.319 15.699 16.118 16.514 16.922 17.328 17.75 18.155 18.558 19.006 19.426 19.899 20.414 20.933 21.402 21.851 22.122 21.971 21.253 20.4 19.537 18.725 17.936 17.154 16.397 15.751 15.08 14.458 13.886 13.346 12.849 12.414 11.966 11.447 11.0 10.613 10.2 9.782 9.429 9.026 8.608 8.283 7.939 7.584 7.213 6.831 6.575 6.301 5.863 5.556 5.227 5.055 4.711 4.342 3.937 3.717 3.332 3.01 2.757 2.484 1.851 1.488 1.114 0.7 0.2 -0.398 -1.265 -4.137 -6 ,26085 ,KEBNE ,16749000,Tue Nov 30 20:16:01 CET,Tue Nov 30 21:55:13 CET,0.0 2.96 3.865 4.487 5.006 5.443 5.824 6.156 6.736 7.01 7.264 7.568 7.924 8.121 8.493 8.845 9.193 9.361 9.671 9.959 10.354 10.588 10.792 11.074 11.337 11.59 11.856 12.132 12.481 12.826 13.155 13.533 13.893 14.25 14.635 15.013 15.38 15.786 16.232 16.671 17.047 17.432 17.852 18.265 18.719 19.161 19.63 20.091 20.467 20.665 20.491 19.756 18.813 17.836 16.92 16.122 15.425 14.733 14.116 13.498 12.903 12.315 11.737 11.228 10.761 10.33 9.899 9.482 9.102 8.688 8.238 7.884 7.515 7.112 6.791 6.443 6.092 5.73 5.341 5.072 4.797 4.375 4.067 3.75 3.594 3.272 2.934 2.565 2.369 2.007 1.709 1.473 1.223 0.672 0.363 0.013 -0.377 -0.838 -1.463 -2.268 -4.585 -7 ,23975 ,KEBNE ,16749001,Tue Nov 30 20:17:03 CET,Tue Nov 30 21:54:59 CET,0.0 3.189 4.044 4.625 5.086 5.478 5.829 6.132 6.658 6.9 7.124 7.386 7.719 7.902 8.249 8.57 8.87 9.012 9.283 9.546 9.912 10.135 10.381 10.766 11.125 11.476 11.807 12.119 12.52 12.885 13.223 13.619 13.986 14.301 14.63 15.0 15.358 15.76 16.209 16.63 17.001 17.384 17.819 18.262 18.732 19.297 19.894 20.38 20.775 20.986 20.835 20.134 19.208 18.284 17.412 16.555 15.742 14.994 14.359 13.687 13.069 12.515 12.031 11.585 11.148 10.705 10.208 9.767 9.384 8.979 8.556 8.203 7.828 7.435 7.119 6.787 6.441 6.075 5.695 5.429 5.153 4.712 4.401 4.079 3.902 3.525 3.135 2.717 2.505 2.145 1.846 1.585 1.315 0.729 0.403 0.052 -0.355 -0.828 -1.398 -2.21 -5.352 -8 ,23855 ,KEBNE ,16749002,Tue Nov 30 20:29:39 CET,Tue Nov 30 22:07:17 CET,0.0 4.391 5.398 6.057 6.571 7.0 7.384 7.725 8.325 8.591 8.836 9.138 9.499 9.693 10.043 10.381 10.694 10.84 11.127 11.399 11.776 12.016 12.242 12.565 12.861 13.14 13.415 13.677 14.033 14.375 14.667 15.008 15.334 15.639 15.975 16.318 16.661 17.05 17.451 17.873 18.309 18.755 19.237 19.686 20.198 20.736 21.252 21.766 22.23 22.484 22.341 21.61 20.643 19.665 18.763 17.831 16.977 16.213 15.555 14.885 14.307 13.815 13.344 12.899 12.472 12.053 11.613 11.228 10.894 10.536 10.136 9.793 9.422 9.034 8.732 8.419 8.097 7.754 7.398 7.153 6.894 6.48 6.184 5.867 5.704 5.366 5.01 4.616 4.404 4.04 3.743 3.488 3.22 2.623 2.277 1.876 1.433 0.962 0.417 -0.339 -2.753 -9 ,3262 ,KEBNE ,16749003,Tue Nov 30 20:39:01 CET,Tue Nov 30 22:12:41 CET,0.0 2.86 3.778 4.417 4.926 5.353 5.732 6.071 6.656 6.925 7.176 7.491 7.858 8.065 8.445 8.817 9.171 9.339 9.663 9.962 10.342 10.568 10.787 11.107 11.405 11.676 11.93 12.167 12.476 12.771 13.044 13.393 13.734 14.05 14.431 14.872 15.302 15.724 16.124 16.527 16.941 17.4 17.911 18.395 18.901 19.415 19.897 20.311 20.709 20.933 20.748 20.045 19.163 18.243 17.337 16.482 15.701 14.984 14.384 13.724 13.081 12.504 11.972 11.446 10.94 10.484 10.012 9.583 9.21 8.816 8.368 7.983 7.595 7.189 6.871 6.554 6.213 5.851 5.478 5.222 4.95 4.503 4.198 3.916 3.785 3.489 3.138 2.744 2.542 2.173 1.858 1.616 1.361 0.805 0.491 0.144 -0.242 -0.688 -1.226 -1.977 -4.327 -10 ,9465 ,KEBNE ,16749004,Tue Nov 30 20:39:01 CET,Tue Nov 30 22:13:38 CET,0.0 2.753 3.702 4.399 4.922 5.357 5.739 6.072 6.642 6.902 7.158 7.486 7.849 8.046 8.439 8.806 9.129 9.287 9.593 9.885 10.299 10.556 10.803 11.144 11.463 11.777 12.061 12.307 12.613 12.909 13.186 13.545 13.921 14.28 14.65 15.029 15.405 15.827 16.247 16.636 17.054 17.539 18.038 18.471 18.939 19.439 19.959 20.419 20.837 21.065 20.864 20.129 19.249 18.408 17.616 16.817 16.096 15.434 14.842 14.212 13.614 13.043 12.485 11.961 11.469 11.03 10.581 10.159 9.774 9.382 8.985 8.646 8.288 7.914 7.588 7.254 6.939 6.597 6.227 5.968 5.695 5.273 4.98 4.668 4.505 4.151 3.776 3.39 3.185 2.823 2.51 2.252 1.989 1.416 1.092 0.734 0.347 -0.107 -0.664 -1.431 -4.098 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 523c8fb9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31688 ,KEBNE ,16749005,Tue Nov 30 20:47:26 CET,Tue Nov 30 22:22:51 CET,0.0 3.143 3.943 4.513 4.988 5.391 5.733 6.039 6.589 6.836 7.064 7.367 7.737 7.938 8.307 8.635 8.955 9.114 9.409 9.679 10.057 10.288 10.513 10.841 11.15 11.434 11.698 11.95 12.264 12.568 12.857 13.191 13.496 13.796 14.134 14.465 14.769 15.092 15.426 15.749 16.045 16.352 16.685 17.017 17.377 17.73 18.044 18.256 18.395 18.319 17.615 16.356 15.104 13.882 12.804 11.782 10.817 9.984 9.298 8.57 7.932 7.352 6.757 6.194 5.669 5.185 4.685 4.225 3.813 3.391 2.945 2.554 2.134 1.708 1.384 1.044 0.693 0.315 -0.1 -0.386 -0.671 -1.105 -1.407 -1.73 -1.908 -2.293 -2.684 -3.09 -3.309 -3.701 -4.04 -4.311 -4.597 -5.212 -5.553 -5.96 -6.439 -6.935 -7.489 -8.268 -10.632 -2 ,6162 ,KEBNE ,16749006,Tue Nov 30 20:47:28 CET,Tue Nov 30 22:21:47 CET,0.0 3.341 4.151 4.75 5.221 5.62 5.977 6.308 6.95 7.235 7.49 7.811 8.174 8.386 8.777 9.135 9.47 9.628 9.929 10.214 10.61 10.862 11.102 11.46 11.8 12.102 12.388 12.656 12.985 13.305 13.623 13.984 14.309 14.611 14.938 15.293 15.639 15.979 16.333 16.716 17.072 17.47 17.935 18.33 18.74 19.205 19.619 19.924 20.091 19.917 19.187 17.87 16.573 15.364 14.222 13.194 12.281 11.413 10.651 9.899 9.306 8.784 8.244 7.726 7.255 6.828 6.37 5.931 5.515 5.07 4.595 4.197 3.791 3.362 3.033 2.699 2.353 1.976 1.57 1.291 1.005 0.567 0.26 -0.063 -0.232 -0.579 -0.945 -1.348 -1.561 -1.932 -2.215 -2.47 -2.737 -3.294 -3.615 -3.979 -4.37 -4.824 -5.401 -6.179 -8.699 -3 ,14897 ,KEBNE ,16749007,Tue Nov 30 20:48:33 CET,Tue Nov 30 22:24:41 CET,0.0 2.885 3.626 4.164 4.61 4.994 5.343 5.673 6.243 6.494 6.743 7.052 7.408 7.61 7.975 8.293 8.588 8.733 9.008 9.273 9.66 9.899 10.131 10.465 10.775 11.074 11.359 11.627 11.937 12.232 12.531 12.874 13.186 13.481 13.816 14.179 14.522 14.848 15.146 15.439 15.741 16.088 16.45 16.774 17.119 17.441 17.743 17.97 18.068 17.932 17.271 16.001 14.732 13.577 12.526 11.497 10.566 9.69 8.863 8.025 7.306 6.682 6.083 5.505 4.984 4.534 4.075 3.655 3.288 2.913 2.52 2.146 1.718 1.277 0.95 0.649 0.362 0.04 -0.326 -0.591 -0.865 -1.292 -1.592 -1.91 -2.079 -2.437 -2.81 -3.201 -3.411 -3.79 -4.107 -4.359 -4.629 -5.232 -5.57 -5.938 -6.329 -6.782 -7.367 -8.17 -10.605 -4 ,11106 ,KEBNE ,16749008,Tue Nov 30 20:48:32 CET,Tue Nov 30 22:24:51 CET,0.0 3.306 4.091 4.675 5.164 5.559 5.918 6.25 6.797 7.046 7.289 7.592 7.944 8.136 8.496 8.828 9.137 9.283 9.573 9.842 10.206 10.441 10.677 11.009 11.313 11.613 11.901 12.178 12.523 12.822 13.106 13.425 13.705 14.003 14.359 14.748 15.093 15.442 15.793 16.123 16.482 16.876 17.286 17.676 18.087 18.451 18.82 19.145 19.301 19.115 18.331 17.142 15.938 14.721 13.603 12.582 11.677 10.853 10.111 9.348 8.663 8.071 7.535 6.991 6.472 6.006 5.49 5.021 4.637 4.215 3.755 3.372 2.975 2.567 2.254 1.914 1.56 1.182 0.773 0.52 0.283 -0.09 -0.357 -0.638 -0.784 -1.107 -1.469 -1.866 -2.081 -2.463 -2.781 -3.026 -3.287 -3.886 -4.218 -4.593 -5.002 -5.486 -6.102 -6.895 -9.127 -5 ,23120 ,KEBNE ,16749009,Tue Nov 30 20:49:34 CET,Tue Nov 30 22:25:27 CET,0.0 2.635 3.412 3.996 4.475 4.891 5.245 5.545 6.09 6.338 6.57 6.856 7.209 7.406 7.786 8.135 8.447 8.592 8.871 9.132 9.49 9.71 9.93 10.271 10.585 10.84 11.06 11.3 11.636 11.949 12.245 12.602 12.948 13.26 13.612 13.99 14.326 14.664 14.988 15.305 15.605 15.946 16.344 16.695 17.048 17.397 17.724 18.005 18.209 18.111 17.423 16.166 14.887 13.68 12.619 11.632 10.743 9.962 9.297 8.614 8.004 7.442 6.864 6.276 5.721 5.221 4.702 4.232 3.823 3.39 2.931 2.578 2.203 1.775 1.449 1.108 0.74 0.351 -0.048 -0.32 -0.606 -1.05 -1.359 -1.683 -1.85 -2.199 -2.569 -2.964 -3.177 -3.556 -3.863 -4.115 -4.387 -4.969 -5.289 -5.654 -6.068 -6.542 -7.112 -7.887 -10.275 -6 ,999 ,KEBNE ,16749010,Tue Nov 30 20:49:37 CET,Tue Nov 30 22:25:40 CET,0.0 3.192 3.947 4.507 4.967 5.356 5.701 6.019 6.594 6.858 7.107 7.413 7.765 7.963 8.342 8.683 8.99 9.138 9.427 9.699 10.067 10.3 10.531 10.874 11.196 11.483 11.746 11.992 12.315 12.618 12.891 13.238 13.585 13.896 14.245 14.621 14.944 15.272 15.593 15.93 16.307 16.72 17.147 17.499 17.85 18.216 18.541 18.774 18.864 18.653 17.896 16.642 15.393 14.217 13.145 12.107 11.112 10.221 9.462 8.707 8.059 7.445 6.878 6.321 5.759 5.252 4.701 4.252 3.92 3.565 3.177 2.83 2.444 2.049 1.76 1.467 1.127 0.757 0.366 0.083 -0.217 -0.685 -1.012 -1.342 -1.51 -1.86 -2.234 -2.641 -2.857 -3.239 -3.577 -3.843 -4.112 -4.69 -5.009 -5.377 -5.794 -6.306 -6.921 -7.732 -10.272 -7 ,23116 ,KEBNE ,16749011,Tue Nov 30 20:51:42 CET,Tue Nov 30 22:31:10 CET,0.0 2.858 3.625 4.185 4.645 5.042 5.392 5.714 6.289 6.546 6.788 7.082 7.441 7.664 8.078 8.443 8.77 8.929 9.245 9.53 9.904 10.119 10.314 10.603 10.876 11.146 11.423 11.695 12.044 12.349 12.615 12.94 13.254 13.543 13.868 14.221 14.558 14.921 15.293 15.667 16.005 16.371 16.837 17.216 17.585 18.0 18.337 18.515 18.619 18.522 17.826 16.565 15.301 14.117 13.089 12.124 11.253 10.437 9.711 8.989 8.309 7.671 7.055 6.493 5.981 5.499 4.975 4.484 4.053 3.609 3.175 2.827 2.44 2.011 1.68 1.347 1.006 0.648 0.28 0.02 -0.254 -0.685 -0.984 -1.293 -1.456 -1.802 -2.183 -2.597 -2.815 -3.216 -3.556 -3.798 -4.063 -4.689 -5.052 -5.44 -5.851 -6.331 -6.907 -7.709 -10.645 -8 ,15777 ,KEBNE ,16749012,Tue Nov 30 21:07:26 CET,Tue Nov 30 22:43:39 CET,0.0 3.278 4.087 4.64 5.101 5.484 5.831 6.16 6.719 6.976 7.223 7.52 7.872 8.067 8.435 8.779 9.089 9.236 9.531 9.809 10.196 10.432 10.649 10.959 11.252 11.54 11.811 12.064 12.347 12.575 12.801 13.077 13.334 13.584 13.886 14.217 14.515 14.816 15.126 15.471 15.843 16.228 16.61 16.95 17.272 17.577 17.905 18.144 18.251 18.136 17.45 16.179 14.882 13.744 12.728 11.778 10.908 10.025 9.263 8.57 7.975 7.406 6.822 6.254 5.715 5.215 4.701 4.223 3.804 3.371 2.9 2.525 2.152 1.761 1.453 1.131 0.801 0.453 0.07 -0.206 -0.483 -0.902 -1.206 -1.536 -1.707 -2.048 -2.409 -2.803 -3.009 -3.396 -3.726 -3.981 -4.244 -4.831 -5.166 -5.539 -5.953 -6.403 -6.975 -7.801 -10.267 -9 ,10991 ,KEBNE ,16749013,Tue Nov 30 21:07:26 CET,Tue Nov 30 22:44:57 CET,0.0 3.263 4.088 4.662 5.13 5.516 5.864 6.191 6.763 7.013 7.25 7.536 7.882 8.074 8.43 8.757 9.07 9.219 9.502 9.769 10.147 10.381 10.597 10.908 11.213 11.498 11.766 12.008 12.306 12.624 12.94 13.304 13.64 13.953 14.296 14.66 14.986 15.304 15.602 15.923 16.255 16.601 16.975 17.299 17.65 17.988 18.288 18.538 18.676 18.541 17.786 16.45 15.164 13.953 12.835 11.818 10.956 10.167 9.457 8.73 8.066 7.443 6.879 6.324 5.799 5.313 4.776 4.292 3.856 3.402 2.95 2.583 2.232 1.888 1.597 1.271 0.908 0.535 0.154 -0.12 -0.407 -0.852 -1.159 -1.481 -1.647 -1.992 -2.362 -2.747 -2.952 -3.312 -3.56 -3.78 -4.008 -4.518 -4.821 -5.15 -5.511 -5.948 -6.491 -7.233 -9.622 -10 ,22251 ,KEBNE ,16749014,Tue Nov 30 21:23:07 CET,Tue Nov 30 23:02:06 CET,0.0 3.45 4.273 4.848 5.312 5.702 6.048 6.366 6.927 7.17 7.403 7.665 7.98 8.136 8.439 8.726 8.981 9.101 9.334 9.553 9.864 10.064 10.257 10.52 10.76 10.98 11.196 11.432 11.74 12.015 12.275 12.594 12.909 13.205 13.55 13.94 14.287 14.626 14.944 15.271 15.609 15.951 16.35 16.721 17.097 17.454 17.77 17.994 18.08 17.978 17.292 16.058 14.873 13.704 12.631 11.663 10.797 10.01 9.304 8.561 7.909 7.307 6.7 6.111 5.566 5.072 4.551 4.07 3.64 3.196 2.723 2.317 1.89 1.443 1.094 0.735 0.374 0.0 -0.383 -0.654 -0.939 -1.374 -1.681 -2.0 -2.168 -2.527 -2.888 -3.277 -3.492 -3.872 -4.182 -4.426 -4.684 -5.292 -5.634 -6.004 -6.425 -6.902 -7.462 -8.256 -10.753 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt deleted file mode 100644 index 6b721c55..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,2 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13289 ,KEBNE ,16749015,Tue Nov 30 21:23:07 CET,Tue Nov 30 23:00:33 CET,0.0 0.932 1.255 1.487 1.662 1.801 1.909 2.001 2.158 2.219 2.28 2.237 2.427 2.46 2.511 2.549 2.571 2.58 2.589 2.579 2.555 2.535 2.508 2.459 2.392 2.322 2.25 2.172 2.07 1.946 1.805 1.614 1.385 1.152 0.864 0.5 0.132 -0.292 -0.815 -1.451 -2.218 -3.147 -4.283 -5.573 -7.219 -9.239 -11.91 -15.411 -20.162 -26.877 -36.797 -47.206 -55.087 -61.235 -66.156 -70.351 -73.869 -76.845 -79.298 -81.775 -83.834 -85.56 -87.169 -88.688 -90.101 -91.333 -92.556 -93.662 -94.63 -95.6 -96.569 -97.362 -98.182 -99.029 -99.678 -100.33 -101.001 -101.681 -102.372 -102.863 -103.37 -104.138 -104.676 -105.234 -105.519 -106.105 -106.714 -107.347 -107.677 -108.295 -108.803 -109.203 -109.623 -110.524 -111.023 -111.551 -112.132 -112.823 -113.662 -114.776 -117.304 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt deleted file mode 100644 index 2e537199..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9181 ,KEBNE ,17028142,Wed Dec 22 19:18:32 CET,Wed Dec 22 20:54:47 CET,0.0 2.216 2.686 2.999 3.233 3.41 3.547 3.664 3.858 3.935 4.007 3.977 4.189 4.228 4.306 4.346 4.368 4.383 4.413 4.431 4.436 4.431 4.42 4.378 4.319 4.255 4.188 4.122 4.021 3.909 3.804 3.658 3.48 3.317 3.12 2.85 2.551 2.178 1.747 1.246 0.675 -0.092 -1.146 -2.27 -3.707 -5.478 -7.785 -10.79 -14.882 -20.602 -29.343 -38.759 -45.704 -51.192 -55.7 -59.532 -62.675 -65.361 -67.608 -69.835 -71.722 -73.384 -74.953 -76.386 -77.685 -78.834 -80.02 -81.07 -81.977 -82.929 -83.898 -84.701 -85.518 -86.324 -86.941 -87.582 -88.238 -88.917 -89.604 -90.063 -90.523 -91.224 -91.72 -92.234 -92.501 -93.065 -93.644 -94.244 -94.563 -95.151 -95.588 -95.958 -96.355 -97.263 -97.772 -98.32 -98.919 -99.582 -100.379 -101.485 -105.907 -2 ,889 ,KEBNE ,17028143,Wed Dec 22 19:18:34 CET,Wed Dec 22 20:54:05 CET,0.0 1.134 1.434 1.647 1.809 1.948 2.079 2.184 2.348 2.417 2.482 2.439 2.648 2.687 2.76 2.832 2.904 2.934 2.977 3.022 3.056 3.056 3.054 3.06 3.063 3.042 3.003 2.954 2.892 2.82 2.728 2.567 2.396 2.241 2.017 1.719 1.411 1.06 0.668 0.192 -0.382 -1.091 -2.017 -3.078 -4.491 -6.262 -8.556 -11.529 -15.649 -21.528 -30.405 -39.861 -46.959 -52.609 -57.217 -61.099 -64.334 -67.103 -69.385 -71.656 -73.551 -75.181 -76.708 -78.078 -79.337 -80.479 -81.638 -82.661 -83.543 -84.457 -85.382 -86.114 -86.874 -87.672 -88.286 -88.926 -89.589 -90.265 -90.953 -91.416 -91.895 -92.652 -93.185 -93.734 -94.017 -94.617 -95.233 -95.864 -96.189 -96.782 -97.232 -97.608 -97.998 -98.84 -99.32 -99.847 -100.432 -101.098 -101.926 -103.03 -108.151 -3 ,5541 ,KEBNE ,17028144,Wed Dec 22 19:18:32 CET,Wed Dec 22 20:53:56 CET,0.0 0.935 1.271 1.523 1.708 1.848 1.962 2.07 2.275 2.359 2.431 2.4 2.605 2.642 2.708 2.766 2.818 2.835 2.869 2.907 2.944 2.956 2.953 2.942 2.912 2.859 2.803 2.75 2.669 2.581 2.477 2.325 2.158 1.974 1.731 1.431 1.119 0.754 0.332 -0.165 -0.735 -1.469 -2.49 -3.6 -4.969 -6.709 -9.065 -12.094 -16.184 -21.996 -30.733 -40.127 -47.18 -52.72 -57.189 -61.029 -64.276 -67.077 -69.42 -71.722 -73.596 -75.206 -76.754 -78.186 -79.491 -80.648 -81.812 -82.833 -83.711 -84.622 -85.559 -86.321 -87.124 -87.94 -88.56 -89.226 -89.913 -90.595 -91.284 -91.771 -92.272 -93.032 -93.555 -94.096 -94.373 -94.94 -95.532 -96.162 -96.496 -97.105 -97.581 -97.96 -98.366 -99.256 -99.744 -100.28 -100.872 -101.554 -102.333 -103.375 -107.157 -4 ,17547 ,KEBNE ,17028145,Wed Dec 22 19:18:33 CET,Wed Dec 22 20:54:22 CET,0.0 1.293 1.719 1.978 2.158 2.313 2.455 2.562 2.749 2.843 2.917 2.871 3.085 3.141 3.234 3.301 3.363 3.392 3.444 3.489 3.563 3.611 3.638 3.659 3.648 3.62 3.591 3.557 3.496 3.403 3.31 3.193 3.058 2.92 2.724 2.482 2.22 1.861 1.425 0.896 0.285 -0.472 -1.471 -2.553 -3.948 -5.707 -8.006 -10.984 -15.05 -20.893 -29.693 -39.05 -46.179 -51.79 -56.27 -60.087 -63.279 -66.032 -68.333 -70.562 -72.406 -74.017 -75.53 -76.909 -78.173 -79.359 -80.536 -81.541 -82.415 -83.34 -84.323 -85.11 -85.903 -86.726 -87.362 -88.014 -88.694 -89.375 -90.054 -90.533 -91.031 -91.805 -92.333 -92.874 -93.147 -93.727 -94.337 -94.965 -95.292 -95.89 -96.37 -96.747 -97.139 -97.997 -98.48 -99.016 -99.627 -100.287 -101.055 -102.113 -105.968 -5 ,27165 ,KEBNE ,17028146,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:53:38 CET,0.0 1.159 1.468 1.693 1.892 2.049 2.161 2.255 2.433 2.522 2.604 2.584 2.79 2.834 2.912 2.958 2.988 3.004 3.04 3.082 3.12 3.128 3.13 3.121 3.115 3.1 3.074 3.04 2.977 2.904 2.829 2.704 2.567 2.43 2.246 1.992 1.707 1.349 0.905 0.41 -0.141 -0.863 -1.832 -2.89 -4.272 -6.027 -8.32 -11.257 -15.319 -21.16 -29.981 -39.466 -46.654 -52.334 -56.823 -60.599 -63.804 -66.59 -68.903 -71.17 -73.062 -74.706 -76.251 -77.678 -78.988 -80.16 -81.377 -82.44 -83.319 -84.238 -85.172 -85.903 -86.663 -87.465 -88.069 -88.678 -89.307 -89.972 -90.681 -91.177 -91.686 -92.457 -92.997 -93.583 -93.879 -94.463 -95.097 -95.771 -96.122 -96.728 -97.213 -97.61 -98.029 -98.946 -99.445 -99.971 -100.53 -101.164 -101.931 -102.918 -106.925 -6 ,32761 ,KEBNE ,17028147,Wed Dec 22 19:19:36 CET,Wed Dec 22 20:55:15 CET,0.0 1.198 1.513 1.747 1.904 2.054 2.195 2.322 2.542 2.629 2.702 2.679 2.895 2.944 3.025 3.098 3.158 3.187 3.243 3.301 3.372 3.391 3.411 3.432 3.449 3.455 3.43 3.392 3.325 3.252 3.17 3.031 2.886 2.738 2.548 2.296 1.993 1.602 1.171 0.675 0.085 -0.647 -1.622 -2.699 -4.116 -5.941 -8.353 -11.407 -15.482 -21.25 -30.041 -39.536 -46.698 -52.298 -56.868 -60.726 -63.86 -66.547 -68.815 -71.035 -72.933 -74.587 -76.1 -77.537 -78.856 -80.01 -81.202 -82.262 -83.135 -84.029 -84.974 -85.725 -86.505 -87.317 -87.934 -88.566 -89.212 -89.886 -90.593 -91.066 -91.539 -92.296 -92.824 -93.363 -93.635 -94.198 -94.792 -95.405 -95.715 -96.295 -96.75 -97.141 -97.562 -98.443 -98.924 -99.475 -100.069 -100.727 -101.508 -102.54 -106.289 -7 ,25597 ,KEBNE ,17028148,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:54:55 CET,0.0 1.479 1.816 2.065 2.255 2.417 2.543 2.649 2.837 2.918 2.992 2.957 3.164 3.209 3.298 3.379 3.433 3.454 3.497 3.53 3.566 3.574 3.568 3.553 3.522 3.492 3.461 3.411 3.333 3.258 3.161 3.012 2.86 2.682 2.453 2.188 1.923 1.588 1.189 0.737 0.164 -0.559 -1.476 -2.487 -3.827 -5.557 -7.869 -10.965 -15.178 -21.02 -29.812 -39.135 -46.139 -51.794 -56.381 -60.255 -63.499 -66.278 -68.579 -70.785 -72.674 -74.364 -75.931 -77.402 -78.742 -79.892 -81.08 -82.134 -83.031 -83.965 -84.912 -85.698 -86.518 -87.359 -87.995 -88.641 -89.308 -89.988 -90.68 -91.175 -91.685 -92.472 -93.033 -93.614 -93.912 -94.517 -95.122 -95.749 -96.086 -96.694 -97.199 -97.607 -98.036 -98.993 -99.522 -100.087 -100.717 -101.44 -102.307 -103.457 -107.532 -8 ,10307 ,KEBNE ,17028149,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:54:02 CET,0.0 1.189 1.519 1.744 1.921 2.076 2.22 2.353 2.559 2.629 2.683 2.647 2.869 2.919 3.005 3.077 3.141 3.166 3.199 3.22 3.26 3.276 3.272 3.271 3.258 3.227 3.186 3.129 3.041 2.931 2.819 2.68 2.526 2.36 2.137 1.857 1.551 1.199 0.794 0.31 -0.243 -0.966 -1.92 -3.015 -4.441 -6.196 -8.541 -11.549 -15.635 -21.445 -30.308 -39.673 -46.621 -52.197 -56.685 -60.489 -63.74 -66.578 -68.897 -71.116 -72.997 -74.661 -76.21 -77.625 -78.95 -80.145 -81.332 -82.36 -83.247 -84.161 -85.098 -85.853 -86.621 -87.427 -88.05 -88.683 -89.338 -90.01 -90.709 -91.198 -91.693 -92.455 -92.977 -93.531 -93.824 -94.415 -95.013 -95.646 -95.981 -96.587 -97.078 -97.472 -97.871 -98.729 -99.22 -99.772 -100.383 -101.096 -101.976 -103.232 -112.428 -9 ,10437 ,KEBNE ,17028150,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:55:26 CET,0.0 1.202 1.505 1.75 1.949 2.086 2.225 2.348 2.534 2.61 2.675 2.635 2.848 2.894 2.972 3.035 3.091 3.117 3.156 3.184 3.217 3.235 3.246 3.255 3.231 3.187 3.152 3.105 3.028 2.962 2.874 2.726 2.561 2.385 2.165 1.89 1.628 1.291 0.857 0.387 -0.174 -0.949 -1.964 -3.032 -4.426 -6.209 -8.551 -11.63 -15.828 -21.685 -30.502 -39.957 -47.02 -52.624 -57.148 -60.972 -64.128 -66.854 -69.14 -71.363 -73.267 -74.925 -76.437 -77.848 -79.117 -80.241 -81.427 -82.467 -83.354 -84.28 -85.201 -85.947 -86.725 -87.524 -88.146 -88.776 -89.431 -90.114 -90.797 -91.249 -91.699 -92.426 -92.925 -93.435 -93.709 -94.289 -94.885 -95.49 -95.803 -96.394 -96.86 -97.23 -97.619 -98.486 -98.983 -99.524 -100.126 -100.821 -101.662 -102.835 -107.703 -10 ,18325 ,KEBNE ,17028151,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:55:52 CET,0.0 1.293 1.638 1.88 2.074 2.232 2.347 2.444 2.633 2.717 2.8 2.783 2.996 3.048 3.129 3.192 3.233 3.255 3.302 3.321 3.334 3.337 3.325 3.297 3.257 3.211 3.161 3.101 3.021 2.936 2.854 2.727 2.581 2.431 2.22 1.937 1.635 1.288 0.838 0.287 -0.333 -1.096 -2.049 -3.173 -4.695 -6.494 -8.774 -11.727 -15.831 -21.689 -30.619 -40.197 -47.277 -52.829 -57.331 -61.163 -64.357 -67.097 -69.388 -71.628 -73.493 -75.096 -76.632 -78.063 -79.348 -80.5 -81.666 -82.717 -83.632 -84.556 -85.495 -86.263 -87.081 -87.916 -88.536 -89.16 -89.805 -90.476 -91.181 -91.682 -92.18 -92.94 -93.479 -94.044 -94.327 -94.908 -95.524 -96.175 -96.513 -97.113 -97.591 -97.965 -98.348 -99.199 -99.685 -100.221 -100.795 -101.456 -102.22 -103.2 -107.007 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt deleted file mode 100644 index 99a2ba53..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -5 ,22871 ,KEBNE ,16749039,Wed Dec 1 05:51:27 CET,Wed Dec 1 07:27:14 CET,0.0 2.206 3.024 3.628 4.132 4.577 4.979 5.343 5.981 6.262 6.54 6.895 7.288 7.511 7.951 8.355 8.745 8.936 9.291 9.626 10.084 10.365 10.637 11.029 11.408 11.785 12.149 12.49 12.932 13.364 13.774 14.258 14.709 15.113 15.553 16.056 16.54 17.045 17.589 18.183 18.825 19.565 20.379 21.119 21.958 22.919 24.029 25.224 26.537 27.938 29.354 30.161 30.346 30.25 30.036 29.752 29.452 29.12 28.763 28.345 27.966 27.624 27.267 26.913 26.608 26.32 25.978 25.674 25.41 25.117 24.814 24.565 24.298 24.011 23.782 23.529 23.243 22.925 22.585 22.334 22.073 21.691 21.419 21.134 20.984 20.67 20.339 19.985 19.794 19.439 19.147 18.913 18.682 18.195 17.92 17.62 17.275 16.859 16.337 15.607 12.761 -6 ,21625 ,KEBNE ,16749040,Wed Dec 1 05:53:35 CET,Wed Dec 1 07:29:15 CET,0.0 2.804 3.581 4.145 4.598 5.019 5.397 5.725 6.311 6.577 6.826 7.129 7.512 7.726 8.142 8.532 8.901 9.077 9.403 9.721 10.175 10.464 10.754 11.163 11.54 11.919 12.29 12.635 13.083 13.515 13.924 14.403 14.848 15.285 15.788 16.317 16.819 17.369 17.947 18.561 19.21 19.929 20.757 21.593 22.509 23.432 24.455 25.579 26.864 28.256 29.7 30.509 30.635 30.446 30.127 29.789 29.447 29.037 28.618 28.16 27.745 27.351 26.949 26.564 26.204 25.878 25.516 25.161 24.846 24.523 24.178 23.874 23.552 23.214 22.935 22.637 22.333 22.013 21.676 21.443 21.226 20.888 20.619 20.313 20.156 19.829 19.48 19.113 18.917 18.566 18.271 18.032 17.789 17.259 16.956 16.604 16.181 15.72 15.183 14.389 12.186 -7 ,23779 ,KEBNE ,16749041,Wed Dec 1 05:54:39 CET,Wed Dec 1 07:29:49 CET,0.0 2.52 3.266 3.824 4.274 4.686 5.056 5.388 5.987 6.25 6.495 6.795 7.183 7.391 7.803 8.198 8.559 8.733 9.073 9.4 9.851 10.133 10.416 10.828 11.216 11.589 11.94 12.275 12.707 13.117 13.506 13.983 14.449 14.897 15.388 15.94 16.478 17.039 17.643 18.303 18.991 19.704 20.483 21.261 22.115 23.033 24.076 25.217 26.498 27.885 29.306 30.056 30.217 30.102 29.836 29.527 29.175 28.729 28.303 27.858 27.482 27.156 26.8 26.428 26.065 25.717 25.335 25.013 24.748 24.449 24.11 23.822 23.53 23.219 22.954 22.677 22.399 22.111 21.795 21.573 21.342 20.963 20.694 20.41 20.259 19.952 19.625 19.282 19.113 18.792 18.559 18.357 18.148 17.676 17.406 17.089 16.729 16.309 15.778 14.998 12.546 -8 ,30240 ,KEBNE ,16749042,Wed Dec 1 05:55:47 CET,Wed Dec 1 07:29:20 CET,0.0 2.627 3.503 4.117 4.636 5.091 5.493 5.854 6.474 6.771 7.068 7.432 7.841 8.069 8.487 8.874 9.242 9.423 9.771 10.097 10.554 10.851 11.137 11.543 11.92 12.272 12.626 12.979 13.427 13.836 14.225 14.703 15.162 15.611 16.121 16.69 17.23 17.794 18.365 18.965 19.584 20.253 21.016 21.78 22.654 23.613 24.681 25.815 27.12 28.575 29.99 30.728 30.874 30.722 30.44 30.11 29.744 29.354 28.967 28.532 28.125 27.743 27.375 26.996 26.584 26.205 25.816 25.462 25.152 24.806 24.436 24.144 23.841 23.496 23.209 22.905 22.582 22.239 21.908 21.689 21.456 21.079 20.801 20.511 20.365 20.061 19.724 19.347 19.148 18.791 18.498 18.267 18.014 17.433 17.1 16.744 16.338 15.861 15.289 14.514 12.482 -9 ,22815 ,KEBNE ,16749043,Wed Dec 1 05:56:52 CET,Wed Dec 1 07:30:37 CET,0.0 2.516 3.314 3.906 4.384 4.775 5.133 5.463 6.061 6.336 6.594 6.901 7.285 7.494 7.889 8.286 8.669 8.84 9.168 9.49 9.943 10.217 10.476 10.86 11.241 11.596 11.935 12.26 12.683 13.111 13.519 13.992 14.419 14.825 15.308 15.851 16.36 16.89 17.457 18.059 18.706 19.397 20.111 20.828 21.678 22.632 23.709 24.856 26.085 27.434 28.894 29.705 29.838 29.709 29.474 29.165 28.822 28.421 28.011 27.56 27.137 26.732 26.329 25.961 25.61 25.278 24.942 24.625 24.323 24.002 23.667 23.391 23.096 22.773 22.518 22.245 21.93 21.598 21.279 21.055 20.818 20.437 20.176 19.909 19.769 19.468 19.133 18.768 18.573 18.227 17.942 17.708 17.458 16.887 16.551 16.198 15.822 15.378 14.833 14.108 11.922 -10 ,24507 ,KEBNE ,16749044,Wed Dec 1 05:56:52 CET,Wed Dec 1 07:31:56 CET,0.0 2.419 3.27 3.857 4.325 4.742 5.115 5.441 6.014 6.279 6.534 6.85 7.25 7.473 7.884 8.239 8.561 8.718 9.047 9.382 9.848 10.144 10.426 10.837 11.228 11.605 11.966 12.304 12.737 13.13 13.476 13.869 14.253 14.638 15.085 15.599 16.112 16.663 17.232 17.845 18.52 19.271 20.079 20.842 21.71 22.675 23.769 24.975 26.297 27.664 29.058 29.864 30.064 29.963 29.734 29.403 29.003 28.552 28.128 27.682 27.275 26.932 26.61 26.288 25.97 25.665 25.327 24.998 24.684 24.356 24.009 23.687 23.35 23.019 22.777 22.507 22.191 21.858 21.498 21.256 21.019 20.627 20.347 20.051 19.896 19.57 19.212 18.822 18.607 18.235 17.909 17.663 17.416 16.863 16.551 16.21 15.811 15.353 14.787 13.93 11.523 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 5de45b58..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20072 ,KEBNE ,16749045,Wed Dec 1 05:58:59 CET,Wed Dec 1 07:34:35 CET,0.0 2.649 3.403 3.956 4.417 4.824 5.186 5.528 6.114 6.367 6.615 6.907 7.282 7.48 7.859 8.218 8.558 8.72 9.033 9.314 9.678 9.902 10.134 10.492 10.838 11.169 11.481 11.778 12.155 12.511 12.841 13.213 13.573 13.937 14.36 14.832 15.281 15.759 16.234 16.706 17.198 17.743 18.405 19.08 19.795 20.503 21.237 22.05 22.857 23.56 24.076 23.755 23.11 22.448 21.768 21.091 20.415 19.733 19.12 18.539 18.014 17.483 16.964 16.469 16.034 15.607 15.143 14.764 14.43 14.055 13.643 13.304 12.951 12.577 12.287 12.008 11.73 11.431 11.122 10.905 10.666 10.28 10.001 9.698 9.541 9.213 8.852 8.466 8.263 7.889 7.592 7.348 7.099 6.559 6.252 5.91 5.524 5.063 4.515 3.815 1.754 -2 ,3924 ,KEBNE ,16749046,Wed Dec 1 05:59:00 CET,Wed Dec 1 07:34:45 CET,0.0 3.047 3.811 4.389 4.871 5.273 5.62 5.935 6.514 6.777 7.027 7.326 7.704 7.906 8.285 8.63 8.97 9.131 9.43 9.721 10.141 10.403 10.66 11.05 11.418 11.754 12.054 12.345 12.739 13.118 13.481 13.903 14.301 14.701 15.151 15.611 16.038 16.497 16.996 17.522 18.031 18.587 19.219 19.827 20.507 21.232 22.021 22.824 23.633 24.302 24.692 24.399 23.802 23.147 22.464 21.761 21.073 20.384 19.753 19.104 18.522 18.001 17.536 17.088 16.623 16.176 15.707 15.275 14.883 14.478 14.053 13.706 13.361 12.988 12.686 12.372 12.032 11.669 11.278 11.011 10.735 10.309 10.017 9.705 9.544 9.212 8.864 8.497 8.303 7.938 7.648 7.411 7.158 6.59 6.273 5.928 5.548 5.111 4.573 3.83 1.792 -3 ,1571 ,KEBNE ,16749047,Wed Dec 1 06:14:49 CET,Wed Dec 1 07:49:09 CET,0.0 3.014 3.773 4.325 4.767 5.165 5.522 5.846 6.46 6.735 6.986 7.275 7.652 7.86 8.244 8.606 8.95 9.111 9.418 9.718 10.16 10.431 10.68 11.04 11.403 11.758 12.102 12.432 12.846 13.231 13.594 14.027 14.443 14.833 15.268 15.745 16.211 16.719 17.241 17.783 18.32 18.86 19.509 20.183 20.899 21.664 22.461 23.212 23.998 24.773 25.209 24.933 24.311 23.554 22.771 22.008 21.32 20.663 20.053 19.433 18.858 18.335 17.875 17.421 16.944 16.487 16.036 15.641 15.284 14.882 14.452 14.087 13.699 13.298 12.998 12.719 12.415 12.069 11.703 11.446 11.179 10.74 10.417 10.084 9.916 9.556 9.16 8.748 8.538 8.157 7.828 7.57 7.3 6.699 6.366 5.984 5.535 5.03 4.419 3.59 1.197 -4 ,15767 ,KEBNE ,16749048,Wed Dec 1 06:14:48 CET,Wed Dec 1 07:50:11 CET,0.0 3.227 4.021 4.587 5.054 5.449 5.804 6.121 6.678 6.928 7.172 7.462 7.831 8.033 8.413 8.751 9.072 9.228 9.533 9.842 10.268 10.526 10.782 11.153 11.498 11.829 12.148 12.45 12.831 13.183 13.526 13.955 14.362 14.737 15.167 15.65 16.103 16.589 17.103 17.649 18.23 18.863 19.525 20.143 20.811 21.493 22.253 23.123 24.008 24.717 25.095 24.75 24.071 23.33 22.643 21.934 21.226 20.57 19.974 19.349 18.818 18.318 17.806 17.325 16.896 16.499 16.073 15.684 15.352 14.993 14.573 14.221 13.848 13.453 13.165 12.878 12.555 12.201 11.833 11.575 11.305 10.877 10.587 10.296 10.138 9.797 9.443 9.055 8.85 8.479 8.182 7.938 7.681 7.142 6.843 6.504 6.105 5.648 5.107 4.404 2.474 -5 ,2809 ,KEBNE ,16749049,Wed Dec 1 06:15:50 CET,Wed Dec 1 07:49:56 CET,0.0 3.038 3.817 4.361 4.831 5.236 5.595 5.915 6.48 6.741 6.99 7.29 7.671 7.881 8.276 8.635 8.971 9.133 9.441 9.738 10.168 10.441 10.709 11.085 11.426 11.752 12.07 12.355 12.679 12.986 13.312 13.736 14.129 14.511 14.95 15.424 15.899 16.416 16.928 17.434 17.946 18.511 19.149 19.738 20.414 21.187 22.039 22.927 23.778 24.445 24.79 24.508 23.915 23.263 22.611 21.914 21.251 20.631 20.038 19.35 18.731 18.179 17.633 17.113 16.648 16.217 15.732 15.284 14.896 14.496 14.052 13.677 13.311 12.916 12.593 12.263 11.92 11.579 11.254 11.041 10.822 10.47 10.201 9.889 9.725 9.383 9.041 8.67 8.464 8.104 7.816 7.572 7.337 6.793 6.474 6.122 5.729 5.272 4.731 4.016 1.896 -6 ,17112 ,KEBNE ,16749050,Wed Dec 1 06:14:48 CET,Wed Dec 1 07:49:27 CET,0.0 2.788 3.565 4.124 4.591 5.007 5.399 5.761 6.401 6.689 6.953 7.27 7.652 7.865 8.281 8.671 9.032 9.2 9.521 9.823 10.276 10.573 10.845 11.227 11.582 11.91 12.21 12.484 12.827 13.164 13.496 13.884 14.269 14.661 15.117 15.599 16.049 16.544 17.062 17.603 18.172 18.802 19.481 20.089 20.764 21.519 22.346 23.142 23.888 24.592 25.043 24.751 24.137 23.453 22.703 21.932 21.226 20.519 19.891 19.271 18.739 18.253 17.76 17.26 16.801 16.395 15.933 15.5 15.108 14.698 14.298 13.964 13.608 13.23 12.93 12.622 12.293 11.937 11.568 11.307 11.031 10.587 10.283 9.972 9.813 9.488 9.135 8.761 8.559 8.188 7.902 7.666 7.413 6.843 6.527 6.18 5.79 5.339 4.806 4.072 2.027 -7 ,26199 ,KEBNE ,16749051,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:54:45 CET,0.0 2.708 3.507 4.062 4.543 4.958 5.319 5.641 6.193 6.439 6.672 6.967 7.357 7.571 7.979 8.365 8.739 8.925 9.27 9.564 9.954 10.201 10.434 10.756 11.064 11.387 11.717 12.04 12.427 12.758 13.091 13.511 13.945 14.361 14.787 15.231 15.64 16.132 16.68 17.184 17.697 18.288 18.961 19.636 20.366 21.061 21.788 22.574 23.349 23.992 24.386 24.102 23.404 22.681 21.956 21.187 20.446 19.773 19.18 18.552 17.969 17.423 16.898 16.414 15.995 15.598 15.116 14.673 14.296 13.893 13.482 13.143 12.779 12.394 12.09 11.77 11.433 11.087 10.714 10.449 10.168 9.698 9.373 9.043 8.872 8.514 8.136 7.721 7.499 7.112 6.774 6.51 6.233 5.644 5.307 4.92 4.49 3.995 3.402 2.607 0.467 -8 ,30804 ,KEBNE ,16749052,Wed Dec 1 06:52:15 CET,Wed Dec 1 08:26:35 CET,0.0 3.01 3.779 4.331 4.784 5.181 5.53 5.842 6.397 6.652 6.9 7.195 7.583 7.793 8.19 8.562 8.92 9.092 9.416 9.736 10.185 10.466 10.723 11.089 11.442 11.765 12.078 12.389 12.797 13.184 13.543 13.965 14.369 14.753 15.196 15.696 16.164 16.657 17.156 17.655 18.163 18.695 19.295 19.958 20.705 21.476 22.299 23.101 23.9 24.628 25.063 24.743 24.106 23.384 22.672 21.962 21.267 20.567 19.935 19.33 18.8 18.274 17.747 17.239 16.751 16.333 15.917 15.536 15.187 14.806 14.392 14.04 13.672 13.277 12.983 12.688 12.365 12.017 11.647 11.389 11.134 10.741 10.458 10.164 10.005 9.668 9.324 8.947 8.748 8.378 8.08 7.836 7.577 7.001 6.691 6.352 5.955 5.503 4.975 4.23 2.268 -9 ,5640 ,KEBNE ,16749053,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:52:16 CET,0.0 3.172 3.946 4.495 4.946 5.356 5.738 6.094 6.694 6.941 7.178 7.473 7.859 8.056 8.416 8.764 9.099 9.263 9.579 9.886 10.321 10.591 10.856 11.248 11.621 11.969 12.299 12.591 12.942 13.273 13.587 13.974 14.356 14.732 15.172 15.648 16.096 16.566 17.041 17.553 18.101 18.718 19.384 20.011 20.712 21.412 22.239 23.105 23.862 24.543 24.935 24.598 23.924 23.18 22.395 21.616 20.855 20.138 19.518 18.884 18.359 17.903 17.447 16.981 16.541 16.139 15.683 15.238 14.839 14.427 14.015 13.698 13.362 12.982 12.68 12.361 12.016 11.643 11.254 10.983 10.704 10.287 10.007 9.715 9.559 9.227 8.882 8.515 8.313 7.939 7.651 7.415 7.161 6.579 6.257 5.913 5.529 5.085 4.542 3.757 1.635 -10 ,13044 ,KEBNE ,16749054,Wed Dec 1 06:14:46 CET,Wed Dec 1 07:50:17 CET,0.0 3.422 4.263 4.872 5.373 5.805 6.196 6.54 7.128 7.406 7.668 7.959 8.345 8.569 8.985 9.374 9.738 9.903 10.215 10.523 10.969 11.252 11.52 11.902 12.27 12.616 12.941 13.244 13.633 14.012 14.374 14.811 15.226 15.626 16.077 16.547 16.983 17.471 17.977 18.477 18.98 19.529 20.141 20.745 21.428 22.12 22.844 23.621 24.403 25.045 25.386 25.123 24.55 23.823 23.083 22.401 21.761 21.123 20.544 19.964 19.45 18.976 18.473 17.978 17.517 17.065 16.579 16.143 15.746 15.34 14.937 14.585 14.236 13.886 13.591 13.269 12.941 12.601 12.239 11.991 11.744 11.37 11.109 10.829 10.678 10.374 10.037 9.65 9.444 9.065 8.776 8.538 8.272 7.691 7.375 7.029 6.64 6.179 5.629 4.905 2.814 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt deleted file mode 100644 index c7dfa11e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2597 ,KEBNE ,16749055,Wed Dec 1 06:16:55 CET,Wed Dec 1 07:51:49 CET,0.0 2.468 3.336 3.961 4.482 4.935 5.351 5.731 6.393 6.702 6.994 7.35 7.833 8.1 8.593 9.07 9.509 9.72 10.14 10.546 11.123 11.49 11.852 12.396 12.915 13.394 13.859 14.321 14.921 15.509 16.085 16.78 17.416 18.009 18.746 19.571 20.368 21.295 22.303 23.375 24.505 25.794 27.321 28.907 30.774 32.804 35.19 38.035 41.411 45.42 50.463 54.723 57.277 58.928 59.951 60.605 60.969 61.154 61.263 61.317 61.296 61.22 61.13 61.004 60.855 60.745 60.625 60.488 60.339 60.158 59.956 59.78 59.594 59.389 59.214 59.022 58.816 58.601 58.359 58.187 58.01 57.725 57.521 57.286 57.15 56.853 56.538 56.222 56.06 55.741 55.514 55.302 55.065 54.489 54.163 53.795 53.362 52.888 52.323 51.458 45.185 -2 ,13733 ,KEBNE ,16749056,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:49:59 CET,0.0 2.634 3.542 4.197 4.727 5.177 5.584 5.972 6.664 6.974 7.271 7.634 8.105 8.367 8.888 9.381 9.837 10.058 10.493 10.908 11.502 11.885 12.268 12.835 13.375 13.886 14.391 14.874 15.495 16.095 16.664 17.372 18.052 18.696 19.455 20.321 21.19 22.163 23.211 24.298 25.434 26.738 28.243 29.799 31.615 33.642 36.058 38.827 42.091 46.104 51.089 55.131 57.472 59.002 60.013 60.658 61.055 61.313 61.499 61.599 61.627 61.579 61.472 61.368 61.258 61.141 61.003 60.856 60.695 60.505 60.3 60.118 59.892 59.625 59.402 59.175 58.926 58.642 58.359 58.163 57.949 57.612 57.363 57.088 56.945 56.644 56.313 55.957 55.779 55.447 55.174 54.944 54.687 54.105 53.789 53.423 52.984 52.468 51.814 50.856 44.265 -3 ,23148 ,KEBNE ,16749057,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:51:21 CET,0.0 2.687 3.53 4.174 4.725 5.192 5.599 5.983 6.667 6.98 7.28 7.647 8.127 8.388 8.901 9.379 9.814 10.027 10.446 10.868 11.492 11.878 12.235 12.753 13.254 13.739 14.215 14.676 15.279 15.875 16.462 17.156 17.82 18.475 19.242 20.113 20.969 21.894 22.903 23.985 25.082 26.326 27.844 29.42 31.284 33.378 35.81 38.607 41.96 45.964 50.832 54.933 57.408 58.964 59.985 60.649 61.052 61.294 61.393 61.434 61.397 61.307 61.216 61.123 61.013 60.889 60.74 60.579 60.409 60.199 59.987 59.808 59.602 59.365 59.165 58.945 58.707 58.468 58.212 58.021 57.813 57.493 57.275 57.032 56.898 56.612 56.304 55.957 55.776 55.449 55.177 54.936 54.67 54.081 53.728 53.316 52.831 52.259 51.563 50.614 46.299 -6 ,27725 ,KEBNE ,16749060,Wed Dec 1 06:14:46 CET,Wed Dec 1 07:49:33 CET,0.0 3.117 3.93 4.573 5.121 5.586 5.995 6.381 7.103 7.423 7.726 8.09 8.565 8.82 9.301 9.772 10.226 10.44 10.864 11.283 11.901 12.302 12.692 13.255 13.792 14.308 14.806 15.291 15.909 16.497 17.061 17.742 18.413 19.073 19.841 20.703 21.53 22.427 23.393 24.427 25.533 26.835 28.388 29.921 31.731 33.813 36.231 39.014 42.375 46.442 51.386 55.445 57.81 59.348 60.304 60.898 61.284 61.508 61.649 61.702 61.637 61.537 61.441 61.356 61.265 61.162 61.029 60.891 60.758 60.615 60.45 60.267 60.043 59.808 59.62 59.408 59.168 58.912 58.674 58.5 58.296 57.97 57.737 57.503 57.394 57.157 56.885 56.594 56.436 56.122 55.905 55.703 55.487 54.996 54.702 54.355 53.951 53.457 52.812 51.85 47.198 -7 ,16908 ,KEBNE ,16749061,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:49:57 CET,0.0 2.401 3.261 3.89 4.419 4.884 5.295 5.667 6.369 6.704 7.008 7.35 7.817 8.072 8.567 9.032 9.482 9.696 10.111 10.505 11.085 11.477 11.849 12.371 12.879 13.376 13.845 14.31 14.921 15.509 16.068 16.72 17.351 17.968 18.712 19.584 20.43 21.344 22.341 23.43 24.578 25.894 27.41 28.919 30.697 32.684 35.009 37.785 41.206 45.277 50.35 54.64 57.062 58.56 59.541 60.208 60.647 60.882 61.009 61.112 61.125 61.093 61.013 60.881 60.715 60.555 60.38 60.202 60.034 59.838 59.616 59.425 59.223 59.027 58.894 58.747 58.577 58.391 58.183 58.029 57.868 57.611 57.426 57.2 57.061 56.774 56.484 56.163 55.985 55.651 55.383 55.156 54.919 54.37 54.045 53.675 53.244 52.739 52.092 51.143 44.744 -9 ,14388 ,KEBNE ,16749063,Wed Dec 1 06:14:50 CET,Wed Dec 1 07:43:26 CET,0.0 2.612 3.509 4.18 4.716 5.173 5.586 5.965 6.648 6.967 7.271 7.647 8.133 8.405 8.906 9.361 9.797 10.024 10.457 10.843 11.405 11.776 12.143 12.687 13.216 13.72 14.203 14.68 15.306 15.932 16.533 17.255 17.959 18.636 19.402 20.269 21.101 21.952 22.847 23.834 24.886 26.119 27.635 29.172 30.949 32.95 35.32 38.049 41.315 45.263 50.208 54.37 56.825 58.366 59.349 60.02 60.447 60.737 60.939 61.053 61.044 60.95 60.794 60.613 60.448 60.284 60.096 59.942 59.8 59.62 59.402 59.205 58.995 58.756 58.551 58.332 58.1 57.861 57.607 57.427 57.229 56.909 56.686 56.437 56.299 56.01 55.703 55.365 55.19 54.856 54.572 54.339 54.092 53.536 53.22 52.865 52.438 51.94 51.335 50.413 37.52 -10 ,539 ,KEBNE ,16749064,Wed Dec 1 06:14:51 CET,Wed Dec 1 07:46:12 CET,0.0 2.508 3.357 3.961 4.468 4.931 5.352 5.748 6.467 6.802 7.116 7.467 7.93 8.197 8.721 9.206 9.669 9.893 10.305 10.682 11.225 11.573 11.931 12.472 12.999 13.51 14.009 14.492 15.109 15.7 16.276 16.974 17.615 18.226 18.979 19.852 20.678 21.612 22.639 23.73 24.87 26.15 27.639 29.131 30.922 33.007 35.436 38.14 41.374 45.339 50.259 54.509 57.017 58.506 59.47 60.141 60.535 60.779 60.904 60.921 60.89 60.819 60.738 60.65 60.54 60.435 60.312 60.178 60.049 59.893 59.711 59.547 59.353 59.142 58.951 58.736 58.506 58.25 57.975 57.775 57.567 57.235 56.996 56.738 56.6 56.311 56.013 55.69 55.512 55.18 54.923 54.692 54.441 53.888 53.574 53.21 52.773 52.273 51.639 50.679 44.573 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 6d6bae9e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25591 ,KEBNE ,16749065,Wed Dec 1 06:23:21 CET,Wed Dec 1 07:59:10 CET,0.0 3.134 4.015 4.671 5.218 5.695 6.128 6.531 7.221 7.534 7.845 8.227 8.707 8.972 9.474 9.948 10.396 10.605 11.004 11.397 11.961 12.321 12.673 13.186 13.678 14.168 14.651 15.106 15.68 16.235 16.786 17.447 18.062 18.65 19.343 20.16 20.931 21.76 22.666 23.654 24.695 25.872 27.251 28.634 30.269 32.073 34.176 36.619 39.435 42.704 46.741 49.945 51.695 52.731 53.252 53.498 53.627 53.65 53.598 53.46 53.284 53.117 52.946 52.766 52.584 52.403 52.147 51.886 51.659 51.412 51.14 50.888 50.62 50.34 50.114 49.877 49.629 49.353 49.053 48.842 48.614 48.244 47.992 47.717 47.564 47.253 46.921 46.547 46.346 45.973 45.667 45.425 45.164 44.556 44.194 43.798 43.379 42.875 42.201 41.204 35.593 -2 ,11117 ,KEBNE ,16749066,Wed Dec 1 06:14:46 CET,Wed Dec 1 07:49:56 CET,0.0 3.051 3.841 4.471 5.004 5.445 5.849 6.212 6.869 7.17 7.453 7.783 8.253 8.509 8.981 9.427 9.859 10.069 10.47 10.851 11.387 11.741 12.095 12.597 13.086 13.565 14.028 14.481 15.076 15.647 16.179 16.821 17.444 18.047 18.739 19.528 20.315 21.153 22.006 22.922 23.917 25.031 26.339 27.692 29.293 31.04 33.072 35.384 38.05 41.277 45.186 48.214 49.749 50.598 51.13 51.413 51.488 51.477 51.451 51.34 51.137 50.949 50.77 50.569 50.353 50.123 49.853 49.614 49.418 49.189 48.929 48.699 48.444 48.166 47.949 47.73 47.502 47.248 46.953 46.735 46.514 46.181 45.956 45.72 45.595 45.334 45.039 44.725 44.559 44.227 44.008 43.801 43.572 43.038 42.725 42.366 41.955 41.461 40.799 39.795 34.473 -3 ,2020 ,KEBNE ,16749067,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:51:04 CET,0.0 3.091 3.908 4.515 5.033 5.495 5.911 6.295 6.998 7.318 7.604 7.928 8.383 8.626 9.092 9.542 9.959 10.159 10.552 10.924 11.451 11.793 12.128 12.609 13.079 13.534 13.972 14.413 14.978 15.496 16.005 16.626 17.206 17.756 18.396 19.129 19.848 20.668 21.573 22.508 23.484 24.615 25.968 27.347 28.95 30.773 32.922 35.368 38.216 41.462 45.199 48.273 49.977 50.92 51.447 51.763 51.878 51.832 51.712 51.561 51.421 51.261 51.065 50.881 50.68 50.461 50.232 50.014 49.822 49.631 49.427 49.239 49.015 48.754 48.533 48.287 48.03 47.74 47.432 47.223 46.998 46.637 46.374 46.111 45.979 45.7 45.387 45.036 44.847 44.494 44.227 43.996 43.744 43.172 42.845 42.484 42.079 41.568 40.889 39.965 36.098 -4 ,9732 ,KEBNE ,16749068,Wed Dec 1 06:14:48 CET,Wed Dec 1 07:51:00 CET,0.0 3.393 4.206 4.796 5.278 5.706 6.094 6.443 7.062 7.348 7.621 7.953 8.406 8.651 9.114 9.534 9.931 10.131 10.542 10.935 11.501 11.871 12.239 12.768 13.253 13.709 14.148 14.578 15.147 15.711 16.254 16.913 17.544 18.135 18.815 19.591 20.339 21.164 22.047 22.963 23.902 24.969 26.279 27.609 29.18 31.026 33.202 35.558 38.257 41.555 45.437 48.487 50.239 51.174 51.632 51.917 52.044 52.037 51.995 51.921 51.79 51.619 51.417 51.212 51.02 50.823 50.558 50.3 50.101 49.898 49.654 49.425 49.179 48.912 48.698 48.477 48.244 47.998 47.726 47.519 47.311 46.981 46.736 46.477 46.339 46.035 45.703 45.363 45.183 44.824 44.548 44.307 44.06 43.47 43.14 42.791 42.385 41.909 41.28 40.331 30.916 -6 ,32327 ,KEBNE ,16749070,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:49:51 CET,0.0 2.452 3.199 3.733 4.191 4.605 4.98 5.319 5.941 6.24 6.518 6.821 7.27 7.507 7.941 8.361 8.765 8.961 9.34 9.699 10.212 10.537 10.853 11.317 11.786 12.244 12.69 13.124 13.676 14.192 14.69 15.294 15.875 16.443 17.084 17.82 18.551 19.377 20.291 21.24 22.239 23.356 24.682 26.072 27.704 29.515 31.623 34.001 36.815 40.156 44.055 47.17 48.876 49.833 50.399 50.709 50.826 50.873 50.85 50.766 50.669 50.53 50.374 50.22 50.058 49.885 49.671 49.465 49.295 49.109 48.861 48.613 48.352 48.071 47.847 47.634 47.416 47.171 46.893 46.694 46.502 46.199 45.983 45.757 45.63 45.357 45.074 44.776 44.609 44.268 44.03 43.813 43.585 43.079 42.79 42.45 42.056 41.583 40.943 39.98 27.315 -7 ,4074 ,KEBNE ,16749071,Wed Dec 1 06:14:49 CET,Wed Dec 1 07:51:28 CET,0.0 3.193 4.007 4.613 5.112 5.56 6.001 6.409 7.098 7.399 7.676 7.999 8.454 8.7 9.156 9.56 9.941 10.127 10.482 10.825 11.312 11.639 11.98 12.472 12.943 13.404 13.86 14.311 14.885 15.409 15.9 16.486 17.038 17.576 18.219 18.96 19.673 20.486 21.402 22.385 23.419 24.549 25.852 27.176 28.74 30.462 32.453 34.785 37.568 40.818 44.652 47.649 49.197 50.107 50.622 50.892 51.026 51.051 51.0 50.897 50.773 50.641 50.489 50.312 50.1 49.864 49.59 49.348 49.133 48.882 48.609 48.367 48.103 47.823 47.591 47.334 47.067 46.794 46.507 46.304 46.078 45.697 45.43 45.149 45.003 44.707 44.392 44.028 43.834 43.48 43.223 42.993 42.73 42.108 41.753 41.385 40.984 40.504 39.887 38.909 31.254 -8 ,8303 ,KEBNE ,16749072,Wed Dec 1 06:14:46 CET,Wed Dec 1 07:49:50 CET,0.0 2.809 3.605 4.188 4.689 5.145 5.552 5.921 6.597 6.893 7.176 7.506 7.959 8.205 8.68 9.131 9.552 9.755 10.158 10.548 11.106 11.458 11.797 12.291 12.77 13.243 13.714 14.172 14.733 15.262 15.785 16.407 16.989 17.577 18.251 18.993 19.715 20.484 21.351 22.285 23.237 24.322 25.615 26.946 28.505 30.236 32.323 34.758 37.56 40.873 44.798 47.946 49.754 50.75 51.296 51.621 51.817 51.901 51.872 51.782 51.652 51.509 51.365 51.19 50.995 50.794 50.532 50.256 50.013 49.773 49.543 49.344 49.105 48.824 48.595 48.355 48.094 47.826 47.546 47.343 47.128 46.785 46.542 46.282 46.145 45.856 45.55 45.207 45.013 44.649 44.38 44.151 43.906 43.39 43.089 42.737 42.337 41.851 41.229 40.324 36.743 -9 ,19505 ,KEBNE ,16749073,Wed Dec 1 06:14:46 CET,Wed Dec 1 07:49:50 CET,0.0 3.376 4.148 4.746 5.236 5.659 6.048 6.414 7.078 7.375 7.657 7.987 8.449 8.699 9.175 9.637 10.086 10.304 10.724 11.129 11.708 12.076 12.438 12.958 13.437 13.901 14.359 14.807 15.399 15.96 16.481 17.122 17.754 18.378 19.114 19.927 20.693 21.518 22.417 23.363 24.342 25.474 26.853 28.232 29.781 31.49 33.566 36.013 38.834 42.146 45.991 49.021 50.801 51.764 52.282 52.583 52.727 52.746 52.666 52.543 52.394 52.238 52.075 51.889 51.702 51.477 51.203 50.947 50.712 50.455 50.176 49.937 49.689 49.424 49.208 48.976 48.73 48.454 48.144 47.938 47.729 47.391 47.141 46.886 46.754 46.46 46.136 45.784 45.599 45.244 44.98 44.746 44.489 43.933 43.62 43.256 42.826 42.297 41.652 40.757 37.257 -10 ,10129 ,KEBNE ,16749074,Wed Dec 1 06:14:48 CET,Wed Dec 1 07:50:23 CET,0.0 2.692 3.509 4.112 4.619 5.092 5.51 5.868 6.513 6.807 7.083 7.399 7.856 8.102 8.57 9.018 9.447 9.658 10.072 10.47 11.035 11.39 11.741 12.251 12.737 13.206 13.655 14.101 14.681 15.234 15.758 16.393 17.008 17.606 18.296 19.049 19.794 20.615 21.463 22.405 23.427 24.543 25.877 27.268 28.881 30.658 32.782 35.254 38.154 41.515 45.482 48.591 50.266 51.209 51.712 52.006 52.179 52.229 52.129 51.945 51.788 51.627 51.425 51.201 51.003 50.83 50.631 50.43 50.24 50.017 49.776 49.569 49.33 49.056 48.835 48.607 48.362 48.089 47.793 47.586 47.363 46.984 46.71 46.428 46.288 45.995 45.663 45.301 45.106 44.74 44.44 44.182 43.908 43.301 42.947 42.572 42.149 41.65 41.042 40.168 34.988 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt deleted file mode 100644 index 496d4881..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,890 ,KEBNE ,17028152,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:52:44 CET,0.0 2.144 2.638 2.99 3.272 3.52 3.743 3.942 4.29 4.454 4.614 4.832 5.009 5.117 5.316 5.505 5.683 5.764 5.923 6.082 6.31 6.428 6.527 6.677 6.813 6.921 7.01 7.103 7.226 7.326 7.423 7.546 7.624 7.675 7.727 7.77 7.815 7.865 7.857 7.768 7.671 7.586 7.445 7.194 6.713 6.04 5.148 3.884 1.968 -1.021 -5.955 -11.602 -16.059 -19.708 -22.672 -25.223 -27.416 -29.31 -30.881 -32.404 -33.663 -34.772 -35.799 -36.755 -37.666 -38.472 -39.282 -40.016 -40.656 -41.31 -41.986 -42.528 -43.074 -43.643 -44.073 -44.488 -44.911 -45.357 -45.823 -46.156 -46.494 -47.014 -47.397 -47.803 -48.005 -48.415 -48.835 -49.266 -49.492 -49.855 -50.23 -50.498 -50.787 -51.395 -51.728 -52.08 -52.486 -52.961 -53.532 -54.337 -57.331 -2 ,21878 ,KEBNE ,17028153,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:52:43 CET,0.0 2.222 2.807 3.189 3.468 3.707 3.923 4.116 4.461 4.6 4.725 4.906 5.071 5.171 5.355 5.519 5.66 5.725 5.844 5.954 6.09 6.175 6.258 6.369 6.472 6.563 6.638 6.72 6.828 6.907 6.974 7.071 7.156 7.209 7.284 7.383 7.462 7.525 7.562 7.554 7.475 7.371 7.196 6.883 6.427 5.781 4.837 3.501 1.472 -1.589 -6.495 -12.051 -16.447 -20.097 -23.122 -25.727 -27.959 -29.867 -31.462 -33.007 -34.295 -35.46 -36.548 -37.559 -38.494 -39.332 -40.185 -40.908 -41.524 -42.152 -42.801 -43.345 -43.901 -44.473 -44.903 -45.347 -45.795 -46.242 -46.705 -47.019 -47.344 -47.866 -48.231 -48.612 -48.811 -49.234 -49.693 -50.168 -50.404 -50.765 -51.129 -51.387 -51.657 -52.265 -52.617 -53.022 -53.471 -53.975 -54.586 -55.427 -59.3 -3 ,3147 ,KEBNE ,17028154,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:52:31 CET,0.0 1.949 2.46 2.827 3.126 3.382 3.61 3.816 4.196 4.361 4.509 4.73 4.926 5.047 5.243 5.433 5.618 5.706 5.888 6.061 6.281 6.41 6.534 6.724 6.897 7.045 7.191 7.316 7.465 7.606 7.739 7.883 7.992 8.063 8.135 8.181 8.192 8.194 8.151 8.069 7.974 7.82 7.624 7.421 7.014 6.347 5.384 4.094 2.168 -0.774 -5.539 -10.941 -15.25 -18.891 -21.854 -24.389 -26.522 -28.386 -29.957 -31.499 -32.818 -33.946 -34.986 -35.956 -36.83 -37.618 -38.461 -39.187 -39.777 -40.377 -41.022 -41.574 -42.133 -42.711 -43.141 -43.572 -44.044 -44.536 -45.036 -45.376 -45.718 -46.233 -46.588 -46.957 -47.147 -47.539 -47.958 -48.385 -48.598 -48.942 -49.27 -49.527 -49.806 -50.412 -50.751 -51.114 -51.501 -51.956 -52.593 -53.505 -56.305 -4 ,26844 ,KEBNE ,17028155,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:52:37 CET,0.0 2.347 2.954 3.354 3.674 3.948 4.169 4.376 4.751 4.928 5.107 5.368 5.563 5.688 5.901 6.096 6.291 6.382 6.542 6.674 6.862 6.989 7.098 7.241 7.361 7.455 7.539 7.619 7.722 7.813 7.903 8.017 8.132 8.244 8.342 8.413 8.432 8.388 8.349 8.3 8.198 8.081 7.869 7.546 7.079 6.425 5.498 4.241 2.44 -0.416 -5.282 -10.863 -15.241 -18.806 -21.71 -24.247 -26.433 -28.312 -29.876 -31.42 -32.729 -33.844 -34.9 -35.911 -36.829 -37.647 -38.483 -39.202 -39.826 -40.463 -41.089 -41.613 -42.153 -42.704 -43.134 -43.59 -44.071 -44.561 -45.066 -45.423 -45.799 -46.372 -46.766 -47.161 -47.36 -47.776 -48.207 -48.659 -48.895 -49.269 -49.656 -49.929 -50.226 -50.88 -51.242 -51.607 -52.013 -52.525 -53.138 -53.937 -56.848 -5 ,27496 ,KEBNE ,17028156,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:52:40 CET,0.0 2.62 3.239 3.661 4.005 4.304 4.555 4.771 5.121 5.274 5.428 5.622 5.797 5.92 6.141 6.335 6.501 6.573 6.725 6.879 7.093 7.224 7.339 7.504 7.654 7.784 7.909 8.032 8.187 8.322 8.442 8.576 8.683 8.773 8.869 8.952 9.003 9.027 9.04 9.04 8.996 8.918 8.762 8.518 8.127 7.532 6.616 5.302 3.422 0.499 -4.376 -9.866 -14.311 -17.976 -20.976 -23.56 -25.69 -27.574 -29.185 -30.725 -31.999 -33.118 -34.137 -35.076 -35.973 -36.808 -37.674 -38.434 -39.084 -39.734 -40.395 -40.953 -41.517 -42.06 -42.478 -42.9 -43.348 -43.822 -44.304 -44.626 -44.946 -45.455 -45.799 -46.18 -46.391 -46.815 -47.243 -47.702 -47.945 -48.323 -48.737 -49.009 -49.293 -49.941 -50.307 -50.71 -51.122 -51.56 -52.082 -52.847 -56.01 -6 ,14025 ,KEBNE ,17028157,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:53:54 CET,0.0 2.677 3.311 3.761 4.116 4.392 4.635 4.855 5.224 5.372 5.519 5.733 5.902 6.014 6.238 6.439 6.606 6.69 6.852 6.999 7.203 7.317 7.427 7.576 7.699 7.826 7.948 8.063 8.18 8.257 8.345 8.451 8.558 8.667 8.763 8.849 8.906 8.943 8.952 8.91 8.845 8.732 8.525 8.211 7.757 7.106 6.112 4.763 2.813 -0.091 -4.781 -10.305 -14.748 -18.362 -21.296 -23.823 -26.014 -27.887 -29.423 -30.955 -32.265 -33.386 -34.444 -35.441 -36.36 -37.195 -38.046 -38.783 -39.4 -40.018 -40.651 -41.179 -41.724 -42.27 -42.686 -43.126 -43.577 -44.034 -44.51 -44.842 -45.203 -45.753 -46.123 -46.518 -46.721 -47.148 -47.59 -48.045 -48.288 -48.673 -49.064 -49.33 -49.612 -50.24 -50.616 -51.041 -51.516 -52.071 -52.727 -53.583 -57.128 -7 ,7315 ,KEBNE ,17028158,Wed Dec 22 19:19:36 CET,Wed Dec 22 20:54:54 CET,0.0 2.693 3.315 3.765 4.133 4.419 4.653 4.847 5.165 5.308 5.458 5.673 5.853 5.969 6.173 6.362 6.543 6.621 6.757 6.895 7.112 7.235 7.338 7.488 7.624 7.743 7.839 7.935 8.076 8.194 8.307 8.459 8.599 8.684 8.746 8.818 8.872 8.898 8.882 8.833 8.756 8.652 8.482 8.176 7.657 6.967 6.04 4.763 2.852 -0.004 -4.695 -10.273 -14.706 -18.299 -21.228 -23.783 -25.962 -27.884 -29.511 -31.076 -32.374 -33.469 -34.505 -35.486 -36.384 -37.202 -38.062 -38.814 -39.432 -40.067 -40.757 -41.335 -41.922 -42.511 -42.95 -43.413 -43.884 -44.367 -44.863 -45.206 -45.556 -46.071 -46.423 -46.797 -46.99 -47.383 -47.8 -48.246 -48.478 -48.855 -49.253 -49.533 -49.84 -50.471 -50.81 -51.189 -51.608 -52.091 -52.62 -53.366 -56.123 -8 ,12937 ,KEBNE ,17028159,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:54:20 CET,0.0 1.972 2.553 2.956 3.303 3.607 3.867 4.096 4.459 4.622 4.779 4.988 5.166 5.292 5.539 5.751 5.929 6.019 6.219 6.397 6.598 6.73 6.874 7.06 7.207 7.331 7.456 7.587 7.737 7.864 7.992 8.135 8.252 8.362 8.472 8.556 8.617 8.643 8.626 8.615 8.566 8.397 8.155 7.891 7.481 6.865 5.872 4.465 2.545 -0.305 -5.084 -10.723 -15.235 -18.877 -21.798 -24.293 -26.419 -28.32 -29.921 -31.486 -32.801 -33.94 -35.031 -36.033 -36.954 -37.756 -38.545 -39.246 -39.852 -40.471 -41.108 -41.629 -42.159 -42.702 -43.13 -43.589 -44.059 -44.539 -45.036 -45.387 -45.753 -46.334 -46.733 -47.135 -47.35 -47.779 -48.202 -48.663 -48.916 -49.297 -49.679 -49.945 -50.231 -50.845 -51.194 -51.591 -52.002 -52.458 -53.02 -53.815 -56.638 -9 ,32403 ,KEBNE ,17028160,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:54:18 CET,0.0 2.064 2.633 2.997 3.299 3.575 3.836 4.066 4.433 4.6 4.763 4.968 5.125 5.222 5.421 5.582 5.714 5.779 5.912 6.034 6.182 6.281 6.387 6.515 6.633 6.754 6.88 7.0 7.127 7.239 7.354 7.495 7.602 7.678 7.75 7.802 7.836 7.857 7.851 7.84 7.795 7.673 7.431 7.115 6.639 5.947 4.974 3.623 1.673 -1.257 -6.077 -11.546 -15.858 -19.405 -22.399 -25.034 -27.25 -29.187 -30.825 -32.417 -33.726 -34.857 -35.926 -36.913 -37.798 -38.604 -39.443 -40.175 -40.813 -41.472 -42.129 -42.681 -43.266 -43.846 -44.286 -44.737 -45.198 -45.688 -46.191 -46.525 -46.857 -47.382 -47.765 -48.164 -48.36 -48.767 -49.198 -49.649 -49.891 -50.269 -50.695 -50.987 -51.278 -51.896 -52.248 -52.633 -53.044 -53.506 -54.105 -54.972 -57.427 -10 ,4702 ,KEBNE ,17028161,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:52:44 CET,0.0 3.936 4.534 4.947 5.26 5.504 5.723 5.923 6.235 6.358 6.471 6.626 6.789 6.884 7.049 7.2 7.334 7.397 7.52 7.632 7.779 7.866 7.956 8.113 8.264 8.409 8.548 8.667 8.805 8.93 9.039 9.149 9.248 9.317 9.371 9.427 9.466 9.501 9.51 9.461 9.36 9.216 9.001 8.747 8.42 7.952 7.203 6.053 4.32 1.761 -2.703 -8.094 -12.451 -16.014 -18.881 -21.351 -23.451 -25.326 -26.914 -28.462 -29.763 -30.886 -31.945 -32.939 -33.847 -34.681 -35.514 -36.231 -36.856 -37.487 -38.134 -38.666 -39.208 -39.785 -40.245 -40.699 -41.165 -41.657 -42.161 -42.501 -42.845 -43.386 -43.744 -44.108 -44.3 -44.693 -45.118 -45.581 -45.819 -46.188 -46.615 -46.915 -47.234 -47.904 -48.251 -48.652 -49.107 -49.66 -50.293 -51.123 -54.338 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt deleted file mode 100644 index 18cafecc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7323 ,KEBNE ,16749075,Wed Dec 1 06:14:46 CET,Wed Dec 1 07:52:11 CET,0.0 1.79 2.277 2.704 3.082 3.403 3.687 3.947 4.435 4.656 4.863 5.072 5.422 5.605 5.958 6.284 6.575 6.724 7.018 7.295 7.7 7.967 8.233 8.599 8.924 9.23 9.519 9.791 10.144 10.487 10.821 11.223 11.607 11.985 12.444 12.95 13.412 13.927 14.49 15.071 15.677 16.392 17.212 17.977 18.879 19.902 21.029 22.231 23.581 25.018 26.487 27.32 27.437 27.303 27.122 26.851 26.506 26.153 25.812 25.404 25.038 24.728 24.419 24.103 23.798 23.488 23.14 22.845 22.583 22.316 22.033 21.779 21.52 21.246 21.023 20.799 20.564 20.321 20.079 19.905 19.723 19.438 19.236 19.018 18.898 18.643 18.389 18.142 18.008 17.708 17.524 17.363 17.206 16.835 16.596 16.327 16.051 15.727 15.287 14.671 12.699 -2 ,22717 ,KEBNE ,16749076,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:50:16 CET,0.0 0.938 1.386 1.714 2.012 2.311 2.558 2.776 3.198 3.392 3.579 3.798 4.142 4.302 4.599 4.87 5.125 5.253 5.515 5.773 6.139 6.381 6.618 6.955 7.281 7.596 7.899 8.191 8.566 8.943 9.305 9.722 10.128 10.53 10.993 11.507 11.998 12.524 13.088 13.72 14.356 15.029 15.826 16.661 17.62 18.581 19.666 20.898 22.197 23.613 25.149 25.936 26.065 25.954 25.701 25.351 25.016 24.658 24.287 23.926 23.624 23.331 23.028 22.731 22.43 22.15 21.862 21.591 21.346 21.094 20.825 20.595 20.349 20.08 19.871 19.652 19.423 19.191 18.944 18.764 18.579 18.281 18.061 17.837 17.724 17.469 17.186 16.899 16.751 16.443 16.239 16.049 15.848 15.414 15.171 14.9 14.598 14.253 13.776 13.03 9.812 -3 ,14939 ,KEBNE ,16749077,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:50:17 CET,0.0 0.849 1.277 1.603 1.875 2.138 2.377 2.603 3.04 3.236 3.418 3.604 3.925 4.079 4.391 4.686 4.965 5.102 5.367 5.618 5.999 6.246 6.468 6.783 7.099 7.397 7.687 7.967 8.321 8.683 9.049 9.48 9.881 10.271 10.724 11.226 11.727 12.293 12.88 13.482 14.122 14.841 15.671 16.485 17.416 18.423 19.51 20.725 22.065 23.471 24.921 25.753 25.998 25.969 25.778 25.491 25.166 24.824 24.492 24.137 23.817 23.525 23.194 22.846 22.526 22.236 21.936 21.659 21.417 21.173 20.906 20.669 20.424 20.174 19.974 19.759 19.528 19.29 19.042 18.857 18.673 18.383 18.178 17.961 17.835 17.567 17.273 16.963 16.807 16.493 16.3 16.123 15.937 15.547 15.341 15.117 14.854 14.533 14.129 13.619 11.921 -4 ,11375 ,KEBNE ,16749078,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:51:55 CET,0.0 1.141 1.562 1.884 2.16 2.414 2.647 2.875 3.315 3.509 3.687 3.858 4.186 4.344 4.637 4.927 5.204 5.339 5.607 5.858 6.211 6.446 6.676 7.02 7.354 7.67 7.982 8.278 8.648 9.01 9.372 9.808 10.229 10.631 11.086 11.601 12.097 12.653 13.251 13.876 14.549 15.3 16.151 16.997 17.937 18.934 20.072 21.306 22.643 24.111 25.569 26.367 26.587 26.504 26.281 25.918 25.53 25.183 24.837 24.417 23.999 23.624 23.301 22.998 22.685 22.39 22.078 21.795 21.562 21.307 20.997 20.743 20.488 20.182 19.943 19.702 19.443 19.179 18.918 18.737 18.53 18.213 18.003 17.757 17.627 17.377 17.104 16.82 16.665 16.361 16.168 15.979 15.788 15.354 15.103 14.847 14.583 14.237 13.784 13.246 11.369 -5 ,4481 ,KEBNE ,16749079,Wed Dec 1 06:14:45 CET,Wed Dec 1 07:50:36 CET,0.0 1.005 1.394 1.697 1.962 2.223 2.45 2.658 3.058 3.246 3.443 3.663 4.004 4.18 4.523 4.835 5.122 5.262 5.541 5.809 6.201 6.458 6.703 7.045 7.367 7.685 7.984 8.265 8.641 9.009 9.362 9.8 10.245 10.675 11.151 11.68 12.168 12.696 13.303 13.959 14.621 15.34 16.142 16.926 17.861 18.871 19.981 21.199 22.554 24.035 25.575 26.456 26.662 26.609 26.44 26.17 25.888 25.564 25.228 24.879 24.555 24.242 23.921 23.612 23.331 23.056 22.748 22.478 22.25 21.99 21.706 21.462 21.19 20.934 20.738 20.52 20.298 20.064 19.811 19.628 19.434 19.137 18.933 18.721 18.608 18.358 18.076 17.788 17.64 17.339 17.129 16.934 16.731 16.283 16.04 15.768 15.467 15.135 14.696 14.059 10.514 -6 ,30942 ,KEBNE ,16749080,Wed Dec 1 06:14:45 CET,Wed Dec 1 07:51:44 CET,0.0 1.171 1.616 1.94 2.234 2.508 2.773 3.026 3.478 3.692 3.899 4.114 4.449 4.62 4.962 5.284 5.589 5.733 6.003 6.266 6.645 6.888 7.126 7.48 7.815 8.136 8.447 8.741 9.131 9.5 9.856 10.296 10.715 11.12 11.583 12.078 12.557 13.095 13.668 14.275 14.897 15.589 16.396 17.186 18.097 19.105 20.265 21.538 22.919 24.376 25.829 26.683 26.85 26.8 26.637 26.354 25.999 25.602 25.246 24.807 24.394 24.054 23.714 23.379 23.053 22.75 22.436 22.148 21.895 21.637 21.349 21.088 20.807 20.519 20.308 20.069 19.815 19.57 19.304 19.11 18.908 18.584 18.364 18.147 18.028 17.772 17.508 17.227 17.085 16.797 16.627 16.457 16.277 15.867 15.632 15.364 15.071 14.748 14.338 13.742 11.528 -7 ,17420 ,KEBNE ,16749081,Wed Dec 1 06:14:46 CET,Wed Dec 1 07:51:04 CET,0.0 1.65 2.131 2.465 2.764 3.049 3.303 3.537 3.965 4.157 4.333 4.507 4.84 5.001 5.311 5.601 5.864 5.993 6.243 6.49 6.852 7.075 7.298 7.624 7.935 8.237 8.53 8.804 9.167 9.54 9.875 10.262 10.64 11.014 11.452 11.928 12.388 12.904 13.459 14.021 14.625 15.355 16.174 16.945 17.816 18.755 19.823 21.021 22.317 23.685 25.165 26.002 26.18 26.144 25.975 25.7 25.374 25.051 24.746 24.365 23.969 23.608 23.273 22.943 22.619 22.308 21.971 21.667 21.41 21.143 20.863 20.623 20.347 20.05 19.822 19.59 19.349 19.105 18.851 18.667 18.479 18.173 17.952 17.725 17.618 17.399 17.148 16.873 16.725 16.421 16.224 16.042 15.837 15.367 15.116 14.842 14.526 14.16 13.722 13.104 9.617 -8 ,13138 ,KEBNE ,16749082,Wed Dec 1 06:14:45 CET,Wed Dec 1 07:49:43 CET,0.0 0.964 1.378 1.702 1.996 2.25 2.49 2.72 3.133 3.331 3.514 3.676 4.001 4.164 4.454 4.749 5.05 5.19 5.455 5.708 6.078 6.319 6.556 6.906 7.241 7.561 7.874 8.172 8.541 8.908 9.271 9.704 10.118 10.512 10.966 11.485 11.974 12.498 13.066 13.661 14.28 14.99 15.789 16.579 17.529 18.542 19.619 20.746 22.092 23.658 25.158 25.917 26.028 25.918 25.649 25.302 24.961 24.601 24.234 23.84 23.502 23.175 22.829 22.497 22.159 21.84 21.504 21.185 20.889 20.598 20.324 20.087 19.854 19.603 19.376 19.126 18.881 18.642 18.376 18.173 17.98 17.699 17.489 17.263 17.148 16.909 16.648 16.346 16.178 15.862 15.674 15.486 15.287 14.842 14.592 14.339 14.065 13.729 13.295 12.741 10.664 -9 ,16253 ,KEBNE ,16749083,Wed Dec 1 06:14:46 CET,Wed Dec 1 07:50:11 CET,0.0 1.08 1.512 1.861 2.176 2.461 2.714 2.937 3.332 3.523 3.706 3.888 4.215 4.374 4.694 4.994 5.264 5.395 5.657 5.922 6.294 6.526 6.758 7.091 7.41 7.715 7.991 8.257 8.611 8.973 9.325 9.748 10.174 10.585 11.048 11.56 12.049 12.596 13.192 13.813 14.448 15.14 15.929 16.744 17.705 18.738 19.874 21.117 22.479 23.85 25.274 26.115 26.327 26.274 26.055 25.711 25.346 24.968 24.595 24.168 23.785 23.463 23.153 22.865 22.56 22.236 21.886 21.568 21.288 20.998 20.694 20.442 20.185 19.908 19.691 19.454 19.184 18.906 18.63 18.44 18.242 17.935 17.712 17.473 17.351 17.102 16.84 16.567 16.433 16.135 15.938 15.759 15.576 15.193 14.981 14.74 14.479 14.148 13.71 13.166 10.823 -10 ,12993 ,KEBNE ,16749084,Wed Dec 1 06:14:46 CET,Wed Dec 1 07:50:18 CET,0.0 1.884 2.339 2.694 3.018 3.316 3.566 3.785 4.211 4.41 4.588 4.76 5.088 5.248 5.558 5.843 6.109 6.244 6.506 6.752 7.111 7.339 7.554 7.86 8.15 8.43 8.709 8.987 9.359 9.717 10.059 10.472 10.859 11.229 11.667 12.153 12.633 13.173 13.733 14.315 14.918 15.586 16.359 17.13 18.039 19.036 20.114 21.315 22.695 24.274 25.908 26.688 26.876 26.833 26.598 26.202 25.822 25.472 25.113 24.732 24.364 24.0 23.643 23.322 23.03 22.747 22.435 22.149 21.894 21.643 21.384 21.146 20.882 20.6 20.373 20.134 19.898 19.66 19.402 19.219 19.027 18.732 18.53 18.318 18.204 17.968 17.723 17.443 17.295 17.002 16.837 16.661 16.475 16.067 15.839 15.581 15.291 14.972 14.609 14.085 11.96 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index 1287ec60..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6065 ,KEBNE ,16749085,Wed Dec 1 06:14:48 CET,Wed Dec 1 07:51:04 CET,0.0 1.983 2.537 2.971 3.325 3.653 3.957 4.229 4.718 4.939 5.164 5.424 5.767 5.946 6.299 6.615 6.91 7.05 7.32 7.59 7.979 8.222 8.458 8.788 9.082 9.359 9.617 9.852 10.156 10.463 10.762 11.117 11.454 11.766 12.131 12.527 12.895 13.301 13.719 14.163 14.646 15.202 15.874 16.52 17.194 17.871 18.569 19.293 20.058 20.781 21.124 20.791 20.224 19.527 18.842 18.223 17.644 17.056 16.442 15.816 15.303 14.837 14.384 13.959 13.561 13.172 12.763 12.409 12.114 11.804 11.476 11.194 10.899 10.604 10.374 10.132 9.857 9.568 9.291 9.097 8.895 8.567 8.322 8.067 7.935 7.66 7.395 7.105 6.952 6.645 6.478 6.299 6.121 5.721 5.498 5.254 4.956 4.619 4.207 3.652 1.769 -2 ,1050 ,KEBNE ,16749086,Wed Dec 1 06:14:49 CET,Wed Dec 1 07:49:25 CET,0.0 1.682 2.242 2.67 3.027 3.321 3.596 3.858 4.342 4.566 4.769 4.989 5.337 5.512 5.841 6.136 6.405 6.539 6.797 7.048 7.424 7.67 7.899 8.227 8.543 8.853 9.155 9.436 9.788 10.127 10.451 10.834 11.194 11.523 11.891 12.28 12.661 13.113 13.602 14.097 14.603 15.167 15.797 16.409 17.11 17.852 18.669 19.543 20.427 21.219 21.733 21.599 21.191 20.682 20.053 19.401 18.822 18.267 17.72 17.111 16.587 16.158 15.747 15.321 14.905 14.54 14.161 13.802 13.494 13.186 12.85 12.566 12.281 11.983 11.741 11.485 11.214 10.927 10.637 10.434 10.214 9.858 9.611 9.353 9.22 8.959 8.695 8.412 8.264 7.948 7.788 7.62 7.434 7.011 6.783 6.546 6.28 5.939 5.539 5.062 2.522 -3 ,3422 ,KEBNE ,16749087,Wed Dec 1 06:14:49 CET,Wed Dec 1 07:53:46 CET,0.0 1.785 2.311 2.724 3.091 3.412 3.69 3.952 4.431 4.651 4.877 5.116 5.472 5.666 6.009 6.325 6.636 6.785 7.06 7.308 7.664 7.899 8.132 8.48 8.794 9.132 9.513 9.842 10.211 10.568 10.899 11.278 11.641 11.976 12.337 12.735 13.123 13.554 14.016 14.493 14.973 15.529 16.195 16.836 17.548 18.325 19.155 19.97 20.755 21.448 21.89 21.67 21.148 20.507 19.818 19.144 18.544 18.029 17.543 16.983 16.5 16.093 15.704 15.318 14.946 14.617 14.262 13.924 13.613 13.282 12.951 12.683 12.392 12.082 11.847 11.598 11.338 11.066 10.777 10.581 10.378 10.063 9.853 9.626 9.503 9.25 8.973 8.676 8.517 8.188 8.024 7.86 7.678 7.249 7.008 6.734 6.428 6.079 5.652 5.086 3.103 -4 ,20400 ,KEBNE ,16749088,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:54:54 CET,0.0 2.157 2.733 3.156 3.502 3.82 4.101 4.367 4.895 5.131 5.331 5.558 5.909 6.084 6.407 6.706 6.991 7.123 7.377 7.633 8.019 8.262 8.487 8.806 9.106 9.381 9.649 9.932 10.283 10.609 10.933 11.335 11.739 12.113 12.488 12.905 13.314 13.757 14.226 14.725 15.244 15.797 16.441 17.059 17.736 18.475 19.268 20.076 20.904 21.662 22.121 21.894 21.395 20.801 20.139 19.428 18.781 18.188 17.658 17.095 16.605 16.167 15.738 15.313 14.919 14.57 14.18 13.814 13.507 13.187 12.837 12.549 12.256 11.949 11.704 11.456 11.207 10.935 10.64 10.434 10.217 9.867 9.624 9.38 9.259 9.011 8.745 8.468 8.327 8.02 7.859 7.69 7.509 7.095 6.861 6.616 6.349 6.019 5.597 5.03 2.653 -5 ,21192 ,KEBNE ,16749089,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:53:10 CET,0.0 1.962 2.537 2.962 3.322 3.633 3.915 4.165 4.615 4.828 5.027 5.237 5.581 5.746 6.081 6.395 6.671 6.811 7.084 7.336 7.69 7.919 8.147 8.477 8.786 9.082 9.38 9.664 10.019 10.356 10.69 11.093 11.459 11.795 12.178 12.605 13.02 13.479 13.958 14.442 14.94 15.472 16.068 16.684 17.386 18.145 18.936 19.683 20.409 21.141 21.616 21.538 21.102 20.514 19.962 19.381 18.794 18.222 17.717 17.204 16.758 16.364 15.961 15.552 15.17 14.832 14.469 14.123 13.808 13.47 13.12 12.827 12.511 12.174 11.923 11.683 11.444 11.189 10.912 10.721 10.517 10.197 9.975 9.735 9.611 9.366 9.09 8.768 8.611 8.295 8.135 7.96 7.773 7.396 7.187 6.949 6.677 6.326 5.918 5.398 3.199 -6 ,15262 ,KEBNE ,16749090,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:50:40 CET,0.0 2.098 2.629 3.022 3.374 3.704 3.984 4.234 4.702 4.917 5.12 5.307 5.642 5.805 6.122 6.43 6.72 6.854 7.121 7.381 7.765 8.023 8.259 8.584 8.895 9.197 9.48 9.746 10.104 10.444 10.763 11.128 11.468 11.795 12.168 12.554 12.93 13.353 13.798 14.271 14.752 15.272 15.854 16.436 17.084 17.775 18.503 19.226 19.974 20.599 20.93 20.785 20.265 19.637 19.036 18.436 17.852 17.253 16.723 16.193 15.686 15.203 14.754 14.32 13.893 13.526 13.163 12.822 12.512 12.178 11.834 11.568 11.282 10.972 10.74 10.502 10.227 9.934 9.644 9.435 9.223 8.911 8.696 8.475 8.353 8.085 7.822 7.547 7.394 7.073 6.904 6.733 6.558 6.146 5.91 5.675 5.417 5.089 4.715 4.199 1.464 -7 ,6801 ,KEBNE ,16749091,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:51:17 CET,0.0 2.072 2.644 3.068 3.42 3.751 4.047 4.314 4.773 4.981 5.19 5.425 5.776 5.956 6.281 6.593 6.891 7.03 7.289 7.524 7.862 8.078 8.297 8.602 8.874 9.14 9.407 9.678 10.041 10.393 10.741 11.148 11.521 11.864 12.253 12.687 13.088 13.521 13.975 14.443 14.939 15.512 16.16 16.788 17.496 18.22 18.979 19.709 20.442 21.115 21.532 21.462 20.988 20.365 19.754 19.166 18.589 18.039 17.526 16.972 16.511 16.103 15.696 15.294 14.927 14.576 14.19 13.829 13.509 13.194 12.877 12.604 12.317 12.017 11.784 11.548 11.307 11.056 10.787 10.593 10.398 10.096 9.873 9.644 9.533 9.286 9.014 8.745 8.606 8.286 8.116 7.944 7.749 7.313 7.087 6.85 6.583 6.297 5.898 5.333 3.274 -8 ,32296 ,KEBNE ,16749092,Wed Dec 1 06:14:46 CET,Wed Dec 1 07:49:28 CET,0.0 2.125 2.701 3.146 3.493 3.793 4.09 4.374 4.875 5.105 5.318 5.52 5.868 6.045 6.352 6.643 6.936 7.076 7.333 7.576 7.927 8.144 8.352 8.663 8.964 9.258 9.55 9.837 10.184 10.498 10.821 11.229 11.602 11.939 12.321 12.751 13.131 13.55 14.026 14.501 14.983 15.55 16.196 16.804 17.508 18.253 19.026 19.839 20.766 21.609 22.049 21.906 21.488 20.903 20.231 19.524 18.889 18.29 17.717 17.148 16.694 16.275 15.846 15.458 15.091 14.714 14.321 13.97 13.651 13.348 13.05 12.784 12.503 12.221 12.001 11.753 11.496 11.238 10.963 10.77 10.57 10.255 10.035 9.812 9.693 9.432 9.17 8.879 8.724 8.407 8.239 8.065 7.878 7.493 7.272 7.013 6.744 6.439 6.061 5.502 3.263 -9 ,8024 ,KEBNE ,16749093,Wed Dec 1 06:14:47 CET,Wed Dec 1 07:50:02 CET,0.0 1.796 2.345 2.764 3.128 3.466 3.781 4.048 4.515 4.728 4.936 5.168 5.514 5.687 6.017 6.332 6.628 6.768 7.047 7.31 7.667 7.887 8.098 8.421 8.726 8.987 9.241 9.499 9.832 10.15 10.444 10.801 11.155 11.487 11.868 12.275 12.651 13.06 13.509 13.996 14.462 14.977 15.618 16.24 16.946 17.704 18.497 19.286 20.05 20.743 21.068 20.771 20.269 19.672 19.073 18.45 17.855 17.319 16.823 16.283 15.816 15.397 14.995 14.605 14.251 13.933 13.577 13.247 12.949 12.634 12.312 12.036 11.743 11.424 11.17 10.906 10.629 10.332 10.024 9.813 9.589 9.233 8.993 8.747 8.617 8.351 8.075 7.794 7.649 7.341 7.202 7.034 6.85 6.443 6.22 5.972 5.67 5.319 4.921 4.406 2.26 -10 ,6863 ,KEBNE ,16749094,Wed Dec 1 06:14:48 CET,Wed Dec 1 07:49:15 CET,0.0 1.803 2.415 2.878 3.302 3.683 4.026 4.322 4.833 5.071 5.293 5.538 5.897 6.093 6.455 6.762 7.056 7.2 7.483 7.758 8.134 8.369 8.598 8.922 9.221 9.506 9.787 10.059 10.395 10.711 11.029 11.415 11.782 12.132 12.529 12.967 13.383 13.839 14.311 14.778 15.253 15.791 16.387 16.952 17.596 18.311 19.042 19.731 20.432 21.071 21.527 21.332 20.795 20.13 19.417 18.667 17.995 17.383 16.815 16.256 15.744 15.276 14.847 14.443 14.061 13.689 13.285 12.927 12.597 12.244 11.886 11.591 11.292 10.981 10.724 10.449 10.177 9.92 9.648 9.438 9.224 8.896 8.659 8.422 8.3 8.044 7.764 7.472 7.322 6.995 6.81 6.624 6.415 5.951 5.717 5.448 5.118 4.782 4.34 3.769 1.719 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt deleted file mode 100644 index fecdbab2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4170 ,KEBNE ,16749095,Wed Dec 1 06:14:48 CET,Wed Dec 1 07:51:13 CET,0.0 0.738 1.051 1.316 1.53 1.715 1.882 2.029 2.3 2.424 2.555 2.368 2.941 3.053 3.263 3.461 3.647 3.748 3.942 4.121 4.376 4.538 4.705 4.954 5.2 5.434 5.658 5.888 6.175 6.443 6.698 7.02 7.343 7.64 7.988 8.368 8.702 9.065 9.473 9.918 10.372 10.872 11.46 12.02 12.63 13.293 14.044 14.814 15.596 16.329 16.898 16.924 16.579 16.088 15.587 15.102 14.601 14.098 13.621 13.149 12.763 12.401 12.034 11.675 11.334 11.027 10.699 10.397 10.132 9.838 9.517 9.256 8.98 8.685 8.458 8.216 7.961 7.697 7.418 7.224 7.024 6.698 6.459 6.22 6.103 5.865 5.614 5.35 5.215 4.624 4.74 4.562 4.361 3.922 3.692 3.45 3.182 2.858 2.423 1.839 0.244 -2 ,11737 ,KEBNE ,16749096,Wed Dec 1 06:14:48 CET,Wed Dec 1 07:54:20 CET,0.0 0.947 1.292 1.531 1.731 1.924 2.102 2.256 2.542 2.679 2.801 2.587 3.165 3.283 3.498 3.688 3.875 3.969 4.152 4.334 4.618 4.792 4.945 5.178 5.407 5.633 5.851 6.066 6.345 6.604 6.851 7.157 7.442 7.698 7.997 8.339 8.662 9.003 9.365 9.769 10.191 10.664 11.221 11.742 12.3 12.919 13.583 14.282 15.085 15.845 16.453 16.471 16.145 15.708 15.206 14.695 14.181 13.681 13.266 12.821 12.39 11.989 11.596 11.22 10.876 10.569 10.228 9.904 9.635 9.358 9.058 8.81 8.548 8.256 8.02 7.775 7.524 7.264 6.996 6.813 6.62 6.31 6.094 5.87 5.753 5.514 5.247 4.939 4.78 4.173 4.25 4.068 3.884 3.482 3.235 2.956 2.661 2.327 1.923 1.342 -0.374 -3 ,20314 ,KEBNE ,16749097,Wed Dec 1 06:16:54 CET,Wed Dec 1 07:54:27 CET,0.0 0.714 1.076 1.336 1.534 1.721 1.902 2.067 2.376 2.52 2.657 2.484 3.077 3.214 3.46 3.686 3.898 4.002 4.202 4.39 4.663 4.83 4.993 5.234 5.458 5.677 5.883 6.077 6.336 6.591 6.836 7.134 7.416 7.671 7.967 8.336 8.688 9.059 9.458 9.869 10.287 10.754 11.3 11.848 12.474 13.151 13.895 14.633 15.42 16.233 16.951 17.141 16.893 16.52 16.077 15.597 15.138 14.681 14.249 13.785 13.377 13.024 12.67 12.325 12.005 11.714 11.4 11.101 10.836 10.559 10.245 9.958 9.666 9.371 9.139 8.911 8.687 8.45 8.178 7.987 7.804 7.531 7.341 7.131 7.018 6.787 6.551 6.301 6.164 5.569 5.687 5.509 5.307 4.79 4.469 4.159 3.869 3.537 3.125 2.587 0.601 -4 ,8686 ,KEBNE ,16749098,Wed Dec 1 06:15:49 CET,Wed Dec 1 07:50:50 CET,0.0 1.087 1.508 1.874 2.173 2.39 2.586 2.786 3.137 3.311 3.474 3.31 3.891 4.017 4.259 4.485 4.697 4.798 4.997 5.191 5.464 5.643 5.823 6.07 6.287 6.505 6.727 6.936 7.2 7.462 7.721 8.032 8.327 8.606 8.921 9.256 9.58 9.939 10.32 10.721 11.126 11.577 12.101 12.613 13.193 13.811 14.505 15.26 16.049 16.795 17.378 17.472 17.195 16.738 16.213 15.664 15.138 14.632 14.205 13.757 13.316 12.917 12.549 12.182 11.83 11.524 11.194 10.895 10.634 10.358 10.069 9.821 9.567 9.287 9.052 8.801 8.541 8.281 8.017 7.845 7.647 7.301 7.069 6.834 6.714 6.47 6.215 5.932 5.777 5.155 5.163 4.915 4.655 4.096 3.789 3.473 3.168 2.829 2.37 1.743 -0.873 -5 ,9120 ,KEBNE ,16749099,Wed Dec 1 06:16:55 CET,Wed Dec 1 07:51:45 CET,0.0 0.829 1.17 1.42 1.637 1.851 2.058 2.242 2.542 2.671 2.789 2.57 3.133 3.238 3.448 3.639 3.817 3.911 4.096 4.277 4.532 4.695 4.862 5.1 5.324 5.538 5.753 5.971 6.248 6.51 6.771 7.092 7.405 7.696 8.006 8.346 8.685 9.074 9.457 9.841 10.269 10.738 11.251 11.78 12.387 13.025 13.736 14.478 15.239 15.961 16.528 16.632 16.392 15.956 15.45 14.932 14.457 13.972 13.498 13.02 12.577 12.19 11.815 11.447 11.12 10.804 10.464 10.174 9.927 9.661 9.382 9.144 8.874 8.597 8.398 8.185 7.962 7.725 7.466 7.295 7.102 6.769 6.548 6.331 6.213 5.955 5.69 5.412 5.272 4.68 4.803 4.634 4.448 4.039 3.817 3.561 3.263 2.934 2.522 1.928 0.012 -6 ,29039 ,KEBNE ,16749100,Wed Dec 1 06:15:50 CET,Wed Dec 1 07:54:51 CET,0.0 0.831 1.123 1.36 1.593 1.805 2.019 2.205 2.542 2.698 2.838 2.656 3.24 3.364 3.598 3.812 4.013 4.112 4.321 4.548 4.854 5.024 5.189 5.429 5.662 5.889 6.116 6.333 6.6 6.842 7.074 7.358 7.633 7.926 8.269 8.612 8.918 9.265 9.649 10.072 10.491 10.94 11.461 11.948 12.501 13.102 13.76 14.443 15.149 15.847 16.441 16.513 16.233 15.777 15.301 14.803 14.298 13.799 13.357 12.925 12.538 12.166 11.779 11.395 11.063 10.769 10.431 10.129 9.873 9.593 9.291 9.033 8.752 8.459 8.236 8.007 7.765 7.51 7.217 7.014 6.822 6.514 6.307 6.096 5.98 5.74 5.489 5.216 5.073 4.483 4.617 4.444 4.252 3.822 3.588 3.338 3.06 2.735 2.275 1.625 -0.616 -7 ,72 ,KEBNE ,16749101,Wed Dec 1 06:15:50 CET,Wed Dec 1 07:53:45 CET,0.0 0.89 1.262 1.5 1.707 1.901 2.104 2.284 2.584 2.721 2.852 2.651 3.223 3.342 3.578 3.795 3.983 4.077 4.268 4.457 4.714 4.875 5.041 5.279 5.509 5.738 5.947 6.135 6.383 6.629 6.862 7.141 7.41 7.677 7.984 8.334 8.683 9.053 9.444 9.858 10.287 10.736 11.259 11.817 12.42 13.015 13.672 14.372 15.151 15.981 16.662 16.743 16.455 16.042 15.565 15.066 14.588 14.085 13.591 13.093 12.696 12.334 11.96 11.592 11.24 10.922 10.588 10.272 9.994 9.718 9.43 9.17 8.885 8.601 8.381 8.139 7.895 7.648 7.369 7.171 6.966 6.648 6.434 6.206 6.089 5.853 5.592 5.303 5.148 4.55 4.684 4.508 4.317 3.899 3.665 3.414 3.12 2.758 2.335 1.766 -0.18 -8 ,21915 ,KEBNE ,16749102,Wed Dec 1 06:15:50 CET,Wed Dec 1 07:52:42 CET,0.0 1.063 1.363 1.606 1.831 2.018 2.17 2.311 2.613 2.761 2.891 2.671 3.233 3.346 3.557 3.751 3.948 4.043 4.228 4.412 4.66 4.826 5.008 5.26 5.48 5.71 5.937 6.151 6.435 6.705 6.958 7.253 7.547 7.839 8.171 8.534 8.883 9.264 9.67 10.109 10.562 11.069 11.643 12.173 12.769 13.456 14.232 14.995 15.802 16.643 17.39 17.609 17.43 17.062 16.639 16.217 15.784 15.354 14.967 14.526 14.141 13.801 13.446 13.103 12.768 12.457 12.132 11.832 11.574 11.309 11.025 10.785 10.527 10.25 10.044 9.832 9.61 9.375 9.128 8.955 8.768 8.465 8.256 8.033 7.92 7.697 7.431 7.14 6.994 6.398 6.513 6.334 6.152 5.772 5.545 5.273 4.936 4.557 4.097 3.443 -3.045 -9 ,3009 ,KEBNE ,16749103,Wed Dec 1 06:15:50 CET,Wed Dec 1 07:50:26 CET,0.0 0.833 1.17 1.388 1.589 1.767 1.936 2.093 2.37 2.504 2.631 2.424 2.997 3.111 3.331 3.543 3.741 3.838 4.036 4.229 4.484 4.641 4.799 5.026 5.237 5.437 5.644 5.85 6.124 6.393 6.644 6.96 7.269 7.56 7.896 8.282 8.641 9.012 9.415 9.85 10.307 10.803 11.371 11.936 12.572 13.262 14.011 14.773 15.512 16.266 16.976 17.146 16.979 16.634 16.224 15.808 15.364 14.89 14.442 13.977 13.582 13.21 12.815 12.445 12.104 11.766 11.397 11.071 10.792 10.477 10.153 9.895 9.61 9.314 9.089 8.861 8.628 8.374 8.107 7.918 7.717 7.406 7.195 6.97 6.848 6.612 6.382 6.113 5.969 5.383 5.507 5.331 5.156 4.748 4.516 4.261 3.987 3.67 3.279 2.732 0.995 -10 ,5436 ,KEBNE ,16749104,Wed Dec 1 06:22:09 CET,Wed Dec 1 07:58:06 CET,0.0 0.662 1.013 1.258 1.461 1.641 1.806 1.977 2.295 2.429 2.546 2.329 2.897 3.009 3.224 3.428 3.626 3.719 3.905 4.09 4.365 4.548 4.724 4.967 5.197 5.422 5.647 5.87 6.139 6.401 6.65 6.931 7.204 7.464 7.763 8.093 8.406 8.747 9.118 9.508 9.915 10.344 10.839 11.334 11.887 12.482 13.121 13.818 14.565 15.237 15.734 15.755 15.425 14.982 14.506 13.984 13.465 12.993 12.572 12.1 11.686 11.303 10.919 10.559 10.221 9.904 9.551 9.229 8.955 8.683 8.382 8.114 7.842 7.565 7.353 7.132 6.891 6.637 6.371 6.18 5.988 5.681 5.454 5.214 5.09 4.837 4.564 4.278 4.139 3.555 3.708 3.541 3.352 2.948 2.721 2.464 2.171 1.819 1.347 0.724 -0.975 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 02744861..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,703 ,KEBNE ,16749105,Wed Dec 1 06:15:50 CET,Wed Dec 1 07:54:10 CET,0.0 1.062 1.291 1.407 1.465 1.492 1.492 1.472 1.397 1.346 1.296 0.938 1.131 1.055 0.877 0.685 0.481 0.381 0.176 -0.046 -0.399 -0.63 -0.854 -1.196 -1.551 -1.927 -2.322 -2.709 -3.228 -3.788 -4.36 -5.082 -5.818 -6.565 -7.487 -8.567 -9.656 -10.941 -12.405 -14.033 -15.848 -18.047 -20.793 -23.744 -27.464 -31.972 -37.622 -44.661 -53.922 -66.495 -84.788 -103.56 -117.099 -127.491 -135.666 -142.447 -148.025 -152.789 -156.693 -160.402 -163.455 -166.074 -168.478 -170.659 -172.63 -174.371 -176.109 -177.61 -178.881 -180.164 -181.474 -182.531 -183.587 -184.668 -185.483 -186.291 -187.119 -187.967 -188.82 -189.391 -189.96 -190.823 -191.424 -192.035 -192.341 -192.968 -193.599 -194.232 -194.55 -195.324 -195.545 -195.902 -196.261 -196.974 -197.343 -197.73 -198.135 -198.564 -199.032 -199.572 -200.731 -2 ,22736 ,KEBNE ,16749106,Wed Dec 1 06:15:51 CET,Wed Dec 1 07:49:56 CET,0.0 0.995 1.225 1.335 1.405 1.445 1.442 1.422 1.354 1.317 1.272 0.896 1.091 1.017 0.852 0.677 0.488 0.39 0.184 -0.038 -0.39 -0.622 -0.861 -1.234 -1.603 -1.978 -2.362 -2.761 -3.3 -3.841 -4.396 -5.104 -5.826 -6.564 -7.463 -8.538 -9.643 -10.92 -12.387 -14.043 -15.871 -18.071 -20.829 -23.805 -27.537 -32.015 -37.666 -44.706 -53.932 -66.513 -84.799 -103.566 -117.17 -127.611 -135.811 -142.632 -148.24 -153.018 -156.905 -160.571 -163.567 -166.13 -168.51 -170.685 -172.65 -174.381 -176.126 -177.649 -178.926 -180.223 -181.534 -182.589 -183.663 -184.736 -185.544 -186.368 -187.193 -188.032 -188.894 -189.468 -190.05 -190.932 -191.52 -192.112 -192.408 -193.016 -193.645 -194.292 -194.621 -195.403 -195.625 -195.97 -196.319 -197.045 -197.43 -197.827 -198.231 -198.662 -199.14 -199.712 -201.087 -3 ,4475 ,KEBNE ,16749107,Wed Dec 1 06:15:51 CET,Wed Dec 1 07:51:29 CET,0.0 0.855 1.038 1.175 1.268 1.303 1.308 1.293 1.224 1.177 1.124 0.742 0.923 0.845 0.691 0.513 0.312 0.211 0.005 -0.217 -0.559 -0.791 -1.03 -1.412 -1.805 -2.196 -2.598 -3.011 -3.569 -4.129 -4.69 -5.404 -6.139 -6.879 -7.785 -8.88 -9.995 -11.293 -12.746 -14.365 -16.188 -18.398 -21.159 -24.119 -27.86 -32.37 -38.002 -45.085 -54.418 -67.019 -85.3 -104.073 -117.639 -128.068 -136.32 -143.192 -148.816 -153.57 -157.437 -161.102 -164.112 -166.702 -169.085 -171.269 -173.221 -174.917 -176.642 -178.146 -179.423 -180.712 -182.007 -183.07 -184.138 -185.205 -186.013 -186.82 -187.635 -188.474 -189.323 -189.889 -190.466 -191.335 -191.925 -192.532 -192.837 -193.456 -194.087 -194.73 -195.057 -195.839 -196.044 -196.385 -196.733 -197.455 -197.836 -198.223 -198.627 -199.069 -199.551 -200.105 -201.359 -4 ,11129 ,KEBNE ,16749108,Wed Dec 1 06:15:51 CET,Wed Dec 1 07:49:45 CET,0.0 0.903 1.136 1.259 1.333 1.366 1.366 1.355 1.307 1.262 1.217 0.862 1.061 1.008 0.879 0.714 0.535 0.441 0.252 0.064 -0.237 -0.467 -0.714 -1.085 -1.461 -1.842 -2.226 -2.617 -3.158 -3.719 -4.294 -5.029 -5.771 -6.527 -7.465 -8.547 -9.615 -10.871 -12.319 -13.951 -15.752 -17.919 -20.658 -23.624 -27.342 -31.849 -37.514 -44.519 -53.725 -66.268 -84.482 -103.192 -116.779 -127.229 -135.465 -142.274 -147.853 -152.59 -156.438 -160.089 -163.115 -165.714 -168.108 -170.316 -172.299 -174.025 -175.745 -177.215 -178.443 -179.717 -181.047 -182.123 -183.195 -184.266 -185.071 -185.887 -186.714 -187.548 -188.387 -188.955 -189.537 -190.407 -190.988 -191.585 -191.889 -192.509 -193.137 -193.773 -194.099 -194.891 -195.11 -195.448 -195.792 -196.508 -196.885 -197.283 -197.712 -198.174 -198.657 -199.209 -200.635 -5 ,10553 ,KEBNE ,16749109,Wed Dec 1 06:15:51 CET,Wed Dec 1 07:53:12 CET,0.0 1.055 1.269 1.393 1.484 1.545 1.562 1.551 1.5 1.461 1.416 1.031 1.215 1.136 0.972 0.8 0.606 0.502 0.288 0.064 -0.297 -0.546 -0.784 -1.133 -1.499 -1.886 -2.282 -2.676 -3.221 -3.788 -4.355 -5.075 -5.808 -6.55 -7.474 -8.574 -9.683 -10.965 -12.421 -14.061 -15.9 -18.112 -20.879 -23.852 -27.57 -32.069 -37.746 -44.819 -54.071 -66.624 -84.854 -103.546 -117.154 -127.635 -135.882 -142.739 -148.347 -153.131 -157.042 -160.728 -163.78 -166.373 -168.731 -170.904 -172.868 -174.602 -176.355 -177.885 -179.171 -180.461 -181.762 -182.807 -183.86 -184.922 -185.725 -186.547 -187.376 -188.198 -189.032 -189.599 -190.17 -191.039 -191.628 -192.223 -192.526 -193.143 -193.766 -194.396 -194.715 -195.496 -195.746 -196.099 -196.447 -197.173 -197.549 -197.946 -198.364 -198.788 -199.247 -199.792 -201.053 -6 ,10193 ,KEBNE ,16749110,Wed Dec 1 06:15:50 CET,Wed Dec 1 07:50:32 CET,0.0 1.091 1.344 1.468 1.514 1.532 1.541 1.533 1.466 1.418 1.359 0.957 1.14 1.066 0.909 0.73 0.535 0.431 0.213 0.0 -0.322 -0.558 -0.805 -1.183 -1.577 -1.983 -2.393 -2.8 -3.355 -3.92 -4.494 -5.225 -5.96 -6.709 -7.626 -8.708 -9.806 -11.088 -12.556 -14.223 -16.071 -18.258 -20.999 -23.964 -27.687 -32.22 -37.936 -45.049 -54.355 -66.912 -85.17 -103.959 -117.577 -128.108 -136.414 -143.252 -148.798 -153.533 -157.447 -161.124 -164.115 -166.691 -169.07 -171.25 -173.234 -174.975 -176.728 -178.251 -179.521 -180.81 -182.111 -183.151 -184.207 -185.275 -186.078 -186.89 -187.71 -188.552 -189.404 -189.964 -190.533 -191.408 -192.0 -192.605 -192.911 -193.519 -194.127 -194.763 -195.088 -195.863 -196.072 -196.415 -196.769 -197.529 -197.917 -198.318 -198.749 -199.186 -199.644 -200.213 -201.629 -7 ,28330 ,KEBNE ,16749111,Wed Dec 1 06:15:51 CET,Wed Dec 1 07:49:32 CET,0.0 1.017 1.263 1.396 1.47 1.506 1.508 1.491 1.427 1.383 1.328 0.946 1.132 1.048 0.864 0.672 0.49 0.393 0.176 -0.052 -0.389 -0.62 -0.872 -1.255 -1.641 -2.043 -2.445 -2.851 -3.395 -3.951 -4.518 -5.236 -5.976 -6.733 -7.644 -8.723 -9.836 -11.105 -12.546 -14.201 -16.057 -18.274 -21.039 -24.022 -27.751 -32.275 -37.964 -45.006 -54.285 -66.851 -85.005 -103.697 -117.281 -127.729 -135.992 -142.836 -148.456 -153.267 -157.201 -160.919 -163.978 -166.623 -169.062 -171.279 -173.246 -174.963 -176.706 -178.21 -179.469 -180.733 -182.005 -183.035 -184.071 -185.134 -185.952 -186.789 -187.634 -188.488 -189.355 -189.935 -190.518 -191.405 -192.01 -192.626 -192.938 -193.563 -194.183 -194.825 -195.153 -195.932 -196.154 -196.495 -196.846 -197.576 -197.952 -198.343 -198.759 -199.209 -199.682 -200.22 -201.295 -8 ,26142 ,KEBNE ,16749112,Wed Dec 1 06:15:51 CET,Wed Dec 1 07:49:29 CET,0.0 1.111 1.49 1.708 1.836 1.888 1.895 1.888 1.831 1.794 1.762 1.414 1.61 1.545 1.403 1.237 1.051 0.956 0.76 0.551 0.216 -0.011 -0.245 -0.605 -0.962 -1.336 -1.721 -2.108 -2.647 -3.194 -3.76 -4.505 -5.254 -6.005 -6.927 -8.019 -9.127 -10.424 -11.9 -13.551 -15.386 -17.6 -20.354 -23.314 -27.045 -31.545 -37.206 -44.281 -53.575 -66.201 -84.507 -103.264 -116.793 -127.206 -135.45 -142.239 -147.814 -152.591 -156.484 -160.175 -163.232 -165.845 -168.226 -170.393 -172.33 -174.053 -175.815 -177.339 -178.627 -179.933 -181.245 -182.309 -183.38 -184.457 -185.286 -186.116 -186.949 -187.798 -188.664 -189.248 -189.836 -190.719 -191.32 -191.934 -192.244 -192.871 -193.495 -194.134 -194.464 -195.258 -195.493 -195.841 -196.198 -196.943 -197.333 -197.75 -198.171 -198.593 -199.047 -199.601 -201.102 -9 ,18425 ,KEBNE ,16749113,Wed Dec 1 06:15:51 CET,Wed Dec 1 07:53:59 CET,0.0 1.811 2.124 2.302 2.413 2.465 2.462 2.43 2.327 2.273 2.216 1.829 2.023 1.963 1.82 1.647 1.461 1.369 1.168 0.946 0.595 0.369 0.141 -0.214 -0.566 -0.933 -1.319 -1.702 -2.212 -2.754 -3.324 -4.052 -4.777 -5.512 -6.417 -7.488 -8.579 -9.84 -11.284 -12.951 -14.807 -16.997 -19.722 -22.674 -26.39 -30.885 -36.598 -43.728 -53.064 -65.685 -83.99 -102.836 -116.564 -127.094 -135.372 -142.217 -147.805 -152.571 -156.472 -160.193 -163.268 -165.893 -168.301 -170.48 -172.434 -174.184 -175.945 -177.46 -178.741 -180.027 -181.31 -182.348 -183.401 -184.46 -185.262 -186.077 -186.896 -187.726 -188.564 -189.131 -189.71 -190.596 -191.198 -191.804 -192.105 -192.713 -193.34 -193.979 -194.304 -195.086 -195.322 -195.675 -196.027 -196.777 -197.165 -197.56 -197.982 -198.427 -198.906 -199.448 -200.659 -10 ,20122 ,KEBNE ,16749114,Wed Dec 1 06:31:39 CET,Wed Dec 1 08:06:05 CET,0.0 1.378 1.722 1.893 2.014 2.092 2.137 2.203 2.279 2.252 2.214 1.866 2.065 1.993 1.844 1.683 1.5 1.411 1.221 1.024 0.727 0.511 0.291 -0.055 -0.43 -0.815 -1.207 -1.606 -2.14 -2.689 -3.253 -3.97 -4.701 -5.438 -6.337 -7.403 -8.497 -9.779 -11.243 -12.903 -14.742 -16.948 -19.711 -22.679 -26.396 -30.847 -36.466 -43.542 -52.819 -65.387 -83.704 -102.557 -116.192 -126.676 -134.914 -141.728 -147.297 -152.024 -155.918 -159.665 -162.738 -165.354 -167.768 -169.968 -171.937 -173.672 -175.429 -176.942 -178.201 -179.49 -180.8 -181.845 -182.895 -183.945 -184.754 -185.583 -186.412 -187.238 -188.076 -188.649 -189.244 -190.136 -190.72 -191.319 -191.626 -192.245 -192.877 -193.526 -193.85 -194.626 -194.826 -195.16 -195.506 -196.234 -196.608 -197.008 -197.443 -197.878 -198.345 -198.875 -200.101 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt deleted file mode 100644 index 5de383dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22293 ,KEBNE ,16749115,Wed Dec 1 06:23:20 CET,Wed Dec 1 07:57:42 CET,0.0 0.51 0.815 1.04 1.245 1.434 1.6 1.768 2.104 2.242 2.371 2.177 2.747 2.859 3.078 3.283 3.488 3.585 3.772 3.961 4.237 4.406 4.567 4.819 5.064 5.294 5.511 5.712 5.966 6.225 6.497 6.824 7.13 7.425 7.76 8.133 8.499 8.924 9.382 9.855 10.359 10.907 11.521 12.132 12.849 13.655 14.537 15.495 16.55 17.693 18.892 19.568 19.725 19.664 19.496 19.263 18.989 18.698 18.428 18.14 17.87 17.621 17.349 17.083 16.84 16.609 16.371 16.163 15.985 15.788 15.589 15.426 15.232 15.025 14.877 14.726 14.574 14.418 14.239 14.117 14.007 13.832 13.717 13.601 13.538 13.397 13.251 13.095 13.014 12.496 12.769 12.672 12.569 12.37 12.259 12.147 12.039 11.912 11.776 11.632 11.403 -2 ,23381 ,KEBNE ,16749116,Wed Dec 1 06:31:40 CET,Wed Dec 1 08:06:23 CET,0.0 0.359 0.574 0.757 0.897 1.044 1.197 1.345 1.607 1.724 1.841 1.6 2.162 2.267 2.453 2.627 2.796 2.887 3.064 3.229 3.478 3.641 3.799 4.023 4.235 4.449 4.659 4.872 5.15 5.412 5.675 6.01 6.323 6.617 6.955 7.332 7.693 8.086 8.528 8.993 9.45 9.973 10.628 11.315 12.067 12.855 13.779 14.765 15.819 16.937 18.059 18.704 18.865 18.804 18.647 18.396 18.099 17.794 17.529 17.235 16.954 16.695 16.433 16.185 15.952 15.729 15.471 15.219 15.007 14.812 14.628 14.468 14.284 14.103 13.974 13.842 13.698 13.539 13.383 13.276 13.156 12.972 12.846 12.716 12.645 12.504 12.356 12.195 12.114 11.59 11.88 11.796 11.709 11.526 11.422 11.312 11.197 11.065 10.914 10.729 10.455 -3 ,1253 ,KEBNE ,16749117,Wed Dec 1 06:23:22 CET,Wed Dec 1 07:58:59 CET,0.0 0.503 0.717 0.892 1.057 1.218 1.359 1.481 1.717 1.836 1.958 1.742 2.31 2.411 2.611 2.803 2.977 3.064 3.243 3.413 3.651 3.801 3.957 4.209 4.445 4.657 4.861 5.06 5.341 5.627 5.891 6.191 6.489 6.78 7.111 7.491 7.849 8.248 8.715 9.206 9.703 10.267 10.922 11.578 12.324 13.109 13.967 14.931 16.01 17.186 18.389 19.002 19.14 19.054 18.797 18.524 18.275 17.998 17.718 17.403 17.096 16.814 16.553 16.305 16.08 15.857 15.6 15.376 15.195 15.026 14.831 14.646 14.46 14.279 14.135 13.976 13.821 13.673 13.515 13.401 13.287 13.113 12.978 12.827 12.756 12.604 12.44 12.279 12.201 11.675 11.951 11.86 11.758 11.536 11.42 11.303 11.161 11.029 10.893 10.673 10.372 -4 ,6801 ,KEBNE ,16749118,Wed Dec 1 06:23:20 CET,Wed Dec 1 07:54:50 CET,0.0 0.351 0.562 0.733 0.894 1.045 1.173 1.309 1.58 1.698 1.808 1.587 2.156 2.256 2.467 2.687 2.896 3.0 3.2 3.376 3.624 3.791 3.965 4.226 4.487 4.741 4.97 5.187 5.487 5.763 6.009 6.314 6.627 6.932 7.274 7.656 8.039 8.446 8.864 9.317 9.798 10.327 10.941 11.581 12.297 13.065 13.925 14.864 15.963 17.183 18.404 19.083 19.253 19.183 18.992 18.721 18.421 18.144 17.889 17.594 17.298 17.023 16.777 16.522 16.267 16.051 15.834 15.631 15.456 15.28 15.076 14.894 14.712 14.527 14.382 14.231 14.077 13.914 13.74 13.624 13.51 13.328 13.202 13.077 13.011 12.874 12.736 12.589 12.512 11.987 12.26 12.175 12.087 11.911 11.808 11.676 11.527 11.382 11.24 11.066 10.654 -5 ,23487 ,KEBNE ,16749119,Wed Dec 1 07:41:19 CET,Wed Dec 1 09:14:38 CET,0.0 0.433 0.68 0.902 1.113 1.294 1.468 1.645 1.946 2.069 2.2 2.018 2.591 2.7 2.92 3.136 3.343 3.445 3.648 3.837 4.103 4.28 4.446 4.682 4.923 5.153 5.369 5.588 5.869 6.148 6.423 6.729 7.021 7.306 7.646 8.023 8.382 8.783 9.22 9.683 10.176 10.748 11.377 12.003 12.734 13.551 14.468 15.427 16.511 17.663 18.825 19.547 19.727 19.634 19.394 19.108 18.842 18.563 18.272 17.967 17.715 17.472 17.234 17.006 16.761 16.531 16.276 16.046 15.864 15.666 15.45 15.265 15.069 14.868 14.706 14.545 14.387 14.226 14.065 13.944 13.823 13.663 13.547 13.423 13.358 13.224 13.081 12.913 12.83 12.307 12.583 12.494 12.405 12.19 12.069 11.951 11.827 11.698 11.558 11.409 11.168 -6 ,23508 ,KEBNE ,16749120,Wed Dec 1 06:31:40 CET,Wed Dec 1 08:05:16 CET,0.0 0.552 0.754 0.917 1.076 1.224 1.354 1.475 1.699 1.815 1.929 1.689 2.257 2.363 2.553 2.736 2.923 3.02 3.21 3.392 3.671 3.85 4.019 4.271 4.525 4.771 4.996 5.207 5.476 5.74 6.008 6.342 6.657 6.955 7.312 7.696 8.063 8.493 8.961 9.429 9.923 10.477 11.092 11.719 12.468 13.265 14.124 15.071 16.141 17.321 18.568 19.34 19.515 19.454 19.276 19.027 18.746 18.424 18.128 17.831 17.554 17.302 17.059 16.816 16.577 16.353 16.116 15.905 15.721 15.547 15.357 15.173 15.002 14.83 14.688 14.546 14.378 14.191 14.008 13.883 13.754 13.555 13.417 13.272 13.193 13.011 12.817 12.617 12.514 11.965 12.192 12.078 11.947 11.674 11.533 11.389 11.235 11.029 10.787 10.511 9.659 -7 ,15761 ,KEBNE ,16749121,Wed Dec 1 06:23:20 CET,Wed Dec 1 08:00:39 CET,0.0 0.351 0.51 0.663 0.829 0.98 1.116 1.259 1.516 1.627 1.737 1.482 2.035 2.139 2.337 2.538 2.726 2.809 2.984 3.163 3.426 3.587 3.743 3.962 4.171 4.383 4.586 4.78 5.028 5.269 5.519 5.845 6.155 6.443 6.783 7.184 7.568 7.988 8.437 8.885 9.354 9.893 10.505 11.112 11.809 12.569 13.452 14.403 15.461 16.595 17.729 18.383 18.533 18.487 18.317 18.08 17.81 17.518 17.246 16.957 16.689 16.43 16.182 15.949 15.711 15.485 15.259 15.05 14.861 14.656 14.425 14.24 14.046 13.833 13.677 13.525 13.368 13.204 13.04 12.917 12.784 12.588 12.444 12.284 12.206 12.064 11.904 11.716 11.613 11.071 11.32 11.214 11.081 10.819 10.678 10.511 10.336 10.15 9.93 9.608 8.619 -8 ,28356 ,KEBNE ,16749122,Wed Dec 1 06:31:39 CET,Wed Dec 1 08:04:59 CET,0.0 0.319 0.568 0.762 0.919 1.063 1.193 1.313 1.542 1.652 1.761 1.514 2.073 2.181 2.38 2.565 2.75 2.84 3.02 3.183 3.415 3.574 3.734 3.961 4.176 4.395 4.615 4.816 5.056 5.293 5.528 5.804 6.065 6.336 6.672 7.064 7.434 7.823 8.257 8.726 9.2 9.72 10.351 11.002 11.72 12.492 13.365 14.31 15.394 16.615 17.763 18.362 18.509 18.45 18.294 18.069 17.819 17.555 17.292 16.994 16.717 16.473 16.237 15.99 15.743 15.523 15.293 15.095 14.93 14.755 14.559 14.388 14.218 14.042 13.897 13.725 13.55 13.385 13.225 13.121 13.0 12.818 12.706 12.588 12.522 12.379 12.226 12.066 11.984 11.451 11.714 11.625 11.531 11.339 11.231 11.098 10.954 10.812 10.662 10.45 10.091 -9 ,12227 ,KEBNE ,16749123,Wed Dec 1 06:23:25 CET,Wed Dec 1 07:52:39 CET,0.0 0.272 0.47 0.65 0.803 0.938 1.086 1.22 1.452 1.562 1.661 1.396 1.945 2.043 2.233 2.409 2.586 2.674 2.849 3.02 3.253 3.402 3.551 3.769 3.988 4.212 4.424 4.622 4.875 5.135 5.395 5.694 5.975 6.258 6.606 6.996 7.371 7.779 8.224 8.706 9.188 9.733 10.376 11.003 11.719 12.512 13.407 14.355 15.464 16.719 17.94 18.662 18.846 18.784 18.619 18.39 18.126 17.854 17.603 17.317 17.045 16.792 16.529 16.264 16.018 15.793 15.562 15.361 15.184 15.0 14.8 14.633 14.463 14.285 14.151 14.009 13.856 13.695 13.529 13.411 13.291 13.113 12.99 12.864 12.799 12.664 12.521 12.383 12.315 11.792 12.078 11.991 11.895 11.67 11.564 11.458 11.328 11.179 11.003 10.786 10.405 -10 ,17196 ,KEBNE ,16749124,Wed Dec 1 06:31:40 CET,Wed Dec 1 08:07:10 CET,0.0 0.481 0.683 0.843 0.99 1.128 1.262 1.39 1.625 1.738 1.859 1.62 2.178 2.273 2.47 2.68 2.871 2.961 3.143 3.316 3.561 3.722 3.889 4.139 4.381 4.612 4.829 5.037 5.303 5.568 5.837 6.158 6.467 6.76 7.099 7.483 7.859 8.265 8.695 9.175 9.666 10.206 10.861 11.494 12.206 12.992 13.881 14.873 15.987 17.187 18.379 18.987 19.062 18.948 18.741 18.489 18.214 17.927 17.64 17.319 17.048 16.8 16.535 16.272 16.011 15.763 15.489 15.251 15.058 14.855 14.653 14.478 14.289 14.079 13.909 13.748 13.589 13.419 13.237 13.105 12.961 12.736 12.587 12.432 12.356 12.197 12.024 11.84 11.747 11.213 11.457 11.358 11.243 10.973 10.822 10.657 10.476 10.276 10.044 9.663 9.1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 1ec41b70..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10345 ,KEBNE ,16749125,Wed Dec 1 06:37:02 CET,Wed Dec 1 08:13:16 CET,0.0 1.442 2.008 2.407 2.708 2.973 3.213 3.439 3.866 4.069 4.259 4.125 4.766 4.924 5.229 5.5 5.759 5.887 6.133 6.376 6.724 6.948 7.163 7.471 7.777 8.075 8.363 8.644 9.005 9.356 9.698 10.111 10.533 10.943 11.409 11.93 12.421 12.986 13.611 14.281 14.968 15.743 16.678 17.621 18.713 19.941 21.403 23.084 25.083 27.42 30.193 32.424 33.658 34.387 34.79 35.025 35.102 35.081 35.023 34.921 34.791 34.627 34.454 34.307 34.178 34.02 33.799 33.605 33.446 33.262 33.039 32.849 32.663 32.458 32.283 32.115 31.937 31.726 31.506 31.35 31.195 30.963 30.799 30.62 30.521 30.312 30.077 29.807 29.666 29.073 29.217 29.051 28.869 28.467 28.222 27.932 27.619 27.263 26.832 26.174 24.272 -2 ,20302 ,KEBNE ,16749126,Wed Dec 1 06:33:49 CET,Wed Dec 1 08:10:35 CET,0.0 1.586 2.104 2.483 2.795 3.079 3.343 3.572 3.974 4.153 4.327 4.187 4.83 4.986 5.297 5.584 5.851 5.979 6.229 6.473 6.824 7.053 7.269 7.585 7.891 8.182 8.473 8.753 9.107 9.466 9.815 10.226 10.633 11.023 11.474 11.989 12.486 13.041 13.651 14.301 14.993 15.784 16.724 17.664 18.792 20.073 21.548 23.212 25.153 27.486 30.309 32.551 33.747 34.473 34.915 35.16 35.273 35.321 35.299 35.215 35.097 34.92 34.72 34.55 34.4 34.234 34.037 33.861 33.686 33.489 33.295 33.139 32.968 32.764 32.595 32.422 32.245 32.047 31.834 31.688 31.534 31.274 31.082 30.875 30.768 30.552 30.327 30.077 29.938 29.343 29.473 29.291 29.101 28.689 28.462 28.2 27.896 27.553 27.134 26.485 23.469 -3 ,5553 ,KEBNE ,16749127,Wed Dec 1 06:31:43 CET,Wed Dec 1 08:04:41 CET,0.0 2.753 3.338 3.727 4.051 4.328 4.579 4.808 5.21 5.389 5.56 5.405 6.04 6.183 6.467 6.741 6.996 7.117 7.36 7.594 7.917 8.14 8.356 8.652 8.946 9.233 9.514 9.797 10.153 10.488 10.81 11.198 11.593 11.987 12.449 12.991 13.518 14.095 14.706 15.337 16.02 16.823 17.744 18.658 19.792 21.062 22.516 24.193 26.151 28.506 31.346 33.659 34.906 35.595 35.989 36.222 36.356 36.369 36.294 36.197 36.089 35.962 35.802 35.61 35.419 35.223 35.001 34.818 34.647 34.447 34.223 34.034 33.837 33.621 33.444 33.253 33.056 32.852 32.633 32.48 32.309 31.992 31.752 31.527 31.421 31.186 30.93 30.645 30.496 29.887 30.008 29.826 29.628 29.201 28.961 28.664 28.325 27.967 27.55 26.957 24.136 -4 ,7840 ,KEBNE ,16749128,Wed Dec 1 06:52:15 CET,Wed Dec 1 08:26:53 CET,0.0 1.819 2.388 2.785 3.103 3.385 3.632 3.864 4.279 4.469 4.658 4.515 5.152 5.31 5.614 5.894 6.155 6.281 6.529 6.767 7.117 7.35 7.576 7.916 8.236 8.536 8.83 9.113 9.477 9.83 10.179 10.603 11.017 11.415 11.869 12.389 12.885 13.431 14.039 14.716 15.446 16.255 17.196 18.146 19.246 20.479 21.893 23.532 25.519 27.876 30.719 32.949 34.173 34.876 35.277 35.503 35.56 35.537 35.452 35.329 35.201 35.054 34.891 34.718 34.548 34.37 34.169 33.979 33.798 33.606 33.422 33.252 33.063 32.878 32.728 32.564 32.388 32.204 31.999 31.845 31.686 31.441 31.28 31.112 31.019 30.813 30.578 30.319 30.182 29.596 29.729 29.546 29.366 28.964 28.725 28.454 28.157 27.804 27.393 26.819 24.253 -5 ,13482 ,KEBNE ,16749129,Wed Dec 1 06:31:40 CET,Wed Dec 1 08:08:05 CET,0.0 1.567 2.211 2.674 3.02 3.34 3.651 3.925 4.376 4.58 4.77 4.654 5.305 5.466 5.782 6.101 6.393 6.526 6.785 7.038 7.417 7.658 7.884 8.222 8.552 8.875 9.191 9.489 9.877 10.248 10.603 11.028 11.433 11.833 12.295 12.818 13.334 13.912 14.529 15.179 15.869 16.642 17.554 18.497 19.624 20.91 22.416 24.092 26.054 28.419 31.255 33.495 34.741 35.508 35.897 36.063 36.132 36.148 36.114 36.026 35.919 35.798 35.652 35.496 35.335 35.167 34.97 34.776 34.597 34.396 34.175 33.98 33.776 33.572 33.413 33.235 33.044 32.864 32.667 32.526 32.379 32.138 31.968 31.771 31.661 31.433 31.185 30.925 30.79 30.183 30.318 30.158 29.987 29.566 29.321 29.056 28.75 28.378 27.907 27.246 25.09 -6 ,28787 ,KEBNE ,16749130,Wed Dec 1 06:31:40 CET,Wed Dec 1 08:06:23 CET,0.0 1.352 1.872 2.233 2.535 2.797 3.04 3.268 3.66 3.836 4.006 3.847 4.486 4.647 4.948 5.221 5.484 5.609 5.85 6.093 6.444 6.666 6.879 7.185 7.497 7.808 8.091 8.371 8.744 9.12 9.5 9.952 10.368 10.764 11.231 11.768 12.287 12.857 13.48 14.131 14.813 15.622 16.573 17.505 18.62 19.879 21.339 23.025 24.976 27.283 30.084 32.404 33.722 34.43 34.852 35.1 35.187 35.192 35.161 35.101 34.999 34.846 34.668 34.503 34.319 34.143 33.971 33.794 33.628 33.437 33.218 33.049 32.869 32.648 32.473 32.287 32.087 31.887 31.672 31.521 31.376 31.127 30.932 30.743 30.639 30.398 30.15 29.901 29.767 29.171 29.32 29.146 28.946 28.514 28.286 28.024 27.732 27.382 26.901 26.266 24.125 -7 ,25797 ,KEBNE ,16749131,Wed Dec 1 06:31:40 CET,Wed Dec 1 08:07:28 CET,0.0 1.731 2.278 2.705 3.049 3.326 3.57 3.788 4.182 4.364 4.544 4.398 5.03 5.181 5.478 5.756 6.022 6.149 6.397 6.63 6.968 7.191 7.41 7.735 8.047 8.35 8.634 8.909 9.289 9.657 9.996 10.398 10.795 11.182 11.635 12.148 12.642 13.187 13.789 14.427 15.118 15.928 16.87 17.816 18.919 20.15 21.609 23.275 25.224 27.57 30.398 32.667 33.925 34.665 35.155 35.445 35.523 35.516 35.479 35.383 35.253 35.104 34.923 34.733 34.544 34.369 34.186 33.992 33.804 33.598 33.36 33.149 32.927 32.702 32.536 32.357 32.183 31.992 31.769 31.614 31.445 31.174 30.984 30.783 30.677 30.453 30.224 29.97 29.829 29.222 29.341 29.156 28.959 28.497 28.234 27.932 27.596 27.214 26.73 26.057 23.419 -8 ,17998 ,KEBNE ,16749132,Wed Dec 1 06:37:02 CET,Wed Dec 1 08:16:02 CET,0.0 1.536 2.049 2.433 2.741 3.007 3.267 3.515 3.946 4.129 4.301 4.16 4.806 4.971 5.292 5.583 5.87 6.021 6.302 6.565 6.951 7.201 7.437 7.775 8.1 8.413 8.725 9.023 9.415 9.794 10.147 10.577 10.988 11.375 11.831 12.345 12.839 13.396 13.997 14.636 15.318 16.105 17.042 17.985 19.086 20.316 21.713 23.351 25.368 27.74 30.607 32.906 34.142 34.866 35.279 35.489 35.56 35.544 35.478 35.384 35.303 35.199 35.06 34.911 34.75 34.578 34.384 34.203 34.044 33.882 33.679 33.502 33.315 33.106 32.945 32.773 32.586 32.38 32.163 32.011 31.854 31.607 31.43 31.244 31.14 30.92 30.667 30.378 30.232 29.632 29.781 29.618 29.441 29.033 28.784 28.508 28.214 27.847 27.39 26.736 24.234 -9 ,24403 ,KEBNE ,16749133,Wed Dec 1 06:31:40 CET,Wed Dec 1 08:12:34 CET,0.0 1.52 2.065 2.469 2.802 3.095 3.347 3.569 3.986 4.175 4.348 4.193 4.831 4.988 5.29 5.571 5.831 5.954 6.2 6.44 6.8 7.032 7.248 7.561 7.872 8.185 8.494 8.803 9.192 9.549 9.896 10.313 10.711 11.097 11.556 12.083 12.588 13.155 13.765 14.399 15.079 15.887 16.837 17.8 18.948 20.227 21.692 23.305 25.232 27.583 30.393 32.706 34.015 34.782 35.209 35.438 35.528 35.528 35.473 35.364 35.264 35.18 35.055 34.888 34.721 34.572 34.394 34.222 34.062 33.874 33.673 33.492 33.278 33.056 32.89 32.715 32.532 32.324 32.096 31.941 31.784 31.528 31.344 31.165 31.074 30.863 30.622 30.346 30.203 29.606 29.752 29.585 29.401 29.003 28.791 28.531 28.216 27.859 27.408 26.783 24.689 -10 ,20547 ,KEBNE ,16749134,Wed Dec 1 06:37:02 CET,Wed Dec 1 08:13:43 CET,0.0 1.551 2.04 2.394 2.698 2.987 3.247 3.474 3.887 4.087 4.275 4.133 4.78 4.939 5.245 5.541 5.814 5.941 6.186 6.424 6.771 6.993 7.212 7.528 7.851 8.173 8.483 8.786 9.156 9.498 9.846 10.277 10.7 11.117 11.574 12.08 12.573 13.131 13.763 14.428 15.126 15.928 16.885 17.84 18.924 20.163 21.596 23.256 25.245 27.558 30.385 32.626 33.84 34.59 35.009 35.218 35.294 35.302 35.263 35.163 35.035 34.901 34.762 34.59 34.411 34.231 34.023 33.842 33.67 33.496 33.295 33.115 32.935 32.74 32.589 32.427 32.248 32.052 31.851 31.712 31.56 31.3 31.106 30.916 30.817 30.601 30.366 30.096 29.959 29.377 29.535 29.367 29.175 28.732 28.479 28.207 27.891 27.539 27.122 26.52 24.145 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt deleted file mode 100644 index 77a41ee3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23890 ,KEBNE ,16749135,Wed Dec 1 06:31:41 CET,Wed Dec 1 08:08:10 CET,0.0 1.607 2.087 2.434 2.703 2.935 3.143 3.331 3.678 3.833 3.975 3.764 4.368 4.484 4.705 4.914 5.12 5.212 5.385 5.559 5.785 5.93 6.079 6.285 6.473 6.651 6.827 6.995 7.213 7.424 7.617 7.853 8.077 8.268 8.481 8.725 8.959 9.223 9.5 9.778 10.06 10.375 10.732 11.043 11.364 11.689 11.965 12.159 12.244 12.145 11.551 10.354 9.075 7.808 6.6 5.477 4.468 3.528 2.727 1.901 1.166 0.517 -0.091 -0.65 -1.175 -1.648 -2.167 -2.646 -3.03 -3.427 -3.845 -4.197 -4.563 -4.936 -5.246 -5.581 -5.921 -6.266 -6.637 -6.889 -7.149 -7.569 -7.861 -8.168 -8.332 -8.664 -8.996 -9.353 -9.539 -10.217 -10.102 -10.313 -10.543 -11.034 -11.306 -11.605 -11.929 -12.326 -12.826 -13.538 -16.507 -2 ,31265 ,KEBNE ,16749136,Wed Dec 1 06:43:34 CET,Wed Dec 1 08:18:17 CET,0.0 1.657 2.19 2.541 2.802 3.024 3.225 3.412 3.749 3.907 4.061 3.845 4.441 4.553 4.765 4.97 5.176 5.275 5.461 5.643 5.903 6.064 6.22 6.44 6.651 6.856 7.052 7.237 7.469 7.68 7.87 8.099 8.329 8.545 8.795 9.084 9.35 9.613 9.891 10.18 10.477 10.787 11.124 11.445 11.802 12.14 12.379 12.537 12.601 12.411 11.742 10.541 9.262 8.012 6.832 5.807 4.901 4.046 3.315 2.539 1.844 1.232 0.622 0.011 -0.528 -1.014 -1.522 -1.965 -2.347 -2.737 -3.14 -3.492 -3.874 -4.276 -4.596 -4.92 -5.244 -5.58 -5.931 -6.173 -6.432 -6.845 -7.126 -7.409 -7.558 -7.891 -8.229 -8.577 -8.762 -9.448 -9.351 -9.568 -9.806 -10.334 -10.616 -10.928 -11.278 -11.697 -12.245 -13.01 -15.719 -3 ,4737 ,KEBNE ,16749137,Wed Dec 1 06:39:11 CET,Wed Dec 1 08:15:54 CET,0.0 1.457 1.937 2.299 2.62 2.87 3.078 3.271 3.604 3.755 3.896 3.698 4.32 4.449 4.696 4.93 5.138 5.239 5.44 5.623 5.887 6.059 6.213 6.424 6.626 6.822 7.004 7.172 7.405 7.629 7.84 8.106 8.347 8.561 8.801 9.073 9.346 9.634 9.919 10.198 10.469 10.761 11.082 11.386 11.705 12.024 12.322 12.586 12.77 12.657 11.966 10.715 9.409 8.248 7.119 6.032 5.105 4.235 3.411 2.584 1.903 1.288 0.697 0.153 -0.365 -0.86 -1.37 -1.83 -2.217 -2.628 -3.064 -3.41 -3.793 -4.203 -4.527 -4.865 -5.198 -5.56 -5.942 -6.184 -6.427 -6.829 -7.111 -7.408 -7.567 -7.897 -8.247 -8.628 -8.831 -9.534 -9.47 -9.706 -10.003 -10.684 -11.031 -11.383 -11.76 -12.243 -12.84 -13.625 -15.828 -4 ,5717 ,KEBNE ,16749138,Wed Dec 1 06:43:34 CET,Wed Dec 1 08:19:14 CET,0.0 1.938 2.451 2.823 3.116 3.367 3.595 3.808 4.202 4.374 4.531 4.302 4.904 5.027 5.255 5.45 5.631 5.719 5.888 6.056 6.304 6.452 6.592 6.802 6.994 7.166 7.327 7.484 7.698 7.909 8.118 8.357 8.577 8.783 9.019 9.278 9.509 9.775 10.056 10.332 10.597 10.877 11.164 11.427 11.723 12.008 12.287 12.526 12.608 12.448 11.803 10.66 9.462 8.252 7.181 6.168 5.226 4.363 3.595 2.816 2.158 1.575 1.01 0.469 -0.042 -0.557 -1.117 -1.589 -2.009 -2.446 -2.862 -3.199 -3.564 -3.943 -4.223 -4.519 -4.845 -5.18 -5.524 -5.761 -6.01 -6.394 -6.655 -6.933 -7.074 -7.364 -7.676 -8.009 -8.191 -8.872 -8.767 -8.972 -9.19 -9.706 -9.992 -10.303 -10.651 -11.056 -11.561 -12.306 -17.059 -5 ,15301 ,KEBNE ,16749139,Wed Dec 1 06:43:34 CET,Wed Dec 1 08:18:11 CET,0.0 1.898 2.38 2.733 3.03 3.277 3.52 3.752 4.124 4.292 4.461 4.283 4.889 5.02 5.258 5.472 5.67 5.771 5.97 6.142 6.39 6.553 6.711 6.938 7.16 7.371 7.556 7.732 7.963 8.186 8.402 8.646 8.876 9.11 9.383 9.671 9.924 10.185 10.464 10.767 11.067 11.363 11.685 11.962 12.249 12.528 12.766 12.958 13.024 12.85 12.216 10.96 9.632 8.363 7.284 6.325 5.43 4.599 3.854 3.064 2.362 1.705 1.063 0.457 -0.077 -0.546 -1.052 -1.497 -1.875 -2.295 -2.736 -3.089 -3.468 -3.876 -4.191 -4.511 -4.85 -5.192 -5.555 -5.824 -6.104 -6.548 -6.848 -7.161 -7.325 -7.665 -8.029 -8.4 -8.595 -9.296 -9.231 -9.474 -9.711 -10.196 -10.468 -10.787 -11.163 -11.608 -12.174 -12.911 -15.959 -6 ,22713 ,KEBNE ,16749140,Wed Dec 1 06:57:40 CET,Wed Dec 1 08:32:11 CET,0.0 1.643 2.164 2.492 2.751 2.987 3.199 3.384 3.691 3.834 3.976 3.764 4.363 4.475 4.695 4.918 5.118 5.208 5.38 5.54 5.764 5.91 6.052 6.26 6.453 6.626 6.792 6.96 7.182 7.397 7.606 7.843 8.078 8.299 8.518 8.752 8.99 9.258 9.535 9.839 10.151 10.458 10.775 11.089 11.428 11.721 11.952 12.112 12.166 11.94 11.121 9.771 8.465 7.309 6.306 5.283 4.312 3.381 2.552 1.745 1.043 0.411 -0.199 -0.768 -1.297 -1.768 -2.272 -2.754 -3.149 -3.545 -3.969 -4.312 -4.661 -5.045 -5.352 -5.652 -5.965 -6.32 -6.684 -6.92 -7.172 -7.569 -7.848 -8.153 -8.306 -8.613 -8.946 -9.296 -9.475 -10.151 -10.039 -10.246 -10.473 -10.989 -11.278 -11.59 -11.93 -12.313 -12.79 -13.498 -15.812 -7 ,9438 ,KEBNE ,16749141,Wed Dec 1 07:00:56 CET,Wed Dec 1 08:37:11 CET,0.0 1.731 2.21 2.551 2.817 3.047 3.268 3.465 3.815 3.979 4.128 3.907 4.511 4.635 4.874 5.082 5.272 5.363 5.544 5.721 5.977 6.131 6.27 6.466 6.658 6.85 7.033 7.214 7.452 7.666 7.862 8.11 8.348 8.567 8.81 9.079 9.33 9.584 9.838 10.086 10.343 10.633 10.965 11.279 11.593 11.921 12.197 12.367 12.442 12.324 11.722 10.511 9.296 8.106 6.943 5.829 4.848 3.943 3.138 2.339 1.649 1.007 0.382 -0.189 -0.716 -1.207 -1.727 -2.201 -2.611 -3.027 -3.453 -3.79 -4.14 -4.514 -4.801 -5.107 -5.429 -5.751 -6.087 -6.333 -6.585 -6.974 -7.256 -7.548 -7.695 -7.992 -8.304 -8.639 -8.815 -9.495 -9.404 -9.64 -9.888 -10.403 -10.69 -11.02 -11.39 -11.839 -12.406 -13.164 -15.924 -8 ,4414 ,KEBNE ,16749142,Wed Dec 1 06:52:15 CET,Wed Dec 1 08:30:31 CET,0.0 1.645 2.098 2.433 2.718 2.958 3.16 3.343 3.675 3.827 3.972 3.751 4.351 4.462 4.682 4.897 5.088 5.178 5.342 5.496 5.728 5.878 6.021 6.239 6.453 6.664 6.862 7.043 7.267 7.48 7.686 7.936 8.188 8.429 8.686 8.956 9.204 9.454 9.713 9.981 10.247 10.537 10.852 11.125 11.406 11.69 11.975 12.213 12.339 12.185 11.504 10.242 9.001 7.87 6.79 5.709 4.701 3.762 2.929 2.109 1.404 0.766 0.159 -0.424 -0.971 -1.446 -1.948 -2.403 -2.788 -3.174 -3.582 -3.951 -4.335 -4.719 -5.021 -5.354 -5.692 -6.019 -6.371 -6.62 -6.869 -7.266 -7.551 -7.855 -8.013 -8.328 -8.656 -9.011 -9.208 -9.908 -9.85 -10.09 -10.341 -10.891 -11.205 -11.562 -11.955 -12.407 -12.969 -13.712 -16.013 -9 ,8367 ,KEBNE ,16749143,Wed Dec 1 06:56:35 CET,Wed Dec 1 08:31:08 CET,0.0 1.562 2.074 2.416 2.703 2.957 3.175 3.375 3.715 3.861 4.005 3.786 4.389 4.505 4.731 4.944 5.145 5.241 5.42 5.589 5.839 6.005 6.161 6.379 6.578 6.762 6.95 7.134 7.353 7.562 7.771 8.026 8.266 8.47 8.696 8.954 9.196 9.453 9.722 10.023 10.323 10.606 10.924 11.224 11.515 11.82 12.137 12.405 12.591 12.53 11.849 10.575 9.376 8.292 7.241 6.259 5.333 4.437 3.669 2.898 2.187 1.524 0.922 0.361 -0.169 -0.644 -1.157 -1.623 -2.024 -2.437 -2.871 -3.232 -3.593 -3.98 -4.275 -4.58 -4.922 -5.265 -5.605 -5.845 -6.098 -6.48 -6.748 -7.051 -7.211 -7.537 -7.866 -8.206 -8.384 -9.067 -8.987 -9.217 -9.457 -9.956 -10.234 -10.535 -10.859 -11.237 -11.708 -12.389 -14.502 -10 ,8729 ,KEBNE ,16749144,Wed Dec 1 07:18:00 CET,Wed Dec 1 08:52:26 CET,0.0 1.703 2.201 2.593 2.926 3.16 3.362 3.549 3.892 4.04 4.176 3.947 4.544 4.663 4.901 5.123 5.335 5.432 5.612 5.788 6.033 6.192 6.359 6.594 6.807 7.007 7.201 7.385 7.617 7.845 8.045 8.26 8.463 8.67 8.921 9.182 9.421 9.696 9.996 10.303 10.614 10.912 11.204 11.497 11.791 12.064 12.359 12.637 12.757 12.578 11.923 10.646 9.39 8.197 7.077 6.056 5.09 4.212 3.495 2.744 2.05 1.418 0.794 0.194 -0.352 -0.839 -1.351 -1.817 -2.219 -2.637 -3.063 -3.419 -3.795 -4.179 -4.491 -4.808 -5.118 -5.444 -5.803 -6.055 -6.315 -6.717 -6.987 -7.266 -7.418 -7.737 -8.06 -8.415 -8.607 -9.298 -9.215 -9.437 -9.664 -10.168 -10.46 -10.78 -11.14 -11.571 -12.069 -12.742 -15.527 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt deleted file mode 100644 index f1054668..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9760 ,KEBNE ,16749145,Wed Dec 1 06:57:40 CET,Wed Dec 1 08:31:48 CET,0.0 1.073 1.475 1.821 2.13 2.397 2.636 2.856 3.267 3.449 3.619 3.447 4.111 4.278 4.599 4.884 5.162 5.305 5.578 5.841 6.233 6.492 6.747 7.111 7.477 7.834 8.158 8.482 8.901 9.294 9.69 10.188 10.677 11.146 11.684 12.292 12.867 13.503 14.228 15.006 15.836 16.797 17.914 19.071 20.47 22.041 23.874 25.985 28.539 31.664 35.609 39.053 41.136 42.434 43.311 43.965 44.419 44.657 44.809 44.974 45.07 45.111 45.12 45.104 45.078 45.044 44.994 44.938 44.868 44.796 44.736 44.669 44.585 44.493 44.409 44.323 44.232 44.133 44.02 43.94 43.862 43.719 43.612 43.504 43.445 43.32 43.175 43.024 42.949 42.405 42.662 42.556 42.437 42.173 42.029 41.881 41.689 41.445 41.142 40.709 39.508 -2 ,31297 ,KEBNE ,16749146,Wed Dec 1 06:59:53 CET,Wed Dec 1 08:38:13 CET,0.0 1.161 1.628 1.981 2.299 2.587 2.858 3.121 3.577 3.789 3.998 3.886 4.57 4.754 5.091 5.423 5.742 5.893 6.211 6.515 6.921 7.187 7.451 7.825 8.182 8.536 8.892 9.236 9.668 10.084 10.485 10.974 11.449 11.923 12.478 13.064 13.628 14.289 15.009 15.78 16.615 17.587 18.769 19.968 21.367 22.973 24.845 26.967 29.541 32.715 36.691 40.03 42.054 43.387 44.293 44.94 45.413 45.721 45.918 46.079 46.151 46.168 46.173 46.163 46.127 46.08 46.006 45.928 45.87 45.816 45.745 45.667 45.578 45.483 45.408 45.309 45.199 45.096 44.987 44.909 44.827 44.697 44.59 44.472 44.413 44.275 44.106 43.926 43.831 43.281 43.535 43.431 43.319 43.053 42.901 42.733 42.546 42.319 42.023 41.624 40.462 -3 ,8851 ,KEBNE ,16749147,Wed Dec 1 07:06:12 CET,Wed Dec 1 08:41:09 CET,0.0 1.128 1.594 1.979 2.287 2.534 2.778 3.008 3.439 3.642 3.825 3.673 4.336 4.49 4.792 5.085 5.363 5.503 5.776 6.039 6.416 6.661 6.898 7.239 7.575 7.908 8.235 8.548 8.954 9.359 9.759 10.262 10.752 11.229 11.786 12.429 13.058 13.729 14.459 15.229 16.064 17.025 18.141 19.271 20.617 22.174 24.009 26.096 28.584 31.729 35.737 39.091 41.154 42.522 43.421 44.068 44.497 44.817 45.046 45.201 45.311 45.383 45.421 45.441 45.445 45.421 45.365 45.3 45.236 45.161 45.088 45.012 44.915 44.813 44.724 44.633 44.539 44.419 44.279 44.178 44.074 43.923 43.81 43.678 43.61 43.468 43.32 43.175 43.099 42.559 42.82 42.716 42.598 42.345 42.204 42.02 41.795 41.547 41.261 40.868 39.51 -4 ,9983 ,KEBNE ,16749148,Wed Dec 1 07:41:19 CET,Wed Dec 1 09:16:27 CET,0.0 1.1 1.557 1.888 2.182 2.441 2.672 2.885 3.292 3.486 3.669 3.519 4.178 4.336 4.641 4.934 5.218 5.356 5.628 5.907 6.309 6.568 6.817 7.17 7.53 7.881 8.218 8.547 8.97 9.387 9.807 10.32 10.811 11.284 11.83 12.46 13.078 13.768 14.51 15.292 16.124 17.07 18.202 19.371 20.735 22.289 24.13 26.209 28.789 32.036 36.056 39.474 41.534 42.875 43.771 44.388 44.819 45.106 45.276 45.427 45.529 45.572 45.602 45.626 45.629 45.593 45.53 45.475 45.41 45.324 45.231 45.147 45.047 44.941 44.865 44.787 44.704 44.618 44.51 44.426 44.339 44.192 44.086 43.967 43.903 43.776 43.642 43.49 43.41 42.876 43.145 43.042 42.929 42.657 42.501 42.346 42.172 41.943 41.661 41.227 39.814 -5 ,29596 ,KEBNE ,16749149,Wed Dec 1 07:06:13 CET,Wed Dec 1 08:40:33 CET,0.0 1.122 1.569 1.902 2.173 2.416 2.654 2.882 3.295 3.484 3.661 3.514 4.18 4.337 4.64 4.939 5.227 5.368 5.642 5.899 6.266 6.509 6.747 7.1 7.45 7.799 8.146 8.482 8.907 9.319 9.729 10.22 10.688 11.155 11.724 12.372 12.972 13.637 14.369 15.139 15.968 16.934 18.097 19.268 20.617 22.153 23.993 26.103 28.651 31.845 35.869 39.302 41.393 42.734 43.623 44.218 44.616 44.917 45.129 45.281 45.372 45.437 45.47 45.477 45.454 45.417 45.375 45.312 45.24 45.154 45.046 44.958 44.873 44.778 44.699 44.612 44.516 44.413 44.289 44.194 44.097 43.937 43.813 43.679 43.609 43.46 43.306 43.148 43.055 42.507 42.763 42.651 42.534 42.28 42.137 41.968 41.772 41.553 41.256 40.8 39.544 -6 ,21857 ,KEBNE ,16749150,Wed Dec 1 07:41:20 CET,Wed Dec 1 09:17:22 CET,0.0 1.259 1.722 2.079 2.389 2.665 2.919 3.15 3.57 3.767 3.954 3.798 4.458 4.621 4.931 5.221 5.506 5.644 5.918 6.189 6.563 6.801 7.035 7.381 7.727 8.066 8.401 8.726 9.145 9.565 9.972 10.464 10.94 11.399 11.927 12.521 13.103 13.757 14.476 15.255 16.073 16.992 18.098 19.276 20.684 22.231 24.062 26.226 28.804 31.938 35.891 39.305 41.386 42.732 43.655 44.337 44.828 45.202 45.441 45.589 45.668 45.689 45.686 45.676 45.649 45.609 45.546 45.468 45.398 45.326 45.224 45.132 45.048 44.948 44.859 44.769 44.676 44.575 44.457 44.365 44.264 44.098 43.978 43.842 43.768 43.608 43.431 43.246 43.156 42.608 42.852 42.738 42.612 42.344 42.195 42.023 41.832 41.613 41.344 40.967 39.843 -7 ,17012 ,KEBNE ,16749151,Wed Dec 1 07:01:00 CET,Wed Dec 1 08:30:47 CET,0.0 0.964 1.382 1.737 2.053 2.327 2.565 2.787 3.205 3.399 3.582 3.423 4.079 4.235 4.53 4.81 5.09 5.224 5.487 5.747 6.121 6.355 6.586 6.931 7.266 7.591 7.915 8.245 8.656 9.054 9.462 9.941 10.415 10.891 11.444 12.082 12.687 13.357 14.1 14.877 15.696 16.66 17.833 19.013 20.383 21.955 23.791 25.909 28.474 31.521 35.374 38.813 40.859 42.206 43.122 43.756 44.227 44.55 44.739 44.889 44.98 45.024 45.049 45.06 45.057 45.025 44.974 44.913 44.852 44.79 44.706 44.623 44.53 44.423 44.337 44.246 44.147 44.03 43.893 43.8 43.704 43.56 43.467 43.353 43.288 43.159 43.022 42.876 42.791 42.241 42.491 42.377 42.266 42.029 41.89 41.722 41.512 41.255 40.909 40.44 38.482 -8 ,588 ,KEBNE ,16749152,Wed Dec 1 07:08:23 CET,Wed Dec 1 08:46:52 CET,0.0 1.721 2.218 2.583 2.887 3.165 3.413 3.631 4.019 4.199 4.373 4.212 4.87 5.024 5.333 5.622 5.893 6.03 6.301 6.56 6.922 7.166 7.416 7.777 8.124 8.451 8.766 9.075 9.484 9.892 10.279 10.753 11.227 11.697 12.235 12.841 13.437 14.102 14.832 15.609 16.431 17.365 18.477 19.617 20.994 22.561 24.378 26.494 29.057 32.226 36.134 39.511 41.649 43.033 43.975 44.613 44.989 45.247 45.417 45.55 45.663 45.722 45.734 45.713 45.693 45.684 45.662 45.63 45.587 45.536 45.46 45.374 45.267 45.15 45.061 44.959 44.847 44.724 44.584 44.493 44.4 44.235 44.108 43.976 43.911 43.768 43.606 43.421 43.325 42.767 42.983 42.851 42.703 42.374 42.197 42.003 41.779 41.517 41.216 40.825 39.668 -9 ,17478 ,KEBNE ,16749153,Wed Dec 1 07:06:12 CET,Wed Dec 1 08:40:53 CET,0.0 1.945 2.486 2.883 3.2 3.457 3.715 3.976 4.418 4.599 4.772 4.608 5.259 5.416 5.725 6.011 6.289 6.426 6.695 6.949 7.316 7.562 7.806 8.16 8.496 8.82 9.153 9.479 9.888 10.299 10.695 11.158 11.615 12.073 12.626 13.245 13.818 14.47 15.199 15.971 16.815 17.813 18.979 20.124 21.505 23.107 24.935 27.065 29.655 32.799 36.767 40.17 42.243 43.649 44.612 45.244 45.637 45.913 46.13 46.282 46.333 46.379 46.421 46.414 46.373 46.324 46.276 46.203 46.116 46.025 45.929 45.852 45.771 45.675 45.588 45.494 45.388 45.282 45.174 45.097 45.011 44.87 44.767 44.639 44.573 44.439 44.285 44.129 44.051 43.518 43.8 43.701 43.588 43.336 43.196 43.031 42.846 42.612 42.316 41.902 40.694 -10 ,26547 ,KEBNE ,16749154,Wed Dec 1 07:06:12 CET,Wed Dec 1 08:41:21 CET,0.0 1.197 1.653 1.988 2.273 2.543 2.796 3.029 3.437 3.615 3.788 3.639 4.306 4.468 4.766 5.06 5.347 5.483 5.754 6.017 6.393 6.634 6.877 7.232 7.564 7.897 8.226 8.541 8.955 9.349 9.733 10.214 10.686 11.141 11.682 12.313 12.92 13.599 14.353 15.13 15.962 16.926 18.057 19.232 20.606 22.131 23.922 26.052 28.608 31.64 35.445 38.792 40.855 42.221 43.135 43.798 44.275 44.607 44.814 44.947 45.04 45.084 45.102 45.103 45.078 45.048 45.005 44.948 44.882 44.796 44.694 44.616 44.521 44.412 44.312 44.204 44.115 44.021 43.899 43.81 43.724 43.587 43.482 43.359 43.29 43.132 42.968 42.807 42.722 42.182 42.443 42.33 42.206 41.928 41.762 41.583 41.383 41.127 40.831 40.434 39.278 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt deleted file mode 100644 index d8eb2709..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2509 ,KEBNE ,17028162,Wed Dec 22 19:19:36 CET,Wed Dec 22 20:54:16 CET,0.0 1.291 1.815 2.238 2.6 2.903 3.182 3.441 3.906 4.119 4.324 4.209 4.88 5.051 5.378 5.721 6.059 6.218 6.525 6.809 7.221 7.489 7.747 8.132 8.512 8.874 9.222 9.562 10.003 10.442 10.884 11.416 11.917 12.409 12.978 13.624 14.262 14.972 15.758 16.62 17.526 18.531 19.705 20.908 22.366 24.045 26.015 28.295 31.058 34.387 38.502 42.131 44.333 45.738 46.667 47.393 47.929 48.322 48.576 48.736 48.839 48.88 48.874 48.864 48.856 48.818 48.755 48.693 48.631 48.549 48.444 48.362 48.279 48.185 48.103 48.01 47.91 47.8 47.675 47.588 47.505 47.378 47.288 47.175 47.107 46.973 46.835 46.68 46.594 46.045 46.261 46.132 46.01 45.731 45.568 45.389 45.177 44.923 44.618 44.155 42.741 -2 ,19924 ,KEBNE ,17028163,Wed Dec 22 19:19:36 CET,Wed Dec 22 20:54:13 CET,0.0 1.235 1.671 2.027 2.339 2.628 2.884 3.118 3.546 3.756 3.954 3.815 4.481 4.643 4.963 5.272 5.572 5.72 6.002 6.278 6.688 6.951 7.202 7.557 7.911 8.263 8.606 8.94 9.369 9.794 10.209 10.706 11.193 11.676 12.237 12.878 13.489 14.166 14.937 15.772 16.638 17.632 18.855 20.104 21.526 23.125 25.041 27.262 29.922 33.114 37.273 40.971 43.163 44.62 45.58 46.234 46.721 47.071 47.303 47.475 47.567 47.612 47.633 47.631 47.614 47.587 47.537 47.456 47.387 47.314 47.201 47.109 47.02 46.919 46.833 46.726 46.608 46.486 46.343 46.24 46.141 45.99 45.881 45.761 45.696 45.554 45.397 45.229 45.142 44.599 44.857 44.746 44.617 44.303 44.124 43.937 43.719 43.467 43.177 42.751 41.452 -3 ,8923 ,KEBNE ,17028164,Wed Dec 22 19:19:35 CET,Wed Dec 22 20:54:13 CET,0.0 1.28 1.76 2.135 2.438 2.709 2.967 3.205 3.656 3.867 4.063 3.918 4.587 4.76 5.097 5.407 5.696 5.848 6.153 6.442 6.865 7.136 7.403 7.793 8.156 8.505 8.857 9.196 9.641 10.077 10.496 11.005 11.503 11.977 12.533 13.186 13.833 14.531 15.276 16.094 16.954 17.933 19.121 20.339 21.755 23.394 25.359 27.609 30.282 33.535 37.722 41.282 43.406 44.817 45.819 46.489 46.934 47.281 47.545 47.737 47.847 47.928 47.994 48.035 48.038 48.028 48.018 47.978 47.918 47.844 47.754 47.676 47.588 47.492 47.4 47.293 47.177 47.054 46.931 46.84 46.742 46.583 46.467 46.333 46.267 46.143 45.999 45.844 45.758 45.212 45.466 45.357 45.242 44.992 44.856 44.688 44.482 44.243 43.921 43.42 41.097 -4 ,8683 ,KEBNE ,17028165,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:57:12 CET,0.0 1.214 1.737 2.128 2.46 2.746 3.001 3.243 3.695 3.9 4.087 3.948 4.624 4.799 5.14 5.469 5.781 5.934 6.238 6.528 6.944 7.216 7.478 7.853 8.228 8.595 8.947 9.302 9.774 10.235 10.679 11.209 11.72 12.221 12.79 13.413 14.03 14.736 15.497 16.331 17.224 18.221 19.404 20.633 22.088 23.745 25.735 27.998 30.737 34.096 38.29 41.953 44.174 45.63 46.653 47.378 47.831 48.125 48.345 48.551 48.687 48.759 48.797 48.816 48.818 48.798 48.755 48.705 48.64 48.565 48.498 48.425 48.334 48.223 48.123 48.013 47.897 47.788 47.677 47.595 47.513 47.37 47.256 47.146 47.089 46.963 46.828 46.676 46.596 46.061 46.332 46.23 46.117 45.846 45.682 45.502 45.313 45.065 44.721 44.239 41.84 -5 ,7225 ,KEBNE ,17028166,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:57:57 CET,0.0 1.148 1.624 1.996 2.305 2.587 2.845 3.077 3.522 3.727 3.92 3.785 4.448 4.615 4.948 5.266 5.569 5.723 6.022 6.313 6.743 7.019 7.29 7.683 8.048 8.405 8.76 9.111 9.567 9.999 10.408 10.901 11.394 11.9 12.503 13.163 13.818 14.544 15.303 16.134 17.028 18.037 19.226 20.429 21.88 23.531 25.471 27.708 30.407 33.763 37.998 41.61 43.715 45.095 46.062 46.713 47.163 47.496 47.728 47.912 48.016 48.073 48.1 48.104 48.087 48.041 47.969 47.901 47.836 47.767 47.699 47.634 47.555 47.464 47.385 47.297 47.207 47.113 47.003 46.923 46.839 46.704 46.596 46.477 46.42 46.298 46.152 45.979 45.889 45.345 45.604 45.501 45.389 45.123 44.968 44.799 44.592 44.345 44.036 43.58 42.414 -6 ,25921 ,KEBNE ,17028167,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:58:03 CET,0.0 1.446 1.923 2.285 2.586 2.864 3.131 3.362 3.78 3.98 4.169 4.025 4.693 4.866 5.197 5.507 5.812 5.964 6.268 6.57 7.005 7.275 7.541 7.941 8.332 8.696 9.043 9.385 9.831 10.27 10.697 11.218 11.733 12.226 12.788 13.42 14.049 14.749 15.498 16.329 17.229 18.247 19.476 20.731 22.183 23.812 25.734 27.997 30.806 34.168 38.357 42.033 44.227 45.663 46.651 47.362 47.863 48.208 48.423 48.597 48.713 48.771 48.802 48.82 48.791 48.748 48.7 48.645 48.603 48.558 48.493 48.422 48.345 48.267 48.207 48.137 48.059 47.966 47.863 47.785 47.691 47.526 47.405 47.283 47.223 47.095 46.946 46.783 46.697 46.15 46.38 46.264 46.148 45.892 45.743 45.577 45.38 45.154 44.851 44.444 43.357 -7 ,29522 ,KEBNE ,17028168,Wed Dec 22 19:21:41 CET,Wed Dec 22 20:57:47 CET,0.0 1.393 1.889 2.271 2.594 2.861 3.104 3.338 3.782 3.983 4.178 4.052 4.72 4.879 5.192 5.5 5.822 5.986 6.31 6.623 7.047 7.318 7.568 7.921 8.28 8.637 8.987 9.32 9.78 10.243 10.676 11.197 11.714 12.219 12.807 13.463 14.086 14.763 15.489 16.312 17.204 18.211 19.429 20.684 22.129 23.767 25.756 28.053 30.805 34.222 38.515 42.163 44.388 45.897 46.93 47.634 48.109 48.443 48.678 48.869 48.994 49.054 49.081 49.096 49.088 49.056 49.001 48.939 48.872 48.787 48.685 48.592 48.497 48.399 48.312 48.208 48.091 47.977 47.872 47.802 47.716 47.579 47.484 47.381 47.326 47.194 47.032 46.848 46.756 46.208 46.441 46.322 46.192 45.917 45.757 45.576 45.362 45.116 44.803 44.341 42.838 -8 ,28451 ,KEBNE ,17028169,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:57:38 CET,0.0 1.309 1.755 2.126 2.448 2.725 2.987 3.235 3.682 3.883 4.071 3.926 4.593 4.76 5.092 5.42 5.73 5.87 6.138 6.409 6.809 7.063 7.323 7.704 8.058 8.398 8.726 9.068 9.525 9.954 10.367 10.888 11.406 11.89 12.45 13.105 13.746 14.462 15.247 16.069 16.951 17.964 19.162 20.403 21.864 23.514 25.424 27.627 30.26 33.51 37.65 41.23 43.426 44.863 45.834 46.53 47.022 47.384 47.63 47.796 47.891 47.942 47.958 47.955 47.948 47.931 47.887 47.843 47.787 47.719 47.639 47.55 47.451 47.339 47.249 47.143 47.03 46.909 46.772 46.673 46.562 46.385 46.252 46.117 46.049 45.896 45.734 45.575 45.479 44.92 45.136 45.015 44.897 44.629 44.461 44.271 44.075 43.845 43.536 43.074 41.77 -9 ,17984 ,KEBNE ,17028170,Wed Dec 22 19:21:39 CET,Wed Dec 22 20:57:42 CET,0.0 1.315 1.801 2.158 2.465 2.736 2.981 3.21 3.65 3.862 4.062 3.948 4.622 4.79 5.118 5.427 5.721 5.865 6.147 6.426 6.835 7.093 7.34 7.703 8.057 8.408 8.753 9.099 9.552 9.987 10.43 10.968 11.473 11.959 12.527 13.163 13.78 14.483 15.253 16.082 16.98 18.0 19.204 20.462 21.95 23.643 25.646 27.933 30.704 34.011 38.117 41.744 43.929 45.326 46.28 46.967 47.414 47.688 47.87 48.011 48.117 48.195 48.227 48.224 48.224 48.198 48.141 48.093 48.036 47.963 47.887 47.809 47.712 47.602 47.505 47.407 47.294 47.158 47.015 46.921 46.816 46.62 46.484 46.348 46.274 46.107 45.933 45.745 45.642 45.085 45.303 45.175 45.039 44.753 44.591 44.418 44.187 43.908 43.585 43.168 42.132 -10 ,22987 ,KEBNE ,17028171,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:56:33 CET,0.0 1.273 1.785 2.179 2.5 2.771 3.025 3.267 3.707 3.907 4.098 3.967 4.651 4.828 5.153 5.47 5.779 5.927 6.214 6.493 6.886 7.141 7.393 7.755 8.102 8.441 8.779 9.11 9.54 9.968 10.395 10.918 11.445 11.954 12.519 13.182 13.837 14.537 15.31 16.147 17.035 18.058 19.271 20.508 21.971 23.61 25.498 27.707 30.399 33.699 37.927 41.62 43.875 45.327 46.284 46.996 47.517 47.883 48.123 48.317 48.423 48.472 48.515 48.551 48.574 48.561 48.518 48.469 48.422 48.371 48.304 48.225 48.131 48.027 47.948 47.864 47.77 47.655 47.529 47.448 47.356 47.203 47.094 46.979 46.919 46.788 46.647 46.494 46.409 45.864 46.116 46.009 45.895 45.628 45.458 45.268 45.072 44.832 44.479 43.987 42.903 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt deleted file mode 100644 index b13e2911..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9420 ,KEBNE ,16749155,Wed Dec 1 07:10:33 CET,Wed Dec 1 08:46:03 CET,0.0 1.113 1.447 1.713 1.925 2.117 2.303 2.474 2.795 2.942 3.078 3.218 3.451 3.579 3.821 4.038 4.237 4.339 4.546 4.741 5.004 5.164 5.329 5.568 5.791 6.015 6.23 6.431 6.678 6.92 7.165 7.459 7.736 7.978 8.221 8.498 8.764 9.052 9.375 9.703 10.033 10.378 10.723 11.058 11.445 11.775 12.1 12.45 12.624 12.505 11.723 10.222 8.656 7.184 5.852 4.605 3.459 2.402 1.541 0.654 -0.14 -0.838 -1.511 -2.167 -2.774 -3.313 -3.886 -4.413 -4.878 -5.372 -5.883 -6.305 -6.751 -7.223 -7.597 -7.99 -8.414 -8.856 -9.313 -9.627 -9.96 -10.483 -10.847 -11.233 -11.427 -11.818 -12.223 -12.644 -12.858 -13.209 -13.562 -13.807 -14.066 -14.648 -14.975 -15.334 -15.737 -16.229 -16.827 -17.655 -20.637 -2 ,30978 ,KEBNE ,16749156,Wed Dec 1 07:42:25 CET,Wed Dec 1 09:16:13 CET,0.0 0.917 1.289 1.615 1.857 2.06 2.247 2.423 2.738 2.887 3.041 3.219 3.452 3.571 3.801 4.01 4.211 4.309 4.493 4.673 4.916 5.058 5.201 5.405 5.602 5.788 5.961 6.121 6.325 6.538 6.74 6.978 7.214 7.449 7.709 8.008 8.322 8.642 8.932 9.234 9.584 9.974 10.39 10.759 11.16 11.556 11.895 12.151 12.221 12.033 11.338 9.872 8.347 6.911 5.626 4.405 3.297 2.304 1.435 0.54 -0.263 -0.995 -1.677 -2.309 -2.908 -3.481 -4.094 -4.631 -5.094 -5.598 -6.142 -6.609 -7.112 -7.608 -7.969 -8.37 -8.796 -9.233 -9.707 -10.019 -10.327 -10.81 -11.153 -11.519 -11.7 -12.077 -12.488 -12.918 -13.14 -13.492 -13.864 -14.134 -14.425 -15.064 -15.433 -15.834 -16.263 -16.752 -17.345 -18.168 -20.565 -3 ,6613 ,KEBNE ,16749157,Wed Dec 1 07:11:37 CET,Wed Dec 1 08:44:55 CET,0.0 1.1 1.47 1.733 1.967 2.177 2.362 2.522 2.824 2.976 3.113 3.247 3.477 3.596 3.815 4.025 4.221 4.315 4.494 4.662 4.908 5.063 5.213 5.43 5.634 5.837 6.031 6.211 6.457 6.698 6.92 7.177 7.403 7.606 7.846 8.132 8.416 8.715 9.019 9.359 9.712 10.039 10.419 10.81 11.186 11.52 11.843 12.133 12.258 12.165 11.463 9.988 8.478 6.995 5.637 4.369 3.178 2.091 1.219 0.302 -0.513 -1.241 -1.97 -2.69 -3.347 -3.926 -4.534 -5.073 -5.554 -6.07 -6.6 -7.028 -7.462 -7.907 -8.259 -8.635 -9.03 -9.454 -9.908 -10.227 -10.553 -11.059 -11.425 -11.802 -11.992 -12.376 -12.789 -13.222 -13.452 -13.817 -14.196 -14.482 -14.784 -15.481 -15.866 -16.268 -16.719 -17.213 -17.748 -18.471 -20.703 -4 ,23967 ,KEBNE ,16749158,Wed Dec 1 07:41:20 CET,Wed Dec 1 09:16:08 CET,0.0 1.142 1.586 1.919 2.21 2.481 2.742 2.964 3.336 3.498 3.653 3.852 4.101 4.23 4.485 4.742 4.982 5.092 5.288 5.468 5.727 5.89 6.057 6.298 6.516 6.731 6.935 7.117 7.341 7.564 7.78 8.023 8.252 8.487 8.743 9.009 9.266 9.524 9.815 10.124 10.437 10.8 11.186 11.516 11.854 12.203 12.533 12.807 12.981 12.842 12.041 10.627 9.175 7.778 6.488 5.262 4.173 3.138 2.244 1.34 0.5 -0.294 -1.058 -1.765 -2.442 -3.035 -3.605 -4.105 -4.546 -5.019 -5.517 -5.921 -6.355 -6.842 -7.223 -7.6 -7.993 -8.397 -8.816 -9.119 -9.435 -9.923 -10.261 -10.611 -10.795 -11.197 -11.623 -12.047 -12.273 -12.642 -13.024 -13.3 -13.593 -14.255 -14.625 -15.036 -15.499 -16.011 -16.644 -17.543 -20.287 -5 ,23924 ,KEBNE ,16749159,Wed Dec 1 07:42:22 CET,Wed Dec 1 09:17:41 CET,0.0 1.123 1.593 1.951 2.26 2.555 2.805 3.022 3.425 3.604 3.76 3.94 4.182 4.312 4.577 4.846 5.093 5.201 5.41 5.612 5.891 6.068 6.242 6.475 6.706 6.945 7.163 7.369 7.637 7.886 8.113 8.386 8.659 8.94 9.234 9.51 9.774 10.083 10.457 10.89 11.306 11.67 12.058 12.438 12.822 13.187 13.521 13.826 14.029 13.897 13.108 11.588 10.135 8.771 7.494 6.272 5.206 4.265 3.383 2.49 1.708 1.017 0.4 -0.207 -0.823 -1.401 -2.005 -2.533 -2.982 -3.46 -3.964 -4.382 -4.818 -5.289 -5.645 -6.001 -6.39 -6.801 -7.228 -7.53 -7.855 -8.385 -8.752 -9.114 -9.288 -9.638 -10.011 -10.406 -10.625 -10.989 -11.38 -11.647 -11.925 -12.597 -12.964 -13.336 -13.752 -14.253 -14.836 -15.586 -17.939 -6 ,4116 ,KEBNE ,16749160,Wed Dec 1 07:18:00 CET,Wed Dec 1 08:52:02 CET,0.0 1.091 1.489 1.801 2.067 2.289 2.492 2.695 3.086 3.265 3.429 3.627 3.88 4.013 4.271 4.533 4.77 4.883 5.096 5.288 5.582 5.774 5.96 6.238 6.485 6.706 6.931 7.149 7.416 7.666 7.896 8.178 8.457 8.726 9.023 9.308 9.557 9.831 10.124 10.432 10.747 11.082 11.448 11.837 12.237 12.619 13.028 13.379 13.572 13.477 12.665 11.098 9.623 8.214 6.896 5.69 4.631 3.637 2.739 1.812 1.005 0.281 -0.392 -1.038 -1.663 -2.228 -2.809 -3.338 -3.833 -4.372 -4.937 -5.408 -5.899 -6.405 -6.791 -7.198 -7.614 -8.026 -8.455 -8.755 -9.061 -9.543 -9.879 -10.216 -10.388 -10.765 -11.168 -11.605 -11.84 -12.21 -12.589 -12.85 -13.129 -13.731 -14.063 -14.436 -14.848 -15.352 -15.976 -16.733 -18.887 -7 ,26429 ,KEBNE ,16749161,Wed Dec 1 07:41:19 CET,Wed Dec 1 09:16:03 CET,0.0 1.137 1.602 1.943 2.213 2.468 2.707 2.933 3.345 3.527 3.687 3.874 4.126 4.262 4.503 4.729 4.953 5.062 5.259 5.424 5.649 5.802 5.956 6.177 6.4 6.625 6.837 7.022 7.256 7.489 7.71 7.985 8.253 8.516 8.814 9.122 9.409 9.721 10.046 10.388 10.725 11.079 11.48 11.837 12.207 12.597 12.976 13.301 13.536 13.466 12.752 11.456 10.094 8.731 7.417 6.165 5.036 4.007 3.128 2.245 1.493 0.824 0.173 -0.46 -1.08 -1.677 -2.32 -2.906 -3.396 -3.899 -4.424 -4.839 -5.257 -5.715 -6.098 -6.499 -6.903 -7.312 -7.743 -8.041 -8.357 -8.846 -9.187 -9.552 -9.737 -10.12 -10.522 -10.95 -11.177 -11.542 -11.941 -12.223 -12.515 -13.149 -13.504 -13.9 -14.34 -14.834 -15.479 -16.355 -19.583 -8 ,19832 ,KEBNE ,16749162,Wed Dec 1 07:41:19 CET,Wed Dec 1 09:14:46 CET,0.0 1.339 1.803 2.132 2.397 2.628 2.83 3.022 3.397 3.564 3.714 3.889 4.138 4.265 4.491 4.696 4.895 4.99 5.168 5.357 5.637 5.806 5.966 6.195 6.426 6.653 6.862 7.063 7.33 7.591 7.834 8.12 8.406 8.659 8.898 9.138 9.361 9.633 9.95 10.267 10.581 10.939 11.358 11.766 12.178 12.53 12.868 13.163 13.345 13.336 12.571 11.031 9.579 8.196 6.97 5.83 4.768 3.776 2.911 2.021 1.242 0.55 -0.118 -0.784 -1.41 -1.941 -2.479 -2.989 -3.446 -3.918 -4.426 -4.863 -5.32 -5.78 -6.12 -6.468 -6.835 -7.21 -7.605 -7.899 -8.22 -8.751 -9.108 -9.46 -9.642 -10.011 -10.404 -10.827 -11.047 -11.39 -11.724 -11.982 -12.248 -12.802 -13.113 -13.482 -13.91 -14.4 -14.993 -15.859 -19.009 -9 ,16084 ,KEBNE ,16749163,Wed Dec 1 07:41:20 CET,Wed Dec 1 09:21:52 CET,0.0 1.024 1.426 1.739 2.0 2.229 2.433 2.617 2.962 3.123 3.276 3.44 3.682 3.809 4.054 4.285 4.5 4.602 4.808 5.017 5.305 5.476 5.642 5.88 6.108 6.323 6.535 6.738 6.999 7.254 7.487 7.745 7.983 8.233 8.546 8.888 9.198 9.506 9.843 10.245 10.676 11.124 11.593 11.995 12.373 12.743 13.09 13.39 13.621 13.54 12.789 11.371 9.954 8.612 7.309 6.066 4.972 3.987 3.109 2.22 1.454 0.729 0.027 -0.623 -1.239 -1.798 -2.36 -2.852 -3.3 -3.772 -4.263 -4.662 -5.079 -5.538 -5.9 -6.282 -6.681 -7.103 -7.544 -7.839 -8.15 -8.638 -8.973 -9.321 -9.498 -9.87 -10.277 -10.717 -10.951 -11.321 -11.711 -11.982 -12.261 -12.87 -13.194 -13.551 -13.971 -14.449 -15.043 -15.838 -18.433 -10 ,30747 ,KEBNE ,16749164,Wed Dec 1 07:42:24 CET,Wed Dec 1 09:20:46 CET,0.0 1.403 1.918 2.279 2.578 2.845 3.085 3.29 3.661 3.836 4.001 4.193 4.45 4.59 4.842 5.062 5.265 5.361 5.543 5.726 6.002 6.181 6.345 6.566 6.786 7.002 7.191 7.361 7.596 7.832 8.052 8.308 8.547 8.775 9.025 9.314 9.594 9.874 10.16 10.428 10.695 11.024 11.427 11.801 12.193 12.584 12.93 13.176 13.29 13.213 12.496 11.043 9.542 8.086 6.733 5.516 4.436 3.461 2.597 1.683 0.914 0.239 -0.43 -1.096 -1.728 -2.313 -2.955 -3.51 -3.971 -4.454 -4.924 -5.313 -5.748 -6.223 -6.579 -6.925 -7.292 -7.705 -8.173 -8.508 -8.846 -9.348 -9.7 -10.063 -10.245 -10.622 -11.024 -11.457 -11.678 -12.021 -12.366 -12.627 -12.908 -13.533 -13.87 -14.236 -14.672 -15.172 -15.743 -16.461 -18.5 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt deleted file mode 100644 index a0c40788..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20094 ,KEBNE ,17028172,Wed Dec 22 19:21:39 CET,Wed Dec 22 20:57:56 CET,0.0 2.178 2.645 2.995 3.266 3.501 3.704 3.896 4.225 4.366 4.498 4.614 4.829 4.929 5.126 5.31 5.455 5.523 5.67 5.825 6.026 6.125 6.22 6.358 6.503 6.627 6.718 6.8 6.907 7.031 7.16 7.293 7.389 7.464 7.544 7.652 7.736 7.794 7.826 7.807 7.804 7.756 7.578 7.361 7.03 6.511 5.713 4.59 2.893 0.128 -4.46 -9.692 -13.891 -17.348 -20.208 -22.685 -24.778 -26.626 -28.203 -29.783 -31.122 -32.273 -33.34 -34.345 -35.283 -36.143 -37.055 -37.875 -38.59 -39.318 -40.063 -40.686 -41.326 -41.996 -42.505 -42.996 -43.507 -44.05 -44.607 -44.999 -45.397 -46.047 -46.506 -46.947 -47.179 -47.668 -48.178 -48.734 -49.023 -49.474 -49.919 -50.243 -50.59 -51.365 -51.8 -52.275 -52.783 -53.341 -53.962 -54.772 -57.556 -2 ,10594 ,KEBNE ,17028173,Wed Dec 22 19:21:39 CET,Wed Dec 22 20:57:49 CET,0.0 2.843 3.351 3.706 3.975 4.216 4.441 4.622 4.952 5.099 5.234 5.365 5.578 5.681 5.868 6.042 6.199 6.27 6.408 6.537 6.708 6.811 6.912 7.06 7.214 7.361 7.483 7.592 7.735 7.861 7.964 8.07 8.161 8.244 8.325 8.396 8.468 8.535 8.597 8.641 8.651 8.639 8.534 8.344 8.074 7.666 6.928 5.764 4.103 1.54 -2.662 -7.64 -11.903 -15.472 -18.433 -21.011 -23.173 -25.067 -26.67 -28.304 -29.718 -30.941 -32.092 -33.188 -34.201 -35.091 -36.002 -36.798 -37.496 -38.235 -38.983 -39.597 -40.239 -40.901 -41.41 -41.936 -42.478 -43.042 -43.622 -44.009 -44.411 -45.04 -45.466 -45.93 -46.178 -46.685 -47.219 -47.765 -48.046 -48.494 -48.918 -49.242 -49.581 -50.326 -50.746 -51.183 -51.673 -52.271 -53.014 -53.99 -58.085 -3 ,32711 ,KEBNE ,17028174,Wed Dec 22 19:21:39 CET,Wed Dec 22 20:56:58 CET,0.0 2.763 3.227 3.604 3.916 4.164 4.38 4.572 4.87 4.996 5.119 5.261 5.496 5.599 5.774 5.943 6.094 6.165 6.318 6.461 6.645 6.764 6.882 7.041 7.195 7.351 7.479 7.598 7.744 7.878 7.992 8.101 8.205 8.289 8.37 8.452 8.533 8.615 8.652 8.657 8.645 8.598 8.497 8.332 8.063 7.628 6.87 5.742 4.172 1.746 -2.376 -7.273 -11.339 -14.713 -17.601 -20.104 -22.256 -24.184 -25.814 -27.437 -28.881 -30.153 -31.302 -32.386 -33.421 -34.352 -35.281 -36.109 -36.815 -37.538 -38.282 -38.915 -39.584 -40.255 -40.774 -41.309 -41.867 -42.462 -43.047 -43.447 -43.87 -44.522 -44.97 -45.426 -45.668 -46.162 -46.675 -47.22 -47.499 -47.951 -48.401 -48.726 -49.075 -49.828 -50.228 -50.66 -51.147 -51.701 -52.369 -53.243 -55.637 -4 ,15815 ,KEBNE ,17028175,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:57:52 CET,0.0 1.645 2.082 2.409 2.658 2.868 3.057 3.24 3.575 3.722 3.858 4.007 4.237 4.34 4.563 4.784 4.976 5.06 5.203 5.318 5.471 5.579 5.674 5.8 5.935 6.065 6.182 6.294 6.418 6.515 6.609 6.725 6.835 6.933 7.036 7.134 7.182 7.201 7.212 7.206 7.183 7.122 7.004 6.819 6.478 5.985 5.28 4.187 2.458 -0.131 -4.44 -9.707 -14.044 -17.641 -20.568 -23.114 -25.335 -27.295 -28.916 -30.469 -31.777 -32.934 -34.04 -35.066 -35.993 -36.835 -37.713 -38.513 -39.193 -39.873 -40.599 -41.215 -41.836 -42.475 -42.986 -43.517 -44.058 -44.605 -45.163 -45.552 -45.959 -46.574 -46.989 -47.414 -47.64 -48.12 -48.619 -49.137 -49.409 -49.846 -50.262 -50.569 -50.896 -51.602 -52.014 -52.478 -53.002 -53.612 -54.369 -55.461 -59.681 -5 ,68 ,KEBNE ,17028176,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:58:56 CET,0.0 2.028 2.539 2.88 3.135 3.354 3.561 3.747 4.084 4.231 4.359 4.48 4.697 4.804 5.0 5.181 5.352 5.433 5.587 5.737 5.941 6.058 6.159 6.309 6.454 6.58 6.697 6.803 6.917 7.024 7.13 7.266 7.392 7.493 7.599 7.693 7.747 7.809 7.867 7.899 7.906 7.84 7.716 7.541 7.236 6.786 6.116 5.198 3.78 1.473 -2.558 -7.566 -11.749 -15.197 -18.077 -20.608 -22.803 -24.78 -26.5 -28.216 -29.665 -30.923 -32.081 -33.155 -34.173 -35.108 -36.025 -36.824 -37.516 -38.23 -38.98 -39.593 -40.235 -40.902 -41.409 -41.932 -42.455 -43.02 -43.632 -44.034 -44.445 -45.087 -45.522 -45.952 -46.168 -46.609 -47.091 -47.626 -47.904 -48.354 -48.802 -49.119 -49.449 -50.179 -50.576 -51.023 -51.528 -52.112 -52.855 -53.842 -57.474 -6 ,21233 ,KEBNE ,17028177,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:58:27 CET,0.0 2.283 2.883 3.28 3.547 3.773 3.977 4.163 4.492 4.639 4.776 4.91 5.148 5.258 5.46 5.638 5.793 5.873 6.027 6.161 6.344 6.461 6.578 6.757 6.92 7.058 7.171 7.281 7.437 7.587 7.698 7.804 7.903 7.995 8.092 8.167 8.221 8.279 8.33 8.36 8.374 8.348 8.267 8.113 7.807 7.307 6.573 5.545 3.956 1.448 -2.777 -7.872 -12.083 -15.547 -18.403 -20.914 -23.063 -24.972 -26.613 -28.216 -29.542 -30.696 -31.779 -32.794 -33.753 -34.625 -35.505 -36.296 -36.988 -37.684 -38.401 -39.0 -39.602 -40.209 -40.678 -41.165 -41.664 -42.192 -42.759 -43.136 -43.516 -44.112 -44.532 -44.975 -45.202 -45.692 -46.213 -46.74 -47.021 -47.482 -47.931 -48.251 -48.606 -49.403 -49.839 -50.311 -50.85 -51.495 -52.218 -53.16 -56.717 -7 ,1439 ,KEBNE ,17028178,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:56:33 CET,0.0 1.88 2.337 2.665 2.94 3.179 3.383 3.568 3.897 4.035 4.157 4.284 4.511 4.624 4.829 5.013 5.182 5.259 5.415 5.559 5.753 5.877 6.0 6.179 6.328 6.472 6.602 6.709 6.842 6.955 7.057 7.185 7.304 7.413 7.52 7.618 7.708 7.787 7.846 7.892 7.91 7.874 7.791 7.673 7.453 7.077 6.469 5.531 4.073 1.803 -2.229 -7.335 -11.573 -15.045 -17.941 -20.502 -22.68 -24.667 -26.35 -27.975 -29.385 -30.619 -31.76 -32.831 -33.825 -34.725 -35.633 -36.421 -37.093 -37.792 -38.519 -39.12 -39.764 -40.423 -40.938 -41.484 -42.031 -42.595 -43.184 -43.588 -44.011 -44.677 -45.135 -45.596 -45.833 -46.328 -46.833 -47.367 -47.655 -48.107 -48.566 -48.911 -49.25 -49.969 -50.366 -50.831 -51.372 -51.971 -52.675 -53.621 -56.065 -8 ,12630 ,KEBNE ,17028179,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:56:41 CET,0.0 2.176 2.689 3.043 3.34 3.616 3.846 4.031 4.36 4.501 4.626 4.74 4.96 5.074 5.287 5.464 5.627 5.709 5.866 5.998 6.182 6.307 6.414 6.547 6.672 6.794 6.916 7.03 7.16 7.284 7.434 7.615 7.748 7.837 7.91 7.995 8.066 8.143 8.202 8.232 8.236 8.205 8.102 7.923 7.606 7.075 6.288 5.209 3.585 1.008 -3.362 -8.513 -12.728 -16.23 -19.172 -21.765 -23.978 -25.889 -27.495 -29.079 -30.415 -31.584 -32.687 -33.693 -34.625 -35.503 -36.412 -37.195 -37.874 -38.598 -39.345 -39.946 -40.567 -41.242 -41.777 -42.321 -42.866 -43.429 -44.016 -44.413 -44.823 -45.475 -45.933 -46.395 -46.629 -47.107 -47.598 -48.139 -48.429 -48.874 -49.31 -49.638 -49.99 -50.743 -51.137 -51.579 -52.076 -52.629 -53.226 -54.06 -56.804 -9 ,4390 ,KEBNE ,17028180,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:56:31 CET,0.0 2.418 2.876 3.21 3.471 3.694 3.89 4.075 4.41 4.549 4.685 4.812 5.031 5.135 5.318 5.486 5.639 5.71 5.85 5.987 6.184 6.307 6.41 6.55 6.682 6.808 6.938 7.06 7.202 7.315 7.412 7.534 7.643 7.726 7.822 7.921 7.985 8.049 8.107 8.121 8.086 7.999 7.863 7.712 7.474 7.097 6.472 5.483 3.941 1.529 -2.632 -7.734 -11.883 -15.25 -18.121 -20.668 -22.829 -24.76 -26.394 -28.015 -29.398 -30.633 -31.787 -32.82 -33.777 -34.68 -35.613 -36.426 -37.122 -37.829 -38.549 -39.154 -39.784 -40.43 -40.93 -41.459 -42.014 -42.58 -43.178 -43.595 -44.01 -44.643 -45.091 -45.554 -45.795 -46.295 -46.809 -47.352 -47.642 -48.099 -48.547 -48.877 -49.225 -49.982 -50.414 -50.858 -51.328 -51.871 -52.496 -53.363 -56.581 -10 ,30072 ,KEBNE ,17028181,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:57:40 CET,0.0 2.134 2.616 2.972 3.248 3.474 3.68 3.856 4.172 4.312 4.445 4.589 4.816 4.937 5.163 5.353 5.526 5.611 5.774 5.919 6.111 6.234 6.351 6.503 6.641 6.769 6.88 6.982 7.117 7.252 7.362 7.485 7.625 7.747 7.853 7.955 8.041 8.104 8.135 8.144 8.115 8.024 7.855 7.63 7.306 6.855 6.165 5.125 3.545 0.996 -3.37 -8.419 -12.535 -15.97 -18.831 -21.36 -23.526 -25.469 -27.138 -28.779 -30.149 -31.338 -32.46 -33.577 -34.653 -35.598 -36.558 -37.385 -38.062 -38.776 -39.534 -40.164 -40.817 -41.498 -42.034 -42.576 -43.136 -43.71 -44.291 -44.687 -45.09 -45.735 -46.191 -46.649 -46.883 -47.368 -47.884 -48.44 -48.728 -49.184 -49.654 -49.991 -50.342 -51.092 -51.511 -51.983 -52.492 -53.036 -53.676 -54.546 -57.291 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt deleted file mode 100644 index e6730446..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28412 ,KEBNE ,16749165,Wed Dec 1 07:41:19 CET,Wed Dec 1 09:17:15 CET,0.0 1.318 1.814 2.171 2.464 2.728 2.946 3.128 3.466 3.632 3.794 3.97 4.214 4.353 4.622 4.891 5.143 5.259 5.471 5.67 5.965 6.144 6.314 6.575 6.826 7.059 7.289 7.518 7.816 8.105 8.371 8.71 9.051 9.343 9.661 10.049 10.413 10.772 11.145 11.531 11.93 12.383 12.895 13.367 13.885 14.43 15.042 15.676 16.313 16.864 17.059 16.731 16.125 15.414 14.753 14.066 13.379 12.76 12.242 11.702 11.213 10.745 10.277 9.799 9.323 8.89 8.442 8.044 7.685 7.309 6.955 6.682 6.401 6.101 5.851 5.578 5.284 4.989 4.67 4.442 4.209 3.857 3.62 3.364 3.226 2.918 2.581 2.23 2.045 1.745 1.436 1.201 0.97 0.498 0.247 -0.04 -0.337 -0.64 -1.001 -1.514 -2.983 -2 ,17261 ,KEBNE ,16749166,Wed Dec 1 07:42:24 CET,Wed Dec 1 09:17:36 CET,0.0 1.362 1.872 2.275 2.61 2.884 3.123 3.347 3.747 3.929 4.093 4.276 4.533 4.673 4.931 5.178 5.42 5.534 5.746 5.949 6.249 6.447 6.638 6.9 7.141 7.372 7.589 7.803 8.079 8.358 8.644 8.977 9.298 9.59 9.91 10.277 10.617 10.981 11.351 11.748 12.162 12.626 13.184 13.684 14.216 14.785 15.332 15.853 16.407 16.913 17.162 16.78 16.122 15.394 14.656 13.989 13.384 12.781 12.234 11.674 11.19 10.727 10.265 9.825 9.4 8.996 8.597 8.252 7.945 7.634 7.301 7.005 6.689 6.361 6.107 5.847 5.584 5.314 5.016 4.803 4.595 4.275 4.034 3.767 3.625 3.327 3.02 2.688 2.511 2.22 1.944 1.739 1.516 1.024 0.763 0.481 0.158 -0.228 -0.652 -1.166 -2.625 -3 ,16691 ,KEBNE ,16749167,Wed Dec 1 07:45:37 CET,Wed Dec 1 09:13:54 CET,0.0 1.241 1.629 1.919 2.172 2.399 2.622 2.83 3.213 3.386 3.542 3.731 3.987 4.131 4.408 4.665 4.909 5.028 5.255 5.469 5.79 6.0 6.204 6.499 6.778 7.045 7.307 7.55 7.843 8.136 8.407 8.727 9.027 9.302 9.626 9.993 10.341 10.738 11.172 11.625 12.072 12.511 13.003 13.478 13.978 14.491 15.056 15.625 16.163 16.631 16.809 16.443 15.838 15.169 14.535 13.852 13.173 12.561 12.056 11.536 11.052 10.61 10.196 9.791 9.385 9.007 8.616 8.257 7.943 7.618 7.254 6.953 6.646 6.312 6.048 5.775 5.476 5.158 4.841 4.614 4.381 4.038 3.79 3.525 3.386 3.083 2.772 2.436 2.262 1.971 1.671 1.468 1.242 0.732 0.446 0.133 -0.188 -0.541 -0.988 -1.575 -3.414 -4 ,1876 ,KEBNE ,16749168,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:34:39 CET,0.0 1.303 1.713 2.019 2.274 2.5 2.708 2.9 3.252 3.412 3.562 3.735 3.978 4.105 4.351 4.584 4.806 4.912 5.113 5.309 5.588 5.761 5.936 6.185 6.412 6.63 6.834 7.027 7.28 7.516 7.734 8.009 8.298 8.578 8.866 9.179 9.511 9.885 10.267 10.667 11.071 11.491 11.964 12.456 13.026 13.576 14.15 14.741 15.315 15.832 16.007 15.546 14.856 14.124 13.431 12.779 12.193 11.618 11.053 10.461 9.95 9.477 8.991 8.517 8.078 7.675 7.277 6.93 6.618 6.275 5.922 5.626 5.296 4.956 4.691 4.41 4.133 3.849 3.546 3.338 3.113 2.741 2.471 2.177 2.018 1.69 1.38 1.069 0.898 0.608 0.297 0.075 -0.139 -0.612 -0.884 -1.179 -1.524 -1.922 -2.383 -2.971 -4.427 -5 ,24345 ,KEBNE ,16749169,Wed Dec 1 07:41:19 CET,Wed Dec 1 09:17:29 CET,0.0 1.282 1.683 2.043 2.35 2.619 2.861 3.069 3.431 3.597 3.753 3.957 4.215 4.364 4.671 4.935 5.18 5.302 5.537 5.75 6.038 6.219 6.394 6.654 6.92 7.175 7.408 7.632 7.913 8.179 8.438 8.751 9.062 9.354 9.674 10.014 10.351 10.72 11.08 11.469 11.872 12.305 12.797 13.252 13.771 14.313 14.898 15.508 16.108 16.586 16.699 16.284 15.622 14.908 14.214 13.538 12.894 12.254 11.685 11.134 10.657 10.199 9.732 9.253 8.818 8.459 8.073 7.703 7.377 7.054 6.72 6.422 6.099 5.764 5.504 5.222 4.921 4.61 4.275 4.043 3.805 3.411 3.135 2.86 2.727 2.462 2.161 1.833 1.661 1.371 1.098 0.885 0.662 0.215 -0.046 -0.337 -0.657 -1.025 -1.439 -2.029 -3.668 -6 ,20953 ,KEBNE ,16749170,Wed Dec 1 07:59:09 CET,Wed Dec 1 09:35:09 CET,0.0 1.236 1.627 1.937 2.186 2.429 2.659 2.848 3.184 3.348 3.503 3.676 3.914 4.048 4.31 4.548 4.772 4.877 5.077 5.264 5.527 5.699 5.867 6.103 6.332 6.558 6.773 6.994 7.293 7.562 7.811 8.118 8.413 8.698 9.032 9.38 9.697 10.05 10.422 10.807 11.232 11.714 12.216 12.677 13.183 13.702 14.264 14.825 15.354 15.874 16.144 15.742 15.119 14.444 13.714 12.977 12.311 11.717 11.179 10.587 10.089 9.661 9.237 8.813 8.388 7.989 7.568 7.19 6.872 6.528 6.148 5.845 5.531 5.2 4.948 4.686 4.421 4.153 3.877 3.675 3.455 3.115 2.867 2.595 2.455 2.168 1.856 1.519 1.348 1.066 0.79 0.581 0.373 -0.106 -0.373 -0.649 -0.956 -1.346 -1.816 -2.367 -3.813 -7 ,7124 ,KEBNE ,16749171,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:33:44 CET,0.0 1.261 1.704 2.038 2.324 2.579 2.827 3.086 3.534 3.719 3.893 4.118 4.386 4.531 4.804 5.066 5.302 5.41 5.63 5.851 6.161 6.376 6.594 6.874 7.143 7.404 7.636 7.868 8.15 8.399 8.653 8.97 9.296 9.6 9.928 10.292 10.64 11.024 11.413 11.807 12.22 12.683 13.222 13.79 14.395 14.931 15.506 16.144 16.76 17.301 17.579 17.228 16.568 15.852 15.16 14.496 13.852 13.213 12.662 12.095 11.59 11.142 10.703 10.288 9.892 9.532 9.165 8.821 8.523 8.224 7.898 7.612 7.311 6.995 6.766 6.51 6.218 5.917 5.605 5.396 5.171 4.797 4.541 4.257 4.106 3.833 3.542 3.221 3.056 2.768 2.52 2.334 2.125 1.635 1.383 1.128 0.835 0.514 0.134 -0.392 -1.938 -8 ,27587 ,KEBNE ,16749172,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:39:29 CET,0.0 1.103 1.455 1.775 2.06 2.297 2.5 2.688 3.031 3.198 3.364 3.553 3.795 3.922 4.176 4.416 4.64 4.75 4.95 5.141 5.416 5.597 5.776 6.022 6.254 6.484 6.718 6.949 7.236 7.511 7.787 8.099 8.374 8.635 8.94 9.286 9.616 9.965 10.325 10.717 11.127 11.564 12.08 12.615 13.2 13.791 14.424 15.021 15.622 16.17 16.405 16.127 15.553 14.841 14.11 13.392 12.749 12.124 11.53 10.952 10.433 9.964 9.55 9.141 8.734 8.363 7.941 7.544 7.221 6.904 6.586 6.324 6.043 5.736 5.498 5.237 4.957 4.667 4.359 4.145 3.931 3.63 3.415 3.169 3.039 2.769 2.488 2.198 2.047 1.78 1.572 1.386 1.174 0.711 0.475 0.221 -0.058 -0.369 -0.773 -1.28 -2.676 -9 ,13496 ,KEBNE ,16749173,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:35:28 CET,0.0 1.369 1.763 2.074 2.327 2.552 2.756 2.946 3.304 3.465 3.624 3.821 4.071 4.2 4.445 4.682 4.9 5.005 5.205 5.399 5.68 5.856 6.024 6.267 6.506 6.729 6.938 7.141 7.402 7.67 7.938 8.25 8.544 8.818 9.114 9.444 9.78 10.146 10.551 10.978 11.382 11.823 12.305 12.755 13.285 13.827 14.385 15.009 15.653 16.179 16.45 16.099 15.525 14.877 14.208 13.537 12.882 12.256 11.692 11.093 10.577 10.121 9.675 9.261 8.895 8.536 8.133 7.776 7.478 7.157 6.797 6.5 6.192 5.865 5.597 5.317 5.037 4.76 4.459 4.241 4.023 3.682 3.434 3.155 3.011 2.722 2.392 2.037 1.863 1.565 1.257 1.052 0.855 0.396 0.123 -0.174 -0.504 -0.884 -1.335 -1.943 -3.411 -10 ,22342 ,KEBNE ,16749174,Wed Dec 1 07:59:09 CET,Wed Dec 1 09:31:22 CET,0.0 1.326 1.791 2.153 2.446 2.697 2.919 3.128 3.516 3.686 3.85 4.056 4.312 4.46 4.742 5.004 5.259 5.378 5.587 5.788 6.089 6.281 6.454 6.698 6.934 7.158 7.368 7.572 7.832 8.062 8.272 8.542 8.794 9.032 9.335 9.694 10.039 10.401 10.774 11.159 11.543 11.964 12.447 12.899 13.383 13.902 14.506 15.121 15.701 16.168 16.352 15.987 15.38 14.727 14.037 13.376 12.753 12.133 11.585 11.03 10.535 10.07 9.643 9.226 8.801 8.408 7.99 7.615 7.277 6.891 6.491 6.175 5.826 5.453 5.167 4.867 4.552 4.238 3.907 3.679 3.455 3.096 2.839 2.578 2.444 2.144 1.841 1.542 1.376 1.086 0.824 0.627 0.41 -0.091 -0.388 -0.689 -0.994 -1.376 -1.824 -2.392 -3.953 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index 4fe63f69..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4991 ,KEBNE ,16749175,Wed Dec 1 07:59:13 CET,Wed Dec 1 09:29:17 CET,0.0 1.157 1.473 1.724 1.949 2.147 2.325 2.473 2.743 2.862 2.968 3.056 3.267 3.357 3.519 3.675 3.824 3.893 4.026 4.156 4.322 4.417 4.512 4.643 4.76 4.875 4.98 5.074 5.187 5.28 5.352 5.419 5.479 5.527 5.582 5.636 5.677 5.712 5.72 5.718 5.664 5.548 5.35 5.063 4.676 4.12 3.281 2.1 0.361 -2.241 -6.437 -11.464 -15.465 -18.679 -21.37 -23.737 -25.762 -27.518 -29.043 -30.574 -31.856 -32.976 -33.987 -34.907 -35.783 -36.564 -37.367 -38.105 -38.732 -39.371 -40.028 -40.588 -41.18 -41.788 -42.253 -42.73 -43.23 -43.743 -44.268 -44.635 -45.012 -45.584 -45.982 -46.4 -46.616 -47.054 -47.512 -47.987 -48.239 -48.663 -49.05 -49.339 -49.646 -50.327 -50.7 -51.085 -51.498 -51.99 -52.564 -53.276 -55.346 -2 ,29091 ,KEBNE ,16749176,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:33:21 CET,0.0 1.043 1.373 1.632 1.859 2.044 2.204 2.351 2.616 2.735 2.846 2.941 3.149 3.24 3.407 3.558 3.686 3.749 3.869 3.981 4.128 4.219 4.307 4.422 4.533 4.64 4.734 4.817 4.921 5.013 5.115 5.225 5.293 5.352 5.423 5.503 5.562 5.586 5.599 5.595 5.549 5.481 5.306 5.017 4.603 4.07 3.318 2.128 0.341 -2.212 -6.501 -11.619 -15.682 -18.942 -21.681 -24.098 -26.163 -27.987 -29.476 -30.921 -32.131 -33.195 -34.213 -35.14 -36.013 -36.804 -37.613 -38.348 -38.964 -39.584 -40.251 -40.79 -41.347 -41.95 -42.409 -42.867 -43.334 -43.826 -44.348 -44.717 -45.1 -45.693 -46.105 -46.533 -46.755 -47.201 -47.646 -48.109 -48.356 -48.768 -49.13 -49.401 -49.701 -50.37 -50.729 -51.112 -51.515 -51.973 -52.53 -53.264 -55.354 -3 ,22375 ,KEBNE ,16749177,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:33:39 CET,0.0 2.179 2.629 2.94 3.18 3.38 3.557 3.72 4.013 4.128 4.234 4.326 4.54 4.627 4.788 4.922 5.034 5.091 5.217 5.346 5.508 5.598 5.69 5.829 5.96 6.093 6.213 6.319 6.433 6.533 6.632 6.744 6.832 6.914 7.001 7.061 7.097 7.103 7.09 7.066 7.003 6.889 6.709 6.483 6.126 5.561 4.707 3.545 1.924 -0.604 -4.812 -9.729 -13.654 -16.876 -19.626 -22.032 -24.046 -25.824 -27.354 -28.857 -30.107 -31.197 -32.242 -33.184 -34.029 -34.819 -35.639 -36.38 -37.006 -37.628 -38.267 -38.796 -39.349 -39.911 -40.337 -40.768 -41.206 -41.653 -42.117 -42.445 -42.792 -43.324 -43.688 -44.075 -44.277 -44.702 -45.148 -45.627 -45.88 -46.296 -46.686 -46.979 -47.278 -47.919 -48.284 -48.67 -49.081 -49.558 -50.16 -50.987 -53.716 -4 ,24820 ,KEBNE ,16749178,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:34:01 CET,0.0 1.011 1.324 1.588 1.826 2.012 2.195 2.36 2.63 2.747 2.853 2.941 3.146 3.239 3.423 3.584 3.747 3.831 3.971 4.086 4.236 4.335 4.438 4.566 4.672 4.772 4.871 4.966 5.079 5.174 5.257 5.336 5.394 5.449 5.507 5.556 5.574 5.569 5.567 5.562 5.505 5.385 5.214 4.947 4.577 4.072 3.217 2.024 0.34 -2.307 -6.607 -11.547 -15.518 -18.782 -21.5 -23.889 -25.918 -27.704 -29.199 -30.658 -31.905 -32.978 -33.997 -34.981 -35.881 -36.65 -37.419 -38.113 -38.731 -39.382 -40.047 -40.588 -41.135 -41.701 -42.133 -42.571 -43.046 -43.549 -44.063 -44.424 -44.792 -45.346 -45.724 -46.114 -46.315 -46.708 -47.12 -47.575 -47.823 -48.241 -48.63 -48.918 -49.212 -49.833 -50.169 -50.535 -50.964 -51.463 -51.973 -52.66 -54.721 -5 ,19607 ,KEBNE ,16749179,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:33:45 CET,0.0 0.941 1.283 1.555 1.771 1.963 2.137 2.292 2.561 2.676 2.786 2.889 3.092 3.176 3.342 3.499 3.643 3.705 3.816 3.934 4.101 4.202 4.296 4.41 4.5 4.576 4.644 4.725 4.828 4.901 4.954 4.998 5.049 5.102 5.145 5.173 5.179 5.184 5.174 5.129 5.073 4.969 4.761 4.544 4.217 3.685 2.867 1.721 0.105 -2.401 -6.56 -11.437 -15.446 -18.736 -21.412 -23.728 -25.681 -27.433 -28.937 -30.386 -31.608 -32.702 -33.737 -34.699 -35.579 -36.379 -37.224 -37.973 -38.611 -39.259 -39.928 -40.485 -41.053 -41.632 -42.085 -42.554 -43.035 -43.527 -44.047 -44.426 -44.813 -45.399 -45.79 -46.192 -46.399 -46.814 -47.251 -47.716 -47.955 -48.36 -48.714 -48.981 -49.264 -49.877 -50.238 -50.63 -51.063 -51.568 -52.127 -52.812 -54.36 -6 ,30704 ,KEBNE ,16749180,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:34:00 CET,0.0 1.013 1.371 1.635 1.868 2.061 2.227 2.372 2.647 2.771 2.882 2.989 3.203 3.299 3.473 3.634 3.784 3.852 3.978 4.098 4.257 4.355 4.451 4.588 4.715 4.827 4.92 5.011 5.132 5.24 5.349 5.466 5.555 5.637 5.734 5.83 5.891 5.915 5.925 5.923 5.903 5.804 5.589 5.331 4.923 4.358 3.563 2.381 0.636 -1.925 -6.193 -11.212 -15.21 -18.53 -21.262 -23.604 -25.604 -27.387 -28.922 -30.427 -31.69 -32.781 -33.786 -34.735 -35.619 -36.417 -37.244 -37.976 -38.599 -39.211 -39.845 -40.382 -40.95 -41.566 -42.045 -42.52 -42.997 -43.487 -44.004 -44.36 -44.712 -45.26 -45.631 -46.008 -46.212 -46.634 -47.056 -47.499 -47.733 -48.137 -48.473 -48.749 -49.051 -49.673 -49.999 -50.361 -50.762 -51.198 -51.703 -52.426 -55.095 -7 ,23169 ,KEBNE ,16749181,Wed Dec 1 07:59:09 CET,Wed Dec 1 09:35:28 CET,0.0 1.039 1.383 1.626 1.843 2.049 2.227 2.383 2.657 2.781 2.9 3.01 3.217 3.307 3.458 3.597 3.735 3.802 3.933 4.047 4.186 4.273 4.366 4.516 4.632 4.717 4.793 4.862 4.933 4.992 5.045 5.094 5.135 5.166 5.187 5.199 5.213 5.239 5.237 5.194 5.133 5.063 4.917 4.67 4.299 3.745 2.947 1.799 0.085 -2.464 -6.704 -11.715 -15.827 -19.122 -21.808 -24.209 -26.259 -28.047 -29.573 -31.063 -32.305 -33.4 -34.43 -35.398 -36.286 -37.075 -37.891 -38.608 -39.228 -39.89 -40.576 -41.134 -41.725 -42.33 -42.78 -43.257 -43.76 -44.278 -44.829 -45.202 -45.576 -46.175 -46.584 -47.002 -47.215 -47.655 -48.11 -48.58 -48.828 -49.247 -49.634 -49.918 -50.21 -50.845 -51.216 -51.627 -52.071 -52.559 -53.112 -53.829 -55.726 -8 ,29594 ,KEBNE ,16749182,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:34:38 CET,0.0 0.942 1.255 1.505 1.717 1.893 2.048 2.189 2.447 2.572 2.686 2.749 2.945 3.033 3.188 3.335 3.459 3.511 3.62 3.722 3.87 3.972 4.074 4.211 4.338 4.456 4.55 4.636 4.747 4.851 4.938 5.028 5.095 5.136 5.185 5.247 5.291 5.303 5.292 5.277 5.233 5.118 4.941 4.702 4.328 3.844 3.134 2.096 0.549 -1.859 -5.993 -10.966 -14.955 -18.18 -20.85 -23.164 -25.153 -26.933 -28.434 -29.893 -31.133 -32.216 -33.25 -34.226 -35.12 -35.948 -36.815 -37.587 -38.245 -38.914 -39.595 -40.125 -40.673 -41.274 -41.726 -42.18 -42.661 -43.165 -43.694 -44.055 -44.415 -44.972 -45.375 -45.796 -46.001 -46.433 -46.897 -47.385 -47.623 -48.019 -48.405 -48.689 -48.985 -49.626 -49.988 -50.373 -50.792 -51.298 -51.879 -52.671 -55.432 -9 ,19728 ,KEBNE ,16749183,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:33:39 CET,0.0 1.313 1.636 1.885 2.096 2.281 2.443 2.585 2.852 2.977 3.095 3.187 3.397 3.491 3.659 3.822 3.966 4.032 4.168 4.294 4.466 4.566 4.661 4.792 4.906 5.01 5.112 5.209 5.319 5.414 5.503 5.601 5.677 5.742 5.809 5.87 5.907 5.924 5.919 5.876 5.777 5.613 5.39 5.125 4.705 4.129 3.303 2.178 0.46 -2.162 -6.365 -11.331 -15.281 -18.513 -21.193 -23.516 -25.502 -27.255 -28.733 -30.183 -31.412 -32.479 -33.509 -34.484 -35.338 -36.107 -36.912 -37.63 -38.246 -38.857 -39.495 -40.048 -40.613 -41.172 -41.607 -42.059 -42.517 -43.005 -43.512 -43.854 -44.216 -44.784 -45.185 -45.613 -45.831 -46.261 -46.73 -47.233 -47.486 -47.902 -48.307 -48.602 -48.903 -49.55 -49.882 -50.237 -50.646 -51.121 -51.682 -52.386 -54.355 -10 ,6314 ,KEBNE ,16749184,Wed Dec 1 07:59:09 CET,Wed Dec 1 09:33:15 CET,0.0 2.807 3.264 3.581 3.832 4.035 4.212 4.383 4.674 4.792 4.904 5.018 5.228 5.314 5.485 5.635 5.779 5.844 5.97 6.093 6.254 6.351 6.452 6.604 6.741 6.87 6.985 7.078 7.182 7.275 7.366 7.463 7.532 7.585 7.626 7.632 7.619 7.587 7.52 7.446 7.366 7.264 7.114 6.881 6.501 5.944 5.161 4.038 2.267 -0.403 -4.713 -9.779 -13.799 -17.086 -19.816 -22.179 -24.197 -25.944 -27.401 -28.851 -30.083 -31.155 -32.19 -33.172 -34.076 -34.894 -35.721 -36.445 -37.073 -37.702 -38.348 -38.908 -39.488 -40.098 -40.58 -41.071 -41.562 -42.059 -42.568 -42.918 -43.283 -43.836 -44.208 -44.593 -44.804 -45.259 -45.714 -46.197 -46.456 -46.866 -47.229 -47.507 -47.799 -48.419 -48.755 -49.129 -49.552 -50.033 -50.565 -51.259 -53.38 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt deleted file mode 100644 index eb72ad98..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20566 ,KEBNE ,16749185,Wed Dec 1 07:59:09 CET,Wed Dec 1 09:35:23 CET,0.0 1.288 1.708 1.982 2.221 2.438 2.634 2.806 3.111 3.253 3.388 3.544 3.785 3.908 4.128 4.333 4.536 4.621 4.76 4.896 5.099 5.226 5.36 5.558 5.742 5.92 6.088 6.252 6.457 6.652 6.838 7.066 7.286 7.496 7.725 7.962 8.214 8.492 8.751 8.994 9.202 9.401 9.638 9.885 10.125 10.347 10.553 10.66 10.561 10.089 9.141 7.655 6.121 4.68 3.409 2.268 1.272 0.378 -0.384 -1.144 -1.824 -2.429 -3.002 -3.545 -4.056 -4.542 -5.059 -5.515 -5.906 -6.323 -6.768 -7.131 -7.5 -7.895 -8.212 -8.532 -8.858 -9.187 -9.524 -9.764 -10.014 -10.419 -10.707 -11.008 -11.166 -11.481 -11.822 -12.18 -12.362 -12.676 -12.92 -13.121 -13.345 -13.856 -14.147 -14.474 -14.822 -15.235 -15.736 -16.4 -18.34 -2 ,24162 ,KEBNE ,16749186,Wed Dec 1 07:59:09 CET,Wed Dec 1 09:32:34 CET,0.0 1.585 2.09 2.444 2.726 2.953 3.145 3.324 3.655 3.8 3.95 4.125 4.36 4.487 4.714 4.924 5.134 5.227 5.394 5.558 5.786 5.927 6.062 6.255 6.436 6.61 6.781 6.951 7.186 7.417 7.632 7.906 8.153 8.376 8.628 8.909 9.201 9.518 9.835 10.164 10.475 10.773 11.094 11.405 11.82 12.179 12.421 12.654 12.761 12.555 11.743 10.35 8.92 7.641 6.501 5.429 4.52 3.724 3.011 2.274 1.631 1.043 0.437 -0.152 -0.691 -1.186 -1.718 -2.21 -2.649 -3.118 -3.612 -4.005 -4.397 -4.808 -5.113 -5.418 -5.744 -6.096 -6.47 -6.727 -6.987 -7.389 -7.662 -7.965 -8.131 -8.481 -8.853 -9.241 -9.439 -9.766 -10.064 -10.286 -10.516 -11.019 -11.324 -11.655 -12.012 -12.418 -12.922 -13.663 -15.579 -3 ,19452 ,KEBNE ,16749187,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:32:54 CET,0.0 1.186 1.571 1.852 2.089 2.315 2.521 2.702 3.013 3.159 3.3 3.466 3.711 3.833 4.061 4.267 4.463 4.557 4.739 4.911 5.155 5.311 5.454 5.663 5.871 6.059 6.23 6.385 6.58 6.789 7.001 7.24 7.468 7.691 7.945 8.245 8.535 8.861 9.187 9.487 9.776 10.098 10.459 10.772 11.077 11.419 11.762 11.962 12.071 11.988 11.214 9.77 8.33 6.896 5.583 4.433 3.42 2.494 1.704 0.874 0.144 -0.477 -1.083 -1.682 -2.232 -2.734 -3.276 -3.76 -4.193 -4.675 -5.18 -5.594 -6.006 -6.412 -6.734 -7.082 -7.44 -7.799 -8.168 -8.432 -8.705 -9.131 -9.436 -9.744 -9.895 -10.199 -10.527 -10.874 -11.061 -11.385 -11.683 -11.915 -12.162 -12.716 -13.031 -13.383 -13.764 -14.181 -14.663 -15.296 -17.068 -4 ,3020 ,KEBNE ,16749188,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:33:58 CET,0.0 1.341 1.766 2.078 2.357 2.629 2.859 3.068 3.434 3.6 3.76 3.941 4.201 4.342 4.587 4.82 5.034 5.127 5.319 5.51 5.767 5.931 6.089 6.31 6.506 6.699 6.919 7.15 7.464 7.761 8.021 8.326 8.613 8.89 9.209 9.527 9.821 10.127 10.427 10.718 11.022 11.353 11.68 12.014 12.379 12.717 12.998 13.149 13.222 13.148 12.503 11.297 10.075 8.816 7.692 6.668 5.761 4.972 4.28 3.543 2.874 2.25 1.664 1.125 0.597 0.095 -0.416 -0.87 -1.255 -1.662 -2.124 -2.505 -2.887 -3.288 -3.616 -3.969 -4.325 -4.705 -5.097 -5.364 -5.65 -6.091 -6.37 -6.647 -6.789 -7.089 -7.427 -7.797 -7.991 -8.317 -8.617 -8.842 -9.081 -9.631 -9.953 -10.293 -10.659 -11.097 -11.651 -12.364 -14.176 -5 ,25975 ,KEBNE ,16749189,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:32:39 CET,0.0 1.218 1.626 1.932 2.186 2.414 2.616 2.8 3.138 3.282 3.423 3.592 3.828 3.955 4.19 4.397 4.596 4.691 4.874 5.05 5.298 5.456 5.614 5.833 6.044 6.241 6.399 6.542 6.754 6.985 7.206 7.466 7.727 7.959 8.22 8.52 8.804 9.121 9.457 9.797 10.174 10.593 11.004 11.364 11.751 12.125 12.471 12.783 12.963 12.827 12.12 10.718 9.133 7.72 6.46 5.239 4.145 3.15 2.304 1.444 0.679 -0.015 -0.673 -1.277 -1.843 -2.364 -2.926 -3.43 -3.868 -4.326 -4.764 -5.119 -5.509 -5.934 -6.265 -6.605 -6.956 -7.309 -7.686 -7.957 -8.219 -8.603 -8.872 -9.165 -9.318 -9.621 -9.951 -10.317 -10.52 -10.85 -11.141 -11.362 -11.599 -12.147 -12.434 -12.737 -13.1 -13.539 -14.071 -14.78 -16.692 -6 ,21351 ,KEBNE ,16749190,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:34:22 CET,0.0 2.661 3.139 3.477 3.749 3.981 4.185 4.362 4.663 4.806 4.948 5.104 5.34 5.448 5.663 5.873 6.054 6.134 6.29 6.439 6.648 6.786 6.927 7.12 7.294 7.461 7.613 7.75 7.921 8.11 8.311 8.541 8.764 8.978 9.205 9.471 9.743 10.024 10.332 10.62 10.871 11.138 11.384 11.622 11.913 12.187 12.487 12.776 12.949 12.842 12.137 10.878 9.632 8.494 7.416 6.366 5.414 4.517 3.752 3.01 2.335 1.728 1.145 0.603 0.112 -0.345 -0.836 -1.293 -1.698 -2.125 -2.586 -2.974 -3.365 -3.783 -4.104 -4.418 -4.735 -5.056 -5.379 -5.609 -5.87 -6.298 -6.594 -6.893 -7.043 -7.357 -7.702 -8.084 -8.292 -8.623 -8.901 -9.114 -9.354 -9.883 -10.166 -10.486 -10.853 -11.285 -11.847 -12.677 -15.165 -7 ,7119 ,KEBNE ,16749191,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:32:27 CET,0.0 1.579 2.019 2.32 2.577 2.804 2.997 3.176 3.526 3.679 3.812 3.947 4.177 4.289 4.499 4.705 4.902 5.002 5.195 5.362 5.606 5.76 5.889 6.073 6.247 6.406 6.562 6.709 6.901 7.094 7.278 7.482 7.665 7.86 8.102 8.374 8.646 8.919 9.166 9.419 9.682 9.983 10.324 10.646 10.951 11.228 11.492 11.667 11.735 11.489 10.604 9.268 7.969 6.771 5.699 4.7 3.807 2.98 2.226 1.488 0.838 0.213 -0.376 -0.91 -1.404 -1.876 -2.393 -2.854 -3.241 -3.644 -4.073 -4.436 -4.805 -5.191 -5.497 -5.806 -6.112 -6.432 -6.782 -7.036 -7.308 -7.735 -8.023 -8.337 -8.512 -8.854 -9.197 -9.581 -9.788 -10.13 -10.471 -10.71 -10.95 -11.443 -11.724 -12.066 -12.474 -12.944 -13.451 -14.093 -15.885 -8 ,4222 ,KEBNE ,16749192,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:33:13 CET,0.0 1.182 1.568 1.866 2.092 2.287 2.49 2.683 3.01 3.154 3.303 3.493 3.741 3.874 4.123 4.366 4.593 4.694 4.88 5.058 5.319 5.482 5.622 5.8 6.0 6.236 6.457 6.631 6.846 7.062 7.258 7.47 7.679 7.897 8.141 8.418 8.687 8.959 9.223 9.495 9.759 10.022 10.337 10.655 10.966 11.242 11.529 11.794 11.924 11.838 11.192 9.785 8.342 6.981 5.779 4.68 3.717 2.837 2.053 1.279 0.604 -0.003 -0.557 -1.084 -1.612 -2.073 -2.56 -3.008 -3.369 -3.759 -4.217 -4.617 -5.015 -5.438 -5.793 -6.158 -6.519 -6.88 -7.256 -7.525 -7.808 -8.271 -8.584 -8.912 -9.083 -9.434 -9.812 -10.205 -10.41 -10.734 -11.042 -11.268 -11.501 -12.032 -12.339 -12.686 -13.073 -13.486 -14.005 -14.764 -16.948 -9 ,3108 ,KEBNE ,16749193,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:34:52 CET,0.0 1.051 1.474 1.819 2.096 2.33 2.548 2.753 3.099 3.255 3.414 3.597 3.842 3.979 4.231 4.464 4.682 4.786 4.995 5.191 5.462 5.629 5.79 6.027 6.248 6.465 6.672 6.861 7.107 7.34 7.571 7.859 8.121 8.344 8.587 8.864 9.129 9.402 9.687 9.994 10.31 10.648 11.005 11.299 11.58 11.871 12.156 12.382 12.54 12.42 11.721 10.47 9.16 7.921 6.787 5.741 4.818 3.935 3.12 2.284 1.573 0.945 0.346 -0.203 -0.708 -1.166 -1.654 -2.118 -2.529 -2.942 -3.385 -3.751 -4.104 -4.488 -4.778 -5.074 -5.395 -5.713 -6.045 -6.282 -6.539 -6.953 -7.245 -7.557 -7.718 -8.049 -8.394 -8.736 -8.917 -9.248 -9.572 -9.799 -10.044 -10.602 -10.899 -11.228 -11.604 -12.019 -12.534 -13.239 -15.149 -10 ,8887 ,KEBNE ,16749194,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:33:24 CET,0.0 1.219 1.634 1.945 2.192 2.398 2.583 2.762 3.09 3.236 3.374 3.542 3.781 3.911 4.152 4.386 4.619 4.724 4.914 5.092 5.346 5.512 5.679 5.917 6.127 6.341 6.564 6.79 7.061 7.296 7.533 7.824 8.087 8.332 8.596 8.903 9.214 9.537 9.854 10.137 10.439 10.793 11.179 11.52 11.84 12.208 12.605 12.892 13.047 12.938 12.216 10.798 9.379 8.054 6.783 5.542 4.483 3.545 2.697 1.86 1.15 0.529 -0.082 -0.697 -1.265 -1.77 -2.307 -2.813 -3.261 -3.713 -4.176 -4.555 -4.937 -5.329 -5.643 -5.977 -6.319 -6.675 -7.039 -7.292 -7.561 -7.971 -8.257 -8.564 -8.719 -9.048 -9.405 -9.764 -9.944 -10.264 -10.58 -10.804 -11.039 -11.585 -11.896 -12.232 -12.592 -12.998 -13.524 -14.306 -16.501 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt deleted file mode 100644 index ba5bddac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19981 ,KEBNE ,16749195,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:33:12 CET,0.0 0.715 1.069 1.397 1.718 2.003 2.257 2.496 2.968 3.192 3.404 3.643 3.994 4.181 4.549 4.891 5.214 5.375 5.697 6.01 6.473 6.777 7.064 7.491 7.907 8.309 8.707 9.1 9.608 10.088 10.563 11.149 11.713 12.275 12.908 13.605 14.299 15.067 15.896 16.805 17.783 18.879 20.179 21.514 23.1 24.954 27.187 29.738 32.857 36.703 41.63 46.068 48.841 50.657 51.945 52.931 53.6 54.075 54.431 54.742 54.979 55.149 55.265 55.341 55.381 55.41 55.415 55.38 55.349 55.298 55.225 55.16 55.069 54.961 54.873 54.783 54.688 54.579 54.463 54.372 54.271 54.101 53.973 53.847 53.772 53.612 53.457 53.282 53.188 52.991 52.87 52.75 52.623 52.348 52.192 52.013 51.813 51.567 51.281 50.927 49.379 -2 ,2425 ,KEBNE ,16749196,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:33:26 CET,0.0 0.718 1.15 1.487 1.79 2.068 2.323 2.571 3.023 3.228 3.432 3.642 3.976 4.149 4.48 4.807 5.126 5.28 5.578 5.867 6.295 6.586 6.872 7.271 7.654 8.046 8.427 8.793 9.272 9.732 10.185 10.735 11.285 11.831 12.444 13.134 13.822 14.6 15.46 16.372 17.339 18.475 19.798 21.129 22.74 24.594 26.812 29.448 32.64 36.547 41.493 45.866 48.606 50.439 51.754 52.726 53.425 53.957 54.348 54.679 54.895 55.023 55.133 55.249 55.349 55.408 55.424 55.418 55.401 55.367 55.321 55.278 55.192 55.077 54.996 54.91 54.827 54.754 54.655 54.565 54.476 54.336 54.228 54.111 54.048 53.902 53.744 53.578 53.485 53.286 53.185 53.077 52.96 52.663 52.5 52.338 52.155 51.941 51.658 51.259 49.932 -3 ,7171 ,KEBNE ,16749197,Wed Dec 1 07:59:12 CET,Wed Dec 1 09:33:06 CET,0.0 0.805 1.254 1.629 1.973 2.286 2.556 2.792 3.235 3.437 3.626 3.825 4.168 4.344 4.676 5.003 5.32 5.469 5.759 6.054 6.482 6.755 7.025 7.428 7.832 8.231 8.615 8.988 9.496 9.993 10.451 11.008 11.562 12.116 12.744 13.426 14.12 14.921 15.808 16.756 17.744 18.901 20.27 21.634 23.242 25.055 27.21 29.749 32.88 36.739 41.698 46.027 48.707 50.577 51.899 52.858 53.574 54.105 54.523 54.892 55.145 55.329 55.46 55.573 55.634 55.643 55.64 55.617 55.581 55.543 55.487 55.422 55.341 55.252 55.173 55.084 54.99 54.893 54.8 54.731 54.648 54.51 54.406 54.289 54.23 54.098 53.941 53.768 53.687 53.492 53.384 53.28 53.143 52.822 52.666 52.501 52.317 52.109 51.854 51.495 50.31 -4 ,850 ,KEBNE ,16749198,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:32:56 CET,0.0 0.885 1.332 1.663 1.956 2.243 2.512 2.754 3.206 3.413 3.616 3.839 4.183 4.359 4.69 5.015 5.328 5.483 5.794 6.099 6.533 6.804 7.068 7.472 7.882 8.273 8.647 9.014 9.492 9.978 10.46 11.027 11.57 12.094 12.709 13.423 14.111 14.876 15.751 16.699 17.702 18.841 20.17 21.531 23.128 24.931 27.089 29.586 32.594 36.381 41.373 45.842 48.622 50.51 51.865 52.837 53.534 54.072 54.466 54.768 54.953 55.088 55.188 55.256 55.325 55.365 55.381 55.386 55.372 55.343 55.304 55.258 55.192 55.118 55.047 54.961 54.858 54.751 54.631 54.549 54.478 54.363 54.272 54.174 54.124 54.01 53.88 53.722 53.628 53.427 53.33 53.225 53.116 52.858 52.696 52.517 52.312 52.032 51.675 51.157 48.48 -5 ,21045 ,KEBNE ,16749199,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:32:54 CET,0.0 0.537 0.896 1.206 1.489 1.76 2.025 2.296 2.784 2.994 3.196 3.437 3.777 3.959 4.322 4.661 4.988 5.147 5.47 5.795 6.249 6.541 6.84 7.28 7.698 8.101 8.496 8.884 9.377 9.859 10.339 10.917 11.48 12.031 12.662 13.378 14.097 14.897 15.78 16.737 17.752 18.916 20.26 21.597 23.2 25.057 27.258 29.868 33.024 36.83 41.732 46.124 48.943 50.851 52.184 53.183 53.902 54.439 54.835 55.171 55.394 55.54 55.652 55.702 55.722 55.738 55.735 55.712 55.683 55.652 55.626 55.612 55.59 55.547 55.487 55.423 55.361 55.29 55.205 55.138 55.077 54.968 54.879 54.781 54.727 54.621 54.496 54.333 54.244 54.055 53.962 53.856 53.749 53.491 53.329 53.149 52.949 52.694 52.356 51.836 49.158 -6 ,24699 ,KEBNE ,16749200,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:34:36 CET,0.0 1.028 1.521 1.889 2.202 2.485 2.744 2.984 3.416 3.619 3.824 4.052 4.405 4.578 4.909 5.237 5.553 5.709 6.023 6.333 6.772 7.05 7.319 7.722 8.124 8.509 8.878 9.245 9.731 10.213 10.689 11.257 11.797 12.322 12.928 13.615 14.276 15.03 15.871 16.75 17.697 18.83 20.2 21.592 23.214 25.082 27.277 29.797 32.945 36.847 41.838 46.314 49.151 51.067 52.415 53.399 54.098 54.617 54.979 55.277 55.478 55.595 55.684 55.764 55.808 55.818 55.826 55.807 55.767 55.717 55.674 55.647 55.61 55.565 55.516 55.457 55.398 55.333 55.25 55.188 55.121 54.995 54.893 54.793 54.746 54.636 54.503 54.347 54.262 54.076 53.988 53.879 53.756 53.469 53.291 53.087 52.863 52.596 52.258 51.771 47.883 -7 ,20894 ,KEBNE ,16749201,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:32:47 CET,0.0 0.912 1.358 1.721 2.034 2.325 2.593 2.836 3.256 3.457 3.661 3.873 4.208 4.381 4.731 5.077 5.405 5.559 5.857 6.153 6.584 6.863 7.138 7.528 7.906 8.287 8.655 9.021 9.537 10.041 10.518 11.102 11.672 12.227 12.846 13.567 14.304 15.12 15.995 16.926 17.946 19.085 20.387 21.747 23.397 25.277 27.537 30.177 33.376 37.258 42.184 46.601 49.385 51.282 52.61 53.601 54.339 54.882 55.256 55.582 55.829 55.989 56.098 56.193 56.226 56.226 56.22 56.175 56.123 56.067 55.993 55.927 55.855 55.77 55.699 55.618 55.537 55.452 55.352 55.27 55.162 54.98 54.857 54.723 54.649 54.479 54.289 54.085 53.984 53.785 53.666 53.537 53.396 53.11 52.951 52.777 52.595 52.377 52.117 51.758 50.429 -8 ,1793 ,KEBNE ,16749202,Wed Dec 1 07:59:12 CET,Wed Dec 1 09:36:24 CET,0.0 0.428 0.767 1.059 1.303 1.544 1.776 1.994 2.424 2.635 2.839 3.074 3.415 3.595 3.972 4.339 4.677 4.842 5.163 5.472 5.936 6.232 6.519 6.942 7.344 7.755 8.156 8.537 9.046 9.556 10.053 10.643 11.194 11.741 12.401 13.132 13.837 14.605 15.422 16.326 17.312 18.447 19.796 21.181 22.84 24.716 26.864 29.397 32.517 36.364 41.379 45.869 48.707 50.588 51.897 52.86 53.536 54.045 54.418 54.732 54.946 55.111 55.244 55.332 55.406 55.459 55.472 55.444 55.386 55.33 55.272 55.197 55.124 55.058 54.997 54.915 54.819 54.727 54.623 54.54 54.457 54.309 54.194 54.083 54.021 53.882 53.725 53.555 53.468 53.278 53.176 53.064 52.951 52.685 52.526 52.356 52.155 51.922 51.676 51.341 49.912 -9 ,4645 ,KEBNE ,16749203,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:36:35 CET,0.0 0.449 0.778 1.048 1.265 1.481 1.695 1.901 2.285 2.46 2.636 2.812 3.133 3.294 3.619 3.939 4.244 4.4 4.713 5.006 5.439 5.724 6.001 6.399 6.79 7.189 7.586 7.966 8.444 8.93 9.41 9.99 10.569 11.128 11.784 12.522 13.229 13.991 14.847 15.793 16.782 17.925 19.287 20.691 22.35 24.219 26.425 28.981 32.075 35.953 41.0 45.347 48.036 49.911 51.238 52.231 52.932 53.472 53.909 54.264 54.523 54.729 54.848 54.918 54.99 55.037 55.049 55.03 55.0 54.954 54.886 54.825 54.768 54.697 54.63 54.561 54.48 54.388 54.277 54.191 54.102 53.931 53.811 53.697 53.629 53.495 53.362 53.206 53.12 52.927 52.826 52.72 52.61 52.332 52.174 52.017 51.834 51.609 51.345 50.987 49.682 -10 ,22734 ,KEBNE ,16749204,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:33:52 CET,0.0 0.872 1.329 1.7 2.004 2.265 2.529 2.785 3.238 3.446 3.644 3.854 4.198 4.371 4.692 5.009 5.325 5.486 5.8 6.094 6.526 6.811 7.099 7.523 7.92 8.3 8.667 9.032 9.538 10.037 10.516 11.096 11.67 12.231 12.871 13.587 14.294 15.101 15.973 16.907 17.893 19.016 20.334 21.69 23.313 25.152 27.332 29.876 33.012 36.857 41.836 46.32 49.087 50.957 52.272 53.224 53.938 54.476 54.86 55.19 55.423 55.613 55.746 55.828 55.894 55.918 55.918 55.924 55.913 55.876 55.845 55.826 55.807 55.764 55.707 55.648 55.588 55.518 55.438 55.363 55.274 55.159 55.077 54.985 54.936 54.821 54.691 54.553 54.474 54.285 54.183 54.069 53.958 53.704 53.54 53.352 53.135 52.873 52.539 52.016 49.152 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 2ef2e3b4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5973 ,KEBNE ,17028182,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:55:45 CET,0.0 1.785 2.003 2.077 2.087 2.038 1.949 1.837 1.589 1.453 1.314 0.864 0.87 0.706 0.375 0.021 -0.354 -0.543 -0.924 -1.312 -1.91 -2.322 -2.743 -3.384 -4.029 -4.681 -5.349 -6.031 -6.946 -7.876 -8.804 -9.955 -11.143 -12.358 -13.826 -15.552 -17.285 -19.279 -21.553 -24.131 -26.986 -30.39 -34.654 -39.189 -44.814 -51.607 -60.167 -70.816 -84.716 -103.435 -130.542 -158.223 -178.153 -193.466 -205.489 -215.403 -223.531 -230.444 -236.08 -241.418 -245.791 -249.536 -252.968 -256.078 -258.858 -261.315 -263.823 -265.988 -267.792 -269.609 -271.447 -272.935 -274.449 -275.966 -277.091 -278.236 -279.402 -280.577 -281.769 -282.566 -283.368 -284.597 -285.428 -286.266 -286.687 -287.535 -288.399 -289.273 -289.712 -290.607 -291.057 -291.519 -291.993 -292.972 -293.48 -294.004 -294.552 -295.156 -295.813 -296.565 -298.223 -2 ,20072 ,KEBNE ,17028183,Wed Dec 22 19:21:41 CET,Wed Dec 22 20:56:26 CET,0.0 0.952 1.16 1.294 1.343 1.314 1.28 1.237 1.082 0.977 0.87 0.465 0.492 0.347 0.027 -0.312 -0.651 -0.826 -1.202 -1.579 -2.153 -2.563 -2.982 -3.613 -4.256 -4.914 -5.577 -6.237 -7.131 -8.047 -8.976 -10.149 -11.331 -12.513 -13.957 -15.684 -17.412 -19.422 -21.709 -24.25 -27.071 -30.458 -34.694 -39.246 -44.909 -51.749 -60.322 -70.869 -84.666 -103.32 -130.384 -158.022 -177.877 -193.105 -205.056 -214.967 -223.071 -229.942 -235.564 -240.91 -245.306 -249.047 -252.466 -255.57 -258.359 -260.827 -263.296 -265.421 -267.215 -269.023 -270.846 -272.319 -273.811 -275.307 -276.445 -277.598 -278.757 -279.929 -281.119 -281.925 -282.74 -283.963 -284.783 -285.63 -286.063 -286.929 -287.8 -288.708 -289.173 -290.085 -290.58 -291.057 -291.534 -292.5 -293.002 -293.53 -294.075 -294.645 -295.257 -295.965 -297.491 -3 ,21666 ,KEBNE ,17028184,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:55:48 CET,0.0 1.07 1.226 1.258 1.238 1.184 1.117 1.025 0.759 0.623 0.492 0.032 0.035 -0.122 -0.457 -0.811 -1.172 -1.357 -1.731 -2.108 -2.698 -3.109 -3.527 -4.163 -4.812 -5.477 -6.142 -6.806 -7.705 -8.624 -9.56 -10.727 -11.894 -13.073 -14.532 -16.254 -17.969 -19.967 -22.235 -24.751 -27.563 -30.954 -35.173 -39.703 -45.369 -52.146 -60.604 -71.156 -85.008 -103.644 -130.615 -158.229 -178.078 -193.332 -205.354 -215.267 -223.338 -230.187 -235.794 -241.125 -245.502 -249.248 -252.68 -255.788 -258.573 -261.027 -263.52 -265.693 -267.507 -269.318 -271.155 -272.647 -274.136 -275.645 -276.788 -277.926 -279.073 -280.237 -281.406 -282.198 -282.999 -284.201 -285.02 -285.847 -286.256 -287.086 -287.933 -288.793 -289.227 -290.117 -290.563 -291.023 -291.496 -292.463 -292.957 -293.478 -294.035 -294.613 -295.247 -295.995 -297.787 -4 ,20766 ,KEBNE ,17028185,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:57:49 CET,0.0 0.999 1.168 1.233 1.216 1.156 1.084 0.992 0.757 0.625 0.485 0.017 0.022 -0.143 -0.483 -0.831 -1.199 -1.39 -1.774 -2.168 -2.776 -3.191 -3.615 -4.247 -4.875 -5.517 -6.175 -6.839 -7.728 -8.636 -9.582 -10.769 -11.941 -13.126 -14.567 -16.274 -17.993 -20.003 -22.281 -24.84 -27.715 -31.127 -35.369 -39.91 -45.578 -52.412 -60.975 -71.605 -85.517 -104.253 -131.241 -158.832 -178.732 -194.017 -206.071 -215.991 -224.057 -230.93 -236.59 -241.936 -246.285 -250.0 -253.408 -256.515 -259.298 -261.763 -264.265 -266.419 -268.229 -270.064 -271.904 -273.381 -274.885 -276.398 -277.548 -278.715 -279.88 -281.054 -282.238 -283.036 -283.843 -285.076 -285.907 -286.739 -287.158 -288.004 -288.881 -289.796 -290.261 -291.184 -291.689 -292.178 -292.674 -293.7 -294.238 -294.787 -295.36 -295.976 -296.62 -297.305 -299.049 -5 ,9455 ,KEBNE ,17028186,Wed Dec 22 19:21:39 CET,Wed Dec 22 20:56:09 CET,0.0 1.79 2.075 2.175 2.219 2.212 2.153 2.095 1.943 1.836 1.703 1.259 1.278 1.126 0.804 0.464 0.104 -0.077 -0.448 -0.834 -1.43 -1.829 -2.229 -2.856 -3.508 -4.164 -4.824 -5.481 -6.359 -7.268 -8.197 -9.372 -10.563 -11.754 -13.182 -14.881 -16.596 -18.577 -20.848 -23.401 -26.242 -29.615 -33.817 -38.356 -44.048 -50.898 -59.453 -70.06 -83.905 -102.638 -129.649 -157.239 -177.15 -192.439 -204.463 -214.353 -222.436 -229.303 -234.928 -240.294 -244.698 -248.422 -251.796 -254.863 -257.64 -260.104 -262.584 -264.719 -266.515 -268.341 -270.183 -271.675 -273.187 -274.704 -275.843 -276.987 -278.142 -279.312 -280.502 -281.297 -282.093 -283.302 -284.11 -284.931 -285.349 -286.189 -287.033 -287.901 -288.343 -289.242 -289.704 -290.169 -290.636 -291.607 -292.121 -292.656 -293.201 -293.766 -294.403 -295.12 -296.681 -6 ,29952 ,KEBNE ,17028187,Wed Dec 22 19:21:39 CET,Wed Dec 22 20:56:05 CET,0.0 0.88 1.03 1.073 1.06 1.017 0.945 0.847 0.618 0.49 0.354 -0.093 -0.075 -0.231 -0.576 -0.937 -1.307 -1.499 -1.894 -2.295 -2.906 -3.31 -3.722 -4.367 -5.014 -5.68 -6.365 -7.057 -7.982 -8.896 -9.815 -10.982 -12.175 -13.379 -14.83 -16.559 -18.308 -20.324 -22.606 -25.144 -27.946 -31.308 -35.497 -39.983 -45.59 -52.361 -60.937 -71.584 -85.463 -104.159 -131.154 -158.806 -178.756 -194.057 -206.115 -216.027 -224.104 -230.973 -236.594 -241.928 -246.29 -250.012 -253.417 -256.507 -259.282 -261.734 -264.195 -266.301 -268.088 -269.908 -271.711 -273.136 -274.58 -276.049 -277.157 -278.287 -279.422 -280.572 -281.743 -282.529 -283.323 -284.523 -285.322 -286.126 -286.536 -287.367 -288.205 -289.063 -289.51 -290.414 -290.883 -291.359 -291.848 -292.853 -293.362 -293.881 -294.432 -295.01 -295.621 -296.331 -297.742 -7 ,29737 ,KEBNE ,17028188,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:58:04 CET,0.0 1.198 1.389 1.457 1.444 1.399 1.339 1.256 1.053 0.936 0.802 0.34 0.353 0.194 -0.147 -0.501 -0.866 -1.05 -1.441 -1.843 -2.432 -2.829 -3.236 -3.838 -4.451 -5.09 -5.734 -6.403 -7.31 -8.204 -9.115 -10.272 -11.44 -12.644 -14.098 -15.801 -17.531 -19.536 -21.821 -24.338 -27.144 -30.534 -34.778 -39.355 -45.037 -51.867 -60.455 -71.096 -84.997 -103.722 -130.712 -158.407 -178.331 -193.584 -205.636 -215.573 -223.652 -230.524 -236.134 -241.462 -245.838 -249.571 -252.993 -256.097 -258.889 -261.35 -263.835 -265.993 -267.802 -269.636 -271.482 -272.951 -274.419 -275.913 -277.05 -278.179 -279.306 -280.451 -281.622 -282.412 -283.208 -284.419 -285.224 -286.031 -286.442 -287.293 -288.155 -289.017 -289.454 -290.351 -290.805 -291.27 -291.74 -292.705 -293.213 -293.746 -294.294 -294.865 -295.501 -296.231 -297.876 -8 ,12186 ,KEBNE ,17028189,Wed Dec 22 19:21:41 CET,Wed Dec 22 20:56:03 CET,0.0 0.924 1.103 1.161 1.126 1.07 0.991 0.901 0.678 0.541 0.398 -0.054 -0.041 -0.198 -0.527 -0.876 -1.245 -1.435 -1.802 -2.164 -2.743 -3.132 -3.528 -4.163 -4.817 -5.465 -6.127 -6.806 -7.719 -8.626 -9.542 -10.704 -11.885 -13.073 -14.52 -16.241 -17.96 -19.946 -22.228 -24.799 -27.645 -31.028 -35.213 -39.733 -45.427 -52.241 -60.749 -71.35 -85.256 -103.94 -130.891 -158.484 -178.392 -193.608 -205.596 -215.492 -223.56 -230.414 -236.008 -241.326 -245.693 -249.427 -252.836 -255.931 -258.706 -261.162 -263.635 -265.764 -267.553 -269.356 -271.169 -272.634 -274.115 -275.618 -276.759 -277.906 -279.068 -280.243 -281.42 -282.2 -282.988 -284.205 -285.019 -285.842 -286.262 -287.104 -287.967 -288.849 -289.291 -290.185 -290.628 -291.082 -291.545 -292.524 -293.045 -293.566 -294.098 -294.656 -295.276 -295.999 -297.835 -9 ,31309 ,KEBNE ,17028190,Wed Dec 22 19:21:39 CET,Wed Dec 22 20:57:33 CET,0.0 2.029 2.22 2.257 2.249 2.208 2.142 2.05 1.805 1.656 1.494 1.012 1.017 0.856 0.514 0.153 -0.221 -0.409 -0.787 -1.165 -1.737 -2.136 -2.546 -3.178 -3.831 -4.483 -5.141 -5.816 -6.735 -7.665 -8.592 -9.767 -10.97 -12.184 -13.656 -15.376 -17.111 -19.124 -21.408 -23.982 -26.845 -30.249 -34.472 -39.022 -44.678 -51.464 -60.048 -70.699 -84.631 -103.375 -130.347 -157.872 -177.71 -192.92 -204.87 -214.743 -222.794 -229.629 -235.216 -240.558 -244.938 -248.649 -252.055 -255.169 -257.966 -260.422 -262.902 -265.062 -266.903 -268.759 -270.596 -272.075 -273.578 -275.094 -276.236 -277.381 -278.539 -279.716 -280.899 -281.689 -282.487 -283.699 -284.524 -285.373 -285.804 -286.673 -287.559 -288.46 -288.918 -289.827 -290.292 -290.757 -291.233 -292.225 -292.74 -293.291 -293.854 -294.432 -295.073 -295.792 -297.268 -10 ,3954 ,KEBNE ,17028191,Wed Dec 22 19:21:41 CET,Wed Dec 22 20:55:33 CET,0.0 1.042 1.318 1.458 1.499 1.484 1.431 1.364 1.188 1.078 0.963 0.55 0.572 0.426 0.11 -0.235 -0.581 -0.757 -1.131 -1.516 -2.108 -2.512 -2.913 -3.527 -4.166 -4.827 -5.477 -6.126 -7.033 -7.951 -8.86 -10.016 -11.195 -12.383 -13.829 -15.537 -17.272 -19.289 -21.554 -24.084 -26.913 -30.275 -34.464 -38.971 -44.607 -51.421 -59.961 -70.517 -84.331 -103.033 -129.999 -157.58 -177.517 -192.801 -204.792 -214.669 -222.771 -229.661 -235.234 -240.539 -244.92 -248.661 -252.084 -255.192 -257.995 -260.471 -262.962 -265.118 -266.928 -268.736 -270.573 -272.069 -273.567 -275.062 -276.197 -277.355 -278.521 -279.688 -280.863 -281.658 -282.462 -283.694 -284.529 -285.37 -285.784 -286.6 -287.447 -288.345 -288.803 -289.717 -290.202 -290.675 -291.159 -292.165 -292.694 -293.248 -293.83 -294.454 -295.132 -295.956 -297.644 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt deleted file mode 100644 index ab3acaad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7807 ,KEBNE ,17077014,Sat Dec 25 09:54:42 CET,Sat Dec 25 11:23:30 CET,0.0 1.763 2.317 2.729 3.082 3.401 3.697 3.967 4.44 4.647 4.844 5.078 5.424 5.599 5.953 6.292 6.628 6.795 7.128 7.45 7.906 8.201 8.474 8.86 9.233 9.589 9.93 10.278 10.736 11.176 11.597 12.104 12.588 13.067 13.674 14.346 14.959 15.633 16.36 17.142 17.988 18.937 20.047 21.195 22.565 24.122 25.944 27.998 30.477 33.581 37.397 40.581 42.488 43.678 44.406 44.846 45.085 45.245 45.329 45.35 45.341 45.303 45.236 45.156 45.072 44.965 44.82 44.663 44.495 44.288 44.053 43.854 43.663 43.492 43.358 43.217 43.057 42.846 42.609 42.447 42.274 42.001 41.799 41.585 41.478 41.265 41.045 40.813 40.68 40.415 40.271 40.123 39.96 39.59 39.366 39.091 38.786 38.423 37.949 37.266 34.955 -2 ,24177 ,KEBNE ,17077015,Sat Dec 25 10:04:05 CET,Sat Dec 25 11:37:49 CET,0.0 2.874 3.532 3.999 4.376 4.686 4.975 5.24 5.705 5.929 6.147 6.384 6.728 6.905 7.251 7.597 7.937 8.101 8.41 8.712 9.159 9.437 9.708 10.119 10.508 10.885 11.259 11.631 12.121 12.569 12.989 13.492 13.968 14.455 15.044 15.691 16.317 17.015 17.765 18.591 19.49 20.476 21.567 22.663 24.002 25.577 27.478 29.582 31.988 34.953 38.685 41.829 43.659 44.836 45.617 46.079 46.354 46.544 46.655 46.708 46.695 46.643 46.551 46.447 46.34 46.235 46.127 46.01 45.873 45.703 45.497 45.301 45.087 44.861 44.68 44.477 44.259 44.038 43.811 43.654 43.487 43.206 43.005 42.8 42.689 42.446 42.194 41.924 41.783 41.511 41.327 41.158 40.969 40.566 40.34 40.081 39.808 39.489 39.068 38.551 37.147 -3 ,15925 ,KEBNE ,17077016,Sat Dec 25 10:06:12 CET,Sat Dec 25 11:39:52 CET,0.0 1.129 1.636 2.015 2.34 2.628 2.898 3.164 3.674 3.92 4.147 4.402 4.757 4.953 5.305 5.653 6.004 6.166 6.482 6.783 7.218 7.506 7.787 8.188 8.552 8.905 9.25 9.576 9.997 10.422 10.844 11.36 11.841 12.313 12.876 13.498 14.097 14.787 15.551 16.385 17.256 18.179 19.254 20.373 21.726 23.256 25.026 27.102 29.626 32.669 36.491 39.716 41.631 42.834 43.608 44.112 44.387 44.521 44.619 44.674 44.65 44.604 44.545 44.461 44.354 44.225 44.054 43.897 43.769 43.638 43.478 43.325 43.156 42.956 42.812 42.658 42.475 42.281 42.083 41.946 41.799 41.565 41.396 41.2 41.094 40.87 40.634 40.383 40.24 39.958 39.743 39.558 39.377 38.971 38.737 38.483 38.201 37.888 37.501 36.984 35.359 -4 ,13845 ,KEBNE ,17077017,Sat Dec 25 10:12:29 CET,Sat Dec 25 11:48:21 CET,0.0 1.327 1.867 2.327 2.715 3.045 3.332 3.592 4.038 4.243 4.452 4.705 5.063 5.254 5.632 6.0 6.351 6.527 6.871 7.185 7.638 7.928 8.204 8.599 8.974 9.346 9.721 10.097 10.564 10.993 11.412 11.944 12.465 12.968 13.536 14.174 14.812 15.515 16.293 17.123 18.011 19.036 20.233 21.457 22.926 24.555 26.384 28.469 31.06 34.127 37.789 40.948 42.878 44.12 44.9 45.376 45.666 45.86 45.963 46.008 46.005 45.963 45.897 45.817 45.725 45.613 45.469 45.324 45.184 45.022 44.82 44.627 44.403 44.165 43.988 43.813 43.622 43.432 43.238 43.094 42.952 42.723 42.553 42.368 42.271 42.048 41.801 41.539 41.393 41.111 40.901 40.708 40.513 40.12 39.894 39.644 39.369 39.048 38.628 38.105 36.415 -5 ,13251 ,KEBNE ,17077018,Sat Dec 25 10:15:40 CET,Sat Dec 25 11:45:06 CET,0.0 2.61 3.243 3.7 4.069 4.396 4.695 4.958 5.422 5.644 5.854 6.106 6.465 6.644 6.983 7.319 7.639 7.79 8.083 8.375 8.806 9.083 9.364 9.78 10.184 10.573 10.937 11.291 11.758 12.204 12.626 13.135 13.637 14.13 14.681 15.294 15.898 16.575 17.336 18.127 18.939 19.858 20.944 22.074 23.42 25.033 26.917 28.972 31.426 34.437 38.207 41.333 43.191 44.412 45.17 45.625 45.937 46.115 46.185 46.144 46.029 45.942 45.844 45.744 45.654 45.562 45.46 45.326 45.19 45.056 44.922 44.8 44.627 44.404 44.231 44.05 43.83 43.598 43.359 43.194 43.028 42.749 42.552 42.349 42.247 42.019 41.767 41.5 41.357 41.079 40.907 40.753 40.576 40.157 39.928 39.692 39.411 39.096 38.715 38.218 36.469 -6 ,885 ,KEBNE ,17077019,Sat Dec 25 10:21:53 CET,Sat Dec 25 11:55:39 CET,0.0 1.146 1.571 1.925 2.254 2.548 2.833 3.101 3.616 3.842 4.05 4.306 4.663 4.865 5.254 5.613 5.954 6.116 6.434 6.739 7.172 7.465 7.747 8.146 8.548 8.947 9.319 9.663 10.108 10.562 11.009 11.535 12.047 12.535 13.102 13.731 14.353 15.049 15.759 16.525 17.369 18.33 19.432 20.562 21.93 23.509 25.333 27.414 29.929 32.933 36.734 39.977 41.907 43.153 43.934 44.456 44.765 44.943 45.035 45.063 45.067 45.022 44.938 44.851 44.736 44.588 44.375 44.162 43.982 43.771 43.531 43.316 43.088 42.852 42.669 42.481 42.275 42.067 41.843 41.667 41.482 41.188 40.982 40.778 40.674 40.44 40.181 39.92 39.787 39.513 39.313 39.141 38.953 38.541 38.327 38.072 37.759 37.412 37.031 36.528 34.423 -7 ,15598 ,KEBNE ,17077020,Sat Dec 25 10:21:53 CET,Sat Dec 25 11:55:55 CET,0.0 1.289 1.698 2.058 2.362 2.639 2.899 3.142 3.629 3.857 4.074 4.328 4.676 4.861 5.213 5.541 5.871 6.041 6.371 6.688 7.158 7.457 7.747 8.164 8.538 8.905 9.271 9.604 10.024 10.444 10.878 11.42 11.933 12.417 12.983 13.63 14.251 14.934 15.675 16.485 17.355 18.324 19.414 20.553 21.99 23.639 25.589 27.778 30.272 33.288 36.993 40.08 41.884 43.065 43.814 44.303 44.563 44.684 44.765 44.759 44.726 44.684 44.591 44.471 44.364 44.266 44.106 43.932 43.796 43.639 43.473 43.334 43.172 42.997 42.869 42.747 42.605 42.444 42.261 42.143 42.017 41.781 41.608 41.422 41.321 41.101 40.861 40.606 40.468 40.198 40.013 39.846 39.679 39.286 39.05 38.79 38.493 38.134 37.702 37.086 34.518 -8 ,32203 ,KEBNE ,17077021,Sat Dec 25 10:21:53 CET,Sat Dec 25 11:55:00 CET,0.0 1.4 1.943 2.332 2.675 2.993 3.285 3.56 4.043 4.261 4.479 4.727 5.088 5.281 5.63 5.962 6.29 6.454 6.77 7.072 7.51 7.795 8.083 8.499 8.862 9.197 9.542 9.892 10.329 10.737 11.152 11.678 12.181 12.657 13.201 13.81 14.398 15.048 15.752 16.529 17.391 18.39 19.554 20.755 22.192 23.793 25.661 27.796 30.279 33.281 37.036 40.129 41.911 43.05 43.781 44.228 44.473 44.623 44.697 44.688 44.634 44.557 44.407 44.238 44.099 43.971 43.821 43.671 43.548 43.415 43.257 43.117 42.964 42.801 42.672 42.522 42.363 42.188 41.968 41.823 41.694 41.489 41.331 41.147 41.042 40.805 40.536 40.252 40.101 39.821 39.629 39.455 39.263 38.81 38.552 38.266 37.929 37.551 37.108 36.523 34.865 -9 ,4068 ,KEBNE ,17077022,Sat Dec 25 10:22:55 CET,Sat Dec 25 11:56:33 CET,0.0 1.436 1.942 2.343 2.711 3.032 3.315 3.571 4.061 4.291 4.509 4.756 5.111 5.307 5.683 6.063 6.431 6.595 6.897 7.204 7.627 7.876 8.123 8.481 8.834 9.217 9.587 9.923 10.37 10.794 11.207 11.735 12.245 12.732 13.284 13.895 14.485 15.131 15.858 16.662 17.482 18.406 19.522 20.745 22.344 24.102 25.978 28.086 30.599 33.596 37.371 40.613 42.493 43.681 44.469 44.999 45.303 45.431 45.469 45.419 45.316 45.187 45.035 44.873 44.701 44.505 44.293 44.143 44.004 43.81 43.579 43.39 43.167 42.923 42.751 42.581 42.405 42.226 42.025 41.88 41.731 41.473 41.282 41.074 40.964 40.735 40.494 40.25 40.124 39.871 39.716 39.556 39.391 39.002 38.771 38.533 38.284 37.987 37.624 37.128 35.554 -10 ,15354 ,KEBNE ,17077023,Sat Dec 25 10:22:55 CET,Sat Dec 25 11:56:18 CET,0.0 1.422 1.947 2.348 2.688 2.985 3.264 3.536 4.032 4.247 4.439 4.652 4.992 5.171 5.522 5.846 6.143 6.293 6.593 6.889 7.309 7.569 7.812 8.163 8.515 8.873 9.243 9.591 10.025 10.448 10.844 11.342 11.855 12.335 12.887 13.492 14.072 14.772 15.535 16.333 17.187 18.16 19.328 20.506 21.872 23.392 25.177 27.269 29.79 32.837 36.612 39.71 41.542 42.728 43.461 43.947 44.257 44.461 44.574 44.591 44.554 44.498 44.404 44.302 44.217 44.131 44.03 43.913 43.761 43.599 43.442 43.29 43.086 42.847 42.653 42.447 42.232 42.006 41.751 41.563 41.386 41.093 40.871 40.643 40.525 40.276 40.028 39.758 39.617 39.354 39.169 38.999 38.804 38.398 38.189 37.942 37.659 37.344 36.958 36.46 34.792 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt deleted file mode 100644 index 5eaf79e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32282 ,KEBNE ,16749205,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:35:03 CET,0.0 2.319 3.048 3.611 4.108 4.547 4.944 5.311 5.978 6.303 6.629 7.069 7.507 7.779 8.316 8.824 9.314 9.557 10.034 10.495 11.152 11.577 12.003 12.628 13.233 13.825 14.396 14.95 15.686 16.413 17.124 18.012 18.854 19.661 20.641 21.751 22.811 24.034 25.428 26.93 28.529 30.373 32.569 34.798 37.483 40.659 44.489 48.959 54.522 61.546 70.829 79.434 84.955 88.796 91.576 93.659 95.234 96.444 97.372 98.207 98.769 99.152 99.434 99.669 99.858 100.024 100.192 100.268 100.279 100.296 100.314 100.301 100.263 100.21 100.159 100.089 100.012 99.914 99.789 99.692 99.572 99.369 99.228 99.092 99.01 98.794 98.567 98.337 98.211 98.017 97.751 97.561 97.356 96.887 96.634 96.367 95.997 95.536 95.012 94.208 91.833 -2 ,20753 ,KEBNE ,16749206,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:33:00 CET,0.0 2.977 3.861 4.495 4.985 5.411 5.81 6.187 6.885 7.22 7.543 8.005 8.458 8.74 9.285 9.82 10.322 10.561 11.039 11.498 12.176 12.622 13.053 13.681 14.286 14.867 15.431 15.991 16.718 17.427 18.127 19.003 19.877 20.716 21.675 22.775 23.877 25.111 26.466 27.929 29.499 31.329 33.546 35.833 38.542 41.666 45.459 50.008 55.669 62.847 72.285 80.851 86.334 90.158 92.985 95.142 96.731 97.983 98.9 99.708 100.302 100.706 101.048 101.346 101.54 101.663 101.782 101.873 101.918 101.926 101.927 101.897 101.846 101.782 101.72 101.647 101.547 101.443 101.321 101.222 101.108 100.903 100.741 100.581 100.499 100.312 100.094 99.86 99.737 99.541 99.275 99.096 98.911 98.466 98.196 97.898 97.547 97.121 96.578 95.77 92.589 -3 ,25218 ,KEBNE ,16749207,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:33:54 CET,0.0 2.714 3.449 4.013 4.493 4.925 5.326 5.699 6.364 6.689 7.011 7.45 7.888 8.16 8.693 9.185 9.663 9.899 10.364 10.817 11.466 11.892 12.31 12.908 13.497 14.074 14.629 15.189 15.915 16.608 17.313 18.194 19.04 19.865 20.839 21.982 23.107 24.333 25.692 27.194 28.779 30.581 32.783 35.06 37.765 40.953 44.761 49.191 54.73 61.816 71.185 79.869 85.419 89.268 92.158 94.364 96.002 97.199 98.062 98.878 99.523 99.946 100.256 100.52 100.693 100.821 100.947 101.03 101.062 101.064 101.048 101.02 100.989 100.932 100.871 100.801 100.706 100.606 100.498 100.396 100.278 100.093 99.959 99.81 99.723 99.521 99.292 99.051 98.922 98.72 98.457 98.278 98.074 97.603 97.354 97.077 96.73 96.289 95.738 95.004 92.639 -4 ,9787 ,KEBNE ,16749208,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:32:46 CET,0.0 2.22 2.968 3.596 4.108 4.536 4.93 5.304 6.01 6.345 6.653 7.061 7.49 7.751 8.265 8.766 9.248 9.478 9.924 10.359 11.001 11.433 11.85 12.462 13.064 13.642 14.206 14.753 15.454 16.16 16.859 17.7 18.526 19.349 20.318 21.429 22.533 23.717 25.028 26.501 28.079 29.909 32.124 34.407 37.128 40.268 44.012 48.459 54.037 61.085 70.257 78.745 84.292 88.138 90.934 92.955 94.462 95.719 96.706 97.593 98.197 98.624 98.945 99.18 99.388 99.571 99.747 99.855 99.89 99.895 99.878 99.841 99.812 99.78 99.731 99.661 99.553 99.435 99.309 99.209 99.101 98.9 98.751 98.589 98.489 98.267 98.038 97.808 97.678 97.475 97.227 97.06 96.865 96.394 96.116 95.804 95.439 94.999 94.494 93.787 91.073 -5 ,22734 ,KEBNE ,16749209,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:37:46 CET,0.0 1.854 2.608 3.2 3.693 4.126 4.531 4.913 5.604 5.927 6.239 6.663 7.098 7.367 7.875 8.368 8.84 9.074 9.548 10.027 10.701 11.111 11.514 12.13 12.723 13.287 13.844 14.385 15.09 15.786 16.474 17.317 18.138 18.957 19.934 21.048 22.169 23.423 24.764 26.228 27.793 29.602 31.783 34.062 36.814 39.942 43.7 48.193 53.751 60.668 69.861 78.45 83.896 87.676 90.472 92.626 94.207 95.354 96.202 96.968 97.604 98.124 98.465 98.684 98.855 98.968 99.033 99.065 99.07 99.049 99.028 99.004 98.945 98.874 98.833 98.771 98.684 98.594 98.467 98.359 98.239 98.024 97.86 97.691 97.6 97.398 97.159 96.885 96.745 96.551 96.289 96.1 95.904 95.474 95.22 94.928 94.588 94.176 93.686 92.932 90.386 -6 ,26605 ,KEBNE ,16749210,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:33:22 CET,0.0 2.074 2.73 3.264 3.715 4.14 4.548 4.925 5.618 5.937 6.252 6.705 7.163 7.454 7.995 8.519 9.024 9.262 9.73 10.185 10.845 11.286 11.718 12.356 12.968 13.548 14.124 14.705 15.464 16.18 16.862 17.712 18.564 19.398 20.384 21.511 22.586 23.77 25.091 26.541 28.113 29.916 32.092 34.41 37.192 40.391 44.21 48.716 54.312 61.424 70.899 79.546 85.152 89.069 91.842 93.954 95.57 96.844 97.784 98.564 99.093 99.51 99.889 100.169 100.375 100.498 100.551 100.585 100.608 100.632 100.633 100.613 100.582 100.508 100.435 100.363 100.293 100.216 100.106 100.012 99.905 99.737 99.62 99.474 99.388 99.206 99.007 98.767 98.63 98.426 98.139 97.952 97.739 97.22 96.95 96.678 96.372 95.972 95.405 94.63 91.893 -7 ,29372 ,KEBNE ,16749211,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:37:30 CET,0.0 1.712 2.426 2.967 3.435 3.879 4.283 4.648 5.349 5.68 5.993 6.423 6.865 7.137 7.64 8.115 8.579 8.814 9.29 9.764 10.408 10.821 11.243 11.853 12.443 13.006 13.555 14.112 14.861 15.598 16.312 17.171 18.02 18.853 19.813 20.907 21.973 23.15 24.466 25.916 27.491 29.347 31.59 33.865 36.585 39.727 43.478 47.972 53.55 60.482 69.795 78.436 84.036 87.92 90.568 92.61 94.201 95.375 96.253 97.074 97.691 98.154 98.536 98.837 99.085 99.249 99.338 99.379 99.403 99.431 99.453 99.452 99.419 99.352 99.279 99.2 99.112 98.992 98.849 98.741 98.626 98.441 98.303 98.146 98.056 97.863 97.648 97.381 97.242 97.054 96.817 96.649 96.45 95.998 95.73 95.422 95.069 94.634 94.09 93.368 90.76 -8 ,22386 ,KEBNE ,16749212,Wed Dec 1 07:59:09 CET,Wed Dec 1 09:35:59 CET,0.0 3.155 3.963 4.544 5.034 5.487 5.904 6.284 6.963 7.279 7.575 7.982 8.431 8.712 9.235 9.732 10.2 10.421 10.882 11.338 11.987 12.404 12.807 13.415 14.013 14.601 15.168 15.698 16.409 17.12 17.81 18.659 19.491 20.311 21.273 22.387 23.489 24.688 25.999 27.452 29.032 30.878 33.118 35.479 38.288 41.456 45.244 49.709 55.22 62.168 71.439 80.059 85.641 89.547 92.372 94.459 95.997 97.154 97.964 98.659 99.195 99.618 99.983 100.267 100.478 100.605 100.688 100.753 100.78 100.761 100.705 100.655 100.599 100.515 100.442 100.374 100.301 100.197 100.054 99.934 99.801 99.608 99.465 99.307 99.235 99.061 98.85 98.625 98.501 98.309 98.062 97.887 97.682 97.195 96.919 96.609 96.266 95.877 95.379 94.65 91.653 -9 ,2049 ,KEBNE ,16749213,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:35:01 CET,0.0 2.171 2.939 3.525 4.007 4.424 4.812 5.187 5.9 6.233 6.547 6.971 7.407 7.685 8.234 8.754 9.237 9.471 9.937 10.407 11.097 11.537 11.96 12.567 13.165 13.75 14.328 14.895 15.618 16.334 17.044 17.902 18.725 19.527 20.481 21.59 22.675 23.877 25.192 26.631 28.183 29.957 32.071 34.281 36.994 40.192 44.062 48.64 54.225 61.21 70.531 79.063 84.674 88.587 91.405 93.648 95.315 96.558 97.458 98.193 98.707 99.157 99.535 99.761 99.924 100.084 100.23 100.328 100.395 100.425 100.409 100.371 100.332 100.284 100.232 100.158 100.045 99.913 99.77 99.657 99.538 99.347 99.2 99.044 98.962 98.809 98.634 98.416 98.292 98.094 97.835 97.655 97.468 97.028 96.764 96.474 96.145 95.741 95.215 94.466 92.033 -10 ,23575 ,KEBNE ,16749214,Wed Dec 1 07:59:09 CET,Wed Dec 1 09:33:06 CET,0.0 1.543 2.257 2.835 3.337 3.77 4.176 4.559 5.237 5.548 5.86 6.313 6.757 7.032 7.552 8.044 8.541 8.776 9.219 9.662 10.331 10.771 11.19 11.798 12.405 13.005 13.582 14.13 14.859 15.576 16.256 17.098 17.931 18.756 19.738 20.883 22.012 23.251 24.588 26.032 27.596 29.388 31.547 33.794 36.464 39.6 43.451 47.994 53.658 60.746 70.049 78.726 84.371 88.259 91.09 93.3 94.871 96.028 96.955 97.811 98.435 98.901 99.309 99.664 99.95 100.192 100.408 100.567 100.686 100.782 100.806 100.775 100.719 100.639 100.57 100.492 100.411 100.314 100.202 100.118 100.027 99.875 99.751 99.618 99.546 99.372 99.178 98.971 98.851 98.664 98.442 98.292 98.129 97.731 97.503 97.237 96.917 96.518 96.045 95.433 92.412 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt deleted file mode 100644 index 7298a76a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22181 ,KEBNE ,16749215,Wed Dec 1 07:59:10 CET,Wed Dec 1 09:38:11 CET,0.0 1.118 1.506 1.824 2.085 2.33 2.566 2.774 3.151 3.337 3.515 3.672 3.991 4.141 4.422 4.687 4.956 5.088 5.342 5.599 5.971 6.2 6.421 6.745 7.061 7.36 7.64 7.915 8.279 8.624 8.949 9.328 9.688 10.052 10.486 10.962 11.41 11.898 12.423 12.967 13.551 14.187 14.881 15.627 16.539 17.489 18.459 19.454 20.56 21.781 23.03 23.69 23.74 23.518 23.146 22.76 22.439 22.068 21.662 21.234 20.88 20.555 20.221 19.902 19.601 19.314 18.996 18.695 18.429 18.139 17.823 17.551 17.267 16.98 16.759 16.524 16.262 15.99 15.713 15.514 15.308 14.991 14.761 14.518 14.397 14.135 13.841 13.522 13.359 13.044 12.839 12.653 12.468 12.048 11.814 11.553 11.242 10.928 10.576 10.064 8.094 -2 ,17445 ,KEBNE ,16749216,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:33:57 CET,0.0 0.832 1.188 1.498 1.802 2.056 2.275 2.48 2.876 3.067 3.245 3.407 3.724 3.872 4.148 4.41 4.672 4.8 5.045 5.28 5.615 5.838 6.055 6.373 6.697 7.005 7.286 7.548 7.898 8.243 8.564 8.954 9.347 9.72 10.144 10.619 11.07 11.555 12.085 12.654 13.234 13.878 14.592 15.272 16.067 16.977 17.962 19.0 20.166 21.405 22.675 23.442 23.7 23.659 23.415 23.062 22.681 22.317 21.958 21.556 21.195 20.832 20.47 20.119 19.785 19.487 19.175 18.886 18.614 18.321 18.023 17.77 17.485 17.177 16.948 16.718 16.474 16.231 15.979 15.796 15.605 15.301 15.079 14.852 14.74 14.501 14.229 13.921 13.76 13.452 13.262 13.071 12.874 12.456 12.236 11.992 11.697 11.354 10.92 10.29 8.33 -3 ,27900 ,KEBNE ,16749217,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:35:32 CET,0.0 1.051 1.506 1.849 2.13 2.399 2.644 2.861 3.263 3.46 3.656 3.86 4.187 4.358 4.666 4.944 5.224 5.362 5.627 5.871 6.232 6.466 6.693 7.02 7.325 7.629 7.921 8.194 8.553 8.905 9.24 9.638 10.031 10.407 10.832 11.307 11.756 12.23 12.724 13.251 13.801 14.424 15.14 15.833 16.66 17.592 18.579 19.599 20.712 21.923 23.101 23.758 23.924 23.785 23.533 23.277 22.987 22.601 22.223 21.818 21.433 21.078 20.74 20.394 20.051 19.721 19.379 19.078 18.806 18.517 18.209 17.969 17.711 17.407 17.163 16.917 16.667 16.407 16.131 15.929 15.714 15.374 15.136 14.895 14.773 14.521 14.251 13.962 13.806 13.49 13.276 13.083 12.886 12.454 12.23 11.997 11.719 11.387 10.963 10.422 8.51 -4 ,19231 ,KEBNE ,16749218,Wed Dec 1 07:59:11 CET,Wed Dec 1 09:33:57 CET,0.0 1.524 1.945 2.242 2.492 2.727 2.962 3.193 3.587 3.754 3.907 4.044 4.356 4.5 4.759 5.004 5.234 5.346 5.573 5.799 6.133 6.345 6.55 6.834 7.105 7.388 7.66 7.927 8.274 8.589 8.893 9.248 9.57 9.885 10.26 10.691 11.104 11.552 12.037 12.557 13.109 13.709 14.384 15.06 15.87 16.749 17.696 18.708 19.832 21.08 22.366 23.082 23.199 23.033 22.786 22.449 22.061 21.693 21.344 20.941 20.592 20.281 19.928 19.573 19.251 18.957 18.636 18.329 18.052 17.76 17.466 17.225 16.993 16.737 16.507 16.267 16.018 15.742 15.45 15.252 15.034 14.685 14.452 14.219 14.104 13.87 13.591 13.274 13.121 12.822 12.638 12.452 12.255 11.845 11.618 11.366 11.081 10.768 10.391 9.886 7.791 -5 ,27602 ,KEBNE ,16749219,Wed Dec 1 08:00:15 CET,Wed Dec 1 09:35:19 CET,0.0 1.496 2.009 2.401 2.732 3.022 3.28 3.504 3.926 4.141 4.353 4.556 4.886 5.047 5.348 5.65 5.944 6.089 6.367 6.625 7.006 7.242 7.457 7.745 8.027 8.306 8.566 8.814 9.135 9.431 9.71 10.05 10.386 10.709 11.09 11.532 11.954 12.417 12.9 13.424 13.986 14.575 15.24 15.925 16.734 17.597 18.526 19.549 20.736 22.024 23.177 23.714 23.801 23.656 23.365 22.997 22.594 22.174 21.806 21.426 21.068 20.704 20.346 19.998 19.636 19.298 18.958 18.657 18.394 18.091 17.745 17.474 17.21 16.938 16.728 16.514 16.291 16.047 15.789 15.609 15.418 15.117 14.897 14.672 14.558 14.312 14.046 13.754 13.601 13.297 13.098 12.912 12.728 12.328 12.085 11.831 11.557 11.191 10.76 10.229 8.491 -6 ,9151 ,KEBNE ,16749220,Wed Dec 1 08:00:12 CET,Wed Dec 1 09:38:43 CET,0.0 1.755 2.238 2.572 2.855 3.096 3.319 3.528 3.912 4.08 4.243 4.395 4.706 4.85 5.121 5.375 5.61 5.725 5.958 6.184 6.491 6.684 6.883 7.176 7.462 7.752 8.04 8.319 8.681 9.022 9.346 9.731 10.113 10.488 10.909 11.386 11.851 12.34 12.843 13.414 14.035 14.694 15.451 16.203 17.035 17.917 18.879 19.902 21.04 22.295 23.509 24.144 24.26 24.104 23.817 23.51 23.191 22.815 22.431 22.023 21.663 21.302 20.94 20.601 20.272 19.967 19.653 19.368 19.107 18.838 18.547 18.284 18.0 17.707 17.488 17.255 17.011 16.749 16.467 16.269 16.059 15.736 15.513 15.271 15.144 14.891 14.622 14.34 14.184 13.877 13.698 13.491 13.278 12.86 12.624 12.367 12.08 11.737 11.359 10.813 9.095 -7 ,14341 ,KEBNE ,16749221,Wed Dec 1 08:00:12 CET,Wed Dec 1 09:35:35 CET,0.0 0.862 1.318 1.684 2.009 2.292 2.556 2.785 3.235 3.448 3.635 3.821 4.148 4.317 4.636 4.942 5.23 5.364 5.619 5.853 6.187 6.412 6.637 6.954 7.256 7.558 7.843 8.109 8.441 8.774 9.105 9.503 9.891 10.26 10.67 11.114 11.551 12.021 12.517 13.032 13.569 14.165 14.853 15.54 16.37 17.331 18.364 19.442 20.622 21.929 23.316 24.094 24.231 24.142 23.873 23.51 23.141 22.751 22.401 22.047 21.708 21.361 21.01 20.665 20.333 20.028 19.717 19.453 19.206 18.918 18.609 18.336 18.035 17.731 17.5 17.264 17.019 16.754 16.478 16.286 16.076 15.735 15.497 15.236 15.097 14.813 14.514 14.206 14.046 13.737 13.533 13.33 13.128 12.711 12.455 12.155 11.817 11.43 10.98 10.394 8.484 -8 ,11887 ,KEBNE ,16749222,Wed Dec 1 08:00:15 CET,Wed Dec 1 09:34:48 CET,0.0 1.076 1.413 1.676 1.931 2.152 2.346 2.54 2.899 3.062 3.226 3.386 3.701 3.847 4.135 4.406 4.664 4.789 5.031 5.258 5.593 5.822 6.042 6.347 6.643 6.933 7.217 7.507 7.88 8.235 8.581 8.994 9.391 9.762 10.184 10.678 11.155 11.662 12.217 12.789 13.385 14.053 14.811 15.555 16.396 17.288 18.33 19.503 20.746 22.056 23.409 24.094 24.154 24.019 23.774 23.44 23.112 22.723 22.312 21.903 21.505 21.115 20.745 20.398 20.076 19.782 19.45 19.143 18.883 18.596 18.291 18.032 17.757 17.48 17.26 17.033 16.802 16.548 16.273 16.083 15.885 15.568 15.342 15.111 14.992 14.742 14.471 14.173 14.016 13.708 13.521 13.337 13.144 12.721 12.487 12.247 11.984 11.663 11.253 10.684 8.928 -9 ,10992 ,KEBNE ,16749223,Wed Dec 1 08:00:14 CET,Wed Dec 1 09:34:46 CET,0.0 1.697 2.076 2.389 2.683 2.943 3.185 3.424 3.863 4.052 4.223 4.401 4.721 4.874 5.178 5.464 5.725 5.843 6.077 6.308 6.638 6.855 7.068 7.363 7.642 7.917 8.179 8.436 8.777 9.097 9.399 9.777 10.14 10.488 10.901 11.368 11.835 12.345 12.863 13.419 14.013 14.658 15.415 16.171 16.998 17.881 18.878 19.947 21.118 22.452 23.828 24.617 24.816 24.761 24.556 24.281 23.975 23.644 23.305 22.907 22.543 22.206 21.882 21.547 21.214 20.901 20.57 20.27 20.005 19.738 19.463 19.225 18.967 18.703 18.511 18.31 18.091 17.853 17.598 17.419 17.222 16.902 16.685 16.457 16.328 16.058 15.776 15.468 15.308 15.006 14.832 14.649 14.458 14.058 13.834 13.586 13.308 12.983 12.596 12.088 10.275 -10 ,7202 ,KEBNE ,16749224,Wed Dec 1 08:00:15 CET,Wed Dec 1 09:39:08 CET,0.0 0.851 1.214 1.512 1.769 2.001 2.228 2.441 2.806 2.976 3.142 3.297 3.608 3.75 4.03 4.3 4.55 4.676 4.937 5.196 5.57 5.816 6.041 6.345 6.634 6.911 7.185 7.448 7.773 8.088 8.392 8.763 9.135 9.477 9.851 10.277 10.693 11.141 11.637 12.177 12.753 13.402 14.143 14.863 15.652 16.504 17.435 18.448 19.635 20.904 22.133 22.762 22.798 22.613 22.295 21.876 21.46 21.074 20.683 20.253 19.88 19.522 19.184 18.838 18.506 18.209 17.874 17.562 17.273 16.951 16.627 16.372 16.099 15.807 15.578 15.337 15.094 14.839 14.574 14.402 14.211 13.894 13.685 13.464 13.343 13.097 12.848 12.572 12.406 12.077 11.845 11.632 11.399 10.939 10.679 10.368 10.038 9.66 9.186 8.563 6.484 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt deleted file mode 100644 index f1fefaf1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22758 ,KEBNE ,16749225,Wed Dec 1 08:01:20 CET,Wed Dec 1 09:39:18 CET,0.0 1.13 1.426 1.627 1.774 1.909 2.036 2.14 2.293 2.353 2.404 2.336 2.536 2.567 2.627 2.679 2.721 2.733 2.737 2.737 2.732 2.719 2.694 2.65 2.597 2.536 2.466 2.386 2.268 2.143 2.006 1.82 1.634 1.442 1.193 0.848 0.487 0.065 -0.445 -1.033 -1.728 -2.591 -3.672 -4.841 -6.314 -8.114 -10.388 -13.349 -17.411 -23.019 -31.516 -40.58 -47.341 -52.66 -56.921 -60.524 -63.501 -66.042 -68.146 -70.18 -71.901 -73.407 -74.82 -76.112 -77.269 -78.294 -79.329 -80.234 -80.996 -81.779 -82.558 -83.17 -83.799 -84.448 -84.959 -85.479 -86.0 -86.531 -87.065 -87.429 -87.802 -88.371 -88.763 -89.169 -89.382 -89.818 -90.261 -90.73 -90.977 -91.478 -91.718 -91.977 -92.241 -92.803 -93.095 -93.393 -93.713 -94.078 -94.521 -95.06 -96.385 -2 ,11621 ,KEBNE ,16749226,Wed Dec 1 08:14:00 CET,Wed Dec 1 09:49:49 CET,0.0 0.976 1.222 1.424 1.589 1.71 1.818 1.905 2.044 2.115 2.187 2.126 2.332 2.37 2.421 2.451 2.464 2.471 2.481 2.488 2.495 2.483 2.464 2.423 2.369 2.308 2.238 2.164 2.051 1.921 1.783 1.621 1.46 1.271 1.021 0.709 0.353 -0.087 -0.592 -1.178 -1.857 -2.714 -3.792 -4.956 -6.472 -8.286 -10.611 -13.643 -17.711 -23.393 -31.942 -41.064 -47.834 -53.147 -57.408 -60.965 -63.908 -66.485 -68.639 -70.692 -72.393 -73.854 -75.218 -76.487 -77.638 -78.682 -79.75 -80.66 -81.426 -82.212 -83.014 -83.66 -84.314 -85.002 -85.539 -86.08 -86.632 -87.194 -87.771 -88.156 -88.546 -89.168 -89.591 -90.021 -90.24 -90.69 -91.163 -91.639 -91.877 -92.383 -92.681 -92.966 -93.261 -93.882 -94.214 -94.569 -94.957 -95.399 -95.886 -96.462 -97.863 -3 ,19913 ,KEBNE ,16749227,Wed Dec 1 08:14:00 CET,Wed Dec 1 09:49:11 CET,0.0 0.809 1.102 1.294 1.441 1.553 1.645 1.731 1.883 1.954 2.013 1.935 2.13 2.16 2.213 2.264 2.325 2.35 2.37 2.388 2.42 2.428 2.423 2.395 2.355 2.298 2.212 2.116 1.993 1.865 1.722 1.535 1.347 1.15 0.889 0.558 0.217 -0.206 -0.684 -1.212 -1.851 -2.67 -3.708 -4.853 -6.319 -8.12 -10.505 -13.557 -17.663 -23.363 -31.868 -40.88 -47.594 -52.908 -57.199 -60.784 -63.737 -66.257 -68.358 -70.411 -72.126 -73.634 -75.043 -76.303 -77.413 -78.402 -79.422 -80.323 -81.089 -81.869 -82.677 -83.344 -84.009 -84.695 -85.219 -85.737 -86.262 -86.791 -87.316 -87.671 -88.032 -88.586 -88.973 -89.361 -89.555 -89.956 -90.365 -90.787 -91.006 -91.49 -91.711 -91.959 -92.216 -92.78 -93.08 -93.396 -93.754 -94.135 -94.586 -95.209 -96.949 -4 ,1377 ,KEBNE ,16749228,Wed Dec 1 08:14:00 CET,Wed Dec 1 09:48:11 CET,0.0 2.738 3.135 3.382 3.555 3.692 3.801 3.886 4.026 4.087 4.136 4.047 4.245 4.27 4.295 4.318 4.338 4.343 4.34 4.319 4.269 4.237 4.206 4.149 4.082 4.003 3.911 3.814 3.665 3.527 3.409 3.226 3.028 2.84 2.588 2.261 1.914 1.494 1.015 0.466 -0.186 -1.012 -2.07 -3.252 -4.745 -6.538 -8.847 -11.863 -15.936 -21.567 -30.072 -39.07 -45.786 -51.124 -55.427 -59.057 -62.03 -64.559 -66.668 -68.72 -70.446 -71.932 -73.292 -74.536 -75.653 -76.636 -77.627 -78.519 -79.301 -80.105 -80.936 -81.615 -82.302 -82.999 -83.528 -84.074 -84.627 -85.173 -85.719 -86.093 -86.487 -87.088 -87.489 -87.901 -88.11 -88.554 -89.016 -89.472 -89.709 -90.205 -90.44 -90.698 -90.966 -91.535 -91.827 -92.136 -92.465 -92.833 -93.253 -93.725 -94.883 -5 ,29559 ,KEBNE ,16749229,Wed Dec 1 08:14:00 CET,Wed Dec 1 09:47:52 CET,0.0 1.059 1.311 1.502 1.654 1.767 1.875 1.968 2.11 2.168 2.215 2.128 2.324 2.358 2.421 2.478 2.51 2.521 2.539 2.54 2.526 2.499 2.463 2.424 2.372 2.305 2.252 2.194 2.089 1.967 1.835 1.67 1.488 1.299 1.074 0.762 0.417 -0.011 -0.516 -1.082 -1.748 -2.562 -3.586 -4.739 -6.23 -8.088 -10.474 -13.49 -17.575 -23.206 -31.711 -40.842 -47.614 -52.918 -57.179 -60.789 -63.804 -66.38 -68.508 -70.572 -72.288 -73.772 -75.154 -76.419 -77.559 -78.582 -79.613 -80.494 -81.227 -81.979 -82.757 -83.412 -84.089 -84.775 -85.317 -85.866 -86.41 -86.97 -87.541 -87.918 -88.305 -88.889 -89.277 -89.683 -89.898 -90.344 -90.805 -91.272 -91.503 -92.005 -92.242 -92.493 -92.754 -93.324 -93.631 -93.954 -94.285 -94.634 -95.038 -95.52 -96.791 -6 ,28675 ,KEBNE ,16749230,Wed Dec 1 08:14:00 CET,Wed Dec 1 09:49:58 CET,0.0 2.017 2.439 2.705 2.897 3.047 3.165 3.248 3.382 3.446 3.5 3.408 3.6 3.62 3.658 3.695 3.714 3.713 3.703 3.7 3.678 3.649 3.625 3.574 3.495 3.406 3.309 3.213 3.087 2.961 2.823 2.643 2.474 2.276 1.996 1.652 1.29 0.877 0.405 -0.157 -0.813 -1.623 -2.64 -3.762 -5.228 -7.077 -9.47 -12.519 -16.614 -22.214 -30.601 -39.632 -46.377 -51.672 -55.922 -59.461 -62.388 -64.926 -67.079 -69.183 -70.905 -72.369 -73.719 -74.944 -76.065 -77.094 -78.136 -79.04 -79.812 -80.603 -81.408 -82.055 -82.715 -83.389 -83.898 -84.404 -84.901 -85.408 -85.944 -86.315 -86.683 -87.245 -87.631 -88.026 -88.225 -88.634 -89.061 -89.5 -89.724 -90.207 -90.424 -90.667 -90.918 -91.473 -91.771 -92.089 -92.44 -92.826 -93.267 -93.858 -95.906 -7 ,21678 ,KEBNE ,16749231,Wed Dec 1 08:14:00 CET,Wed Dec 1 09:47:44 CET,0.0 1.063 1.379 1.597 1.73 1.853 1.949 2.026 2.176 2.238 2.289 2.218 2.413 2.441 2.501 2.555 2.596 2.609 2.605 2.599 2.589 2.565 2.538 2.504 2.472 2.423 2.348 2.257 2.146 2.048 1.934 1.759 1.564 1.365 1.089 0.744 0.403 -0.008 -0.5 -1.088 -1.747 -2.523 -3.541 -4.691 -6.134 -7.918 -10.267 -13.234 -17.226 -22.842 -31.309 -40.36 -47.084 -52.378 -56.646 -60.211 -63.177 -65.728 -67.851 -69.926 -71.656 -73.145 -74.535 -75.828 -76.99 -78.004 -79.035 -79.949 -80.714 -81.49 -82.289 -82.944 -83.613 -84.291 -84.815 -85.346 -85.889 -86.452 -87.021 -87.409 -87.807 -88.413 -88.835 -89.266 -89.481 -89.926 -90.378 -90.855 -91.107 -91.619 -91.903 -92.181 -92.462 -93.075 -93.411 -93.753 -94.103 -94.512 -94.989 -95.572 -96.817 -8 ,24628 ,KEBNE ,16749232,Wed Dec 1 08:14:00 CET,Wed Dec 1 09:47:31 CET,0.0 2.669 3.061 3.299 3.476 3.617 3.732 3.812 3.944 4.002 4.052 3.97 4.164 4.188 4.21 4.227 4.244 4.247 4.239 4.22 4.193 4.178 4.152 4.104 4.055 4.001 3.927 3.83 3.704 3.572 3.442 3.26 3.051 2.835 2.57 2.245 1.876 1.439 0.959 0.397 -0.278 -1.094 -2.099 -3.195 -4.631 -6.455 -8.811 -11.805 -15.887 -21.577 -30.042 -39.046 -45.736 -51.027 -55.318 -58.89 -61.811 -64.349 -66.468 -68.5 -70.207 -71.704 -73.104 -74.376 -75.508 -76.543 -77.597 -78.493 -79.253 -80.033 -80.826 -81.469 -82.117 -82.78 -83.292 -83.817 -84.364 -84.917 -85.47 -85.843 -86.226 -86.815 -87.219 -87.641 -87.854 -88.276 -88.72 -89.191 -89.43 -89.929 -90.176 -90.433 -90.695 -91.257 -91.555 -91.857 -92.192 -92.573 -92.979 -93.468 -94.811 -9 ,12916 ,KEBNE ,16749233,Wed Dec 1 08:14:04 CET,Wed Dec 1 09:46:43 CET,0.0 0.909 1.268 1.489 1.666 1.812 1.943 2.069 2.271 2.354 2.435 2.412 2.623 2.666 2.757 2.83 2.88 2.902 2.934 2.964 2.984 2.98 2.972 2.953 2.91 2.854 2.795 2.731 2.63 2.52 2.388 2.19 1.978 1.768 1.509 1.193 0.855 0.424 -0.071 -0.622 -1.258 -2.044 -3.041 -4.161 -5.622 -7.458 -9.833 -12.825 -16.891 -22.654 -31.274 -40.392 -47.192 -52.509 -56.756 -60.345 -63.392 -66.002 -68.111 -70.172 -71.893 -73.364 -74.719 -75.947 -77.064 -78.069 -79.11 -80.007 -80.763 -81.548 -82.332 -82.971 -83.641 -84.326 -84.84 -85.357 -85.891 -86.444 -87.01 -87.391 -87.775 -88.363 -88.76 -89.165 -89.371 -89.81 -90.271 -90.736 -90.973 -91.47 -91.7 -91.962 -92.235 -92.777 -93.074 -93.4 -93.735 -94.106 -94.508 -94.977 -96.162 -10 ,15703 ,KEBNE ,16749234,Wed Dec 1 08:14:00 CET,Wed Dec 1 09:48:58 CET,0.0 4.308 4.703 4.962 5.149 5.293 5.412 5.501 5.633 5.682 5.727 5.632 5.83 5.859 5.904 5.944 5.97 5.98 5.991 6.001 6.009 6.005 5.992 5.965 5.929 5.881 5.825 5.761 5.655 5.536 5.402 5.204 4.985 4.755 4.477 4.164 3.845 3.451 2.971 2.39 1.738 0.931 -0.12 -1.26 -2.753 -4.605 -6.956 -9.994 -14.102 -19.71 -28.195 -37.329 -44.034 -49.287 -53.502 -57.064 -60.022 -62.609 -64.776 -66.839 -68.531 -69.996 -71.375 -72.65 -73.812 -74.836 -75.852 -76.737 -77.515 -78.323 -79.148 -79.809 -80.465 -81.148 -81.687 -82.239 -82.798 -83.357 -83.926 -84.311 -84.703 -85.321 -85.741 -86.159 -86.369 -86.8 -87.241 -87.703 -87.943 -88.436 -88.662 -88.914 -89.178 -89.744 -90.035 -90.345 -90.686 -91.045 -91.435 -91.881 -93.121 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt deleted file mode 100644 index 34fd6abe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24718 ,KEBNE ,16749235,Wed Dec 1 08:14:00 CET,Wed Dec 1 09:49:57 CET,0.0 1.354 1.776 2.067 2.31 2.504 2.673 2.849 3.186 3.326 3.445 3.312 3.789 3.891 4.083 4.263 4.432 4.514 4.673 4.823 5.046 5.19 5.33 5.518 5.687 5.855 6.011 6.154 6.34 6.52 6.688 6.895 7.093 7.288 7.514 7.744 7.951 8.173 8.408 8.664 8.93 9.209 9.512 9.791 10.086 10.389 10.697 10.977 11.209 11.309 11.07 10.41 9.772 9.127 8.467 7.857 7.31 6.785 6.327 5.858 5.443 5.075 4.723 4.4 4.092 3.784 3.453 3.157 2.889 2.599 2.315 2.083 1.821 1.555 1.361 1.151 0.928 0.697 0.443 0.271 0.102 -0.168 -0.371 -0.585 -0.697 -0.938 -1.18 -1.461 -1.625 -2.155 -2.116 -2.29 -2.481 -2.907 -3.139 -3.397 -3.708 -4.065 -4.519 -5.149 -6.52 -2 ,414 ,KEBNE ,16749236,Wed Dec 1 08:14:00 CET,Wed Dec 1 09:53:24 CET,0.0 1.055 1.422 1.702 1.939 2.124 2.285 2.453 2.778 2.907 3.02 2.898 3.368 3.467 3.655 3.833 4.01 4.095 4.258 4.406 4.619 4.76 4.886 5.069 5.247 5.421 5.588 5.736 5.924 6.104 6.273 6.464 6.653 6.846 7.063 7.308 7.536 7.762 7.977 8.21 8.455 8.724 9.033 9.321 9.621 9.917 10.231 10.522 10.757 10.852 10.657 10.036 9.311 8.627 8.007 7.382 6.79 6.247 5.781 5.28 4.844 4.474 4.117 3.766 3.434 3.133 2.801 2.485 2.204 1.919 1.633 1.389 1.141 0.889 0.684 0.463 0.224 -0.01 -0.244 -0.416 -0.603 -0.905 -1.113 -1.324 -1.436 -1.672 -1.907 -2.147 -2.284 -2.801 -2.752 -2.921 -3.101 -3.515 -3.754 -4.04 -4.372 -4.773 -5.233 -5.88 -7.391 -3 ,9533 ,KEBNE ,16749237,Wed Dec 1 08:14:00 CET,Wed Dec 1 09:49:59 CET,0.0 1.06 1.509 1.803 2.023 2.215 2.402 2.582 2.892 3.029 3.161 3.045 3.519 3.627 3.842 4.036 4.206 4.288 4.457 4.618 4.849 4.992 5.122 5.306 5.488 5.678 5.856 6.012 6.211 6.395 6.563 6.766 6.96 7.143 7.353 7.569 7.771 8.0 8.236 8.482 8.742 9.015 9.31 9.587 9.895 10.217 10.521 10.782 11.025 11.142 10.895 10.283 9.604 8.935 8.267 7.624 7.058 6.538 6.079 5.598 5.175 4.788 4.416 4.087 3.767 3.462 3.14 2.842 2.595 2.34 2.071 1.843 1.6 1.344 1.123 0.899 0.672 0.422 0.178 0.014 -0.165 -0.441 -0.632 -0.836 -0.944 -1.176 -1.434 -1.725 -1.876 -2.393 -2.36 -2.539 -2.718 -3.135 -3.385 -3.678 -3.995 -4.342 -4.787 -5.487 -7.505 -4 ,26378 ,KEBNE ,16749238,Wed Dec 1 08:18:13 CET,Wed Dec 1 09:54:26 CET,0.0 1.177 1.561 1.855 2.106 2.317 2.497 2.668 2.973 3.104 3.224 3.096 3.58 3.695 3.905 4.101 4.277 4.359 4.514 4.657 4.874 5.014 5.139 5.308 5.488 5.664 5.818 5.967 6.157 6.334 6.509 6.713 6.913 7.11 7.334 7.558 7.773 8.01 8.251 8.511 8.762 9.014 9.297 9.582 9.875 10.167 10.46 10.738 11.008 11.111 10.8 10.146 9.462 8.773 8.115 7.496 6.943 6.413 5.933 5.454 5.047 4.671 4.306 3.971 3.646 3.339 3.018 2.741 2.492 2.205 1.91 1.674 1.417 1.151 0.94 0.723 0.504 0.269 0.016 -0.163 -0.333 -0.612 -0.826 -1.039 -1.149 -1.387 -1.647 -1.912 -2.045 -2.556 -2.503 -2.678 -2.863 -3.246 -3.466 -3.718 -4.026 -4.418 -4.888 -5.524 -7.025 -5 ,22717 ,KEBNE ,16749239,Wed Dec 1 08:18:13 CET,Wed Dec 1 09:56:58 CET,0.0 0.946 1.274 1.543 1.791 1.994 2.163 2.322 2.604 2.733 2.854 2.733 3.206 3.301 3.485 3.658 3.833 3.923 4.085 4.231 4.453 4.601 4.744 4.939 5.111 5.273 5.429 5.58 5.781 5.974 6.156 6.377 6.587 6.769 6.97 7.201 7.416 7.645 7.886 8.117 8.356 8.622 8.914 9.203 9.502 9.794 10.067 10.314 10.536 10.663 10.534 9.932 9.241 8.568 7.91 7.271 6.702 6.199 5.751 5.276 4.874 4.528 4.183 3.858 3.565 3.287 2.991 2.727 2.492 2.232 1.945 1.704 1.457 1.202 1.007 0.798 0.572 0.329 0.072 -0.095 -0.274 -0.574 -0.776 -0.999 -1.115 -1.353 -1.613 -1.897 -2.045 -2.562 -2.52 -2.698 -2.886 -3.319 -3.556 -3.819 -4.111 -4.445 -4.901 -5.553 -7.133 -6 ,5292 ,KEBNE ,16749240,Wed Dec 1 08:27:48 CET,Wed Dec 1 10:01:46 CET,0.0 0.908 1.228 1.509 1.757 1.948 2.105 2.26 2.556 2.688 2.813 2.691 3.154 3.25 3.455 3.649 3.814 3.891 4.041 4.187 4.397 4.532 4.656 4.837 5.028 5.214 5.373 5.515 5.706 5.888 6.05 6.246 6.436 6.617 6.83 7.05 7.244 7.457 7.693 7.96 8.237 8.522 8.828 9.111 9.427 9.74 10.04 10.326 10.54 10.588 10.283 9.64 8.948 8.24 7.568 6.957 6.39 5.832 5.337 4.842 4.411 4.029 3.65 3.296 2.958 2.626 2.284 1.973 1.7 1.439 1.17 0.945 0.724 0.474 0.26 0.05 -0.154 -0.388 -0.645 -0.807 -0.961 -1.207 -1.391 -1.596 -1.703 -1.925 -2.166 -2.439 -2.582 -3.098 -3.056 -3.218 -3.391 -3.802 -4.038 -4.295 -4.579 -4.922 -5.35 -5.971 -8.259 -7 ,10838 ,KEBNE ,16749241,Wed Dec 1 08:27:47 CET,Wed Dec 1 10:01:42 CET,0.0 1.052 1.537 1.85 2.082 2.288 2.475 2.638 2.923 3.061 3.185 3.042 3.511 3.613 3.797 3.952 4.103 4.189 4.359 4.509 4.703 4.827 4.96 5.145 5.324 5.492 5.647 5.81 6.022 6.211 6.393 6.629 6.837 7.01 7.215 7.453 7.662 7.882 8.107 8.347 8.603 8.872 9.161 9.437 9.773 10.105 10.434 10.748 10.968 11.05 10.851 10.28 9.635 8.977 8.33 7.732 7.232 6.757 6.292 5.783 5.349 4.972 4.597 4.242 3.905 3.595 3.283 2.978 2.705 2.427 2.136 1.905 1.662 1.403 1.193 0.981 0.764 0.528 0.256 0.066 -0.116 -0.399 -0.594 -0.797 -0.905 -1.15 -1.425 -1.707 -1.853 -2.371 -2.312 -2.485 -2.681 -3.101 -3.348 -3.643 -3.964 -4.317 -4.763 -5.399 -7.297 -8 ,9801 ,KEBNE ,16749242,Wed Dec 1 08:29:55 CET,Wed Dec 1 10:07:08 CET,0.0 1.232 1.63 1.921 2.179 2.383 2.559 2.725 2.993 3.112 3.237 3.093 3.554 3.651 3.837 4.023 4.197 4.278 4.438 4.583 4.791 4.929 5.06 5.251 5.421 5.588 5.75 5.889 6.076 6.269 6.45 6.66 6.853 7.04 7.252 7.479 7.692 7.924 8.179 8.442 8.693 8.964 9.28 9.588 9.917 10.204 10.485 10.765 10.995 11.133 10.947 10.318 9.592 8.88 8.198 7.564 6.993 6.454 5.985 5.512 5.078 4.697 4.336 3.976 3.635 3.324 3.005 2.706 2.44 2.164 1.87 1.63 1.383 1.116 0.911 0.691 0.465 0.226 -0.026 -0.198 -0.381 -0.661 -0.866 -1.082 -1.19 -1.405 -1.637 -1.909 -2.049 -2.561 -2.497 -2.671 -2.874 -3.302 -3.537 -3.786 -4.077 -4.418 -4.856 -5.527 -7.355 -9 ,14819 ,KEBNE ,16749243,Wed Dec 1 08:33:05 CET,Wed Dec 1 10:06:55 CET,0.0 0.917 1.323 1.644 1.878 2.082 2.274 2.453 2.763 2.898 3.028 2.913 3.39 3.491 3.676 3.853 4.025 4.107 4.263 4.404 4.606 4.739 4.865 5.049 5.224 5.387 5.548 5.708 5.905 6.08 6.24 6.446 6.647 6.836 7.051 7.282 7.497 7.728 7.976 8.244 8.52 8.8 9.092 9.382 9.7 10.003 10.301 10.573 10.791 10.869 10.585 9.859 9.133 8.44 7.775 7.129 6.565 6.055 5.603 5.143 4.718 4.35 4.015 3.681 3.371 3.086 2.781 2.506 2.256 1.973 1.676 1.438 1.189 0.924 0.717 0.509 0.297 0.064 -0.2 -0.383 -0.562 -0.845 -1.046 -1.259 -1.371 -1.594 -1.847 -2.135 -2.271 -2.773 -2.719 -2.886 -3.069 -3.497 -3.733 -3.978 -4.256 -4.606 -5.037 -5.661 -7.478 -10 ,28836 ,KEBNE ,16749244,Wed Dec 1 08:33:05 CET,Wed Dec 1 10:07:01 CET,0.0 0.916 1.305 1.575 1.808 2.027 2.209 2.368 2.678 2.815 2.952 2.856 3.324 3.421 3.621 3.818 4.002 4.087 4.258 4.418 4.617 4.755 4.899 5.087 5.259 5.43 5.591 5.744 5.933 6.117 6.302 6.512 6.713 6.899 7.112 7.342 7.536 7.745 7.974 8.228 8.482 8.758 9.086 9.395 9.723 10.046 10.375 10.687 10.96 11.082 10.843 10.19 9.505 8.844 8.221 7.634 7.091 6.568 6.103 5.63 5.232 4.861 4.483 4.124 3.789 3.468 3.133 2.835 2.575 2.321 2.063 1.842 1.613 1.374 1.184 0.987 0.768 0.526 0.274 0.104 -0.073 -0.335 -0.506 -0.704 -0.813 -1.037 -1.265 -1.495 -1.619 -2.123 -2.051 -2.212 -2.383 -2.748 -2.959 -3.214 -3.515 -3.882 -4.378 -5.028 -7.639 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt deleted file mode 100644 index 745c6a74..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2169 ,KEBNE ,16749245,Wed Dec 1 08:33:05 CET,Wed Dec 1 10:10:21 CET,0.0 1.316 1.806 2.142 2.431 2.689 2.929 3.139 3.503 3.665 3.817 3.75 4.252 4.386 4.644 4.881 5.078 5.18 5.386 5.565 5.81 5.969 6.125 6.338 6.539 6.742 6.937 7.142 7.41 7.642 7.852 8.101 8.332 8.558 8.836 9.128 9.393 9.678 9.974 10.282 10.613 10.976 11.381 11.777 12.24 12.736 13.21 13.687 14.177 14.591 14.786 14.553 14.111 13.606 13.101 12.608 12.158 11.729 11.335 10.946 10.597 10.272 9.941 9.612 9.324 9.06 8.751 8.474 8.248 8.001 7.732 7.511 7.28 7.032 6.838 6.636 6.425 6.213 5.992 5.83 5.661 5.407 5.224 5.027 4.923 4.692 4.444 4.186 4.055 3.556 3.589 3.412 3.194 2.694 2.455 2.207 1.9 1.545 1.135 0.566 -1.026 -2 ,22896 ,KEBNE ,16749246,Wed Dec 1 08:33:05 CET,Wed Dec 1 10:07:10 CET,0.0 1.274 1.719 2.083 2.397 2.642 2.86 3.078 3.453 3.616 3.768 3.684 4.174 4.297 4.531 4.748 4.953 5.044 5.228 5.416 5.669 5.83 5.994 6.226 6.443 6.645 6.838 7.029 7.283 7.51 7.717 7.984 8.243 8.483 8.747 9.045 9.326 9.636 9.977 10.312 10.64 11.011 11.438 11.859 12.335 12.817 13.306 13.803 14.307 14.723 14.953 14.762 14.285 13.797 13.305 12.777 12.288 11.82 11.42 11.018 10.667 10.343 10.018 9.708 9.403 9.128 8.834 8.559 8.331 8.082 7.823 7.618 7.4 7.167 6.978 6.777 6.572 6.363 6.145 5.995 5.833 5.553 5.357 5.152 5.05 4.852 4.627 4.368 4.239 3.75 3.837 3.681 3.512 3.155 2.938 2.675 2.39 2.072 1.638 1.036 -1.018 -3 ,27564 ,KEBNE ,16749247,Wed Dec 1 08:33:09 CET,Wed Dec 1 10:02:27 CET,0.0 1.058 1.507 1.858 2.158 2.409 2.65 2.858 3.233 3.401 3.548 3.46 3.949 4.074 4.306 4.522 4.723 4.821 5.011 5.189 5.441 5.602 5.756 5.978 6.198 6.394 6.58 6.779 7.019 7.243 7.466 7.74 7.993 8.217 8.468 8.746 9.011 9.304 9.628 9.983 10.35 10.727 11.148 11.558 12.005 12.469 12.946 13.426 13.92 14.39 14.673 14.462 14.046 13.567 13.093 12.605 12.098 11.619 11.202 10.807 10.473 10.141 9.796 9.467 9.174 8.89 8.592 8.313 8.064 7.826 7.575 7.359 7.133 6.889 6.693 6.496 6.301 6.09 5.857 5.694 5.534 5.281 5.086 4.877 4.771 4.539 4.287 4.02 3.883 3.372 3.414 3.253 3.089 2.706 2.487 2.234 1.944 1.598 1.147 0.496 -1.093 -4 ,30277 ,KEBNE ,16749248,Wed Dec 1 08:40:27 CET,Wed Dec 1 10:16:00 CET,0.0 1.153 1.638 2.028 2.308 2.536 2.763 2.963 3.302 3.463 3.619 3.532 4.015 4.13 4.382 4.626 4.845 4.948 5.137 5.313 5.56 5.732 5.897 6.116 6.326 6.533 6.73 6.925 7.163 7.377 7.59 7.841 8.089 8.327 8.585 8.881 9.155 9.434 9.738 10.06 10.395 10.754 11.156 11.574 12.062 12.574 13.098 13.622 14.153 14.566 14.753 14.587 14.159 13.665 13.182 12.709 12.26 11.828 11.443 11.035 10.658 10.329 10.013 9.694 9.387 9.114 8.824 8.545 8.296 8.029 7.745 7.509 7.266 7.026 6.848 6.649 6.423 6.19 5.948 5.782 5.611 5.34 5.154 4.955 4.848 4.619 4.38 4.142 4.01 3.495 3.52 3.354 3.19 2.806 2.59 2.342 2.062 1.712 1.255 0.653 -0.816 -5 ,6133 ,KEBNE ,16749249,Wed Dec 1 08:40:27 CET,Wed Dec 1 10:18:48 CET,0.0 1.133 1.631 1.992 2.29 2.545 2.762 2.956 3.331 3.503 3.658 3.563 4.045 4.157 4.384 4.606 4.812 4.907 5.088 5.269 5.511 5.668 5.826 6.059 6.27 6.462 6.645 6.824 7.052 7.275 7.494 7.75 7.991 8.227 8.512 8.811 9.073 9.347 9.642 9.962 10.306 10.7 11.13 11.538 11.972 12.426 12.942 13.453 13.973 14.439 14.666 14.505 14.13 13.673 13.219 12.771 12.311 11.868 11.501 11.124 10.773 10.447 10.133 9.824 9.518 9.26 9.001 8.753 8.539 8.317 8.081 7.883 7.67 7.438 7.261 7.08 6.877 6.671 6.464 6.308 6.146 5.892 5.713 5.533 5.434 5.231 5.029 4.788 4.649 4.144 4.202 4.04 3.857 3.464 3.242 2.988 2.722 2.407 1.993 1.41 -1.501 -6 ,23972 ,KEBNE ,16749250,Wed Dec 1 08:41:35 CET,Wed Dec 1 10:16:29 CET,0.0 1.042 1.51 1.893 2.185 2.429 2.659 2.878 3.23 3.382 3.534 3.452 3.939 4.058 4.28 4.486 4.69 4.787 4.98 5.163 5.431 5.608 5.765 5.991 6.207 6.402 6.58 6.759 6.996 7.221 7.429 7.68 7.924 8.144 8.405 8.708 8.995 9.298 9.617 9.96 10.312 10.695 11.145 11.559 12.019 12.536 13.031 13.538 14.073 14.558 14.833 14.683 14.334 13.894 13.457 13.032 12.637 12.239 11.869 11.479 11.127 10.807 10.488 10.175 9.883 9.615 9.327 9.066 8.837 8.573 8.297 8.085 7.847 7.576 7.369 7.165 6.958 6.735 6.5 6.34 6.175 5.914 5.717 5.502 5.4 5.192 4.969 4.719 4.586 4.073 4.098 3.928 3.746 3.334 3.094 2.825 2.515 2.142 1.688 1.023 -0.663 -7 ,11821 ,KEBNE ,16749251,Wed Dec 1 08:41:37 CET,Wed Dec 1 10:15:35 CET,0.0 1.501 1.983 2.302 2.576 2.827 3.061 3.266 3.621 3.782 3.932 3.841 4.338 4.467 4.695 4.916 5.123 5.22 5.414 5.599 5.879 6.062 6.219 6.428 6.624 6.818 7.01 7.187 7.408 7.634 7.856 8.116 8.364 8.597 8.867 9.173 9.449 9.724 10.032 10.364 10.695 11.054 11.468 11.888 12.334 12.796 13.3 13.837 14.374 14.806 15.044 14.83 14.395 13.898 13.396 12.882 12.382 11.931 11.528 11.085 10.705 10.37 10.053 9.761 9.474 9.212 8.928 8.654 8.405 8.145 7.893 7.677 7.44 7.185 6.985 6.786 6.58 6.354 6.114 5.95 5.783 5.513 5.318 5.104 4.994 4.775 4.547 4.287 4.147 3.641 3.669 3.498 3.313 2.882 2.635 2.354 2.066 1.786 1.438 0.867 -0.819 -8 ,21146 ,KEBNE ,16749252,Wed Dec 1 08:41:37 CET,Wed Dec 1 10:16:06 CET,0.0 1.287 1.696 2.006 2.301 2.555 2.776 2.979 3.357 3.535 3.695 3.612 4.104 4.227 4.461 4.688 4.903 5.002 5.185 5.366 5.618 5.771 5.923 6.152 6.369 6.57 6.76 6.943 7.191 7.42 7.633 7.886 8.129 8.375 8.65 8.934 9.203 9.484 9.789 10.124 10.471 10.84 11.252 11.667 12.127 12.611 13.135 13.637 14.173 14.676 14.931 14.744 14.345 13.898 13.418 12.917 12.474 12.042 11.647 11.234 10.843 10.493 10.149 9.819 9.526 9.255 8.966 8.701 8.468 8.233 7.982 7.762 7.533 7.293 7.106 6.906 6.684 6.451 6.206 6.018 5.823 5.553 5.379 5.186 5.083 4.858 4.616 4.365 4.225 3.71 3.769 3.6 3.418 3.04 2.833 2.592 2.287 1.898 1.406 0.711 -1.185 -9 ,26677 ,KEBNE ,16749253,Wed Dec 1 08:46:55 CET,Wed Dec 1 10:20:23 CET,0.0 0.963 1.422 1.774 2.07 2.307 2.509 2.698 3.053 3.224 3.384 3.309 3.796 3.912 4.15 4.375 4.57 4.665 4.848 5.026 5.271 5.421 5.578 5.795 6.011 6.227 6.419 6.596 6.832 7.069 7.288 7.546 7.785 8.015 8.282 8.576 8.846 9.135 9.458 9.779 10.101 10.453 10.858 11.249 11.699 12.205 12.723 13.242 13.755 14.18 14.43 14.24 13.851 13.396 12.929 12.465 11.991 11.562 11.166 10.74 10.382 10.068 9.763 9.453 9.144 8.87 8.576 8.314 8.09 7.843 7.58 7.342 7.102 6.873 6.671 6.456 6.249 6.03 5.783 5.607 5.443 5.179 4.987 4.791 4.683 4.46 4.216 3.946 3.805 3.289 3.31 3.136 2.964 2.561 2.331 2.078 1.788 1.463 1.049 0.423 -1.16 -10 ,18500 ,KEBNE ,16749254,Wed Dec 1 08:46:56 CET,Wed Dec 1 10:22:28 CET,0.0 1.188 1.659 1.989 2.271 2.524 2.739 2.947 3.32 3.497 3.655 3.566 4.06 4.18 4.406 4.623 4.833 4.934 5.119 5.295 5.542 5.703 5.857 6.081 6.294 6.5 6.705 6.897 7.135 7.355 7.561 7.807 8.033 8.253 8.516 8.81 9.091 9.399 9.722 10.048 10.386 10.763 11.178 11.575 12.016 12.46 12.947 13.461 13.99 14.448 14.678 14.468 14.037 13.545 13.074 12.588 12.116 11.676 11.288 10.853 10.459 10.124 9.8 9.499 9.208 8.927 8.632 8.358 8.105 7.848 7.59 7.369 7.146 6.928 6.735 6.509 6.299 6.092 5.856 5.684 5.505 5.239 5.051 4.834 4.718 4.461 4.179 3.874 3.704 3.167 3.188 3.017 2.84 2.451 2.229 1.964 1.664 1.311 0.846 0.226 -1.981 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt deleted file mode 100644 index 052837f2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9864 ,KEBNE ,17028192,Wed Dec 22 19:21:41 CET,Wed Dec 22 20:54:36 CET,0.0 1.846 2.442 2.899 3.24 3.521 3.748 3.935 4.262 4.407 4.537 4.409 4.874 4.976 5.18 5.354 5.516 5.595 5.739 5.866 6.04 6.152 6.248 6.373 6.482 6.578 6.668 6.751 6.854 6.947 7.024 7.096 7.157 7.217 7.254 7.254 7.248 7.251 7.212 7.098 6.955 6.781 6.532 6.209 5.752 5.122 4.223 2.994 1.182 -1.707 -6.565 -12.064 -16.276 -19.701 -22.563 -25.01 -27.052 -28.814 -30.279 -31.716 -32.922 -33.97 -34.943 -35.83 -36.652 -37.4 -38.171 -38.838 -39.413 -40.006 -40.587 -41.059 -41.559 -42.091 -42.488 -42.882 -43.3 -43.729 -44.169 -44.482 -44.799 -45.296 -45.65 -46.018 -46.212 -46.601 -47.013 -47.439 -47.659 -48.323 -48.41 -48.659 -48.925 -49.521 -49.839 -50.191 -50.591 -51.058 -51.636 -52.406 -54.283 -2 ,25152 ,KEBNE ,17028193,Wed Dec 22 19:21:41 CET,Wed Dec 22 20:56:22 CET,0.0 1.812 2.416 2.852 3.184 3.45 3.682 3.878 4.191 4.327 4.456 4.314 4.785 4.884 5.06 5.214 5.35 5.42 5.552 5.674 5.826 5.9 5.981 6.107 6.222 6.32 6.399 6.483 6.581 6.648 6.713 6.795 6.849 6.891 6.937 6.965 6.962 6.93 6.88 6.815 6.716 6.538 6.245 5.894 5.368 4.672 3.81 2.522 0.603 -2.093 -6.782 -12.391 -16.702 -20.188 -22.992 -25.339 -27.369 -29.169 -30.663 -32.106 -33.298 -34.37 -35.399 -36.344 -37.192 -37.948 -38.746 -39.442 -40.009 -40.576 -41.183 -41.686 -42.183 -42.702 -43.102 -43.504 -43.922 -44.374 -44.848 -45.165 -45.484 -45.967 -46.304 -46.658 -46.841 -47.226 -47.618 -48.027 -48.242 -48.883 -48.934 -49.194 -49.454 -50.004 -50.319 -50.648 -51.015 -51.458 -52.026 -52.748 -54.858 -3 ,16251 ,KEBNE ,17028194,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:55:17 CET,0.0 1.827 2.493 2.941 3.275 3.58 3.829 4.015 4.366 4.531 4.676 4.583 5.068 5.175 5.353 5.511 5.668 5.74 5.869 5.981 6.125 6.212 6.294 6.41 6.515 6.619 6.728 6.824 6.916 7.003 7.1 7.184 7.239 7.291 7.337 7.365 7.371 7.363 7.356 7.298 7.161 6.958 6.661 6.305 5.827 5.146 4.166 2.874 1.024 -1.748 -6.555 -12.191 -16.444 -19.881 -22.703 -25.114 -27.114 -28.837 -30.306 -31.768 -33.004 -34.063 -35.056 -35.96 -36.788 -37.552 -38.32 -38.971 -39.536 -40.134 -40.751 -41.257 -41.78 -42.307 -42.705 -43.116 -43.527 -43.941 -44.38 -44.689 -45.001 -45.491 -45.837 -46.205 -46.391 -46.773 -47.178 -47.605 -47.831 -48.488 -48.54 -48.782 -49.041 -49.621 -49.951 -50.331 -50.745 -51.207 -51.755 -52.477 -54.331 -4 ,23253 ,KEBNE ,17028195,Wed Dec 22 19:21:40 CET,Wed Dec 22 20:55:06 CET,0.0 2.004 2.584 2.98 3.294 3.548 3.771 3.965 4.297 4.437 4.567 4.431 4.896 5.001 5.186 5.347 5.49 5.563 5.708 5.829 5.974 6.075 6.166 6.274 6.38 6.485 6.572 6.644 6.74 6.828 6.89 6.927 6.955 6.993 7.031 7.063 7.066 7.04 6.986 6.894 6.791 6.639 6.373 6.035 5.57 4.924 3.983 2.705 0.783 -2.154 -6.914 -12.26 -16.374 -19.726 -22.54 -25.029 -27.116 -28.898 -30.394 -31.853 -33.067 -34.126 -35.105 -35.999 -36.823 -37.562 -38.325 -39.002 -39.578 -40.175 -40.795 -41.299 -41.81 -42.34 -42.737 -43.134 -43.547 -43.987 -44.456 -44.767 -45.079 -45.555 -45.887 -46.237 -46.412 -46.761 -47.133 -47.533 -47.743 -48.39 -48.439 -48.675 -48.923 -49.469 -49.772 -50.102 -50.473 -50.882 -51.413 -52.174 -54.116 -5 ,30044 ,KEBNE ,17028196,Wed Dec 22 19:22:43 CET,Wed Dec 22 20:56:19 CET,0.0 1.645 2.186 2.611 2.944 3.208 3.439 3.639 3.972 4.121 4.26 4.132 4.603 4.712 4.895 5.053 5.202 5.268 5.394 5.518 5.695 5.794 5.885 6.021 6.141 6.244 6.331 6.411 6.504 6.578 6.653 6.742 6.806 6.85 6.878 6.878 6.861 6.825 6.761 6.675 6.553 6.386 6.127 5.784 5.311 4.613 3.662 2.381 0.509 -2.326 -6.952 -12.165 -16.285 -19.638 -22.418 -24.82 -26.867 -28.662 -30.167 -31.609 -32.821 -33.902 -34.888 -35.771 -36.612 -37.394 -38.182 -38.862 -39.447 -40.068 -40.694 -41.204 -41.724 -42.252 -42.662 -43.081 -43.511 -43.965 -44.437 -44.747 -45.06 -45.542 -45.878 -46.235 -46.423 -46.81 -47.204 -47.626 -47.85 -48.503 -48.572 -48.822 -49.086 -49.678 -50.006 -50.366 -50.773 -51.244 -51.82 -52.579 -54.969 -6 ,16569 ,KEBNE ,17028197,Wed Dec 22 19:22:44 CET,Wed Dec 22 20:53:01 CET,0.0 2.151 2.722 3.131 3.434 3.691 3.914 4.107 4.444 4.581 4.718 4.625 5.103 5.211 5.405 5.578 5.742 5.816 5.947 6.072 6.239 6.332 6.418 6.552 6.689 6.814 6.914 6.993 7.098 7.173 7.225 7.29 7.337 7.366 7.397 7.434 7.455 7.446 7.396 7.3 7.181 7.018 6.729 6.352 5.853 5.211 4.313 3.022 1.096 -1.745 -6.344 -11.625 -15.815 -19.211 -21.961 -24.331 -26.363 -28.135 -29.632 -31.111 -32.352 -33.411 -34.401 -35.337 -36.197 -36.953 -37.734 -38.422 -39.0 -39.585 -40.177 -40.669 -41.197 -41.729 -42.118 -42.528 -42.947 -43.372 -43.817 -44.115 -44.421 -44.927 -45.281 -45.643 -45.831 -46.23 -46.637 -47.042 -47.253 -47.893 -47.948 -48.207 -48.472 -49.018 -49.32 -49.676 -50.077 -50.53 -51.067 -51.835 -53.94 -7 ,10187 ,KEBNE ,17028198,Wed Dec 22 19:22:43 CET,Wed Dec 22 20:58:22 CET,0.0 2.173 2.833 3.271 3.572 3.806 4.02 4.214 4.557 4.709 4.832 4.675 5.148 5.249 5.422 5.577 5.705 5.772 5.917 6.047 6.216 6.313 6.407 6.54 6.652 6.755 6.849 6.93 7.02 7.097 7.178 7.252 7.302 7.349 7.385 7.398 7.381 7.35 7.3 7.206 7.08 6.883 6.6 6.258 5.75 5.087 4.242 3.031 1.092 -1.839 -6.545 -12.023 -16.315 -19.731 -22.52 -24.926 -26.941 -28.696 -30.185 -31.642 -32.879 -33.969 -34.979 -35.906 -36.745 -37.5 -38.276 -38.94 -39.518 -40.127 -40.735 -41.246 -41.779 -42.312 -42.722 -43.138 -43.566 -44.003 -44.449 -44.761 -45.074 -45.567 -45.903 -46.259 -46.452 -46.832 -47.22 -47.637 -47.857 -48.5 -48.552 -48.813 -49.081 -49.642 -49.943 -50.281 -50.677 -51.137 -51.664 -52.381 -54.509 -8 ,22893 ,KEBNE ,17028199,Wed Dec 22 19:22:43 CET,Wed Dec 22 20:57:38 CET,0.0 1.453 2.004 2.45 2.802 3.08 3.317 3.513 3.883 4.051 4.192 4.079 4.556 4.657 4.84 5.016 5.171 5.243 5.373 5.492 5.661 5.76 5.85 5.966 6.066 6.171 6.272 6.36 6.467 6.555 6.623 6.677 6.715 6.745 6.776 6.789 6.77 6.738 6.693 6.616 6.495 6.311 6.038 5.692 5.187 4.503 3.549 2.246 0.339 -2.463 -6.977 -12.322 -16.577 -20.064 -22.88 -25.249 -27.268 -29.02 -30.498 -31.949 -33.149 -34.203 -35.224 -36.164 -36.999 -37.744 -38.493 -39.168 -39.762 -40.358 -40.96 -41.455 -41.966 -42.489 -42.895 -43.314 -43.746 -44.189 -44.634 -44.942 -45.262 -45.758 -46.097 -46.462 -46.655 -47.036 -47.43 -47.827 -48.037 -48.685 -48.75 -49.005 -49.257 -49.798 -50.119 -50.487 -50.885 -51.328 -51.866 -52.619 -55.223 -9 ,9447 ,KEBNE ,17028200,Wed Dec 22 19:22:43 CET,Wed Dec 22 20:57:31 CET,0.0 1.988 2.586 2.985 3.329 3.62 3.86 4.054 4.375 4.519 4.65 4.525 4.995 5.107 5.312 5.478 5.617 5.683 5.8 5.911 6.072 6.169 6.27 6.408 6.519 6.63 6.739 6.829 6.928 7.017 7.093 7.175 7.241 7.288 7.334 7.367 7.376 7.363 7.304 7.222 7.088 6.869 6.573 6.211 5.744 5.096 4.144 2.845 0.951 -1.876 -6.434 -11.591 -15.636 -19.04 -21.931 -24.408 -26.471 -28.255 -29.731 -31.211 -32.452 -33.513 -34.504 -35.429 -36.282 -37.039 -37.807 -38.489 -39.08 -39.667 -40.261 -40.775 -41.306 -41.838 -42.245 -42.668 -43.11 -43.561 -44.014 -44.318 -44.627 -45.112 -45.472 -45.828 -46.002 -46.37 -46.772 -47.206 -47.414 -48.041 -48.084 -48.341 -48.612 -49.182 -49.488 -49.824 -50.211 -50.648 -51.165 -51.899 -54.341 -10 ,13985 ,KEBNE ,17028201,Wed Dec 22 19:22:43 CET,Wed Dec 22 20:57:21 CET,0.0 1.547 2.121 2.555 2.881 3.161 3.418 3.628 3.966 4.107 4.241 4.14 4.616 4.716 4.912 5.104 5.264 5.333 5.46 5.582 5.754 5.869 5.974 6.1 6.218 6.337 6.437 6.52 6.624 6.711 6.78 6.847 6.907 6.956 6.985 7.012 7.018 7.003 6.967 6.886 6.766 6.576 6.277 5.914 5.415 4.784 3.884 2.583 0.655 -2.233 -6.811 -12.135 -16.367 -19.818 -22.691 -25.139 -27.15 -28.926 -30.428 -31.855 -33.045 -34.097 -35.1 -36.059 -36.928 -37.686 -38.47 -39.156 -39.725 -40.316 -40.94 -41.46 -41.98 -42.509 -42.925 -43.353 -43.789 -44.227 -44.679 -44.976 -45.272 -45.758 -46.1 -46.457 -46.645 -47.026 -47.407 -47.807 -48.016 -48.661 -48.724 -48.98 -49.244 -49.802 -50.102 -50.429 -50.804 -51.239 -51.759 -52.466 -54.746 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt deleted file mode 100644 index 6ffa57ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14705 ,KEBNE ,16749255,Wed Dec 1 08:48:03 CET,Wed Dec 1 10:26:15 CET,0.0 1.991 2.773 3.458 4.073 4.665 5.221 5.741 6.72 7.193 7.669 8.248 9.073 9.532 10.43 11.294 12.154 12.584 13.429 14.257 15.48 16.279 17.082 18.289 19.471 20.63 21.777 22.926 24.429 25.912 27.399 29.254 31.083 32.867 34.993 37.476 39.944 42.728 45.822 49.251 52.996 57.419 62.861 68.586 75.575 83.84 93.99 106.264 121.884 142.365 170.95 199.061 218.585 233.066 244.174 253.168 260.336 266.293 271.105 275.628 279.245 282.272 285.025 287.461 289.588 291.435 293.279 294.854 296.156 297.435 298.714 299.737 300.732 301.727 302.47 303.203 303.923 304.628 305.333 305.777 306.212 306.874 307.3 307.731 307.944 308.356 308.746 309.097 309.264 309.372 309.749 309.895 310.039 310.283 310.372 310.441 310.478 310.474 310.39 310.175 308.717 -2 ,975 ,KEBNE ,16749256,Wed Dec 1 08:52:15 CET,Wed Dec 1 10:26:47 CET,0.0 1.545 2.314 2.952 3.564 4.159 4.717 5.244 6.234 6.71 7.186 7.746 8.552 9.0 9.878 10.743 11.613 12.036 12.869 13.705 14.942 15.754 16.557 17.74 18.913 20.092 21.27 22.428 23.947 25.465 26.978 28.844 30.684 32.507 34.663 37.156 39.634 42.43 45.596 49.097 52.875 57.303 62.742 68.479 75.515 83.845 94.019 106.306 121.956 142.534 171.218 199.316 218.89 233.487 244.659 253.63 260.805 266.806 271.574 275.999 279.577 282.566 285.271 287.693 289.821 291.682 293.557 295.147 296.451 297.754 299.035 300.041 301.037 302.024 302.755 303.464 304.154 304.834 305.518 305.972 306.41 307.052 307.482 307.894 308.088 308.471 308.841 309.182 309.348 309.461 309.854 310.011 310.158 310.413 310.503 310.566 310.581 310.557 310.469 310.248 309.218 -3 ,6616 ,KEBNE ,16749257,Wed Dec 1 08:52:15 CET,Wed Dec 1 10:27:56 CET,0.0 1.566 2.304 2.958 3.577 4.174 4.747 5.293 6.344 6.844 7.324 7.901 8.724 9.173 10.057 10.933 11.79 12.21 13.045 13.882 15.122 15.94 16.74 17.915 19.085 20.232 21.356 22.468 23.949 25.436 26.924 28.761 30.584 32.399 34.547 37.022 39.499 42.334 45.477 48.946 52.769 57.238 62.671 68.414 75.479 83.799 93.979 106.278 121.9 142.458 171.207 199.314 218.805 233.326 244.478 253.508 260.67 266.619 271.412 275.852 279.44 282.488 285.236 287.678 289.836 291.723 293.602 295.179 296.474 297.759 299.043 300.056 301.039 302.022 302.762 303.472 304.173 304.88 305.58 306.041 306.497 307.173 307.598 308.004 308.204 308.59 308.973 309.355 309.54 309.663 310.036 310.187 310.328 310.589 310.699 310.787 310.842 310.842 310.763 310.551 309.379 -4 ,21506 ,KEBNE ,16749258,Wed Dec 1 08:52:16 CET,Wed Dec 1 10:26:38 CET,0.0 1.554 2.345 3.043 3.655 4.213 4.743 5.264 6.284 6.783 7.276 7.861 8.683 9.15 10.067 10.928 11.767 12.186 13.012 13.838 15.06 15.86 16.642 17.811 18.985 20.129 21.256 22.405 23.929 25.426 26.912 28.758 30.595 32.408 34.576 37.09 39.581 42.439 45.62 49.11 52.923 57.351 62.767 68.503 75.501 83.721 93.814 106.045 121.657 142.163 170.778 198.932 218.456 233.001 244.18 253.16 260.341 266.327 271.13 275.642 279.268 282.289 285.024 287.478 289.623 291.464 293.287 294.828 296.096 297.362 298.631 299.635 300.624 301.611 302.352 303.079 303.8 304.516 305.195 305.629 306.064 306.727 307.151 307.549 307.742 308.124 308.499 308.858 309.032 309.144 309.517 309.655 309.785 310.012 310.103 310.186 310.255 310.258 310.183 310.023 308.698 -5 ,15564 ,KEBNE ,16749259,Wed Dec 1 09:05:50 CET,Wed Dec 1 10:39:44 CET,0.0 1.664 2.455 3.133 3.757 4.324 4.862 5.4 6.426 6.912 7.393 7.985 8.807 9.263 10.156 11.024 11.878 12.302 13.133 13.943 15.156 15.966 16.765 17.953 19.127 20.289 21.456 22.616 24.142 25.657 27.147 28.988 30.817 32.639 34.816 37.32 39.815 42.657 45.828 49.319 53.089 57.492 62.884 68.57 75.565 83.871 94.096 106.446 122.181 142.771 171.369 199.426 218.951 233.512 244.608 253.574 260.762 266.738 271.534 276.017 279.616 282.62 285.346 287.78 289.935 291.811 293.664 295.241 296.532 297.787 299.031 300.026 301.03 302.022 302.742 303.447 304.144 304.831 305.518 305.975 306.42 307.062 307.483 307.888 308.079 308.456 308.826 309.189 309.369 309.48 309.859 310.017 310.161 310.408 310.511 310.57 310.582 310.578 310.48 310.144 308.596 -6 ,17677 ,KEBNE ,16749260,Wed Dec 1 09:05:49 CET,Wed Dec 1 10:40:31 CET,0.0 1.494 2.426 3.213 3.879 4.498 5.067 5.598 6.617 7.116 7.606 8.19 9.006 9.456 10.355 11.266 12.16 12.588 13.436 14.273 15.494 16.305 17.115 18.299 19.466 20.629 21.787 22.946 24.484 25.994 27.484 29.351 31.209 33.034 35.205 37.713 40.205 43.027 46.17 49.654 53.48 57.943 63.336 68.998 75.965 84.182 94.246 106.5 122.127 142.588 171.193 199.287 218.846 233.298 244.38 253.403 260.61 266.574 271.299 275.742 279.377 282.409 285.11 287.529 289.68 291.544 293.39 294.969 296.274 297.565 298.829 299.823 300.814 301.794 302.521 303.245 303.966 304.687 305.388 305.837 306.287 306.939 307.343 307.738 307.943 308.348 308.733 309.081 309.244 309.349 309.724 309.867 309.995 310.192 310.266 310.331 310.363 310.359 310.279 310.005 308.565 -7 ,27002 ,KEBNE ,16749261,Wed Dec 1 09:05:48 CET,Wed Dec 1 10:41:38 CET,0.0 1.887 2.858 3.679 4.409 5.042 5.635 6.206 7.245 7.729 8.205 8.766 9.593 10.048 10.913 11.758 12.589 12.998 13.812 14.618 15.818 16.612 17.406 18.586 19.749 20.917 22.08 23.227 24.762 26.28 27.761 29.586 31.409 33.226 35.387 37.897 40.383 43.226 46.45 49.988 53.811 58.264 63.66 69.327 76.293 84.543 94.637 106.876 122.532 143.087 171.732 199.842 219.399 234.013 245.15 254.112 261.306 267.295 272.082 276.538 280.151 283.156 285.835 288.241 290.387 292.253 294.103 295.663 296.953 298.248 299.531 300.545 301.538 302.513 303.233 303.948 304.667 305.37 306.058 306.518 306.971 307.628 308.052 308.46 308.663 309.065 309.445 309.807 309.971 310.076 310.463 310.611 310.751 311.011 311.116 311.192 311.228 311.222 311.127 310.853 309.68 -8 ,3165 ,KEBNE ,16749262,Wed Dec 1 09:05:49 CET,Wed Dec 1 10:40:14 CET,0.0 1.747 2.613 3.312 3.917 4.488 5.041 5.585 6.631 7.117 7.607 8.203 9.039 9.508 10.392 11.256 12.118 12.549 13.396 14.216 15.436 16.242 17.039 18.234 19.423 20.596 21.746 22.877 24.377 25.879 27.389 29.253 31.077 32.892 35.074 37.595 40.068 42.877 46.034 49.495 53.267 57.685 63.068 68.758 75.769 84.009 94.063 106.317 121.988 142.527 171.12 199.231 218.753 233.212 244.324 253.287 260.462 266.476 271.276 275.749 279.375 282.399 285.11 287.544 289.707 291.59 293.459 295.035 296.337 297.629 298.918 299.948 300.961 301.946 302.673 303.399 304.117 304.825 305.528 305.989 306.432 307.091 307.535 307.962 308.172 308.575 308.96 309.337 309.519 309.637 310.03 310.183 310.323 310.565 310.68 310.75 310.785 310.782 310.695 310.427 309.201 -9 ,19742 ,KEBNE ,16749263,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 11:36:20 CET,0.0 1.539 2.373 3.081 3.725 4.316 4.893 5.451 6.474 6.961 7.434 7.992 8.813 9.277 10.172 11.036 11.892 12.317 13.159 13.984 15.196 15.996 16.796 17.982 19.157 20.32 21.459 22.594 24.109 25.602 27.091 28.966 30.814 32.645 34.822 37.31 39.791 42.62 45.784 49.27 53.061 57.502 62.93 68.686 75.696 83.898 94.03 106.36 122.028 142.53 171.106 199.258 218.845 233.437 244.612 253.603 260.782 266.783 271.589 276.043 279.649 282.706 285.471 287.929 290.087 291.952 293.805 295.377 296.68 297.965 299.23 300.248 301.251 302.23 302.941 303.639 304.338 305.027 305.711 306.162 306.608 307.278 307.721 308.149 308.353 308.76 309.15 309.512 309.678 309.779 310.162 310.319 310.462 310.68 310.743 310.807 310.857 310.845 310.754 310.468 309.282 -10 ,8540 ,KEBNE ,16749264,Wed Dec 1 10:02:09 CET,Wed Dec 1 11:36:23 CET,0.0 1.613 2.522 3.241 3.882 4.481 5.038 5.556 6.562 7.058 7.534 8.099 8.923 9.38 10.277 11.152 12.003 12.423 13.264 14.09 15.3 16.097 16.89 18.081 19.268 20.441 21.594 22.735 24.244 25.762 27.271 29.119 30.96 32.792 34.952 37.435 39.914 42.734 45.901 49.399 53.182 57.624 63.093 68.867 75.882 84.13 94.274 106.621 122.33 142.879 171.536 199.659 219.173 233.679 244.827 253.841 261.037 267.041 271.855 276.331 279.945 282.965 285.672 288.107 290.251 292.094 293.914 295.464 296.752 298.03 299.306 300.31 301.291 302.248 302.96 303.669 304.363 305.042 305.713 306.154 306.595 307.257 307.675 308.079 308.286 308.704 309.111 309.478 309.651 309.77 310.166 310.323 310.475 310.732 310.831 310.896 310.921 310.887 310.745 310.482 309.179 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index a96ee5eb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11212 ,KEBNE ,16749280,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 11:56:45 CET,0.0 2.02 2.696 3.147 3.529 3.859 4.136 4.402 4.881 5.103 5.317 5.497 5.883 6.049 6.381 6.686 6.986 7.13 7.403 7.688 8.105 8.353 8.582 8.912 9.238 9.579 9.898 10.172 10.524 10.858 11.159 11.506 11.864 12.202 12.564 12.974 13.352 13.75 14.186 14.641 15.096 15.61 16.21 16.763 17.324 17.891 18.503 19.089 19.482 19.477 18.787 17.303 15.765 14.327 13.035 11.9 10.907 9.979 9.094 8.149 7.336 6.597 5.87 5.208 4.603 4.049 3.468 2.962 2.53 2.054 1.563 1.164 0.761 0.331 -0.008 -0.347 -0.702 -1.071 -1.455 -1.723 -1.998 -2.423 -2.722 -3.036 -3.199 -3.543 -3.891 -4.26 -4.464 -4.899 -5.128 -5.366 -5.591 -6.094 -6.402 -6.748 -7.12 -7.523 -8.008 -8.602 -10.07 -2 ,20223 ,KEBNE ,16749281,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 11:55:45 CET,0.0 1.925 2.552 3.035 3.449 3.776 4.058 4.321 4.804 5.021 5.211 5.339 5.736 5.942 6.327 6.638 6.922 7.052 7.296 7.542 7.911 8.136 8.351 8.662 8.94 9.199 9.459 9.71 10.029 10.334 10.613 10.952 11.287 11.614 11.976 12.365 12.728 13.114 13.531 13.97 14.42 14.907 15.472 15.973 16.49 17.089 17.713 18.309 18.891 19.173 18.764 17.524 15.921 14.267 12.823 11.53 10.391 9.319 8.38 7.479 6.694 5.956 5.246 4.611 4.01 3.437 2.849 2.336 1.882 1.413 0.916 0.512 0.085 -0.387 -0.737 -1.099 -1.478 -1.879 -2.313 -2.613 -2.928 -3.423 -3.762 -4.116 -4.311 -4.712 -5.104 -5.523 -5.74 -6.188 -6.467 -6.743 -7.012 -7.619 -7.971 -8.343 -8.753 -9.197 -9.729 -10.477 -12.284 -3 ,490 ,KEBNE ,16749282,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 11:52:14 CET,0.0 1.742 2.417 2.9 3.304 3.663 3.976 4.275 4.808 5.032 5.227 5.403 5.792 5.957 6.268 6.583 6.881 7.014 7.264 7.505 7.845 8.054 8.267 8.572 8.865 9.138 9.391 9.64 9.98 10.296 10.579 10.93 11.261 11.572 11.927 12.317 12.697 13.115 13.548 13.985 14.425 14.891 15.41 15.927 16.502 17.074 17.645 18.182 18.561 18.568 17.993 16.823 15.316 13.754 12.378 11.128 10.019 8.993 8.1 7.196 6.408 5.719 5.026 4.374 3.781 3.243 2.712 2.237 1.811 1.388 0.97 0.611 0.237 -0.169 -0.496 -0.83 -1.162 -1.507 -1.889 -2.16 -2.429 -2.816 -3.092 -3.411 -3.569 -3.869 -4.19 -4.537 -4.728 -5.155 -5.358 -5.59 -5.828 -6.311 -6.575 -6.871 -7.202 -7.598 -8.063 -8.664 -10.191 -4 ,26218 ,KEBNE ,16749283,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 11:53:13 CET,0.0 2.634 3.344 3.85 4.278 4.645 4.97 5.253 5.734 5.947 6.143 6.302 6.69 6.868 7.212 7.533 7.827 7.965 8.225 8.48 8.831 9.047 9.262 9.582 9.898 10.195 10.474 10.736 11.062 11.379 11.693 12.064 12.395 12.712 13.094 13.508 13.88 14.282 14.695 15.129 15.585 16.087 16.629 17.113 17.661 18.278 18.928 19.518 20.001 20.216 19.89 18.791 17.562 16.251 14.94 13.743 12.66 11.633 10.783 9.945 9.186 8.49 7.796 7.131 6.531 5.993 5.442 4.947 4.487 3.993 3.485 3.081 2.673 2.25 1.922 1.567 1.211 0.857 0.469 0.183 -0.118 -0.563 -0.87 -1.19 -1.36 -1.728 -2.101 -2.49 -2.696 -3.134 -3.341 -3.576 -3.829 -4.356 -4.635 -4.972 -5.362 -5.769 -6.243 -6.846 -8.471 -5 ,10990 ,KEBNE ,16749284,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 11:53:29 CET,0.0 2.285 3.06 3.567 3.958 4.306 4.611 4.894 5.387 5.608 5.816 5.99 6.389 6.552 6.844 7.132 7.422 7.569 7.852 8.114 8.475 8.699 8.926 9.249 9.546 9.832 10.103 10.371 10.712 11.029 11.347 11.733 12.1 12.452 12.847 13.267 13.652 14.09 14.558 14.989 15.404 15.862 16.394 16.921 17.462 17.991 18.548 19.08 19.476 19.597 19.044 17.596 16.023 14.571 13.276 12.059 10.998 9.991 9.085 8.171 7.379 6.719 6.088 5.477 4.913 4.411 3.898 3.439 3.034 2.582 2.1 1.713 1.305 0.859 0.521 0.195 -0.138 -0.482 -0.845 -1.1 -1.362 -1.773 -2.061 -2.365 -2.518 -2.837 -3.176 -3.551 -3.746 -4.155 -4.369 -4.614 -4.856 -5.371 -5.651 -5.951 -6.292 -6.68 -7.128 -7.738 -9.237 -6 ,12209 ,KEBNE ,16749285,Wed Dec 1 10:02:09 CET,Wed Dec 1 11:52:52 CET,0.0 1.717 2.367 2.834 3.223 3.554 3.852 4.14 4.621 4.828 5.032 5.209 5.603 5.771 6.089 6.394 6.684 6.835 7.122 7.365 7.708 7.926 8.138 8.469 8.784 9.065 9.341 9.621 9.968 10.281 10.577 10.943 11.288 11.61 11.987 12.401 12.765 13.141 13.571 14.061 14.56 15.088 15.665 16.197 16.784 17.359 17.928 18.463 18.855 18.942 18.424 17.041 15.74 14.452 13.045 11.603 10.3 9.165 8.227 7.311 6.489 5.759 5.078 4.445 3.865 3.305 2.695 2.17 1.73 1.287 0.843 0.47 0.055 -0.38 -0.714 -1.065 -1.427 -1.783 -2.127 -2.371 -2.639 -3.055 -3.346 -3.651 -3.803 -4.116 -4.452 -4.827 -5.025 -5.447 -5.657 -5.907 -6.168 -6.722 -7.036 -7.37 -7.71 -8.101 -8.557 -9.18 -10.978 -7 ,27049 ,KEBNE ,16749286,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 11:54:58 CET,0.0 1.759 2.423 2.894 3.299 3.646 3.942 4.207 4.682 4.887 5.069 5.225 5.618 5.773 6.073 6.381 6.672 6.809 7.067 7.309 7.652 7.865 8.076 8.392 8.699 8.999 9.271 9.51 9.808 10.099 10.374 10.681 10.968 11.254 11.58 11.927 12.266 12.655 13.078 13.508 13.956 14.493 15.056 15.53 16.075 16.619 17.172 17.626 17.985 18.068 17.376 15.999 14.467 12.994 11.607 10.331 9.257 8.333 7.516 6.651 5.875 5.197 4.573 3.972 3.417 2.916 2.406 1.942 1.523 1.098 0.636 0.255 -0.119 -0.519 -0.848 -1.189 -1.534 -1.876 -2.23 -2.482 -2.735 -3.148 -3.439 -3.73 -3.879 -4.188 -4.525 -4.888 -5.083 -5.521 -5.748 -5.962 -6.182 -6.695 -6.978 -7.293 -7.657 -8.058 -8.521 -9.167 -10.826 -8 ,9185 ,KEBNE ,16749287,Wed Dec 1 10:02:09 CET,Wed Dec 1 11:53:24 CET,0.0 2.398 3.016 3.471 3.862 4.17 4.43 4.671 5.12 5.321 5.5 5.63 6.008 6.16 6.451 6.73 6.995 7.13 7.398 7.637 7.954 8.159 8.358 8.653 8.941 9.214 9.469 9.715 10.047 10.364 10.64 10.962 11.277 11.569 11.892 12.227 12.547 12.912 13.302 13.711 14.13 14.581 15.087 15.566 16.069 16.604 17.196 17.712 18.07 18.124 17.44 15.937 14.488 13.038 11.648 10.34 9.182 8.115 7.127 6.142 5.307 4.56 3.823 3.123 2.492 1.921 1.299 0.753 0.298 -0.173 -0.642 -1.023 -1.426 -1.853 -2.183 -2.519 -2.87 -3.228 -3.608 -3.879 -4.142 -4.521 -4.79 -5.099 -5.266 -5.622 -5.984 -6.342 -6.533 -6.958 -7.161 -7.404 -7.662 -8.167 -8.453 -8.795 -9.171 -9.562 -9.995 -10.592 -11.851 -9 ,7618 ,KEBNE ,16749288,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 11:53:17 CET,0.0 1.902 2.486 2.966 3.355 3.68 3.98 4.236 4.677 4.881 5.08 5.256 5.656 5.833 6.122 6.403 6.684 6.813 7.053 7.286 7.637 7.847 8.054 8.359 8.618 8.867 9.112 9.352 9.663 9.957 10.253 10.602 10.914 11.208 11.534 11.919 12.313 12.733 13.167 13.614 14.052 14.522 15.037 15.507 16.053 16.675 17.289 17.785 18.134 18.185 17.472 15.866 14.168 12.545 11.128 9.795 8.595 7.53 6.597 5.661 4.899 4.216 3.515 2.85 2.215 1.629 1.03 0.498 0.017 -0.484 -0.98 -1.384 -1.817 -2.253 -2.585 -2.948 -3.308 -3.672 -4.066 -4.329 -4.602 -5.048 -5.344 -5.633 -5.781 -6.097 -6.422 -6.762 -6.952 -7.374 -7.57 -7.806 -8.052 -8.521 -8.789 -9.099 -9.458 -9.865 -10.314 -10.873 -12.469 -10 ,22063 ,KEBNE ,16749289,Wed Dec 1 10:02:09 CET,Wed Dec 1 11:53:16 CET,0.0 2.778 3.443 3.964 4.443 4.859 5.23 5.565 6.142 6.394 6.618 6.796 7.197 7.381 7.712 8.002 8.295 8.438 8.709 8.973 9.342 9.567 9.787 10.108 10.429 10.737 11.021 11.297 11.639 11.943 12.23 12.575 12.902 13.23 13.613 14.014 14.396 14.823 15.267 15.747 16.233 16.721 17.261 17.766 18.275 18.779 19.319 19.833 20.332 20.583 20.086 18.591 16.99 15.46 14.086 12.811 11.701 10.723 9.803 8.845 8.071 7.406 6.776 6.177 5.605 5.104 4.577 4.106 3.7 3.266 2.794 2.384 1.938 1.472 1.123 0.77 0.424 0.073 -0.299 -0.565 -0.837 -1.253 -1.554 -1.862 -2.023 -2.381 -2.788 -3.189 -3.37 -3.778 -3.966 -4.198 -4.441 -4.972 -5.255 -5.553 -5.889 -6.232 -6.64 -7.204 -8.481 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt deleted file mode 100644 index 204c4452..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15927 ,KEBNE ,16749290,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:02:59 CET,0.0 1.981 2.73 3.35 3.862 4.321 4.746 5.131 5.812 6.129 6.425 6.682 7.276 7.537 8.036 8.504 8.93 9.126 9.51 9.861 10.379 10.711 11.022 11.486 11.94 12.399 12.848 13.266 13.779 14.253 14.693 15.219 15.734 16.237 16.826 17.466 18.048 18.645 19.232 19.832 20.457 21.179 22.043 22.817 23.574 24.487 25.436 26.167 26.888 27.335 26.992 25.571 23.851 22.251 20.784 19.365 18.069 16.879 15.818 14.759 13.83 12.974 12.145 11.338 10.552 9.829 9.075 8.37 7.753 7.086 6.331 5.689 5.035 4.342 3.82 3.305 2.77 2.205 1.626 1.232 0.816 0.161 -0.292 -0.753 -0.992 -1.5 -2.029 -2.583 -2.871 -3.484 -3.835 -4.185 -4.55 -5.374 -5.856 -6.381 -6.934 -7.523 -8.22 -9.18 -12.975 -2 ,4309 ,KEBNE ,16749291,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 12:01:55 CET,0.0 2.216 3.065 3.726 4.311 4.864 5.337 5.752 6.53 6.91 7.282 7.611 8.245 8.545 9.123 9.687 10.201 10.447 10.919 11.362 12.006 12.411 12.805 13.373 13.908 14.403 14.879 15.35 15.942 16.505 17.033 17.651 18.245 18.815 19.441 20.063 20.588 21.164 21.782 22.394 23.017 23.677 24.398 25.101 25.899 26.782 27.73 28.559 29.177 29.445 28.929 27.348 25.557 23.831 22.281 20.888 19.635 18.456 17.387 16.292 15.364 14.475 13.61 12.817 12.031 11.307 10.524 9.814 9.225 8.597 7.934 7.38 6.796 6.152 5.642 5.106 4.538 3.958 3.35 2.927 2.493 1.813 1.353 0.885 0.642 0.136 -0.412 -0.999 -1.309 -1.947 -2.325 -2.703 -3.11 -3.981 -4.497 -5.11 -5.787 -6.507 -7.375 -8.698 -14.21 -3 ,5428 ,KEBNE ,16749292,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:02:22 CET,0.0 1.932 2.568 3.08 3.52 3.913 4.277 4.606 5.159 5.407 5.648 5.792 6.345 6.549 6.907 7.266 7.617 7.777 8.074 8.365 8.787 9.062 9.356 9.789 10.165 10.494 10.819 11.151 11.577 11.962 12.32 12.753 13.151 13.53 13.988 14.495 14.963 15.466 15.993 16.581 17.194 17.824 18.506 19.193 19.945 20.694 21.499 22.174 22.596 22.799 22.297 20.889 19.386 17.925 16.607 15.362 14.148 12.916 11.886 10.949 10.143 9.41 8.703 8.022 7.376 6.778 6.163 5.601 5.093 4.548 3.963 3.47 2.967 2.446 2.031 1.597 1.129 0.651 0.176 -0.145 -0.478 -1.038 -1.426 -1.823 -2.037 -2.49 -2.98 -3.52 -3.804 -4.411 -4.719 -5.042 -5.364 -6.052 -6.443 -6.878 -7.353 -7.901 -8.534 -9.386 -11.788 -4 ,8543 ,KEBNE ,16749293,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:01:58 CET,0.0 2.521 3.146 3.719 4.185 4.579 4.924 5.239 5.811 6.077 6.343 6.502 7.038 7.245 7.639 8.017 8.384 8.563 8.905 9.213 9.642 9.913 10.173 10.563 10.947 11.319 11.643 11.944 12.346 12.735 13.121 13.576 14.0 14.378 14.77 15.213 15.673 16.152 16.629 17.139 17.664 18.224 18.835 19.413 20.026 20.609 21.135 21.812 22.65 23.116 22.82 21.747 20.536 19.204 17.826 16.504 15.309 14.193 13.232 12.297 11.466 10.714 9.973 9.242 8.571 7.967 7.327 6.733 6.205 5.657 5.102 4.634 4.126 3.602 3.197 2.768 2.326 1.857 1.333 0.976 0.608 0.01 -0.379 -0.782 -0.998 -1.452 -1.919 -2.39 -2.647 -3.232 -3.484 -3.791 -4.117 -4.81 -5.188 -5.617 -6.097 -6.61 -7.247 -8.07 -9.853 -5 ,24049 ,KEBNE ,16749294,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 12:05:37 CET,0.0 2.281 3.005 3.521 3.932 4.3 4.642 4.961 5.512 5.743 5.976 6.096 6.6 6.805 7.215 7.593 7.963 8.14 8.471 8.791 9.262 9.57 9.874 10.314 10.71 11.045 11.371 11.688 12.056 12.416 12.76 13.135 13.491 13.852 14.269 14.744 15.214 15.718 16.248 16.79 17.3 17.824 18.431 18.996 19.561 20.088 20.632 21.143 21.592 21.848 21.388 20.088 18.575 17.043 15.698 14.506 13.361 12.26 11.294 10.297 9.41 8.591 7.797 7.051 6.356 5.695 5.009 4.417 3.9 3.364 2.794 2.312 1.818 1.288 0.884 0.483 0.051 -0.413 -0.92 -1.275 -1.639 -2.206 -2.601 -3.011 -3.221 -3.66 -4.13 -4.644 -4.91 -5.479 -5.723 -6.017 -6.323 -7.034 -7.437 -7.848 -8.288 -8.807 -9.388 -10.111 -12.004 -6 ,12030 ,KEBNE ,16749295,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:02:19 CET,0.0 2.701 3.434 3.989 4.454 4.888 5.279 5.619 6.21 6.493 6.777 6.976 7.509 7.699 8.077 8.445 8.792 8.96 9.3 9.639 10.134 10.434 10.702 11.076 11.464 11.892 12.329 12.748 13.262 13.693 14.065 14.487 14.877 15.273 15.704 16.178 16.622 17.077 17.602 18.145 18.651 19.22 19.853 20.556 21.473 22.418 23.3 23.954 24.553 24.911 24.659 23.543 21.907 20.179 18.634 17.251 16.016 14.878 13.85 12.75 11.761 10.879 10.024 9.159 8.357 7.649 6.903 6.217 5.603 4.957 4.262 3.702 3.126 2.501 1.991 1.457 0.924 0.391 -0.166 -0.563 -0.976 -1.627 -2.096 -2.599 -2.846 -3.334 -3.858 -4.407 -4.687 -5.295 -5.654 -6.01 -6.384 -7.178 -7.622 -8.117 -8.673 -9.305 -10.126 -11.271 -14.338 -7 ,30923 ,KEBNE ,16749296,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:01:43 CET,0.0 4.003 4.947 5.773 6.42 6.956 7.465 7.959 8.862 9.24 9.578 9.843 10.419 10.681 11.173 11.603 11.987 12.167 12.538 12.919 13.44 13.735 14.018 14.414 14.778 15.146 15.517 15.864 16.291 16.712 17.104 17.545 17.953 18.355 18.834 19.343 19.811 20.321 20.85 21.414 22.041 22.733 23.44 24.08 24.735 25.386 26.042 26.628 27.143 27.451 27.028 25.632 24.1 22.647 21.269 19.958 18.781 17.66 16.667 15.686 14.815 14.003 13.234 12.514 11.827 11.161 10.41 9.754 9.204 8.608 7.999 7.508 6.994 6.455 6.029 5.575 5.11 4.655 4.18 3.848 3.508 2.957 2.563 2.154 1.94 1.504 1.02 0.479 0.202 -0.384 -0.625 -0.936 -1.301 -2.115 -2.55 -3.0 -3.507 -4.077 -4.745 -5.544 -7.622 -8 ,32346 ,KEBNE ,16749297,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:03:04 CET,0.0 1.557 2.23 2.713 3.092 3.464 3.816 4.144 4.698 4.939 5.173 5.268 5.779 5.978 6.342 6.687 7.032 7.199 7.525 7.846 8.28 8.552 8.832 9.227 9.578 9.899 10.212 10.528 10.936 11.308 11.65 12.076 12.488 12.851 13.259 13.733 14.159 14.61 15.114 15.658 16.193 16.707 17.233 17.742 18.363 19.032 19.689 20.282 20.837 21.165 20.671 19.342 18.0 16.628 15.303 14.052 12.897 11.806 10.874 9.941 9.114 8.356 7.63 6.941 6.277 5.668 5.045 4.484 3.978 3.45 2.918 2.473 1.991 1.462 1.053 0.635 0.189 -0.267 -0.742 -1.077 -1.426 -2.0 -2.401 -2.798 -3.008 -3.447 -3.912 -4.424 -4.704 -5.302 -5.567 -5.886 -6.218 -6.921 -7.338 -7.788 -8.26 -8.794 -9.433 -10.218 -11.996 -9 ,17394 ,KEBNE ,16749298,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:03:09 CET,0.0 2.766 3.628 4.266 4.815 5.277 5.716 6.116 6.79 7.09 7.381 7.627 8.187 8.426 8.877 9.291 9.686 9.877 10.219 10.551 11.035 11.328 11.607 12.037 12.469 12.872 13.263 13.633 14.069 14.466 14.855 15.298 15.688 16.078 16.501 16.941 17.356 17.787 18.265 18.755 19.214 19.701 20.23 20.713 21.237 21.793 22.389 22.987 23.469 23.768 23.66 22.807 21.529 20.026 18.62 17.257 16.017 14.819 13.726 12.598 11.637 10.836 10.078 9.341 8.665 8.046 7.377 6.784 6.272 5.74 5.174 4.678 4.134 3.522 3.046 2.572 2.081 1.557 1.014 0.629 0.235 -0.362 -0.804 -1.269 -1.508 -1.999 -2.517 -3.061 -3.345 -3.96 -4.291 -4.633 -4.986 -5.752 -6.174 -6.623 -7.121 -7.74 -8.487 -9.371 -11.811 -10 ,2097 ,KEBNE ,16749299,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:03:32 CET,0.0 4.367 5.287 5.983 6.623 7.155 7.606 8.048 8.804 9.151 9.48 9.781 10.412 10.706 11.27 11.793 12.265 12.49 12.931 13.362 13.976 14.353 14.728 15.308 15.83 16.288 16.717 17.118 17.621 18.122 18.632 19.199 19.684 20.187 20.756 21.321 21.849 22.425 23.042 23.662 24.282 24.979 25.748 26.575 27.487 28.24 29.026 29.758 30.383 30.952 30.794 29.396 27.846 26.343 24.925 23.62 22.443 21.319 20.366 19.396 18.502 17.673 16.839 16.034 15.284 14.572 13.841 13.214 12.651 12.021 11.355 10.808 10.232 9.634 9.162 8.676 8.174 7.64 7.08 6.695 6.302 5.668 5.201 4.716 4.464 3.961 3.467 2.925 2.631 2.025 1.708 1.371 1.012 0.212 -0.217 -0.67 -1.183 -1.802 -2.587 -3.607 -7.358 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt deleted file mode 100644 index 01900457..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7391 ,KEBNE ,16749300,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:02:08 CET,0.0 2.918 3.727 4.401 4.98 5.504 5.944 6.333 7.037 7.355 7.661 7.916 8.516 8.777 9.272 9.75 10.204 10.42 10.834 11.246 11.833 12.19 12.535 13.046 13.523 13.973 14.41 14.829 15.372 15.887 16.354 16.911 17.457 17.994 18.612 19.296 19.973 20.716 21.466 22.202 22.964 23.783 24.691 25.592 26.544 27.487 28.527 29.536 30.359 30.655 29.941 27.991 25.774 23.696 21.775 19.973 18.33 16.862 15.66 14.436 13.355 12.382 11.439 10.529 9.665 8.898 8.114 7.407 6.794 6.176 5.539 4.989 4.415 3.832 3.362 2.872 2.381 1.851 1.282 0.909 0.54 -0.031 -0.438 -0.861 -1.079 -1.535 -2.017 -2.525 -2.789 -3.407 -3.668 -4.001 -4.349 -5.078 -5.5 -5.965 -6.463 -6.997 -7.647 -8.543 -10.994 -2 ,15280 ,KEBNE ,16749301,Wed Dec 1 10:02:09 CET,Wed Dec 1 12:00:40 CET,0.0 3.711 4.78 5.541 6.135 6.656 7.095 7.473 8.163 8.478 8.784 9.041 9.635 9.892 10.372 10.843 11.291 11.507 11.931 12.334 12.886 13.231 13.563 14.028 14.476 14.907 15.311 15.712 16.247 16.766 17.247 17.812 18.364 18.888 19.467 20.067 20.654 21.331 22.001 22.651 23.324 24.056 24.926 25.806 26.747 27.674 28.648 29.671 30.535 30.895 30.368 28.77 26.756 24.707 22.899 21.095 19.426 17.94 16.658 15.379 14.268 13.283 12.325 11.415 10.608 9.867 9.061 8.351 7.751 7.123 6.463 5.908 5.329 4.738 4.274 3.79 3.312 2.807 2.258 1.874 1.465 0.857 0.454 0.035 -0.175 -0.609 -1.077 -1.588 -1.865 -2.489 -2.74 -3.063 -3.426 -4.214 -4.653 -5.138 -5.674 -6.262 -6.921 -7.78 -10.892 -3 ,96 ,KEBNE ,16749302,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:01:13 CET,0.0 2.651 3.525 4.13 4.637 5.13 5.576 5.962 6.622 6.917 7.211 7.449 8.044 8.307 8.778 9.211 9.627 9.832 10.204 10.554 11.063 11.385 11.703 12.151 12.564 12.96 13.356 13.739 14.231 14.698 15.133 15.664 16.19 16.703 17.296 17.941 18.529 19.157 19.84 20.602 21.356 22.153 23.046 23.853 24.704 25.622 26.649 27.66 28.45 28.898 28.466 26.537 24.406 22.33 20.359 18.57 17.046 15.647 14.367 13.073 11.972 10.99 10.058 9.156 8.336 7.598 6.813 6.124 5.535 4.896 4.219 3.659 3.089 2.535 2.109 1.658 1.185 0.699 0.187 -0.168 -0.527 -1.103 -1.52 -1.96 -2.192 -2.712 -3.249 -3.805 -4.105 -4.745 -5.068 -5.416 -5.779 -6.531 -6.946 -7.388 -7.887 -8.506 -9.257 -10.311 -13.137 -4 ,19429 ,KEBNE ,16749303,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 11:59:56 CET,0.0 2.491 3.369 3.983 4.52 4.992 5.414 5.84 6.586 6.915 7.221 7.469 8.054 8.301 8.79 9.279 9.745 9.966 10.385 10.778 11.307 11.632 11.956 12.427 12.884 13.327 13.748 14.153 14.682 15.195 15.669 16.227 16.747 17.233 17.791 18.428 19.058 19.733 20.444 21.209 21.969 22.779 23.676 24.518 25.455 26.424 27.458 28.439 29.3 29.894 29.589 27.856 25.749 23.764 21.892 20.089 18.449 16.986 15.719 14.43 13.338 12.395 11.508 10.658 9.848 9.079 8.259 7.571 6.994 6.372 5.72 5.175 4.601 4.023 3.599 3.149 2.672 2.186 1.669 1.301 0.923 0.338 -0.078 -0.516 -0.745 -1.223 -1.731 -2.27 -2.54 -3.143 -3.377 -3.681 -4.009 -4.745 -5.153 -5.573 -6.014 -6.554 -7.223 -8.09 -10.599 -5 ,14443 ,KEBNE ,16749304,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:00:49 CET,0.0 2.578 3.49 4.161 4.736 5.25 5.678 6.068 6.775 7.1 7.409 7.683 8.283 8.531 9.0 9.465 9.904 10.11 10.528 10.935 11.497 11.852 12.192 12.669 13.119 13.561 13.996 14.411 14.952 15.479 15.989 16.572 17.093 17.604 18.196 18.859 19.536 20.263 20.981 21.71 22.445 23.248 24.166 25.07 26.091 27.189 28.335 29.455 30.449 30.9 30.521 28.983 26.779 24.605 22.611 20.796 19.158 17.629 16.312 15.025 13.938 12.979 12.094 11.25 10.455 9.718 8.955 8.274 7.673 7.065 6.444 5.919 5.368 4.81 4.382 3.938 3.465 2.958 2.435 2.076 1.708 1.143 0.748 0.324 0.107 -0.332 -0.786 -1.279 -1.55 -2.173 -2.41 -2.705 -3.021 -3.761 -4.191 -4.658 -5.169 -5.764 -6.442 -7.291 -10.105 -6 ,29801 ,KEBNE ,16749305,Wed Dec 1 10:02:09 CET,Wed Dec 1 11:59:53 CET,0.0 3.005 3.945 4.701 5.341 5.862 6.311 6.729 7.457 7.779 8.077 8.335 8.92 9.16 9.64 10.107 10.533 10.73 11.114 11.484 12.029 12.383 12.717 13.188 13.641 14.079 14.501 14.891 15.394 15.895 16.366 16.936 17.482 17.982 18.565 19.22 19.831 20.488 21.166 21.872 22.591 23.413 24.38 25.325 26.327 27.343 28.464 29.469 30.34 30.826 30.213 28.44 26.408 24.36 22.43 20.52 18.768 17.236 15.933 14.608 13.455 12.438 11.472 10.559 9.72 8.958 8.121 7.348 6.7 6.047 5.377 4.822 4.248 3.638 3.146 2.641 2.141 1.637 1.117 0.74 0.321 -0.315 -0.74 -1.171 -1.395 -1.876 -2.391 -2.93 -3.212 -3.842 -4.12 -4.442 -4.787 -5.521 -5.915 -6.352 -6.868 -7.476 -8.221 -9.222 -11.854 -7 ,26825 ,KEBNE ,16749306,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:00:31 CET,0.0 3.293 4.184 4.905 5.485 5.956 6.378 6.787 7.57 7.911 8.228 8.5 9.106 9.371 9.868 10.338 10.777 10.989 11.403 11.808 12.384 12.738 13.081 13.581 14.056 14.515 14.943 15.329 15.803 16.273 16.742 17.306 17.837 18.323 18.88 19.522 20.132 20.818 21.543 22.255 22.961 23.759 24.684 25.575 26.591 27.678 28.853 30.01 30.973 31.495 31.153 29.444 27.357 25.416 23.57 21.748 20.117 18.656 17.395 16.123 15.069 14.112 13.142 12.268 11.47 10.728 9.96 9.285 8.709 8.103 7.474 6.939 6.365 5.777 5.326 4.86 4.375 3.892 3.399 3.047 2.684 2.115 1.713 1.291 1.072 0.613 0.101 -0.462 -0.745 -1.365 -1.592 -1.9 -2.231 -2.926 -3.331 -3.796 -4.302 -4.906 -5.617 -6.432 -9.45 -8 ,23976 ,KEBNE ,16749307,Wed Dec 1 10:02:09 CET,Wed Dec 1 12:00:16 CET,0.0 3.633 4.575 5.276 5.855 6.373 6.834 7.253 8.012 8.34 8.636 8.867 9.468 9.733 10.223 10.683 11.114 11.313 11.682 12.047 12.599 12.958 13.3 13.779 14.246 14.698 15.122 15.538 16.062 16.552 17.035 17.605 18.113 18.568 19.105 19.739 20.323 20.933 21.607 22.327 23.07 23.899 24.801 25.674 26.657 27.669 28.698 29.659 30.311 30.56 30.303 28.564 26.312 24.128 22.161 20.426 18.89 17.413 16.098 14.847 13.765 12.746 11.742 10.831 10.015 9.267 8.463 7.743 7.131 6.475 5.801 5.246 4.667 4.08 3.634 3.16 2.666 2.16 1.635 1.282 0.916 0.346 -0.053 -0.487 -0.713 -1.169 -1.648 -2.142 -2.397 -3.014 -3.263 -3.581 -3.908 -4.616 -5.028 -5.489 -6.007 -6.597 -7.294 -8.195 -10.949 -9 ,3069 ,KEBNE ,16749308,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 11:59:47 CET,0.0 2.479 3.35 3.987 4.516 4.975 5.39 5.773 6.428 6.738 7.043 7.291 7.877 8.121 8.584 9.043 9.487 9.694 10.111 10.524 11.091 11.439 11.773 12.247 12.703 13.16 13.601 14.019 14.546 15.063 15.582 16.182 16.719 17.22 17.834 18.501 19.12 19.789 20.494 21.237 21.986 22.807 23.715 24.61 25.653 26.714 27.869 29.039 29.982 30.589 30.3 28.664 26.613 24.561 22.675 20.91 19.294 17.813 16.58 15.332 14.217 13.239 12.322 11.449 10.639 9.893 9.094 8.385 7.769 7.134 6.482 5.921 5.329 4.718 4.243 3.749 3.233 2.699 2.148 1.771 1.395 0.818 0.402 -0.039 -0.268 -0.739 -1.229 -1.75 -2.036 -2.673 -2.963 -3.29 -3.622 -4.353 -4.775 -5.246 -5.764 -6.352 -7.044 -7.966 -10.208 -10 ,6424 ,KEBNE ,16749309,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 12:01:17 CET,0.0 4.142 5.017 5.644 6.161 6.637 7.069 7.466 8.178 8.493 8.793 9.017 9.597 9.845 10.326 10.78 11.223 11.434 11.848 12.256 12.826 13.186 13.542 14.06 14.527 14.96 15.389 15.796 16.296 16.776 17.239 17.787 18.318 18.821 19.377 20.008 20.627 21.276 21.96 22.673 23.396 24.237 25.187 26.077 27.031 28.02 29.122 30.249 31.15 31.538 31.05 29.275 27.219 25.137 23.274 21.635 20.13 18.727 17.5 16.214 15.101 14.129 13.203 12.325 11.517 10.801 10.034 9.325 8.733 8.139 7.525 7.003 6.455 5.888 5.441 4.981 4.486 3.96 3.428 3.052 2.661 2.061 1.646 1.192 0.949 0.46 -0.054 -0.59 -0.87 -1.496 -1.723 -2.025 -2.349 -3.109 -3.536 -3.967 -4.424 -4.929 -5.547 -6.408 -9.044 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt deleted file mode 100644 index 5584bef9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24644 ,KEBNE ,16749310,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 12:00:50 CET,0.0 1.648 2.305 2.815 3.241 3.614 3.934 4.222 4.696 4.893 5.085 5.233 5.658 5.824 6.134 6.413 6.673 6.802 7.049 7.274 7.583 7.776 7.96 8.209 8.453 8.686 8.901 9.108 9.374 9.628 9.868 10.16 10.443 10.687 10.936 11.213 11.474 11.741 11.979 12.182 12.398 12.643 12.819 12.917 13.012 13.004 12.771 12.312 11.575 10.213 7.327 3.591 0.382 -2.39 -4.748 -6.883 -8.762 -10.394 -11.742 -13.105 -14.284 -15.325 -16.343 -17.304 -18.178 -18.96 -19.769 -20.474 -21.077 -21.703 -22.348 -22.903 -23.493 -24.118 -24.597 -25.082 -25.572 -26.059 -26.565 -26.914 -27.291 -27.909 -28.331 -28.756 -28.972 -29.427 -29.921 -30.438 -30.716 -31.293 -31.622 -31.958 -32.321 -33.102 -33.522 -33.984 -34.489 -35.047 -35.734 -36.656 -39.24 -2 ,4252 ,KEBNE ,16749311,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:03:48 CET,0.0 1.658 2.317 2.846 3.275 3.631 3.948 4.242 4.732 4.935 5.141 5.31 5.724 5.89 6.205 6.478 6.738 6.86 7.094 7.32 7.651 7.847 8.021 8.278 8.517 8.739 8.959 9.173 9.438 9.675 9.899 10.161 10.399 10.62 10.857 11.118 11.338 11.552 11.796 12.029 12.251 12.487 12.701 12.829 12.878 12.846 12.654 12.212 11.428 10.038 7.335 3.783 0.769 -1.95 -4.352 -6.444 -8.255 -9.875 -11.261 -12.605 -13.795 -14.888 -15.877 -16.787 -17.637 -18.428 -19.249 -19.958 -20.578 -21.211 -21.871 -22.428 -22.98 -23.558 -24.023 -24.492 -24.967 -25.463 -25.983 -26.339 -26.705 -27.301 -27.711 -28.124 -28.342 -28.803 -29.298 -29.826 -30.121 -30.71 -31.038 -31.368 -31.71 -32.453 -32.892 -33.375 -33.899 -34.506 -35.178 -36.043 -41.033 -3 ,17997 ,KEBNE ,16749312,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 12:00:48 CET,0.0 1.842 2.468 2.933 3.317 3.65 3.955 4.236 4.733 4.947 5.15 5.289 5.7 5.863 6.167 6.432 6.677 6.8 7.027 7.239 7.527 7.703 7.879 8.135 8.383 8.619 8.828 9.029 9.295 9.53 9.746 10.017 10.266 10.474 10.709 10.98 11.219 11.443 11.689 11.939 12.143 12.361 12.611 12.769 12.812 12.704 12.443 12.0 11.165 9.721 6.98 3.276 0.054 -2.638 -4.967 -7.11 -8.954 -10.578 -11.979 -13.378 -14.553 -15.602 -16.601 -17.511 -18.353 -19.144 -19.965 -20.697 -21.325 -21.982 -22.676 -23.257 -23.866 -24.485 -24.97 -25.466 -25.96 -26.478 -27.019 -27.39 -27.786 -28.418 -28.851 -29.302 -29.529 -30.006 -30.524 -31.047 -31.319 -31.882 -32.212 -32.539 -32.881 -33.643 -34.05 -34.478 -34.957 -35.516 -36.169 -37.044 -40.071 -4 ,1981 ,KEBNE ,16749313,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 12:01:16 CET,0.0 1.599 2.242 2.713 3.142 3.545 3.872 4.144 4.65 4.869 5.071 5.219 5.652 5.845 6.175 6.473 6.753 6.883 7.136 7.367 7.683 7.878 8.064 8.322 8.565 8.797 9.014 9.222 9.487 9.724 9.931 10.174 10.404 10.62 10.856 11.108 11.347 11.587 11.83 12.082 12.301 12.528 12.736 12.833 12.92 12.922 12.731 12.309 11.509 9.972 6.975 3.061 -0.143 -2.752 -5.034 -7.114 -8.951 -10.611 -12.008 -13.353 -14.483 -15.496 -16.445 -17.323 -18.171 -18.969 -19.8 -20.519 -21.116 -21.726 -22.374 -22.913 -23.473 -24.066 -24.533 -25.02 -25.526 -26.051 -26.593 -26.956 -27.335 -27.945 -28.364 -28.795 -29.016 -29.519 -30.072 -30.615 -30.893 -31.473 -31.829 -32.19 -32.54 -33.25 -33.689 -34.206 -34.745 -35.301 -35.948 -36.855 -39.746 -5 ,15166 ,KEBNE ,16749314,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 12:04:09 CET,0.0 1.809 2.419 2.898 3.307 3.661 3.975 4.257 4.762 4.979 5.191 5.34 5.767 5.94 6.261 6.561 6.829 6.956 7.2 7.422 7.739 7.956 8.163 8.442 8.698 8.935 9.169 9.394 9.679 9.952 10.203 10.491 10.762 11.023 11.305 11.592 11.853 12.143 12.44 12.702 12.934 13.179 13.406 13.543 13.648 13.646 13.492 13.124 12.275 10.727 7.88 4.011 0.674 -2.109 -4.455 -6.526 -8.28 -9.874 -11.266 -12.65 -13.824 -14.847 -15.844 -16.796 -17.666 -18.446 -19.252 -19.972 -20.61 -21.27 -21.956 -22.53 -23.115 -23.738 -24.241 -24.75 -25.265 -25.811 -26.368 -26.738 -27.128 -27.721 -28.128 -28.551 -28.778 -29.27 -29.784 -30.326 -30.602 -31.171 -31.473 -31.798 -32.136 -32.892 -33.319 -33.775 -34.293 -34.887 -35.57 -36.532 -39.951 -6 ,2656 ,KEBNE ,16749315,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 12:04:11 CET,0.0 2.049 2.683 3.117 3.482 3.819 4.125 4.403 4.875 5.091 5.296 5.426 5.845 6.017 6.34 6.636 6.903 7.032 7.278 7.516 7.853 8.058 8.254 8.524 8.763 8.996 9.227 9.448 9.726 9.984 10.227 10.495 10.743 10.973 11.207 11.448 11.659 11.873 12.096 12.341 12.568 12.738 12.913 13.06 13.096 13.056 12.907 12.501 11.769 10.419 7.692 4.068 0.925 -1.747 -3.913 -5.788 -7.488 -9.043 -10.387 -11.735 -12.888 -13.912 -14.867 -15.768 -16.606 -17.367 -18.164 -18.846 -19.426 -20.065 -20.77 -21.349 -21.933 -22.529 -22.987 -23.473 -23.977 -24.487 -25.021 -25.386 -25.76 -26.336 -26.725 -27.125 -27.339 -27.817 -28.313 -28.824 -29.1 -29.665 -29.983 -30.299 -30.624 -31.349 -31.754 -32.211 -32.739 -33.292 -33.879 -34.717 -37.175 -7 ,2542 ,KEBNE ,16749316,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:00:02 CET,0.0 1.791 2.408 2.901 3.33 3.675 3.979 4.259 4.762 4.978 5.171 5.289 5.701 5.869 6.166 6.44 6.708 6.836 7.075 7.289 7.596 7.8 7.999 8.289 8.559 8.814 9.047 9.263 9.531 9.769 10.005 10.283 10.534 10.777 11.047 11.334 11.597 11.865 12.132 12.371 12.598 12.835 13.047 13.185 13.239 13.225 13.089 12.693 11.889 10.388 7.406 3.707 0.609 -2.155 -4.503 -6.575 -8.389 -10.003 -11.407 -12.831 -14.031 -15.09 -16.088 -16.995 -17.855 -18.647 -19.454 -20.168 -20.789 -21.449 -22.156 -22.728 -23.309 -23.919 -24.392 -24.88 -25.376 -25.891 -26.438 -26.818 -27.213 -27.824 -28.244 -28.671 -28.889 -29.347 -29.835 -30.36 -30.641 -31.214 -31.541 -31.865 -32.2 -32.945 -33.368 -33.819 -34.316 -34.877 -35.558 -36.487 -39.399 -8 ,30365 ,KEBNE ,16749317,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:03:38 CET,0.0 1.753 2.409 2.929 3.328 3.67 3.958 4.222 4.694 4.906 5.108 5.24 5.659 5.829 6.145 6.427 6.687 6.813 7.058 7.29 7.61 7.81 8.002 8.257 8.509 8.751 8.969 9.185 9.451 9.683 9.901 10.168 10.43 10.666 10.93 11.209 11.464 11.73 11.959 12.171 12.392 12.618 12.837 12.983 13.026 12.999 12.855 12.401 11.603 10.172 7.314 3.559 0.402 -2.287 -4.62 -6.7 -8.53 -10.177 -11.576 -12.994 -14.219 -15.257 -16.231 -17.154 -17.996 -18.757 -19.544 -20.221 -20.806 -21.435 -22.1 -22.644 -23.21 -23.79 -24.238 -24.73 -25.237 -25.77 -26.337 -26.711 -27.092 -27.722 -28.157 -28.594 -28.823 -29.291 -29.785 -30.297 -30.566 -31.159 -31.544 -31.89 -32.242 -32.954 -33.372 -33.898 -34.466 -35.033 -35.698 -36.629 -40.387 -9 ,66 ,KEBNE ,16749318,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 12:02:59 CET,0.0 2.092 2.822 3.332 3.747 4.109 4.436 4.737 5.282 5.531 5.761 5.916 6.323 6.501 6.853 7.172 7.464 7.603 7.862 8.115 8.459 8.673 8.874 9.152 9.431 9.688 9.926 10.154 10.427 10.689 10.945 11.225 11.474 11.705 11.976 12.28 12.539 12.796 13.068 13.332 13.565 13.778 13.959 14.101 14.193 14.212 14.074 13.576 12.594 10.974 7.972 3.963 0.645 -2.137 -4.492 -6.627 -8.498 -10.134 -11.546 -12.955 -14.163 -15.234 -16.27 -17.243 -18.144 -18.972 -19.816 -20.566 -21.216 -21.897 -22.599 -23.171 -23.767 -24.373 -24.848 -25.354 -25.868 -26.408 -26.985 -27.372 -27.765 -28.369 -28.78 -29.221 -29.448 -29.915 -30.419 -30.959 -31.24 -31.805 -32.122 -32.446 -32.787 -33.539 -33.964 -34.412 -34.905 -35.497 -36.205 -37.127 -39.32 -10 ,2335 ,KEBNE ,16749319,Wed Dec 1 10:02:10 CET,Wed Dec 1 12:02:08 CET,0.0 1.511 2.119 2.582 2.963 3.289 3.59 3.882 4.392 4.612 4.81 4.919 5.336 5.504 5.826 6.127 6.404 6.534 6.792 7.029 7.347 7.54 7.724 7.993 8.231 8.452 8.676 8.883 9.138 9.4 9.643 9.909 10.164 10.418 10.704 10.978 11.199 11.418 11.637 11.867 12.099 12.33 12.522 12.612 12.659 12.65 12.512 12.16 11.406 9.928 7.004 3.177 -0.052 -2.775 -5.178 -7.364 -9.229 -10.879 -12.31 -13.746 -14.981 -16.056 -17.052 -17.96 -18.784 -19.527 -20.311 -21.013 -21.631 -22.274 -22.921 -23.48 -24.085 -24.7 -25.165 -25.639 -26.131 -26.634 -27.175 -27.551 -27.933 -28.533 -28.95 -29.395 -29.627 -30.092 -30.598 -31.124 -31.387 -31.954 -32.24 -32.557 -32.895 -33.587 -33.983 -34.419 -34.917 -35.496 -36.177 -37.129 -40.317 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 5d4c2eaa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14208 ,KEBNE ,16749320,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 11:56:04 CET,0.0 0.58 1.015 1.382 1.718 2.019 2.293 2.783 3.004 3.215 3.39 3.836 4.02 4.387 4.742 5.066 5.216 5.509 5.793 6.208 6.488 6.762 7.151 7.519 7.863 8.198 8.524 8.935 9.333 9.715 10.188 10.665 11.119 11.649 12.267 12.845 13.466 14.16 14.899 15.66 16.516 17.491 18.479 19.692 21.013 22.505 24.198 26.054 28.083 30.342 31.674 32.045 32.05 31.786 31.309 30.839 30.336 29.731 29.061 28.463 27.923 27.419 26.904 26.395 25.944 25.462 25.022 24.633 24.211 23.771 23.404 22.991 22.574 22.238 21.871 21.511 21.131 20.699 20.388 20.072 19.596 19.275 18.9 18.68 18.205 17.705 17.22 16.968 16.471 16.113 15.794 15.422 14.608 14.158 13.603 12.934 12.225 11.311 9.854 -2 ,15199 ,KEBNE ,16749321,Wed Dec 1 10:02:12 CET,Wed Dec 1 11:58:08 CET,0.0 0.641 1.126 1.519 1.896 2.229 2.508 3.015 3.253 3.489 3.662 4.096 4.275 4.619 4.959 5.274 5.425 5.727 6.025 6.451 6.717 6.972 7.345 7.704 8.051 8.401 8.735 9.157 9.553 9.928 10.385 10.831 11.247 11.743 12.33 12.893 13.512 14.182 14.898 15.658 16.509 17.509 18.544 19.75 21.004 22.306 23.726 25.433 27.335 29.156 30.071 30.183 29.982 29.588 29.083 28.579 28.095 27.571 27.002 26.488 25.97 25.451 24.936 24.423 23.947 23.453 23.011 22.595 22.154 21.7 21.275 20.833 20.369 19.99 19.62 19.242 18.833 18.389 18.065 17.737 17.221 16.823 16.392 16.16 15.669 15.187 14.679 14.423 13.942 13.59 13.302 12.988 12.219 11.704 11.081 10.419 9.664 8.787 7.615 -3 ,18649 ,KEBNE ,16749322,Wed Dec 1 10:02:11 CET,Wed Dec 1 11:59:38 CET,0.0 0.666 1.138 1.516 1.871 2.185 2.462 2.934 3.149 3.361 3.509 3.942 4.118 4.457 4.791 5.092 5.232 5.52 5.793 6.199 6.475 6.73 7.094 7.449 7.794 8.137 8.464 8.877 9.287 9.682 10.164 10.652 11.121 11.645 12.216 12.745 13.324 13.985 14.708 15.444 16.255 17.181 18.094 19.19 20.422 21.73 23.001 24.308 25.855 27.545 28.419 28.613 28.39 27.937 27.31 26.606 25.837 25.075 24.308 23.598 22.917 22.241 21.569 20.924 20.328 19.701 19.134 18.643 18.125 17.576 17.114 16.611 16.07 15.654 15.211 14.737 14.271 13.766 13.391 13.009 12.427 12.018 11.58 11.347 10.86 10.32 9.755 9.472 8.948 8.509 8.136 7.754 6.932 6.454 5.938 5.318 4.54 3.384 1.759 -4 ,8135 ,KEBNE ,16749323,Wed Dec 1 10:03:19 CET,Wed Dec 1 11:53:15 CET,0.0 0.505 0.908 1.252 1.549 1.822 2.07 2.519 2.723 2.913 3.025 3.432 3.592 3.9 4.197 4.491 4.627 4.891 5.154 5.529 5.761 5.982 6.307 6.625 6.929 7.228 7.518 7.896 8.259 8.609 9.037 9.449 9.846 10.301 10.818 11.319 11.857 12.412 13.001 13.632 14.325 15.116 15.928 16.874 17.886 19.053 20.292 21.604 22.948 24.218 24.827 24.788 24.43 23.929 23.363 22.79 22.218 21.677 21.058 20.474 19.962 19.479 19.0 18.538 18.096 17.628 17.218 16.837 16.414 15.955 15.552 15.127 14.684 14.335 13.978 13.594 13.181 12.732 12.429 12.134 11.646 11.285 10.892 10.683 10.243 9.772 9.232 8.944 8.426 7.987 7.624 7.268 6.459 5.993 5.433 4.765 4.045 2.984 1.488 -5 ,1390 ,KEBNE ,16749324,Wed Dec 1 10:10:36 CET,Wed Dec 1 12:05:33 CET,0.0 0.518 0.941 1.32 1.67 1.987 2.258 2.737 2.964 3.172 3.308 3.735 3.917 4.274 4.605 4.913 5.062 5.354 5.636 6.051 6.319 6.582 6.964 7.327 7.68 8.022 8.355 8.777 9.193 9.607 10.085 10.545 10.985 11.484 12.068 12.631 13.24 13.925 14.676 15.459 16.336 17.31 18.25 19.367 20.616 22.057 23.637 25.375 27.319 29.416 30.47 30.449 30.005 29.418 28.783 28.168 27.554 26.962 26.344 25.781 25.272 24.762 24.244 23.732 23.251 22.722 22.232 21.831 21.402 20.944 20.579 20.176 19.744 19.416 19.048 18.651 18.262 17.834 17.524 17.199 16.677 16.315 15.937 15.731 15.289 14.828 14.353 14.082 13.562 13.179 12.837 12.439 11.62 11.165 10.595 9.937 9.252 8.244 6.769 -6 ,24055 ,KEBNE ,16749325,Wed Dec 1 10:10:36 CET,Wed Dec 1 12:04:29 CET,0.0 0.526 0.924 1.288 1.635 1.946 2.213 2.691 2.935 3.206 3.478 3.958 4.19 4.638 5.049 5.433 5.625 5.996 6.321 6.748 7.012 7.259 7.624 7.981 8.334 8.689 9.027 9.45 9.856 10.251 10.742 11.21 11.646 12.163 12.761 13.323 13.937 14.605 15.295 16.011 16.837 17.803 18.768 19.905 21.187 22.578 24.075 25.8 27.735 29.849 31.111 31.253 30.853 30.334 29.756 29.166 28.589 28.068 27.509 26.954 26.422 25.893 25.386 24.934 24.518 24.059 23.597 23.156 22.694 22.231 21.826 21.413 21.013 20.668 20.283 19.901 19.505 19.06 18.733 18.379 17.823 17.436 17.035 16.828 16.389 15.922 15.414 15.128 14.638 14.298 13.942 13.543 12.668 12.205 11.742 11.192 10.465 9.481 7.999 -7 ,23805 ,KEBNE ,16749326,Wed Dec 1 10:10:38 CET,Wed Dec 1 12:04:30 CET,0.0 0.494 0.88 1.203 1.486 1.743 1.986 2.435 2.634 2.818 2.929 3.343 3.515 3.837 4.119 4.379 4.503 4.762 5.018 5.368 5.593 5.823 6.164 6.49 6.811 7.121 7.414 7.788 8.15 8.503 8.923 9.323 9.703 10.14 10.611 11.054 11.578 12.157 12.777 13.404 14.068 14.871 15.686 16.622 17.659 18.842 20.089 21.406 22.925 24.445 25.093 25.058 24.748 24.278 23.682 23.102 22.539 22.014 21.438 20.901 20.4 19.891 19.4 18.933 18.501 18.015 17.547 17.17 16.791 16.372 16.009 15.605 15.169 14.812 14.43 14.045 13.654 13.214 12.898 12.583 12.103 11.775 11.414 11.224 10.825 10.384 9.915 9.656 9.151 8.732 8.38 7.991 7.159 6.736 6.257 5.642 4.868 3.964 2.548 -8 ,25256 ,KEBNE ,16749327,Wed Dec 1 10:10:38 CET,Wed Dec 1 12:05:07 CET,0.0 0.53 0.939 1.266 1.545 1.81 2.071 2.573 2.804 3.026 3.171 3.609 3.796 4.15 4.479 4.81 4.968 5.259 5.553 5.964 6.223 6.484 6.86 7.227 7.583 7.92 8.238 8.645 9.043 9.436 9.905 10.364 10.814 11.332 11.931 12.502 13.108 13.755 14.424 15.129 15.95 16.914 17.865 18.981 20.227 21.654 23.205 24.895 26.726 28.603 29.755 30.137 30.129 29.857 29.467 29.067 28.649 28.181 27.528 26.921 26.426 25.964 25.537 25.134 24.711 24.184 23.677 23.238 22.773 22.23 21.755 21.283 20.792 20.401 19.973 19.538 19.095 18.636 18.29 17.906 17.345 16.979 16.596 16.371 15.848 15.294 14.677 14.316 13.714 13.174 12.756 12.319 11.324 10.702 9.933 9.041 8.081 6.906 5.234 -9 ,7389 ,KEBNE ,16749328,Wed Dec 1 10:10:36 CET,Wed Dec 1 12:04:58 CET,0.0 0.556 0.991 1.349 1.657 1.945 2.208 2.68 2.899 3.108 3.284 3.72 3.896 4.235 4.555 4.857 5.008 5.297 5.574 5.977 6.242 6.506 6.869 7.204 7.521 7.844 8.178 8.595 8.975 9.336 9.77 10.202 10.63 11.121 11.654 12.167 12.75 13.354 14.005 14.706 15.467 16.367 17.306 18.363 19.536 20.978 22.641 24.536 26.665 28.939 30.41 30.833 30.586 30.14 29.635 29.1 28.578 28.075 27.52 26.951 26.311 25.617 24.967 24.365 23.777 23.146 22.591 22.104 21.564 20.977 20.499 19.998 19.453 19.03 18.594 18.139 17.669 17.16 16.795 16.393 15.737 15.306 14.876 14.658 14.204 13.665 13.06 12.762 12.24 11.844 11.525 11.163 10.326 9.817 9.249 8.642 7.933 7.095 5.965 -10 ,9960 ,KEBNE ,16749329,Wed Dec 1 10:10:36 CET,Wed Dec 1 12:06:12 CET,0.0 0.561 0.997 1.343 1.643 1.917 2.17 2.63 2.851 3.081 3.245 3.668 3.854 4.222 4.566 4.892 5.041 5.335 5.635 6.064 6.342 6.62 7.018 7.399 7.763 8.107 8.448 8.892 9.304 9.699 10.179 10.678 11.158 11.701 12.317 12.897 13.53 14.218 14.967 15.75 16.624 17.648 18.683 19.885 21.193 22.701 24.379 26.283 28.429 30.637 31.902 32.339 32.271 31.818 31.261 30.76 30.271 29.818 29.326 28.727 28.044 27.366 26.708 26.072 25.46 24.808 24.225 23.718 23.184 22.617 22.163 21.721 21.25 20.873 20.5 20.08 19.603 19.104 18.759 18.402 17.827 17.422 16.986 16.756 16.285 15.776 15.236 14.95 14.433 13.993 13.65 13.316 12.582 12.086 11.462 10.786 10.003 9.013 7.576 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt deleted file mode 100644 index c1a42b5e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24942 ,KEBNE ,16749330,Wed Dec 1 10:10:36 CET,Wed Dec 1 12:11:25 CET,0.0 3.491 4.435 5.114 5.734 6.252 6.694 7.115 7.922 8.289 8.625 8.938 9.579 9.857 10.418 10.966 11.461 11.704 12.175 12.613 13.228 13.628 14.02 14.577 15.113 15.655 16.176 16.65 17.257 17.861 18.446 19.176 19.898 20.537 21.215 21.994 22.786 23.693 24.664 25.674 26.705 27.846 29.186 30.433 31.703 33.013 34.399 35.805 37.26 38.465 38.869 37.973 36.572 34.963 33.405 31.945 30.517 29.181 28.039 26.861 25.811 24.821 23.87 23.016 22.201 21.46 20.656 19.908 19.273 18.608 17.901 17.315 16.715 16.078 15.573 15.056 14.52 13.952 13.376 12.97 12.542 11.87 11.421 10.979 10.745 10.261 9.728 9.136 8.824 8.185 7.817 7.47 7.109 6.299 5.838 5.332 4.802 4.173 3.403 2.462 -0.28 -2 ,29608 ,KEBNE ,16749331,Wed Dec 1 10:10:37 CET,Wed Dec 1 12:11:46 CET,0.0 1.995 2.805 3.369 3.804 4.214 4.61 5.011 5.793 6.158 6.49 6.763 7.394 7.689 8.236 8.765 9.269 9.512 9.978 10.418 11.046 11.423 11.779 12.297 12.786 13.26 13.715 14.148 14.739 15.306 15.843 16.515 17.137 17.743 18.475 19.28 20.046 20.891 21.78 22.733 23.72 24.773 25.969 27.148 28.329 29.521 30.935 32.403 33.746 34.967 35.86 35.38 34.165 32.708 31.26 29.875 28.597 27.422 26.363 25.237 24.236 23.316 22.398 21.535 20.741 20.009 19.225 18.492 17.877 17.246 16.582 16.023 15.418 14.81 14.338 13.813 13.256 12.681 12.098 11.698 11.27 10.611 10.151 9.685 9.447 8.917 8.338 7.749 7.452 6.817 6.42 6.055 5.665 4.804 4.341 3.853 3.325 2.694 1.949 0.999 -1.68 -3 ,19478 ,KEBNE ,16749332,Wed Dec 1 10:10:36 CET,Wed Dec 1 12:10:51 CET,0.0 3.895 4.954 5.673 6.289 6.888 7.403 7.852 8.691 9.08 9.461 9.827 10.499 10.808 11.388 11.971 12.519 12.772 13.225 13.639 14.232 14.598 14.954 15.478 15.981 16.47 16.957 17.414 18.005 18.589 19.135 19.782 20.415 21.03 21.736 22.539 23.321 24.137 25.008 25.972 26.946 28.009 29.308 30.57 31.963 33.357 34.724 36.087 37.428 38.666 39.129 38.332 36.986 35.433 33.935 32.42 30.996 29.701 28.523 27.269 26.163 25.176 24.259 23.385 22.54 21.771 20.947 20.171 19.503 18.817 18.084 17.484 16.875 16.24 15.733 15.194 14.667 14.13 13.551 13.137 12.699 12.028 11.563 11.089 10.848 10.353 9.83 9.237 8.921 8.289 7.936 7.587 7.21 6.41 5.974 5.518 5.034 4.461 3.699 2.676 -0.59 -4 ,7861 ,KEBNE ,16749333,Wed Dec 1 10:10:36 CET,Wed Dec 1 12:11:18 CET,0.0 3.67 4.631 5.379 5.996 6.538 6.988 7.36 8.059 8.402 8.743 9.013 9.63 9.908 10.44 10.959 11.435 11.663 12.121 12.571 13.214 13.615 13.999 14.525 15.029 15.527 16.017 16.499 17.1 17.694 18.264 18.9 19.516 20.099 20.769 21.544 22.285 23.087 23.888 24.752 25.709 26.713 27.82 28.971 30.362 31.796 33.263 34.791 36.258 37.514 38.151 37.538 36.16 34.581 33.183 31.792 30.344 28.964 27.723 26.48 25.493 24.597 23.673 22.778 21.964 21.235 20.465 19.8 19.205 18.533 17.858 17.305 16.716 16.073 15.54 14.991 14.448 13.898 13.284 12.852 12.415 11.726 11.264 10.805 10.572 10.074 9.523 8.916 8.588 7.953 7.604 7.255 6.885 6.093 5.624 5.087 4.509 3.874 3.142 2.194 -0.815 -5 ,5297 ,KEBNE ,16749334,Wed Dec 1 10:10:39 CET,Wed Dec 1 12:15:03 CET,0.0 3.344 4.457 5.281 5.986 6.596 7.145 7.67 8.614 9.038 9.413 9.724 10.355 10.673 11.328 11.965 12.543 12.801 13.309 13.827 14.522 14.948 15.387 15.995 16.516 17.041 17.583 18.099 18.763 19.407 20.019 20.802 21.589 22.311 23.106 24.02 24.877 25.776 26.786 27.825 28.823 29.877 31.079 32.279 33.661 35.113 36.644 38.165 39.664 41.181 42.102 41.597 40.46 38.885 37.353 35.913 34.528 33.318 32.248 31.12 30.098 29.134 28.197 27.276 26.4 25.601 24.724 23.963 23.329 22.675 21.979 21.366 20.773 20.125 19.604 19.097 18.528 17.884 17.207 16.743 16.247 15.441 14.885 14.331 14.058 13.47 12.857 12.22 11.868 11.177 10.754 10.361 9.931 9.001 8.468 7.908 7.294 6.557 5.691 4.548 1.04 -6 ,18972 ,KEBNE ,16749335,Wed Dec 1 10:10:38 CET,Wed Dec 1 12:16:03 CET,0.0 4.842 5.88 6.616 7.241 7.818 8.361 8.834 9.656 10.037 10.415 10.824 11.497 11.825 12.431 12.996 13.544 13.809 14.34 14.824 15.5 15.952 16.409 17.044 17.618 18.162 18.647 19.139 19.792 20.374 20.962 21.71 22.417 23.092 23.848 24.627 25.367 26.205 27.114 28.047 29.014 30.093 31.358 32.589 33.945 35.372 36.736 38.161 39.781 41.173 42.087 41.697 40.597 39.171 37.545 35.974 34.575 33.161 31.835 30.541 29.447 28.462 27.485 26.535 25.67 24.884 24.033 23.269 22.6 21.89 21.155 20.556 19.951 19.357 18.904 18.421 17.905 17.368 16.816 16.428 16.018 15.376 14.945 14.51 14.283 13.804 13.309 12.799 12.535 11.946 11.662 11.34 10.967 10.08 9.599 9.086 8.519 7.877 7.084 5.944 1.101 -7 ,32404 ,KEBNE ,16749336,Wed Dec 1 10:10:38 CET,Wed Dec 1 12:11:26 CET,0.0 4.386 5.656 6.49 7.192 7.828 8.353 8.834 9.756 10.161 10.536 10.953 11.64 11.983 12.614 13.191 13.754 14.02 14.527 15.041 15.796 16.282 16.75 17.398 17.97 18.463 18.934 19.389 19.982 20.552 21.092 21.73 22.336 22.914 23.571 24.281 24.973 25.768 26.611 27.52 28.477 29.526 30.734 31.927 33.342 34.846 36.423 38.104 39.746 41.205 42.279 42.081 40.843 39.21 37.651 36.26 34.936 33.575 32.359 31.111 30.041 29.042 28.066 27.176 26.315 25.497 24.627 23.868 23.235 22.606 21.971 21.418 20.828 20.208 19.713 19.196 18.663 18.093 17.504 17.111 16.682 15.992 15.548 15.086 14.835 14.331 13.796 13.215 12.911 12.285 11.923 11.555 11.185 10.419 10.003 9.544 9.054 8.511 7.862 6.986 3.995 -8 ,6345 ,KEBNE ,16749337,Wed Dec 1 10:10:38 CET,Wed Dec 1 12:13:21 CET,0.0 4.875 5.986 6.806 7.487 8.109 8.634 9.101 10.039 10.474 10.875 11.287 11.979 12.32 12.962 13.57 14.138 14.42 14.974 15.479 16.176 16.617 17.044 17.659 18.206 18.73 19.263 19.784 20.468 21.127 21.764 22.537 23.287 24.011 24.821 25.706 26.59 27.574 28.592 29.603 30.639 31.763 32.931 34.072 35.358 36.719 38.144 39.605 41.06 42.337 43.073 42.605 41.64 40.412 39.107 37.694 36.3 35.099 34.059 32.893 31.858 30.92 30.01 29.182 28.417 27.731 26.992 26.321 25.737 25.122 24.493 23.969 23.413 22.831 22.362 21.878 21.387 20.869 20.35 19.965 19.546 18.896 18.434 17.948 17.7 17.186 16.641 16.057 15.754 15.152 14.832 14.463 14.085 13.324 12.893 12.383 11.806 11.182 10.423 9.478 6.37 -9 ,18046 ,KEBNE ,16749338,Wed Dec 1 10:10:37 CET,Wed Dec 1 12:12:58 CET,0.0 2.257 3.086 3.698 4.193 4.659 5.085 5.477 6.206 6.533 6.848 7.115 7.708 7.981 8.501 8.979 9.434 9.656 10.096 10.522 11.128 11.53 11.91 12.45 12.986 13.498 13.99 14.479 15.117 15.693 16.208 16.842 17.464 18.059 18.724 19.449 20.166 20.924 21.746 22.615 23.48 24.451 25.653 26.893 28.219 29.603 31.054 32.515 33.903 35.134 35.969 35.518 34.348 32.864 31.295 29.758 28.397 27.168 26.112 24.999 24.014 23.168 22.281 21.4 20.6 19.847 19.065 18.353 17.706 17.041 16.365 15.813 15.216 14.574 14.091 13.595 13.068 12.506 11.921 11.529 11.12 10.474 10.037 9.591 9.348 8.836 8.328 7.829 7.573 6.987 6.697 6.346 5.974 5.185 4.736 4.248 3.702 3.099 2.388 1.41 -2.404 -10 ,12729 ,KEBNE ,16749339,Wed Dec 1 10:12:46 CET,Wed Dec 1 12:13:46 CET,0.0 1.707 2.477 3.096 3.586 4.036 4.459 4.831 5.499 5.819 6.121 6.394 7.015 7.282 7.783 8.247 8.692 8.915 9.338 9.752 10.36 10.744 11.131 11.697 12.223 12.717 13.205 13.679 14.277 14.848 15.392 16.044 16.676 17.28 17.975 18.789 19.547 20.326 21.158 22.109 23.153 24.259 25.479 26.678 28.002 29.416 31.072 32.64 33.985 35.112 35.762 35.336 34.345 33.115 31.642 30.092 28.748 27.526 26.437 25.375 24.405 23.457 22.545 21.65 20.79 20.016 19.242 18.53 17.866 17.154 16.398 15.77 15.111 14.431 13.921 13.418 12.892 12.326 11.719 11.288 10.841 10.133 9.659 9.181 8.917 8.358 7.785 7.161 6.834 6.203 5.803 5.402 4.985 4.064 3.554 3.008 2.421 1.768 1.003 0.063 -2.697 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index e7147e85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16915 ,KEBNE ,16749340,Wed Dec 1 10:12:47 CET,Wed Dec 1 12:14:03 CET,0.0 2.238 3.093 3.73 4.252 4.714 5.132 5.522 6.249 6.587 6.9 7.132 7.811 8.096 8.616 9.132 9.623 9.855 10.31 10.762 11.407 11.81 12.217 12.816 13.362 13.881 14.394 14.885 15.512 16.118 16.72 17.457 18.154 18.825 19.619 20.496 21.312 22.198 23.163 24.213 25.324 26.592 28.125 29.693 31.561 33.642 36.009 38.701 41.855 45.656 50.454 54.469 56.814 58.262 59.127 59.671 59.986 60.053 59.986 59.851 59.694 59.515 59.251 58.903 58.543 58.209 57.811 57.467 57.157 56.788 56.362 55.985 55.614 55.218 54.895 54.556 54.177 53.774 53.363 53.075 52.78 52.319 51.99 51.658 51.48 51.099 50.695 50.241 49.999 49.422 49.179 48.885 48.564 47.843 47.459 47.031 46.534 45.941 45.2 44.258 41.06 -2 ,13509 ,KEBNE ,16749341,Wed Dec 1 10:12:50 CET,Wed Dec 1 12:05:44 CET,0.0 2.297 3.117 3.742 4.262 4.71 5.129 5.524 6.242 6.579 6.903 7.121 7.779 8.05 8.573 9.078 9.562 9.791 10.221 10.647 11.285 11.688 12.065 12.601 13.119 13.629 14.124 14.605 15.233 15.844 16.436 17.162 17.866 18.536 19.299 20.197 21.107 22.089 23.146 24.282 25.452 26.761 28.309 29.897 31.726 33.783 36.265 39.093 42.421 46.3 50.971 54.917 57.163 58.523 59.412 59.858 60.066 60.201 60.217 60.147 59.999 59.802 59.554 59.246 58.957 58.68 58.316 57.954 57.66 57.355 57.013 56.714 56.369 55.97 55.661 55.356 55.008 54.624 54.231 53.948 53.641 53.154 52.806 52.448 52.266 51.887 51.48 51.01 50.757 50.172 49.94 49.656 49.337 48.596 48.176 47.697 47.176 46.624 45.936 44.963 41.504 -3 ,13404 ,KEBNE ,16749342,Wed Dec 1 10:30:34 CET,Wed Dec 1 12:28:54 CET,0.0 1.705 2.481 3.104 3.617 4.087 4.527 4.92 5.641 5.977 6.283 6.465 7.127 7.408 7.933 8.432 8.909 9.133 9.572 10.011 10.644 11.055 11.443 11.995 12.55 13.086 13.607 14.113 14.755 15.378 15.971 16.692 17.392 18.081 18.896 19.812 20.702 21.65 22.667 23.754 24.91 26.227 27.754 29.314 31.15 33.2 35.558 38.272 41.475 45.275 50.04 54.06 56.295 57.636 58.473 58.944 59.178 59.251 59.174 59.004 58.812 58.568 58.253 57.941 57.663 57.37 57.019 56.708 56.415 56.095 55.72 55.374 54.995 54.59 54.272 53.948 53.615 53.254 52.886 52.63 52.365 51.914 51.555 51.189 51.007 50.626 50.214 49.783 49.558 49.009 48.838 48.561 48.239 47.43 46.967 46.465 45.889 45.213 44.367 43.248 39.662 -4 ,3138 ,KEBNE ,16749343,Wed Dec 1 10:30:33 CET,Wed Dec 1 12:29:33 CET,0.0 1.968 2.725 3.293 3.776 4.246 4.684 5.076 5.796 6.146 6.472 6.705 7.374 7.651 8.17 8.671 9.144 9.366 9.796 10.233 10.884 11.291 11.68 12.253 12.808 13.36 13.903 14.426 15.11 15.771 16.396 17.15 17.906 18.621 19.416 20.331 21.232 22.193 23.23 24.373 25.55 26.874 28.427 30.006 31.853 33.938 36.404 39.159 42.399 46.29 51.127 55.271 57.686 59.188 60.117 60.645 60.915 61.077 61.053 60.898 60.694 60.524 60.371 60.161 59.937 59.655 59.268 58.909 58.585 58.228 57.868 57.571 57.224 56.824 56.499 56.164 55.813 55.434 55.057 54.794 54.506 54.041 53.698 53.337 53.153 52.776 52.351 51.881 51.638 51.062 50.829 50.526 50.208 49.507 49.101 48.674 48.202 47.609 46.899 45.985 42.477 -5 ,4831 ,KEBNE ,16749344,Wed Dec 1 10:30:33 CET,Wed Dec 1 12:30:11 CET,0.0 2.688 3.499 4.119 4.65 5.105 5.515 5.898 6.6 6.927 7.234 7.434 8.075 8.343 8.873 9.388 9.885 10.124 10.58 11.016 11.634 12.044 12.448 13.022 13.588 14.136 14.662 15.175 15.853 16.514 17.154 17.928 18.677 19.408 20.283 21.247 22.124 23.063 24.081 25.173 26.305 27.584 29.105 30.687 32.564 34.633 36.999 39.767 43.09 46.895 51.557 55.552 57.932 59.377 60.251 60.776 61.071 61.174 61.104 60.992 60.793 60.559 60.315 60.01 59.717 59.392 59.026 58.688 58.351 57.99 57.601 57.272 56.932 56.561 56.253 55.92 55.546 55.145 54.716 54.423 54.134 53.653 53.307 52.939 52.741 52.319 51.89 51.457 51.217 50.627 50.376 50.065 49.753 49.065 48.665 48.215 47.744 47.234 46.599 45.685 42.877 -6 ,10514 ,KEBNE ,16749345,Wed Dec 1 10:30:34 CET,Wed Dec 1 12:29:30 CET,0.0 2.142 2.921 3.505 4.01 4.467 4.871 5.242 5.922 6.233 6.536 6.753 7.411 7.682 8.213 8.73 9.222 9.457 9.916 10.363 10.995 11.405 11.803 12.375 12.939 13.493 14.023 14.534 15.176 15.787 16.389 17.109 17.811 18.501 19.296 20.234 21.148 22.156 23.244 24.373 25.57 26.946 28.524 30.044 31.831 33.911 36.355 39.073 42.27 46.094 50.708 54.543 56.768 58.241 59.171 59.736 60.109 60.293 60.362 60.361 60.225 59.978 59.644 59.271 58.922 58.573 58.16 57.789 57.471 57.129 56.735 56.384 56.025 55.645 55.337 55.006 54.652 54.277 53.88 53.603 53.312 52.838 52.5 52.133 51.938 51.533 51.103 50.646 50.401 49.806 49.559 49.245 48.915 48.205 47.803 47.38 46.911 46.345 45.649 44.677 41.953 -7 ,31344 ,KEBNE ,16749346,Wed Dec 1 10:30:33 CET,Wed Dec 1 12:29:25 CET,0.0 1.736 2.509 3.129 3.635 4.09 4.505 4.875 5.546 5.858 6.165 6.371 7.027 7.305 7.844 8.336 8.803 9.035 9.483 9.913 10.531 10.919 11.304 11.876 12.432 12.965 13.468 13.948 14.571 15.188 15.795 16.531 17.238 17.937 18.755 19.665 20.552 21.531 22.595 23.712 24.88 26.213 27.761 29.317 31.195 33.36 35.955 38.978 42.361 46.275 51.19 55.348 57.774 59.259 60.171 60.698 60.992 61.172 61.145 60.904 60.597 60.31 60.035 59.718 59.409 59.138 58.787 58.396 58.085 57.78 57.409 57.078 56.718 56.335 56.036 55.716 55.375 55.018 54.647 54.382 54.094 53.627 53.294 52.94 52.757 52.378 51.98 51.537 51.279 50.693 50.483 50.203 49.917 49.304 48.954 48.545 48.053 47.471 46.792 45.89 42.399 -8 ,29327 ,KEBNE ,16749347,Wed Dec 1 10:30:34 CET,Wed Dec 1 12:29:55 CET,0.0 2.252 3.062 3.655 4.156 4.605 5.014 5.391 6.077 6.393 6.701 6.921 7.571 7.847 8.385 8.872 9.331 9.558 10.009 10.435 11.046 11.446 11.84 12.422 12.977 13.543 14.095 14.594 15.227 15.826 16.41 17.131 17.833 18.514 19.308 20.21 21.097 22.092 23.128 24.215 25.379 26.689 28.252 29.824 31.639 33.711 36.135 38.839 42.126 46.164 51.098 55.309 57.829 59.333 60.176 60.632 60.809 60.751 60.599 60.405 60.127 59.818 59.508 59.162 58.767 58.399 58.051 57.738 57.44 57.095 56.704 56.379 56.054 55.682 55.369 55.054 54.731 54.39 54.018 53.759 53.485 53.022 52.701 52.37 52.201 51.842 51.432 50.992 50.769 50.221 50.019 49.717 49.381 48.662 48.264 47.784 47.252 46.667 45.957 44.926 41.466 -9 ,10201 ,KEBNE ,16749348,Wed Dec 1 10:30:33 CET,Wed Dec 1 12:29:13 CET,0.0 2.129 2.927 3.537 4.053 4.518 4.951 5.34 6.039 6.373 6.702 6.934 7.595 7.87 8.411 8.921 9.4 9.633 10.102 10.567 11.238 11.664 12.079 12.694 13.284 13.863 14.436 14.974 15.665 16.334 16.977 17.757 18.521 19.278 20.164 21.143 22.072 23.096 24.198 25.357 26.581 27.982 29.674 31.346 33.187 35.267 37.704 40.443 43.716 47.668 52.539 56.597 58.861 60.224 61.026 61.51 61.782 61.849 61.823 61.628 61.258 60.931 60.674 60.368 60.027 59.68 59.27 58.884 58.554 58.21 57.833 57.496 57.115 56.728 56.422 56.089 55.757 55.406 55.009 54.727 54.429 53.943 53.596 53.234 53.043 52.629 52.187 51.722 51.482 50.916 50.733 50.465 50.17 49.489 49.08 48.648 48.158 47.536 46.859 45.987 42.986 -10 ,21096 ,KEBNE ,16749349,Wed Dec 1 10:30:34 CET,Wed Dec 1 12:29:25 CET,0.0 1.88 2.667 3.28 3.814 4.281 4.691 5.089 5.839 6.179 6.51 6.75 7.43 7.712 8.247 8.767 9.254 9.491 9.965 10.416 11.059 11.484 11.917 12.547 13.147 13.726 14.276 14.801 15.489 16.155 16.778 17.515 18.215 18.886 19.681 20.621 21.521 22.472 23.5 24.602 25.76 27.061 28.611 30.223 32.11 34.142 36.468 39.188 42.409 46.212 50.897 54.8 57.079 58.368 59.182 59.686 59.868 59.828 59.688 59.519 59.319 59.049 58.711 58.358 58.03 57.735 57.369 57.015 56.695 56.333 55.955 55.628 55.287 54.936 54.633 54.297 53.957 53.595 53.182 52.898 52.622 52.177 51.838 51.48 51.298 50.914 50.499 50.066 49.836 49.269 49.051 48.746 48.413 47.667 47.265 46.835 46.339 45.747 45.055 44.139 41.703 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt deleted file mode 100644 index 39b080f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27684 ,KEBNE ,16749350,Wed Dec 1 10:30:33 CET,Wed Dec 1 12:29:05 CET,0.0 3.23 4.142 4.839 5.431 5.959 6.434 6.865 7.62 7.991 8.361 8.662 9.36 9.671 10.276 10.868 11.413 11.673 12.166 12.631 13.305 13.736 14.156 14.778 15.378 15.968 16.556 17.113 17.811 18.496 19.163 19.975 20.779 21.604 22.567 23.608 24.621 25.747 26.917 28.14 29.433 30.922 32.637 34.352 36.402 38.616 41.122 43.949 47.244 50.832 54.579 57.028 57.764 57.712 57.304 56.706 56.098 55.48 54.847 54.136 53.486 52.844 52.214 51.637 51.079 50.531 49.958 49.441 48.969 48.485 47.974 47.517 47.038 46.575 46.215 45.821 45.402 44.961 44.503 44.179 43.826 43.255 42.848 42.413 42.194 41.76 41.296 40.779 40.496 39.843 39.534 39.211 38.872 38.098 37.639 37.132 36.574 35.947 35.214 34.307 31.365 -2 ,26132 ,KEBNE ,16749351,Wed Dec 1 10:30:34 CET,Wed Dec 1 12:31:07 CET,0.0 3.575 4.505 5.239 5.888 6.416 6.901 7.361 8.165 8.519 8.867 9.163 9.857 10.178 10.797 11.361 11.9 12.177 12.724 13.246 13.993 14.468 14.941 15.632 16.28 16.879 17.436 17.981 18.676 19.351 20.017 20.817 21.602 22.376 23.272 24.253 25.198 26.249 27.412 28.676 29.993 31.484 33.189 34.863 36.866 39.118 41.76 44.661 47.807 51.494 55.725 58.25 58.987 58.859 58.372 57.771 57.19 56.542 55.896 55.244 54.614 53.979 53.385 52.818 52.25 51.724 51.149 50.613 50.148 49.646 49.112 48.672 48.213 47.707 47.26 46.752 46.221 45.645 45.037 44.634 44.253 43.701 43.294 42.852 42.615 42.127 41.651 41.122 40.829 40.202 39.897 39.54 39.169 38.345 37.878 37.348 36.747 36.063 35.216 34.029 30.93 -3 ,4926 ,KEBNE ,16749352,Wed Dec 1 10:30:34 CET,Wed Dec 1 12:29:48 CET,0.0 2.935 3.88 4.595 5.182 5.716 6.216 6.649 7.443 7.818 8.162 8.447 9.139 9.428 9.991 10.537 11.052 11.296 11.798 12.291 13.03 13.515 13.966 14.622 15.256 15.856 16.424 16.963 17.657 18.324 18.966 19.74 20.501 21.237 22.075 23.043 24.007 25.085 26.264 27.524 28.872 30.345 32.004 33.691 35.654 37.886 40.504 43.38 46.539 50.066 53.887 56.251 57.137 57.285 57.116 56.765 56.215 55.607 55.024 54.418 53.873 53.351 52.796 52.248 51.725 51.227 50.7 50.215 49.775 49.284 48.763 48.344 47.91 47.458 47.115 46.763 46.384 45.969 45.515 45.197 44.884 44.391 44.033 43.642 43.435 42.994 42.504 41.979 41.706 41.093 40.809 40.47 40.131 39.409 38.97 38.488 37.952 37.311 36.547 35.37 31.742 -4 ,32687 ,KEBNE ,16749353,Wed Dec 1 10:30:34 CET,Wed Dec 1 12:31:24 CET,0.0 2.724 3.623 4.334 4.959 5.534 6.013 6.457 7.278 7.64 7.996 8.312 9.009 9.319 9.923 10.475 11.001 11.256 11.759 12.246 12.935 13.375 13.794 14.401 14.986 15.575 16.154 16.696 17.409 18.11 18.786 19.61 20.428 21.217 22.128 23.193 24.228 25.359 26.608 27.952 29.363 30.932 32.787 34.62 36.631 38.843 41.319 44.078 47.336 50.914 54.696 57.052 57.742 57.691 57.314 56.744 56.141 55.486 54.832 54.142 53.535 52.976 52.411 51.855 51.3 50.775 50.231 49.688 49.19 48.674 48.112 47.65 47.2 46.754 46.379 45.976 45.554 45.097 44.61 44.259 43.903 43.355 42.944 42.489 42.274 41.835 41.352 40.855 40.595 39.982 39.697 39.357 39.004 38.221 37.77 37.263 36.729 36.119 35.369 34.412 30.627 -5 ,16518 ,KEBNE ,16749354,Wed Dec 1 10:30:33 CET,Wed Dec 1 12:30:32 CET,0.0 2.914 3.879 4.589 5.191 5.702 6.185 6.623 7.401 7.773 8.135 8.446 9.137 9.444 10.02 10.561 11.071 11.325 11.846 12.347 13.052 13.524 13.968 14.555 15.132 15.743 16.352 16.919 17.642 18.338 18.999 19.782 20.543 21.284 22.177 23.188 24.157 25.219 26.334 27.517 28.792 30.261 31.958 33.605 35.554 37.81 40.405 43.302 46.387 49.863 53.971 56.419 57.069 57.037 56.733 56.246 55.637 55.027 54.404 53.717 53.099 52.515 51.932 51.325 50.766 50.253 49.724 49.254 48.825 48.373 47.894 47.493 47.072 46.609 46.235 45.835 45.412 44.979 44.513 44.179 43.82 43.254 42.844 42.392 42.172 41.737 41.255 40.716 40.431 39.807 39.524 39.182 38.827 38.06 37.633 37.157 36.604 35.921 35.101 34.021 30.822 -6 ,10732 ,KEBNE ,16749355,Wed Dec 1 10:30:35 CET,Wed Dec 1 12:29:07 CET,0.0 4.195 5.423 6.254 6.903 7.454 7.905 8.316 9.11 9.483 9.84 10.135 10.827 11.144 11.746 12.288 12.816 13.075 13.582 14.087 14.793 15.239 15.68 16.328 16.949 17.538 18.096 18.635 19.362 20.086 20.77 21.578 22.359 23.122 24.029 25.067 26.03 27.066 28.182 29.35 30.596 32.073 33.824 35.594 37.631 39.887 42.52 45.445 48.769 52.294 55.923 58.278 59.008 59.006 58.729 58.285 57.715 57.081 56.449 55.749 55.103 54.486 53.882 53.271 52.708 52.235 51.716 51.227 50.767 50.272 49.755 49.289 48.768 48.226 47.841 47.45 47.018 46.549 46.068 45.738 45.396 44.848 44.48 44.06 43.83 43.373 42.882 42.368 42.105 41.486 41.161 40.805 40.445 39.632 39.148 38.62 38.054 37.382 36.54 35.427 32.294 -7 ,24954 ,KEBNE ,16749356,Wed Dec 1 10:30:33 CET,Wed Dec 1 12:29:56 CET,0.0 3.11 4.051 4.738 5.343 5.85 6.309 6.732 7.48 7.818 8.136 8.378 9.046 9.342 9.916 10.45 10.959 11.205 11.695 12.19 12.906 13.355 13.785 14.417 15.028 15.617 16.194 16.756 17.481 18.174 18.882 19.751 20.543 21.339 22.299 23.421 24.551 25.699 26.815 27.997 29.283 30.757 32.495 34.227 36.229 38.431 40.875 43.582 46.656 50.034 53.503 55.579 56.417 56.594 56.351 55.879 55.323 54.734 54.139 53.494 52.917 52.375 51.841 51.285 50.716 50.221 49.701 49.202 48.775 48.303 47.788 47.356 46.906 46.444 46.032 45.586 45.136 44.678 44.201 43.862 43.497 42.907 42.484 42.056 41.836 41.325 40.809 40.295 40.017 39.366 38.998 38.645 38.271 37.448 37.012 36.556 36.031 35.366 34.57 33.479 30.328 -8 ,6775 ,KEBNE ,16749357,Wed Dec 1 10:30:34 CET,Wed Dec 1 12:30:05 CET,0.0 2.915 3.841 4.578 5.206 5.731 6.209 6.656 7.453 7.82 8.17 8.477 9.17 9.481 10.103 10.692 11.249 11.518 12.016 12.482 13.151 13.573 13.978 14.574 15.15 15.706 16.242 16.768 17.453 18.135 18.805 19.604 20.42 21.209 22.088 23.07 24.0 25.023 26.125 27.295 28.544 29.941 31.542 33.124 34.964 37.047 39.469 42.231 45.356 48.693 52.269 54.377 54.958 55.027 54.756 54.237 53.642 53.001 52.374 51.699 51.079 50.504 49.929 49.377 48.843 48.334 47.759 47.228 46.774 46.299 45.791 45.362 44.914 44.441 44.064 43.655 43.237 42.795 42.289 41.921 41.546 40.98 40.592 40.195 39.984 39.509 38.998 38.462 38.187 37.572 37.332 37.019 36.666 35.911 35.461 34.955 34.371 33.683 32.831 31.709 28.223 -9 ,6321 ,KEBNE ,16749358,Wed Dec 1 10:30:34 CET,Wed Dec 1 12:31:15 CET,0.0 2.975 3.917 4.621 5.227 5.747 6.206 6.626 7.414 7.775 8.117 8.393 9.064 9.335 9.856 10.394 10.925 11.19 11.692 12.15 12.798 13.207 13.618 14.248 14.861 15.452 16.046 16.607 17.282 17.923 18.572 19.364 20.14 20.907 21.776 22.766 23.736 24.856 26.096 27.374 28.712 30.227 32.056 33.87 35.926 38.171 40.744 43.767 47.194 50.882 54.997 57.532 58.246 58.284 57.998 57.524 56.997 56.437 55.871 55.25 54.663 54.095 53.55 53.001 52.448 51.922 51.347 50.82 50.364 49.886 49.363 48.92 48.47 47.99 47.607 47.218 46.823 46.417 45.965 45.629 45.29 44.751 44.376 43.985 43.777 43.343 42.87 42.363 42.095 41.458 41.122 40.771 40.385 39.519 39.053 38.52 37.923 37.272 36.478 35.397 31.28 -10 ,21068 ,KEBNE ,16749359,Wed Dec 1 10:30:34 CET,Wed Dec 1 12:31:29 CET,0.0 2.881 3.751 4.4 4.94 5.455 5.943 6.377 7.162 7.532 7.87 8.14 8.834 9.151 9.741 10.29 10.822 11.065 11.532 12.019 12.723 13.157 13.583 14.201 14.811 15.406 15.974 16.527 17.228 17.884 18.513 19.265 20.045 20.83 21.728 22.732 23.705 24.773 25.898 27.132 28.428 29.878 31.598 33.325 35.333 37.624 40.268 43.11 46.092 49.459 53.643 56.297 57.196 57.33 57.048 56.629 56.089 55.464 54.816 54.134 53.498 52.875 52.316 51.78 51.239 50.725 50.18 49.698 49.259 48.769 48.248 47.809 47.353 46.883 46.512 46.118 45.701 45.271 44.822 44.49 44.134 43.574 43.187 42.763 42.541 42.102 41.651 41.141 40.859 40.232 39.953 39.625 39.267 38.449 38.012 37.544 37.028 36.432 35.637 34.539 30.757 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 351e142f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,5041 ,KEBNE ,16749361,Wed Dec 1 12:09:43 CET,Wed Dec 1 14:04:16 CET,0.0 1.74 2.359 2.842 3.242 3.58 3.9 4.227 4.859 5.139 5.387 5.553 6.059 6.271 6.69 7.105 7.505 7.696 8.073 8.455 9.008 9.362 9.709 10.207 10.694 11.176 11.659 12.132 12.718 13.314 13.912 14.614 15.312 15.995 16.779 17.654 18.511 19.496 20.558 21.722 23.017 24.502 26.21 27.926 29.993 32.301 34.983 38.078 41.791 46.278 51.643 56.022 58.544 59.881 60.538 60.834 60.81 60.653 60.498 60.277 59.986 59.675 59.377 59.082 58.764 58.451 58.104 57.786 57.505 57.207 56.905 56.64 56.331 55.998 55.733 55.433 55.099 54.74 54.359 54.089 53.819 53.405 53.058 52.646 52.443 52.046 51.628 51.208 51.005 50.556 50.249 49.937 49.559 48.721 48.27 47.772 47.174 46.434 45.47 44.017 30.995 -7 ,18467 ,KEBNE ,16749366,Wed Dec 1 12:09:44 CET,Wed Dec 1 14:02:39 CET,0.0 1.634 2.202 2.642 3.001 3.311 3.608 3.881 4.38 4.623 4.873 5.062 5.566 5.773 6.161 6.533 6.893 7.065 7.411 7.761 8.256 8.57 8.887 9.356 9.802 10.227 10.648 11.056 11.584 12.1 12.598 13.218 13.837 14.433 15.116 15.912 16.696 17.56 18.492 19.471 20.514 21.712 23.13 24.598 26.371 28.388 30.732 33.434 36.608 40.366 45.23 49.325 51.491 52.83 53.675 54.228 54.579 54.745 54.786 54.794 54.715 54.585 54.458 54.333 54.179 54.013 53.802 53.562 53.344 53.091 52.821 52.591 52.339 52.051 51.785 51.495 51.201 50.934 50.649 50.421 50.192 49.81 49.522 49.226 49.079 48.755 48.364 47.933 47.711 47.26 46.926 46.61 46.286 45.526 45.101 44.682 44.184 43.563 42.713 41.493 32.409 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt deleted file mode 100644 index ed0cdc66..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31066 ,KEBNE ,16749370,Wed Dec 1 12:09:45 CET,Wed Dec 1 14:04:31 CET,0.0 1.313 1.849 2.303 2.684 3.027 3.348 3.651 4.26 4.539 4.806 5.026 5.564 5.815 6.297 6.763 7.223 7.441 7.857 8.26 8.848 9.228 9.607 10.156 10.684 11.202 11.707 12.197 12.846 13.5 14.139 14.916 15.684 16.436 17.32 18.339 19.347 20.46 21.665 22.978 24.385 25.981 27.871 29.867 32.275 35.041 38.368 42.275 47.043 52.829 60.149 66.683 70.753 73.366 75.029 76.208 77.039 77.66 78.108 78.438 78.654 78.797 78.896 78.943 78.959 78.952 78.89 78.787 78.684 78.57 78.411 78.257 78.085 77.905 77.754 77.567 77.358 77.136 76.909 76.746 76.564 76.259 76.017 75.751 75.607 75.286 74.96 74.579 74.355 73.915 73.621 73.372 73.097 72.44 72.02 71.534 71.033 70.446 69.692 68.525 61.675 -2 ,19138 ,KEBNE ,16749371,Wed Dec 1 12:09:43 CET,Wed Dec 1 14:08:20 CET,0.0 1.074 1.62 2.027 2.369 2.691 2.988 3.266 3.795 4.055 4.312 4.526 5.047 5.279 5.721 6.136 6.548 6.748 7.142 7.535 8.11 8.484 8.853 9.391 9.908 10.408 10.898 11.384 12.033 12.678 13.305 14.082 14.853 15.608 16.497 17.504 18.485 19.583 20.78 22.095 23.514 25.125 27.025 28.945 31.242 33.888 37.059 40.781 45.257 51.038 58.754 65.521 69.717 72.508 74.47 75.871 76.763 77.345 77.737 77.979 78.076 78.124 78.134 78.081 77.958 77.814 77.63 77.427 77.247 77.067 76.87 76.703 76.527 76.338 76.175 75.982 75.769 75.518 75.246 75.047 74.84 74.504 74.237 73.948 73.801 73.474 73.124 72.765 72.573 72.149 71.832 71.564 71.294 70.738 70.397 69.925 69.374 68.758 67.883 66.549 59.918 -3 ,3976 ,KEBNE ,16749372,Wed Dec 1 12:09:43 CET,Wed Dec 1 14:04:54 CET,0.0 1.423 1.961 2.376 2.742 3.065 3.371 3.675 4.268 4.55 4.821 5.049 5.588 5.83 6.293 6.743 7.17 7.379 7.799 8.205 8.785 9.165 9.539 10.091 10.632 11.153 11.657 12.157 12.811 13.443 14.066 14.838 15.596 16.346 17.222 18.211 19.182 20.27 21.472 22.79 24.207 25.812 27.72 29.729 32.189 34.974 38.213 42.027 46.764 52.624 60.13 66.753 70.868 73.666 75.673 77.151 78.197 78.944 79.456 79.872 80.08 80.185 80.279 80.325 80.311 80.216 80.085 79.986 79.885 79.745 79.575 79.446 79.307 79.112 78.954 78.784 78.582 78.386 78.163 77.997 77.836 77.576 77.359 77.099 76.968 76.66 76.296 75.931 75.754 75.344 75.001 74.74 74.5 73.964 73.623 73.232 72.778 72.177 71.321 70.281 64.988 -4 ,7550 ,KEBNE ,16749373,Wed Dec 1 12:09:46 CET,Wed Dec 1 14:07:44 CET,0.0 1.545 2.132 2.583 2.967 3.324 3.644 3.951 4.537 4.813 5.082 5.313 5.831 6.065 6.528 6.975 7.401 7.61 8.012 8.41 8.999 9.393 9.776 10.303 10.821 11.344 11.851 12.349 13.016 13.672 14.299 15.054 15.805 16.531 17.38 18.368 19.316 20.367 21.544 22.813 24.153 25.703 27.573 29.526 31.862 34.466 37.577 41.261 45.696 51.196 58.341 64.612 68.531 71.153 72.929 74.202 75.048 75.666 76.114 76.374 76.499 76.562 76.547 76.484 76.361 76.203 76.026 75.862 75.729 75.597 75.427 75.233 75.0 74.745 74.53 74.301 74.065 73.796 73.476 73.228 72.985 72.669 72.423 72.107 71.931 71.584 71.251 70.913 70.739 70.339 70.045 69.787 69.538 68.96 68.592 68.175 67.716 67.18 66.46 65.329 55.683 -5 ,8835 ,KEBNE ,16749374,Wed Dec 1 12:09:43 CET,Wed Dec 1 14:05:57 CET,0.0 1.129 1.657 2.116 2.515 2.855 3.166 3.481 4.077 4.338 4.587 4.777 5.305 5.539 5.993 6.426 6.83 7.036 7.437 7.824 8.408 8.791 9.162 9.692 10.208 10.726 11.25 11.761 12.409 13.046 13.684 14.463 15.22 15.982 16.881 17.87 18.81 19.868 21.058 22.36 23.743 25.331 27.216 29.123 31.427 34.128 37.323 41.067 45.571 50.986 58.105 64.329 68.236 70.972 72.83 74.214 75.226 75.921 76.285 76.498 76.633 76.698 76.7 76.63 76.522 76.422 76.311 76.182 76.04 75.878 75.671 75.48 75.298 75.088 74.889 74.65 74.397 74.147 73.874 73.667 73.443 73.08 72.807 72.514 72.372 72.044 71.683 71.309 71.102 70.684 70.418 70.166 69.882 69.257 68.908 68.473 67.926 67.328 66.633 65.468 59.845 -6 ,11569 ,KEBNE ,16749375,Wed Dec 1 12:09:45 CET,Wed Dec 1 14:05:45 CET,0.0 1.033 1.512 1.931 2.31 2.645 2.959 3.256 3.802 4.055 4.299 4.471 4.994 5.231 5.692 6.151 6.578 6.778 7.18 7.588 8.188 8.563 8.932 9.478 10.004 10.529 11.056 11.573 12.234 12.876 13.491 14.245 14.99 15.709 16.553 17.519 18.459 19.523 20.728 22.014 23.4 25.042 26.986 28.949 31.333 34.077 37.262 40.955 45.52 51.176 58.304 64.447 68.251 70.818 72.525 73.742 74.63 75.243 75.626 75.949 76.156 76.273 76.363 76.424 76.449 76.44 76.376 76.274 76.155 76.013 75.839 75.679 75.529 75.354 75.183 75.016 74.853 74.65 74.399 74.201 73.99 73.645 73.397 73.149 73.01 72.694 72.384 72.053 71.863 71.468 71.205 70.949 70.684 70.083 69.743 69.363 68.877 68.258 67.448 66.361 60.088 -7 ,20963 ,KEBNE ,16749376,Wed Dec 1 12:09:43 CET,Wed Dec 1 14:04:02 CET,0.0 1.508 2.069 2.514 2.913 3.289 3.644 3.946 4.499 4.773 5.045 5.269 5.807 6.05 6.518 6.959 7.381 7.589 7.999 8.411 9.022 9.409 9.781 10.327 10.869 11.41 11.935 12.439 13.101 13.743 14.373 15.173 15.956 16.712 17.613 18.639 19.633 20.756 21.999 23.326 24.74 26.372 28.31 30.321 32.712 35.42 38.572 42.181 46.495 51.71 58.406 64.325 67.975 70.311 71.907 73.042 73.815 74.371 74.827 75.155 75.244 75.254 75.216 75.129 75.009 74.886 74.745 74.594 74.45 74.273 74.068 73.899 73.716 73.546 73.399 73.207 73.0 72.795 72.538 72.304 72.051 71.673 71.388 71.067 70.901 70.563 70.205 69.809 69.586 69.157 68.904 68.667 68.404 67.789 67.417 66.959 66.416 65.814 65.092 63.864 51.863 -8 ,23577 ,KEBNE ,16749377,Wed Dec 1 12:09:44 CET,Wed Dec 1 14:07:47 CET,0.0 1.424 1.946 2.348 2.708 3.054 3.376 3.671 4.231 4.496 4.762 4.989 5.521 5.757 6.205 6.621 7.023 7.224 7.614 7.985 8.542 8.911 9.267 9.802 10.335 10.853 11.363 11.871 12.537 13.173 13.793 14.552 15.279 15.988 16.825 17.793 18.741 19.767 20.893 22.147 23.542 25.143 27.037 29.009 31.354 34.047 37.297 41.132 45.837 51.716 59.384 66.176 70.334 73.072 74.962 76.333 77.294 77.944 78.313 78.596 78.819 78.893 78.916 78.986 78.992 78.915 78.786 78.67 78.558 78.404 78.19 77.994 77.81 77.596 77.415 77.219 77.005 76.773 76.515 76.324 76.099 75.729 75.452 75.149 74.982 74.627 74.239 73.857 73.66 73.248 72.992 72.734 72.457 71.826 71.409 70.927 70.461 69.898 69.028 67.771 60.052 -9 ,9511 ,KEBNE ,16749378,Wed Dec 1 12:09:44 CET,Wed Dec 1 14:03:53 CET,0.0 1.187 1.714 2.099 2.459 2.807 3.124 3.421 3.995 4.264 4.517 4.709 5.229 5.463 5.917 6.348 6.764 6.969 7.377 7.771 8.344 8.714 9.069 9.586 10.103 10.617 11.131 11.644 12.306 12.945 13.565 14.322 15.069 15.809 16.664 17.64 18.584 19.638 20.812 22.077 23.421 24.971 26.841 28.755 31.024 33.612 36.759 40.527 45.164 50.895 58.199 64.649 68.703 71.229 72.821 73.972 74.745 75.294 75.654 75.873 75.967 75.989 75.958 75.909 75.816 75.703 75.561 75.392 75.243 75.064 74.84 74.656 74.456 74.225 74.022 73.817 73.606 73.34 73.056 72.876 72.688 72.354 72.086 71.8 71.648 71.327 71.004 70.65 70.448 70.042 69.762 69.492 69.155 68.379 67.933 67.443 66.916 66.293 65.47 64.138 58.683 -10 ,29193 ,KEBNE ,16749379,Wed Dec 1 12:09:44 CET,Wed Dec 1 14:04:12 CET,0.0 1.22 1.746 2.166 2.517 2.849 3.17 3.476 4.056 4.331 4.599 4.829 5.373 5.608 6.059 6.49 6.904 7.103 7.493 7.877 8.456 8.846 9.217 9.744 10.273 10.808 11.334 11.832 12.479 13.113 13.727 14.489 15.25 15.996 16.876 17.893 18.878 19.98 21.195 22.505 23.893 25.457 27.333 29.32 31.701 34.436 37.666 41.484 46.199 51.955 59.245 65.676 69.856 72.719 74.604 75.989 77.023 77.789 78.33 78.774 79.064 79.262 79.436 79.557 79.552 79.472 79.361 79.22 79.082 78.917 78.717 78.542 78.34 78.121 77.936 77.712 77.456 77.184 76.922 76.734 76.525 76.149 75.874 75.588 75.432 75.108 74.767 74.421 74.234 73.812 73.514 73.243 72.939 72.297 71.925 71.45 70.91 70.258 69.494 68.42 60.407 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index 1cddecc3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,21685 ,KEBNE ,16749381,Wed Dec 1 12:09:43 CET,Wed Dec 1 14:10:39 CET,0.0 1.727 2.59 3.291 3.897 4.455 4.979 5.485 6.462 6.93 7.376 7.7 8.615 9.013 9.778 10.514 11.227 11.572 12.266 12.94 13.908 14.548 15.193 16.151 17.087 18.01 18.921 19.815 20.985 22.141 23.285 24.684 26.058 27.424 29.053 30.909 32.731 34.797 37.087 39.59 42.29 45.438 49.283 53.315 58.194 63.856 70.732 78.972 89.361 102.749 120.769 137.771 149.126 157.299 163.344 168.072 171.747 174.697 177.025 179.186 180.863 182.191 183.372 184.425 185.295 185.99 186.649 187.182 187.589 187.997 188.38 188.657 188.915 189.118 189.24 189.368 189.475 189.548 189.617 189.646 189.639 189.604 189.563 189.488 189.437 189.315 189.169 188.982 188.875 188.427 188.447 188.245 187.94 187.241 186.835 186.292 185.689 184.977 184.037 182.56 175.889 -3 ,17409 ,KEBNE ,16749382,Wed Dec 1 12:09:44 CET,Wed Dec 1 14:10:47 CET,0.0 1.359 2.143 2.797 3.391 3.941 4.44 4.907 5.81 6.25 6.682 7.017 7.939 8.345 9.153 9.906 10.644 11.01 11.726 12.44 13.474 14.137 14.787 15.753 16.7 17.619 18.515 19.409 20.581 21.736 22.893 24.33 25.752 27.139 28.771 30.638 32.474 34.555 36.857 39.393 42.163 45.367 49.212 53.22 58.118 63.871 70.817 79.135 89.578 103.016 121.21 138.392 149.892 158.237 164.491 169.394 173.195 176.243 178.596 180.755 182.409 183.692 184.797 185.742 186.6 187.356 188.032 188.574 189.005 189.387 189.753 190.021 190.233 190.398 190.493 190.566 190.62 190.66 190.666 190.618 190.571 190.472 190.371 190.266 190.185 190.0 189.82 189.59 189.439 188.952 188.904 188.688 188.46 187.861 187.503 187.1 186.577 185.905 184.985 183.482 177.581 -4 ,4926 ,KEBNE ,16749383,Wed Dec 1 12:09:45 CET,Wed Dec 1 14:09:16 CET,0.0 1.623 2.473 3.156 3.733 4.263 4.773 5.262 6.194 6.628 7.046 7.355 8.267 8.662 9.432 10.175 10.895 11.25 11.939 12.602 13.591 14.251 14.902 15.866 16.818 17.744 18.651 19.541 20.712 21.862 22.999 24.433 25.842 27.198 28.789 30.648 32.486 34.54 36.818 39.323 42.02 45.143 48.959 52.963 57.804 63.489 70.419 78.671 89.025 102.319 120.381 137.537 148.992 157.242 163.406 168.132 171.877 174.993 177.311 179.336 180.927 182.228 183.328 184.252 185.057 185.753 186.401 186.905 187.277 187.609 187.913 188.136 188.353 188.551 188.691 188.819 188.925 189.009 189.043 189.056 189.073 189.055 189.014 188.96 188.906 188.717 188.481 188.232 188.106 187.614 187.54 187.32 187.057 186.426 186.044 185.586 184.991 184.255 183.328 182.042 169.688 -6 ,25597 ,KEBNE ,16749385,Wed Dec 1 12:09:45 CET,Wed Dec 1 14:17:21 CET,0.0 1.892 2.789 3.507 4.133 4.705 5.247 5.779 6.775 7.222 7.669 8.008 8.934 9.347 10.163 10.933 11.669 12.03 12.733 13.426 14.438 15.098 15.765 16.748 17.7 18.644 19.585 20.504 21.713 22.913 24.078 25.498 26.9 28.292 29.917 31.786 33.636 35.707 37.995 40.506 43.241 46.433 50.281 54.257 59.107 64.831 71.737 79.901 90.217 103.515 121.366 138.178 149.474 157.633 163.678 168.407 172.08 175.077 177.448 179.559 181.169 182.464 183.586 184.559 185.37 186.018 186.611 187.094 187.454 187.747 188.014 188.215 188.411 188.605 188.726 188.824 188.912 188.958 188.951 188.933 188.906 188.821 188.714 188.57 188.492 188.331 188.138 187.892 187.727 187.216 187.153 186.925 186.633 185.95 185.532 185.051 184.54 183.875 183.01 181.546 173.272 -8 ,28890 ,KEBNE ,16749387,Wed Dec 1 12:09:43 CET,Wed Dec 1 14:09:12 CET,0.0 1.634 2.478 3.202 3.851 4.446 5.013 5.537 6.504 6.969 7.44 7.814 8.745 9.144 9.937 10.711 11.455 11.822 12.542 13.251 14.308 14.996 15.658 16.639 17.603 18.55 19.488 20.408 21.606 22.79 23.955 25.385 26.801 28.204 29.878 31.789 33.656 35.766 38.1 40.641 43.406 46.639 50.559 54.631 59.56 65.346 72.346 80.677 91.058 104.238 121.849 138.361 149.397 157.37 163.274 167.846 171.394 174.274 176.521 178.454 179.918 181.159 182.24 183.159 183.925 184.53 185.032 185.449 185.791 186.077 186.327 186.522 186.722 186.888 186.987 187.046 187.093 187.131 187.097 187.056 187.023 186.943 186.863 186.755 186.695 186.55 186.347 186.107 185.977 185.516 185.514 185.327 185.11 184.486 184.073 183.591 182.999 182.313 181.404 180.02 174.916 -9 ,23272 ,KEBNE ,16749388,Wed Dec 1 12:09:44 CET,Wed Dec 1 14:10:59 CET,0.0 2.291 3.218 3.973 4.628 5.221 5.781 6.313 7.28 7.737 8.177 8.497 9.411 9.826 10.633 11.398 12.145 12.506 13.252 13.992 15.019 15.689 16.354 17.33 18.285 19.228 20.146 21.041 22.222 23.388 24.538 25.959 27.356 28.74 30.386 32.273 34.132 36.229 38.538 41.041 43.784 46.998 50.866 54.876 59.748 65.442 72.357 80.743 91.295 104.706 122.65 139.547 150.876 159.044 165.118 169.933 173.697 176.746 179.142 181.321 183.034 184.407 185.565 186.555 187.391 188.048 188.675 189.207 189.601 189.962 190.309 190.565 190.764 190.912 190.992 191.048 191.082 191.11 191.125 191.099 191.057 190.953 190.84 190.704 190.623 190.439 190.228 189.962 189.791 189.277 189.209 188.972 188.729 188.162 187.79 187.293 186.644 185.81 184.719 183.22 176.038 -10 ,31476 ,KEBNE ,16749389,Wed Dec 1 12:09:43 CET,Wed Dec 1 14:09:14 CET,0.0 1.892 2.717 3.384 3.984 4.546 5.055 5.537 6.449 6.897 7.337 7.658 8.572 8.967 9.748 10.5 11.239 11.602 12.319 13.021 14.052 14.722 15.372 16.347 17.324 18.279 19.208 20.109 21.295 22.47 23.636 25.054 26.441 27.829 29.459 31.3 33.129 35.224 37.554 40.096 42.857 46.089 49.98 54.028 58.92 64.66 71.691 80.052 90.496 104.0 122.276 139.453 150.863 159.065 165.084 169.798 173.401 176.215 178.429 180.484 182.066 183.275 184.332 185.279 186.043 186.699 187.353 187.845 188.212 188.571 188.924 189.181 189.415 189.594 189.682 189.761 189.812 189.827 189.82 189.804 189.764 189.662 189.559 189.413 189.335 189.183 189.023 188.836 188.715 188.272 188.279 188.08 187.84 187.224 186.88 186.491 185.93 185.116 184.153 182.924 178.632 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt deleted file mode 100644 index 478fd630..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4038 ,KEBNE ,16749390,Wed Dec 1 12:09:44 CET,Wed Dec 1 14:10:41 CET,0.0 2.12 3.12 3.872 4.517 5.084 5.628 6.179 7.203 7.678 8.14 8.505 9.449 9.865 10.647 11.382 12.095 12.46 13.182 13.872 14.892 15.557 16.199 17.143 18.061 18.954 19.835 20.694 21.826 22.947 24.028 25.365 26.68 27.956 29.495 31.24 32.904 34.788 36.837 39.015 41.36 44.044 47.209 50.492 54.463 59.061 64.664 71.235 79.225 89.332 102.623 114.78 122.787 128.441 132.532 135.57 137.788 139.565 140.947 142.227 143.195 143.918 144.511 144.97 145.302 145.562 145.819 146.006 146.104 146.178 146.224 146.219 146.22 146.195 146.139 146.074 145.995 145.887 145.756 145.646 145.501 145.254 145.074 144.879 144.762 144.49 144.211 143.885 143.699 143.138 143.118 142.892 142.64 142.064 141.721 141.274 140.742 140.14 139.367 138.165 130.184 -2 ,19330 ,KEBNE ,16749391,Wed Dec 1 12:09:45 CET,Wed Dec 1 14:10:23 CET,0.0 2.504 3.376 4.09 4.736 5.328 5.89 6.403 7.348 7.807 8.251 8.582 9.501 9.894 10.676 11.424 12.125 12.472 13.157 13.834 14.831 15.477 16.117 17.037 17.947 18.842 19.692 20.539 21.646 22.722 23.803 25.149 26.481 27.777 29.258 30.953 32.627 34.528 36.598 38.826 41.228 44.062 47.498 50.982 55.107 59.813 65.429 71.967 80.162 90.492 103.853 116.139 124.177 129.944 134.093 137.133 139.407 141.175 142.466 143.492 144.189 144.745 145.209 145.551 145.814 145.987 146.12 146.213 146.248 146.26 146.269 146.26 146.219 146.121 146.012 145.889 145.765 145.623 145.43 145.273 145.089 144.784 144.563 144.305 144.138 143.774 143.421 143.007 142.782 142.196 142.183 141.949 141.663 140.958 140.505 140.009 139.37 138.493 137.433 135.924 128.324 -3 ,16848 ,KEBNE ,16749392,Wed Dec 1 12:09:46 CET,Wed Dec 1 14:11:57 CET,0.0 2.476 3.446 4.244 4.934 5.535 6.117 6.672 7.67 8.14 8.598 8.953 9.869 10.264 11.017 11.758 12.49 12.846 13.545 14.225 15.188 15.797 16.394 17.274 18.135 18.997 19.85 20.667 21.746 22.841 23.902 25.193 26.478 27.754 29.24 30.899 32.54 34.392 36.407 38.585 40.915 43.602 46.872 50.288 54.429 59.246 64.973 71.793 80.23 90.588 103.912 116.056 124.0 129.588 133.567 136.492 138.636 140.235 141.395 142.371 143.105 143.684 144.127 144.476 144.751 144.91 144.992 145.042 145.068 145.045 144.97 144.886 144.779 144.598 144.416 144.23 144.057 143.906 143.738 143.611 143.469 143.247 143.091 142.907 142.808 142.592 142.369 142.12 141.964 141.421 141.423 141.179 140.887 140.191 139.785 139.342 138.8 138.107 137.183 135.858 129.767 -4 ,20115 ,KEBNE ,16749393,Wed Dec 1 12:09:46 CET,Wed Dec 1 14:10:17 CET,0.0 2.312 3.242 4.021 4.706 5.307 5.864 6.385 7.364 7.825 8.275 8.625 9.535 9.93 10.672 11.408 12.129 12.484 13.179 13.85 14.819 15.435 16.051 16.98 17.891 18.78 19.64 20.492 21.622 22.712 23.779 25.085 26.374 27.648 29.163 30.91 32.602 34.509 36.623 38.891 41.319 44.121 47.45 50.874 55.0 59.717 65.348 71.911 79.764 89.696 102.864 114.7 122.405 127.749 131.619 134.586 136.729 138.423 139.792 140.99 141.841 142.485 143.038 143.504 143.863 144.114 144.307 144.477 144.618 144.712 144.757 144.747 144.728 144.671 144.583 144.49 144.387 144.262 144.096 143.961 143.819 143.601 143.452 143.276 143.177 142.957 142.694 142.344 142.134 141.55 141.399 141.098 140.796 140.156 139.782 139.332 138.825 138.251 137.372 136.021 131.777 -5 ,1693 ,KEBNE ,16749394,Wed Dec 1 12:09:45 CET,Wed Dec 1 14:12:57 CET,0.0 2.594 3.617 4.373 5.002 5.587 6.166 6.712 7.658 8.102 8.534 8.826 9.729 10.115 10.885 11.619 12.341 12.71 13.419 14.081 15.044 15.673 16.305 17.228 18.122 19.017 19.893 20.759 21.881 22.973 24.069 25.428 26.73 27.988 29.49 31.226 32.915 34.839 37.009 39.366 41.895 44.799 48.242 51.837 56.222 61.232 67.24 74.309 82.822 93.437 107.21 119.634 127.572 133.103 137.189 140.296 142.47 144.093 145.317 146.356 147.125 147.731 148.27 148.727 149.049 149.27 149.437 149.528 149.569 149.581 149.571 149.522 149.453 149.352 149.239 149.142 149.029 148.841 148.645 148.545 148.389 148.045 147.824 147.592 147.46 147.176 146.806 146.354 146.129 145.549 145.474 145.214 144.933 144.287 143.92 143.526 143.038 142.454 141.821 140.872 137.037 -6 ,30905 ,KEBNE ,16749395,Wed Dec 1 12:09:44 CET,Wed Dec 1 14:10:02 CET,0.0 2.04 3.01 3.82 4.512 5.139 5.735 6.26 7.269 7.754 8.209 8.573 9.501 9.917 10.721 11.476 12.206 12.562 13.271 13.958 14.959 15.617 16.26 17.205 18.127 19.039 19.927 20.806 21.963 23.08 24.165 25.503 26.831 28.119 29.673 31.451 33.153 35.081 37.213 39.462 41.887 44.745 48.167 51.698 55.869 60.629 66.215 72.708 80.739 90.819 104.098 115.963 123.526 128.914 132.842 135.849 138.123 139.889 141.206 142.334 143.165 143.82 144.361 144.815 145.163 145.439 145.695 145.858 145.941 145.972 145.982 145.982 145.939 145.821 145.672 145.491 145.286 145.061 144.822 144.652 144.461 144.133 143.873 143.591 143.463 143.2 142.894 142.554 142.377 141.817 141.792 141.561 141.291 140.672 140.263 139.754 139.19 138.577 137.785 136.68 131.991 -7 ,29889 ,KEBNE ,16749396,Wed Dec 1 12:09:45 CET,Wed Dec 1 14:13:07 CET,0.0 2.281 3.26 4.033 4.723 5.355 5.931 6.444 7.458 7.953 8.406 8.747 9.654 10.04 10.826 11.588 12.315 12.668 13.364 14.031 14.979 15.598 16.202 17.071 17.954 18.83 19.664 20.481 21.572 22.677 23.784 25.101 26.368 27.614 29.102 30.822 32.479 34.295 36.272 38.444 40.787 43.506 46.739 50.11 54.221 58.947 64.596 71.286 79.578 89.935 103.544 115.88 123.712 129.123 132.908 135.751 137.884 139.55 140.799 141.869 142.695 143.322 143.798 144.173 144.458 144.686 144.897 145.024 145.093 145.141 145.189 145.221 145.209 145.12 145.02 144.906 144.772 144.612 144.441 144.324 144.165 143.871 143.671 143.471 143.35 143.073 142.796 142.441 142.247 141.699 141.655 141.43 141.187 140.637 140.289 139.906 139.487 138.976 138.239 137.154 133.116 -8 ,10644 ,KEBNE ,16749397,Wed Dec 1 12:20:12 CET,Wed Dec 1 14:22:50 CET,0.0 3.304 4.51 5.427 6.237 6.961 7.621 8.251 9.437 9.991 10.491 10.83 11.746 12.145 12.933 13.681 14.392 14.747 15.445 16.155 17.196 17.847 18.493 19.477 20.433 21.334 22.22 23.103 24.252 25.354 26.447 27.81 29.133 30.414 31.922 33.663 35.341 37.168 39.181 41.459 43.92 46.699 50.019 53.429 57.441 62.071 67.608 74.122 82.307 92.679 106.388 119.113 127.402 133.169 137.391 140.707 143.119 144.843 146.14 147.291 148.156 148.798 149.351 149.857 150.226 150.485 150.723 150.874 150.951 150.986 150.988 150.996 150.981 150.907 150.826 150.738 150.653 150.53 150.376 150.255 150.112 149.884 149.686 149.442 149.319 149.069 148.781 148.452 148.234 147.606 147.414 147.074 146.713 145.915 145.515 145.089 144.558 143.956 143.208 141.959 131.946 -9 ,14064 ,KEBNE ,16749398,Wed Dec 1 12:20:12 CET,Wed Dec 1 14:20:38 CET,0.0 2.753 3.843 4.643 5.325 5.944 6.513 7.074 8.113 8.579 9.029 9.378 10.297 10.69 11.437 12.158 12.874 13.225 13.91 14.568 15.554 16.203 16.821 17.732 18.614 19.47 20.312 21.14 22.215 23.253 24.291 25.586 26.848 28.079 29.541 31.231 32.878 34.734 36.791 39.004 41.358 44.078 47.35 50.744 54.81 59.512 65.205 71.875 79.975 90.228 103.779 115.854 123.599 128.926 132.649 135.505 137.586 139.207 140.413 141.411 142.122 142.603 142.934 143.198 143.39 143.546 143.705 143.777 143.798 143.798 143.74 143.657 143.59 143.541 143.498 143.409 143.277 143.139 142.982 142.855 142.716 142.456 142.247 142.002 141.861 141.553 141.204 140.781 140.543 139.923 139.686 139.321 138.932 138.125 137.691 137.189 136.602 135.896 135.07 133.922 130.245 -10 ,21378 ,KEBNE ,16749399,Wed Dec 1 12:20:13 CET,Wed Dec 1 14:20:54 CET,0.0 2.359 3.312 4.078 4.726 5.298 5.838 6.371 7.368 7.83 8.284 8.62 9.527 9.926 10.729 11.509 12.238 12.583 13.27 13.943 14.921 15.545 16.164 17.087 17.977 18.86 19.738 20.595 21.705 22.761 23.789 25.039 26.26 27.509 29.026 30.744 32.403 34.292 36.371 38.632 41.052 43.767 46.998 50.336 54.392 59.112 64.742 71.39 79.711 90.202 104.051 116.749 124.901 130.528 134.37 137.237 139.51 141.316 142.62 143.715 144.488 145.09 145.619 146.026 146.349 146.598 146.787 146.897 146.955 147.01 147.067 147.072 147.031 146.987 146.949 146.9 146.821 146.715 146.579 146.46 146.323 146.102 145.939 145.752 145.642 145.352 145.045 144.766 144.61 144.072 144.053 143.812 143.543 142.928 142.588 142.203 141.752 141.205 140.518 139.532 134.71 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt deleted file mode 100644 index 49f52616..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18612 ,KEBNE ,17028222,Wed Dec 22 19:22:43 CET,Wed Dec 22 21:24:05 CET,0.0 2.627 3.642 4.424 5.099 5.691 6.233 6.743 7.687 8.14 8.582 8.952 9.884 10.287 11.066 11.804 12.52 12.87 13.557 14.221 15.169 15.798 16.428 17.341 18.239 19.138 20.016 20.866 21.985 23.096 24.179 25.513 26.818 28.088 29.597 31.342 33.094 35.063 37.204 39.511 41.996 44.907 48.442 52.121 56.604 61.853 68.181 75.647 84.773 96.349 112.003 126.719 136.526 143.588 148.864 152.899 155.939 158.354 160.275 162.035 163.343 164.388 165.301 166.086 166.735 167.28 167.738 168.033 168.269 168.491 168.67 168.774 168.855 168.932 168.983 169.009 169.01 168.984 168.904 168.849 168.797 168.63 168.47 168.295 168.202 167.977 167.683 167.37 167.203 166.69 166.637 166.432 166.187 165.607 165.298 164.965 164.519 163.992 163.33 162.282 158.723 -2 ,18156 ,KEBNE ,17028223,Wed Dec 22 19:22:43 CET,Wed Dec 22 21:23:07 CET,0.0 2.227 3.309 4.213 4.918 5.51 6.077 6.635 7.699 8.192 8.66 9.032 9.968 10.388 11.193 11.954 12.698 13.059 13.763 14.462 15.494 16.151 16.794 17.744 18.663 19.555 20.439 21.319 22.474 23.622 24.757 26.131 27.473 28.792 30.357 32.171 33.969 35.975 38.181 40.577 43.151 46.156 49.837 53.689 58.327 63.702 70.143 77.796 87.388 99.491 115.816 131.361 141.512 148.658 153.914 158.041 161.253 163.815 165.775 167.539 168.893 169.954 170.889 171.704 172.376 172.922 173.436 173.833 174.152 174.454 174.714 174.901 175.048 175.142 175.216 175.285 175.328 175.354 175.349 175.331 175.309 175.258 175.192 175.086 175.021 174.864 174.673 174.425 174.284 173.812 173.766 173.548 173.322 172.755 172.425 172.059 171.607 171.038 170.287 169.271 165.592 -3 ,22427 ,KEBNE ,17028224,Wed Dec 22 19:22:43 CET,Wed Dec 22 21:23:27 CET,0.0 2.643 3.789 4.632 5.336 5.989 6.592 7.143 8.158 8.647 9.113 9.469 10.399 10.824 11.644 12.404 13.13 13.49 14.211 14.908 15.915 16.582 17.245 18.207 19.132 20.04 20.949 21.848 23.008 24.157 25.29 26.646 27.998 29.348 30.942 32.767 34.548 36.579 38.823 41.217 43.827 46.908 50.614 54.457 59.139 64.559 70.932 78.433 87.872 100.05 116.535 132.062 142.266 149.467 154.661 158.659 161.775 164.246 166.18 167.963 169.294 170.347 171.232 171.959 172.544 172.993 173.42 173.761 174.013 174.233 174.451 174.606 174.729 174.846 174.939 175.028 175.083 175.099 175.094 175.088 175.057 174.96 174.888 174.812 174.763 174.593 174.332 174.027 173.865 173.372 173.27 173.034 172.788 172.191 171.849 171.439 170.947 170.357 169.579 168.549 166.314 -4 ,11798 ,KEBNE ,17028225,Wed Dec 22 19:26:51 CET,Wed Dec 22 21:27:09 CET,0.0 2.123 3.197 4.056 4.76 5.4 5.984 6.505 7.491 7.966 8.402 8.723 9.641 10.053 10.85 11.604 12.327 12.685 13.383 14.065 15.063 15.712 16.36 17.31 18.236 19.147 20.05 20.936 22.093 23.228 24.336 25.696 27.038 28.346 29.86 31.636 33.407 35.376 37.594 40.036 42.634 45.62 49.222 52.997 57.562 62.845 69.255 76.834 86.227 98.13 113.934 128.873 138.825 145.866 151.071 155.142 158.23 160.689 162.616 164.341 165.697 166.795 167.714 168.505 169.155 169.667 170.156 170.559 170.872 171.164 171.422 171.605 171.768 171.91 171.982 172.006 172.002 171.992 171.983 171.947 171.894 171.788 171.694 171.563 171.477 171.299 171.059 170.756 170.588 170.089 170.013 169.767 169.501 168.837 168.428 167.977 167.479 166.887 166.073 164.96 161.54 -5 ,5616 ,KEBNE ,17028226,Wed Dec 22 19:26:51 CET,Wed Dec 22 21:27:40 CET,0.0 2.949 4.005 4.806 5.511 6.132 6.748 7.331 8.365 8.856 9.321 9.677 10.592 11.003 11.778 12.513 13.227 13.589 14.313 15.012 16.033 16.71 17.373 18.329 19.273 20.256 21.248 22.205 23.444 24.623 25.743 27.122 28.499 29.834 31.402 33.211 34.996 37.004 39.234 41.656 44.256 47.255 50.849 54.637 59.293 64.739 71.249 78.894 88.433 100.812 117.632 133.35 143.78 151.148 156.538 160.718 163.967 166.642 168.675 170.425 171.794 172.923 173.856 174.592 175.209 175.75 176.288 176.702 177.007 177.296 177.503 177.602 177.678 177.719 177.727 177.733 177.712 177.641 177.555 177.497 177.421 177.239 177.069 176.89 176.795 176.57 176.34 176.08 175.923 175.424 175.323 175.076 174.821 174.248 173.91 173.521 173.033 172.439 171.667 170.689 167.908 -6 ,13130 ,KEBNE ,17028227,Wed Dec 22 19:26:51 CET,Wed Dec 22 21:27:46 CET,0.0 2.255 3.305 4.113 4.828 5.48 6.061 6.593 7.579 8.047 8.496 8.832 9.747 10.143 10.897 11.636 12.355 12.707 13.4 14.087 15.089 15.735 16.378 17.321 18.256 19.179 20.08 20.969 22.117 23.224 24.304 25.652 27.002 28.341 29.907 31.677 33.42 35.375 37.534 39.917 42.504 45.454 48.99 52.663 57.094 62.275 68.604 76.156 85.491 97.297 113.187 128.0 137.831 144.945 150.245 154.39 157.558 160.1 162.063 163.852 165.263 166.374 167.335 168.192 168.872 169.383 169.872 170.255 170.559 170.859 171.128 171.325 171.496 171.644 171.756 171.841 171.894 171.92 171.892 171.871 171.853 171.795 171.722 171.59 171.505 171.31 171.077 170.819 170.652 170.108 169.939 169.666 169.354 168.634 168.235 167.796 167.301 166.714 165.967 164.919 160.221 -7 ,28087 ,KEBNE ,17028228,Wed Dec 22 19:26:58 CET,Wed Dec 22 21:25:53 CET,0.0 2.234 3.253 4.049 4.745 5.376 5.952 6.482 7.464 7.936 8.395 8.745 9.653 10.045 10.804 11.541 12.265 12.623 13.322 13.998 14.981 15.618 16.239 17.141 18.025 18.892 19.757 20.614 21.738 22.844 23.922 25.253 26.561 27.854 29.392 31.166 32.895 34.848 37.022 39.356 41.863 44.802 48.4 52.136 56.664 61.966 68.375 75.973 85.37 97.461 113.867 129.382 139.623 146.887 152.313 156.561 159.893 162.619 164.671 166.456 167.837 168.932 169.866 170.692 171.396 171.977 172.534 172.953 173.268 173.563 173.828 173.994 174.125 174.225 174.257 174.245 174.204 174.159 174.085 174.009 173.908 173.71 173.551 173.363 173.26 173.032 172.789 172.512 172.332 171.809 171.743 171.513 171.242 170.6 170.225 169.81 169.329 168.764 168.029 166.862 163.183 -8 ,13931 ,KEBNE ,17028229,Wed Dec 22 19:26:58 CET,Wed Dec 22 21:26:10 CET,0.0 3.383 4.452 5.297 6.046 6.712 7.326 7.87 8.862 9.327 9.765 10.072 10.98 11.377 12.149 12.888 13.584 13.916 14.57 15.204 16.139 16.752 17.367 18.29 19.191 20.074 20.948 21.797 22.893 23.974 25.036 26.348 27.652 28.942 30.464 32.182 33.874 35.786 37.893 40.198 42.688 45.603 49.147 52.832 57.305 62.454 68.586 75.859 84.886 96.43 111.976 126.691 136.741 143.929 149.142 153.191 156.285 158.746 160.695 162.48 163.831 164.886 165.796 166.534 167.124 167.625 168.124 168.505 168.76 168.971 169.172 169.321 169.448 169.513 169.509 169.494 169.493 169.462 169.403 169.364 169.299 169.151 169.036 168.913 168.837 168.641 168.43 168.212 168.083 167.633 167.63 167.423 167.183 166.613 166.275 165.893 165.451 164.924 164.273 163.192 158.414 -9 ,20551 ,KEBNE ,17028230,Wed Dec 22 19:26:51 CET,Wed Dec 22 21:27:14 CET,0.0 2.255 3.17 3.888 4.525 5.111 5.671 6.202 7.169 7.617 8.053 8.387 9.295 9.696 10.474 11.212 11.908 12.245 12.909 13.554 14.479 15.089 15.708 16.617 17.481 18.331 19.178 20.023 21.155 22.258 23.329 24.669 26.005 27.296 28.815 30.598 32.376 34.348 36.486 38.814 41.355 44.307 47.859 51.505 55.876 61.039 67.353 74.9 84.201 95.931 111.699 126.628 136.61 143.727 149.002 153.085 156.243 158.808 160.79 162.579 163.932 164.968 165.847 166.638 167.302 167.834 168.344 168.738 169.044 169.321 169.567 169.727 169.856 169.966 170.017 170.047 170.091 170.12 170.104 170.079 170.026 169.887 169.77 169.641 169.558 169.361 169.158 168.916 168.744 168.229 168.182 167.969 167.73 167.182 166.867 166.464 165.962 165.385 164.692 163.693 159.635 -10 ,17070 ,KEBNE ,17028231,Wed Dec 22 19:26:52 CET,Wed Dec 22 21:27:34 CET,0.0 2.403 3.352 4.159 4.848 5.438 5.982 6.494 7.457 7.917 8.365 8.711 9.633 10.026 10.813 11.566 12.265 12.612 13.293 13.946 14.889 15.495 16.098 16.995 17.861 18.715 19.568 20.412 21.515 22.585 23.648 24.984 26.309 27.592 29.1 30.852 32.566 34.527 36.736 39.153 41.77 44.757 48.321 52.054 56.525 61.651 67.864 75.337 84.722 96.719 112.787 128.026 138.283 145.616 151.066 155.235 158.384 160.942 162.943 164.744 166.112 167.218 168.194 169.011 169.68 170.225 170.741 171.183 171.492 171.703 171.873 172.009 172.142 172.253 172.339 172.432 172.502 172.543 172.561 172.564 172.565 172.499 172.401 172.282 172.204 171.985 171.711 171.42 171.274 170.791 170.748 170.537 170.285 169.674 169.359 169.01 168.563 168.044 167.419 166.519 163.983 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index 00bc9882..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16355 ,KEBNE ,16749400,Wed Dec 1 12:20:12 CET,Wed Dec 1 14:17:36 CET,0.0 1.357 2.038 2.564 3.028 3.422 3.765 4.089 4.674 4.949 5.208 5.369 5.931 6.15 6.567 6.945 7.291 7.463 7.795 8.111 8.575 8.872 9.154 9.566 9.959 10.331 10.697 11.05 11.501 11.939 12.356 12.85 13.321 13.773 14.296 14.884 15.449 16.06 16.731 17.474 18.254 19.103 20.044 20.989 22.093 23.262 24.578 26.075 27.77 29.551 31.465 32.783 33.23 33.261 32.996 32.571 32.128 31.661 31.236 30.795 30.364 29.943 29.487 29.023 28.57 28.142 27.698 27.302 26.965 26.591 26.15 25.769 25.385 24.978 24.647 24.313 23.979 23.627 23.251 22.965 22.643 22.153 21.806 21.432 21.241 20.835 20.399 19.932 19.689 19.111 18.875 18.566 18.221 17.458 17.05 16.597 16.058 15.421 14.682 13.623 10.332 -2 ,11534 ,KEBNE ,16749401,Wed Dec 1 12:20:12 CET,Wed Dec 1 14:22:22 CET,0.0 2.378 3.184 3.778 4.269 4.678 5.031 5.355 5.94 6.216 6.477 6.618 7.16 7.385 7.823 8.233 8.63 8.826 9.193 9.543 10.048 10.354 10.637 11.056 11.457 11.834 12.2 12.562 13.044 13.54 14.014 14.544 15.028 15.488 16.023 16.648 17.245 17.881 18.579 19.3 20.051 20.906 21.881 22.901 24.095 25.323 26.697 28.205 29.935 31.819 33.643 34.697 34.961 34.899 34.641 34.232 33.729 33.213 32.756 32.26 31.8 31.324 30.809 30.299 29.803 29.319 28.814 28.371 27.957 27.518 27.071 26.674 26.242 25.811 25.473 25.113 24.738 24.334 23.9 23.59 23.262 22.724 22.331 21.925 21.722 21.307 20.857 20.359 20.098 19.505 19.193 18.849 18.495 17.717 17.27 16.791 16.253 15.619 14.819 13.675 10.01 -3 ,4473 ,KEBNE ,16749402,Wed Dec 1 12:20:12 CET,Wed Dec 1 14:18:39 CET,0.0 2.077 2.825 3.388 3.846 4.244 4.603 4.971 5.618 5.882 6.151 6.335 6.9 7.128 7.545 7.93 8.293 8.465 8.796 9.118 9.587 9.883 10.166 10.581 10.975 11.345 11.704 12.053 12.498 12.931 13.347 13.847 14.325 14.786 15.318 15.918 16.492 17.113 17.775 18.47 19.2 20.028 20.995 21.952 23.056 24.305 25.72 27.264 29.011 30.931 32.919 34.188 34.595 34.545 34.288 33.952 33.57 33.105 32.616 32.096 31.618 31.151 30.72 30.292 29.847 29.423 28.994 28.621 28.297 27.942 27.53 27.171 26.786 26.365 26.044 25.707 25.322 24.913 24.484 24.18 23.853 23.322 22.949 22.542 22.329 21.89 21.42 20.924 20.653 20.041 19.739 19.414 19.044 18.2 17.752 17.247 16.669 16.003 15.205 14.147 10.697 -4 ,14224 ,KEBNE ,16749403,Wed Dec 1 12:20:13 CET,Wed Dec 1 14:17:38 CET,0.0 1.534 2.277 2.854 3.34 3.753 4.119 4.458 5.065 5.342 5.603 5.762 6.314 6.53 6.952 7.37 7.767 7.948 8.302 8.651 9.149 9.451 9.737 10.156 10.539 10.904 11.261 11.615 12.077 12.518 12.942 13.465 13.96 14.428 14.986 15.596 16.168 16.797 17.476 18.174 18.891 19.701 20.657 21.627 22.767 24.031 25.405 26.932 28.667 30.452 32.18 33.181 33.439 33.347 33.018 32.566 32.122 31.619 31.082 30.572 30.169 29.8 29.428 29.03 28.603 28.224 27.85 27.492 27.161 26.796 26.395 26.047 25.69 25.313 25.003 24.633 24.237 23.886 23.49 23.172 22.842 22.337 21.985 21.575 21.35 20.941 20.512 20.031 19.777 19.198 18.903 18.577 18.247 17.446 17.002 16.522 15.94 15.241 14.398 13.204 9.831 -5 ,1550 ,KEBNE ,16749404,Wed Dec 1 12:32:01 CET,Wed Dec 1 14:29:25 CET,0.0 1.505 2.17 2.729 3.183 3.588 3.961 4.291 4.872 5.144 5.412 5.596 6.156 6.38 6.806 7.197 7.559 7.732 8.065 8.383 8.829 9.119 9.404 9.812 10.217 10.606 10.97 11.331 11.807 12.261 12.689 13.199 13.694 14.177 14.735 15.355 15.947 16.605 17.316 18.062 18.838 19.707 20.706 21.706 22.848 24.076 25.434 26.909 28.593 30.456 32.49 33.812 34.281 34.34 34.109 33.653 33.167 32.691 32.231 31.731 31.24 30.769 30.285 29.829 29.397 28.981 28.557 28.143 27.768 27.391 26.985 26.631 26.251 25.828 25.484 25.136 24.781 24.418 23.997 23.69 23.364 22.828 22.468 22.09 21.891 21.484 21.044 20.564 20.312 19.729 19.458 19.141 18.808 18.053 17.638 17.153 16.552 15.853 14.993 13.794 9.905 -6 ,5288 ,KEBNE ,16749405,Wed Dec 1 12:32:00 CET,Wed Dec 1 14:28:47 CET,0.0 2.299 2.981 3.502 3.938 4.33 4.678 5.002 5.61 5.879 6.127 6.258 6.798 6.996 7.394 7.794 8.169 8.344 8.683 9.007 9.47 9.772 10.062 10.468 10.849 11.217 11.584 11.947 12.412 12.851 13.271 13.78 14.271 14.751 15.305 15.903 16.478 17.11 17.78 18.492 19.238 20.104 21.078 22.014 23.085 24.26 25.623 27.154 29.003 31.083 33.157 34.41 34.715 34.626 34.441 34.108 33.675 33.27 32.855 32.382 31.973 31.571 31.152 30.742 30.323 29.88 29.398 28.964 28.568 28.137 27.699 27.352 26.997 26.593 26.272 25.961 25.605 25.206 24.802 24.51 24.202 23.735 23.394 23.031 22.838 22.4 21.919 21.395 21.121 20.534 20.254 19.917 19.541 18.726 18.28 17.788 17.239 16.559 15.729 14.582 11.149 -7 ,697 ,KEBNE ,16749406,Wed Dec 1 12:32:01 CET,Wed Dec 1 14:30:15 CET,0.0 2.01 2.718 3.274 3.746 4.137 4.493 4.827 5.402 5.671 5.928 6.077 6.627 6.838 7.238 7.619 7.983 8.153 8.491 8.823 9.273 9.564 9.847 10.242 10.628 11.003 11.368 11.724 12.194 12.657 13.094 13.611 14.113 14.593 15.134 15.747 16.33 16.95 17.642 18.388 19.147 19.992 20.966 21.932 23.052 24.3 25.696 27.203 28.947 30.861 32.891 34.208 34.657 34.656 34.374 33.95 33.478 32.953 32.452 31.898 31.381 30.929 30.454 29.975 29.543 29.161 28.739 28.307 27.925 27.53 27.071 26.676 26.279 25.856 25.516 25.169 24.809 24.425 24.029 23.741 23.425 22.941 22.604 22.24 22.051 21.637 21.168 20.657 20.389 19.799 19.516 19.193 18.862 18.112 17.673 17.175 16.615 15.958 15.1 13.951 10.805 -8 ,17570 ,KEBNE ,16749407,Wed Dec 1 12:32:01 CET,Wed Dec 1 14:29:49 CET,0.0 2.234 3.025 3.554 3.981 4.348 4.679 4.988 5.556 5.825 6.094 6.266 6.814 7.024 7.438 7.817 8.175 8.353 8.69 9.015 9.492 9.787 10.066 10.462 10.85 11.247 11.631 11.987 12.445 12.89 13.313 13.808 14.293 14.761 15.289 15.876 16.43 17.029 17.685 18.392 19.125 19.963 20.926 21.902 23.062 24.312 25.734 27.34 29.191 31.303 33.435 34.656 35.061 35.109 34.94 34.638 34.304 33.901 33.485 33.034 32.618 32.246 31.847 31.423 30.985 30.544 30.089 29.686 29.325 28.935 28.505 28.128 27.729 27.3 26.948 26.569 26.186 25.827 25.427 25.125 24.821 24.354 24.01 23.628 23.435 23.019 22.546 22.07 21.822 21.23 20.934 20.606 20.263 19.496 19.078 18.606 18.073 17.472 16.69 15.508 12.38 -9 ,3485 ,KEBNE ,16749408,Wed Dec 1 12:32:01 CET,Wed Dec 1 14:30:58 CET,0.0 1.874 2.621 3.123 3.549 3.941 4.287 4.588 5.122 5.37 5.616 5.77 6.323 6.542 6.951 7.347 7.724 7.9 8.242 8.582 9.064 9.361 9.651 10.063 10.454 10.85 11.221 11.564 12.003 12.436 12.852 13.346 13.823 14.276 14.802 15.386 15.948 16.572 17.245 17.968 18.713 19.561 20.548 21.506 22.603 23.811 25.17 26.657 28.36 30.251 32.265 33.499 33.804 33.696 33.389 32.961 32.456 31.884 31.343 30.839 30.397 29.974 29.553 29.1 28.648 28.243 27.788 27.319 26.902 26.46 25.981 25.597 25.198 24.772 24.443 24.099 23.741 23.377 22.997 22.727 22.434 21.947 21.59 21.215 21.03 20.638 20.2 19.712 19.443 18.837 18.545 18.22 17.874 17.082 16.647 16.187 15.649 14.997 14.182 12.96 9.585 -10 ,29278 ,KEBNE ,16749409,Wed Dec 1 12:32:00 CET,Wed Dec 1 14:30:04 CET,0.0 2.715 3.501 4.073 4.558 4.979 5.352 5.689 6.282 6.567 6.834 6.984 7.532 7.745 8.168 8.566 8.943 9.126 9.47 9.794 10.266 10.565 10.844 11.254 11.655 12.031 12.383 12.72 13.152 13.564 13.961 14.451 14.922 15.368 15.879 16.452 17.006 17.603 18.241 18.928 19.645 20.448 21.404 22.366 23.458 24.666 26.036 27.533 29.246 31.186 33.159 34.371 34.759 34.73 34.517 34.182 33.811 33.406 32.98 32.488 32.025 31.595 31.153 30.714 30.295 29.91 29.509 29.113 28.74 28.366 27.976 27.628 27.251 26.842 26.516 26.178 25.815 25.44 25.055 24.77 24.465 23.976 23.638 23.291 23.114 22.716 22.252 21.791 21.562 20.982 20.727 20.413 20.069 19.277 18.844 18.359 17.774 17.079 16.262 15.185 11.685 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt deleted file mode 100644 index db5c1351..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2493 ,KEBNE ,16749410,Wed Dec 1 12:32:00 CET,Wed Dec 1 14:34:14 CET,0.0 2.457 3.338 3.997 4.534 4.995 5.398 5.756 6.385 6.688 6.976 7.167 7.739 7.966 8.379 8.781 9.162 9.337 9.673 9.992 10.438 10.719 10.994 11.383 11.73 12.066 12.387 12.695 13.094 13.475 13.847 14.251 14.619 14.984 15.391 15.823 16.211 16.62 17.055 17.495 17.918 18.378 18.839 19.182 19.459 19.685 19.866 19.85 19.405 18.241 15.798 12.558 9.831 7.33 5.024 2.966 1.199 -0.384 -1.784 -3.236 -4.446 -5.485 -6.495 -7.446 -8.298 -9.084 -9.936 -10.668 -11.277 -11.916 -12.573 -13.095 -13.643 -14.234 -14.7 -15.176 -15.66 -16.166 -16.703 -17.07 -17.442 -18.037 -18.476 -18.924 -19.146 -19.613 -20.107 -20.624 -20.902 -21.563 -21.78 -22.111 -22.483 -23.267 -23.677 -24.126 -24.632 -25.205 -25.912 -26.813 -29.433 -2 ,1645 ,KEBNE ,16749411,Wed Dec 1 12:32:00 CET,Wed Dec 1 14:32:30 CET,0.0 2.751 3.566 4.157 4.631 5.037 5.41 5.767 6.439 6.742 7.004 7.185 7.734 7.945 8.368 8.762 9.118 9.292 9.627 9.928 10.338 10.598 10.84 11.203 11.57 11.898 12.19 12.489 12.872 13.231 13.59 14.005 14.377 14.71 15.075 15.451 15.777 16.119 16.458 16.797 17.181 17.624 18.054 18.397 18.716 18.882 18.85 18.558 17.917 16.681 14.167 10.735 7.582 4.817 2.509 0.538 -1.227 -2.858 -4.217 -5.569 -6.735 -7.775 -8.747 -9.645 -10.474 -11.249 -12.074 -12.8 -13.424 -14.065 -14.721 -15.26 -15.829 -16.425 -16.888 -17.366 -17.86 -18.362 -18.871 -19.224 -19.595 -20.171 -20.562 -20.983 -21.211 -21.683 -22.15 -22.64 -22.928 -23.597 -23.818 -24.152 -24.498 -25.203 -25.592 -26.025 -26.514 -27.047 -27.719 -28.642 -30.876 -3 ,21493 ,KEBNE ,16749412,Wed Dec 1 12:32:01 CET,Wed Dec 1 14:30:19 CET,0.0 2.056 3.002 3.652 4.16 4.579 4.942 5.28 5.904 6.185 6.45 6.632 7.183 7.416 7.871 8.274 8.652 8.835 9.191 9.54 10.034 10.333 10.605 10.967 11.293 11.632 11.95 12.226 12.609 12.965 13.291 13.694 14.08 14.446 14.841 15.258 15.659 16.085 16.524 16.971 17.368 17.741 18.139 18.521 18.917 19.271 19.502 19.491 18.961 17.595 14.907 11.361 8.275 5.671 3.493 1.519 -0.235 -1.839 -3.224 -4.624 -5.807 -6.852 -7.861 -8.801 -9.661 -10.454 -11.286 -12.023 -12.668 -13.327 -14.006 -14.582 -15.197 -15.824 -16.299 -16.793 -17.299 -17.819 -18.38 -18.773 -19.166 -19.787 -20.216 -20.676 -20.912 -21.368 -21.857 -22.39 -22.669 -23.329 -23.587 -23.938 -24.308 -25.109 -25.551 -26.03 -26.549 -27.11 -27.788 -28.676 -31.355 -4 ,25830 ,KEBNE ,16749413,Wed Dec 1 12:32:00 CET,Wed Dec 1 14:32:03 CET,0.0 2.338 3.144 3.731 4.229 4.65 5.044 5.402 6.067 6.358 6.604 6.749 7.29 7.507 7.904 8.273 8.623 8.79 9.112 9.405 9.817 10.079 10.327 10.692 11.041 11.367 11.689 11.993 12.378 12.757 13.095 13.467 13.812 14.141 14.506 14.911 15.304 15.717 16.138 16.543 16.936 17.359 17.805 18.182 18.486 18.641 18.644 18.437 17.918 16.803 14.292 10.756 7.816 5.253 2.997 0.993 -0.801 -2.42 -3.783 -5.153 -6.354 -7.419 -8.399 -9.316 -10.189 -10.974 -11.79 -12.508 -13.126 -13.777 -14.462 -15.032 -15.61 -16.187 -16.64 -17.106 -17.57 -18.067 -18.59 -18.962 -19.343 -19.923 -20.337 -20.766 -20.985 -21.428 -21.894 -22.402 -22.672 -23.336 -23.563 -23.878 -24.206 -24.926 -25.318 -25.744 -26.219 -26.761 -27.458 -28.452 -31.111 -5 ,8458 ,KEBNE ,16749414,Wed Dec 1 12:32:01 CET,Wed Dec 1 14:32:05 CET,0.0 3.247 4.12 4.809 5.366 5.816 6.212 6.566 7.216 7.509 7.784 7.979 8.543 8.767 9.187 9.57 9.913 10.079 10.402 10.71 11.154 11.432 11.698 12.069 12.407 12.711 13.009 13.322 13.729 14.109 14.491 14.928 15.31 15.656 16.018 16.415 16.781 17.158 17.541 17.914 18.31 18.761 19.208 19.54 19.828 20.044 20.079 19.829 19.184 17.911 15.424 11.98 9.019 6.53 4.376 2.436 0.701 -0.866 -2.209 -3.561 -4.724 -5.745 -6.694 -7.595 -8.463 -9.243 -10.049 -10.776 -11.389 -12.045 -12.741 -13.33 -13.94 -14.56 -15.052 -15.561 -16.096 -16.642 -17.192 -17.565 -17.942 -18.543 -18.98 -19.429 -19.652 -20.101 -20.587 -21.1 -21.355 -22.01 -22.222 -22.524 -22.834 -23.515 -23.897 -24.319 -24.795 -25.386 -26.03 -26.782 -28.744 -6 ,377 ,KEBNE ,16749415,Wed Dec 1 12:32:01 CET,Wed Dec 1 14:32:47 CET,0.0 2.112 2.901 3.478 3.979 4.421 4.809 5.147 5.757 6.029 6.28 6.432 6.984 7.196 7.592 7.973 8.317 8.469 8.785 9.105 9.539 9.801 10.043 10.397 10.749 11.086 11.398 11.7 12.074 12.409 12.73 13.109 13.457 13.767 14.133 14.546 14.911 15.292 15.686 16.096 16.511 16.921 17.323 17.668 17.919 18.036 17.98 17.738 17.167 15.905 13.405 10.11 7.059 4.342 2.098 0.126 -1.625 -3.26 -4.684 -6.065 -7.24 -8.295 -9.287 -10.218 -11.098 -11.904 -12.75 -13.509 -14.15 -14.809 -15.494 -16.069 -16.671 -17.268 -17.726 -18.21 -18.705 -19.218 -19.761 -20.139 -20.534 -21.161 -21.604 -22.063 -22.294 -22.755 -23.234 -23.751 -24.028 -24.7 -24.963 -25.297 -25.636 -26.377 -26.789 -27.265 -27.792 -28.36 -29.014 -29.85 -32.257 -7 ,31495 ,KEBNE ,16749416,Wed Dec 1 12:32:00 CET,Wed Dec 1 14:33:42 CET,0.0 2.06 2.844 3.446 3.952 4.395 4.769 5.112 5.761 6.052 6.334 6.542 7.104 7.314 7.716 8.114 8.477 8.635 8.944 9.251 9.705 9.986 10.246 10.621 10.965 11.279 11.568 11.838 12.185 12.529 12.846 13.203 13.552 13.884 14.251 14.649 15.004 15.381 15.785 16.195 16.616 17.044 17.486 17.872 18.235 18.561 18.746 18.635 18.058 16.855 14.533 11.241 8.253 5.643 3.396 1.426 -0.322 -1.986 -3.429 -4.865 -6.065 -7.1 -8.102 -9.065 -9.953 -10.749 -11.599 -12.368 -13.012 -13.692 -14.406 -14.97 -15.542 -16.138 -16.606 -17.092 -17.589 -18.109 -18.65 -19.029 -19.427 -20.035 -20.468 -20.918 -21.147 -21.623 -22.119 -22.652 -22.933 -23.602 -23.85 -24.191 -24.557 -25.323 -25.738 -26.215 -26.756 -27.33 -27.977 -28.871 -31.285 -8 ,4336 ,KEBNE ,16749417,Wed Dec 1 12:37:20 CET,Wed Dec 1 14:36:45 CET,0.0 2.031 2.743 3.369 3.921 4.359 4.743 5.094 5.727 6.02 6.303 6.523 7.099 7.333 7.75 8.12 8.471 8.648 9.008 9.359 9.824 10.101 10.365 10.758 11.142 11.51 11.868 12.193 12.596 12.986 13.359 13.81 14.214 14.573 14.99 15.428 15.825 16.265 16.726 17.162 17.586 18.062 18.529 18.949 19.419 19.74 19.857 19.82 19.532 18.502 15.992 12.698 9.886 7.504 5.415 3.461 1.709 0.148 -1.25 -2.647 -3.794 -4.827 -5.816 -6.747 -7.62 -8.429 -9.257 -9.977 -10.598 -11.254 -11.942 -12.513 -13.099 -13.702 -14.178 -14.671 -15.181 -15.705 -16.229 -16.585 -16.96 -17.525 -17.919 -18.334 -18.549 -19.02 -19.523 -20.037 -20.299 -20.945 -21.158 -21.47 -21.802 -22.528 -22.932 -23.374 -23.845 -24.349 -24.988 -25.869 -28.371 -9 ,761 ,KEBNE ,16749418,Wed Dec 1 12:59:37 CET,Wed Dec 1 14:58:48 CET,0.0 2.587 3.493 4.144 4.627 5.042 5.414 5.756 6.38 6.678 6.966 7.146 7.703 7.923 8.34 8.733 9.094 9.277 9.63 9.929 10.33 10.588 10.843 11.214 11.558 11.882 12.19 12.473 12.847 13.215 13.54 13.906 14.26 14.625 15.022 15.418 15.756 16.086 16.452 16.842 17.231 17.662 18.122 18.508 18.908 19.175 19.195 18.907 18.206 16.929 14.316 10.875 7.921 5.213 2.779 0.637 -1.19 -2.807 -4.189 -5.549 -6.714 -7.812 -8.852 -9.793 -10.664 -11.455 -12.268 -12.991 -13.608 -14.246 -14.921 -15.477 -16.055 -16.653 -17.116 -17.589 -18.082 -18.615 -19.168 -19.537 -19.918 -20.537 -20.959 -21.38 -21.597 -22.052 -22.543 -23.07 -23.343 -24.0 -24.218 -24.537 -24.878 -25.674 -26.121 -26.573 -27.072 -27.65 -28.358 -29.337 -31.572 -10 ,21368 ,KEBNE ,16749419,Wed Dec 1 13:25:23 CET,Wed Dec 1 15:24:46 CET,0.0 2.731 3.545 4.13 4.647 5.115 5.503 5.849 6.443 6.714 6.98 7.15 7.702 7.917 8.325 8.717 9.08 9.25 9.583 9.903 10.36 10.641 10.893 11.237 11.561 11.893 12.208 12.493 12.838 13.163 13.5 13.909 14.267 14.582 14.967 15.4 15.764 16.118 16.513 16.902 17.284 17.708 18.076 18.307 18.512 18.658 18.616 18.361 17.722 16.402 13.783 10.359 7.408 4.776 2.429 0.347 -1.454 -3.103 -4.51 -5.862 -7.036 -8.117 -9.141 -10.081 -10.972 -11.812 -12.666 -13.406 -14.049 -14.706 -15.376 -15.938 -16.524 -17.13 -17.597 -18.084 -18.581 -19.075 -19.604 -19.986 -20.378 -20.994 -21.417 -21.848 -22.071 -22.539 -23.03 -23.553 -23.825 -24.488 -24.744 -25.083 -25.445 -26.205 -26.633 -27.098 -27.592 -28.156 -28.844 -29.718 -31.933 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index 2b251392..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6226 ,KEBNE ,16749420,Wed Dec 1 13:30:48 CET,Wed Dec 1 15:32:33 CET,0.0 2.63 3.404 4.01 4.54 4.961 5.309 5.643 6.224 6.483 6.728 6.93 7.401 7.602 7.991 8.362 8.694 8.849 9.149 9.431 9.85 10.13 10.394 10.769 11.123 11.467 11.793 12.106 12.518 12.902 13.27 13.712 14.129 14.525 14.977 15.486 15.967 16.495 17.052 17.626 18.235 18.906 19.64 20.366 21.182 22.065 23.064 24.123 25.24 26.342 27.245 27.448 27.167 26.688 26.153 25.597 25.045 24.505 23.992 23.446 22.957 22.519 22.093 21.662 21.247 20.868 20.45 20.066 19.728 19.369 19.01 18.71 18.371 17.992 17.703 17.409 17.104 16.8 16.468 16.233 15.992 15.617 15.352 15.057 14.9 14.578 14.249 13.893 13.7 13.249 13.053 12.811 12.56 11.986 11.654 11.308 10.928 10.485 9.904 9.087 6.623 -2 ,292 ,KEBNE ,16749421,Wed Dec 1 13:39:19 CET,Wed Dec 1 15:42:10 CET,0.0 1.987 2.679 3.188 3.646 4.056 4.419 4.741 5.315 5.585 5.836 6.033 6.497 6.698 7.076 7.442 7.783 7.942 8.255 8.547 8.958 9.23 9.497 9.88 10.247 10.597 10.934 11.259 11.662 12.04 12.397 12.815 13.217 13.611 14.064 14.557 15.015 15.517 16.062 16.648 17.249 17.888 18.613 19.313 20.107 21.001 22.0 23.044 24.135 25.203 26.074 26.239 25.97 25.551 25.067 24.561 24.056 23.522 23.016 22.496 22.02 21.589 21.172 20.764 20.375 20.018 19.644 19.293 18.974 18.617 18.244 17.943 17.626 17.287 17.015 16.73 16.436 16.117 15.777 15.55 15.324 14.958 14.683 14.375 14.211 13.89 13.565 13.212 13.013 12.554 12.348 12.11 11.872 11.334 11.023 10.677 10.288 9.855 9.345 8.622 6.226 -3 ,27216 ,KEBNE ,16749422,Wed Dec 1 13:46:51 CET,Wed Dec 1 15:48:27 CET,0.0 2.608 3.471 4.005 4.482 4.895 5.243 5.564 6.14 6.401 6.65 6.86 7.326 7.528 7.902 8.259 8.611 8.779 9.091 9.395 9.837 10.115 10.376 10.746 11.102 11.443 11.775 12.104 12.518 12.908 13.298 13.807 14.31 14.758 15.223 15.71 16.177 16.687 17.237 17.811 18.396 19.042 19.774 20.498 21.327 22.217 23.221 24.306 25.415 26.475 27.385 27.625 27.405 27.017 26.552 26.003 25.402 24.822 24.293 23.71 23.19 22.716 22.254 21.816 21.419 21.038 20.613 20.227 19.886 19.527 19.153 18.839 18.507 18.164 17.883 17.595 17.302 16.983 16.626 16.371 16.109 15.689 15.403 15.112 14.962 14.631 14.278 13.913 13.713 13.262 13.057 12.809 12.559 12.006 11.673 11.309 10.897 10.398 9.803 9.023 6.79 -4 ,29258 ,KEBNE ,16749423,Wed Dec 1 13:50:07 CET,Wed Dec 1 15:53:39 CET,0.0 2.5 3.188 3.731 4.179 4.579 4.951 5.295 5.901 6.171 6.424 6.628 7.09 7.296 7.676 8.046 8.395 8.557 8.876 9.175 9.583 9.847 10.112 10.491 10.849 11.2 11.535 11.849 12.247 12.613 12.972 13.424 13.852 14.261 14.733 15.251 15.73 16.247 16.798 17.379 17.992 18.655 19.367 20.071 20.883 21.737 22.695 23.728 24.754 25.727 26.574 26.803 26.574 26.155 25.644 25.041 24.466 23.938 23.441 22.925 22.451 21.997 21.544 21.092 20.67 20.302 19.901 19.528 19.205 18.873 18.517 18.217 17.903 17.55 17.267 16.973 16.657 16.319 15.975 15.735 15.479 15.082 14.798 14.495 14.339 14.005 13.661 13.309 13.115 12.665 12.484 12.257 12.01 11.464 11.145 10.779 10.367 9.888 9.336 8.581 6.511 -5 ,29430 ,KEBNE ,16749424,Wed Dec 1 13:52:14 CET,Wed Dec 1 15:53:52 CET,0.0 2.453 3.208 3.731 4.178 4.563 4.901 5.237 5.86 6.129 6.366 6.549 7.02 7.226 7.647 8.072 8.439 8.599 8.908 9.203 9.616 9.874 10.114 10.469 10.81 11.135 11.451 11.75 12.144 12.541 12.924 13.365 13.777 14.18 14.629 15.125 15.605 16.127 16.674 17.227 17.809 18.455 19.191 19.921 20.778 21.688 22.693 23.764 24.849 25.905 26.736 26.986 26.844 26.494 26.038 25.514 24.984 24.453 23.947 23.405 22.929 22.504 22.058 21.55 21.059 20.642 20.238 19.88 19.528 19.14 18.742 18.414 18.087 17.74 17.454 17.154 16.842 16.511 16.159 15.912 15.66 15.254 14.962 14.654 14.488 14.139 13.79 13.414 13.214 12.76 12.509 12.259 12.008 11.424 11.093 10.739 10.336 9.87 9.341 8.615 6.619 -6 ,32752 ,KEBNE ,16749425,Wed Dec 1 13:56:38 CET,Wed Dec 1 15:59:32 CET,0.0 1.978 2.663 3.186 3.625 4.019 4.368 4.688 5.25 5.511 5.767 5.963 6.432 6.642 7.024 7.386 7.733 7.901 8.227 8.526 8.941 9.212 9.469 9.839 10.183 10.514 10.838 11.156 11.575 11.98 12.356 12.796 13.217 13.621 14.084 14.599 15.095 15.619 16.168 16.764 17.377 18.03 18.78 19.524 20.354 21.247 22.245 23.282 24.375 25.483 26.488 26.784 26.541 26.068 25.542 25.001 24.402 23.784 23.237 22.686 22.196 21.769 21.357 20.937 20.527 20.142 19.741 19.383 19.062 18.725 18.371 18.075 17.757 17.419 17.154 16.873 16.591 16.299 15.989 15.772 15.534 15.15 14.891 14.614 14.468 14.17 13.838 13.474 13.282 12.834 12.657 12.436 12.196 11.662 11.358 11.01 10.624 10.193 9.641 8.894 6.793 -7 ,22269 ,KEBNE ,16749426,Wed Dec 1 14:05:05 CET,Wed Dec 1 16:08:40 CET,0.0 1.995 2.673 3.206 3.668 4.07 4.423 4.741 5.322 5.584 5.836 6.03 6.489 6.694 7.098 7.474 7.804 7.963 8.274 8.573 9.007 9.28 9.548 9.937 10.299 10.638 10.966 11.282 11.687 12.074 12.451 12.904 13.331 13.741 14.211 14.736 15.23 15.748 16.308 16.903 17.515 18.179 18.916 19.639 20.454 21.314 22.279 23.313 24.433 25.546 26.467 26.754 26.544 26.089 25.531 24.969 24.416 23.865 23.372 22.853 22.386 21.945 21.516 21.111 20.712 20.33 19.913 19.532 19.205 18.868 18.499 18.174 17.837 17.483 17.205 16.925 16.629 16.301 15.961 15.732 15.487 15.065 14.766 14.469 14.321 14.004 13.659 13.287 13.076 12.615 12.404 12.162 11.916 11.351 11.036 10.703 10.307 9.846 9.318 8.626 6.201 -8 ,21940 ,KEBNE ,16749427,Wed Dec 1 14:05:06 CET,Wed Dec 1 16:06:31 CET,0.0 2.522 3.202 3.738 4.197 4.596 4.951 5.283 5.89 6.155 6.412 6.628 7.09 7.292 7.666 8.012 8.356 8.523 8.843 9.15 9.578 9.844 10.107 10.484 10.832 11.166 11.495 11.814 12.215 12.596 12.97 13.429 13.86 14.262 14.715 15.208 15.689 16.21 16.745 17.307 17.886 18.542 19.294 20.025 20.863 21.74 22.698 23.662 24.684 25.793 26.771 27.038 26.735 26.281 25.795 25.285 24.785 24.26 23.74 23.174 22.683 22.245 21.816 21.394 20.989 20.612 20.202 19.815 19.463 19.097 18.712 18.374 18.038 17.708 17.435 17.151 16.856 16.537 16.205 15.97 15.725 15.335 15.053 14.741 14.582 14.267 13.935 13.582 13.394 12.946 12.762 12.536 12.305 11.758 11.44 11.114 10.731 10.301 9.793 9.073 7.043 -9 ,29882 ,KEBNE ,16749428,Wed Dec 1 14:05:05 CET,Wed Dec 1 16:07:40 CET,0.0 2.434 3.324 3.932 4.423 4.874 5.258 5.574 6.132 6.381 6.623 6.837 7.307 7.509 7.89 8.254 8.593 8.755 9.069 9.372 9.784 10.047 10.31 10.674 11.021 11.357 11.684 12.007 12.399 12.775 13.142 13.581 14.006 14.404 14.858 15.353 15.826 16.348 16.898 17.476 18.056 18.693 19.437 20.162 20.994 21.897 22.862 23.865 24.957 26.12 27.112 27.344 27.119 26.712 26.218 25.702 25.182 24.652 24.155 23.629 23.158 22.723 22.288 21.871 21.481 21.096 20.686 20.314 19.975 19.602 19.211 18.889 18.55 18.191 17.908 17.617 17.31 16.992 16.662 16.421 16.171 15.79 15.513 15.225 15.075 14.756 14.427 14.057 13.86 13.419 13.227 12.994 12.751 12.21 11.908 11.566 11.189 10.772 10.243 9.54 7.573 -10 ,30746 ,KEBNE ,16749429,Wed Dec 1 14:05:05 CET,Wed Dec 1 16:07:00 CET,0.0 2.5 3.264 3.827 4.262 4.644 4.983 5.301 5.882 6.152 6.408 6.624 7.084 7.287 7.691 8.068 8.415 8.579 8.893 9.192 9.618 9.89 10.14 10.493 10.839 11.177 11.496 11.812 12.218 12.589 12.953 13.388 13.803 14.212 14.689 15.202 15.683 16.21 16.761 17.349 17.957 18.613 19.334 20.048 20.891 21.777 22.743 23.774 24.854 25.942 26.902 27.186 26.983 26.576 26.081 25.546 25.017 24.466 23.965 23.459 22.981 22.522 22.077 21.653 21.238 20.844 20.437 20.074 19.745 19.401 19.05 18.741 18.398 18.037 17.747 17.455 17.161 16.851 16.518 16.271 16.011 15.572 15.26 14.948 14.791 14.477 14.145 13.781 13.589 13.143 12.947 12.719 12.472 11.921 11.619 11.29 10.917 10.464 9.943 9.299 7.482 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt deleted file mode 100644 index 7c43cda3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32523 ,KEBNE ,16749430,Wed Dec 1 14:05:05 CET,Wed Dec 1 16:05:45 CET,0.0 2.115 2.842 3.369 3.791 4.14 4.465 4.773 5.312 5.551 5.78 5.946 6.399 6.587 6.967 7.329 7.65 7.8 8.085 8.359 8.735 8.968 9.194 9.522 9.823 10.102 10.371 10.627 10.942 11.24 11.53 11.878 12.221 12.541 12.866 13.206 13.537 13.874 14.219 14.59 14.949 15.298 15.655 15.976 16.327 16.686 16.947 16.93 16.579 15.677 13.478 10.288 7.585 5.197 3.026 1.044 -0.699 -2.297 -3.675 -5.006 -6.166 -7.193 -8.124 -9.022 -9.888 -10.68 -11.499 -12.238 -12.869 -13.518 -14.203 -14.775 -15.365 -15.964 -16.437 -16.915 -17.408 -17.932 -18.464 -18.823 -19.194 -19.778 -20.168 -20.575 -20.79 -21.241 -21.719 -22.242 -22.52 -23.083 -23.407 -23.762 -24.127 -24.902 -25.325 -25.786 -26.286 -26.854 -27.582 -28.641 -31.647 -2 ,13575 ,KEBNE ,16749431,Wed Dec 1 14:05:05 CET,Wed Dec 1 16:05:57 CET,0.0 2.05 2.724 3.25 3.707 4.104 4.442 4.75 5.293 5.531 5.755 5.904 6.351 6.534 6.876 7.196 7.491 7.634 7.917 8.177 8.534 8.756 8.974 9.283 9.579 9.885 10.174 10.44 10.77 11.079 11.373 11.718 12.04 12.341 12.677 13.045 13.396 13.742 14.091 14.472 14.853 15.267 15.723 16.106 16.474 16.822 17.121 17.244 17.078 16.41 14.392 11.339 8.477 5.822 3.557 1.534 -0.245 -1.817 -3.174 -4.53 -5.694 -6.743 -7.752 -8.684 -9.53 -10.324 -11.146 -11.864 -12.494 -13.14 -13.811 -14.385 -14.976 -15.591 -16.084 -16.599 -17.12 -17.645 -18.185 -18.559 -18.956 -19.573 -20.001 -20.45 -20.673 -21.114 -21.591 -22.116 -22.383 -22.948 -23.247 -23.57 -23.922 -24.684 -25.098 -25.573 -26.12 -26.755 -27.515 -28.559 -31.579 -3 ,19757 ,KEBNE ,16749432,Wed Dec 1 14:05:05 CET,Wed Dec 1 16:04:52 CET,0.0 2.277 3.013 3.536 3.964 4.337 4.666 4.96 5.476 5.712 5.94 6.111 6.56 6.742 7.089 7.412 7.716 7.866 8.152 8.426 8.792 9.014 9.241 9.572 9.882 10.165 10.424 10.676 11.006 11.307 11.59 11.93 12.25 12.549 12.871 13.221 13.572 13.929 14.287 14.627 14.962 15.341 15.77 16.164 16.501 16.756 16.962 17.074 16.87 16.059 13.818 10.459 7.44 4.812 2.622 0.666 -1.045 -2.591 -3.925 -5.275 -6.435 -7.416 -8.335 -9.191 -9.989 -10.721 -11.509 -12.248 -12.857 -13.466 -14.111 -14.646 -15.211 -15.797 -16.249 -16.734 -17.25 -17.766 -18.273 -18.629 -19.008 -19.609 -20.017 -20.433 -20.65 -21.104 -21.607 -22.156 -22.434 -23.007 -23.349 -23.691 -24.044 -24.788 -25.207 -25.66 -26.169 -26.755 -27.493 -28.54 -30.728 -4 ,13808 ,KEBNE ,16749433,Wed Dec 1 14:05:09 CET,Wed Dec 1 16:03:58 CET,0.0 2.027 2.71 3.193 3.613 3.989 4.316 4.623 5.128 5.346 5.55 5.675 6.112 6.296 6.637 6.945 7.242 7.382 7.652 7.915 8.277 8.507 8.727 9.054 9.346 9.616 9.885 10.148 10.494 10.808 11.088 11.435 11.764 12.055 12.383 12.757 13.125 13.512 13.894 14.276 14.643 15.018 15.433 15.821 16.203 16.536 16.729 16.745 16.539 15.845 13.915 10.591 7.592 5.009 2.705 0.625 -1.145 -2.694 -4.068 -5.465 -6.631 -7.695 -8.708 -9.662 -10.543 -11.33 -12.117 -12.799 -13.428 -14.113 -14.802 -15.351 -15.914 -16.495 -16.958 -17.437 -17.927 -18.446 -18.996 -19.372 -19.754 -20.36 -20.786 -21.23 -21.461 -21.972 -22.526 -23.078 -23.357 -23.936 -24.3 -24.643 -25.004 -25.822 -26.289 -26.792 -27.328 -27.963 -28.749 -29.808 -33.384 -5 ,15358 ,KEBNE ,16749434,Wed Dec 1 14:05:05 CET,Wed Dec 1 16:05:36 CET,0.0 2.074 2.785 3.297 3.713 4.076 4.404 4.7 5.247 5.495 5.721 5.889 6.351 6.541 6.897 7.242 7.563 7.715 7.998 8.269 8.645 8.877 9.104 9.429 9.742 10.033 10.306 10.572 10.907 11.218 11.513 11.859 12.17 12.477 12.815 13.177 13.521 13.882 14.246 14.611 14.969 15.335 15.729 16.041 16.368 16.653 16.874 16.995 16.682 15.71 13.557 10.32 7.273 4.663 2.439 0.438 -1.278 -2.828 -4.206 -5.615 -6.787 -7.793 -8.763 -9.67 -10.51 -11.266 -12.062 -12.778 -13.385 -14.021 -14.703 -15.266 -15.84 -16.439 -16.894 -17.36 -17.84 -18.35 -18.9 -19.28 -19.654 -20.247 -20.691 -21.161 -21.397 -21.888 -22.441 -23.028 -23.326 -23.931 -24.291 -24.645 -25.025 -25.818 -26.279 -26.769 -27.287 -27.904 -28.649 -29.701 -33.08 -6 ,12313 ,KEBNE ,16749435,Wed Dec 1 14:05:06 CET,Wed Dec 1 16:05:01 CET,0.0 1.986 2.641 3.129 3.567 3.95 4.293 4.626 5.209 5.455 5.679 5.815 6.268 6.463 6.82 7.156 7.467 7.614 7.887 8.146 8.543 8.792 9.02 9.35 9.66 9.949 10.228 10.492 10.837 11.165 11.46 11.801 12.134 12.453 12.803 13.174 13.507 13.872 14.257 14.633 14.996 15.409 15.904 16.316 16.675 16.949 17.138 17.135 16.642 15.385 12.941 9.627 6.649 3.975 1.623 -0.433 -2.213 -3.773 -5.122 -6.489 -7.662 -8.718 -9.726 -10.681 -11.548 -12.305 -13.103 -13.843 -14.479 -15.118 -15.774 -16.322 -16.891 -17.492 -17.966 -18.459 -18.97 -19.505 -20.064 -20.436 -20.809 -21.398 -21.81 -22.229 -22.444 -22.902 -23.392 -23.902 -24.174 -24.743 -25.061 -25.386 -25.709 -26.444 -26.886 -27.353 -27.854 -28.445 -29.168 -30.11 -32.551 -7 ,18205 ,KEBNE ,16749436,Wed Dec 1 14:05:06 CET,Wed Dec 1 16:04:52 CET,0.0 1.711 2.437 2.987 3.427 3.782 4.105 4.416 4.949 5.18 5.397 5.549 6.001 6.184 6.54 6.882 7.188 7.333 7.597 7.843 8.184 8.399 8.619 8.933 9.229 9.514 9.775 10.019 10.333 10.619 10.876 11.192 11.479 11.734 12.03 12.353 12.649 12.978 13.332 13.691 14.021 14.341 14.675 14.953 15.204 15.366 15.359 15.163 14.719 13.532 10.861 7.43 4.404 1.827 -0.436 -2.493 -4.285 -5.905 -7.304 -8.65 -9.79 -10.834 -11.839 -12.77 -13.624 -14.398 -15.229 -15.982 -16.618 -17.302 -18.003 -18.532 -19.073 -19.664 -20.131 -20.614 -21.102 -21.612 -22.152 -22.516 -22.88 -23.451 -23.866 -24.303 -24.528 -24.989 -25.499 -26.055 -26.334 -26.917 -27.286 -27.62 -27.959 -28.74 -29.184 -29.691 -30.251 -30.859 -31.561 -32.493 -35.856 -8 ,28016 ,KEBNE ,16749437,Wed Dec 1 14:05:06 CET,Wed Dec 1 16:04:51 CET,0.0 2.529 3.196 3.695 4.117 4.467 4.783 5.066 5.574 5.804 6.021 6.173 6.613 6.791 7.135 7.463 7.757 7.89 8.151 8.402 8.752 8.97 9.182 9.483 9.758 10.023 10.273 10.502 10.786 11.062 11.332 11.656 11.966 12.241 12.533 12.863 13.175 13.488 13.792 14.102 14.389 14.665 14.943 15.145 15.311 15.426 15.381 15.101 14.418 13.122 10.766 7.532 4.564 1.998 -0.274 -2.346 -4.12 -5.704 -7.014 -8.355 -9.546 -10.558 -11.501 -12.407 -13.264 -14.044 -14.847 -15.566 -16.204 -16.865 -17.526 -18.073 -18.65 -19.233 -19.685 -20.164 -20.657 -21.174 -21.701 -22.065 -22.449 -23.022 -23.44 -23.921 -24.164 -24.628 -25.114 -25.672 -25.97 -26.564 -26.95 -27.302 -27.662 -28.494 -28.923 -29.376 -29.912 -30.525 -31.276 -32.273 -35.622 -9 ,25435 ,KEBNE ,16749438,Wed Dec 1 14:06:10 CET,Wed Dec 1 16:07:16 CET,0.0 2.427 3.132 3.664 4.092 4.456 4.805 5.133 5.714 5.962 6.175 6.305 6.735 6.905 7.235 7.544 7.832 7.974 8.24 8.48 8.832 9.063 9.276 9.568 9.847 10.114 10.373 10.622 10.935 11.219 11.486 11.802 12.089 12.366 12.681 13.016 13.326 13.665 14.01 14.35 14.688 15.029 15.384 15.688 15.981 16.233 16.379 16.307 15.913 14.86 12.575 9.552 6.686 4.105 1.965 0.087 -1.578 -3.094 -4.418 -5.714 -6.838 -7.869 -8.834 -9.715 -10.536 -11.297 -12.089 -12.781 -13.375 -13.995 -14.641 -15.188 -15.767 -16.374 -16.828 -17.287 -17.781 -18.3 -18.834 -19.21 -19.609 -20.233 -20.669 -21.12 -21.346 -21.802 -22.281 -22.802 -23.076 -23.638 -23.967 -24.304 -24.662 -25.483 -25.931 -26.387 -26.882 -27.458 -28.134 -29.082 -32.338 -10 ,4808 ,KEBNE ,16749439,Wed Dec 1 14:06:11 CET,Wed Dec 1 16:07:17 CET,0.0 2.114 2.825 3.343 3.777 4.166 4.51 4.812 5.351 5.596 5.828 6.005 6.449 6.628 6.962 7.273 7.572 7.717 7.975 8.221 8.597 8.833 9.053 9.378 9.689 9.979 10.246 10.5 10.821 11.114 11.386 11.727 12.06 12.364 12.7 13.067 13.418 13.792 14.186 14.58 14.951 15.341 15.755 16.133 16.476 16.704 16.846 16.79 16.37 15.331 12.835 9.367 6.449 3.957 1.749 -0.295 -2.036 -3.545 -4.867 -6.223 -7.366 -8.39 -9.363 -10.257 -11.087 -11.862 -12.664 -13.387 -14.024 -14.673 -15.345 -15.904 -16.481 -17.09 -17.577 -18.07 -18.574 -19.101 -19.661 -20.049 -20.445 -21.069 -21.5 -21.94 -22.163 -22.611 -23.083 -23.593 -23.866 -24.447 -24.775 -25.099 -25.438 -26.254 -26.715 -27.217 -27.775 -28.401 -29.224 -30.335 -33.483 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt deleted file mode 100644 index 2ba592ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18761 ,KEBNE ,17028232,Wed Dec 22 19:26:51 CET,Wed Dec 22 21:27:40 CET,0.0 2.16 2.915 3.456 3.928 4.324 4.685 5.021 5.621 5.889 6.145 6.395 6.881 7.096 7.505 7.889 8.255 8.431 8.765 9.09 9.556 9.846 10.121 10.511 10.887 11.251 11.6 11.924 12.343 12.758 13.149 13.609 14.064 14.511 15.031 15.614 16.146 16.72 17.348 18.018 18.713 19.481 20.383 21.267 22.216 23.212 24.316 25.471 26.63 27.72 28.659 28.864 28.45 27.819 27.188 26.534 25.875 25.235 24.64 23.984 23.408 22.903 22.406 21.921 21.48 21.058 20.601 20.208 19.855 19.477 19.085 18.762 18.419 18.039 17.729 17.413 17.101 16.783 16.444 16.202 15.945 15.545 15.266 14.973 14.821 14.496 14.153 13.79 13.597 13.153 12.978 12.733 12.468 11.898 11.574 11.222 10.822 10.366 9.849 9.14 6.85 -2 ,16816 ,KEBNE ,17028233,Wed Dec 22 19:26:51 CET,Wed Dec 22 21:27:48 CET,0.0 2.419 3.145 3.688 4.145 4.551 4.889 5.203 5.772 6.036 6.308 6.547 7.014 7.222 7.621 8.006 8.377 8.548 8.879 9.209 9.655 9.927 10.197 10.595 10.975 11.342 11.702 12.04 12.468 12.891 13.297 13.781 14.232 14.664 15.189 15.764 16.292 16.876 17.523 18.219 18.956 19.76 20.607 21.409 22.341 23.362 24.515 25.745 26.984 28.066 28.941 29.127 28.783 28.277 27.679 27.027 26.396 25.786 25.2 24.581 24.018 23.503 23.027 22.564 22.117 21.699 21.239 20.809 20.418 20.02 19.624 19.282 18.921 18.545 18.252 17.938 17.602 17.252 16.893 16.647 16.391 15.973 15.679 15.383 15.222 14.868 14.516 14.149 13.952 13.505 13.289 13.059 12.814 12.249 11.936 11.579 11.17 10.682 10.109 9.314 6.928 -3 ,19170 ,KEBNE ,17028234,Wed Dec 22 19:26:52 CET,Wed Dec 22 21:28:43 CET,0.0 2.547 3.296 3.853 4.337 4.769 5.131 5.453 6.049 6.327 6.582 6.785 7.267 7.487 7.911 8.305 8.663 8.837 9.171 9.488 9.944 10.226 10.508 10.921 11.305 11.684 12.056 12.41 12.864 13.295 13.7 14.199 14.685 15.142 15.654 16.225 16.784 17.372 17.991 18.662 19.352 20.1 20.946 21.759 22.642 23.687 24.914 26.134 27.415 28.712 29.807 29.966 29.486 28.77 28.08 27.41 26.737 26.118 25.581 24.998 24.457 23.958 23.474 22.995 22.529 22.115 21.689 21.289 20.936 20.573 20.204 19.891 19.555 19.19 18.911 18.642 18.341 18.007 17.656 17.409 17.158 16.77 16.496 16.202 16.048 15.733 15.393 15.015 14.816 14.372 14.191 13.968 13.731 13.177 12.845 12.483 12.095 11.648 11.116 10.354 8.245 -4 ,29361 ,KEBNE ,17028235,Wed Dec 22 19:26:51 CET,Wed Dec 22 21:28:13 CET,0.0 2.077 2.775 3.309 3.779 4.182 4.528 4.846 5.412 5.678 5.931 6.138 6.613 6.831 7.232 7.602 7.963 8.143 8.479 8.805 9.279 9.58 9.873 10.287 10.683 11.059 11.415 11.76 12.204 12.628 13.049 13.543 14.003 14.453 14.978 15.563 16.12 16.718 17.348 17.984 18.624 19.351 20.147 20.91 21.852 22.851 23.929 25.167 26.382 27.43 28.097 27.97 27.468 26.91 26.337 25.677 25.005 24.352 23.781 23.192 22.666 22.181 21.706 21.246 20.8 20.395 19.976 19.584 19.224 18.843 18.429 18.078 17.721 17.355 17.077 16.788 16.48 16.154 15.818 15.588 15.347 14.957 14.67 14.355 14.197 13.886 13.558 13.209 13.025 12.581 12.424 12.207 11.964 11.414 11.113 10.756 10.344 9.903 9.373 8.637 6.699 -5 ,26703 ,KEBNE ,17028236,Wed Dec 22 19:26:52 CET,Wed Dec 22 21:27:31 CET,0.0 3.065 3.815 4.364 4.824 5.221 5.582 5.907 6.486 6.751 7.0 7.222 7.701 7.914 8.313 8.691 9.056 9.236 9.578 9.896 10.343 10.628 10.905 11.306 11.693 12.061 12.418 12.765 13.2 13.621 14.04 14.54 14.997 15.429 15.952 16.543 17.106 17.708 18.337 19.018 19.724 20.51 21.449 22.378 23.406 24.532 25.746 26.964 28.269 29.499 30.463 30.625 30.247 29.595 28.848 28.106 27.385 26.711 26.108 25.48 24.899 24.371 23.874 23.394 22.931 22.507 22.055 21.634 21.277 20.903 20.507 20.173 19.811 19.431 19.138 18.83 18.517 18.192 17.835 17.585 17.321 16.908 16.634 16.359 16.218 15.911 15.566 15.199 15.006 14.553 14.36 14.117 13.859 13.275 12.938 12.578 12.175 11.721 11.179 10.45 8.298 -6 ,24723 ,KEBNE ,17028237,Wed Dec 22 19:26:52 CET,Wed Dec 22 21:27:27 CET,0.0 1.112 1.697 2.153 2.575 2.963 3.302 3.612 4.147 4.401 4.648 4.84 5.303 5.514 5.911 6.28 6.616 6.778 7.103 7.433 7.913 8.201 8.49 8.909 9.301 9.683 10.057 10.414 10.855 11.279 11.689 12.17 12.632 13.072 13.574 14.149 14.695 15.29 15.924 16.59 17.288 18.074 18.97 19.83 20.725 21.654 22.772 23.929 25.028 26.047 26.782 26.707 26.207 25.522 24.734 23.957 23.258 22.577 21.979 21.355 20.763 20.189 19.62 19.113 18.649 18.201 17.723 17.309 16.946 16.57 16.179 15.825 15.441 15.052 14.731 14.398 14.067 13.712 13.338 13.072 12.788 12.339 12.037 11.735 11.581 11.266 10.919 10.529 10.323 9.866 9.642 9.387 9.122 8.552 8.233 7.882 7.493 7.03 6.478 5.773 3.56 -7 ,2636 ,KEBNE ,17028238,Wed Dec 22 19:26:53 CET,Wed Dec 22 21:27:32 CET,0.0 2.497 3.212 3.711 4.147 4.549 4.903 5.223 5.808 6.063 6.303 6.521 6.999 7.211 7.632 8.039 8.408 8.587 8.937 9.261 9.71 9.997 10.282 10.691 11.072 11.448 11.82 12.174 12.624 13.06 13.465 13.925 14.371 14.798 15.294 15.873 16.391 16.937 17.546 18.206 18.885 19.612 20.461 21.296 22.235 23.287 24.483 25.751 27.014 28.213 29.316 29.618 29.308 28.734 28.091 27.369 26.638 25.906 25.264 24.637 24.073 23.559 23.056 22.559 22.08 21.644 21.194 20.781 20.403 19.99 19.583 19.253 18.893 18.5 18.193 17.878 17.545 17.195 16.801 16.532 16.279 15.875 15.575 15.263 15.108 14.786 14.437 14.073 13.876 13.417 13.203 12.96 12.718 12.161 11.839 11.498 11.105 10.649 10.115 9.32 6.631 -8 ,21668 ,KEBNE ,17028239,Wed Dec 22 19:26:56 CET,Wed Dec 22 21:24:33 CET,0.0 2.216 2.962 3.517 3.981 4.375 4.717 5.029 5.596 5.856 6.101 6.315 6.795 7.008 7.403 7.766 8.124 8.301 8.62 8.92 9.37 9.661 9.94 10.332 10.699 11.049 11.39 11.722 12.151 12.573 12.98 13.465 13.943 14.417 14.97 15.582 16.144 16.713 17.314 17.959 18.644 19.44 20.37 21.284 22.305 23.365 24.529 25.728 26.827 27.843 28.929 29.224 28.975 28.492 27.831 27.157 26.514 25.909 25.367 24.778 24.263 23.787 23.291 22.809 22.352 21.924 21.479 21.075 20.718 20.334 19.942 19.637 19.304 18.94 18.661 18.37 18.061 17.741 17.388 17.129 16.868 16.461 16.163 15.845 15.69 15.379 15.028 14.632 14.429 13.969 13.764 13.523 13.271 12.716 12.401 12.056 11.638 11.153 10.581 9.853 7.794 -9 ,32637 ,KEBNE ,17028240,Wed Dec 22 19:31:02 CET,Wed Dec 22 21:31:44 CET,0.0 1.939 2.579 3.067 3.485 3.863 4.216 4.543 5.125 5.38 5.632 5.874 6.352 6.572 6.987 7.369 7.725 7.9 8.246 8.573 9.033 9.317 9.597 10.007 10.405 10.785 11.15 11.497 11.947 12.371 12.773 13.264 13.72 14.154 14.656 15.214 15.751 16.339 16.96 17.639 18.353 19.118 20.007 20.945 21.987 23.069 24.285 25.558 26.757 27.695 28.52 28.673 28.247 27.65 26.991 26.313 25.679 25.043 24.432 23.783 23.17 22.635 22.14 21.648 21.169 20.706 20.225 19.811 19.452 19.08 18.692 18.357 18.007 17.644 17.346 17.022 16.692 16.351 15.985 15.729 15.465 15.058 14.766 14.445 14.287 13.971 13.624 13.254 13.062 12.611 12.408 12.166 11.908 11.366 11.07 10.722 10.341 9.916 9.35 8.597 6.397 -10 ,29074 ,KEBNE ,17028241,Wed Dec 22 19:26:55 CET,Wed Dec 22 21:36:05 CET,0.0 2.34 3.005 3.549 4.053 4.505 4.894 5.238 5.849 6.12 6.379 6.62 7.099 7.32 7.743 8.153 8.536 8.716 9.063 9.395 9.865 10.156 10.439 10.854 11.262 11.64 11.997 12.345 12.789 13.225 13.642 14.115 14.557 14.996 15.521 16.113 16.684 17.314 17.988 18.675 19.362 20.144 21.06 21.956 22.922 23.92 25.033 26.306 27.593 28.747 29.781 29.908 29.415 28.829 28.197 27.467 26.777 26.147 25.558 24.924 24.389 23.91 23.413 22.936 22.483 22.064 21.637 21.242 20.884 20.508 20.104 19.766 19.419 19.045 18.748 18.444 18.127 17.794 17.431 17.167 16.896 16.48 16.191 15.88 15.72 15.387 15.034 14.664 14.464 14.003 13.799 13.565 13.32 12.758 12.439 12.083 11.683 11.212 10.645 9.892 7.079 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt deleted file mode 100644 index 245c2497..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27654 ,KEBNE ,17028242,Wed Dec 22 19:26:56 CET,Wed Dec 22 21:24:33 CET,0.0 3.097 3.935 4.545 5.053 5.512 5.913 6.256 6.869 7.158 7.44 7.695 8.188 8.426 8.866 9.268 9.646 9.831 10.212 10.575 11.085 11.412 11.724 12.158 12.567 12.982 13.386 13.763 14.253 14.736 15.201 15.753 16.281 16.791 17.388 18.073 18.711 19.392 20.13 20.923 21.757 22.652 23.694 24.774 26.014 27.294 28.75 30.447 32.25 34.092 36.0 37.119 37.368 37.32 37.045 36.578 36.094 35.599 35.143 34.678 34.247 33.831 33.4 32.981 32.589 32.207 31.773 31.383 31.056 30.702 30.321 30.002 29.654 29.301 29.03 28.736 28.425 28.096 27.757 27.511 27.252 26.851 26.557 26.257 26.11 25.799 25.457 25.1 24.916 24.476 24.288 24.054 23.798 23.23 22.906 22.554 22.148 21.677 21.113 20.34 18.122 -2 ,4881 ,KEBNE ,17028243,Wed Dec 22 19:26:52 CET,Wed Dec 22 21:28:43 CET,0.0 2.305 3.103 3.693 4.168 4.575 4.928 5.263 5.894 6.181 6.456 6.727 7.217 7.448 7.898 8.322 8.703 8.889 9.256 9.595 10.079 10.405 10.728 11.18 11.616 12.048 12.453 12.836 13.342 13.817 14.265 14.83 15.367 15.862 16.449 17.129 17.767 18.454 19.216 20.032 20.881 21.817 22.854 23.889 25.096 26.409 27.884 29.459 31.156 32.981 35.015 36.374 36.727 36.703 36.456 36.064 35.654 35.144 34.62 34.116 33.696 33.287 32.877 32.486 32.105 31.75 31.357 30.985 30.666 30.325 29.968 29.666 29.332 28.979 28.705 28.42 28.134 27.817 27.47 27.238 26.987 26.584 26.298 25.994 25.839 25.537 25.216 24.846 24.651 24.215 24.001 23.74 23.474 22.932 22.63 22.268 21.825 21.293 20.686 19.894 17.276 -3 ,2928 ,KEBNE ,17028244,Wed Dec 22 19:26:51 CET,Wed Dec 22 21:28:18 CET,0.0 2.852 3.673 4.265 4.742 5.172 5.555 5.888 6.489 6.771 7.039 7.292 7.787 8.019 8.44 8.822 9.206 9.396 9.752 10.102 10.608 10.915 11.205 11.645 12.069 12.466 12.844 13.205 13.67 14.116 14.535 15.049 15.553 16.045 16.596 17.22 17.84 18.496 19.189 19.924 20.673 21.51 22.504 23.497 24.588 25.74 27.121 28.657 30.288 32.028 33.855 34.903 35.155 35.063 34.815 34.523 34.148 33.744 33.333 32.847 32.397 31.955 31.525 31.138 30.76 30.386 29.987 29.615 29.291 28.941 28.547 28.204 27.846 27.494 27.223 26.938 26.642 26.329 25.989 25.74 25.497 25.126 24.845 24.553 24.403 24.096 23.75 23.352 23.144 22.692 22.485 22.252 22.008 21.472 21.158 20.797 20.406 19.966 19.418 18.692 16.999 -4 ,17248 ,KEBNE ,17028245,Wed Dec 22 19:26:52 CET,Wed Dec 22 21:27:50 CET,0.0 2.265 3.048 3.665 4.179 4.622 5.003 5.36 6.004 6.283 6.554 6.805 7.279 7.498 7.937 8.366 8.766 8.96 9.338 9.698 10.212 10.546 10.861 11.301 11.722 12.117 12.483 12.852 13.342 13.82 14.271 14.805 15.347 15.878 16.48 17.145 17.779 18.484 19.238 20.024 20.85 21.754 22.774 23.828 25.113 26.517 28.035 29.663 31.528 33.473 35.207 36.369 36.862 36.838 36.57 36.187 35.767 35.354 34.936 34.466 34.02 33.604 33.213 32.818 32.434 32.07 31.687 31.323 30.991 30.649 30.284 29.976 29.655 29.316 29.046 28.762 28.47 28.156 27.829 27.602 27.355 26.959 26.687 26.4 26.241 25.913 25.573 25.202 25.003 24.552 24.329 24.089 23.831 23.254 22.929 22.573 22.183 21.737 21.162 20.298 17.649 -5 ,27586 ,KEBNE ,17028246,Wed Dec 22 19:26:52 CET,Wed Dec 22 21:28:06 CET,0.0 3.071 3.876 4.477 5.026 5.499 5.901 6.274 6.933 7.229 7.5 7.748 8.245 8.479 8.933 9.357 9.748 9.933 10.3 10.671 11.207 11.542 11.868 12.345 12.795 13.219 13.62 14.004 14.497 14.96 15.411 15.98 16.534 17.058 17.646 18.284 18.899 19.588 20.336 21.13 21.942 22.87 23.975 25.036 26.189 27.41 28.784 30.361 32.142 34.039 35.96 37.107 37.395 37.199 36.803 36.345 35.864 35.337 34.845 34.341 33.901 33.474 33.034 32.604 32.2 31.816 31.41 31.051 30.721 30.372 30.004 29.692 29.368 29.027 28.757 28.475 28.175 27.854 27.513 27.274 27.02 26.614 26.336 26.045 25.896 25.573 25.218 24.832 24.623 24.177 23.976 23.744 23.495 22.928 22.624 22.29 21.892 21.426 20.848 20.048 17.45 -6 ,15760 ,KEBNE ,17028247,Wed Dec 22 19:31:04 CET,Wed Dec 22 21:32:55 CET,0.0 3.021 3.905 4.498 4.981 5.421 5.797 6.159 6.812 7.112 7.401 7.657 8.159 8.397 8.858 9.288 9.693 9.891 10.266 10.615 11.105 11.427 11.746 12.199 12.628 13.046 13.456 13.847 14.336 14.808 15.274 15.823 16.338 16.843 17.424 18.077 18.687 19.351 20.049 20.783 21.565 22.427 23.474 24.553 25.789 27.121 28.65 30.296 32.117 34.159 36.261 37.541 37.805 37.723 37.466 37.061 36.565 36.035 35.578 35.046 34.57 34.171 33.762 33.355 32.977 32.632 32.251 31.881 31.538 31.194 30.833 30.516 30.192 29.841 29.556 29.259 28.955 28.645 28.296 28.042 27.79 27.399 27.123 26.82 26.659 26.325 25.969 25.578 25.37 24.926 24.727 24.488 24.237 23.705 23.39 23.033 22.639 22.173 21.591 20.727 17.828 -7 ,24600 ,KEBNE ,17028248,Wed Dec 22 19:31:05 CET,Wed Dec 22 21:32:14 CET,0.0 3.017 3.795 4.357 4.824 5.259 5.66 6.025 6.675 6.989 7.274 7.514 8.013 8.261 8.729 9.153 9.534 9.72 10.087 10.439 10.944 11.257 11.559 12.01 12.441 12.851 13.253 13.646 14.157 14.643 15.094 15.631 16.166 16.693 17.285 17.931 18.552 19.24 19.994 20.792 21.625 22.558 23.637 24.67 25.814 27.098 28.653 30.41 32.249 34.192 36.255 37.469 37.868 37.91 37.699 37.402 37.054 36.653 36.288 35.863 35.439 35.011 34.576 34.186 33.824 33.48 33.111 32.77 32.474 32.148 31.782 31.479 31.163 30.832 30.57 30.264 29.939 29.619 29.28 29.034 28.775 28.371 28.073 27.757 27.598 27.268 26.915 26.539 26.34 25.898 25.698 25.466 25.214 24.63 24.289 23.906 23.487 23.027 22.478 21.712 18.684 -8 ,22526 ,KEBNE ,17028249,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:31:56 CET,0.0 1.873 2.624 3.222 3.712 4.141 4.533 4.896 5.587 5.898 6.182 6.449 6.939 7.163 7.595 8.009 8.411 8.609 8.985 9.335 9.833 10.152 10.458 10.911 11.346 11.755 12.139 12.509 12.989 13.457 13.915 14.467 14.992 15.492 16.044 16.659 17.279 17.957 18.7 19.479 20.283 21.181 22.22 23.311 24.56 25.905 27.442 29.048 30.817 32.767 34.85 36.154 36.5 36.382 36.046 35.633 35.254 34.865 34.452 34.022 33.629 33.253 32.884 32.516 32.149 31.804 31.433 31.056 30.713 30.37 30.009 29.701 29.38 29.038 28.758 28.454 28.129 27.808 27.476 27.233 26.993 26.608 26.325 26.041 25.893 25.571 25.227 24.871 24.685 24.247 24.035 23.793 23.531 22.925 22.581 22.223 21.837 21.369 20.783 19.891 16.748 -9 ,22653 ,KEBNE ,17028250,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:31:51 CET,0.0 2.334 3.115 3.684 4.159 4.594 4.982 5.327 5.946 6.229 6.483 6.722 7.21 7.435 7.85 8.239 8.603 8.779 9.124 9.462 9.946 10.249 10.54 10.959 11.356 11.739 12.121 12.487 12.962 13.422 13.855 14.366 14.864 15.339 15.884 16.514 17.121 17.77 18.442 19.145 19.867 20.688 21.673 22.635 23.74 25.006 26.469 28.137 29.854 31.455 33.188 34.247 34.46 34.327 34.047 33.667 33.237 32.82 32.423 31.951 31.478 31.039 30.639 30.249 29.863 29.494 29.11 28.765 28.44 28.099 27.745 27.431 27.093 26.75 26.484 26.206 25.917 25.613 25.301 25.074 24.825 24.441 24.172 23.884 23.737 23.436 23.107 22.754 22.569 22.13 21.927 21.681 21.416 20.861 20.532 20.189 19.848 19.435 18.965 18.315 16.338 -10 ,5858 ,KEBNE ,17028251,Wed Dec 22 19:31:04 CET,Wed Dec 22 21:32:14 CET,0.0 2.625 3.451 4.049 4.535 4.954 5.328 5.678 6.303 6.587 6.861 7.107 7.581 7.805 8.252 8.684 9.089 9.275 9.646 10.0 10.496 10.816 11.122 11.559 11.985 12.389 12.774 13.148 13.624 14.084 14.534 15.083 15.607 16.108 16.689 17.354 17.997 18.691 19.426 20.204 21.012 21.931 22.977 24.004 25.222 26.572 28.024 29.516 31.185 32.92 34.744 35.823 36.107 36.099 35.893 35.58 35.195 34.739 34.268 33.754 33.283 32.854 32.424 32.008 31.607 31.239 30.842 30.453 30.109 29.746 29.36 29.021 28.676 28.338 28.063 27.772 27.458 27.126 26.783 26.534 26.275 25.871 25.595 25.318 25.169 24.857 24.522 24.137 23.941 23.498 23.292 23.04 22.76 22.087 21.666 21.214 20.744 20.208 19.595 18.706 16.443 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index b0cda43e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7069 ,KEBNE ,16749440,Wed Dec 1 14:06:10 CET,Wed Dec 1 16:06:37 CET,0.0 2.229 2.984 3.52 3.969 4.373 4.726 5.034 5.585 5.835 6.069 6.255 6.721 6.926 7.288 7.635 7.965 8.129 8.443 8.738 9.157 9.42 9.68 10.053 10.416 10.756 11.062 11.35 11.729 12.093 12.447 12.869 13.278 13.677 14.123 14.604 15.056 15.547 16.068 16.597 17.14 17.771 18.506 19.206 19.97 20.781 21.599 22.451 23.351 24.154 24.605 24.366 23.698 22.731 21.786 20.883 20.046 19.304 18.643 17.941 17.295 16.71 16.17 15.663 15.177 14.716 14.2 13.726 13.302 12.849 12.403 12.035 11.648 11.239 10.911 10.579 10.24 9.882 9.505 9.234 8.953 8.515 8.215 7.902 7.738 7.38 6.99 6.598 6.401 5.945 5.722 5.474 5.219 4.687 4.372 4.021 3.647 3.225 2.684 1.911 -0.146 -2 ,10927 ,KEBNE ,16749441,Wed Dec 1 14:07:15 CET,Wed Dec 1 16:08:09 CET,0.0 2.645 3.453 4.097 4.582 4.967 5.323 5.659 6.244 6.509 6.755 6.936 7.384 7.576 7.945 8.291 8.612 8.767 9.073 9.365 9.779 10.054 10.317 10.689 11.041 11.381 11.71 12.017 12.411 12.776 13.123 13.537 13.923 14.302 14.751 15.234 15.689 16.201 16.725 17.255 17.82 18.459 19.191 19.899 20.678 21.515 22.426 23.364 24.294 25.169 25.622 25.236 24.577 23.751 22.866 21.968 21.142 20.378 19.696 18.965 18.304 17.719 17.161 16.614 16.096 15.621 15.123 14.677 14.3 13.892 13.454 13.083 12.683 12.279 11.977 11.661 11.324 10.978 10.608 10.339 10.062 9.644 9.339 9.013 8.849 8.503 8.145 7.76 7.542 7.07 6.864 6.616 6.346 5.747 5.398 5.021 4.615 4.158 3.621 2.898 0.941 -3 ,24087 ,KEBNE ,16749442,Wed Dec 1 14:13:35 CET,Wed Dec 1 16:16:00 CET,0.0 2.286 3.009 3.555 4.01 4.412 4.778 5.093 5.644 5.887 6.13 6.345 6.796 6.988 7.355 7.714 8.062 8.226 8.532 8.82 9.234 9.502 9.767 10.14 10.484 10.819 11.137 11.429 11.803 12.168 12.526 12.956 13.351 13.736 14.169 14.638 15.092 15.579 16.079 16.609 17.174 17.78 18.462 19.157 19.945 20.792 21.691 22.57 23.516 24.324 24.499 23.822 22.838 21.888 20.993 20.08 19.224 18.41 17.673 16.907 16.216 15.57 14.951 14.377 13.849 13.358 12.844 12.383 11.979 11.555 11.105 10.731 10.343 9.935 9.616 9.275 8.927 8.564 8.177 7.92 7.659 7.225 6.917 6.607 6.445 6.102 5.722 5.328 5.118 4.638 4.393 4.142 3.881 3.302 2.968 2.594 2.178 1.709 1.129 0.309 -2.197 -4 ,23140 ,KEBNE ,16749443,Wed Dec 1 14:13:35 CET,Wed Dec 1 16:16:08 CET,0.0 2.685 3.452 3.999 4.421 4.794 5.151 5.485 6.075 6.342 6.584 6.774 7.221 7.414 7.799 8.166 8.507 8.672 8.981 9.275 9.699 9.967 10.224 10.591 10.94 11.277 11.6 11.909 12.303 12.691 13.064 13.488 13.885 14.261 14.692 15.157 15.611 16.125 16.672 17.228 17.781 18.409 19.121 19.799 20.567 21.422 22.341 23.234 24.119 24.879 25.262 24.942 24.126 23.135 22.192 21.305 20.438 19.59 18.868 18.156 17.539 16.964 16.393 15.826 15.294 14.828 14.32 13.829 13.395 12.946 12.478 12.09 11.686 11.26 10.914 10.55 10.19 9.816 9.421 9.14 8.856 8.416 8.103 7.776 7.6 7.239 6.869 6.477 6.269 5.813 5.559 5.3 5.047 4.479 4.151 3.783 3.365 2.866 2.248 1.4 -0.779 -5 ,20547 ,KEBNE ,16749444,Wed Dec 1 14:13:36 CET,Wed Dec 1 16:16:11 CET,0.0 2.234 2.939 3.482 3.957 4.354 4.712 5.04 5.615 5.886 6.14 6.342 6.814 7.026 7.416 7.775 8.12 8.289 8.604 8.896 9.31 9.574 9.827 10.192 10.536 10.868 11.191 11.496 11.888 12.265 12.611 13.016 13.415 13.811 14.249 14.723 15.176 15.653 16.152 16.664 17.187 17.747 18.388 19.028 19.72 20.425 21.196 21.979 22.745 23.443 23.606 22.972 22.173 21.238 20.281 19.352 18.496 17.686 16.984 16.296 15.683 15.106 14.527 13.968 13.45 12.981 12.483 12.024 11.629 11.215 10.781 10.416 10.027 9.627 9.319 9.002 8.671 8.317 7.93 7.662 7.398 6.991 6.695 6.37 6.199 5.856 5.489 5.096 4.893 4.444 4.244 4.002 3.753 3.215 2.906 2.542 2.142 1.71 1.193 0.523 -1.802 -6 ,20305 ,KEBNE ,16749445,Wed Dec 1 14:13:36 CET,Wed Dec 1 16:14:21 CET,0.0 2.866 3.581 4.1 4.53 4.903 5.229 5.543 6.131 6.387 6.624 6.828 7.285 7.491 7.888 8.255 8.594 8.756 9.069 9.367 9.787 10.055 10.311 10.677 11.027 11.362 11.686 11.997 12.399 12.785 13.155 13.594 14.004 14.387 14.822 15.298 15.748 16.229 16.742 17.276 17.821 18.461 19.206 19.902 20.653 21.449 22.32 23.201 24.085 24.868 25.434 25.276 24.634 23.803 22.922 22.031 21.181 20.387 19.64 18.856 18.175 17.571 16.995 16.438 15.929 15.476 14.971 14.48 14.057 13.635 13.201 12.836 12.449 12.048 11.731 11.388 11.039 10.682 10.311 10.002 9.672 9.228 8.921 8.6 8.436 8.093 7.72 7.321 7.106 6.62 6.309 6.025 5.739 5.117 4.779 4.414 4.004 3.559 3.018 2.259 -0.075 -7 ,9411 ,KEBNE ,16749446,Wed Dec 1 14:13:37 CET,Wed Dec 1 16:16:18 CET,0.0 2.22 3.008 3.54 4.009 4.439 4.824 5.152 5.707 5.978 6.239 6.472 6.943 7.15 7.522 7.893 8.248 8.416 8.742 9.049 9.466 9.727 9.984 10.356 10.708 11.034 11.359 11.68 12.076 12.443 12.789 13.202 13.606 13.995 14.418 14.89 15.348 15.844 16.368 16.903 17.461 18.074 18.774 19.446 20.221 21.06 21.882 22.642 23.351 23.953 24.169 23.585 22.71 21.787 20.869 19.924 19.053 18.249 17.51 16.76 16.116 15.533 14.972 14.432 13.919 13.458 12.959 12.483 12.059 11.631 11.181 10.793 10.39 9.978 9.656 9.327 8.999 8.648 8.274 8.013 7.733 7.283 6.965 6.634 6.458 6.093 5.714 5.267 5.03 4.539 4.242 3.972 3.675 2.951 2.547 2.105 1.635 1.078 0.393 -0.464 -2.622 -8 ,24074 ,KEBNE ,16749447,Wed Dec 1 14:13:36 CET,Wed Dec 1 16:14:10 CET,0.0 2.86 3.633 4.193 4.635 5.025 5.371 5.692 6.27 6.523 6.761 7.006 7.494 7.717 8.128 8.485 8.825 8.992 9.292 9.571 9.992 10.27 10.541 10.922 11.272 11.61 11.933 12.23 12.617 12.989 13.346 13.775 14.172 14.553 15.005 15.484 15.923 16.418 16.943 17.494 18.082 18.722 19.44 20.124 20.88 21.674 22.508 23.334 24.113 24.852 25.372 24.961 24.0 23.054 22.251 21.415 20.633 19.863 19.141 18.393 17.694 17.062 16.448 15.849 15.33 14.875 14.354 13.867 13.462 13.037 12.587 12.216 11.826 11.419 11.098 10.765 10.415 10.048 9.666 9.399 9.114 8.663 8.357 8.041 7.877 7.533 7.162 6.777 6.578 6.13 5.91 5.65 5.375 4.778 4.447 4.075 3.674 3.221 2.662 1.914 -0.757 -9 ,5401 ,KEBNE ,16749448,Wed Dec 1 14:13:36 CET,Wed Dec 1 16:14:13 CET,0.0 2.485 3.206 3.761 4.225 4.627 4.97 5.275 5.835 6.097 6.336 6.546 7.012 7.217 7.6 7.959 8.302 8.465 8.781 9.094 9.539 9.821 10.091 10.47 10.83 11.165 11.489 11.8 12.184 12.565 12.929 13.353 13.773 14.172 14.622 15.132 15.608 16.106 16.617 17.156 17.72 18.332 19.044 19.747 20.514 21.318 22.186 23.12 24.137 25.085 25.695 25.541 24.929 24.189 23.39 22.572 21.799 21.072 20.464 19.833 19.241 18.677 18.117 17.59 17.11 16.66 16.168 15.713 15.305 14.882 14.449 14.075 13.673 13.254 12.928 12.604 12.268 11.91 11.531 11.272 11.003 10.564 10.238 9.897 9.734 9.396 9.024 8.614 8.386 7.919 7.686 7.426 7.171 6.606 6.271 5.9 5.506 5.032 4.482 3.73 1.76 -10 ,22133 ,KEBNE ,16749449,Wed Dec 1 14:13:36 CET,Wed Dec 1 16:14:02 CET,0.0 1.845 2.561 3.083 3.54 3.943 4.327 4.67 5.202 5.441 5.686 5.9 6.36 6.569 6.98 7.365 7.72 7.89 8.223 8.541 8.982 9.265 9.532 9.904 10.251 10.583 10.903 11.211 11.615 11.991 12.356 12.788 13.188 13.577 14.029 14.532 15.002 15.528 16.093 16.681 17.272 17.912 18.641 19.34 20.152 20.989 21.866 22.811 23.82 24.648 25.06 24.759 24.038 23.208 22.387 21.552 20.769 19.983 19.263 18.537 17.876 17.251 16.662 16.124 15.623 15.16 14.652 14.184 13.751 13.303 12.851 12.473 12.089 11.691 11.369 11.028 10.629 10.215 9.827 9.56 9.279 8.829 8.518 8.183 8.004 7.635 7.252 6.842 6.631 6.184 5.977 5.736 5.483 4.889 4.549 4.159 3.717 3.251 2.729 2.013 0.09 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index b5893dff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15396 ,KEBNE ,16749450,Wed Dec 1 14:13:37 CET,Wed Dec 1 16:16:16 CET,0.0 3.402 4.268 4.864 5.35 5.771 6.146 6.492 7.124 7.396 7.663 7.934 8.394 8.603 8.984 9.347 9.694 9.861 10.188 10.499 10.928 11.197 11.451 11.805 12.145 12.463 12.769 13.065 13.434 13.775 14.104 14.507 14.883 15.242 15.644 16.082 16.507 16.971 17.45 17.959 18.484 19.038 19.655 20.24 20.876 21.536 22.186 22.758 23.234 23.473 23.01 21.59 20.071 18.65 17.357 16.106 14.997 14.047 13.2 12.28 11.494 10.801 10.127 9.496 8.9 8.336 7.742 7.208 6.744 6.272 5.78 5.366 4.934 4.496 4.154 3.794 3.423 3.026 2.609 2.325 2.027 1.554 1.207 0.853 0.68 0.317 -0.07 -0.484 -0.702 -1.175 -1.415 -1.685 -1.972 -2.577 -2.919 -3.295 -3.707 -4.27 -4.982 -5.863 -8.369 -2 ,2168 ,KEBNE ,16749451,Wed Dec 1 14:13:36 CET,Wed Dec 1 16:18:57 CET,0.0 2.878 3.657 4.249 4.773 5.186 5.527 5.842 6.404 6.663 6.903 7.11 7.562 7.767 8.153 8.516 8.856 9.02 9.332 9.619 10.041 10.308 10.552 10.896 11.222 11.535 11.838 12.124 12.484 12.828 13.164 13.572 13.946 14.303 14.721 15.169 15.575 16.01 16.469 16.958 17.452 17.975 18.548 19.094 19.686 20.242 20.741 21.193 21.555 21.643 21.112 19.721 18.193 16.728 15.411 14.181 13.091 12.034 11.064 10.11 9.295 8.566 7.865 7.196 6.57 6.0 5.398 4.854 4.375 3.88 3.369 2.945 2.512 2.049 1.688 1.323 0.945 0.561 0.155 -0.128 -0.417 -0.906 -1.253 -1.6 -1.79 -2.203 -2.614 -3.035 -3.264 -3.743 -3.985 -4.246 -4.518 -5.101 -5.434 -5.808 -6.242 -6.753 -7.325 -8.189 -11.413 -3 ,27741 ,KEBNE ,16749452,Wed Dec 1 14:13:37 CET,Wed Dec 1 16:18:49 CET,0.0 2.543 3.305 3.895 4.385 4.798 5.173 5.512 6.124 6.404 6.669 6.874 7.319 7.523 7.911 8.29 8.643 8.807 9.109 9.392 9.802 10.058 10.301 10.648 10.985 11.309 11.613 11.899 12.258 12.606 12.948 13.349 13.715 14.064 14.469 14.911 15.333 15.78 16.249 16.762 17.279 17.823 18.391 18.91 19.481 20.033 20.587 21.138 21.63 21.857 21.373 19.913 18.39 16.937 15.564 14.393 13.357 12.338 11.425 10.473 9.651 8.94 8.265 7.622 7.023 6.471 5.881 5.339 4.846 4.317 3.767 3.322 2.858 2.361 1.967 1.569 1.159 0.725 0.279 -0.027 -0.324 -0.787 -1.119 -1.457 -1.638 -2.013 -2.394 -2.804 -3.024 -3.497 -3.753 -4.019 -4.295 -4.938 -5.308 -5.697 -6.107 -6.576 -7.201 -8.002 -10.03 -4 ,6976 ,KEBNE ,16749453,Wed Dec 1 14:13:36 CET,Wed Dec 1 16:15:41 CET,0.0 2.374 3.193 3.791 4.353 4.826 5.208 5.554 6.121 6.385 6.63 6.836 7.287 7.496 7.904 8.28 8.628 8.785 9.072 9.365 9.79 10.046 10.294 10.655 10.995 11.307 11.6 11.91 12.336 12.711 13.046 13.443 13.822 14.191 14.601 15.046 15.479 15.93 16.393 16.872 17.345 17.863 18.451 18.996 19.537 20.11 20.746 21.276 21.591 21.567 20.933 19.573 18.041 16.509 15.167 13.951 12.803 11.736 10.824 9.907 9.084 8.352 7.653 6.973 6.33 5.734 5.129 4.589 4.131 3.666 3.173 2.762 2.33 1.886 1.536 1.173 0.806 0.414 -0.014 -0.312 -0.616 -1.113 -1.481 -1.871 -2.064 -2.443 -2.837 -3.264 -3.492 -3.967 -4.211 -4.472 -4.749 -5.367 -5.714 -6.101 -6.545 -7.049 -7.655 -8.49 -11.408 -5 ,77 ,KEBNE ,16749454,Wed Dec 1 14:13:35 CET,Wed Dec 1 16:17:06 CET,0.0 3.052 3.828 4.428 4.907 5.322 5.696 6.027 6.612 6.875 7.127 7.349 7.821 8.07 8.504 8.87 9.201 9.363 9.686 9.998 10.431 10.705 10.969 11.348 11.693 12.009 12.311 12.606 12.988 13.355 13.702 14.117 14.514 14.88 15.297 15.75 16.172 16.619 17.064 17.504 17.95 18.466 19.052 19.598 20.211 20.798 21.287 21.714 22.082 22.187 21.666 20.378 18.93 17.484 16.136 14.899 13.749 12.662 11.695 10.698 9.852 9.118 8.433 7.78 7.157 6.58 5.99 5.445 4.978 4.502 3.992 3.57 3.129 2.663 2.3 1.927 1.541 1.149 0.743 0.458 0.164 -0.296 -0.615 -0.965 -1.149 -1.521 -1.918 -2.337 -2.56 -3.039 -3.297 -3.567 -3.848 -4.465 -4.807 -5.187 -5.608 -6.1 -6.697 -7.449 -9.934 -6 ,9056 ,KEBNE ,16749455,Wed Dec 1 14:13:36 CET,Wed Dec 1 16:17:45 CET,0.0 3.346 4.119 4.74 5.258 5.712 6.091 6.421 7.006 7.264 7.501 7.697 8.153 8.36 8.746 9.102 9.449 9.615 9.928 10.226 10.617 10.863 11.118 11.491 11.835 12.156 12.45 12.733 13.11 13.459 13.789 14.168 14.525 14.878 15.283 15.732 16.146 16.588 17.056 17.545 18.041 18.582 19.184 19.731 20.294 20.855 21.409 21.952 22.346 22.408 21.789 20.377 18.966 17.621 16.354 15.089 13.911 12.878 11.945 10.985 10.165 9.403 8.693 8.03 7.414 6.844 6.221 5.69 5.232 4.737 4.227 3.798 3.354 2.909 2.559 2.193 1.808 1.402 0.978 0.691 0.4 -0.06 -0.384 -0.718 -0.896 -1.271 -1.661 -2.082 -2.302 -2.774 -3.064 -3.346 -3.631 -4.241 -4.582 -4.948 -5.347 -5.814 -6.412 -7.196 -9.727 -7 ,6449 ,KEBNE ,16749456,Wed Dec 1 14:13:37 CET,Wed Dec 1 16:16:10 CET,0.0 3.36 4.25 4.929 5.458 5.878 6.258 6.59 7.173 7.438 7.699 7.945 8.396 8.594 8.963 9.326 9.658 9.817 10.129 10.42 10.83 11.088 11.333 11.699 12.069 12.419 12.749 13.054 13.419 13.762 14.088 14.48 14.856 15.216 15.62 16.056 16.467 16.917 17.398 17.888 18.387 18.927 19.514 20.053 20.622 21.268 21.953 22.513 22.864 22.829 22.159 20.668 19.128 17.684 16.293 15.026 13.872 12.786 11.879 10.98 10.184 9.456 8.754 8.101 7.499 6.945 6.36 5.828 5.368 4.902 4.419 4.005 3.576 3.134 2.779 2.384 1.977 1.565 1.147 0.862 0.556 0.089 -0.239 -0.586 -0.766 -1.139 -1.544 -1.973 -2.191 -2.672 -2.942 -3.222 -3.51 -4.124 -4.474 -4.85 -5.258 -5.75 -6.388 -7.225 -9.562 -8 ,14762 ,KEBNE ,16749457,Wed Dec 1 14:13:36 CET,Wed Dec 1 16:17:13 CET,0.0 2.263 3.082 3.678 4.13 4.521 4.876 5.205 5.807 6.078 6.336 6.562 6.998 7.203 7.607 7.979 8.325 8.489 8.796 9.086 9.496 9.751 10.008 10.38 10.722 11.042 11.355 11.658 12.03 12.371 12.692 13.079 13.437 13.795 14.215 14.658 15.069 15.495 15.957 16.459 16.963 17.497 18.079 18.617 19.163 19.75 20.293 20.744 21.156 21.316 20.912 19.647 18.154 16.697 15.379 14.119 12.973 11.94 11.02 10.111 9.316 8.572 7.882 7.22 6.596 6.051 5.461 4.919 4.458 3.978 3.465 3.035 2.579 2.088 1.718 1.343 0.956 0.554 0.144 -0.138 -0.434 -0.916 -1.261 -1.613 -1.794 -2.19 -2.617 -3.064 -3.295 -3.77 -3.996 -4.24 -4.514 -5.12 -5.46 -5.854 -6.302 -6.799 -7.378 -8.181 -11.106 -9 ,27128 ,KEBNE ,16749458,Wed Dec 1 14:13:37 CET,Wed Dec 1 16:16:02 CET,0.0 2.525 3.307 3.846 4.278 4.656 5.018 5.352 5.9 6.157 6.401 6.602 7.065 7.278 7.668 8.054 8.408 8.562 8.852 9.135 9.541 9.803 10.062 10.424 10.756 11.08 11.393 11.691 12.078 12.448 12.788 13.177 13.551 13.909 14.293 14.727 15.158 15.621 16.103 16.58 17.065 17.603 18.201 18.778 19.39 20.002 20.619 21.181 21.592 21.702 21.168 20.021 18.736 17.415 16.169 14.99 13.894 12.822 11.856 10.905 10.099 9.35 8.614 7.92 7.26 6.666 6.07 5.544 5.089 4.61 4.114 3.704 3.277 2.82 2.463 2.1 1.726 1.32 0.884 0.582 0.268 -0.218 -0.563 -0.913 -1.096 -1.49 -1.896 -2.328 -2.56 -3.042 -3.278 -3.544 -3.827 -4.479 -4.834 -5.203 -5.628 -6.114 -6.677 -7.435 -10.218 -10 ,32287 ,KEBNE ,16749459,Wed Dec 1 14:13:36 CET,Wed Dec 1 16:18:37 CET,0.0 3.155 3.985 4.591 5.076 5.473 5.835 6.17 6.751 7.014 7.258 7.465 7.91 8.11 8.491 8.844 9.175 9.343 9.675 9.967 10.356 10.602 10.842 11.205 11.544 11.857 12.166 12.463 12.821 13.15 13.472 13.854 14.213 14.567 14.967 15.406 15.82 16.269 16.738 17.21 17.699 18.215 18.783 19.33 19.91 20.474 20.992 21.416 21.742 21.739 20.995 19.561 17.996 16.546 15.208 13.918 12.754 11.706 10.83 9.943 9.17 8.46 7.757 7.073 6.446 5.898 5.322 4.788 4.314 3.828 3.318 2.885 2.438 1.976 1.611 1.217 0.807 0.394 -0.041 -0.348 -0.668 -1.164 -1.514 -1.878 -2.06 -2.444 -2.852 -3.289 -3.513 -3.993 -4.269 -4.553 -4.837 -5.428 -5.757 -6.122 -6.535 -7.004 -7.575 -8.34 -10.317 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt deleted file mode 100644 index 9b0e2090..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1302 ,KEBNE ,16749460,Wed Dec 1 14:13:36 CET,Wed Dec 1 16:14:49 CET,0.0 2.789 3.584 4.191 4.646 5.035 5.383 5.681 6.224 6.472 6.716 6.95 7.389 7.59 7.975 8.315 8.634 8.79 9.091 9.381 9.794 10.044 10.283 10.649 10.995 11.307 11.606 11.899 12.278 12.622 12.946 13.351 13.728 14.088 14.513 14.975 15.397 15.844 16.31 16.816 17.335 17.872 18.488 19.049 19.614 20.245 20.92 21.43 21.739 21.846 21.304 19.725 18.095 16.566 15.164 13.872 12.755 11.747 10.873 9.968 9.187 8.494 7.811 7.176 6.573 6.015 5.426 4.894 4.435 3.941 3.413 2.985 2.547 2.085 1.734 1.375 0.996 0.603 0.18 -0.116 -0.418 -0.893 -1.221 -1.565 -1.74 -2.094 -2.467 -2.876 -3.098 -3.581 -3.788 -4.034 -4.307 -4.913 -5.244 -5.611 -6.015 -6.468 -7.038 -7.805 -9.927 -2 ,26290 ,KEBNE ,16749461,Wed Dec 1 14:13:37 CET,Wed Dec 1 16:18:05 CET,0.0 1.996 2.672 3.245 3.74 4.174 4.553 4.887 5.47 5.716 5.947 6.136 6.576 6.78 7.147 7.479 7.81 7.971 8.295 8.597 9.002 9.256 9.502 9.861 10.199 10.518 10.818 11.1 11.444 11.779 12.116 12.517 12.899 13.255 13.648 14.094 14.512 14.953 15.435 15.912 16.378 16.897 17.466 17.996 18.575 19.212 19.854 20.364 20.686 20.824 20.308 18.931 17.551 16.199 14.925 13.76 12.671 11.624 10.709 9.767 8.944 8.208 7.495 6.844 6.266 5.731 5.157 4.629 4.17 3.698 3.212 2.809 2.376 1.902 1.521 1.129 0.739 0.335 -0.094 -0.384 -0.685 -1.148 -1.495 -1.861 -2.039 -2.409 -2.796 -3.206 -3.423 -3.91 -4.171 -4.446 -4.731 -5.323 -5.647 -6.009 -6.43 -6.894 -7.416 -8.11 -10.387 -3 ,19474 ,KEBNE ,16749462,Wed Dec 1 14:39:48 CET,Wed Dec 1 16:43:12 CET,0.0 2.254 2.949 3.501 3.976 4.368 4.703 4.997 5.536 5.797 6.045 6.241 6.689 6.881 7.238 7.581 7.907 8.073 8.383 8.678 9.1 9.352 9.587 9.933 10.283 10.608 10.912 11.212 11.594 11.961 12.316 12.723 13.104 13.461 13.849 14.28 14.694 15.14 15.606 16.093 16.602 17.13 17.67 18.163 18.716 19.32 19.894 20.389 20.819 20.876 20.223 18.769 17.197 15.775 14.469 13.243 12.153 11.131 10.21 9.291 8.515 7.783 7.078 6.435 5.827 5.246 4.655 4.137 3.683 3.21 2.711 2.304 1.877 1.425 1.079 0.715 0.341 -0.047 -0.461 -0.744 -1.029 -1.482 -1.805 -2.131 -2.299 -2.648 -3.017 -3.414 -3.628 -4.101 -4.328 -4.576 -4.843 -5.424 -5.733 -6.071 -6.468 -6.919 -7.422 -8.125 -10.491 -4 ,5172 ,KEBNE ,16749463,Wed Dec 1 14:39:47 CET,Wed Dec 1 16:43:38 CET,0.0 2.849 3.584 4.125 4.598 4.997 5.332 5.63 6.177 6.432 6.677 6.889 7.339 7.537 7.914 8.267 8.589 8.747 9.051 9.334 9.732 9.987 10.254 10.625 10.954 11.277 11.598 11.891 12.245 12.587 12.912 13.325 13.725 14.09 14.499 14.944 15.362 15.8 16.253 16.721 17.195 17.698 18.238 18.752 19.338 19.966 20.611 21.172 21.652 21.839 21.172 19.742 18.284 16.927 15.699 14.514 13.428 12.409 11.496 10.589 9.804 9.077 8.377 7.732 7.134 6.586 6.022 5.511 5.079 4.631 4.14 3.742 3.329 2.891 2.55 2.194 1.832 1.459 1.073 0.799 0.514 0.065 -0.258 -0.595 -0.77 -1.131 -1.537 -1.964 -2.172 -2.637 -2.852 -3.101 -3.373 -3.971 -4.306 -4.672 -5.062 -5.513 -6.045 -6.777 -9.532 -5 ,25333 ,KEBNE ,16749464,Wed Dec 1 14:39:48 CET,Wed Dec 1 16:43:07 CET,0.0 2.551 3.31 3.863 4.328 4.725 5.076 5.394 5.969 6.232 6.486 6.72 7.166 7.361 7.739 8.094 8.417 8.572 8.894 9.195 9.582 9.823 10.062 10.403 10.737 11.068 11.382 11.67 12.013 12.344 12.683 13.091 13.464 13.805 14.191 14.617 15.023 15.457 15.912 16.397 16.885 17.397 17.936 18.444 19.046 19.65 20.19 20.681 21.11 21.173 20.443 18.956 17.537 16.114 14.747 13.49 12.342 11.281 10.368 9.421 8.58 7.847 7.167 6.526 5.919 5.358 4.777 4.261 3.805 3.338 2.867 2.472 2.046 1.594 1.25 0.893 0.513 0.113 -0.291 -0.568 -0.862 -1.327 -1.645 -1.975 -2.145 -2.497 -2.873 -3.268 -3.48 -3.951 -4.171 -4.421 -4.684 -5.252 -5.573 -5.939 -6.345 -6.798 -7.35 -8.074 -10.009 -6 ,12696 ,KEBNE ,16749465,Wed Dec 1 14:39:47 CET,Wed Dec 1 16:41:41 CET,0.0 1.763 2.504 3.061 3.499 3.88 4.226 4.543 5.132 5.392 5.626 5.844 6.297 6.492 6.87 7.226 7.552 7.707 8.012 8.306 8.712 8.962 9.203 9.544 9.862 10.166 10.451 10.723 11.073 11.42 11.761 12.168 12.557 12.94 13.375 13.826 14.243 14.712 15.209 15.705 16.199 16.749 17.336 17.859 18.471 19.093 19.738 20.34 20.722 20.762 20.057 18.505 16.914 15.424 14.081 12.786 11.564 10.498 9.617 8.706 7.911 7.191 6.505 5.851 5.227 4.661 4.063 3.504 3.018 2.535 2.055 1.654 1.222 0.776 0.415 0.03 -0.363 -0.78 -1.212 -1.504 -1.795 -2.253 -2.576 -2.915 -3.094 -3.473 -3.871 -4.28 -4.496 -4.986 -5.234 -5.482 -5.75 -6.351 -6.677 -7.029 -7.424 -7.884 -8.438 -9.288 -12.142 -7 ,28495 ,KEBNE ,16749466,Wed Dec 1 14:39:47 CET,Wed Dec 1 16:44:08 CET,0.0 2.367 3.075 3.609 4.036 4.413 4.753 5.058 5.601 5.847 6.074 6.254 6.696 6.893 7.265 7.6 7.929 8.091 8.386 8.666 9.069 9.315 9.549 9.894 10.221 10.533 10.84 11.129 11.49 11.829 12.16 12.558 12.927 13.266 13.656 14.099 14.503 14.948 15.436 15.927 16.423 16.982 17.58 18.117 18.721 19.335 19.967 20.593 21.105 21.289 20.878 19.736 18.397 17.032 15.692 14.378 13.232 12.249 11.404 10.494 9.692 8.997 8.343 7.73 7.144 6.601 6.026 5.496 5.026 4.543 4.045 3.623 3.167 2.682 2.304 1.919 1.534 1.145 0.741 0.446 0.136 -0.328 -0.653 -0.986 -1.155 -1.509 -1.873 -2.246 -2.443 -2.913 -3.158 -3.412 -3.669 -4.251 -4.581 -4.951 -5.342 -5.755 -6.265 -6.922 -9.363 -8 ,29836 ,KEBNE ,16749467,Wed Dec 1 14:39:47 CET,Wed Dec 1 16:41:38 CET,0.0 1.982 2.669 3.193 3.657 4.048 4.384 4.674 5.186 5.42 5.636 5.825 6.266 6.459 6.823 7.172 7.507 7.663 7.958 8.229 8.614 8.862 9.092 9.424 9.755 10.067 10.381 10.685 11.068 11.447 11.792 12.198 12.586 12.968 13.409 13.896 14.349 14.837 15.359 15.875 16.377 16.932 17.573 18.15 18.783 19.448 20.084 20.677 21.147 21.311 20.771 19.406 17.957 16.589 15.256 14.018 12.965 11.978 11.101 10.217 9.457 8.786 8.143 7.519 6.917 6.358 5.774 5.26 4.808 4.331 3.837 3.414 2.982 2.538 2.192 1.835 1.451 1.041 0.622 0.346 0.059 -0.397 -0.721 -1.057 -1.229 -1.596 -1.982 -2.396 -2.614 -3.08 -3.321 -3.583 -3.862 -4.461 -4.785 -5.138 -5.528 -6.003 -6.587 -7.303 -9.426 -9 ,27318 ,KEBNE ,16749468,Wed Dec 1 14:39:47 CET,Wed Dec 1 16:40:59 CET,0.0 1.681 2.344 2.839 3.252 3.608 3.942 4.248 4.8 5.041 5.255 5.439 5.885 6.083 6.464 6.813 7.13 7.287 7.585 7.866 8.263 8.507 8.759 9.123 9.459 9.78 10.081 10.371 10.751 11.104 11.425 11.813 12.177 12.52 12.917 13.369 13.81 14.283 14.764 15.253 15.756 16.314 16.906 17.448 18.063 18.671 19.283 19.875 20.436 20.759 20.124 18.619 17.117 15.672 14.451 13.289 12.205 11.223 10.35 9.437 8.627 7.918 7.257 6.602 5.978 5.42 4.825 4.288 3.821 3.323 2.821 2.412 1.973 1.52 1.164 0.791 0.401 0.01 -0.399 -0.689 -0.984 -1.45 -1.768 -2.087 -2.255 -2.613 -3.001 -3.42 -3.633 -4.096 -4.339 -4.601 -4.878 -5.498 -5.84 -6.203 -6.6 -7.045 -7.601 -8.34 -10.287 -10 ,19609 ,KEBNE ,16749469,Wed Dec 1 14:39:47 CET,Wed Dec 1 16:41:31 CET,0.0 1.946 2.7 3.228 3.676 4.045 4.379 4.693 5.244 5.494 5.725 5.936 6.387 6.589 6.97 7.325 7.665 7.832 8.146 8.443 8.882 9.156 9.41 9.78 10.127 10.447 10.755 11.046 11.409 11.764 12.104 12.484 12.85 13.217 13.638 14.096 14.526 15.006 15.528 16.067 16.587 17.132 17.773 18.38 19.029 19.698 20.279 20.765 21.137 21.17 20.623 19.24 17.689 16.257 15.03 13.838 12.663 11.608 10.733 9.845 9.051 8.334 7.662 7.021 6.406 5.846 5.269 4.748 4.289 3.807 3.32 2.927 2.512 2.076 1.726 1.357 0.977 0.583 0.176 -0.113 -0.409 -0.851 -1.167 -1.505 -1.68 -2.049 -2.448 -2.871 -3.089 -3.552 -3.777 -4.041 -4.322 -4.94 -5.294 -5.696 -6.143 -6.645 -7.205 -7.955 -10.234 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 76d84605..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,823 ,KEBNE ,16749470,Wed Dec 1 14:46:05 CET,Wed Dec 1 16:37:34 CET,0.0 1.286 1.746 2.106 2.408 2.661 2.876 3.065 3.384 3.538 3.697 3.778 4.094 4.2 4.385 4.564 4.752 4.85 5.035 5.196 5.418 5.559 5.685 5.879 6.069 6.234 6.385 6.527 6.705 6.882 7.056 7.26 7.437 7.6 7.803 7.997 8.144 8.303 8.47 8.636 8.777 8.887 8.991 9.07 9.115 9.095 8.987 8.747 8.275 7.358 5.576 3.299 1.356 -0.324 -1.78 -3.069 -4.172 -5.168 -6.026 -6.902 -7.654 -8.308 -8.942 -9.551 -10.132 -10.668 -11.251 -11.765 -12.165 -12.579 -13.027 -13.397 -13.797 -14.222 -14.55 -14.891 -15.218 -15.558 -15.933 -16.197 -16.471 -16.896 -17.186 -17.49 -17.657 -18.009 -18.384 -18.777 -18.97 -19.371 -19.538 -19.75 -19.983 -20.501 -20.788 -21.136 -21.516 -21.92 -22.442 -23.161 -25.308 -2 ,4519 ,KEBNE ,16749471,Wed Dec 1 14:46:05 CET,Wed Dec 1 16:38:20 CET,0.0 1.168 1.607 1.94 2.229 2.467 2.678 2.865 3.209 3.377 3.535 3.609 3.942 4.066 4.289 4.489 4.672 4.758 4.924 5.091 5.331 5.491 5.651 5.872 6.071 6.243 6.404 6.565 6.766 6.965 7.153 7.353 7.529 7.682 7.847 8.038 8.224 8.393 8.56 8.73 8.872 8.999 9.108 9.166 9.185 9.149 9.014 8.766 8.294 7.358 5.492 3.094 1.074 -0.651 -2.157 -3.517 -4.67 -5.698 -6.573 -7.429 -8.178 -8.854 -9.475 -10.056 -10.606 -11.097 -11.609 -12.063 -12.452 -12.862 -13.301 -13.686 -14.075 -14.471 -14.783 -15.098 -15.429 -15.777 -16.117 -16.354 -16.611 -17.008 -17.291 -17.594 -17.754 -18.076 -18.407 -18.759 -18.945 -19.351 -19.531 -19.757 -19.991 -20.51 -20.796 -21.118 -21.475 -21.858 -22.364 -23.113 -25.41 -3 ,7579 ,KEBNE ,16749472,Wed Dec 1 14:49:18 CET,Wed Dec 1 16:42:41 CET,0.0 1.434 1.923 2.314 2.674 2.997 3.266 3.516 3.99 4.217 4.423 4.6 4.969 5.125 5.426 5.704 5.947 6.053 6.229 6.381 6.609 6.759 6.893 7.096 7.282 7.444 7.599 7.739 7.91 8.073 8.222 8.397 8.559 8.702 8.874 9.068 9.237 9.401 9.554 9.707 9.868 10.029 10.159 10.235 10.279 10.256 10.091 9.78 9.215 8.238 6.379 3.989 2.077 0.447 -0.991 -2.281 -3.401 -4.404 -5.277 -6.139 -6.874 -7.539 -8.186 -8.805 -9.366 -9.883 -10.417 -10.884 -11.304 -11.778 -12.26 -12.635 -13.021 -13.426 -13.732 -14.055 -14.393 -14.738 -15.091 -15.351 -15.626 -16.081 -16.438 -16.805 -16.996 -17.378 -17.783 -18.228 -18.46 -18.928 -19.204 -19.465 -19.737 -20.346 -20.69 -21.079 -21.515 -21.989 -22.567 -23.329 -25.783 -4 ,19592 ,KEBNE ,16749473,Wed Dec 1 14:50:23 CET,Wed Dec 1 16:41:50 CET,0.0 1.399 1.931 2.302 2.6 2.86 3.075 3.281 3.681 3.854 4.005 4.069 4.396 4.514 4.753 4.975 5.181 5.275 5.448 5.607 5.84 5.996 6.149 6.361 6.543 6.7 6.861 7.018 7.206 7.392 7.556 7.739 7.912 8.052 8.208 8.405 8.587 8.768 8.926 9.059 9.179 9.302 9.431 9.509 9.552 9.521 9.359 9.043 8.492 7.526 5.715 3.445 1.504 -0.16 -1.623 -2.962 -4.139 -5.186 -6.075 -6.961 -7.721 -8.384 -9.036 -9.658 -10.226 -10.759 -11.311 -11.808 -12.231 -12.651 -13.091 -13.465 -13.853 -14.252 -14.55 -14.85 -15.164 -15.5 -15.875 -16.145 -16.416 -16.832 -17.124 -17.44 -17.6 -17.931 -18.297 -18.689 -18.89 -19.31 -19.505 -19.73 -19.967 -20.497 -20.793 -21.127 -21.496 -21.934 -22.503 -23.313 -25.975 -5 ,25030 ,KEBNE ,16749474,Wed Dec 1 15:04:02 CET,Wed Dec 1 16:56:57 CET,0.0 1.356 1.812 2.171 2.467 2.699 2.905 3.097 3.437 3.587 3.736 3.797 4.124 4.254 4.471 4.66 4.835 4.923 5.109 5.279 5.493 5.62 5.746 5.928 6.109 6.279 6.429 6.574 6.757 6.931 7.099 7.288 7.467 7.641 7.832 8.029 8.194 8.362 8.534 8.687 8.797 8.896 9.025 9.117 9.165 9.164 9.079 8.839 8.326 7.381 5.591 3.272 1.273 -0.375 -1.821 -3.104 -4.189 -5.169 -6.037 -6.897 -7.609 -8.256 -8.88 -9.46 -10.005 -10.526 -11.076 -11.564 -11.985 -12.425 -12.885 -13.257 -13.639 -14.036 -14.345 -14.665 -15.004 -15.355 -15.738 -16.003 -16.276 -16.721 -17.015 -17.317 -17.477 -17.789 -18.106 -18.465 -18.658 -19.078 -19.301 -19.537 -19.771 -20.29 -20.591 -20.927 -21.274 -21.693 -22.219 -22.906 -25.147 -6 ,13015 ,KEBNE ,16749475,Wed Dec 1 15:04:01 CET,Wed Dec 1 16:56:43 CET,0.0 1.15 1.612 1.955 2.236 2.488 2.693 2.876 3.225 3.395 3.554 3.634 3.978 4.115 4.356 4.56 4.747 4.834 5.003 5.169 5.402 5.55 5.685 5.877 6.057 6.229 6.393 6.554 6.748 6.913 7.074 7.271 7.456 7.626 7.789 7.948 8.106 8.286 8.458 8.603 8.737 8.863 8.978 9.07 9.109 9.077 8.971 8.714 8.202 7.205 5.367 3.091 1.134 -0.552 -2.012 -3.343 -4.501 -5.521 -6.378 -7.239 -7.986 -8.639 -9.278 -9.887 -10.457 -10.967 -11.514 -12.029 -12.444 -12.858 -13.297 -13.676 -14.071 -14.492 -14.825 -15.16 -15.492 -15.835 -16.213 -16.478 -16.739 -17.15 -17.446 -17.768 -17.926 -18.235 -18.584 -18.97 -19.161 -19.582 -19.769 -19.986 -20.225 -20.743 -21.044 -21.359 -21.696 -22.117 -22.603 -23.284 -25.857 -7 ,8339 ,KEBNE ,16749476,Wed Dec 1 15:14:34 CET,Wed Dec 1 17:06:45 CET,0.0 1.319 1.798 2.13 2.401 2.662 2.909 3.119 3.489 3.646 3.793 3.867 4.203 4.322 4.53 4.732 4.922 5.013 5.191 5.352 5.559 5.688 5.811 5.989 6.156 6.308 6.461 6.609 6.782 6.95 7.112 7.298 7.477 7.645 7.821 8.01 8.185 8.383 8.572 8.731 8.876 9.013 9.145 9.221 9.222 9.148 8.989 8.708 8.221 7.29 5.426 3.114 1.161 -0.557 -2.029 -3.309 -4.422 -5.453 -6.352 -7.249 -8.01 -8.661 -9.27 -9.852 -10.405 -10.92 -11.465 -11.962 -12.389 -12.817 -13.26 -13.618 -13.995 -14.403 -14.713 -15.039 -15.379 -15.728 -16.094 -16.338 -16.592 -16.991 -17.269 -17.567 -17.728 -18.057 -18.381 -18.726 -18.913 -19.331 -19.529 -19.743 -19.968 -20.502 -20.779 -21.081 -21.451 -21.867 -22.364 -23.038 -25.357 -8 ,18999 ,KEBNE ,16749477,Wed Dec 1 15:15:39 CET,Wed Dec 1 17:07:04 CET,0.0 1.616 2.084 2.409 2.682 2.933 3.182 3.4 3.778 3.944 4.086 4.148 4.474 4.594 4.825 5.058 5.27 5.364 5.543 5.712 5.945 6.084 6.224 6.429 6.615 6.783 6.943 7.096 7.283 7.454 7.618 7.814 8.015 8.208 8.389 8.565 8.736 8.904 9.073 9.228 9.363 9.511 9.635 9.714 9.763 9.749 9.636 9.389 8.858 7.889 6.047 3.707 1.775 0.083 -1.418 -2.731 -3.828 -4.849 -5.773 -6.684 -7.428 -8.097 -8.746 -9.333 -9.878 -10.376 -10.899 -11.389 -11.815 -12.27 -12.731 -13.09 -13.462 -13.858 -14.168 -14.497 -14.839 -15.186 -15.558 -15.822 -16.096 -16.514 -16.802 -17.112 -17.27 -17.583 -17.911 -18.318 -18.567 -19.035 -19.265 -19.486 -19.722 -20.236 -20.525 -20.833 -21.17 -21.568 -22.052 -22.728 -25.482 -9 ,21682 ,KEBNE ,16749478,Wed Dec 1 15:19:55 CET,Wed Dec 1 17:12:14 CET,0.0 1.213 1.691 2.028 2.302 2.548 2.768 2.957 3.267 3.406 3.55 3.618 3.943 4.066 4.279 4.477 4.679 4.772 4.938 5.106 5.337 5.464 5.593 5.791 5.964 6.111 6.244 6.379 6.559 6.716 6.859 7.025 7.186 7.347 7.513 7.688 7.845 7.998 8.145 8.296 8.459 8.607 8.724 8.805 8.856 8.814 8.682 8.429 7.868 6.85 5.081 2.768 0.746 -0.945 -2.39 -3.671 -4.775 -5.79 -6.681 -7.568 -8.315 -8.996 -9.644 -10.241 -10.8 -11.316 -11.839 -12.292 -12.695 -13.13 -13.577 -13.936 -14.31 -14.703 -15.016 -15.351 -15.684 -16.01 -16.354 -16.601 -16.856 -17.258 -17.528 -17.792 -17.938 -18.249 -18.563 -18.899 -19.095 -19.519 -19.747 -19.993 -20.241 -20.75 -21.031 -21.335 -21.658 -22.04 -22.53 -23.156 -25.204 -10 ,14883 ,KEBNE ,16749479,Wed Dec 1 15:20:57 CET,Wed Dec 1 17:14:13 CET,0.0 1.228 1.668 2.031 2.338 2.58 2.807 3.038 3.49 3.688 3.884 4.071 4.449 4.631 4.979 5.273 5.544 5.68 5.929 6.149 6.418 6.585 6.769 7.046 7.31 7.569 7.782 7.939 8.109 8.28 8.442 8.61 8.761 8.89 9.038 9.201 9.328 9.456 9.601 9.752 9.894 10.019 10.148 10.268 10.33 10.329 10.224 9.949 9.432 8.449 6.655 4.354 2.338 0.626 -0.857 -2.167 -3.3 -4.308 -5.17 -6.05 -6.828 -7.526 -8.162 -8.752 -9.311 -9.834 -10.365 -10.84 -11.253 -11.67 -12.091 -12.459 -12.855 -13.27 -13.596 -13.92 -14.247 -14.58 -14.945 -15.198 -15.452 -15.869 -16.167 -16.48 -16.645 -16.979 -17.327 -17.701 -17.899 -18.32 -18.529 -18.768 -19.016 -19.565 -19.87 -20.201 -20.578 -21.03 -21.565 -22.201 -24.256 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt deleted file mode 100644 index f7257b7b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11490 ,KEBNE ,16749480,Wed Dec 1 15:20:57 CET,Wed Dec 1 17:12:40 CET,0.0 1.326 1.967 2.401 2.73 3.019 3.284 3.553 4.048 4.255 4.451 4.583 5.007 5.177 5.515 5.839 6.132 6.281 6.582 6.864 7.252 7.487 7.721 8.072 8.411 8.744 9.074 9.384 9.776 10.162 10.522 10.954 11.363 11.743 12.196 12.73 13.238 13.785 14.36 14.964 15.628 16.377 17.225 18.048 18.981 20.021 21.149 22.306 23.6 25.083 26.684 27.458 27.384 27.01 26.526 26.049 25.539 24.972 24.481 23.975 23.519 23.096 22.67 22.268 21.886 21.523 21.124 20.751 20.43 20.097 19.752 19.482 19.21 18.933 18.714 18.474 18.233 17.98 17.679 17.458 17.234 16.884 16.634 16.375 16.251 15.999 15.723 15.431 15.285 14.88 14.74 14.544 14.317 13.821 13.522 13.164 12.791 12.394 11.927 11.258 9.625 -2 ,23556 ,KEBNE ,16749481,Wed Dec 1 15:22:02 CET,Wed Dec 1 17:14:05 CET,0.0 1.058 1.542 1.917 2.259 2.575 2.846 3.098 3.567 3.781 3.982 4.135 4.561 4.735 5.053 5.346 5.632 5.771 6.036 6.28 6.635 6.875 7.116 7.473 7.815 8.126 8.418 8.704 9.08 9.446 9.786 10.208 10.63 11.031 11.492 12.018 12.514 13.032 13.572 14.156 14.8 15.519 16.343 17.17 18.107 19.113 20.208 21.419 22.883 24.413 25.765 26.389 26.4 26.088 25.678 25.225 24.764 24.286 23.838 23.373 22.98 22.614 22.211 21.794 21.398 21.031 20.637 20.286 19.983 19.663 19.35 19.106 18.83 18.519 18.282 18.031 17.76 17.492 17.197 16.985 16.763 16.422 16.192 15.943 15.813 15.541 15.258 14.961 14.798 14.391 14.24 14.037 13.835 13.39 13.135 12.873 12.576 12.217 11.779 11.195 9.484 -3 ,21376 ,KEBNE ,16749482,Wed Dec 1 15:22:00 CET,Wed Dec 1 17:15:00 CET,0.0 1.4 1.953 2.371 2.731 3.038 3.321 3.582 4.018 4.216 4.397 4.529 4.967 5.152 5.49 5.804 6.102 6.245 6.527 6.802 7.186 7.431 7.681 8.052 8.397 8.712 9.03 9.341 9.728 10.104 10.465 10.893 11.308 11.727 12.2 12.708 13.213 13.757 14.345 14.971 15.616 16.335 17.164 17.996 18.936 19.964 21.115 22.3 23.568 24.768 25.997 26.727 26.616 26.254 25.817 25.341 24.887 24.414 23.964 23.486 23.068 22.69 22.314 21.943 21.571 21.22 20.855 20.517 20.214 19.889 19.543 19.253 18.933 18.585 18.306 17.993 17.671 17.363 17.06 16.851 16.629 16.27 16.014 15.756 15.625 15.35 15.065 14.761 14.595 14.188 14.056 13.858 13.656 13.188 12.904 12.582 12.233 11.829 11.349 10.741 9.087 -4 ,3876 ,KEBNE ,16749483,Wed Dec 1 15:22:03 CET,Wed Dec 1 17:13:14 CET,0.0 1.181 1.758 2.209 2.584 2.908 3.191 3.451 3.922 4.139 4.358 4.517 4.946 5.123 5.447 5.749 6.022 6.161 6.443 6.705 7.086 7.326 7.562 7.918 8.262 8.589 8.912 9.213 9.584 9.958 10.338 10.796 11.21 11.599 12.029 12.513 13.016 13.575 14.149 14.724 15.32 15.986 16.737 17.509 18.426 19.459 20.688 22.051 23.553 25.166 26.586 27.025 26.873 26.368 25.821 25.308 24.771 24.256 23.769 23.204 22.678 22.201 21.746 21.288 20.849 20.452 20.053 19.71 19.408 19.097 18.776 18.501 18.21 17.894 17.636 17.379 17.116 16.837 16.542 16.335 16.126 15.8 15.568 15.321 15.194 14.934 14.652 14.334 14.164 13.759 13.639 13.455 13.249 12.788 12.543 12.281 11.997 11.662 11.225 10.684 8.777 -5 ,24116 ,KEBNE ,16749484,Wed Dec 1 15:45:11 CET,Wed Dec 1 17:37:48 CET,0.0 1.114 1.708 2.191 2.575 2.914 3.235 3.526 4.031 4.266 4.48 4.624 5.057 5.242 5.6 5.933 6.254 6.411 6.704 6.981 7.378 7.624 7.869 8.239 8.592 8.924 9.235 9.537 9.945 10.33 10.686 11.113 11.526 11.922 12.38 12.908 13.413 13.961 14.548 15.161 15.78 16.474 17.269 18.065 18.981 19.95 21.0 22.1 23.362 24.784 26.16 26.811 26.847 26.591 26.168 25.67 25.193 24.718 24.286 23.856 23.459 23.087 22.728 22.369 22.022 21.698 21.345 21.024 20.75 20.46 20.148 19.895 19.635 19.339 19.1 18.858 18.606 18.351 18.079 17.881 17.683 17.365 17.123 16.88 16.756 16.494 16.22 15.917 15.751 15.357 15.269 15.08 14.866 14.416 14.172 13.903 13.598 13.236 12.796 12.229 10.483 -6 ,10864 ,KEBNE ,16749485,Wed Dec 1 15:45:11 CET,Wed Dec 1 17:36:17 CET,0.0 1.094 1.678 2.174 2.578 2.913 3.219 3.509 4.04 4.269 4.494 4.68 5.115 5.293 5.641 5.973 6.284 6.433 6.719 6.988 7.362 7.605 7.85 8.196 8.508 8.811 9.123 9.42 9.793 10.164 10.523 10.957 11.375 11.777 12.231 12.738 13.245 13.799 14.371 14.976 15.604 16.288 17.081 17.882 18.775 19.741 20.828 21.975 23.152 24.445 25.773 26.232 26.036 25.647 25.178 24.649 24.125 23.596 23.104 22.601 22.14 21.739 21.371 21.004 20.656 20.333 20.001 19.704 19.417 19.111 18.802 18.541 18.262 17.953 17.7 17.438 17.171 16.899 16.611 16.4 16.185 15.854 15.618 15.365 15.233 14.962 14.673 14.362 14.2 13.799 13.669 13.48 13.275 12.825 12.587 12.325 12.024 11.667 11.236 10.657 8.901 -7 ,32170 ,KEBNE ,16749486,Wed Dec 1 15:45:11 CET,Wed Dec 1 17:37:22 CET,0.0 1.871 2.443 2.91 3.307 3.68 4.014 4.302 4.812 5.031 5.228 5.34 5.751 5.918 6.236 6.553 6.86 6.993 7.254 7.529 7.915 8.152 8.377 8.701 9.013 9.305 9.586 9.866 10.229 10.585 10.932 11.352 11.756 12.136 12.6 13.12 13.594 14.111 14.675 15.293 15.946 16.681 17.529 18.357 19.269 20.298 21.496 22.749 24.071 25.37 26.642 27.271 27.282 26.97 26.446 25.888 25.361 24.865 24.411 23.891 23.402 22.966 22.567 22.179 21.797 21.437 21.054 20.698 20.391 20.091 19.775 19.499 19.219 18.919 18.678 18.438 18.182 17.919 17.642 17.445 17.249 16.949 16.73 16.492 16.366 16.092 15.805 15.504 15.339 14.927 14.766 14.567 14.359 13.899 13.627 13.328 13.034 12.691 12.265 11.645 9.814 -8 ,21679 ,KEBNE ,16749487,Wed Dec 1 15:45:11 CET,Wed Dec 1 17:36:53 CET,0.0 1.37 1.931 2.348 2.712 3.023 3.304 3.554 4.001 4.208 4.411 4.571 5.003 5.184 5.537 5.858 6.144 6.289 6.584 6.863 7.245 7.472 7.699 8.044 8.382 8.707 9.007 9.291 9.661 10.014 10.359 10.794 11.198 11.565 11.994 12.491 12.968 13.473 14.025 14.633 15.253 15.966 16.818 17.646 18.583 19.575 20.694 21.862 22.973 24.304 25.797 26.468 26.417 26.018 25.57 25.093 24.604 24.127 23.672 23.187 22.754 22.374 22.012 21.648 21.282 20.923 20.538 20.213 19.932 19.616 19.274 18.984 18.69 18.386 18.138 17.871 17.598 17.33 17.041 16.839 16.632 16.296 16.066 15.818 15.683 15.399 15.103 14.794 14.632 14.227 14.09 13.887 13.681 13.213 12.945 12.656 12.336 11.943 11.447 10.832 8.8 -9 ,19993 ,KEBNE ,16749488,Wed Dec 1 16:00:55 CET,Wed Dec 1 17:53:32 CET,0.0 1.263 1.755 2.14 2.473 2.789 3.1 3.363 3.807 4.028 4.234 4.359 4.781 4.956 5.297 5.613 5.919 6.073 6.369 6.638 7.039 7.286 7.505 7.832 8.17 8.499 8.799 9.085 9.455 9.804 10.144 10.558 10.952 11.332 11.769 12.259 12.745 13.286 13.862 14.471 15.107 15.814 16.612 17.399 18.307 19.335 20.532 21.872 23.362 24.901 26.38 27.068 26.9 26.495 26.092 25.61 25.103 24.62 24.163 23.681 23.243 22.851 22.492 22.127 21.771 21.432 21.051 20.704 20.404 20.083 19.738 19.444 19.148 18.858 18.628 18.373 18.099 17.816 17.521 17.326 17.124 16.793 16.563 16.323 16.2 15.937 15.648 15.339 15.177 14.774 14.649 14.456 14.249 13.77 13.512 13.248 12.955 12.602 12.166 11.563 9.938 -10 ,17770 ,KEBNE ,16749489,Wed Dec 1 16:00:54 CET,Wed Dec 1 17:52:16 CET,0.0 1.455 2.049 2.469 2.837 3.195 3.498 3.76 4.239 4.456 4.666 4.822 5.251 5.426 5.768 6.092 6.398 6.539 6.802 7.069 7.468 7.712 7.946 8.292 8.627 8.951 9.267 9.576 9.985 10.385 10.76 11.198 11.62 12.035 12.51 13.028 13.516 14.052 14.639 15.244 15.883 16.598 17.394 18.179 19.09 20.119 21.297 22.494 23.712 25.048 26.371 26.91 26.798 26.49 26.093 25.644 25.216 24.749 24.289 23.788 23.316 22.898 22.499 22.098 21.725 21.392 21.028 20.694 20.393 20.059 19.715 19.438 19.139 18.836 18.611 18.38 18.14 17.889 17.61 17.409 17.197 16.87 16.636 16.376 16.242 15.97 15.694 15.384 15.211 14.803 14.658 14.457 14.241 13.784 13.535 13.266 12.983 12.636 12.195 11.583 9.833 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt deleted file mode 100644 index 73d788f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22214 ,KEBNE ,16749490,Wed Dec 1 16:00:54 CET,Wed Dec 1 17:53:39 CET,0.0 1.965 2.667 3.203 3.685 4.142 4.59 5.006 5.739 6.076 6.381 6.644 7.087 7.282 7.644 7.988 8.327 8.487 8.784 9.061 9.453 9.709 9.96 10.316 10.66 10.99 11.305 11.618 12.021 12.403 12.773 13.225 13.66 14.079 14.561 15.092 15.594 16.145 16.729 17.351 18.003 18.724 19.573 20.442 21.412 22.474 23.661 24.922 26.34 27.835 29.168 29.649 29.47 29.059 28.604 27.986 27.318 26.7 26.11 25.48 24.931 24.42 23.923 23.467 23.03 22.61 22.172 21.772 21.414 21.049 20.674 20.355 20.024 19.672 19.4 19.116 18.812 18.494 18.172 17.951 17.716 17.345 17.086 16.823 16.681 16.375 16.066 15.719 15.516 15.079 14.884 14.679 14.466 13.997 13.733 13.41 13.036 12.621 12.117 11.498 9.917 -2 ,11775 ,KEBNE ,16749491,Wed Dec 1 16:00:55 CET,Wed Dec 1 17:53:53 CET,0.0 1.314 1.878 2.284 2.67 3.014 3.314 3.599 4.11 4.339 4.558 4.75 5.179 5.373 5.759 6.111 6.429 6.582 6.87 7.164 7.593 7.861 8.124 8.508 8.871 9.206 9.544 9.875 10.273 10.645 11.011 11.464 11.894 12.309 12.792 13.321 13.84 14.433 15.06 15.718 16.383 17.063 17.889 18.799 19.852 20.953 22.119 23.32 24.683 26.223 27.662 28.205 28.103 27.711 27.126 26.456 25.765 25.097 24.511 23.897 23.348 22.836 22.342 21.865 21.403 20.986 20.532 20.11 19.747 19.362 18.952 18.608 18.253 17.869 17.567 17.27 16.956 16.621 16.265 16.019 15.769 15.376 15.116 14.86 14.726 14.427 14.109 13.806 13.646 13.236 13.071 12.852 12.624 12.136 11.87 11.588 11.263 10.879 10.387 9.741 8.067 -3 ,29321 ,KEBNE ,16749492,Wed Dec 1 16:00:55 CET,Wed Dec 1 17:53:16 CET,0.0 1.648 2.311 2.778 3.171 3.527 3.851 4.143 4.663 4.907 5.141 5.337 5.776 5.979 6.371 6.753 7.096 7.247 7.549 7.856 8.296 8.569 8.842 9.242 9.625 10.003 10.369 10.717 11.158 11.581 11.997 12.497 12.967 13.421 13.947 14.503 15.027 15.615 16.259 16.942 17.658 18.471 19.389 20.298 21.354 22.492 23.748 25.106 26.632 28.166 29.432 29.858 29.669 29.271 28.769 28.164 27.565 27.003 26.493 25.947 25.446 24.979 24.52 24.076 23.657 23.268 22.83 22.416 22.051 21.666 21.247 20.885 20.513 20.129 19.841 19.546 19.23 18.905 18.567 18.326 18.069 17.657 17.374 17.065 16.902 16.573 16.224 15.848 15.651 15.221 15.011 14.777 14.53 13.995 13.695 13.376 13.026 12.597 12.11 11.509 10.277 -4 ,32382 ,KEBNE ,16749493,Wed Dec 1 16:00:54 CET,Wed Dec 1 17:52:36 CET,0.0 1.299 1.902 2.369 2.751 3.098 3.428 3.72 4.218 4.443 4.664 4.848 5.274 5.464 5.845 6.202 6.521 6.683 7.002 7.293 7.716 7.993 8.257 8.631 8.976 9.299 9.62 9.935 10.35 10.763 11.161 11.646 12.106 12.536 13.027 13.573 14.101 14.7 15.363 16.049 16.747 17.507 18.359 19.199 20.179 21.218 22.336 23.554 24.937 26.472 27.9 28.398 28.245 27.858 27.374 26.823 26.237 25.647 25.106 24.56 24.081 23.628 23.163 22.713 22.291 21.916 21.514 21.125 20.782 20.413 20.014 19.676 19.324 18.96 18.678 18.387 18.086 17.775 17.43 17.184 16.931 16.527 16.242 15.948 15.793 15.483 15.167 14.821 14.643 14.237 14.069 13.85 13.613 13.111 12.845 12.559 12.235 11.845 11.328 10.676 8.799 -5 ,15547 ,KEBNE ,16749494,Wed Dec 1 16:00:53 CET,Wed Dec 1 17:53:31 CET,0.0 1.439 2.052 2.513 2.925 3.3 3.626 3.928 4.483 4.74 4.987 5.214 5.656 5.864 6.255 6.613 6.958 7.128 7.465 7.788 8.25 8.544 8.832 9.247 9.635 10.01 10.354 10.693 11.144 11.577 12.004 12.515 12.999 13.454 13.968 14.535 15.083 15.711 16.397 17.101 17.788 18.568 19.556 20.505 21.513 22.605 23.878 25.139 26.321 27.542 28.524 28.68 28.278 27.604 26.825 26.035 25.262 24.484 23.81 23.115 22.473 21.937 21.448 20.982 20.54 20.098 19.636 19.225 18.828 18.399 17.981 17.638 17.286 16.938 16.668 16.379 16.07 15.752 15.428 15.197 14.952 14.572 14.289 13.993 13.842 13.53 13.216 12.879 12.701 12.286 12.085 11.863 11.636 11.141 10.865 10.57 10.226 9.869 9.445 8.809 6.913 -6 ,24740 ,KEBNE ,16749495,Wed Dec 1 16:00:55 CET,Wed Dec 1 17:53:56 CET,0.0 1.745 2.356 2.821 3.208 3.551 3.86 4.158 4.703 4.952 5.179 5.36 5.784 5.97 6.351 6.705 7.036 7.199 7.513 7.82 8.263 8.548 8.828 9.223 9.612 9.988 10.331 10.648 11.066 11.481 11.875 12.354 12.83 13.292 13.818 14.406 14.963 15.554 16.178 16.838 17.53 18.317 19.235 20.137 21.177 22.334 23.625 24.954 26.292 27.501 28.406 28.522 28.106 27.411 26.644 25.892 25.16 24.446 23.824 23.194 22.622 22.098 21.627 21.178 20.751 20.377 19.969 19.586 19.251 18.909 18.544 18.23 17.904 17.58 17.327 17.058 16.778 16.485 16.181 15.968 15.747 15.401 15.159 14.905 14.772 14.491 14.192 13.858 13.671 13.265 13.123 12.924 12.715 12.222 11.931 11.622 11.278 10.871 10.408 9.743 7.333 -7 ,10801 ,KEBNE ,16749496,Wed Dec 1 16:00:54 CET,Wed Dec 1 17:52:15 CET,0.0 1.573 2.166 2.615 2.98 3.303 3.602 3.881 4.414 4.669 4.9 5.088 5.515 5.706 6.082 6.44 6.782 6.951 7.278 7.585 8.023 8.298 8.566 8.954 9.317 9.682 10.039 10.366 10.774 11.155 11.519 11.96 12.394 12.809 13.291 13.841 14.364 14.929 15.519 16.149 16.836 17.59 18.435 19.287 20.239 21.243 22.424 23.76 25.107 26.445 27.634 28.009 27.821 27.378 26.811 26.11 25.394 24.718 24.093 23.437 22.862 22.334 21.819 21.327 20.877 20.467 20.029 19.637 19.287 18.922 18.547 18.229 17.897 17.566 17.31 17.039 16.76 16.469 16.171 15.96 15.729 15.363 15.102 14.824 14.681 14.39 14.068 13.745 13.587 13.193 13.038 12.833 12.622 12.121 11.829 11.521 11.165 10.787 10.371 9.789 7.97 -8 ,32315 ,KEBNE ,16749497,Wed Dec 1 16:00:57 CET,Wed Dec 1 17:53:40 CET,0.0 1.912 2.528 2.989 3.394 3.738 4.048 4.327 4.841 5.087 5.325 5.527 5.957 6.147 6.5 6.841 7.16 7.314 7.618 7.912 8.337 8.604 8.861 9.246 9.604 9.932 10.271 10.608 11.029 11.422 11.784 12.228 12.657 13.071 13.54 14.071 14.603 15.178 15.8 16.442 17.097 17.857 18.731 19.635 20.692 21.779 22.994 24.287 25.592 26.982 28.494 29.17 29.065 28.664 28.124 27.48 26.851 26.263 25.709 25.11 24.584 24.096 23.587 23.104 22.654 22.233 21.8 21.396 21.033 20.66 20.26 19.907 19.535 19.164 18.868 18.547 18.229 17.905 17.554 17.306 17.051 16.646 16.353 16.055 15.905 15.584 15.241 14.884 14.696 14.27 14.034 13.778 13.52 13.003 12.711 12.386 12.032 11.606 11.093 10.444 9.034 -9 ,570 ,KEBNE ,16749498,Wed Dec 1 16:00:59 CET,Wed Dec 1 17:49:08 CET,0.0 1.377 1.992 2.449 2.867 3.228 3.55 3.853 4.408 4.66 4.897 5.109 5.554 5.753 6.132 6.486 6.817 6.975 7.283 7.596 8.046 8.323 8.587 8.968 9.333 9.677 10.002 10.316 10.727 11.136 11.553 12.046 12.499 12.936 13.439 13.982 14.495 15.048 15.633 16.269 16.95 17.723 18.602 19.504 20.529 21.611 22.868 24.255 25.816 27.505 29.048 29.791 29.841 29.49 29.004 28.447 27.811 27.146 26.557 25.949 25.394 24.902 24.437 23.977 23.53 23.112 22.668 22.249 21.871 21.474 21.058 20.72 20.377 20.031 19.773 19.5 19.202 18.892 18.568 18.336 18.101 17.731 17.459 17.178 17.029 16.709 16.375 16.029 15.856 15.452 15.277 15.059 14.828 14.322 14.056 13.77 13.429 13.012 12.512 11.903 10.663 -10 ,3260 ,KEBNE ,16749499,Wed Dec 1 16:00:55 CET,Wed Dec 1 17:52:47 CET,0.0 1.323 1.951 2.432 2.845 3.226 3.572 3.874 4.423 4.673 4.914 5.132 5.591 5.813 6.212 6.585 6.947 7.119 7.441 7.761 8.227 8.519 8.789 9.178 9.555 9.904 10.24 10.572 10.997 11.402 11.797 12.278 12.749 13.197 13.692 14.243 14.777 15.353 15.984 16.662 17.358 18.127 19.017 19.907 20.861 21.856 22.954 24.16 25.505 26.838 27.869 28.091 27.748 27.116 26.444 25.767 25.08 24.437 23.891 23.314 22.753 22.251 21.79 21.317 20.838 20.388 19.928 19.528 19.175 18.803 18.419 18.092 17.734 17.365 17.08 16.774 16.46 16.128 15.775 15.536 15.283 14.869 14.57 14.262 14.108 13.784 13.429 13.046 12.847 12.413 12.205 11.97 11.724 11.186 10.876 10.54 10.171 9.764 9.241 8.588 7.411 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index df8c84f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17320 ,KEBNE ,16749500,Wed Dec 1 16:00:54 CET,Wed Dec 1 17:52:17 CET,0.0 1.196 1.742 2.15 2.526 2.859 3.158 3.448 3.967 4.206 4.435 4.601 5.056 5.267 5.689 6.078 6.44 6.617 6.968 7.308 7.803 8.124 8.432 8.876 9.323 9.75 10.156 10.55 11.059 11.558 12.048 12.639 13.217 13.784 14.44 15.187 15.904 16.708 17.599 18.543 19.554 20.719 22.099 23.515 25.216 27.162 29.413 31.962 35.032 38.721 43.103 46.615 48.589 49.8 50.487 50.813 50.987 51.028 50.997 50.884 50.662 50.412 50.174 49.942 49.65 49.356 49.053 48.78 48.537 48.263 47.943 47.675 47.401 47.094 46.846 46.598 46.348 46.063 45.745 45.51 45.268 44.885 44.604 44.309 44.154 43.832 43.466 43.051 42.84 42.428 42.225 41.994 41.75 41.185 40.841 40.477 40.1 39.68 39.163 38.398 36.429 -2 ,2095 ,KEBNE ,16749501,Wed Dec 1 16:00:53 CET,Wed Dec 1 17:53:14 CET,0.0 1.04 1.541 1.96 2.344 2.681 2.968 3.227 3.712 3.949 4.182 4.364 4.823 5.026 5.427 5.815 6.192 6.367 6.698 7.026 7.509 7.819 8.12 8.564 8.994 9.408 9.825 10.236 10.76 11.273 11.768 12.362 12.945 13.527 14.191 14.925 15.657 16.471 17.339 18.279 19.279 20.454 21.899 23.351 25.026 26.935 29.184 31.735 34.749 38.397 42.843 46.236 48.029 49.016 49.534 49.813 49.928 49.912 49.853 49.779 49.659 49.498 49.312 49.111 48.932 48.751 48.506 48.254 48.009 47.753 47.494 47.266 47.0 46.674 46.408 46.153 45.891 45.608 45.3 45.082 44.849 44.463 44.19 43.915 43.768 43.445 43.096 42.716 42.525 42.132 41.936 41.708 41.462 40.859 40.519 40.161 39.767 39.297 38.75 38.006 35.789 -3 ,17234 ,KEBNE ,16749502,Wed Dec 1 16:01:05 CET,Wed Dec 1 17:53:21 CET,0.0 1.156 1.676 2.088 2.458 2.786 3.092 3.38 3.891 4.13 4.364 4.547 5.019 5.221 5.61 5.989 6.353 6.525 6.855 7.189 7.691 8.006 8.318 8.771 9.188 9.592 9.988 10.387 10.93 11.454 11.95 12.547 13.109 13.666 14.333 15.087 15.827 16.645 17.521 18.483 19.524 20.697 22.094 23.558 25.266 27.142 29.335 31.892 34.951 38.473 42.688 46.217 48.196 49.378 50.073 50.47 50.637 50.598 50.467 50.279 50.078 49.908 49.735 49.529 49.315 49.089 48.826 48.559 48.312 48.066 47.804 47.573 47.32 47.047 46.82 46.55 46.289 46.037 45.735 45.523 45.303 44.919 44.644 44.353 44.199 43.902 43.56 43.173 42.965 42.512 42.233 41.992 41.709 41.057 40.704 40.332 39.915 39.366 38.671 37.836 35.222 -4 ,17460 ,KEBNE ,16749503,Wed Dec 1 16:01:04 CET,Wed Dec 1 17:53:30 CET,0.0 1.716 2.302 2.755 3.143 3.465 3.738 3.992 4.484 4.722 4.944 5.101 5.553 5.754 6.135 6.491 6.837 7.01 7.343 7.657 8.116 8.42 8.722 9.167 9.614 10.035 10.424 10.814 11.316 11.804 12.296 12.905 13.496 14.064 14.733 15.49 16.213 17.008 17.882 18.837 19.867 21.062 22.503 23.96 25.638 27.554 29.794 32.4 35.597 39.271 43.472 46.79 48.649 49.732 50.281 50.566 50.704 50.774 50.768 50.626 50.42 50.211 49.965 49.694 49.451 49.221 48.945 48.674 48.434 48.178 47.89 47.634 47.353 47.067 46.83 46.582 46.331 46.054 45.757 45.537 45.301 44.93 44.661 44.372 44.227 43.93 43.597 43.244 43.057 42.661 42.467 42.234 41.997 41.475 41.178 40.822 40.419 39.958 39.387 38.67 36.562 -5 ,18151 ,KEBNE ,16749504,Wed Dec 1 16:00:55 CET,Wed Dec 1 17:51:20 CET,0.0 1.336 1.864 2.272 2.613 2.923 3.214 3.494 4.03 4.273 4.505 4.693 5.159 5.371 5.789 6.161 6.507 6.681 7.02 7.351 7.831 8.135 8.431 8.861 9.283 9.706 10.107 10.49 11.009 11.521 12.014 12.61 13.189 13.759 14.424 15.187 15.921 16.713 17.568 18.506 19.546 20.741 22.167 23.639 25.374 27.302 29.594 32.277 35.429 39.108 43.333 46.645 48.54 49.676 50.26 50.548 50.667 50.667 50.58 50.389 50.172 49.93 49.658 49.384 49.112 48.858 48.58 48.302 48.044 47.771 47.469 47.199 46.907 46.599 46.349 46.077 45.791 45.484 45.147 44.921 44.69 44.299 44.031 43.737 43.582 43.285 42.97 42.638 42.456 42.047 41.839 41.609 41.383 40.881 40.582 40.259 39.896 39.413 38.765 37.978 35.312 -6 ,3459 ,KEBNE ,16749505,Wed Dec 1 16:00:55 CET,Wed Dec 1 17:53:52 CET,0.0 1.238 1.764 2.177 2.527 2.849 3.148 3.421 3.934 4.177 4.411 4.585 5.047 5.251 5.65 6.038 6.4 6.571 6.9 7.237 7.722 8.025 8.321 8.753 9.176 9.581 9.985 10.381 10.897 11.386 11.873 12.478 13.061 13.644 14.318 15.068 15.8 16.629 17.535 18.51 19.555 20.708 22.06 23.466 25.125 26.995 29.16 31.653 34.685 38.139 42.346 45.847 47.579 48.522 48.988 49.214 49.24 49.134 49.014 48.828 48.586 48.321 48.011 47.695 47.393 47.094 46.772 46.466 46.172 45.847 45.516 45.237 44.936 44.595 44.291 43.982 43.69 43.37 42.982 42.72 42.457 42.022 41.748 41.473 41.329 41.033 40.684 40.281 40.065 39.617 39.338 39.077 38.787 38.179 37.85 37.502 37.102 36.606 35.998 35.245 32.766 -7 ,2209 ,KEBNE ,16749506,Wed Dec 1 16:00:55 CET,Wed Dec 1 17:53:11 CET,0.0 1.436 1.944 2.338 2.677 2.983 3.267 3.525 4.005 4.234 4.457 4.631 5.095 5.295 5.669 6.038 6.394 6.564 6.896 7.222 7.725 8.055 8.363 8.806 9.229 9.643 10.059 10.464 11.001 11.522 12.012 12.599 13.179 13.755 14.427 15.199 15.973 16.826 17.726 18.684 19.713 20.887 22.3 23.766 25.443 27.326 29.605 32.176 35.088 38.645 42.959 46.308 48.17 49.327 50.039 50.456 50.588 50.539 50.44 50.268 50.041 49.826 49.59 49.341 49.118 48.889 48.618 48.339 48.078 47.795 47.511 47.281 47.031 46.751 46.533 46.317 46.076 45.806 45.52 45.316 45.104 44.77 44.513 44.231 44.083 43.792 43.463 43.075 42.875 42.451 42.203 41.964 41.721 41.187 40.875 40.531 40.124 39.623 39.057 38.297 35.677 -8 ,13076 ,KEBNE ,16749507,Wed Dec 1 16:06:07 CET,Wed Dec 1 17:57:25 CET,0.0 1.225 1.744 2.171 2.533 2.876 3.191 3.475 4.011 4.258 4.482 4.663 5.133 5.34 5.74 6.112 6.468 6.64 6.979 7.315 7.799 8.108 8.409 8.846 9.264 9.694 10.117 10.511 11.03 11.533 12.027 12.651 13.254 13.812 14.47 15.231 15.97 16.783 17.66 18.603 19.611 20.779 22.195 23.627 25.294 27.211 29.5 32.08 35.055 38.654 43.045 46.522 48.463 49.657 50.299 50.58 50.66 50.607 50.425 50.129 49.826 49.54 49.276 49.001 48.703 48.354 47.9 47.49 47.153 46.8 46.431 46.106 45.752 45.388 45.087 44.788 44.49 44.139 43.777 43.538 43.268 42.813 42.486 42.157 41.986 41.621 41.237 40.799 40.577 40.144 39.88 39.609 39.322 38.676 38.29 37.866 37.346 36.75 36.126 35.215 32.388 -9 ,13882 ,KEBNE ,16749508,Wed Dec 1 16:06:06 CET,Wed Dec 1 17:58:19 CET,0.0 1.413 1.965 2.389 2.72 3.017 3.289 3.547 4.052 4.295 4.524 4.679 5.131 5.328 5.713 6.092 6.456 6.63 6.971 7.303 7.775 8.076 8.373 8.806 9.236 9.66 10.067 10.463 10.994 11.5 11.985 12.592 13.198 13.768 14.44 15.227 15.987 16.823 17.73 18.73 19.774 20.966 22.409 23.877 25.627 27.561 29.742 32.34 35.478 38.961 43.231 46.848 48.702 49.759 50.39 50.707 50.85 50.852 50.747 50.581 50.427 50.273 50.075 49.839 49.584 49.352 49.097 48.848 48.618 48.367 48.092 47.855 47.612 47.333 47.105 46.871 46.623 46.352 46.053 45.867 45.678 45.368 45.144 44.876 44.744 44.476 44.153 43.778 43.58 43.17 42.924 42.664 42.401 41.834 41.52 41.179 40.783 40.316 39.764 39.064 36.72 -10 ,4981 ,KEBNE ,16749509,Wed Dec 1 16:06:06 CET,Wed Dec 1 17:57:07 CET,0.0 1.234 1.769 2.182 2.563 2.899 3.191 3.462 3.972 4.213 4.455 4.654 5.111 5.308 5.681 6.047 6.42 6.601 6.94 7.272 7.747 8.052 8.353 8.797 9.239 9.668 10.076 10.474 10.995 11.493 11.972 12.56 13.143 13.723 14.417 15.194 15.944 16.8 17.702 18.662 19.716 20.915 22.354 23.839 25.586 27.565 29.83 32.338 35.304 39.057 43.718 47.473 49.619 50.83 51.467 51.836 52.038 52.108 52.088 51.955 51.747 51.539 51.337 51.125 50.92 50.705 50.422 50.126 49.83 49.481 49.096 48.772 48.442 48.081 47.774 47.475 47.196 46.898 46.576 46.353 46.123 45.755 45.482 45.197 45.047 44.692 44.285 43.878 43.684 43.263 43.055 42.822 42.561 41.94 41.575 41.21 40.822 40.353 39.819 39.105 36.67 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 8dc1532e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19912 ,KEBNE ,16749510,Wed Dec 1 16:06:11 CET,Wed Dec 1 17:53:59 CET,0.0 1.298 1.783 2.149 2.483 2.798 3.078 3.335 3.792 4.002 4.21 4.335 4.764 4.935 5.262 5.588 5.897 6.051 6.353 6.628 7.036 7.302 7.549 7.903 8.249 8.595 8.931 9.252 9.666 10.078 10.474 10.946 11.407 11.852 12.363 12.932 13.488 14.111 14.779 15.485 16.239 17.09 18.086 19.093 20.295 21.659 23.241 25.052 27.208 29.827 32.979 35.455 36.773 37.514 37.922 38.098 38.136 38.081 37.99 37.867 37.742 37.592 37.39 37.188 36.997 36.802 36.555 36.293 36.059 35.83 35.605 35.421 35.217 34.976 34.777 34.574 34.361 34.138 33.899 33.733 33.561 33.249 33.019 32.785 32.659 32.384 32.097 31.799 31.634 31.223 31.051 30.842 30.611 30.062 29.747 29.409 29.045 28.605 28.079 27.442 25.433 -2 ,27578 ,KEBNE ,16749511,Wed Dec 1 16:06:07 CET,Wed Dec 1 17:57:44 CET,0.0 1.314 1.831 2.24 2.573 2.868 3.139 3.397 3.876 4.09 4.293 4.4 4.833 5.015 5.358 5.676 5.975 6.123 6.416 6.687 7.073 7.319 7.563 7.921 8.258 8.587 8.92 9.249 9.666 10.062 10.441 10.896 11.343 11.785 12.299 12.89 13.462 14.084 14.75 15.446 16.184 17.042 18.049 19.073 20.297 21.691 23.309 25.08 27.167 29.743 32.846 35.3 36.662 37.471 37.933 38.162 38.247 38.204 38.109 38.006 37.881 37.734 37.564 37.374 37.188 37.0 36.745 36.491 36.29 36.057 35.796 35.594 35.373 35.123 34.909 34.689 34.476 34.251 33.989 33.799 33.596 33.265 33.05 32.8 32.654 32.367 32.078 31.789 31.625 31.224 31.08 30.879 30.662 30.166 29.88 29.541 29.177 28.791 28.303 27.608 25.673 -3 ,4931 ,KEBNE ,16749512,Wed Dec 1 16:06:07 CET,Wed Dec 1 17:57:09 CET,0.0 1.846 2.373 2.744 3.054 3.334 3.587 3.831 4.283 4.486 4.687 4.791 5.208 5.385 5.715 6.015 6.316 6.461 6.743 7.03 7.43 7.671 7.901 8.242 8.589 8.928 9.259 9.572 9.971 10.364 10.748 11.203 11.646 12.089 12.593 13.146 13.678 14.27 14.912 15.59 16.325 17.171 18.165 19.182 20.375 21.718 23.256 25.026 27.142 29.701 32.875 35.426 36.823 37.672 38.173 38.416 38.541 38.581 38.543 38.462 38.355 38.199 38.01 37.833 37.652 37.453 37.209 36.988 36.797 36.58 36.347 36.149 35.921 35.675 35.497 35.303 35.087 34.856 34.611 34.432 34.238 33.917 33.678 33.435 33.309 33.037 32.742 32.439 32.283 31.895 31.727 31.507 31.272 30.759 30.493 30.193 29.849 29.442 28.942 28.291 26.618 -4 ,21953 ,KEBNE ,16749513,Wed Dec 1 16:06:07 CET,Wed Dec 1 17:57:02 CET,0.0 1.429 1.966 2.369 2.701 3.003 3.287 3.554 4.0 4.199 4.403 4.527 4.964 5.139 5.468 5.783 6.078 6.217 6.492 6.76 7.142 7.402 7.657 8.013 8.364 8.713 9.038 9.346 9.758 10.166 10.557 11.022 11.467 11.893 12.403 12.975 13.508 14.099 14.747 15.447 16.209 17.073 18.083 19.098 20.288 21.63 23.197 24.976 27.057 29.567 32.586 35.074 36.499 37.346 37.826 38.044 38.103 38.104 38.041 37.898 37.736 37.54 37.302 37.077 36.868 36.654 36.404 36.157 35.921 35.681 35.461 35.279 35.077 34.85 34.658 34.453 34.229 33.982 33.723 33.545 33.35 33.008 32.761 32.521 32.398 32.124 31.816 31.473 31.296 30.883 30.708 30.517 30.307 29.832 29.571 29.28 28.933 28.493 27.945 27.215 25.114 -5 ,10381 ,KEBNE ,16749514,Wed Dec 1 16:06:07 CET,Wed Dec 1 17:57:00 CET,0.0 1.18 1.7 2.105 2.437 2.729 2.996 3.247 3.696 3.898 4.092 4.22 4.671 4.857 5.214 5.55 5.869 6.02 6.314 6.596 6.992 7.256 7.51 7.858 8.197 8.537 8.872 9.188 9.597 10.002 10.387 10.844 11.279 11.695 12.183 12.748 13.306 13.918 14.584 15.304 16.056 16.895 17.891 18.915 20.155 21.565 23.179 25.002 27.176 29.815 33.024 35.563 36.989 37.814 38.268 38.538 38.644 38.64 38.586 38.475 38.331 38.175 38.005 37.812 37.593 37.386 37.179 36.967 36.763 36.543 36.303 36.094 35.862 35.603 35.392 35.172 34.95 34.719 34.477 34.308 34.112 33.791 33.56 33.313 33.178 32.891 32.601 32.285 32.13 31.744 31.588 31.378 31.156 30.605 30.26 29.904 29.485 28.968 28.338 27.454 24.829 -6 ,31679 ,KEBNE ,16749515,Wed Dec 1 16:09:17 CET,Wed Dec 1 18:14:21 CET,0.0 1.235 1.783 2.218 2.575 2.869 3.147 3.404 3.868 4.082 4.286 4.394 4.814 4.975 5.279 5.576 5.873 6.019 6.301 6.575 6.979 7.234 7.477 7.837 8.176 8.492 8.802 9.114 9.526 9.927 10.318 10.778 11.213 11.637 12.146 12.726 13.269 13.887 14.559 15.264 16.008 16.828 17.801 18.791 19.962 21.297 22.869 24.687 26.819 29.298 32.283 34.777 36.151 36.878 37.26 37.449 37.49 37.441 37.359 37.259 37.144 36.995 36.802 36.603 36.42 36.224 35.958 35.688 35.454 35.217 34.969 34.762 34.523 34.251 34.055 33.851 33.616 33.36 33.076 32.876 32.672 32.335 32.084 31.819 31.689 31.439 31.166 30.857 30.69 30.29 30.105 29.89 29.655 29.151 28.872 28.562 28.256 27.879 27.367 26.638 24.566 -7 ,6497 ,KEBNE ,16749516,Wed Dec 1 16:09:18 CET,Wed Dec 1 17:59:49 CET,0.0 1.463 1.996 2.407 2.75 3.043 3.304 3.55 4.013 4.231 4.485 4.809 5.323 5.522 5.862 6.188 6.496 6.644 6.933 7.218 7.621 7.88 8.132 8.492 8.83 9.161 9.502 9.836 10.254 10.647 11.026 11.493 11.944 12.385 12.886 13.436 13.975 14.583 15.245 15.959 16.713 17.565 18.567 19.593 20.789 22.137 23.736 25.584 27.787 30.414 33.556 36.115 37.524 38.341 38.811 39.045 39.107 39.058 38.977 38.876 38.746 38.58 38.405 38.226 38.009 37.787 37.553 37.328 37.128 36.894 36.617 36.391 36.169 35.935 35.732 35.517 35.303 35.063 34.795 34.606 34.4 34.064 33.799 33.496 33.343 33.029 32.7 32.363 32.187 31.774 31.561 31.33 31.09 30.552 30.243 29.904 29.524 29.115 28.591 27.876 25.98 -8 ,24145 ,KEBNE ,16749517,Wed Dec 1 16:09:17 CET,Wed Dec 1 18:02:14 CET,0.0 1.723 2.249 2.635 2.946 3.225 3.495 3.75 4.209 4.417 4.616 4.738 5.182 5.368 5.72 6.035 6.331 6.477 6.757 7.024 7.406 7.647 7.885 8.24 8.591 8.929 9.245 9.553 9.953 10.349 10.731 11.186 11.629 12.061 12.563 13.13 13.674 14.285 14.959 15.67 16.414 17.27 18.289 19.324 20.527 21.876 23.452 25.263 27.404 29.888 32.905 35.395 36.773 37.555 37.983 38.152 38.164 38.115 38.019 37.861 37.692 37.522 37.342 37.137 36.893 36.64 36.379 36.133 35.923 35.72 35.461 35.233 35.007 34.76 34.554 34.325 34.084 33.838 33.591 33.419 33.236 32.937 32.722 32.496 32.371 32.089 31.766 31.38 31.167 30.729 30.473 30.193 29.892 29.277 28.953 28.6 28.233 27.806 27.262 26.545 24.919 -9 ,28444 ,KEBNE ,16749518,Wed Dec 1 16:09:17 CET,Wed Dec 1 17:59:59 CET,0.0 1.554 2.086 2.49 2.833 3.112 3.38 3.63 4.082 4.299 4.499 4.618 5.062 5.235 5.564 5.885 6.201 6.35 6.631 6.902 7.28 7.524 7.775 8.134 8.462 8.794 9.127 9.447 9.854 10.245 10.63 11.1 11.553 11.987 12.489 13.057 13.607 14.202 14.835 15.525 16.275 17.129 18.134 19.177 20.396 21.735 23.286 25.047 27.159 29.72 32.755 35.227 36.604 37.391 37.834 38.027 38.09 38.081 38.04 37.948 37.813 37.639 37.408 37.158 36.909 36.67 36.411 36.168 35.947 35.69 35.406 35.165 34.905 34.611 34.371 34.127 33.879 33.608 33.328 33.15 32.97 32.678 32.467 32.24 32.124 31.863 31.557 31.23 31.057 30.656 30.488 30.265 30.032 29.54 29.265 28.967 28.633 28.265 27.796 27.159 25.395 -10 ,8256 ,KEBNE ,16749519,Wed Dec 1 16:09:17 CET,Wed Dec 1 18:00:27 CET,0.0 1.276 1.759 2.141 2.51 2.846 3.119 3.37 3.855 4.083 4.293 4.418 4.848 5.033 5.407 5.757 6.077 6.224 6.495 6.761 7.172 7.445 7.702 8.067 8.422 8.766 9.101 9.43 9.845 10.235 10.627 11.091 11.523 11.953 12.461 13.026 13.565 14.17 14.845 15.589 16.366 17.222 18.215 19.219 20.446 21.849 23.452 25.292 27.468 29.984 33.008 35.541 37.008 37.838 38.249 38.43 38.428 38.308 38.151 37.953 37.757 37.575 37.384 37.18 36.98 36.773 36.544 36.323 36.113 35.878 35.613 35.372 35.121 34.872 34.655 34.406 34.148 33.878 33.571 33.345 33.126 32.796 32.549 32.279 32.137 31.854 31.569 31.263 31.1 30.692 30.51 30.283 30.014 29.387 29.062 28.728 28.34 27.852 27.266 26.545 24.302 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt deleted file mode 100644 index 59127302..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9367 ,KEBNE ,16749520,Wed Dec 1 16:09:17 CET,Wed Dec 1 18:02:09 CET,0.0 1.787 2.274 2.673 3.009 3.306 3.581 3.844 4.33 4.555 4.769 4.91 5.344 5.526 5.874 6.211 6.541 6.691 6.984 7.264 7.632 7.874 8.12 8.476 8.842 9.219 9.59 9.952 10.411 10.841 11.257 11.75 12.216 12.663 13.185 13.788 14.388 15.063 15.77 16.511 17.292 18.169 19.211 20.146 21.088 22.085 23.158 24.311 25.556 26.835 28.065 28.645 28.639 28.375 27.986 27.503 26.99 26.47 25.996 25.486 24.999 24.534 24.067 23.603 23.169 22.774 22.347 21.966 21.618 21.245 20.852 20.516 20.147 19.739 19.415 19.074 18.715 18.335 17.941 17.667 17.392 16.939 16.618 16.3 16.135 15.802 15.462 15.092 14.89 14.443 14.263 14.035 13.79 13.251 12.958 12.63 12.234 11.802 11.316 10.57 7.788 -2 ,21728 ,KEBNE ,16749521,Wed Dec 1 16:09:18 CET,Wed Dec 1 18:00:49 CET,0.0 1.893 2.5 2.971 3.323 3.637 3.932 4.211 4.744 4.976 5.187 5.351 5.8 5.981 6.334 6.666 6.988 7.145 7.452 7.746 8.164 8.432 8.699 9.104 9.477 9.828 10.162 10.471 10.852 11.207 11.557 11.977 12.373 12.757 13.212 13.726 14.224 14.749 15.29 15.895 16.539 17.253 18.083 18.86 19.734 20.718 21.805 22.962 24.187 25.483 26.736 27.215 27.14 26.832 26.379 25.848 25.315 24.781 24.208 23.576 22.99 22.432 21.888 21.356 20.869 20.494 20.148 19.83 19.555 19.259 18.941 18.653 18.336 17.988 17.712 17.422 17.107 16.769 16.409 16.159 15.899 15.478 15.179 14.858 14.694 14.375 14.04 13.687 13.499 13.052 12.875 12.641 12.381 11.782 11.439 11.084 10.679 10.223 9.659 8.856 6.119 -3 ,26468 ,KEBNE ,16749522,Wed Dec 1 16:09:18 CET,Wed Dec 1 18:00:57 CET,0.0 1.679 2.24 2.679 3.054 3.378 3.676 3.953 4.442 4.664 4.88 5.023 5.475 5.655 6.001 6.325 6.634 6.785 7.069 7.342 7.743 7.993 8.223 8.563 8.891 9.214 9.524 9.819 10.203 10.576 10.94 11.371 11.778 12.165 12.615 13.12 13.607 14.142 14.703 15.316 15.971 16.667 17.447 18.228 19.129 20.075 21.114 22.268 23.538 24.829 25.986 26.361 26.155 25.762 25.311 24.811 24.294 23.754 23.238 22.709 22.244 21.804 21.363 20.912 20.48 20.096 19.697 19.318 18.973 18.609 18.239 17.927 17.585 17.226 16.934 16.597 16.224 15.841 15.457 15.197 14.925 14.474 14.146 13.814 13.64 13.278 12.914 12.519 12.308 11.848 11.62 11.379 11.126 10.564 10.234 9.877 9.483 8.976 8.371 7.609 5.382 -4 ,20552 ,KEBNE ,16749523,Wed Dec 1 16:09:19 CET,Wed Dec 1 17:56:57 CET,0.0 1.777 2.291 2.693 3.04 3.345 3.623 3.876 4.333 4.563 4.786 4.934 5.375 5.558 5.921 6.262 6.586 6.747 7.076 7.387 7.828 8.111 8.379 8.765 9.154 9.521 9.856 10.193 10.643 11.072 11.493 11.996 12.44 12.838 13.292 13.799 14.291 14.816 15.351 15.918 16.529 17.22 18.003 18.745 19.593 20.545 21.606 22.776 24.064 25.346 26.624 27.326 27.36 27.064 26.62 26.105 25.6 25.108 24.617 24.058 23.561 23.08 22.552 22.012 21.509 21.073 20.635 20.245 19.905 19.559 19.194 18.872 18.529 18.151 17.85 17.539 17.21 16.808 16.375 16.105 15.837 15.446 15.165 14.862 14.714 14.415 14.081 13.732 13.557 13.119 12.93 12.702 12.461 11.912 11.621 11.309 10.929 10.506 10.007 9.335 7.205 -5 ,6089 ,KEBNE ,16749524,Wed Dec 1 16:09:17 CET,Wed Dec 1 18:02:09 CET,0.0 1.642 2.171 2.592 2.943 3.261 3.557 3.84 4.343 4.564 4.771 4.894 5.324 5.503 5.846 6.164 6.459 6.597 6.861 7.118 7.497 7.743 7.989 8.356 8.698 9.024 9.338 9.637 10.025 10.403 10.767 11.191 11.594 11.981 12.421 12.927 13.413 13.935 14.507 15.123 15.733 16.4 17.192 17.974 18.862 19.862 20.979 22.12 23.361 24.666 25.928 26.479 26.367 25.996 25.56 25.127 24.661 24.108 23.549 22.971 22.469 22.012 21.569 21.147 20.722 20.317 19.896 19.514 19.176 18.797 18.377 18.03 17.657 17.242 16.941 16.656 16.369 16.062 15.712 15.459 15.192 14.779 14.487 14.187 14.039 13.717 13.367 13.008 12.823 12.391 12.224 11.994 11.737 11.182 10.879 10.544 10.137 9.665 9.082 8.384 5.96 -6 ,2209 ,KEBNE ,16749525,Wed Dec 1 16:09:18 CET,Wed Dec 1 18:01:20 CET,0.0 1.744 2.307 2.76 3.138 3.471 3.79 4.074 4.579 4.822 5.051 5.205 5.653 5.833 6.185 6.534 6.861 7.006 7.292 7.587 7.995 8.235 8.474 8.819 9.145 9.471 9.784 10.078 10.455 10.816 11.172 11.602 11.997 12.382 12.831 13.331 13.815 14.353 14.938 15.541 16.144 16.833 17.639 18.417 19.283 20.222 21.307 22.463 23.745 25.144 26.398 26.957 26.948 26.692 26.302 25.827 25.333 24.824 24.349 23.849 23.39 22.939 22.496 22.058 21.62 21.222 20.773 20.361 20.023 19.644 19.243 18.929 18.596 18.233 17.954 17.668 17.368 17.054 16.719 16.49 16.255 15.876 15.594 15.289 15.131 14.811 14.473 14.109 13.916 13.463 13.281 13.041 12.774 12.194 11.866 11.512 11.11 10.645 10.073 9.292 6.884 -7 ,25039 ,KEBNE ,16749526,Wed Dec 1 16:20:56 CET,Wed Dec 1 18:12:05 CET,0.0 2.497 3.028 3.444 3.783 4.08 4.356 4.617 5.088 5.303 5.514 5.673 6.13 6.323 6.68 7.03 7.354 7.498 7.78 8.055 8.44 8.688 8.93 9.275 9.593 9.9 10.202 10.493 10.871 11.237 11.576 11.996 12.395 12.769 13.215 13.724 14.213 14.751 15.325 15.949 16.602 17.292 18.081 18.863 19.758 20.73 21.793 22.966 24.276 25.636 27.041 27.724 27.621 27.193 26.717 26.213 25.649 25.072 24.533 23.912 23.36 22.895 22.43 21.971 21.521 21.091 20.637 20.194 19.793 19.4 19.007 18.68 18.345 17.989 17.712 17.426 17.122 16.806 16.464 16.214 15.961 15.547 15.222 14.889 14.723 14.379 14.008 13.613 13.405 12.941 12.72 12.481 12.227 11.639 11.299 10.929 10.548 10.144 9.678 9.012 6.843 -8 ,16146 ,KEBNE ,16749527,Wed Dec 1 16:20:56 CET,Wed Dec 1 18:14:23 CET,0.0 1.956 2.588 3.044 3.411 3.716 3.986 4.25 4.744 4.972 5.191 5.35 5.786 5.965 6.348 6.715 7.042 7.199 7.516 7.822 8.254 8.537 8.816 9.234 9.618 9.973 10.334 10.693 11.145 11.592 12.003 12.445 12.852 13.236 13.686 14.182 14.672 15.209 15.781 16.399 17.025 17.719 18.494 19.263 20.157 21.114 22.179 23.313 24.573 25.898 27.176 27.802 27.814 27.487 27.036 26.557 26.052 25.533 25.033 24.502 24.032 23.579 23.117 22.68 22.251 21.848 21.423 21.029 20.689 20.289 19.827 19.439 19.024 18.607 18.301 17.987 17.667 17.306 16.916 16.658 16.385 15.949 15.624 15.278 15.1 14.735 14.373 14.004 13.803 13.342 13.098 12.843 12.592 12.046 11.711 11.342 10.927 10.454 9.884 9.15 7.18 -9 ,3365 ,KEBNE ,16749528,Wed Dec 1 16:20:56 CET,Wed Dec 1 18:11:21 CET,0.0 1.613 2.155 2.557 2.893 3.195 3.473 3.733 4.23 4.46 4.674 4.819 5.261 5.449 5.834 6.193 6.519 6.682 6.988 7.253 7.607 7.836 8.067 8.421 8.802 9.187 9.558 9.914 10.373 10.793 11.148 11.567 11.983 12.386 12.855 13.386 13.888 14.42 14.995 15.643 16.31 17.024 17.831 18.604 19.512 20.469 21.509 22.658 23.891 25.091 26.203 26.714 26.677 26.34 25.828 25.251 24.662 24.098 23.554 22.968 22.497 22.066 21.59 21.104 20.654 20.246 19.793 19.378 19.021 18.628 18.196 17.848 17.494 17.113 16.819 16.51 16.18 15.847 15.5 15.248 14.972 14.513 14.194 13.857 13.674 13.291 12.882 12.446 12.217 11.744 11.488 11.211 10.94 10.364 10.036 9.652 9.223 8.751 8.229 7.558 4.884 -10 ,4254 ,KEBNE ,16749529,Wed Dec 1 16:20:56 CET,Wed Dec 1 18:15:21 CET,0.0 1.654 2.263 2.77 3.206 3.586 3.932 4.229 4.775 5.036 5.281 5.491 5.951 6.149 6.537 6.924 7.286 7.452 7.781 8.091 8.545 8.835 9.107 9.485 9.852 10.219 10.582 10.942 11.388 11.816 12.249 12.778 13.276 13.75 14.286 14.893 15.492 16.158 16.859 17.584 18.331 19.184 20.195 21.144 22.258 23.533 24.859 26.085 27.287 28.584 29.811 30.303 30.275 30.0 29.589 29.113 28.612 28.093 27.595 27.074 26.597 26.151 25.707 25.265 24.852 24.458 24.037 23.669 23.334 22.955 22.547 22.219 21.898 21.562 21.297 21.018 20.713 20.387 20.054 19.831 19.602 19.219 18.941 18.639 18.476 18.157 17.812 17.42 17.218 16.75 16.503 16.234 15.954 15.321 14.959 14.556 14.114 13.652 13.063 12.263 9.674 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt deleted file mode 100644 index 9e708d61..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11438 ,KEBNE ,16749530,Wed Dec 1 16:20:56 CET,Wed Dec 1 18:14:00 CET,0.0 1.823 2.467 2.964 3.358 3.724 4.075 4.401 4.978 5.244 5.498 5.723 6.196 6.406 6.829 7.232 7.616 7.801 8.15 8.474 8.949 9.264 9.57 10.014 10.443 10.876 11.293 11.677 12.187 12.687 13.146 13.672 14.174 14.654 15.203 15.838 16.47 17.14 17.82 18.553 19.357 20.264 21.313 22.34 23.517 24.841 26.363 28.046 29.963 32.128 34.674 36.586 37.442 37.756 37.788 37.677 37.493 37.215 36.914 36.584 36.243 35.899 35.547 35.214 34.895 34.586 34.269 33.971 33.679 33.373 33.057 32.789 32.523 32.206 31.944 31.687 31.404 31.104 30.793 30.574 30.34 29.982 29.733 29.462 29.316 29.005 28.669 28.298 28.099 27.665 27.478 27.244 26.996 26.458 26.163 25.851 25.509 25.135 24.67 23.948 22.237 -2 ,12533 ,KEBNE ,16749531,Wed Dec 1 16:20:55 CET,Wed Dec 1 18:14:02 CET,0.0 2.396 3.036 3.599 4.064 4.438 4.776 5.096 5.691 5.953 6.194 6.388 6.866 7.073 7.468 7.838 8.188 8.361 8.702 9.044 9.524 9.827 10.121 10.523 10.905 11.288 11.661 12.023 12.495 12.975 13.443 13.986 14.5 15.003 15.585 16.228 16.852 17.526 18.252 19.028 19.84 20.769 21.817 22.849 24.072 25.413 26.889 28.559 30.52 32.768 35.378 37.311 38.175 38.487 38.493 38.374 38.207 37.961 37.671 37.353 37.036 36.697 36.354 36.024 35.693 35.375 35.038 34.714 34.426 34.131 33.819 33.557 33.275 32.966 32.72 32.466 32.205 31.934 31.656 31.467 31.26 30.905 30.658 30.399 30.262 29.976 29.67 29.349 29.18 28.768 28.616 28.413 28.178 27.639 27.353 27.037 26.675 26.257 25.766 25.139 22.803 -3 ,12694 ,KEBNE ,16749532,Wed Dec 1 16:20:57 CET,Wed Dec 1 18:13:54 CET,0.0 1.843 2.574 3.097 3.523 3.903 4.253 4.564 5.117 5.366 5.596 5.773 6.246 6.463 6.877 7.276 7.64 7.81 8.153 8.485 8.958 9.258 9.551 9.979 10.383 10.789 11.181 11.535 11.991 12.434 12.877 13.407 13.907 14.41 14.989 15.614 16.2 16.843 17.535 18.271 19.06 19.975 21.015 22.046 23.252 24.561 26.041 27.659 29.528 31.69 34.144 35.973 36.809 37.166 37.268 37.215 37.048 36.806 36.556 36.271 35.983 35.675 35.351 35.024 34.701 34.395 34.064 33.752 33.471 33.184 32.884 32.62 32.333 32.043 31.814 31.56 31.303 31.035 30.736 30.523 30.306 29.967 29.726 29.468 29.325 28.992 28.645 28.299 28.126 27.712 27.471 27.192 26.912 26.246 25.879 25.504 25.089 24.661 24.152 23.41 21.573 -4 ,29750 ,KEBNE ,16749533,Wed Dec 1 16:20:56 CET,Wed Dec 1 18:12:50 CET,0.0 2.444 3.067 3.557 3.992 4.358 4.676 4.984 5.532 5.774 6.018 6.229 6.705 6.912 7.331 7.735 8.112 8.289 8.617 8.936 9.42 9.726 10.008 10.427 10.827 11.205 11.573 11.939 12.426 12.89 13.332 13.869 14.389 14.877 15.432 16.062 16.672 17.351 18.084 18.862 19.68 20.589 21.602 22.592 23.764 25.068 26.524 28.163 30.061 32.199 34.643 36.344 37.109 37.386 37.369 37.224 36.999 36.731 36.466 36.139 35.779 35.428 35.072 34.717 34.385 34.078 33.74 33.409 33.112 32.791 32.45 32.174 31.882 31.574 31.331 31.082 30.827 30.539 30.215 30.006 29.784 29.415 29.179 28.929 28.793 28.514 28.197 27.861 27.687 27.279 27.099 26.873 26.654 26.178 25.902 25.596 25.234 24.787 24.298 23.718 20.973 -5 ,20373 ,KEBNE ,16749534,Wed Dec 1 16:20:57 CET,Wed Dec 1 18:16:03 CET,0.0 1.418 2.024 2.509 2.923 3.301 3.639 3.944 4.508 4.77 5.024 5.249 5.727 5.941 6.342 6.732 7.111 7.289 7.641 7.982 8.476 8.79 9.095 9.539 9.95 10.331 10.699 11.056 11.509 11.964 12.413 12.936 13.442 13.931 14.498 15.147 15.762 16.415 17.114 17.857 18.645 19.536 20.582 21.644 22.873 24.235 25.81 27.552 29.48 31.655 34.137 35.906 36.63 36.88 36.941 36.822 36.59 36.316 36.038 35.715 35.406 35.113 34.8 34.473 34.163 33.884 33.58 33.285 33.012 32.711 32.377 32.087 31.793 31.466 31.2 30.944 30.688 30.419 30.122 29.907 29.692 29.37 29.13 28.86 28.72 28.43 28.119 27.788 27.61 27.179 27.003 26.796 26.555 26.005 25.717 25.399 25.043 24.628 24.164 23.516 21.238 -6 ,10532 ,KEBNE ,16749535,Wed Dec 1 16:20:57 CET,Wed Dec 1 18:13:54 CET,0.0 1.857 2.513 2.991 3.407 3.795 4.135 4.439 5.015 5.266 5.493 5.686 6.169 6.387 6.793 7.157 7.515 7.687 8.01 8.331 8.798 9.087 9.356 9.767 10.171 10.56 10.936 11.298 11.758 12.193 12.617 13.134 13.636 14.113 14.673 15.316 15.916 16.569 17.295 18.089 18.92 19.836 20.888 21.936 23.149 24.49 26.019 27.693 29.621 31.87 34.377 36.112 36.897 37.187 37.239 37.155 36.937 36.627 36.298 35.914 35.579 35.272 34.948 34.63 34.294 33.969 33.601 33.234 32.92 32.591 32.252 31.978 31.68 31.36 31.088 30.804 30.53 30.252 29.95 29.728 29.506 29.167 28.922 28.671 28.541 28.253 27.942 27.629 27.468 27.062 26.915 26.724 26.506 26.008 25.73 25.435 25.118 24.736 24.257 23.613 21.51 -7 ,5689 ,KEBNE ,16749536,Wed Dec 1 16:20:56 CET,Wed Dec 1 18:13:05 CET,0.0 1.816 2.432 2.925 3.309 3.652 3.951 4.233 4.804 5.072 5.316 5.516 5.994 6.191 6.571 6.941 7.308 7.501 7.89 8.255 8.731 9.026 9.317 9.738 10.127 10.491 10.835 11.169 11.609 12.029 12.435 12.932 13.408 13.867 14.407 15.01 15.576 16.202 16.881 17.607 18.396 19.283 20.307 21.343 22.51 23.809 25.331 27.053 29.066 31.387 34.036 36.011 37.014 37.487 37.665 37.661 37.509 37.193 36.825 36.409 36.005 35.617 35.229 34.859 34.513 34.191 33.863 33.562 33.279 32.968 32.634 32.36 32.086 31.807 31.58 31.345 31.106 30.832 30.543 30.355 30.156 29.845 29.629 29.39 29.264 29.0 28.715 28.394 28.219 27.808 27.647 27.425 27.184 26.652 26.348 26.04 25.72 25.342 24.879 24.275 22.478 -8 ,29989 ,KEBNE ,16749537,Wed Dec 1 16:20:57 CET,Wed Dec 1 18:15:55 CET,0.0 2.226 2.871 3.406 3.84 4.21 4.559 4.887 5.46 5.717 5.963 6.172 6.646 6.848 7.239 7.602 7.96 8.138 8.481 8.807 9.279 9.588 9.881 10.301 10.709 11.115 11.512 11.885 12.366 12.812 13.231 13.753 14.257 14.743 15.312 15.949 16.551 17.195 17.88 18.628 19.422 20.295 21.316 22.354 23.556 24.864 26.364 28.061 29.986 32.157 34.593 36.337 37.146 37.453 37.491 37.355 37.115 36.846 36.567 36.221 35.893 35.577 35.247 34.931 34.622 34.326 33.992 33.673 33.405 33.112 32.809 32.56 32.292 31.99 31.737 31.491 31.241 30.969 30.669 30.455 30.231 29.891 29.659 29.408 29.274 28.991 28.696 28.372 28.199 27.796 27.655 27.439 27.201 26.713 26.464 26.177 25.847 25.468 24.996 24.345 22.471 -9 ,926 ,KEBNE ,16749538,Wed Dec 1 16:20:57 CET,Wed Dec 1 18:12:38 CET,0.0 2.084 2.68 3.151 3.576 3.956 4.291 4.596 5.151 5.423 5.688 5.934 6.407 6.614 7.011 7.377 7.74 7.919 8.266 8.599 9.087 9.405 9.719 10.211 10.692 11.162 11.638 12.077 12.599 13.09 13.566 14.128 14.665 15.181 15.763 16.405 17.002 17.638 18.328 19.086 19.895 20.794 21.859 22.914 24.094 25.411 26.942 28.671 30.637 32.899 35.476 37.306 38.153 38.508 38.568 38.452 38.215 37.936 37.642 37.299 36.944 36.581 36.244 35.921 35.596 35.283 34.935 34.603 34.308 34.006 33.682 33.407 33.116 32.81 32.567 32.302 32.021 31.721 31.413 31.193 30.959 30.588 30.322 30.052 29.907 29.603 29.302 28.98 28.81 28.389 28.213 27.997 27.772 27.268 26.977 26.663 26.321 25.93 25.465 24.845 22.783 -10 ,12531 ,KEBNE ,16749539,Wed Dec 1 16:20:57 CET,Wed Dec 1 18:16:13 CET,0.0 2.03 2.652 3.152 3.592 3.979 4.325 4.629 5.176 5.417 5.653 5.877 6.357 6.564 6.955 7.334 7.699 7.88 8.226 8.538 9.014 9.334 9.644 10.095 10.524 10.933 11.33 11.722 12.242 12.751 13.236 13.82 14.375 14.915 15.537 16.239 16.919 17.654 18.451 19.312 20.145 20.999 22.036 23.072 24.229 25.527 27.03 28.74 30.686 32.891 35.383 37.141 37.891 38.116 38.046 37.81 37.536 37.233 36.907 36.507 36.114 35.75 35.391 35.005 34.63 34.286 33.915 33.589 33.306 33.002 32.664 32.366 32.047 31.727 31.469 31.195 30.914 30.619 30.318 30.107 29.877 29.508 29.242 28.962 28.817 28.496 28.164 27.832 27.651 27.233 27.045 26.799 26.536 25.964 25.632 25.271 24.887 24.468 23.952 23.239 20.867 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt deleted file mode 100644 index a413ddc6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3268 ,KEBNE ,16749540,Wed Dec 1 16:28:15 CET,Wed Dec 1 18:20:22 CET,0.0 2.005 2.812 3.425 3.948 4.399 4.803 5.178 5.868 6.197 6.503 6.815 7.335 7.591 8.044 8.451 8.839 9.029 9.384 9.732 10.27 10.619 10.947 11.419 11.861 12.275 12.701 13.131 13.678 14.187 14.679 15.291 15.903 16.479 17.121 17.867 18.589 19.368 20.174 21.026 21.921 22.878 23.948 24.993 26.235 27.556 29.069 30.785 32.582 34.542 36.695 37.945 38.224 38.078 37.732 37.304 36.818 36.346 35.919 35.409 34.934 34.518 34.096 33.674 33.254 32.834 32.401 31.978 31.575 31.181 30.775 30.437 30.083 29.707 29.42 29.119 28.811 28.495 28.183 27.97 27.729 27.334 27.057 26.77 26.626 26.338 26.035 25.685 25.488 25.049 24.864 24.629 24.387 23.871 23.587 23.273 22.921 22.515 22.018 21.304 19.071 -2 ,19756 ,KEBNE ,16749541,Wed Dec 1 16:28:16 CET,Wed Dec 1 18:22:23 CET,0.0 2.671 3.391 3.919 4.395 4.81 5.167 5.495 6.107 6.411 6.697 6.934 7.429 7.671 8.119 8.525 8.914 9.102 9.467 9.824 10.346 10.688 11.015 11.498 11.99 12.45 12.881 13.302 13.834 14.356 14.867 15.462 16.056 16.646 17.309 18.033 18.714 19.457 20.259 21.105 21.966 22.944 24.09 25.171 26.351 27.653 29.175 30.883 32.87 35.119 37.538 38.974 39.371 39.344 39.073 38.621 38.126 37.626 37.136 36.608 36.115 35.642 35.23 34.837 34.449 34.087 33.689 33.342 33.032 32.682 32.315 32.007 31.666 31.287 30.97 30.637 30.305 29.956 29.581 29.331 29.074 28.649 28.347 28.032 27.861 27.499 27.121 26.712 26.482 26.004 25.779 25.548 25.287 24.694 24.378 24.034 23.658 23.21 22.662 21.871 18.99 -3 ,8558 ,KEBNE ,16749542,Wed Dec 1 16:28:16 CET,Wed Dec 1 18:22:43 CET,0.0 2.707 3.401 3.919 4.351 4.741 5.111 5.48 6.155 6.461 6.761 7.097 7.634 7.911 8.41 8.867 9.317 9.537 9.948 10.311 10.829 11.156 11.478 11.95 12.402 12.837 13.246 13.638 14.149 14.65 15.147 15.752 16.319 16.852 17.469 18.169 18.82 19.514 20.27 21.115 22.053 23.05 24.189 25.367 26.69 28.073 29.609 31.404 33.403 35.532 37.577 38.683 39.022 38.948 38.605 38.119 37.612 37.109 36.612 36.069 35.605 35.171 34.719 34.269 33.841 33.428 32.995 32.608 32.256 31.878 31.475 31.139 30.78 30.398 30.115 29.828 29.514 29.194 28.853 28.601 28.334 27.928 27.647 27.354 27.208 26.893 26.549 26.16 25.96 25.501 25.275 25.027 24.761 24.24 23.951 23.6 23.197 22.726 22.125 21.282 18.949 -4 ,1808 ,KEBNE ,16749543,Wed Dec 1 16:40:49 CET,Wed Dec 1 18:34:51 CET,0.0 2.587 3.283 3.802 4.257 4.676 5.052 5.41 6.075 6.365 6.639 6.895 7.389 7.614 8.028 8.423 8.807 8.991 9.357 9.72 10.239 10.575 10.91 11.382 11.827 12.255 12.673 13.073 13.584 14.1 14.586 15.158 15.699 16.25 16.918 17.608 18.27 19.014 19.797 20.652 21.568 22.535 23.653 24.812 26.172 27.65 29.268 30.999 32.946 35.092 37.237 38.584 39.054 39.116 38.925 38.6 38.243 37.819 37.317 36.756 36.297 35.86 35.399 34.937 34.517 34.119 33.694 33.331 33.007 32.651 32.261 31.933 31.596 31.239 30.959 30.663 30.347 30.003 29.644 29.393 29.129 28.719 28.419 28.098 27.93 27.598 27.243 26.847 26.631 26.162 25.945 25.7 25.454 24.902 24.583 24.246 23.858 23.407 22.879 22.199 20.034 -5 ,13704 ,KEBNE ,16749544,Wed Dec 1 16:40:49 CET,Wed Dec 1 18:34:04 CET,0.0 3.806 4.602 5.188 5.645 6.055 6.442 6.792 7.427 7.714 7.987 8.258 8.769 9.004 9.441 9.851 10.254 10.448 10.809 11.155 11.659 11.989 12.324 12.835 13.288 13.671 14.056 14.433 14.924 15.398 15.864 16.427 16.936 17.434 18.026 18.687 19.302 19.972 20.719 21.501 22.317 23.241 24.315 25.384 26.572 27.886 29.437 31.142 33.07 35.218 37.459 38.809 39.351 39.401 39.148 38.737 38.249 37.735 37.266 36.789 36.346 35.925 35.504 35.084 34.671 34.276 33.859 33.481 33.131 32.74 32.324 31.985 31.643 31.301 31.036 30.733 30.409 30.09 29.777 29.558 29.321 28.954 28.674 28.361 28.208 27.897 27.55 27.176 26.983 26.535 26.347 26.118 25.879 25.337 25.031 24.713 24.363 23.965 23.427 22.734 20.441 -6 ,30614 ,KEBNE ,16749545,Wed Dec 1 16:40:50 CET,Wed Dec 1 18:33:25 CET,0.0 2.804 3.531 4.079 4.543 4.963 5.346 5.717 6.358 6.639 6.918 7.185 7.667 7.89 8.324 8.742 9.146 9.339 9.703 10.046 10.548 10.891 11.224 11.698 12.158 12.61 13.044 13.446 13.971 14.478 14.958 15.529 16.038 16.526 17.127 17.803 18.454 19.178 19.947 20.752 21.579 22.482 23.519 24.56 25.784 27.152 28.679 30.374 32.282 34.355 36.442 37.55 37.836 37.702 37.308 36.845 36.417 35.993 35.576 35.098 34.624 34.181 33.75 33.287 32.825 32.415 31.994 31.618 31.272 30.879 30.48 30.159 29.813 29.447 29.158 28.842 28.504 28.149 27.786 27.537 27.28 26.874 26.585 26.29 26.138 25.818 25.477 25.11 24.923 24.487 24.34 24.135 23.899 23.356 23.053 22.74 22.391 21.968 21.493 20.855 18.244 -7 ,23907 ,KEBNE ,16749546,Wed Dec 1 16:40:50 CET,Wed Dec 1 18:34:19 CET,0.0 5.421 6.362 6.97 7.442 7.865 8.258 8.627 9.348 9.676 9.979 10.295 10.809 11.065 11.573 12.065 12.514 12.735 13.174 13.579 14.154 14.501 14.833 15.317 15.78 16.217 16.627 17.031 17.566 18.06 18.537 19.152 19.769 20.358 21.001 21.694 22.356 23.084 23.839 24.629 25.449 26.364 27.408 28.423 29.597 30.894 32.342 33.964 35.776 37.7 39.854 41.307 41.73 41.63 41.245 40.754 40.251 39.725 39.233 38.712 38.188 37.698 37.222 36.746 36.282 35.86 35.418 34.996 34.631 34.266 33.869 33.541 33.185 32.808 32.532 32.236 31.918 31.593 31.253 31.016 30.766 30.362 30.08 29.786 29.623 29.273 28.911 28.52 28.317 27.865 27.653 27.391 27.119 26.551 26.226 25.883 25.484 25.02 24.477 23.738 22.032 -8 ,32280 ,KEBNE ,16749547,Wed Dec 1 16:40:49 CET,Wed Dec 1 18:34:09 CET,0.0 3.521 4.263 4.834 5.31 5.724 6.107 6.456 7.082 7.37 7.643 7.91 8.424 8.669 9.128 9.547 9.941 10.132 10.495 10.838 11.339 11.667 11.996 12.478 12.956 13.418 13.85 14.273 14.79 15.264 15.755 16.358 16.926 17.504 18.201 18.978 19.677 20.417 21.223 22.046 22.925 23.923 25.038 26.135 27.392 28.774 30.356 32.079 33.9 35.922 38.002 39.105 39.326 39.167 38.83 38.351 37.778 37.167 36.632 36.086 35.545 35.037 34.572 34.108 33.641 33.208 32.782 32.396 32.038 31.635 31.2 30.862 30.517 30.141 29.825 29.486 29.13 28.773 28.403 28.138 27.86 27.419 27.129 26.833 26.67 26.329 25.987 25.628 25.425 24.955 24.717 24.455 24.196 23.659 23.355 23.02 22.639 22.207 21.724 21.106 19.449 -9 ,227 ,KEBNE ,16749548,Wed Dec 1 16:40:49 CET,Wed Dec 1 18:33:42 CET,0.0 2.167 2.955 3.57 4.111 4.599 5.032 5.412 6.085 6.392 6.68 6.958 7.467 7.711 8.173 8.605 9.017 9.22 9.603 9.959 10.468 10.801 11.13 11.613 12.075 12.519 12.953 13.371 13.882 14.376 14.879 15.487 16.053 16.587 17.209 17.905 18.597 19.394 20.227 21.08 21.902 22.781 23.852 24.914 26.209 27.691 29.339 31.174 33.158 35.258 37.269 38.223 38.337 38.126 37.787 37.343 36.883 36.378 35.894 35.369 34.876 34.424 33.966 33.51 33.077 32.67 32.228 31.829 31.467 31.081 30.67 30.323 29.963 29.567 29.257 28.94 28.617 28.282 27.922 27.672 27.414 26.999 26.701 26.395 26.231 25.885 25.533 25.172 24.984 24.55 24.391 24.164 23.914 23.362 23.048 22.698 22.336 21.928 21.432 20.774 19.108 -10 ,5641 ,KEBNE ,16749549,Wed Dec 1 16:40:49 CET,Wed Dec 1 18:32:52 CET,0.0 2.501 3.51 4.263 4.863 5.333 5.709 6.033 6.647 6.934 7.199 7.427 7.919 8.147 8.581 8.985 9.382 9.583 9.949 10.279 10.768 11.104 11.441 11.934 12.412 12.858 13.273 13.687 14.221 14.734 15.232 15.818 16.38 16.933 17.587 18.331 19.047 19.822 20.642 21.503 22.397 23.388 24.558 25.723 27.059 28.476 30.087 31.84 33.793 35.948 38.084 39.417 39.804 39.825 39.672 39.34 38.974 38.522 38.019 37.469 36.985 36.539 36.075 35.599 35.13 34.68 34.202 33.775 33.388 33.002 32.626 32.299 31.936 31.546 31.243 30.941 30.621 30.285 29.928 29.673 29.415 29.007 28.698 28.371 28.214 27.906 27.595 27.251 27.057 26.606 26.39 26.148 25.889 25.337 25.03 24.662 24.233 23.753 23.193 22.417 20.003 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index 4c383b02..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,380 ,KEBNE ,17028262,Wed Dec 22 19:31:04 CET,Wed Dec 22 21:21:15 CET,0.0 1.101 1.621 2.051 2.432 2.782 3.103 3.408 3.958 4.22 4.485 4.739 5.224 5.443 5.872 6.308 6.734 6.945 7.367 7.762 8.34 8.722 9.092 9.633 10.172 10.689 11.189 11.674 12.305 12.937 13.565 14.343 15.091 15.816 16.672 17.661 18.629 19.721 20.924 22.209 23.594 25.202 27.157 29.166 31.544 34.338 37.696 41.611 46.366 52.248 59.886 66.719 71.079 74.114 76.246 77.821 78.985 79.85 80.477 81.034 81.444 81.743 81.964 82.115 82.203 82.278 82.375 82.445 82.458 82.415 82.371 82.331 82.24 82.132 82.049 81.956 81.842 81.686 81.497 81.35 81.2 80.98 80.812 80.594 80.471 80.202 79.923 79.634 79.47 79.139 78.984 78.786 78.555 78.028 77.727 77.383 76.975 76.512 75.904 75.104 72.486 -2 ,4547 ,KEBNE ,17028263,Wed Dec 22 19:31:02 CET,Wed Dec 22 21:20:56 CET,0.0 1.189 1.756 2.213 2.597 2.927 3.234 3.537 4.118 4.402 4.669 4.903 5.401 5.635 6.086 6.52 6.942 7.149 7.555 7.951 8.522 8.894 9.245 9.742 10.24 10.75 11.258 11.767 12.427 13.057 13.666 14.425 15.181 15.929 16.816 17.803 18.757 19.835 21.028 22.322 23.735 25.378 27.316 29.331 31.77 34.599 38.001 42.014 46.972 53.101 60.901 67.911 72.461 75.623 77.876 79.546 80.736 81.663 82.369 82.983 83.447 83.791 84.071 84.291 84.432 84.511 84.572 84.583 84.551 84.503 84.41 84.303 84.178 84.016 83.882 83.75 83.613 83.458 83.263 83.113 82.953 82.672 82.478 82.273 82.161 81.93 81.687 81.385 81.196 80.822 80.583 80.366 80.137 79.635 79.35 79.035 78.682 78.227 77.648 76.883 74.271 -3 ,15038 ,KEBNE ,17028264,Wed Dec 22 19:31:02 CET,Wed Dec 22 21:21:37 CET,0.0 1.127 1.639 2.052 2.418 2.765 3.084 3.375 3.904 4.164 4.432 4.685 5.17 5.393 5.82 6.234 6.632 6.832 7.239 7.637 8.201 8.564 8.929 9.474 10.015 10.531 11.032 11.536 12.189 12.828 13.45 14.224 14.994 15.733 16.578 17.549 18.519 19.608 20.811 22.123 23.524 25.128 27.066 29.087 31.476 34.222 37.525 41.432 46.301 52.381 60.217 67.294 71.719 74.685 76.802 78.322 79.419 80.226 80.809 81.289 81.639 81.924 82.153 82.308 82.364 82.388 82.399 82.382 82.341 82.256 82.155 82.067 81.941 81.796 81.677 81.54 81.379 81.195 80.997 80.849 80.7 80.428 80.211 80.001 79.893 79.646 79.364 79.027 78.847 78.496 78.262 78.042 77.797 77.222 76.906 76.577 76.199 75.734 75.177 74.366 72.311 -4 ,8766 ,KEBNE ,17028265,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:22:31 CET,0.0 1.343 1.971 2.469 2.902 3.285 3.652 3.998 4.62 4.893 5.155 5.428 5.938 6.168 6.606 7.04 7.484 7.698 8.11 8.51 9.107 9.505 9.881 10.43 10.967 11.48 11.995 12.5 13.149 13.788 14.404 15.147 15.892 16.636 17.514 18.532 19.516 20.6 21.802 23.122 24.562 26.202 28.134 30.165 32.617 35.438 38.823 42.817 47.779 53.973 61.85 68.798 73.128 76.08 78.186 79.731 80.825 81.65 82.249 82.729 83.051 83.27 83.438 83.551 83.628 83.667 83.677 83.662 83.631 83.589 83.527 83.435 83.319 83.209 83.112 82.993 82.857 82.698 82.516 82.398 82.281 82.074 81.915 81.705 81.586 81.343 81.081 80.796 80.634 80.289 80.072 79.86 79.637 79.124 78.852 78.531 78.125 77.651 77.117 76.399 74.523 -5 ,16973 ,KEBNE ,17028266,Wed Dec 22 19:31:04 CET,Wed Dec 22 21:21:59 CET,0.0 1.383 1.908 2.343 2.744 3.101 3.435 3.78 4.387 4.654 4.917 5.155 5.653 5.884 6.329 6.768 7.193 7.399 7.814 8.227 8.812 9.191 9.57 10.115 10.648 11.174 11.677 12.164 12.815 13.458 14.085 14.851 15.595 16.327 17.206 18.227 19.222 20.361 21.633 22.985 24.41 26.049 28.038 30.126 32.582 35.345 38.733 42.727 47.573 53.597 61.436 68.484 72.862 75.834 77.95 79.59 80.808 81.671 82.268 82.779 83.159 83.453 83.712 83.877 83.946 84.011 84.095 84.15 84.172 84.154 84.104 84.06 83.97 83.848 83.771 83.692 83.598 83.461 83.282 83.152 83.029 82.836 82.676 82.469 82.352 82.076 81.772 81.461 81.305 80.973 80.761 80.559 80.353 79.901 79.62 79.309 78.9 78.386 77.785 76.985 74.645 -6 ,15747 ,KEBNE ,17028267,Wed Dec 22 19:31:02 CET,Wed Dec 22 21:22:11 CET,0.0 1.436 1.97 2.397 2.779 3.145 3.489 3.813 4.383 4.661 4.94 5.206 5.716 5.949 6.403 6.839 7.274 7.493 7.92 8.333 8.945 9.341 9.725 10.286 10.831 11.368 11.888 12.394 13.048 13.68 14.303 15.074 15.823 16.554 17.434 18.443 19.416 20.504 21.712 23.014 24.416 26.062 28.015 30.017 32.438 35.256 38.581 42.395 47.111 53.116 61.036 68.188 72.759 75.94 78.15 79.742 80.898 81.794 82.449 83.008 83.429 83.727 83.965 84.164 84.298 84.401 84.506 84.573 84.59 84.535 84.432 84.346 84.247 84.124 84.027 83.936 83.842 83.689 83.46 83.3 83.136 82.871 82.667 82.436 82.315 82.066 81.803 81.511 81.342 80.986 80.78 80.579 80.362 79.878 79.585 79.252 78.893 78.471 77.936 77.202 75.71 -7 ,19090 ,KEBNE ,17028268,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:21:55 CET,0.0 1.173 1.7 2.14 2.543 2.912 3.241 3.556 4.139 4.412 4.676 4.918 5.411 5.644 6.101 6.544 6.977 7.187 7.594 7.989 8.569 8.947 9.322 9.872 10.398 10.916 11.427 11.934 12.605 13.258 13.896 14.669 15.415 16.148 17.032 18.059 19.065 20.193 21.429 22.761 24.174 25.801 27.782 29.824 32.283 35.111 38.475 42.449 47.37 53.478 61.192 68.061 72.431 75.442 77.529 79.02 80.198 81.105 81.704 82.218 82.603 82.909 83.141 83.292 83.411 83.493 83.543 83.546 83.51 83.445 83.368 83.294 83.199 83.093 82.986 82.86 82.727 82.598 82.458 82.346 82.218 81.953 81.741 81.515 81.398 81.13 80.833 80.551 80.406 80.094 79.955 79.784 79.561 79.022 78.717 78.373 77.997 77.589 77.051 76.268 73.97 -8 ,19041 ,KEBNE ,17028269,Wed Dec 22 19:31:04 CET,Wed Dec 22 21:21:50 CET,0.0 1.128 1.606 1.997 2.359 2.705 3.023 3.319 3.86 4.121 4.388 4.638 5.134 5.381 5.861 6.311 6.721 6.922 7.316 7.697 8.288 8.686 9.066 9.611 10.125 10.635 11.14 11.616 12.232 12.843 13.461 14.222 14.969 15.712 16.57 17.557 18.55 19.666 20.877 22.189 23.616 25.248 27.196 29.236 31.703 34.557 37.978 41.948 46.824 52.902 60.796 68.097 72.697 75.851 78.124 79.84 81.098 82.049 82.773 83.348 83.722 83.998 84.202 84.328 84.4 84.437 84.421 84.402 84.381 84.335 84.275 84.183 84.054 83.927 83.839 83.728 83.59 83.432 83.253 83.126 82.998 82.792 82.639 82.473 82.375 82.147 81.908 81.654 81.519 81.207 81.044 80.846 80.637 80.174 79.901 79.61 79.284 78.873 78.324 77.583 75.739 -9 ,20610 ,KEBNE ,17028270,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:21:47 CET,0.0 1.227 1.809 2.259 2.631 2.953 3.257 3.557 4.141 4.41 4.657 4.907 5.405 5.647 6.123 6.576 7.006 7.21 7.61 7.993 8.543 8.908 9.272 9.814 10.352 10.883 11.394 11.896 12.551 13.189 13.81 14.564 15.304 16.04 16.922 17.92 18.887 19.975 21.17 22.46 23.86 25.48 27.407 29.449 31.922 34.741 38.094 42.029 46.816 52.77 60.577 67.727 72.344 75.503 77.775 79.501 80.783 81.802 82.55 83.152 83.591 83.903 84.141 84.291 84.352 84.412 84.485 84.534 84.564 84.55 84.488 84.406 84.305 84.199 84.116 84.021 83.895 83.756 83.617 83.506 83.378 83.188 83.047 82.889 82.8 82.587 82.347 82.087 81.947 81.631 81.501 81.336 81.137 80.687 80.415 80.093 79.725 79.287 78.745 77.98 75.185 -10 ,6149 ,KEBNE ,17028271,Wed Dec 22 19:31:02 CET,Wed Dec 22 21:22:19 CET,0.0 1.163 1.737 2.196 2.579 2.917 3.212 3.496 4.045 4.305 4.545 4.758 5.244 5.48 5.938 6.372 6.78 6.976 7.375 7.765 8.33 8.693 9.043 9.571 10.096 10.608 11.115 11.622 12.286 12.93 13.557 14.324 15.079 15.82 16.674 17.653 18.622 19.707 20.902 22.215 23.636 25.281 27.257 29.262 31.635 34.431 37.822 41.835 46.726 52.781 60.638 67.814 72.527 75.666 77.814 79.422 80.604 81.499 82.195 82.817 83.221 83.486 83.667 83.79 83.862 83.877 83.851 83.813 83.775 83.728 83.666 83.594 83.485 83.349 83.243 83.121 82.985 82.837 82.658 82.509 82.343 82.099 81.918 81.701 81.58 81.328 81.059 80.768 80.612 80.268 80.087 79.897 79.675 79.159 78.863 78.532 78.166 77.724 77.188 76.475 73.752 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 56fc3b91..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9984 ,KEBNE ,16749550,Wed Dec 1 16:40:49 CET,Wed Dec 1 18:31:38 CET,0.0 1.207 1.699 2.115 2.505 2.846 3.153 3.442 3.972 4.225 4.467 4.661 5.13 5.347 5.775 6.18 6.57 6.757 7.121 7.482 8.027 8.38 8.721 9.226 9.708 10.187 10.652 11.093 11.683 12.273 12.85 13.557 14.257 14.942 15.725 16.595 17.46 18.457 19.572 20.755 21.976 23.398 25.115 26.901 29.053 31.532 34.524 38.023 42.225 47.229 53.537 59.161 62.626 64.902 66.439 67.49 68.215 68.723 69.04 69.285 69.451 69.585 69.66 69.651 69.634 69.599 69.528 69.442 69.341 69.23 69.105 69.002 68.856 68.666 68.518 68.367 68.211 68.026 67.807 67.64 67.465 67.188 66.984 66.743 66.591 66.243 65.878 65.518 65.348 65.001 64.837 64.619 64.39 63.893 63.604 63.274 62.863 62.362 61.733 60.823 58.754 -2 ,18831 ,KEBNE ,16749551,Wed Dec 1 16:40:49 CET,Wed Dec 1 18:31:02 CET,0.0 1.357 1.972 2.51 2.951 3.344 3.707 4.038 4.646 4.933 5.206 5.453 5.957 6.197 6.652 7.099 7.529 7.741 8.154 8.535 9.07 9.433 9.781 10.274 10.77 11.252 11.726 12.18 12.765 13.348 13.915 14.627 15.318 15.957 16.678 17.504 18.33 19.284 20.355 21.513 22.744 24.152 25.809 27.491 29.515 31.874 34.669 37.918 41.848 46.742 53.108 58.681 62.179 64.583 66.273 67.5 68.355 68.945 69.339 69.608 69.779 69.892 69.956 69.989 69.966 69.915 69.848 69.776 69.704 69.621 69.526 69.41 69.271 69.113 68.978 68.844 68.683 68.486 68.266 68.109 67.955 67.71 67.52 67.315 67.208 66.974 66.709 66.413 66.257 65.91 65.747 65.542 65.32 64.838 64.562 64.228 63.816 63.338 62.76 61.94 59.204 -3 ,15764 ,KEBNE ,16749552,Wed Dec 1 16:40:50 CET,Wed Dec 1 18:31:20 CET,0.0 1.146 1.685 2.136 2.521 2.89 3.254 3.565 4.109 4.368 4.61 4.814 5.302 5.532 5.977 6.384 6.775 6.962 7.316 7.659 8.151 8.485 8.817 9.298 9.765 10.225 10.686 11.128 11.703 12.268 12.82 13.508 14.182 14.831 15.584 16.448 17.301 18.258 19.32 20.474 21.693 23.08 24.76 26.504 28.54 30.856 33.685 37.094 41.39 46.702 53.279 59.143 62.888 65.411 67.11 68.314 69.16 69.812 70.285 70.659 70.894 71.046 71.147 71.17 71.149 71.081 70.977 70.853 70.712 70.556 70.382 70.227 70.032 69.816 69.656 69.473 69.278 69.068 68.844 68.693 68.522 68.232 68.009 67.753 67.615 67.34 67.054 66.717 66.536 66.155 65.904 65.683 65.462 64.952 64.648 64.298 63.928 63.481 62.921 62.127 59.894 -4 ,1685 ,KEBNE ,16749553,Wed Dec 1 16:41:54 CET,Wed Dec 1 18:32:49 CET,0.0 1.109 1.651 2.092 2.475 2.806 3.09 3.361 3.864 4.106 4.349 4.569 5.058 5.277 5.674 6.059 6.438 6.627 6.99 7.334 7.844 8.177 8.503 8.993 9.488 9.963 10.43 10.89 11.481 12.076 12.657 13.35 14.029 14.693 15.449 16.294 17.128 18.081 19.155 20.33 21.583 23.014 24.695 26.39 28.445 30.794 33.559 36.855 40.819 45.763 52.289 57.888 61.297 63.662 65.296 66.429 67.216 67.785 68.147 68.392 68.535 68.6 68.603 68.564 68.503 68.416 68.3 68.186 68.065 67.929 67.776 67.625 67.452 67.283 67.144 66.978 66.788 66.59 66.405 66.267 66.099 65.773 65.515 65.259 65.127 64.819 64.499 64.176 63.994 63.612 63.401 63.182 62.951 62.418 62.097 61.751 61.373 60.931 60.358 59.511 56.625 -5 ,4543 ,KEBNE ,16749554,Wed Dec 1 16:41:54 CET,Wed Dec 1 18:32:47 CET,0.0 1.095 1.626 2.031 2.379 2.703 3.0 3.284 3.812 4.063 4.306 4.51 4.987 5.206 5.638 6.06 6.457 6.652 7.021 7.379 7.918 8.261 8.594 9.073 9.548 10.026 10.489 10.938 11.525 12.106 12.676 13.379 14.069 14.737 15.519 16.414 17.3 18.28 19.348 20.54 21.812 23.269 25.007 26.776 28.927 31.435 34.412 37.874 42.187 47.539 54.315 60.278 63.883 66.214 67.791 68.973 69.86 70.487 70.907 71.235 71.464 71.604 71.632 71.605 71.589 71.567 71.489 71.377 71.259 71.118 70.974 70.855 70.721 70.557 70.415 70.258 70.094 69.92 69.711 69.558 69.395 69.101 68.876 68.638 68.52 68.284 68.017 67.732 67.587 67.232 67.042 66.853 66.648 66.191 65.944 65.665 65.341 64.925 64.363 63.59 61.386 -6 ,1640 ,KEBNE ,16749555,Wed Dec 1 16:41:54 CET,Wed Dec 1 18:32:17 CET,0.0 1.137 1.664 2.115 2.523 2.861 3.169 3.474 4.027 4.285 4.544 4.782 5.274 5.495 5.933 6.366 6.774 6.966 7.346 7.711 8.224 8.563 8.91 9.415 9.899 10.381 10.862 11.332 11.937 12.513 13.063 13.739 14.412 15.084 15.881 16.781 17.658 18.657 19.769 20.976 22.255 23.691 25.422 27.226 29.35 31.84 34.773 38.171 42.338 47.37 53.883 59.72 63.425 65.944 67.702 68.907 69.722 70.335 70.751 71.042 71.208 71.292 71.321 71.324 71.292 71.226 71.121 71.015 70.91 70.782 70.641 70.519 70.38 70.219 70.078 69.879 69.669 69.482 69.288 69.162 69.013 68.742 68.552 68.351 68.234 67.981 67.736 67.471 67.322 66.956 66.711 66.499 66.287 65.79 65.505 65.182 64.806 64.367 63.838 63.064 59.96 -7 ,18197 ,KEBNE ,16749556,Wed Dec 1 16:48:12 CET,Wed Dec 1 18:38:32 CET,0.0 1.285 1.806 2.235 2.626 2.962 3.305 3.628 4.2 4.466 4.711 4.921 5.398 5.612 6.032 6.448 6.857 7.06 7.456 7.833 8.366 8.712 9.055 9.556 10.043 10.523 10.992 11.448 12.034 12.62 13.207 13.932 14.637 15.304 16.093 17.008 17.886 18.87 19.96 21.123 22.37 23.792 25.509 27.287 29.423 31.888 34.777 38.168 42.259 47.352 54.03 59.848 63.487 65.936 67.662 68.919 69.794 70.411 70.828 71.162 71.415 71.594 71.701 71.779 71.806 71.787 71.737 71.684 71.63 71.543 71.429 71.335 71.22 71.065 70.943 70.811 70.669 70.504 70.304 70.167 70.024 69.77 69.594 69.403 69.297 69.097 68.878 68.622 68.489 68.16 67.991 67.806 67.61 67.143 66.863 66.545 66.202 65.759 65.198 64.428 61.619 -8 ,16632 ,KEBNE ,16749557,Wed Dec 1 16:48:12 CET,Wed Dec 1 18:40:00 CET,0.0 1.24 1.77 2.17 2.545 2.877 3.178 3.462 3.999 4.26 4.505 4.732 5.214 5.437 5.877 6.279 6.653 6.835 7.192 7.541 8.047 8.384 8.726 9.222 9.703 10.183 10.645 11.099 11.696 12.278 12.85 13.551 14.235 14.906 15.697 16.602 17.491 18.462 19.525 20.714 21.992 23.431 25.17 26.984 29.142 31.666 34.615 38.007 42.066 46.978 53.41 59.115 62.572 64.742 66.064 66.96 67.606 68.106 68.447 68.652 68.772 68.832 68.834 68.798 68.709 68.612 68.511 68.384 68.265 68.135 67.974 67.814 67.625 67.443 67.284 67.09 66.893 66.685 66.452 66.281 66.079 65.754 65.53 65.312 65.205 64.967 64.709 64.427 64.27 63.931 63.8 63.615 63.402 62.911 62.632 62.317 61.929 61.464 60.941 60.233 57.715 -9 ,32293 ,KEBNE ,16749558,Wed Dec 1 16:48:12 CET,Wed Dec 1 18:41:07 CET,0.0 1.39 1.977 2.442 2.861 3.228 3.564 3.877 4.479 4.762 5.008 5.216 5.699 5.923 6.344 6.759 7.151 7.335 7.7 8.067 8.605 8.951 9.287 9.782 10.258 10.716 11.176 11.638 12.24 12.834 13.417 14.129 14.824 15.497 16.266 17.135 17.981 18.944 20.036 21.244 22.532 23.998 25.728 27.472 29.527 31.875 34.742 38.185 42.354 47.402 53.813 59.325 62.764 65.142 66.829 68.007 68.752 69.249 69.561 69.767 69.883 69.933 69.924 69.886 69.826 69.739 69.61 69.468 69.325 69.169 69.001 68.837 68.661 68.446 68.246 68.05 67.856 67.653 67.425 67.257 67.077 66.753 66.526 66.298 66.184 65.954 65.686 65.394 65.23 64.866 64.68 64.468 64.252 63.792 63.491 63.141 62.757 62.316 61.766 60.979 58.42 -10 ,18228 ,KEBNE ,16749559,Wed Dec 1 16:48:13 CET,Wed Dec 1 18:56:09 CET,0.0 1.587 2.229 2.701 3.085 3.452 3.8 4.121 4.72 4.991 5.249 5.472 5.956 6.179 6.604 7.016 7.423 7.613 7.986 8.356 8.883 9.226 9.567 10.076 10.569 11.043 11.501 11.943 12.523 13.106 13.693 14.403 15.094 15.769 16.566 17.483 18.372 19.358 20.448 21.637 22.914 24.426 26.232 28.069 30.251 32.752 35.733 39.193 43.402 48.49 55.01 60.708 64.097 66.327 67.856 68.969 69.731 70.214 70.505 70.699 70.819 70.884 70.89 70.888 70.862 70.794 70.683 70.57 70.423 70.237 70.07 69.916 69.718 69.497 69.338 69.167 68.968 68.741 68.493 68.32 68.14 67.846 67.62 67.37 67.233 66.941 66.641 66.323 66.153 65.783 65.575 65.345 65.076 64.494 64.19 63.867 63.499 63.052 62.526 61.778 59.859 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 8c872520..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11040 ,KEBNE ,16749560,Wed Dec 1 16:48:13 CET,Wed Dec 1 18:41:02 CET,0.0 0.992 1.512 1.922 2.271 2.609 2.913 3.179 3.69 3.921 4.142 4.321 4.783 4.988 5.376 5.74 6.109 6.29 6.638 6.975 7.469 7.792 8.118 8.598 9.055 9.505 9.964 10.424 11.027 11.623 12.203 12.899 13.567 14.222 15.008 15.918 16.816 17.821 18.893 20.056 21.282 22.626 24.225 25.855 27.78 30.034 32.724 35.846 39.663 44.358 50.443 55.841 59.189 61.444 63.014 64.176 64.974 65.545 65.965 66.305 66.527 66.682 66.811 66.881 66.891 66.878 66.836 66.77 66.706 66.624 66.516 66.416 66.295 66.148 66.013 65.871 65.699 65.509 65.329 65.203 65.067 64.826 64.645 64.459 64.356 64.142 63.923 63.658 63.516 63.193 63.07 62.893 62.7 62.253 62.01 61.752 61.438 61.025 60.524 59.821 57.924 -2 ,18052 ,KEBNE ,16749561,Wed Dec 1 16:48:11 CET,Wed Dec 1 18:41:00 CET,0.0 1.032 1.531 1.959 2.324 2.639 2.921 3.195 3.721 3.96 4.194 4.397 4.879 5.088 5.493 5.887 6.264 6.445 6.802 7.147 7.642 7.961 8.274 8.741 9.184 9.614 10.043 10.462 11.008 11.541 12.065 12.698 13.313 13.914 14.626 15.443 16.245 17.144 18.144 19.236 20.403 21.757 23.362 25.001 26.937 29.173 31.881 35.049 38.862 43.541 49.59 55.042 58.435 60.719 62.274 63.4 64.244 64.869 65.319 65.672 65.889 66.029 66.135 66.162 66.146 66.111 66.033 65.955 65.872 65.751 65.611 65.486 65.337 65.181 65.046 64.888 64.711 64.524 64.339 64.197 64.035 63.766 63.569 63.372 63.27 63.032 62.764 62.47 62.301 61.935 61.704 61.463 61.207 60.628 60.273 59.887 59.475 59.005 58.409 57.586 55.581 -3 ,5092 ,KEBNE ,16749562,Wed Dec 1 16:48:11 CET,Wed Dec 1 18:40:55 CET,0.0 1.108 1.578 1.977 2.352 2.686 2.993 3.285 3.84 4.102 4.353 4.589 5.071 5.284 5.696 6.098 6.479 6.662 7.014 7.348 7.831 8.156 8.48 8.951 9.411 9.854 10.278 10.692 11.243 11.779 12.303 12.968 13.613 14.236 14.97 15.797 16.605 17.529 18.549 19.633 20.78 22.116 23.717 25.337 27.27 29.48 32.098 35.233 39.125 43.886 49.837 54.916 58.088 60.303 61.831 62.85 63.538 64.041 64.391 64.663 64.82 64.913 64.968 64.959 64.896 64.824 64.717 64.601 64.484 64.308 64.12 63.964 63.778 63.585 63.423 63.228 63.005 62.771 62.504 62.306 62.101 61.774 61.539 61.291 61.163 60.878 60.57 60.233 60.049 59.678 59.476 59.257 59.025 58.461 58.137 57.796 57.425 57.016 56.446 55.706 53.754 -4 ,4365 ,KEBNE ,16749563,Wed Dec 1 16:48:11 CET,Wed Dec 1 18:42:17 CET,0.0 1.135 1.629 2.016 2.354 2.678 2.99 3.267 3.754 3.986 4.228 4.433 4.909 5.119 5.506 5.871 6.224 6.409 6.77 7.125 7.651 7.978 8.291 8.739 9.185 9.627 10.056 10.483 11.044 11.578 12.1 12.742 13.374 13.988 14.697 15.518 16.322 17.219 18.222 19.327 20.483 21.79 23.379 25.018 26.95 29.175 31.863 34.971 38.742 43.509 49.549 54.851 58.119 60.353 62.021 63.203 64.012 64.614 65.063 65.437 65.69 65.856 65.962 66.014 66.026 66.03 66.018 65.977 65.929 65.868 65.777 65.682 65.572 65.436 65.323 65.199 65.069 64.937 64.78 64.66 64.544 64.349 64.186 64.007 63.91 63.656 63.335 62.974 62.777 62.395 62.168 61.951 61.705 61.108 60.765 60.408 60.007 59.523 58.89 58.038 55.895 -5 ,25283 ,KEBNE ,16749564,Wed Dec 1 16:54:29 CET,Wed Dec 1 18:46:30 CET,0.0 1.174 1.677 2.056 2.392 2.708 3.012 3.311 3.845 4.092 4.335 4.518 4.982 5.188 5.6 5.997 6.363 6.537 6.877 7.222 7.717 8.038 8.363 8.829 9.267 9.699 10.127 10.542 11.075 11.602 12.124 12.76 13.389 14.018 14.748 15.565 16.387 17.322 18.323 19.387 20.519 21.813 23.385 25.023 26.957 29.172 31.83 34.968 38.855 43.65 49.841 55.353 58.785 61.099 62.707 63.867 64.668 65.284 65.742 66.095 66.326 66.503 66.626 66.677 66.705 66.707 66.686 66.649 66.606 66.53 66.402 66.282 66.172 66.058 65.933 65.786 65.644 65.47 65.256 65.112 64.954 64.682 64.494 64.265 64.14 63.925 63.703 63.429 63.266 62.913 62.718 62.503 62.279 61.776 61.492 61.161 60.794 60.37 59.855 59.149 56.586 -6 ,1576 ,KEBNE ,16749565,Wed Dec 1 16:54:30 CET,Wed Dec 1 18:47:13 CET,0.0 1.158 1.685 2.097 2.458 2.771 3.051 3.318 3.823 4.066 4.301 4.48 4.931 5.135 5.554 5.942 6.311 6.497 6.859 7.208 7.717 8.052 8.374 8.842 9.308 9.763 10.214 10.655 11.223 11.791 12.331 12.961 13.574 14.189 14.911 15.727 16.533 17.431 18.424 19.511 20.661 21.983 23.578 25.219 27.202 29.468 32.144 35.26 39.037 43.732 49.721 55.061 58.558 60.97 62.631 63.87 64.756 65.414 65.885 66.248 66.5 66.674 66.793 66.858 66.885 66.883 66.856 66.803 66.729 66.647 66.552 66.473 66.382 66.261 66.154 66.042 65.923 65.77 65.593 65.461 65.298 65.028 64.839 64.659 64.573 64.368 64.131 63.853 63.715 63.382 63.214 63.03 62.825 62.351 62.092 61.793 61.442 61.044 60.562 59.916 57.799 -7 ,7374 ,KEBNE ,16749566,Wed Dec 1 17:01:50 CET,Wed Dec 1 18:54:25 CET,0.0 1.131 1.66 2.074 2.445 2.779 3.085 3.368 3.88 4.126 4.371 4.574 5.046 5.242 5.633 6.021 6.395 6.581 6.938 7.278 7.788 8.112 8.429 8.911 9.386 9.848 10.293 10.717 11.269 11.807 12.334 12.993 13.636 14.246 14.949 15.751 16.556 17.463 18.443 19.504 20.664 22.002 23.601 25.284 27.311 29.589 32.227 35.303 39.194 44.027 50.096 55.503 58.842 61.043 62.575 63.703 64.542 65.202 65.648 65.979 66.181 66.288 66.355 66.395 66.389 66.33 66.248 66.187 66.094 65.953 65.799 65.654 65.477 65.289 65.166 65.042 64.888 64.691 64.442 64.26 64.076 63.777 63.572 63.358 63.239 62.981 62.709 62.42 62.248 61.89 61.746 61.561 61.348 60.85 60.58 60.268 59.877 59.407 58.786 57.962 55.44 -8 ,18455 ,KEBNE ,16749567,Wed Dec 1 17:01:50 CET,Wed Dec 1 18:53:08 CET,0.0 1.143 1.671 2.084 2.45 2.77 3.067 3.35 3.856 4.082 4.3 4.488 4.954 5.158 5.561 5.952 6.324 6.501 6.849 7.187 7.684 8.014 8.343 8.815 9.266 9.7 10.123 10.537 11.088 11.63 12.143 12.767 13.406 14.04 14.783 15.638 16.456 17.345 18.32 19.396 20.549 21.875 23.441 25.053 26.996 29.268 31.955 35.01 38.766 43.563 49.693 54.924 58.169 60.354 61.923 63.045 63.791 64.35 64.755 65.059 65.279 65.446 65.541 65.585 65.616 65.62 65.601 65.566 65.529 65.495 65.391 65.232 65.043 64.863 64.712 64.558 64.394 64.189 63.953 63.781 63.614 63.369 63.199 62.998 62.879 62.646 62.397 62.107 61.948 61.589 61.396 61.168 60.92 60.421 60.142 59.829 59.474 59.036 58.456 57.629 55.104 -9 ,6920 ,KEBNE ,16749568,Wed Dec 1 17:07:08 CET,Wed Dec 1 19:07:13 CET,0.0 1.336 1.86 2.264 2.603 2.917 3.217 3.506 4.031 4.263 4.481 4.651 5.131 5.342 5.734 6.138 6.542 6.729 7.088 7.447 7.983 8.321 8.641 9.122 9.59 10.037 10.486 10.923 11.481 12.027 12.569 13.222 13.843 14.439 15.143 15.972 16.794 17.706 18.687 19.767 20.938 22.265 23.858 25.492 27.442 29.71 32.43 35.63 39.526 44.349 50.551 55.96 59.333 61.571 63.105 64.258 65.113 65.763 66.25 66.64 66.891 67.069 67.191 67.264 67.299 67.316 67.315 67.275 67.212 67.116 66.994 66.872 66.75 66.627 66.513 66.407 66.275 66.087 65.875 65.724 65.56 65.288 65.106 64.912 64.799 64.57 64.335 64.074 63.92 63.558 63.388 63.185 62.96 62.472 62.213 61.876 61.459 60.975 60.421 59.719 57.165 -10 ,12896 ,KEBNE ,16749569,Wed Dec 1 17:07:05 CET,Wed Dec 1 18:57:50 CET,0.0 1.065 1.595 2.022 2.382 2.72 3.034 3.317 3.832 4.076 4.311 4.494 4.959 5.17 5.581 5.978 6.368 6.556 6.916 7.264 7.766 8.088 8.398 8.834 9.259 9.682 10.102 10.519 11.061 11.595 12.114 12.75 13.383 14.012 14.746 15.572 16.38 17.275 18.269 19.34 20.485 21.813 23.397 25.016 26.972 29.236 31.899 34.991 38.722 43.352 49.363 54.862 58.352 60.664 62.323 63.514 64.278 64.823 65.219 65.496 65.656 65.758 65.82 65.867 65.878 65.842 65.778 65.72 65.672 65.593 65.48 65.365 65.22 65.067 64.94 64.803 64.621 64.393 64.137 63.953 63.776 63.478 63.25 63.003 62.868 62.605 62.333 62.035 61.866 61.482 61.246 60.997 60.731 60.167 59.854 59.505 59.076 58.595 58.024 57.199 54.453 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index a68a159e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16135 ,KEBNE ,16749570,Wed Dec 1 17:07:05 CET,Wed Dec 1 18:58:43 CET,0.0 1.884 2.739 3.327 3.796 4.182 4.519 4.836 5.374 5.608 5.852 6.058 6.484 6.678 7.089 7.49 7.871 8.059 8.406 8.732 9.174 9.445 9.716 10.114 10.494 10.862 11.216 11.555 11.994 12.426 12.849 13.362 13.865 14.345 14.883 15.494 16.078 16.713 17.437 18.245 19.084 19.973 21.012 22.088 23.343 24.623 26.042 27.616 29.301 31.028 32.572 33.351 33.336 32.965 32.424 31.804 31.152 30.512 29.949 29.321 28.758 28.245 27.729 27.225 26.764 26.352 25.905 25.501 25.155 24.777 24.35 23.986 23.612 23.222 22.913 22.558 22.189 21.827 21.454 21.197 20.923 20.484 20.167 19.825 19.644 19.292 18.937 18.545 18.331 17.89 17.613 17.366 17.084 16.406 16.008 15.569 15.105 14.545 13.833 12.904 9.381 -2 ,7675 ,KEBNE ,16749571,Wed Dec 1 17:07:05 CET,Wed Dec 1 18:59:26 CET,0.0 1.65 2.258 2.745 3.153 3.494 3.817 4.124 4.694 4.959 5.183 5.366 5.8 5.998 6.404 6.801 7.16 7.329 7.674 8.006 8.467 8.76 9.037 9.434 9.818 10.19 10.556 10.898 11.322 11.746 12.162 12.65 13.112 13.577 14.117 14.717 15.302 15.945 16.632 17.363 18.142 19.015 20.028 21.056 22.255 23.56 24.988 26.5 28.139 30.08 32.137 33.089 33.193 32.965 32.545 32.003 31.393 30.745 30.148 29.488 28.903 28.404 27.908 27.411 26.959 26.546 26.092 25.67 25.307 24.942 24.545 24.211 23.86 23.474 23.17 22.849 22.504 22.145 21.785 21.532 21.254 20.804 20.479 20.132 19.952 19.567 19.145 18.736 18.53 18.094 17.818 17.546 17.272 16.684 16.339 15.946 15.521 15.038 14.433 13.555 9.888 -3 ,2868 ,KEBNE ,16749572,Wed Dec 1 17:07:05 CET,Wed Dec 1 18:58:07 CET,0.0 1.411 1.96 2.417 2.837 3.199 3.503 3.795 4.327 4.562 4.796 5.029 5.49 5.714 6.101 6.468 6.847 7.026 7.369 7.698 8.167 8.46 8.743 9.152 9.523 9.877 10.232 10.585 11.042 11.487 11.916 12.439 12.941 13.413 13.974 14.636 15.273 15.97 16.701 17.486 18.323 19.236 20.316 21.362 22.514 23.823 25.292 26.938 28.815 30.793 32.666 33.591 33.624 33.192 32.597 31.971 31.325 30.671 30.059 29.404 28.837 28.33 27.844 27.377 26.92 26.487 26.037 25.633 25.275 24.897 24.506 24.187 23.853 23.483 23.17 22.824 22.485 22.155 21.79 21.541 21.285 20.853 20.54 20.224 20.066 19.734 19.384 18.989 18.777 18.348 18.057 17.791 17.519 16.907 16.522 16.037 15.534 15.013 14.376 13.36 9.068 -4 ,26667 ,KEBNE ,16749573,Wed Dec 1 17:07:06 CET,Wed Dec 1 18:59:22 CET,0.0 2.024 2.731 3.275 3.759 4.178 4.527 4.811 5.31 5.557 5.802 6.019 6.463 6.678 7.098 7.509 7.873 8.04 8.386 8.727 9.181 9.477 9.788 10.21 10.614 11.021 11.399 11.752 12.221 12.675 13.092 13.578 14.049 14.529 15.089 15.684 16.274 16.955 17.687 18.442 19.204 20.063 21.073 22.058 23.279 24.672 26.216 27.929 29.722 31.598 33.402 34.313 34.398 33.975 33.371 32.787 32.227 31.595 30.977 30.303 29.692 29.166 28.665 28.169 27.682 27.209 26.726 26.302 25.913 25.512 25.078 24.701 24.322 23.931 23.625 23.306 22.976 22.616 22.211 21.923 21.627 21.164 20.842 20.514 20.341 19.966 19.568 19.166 18.953 18.497 18.171 17.882 17.583 16.949 16.603 16.223 15.801 15.296 14.586 13.632 10.409 -5 ,4763 ,KEBNE ,16749574,Wed Dec 1 17:09:12 CET,Wed Dec 1 19:01:26 CET,0.0 1.524 2.165 2.648 3.063 3.442 3.787 4.102 4.687 4.946 5.207 5.499 5.979 6.185 6.556 6.949 7.34 7.523 7.866 8.199 8.682 8.968 9.222 9.611 9.995 10.368 10.73 11.089 11.536 11.966 12.38 12.88 13.372 13.843 14.394 14.994 15.564 16.227 16.97 17.707 18.425 19.239 20.183 21.155 22.343 23.627 25.055 26.575 28.217 29.994 31.603 32.245 32.127 31.704 31.143 30.517 29.9 29.237 28.62 28.006 27.493 27.011 26.481 25.972 25.511 25.082 24.619 24.203 23.857 23.494 23.085 22.73 22.35 21.935 21.612 21.279 20.943 20.591 20.228 19.98 19.716 19.295 18.982 18.644 18.47 18.113 17.742 17.337 17.118 16.676 16.403 16.12 15.789 15.018 14.597 14.148 13.647 12.971 12.111 10.95 5.854 -6 ,31868 ,KEBNE ,16749575,Wed Dec 1 17:09:12 CET,Wed Dec 1 19:01:26 CET,0.0 2.051 2.778 3.3 3.705 4.065 4.381 4.676 5.225 5.475 5.732 6.006 6.457 6.674 7.088 7.479 7.845 8.024 8.371 8.684 9.128 9.411 9.685 10.077 10.463 10.837 11.209 11.57 12.028 12.466 12.888 13.407 13.892 14.354 14.927 15.563 16.127 16.776 17.499 18.229 18.97 19.795 20.825 21.874 23.055 24.331 25.786 27.438 29.194 30.969 32.667 33.074 32.767 32.296 31.71 31.11 30.512 29.9 29.294 28.639 28.04 27.49 26.953 26.405 25.857 25.365 24.877 24.434 24.043 23.608 23.125 22.726 22.319 21.921 21.623 21.282 20.916 20.534 20.142 19.878 19.591 19.12 18.787 18.448 18.278 17.918 17.543 17.145 16.934 16.492 16.185 15.89 15.577 14.898 14.512 14.056 13.532 12.971 12.312 11.271 5.206 -7 ,4006 ,KEBNE ,16749576,Wed Dec 1 17:09:12 CET,Wed Dec 1 19:00:56 CET,0.0 1.573 2.231 2.75 3.179 3.531 3.848 4.147 4.719 4.992 5.246 5.497 5.958 6.164 6.553 6.927 7.28 7.447 7.766 8.078 8.522 8.804 9.086 9.493 9.898 10.278 10.618 10.955 11.377 11.768 12.155 12.652 13.157 13.627 14.174 14.785 15.373 16.064 16.808 17.59 18.368 19.207 20.222 21.237 22.424 23.749 25.203 26.737 28.315 29.945 31.778 32.872 33.047 32.82 32.415 31.868 31.294 30.748 30.267 29.734 29.222 28.732 28.25 27.781 27.337 26.935 26.491 26.084 25.729 25.354 24.943 24.61 24.277 23.93 23.651 23.351 23.042 22.715 22.362 22.112 21.852 21.455 21.186 20.887 20.725 20.401 20.04 19.635 19.416 18.966 18.68 18.407 18.111 17.486 17.082 16.583 16.059 15.505 14.778 13.639 9.642 -8 ,12301 ,KEBNE ,16749577,Wed Dec 1 17:10:17 CET,Wed Dec 1 19:02:40 CET,0.0 1.737 2.382 2.867 3.263 3.601 3.893 4.159 4.665 4.909 5.125 5.308 5.74 5.937 6.327 6.696 7.045 7.21 7.542 7.87 8.326 8.601 8.859 9.24 9.626 9.999 10.351 10.7 11.137 11.56 11.987 12.504 13.021 13.524 14.09 14.722 15.336 16.005 16.713 17.469 18.278 19.216 20.316 21.388 22.538 23.778 25.22 26.73 28.369 30.171 32.057 33.187 33.312 33.002 32.591 32.096 31.495 30.885 30.329 29.735 29.188 28.645 28.109 27.612 27.159 26.738 26.288 25.903 25.56 25.182 24.779 24.439 24.072 23.68 23.368 23.034 22.689 22.315 21.904 21.625 21.337 20.883 20.552 20.181 19.994 19.638 19.261 18.823 18.595 18.162 17.9 17.625 17.333 16.685 16.327 15.947 15.493 14.934 14.181 13.135 9.225 -9 ,11497 ,KEBNE ,16749578,Wed Dec 1 17:12:27 CET,Wed Dec 1 19:04:07 CET,0.0 1.569 2.228 2.75 3.136 3.481 3.84 4.162 4.733 4.996 5.237 5.457 5.91 6.124 6.508 6.864 7.207 7.37 7.696 8.014 8.439 8.71 8.992 9.4 9.787 10.151 10.503 10.846 11.286 11.712 12.125 12.614 13.094 13.57 14.105 14.726 15.329 15.97 16.659 17.386 18.162 19.027 20.013 20.949 22.029 23.292 24.745 26.298 27.974 29.868 31.741 32.68 32.616 32.124 31.476 30.766 30.083 29.398 28.769 28.061 27.418 26.866 26.343 25.846 25.378 24.947 24.488 24.069 23.697 23.304 22.885 22.529 22.16 21.778 21.465 21.13 20.787 20.433 20.07 19.81 19.529 19.055 18.719 18.376 18.198 17.843 17.464 17.048 16.826 16.384 16.116 15.847 15.572 14.986 14.649 14.278 13.847 13.305 12.651 11.593 7.345 -10 ,24943 ,KEBNE ,16749579,Wed Dec 1 17:13:33 CET,Wed Dec 1 19:05:19 CET,0.0 1.676 2.299 2.777 3.205 3.584 3.909 4.19 4.724 4.985 5.225 5.418 5.836 6.033 6.411 6.771 7.119 7.288 7.623 7.941 8.376 8.645 8.901 9.282 9.633 9.957 10.289 10.616 11.029 11.433 11.829 12.293 12.731 13.145 13.647 14.228 14.794 15.442 16.134 16.858 17.625 18.497 19.482 20.412 21.522 22.81 24.252 25.802 27.459 29.198 30.888 31.704 31.643 31.254 30.694 30.061 29.461 28.836 28.255 27.608 27.004 26.463 25.938 25.409 24.907 24.475 24.013 23.611 23.283 22.925 22.523 22.178 21.827 21.467 21.193 20.901 20.574 20.229 19.883 19.639 19.377 18.962 18.672 18.37 18.206 17.852 17.488 17.092 16.879 16.457 16.21 15.949 15.658 14.993 14.648 14.275 13.86 13.373 12.748 11.904 8.237 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 28d5f310..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13067 ,KEBNE ,17028272,Wed Dec 22 19:31:04 CET,Wed Dec 22 21:22:01 CET,0.0 1.371 1.914 2.359 2.752 3.109 3.428 3.719 4.244 4.481 4.707 4.897 5.309 5.471 5.746 5.99 6.221 6.342 6.575 6.796 7.112 7.301 7.487 7.757 8.009 8.247 8.477 8.697 8.971 9.234 9.493 9.818 10.129 10.414 10.725 11.063 11.403 11.789 12.194 12.637 13.088 13.564 14.15 14.694 15.268 15.893 16.608 17.385 18.201 18.953 19.523 19.616 19.339 18.914 18.426 17.919 17.417 16.883 16.402 15.877 15.386 14.942 14.512 14.104 13.712 13.351 12.976 12.627 12.318 11.984 11.64 11.368 11.091 10.792 10.544 10.285 10.009 9.707 9.377 9.15 8.934 8.587 8.328 8.057 7.919 7.644 7.34 6.999 6.814 6.39 6.205 5.992 5.772 5.271 4.979 4.651 4.278 3.814 3.255 2.519 -0.793 -2 ,21587 ,KEBNE ,17028273,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:22:45 CET,0.0 1.363 1.861 2.231 2.522 2.784 3.029 3.257 3.674 3.863 4.038 4.125 4.509 4.678 4.986 5.252 5.506 5.625 5.859 6.09 6.414 6.616 6.809 7.076 7.315 7.555 7.789 8.014 8.306 8.579 8.846 9.166 9.47 9.755 10.066 10.409 10.741 11.117 11.527 11.957 12.401 12.906 13.478 14.002 14.603 15.275 16.051 16.877 17.682 18.509 19.18 19.064 18.452 17.615 16.768 15.903 14.994 14.098 13.317 12.552 11.869 11.233 10.617 10.016 9.463 8.965 8.427 7.928 7.474 7.011 6.514 6.106 5.686 5.237 4.889 4.515 4.137 3.761 3.377 3.109 2.829 2.385 2.068 1.735 1.56 1.193 0.819 0.438 0.243 -0.195 -0.457 -0.713 -0.97 -1.522 -1.842 -2.182 -2.57 -3.048 -3.597 -4.312 -7.293 -3 ,10287 ,KEBNE ,17028274,Wed Dec 22 19:31:02 CET,Wed Dec 22 21:22:05 CET,0.0 1.616 2.119 2.468 2.758 3.011 3.251 3.488 3.902 4.083 4.268 4.411 4.801 4.948 5.224 5.477 5.717 5.836 6.06 6.267 6.571 6.766 6.955 7.222 7.479 7.731 7.975 8.211 8.515 8.813 9.09 9.406 9.702 9.989 10.333 10.725 11.091 11.496 11.909 12.343 12.817 13.316 13.871 14.418 15.031 15.704 16.445 17.235 18.081 18.871 19.409 19.457 19.228 18.842 18.373 17.879 17.36 16.839 16.376 15.887 15.426 14.992 14.554 14.11 13.705 13.341 12.94 12.575 12.257 11.932 11.586 11.276 10.934 10.576 10.31 10.04 9.751 9.438 9.122 8.914 8.684 8.312 8.048 7.775 7.63 7.299 6.956 6.596 6.396 5.964 5.774 5.542 5.298 4.786 4.476 4.108 3.692 3.227 2.646 1.735 -1.877 -4 ,30378 ,KEBNE ,17028275,Wed Dec 22 19:31:04 CET,Wed Dec 22 21:22:23 CET,0.0 1.513 1.997 2.331 2.625 2.878 3.108 3.328 3.713 3.892 4.064 4.144 4.514 4.651 4.906 5.149 5.404 5.529 5.76 5.976 6.281 6.475 6.663 6.93 7.188 7.433 7.677 7.915 8.203 8.482 8.75 9.06 9.374 9.699 10.062 10.437 10.788 11.174 11.593 12.028 12.471 12.962 13.528 14.091 14.746 15.425 16.133 16.859 17.634 18.463 19.138 19.269 19.045 18.651 18.198 17.704 17.222 16.762 16.322 15.86 15.453 15.067 14.67 14.285 13.918 13.564 13.178 12.848 12.569 12.266 11.94 11.664 11.365 11.055 10.817 10.553 10.264 9.969 9.652 9.422 9.197 8.841 8.579 8.315 8.186 7.915 7.61 7.281 7.107 6.705 6.519 6.283 6.048 5.573 5.292 4.973 4.627 4.232 3.738 3.055 0.162 -5 ,3851 ,KEBNE ,17028276,Wed Dec 22 19:31:04 CET,Wed Dec 22 21:23:23 CET,0.0 1.482 1.955 2.311 2.608 2.866 3.106 3.33 3.719 3.901 4.082 4.176 4.556 4.714 5.008 5.28 5.534 5.652 5.883 6.107 6.421 6.614 6.806 7.083 7.334 7.578 7.815 8.045 8.343 8.636 8.921 9.252 9.571 9.876 10.22 10.6 10.945 11.329 11.765 12.211 12.663 13.177 13.756 14.307 14.928 15.586 16.272 16.988 17.746 18.509 19.098 19.076 18.694 18.201 17.624 17.027 16.49 15.949 15.444 14.896 14.405 13.964 13.521 13.067 12.631 12.236 11.823 11.439 11.093 10.736 10.36 10.029 9.688 9.339 9.068 8.788 8.486 8.165 7.849 7.637 7.404 7.022 6.763 6.482 6.33 6.02 5.699 5.365 5.187 4.766 4.553 4.329 4.095 3.586 3.305 2.993 2.634 2.225 1.714 0.977 -1.512 -6 ,5880 ,KEBNE ,17028277,Wed Dec 22 19:31:05 CET,Wed Dec 22 21:22:48 CET,0.0 1.217 1.697 2.071 2.404 2.688 2.94 3.178 3.62 3.814 3.984 4.072 4.452 4.595 4.87 5.116 5.342 5.462 5.702 5.936 6.266 6.474 6.679 6.966 7.23 7.486 7.746 7.999 8.325 8.634 8.917 9.247 9.561 9.862 10.218 10.616 11.0 11.41 11.823 12.261 12.721 13.215 13.789 14.364 15.002 15.681 16.415 17.205 18.212 19.435 20.462 20.542 20.004 19.128 18.253 17.441 16.649 15.856 15.122 14.345 13.641 13.008 12.417 11.879 11.349 10.849 10.331 9.862 9.459 9.024 8.551 8.158 7.759 7.326 6.974 6.619 6.266 5.902 5.514 5.243 4.96 4.511 4.211 3.898 3.723 3.353 2.953 2.543 2.334 1.879 1.615 1.358 1.069 0.418 0.047 -0.393 -0.874 -1.385 -2.008 -2.938 -6.36 -7 ,31173 ,KEBNE ,17028278,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:22:16 CET,0.0 1.313 1.773 2.116 2.423 2.701 2.94 3.161 3.569 3.756 3.93 4.002 4.367 4.504 4.768 5.034 5.28 5.392 5.616 5.837 6.165 6.377 6.571 6.847 7.11 7.356 7.597 7.836 8.145 8.448 8.729 9.056 9.378 9.679 10.008 10.388 10.764 11.165 11.586 12.004 12.447 12.962 13.545 14.113 14.742 15.414 16.151 16.907 17.708 18.545 19.178 19.2 18.925 18.557 18.1 17.607 17.119 16.62 16.157 15.67 15.21 14.792 14.411 14.06 13.714 13.358 12.974 12.644 12.361 12.05 11.701 11.399 11.093 10.776 10.517 10.248 9.97 9.67 9.357 9.142 8.909 8.53 8.262 7.984 7.846 7.558 7.257 6.939 6.763 6.352 6.199 6.001 5.778 5.228 4.911 4.542 4.145 3.731 3.188 2.4 -0.411 -8 ,27567 ,KEBNE ,17028279,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:22:56 CET,0.0 1.753 2.317 2.733 3.054 3.35 3.632 3.887 4.317 4.521 4.719 4.849 5.246 5.401 5.707 6.0 6.272 6.401 6.653 6.893 7.234 7.456 7.658 7.94 8.217 8.478 8.721 8.958 9.267 9.567 9.862 10.22 10.56 10.886 11.252 11.654 12.039 12.467 12.927 13.402 13.898 14.455 15.084 15.691 16.371 17.107 17.911 18.762 19.719 20.638 21.368 21.542 21.226 20.765 20.218 19.588 18.995 18.439 17.937 17.38 16.874 16.426 15.968 15.519 15.102 14.725 14.326 13.974 13.667 13.338 12.976 12.655 12.327 11.991 11.717 11.42 11.119 10.796 10.435 10.189 9.943 9.563 9.296 9.014 8.864 8.535 8.176 7.787 7.587 7.155 6.965 6.738 6.492 5.963 5.67 5.345 4.976 4.568 4.08 3.418 -0.006 -9 ,10651 ,KEBNE ,17028280,Wed Dec 22 19:31:02 CET,Wed Dec 22 21:22:15 CET,0.0 1.531 2.068 2.495 2.817 3.091 3.336 3.565 3.995 4.174 4.332 4.408 4.799 4.942 5.221 5.485 5.738 5.867 6.112 6.337 6.656 6.859 7.053 7.33 7.581 7.818 8.056 8.297 8.601 8.881 9.156 9.469 9.757 10.047 10.378 10.727 11.064 11.449 11.847 12.274 12.72 13.19 13.739 14.297 14.932 15.585 16.26 16.964 17.725 18.49 19.045 19.06 18.751 18.304 17.806 17.315 16.812 16.284 15.797 15.266 14.799 14.373 13.956 13.565 13.193 12.838 12.47 12.13 11.812 11.464 11.108 10.814 10.505 10.201 9.969 9.722 9.46 9.185 8.888 8.669 8.436 8.058 7.792 7.532 7.402 7.127 6.805 6.448 6.262 5.854 5.674 5.438 5.203 4.705 4.412 4.088 3.709 3.255 2.687 1.914 -1.366 -10 ,13508 ,KEBNE ,17028281,Wed Dec 22 19:31:05 CET,Wed Dec 22 21:21:38 CET,0.0 1.941 2.48 2.888 3.203 3.48 3.739 3.985 4.419 4.621 4.821 4.929 5.327 5.488 5.79 6.088 6.371 6.498 6.738 6.972 7.321 7.551 7.773 8.087 8.377 8.653 8.911 9.158 9.483 9.806 10.111 10.473 10.827 11.156 11.527 11.95 12.342 12.771 13.24 13.729 14.216 14.741 15.352 15.945 16.615 17.363 18.211 19.086 19.966 20.855 21.625 21.774 21.476 20.975 20.371 19.766 19.205 18.682 18.226 17.704 17.204 16.754 16.328 15.899 15.473 15.09 14.691 14.327 13.997 13.636 13.262 12.945 12.602 12.227 11.927 11.622 11.305 10.98 10.64 10.402 10.16 9.768 9.486 9.184 9.023 8.706 8.372 8.019 7.819 7.368 7.135 6.89 6.619 6.028 5.701 5.333 4.888 4.353 3.652 2.758 -0.084 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index 7cfb54b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22572 ,KEBNE ,17028282,Wed Dec 22 19:31:04 CET,Wed Dec 22 21:22:52 CET,0.0 1.189 1.714 2.135 2.463 2.749 3.013 3.253 3.708 3.93 4.143 4.323 4.76 4.946 5.281 5.586 5.892 6.036 6.306 6.575 6.975 7.223 7.454 7.79 8.122 8.443 8.757 9.062 9.45 9.822 10.191 10.631 11.051 11.465 11.942 12.482 13.005 13.597 14.242 14.911 15.61 16.391 17.314 18.279 19.393 20.621 22.036 23.599 25.408 27.557 30.103 32.06 33.158 33.759 34.002 34.026 33.863 33.621 33.412 33.175 32.931 32.69 32.425 32.141 31.874 31.624 31.336 31.042 30.775 30.52 30.255 29.992 29.697 29.396 29.147 28.87 28.565 28.237 27.91 27.678 27.433 27.041 26.755 26.448 26.285 25.961 25.614 25.23 25.028 24.597 24.359 24.133 23.866 23.231 22.9 22.516 22.064 21.553 20.915 19.991 17.199 -2 ,18727 ,KEBNE ,17028283,Wed Dec 22 19:31:02 CET,Wed Dec 22 21:22:17 CET,0.0 1.116 1.63 2.026 2.368 2.667 2.915 3.161 3.628 3.844 4.054 4.211 4.632 4.798 5.119 5.422 5.712 5.857 6.138 6.415 6.816 7.066 7.311 7.668 8.006 8.324 8.643 8.95 9.335 9.714 10.088 10.52 10.919 11.326 11.814 12.348 12.869 13.446 14.059 14.725 15.432 16.24 17.17 18.08 19.163 20.39 21.791 23.36 25.24 27.474 30.126 32.323 33.46 34.034 34.34 34.414 34.321 34.127 33.893 33.628 33.375 33.108 32.828 32.515 32.193 31.91 31.596 31.313 31.065 30.781 30.463 30.174 29.87 29.539 29.269 28.988 28.706 28.397 28.058 27.833 27.594 27.174 26.877 26.572 26.409 26.07 25.738 25.378 25.178 24.764 24.583 24.341 24.048 23.432 23.11 22.763 22.349 21.863 21.258 20.417 15.87 -3 ,14618 ,KEBNE ,17028284,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:21:23 CET,0.0 1.301 1.793 2.199 2.541 2.844 3.112 3.352 3.8 4.013 4.217 4.341 4.755 4.934 5.286 5.608 5.899 6.043 6.327 6.588 6.97 7.219 7.457 7.802 8.135 8.448 8.749 9.049 9.446 9.832 10.209 10.656 11.107 11.561 12.064 12.608 13.13 13.712 14.368 15.072 15.785 16.584 17.545 18.529 19.679 20.967 22.444 24.132 26.122 28.437 31.111 33.088 34.106 34.649 34.893 34.997 34.998 34.838 34.667 34.49 34.285 34.066 33.814 33.541 33.261 32.987 32.655 32.339 32.065 31.783 31.486 31.219 30.928 30.623 30.403 30.169 29.903 29.595 29.265 29.048 28.826 28.462 28.217 27.995 27.877 27.575 27.194 26.759 26.535 26.112 25.893 25.655 25.409 24.857 24.54 24.205 23.821 23.344 22.78 21.953 19.092 -4 ,3513 ,KEBNE ,17028285,Wed Dec 22 19:31:05 CET,Wed Dec 22 21:22:21 CET,0.0 0.879 1.34 1.679 1.954 2.21 2.456 2.694 3.12 3.325 3.523 3.636 4.036 4.197 4.5 4.782 5.052 5.184 5.449 5.71 6.077 6.309 6.544 6.892 7.217 7.546 7.87 8.179 8.58 8.96 9.32 9.757 10.213 10.651 11.144 11.687 12.195 12.762 13.382 14.05 14.761 15.555 16.492 17.457 18.582 19.823 21.281 22.98 24.993 27.436 30.281 32.421 33.5 34.006 34.218 34.286 34.268 34.132 33.963 33.746 33.498 33.223 32.913 32.621 32.343 32.067 31.751 31.452 31.182 30.908 30.595 30.319 30.05 29.766 29.515 29.232 28.929 28.603 28.277 28.053 27.807 27.424 27.159 26.876 26.732 26.415 26.037 25.625 25.421 25.001 24.759 24.5 24.239 23.7 23.408 23.078 22.676 22.204 21.693 21.011 18.45 -5 ,23990 ,KEBNE ,17028286,Wed Dec 22 19:31:04 CET,Wed Dec 22 21:22:06 CET,0.0 1.226 1.709 2.064 2.355 2.625 2.886 3.121 3.539 3.734 3.922 4.035 4.445 4.616 4.936 5.231 5.519 5.662 5.93 6.196 6.592 6.834 7.057 7.394 7.727 8.044 8.339 8.627 9.012 9.391 9.76 10.201 10.626 11.023 11.485 12.022 12.546 13.116 13.719 14.369 15.068 15.853 16.794 17.755 18.876 20.156 21.612 23.238 25.109 27.316 30.058 32.139 33.078 33.564 33.8 33.805 33.693 33.523 33.343 33.118 32.855 32.573 32.274 31.967 31.656 31.373 31.06 30.757 30.498 30.224 29.93 29.668 29.385 29.093 28.853 28.598 28.33 28.034 27.709 27.482 27.238 26.852 26.576 26.27 26.117 25.794 25.417 24.999 24.766 24.299 24.021 23.775 23.498 22.844 22.488 22.127 21.739 21.3 20.771 20.041 18.607 -6 ,5210 ,KEBNE ,17028287,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:22:10 CET,0.0 0.988 1.417 1.778 2.094 2.364 2.622 2.871 3.297 3.495 3.684 3.788 4.196 4.361 4.676 4.974 5.249 5.387 5.665 5.919 6.281 6.52 6.751 7.086 7.418 7.744 8.066 8.38 8.775 9.161 9.531 9.97 10.395 10.82 11.328 11.891 12.421 13.006 13.645 14.324 15.058 15.903 16.878 17.842 18.974 20.239 21.657 23.224 25.097 27.357 29.993 32.034 33.095 33.586 33.782 33.844 33.746 33.518 33.287 33.054 32.803 32.562 32.335 32.07 31.776 31.5 31.219 30.938 30.661 30.361 30.032 29.76 29.475 29.16 28.911 28.661 28.391 28.102 27.779 27.533 27.273 26.869 26.596 26.307 26.149 25.816 25.457 25.072 24.875 24.465 24.222 23.975 23.715 23.13 22.82 22.474 22.1 21.671 21.131 20.378 17.563 -7 ,16378 ,KEBNE ,17028288,Wed Dec 22 19:31:04 CET,Wed Dec 22 21:21:41 CET,0.0 1.011 1.472 1.835 2.129 2.404 2.667 2.907 3.344 3.543 3.729 3.838 4.24 4.402 4.719 5.026 5.317 5.46 5.743 6.006 6.373 6.609 6.845 7.188 7.515 7.824 8.127 8.435 8.848 9.246 9.622 10.079 10.516 10.933 11.417 11.962 12.5 13.087 13.711 14.384 15.098 15.901 16.836 17.797 18.936 20.213 21.688 23.335 25.236 27.514 30.249 32.332 33.375 33.88 34.128 34.196 34.13 33.973 33.752 33.474 33.215 32.979 32.694 32.386 32.108 31.847 31.554 31.253 30.992 30.726 30.413 30.141 29.868 29.578 29.344 29.101 28.848 28.558 28.23 28.011 27.786 27.421 27.162 26.868 26.714 26.396 26.041 25.632 25.418 24.996 24.742 24.507 24.276 23.729 23.416 23.082 22.687 22.215 21.66 20.899 18.105 -8 ,14465 ,KEBNE ,17028289,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:22:22 CET,0.0 1.105 1.608 1.985 2.295 2.585 2.863 3.11 3.551 3.76 3.96 4.109 4.54 4.724 5.055 5.347 5.628 5.76 6.021 6.286 6.667 6.919 7.167 7.51 7.844 8.172 8.481 8.785 9.184 9.576 9.962 10.424 10.855 11.276 11.77 12.308 12.826 13.392 14.009 14.69 15.415 16.22 17.145 18.079 19.192 20.454 21.918 23.595 25.559 27.802 30.448 32.53 33.567 34.198 34.536 34.623 34.567 34.422 34.205 33.92 33.662 33.397 33.098 32.77 32.451 32.128 31.779 31.49 31.241 30.998 30.743 30.493 30.204 29.879 29.614 29.347 29.085 28.809 28.495 28.267 28.03 27.66 27.405 27.133 26.994 26.697 26.357 25.982 25.786 25.367 25.136 24.902 24.652 24.101 23.79 23.437 23.041 22.575 22.02 21.265 18.572 -9 ,16169 ,KEBNE ,17028290,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:23:07 CET,0.0 1.345 1.791 2.161 2.477 2.74 3.018 3.281 3.726 3.941 4.151 4.29 4.711 4.884 5.223 5.54 5.84 5.982 6.264 6.549 6.946 7.193 7.43 7.769 8.094 8.42 8.738 9.048 9.454 9.848 10.23 10.668 11.082 11.5 11.992 12.54 13.057 13.631 14.269 14.946 15.665 16.484 17.436 18.397 19.508 20.747 22.163 23.76 25.624 27.804 30.423 32.494 33.587 34.153 34.423 34.469 34.35 34.164 33.99 33.773 33.538 33.313 33.058 32.759 32.448 32.133 31.785 31.482 31.202 30.892 30.572 30.313 30.043 29.733 29.473 29.177 28.872 28.591 28.305 28.103 27.87 27.486 27.219 26.934 26.788 26.467 26.133 25.802 25.618 25.199 24.965 24.698 24.401 23.779 23.438 23.084 22.703 22.254 21.669 20.813 18.837 -10 ,10740 ,KEBNE ,17028291,Wed Dec 22 19:31:03 CET,Wed Dec 22 21:21:56 CET,0.0 1.201 1.682 2.045 2.344 2.605 2.85 3.085 3.515 3.711 3.903 4.02 4.423 4.582 4.887 5.177 5.448 5.583 5.86 6.129 6.486 6.712 6.94 7.27 7.581 7.878 8.17 8.472 8.865 9.236 9.601 10.038 10.451 10.845 11.31 11.836 12.341 12.903 13.514 14.147 14.804 15.577 16.506 17.454 18.574 19.808 21.225 22.823 24.725 27.028 29.729 31.825 32.953 33.513 33.78 33.859 33.75 33.577 33.378 33.109 32.812 32.479 32.124 31.764 31.434 31.142 30.815 30.509 30.232 29.939 29.642 29.383 29.092 28.771 28.519 28.258 27.984 27.698 27.385 27.158 26.925 26.572 26.334 26.072 25.931 25.635 25.312 24.958 24.776 24.369 24.154 23.932 23.697 23.178 22.863 22.479 22.074 21.624 21.092 20.291 17.608 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt deleted file mode 100644 index 37fefd04..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5283 ,KEBNE ,16749580,Wed Dec 1 17:13:33 CET,Wed Dec 1 19:04:34 CET,0.0 1.06 1.513 1.877 2.197 2.497 2.76 3.007 3.475 3.685 3.879 3.989 4.394 4.543 4.83 5.097 5.348 5.478 5.726 5.945 6.259 6.456 6.652 6.947 7.226 7.485 7.741 7.994 8.316 8.606 8.885 9.241 9.585 9.914 10.282 10.683 11.072 11.497 11.942 12.413 12.904 13.433 14.047 14.646 15.318 16.037 16.817 17.648 18.489 19.312 19.992 20.012 19.6 19.027 18.483 17.903 17.266 16.657 16.112 15.533 14.996 14.445 13.869 13.324 12.832 12.387 11.904 11.47 11.078 10.652 10.202 9.834 9.456 9.053 8.735 8.406 8.053 7.681 7.295 7.02 6.731 6.278 5.957 5.612 5.441 5.085 4.696 4.281 4.06 3.596 3.354 3.09 2.807 2.237 1.931 1.568 1.158 0.702 0.153 -0.656 -2.691 -2 ,10526 ,KEBNE ,16749581,Wed Dec 1 17:18:48 CET,Wed Dec 1 19:09:58 CET,0.0 1.025 1.439 1.814 2.147 2.402 2.625 2.858 3.29 3.476 3.651 3.748 4.15 4.301 4.583 4.86 5.12 5.24 5.474 5.7 6.023 6.23 6.432 6.725 7.001 7.263 7.513 7.752 8.051 8.336 8.631 8.995 9.348 9.689 10.062 10.442 10.794 11.197 11.644 12.118 12.599 13.117 13.708 14.289 14.965 15.69 16.464 17.256 18.127 18.951 19.547 19.585 19.193 18.622 18.014 17.351 16.669 15.997 15.378 14.735 14.185 13.688 13.196 12.711 12.235 11.762 11.262 10.84 10.463 10.053 9.616 9.246 8.854 8.452 8.139 7.806 7.464 7.089 6.694 6.422 6.132 5.686 5.378 5.057 4.885 4.525 4.163 3.774 3.565 3.118 2.888 2.646 2.393 1.773 1.411 1.051 0.678 0.229 -0.321 -1.04 -2.635 -3 ,16573 ,KEBNE ,16749582,Wed Dec 1 17:18:48 CET,Wed Dec 1 19:10:31 CET,0.0 1.292 1.798 2.214 2.56 2.841 3.081 3.296 3.717 3.918 4.114 4.241 4.652 4.815 5.115 5.378 5.634 5.762 6.005 6.229 6.57 6.792 7.003 7.311 7.604 7.878 8.142 8.387 8.69 8.992 9.297 9.665 9.993 10.298 10.668 11.08 11.467 11.887 12.331 12.818 13.3 13.804 14.388 14.974 15.629 16.332 17.145 18.005 18.927 19.87 20.534 20.509 20.118 19.546 18.955 18.376 17.789 17.157 16.558 15.983 15.459 14.952 14.471 14.03 13.63 13.23 12.789 12.393 12.036 11.659 11.266 10.931 10.581 10.223 9.941 9.651 9.332 8.977 8.621 8.387 8.136 7.719 7.413 7.081 6.911 6.536 6.152 5.772 5.57 5.138 4.942 4.704 4.449 3.882 3.554 3.22 2.862 2.433 1.888 1.1 -1.723 -4 ,2850 ,KEBNE ,16749583,Wed Dec 1 17:18:48 CET,Wed Dec 1 19:09:25 CET,0.0 1.548 2.065 2.455 2.789 3.082 3.349 3.621 4.128 4.358 4.575 4.718 5.137 5.303 5.631 5.949 6.245 6.388 6.654 6.906 7.29 7.539 7.759 8.048 8.325 8.6 8.864 9.113 9.433 9.745 10.059 10.45 10.824 11.178 11.578 11.992 12.37 12.79 13.232 13.716 14.23 14.768 15.384 16.003 16.691 17.412 18.195 19.035 19.973 20.871 21.479 21.513 21.186 20.674 20.02 19.32 18.646 18.016 17.435 16.829 16.31 15.781 15.265 14.777 14.299 13.825 13.323 12.886 12.503 12.109 11.688 11.336 10.955 10.542 10.233 9.922 9.584 9.208 8.824 8.563 8.283 7.831 7.513 7.183 7.011 6.662 6.296 5.911 5.709 5.263 5.019 4.762 4.495 3.894 3.544 3.172 2.772 2.323 1.792 1.14 -0.228 -5 ,30828 ,KEBNE ,16749584,Wed Dec 1 17:18:48 CET,Wed Dec 1 19:11:32 CET,0.0 1.106 1.593 1.957 2.278 2.552 2.783 3.003 3.405 3.583 3.755 3.827 4.222 4.371 4.661 4.942 5.206 5.331 5.571 5.805 6.154 6.378 6.591 6.896 7.181 7.453 7.711 7.961 8.314 8.657 8.975 9.358 9.707 10.033 10.417 10.845 11.251 11.682 12.114 12.588 13.114 13.677 14.33 14.968 15.631 16.318 17.063 17.81 18.598 19.369 19.864 19.726 19.228 18.582 17.824 17.08 16.414 15.766 15.203 14.615 14.068 13.564 13.087 12.62 12.171 11.76 11.331 10.938 10.592 10.237 9.851 9.517 9.156 8.781 8.497 8.192 7.855 7.482 7.062 6.755 6.443 5.958 5.622 5.271 5.081 4.685 4.274 3.818 3.578 3.105 2.843 2.594 2.314 1.665 1.306 0.903 0.487 -0.002 -0.665 -1.481 -5.479 -6 ,2166 ,KEBNE ,16749585,Wed Dec 1 17:18:48 CET,Wed Dec 1 19:10:41 CET,0.0 1.293 1.796 2.193 2.554 2.876 3.168 3.441 3.93 4.147 4.36 4.515 4.949 5.137 5.487 5.814 6.129 6.281 6.574 6.85 7.244 7.493 7.736 8.097 8.426 8.726 8.994 9.234 9.542 9.845 10.131 10.487 10.824 11.127 11.488 11.897 12.286 12.719 13.191 13.679 14.182 14.732 15.338 15.941 16.631 17.36 18.154 18.996 19.886 20.759 21.451 21.516 21.164 20.671 20.15 19.583 19.009 18.429 17.899 17.364 16.89 16.453 16.008 15.572 15.155 14.77 14.351 13.975 13.65 13.308 12.946 12.628 12.269 11.9 11.639 11.347 11.032 10.704 10.338 10.079 9.804 9.375 9.095 8.815 8.667 8.337 7.978 7.589 7.38 6.93 6.704 6.464 6.221 5.67 5.374 5.061 4.699 4.281 3.803 3.18 0.715 -7 ,22937 ,KEBNE ,16749586,Wed Dec 1 17:18:48 CET,Wed Dec 1 19:12:15 CET,0.0 0.993 1.418 1.744 2.04 2.31 2.556 2.787 3.209 3.404 3.592 3.68 4.064 4.212 4.519 4.793 5.035 5.15 5.374 5.591 5.907 6.113 6.315 6.6 6.877 7.147 7.405 7.661 7.993 8.305 8.596 8.94 9.273 9.594 9.963 10.365 10.762 11.19 11.628 12.104 12.602 13.13 13.734 14.332 15.004 15.735 16.544 17.377 18.199 18.984 19.633 19.67 19.289 18.775 18.225 17.58 16.895 16.224 15.635 15.02 14.451 13.925 13.419 12.958 12.52 12.102 11.639 11.221 10.855 10.461 10.047 9.686 9.3 8.895 8.573 8.234 7.881 7.504 7.091 6.801 6.512 6.086 5.793 5.46 5.282 4.923 4.543 4.132 3.914 3.461 3.218 2.965 2.706 2.116 1.781 1.416 1.024 0.576 0.035 -0.704 -2.696 -8 ,15215 ,KEBNE ,16749587,Wed Dec 1 17:24:03 CET,Wed Dec 1 19:16:43 CET,0.0 0.928 1.366 1.718 2.012 2.255 2.478 2.693 3.097 3.293 3.476 3.57 3.962 4.102 4.362 4.61 4.853 4.966 5.181 5.392 5.695 5.89 6.076 6.344 6.607 6.861 7.108 7.348 7.656 7.94 8.21 8.537 8.852 9.162 9.523 9.921 10.303 10.749 11.222 11.691 12.192 12.725 13.329 13.947 14.639 15.395 16.243 17.132 17.995 18.712 19.246 19.187 18.745 18.117 17.442 16.799 16.175 15.547 14.946 14.29 13.726 13.25 12.791 12.335 11.887 11.472 11.031 10.639 10.303 9.931 9.524 9.176 8.809 8.423 8.112 7.782 7.442 7.085 6.698 6.419 6.129 5.674 5.355 5.034 4.87 4.533 4.176 3.791 3.581 3.117 2.865 2.608 2.325 1.716 1.379 1.01 0.612 0.173 -0.347 -1.017 -2.403 -9 ,11949 ,KEBNE ,16749588,Wed Dec 1 17:24:03 CET,Wed Dec 1 19:16:44 CET,0.0 1.5 2.038 2.423 2.763 3.095 3.392 3.663 4.145 4.361 4.567 4.714 5.141 5.312 5.641 5.968 6.271 6.411 6.68 6.937 7.296 7.517 7.736 8.056 8.353 8.637 8.929 9.212 9.563 9.897 10.204 10.557 10.905 11.255 11.658 12.098 12.495 12.9 13.343 13.82 14.305 14.834 15.443 16.034 16.713 17.468 18.295 19.134 19.983 20.846 21.471 21.331 20.746 20.093 19.432 18.718 18.004 17.317 16.72 16.097 15.544 15.027 14.527 14.083 13.649 13.239 12.801 12.389 12.017 11.604 11.171 10.813 10.423 10.002 9.664 9.329 9.011 8.665 8.283 8.018 7.748 7.305 6.969 6.618 6.448 6.111 5.732 5.322 5.113 4.669 4.457 4.207 3.94 3.368 3.045 2.691 2.277 1.815 1.318 0.611 -1.552 -10 ,26585 ,KEBNE ,16749589,Wed Dec 1 17:24:03 CET,Wed Dec 1 19:16:19 CET,0.0 1.161 1.686 2.045 2.337 2.6 2.85 3.098 3.564 3.765 3.959 4.093 4.506 4.665 4.974 5.264 5.526 5.652 5.896 6.128 6.472 6.688 6.899 7.212 7.499 7.759 8.021 8.279 8.608 8.939 9.246 9.597 9.949 10.288 10.652 11.046 11.435 11.859 12.302 12.761 13.241 13.792 14.414 15.008 15.685 16.412 17.205 18.031 18.854 19.611 20.207 20.144 19.703 19.18 18.607 17.99 17.393 16.809 16.251 15.633 15.055 14.525 14.023 13.524 13.035 12.591 12.141 11.735 11.392 11.035 10.645 10.309 9.941 9.572 9.285 8.968 8.635 8.296 7.96 7.724 7.47 7.069 6.777 6.463 6.299 5.978 5.621 5.21 4.999 4.543 4.291 4.026 3.751 3.147 2.824 2.483 2.077 1.589 0.977 0.118 -2.69 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt deleted file mode 100644 index 6538d49e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15136 ,KEBNE ,16749590,Wed Dec 1 17:24:08 CET,Wed Dec 1 19:11:11 CET,0.0 1.757 2.394 2.881 3.288 3.654 3.998 4.303 4.834 5.084 5.316 5.484 5.915 6.106 6.493 6.849 7.174 7.335 7.651 7.938 8.339 8.605 8.866 9.249 9.63 9.982 10.314 10.645 11.065 11.46 11.838 12.278 12.697 13.109 13.598 14.153 14.674 15.248 15.857 16.488 17.167 17.956 18.88 19.779 20.791 21.901 23.148 24.477 25.966 27.65 29.485 30.636 31.012 31.025 30.796 30.421 30.048 29.669 29.271 28.802 28.408 28.055 27.672 27.27 26.895 26.559 26.171 25.819 25.512 25.177 24.814 24.462 24.056 23.631 23.305 22.983 22.644 22.284 21.929 21.684 21.423 21.022 20.723 20.392 20.229 19.897 19.532 19.156 18.959 18.522 18.318 18.073 17.797 17.211 16.878 16.491 16.073 15.632 15.087 14.336 12.731 -2 ,16839 ,KEBNE ,16749591,Wed Dec 1 17:28:16 CET,Wed Dec 1 19:22:19 CET,0.0 1.399 2.029 2.516 2.902 3.257 3.569 3.845 4.361 4.592 4.815 4.995 5.442 5.635 6.008 6.371 6.687 6.834 7.137 7.422 7.839 8.113 8.372 8.753 9.131 9.498 9.844 10.164 10.572 10.978 11.365 11.826 12.267 12.669 13.137 13.669 14.17 14.728 15.331 15.97 16.629 17.358 18.22 19.086 20.074 21.142 22.304 23.591 25.103 26.739 28.394 29.414 29.719 29.684 29.505 29.241 28.914 28.487 28.024 27.585 27.188 26.777 26.375 25.98 25.575 25.195 24.812 24.484 24.193 23.885 23.541 23.235 22.934 22.596 22.323 22.048 21.751 21.446 21.126 20.905 20.678 20.312 20.046 19.752 19.601 19.29 18.96 18.627 18.449 18.037 17.84 17.604 17.363 16.77 16.412 16.045 15.661 15.233 14.734 14.101 11.616 -3 ,15950 ,KEBNE ,16749592,Wed Dec 1 17:28:16 CET,Wed Dec 1 19:21:34 CET,0.0 1.681 2.275 2.743 3.123 3.473 3.809 4.108 4.631 4.87 5.1 5.298 5.732 5.918 6.293 6.662 6.998 7.162 7.485 7.782 8.209 8.483 8.732 9.096 9.465 9.819 10.153 10.466 10.87 11.265 11.643 12.1 12.539 12.954 13.448 13.999 14.514 15.077 15.685 16.326 16.992 17.755 18.63 19.469 20.455 21.573 22.824 24.206 25.785 27.523 29.353 30.517 30.986 31.092 30.988 30.768 30.513 30.226 29.91 29.559 29.229 28.918 28.613 28.262 27.904 27.602 27.275 26.946 26.628 26.278 25.904 25.579 25.242 24.884 24.588 24.259 23.895 23.508 23.099 22.813 22.52 22.062 21.743 21.413 21.24 20.874 20.496 20.083 19.86 19.393 19.131 18.882 18.616 18.019 17.678 17.321 16.937 16.478 15.918 15.202 13.482 -4 ,4172 ,KEBNE ,16749593,Wed Dec 1 17:31:26 CET,Wed Dec 1 19:23:34 CET,0.0 1.574 2.153 2.615 3.019 3.398 3.723 4.015 4.531 4.776 5.015 5.208 5.657 5.852 6.224 6.569 6.889 7.045 7.358 7.663 8.102 8.378 8.644 9.033 9.396 9.742 10.072 10.387 10.798 11.194 11.596 12.115 12.608 13.05 13.541 14.091 14.619 15.176 15.772 16.412 17.079 17.842 18.717 19.585 20.607 21.736 22.986 24.334 25.837 27.472 29.232 30.337 30.663 30.589 30.338 30.018 29.682 29.299 28.923 28.494 28.073 27.684 27.312 26.944 26.577 26.245 25.911 25.608 25.321 25.011 24.677 24.391 24.102 23.794 23.551 23.311 23.054 22.776 22.479 22.266 22.042 21.694 21.44 21.162 21.019 20.719 20.4 20.06 19.878 19.468 19.291 19.068 18.835 18.317 18.017 17.68 17.271 16.807 16.26 15.512 12.986 -5 ,28535 ,KEBNE ,16749594,Wed Dec 1 17:31:26 CET,Wed Dec 1 19:24:13 CET,0.0 2.049 2.712 3.239 3.666 4.049 4.384 4.67 5.184 5.43 5.667 5.855 6.29 6.479 6.832 7.16 7.481 7.64 7.942 8.232 8.665 8.935 9.185 9.552 9.904 10.245 10.586 10.908 11.305 11.69 12.085 12.57 13.02 13.447 13.937 14.484 15.001 15.562 16.152 16.786 17.466 18.207 19.052 19.917 20.927 22.012 23.199 24.545 26.066 27.681 29.441 30.58 30.953 30.947 30.776 30.523 30.174 29.802 29.474 29.109 28.761 28.435 28.096 27.757 27.408 27.072 26.734 26.431 26.139 25.816 25.497 25.227 24.929 24.622 24.376 24.113 23.839 23.55 23.254 23.045 22.808 22.398 22.122 21.856 21.721 21.42 21.07 20.682 20.476 20.044 19.844 19.613 19.368 18.845 18.546 18.213 17.858 17.439 16.902 16.156 11.443 -6 ,6209 ,KEBNE ,16749595,Wed Dec 1 17:31:26 CET,Wed Dec 1 19:24:44 CET,0.0 1.576 2.228 2.74 3.19 3.589 3.941 4.26 4.819 5.058 5.291 5.505 5.958 6.158 6.55 6.919 7.257 7.417 7.729 8.027 8.447 8.728 8.997 9.364 9.71 10.035 10.353 10.675 11.101 11.499 11.877 12.339 12.779 13.199 13.69 14.225 14.723 15.274 15.873 16.509 17.175 17.924 18.78 19.632 20.631 21.712 22.888 24.14 25.502 26.932 28.463 29.448 29.688 29.575 29.354 29.061 28.7 28.311 27.946 27.534 27.144 26.76 26.379 26.0 25.614 25.257 24.878 24.536 24.244 23.928 23.581 23.297 23.0 22.67 22.401 22.12 21.819 21.487 21.116 20.846 20.571 20.14 19.84 19.54 19.388 19.062 18.711 18.332 18.125 17.68 17.439 17.196 16.947 16.427 16.134 15.8 15.427 15.001 14.473 13.809 12.213 -7 ,32199 ,KEBNE ,16749596,Wed Dec 1 17:39:50 CET,Wed Dec 1 19:32:39 CET,0.0 1.312 1.974 2.472 2.904 3.277 3.613 3.943 4.527 4.781 5.02 5.239 5.708 5.924 6.33 6.717 7.082 7.259 7.616 7.955 8.438 8.761 9.077 9.527 9.966 10.395 10.803 11.191 11.672 12.125 12.558 13.077 13.573 14.065 14.634 15.254 15.837 16.481 17.157 17.844 18.563 19.339 20.242 21.141 22.146 23.242 24.501 25.895 27.45 29.115 30.773 31.737 31.932 31.81 31.58 31.268 30.934 30.566 30.166 29.704 29.281 28.919 28.565 28.2 27.836 27.488 27.12 26.786 26.493 26.182 25.86 25.599 25.316 24.989 24.723 24.453 24.162 23.866 23.562 23.34 23.11 22.755 22.496 22.221 22.078 21.777 21.453 21.107 20.917 20.491 20.335 20.144 19.935 19.428 19.123 18.793 18.45 18.038 17.503 16.785 14.172 -8 ,1993 ,KEBNE ,16749597,Wed Dec 1 17:39:50 CET,Wed Dec 1 19:32:48 CET,0.0 1.608 2.214 2.672 3.052 3.387 3.691 3.99 4.557 4.801 5.044 5.251 5.685 5.874 6.244 6.591 6.928 7.087 7.39 7.688 8.116 8.388 8.655 9.047 9.414 9.754 10.081 10.412 10.83 11.216 11.592 12.031 12.437 12.837 13.299 13.8 14.293 14.839 15.428 16.063 16.729 17.458 18.313 19.195 20.203 21.294 22.519 23.861 25.393 27.124 28.946 30.18 30.67 30.734 30.645 30.442 30.149 29.838 29.501 29.12 28.76 28.398 28.041 27.698 27.362 27.03 26.682 26.372 26.088 25.791 25.477 25.195 24.906 24.602 24.351 24.089 23.799 23.469 23.129 22.899 22.642 22.244 21.984 21.679 21.516 21.205 20.872 20.488 20.274 19.834 19.641 19.444 19.216 18.684 18.393 18.093 17.775 17.386 16.927 16.294 13.931 -9 ,17446 ,KEBNE ,16749598,Wed Dec 1 17:39:49 CET,Wed Dec 1 19:32:09 CET,0.0 1.679 2.249 2.689 3.079 3.433 3.748 4.039 4.558 4.797 5.021 5.2 5.66 5.878 6.315 6.758 7.203 7.423 7.834 8.206 8.742 9.079 9.363 9.736 10.088 10.42 10.741 11.054 11.465 11.87 12.259 12.712 13.14 13.567 14.062 14.599 15.113 15.695 16.329 16.998 17.677 18.435 19.327 20.191 21.184 22.275 23.513 24.873 26.365 28.038 29.924 31.132 31.522 31.536 31.352 31.042 30.72 30.414 30.11 29.732 29.367 29.019 28.661 28.339 28.038 27.736 27.398 27.087 26.824 26.548 26.253 26.004 25.743 25.454 25.215 24.959 24.701 24.433 24.144 23.94 23.725 23.351 23.071 22.793 22.652 22.356 22.033 21.687 21.5 21.069 20.873 20.656 20.415 19.851 19.527 19.197 18.865 18.446 17.923 17.226 14.989 -10 ,31120 ,KEBNE ,16749599,Wed Dec 1 17:39:50 CET,Wed Dec 1 19:32:43 CET,0.0 1.542 2.159 2.701 3.191 3.605 3.957 4.295 4.933 5.225 5.501 5.769 6.253 6.497 6.95 7.37 7.766 7.957 8.326 8.668 9.148 9.45 9.727 10.1 10.448 10.793 11.126 11.444 11.846 12.226 12.59 13.025 13.441 13.837 14.297 14.836 15.369 15.972 16.61 17.241 17.91 18.653 19.541 20.425 21.396 22.471 23.674 24.993 26.49 28.134 29.867 30.965 31.253 31.13 30.873 30.529 30.13 29.752 29.391 28.961 28.553 28.167 27.78 27.405 27.029 26.669 26.28 25.934 25.634 25.298 24.932 24.643 24.36 24.037 23.77 23.493 23.195 22.89 22.575 22.356 22.115 21.71 21.424 21.14 21.004 20.705 20.391 20.074 19.898 19.488 19.302 19.087 18.858 18.394 18.136 17.84 17.501 17.089 16.595 15.905 13.219 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index bb9fe296..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20795 ,KEBNE ,16749600,Wed Dec 1 17:39:49 CET,Wed Dec 1 19:32:17 CET,0.0 1.303 1.884 2.324 2.671 2.957 3.227 3.498 3.991 4.217 4.433 4.606 5.027 5.211 5.565 5.9 6.219 6.371 6.664 6.946 7.357 7.641 7.915 8.294 8.665 9.031 9.381 9.713 10.137 10.547 10.953 11.455 11.93 12.369 12.891 13.483 14.029 14.633 15.298 16.006 16.746 17.56 18.504 19.453 20.525 21.658 22.913 24.309 25.772 27.017 27.845 27.882 27.434 26.745 25.981 25.225 24.468 23.704 22.991 22.252 21.619 21.053 20.511 19.982 19.482 19.037 18.555 18.098 17.702 17.289 16.848 16.482 16.105 15.703 15.391 15.06 14.705 14.346 13.978 13.725 13.46 13.055 12.75 12.394 12.219 11.871 11.487 11.081 10.87 10.432 10.165 9.901 9.618 9.003 8.689 8.345 7.96 7.521 6.979 6.227 3.273 -2 ,4652 ,KEBNE ,16749601,Wed Dec 1 17:39:50 CET,Wed Dec 1 19:31:33 CET,0.0 1.123 1.597 1.955 2.264 2.534 2.788 3.037 3.469 3.652 3.827 3.95 4.337 4.487 4.771 5.043 5.309 5.443 5.689 5.92 6.264 6.488 6.703 7.023 7.328 7.606 7.872 8.125 8.452 8.773 9.078 9.438 9.781 10.114 10.505 10.942 11.353 11.803 12.285 12.784 13.313 13.909 14.599 15.263 16.012 16.834 17.766 18.811 19.973 21.404 22.77 23.256 23.031 22.441 21.79 21.044 20.324 19.602 18.919 18.204 17.593 17.047 16.491 15.967 15.467 15.0 14.536 14.097 13.705 13.311 12.906 12.563 12.188 11.784 11.463 11.143 10.805 10.439 10.053 9.777 9.499 9.059 8.75 8.449 8.294 7.958 7.581 7.167 6.952 6.505 6.222 5.964 5.698 5.085 4.758 4.42 4.017 3.539 2.963 2.137 -0.352 -3 ,14409 ,KEBNE ,16749602,Wed Dec 1 17:39:50 CET,Wed Dec 1 19:31:31 CET,0.0 1.455 1.998 2.437 2.81 3.133 3.417 3.668 4.133 4.358 4.574 4.769 5.193 5.38 5.741 6.079 6.396 6.543 6.819 7.088 7.489 7.769 8.036 8.412 8.773 9.112 9.437 9.751 10.158 10.556 10.945 11.428 11.9 12.326 12.839 13.457 14.037 14.651 15.295 15.961 16.618 17.348 18.233 19.089 20.042 21.103 22.334 23.702 25.126 26.61 27.872 28.158 27.701 27.044 26.404 25.72 25.103 24.482 23.881 23.245 22.656 22.104 21.558 21.04 20.548 20.065 19.566 19.132 18.737 18.306 17.838 17.461 17.097 16.723 16.432 16.135 15.804 15.453 15.092 14.839 14.573 14.131 13.824 13.51 13.343 12.993 12.638 12.24 12.016 11.564 11.299 11.041 10.767 10.164 9.833 9.476 9.073 8.593 7.98 7.169 4.914 -4 ,30899 ,KEBNE ,16749603,Wed Dec 1 17:39:49 CET,Wed Dec 1 19:32:21 CET,0.0 1.393 1.908 2.309 2.662 2.979 3.246 3.504 4.002 4.226 4.433 4.588 4.999 5.182 5.532 5.863 6.177 6.337 6.651 6.939 7.345 7.601 7.852 8.224 8.593 8.954 9.297 9.632 10.072 10.495 10.888 11.346 11.796 12.227 12.721 13.295 13.87 14.49 15.13 15.802 16.491 17.248 18.126 19.067 20.15 21.227 22.458 23.838 25.401 27.108 28.49 28.863 28.483 27.828 27.128 26.357 25.571 24.789 24.087 23.401 22.801 22.258 21.741 21.206 20.682 20.22 19.724 19.265 18.872 18.448 17.996 17.627 17.242 16.848 16.541 16.218 15.878 15.515 15.141 14.887 14.627 14.196 13.879 13.55 13.386 13.055 12.71 12.33 12.122 11.69 11.447 11.199 10.942 10.359 10.026 9.66 9.24 8.753 8.14 7.282 4.585 -5 ,15390 ,KEBNE ,16749604,Wed Dec 1 17:39:49 CET,Wed Dec 1 19:31:44 CET,0.0 1.39 1.913 2.311 2.639 2.929 3.193 3.445 3.914 4.123 4.326 4.497 4.903 5.084 5.432 5.776 6.104 6.262 6.566 6.859 7.276 7.539 7.802 8.177 8.518 8.844 9.169 9.485 9.903 10.311 10.694 11.162 11.613 12.048 12.577 13.16 13.686 14.261 14.894 15.563 16.26 17.008 17.863 18.721 19.687 20.769 22.017 23.347 24.815 26.293 27.467 27.56 27.082 26.377 25.539 24.685 23.883 23.148 22.474 21.773 21.159 20.604 20.034 19.491 19.013 18.563 18.066 17.595 17.191 16.761 16.282 15.897 15.504 15.093 14.774 14.44 14.084 13.71 13.335 13.079 12.809 12.352 12.018 11.674 11.487 11.071 10.656 10.235 10.008 9.559 9.275 8.996 8.703 8.035 7.68 7.293 6.837 6.321 5.678 4.823 2.295 -6 ,8604 ,KEBNE ,16749605,Wed Dec 1 17:47:15 CET,Wed Dec 1 19:39:44 CET,0.0 1.35 1.908 2.336 2.693 3.01 3.293 3.552 4.031 4.242 4.438 4.589 4.988 5.176 5.539 5.881 6.206 6.364 6.674 6.97 7.398 7.662 7.913 8.269 8.605 8.937 9.276 9.602 10.002 10.388 10.76 11.218 11.674 12.105 12.597 13.156 13.692 14.298 14.965 15.637 16.321 17.111 18.021 18.906 19.919 21.022 22.299 23.724 25.224 26.586 27.707 27.868 27.658 27.213 26.466 25.748 25.052 24.314 23.607 22.82 22.126 21.55 21.013 20.462 19.934 19.479 19.001 18.555 18.169 17.779 17.374 17.016 16.634 16.216 15.891 15.565 15.2 14.818 14.446 14.182 13.912 13.492 13.193 12.877 12.716 12.381 12.004 11.607 11.394 10.938 10.671 10.419 10.156 9.57 9.232 8.865 8.454 7.941 7.336 6.56 4.225 -7 ,25911 ,KEBNE ,16749606,Wed Dec 1 17:47:15 CET,Wed Dec 1 19:40:14 CET,0.0 1.433 1.981 2.363 2.689 2.988 3.274 3.538 4.022 4.248 4.454 4.613 5.025 5.215 5.567 5.894 6.205 6.355 6.644 6.925 7.329 7.593 7.862 8.257 8.619 8.963 9.302 9.635 10.075 10.501 10.896 11.364 11.82 12.264 12.777 13.344 13.894 14.481 15.1 15.786 16.516 17.293 18.172 19.057 20.058 21.17 22.413 23.773 25.178 26.43 27.576 27.997 27.665 27.013 26.27 25.567 24.884 24.17 23.529 22.881 22.318 21.803 21.297 20.794 20.274 19.794 19.283 18.789 18.388 17.998 17.571 17.212 16.829 16.413 16.084 15.718 15.346 14.963 14.557 14.294 14.002 13.503 13.169 12.827 12.647 12.264 11.852 11.441 11.22 10.758 10.479 10.203 9.895 9.202 8.822 8.428 7.999 7.497 6.877 6.036 3.494 -8 ,16183 ,KEBNE ,16749607,Wed Dec 1 17:54:38 CET,Wed Dec 1 19:46:50 CET,0.0 1.12 1.667 2.12 2.495 2.808 3.102 3.377 3.874 4.104 4.317 4.476 4.889 5.074 5.425 5.77 6.082 6.222 6.487 6.761 7.174 7.433 7.684 8.035 8.365 8.69 9.002 9.315 9.734 10.141 10.529 10.989 11.422 11.846 12.326 12.872 13.446 14.084 14.746 15.411 16.1 16.908 17.822 18.73 19.773 20.854 22.006 23.232 24.592 25.93 27.002 27.269 26.978 26.408 25.663 24.869 24.146 23.442 22.84 22.246 21.638 21.064 20.519 19.994 19.515 19.067 18.595 18.164 17.792 17.403 16.986 16.637 16.275 15.886 15.568 15.242 14.91 14.571 14.23 13.989 13.719 13.261 12.935 12.613 12.452 12.113 11.757 11.385 11.175 10.739 10.454 10.122 9.722 8.81 8.314 7.767 7.151 6.454 5.626 4.5 1.025 -9 ,29577 ,KEBNE ,16749608,Wed Dec 1 17:54:37 CET,Wed Dec 1 19:46:24 CET,0.0 1.653 2.205 2.68 3.092 3.426 3.721 3.981 4.454 4.664 4.871 5.051 5.474 5.663 6.014 6.352 6.685 6.853 7.18 7.486 7.911 8.177 8.441 8.822 9.189 9.546 9.893 10.218 10.628 11.037 11.433 11.916 12.394 12.847 13.371 13.955 14.5 15.113 15.796 16.515 17.261 18.096 19.066 20.045 21.15 22.315 23.547 24.87 26.321 27.798 29.237 29.818 29.634 29.078 28.382 27.698 26.993 26.256 25.555 24.839 24.215 23.635 23.082 22.586 22.115 21.641 21.135 20.674 20.253 19.814 19.37 19.004 18.602 18.175 17.84 17.474 17.082 16.675 16.242 15.944 15.644 15.173 14.848 14.487 14.287 13.87 13.436 12.97 12.728 12.256 11.903 11.614 11.308 10.625 10.243 9.82 9.358 8.816 8.172 7.358 4.694 -10 ,3352 ,KEBNE ,16749609,Wed Dec 1 17:54:39 CET,Wed Dec 1 19:47:07 CET,0.0 1.159 1.688 2.107 2.462 2.777 3.05 3.304 3.796 4.029 4.254 4.435 4.843 5.024 5.367 5.693 6.018 6.172 6.46 6.736 7.135 7.394 7.65 8.039 8.406 8.754 9.102 9.431 9.843 10.234 10.608 11.068 11.521 11.957 12.461 13.044 13.59 14.185 14.836 15.514 16.207 16.971 17.866 18.75 19.718 20.845 22.123 23.373 24.679 25.956 26.866 26.94 26.476 25.697 24.841 24.01 23.252 22.523 21.809 21.049 20.41 19.854 19.308 18.777 18.282 17.822 17.32 16.856 16.449 16.02 15.568 15.166 14.743 14.336 14.025 13.69 13.32 12.936 12.548 12.257 11.93 11.437 11.102 10.722 10.525 10.124 9.69 9.245 9.017 8.557 8.25 7.97 7.66 6.952 6.571 6.169 5.717 5.192 4.559 3.706 1.3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt deleted file mode 100644 index 23ed11de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22331 ,KEBNE ,16749610,Wed Dec 1 17:54:38 CET,Wed Dec 1 19:48:13 CET,0.0 4.262 5.11 5.714 6.192 6.592 6.937 7.241 7.769 8.006 8.228 8.423 8.846 9.036 9.414 9.784 10.122 10.278 10.577 10.865 11.273 11.524 11.766 12.106 12.43 12.747 13.056 13.352 13.709 14.047 14.376 14.758 15.113 15.454 15.848 16.291 16.728 17.203 17.68 18.17 18.674 19.216 19.824 20.37 20.959 21.573 22.218 22.91 23.535 23.914 23.748 22.83 21.729 20.67 19.698 18.7 17.759 16.929 16.184 15.429 14.755 14.135 13.541 12.96 12.415 11.915 11.39 10.909 10.493 10.063 9.616 9.245 8.842 8.418 8.076 7.722 7.372 7.005 6.611 6.325 6.024 5.568 5.254 4.922 4.75 4.398 4.034 3.651 3.445 3.01 2.803 2.568 2.31 1.74 1.425 1.058 0.635 0.131 -0.523 -1.382 -4.307 -2 ,12179 ,KEBNE ,16749611,Wed Dec 1 17:54:38 CET,Wed Dec 1 19:47:23 CET,0.0 3.126 3.979 4.566 5.062 5.467 5.824 6.149 6.714 6.968 7.203 7.427 7.865 8.066 8.433 8.778 9.111 9.265 9.558 9.843 10.245 10.5 10.75 11.121 11.466 11.757 12.031 12.318 12.696 13.046 13.385 13.782 14.156 14.515 14.898 15.314 15.714 16.149 16.601 17.09 17.613 18.195 18.875 19.506 20.126 20.729 21.396 22.048 22.585 22.978 22.979 22.213 21.163 20.13 19.179 18.262 17.398 16.564 15.844 15.074 14.385 13.809 13.25 12.702 12.17 11.67 11.119 10.62 10.197 9.766 9.317 8.923 8.511 8.093 7.762 7.422 7.083 6.722 6.346 6.081 5.805 5.354 5.044 4.74 4.57 4.202 3.833 3.445 3.228 2.762 2.49 2.228 1.941 1.292 0.92 0.527 0.106 -0.399 -1.011 -1.835 -4.597 -3 ,27335 ,KEBNE ,16749612,Wed Dec 1 17:54:38 CET,Wed Dec 1 19:47:11 CET,0.0 3.129 3.944 4.55 5.04 5.455 5.818 6.13 6.68 6.946 7.218 7.473 7.914 8.124 8.508 8.862 9.214 9.379 9.684 9.97 10.381 10.643 10.897 11.262 11.591 11.894 12.179 12.457 12.827 13.182 13.503 13.875 14.23 14.554 14.937 15.397 15.82 16.25 16.697 17.174 17.695 18.257 18.866 19.452 20.097 20.812 21.63 22.346 22.947 23.446 23.36 22.487 21.398 20.311 19.355 18.471 17.661 16.928 16.282 15.611 15.02 14.468 13.927 13.403 12.9 12.43 11.92 11.467 11.088 10.681 10.22 9.833 9.448 9.036 8.729 8.414 8.078 7.741 7.374 7.094 6.81 6.388 6.082 5.766 5.602 5.235 4.855 4.478 4.269 3.809 3.547 3.282 2.995 2.354 2.006 1.615 1.185 0.707 0.109 -0.727 -3.802 -4 ,18192 ,KEBNE ,16749613,Wed Dec 1 17:54:39 CET,Wed Dec 1 19:47:54 CET,0.0 3.352 4.135 4.676 5.129 5.555 5.93 6.259 6.81 7.047 7.284 7.511 7.957 8.175 8.586 8.951 9.263 9.407 9.695 9.97 10.353 10.6 10.838 11.169 11.491 11.816 12.12 12.409 12.759 13.08 13.399 13.769 14.12 14.468 14.848 15.264 15.692 16.146 16.601 17.07 17.537 18.036 18.593 19.117 19.709 20.397 21.143 21.816 22.354 22.715 22.531 21.603 20.522 19.416 18.406 17.477 16.615 15.833 15.174 14.494 13.874 13.303 12.75 12.207 11.689 11.2 10.695 10.25 9.863 9.468 9.044 8.692 8.32 7.93 7.628 7.31 6.99 6.661 6.318 6.076 5.813 5.402 5.112 4.812 4.661 4.349 4.005 3.618 3.41 2.964 2.755 2.508 2.239 1.621 1.281 0.917 0.506 0.053 -0.511 -1.31 -3.989 -5 ,14921 ,KEBNE ,16749614,Wed Dec 1 17:54:39 CET,Wed Dec 1 19:47:42 CET,0.0 3.212 4.037 4.638 5.139 5.579 5.989 6.331 6.901 7.171 7.419 7.628 8.059 8.251 8.641 9.013 9.343 9.495 9.786 10.064 10.467 10.729 10.974 11.324 11.645 11.935 12.225 12.507 12.877 13.234 13.559 13.935 14.286 14.603 14.963 15.399 15.783 16.161 16.58 17.026 17.491 17.991 18.545 19.07 19.668 20.291 20.884 21.477 22.067 22.481 22.342 21.589 20.718 19.801 18.887 17.965 17.126 16.342 15.643 14.928 14.293 13.722 13.166 12.628 12.118 11.651 11.151 10.689 10.298 9.892 9.477 9.13 8.76 8.367 8.069 7.769 7.454 7.112 6.745 6.49 6.223 5.802 5.514 5.21 5.055 4.741 4.406 4.045 3.856 3.437 3.236 3.004 2.744 2.142 1.8 1.428 1.001 0.473 -0.179 -1.061 -4.132 -6 ,19697 ,KEBNE ,16749615,Wed Dec 1 17:54:39 CET,Wed Dec 1 19:46:50 CET,0.0 3.202 4.004 4.562 5.009 5.417 5.783 6.135 6.836 7.139 7.389 7.613 8.028 8.207 8.565 8.917 9.241 9.393 9.677 9.952 10.346 10.591 10.838 11.19 11.513 11.825 12.123 12.405 12.756 13.105 13.454 13.845 14.204 14.54 14.911 15.335 15.761 16.236 16.73 17.235 17.75 18.3 18.875 19.371 19.905 20.504 21.215 22.002 22.717 23.133 23.091 22.326 21.223 20.19 19.245 18.246 17.346 16.538 15.797 15.043 14.373 13.766 13.172 12.606 12.11 11.646 11.137 10.683 10.291 9.883 9.455 9.09 8.701 8.297 7.994 7.661 7.297 6.942 6.572 6.303 6.03 5.594 5.284 4.96 4.797 4.462 4.091 3.703 3.498 3.055 2.824 2.581 2.32 1.759 1.432 1.064 0.672 0.2 -0.381 -1.218 -4.729 -7 ,22948 ,KEBNE ,16749616,Wed Dec 1 17:54:38 CET,Wed Dec 1 19:48:00 CET,0.0 3.129 4.011 4.604 5.053 5.46 5.826 6.154 6.729 6.988 7.222 7.447 7.892 8.098 8.491 8.9 9.296 9.471 9.797 10.114 10.561 10.828 11.078 11.424 11.749 12.056 12.354 12.649 13.016 13.36 13.689 14.085 14.441 14.762 15.128 15.544 15.95 16.388 16.843 17.304 17.783 18.313 18.907 19.473 20.062 20.662 21.319 21.974 22.555 22.972 22.875 21.958 20.915 19.895 18.927 18.007 17.162 16.353 15.657 14.974 14.376 13.857 13.339 12.819 12.312 11.845 11.377 10.949 10.567 10.151 9.684 9.31 8.93 8.526 8.228 7.917 7.568 7.2 6.821 6.548 6.263 5.8 5.463 5.12 4.945 4.575 4.191 3.779 3.549 3.07 2.79 2.514 2.227 1.616 1.252 0.838 0.381 -0.129 -0.764 -1.661 -5.117 -8 ,2611 ,KEBNE ,16749617,Wed Dec 1 17:54:41 CET,Wed Dec 1 19:43:15 CET,0.0 3.332 4.127 4.698 5.199 5.633 5.984 6.297 6.865 7.118 7.358 7.591 8.034 8.244 8.637 8.984 9.3 9.458 9.758 10.047 10.451 10.697 10.937 11.293 11.648 11.976 12.276 12.562 12.914 13.241 13.567 13.961 14.331 14.688 15.099 15.549 15.961 16.4 16.868 17.336 17.823 18.377 18.982 19.573 20.256 20.955 21.693 22.437 23.132 23.626 23.759 23.15 22.272 21.288 20.26 19.311 18.421 17.536 16.756 15.983 15.32 14.725 14.134 13.559 13.033 12.545 12.005 11.528 11.121 10.699 10.261 9.877 9.481 9.092 8.786 8.465 8.127 7.766 7.372 7.088 6.811 6.407 6.128 5.833 5.669 5.308 4.944 4.552 4.344 3.9 3.671 3.419 3.156 2.552 2.217 1.87 1.46 0.945 0.318 -0.539 -3.411 -9 ,24795 ,KEBNE ,16749618,Wed Dec 1 17:54:42 CET,Wed Dec 1 19:41:46 CET,0.0 3.208 4.048 4.681 5.194 5.619 5.981 6.299 6.885 7.162 7.423 7.676 8.107 8.293 8.67 9.028 9.377 9.543 9.84 10.123 10.522 10.766 10.998 11.346 11.676 11.984 12.272 12.549 12.919 13.275 13.601 13.978 14.338 14.685 15.067 15.468 15.852 16.267 16.715 17.177 17.65 18.177 18.763 19.312 19.87 20.419 21.016 21.578 21.982 22.11 21.774 20.848 19.746 18.608 17.55 16.604 15.739 14.925 14.217 13.494 12.856 12.278 11.736 11.224 10.741 10.29 9.799 9.385 9.038 8.655 8.253 7.913 7.546 7.167 6.873 6.565 6.233 5.882 5.52 5.269 5.002 4.597 4.314 4.011 3.848 3.507 3.16 2.785 2.59 2.144 1.916 1.665 1.397 0.838 0.533 0.193 -0.191 -0.646 -1.215 -1.943 -4.246 -10 ,5325 ,KEBNE ,16749619,Wed Dec 1 17:54:38 CET,Wed Dec 1 19:47:08 CET,0.0 2.437 3.141 3.678 4.118 4.501 4.849 5.169 5.74 5.987 6.225 6.451 6.889 7.102 7.489 7.825 8.145 8.298 8.594 8.876 9.28 9.529 9.764 10.108 10.424 10.718 11.001 11.272 11.619 11.951 12.272 12.647 12.999 13.327 13.691 14.102 14.483 14.886 15.332 15.801 16.268 16.795 17.385 17.958 18.637 19.275 19.851 20.408 20.956 21.32 21.084 20.184 19.228 18.218 17.194 16.258 15.436 14.673 13.971 13.222 12.551 11.936 11.35 10.812 10.319 9.85 9.344 8.887 8.465 8.006 7.549 7.177 6.767 6.336 6.012 5.672 5.328 4.959 4.547 4.274 3.995 3.561 3.266 2.941 2.771 2.424 2.058 1.661 1.436 0.97 0.758 0.516 0.249 -0.347 -0.687 -1.063 -1.499 -2.015 -2.642 -3.529 -6.853 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt deleted file mode 100644 index 7cc406c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29701 ,KEBNE ,16749620,Wed Dec 1 17:54:38 CET,Wed Dec 1 19:45:43 CET,0.0 1.371 1.947 2.382 2.732 3.007 3.254 3.501 3.901 4.064 4.228 4.345 4.664 4.802 5.046 5.271 5.486 5.59 5.803 6.013 6.299 6.482 6.668 6.935 7.174 7.393 7.598 7.797 8.047 8.267 8.474 8.736 8.99 9.217 9.471 9.736 9.978 10.26 10.539 10.82 11.11 11.425 11.757 12.03 12.284 12.539 12.748 12.874 12.88 12.515 11.32 9.466 7.847 6.496 5.284 4.066 2.948 1.932 1.056 0.189 -0.566 -1.248 -1.901 -2.483 -3.033 -3.552 -4.094 -4.581 -4.991 -5.419 -5.862 -6.228 -6.621 -7.057 -7.394 -7.734 -8.087 -8.467 -8.899 -9.193 -9.497 -9.966 -10.298 -10.678 -10.872 -11.256 -11.66 -12.079 -12.29 -12.708 -12.989 -13.25 -13.513 -14.099 -14.435 -14.807 -15.219 -15.698 -16.278 -16.999 -18.875 -2 ,27776 ,KEBNE ,16749621,Wed Dec 1 17:54:38 CET,Wed Dec 1 19:45:39 CET,0.0 1.291 1.825 2.185 2.507 2.794 3.039 3.264 3.664 3.847 4.013 4.127 4.448 4.58 4.84 5.081 5.295 5.399 5.601 5.796 6.07 6.237 6.399 6.63 6.853 7.066 7.26 7.453 7.699 7.924 8.142 8.399 8.625 8.835 9.084 9.363 9.617 9.887 10.171 10.448 10.712 10.991 11.299 11.583 11.867 12.1 12.258 12.314 12.291 12.04 11.059 9.504 8.135 6.854 5.694 4.548 3.443 2.466 1.648 0.849 0.172 -0.448 -1.039 -1.584 -2.088 -2.559 -3.049 -3.469 -3.838 -4.244 -4.67 -5.024 -5.431 -5.862 -6.169 -6.517 -6.928 -7.344 -7.761 -8.045 -8.33 -8.786 -9.117 -9.45 -9.616 -9.935 -10.244 -10.599 -10.798 -11.202 -11.414 -11.627 -11.848 -12.35 -12.632 -12.939 -13.286 -13.693 -14.217 -14.914 -16.678 -3 ,31540 ,KEBNE ,16749622,Wed Dec 1 17:54:46 CET,Wed Dec 1 19:46:41 CET,0.0 1.394 1.85 2.203 2.526 2.81 3.037 3.242 3.62 3.792 3.955 4.088 4.411 4.547 4.801 5.029 5.239 5.338 5.527 5.717 6.0 6.174 6.337 6.571 6.79 6.997 7.2 7.39 7.614 7.829 8.036 8.277 8.512 8.716 8.937 9.203 9.454 9.707 9.971 10.242 10.492 10.767 11.073 11.322 11.57 11.806 12.005 12.178 12.245 11.975 11.094 9.592 8.153 6.911 5.768 4.71 3.782 2.949 2.193 1.38 0.674 0.007 -0.618 -1.192 -1.759 -2.257 -2.746 -3.216 -3.644 -4.077 -4.507 -4.861 -5.252 -5.677 -5.995 -6.312 -6.651 -6.992 -7.352 -7.608 -7.869 -8.287 -8.58 -8.882 -9.037 -9.363 -9.706 -10.092 -10.291 -10.68 -10.893 -11.139 -11.385 -11.888 -12.174 -12.479 -12.816 -13.212 -13.708 -14.31 -15.917 -4 ,14620 ,KEBNE ,16749623,Wed Dec 1 17:54:46 CET,Wed Dec 1 19:45:35 CET,0.0 1.099 1.603 2.015 2.369 2.655 2.892 3.105 3.5 3.666 3.814 3.916 4.236 4.364 4.607 4.856 5.075 5.182 5.395 5.582 5.848 6.02 6.185 6.415 6.63 6.842 7.047 7.23 7.46 7.689 7.913 8.176 8.414 8.639 8.891 9.152 9.412 9.699 9.983 10.275 10.562 10.858 11.142 11.371 11.587 11.8 11.982 12.05 12.001 11.653 10.539 8.849 7.285 5.832 4.571 3.427 2.475 1.642 0.868 0.049 -0.664 -1.291 -1.888 -2.468 -3.022 -3.513 -4.027 -4.518 -4.976 -5.468 -5.972 -6.37 -6.774 -7.202 -7.527 -7.877 -8.272 -8.678 -9.076 -9.352 -9.653 -10.119 -10.433 -10.77 -10.943 -11.3 -11.697 -12.142 -12.364 -12.785 -13.074 -13.345 -13.615 -14.196 -14.521 -14.871 -15.27 -15.727 -16.278 -17.042 -19.772 -5 ,11469 ,KEBNE ,16749624,Wed Dec 1 17:54:37 CET,Wed Dec 1 19:44:20 CET,0.0 1.42 1.968 2.378 2.714 3.004 3.275 3.535 3.947 4.127 4.293 4.43 4.748 4.876 5.127 5.372 5.607 5.719 5.935 6.133 6.438 6.633 6.798 7.051 7.308 7.533 7.73 7.916 8.162 8.395 8.617 8.869 9.095 9.312 9.547 9.794 10.027 10.269 10.514 10.758 11.006 11.283 11.576 11.84 12.092 12.294 12.489 12.635 12.601 12.264 11.344 9.782 8.287 6.963 5.792 4.742 3.793 2.933 2.179 1.429 0.799 0.219 -0.323 -0.837 -1.338 -1.795 -2.273 -2.714 -3.09 -3.455 -3.842 -4.167 -4.502 -4.884 -5.191 -5.503 -5.827 -6.14 -6.464 -6.7 -6.938 -7.314 -7.579 -7.848 -7.986 -8.297 -8.641 -9.015 -9.217 -9.627 -9.862 -10.102 -10.356 -10.936 -11.274 -11.621 -11.942 -12.298 -12.746 -13.399 -16.113 -6 ,6112 ,KEBNE ,16749625,Wed Dec 1 17:54:38 CET,Wed Dec 1 19:46:46 CET,0.0 1.332 1.784 2.14 2.441 2.721 2.972 3.197 3.583 3.753 3.929 4.072 4.4 4.539 4.781 5.0 5.208 5.306 5.494 5.673 5.934 6.104 6.265 6.479 6.694 6.908 7.102 7.282 7.513 7.741 7.954 8.198 8.437 8.667 8.919 9.19 9.446 9.706 9.967 10.263 10.576 10.894 11.197 11.456 11.704 11.915 12.108 12.164 12.079 11.734 10.706 9.14 7.694 6.375 5.141 4.035 3.084 2.211 1.43 0.624 -0.06 -0.667 -1.261 -1.834 -2.365 -2.824 -3.27 -3.665 -4.02 -4.399 -4.804 -5.165 -5.546 -5.932 -6.241 -6.566 -6.915 -7.276 -7.64 -7.916 -8.215 -8.643 -8.926 -9.231 -9.39 -9.706 -10.042 -10.427 -10.625 -11.026 -11.236 -11.451 -11.683 -12.2 -12.482 -12.809 -13.192 -13.61 -14.093 -14.77 -17.521 -7 ,31043 ,KEBNE ,16749626,Wed Dec 1 17:54:38 CET,Wed Dec 1 19:46:45 CET,0.0 1.401 1.927 2.265 2.541 2.811 3.052 3.25 3.615 3.784 3.956 4.109 4.439 4.585 4.863 5.121 5.364 5.473 5.684 5.886 6.153 6.309 6.462 6.685 6.89 7.096 7.303 7.495 7.721 7.942 8.147 8.389 8.628 8.838 9.068 9.32 9.555 9.811 10.065 10.324 10.6 10.897 11.185 11.429 11.657 11.868 12.067 12.2 12.184 11.843 10.941 9.55 8.153 6.885 5.77 4.807 3.911 3.034 2.27 1.488 0.808 0.191 -0.372 -0.888 -1.391 -1.858 -2.342 -2.794 -3.188 -3.598 -4.05 -4.426 -4.806 -5.201 -5.493 -5.795 -6.109 -6.416 -6.744 -6.976 -7.209 -7.599 -7.894 -8.199 -8.347 -8.656 -8.986 -9.346 -9.541 -9.938 -10.122 -10.328 -10.543 -11.03 -11.348 -11.685 -12.054 -12.466 -12.902 -13.456 -15.241 -8 ,503 ,KEBNE ,16749627,Wed Dec 1 17:54:38 CET,Wed Dec 1 19:45:47 CET,0.0 1.194 1.683 2.031 2.324 2.593 2.831 3.026 3.373 3.554 3.726 3.857 4.184 4.317 4.567 4.799 5.018 5.121 5.321 5.514 5.764 5.914 6.069 6.298 6.514 6.715 6.901 7.072 7.285 7.489 7.682 7.908 8.122 8.32 8.546 8.796 9.012 9.238 9.5 9.76 10.021 10.309 10.59 10.823 11.052 11.271 11.468 11.582 11.561 11.253 10.182 8.491 6.932 5.516 4.222 3.035 2.003 1.028 0.194 -0.611 -1.288 -1.903 -2.526 -3.093 -3.602 -4.076 -4.582 -5.039 -5.431 -5.843 -6.269 -6.619 -6.988 -7.372 -7.662 -7.954 -8.264 -8.593 -8.957 -9.221 -9.479 -9.88 -10.152 -10.436 -10.584 -10.892 -11.235 -11.585 -11.756 -12.139 -12.339 -12.557 -12.787 -13.289 -13.568 -13.867 -14.193 -14.581 -15.041 -15.661 -17.941 -9 ,5165 ,KEBNE ,16749628,Wed Dec 1 17:55:42 CET,Wed Dec 1 19:47:47 CET,0.0 1.069 1.515 1.864 2.166 2.437 2.696 2.92 3.332 3.522 3.687 3.813 4.14 4.286 4.572 4.831 5.067 5.174 5.376 5.571 5.852 6.024 6.188 6.435 6.673 6.899 7.116 7.319 7.569 7.795 8.008 8.267 8.51 8.737 8.997 9.279 9.544 9.822 10.108 10.399 10.674 10.975 11.287 11.562 11.869 12.163 12.391 12.538 12.561 12.268 11.362 9.949 8.579 7.344 6.257 5.268 4.339 3.442 2.665 1.888 1.225 0.603 0.006 -0.524 -1.02 -1.48 -1.944 -2.355 -2.724 -3.115 -3.516 -3.867 -4.246 -4.637 -4.938 -5.265 -5.619 -5.959 -6.298 -6.541 -6.792 -7.182 -7.446 -7.726 -7.875 -8.184 -8.499 -8.833 -9.021 -9.417 -9.651 -9.886 -10.115 -10.593 -10.862 -11.16 -11.515 -11.931 -12.404 -12.996 -14.54 -10 ,6214 ,KEBNE ,16749629,Wed Dec 1 17:58:53 CET,Wed Dec 1 19:49:19 CET,0.0 1.095 1.557 1.91 2.207 2.484 2.731 2.945 3.306 3.472 3.623 3.719 4.037 4.169 4.419 4.638 4.829 4.927 5.114 5.286 5.533 5.685 5.834 6.062 6.278 6.49 6.691 6.877 7.11 7.316 7.504 7.73 7.962 8.174 8.407 8.682 8.942 9.2 9.471 9.749 10.007 10.275 10.547 10.797 11.053 11.234 11.362 11.443 11.387 11.14 10.491 9.327 8.145 6.933 5.782 4.685 3.674 2.774 2.013 1.221 0.522 -0.125 -0.761 -1.341 -1.876 -2.367 -2.905 -3.38 -3.775 -4.21 -4.685 -5.083 -5.477 -5.88 -6.197 -6.516 -6.858 -7.208 -7.58 -7.849 -8.121 -8.523 -8.792 -9.084 -9.239 -9.547 -9.875 -10.239 -10.432 -10.845 -11.066 -11.268 -11.479 -12.002 -12.304 -12.614 -12.984 -13.401 -13.876 -14.45 -16.244 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 92dcff25..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7710 ,KEBNE ,16749630,Wed Dec 1 17:58:53 CET,Wed Dec 1 19:49:20 CET,0.0 1.35 1.865 2.279 2.596 2.848 3.071 3.26 3.599 3.755 3.911 4.05 4.363 4.496 4.747 4.977 5.187 5.297 5.512 5.714 6.014 6.201 6.378 6.62 6.852 7.068 7.255 7.454 7.723 7.965 8.2 8.475 8.721 8.936 9.167 9.424 9.672 9.946 10.252 10.572 10.895 11.22 11.542 11.808 12.066 12.323 12.55 12.699 12.721 12.384 11.306 9.77 8.292 6.92 5.723 4.632 3.656 2.763 1.995 1.217 0.541 -0.059 -0.615 -1.159 -1.677 -2.127 -2.587 -3.004 -3.37 -3.761 -4.176 -4.509 -4.852 -5.204 -5.473 -5.75 -6.028 -6.318 -6.637 -6.853 -7.077 -7.44 -7.681 -7.933 -8.066 -8.336 -8.622 -8.926 -9.096 -9.461 -9.648 -9.842 -10.046 -10.483 -10.722 -10.983 -11.285 -11.664 -12.104 -12.663 -14.342 -2 ,20850 ,KEBNE ,16749631,Wed Dec 1 17:58:52 CET,Wed Dec 1 19:49:37 CET,0.0 1.074 1.51 1.879 2.183 2.431 2.665 2.884 3.312 3.522 3.7 3.832 4.144 4.276 4.516 4.745 4.972 5.082 5.295 5.495 5.756 5.923 6.094 6.335 6.545 6.745 6.939 7.124 7.354 7.565 7.772 8.027 8.259 8.487 8.755 9.014 9.26 9.532 9.815 10.098 10.379 10.669 10.948 11.175 11.41 11.65 11.803 11.86 11.796 11.462 10.399 8.817 7.467 6.157 4.927 3.837 2.903 2.012 1.22 0.383 -0.344 -0.96 -1.544 -2.104 -2.617 -3.088 -3.603 -4.043 -4.409 -4.81 -5.22 -5.549 -5.897 -6.267 -6.559 -6.858 -7.173 -7.509 -7.856 -8.105 -8.364 -8.754 -9.023 -9.295 -9.44 -9.744 -10.074 -10.43 -10.611 -10.985 -11.213 -11.444 -11.679 -12.179 -12.458 -12.749 -13.081 -13.466 -13.894 -14.468 -16.197 -3 ,5084 ,KEBNE ,16749632,Wed Dec 1 17:58:53 CET,Wed Dec 1 19:48:39 CET,0.0 1.279 1.758 2.097 2.394 2.645 2.859 3.046 3.396 3.566 3.719 3.807 4.105 4.231 4.459 4.677 4.883 4.976 5.151 5.324 5.576 5.73 5.872 6.092 6.322 6.539 6.744 6.942 7.176 7.392 7.612 7.874 8.117 8.338 8.593 8.88 9.143 9.406 9.665 9.936 10.238 10.569 10.915 11.23 11.525 11.764 11.991 12.152 12.131 11.838 10.911 9.384 7.876 6.478 5.228 4.068 3.047 2.124 1.339 0.562 -0.124 -0.753 -1.358 -1.914 -2.433 -2.902 -3.385 -3.82 -4.212 -4.636 -5.057 -5.395 -5.739 -6.101 -6.391 -6.694 -7.016 -7.338 -7.66 -7.891 -8.128 -8.49 -8.744 -9.009 -9.151 -9.446 -9.754 -10.069 -10.234 -10.598 -10.794 -10.997 -11.205 -11.668 -11.936 -12.224 -12.533 -12.894 -13.33 -13.911 -15.383 -4 ,4697 ,KEBNE ,16749633,Wed Dec 1 17:58:52 CET,Wed Dec 1 19:48:27 CET,0.0 1.187 1.731 2.118 2.439 2.709 2.942 3.151 3.53 3.699 3.906 4.236 4.631 4.811 5.093 5.335 5.555 5.66 5.859 6.058 6.352 6.527 6.689 6.928 7.142 7.324 7.512 7.7 7.925 8.145 8.354 8.586 8.818 9.042 9.291 9.567 9.825 10.091 10.381 10.669 10.947 11.272 11.606 11.897 12.214 12.502 12.766 12.948 12.994 12.727 11.712 10.154 8.718 7.353 6.099 4.944 3.956 3.028 2.202 1.4 0.696 0.049 -0.576 -1.165 -1.713 -2.187 -2.689 -3.165 -3.552 -3.944 -4.362 -4.703 -5.059 -5.446 -5.748 -6.053 -6.378 -6.72 -7.051 -7.273 -7.521 -7.908 -8.173 -8.45 -8.592 -8.89 -9.219 -9.565 -9.736 -10.112 -10.31 -10.509 -10.718 -11.194 -11.455 -11.732 -12.059 -12.435 -12.853 -13.418 -14.727 -5 ,13974 ,KEBNE ,16749634,Wed Dec 1 17:58:54 CET,Wed Dec 1 19:45:03 CET,0.0 1.264 1.773 2.163 2.482 2.743 2.961 3.15 3.502 3.681 3.856 4.009 4.335 4.469 4.714 4.943 5.155 5.259 5.467 5.663 5.935 6.111 6.272 6.507 6.732 6.934 7.126 7.319 7.574 7.813 8.044 8.314 8.546 8.777 9.039 9.307 9.556 9.826 10.114 10.398 10.681 10.98 11.318 11.63 11.935 12.194 12.371 12.468 12.487 12.204 11.203 9.626 8.114 6.763 5.576 4.442 3.443 2.56 1.757 0.943 0.236 -0.412 -1.028 -1.611 -2.145 -2.617 -3.098 -3.535 -3.92 -4.312 -4.711 -5.06 -5.426 -5.797 -6.11 -6.448 -6.798 -7.172 -7.579 -7.858 -8.142 -8.593 -8.898 -9.216 -9.381 -9.705 -10.029 -10.369 -10.545 -10.923 -11.139 -11.363 -11.586 -12.056 -12.32 -12.592 -12.899 -13.244 -13.643 -14.237 -15.787 -6 ,22432 ,KEBNE ,16749635,Wed Dec 1 18:02:03 CET,Wed Dec 1 19:52:54 CET,0.0 1.074 1.504 1.853 2.146 2.416 2.645 2.835 3.192 3.357 3.512 3.632 3.938 4.067 4.308 4.535 4.753 4.86 5.068 5.252 5.521 5.701 5.876 6.133 6.374 6.589 6.779 6.968 7.207 7.434 7.666 7.931 8.182 8.422 8.692 8.983 9.237 9.507 9.784 10.072 10.383 10.74 11.113 11.418 11.714 11.934 12.084 12.157 12.102 11.755 10.605 8.806 7.228 5.807 4.538 3.375 2.334 1.38 0.548 -0.259 -0.927 -1.507 -2.089 -2.637 -3.145 -3.618 -4.097 -4.517 -4.885 -5.282 -5.713 -6.079 -6.466 -6.851 -7.123 -7.419 -7.745 -8.078 -8.433 -8.69 -8.968 -9.4 -9.69 -9.999 -10.157 -10.484 -10.841 -11.216 -11.406 -11.789 -12.036 -12.276 -12.519 -13.052 -13.343 -13.642 -13.983 -14.418 -14.959 -15.635 -17.227 -7 ,2619 ,KEBNE ,16749636,Wed Dec 1 18:02:03 CET,Wed Dec 1 19:51:52 CET,0.0 1.285 1.75 2.126 2.437 2.709 2.965 3.184 3.552 3.728 3.905 4.04 4.35 4.493 4.767 5.009 5.246 5.366 5.595 5.807 6.096 6.268 6.435 6.673 6.896 7.096 7.288 7.481 7.738 7.987 8.209 8.457 8.686 8.908 9.161 9.434 9.699 9.981 10.277 10.577 10.871 11.192 11.509 11.791 12.105 12.384 12.591 12.686 12.677 12.38 11.292 9.555 7.956 6.545 5.306 4.185 3.168 2.227 1.414 0.588 -0.114 -0.726 -1.316 -1.858 -2.375 -2.864 -3.368 -3.81 -4.177 -4.56 -4.962 -5.302 -5.663 -6.034 -6.32 -6.613 -6.928 -7.255 -7.577 -7.811 -8.058 -8.44 -8.707 -8.974 -9.107 -9.388 -9.704 -10.034 -10.214 -10.597 -10.809 -11.003 -11.211 -11.676 -11.934 -12.234 -12.545 -12.875 -13.27 -13.809 -15.166 -8 ,1096 ,KEBNE ,16749637,Wed Dec 1 18:02:03 CET,Wed Dec 1 19:51:45 CET,0.0 1.372 1.977 2.448 2.803 3.111 3.379 3.625 4.084 4.293 4.499 4.677 4.993 5.137 5.422 5.681 5.922 6.038 6.252 6.451 6.731 6.907 7.08 7.327 7.546 7.759 7.975 8.174 8.417 8.649 8.868 9.126 9.373 9.6 9.849 10.123 10.376 10.642 10.907 11.195 11.504 11.8 12.138 12.461 12.768 13.039 13.278 13.393 13.317 12.953 12.003 10.594 9.201 7.91 6.803 5.778 4.807 3.925 3.189 2.448 1.781 1.152 0.555 -0.002 -0.529 -1.034 -1.608 -2.118 -2.542 -2.981 -3.433 -3.793 -4.169 -4.568 -4.886 -5.22 -5.576 -5.934 -6.289 -6.54 -6.8 -7.226 -7.52 -7.808 -7.961 -8.313 -8.694 -9.084 -9.291 -9.694 -9.939 -10.178 -10.423 -10.978 -11.318 -11.671 -12.031 -12.426 -12.878 -13.517 -15.254 -9 ,14266 ,KEBNE ,16749638,Wed Dec 1 18:02:03 CET,Wed Dec 1 19:51:47 CET,0.0 1.425 1.942 2.288 2.584 2.85 3.101 3.327 3.709 3.876 4.036 4.193 4.515 4.657 4.929 5.19 5.44 5.565 5.788 5.987 6.285 6.465 6.626 6.857 7.09 7.305 7.505 7.696 7.933 8.16 8.38 8.656 8.921 9.168 9.441 9.735 10.008 10.281 10.555 10.852 11.149 11.452 11.764 12.039 12.339 12.646 12.884 12.971 12.909 12.559 11.591 10.107 8.687 7.392 6.219 5.129 4.125 3.216 2.444 1.645 0.95 0.346 -0.238 -0.795 -1.323 -1.795 -2.271 -2.707 -3.078 -3.455 -3.875 -4.234 -4.603 -4.999 -5.309 -5.633 -5.965 -6.31 -6.665 -6.913 -7.177 -7.582 -7.868 -8.157 -8.304 -8.617 -8.948 -9.291 -9.472 -9.845 -10.055 -10.277 -10.506 -11.006 -11.271 -11.543 -11.842 -12.166 -12.584 -13.198 -14.664 -10 ,3658 ,KEBNE ,16749639,Wed Dec 1 18:02:03 CET,Wed Dec 1 19:52:51 CET,0.0 1.314 1.81 2.168 2.478 2.75 2.98 3.202 3.597 3.776 3.953 4.102 4.403 4.52 4.74 4.959 5.179 5.281 5.483 5.694 5.997 6.181 6.35 6.587 6.814 7.025 7.222 7.411 7.631 7.831 8.042 8.314 8.558 8.789 9.073 9.361 9.616 9.888 10.164 10.461 10.751 11.026 11.313 11.566 11.856 12.149 12.332 12.461 12.567 12.344 11.492 10.199 8.89 7.654 6.518 5.466 4.554 3.738 3.033 2.308 1.664 1.093 0.56 0.056 -0.411 -0.841 -1.301 -1.716 -2.093 -2.503 -2.919 -3.266 -3.626 -4.0 -4.293 -4.585 -4.892 -5.214 -5.554 -5.787 -6.024 -6.393 -6.659 -6.944 -7.084 -7.367 -7.673 -8.01 -8.188 -8.566 -8.783 -8.996 -9.215 -9.652 -9.897 -10.182 -10.516 -10.891 -11.308 -11.819 -13.184 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index a572ddea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19852 ,KEBNE ,16749640,Wed Dec 1 18:03:08 CET,Wed Dec 1 19:54:38 CET,0.0 1.284 1.784 2.142 2.438 2.703 2.919 3.128 3.534 3.717 3.887 4.021 4.342 4.472 4.714 4.955 5.184 5.292 5.496 5.684 5.948 6.117 6.278 6.495 6.699 6.886 7.058 7.239 7.461 7.648 7.833 8.088 8.33 8.532 8.749 8.991 9.214 9.438 9.648 9.86 10.083 10.306 10.54 10.744 10.907 11.041 11.122 11.022 10.678 9.934 8.395 6.373 4.617 3.025 1.642 0.414 -0.623 -1.554 -2.362 -3.154 -3.828 -4.424 -4.984 -5.518 -6.057 -6.548 -7.028 -7.45 -7.829 -8.225 -8.62 -8.948 -9.293 -9.649 -9.918 -10.193 -10.482 -10.789 -11.114 -11.341 -11.577 -11.934 -12.181 -12.446 -12.587 -12.868 -13.156 -13.46 -13.618 -13.959 -14.116 -14.298 -14.49 -14.922 -15.156 -15.407 -15.681 -15.987 -16.359 -16.888 -18.449 -2 ,23879 ,KEBNE ,16749641,Wed Dec 1 18:03:08 CET,Wed Dec 1 19:54:41 CET,0.0 1.291 1.835 2.238 2.548 2.813 3.048 3.261 3.648 3.817 3.979 4.103 4.412 4.549 4.799 5.033 5.254 5.364 5.573 5.771 6.061 6.24 6.418 6.672 6.9 7.115 7.308 7.484 7.696 7.892 8.081 8.299 8.498 8.682 8.885 9.103 9.322 9.551 9.759 9.974 10.187 10.398 10.619 10.808 11.001 11.145 11.19 11.093 10.828 10.103 8.484 6.362 4.463 2.869 1.521 0.311 -0.756 -1.723 -2.517 -3.302 -3.992 -4.618 -5.206 -5.751 -6.255 -6.712 -7.198 -7.645 -8.022 -8.403 -8.803 -9.141 -9.486 -9.837 -10.104 -10.375 -10.664 -10.963 -11.283 -11.524 -11.778 -12.145 -12.385 -12.638 -12.772 -13.049 -13.336 -13.642 -13.808 -14.17 -14.345 -14.532 -14.725 -15.128 -15.354 -15.621 -15.932 -16.282 -16.644 -17.106 -18.262 -3 ,13854 ,KEBNE ,16749642,Wed Dec 1 18:03:08 CET,Wed Dec 1 19:54:21 CET,0.0 1.38 1.962 2.354 2.673 2.935 3.165 3.376 3.768 3.949 4.119 4.289 4.621 4.76 5.021 5.283 5.535 5.657 5.892 6.106 6.421 6.622 6.799 7.046 7.282 7.504 7.715 7.905 8.133 8.349 8.577 8.881 9.17 9.404 9.659 9.937 10.191 10.472 10.759 11.044 11.333 11.593 11.827 12.05 12.229 12.361 12.451 12.446 12.243 11.626 10.084 7.939 6.18 4.703 3.397 2.205 1.166 0.222 -0.62 -1.438 -2.109 -2.704 -3.277 -3.816 -4.296 -4.741 -5.212 -5.629 -6.004 -6.404 -6.815 -7.144 -7.481 -7.829 -8.096 -8.383 -8.685 -8.994 -9.308 -9.521 -9.742 -10.09 -10.329 -10.579 -10.708 -10.969 -11.251 -11.564 -11.721 -12.066 -12.224 -12.415 -12.615 -13.065 -13.303 -13.55 -13.82 -14.129 -14.5 -14.992 -16.199 -4 ,4339 ,KEBNE ,16749643,Wed Dec 1 18:04:12 CET,Wed Dec 1 19:54:47 CET,0.0 1.215 1.683 2.042 2.362 2.625 2.845 3.062 3.438 3.603 3.757 3.879 4.191 4.326 4.578 4.817 5.038 5.148 5.359 5.543 5.805 5.977 6.149 6.385 6.606 6.825 7.029 7.223 7.476 7.71 7.943 8.214 8.458 8.685 8.92 9.174 9.404 9.625 9.873 10.123 10.336 10.551 10.755 10.91 11.114 11.257 11.21 11.027 10.666 9.936 8.335 6.082 4.136 2.549 1.199 -0.033 -1.106 -2.047 -2.874 -3.714 -4.417 -5.042 -5.645 -6.195 -6.699 -7.162 -7.637 -8.061 -8.425 -8.805 -9.196 -9.523 -9.878 -10.244 -10.527 -10.822 -11.129 -11.443 -11.758 -11.981 -12.213 -12.579 -12.842 -13.116 -13.258 -13.534 -13.818 -14.134 -14.302 -14.665 -14.837 -15.03 -15.226 -15.633 -15.86 -16.105 -16.375 -16.694 -17.076 -17.552 -18.637 -5 ,21060 ,KEBNE ,16749644,Wed Dec 1 18:06:21 CET,Wed Dec 1 19:57:13 CET,0.0 1.195 1.627 1.97 2.264 2.524 2.758 2.982 3.376 3.533 3.692 3.832 4.149 4.279 4.513 4.729 4.94 5.044 5.233 5.417 5.68 5.842 6.004 6.233 6.44 6.65 6.871 7.07 7.3 7.526 7.746 7.987 8.211 8.435 8.68 8.928 9.154 9.369 9.592 9.842 10.089 10.364 10.626 10.831 11.051 11.212 11.328 11.33 11.068 10.331 8.713 6.595 4.8 3.257 1.864 0.615 -0.433 -1.352 -2.141 -2.956 -3.657 -4.275 -4.855 -5.375 -5.857 -6.309 -6.781 -7.205 -7.573 -7.949 -8.345 -8.681 -9.021 -9.373 -9.672 -10.001 -10.322 -10.628 -10.937 -11.149 -11.376 -11.744 -11.995 -12.256 -12.396 -12.678 -12.966 -13.272 -13.431 -13.782 -13.934 -14.127 -14.328 -14.733 -14.952 -15.189 -15.454 -15.745 -16.104 -16.566 -17.63 -6 ,19196 ,KEBNE ,16749645,Wed Dec 1 18:09:36 CET,Wed Dec 1 20:00:28 CET,0.0 1.514 1.952 2.291 2.578 2.829 3.054 3.257 3.596 3.746 3.881 3.992 4.302 4.43 4.674 4.888 5.09 5.186 5.374 5.557 5.797 5.958 6.115 6.323 6.533 6.735 6.918 7.084 7.292 7.494 7.683 7.909 8.133 8.344 8.575 8.823 9.053 9.286 9.51 9.747 9.993 10.244 10.495 10.684 10.863 11.014 11.058 10.917 10.574 9.885 8.292 6.154 4.335 2.771 1.448 0.282 -0.738 -1.649 -2.444 -3.262 -3.958 -4.587 -5.182 -5.719 -6.223 -6.694 -7.188 -7.63 -8.013 -8.401 -8.807 -9.151 -9.504 -9.856 -10.116 -10.391 -10.68 -10.983 -11.305 -11.535 -11.766 -12.114 -12.367 -12.628 -12.763 -13.04 -13.323 -13.62 -13.775 -14.123 -14.282 -14.458 -14.65 -15.09 -15.325 -15.582 -15.87 -16.179 -16.527 -17.009 -18.163 -7 ,27276 ,KEBNE ,16749646,Wed Dec 1 18:14:50 CET,Wed Dec 1 20:06:52 CET,0.0 1.465 1.963 2.343 2.672 2.966 3.231 3.454 3.828 4.015 4.19 4.327 4.651 4.792 5.033 5.263 5.476 5.575 5.767 5.953 6.223 6.408 6.595 6.854 7.096 7.329 7.548 7.756 8.016 8.257 8.488 8.747 8.984 9.208 9.439 9.677 9.908 10.139 10.359 10.591 10.827 11.053 11.263 11.46 11.67 11.823 11.887 11.825 11.554 10.841 9.278 7.207 5.379 3.777 2.371 1.067 -0.077 -1.056 -1.896 -2.751 -3.469 -4.112 -4.721 -5.283 -5.806 -6.289 -6.792 -7.234 -7.614 -7.999 -8.409 -8.757 -9.105 -9.453 -9.722 -10.0 -10.284 -10.592 -10.912 -11.133 -11.36 -11.706 -11.948 -12.207 -12.339 -12.604 -12.878 -13.185 -13.352 -13.705 -13.839 -14.011 -14.202 -14.617 -14.841 -15.091 -15.372 -15.685 -16.034 -16.458 -17.526 -8 ,13083 ,KEBNE ,16749647,Wed Dec 1 18:14:51 CET,Wed Dec 1 20:05:40 CET,0.0 1.104 1.586 1.958 2.289 2.573 2.829 3.047 3.425 3.612 3.784 3.925 4.244 4.383 4.652 4.895 5.107 5.207 5.389 5.559 5.802 5.959 6.115 6.336 6.542 6.725 6.895 7.069 7.287 7.479 7.668 7.902 8.109 8.298 8.516 8.739 8.933 9.139 9.354 9.562 9.755 9.951 10.136 10.285 10.425 10.531 10.543 10.396 10.003 9.133 7.467 5.375 3.551 1.976 0.619 -0.592 -1.645 -2.585 -3.386 -4.18 -4.85 -5.456 -6.054 -6.625 -7.14 -7.596 -8.082 -8.518 -8.891 -9.275 -9.67 -10.0 -10.338 -10.685 -10.958 -11.237 -11.531 -11.847 -12.182 -12.407 -12.631 -12.987 -13.24 -13.499 -13.633 -13.918 -14.212 -14.511 -14.665 -15.015 -15.183 -15.378 -15.58 -16.003 -16.241 -16.497 -16.77 -17.087 -17.444 -17.926 -19.202 -9 ,13787 ,KEBNE ,16749648,Wed Dec 1 18:14:51 CET,Wed Dec 1 20:08:01 CET,0.0 1.29 1.764 2.123 2.425 2.687 2.926 3.151 3.559 3.737 3.9 4.004 4.305 4.435 4.695 4.936 5.161 5.269 5.471 5.662 5.932 6.113 6.301 6.546 6.746 6.939 7.121 7.291 7.522 7.74 7.95 8.185 8.381 8.556 8.766 9.003 9.202 9.41 9.62 9.836 10.054 10.256 10.475 10.675 10.864 11.021 11.151 11.215 11.066 10.465 9.01 7.091 5.344 3.74 2.364 1.177 0.156 -0.775 -1.56 -2.334 -3.033 -3.658 -4.236 -4.795 -5.304 -5.762 -6.246 -6.656 -7.015 -7.402 -7.803 -8.133 -8.465 -8.808 -9.081 -9.367 -9.667 -9.977 -10.29 -10.504 -10.723 -11.071 -11.312 -11.559 -11.688 -11.964 -12.26 -12.569 -12.727 -13.067 -13.206 -13.39 -13.589 -13.992 -14.214 -14.48 -14.784 -15.117 -15.507 -15.987 -17.114 -10 ,28238 ,KEBNE ,16749649,Wed Dec 1 18:14:50 CET,Wed Dec 1 20:04:40 CET,0.0 1.143 1.634 1.995 2.292 2.557 2.789 3.003 3.39 3.562 3.721 3.843 4.159 4.291 4.545 4.783 4.997 5.098 5.296 5.479 5.739 5.909 6.065 6.294 6.514 6.703 6.88 7.055 7.273 7.477 7.667 7.902 8.125 8.319 8.543 8.794 9.008 9.244 9.513 9.744 9.964 10.197 10.395 10.551 10.703 10.787 10.777 10.651 10.302 9.542 7.963 5.93 4.17 2.582 1.162 -0.112 -1.207 -2.203 -3.082 -3.949 -4.681 -5.311 -5.902 -6.461 -6.979 -7.455 -7.948 -8.391 -8.771 -9.153 -9.564 -9.904 -10.24 -10.595 -10.865 -11.134 -11.417 -11.715 -12.024 -12.243 -12.475 -12.835 -13.085 -13.343 -13.473 -13.744 -14.03 -14.332 -14.491 -14.839 -15.005 -15.192 -15.384 -15.805 -16.028 -16.282 -16.582 -16.899 -17.25 -17.703 -18.844 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt deleted file mode 100644 index 334836cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5870 ,KEBNE ,16749650,Wed Dec 1 18:14:51 CET,Wed Dec 1 20:05:57 CET,0.0 1.372 1.91 2.314 2.674 2.976 3.241 3.501 3.988 4.21 4.413 4.614 4.936 5.061 5.299 5.527 5.742 5.846 6.045 6.22 6.477 6.647 6.807 7.037 7.248 7.439 7.631 7.822 8.053 8.253 8.439 8.674 8.886 9.089 9.336 9.6 9.843 10.113 10.401 10.669 10.927 11.227 11.554 11.844 12.153 12.417 12.635 12.786 12.794 12.549 11.749 10.481 9.216 8.006 6.921 5.965 5.114 4.313 3.614 2.928 2.36 1.855 1.378 0.942 0.526 0.126 -0.29 -0.657 -0.974 -1.312 -1.68 -1.981 -2.286 -2.608 -2.858 -3.107 -3.36 -3.631 -3.928 -4.138 -4.354 -4.678 -4.898 -5.143 -5.268 -5.518 -5.779 -6.067 -6.228 -6.574 -6.739 -6.934 -7.146 -7.593 -7.823 -8.068 -8.339 -8.663 -9.055 -9.551 -10.791 -2 ,28047 ,KEBNE ,16749651,Wed Dec 1 18:14:51 CET,Wed Dec 1 20:04:53 CET,0.0 1.022 1.5 1.859 2.147 2.392 2.623 2.836 3.206 3.391 3.569 3.703 4.012 4.151 4.395 4.612 4.829 4.932 5.127 5.311 5.569 5.732 5.884 6.107 6.336 6.547 6.74 6.935 7.199 7.44 7.661 7.92 8.159 8.398 8.661 8.943 9.204 9.489 9.78 10.075 10.377 10.69 11.021 11.295 11.579 11.904 12.214 12.424 12.521 12.421 11.851 10.718 9.539 8.428 7.443 6.556 5.765 5.054 4.444 3.816 3.265 2.755 2.265 1.802 1.364 0.96 0.555 0.206 -0.099 -0.429 -0.788 -1.093 -1.417 -1.75 -2.02 -2.309 -2.6 -2.881 -3.167 -3.373 -3.583 -3.911 -4.141 -4.383 -4.508 -4.766 -5.051 -5.355 -5.514 -5.861 -6.013 -6.196 -6.388 -6.808 -7.028 -7.266 -7.53 -7.802 -8.177 -8.701 -9.791 -3 ,4320 ,KEBNE ,16749652,Wed Dec 1 18:14:52 CET,Wed Dec 1 20:04:34 CET,0.0 1.306 1.805 2.144 2.431 2.678 2.894 3.099 3.477 3.656 3.811 3.912 4.214 4.349 4.612 4.847 5.07 5.191 5.433 5.638 5.901 6.083 6.27 6.51 6.722 6.927 7.116 7.299 7.529 7.742 7.94 8.183 8.421 8.644 8.892 9.157 9.403 9.649 9.902 10.172 10.455 10.759 11.086 11.389 11.738 12.092 12.388 12.602 12.704 12.594 11.912 10.697 9.548 8.48 7.48 6.539 5.736 5.019 4.364 3.708 3.154 2.642 2.137 1.659 1.226 0.829 0.412 0.05 -0.259 -0.599 -0.964 -1.252 -1.546 -1.864 -2.113 -2.375 -2.655 -2.952 -3.257 -3.466 -3.694 -4.048 -4.284 -4.527 -4.66 -4.948 -5.247 -5.559 -5.718 -6.067 -6.223 -6.428 -6.67 -7.148 -7.386 -7.646 -7.916 -8.22 -8.59 -9.068 -10.158 -4 ,6894 ,KEBNE ,16749653,Wed Dec 1 18:14:51 CET,Wed Dec 1 20:05:40 CET,0.0 1.69 2.209 2.61 2.951 3.257 3.537 3.796 4.26 4.465 4.661 4.836 5.178 5.332 5.572 5.784 5.981 6.077 6.269 6.455 6.732 6.918 7.082 7.302 7.513 7.713 7.905 8.095 8.333 8.553 8.778 9.042 9.275 9.489 9.73 9.992 10.234 10.492 10.76 11.032 11.295 11.577 11.891 12.175 12.463 12.711 12.915 13.035 12.994 12.784 12.155 11.044 9.871 8.753 7.758 6.878 6.076 5.316 4.664 3.993 3.412 2.889 2.395 1.949 1.525 1.134 0.733 0.362 0.038 -0.304 -0.673 -0.979 -1.294 -1.623 -1.88 -2.144 -2.404 -2.664 -2.941 -3.14 -3.346 -3.677 -3.916 -4.164 -4.291 -4.542 -4.812 -5.094 -5.241 -5.582 -5.748 -5.943 -6.132 -6.498 -6.715 -6.963 -7.244 -7.555 -7.908 -8.351 -9.4 -5 ,16078 ,KEBNE ,16749654,Wed Dec 1 18:14:51 CET,Wed Dec 1 20:06:23 CET,0.0 1.123 1.62 1.977 2.268 2.528 2.763 2.978 3.365 3.546 3.725 3.864 4.175 4.305 4.56 4.796 5.009 5.111 5.307 5.511 5.803 5.967 6.126 6.359 6.569 6.763 6.966 7.172 7.422 7.656 7.877 8.132 8.382 8.629 8.893 9.168 9.424 9.683 9.946 10.206 10.49 10.809 11.122 11.399 11.691 12.0 12.295 12.487 12.528 12.344 11.631 10.469 9.326 8.205 7.218 6.333 5.546 4.806 4.146 3.492 2.937 2.422 1.938 1.492 1.051 0.648 0.231 -0.147 -0.478 -0.833 -1.2 -1.488 -1.78 -2.08 -2.318 -2.572 -2.839 -3.117 -3.409 -3.618 -3.824 -4.132 -4.352 -4.584 -4.706 -4.964 -5.228 -5.504 -5.645 -5.968 -6.081 -6.244 -6.43 -6.841 -7.066 -7.302 -7.548 -7.839 -8.215 -8.703 -9.838 -6 ,27302 ,KEBNE ,16749655,Wed Dec 1 18:14:51 CET,Wed Dec 1 20:06:40 CET,0.0 1.325 1.788 2.121 2.413 2.669 2.893 3.101 3.469 3.633 3.795 3.925 4.235 4.354 4.574 4.801 5.031 5.145 5.364 5.566 5.847 6.014 6.18 6.418 6.637 6.841 7.027 7.206 7.429 7.638 7.834 8.078 8.332 8.572 8.834 9.106 9.372 9.663 9.948 10.233 10.543 10.861 11.177 11.478 11.801 12.177 12.549 12.829 13.004 12.908 12.259 11.122 10.034 8.982 8.001 7.083 6.262 5.499 4.829 4.144 3.546 3.004 2.461 1.941 1.453 1.004 0.534 0.132 -0.207 -0.581 -0.969 -1.272 -1.586 -1.916 -2.175 -2.45 -2.739 -3.025 -3.319 -3.519 -3.721 -4.048 -4.283 -4.532 -4.659 -4.92 -5.188 -5.483 -5.648 -5.999 -6.166 -6.355 -6.541 -6.996 -7.258 -7.547 -7.866 -8.234 -8.648 -9.149 -10.519 -7 ,14752 ,KEBNE ,16749656,Wed Dec 1 18:14:51 CET,Wed Dec 1 20:06:02 CET,0.0 1.123 1.603 1.961 2.256 2.511 2.742 2.97 3.382 3.559 3.732 3.885 4.202 4.329 4.581 4.843 5.107 5.244 5.497 5.728 6.041 6.234 6.419 6.675 6.914 7.14 7.347 7.526 7.754 7.979 8.181 8.415 8.642 8.853 9.093 9.364 9.614 9.872 10.127 10.407 10.715 11.04 11.373 11.69 12.037 12.314 12.58 12.807 12.885 12.769 12.107 10.923 9.761 8.647 7.675 6.789 5.979 5.257 4.607 3.903 3.295 2.762 2.264 1.808 1.386 0.984 0.561 0.181 -0.153 -0.495 -0.85 -1.155 -1.477 -1.796 -2.047 -2.318 -2.588 -2.875 -3.178 -3.385 -3.602 -3.927 -4.142 -4.37 -4.489 -4.735 -5.006 -5.307 -5.467 -5.813 -5.973 -6.153 -6.327 -6.695 -6.904 -7.154 -7.443 -7.774 -8.155 -8.638 -9.82 -8 ,11085 ,KEBNE ,16749657,Wed Dec 1 18:14:51 CET,Wed Dec 1 20:04:47 CET,0.0 1.149 1.617 2.029 2.396 2.699 2.977 3.238 3.707 3.911 4.112 4.317 4.64 4.773 5.025 5.262 5.481 5.584 5.784 5.978 6.24 6.409 6.581 6.82 7.038 7.236 7.429 7.616 7.851 8.077 8.295 8.553 8.805 9.041 9.281 9.546 9.817 10.117 10.433 10.753 11.055 11.358 11.69 12.007 12.329 12.648 12.947 13.153 13.279 13.195 12.549 11.365 10.228 9.169 8.184 7.252 6.415 5.661 4.995 4.329 3.749 3.219 2.741 2.291 1.862 1.464 1.036 0.658 0.322 -0.012 -0.345 -0.637 -0.961 -1.295 -1.555 -1.851 -2.161 -2.477 -2.808 -3.042 -3.288 -3.665 -3.906 -4.139 -4.258 -4.524 -4.802 -5.082 -5.229 -5.556 -5.675 -5.836 -6.018 -6.445 -6.666 -6.89 -7.142 -7.453 -7.801 -8.245 -9.267 -9 ,22166 ,KEBNE ,16749658,Wed Dec 1 18:14:51 CET,Wed Dec 1 20:05:17 CET,0.0 1.166 1.59 1.93 2.226 2.501 2.732 2.93 3.297 3.465 3.614 3.707 4.0 4.129 4.391 4.628 4.847 4.952 5.151 5.339 5.621 5.795 5.949 6.173 6.386 6.582 6.77 6.958 7.194 7.419 7.626 7.865 8.102 8.333 8.592 8.879 9.14 9.411 9.704 9.996 10.283 10.583 10.91 11.215 11.538 11.876 12.171 12.335 12.37 12.168 11.39 10.048 8.796 7.735 6.799 5.93 5.133 4.413 3.78 3.115 2.549 2.035 1.533 1.074 0.654 0.259 -0.165 -0.525 -0.831 -1.148 -1.478 -1.763 -2.07 -2.388 -2.625 -2.871 -3.133 -3.411 -3.71 -3.916 -4.124 -4.449 -4.682 -4.93 -5.057 -5.317 -5.589 -5.878 -6.031 -6.369 -6.514 -6.694 -6.888 -7.299 -7.525 -7.771 -8.049 -8.37 -8.731 -9.186 -10.482 -10 ,10385 ,KEBNE ,16749659,Wed Dec 1 18:17:01 CET,Wed Dec 1 20:10:10 CET,0.0 1.264 1.767 2.176 2.507 2.736 2.938 3.118 3.469 3.65 3.811 3.918 4.237 4.372 4.616 4.84 5.052 5.157 5.356 5.547 5.81 5.974 6.147 6.402 6.632 6.84 7.038 7.222 7.454 7.672 7.894 8.166 8.4 8.618 8.86 9.117 9.37 9.634 9.899 10.172 10.435 10.727 11.042 11.329 11.633 11.949 12.265 12.503 12.618 12.489 11.819 10.634 9.45 8.389 7.407 6.488 5.696 4.949 4.299 3.649 3.086 2.571 2.065 1.597 1.17 0.783 0.378 0.003 -0.316 -0.653 -1.009 -1.3 -1.618 -1.936 -2.177 -2.444 -2.739 -3.038 -3.342 -3.556 -3.773 -4.112 -4.34 -4.57 -4.693 -4.953 -5.221 -5.509 -5.658 -5.991 -6.149 -6.337 -6.531 -6.948 -7.159 -7.407 -7.698 -8.021 -8.362 -8.794 -9.813 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt deleted file mode 100644 index 78cc6d82..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6245 ,KEBNE ,16749660,Wed Dec 1 18:17:01 CET,Wed Dec 1 20:08:45 CET,0.0 0.581 0.891 1.13 1.33 1.559 1.777 1.946 2.251 2.391 2.529 2.612 2.901 3.01 3.216 3.41 3.596 3.685 3.857 4.029 4.285 4.456 4.617 4.854 5.073 5.259 5.442 5.621 5.841 6.047 6.251 6.508 6.752 6.983 7.248 7.549 7.847 8.168 8.507 8.877 9.249 9.635 10.075 10.521 11.031 11.559 12.152 12.781 13.433 14.088 14.635 14.71 14.47 14.052 13.508 12.952 12.384 11.847 11.39 10.903 10.495 10.141 9.784 9.424 9.081 8.766 8.404 8.047 7.739 7.44 7.154 6.909 6.634 6.341 6.119 5.897 5.661 5.416 5.161 4.969 4.76 4.408 4.157 3.912 3.788 3.538 3.271 2.941 2.752 2.389 2.162 1.951 1.735 1.267 0.988 0.677 0.327 -0.035 -0.51 -1.264 -4.52 -2 ,18741 ,KEBNE ,16749661,Wed Dec 1 18:23:20 CET,Wed Dec 1 20:12:18 CET,0.0 0.508 0.853 1.11 1.324 1.493 1.649 1.812 2.104 2.242 2.384 2.462 2.75 2.86 3.066 3.272 3.486 3.59 3.782 3.968 4.237 4.404 4.564 4.799 5.027 5.251 5.458 5.648 5.884 6.101 6.314 6.576 6.827 7.067 7.339 7.645 7.938 8.249 8.594 8.966 9.332 9.742 10.226 10.705 11.237 11.747 12.296 12.881 13.513 14.124 14.437 14.234 13.818 13.352 12.829 12.277 11.769 11.267 10.813 10.329 9.872 9.451 9.033 8.632 8.268 7.931 7.576 7.253 6.959 6.65 6.319 6.052 5.795 5.518 5.299 5.075 4.837 4.591 4.323 4.12 3.917 3.618 3.404 3.179 3.054 2.795 2.525 2.222 2.07 1.759 1.61 1.43 1.238 0.801 0.53 0.232 -0.078 -0.405 -0.8 -1.388 -3.268 -3 ,18414 ,KEBNE ,16749662,Wed Dec 1 18:23:21 CET,Wed Dec 1 20:14:18 CET,0.0 0.678 0.998 1.252 1.476 1.675 1.849 2.003 2.295 2.439 2.577 2.655 2.944 3.056 3.263 3.46 3.656 3.757 3.958 4.141 4.385 4.538 4.688 4.901 5.11 5.323 5.519 5.706 5.958 6.194 6.413 6.673 6.911 7.138 7.416 7.739 8.049 8.371 8.698 9.045 9.4 9.805 10.276 10.721 11.243 11.796 12.371 12.934 13.462 14.057 14.652 14.887 14.78 14.482 14.058 13.554 13.082 12.629 12.216 11.77 11.384 11.031 10.689 10.369 10.02 9.688 9.335 9.0 8.715 8.422 8.111 7.856 7.603 7.337 7.131 6.914 6.684 6.431 6.144 5.951 5.755 5.45 5.227 4.995 4.888 4.658 4.382 4.094 3.944 3.618 3.474 3.309 3.121 2.686 2.438 2.154 1.832 1.483 1.083 0.527 -1.013 -4 ,25673 ,KEBNE ,16749663,Wed Dec 1 18:23:21 CET,Wed Dec 1 20:13:20 CET,0.0 0.493 0.795 1.088 1.325 1.522 1.704 1.869 2.173 2.323 2.467 2.571 2.868 2.989 3.218 3.436 3.635 3.722 3.89 4.056 4.285 4.439 4.598 4.819 5.024 5.225 5.422 5.612 5.853 6.082 6.298 6.554 6.798 7.032 7.301 7.603 7.892 8.205 8.532 8.876 9.239 9.637 10.09 10.535 11.066 11.65 12.251 12.86 13.53 14.21 14.748 14.787 14.484 14.031 13.506 12.951 12.408 11.909 11.468 10.996 10.535 10.088 9.694 9.334 8.977 8.65 8.314 7.996 7.706 7.403 7.101 6.852 6.587 6.303 6.073 5.832 5.579 5.316 5.054 4.876 4.678 4.345 4.114 3.87 3.734 3.43 3.079 2.747 2.598 2.272 2.079 1.881 1.674 1.218 0.958 0.659 0.327 -0.009 -0.405 -0.963 -2.972 -5 ,8606 ,KEBNE ,16749664,Wed Dec 1 18:26:30 CET,Wed Dec 1 20:16:25 CET,0.0 0.683 1.021 1.304 1.549 1.77 1.958 2.123 2.425 2.571 2.716 2.794 3.078 3.189 3.407 3.619 3.829 3.929 4.12 4.305 4.571 4.742 4.896 5.116 5.335 5.543 5.742 5.931 6.18 6.425 6.651 6.916 7.176 7.421 7.696 8.009 8.314 8.653 8.998 9.347 9.707 10.104 10.563 11.031 11.586 12.168 12.778 13.416 14.106 14.802 15.431 15.539 15.264 14.851 14.407 13.934 13.484 13.054 12.647 12.222 11.832 11.462 11.081 10.714 10.37 10.055 9.707 9.375 9.092 8.802 8.489 8.221 7.95 7.667 7.437 7.185 6.93 6.676 6.395 6.206 6.017 5.698 5.477 5.249 5.12 4.852 4.58 4.253 4.069 3.73 3.509 3.291 3.085 2.695 2.461 2.16 1.82 1.441 1.007 0.469 -1.085 -6 ,24013 ,KEBNE ,16749665,Wed Dec 1 18:26:30 CET,Wed Dec 1 20:16:20 CET,0.0 0.607 0.952 1.2 1.408 1.61 1.806 1.979 2.282 2.418 2.552 2.641 2.932 3.04 3.247 3.451 3.639 3.723 3.889 4.058 4.324 4.501 4.662 4.888 5.101 5.295 5.486 5.677 5.922 6.153 6.37 6.643 6.915 7.164 7.433 7.716 7.991 8.298 8.616 8.959 9.319 9.72 10.185 10.632 11.139 11.665 12.203 12.771 13.359 13.894 14.178 14.059 13.676 13.159 12.665 12.16 11.673 11.206 10.796 10.361 9.959 9.592 9.221 8.861 8.518 8.2 7.874 7.57 7.304 7.018 6.7 6.435 6.165 5.888 5.665 5.431 5.187 4.924 4.649 4.46 4.267 3.954 3.734 3.499 3.377 3.135 2.854 2.548 2.393 2.069 1.892 1.708 1.519 1.124 0.888 0.581 0.241 -0.15 -0.675 -1.39 -2.832 -7 ,15389 ,KEBNE ,16749666,Wed Dec 1 18:34:56 CET,Wed Dec 1 20:24:21 CET,0.0 0.443 0.704 0.915 1.109 1.291 1.452 1.617 1.92 2.054 2.185 2.248 2.534 2.637 2.834 3.042 3.261 3.364 3.548 3.726 3.979 4.14 4.298 4.514 4.711 4.917 5.118 5.303 5.554 5.8 6.023 6.279 6.529 6.77 7.053 7.374 7.669 7.978 8.32 8.683 9.067 9.491 9.965 10.432 10.966 11.549 12.153 12.798 13.504 14.21 14.778 14.868 14.698 14.353 13.896 13.369 12.859 12.415 12.019 11.587 11.19 10.815 10.444 10.1 9.768 9.43 9.065 8.753 8.487 8.196 7.894 7.646 7.377 7.083 6.848 6.598 6.329 6.044 5.757 5.565 5.363 5.012 4.761 4.505 4.378 4.121 3.832 3.509 3.334 2.997 2.81 2.631 2.45 2.041 1.79 1.491 1.156 0.777 0.333 -0.261 -1.548 -8 ,921 ,KEBNE ,16749667,Wed Dec 1 18:34:56 CET,Wed Dec 1 20:23:11 CET,0.0 0.499 0.877 1.183 1.434 1.642 1.836 2.017 2.321 2.454 2.581 2.678 2.98 3.103 3.328 3.543 3.75 3.842 4.027 4.21 4.475 4.643 4.801 5.034 5.253 5.455 5.649 5.844 6.108 6.349 6.575 6.85 7.105 7.36 7.656 7.969 8.27 8.598 8.953 9.316 9.699 10.128 10.604 11.068 11.603 12.175 12.793 13.432 14.08 14.756 15.338 15.483 15.309 15.004 14.643 14.225 13.797 13.38 12.973 12.562 12.216 11.886 11.551 11.23 10.923 10.621 10.289 9.984 9.714 9.428 9.122 8.866 8.596 8.306 8.076 7.83 7.575 7.315 7.037 6.836 6.627 6.313 6.08 5.831 5.701 5.429 5.152 4.858 4.705 4.373 4.17 3.971 3.785 3.355 3.104 2.836 2.529 2.155 1.72 1.184 -0.104 -9 ,14005 ,KEBNE ,16749668,Wed Dec 1 18:34:56 CET,Wed Dec 1 20:25:07 CET,0.0 0.475 0.817 1.109 1.344 1.535 1.715 1.897 2.22 2.355 2.489 2.578 2.866 2.974 3.184 3.391 3.587 3.678 3.86 4.038 4.285 4.438 4.587 4.811 5.033 5.234 5.427 5.618 5.869 6.114 6.342 6.607 6.855 7.1 7.386 7.686 7.97 8.302 8.649 8.996 9.36 9.766 10.22 10.662 11.165 11.724 12.367 13.045 13.717 14.277 14.602 14.541 14.201 13.773 13.342 12.782 12.215 11.729 11.274 10.787 10.364 9.99 9.634 9.273 8.915 8.601 8.291 7.994 7.713 7.417 7.093 6.819 6.524 6.205 5.962 5.703 5.42 5.132 4.834 4.607 4.355 3.984 3.741 3.464 3.326 3.055 2.763 2.446 2.273 1.914 1.664 1.462 1.256 0.76 0.443 0.071 -0.345 -0.79 -1.371 -2.244 -5.245 -10 ,25819 ,KEBNE ,16749669,Wed Dec 1 18:34:56 CET,Wed Dec 1 20:23:11 CET,0.0 0.563 0.936 1.209 1.439 1.648 1.811 1.952 2.239 2.391 2.532 2.599 2.884 2.997 3.204 3.383 3.563 3.656 3.836 4.005 4.253 4.412 4.561 4.776 4.988 5.194 5.394 5.588 5.827 6.063 6.301 6.583 6.85 7.11 7.405 7.727 8.033 8.373 8.732 9.106 9.488 9.898 10.36 10.827 11.355 11.925 12.565 13.211 13.883 14.577 15.178 15.209 14.854 14.393 13.894 13.359 12.83 12.352 11.925 11.454 11.02 10.621 10.243 9.892 9.567 9.246 8.887 8.563 8.298 8.029 7.736 7.466 7.153 6.846 6.631 6.41 6.177 5.925 5.657 5.474 5.28 4.974 4.766 4.524 4.389 4.097 3.792 3.497 3.337 3.003 2.836 2.644 2.418 1.926 1.674 1.404 1.074 0.712 0.309 -0.315 -2.027 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 8a31d5d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3964 ,KEBNE ,16749670,Wed Dec 1 18:34:56 CET,Wed Dec 1 20:25:38 CET,0.0 1.074 1.578 1.971 2.32 2.63 2.928 3.207 3.698 3.924 4.145 4.339 4.723 4.913 5.283 5.603 5.91 6.05 6.295 6.541 6.883 7.104 7.325 7.638 7.93 8.221 8.5 8.774 9.127 9.449 9.762 10.138 10.497 10.85 11.264 11.723 12.157 12.63 13.141 13.68 14.233 14.862 15.614 16.349 17.185 18.143 19.2 20.288 21.535 22.98 24.537 25.533 25.905 25.967 25.85 25.698 25.539 25.329 25.119 24.868 24.61 24.379 24.167 23.948 23.721 23.497 23.246 23.017 22.81 22.596 22.371 22.169 21.955 21.729 21.561 21.386 21.187 20.973 20.757 20.609 20.445 20.179 20.004 19.812 19.713 19.508 19.284 19.039 18.91 18.596 18.513 18.362 18.196 17.85 17.656 17.445 17.221 16.966 16.626 16.182 15.114 -2 ,21006 ,KEBNE ,16749671,Wed Dec 1 18:34:55 CET,Wed Dec 1 20:24:36 CET,0.0 1.043 1.527 1.87 2.153 2.397 2.627 2.838 3.227 3.41 3.579 3.703 4.056 4.214 4.522 4.792 5.045 5.169 5.402 5.626 5.95 6.154 6.347 6.619 6.881 7.135 7.392 7.651 7.986 8.313 8.616 8.964 9.305 9.642 10.03 10.463 10.893 11.359 11.854 12.375 12.917 13.524 14.21 14.875 15.665 16.553 17.518 18.548 19.731 21.033 22.432 23.345 23.671 23.721 23.641 23.476 23.219 22.898 22.594 22.289 22.007 21.736 21.469 21.215 20.961 20.702 20.42 20.171 19.968 19.772 19.57 19.399 19.215 19.002 18.821 18.636 18.452 18.257 18.043 17.888 17.732 17.49 17.316 17.136 17.043 16.853 16.626 16.38 16.258 15.937 15.818 15.643 15.46 15.077 14.873 14.657 14.421 14.156 13.82 13.384 12.265 -3 ,17380 ,KEBNE ,16749672,Wed Dec 1 18:34:55 CET,Wed Dec 1 20:24:57 CET,0.0 1.227 1.662 2.012 2.345 2.632 2.892 3.122 3.496 3.678 3.859 3.981 4.335 4.491 4.777 5.053 5.322 5.444 5.683 5.917 6.252 6.47 6.68 6.978 7.263 7.541 7.812 8.084 8.435 8.759 9.074 9.446 9.785 10.109 10.493 10.921 11.337 11.797 12.281 12.775 13.297 13.905 14.599 15.285 16.057 16.911 17.883 18.952 20.187 21.572 23.066 23.977 24.285 24.343 24.257 24.078 23.854 23.59 23.32 23.023 22.744 22.478 22.227 21.985 21.741 21.504 21.249 21.005 20.787 20.543 20.288 20.089 19.885 19.662 19.472 19.276 19.077 18.863 18.643 18.494 18.327 18.071 17.902 17.71 17.604 17.395 17.194 16.966 16.848 16.54 16.466 16.323 16.173 15.841 15.647 15.423 15.166 14.863 14.513 14.06 12.97 -4 ,15024 ,KEBNE ,16749673,Wed Dec 1 18:34:55 CET,Wed Dec 1 20:25:01 CET,0.0 1.047 1.487 1.819 2.128 2.384 2.62 2.839 3.235 3.417 3.585 3.69 4.044 4.187 4.467 4.748 5.015 5.138 5.371 5.602 5.942 6.158 6.362 6.644 6.928 7.219 7.488 7.762 8.109 8.414 8.717 9.08 9.424 9.756 10.141 10.579 10.993 11.452 11.961 12.487 13.033 13.634 14.33 15.027 15.821 16.712 17.74 18.861 20.13 21.538 23.011 24.042 24.469 24.518 24.397 24.209 23.998 23.788 23.549 23.259 22.999 22.759 22.523 22.286 22.045 21.808 21.557 21.322 21.103 20.882 20.652 20.439 20.213 19.978 19.787 19.593 19.393 19.18 18.961 18.809 18.632 18.329 18.125 17.927 17.825 17.606 17.37 17.108 16.976 16.658 16.584 16.426 16.258 15.9 15.701 15.488 15.239 14.958 14.635 14.188 13.108 -5 ,14088 ,KEBNE ,16749674,Wed Dec 1 18:34:56 CET,Wed Dec 1 20:25:05 CET,0.0 1.097 1.55 1.896 2.186 2.444 2.682 2.891 3.257 3.422 3.58 3.7 4.061 4.203 4.481 4.753 5.004 5.127 5.376 5.616 5.952 6.164 6.369 6.654 6.919 7.186 7.454 7.708 8.018 8.308 8.595 8.939 9.272 9.603 9.986 10.411 10.818 11.255 11.741 12.265 12.806 13.4 14.095 14.818 15.638 16.513 17.493 18.581 19.84 21.235 22.703 23.699 24.066 24.118 24.049 23.887 23.708 23.486 23.225 22.94 22.687 22.454 22.214 21.967 21.723 21.48 21.194 20.932 20.718 20.504 20.276 20.082 19.858 19.607 19.405 19.181 18.947 18.72 18.499 18.344 18.168 17.899 17.715 17.526 17.432 17.223 16.989 16.745 16.611 16.284 16.174 16.019 15.866 15.502 15.297 15.081 14.844 14.578 14.259 13.813 12.77 -6 ,15722 ,KEBNE ,16749675,Wed Dec 1 18:34:56 CET,Wed Dec 1 20:26:03 CET,0.0 1.003 1.432 1.754 2.045 2.298 2.514 2.719 3.096 3.278 3.458 3.594 3.952 4.097 4.379 4.662 4.926 5.058 5.32 5.57 5.923 6.145 6.364 6.673 6.961 7.248 7.533 7.791 8.107 8.421 8.728 9.081 9.417 9.759 10.147 10.563 10.962 11.404 11.882 12.383 12.91 13.5 14.196 14.915 15.748 16.661 17.687 18.783 20.029 21.493 23.101 24.16 24.546 24.638 24.61 24.477 24.245 23.966 23.674 23.367 23.108 22.866 22.599 22.334 22.1 21.875 21.61 21.36 21.147 20.925 20.693 20.492 20.27 20.049 19.873 19.681 19.479 19.265 19.028 18.858 18.689 18.426 18.235 18.029 17.919 17.697 17.467 17.22 17.095 16.783 16.688 16.526 16.35 15.991 15.802 15.595 15.368 15.106 14.775 14.353 13.366 -7 ,21223 ,KEBNE ,16749676,Wed Dec 1 18:34:56 CET,Wed Dec 1 20:24:33 CET,0.0 1.01 1.463 1.787 2.082 2.353 2.593 2.818 3.236 3.418 3.591 3.74 4.107 4.259 4.546 4.823 5.09 5.218 5.466 5.694 6.018 6.227 6.431 6.718 6.981 7.239 7.495 7.737 8.046 8.335 8.62 8.97 9.313 9.658 10.059 10.505 10.924 11.376 11.854 12.374 12.917 13.491 14.157 14.868 15.699 16.626 17.657 18.786 20.09 21.481 22.964 23.971 24.347 24.423 24.364 24.242 24.072 23.867 23.628 23.33 23.047 22.77 22.499 22.24 21.981 21.732 21.461 21.196 20.974 20.762 20.526 20.311 20.077 19.845 19.664 19.463 19.267 19.074 18.872 18.73 18.573 18.332 18.155 17.964 17.869 17.678 17.479 17.254 17.135 16.833 16.762 16.618 16.467 16.147 15.966 15.766 15.539 15.268 14.951 14.542 13.619 -8 ,25090 ,KEBNE ,16749677,Wed Dec 1 18:34:56 CET,Wed Dec 1 20:24:39 CET,0.0 1.243 1.705 2.058 2.367 2.638 2.879 3.086 3.454 3.631 3.802 3.927 4.287 4.43 4.702 4.954 5.202 5.327 5.561 5.785 6.119 6.339 6.545 6.831 7.116 7.39 7.666 7.938 8.286 8.622 8.938 9.303 9.656 9.992 10.379 10.829 11.265 11.749 12.269 12.812 13.381 14.023 14.756 15.468 16.294 17.2 18.21 19.316 20.617 22.018 23.372 24.28 24.556 24.558 24.476 24.316 24.11 23.882 23.655 23.383 23.108 22.849 22.592 22.336 22.085 21.831 21.547 21.305 21.089 20.852 20.6 20.386 20.172 19.955 19.78 19.588 19.395 19.193 18.969 18.817 18.653 18.39 18.195 17.98 17.879 17.669 17.446 17.215 17.085 16.754 16.665 16.514 16.355 16.014 15.812 15.591 15.343 15.047 14.692 14.264 13.168 -9 ,27935 ,KEBNE ,16749678,Wed Dec 1 18:37:09 CET,Wed Dec 1 20:29:14 CET,0.0 1.077 1.54 1.893 2.176 2.426 2.663 2.892 3.293 3.472 3.638 3.763 4.129 4.281 4.571 4.845 5.1 5.216 5.451 5.675 5.975 6.174 6.372 6.674 6.967 7.232 7.483 7.723 8.035 8.331 8.611 8.97 9.304 9.613 9.985 10.41 10.835 11.309 11.806 12.332 12.884 13.497 14.178 14.87 15.69 16.573 17.569 18.659 19.876 21.246 22.716 23.617 23.938 24.004 23.9 23.705 23.482 23.225 22.946 22.627 22.378 22.167 21.945 21.722 21.495 21.267 21.034 20.811 20.601 20.384 20.148 19.93 19.713 19.5 19.328 19.144 18.95 18.733 18.499 18.345 18.19 17.934 17.748 17.557 17.458 17.256 17.032 16.77 16.636 16.313 16.23 16.084 15.933 15.597 15.416 15.233 15.007 14.735 14.398 13.937 12.78 -10 ,25392 ,KEBNE ,16749679,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:18:40 CET,0.0 1.349 1.832 2.185 2.469 2.719 2.945 3.152 3.55 3.735 3.904 4.014 4.368 4.512 4.8 5.064 5.303 5.425 5.657 5.88 6.206 6.409 6.61 6.908 7.193 7.463 7.723 7.978 8.311 8.633 8.945 9.306 9.647 9.984 10.369 10.799 11.214 11.666 12.169 12.713 13.269 13.887 14.612 15.336 16.166 17.079 18.116 19.256 20.517 21.939 23.524 24.644 25.15 25.334 25.325 25.197 25.013 24.798 24.554 24.282 24.052 23.811 23.557 23.326 23.108 22.888 22.652 22.441 22.249 22.037 21.813 21.623 21.434 21.235 21.067 20.88 20.689 20.483 20.25 20.093 19.939 19.689 19.516 19.342 19.245 19.041 18.812 18.546 18.405 18.087 18.01 17.859 17.703 17.356 17.163 16.946 16.697 16.422 16.087 15.664 14.266 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index ebc68395..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12826 ,KEBNE ,16749680,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:20:48 CET,0.0 1.3 1.752 2.077 2.364 2.619 2.853 3.074 3.493 3.692 3.867 4.014 4.357 4.492 4.753 5.02 5.278 5.396 5.62 5.836 6.153 6.35 6.539 6.822 7.089 7.336 7.567 7.788 8.071 8.352 8.618 8.931 9.228 9.505 9.821 10.197 10.559 10.95 11.374 11.814 12.271 12.773 13.351 13.902 14.507 15.198 15.966 16.757 17.64 18.596 19.48 19.861 19.865 19.666 19.348 19.015 18.686 18.335 18.009 17.668 17.368 17.079 16.779 16.5 16.222 15.96 15.675 15.407 15.181 14.942 14.689 14.471 14.242 14.007 13.825 13.638 13.433 13.203 12.972 12.809 12.632 12.352 12.146 11.926 11.814 11.593 11.358 11.094 10.953 10.631 10.513 10.364 10.198 9.817 9.621 9.411 9.176 8.922 8.612 8.173 6.978 -2 ,2294 ,KEBNE ,16749681,Wed Dec 1 19:29:16 CET,Wed Dec 1 21:21:21 CET,0.0 1.122 1.554 1.887 2.168 2.403 2.624 2.848 3.264 3.44 3.606 3.75 4.09 4.237 4.515 4.767 5.006 5.112 5.325 5.546 5.85 6.041 6.219 6.468 6.712 6.961 7.206 7.442 7.735 8.001 8.265 8.593 8.916 9.221 9.561 9.937 10.293 10.684 11.11 11.552 11.983 12.455 13.014 13.572 14.225 14.925 15.665 16.463 17.354 18.295 19.196 19.628 19.626 19.418 19.122 18.777 18.404 18.029 17.682 17.345 17.059 16.783 16.494 16.199 15.909 15.629 15.318 15.04 14.803 14.557 14.294 14.069 13.84 13.599 13.407 13.208 13.005 12.787 12.543 12.374 12.197 11.919 11.731 11.53 11.417 11.176 10.925 10.66 10.516 10.186 10.056 9.878 9.688 9.287 9.073 8.859 8.608 8.284 7.912 7.449 6.332 -3 ,3653 ,KEBNE ,16749682,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:20:45 CET,0.0 1.009 1.449 1.764 2.042 2.295 2.529 2.746 3.119 3.296 3.483 3.659 4.011 4.16 4.434 4.702 4.959 5.08 5.316 5.535 5.858 6.07 6.27 6.542 6.792 7.034 7.275 7.507 7.797 8.09 8.383 8.726 9.05 9.347 9.677 10.051 10.405 10.8 11.229 11.685 12.159 12.675 13.241 13.789 14.454 15.205 16.024 16.875 17.789 18.771 19.629 19.949 19.931 19.754 19.424 19.077 18.763 18.415 18.086 17.713 17.367 17.053 16.739 16.442 16.168 15.912 15.631 15.368 15.143 14.905 14.63 14.386 14.141 13.903 13.723 13.532 13.326 13.11 12.87 12.696 12.517 12.252 12.071 11.872 11.767 11.539 11.301 11.057 10.929 10.606 10.487 10.331 10.164 9.773 9.566 9.357 9.106 8.813 8.485 8.057 7.03 -4 ,2920 ,KEBNE ,16749683,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:20:32 CET,0.0 1.104 1.536 1.848 2.115 2.357 2.582 2.8 3.191 3.372 3.547 3.681 4.024 4.181 4.478 4.743 4.991 5.107 5.335 5.556 5.869 6.074 6.269 6.548 6.819 7.069 7.314 7.56 7.859 8.146 8.431 8.793 9.157 9.493 9.847 10.232 10.601 10.99 11.386 11.793 12.231 12.73 13.282 13.811 14.402 15.02 15.725 16.495 17.328 18.139 18.877 19.265 19.209 18.917 18.558 18.176 17.778 17.381 17.035 16.677 16.351 16.031 15.704 15.407 15.13 14.87 14.604 14.35 14.118 13.867 13.612 13.395 13.17 12.953 12.774 12.584 12.378 12.148 11.907 11.743 11.567 11.297 11.111 10.911 10.807 10.58 10.339 10.082 9.947 9.639 9.557 9.399 9.215 8.841 8.646 8.427 8.184 7.906 7.566 7.12 6.049 -5 ,16108 ,KEBNE ,16749684,Wed Dec 1 19:29:28 CET,Wed Dec 1 21:19:32 CET,0.0 1.2 1.688 2.076 2.397 2.657 2.886 3.104 3.509 3.695 3.88 4.041 4.395 4.546 4.819 5.093 5.365 5.493 5.739 5.964 6.281 6.484 6.677 6.965 7.252 7.514 7.75 7.98 8.285 8.582 8.869 9.203 9.523 9.836 10.19 10.563 10.911 11.313 11.758 12.209 12.676 13.19 13.763 14.338 15.009 15.743 16.532 17.347 18.289 19.347 20.384 20.887 20.881 20.716 20.445 20.122 19.778 19.417 19.094 18.741 18.424 18.117 17.811 17.519 17.222 16.958 16.688 16.436 16.214 15.968 15.696 15.465 15.211 14.937 14.73 14.511 14.283 14.058 13.808 13.625 13.44 13.157 12.952 12.734 12.63 12.414 12.181 11.938 11.81 11.49 11.375 11.215 11.03 10.608 10.385 10.146 9.873 9.574 9.252 8.822 7.688 -6 ,21071 ,KEBNE ,16749685,Wed Dec 1 19:29:28 CET,Wed Dec 1 21:18:56 CET,0.0 1.179 1.701 2.072 2.387 2.663 2.891 3.106 3.484 3.65 3.818 3.94 4.267 4.414 4.676 4.932 5.172 5.287 5.516 5.73 6.043 6.241 6.435 6.721 6.995 7.26 7.512 7.756 8.075 8.37 8.643 8.948 9.225 9.506 9.848 10.232 10.598 11.004 11.419 11.836 12.281 12.786 13.36 13.922 14.562 15.238 15.966 16.725 17.538 18.355 19.107 19.431 19.402 19.208 18.923 18.601 18.26 17.91 17.584 17.242 16.932 16.633 16.312 15.995 15.711 15.455 15.187 14.946 14.737 14.512 14.26 14.053 13.831 13.587 13.406 13.212 13.004 12.789 12.553 12.38 12.202 11.93 11.75 11.554 11.446 11.227 11.007 10.768 10.64 10.334 10.219 10.058 9.896 9.547 9.341 9.099 8.83 8.536 8.181 7.679 6.299 -7 ,16783 ,KEBNE ,16749686,Wed Dec 1 19:29:28 CET,Wed Dec 1 21:15:49 CET,0.0 0.977 1.464 1.827 2.142 2.434 2.664 2.881 3.296 3.466 3.619 3.759 4.099 4.242 4.52 4.791 5.041 5.16 5.385 5.585 5.889 6.094 6.284 6.571 6.845 7.098 7.345 7.584 7.894 8.178 8.44 8.766 9.101 9.42 9.767 10.148 10.526 10.941 11.351 11.77 12.212 12.722 13.314 13.882 14.549 15.286 16.091 16.96 17.903 18.855 19.828 20.364 20.407 20.245 19.974 19.655 19.317 18.953 18.611 18.254 17.903 17.569 17.261 16.956 16.665 16.397 16.108 15.85 15.63 15.39 15.132 14.917 14.685 14.445 14.263 14.069 13.847 13.614 13.374 13.202 13.031 12.766 12.577 12.37 12.266 12.06 11.824 11.577 11.448 11.12 11.0 10.84 10.665 10.295 10.085 9.849 9.598 9.326 8.993 8.535 7.437 -8 ,2283 ,KEBNE ,16749687,Wed Dec 1 19:29:21 CET,Wed Dec 1 21:15:55 CET,0.0 1.15 1.645 2.054 2.384 2.638 2.848 3.062 3.459 3.631 3.803 3.942 4.279 4.423 4.69 4.951 5.217 5.341 5.563 5.777 6.072 6.261 6.454 6.724 6.991 7.254 7.49 7.708 8.003 8.293 8.573 8.913 9.241 9.545 9.891 10.279 10.637 11.019 11.423 11.873 12.35 12.879 13.504 14.12 14.795 15.544 16.421 17.338 18.335 19.359 20.326 20.8 20.831 20.637 20.354 20.043 19.714 19.372 19.045 18.668 18.331 18.043 17.772 17.482 17.188 16.921 16.628 16.355 16.128 15.891 15.626 15.405 15.167 14.9 14.69 14.476 14.255 14.034 13.804 13.644 13.478 13.202 13.007 12.81 12.704 12.488 12.265 12.009 11.871 11.544 11.422 11.257 11.086 10.724 10.516 10.267 9.98 9.678 9.323 8.849 7.821 -9 ,28724 ,KEBNE ,16749688,Wed Dec 1 19:29:16 CET,Wed Dec 1 21:21:13 CET,0.0 1.181 1.67 2.054 2.369 2.66 2.936 3.186 3.614 3.791 3.957 4.112 4.462 4.617 4.915 5.195 5.453 5.579 5.835 6.074 6.409 6.623 6.83 7.127 7.4 7.657 7.903 8.138 8.445 8.738 9.017 9.349 9.67 9.993 10.38 10.815 11.211 11.603 12.02 12.472 12.943 13.461 14.065 14.683 15.337 16.006 16.775 17.589 18.411 19.251 20.036 20.483 20.497 20.297 19.99 19.65 19.317 18.947 18.59 18.219 17.862 17.517 17.207 16.927 16.652 16.378 16.089 15.826 15.595 15.346 15.078 14.853 14.613 14.363 14.171 13.974 13.772 13.552 13.3 13.124 12.958 12.704 12.519 12.333 12.233 11.998 11.738 11.458 11.321 11.008 10.872 10.687 10.502 10.113 9.9 9.677 9.425 9.127 8.79 8.339 7.135 -10 ,1509 ,KEBNE ,16749689,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:19:56 CET,0.0 1.122 1.584 1.925 2.19 2.421 2.655 2.882 3.269 3.441 3.608 3.739 4.075 4.208 4.468 4.706 4.941 5.063 5.292 5.502 5.8 5.991 6.171 6.436 6.701 6.946 7.175 7.395 7.682 7.948 8.198 8.489 8.784 9.084 9.429 9.816 10.169 10.549 10.969 11.415 11.863 12.374 12.991 13.582 14.243 14.965 15.771 16.641 17.532 18.451 19.296 19.625 19.576 19.34 19.056 18.756 18.436 18.088 17.755 17.385 17.025 16.71 16.385 16.071 15.806 15.532 15.23 14.972 14.745 14.503 14.226 13.976 13.724 13.476 13.281 13.071 12.856 12.626 12.374 12.206 12.043 11.784 11.594 11.382 11.271 11.048 10.818 10.577 10.446 10.131 10.012 9.85 9.67 9.227 8.992 8.745 8.474 8.171 7.797 7.325 6.163 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 99199acb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1802 ,KEBNE ,16749690,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:20:18 CET,0.0 1.209 1.724 2.088 2.38 2.637 2.873 3.07 3.417 3.588 3.744 3.87 4.198 4.333 4.596 4.831 5.052 5.161 5.367 5.577 5.875 6.049 6.217 6.466 6.694 6.899 7.099 7.304 7.567 7.811 8.046 8.312 8.567 8.814 9.1 9.441 9.766 10.102 10.432 10.744 11.065 11.421 11.794 12.164 12.558 12.892 13.224 13.557 13.782 13.748 13.142 11.994 10.911 9.912 9.018 8.186 7.427 6.731 6.125 5.505 4.959 4.482 4.026 3.597 3.198 2.812 2.414 2.065 1.74 1.41 1.091 0.828 0.544 0.237 0.006 -0.225 -0.477 -0.748 -1.041 -1.242 -1.439 -1.755 -1.986 -2.218 -2.334 -2.586 -2.845 -3.116 -3.263 -3.602 -3.736 -3.901 -4.084 -4.481 -4.691 -4.924 -5.161 -5.426 -5.778 -6.295 -7.405 -2 ,9248 ,KEBNE ,16749691,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:21:17 CET,0.0 1.094 1.559 1.934 2.238 2.482 2.718 2.946 3.362 3.545 3.705 3.822 4.143 4.274 4.52 4.75 4.979 5.084 5.277 5.47 5.752 5.93 6.093 6.33 6.566 6.793 7.013 7.224 7.479 7.715 7.943 8.217 8.485 8.734 8.99 9.241 9.479 9.768 10.102 10.443 10.779 11.125 11.478 11.802 12.128 12.44 12.748 12.994 13.131 13.025 12.415 11.314 10.224 9.235 8.333 7.479 6.718 6.019 5.401 4.757 4.203 3.709 3.247 2.821 2.407 2.032 1.651 1.305 1.007 0.696 0.359 0.064 -0.246 -0.558 -0.801 -1.046 -1.292 -1.539 -1.792 -1.968 -2.157 -2.476 -2.697 -2.931 -3.051 -3.293 -3.549 -3.816 -3.955 -4.297 -4.427 -4.581 -4.743 -5.116 -5.318 -5.541 -5.797 -6.073 -6.409 -6.853 -8.076 -3 ,6906 ,KEBNE ,16749692,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:20:15 CET,0.0 1.108 1.555 1.888 2.181 2.456 2.699 2.904 3.281 3.46 3.626 3.757 4.079 4.212 4.46 4.674 4.875 4.973 5.159 5.337 5.601 5.775 5.938 6.166 6.383 6.594 6.791 6.973 7.195 7.41 7.625 7.87 8.094 8.312 8.562 8.828 9.06 9.332 9.637 9.928 10.204 10.481 10.794 11.1 11.406 11.693 11.928 12.082 12.131 12.002 11.393 10.18 9.002 7.971 7.062 6.199 5.432 4.746 4.139 3.52 2.988 2.52 2.073 1.637 1.218 0.831 0.43 0.064 -0.254 -0.574 -0.898 -1.169 -1.449 -1.743 -1.974 -2.209 -2.463 -2.728 -2.993 -3.177 -3.375 -3.686 -3.903 -4.13 -4.246 -4.484 -4.742 -5.012 -5.149 -5.471 -5.594 -5.763 -5.938 -6.315 -6.521 -6.746 -7.005 -7.299 -7.627 -8.045 -9.002 -4 ,14148 ,KEBNE ,16749693,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:21:11 CET,0.0 1.27 1.78 2.144 2.441 2.702 2.927 3.115 3.463 3.616 3.76 3.866 4.172 4.3 4.558 4.807 5.029 5.134 5.338 5.526 5.817 6.004 6.161 6.379 6.592 6.791 6.989 7.18 7.415 7.641 7.858 8.122 8.368 8.604 8.884 9.174 9.462 9.795 10.121 10.434 10.746 11.058 11.395 11.718 12.042 12.389 12.741 12.998 13.119 13.004 12.36 11.226 10.14 9.113 8.163 7.304 6.553 5.867 5.25 4.615 4.067 3.588 3.136 2.688 2.273 1.894 1.501 1.146 0.826 0.497 0.173 -0.089 -0.369 -0.67 -0.903 -1.133 -1.384 -1.662 -1.939 -2.127 -2.329 -2.642 -2.854 -3.072 -3.184 -3.423 -3.69 -3.976 -4.122 -4.452 -4.547 -4.704 -4.88 -5.257 -5.476 -5.709 -5.962 -6.244 -6.569 -7.005 -8.127 -5 ,11632 ,KEBNE ,16749694,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:20:51 CET,0.0 1.265 1.708 2.038 2.332 2.591 2.825 3.044 3.415 3.577 3.744 3.889 4.213 4.354 4.625 4.866 5.1 5.215 5.439 5.639 5.905 6.072 6.224 6.454 6.684 6.897 7.106 7.308 7.545 7.775 8.008 8.272 8.521 8.749 9.003 9.293 9.555 9.83 10.115 10.395 10.679 10.996 11.34 11.663 12.006 12.341 12.657 12.898 13.024 12.909 12.226 11.035 9.953 8.957 8.024 7.143 6.375 5.68 5.041 4.392 3.858 3.357 2.866 2.413 1.999 1.615 1.209 0.867 0.568 0.247 -0.089 -0.359 -0.628 -0.906 -1.126 -1.359 -1.607 -1.864 -2.142 -2.343 -2.545 -2.861 -3.085 -3.312 -3.433 -3.691 -3.943 -4.19 -4.334 -4.672 -4.801 -4.97 -5.144 -5.54 -5.762 -5.992 -6.239 -6.531 -6.881 -7.288 -8.263 -6 ,18246 ,KEBNE ,16749695,Wed Dec 1 19:29:16 CET,Wed Dec 1 21:19:22 CET,0.0 1.07 1.558 1.94 2.245 2.528 2.776 2.988 3.364 3.539 3.713 3.869 4.209 4.35 4.621 4.883 5.119 5.231 5.453 5.66 5.957 6.15 6.331 6.581 6.827 7.071 7.295 7.511 7.791 8.049 8.295 8.566 8.803 9.031 9.303 9.609 9.877 10.162 10.491 10.831 11.149 11.468 11.832 12.169 12.486 12.782 13.028 13.212 13.305 13.207 12.635 11.505 10.38 9.329 8.402 7.553 6.775 6.072 5.468 4.844 4.304 3.827 3.371 2.941 2.53 2.158 1.787 1.441 1.115 0.783 0.454 0.179 -0.096 -0.393 -0.639 -0.901 -1.169 -1.426 -1.701 -1.9 -2.105 -2.42 -2.634 -2.862 -2.981 -3.224 -3.479 -3.747 -3.894 -4.235 -4.361 -4.535 -4.714 -5.102 -5.328 -5.562 -5.822 -6.097 -6.408 -6.843 -7.851 -7 ,14006 ,KEBNE ,16749696,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:20:20 CET,0.0 1.081 1.571 1.93 2.211 2.469 2.693 2.889 3.269 3.45 3.613 3.736 4.06 4.188 4.438 4.671 4.895 5.006 5.214 5.407 5.673 5.838 6.002 6.241 6.459 6.666 6.869 7.064 7.309 7.529 7.736 7.993 8.239 8.467 8.727 9.012 9.273 9.537 9.787 10.07 10.388 10.699 11.004 11.284 11.592 11.899 12.187 12.406 12.555 12.467 11.805 10.627 9.471 8.423 7.492 6.63 5.844 5.114 4.501 3.888 3.346 2.857 2.382 1.946 1.556 1.185 0.781 0.415 0.097 -0.234 -0.577 -0.857 -1.148 -1.445 -1.678 -1.921 -2.176 -2.44 -2.72 -2.918 -3.119 -3.434 -3.656 -3.893 -4.013 -4.254 -4.506 -4.79 -4.94 -5.28 -5.421 -5.593 -5.767 -6.161 -6.397 -6.645 -6.892 -7.189 -7.568 -8.049 -9.202 -8 ,30813 ,KEBNE ,16749697,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:21:24 CET,0.0 1.469 1.97 2.324 2.619 2.876 3.102 3.314 3.691 3.857 4.019 4.139 4.458 4.595 4.869 5.127 5.361 5.47 5.677 5.878 6.175 6.367 6.549 6.791 7.014 7.232 7.439 7.639 7.907 8.158 8.38 8.645 8.905 9.165 9.46 9.768 10.058 10.382 10.72 11.048 11.378 11.718 12.063 12.383 12.725 13.046 13.38 13.659 13.809 13.796 13.262 12.182 11.033 9.905 8.945 8.102 7.338 6.649 6.058 5.448 4.907 4.402 3.91 3.471 3.071 2.701 2.32 1.978 1.676 1.352 1.006 0.72 0.425 0.127 -0.101 -0.341 -0.583 -0.826 -1.08 -1.271 -1.471 -1.771 -1.98 -2.206 -2.324 -2.559 -2.808 -3.083 -3.232 -3.572 -3.706 -3.867 -4.033 -4.392 -4.595 -4.821 -5.085 -5.414 -5.768 -6.201 -7.297 -9 ,9813 ,KEBNE ,16749698,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:21:14 CET,0.0 1.246 1.678 2.004 2.267 2.499 2.718 2.931 3.322 3.499 3.667 3.783 4.101 4.238 4.492 4.719 4.932 5.031 5.226 5.413 5.68 5.857 6.031 6.278 6.507 6.723 6.941 7.148 7.399 7.643 7.872 8.134 8.385 8.623 8.877 9.165 9.443 9.735 10.029 10.339 10.635 10.922 11.251 11.544 11.856 12.164 12.45 12.726 12.897 12.803 12.254 11.144 10.001 8.959 8.014 7.159 6.38 5.666 5.036 4.391 3.847 3.363 2.883 2.431 2.021 1.656 1.281 0.938 0.639 0.329 0.01 -0.254 -0.526 -0.813 -1.047 -1.288 -1.534 -1.785 -2.05 -2.237 -2.437 -2.738 -2.942 -3.16 -3.27 -3.495 -3.737 -3.993 -4.124 -4.45 -4.571 -4.751 -4.94 -5.311 -5.512 -5.73 -5.986 -6.286 -6.635 -7.067 -7.996 -10 ,13086 ,KEBNE ,16749699,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:20:18 CET,0.0 1.079 1.538 1.935 2.278 2.54 2.755 2.956 3.327 3.505 3.675 3.802 4.122 4.259 4.518 4.749 4.977 5.085 5.321 5.571 5.91 6.114 6.284 6.517 6.739 6.953 7.159 7.36 7.619 7.872 8.103 8.362 8.61 8.836 9.086 9.359 9.613 9.887 10.173 10.45 10.72 11.007 11.312 11.583 11.89 12.217 12.522 12.768 12.884 12.72 11.988 10.803 9.683 8.642 7.694 6.81 6.02 5.288 4.657 4.051 3.533 3.061 2.613 2.185 1.772 1.397 1.01 0.663 0.352 0.027 -0.303 -0.573 -0.854 -1.142 -1.367 -1.603 -1.843 -2.092 -2.35 -2.527 -2.712 -3.008 -3.214 -3.443 -3.566 -3.809 -4.063 -4.334 -4.481 -4.824 -4.981 -5.151 -5.317 -5.703 -5.913 -6.136 -6.375 -6.654 -7.014 -7.491 -8.468 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index 1c9ceb6a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4505 ,KEBNE ,16749700,Wed Dec 1 19:29:16 CET,Wed Dec 1 21:21:14 CET,0.0 0.869 1.306 1.683 1.987 2.242 2.474 2.684 3.055 3.232 3.409 3.576 3.917 4.059 4.343 4.621 4.874 4.997 5.233 5.458 5.789 6.003 6.208 6.503 6.79 7.063 7.323 7.569 7.888 8.202 8.52 8.923 9.303 9.669 10.085 10.539 10.961 11.418 11.907 12.409 12.94 13.531 14.22 14.895 15.657 16.529 17.516 18.566 19.771 21.192 22.787 23.843 24.202 24.235 24.151 23.926 23.594 23.271 22.995 22.661 22.321 21.997 21.686 21.398 21.117 20.842 20.521 20.208 19.937 19.669 19.378 19.13 18.867 18.597 18.379 18.143 17.899 17.625 17.336 17.148 16.941 16.586 16.329 16.057 15.915 15.61 15.301 14.99 14.814 14.449 14.217 14.004 13.769 13.222 12.928 12.618 12.271 11.881 11.381 10.704 8.575 -2 ,11398 ,KEBNE ,16749701,Wed Dec 1 19:29:16 CET,Wed Dec 1 21:20:28 CET,0.0 0.967 1.374 1.699 1.982 2.229 2.439 2.635 3.007 3.169 3.332 3.478 3.795 3.938 4.214 4.478 4.722 4.839 5.075 5.291 5.597 5.797 5.995 6.284 6.545 6.791 7.046 7.312 7.653 7.985 8.303 8.68 9.052 9.409 9.81 10.247 10.664 11.103 11.573 12.07 12.587 13.166 13.83 14.481 15.218 16.028 16.922 17.886 18.984 20.247 21.642 22.59 22.952 22.99 22.896 22.712 22.464 22.205 21.956 21.676 21.387 21.108 20.841 20.564 20.31 20.071 19.8 19.548 19.313 19.069 18.837 18.634 18.386 18.128 17.922 17.696 17.454 17.195 16.915 16.721 16.521 16.181 15.932 15.687 15.564 15.271 14.94 14.587 14.402 14.048 13.821 13.617 13.409 12.935 12.65 12.338 12.005 11.581 11.05 10.406 8.584 -3 ,19974 ,KEBNE ,16749702,Wed Dec 1 19:29:16 CET,Wed Dec 1 21:21:01 CET,0.0 1.021 1.43 1.767 2.051 2.308 2.532 2.737 3.113 3.278 3.437 3.573 3.893 4.037 4.327 4.609 4.869 4.984 5.208 5.44 5.766 5.965 6.156 6.433 6.694 6.948 7.201 7.437 7.746 8.044 8.32 8.656 8.984 9.299 9.651 10.037 10.409 10.817 11.267 11.741 12.227 12.779 13.405 14.045 14.806 15.652 16.629 17.709 18.932 20.321 21.887 22.911 23.303 23.336 23.222 23.047 22.834 22.58 22.298 22.013 21.747 21.481 21.184 20.883 20.603 20.319 20.01 19.738 19.489 19.219 18.926 18.66 18.38 18.089 17.849 17.588 17.319 17.032 16.722 16.505 16.271 15.9 15.644 15.383 15.25 14.971 14.661 14.319 14.14 13.773 13.533 13.323 13.105 12.638 12.369 12.064 11.729 11.354 10.905 10.35 8.716 -4 ,2497 ,KEBNE ,16749703,Wed Dec 1 19:29:16 CET,Wed Dec 1 21:20:06 CET,0.0 0.83 1.242 1.576 1.87 2.128 2.344 2.561 2.96 3.128 3.288 3.408 3.72 3.858 4.118 4.352 4.578 4.687 4.902 5.11 5.411 5.604 5.796 6.077 6.334 6.588 6.837 7.068 7.352 7.631 7.903 8.224 8.541 8.844 9.195 9.602 9.985 10.388 10.828 11.31 11.809 12.361 12.985 13.613 14.362 15.185 16.102 17.114 18.284 19.596 20.987 21.917 22.299 22.408 22.367 22.24 22.06 21.807 21.549 21.279 21.019 20.766 20.484 20.201 19.948 19.719 19.449 19.169 18.918 18.635 18.325 18.073 17.804 17.506 17.267 17.03 16.79 16.529 16.241 16.024 15.791 15.418 15.158 14.903 14.766 14.473 14.17 13.841 13.661 13.296 13.049 12.809 12.548 11.958 11.627 11.294 10.932 10.509 10.018 9.333 7.144 -5 ,13483 ,KEBNE ,16749704,Wed Dec 1 19:29:16 CET,Wed Dec 1 21:17:17 CET,0.0 1.089 1.509 1.831 2.118 2.374 2.587 2.784 3.147 3.31 3.469 3.606 3.92 4.057 4.324 4.575 4.801 4.91 5.138 5.362 5.666 5.861 6.053 6.326 6.595 6.844 7.085 7.325 7.624 7.913 8.197 8.54 8.867 9.176 9.527 9.922 10.318 10.751 11.203 11.683 12.185 12.741 13.391 14.042 14.786 15.604 16.542 17.551 18.695 20.015 21.464 22.396 22.713 22.775 22.664 22.482 22.269 22.05 21.799 21.445 21.135 20.875 20.621 20.372 20.131 19.893 19.634 19.407 19.201 18.973 18.737 18.531 18.307 18.069 17.867 17.647 17.403 17.133 16.892 16.74 16.569 16.288 16.088 15.883 15.766 15.489 15.184 14.851 14.67 14.312 14.078 13.871 13.658 13.19 12.921 12.641 12.329 11.952 11.474 10.816 8.574 -6 ,1106 ,KEBNE ,16749705,Wed Dec 1 19:29:16 CET,Wed Dec 1 21:21:50 CET,0.0 0.884 1.272 1.583 1.848 2.072 2.273 2.468 2.839 3.018 3.187 3.317 3.629 3.759 4.013 4.257 4.486 4.598 4.815 5.015 5.313 5.509 5.696 5.963 6.225 6.473 6.707 6.931 7.22 7.506 7.766 8.078 8.386 8.695 9.052 9.448 9.83 10.243 10.696 11.17 11.667 12.231 12.872 13.499 14.249 15.113 16.101 17.125 18.213 19.441 20.787 21.63 21.938 21.992 21.889 21.665 21.395 21.132 20.894 20.625 20.371 20.114 19.839 19.573 19.312 19.062 18.804 18.565 18.349 18.093 17.768 17.486 17.201 16.885 16.635 16.397 16.162 15.908 15.633 15.439 15.242 14.942 14.716 14.466 14.335 14.061 13.771 13.441 13.268 12.922 12.686 12.485 12.269 11.768 11.482 11.148 10.798 10.439 10.001 9.367 6.893 -7 ,17247 ,KEBNE ,16749706,Wed Dec 1 19:29:16 CET,Wed Dec 1 21:19:40 CET,0.0 0.83 1.237 1.561 1.835 2.083 2.307 2.504 2.846 3.013 3.176 3.301 3.617 3.753 4.012 4.264 4.497 4.615 4.857 5.08 5.389 5.585 5.775 6.057 6.327 6.582 6.831 7.071 7.377 7.676 7.954 8.278 8.596 8.907 9.259 9.657 10.041 10.454 10.89 11.355 11.855 12.43 13.101 13.75 14.481 15.285 16.202 17.241 18.446 19.784 21.225 22.147 22.466 22.566 22.549 22.387 22.144 21.858 21.567 21.239 20.958 20.705 20.432 20.169 19.923 19.688 19.4 19.134 18.91 18.68 18.438 18.217 17.971 17.699 17.48 17.266 17.044 16.789 16.546 16.398 16.225 15.899 15.676 15.446 15.334 15.122 14.88 14.575 14.411 14.095 13.913 13.721 13.519 13.069 12.818 12.516 12.15 11.731 11.206 10.563 8.4 -8 ,24897 ,KEBNE ,16749707,Wed Dec 1 19:29:16 CET,Wed Dec 1 21:20:33 CET,0.0 0.836 1.231 1.562 1.83 2.064 2.277 2.471 2.823 2.988 3.146 3.265 3.577 3.712 3.976 4.229 4.458 4.568 4.785 4.988 5.287 5.483 5.673 5.944 6.203 6.46 6.713 6.949 7.237 7.51 7.778 8.108 8.428 8.732 9.088 9.488 9.869 10.285 10.739 11.218 11.718 12.276 12.911 13.543 14.263 15.037 15.896 16.849 17.918 19.105 20.402 21.315 21.76 21.917 21.907 21.801 21.572 21.272 21.004 20.724 20.425 20.117 19.831 19.557 19.297 19.052 18.796 18.554 18.343 18.122 17.864 17.645 17.412 17.159 16.945 16.718 16.473 16.191 15.911 15.73 15.542 15.248 15.039 14.822 14.713 14.453 14.162 13.86 13.692 13.357 13.173 12.964 12.718 12.172 11.888 11.576 11.206 10.78 10.266 9.587 7.401 -9 ,14723 ,KEBNE ,16749708,Wed Dec 1 19:29:17 CET,Wed Dec 1 21:20:53 CET,0.0 0.95 1.387 1.731 2.035 2.296 2.544 2.766 3.16 3.34 3.507 3.641 3.964 4.095 4.347 4.591 4.83 4.944 5.169 5.393 5.709 5.911 6.11 6.394 6.66 6.928 7.172 7.398 7.697 7.988 8.266 8.604 8.939 9.24 9.586 9.975 10.345 10.758 11.19 11.645 12.119 12.649 13.262 13.871 14.576 15.371 16.268 17.254 18.43 19.747 21.071 21.929 22.253 22.317 22.22 22.031 21.8 21.521 21.188 20.803 20.469 20.152 19.823 19.488 19.161 18.847 18.501 18.194 17.934 17.672 17.393 17.14 16.877 16.606 16.393 16.165 15.91 15.633 15.339 15.129 14.912 14.56 14.314 14.06 13.917 13.611 13.304 12.972 12.789 12.433 12.208 12.001 11.779 11.284 10.999 10.668 10.326 9.941 9.424 8.741 6.851 -10 ,19103 ,KEBNE ,16749709,Wed Dec 1 19:29:18 CET,Wed Dec 1 21:22:31 CET,0.0 1.276 1.715 2.064 2.352 2.598 2.827 3.033 3.403 3.578 3.741 3.867 4.189 4.331 4.607 4.879 5.14 5.261 5.483 5.695 6.0 6.193 6.385 6.663 6.928 7.181 7.428 7.67 7.979 8.272 8.546 8.886 9.217 9.533 9.903 10.308 10.686 11.098 11.543 12.016 12.516 13.071 13.706 14.361 15.127 15.966 16.914 17.982 19.188 20.462 21.781 22.621 22.952 23.039 22.98 22.804 22.576 22.312 22.066 21.801 21.542 21.29 21.023 20.737 20.459 20.199 19.927 19.663 19.407 19.129 18.851 18.636 18.403 18.136 17.911 17.688 17.457 17.221 16.961 16.757 16.551 16.238 16.016 15.794 15.667 15.385 15.093 14.759 14.589 14.255 14.061 13.866 13.673 13.217 12.925 12.614 12.286 11.898 11.381 10.596 8.015 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt deleted file mode 100644 index 0510e436..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4795 ,KEBNE ,16749710,Wed Dec 1 19:29:17 CET,Wed Dec 1 21:19:22 CET,0.0 1.007 1.496 1.841 2.123 2.395 2.63 2.864 3.31 3.503 3.687 3.817 4.155 4.311 4.601 4.869 5.116 5.235 5.47 5.694 6.008 6.201 6.388 6.665 6.93 7.192 7.454 7.702 8.005 8.294 8.573 8.897 9.217 9.536 9.898 10.298 10.682 11.108 11.564 12.055 12.565 13.13 13.792 14.449 15.192 15.999 16.889 17.813 18.861 20.112 21.536 22.51 22.884 22.959 22.889 22.709 22.459 22.181 21.898 21.586 21.316 21.049 20.763 20.463 20.171 19.915 19.622 19.33 19.076 18.799 18.49 18.24 17.988 17.705 17.483 17.259 17.016 16.756 16.48 16.295 16.109 15.817 15.607 15.374 15.257 15.012 14.732 14.449 14.294 13.938 13.771 13.575 13.344 12.893 12.659 12.413 12.131 11.779 11.319 10.694 8.88 -2 ,28328 ,KEBNE ,16749711,Wed Dec 1 19:29:17 CET,Wed Dec 1 21:20:31 CET,0.0 1.017 1.434 1.761 2.062 2.329 2.563 2.788 3.194 3.381 3.561 3.691 4.018 4.161 4.458 4.721 4.944 5.052 5.27 5.477 5.772 5.969 6.168 6.452 6.707 6.956 7.207 7.452 7.754 8.035 8.304 8.629 8.948 9.261 9.621 10.024 10.413 10.828 11.267 11.749 12.251 12.789 13.401 14.032 14.791 15.622 16.531 17.511 18.636 19.895 21.236 22.082 22.402 22.49 22.409 22.216 21.965 21.705 21.449 21.174 20.951 20.702 20.436 20.169 19.912 19.628 19.302 19.055 18.84 18.604 18.334 18.095 17.857 17.61 17.402 17.166 16.915 16.659 16.392 16.204 16.016 15.721 15.495 15.253 15.125 14.864 14.609 14.317 14.156 13.817 13.619 13.395 13.163 12.68 12.419 12.148 11.836 11.475 11.02 10.315 8.257 -3 ,4316 ,KEBNE ,16749712,Wed Dec 1 19:29:15 CET,Wed Dec 1 21:21:29 CET,0.0 1.144 1.623 1.975 2.259 2.526 2.785 3.013 3.411 3.591 3.758 3.878 4.209 4.344 4.623 4.907 5.175 5.292 5.516 5.741 6.078 6.292 6.483 6.747 7.008 7.27 7.525 7.76 8.06 8.36 8.637 8.98 9.334 9.665 10.028 10.434 10.83 11.258 11.702 12.18 12.689 13.274 13.956 14.601 15.334 16.15 17.067 18.093 19.285 20.583 22.025 23.078 23.481 23.536 23.464 23.322 23.121 22.859 22.578 22.263 21.969 21.681 21.375 21.087 20.822 20.563 20.277 20.013 19.776 19.506 19.231 19.003 18.749 18.481 18.269 18.039 17.787 17.503 17.199 16.991 16.784 16.483 16.261 16.011 15.883 15.609 15.321 15.009 14.843 14.493 14.297 14.094 13.885 13.388 13.088 12.75 12.392 12.014 11.558 10.964 9.244 -4 ,21186 ,KEBNE ,16749713,Wed Dec 1 19:29:16 CET,Wed Dec 1 21:21:40 CET,0.0 1.109 1.564 1.885 2.172 2.427 2.658 2.864 3.252 3.434 3.601 3.723 4.051 4.188 4.45 4.704 4.956 5.076 5.319 5.557 5.886 6.096 6.298 6.586 6.862 7.129 7.382 7.623 7.935 8.237 8.522 8.861 9.197 9.513 9.875 10.282 10.658 11.066 11.507 11.979 12.474 13.042 13.683 14.306 15.059 15.893 16.811 17.828 19.034 20.355 21.8 22.86 23.245 23.329 23.206 22.961 22.764 22.573 22.35 22.063 21.785 21.536 21.292 21.058 20.84 20.623 20.383 20.152 19.94 19.718 19.495 19.301 19.074 18.825 18.616 18.404 18.187 17.96 17.727 17.566 17.389 17.098 16.882 16.658 16.55 16.317 16.06 15.78 15.631 15.294 15.099 14.88 14.652 14.182 13.911 13.616 13.292 12.885 12.365 11.706 9.758 -5 ,30284 ,KEBNE ,16749714,Wed Dec 1 19:29:17 CET,Wed Dec 1 21:21:31 CET,0.0 1.14 1.581 1.892 2.16 2.4 2.616 2.824 3.192 3.357 3.524 3.662 3.991 4.123 4.401 4.673 4.916 5.034 5.268 5.484 5.782 5.974 6.158 6.426 6.684 6.937 7.184 7.416 7.723 8.019 8.298 8.632 8.938 9.237 9.591 9.977 10.344 10.752 11.189 11.643 12.129 12.683 13.311 13.92 14.62 15.408 16.324 17.323 18.436 19.713 21.063 21.932 22.275 22.362 22.314 22.145 21.903 21.639 21.382 21.099 20.841 20.57 20.258 19.962 19.704 19.46 19.2 18.976 18.771 18.53 18.253 18.008 17.75 17.497 17.306 17.094 16.851 16.594 16.312 16.127 15.946 15.636 15.43 15.195 15.058 14.763 14.443 14.095 13.918 13.571 13.386 13.192 12.993 12.529 12.254 11.974 11.666 11.264 10.777 10.12 8.008 -6 ,23279 ,KEBNE ,16749715,Wed Dec 1 19:29:17 CET,Wed Dec 1 21:18:55 CET,0.0 1.074 1.57 1.937 2.255 2.501 2.731 2.951 3.354 3.529 3.69 3.825 4.167 4.312 4.59 4.844 5.072 5.183 5.404 5.622 5.935 6.128 6.323 6.61 6.867 7.122 7.376 7.611 7.911 8.196 8.472 8.808 9.128 9.44 9.797 10.191 10.581 10.999 11.421 11.871 12.357 12.904 13.54 14.173 14.911 15.732 16.63 17.624 18.808 20.091 21.415 22.294 22.655 22.779 22.773 22.674 22.469 22.246 21.998 21.647 21.295 20.94 20.603 20.332 20.088 19.85 19.567 19.288 19.044 18.793 18.52 18.274 18.029 17.794 17.613 17.408 17.154 16.867 16.57 16.366 16.168 15.841 15.595 15.343 15.221 14.987 14.731 14.452 14.299 13.939 13.718 13.499 13.273 12.805 12.533 12.219 11.886 11.515 11.045 10.411 8.272 -7 ,27551 ,KEBNE ,16749716,Wed Dec 1 19:36:50 CET,Wed Dec 1 21:28:21 CET,0.0 1.381 1.888 2.295 2.649 2.976 3.272 3.531 3.998 4.202 4.384 4.52 4.865 5.012 5.291 5.576 5.867 6.01 6.292 6.557 6.95 7.204 7.439 7.76 8.033 8.276 8.513 8.75 9.061 9.35 9.622 9.961 10.292 10.615 10.984 11.391 11.78 12.2 12.665 13.153 13.641 14.185 14.826 15.457 16.193 17.038 17.996 19.035 20.226 21.583 23.065 23.942 24.182 24.207 24.073 23.847 23.591 23.309 23.044 22.769 22.51 22.246 21.964 21.671 21.408 21.177 20.899 20.635 20.414 20.181 19.928 19.71 19.484 19.23 19.018 18.802 18.552 18.265 17.95 17.721 17.486 17.09 16.807 16.51 16.355 16.041 15.697 15.323 15.127 14.736 14.449 14.197 13.937 13.353 13.018 12.647 12.254 11.804 11.258 10.445 7.997 -8 ,1160 ,KEBNE ,16749717,Wed Dec 1 19:36:50 CET,Wed Dec 1 21:28:46 CET,0.0 1.09 1.531 1.874 2.153 2.399 2.63 2.856 3.255 3.43 3.605 3.752 4.095 4.237 4.512 4.757 4.981 5.094 5.315 5.529 5.829 6.014 6.195 6.475 6.756 7.01 7.246 7.484 7.791 8.085 8.367 8.693 9.009 9.324 9.686 10.074 10.446 10.855 11.289 11.763 12.258 12.807 13.433 14.052 14.756 15.531 16.454 17.466 18.592 19.884 21.257 22.206 22.628 22.725 22.672 22.585 22.432 22.23 22.021 21.756 21.508 21.273 21.027 20.773 20.502 20.256 20.009 19.764 19.535 19.303 19.05 18.818 18.575 18.313 18.115 17.912 17.69 17.458 17.2 17.009 16.816 16.498 16.257 16.019 15.892 15.598 15.297 14.984 14.818 14.463 14.276 14.088 13.865 13.33 13.037 12.722 12.371 11.994 11.517 10.784 8.491 -9 ,18846 ,KEBNE ,16749718,Wed Dec 1 19:36:49 CET,Wed Dec 1 21:28:12 CET,0.0 1.075 1.496 1.799 2.082 2.341 2.571 2.783 3.171 3.358 3.529 3.648 3.984 4.127 4.4 4.653 4.891 5.006 5.239 5.46 5.766 5.963 6.155 6.43 6.696 6.95 7.197 7.435 7.736 8.04 8.337 8.678 9.012 9.341 9.699 10.1 10.502 10.931 11.386 11.875 12.389 12.957 13.604 14.258 14.991 15.787 16.734 17.783 18.935 20.189 21.521 22.47 22.882 23.001 22.983 22.88 22.677 22.39 22.132 21.877 21.629 21.366 21.064 20.777 20.519 20.243 19.942 19.681 19.447 19.212 18.935 18.643 18.342 18.056 17.828 17.595 17.363 17.114 16.831 16.642 16.453 16.124 15.882 15.625 15.498 15.239 14.962 14.666 14.499 14.125 13.895 13.695 13.489 13.0 12.739 12.469 12.147 11.737 11.219 10.592 9.119 -10 ,10904 ,KEBNE ,16749719,Wed Dec 1 19:36:50 CET,Wed Dec 1 21:27:52 CET,0.0 1.027 1.496 1.838 2.127 2.378 2.619 2.839 3.211 3.387 3.558 3.675 4.004 4.147 4.428 4.685 4.925 5.043 5.263 5.474 5.788 5.986 6.172 6.451 6.711 6.949 7.185 7.415 7.714 8.006 8.291 8.63 8.948 9.255 9.616 10.031 10.429 10.85 11.301 11.779 12.275 12.843 13.492 14.138 14.888 15.711 16.632 17.627 18.767 20.018 21.393 22.288 22.637 22.758 22.731 22.575 22.375 22.131 21.86 21.529 21.229 20.958 20.666 20.379 20.101 19.821 19.503 19.21 18.948 18.659 18.369 18.154 17.911 17.62 17.391 17.165 16.931 16.661 16.377 16.191 15.986 15.625 15.373 15.113 14.975 14.692 14.389 14.071 13.905 13.543 13.335 13.132 12.914 12.415 12.135 11.836 11.484 11.087 10.612 9.927 7.996 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt deleted file mode 100644 index 29b102f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1580 ,KEBNE ,16749720,Wed Dec 1 19:36:50 CET,Wed Dec 1 21:28:09 CET,0.0 1.811 2.396 2.854 3.221 3.541 3.832 4.101 4.56 4.766 4.96 5.139 5.502 5.674 5.984 6.261 6.532 6.668 6.917 7.153 7.494 7.708 7.91 8.193 8.458 8.711 8.961 9.206 9.529 9.854 10.162 10.522 10.868 11.201 11.586 11.991 12.359 12.764 13.191 13.654 14.152 14.712 15.378 16.013 16.714 17.498 18.39 19.37 20.404 21.469 22.597 23.298 23.465 23.405 23.258 23.015 22.731 22.441 22.152 21.829 21.527 21.244 20.97 20.709 20.435 20.172 19.911 19.68 19.475 19.25 19.003 18.776 18.512 18.219 17.988 17.753 17.507 17.243 16.966 16.781 16.584 16.264 16.041 15.822 15.714 15.481 15.236 14.974 14.833 14.518 14.387 14.222 14.046 13.654 13.429 13.178 12.899 12.579 12.193 11.693 10.4 -2 ,9414 ,KEBNE ,16749721,Wed Dec 1 19:36:50 CET,Wed Dec 1 21:28:15 CET,0.0 1.737 2.292 2.712 3.075 3.407 3.686 3.926 4.338 4.546 4.778 5.027 5.413 5.599 5.95 6.287 6.609 6.751 7.0 7.238 7.585 7.812 8.033 8.351 8.66 8.94 9.19 9.423 9.732 10.045 10.348 10.71 11.046 11.38 11.777 12.193 12.575 12.995 13.461 13.974 14.52 15.115 15.775 16.431 17.169 17.955 18.823 19.741 20.779 21.94 23.079 23.632 23.7 23.549 23.278 22.936 22.528 22.138 21.773 21.379 21.047 20.722 20.364 20.023 19.712 19.409 19.084 18.795 18.549 18.28 17.98 17.739 17.491 17.224 17.026 16.82 16.589 16.346 16.085 15.9 15.716 15.431 15.229 15.026 14.919 14.679 14.444 14.203 14.062 13.736 13.607 13.437 13.252 12.859 12.647 12.408 12.122 11.791 11.416 10.935 9.796 -3 ,20501 ,KEBNE ,16749722,Wed Dec 1 19:36:50 CET,Wed Dec 1 21:28:30 CET,0.0 1.849 2.456 2.953 3.358 3.7 4.019 4.315 4.854 5.1 5.319 5.538 5.928 6.109 6.45 6.777 7.09 7.238 7.526 7.807 8.181 8.409 8.627 8.918 9.176 9.432 9.688 9.928 10.236 10.534 10.824 11.179 11.513 11.829 12.199 12.626 13.025 13.455 13.91 14.381 14.872 15.403 16.016 16.633 17.34 18.09 18.941 19.859 20.834 21.886 22.932 23.492 23.58 23.43 23.171 22.876 22.575 22.222 21.888 21.542 21.219 20.935 20.641 20.343 20.055 19.761 19.416 19.101 18.836 18.549 18.234 17.973 17.711 17.443 17.224 16.989 16.737 16.474 16.187 15.971 15.765 15.476 15.274 15.067 14.954 14.695 14.427 14.147 13.99 13.633 13.419 13.217 13.014 12.56 12.301 12.012 11.69 11.323 10.859 10.218 8.822 -4 ,12112 ,KEBNE ,16749723,Wed Dec 1 19:36:50 CET,Wed Dec 1 21:28:47 CET,0.0 2.029 2.671 3.166 3.549 3.854 4.141 4.398 4.874 5.094 5.297 5.476 5.822 5.977 6.274 6.559 6.831 6.963 7.215 7.453 7.8 8.033 8.261 8.583 8.886 9.164 9.43 9.684 9.994 10.297 10.58 10.911 11.249 11.57 11.916 12.312 12.704 13.133 13.594 14.081 14.594 15.165 15.789 16.379 17.08 17.89 18.81 19.795 20.871 22.065 23.267 23.966 24.233 24.204 24.036 23.838 23.569 23.275 22.991 22.662 22.374 22.128 21.872 21.608 21.361 21.117 20.848 20.604 20.364 20.119 19.864 19.638 19.408 19.172 18.994 18.799 18.58 18.348 18.112 17.947 17.775 17.532 17.353 17.148 17.041 16.809 16.563 16.297 16.157 15.838 15.689 15.511 15.326 14.92 14.695 14.437 14.139 13.803 13.44 12.936 11.515 -5 ,4583 ,KEBNE ,16749724,Wed Dec 1 19:36:49 CET,Wed Dec 1 21:28:52 CET,0.0 1.971 2.71 3.236 3.616 3.959 4.259 4.519 4.985 5.188 5.373 5.539 5.886 6.048 6.37 6.666 6.931 7.062 7.314 7.554 7.897 8.099 8.286 8.571 8.864 9.14 9.4 9.651 9.969 10.28 10.578 10.927 11.249 11.55 11.904 12.306 12.693 13.118 13.562 14.042 14.543 15.068 15.648 16.216 16.884 17.634 18.493 19.443 20.496 21.669 22.874 23.588 23.84 23.822 23.648 23.397 23.105 22.813 22.544 22.249 21.968 21.693 21.404 21.106 20.822 20.56 20.287 20.023 19.788 19.548 19.287 19.049 18.797 18.549 18.357 18.169 17.952 17.713 17.469 17.286 17.104 16.834 16.63 16.408 16.295 16.06 15.82 15.565 15.422 15.096 14.95 14.777 14.611 14.263 14.064 13.829 13.571 13.293 12.948 12.466 11.227 -6 ,7967 ,KEBNE ,16749725,Wed Dec 1 19:36:49 CET,Wed Dec 1 21:28:44 CET,0.0 1.793 2.376 2.767 3.089 3.363 3.618 3.857 4.298 4.512 4.711 4.883 5.232 5.388 5.679 5.963 6.248 6.386 6.641 6.878 7.2 7.402 7.604 7.89 8.162 8.425 8.682 8.928 9.255 9.571 9.86 10.208 10.537 10.85 11.223 11.632 12.015 12.43 12.867 13.343 13.853 14.425 15.09 15.741 16.479 17.286 18.169 19.119 20.195 21.311 22.391 23.06 23.266 23.164 22.937 22.637 22.331 22.027 21.754 21.488 21.23 20.965 20.686 20.402 20.127 19.871 19.578 19.31 19.083 18.82 18.528 18.29 18.055 17.805 17.606 17.382 17.144 16.906 16.675 16.516 16.339 16.046 15.827 15.594 15.471 15.211 14.942 14.648 14.496 14.169 14.041 13.871 13.666 13.197 12.948 12.689 12.393 12.009 11.543 10.931 9.344 -7 ,17044 ,KEBNE ,16749726,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:47:11 CET,0.0 1.936 2.575 3.031 3.38 3.653 3.893 4.129 4.573 4.769 4.95 5.118 5.474 5.646 5.958 6.245 6.509 6.632 6.878 7.113 7.436 7.652 7.857 8.137 8.391 8.644 8.905 9.148 9.452 9.751 10.04 10.39 10.719 11.034 11.396 11.799 12.184 12.605 13.053 13.547 14.111 14.719 15.35 15.959 16.671 17.435 18.258 19.158 20.201 21.354 22.581 23.333 23.539 23.471 23.237 22.916 22.582 22.255 21.948 21.605 21.268 20.961 20.641 20.324 20.038 19.77 19.473 19.194 18.952 18.715 18.464 18.248 18.022 17.796 17.617 17.418 17.197 16.944 16.679 16.501 16.326 16.048 15.838 15.621 15.506 15.259 15.004 14.737 14.598 14.277 14.145 13.969 13.777 13.363 13.139 12.883 12.593 12.276 11.935 11.49 10.278 -8 ,8049 ,KEBNE ,16749727,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:48:22 CET,0.0 1.649 2.233 2.679 3.041 3.345 3.613 3.853 4.29 4.489 4.692 4.883 5.234 5.401 5.73 6.05 6.348 6.481 6.742 6.996 7.355 7.574 7.786 8.11 8.429 8.746 9.042 9.316 9.656 9.986 10.308 10.679 11.023 11.358 11.734 12.15 12.564 12.997 13.438 13.932 14.474 15.055 15.675 16.263 16.959 17.737 18.625 19.562 20.581 21.699 22.926 23.701 23.865 23.757 23.513 23.244 22.964 22.655 22.387 22.089 21.791 21.517 21.245 20.958 20.652 20.366 20.067 19.782 19.535 19.282 19.013 18.789 18.561 18.319 18.131 17.926 17.701 17.471 17.224 17.046 16.865 16.579 16.368 16.134 16.016 15.778 15.517 15.234 15.094 14.761 14.596 14.415 14.22 13.817 13.622 13.403 13.152 12.865 12.487 11.99 10.761 -9 ,24904 ,KEBNE ,16749728,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:48:04 CET,0.0 1.886 2.442 2.863 3.235 3.546 3.819 4.093 4.591 4.812 5.029 5.253 5.62 5.777 6.092 6.391 6.67 6.814 7.096 7.37 7.756 7.972 8.178 8.477 8.752 9.012 9.27 9.51 9.808 10.104 10.396 10.737 11.072 11.416 11.803 12.221 12.613 13.04 13.502 13.979 14.468 15.0 15.594 16.208 16.918 17.658 18.489 19.409 20.436 21.516 22.567 23.181 23.381 23.368 23.196 22.918 22.659 22.415 22.17 21.885 21.615 21.334 21.041 20.773 20.508 20.255 19.992 19.735 19.492 19.243 18.984 18.765 18.535 18.295 18.107 17.897 17.671 17.442 17.189 17.012 16.845 16.569 16.354 16.14 16.036 15.817 15.58 15.324 15.183 14.856 14.729 14.57 14.406 14.009 13.765 13.507 13.234 12.936 12.568 12.114 11.086 -10 ,25633 ,KEBNE ,16749729,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:48:05 CET,0.0 1.535 2.086 2.508 2.898 3.244 3.544 3.823 4.363 4.608 4.825 5.045 5.429 5.611 5.958 6.283 6.593 6.75 7.052 7.329 7.718 7.959 8.193 8.535 8.86 9.169 9.478 9.785 10.162 10.506 10.831 11.217 11.596 11.94 12.326 12.766 13.173 13.614 14.09 14.589 15.101 15.673 16.336 16.978 17.714 18.531 19.425 20.363 21.397 22.52 23.688 24.438 24.626 24.537 24.336 24.079 23.817 23.514 23.199 22.851 22.517 22.204 21.873 21.548 21.234 20.935 20.638 20.344 20.068 19.784 19.48 19.225 18.966 18.7 18.497 18.284 18.056 17.798 17.52 17.328 17.124 16.808 16.602 16.401 16.291 16.063 15.839 15.58 15.433 15.105 14.961 14.79 14.602 14.174 13.954 13.7 13.381 13.014 12.58 12.083 10.635 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index 6a908a81..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24864 ,KEBNE ,16749730,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:46:46 CET,0.0 1.027 1.497 1.85 2.157 2.45 2.725 2.966 3.38 3.56 3.728 3.863 4.224 4.369 4.648 4.909 5.177 5.309 5.558 5.799 6.144 6.374 6.602 6.932 7.245 7.536 7.815 8.095 8.456 8.8 9.132 9.544 9.947 10.344 10.818 11.355 11.866 12.407 12.971 13.578 14.225 14.93 15.763 16.629 17.629 18.726 19.963 21.318 22.874 24.66 26.436 27.527 27.978 28.037 27.912 27.712 27.463 27.176 26.898 26.611 26.343 26.053 25.752 25.456 25.175 24.91 24.62 24.373 24.153 23.919 23.676 23.449 23.211 22.98 22.792 22.583 22.358 22.128 21.884 21.714 21.535 21.239 21.018 20.786 20.669 20.431 20.175 19.898 19.756 19.417 19.276 19.12 18.95 18.525 18.28 18.02 17.733 17.42 17.044 16.524 15.178 -2 ,14029 ,KEBNE ,16749731,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:45:35 CET,0.0 1.175 1.697 2.146 2.555 2.925 3.253 3.556 4.092 4.321 4.541 4.758 5.168 5.366 5.736 6.087 6.403 6.548 6.826 7.088 7.454 7.69 7.924 8.266 8.601 8.933 9.268 9.604 10.042 10.435 10.797 11.247 11.67 12.079 12.549 13.055 13.538 14.084 14.667 15.251 15.839 16.51 17.327 18.123 19.041 20.081 21.249 22.534 23.988 25.626 27.487 28.669 29.014 29.051 28.938 28.691 28.393 28.095 27.806 27.474 27.158 26.865 26.574 26.278 25.992 25.735 25.457 25.202 24.969 24.722 24.463 24.232 23.989 23.722 23.509 23.289 23.061 22.826 22.56 22.373 22.182 21.873 21.663 21.435 21.31 21.055 20.778 20.472 20.322 19.988 19.85 19.691 19.501 19.062 18.832 18.576 18.274 17.917 17.497 16.974 15.602 -3 ,21142 ,KEBNE ,16749732,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:47:04 CET,0.0 1.222 1.755 2.12 2.438 2.712 2.961 3.192 3.607 3.81 4.029 4.271 4.672 4.866 5.236 5.601 5.929 6.072 6.346 6.609 6.986 7.215 7.431 7.748 8.073 8.403 8.713 9.003 9.384 9.754 10.098 10.514 10.917 11.299 11.749 12.261 12.766 13.326 13.923 14.54 15.182 15.932 16.808 17.659 18.616 19.679 20.823 22.112 23.676 25.403 27.287 28.607 29.12 29.197 29.071 28.865 28.634 28.356 28.088 27.802 27.533 27.281 27.016 26.742 26.466 26.215 25.95 25.705 25.482 25.235 24.979 24.754 24.505 24.239 24.03 23.827 23.623 23.388 23.122 22.929 22.727 22.431 22.217 22.002 21.896 21.65 21.386 21.115 20.963 20.615 20.444 20.265 20.085 19.679 19.446 19.196 18.928 18.606 18.218 17.703 16.205 -4 ,15778 ,KEBNE ,16749733,Wed Dec 1 19:55:56 CET,Wed Dec 1 21:41:43 CET,0.0 1.116 1.632 2.003 2.309 2.567 2.801 3.025 3.455 3.649 3.834 3.969 4.325 4.479 4.783 5.074 5.363 5.503 5.764 6.013 6.383 6.619 6.838 7.159 7.464 7.744 8.025 8.307 8.672 9.034 9.379 9.796 10.207 10.601 11.062 11.572 12.047 12.573 13.131 13.716 14.356 15.088 15.896 16.712 17.687 18.713 19.884 21.204 22.652 24.213 25.95 27.041 27.412 27.495 27.364 27.123 26.872 26.58 26.29 25.988 25.698 25.407 25.106 24.816 24.552 24.306 24.027 23.755 23.527 23.293 23.031 22.809 22.578 22.319 22.097 21.869 21.646 21.419 21.166 20.986 20.802 20.499 20.285 20.055 19.941 19.695 19.429 19.152 19.014 18.688 18.519 18.342 18.153 17.715 17.477 17.211 16.906 16.566 16.179 15.707 14.591 -5 ,5673 ,KEBNE ,16749734,Wed Dec 1 19:55:58 CET,Wed Dec 1 21:41:51 CET,0.0 1.271 1.708 2.067 2.379 2.647 2.9 3.142 3.586 3.779 3.969 4.112 4.477 4.635 4.938 5.227 5.495 5.626 5.891 6.134 6.479 6.71 6.934 7.255 7.57 7.884 8.188 8.478 8.843 9.188 9.537 9.969 10.392 10.799 11.261 11.774 12.256 12.773 13.328 13.932 14.56 15.245 16.071 16.939 17.959 19.075 20.347 21.781 23.372 24.962 26.658 27.767 28.036 28.017 27.863 27.645 27.372 27.064 26.776 26.45 26.14 25.836 25.527 25.217 24.921 24.658 24.369 24.088 23.841 23.579 23.286 23.044 22.804 22.561 22.36 22.142 21.93 21.724 21.492 21.309 21.118 20.843 20.635 20.406 20.295 20.07 19.824 19.538 19.388 19.062 18.92 18.736 18.52 18.063 17.825 17.558 17.28 16.948 16.498 15.913 14.402 -6 ,23445 ,KEBNE ,16749735,Wed Dec 1 19:55:59 CET,Wed Dec 1 21:42:51 CET,0.0 1.354 1.838 2.199 2.496 2.78 3.048 3.304 3.76 3.966 4.159 4.322 4.698 4.859 5.164 5.473 5.778 5.921 6.188 6.446 6.824 7.07 7.308 7.648 7.974 8.292 8.6 8.895 9.271 9.629 9.977 10.397 10.799 11.196 11.655 12.159 12.638 13.163 13.731 14.324 14.95 15.671 16.499 17.315 18.263 19.317 20.546 21.933 23.445 25.15 27.088 28.328 28.77 28.875 28.757 28.524 28.296 28.055 27.823 27.519 27.207 26.908 26.59 26.29 26.003 25.728 25.43 25.134 24.883 24.62 24.329 24.096 23.87 23.631 23.431 23.225 23.012 22.776 22.514 22.331 22.143 21.843 21.632 21.407 21.295 21.062 20.805 20.535 20.393 20.058 19.922 19.75 19.556 19.135 18.915 18.657 18.36 18.047 17.669 17.128 15.714 -7 ,29978 ,KEBNE ,16749736,Wed Dec 1 19:55:53 CET,Wed Dec 1 21:46:40 CET,0.0 1.024 1.548 1.963 2.297 2.587 2.859 3.112 3.551 3.741 3.928 4.12 4.516 4.693 5.023 5.326 5.611 5.754 6.025 6.286 6.667 6.905 7.134 7.47 7.795 8.098 8.384 8.662 9.015 9.36 9.702 10.121 10.507 10.877 11.314 11.795 12.259 12.765 13.322 13.936 14.59 15.289 16.072 16.852 17.76 18.759 19.941 21.298 22.788 24.413 26.138 27.382 27.865 27.924 27.765 27.551 27.341 27.077 26.794 26.478 26.187 25.893 25.613 25.341 25.036 24.752 24.448 24.147 23.875 23.611 23.347 23.128 22.907 22.653 22.433 22.208 21.982 21.752 21.502 21.334 21.17 20.894 20.687 20.47 20.358 20.121 19.86 19.574 19.429 19.103 18.947 18.774 18.601 18.187 17.94 17.682 17.409 17.103 16.722 16.187 15.001 -8 ,32209 ,KEBNE ,16749737,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:46:47 CET,0.0 1.069 1.54 1.874 2.163 2.426 2.66 2.88 3.305 3.503 3.682 3.816 4.172 4.329 4.642 4.935 5.207 5.335 5.593 5.846 6.204 6.429 6.644 6.967 7.275 7.569 7.849 8.125 8.497 8.848 9.179 9.585 9.971 10.349 10.787 11.281 11.764 12.301 12.885 13.508 14.154 14.864 15.697 16.542 17.525 18.562 19.686 20.989 22.52 24.217 25.934 26.975 27.343 27.39 27.281 27.094 26.849 26.551 26.239 25.885 25.549 25.257 24.983 24.709 24.443 24.181 23.9 23.638 23.41 23.172 22.893 22.656 22.405 22.138 21.938 21.724 21.491 21.258 21.012 20.837 20.667 20.392 20.18 19.955 19.841 19.594 19.32 19.042 18.905 18.579 18.432 18.247 18.074 17.72 17.497 17.235 16.949 16.636 16.242 15.682 14.376 -9 ,30036 ,KEBNE ,16749738,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:46:10 CET,0.0 1.242 1.698 2.027 2.316 2.592 2.842 3.068 3.477 3.686 3.895 4.059 4.442 4.61 4.928 5.248 5.555 5.697 5.961 6.211 6.581 6.825 7.065 7.416 7.753 8.074 8.377 8.673 9.071 9.46 9.818 10.256 10.693 11.116 11.601 12.129 12.625 13.172 13.788 14.448 15.138 15.947 16.89 17.809 18.868 20.052 21.396 22.877 24.53 26.343 28.37 29.725 30.242 30.349 30.251 30.075 29.883 29.683 29.444 29.162 28.893 28.629 28.349 28.06 27.773 27.476 27.171 26.92 26.681 26.432 26.178 25.955 25.723 25.459 25.253 25.044 24.821 24.594 24.363 24.203 24.037 23.762 23.562 23.358 23.246 23.014 22.772 22.51 22.376 22.063 21.943 21.788 21.626 21.259 21.051 20.819 20.564 20.278 19.942 19.453 17.921 -10 ,28570 ,KEBNE ,16749739,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:47:05 CET,0.0 1.335 1.811 2.169 2.485 2.782 3.045 3.275 3.703 3.89 4.072 4.231 4.593 4.744 5.058 5.369 5.65 5.787 6.057 6.325 6.712 6.95 7.181 7.513 7.824 8.12 8.412 8.704 9.083 9.448 9.793 10.208 10.618 11.013 11.462 11.97 12.451 12.973 13.539 14.144 14.806 15.557 16.401 17.23 18.177 19.243 20.488 21.863 23.422 25.15 26.962 28.21 28.716 28.772 28.603 28.347 28.05 27.737 27.43 27.083 26.75 26.422 26.135 25.885 25.626 25.349 25.025 24.742 24.502 24.257 23.993 23.771 23.548 23.309 23.11 22.896 22.676 22.446 22.193 22.012 21.822 21.51 21.3 21.094 20.983 20.745 20.471 20.125 19.938 19.567 19.364 19.164 18.936 18.435 18.147 17.813 17.44 17.041 16.591 15.976 14.047 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt deleted file mode 100644 index 0c747804..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15940 ,KEBNE ,16749740,Wed Dec 1 19:55:53 CET,Wed Dec 1 21:46:35 CET,0.0 1.11 1.617 1.994 2.315 2.595 2.834 3.065 3.508 3.717 3.899 4.023 4.388 4.537 4.821 5.092 5.363 5.495 5.745 5.988 6.346 6.582 6.808 7.12 7.419 7.722 8.016 8.28 8.597 8.913 9.232 9.592 9.945 10.293 10.681 11.119 11.543 11.983 12.42 12.893 13.416 14.011 14.679 15.291 15.923 16.531 17.155 17.768 18.229 18.495 18.379 17.513 16.42 15.319 14.294 13.276 12.31 11.44 10.671 9.906 9.27 8.695 8.123 7.587 7.107 6.657 6.188 5.77 5.386 4.991 4.613 4.308 3.983 3.639 3.365 3.078 2.779 2.468 2.158 1.945 1.719 1.374 1.137 0.893 0.762 0.475 0.181 -0.132 -0.294 -0.659 -0.819 -1.014 -1.206 -1.626 -1.865 -2.118 -2.395 -2.717 -3.089 -3.582 -4.848 -2 ,2139 ,KEBNE ,16749741,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:46:48 CET,0.0 1.093 1.549 1.913 2.249 2.56 2.817 3.052 3.501 3.708 3.9 4.044 4.423 4.59 4.92 5.222 5.506 5.647 5.905 6.141 6.475 6.681 6.886 7.2 7.499 7.77 8.02 8.268 8.595 8.914 9.226 9.589 9.928 10.254 10.62 11.017 11.388 11.802 12.247 12.706 13.204 13.741 14.32 14.886 15.489 16.083 16.731 17.399 18.036 18.5 18.436 17.76 16.772 15.643 14.664 13.765 12.906 12.112 11.435 10.719 10.07 9.488 8.948 8.439 7.964 7.533 7.088 6.694 6.343 5.962 5.561 5.23 4.885 4.519 4.236 3.958 3.665 3.358 3.049 2.829 2.596 2.239 1.989 1.725 1.591 1.311 1.017 0.703 0.539 0.166 0.004 -0.193 -0.399 -0.838 -1.089 -1.362 -1.652 -1.971 -2.341 -2.807 -3.977 -3 ,30887 ,KEBNE ,16749742,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:47:16 CET,0.0 1.221 1.769 2.182 2.548 2.9 3.243 3.539 4.056 4.292 4.518 4.73 5.132 5.327 5.691 6.022 6.345 6.507 6.815 7.095 7.487 7.751 8.015 8.383 8.698 8.985 9.267 9.545 9.886 10.202 10.509 10.889 11.277 11.645 12.06 12.51 12.929 13.383 13.851 14.335 14.82 15.307 15.857 16.389 16.982 17.603 18.238 18.884 19.428 19.716 19.585 18.714 17.687 16.629 15.561 14.561 13.652 12.789 12.018 11.222 10.539 9.966 9.411 8.868 8.373 7.936 7.487 7.069 6.697 6.312 5.912 5.585 5.242 4.881 4.596 4.311 4.02 3.709 3.381 3.16 2.934 2.567 2.325 2.073 1.94 1.673 1.372 1.052 0.894 0.518 0.39 0.205 0.003 -0.408 -0.627 -0.879 -1.164 -1.464 -1.818 -2.258 -3.3 -4 ,12186 ,KEBNE ,16749743,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:46:19 CET,0.0 1.057 1.538 1.921 2.234 2.501 2.764 3.027 3.474 3.665 3.843 3.985 4.367 4.539 4.868 5.165 5.436 5.564 5.796 6.022 6.362 6.589 6.818 7.125 7.421 7.712 7.984 8.253 8.591 8.912 9.222 9.585 9.938 10.284 10.676 11.106 11.51 11.951 12.428 12.919 13.436 13.967 14.505 15.057 15.646 16.206 16.847 17.511 18.065 18.438 18.307 17.457 16.411 15.301 14.255 13.258 12.393 11.588 10.862 10.134 9.493 8.916 8.367 7.837 7.335 6.862 6.347 5.899 5.51 5.099 4.689 4.351 3.986 3.614 3.331 3.049 2.76 2.451 2.122 1.893 1.657 1.295 1.043 0.777 0.647 0.374 0.063 -0.27 -0.431 -0.795 -0.925 -1.119 -1.327 -1.751 -1.993 -2.273 -2.593 -2.955 -3.362 -3.862 -4.941 -5 ,15104 ,KEBNE ,16749744,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:46:42 CET,0.0 1.235 1.799 2.232 2.604 2.925 3.211 3.487 3.991 4.213 4.43 4.623 5.019 5.198 5.557 5.901 6.208 6.362 6.657 6.937 7.33 7.56 7.778 8.082 8.361 8.632 8.898 9.166 9.494 9.806 10.116 10.467 10.797 11.109 11.462 11.844 12.213 12.618 13.028 13.466 13.927 14.428 14.977 15.533 16.161 16.763 17.436 18.037 18.528 18.872 18.602 17.664 16.568 15.489 14.543 13.616 12.721 11.919 11.209 10.461 9.825 9.253 8.692 8.174 7.705 7.268 6.805 6.375 5.987 5.598 5.199 4.863 4.516 4.157 3.874 3.578 3.27 2.952 2.629 2.408 2.184 1.826 1.576 1.309 1.17 0.9 0.613 0.313 0.156 -0.207 -0.373 -0.57 -0.761 -1.188 -1.412 -1.659 -1.963 -2.296 -2.659 -3.13 -4.179 -6 ,16136 ,KEBNE ,16749745,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:46:25 CET,0.0 1.159 1.691 2.061 2.329 2.579 2.828 3.053 3.464 3.65 3.827 3.966 4.332 4.481 4.761 5.032 5.301 5.431 5.666 5.881 6.196 6.399 6.595 6.896 7.189 7.466 7.728 7.973 8.292 8.586 8.87 9.221 9.555 9.882 10.259 10.661 11.034 11.461 11.913 12.358 12.829 13.362 13.977 14.576 15.195 15.812 16.443 17.024 17.533 17.901 17.823 16.997 15.955 14.796 13.652 12.597 11.653 10.792 10.056 9.324 8.671 8.089 7.554 7.039 6.536 6.08 5.617 5.199 4.842 4.468 4.075 3.744 3.402 3.056 2.794 2.529 2.24 1.931 1.596 1.363 1.133 0.765 0.513 0.262 0.135 -0.144 -0.446 -0.761 -0.932 -1.309 -1.448 -1.624 -1.819 -2.278 -2.523 -2.777 -3.054 -3.372 -3.785 -4.293 -5.384 -7 ,18419 ,KEBNE ,16749746,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:46:55 CET,0.0 1.086 1.565 1.955 2.282 2.561 2.802 3.031 3.445 3.634 3.824 3.956 4.308 4.46 4.752 5.032 5.303 5.43 5.669 5.887 6.206 6.415 6.617 6.895 7.153 7.413 7.667 7.908 8.219 8.521 8.818 9.18 9.511 9.819 10.185 10.587 10.989 11.425 11.872 12.334 12.79 13.306 13.897 14.467 15.064 15.635 16.194 16.724 17.258 17.637 17.519 16.589 15.34 14.155 13.142 12.16 11.239 10.446 9.777 9.06 8.401 7.806 7.232 6.694 6.224 5.792 5.316 4.89 4.532 4.155 3.749 3.414 3.071 2.723 2.445 2.155 1.857 1.538 1.2 0.965 0.731 0.372 0.115 -0.155 -0.303 -0.607 -0.914 -1.232 -1.395 -1.776 -1.927 -2.118 -2.328 -2.791 -3.054 -3.346 -3.656 -4.004 -4.409 -4.961 -6.374 -8 ,32715 ,KEBNE ,16749747,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:46:30 CET,0.0 1.224 1.677 2.042 2.343 2.617 2.868 3.098 3.533 3.724 3.897 4.034 4.387 4.543 4.844 5.115 5.381 5.5 5.722 5.931 6.239 6.435 6.618 6.89 7.159 7.411 7.654 7.907 8.223 8.51 8.791 9.122 9.433 9.768 10.157 10.558 10.959 11.38 11.804 12.254 12.706 13.193 13.748 14.266 14.817 15.403 16.032 16.629 17.165 17.445 17.18 16.324 15.216 14.009 12.846 11.79 10.877 10.05 9.359 8.656 7.998 7.395 6.825 6.273 5.755 5.293 4.807 4.39 4.019 3.615 3.215 2.881 2.525 2.156 1.868 1.557 1.227 0.897 0.56 0.326 0.105 -0.263 -0.536 -0.795 -0.925 -1.192 -1.474 -1.774 -1.935 -2.308 -2.464 -2.662 -2.866 -3.293 -3.525 -3.763 -4.049 -4.393 -4.79 -5.296 -6.618 -9 ,24008 ,KEBNE ,16749748,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:47:38 CET,0.0 1.284 1.803 2.189 2.495 2.762 3.003 3.223 3.622 3.811 3.987 4.11 4.46 4.603 4.885 5.175 5.441 5.565 5.813 6.055 6.393 6.601 6.808 7.099 7.366 7.638 7.905 8.151 8.458 8.754 9.048 9.402 9.742 10.041 10.37 10.758 11.124 11.526 11.982 12.441 12.916 13.44 14.0 14.548 15.15 15.766 16.426 17.032 17.533 17.869 17.614 16.642 15.558 14.414 13.341 12.364 11.482 10.629 9.899 9.164 8.518 7.952 7.399 6.869 6.38 5.929 5.443 5.015 4.647 4.254 3.85 3.518 3.165 2.809 2.53 2.236 1.944 1.642 1.323 1.104 0.882 0.543 0.307 0.056 -0.081 -0.351 -0.627 -0.944 -1.108 -1.471 -1.608 -1.792 -1.991 -2.43 -2.666 -2.921 -3.206 -3.536 -3.899 -4.353 -5.4 -10 ,3359 ,KEBNE ,16749749,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:46:22 CET,0.0 1.268 1.868 2.325 2.729 3.081 3.39 3.658 4.167 4.403 4.618 4.824 5.218 5.403 5.755 6.072 6.378 6.528 6.827 7.109 7.504 7.749 7.979 8.324 8.653 8.969 9.283 9.58 9.937 10.264 10.556 10.91 11.279 11.623 12.01 12.444 12.856 13.312 13.82 14.351 14.891 15.478 16.14 16.788 17.479 18.182 18.962 19.669 20.271 20.704 20.548 19.67 18.598 17.559 16.578 15.651 14.795 13.998 13.3 12.554 11.861 11.25 10.671 10.144 9.669 9.219 8.747 8.296 7.909 7.522 7.116 6.791 6.471 6.122 5.842 5.562 5.267 4.967 4.667 4.459 4.233 3.874 3.638 3.388 3.252 2.967 2.676 2.382 2.222 1.843 1.714 1.527 1.322 0.888 0.65 0.391 0.133 -0.165 -0.57 -1.088 -2.302 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt deleted file mode 100644 index 71dc5375..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26376 ,KEBNE ,16749750,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:47:58 CET,0.0 1.008 1.524 1.949 2.293 2.587 2.855 3.106 3.574 3.793 4.008 4.205 4.595 4.779 5.139 5.487 5.803 5.947 6.23 6.497 6.891 7.156 7.414 7.791 8.149 8.502 8.855 9.187 9.619 10.064 10.492 10.981 11.456 11.916 12.441 13.032 13.603 14.256 14.975 15.746 16.562 17.47 18.51 19.553 20.799 22.216 23.877 25.739 27.844 30.249 33.177 35.574 36.899 37.641 38.026 38.228 38.291 38.28 38.211 38.069 37.944 37.816 37.666 37.512 37.358 37.216 37.045 36.868 36.689 36.477 36.247 36.044 35.818 35.576 35.393 35.206 35.015 34.831 34.655 34.527 34.38 34.153 33.993 33.824 33.738 33.564 33.376 33.148 33.025 32.729 32.626 32.48 32.315 31.938 31.734 31.519 31.291 31.021 30.704 30.245 29.176 -2 ,26150 ,KEBNE ,16749751,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:47:37 CET,0.0 1.217 1.685 2.055 2.374 2.671 2.937 3.191 3.678 3.899 4.109 4.295 4.684 4.862 5.184 5.497 5.818 5.978 6.295 6.601 7.01 7.261 7.515 7.897 8.264 8.614 8.95 9.28 9.706 10.125 10.535 11.019 11.485 11.942 12.492 13.109 13.698 14.353 15.065 15.82 16.603 17.509 18.575 19.657 20.943 22.358 24.014 25.907 28.12 30.821 34.057 36.626 38.072 38.931 39.423 39.669 39.782 39.797 39.751 39.677 39.559 39.445 39.326 39.179 39.023 38.858 38.671 38.507 38.351 38.187 38.006 37.833 37.652 37.468 37.324 37.175 37.019 36.848 36.667 36.535 36.388 36.154 35.985 35.816 35.732 35.548 35.343 35.124 35.01 34.725 34.636 34.502 34.36 34.058 33.876 33.655 33.418 33.159 32.853 32.443 31.428 -3 ,20287 ,KEBNE ,16749752,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:47:02 CET,0.0 1.217 1.75 2.17 2.535 2.87 3.176 3.472 4.021 4.279 4.524 4.763 5.172 5.373 5.762 6.136 6.491 6.66 6.985 7.309 7.788 8.096 8.387 8.8 9.202 9.594 9.97 10.34 10.801 11.219 11.63 12.138 12.648 13.141 13.699 14.312 14.887 15.522 16.224 16.971 17.754 18.676 19.773 20.868 22.124 23.508 25.108 26.919 29.029 31.551 34.705 37.137 38.464 39.241 39.65 39.864 39.937 39.924 39.871 39.759 39.632 39.506 39.365 39.209 39.064 38.922 38.747 38.583 38.439 38.281 38.097 37.937 37.764 37.574 37.428 37.283 37.12 36.934 36.739 36.604 36.454 36.207 36.027 35.837 35.744 35.549 35.353 35.137 35.008 34.705 34.602 34.454 34.289 33.931 33.746 33.526 33.266 32.962 32.604 32.137 31.077 -4 ,4778 ,KEBNE ,16749753,Wed Dec 1 19:55:56 CET,Wed Dec 1 21:46:27 CET,0.0 1.283 1.777 2.17 2.521 2.84 3.105 3.346 3.786 3.995 4.189 4.348 4.725 4.89 5.209 5.518 5.818 5.965 6.247 6.521 6.935 7.2 7.458 7.83 8.186 8.531 8.862 9.182 9.604 10.025 10.427 10.899 11.364 11.828 12.373 12.971 13.55 14.206 14.909 15.672 16.484 17.402 18.5 19.622 20.898 22.274 23.89 25.737 27.95 30.56 33.601 36.008 37.372 38.188 38.635 38.856 38.938 38.979 38.969 38.876 38.749 38.621 38.477 38.299 38.113 37.93 37.737 37.549 37.367 37.177 36.974 36.804 36.624 36.436 36.292 36.128 35.943 35.745 35.538 35.395 35.241 34.991 34.804 34.603 34.504 34.309 34.098 33.871 33.749 33.447 33.316 33.127 32.924 32.474 32.226 31.963 31.662 31.33 30.926 30.414 29.13 -5 ,2088 ,KEBNE ,16749754,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:46:50 CET,0.0 1.004 1.526 1.925 2.271 2.588 2.863 3.114 3.574 3.786 3.999 4.191 4.558 4.729 5.072 5.404 5.71 5.852 6.134 6.412 6.811 7.067 7.324 7.702 8.063 8.414 8.76 9.093 9.516 9.932 10.337 10.814 11.276 11.733 12.243 12.827 13.407 14.044 14.76 15.514 16.284 17.159 18.201 19.268 20.533 21.964 23.596 25.421 27.607 30.234 33.333 35.712 36.987 37.751 38.227 38.497 38.64 38.714 38.731 38.681 38.601 38.503 38.383 38.243 38.088 37.926 37.739 37.583 37.445 37.28 37.095 36.941 36.773 36.577 36.415 36.249 36.079 35.891 35.668 35.512 35.357 35.112 34.944 34.76 34.663 34.465 34.261 34.028 33.9 33.607 33.517 33.367 33.211 32.867 32.678 32.488 32.258 31.988 31.678 31.285 30.28 -6 ,16438 ,KEBNE ,16749755,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:48:24 CET,0.0 1.077 1.554 1.921 2.248 2.559 2.843 3.101 3.581 3.807 4.017 4.194 4.589 4.766 5.101 5.428 5.746 5.901 6.207 6.497 6.895 7.153 7.414 7.782 8.133 8.484 8.826 9.157 9.586 9.996 10.393 10.873 11.333 11.785 12.302 12.877 13.436 14.056 14.736 15.48 16.274 17.183 18.238 19.288 20.544 21.994 23.669 25.554 27.754 30.263 33.249 35.633 37.017 37.853 38.34 38.663 38.836 38.882 38.845 38.77 38.669 38.559 38.435 38.289 38.141 37.995 37.828 37.675 37.533 37.377 37.205 37.054 36.89 36.716 36.575 36.426 36.275 36.122 35.952 35.824 35.685 35.465 35.308 35.143 35.053 34.867 34.68 34.461 34.344 34.064 33.963 33.818 33.666 33.319 33.124 32.907 32.666 32.398 32.084 31.676 30.712 -7 ,16309 ,KEBNE ,16749756,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:47:53 CET,0.0 1.139 1.702 2.147 2.492 2.781 3.058 3.312 3.737 3.941 4.144 4.314 4.698 4.878 5.238 5.566 5.872 6.021 6.31 6.6 7.027 7.301 7.567 7.955 8.325 8.676 9.015 9.331 9.752 10.178 10.589 11.087 11.577 12.047 12.571 13.149 13.707 14.345 15.059 15.814 16.604 17.527 18.6 19.644 20.876 22.276 23.955 25.886 28.113 30.723 33.882 36.327 37.642 38.429 38.902 39.194 39.343 39.389 39.391 39.335 39.257 39.171 39.057 38.927 38.792 38.645 38.475 38.315 38.155 37.982 37.808 37.655 37.479 37.295 37.151 37.003 36.843 36.667 36.485 36.35 36.211 35.994 35.838 35.686 35.61 35.443 35.26 35.074 34.975 34.707 34.647 34.511 34.361 34.033 33.846 33.642 33.407 33.133 32.778 32.3 31.14 -8 ,21553 ,KEBNE ,16749757,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:47:10 CET,0.0 1.297 1.911 2.369 2.759 3.094 3.393 3.686 4.251 4.504 4.731 4.97 5.392 5.603 5.991 6.35 6.697 6.875 7.225 7.554 8.033 8.332 8.609 9.007 9.393 9.759 10.11 10.454 10.892 11.3 11.698 12.189 12.661 13.131 13.675 14.28 14.868 15.509 16.207 16.955 17.723 18.61 19.712 20.807 22.098 23.564 25.204 27.059 29.245 31.859 35.077 37.583 38.95 39.749 40.203 40.478 40.628 40.667 40.645 40.576 40.473 40.378 40.281 40.163 40.022 39.875 39.717 39.546 39.379 39.216 39.045 38.886 38.713 38.531 38.384 38.231 38.062 37.883 37.688 37.547 37.408 37.197 37.05 36.894 36.81 36.633 36.439 36.233 36.125 35.845 35.773 35.64 35.496 35.148 34.95 34.738 34.503 34.236 33.888 33.437 32.53 -9 ,11377 ,KEBNE ,16749758,Wed Dec 1 19:56:04 CET,Wed Dec 1 21:47:53 CET,0.0 1.122 1.615 1.993 2.311 2.586 2.827 3.057 3.481 3.675 3.872 4.05 4.436 4.61 4.943 5.262 5.563 5.71 5.992 6.257 6.651 6.905 7.149 7.503 7.846 8.183 8.505 8.827 9.26 9.677 10.07 10.526 10.986 11.438 11.958 12.559 13.134 13.773 14.456 15.179 15.948 16.838 17.912 19.007 20.353 21.803 23.425 25.293 27.463 30.051 33.175 35.708 37.059 37.781 38.178 38.408 38.485 38.457 38.388 38.287 38.146 37.982 37.811 37.644 37.498 37.343 37.146 36.947 36.766 36.582 36.391 36.23 36.057 35.871 35.717 35.558 35.382 35.185 34.981 34.846 34.693 34.45 34.292 34.123 34.016 33.76 33.491 33.207 33.062 32.75 32.638 32.489 32.332 31.995 31.82 31.614 31.381 31.116 30.786 30.289 28.951 -10 ,13625 ,KEBNE ,16749759,Wed Dec 1 19:55:59 CET,Wed Dec 1 21:47:19 CET,0.0 1.103 1.612 2.049 2.423 2.729 3.002 3.254 3.711 3.933 4.145 4.309 4.675 4.845 5.17 5.488 5.789 5.932 6.223 6.506 6.906 7.158 7.4 7.751 8.093 8.435 8.77 9.09 9.514 9.93 10.332 10.825 11.298 11.754 12.289 12.894 13.479 14.13 14.825 15.572 16.373 17.282 18.347 19.442 20.762 22.247 23.972 25.92 28.148 30.724 33.717 36.178 37.598 38.399 38.829 39.054 39.16 39.184 39.161 39.111 39.024 38.901 38.773 38.645 38.508 38.379 38.236 38.089 37.934 37.761 37.581 37.427 37.256 37.066 36.913 36.762 36.59 36.396 36.192 36.035 35.875 35.629 35.437 35.223 35.127 34.93 34.701 34.46 34.335 34.041 33.95 33.809 33.663 33.321 33.117 32.881 32.633 32.366 32.033 31.597 30.412 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt deleted file mode 100644 index afc2550d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4555 ,KEBNE ,16749760,Wed Dec 1 19:55:54 CET,Wed Dec 1 21:45:56 CET,0.0 1.09 1.534 1.9 2.223 2.515 2.802 3.05 3.497 3.704 3.904 4.085 4.473 4.65 4.986 5.298 5.592 5.735 6.017 6.292 6.695 6.963 7.242 7.637 7.997 8.351 8.706 9.057 9.506 9.942 10.361 10.86 11.343 11.81 12.37 13.012 13.632 14.336 15.089 15.884 16.742 17.715 18.852 20.046 21.496 23.105 24.992 27.149 29.735 32.816 36.541 39.63 41.372 42.417 43.004 43.299 43.45 43.509 43.491 43.437 43.366 43.253 43.105 42.953 42.791 42.596 42.338 42.114 41.959 41.791 41.583 41.379 41.145 40.901 40.706 40.513 40.327 40.143 39.95 39.8 39.641 39.401 39.23 39.059 38.968 38.775 38.577 38.347 38.228 37.947 37.858 37.718 37.569 37.23 37.027 36.803 36.548 36.264 35.924 35.461 34.368 -2 ,21388 ,KEBNE ,16749761,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:48:00 CET,0.0 1.377 1.913 2.308 2.636 2.925 3.19 3.458 3.949 4.161 4.36 4.527 4.909 5.084 5.44 5.785 6.107 6.267 6.575 6.873 7.323 7.612 7.879 8.273 8.658 9.019 9.367 9.703 10.145 10.582 11.005 11.515 12.029 12.535 13.116 13.768 14.405 15.101 15.825 16.607 17.478 18.495 19.717 20.96 22.412 24.088 26.076 28.297 30.897 33.956 37.649 40.81 42.59 43.623 44.32 44.825 45.117 45.241 45.272 45.252 45.174 45.064 44.947 44.82 44.691 44.564 44.411 44.253 44.114 43.977 43.837 43.719 43.587 43.437 43.308 43.162 43.015 42.858 42.669 42.526 42.383 42.169 42.012 41.84 41.752 41.556 41.341 41.127 41.015 40.724 40.639 40.502 40.347 40.004 39.82 39.61 39.368 39.111 38.801 38.359 37.208 -3 ,21095 ,KEBNE ,16749762,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:47:54 CET,0.0 1.067 1.595 1.984 2.319 2.614 2.881 3.136 3.635 3.864 4.076 4.275 4.667 4.846 5.192 5.535 5.877 6.04 6.343 6.638 7.071 7.351 7.632 8.044 8.428 8.797 9.168 9.52 9.972 10.424 10.871 11.411 11.916 12.404 12.997 13.668 14.304 15.01 15.769 16.58 17.464 18.475 19.678 20.914 22.369 23.997 25.86 27.986 30.521 33.555 37.225 40.169 41.886 43.019 43.716 44.129 44.383 44.531 44.604 44.621 44.591 44.525 44.445 44.352 44.226 44.086 43.935 43.79 43.653 43.49 43.3 43.146 42.983 42.783 42.615 42.436 42.25 42.053 41.853 41.712 41.551 41.291 41.119 40.947 40.856 40.669 40.464 40.23 40.105 39.805 39.692 39.542 39.364 38.985 38.795 38.571 38.312 38.009 37.625 37.169 36.201 -4 ,23395 ,KEBNE ,16749763,Wed Dec 1 19:55:55 CET,Wed Dec 1 21:48:05 CET,0.0 1.156 1.628 2.01 2.333 2.629 2.901 3.15 3.586 3.787 3.988 4.166 4.56 4.741 5.081 5.409 5.728 5.882 6.183 6.471 6.896 7.17 7.43 7.818 8.215 8.6 8.961 9.306 9.752 10.191 10.618 11.132 11.624 12.102 12.649 13.258 13.869 14.553 15.288 16.086 16.964 17.974 19.136 20.301 21.66 23.235 25.134 27.289 29.86 32.833 36.425 39.324 40.901 41.948 42.521 42.822 42.965 42.994 42.974 42.87 42.726 42.572 42.413 42.263 42.117 41.976 41.814 41.641 41.471 41.298 41.109 40.934 40.756 40.569 40.41 40.238 40.048 39.842 39.624 39.475 39.325 39.091 38.92 38.714 38.606 38.402 38.202 37.973 37.847 37.546 37.433 37.287 37.132 36.799 36.612 36.382 36.122 35.851 35.514 35.0 33.901 -5 ,13921 ,KEBNE ,16749764,Wed Dec 1 19:58:03 CET,Wed Dec 1 21:49:34 CET,0.0 1.174 1.696 2.082 2.386 2.661 2.929 3.179 3.615 3.826 4.036 4.234 4.631 4.808 5.148 5.486 5.815 5.969 6.267 6.578 7.028 7.297 7.561 7.947 8.326 8.696 9.064 9.432 9.885 10.322 10.751 11.269 11.771 12.267 12.847 13.493 14.113 14.791 15.53 16.327 17.173 18.156 19.348 20.57 21.999 23.576 25.38 27.472 29.99 32.965 36.574 39.552 41.295 42.405 43.083 43.526 43.829 44.005 44.079 44.069 44.009 43.94 43.844 43.701 43.538 43.387 43.219 43.059 42.913 42.738 42.546 42.38 42.196 42.001 41.845 41.676 41.484 41.277 41.053 40.904 40.763 40.535 40.365 40.178 40.082 39.879 39.658 39.429 39.301 38.994 38.861 38.704 38.54 38.168 37.968 37.754 37.498 37.16 36.77 36.281 34.975 -6 ,28726 ,KEBNE ,16749765,Wed Dec 1 20:04:23 CET,Wed Dec 1 21:54:50 CET,0.0 1.073 1.552 1.924 2.279 2.603 2.886 3.144 3.64 3.87 4.084 4.304 4.723 4.922 5.292 5.636 5.956 6.111 6.415 6.712 7.134 7.407 7.678 8.075 8.462 8.829 9.188 9.538 9.987 10.422 10.846 11.363 11.871 12.367 12.954 13.621 14.261 14.967 15.738 16.574 17.451 18.455 19.65 20.845 22.224 23.785 25.662 27.794 30.297 33.31 36.962 39.961 41.687 42.852 43.633 44.106 44.406 44.551 44.589 44.58 44.539 44.478 44.378 44.266 44.155 44.023 43.867 43.737 43.607 43.463 43.315 43.163 42.99 42.813 42.68 42.535 42.374 42.198 42.014 41.885 41.744 41.505 41.329 41.161 41.073 40.876 40.667 40.44 40.317 40.028 39.919 39.762 39.609 39.267 39.066 38.859 38.617 38.332 37.983 37.556 36.458 -7 ,12793 ,KEBNE ,16749766,Wed Dec 1 20:05:27 CET,Wed Dec 1 21:55:34 CET,0.0 1.173 1.655 2.025 2.364 2.679 2.956 3.217 3.705 3.928 4.137 4.321 4.711 4.884 5.217 5.531 5.839 5.991 6.278 6.554 6.952 7.217 7.481 7.848 8.205 8.553 8.891 9.235 9.682 10.108 10.52 11.027 11.532 12.023 12.562 13.156 13.752 14.412 15.123 15.899 16.719 17.652 18.786 19.957 21.363 22.962 24.778 26.802 29.231 32.171 35.796 38.69 40.306 41.256 41.869 42.304 42.546 42.654 42.625 42.499 42.353 42.217 42.067 41.891 41.708 41.522 41.335 41.155 40.985 40.815 40.63 40.468 40.284 40.075 39.902 39.709 39.511 39.304 39.088 38.949 38.806 38.57 38.401 38.227 38.14 37.96 37.774 37.567 37.444 37.148 37.064 36.916 36.761 36.423 36.241 36.033 35.786 35.512 35.174 34.76 33.745 -8 ,13693 ,KEBNE ,16749767,Wed Dec 1 20:05:28 CET,Wed Dec 1 21:56:14 CET,0.0 1.154 1.651 2.052 2.408 2.706 2.984 3.255 3.754 3.975 4.191 4.399 4.79 4.966 5.326 5.677 5.992 6.14 6.436 6.731 7.166 7.447 7.719 8.122 8.509 8.874 9.228 9.58 10.05 10.524 10.971 11.472 11.973 12.473 13.043 13.697 14.351 15.06 15.817 16.658 17.556 18.568 19.757 20.937 22.338 23.959 25.841 28.017 30.657 33.825 37.685 40.93 42.817 43.942 44.591 44.932 45.138 45.226 45.233 45.203 45.129 45.037 44.903 44.737 44.56 44.394 44.222 44.05 43.888 43.708 43.507 43.34 43.171 42.982 42.828 42.67 42.492 42.291 42.09 41.946 41.766 41.465 41.26 41.043 40.929 40.692 40.432 40.132 39.968 39.619 39.415 39.241 39.065 38.635 38.37 38.094 37.773 37.385 36.954 36.402 34.726 -9 ,14778 ,KEBNE ,16749768,Wed Dec 1 20:06:33 CET,Wed Dec 1 21:58:07 CET,0.0 1.093 1.606 2.03 2.41 2.719 2.989 3.248 3.707 3.911 4.108 4.298 4.703 4.898 5.265 5.61 5.929 6.082 6.393 6.696 7.131 7.407 7.663 8.043 8.417 8.78 9.136 9.478 9.918 10.354 10.793 11.33 11.844 12.326 12.891 13.547 14.169 14.861 15.636 16.482 17.357 18.326 19.52 20.76 22.189 23.778 25.663 27.84 30.461 33.66 37.59 40.726 42.42 43.421 44.033 44.368 44.548 44.707 44.797 44.816 44.815 44.783 44.735 44.667 44.567 44.452 44.31 44.162 44.021 43.851 43.671 43.534 43.365 43.186 43.046 42.891 42.719 42.528 42.336 42.2 42.057 41.832 41.675 41.505 41.412 41.213 41.001 40.757 40.622 40.321 40.198 40.042 39.887 39.545 39.355 39.152 38.931 38.664 38.278 37.816 36.823 -10 ,31359 ,KEBNE ,16749769,Wed Dec 1 20:06:33 CET,Wed Dec 1 21:58:50 CET,0.0 1.02 1.523 1.946 2.31 2.612 2.879 3.124 3.575 3.776 3.964 4.136 4.526 4.701 5.044 5.376 5.706 5.865 6.168 6.479 6.918 7.186 7.449 7.821 8.182 8.557 8.93 9.293 9.756 10.196 10.609 11.102 11.608 12.098 12.655 13.3 13.924 14.615 15.373 16.2 17.096 18.096 19.255 20.426 21.793 23.321 25.131 27.225 29.74 32.711 36.29 39.267 40.884 41.883 42.535 42.924 43.101 43.194 43.209 43.137 43.046 42.95 42.84 42.698 42.528 42.366 42.19 42.014 41.858 41.705 41.544 41.401 41.246 41.063 40.886 40.675 40.439 40.206 39.997 39.859 39.718 39.479 39.308 39.139 39.046 38.851 38.649 38.422 38.303 38.014 37.909 37.768 37.625 37.278 37.071 36.847 36.61 36.317 35.949 35.504 34.411 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index 28c92999..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19354 ,KEBNE ,16749770,Wed Dec 1 20:06:33 CET,Wed Dec 1 21:58:20 CET,0.0 1.089 1.559 1.915 2.201 2.451 2.685 2.892 3.25 3.423 3.59 3.721 4.033 4.162 4.399 4.634 4.855 4.956 5.139 5.314 5.587 5.746 5.888 6.095 6.306 6.506 6.682 6.846 7.047 7.234 7.408 7.605 7.79 7.966 8.173 8.397 8.592 8.801 9.019 9.257 9.499 9.73 9.965 10.16 10.337 10.461 10.519 10.494 10.317 9.829 8.738 7.218 5.75 4.473 3.38 2.36 1.451 0.613 -0.117 -0.842 -1.473 -2.053 -2.6 -3.092 -3.547 -3.969 -4.403 -4.78 -5.122 -5.485 -5.86 -6.174 -6.498 -6.839 -7.098 -7.363 -7.646 -7.943 -8.253 -8.476 -8.696 -9.035 -9.278 -9.527 -9.652 -9.916 -10.207 -10.514 -10.666 -10.998 -11.15 -11.337 -11.535 -11.961 -12.197 -12.468 -12.77 -13.102 -13.482 -13.989 -15.09 -2 ,2804 ,KEBNE ,16749771,Wed Dec 1 20:06:33 CET,Wed Dec 1 21:57:25 CET,0.0 1.07 1.545 1.901 2.187 2.431 2.63 2.814 3.188 3.351 3.501 3.613 3.903 4.026 4.264 4.482 4.679 4.772 4.967 5.148 5.386 5.55 5.708 5.916 6.11 6.302 6.49 6.66 6.874 7.074 7.247 7.451 7.645 7.826 8.033 8.239 8.427 8.645 8.859 9.069 9.274 9.479 9.697 9.894 10.072 10.198 10.271 10.26 10.099 9.599 8.45 6.752 5.168 3.75 2.519 1.437 0.497 -0.348 -1.087 -1.817 -2.433 -2.978 -3.497 -3.987 -4.44 -4.865 -5.321 -5.745 -6.119 -6.496 -6.861 -7.173 -7.513 -7.859 -8.13 -8.414 -8.711 -9.015 -9.374 -9.635 -9.88 -10.237 -10.487 -10.755 -10.886 -11.159 -11.463 -11.772 -11.929 -12.281 -12.477 -12.685 -12.901 -13.352 -13.595 -13.865 -14.154 -14.469 -14.856 -15.354 -16.396 -3 ,28841 ,KEBNE ,16749772,Wed Dec 1 20:08:42 CET,Wed Dec 1 22:00:14 CET,0.0 1.075 1.539 1.897 2.217 2.485 2.696 2.891 3.236 3.392 3.543 3.654 3.95 4.073 4.307 4.523 4.728 4.833 5.025 5.195 5.425 5.569 5.714 5.921 6.105 6.276 6.448 6.613 6.824 7.018 7.197 7.425 7.651 7.848 8.059 8.285 8.491 8.705 8.905 9.105 9.323 9.551 9.77 9.962 10.15 10.319 10.454 10.449 10.269 9.816 8.65 6.968 5.524 4.192 3.002 1.929 0.974 0.09 -0.69 -1.463 -2.135 -2.715 -3.255 -3.771 -4.244 -4.686 -5.162 -5.586 -5.955 -6.334 -6.721 -7.035 -7.351 -7.695 -7.973 -8.254 -8.546 -8.862 -9.19 -9.415 -9.654 -10.013 -10.259 -10.535 -10.676 -10.939 -11.212 -11.543 -11.714 -12.058 -12.234 -12.435 -12.657 -13.123 -13.373 -13.643 -13.951 -14.307 -14.735 -15.262 -16.662 -4 ,29904 ,KEBNE ,16749773,Wed Dec 1 20:08:42 CET,Wed Dec 1 22:00:45 CET,0.0 1.136 1.583 1.916 2.181 2.418 2.62 2.801 3.159 3.328 3.481 3.602 3.912 4.036 4.281 4.52 4.747 4.851 5.031 5.201 5.441 5.589 5.738 5.957 6.156 6.341 6.53 6.712 6.925 7.125 7.316 7.545 7.765 7.959 8.163 8.384 8.584 8.814 9.07 9.316 9.549 9.777 10.013 10.248 10.48 10.643 10.754 10.755 10.533 9.977 8.823 7.171 5.647 4.269 3.063 1.957 0.971 0.107 -0.627 -1.35 -1.972 -2.536 -3.075 -3.596 -4.077 -4.502 -4.948 -5.351 -5.691 -6.051 -6.428 -6.735 -7.056 -7.395 -7.664 -7.948 -8.25 -8.562 -8.881 -9.107 -9.337 -9.671 -9.913 -10.18 -10.317 -10.608 -10.924 -11.255 -11.416 -11.758 -11.92 -12.113 -12.332 -12.794 -13.047 -13.32 -13.626 -13.966 -14.356 -14.863 -16.087 -5 ,3069 ,KEBNE ,16749774,Wed Dec 1 20:09:51 CET,Wed Dec 1 22:02:22 CET,0.0 1.176 1.677 2.018 2.301 2.55 2.761 2.952 3.284 3.434 3.571 3.673 3.978 4.105 4.347 4.566 4.761 4.852 5.023 5.191 5.441 5.6 5.747 5.939 6.137 6.33 6.507 6.683 6.901 7.101 7.285 7.502 7.707 7.891 8.087 8.297 8.495 8.723 8.972 9.196 9.408 9.628 9.866 10.087 10.278 10.409 10.487 10.503 10.348 9.884 8.847 7.315 5.86 4.552 3.426 2.418 1.488 0.637 -0.083 -0.802 -1.434 -2.017 -2.576 -3.091 -3.559 -3.988 -4.447 -4.858 -5.212 -5.573 -5.958 -6.274 -6.6 -6.936 -7.196 -7.476 -7.768 -8.066 -8.37 -8.585 -8.819 -9.198 -9.448 -9.71 -9.85 -10.126 -10.41 -10.722 -10.888 -11.251 -11.458 -11.661 -11.885 -12.367 -12.633 -12.934 -13.267 -13.613 -14.017 -14.564 -15.671 -6 ,3809 ,KEBNE ,16749775,Wed Dec 1 20:14:05 CET,Wed Dec 1 22:03:42 CET,0.0 0.873 1.316 1.666 1.962 2.222 2.463 2.669 3.056 3.23 3.385 3.516 3.818 3.94 4.163 4.373 4.578 4.674 4.846 5.01 5.243 5.384 5.527 5.743 5.944 6.125 6.292 6.465 6.7 6.915 7.109 7.334 7.552 7.763 7.986 8.204 8.407 8.624 8.844 9.065 9.272 9.487 9.715 9.904 10.072 10.223 10.327 10.332 10.236 9.834 8.674 6.929 5.395 4.065 2.901 1.892 1.006 0.191 -0.526 -1.261 -1.893 -2.468 -3.025 -3.556 -4.05 -4.492 -4.959 -5.371 -5.724 -6.093 -6.504 -6.854 -7.202 -7.56 -7.845 -8.135 -8.424 -8.727 -9.036 -9.256 -9.482 -9.838 -10.086 -10.34 -10.476 -10.763 -11.066 -11.387 -11.553 -11.906 -12.099 -12.304 -12.522 -12.989 -13.246 -13.513 -13.807 -14.164 -14.575 -15.068 -16.438 -7 ,7927 ,KEBNE ,16749776,Wed Dec 1 20:14:05 CET,Wed Dec 1 22:03:57 CET,0.0 1.069 1.466 1.767 2.034 2.269 2.472 2.666 3.029 3.201 3.357 3.467 3.765 3.902 4.155 4.379 4.589 4.687 4.881 5.068 5.307 5.456 5.595 5.797 5.998 6.182 6.356 6.523 6.738 6.934 7.112 7.332 7.54 7.736 7.951 8.18 8.399 8.636 8.873 9.101 9.313 9.53 9.774 9.978 10.164 10.331 10.439 10.463 10.373 10.009 8.961 7.371 5.908 4.586 3.45 2.403 1.477 0.657 -0.054 -0.782 -1.41 -1.955 -2.473 -2.979 -3.461 -3.884 -4.318 -4.704 -5.037 -5.396 -5.789 -6.123 -6.458 -6.794 -7.052 -7.327 -7.623 -7.924 -8.229 -8.435 -8.645 -8.988 -9.227 -9.488 -9.628 -9.917 -10.223 -10.537 -10.7 -11.044 -11.216 -11.417 -11.618 -12.031 -12.271 -12.522 -12.8 -13.128 -13.528 -14.044 -15.336 -8 ,22676 ,KEBNE ,16749777,Wed Dec 1 20:15:12 CET,Wed Dec 1 22:07:09 CET,0.0 1.105 1.56 1.903 2.185 2.442 2.673 2.874 3.215 3.382 3.535 3.631 3.926 4.054 4.327 4.6 4.863 4.989 5.229 5.45 5.753 5.953 6.146 6.418 6.675 6.907 7.11 7.287 7.515 7.733 7.924 8.151 8.379 8.605 8.86 9.125 9.368 9.625 9.887 10.14 10.37 10.592 10.849 11.082 11.291 11.475 11.574 11.556 11.372 10.845 9.673 8.008 6.542 5.279 4.127 3.049 2.092 1.214 0.486 -0.206 -0.806 -1.368 -1.915 -2.412 -2.87 -3.298 -3.742 -4.141 -4.484 -4.833 -5.202 -5.516 -5.851 -6.211 -6.494 -6.772 -7.05 -7.348 -7.669 -7.876 -8.083 -8.437 -8.69 -8.959 -9.101 -9.393 -9.687 -9.988 -10.143 -10.492 -10.692 -10.891 -11.101 -11.548 -11.792 -12.076 -12.38 -12.689 -13.034 -13.506 -14.845 -9 ,6405 ,KEBNE ,16749778,Wed Dec 1 20:17:25 CET,Wed Dec 1 22:08:34 CET,0.0 1.244 1.669 1.992 2.272 2.513 2.726 2.932 3.322 3.495 3.647 3.762 4.055 4.17 4.385 4.605 4.818 4.914 5.094 5.266 5.51 5.669 5.817 6.027 6.225 6.411 6.582 6.737 6.94 7.128 7.299 7.516 7.726 7.915 8.126 8.355 8.561 8.776 8.996 9.212 9.441 9.67 9.895 10.102 10.283 10.42 10.529 10.561 10.414 9.976 8.862 7.159 5.736 4.431 3.237 2.228 1.342 0.508 -0.228 -0.937 -1.542 -2.095 -2.638 -3.159 -3.643 -4.087 -4.546 -4.957 -5.311 -5.672 -6.056 -6.387 -6.725 -7.063 -7.314 -7.576 -7.848 -8.13 -8.432 -8.635 -8.856 -9.212 -9.438 -9.673 -9.806 -10.074 -10.342 -10.646 -10.811 -11.156 -11.301 -11.476 -11.668 -12.082 -12.301 -12.544 -12.816 -13.138 -13.511 -13.993 -15.238 -10 ,17458 ,KEBNE ,16749779,Wed Dec 1 20:17:25 CET,Wed Dec 1 22:08:19 CET,0.0 1.245 1.674 2.016 2.304 2.551 2.77 2.965 3.286 3.434 3.578 3.677 3.979 4.103 4.328 4.535 4.728 4.826 5.019 5.198 5.435 5.581 5.725 5.93 6.116 6.289 6.462 6.621 6.811 7.001 7.184 7.397 7.601 7.79 7.991 8.207 8.402 8.612 8.839 9.053 9.244 9.431 9.626 9.805 9.99 10.138 10.255 10.254 10.076 9.644 8.499 6.746 5.135 3.75 2.544 1.444 0.496 -0.373 -1.125 -1.872 -2.503 -3.049 -3.576 -4.083 -4.56 -4.993 -5.445 -5.845 -6.187 -6.537 -6.9 -7.206 -7.514 -7.846 -8.119 -8.398 -8.69 -8.996 -9.315 -9.538 -9.769 -10.129 -10.379 -10.646 -10.783 -11.066 -11.381 -11.704 -11.865 -12.215 -12.385 -12.565 -12.763 -13.23 -13.489 -13.762 -14.043 -14.345 -14.716 -15.301 -16.504 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index c0e131b4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20110 ,KEBNE ,17028292,Wed Dec 22 19:33:06 CET,Wed Dec 22 21:24:10 CET,0.0 0.899 1.301 1.618 1.88 2.113 2.336 2.541 2.899 3.068 3.233 3.338 3.63 3.75 3.97 4.178 4.39 4.488 4.673 4.836 5.036 5.159 5.289 5.493 5.68 5.85 6.013 6.166 6.364 6.556 6.738 6.958 7.159 7.334 7.531 7.749 7.941 8.128 8.315 8.489 8.655 8.841 9.036 9.195 9.308 9.362 9.358 9.247 8.936 8.129 6.374 4.102 2.182 0.482 -1.025 -2.327 -3.444 -4.449 -5.322 -6.222 -7.0 -7.678 -8.315 -8.886 -9.405 -9.89 -10.39 -10.841 -11.236 -11.655 -12.095 -12.465 -12.88 -13.301 -13.606 -13.913 -14.23 -14.56 -14.892 -15.127 -15.366 -15.727 -15.982 -16.25 -16.386 -16.669 -16.981 -17.324 -17.496 -17.853 -18.047 -18.244 -18.439 -18.879 -19.127 -19.381 -19.669 -20.003 -20.415 -20.941 -22.388 -2 ,12409 ,KEBNE ,17028293,Wed Dec 22 19:33:06 CET,Wed Dec 22 21:24:41 CET,0.0 1.088 1.51 1.815 2.07 2.299 2.488 2.669 3.01 3.169 3.313 3.394 3.675 3.785 3.987 4.173 4.36 4.456 4.635 4.8 5.037 5.175 5.305 5.499 5.683 5.864 6.041 6.207 6.406 6.592 6.767 6.961 7.148 7.32 7.499 7.696 7.872 8.057 8.237 8.399 8.541 8.666 8.796 8.901 8.978 8.994 8.907 8.693 8.218 7.316 5.568 3.295 1.341 -0.33 -1.765 -3.081 -4.221 -5.222 -6.072 -6.913 -7.646 -8.315 -8.937 -9.515 -10.068 -10.563 -11.077 -11.536 -11.933 -12.347 -12.783 -13.143 -13.51 -13.906 -14.217 -14.522 -14.837 -15.16 -15.507 -15.758 -16.012 -16.391 -16.646 -16.912 -17.049 -17.334 -17.632 -17.952 -18.12 -18.477 -18.648 -18.839 -19.052 -19.511 -19.758 -20.017 -20.306 -20.626 -20.986 -21.469 -22.765 -3 ,9482 ,KEBNE ,17028294,Wed Dec 22 19:33:07 CET,Wed Dec 22 21:23:54 CET,0.0 1.021 1.423 1.74 1.997 2.223 2.441 2.648 2.995 3.15 3.3 3.399 3.699 3.819 4.047 4.259 4.452 4.541 4.713 4.878 5.112 5.258 5.405 5.629 5.827 6.009 6.186 6.35 6.562 6.776 6.976 7.205 7.411 7.596 7.795 8.011 8.209 8.399 8.582 8.781 8.989 9.206 9.43 9.612 9.776 9.849 9.793 9.597 9.205 8.429 6.777 4.46 2.397 0.59 -0.958 -2.249 -3.354 -4.382 -5.255 -6.101 -6.84 -7.508 -8.137 -8.721 -9.253 -9.732 -10.243 -10.703 -11.098 -11.515 -11.949 -12.308 -12.665 -13.027 -13.307 -13.595 -13.894 -14.207 -14.563 -14.832 -15.112 -15.507 -15.764 -16.045 -16.191 -16.484 -16.782 -17.096 -17.267 -17.629 -17.793 -17.986 -18.2 -18.658 -18.911 -19.181 -19.483 -19.828 -20.203 -20.654 -21.618 -4 ,7360 ,KEBNE ,17028295,Wed Dec 22 19:33:06 CET,Wed Dec 22 21:24:18 CET,0.0 1.074 1.531 1.892 2.167 2.381 2.584 2.779 3.094 3.243 3.392 3.501 3.799 3.917 4.137 4.351 4.547 4.641 4.825 4.983 5.205 5.348 5.484 5.675 5.856 6.026 6.197 6.361 6.566 6.757 6.919 7.109 7.305 7.487 7.691 7.914 8.115 8.324 8.517 8.687 8.841 8.996 9.157 9.29 9.393 9.419 9.313 9.048 8.601 7.75 6.041 3.836 1.881 0.169 -1.283 -2.579 -3.714 -4.743 -5.628 -6.508 -7.245 -7.875 -8.475 -9.063 -9.61 -10.102 -10.628 -11.101 -11.495 -11.886 -12.303 -12.658 -13.026 -13.414 -13.72 -14.037 -14.366 -14.71 -15.084 -15.34 -15.595 -15.991 -16.272 -16.571 -16.718 -17.019 -17.338 -17.668 -17.842 -18.217 -18.415 -18.617 -18.832 -19.31 -19.582 -19.864 -20.161 -20.499 -20.881 -21.348 -22.544 -5 ,11582 ,KEBNE ,17028296,Wed Dec 22 19:33:08 CET,Wed Dec 22 21:22:26 CET,0.0 1.131 1.553 1.857 2.106 2.355 2.594 2.802 3.176 3.336 3.481 3.561 3.861 3.99 4.216 4.431 4.644 4.74 4.913 5.076 5.311 5.463 5.6 5.784 5.965 6.138 6.301 6.464 6.672 6.864 7.044 7.251 7.449 7.629 7.825 8.022 8.205 8.404 8.578 8.758 8.932 9.074 9.198 9.29 9.371 9.414 9.342 9.106 8.646 7.782 6.042 3.675 1.615 -0.157 -1.65 -2.987 -4.164 -5.255 -6.189 -7.091 -7.878 -8.572 -9.229 -9.834 -10.366 -10.857 -11.38 -11.854 -12.254 -12.642 -13.058 -13.412 -13.769 -14.167 -14.484 -14.808 -15.133 -15.46 -15.814 -16.057 -16.306 -16.703 -16.965 -17.235 -17.385 -17.705 -18.027 -18.346 -18.518 -18.89 -19.093 -19.284 -19.479 -19.916 -20.164 -20.427 -20.705 -21.042 -21.453 -21.942 -23.028 -6 ,11784 ,KEBNE ,17028297,Wed Dec 22 19:33:06 CET,Wed Dec 22 21:23:24 CET,0.0 0.995 1.392 1.715 1.968 2.221 2.444 2.623 2.948 3.102 3.251 3.348 3.648 3.772 4.004 4.227 4.424 4.52 4.705 4.879 5.128 5.29 5.441 5.64 5.834 6.008 6.171 6.34 6.556 6.762 6.948 7.151 7.352 7.537 7.725 7.928 8.111 8.319 8.529 8.719 8.916 9.119 9.314 9.43 9.476 9.47 9.376 9.146 8.68 7.797 6.167 4.025 2.14 0.431 -1.057 -2.35 -3.518 -4.58 -5.477 -6.377 -7.149 -7.83 -8.464 -9.075 -9.646 -10.152 -10.674 -11.152 -11.568 -11.99 -12.425 -12.778 -13.162 -13.57 -13.881 -14.198 -14.516 -14.851 -15.201 -15.444 -15.697 -16.087 -16.347 -16.621 -16.765 -17.056 -17.369 -17.714 -17.893 -18.266 -18.446 -18.645 -18.859 -19.345 -19.618 -19.901 -20.201 -20.538 -20.94 -21.415 -22.527 -7 ,7079 ,KEBNE ,17028298,Wed Dec 22 19:33:07 CET,Wed Dec 22 21:24:25 CET,0.0 1.672 2.279 2.744 3.111 3.441 3.748 4.028 4.457 4.613 4.765 4.874 5.168 5.287 5.51 5.725 5.918 6.007 6.19 6.364 6.6 6.743 6.881 7.087 7.276 7.453 7.645 7.829 8.042 8.247 8.431 8.63 8.831 9.038 9.277 9.521 9.737 9.974 10.214 10.433 10.623 10.788 10.945 11.057 11.095 11.119 11.035 10.763 10.308 9.402 7.523 5.069 3.075 1.409 0.01 -1.287 -2.414 -3.414 -4.303 -5.191 -5.929 -6.565 -7.174 -7.768 -8.33 -8.853 -9.421 -9.921 -10.332 -10.736 -11.14 -11.482 -11.84 -12.216 -12.52 -12.83 -13.139 -13.454 -13.782 -14.006 -14.229 -14.595 -14.857 -15.131 -15.274 -15.574 -15.891 -16.211 -16.381 -16.754 -16.974 -17.18 -17.392 -17.873 -18.136 -18.417 -18.728 -19.06 -19.426 -19.971 -21.195 -8 ,2930 ,KEBNE ,17028299,Wed Dec 22 19:33:07 CET,Wed Dec 22 21:24:23 CET,0.0 1.057 1.481 1.807 2.074 2.298 2.503 2.689 3.026 3.18 3.32 3.416 3.718 3.841 4.065 4.277 4.46 4.551 4.736 4.906 5.144 5.287 5.422 5.621 5.803 5.977 6.137 6.282 6.463 6.624 6.777 6.967 7.132 7.286 7.463 7.658 7.832 8.002 8.206 8.413 8.576 8.727 8.88 8.984 9.036 8.993 8.877 8.674 8.233 7.407 5.772 3.499 1.483 -0.233 -1.702 -3.003 -4.118 -5.138 -6.014 -6.875 -7.612 -8.258 -8.874 -9.461 -10.005 -10.486 -10.993 -11.454 -11.857 -12.281 -12.714 -13.062 -13.423 -13.794 -14.072 -14.364 -14.672 -14.987 -15.313 -15.548 -15.787 -16.169 -16.439 -16.712 -16.852 -17.135 -17.433 -17.767 -17.952 -18.323 -18.523 -18.723 -18.935 -19.384 -19.616 -19.879 -20.184 -20.513 -20.906 -21.426 -22.791 -9 ,18433 ,KEBNE ,17028300,Wed Dec 22 19:33:07 CET,Wed Dec 22 21:23:42 CET,0.0 1.12 1.552 1.897 2.172 2.39 2.592 2.776 3.111 3.264 3.402 3.493 3.79 3.915 4.135 4.337 4.521 4.613 4.791 4.963 5.214 5.368 5.517 5.726 5.915 6.091 6.255 6.411 6.618 6.814 6.996 7.212 7.417 7.61 7.814 8.027 8.227 8.459 8.7 8.92 9.144 9.39 9.648 9.844 10.024 10.181 10.27 10.246 9.992 9.344 7.879 5.816 3.946 2.338 0.945 -0.32 -1.439 -2.477 -3.336 -4.189 -4.954 -5.624 -6.262 -6.881 -7.453 -7.977 -8.516 -8.976 -9.382 -9.816 -10.266 -10.625 -10.985 -11.362 -11.654 -11.958 -12.269 -12.588 -12.924 -13.152 -13.378 -13.738 -14.001 -14.274 -14.418 -14.713 -15.012 -15.336 -15.517 -15.89 -16.098 -16.313 -16.524 -16.977 -17.24 -17.544 -17.889 -18.269 -18.705 -19.25 -20.729 -10 ,24735 ,KEBNE ,17028301,Wed Dec 22 19:33:07 CET,Wed Dec 22 21:23:36 CET,0.0 0.97 1.391 1.696 1.942 2.17 2.382 2.572 2.931 3.101 3.252 3.339 3.625 3.74 3.959 4.166 4.349 4.438 4.619 4.797 5.048 5.196 5.328 5.503 5.665 5.82 5.965 6.108 6.275 6.422 6.576 6.764 6.937 7.095 7.266 7.454 7.614 7.778 7.935 8.067 8.202 8.339 8.463 8.536 8.589 8.599 8.49 8.267 7.871 7.078 5.461 3.316 1.437 -0.196 -1.664 -2.998 -4.118 -5.117 -5.971 -6.801 -7.511 -8.156 -8.777 -9.378 -9.941 -10.443 -10.968 -11.44 -11.849 -12.271 -12.708 -13.072 -13.442 -13.818 -14.11 -14.426 -14.749 -15.078 -15.418 -15.645 -15.881 -16.248 -16.502 -16.77 -16.91 -17.202 -17.517 -17.845 -18.012 -18.383 -18.601 -18.801 -18.996 -19.411 -19.641 -19.912 -20.218 -20.565 -20.955 -21.458 -22.644 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index ab2f32d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29832 ,KEBNE ,16749780,Wed Dec 1 20:23:55 CET,Wed Dec 1 22:11:09 CET,0.0 0.406 0.7 0.933 1.144 1.34 1.501 1.643 1.918 2.053 2.186 2.256 2.561 2.679 2.907 3.116 3.321 3.422 3.622 3.811 4.074 4.257 4.441 4.695 4.942 5.186 5.428 5.66 5.951 6.227 6.488 6.817 7.15 7.47 7.837 8.265 8.675 9.114 9.607 10.149 10.696 11.302 12.047 12.818 13.729 14.742 15.99 17.453 19.171 21.289 23.872 26.077 27.449 28.281 28.81 29.186 29.388 29.467 29.491 29.492 29.468 29.42 29.33 29.223 29.118 29.015 28.876 28.733 28.626 28.51 28.369 28.247 28.117 27.97 27.85 27.716 27.561 27.391 27.223 27.106 26.969 26.745 26.596 26.438 26.357 26.178 25.969 25.764 25.665 25.401 25.321 25.182 25.03 24.679 24.478 24.256 23.975 23.601 23.174 22.638 20.957 -2 ,12608 ,KEBNE ,16749781,Wed Dec 1 20:23:55 CET,Wed Dec 1 22:10:26 CET,0.0 0.339 0.589 0.798 0.994 1.179 1.342 1.488 1.767 1.908 2.047 2.106 2.413 2.523 2.754 2.974 3.173 3.271 3.458 3.65 3.934 4.116 4.303 4.578 4.844 5.091 5.319 5.547 5.848 6.132 6.406 6.749 7.089 7.415 7.792 8.233 8.656 9.115 9.614 10.171 10.77 11.433 12.214 13.036 14.023 15.123 16.364 17.73 19.36 21.386 24.002 26.254 27.576 28.433 28.976 29.305 29.483 29.582 29.634 29.614 29.571 29.514 29.42 29.31 29.186 29.039 28.862 28.712 28.589 28.445 28.273 28.129 27.994 27.848 27.722 27.584 27.432 27.274 27.112 27.002 26.879 26.682 26.546 26.389 26.31 26.156 25.989 25.788 25.675 25.397 25.275 25.132 24.979 24.61 24.402 24.178 23.916 23.632 23.316 22.874 21.555 -3 ,1867 ,KEBNE ,16749782,Wed Dec 1 20:27:06 CET,Wed Dec 1 22:14:39 CET,0.0 0.386 0.664 0.876 1.049 1.208 1.376 1.544 1.848 1.98 2.104 2.175 2.493 2.62 2.855 3.072 3.28 3.379 3.571 3.762 4.039 4.211 4.382 4.623 4.859 5.1 5.33 5.559 5.853 6.139 6.41 6.733 7.042 7.346 7.705 8.108 8.499 8.936 9.416 9.922 10.468 11.096 11.841 12.611 13.528 14.577 15.814 17.243 18.96 21.007 23.558 25.733 26.988 27.77 28.295 28.63 28.829 28.958 29.022 29.025 28.996 28.963 28.9 28.821 28.748 28.67 28.561 28.434 28.315 28.179 28.013 27.882 27.761 27.618 27.502 27.378 27.242 27.105 26.943 26.823 26.702 26.491 26.339 26.18 26.094 25.905 25.72 25.534 25.423 25.139 25.044 24.907 24.755 24.437 24.245 24.042 23.819 23.506 23.13 22.675 21.497 -4 ,26137 ,KEBNE ,16749783,Wed Dec 1 20:27:06 CET,Wed Dec 1 22:14:46 CET,0.0 0.321 0.566 0.78 0.976 1.159 1.316 1.459 1.728 1.85 1.969 2.018 2.309 2.414 2.629 2.839 3.042 3.146 3.35 3.541 3.807 3.986 4.164 4.408 4.646 4.881 5.106 5.324 5.602 5.871 6.144 6.484 6.818 7.145 7.534 7.975 8.397 8.865 9.373 9.923 10.522 11.208 12.024 12.846 13.787 14.86 16.124 17.582 19.331 21.466 24.122 26.351 27.775 28.698 29.285 29.62 29.835 30.014 30.098 30.124 30.128 30.117 30.069 29.976 29.862 29.755 29.634 29.528 29.429 29.307 29.173 29.053 28.918 28.771 28.658 28.547 28.435 28.314 28.171 28.056 27.935 27.761 27.633 27.488 27.413 27.257 27.095 26.92 26.82 26.562 26.489 26.346 26.173 25.828 25.66 25.462 25.252 24.999 24.69 24.299 23.016 -5 ,8079 ,KEBNE ,16749784,Wed Dec 1 20:27:06 CET,Wed Dec 1 22:15:26 CET,0.0 0.347 0.581 0.776 0.952 1.126 1.299 1.461 1.738 1.861 1.982 2.035 2.341 2.466 2.694 2.902 3.12 3.225 3.426 3.622 3.893 4.063 4.231 4.485 4.741 4.991 5.229 5.46 5.752 6.025 6.296 6.633 6.967 7.304 7.701 8.133 8.541 8.99 9.464 9.979 10.544 11.195 11.947 12.692 13.609 14.671 15.877 17.287 18.978 20.966 23.55 25.799 27.082 27.868 28.391 28.766 29.003 29.142 29.222 29.261 29.261 29.244 29.204 29.119 29.037 28.971 28.872 28.768 28.643 28.469 28.295 28.178 28.065 27.939 27.832 27.705 27.568 27.429 27.278 27.171 27.06 26.88 26.758 26.628 26.548 26.358 26.141 25.907 25.795 25.532 25.441 25.28 25.101 24.78 24.614 24.424 24.208 23.966 23.631 23.134 21.092 -6 ,10124 ,KEBNE ,16749785,Wed Dec 1 20:27:05 CET,Wed Dec 1 22:14:06 CET,0.0 0.301 0.523 0.74 0.943 1.135 1.328 1.503 1.814 1.951 2.079 2.133 2.434 2.546 2.772 2.983 3.186 3.283 3.466 3.655 3.933 4.112 4.29 4.545 4.787 5.031 5.274 5.507 5.81 6.088 6.358 6.698 7.029 7.355 7.734 8.167 8.592 9.054 9.549 10.074 10.63 11.268 12.03 12.816 13.756 14.832 16.068 17.457 19.139 21.17 23.773 25.979 27.273 28.111 28.651 29.011 29.228 29.353 29.408 29.397 29.343 29.262 29.173 29.091 28.992 28.888 28.782 28.661 28.541 28.403 28.227 28.062 27.907 27.774 27.648 27.496 27.344 27.182 27.008 26.888 26.766 26.525 26.351 26.18 26.088 25.908 25.718 25.521 25.415 25.142 25.077 24.948 24.806 24.527 24.363 24.179 23.949 23.659 23.316 22.87 21.27 -7 ,20557 ,KEBNE ,16749786,Wed Dec 1 20:27:06 CET,Wed Dec 1 22:14:09 CET,0.0 0.298 0.517 0.715 0.904 1.087 1.252 1.404 1.678 1.809 1.942 1.998 2.296 2.404 2.609 2.809 3.001 3.098 3.29 3.478 3.749 3.92 4.091 4.347 4.582 4.809 5.033 5.26 5.564 5.853 6.128 6.462 6.785 7.088 7.44 7.847 8.244 8.684 9.169 9.687 10.245 10.912 11.702 12.51 13.482 14.607 15.931 17.463 19.368 21.71 24.51 26.753 28.139 29.043 29.597 29.956 30.197 30.355 30.44 30.429 30.383 30.347 30.288 30.23 30.167 30.094 30.011 29.92 29.821 29.705 29.57 29.467 29.365 29.248 29.15 29.027 28.894 28.766 28.63 28.525 28.417 28.235 28.102 27.97 27.904 27.754 27.562 27.349 27.236 26.961 26.841 26.699 26.558 26.265 26.063 25.82 25.596 25.322 24.998 24.578 23.442 -8 ,14700 ,KEBNE ,16749787,Wed Dec 1 20:27:06 CET,Wed Dec 1 22:13:53 CET,0.0 0.326 0.569 0.805 1.025 1.206 1.361 1.502 1.785 1.927 2.058 2.114 2.411 2.525 2.745 2.958 3.167 3.268 3.461 3.642 3.902 4.083 4.257 4.502 4.76 5.006 5.234 5.454 5.738 6.012 6.271 6.589 6.907 7.218 7.583 7.99 8.382 8.82 9.3 9.824 10.377 11.001 11.757 12.538 13.462 14.505 15.731 17.192 18.979 21.141 23.84 26.148 27.482 28.307 28.814 29.118 29.307 29.447 29.547 29.597 29.561 29.499 29.453 29.38 29.281 29.184 29.066 28.936 28.815 28.703 28.6 28.49 28.354 28.208 28.1 27.98 27.828 27.677 27.526 27.417 27.301 27.116 26.976 26.819 26.74 26.568 26.381 26.178 26.063 25.777 25.682 25.545 25.389 25.036 24.842 24.616 24.352 24.03 23.663 23.233 21.877 -9 ,12146 ,KEBNE ,16749788,Wed Dec 1 20:27:06 CET,Wed Dec 1 22:14:24 CET,0.0 0.285 0.505 0.71 0.899 1.079 1.235 1.375 1.65 1.783 1.912 1.971 2.279 2.397 2.623 2.835 3.038 3.136 3.332 3.525 3.801 3.982 4.161 4.421 4.676 4.912 5.136 5.36 5.642 5.911 6.183 6.526 6.855 7.165 7.526 7.939 8.335 8.768 9.248 9.771 10.336 10.966 11.71 12.482 13.404 14.467 15.723 17.179 18.963 21.157 23.929 26.28 27.64 28.528 29.097 29.459 29.683 29.823 29.894 29.922 29.908 29.85 29.768 29.647 29.524 29.399 29.253 29.152 29.052 28.917 28.768 28.637 28.49 28.334 28.21 28.07 27.928 27.79 27.647 27.532 27.397 27.189 27.046 26.901 26.824 26.66 26.488 26.286 26.169 25.884 25.783 25.646 25.49 25.121 24.926 24.713 24.453 24.14 23.741 23.214 21.672 -10 ,28840 ,KEBNE ,16749789,Wed Dec 1 20:27:06 CET,Wed Dec 1 22:15:12 CET,0.0 0.262 0.494 0.728 0.944 1.126 1.296 1.448 1.721 1.856 1.98 2.027 2.339 2.463 2.704 2.917 3.117 3.222 3.42 3.6 3.862 4.026 4.186 4.432 4.676 4.912 5.152 5.385 5.67 5.949 6.222 6.544 6.86 7.181 7.563 7.99 8.408 8.882 9.388 9.942 10.533 11.177 11.925 12.72 13.69 14.794 16.062 17.493 19.24 21.349 23.98 26.239 27.533 28.301 28.802 29.121 29.28 29.353 29.365 29.358 29.324 29.272 29.202 29.109 29.018 28.916 28.806 28.698 28.572 28.439 28.311 28.196 28.047 27.885 27.768 27.646 27.486 27.316 27.154 27.032 26.898 26.669 26.515 26.364 26.285 26.105 25.913 25.718 25.616 25.355 25.268 25.125 24.966 24.601 24.399 24.159 23.874 23.539 23.127 22.551 20.8 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index 8aaed971..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8070 ,KEBNE ,16749790,Wed Dec 1 20:27:06 CET,Wed Dec 1 22:14:50 CET,0.0 0.344 0.553 0.718 0.884 1.041 1.177 1.309 1.557 1.671 1.784 1.829 2.099 2.205 2.402 2.567 2.718 2.795 2.942 3.092 3.31 3.444 3.572 3.754 3.94 4.124 4.293 4.453 4.654 4.861 5.057 5.284 5.516 5.741 6.001 6.291 6.552 6.83 7.136 7.451 7.769 8.156 8.595 9.015 9.498 10.0 10.576 11.202 11.841 12.526 13.217 13.464 13.304 12.99 12.658 12.286 11.887 11.525 11.223 10.88 10.535 10.231 9.947 9.653 9.378 9.117 8.841 8.597 8.373 8.12 7.855 7.651 7.437 7.192 6.982 6.77 6.563 6.351 6.13 5.977 5.81 5.52 5.317 5.119 5.018 4.808 4.6 4.374 4.241 3.946 3.823 3.665 3.494 3.083 2.851 2.605 2.329 2.024 1.667 1.153 -0.194 -2 ,25991 ,KEBNE ,16749791,Wed Dec 1 20:27:07 CET,Wed Dec 1 22:15:20 CET,0.0 0.253 0.486 0.679 0.864 1.036 1.18 1.314 1.558 1.671 1.787 1.838 2.095 2.182 2.355 2.522 2.679 2.756 2.909 3.06 3.285 3.421 3.551 3.753 3.943 4.112 4.276 4.435 4.63 4.818 5.013 5.249 5.473 5.68 5.92 6.191 6.45 6.749 7.053 7.36 7.686 8.036 8.442 8.852 9.324 9.859 10.451 11.066 11.752 12.473 13.083 13.268 13.089 12.783 12.44 12.069 11.707 11.364 11.034 10.662 10.347 10.064 9.78 9.51 9.229 8.966 8.689 8.429 8.213 7.968 7.701 7.494 7.264 7.021 6.836 6.632 6.426 6.227 6.017 5.861 5.696 5.455 5.27 5.06 4.959 4.741 4.509 4.262 4.123 3.825 3.694 3.532 3.353 2.961 2.747 2.513 2.267 1.991 1.638 1.182 -0.293 -3 ,7746 ,KEBNE ,16749792,Wed Dec 1 20:30:23 CET,Wed Dec 1 22:19:59 CET,0.0 0.285 0.481 0.656 0.821 0.972 1.105 1.226 1.456 1.578 1.702 1.762 2.041 2.143 2.335 2.534 2.726 2.81 2.963 3.114 3.331 3.465 3.595 3.783 3.966 4.141 4.306 4.47 4.693 4.899 5.087 5.31 5.53 5.744 5.988 6.261 6.522 6.798 7.091 7.411 7.746 8.107 8.526 8.939 9.413 9.949 10.513 11.114 11.826 12.566 13.179 13.399 13.335 13.116 12.79 12.445 12.129 11.81 11.51 11.191 10.895 10.627 10.352 10.079 9.82 9.567 9.299 9.071 8.872 8.644 8.392 8.193 7.975 7.739 7.556 7.357 7.152 6.935 6.705 6.544 6.371 6.1 5.917 5.722 5.616 5.388 5.139 4.858 4.711 4.413 4.289 4.144 3.996 3.648 3.454 3.242 2.988 2.722 2.421 1.957 0.751 -4 ,14206 ,KEBNE ,16749793,Wed Dec 1 20:37:43 CET,Wed Dec 1 22:25:01 CET,0.0 0.349 0.615 0.82 0.979 1.13 1.275 1.414 1.665 1.787 1.897 1.926 2.193 2.291 2.47 2.64 2.81 2.893 3.047 3.192 3.403 3.541 3.669 3.85 4.036 4.214 4.381 4.545 4.754 4.947 5.135 5.377 5.615 5.839 6.099 6.381 6.65 6.96 7.275 7.601 7.947 8.326 8.764 9.174 9.633 10.151 10.7 11.264 11.898 12.587 13.298 13.667 13.606 13.359 13.054 12.728 12.382 12.018 11.698 11.373 11.062 10.763 10.45 10.136 9.846 9.588 9.329 9.066 8.828 8.576 8.312 8.082 7.83 7.577 7.378 7.163 6.944 6.722 6.486 6.322 6.14 5.845 5.647 5.446 5.34 5.098 4.841 4.575 4.436 4.128 3.983 3.821 3.64 3.245 3.023 2.775 2.494 2.168 1.785 1.31 0.154 -5 ,21675 ,KEBNE ,16749794,Wed Dec 1 20:47:15 CET,Wed Dec 1 22:35:14 CET,0.0 0.316 0.535 0.715 0.889 1.048 1.191 1.326 1.557 1.667 1.783 1.837 2.114 2.216 2.396 2.569 2.742 2.825 2.989 3.149 3.381 3.53 3.675 3.886 4.084 4.261 4.428 4.601 4.826 5.044 5.248 5.479 5.701 5.916 6.155 6.411 6.673 6.966 7.273 7.599 7.937 8.303 8.722 9.149 9.639 10.173 10.765 11.421 12.143 12.85 13.507 13.748 13.66 13.474 13.158 12.782 12.443 12.088 11.76 11.419 11.088 10.795 10.528 10.26 10.009 9.763 9.49 9.239 9.01 8.771 8.528 8.33 8.125 7.907 7.724 7.53 7.327 7.103 6.86 6.692 6.527 6.271 6.094 5.903 5.796 5.566 5.306 5.029 4.905 4.621 4.488 4.335 4.173 3.82 3.628 3.416 3.167 2.881 2.563 2.114 0.897 -6 ,11241 ,KEBNE ,16749795,Wed Dec 1 20:47:16 CET,Wed Dec 1 22:34:34 CET,0.0 0.288 0.521 0.719 0.891 1.043 1.176 1.301 1.546 1.663 1.778 1.818 2.089 2.189 2.362 2.527 2.688 2.766 2.916 3.058 3.273 3.417 3.558 3.757 3.95 4.146 4.331 4.497 4.71 4.922 5.118 5.349 5.58 5.795 6.034 6.303 6.553 6.812 7.091 7.391 7.699 8.057 8.487 8.931 9.431 9.972 10.594 11.26 11.943 12.591 13.161 13.352 13.19 12.882 12.571 12.207 11.817 11.455 11.127 10.758 10.435 10.138 9.817 9.495 9.218 8.975 8.71 8.464 8.231 7.975 7.71 7.5 7.268 7.024 6.835 6.63 6.422 6.215 6.002 5.833 5.649 5.368 5.172 4.976 4.871 4.657 4.443 4.203 4.066 3.764 3.639 3.469 3.288 2.916 2.69 2.442 2.178 1.873 1.509 1.065 -0.102 -7 ,6855 ,KEBNE ,16749796,Wed Dec 1 20:56:53 CET,Wed Dec 1 22:45:01 CET,0.0 0.402 0.619 0.793 0.957 1.122 1.268 1.407 1.663 1.777 1.886 1.937 2.212 2.308 2.489 2.679 2.863 2.947 3.099 3.248 3.461 3.593 3.723 3.913 4.103 4.29 4.462 4.624 4.837 5.048 5.254 5.482 5.689 5.893 6.139 6.405 6.646 6.924 7.242 7.581 7.939 8.352 8.797 9.202 9.651 10.152 10.755 11.378 12.029 12.717 13.348 13.641 13.535 13.218 12.866 12.51 12.139 11.768 11.433 11.1 10.8 10.496 10.183 9.891 9.625 9.372 9.086 8.828 8.61 8.372 8.121 7.911 7.694 7.47 7.282 7.087 6.871 6.65 6.429 6.263 6.09 5.815 5.612 5.409 5.316 5.121 4.884 4.625 4.493 4.19 4.035 3.863 3.681 3.269 3.045 2.799 2.535 2.244 1.874 1.442 0.314 -8 ,16949 ,KEBNE ,16749797,Wed Dec 1 20:56:53 CET,Wed Dec 1 22:45:34 CET,0.0 0.341 0.59 0.8 0.976 1.125 1.27 1.405 1.632 1.741 1.845 1.88 2.148 2.24 2.422 2.596 2.755 2.839 3.007 3.169 3.4 3.546 3.687 3.879 4.075 4.27 4.45 4.616 4.813 4.998 5.171 5.386 5.608 5.819 6.067 6.342 6.594 6.879 7.193 7.525 7.873 8.252 8.696 9.119 9.596 10.142 10.752 11.371 12.056 12.873 13.634 13.85 13.68 13.424 13.129 12.782 12.413 12.036 11.719 11.389 11.078 10.782 10.485 10.193 9.915 9.676 9.432 9.2 8.986 8.748 8.504 8.302 8.073 7.844 7.666 7.477 7.283 7.063 6.828 6.666 6.496 6.232 6.049 5.859 5.761 5.541 5.292 5.03 4.892 4.592 4.463 4.3 4.134 3.781 3.586 3.365 3.105 2.804 2.447 2.044 0.937 -9 ,9492 ,KEBNE ,16749798,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:12:42 CET,0.0 0.322 0.524 0.69 0.851 1.002 1.138 1.263 1.508 1.628 1.738 1.784 2.046 2.136 2.314 2.482 2.65 2.732 2.883 3.023 3.227 3.358 3.488 3.68 3.859 4.034 4.207 4.374 4.576 4.77 4.964 5.193 5.406 5.616 5.867 6.152 6.424 6.699 6.992 7.299 7.611 7.97 8.377 8.77 9.238 9.761 10.333 10.926 11.564 12.201 12.796 13.081 13.016 12.808 12.504 12.136 11.769 11.391 11.035 10.662 10.335 10.037 9.741 9.456 9.178 8.904 8.616 8.355 8.12 7.873 7.62 7.416 7.196 6.967 6.783 6.577 6.366 6.148 5.914 5.751 5.583 5.305 5.108 4.909 4.813 4.624 4.397 4.13 3.994 3.692 3.566 3.413 3.252 2.907 2.704 2.477 2.208 1.921 1.58 1.073 -0.074 -10 ,32656 ,KEBNE ,16749799,Wed Dec 1 21:23:29 CET,Wed Dec 1 23:11:32 CET,0.0 0.304 0.497 0.677 0.876 1.049 1.193 1.321 1.555 1.667 1.773 1.811 2.065 2.155 2.332 2.495 2.643 2.714 2.861 3.008 3.212 3.341 3.472 3.659 3.839 4.01 4.177 4.345 4.559 4.763 4.956 5.187 5.406 5.621 5.872 6.144 6.4 6.674 6.965 7.294 7.64 7.989 8.38 8.77 9.232 9.74 10.282 10.882 11.538 12.266 13.021 13.262 13.096 12.809 12.502 12.163 11.806 11.443 11.124 10.783 10.474 10.189 9.884 9.6 9.342 9.099 8.848 8.604 8.37 8.136 7.891 7.678 7.45 7.206 7.02 6.829 6.623 6.398 6.172 6.02 5.855 5.588 5.401 5.209 5.106 4.884 4.642 4.39 4.265 3.972 3.845 3.686 3.504 3.127 2.929 2.711 2.449 2.127 1.79 1.349 -0.207 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt deleted file mode 100644 index edf485d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6570 ,KEBNE ,16749800,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:13:24 CET,0.0 1.225 1.715 2.043 2.316 2.531 2.716 2.896 3.273 3.44 3.587 3.69 3.97 4.086 4.309 4.504 4.686 4.782 4.955 5.097 5.3 5.436 5.563 5.725 5.868 6.004 6.149 6.284 6.438 6.596 6.786 6.995 7.168 7.336 7.504 7.69 7.853 7.981 8.109 8.232 8.349 8.465 8.539 8.572 8.583 8.525 8.372 8.098 7.586 6.685 5.051 2.93 1.074 -0.463 -1.754 -2.966 -4.014 -4.915 -5.69 -6.47 -7.149 -7.786 -8.395 -8.943 -9.429 -9.873 -10.342 -10.757 -11.122 -11.522 -11.934 -12.262 -12.605 -12.959 -13.231 -13.512 -13.799 -14.096 -14.412 -14.632 -14.86 -15.214 -15.452 -15.707 -15.841 -16.106 -16.385 -16.683 -16.845 -17.2 -17.373 -17.559 -17.748 -18.172 -18.392 -18.607 -18.867 -19.168 -19.491 -19.946 -21.35 -2 ,12733 ,KEBNE ,16749801,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:13:53 CET,0.0 1.037 1.453 1.812 2.178 2.516 2.751 2.93 3.262 3.416 3.562 3.69 3.984 4.103 4.336 4.58 4.803 4.9 5.078 5.244 5.469 5.605 5.738 5.931 6.109 6.269 6.415 6.561 6.747 6.912 7.052 7.217 7.379 7.528 7.679 7.828 7.978 8.129 8.269 8.408 8.53 8.631 8.725 8.806 8.836 8.801 8.667 8.364 7.764 6.69 4.829 2.499 0.568 -1.096 -2.583 -3.859 -4.913 -5.901 -6.759 -7.595 -8.313 -8.94 -9.538 -10.099 -10.611 -11.071 -11.545 -11.982 -12.359 -12.745 -13.146 -13.477 -13.819 -14.177 -14.445 -14.716 -14.999 -15.292 -15.59 -15.791 -16.005 -16.352 -16.602 -16.861 -16.993 -17.266 -17.546 -17.834 -17.986 -18.336 -18.476 -18.647 -18.828 -19.214 -19.425 -19.661 -19.904 -20.167 -20.465 -20.842 -21.691 -3 ,22036 ,KEBNE ,16749802,Wed Dec 1 21:23:39 CET,Wed Dec 1 23:11:38 CET,0.0 1.014 1.421 1.832 2.186 2.47 2.719 2.952 3.34 3.485 3.63 3.761 4.055 4.172 4.373 4.54 4.709 4.8 4.98 5.13 5.321 5.438 5.554 5.722 5.891 6.051 6.175 6.296 6.452 6.602 6.737 6.897 7.059 7.215 7.395 7.562 7.688 7.808 7.936 8.057 8.137 8.197 8.235 8.246 8.25 8.17 7.959 7.615 7.031 6.1 4.391 2.217 0.381 -1.201 -2.549 -3.759 -4.802 -5.738 -6.531 -7.332 -8.01 -8.611 -9.204 -9.748 -10.242 -10.682 -11.125 -11.514 -11.854 -12.212 -12.58 -12.893 -13.218 -13.55 -13.815 -14.088 -14.372 -14.67 -14.967 -15.172 -15.4 -15.775 -16.029 -16.283 -16.411 -16.665 -16.943 -17.264 -17.424 -17.766 -17.93 -18.11 -18.305 -18.714 -18.945 -19.202 -19.465 -19.793 -20.21 -20.704 -22.294 -4 ,17628 ,KEBNE ,16749803,Wed Dec 1 21:23:35 CET,Wed Dec 1 23:10:47 CET,0.0 0.828 1.279 1.578 1.82 2.048 2.248 2.429 2.717 2.846 2.975 3.044 3.316 3.423 3.635 3.835 4.016 4.1 4.258 4.415 4.633 4.765 4.886 5.068 5.249 5.415 5.579 5.73 5.919 6.103 6.272 6.468 6.643 6.8 6.971 7.142 7.303 7.461 7.621 7.792 7.945 8.053 8.136 8.181 8.163 8.091 7.903 7.58 6.979 5.961 4.227 2.022 0.187 -1.339 -2.647 -3.859 -4.954 -5.899 -6.69 -7.487 -8.182 -8.812 -9.403 -9.988 -10.523 -10.976 -11.454 -11.896 -12.281 -12.664 -13.058 -13.401 -13.754 -14.104 -14.378 -14.656 -14.927 -15.213 -15.525 -15.738 -15.951 -16.294 -16.524 -16.762 -16.887 -17.142 -17.401 -17.67 -17.82 -18.164 -18.304 -18.482 -18.663 -19.07 -19.298 -19.524 -19.766 -20.042 -20.371 -20.766 -21.544 -5 ,9193 ,KEBNE ,16749804,Wed Dec 1 21:23:35 CET,Wed Dec 1 23:06:48 CET,0.0 1.438 1.886 2.271 2.611 2.875 3.118 3.344 3.774 3.95 4.1 4.201 4.501 4.633 4.888 5.139 5.356 5.446 5.626 5.799 6.049 6.202 6.336 6.53 6.717 6.899 7.072 7.235 7.429 7.616 7.786 7.968 8.141 8.289 8.447 8.621 8.773 8.944 9.109 9.243 9.372 9.521 9.678 9.809 9.884 9.896 9.807 9.521 9.053 8.211 6.525 4.322 2.505 0.894 -0.505 -1.727 -2.765 -3.67 -4.448 -5.205 -5.856 -6.448 -7.01 -7.553 -8.053 -8.492 -8.945 -9.344 -9.681 -10.04 -10.431 -10.751 -11.089 -11.448 -11.718 -11.999 -12.29 -12.584 -12.886 -13.092 -13.303 -13.648 -13.894 -14.149 -14.282 -14.56 -14.849 -15.13 -15.277 -15.622 -15.754 -15.922 -16.096 -16.489 -16.713 -16.943 -17.187 -17.439 -17.745 -18.12 -19.023 -6 ,16474 ,KEBNE ,16749805,Wed Dec 1 21:23:32 CET,Wed Dec 1 23:10:33 CET,0.0 1.137 1.551 1.851 2.103 2.324 2.503 2.662 2.997 3.169 3.311 3.384 3.662 3.77 3.982 4.195 4.393 4.48 4.642 4.795 5.023 5.17 5.3 5.482 5.67 5.85 6.004 6.144 6.329 6.509 6.682 6.873 7.033 7.159 7.305 7.475 7.636 7.78 7.88 7.978 8.08 8.16 8.199 8.219 8.216 8.15 7.978 7.666 7.083 6.038 4.196 1.981 0.099 -1.509 -2.868 -4.047 -5.066 -5.995 -6.765 -7.558 -8.246 -8.831 -9.382 -9.903 -10.397 -10.862 -11.338 -11.743 -12.096 -12.47 -12.87 -13.21 -13.558 -13.908 -14.172 -14.431 -14.698 -14.979 -15.266 -15.47 -15.685 -16.018 -16.257 -16.502 -16.628 -16.93 -17.264 -17.6 -17.765 -18.109 -18.295 -18.486 -18.675 -19.07 -19.279 -19.505 -19.753 -20.021 -20.331 -20.735 -21.713 -7 ,4421 ,KEBNE ,16749806,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:12:43 CET,0.0 2.085 2.731 3.159 3.487 3.777 4.019 4.222 4.596 4.773 4.924 5.006 5.304 5.433 5.655 5.846 6.013 6.097 6.262 6.42 6.624 6.75 6.884 7.058 7.211 7.359 7.499 7.635 7.797 7.944 8.099 8.316 8.521 8.689 8.863 9.047 9.238 9.428 9.598 9.757 9.887 10.008 10.09 10.137 10.136 10.018 9.85 9.59 9.054 8.134 6.428 4.203 2.312 0.73 -0.583 -1.752 -2.787 -3.707 -4.473 -5.263 -5.952 -6.55 -7.116 -7.643 -8.143 -8.603 -9.081 -9.511 -9.862 -10.22 -10.604 -10.916 -11.23 -11.566 -11.832 -12.122 -12.429 -12.74 -13.059 -13.285 -13.524 -13.908 -14.162 -14.41 -14.543 -14.826 -15.136 -15.472 -15.642 -15.999 -16.197 -16.398 -16.593 -17.017 -17.251 -17.518 -17.838 -18.185 -18.562 -19.116 -20.284 -8 ,14531 ,KEBNE ,16749807,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:12:16 CET,0.0 1.632 2.17 2.541 2.852 3.139 3.406 3.626 4.036 4.229 4.412 4.575 4.889 5.025 5.292 5.525 5.711 5.796 5.967 6.146 6.404 6.562 6.72 6.954 7.158 7.342 7.524 7.701 7.899 8.068 8.234 8.414 8.547 8.688 8.864 9.052 9.235 9.444 9.652 9.828 9.972 10.109 10.257 10.406 10.506 10.465 10.283 9.934 9.295 8.243 6.421 4.207 2.38 0.809 -0.54 -1.748 -2.794 -3.715 -4.503 -5.325 -6.027 -6.631 -7.194 -7.734 -8.239 -8.676 -9.14 -9.574 -9.938 -10.311 -10.705 -11.031 -11.372 -11.726 -11.998 -12.286 -12.583 -12.9 -13.258 -13.502 -13.736 -14.084 -14.328 -14.599 -14.746 -15.043 -15.327 -15.625 -15.789 -16.141 -16.302 -16.487 -16.698 -17.169 -17.43 -17.685 -17.928 -18.219 -18.594 -19.115 -20.479 -9 ,6812 ,KEBNE ,16749808,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:13:27 CET,0.0 1.569 2.082 2.422 2.705 2.948 3.166 3.408 3.835 3.988 4.128 4.222 4.508 4.627 4.848 5.045 5.22 5.299 5.454 5.616 5.842 5.988 6.122 6.297 6.459 6.603 6.747 6.888 7.055 7.21 7.359 7.528 7.675 7.815 7.973 8.134 8.282 8.444 8.628 8.786 8.92 9.071 9.177 9.221 9.238 9.209 9.079 8.767 8.158 7.133 5.292 2.97 1.043 -0.616 -2.058 -3.3 -4.343 -5.291 -6.129 -6.953 -7.653 -8.286 -8.869 -9.396 -9.885 -10.342 -10.822 -11.263 -11.651 -12.045 -12.471 -12.81 -13.131 -13.481 -13.771 -14.076 -14.39 -14.703 -15.007 -15.22 -15.44 -15.788 -16.027 -16.273 -16.41 -16.692 -16.972 -17.254 -17.398 -17.74 -17.874 -18.045 -18.23 -18.636 -18.856 -19.096 -19.354 -19.648 -20.005 -20.444 -21.203 -10 ,17738 ,KEBNE ,16749809,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:13:56 CET,0.0 1.493 2.02 2.411 2.732 3.031 3.281 3.497 3.914 4.081 4.228 4.32 4.589 4.709 4.971 5.199 5.424 5.54 5.746 5.956 6.253 6.431 6.602 6.817 6.986 7.143 7.3 7.44 7.592 7.728 7.858 8.014 8.169 8.32 8.494 8.681 8.838 8.985 9.146 9.286 9.427 9.572 9.662 9.735 9.793 9.763 9.577 9.161 8.462 7.416 5.653 3.444 1.61 0.1 -1.235 -2.455 -3.487 -4.426 -5.241 -6.045 -6.735 -7.336 -7.901 -8.436 -8.949 -9.406 -9.884 -10.317 -10.681 -11.06 -11.443 -11.757 -12.074 -12.418 -12.704 -12.985 -13.266 -13.578 -13.897 -14.107 -14.324 -14.66 -14.885 -15.121 -15.244 -15.493 -15.78 -16.086 -16.239 -16.576 -16.725 -16.913 -17.103 -17.504 -17.751 -18.015 -18.283 -18.608 -18.989 -19.417 -20.606 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt deleted file mode 100644 index 4479fa76..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29936 ,KEBNE ,17028302,Wed Dec 22 19:33:07 CET,Wed Dec 22 21:22:28 CET,0.0 1.814 2.328 2.71 3.049 3.34 3.563 3.793 4.216 4.395 4.572 4.725 5.049 5.198 5.49 5.742 5.994 6.124 6.38 6.619 6.941 7.136 7.328 7.628 7.924 8.193 8.441 8.686 8.996 9.304 9.599 9.936 10.271 10.608 10.979 11.371 11.75 12.169 12.632 13.151 13.68 14.242 14.871 15.472 16.227 17.081 17.994 18.998 20.049 21.036 21.861 22.146 22.076 21.833 21.498 21.074 20.672 20.297 19.931 19.533 19.193 18.876 18.544 18.221 17.911 17.632 17.338 17.066 16.829 16.587 16.329 16.107 15.884 15.645 15.449 15.259 15.062 14.85 14.637 14.481 14.304 14.043 13.87 13.674 13.573 13.355 13.12 12.863 12.72 12.402 12.28 12.111 11.945 11.596 11.387 11.16 10.935 10.696 10.376 9.971 9.128 -2 ,6322 ,KEBNE ,17028303,Wed Dec 22 19:33:07 CET,Wed Dec 22 21:22:21 CET,0.0 1.825 2.338 2.704 3.024 3.321 3.542 3.753 4.137 4.305 4.482 4.654 4.99 5.132 5.419 5.703 5.973 6.104 6.353 6.579 6.903 7.117 7.325 7.623 7.903 8.173 8.438 8.686 9.004 9.309 9.621 10.007 10.355 10.688 11.092 11.532 11.939 12.391 12.852 13.343 13.885 14.482 15.134 15.762 16.511 17.33 18.208 19.124 20.078 20.995 21.743 22.003 21.885 21.541 21.138 20.728 20.355 19.981 19.607 19.224 18.842 18.479 18.133 17.814 17.525 17.253 16.955 16.68 16.431 16.174 15.913 15.686 15.451 15.214 15.039 14.862 14.675 14.473 14.246 14.097 13.947 13.699 13.527 13.348 13.246 13.021 12.794 12.56 12.433 12.144 12.031 11.863 11.699 11.345 11.158 10.95 10.728 10.474 10.193 9.877 8.877 -3 ,24141 ,KEBNE ,17028304,Wed Dec 22 19:33:07 CET,Wed Dec 22 21:22:10 CET,0.0 1.522 1.966 2.287 2.59 2.868 3.117 3.35 3.782 3.981 4.168 4.338 4.687 4.851 5.175 5.466 5.749 5.884 6.13 6.363 6.682 6.89 7.093 7.377 7.652 7.924 8.182 8.425 8.753 9.083 9.386 9.741 10.08 10.41 10.802 11.238 11.657 12.117 12.618 13.137 13.688 14.305 15.016 15.697 16.425 17.216 18.149 19.182 20.324 21.423 22.273 22.802 22.951 22.814 22.492 22.049 21.592 21.169 20.769 20.305 19.901 19.55 19.206 18.88 18.569 18.273 17.95 17.642 17.378 17.109 16.819 16.571 16.317 16.039 15.81 15.577 15.329 15.063 14.795 14.61 14.429 14.148 13.952 13.748 13.64 13.425 13.18 12.908 12.781 12.48 12.371 12.217 12.062 11.697 11.47 11.222 10.946 10.622 10.299 9.919 8.984 -4 ,22411 ,KEBNE ,17028305,Wed Dec 22 19:33:07 CET,Wed Dec 22 21:22:12 CET,0.0 1.312 1.808 2.183 2.499 2.758 3.015 3.243 3.612 3.787 3.957 4.092 4.433 4.582 4.864 5.131 5.392 5.524 5.785 6.026 6.366 6.587 6.805 7.12 7.423 7.719 8.008 8.285 8.658 9.031 9.375 9.764 10.115 10.439 10.826 11.271 11.677 12.126 12.606 13.102 13.63 14.238 14.958 15.683 16.554 17.495 18.517 19.574 20.678 21.839 23.007 23.525 23.435 23.121 22.668 22.207 21.816 21.361 20.91 20.464 20.05 19.694 19.352 19.014 18.69 18.39 18.062 17.764 17.504 17.222 16.93 16.683 16.42 16.168 15.99 15.809 15.612 15.4 15.182 15.012 14.832 14.574 14.395 14.197 14.097 13.886 13.646 13.39 13.255 12.939 12.845 12.704 12.535 12.166 11.966 11.726 11.461 11.163 10.739 10.189 9.064 -5 ,14781 ,KEBNE ,17028306,Wed Dec 22 19:33:07 CET,Wed Dec 22 21:22:40 CET,0.0 1.255 1.696 2.043 2.314 2.541 2.775 2.996 3.379 3.551 3.723 3.856 4.185 4.334 4.618 4.877 5.118 5.235 5.478 5.725 6.069 6.284 6.494 6.791 7.077 7.337 7.577 7.829 8.182 8.53 8.848 9.21 9.55 9.863 10.222 10.639 11.033 11.488 11.974 12.431 12.903 13.429 14.0 14.559 15.214 15.936 16.75 17.6 18.544 19.498 20.312 20.658 20.636 20.417 20.084 19.72 19.307 18.895 18.546 18.191 17.874 17.585 17.313 17.061 16.807 16.55 16.26 15.977 15.727 15.486 15.226 14.985 14.738 14.488 14.295 14.077 13.852 13.632 13.408 13.25 13.074 12.81 12.631 12.45 12.359 12.147 11.888 11.605 11.469 11.16 11.048 10.881 10.711 10.38 10.172 9.944 9.71 9.477 9.213 8.828 8.065 -6 ,25894 ,KEBNE ,17028307,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:30:59 CET,0.0 1.063 1.48 1.788 2.037 2.265 2.476 2.682 3.075 3.247 3.411 3.55 3.883 4.033 4.319 4.584 4.848 4.98 5.212 5.427 5.744 5.961 6.17 6.464 6.756 7.033 7.292 7.536 7.848 8.147 8.422 8.759 9.104 9.443 9.835 10.262 10.646 11.044 11.471 11.942 12.438 12.977 13.626 14.289 15.029 15.8 16.61 17.549 18.666 19.707 20.464 20.669 20.448 20.004 19.519 19.037 18.586 18.127 17.696 17.269 16.882 16.515 16.148 15.801 15.484 15.204 14.906 14.631 14.402 14.156 13.878 13.647 13.414 13.162 12.962 12.759 12.529 12.274 12.027 11.869 11.711 11.448 11.258 11.071 10.971 10.766 10.551 10.303 10.175 9.874 9.772 9.62 9.466 9.12 8.94 8.767 8.53 8.255 7.975 7.6 6.754 -7 ,31330 ,KEBNE ,17028308,Wed Dec 22 19:40:20 CET,Wed Dec 22 21:31:01 CET,0.0 0.979 1.385 1.727 1.997 2.252 2.5 2.718 3.101 3.277 3.443 3.579 3.924 4.076 4.36 4.623 4.88 5.003 5.238 5.454 5.752 5.952 6.155 6.427 6.683 6.949 7.214 7.469 7.801 8.119 8.407 8.74 9.057 9.374 9.744 10.18 10.596 11.031 11.482 11.932 12.402 12.937 13.582 14.189 14.804 15.494 16.359 17.281 18.208 19.189 19.976 20.294 20.32 20.078 19.74 19.401 19.082 18.713 18.35 17.973 17.637 17.336 17.027 16.73 16.45 16.21 15.971 15.726 15.506 15.267 15.005 14.798 14.575 14.33 14.131 13.902 13.668 13.443 13.2 13.032 12.868 12.584 12.368 12.159 12.044 11.786 11.505 11.231 11.097 10.782 10.684 10.539 10.351 9.927 9.709 9.455 9.158 8.869 8.532 8.109 7.366 -8 ,31791 ,KEBNE ,17028309,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:30:58 CET,0.0 1.336 1.892 2.282 2.555 2.783 3.026 3.273 3.677 3.844 4.018 4.193 4.535 4.689 4.969 5.235 5.494 5.619 5.863 6.096 6.438 6.654 6.855 7.149 7.44 7.734 8.025 8.301 8.661 8.99 9.286 9.625 9.925 10.213 10.557 10.953 11.328 11.719 12.125 12.55 13.026 13.573 14.164 14.761 15.488 16.25 17.084 18.005 19.048 20.082 20.876 21.18 21.059 20.697 20.255 19.754 19.253 18.803 18.401 17.953 17.579 17.237 16.894 16.567 16.258 15.983 15.675 15.381 15.122 14.856 14.561 14.296 14.023 13.766 13.559 13.336 13.128 12.904 12.659 12.493 12.322 12.039 11.834 11.613 11.5 11.285 11.061 10.805 10.662 10.33 10.193 10.038 9.885 9.548 9.353 9.15 8.924 8.676 8.379 7.976 6.485 -9 ,28954 ,KEBNE ,17028310,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:30:55 CET,0.0 1.522 1.884 2.227 2.551 2.817 3.033 3.232 3.635 3.82 3.993 4.162 4.529 4.7 4.986 5.265 5.549 5.677 5.913 6.146 6.501 6.734 6.952 7.268 7.568 7.85 8.132 8.391 8.709 9.022 9.321 9.671 10.004 10.342 10.734 11.168 11.586 12.031 12.492 13.001 13.551 14.141 14.81 15.471 16.226 17.092 18.085 19.216 20.416 21.479 22.392 22.775 22.722 22.457 22.1 21.683 21.212 20.727 20.307 19.917 19.59 19.262 18.933 18.627 18.345 18.081 17.779 17.497 17.26 17.016 16.757 16.548 16.333 16.097 15.909 15.704 15.496 15.281 15.054 14.897 14.729 14.449 14.262 14.061 13.944 13.71 13.477 13.248 13.129 12.815 12.66 12.48 12.296 11.899 11.684 11.463 11.211 10.917 10.55 10.149 9.487 -10 ,3240 ,KEBNE ,17028311,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:29:33 CET,0.0 1.769 2.259 2.613 2.885 3.138 3.359 3.57 3.985 4.166 4.338 4.495 4.838 4.995 5.293 5.571 5.832 5.957 6.19 6.408 6.734 6.936 7.133 7.435 7.731 8.025 8.302 8.557 8.881 9.203 9.514 9.886 10.229 10.569 10.977 11.403 11.799 12.215 12.658 13.15 13.658 14.191 14.801 15.426 16.109 16.828 17.692 18.614 19.62 20.663 21.642 22.215 22.196 21.879 21.468 21.045 20.597 20.159 19.777 19.358 18.988 18.632 18.288 17.973 17.68 17.4 17.094 16.814 16.555 16.303 16.076 15.872 15.649 15.43 15.242 15.048 14.842 14.608 14.365 14.187 13.999 13.713 13.527 13.344 13.248 13.042 12.826 12.604 12.473 12.149 11.999 11.831 11.661 11.304 11.112 10.903 10.659 10.383 10.051 9.613 8.327 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt deleted file mode 100644 index 1329a3c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11607 ,KEBNE ,16749810,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:16:55 CET,0.0 0.444 0.668 0.89 1.11 1.321 1.51 1.687 2.044 2.22 2.388 2.483 2.852 3.002 3.288 3.555 3.815 3.946 4.198 4.441 4.806 5.039 5.261 5.588 5.913 6.229 6.532 6.821 7.205 7.598 7.98 8.44 8.872 9.278 9.773 10.346 10.892 11.486 12.137 12.842 13.606 14.481 15.525 16.574 17.792 19.237 20.973 22.985 25.425 28.35 32.077 35.219 37.008 38.213 38.996 39.516 39.883 40.107 40.208 40.26 40.281 40.279 40.239 40.187 40.12 40.02 39.883 39.747 39.63 39.507 39.379 39.265 39.115 38.933 38.796 38.659 38.496 38.305 38.094 37.937 37.774 37.545 37.376 37.189 37.09 36.873 36.668 36.477 36.369 36.064 35.976 35.837 35.694 35.388 35.211 34.995 34.764 34.497 34.147 33.686 32.193 -2 ,21643 ,KEBNE ,16749811,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:17:28 CET,0.0 0.384 0.696 0.961 1.218 1.455 1.668 1.874 2.277 2.463 2.639 2.755 3.137 3.291 3.591 3.861 4.121 4.253 4.51 4.758 5.122 5.357 5.576 5.891 6.195 6.489 6.786 7.092 7.476 7.827 8.18 8.642 9.109 9.563 10.094 10.69 11.26 11.867 12.544 13.293 14.063 14.964 16.038 17.104 18.367 19.817 21.591 23.684 26.168 29.244 33.213 36.638 38.639 39.831 40.552 41.055 41.4 41.608 41.732 41.806 41.826 41.825 41.793 41.74 41.669 41.566 41.438 41.314 41.196 41.073 40.953 40.849 40.716 40.57 40.451 40.306 40.152 39.991 39.804 39.656 39.493 39.234 39.04 38.832 38.727 38.531 38.336 38.125 38.009 37.698 37.619 37.479 37.337 37.025 36.83 36.603 36.363 36.088 35.774 35.354 34.238 -3 ,8623 ,KEBNE ,16749812,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:17:11 CET,0.0 0.345 0.609 0.858 1.096 1.31 1.492 1.67 2.025 2.197 2.359 2.444 2.802 2.938 3.196 3.442 3.681 3.799 4.031 4.261 4.601 4.813 5.015 5.329 5.643 5.941 6.252 6.568 6.964 7.331 7.685 8.126 8.577 9.018 9.513 10.068 10.627 11.273 11.993 12.776 13.608 14.515 15.568 16.64 17.868 19.288 21.031 23.033 25.431 28.444 32.262 35.48 37.433 38.702 39.5 40.065 40.462 40.726 40.901 41.032 41.086 41.089 41.057 40.998 40.928 40.851 40.76 40.664 40.573 40.459 40.331 40.215 40.079 39.936 39.823 39.688 39.53 39.358 39.168 39.041 38.901 38.644 38.465 38.274 38.175 37.981 37.769 37.531 37.404 37.1 37.004 36.847 36.693 36.354 36.143 35.931 35.704 35.431 35.082 34.607 33.63 -4 ,542 ,KEBNE ,16749813,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:18:10 CET,0.0 0.422 0.688 0.945 1.197 1.413 1.618 1.805 2.13 2.293 2.455 2.55 2.918 3.06 3.333 3.596 3.856 3.981 4.22 4.456 4.791 5.004 5.216 5.519 5.803 6.085 6.369 6.65 7.004 7.348 7.685 8.108 8.529 8.933 9.403 9.939 10.461 11.039 11.691 12.386 13.11 13.951 14.966 16.021 17.26 18.685 20.396 22.386 24.841 27.885 31.693 34.932 36.851 38.143 39.011 39.595 39.963 40.187 40.338 40.42 40.442 40.441 40.424 40.377 40.287 40.184 40.06 39.932 39.818 39.691 39.55 39.42 39.274 39.114 38.992 38.88 38.734 38.576 38.423 38.307 38.174 37.959 37.814 37.629 37.533 37.35 37.129 36.888 36.766 36.465 36.373 36.222 36.063 35.699 35.5 35.28 35.028 34.728 34.367 33.862 32.697 -5 ,1857 ,KEBNE ,16749814,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:17:46 CET,0.0 0.564 0.884 1.126 1.353 1.563 1.764 1.957 2.323 2.499 2.664 2.743 3.113 3.257 3.54 3.814 4.075 4.209 4.472 4.723 5.091 5.329 5.56 5.892 6.213 6.525 6.826 7.108 7.472 7.836 8.19 8.622 9.07 9.501 9.973 10.524 11.09 11.715 12.38 13.101 13.867 14.743 15.78 16.803 18.027 19.478 21.169 23.139 25.545 28.467 32.17 35.418 37.386 38.644 39.472 40.056 40.437 40.699 40.841 40.893 40.896 40.879 40.853 40.762 40.645 40.556 40.462 40.345 40.207 40.056 39.896 39.769 39.644 39.507 39.386 39.251 39.112 38.962 38.8 38.68 38.547 38.333 38.178 38.007 37.916 37.726 37.528 37.31 37.184 36.873 36.8 36.667 36.521 36.175 35.989 35.798 35.565 35.303 35.035 34.694 33.26 -6 ,6917 ,KEBNE ,16749815,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:17:29 CET,0.0 0.59 0.854 1.076 1.267 1.464 1.653 1.825 2.147 2.297 2.447 2.518 2.871 3.008 3.284 3.552 3.82 3.957 4.218 4.468 4.819 5.033 5.242 5.549 5.859 6.163 6.46 6.751 7.12 7.472 7.818 8.245 8.667 9.098 9.598 10.147 10.683 11.282 11.951 12.675 13.447 14.342 15.376 16.424 17.663 19.065 20.749 22.737 25.223 28.289 32.058 35.142 36.859 37.959 38.647 39.113 39.444 39.676 39.81 39.907 39.953 39.953 39.905 39.811 39.735 39.652 39.537 39.429 39.327 39.2 39.043 38.922 38.802 38.666 38.56 38.432 38.288 38.139 37.961 37.84 37.712 37.503 37.348 37.173 37.085 36.896 36.685 36.469 36.362 36.069 35.984 35.845 35.696 35.351 35.139 34.915 34.695 34.424 34.117 33.711 32.8 -7 ,11388 ,KEBNE ,16749816,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:17:46 CET,0.0 0.506 0.901 1.187 1.418 1.623 1.802 1.976 2.348 2.531 2.704 2.82 3.2 3.355 3.659 3.952 4.228 4.363 4.631 4.891 5.254 5.481 5.693 6.002 6.307 6.615 6.927 7.231 7.617 7.985 8.348 8.784 9.212 9.633 10.122 10.659 11.176 11.768 12.422 13.138 13.89 14.742 15.773 16.852 18.12 19.549 21.268 23.322 25.792 28.754 32.468 35.657 37.56 38.72 39.418 39.857 40.166 40.378 40.489 40.538 40.542 40.52 40.48 40.417 40.341 40.242 40.116 40.001 39.882 39.739 39.58 39.418 39.218 39.019 38.872 38.73 38.585 38.426 38.236 38.095 37.936 37.683 37.531 37.365 37.269 37.063 36.831 36.57 36.44 36.129 36.004 35.847 35.686 35.332 35.138 34.934 34.693 34.402 34.021 33.58 32.256 -8 ,11544 ,KEBNE ,16749817,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:17:17 CET,0.0 0.708 1.074 1.352 1.57 1.775 1.974 2.168 2.534 2.714 2.895 3.035 3.431 3.598 3.903 4.172 4.415 4.54 4.802 5.039 5.381 5.613 5.847 6.195 6.52 6.822 7.112 7.407 7.8 8.173 8.528 8.958 9.4 9.845 10.344 10.915 11.479 12.091 12.74 13.423 14.163 15.03 16.066 17.111 18.354 19.779 21.494 23.499 25.873 28.776 32.455 35.701 37.706 39.012 39.847 40.375 40.686 40.883 41.023 41.101 41.1 41.068 41.005 40.917 40.809 40.7 40.574 40.416 40.285 40.177 40.041 39.903 39.761 39.619 39.485 39.336 39.168 38.994 38.815 38.683 38.543 38.323 38.165 37.993 37.905 37.717 37.508 37.295 37.175 36.853 36.773 36.625 36.457 36.1 35.889 35.645 35.389 35.128 34.794 34.338 33.268 -9 ,26395 ,KEBNE ,16749818,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:17:54 CET,0.0 0.374 0.656 0.892 1.12 1.355 1.564 1.756 2.107 2.276 2.434 2.515 2.878 3.018 3.292 3.574 3.848 3.977 4.217 4.435 4.746 4.95 5.149 5.442 5.727 6.007 6.289 6.571 6.942 7.305 7.658 8.088 8.511 8.932 9.432 9.99 10.541 11.151 11.789 12.471 13.21 14.056 15.06 16.115 17.378 18.786 20.417 22.313 24.683 27.623 31.299 34.477 36.306 37.444 38.211 38.752 39.108 39.339 39.475 39.543 39.573 39.584 39.545 39.468 39.37 39.258 39.128 38.979 38.836 38.701 38.557 38.422 38.263 38.094 37.957 37.806 37.647 37.477 37.292 37.15 36.989 36.725 36.536 36.337 36.236 36.035 35.817 35.584 35.461 35.156 35.048 34.889 34.731 34.372 34.164 33.946 33.718 33.456 33.123 32.67 31.475 -10 ,22509 ,KEBNE ,16749819,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:16:01 CET,0.0 0.338 0.583 0.814 1.014 1.203 1.371 1.53 1.857 2.011 2.15 2.198 2.55 2.68 2.929 3.167 3.402 3.519 3.758 4.008 4.384 4.624 4.855 5.186 5.495 5.788 6.069 6.352 6.727 7.093 7.452 7.898 8.351 8.794 9.305 9.896 10.484 11.151 11.9 12.736 13.594 14.546 15.647 16.71 17.966 19.425 21.181 23.221 25.733 28.839 32.712 35.971 37.914 39.187 40.064 40.677 41.045 41.277 41.391 41.451 41.47 41.44 41.365 41.283 41.213 41.135 41.037 40.941 40.837 40.704 40.561 40.441 40.295 40.139 40.023 39.89 39.752 39.595 39.42 39.295 39.177 38.985 38.832 38.66 38.564 38.374 38.165 37.944 37.842 37.547 37.464 37.319 37.162 36.804 36.587 36.343 36.068 35.78 35.451 35.029 33.979 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index c39caa40..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5119 ,KEBNE ,16749820,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:13:50 CET,0.0 0.369 0.666 0.939 1.216 1.475 1.687 1.892 2.294 2.479 2.671 2.84 3.24 3.411 3.746 4.07 4.373 4.526 4.838 5.144 5.587 5.879 6.159 6.558 6.951 7.343 7.719 8.087 8.575 9.043 9.502 10.074 10.637 11.194 11.862 12.623 13.359 14.19 15.104 16.109 17.188 18.413 19.873 21.387 23.187 25.221 27.685 30.495 33.897 38.255 43.884 48.936 52.105 54.265 55.806 56.97 57.762 58.31 58.722 59.044 59.267 59.445 59.554 59.607 59.635 59.639 59.633 59.608 59.566 59.513 59.444 59.372 59.284 59.184 59.091 58.988 58.87 58.737 58.6 58.501 58.393 58.206 58.056 57.905 57.829 57.656 57.475 57.272 57.155 56.891 56.796 56.653 56.506 56.17 55.989 55.803 55.576 55.288 54.963 54.56 53.42 -2 ,19980 ,KEBNE ,16749821,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:18:00 CET,0.0 0.524 0.819 1.076 1.326 1.552 1.779 2.005 2.424 2.622 2.819 2.973 3.374 3.552 3.904 4.24 4.553 4.708 5.02 5.315 5.741 6.029 6.317 6.744 7.155 7.555 7.95 8.33 8.825 9.322 9.807 10.383 10.941 11.484 12.122 12.841 13.549 14.349 15.222 16.195 17.261 18.479 19.934 21.459 23.256 25.261 27.67 30.482 33.848 38.083 43.721 48.892 52.176 54.389 55.886 56.958 57.793 58.422 58.844 59.159 59.399 59.573 59.69 59.771 59.815 59.837 59.847 59.837 59.797 59.743 59.681 59.618 59.532 59.423 59.322 59.208 59.081 58.942 58.783 58.675 58.573 58.412 58.296 58.155 58.079 57.919 57.74 57.559 57.451 57.154 57.009 56.85 56.685 56.313 56.093 55.844 55.554 55.213 54.869 54.445 53.013 -3 ,23630 ,KEBNE ,16749822,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:19:29 CET,0.0 0.384 0.69 0.959 1.194 1.433 1.67 1.89 2.276 2.47 2.673 2.826 3.211 3.382 3.715 4.037 4.354 4.511 4.812 5.093 5.512 5.792 6.062 6.454 6.835 7.22 7.606 7.987 8.477 8.955 9.429 10.005 10.582 11.153 11.795 12.53 13.263 14.063 14.94 15.904 16.94 18.139 19.56 21.014 22.775 24.809 27.245 30.079 33.587 38.002 43.691 48.952 52.324 54.603 56.178 57.314 58.139 58.751 59.205 59.601 59.896 60.116 60.276 60.371 60.42 60.452 60.454 60.437 60.425 60.39 60.337 60.29 60.223 60.127 60.043 59.945 59.83 59.709 59.574 59.468 59.358 59.164 59.022 58.883 58.803 58.635 58.457 58.256 58.144 57.862 57.757 57.616 57.477 57.161 56.961 56.737 56.487 56.217 55.879 55.447 54.108 -4 ,6931 ,KEBNE ,16749823,Wed Dec 1 21:23:30 CET,Wed Dec 1 23:17:38 CET,0.0 0.462 0.816 1.111 1.39 1.659 1.903 2.126 2.552 2.755 2.955 3.119 3.522 3.703 4.057 4.404 4.741 4.901 5.208 5.515 5.975 6.273 6.558 6.969 7.372 7.774 8.17 8.567 9.089 9.591 10.075 10.654 11.23 11.795 12.451 13.19 13.903 14.698 15.587 16.589 17.672 18.899 20.374 21.898 23.667 25.66 28.064 30.92 34.399 38.732 44.316 49.241 52.354 54.51 56.058 57.211 58.065 58.699 59.15 59.519 59.785 59.98 60.124 60.228 60.299 60.361 60.393 60.392 60.36 60.312 60.255 60.188 60.117 60.035 59.97 59.905 59.803 59.681 59.555 59.459 59.355 59.186 59.056 58.913 58.839 58.679 58.505 58.32 58.215 57.926 57.805 57.652 57.485 57.141 56.924 56.688 56.447 56.15 55.801 55.314 53.97 -5 ,8750 ,KEBNE ,16749824,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:17:03 CET,0.0 0.564 0.917 1.207 1.461 1.677 1.905 2.142 2.565 2.762 2.955 3.114 3.515 3.687 4.027 4.359 4.669 4.817 5.123 5.428 5.866 6.148 6.438 6.856 7.25 7.641 8.015 8.377 8.85 9.304 9.76 10.326 10.876 11.421 12.067 12.808 13.541 14.353 15.242 16.223 17.272 18.464 19.86 21.288 23.015 25.061 27.527 30.448 34.056 38.453 44.0 48.981 52.111 54.241 55.761 56.887 57.686 58.288 58.734 59.097 59.344 59.529 59.678 59.778 59.829 59.858 59.86 59.839 59.799 59.704 59.592 59.495 59.372 59.238 59.124 59.004 58.862 58.701 58.519 58.374 58.233 58.015 57.84 57.663 57.575 57.387 57.21 57.004 56.879 56.585 56.467 56.314 56.143 55.774 55.584 55.363 55.11 54.81 54.416 53.913 52.688 -6 ,9821 ,KEBNE ,16749825,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:17:29 CET,0.0 0.494 0.831 1.112 1.371 1.631 1.89 2.121 2.55 2.757 2.953 3.099 3.495 3.664 3.989 4.302 4.602 4.75 5.044 5.331 5.747 6.018 6.286 6.673 7.067 7.47 7.858 8.229 8.701 9.156 9.598 10.15 10.699 11.25 11.897 12.615 13.316 14.104 14.976 15.947 16.997 18.191 19.633 21.123 22.876 24.858 27.249 30.095 33.516 37.851 43.568 48.62 51.922 54.185 55.769 56.981 57.866 58.525 58.951 59.304 59.565 59.727 59.863 59.984 60.057 60.098 60.118 60.102 60.07 60.034 59.982 59.908 59.811 59.711 59.629 59.528 59.417 59.289 59.143 59.038 58.928 58.747 58.608 58.464 58.384 58.213 58.05 57.88 57.771 57.484 57.361 57.21 57.046 56.661 56.464 56.263 56.025 55.746 55.412 54.97 54.114 -7 ,15224 ,KEBNE ,16749826,Wed Dec 1 21:23:27 CET,Wed Dec 1 23:17:47 CET,0.0 0.486 0.788 1.063 1.311 1.532 1.737 1.93 2.297 2.475 2.651 2.787 3.181 3.353 3.683 3.999 4.303 4.455 4.75 5.023 5.442 5.722 5.998 6.403 6.783 7.146 7.51 7.873 8.365 8.843 9.294 9.851 10.408 10.953 11.593 12.335 13.068 13.904 14.814 15.771 16.787 17.952 19.373 20.882 22.698 24.764 27.205 30.098 33.618 37.95 43.584 48.673 51.885 54.069 55.682 56.882 57.722 58.322 58.763 59.14 59.396 59.601 59.764 59.883 59.965 60.014 60.022 59.99 59.972 59.954 59.91 59.851 59.772 59.693 59.624 59.543 59.461 59.365 59.226 59.124 59.032 58.888 58.78 58.634 58.544 58.382 58.202 57.99 57.878 57.603 57.524 57.384 57.219 56.876 56.701 56.521 56.292 56.009 55.66 55.132 54.007 -8 ,11560 ,KEBNE ,16749827,Wed Dec 1 21:23:29 CET,Wed Dec 1 23:19:24 CET,0.0 0.362 0.668 0.967 1.24 1.466 1.683 1.893 2.291 2.488 2.676 2.806 3.199 3.372 3.713 4.038 4.346 4.493 4.783 5.076 5.496 5.773 6.049 6.454 6.855 7.243 7.62 7.998 8.498 8.981 9.453 10.041 10.619 11.179 11.837 12.588 13.323 14.133 15.025 15.998 17.027 18.201 19.588 21.026 22.791 24.824 27.23 30.016 33.383 37.629 43.138 48.019 51.157 53.354 54.912 56.086 56.911 57.508 57.948 58.339 58.638 58.814 58.903 58.965 59.01 59.03 59.013 58.972 58.921 58.864 58.79 58.711 58.633 58.533 58.445 58.353 58.24 58.116 57.965 57.86 57.752 57.575 57.447 57.297 57.221 57.058 56.876 56.698 56.601 56.336 56.249 56.122 55.978 55.619 55.435 55.239 55.011 54.752 54.446 54.052 52.892 -9 ,9366 ,KEBNE ,16749828,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:17:24 CET,0.0 0.419 0.739 1.038 1.291 1.518 1.736 1.948 2.354 2.551 2.748 2.894 3.292 3.467 3.803 4.124 4.444 4.595 4.894 5.189 5.603 5.877 6.15 6.542 6.926 7.295 7.656 8.02 8.509 8.988 9.443 9.998 10.564 11.111 11.747 12.494 13.219 14.013 14.886 15.845 16.861 18.019 19.419 20.865 22.581 24.568 26.948 29.773 33.147 37.201 42.63 47.636 50.815 52.982 54.502 55.614 56.45 57.07 57.526 57.908 58.16 58.355 58.507 58.619 58.675 58.686 58.665 58.632 58.578 58.499 58.397 58.305 58.219 58.107 58.019 57.93 57.811 57.678 57.531 57.409 57.296 57.124 56.989 56.847 56.768 56.613 56.445 56.257 56.168 55.917 55.832 55.676 55.517 55.177 54.976 54.745 54.484 54.205 53.865 53.398 52.249 -10 ,20441 ,KEBNE ,16749829,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:16:52 CET,0.0 0.323 0.609 0.892 1.164 1.419 1.65 1.856 2.266 2.46 2.65 2.805 3.208 3.391 3.752 4.098 4.433 4.595 4.914 5.215 5.655 5.931 6.203 6.617 7.018 7.404 7.786 8.168 8.664 9.148 9.634 10.235 10.82 11.381 12.017 12.747 13.475 14.285 15.178 16.154 17.196 18.368 19.784 21.268 23.038 25.058 27.462 30.313 33.838 38.22 43.788 48.856 52.088 54.229 55.757 56.889 57.708 58.344 58.812 59.174 59.412 59.597 59.716 59.786 59.842 59.87 59.875 59.864 59.853 59.845 59.797 59.747 59.698 59.595 59.507 59.419 59.307 59.186 59.062 58.98 58.897 58.738 58.616 58.486 58.415 58.254 58.063 57.865 57.766 57.506 57.403 57.241 57.073 56.737 56.553 56.342 56.11 55.858 55.499 55.053 53.619 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt deleted file mode 100644 index a7f6508c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7971 ,KEBNE ,16749830,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:14:20 CET,0.0 0.833 1.123 1.329 1.539 1.72 1.873 2.032 2.347 2.493 2.632 2.715 2.979 3.08 3.291 3.488 3.663 3.744 3.896 4.038 4.242 4.383 4.526 4.731 4.908 5.068 5.223 5.374 5.564 5.745 5.91 6.086 6.266 6.453 6.657 6.869 7.062 7.27 7.479 7.653 7.796 7.954 8.108 8.216 8.291 8.297 8.281 8.209 7.928 7.277 5.786 3.713 1.867 0.211 -1.197 -2.42 -3.513 -4.512 -5.341 -6.175 -6.916 -7.575 -8.189 -8.745 -9.256 -9.736 -10.225 -10.654 -11.03 -11.407 -11.79 -12.111 -12.446 -12.792 -13.065 -13.342 -13.618 -13.909 -14.21 -14.413 -14.629 -14.97 -15.199 -15.435 -15.559 -15.824 -16.097 -16.381 -16.53 -16.869 -17.025 -17.194 -17.374 -17.745 -17.947 -18.181 -18.415 -18.657 -18.933 -19.28 -20.02 -2 ,1233 ,KEBNE ,16749831,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:15:08 CET,0.0 1.117 1.475 1.769 2.047 2.291 2.487 2.662 2.966 3.105 3.228 3.288 3.556 3.667 3.887 4.078 4.234 4.304 4.454 4.605 4.807 4.941 5.067 5.239 5.409 5.577 5.729 5.863 6.043 6.197 6.33 6.497 6.657 6.8 6.961 7.152 7.345 7.536 7.719 7.918 8.128 8.388 8.695 8.929 9.1 9.208 9.216 9.043 8.595 7.707 6.018 3.729 1.78 0.15 -1.254 -2.482 -3.531 -4.513 -5.38 -6.263 -7.037 -7.724 -8.371 -8.96 -9.507 -10.015 -10.535 -10.984 -11.368 -11.786 -12.223 -12.573 -12.919 -13.279 -13.56 -13.848 -14.157 -14.477 -14.802 -15.028 -15.258 -15.616 -15.868 -16.13 -16.262 -16.531 -16.812 -17.102 -17.242 -17.579 -17.72 -17.895 -18.083 -18.472 -18.678 -18.9 -19.14 -19.396 -19.704 -20.12 -21.094 -3 ,2933 ,KEBNE ,16749832,Wed Dec 1 21:23:28 CET,Wed Dec 1 23:14:52 CET,0.0 0.968 1.286 1.517 1.775 2.023 2.244 2.439 2.756 2.882 3.007 3.082 3.354 3.463 3.645 3.801 3.961 4.046 4.195 4.338 4.549 4.674 4.793 4.965 5.133 5.296 5.434 5.574 5.772 5.955 6.135 6.335 6.506 6.651 6.81 7.001 7.168 7.327 7.496 7.669 7.819 7.96 8.104 8.233 8.375 8.484 8.501 8.317 7.876 7.164 5.769 3.84 2.176 0.716 -0.544 -1.66 -2.747 -3.761 -4.6 -5.444 -6.143 -6.754 -7.336 -7.899 -8.413 -8.858 -9.331 -9.765 -10.129 -10.51 -10.927 -11.273 -11.628 -11.998 -12.299 -12.623 -12.943 -13.253 -13.577 -13.802 -14.032 -14.379 -14.618 -14.871 -14.997 -15.249 -15.516 -15.81 -15.966 -16.308 -16.469 -16.657 -16.847 -17.244 -17.472 -17.718 -17.964 -18.234 -18.56 -18.953 -20.024 -4 ,24746 ,KEBNE ,16749833,Wed Dec 1 21:23:29 CET,Wed Dec 1 23:12:44 CET,0.0 0.752 1.033 1.242 1.466 1.663 1.83 1.989 2.286 2.419 2.537 2.599 2.862 2.959 3.149 3.332 3.494 3.571 3.729 3.891 4.123 4.259 4.384 4.568 4.761 4.944 5.112 5.267 5.443 5.597 5.755 5.958 6.139 6.3 6.486 6.692 6.891 7.085 7.268 7.477 7.656 7.841 8.057 8.207 8.321 8.369 8.376 8.289 7.93 7.129 5.656 3.606 1.691 0.018 -1.429 -2.724 -3.836 -4.84 -5.692 -6.533 -7.255 -7.878 -8.49 -9.042 -9.54 -10.01 -10.515 -10.973 -11.363 -11.77 -12.188 -12.534 -12.889 -13.263 -13.55 -13.837 -14.126 -14.441 -14.778 -14.996 -15.215 -15.569 -15.82 -16.072 -16.204 -16.478 -16.752 -17.035 -17.185 -17.528 -17.668 -17.844 -18.03 -18.431 -18.658 -18.903 -19.177 -19.478 -19.815 -20.236 -21.005 -5 ,1033 ,KEBNE ,16749834,Wed Dec 1 21:25:36 CET,Wed Dec 1 23:17:04 CET,0.0 0.865 1.198 1.454 1.671 1.836 1.991 2.156 2.441 2.569 2.686 2.727 2.986 3.096 3.291 3.473 3.659 3.741 3.891 4.037 4.257 4.403 4.54 4.726 4.893 5.05 5.199 5.338 5.52 5.697 5.859 6.025 6.164 6.302 6.481 6.698 6.9 7.101 7.295 7.488 7.658 7.79 7.905 8.011 8.08 8.105 8.076 7.893 7.533 6.806 5.247 3.183 1.383 -0.198 -1.604 -2.899 -4.005 -4.971 -5.813 -6.639 -7.318 -7.931 -8.526 -9.078 -9.592 -10.066 -10.545 -10.977 -11.357 -11.737 -12.126 -12.452 -12.795 -13.145 -13.413 -13.692 -13.992 -14.3 -14.612 -14.829 -15.051 -15.399 -15.639 -15.879 -16.005 -16.274 -16.541 -16.822 -16.977 -17.318 -17.433 -17.598 -17.788 -18.203 -18.415 -18.637 -18.878 -19.129 -19.398 -19.74 -20.457 -6 ,22233 ,KEBNE ,16749835,Wed Dec 1 21:25:36 CET,Wed Dec 1 23:15:53 CET,0.0 0.786 1.12 1.397 1.62 1.818 2.007 2.188 2.497 2.627 2.75 2.827 3.101 3.206 3.401 3.593 3.772 3.859 4.016 4.153 4.374 4.517 4.647 4.843 5.017 5.173 5.319 5.467 5.658 5.83 5.973 6.155 6.344 6.517 6.706 6.913 7.114 7.288 7.431 7.585 7.741 7.882 8.055 8.23 8.333 8.317 8.175 7.885 7.298 6.249 4.452 2.104 0.12 -1.592 -3.102 -4.393 -5.452 -6.386 -7.227 -8.056 -8.744 -9.358 -9.944 -10.493 -11.013 -11.479 -11.957 -12.374 -12.722 -13.085 -13.46 -13.76 -14.068 -14.398 -14.664 -14.957 -15.265 -15.572 -15.886 -16.108 -16.336 -16.687 -16.927 -17.172 -17.298 -17.563 -17.847 -18.14 -18.288 -18.616 -18.746 -18.922 -19.105 -19.47 -19.674 -19.917 -20.176 -20.458 -20.794 -21.17 -21.915 -7 ,31841 ,KEBNE ,16749836,Wed Dec 1 21:28:48 CET,Wed Dec 1 23:20:28 CET,0.0 0.859 1.196 1.469 1.724 1.94 2.126 2.296 2.593 2.736 2.862 2.961 3.251 3.357 3.549 3.721 3.883 3.953 4.081 4.212 4.425 4.562 4.686 4.853 5.006 5.151 5.29 5.433 5.612 5.759 5.886 6.028 6.153 6.283 6.43 6.584 6.744 6.899 7.041 7.183 7.311 7.428 7.528 7.619 7.667 7.621 7.542 7.34 6.902 6.128 4.54 2.371 0.551 -1.0 -2.376 -3.621 -4.699 -5.655 -6.446 -7.247 -7.966 -8.602 -9.207 -9.778 -10.285 -10.744 -11.226 -11.656 -12.017 -12.378 -12.768 -13.097 -13.436 -13.775 -14.037 -14.319 -14.61 -14.907 -15.199 -15.392 -15.596 -15.924 -16.149 -16.391 -16.516 -16.773 -17.052 -17.334 -17.476 -17.808 -17.951 -18.124 -18.317 -18.722 -18.931 -19.154 -19.397 -19.653 -19.957 -20.354 -21.261 -8 ,17583 ,KEBNE ,16749837,Wed Dec 1 21:28:48 CET,Wed Dec 1 23:19:05 CET,0.0 0.66 1.043 1.366 1.62 1.826 1.99 2.135 2.398 2.512 2.623 2.694 2.96 3.057 3.244 3.403 3.551 3.624 3.77 3.904 4.085 4.204 4.312 4.466 4.61 4.768 4.917 5.041 5.189 5.327 5.465 5.633 5.777 5.893 6.02 6.171 6.316 6.463 6.607 6.746 6.892 7.002 7.073 7.141 7.173 7.154 7.063 6.864 6.448 5.619 4.101 2.056 0.247 -1.286 -2.588 -3.762 -4.766 -5.635 -6.411 -7.197 -7.855 -8.445 -9.013 -9.562 -10.068 -10.514 -10.993 -11.435 -11.816 -12.2 -12.6 -12.948 -13.297 -13.656 -13.94 -14.226 -14.524 -14.835 -15.163 -15.389 -15.608 -15.94 -16.179 -16.435 -16.561 -16.8 -17.058 -17.33 -17.473 -17.808 -17.952 -18.123 -18.301 -18.667 -18.876 -19.109 -19.347 -19.614 -19.921 -20.297 -21.256 -9 ,27386 ,KEBNE ,16749838,Wed Dec 1 21:28:48 CET,Wed Dec 1 23:19:08 CET,0.0 0.849 1.282 1.585 1.822 2.028 2.211 2.376 2.652 2.784 2.909 2.976 3.244 3.344 3.545 3.735 3.92 4.009 4.171 4.326 4.556 4.696 4.827 5.021 5.21 5.38 5.53 5.676 5.858 6.021 6.18 6.381 6.573 6.733 6.891 7.048 7.196 7.365 7.519 7.651 7.778 7.906 8.02 8.096 8.131 8.098 7.991 7.766 7.299 6.396 4.794 2.761 0.988 -0.544 -1.924 -3.218 -4.362 -5.41 -6.325 -7.225 -8.009 -8.718 -9.385 -10.004 -10.542 -11.017 -11.512 -11.961 -12.358 -12.77 -13.185 -13.531 -13.904 -14.29 -14.594 -14.904 -15.22 -15.547 -15.875 -16.098 -16.325 -16.666 -16.906 -17.174 -17.319 -17.608 -17.887 -18.185 -18.349 -18.706 -18.869 -19.04 -19.225 -19.659 -19.909 -20.181 -20.465 -20.747 -21.055 -21.444 -22.633 -10 ,11155 ,KEBNE ,16749839,Wed Dec 1 21:28:48 CET,Wed Dec 1 23:18:48 CET,0.0 1.347 1.653 1.899 2.105 2.291 2.461 2.623 2.925 3.074 3.217 3.318 3.6 3.702 3.89 4.076 4.279 4.369 4.527 4.673 4.861 4.97 5.069 5.205 5.352 5.497 5.623 5.742 5.891 6.035 6.18 6.344 6.492 6.628 6.767 6.905 7.039 7.183 7.314 7.416 7.515 7.619 7.691 7.711 7.691 7.64 7.514 7.277 6.856 6.078 4.481 2.289 0.422 -1.126 -2.439 -3.656 -4.775 -5.8 -6.693 -7.61 -8.365 -8.998 -9.618 -10.223 -10.769 -11.25 -11.739 -12.163 -12.547 -12.938 -13.329 -13.66 -14.004 -14.376 -14.665 -14.959 -15.259 -15.553 -15.86 -16.075 -16.295 -16.649 -16.903 -17.17 -17.303 -17.568 -17.839 -18.116 -18.263 -18.602 -18.748 -18.918 -19.1 -19.514 -19.742 -19.982 -20.229 -20.502 -20.82 -21.195 -22.585 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt deleted file mode 100644 index 1c7ebdbd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11155 ,KEBNE ,16749840,Wed Dec 1 21:28:48 CET,Wed Dec 1 23:18:21 CET,0.0 0.696 1.049 1.31 1.522 1.738 1.945 2.134 2.458 2.6 2.735 2.82 3.094 3.207 3.428 3.619 3.787 3.864 4.014 4.15 4.352 4.486 4.591 4.74 4.901 5.048 5.19 5.326 5.489 5.659 5.825 6.015 6.188 6.336 6.491 6.658 6.798 6.94 7.083 7.228 7.361 7.475 7.581 7.644 7.66 7.621 7.534 7.317 6.816 5.889 4.242 2.117 0.175 -1.518 -2.944 -4.149 -5.168 -6.075 -6.823 -7.575 -8.241 -8.821 -9.357 -9.86 -10.338 -10.783 -11.249 -11.662 -12.017 -12.378 -12.742 -13.041 -13.362 -13.699 -13.954 -14.206 -14.456 -14.707 -14.963 -15.145 -15.326 -15.61 -15.827 -16.065 -16.185 -16.436 -16.694 -16.945 -17.075 -17.386 -17.492 -17.639 -17.782 -18.133 -18.334 -18.537 -18.751 -18.976 -19.218 -19.551 -20.012 -2 ,27597 ,KEBNE ,16749841,Wed Dec 1 21:28:48 CET,Wed Dec 1 23:19:02 CET,0.0 0.587 0.869 1.073 1.257 1.432 1.6 1.753 1.997 2.108 2.219 2.259 2.522 2.618 2.798 2.954 3.09 3.165 3.317 3.462 3.672 3.807 3.94 4.122 4.289 4.441 4.582 4.721 4.91 5.079 5.218 5.379 5.536 5.678 5.833 5.995 6.13 6.261 6.4 6.532 6.657 6.795 6.93 7.036 7.125 7.137 7.07 6.883 6.433 5.578 3.963 1.837 0.005 -1.474 -2.733 -3.911 -4.947 -5.879 -6.683 -7.461 -8.127 -8.738 -9.316 -9.852 -10.336 -10.774 -11.236 -11.638 -11.987 -12.352 -12.741 -13.076 -13.407 -13.747 -14.018 -14.286 -14.552 -14.851 -15.165 -15.374 -15.593 -15.944 -16.17 -16.388 -16.511 -16.769 -17.029 -17.299 -17.442 -17.763 -17.893 -18.06 -18.229 -18.604 -18.797 -18.992 -19.215 -19.477 -19.77 -20.098 -20.748 -3 ,4590 ,KEBNE ,16749842,Wed Dec 1 21:32:00 CET,Wed Dec 1 23:23:20 CET,0.0 0.716 0.985 1.226 1.435 1.629 1.814 1.982 2.264 2.386 2.508 2.563 2.829 2.936 3.133 3.321 3.495 3.575 3.72 3.848 4.035 4.163 4.277 4.43 4.585 4.74 4.881 5.024 5.201 5.346 5.49 5.666 5.837 6.017 6.231 6.446 6.619 6.773 6.911 7.04 7.163 7.309 7.429 7.487 7.524 7.529 7.459 7.231 6.737 5.833 4.143 1.957 0.113 -1.498 -2.896 -4.124 -5.209 -6.19 -7.044 -7.906 -8.625 -9.254 -9.847 -10.392 -10.902 -11.376 -11.87 -12.306 -12.679 -13.062 -13.453 -13.764 -14.085 -14.43 -14.699 -14.971 -15.249 -15.534 -15.821 -16.025 -16.243 -16.576 -16.815 -17.061 -17.184 -17.427 -17.671 -17.952 -18.101 -18.429 -18.56 -18.716 -18.881 -19.254 -19.458 -19.676 -19.9 -20.138 -20.398 -20.72 -21.25 -4 ,15111 ,KEBNE ,16749843,Wed Dec 1 21:32:00 CET,Wed Dec 1 23:23:24 CET,0.0 0.534 0.863 1.147 1.387 1.569 1.721 1.863 2.142 2.267 2.386 2.457 2.724 2.824 3.013 3.188 3.355 3.433 3.586 3.736 3.947 4.078 4.207 4.386 4.548 4.7 4.848 4.993 5.17 5.326 5.47 5.638 5.797 5.945 6.115 6.267 6.388 6.536 6.671 6.804 6.957 7.102 7.227 7.321 7.376 7.379 7.302 6.98 6.328 5.349 3.691 1.476 -0.563 -2.282 -3.687 -4.888 -5.912 -6.866 -7.721 -8.56 -9.266 -9.903 -10.51 -11.059 -11.565 -12.029 -12.513 -12.943 -13.302 -13.668 -14.057 -14.386 -14.716 -15.066 -15.346 -15.629 -15.916 -16.216 -16.527 -16.739 -16.957 -17.291 -17.523 -17.763 -17.883 -18.132 -18.391 -18.667 -18.814 -19.139 -19.278 -19.447 -19.614 -19.944 -20.144 -20.378 -20.616 -20.867 -21.145 -21.446 -22.063 -5 ,29586 ,KEBNE ,16749844,Wed Dec 1 21:32:00 CET,Wed Dec 1 23:22:15 CET,0.0 0.795 1.118 1.368 1.58 1.771 1.933 2.085 2.365 2.495 2.62 2.692 2.95 3.046 3.214 3.394 3.586 3.665 3.81 3.955 4.144 4.269 4.384 4.535 4.691 4.831 4.966 5.11 5.293 5.456 5.607 5.791 5.95 6.094 6.261 6.44 6.6 6.755 6.947 7.142 7.263 7.38 7.539 7.659 7.724 7.733 7.646 7.461 7.062 6.288 4.743 2.794 1.07 -0.511 -1.843 -3.039 -4.15 -5.161 -5.992 -6.81 -7.53 -8.178 -8.802 -9.379 -9.894 -10.383 -10.912 -11.379 -11.773 -12.168 -12.567 -12.895 -13.237 -13.583 -13.856 -14.15 -14.444 -14.74 -15.061 -15.294 -15.529 -15.891 -16.147 -16.405 -16.535 -16.795 -17.08 -17.392 -17.546 -17.88 -18.018 -18.172 -18.329 -18.685 -18.89 -19.11 -19.335 -19.588 -19.87 -20.2 -20.882 -6 ,14785 ,KEBNE ,16749845,Wed Dec 1 21:32:00 CET,Wed Dec 1 23:23:06 CET,0.0 0.585 0.893 1.123 1.351 1.574 1.771 1.938 2.209 2.337 2.461 2.529 2.792 2.891 3.074 3.251 3.426 3.507 3.657 3.781 3.944 4.044 4.145 4.303 4.451 4.596 4.734 4.858 5.029 5.202 5.362 5.528 5.671 5.799 5.928 6.091 6.277 6.45 6.584 6.714 6.851 6.972 7.082 7.177 7.222 7.149 6.95 6.686 6.272 5.454 3.864 1.874 0.116 -1.445 -2.81 -3.994 -5.064 -6.046 -6.89 -7.759 -8.484 -9.127 -9.724 -10.267 -10.774 -11.243 -11.75 -12.218 -12.601 -12.982 -13.379 -13.706 -14.042 -14.384 -14.646 -14.919 -15.218 -15.532 -15.85 -16.061 -16.273 -16.599 -16.832 -17.081 -17.205 -17.467 -17.731 -17.994 -18.133 -18.451 -18.586 -18.737 -18.897 -19.283 -19.503 -19.742 -19.985 -20.236 -20.515 -20.808 -21.324 -7 ,14167 ,KEBNE ,16749846,Wed Dec 1 21:32:00 CET,Wed Dec 1 23:22:40 CET,0.0 0.477 0.805 0.999 1.156 1.306 1.448 1.591 1.841 1.951 2.058 2.107 2.354 2.432 2.589 2.749 2.91 2.989 3.143 3.291 3.485 3.591 3.691 3.854 4.014 4.153 4.292 4.424 4.581 4.731 4.868 5.033 5.179 5.32 5.484 5.65 5.785 5.91 6.052 6.181 6.307 6.442 6.577 6.696 6.768 6.786 6.684 6.45 6.005 5.064 3.296 1.087 -0.775 -2.357 -3.759 -4.981 -6.036 -7.017 -7.838 -8.647 -9.343 -9.956 -10.536 -11.092 -11.593 -12.041 -12.519 -12.931 -13.283 -13.649 -14.018 -14.322 -14.638 -14.971 -15.227 -15.498 -15.782 -16.063 -16.35 -16.546 -16.742 -17.047 -17.261 -17.494 -17.612 -17.844 -18.086 -18.338 -18.47 -18.781 -18.869 -19.017 -19.167 -19.477 -19.648 -19.825 -20.038 -20.304 -20.578 -20.851 -21.182 -8 ,8699 ,KEBNE ,16749847,Wed Dec 1 21:37:16 CET,Wed Dec 1 23:28:17 CET,0.0 0.535 0.872 1.109 1.298 1.483 1.662 1.826 2.116 2.249 2.384 2.445 2.707 2.808 2.997 3.176 3.355 3.441 3.588 3.717 3.904 4.03 4.145 4.288 4.427 4.562 4.69 4.815 4.978 5.124 5.264 5.442 5.604 5.753 5.929 6.116 6.28 6.456 6.637 6.818 6.977 7.108 7.217 7.311 7.373 7.374 7.307 7.122 6.692 5.804 4.123 2.014 0.173 -1.433 -2.842 -4.092 -5.161 -6.12 -6.952 -7.782 -8.454 -9.072 -9.692 -10.268 -10.774 -11.236 -11.735 -12.174 -12.547 -12.926 -13.305 -13.617 -13.935 -14.257 -14.512 -14.766 -15.025 -15.302 -15.591 -15.802 -16.02 -16.336 -16.556 -16.79 -16.91 -17.146 -17.39 -17.644 -17.774 -18.104 -18.259 -18.431 -18.61 -18.99 -19.185 -19.388 -19.618 -19.867 -20.146 -20.459 -20.934 -9 ,10076 ,KEBNE ,16749848,Wed Dec 1 21:37:16 CET,Wed Dec 1 23:27:18 CET,0.0 0.668 0.984 1.233 1.459 1.657 1.812 1.956 2.257 2.384 2.506 2.566 2.817 2.909 3.093 3.259 3.411 3.484 3.621 3.755 3.935 4.048 4.148 4.29 4.448 4.597 4.732 4.856 5.01 5.16 5.311 5.493 5.667 5.816 5.972 6.163 6.332 6.486 6.648 6.793 6.925 7.066 7.199 7.28 7.305 7.252 7.119 6.838 6.301 5.441 3.753 1.484 -0.369 -1.936 -3.338 -4.617 -5.706 -6.672 -7.483 -8.295 -9.004 -9.631 -10.241 -10.806 -11.315 -11.792 -12.277 -12.704 -13.08 -13.471 -13.893 -14.245 -14.595 -14.951 -15.217 -15.49 -15.779 -16.083 -16.398 -16.616 -16.833 -17.161 -17.396 -17.64 -17.759 -18.001 -18.264 -18.546 -18.694 -19.019 -19.16 -19.336 -19.511 -19.872 -20.07 -20.281 -20.523 -20.794 -21.099 -21.475 -22.176 -10 ,10306 ,KEBNE ,16749849,Wed Dec 1 21:42:37 CET,Wed Dec 1 23:29:00 CET,0.0 0.688 0.997 1.276 1.536 1.761 1.964 2.157 2.479 2.619 2.748 2.833 3.108 3.212 3.402 3.577 3.75 3.83 3.977 4.104 4.274 4.378 4.485 4.646 4.79 4.923 5.035 5.142 5.3 5.454 5.592 5.732 5.844 5.949 6.072 6.201 6.328 6.454 6.559 6.659 6.753 6.872 7.01 7.123 7.239 7.29 7.191 6.998 6.662 5.867 4.171 2.025 0.263 -1.216 -2.529 -3.707 -4.729 -5.648 -6.437 -7.28 -8.011 -8.607 -9.181 -9.728 -10.211 -10.661 -11.13 -11.528 -11.873 -12.244 -12.635 -12.958 -13.289 -13.638 -13.913 -14.184 -14.462 -14.748 -15.044 -15.263 -15.493 -15.835 -16.071 -16.317 -16.443 -16.691 -16.956 -17.245 -17.393 -17.72 -17.87 -18.042 -18.198 -18.528 -18.723 -18.925 -19.145 -19.426 -19.739 -20.048 -20.694 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt deleted file mode 100644 index 66e68d2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25818 ,KEBNE ,16749850,Wed Dec 1 21:42:37 CET,Wed Dec 1 23:32:21 CET,0.0 0.632 1.094 1.51 1.913 2.299 2.675 3.026 3.654 3.962 4.266 4.5 5.127 5.399 5.952 6.495 7.01 7.26 7.762 8.258 8.968 9.422 9.872 10.533 11.176 11.821 12.46 13.095 13.933 14.753 15.566 16.58 17.563 18.521 19.666 20.971 22.252 23.667 25.193 26.877 28.691 30.811 33.392 36.077 39.365 43.152 47.686 53.099 59.914 68.595 80.157 91.123 98.48 103.745 107.666 110.742 113.146 115.075 116.571 117.913 118.982 119.888 120.67 121.35 121.928 122.42 122.905 123.307 123.634 123.957 124.261 124.485 124.696 124.885 125.019 125.149 125.276 125.402 125.504 125.553 125.606 125.671 125.704 125.736 125.746 125.758 125.763 125.759 125.75 125.509 125.668 125.633 125.595 125.501 125.448 125.38 125.296 125.193 125.078 124.922 124.634 -2 ,3112 ,KEBNE ,16749851,Wed Dec 1 21:43:44 CET,Wed Dec 1 23:34:37 CET,0.0 0.716 1.135 1.52 1.879 2.225 2.58 2.929 3.56 3.864 4.16 4.372 4.99 5.262 5.794 6.301 6.8 7.051 7.548 8.041 8.755 9.215 9.665 10.323 10.976 11.644 12.311 12.962 13.827 14.668 15.488 16.497 17.472 18.425 19.539 20.805 22.046 23.461 25.049 26.768 28.618 30.754 33.33 36.037 39.306 43.063 47.596 53.023 59.829 68.466 79.87 90.767 98.151 103.372 107.279 110.338 112.693 114.655 116.223 117.629 118.728 119.64 120.463 121.183 121.777 122.264 122.739 123.141 123.463 123.771 124.058 124.276 124.496 124.715 124.866 125.001 125.119 125.221 125.31 125.364 125.408 125.47 125.52 125.558 125.572 125.593 125.592 125.583 125.572 125.332 125.501 125.467 125.434 125.347 125.289 125.22 125.135 125.046 124.94 124.769 124.409 -3 ,23060 ,KEBNE ,16749852,Wed Dec 1 21:47:00 CET,Wed Dec 1 23:39:02 CET,0.0 0.742 1.264 1.721 2.144 2.524 2.864 3.201 3.837 4.138 4.425 4.625 5.246 5.511 6.032 6.536 7.018 7.261 7.746 8.212 8.899 9.348 9.796 10.452 11.098 11.736 12.37 12.986 13.781 14.57 15.353 16.323 17.274 18.206 19.304 20.563 21.794 23.2 24.76 26.438 28.271 30.418 33.0 35.672 38.917 42.735 47.351 52.813 59.605 68.318 80.037 91.075 98.489 103.849 107.886 111.091 113.593 115.615 117.208 118.694 119.888 120.816 121.597 122.294 122.884 123.377 123.847 124.234 124.548 124.854 125.141 125.357 125.569 125.771 125.917 126.052 126.162 126.262 126.361 126.421 126.477 126.551 126.601 126.642 126.657 126.681 126.691 126.681 126.671 126.434 126.612 126.592 126.564 126.465 126.402 126.331 126.244 126.133 125.994 125.839 125.545 -4 ,21332 ,KEBNE ,16749853,Wed Dec 1 21:47:00 CET,Wed Dec 1 23:40:01 CET,0.0 0.634 1.101 1.503 1.863 2.217 2.561 2.878 3.447 3.734 4.034 4.249 4.869 5.138 5.668 6.187 6.693 6.939 7.418 7.879 8.572 9.028 9.474 10.132 10.781 11.42 12.05 12.673 13.498 14.304 15.086 16.047 16.998 17.952 19.077 20.354 21.609 23.018 24.567 26.248 28.074 30.206 32.763 35.443 38.689 42.443 47.069 52.61 59.452 68.127 79.804 90.859 98.38 103.869 107.911 111.069 113.504 115.469 117.026 118.467 119.638 120.613 121.465 122.177 122.769 123.268 123.743 124.123 124.421 124.7 124.946 125.13 125.313 125.502 125.641 125.77 125.893 126.006 126.101 126.153 126.194 126.246 126.281 126.312 126.32 126.321 126.318 126.306 126.292 126.056 126.238 126.206 126.159 126.048 125.988 125.912 125.807 125.7 125.56 125.374 125.066 -5 ,5343 ,KEBNE ,16749854,Wed Dec 1 21:47:00 CET,Wed Dec 1 23:38:53 CET,0.0 0.775 1.289 1.718 2.09 2.437 2.775 3.097 3.699 3.992 4.28 4.483 5.11 5.384 5.897 6.403 6.9 7.141 7.617 8.086 8.778 9.225 9.668 10.335 10.985 11.614 12.241 12.871 13.697 14.497 15.284 16.248 17.202 18.146 19.249 20.518 21.778 23.182 24.747 26.463 28.304 30.42 32.92 35.539 38.773 42.511 47.036 52.448 59.227 67.927 79.643 90.645 97.939 103.237 107.268 110.46 112.949 114.99 116.611 118.082 119.234 120.169 120.931 121.578 122.138 122.599 123.064 123.463 123.779 124.079 124.371 124.593 124.802 125.007 125.158 125.298 125.433 125.552 125.639 125.693 125.753 125.82 125.851 125.888 125.905 125.933 125.955 125.962 125.961 125.731 125.912 125.893 125.865 125.784 125.736 125.675 125.598 125.51 125.4 125.217 124.931 -6 ,18890 ,KEBNE ,16749855,Wed Dec 1 21:47:00 CET,Wed Dec 1 23:39:33 CET,0.0 0.584 1.053 1.473 1.835 2.176 2.519 2.846 3.442 3.728 4.012 4.22 4.834 5.102 5.62 6.133 6.643 6.888 7.373 7.848 8.547 8.991 9.422 10.069 10.717 11.367 11.994 12.595 13.39 14.19 14.977 15.942 16.901 17.849 18.975 20.269 21.521 22.921 24.472 26.181 28.039 30.17 32.723 35.373 38.619 42.435 47.037 52.493 59.309 67.972 79.454 90.371 97.719 102.997 106.902 109.997 112.416 114.361 115.881 117.263 118.355 119.238 120.01 120.666 121.235 121.721 122.176 122.549 122.843 123.134 123.427 123.636 123.821 124.006 124.138 124.265 124.385 124.491 124.59 124.653 124.716 124.792 124.824 124.845 124.857 124.878 124.885 124.88 124.872 124.638 124.808 124.772 124.739 124.64 124.572 124.495 124.416 124.328 124.2 124.005 123.717 -7 ,14653 ,KEBNE ,16749856,Wed Dec 1 21:47:00 CET,Wed Dec 1 23:39:00 CET,0.0 0.71 1.209 1.621 1.974 2.301 2.617 2.934 3.573 3.864 4.14 4.338 4.955 5.216 5.712 6.204 6.696 6.936 7.417 7.889 8.567 9.004 9.438 10.084 10.728 11.364 11.99 12.593 13.381 14.171 14.943 15.884 16.823 17.751 18.841 20.09 21.329 22.726 24.258 25.925 27.748 29.865 32.435 35.126 38.339 42.085 46.665 52.118 58.918 67.558 79.068 90.122 97.637 103.041 107.078 110.255 112.706 114.706 116.26 117.628 118.707 119.603 120.401 121.105 121.72 122.246 122.739 123.155 123.495 123.804 124.095 124.329 124.551 124.76 124.912 125.059 125.21 125.352 125.463 125.519 125.567 125.646 125.697 125.739 125.758 125.781 125.776 125.746 125.725 125.48 125.651 125.622 125.582 125.479 125.421 125.358 125.29 125.208 125.095 124.942 124.569 -8 ,16467 ,KEBNE ,16749857,Wed Dec 1 21:47:00 CET,Wed Dec 1 23:40:16 CET,0.0 0.588 1.02 1.431 1.807 2.159 2.493 2.805 3.412 3.708 3.991 4.199 4.815 5.078 5.605 6.125 6.62 6.863 7.344 7.81 8.497 8.951 9.402 10.079 10.738 11.371 11.986 12.596 13.415 14.233 15.028 15.992 16.943 17.882 18.991 20.274 21.536 22.943 24.503 26.206 28.053 30.174 32.733 35.402 38.621 42.385 46.958 52.418 59.232 67.971 79.828 90.981 98.382 103.714 107.62 110.647 113.019 114.964 116.498 117.877 118.942 119.808 120.581 121.251 121.816 122.281 122.715 123.085 123.402 123.718 124.016 124.226 124.419 124.618 124.755 124.883 125.014 125.125 125.218 125.271 125.317 125.383 125.416 125.439 125.446 125.446 125.433 125.417 125.404 125.171 125.341 125.31 125.271 125.17 125.106 125.031 124.949 124.825 124.641 124.439 124.076 -9 ,6045 ,KEBNE ,16749858,Wed Dec 1 21:47:00 CET,Wed Dec 1 23:38:25 CET,0.0 0.647 1.095 1.488 1.846 2.192 2.531 2.855 3.48 3.782 4.071 4.272 4.888 5.162 5.705 6.227 6.742 6.999 7.492 7.967 8.68 9.153 9.613 10.282 10.945 11.61 12.261 12.893 13.719 14.535 15.34 16.317 17.264 18.187 19.279 20.549 21.803 23.194 24.75 26.466 28.295 30.417 32.993 35.681 38.947 42.73 47.29 52.756 59.57 68.241 79.996 91.153 98.581 103.94 107.947 111.107 113.584 115.554 117.054 118.434 119.545 120.458 121.247 121.923 122.517 123.019 123.501 123.915 124.247 124.554 124.852 125.093 125.323 125.528 125.669 125.806 125.925 126.029 126.137 126.195 126.237 126.289 126.311 126.328 126.337 126.34 126.335 126.335 126.329 126.09 126.254 126.231 126.211 126.119 126.06 126.005 125.934 125.838 125.738 125.573 125.221 -10 ,8520 ,KEBNE ,16749859,Wed Dec 1 21:47:00 CET,Wed Dec 1 23:39:47 CET,0.0 0.635 1.086 1.491 1.848 2.188 2.532 2.867 3.485 3.776 4.063 4.278 4.892 5.154 5.677 6.187 6.689 6.935 7.411 7.875 8.57 9.025 9.472 10.139 10.805 11.472 12.127 12.759 13.586 14.395 15.186 16.143 17.101 18.071 19.212 20.521 21.823 23.266 24.829 26.534 28.386 30.54 33.174 35.948 39.268 43.132 47.785 53.182 59.89 68.517 80.094 91.056 98.345 103.649 107.606 110.672 113.081 115.033 116.543 117.921 119.019 119.905 120.65 121.311 121.894 122.371 122.827 123.201 123.5 123.783 124.057 124.282 124.496 124.701 124.848 124.993 125.129 125.249 125.378 125.451 125.505 125.576 125.61 125.631 125.637 125.647 125.666 125.664 125.649 125.413 125.577 125.547 125.51 125.39 125.303 125.204 125.099 124.974 124.818 124.597 124.275 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 973d75e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23709 ,KEBNE ,16749860,Wed Dec 1 21:47:00 CET,Wed Dec 1 23:37:27 CET,0.0 0.471 0.902 1.33 1.711 2.051 2.385 2.721 3.369 3.685 4.008 4.298 4.957 5.266 5.875 6.465 7.03 7.306 7.852 8.398 9.21 9.736 10.257 11.033 11.8 12.562 13.314 14.057 15.046 16.03 17.016 18.236 19.441 20.632 22.041 23.691 25.329 27.171 29.231 31.479 33.905 36.745 40.198 43.825 48.259 53.422 59.731 67.378 77.07 89.543 106.457 122.707 133.835 142.037 148.194 153.066 156.907 160.071 162.561 164.853 166.688 168.192 169.542 170.755 171.803 172.673 173.503 174.203 174.77 175.32 175.855 176.267 176.663 177.043 177.331 177.597 177.844 178.104 178.353 178.497 178.623 178.795 178.909 179.005 179.043 179.11 179.174 179.239 179.263 179.129 179.309 179.28 179.242 179.139 179.057 178.969 178.858 178.699 178.498 178.208 177.26 -2 ,30550 ,KEBNE ,16749861,Wed Dec 1 21:47:00 CET,Wed Dec 1 23:37:23 CET,0.0 0.638 1.058 1.471 1.856 2.224 2.586 2.939 3.621 3.95 4.274 4.56 5.223 5.524 6.098 6.663 7.227 7.504 8.064 8.627 9.464 10.012 10.548 11.339 12.12 12.887 13.644 14.402 15.414 16.409 17.384 18.597 19.796 20.982 22.393 24.011 25.617 27.448 29.49 31.726 34.152 36.974 40.404 44.01 48.406 53.567 59.826 67.378 76.928 89.311 106.317 122.65 133.778 141.904 148.061 152.998 156.871 160.042 162.541 164.829 166.663 168.184 169.533 170.702 171.706 172.561 173.395 174.092 174.66 175.215 175.735 176.141 176.558 176.956 177.235 177.499 177.747 177.985 178.211 178.361 178.506 178.693 178.801 178.903 178.952 179.04 179.115 179.172 179.192 179.04 179.206 179.19 179.168 179.099 179.034 178.944 178.814 178.66 178.445 178.111 177.417 -3 ,26347 ,KEBNE ,16749862,Wed Dec 1 21:47:00 CET,Wed Dec 1 23:37:21 CET,0.0 0.731 1.172 1.567 1.947 2.293 2.625 2.959 3.639 3.965 4.27 4.525 5.166 5.454 6.032 6.615 7.185 7.463 8.005 8.54 9.341 9.87 10.394 11.165 11.927 12.693 13.447 14.196 15.2 16.182 17.147 18.342 19.519 20.691 22.088 23.698 25.288 27.092 29.098 31.314 33.742 36.561 40.001 43.613 48.045 53.269 59.592 67.217 76.854 89.254 106.197 122.571 133.774 142.007 148.308 153.34 157.262 160.457 163.017 165.401 167.265 168.809 170.195 171.415 172.474 173.378 174.275 175.022 175.626 176.218 176.787 177.225 177.65 178.069 178.368 178.645 178.914 179.173 179.409 179.558 179.705 179.913 180.047 180.16 180.209 180.307 180.37 180.396 180.4 180.226 180.323 180.283 180.242 180.152 180.098 180.041 179.956 179.826 179.653 179.306 178.325 -4 ,18924 ,KEBNE ,16749863,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:45:49 CET,0.0 0.505 0.942 1.346 1.735 2.104 2.462 2.798 3.448 3.767 4.095 4.378 5.026 5.325 5.937 6.538 7.119 7.403 7.961 8.499 9.295 9.831 10.378 11.184 11.962 12.735 13.508 14.277 15.295 16.279 17.257 18.485 19.692 20.889 22.307 23.951 25.585 27.415 29.442 31.677 34.106 36.934 40.365 43.959 48.36 53.521 59.788 67.336 76.879 89.236 106.238 122.693 133.969 142.182 148.328 153.175 157.022 160.224 162.751 165.056 166.873 168.401 169.775 170.991 172.044 172.938 173.813 174.551 175.154 175.739 176.307 176.737 177.145 177.546 177.84 178.122 178.382 178.625 178.871 179.021 179.155 179.33 179.44 179.53 179.576 179.671 179.725 179.763 179.773 179.623 179.789 179.779 179.751 179.629 179.538 179.434 179.314 179.168 179.003 178.755 178.097 -5 ,21668 ,KEBNE ,16749864,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:45:26 CET,0.0 0.539 1.011 1.438 1.832 2.206 2.554 2.91 3.617 3.956 4.287 4.572 5.235 5.54 6.128 6.706 7.28 7.563 8.121 8.671 9.483 10.015 10.539 11.324 12.107 12.878 13.644 14.398 15.379 16.34 17.292 18.482 19.671 20.856 22.257 23.872 25.471 27.281 29.297 31.507 33.914 36.73 40.15 43.741 48.108 53.198 59.418 66.986 76.638 89.168 106.351 122.783 133.974 142.147 148.33 153.28 157.18 160.357 162.84 165.121 166.954 168.497 169.886 171.101 172.145 173.037 173.907 174.642 175.237 175.798 176.34 176.775 177.187 177.563 177.852 178.153 178.448 178.718 178.969 179.126 179.26 179.441 179.563 179.686 179.743 179.845 179.932 179.992 180.014 179.866 180.022 180.012 180.006 179.992 179.946 179.858 179.757 179.62 179.43 179.157 178.158 -6 ,22976 ,KEBNE ,16749865,Wed Dec 1 21:55:22 CET,Wed Dec 1 23:45:25 CET,0.0 0.499 0.924 1.314 1.672 2.023 2.38 2.737 3.43 3.766 4.099 4.398 5.052 5.359 5.975 6.584 7.173 7.463 8.044 8.611 9.434 9.974 10.511 11.302 12.079 12.835 13.589 14.354 15.364 16.347 17.319 18.544 19.753 20.945 22.35 23.968 25.582 27.409 29.444 31.683 34.123 36.989 40.481 44.143 48.61 53.83 60.232 67.985 77.737 90.277 107.418 123.913 135.11 143.337 149.57 154.49 158.366 161.591 164.165 166.54 168.444 170.026 171.408 172.599 173.62 174.513 175.386 176.098 176.685 177.26 177.811 178.248 178.677 179.083 179.378 179.657 179.907 180.146 180.372 180.519 180.673 180.89 181.014 181.123 181.174 181.259 181.327 181.367 181.383 181.244 181.433 181.425 181.389 181.263 181.199 181.142 181.043 180.911 180.739 180.49 179.643 -7 ,23465 ,KEBNE ,16749866,Wed Dec 1 21:55:22 CET,Wed Dec 1 23:46:27 CET,0.0 0.577 1.049 1.463 1.856 2.235 2.605 2.961 3.616 3.932 4.246 4.503 5.152 5.456 6.052 6.64 7.212 7.492 8.054 8.611 9.425 9.955 10.487 11.276 12.055 12.831 13.598 14.355 15.346 16.322 17.299 18.505 19.702 20.896 22.309 23.928 25.514 27.312 29.342 31.571 33.974 36.78 40.176 43.741 48.117 53.257 59.519 67.037 76.563 88.898 105.846 122.193 133.363 141.582 147.773 152.705 156.605 159.814 162.334 164.623 166.415 167.901 169.245 170.464 171.535 172.439 173.311 174.02 174.597 175.184 175.741 176.18 176.623 177.035 177.33 177.619 177.904 178.17 178.412 178.564 178.71 178.91 179.027 179.128 179.168 179.244 179.333 179.428 179.459 179.31 179.507 179.513 179.498 179.422 179.373 179.31 179.229 179.158 179.03 178.751 177.718 -8 ,6705 ,KEBNE ,16749867,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:46:06 CET,0.0 0.557 1.025 1.435 1.81 2.177 2.532 2.884 3.568 3.891 4.204 4.485 5.143 5.446 6.048 6.636 7.207 7.483 8.021 8.564 9.399 9.949 10.481 11.258 12.028 12.797 13.563 14.321 15.309 16.294 17.256 18.42 19.589 20.773 22.177 23.795 25.408 27.232 29.262 31.466 33.856 36.667 40.077 43.655 48.024 53.175 59.466 67.029 76.565 88.96 106.053 122.414 133.498 141.574 147.706 152.622 156.499 159.683 162.195 164.489 166.303 167.802 169.126 170.319 171.366 172.257 173.121 173.847 174.434 174.987 175.511 175.928 176.348 176.744 177.025 177.297 177.564 177.811 178.027 178.17 178.318 178.507 178.619 178.724 178.772 178.867 178.955 179.01 179.025 178.882 179.074 179.078 179.06 178.963 178.907 178.841 178.744 178.62 178.458 178.255 177.6 -9 ,5436 ,KEBNE ,16749868,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:45:51 CET,0.0 0.614 1.128 1.595 2.012 2.395 2.757 3.115 3.805 4.152 4.492 4.775 5.44 5.738 6.33 6.926 7.504 7.79 8.353 8.898 9.709 10.249 10.782 11.558 12.332 13.106 13.872 14.633 15.635 16.63 17.615 18.832 20.039 21.233 22.653 24.289 25.907 27.754 29.812 32.067 34.512 37.362 40.822 44.448 48.875 54.044 60.316 67.914 77.502 89.892 106.969 123.403 134.633 142.79 148.878 153.815 157.758 160.973 163.51 165.853 167.71 169.224 170.588 171.777 172.805 173.712 174.598 175.328 175.91 176.472 177.009 177.424 177.817 178.178 178.447 178.732 179.012 179.285 179.53 179.677 179.825 180.032 180.156 180.264 180.31 180.392 180.458 180.508 180.529 180.383 180.527 180.517 180.511 180.45 180.404 180.328 180.228 180.11 179.942 179.661 178.885 -10 ,6805 ,KEBNE ,16749869,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:45:40 CET,0.0 0.609 1.074 1.449 1.827 2.189 2.533 2.864 3.498 3.814 4.125 4.376 5.019 5.311 5.895 6.471 7.037 7.313 7.858 8.397 9.195 9.74 10.274 11.04 11.812 12.576 13.317 14.055 15.032 16.001 16.968 18.161 19.347 20.53 21.944 23.554 25.131 26.939 28.953 31.183 33.626 36.456 39.899 43.511 47.921 53.099 59.403 66.977 76.61 89.218 106.39 122.969 134.348 142.601 148.848 153.852 157.782 160.994 163.54 165.864 167.706 169.274 170.67 171.88 172.933 173.836 174.689 175.388 175.966 176.538 177.107 177.557 177.975 178.339 178.619 178.913 179.202 179.477 179.725 179.887 180.041 180.251 180.371 180.479 180.53 180.625 180.712 180.787 180.821 180.692 180.86 180.862 180.86 180.818 180.773 180.686 180.572 180.439 180.253 179.954 179.261 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt deleted file mode 100644 index e9439fe1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26761 ,KEBNE ,16749870,Wed Dec 1 21:55:22 CET,Wed Dec 1 23:45:47 CET,0.0 0.762 1.263 1.682 2.078 2.505 2.891 3.231 3.927 4.258 4.571 4.819 5.463 5.746 6.31 6.887 7.449 7.725 8.28 8.825 9.648 10.195 10.716 11.472 12.205 12.933 13.664 14.385 15.329 16.249 17.158 18.301 19.432 20.543 21.863 23.371 24.861 26.549 28.406 30.435 32.65 35.245 38.398 41.688 45.711 50.449 56.179 63.001 71.567 82.658 98.079 112.892 122.885 130.158 135.572 139.813 143.13 145.88 148.062 150.006 151.535 152.838 154.0 155.018 155.904 156.662 157.405 158.037 158.566 159.09 159.6 159.992 160.345 160.685 160.942 161.188 161.426 161.656 161.877 162.005 162.122 162.301 162.409 162.492 162.528 162.607 162.678 162.738 162.764 162.588 162.767 162.767 162.764 162.71 162.672 162.618 162.551 162.473 162.354 162.112 161.406 -2 ,10549 ,KEBNE ,16749871,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:46:47 CET,0.0 0.961 1.462 1.904 2.324 2.707 3.078 3.437 4.127 4.469 4.805 5.119 5.79 6.102 6.71 7.296 7.887 8.172 8.713 9.245 10.028 10.541 11.047 11.788 12.528 13.273 14.012 14.749 15.714 16.656 17.591 18.733 19.862 20.996 22.339 23.87 25.391 27.127 29.053 31.168 33.475 36.14 39.372 42.774 46.871 51.659 57.461 64.36 73.022 84.245 99.519 114.133 124.065 131.227 136.597 140.849 144.153 146.802 148.872 150.771 152.308 153.596 154.736 155.753 156.627 157.348 158.035 158.61 159.071 159.529 159.987 160.341 160.687 161.018 161.252 161.474 161.687 161.88 162.051 162.157 162.27 162.428 162.51 162.579 162.613 162.681 162.731 162.768 162.778 162.588 162.756 162.74 162.715 162.652 162.614 162.565 162.454 162.303 162.137 161.946 161.149 -3 ,24956 ,KEBNE ,16749872,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:46:29 CET,0.0 0.761 1.288 1.728 2.149 2.562 2.953 3.329 4.044 4.394 4.737 5.046 5.712 6.033 6.678 7.293 7.894 8.189 8.765 9.311 10.092 10.605 11.108 11.856 12.605 13.336 14.038 14.736 15.66 16.566 17.482 18.612 19.717 20.837 22.181 23.699 25.17 26.844 28.724 30.771 32.975 35.572 38.732 42.013 46.036 50.727 56.396 63.265 71.974 83.195 98.48 113.093 123.044 130.291 135.76 140.15 143.611 146.433 148.644 150.669 152.276 153.609 154.777 155.797 156.705 157.499 158.255 158.852 159.347 159.843 160.318 160.694 161.063 161.412 161.657 161.887 162.112 162.33 162.538 162.669 162.79 162.952 163.056 163.152 163.193 163.261 163.327 163.379 163.386 163.204 163.369 163.35 163.335 163.266 163.212 163.157 163.072 162.941 162.764 162.487 161.77 -4 ,17515 ,KEBNE ,16749873,Wed Dec 1 21:55:24 CET,Wed Dec 1 23:47:36 CET,0.0 0.929 1.404 1.851 2.282 2.67 3.024 3.388 4.097 4.416 4.727 5.015 5.67 5.959 6.532 7.115 7.685 7.963 8.521 9.066 9.866 10.399 10.915 11.653 12.378 13.096 13.813 14.53 15.465 16.379 17.285 18.4 19.51 20.607 21.892 23.382 24.875 26.563 28.43 30.472 32.691 35.268 38.41 41.737 45.789 50.528 56.243 63.101 71.763 82.934 98.184 112.802 122.78 130.054 135.542 139.912 143.332 146.179 148.431 150.466 152.079 153.405 154.596 155.652 156.567 157.353 158.109 158.727 159.216 159.683 160.139 160.496 160.857 161.213 161.466 161.703 161.904 162.086 162.29 162.438 162.585 162.773 162.872 162.968 163.023 163.109 163.154 163.177 163.19 163.017 163.18 163.167 163.16 163.117 163.058 162.985 162.885 162.733 162.54 162.295 161.326 -5 ,2548 ,KEBNE ,16749874,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:47:17 CET,0.0 0.644 1.148 1.602 2.016 2.391 2.742 3.095 3.779 4.11 4.441 4.729 5.387 5.694 6.284 6.859 7.422 7.697 8.243 8.778 9.584 10.116 10.627 11.38 12.132 12.869 13.585 14.302 15.259 16.213 17.171 18.344 19.499 20.655 22.022 23.592 25.125 26.852 28.762 30.836 33.116 35.791 39.03 42.412 46.489 51.253 57.052 64.002 72.745 83.954 99.296 114.099 124.028 131.134 136.479 140.766 144.108 146.788 148.907 150.877 152.415 153.687 154.863 155.905 156.816 157.596 158.345 158.955 159.425 159.869 160.313 160.664 160.995 161.312 161.536 161.748 161.951 162.137 162.31 162.424 162.537 162.689 162.773 162.855 162.896 162.96 163.001 163.023 163.032 162.85 163.029 163.026 163.012 162.942 162.879 162.819 162.751 162.638 162.472 162.207 161.356 -6 ,25671 ,KEBNE ,16749875,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:46:23 CET,0.0 1.113 1.716 2.241 2.701 3.147 3.562 3.948 4.665 4.988 5.301 5.559 6.208 6.506 7.087 7.649 8.199 8.473 9.015 9.541 10.32 10.827 11.35 12.139 12.89 13.625 14.341 15.05 15.992 16.921 17.839 18.976 20.105 21.208 22.505 24.001 25.483 27.174 29.06 31.142 33.387 35.983 39.128 42.427 46.454 51.172 56.942 63.853 72.545 83.874 99.3 113.814 123.522 130.558 135.829 140.075 143.487 146.247 148.398 150.352 151.905 153.19 154.353 155.403 156.29 157.057 157.828 158.461 158.964 159.445 159.911 160.264 160.615 160.964 161.208 161.447 161.675 161.881 162.077 162.205 162.32 162.476 162.573 162.673 162.719 162.805 162.88 162.936 162.957 162.79 162.967 162.955 162.941 162.889 162.845 162.773 162.674 162.519 162.323 162.103 161.316 -7 ,14127 ,KEBNE ,16749876,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:47:06 CET,0.0 0.591 1.044 1.476 1.873 2.266 2.643 2.997 3.663 3.985 4.305 4.567 5.211 5.507 6.084 6.646 7.202 7.48 8.033 8.583 9.401 9.929 10.443 11.209 11.966 12.71 13.452 14.188 15.155 16.114 17.056 18.207 19.349 20.485 21.832 23.386 24.922 26.646 28.577 30.706 32.992 35.662 38.914 42.289 46.356 51.115 56.962 64.02 72.804 84.008 99.341 113.959 123.842 131.078 136.497 140.747 144.043 146.686 148.737 150.644 152.191 153.489 154.662 155.682 156.565 157.317 158.032 158.645 159.147 159.622 160.084 160.444 160.795 161.112 161.33 161.555 161.786 162.003 162.198 162.319 162.43 162.588 162.686 162.765 162.8 162.857 162.919 162.964 162.973 162.808 163.008 163.002 162.993 162.95 162.912 162.856 162.774 162.658 162.506 162.293 161.664 -8 ,7113 ,KEBNE ,16749877,Wed Dec 1 21:55:24 CET,Wed Dec 1 23:46:14 CET,0.0 0.777 1.296 1.767 2.19 2.564 2.917 3.264 3.914 4.226 4.529 4.77 5.409 5.693 6.257 6.814 7.362 7.638 8.181 8.707 9.483 9.991 10.503 11.259 11.997 12.726 13.449 14.18 15.129 16.054 16.969 18.103 19.221 20.315 21.61 23.107 24.59 26.276 28.166 30.217 32.426 35.016 38.144 41.426 45.445 50.141 55.877 62.789 71.494 82.63 97.733 112.361 122.343 129.584 135.02 139.349 142.797 145.652 147.883 149.942 151.588 152.922 154.104 155.145 156.054 156.831 157.581 158.21 158.708 159.176 159.646 160.028 160.38 160.713 160.953 161.173 161.367 161.543 161.723 161.851 161.975 162.129 162.212 162.292 162.332 162.405 162.46 162.509 162.534 162.363 162.542 162.545 162.541 162.482 162.435 162.372 162.272 162.142 161.932 161.593 160.931 -9 ,1102 ,KEBNE ,16749878,Wed Dec 1 21:55:30 CET,Wed Dec 1 23:46:30 CET,0.0 0.703 1.191 1.652 2.047 2.409 2.77 3.117 3.77 4.08 4.39 4.647 5.293 5.59 6.174 6.742 7.293 7.562 8.098 8.633 9.43 9.94 10.431 11.154 11.875 12.601 13.327 14.046 14.988 15.909 16.824 17.948 19.072 20.206 21.539 23.067 24.58 26.293 28.207 30.296 32.561 35.222 38.423 41.72 45.739 50.464 56.233 63.163 71.871 83.142 98.393 112.866 122.685 129.848 135.199 139.432 142.81 145.587 147.788 149.821 151.43 152.752 153.928 154.971 155.862 156.614 157.362 157.989 158.497 158.988 159.464 159.829 160.173 160.521 160.774 161.003 161.218 161.411 161.594 161.715 161.836 162.01 162.115 162.216 162.261 162.34 162.398 162.44 162.455 162.282 162.478 162.468 162.446 162.379 162.324 162.259 162.186 162.105 161.974 161.795 161.313 -10 ,24903 ,KEBNE ,16749879,Wed Dec 1 21:55:30 CET,Wed Dec 1 23:46:58 CET,0.0 0.809 1.282 1.717 2.12 2.507 2.885 3.238 3.88 4.196 4.511 4.773 5.423 5.714 6.29 6.863 7.422 7.7 8.251 8.79 9.602 10.142 10.685 11.497 12.277 13.024 13.769 14.514 15.47 16.406 17.339 18.48 19.613 20.748 22.096 23.631 25.139 26.852 28.754 30.87 33.181 35.866 39.114 42.506 46.616 51.421 57.231 64.134 72.8 83.955 99.173 113.596 123.268 130.291 135.575 139.679 142.844 145.465 147.566 149.52 151.06 152.342 153.488 154.476 155.32 156.022 156.684 157.223 157.678 158.124 158.566 158.916 159.269 159.623 159.854 160.057 160.248 160.431 160.602 160.707 160.808 160.965 161.062 161.139 161.175 161.229 161.265 161.301 161.318 161.15 161.333 161.325 161.315 161.246 161.179 161.112 161.048 160.935 160.8 160.623 160.294 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index 1701c708..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29568 ,KEBNE ,16749880,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:43:20 CET,0.0 0.324 0.577 0.754 0.917 1.067 1.229 1.388 1.648 1.777 1.905 1.96 2.246 2.35 2.551 2.745 2.929 3.016 3.184 3.354 3.582 3.725 3.864 4.065 4.26 4.452 4.632 4.81 5.049 5.279 5.507 5.787 6.049 6.289 6.566 6.885 7.192 7.521 7.88 8.26 8.662 9.111 9.6 10.092 10.704 11.412 12.184 12.99 13.965 14.916 15.682 16.097 16.008 15.685 15.314 14.857 14.387 13.94 13.548 13.129 12.761 12.422 12.091 11.774 11.444 11.14 10.804 10.465 10.182 9.889 9.575 9.306 9.014 8.718 8.471 8.197 7.914 7.607 7.29 7.094 6.9 6.581 6.336 6.079 5.954 5.69 5.38 5.025 4.822 4.456 4.184 3.962 3.736 3.224 2.923 2.579 2.205 1.756 1.16 0.262 -3.17 -2 ,17642 ,KEBNE ,16749881,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:43:43 CET,0.0 0.397 0.655 0.863 1.031 1.189 1.345 1.495 1.755 1.873 1.985 2.019 2.294 2.397 2.605 2.798 2.979 3.067 3.232 3.398 3.648 3.811 3.971 4.184 4.382 4.581 4.77 4.954 5.206 5.452 5.674 5.947 6.216 6.457 6.726 7.042 7.349 7.68 8.036 8.421 8.829 9.28 9.796 10.297 10.872 11.515 12.277 13.139 14.077 15.049 16.021 16.516 16.411 15.989 15.502 15.027 14.627 14.218 13.803 13.389 13.005 12.645 12.312 11.972 11.61 11.278 10.945 10.646 10.383 10.109 9.833 9.589 9.318 9.046 8.823 8.583 8.34 8.075 7.78 7.58 7.386 7.085 6.867 6.605 6.462 6.175 5.874 5.552 5.365 5.019 4.782 4.564 4.364 3.904 3.607 3.279 2.891 2.431 1.893 1.069 -3.134 -3 ,21356 ,KEBNE ,16749882,Wed Dec 1 21:55:23 CET,Wed Dec 1 23:42:46 CET,0.0 0.321 0.597 0.848 1.077 1.267 1.411 1.538 1.78 1.905 2.024 2.06 2.338 2.447 2.66 2.847 3.019 3.099 3.257 3.411 3.631 3.782 3.922 4.114 4.307 4.496 4.673 4.843 5.066 5.281 5.498 5.763 6.013 6.259 6.547 6.861 7.154 7.489 7.855 8.242 8.652 9.102 9.612 10.144 10.78 11.477 12.269 13.093 13.921 14.726 15.423 15.586 15.393 15.076 14.691 14.244 13.785 13.35 12.991 12.625 12.272 11.935 11.592 11.244 10.907 10.607 10.316 10.058 9.812 9.54 9.248 8.98 8.705 8.407 8.169 7.936 7.668 7.382 7.097 6.903 6.708 6.4 6.18 5.961 5.849 5.594 5.3 5.003 4.861 4.541 4.3 4.088 3.856 3.344 3.071 2.793 2.496 2.111 1.621 0.848 -2.012 -4 ,12444 ,KEBNE ,16749883,Wed Dec 1 22:01:40 CET,Wed Dec 1 23:48:54 CET,0.0 0.456 0.711 0.931 1.137 1.321 1.478 1.623 1.884 1.994 2.105 2.164 2.451 2.552 2.743 2.932 3.108 3.193 3.359 3.521 3.755 3.9 4.04 4.248 4.452 4.647 4.836 5.023 5.265 5.501 5.727 5.998 6.27 6.533 6.834 7.167 7.482 7.823 8.183 8.56 8.955 9.408 9.933 10.434 11.0 11.626 12.321 13.116 14.074 15.077 15.95 16.273 16.084 15.682 15.293 14.906 14.478 14.025 13.577 13.157 12.834 12.506 12.184 11.885 11.572 11.275 10.982 10.707 10.464 10.199 9.863 9.575 9.32 9.066 8.862 8.638 8.395 8.138 7.839 7.604 7.364 7.004 6.769 6.534 6.404 6.128 5.85 5.553 5.395 5.07 4.833 4.613 4.394 3.899 3.605 3.272 2.9 2.438 1.805 1.026 -2.884 -5 ,12805 ,KEBNE ,16749884,Wed Dec 1 22:01:40 CET,Wed Dec 1 23:47:49 CET,0.0 0.374 0.637 0.841 1.015 1.185 1.344 1.484 1.742 1.864 1.986 2.038 2.311 2.416 2.618 2.798 2.971 3.057 3.222 3.377 3.598 3.74 3.883 4.106 4.318 4.513 4.696 4.863 5.082 5.3 5.507 5.76 6.02 6.274 6.562 6.878 7.182 7.512 7.868 8.237 8.601 9.043 9.573 10.068 10.633 11.263 11.97 12.711 13.531 14.375 15.219 15.506 15.364 15.087 14.786 14.408 13.92 13.459 13.061 12.627 12.257 11.908 11.552 11.21 10.875 10.57 10.251 9.963 9.723 9.467 9.166 8.9 8.617 8.311 8.065 7.828 7.571 7.303 7.014 6.798 6.59 6.292 6.087 5.845 5.713 5.437 5.139 4.827 4.66 4.315 4.096 3.899 3.675 3.222 2.941 2.616 2.23 1.776 1.268 0.546 -3.511 -6 ,4211 ,KEBNE ,16749885,Wed Dec 1 22:01:40 CET,Wed Dec 1 23:48:59 CET,0.0 0.231 0.414 0.576 0.725 0.865 1.005 1.135 1.377 1.49 1.605 1.662 1.942 2.036 2.216 2.389 2.551 2.634 2.802 2.963 3.198 3.348 3.484 3.676 3.863 4.05 4.241 4.42 4.643 4.857 5.078 5.34 5.584 5.829 6.12 6.443 6.759 7.096 7.446 7.836 8.246 8.7 9.221 9.719 10.294 10.929 11.652 12.486 13.366 14.235 15.045 15.398 15.353 15.101 14.744 14.316 13.873 13.466 13.084 12.655 12.242 11.853 11.505 11.172 10.828 10.501 10.157 9.851 9.571 9.262 8.928 8.646 8.354 8.05 7.808 7.557 7.3 7.032 6.73 6.519 6.318 6.003 5.767 5.52 5.396 5.138 4.868 4.557 4.388 4.058 3.809 3.594 3.384 2.881 2.605 2.318 1.927 1.432 0.879 0.112 -4.701 -7 ,24697 ,KEBNE ,16749886,Wed Dec 1 22:01:40 CET,Wed Dec 1 23:48:19 CET,0.0 0.338 0.589 0.816 1.011 1.181 1.342 1.495 1.77 1.901 2.021 2.066 2.345 2.451 2.649 2.834 3.011 3.097 3.261 3.412 3.629 3.772 3.916 4.132 4.345 4.553 4.754 4.932 5.158 5.386 5.6 5.844 6.083 6.33 6.616 6.922 7.208 7.531 7.88 8.263 8.675 9.12 9.634 10.112 10.682 11.351 12.056 12.809 13.664 14.607 15.431 15.61 15.425 15.108 14.733 14.341 13.924 13.492 13.11 12.728 12.37 12.02 11.654 11.306 10.989 10.683 10.352 10.056 9.785 9.493 9.199 8.939 8.659 8.364 8.123 7.878 7.636 7.354 7.054 6.862 6.656 6.334 6.078 5.794 5.661 5.386 5.111 4.806 4.645 4.321 4.068 3.837 3.597 3.025 2.682 2.357 2.019 1.598 1.096 0.371 -8.673 -8 ,1302 ,KEBNE ,16749887,Wed Dec 1 22:01:40 CET,Wed Dec 1 23:46:46 CET,0.0 0.372 0.608 0.794 0.966 1.129 1.269 1.397 1.642 1.757 1.874 1.93 2.206 2.304 2.5 2.691 2.879 2.964 3.125 3.287 3.519 3.673 3.825 4.033 4.23 4.428 4.62 4.807 5.048 5.267 5.479 5.743 5.994 6.245 6.553 6.9 7.228 7.597 7.993 8.389 8.792 9.258 9.796 10.329 10.935 11.547 12.246 13.058 13.942 14.883 15.757 16.087 16.02 15.773 15.435 14.96 14.447 13.965 13.54 13.076 12.654 12.286 11.921 11.559 11.2 10.884 10.53 10.174 9.887 9.594 9.267 8.987 8.675 8.332 8.06 7.759 7.457 7.169 6.849 6.616 6.38 6.027 5.771 5.494 5.36 5.067 4.741 4.387 4.194 3.84 3.599 3.378 3.154 2.625 2.299 1.943 1.549 1.166 0.724 0.043 -2.835 -9 ,20918 ,KEBNE ,16749888,Wed Dec 1 22:04:52 CET,Wed Dec 1 23:50:46 CET,0.0 0.5 0.759 0.948 1.13 1.297 1.451 1.599 1.857 1.982 2.101 2.147 2.432 2.542 2.761 2.962 3.147 3.236 3.404 3.569 3.825 3.982 4.122 4.342 4.552 4.744 4.93 5.121 5.362 5.584 5.804 6.077 6.341 6.581 6.866 7.196 7.515 7.875 8.252 8.641 9.053 9.525 10.044 10.546 11.152 11.806 12.518 13.27 14.125 15.002 15.716 15.87 15.605 15.268 14.861 14.315 13.818 13.403 13.004 12.525 12.096 11.74 11.389 11.039 10.705 10.404 10.058 9.705 9.396 9.084 8.767 8.5 8.21 7.899 7.642 7.381 7.114 6.843 6.565 6.37 6.174 5.833 5.575 5.317 5.189 4.928 4.665 4.366 4.201 3.877 3.625 3.403 3.168 2.631 2.329 1.994 1.607 1.205 0.684 -0.035 -3.437 -10 ,542 ,KEBNE ,16749889,Wed Dec 1 22:04:52 CET,Wed Dec 1 23:51:38 CET,0.0 0.493 0.789 1.034 1.236 1.403 1.563 1.713 1.976 2.089 2.204 2.262 2.546 2.642 2.835 3.019 3.19 3.275 3.438 3.592 3.815 3.961 4.101 4.305 4.504 4.694 4.869 5.048 5.294 5.523 5.745 6.008 6.253 6.493 6.755 7.048 7.332 7.654 8.025 8.426 8.845 9.308 9.82 10.297 10.849 11.476 12.176 12.866 13.595 14.369 15.108 15.344 15.128 14.788 14.362 13.871 13.409 12.954 12.526 12.078 11.639 11.229 10.851 10.484 10.159 9.878 9.559 9.236 8.917 8.587 8.285 8.038 7.747 7.427 7.196 6.969 6.729 6.481 6.228 6.035 5.815 5.496 5.279 5.036 4.899 4.607 4.307 3.974 3.797 3.454 3.203 2.984 2.765 2.32 2.059 1.728 1.33 0.876 0.324 -0.477 -4.892 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt deleted file mode 100644 index 6c46f9b5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23043 ,KEBNE ,16749890,Wed Dec 1 22:08:08 CET,Wed Dec 1 23:57:11 CET,0.0 0.662 1.021 1.32 1.565 1.792 1.988 2.152 2.458 2.603 2.739 2.816 3.112 3.232 3.46 3.675 3.894 4.002 4.198 4.378 4.648 4.818 4.974 5.205 5.437 5.661 5.875 6.078 6.337 6.59 6.825 7.106 7.378 7.639 7.949 8.291 8.602 8.934 9.306 9.693 10.073 10.513 11.036 11.55 12.124 12.705 13.34 14.026 14.715 15.307 15.745 15.683 15.273 14.726 14.145 13.572 13.043 12.574 12.114 11.621 11.188 10.753 10.337 9.964 9.626 9.297 8.944 8.62 8.321 8.005 7.671 7.403 7.115 6.785 6.521 6.234 5.943 5.668 5.371 5.154 4.932 4.584 4.336 4.082 3.952 3.687 3.391 3.031 2.848 2.513 2.294 2.099 1.883 1.32 1.024 0.715 0.389 0.022 -0.492 -1.207 -4.413 -2 ,21412 ,KEBNE ,16749891,Wed Dec 1 22:08:07 CET,Wed Dec 1 23:57:05 CET,0.0 0.457 0.795 1.09 1.304 1.485 1.672 1.843 2.163 2.32 2.468 2.58 2.889 3.015 3.251 3.471 3.682 3.784 3.973 4.154 4.42 4.592 4.754 4.979 5.206 5.43 5.643 5.847 6.092 6.334 6.579 6.861 7.133 7.401 7.693 8.016 8.337 8.702 9.083 9.474 9.875 10.301 10.8 11.315 11.92 12.555 13.217 13.866 14.547 15.262 15.882 15.972 15.664 15.223 14.705 14.187 13.708 13.21 12.718 12.164 11.691 11.262 10.816 10.377 9.974 9.62 9.247 8.905 8.58 8.22 7.866 7.579 7.283 6.955 6.708 6.48 6.232 5.961 5.674 5.48 5.259 4.883 4.632 4.384 4.251 3.958 3.644 3.319 3.156 2.829 2.647 2.46 2.269 1.855 1.619 1.351 1.034 0.664 0.242 -0.336 -1.934 -3 ,31709 ,KEBNE ,16749892,Wed Dec 1 22:11:19 CET,Wed Dec 1 23:58:50 CET,0.0 0.665 0.958 1.197 1.424 1.63 1.816 1.985 2.297 2.444 2.59 2.693 2.997 3.115 3.338 3.548 3.745 3.841 4.03 4.213 4.473 4.636 4.796 5.023 5.229 5.438 5.645 5.845 6.105 6.343 6.564 6.83 7.083 7.323 7.613 7.941 8.254 8.596 8.947 9.312 9.687 10.109 10.614 11.116 11.653 12.217 12.839 13.504 14.229 14.921 15.266 15.078 14.684 14.18 13.641 13.112 12.597 12.119 11.7 11.239 10.834 10.474 10.108 9.704 9.315 8.95 8.554 8.226 7.966 7.693 7.373 7.1 6.823 6.508 6.253 5.985 5.708 5.437 5.143 4.921 4.687 4.338 4.102 3.851 3.718 3.439 3.15 2.836 2.673 2.34 2.131 1.926 1.729 1.341 1.123 0.835 0.519 0.185 -0.205 -0.69 -2.818 -4 ,31257 ,KEBNE ,16749893,Wed Dec 1 22:11:19 CET,Wed Dec 1 23:58:31 CET,0.0 0.626 0.929 1.215 1.431 1.608 1.803 2.0 2.334 2.476 2.611 2.715 3.025 3.149 3.384 3.604 3.812 3.913 4.113 4.305 4.566 4.734 4.898 5.144 5.375 5.576 5.768 5.968 6.232 6.471 6.69 6.95 7.2 7.46 7.747 8.061 8.373 8.709 9.06 9.431 9.838 10.271 10.737 11.232 11.8 12.355 12.943 13.543 14.199 14.905 15.375 15.235 14.804 14.294 13.669 12.999 12.428 11.893 11.407 10.925 10.46 10.014 9.607 9.229 8.881 8.558 8.194 7.872 7.611 7.326 6.993 6.7 6.401 6.096 5.834 5.557 5.278 4.982 4.683 4.473 4.259 3.918 3.685 3.452 3.322 3.015 2.694 2.387 2.216 1.873 1.679 1.478 1.259 0.788 0.524 0.255 -0.032 -0.392 -0.814 -1.413 -3.517 -5 ,12285 ,KEBNE ,16749894,Wed Dec 1 22:11:19 CET,Wed Dec 1 23:59:38 CET,0.0 0.734 1.047 1.309 1.534 1.728 1.904 2.079 2.419 2.564 2.697 2.769 3.057 3.171 3.405 3.626 3.835 3.934 4.123 4.306 4.564 4.727 4.888 5.117 5.337 5.55 5.751 5.946 6.21 6.472 6.71 6.974 7.236 7.498 7.791 8.123 8.44 8.779 9.149 9.543 9.945 10.384 10.875 11.37 11.937 12.482 13.071 13.716 14.425 15.11 15.596 15.502 15.037 14.464 13.879 13.325 12.833 12.345 11.878 11.379 10.947 10.541 10.096 9.673 9.281 8.922 8.526 8.149 7.852 7.547 7.205 6.914 6.607 6.296 6.053 5.778 5.479 5.18 4.885 4.687 4.474 4.112 3.854 3.594 3.465 3.193 2.896 2.569 2.389 2.041 1.821 1.608 1.405 0.971 0.723 0.452 0.155 -0.19 -0.626 -1.289 -4.25 -6 ,17818 ,KEBNE ,16749895,Wed Dec 1 22:16:35 CET,Thu Dec 2 00:04:17 CET,0.0 0.566 0.961 1.249 1.494 1.699 1.873 2.038 2.373 2.531 2.674 2.757 3.057 3.172 3.382 3.59 3.801 3.902 4.099 4.289 4.548 4.705 4.862 5.088 5.291 5.489 5.685 5.878 6.124 6.353 6.585 6.87 7.129 7.377 7.668 7.991 8.315 8.662 9.023 9.419 9.828 10.274 10.794 11.278 11.801 12.423 13.11 13.771 14.441 15.115 15.722 15.743 15.316 14.808 14.317 13.775 13.242 12.77 12.291 11.782 11.356 10.945 10.552 10.202 9.862 9.525 9.175 8.87 8.59 8.283 7.97 7.716 7.459 7.171 6.934 6.7 6.446 6.16 5.865 5.668 5.462 5.136 4.895 4.639 4.513 4.239 3.933 3.616 3.446 3.097 2.874 2.67 2.459 2.013 1.772 1.493 1.171 0.792 0.337 -0.242 -2.901 -7 ,31768 ,KEBNE ,16749896,Wed Dec 1 22:16:35 CET,Thu Dec 2 00:05:34 CET,0.0 0.63 0.939 1.19 1.417 1.648 1.863 2.047 2.387 2.534 2.67 2.769 3.076 3.198 3.423 3.638 3.839 3.936 4.13 4.315 4.579 4.751 4.923 5.167 5.392 5.608 5.823 6.03 6.288 6.537 6.777 7.07 7.368 7.646 7.949 8.273 8.579 8.932 9.32 9.712 10.116 10.563 11.077 11.599 12.203 12.837 13.521 14.2 14.887 15.545 15.826 15.663 15.275 14.786 14.268 13.682 13.063 12.47 11.951 11.368 10.851 10.427 10.037 9.658 9.286 8.934 8.572 8.233 7.927 7.61 7.264 6.952 6.638 6.347 6.12 5.869 5.606 5.342 5.075 4.9 4.708 4.373 4.142 3.908 3.788 3.54 3.263 2.943 2.775 2.437 2.24 2.057 1.865 1.415 1.17 0.897 0.573 0.175 -0.258 -0.894 -3.45 -8 ,7826 ,KEBNE ,16749897,Wed Dec 1 22:16:35 CET,Thu Dec 2 00:05:28 CET,0.0 0.509 0.82 1.058 1.272 1.461 1.637 1.813 2.124 2.264 2.408 2.498 2.791 2.9 3.114 3.331 3.539 3.638 3.832 4.023 4.291 4.45 4.611 4.847 5.064 5.271 5.47 5.663 5.917 6.163 6.396 6.684 6.961 7.221 7.512 7.833 8.143 8.487 8.856 9.236 9.635 10.085 10.584 11.075 11.652 12.32 13.087 13.843 14.588 15.256 15.653 15.418 14.941 14.433 13.849 13.296 12.808 12.367 11.981 11.525 11.083 10.665 10.265 9.897 9.506 9.123 8.732 8.367 8.068 7.784 7.472 7.195 6.895 6.572 6.319 6.066 5.802 5.526 5.23 5.018 4.807 4.467 4.218 3.961 3.837 3.584 3.287 2.952 2.78 2.441 2.249 2.055 1.855 1.405 1.166 0.91 0.618 0.289 -0.115 -0.709 -2.811 -9 ,28608 ,KEBNE ,16749898,Wed Dec 1 22:16:34 CET,Thu Dec 2 00:04:11 CET,0.0 0.578 0.855 1.103 1.363 1.613 1.825 2.021 2.387 2.545 2.684 2.775 3.077 3.202 3.447 3.682 3.904 4.009 4.219 4.425 4.709 4.889 5.073 5.336 5.573 5.803 6.02 6.222 6.484 6.741 6.991 7.283 7.546 7.791 8.079 8.416 8.738 9.076 9.436 9.825 10.226 10.651 11.16 11.695 12.285 12.901 13.598 14.351 15.167 15.859 16.208 16.057 15.638 15.1 14.576 14.025 13.498 12.994 12.506 11.975 11.529 11.121 10.708 10.347 10.002 9.655 9.272 8.973 8.738 8.479 8.191 7.935 7.644 7.348 7.131 6.886 6.614 6.32 6.029 5.829 5.615 5.273 5.04 4.79 4.662 4.381 4.08 3.799 3.652 3.321 3.101 2.911 2.715 2.275 2.039 1.751 1.423 1.069 0.664 0.047 -2.847 -10 ,11746 ,KEBNE ,16749899,Wed Dec 1 22:16:35 CET,Thu Dec 2 00:04:43 CET,0.0 0.959 1.35 1.64 1.887 2.124 2.35 2.543 2.875 3.023 3.167 3.264 3.571 3.702 3.939 4.158 4.362 4.462 4.668 4.861 5.126 5.297 5.462 5.702 5.939 6.169 6.378 6.577 6.838 7.092 7.344 7.641 7.911 8.165 8.461 8.8 9.131 9.497 9.86 10.239 10.656 11.126 11.65 12.133 12.67 13.27 13.914 14.496 15.131 15.782 16.126 16.013 15.62 15.124 14.588 14.01 13.509 13.027 12.552 12.081 11.659 11.246 10.815 10.362 9.935 9.565 9.186 8.852 8.555 8.245 7.925 7.652 7.375 7.085 6.849 6.602 6.328 6.04 5.769 5.592 5.4 5.068 4.827 4.583 4.463 4.202 3.893 3.566 3.412 3.083 2.869 2.676 2.474 1.982 1.713 1.432 1.133 0.792 0.414 -0.085 -2.062 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index f606906c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9508 ,KEBNE ,16749900,Wed Dec 1 22:16:35 CET,Thu Dec 2 00:04:07 CET,0.0 0.356 0.724 1.003 1.225 1.434 1.623 1.805 2.161 2.326 2.484 2.597 2.921 3.059 3.32 3.563 3.803 3.92 4.151 4.378 4.705 4.914 5.117 5.407 5.69 5.959 6.214 6.473 6.817 7.144 7.465 7.852 8.232 8.603 9.032 9.499 9.927 10.41 10.93 11.475 12.046 12.693 13.459 14.239 15.158 16.165 17.295 18.542 20.021 21.794 23.801 25.267 26.027 26.448 26.622 26.65 26.575 26.402 26.224 26.051 25.894 25.717 25.494 25.239 24.968 24.723 24.472 24.23 24.004 23.771 23.534 23.318 23.092 22.851 22.648 22.435 22.204 21.963 21.723 21.557 21.376 21.084 20.886 20.68 20.576 20.365 20.123 19.862 19.724 19.417 19.253 19.078 18.905 18.53 18.315 18.079 17.809 17.499 17.181 16.804 15.817 -2 ,17058 ,KEBNE ,16749901,Wed Dec 1 22:16:35 CET,Thu Dec 2 00:07:26 CET,0.0 0.382 0.686 0.957 1.175 1.391 1.604 1.794 2.141 2.309 2.471 2.604 2.938 3.085 3.348 3.598 3.842 3.96 4.196 4.436 4.789 5.007 5.215 5.528 5.826 6.108 6.376 6.635 6.977 7.293 7.601 7.991 8.379 8.737 9.144 9.615 10.06 10.546 11.084 11.658 12.255 12.94 13.736 14.521 15.451 16.458 17.599 18.897 20.414 22.197 24.259 25.793 26.556 26.934 27.117 27.161 27.098 26.993 26.861 26.677 26.481 26.278 26.076 25.886 25.703 25.503 25.271 25.06 24.87 24.644 24.387 24.2 24.023 23.831 23.683 23.526 23.354 23.18 22.998 22.859 22.708 22.453 22.251 22.03 21.923 21.703 21.456 21.189 21.043 20.728 20.608 20.463 20.308 19.993 19.814 19.626 19.398 19.139 18.88 18.528 17.467 -3 ,17962 ,KEBNE ,16749902,Wed Dec 1 22:16:35 CET,Thu Dec 2 00:08:34 CET,0.0 0.38 0.694 0.973 1.22 1.428 1.617 1.801 2.142 2.312 2.468 2.573 2.89 3.026 3.287 3.541 3.792 3.913 4.146 4.371 4.694 4.899 5.112 5.422 5.711 5.993 6.264 6.53 6.865 7.186 7.501 7.88 8.247 8.599 9.01 9.459 9.886 10.365 10.89 11.467 12.104 12.824 13.66 14.5 15.491 16.606 17.863 19.261 20.93 22.859 25.056 26.593 27.14 27.316 27.344 27.282 27.144 26.927 26.672 26.41 26.198 25.981 25.747 25.506 25.241 24.976 24.694 24.441 24.225 24.002 23.768 23.561 23.332 23.096 22.906 22.712 22.521 22.301 22.063 21.919 21.78 21.542 21.366 21.182 21.083 20.872 20.662 20.433 20.304 20.007 19.904 19.763 19.612 19.294 19.11 18.922 18.713 18.47 18.215 17.897 17.336 -4 ,8505 ,KEBNE ,16749903,Wed Dec 1 22:16:35 CET,Thu Dec 2 00:07:45 CET,0.0 0.621 0.911 1.181 1.438 1.641 1.831 2.018 2.358 2.521 2.676 2.785 3.096 3.221 3.451 3.682 3.907 4.015 4.226 4.443 4.774 4.983 5.178 5.46 5.743 6.019 6.283 6.548 6.88 7.191 7.494 7.871 8.234 8.581 8.99 9.436 9.867 10.368 10.916 11.49 12.106 12.819 13.623 14.435 15.405 16.47 17.67 19.043 20.688 22.603 24.779 26.381 27.177 27.61 27.841 27.918 27.885 27.79 27.668 27.5 27.316 27.141 26.942 26.726 26.507 26.304 26.098 25.897 25.715 25.53 25.326 25.138 24.929 24.713 24.542 24.356 24.164 23.971 23.764 23.617 23.464 23.217 23.037 22.835 22.73 22.525 22.317 22.09 21.967 21.686 21.577 21.436 21.284 20.95 20.761 20.556 20.338 20.106 19.83 19.419 18.237 -5 ,6375 ,KEBNE ,16749904,Wed Dec 1 22:16:36 CET,Thu Dec 2 00:07:37 CET,0.0 0.531 0.815 1.062 1.305 1.521 1.703 1.879 2.24 2.404 2.551 2.649 2.968 3.105 3.367 3.617 3.863 3.986 4.227 4.454 4.768 4.977 5.187 5.488 5.786 6.071 6.333 6.596 6.949 7.284 7.608 8.005 8.381 8.737 9.144 9.603 10.063 10.582 11.138 11.719 12.342 13.067 13.915 14.758 15.73 16.818 18.085 19.474 20.99 22.717 24.693 26.19 26.97 27.325 27.407 27.28 27.109 26.958 26.796 26.572 26.325 26.072 25.819 25.587 25.355 25.132 24.896 24.672 24.462 24.233 24.0 23.799 23.574 23.346 23.167 22.96 22.747 22.537 22.313 22.148 21.981 21.717 21.539 21.369 21.273 21.063 20.851 20.621 20.499 20.213 20.093 19.951 19.808 19.494 19.327 19.138 18.948 18.754 18.516 18.178 17.494 -6 ,9376 ,KEBNE ,16749905,Wed Dec 1 22:26:00 CET,Thu Dec 2 00:16:41 CET,0.0 0.617 0.919 1.168 1.398 1.607 1.807 2.004 2.347 2.494 2.643 2.748 3.07 3.201 3.446 3.701 3.965 4.095 4.343 4.57 4.891 5.098 5.317 5.64 5.931 6.21 6.474 6.728 7.066 7.379 7.671 8.048 8.415 8.764 9.178 9.634 10.053 10.518 11.035 11.587 12.167 12.822 13.599 14.393 15.286 16.267 17.41 18.691 20.176 21.908 23.924 25.483 26.229 26.597 26.808 26.875 26.825 26.689 26.521 26.323 26.126 25.937 25.734 25.528 25.332 25.146 24.932 24.718 24.514 24.297 24.091 23.916 23.737 23.547 23.394 23.234 23.052 22.863 22.658 22.517 22.365 22.109 21.935 21.751 21.653 21.458 21.257 21.033 20.922 20.647 20.569 20.44 20.3 20.004 19.833 19.624 19.406 19.162 18.885 18.543 17.533 -7 ,18419 ,KEBNE ,16749906,Wed Dec 1 22:26:01 CET,Thu Dec 2 00:17:47 CET,0.0 0.404 0.696 0.96 1.187 1.397 1.581 1.765 2.118 2.266 2.402 2.504 2.835 2.978 3.257 3.534 3.786 3.908 4.139 4.367 4.705 4.922 5.128 5.418 5.712 6.008 6.29 6.562 6.92 7.266 7.593 7.998 8.391 8.749 9.175 9.653 10.109 10.629 11.196 11.791 12.429 13.16 14.025 14.894 15.868 16.96 18.233 19.657 21.308 23.125 25.166 26.792 27.509 27.795 27.891 27.817 27.68 27.528 27.316 27.038 26.792 26.533 26.262 26.009 25.774 25.558 25.326 25.088 24.854 24.632 24.406 24.2 23.978 23.743 23.562 23.38 23.178 22.962 22.753 22.607 22.453 22.202 22.015 21.822 21.723 21.515 21.289 21.039 20.91 20.617 20.481 20.317 20.147 19.775 19.567 19.333 19.088 18.82 18.515 18.118 16.728 -8 ,27457 ,KEBNE ,16749907,Wed Dec 1 22:48:11 CET,Thu Dec 2 00:37:45 CET,0.0 0.441 0.68 0.916 1.163 1.396 1.605 1.791 2.126 2.281 2.429 2.541 2.87 3.006 3.268 3.533 3.793 3.914 4.145 4.371 4.69 4.891 5.091 5.395 5.692 5.973 6.235 6.487 6.813 7.131 7.447 7.84 8.225 8.608 9.053 9.56 10.048 10.565 11.112 11.704 12.343 13.054 13.903 14.761 15.753 16.88 18.156 19.556 21.098 22.799 24.719 26.131 26.774 27.044 27.076 26.972 26.826 26.639 26.419 26.169 25.93 25.69 25.45 25.199 24.961 24.747 24.503 24.285 24.094 23.876 23.628 23.429 23.225 22.995 22.817 22.628 22.429 22.22 22.008 21.863 21.694 21.434 21.269 21.086 20.987 20.79 20.586 20.37 20.261 19.992 19.924 19.783 19.625 19.321 19.163 18.978 18.771 18.528 18.251 17.887 17.046 -9 ,647 ,KEBNE ,16749908,Wed Dec 1 22:55:42 CET,Thu Dec 2 00:46:32 CET,0.0 0.532 0.85 1.081 1.269 1.451 1.622 1.795 2.127 2.289 2.442 2.532 2.849 2.978 3.219 3.447 3.685 3.798 4.015 4.228 4.534 4.736 4.936 5.216 5.48 5.742 6.002 6.268 6.616 6.937 7.25 7.619 7.976 8.327 8.736 9.214 9.686 10.187 10.71 11.288 11.917 12.636 13.494 14.361 15.358 16.47 17.732 19.145 20.819 22.738 25.004 26.741 27.529 27.829 27.839 27.711 27.528 27.334 27.162 26.965 26.747 26.503 26.231 25.96 25.715 25.513 25.3 25.082 24.877 24.653 24.413 24.215 24.009 23.799 23.622 23.429 23.234 23.029 22.795 22.619 22.44 22.171 21.976 21.75 21.624 21.354 21.083 20.803 20.66 20.358 20.228 20.078 19.914 19.523 19.307 19.081 18.824 18.535 18.187 17.757 17.024 -10 ,19164 ,KEBNE ,16749909,Wed Dec 1 23:08:21 CET,Thu Dec 2 00:55:20 CET,0.0 0.452 0.752 1.001 1.251 1.499 1.721 1.917 2.267 2.433 2.59 2.708 3.036 3.178 3.463 3.73 3.991 4.109 4.327 4.542 4.848 5.05 5.252 5.557 5.856 6.153 6.446 6.724 7.081 7.43 7.771 8.179 8.567 8.939 9.367 9.832 10.267 10.752 11.279 11.825 12.383 13.037 13.831 14.61 15.534 16.59 17.798 19.173 20.736 22.478 24.529 26.082 26.837 27.235 27.386 27.38 27.308 27.179 27.038 26.882 26.719 26.553 26.361 26.146 25.947 25.767 25.556 25.353 25.176 24.99 24.784 24.595 24.401 24.208 24.047 23.867 23.687 23.491 23.287 23.159 23.018 22.781 22.613 22.434 22.332 22.133 21.934 21.711 21.591 21.292 21.15 20.998 20.84 20.502 20.316 20.107 19.887 19.646 19.318 18.799 16.939 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt deleted file mode 100644 index c2b2a9ef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1177 ,KEBNE ,16749910,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:19:53 CET,0.0 0.948 1.39 1.737 1.995 2.212 2.424 2.632 2.978 3.123 3.261 3.333 3.636 3.768 4.035 4.255 4.446 4.55 4.775 4.974 5.253 5.445 5.632 5.908 6.163 6.394 6.62 6.85 7.129 7.384 7.633 7.922 8.187 8.423 8.705 9.028 9.319 9.649 9.991 10.309 10.638 11.027 11.455 11.857 12.306 12.805 13.344 13.91 14.465 14.843 14.934 14.568 13.995 13.363 12.774 12.108 11.41 10.713 10.055 9.363 8.776 8.258 7.745 7.26 6.83 6.415 5.96 5.569 5.241 4.905 4.547 4.252 3.948 3.62 3.366 3.111 2.849 2.57 2.281 2.08 1.873 1.556 1.336 1.104 0.985 0.75 0.501 0.226 0.083 -0.245 -0.403 -0.579 -0.764 -1.177 -1.403 -1.648 -1.898 -2.163 -2.463 -2.855 -4.808 -2 ,4006 ,KEBNE ,16749911,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:20:31 CET,0.0 0.851 1.178 1.444 1.656 1.844 2.021 2.196 2.524 2.676 2.816 2.896 3.2 3.317 3.538 3.738 3.937 4.032 4.211 4.396 4.667 4.841 5.019 5.259 5.472 5.681 5.885 6.08 6.321 6.556 6.799 7.09 7.364 7.627 7.909 8.205 8.497 8.824 9.158 9.489 9.868 10.301 10.769 11.227 11.719 12.241 12.781 13.298 13.816 14.228 14.296 13.83 13.241 12.57 11.878 11.273 10.671 10.056 9.51 8.946 8.422 7.96 7.516 7.064 6.662 6.301 5.905 5.551 5.252 4.944 4.624 4.353 4.072 3.782 3.545 3.297 3.049 2.796 2.532 2.344 2.151 1.85 1.633 1.403 1.289 1.047 0.771 0.462 0.304 -0.033 -0.197 -0.389 -0.592 -1.018 -1.266 -1.532 -1.803 -2.102 -2.466 -2.953 -4.201 -3 ,31200 ,KEBNE ,16749912,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:19:13 CET,0.0 1.173 1.575 1.868 2.118 2.314 2.489 2.658 3.005 3.17 3.324 3.44 3.754 3.878 4.118 4.345 4.58 4.695 4.899 5.093 5.372 5.553 5.726 5.966 6.182 6.383 6.578 6.764 7.003 7.237 7.454 7.716 7.993 8.254 8.541 8.857 9.159 9.497 9.85 10.226 10.597 10.988 11.443 11.921 12.427 12.914 13.512 14.076 14.517 14.925 15.054 14.627 14.053 13.406 12.761 12.169 11.588 11.01 10.5 9.961 9.494 9.091 8.68 8.263 7.884 7.53 7.148 6.825 6.56 6.255 5.913 5.649 5.397 5.125 4.906 4.674 4.42 4.155 3.87 3.663 3.439 3.073 2.835 2.592 2.468 2.191 1.89 1.576 1.402 1.051 0.867 0.674 0.475 0.05 -0.177 -0.423 -0.7 -1.039 -1.429 -1.946 -3.476 -4 ,19907 ,KEBNE ,16749913,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:20:31 CET,0.0 0.787 1.177 1.476 1.789 2.059 2.278 2.504 2.897 3.063 3.245 3.379 3.702 3.834 4.078 4.31 4.519 4.622 4.84 5.056 5.359 5.559 5.743 5.995 6.239 6.478 6.71 6.94 7.215 7.466 7.699 7.972 8.236 8.484 8.763 9.064 9.381 9.732 10.09 10.496 10.918 11.347 11.84 12.323 12.863 13.445 14.046 14.6 15.168 15.727 16.079 15.918 15.385 14.85 14.356 13.808 13.194 12.539 11.938 11.306 10.735 10.218 9.713 9.224 8.78 8.395 7.968 7.585 7.261 6.913 6.547 6.248 5.938 5.611 5.357 5.078 4.789 4.494 4.191 3.985 3.772 3.437 3.189 2.946 2.826 2.557 2.291 2.018 1.87 1.524 1.348 1.172 0.994 0.597 0.377 0.151 -0.086 -0.38 -0.769 -1.29 -2.285 -5 ,24531 ,KEBNE ,16749914,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:20:35 CET,0.0 0.87 1.267 1.622 1.934 2.198 2.436 2.645 2.973 3.119 3.263 3.352 3.657 3.767 3.978 4.21 4.432 4.536 4.738 4.921 5.169 5.327 5.493 5.73 5.936 6.141 6.338 6.515 6.755 6.999 7.224 7.489 7.75 8.002 8.292 8.612 8.914 9.229 9.563 9.918 10.276 10.655 11.072 11.465 11.881 12.323 12.789 13.223 13.615 13.971 14.099 13.6 12.94 12.243 11.529 10.825 10.136 9.532 9.019 8.485 7.999 7.558 7.139 6.736 6.343 5.973 5.606 5.287 5.012 4.712 4.392 4.124 3.837 3.538 3.308 3.065 2.792 2.488 2.175 1.975 1.767 1.438 1.209 0.959 0.827 0.555 0.266 -0.039 -0.202 -0.562 -0.783 -0.982 -1.164 -1.521 -1.721 -1.946 -2.191 -2.483 -2.873 -3.332 -5.242 -6 ,20680 ,KEBNE ,16749915,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:19:52 CET,0.0 0.752 1.114 1.401 1.636 1.851 2.048 2.228 2.555 2.724 2.887 2.967 3.259 3.381 3.63 3.854 4.077 4.188 4.393 4.581 4.834 4.999 5.158 5.38 5.588 5.797 6.016 6.232 6.499 6.74 6.96 7.222 7.487 7.745 8.025 8.348 8.662 8.995 9.365 9.747 10.121 10.544 10.993 11.378 11.886 12.468 12.989 13.501 14.001 14.41 14.541 14.071 13.433 12.748 12.057 11.373 10.73 10.094 9.525 8.974 8.476 8.014 7.568 7.137 6.744 6.383 6.001 5.669 5.386 5.081 4.752 4.497 4.238 3.946 3.714 3.472 3.219 2.963 2.7 2.522 2.337 2.035 1.823 1.602 1.488 1.249 1.0 0.737 0.595 0.266 0.138 -0.028 -0.198 -0.535 -0.728 -0.956 -1.223 -1.519 -1.87 -2.356 -4.596 -7 ,15057 ,KEBNE ,16749916,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:18:59 CET,0.0 1.031 1.37 1.666 1.921 2.134 2.329 2.51 2.831 2.973 3.104 3.202 3.513 3.638 3.874 4.086 4.273 4.359 4.536 4.711 4.957 5.117 5.271 5.484 5.682 5.883 6.094 6.299 6.584 6.861 7.092 7.352 7.602 7.832 8.084 8.364 8.647 8.953 9.249 9.569 9.923 10.317 10.721 11.105 11.54 11.999 12.51 12.985 13.408 13.736 13.572 12.747 11.901 11.076 10.251 9.362 8.587 7.918 7.287 6.624 6.052 5.551 5.071 4.586 4.121 3.723 3.321 2.945 2.611 2.272 1.949 1.682 1.364 1.0 0.732 0.461 0.169 -0.132 -0.446 -0.663 -0.875 -1.208 -1.447 -1.688 -1.81 -2.056 -2.315 -2.574 -2.715 -3.051 -3.192 -3.363 -3.577 -4.043 -4.284 -4.555 -4.843 -5.164 -5.561 -6.076 -7.529 -8 ,27639 ,KEBNE ,16749917,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:19:38 CET,0.0 1.032 1.388 1.739 2.018 2.226 2.431 2.638 2.99 3.147 3.311 3.416 3.724 3.854 4.118 4.357 4.565 4.664 4.851 5.032 5.314 5.506 5.697 5.96 6.191 6.407 6.626 6.835 7.07 7.3 7.538 7.813 8.075 8.324 8.608 8.923 9.225 9.547 9.869 10.192 10.542 10.928 11.372 11.788 12.221 12.697 13.226 13.766 14.344 14.854 14.92 14.201 13.219 12.257 11.329 10.439 9.64 8.901 8.248 7.54 6.908 6.385 5.877 5.372 4.909 4.48 4.042 3.687 3.377 3.048 2.696 2.405 2.114 1.805 1.572 1.327 1.064 0.791 0.5 0.296 0.077 -0.273 -0.519 -0.765 -0.888 -1.158 -1.44 -1.725 -1.877 -2.217 -2.359 -2.527 -2.705 -3.192 -3.48 -3.774 -4.095 -4.395 -4.726 -5.184 -6.451 -9 ,24495 ,KEBNE ,16749918,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:21:06 CET,0.0 1.059 1.44 1.727 1.982 2.207 2.414 2.606 2.938 3.08 3.217 3.276 3.575 3.684 3.899 4.116 4.328 4.431 4.643 4.853 5.144 5.33 5.514 5.775 6.004 6.215 6.42 6.616 6.861 7.092 7.324 7.606 7.876 8.139 8.43 8.734 9.013 9.322 9.663 10.02 10.368 10.732 11.133 11.521 11.942 12.368 12.833 13.244 13.614 13.972 14.04 13.608 12.962 12.196 11.46 10.776 10.103 9.423 8.819 8.191 7.678 7.232 6.765 6.322 5.929 5.574 5.179 4.833 4.519 4.183 3.838 3.556 3.264 2.936 2.682 2.419 2.148 1.86 1.565 1.369 1.161 0.828 0.594 0.339 0.208 -0.044 -0.302 -0.581 -0.718 -1.052 -1.233 -1.413 -1.603 -2.036 -2.271 -2.531 -2.829 -3.175 -3.565 -4.084 -5.562 -10 ,1003 ,KEBNE ,16749919,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:20:14 CET,0.0 0.971 1.31 1.605 1.877 2.083 2.274 2.447 2.745 2.896 3.042 3.124 3.449 3.583 3.816 4.022 4.241 4.353 4.561 4.751 5.043 5.227 5.397 5.644 5.884 6.107 6.312 6.533 6.808 7.046 7.293 7.603 7.897 8.168 8.469 8.782 9.077 9.425 9.8 10.177 10.534 10.9 11.278 11.637 12.047 12.495 12.918 13.308 13.682 13.902 13.609 12.725 11.878 11.044 10.194 9.373 8.666 8.026 7.442 6.832 6.317 5.856 5.4 4.951 4.532 4.156 3.748 3.382 3.045 2.69 2.333 2.051 1.774 1.482 1.252 1.0 0.72 0.426 0.119 -0.098 -0.319 -0.664 -0.903 -1.148 -1.279 -1.555 -1.843 -2.147 -2.304 -2.649 -2.823 -3.007 -3.204 -3.621 -3.842 -4.083 -4.334 -4.65 -5.056 -5.546 -6.667 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index 52ff945e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22022 ,KEBNE ,16749920,Wed Dec 1 23:28:18 CET,Thu Dec 2 01:16:02 CET,0.0 1.125 1.529 1.846 2.121 2.349 2.553 2.755 3.124 3.289 3.442 3.566 3.852 3.967 4.197 4.416 4.616 4.713 4.901 5.081 5.347 5.513 5.666 5.888 6.099 6.302 6.488 6.666 6.905 7.134 7.355 7.614 7.852 8.084 8.342 8.626 8.892 9.174 9.477 9.786 10.113 10.464 10.825 11.189 11.584 11.984 12.368 12.67 12.92 13.018 12.616 11.567 10.47 9.363 8.333 7.347 6.39 5.488 4.679 3.849 3.149 2.483 1.813 1.173 0.588 0.072 -0.483 -0.996 -1.437 -1.912 -2.418 -2.834 -3.27 -3.744 -4.117 -4.494 -4.888 -5.3 -5.721 -6.02 -6.325 -6.797 -7.16 -7.545 -7.734 -8.154 -8.605 -9.041 -9.29 -9.72 -10.064 -10.344 -10.662 -11.311 -11.649 -12.055 -12.517 -13.013 -13.585 -14.41 -16.795 -2 ,14491 ,KEBNE ,16749921,Wed Dec 1 23:28:15 CET,Thu Dec 2 01:15:09 CET,0.0 1.078 1.551 1.892 2.169 2.412 2.622 2.816 3.171 3.326 3.474 3.598 3.905 4.04 4.286 4.524 4.748 4.852 5.052 5.247 5.519 5.69 5.854 6.088 6.32 6.553 6.768 6.97 7.229 7.467 7.703 7.992 8.266 8.52 8.799 9.105 9.401 9.74 10.099 10.455 10.805 11.184 11.598 11.985 12.391 12.787 13.197 13.546 13.795 13.801 13.217 12.1 10.914 9.726 8.644 7.614 6.687 5.831 5.084 4.301 3.574 2.896 2.241 1.621 1.036 0.508 -0.066 -0.618 -1.092 -1.603 -2.154 -2.592 -3.034 -3.503 -3.863 -4.219 -4.614 -5.032 -5.448 -5.736 -6.049 -6.565 -6.927 -7.309 -7.505 -7.894 -8.309 -8.736 -8.97 -9.402 -9.787 -10.074 -10.377 -11.038 -11.396 -11.801 -12.245 -12.775 -13.421 -14.248 -18.709 -3 ,28640 ,KEBNE ,16749922,Wed Dec 1 23:28:16 CET,Thu Dec 2 01:13:57 CET,0.0 1.168 1.618 1.963 2.255 2.499 2.701 2.887 3.233 3.389 3.541 3.662 3.966 4.098 4.34 4.563 4.771 4.866 5.064 5.259 5.542 5.724 5.895 6.144 6.393 6.624 6.829 7.023 7.27 7.502 7.719 7.981 8.223 8.449 8.72 9.015 9.292 9.604 9.926 10.24 10.555 10.89 11.269 11.624 11.994 12.37 12.748 13.075 13.3 13.302 12.762 11.632 10.433 9.292 8.228 7.21 6.277 5.364 4.54 3.733 3.046 2.402 1.755 1.126 0.531 -0.008 -0.582 -1.12 -1.582 -2.064 -2.579 -2.994 -3.443 -3.92 -4.285 -4.654 -5.04 -5.46 -5.904 -6.212 -6.516 -7.001 -7.354 -7.714 -7.897 -8.27 -8.681 -9.139 -9.369 -9.768 -10.108 -10.378 -10.647 -11.305 -11.684 -12.057 -12.451 -12.921 -13.505 -14.292 -16.565 -4 ,22340 ,KEBNE ,16749923,Wed Dec 1 23:28:10 CET,Thu Dec 2 01:16:47 CET,0.0 1.063 1.501 1.802 2.051 2.278 2.485 2.688 3.054 3.213 3.361 3.47 3.77 3.902 4.152 4.385 4.617 4.729 4.93 5.121 5.393 5.566 5.737 6.0 6.249 6.48 6.706 6.92 7.193 7.452 7.697 7.991 8.262 8.515 8.793 9.096 9.407 9.731 10.063 10.412 10.746 11.102 11.507 11.903 12.314 12.695 13.039 13.381 13.71 13.853 13.547 12.678 11.678 10.682 9.724 8.76 7.821 6.884 6.107 5.347 4.613 3.917 3.267 2.65 2.069 1.536 0.945 0.425 0.005 -0.452 -0.935 -1.34 -1.78 -2.233 -2.592 -2.973 -3.366 -3.774 -4.204 -4.505 -4.814 -5.3 -5.635 -5.965 -6.134 -6.501 -6.888 -7.307 -7.544 -7.958 -8.279 -8.561 -8.867 -9.499 -9.832 -10.197 -10.616 -11.105 -11.724 -12.44 -14.469 -5 ,13428 ,KEBNE ,16749924,Wed Dec 1 23:28:10 CET,Thu Dec 2 01:17:55 CET,0.0 1.01 1.451 1.791 2.078 2.323 2.521 2.715 3.104 3.276 3.437 3.58 3.866 3.982 4.209 4.431 4.643 4.749 4.951 5.131 5.39 5.558 5.727 5.978 6.208 6.422 6.633 6.838 7.095 7.336 7.565 7.827 8.073 8.319 8.601 8.904 9.193 9.502 9.825 10.142 10.451 10.81 11.222 11.599 12.002 12.383 12.757 13.113 13.335 13.331 12.827 11.635 10.367 9.175 8.104 7.126 6.194 5.3 4.493 3.67 2.986 2.322 1.652 1.003 0.362 -0.226 -0.83 -1.372 -1.835 -2.318 -2.811 -3.206 -3.635 -4.101 -4.481 -4.872 -5.256 -5.659 -6.079 -6.354 -6.635 -7.113 -7.455 -7.796 -7.972 -8.334 -8.717 -9.148 -9.375 -9.788 -10.121 -10.391 -10.672 -11.252 -11.58 -11.945 -12.331 -12.778 -13.292 -14.073 -16.909 -6 ,10607 ,KEBNE ,16749925,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:16:48 CET,0.0 1.077 1.558 1.87 2.137 2.409 2.652 2.853 3.214 3.394 3.565 3.687 3.986 4.109 4.335 4.55 4.767 4.872 5.075 5.263 5.523 5.693 5.867 6.118 6.327 6.527 6.735 6.934 7.172 7.394 7.606 7.87 8.122 8.351 8.603 8.884 9.143 9.426 9.733 10.05 10.377 10.726 11.114 11.477 11.901 12.343 12.748 13.138 13.476 13.584 13.2 12.27 11.225 10.115 9.068 8.095 7.185 6.328 5.54 4.757 4.126 3.562 2.969 2.373 1.815 1.297 0.736 0.224 -0.214 -0.691 -1.204 -1.645 -2.115 -2.597 -2.964 -3.333 -3.726 -4.137 -4.565 -4.863 -5.16 -5.631 -5.974 -6.319 -6.496 -6.858 -7.235 -7.651 -7.871 -8.268 -8.543 -8.777 -9.044 -9.657 -9.982 -10.322 -10.685 -11.11 -11.649 -12.42 -14.881 -7 ,30508 ,KEBNE ,16749926,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:17:13 CET,0.0 1.11 1.569 1.927 2.231 2.474 2.685 2.882 3.26 3.431 3.587 3.716 4.032 4.159 4.401 4.632 4.861 4.97 5.173 5.366 5.635 5.804 5.973 6.236 6.474 6.712 6.962 7.212 7.522 7.79 8.036 8.322 8.596 8.852 9.141 9.464 9.765 10.096 10.453 10.822 11.176 11.525 11.898 12.242 12.616 13.0 13.39 13.765 14.056 14.176 13.766 12.662 11.585 10.528 9.517 8.548 7.644 6.786 5.941 5.058 4.298 3.582 2.893 2.255 1.673 1.151 0.595 0.071 -0.413 -0.916 -1.443 -1.87 -2.294 -2.743 -3.089 -3.444 -3.819 -4.212 -4.635 -4.934 -5.246 -5.725 -6.075 -6.429 -6.599 -6.97 -7.363 -7.796 -8.023 -8.43 -8.774 -9.035 -9.318 -9.969 -10.357 -10.775 -11.179 -11.598 -12.125 -12.829 -14.956 -8 ,22329 ,KEBNE ,16749927,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:18:17 CET,0.0 0.849 1.249 1.604 1.908 2.159 2.388 2.586 2.94 3.108 3.267 3.415 3.741 3.873 4.123 4.363 4.592 4.696 4.893 5.083 5.354 5.532 5.699 5.946 6.192 6.417 6.623 6.821 7.065 7.291 7.516 7.782 8.035 8.276 8.547 8.858 9.153 9.451 9.746 10.064 10.4 10.742 11.109 11.471 11.86 12.261 12.661 12.989 13.251 13.34 12.84 11.653 10.438 9.257 8.086 6.966 5.976 5.041 4.211 3.379 2.62 1.928 1.28 0.637 0.05 -0.451 -1.005 -1.526 -1.973 -2.434 -2.928 -3.342 -3.776 -4.234 -4.586 -4.95 -5.323 -5.706 -6.106 -6.405 -6.722 -7.195 -7.539 -7.904 -8.089 -8.502 -8.908 -9.31 -9.535 -9.946 -10.303 -10.587 -10.863 -11.47 -11.812 -12.197 -12.644 -13.098 -13.637 -14.47 -16.678 -9 ,26020 ,KEBNE ,16749928,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:16:40 CET,0.0 0.994 1.384 1.694 1.971 2.229 2.455 2.645 2.99 3.164 3.323 3.451 3.767 3.903 4.141 4.369 4.58 4.679 4.862 5.035 5.295 5.468 5.634 5.863 6.078 6.295 6.5 6.68 6.916 7.149 7.375 7.641 7.888 8.133 8.417 8.728 9.017 9.318 9.638 9.975 10.328 10.703 11.108 11.482 11.849 12.206 12.526 12.794 12.97 12.873 12.189 10.842 9.49 8.138 6.842 5.668 4.601 3.608 2.78 1.943 1.187 0.501 -0.16 -0.794 -1.404 -1.96 -2.543 -3.076 -3.544 -4.036 -4.548 -4.967 -5.4 -5.85 -6.189 -6.538 -6.896 -7.293 -7.742 -8.041 -8.343 -8.838 -9.184 -9.545 -9.732 -10.124 -10.559 -11.017 -11.241 -11.633 -11.95 -12.214 -12.487 -13.099 -13.451 -13.821 -14.231 -14.749 -15.389 -16.248 -19.14 -10 ,15496 ,KEBNE ,16749929,Wed Dec 1 23:28:14 CET,Thu Dec 2 01:15:54 CET,0.0 0.996 1.468 1.865 2.209 2.512 2.783 3.025 3.476 3.674 3.865 4.094 4.425 4.559 4.807 5.038 5.256 5.364 5.582 5.786 6.071 6.245 6.406 6.636 6.865 7.096 7.313 7.512 7.77 8.024 8.258 8.53 8.79 9.028 9.297 9.606 9.896 10.206 10.541 10.891 11.244 11.608 11.964 12.303 12.668 13.022 13.397 13.743 13.98 13.934 13.416 12.358 11.122 9.949 8.833 7.731 6.739 5.8 4.96 4.122 3.375 2.702 2.054 1.401 0.811 0.289 -0.27 -0.772 -1.226 -1.699 -2.173 -2.575 -3.021 -3.503 -3.874 -4.246 -4.632 -5.043 -5.475 -5.778 -6.095 -6.591 -6.94 -7.307 -7.506 -7.932 -8.365 -8.816 -9.058 -9.491 -9.871 -10.156 -10.451 -11.097 -11.456 -11.844 -12.271 -12.798 -13.5 -14.411 -16.79 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 4bf8dcdf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28156 ,KEBNE ,16749930,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:19:18 CET,0.0 0.538 0.811 1.026 1.242 1.445 1.633 1.808 2.134 2.29 2.438 2.561 2.862 2.985 3.224 3.449 3.66 3.763 3.965 4.157 4.432 4.617 4.798 5.058 5.307 5.538 5.764 5.98 6.268 6.55 6.806 7.115 7.412 7.698 8.042 8.416 8.763 9.138 9.532 9.945 10.386 10.878 11.408 11.913 12.504 13.142 13.821 14.522 15.237 15.905 16.362 16.172 15.623 14.976 14.344 13.708 13.047 12.402 11.85 11.245 10.68 10.159 9.644 9.17 8.729 8.316 7.885 7.496 7.129 6.73 6.32 5.98 5.624 5.245 4.95 4.639 4.318 3.989 3.65 3.414 3.178 2.808 2.541 2.264 2.109 1.795 1.488 1.159 0.983 0.644 0.434 0.237 0.028 -0.422 -0.686 -0.988 -1.306 -1.648 -2.072 -2.638 -4.084 -2 ,28814 ,KEBNE ,16749931,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:18:52 CET,0.0 0.327 0.559 0.76 0.927 1.087 1.253 1.417 1.727 1.871 2.012 2.098 2.391 2.515 2.763 2.988 3.203 3.308 3.499 3.686 3.955 4.118 4.277 4.516 4.745 4.963 5.187 5.402 5.672 5.936 6.191 6.507 6.805 7.095 7.442 7.823 8.171 8.548 8.964 9.406 9.86 10.327 10.859 11.366 11.909 12.511 13.147 13.802 14.53 15.247 15.729 15.574 15.054 14.381 13.692 13.013 12.343 11.723 11.184 10.631 10.121 9.637 9.181 8.747 8.331 7.938 7.513 7.136 6.801 6.429 6.043 5.732 5.409 5.074 4.815 4.537 4.247 3.945 3.611 3.365 3.104 2.698 2.416 2.097 1.934 1.611 1.246 0.836 0.619 0.239 -0.081 -0.324 -0.56 -1.083 -1.371 -1.669 -2.006 -2.41 -2.88 -3.506 -5.243 -3 ,7097 ,KEBNE ,16749932,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:19:36 CET,0.0 0.396 0.663 0.883 1.073 1.252 1.42 1.575 1.859 1.993 2.119 2.206 2.49 2.61 2.849 3.071 3.274 3.372 3.559 3.742 3.997 4.159 4.329 4.582 4.828 5.068 5.291 5.495 5.754 6.005 6.245 6.518 6.772 7.022 7.315 7.652 7.963 8.285 8.629 8.985 9.357 9.786 10.301 10.788 11.299 11.835 12.443 13.043 13.645 14.283 14.732 14.477 13.881 13.234 12.627 11.969 11.32 10.674 10.041 9.387 8.792 8.253 7.75 7.273 6.82 6.386 5.922 5.51 5.156 4.792 4.406 4.068 3.691 3.307 3.023 2.712 2.385 2.054 1.713 1.48 1.241 0.872 0.615 0.355 0.218 -0.079 -0.387 -0.708 -0.879 -1.221 -1.458 -1.655 -1.861 -2.297 -2.521 -2.801 -3.126 -3.448 -3.83 -4.359 -5.587 -4 ,6138 ,KEBNE ,16749933,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:20:43 CET,0.0 0.421 0.711 0.954 1.165 1.354 1.518 1.67 1.941 2.072 2.199 2.299 2.585 2.699 2.913 3.123 3.326 3.423 3.619 3.804 4.071 4.247 4.403 4.631 4.863 5.087 5.301 5.516 5.785 6.025 6.257 6.542 6.813 7.062 7.362 7.702 8.01 8.348 8.723 9.118 9.513 9.954 10.454 10.908 11.4 11.917 12.491 13.098 13.716 14.263 14.618 14.549 14.103 13.546 12.971 12.328 11.729 11.145 10.584 10.01 9.509 9.011 8.503 8.038 7.593 7.174 6.73 6.345 6.024 5.673 5.298 4.969 4.624 4.274 3.995 3.686 3.362 3.045 2.725 2.506 2.268 1.843 1.559 1.284 1.143 0.84 0.513 0.168 -0.02 -0.368 -0.592 -0.798 -1.015 -1.445 -1.702 -1.992 -2.303 -2.644 -3.097 -3.754 -5.594 -5 ,10026 ,KEBNE ,16749934,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:19:00 CET,0.0 0.361 0.629 0.853 1.074 1.285 1.481 1.647 1.931 2.068 2.199 2.29 2.577 2.688 2.907 3.118 3.316 3.411 3.598 3.788 4.052 4.217 4.387 4.641 4.877 5.102 5.319 5.522 5.784 6.038 6.277 6.569 6.857 7.123 7.414 7.759 8.091 8.436 8.8 9.18 9.574 10.02 10.544 11.038 11.568 12.127 12.712 13.333 13.964 14.469 14.676 14.337 13.892 13.316 12.65 11.992 11.355 10.751 10.179 9.537 8.966 8.438 7.928 7.451 6.993 6.564 6.12 5.741 5.42 5.063 4.661 4.326 3.971 3.591 3.3 3.001 2.667 2.313 1.953 1.71 1.457 1.06 0.788 0.507 0.351 0.024 -0.292 -0.61 -0.774 -1.101 -1.32 -1.543 -1.765 -2.218 -2.484 -2.766 -3.067 -3.407 -3.81 -4.335 -5.502 -6 ,1810 ,KEBNE ,16749935,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:18:38 CET,0.0 0.554 0.795 0.997 1.175 1.344 1.513 1.668 1.975 2.121 2.249 2.336 2.634 2.77 3.03 3.257 3.459 3.558 3.755 3.943 4.222 4.4 4.558 4.789 5.02 5.245 5.466 5.675 5.937 6.196 6.442 6.746 7.052 7.342 7.673 8.045 8.388 8.761 9.17 9.584 9.993 10.46 10.996 11.5 12.045 12.611 13.229 13.908 14.636 15.308 15.757 15.59 15.091 14.449 13.771 13.115 12.516 11.963 11.462 10.898 10.387 9.933 9.489 9.052 8.633 8.24 7.831 7.456 7.098 6.725 6.355 6.055 5.732 5.37 5.093 4.802 4.486 4.154 3.796 3.533 3.264 2.86 2.576 2.266 2.1 1.756 1.381 0.972 0.765 0.387 0.06 -0.202 -0.492 -1.127 -1.442 -1.749 -2.102 -2.516 -2.982 -3.57 -5.27 -7 ,14566 ,KEBNE ,16749936,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:19:15 CET,0.0 0.369 0.647 0.9 1.129 1.355 1.561 1.735 2.05 2.196 2.337 2.431 2.72 2.84 3.066 3.28 3.49 3.594 3.792 3.986 4.26 4.435 4.61 4.85 5.082 5.326 5.558 5.775 6.072 6.367 6.643 6.955 7.246 7.552 7.917 8.303 8.657 9.036 9.442 9.867 10.317 10.838 11.431 11.973 12.555 13.212 13.988 14.782 15.473 16.109 16.681 16.589 16.193 15.688 15.104 14.466 13.803 13.152 12.595 12.003 11.462 10.987 10.538 10.089 9.648 9.249 8.836 8.445 8.083 7.706 7.286 6.921 6.526 6.114 5.825 5.541 5.243 4.917 4.561 4.302 4.035 3.638 3.354 3.031 2.855 2.515 2.172 1.773 1.552 1.174 0.894 0.664 0.419 -0.149 -0.46 -0.807 -1.209 -1.658 -2.202 -2.999 -4.863 -8 ,25689 ,KEBNE ,16749937,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:18:22 CET,0.0 0.428 0.713 0.938 1.144 1.347 1.528 1.677 1.93 2.051 2.172 2.243 2.528 2.645 2.864 3.065 3.259 3.354 3.542 3.729 3.999 4.171 4.338 4.582 4.813 5.031 5.241 5.441 5.693 5.947 6.193 6.492 6.777 7.046 7.354 7.693 8.024 8.39 8.788 9.2 9.633 10.134 10.695 11.234 11.834 12.447 13.125 13.848 14.593 15.295 15.718 15.536 15.076 14.442 13.741 13.032 12.36 11.685 11.075 10.503 9.989 9.494 9.006 8.537 8.111 7.719 7.295 6.918 6.563 6.179 5.782 5.437 5.081 4.716 4.44 4.16 3.872 3.581 3.27 3.041 2.797 2.426 2.175 1.915 1.773 1.463 1.126 0.772 0.589 0.239 -0.021 -0.265 -0.511 -1.0 -1.256 -1.548 -1.894 -2.273 -2.714 -3.29 -5.583 -9 ,1310 ,KEBNE ,16749938,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:18:09 CET,0.0 0.488 0.794 1.061 1.299 1.514 1.712 1.885 2.187 2.339 2.482 2.579 2.888 3.02 3.25 3.483 3.716 3.826 4.036 4.233 4.515 4.702 4.88 5.137 5.385 5.632 5.871 6.097 6.388 6.66 6.924 7.243 7.546 7.829 8.149 8.515 8.857 9.223 9.607 10.018 10.433 10.877 11.416 11.951 12.538 13.119 13.736 14.39 15.026 15.582 15.902 15.697 15.202 14.591 13.953 13.307 12.649 12.008 11.478 10.919 10.35 9.821 9.327 8.852 8.401 7.959 7.492 7.07 6.699 6.335 5.96 5.648 5.314 4.942 4.649 4.342 4.017 3.67 3.314 3.063 2.784 2.334 2.017 1.684 1.509 1.16 0.801 0.412 0.212 -0.16 -0.454 -0.687 -0.927 -1.434 -1.733 -2.071 -2.455 -2.901 -3.408 -4.105 -5.976 -10 ,17433 ,KEBNE ,16749939,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:19:13 CET,0.0 0.373 0.645 0.899 1.091 1.258 1.42 1.557 1.833 1.966 2.093 2.182 2.462 2.577 2.802 3.01 3.221 3.33 3.531 3.717 3.974 4.137 4.295 4.533 4.775 5.005 5.23 5.449 5.73 5.994 6.244 6.545 6.821 7.083 7.388 7.734 8.054 8.377 8.736 9.142 9.54 9.942 10.419 10.903 11.462 12.06 12.704 13.393 14.094 14.744 15.213 15.111 14.671 14.065 13.42 12.772 12.093 11.452 10.92 10.34 9.773 9.236 8.733 8.25 7.797 7.407 6.992 6.61 6.272 5.912 5.533 5.22 4.889 4.518 4.229 3.918 3.593 3.254 2.89 2.637 2.369 1.958 1.683 1.402 1.265 0.983 0.664 0.316 0.137 -0.209 -0.472 -0.695 -0.918 -1.419 -1.683 -1.947 -2.258 -2.626 -3.067 -3.629 -5.362 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 3317fa0c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11151 ,KEBNE ,16749940,Wed Dec 1 23:28:13 CET,Thu Dec 2 01:06:04 CET,0.0 2.06 2.851 3.446 3.907 4.276 4.585 4.871 5.371 5.591 5.803 6.004 6.385 6.552 6.882 7.184 7.468 7.604 7.864 8.117 8.482 8.705 8.934 9.278 9.582 9.861 10.13 10.412 10.801 11.173 11.503 11.871 12.213 12.537 12.899 13.306 13.708 14.135 14.566 15.011 15.48 15.975 16.532 17.076 17.69 18.333 18.92 19.478 19.953 20.077 19.435 17.899 16.287 14.683 13.248 11.953 10.773 9.688 8.734 7.771 6.945 6.208 5.522 4.878 4.254 3.677 3.091 2.592 2.153 1.676 1.187 0.771 0.342 -0.096 -0.437 -0.792 -1.171 -1.549 -1.933 -2.209 -2.492 -2.924 -3.212 -3.512 -3.675 -4.056 -4.47 -4.89 -5.097 -5.52 -5.77 -6.005 -6.248 -6.785 -7.083 -7.399 -7.751 -8.169 -8.67 -9.345 -11.038 -2 ,17935 ,KEBNE ,16749941,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:05:24 CET,0.0 1.817 2.547 3.119 3.587 3.989 4.329 4.639 5.167 5.399 5.62 5.826 6.211 6.383 6.712 7.032 7.354 7.512 7.815 8.099 8.505 8.772 9.026 9.395 9.758 10.097 10.418 10.708 11.053 11.379 11.684 12.052 12.415 12.756 13.125 13.529 13.925 14.346 14.783 15.228 15.69 16.204 16.774 17.317 17.912 18.514 19.15 19.676 20.064 20.231 19.648 18.203 16.537 14.96 13.585 12.282 11.071 9.989 9.058 8.106 7.269 6.53 5.811 5.139 4.533 3.97 3.395 2.908 2.481 2.017 1.538 1.138 0.72 0.298 -0.028 -0.371 -0.736 -1.109 -1.49 -1.753 -2.031 -2.471 -2.767 -3.076 -3.25 -3.639 -4.06 -4.503 -4.724 -5.171 -5.477 -5.741 -6.023 -6.609 -6.917 -7.258 -7.63 -8.053 -8.568 -9.192 -10.72 -3 ,9941 ,KEBNE ,16749942,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:04:10 CET,0.0 1.886 2.494 2.984 3.425 3.832 4.184 4.49 5.012 5.25 5.475 5.674 6.057 6.233 6.567 6.898 7.219 7.362 7.627 7.879 8.233 8.464 8.708 9.082 9.448 9.766 10.042 10.295 10.617 10.939 11.246 11.622 11.986 12.341 12.732 13.12 13.489 13.911 14.365 14.822 15.268 15.762 16.345 16.908 17.522 18.151 18.754 19.269 19.643 19.714 19.024 17.493 15.934 14.342 12.838 11.507 10.33 9.224 8.262 7.305 6.481 5.771 5.112 4.477 3.884 3.332 2.739 2.212 1.748 1.267 0.792 0.387 -0.063 -0.542 -0.904 -1.254 -1.596 -1.959 -2.363 -2.638 -2.917 -3.348 -3.645 -3.964 -4.129 -4.463 -4.833 -5.235 -5.442 -5.866 -6.093 -6.326 -6.576 -7.105 -7.396 -7.724 -8.101 -8.529 -9.026 -9.68 -11.237 -4 ,21401 ,KEBNE ,16749943,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:06:03 CET,0.0 2.024 2.664 3.164 3.592 3.962 4.275 4.563 5.046 5.261 5.495 5.745 6.144 6.331 6.657 6.95 7.232 7.368 7.637 7.92 8.325 8.556 8.792 9.162 9.5 9.796 10.073 10.338 10.686 11.037 11.356 11.73 12.09 12.418 12.787 13.192 13.584 14.004 14.426 14.876 15.324 15.808 16.386 16.945 17.514 18.063 18.612 19.14 19.611 19.786 19.176 17.782 16.186 14.593 13.181 11.866 10.663 9.588 8.659 7.724 6.912 6.182 5.501 4.829 4.195 3.642 3.052 2.518 2.072 1.613 1.127 0.722 0.305 -0.119 -0.451 -0.805 -1.189 -1.574 -1.969 -2.253 -2.562 -3.032 -3.341 -3.697 -3.895 -4.272 -4.639 -5.019 -5.217 -5.634 -5.859 -6.083 -6.329 -6.962 -7.33 -7.707 -8.149 -8.667 -9.235 -9.989 -11.724 -5 ,20082 ,KEBNE ,16749944,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:06:17 CET,0.0 2.359 3.13 3.699 4.19 4.594 4.931 5.225 5.729 5.95 6.168 6.397 6.778 6.945 7.27 7.579 7.871 8.011 8.288 8.557 8.93 9.168 9.397 9.708 10.003 10.293 10.568 10.845 11.199 11.525 11.836 12.195 12.534 12.853 13.228 13.67 14.101 14.545 15.003 15.478 15.952 16.467 17.012 17.535 18.153 18.783 19.347 19.806 20.178 20.318 19.748 18.144 16.454 14.919 13.522 12.206 11.041 9.997 9.068 8.094 7.272 6.539 5.84 5.178 4.575 4.05 3.488 2.987 2.546 2.089 1.617 1.212 0.798 0.369 0.037 -0.313 -0.681 -1.062 -1.46 -1.746 -2.054 -2.549 -2.873 -3.177 -3.33 -3.663 -4.025 -4.383 -4.575 -4.996 -5.213 -5.438 -5.683 -6.247 -6.555 -6.884 -7.258 -7.705 -8.22 -8.907 -10.913 -6 ,19160 ,KEBNE ,16749945,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:04:14 CET,0.0 1.835 2.541 3.096 3.557 3.956 4.32 4.643 5.237 5.519 5.77 6.004 6.397 6.574 6.914 7.24 7.542 7.68 7.952 8.219 8.585 8.809 9.022 9.35 9.658 9.939 10.216 10.474 10.794 11.102 11.399 11.767 12.119 12.452 12.843 13.28 13.67 14.106 14.574 15.026 15.503 16.034 16.605 17.146 17.744 18.327 18.914 19.469 19.848 19.981 19.271 17.538 15.874 14.295 12.892 11.6 10.42 9.345 8.412 7.474 6.645 5.887 5.176 4.5 3.878 3.307 2.703 2.178 1.721 1.239 0.735 0.333 -0.077 -0.505 -0.845 -1.206 -1.586 -1.959 -2.33 -2.595 -2.888 -3.391 -3.744 -4.093 -4.264 -4.616 -4.987 -5.377 -5.576 -5.993 -6.222 -6.454 -6.698 -7.249 -7.544 -7.848 -8.211 -8.627 -9.123 -9.79 -11.497 -7 ,25855 ,KEBNE ,16749946,Wed Dec 1 23:28:13 CET,Thu Dec 2 01:03:58 CET,0.0 2.147 2.805 3.256 3.634 3.972 4.26 4.532 5.02 5.237 5.451 5.654 6.037 6.213 6.544 6.845 7.13 7.267 7.539 7.805 8.173 8.427 8.69 9.051 9.372 9.661 9.934 10.19 10.522 10.855 11.17 11.542 11.909 12.266 12.666 13.08 13.468 13.898 14.356 14.815 15.266 15.754 16.31 16.852 17.419 17.982 18.563 19.069 19.386 19.423 18.849 17.397 15.764 14.204 12.752 11.447 10.289 9.22 8.269 7.292 6.464 5.744 5.045 4.364 3.76 3.208 2.637 2.123 1.663 1.2 0.725 0.323 -0.101 -0.531 -0.855 -1.194 -1.546 -1.913 -2.309 -2.579 -2.876 -3.367 -3.68 -3.997 -4.165 -4.502 -4.862 -5.24 -5.438 -5.86 -6.098 -6.328 -6.573 -7.118 -7.422 -7.789 -8.217 -8.715 -9.316 -10.035 -11.889 -8 ,12830 ,KEBNE ,16749947,Wed Dec 1 23:28:11 CET,Thu Dec 2 01:03:59 CET,0.0 1.741 2.474 3.027 3.474 3.831 4.141 4.426 4.94 5.174 5.397 5.612 5.999 6.167 6.491 6.814 7.115 7.249 7.51 7.783 8.204 8.476 8.744 9.121 9.435 9.726 10.042 10.335 10.671 10.994 11.297 11.664 12.009 12.342 12.732 13.145 13.516 13.915 14.358 14.822 15.319 15.866 16.419 16.947 17.575 18.209 18.854 19.364 19.709 19.935 19.415 17.881 16.233 14.713 13.309 11.953 10.765 9.692 8.747 7.787 6.93 6.195 5.533 4.887 4.265 3.69 3.099 2.572 2.095 1.601 1.091 0.686 0.275 -0.175 -0.525 -0.868 -1.237 -1.624 -2.006 -2.266 -2.549 -2.987 -3.286 -3.602 -3.766 -4.109 -4.475 -4.871 -5.085 -5.525 -5.795 -6.053 -6.327 -6.944 -7.304 -7.694 -8.107 -8.575 -9.13 -9.894 -11.983 -9 ,27776 ,KEBNE ,16749948,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:06:50 CET,0.0 2.01 2.693 3.201 3.611 3.963 4.26 4.544 5.085 5.319 5.537 5.745 6.136 6.32 6.677 7.004 7.297 7.438 7.719 7.995 8.385 8.63 8.884 9.256 9.569 9.855 10.143 10.408 10.761 11.139 11.473 11.834 12.19 12.535 12.923 13.351 13.751 14.169 14.607 15.056 15.527 16.059 16.664 17.206 17.771 18.374 19.045 19.66 20.048 20.156 19.51 18.002 16.416 14.832 13.418 12.152 11.005 9.922 8.983 8.042 7.219 6.494 5.806 5.153 4.539 3.973 3.373 2.838 2.368 1.852 1.314 0.891 0.47 0.05 -0.287 -0.665 -1.074 -1.493 -1.915 -2.205 -2.497 -2.936 -3.249 -3.571 -3.737 -4.083 -4.441 -4.841 -5.05 -5.466 -5.699 -5.941 -6.194 -6.741 -7.051 -7.384 -7.752 -8.191 -8.734 -9.463 -11.241 -10 ,7421 ,KEBNE ,16749949,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:04:06 CET,0.0 2.375 3.148 3.723 4.223 4.632 4.993 5.324 5.915 6.189 6.461 6.734 7.155 7.366 7.731 8.058 8.374 8.535 8.851 9.14 9.563 9.842 10.1 10.434 10.733 11.027 11.302 11.566 11.896 12.211 12.521 12.875 13.204 13.546 13.968 14.43 14.829 15.249 15.703 16.167 16.631 17.141 17.714 18.257 18.879 19.494 20.106 20.699 21.224 21.485 20.918 19.319 17.657 16.093 14.65 13.317 12.138 11.074 10.146 9.214 8.404 7.699 7.035 6.374 5.759 5.201 4.6 4.078 3.63 3.158 2.681 2.267 1.833 1.386 1.013 0.632 0.267 -0.104 -0.497 -0.763 -1.046 -1.51 -1.844 -2.192 -2.36 -2.706 -3.076 -3.484 -3.704 -4.14 -4.382 -4.609 -4.865 -5.446 -5.754 -6.099 -6.49 -6.924 -7.434 -8.079 -10.174 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt deleted file mode 100644 index db2e5bb9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18246 ,KEBNE ,16749950,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:10:07 CET,0.0 1.833 2.656 3.233 3.716 4.193 4.605 4.95 5.569 5.838 6.094 6.297 6.84 7.069 7.487 7.889 8.27 8.447 8.783 9.089 9.549 9.853 10.131 10.543 10.94 11.304 11.649 11.968 12.358 12.732 13.096 13.515 13.907 14.266 14.657 15.129 15.576 16.043 16.543 17.044 17.561 18.137 18.788 19.387 20.013 20.654 21.29 21.828 22.262 22.491 22.082 20.71 19.139 17.67 16.297 14.97 13.785 12.704 11.738 10.751 9.898 9.115 8.351 7.623 6.918 6.277 5.609 5.001 4.479 3.937 3.361 2.878 2.376 1.853 1.462 1.057 0.633 0.183 -0.318 -0.676 -1.037 -1.604 -1.983 -2.36 -2.569 -3.012 -3.491 -3.991 -4.246 -4.815 -5.127 -5.467 -5.818 -6.572 -6.986 -7.461 -7.979 -8.552 -9.283 -10.279 -12.827 -2 ,7026 ,KEBNE ,16749951,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:11:55 CET,0.0 2.22 2.965 3.499 3.95 4.349 4.703 5.016 5.583 5.844 6.097 6.253 6.763 6.978 7.404 7.793 8.152 8.324 8.646 8.966 9.447 9.731 9.988 10.353 10.692 11.04 11.37 11.664 12.08 12.499 12.964 13.631 14.241 14.769 15.38 16.062 16.718 17.417 18.121 18.858 19.576 20.373 21.281 22.115 23.079 24.057 25.008 25.934 26.674 27.07 26.708 24.999 23.091 21.305 19.61 18.01 16.52 15.123 13.888 12.651 11.587 10.607 9.661 8.788 7.946 7.122 6.264 5.511 4.86 4.165 3.452 2.859 2.222 1.571 1.046 0.497 -0.053 -0.613 -1.22 -1.644 -2.074 -2.773 -3.261 -3.765 -4.027 -4.543 -5.062 -5.639 -5.948 -6.565 -6.924 -7.268 -7.638 -8.462 -8.93 -9.444 -10.032 -10.763 -11.713 -13.018 -17.939 -3 ,26355 ,KEBNE ,16749952,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:10:36 CET,0.0 1.888 2.823 3.541 4.141 4.651 5.089 5.496 6.29 6.656 6.986 7.27 7.833 8.099 8.642 9.16 9.627 9.846 10.264 10.672 11.246 11.615 11.968 12.47 12.955 13.414 13.875 14.344 14.919 15.439 15.915 16.492 17.064 17.612 18.259 18.919 19.496 20.153 20.876 21.605 22.354 23.184 24.071 24.9 25.824 26.746 27.726 28.821 29.833 30.368 30.066 28.608 26.689 24.686 22.823 21.167 19.707 18.371 17.211 15.942 14.806 13.812 12.871 11.952 11.076 10.278 9.422 8.647 7.996 7.291 6.537 5.941 5.341 4.708 4.209 3.691 3.157 2.614 2.02 1.591 1.156 0.507 0.064 -0.391 -0.627 -1.142 -1.7 -2.299 -2.608 -3.221 -3.615 -3.997 -4.394 -5.335 -5.895 -6.446 -7.043 -7.739 -8.536 -9.572 -12.564 -4 ,5091 ,KEBNE ,16749953,Wed Dec 1 23:28:13 CET,Thu Dec 2 01:08:27 CET,0.0 3.485 4.456 5.128 5.711 6.195 6.618 7.016 7.779 8.128 8.439 8.719 9.296 9.567 10.104 10.618 11.106 11.328 11.745 12.154 12.723 13.088 13.436 13.937 14.452 14.959 15.424 15.855 16.372 16.853 17.353 17.978 18.55 19.084 19.688 20.351 20.979 21.636 22.346 23.081 23.828 24.621 25.496 26.429 27.46 28.427 29.457 30.436 31.212 31.643 31.321 29.955 28.333 26.691 25.035 23.344 21.773 20.322 19.04 17.786 16.711 15.711 14.749 13.841 12.971 12.183 11.365 10.625 9.998 9.32 8.552 7.919 7.299 6.648 6.122 5.576 5.006 4.425 3.827 3.404 2.964 2.286 1.801 1.273 1.006 0.468 -0.083 -0.672 -0.992 -1.616 -1.998 -2.374 -2.761 -3.63 -4.13 -4.654 -5.23 -5.891 -6.671 -7.786 -10.926 -5 ,17778 ,KEBNE ,16749954,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:08:51 CET,0.0 2.195 2.931 3.455 3.909 4.327 4.689 5.015 5.635 5.928 6.21 6.461 7.038 7.308 7.815 8.292 8.739 8.955 9.37 9.773 10.366 10.738 11.09 11.601 12.108 12.603 13.075 13.508 14.063 14.61 15.12 15.71 16.247 16.786 17.471 18.214 18.845 19.523 20.213 20.905 21.633 22.435 23.374 24.301 25.27 26.202 27.183 28.069 28.833 29.468 29.118 27.514 25.673 23.821 22.152 20.505 18.906 17.45 16.207 14.965 13.894 12.893 11.912 10.983 10.098 9.298 8.44 7.647 7.006 6.347 5.626 5.028 4.414 3.773 3.269 2.731 2.157 1.551 0.921 0.497 0.07 -0.602 -1.068 -1.538 -1.783 -2.325 -2.886 -3.471 -3.787 -4.416 -4.83 -5.196 -5.571 -6.454 -6.947 -7.473 -8.03 -8.648 -9.415 -10.485 -14.305 -6 ,25280 ,KEBNE ,16749955,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:10:43 CET,0.0 2.567 3.482 4.167 4.729 5.238 5.674 6.059 6.789 7.128 7.46 7.806 8.39 8.665 9.18 9.646 10.101 10.32 10.731 11.131 11.716 12.09 12.431 12.934 13.452 13.932 14.397 14.83 15.35 15.878 16.382 16.994 17.6 18.142 18.758 19.421 20.035 20.733 21.479 22.251 23.023 23.808 24.721 25.589 26.501 27.459 28.421 29.3 30.006 30.442 30.05 28.33 26.434 24.548 22.721 21.025 19.585 18.249 17.043 15.882 14.853 13.875 12.936 12.028 11.187 10.406 9.568 8.843 8.198 7.501 6.776 6.18 5.557 4.898 4.379 3.834 3.284 2.714 2.108 1.694 1.262 0.574 0.108 -0.395 -0.662 -1.207 -1.8 -2.414 -2.732 -3.37 -3.789 -4.156 -4.54 -5.399 -5.881 -6.417 -7.042 -7.713 -8.455 -9.611 -14.549 -7 ,24219 ,KEBNE ,16749956,Wed Dec 1 23:28:12 CET,Thu Dec 2 01:08:58 CET,0.0 2.503 3.495 4.193 4.763 5.238 5.682 6.079 6.747 7.066 7.384 7.696 8.286 8.566 9.108 9.624 10.088 10.3 10.716 11.13 11.717 12.082 12.438 12.945 13.429 13.916 14.39 14.832 15.363 15.876 16.383 17.003 17.596 18.13 18.739 19.444 20.073 20.71 21.387 22.104 22.857 23.678 24.617 25.491 26.384 27.217 28.145 29.11 29.978 30.496 30.039 28.347 26.365 24.492 22.8 21.188 19.624 18.179 16.95 15.697 14.561 13.523 12.549 11.631 10.789 10.0 9.154 8.383 7.724 7.051 6.335 5.748 5.121 4.442 3.928 3.379 2.809 2.252 1.665 1.254 0.84 0.188 -0.271 -0.737 -0.975 -1.468 -1.991 -2.547 -2.841 -3.456 -3.824 -4.175 -4.544 -5.345 -5.8 -6.322 -6.905 -7.569 -8.384 -9.49 -12.77 -8 ,8606 ,KEBNE ,16749957,Wed Dec 1 23:29:15 CET,Thu Dec 2 01:10:54 CET,0.0 2.466 3.34 3.982 4.507 4.987 5.442 5.847 6.584 6.959 7.318 7.653 8.241 8.535 9.097 9.583 10.041 10.268 10.704 11.116 11.706 12.074 12.438 12.96 13.435 13.881 14.313 14.734 15.262 15.757 16.229 16.828 17.404 17.926 18.519 19.213 19.863 20.555 21.349 22.147 22.926 23.772 24.701 25.519 26.4 27.376 28.446 29.455 30.34 30.951 30.457 28.696 26.741 24.912 23.281 21.648 20.132 18.753 17.525 16.235 15.057 13.954 12.9 11.942 11.06 10.262 9.428 8.678 8.022 7.352 6.65 6.06 5.444 4.797 4.284 3.752 3.214 2.647 2.03 1.603 1.17 0.483 0.016 -0.472 -0.734 -1.274 -1.846 -2.462 -2.789 -3.428 -3.845 -4.227 -4.628 -5.534 -6.036 -6.583 -7.17 -7.84 -8.683 -9.749 -12.346 -9 ,12550 ,KEBNE ,16749958,Wed Dec 1 23:29:17 CET,Thu Dec 2 01:03:53 CET,0.0 2.172 2.906 3.453 3.906 4.305 4.659 4.988 5.593 5.868 6.117 6.266 6.779 6.989 7.409 7.793 8.145 8.314 8.638 8.968 9.432 9.715 10.002 10.407 10.774 11.126 11.462 11.788 12.218 12.625 13.006 13.446 13.856 14.263 14.766 15.455 16.153 16.81 17.531 18.332 19.126 19.968 20.837 21.674 22.643 23.609 24.561 25.461 26.287 26.847 26.569 24.998 23.173 21.386 19.682 18.041 16.547 15.196 14.017 12.757 11.636 10.63 9.623 8.65 7.728 6.866 5.988 5.205 4.547 3.851 3.125 2.542 1.928 1.298 0.804 0.293 -0.25 -0.818 -1.419 -1.859 -2.31 -2.993 -3.471 -3.981 -4.247 -4.767 -5.299 -5.859 -6.146 -6.758 -7.128 -7.502 -7.926 -8.885 -9.413 -9.981 -10.584 -11.227 -11.97 -13.039 -16.966 -10 ,15353 ,KEBNE ,16749959,Wed Dec 1 23:45:05 CET,Thu Dec 2 01:27:04 CET,0.0 2.452 3.425 4.147 4.708 5.199 5.658 6.064 6.832 7.177 7.495 7.854 8.447 8.719 9.263 9.775 10.241 10.47 10.918 11.322 11.896 12.275 12.636 13.153 13.633 14.089 14.527 14.947 15.522 16.073 16.568 17.152 17.677 18.193 18.829 19.517 20.124 20.749 21.457 22.204 22.944 23.772 24.723 25.609 26.537 27.498 28.535 29.566 30.506 31.108 30.801 29.277 27.409 25.539 23.771 22.089 20.612 19.252 18.032 16.765 15.644 14.664 13.725 12.801 11.904 11.086 10.236 9.504 8.872 8.186 7.463 6.842 6.199 5.513 4.981 4.425 3.831 3.238 2.631 2.199 1.746 1.07 0.6 0.097 -0.159 -0.704 -1.288 -1.902 -2.221 -2.848 -3.233 -3.602 -3.992 -4.845 -5.311 -5.818 -6.423 -7.095 -7.913 -9.023 -12.506 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt deleted file mode 100644 index 82f920fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17658 ,KEBNE ,16749960,Wed Dec 1 23:45:05 CET,Thu Dec 2 01:24:29 CET,0.0 2.474 3.347 4.0 4.586 5.108 5.571 5.993 6.764 7.131 7.474 7.797 8.387 8.643 9.102 9.561 10.011 10.219 10.617 10.993 11.533 11.881 12.23 12.768 13.288 13.789 14.274 14.717 15.254 15.761 16.256 16.854 17.412 17.937 18.543 19.219 19.875 20.584 21.309 22.075 22.868 23.725 24.702 25.674 26.753 27.888 29.088 30.159 31.028 31.528 31.248 29.567 27.328 25.14 23.068 21.124 19.397 17.823 16.48 15.113 13.941 12.946 11.968 11.005 10.119 9.315 8.477 7.718 7.042 6.336 5.632 5.081 4.487 3.821 3.329 2.838 2.319 1.797 1.25 0.871 0.48 -0.155 -0.583 -1.008 -1.229 -1.692 -2.195 -2.718 -2.988 -3.572 -3.806 -4.109 -4.432 -5.12 -5.516 -5.955 -6.441 -6.992 -7.629 -8.468 -10.368 -2 ,28062 ,KEBNE ,16749961,Wed Dec 1 23:45:05 CET,Thu Dec 2 01:25:17 CET,0.0 2.413 3.336 4.037 4.619 5.1 5.523 5.921 6.634 6.967 7.271 7.518 8.084 8.336 8.802 9.26 9.711 9.918 10.312 10.694 11.257 11.628 11.966 12.441 12.904 13.353 13.799 14.231 14.779 15.299 15.808 16.411 16.946 17.462 18.065 18.755 19.43 20.128 20.87 21.652 22.423 23.287 24.282 25.258 26.379 27.485 28.585 29.724 30.736 31.298 30.882 28.847 26.524 24.352 22.358 20.49 18.8 17.268 15.9 14.538 13.365 12.301 11.297 10.373 9.533 8.744 7.917 7.169 6.508 5.847 5.188 4.638 4.035 3.411 2.934 2.431 1.924 1.401 0.869 0.497 0.092 -0.587 -1.072 -1.55 -1.801 -2.334 -2.876 -3.424 -3.716 -4.351 -4.724 -5.084 -5.453 -6.253 -6.7 -7.187 -7.725 -8.324 -9.024 -9.946 -12.197 -3 ,8572 ,KEBNE ,16749962,Wed Dec 1 23:45:05 CET,Thu Dec 2 01:24:58 CET,0.0 2.261 3.101 3.766 4.306 4.758 5.165 5.539 6.238 6.569 6.866 7.115 7.676 7.927 8.408 8.87 9.308 9.512 9.9 10.282 10.828 11.168 11.502 11.98 12.428 12.857 13.284 13.688 14.213 14.737 15.233 15.819 16.37 16.881 17.454 18.111 18.753 19.461 20.229 20.995 21.783 22.689 23.691 24.606 25.669 26.83 27.988 29.096 30.102 30.777 30.591 28.927 26.76 24.662 22.632 20.682 19.026 17.55 16.215 14.853 13.684 12.644 11.649 10.714 9.867 9.091 8.293 7.556 6.905 6.237 5.538 4.964 4.362 3.724 3.215 2.712 2.217 1.7 1.157 0.783 0.392 -0.224 -0.657 -1.107 -1.339 -1.802 -2.276 -2.8 -3.085 -3.695 -4.017 -4.357 -4.705 -5.451 -5.87 -6.31 -6.774 -7.309 -7.964 -8.843 -10.779 -4 ,31671 ,KEBNE ,16749963,Wed Dec 1 23:45:04 CET,Thu Dec 2 01:27:13 CET,0.0 2.597 3.501 4.197 4.775 5.291 5.727 6.107 6.809 7.127 7.435 7.737 8.34 8.63 9.181 9.698 10.178 10.406 10.829 11.221 11.784 12.163 12.536 13.081 13.597 14.058 14.504 14.945 15.494 16.026 16.542 17.126 17.657 18.182 18.804 19.473 20.121 20.841 21.593 22.353 23.107 23.954 24.936 25.862 26.91 28.059 29.193 30.235 31.138 31.67 31.313 29.526 27.352 25.202 23.176 21.301 19.599 18.014 16.667 15.327 14.169 13.157 12.184 11.262 10.39 9.597 8.78 8.018 7.363 6.713 6.048 5.504 4.924 4.287 3.809 3.338 2.836 2.309 1.744 1.338 0.919 0.256 -0.213 -0.701 -0.952 -1.449 -1.93 -2.45 -2.732 -3.33 -3.63 -3.961 -4.286 -4.976 -5.361 -5.768 -6.224 -6.772 -7.45 -8.311 -10.172 -5 ,28449 ,KEBNE ,16749964,Wed Dec 1 23:45:04 CET,Thu Dec 2 01:22:16 CET,0.0 1.955 2.757 3.395 3.961 4.448 4.876 5.259 5.943 6.248 6.545 6.821 7.388 7.642 8.124 8.58 9.017 9.223 9.629 10.046 10.675 11.076 11.45 11.991 12.509 12.969 13.383 13.777 14.3 14.819 15.323 15.909 16.454 16.978 17.589 18.253 18.882 19.615 20.4 21.204 22.004 22.887 23.878 24.85 25.95 27.027 28.174 29.407 30.5 31.065 30.564 28.833 26.658 24.418 22.443 20.617 18.924 17.364 16.036 14.676 13.47 12.393 11.364 10.379 9.503 8.729 7.904 7.175 6.533 5.848 5.149 4.57 3.969 3.361 2.897 2.413 1.913 1.389 0.827 0.445 0.055 -0.553 -0.979 -1.415 -1.647 -2.144 -2.665 -3.2 -3.462 -4.051 -4.344 -4.659 -4.991 -5.739 -6.14 -6.562 -7.031 -7.594 -8.319 -9.265 -11.199 -6 ,24786 ,KEBNE ,16749965,Wed Dec 1 23:45:05 CET,Thu Dec 2 01:21:23 CET,0.0 3.149 4.109 4.808 5.396 5.925 6.409 6.843 7.607 7.961 8.305 8.66 9.263 9.547 10.089 10.595 11.065 11.269 11.645 12.034 12.62 12.992 13.342 13.848 14.326 14.767 15.19 15.601 16.137 16.658 17.15 17.756 18.338 18.858 19.458 20.174 20.851 21.529 22.257 23.038 23.824 24.69 25.685 26.623 27.701 28.87 30.018 31.086 32.132 32.778 32.221 30.304 28.188 25.996 23.983 22.088 20.372 18.816 17.431 16.018 14.809 13.767 12.77 11.812 10.937 10.152 9.329 8.613 7.995 7.332 6.622 6.044 5.448 4.83 4.361 3.881 3.374 2.828 2.257 1.861 1.442 0.779 0.318 -0.156 -0.394 -0.877 -1.4 -1.975 -2.281 -2.91 -3.252 -3.591 -3.939 -4.701 -5.107 -5.537 -6.009 -6.532 -7.161 -7.986 -10.051 -7 ,2901 ,KEBNE ,16749966,Wed Dec 1 23:45:07 CET,Thu Dec 2 01:21:24 CET,0.0 2.241 3.187 3.894 4.473 4.989 5.473 5.915 6.716 7.08 7.416 7.765 8.377 8.651 9.135 9.595 10.049 10.268 10.677 11.056 11.61 11.96 12.283 12.763 13.222 13.666 14.101 14.5 15.015 15.534 16.034 16.612 17.151 17.676 18.278 18.972 19.65 20.366 21.153 21.961 22.749 23.636 24.666 25.638 26.738 27.888 29.006 30.116 31.191 31.972 31.631 29.699 27.669 25.574 23.525 21.582 19.875 18.368 17.028 15.626 14.437 13.414 12.418 11.466 10.592 9.795 8.956 8.196 7.547 6.895 6.232 5.662 5.055 4.444 3.95 3.437 2.914 2.372 1.827 1.465 1.092 0.483 0.052 -0.416 -0.65 -1.114 -1.617 -2.147 -2.421 -3.021 -3.289 -3.614 -3.954 -4.647 -5.046 -5.51 -6.023 -6.607 -7.376 -8.367 -10.655 -8 ,3291 ,KEBNE ,16749967,Wed Dec 1 23:45:03 CET,Thu Dec 2 01:26:22 CET,0.0 2.126 3.013 3.691 4.215 4.678 5.099 5.476 6.171 6.489 6.78 7.008 7.575 7.841 8.341 8.811 9.258 9.476 9.878 10.261 10.834 11.19 11.525 12.001 12.466 12.932 13.376 13.803 14.344 14.836 15.324 15.954 16.574 17.15 17.775 18.461 19.112 19.82 20.579 21.355 22.149 23.003 23.938 24.873 25.939 27.015 28.131 29.294 30.329 30.863 30.472 28.718 26.619 24.415 22.35 20.494 18.818 17.273 15.921 14.536 13.359 12.3 11.27 10.33 9.48 8.693 7.856 7.112 6.467 5.788 5.112 4.564 3.992 3.388 2.905 2.412 1.907 1.376 0.83 0.458 0.078 -0.506 -0.928 -1.363 -1.581 -2.03 -2.518 -3.05 -3.324 -3.915 -4.205 -4.516 -4.838 -5.545 -5.943 -6.395 -6.877 -7.411 -8.03 -8.89 -11.022 -9 ,29320 ,KEBNE ,16749968,Wed Dec 1 23:45:04 CET,Thu Dec 2 01:25:28 CET,0.0 2.314 3.132 3.736 4.254 4.707 5.118 5.502 6.195 6.517 6.827 7.102 7.652 7.9 8.404 8.868 9.306 9.524 9.935 10.323 10.87 11.214 11.547 12.042 12.525 12.988 13.445 13.864 14.359 14.852 15.342 15.937 16.501 17.068 17.741 18.451 19.098 19.792 20.539 21.297 22.076 22.983 24.032 25.032 26.165 27.341 28.494 29.46 30.261 30.856 30.457 28.545 26.399 24.302 22.326 20.472 18.755 17.207 15.904 14.548 13.372 12.297 11.255 10.319 9.442 8.643 7.819 7.073 6.431 5.77 5.083 4.504 3.904 3.29 2.818 2.331 1.83 1.311 0.774 0.404 0.024 -0.571 -0.993 -1.436 -1.67 -2.19 -2.747 -3.315 -3.618 -4.25 -4.619 -4.978 -5.349 -6.112 -6.49 -6.894 -7.358 -7.87 -8.489 -9.324 -11.063 -10 ,1111 ,KEBNE ,16749969,Wed Dec 1 23:45:04 CET,Thu Dec 2 01:25:06 CET,0.0 2.49 3.431 4.13 4.752 5.304 5.786 6.226 7.014 7.375 7.73 8.085 8.694 8.989 9.547 10.051 10.53 10.751 11.166 11.575 12.169 12.541 12.891 13.381 13.854 14.317 14.748 15.153 15.688 16.209 16.698 17.278 17.845 18.381 18.99 19.65 20.249 20.929 21.664 22.414 23.182 24.041 25.008 25.946 27.032 28.123 29.134 30.209 31.358 32.143 31.796 30.095 27.967 25.784 23.794 21.91 20.193 18.672 17.36 16.002 14.803 13.756 12.759 11.788 10.901 10.125 9.318 8.568 7.898 7.2 6.499 5.943 5.364 4.758 4.29 3.81 3.299 2.757 2.208 1.835 1.448 0.84 0.413 -0.049 -0.276 -0.729 -1.218 -1.751 -2.047 -2.675 -3.054 -3.42 -3.798 -4.627 -5.09 -5.56 -6.055 -6.623 -7.325 -8.262 -10.57 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt deleted file mode 100644 index 48b9dece..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3896 ,KEBNE ,16749970,Wed Dec 1 23:45:03 CET,Thu Dec 2 01:26:03 CET,0.0 1.812 2.5 2.987 3.381 3.725 4.027 4.291 4.746 4.954 5.168 5.374 5.787 5.968 6.307 6.593 6.853 6.982 7.238 7.479 7.82 8.034 8.239 8.519 8.77 9.016 9.255 9.472 9.742 9.999 10.238 10.527 10.797 11.046 11.305 11.567 11.81 12.045 12.269 12.504 12.743 12.953 13.149 13.298 13.38 13.367 13.184 12.767 11.987 10.454 7.379 3.492 0.218 -2.652 -5.101 -7.278 -9.19 -10.903 -12.373 -13.833 -15.053 -16.135 -17.157 -18.09 -18.944 -19.732 -20.558 -21.301 -21.943 -22.604 -23.301 -23.877 -24.468 -25.088 -25.564 -26.052 -26.558 -27.092 -27.644 -28.017 -28.395 -29.009 -29.458 -29.917 -30.157 -30.647 -31.135 -31.649 -31.938 -32.509 -32.901 -33.259 -33.632 -34.469 -34.934 -35.428 -35.954 -36.533 -37.258 -38.222 -40.61 -2 ,16540 ,KEBNE ,16749971,Wed Dec 1 23:45:03 CET,Thu Dec 2 01:25:15 CET,0.0 1.307 1.904 2.355 2.756 3.102 3.395 3.671 4.153 4.364 4.564 4.73 5.121 5.277 5.575 5.859 6.124 6.25 6.484 6.713 7.026 7.209 7.402 7.69 7.973 8.242 8.483 8.714 9.005 9.268 9.513 9.789 10.031 10.259 10.532 10.825 11.077 11.32 11.559 11.811 12.037 12.24 12.43 12.584 12.669 12.633 12.439 12.005 11.164 9.59 6.57 2.598 -0.773 -3.608 -6.0 -8.145 -10.064 -11.768 -13.179 -14.535 -15.713 -16.778 -17.781 -18.718 -19.606 -20.432 -21.272 -22.01 -22.663 -23.38 -24.108 -24.66 -25.224 -25.836 -26.307 -26.781 -27.274 -27.775 -28.311 -28.687 -29.069 -29.678 -30.11 -30.582 -30.837 -31.369 -31.913 -32.484 -32.784 -33.361 -33.758 -34.111 -34.485 -35.311 -35.758 -36.244 -36.757 -37.305 -37.993 -38.872 -41.06 -3 ,16959 ,KEBNE ,16749972,Wed Dec 1 23:45:04 CET,Thu Dec 2 01:28:34 CET,0.0 1.295 1.891 2.336 2.721 3.052 3.36 3.674 4.237 4.484 4.719 4.926 5.353 5.547 5.921 6.274 6.594 6.748 7.034 7.299 7.684 7.916 8.125 8.415 8.69 8.973 9.249 9.504 9.819 10.101 10.366 10.652 10.913 11.158 11.406 11.665 11.915 12.169 12.396 12.619 12.824 13.053 13.294 13.426 13.485 13.459 13.258 12.798 11.929 10.317 7.225 3.299 -0.003 -2.878 -5.39 -7.588 -9.5 -11.199 -12.634 -14.049 -15.247 -16.322 -17.362 -18.319 -19.195 -20.003 -20.841 -21.584 -22.226 -22.895 -23.587 -24.162 -24.758 -25.357 -25.819 -26.303 -26.804 -27.33 -27.872 -28.232 -28.602 -29.22 -29.67 -30.118 -30.337 -30.794 -31.277 -31.782 -32.048 -32.591 -32.939 -33.266 -33.596 -34.307 -34.718 -35.194 -35.7 -36.255 -36.902 -37.858 -40.845 -4 ,31097 ,KEBNE ,16749973,Wed Dec 1 23:45:04 CET,Thu Dec 2 01:29:14 CET,0.0 1.643 2.265 2.677 3.044 3.381 3.707 4.037 4.635 4.897 5.132 5.312 5.709 5.879 6.192 6.463 6.718 6.845 7.079 7.298 7.624 7.835 8.034 8.31 8.568 8.801 9.02 9.236 9.514 9.777 10.026 10.305 10.56 10.795 11.052 11.339 11.597 11.844 12.068 12.278 12.51 12.764 12.993 13.108 13.133 13.098 12.908 12.429 11.567 10.034 7.023 3.112 -0.274 -3.204 -5.622 -7.738 -9.668 -11.431 -12.888 -14.337 -15.599 -16.71 -17.737 -18.67 -19.536 -20.327 -21.145 -21.857 -22.459 -23.09 -23.774 -24.368 -24.976 -25.585 -26.037 -26.495 -26.98 -27.493 -28.022 -28.385 -28.769 -29.374 -29.787 -30.202 -30.424 -30.895 -31.385 -31.904 -32.17 -32.717 -33.042 -33.358 -33.687 -34.372 -34.77 -35.218 -35.706 -36.262 -36.95 -37.907 -40.979 -5 ,23247 ,KEBNE ,16749974,Wed Dec 1 23:45:04 CET,Thu Dec 2 01:26:09 CET,0.0 1.523 2.14 2.608 2.995 3.328 3.626 3.909 4.4 4.615 4.824 4.978 5.373 5.538 5.853 6.125 6.384 6.506 6.725 6.946 7.268 7.469 7.677 8.001 8.322 8.62 8.871 9.086 9.363 9.632 9.872 10.13 10.383 10.622 10.884 11.16 11.399 11.645 11.891 12.149 12.384 12.588 12.77 12.889 12.943 12.887 12.717 12.315 11.42 9.751 6.656 2.671 -0.652 -3.502 -5.975 -8.151 -10.006 -11.674 -13.152 -14.612 -15.83 -16.9 -17.919 -18.869 -19.74 -20.548 -21.395 -22.128 -22.75 -23.399 -24.064 -24.619 -25.199 -25.793 -26.25 -26.717 -27.196 -27.702 -28.245 -28.611 -28.99 -29.613 -30.041 -30.477 -30.695 -31.171 -31.741 -32.334 -32.623 -33.193 -33.6 -33.959 -34.346 -35.178 -35.616 -36.097 -36.641 -37.271 -37.982 -38.85 -41.163 -6 ,28000 ,KEBNE ,16749975,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:30:24 CET,0.0 1.629 2.215 2.696 3.096 3.443 3.754 4.038 4.529 4.738 4.948 5.145 5.562 5.731 6.027 6.312 6.592 6.725 6.979 7.223 7.556 7.761 7.95 8.206 8.451 8.684 8.902 9.111 9.377 9.623 9.86 10.134 10.395 10.641 10.9 11.198 11.475 11.74 12.019 12.267 12.46 12.637 12.783 12.893 12.963 12.938 12.769 12.322 11.394 9.701 6.61 2.572 -0.924 -3.816 -6.257 -8.47 -10.37 -12.019 -13.447 -14.873 -16.094 -17.157 -18.167 -19.12 -19.999 -20.815 -21.69 -22.461 -23.112 -23.781 -24.472 -25.056 -25.638 -26.232 -26.716 -27.229 -27.753 -28.309 -28.889 -29.268 -29.665 -30.325 -30.784 -31.233 -31.452 -31.9 -32.379 -32.875 -33.139 -33.683 -34.007 -34.339 -34.688 -35.458 -35.879 -36.333 -36.823 -37.347 -38.027 -38.941 -41.517 -7 ,8103 ,KEBNE ,16749976,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:31:54 CET,0.0 1.551 2.121 2.576 2.958 3.273 3.559 3.85 4.381 4.619 4.863 5.121 5.56 5.742 6.064 6.362 6.651 6.789 7.037 7.264 7.592 7.808 8.013 8.286 8.559 8.846 9.103 9.322 9.587 9.84 10.073 10.343 10.604 10.839 11.099 11.378 11.612 11.868 12.144 12.396 12.636 12.864 13.058 13.221 13.328 13.307 13.108 12.622 11.684 10.118 7.178 3.179 -0.267 -3.207 -5.657 -7.781 -9.653 -11.343 -12.766 -14.191 -15.42 -16.507 -17.516 -18.45 -19.316 -20.093 -20.922 -21.699 -22.374 -23.062 -23.763 -24.352 -24.967 -25.573 -26.043 -26.538 -27.044 -27.566 -28.111 -28.479 -28.866 -29.488 -29.904 -30.338 -30.566 -31.031 -31.51 -32.001 -32.256 -32.797 -33.114 -33.41 -33.74 -34.52 -34.955 -35.424 -35.961 -36.573 -37.316 -38.253 -41.119 -8 ,14248 ,KEBNE ,16749977,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:30:07 CET,0.0 1.426 2.023 2.504 2.903 3.237 3.533 3.827 4.348 4.572 4.78 4.929 5.312 5.463 5.754 6.042 6.321 6.45 6.698 6.947 7.342 7.584 7.786 8.074 8.345 8.614 8.872 9.116 9.432 9.717 9.962 10.223 10.459 10.693 10.954 11.232 11.492 11.746 11.983 12.192 12.392 12.592 12.758 12.857 12.947 13.013 12.896 12.458 11.564 9.944 6.826 2.881 -0.419 -3.263 -5.713 -7.88 -9.736 -11.394 -12.816 -14.247 -15.484 -16.579 -17.623 -18.588 -19.462 -20.259 -21.073 -21.782 -22.408 -23.083 -23.782 -24.342 -24.923 -25.534 -26.004 -26.489 -27.005 -27.521 -28.044 -28.421 -28.816 -29.418 -29.831 -30.254 -30.476 -30.974 -31.512 -32.061 -32.337 -32.887 -33.205 -33.507 -33.839 -34.601 -35.023 -35.472 -35.961 -36.515 -37.193 -38.036 -40.285 -9 ,19831 ,KEBNE ,16749978,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:32:01 CET,0.0 1.735 2.484 3.054 3.514 3.903 4.244 4.558 5.055 5.269 5.478 5.635 6.024 6.183 6.493 6.785 7.066 7.197 7.432 7.656 7.989 8.21 8.414 8.686 8.944 9.186 9.417 9.632 9.886 10.126 10.353 10.614 10.864 11.087 11.328 11.605 11.855 12.107 12.351 12.599 12.832 13.05 13.255 13.393 13.461 13.459 13.358 12.963 12.069 10.481 7.491 3.538 0.167 -2.701 -5.186 -7.345 -9.204 -10.869 -12.284 -13.679 -14.885 -15.987 -17.032 -18.013 -18.92 -19.73 -20.58 -21.34 -21.974 -22.628 -23.326 -23.897 -24.466 -25.055 -25.521 -26.004 -26.502 -27.006 -27.511 -27.864 -28.244 -28.856 -29.295 -29.754 -29.98 -30.423 -30.888 -31.397 -31.669 -32.208 -32.509 -32.804 -33.138 -33.886 -34.284 -34.71 -35.189 -35.748 -36.411 -37.293 -39.898 -10 ,5560 ,KEBNE ,16749979,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:30:50 CET,0.0 1.412 1.989 2.487 2.926 3.318 3.674 3.999 4.562 4.815 5.048 5.262 5.689 5.867 6.195 6.513 6.794 6.923 7.164 7.392 7.725 7.934 8.134 8.425 8.681 8.921 9.164 9.38 9.632 9.883 10.138 10.432 10.694 10.917 11.159 11.419 11.65 11.901 12.152 12.387 12.58 12.743 12.904 13.008 13.072 13.064 12.886 12.438 11.574 9.976 6.941 3.029 -0.294 -3.138 -5.58 -7.746 -9.599 -11.279 -12.722 -14.135 -15.356 -16.439 -17.475 -18.446 -19.346 -20.169 -21.024 -21.781 -22.421 -23.075 -23.762 -24.348 -24.945 -25.543 -26.01 -26.493 -26.982 -27.478 -28.021 -28.41 -28.805 -29.41 -29.813 -30.241 -30.459 -30.891 -31.369 -31.886 -32.147 -32.68 -33.024 -33.349 -33.692 -34.437 -34.854 -35.349 -35.89 -36.479 -37.196 -38.146 -40.757 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 34c89081..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28682 ,KEBNE ,16749980,Wed Dec 1 23:49:14 CET,Thu Dec 2 01:29:45 CET,0.0 0.643 1.138 1.579 1.935 2.226 2.481 2.953 3.177 3.385 3.538 3.942 4.115 4.449 4.757 5.05 5.193 5.462 5.718 6.118 6.369 6.595 6.92 7.248 7.572 7.868 8.154 8.533 8.898 9.244 9.656 10.046 10.419 10.847 11.326 11.795 12.296 12.84 13.41 13.995 14.654 15.4 16.244 17.307 18.397 19.589 20.819 22.133 23.576 24.77 24.928 24.422 23.647 22.809 21.897 21.004 20.16 19.411 18.634 17.913 17.247 16.592 15.929 15.311 14.759 14.174 13.643 13.165 12.65 12.13 11.71 11.242 10.73 10.319 9.897 9.45 8.982 8.477 8.112 7.751 7.182 6.78 6.346 6.112 5.637 5.15 4.621 4.348 3.842 3.315 2.947 2.612 1.804 1.317 0.783 0.186 -0.531 -1.449 -2.767 -2 ,23751 ,KEBNE ,16749981,Wed Dec 1 23:49:14 CET,Thu Dec 2 01:29:57 CET,0.0 0.609 1.082 1.494 1.854 2.149 2.412 2.904 3.145 3.375 3.57 4.006 4.224 4.649 5.031 5.37 5.528 5.849 6.176 6.663 6.977 7.256 7.621 7.999 8.395 8.767 9.106 9.533 9.979 10.437 10.988 11.488 11.944 12.477 13.06 13.618 14.255 14.932 15.634 16.358 17.185 18.125 19.035 20.122 21.255 22.467 23.808 25.276 26.754 27.953 28.231 27.823 27.061 26.159 25.278 24.444 23.614 22.827 21.986 21.254 20.614 19.977 19.342 18.743 18.218 17.643 17.11 16.651 16.169 15.646 15.193 14.718 14.206 13.813 13.415 13.001 12.561 12.078 11.735 11.368 10.73 10.261 9.803 9.572 9.073 8.528 7.931 7.61 7.07 6.567 6.185 5.8 4.959 4.481 3.96 3.38 2.678 1.772 0.338 -3 ,22779 ,KEBNE ,16749982,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:29:42 CET,0.0 0.587 1.064 1.45 1.783 2.106 2.433 3.022 3.289 3.538 3.778 4.23 4.448 4.87 5.266 5.607 5.766 6.068 6.353 6.765 7.039 7.328 7.726 8.087 8.439 8.772 9.099 9.544 9.972 10.379 10.89 11.39 11.853 12.37 12.946 13.477 14.081 14.748 15.474 16.234 17.064 18.034 18.976 20.002 21.135 22.467 23.848 25.249 26.717 27.971 28.079 27.457 26.604 25.724 24.843 23.971 23.136 22.375 21.603 20.947 20.312 19.658 19.014 18.4 17.84 17.261 16.747 16.287 15.797 15.292 14.857 14.388 13.881 13.474 13.046 12.605 12.164 11.707 11.368 11.016 10.484 10.12 9.733 9.514 9.007 8.482 7.918 7.6 7.063 6.649 6.338 6.004 5.212 4.727 4.152 3.462 2.631 1.585 0.14 -4 ,11343 ,KEBNE ,16749983,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:29:51 CET,0.0 0.642 1.161 1.566 1.91 2.196 2.442 2.905 3.118 3.309 3.444 3.854 4.022 4.341 4.65 4.936 5.074 5.348 5.639 6.075 6.351 6.62 7.014 7.386 7.718 8.021 8.306 8.678 9.051 9.405 9.799 10.192 10.573 11.004 11.524 12.013 12.529 13.088 13.659 14.265 14.941 15.686 16.416 17.261 18.161 19.196 20.315 21.504 22.733 23.804 24.05 23.656 23.059 22.402 21.719 21.055 20.402 19.771 19.117 18.537 17.947 17.376 16.848 16.328 15.848 15.339 14.871 14.476 14.058 13.597 13.212 12.814 12.378 12.002 11.596 11.189 10.788 10.391 10.109 9.801 9.284 8.904 8.489 8.259 7.778 7.262 6.697 6.39 5.865 5.389 5.001 4.601 3.655 3.125 2.586 1.94 1.111 0.134 -1.196 -5 ,10706 ,KEBNE ,16749984,Wed Dec 1 23:49:23 CET,Thu Dec 2 01:29:13 CET,0.0 0.601 1.053 1.425 1.77 2.075 2.374 2.896 3.116 3.323 3.505 3.929 4.124 4.523 4.921 5.31 5.499 5.869 6.208 6.641 6.898 7.16 7.56 7.942 8.302 8.641 8.982 9.419 9.827 10.215 10.693 11.174 11.619 12.122 12.686 13.249 13.868 14.517 15.222 15.962 16.783 17.75 18.706 19.765 20.88 22.114 23.478 24.929 26.364 27.447 27.603 27.092 26.27 25.344 24.391 23.53 22.751 22.045 21.236 20.491 19.8 19.111 18.469 17.874 17.299 16.695 16.162 15.693 15.2 14.677 14.24 13.778 13.29 12.903 12.493 12.06 11.587 11.064 10.699 10.326 9.746 9.329 8.891 8.67 8.205 7.707 7.18 6.91 6.413 5.942 5.567 5.176 4.296 3.827 3.322 2.716 1.997 1.148 -0.187 -6 ,15049 ,KEBNE ,16749985,Wed Dec 1 23:49:23 CET,Thu Dec 2 01:28:18 CET,0.0 0.652 1.167 1.577 1.954 2.308 2.63 3.194 3.451 3.696 3.926 4.365 4.577 4.995 5.4 5.795 5.981 6.334 6.684 7.181 7.484 7.772 8.176 8.557 8.929 9.277 9.602 10.031 10.46 10.893 11.428 11.952 12.436 12.945 13.517 14.085 14.691 15.319 16.006 16.727 17.511 18.402 19.299 20.337 21.46 22.735 24.056 25.343 26.543 27.526 27.804 27.445 26.688 25.779 24.931 24.147 23.284 22.487 21.695 20.98 20.318 19.672 19.055 18.458 17.889 17.289 16.754 16.285 15.785 15.253 14.806 14.347 13.871 13.486 13.094 12.704 12.285 11.823 11.494 11.127 10.539 10.135 9.7 9.477 9.006 8.502 7.975 7.707 7.216 6.781 6.425 6.034 5.09 4.57 4.033 3.376 2.571 1.627 0.199 -7 ,26860 ,KEBNE ,16749986,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:29:41 CET,0.0 0.532 0.954 1.319 1.64 1.93 2.208 2.707 2.93 3.143 3.334 3.767 3.967 4.362 4.753 5.13 5.296 5.593 5.892 6.317 6.585 6.842 7.22 7.591 7.948 8.272 8.584 9.016 9.434 9.844 10.341 10.797 11.236 11.751 12.316 12.894 13.52 14.179 14.904 15.644 16.443 17.36 18.297 19.348 20.482 21.781 23.14 24.555 25.988 27.049 27.07 26.499 25.639 24.794 23.92 23.003 22.142 21.375 20.555 19.826 19.161 18.512 17.891 17.325 16.818 16.253 15.711 15.238 14.76 14.234 13.758 13.238 12.707 12.293 11.848 11.385 10.921 10.461 10.141 9.807 9.261 8.866 8.443 8.218 7.716 7.16 6.598 6.303 5.785 5.303 4.908 4.509 3.68 3.202 2.675 2.064 1.271 0.32 -0.987 -8 ,18876 ,KEBNE ,16749987,Wed Dec 1 23:49:14 CET,Thu Dec 2 01:27:46 CET,0.0 0.597 1.083 1.524 1.915 2.261 2.568 3.114 3.374 3.632 3.88 4.328 4.541 4.917 5.252 5.577 5.734 6.033 6.323 6.747 7.018 7.275 7.638 7.994 8.35 8.692 9.021 9.447 9.864 10.257 10.724 11.195 11.655 12.194 12.788 13.351 13.969 14.61 15.263 15.944 16.758 17.705 18.604 19.623 20.763 22.049 23.394 24.806 26.183 27.333 27.574 27.021 26.251 25.495 24.734 23.938 23.089 22.283 21.49 20.818 20.171 19.525 18.903 18.3 17.739 17.14 16.572 16.081 15.56 15.018 14.571 14.102 13.613 13.233 12.845 12.429 11.998 11.553 11.238 10.887 10.322 9.954 9.564 9.34 8.833 8.289 7.733 7.458 6.955 6.489 6.126 5.757 4.977 4.539 4.031 3.393 2.61 1.642 0.174 -9 ,6923 ,KEBNE ,16749988,Wed Dec 1 23:49:14 CET,Thu Dec 2 01:29:21 CET,0.0 0.739 1.256 1.641 1.974 2.284 2.567 3.061 3.289 3.512 3.704 4.128 4.315 4.658 4.971 5.284 5.443 5.748 6.04 6.465 6.734 6.999 7.404 7.788 8.138 8.478 8.816 9.272 9.711 10.126 10.622 11.091 11.535 12.054 12.646 13.227 13.897 14.6 15.299 16.012 16.812 17.722 18.62 19.713 20.912 22.171 23.464 24.857 26.278 27.555 27.843 27.436 26.719 25.762 24.791 23.917 23.048 22.254 21.465 20.77 20.135 19.515 18.9 18.319 17.779 17.194 16.628 16.117 15.612 15.085 14.637 14.157 13.64 13.243 12.833 12.396 11.953 11.51 11.198 10.857 10.3 9.914 9.515 9.304 8.854 8.381 7.864 7.581 7.09 6.673 6.308 5.923 5.111 4.641 4.08 3.415 2.662 1.698 0.317 -10 ,16751 ,KEBNE ,16749989,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:28:13 CET,0.0 0.598 1.026 1.386 1.696 1.97 2.227 2.706 2.911 3.103 3.267 3.665 3.822 4.135 4.447 4.741 4.887 5.21 5.515 5.888 6.118 6.35 6.691 7.006 7.32 7.63 7.916 8.267 8.602 8.959 9.409 9.817 10.195 10.63 11.127 11.604 12.142 12.725 13.33 13.99 14.741 15.544 16.307 17.175 18.123 19.171 20.275 21.44 22.586 23.646 23.94 23.607 23.047 22.416 21.748 21.038 20.31 19.694 19.082 18.51 17.949 17.395 16.867 16.346 15.852 15.334 14.868 14.428 13.94 13.418 12.984 12.542 12.079 11.72 11.354 10.968 10.535 10.087 9.78 9.47 8.993 8.629 8.239 8.037 7.593 7.11 6.578 6.287 5.778 5.349 5.005 4.642 3.842 3.402 2.855 2.227 1.442 0.387 -1.15 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt deleted file mode 100644 index 31bf10b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32017 ,KEBNE ,16749990,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:31:25 CET,0.0 3.034 3.927 4.649 5.28 5.839 6.322 6.746 7.574 7.964 8.339 8.723 9.344 9.633 10.175 10.732 11.28 11.542 12.037 12.495 13.134 13.522 13.904 14.466 15.016 15.567 16.096 16.595 17.227 17.84 18.431 19.143 19.828 20.482 21.201 22.001 22.763 23.577 24.451 25.382 26.356 27.391 28.565 29.701 30.958 32.261 33.684 35.213 36.642 37.872 38.52 37.573 36.047 34.612 33.138 31.565 30.196 28.942 27.727 26.465 25.39 24.396 23.439 22.536 21.665 20.869 20.067 19.348 18.707 18.045 17.37 16.8 16.207 15.599 15.113 14.604 14.079 13.531 12.968 12.586 12.178 11.511 11.048 10.569 10.315 9.798 9.265 8.705 8.414 7.788 7.393 7.029 6.652 5.819 5.366 4.868 4.285 3.597 2.795 1.777 -1.516 -2 ,11124 ,KEBNE ,16749991,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:31:07 CET,0.0 2.693 3.602 4.335 4.988 5.552 6.039 6.463 7.22 7.581 7.912 8.237 8.865 9.16 9.719 10.289 10.83 11.074 11.531 11.972 12.637 13.054 13.446 14.013 14.546 15.063 15.58 16.076 16.674 17.257 17.832 18.523 19.17 19.771 20.484 21.301 22.064 22.875 23.74 24.66 25.614 26.644 27.785 28.918 30.26 31.694 33.201 34.764 36.365 37.666 38.185 37.497 36.179 34.644 33.16 31.694 30.302 28.937 27.713 26.459 25.33 24.339 23.384 22.446 21.577 20.796 19.976 19.252 18.638 18.011 17.36 16.806 16.21 15.583 15.109 14.616 14.112 13.581 13.013 12.615 12.204 11.567 11.11 10.636 10.398 9.91 9.388 8.816 8.516 7.904 7.573 7.228 6.859 6.053 5.614 5.137 4.572 3.893 3.105 2.064 -1.938 -3 ,27198 ,KEBNE ,16749992,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:29:57 CET,0.0 3.117 4.029 4.745 5.426 6.043 6.552 7.011 7.908 8.289 8.651 9.035 9.654 9.945 10.516 11.059 11.557 11.792 12.266 12.723 13.367 13.773 14.173 14.744 15.271 15.779 16.268 16.75 17.371 17.973 18.571 19.274 19.939 20.58 21.29 22.093 22.887 23.755 24.649 25.59 26.6 27.637 28.768 29.902 31.186 32.561 34.005 35.5 37.005 38.331 38.959 38.238 36.818 35.239 33.732 32.252 30.871 29.559 28.407 27.234 26.174 25.191 24.235 23.316 22.477 21.719 20.918 20.212 19.58 18.898 18.179 17.601 17.012 16.364 15.86 15.356 14.817 14.268 13.705 13.304 12.895 12.261 11.81 11.33 11.081 10.587 10.075 9.526 9.236 8.622 8.277 7.941 7.562 6.745 6.304 5.799 5.28 4.717 4.034 3.07 -1.433 -4 ,17007 ,KEBNE ,16749993,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:29:59 CET,0.0 3.014 3.854 4.541 5.181 5.724 6.173 6.581 7.332 7.685 8.032 8.358 8.966 9.247 9.813 10.341 10.813 11.047 11.531 11.994 12.624 13.013 13.397 13.945 14.465 14.982 15.473 15.931 16.532 17.133 17.696 18.365 18.994 19.605 20.35 21.187 21.986 22.853 23.761 24.678 25.609 26.644 27.858 29.069 30.44 31.832 33.232 34.656 36.116 37.411 38.106 37.564 36.218 34.643 33.17 31.706 30.332 29.01 27.784 26.548 25.495 24.529 23.615 22.757 21.922 21.141 20.32 19.563 18.904 18.216 17.519 16.952 16.347 15.74 15.286 14.79 14.26 13.722 13.175 12.795 12.388 11.731 11.29 10.833 10.585 10.075 9.559 9.035 8.752 8.135 7.749 7.395 7.031 6.246 5.798 5.285 4.713 4.064 3.293 2.234 -1.141 -5 ,30419 ,KEBNE ,16749994,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:29:20 CET,0.0 3.224 4.174 4.871 5.466 5.99 6.433 6.841 7.625 7.975 8.316 8.671 9.279 9.557 10.078 10.583 11.077 11.316 11.773 12.202 12.81 13.202 13.594 14.175 14.742 15.305 15.835 16.328 16.946 17.536 18.113 18.81 19.458 20.088 20.857 21.711 22.497 23.354 24.236 25.185 26.188 27.241 28.423 29.526 30.813 32.246 33.766 35.329 36.857 38.226 38.904 38.116 36.693 35.084 33.537 31.98 30.538 29.232 28.03 26.758 25.669 24.683 23.729 22.836 21.984 21.158 20.311 19.582 18.941 18.278 17.573 16.962 16.345 15.748 15.28 14.786 14.284 13.748 13.177 12.784 12.377 11.755 11.321 10.864 10.632 10.15 9.615 9.076 8.797 8.192 7.839 7.486 7.141 6.4 5.942 5.436 4.906 4.273 3.492 2.421 -2.096 -6 ,710 ,KEBNE ,16749995,Wed Dec 1 23:49:15 CET,Thu Dec 2 01:32:06 CET,0.0 3.021 4.022 4.777 5.415 5.929 6.384 6.822 7.642 8.013 8.359 8.711 9.327 9.614 10.144 10.661 11.14 11.364 11.832 12.278 12.891 13.301 13.713 14.292 14.842 15.375 15.882 16.36 16.977 17.582 18.156 18.849 19.535 20.202 20.954 21.765 22.524 23.384 24.302 25.224 26.184 27.262 28.493 29.653 30.991 32.419 33.889 35.412 37.021 38.408 39.108 38.415 36.897 35.355 33.834 32.368 30.982 29.606 28.416 27.226 26.182 25.258 24.356 23.463 22.628 21.864 21.043 20.314 19.677 18.987 18.272 17.683 17.075 16.426 15.91 15.385 14.855 14.291 13.685 13.281 12.868 12.213 11.756 11.27 11.013 10.482 9.921 9.338 9.051 8.462 8.148 7.827 7.488 6.757 6.329 5.815 5.235 4.58 3.794 2.767 -0.885 -7 ,25560 ,KEBNE ,16749996,Wed Dec 1 23:49:16 CET,Thu Dec 2 01:29:58 CET,0.0 2.836 3.761 4.472 5.076 5.605 6.113 6.56 7.308 7.667 8.019 8.353 8.952 9.242 9.802 10.321 10.831 11.067 11.54 12.015 12.689 13.11 13.508 14.083 14.637 15.16 15.651 16.14 16.778 17.37 17.947 18.653 19.303 19.91 20.623 21.41 22.136 22.938 23.83 24.757 25.705 26.781 27.977 29.129 30.407 31.806 33.309 34.853 36.404 37.765 38.513 37.803 36.337 34.786 33.304 31.774 30.309 29.016 27.892 26.683 25.601 24.621 23.693 22.786 21.913 21.121 20.294 19.568 18.957 18.34 17.701 17.144 16.55 15.929 15.44 14.941 14.433 13.912 13.348 12.955 12.543 11.863 11.381 10.888 10.643 10.132 9.587 8.997 8.67 8.022 7.627 7.271 6.893 6.03 5.566 5.071 4.522 3.891 3.141 2.1 -0.985 -8 ,31532 ,KEBNE ,16749997,Wed Dec 1 23:51:23 CET,Thu Dec 2 01:31:11 CET,0.0 2.373 3.461 4.198 4.761 5.273 5.736 6.16 6.97 7.355 7.712 8.049 8.673 8.971 9.527 10.094 10.623 10.863 11.336 11.788 12.435 12.841 13.238 13.831 14.391 14.904 15.405 15.911 16.548 17.151 17.728 18.413 19.077 19.718 20.443 21.249 22.027 22.84 23.708 24.633 25.575 26.635 27.811 28.926 30.221 31.576 32.977 34.415 35.814 37.048 37.744 37.119 35.763 34.284 32.812 31.278 29.851 28.536 27.332 26.098 24.989 23.965 22.988 22.131 21.355 20.585 19.77 19.054 18.412 17.726 17.038 16.474 15.858 15.195 14.686 14.161 13.603 13.015 12.419 12.016 11.581 10.872 10.405 9.934 9.686 9.168 8.61 8.012 7.691 7.048 6.617 6.224 5.837 5.039 4.603 4.136 3.625 2.998 2.176 1.073 -1.941 -9 ,10341 ,KEBNE ,16749998,Wed Dec 1 23:53:31 CET,Thu Dec 2 01:35:39 CET,0.0 2.974 3.953 4.665 5.255 5.748 6.199 6.612 7.371 7.72 8.055 8.361 8.958 9.245 9.837 10.401 10.904 11.147 11.608 12.043 12.675 13.093 13.5 14.047 14.571 15.091 15.587 16.056 16.652 17.251 17.857 18.565 19.215 19.839 20.553 21.335 22.072 22.915 23.824 24.739 25.709 26.781 27.972 29.113 30.398 31.762 33.172 34.6 36.055 37.38 38.112 37.507 36.119 34.55 33.064 31.616 30.235 28.868 27.683 26.505 25.415 24.411 23.464 22.553 21.679 20.89 20.072 19.314 18.65 17.961 17.26 16.689 16.074 15.443 14.963 14.452 13.918 13.373 12.798 12.395 11.978 11.321 10.864 10.377 10.118 9.595 9.039 8.436 8.127 7.501 7.121 6.748 6.363 5.518 5.023 4.499 3.947 3.347 2.613 1.626 -1.687 -10 ,9412 ,KEBNE ,16749999,Wed Dec 1 23:57:51 CET,Thu Dec 2 01:41:10 CET,0.0 2.333 3.188 3.849 4.468 5.06 5.565 6.007 6.804 7.174 7.518 7.855 8.474 8.77 9.361 9.896 10.375 10.615 11.087 11.534 12.193 12.604 12.999 13.602 14.168 14.711 15.224 15.711 16.35 16.963 17.549 18.243 18.903 19.543 20.27 21.054 21.801 22.641 23.588 24.555 25.473 26.472 27.647 28.814 30.126 31.486 32.902 34.366 35.856 37.115 37.535 36.737 35.394 33.834 32.262 30.727 29.311 27.947 26.734 25.509 24.445 23.494 22.555 21.648 20.796 19.99 19.159 18.419 17.75 17.074 16.398 15.84 15.251 14.638 14.137 13.589 13.053 12.517 11.949 11.567 11.181 10.543 10.088 9.613 9.373 8.871 8.353 7.829 7.544 6.943 6.583 6.217 5.83 4.937 4.447 3.945 3.412 2.801 2.024 0.978 -2.039 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index 5dec0aa4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2796 ,KEBNE ,16750000,Wed Dec 1 23:57:51 CET,Thu Dec 2 01:40:05 CET,0.0 1.441 2.252 2.893 3.422 3.895 4.318 4.702 5.395 5.721 6.041 6.296 6.945 7.25 7.838 8.385 8.878 9.112 9.573 10.012 10.65 11.068 11.477 12.084 12.671 13.235 13.793 14.333 15.029 15.702 16.352 17.136 17.89 18.626 19.493 20.456 21.377 22.393 23.495 24.66 25.85 27.213 28.811 30.381 32.231 34.344 36.796 39.538 42.743 46.547 51.15 54.938 57.077 58.334 59.09 59.47 59.619 59.635 59.561 59.454 59.294 59.08 58.789 58.422 58.072 57.741 57.397 57.086 56.768 56.382 55.96 55.624 55.251 54.847 54.509 54.15 53.809 53.455 53.059 52.786 52.501 52.022 51.679 51.321 51.131 50.718 50.307 49.865 49.621 49.056 48.786 48.498 48.198 47.518 47.147 46.725 46.207 45.589 44.846 43.824 40.577 -2 ,6027 ,KEBNE ,16750001,Thu Dec 2 00:01:01 CET,Thu Dec 2 01:41:33 CET,0.0 1.841 2.597 3.163 3.698 4.175 4.592 4.974 5.686 6.013 6.334 6.597 7.227 7.5 8.028 8.535 9.028 9.269 9.763 10.243 10.902 11.324 11.738 12.332 12.899 13.454 14.004 14.548 15.294 16.006 16.671 17.494 18.279 19.016 19.874 20.838 21.722 22.671 23.72 24.874 26.092 27.488 29.115 30.712 32.579 34.673 37.067 39.802 43.031 46.888 51.604 55.484 57.693 58.961 59.707 60.129 60.338 60.364 60.301 60.208 59.992 59.722 59.381 59.004 58.624 58.272 57.931 57.586 57.238 56.862 56.467 56.121 55.752 55.364 55.049 54.693 54.306 53.934 53.563 53.277 52.98 52.528 52.209 51.865 51.677 51.292 50.888 50.44 50.183 49.594 49.28 48.96 48.614 47.848 47.448 47.054 46.6 46.036 45.318 44.289 41.548 -3 ,30861 ,KEBNE ,16750002,Thu Dec 2 00:01:01 CET,Thu Dec 2 01:41:30 CET,0.0 1.834 2.713 3.384 3.961 4.473 4.959 5.428 6.269 6.65 7.022 7.377 8.066 8.386 8.994 9.58 10.112 10.353 10.825 11.294 11.965 12.405 12.834 13.427 14.002 14.583 15.145 15.671 16.349 17.023 17.697 18.531 19.318 20.046 20.865 21.787 22.719 23.754 24.848 26.002 27.215 28.594 30.201 31.809 33.657 35.74 38.164 40.884 44.143 48.0 52.688 56.52 58.601 59.775 60.492 60.951 61.154 61.225 61.196 61.075 60.904 60.664 60.353 59.97 59.601 59.258 58.844 58.455 58.1 57.715 57.296 56.948 56.596 56.223 55.924 55.585 55.232 54.876 54.487 54.217 53.909 53.419 53.095 52.743 52.558 52.185 51.798 51.351 51.097 50.543 50.311 50.02 49.713 49.066 48.686 48.237 47.752 47.185 46.5 45.59 43.063 -4 ,10862 ,KEBNE ,16750003,Thu Dec 2 00:01:02 CET,Thu Dec 2 01:41:37 CET,0.0 1.605 2.421 3.077 3.585 4.022 4.429 4.824 5.564 5.9 6.219 6.488 7.153 7.471 8.067 8.627 9.178 9.443 9.943 10.436 11.121 11.54 11.961 12.568 13.156 13.73 14.28 14.827 15.535 16.212 16.845 17.579 18.285 18.997 19.844 20.809 21.734 22.692 23.727 24.849 26.034 27.371 28.958 30.58 32.418 34.471 36.915 39.689 42.916 46.768 51.394 55.131 57.32 58.645 59.42 59.897 60.082 60.069 60.034 59.939 59.751 59.502 59.196 58.834 58.455 58.121 57.717 57.304 56.961 56.6 56.188 55.852 55.512 55.133 54.831 54.497 54.124 53.732 53.272 52.935 52.592 52.05 51.687 51.317 51.123 50.72 50.3 49.868 49.633 49.079 48.825 48.528 48.229 47.571 47.181 46.74 46.239 45.651 44.925 43.939 40.848 -5 ,22391 ,KEBNE ,16750004,Thu Dec 2 00:03:11 CET,Thu Dec 2 01:43:41 CET,0.0 1.593 2.373 3.022 3.608 4.13 4.582 5.017 5.84 6.23 6.581 6.867 7.515 7.802 8.334 8.848 9.332 9.567 10.059 10.553 11.264 11.721 12.168 12.802 13.386 13.949 14.51 15.054 15.737 16.4 17.051 17.832 18.578 19.284 20.12 21.065 21.99 22.991 24.047 25.227 26.447 27.795 29.394 31.006 32.876 34.95 37.37 40.115 43.356 47.221 51.899 55.727 57.819 59.041 59.774 60.168 60.359 60.395 60.308 60.002 59.656 59.357 59.023 58.715 58.39 58.015 57.591 57.212 56.819 56.39 55.989 55.649 55.264 54.827 54.485 54.147 53.8 53.426 53.026 52.751 52.452 51.966 51.627 51.267 51.082 50.693 50.277 49.824 49.572 49.02 48.783 48.49 48.189 47.51 47.09 46.607 46.069 45.45 44.714 43.666 40.086 -6 ,13705 ,KEBNE ,16750005,Thu Dec 2 00:03:11 CET,Thu Dec 2 01:44:54 CET,0.0 2.017 2.807 3.378 3.887 4.344 4.758 5.148 5.872 6.208 6.534 6.798 7.438 7.722 8.266 8.774 9.272 9.517 9.983 10.427 11.086 11.521 11.936 12.528 13.088 13.628 14.164 14.685 15.357 16.02 16.659 17.441 18.201 18.916 19.745 20.684 21.581 22.597 23.764 24.953 26.156 27.555 29.174 30.814 32.706 34.79 37.206 39.93 43.172 46.97 51.534 55.299 57.421 58.742 59.497 59.866 60.079 60.161 60.105 59.963 59.8 59.547 59.235 58.905 58.557 58.232 57.852 57.51 57.223 56.888 56.492 56.143 55.768 55.367 55.049 54.718 54.377 54.019 53.637 53.37 53.084 52.635 52.31 51.941 51.749 51.366 50.96 50.518 50.281 49.739 49.523 49.24 48.943 48.272 47.874 47.428 46.904 46.286 45.558 44.586 41.807 -7 ,28200 ,KEBNE ,16750006,Thu Dec 2 00:03:11 CET,Thu Dec 2 01:43:52 CET,0.0 1.859 2.802 3.495 4.064 4.539 4.954 5.338 6.108 6.477 6.821 7.127 7.779 8.064 8.597 9.111 9.618 9.855 10.318 10.77 11.392 11.798 12.211 12.818 13.415 13.995 14.552 15.085 15.779 16.492 17.173 17.941 18.688 19.419 20.255 21.228 22.146 23.125 24.233 25.445 26.649 27.938 29.475 31.058 32.948 35.079 37.507 40.251 43.496 47.36 52.128 55.956 58.094 59.414 60.199 60.681 60.905 60.893 60.798 60.635 60.42 60.208 59.987 59.722 59.36 58.947 58.505 58.157 57.889 57.567 57.196 56.851 56.439 56.022 55.707 55.379 55.021 54.623 54.223 53.943 53.637 53.155 52.817 52.469 52.283 51.884 51.46 50.986 50.739 50.15 49.809 49.487 49.136 48.359 47.934 47.463 46.921 46.267 45.478 44.478 41.959 -8 ,15477 ,KEBNE ,16750007,Thu Dec 2 00:06:22 CET,Thu Dec 2 01:47:01 CET,0.0 1.618 2.356 2.952 3.446 3.89 4.315 4.718 5.456 5.795 6.117 6.375 7.007 7.282 7.821 8.344 8.853 9.102 9.584 10.048 10.706 11.126 11.542 12.14 12.702 13.233 13.762 14.28 14.961 15.629 16.29 17.11 17.88 18.6 19.445 20.425 21.376 22.402 23.535 24.757 26.045 27.475 29.048 30.61 32.423 34.467 36.851 39.618 42.92 46.816 51.53 55.416 57.587 58.836 59.578 60.041 60.242 60.257 60.185 60.016 59.855 59.679 59.446 59.206 58.906 58.576 58.243 57.924 57.599 57.231 56.809 56.429 56.045 55.636 55.308 54.971 54.615 54.228 53.812 53.524 53.236 52.788 52.457 52.102 51.926 51.554 51.15 50.725 50.487 49.927 49.666 49.374 49.058 48.363 47.978 47.542 47.061 46.52 45.802 44.873 42.4 -9 ,17407 ,KEBNE ,16750008,Thu Dec 2 00:06:22 CET,Thu Dec 2 01:48:38 CET,0.0 1.26 2.007 2.604 3.183 3.708 4.177 4.609 5.4 5.772 6.118 6.442 7.098 7.372 7.922 8.459 8.968 9.212 9.698 10.172 10.836 11.274 11.694 12.288 12.862 13.423 13.978 14.525 15.239 15.939 16.638 17.486 18.285 19.038 19.884 20.849 21.794 22.786 23.848 25.016 26.233 27.563 29.11 30.706 32.572 34.657 37.075 39.796 43.038 46.937 51.728 55.722 57.913 59.198 59.988 60.424 60.667 60.747 60.667 60.53 60.312 60.022 59.645 59.255 58.94 58.63 58.251 57.856 57.474 57.054 56.643 56.315 55.956 55.554 55.237 54.91 54.55 54.179 53.762 53.464 53.157 52.632 52.253 51.865 51.662 51.227 50.743 50.227 49.961 49.408 49.205 48.924 48.62 47.88 47.441 46.966 46.438 45.838 45.1 44.052 40.861 -10 ,2531 ,KEBNE ,16750009,Thu Dec 2 00:06:22 CET,Thu Dec 2 01:49:19 CET,0.0 1.578 2.282 2.836 3.369 3.887 4.342 4.772 5.583 5.951 6.29 6.568 7.227 7.521 8.072 8.591 9.088 9.326 9.786 10.246 10.91 11.329 11.734 12.326 12.907 13.468 14.022 14.556 15.235 15.904 16.554 17.331 18.1 18.857 19.729 20.711 21.63 22.598 23.646 24.788 25.995 27.325 28.855 30.435 32.292 34.368 36.828 39.586 42.77 46.478 51.092 54.905 56.969 58.191 58.906 59.332 59.533 59.575 59.528 59.369 59.137 58.879 58.587 58.318 57.999 57.623 57.263 56.96 56.65 56.295 55.904 55.553 55.175 54.758 54.431 54.086 53.721 53.347 52.957 52.68 52.385 51.919 51.593 51.25 51.073 50.691 50.277 49.83 49.589 49.043 48.808 48.515 48.19 47.45 47.053 46.634 46.15 45.56 44.855 43.928 40.943 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt deleted file mode 100644 index 1e7cefcb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4842 ,KEBNE ,16750010,Thu Dec 2 00:06:21 CET,Thu Dec 2 01:46:28 CET,0.0 2.439 3.371 4.018 4.568 5.061 5.509 5.951 6.716 7.048 7.38 7.648 8.297 8.601 9.205 9.8 10.361 10.628 11.178 11.722 12.507 13.017 13.512 14.232 14.888 15.467 16.026 16.568 17.268 17.95 18.583 19.391 20.222 21.036 21.979 23.005 23.952 24.982 26.122 27.358 28.647 30.091 31.804 33.544 35.626 37.897 40.411 43.252 46.465 49.915 53.421 55.606 56.312 56.427 56.184 55.684 55.085 54.451 53.875 53.218 52.619 52.059 51.466 50.897 50.353 49.847 49.289 48.774 48.306 47.788 47.25 46.805 46.321 45.801 45.407 44.986 44.555 44.089 43.536 43.156 42.813 42.292 41.892 41.464 41.24 40.767 40.263 39.738 39.466 38.86 38.55 38.238 37.917 37.124 36.682 36.238 35.736 35.112 34.314 33.302 30.178 -2 ,28334 ,KEBNE ,16750011,Thu Dec 2 00:06:21 CET,Thu Dec 2 01:46:45 CET,0.0 2.021 2.956 3.744 4.417 4.993 5.492 5.98 6.901 7.299 7.675 8.054 8.721 9.001 9.57 10.132 10.684 10.953 11.455 11.931 12.597 13.023 13.456 14.083 14.696 15.293 15.889 16.507 17.263 17.929 18.587 19.415 20.212 20.967 21.849 22.843 23.844 24.968 26.145 27.381 28.667 30.118 31.795 33.508 35.491 37.657 40.124 42.762 45.789 49.295 53.128 55.479 56.264 56.345 56.059 55.545 54.958 54.274 53.613 52.953 52.334 51.744 51.177 50.549 49.923 49.342 48.73 48.185 47.709 47.211 46.662 46.212 45.68 45.094 44.688 44.281 43.867 43.427 42.958 42.639 42.284 41.716 41.326 40.891 40.663 40.211 39.712 39.16 38.888 38.3 37.994 37.664 37.299 36.451 35.958 35.407 34.797 34.081 33.236 32.122 28.693 -3 ,26734 ,KEBNE ,16750012,Thu Dec 2 00:06:21 CET,Thu Dec 2 01:47:03 CET,0.0 2.014 2.848 3.496 4.044 4.533 5.006 5.45 6.245 6.598 6.933 7.252 7.915 8.212 8.797 9.357 9.878 10.136 10.664 11.168 11.901 12.374 12.83 13.498 14.139 14.727 15.304 15.892 16.658 17.393 18.092 18.938 19.746 20.505 21.373 22.348 23.287 24.34 25.482 26.688 27.996 29.493 31.238 32.996 35.028 37.265 39.767 42.531 45.692 49.236 52.974 55.359 56.113 56.051 55.741 55.298 54.742 54.097 53.482 52.802 52.162 51.582 50.973 50.354 49.785 49.267 48.697 48.183 47.683 47.097 46.541 46.123 45.659 45.157 44.754 44.264 43.738 43.243 42.704 42.307 41.899 41.278 40.865 40.45 40.234 39.759 39.244 38.688 38.403 37.816 37.537 37.222 36.901 36.175 35.753 35.294 34.786 34.154 33.361 32.365 29.376 -4 ,27989 ,KEBNE ,16750013,Thu Dec 2 00:14:45 CET,Thu Dec 2 01:55:19 CET,0.0 2.158 3.007 3.675 4.242 4.758 5.213 5.624 6.383 6.74 7.077 7.385 8.053 8.363 8.954 9.498 10.014 10.268 10.769 11.252 11.936 12.374 12.81 13.446 14.044 14.632 15.188 15.72 16.439 17.165 17.884 18.727 19.516 20.28 21.16 22.15 23.116 24.159 25.27 26.478 27.806 29.303 31.048 32.832 34.835 36.99 39.549 42.434 45.719 49.389 53.177 55.564 56.409 56.45 56.123 55.651 55.077 54.406 53.802 53.186 52.582 51.998 51.418 50.846 50.297 49.778 49.215 48.691 48.216 47.709 47.204 46.78 46.316 45.83 45.419 45.002 44.591 44.118 43.575 43.207 42.853 42.298 41.908 41.486 41.254 40.779 40.283 39.77 39.511 38.914 38.592 38.243 37.857 36.996 36.515 35.983 35.419 34.838 34.168 33.169 29.995 -5 ,26468 ,KEBNE ,16750014,Thu Dec 2 00:14:45 CET,Thu Dec 2 01:56:47 CET,0.0 2.017 2.789 3.451 4.021 4.526 5.023 5.48 6.295 6.682 7.042 7.348 8.003 8.296 8.854 9.393 9.907 10.166 10.712 11.256 12.01 12.462 12.911 13.6 14.265 14.871 15.418 15.964 16.718 17.452 18.141 18.998 19.839 20.651 21.589 22.621 23.585 24.627 25.771 26.975 28.274 29.73 31.413 33.144 35.105 37.267 39.785 42.611 45.809 49.298 52.928 55.323 56.31 56.503 56.266 55.803 55.203 54.576 54.016 53.373 52.746 52.144 51.532 50.954 50.414 49.887 49.321 48.822 48.371 47.881 47.372 46.941 46.467 45.973 45.591 45.197 44.772 44.313 43.865 43.546 43.154 42.52 42.095 41.65 41.428 40.986 40.516 39.998 39.72 39.119 38.754 38.383 37.996 37.122 36.636 36.13 35.56 34.868 34.044 32.963 29.721 -6 ,22991 ,KEBNE ,16750015,Thu Dec 2 00:14:44 CET,Thu Dec 2 01:55:09 CET,0.0 2.946 3.977 4.774 5.449 6.036 6.545 7.014 7.899 8.296 8.665 9.002 9.659 9.963 10.568 11.161 11.732 12.012 12.529 13.015 13.737 14.197 14.647 15.305 15.941 16.548 17.13 17.68 18.373 19.038 19.693 20.531 21.329 22.073 22.94 23.911 24.843 25.9 27.064 28.277 29.551 30.996 32.67 34.369 36.364 38.568 41.048 43.82 46.989 50.485 54.245 56.579 57.293 57.299 56.942 56.331 55.725 55.123 54.522 53.856 53.229 52.631 52.058 51.533 51.006 50.423 49.834 49.332 48.859 48.337 47.779 47.259 46.746 46.242 45.823 45.407 44.979 44.546 44.061 43.713 43.354 42.782 42.377 41.949 41.726 41.267 40.779 40.245 39.959 39.329 38.956 38.59 38.207 37.346 36.851 36.308 35.703 35.032 34.208 33.087 29.547 -7 ,18473 ,KEBNE ,16750016,Thu Dec 2 00:16:52 CET,Thu Dec 2 01:57:11 CET,0.0 2.251 3.28 4.015 4.62 5.193 5.727 6.219 7.119 7.53 7.92 8.271 8.93 9.239 9.82 10.324 10.798 11.048 11.555 12.013 12.659 13.099 13.526 14.191 14.849 15.452 16.042 16.63 17.362 18.046 18.704 19.488 20.281 21.028 21.886 22.865 23.836 24.942 26.095 27.304 28.663 30.225 31.942 33.636 35.584 37.785 40.351 43.124 46.294 49.909 53.797 56.075 56.8 56.823 56.475 55.992 55.505 54.94 54.344 53.665 53.032 52.454 51.887 51.274 50.678 50.148 49.553 48.994 48.521 48.007 47.461 47.002 46.486 45.921 45.469 45.017 44.553 44.089 43.617 43.275 42.902 42.323 41.933 41.48 41.233 40.768 40.293 39.777 39.51 38.927 38.648 38.318 37.965 37.185 36.711 36.184 35.573 34.868 34.028 32.939 30.181 -8 ,2502 ,KEBNE ,16750017,Thu Dec 2 00:18:59 CET,Thu Dec 2 02:02:13 CET,0.0 2.059 2.903 3.561 4.129 4.641 5.079 5.488 6.29 6.661 7.015 7.341 8.006 8.338 8.963 9.536 10.078 10.337 10.839 11.304 11.988 12.444 12.868 13.458 14.024 14.597 15.156 15.697 16.427 17.145 17.822 18.634 19.43 20.225 21.182 22.264 23.282 24.348 25.482 26.68 27.946 29.434 31.183 32.893 34.861 37.088 39.709 42.599 45.699 49.04 52.56 54.676 55.447 55.573 55.336 54.843 54.251 53.65 53.073 52.427 51.768 51.162 50.575 49.987 49.422 48.87 48.299 47.791 47.33 46.845 46.332 45.888 45.407 44.91 44.519 44.097 43.665 43.214 42.756 42.423 42.064 41.495 41.112 40.721 40.514 40.075 39.592 39.057 38.767 38.175 37.892 37.572 37.236 36.5 36.079 35.607 35.084 34.435 33.643 32.627 29.606 -9 ,7192 ,KEBNE ,16750018,Thu Dec 2 00:30:47 CET,Thu Dec 2 02:11:19 CET,0.0 1.967 2.812 3.505 4.15 4.716 5.215 5.65 6.405 6.763 7.108 7.435 8.108 8.406 8.992 9.557 10.09 10.346 10.844 11.322 12.047 12.528 13.005 13.724 14.419 15.079 15.68 16.239 16.939 17.636 18.327 19.16 19.988 20.789 21.678 22.663 23.61 24.629 25.748 26.943 28.19 29.639 31.359 33.08 35.051 37.21 39.718 42.536 45.718 49.18 52.824 55.09 55.786 55.836 55.566 55.078 54.461 53.797 53.185 52.54 51.947 51.394 50.804 50.199 49.63 49.115 48.557 48.022 47.565 47.091 46.52 46.013 45.477 44.918 44.491 44.051 43.598 43.108 42.576 42.22 41.841 41.226 40.799 40.348 40.123 39.652 39.153 38.644 38.38 37.795 37.496 37.166 36.824 36.052 35.629 35.158 34.589 33.948 33.254 32.377 29.857 -10 ,5332 ,KEBNE ,16750019,Thu Dec 2 00:30:47 CET,Thu Dec 2 02:12:33 CET,0.0 2.307 3.297 4.071 4.718 5.286 5.771 6.203 6.975 7.329 7.687 8.015 8.682 8.977 9.531 10.082 10.639 10.911 11.458 11.968 12.656 13.104 13.537 14.145 14.717 15.294 15.864 16.414 17.165 17.893 18.602 19.5 20.324 21.068 21.925 22.887 23.816 24.887 26.055 27.25 28.499 29.875 31.502 33.193 35.214 37.494 40.107 42.965 46.12 49.66 53.487 55.905 56.717 56.771 56.515 56.061 55.487 54.826 54.181 53.493 52.888 52.327 51.748 51.177 50.624 50.092 49.516 48.977 48.515 48.043 47.511 47.069 46.6 46.093 45.67 45.232 44.782 44.296 43.787 43.423 43.048 42.473 42.078 41.668 41.454 41.0 40.501 39.958 39.688 39.088 38.762 38.43 38.098 37.366 36.934 36.48 35.954 35.269 34.417 33.32 30.391 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 6d4c3261..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,20455 ,KEBNE ,16750022,Thu Dec 2 00:56:25 CET,Thu Dec 2 02:29:32 CET,0.0 1.633 2.398 2.967 3.437 3.87 4.261 4.621 5.301 5.615 5.917 6.207 6.729 6.969 7.429 7.85 8.254 8.452 8.834 9.201 9.734 10.084 10.432 10.958 11.469 11.968 12.455 12.939 13.595 14.227 14.819 15.517 16.204 16.881 17.67 18.571 19.433 20.386 21.436 22.584 23.79 25.135 26.787 28.477 30.429 32.624 35.123 37.984 41.42 45.486 50.324 54.041 55.925 56.947 57.517 57.768 57.796 57.729 57.586 57.36 57.132 56.899 56.617 56.296 55.975 55.692 55.428 55.178 54.956 54.733 54.483 54.243 53.966 53.67 53.44 53.187 52.908 52.612 52.29 52.073 51.851 51.488 51.192 50.84 50.667 50.299 49.889 49.426 49.161 48.689 48.363 48.059 47.717 46.942 46.46 45.91 45.304 44.61 43.696 42.404 30.598 -4 ,4298 ,KEBNE ,16750023,Thu Dec 2 01:04:51 CET,Thu Dec 2 02:43:19 CET,0.0 1.479 2.066 2.541 2.922 3.233 3.541 3.881 4.504 4.756 4.99 5.175 5.661 5.861 6.236 6.619 7.026 7.242 7.685 8.113 8.701 9.082 9.479 10.06 10.59 11.079 11.563 12.051 12.693 13.308 13.9 14.639 15.353 16.023 16.775 17.629 18.492 19.454 20.496 21.629 22.825 24.185 25.774 27.359 29.249 31.418 33.97 36.919 40.425 44.48 49.245 52.771 54.461 55.407 55.935 56.104 56.117 56.054 55.898 55.709 55.475 55.173 54.867 54.551 54.224 53.923 53.614 53.299 52.988 52.648 52.243 51.918 51.606 51.267 51.009 50.74 50.433 50.102 49.755 49.494 49.214 48.763 48.422 48.07 47.9 47.556 47.142 46.668 46.421 45.966 45.642 45.337 45.005 44.223 43.761 43.265 42.691 41.945 40.942 39.472 31.686 -5 ,30358 ,KEBNE ,16750024,Thu Dec 2 01:04:53 CET,Thu Dec 2 02:37:47 CET,0.0 1.419 1.935 2.413 2.897 3.321 3.695 4.044 4.679 4.971 5.264 5.565 6.089 6.332 6.784 7.189 7.558 7.739 8.099 8.444 8.942 9.264 9.577 10.06 10.526 10.959 11.388 11.808 12.356 12.879 13.397 14.028 14.632 15.225 15.921 16.725 17.5 18.342 19.25 20.242 21.32 22.529 23.953 25.412 27.119 29.09 31.439 34.09 37.278 41.166 45.833 49.527 51.637 52.934 53.679 54.1 54.288 54.31 54.263 54.17 54.062 53.931 53.742 53.535 53.324 53.109 52.866 52.626 52.398 52.141 51.863 51.629 51.363 51.072 50.843 50.608 50.344 50.038 49.715 49.49 49.245 48.823 48.53 48.214 48.048 47.714 47.337 46.892 46.643 46.178 45.808 45.491 45.148 44.327 43.878 43.387 42.828 42.173 41.275 39.977 31.184 -8 ,20265 ,KEBNE ,16750027,Thu Dec 2 01:04:51 CET,Thu Dec 2 02:43:13 CET,0.0 1.579 2.187 2.671 3.081 3.441 3.762 4.054 4.604 4.879 5.151 5.37 5.867 6.084 6.483 6.863 7.235 7.417 7.773 8.124 8.621 8.946 9.273 9.744 10.188 10.623 11.048 11.48 12.071 12.615 13.117 13.729 14.328 14.92 15.615 16.416 17.212 18.072 19.029 20.143 21.356 22.727 24.339 25.945 27.839 30.001 32.527 35.435 38.845 42.933 47.851 51.681 53.739 54.744 55.303 55.577 55.601 55.503 55.332 55.106 54.879 54.632 54.336 54.024 53.741 53.454 53.085 52.751 52.47 52.165 51.844 51.572 51.264 50.932 50.671 50.394 50.124 49.8 49.425 49.168 48.899 48.497 48.227 47.924 47.754 47.376 46.951 46.495 46.262 45.821 45.528 45.211 44.847 44.063 43.626 43.144 42.544 41.761 40.788 39.381 33.274 -10 ,30290 ,KEBNE ,16750029,Thu Dec 2 01:19:31 CET,Thu Dec 2 02:58:07 CET,0.0 1.278 1.872 2.341 2.736 3.116 3.451 3.777 4.433 4.733 5.012 5.285 5.813 6.04 6.445 6.848 7.242 7.432 7.798 8.14 8.653 9.017 9.386 9.907 10.389 10.842 11.287 11.721 12.259 12.759 13.254 13.899 14.514 15.102 15.831 16.645 17.404 18.309 19.353 20.465 21.652 22.998 24.597 26.258 28.184 30.343 32.865 35.752 39.178 43.212 48.081 51.859 53.726 54.584 55.045 55.314 55.368 55.311 55.169 54.931 54.68 54.424 54.145 53.803 53.453 53.152 52.851 52.552 52.248 51.921 51.554 51.237 50.909 50.553 50.237 49.87 49.513 49.153 48.797 48.536 48.222 47.729 47.393 47.039 46.846 46.441 46.01 45.536 45.287 44.826 44.451 44.098 43.731 42.988 42.573 42.106 41.525 40.813 39.916 38.592 31.95 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt deleted file mode 100644 index f5482e0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2469 ,KEBNE ,16750030,Thu Dec 2 01:19:33 CET,Thu Dec 2 03:01:36 CET,0.0 1.533 2.178 2.712 3.184 3.612 3.984 4.291 4.852 5.116 5.374 5.596 6.099 6.346 6.86 7.357 7.824 8.046 8.476 8.876 9.441 9.805 10.161 10.695 11.209 11.708 12.189 12.667 13.299 13.905 14.517 15.279 16.024 16.74 17.57 18.522 19.438 20.462 21.581 22.775 24.055 25.53 27.315 29.162 31.365 33.935 36.961 40.42 44.681 50.028 56.745 62.537 66.09 68.51 70.202 71.369 72.177 72.772 73.193 73.544 73.764 73.894 73.978 74.017 73.989 73.924 73.849 73.766 73.671 73.556 73.398 73.24 73.088 72.92 72.761 72.582 72.385 72.167 71.923 71.744 71.565 71.297 71.083 70.845 70.73 70.456 70.138 69.809 69.639 69.267 69.017 68.773 68.526 67.926 67.563 67.149 66.651 66.076 65.311 64.185 57.9 -2 ,17881 ,KEBNE ,16750031,Thu Dec 2 01:19:30 CET,Thu Dec 2 03:00:23 CET,0.0 1.446 2.062 2.572 3.054 3.477 3.857 4.214 4.874 5.182 5.473 5.769 6.314 6.575 7.084 7.577 8.045 8.27 8.702 9.109 9.695 10.073 10.432 10.951 11.458 11.96 12.448 12.927 13.554 14.172 14.778 15.513 16.228 16.926 17.756 18.7 19.615 20.638 21.764 22.982 24.276 25.789 27.61 29.47 31.677 34.192 37.171 40.678 44.951 50.195 56.914 62.813 66.559 69.058 70.696 71.843 72.666 73.282 73.698 74.053 74.312 74.461 74.55 74.582 74.54 74.476 74.384 74.27 74.165 74.057 73.942 73.837 73.691 73.494 73.334 73.176 72.992 72.793 72.572 72.397 72.204 71.899 71.664 71.411 71.289 71.035 70.761 70.424 70.22 69.813 69.549 69.32 69.057 68.46 68.09 67.665 67.19 66.576 65.733 64.565 60.437 -3 ,11587 ,KEBNE ,16750032,Thu Dec 2 01:19:39 CET,Thu Dec 2 02:55:14 CET,0.0 1.499 2.181 2.719 3.163 3.561 3.933 4.304 4.977 5.28 5.576 5.86 6.382 6.633 7.127 7.586 8.007 8.211 8.622 9.016 9.565 9.923 10.277 10.788 11.285 11.777 12.269 12.772 13.441 14.093 14.715 15.453 16.17 16.863 17.672 18.625 19.569 20.603 21.729 22.952 24.279 25.813 27.621 29.457 31.654 34.154 37.14 40.68 44.947 50.207 56.988 62.936 66.58 68.98 70.625 71.777 72.621 73.23 73.645 73.979 74.169 74.269 74.308 74.322 74.299 74.242 74.179 74.091 73.977 73.836 73.674 73.535 73.374 73.18 73.015 72.818 72.627 72.444 72.212 72.036 71.854 71.552 71.328 71.088 70.968 70.695 70.382 70.039 69.862 69.5 69.262 69.015 68.742 68.135 67.787 67.404 66.938 66.359 65.64 64.571 58.2 -4 ,19934 ,KEBNE ,16750033,Thu Dec 2 01:19:39 CET,Thu Dec 2 02:56:13 CET,0.0 1.45 2.134 2.673 3.133 3.55 3.935 4.295 4.941 5.249 5.548 5.839 6.376 6.618 7.068 7.508 7.924 8.128 8.536 8.937 9.514 9.877 10.231 10.761 11.289 11.789 12.261 12.744 13.392 14.025 14.638 15.375 16.094 16.819 17.665 18.614 19.536 20.543 21.693 22.962 24.297 25.832 27.675 29.561 31.768 34.31 37.305 40.77 45.109 50.561 57.438 63.321 66.987 69.486 71.188 72.375 73.245 73.907 74.344 74.67 74.864 74.982 75.058 75.105 75.107 75.081 74.998 74.864 74.735 74.61 74.444 74.254 74.065 73.88 73.731 73.576 73.409 73.198 72.963 72.794 72.604 72.269 72.053 71.833 71.705 71.43 71.123 70.79 70.607 70.239 70.005 69.757 69.517 68.993 68.691 68.322 67.852 67.238 66.424 65.223 61.214 -5 ,27419 ,KEBNE ,16750034,Thu Dec 2 01:19:37 CET,Thu Dec 2 02:56:48 CET,0.0 1.315 1.841 2.275 2.622 2.941 3.233 3.508 4.023 4.263 4.493 4.674 5.16 5.377 5.787 6.18 6.575 6.771 7.156 7.529 8.075 8.431 8.778 9.29 9.787 10.271 10.756 11.223 11.825 12.431 13.038 13.772 14.491 15.207 16.03 16.968 17.895 18.921 20.05 21.272 22.596 24.113 25.915 27.771 29.975 32.534 35.581 39.112 43.352 48.565 55.392 61.397 65.053 67.502 69.176 70.4 71.271 71.882 72.316 72.661 72.889 73.026 73.083 73.112 73.107 73.087 73.015 72.913 72.815 72.693 72.542 72.395 72.236 72.051 71.889 71.711 71.535 71.339 71.096 70.924 70.758 70.469 70.242 70.0 69.868 69.591 69.289 68.969 68.798 68.429 68.201 67.963 67.683 66.993 66.592 66.139 65.602 64.998 64.264 63.199 58.044 -6 ,17892 ,KEBNE ,16750035,Thu Dec 2 01:19:31 CET,Thu Dec 2 02:58:27 CET,0.0 1.468 2.161 2.685 3.153 3.568 3.932 4.238 4.782 5.038 5.289 5.517 6.026 6.257 6.699 7.148 7.588 7.796 8.193 8.579 9.149 9.519 9.874 10.391 10.911 11.451 11.989 12.509 13.156 13.741 14.301 14.999 15.692 16.372 17.172 18.101 19.006 20.016 21.12 22.302 23.59 25.093 26.887 28.729 30.917 33.425 36.424 39.995 44.339 49.721 56.741 62.874 66.592 68.979 70.597 71.811 72.683 73.309 73.72 74.016 74.221 74.341 74.399 74.411 74.389 74.329 74.223 74.127 74.044 73.926 73.777 73.652 73.506 73.347 73.213 73.047 72.866 72.687 72.486 72.328 72.15 71.846 71.609 71.328 71.165 70.808 70.441 70.053 69.85 69.444 69.13 68.868 68.593 68.007 67.669 67.279 66.795 66.227 65.513 64.301 53.819 -7 ,8984 ,KEBNE ,16750036,Thu Dec 2 01:19:30 CET,Thu Dec 2 02:59:46 CET,0.0 1.346 2.033 2.559 2.987 3.379 3.758 4.123 4.795 5.113 5.427 5.727 6.255 6.523 7.034 7.475 7.885 8.081 8.46 8.843 9.407 9.77 10.12 10.632 11.143 11.648 12.139 12.623 13.285 13.93 14.538 15.264 15.964 16.65 17.472 18.426 19.363 20.406 21.532 22.731 24.031 25.521 27.279 29.151 31.409 33.985 37.069 40.628 44.964 50.39 57.365 63.352 66.984 69.394 71.05 72.264 73.088 73.679 74.12 74.443 74.627 74.759 74.829 74.837 74.812 74.756 74.678 74.595 74.507 74.406 74.282 74.158 73.985 73.795 73.644 73.469 73.265 73.036 72.79 72.615 72.446 72.16 71.937 71.712 71.593 71.324 71.018 70.686 70.517 70.145 69.924 69.699 69.426 68.81 68.46 68.061 67.596 67.0 66.235 65.16 56.363 -8 ,24596 ,KEBNE ,16750037,Thu Dec 2 01:19:31 CET,Thu Dec 2 02:58:20 CET,0.0 1.112 1.674 2.121 2.516 2.856 3.177 3.507 4.156 4.46 4.756 5.02 5.518 5.748 6.195 6.612 7.021 7.22 7.604 7.991 8.568 8.935 9.285 9.795 10.302 10.794 11.279 11.763 12.391 13.014 13.622 14.363 15.089 15.788 16.607 17.548 18.457 19.457 20.562 21.764 23.063 24.585 26.407 28.28 30.523 33.109 36.161 39.662 43.992 49.407 56.228 62.221 65.874 68.321 70.031 71.234 72.087 72.673 73.055 73.347 73.512 73.612 73.654 73.641 73.602 73.551 73.494 73.429 73.355 73.244 73.097 72.953 72.789 72.621 72.475 72.286 72.054 71.813 71.575 71.41 71.232 70.925 70.69 70.433 70.299 70.025 69.718 69.342 69.135 68.731 68.428 68.173 67.893 67.18 66.785 66.393 65.935 65.387 64.685 63.709 58.151 -9 ,5000 ,KEBNE ,16750038,Thu Dec 2 01:19:31 CET,Thu Dec 2 02:58:33 CET,0.0 1.355 2.024 2.57 3.024 3.431 3.791 4.105 4.656 4.921 5.184 5.442 5.979 6.249 6.771 7.267 7.745 7.976 8.411 8.835 9.458 9.859 10.237 10.785 11.321 11.845 12.36 12.867 13.535 14.197 14.835 15.582 16.294 17.014 17.893 18.863 19.773 20.809 21.966 23.187 24.482 26.011 27.857 29.745 31.977 34.506 37.54 41.126 45.44 50.787 57.648 63.612 67.352 69.853 71.525 72.734 73.633 74.266 74.67 74.971 75.15 75.263 75.33 75.351 75.319 75.252 75.181 75.102 74.986 74.851 74.706 74.56 74.405 74.221 74.039 73.845 73.66 73.475 73.268 73.112 72.937 72.646 72.416 72.161 72.04 71.768 71.452 71.113 70.93 70.543 70.287 70.056 69.799 69.148 68.799 68.393 67.888 67.342 66.62 65.561 52.617 -10 ,25362 ,KEBNE ,16750039,Thu Dec 2 01:19:31 CET,Thu Dec 2 02:59:54 CET,0.0 1.365 1.963 2.456 2.873 3.227 3.552 3.861 4.422 4.68 4.93 5.128 5.636 5.875 6.342 6.81 7.254 7.471 7.901 8.316 8.912 9.284 9.637 10.157 10.674 11.175 11.675 12.174 12.8 13.41 14.012 14.748 15.474 16.19 17.042 18.004 18.928 19.968 21.123 22.362 23.668 25.151 26.918 28.755 30.967 33.502 36.517 40.005 44.252 49.574 56.433 62.427 66.078 68.522 70.204 71.406 72.252 72.874 73.306 73.613 73.788 73.88 73.902 73.893 73.87 73.832 73.778 73.7 73.606 73.488 73.339 73.188 73.025 72.857 72.703 72.527 72.313 72.055 71.753 71.537 71.334 71.0 70.764 70.522 70.385 70.09 69.772 69.389 69.18 68.777 68.459 68.188 67.885 67.193 66.81 66.365 65.865 65.269 64.512 63.391 56.679 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index f3575ecc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17498 ,KEBNE ,16750040,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:02:35 CET,0.0 1.767 2.598 3.27 3.892 4.462 4.988 5.476 6.422 6.906 7.392 7.815 8.748 9.18 9.979 10.733 11.47 11.823 12.524 13.224 14.278 14.969 15.643 16.626 17.571 18.5 19.409 20.3 21.486 22.663 23.823 25.248 26.657 28.045 29.72 31.662 33.533 35.634 37.967 40.541 43.349 46.602 50.502 54.557 59.511 65.341 72.396 80.735 91.086 104.339 122.265 138.952 150.008 157.844 163.536 168.019 171.482 174.208 176.33 178.265 179.753 180.96 182.004 182.886 183.636 184.244 184.788 185.219 185.558 185.847 186.1 186.296 186.458 186.585 186.676 186.754 186.793 186.804 186.799 186.789 186.76 186.674 186.589 186.478 186.418 186.278 186.104 185.884 185.736 185.276 185.173 184.949 184.73 184.24 183.87 183.427 182.899 182.187 181.267 179.842 173.296 -2 ,22531 ,KEBNE ,16750041,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:00:12 CET,0.0 1.504 2.348 3.118 3.785 4.365 4.892 5.413 6.417 6.884 7.321 7.69 8.591 8.982 9.752 10.502 11.228 11.588 12.299 12.998 14.041 14.726 15.408 16.43 17.429 18.401 19.345 20.291 21.556 22.809 24.051 25.551 26.981 28.392 30.068 31.982 33.877 36.002 38.356 40.916 43.681 46.899 50.789 54.844 59.766 65.528 72.509 80.824 91.217 104.485 122.356 139.213 150.209 158.042 163.853 168.322 171.726 174.494 176.669 178.598 180.085 181.297 182.347 183.207 183.917 184.509 185.071 185.516 185.856 186.193 186.518 186.743 186.915 187.039 187.108 187.145 187.155 187.14 187.104 187.076 187.033 186.929 186.864 186.785 186.724 186.582 186.406 186.172 186.033 185.601 185.587 185.381 185.131 184.499 184.092 183.63 183.113 182.392 181.419 179.98 173.982 -3 ,1173 ,KEBNE ,16750042,Thu Dec 2 01:19:31 CET,Thu Dec 2 03:02:04 CET,0.0 1.725 2.594 3.29 3.888 4.454 4.991 5.524 6.569 7.068 7.543 7.98 8.919 9.351 10.17 10.958 11.734 12.123 12.899 13.642 14.711 15.414 16.101 17.075 18.011 18.934 19.837 20.741 21.94 23.115 24.27 25.685 27.088 28.481 30.133 32.033 33.895 36.001 38.348 40.927 43.733 46.956 50.814 54.838 59.741 65.512 72.53 80.871 91.289 104.609 122.555 139.502 150.689 158.587 164.366 168.903 172.419 175.193 177.331 179.273 180.775 181.988 183.055 183.95 184.699 185.324 185.879 186.333 186.663 186.95 187.223 187.415 187.581 187.72 187.812 187.881 187.931 187.945 187.914 187.889 187.856 187.792 187.72 187.592 187.514 187.347 187.189 186.981 186.833 186.376 186.25 185.995 185.7 184.971 184.53 184.022 183.43 182.731 181.814 180.411 174.92 -4 ,19471 ,KEBNE ,16750043,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:00:52 CET,0.0 1.901 2.736 3.433 4.051 4.621 5.143 5.635 6.568 7.015 7.451 7.805 8.706 9.1 9.884 10.645 11.389 11.756 12.461 13.159 14.213 14.897 15.563 16.547 17.508 18.453 19.377 20.293 21.511 22.708 23.884 25.325 26.747 28.154 29.822 31.728 33.599 35.733 38.104 40.689 43.488 46.751 50.698 54.776 59.698 65.427 72.367 80.659 91.066 104.362 122.205 138.662 149.402 157.151 162.937 167.439 170.89 173.665 175.803 177.699 179.17 180.364 181.399 182.279 183.037 183.673 184.247 184.691 185.016 185.32 185.621 185.857 186.062 186.2 186.279 186.354 186.403 186.415 186.403 186.395 186.364 186.244 186.139 186.013 185.939 185.767 185.539 185.292 185.167 184.74 184.709 184.483 184.224 183.57 183.154 182.678 182.1 181.416 180.517 179.17 173.99 -6 ,10639 ,KEBNE ,16750045,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:02:34 CET,0.0 2.072 2.966 3.717 4.382 4.983 5.55 6.091 7.089 7.549 7.984 8.326 9.218 9.642 10.498 11.322 12.116 12.501 13.259 14.007 15.113 15.83 16.528 17.556 18.557 19.538 20.513 21.478 22.718 23.906 25.073 26.494 27.887 29.268 30.909 32.813 34.713 36.856 39.219 41.812 44.621 47.866 51.781 55.877 60.871 66.681 73.667 81.999 92.396 105.587 123.37 140.104 151.159 158.995 164.7 169.046 172.385 175.12 177.259 179.167 180.635 181.825 182.826 183.648 184.372 184.971 185.527 185.989 186.345 186.659 186.939 187.133 187.295 187.412 187.492 187.572 187.622 187.654 187.672 187.669 187.644 187.56 187.475 187.353 187.287 187.162 186.968 186.686 186.544 186.104 185.933 185.661 185.386 184.73 184.322 183.799 183.175 182.482 181.639 180.324 174.241 -7 ,22982 ,KEBNE ,16750046,Thu Dec 2 01:19:31 CET,Thu Dec 2 03:00:53 CET,0.0 1.772 2.59 3.252 3.856 4.416 4.93 5.434 6.436 6.923 7.408 7.872 8.817 9.244 10.066 10.851 11.613 11.982 12.696 13.395 14.457 15.181 15.893 16.922 17.898 18.855 19.799 20.729 21.944 23.123 24.304 25.768 27.193 28.586 30.244 32.178 34.095 36.252 38.618 41.18 43.951 47.164 51.058 55.124 60.066 65.828 72.82 81.183 91.636 104.971 122.937 139.701 150.738 158.651 164.471 168.984 172.428 175.146 177.234 179.132 180.64 181.846 182.871 183.768 184.523 185.112 185.68 186.139 186.473 186.786 187.102 187.312 187.474 187.62 187.687 187.752 187.815 187.845 187.841 187.799 187.73 187.588 187.487 187.364 187.291 187.137 186.909 186.601 186.428 185.953 185.805 185.565 185.314 184.672 184.242 183.746 183.195 182.532 181.557 180.224 173.485 -8 ,17781 ,KEBNE ,16750047,Thu Dec 2 01:19:31 CET,Thu Dec 2 03:02:30 CET,0.0 2.474 3.458 4.274 4.991 5.582 6.11 6.616 7.563 8.018 8.45 8.784 9.672 10.071 10.883 11.692 12.467 12.85 13.632 14.375 15.432 16.127 16.801 17.789 18.754 19.7 20.627 21.546 22.766 23.987 25.203 26.682 28.123 29.537 31.201 33.107 35.003 37.139 39.493 42.069 44.852 48.078 51.99 56.097 61.062 66.851 73.847 82.192 92.642 105.955 123.93 140.705 151.654 159.435 165.193 169.651 173.046 175.79 177.907 179.804 181.251 182.397 183.413 184.281 185.016 185.618 186.162 186.56 186.884 187.199 187.465 187.672 187.865 188.019 188.119 188.213 188.274 188.285 188.263 188.242 188.193 188.074 187.981 187.884 187.825 187.663 187.46 187.185 187.026 186.589 186.529 186.3 186.027 185.4 185.049 184.649 184.154 183.468 182.556 181.324 175.651 -9 ,29601 ,KEBNE ,16750048,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:00:52 CET,0.0 1.666 2.506 3.198 3.796 4.364 4.898 5.387 6.311 6.77 7.239 7.608 8.495 8.894 9.688 10.454 11.208 11.582 12.32 13.04 14.075 14.751 15.43 16.451 17.448 18.402 19.333 20.245 21.443 22.638 23.813 25.275 26.739 28.148 29.792 31.715 33.633 35.796 38.187 40.799 43.605 46.845 50.779 54.891 59.855 65.637 72.629 80.97 91.385 104.679 122.596 139.445 150.541 158.379 164.128 168.572 172.029 174.808 176.969 178.914 180.408 181.615 182.627 183.481 184.176 184.746 185.317 185.767 186.069 186.313 186.557 186.734 186.879 187.008 187.087 187.148 187.203 187.238 187.232 187.197 187.16 187.061 186.963 186.849 186.785 186.612 186.376 186.133 185.977 185.51 185.448 185.235 185.009 184.409 184.026 183.61 183.091 182.41 181.549 180.288 175.223 -10 ,8962 ,KEBNE ,16750049,Thu Dec 2 01:19:31 CET,Thu Dec 2 03:01:15 CET,0.0 1.813 2.826 3.613 4.24 4.774 5.303 5.821 6.808 7.304 7.779 8.137 9.028 9.428 10.216 10.983 11.726 12.082 12.779 13.468 14.484 15.155 15.816 16.792 17.752 18.696 19.627 20.552 21.768 22.946 24.105 25.554 26.979 28.392 30.071 31.975 33.849 35.968 38.306 40.864 43.632 46.863 50.774 54.84 59.759 65.523 72.578 80.948 91.309 104.575 122.394 139.105 150.269 158.12 163.832 168.276 171.701 174.456 176.612 178.562 180.095 181.34 182.38 183.269 184.018 184.631 185.185 185.626 185.979 186.296 186.587 186.798 186.96 187.085 187.141 187.153 187.157 187.154 187.111 187.022 186.896 186.659 186.474 186.317 186.237 186.071 185.848 185.542 185.404 184.963 184.821 184.567 184.301 183.624 183.206 182.768 182.233 181.469 180.497 179.14 173.687 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt deleted file mode 100644 index 716364c2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22632 ,KEBNE ,16750050,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:02:56 CET,0.0 2.728 3.749 4.557 5.245 5.827 6.37 6.903 7.876 8.339 8.785 9.147 10.042 10.441 11.236 12.006 12.742 13.103 13.813 14.489 15.461 16.113 16.764 17.71 18.638 19.541 20.414 21.294 22.452 23.557 24.625 25.935 27.24 28.562 30.135 31.925 33.633 35.508 37.582 39.823 42.279 45.164 48.593 52.159 56.514 61.436 67.088 73.732 81.962 92.188 105.692 117.864 125.513 130.842 134.671 137.54 139.642 141.186 142.349 143.374 144.095 144.605 145.012 145.333 145.565 145.763 145.93 146.018 146.022 146.001 145.975 145.927 145.87 145.803 145.736 145.65 145.522 145.315 145.104 144.981 144.839 144.565 144.366 144.134 143.993 143.691 143.358 142.963 142.759 142.209 142.064 141.815 141.582 140.997 140.589 140.087 139.538 138.902 138.104 137.099 134.31 -2 ,17500 ,KEBNE ,16750051,Thu Dec 2 01:19:31 CET,Thu Dec 2 03:01:25 CET,0.0 2.112 3.005 3.794 4.513 5.163 5.736 6.25 7.216 7.672 8.112 8.491 9.39 9.804 10.6 11.361 12.109 12.472 13.175 13.848 14.845 15.513 16.162 17.094 18.01 18.921 19.813 20.68 21.819 22.919 23.993 25.329 26.667 28.013 29.587 31.317 32.953 34.802 36.836 39.024 41.405 44.162 47.489 50.939 55.027 59.72 65.378 72.011 80.12 90.405 103.74 115.775 123.519 128.78 132.525 135.408 137.604 139.296 140.554 141.642 142.42 142.968 143.45 143.873 144.164 144.369 144.561 144.695 144.761 144.807 144.817 144.781 144.72 144.629 144.534 144.396 144.243 144.055 143.835 143.695 143.558 143.335 143.138 142.912 142.805 142.565 142.275 141.952 141.76 141.188 141.009 140.71 140.396 139.614 139.149 138.661 138.059 137.274 136.372 135.175 131.09 -3 ,1539 ,KEBNE ,16750052,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:01:19 CET,0.0 2.095 3.012 3.768 4.435 5.021 5.57 6.098 7.062 7.517 7.955 8.293 9.19 9.582 10.318 11.02 11.727 12.071 12.738 13.406 14.392 15.028 15.651 16.557 17.447 18.323 19.186 20.041 21.156 22.257 23.347 24.676 25.985 27.268 28.778 30.501 32.193 34.095 36.208 38.525 41.02 43.86 47.193 50.659 54.886 59.798 65.581 72.314 80.639 90.989 104.369 116.306 123.821 128.931 132.577 135.266 137.309 138.968 140.183 141.178 141.891 142.458 142.951 143.334 143.616 143.812 143.966 144.073 144.131 144.152 144.152 144.094 144.02 143.96 143.883 143.773 143.642 143.49 143.32 143.186 143.04 142.821 142.633 142.404 142.274 141.968 141.613 141.199 140.963 140.38 140.242 139.965 139.647 138.922 138.512 138.035 137.537 136.902 135.961 134.793 130.856 -4 ,15423 ,KEBNE ,16750053,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:03:15 CET,0.0 2.323 3.334 4.175 4.893 5.527 6.074 6.588 7.536 7.975 8.41 8.771 9.683 10.091 10.839 11.553 12.264 12.621 13.32 13.977 14.962 15.643 16.302 17.267 18.203 19.099 19.973 20.824 21.957 23.066 24.126 25.441 26.746 28.039 29.571 31.298 32.987 34.899 37.003 39.248 41.65 44.445 47.802 51.283 55.424 60.169 65.934 72.738 81.212 91.77 105.125 117.185 124.788 129.992 133.781 136.623 138.723 140.349 141.554 142.532 143.251 143.795 144.213 144.533 144.775 144.938 145.048 145.146 145.236 145.28 145.232 145.172 145.114 145.033 144.943 144.818 144.663 144.485 144.265 144.093 143.91 143.608 143.405 143.166 143.036 142.765 142.459 142.117 141.911 141.352 141.283 141.044 140.768 140.113 139.719 139.251 138.681 137.983 137.141 135.954 131.561 -5 ,7806 ,KEBNE ,16750054,Thu Dec 2 01:19:31 CET,Thu Dec 2 03:03:18 CET,0.0 2.136 3.062 3.837 4.509 5.128 5.696 6.212 7.152 7.602 8.075 8.524 9.463 9.901 10.746 11.533 12.295 12.673 13.392 14.069 15.077 15.728 16.345 17.254 18.147 19.023 19.878 20.723 21.84 22.924 23.992 25.329 26.649 27.932 29.445 31.196 32.915 34.819 36.94 39.243 41.686 44.533 47.952 51.406 55.537 60.358 66.191 73.102 81.533 91.984 105.603 118.11 125.997 131.232 134.956 137.795 139.9 141.492 142.688 143.737 144.531 145.151 145.635 146.015 146.312 146.558 146.764 146.879 146.927 146.944 146.954 146.936 146.874 146.774 146.675 146.562 146.445 146.291 146.083 145.931 145.772 145.52 145.35 145.162 145.063 144.864 144.621 144.335 144.178 143.658 143.574 143.342 143.091 142.433 142.038 141.564 141.007 140.279 139.33 137.969 133.629 -6 ,15951 ,KEBNE ,16750055,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:02:47 CET,0.0 2.413 3.37 4.161 4.866 5.495 6.091 6.678 7.765 8.258 8.736 9.168 10.094 10.514 11.3 12.041 12.773 13.133 13.859 14.565 15.584 16.248 16.888 17.818 18.721 19.608 20.474 21.33 22.465 23.579 24.665 26.004 27.322 28.6 30.119 31.875 33.587 35.495 37.584 39.882 42.345 45.144 48.568 52.129 56.381 61.317 67.16 73.904 82.156 92.53 106.149 118.274 126.08 131.447 135.119 137.865 139.952 141.612 142.828 143.851 144.582 145.145 145.602 145.946 146.209 146.409 146.566 146.655 146.713 146.748 146.737 146.689 146.625 146.581 146.512 146.385 146.234 146.044 145.841 145.698 145.529 145.223 144.973 144.719 144.578 144.234 143.905 143.593 143.426 142.905 142.818 142.559 142.279 141.598 141.202 140.771 140.304 139.725 138.976 137.992 134.039 -7 ,13669 ,KEBNE ,16750056,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:02:58 CET,0.0 2.528 3.574 4.423 5.129 5.757 6.312 6.819 7.785 8.24 8.679 9.031 9.914 10.302 11.065 11.797 12.511 12.861 13.564 14.237 15.207 15.849 16.477 17.393 18.294 19.19 20.068 20.926 22.045 23.143 24.221 25.544 26.841 28.108 29.6 31.363 33.117 35.036 37.164 39.526 42.088 44.998 48.297 51.73 55.889 60.593 66.283 72.943 81.053 91.318 104.828 117.055 124.819 130.115 133.998 136.903 139.048 140.736 141.981 142.976 143.681 144.241 144.687 145.036 145.299 145.494 145.675 145.795 145.87 145.913 145.905 145.88 145.831 145.749 145.631 145.47 145.32 145.152 144.949 144.807 144.643 144.353 144.126 143.872 143.75 143.514 143.212 142.88 142.725 142.206 142.173 141.952 141.699 141.114 140.756 140.322 139.788 139.147 138.328 137.15 131.455 -8 ,29995 ,KEBNE ,16750057,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:04:11 CET,0.0 2.015 2.936 3.652 4.287 4.903 5.468 6.014 7.023 7.463 7.879 8.199 9.095 9.497 10.283 11.041 11.776 12.131 12.812 13.483 14.466 15.099 15.723 16.638 17.535 18.413 19.279 20.131 21.28 22.446 23.544 24.85 26.157 27.451 28.962 30.676 32.349 34.223 36.284 38.563 41.04 43.863 47.266 50.827 55.061 59.947 65.83 72.73 81.113 91.441 105.048 117.286 124.872 130.113 133.969 136.894 138.995 140.586 141.791 142.826 143.569 144.172 144.673 145.04 145.325 145.511 145.662 145.747 145.768 145.79 145.761 145.712 145.635 145.525 145.441 145.338 145.213 145.048 144.86 144.73 144.583 144.327 144.143 143.933 143.825 143.604 143.355 143.075 142.921 142.4 142.333 142.112 141.862 141.27 140.942 140.57 140.084 139.45 138.622 137.324 132.879 -9 ,17204 ,KEBNE ,16750058,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:02:48 CET,0.0 2.64 3.591 4.344 4.997 5.605 6.18 6.724 7.72 8.18 8.646 9.091 10.015 10.43 11.234 12.021 12.796 13.173 13.905 14.626 15.68 16.367 17.044 18.033 19.0 19.949 20.868 21.732 22.852 23.969 25.072 26.41 27.697 28.966 30.458 32.18 33.898 35.778 37.787 40.032 42.475 45.204 48.469 51.897 55.995 60.72 66.357 73.001 81.15 91.31 104.699 116.851 124.721 130.183 134.099 136.975 139.099 140.757 142.001 143.094 143.884 144.453 144.893 145.24 145.521 145.737 145.888 145.956 145.993 146.007 145.982 145.905 145.778 145.63 145.517 145.43 145.339 145.224 145.063 144.936 144.77 144.444 144.214 143.984 143.874 143.634 143.287 142.847 142.628 142.073 141.975 141.721 141.44 140.804 140.45 140.06 139.573 138.95 138.232 137.301 133.914 -10 ,25550 ,KEBNE ,16750059,Thu Dec 2 01:19:33 CET,Thu Dec 2 03:00:39 CET,0.0 1.952 2.91 3.675 4.353 4.961 5.51 6.025 6.96 7.412 7.845 8.184 9.066 9.468 10.254 11.001 11.718 12.076 12.791 13.511 14.557 15.221 15.863 16.824 17.775 18.705 19.625 20.538 21.757 22.918 24.04 25.417 26.751 28.074 29.639 31.41 33.131 35.066 37.194 39.505 41.987 44.786 48.138 51.616 55.796 60.664 66.424 73.132 81.261 91.338 104.34 115.922 123.361 128.602 132.51 135.443 137.53 139.131 140.311 141.322 142.042 142.599 143.071 143.432 143.701 143.901 144.02 144.086 144.136 144.148 144.155 144.156 144.116 144.04 143.955 143.854 143.741 143.591 143.415 143.279 143.125 142.871 142.673 142.468 142.367 142.149 141.911 141.632 141.468 140.941 140.939 140.737 140.487 139.87 139.513 139.13 138.708 138.154 137.479 136.575 132.611 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt deleted file mode 100644 index 6c3fb92b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8571 ,KEBNE ,17028312,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:23:17 CET,0.0 2.119 2.98 3.681 4.321 4.916 5.463 5.967 6.907 7.363 7.806 8.158 9.034 9.42 10.175 10.897 11.602 11.954 12.637 13.294 14.263 14.899 15.524 16.456 17.369 18.25 19.113 19.971 21.096 22.196 23.292 24.633 25.968 27.296 28.857 30.662 32.426 34.395 36.591 39.019 41.649 44.695 48.365 52.184 56.791 62.162 68.657 76.347 85.904 98.042 114.274 129.387 139.379 146.438 151.574 155.564 158.639 161.111 163.014 164.693 165.984 167.029 167.897 168.649 169.315 169.858 170.335 170.693 170.984 171.27 171.529 171.676 171.79 171.897 171.958 172.0 172.028 172.045 172.021 171.986 171.954 171.894 171.831 171.714 171.64 171.485 171.304 171.071 170.948 170.522 170.499 170.311 170.103 169.609 169.316 168.974 168.549 168.061 167.451 166.469 163.614 -2 ,6040 ,KEBNE ,17028313,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:22:58 CET,0.0 2.02 2.974 3.731 4.408 5.042 5.64 6.215 7.263 7.759 8.245 8.681 9.613 10.037 10.856 11.659 12.44 12.824 13.572 14.276 15.273 15.919 16.55 17.496 18.431 19.337 20.205 21.065 22.213 23.337 24.445 25.779 27.113 28.443 29.995 31.795 33.562 35.526 37.714 40.142 42.733 45.714 49.321 53.024 57.529 62.825 69.188 76.743 86.207 98.288 114.418 129.434 139.505 146.645 151.798 155.776 158.857 161.307 163.168 164.86 166.179 167.211 168.087 168.829 169.409 169.875 170.341 170.72 170.997 171.261 171.506 171.671 171.812 171.913 171.964 172.011 172.042 172.044 172.031 172.019 171.977 171.786 171.597 171.385 171.27 171.038 170.784 170.456 170.267 169.774 169.67 169.444 169.196 168.583 168.196 167.751 167.232 166.602 165.806 164.728 161.642 -3 ,9965 ,KEBNE ,17028314,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:21:29 CET,0.0 1.824 2.806 3.643 4.341 4.993 5.607 6.142 7.106 7.555 7.994 8.374 9.279 9.688 10.455 11.193 11.916 12.277 12.988 13.672 14.688 15.351 16.0 16.952 17.879 18.784 19.675 20.55 21.683 22.814 23.946 25.338 26.697 28.021 29.597 31.418 33.199 35.242 37.493 39.881 42.464 45.484 49.149 52.955 57.509 62.801 69.206 76.842 86.35 98.443 114.633 129.555 139.447 146.551 151.745 155.773 158.916 161.448 163.366 165.066 166.375 167.446 168.376 169.148 169.806 170.35 170.855 171.243 171.504 171.712 171.913 172.081 172.219 172.297 172.326 172.355 172.377 172.394 172.369 172.322 172.276 172.19 172.114 172.01 171.948 171.809 171.635 171.415 171.282 170.834 170.802 170.618 170.406 169.887 169.582 169.225 168.797 168.25 167.521 166.434 163.136 -4 ,24757 ,KEBNE ,17028316,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:21:16 CET,0.0 2.392 3.236 3.937 4.579 5.181 5.735 6.254 7.227 7.686 8.128 8.491 9.382 9.769 10.522 11.248 11.954 12.306 13.028 13.739 14.742 15.381 16.018 16.962 17.876 18.763 19.638 20.52 21.699 22.842 23.951 25.319 26.655 27.952 29.498 31.301 33.067 35.048 37.25 39.684 42.325 45.358 49.013 52.804 57.386 62.732 69.167 76.878 86.538 98.787 115.001 130.067 140.104 147.258 152.492 156.517 159.602 162.063 163.998 165.748 167.083 168.161 169.081 169.85 170.482 171.008 171.489 171.84 172.083 172.288 172.462 172.564 172.666 172.775 172.85 172.917 172.956 172.983 172.973 172.936 172.875 172.734 172.628 172.519 172.445 172.281 172.123 171.906 171.774 171.349 171.345 171.144 170.888 170.289 169.94 169.527 169.085 168.542 167.836 166.915 163.862 -5 ,19332 ,KEBNE ,17028317,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:21:24 CET,0.0 2.419 3.392 4.114 4.734 5.321 5.859 6.377 7.341 7.792 8.246 8.625 9.545 9.966 10.758 11.533 12.262 12.618 13.347 14.065 15.098 15.76 16.405 17.344 18.25 19.146 20.04 20.921 22.074 23.207 24.323 25.695 27.03 28.347 29.916 31.705 33.472 35.47 37.689 40.099 42.708 45.765 49.469 53.331 57.937 63.303 69.827 77.51 87.016 99.081 115.023 129.823 139.729 146.775 151.925 155.914 158.939 161.392 163.308 165.013 166.308 167.348 168.252 169.014 169.654 170.17 170.643 171.01 171.28 171.545 171.807 171.977 172.079 172.168 172.229 172.263 172.296 172.305 172.253 172.192 172.105 171.941 171.805 171.63 171.537 171.328 171.09 170.818 170.641 170.138 169.972 169.713 169.479 168.962 168.618 168.21 167.764 167.17 166.351 165.233 162.218 -6 ,32053 ,KEBNE ,17028318,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:21:20 CET,0.0 2.513 3.45 4.176 4.84 5.425 5.953 6.462 7.445 7.903 8.337 8.708 9.635 10.069 10.896 11.705 12.495 12.869 13.587 14.265 15.217 15.842 16.47 17.396 18.308 19.198 20.061 20.927 22.096 23.252 24.376 25.729 27.059 28.385 29.968 31.767 33.508 35.479 37.654 40.036 42.663 45.714 49.342 53.141 57.753 63.11 69.574 77.225 86.723 98.824 114.992 129.988 139.93 146.974 152.116 156.087 159.188 161.689 163.62 165.335 166.623 167.665 168.581 169.35 169.972 170.483 170.941 171.298 171.593 171.861 172.079 172.217 172.347 172.444 172.498 172.557 172.597 172.607 172.602 172.585 172.515 172.382 172.282 172.12 172.03 171.86 171.674 171.441 171.29 170.803 170.687 170.444 170.169 169.529 169.166 168.747 168.221 167.593 166.874 165.913 162.104 -7 ,18442 ,KEBNE ,17028319,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:22:08 CET,0.0 2.217 3.184 3.901 4.526 5.108 5.657 6.176 7.15 7.61 8.047 8.404 9.316 9.744 10.561 11.316 12.026 12.37 13.043 13.702 14.683 15.327 15.958 16.89 17.792 18.676 19.56 20.434 21.568 22.685 23.789 25.136 26.455 27.769 29.35 31.155 32.914 34.908 37.113 39.521 42.105 45.092 48.682 52.432 57.005 62.314 68.776 76.49 86.016 98.155 114.398 129.611 139.584 146.594 151.785 155.784 158.861 161.325 163.212 164.901 166.195 167.226 168.136 168.945 169.608 170.107 170.556 170.921 171.219 171.504 171.747 171.898 172.023 172.135 172.21 172.273 172.307 172.313 172.266 172.212 172.17 172.057 171.957 171.866 171.816 171.676 171.481 171.269 171.161 170.731 170.699 170.504 170.276 169.734 169.39 168.988 168.534 167.998 167.263 166.319 163.198 -8 ,4643 ,KEBNE ,17028320,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:21:26 CET,0.0 1.942 2.816 3.546 4.144 4.714 5.264 5.77 6.719 7.168 7.6 7.938 8.849 9.265 10.021 10.726 11.429 11.775 12.45 13.124 14.116 14.762 15.394 16.321 17.232 18.133 19.015 19.883 21.047 22.208 23.345 24.724 26.105 27.482 29.075 30.858 32.625 34.624 36.814 39.182 41.744 44.751 48.421 52.247 56.815 62.112 68.607 76.291 85.732 97.827 113.834 128.622 138.501 145.629 150.953 155.063 158.204 160.705 162.606 164.322 165.651 166.69 167.565 168.289 168.87 169.36 169.821 170.174 170.433 170.659 170.839 170.938 171.04 171.142 171.176 171.164 171.136 171.102 171.026 170.96 170.876 170.7 170.554 170.387 170.297 170.083 169.841 169.555 169.387 168.907 168.837 168.622 168.361 167.791 167.483 167.112 166.631 166.045 165.333 164.336 161.099 -9 ,16620 ,KEBNE ,17028321,Wed Dec 22 19:40:20 CET,Wed Dec 22 21:21:29 CET,0.0 1.8 2.623 3.303 3.924 4.487 5.014 5.512 6.44 6.888 7.32 7.653 8.535 8.929 9.697 10.447 11.189 11.552 12.252 12.954 14.003 14.682 15.331 16.26 17.179 18.073 18.949 19.839 21.028 22.164 23.27 24.634 25.976 27.297 28.846 30.617 32.356 34.328 36.538 38.967 41.581 44.61 48.301 52.169 56.806 62.095 68.503 76.192 85.684 97.755 113.958 129.192 139.184 146.149 151.305 155.355 158.434 160.874 162.748 164.375 165.684 166.77 167.64 168.361 168.975 169.465 169.933 170.309 170.585 170.83 171.042 171.176 171.259 171.303 171.319 171.337 171.349 171.324 171.253 171.174 171.09 170.93 170.797 170.651 170.568 170.372 170.132 169.848 169.687 169.216 169.155 168.953 168.716 168.132 167.788 167.432 167.007 166.451 165.754 164.871 162.241 -10 ,23619 ,KEBNE ,17028322,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:21:36 CET,0.0 1.726 2.587 3.313 3.962 4.546 5.105 5.662 6.696 7.178 7.63 7.984 8.877 9.274 10.035 10.77 11.506 11.869 12.574 13.251 14.228 14.869 15.509 16.454 17.373 18.294 19.214 20.116 21.314 22.471 23.564 24.884 26.205 27.518 29.064 30.836 32.602 34.605 36.814 39.231 41.831 44.844 48.48 52.253 56.81 62.135 68.583 76.258 85.837 98.019 114.485 129.916 140.031 147.223 152.543 156.604 159.666 162.153 164.078 165.786 167.114 168.201 169.141 169.932 170.59 171.122 171.61 171.974 172.22 172.433 172.631 172.782 172.906 172.994 173.012 173.012 173.029 173.023 173.003 172.983 172.938 172.853 172.771 172.658 172.595 172.422 172.182 171.909 171.755 171.28 171.183 170.957 170.713 170.141 169.811 169.437 169.003 168.468 167.795 166.848 163.165 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index 2cfdf873..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1055 ,KEBNE ,16750060,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 02:59:52 CET,0.0 1.304 2.006 2.57 3.03 3.435 3.789 4.107 4.691 4.95 5.195 5.351 5.88 6.103 6.549 6.995 7.377 7.546 7.879 8.214 8.705 9.019 9.327 9.762 10.164 10.55 10.92 11.279 11.729 12.162 12.589 13.085 13.563 14.028 14.568 15.176 15.777 16.465 17.181 17.922 18.704 19.573 20.555 21.519 22.645 23.895 25.307 26.881 28.653 30.576 32.575 33.684 33.993 33.906 33.561 33.134 32.668 32.132 31.623 31.084 30.58 30.099 29.596 29.082 28.604 28.156 27.641 27.158 26.763 26.345 25.876 25.493 25.105 24.686 24.342 23.97 23.57 23.146 22.71 22.426 22.126 21.639 21.3 20.934 20.744 20.352 19.923 19.429 19.159 18.598 18.349 18.05 17.723 16.948 16.463 15.925 15.378 14.75 13.929 12.811 9.505 -2 ,14704 ,KEBNE ,16750061,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 03:01:32 CET,0.0 1.625 2.4 2.996 3.443 3.811 4.141 4.449 5.033 5.317 5.577 5.733 6.247 6.45 6.861 7.252 7.608 7.789 8.156 8.499 8.977 9.276 9.57 10.018 10.45 10.848 11.225 11.591 12.066 12.528 12.963 13.471 13.948 14.415 14.965 15.573 16.159 16.81 17.506 18.236 18.983 19.812 20.798 21.778 22.902 24.157 25.584 27.116 28.814 30.75 32.772 33.948 34.183 34.004 33.639 33.15 32.68 32.208 31.724 31.167 30.638 30.135 29.595 29.093 28.623 28.152 27.658 27.191 26.775 26.354 25.911 25.532 25.144 24.75 24.428 24.073 23.706 23.3 22.856 22.542 22.211 21.712 21.376 21.014 20.811 20.395 19.969 19.492 19.235 18.677 18.412 18.101 17.777 17.084 16.688 16.244 15.719 15.089 14.35 13.285 10.562 -3 ,20006 ,KEBNE ,16750062,Thu Dec 2 01:19:32 CET,Thu Dec 2 02:59:53 CET,0.0 1.737 2.401 2.906 3.326 3.739 4.102 4.415 4.986 5.254 5.5 5.647 6.167 6.38 6.797 7.194 7.561 7.737 8.077 8.408 8.888 9.204 9.517 9.948 10.349 10.751 11.157 11.541 12.002 12.443 12.872 13.396 13.893 14.371 14.941 15.579 16.166 16.804 17.531 18.295 19.063 19.906 20.901 21.925 23.107 24.393 25.8 27.323 29.047 30.96 32.909 34.021 34.274 34.103 33.767 33.358 32.874 32.34 31.824 31.267 30.753 30.284 29.816 29.323 28.842 28.404 27.94 27.5 27.111 26.689 26.231 25.841 25.403 24.931 24.546 24.131 23.71 23.314 22.914 22.625 22.32 21.838 21.491 21.124 20.932 20.513 20.05 19.54 19.28 18.721 18.452 18.149 17.849 17.214 16.834 16.392 15.889 15.255 14.38 13.121 9.172 -4 ,30055 ,KEBNE ,16750063,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:12:30 CET,0.0 1.838 2.553 3.069 3.513 3.906 4.261 4.594 5.183 5.457 5.731 5.915 6.427 6.644 7.058 7.466 7.881 8.082 8.456 8.787 9.263 9.571 9.865 10.289 10.695 11.098 11.478 11.851 12.355 12.811 13.233 13.742 14.226 14.699 15.256 15.857 16.436 17.099 17.803 18.521 19.267 20.121 21.104 22.058 23.175 24.44 25.869 27.463 29.27 31.209 33.218 34.321 34.549 34.392 34.044 33.608 33.12 32.601 32.115 31.569 31.05 30.569 30.093 29.614 29.131 28.684 28.218 27.779 27.384 26.958 26.479 26.071 25.658 25.241 24.917 24.545 24.17 23.796 23.375 23.064 22.742 22.253 21.904 21.517 21.325 20.939 20.508 20.011 19.739 19.163 18.833 18.495 18.137 17.339 16.891 16.39 15.818 15.177 14.369 13.12 8.948 -5 ,3010 ,KEBNE ,16750064,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:10:48 CET,0.0 1.759 2.558 3.137 3.636 4.117 4.547 4.925 5.625 5.92 6.178 6.378 6.909 7.119 7.518 7.909 8.287 8.465 8.809 9.129 9.591 9.895 10.188 10.612 11.028 11.437 11.833 12.211 12.693 13.156 13.594 14.127 14.636 15.121 15.691 16.309 16.889 17.535 18.229 18.967 19.758 20.64 21.653 22.665 23.806 25.053 26.48 28.04 29.726 31.589 33.579 34.751 35.045 34.929 34.622 34.195 33.737 33.241 32.75 32.218 31.724 31.254 30.757 30.27 29.817 29.389 28.921 28.462 28.05 27.622 27.151 26.757 26.344 25.902 25.552 25.187 24.801 24.402 24.001 23.715 23.41 22.926 22.583 22.22 22.017 21.577 21.118 20.634 20.38 19.837 19.625 19.33 18.991 18.23 17.804 17.31 16.76 16.173 15.479 14.422 11.567 -6 ,19819 ,KEBNE ,16750065,Thu Dec 2 01:31:01 CET,Thu Dec 2 03:11:26 CET,0.0 1.532 2.283 2.856 3.362 3.832 4.25 4.62 5.277 5.582 5.883 6.146 6.716 6.946 7.368 7.777 8.159 8.344 8.705 9.042 9.512 9.815 10.108 10.528 10.922 11.297 11.657 12.013 12.467 12.905 13.338 13.867 14.374 14.855 15.421 16.05 16.636 17.273 17.951 18.674 19.449 20.322 21.318 22.321 23.483 24.727 26.146 27.698 29.41 31.263 33.197 34.376 34.7 34.63 34.301 33.875 33.394 32.87 32.394 31.869 31.343 30.858 30.388 29.907 29.433 29.002 28.553 28.114 27.695 27.251 26.798 26.421 26.011 25.557 25.204 24.847 24.464 24.058 23.645 23.353 23.039 22.528 22.154 21.766 21.563 21.142 20.712 20.246 20.002 19.446 19.197 18.907 18.588 17.863 17.437 16.983 16.486 15.884 15.168 14.126 11.227 -7 ,26426 ,KEBNE ,16750066,Thu Dec 2 01:31:01 CET,Thu Dec 2 03:12:49 CET,0.0 1.732 2.505 3.105 3.642 4.108 4.51 4.88 5.546 5.852 6.146 6.379 6.941 7.19 7.627 8.032 8.416 8.598 8.953 9.295 9.8 10.116 10.412 10.844 11.263 11.656 12.043 12.423 12.897 13.351 13.784 14.306 14.827 15.328 15.886 16.5 17.097 17.747 18.432 19.173 19.949 20.802 21.801 22.786 23.895 25.123 26.508 28.024 29.756 31.679 33.668 34.877 35.167 34.978 34.598 34.14 33.661 33.152 32.669 32.139 31.648 31.187 30.698 30.214 29.746 29.269 28.771 28.369 27.994 27.572 27.137 26.757 26.318 25.864 25.524 25.161 24.778 24.376 23.934 23.634 23.341 22.86 22.509 22.138 21.94 21.521 21.065 20.587 20.343 19.781 19.53 19.247 18.954 18.262 17.832 17.362 16.859 16.26 15.54 14.554 11.572 -8 ,4175 ,KEBNE ,16750067,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:11:36 CET,0.0 1.495 2.132 2.622 3.075 3.476 3.839 4.175 4.769 5.038 5.291 5.47 5.999 6.218 6.648 7.041 7.418 7.596 7.932 8.26 8.728 9.018 9.297 9.72 10.141 10.543 10.928 11.305 11.789 12.237 12.669 13.203 13.709 14.195 14.763 15.381 15.967 16.602 17.289 18.032 18.812 19.693 20.706 21.724 22.874 24.124 25.564 27.157 28.975 30.91 32.905 34.096 34.31 34.181 33.887 33.439 32.948 32.411 31.883 31.331 30.816 30.325 29.832 29.348 28.878 28.419 27.923 27.47 27.077 26.673 26.244 25.856 25.431 24.995 24.667 24.317 23.925 23.517 23.096 22.803 22.506 22.034 21.7 21.35 21.167 20.776 20.363 19.899 19.626 19.058 18.803 18.48 18.12 17.297 16.831 16.321 15.728 15.063 14.25 13.187 10.044 -9 ,481 ,KEBNE ,16750068,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:12:50 CET,0.0 1.262 1.933 2.434 2.87 3.279 3.631 3.954 4.539 4.812 5.078 5.253 5.78 6.002 6.435 6.842 7.226 7.414 7.77 8.102 8.584 8.887 9.166 9.586 9.987 10.371 10.75 11.126 11.608 12.071 12.504 13.028 13.539 14.007 14.555 15.204 15.804 16.438 17.132 17.866 18.634 19.479 20.46 21.443 22.598 23.876 25.285 26.83 28.573 30.426 32.312 33.416 33.703 33.62 33.311 32.875 32.413 31.911 31.405 30.828 30.32 29.88 29.431 28.958 28.466 28.017 27.546 27.083 26.663 26.247 25.821 25.442 25.039 24.619 24.276 23.914 23.533 23.131 22.705 22.38 22.029 21.499 21.133 20.757 20.56 20.132 19.69 19.222 18.961 18.393 18.107 17.785 17.432 16.66 16.231 15.756 15.218 14.611 13.863 12.826 9.813 -10 ,32529 ,KEBNE ,16750069,Thu Dec 2 01:31:05 CET,Thu Dec 2 03:08:39 CET,0.0 1.436 2.08 2.634 3.153 3.614 4.013 4.367 4.984 5.264 5.527 5.723 6.259 6.478 6.893 7.291 7.666 7.842 8.173 8.487 8.958 9.264 9.556 9.978 10.378 10.774 11.155 11.517 11.99 12.445 12.878 13.399 13.886 14.362 14.923 15.536 16.119 16.766 17.468 18.211 18.997 19.856 20.818 21.779 22.894 24.151 25.619 27.213 28.983 30.94 32.918 34.058 34.313 34.178 33.895 33.486 32.977 32.461 31.985 31.456 30.959 30.475 29.984 29.512 29.057 28.592 28.078 27.613 27.197 26.755 26.305 25.931 25.528 25.101 24.767 24.407 24.025 23.629 23.218 22.931 22.619 22.116 21.758 21.359 21.148 20.708 20.204 19.645 19.361 18.779 18.494 18.189 17.862 17.149 16.754 16.301 15.798 15.195 14.409 13.353 10.272 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt deleted file mode 100644 index c8e841a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12384 ,KEBNE ,16750070,Thu Dec 2 01:31:08 CET,Thu Dec 2 03:08:34 CET,0.0 2.869 3.792 4.463 5.019 5.468 5.877 6.301 7.049 7.362 7.658 7.938 8.507 8.749 9.209 9.66 10.076 10.268 10.616 10.924 11.367 11.649 11.921 12.297 12.648 13.0 13.331 13.638 14.039 14.397 14.729 15.137 15.504 15.852 16.261 16.715 17.116 17.509 17.931 18.294 18.631 19.042 19.455 19.806 20.125 20.299 20.379 20.316 19.834 18.709 16.289 12.894 9.949 7.394 5.114 2.993 1.089 -0.629 -2.069 -3.485 -4.718 -5.799 -6.841 -7.821 -8.711 -9.517 -10.363 -11.12 -11.766 -12.434 -13.156 -13.754 -14.356 -15.006 -15.514 -16.018 -16.517 -17.038 -17.597 -17.982 -18.37 -18.973 -19.405 -19.856 -20.081 -20.535 -21.012 -21.519 -21.788 -22.417 -22.674 -23.0 -23.338 -24.08 -24.487 -24.92 -25.401 -25.941 -26.54 -27.35 -29.31 -2 ,3289 ,KEBNE ,16750071,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:12:13 CET,0.0 2.461 3.351 3.973 4.477 4.931 5.352 5.751 6.486 6.812 7.13 7.419 7.982 8.235 8.694 9.125 9.553 9.752 10.112 10.447 10.921 11.224 11.527 11.963 12.377 12.768 13.115 13.419 13.806 14.157 14.494 14.92 15.292 15.636 16.036 16.473 16.857 17.244 17.648 18.052 18.453 18.893 19.313 19.593 19.855 20.068 20.144 20.057 19.689 18.701 16.241 12.858 9.836 7.123 4.707 2.515 0.636 -1.046 -2.482 -3.901 -5.121 -6.214 -7.253 -8.21 -9.083 -9.89 -10.764 -11.592 -12.321 -13.038 -13.765 -14.368 -14.983 -15.609 -16.088 -16.582 -17.095 -17.632 -18.212 -18.615 -19.038 -19.725 -20.211 -20.721 -20.984 -21.537 -22.133 -22.713 -22.982 -23.604 -23.84 -24.156 -24.499 -25.258 -25.656 -26.07 -26.526 -27.047 -27.771 -28.698 -30.762 -3 ,5489 ,KEBNE ,16750072,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:12:12 CET,0.0 2.647 3.391 4.001 4.521 4.979 5.39 5.745 6.369 6.659 6.928 7.122 7.661 7.883 8.304 8.684 9.039 9.213 9.547 9.855 10.293 10.577 10.846 11.247 11.646 12.011 12.329 12.615 12.971 13.313 13.646 14.05 14.435 14.797 15.183 15.6 15.995 16.413 16.823 17.249 17.662 18.059 18.515 18.91 19.194 19.381 19.484 19.384 19.002 17.945 15.569 12.215 9.128 6.521 4.245 2.088 0.233 -1.418 -2.868 -4.333 -5.591 -6.706 -7.749 -8.695 -9.576 -10.39 -11.236 -12.0 -12.662 -13.35 -14.069 -14.671 -15.302 -15.933 -16.41 -16.918 -17.442 -18.001 -18.591 -18.981 -19.382 -20.029 -20.478 -20.959 -21.214 -21.727 -22.261 -22.838 -23.144 -23.813 -24.126 -24.487 -24.883 -25.727 -26.186 -26.684 -27.221 -27.828 -28.554 -29.475 -31.772 -4 ,14908 ,KEBNE ,16750073,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:13:38 CET,0.0 1.907 2.677 3.318 3.861 4.293 4.676 5.024 5.634 5.916 6.186 6.403 6.96 7.219 7.709 8.138 8.54 8.72 9.056 9.376 9.808 10.086 10.366 10.764 11.111 11.432 11.741 12.04 12.43 12.801 13.159 13.582 13.96 14.314 14.733 15.164 15.547 15.949 16.363 16.772 17.166 17.571 17.975 18.328 18.67 18.947 19.104 19.071 18.696 17.629 15.214 11.855 8.821 6.175 3.824 1.683 -0.192 -1.884 -3.307 -4.713 -5.967 -7.084 -8.125 -9.084 -9.955 -10.745 -11.591 -12.372 -13.053 -13.746 -14.455 -15.039 -15.652 -16.303 -16.807 -17.318 -17.854 -18.393 -18.944 -19.329 -19.724 -20.336 -20.755 -21.195 -21.425 -21.899 -22.381 -22.943 -23.255 -23.922 -24.204 -24.515 -24.842 -25.579 -25.99 -26.439 -26.962 -27.582 -28.347 -29.389 -31.962 -5 ,30719 ,KEBNE ,16750074,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:12:01 CET,0.0 2.669 3.488 4.074 4.554 4.995 5.382 5.727 6.337 6.611 6.866 7.047 7.584 7.809 8.237 8.634 8.997 9.167 9.489 9.795 10.217 10.482 10.753 11.159 11.544 11.899 12.241 12.568 12.969 13.36 13.722 14.126 14.491 14.836 15.217 15.618 16.014 16.437 16.889 17.316 17.687 18.059 18.437 18.787 19.112 19.372 19.53 19.582 19.267 18.181 15.749 12.395 9.492 6.802 4.334 2.088 0.173 -1.47 -2.888 -4.319 -5.521 -6.592 -7.615 -8.57 -9.471 -10.289 -11.136 -11.917 -12.606 -13.312 -14.049 -14.661 -15.281 -15.926 -16.428 -16.928 -17.438 -17.993 -18.587 -18.978 -19.378 -20.011 -20.436 -20.878 -21.108 -21.57 -22.052 -22.578 -22.877 -23.551 -23.843 -24.165 -24.495 -25.235 -25.656 -26.109 -26.585 -27.146 -27.809 -28.683 -31.47 -6 ,1973 ,KEBNE ,16750075,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:13:47 CET,0.0 2.222 3.133 3.826 4.424 4.908 5.31 5.677 6.33 6.616 6.885 7.102 7.645 7.86 8.268 8.671 9.037 9.206 9.528 9.824 10.257 10.541 10.815 11.199 11.556 11.884 12.192 12.485 12.855 13.225 13.593 14.007 14.373 14.741 15.162 15.604 16.002 16.404 16.833 17.27 17.685 18.123 18.609 19.005 19.356 19.606 19.726 19.693 19.298 18.244 15.828 12.311 9.225 6.641 4.378 2.317 0.48 -1.197 -2.626 -4.03 -5.243 -6.352 -7.434 -8.448 -9.374 -10.202 -11.046 -11.813 -12.498 -13.197 -13.917 -14.529 -15.175 -15.837 -16.332 -16.836 -17.347 -17.863 -18.417 -18.805 -19.189 -19.812 -20.262 -20.709 -20.944 -21.452 -21.97 -22.515 -22.791 -23.424 -23.723 -24.061 -24.386 -25.108 -25.546 -26.034 -26.551 -27.13 -27.84 -28.743 -31.142 -7 ,6312 ,KEBNE ,16750076,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:13:59 CET,0.0 2.65 3.487 4.075 4.561 5.004 5.401 5.74 6.366 6.649 6.907 7.093 7.625 7.845 8.252 8.622 8.987 9.155 9.473 9.793 10.237 10.518 10.791 11.18 11.525 11.844 12.168 12.479 12.871 13.247 13.579 13.955 14.314 14.665 15.056 15.439 15.813 16.227 16.621 17.024 17.417 17.813 18.233 18.613 19.027 19.354 19.502 19.382 18.908 17.772 15.318 11.942 8.976 6.348 3.968 1.833 0.005 -1.645 -3.109 -4.598 -5.874 -6.986 -8.019 -8.97 -9.867 -10.701 -11.574 -12.356 -13.017 -13.695 -14.404 -14.976 -15.566 -16.198 -16.692 -17.193 -17.715 -18.276 -18.847 -19.23 -19.628 -20.259 -20.702 -21.16 -21.395 -21.903 -22.457 -23.025 -23.328 -23.996 -24.303 -24.631 -24.983 -25.782 -26.203 -26.638 -27.113 -27.65 -28.315 -29.159 -31.324 -8 ,25487 ,KEBNE ,16750077,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:12:20 CET,0.0 2.07 3.0 3.681 4.225 4.728 5.16 5.558 6.32 6.659 6.954 7.199 7.764 8.018 8.503 8.959 9.387 9.594 10.009 10.388 10.859 11.137 11.406 11.792 12.165 12.515 12.83 13.123 13.511 13.875 14.198 14.57 14.936 15.293 15.687 16.117 16.512 16.932 17.345 17.747 18.155 18.561 18.995 19.399 19.747 19.994 20.112 20.087 19.756 18.71 16.25 12.929 9.927 7.167 4.777 2.658 0.823 -0.852 -2.307 -3.744 -4.956 -6.031 -7.047 -8.008 -8.915 -9.741 -10.608 -11.4 -12.072 -12.742 -13.439 -14.05 -14.682 -15.311 -15.79 -16.281 -16.794 -17.342 -17.923 -18.322 -18.725 -19.368 -19.822 -20.274 -20.498 -20.958 -21.448 -21.969 -22.242 -22.862 -23.108 -23.426 -23.765 -24.546 -24.984 -25.452 -25.995 -26.622 -27.364 -28.307 -30.554 -9 ,23650 ,KEBNE ,16750078,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:12:07 CET,0.0 2.118 2.926 3.556 4.055 4.483 4.873 5.213 5.823 6.107 6.373 6.56 7.083 7.301 7.721 8.115 8.483 8.671 9.027 9.34 9.802 10.103 10.369 10.75 11.126 11.484 11.824 12.146 12.559 12.95 13.3 13.699 14.08 14.441 14.864 15.338 15.739 16.142 16.569 17.002 17.436 17.884 18.323 18.691 19.031 19.287 19.377 19.217 18.716 17.608 15.278 12.022 9.075 6.444 4.073 1.996 0.266 -1.336 -2.761 -4.191 -5.416 -6.506 -7.531 -8.49 -9.366 -10.168 -11.042 -11.825 -12.503 -13.212 -13.918 -14.512 -15.135 -15.771 -16.271 -16.798 -17.338 -17.889 -18.47 -18.856 -19.25 -19.879 -20.309 -20.757 -20.983 -21.445 -21.931 -22.44 -22.71 -23.345 -23.603 -23.941 -24.314 -25.146 -25.589 -26.031 -26.53 -27.116 -27.73 -28.476 -30.753 -10 ,14159 ,KEBNE ,16750079,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:09:18 CET,0.0 2.739 3.614 4.261 4.786 5.223 5.61 5.97 6.62 6.914 7.193 7.391 7.918 8.136 8.55 8.963 9.366 9.547 9.891 10.232 10.7 10.987 11.257 11.63 11.989 12.331 12.651 12.973 13.403 13.772 14.099 14.48 14.858 15.232 15.642 16.066 16.45 16.867 17.26 17.64 18.016 18.398 18.81 19.212 19.594 19.814 19.934 19.928 19.52 18.388 15.957 12.588 9.604 6.935 4.636 2.572 0.722 -0.902 -2.309 -3.762 -4.985 -6.036 -7.057 -8.011 -8.871 -9.668 -10.513 -11.277 -11.945 -12.637 -13.359 -13.984 -14.631 -15.274 -15.767 -16.261 -16.762 -17.286 -17.833 -18.217 -18.622 -19.272 -19.727 -20.199 -20.447 -20.964 -21.521 -22.109 -22.411 -23.07 -23.408 -23.783 -24.169 -25.008 -25.448 -25.906 -26.434 -27.042 -27.776 -28.738 -30.875 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index a1a3d430..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6078 ,KEBNE ,16750080,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:14:25 CET,0.0 1.902 2.751 3.332 3.827 4.275 4.678 5.055 5.704 5.969 6.216 6.452 6.88 7.077 7.461 7.82 8.16 8.322 8.631 8.92 9.347 9.635 9.917 10.346 10.756 11.122 11.47 11.814 12.27 12.71 13.141 13.63 14.042 14.425 14.885 15.4 15.884 16.427 17.006 17.593 18.196 18.85 19.588 20.293 21.079 21.93 22.855 23.808 24.771 25.72 26.453 26.391 25.881 25.228 24.551 23.853 23.179 22.529 21.93 21.325 20.774 20.243 19.73 19.24 18.781 18.349 17.892 17.491 17.123 16.708 16.256 15.871 15.496 15.137 14.851 14.54 14.222 13.899 13.549 13.304 13.035 12.616 12.348 12.06 11.908 11.592 11.236 10.867 10.67 10.238 9.997 9.728 9.441 8.815 8.448 8.039 7.596 7.101 6.518 5.724 3.725 -2 ,325 ,KEBNE ,16750081,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:12:41 CET,0.0 4.546 5.33 5.921 6.41 6.84 7.219 7.552 8.153 8.416 8.665 8.914 9.363 9.575 9.965 10.333 10.679 10.842 11.161 11.457 11.868 12.129 12.384 12.756 13.12 13.469 13.796 14.121 14.546 14.931 15.285 15.725 16.158 16.564 17.019 17.529 18.02 18.542 19.088 19.658 20.262 20.947 21.713 22.458 23.312 24.2 25.119 26.062 27.062 28.035 28.703 28.648 28.189 27.588 26.977 26.322 25.672 25.025 24.431 23.822 23.307 22.841 22.347 21.864 21.415 21.007 20.568 20.161 19.809 19.426 19.007 18.666 18.3 17.9 17.593 17.287 16.962 16.613 16.269 16.016 15.74 15.336 15.057 14.754 14.595 14.28 13.942 13.571 13.382 12.959 12.726 12.463 12.174 11.537 11.183 10.784 10.331 9.826 9.227 8.469 3.727 -3 ,19815 ,KEBNE ,16750082,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:14:04 CET,0.0 1.336 1.923 2.375 2.734 3.04 3.322 3.591 4.1 4.341 4.565 4.729 5.144 5.323 5.662 5.983 6.304 6.464 6.787 7.097 7.531 7.801 8.057 8.429 8.779 9.106 9.434 9.755 10.151 10.525 10.888 11.32 11.736 12.138 12.599 13.109 13.59 14.119 14.695 15.285 15.865 16.496 17.223 17.913 18.693 19.571 20.527 21.517 22.575 23.541 24.175 24.106 23.605 22.984 22.31 21.622 20.954 20.307 19.72 19.099 18.544 18.012 17.48 16.97 16.494 16.067 15.602 15.18 14.82 14.43 14.007 13.656 13.278 12.868 12.559 12.232 11.89 11.553 11.195 10.943 10.676 10.258 9.95 9.612 9.437 9.061 8.669 8.276 8.072 7.638 7.425 7.188 6.937 6.413 6.118 5.804 5.456 5.04 4.508 3.721 1.687 -4 ,9282 ,KEBNE ,16750083,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:14:11 CET,0.0 1.677 2.276 2.737 3.153 3.582 3.972 4.282 4.84 5.097 5.338 5.565 6.005 6.204 6.585 6.957 7.292 7.446 7.756 8.056 8.493 8.767 9.027 9.418 9.781 10.108 10.428 10.733 11.115 11.488 11.848 12.291 12.732 13.127 13.561 14.058 14.536 15.057 15.601 16.17 16.766 17.437 18.183 18.895 19.729 20.595 21.532 22.541 23.599 24.569 25.198 25.119 24.621 24.001 23.343 22.62 21.956 21.302 20.672 20.04 19.495 18.965 18.431 17.945 17.486 17.053 16.6 16.207 15.852 15.463 15.07 14.734 14.358 13.96 13.658 13.342 13.003 12.65 12.295 12.036 11.766 11.371 11.08 10.773 10.62 10.303 9.936 9.506 9.283 8.837 8.569 8.288 8.0 7.354 6.983 6.594 6.166 5.689 5.098 4.304 2.608 -5 ,31059 ,KEBNE ,16750084,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:13:17 CET,0.0 1.577 2.171 2.599 2.965 3.322 3.68 4.036 4.661 4.931 5.181 5.423 5.901 6.146 6.604 7.016 7.418 7.609 7.938 8.229 8.654 8.926 9.189 9.575 9.926 10.262 10.6 10.916 11.304 11.679 12.054 12.5 12.922 13.329 13.804 14.341 14.853 15.398 15.961 16.544 17.141 17.806 18.579 19.317 20.163 21.074 22.033 23.049 24.102 25.055 25.767 25.755 25.272 24.617 23.913 23.208 22.532 21.897 21.316 20.683 20.129 19.629 19.151 18.69 18.242 17.823 17.357 16.949 16.603 16.241 15.858 15.523 15.172 14.806 14.511 14.195 13.866 13.523 13.13 12.836 12.551 12.135 11.851 11.563 11.419 11.095 10.706 10.284 10.061 9.606 9.367 9.133 8.893 8.366 8.061 7.718 7.336 6.885 6.34 5.615 3.92 -6 ,6385 ,KEBNE ,16750085,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:12:44 CET,0.0 1.821 2.398 2.849 3.224 3.61 3.979 4.283 4.816 5.063 5.309 5.544 5.988 6.192 6.59 6.955 7.286 7.449 7.765 8.07 8.52 8.807 9.097 9.504 9.859 10.203 10.536 10.848 11.247 11.63 12.0 12.459 12.908 13.353 13.866 14.418 14.922 15.461 16.03 16.606 17.197 17.855 18.596 19.33 20.174 21.06 22.01 22.982 23.987 24.935 25.636 25.646 25.133 24.453 23.768 23.088 22.458 21.824 21.233 20.604 20.033 19.55 19.046 18.54 18.107 17.709 17.277 16.88 16.5 16.113 15.745 15.43 15.087 14.726 14.443 14.152 13.852 13.53 13.185 12.948 12.699 12.298 12.011 11.698 11.538 11.212 10.86 10.463 10.259 9.835 9.622 9.393 9.146 8.596 8.282 7.951 7.591 7.179 6.671 5.987 4.227 -7 ,22120 ,KEBNE ,16750086,Thu Dec 2 01:31:02 CET,Thu Dec 2 03:14:40 CET,0.0 1.76 2.46 3.057 3.553 3.957 4.3 4.635 5.217 5.47 5.72 5.95 6.394 6.603 7.036 7.458 7.846 8.03 8.376 8.693 9.126 9.396 9.658 10.033 10.392 10.752 11.124 11.483 11.917 12.31 12.668 13.103 13.524 13.915 14.348 14.842 15.326 15.85 16.399 16.975 17.567 18.21 18.973 19.695 20.497 21.372 22.316 23.29 24.292 25.277 26.015 25.976 25.502 24.862 24.181 23.51 22.875 22.217 21.594 20.971 20.398 19.876 19.38 18.869 18.373 17.929 17.462 17.03 16.646 16.245 15.84 15.506 15.158 14.787 14.499 14.213 13.903 13.559 13.191 12.947 12.697 12.293 12.013 11.697 11.512 11.119 10.733 10.337 10.128 9.695 9.492 9.262 9.018 8.497 8.212 7.888 7.507 7.088 6.595 5.873 4.141 -8 ,13378 ,KEBNE ,16750087,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:12:40 CET,0.0 1.525 2.185 2.674 3.068 3.429 3.783 4.121 4.714 4.986 5.236 5.473 5.928 6.125 6.492 6.841 7.165 7.319 7.617 7.909 8.347 8.62 8.887 9.274 9.634 9.996 10.346 10.681 11.11 11.503 11.876 12.307 12.721 13.122 13.573 14.09 14.611 15.177 15.746 16.311 16.916 17.604 18.359 19.101 19.946 20.823 21.758 22.724 23.747 24.723 25.483 25.507 25.021 24.38 23.718 23.042 22.381 21.755 21.184 20.534 19.943 19.429 18.939 18.457 18.001 17.585 17.123 16.689 16.329 15.952 15.545 15.212 14.868 14.5 14.212 13.912 13.595 13.273 12.933 12.693 12.438 12.011 11.715 11.412 11.254 10.927 10.567 10.181 9.986 9.561 9.335 9.09 8.828 8.261 7.968 7.666 7.318 6.912 6.414 5.75 4.351 -9 ,19975 ,KEBNE ,16750088,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:14:00 CET,0.0 2.095 2.908 3.478 3.987 4.447 4.846 5.181 5.73 5.97 6.197 6.401 6.835 7.038 7.441 7.812 8.156 8.319 8.631 8.937 9.377 9.651 9.903 10.279 10.677 11.062 11.408 11.728 12.118 12.5 12.886 13.358 13.805 14.219 14.681 15.188 15.678 16.213 16.78 17.362 17.966 18.65 19.43 20.173 20.971 21.827 22.778 23.736 24.72 25.702 26.491 26.417 25.867 25.167 24.432 23.714 23.023 22.366 21.768 21.158 20.615 20.117 19.641 19.16 18.708 18.304 17.876 17.498 17.154 16.773 16.374 16.041 15.695 15.32 15.02 14.715 14.393 14.039 13.667 13.421 13.159 12.747 12.477 12.182 12.023 11.693 11.343 10.968 10.775 10.362 10.168 9.94 9.707 9.193 8.88 8.546 8.182 7.757 7.251 6.612 4.983 -10 ,18851 ,KEBNE ,16750089,Thu Dec 2 01:31:04 CET,Thu Dec 2 03:12:13 CET,0.0 2.322 3.175 3.825 4.384 4.857 5.264 5.625 6.277 6.584 6.87 7.153 7.62 7.838 8.24 8.603 8.932 9.111 9.468 9.803 10.25 10.505 10.753 11.14 11.532 11.906 12.269 12.621 13.063 13.5 13.914 14.403 14.868 15.275 15.727 16.234 16.707 17.228 17.784 18.354 18.953 19.621 20.379 21.12 21.951 22.81 23.746 24.726 25.73 26.719 27.495 27.575 27.058 26.359 25.654 24.963 24.315 23.645 23.061 22.464 21.9 21.385 20.892 20.419 19.966 19.55 19.125 18.741 18.392 18.024 17.639 17.298 16.92 16.511 16.191 15.86 15.526 15.19 14.83 14.566 14.288 13.864 13.57 13.265 13.109 12.766 12.4 12.013 11.813 11.394 11.188 10.951 10.694 10.118 9.798 9.448 9.069 8.644 8.143 7.478 5.993 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt deleted file mode 100644 index 1bc9768e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,947 ,KEBNE ,16750090,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:13:30 CET,0.0 1.876 2.599 3.1 3.553 3.975 4.343 4.666 5.208 5.435 5.662 5.849 6.27 6.467 6.85 7.215 7.57 7.74 8.058 8.348 8.72 8.947 9.179 9.507 9.813 10.127 10.436 10.716 11.059 11.373 11.649 11.985 12.302 12.581 12.887 13.186 13.478 13.811 14.131 14.429 14.734 15.07 15.416 15.702 15.943 16.115 16.145 15.96 15.422 14.246 11.71 8.155 4.984 2.231 -0.152 -2.279 -4.114 -5.792 -7.247 -8.707 -9.946 -11.006 -12.031 -13.014 -13.895 -14.672 -15.469 -16.207 -16.859 -17.498 -18.156 -18.73 -19.338 -19.963 -20.448 -20.953 -21.483 -22.019 -22.583 -22.973 -23.367 -24.004 -24.452 -24.896 -25.125 -25.624 -26.161 -26.744 -27.059 -27.657 -28.074 -28.442 -28.841 -29.69 -30.143 -30.641 -31.196 -31.803 -32.517 -33.471 -35.945 -2 ,7212 ,KEBNE ,16750091,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:13:50 CET,0.0 1.66 2.273 2.789 3.252 3.616 3.92 4.2 4.696 4.919 5.143 5.315 5.712 5.887 6.225 6.541 6.856 7.003 7.274 7.54 7.903 8.121 8.336 8.657 8.969 9.256 9.509 9.755 10.072 10.36 10.619 10.93 11.238 11.524 11.846 12.21 12.547 12.873 13.184 13.511 13.829 14.143 14.461 14.668 14.822 14.988 15.058 14.886 14.295 13.041 10.43 6.674 3.432 0.695 -1.698 -3.864 -5.715 -7.361 -8.784 -10.176 -11.355 -12.413 -13.442 -14.42 -15.3 -16.096 -16.925 -17.668 -18.331 -18.994 -19.679 -20.257 -20.833 -21.452 -21.938 -22.442 -22.957 -23.473 -24.008 -24.383 -24.786 -25.404 -25.842 -26.301 -26.537 -27.024 -27.536 -28.116 -28.426 -29.009 -29.429 -29.799 -30.182 -30.993 -31.43 -31.914 -32.464 -33.087 -33.835 -34.861 -37.469 -3 ,8520 ,KEBNE ,16750092,Thu Dec 2 01:31:04 CET,Thu Dec 2 03:12:34 CET,0.0 1.219 1.844 2.324 2.747 3.168 3.542 3.89 4.455 4.691 4.925 5.158 5.621 5.843 6.235 6.585 6.915 7.063 7.353 7.65 8.078 8.339 8.571 8.889 9.19 9.459 9.737 10.011 10.348 10.66 10.937 11.262 11.56 11.837 12.146 12.483 12.786 13.094 13.415 13.76 14.083 14.399 14.727 15.006 15.252 15.388 15.39 15.216 14.671 13.42 10.866 7.398 4.232 1.453 -0.947 -3.075 -4.914 -6.587 -8.016 -9.437 -10.67 -11.768 -12.809 -13.775 -14.674 -15.513 -16.386 -17.138 -17.775 -18.447 -19.144 -19.71 -20.299 -20.938 -21.435 -21.911 -22.396 -22.919 -23.471 -23.836 -24.216 -24.848 -25.284 -25.727 -25.966 -26.484 -27.048 -27.645 -27.953 -28.536 -28.921 -29.261 -29.62 -30.405 -30.826 -31.279 -31.772 -32.364 -33.104 -33.986 -36.512 -4 ,19873 ,KEBNE ,16750093,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:12:12 CET,0.0 1.496 2.118 2.577 2.964 3.305 3.61 3.894 4.402 4.635 4.862 5.051 5.468 5.658 6.036 6.398 6.739 6.902 7.212 7.489 7.863 8.097 8.322 8.639 8.918 9.182 9.44 9.69 10.02 10.345 10.66 11.016 11.324 11.619 11.963 12.301 12.608 12.948 13.301 13.652 13.984 14.327 14.66 14.932 15.174 15.322 15.303 15.011 14.422 13.295 10.766 7.13 3.895 1.152 -1.199 -3.298 -5.13 -6.805 -8.262 -9.69 -10.905 -11.982 -12.997 -13.955 -14.863 -15.681 -16.526 -17.294 -17.945 -18.62 -19.308 -19.853 -20.439 -21.071 -21.546 -22.017 -22.512 -23.052 -23.626 -24.014 -24.404 -25.045 -25.513 -25.979 -26.206 -26.666 -27.142 -27.655 -27.943 -28.504 -28.849 -29.179 -29.532 -30.351 -30.82 -31.337 -31.891 -32.492 -33.2 -34.14 -36.544 -5 ,29187 ,KEBNE ,16750094,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:11:42 CET,0.0 1.685 2.39 2.936 3.397 3.801 4.151 4.483 5.07 5.332 5.58 5.823 6.269 6.463 6.816 7.133 7.438 7.583 7.854 8.119 8.492 8.723 8.94 9.246 9.531 9.802 10.053 10.287 10.597 10.899 11.17 11.495 11.793 12.055 12.369 12.719 13.021 13.341 13.679 14.019 14.356 14.684 14.999 15.258 15.553 15.78 15.788 15.534 14.821 13.523 10.963 7.331 4.109 1.272 -1.223 -3.433 -5.299 -6.959 -8.362 -9.767 -10.999 -12.082 -13.085 -14.012 -14.881 -15.677 -16.515 -17.265 -17.921 -18.625 -19.325 -19.874 -20.463 -21.102 -21.585 -22.073 -22.595 -23.133 -23.688 -24.095 -24.511 -25.126 -25.556 -26.003 -26.231 -26.712 -27.237 -27.771 -28.044 -28.602 -28.932 -29.241 -29.578 -30.319 -30.732 -31.163 -31.62 -32.198 -32.919 -33.795 -36.66 -6 ,32468 ,KEBNE ,16750095,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:12:39 CET,0.0 1.144 1.786 2.287 2.699 3.059 3.391 3.681 4.161 4.395 4.627 4.807 5.224 5.405 5.74 6.044 6.327 6.462 6.727 6.982 7.332 7.557 7.774 8.075 8.362 8.647 8.93 9.191 9.525 9.833 10.11 10.426 10.715 10.995 11.311 11.651 11.974 12.331 12.686 13.025 13.366 13.715 14.03 14.297 14.572 14.748 14.772 14.574 14.016 12.755 10.029 6.402 3.263 0.534 -1.843 -3.984 -5.858 -7.537 -8.951 -10.347 -11.564 -12.653 -13.687 -14.612 -15.414 -16.125 -16.858 -17.514 -18.072 -18.669 -19.305 -19.814 -20.334 -20.879 -21.319 -21.759 -22.212 -22.7 -23.204 -23.54 -23.873 -24.417 -24.813 -25.227 -25.45 -25.928 -26.45 -27.014 -27.305 -27.875 -28.274 -28.621 -28.987 -29.81 -30.255 -30.758 -31.326 -31.94 -32.653 -33.642 -36.538 -7 ,28690 ,KEBNE ,16750096,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:13:42 CET,0.0 1.284 1.88 2.42 2.857 3.202 3.524 3.799 4.303 4.538 4.746 4.917 5.336 5.511 5.872 6.234 6.574 6.745 7.079 7.384 7.778 8.017 8.246 8.555 8.845 9.13 9.396 9.647 9.946 10.211 10.485 10.804 11.093 11.374 11.681 12.005 12.31 12.652 12.997 13.304 13.606 13.925 14.22 14.473 14.727 14.901 14.89 14.637 14.057 12.863 10.41 6.919 3.806 1.061 -1.361 -3.52 -5.377 -7.018 -8.447 -9.868 -11.083 -12.161 -13.163 -14.104 -14.989 -15.792 -16.64 -17.434 -18.124 -18.818 -19.525 -20.091 -20.682 -21.307 -21.778 -22.278 -22.816 -23.369 -23.929 -24.305 -24.694 -25.331 -25.784 -26.232 -26.453 -26.907 -27.381 -27.912 -28.204 -28.774 -29.158 -29.49 -29.82 -30.579 -31.024 -31.499 -32.001 -32.553 -33.188 -34.037 -36.352 -8 ,18377 ,KEBNE ,16750097,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:12:30 CET,0.0 2.036 2.751 3.295 3.799 4.227 4.592 4.906 5.445 5.681 5.891 6.048 6.466 6.666 7.071 7.44 7.786 7.947 8.232 8.491 8.871 9.101 9.309 9.617 9.937 10.251 10.532 10.789 11.106 11.403 11.675 11.983 12.286 12.564 12.862 13.191 13.501 13.85 14.213 14.526 14.804 15.105 15.433 15.683 15.923 16.072 16.095 15.978 15.472 14.315 11.795 8.285 5.054 2.296 -0.015 -2.14 -4.03 -5.698 -7.129 -8.571 -9.827 -10.944 -11.963 -12.878 -13.731 -14.539 -15.381 -16.12 -16.759 -17.443 -18.16 -18.74 -19.337 -19.958 -20.438 -20.932 -21.447 -21.974 -22.509 -22.88 -23.26 -23.864 -24.294 -24.749 -24.979 -25.443 -25.931 -26.456 -26.732 -27.281 -27.624 -27.945 -28.285 -29.033 -29.448 -29.888 -30.359 -30.948 -31.735 -32.809 -35.607 -9 ,29884 ,KEBNE ,16750098,Thu Dec 2 01:31:11 CET,Thu Dec 2 03:13:30 CET,0.0 1.49 2.199 2.758 3.184 3.531 3.83 4.098 4.55 4.757 4.947 5.045 5.438 5.6 5.916 6.216 6.483 6.597 6.811 7.014 7.299 7.478 7.645 7.894 8.12 8.316 8.512 8.703 8.937 9.147 9.346 9.583 9.808 10.014 10.224 10.435 10.63 10.847 11.052 11.212 11.354 11.498 11.618 11.678 11.677 11.568 11.281 10.801 9.988 8.508 5.697 2.175 -0.781 -3.274 -5.394 -7.265 -8.904 -10.394 -11.664 -12.915 -13.976 -14.905 -15.798 -16.664 -17.466 -18.192 -18.936 -19.589 -20.155 -20.746 -21.369 -21.877 -22.399 -22.946 -23.373 -23.824 -24.289 -24.763 -25.254 -25.596 -25.967 -26.565 -26.968 -27.37 -27.579 -28.006 -28.442 -28.918 -29.173 -29.702 -29.985 -30.275 -30.599 -31.309 -31.713 -32.157 -32.626 -33.131 -33.742 -34.573 -37.383 -10 ,13303 ,KEBNE ,16750099,Thu Dec 2 01:31:11 CET,Thu Dec 2 03:12:18 CET,0.0 1.708 2.403 2.928 3.37 3.728 4.051 4.341 4.875 5.113 5.342 5.544 5.973 6.174 6.58 6.965 7.296 7.449 7.761 8.048 8.423 8.649 8.872 9.195 9.481 9.743 10.001 10.245 10.565 10.885 11.179 11.515 11.841 12.138 12.448 12.799 13.13 13.472 13.822 14.144 14.451 14.794 15.126 15.379 15.62 15.737 15.729 15.56 15.05 13.96 11.413 7.736 4.577 1.824 -0.576 -2.685 -4.471 -6.089 -7.532 -8.966 -10.162 -11.244 -12.27 -13.214 -14.105 -14.926 -15.771 -16.516 -17.157 -17.811 -18.474 -19.015 -19.618 -20.267 -20.752 -21.246 -21.758 -22.295 -22.852 -23.232 -23.631 -24.265 -24.691 -25.133 -25.362 -25.834 -26.34 -26.886 -27.172 -27.73 -28.064 -28.383 -28.738 -29.546 -29.961 -30.383 -30.862 -31.402 -32.091 -33.104 -35.841 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt deleted file mode 100644 index a673c70f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5980 ,KEBNE ,17028323,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:21:35 CET,0.0 1.597 2.34 2.877 3.319 3.722 4.097 4.441 5.078 5.379 5.652 5.899 6.341 6.549 6.951 7.323 7.665 7.833 8.167 8.493 8.964 9.264 9.558 9.984 10.385 10.758 11.125 11.486 11.952 12.41 12.831 13.308 13.762 14.21 14.708 15.244 15.789 16.393 17.03 17.694 18.379 19.137 19.982 20.793 21.701 22.71 23.844 25.053 26.312 27.493 28.4 28.297 27.665 26.856 26.046 25.302 24.561 23.82 23.153 22.45 21.836 21.302 20.768 20.234 19.727 19.274 18.82 18.404 18.035 17.652 17.24 16.899 16.533 16.137 15.828 15.513 15.194 14.853 14.49 14.247 13.996 13.584 13.296 12.99 12.827 12.498 12.171 11.83 11.639 11.216 11.01 10.776 10.529 9.923 9.571 9.205 8.808 8.375 7.914 7.282 5.81 -2 ,20270 ,KEBNE ,17028324,Wed Dec 22 19:40:21 CET,Wed Dec 22 21:22:13 CET,0.0 1.452 2.087 2.578 2.975 3.363 3.739 4.076 4.665 4.928 5.187 5.454 5.924 6.147 6.556 6.936 7.293 7.466 7.811 8.147 8.623 8.92 9.203 9.602 9.977 10.35 10.732 11.105 11.605 12.098 12.539 13.026 13.505 13.954 14.448 15.01 15.557 16.181 16.866 17.552 18.242 19.024 19.898 20.757 21.706 22.654 23.715 24.831 25.963 27.087 27.836 27.69 27.074 26.349 25.587 24.763 23.98 23.271 22.618 21.955 21.378 20.798 20.221 19.674 19.162 18.715 18.25 17.808 17.43 17.047 16.626 16.261 15.88 15.472 15.155 14.834 14.489 14.124 13.746 13.488 13.227 12.802 12.504 12.199 12.036 11.693 11.334 10.95 10.749 10.322 10.104 9.861 9.607 9.077 8.781 8.44 8.044 7.614 7.096 6.39 4.442 -3 ,3817 ,KEBNE ,17028325,Wed Dec 22 19:40:20 CET,Wed Dec 22 21:21:54 CET,0.0 1.595 2.247 2.758 3.185 3.589 3.957 4.29 4.92 5.207 5.463 5.699 6.149 6.375 6.789 7.188 7.575 7.75 8.093 8.431 8.909 9.213 9.51 9.936 10.336 10.752 11.179 11.552 12.002 12.463 12.909 13.424 13.915 14.378 14.899 15.492 16.055 16.635 17.251 17.908 18.574 19.326 20.195 21.034 21.966 22.941 23.999 25.066 26.177 27.287 28.042 27.931 27.298 26.483 25.677 24.88 24.129 23.425 22.776 22.097 21.487 20.916 20.36 19.83 19.339 18.86 18.362 17.922 17.512 17.085 16.654 16.299 15.923 15.521 15.184 14.817 14.441 14.047 13.64 13.356 13.051 12.577 12.278 11.983 11.816 11.467 11.108 10.741 10.555 10.137 9.922 9.689 9.439 8.889 8.59 8.262 7.894 7.461 6.953 6.28 4.851 -4 ,20302 ,KEBNE ,17028326,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:22:49 CET,0.0 1.413 2.097 2.634 3.078 3.451 3.805 4.165 4.831 5.138 5.435 5.735 6.204 6.434 6.88 7.309 7.7 7.877 8.201 8.511 8.977 9.273 9.561 9.981 10.381 10.746 11.099 11.459 11.934 12.376 12.777 13.264 13.728 14.17 14.682 15.25 15.781 16.346 16.953 17.623 18.308 19.064 19.915 20.731 21.656 22.641 23.748 24.913 26.122 27.216 27.97 28.019 27.528 26.786 25.996 25.215 24.486 23.77 23.117 22.446 21.84 21.281 20.721 20.171 19.661 19.189 18.683 18.202 17.773 17.332 16.885 16.514 16.138 15.739 15.406 15.056 14.711 14.357 13.984 13.732 13.47 13.071 12.796 12.491 12.333 12.008 11.631 11.221 11.021 10.591 10.348 10.072 9.782 9.215 8.9 8.549 8.159 7.731 7.197 6.428 4.457 -5 ,12819 ,KEBNE ,17028327,Wed Dec 22 19:40:20 CET,Wed Dec 22 21:21:36 CET,0.0 1.826 2.647 3.268 3.783 4.227 4.631 4.998 5.684 6.005 6.304 6.625 7.119 7.38 7.862 8.305 8.717 8.922 9.332 9.719 10.262 10.585 10.88 11.306 11.703 12.081 12.458 12.822 13.279 13.702 14.107 14.626 15.135 15.611 16.157 16.756 17.303 17.893 18.535 19.217 19.919 20.695 21.578 22.419 23.335 24.329 25.414 26.477 27.626 28.706 29.449 29.461 28.888 28.088 27.278 26.502 25.771 25.043 24.368 23.686 23.093 22.516 21.935 21.407 20.911 20.446 19.96 19.505 19.101 18.699 18.273 17.913 17.548 17.164 16.854 16.522 16.177 15.826 15.468 15.218 14.952 14.516 14.175 13.812 13.639 13.276 12.882 12.454 12.225 11.76 11.476 11.208 10.918 10.268 9.904 9.513 9.073 8.574 8.006 7.239 5.388 -6 ,31750 ,KEBNE ,17028328,Wed Dec 22 19:40:20 CET,Wed Dec 22 21:22:53 CET,0.0 1.637 2.431 3.025 3.543 4.008 4.418 4.799 5.413 5.691 5.976 6.271 6.751 6.988 7.401 7.784 8.171 8.359 8.721 9.063 9.545 9.846 10.132 10.546 10.937 11.309 11.675 12.041 12.501 12.922 13.338 13.847 14.323 14.783 15.313 15.895 16.445 17.036 17.657 18.308 18.998 19.76 20.629 21.488 22.461 23.453 24.486 25.601 26.73 27.777 28.608 28.65 28.186 27.463 26.673 25.91 25.163 24.433 23.776 23.064 22.432 21.874 21.314 20.766 20.267 19.808 19.325 18.904 18.518 18.103 17.678 17.324 16.96 16.579 16.276 15.96 15.632 15.299 14.95 14.691 14.419 13.997 13.705 13.402 13.244 12.918 12.565 12.194 11.995 11.57 11.372 11.143 10.906 10.406 10.108 9.753 9.352 8.913 8.404 7.739 6.271 -7 ,19118 ,KEBNE ,17028329,Wed Dec 22 19:40:20 CET,Wed Dec 22 21:21:42 CET,0.0 1.951 2.792 3.4 3.907 4.374 4.796 5.18 5.838 6.133 6.399 6.643 7.107 7.329 7.73 8.114 8.508 8.699 9.059 9.414 9.894 10.191 10.492 10.946 11.396 11.825 12.228 12.618 13.093 13.514 13.927 14.409 14.866 15.327 15.865 16.455 16.985 17.543 18.137 18.769 19.456 20.226 21.077 21.889 22.812 23.794 24.866 25.995 27.183 28.348 29.189 29.113 28.464 27.735 26.989 26.165 25.344 24.606 23.942 23.253 22.65 22.092 21.533 20.991 20.498 20.04 19.548 19.103 18.719 18.327 17.926 17.573 17.188 16.802 16.509 16.208 15.885 15.532 15.15 14.873 14.591 14.169 13.871 13.542 13.375 13.026 12.624 12.181 11.954 11.507 11.29 11.06 10.814 10.27 9.954 9.6 9.228 8.802 8.25 7.578 6.093 -8 ,16746 ,KEBNE ,17028330,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:24:03 CET,0.0 1.823 2.467 2.999 3.455 3.85 4.207 4.541 5.152 5.434 5.696 5.939 6.391 6.604 7.002 7.383 7.743 7.92 8.272 8.597 9.098 9.421 9.702 10.107 10.503 10.903 11.323 11.724 12.19 12.618 13.037 13.544 14.02 14.47 15.003 15.615 16.182 16.761 17.379 18.019 18.699 19.454 20.272 21.1 22.039 23.052 24.19 25.341 26.497 27.62 28.407 28.281 27.666 26.9 26.149 25.382 24.612 23.902 23.242 22.529 21.913 21.355 20.815 20.298 19.792 19.348 18.881 18.447 18.065 17.651 17.233 16.89 16.524 16.134 15.825 15.497 15.16 14.809 14.42 14.154 13.895 13.472 13.159 12.839 12.675 12.326 11.938 11.539 11.342 10.909 10.7 10.481 10.258 9.749 9.453 9.126 8.756 8.332 7.842 7.179 5.435 -9 ,30041 ,KEBNE ,17028331,Wed Dec 22 19:40:20 CET,Wed Dec 22 21:21:25 CET,0.0 1.889 2.66 3.274 3.793 4.242 4.651 5.031 5.716 6.039 6.349 6.657 7.147 7.401 7.872 8.317 8.738 8.944 9.345 9.7 10.166 10.46 10.745 11.16 11.564 11.955 12.334 12.701 13.178 13.646 14.086 14.594 15.066 15.545 16.109 16.704 17.257 17.854 18.473 19.121 19.803 20.537 21.359 22.157 23.099 24.141 25.234 26.319 27.476 28.606 29.435 29.398 28.907 28.32 27.629 26.859 26.096 25.384 24.707 23.979 23.376 22.842 22.303 21.773 21.269 20.786 20.273 19.838 19.455 19.041 18.62 18.278 17.913 17.531 17.228 16.875 16.49 16.089 15.656 15.365 15.09 14.691 14.41 14.1 13.943 13.627 13.287 12.92 12.729 12.301 12.085 11.856 11.625 11.119 10.838 10.511 10.133 9.723 9.232 8.557 6.974 -10 ,22835 ,KEBNE ,17028332,Wed Dec 22 19:40:20 CET,Wed Dec 22 21:21:48 CET,0.0 2.031 2.74 3.244 3.676 4.073 4.425 4.743 5.306 5.574 5.83 6.071 6.533 6.757 7.167 7.554 7.919 8.096 8.438 8.772 9.242 9.532 9.815 10.231 10.649 11.071 11.463 11.814 12.25 12.674 13.086 13.571 14.032 14.497 15.018 15.571 16.107 16.704 17.34 18.011 18.716 19.491 20.355 21.208 22.16 23.107 24.158 25.33 26.559 27.666 28.435 28.389 27.796 27.055 26.289 25.532 24.772 24.006 23.333 22.658 22.061 21.514 20.971 20.435 19.939 19.49 19.011 18.586 18.229 17.843 17.434 17.091 16.723 16.348 16.052 15.74 15.422 15.085 14.729 14.484 14.224 13.801 13.51 13.215 13.059 12.725 12.367 11.985 11.786 11.346 11.051 10.77 10.476 9.839 9.488 9.076 8.621 8.132 7.548 6.855 5.307 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt deleted file mode 100644 index 94a3cf70..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30479 ,KEBNE ,17028333,Wed Dec 22 19:40:20 CET,Wed Dec 22 21:23:05 CET,0.0 1.859 2.658 3.251 3.739 4.193 4.64 5.045 5.754 6.081 6.378 6.72 7.22 7.462 7.892 8.286 8.658 8.852 9.238 9.595 10.099 10.407 10.696 11.124 11.551 11.956 12.336 12.705 13.195 13.67 14.119 14.682 15.227 15.721 16.291 16.94 17.554 18.257 19.027 19.797 20.578 21.463 22.513 23.55 24.723 25.995 27.346 28.757 30.337 32.131 33.88 34.708 34.83 34.593 34.163 33.65 33.13 32.639 32.161 31.582 31.059 30.586 30.114 29.659 29.238 28.857 28.442 28.055 27.712 27.344 26.953 26.612 26.232 25.838 25.547 25.256 24.951 24.631 24.288 24.046 23.8 23.412 23.127 22.812 22.64 22.263 21.868 21.46 21.246 20.807 20.517 20.23 19.923 19.281 18.929 18.543 18.108 17.641 17.133 16.483 14.608 -2 ,6250 ,KEBNE ,17028334,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:22:58 CET,0.0 2.446 3.226 3.771 4.248 4.669 5.041 5.402 6.034 6.304 6.568 6.837 7.304 7.542 7.981 8.406 8.84 9.05 9.433 9.791 10.304 10.627 10.938 11.39 11.822 12.233 12.623 12.996 13.476 13.933 14.386 14.961 15.501 15.984 16.554 17.207 17.838 18.503 19.17 19.892 20.663 21.552 22.568 23.543 24.688 25.934 27.31 28.82 30.482 32.22 33.913 34.811 34.892 34.568 34.043 33.445 32.846 32.284 31.756 31.153 30.641 30.174 29.672 29.206 28.802 28.415 27.982 27.563 27.21 26.859 26.461 26.111 25.752 25.379 25.086 24.787 24.471 24.144 23.808 23.561 23.296 22.869 22.559 22.246 22.086 21.724 21.324 20.89 20.653 20.194 19.944 19.691 19.409 18.79 18.442 18.055 17.632 17.152 16.573 15.836 14.207 -3 ,27333 ,KEBNE ,17028335,Wed Dec 22 19:40:20 CET,Wed Dec 22 21:21:44 CET,0.0 2.2 2.987 3.585 4.134 4.636 5.07 5.471 6.151 6.457 6.763 7.071 7.528 7.749 8.179 8.607 9.038 9.254 9.671 10.062 10.615 10.959 11.275 11.718 12.143 12.554 12.947 13.325 13.801 14.275 14.722 15.233 15.738 16.237 16.836 17.49 18.093 18.771 19.49 20.245 21.055 21.95 22.94 23.931 25.103 26.368 27.775 29.339 31.054 32.771 34.468 35.367 35.443 35.133 34.681 34.135 33.535 32.937 32.4 31.832 31.318 30.853 30.401 29.947 29.505 29.113 28.705 28.327 27.982 27.621 27.24 26.915 26.566 26.191 25.906 25.604 25.275 24.918 24.545 24.303 24.056 23.644 23.34 23.004 22.845 22.553 22.238 21.878 21.679 21.264 21.029 20.788 20.542 19.972 19.661 19.317 18.937 18.526 18.021 17.292 15.081 -4 ,14816 ,KEBNE ,17028336,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:22:59 CET,0.0 2.749 3.562 4.174 4.707 5.166 5.554 5.904 6.553 6.848 7.122 7.429 7.926 8.192 8.689 9.152 9.588 9.796 10.176 10.511 10.997 11.314 11.627 12.081 12.507 12.909 13.286 13.654 14.137 14.591 15.021 15.55 16.041 16.534 17.12 17.741 18.342 19.02 19.738 20.477 21.241 22.11 23.112 24.101 25.26 26.526 27.958 29.46 31.09 32.943 34.696 35.525 35.604 35.284 34.832 34.311 33.785 33.233 32.7 32.159 31.658 31.17 30.7 30.248 29.806 29.367 28.878 28.44 28.066 27.675 27.268 26.938 26.602 26.25 25.967 25.669 25.358 25.02 24.651 24.395 24.133 23.731 23.441 23.127 22.964 22.638 22.301 21.924 21.72 21.283 21.035 20.791 20.541 20.0 19.698 19.373 19.005 18.573 18.022 17.313 15.327 -5 ,6112 ,KEBNE ,17028337,Wed Dec 22 19:40:19 CET,Wed Dec 22 21:21:42 CET,0.0 1.557 2.295 2.919 3.47 3.944 4.365 4.753 5.468 5.777 6.045 6.314 6.773 6.999 7.436 7.845 8.228 8.413 8.798 9.175 9.692 10.015 10.327 10.788 11.235 11.668 12.087 12.475 12.963 13.43 13.861 14.372 14.858 15.331 15.905 16.555 17.163 17.813 18.525 19.279 20.035 20.883 21.886 22.887 24.033 25.256 26.628 28.176 29.873 31.655 33.454 34.403 34.462 34.121 33.656 33.142 32.588 32.0 31.479 30.933 30.415 29.932 29.483 29.037 28.595 28.195 27.745 27.321 26.976 26.607 26.206 25.845 25.448 25.042 24.722 24.415 24.121 23.8 23.439 23.188 22.928 22.514 22.231 21.937 21.783 21.464 21.116 20.748 20.553 20.114 19.817 19.527 19.225 18.577 18.207 17.815 17.396 16.902 16.29 15.485 13.733 -6 ,2548 ,KEBNE ,17028338,Wed Dec 22 19:40:20 CET,Wed Dec 22 21:22:55 CET,0.0 1.844 2.584 3.125 3.558 3.978 4.359 4.7 5.341 5.627 5.899 6.199 6.673 6.901 7.33 7.741 8.147 8.346 8.724 9.075 9.58 9.899 10.212 10.658 11.073 11.476 11.862 12.238 12.736 13.2 13.628 14.148 14.653 15.148 15.739 16.401 17.018 17.685 18.416 19.189 19.981 20.857 21.839 22.815 23.936 25.145 26.528 28.033 29.726 31.554 33.273 34.015 34.09 33.834 33.42 32.887 32.257 31.634 31.073 30.493 29.975 29.478 28.989 28.543 28.108 27.672 27.198 26.774 26.409 26.021 25.605 25.256 24.893 24.521 24.241 23.945 23.626 23.284 22.919 22.663 22.395 21.978 21.693 21.384 21.221 20.887 20.533 20.15 19.93 19.483 19.208 18.925 18.622 17.974 17.612 17.229 16.813 16.335 15.711 14.873 13.101 -7 ,20071 ,KEBNE ,17028339,Wed Dec 22 19:40:20 CET,Wed Dec 22 21:21:36 CET,0.0 1.631 2.397 2.945 3.412 3.82 4.165 4.488 5.093 5.365 5.625 5.9 6.377 6.635 7.13 7.577 8.012 8.228 8.635 9.003 9.513 9.834 10.136 10.578 10.997 11.399 11.794 12.176 12.667 13.138 13.6 14.142 14.648 15.134 15.697 16.355 16.988 17.674 18.418 19.182 19.98 20.861 21.895 22.932 24.084 25.392 26.886 28.435 30.154 31.898 33.573 34.473 34.487 34.152 33.711 33.209 32.669 32.112 31.6 31.013 30.478 30.014 29.57 29.132 28.705 28.304 27.872 27.476 27.136 26.771 26.381 26.06 25.715 25.355 25.078 24.779 24.471 24.148 23.794 23.556 23.315 22.928 22.652 22.359 22.204 21.893 21.551 21.191 21.006 20.598 20.39 20.151 19.893 19.316 18.993 18.631 18.232 17.803 17.3 16.617 14.454 -8 ,29307 ,KEBNE ,17028340,Wed Dec 22 19:40:21 CET,Wed Dec 22 21:22:55 CET,0.0 2.1 2.798 3.331 3.831 4.268 4.619 4.952 5.602 5.888 6.144 6.416 6.887 7.109 7.533 7.93 8.302 8.49 8.855 9.204 9.703 10.014 10.31 10.74 11.166 11.572 11.962 12.336 12.806 13.267 13.709 14.245 14.765 15.248 15.782 16.378 16.972 17.647 18.393 19.178 19.988 20.889 21.912 22.905 24.044 25.28 26.669 28.204 29.836 31.568 33.376 34.333 34.461 34.209 33.713 33.138 32.571 31.995 31.475 30.945 30.456 29.967 29.47 28.983 28.502 28.074 27.638 27.24 26.903 26.554 26.175 25.843 25.478 25.095 24.783 24.45 24.106 23.742 23.348 23.091 22.83 22.383 22.066 21.746 21.59 21.273 20.934 20.553 20.339 19.907 19.7 19.485 19.249 18.711 18.41 18.07 17.679 17.252 16.769 16.085 14.501 -9 ,24398 ,KEBNE ,17028341,Wed Dec 22 19:45:27 CET,Wed Dec 22 21:28:41 CET,0.0 2.03 2.896 3.568 4.124 4.589 4.983 5.324 5.941 6.227 6.503 6.826 7.329 7.581 8.071 8.535 8.977 9.194 9.582 9.924 10.409 10.719 11.018 11.456 11.887 12.293 12.682 13.06 13.555 14.034 14.486 15.041 15.593 16.129 16.726 17.374 17.994 18.663 19.389 20.168 20.961 21.848 22.892 23.931 25.096 26.346 27.771 29.31 31.014 32.814 34.446 35.31 35.45 35.161 34.723 34.175 33.6 33.038 32.531 31.99 31.495 31.016 30.525 30.061 29.613 29.22 28.819 28.438 28.089 27.718 27.331 27.006 26.658 26.271 25.964 25.648 25.316 24.972 24.624 24.372 24.111 23.702 23.416 23.116 22.954 22.616 22.262 21.886 21.691 21.278 21.056 20.819 20.576 20.052 19.762 19.431 19.041 18.591 18.05 17.262 15.139 -10 ,12213 ,KEBNE ,17028342,Wed Dec 22 19:45:27 CET,Wed Dec 22 21:28:14 CET,0.0 2.031 2.791 3.391 3.882 4.296 4.66 4.996 5.613 5.891 6.156 6.437 6.91 7.138 7.588 8.021 8.43 8.621 8.979 9.322 9.807 10.106 10.394 10.829 11.252 11.65 12.031 12.403 12.878 13.342 13.814 14.402 14.971 15.495 16.069 16.701 17.296 17.963 18.718 19.526 20.33 21.197 22.191 23.184 24.331 25.598 27.049 28.617 30.371 32.171 33.859 34.765 34.799 34.445 33.966 33.483 33.002 32.472 31.973 31.424 30.922 30.458 30.001 29.575 29.161 28.763 28.314 27.889 27.524 27.136 26.733 26.394 26.039 25.67 25.373 25.068 24.77 24.453 24.103 23.86 23.62 23.225 22.936 22.65 22.502 22.178 21.806 21.394 21.169 20.711 20.412 20.136 19.844 19.214 18.864 18.472 18.016 17.513 16.89 16.086 14.146 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index c2f50559..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26244 ,KEBNE ,17028343,Wed Dec 22 19:45:27 CET,Wed Dec 22 21:23:40 CET,0.0 1.269 1.934 2.429 2.864 3.271 3.63 3.944 4.546 4.816 5.051 5.262 5.717 5.941 6.374 6.774 7.149 7.337 7.708 8.055 8.519 8.796 9.066 9.471 9.873 10.261 10.648 11.014 11.482 11.967 12.426 12.957 13.467 13.966 14.536 15.171 15.762 16.415 17.121 17.874 18.697 19.604 20.666 21.721 22.936 24.254 25.685 27.169 28.756 30.432 31.923 32.505 32.175 31.418 30.579 29.745 28.875 28.029 27.319 26.581 25.918 25.276 24.615 24.008 23.449 22.91 22.348 21.833 21.373 20.884 20.381 19.972 19.531 19.068 18.708 18.334 17.94 17.522 17.071 16.724 16.354 15.801 15.403 14.978 14.767 14.346 13.897 13.387 13.107 12.641 12.31 11.99 11.602 10.656 10.161 9.666 9.106 8.365 7.46 6.117 -5.776 -2 ,520 ,KEBNE ,17028344,Wed Dec 22 19:45:27 CET,Wed Dec 22 21:24:22 CET,0.0 1.71 2.361 2.863 3.268 3.609 3.91 4.187 4.682 4.935 5.204 5.482 5.962 6.189 6.619 7.01 7.354 7.518 7.841 8.154 8.59 8.87 9.136 9.515 9.89 10.251 10.617 10.968 11.406 11.855 12.321 12.88 13.371 13.833 14.388 15.0 15.598 16.276 16.984 17.744 18.544 19.4 20.42 21.501 22.75 24.04 25.453 27.054 28.762 30.442 31.914 32.384 31.978 31.312 30.562 29.669 28.784 27.945 27.187 26.417 25.731 25.104 24.497 23.904 23.336 22.817 22.269 21.76 21.316 20.835 20.332 19.922 19.476 18.965 18.566 18.156 17.707 17.236 16.745 16.414 16.072 15.531 15.114 14.65 14.422 13.92 13.362 12.748 12.419 11.884 11.359 10.955 10.546 9.642 9.136 8.544 7.88 7.128 6.17 4.704 -9.111 -4 ,4530 ,KEBNE ,17028346,Wed Dec 22 19:45:27 CET,Wed Dec 22 21:24:12 CET,0.0 1.234 1.789 2.249 2.69 3.084 3.41 3.704 4.253 4.512 4.759 4.992 5.468 5.698 6.115 6.517 6.899 7.08 7.438 7.796 8.311 8.635 8.941 9.393 9.826 10.221 10.584 10.926 11.384 11.825 12.249 12.781 13.301 13.776 14.326 14.955 15.548 16.187 16.864 17.578 18.336 19.2 20.236 21.312 22.544 23.877 25.402 27.025 28.756 30.577 32.193 32.709 32.281 31.599 30.887 30.107 29.31 28.519 27.748 26.925 26.268 25.687 25.075 24.5 23.963 23.437 22.891 22.397 21.951 21.488 20.973 20.502 20.016 19.518 19.12 18.727 18.326 17.895 17.449 17.123 16.76 16.194 15.797 15.39 15.189 14.748 14.237 13.683 13.39 12.873 12.434 12.085 11.704 10.863 10.378 9.838 9.248 8.466 7.404 5.977 -7.174 -6 ,812 ,KEBNE ,17028348,Wed Dec 22 19:45:27 CET,Wed Dec 22 21:23:34 CET,0.0 1.971 2.634 3.078 3.434 3.741 4.008 4.251 4.683 4.886 5.094 5.26 5.665 5.854 6.23 6.568 6.881 7.023 7.306 7.591 7.997 8.255 8.519 8.924 9.324 9.709 10.073 10.402 10.794 11.169 11.535 11.971 12.399 12.818 13.303 13.839 14.344 14.906 15.502 16.14 16.872 17.758 18.808 19.843 21.012 22.282 23.674 25.229 26.973 28.75 30.25 30.581 30.261 29.655 28.911 28.162 27.376 26.539 25.772 24.977 24.303 23.674 23.044 22.446 21.842 21.265 20.649 20.124 19.687 19.218 18.722 18.296 17.818 17.309 16.915 16.513 16.098 15.667 15.208 14.876 14.543 14.018 13.618 13.201 12.974 12.479 11.988 11.439 11.151 10.646 10.203 9.842 9.466 8.566 8.034 7.463 6.828 6.123 5.164 3.672 -2.704 -8 ,4950 ,KEBNE ,17028350,Wed Dec 22 19:45:27 CET,Wed Dec 22 21:24:08 CET,0.0 1.668 2.33 2.867 3.307 3.662 4.0 4.3 4.804 5.021 5.218 5.361 5.781 5.962 6.304 6.662 7.032 7.21 7.549 7.845 8.226 8.464 8.697 9.036 9.368 9.694 10.01 10.31 10.691 11.064 11.436 11.896 12.358 12.824 13.354 13.905 14.412 14.963 15.573 16.26 16.964 17.717 18.599 19.46 20.456 21.571 22.828 24.213 25.74 27.476 29.158 29.67 29.295 28.517 27.599 26.739 25.968 25.181 24.449 23.674 22.983 22.36 21.765 21.191 20.592 20.026 19.445 18.886 18.395 17.913 17.376 16.929 16.473 15.966 15.569 15.151 14.708 14.244 13.751 13.416 13.076 12.545 12.144 11.686 11.439 10.934 10.409 9.831 9.522 8.965 8.439 8.071 7.685 6.806 6.278 5.676 4.983 4.179 3.193 1.723 -6.309 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index 1bac5b29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17225 ,KEBNE ,16750100,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:12:04 CET,0.0 1.853 2.527 3.065 3.554 4.01 4.424 4.764 5.327 5.585 5.825 6.04 6.477 6.682 7.07 7.427 7.774 7.956 8.303 8.635 9.101 9.38 9.654 10.047 10.421 10.784 11.125 11.444 11.863 12.26 12.626 13.07 13.515 13.955 14.472 15.038 15.542 16.077 16.644 17.241 17.879 18.554 19.294 20.04 20.844 21.667 22.583 23.535 24.429 25.107 25.346 24.769 23.865 22.88 21.883 20.869 19.913 19.012 18.22 17.431 16.766 16.155 15.541 14.965 14.429 13.923 13.39 12.924 12.503 12.037 11.552 11.15 10.727 10.303 9.968 9.611 9.235 8.83 8.416 8.144 7.862 7.403 7.075 6.743 6.57 6.211 5.851 5.431 5.204 4.751 4.496 4.241 3.97 3.386 3.042 2.638 2.165 1.634 0.995 0.191 -1.501 -2 ,15847 ,KEBNE ,16750101,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:14:20 CET,0.0 1.596 2.241 2.698 3.097 3.449 3.781 4.073 4.604 4.85 5.086 5.34 5.783 5.983 6.367 6.741 7.116 7.303 7.646 7.969 8.431 8.715 8.987 9.377 9.735 10.069 10.398 10.732 11.163 11.561 11.929 12.371 12.793 13.193 13.658 14.173 14.663 15.197 15.765 16.362 16.974 17.636 18.39 19.127 19.929 20.777 21.659 22.5 23.373 24.143 24.568 24.14 23.233 22.27 21.322 20.37 19.46 18.596 17.838 17.042 16.352 15.713 15.089 14.499 13.935 13.425 12.897 12.418 11.999 11.568 11.106 10.705 10.264 9.812 9.457 9.062 8.645 8.206 7.739 7.414 7.083 6.578 6.232 5.884 5.713 5.355 4.966 4.568 4.365 3.924 3.672 3.409 3.119 2.491 2.147 1.749 1.292 0.786 0.184 -0.603 -2.59 -3 ,16767 ,KEBNE ,16750102,Thu Dec 2 01:31:04 CET,Thu Dec 2 03:15:44 CET,0.0 1.968 2.813 3.412 3.897 4.318 4.712 5.098 5.725 5.981 6.237 6.468 6.911 7.15 7.606 8.009 8.381 8.568 8.93 9.279 9.749 10.023 10.292 10.701 11.102 11.48 11.833 12.172 12.623 13.065 13.471 13.938 14.389 14.811 15.281 15.809 16.295 16.825 17.395 17.983 18.604 19.278 20.041 20.781 21.601 22.477 23.45 24.412 25.288 26.073 26.54 26.151 25.256 24.265 23.323 22.376 21.485 20.629 19.842 19.04 18.34 17.722 17.102 16.498 15.933 15.407 14.87 14.391 13.971 13.54 13.076 12.67 12.259 11.843 11.507 11.139 10.753 10.357 9.959 9.677 9.37 8.903 8.592 8.27 8.102 7.749 7.375 6.976 6.764 6.328 6.087 5.845 5.597 5.064 4.76 4.412 3.985 3.51 3.0 2.363 0.749 -4 ,18685 ,KEBNE ,16750103,Thu Dec 2 01:31:04 CET,Thu Dec 2 03:12:48 CET,0.0 1.463 2.22 2.827 3.347 3.777 4.166 4.504 5.081 5.349 5.601 5.822 6.27 6.515 6.982 7.388 7.77 7.956 8.322 8.658 9.118 9.404 9.665 10.06 10.44 10.794 11.135 11.456 11.876 12.285 12.672 13.121 13.544 13.965 14.429 14.932 15.43 15.978 16.554 17.148 17.755 18.408 19.164 19.912 20.745 21.613 22.516 23.42 24.36 25.199 25.669 25.254 24.362 23.328 22.307 21.347 20.441 19.583 18.831 18.061 17.323 16.658 16.038 15.426 14.829 14.285 13.73 13.201 12.746 12.304 11.837 11.438 11.019 10.58 10.244 9.887 9.508 9.116 8.708 8.418 8.098 7.571 7.203 6.818 6.614 6.202 5.788 5.323 5.071 4.584 4.249 3.966 3.694 3.108 2.777 2.432 2.051 1.615 1.119 0.446 -1.244 -5 ,23242 ,KEBNE ,16750104,Thu Dec 2 01:31:03 CET,Thu Dec 2 03:14:18 CET,0.0 1.478 2.122 2.603 3.037 3.446 3.838 4.202 4.855 5.172 5.466 5.772 6.236 6.446 6.835 7.203 7.548 7.712 8.03 8.334 8.767 9.053 9.327 9.712 10.077 10.405 10.712 11.016 11.426 11.82 12.216 12.689 13.095 13.485 13.941 14.46 14.957 15.495 16.051 16.64 17.253 17.902 18.668 19.4 20.2 21.033 21.888 22.749 23.63 24.423 24.755 24.235 23.397 22.508 21.556 20.595 19.682 18.79 17.999 17.218 16.529 15.859 15.218 14.639 14.09 13.558 12.976 12.474 12.05 11.591 11.102 10.706 10.295 9.849 9.499 9.136 8.767 8.373 7.957 7.681 7.395 6.925 6.578 6.197 5.996 5.589 5.167 4.714 4.469 3.986 3.653 3.358 3.048 2.361 1.977 1.582 1.145 0.65 0.041 -0.763 -2.473 -6 ,10958 ,KEBNE ,16750105,Thu Dec 2 01:34:11 CET,Thu Dec 2 03:14:50 CET,0.0 1.414 2.064 2.565 2.999 3.415 3.798 4.155 4.795 5.081 5.351 5.632 6.096 6.326 6.774 7.185 7.562 7.747 8.097 8.426 8.912 9.224 9.523 9.929 10.284 10.61 10.932 11.242 11.652 12.051 12.415 12.851 13.283 13.688 14.143 14.65 15.131 15.643 16.179 16.748 17.333 17.965 18.678 19.356 20.126 20.994 21.946 22.897 23.875 24.73 25.152 24.647 23.72 22.755 21.808 20.863 19.973 19.122 18.326 17.461 16.735 16.119 15.514 14.921 14.351 13.831 13.307 12.838 12.412 11.962 11.509 11.124 10.704 10.265 9.925 9.568 9.182 8.752 8.282 7.968 7.663 7.175 6.823 6.451 6.257 5.86 5.445 4.988 4.748 4.267 3.94 3.654 3.346 2.663 2.302 1.971 1.621 1.18 0.663 0.009 -1.44 -7 ,28154 ,KEBNE ,16750106,Thu Dec 2 01:34:12 CET,Thu Dec 2 03:17:36 CET,0.0 1.183 1.793 2.268 2.69 3.081 3.413 3.714 4.277 4.54 4.797 5.066 5.528 5.763 6.218 6.636 7.032 7.219 7.543 7.83 8.244 8.51 8.772 9.153 9.521 9.879 10.218 10.538 10.934 11.322 11.708 12.165 12.592 12.997 13.446 13.955 14.437 14.949 15.514 16.097 16.686 17.363 18.133 18.859 19.682 20.558 21.485 22.39 23.272 24.043 24.374 23.954 23.139 22.188 21.204 20.213 19.329 18.502 17.738 16.935 16.185 15.518 14.91 14.319 13.751 13.23 12.674 12.145 11.653 11.161 10.695 10.305 9.893 9.463 9.135 8.796 8.44 8.04 7.57 7.233 6.896 6.386 6.036 5.689 5.522 5.177 4.794 4.378 4.159 3.705 3.44 3.192 2.939 2.368 2.051 1.72 1.357 0.914 0.392 -0.247 -1.718 -8 ,16966 ,KEBNE ,16750107,Thu Dec 2 01:34:12 CET,Thu Dec 2 03:17:25 CET,0.0 1.876 2.541 3.069 3.505 3.882 4.201 4.507 5.072 5.325 5.57 5.812 6.251 6.446 6.815 7.17 7.519 7.687 8.004 8.302 8.728 9.012 9.279 9.654 10.019 10.366 10.692 11.011 11.424 11.821 12.198 12.633 13.048 13.458 13.937 14.462 14.955 15.483 16.045 16.627 17.215 17.839 18.563 19.311 20.135 20.973 21.851 22.779 23.764 24.691 25.161 24.663 23.78 22.784 21.786 20.801 19.892 19.036 18.275 17.5 16.806 16.178 15.579 15.009 14.473 13.97 13.404 12.872 12.448 12.026 11.568 11.18 10.759 10.314 9.981 9.64 9.286 8.889 8.445 8.144 7.845 7.38 7.063 6.735 6.559 6.181 5.8 5.421 5.218 4.787 4.551 4.304 4.025 3.368 2.988 2.579 2.128 1.603 1.012 0.319 -1.062 -9 ,593 ,KEBNE ,16750108,Thu Dec 2 01:34:12 CET,Thu Dec 2 03:17:42 CET,0.0 1.56 2.224 2.695 3.086 3.432 3.753 4.054 4.62 4.874 5.118 5.347 5.766 5.957 6.33 6.672 6.994 7.154 7.473 7.779 8.212 8.489 8.753 9.118 9.471 9.816 10.151 10.475 10.885 11.284 11.655 12.095 12.525 12.921 13.373 13.877 14.357 14.887 15.444 16.028 16.628 17.253 17.985 18.737 19.559 20.433 21.341 22.218 23.087 23.861 24.268 23.834 23.01 22.041 21.062 20.122 19.209 18.358 17.614 16.838 16.162 15.554 14.958 14.374 13.82 13.311 12.775 12.295 11.888 11.448 10.986 10.606 10.194 9.76 9.429 9.085 8.69 8.266 7.844 7.552 7.239 6.745 6.416 6.084 5.908 5.53 5.118 4.662 4.427 3.978 3.738 3.498 3.249 2.687 2.378 2.043 1.646 1.189 0.637 -0.127 -1.916 -10 ,17657 ,KEBNE ,16750109,Thu Dec 2 01:34:11 CET,Thu Dec 2 03:17:02 CET,0.0 1.389 1.965 2.418 2.797 3.107 3.388 3.649 4.115 4.323 4.539 4.746 5.179 5.377 5.754 6.121 6.46 6.619 6.948 7.27 7.716 8.002 8.271 8.662 9.031 9.375 9.712 10.03 10.425 10.811 11.193 11.649 12.069 12.468 12.916 13.428 13.909 14.42 15.006 15.618 16.22 16.897 17.665 18.413 19.248 20.091 20.995 21.872 22.755 23.538 23.953 23.499 22.542 21.547 20.616 19.73 18.897 18.061 17.292 16.507 15.797 15.15 14.516 13.907 13.343 12.814 12.266 11.775 11.35 10.919 10.457 10.066 9.665 9.227 8.879 8.519 8.14 7.748 7.321 7.014 6.707 6.251 5.931 5.592 5.421 5.062 4.664 4.237 4.019 3.579 3.332 3.064 2.774 2.109 1.729 1.326 0.874 0.35 -0.252 -0.998 -2.948 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index c17f5ad7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14489 ,KEBNE ,16750110,Thu Dec 2 01:38:27 CET,Thu Dec 2 03:21:51 CET,0.0 1.955 2.682 3.212 3.621 3.984 4.372 4.749 5.383 5.671 5.956 6.266 6.712 6.925 7.31 7.659 8.016 8.198 8.54 8.851 9.283 9.549 9.802 10.186 10.58 10.963 11.323 11.676 12.109 12.486 12.829 13.244 13.643 14.016 14.465 14.953 15.398 15.891 16.417 16.943 17.457 18.037 18.694 19.295 19.943 20.607 21.319 22.031 22.64 23.0 22.626 21.147 19.481 17.891 16.428 15.08 13.871 12.776 11.847 10.897 10.074 9.345 8.628 7.936 7.276 6.675 6.052 5.479 4.981 4.476 3.959 3.533 3.077 2.6 2.225 1.822 1.392 0.932 0.46 0.144 -0.166 -0.624 -0.953 -1.316 -1.504 -1.902 -2.326 -2.791 -3.049 -3.538 -3.857 -4.126 -4.402 -4.984 -5.308 -5.667 -6.086 -6.575 -7.138 -7.855 -9.905 -2 ,10118 ,KEBNE ,16750111,Thu Dec 2 01:52:03 CET,Thu Dec 2 03:33:39 CET,0.0 2.278 3.137 3.79 4.275 4.703 5.106 5.479 6.08 6.336 6.582 6.811 7.231 7.437 7.833 8.183 8.509 8.666 8.982 9.274 9.667 9.922 10.182 10.552 10.894 11.226 11.543 11.859 12.276 12.673 13.056 13.493 13.894 14.289 14.712 15.156 15.58 16.028 16.513 17.045 17.581 18.154 18.805 19.422 20.082 20.766 21.456 22.037 22.447 22.572 22.048 20.725 19.222 17.689 16.263 14.906 13.707 12.638 11.688 10.73 9.906 9.171 8.463 7.786 7.159 6.566 5.96 5.444 4.984 4.487 3.948 3.482 3.003 2.504 2.121 1.725 1.292 0.843 0.405 0.121 -0.174 -0.652 -0.988 -1.327 -1.497 -1.864 -2.259 -2.672 -2.883 -3.305 -3.54 -3.806 -4.07 -4.644 -4.989 -5.361 -5.774 -6.287 -6.928 -7.755 -10.311 -3 ,18309 ,KEBNE ,16750112,Thu Dec 2 01:52:03 CET,Thu Dec 2 03:33:41 CET,0.0 2.025 2.773 3.352 3.859 4.314 4.695 5.0 5.563 5.819 6.068 6.331 6.755 6.948 7.318 7.661 7.972 8.126 8.445 8.757 9.189 9.458 9.709 10.056 10.388 10.722 11.048 11.346 11.726 12.105 12.473 12.896 13.317 13.737 14.206 14.719 15.186 15.671 16.176 16.684 17.178 17.725 18.346 18.949 19.681 20.435 21.16 21.811 22.244 22.344 21.807 20.451 18.896 17.423 16.036 14.717 13.552 12.461 11.51 10.523 9.639 8.865 8.135 7.449 6.819 6.248 5.635 5.073 4.592 4.087 3.552 3.114 2.653 2.168 1.79 1.395 0.997 0.568 0.127 -0.166 -0.474 -0.948 -1.284 -1.647 -1.839 -2.238 -2.652 -3.094 -3.325 -3.784 -4.066 -4.369 -4.712 -5.419 -5.797 -6.213 -6.664 -7.202 -7.865 -8.7 -11.337 -4 ,19543 ,KEBNE ,16750113,Thu Dec 2 01:52:03 CET,Thu Dec 2 03:35:25 CET,0.0 1.894 2.63 3.172 3.585 3.966 4.31 4.61 5.141 5.387 5.62 5.839 6.27 6.477 6.857 7.226 7.581 7.745 8.049 8.336 8.752 9.017 9.278 9.652 9.989 10.324 10.647 10.95 11.343 11.704 12.047 12.478 12.888 13.276 13.714 14.191 14.65 15.121 15.6 16.09 16.609 17.196 17.87 18.509 19.168 19.832 20.524 21.12 21.547 21.722 21.085 19.528 17.911 16.341 14.934 13.613 12.385 11.238 10.263 9.291 8.421 7.624 6.86 6.16 5.52 4.916 4.295 3.751 3.26 2.748 2.231 1.819 1.362 0.835 0.437 0.049 -0.353 -0.772 -1.229 -1.546 -1.849 -2.337 -2.695 -3.066 -3.249 -3.631 -4.077 -4.58 -4.837 -5.319 -5.665 -5.97 -6.289 -6.919 -7.253 -7.63 -8.065 -8.546 -9.119 -9.886 -11.794 -5 ,14719 ,KEBNE ,16750114,Thu Dec 2 01:52:03 CET,Thu Dec 2 03:35:14 CET,0.0 2.322 3.078 3.633 4.133 4.575 4.956 5.31 5.972 6.286 6.579 6.889 7.335 7.538 7.927 8.284 8.611 8.772 9.088 9.407 9.87 10.144 10.398 10.767 11.118 11.453 11.768 12.067 12.448 12.817 13.176 13.61 14.016 14.385 14.806 15.283 15.735 16.215 16.708 17.222 17.763 18.348 18.993 19.615 20.314 20.993 21.609 22.196 22.705 22.931 22.485 21.066 19.552 18.053 16.636 15.378 14.233 13.148 12.175 11.182 10.326 9.593 8.881 8.175 7.522 6.938 6.316 5.725 5.223 4.729 4.232 3.821 3.376 2.903 2.515 2.093 1.659 1.228 0.789 0.48 0.164 -0.336 -0.701 -1.082 -1.269 -1.644 -2.026 -2.439 -2.655 -3.11 -3.412 -3.686 -3.968 -4.631 -5.029 -5.456 -5.913 -6.405 -6.971 -7.745 -9.395 -6 ,22582 ,KEBNE ,16750115,Thu Dec 2 01:52:02 CET,Thu Dec 2 03:33:13 CET,0.0 1.756 2.574 3.164 3.649 4.046 4.39 4.703 5.234 5.476 5.714 5.946 6.381 6.601 7.005 7.37 7.707 7.863 8.161 8.452 8.877 9.148 9.402 9.759 10.103 10.455 10.798 11.109 11.482 11.821 12.147 12.565 12.983 13.361 13.778 14.253 14.707 15.187 15.674 16.174 16.7 17.277 17.9 18.485 19.122 19.754 20.376 20.962 21.414 21.546 21.042 19.605 18.044 16.566 15.156 13.794 12.537 11.434 10.498 9.557 8.717 7.953 7.226 6.538 5.886 5.277 4.645 4.071 3.565 3.052 2.526 2.092 1.649 1.173 0.789 0.366 -0.069 -0.479 -0.894 -1.187 -1.492 -1.981 -2.324 -2.682 -2.866 -3.261 -3.675 -4.095 -4.328 -4.792 -5.062 -5.319 -5.577 -6.194 -6.578 -7.01 -7.472 -7.997 -8.615 -9.446 -11.668 -7 ,26809 ,KEBNE ,16750116,Thu Dec 2 01:52:02 CET,Thu Dec 2 03:33:25 CET,0.0 1.845 2.643 3.237 3.71 4.111 4.465 4.787 5.321 5.565 5.803 6.025 6.459 6.673 7.061 7.401 7.72 7.878 8.207 8.525 8.936 9.182 9.433 9.806 10.156 10.489 10.815 11.125 11.497 11.843 12.175 12.599 13.037 13.454 13.918 14.404 14.839 15.324 15.835 16.346 16.868 17.442 18.084 18.701 19.338 19.968 20.64 21.275 21.795 22.051 21.595 20.117 18.588 17.125 15.716 14.375 13.153 12.046 11.108 10.137 9.254 8.457 7.707 6.994 6.334 5.741 5.117 4.557 4.076 3.587 3.072 2.65 2.208 1.738 1.37 0.993 0.605 0.172 -0.29 -0.596 -0.904 -1.398 -1.745 -2.098 -2.28 -2.657 -3.055 -3.479 -3.704 -4.163 -4.436 -4.728 -5.07 -5.827 -6.233 -6.664 -7.167 -7.716 -8.355 -9.196 -10.921 -8 ,8346 ,KEBNE ,16750117,Thu Dec 2 01:52:03 CET,Thu Dec 2 03:33:43 CET,0.0 1.801 2.457 2.955 3.392 3.802 4.189 4.555 5.207 5.507 5.79 6.086 6.554 6.787 7.208 7.612 7.983 8.158 8.512 8.841 9.273 9.534 9.786 10.154 10.504 10.834 11.161 11.481 11.859 12.207 12.543 12.946 13.35 13.744 14.189 14.682 15.149 15.634 16.134 16.664 17.182 17.718 18.347 18.959 19.611 20.292 21.003 21.654 22.122 22.327 21.836 20.31 18.739 17.251 15.832 14.523 13.389 12.366 11.428 10.456 9.637 8.914 8.215 7.518 6.862 6.279 5.67 5.126 4.639 4.127 3.598 3.17 2.73 2.25 1.854 1.438 1.02 0.578 0.114 -0.2 -0.517 -1.031 -1.422 -1.845 -2.055 -2.461 -2.88 -3.321 -3.552 -4.011 -4.338 -4.654 -4.971 -5.604 -5.945 -6.306 -6.696 -7.155 -7.722 -8.477 -10.548 -9 ,27858 ,KEBNE ,16750118,Thu Dec 2 01:52:03 CET,Thu Dec 2 03:36:24 CET,0.0 2.159 2.981 3.594 4.05 4.421 4.768 5.089 5.65 5.904 6.146 6.381 6.801 6.993 7.373 7.746 8.09 8.253 8.566 8.847 9.242 9.502 9.762 10.157 10.55 10.93 11.292 11.626 12.049 12.443 12.789 13.192 13.592 13.965 14.374 14.852 15.311 15.788 16.276 16.789 17.313 17.874 18.485 19.073 19.737 20.377 21.011 21.612 22.12 22.369 21.86 20.443 18.914 17.422 15.993 14.647 13.467 12.413 11.502 10.562 9.707 8.94 8.202 7.505 6.863 6.248 5.593 5.021 4.544 4.051 3.529 3.086 2.631 2.164 1.79 1.393 0.981 0.545 0.086 -0.225 -0.551 -1.062 -1.431 -1.836 -2.049 -2.482 -2.942 -3.444 -3.71 -4.204 -4.534 -4.809 -5.087 -5.727 -6.074 -6.439 -6.843 -7.297 -7.838 -8.486 -10.252 -10 ,29754 ,KEBNE ,16750119,Thu Dec 2 01:52:03 CET,Thu Dec 2 03:33:40 CET,0.0 1.652 2.262 2.763 3.173 3.549 3.895 4.194 4.759 5.012 5.252 5.494 5.917 6.122 6.507 6.857 7.191 7.367 7.697 8.005 8.484 8.793 9.087 9.489 9.856 10.196 10.5 10.796 11.204 11.596 11.966 12.397 12.784 13.154 13.584 14.067 14.532 15.015 15.513 16.045 16.569 17.127 17.756 18.345 18.985 19.662 20.37 20.953 21.338 21.377 20.77 19.363 17.85 16.355 14.936 13.621 12.471 11.391 10.41 9.457 8.639 7.901 7.214 6.542 5.888 5.284 4.65 4.069 3.562 3.045 2.507 2.074 1.643 1.191 0.825 0.437 0.023 -0.401 -0.843 -1.145 -1.45 -1.94 -2.299 -2.693 -2.898 -3.331 -3.799 -4.3 -4.558 -5.021 -5.278 -5.531 -5.808 -6.451 -6.792 -7.16 -7.594 -8.071 -8.642 -9.458 -11.704 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt deleted file mode 100644 index 8def8c3a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15204 ,KEBNE ,16750120,Thu Dec 2 01:52:03 CET,Thu Dec 2 03:33:43 CET,0.0 1.929 2.566 3.071 3.501 3.859 4.174 4.461 4.967 5.196 5.421 5.627 6.036 6.226 6.604 6.961 7.284 7.44 7.751 8.053 8.479 8.731 8.972 9.331 9.673 10.007 10.328 10.614 10.982 11.342 11.681 12.088 12.472 12.84 13.251 13.714 14.147 14.6 15.079 15.56 16.063 16.649 17.317 17.914 18.559 19.222 19.907 20.565 21.112 21.367 21.01 19.868 18.464 17.031 15.7 14.463 13.306 12.241 11.333 10.408 9.595 8.851 8.155 7.499 6.873 6.307 5.723 5.195 4.739 4.271 3.78 3.379 2.949 2.495 2.146 1.788 1.423 1.038 0.629 0.343 0.046 -0.404 -0.719 -1.079 -1.268 -1.641 -2.02 -2.411 -2.623 -3.07 -3.306 -3.555 -3.831 -4.417 -4.73 -5.068 -5.48 -5.948 -6.434 -7.11 -8.732 -2 ,23677 ,KEBNE ,16750121,Thu Dec 2 01:52:03 CET,Thu Dec 2 03:35:25 CET,0.0 1.742 2.433 2.97 3.433 3.815 4.146 4.46 4.999 5.229 5.451 5.637 6.038 6.222 6.565 6.888 7.211 7.365 7.676 7.991 8.405 8.662 8.91 9.263 9.623 9.994 10.346 10.648 11.016 11.372 11.698 12.095 12.475 12.83 13.23 13.674 14.104 14.561 15.043 15.546 16.097 16.729 17.381 17.986 18.653 19.331 20.032 20.671 21.214 21.495 21.148 19.963 18.606 17.214 15.876 14.605 13.514 12.534 11.634 10.696 9.879 9.134 8.423 7.746 7.094 6.518 5.945 5.419 4.94 4.45 3.938 3.491 3.038 2.556 2.175 1.777 1.352 0.907 0.432 0.114 -0.201 -0.696 -1.022 -1.356 -1.531 -1.894 -2.298 -2.701 -2.912 -3.366 -3.598 -3.834 -4.099 -4.685 -4.987 -5.3 -5.664 -6.104 -6.669 -7.446 -9.28 -3 ,17153 ,KEBNE ,16750122,Thu Dec 2 01:52:03 CET,Thu Dec 2 03:33:52 CET,0.0 1.636 2.29 2.798 3.216 3.569 3.903 4.205 4.738 4.988 5.225 5.455 5.884 6.098 6.491 6.843 7.169 7.327 7.639 7.933 8.35 8.61 8.862 9.212 9.553 9.887 10.192 10.485 10.858 11.209 11.547 11.942 12.313 12.672 13.087 13.544 13.979 14.454 14.955 15.481 16.014 16.578 17.198 17.786 18.407 19.058 19.769 20.429 21.052 21.478 21.185 20.074 18.731 17.335 16.03 14.775 13.634 12.599 11.69 10.764 9.96 9.228 8.525 7.845 7.193 6.579 5.925 5.365 4.893 4.417 3.907 3.481 3.034 2.539 2.152 1.751 1.338 0.907 0.445 0.112 -0.226 -0.742 -1.108 -1.477 -1.66 -2.043 -2.45 -2.886 -3.115 -3.566 -3.815 -4.062 -4.319 -4.877 -5.185 -5.53 -5.911 -6.337 -6.879 -7.664 -9.789 -4 ,2545 ,KEBNE ,16750123,Thu Dec 2 01:52:03 CET,Thu Dec 2 03:35:13 CET,0.0 1.731 2.448 3.001 3.488 3.905 4.266 4.601 5.231 5.516 5.783 6.044 6.464 6.653 7.023 7.366 7.685 7.841 8.137 8.418 8.834 9.087 9.319 9.658 9.992 10.31 10.617 10.92 11.295 11.648 11.991 12.386 12.76 13.133 13.563 14.03 14.463 14.933 15.436 15.963 16.487 17.046 17.674 18.233 18.838 19.498 20.162 20.764 21.256 21.481 21.11 19.957 18.621 17.269 16.019 14.84 13.726 12.647 11.696 10.772 9.964 9.222 8.522 7.859 7.233 6.668 6.082 5.547 5.069 4.577 4.08 3.641 3.187 2.729 2.364 2.003 1.617 1.218 0.819 0.527 0.231 -0.212 -0.536 -0.873 -1.045 -1.404 -1.788 -2.214 -2.442 -2.908 -3.208 -3.499 -3.803 -4.483 -4.859 -5.253 -5.69 -6.188 -6.806 -7.586 -9.306 -5 ,28038 ,KEBNE ,16750124,Thu Dec 2 01:52:03 CET,Thu Dec 2 03:33:56 CET,0.0 1.38 2.024 2.529 2.932 3.316 3.686 4.017 4.583 4.826 5.056 5.265 5.671 5.862 6.233 6.585 6.917 7.072 7.367 7.654 8.07 8.333 8.587 8.948 9.285 9.605 9.915 10.216 10.613 10.997 11.352 11.774 12.164 12.548 12.999 13.472 13.921 14.391 14.864 15.372 15.92 16.492 17.097 17.668 18.315 19.024 19.745 20.363 20.875 21.187 20.853 19.634 18.196 16.818 15.55 14.293 13.131 12.061 11.126 10.203 9.395 8.674 7.987 7.313 6.682 6.08 5.425 4.856 4.378 3.88 3.371 2.953 2.518 2.08 1.728 1.347 0.966 0.579 0.173 -0.11 -0.417 -0.916 -1.246 -1.575 -1.751 -2.135 -2.529 -2.929 -3.138 -3.574 -3.804 -4.049 -4.309 -4.905 -5.237 -5.601 -6.01 -6.462 -6.994 -7.694 -9.454 -6 ,31182 ,KEBNE ,16750125,Thu Dec 2 02:00:24 CET,Thu Dec 2 03:42:06 CET,0.0 1.886 2.567 3.064 3.465 3.817 4.144 4.445 4.995 5.248 5.487 5.713 6.136 6.329 6.683 7.008 7.324 7.483 7.785 8.069 8.482 8.744 8.984 9.321 9.646 9.954 10.254 10.542 10.905 11.262 11.622 12.055 12.436 12.788 13.195 13.648 14.084 14.558 15.042 15.531 16.015 16.554 17.173 17.743 18.392 19.124 19.863 20.477 20.954 21.23 20.888 19.664 18.272 16.902 15.565 14.325 13.198 12.142 11.227 10.284 9.472 8.746 8.023 7.325 6.688 6.11 5.498 4.919 4.412 3.909 3.393 2.967 2.519 2.049 1.69 1.321 0.932 0.526 0.108 -0.179 -0.485 -0.96 -1.285 -1.644 -1.831 -2.192 -2.558 -2.949 -3.16 -3.605 -3.854 -4.113 -4.379 -4.971 -5.295 -5.643 -6.059 -6.515 -7.009 -7.688 -9.27 -7 ,1019 ,KEBNE ,16750126,Thu Dec 2 01:57:17 CET,Thu Dec 2 03:39:10 CET,0.0 1.657 2.267 2.74 3.145 3.513 3.846 4.174 4.774 5.022 5.258 5.491 5.906 6.093 6.446 6.774 7.09 7.242 7.542 7.842 8.26 8.513 8.743 9.074 9.409 9.735 10.041 10.33 10.702 11.068 11.417 11.843 12.255 12.628 13.047 13.505 13.94 14.416 14.906 15.397 15.886 16.431 17.05 17.649 18.302 18.988 19.766 20.466 21.003 21.281 20.893 19.648 18.233 16.826 15.521 14.305 13.217 12.197 11.296 10.352 9.518 8.791 8.086 7.407 6.763 6.165 5.527 4.932 4.439 3.945 3.419 2.986 2.545 2.082 1.712 1.33 0.946 0.555 0.148 -0.14 -0.449 -0.924 -1.239 -1.572 -1.751 -2.131 -2.526 -2.94 -3.154 -3.59 -3.821 -4.064 -4.321 -4.893 -5.214 -5.582 -5.99 -6.444 -7.023 -7.821 -9.86 -8 ,17206 ,KEBNE ,16750127,Thu Dec 2 01:57:17 CET,Thu Dec 2 03:40:20 CET,0.0 1.521 2.167 2.736 3.263 3.702 4.074 4.423 5.02 5.28 5.541 5.819 6.258 6.47 6.902 7.312 7.68 7.855 8.176 8.47 8.87 9.126 9.384 9.741 10.058 10.368 10.67 10.958 11.347 11.721 12.068 12.48 12.876 13.241 13.639 14.088 14.522 14.979 15.453 15.948 16.472 17.049 17.686 18.278 18.901 19.564 20.215 20.781 21.293 21.554 21.068 19.742 18.344 16.971 15.66 14.447 13.35 12.316 11.391 10.447 9.624 8.885 8.177 7.522 6.925 6.358 5.746 5.197 4.708 4.194 3.664 3.22 2.766 2.317 1.965 1.596 1.226 0.819 0.366 0.039 -0.299 -0.829 -1.176 -1.515 -1.691 -2.045 -2.429 -2.835 -3.043 -3.485 -3.749 -4.009 -4.277 -4.863 -5.192 -5.566 -5.973 -6.419 -7.026 -7.816 -9.236 -9 ,6125 ,KEBNE ,16750128,Thu Dec 2 01:57:17 CET,Thu Dec 2 03:39:08 CET,0.0 1.7 2.327 2.832 3.259 3.619 3.946 4.264 4.855 5.108 5.331 5.541 5.975 6.189 6.551 6.884 7.2 7.348 7.627 7.903 8.305 8.553 8.785 9.137 9.485 9.805 10.106 10.399 10.773 11.123 11.47 11.881 12.249 12.609 13.024 13.48 13.909 14.35 14.8 15.281 15.807 16.373 16.96 17.546 18.209 18.889 19.587 20.182 20.681 20.973 20.588 19.42 18.142 16.797 15.428 14.092 12.912 11.859 10.937 10.0 9.181 8.443 7.748 7.09 6.479 5.916 5.309 4.76 4.295 3.799 3.269 2.837 2.395 1.931 1.568 1.203 0.824 0.416 -0.007 -0.305 -0.614 -1.078 -1.402 -1.735 -1.907 -2.27 -2.659 -3.094 -3.324 -3.797 -4.123 -4.418 -4.726 -5.381 -5.731 -6.102 -6.497 -6.925 -7.43 -8.162 -9.766 -10 ,12154 ,KEBNE ,16750129,Thu Dec 2 02:02:32 CET,Thu Dec 2 03:47:03 CET,0.0 1.632 2.26 2.743 3.138 3.474 3.782 4.079 4.6 4.832 5.062 5.288 5.708 5.899 6.275 6.632 6.964 7.125 7.455 7.778 8.224 8.5 8.762 9.118 9.451 9.773 10.075 10.382 10.78 11.142 11.477 11.872 12.244 12.596 13.005 13.455 13.878 14.331 14.796 15.32 15.875 16.445 17.086 17.699 18.365 19.035 19.7 20.343 20.9 21.238 20.966 19.799 18.446 17.052 15.751 14.528 13.407 12.418 11.515 10.591 9.807 9.104 8.408 7.72 7.096 6.509 5.881 5.34 4.886 4.415 3.913 3.499 3.078 2.64 2.296 1.939 1.556 1.152 0.736 0.44 0.134 -0.359 -0.728 -1.118 -1.317 -1.726 -2.169 -2.647 -2.895 -3.375 -3.7 -3.986 -4.308 -5.049 -5.442 -5.862 -6.31 -6.806 -7.412 -8.211 -9.92 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index ed48e768..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9857 ,KEBNE ,16750130,Thu Dec 2 02:11:59 CET,Thu Dec 2 03:48:30 CET,0.0 1.809 2.51 2.995 3.381 3.722 4.035 4.312 4.786 4.998 5.204 5.39 5.749 5.91 6.174 6.4 6.622 6.73 6.918 7.101 7.413 7.599 7.75 7.96 8.161 8.34 8.501 8.65 8.835 9.01 9.192 9.406 9.592 9.785 10.0 10.211 10.403 10.599 10.776 10.948 11.114 11.252 11.374 11.466 11.514 11.497 11.37 11.099 10.624 9.722 7.967 5.615 3.563 1.844 0.368 -0.988 -2.186 -3.268 -4.191 -5.106 -5.891 -6.578 -7.238 -7.846 -8.417 -8.965 -9.536 -10.024 -10.459 -10.925 -11.398 -11.781 -12.179 -12.609 -12.945 -13.28 -13.614 -13.959 -14.312 -14.563 -14.835 -15.274 -15.6 -15.946 -16.126 -16.516 -16.929 -17.332 -17.534 -17.947 -18.162 -18.396 -18.644 -19.191 -19.502 -19.853 -20.235 -20.658 -21.165 -21.869 -23.831 -2 ,27184 ,KEBNE ,16750131,Thu Dec 2 02:13:02 CET,Thu Dec 2 03:51:00 CET,0.0 1.3 1.856 2.255 2.596 2.885 3.15 3.378 3.748 3.91 4.06 4.154 4.474 4.604 4.863 5.099 5.302 5.4 5.587 5.758 5.998 6.157 6.313 6.521 6.722 6.908 7.082 7.253 7.455 7.641 7.813 8.009 8.195 8.373 8.568 8.762 8.933 9.107 9.282 9.475 9.653 9.819 9.984 10.089 10.155 10.172 10.08 9.828 9.344 8.435 6.651 4.307 2.292 0.546 -0.933 -2.245 -3.426 -4.477 -5.372 -6.296 -7.081 -7.762 -8.431 -9.08 -9.673 -10.212 -10.769 -11.258 -11.677 -12.112 -12.574 -12.959 -13.358 -13.783 -14.114 -14.437 -14.771 -15.129 -15.515 -15.78 -16.043 -16.466 -16.769 -17.086 -17.249 -17.617 -18.008 -18.383 -18.58 -19.001 -19.254 -19.5 -19.744 -20.297 -20.601 -20.932 -21.317 -21.727 -22.203 -22.832 -25.137 -3 ,31127 ,KEBNE ,16750132,Thu Dec 2 02:19:24 CET,Thu Dec 2 03:55:58 CET,0.0 1.25 1.787 2.173 2.509 2.811 3.049 3.264 3.662 3.828 3.982 4.074 4.392 4.537 4.829 5.093 5.317 5.41 5.583 5.77 6.048 6.203 6.354 6.579 6.798 7.01 7.192 7.356 7.559 7.74 7.925 8.142 8.335 8.543 8.772 8.985 9.168 9.353 9.551 9.753 9.932 10.1 10.251 10.361 10.458 10.474 10.381 10.153 9.639 8.686 6.877 4.518 2.489 0.729 -0.788 -2.123 -3.288 -4.333 -5.228 -6.121 -6.914 -7.623 -8.282 -8.906 -9.485 -9.992 -10.514 -10.999 -11.422 -11.865 -12.328 -12.722 -13.126 -13.541 -13.869 -14.206 -14.564 -14.927 -15.279 -15.526 -15.8 -16.229 -16.516 -16.817 -16.985 -17.326 -17.703 -18.137 -18.364 -18.807 -19.105 -19.378 -19.667 -20.303 -20.627 -20.958 -21.324 -21.743 -22.212 -22.802 -24.548 -4 ,28140 ,KEBNE ,16750133,Thu Dec 2 02:26:45 CET,Thu Dec 2 04:03:25 CET,0.0 1.435 2.038 2.494 2.864 3.166 3.423 3.684 4.189 4.413 4.616 4.775 5.123 5.266 5.518 5.75 5.966 6.06 6.24 6.415 6.649 6.791 6.942 7.169 7.375 7.57 7.758 7.931 8.134 8.32 8.491 8.7 8.894 9.062 9.246 9.459 9.649 9.83 10.026 10.227 10.403 10.565 10.709 10.823 10.905 10.923 10.877 10.672 10.208 9.324 7.587 5.301 3.274 1.504 -0.004 -1.329 -2.502 -3.556 -4.467 -5.374 -6.159 -6.854 -7.502 -8.125 -8.699 -9.22 -9.767 -10.25 -10.66 -11.08 -11.521 -11.896 -12.291 -12.731 -13.092 -13.472 -13.86 -14.252 -14.668 -14.967 -15.283 -15.766 -16.096 -16.435 -16.615 -16.992 -17.379 -17.792 -18.003 -18.419 -18.642 -18.868 -19.119 -19.656 -19.962 -20.323 -20.747 -21.211 -21.707 -22.338 -24.276 -5 ,6481 ,KEBNE ,16750134,Thu Dec 2 02:29:56 CET,Thu Dec 2 04:01:31 CET,0.0 1.354 1.996 2.505 2.904 3.192 3.429 3.648 4.055 4.249 4.431 4.557 4.883 5.01 5.245 5.467 5.664 5.759 5.936 6.103 6.355 6.512 6.657 6.888 7.119 7.313 7.478 7.632 7.839 8.027 8.205 8.416 8.606 8.786 8.973 9.175 9.378 9.584 9.763 9.931 10.1 10.269 10.411 10.494 10.545 10.542 10.421 10.158 9.658 8.699 6.827 4.418 2.39 0.669 -0.824 -2.186 -3.397 -4.475 -5.368 -6.261 -7.005 -7.684 -8.371 -9.004 -9.599 -10.147 -10.713 -11.215 -11.668 -12.15 -12.618 -12.993 -13.388 -13.802 -14.122 -14.453 -14.797 -15.171 -15.564 -15.824 -16.093 -16.506 -16.795 -17.113 -17.275 -17.639 -18.057 -18.511 -18.737 -19.148 -19.354 -19.588 -19.841 -20.389 -20.701 -21.001 -21.319 -21.74 -22.307 -23.137 -25.197 -6 ,4684 ,KEBNE ,16750135,Thu Dec 2 02:38:27 CET,Thu Dec 2 04:10:01 CET,0.0 1.485 2.09 2.568 2.986 3.334 3.631 3.907 4.393 4.603 4.8 4.982 5.353 5.515 5.819 6.106 6.349 6.45 6.639 6.839 7.136 7.327 7.501 7.726 7.919 8.081 8.236 8.401 8.631 8.86 9.082 9.325 9.524 9.706 9.887 10.065 10.241 10.434 10.63 10.807 10.968 11.115 11.253 11.362 11.442 11.451 11.35 11.121 10.663 9.757 7.96 5.627 3.634 1.845 0.317 -1.004 -2.174 -3.207 -4.081 -4.974 -5.751 -6.44 -7.108 -7.733 -8.293 -8.794 -9.345 -9.851 -10.284 -10.741 -11.211 -11.596 -11.995 -12.4 -12.723 -13.053 -13.383 -13.726 -14.091 -14.347 -14.609 -15.025 -15.322 -15.631 -15.788 -16.118 -16.463 -16.837 -17.03 -17.428 -17.63 -17.846 -18.082 -18.627 -18.942 -19.28 -19.651 -20.064 -20.605 -21.336 -23.269 -7 ,22572 ,KEBNE ,16750136,Thu Dec 2 02:43:43 CET,Thu Dec 2 04:20:37 CET,0.0 1.334 1.983 2.451 2.82 3.135 3.407 3.629 4.018 4.194 4.35 4.459 4.784 4.907 5.136 5.35 5.548 5.639 5.822 6.0 6.233 6.372 6.505 6.708 6.901 7.078 7.242 7.393 7.589 7.768 7.924 8.122 8.317 8.494 8.69 8.899 9.095 9.298 9.48 9.655 9.812 9.962 10.122 10.222 10.281 10.281 10.169 9.898 9.36 8.409 6.611 4.289 2.265 0.505 -0.978 -2.31 -3.466 -4.498 -5.409 -6.314 -7.082 -7.771 -8.422 -9.042 -9.61 -10.123 -10.676 -11.172 -11.597 -12.047 -12.52 -12.914 -13.333 -13.79 -14.156 -14.527 -14.881 -15.244 -15.625 -15.872 -16.126 -16.537 -16.825 -17.131 -17.291 -17.633 -17.991 -18.356 -18.545 -18.948 -19.164 -19.386 -19.635 -20.27 -20.618 -20.983 -21.397 -21.874 -22.465 -23.308 -25.491 -8 ,9123 ,KEBNE ,16750137,Thu Dec 2 02:43:42 CET,Thu Dec 2 04:20:24 CET,0.0 1.879 2.499 2.943 3.344 3.708 4.031 4.307 4.78 4.997 5.201 5.39 5.744 5.885 6.145 6.378 6.582 6.68 6.862 7.03 7.283 7.446 7.599 7.797 7.999 8.212 8.392 8.553 8.76 8.955 9.13 9.325 9.509 9.68 9.861 10.06 10.239 10.416 10.592 10.755 10.902 11.051 11.197 11.282 11.328 11.323 11.217 10.945 10.385 9.387 7.497 5.047 3.011 1.257 -0.248 -1.601 -2.773 -3.824 -4.759 -5.692 -6.49 -7.208 -7.879 -8.496 -9.08 -9.627 -10.211 -10.737 -11.178 -11.615 -12.074 -12.464 -12.877 -13.302 -13.622 -13.955 -14.316 -14.711 -15.102 -15.357 -15.616 -16.025 -16.326 -16.645 -16.808 -17.141 -17.493 -17.866 -18.074 -18.535 -18.876 -19.16 -19.462 -20.138 -20.505 -20.886 -21.309 -21.83 -22.464 -23.265 -25.292 -9 ,30638 ,KEBNE ,16750138,Thu Dec 2 02:43:42 CET,Thu Dec 2 04:20:16 CET,0.0 1.852 2.5 2.939 3.27 3.543 3.79 4.022 4.444 4.627 4.796 4.925 5.255 5.385 5.656 5.92 6.135 6.232 6.435 6.628 6.903 7.071 7.216 7.419 7.627 7.834 8.018 8.174 8.383 8.591 8.771 8.964 9.157 9.342 9.531 9.725 9.894 10.09 10.296 10.48 10.638 10.791 10.99 11.264 11.597 11.89 12.101 12.177 11.98 11.272 9.675 7.322 5.036 2.907 1.055 -0.634 -2.132 -3.447 -4.556 -5.695 -6.648 -7.461 -8.235 -8.955 -9.637 -10.285 -10.959 -11.555 -12.077 -12.611 -13.157 -13.622 -14.137 -14.684 -15.096 -15.511 -15.933 -16.359 -16.815 -17.148 -17.486 -17.989 -18.325 -18.662 -18.842 -19.221 -19.625 -20.054 -20.264 -20.687 -20.959 -21.223 -21.503 -22.09 -22.408 -22.766 -23.164 -23.626 -24.23 -25.008 -27.085 -10 ,32591 ,KEBNE ,16750139,Thu Dec 2 02:43:43 CET,Thu Dec 2 04:20:20 CET,0.0 1.899 2.511 2.929 3.279 3.56 3.812 4.032 4.395 4.563 4.725 4.86 5.218 5.361 5.591 5.791 5.987 6.085 6.273 6.477 6.798 6.973 7.129 7.371 7.604 7.796 7.972 8.157 8.365 8.537 8.698 8.907 9.105 9.276 9.466 9.672 9.856 10.043 10.234 10.415 10.583 10.748 10.909 11.021 11.066 11.056 10.954 10.702 10.21 9.254 7.421 5.04 2.999 1.224 -0.279 -1.594 -2.752 -3.799 -4.702 -5.612 -6.393 -7.079 -7.74 -8.368 -8.954 -9.477 -10.002 -10.48 -10.908 -11.355 -11.81 -12.192 -12.601 -13.027 -13.362 -13.699 -14.053 -14.419 -14.805 -15.069 -15.323 -15.742 -16.036 -16.326 -16.481 -16.814 -17.17 -17.553 -17.749 -18.159 -18.377 -18.618 -18.869 -19.396 -19.69 -20.035 -20.445 -20.957 -21.591 -22.403 -24.749 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt deleted file mode 100644 index 3e9bc80e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24788 ,KEBNE ,16750140,Thu Dec 2 02:43:42 CET,Thu Dec 2 04:19:39 CET,0.0 1.229 1.802 2.274 2.661 2.992 3.289 3.552 4.053 4.298 4.536 4.756 5.196 5.395 5.755 6.085 6.413 6.574 6.879 7.165 7.568 7.835 8.087 8.452 8.81 9.144 9.466 9.782 10.189 10.574 10.934 11.369 11.79 12.209 12.697 13.237 13.749 14.3 14.91 15.541 16.191 16.933 17.766 18.591 19.527 20.554 21.74 22.971 24.284 25.723 27.041 27.47 27.277 26.786 26.192 25.569 24.989 24.425 23.895 23.368 22.896 22.437 21.981 21.56 21.15 20.738 20.301 19.913 19.57 19.193 18.782 18.473 18.17 17.833 17.58 17.302 16.976 16.629 16.283 16.051 15.798 15.378 15.082 14.793 14.648 14.359 14.061 13.721 13.53 13.106 12.882 12.64 12.384 11.792 11.466 11.149 10.818 10.42 9.936 9.317 8.029 -2 ,17211 ,KEBNE ,16750141,Thu Dec 2 02:56:35 CET,Thu Dec 2 04:28:49 CET,0.0 1.487 2.108 2.549 2.93 3.285 3.613 3.917 4.497 4.775 5.02 5.222 5.648 5.837 6.231 6.611 6.935 7.087 7.384 7.672 8.079 8.338 8.589 8.956 9.306 9.632 9.943 10.274 10.709 11.097 11.464 11.896 12.31 12.715 13.18 13.696 14.186 14.712 15.285 15.904 16.575 17.328 18.152 18.955 19.908 20.984 22.198 23.483 24.833 26.235 27.557 28.065 27.97 27.614 27.111 26.538 25.98 25.425 24.921 24.395 23.891 23.437 23.008 22.588 22.172 21.768 21.348 20.978 20.666 20.333 19.975 19.682 19.373 19.044 18.792 18.518 18.233 17.937 17.623 17.414 17.192 16.839 16.594 16.339 16.212 15.937 15.633 15.315 15.146 14.746 14.593 14.392 14.168 13.68 13.422 13.139 12.802 12.362 11.797 11.095 9.593 -3 ,29394 ,KEBNE ,16750142,Thu Dec 2 02:56:35 CET,Thu Dec 2 04:30:01 CET,0.0 1.672 2.438 3.005 3.461 3.881 4.276 4.634 5.258 5.528 5.767 5.988 6.443 6.65 7.03 7.368 7.676 7.826 8.125 8.409 8.809 9.069 9.325 9.684 10.047 10.401 10.722 11.034 11.446 11.857 12.26 12.744 13.181 13.579 14.056 14.592 15.092 15.654 16.266 16.908 17.575 18.319 19.166 20.008 20.974 22.0 23.152 24.404 25.762 27.12 28.24 28.667 28.447 27.959 27.424 26.878 26.318 25.752 25.251 24.734 24.265 23.822 23.376 22.953 22.551 22.17 21.781 21.439 21.131 20.788 20.434 20.148 19.851 19.539 19.291 19.023 18.741 18.449 18.111 17.886 17.674 17.325 17.08 16.817 16.682 16.409 16.114 15.802 15.634 15.228 15.073 14.887 14.68 14.193 13.91 13.602 13.285 12.912 12.432 11.812 10.235 -4 ,7059 ,KEBNE ,16750143,Thu Dec 2 02:57:36 CET,Thu Dec 2 04:31:42 CET,0.0 1.686 2.38 2.854 3.244 3.603 3.924 4.196 4.683 4.92 5.153 5.346 5.765 5.955 6.353 6.755 7.122 7.285 7.587 7.862 8.264 8.532 8.78 9.144 9.498 9.83 10.156 10.474 10.881 11.262 11.632 12.072 12.496 12.924 13.418 13.953 14.451 14.993 15.585 16.217 16.876 17.626 18.47 19.295 20.272 21.307 22.48 23.786 25.205 26.686 27.964 28.449 28.279 27.842 27.346 26.797 26.238 25.646 25.101 24.573 24.11 23.684 23.249 22.816 22.408 22.024 21.634 21.291 20.972 20.615 20.228 19.906 19.579 19.242 18.986 18.722 18.441 18.151 17.839 17.617 17.374 16.963 16.681 16.388 16.229 15.898 15.542 15.148 14.944 14.521 14.301 14.065 13.813 13.227 12.925 12.598 12.224 11.821 11.359 10.73 9.04 -5 ,2778 ,KEBNE ,16750144,Thu Dec 2 02:58:37 CET,Thu Dec 2 04:34:55 CET,0.0 1.467 2.023 2.472 2.883 3.251 3.583 3.897 4.422 4.65 4.875 5.104 5.57 5.805 6.21 6.57 6.946 7.112 7.398 7.678 8.092 8.356 8.603 8.97 9.322 9.654 9.978 10.281 10.671 11.06 11.436 11.89 12.339 12.766 13.243 13.782 14.303 14.869 15.474 16.127 16.822 17.568 18.427 19.295 20.265 21.331 22.542 23.823 25.202 26.687 27.91 28.236 27.997 27.547 27.031 26.45 25.866 25.291 24.749 24.182 23.675 23.225 22.786 22.354 21.939 21.564 21.172 20.807 20.5 20.165 19.767 19.446 19.111 18.744 18.462 18.159 17.839 17.52 17.207 16.993 16.771 16.412 16.158 15.899 15.77 15.463 15.094 14.698 14.486 14.053 13.856 13.633 13.384 12.805 12.479 12.129 11.777 11.41 10.918 10.26 8.562 -6 ,8279 ,KEBNE ,16750145,Thu Dec 2 02:58:37 CET,Thu Dec 2 04:34:29 CET,0.0 1.604 2.324 2.844 3.289 3.66 3.958 4.238 4.755 4.999 5.232 5.43 5.866 6.073 6.439 6.773 7.093 7.243 7.536 7.827 8.261 8.529 8.785 9.155 9.509 9.86 10.194 10.514 10.922 11.307 11.685 12.13 12.544 12.959 13.447 13.984 14.513 15.085 15.677 16.301 16.958 17.707 18.561 19.392 20.345 21.389 22.549 23.772 25.091 26.469 27.669 27.997 27.751 27.321 26.723 26.054 25.468 24.916 24.403 23.861 23.376 22.934 22.513 22.094 21.673 21.286 20.89 20.539 20.232 19.9 19.548 19.253 18.936 18.619 18.377 18.1 17.792 17.46 17.09 16.848 16.616 16.259 16.019 15.757 15.613 15.313 15.009 14.679 14.504 14.112 13.94 13.722 13.502 13.038 12.78 12.488 12.175 11.822 11.363 10.704 8.741 -7 ,2470 ,KEBNE ,16750146,Thu Dec 2 02:58:37 CET,Thu Dec 2 04:34:12 CET,0.0 1.422 2.124 2.638 3.019 3.339 3.642 3.909 4.427 4.685 4.906 5.082 5.511 5.708 6.073 6.407 6.733 6.896 7.202 7.502 7.948 8.237 8.512 8.894 9.247 9.587 9.922 10.252 10.658 11.041 11.417 11.866 12.314 12.752 13.239 13.777 14.274 14.818 15.423 16.053 16.698 17.433 18.285 19.138 20.113 21.161 22.346 23.606 24.98 26.427 27.689 28.15 28.056 27.634 27.114 26.517 25.889 25.32 24.795 24.228 23.739 23.3 22.861 22.451 22.085 21.734 21.338 20.982 20.667 20.327 19.976 19.68 19.365 19.032 18.766 18.497 18.226 17.945 17.649 17.439 17.221 16.892 16.665 16.427 16.302 16.021 15.701 15.364 15.205 14.821 14.653 14.457 14.26 13.808 13.536 13.217 12.86 12.448 11.943 11.282 9.62 -8 ,6343 ,KEBNE ,16750147,Thu Dec 2 02:59:42 CET,Thu Dec 2 04:35:30 CET,0.0 1.585 2.316 2.862 3.244 3.557 3.848 4.112 4.584 4.799 5.017 5.239 5.698 5.905 6.259 6.599 6.92 7.073 7.372 7.666 8.114 8.403 8.663 9.032 9.379 9.717 10.042 10.352 10.775 11.184 11.562 12.013 12.441 12.851 13.339 13.894 14.408 14.965 15.568 16.205 16.868 17.586 18.389 19.202 20.164 21.202 22.355 23.566 24.829 26.145 27.266 27.628 27.482 26.99 26.402 25.847 25.298 24.784 24.303 23.769 23.281 22.798 22.318 21.866 21.429 21.03 20.595 20.186 19.838 19.465 19.055 18.728 18.407 18.068 17.796 17.508 17.22 16.923 16.603 16.371 16.131 15.779 15.534 15.266 15.131 14.846 14.536 14.214 14.046 13.643 13.478 13.274 13.048 12.551 12.262 11.93 11.592 11.239 10.841 10.256 8.4 -9 ,1643 ,KEBNE ,16750148,Thu Dec 2 03:00:45 CET,Thu Dec 2 04:36:33 CET,0.0 1.239 1.856 2.315 2.706 3.039 3.341 3.629 4.161 4.425 4.674 4.878 5.302 5.49 5.836 6.171 6.495 6.65 6.945 7.228 7.66 7.937 8.199 8.572 8.917 9.251 9.584 9.898 10.292 10.669 11.036 11.502 11.96 12.409 12.915 13.442 13.96 14.521 15.103 15.73 16.387 17.111 17.949 18.768 19.705 20.755 21.961 23.207 24.541 26.04 27.316 27.757 27.625 27.15 26.581 26.011 25.428 24.832 24.296 23.736 23.251 22.813 22.379 21.966 21.577 21.214 20.809 20.441 20.126 19.796 19.45 19.161 18.829 18.447 18.155 17.866 17.575 17.289 17.004 16.798 16.582 16.239 15.99 15.736 15.606 15.332 15.039 14.725 14.56 14.172 14.024 13.817 13.603 13.141 12.872 12.568 12.225 11.846 11.393 10.771 9.007 -10 ,1588 ,KEBNE ,16750149,Thu Dec 2 03:00:45 CET,Thu Dec 2 04:36:33 CET,0.0 1.502 2.124 2.61 3.014 3.389 3.738 4.061 4.655 4.927 5.182 5.428 5.877 6.076 6.441 6.778 7.118 7.292 7.612 7.906 8.32 8.583 8.831 9.186 9.542 9.892 10.223 10.532 10.935 11.326 11.709 12.168 12.603 13.025 13.512 14.08 14.674 15.328 16.009 16.704 17.434 18.232 19.108 19.953 20.893 21.961 23.17 24.466 25.848 27.211 28.449 28.917 28.766 28.399 27.871 27.272 26.711 26.143 25.614 25.063 24.559 24.102 23.666 23.238 22.804 22.391 21.956 21.547 21.201 20.871 20.53 20.232 19.92 19.593 19.344 19.083 18.797 18.49 18.175 17.963 17.742 17.404 17.15 16.877 16.744 16.464 16.172 15.87 15.687 15.258 15.032 14.798 14.549 13.969 13.654 13.327 12.955 12.475 11.897 11.17 9.511 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt deleted file mode 100644 index 69452990..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28322 ,KEBNE ,16750150,Thu Dec 2 03:01:52 CET,Thu Dec 2 04:39:03 CET,0.0 1.626 2.297 2.766 3.142 3.48 3.817 4.129 4.662 4.91 5.147 5.369 5.787 5.986 6.372 6.732 7.056 7.219 7.541 7.838 8.26 8.526 8.787 9.152 9.493 9.849 10.208 10.544 10.991 11.434 11.837 12.3 12.734 13.153 13.657 14.236 14.816 15.416 16.012 16.634 17.254 17.963 18.793 19.611 20.573 21.606 22.746 23.974 25.315 26.63 27.633 27.826 27.468 26.904 26.256 25.59 24.933 24.296 23.724 23.12 22.566 22.064 21.575 21.11 20.679 20.282 19.847 19.424 19.068 18.718 18.341 18.006 17.653 17.296 17.001 16.67 16.337 15.983 15.577 15.301 15.012 14.556 14.243 13.927 13.781 13.479 13.159 12.817 12.633 12.215 11.965 11.733 11.5 10.994 10.696 10.353 9.978 9.567 9.062 8.34 6.083 -2 ,6345 ,KEBNE ,16750151,Thu Dec 2 03:00:48 CET,Thu Dec 2 04:38:32 CET,0.0 1.683 2.447 3.037 3.493 3.847 4.174 4.51 5.124 5.406 5.648 5.84 6.262 6.453 6.811 7.155 7.492 7.662 7.989 8.288 8.712 8.996 9.271 9.662 10.036 10.393 10.727 11.052 11.483 11.886 12.279 12.755 13.211 13.661 14.159 14.704 15.242 15.815 16.403 17.079 17.825 18.607 19.448 20.287 21.277 22.295 23.459 24.725 25.991 27.222 28.281 28.553 28.259 27.712 27.042 26.35 25.698 25.063 24.487 23.866 23.319 22.806 22.294 21.809 21.366 20.963 20.54 20.16 19.827 19.464 19.065 18.742 18.397 18.037 17.752 17.442 17.121 16.801 16.472 16.243 15.996 15.599 15.338 15.063 14.913 14.61 14.309 13.982 13.81 13.419 13.205 12.985 12.76 12.233 11.938 11.636 11.307 10.944 10.472 9.75 7.729 -3 ,11532 ,KEBNE ,16750152,Thu Dec 2 03:00:45 CET,Thu Dec 2 04:39:58 CET,0.0 1.728 2.419 2.892 3.297 3.66 3.964 4.248 4.804 5.056 5.282 5.491 5.922 6.134 6.532 6.892 7.224 7.387 7.725 8.069 8.564 8.873 9.157 9.547 9.916 10.272 10.603 10.921 11.338 11.762 12.178 12.665 13.148 13.603 14.103 14.658 15.196 15.801 16.419 17.055 17.723 18.449 19.317 20.166 21.118 22.13 23.197 24.368 25.638 26.902 27.948 28.201 27.888 27.343 26.701 26.034 25.382 24.732 24.165 23.57 23.028 22.526 22.026 21.538 21.073 20.65 20.206 19.799 19.42 19.02 18.612 18.271 17.917 17.548 17.237 16.909 16.593 16.274 15.96 15.734 15.48 15.085 14.824 14.542 14.383 14.05 13.694 13.307 13.099 12.669 12.406 12.14 11.858 11.277 10.945 10.585 10.201 9.725 9.115 8.321 6.535 -4 ,7130 ,KEBNE ,16750153,Thu Dec 2 03:00:48 CET,Thu Dec 2 04:39:16 CET,0.0 1.848 2.588 3.131 3.58 4.012 4.39 4.692 5.208 5.437 5.674 5.908 6.346 6.561 6.955 7.317 7.652 7.811 8.116 8.414 8.854 9.136 9.394 9.764 10.138 10.487 10.828 11.174 11.606 12.001 12.385 12.85 13.295 13.752 14.278 14.83 15.363 15.965 16.598 17.228 17.876 18.618 19.499 20.412 21.424 22.425 23.511 24.669 25.914 27.183 28.28 28.594 28.341 27.827 27.19 26.491 25.838 25.226 24.637 24.022 23.489 22.978 22.448 21.928 21.448 21.032 20.566 20.141 19.792 19.421 19.034 18.719 18.397 18.053 17.77 17.477 17.16 16.794 16.421 16.171 15.909 15.518 15.232 14.925 14.767 14.424 14.039 13.627 13.411 12.973 12.686 12.406 12.114 11.503 11.173 10.805 10.404 9.959 9.42 8.696 7.116 -5 ,22686 ,KEBNE ,16750154,Thu Dec 2 03:00:48 CET,Thu Dec 2 04:39:04 CET,0.0 1.617 2.354 2.863 3.269 3.617 3.935 4.222 4.756 5.004 5.239 5.475 5.901 6.119 6.56 6.964 7.33 7.506 7.836 8.157 8.622 8.897 9.153 9.532 9.902 10.256 10.603 10.925 11.326 11.732 12.126 12.594 13.031 13.45 13.936 14.472 14.986 15.54 16.132 16.774 17.459 18.234 19.17 20.113 21.139 22.166 23.268 24.438 25.681 26.912 27.891 28.074 27.71 27.135 26.477 25.804 25.179 24.558 23.99 23.334 22.724 22.223 21.762 21.302 20.86 20.44 19.998 19.613 19.271 18.904 18.502 18.154 17.784 17.403 17.115 16.815 16.477 16.123 15.779 15.526 15.242 14.773 14.446 14.119 13.952 13.6 13.221 12.814 12.6 12.172 11.918 11.659 11.383 10.812 10.494 10.149 9.764 9.299 8.754 8.008 6.491 -6 ,5064 ,KEBNE ,16750155,Thu Dec 2 03:01:52 CET,Thu Dec 2 04:38:42 CET,0.0 1.51 2.288 2.851 3.257 3.608 3.939 4.24 4.806 5.067 5.303 5.515 5.947 6.153 6.517 6.858 7.196 7.364 7.689 7.992 8.438 8.734 9.013 9.421 9.809 10.166 10.507 10.826 11.226 11.622 12.006 12.469 12.919 13.351 13.84 14.385 14.898 15.436 16.057 16.756 17.488 18.239 19.032 19.849 20.822 21.868 22.979 24.174 25.429 26.691 27.833 28.131 27.876 27.378 26.713 26.012 25.366 24.725 24.126 23.49 22.942 22.449 21.96 21.49 21.019 20.557 20.104 19.713 19.374 19.004 18.594 18.268 17.934 17.568 17.279 16.988 16.694 16.397 16.086 15.862 15.627 15.267 15.008 14.738 14.601 14.314 13.994 13.636 13.451 13.04 12.795 12.548 12.288 11.705 11.374 11.015 10.623 10.159 9.59 8.855 7.455 -7 ,18076 ,KEBNE ,16750156,Thu Dec 2 03:01:53 CET,Thu Dec 2 04:41:48 CET,0.0 1.461 2.145 2.659 3.083 3.477 3.865 4.234 4.917 5.208 5.463 5.72 6.177 6.407 6.84 7.253 7.63 7.802 8.125 8.459 8.955 9.265 9.549 9.942 10.318 10.67 11.015 11.346 11.773 12.176 12.55 13.035 13.495 13.92 14.418 14.969 15.493 16.059 16.657 17.289 17.953 18.686 19.542 20.39 21.344 22.348 23.458 24.661 25.954 27.259 28.317 28.644 28.36 27.77 27.103 26.435 25.768 25.084 24.503 23.944 23.438 22.949 22.47 22.015 21.574 21.158 20.699 20.265 19.895 19.499 19.048 18.677 18.287 17.889 17.602 17.295 16.951 16.583 16.186 15.902 15.627 15.232 14.966 14.689 14.544 14.24 13.907 13.533 13.331 12.916 12.711 12.495 12.265 11.741 11.449 11.145 10.8 10.362 9.792 8.949 6.85 -8 ,11988 ,KEBNE ,16750157,Thu Dec 2 03:01:53 CET,Thu Dec 2 04:39:04 CET,0.0 1.455 2.154 2.684 3.124 3.487 3.829 4.146 4.748 5.047 5.328 5.585 6.017 6.217 6.594 6.962 7.302 7.462 7.787 8.104 8.534 8.809 9.074 9.463 9.862 10.241 10.606 10.948 11.391 11.809 12.185 12.636 13.082 13.544 14.072 14.61 15.098 15.645 16.253 16.904 17.569 18.301 19.174 20.021 20.956 21.986 23.089 24.206 25.41 26.684 27.759 28.005 27.683 27.148 26.536 25.869 25.124 24.424 23.847 23.242 22.718 22.211 21.701 21.198 20.716 20.306 19.88 19.448 19.067 18.686 18.295 17.985 17.672 17.331 17.039 16.727 16.403 16.055 15.67 15.405 15.135 14.689 14.379 14.081 13.937 13.633 13.304 12.956 12.771 12.372 12.202 11.966 11.685 11.101 10.79 10.445 10.055 9.597 9.058 8.35 6.965 -9 ,120 ,KEBNE ,16750158,Thu Dec 2 03:01:52 CET,Thu Dec 2 04:40:34 CET,0.0 1.447 2.111 2.611 3.011 3.351 3.662 3.95 4.492 4.751 4.981 5.189 5.613 5.812 6.203 6.573 6.927 7.095 7.41 7.716 8.177 8.475 8.745 9.115 9.466 9.812 10.14 10.444 10.844 11.254 11.66 12.133 12.562 12.966 13.455 14.009 14.519 15.09 15.699 16.313 16.955 17.682 18.526 19.35 20.324 21.428 22.558 23.699 24.952 26.253 27.386 27.76 27.557 27.004 26.339 25.665 24.998 24.38 23.815 23.195 22.648 22.138 21.638 21.173 20.73 20.286 19.772 19.307 18.916 18.508 18.077 17.714 17.35 16.999 16.741 16.468 16.171 15.851 15.496 15.235 14.976 14.598 14.338 14.04 13.866 13.531 13.211 12.869 12.684 12.27 12.035 11.801 11.556 11.034 10.763 10.482 10.159 9.76 9.253 8.617 6.63 -10 ,14215 ,KEBNE ,16750159,Thu Dec 2 03:01:52 CET,Thu Dec 2 04:39:03 CET,0.0 1.725 2.393 2.918 3.348 3.75 4.101 4.413 5.012 5.283 5.525 5.753 6.183 6.389 6.764 7.115 7.454 7.621 7.939 8.24 8.669 8.936 9.197 9.574 9.93 10.277 10.615 10.942 11.359 11.764 12.181 12.676 13.123 13.57 14.099 14.698 15.27 15.884 16.536 17.183 17.827 18.56 19.426 20.289 21.242 22.251 23.344 24.458 25.663 26.976 28.115 28.333 27.989 27.46 26.828 26.163 25.514 24.876 24.308 23.681 23.128 22.62 22.107 21.638 21.207 20.793 20.33 19.903 19.519 19.111 18.673 18.319 17.955 17.567 17.266 16.94 16.59 16.246 15.909 15.671 15.409 15.012 14.75 14.466 14.307 13.946 13.562 13.154 12.939 12.512 12.262 12.004 11.733 11.146 10.819 10.448 10.032 9.563 9.002 8.293 6.76 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index 9cdf0f17..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8188 ,KEBNE ,16750160,Thu Dec 2 03:01:52 CET,Thu Dec 2 04:38:36 CET,0.0 1.445 2.169 2.747 3.208 3.61 3.977 4.314 4.967 5.276 5.537 5.738 6.195 6.409 6.822 7.214 7.579 7.759 8.119 8.49 9.045 9.394 9.727 10.192 10.634 11.068 11.497 11.907 12.432 12.946 13.462 14.092 14.695 15.299 16.017 16.804 17.572 18.439 19.353 20.322 21.352 22.517 23.904 25.34 27.033 28.951 31.213 33.742 36.709 40.196 44.381 47.676 49.411 50.336 50.803 51.047 51.097 50.991 50.807 50.548 50.273 49.998 49.721 49.416 49.107 48.826 48.506 48.215 47.954 47.666 47.355 47.093 46.815 46.494 46.242 45.985 45.71 45.413 45.086 44.857 44.624 44.232 43.93 43.607 43.441 43.119 42.769 42.368 42.169 41.773 41.524 41.282 41.027 40.43 40.089 39.728 39.307 38.798 38.159 37.261 34.686 -2 ,32272 ,KEBNE ,16750161,Thu Dec 2 03:01:52 CET,Thu Dec 2 04:38:29 CET,0.0 1.39 2.086 2.632 3.087 3.463 3.781 4.07 4.608 4.86 5.1 5.309 5.771 6.001 6.452 6.877 7.288 7.478 7.826 8.187 8.744 9.103 9.457 9.946 10.398 10.836 11.25 11.659 12.198 12.722 13.231 13.853 14.459 15.045 15.743 16.525 17.291 18.144 19.055 20.045 21.104 22.333 23.806 25.253 26.918 28.838 31.127 33.743 36.805 40.412 44.792 48.208 50.036 51.033 51.494 51.643 51.631 51.541 51.424 51.236 51.0 50.765 50.502 50.225 49.946 49.67 49.353 49.054 48.781 48.458 48.098 47.814 47.525 47.209 46.966 46.722 46.462 46.176 45.874 45.655 45.419 45.033 44.761 44.486 44.339 44.007 43.626 43.214 43.002 42.595 42.364 42.122 41.841 41.173 40.812 40.451 40.054 39.597 39.047 38.169 35.123 -3 ,14442 ,KEBNE ,16750162,Thu Dec 2 03:01:52 CET,Thu Dec 2 04:38:19 CET,0.0 1.27 1.787 2.208 2.587 2.939 3.261 3.558 4.116 4.384 4.631 4.841 5.303 5.513 5.922 6.32 6.687 6.863 7.21 7.548 8.023 8.333 8.636 9.069 9.491 9.902 10.299 10.688 11.207 11.715 12.206 12.803 13.391 13.97 14.628 15.355 16.075 16.887 17.787 18.748 19.748 20.914 22.259 23.581 25.126 26.868 28.919 31.222 33.915 37.109 40.899 43.968 45.645 46.596 47.129 47.378 47.417 47.328 47.229 47.098 46.907 46.683 46.438 46.212 45.989 45.745 45.446 45.178 44.968 44.731 44.473 44.254 44.02 43.764 43.546 43.314 43.083 42.834 42.561 42.379 42.168 41.796 41.528 41.253 41.111 40.815 40.519 40.198 40.025 39.639 39.409 39.165 38.905 38.338 38.034 37.722 37.322 36.814 36.191 35.307 32.944 -4 ,19462 ,KEBNE ,16750163,Thu Dec 2 03:02:55 CET,Thu Dec 2 04:40:57 CET,0.0 1.415 2.081 2.607 3.056 3.429 3.758 4.05 4.586 4.842 5.074 5.27 5.726 5.926 6.312 6.688 7.059 7.246 7.603 7.945 8.437 8.749 9.061 9.517 9.957 10.375 10.777 11.191 11.746 12.273 12.782 13.4 14.003 14.588 15.265 16.031 16.769 17.606 18.531 19.528 20.59 21.788 23.194 24.63 26.351 28.298 30.546 33.083 36.108 39.648 43.807 46.938 48.359 49.07 49.426 49.511 49.405 49.17 48.909 48.579 48.267 48.044 47.833 47.612 47.409 47.204 46.935 46.658 46.417 46.173 45.91 45.668 45.411 45.152 44.947 44.724 44.49 44.253 43.99 43.802 43.605 43.281 43.044 42.772 42.628 42.349 42.045 41.701 41.528 41.156 40.975 40.764 40.532 40.015 39.72 39.378 38.961 38.468 37.889 37.132 34.727 -5 ,9299 ,KEBNE ,16750164,Thu Dec 2 03:02:55 CET,Thu Dec 2 04:41:02 CET,0.0 1.12 1.673 2.111 2.507 2.879 3.218 3.536 4.094 4.337 4.582 4.8 5.267 5.508 5.989 6.445 6.861 7.066 7.473 7.862 8.433 8.79 9.123 9.602 10.061 10.496 10.917 11.325 11.854 12.384 12.912 13.541 14.143 14.727 15.418 16.187 16.928 17.766 18.684 19.668 20.714 21.903 23.316 24.747 26.481 28.451 30.71 33.297 36.365 39.949 44.068 47.329 49.079 50.015 50.512 50.728 50.758 50.695 50.592 50.418 50.185 49.938 49.659 49.381 49.096 48.797 48.48 48.179 47.887 47.562 47.239 46.959 46.637 46.269 45.967 45.66 45.364 45.07 44.735 44.482 44.22 43.799 43.484 43.138 42.964 42.628 42.271 41.884 41.676 41.265 41.046 40.819 40.567 40.001 39.679 39.322 38.893 38.356 37.701 36.827 34.844 -6 ,14830 ,KEBNE ,16750165,Thu Dec 2 03:02:55 CET,Thu Dec 2 04:41:06 CET,0.0 1.13 1.689 2.163 2.584 2.935 3.257 3.583 4.194 4.474 4.746 5.0 5.47 5.679 6.062 6.435 6.792 6.961 7.302 7.638 8.133 8.461 8.765 9.202 9.645 10.068 10.478 10.877 11.387 11.894 12.401 13.008 13.582 14.152 14.835 15.601 16.331 17.13 18.003 18.973 20.0 21.126 22.414 23.722 25.271 27.011 28.997 31.248 33.965 37.254 41.101 44.079 45.755 46.69 47.137 47.303 47.347 47.334 47.252 47.107 46.954 46.775 46.559 46.345 46.119 45.895 45.618 45.346 45.109 44.846 44.58 44.362 44.118 43.85 43.644 43.425 43.194 42.943 42.66 42.462 42.269 41.919 41.635 41.341 41.187 40.856 40.503 40.115 39.907 39.487 39.208 38.943 38.665 38.049 37.725 37.392 36.987 36.48 35.877 35.09 33.085 -7 ,9872 ,KEBNE ,16750166,Thu Dec 2 03:02:55 CET,Thu Dec 2 04:40:41 CET,0.0 1.355 2.061 2.541 2.911 3.237 3.578 3.932 4.566 4.855 5.141 5.415 5.876 6.103 6.565 6.975 7.338 7.513 7.865 8.202 8.679 8.986 9.291 9.731 10.162 10.596 11.014 11.417 11.945 12.461 12.968 13.568 14.152 14.725 15.386 16.131 16.853 17.656 18.523 19.459 20.455 21.599 22.97 24.339 25.935 27.768 29.961 32.532 35.409 38.556 42.377 45.474 47.065 47.887 48.348 48.597 48.684 48.659 48.556 48.411 48.247 48.069 47.861 47.632 47.39 47.149 46.892 46.663 46.451 46.218 45.965 45.739 45.484 45.222 45.024 44.81 44.577 44.327 44.06 43.872 43.676 43.351 43.097 42.807 42.653 42.326 41.967 41.584 41.38 40.973 40.723 40.456 40.17 39.555 39.229 38.875 38.455 37.947 37.313 36.469 34.51 -8 ,30079 ,KEBNE ,16750167,Thu Dec 2 03:02:55 CET,Thu Dec 2 04:41:07 CET,0.0 1.276 1.85 2.287 2.682 3.039 3.336 3.615 4.165 4.424 4.665 4.897 5.361 5.566 5.964 6.349 6.719 6.895 7.246 7.59 8.08 8.409 8.725 9.172 9.611 10.041 10.476 10.89 11.413 11.931 12.426 13.04 13.651 14.256 14.957 15.737 16.493 17.319 18.219 19.196 20.208 21.361 22.757 24.189 25.897 27.86 30.172 32.764 35.74 39.194 43.297 46.402 47.956 48.685 48.926 48.936 48.772 48.525 48.299 48.054 47.771 47.461 47.139 46.786 46.405 46.071 45.723 45.382 45.083 44.758 44.388 44.083 43.789 43.464 43.197 42.912 42.607 42.275 41.929 41.691 41.429 40.97 40.645 40.328 40.164 39.826 39.465 39.076 38.873 38.46 38.192 37.927 37.645 37.042 36.688 36.316 35.931 35.422 34.757 33.908 30.857 -9 ,2391 ,KEBNE ,16750168,Thu Dec 2 03:04:00 CET,Thu Dec 2 04:42:12 CET,0.0 1.234 1.839 2.306 2.689 3.069 3.446 3.791 4.428 4.697 4.939 5.161 5.622 5.843 6.255 6.634 7.018 7.202 7.557 7.907 8.417 8.758 9.096 9.577 10.028 10.45 10.861 11.274 11.814 12.335 12.839 13.459 14.058 14.635 15.321 16.102 16.861 17.703 18.606 19.579 20.617 21.812 23.23 24.676 26.41 28.362 30.635 33.23 36.272 39.914 44.287 47.759 49.626 50.645 51.185 51.43 51.494 51.404 51.241 51.016 50.778 50.531 50.28 50.055 49.8 49.519 49.199 48.903 48.618 48.302 47.999 47.736 47.442 47.128 46.863 46.579 46.296 46.008 45.706 45.49 45.24 44.796 44.479 44.145 43.967 43.589 43.18 42.741 42.511 42.069 41.753 41.473 41.172 40.503 40.119 39.7 39.219 38.636 37.924 37.048 34.863 -10 ,2385 ,KEBNE ,16750169,Thu Dec 2 03:04:00 CET,Thu Dec 2 04:42:24 CET,0.0 1.139 1.762 2.214 2.602 2.958 3.277 3.572 4.115 4.371 4.615 4.829 5.287 5.498 5.883 6.285 6.699 6.893 7.259 7.599 8.111 8.453 8.775 9.225 9.659 10.082 10.487 10.885 11.407 11.922 12.416 12.995 13.57 14.132 14.799 15.578 16.323 17.136 18.006 18.955 19.953 21.044 22.326 23.658 25.213 26.932 28.935 31.159 33.81 37.029 40.822 43.776 45.36 46.286 46.81 47.089 47.187 47.151 47.053 46.891 46.7 46.522 46.339 46.138 45.922 45.699 45.459 45.228 45.004 44.763 44.519 44.3 44.066 43.817 43.596 43.355 43.112 42.859 42.584 42.395 42.198 41.874 41.657 41.437 41.313 41.04 40.729 40.392 40.211 39.811 39.598 39.361 39.088 38.483 38.134 37.761 37.359 36.892 36.292 35.461 33.391 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 1e35291c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,770 ,KEBNE ,16750170,Thu Dec 2 03:04:00 CET,Thu Dec 2 04:42:30 CET,0.0 1.517 2.194 2.7 3.156 3.575 3.918 4.195 4.712 4.944 5.147 5.293 5.72 5.897 6.236 6.562 6.88 7.036 7.347 7.645 8.092 8.382 8.648 9.027 9.391 9.759 10.121 10.454 10.871 11.288 11.68 12.14 12.603 13.049 13.576 14.178 14.733 15.34 16.012 16.733 17.482 18.356 19.383 20.399 21.62 22.981 24.548 26.369 28.509 30.954 33.89 36.246 37.458 38.092 38.412 38.569 38.594 38.527 38.412 38.234 38.024 37.803 37.562 37.296 37.026 36.777 36.51 36.257 36.035 35.795 35.529 35.306 35.057 34.782 34.559 34.333 34.093 33.822 33.523 33.313 33.098 32.728 32.453 32.166 32.01 31.672 31.304 30.941 30.759 30.365 30.186 29.942 29.666 29.057 28.702 28.327 27.913 27.475 26.949 26.201 24.097 -2 ,31850 ,KEBNE ,16750171,Thu Dec 2 03:04:00 CET,Thu Dec 2 04:42:21 CET,0.0 1.285 1.98 2.466 2.902 3.295 3.647 3.97 4.545 4.803 5.054 5.279 5.736 5.934 6.279 6.614 6.943 7.099 7.403 7.697 8.111 8.367 8.617 8.995 9.386 9.764 10.108 10.432 10.842 11.234 11.623 12.094 12.551 13.003 13.531 14.13 14.7 15.321 15.999 16.722 17.507 18.399 19.425 20.467 21.673 23.05 24.657 26.455 28.584 31.078 34.022 36.351 37.578 38.242 38.558 38.661 38.633 38.491 38.316 38.126 37.935 37.728 37.495 37.246 37.013 36.794 36.536 36.295 36.08 35.834 35.557 35.307 35.037 34.738 34.483 34.232 33.982 33.71 33.433 33.236 33.023 32.704 32.474 32.217 32.079 31.784 31.465 31.122 30.948 30.564 30.387 30.165 29.931 29.41 29.105 28.748 28.335 27.858 27.227 26.308 24.07 -3 ,31899 ,KEBNE ,16750172,Thu Dec 2 03:05:03 CET,Thu Dec 2 04:44:17 CET,0.0 1.357 2.025 2.524 2.935 3.304 3.64 3.928 4.402 4.633 4.871 5.054 5.487 5.67 6.015 6.35 6.675 6.832 7.14 7.452 7.908 8.198 8.473 8.855 9.21 9.552 9.887 10.211 10.63 11.032 11.423 11.896 12.345 12.774 13.279 13.89 14.486 15.118 15.819 16.571 17.341 18.215 19.242 20.267 21.483 22.856 24.438 26.216 28.309 30.818 33.827 36.156 37.346 37.977 38.327 38.478 38.459 38.343 38.191 38.003 37.789 37.571 37.344 37.092 36.818 36.559 36.291 36.036 35.814 35.575 35.3 35.048 34.778 34.502 34.267 34.018 33.767 33.501 33.181 32.946 32.718 32.366 32.126 31.865 31.72 31.411 31.056 30.643 30.428 30.009 29.785 29.555 29.315 28.785 28.474 28.116 27.738 27.299 26.761 26.02 23.534 -4 ,32293 ,KEBNE ,16750173,Thu Dec 2 03:10:21 CET,Thu Dec 2 04:44:25 CET,0.0 1.267 1.916 2.449 2.913 3.314 3.665 3.976 4.567 4.838 5.098 5.346 5.803 6.006 6.408 6.793 7.164 7.347 7.69 7.979 8.397 8.695 8.996 9.415 9.78 10.119 10.447 10.764 11.186 11.607 12.017 12.504 12.972 13.434 13.97 14.557 15.112 15.731 16.409 17.133 17.882 18.729 19.732 20.778 22.018 23.379 24.945 26.75 28.851 31.27 34.208 36.531 37.766 38.425 38.763 38.881 38.846 38.753 38.621 38.439 38.234 38.032 37.825 37.58 37.332 37.092 36.821 36.572 36.352 36.111 35.835 35.592 35.309 35.019 34.799 34.526 34.223 33.911 33.574 33.33 33.079 32.685 32.394 32.083 31.919 31.58 31.231 30.879 30.694 30.27 30.007 29.745 29.466 28.903 28.603 28.265 27.88 27.403 26.802 26.068 23.674 -5 ,13178 ,KEBNE ,16750174,Thu Dec 2 03:10:23 CET,Thu Dec 2 04:44:04 CET,0.0 1.358 1.925 2.365 2.775 3.137 3.47 3.783 4.307 4.539 4.765 4.937 5.365 5.548 5.899 6.225 6.53 6.673 6.963 7.254 7.66 7.914 8.16 8.527 8.889 9.234 9.567 9.899 10.325 10.735 11.132 11.603 12.051 12.488 13.005 13.592 14.17 14.813 15.506 16.244 17.01 17.873 18.887 19.937 21.172 22.531 24.095 25.881 27.969 30.468 33.496 35.827 37.04 37.687 38.002 38.132 38.141 38.043 37.896 37.71 37.517 37.305 37.072 36.841 36.615 36.39 36.123 35.851 35.607 35.36 35.095 34.856 34.595 34.326 34.11 33.887 33.647 33.366 33.067 32.869 32.673 32.355 32.13 31.895 31.764 31.498 31.219 30.894 30.713 30.296 30.015 29.746 29.473 28.849 28.504 28.117 27.647 27.124 26.535 25.71 23.645 -6 ,19456 ,KEBNE ,16750175,Thu Dec 2 03:10:25 CET,Thu Dec 2 04:43:31 CET,0.0 1.463 2.117 2.67 3.125 3.499 3.853 4.181 4.768 5.044 5.308 5.552 6.019 6.234 6.637 6.993 7.309 7.467 7.783 8.076 8.515 8.819 9.102 9.472 9.83 10.173 10.5 10.833 11.291 11.753 12.182 12.659 13.123 13.576 14.085 14.666 15.235 15.855 16.532 17.244 17.983 18.835 19.855 20.888 22.119 23.493 25.044 26.801 28.895 31.383 34.299 36.619 37.866 38.516 38.841 38.984 38.973 38.858 38.719 38.504 38.276 38.05 37.799 37.533 37.278 37.041 36.777 36.53 36.301 36.062 35.801 35.552 35.281 35.016 34.785 34.535 34.301 34.026 33.722 33.524 33.303 32.953 32.719 32.466 32.313 31.961 31.584 31.178 30.965 30.53 30.261 29.994 29.711 29.099 28.79 28.469 28.084 27.606 27.034 26.28 23.822 -7 ,19592 ,KEBNE ,16750176,Thu Dec 2 03:11:28 CET,Thu Dec 2 04:48:46 CET,0.0 1.394 2.132 2.651 3.065 3.427 3.782 4.129 4.736 5.01 5.273 5.509 5.985 6.223 6.682 7.109 7.522 7.719 8.09 8.432 8.9 9.204 9.499 9.942 10.377 10.786 11.173 11.547 12.037 12.509 12.978 13.537 14.065 14.588 15.196 15.905 16.599 17.333 18.059 18.777 19.549 20.429 21.468 22.491 23.674 25.052 26.662 28.451 30.5 32.888 35.733 37.872 38.888 39.385 39.591 39.608 39.5 39.337 39.153 38.915 38.676 38.459 38.226 37.954 37.677 37.408 37.114 36.846 36.616 36.355 36.053 35.808 35.557 35.289 35.071 34.844 34.593 34.309 33.991 33.76 33.535 33.196 32.967 32.719 32.584 32.306 32.001 31.633 31.426 31.002 30.747 30.491 30.216 29.585 29.23 28.851 28.405 27.895 27.293 26.415 24.475 -8 ,16163 ,KEBNE ,16750177,Thu Dec 2 03:12:30 CET,Thu Dec 2 04:48:53 CET,0.0 1.328 1.952 2.435 2.835 3.194 3.488 3.748 4.259 4.493 4.721 4.932 5.393 5.606 6.022 6.401 6.761 6.947 7.301 7.622 8.059 8.319 8.566 8.929 9.284 9.644 10.011 10.39 10.891 11.35 11.786 12.295 12.759 13.211 13.741 14.326 14.882 15.491 16.166 16.903 17.691 18.617 19.68 20.718 21.942 23.288 24.863 26.683 28.827 31.334 34.26 36.543 37.737 38.359 38.693 38.857 38.86 38.765 38.638 38.465 38.287 38.081 37.855 37.642 37.412 37.174 36.91 36.629 36.374 36.114 35.824 35.578 35.322 35.042 34.82 34.581 34.324 34.054 33.771 33.573 33.36 33.027 32.785 32.516 32.361 32.015 31.649 31.245 31.031 30.599 30.319 30.045 29.756 29.171 28.872 28.562 28.206 27.759 27.206 26.461 24.077 -9 ,650 ,KEBNE ,16750178,Thu Dec 2 03:12:30 CET,Thu Dec 2 04:49:01 CET,0.0 1.569 2.075 2.525 2.92 3.256 3.56 3.824 4.286 4.5 4.706 4.877 5.314 5.518 5.92 6.268 6.594 6.749 7.062 7.389 7.828 8.085 8.342 8.725 9.096 9.446 9.783 10.11 10.523 10.913 11.295 11.771 12.22 12.657 13.159 13.721 14.289 14.928 15.617 16.343 17.112 17.984 19.003 20.043 21.243 22.583 24.137 25.899 28.005 30.512 33.422 35.678 36.906 37.6 37.967 38.1 38.08 38.0 37.882 37.687 37.465 37.236 36.99 36.737 36.473 36.226 35.969 35.693 35.415 35.114 34.821 34.583 34.321 34.044 33.822 33.581 33.325 33.07 32.794 32.595 32.389 32.053 31.817 31.532 31.373 31.037 30.664 30.274 30.078 29.669 29.464 29.239 29.001 28.489 28.199 27.833 27.402 26.909 26.291 25.464 23.018 -10 ,300 ,KEBNE ,16750179,Thu Dec 2 03:12:31 CET,Thu Dec 2 04:49:51 CET,0.0 1.436 2.007 2.457 2.813 3.124 3.417 3.688 4.186 4.425 4.638 4.785 5.214 5.405 5.786 6.136 6.466 6.623 6.923 7.21 7.628 7.901 8.159 8.519 8.883 9.243 9.602 9.942 10.343 10.735 11.132 11.615 12.081 12.535 13.061 13.649 14.201 14.823 15.496 16.222 17.02 17.887 18.883 19.893 21.086 22.422 23.977 25.784 27.906 30.421 33.435 35.783 37.042 37.734 38.079 38.212 38.217 38.147 38.006 37.788 37.556 37.345 37.122 36.89 36.666 36.418 36.136 35.884 35.651 35.407 35.137 34.898 34.643 34.359 34.139 33.919 33.672 33.412 33.141 32.951 32.744 32.388 32.136 31.875 31.734 31.445 31.151 30.826 30.645 30.24 30.041 29.824 29.59 29.061 28.771 28.436 28.052 27.532 26.869 26.069 23.933 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt deleted file mode 100644 index e7eaaf32..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13830 ,KEBNE ,16750180,Thu Dec 2 03:12:30 CET,Thu Dec 2 04:48:57 CET,0.0 1.509 2.086 2.536 2.951 3.34 3.66 3.936 4.44 4.673 4.895 5.074 5.519 5.719 6.1 6.438 6.759 6.918 7.231 7.52 7.94 8.218 8.501 8.933 9.33 9.7 10.057 10.404 10.842 11.235 11.588 11.986 12.367 12.75 13.179 13.637 14.076 14.573 15.128 15.71 16.307 16.976 17.745 18.508 19.344 20.234 21.231 22.292 23.473 24.7 25.817 26.231 26.054 25.604 25.041 24.415 23.823 23.258 22.739 22.207 21.737 21.285 20.824 20.395 19.977 19.577 19.147 18.751 18.411 18.058 17.686 17.325 16.903 16.468 16.116 15.731 15.322 14.9 14.467 14.162 13.845 13.366 13.046 12.715 12.535 12.146 11.756 11.354 11.135 10.664 10.332 10.04 9.73 9.008 8.612 8.194 7.746 7.249 6.633 5.793 4.217 -2 ,2161 ,KEBNE ,16750181,Thu Dec 2 03:12:36 CET,Thu Dec 2 04:49:12 CET,0.0 1.693 2.306 2.777 3.151 3.504 3.854 4.186 4.805 5.091 5.355 5.602 6.07 6.289 6.695 7.069 7.429 7.607 7.965 8.308 8.779 9.072 9.346 9.727 10.098 10.438 10.74 11.027 11.396 11.74 12.081 12.489 12.871 13.248 13.666 14.127 14.582 15.086 15.638 16.206 16.809 17.469 18.212 18.93 19.728 20.612 21.595 22.665 23.803 24.953 26.031 26.402 26.222 25.817 25.308 24.735 24.184 23.658 23.117 22.533 22.05 21.57 21.093 20.648 20.196 19.764 19.292 18.885 18.556 18.216 17.837 17.455 17.043 16.656 16.359 16.034 15.712 15.402 15.055 14.803 14.556 14.163 13.862 13.526 13.35 12.986 12.592 12.153 11.913 11.442 11.211 10.977 10.71 10.086 9.738 9.354 8.925 8.446 7.866 7.015 5.159 -3 ,31067 ,KEBNE ,16750182,Thu Dec 2 03:12:30 CET,Thu Dec 2 04:49:20 CET,0.0 1.56 2.196 2.679 3.091 3.456 3.784 4.069 4.575 4.812 5.044 5.223 5.662 5.85 6.217 6.606 6.976 7.146 7.464 7.77 8.211 8.488 8.757 9.151 9.538 9.908 10.265 10.613 11.08 11.541 11.985 12.545 13.083 13.588 14.179 14.797 15.315 15.826 16.366 16.958 17.595 18.27 19.008 19.747 20.583 21.481 22.474 23.54 24.684 25.819 26.848 27.229 27.032 26.621 26.142 25.601 25.062 24.518 24.006 23.47 22.986 22.54 22.093 21.648 21.229 20.793 20.328 19.922 19.548 19.159 18.75 18.419 18.085 17.739 17.464 17.175 16.881 16.554 16.14 15.835 15.547 15.086 14.764 14.434 14.257 13.879 13.486 13.07 12.853 12.393 12.085 11.798 11.486 10.767 10.384 9.987 9.547 9.039 8.393 7.566 5.984 -4 ,23293 ,KEBNE ,16750183,Thu Dec 2 03:12:30 CET,Thu Dec 2 04:49:38 CET,0.0 1.597 2.265 2.773 3.177 3.502 3.787 4.058 4.589 4.854 5.116 5.377 5.849 6.051 6.404 6.742 7.083 7.246 7.549 7.839 8.27 8.544 8.805 9.185 9.563 9.938 10.302 10.666 11.144 11.621 12.089 12.629 13.12 13.591 14.139 14.743 15.286 15.813 16.333 16.874 17.46 18.119 18.865 19.594 20.431 21.361 22.384 23.422 24.565 25.803 26.912 27.274 27.125 26.748 26.253 25.722 25.167 24.584 24.035 23.449 22.925 22.458 22.001 21.524 21.068 20.676 20.249 19.825 19.444 19.066 18.678 18.351 17.999 17.614 17.325 17.022 16.701 16.376 16.036 15.792 15.543 15.154 14.88 14.583 14.43 14.117 13.753 13.332 13.103 12.636 12.37 12.103 11.813 11.191 10.842 10.453 10.031 9.546 8.933 8.106 6.27 -5 ,22778 ,KEBNE ,16750184,Thu Dec 2 03:12:31 CET,Thu Dec 2 04:49:05 CET,0.0 1.3 1.916 2.385 2.758 3.085 3.374 3.637 4.115 4.34 4.58 4.805 5.248 5.434 5.791 6.137 6.462 6.606 6.873 7.152 7.598 7.883 8.158 8.568 8.952 9.318 9.685 10.064 10.555 10.999 11.421 11.939 12.423 12.874 13.436 14.105 14.744 15.418 16.069 16.689 17.305 17.952 18.683 19.426 20.253 21.144 22.143 23.202 24.365 25.542 26.595 26.954 26.719 26.286 25.815 25.287 24.699 24.097 23.569 23.04 22.575 22.108 21.624 21.167 20.729 20.339 19.933 19.55 19.205 18.847 18.479 18.175 17.861 17.496 17.166 16.802 16.419 16.022 15.615 15.333 15.014 14.471 14.118 13.765 13.581 13.204 12.823 12.426 12.206 11.745 11.456 11.17 10.869 10.218 9.868 9.491 9.065 8.621 8.098 7.389 5.168 -6 ,19629 ,KEBNE ,16750185,Thu Dec 2 03:12:33 CET,Thu Dec 2 04:49:35 CET,0.0 1.433 2.139 2.655 3.104 3.513 3.861 4.17 4.737 5.006 5.258 5.474 5.919 6.113 6.474 6.823 7.157 7.306 7.598 7.888 8.313 8.594 8.859 9.244 9.627 10.022 10.408 10.754 11.195 11.63 12.057 12.552 12.973 13.351 13.786 14.249 14.686 15.185 15.706 16.24 16.813 17.468 18.232 18.958 19.736 20.612 21.603 22.629 23.733 24.904 25.996 26.339 26.158 25.767 25.251 24.679 24.149 23.613 23.097 22.562 22.058 21.596 21.143 20.716 20.31 19.906 19.462 19.04 18.665 18.274 17.87 17.536 17.193 16.848 16.574 16.272 15.945 15.614 15.278 15.041 14.769 14.301 13.965 13.61 13.43 13.087 12.705 12.267 12.052 11.605 11.364 11.11 10.831 10.215 9.847 9.418 8.936 8.379 7.713 6.847 4.946 -7 ,26572 ,KEBNE ,16750186,Thu Dec 2 03:12:32 CET,Thu Dec 2 04:48:53 CET,0.0 1.753 2.473 3.01 3.429 3.794 4.146 4.486 5.076 5.342 5.604 5.81 6.238 6.429 6.781 7.09 7.394 7.55 7.867 8.168 8.6 8.873 9.138 9.526 9.896 10.253 10.59 10.908 11.318 11.692 12.027 12.43 12.825 13.197 13.614 14.105 14.581 15.089 15.66 16.254 16.858 17.53 18.305 19.056 19.893 20.829 21.865 22.944 24.128 25.38 26.45 26.77 26.6 26.202 25.694 25.146 24.627 24.093 23.574 23.024 22.526 22.039 21.552 21.101 20.679 20.284 19.865 19.49 19.138 18.767 18.394 18.08 17.727 17.316 16.988 16.663 16.326 15.979 15.63 15.374 15.109 14.695 14.374 14.002 13.797 13.374 12.946 12.524 12.317 11.874 11.584 11.304 11.027 10.401 10.047 9.665 9.265 8.825 8.29 7.521 5.442 -8 ,13465 ,KEBNE ,16750187,Thu Dec 2 03:12:33 CET,Thu Dec 2 04:49:08 CET,0.0 1.735 2.413 2.904 3.324 3.689 3.997 4.281 4.756 4.959 5.154 5.279 5.699 5.871 6.205 6.52 6.806 6.947 7.219 7.493 7.906 8.173 8.446 8.825 9.158 9.467 9.764 10.045 10.446 10.884 11.303 11.794 12.262 12.721 13.261 13.861 14.428 15.061 15.739 16.457 17.224 18.084 19.065 19.959 20.854 21.771 22.744 23.762 24.882 26.018 27.123 27.551 27.37 26.96 26.447 25.925 25.411 24.874 24.335 23.741 23.201 22.668 22.155 21.714 21.308 20.912 20.466 20.04 19.67 19.311 18.938 18.6 18.226 17.834 17.525 17.175 16.797 16.417 16.022 15.744 15.442 14.96 14.636 14.299 14.118 13.731 13.329 12.873 12.627 12.153 11.856 11.571 11.26 10.599 10.231 9.797 9.328 8.844 8.295 7.487 5.609 -9 ,23296 ,KEBNE ,16750188,Thu Dec 2 03:12:32 CET,Thu Dec 2 04:48:37 CET,0.0 1.546 2.309 2.87 3.309 3.708 4.072 4.409 5.027 5.308 5.564 5.804 6.261 6.46 6.836 7.194 7.532 7.699 8.02 8.312 8.732 9.002 9.264 9.628 9.96 10.269 10.566 10.856 11.219 11.563 11.901 12.306 12.691 13.058 13.479 13.951 14.38 14.87 15.412 15.981 16.589 17.262 18.007 18.711 19.534 20.45 21.428 22.472 23.654 24.859 25.964 26.451 26.318 25.914 25.417 24.859 24.315 23.773 23.229 22.638 22.13 21.68 21.232 20.787 20.348 19.938 19.5 19.102 18.771 18.405 18.005 17.692 17.375 17.022 16.737 16.445 16.141 15.819 15.474 15.23 14.974 14.564 14.273 13.973 13.817 13.498 13.137 12.729 12.503 12.019 11.728 11.458 11.161 10.481 10.109 9.689 9.241 8.782 8.161 7.309 4.871 -10 ,23882 ,KEBNE ,16750189,Thu Dec 2 03:14:38 CET,Thu Dec 2 04:52:22 CET,0.0 1.876 2.488 2.946 3.337 3.68 3.977 4.252 4.756 4.99 5.216 5.393 5.839 6.039 6.412 6.771 7.111 7.275 7.588 7.88 8.291 8.563 8.836 9.233 9.618 10.005 10.381 10.709 11.13 11.569 11.997 12.513 13.008 13.468 14.003 14.611 15.203 15.876 16.582 17.313 18.105 18.936 19.77 20.533 21.379 22.302 23.296 24.322 25.458 26.68 27.746 28.103 27.924 27.536 27.066 26.518 25.964 25.401 24.854 24.297 23.807 23.356 22.894 22.448 22.038 21.657 21.238 20.829 20.481 20.138 19.765 19.427 19.068 18.691 18.386 18.055 17.694 17.326 16.975 16.734 16.479 16.044 15.697 15.319 15.123 14.728 14.332 13.924 13.707 13.25 13.003 12.764 12.501 11.91 11.595 11.252 10.856 10.388 9.763 8.81 6.133 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt deleted file mode 100644 index c9bca0a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19580 ,KEBNE ,16750190,Thu Dec 2 03:13:36 CET,Thu Dec 2 04:51:58 CET,0.0 1.912 2.609 3.13 3.563 3.935 4.259 4.584 5.23 5.54 5.827 6.074 6.541 6.762 7.192 7.61 8.011 8.199 8.561 8.914 9.405 9.72 10.039 10.513 10.968 11.4 11.814 12.219 12.764 13.279 13.752 14.333 14.903 15.451 16.09 16.784 17.446 18.193 19.02 19.9 20.8 21.727 22.732 23.753 24.929 26.202 27.683 29.377 31.335 33.55 35.981 37.693 38.446 38.727 38.788 38.68 38.456 38.172 37.855 37.481 37.126 36.781 36.446 36.121 35.808 35.5 35.154 34.818 34.496 34.174 33.841 33.563 33.276 32.958 32.692 32.415 32.128 31.837 31.54 31.34 31.132 30.754 30.449 30.11 29.933 29.597 29.288 28.944 28.74 28.31 28.051 27.783 27.53 26.979 26.641 26.243 25.795 25.295 24.711 23.937 22.008 -2 ,22665 ,KEBNE ,16750191,Thu Dec 2 03:13:36 CET,Thu Dec 2 04:52:39 CET,0.0 2.013 2.766 3.354 3.863 4.285 4.66 5.031 5.716 6.012 6.297 6.605 7.099 7.336 7.791 8.219 8.617 8.816 9.193 9.536 10.048 10.378 10.7 11.203 11.692 12.128 12.535 12.944 13.478 13.984 14.47 15.067 15.642 16.208 16.858 17.584 18.277 19.014 19.815 20.674 21.573 22.588 23.787 24.979 26.244 27.564 29.06 30.684 32.592 34.773 37.162 38.816 39.518 39.824 39.864 39.756 39.564 39.292 38.999 38.656 38.312 37.975 37.633 37.297 36.983 36.686 36.381 36.101 35.82 35.489 35.117 34.817 34.51 34.181 33.939 33.698 33.442 33.16 32.852 32.643 32.425 32.088 31.845 31.582 31.445 31.149 30.838 30.495 30.31 29.889 29.623 29.361 29.083 28.478 28.128 27.729 27.324 26.892 26.335 25.594 23.903 -3 ,18801 ,KEBNE ,16750192,Thu Dec 2 03:13:36 CET,Thu Dec 2 04:50:53 CET,0.0 2.46 3.234 3.818 4.329 4.763 5.155 5.52 6.167 6.479 6.78 7.081 7.578 7.838 8.334 8.78 9.191 9.38 9.735 10.077 10.574 10.892 11.204 11.663 12.102 12.541 12.982 13.417 13.986 14.496 14.963 15.549 16.113 16.634 17.247 17.944 18.613 19.372 20.219 21.135 22.034 22.95 23.99 25.01 26.194 27.515 29.009 30.663 32.568 34.743 37.145 38.807 39.521 39.787 39.828 39.708 39.496 39.212 38.894 38.526 38.154 37.819 37.522 37.207 36.875 36.568 36.238 35.933 35.666 35.354 34.998 34.687 34.339 33.979 33.714 33.442 33.173 32.898 32.61 32.401 32.178 31.841 31.571 31.268 31.122 30.823 30.52 30.2 30.031 29.626 29.406 29.163 28.904 28.345 28.042 27.711 27.339 26.904 26.373 25.614 23.26 -4 ,6674 ,KEBNE ,16750193,Thu Dec 2 03:14:41 CET,Thu Dec 2 04:53:33 CET,0.0 1.684 2.439 3.03 3.539 3.996 4.421 4.779 5.355 5.623 5.902 6.192 6.686 6.923 7.338 7.737 8.122 8.304 8.657 9.007 9.516 9.831 10.142 10.598 11.029 11.421 11.791 12.172 12.644 13.08 13.515 14.034 14.523 15.04 15.651 16.274 16.854 17.504 18.203 18.928 19.708 20.599 21.607 22.625 23.82 25.145 26.634 28.277 30.117 32.208 34.594 36.219 36.928 37.214 37.228 37.064 36.814 36.534 36.235 35.878 35.527 35.195 34.875 34.546 34.205 33.893 33.569 33.267 32.989 32.665 32.321 32.047 31.765 31.459 31.216 30.951 30.664 30.351 29.986 29.744 29.523 29.183 28.924 28.62 28.461 28.132 27.776 27.408 27.221 26.813 26.643 26.433 26.21 25.722 25.457 25.158 24.799 24.405 23.931 23.311 21.472 -5 ,19755 ,KEBNE ,16750194,Thu Dec 2 03:13:36 CET,Thu Dec 2 04:52:19 CET,0.0 2.176 2.871 3.389 3.861 4.294 4.704 5.072 5.733 6.042 6.336 6.656 7.159 7.404 7.89 8.356 8.783 8.983 9.362 9.74 10.309 10.646 10.958 11.419 11.865 12.287 12.685 13.078 13.6 14.114 14.606 15.184 15.748 16.301 16.933 17.631 18.27 18.934 19.658 20.432 21.215 22.104 23.138 24.151 25.335 26.619 28.093 29.729 31.583 33.729 36.109 37.792 38.542 38.812 38.805 38.668 38.464 38.168 37.86 37.511 37.188 36.882 36.573 36.266 35.946 35.632 35.279 34.941 34.6 34.211 33.824 33.498 33.16 32.849 32.622 32.381 32.126 31.828 31.463 31.212 30.985 30.641 30.395 30.125 29.98 29.659 29.304 28.923 28.713 28.268 28.073 27.865 27.63 27.084 26.776 26.457 26.109 25.69 25.189 24.554 22.803 -6 ,8575 ,KEBNE ,16750195,Thu Dec 2 03:13:36 CET,Thu Dec 2 04:50:43 CET,0.0 1.557 2.232 2.757 3.21 3.612 3.987 4.353 4.998 5.287 5.585 5.902 6.406 6.658 7.113 7.515 7.896 8.081 8.436 8.787 9.289 9.603 9.91 10.368 10.802 11.215 11.596 11.946 12.398 12.844 13.297 13.832 14.321 14.794 15.349 15.981 16.578 17.225 17.912 18.664 19.455 20.325 21.354 22.375 23.535 24.856 26.391 28.066 29.967 32.149 34.602 36.312 37.092 37.402 37.417 37.255 37.005 36.716 36.42 36.09 35.778 35.477 35.132 34.762 34.426 34.131 33.801 33.465 33.179 32.894 32.58 32.314 32.024 31.693 31.408 31.101 30.778 30.42 30.048 29.811 29.566 29.173 28.913 28.647 28.506 28.2 27.875 27.515 27.316 26.882 26.596 26.32 26.041 25.41 25.056 24.684 24.262 23.766 23.169 22.403 20.69 -7 ,21738 ,KEBNE ,16750196,Thu Dec 2 03:13:36 CET,Thu Dec 2 04:51:19 CET,0.0 1.727 2.373 2.909 3.407 3.843 4.258 4.608 5.182 5.45 5.702 5.953 6.427 6.656 7.083 7.478 7.866 8.053 8.402 8.737 9.234 9.569 9.899 10.367 10.83 11.257 11.653 12.056 12.591 13.096 13.56 14.115 14.672 15.228 15.882 16.619 17.315 18.074 18.88 19.752 20.694 21.744 22.884 23.92 25.107 26.412 27.897 29.557 31.465 33.635 36.005 37.626 38.326 38.528 38.467 38.278 38.029 37.751 37.46 37.128 36.799 36.475 36.153 35.828 35.508 35.19 34.838 34.52 34.212 33.841 33.467 33.199 32.914 32.6 32.355 32.077 31.789 31.513 31.218 31.007 30.776 30.419 30.176 29.908 29.768 29.482 29.157 28.785 28.593 28.18 27.984 27.768 27.536 27.003 26.693 26.361 25.987 25.516 24.897 24.048 21.73 -8 ,15656 ,KEBNE ,16750197,Thu Dec 2 03:13:36 CET,Thu Dec 2 04:50:52 CET,0.0 1.485 2.233 2.814 3.334 3.792 4.198 4.567 5.233 5.543 5.836 6.142 6.623 6.848 7.276 7.69 8.092 8.286 8.651 8.987 9.489 9.819 10.135 10.586 11.022 11.451 11.872 12.266 12.772 13.269 13.72 14.243 14.761 15.252 15.835 16.535 17.22 17.941 18.654 19.403 20.194 21.085 22.128 23.136 24.282 25.578 27.068 28.721 30.587 32.694 35.087 36.734 37.406 37.629 37.582 37.389 37.142 36.876 36.563 36.17 35.817 35.496 35.177 34.852 34.512 34.211 33.885 33.549 33.269 32.989 32.652 32.342 32.025 31.718 31.493 31.243 30.961 30.681 30.39 30.175 29.946 29.584 29.333 29.07 28.933 28.651 28.35 28.036 27.856 27.424 27.173 26.922 26.661 26.091 25.772 25.407 24.997 24.541 23.987 23.256 21.34 -9 ,29447 ,KEBNE ,16750198,Thu Dec 2 03:13:36 CET,Thu Dec 2 04:50:55 CET,0.0 1.623 2.405 3.019 3.531 3.959 4.349 4.73 5.42 5.729 6.03 6.312 6.775 6.991 7.381 7.775 8.204 8.408 8.773 9.109 9.594 9.893 10.171 10.577 10.995 11.395 11.77 12.153 12.634 13.068 13.487 14.01 14.515 14.992 15.546 16.159 16.732 17.373 18.076 18.819 19.612 20.504 21.539 22.565 23.749 25.085 26.618 28.344 30.345 32.585 35.168 37.158 38.129 38.548 38.659 38.625 38.5 38.294 38.056 37.765 37.465 37.189 36.911 36.584 36.195 35.823 35.493 35.224 34.947 34.632 34.316 34.014 33.689 33.358 33.098 32.836 32.552 32.265 31.983 31.779 31.556 31.199 30.935 30.619 30.459 30.165 29.842 29.469 29.268 28.852 28.664 28.445 28.22 27.698 27.405 27.086 26.703 26.276 25.799 25.125 23.314 -10 ,13158 ,KEBNE ,16750199,Thu Dec 2 03:13:36 CET,Thu Dec 2 04:50:45 CET,0.0 1.646 2.361 2.918 3.385 3.819 4.221 4.585 5.261 5.576 5.867 6.178 6.696 6.95 7.415 7.869 8.311 8.523 8.911 9.253 9.725 10.048 10.379 10.852 11.301 11.716 12.115 12.51 13.013 13.501 13.947 14.462 14.957 15.47 16.103 16.812 17.438 18.079 18.786 19.544 20.33 21.199 22.223 23.277 24.472 25.748 27.22 28.85 30.703 32.875 35.281 36.939 37.669 37.918 37.934 37.82 37.601 37.341 37.055 36.713 36.388 36.038 35.685 35.341 35.006 34.7 34.375 34.05 33.751 33.454 33.133 32.859 32.573 32.242 31.97 31.683 31.368 31.029 30.653 30.395 30.138 29.715 29.405 29.099 28.944 28.604 28.276 27.961 27.786 27.375 27.182 26.97 26.74 26.211 25.928 25.61 25.251 24.806 24.261 23.556 21.743 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt deleted file mode 100644 index 4b7aa272..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23753 ,KEBNE ,16750200,Thu Dec 2 03:13:36 CET,Thu Dec 2 04:50:56 CET,0.0 1.61 2.359 2.991 3.566 4.051 4.485 4.883 5.589 5.903 6.202 6.516 7.018 7.274 7.746 8.163 8.562 8.756 9.129 9.492 10.008 10.341 10.667 11.124 11.56 11.99 12.407 12.807 13.328 13.826 14.307 14.893 15.453 16.002 16.639 17.364 18.046 18.729 19.449 20.242 21.057 21.935 22.927 23.929 25.127 26.422 27.865 29.43 31.165 33.077 35.009 35.952 36.06 35.83 35.407 34.926 34.437 33.943 33.449 32.91 32.421 31.938 31.472 31.041 30.621 30.215 29.761 29.351 29.011 28.659 28.289 27.965 27.607 27.216 26.883 26.526 26.174 25.822 25.449 25.181 24.888 24.407 24.089 23.783 23.623 23.282 22.909 22.495 22.263 21.785 21.488 21.211 20.943 20.398 20.083 19.717 19.29 18.771 18.149 17.356 15.547 -2 ,440 ,KEBNE ,16750201,Thu Dec 2 03:14:38 CET,Thu Dec 2 04:53:10 CET,0.0 1.637 2.457 3.114 3.649 4.101 4.526 4.913 5.571 5.883 6.195 6.525 7.03 7.29 7.769 8.233 8.683 8.891 9.301 9.709 10.283 10.642 10.985 11.466 11.911 12.352 12.798 13.211 13.724 14.226 14.724 15.335 15.916 16.483 17.154 17.907 18.64 19.418 20.169 20.947 21.838 22.859 24.016 25.189 26.562 28.036 29.707 31.517 33.485 35.55 37.442 38.494 38.645 38.331 37.923 37.383 36.745 36.125 35.591 35.009 34.458 33.935 33.416 32.915 32.422 31.966 31.51 31.11 30.751 30.355 29.926 29.58 29.217 28.82 28.515 28.17 27.786 27.41 27.036 26.767 26.492 26.072 25.769 25.454 25.291 24.962 24.624 24.252 24.049 23.615 23.356 23.075 22.786 22.181 21.84 21.443 21.013 20.529 19.891 19.071 17.324 -3 ,11803 ,KEBNE ,16750202,Thu Dec 2 03:14:38 CET,Thu Dec 2 04:53:37 CET,0.0 2.354 3.064 3.647 4.121 4.539 4.964 5.366 6.045 6.356 6.646 6.958 7.468 7.731 8.198 8.61 9.007 9.205 9.587 9.95 10.446 10.745 11.044 11.488 11.907 12.287 12.663 13.043 13.529 13.993 14.433 14.986 15.545 16.093 16.702 17.355 18.021 18.762 19.545 20.357 21.162 22.072 23.131 24.179 25.369 26.678 28.187 29.786 31.533 33.448 35.32 36.26 36.391 36.149 35.759 35.285 34.745 34.196 33.701 33.19 32.705 32.229 31.77 31.337 30.932 30.527 30.094 29.713 29.359 28.979 28.595 28.283 27.968 27.629 27.353 27.069 26.743 26.38 26.008 25.746 25.468 25.031 24.725 24.4 24.229 23.883 23.54 23.168 22.961 22.529 22.314 22.056 21.776 21.202 20.896 20.54 20.159 19.752 19.28 18.606 16.418 -4 ,14483 ,KEBNE ,16750203,Thu Dec 2 03:14:39 CET,Thu Dec 2 04:53:11 CET,0.0 1.957 2.752 3.344 3.875 4.347 4.766 5.162 5.857 6.174 6.478 6.816 7.342 7.613 8.125 8.615 9.065 9.278 9.71 10.121 10.687 11.057 11.415 11.92 12.419 12.898 13.361 13.809 14.393 14.958 15.493 16.133 16.7 17.224 17.859 18.571 19.25 20.005 20.781 21.559 22.361 23.254 24.281 25.296 26.436 27.674 29.088 30.64 32.346 34.167 36.061 37.088 37.211 36.954 36.508 35.987 35.425 34.837 34.314 33.77 33.248 32.759 32.302 31.886 31.488 31.079 30.616 30.169 29.734 29.262 28.759 28.337 27.921 27.51 27.191 26.85 26.498 26.138 25.763 25.495 25.211 24.761 24.447 24.125 23.959 23.614 23.24 22.836 22.624 22.172 21.879 21.602 21.33 20.756 20.457 20.14 19.77 19.338 18.843 18.227 16.374 -5 ,29806 ,KEBNE ,16750204,Thu Dec 2 03:14:38 CET,Thu Dec 2 04:53:08 CET,0.0 2.06 2.918 3.551 4.083 4.548 4.952 5.323 6.041 6.357 6.64 6.921 7.407 7.642 8.071 8.486 8.885 9.073 9.458 9.842 10.375 10.71 11.033 11.495 11.938 12.374 12.808 13.24 13.779 14.295 14.8 15.384 15.917 16.409 16.967 17.603 18.215 18.88 19.61 20.355 21.109 21.976 23.004 24.057 25.317 26.676 28.143 29.738 31.472 33.426 35.404 36.383 36.543 36.338 35.965 35.467 34.942 34.417 33.924 33.381 32.858 32.41 31.985 31.569 31.16 30.742 30.251 29.761 29.336 28.917 28.486 28.115 27.724 27.319 26.998 26.668 26.315 25.933 25.515 25.224 24.943 24.502 24.198 23.877 23.706 23.355 22.99 22.614 22.414 21.979 21.756 21.503 21.223 20.608 20.276 19.915 19.519 19.055 18.501 17.805 14.696 -6 ,7005 ,KEBNE ,16750205,Thu Dec 2 03:14:38 CET,Thu Dec 2 04:53:41 CET,0.0 2.177 2.986 3.602 4.119 4.567 4.983 5.377 6.1 6.415 6.719 7.074 7.6 7.861 8.349 8.817 9.265 9.481 9.895 10.265 10.774 11.102 11.416 11.864 12.312 12.768 13.219 13.646 14.16 14.647 15.134 15.718 16.274 16.825 17.463 18.194 18.894 19.617 20.374 21.148 21.925 22.83 23.882 24.911 26.102 27.418 28.877 30.45 32.238 34.141 36.043 37.055 37.256 37.071 36.645 36.133 35.546 34.849 34.19 33.567 33.07 32.624 32.152 31.679 31.233 30.816 30.391 30.021 29.688 29.319 28.928 28.584 28.21 27.84 27.565 27.28 26.965 26.612 26.224 25.947 25.67 25.246 24.947 24.616 24.449 24.143 23.806 23.432 23.247 22.832 22.65 22.424 22.183 21.638 21.319 20.963 20.573 20.097 19.54 18.767 16.915 -7 ,25223 ,KEBNE ,16750206,Thu Dec 2 03:14:41 CET,Thu Dec 2 04:54:03 CET,0.0 2.307 3.095 3.684 4.205 4.656 5.063 5.468 6.2 6.54 6.863 7.203 7.703 7.954 8.464 8.953 9.404 9.624 10.052 10.467 11.05 11.397 11.7 12.128 12.551 12.949 13.333 13.707 14.173 14.621 15.06 15.571 16.061 16.556 17.138 17.818 18.461 19.136 19.88 20.666 21.476 22.39 23.417 24.439 25.651 26.93 28.326 29.928 31.715 33.554 35.323 36.252 36.408 36.111 35.689 35.238 34.715 34.153 33.613 33.023 32.464 31.966 31.478 30.949 30.439 29.965 29.418 28.912 28.496 28.078 27.612 27.209 26.807 26.407 26.078 25.736 25.386 25.006 24.621 24.35 24.066 23.645 23.346 23.022 22.861 22.522 22.131 21.729 21.528 21.072 20.784 20.51 20.226 19.589 19.24 18.848 18.397 17.898 17.306 16.552 15.04 -8 ,17115 ,KEBNE ,16750207,Thu Dec 2 03:14:41 CET,Thu Dec 2 04:52:43 CET,0.0 1.691 2.494 3.125 3.66 4.123 4.544 4.944 5.682 6.025 6.351 6.706 7.203 7.444 7.939 8.413 8.861 9.08 9.487 9.884 10.445 10.787 11.114 11.58 12.025 12.453 12.872 13.28 13.799 14.304 14.803 15.397 15.987 16.555 17.178 17.877 18.543 19.241 19.979 20.763 21.579 22.51 23.576 24.583 25.734 27.019 28.455 30.017 31.775 33.666 35.57 36.633 36.793 36.516 36.079 35.582 35.076 34.549 34.059 33.522 33.023 32.578 32.147 31.719 31.298 30.892 30.426 29.979 29.587 29.184 28.77 28.418 28.051 27.687 27.42 27.131 26.799 26.433 26.049 25.772 25.484 25.042 24.72 24.383 24.21 23.858 23.481 23.091 22.893 22.452 22.224 21.984 21.723 21.138 20.806 20.441 20.037 19.567 18.971 18.154 16.392 -9 ,32265 ,KEBNE ,16750208,Thu Dec 2 03:14:38 CET,Thu Dec 2 04:53:25 CET,0.0 1.944 2.727 3.331 3.858 4.329 4.755 5.154 5.883 6.191 6.461 6.727 7.21 7.459 7.964 8.427 8.852 9.051 9.461 9.872 10.444 10.805 11.135 11.602 12.06 12.48 12.893 13.306 13.842 14.362 14.858 15.456 16.036 16.601 17.249 17.963 18.653 19.382 20.115 20.85 21.67 22.62 23.643 24.672 25.895 27.185 28.648 30.27 32.014 33.92 35.745 36.624 36.705 36.349 35.837 35.318 34.783 34.251 33.739 33.201 32.728 32.269 31.815 31.389 30.988 30.608 30.195 29.772 29.367 28.938 28.478 28.088 27.662 27.232 26.888 26.494 26.085 25.675 25.277 24.999 24.689 24.193 23.846 23.488 23.307 22.946 22.557 22.132 21.91 21.453 21.23 21.003 20.749 20.212 19.917 19.584 19.204 18.748 18.215 17.444 14.8 -10 ,26062 ,KEBNE ,16750209,Thu Dec 2 03:14:45 CET,Thu Dec 2 04:53:13 CET,0.0 2.352 3.181 3.802 4.309 4.74 5.115 5.458 6.066 6.349 6.614 6.872 7.356 7.586 8.028 8.474 8.889 9.069 9.408 9.761 10.284 10.628 10.983 11.492 11.964 12.422 12.868 13.279 13.786 14.282 14.781 15.385 15.972 16.537 17.179 17.894 18.576 19.334 20.146 20.977 21.862 22.906 24.133 25.359 26.727 28.108 29.585 31.193 32.978 34.835 36.607 37.613 37.788 37.554 37.137 36.631 36.137 35.624 35.105 34.531 34.035 33.615 33.182 32.741 32.326 31.931 31.521 31.143 30.798 30.417 30.009 29.684 29.353 28.99 28.68 28.355 28.038 27.721 27.383 27.151 26.915 26.546 26.295 25.999 25.836 25.507 25.171 24.817 24.631 24.216 24.026 23.792 23.547 22.982 22.661 22.345 21.982 21.5 20.918 20.159 17.161 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index 3e2365a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27394 ,KEBNE ,17028353,Wed Dec 22 19:45:28 CET,Wed Dec 22 21:21:07 CET,0.0 1.182 1.879 2.449 2.94 3.383 3.783 4.156 4.825 5.145 5.451 5.759 6.242 6.479 6.946 7.392 7.82 8.033 8.454 8.849 9.427 9.814 10.197 10.745 11.264 11.779 12.299 12.816 13.482 14.139 14.794 15.581 16.351 17.109 18.0 19.023 20.015 21.126 22.354 23.668 25.095 26.729 28.699 30.746 33.202 36.028 39.398 43.279 47.824 53.436 60.878 67.576 71.766 74.569 76.562 78.077 79.154 79.97 80.554 81.02 81.344 81.576 81.747 81.878 81.987 82.044 82.038 81.998 81.972 81.933 81.85 81.767 81.67 81.557 81.46 81.339 81.197 81.014 80.817 80.687 80.532 80.274 80.09 79.875 79.753 79.483 79.177 78.858 78.688 78.35 78.126 77.91 77.671 77.102 76.768 76.389 75.963 75.513 74.952 74.119 71.99 -2 ,30069 ,KEBNE ,17028354,Wed Dec 22 19:47:32 CET,Wed Dec 22 21:24:45 CET,0.0 1.284 1.908 2.44 2.899 3.275 3.61 3.943 4.553 4.835 5.118 5.405 5.899 6.144 6.609 7.065 7.511 7.732 8.181 8.631 9.28 9.696 10.092 10.657 11.208 11.736 12.252 12.763 13.423 14.068 14.709 15.487 16.242 16.991 17.886 18.903 19.899 21.02 22.25 23.582 24.986 26.611 28.598 30.649 33.094 35.896 39.178 42.914 47.502 53.253 60.672 67.35 71.622 74.516 76.506 77.961 79.031 79.829 80.396 80.87 81.183 81.414 81.592 81.716 81.806 81.855 81.887 81.884 81.846 81.789 81.717 81.613 81.466 81.336 81.236 81.098 80.945 80.776 80.561 80.406 80.24 79.98 79.814 79.631 79.528 79.317 79.082 78.796 78.636 78.304 78.068 77.841 77.587 76.999 76.657 76.286 75.883 75.415 74.842 74.0 71.426 -3 ,16408 ,KEBNE ,17028355,Wed Dec 22 19:47:32 CET,Wed Dec 22 21:25:24 CET,0.0 1.367 2.037 2.526 2.934 3.307 3.641 3.955 4.538 4.82 5.099 5.391 5.888 6.136 6.607 7.052 7.493 7.711 8.13 8.539 9.139 9.53 9.901 10.448 10.984 11.505 12.027 12.533 13.187 13.832 14.47 15.255 16.008 16.736 17.603 18.6 19.579 20.66 21.865 23.211 24.626 26.231 28.152 30.107 32.416 35.081 38.301 42.083 46.682 52.437 59.968 66.707 70.936 73.742 75.711 77.174 78.228 79.042 79.616 80.07 80.384 80.615 80.78 80.868 80.919 80.96 80.997 80.999 80.969 80.923 80.831 80.726 80.622 80.499 80.377 80.223 80.05 79.867 79.669 79.529 79.379 79.127 78.944 78.753 78.648 78.438 78.197 77.91 77.743 77.393 77.124 76.883 76.64 76.172 75.902 75.551 75.115 74.631 74.106 73.429 70.945 -4 ,24109 ,KEBNE ,17028356,Wed Dec 22 19:47:32 CET,Wed Dec 22 21:23:18 CET,0.0 1.027 1.626 2.103 2.57 3.018 3.424 3.785 4.436 4.756 5.071 5.424 5.951 6.228 6.763 7.274 7.764 8.001 8.465 8.899 9.497 9.887 10.268 10.835 11.382 11.905 12.418 12.928 13.599 14.254 14.891 15.677 16.438 17.173 18.06 19.066 20.042 21.155 22.379 23.688 25.089 26.706 28.642 30.626 32.963 35.622 38.792 42.52 47.126 52.858 60.236 66.791 70.916 73.825 75.891 77.399 78.466 79.239 79.813 80.297 80.637 80.871 81.042 81.155 81.221 81.255 81.26 81.224 81.167 81.106 81.028 80.949 80.852 80.731 80.621 80.508 80.382 80.226 80.066 79.949 79.799 79.519 79.292 79.045 78.918 78.644 78.343 78.02 77.839 77.477 77.197 76.956 76.7 76.132 75.79 75.403 74.988 74.515 73.888 73.006 70.726 -5 ,13225 ,KEBNE ,17028357,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:36:16 CET,0.0 1.263 1.827 2.3 2.707 3.073 3.421 3.748 4.356 4.633 4.9 5.182 5.683 5.942 6.437 6.881 7.313 7.529 7.94 8.332 8.917 9.3 9.675 10.227 10.76 11.275 11.782 12.286 12.95 13.603 14.248 15.034 15.79 16.537 17.417 18.41 19.391 20.489 21.692 23.005 24.412 26.012 27.926 29.929 32.344 35.136 38.494 42.418 47.197 53.037 60.465 67.158 71.411 74.257 76.252 77.736 78.799 79.583 80.179 80.674 81.021 81.265 81.422 81.522 81.572 81.588 81.585 81.547 81.489 81.403 81.295 81.208 81.102 80.956 80.821 80.681 80.531 80.355 80.16 80.031 79.898 79.678 79.494 79.287 79.185 78.966 78.722 78.443 78.283 77.962 77.78 77.582 77.361 76.84 76.558 76.247 75.883 75.46 74.853 73.966 71.429 -6 ,25001 ,KEBNE ,17028358,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:35:46 CET,0.0 1.24 1.828 2.306 2.724 3.104 3.465 3.798 4.403 4.686 4.951 5.219 5.71 5.969 6.465 6.908 7.343 7.554 7.97 8.377 8.967 9.35 9.724 10.264 10.796 11.318 11.833 12.361 13.06 13.719 14.376 15.19 15.955 16.707 17.606 18.623 19.59 20.678 21.889 23.189 24.6 26.26 28.233 30.268 32.698 35.434 38.635 42.41 47.053 52.745 60.185 66.927 71.16 74.041 76.036 77.504 78.569 79.369 79.91 80.361 80.697 80.912 81.061 81.175 81.258 81.302 81.308 81.277 81.253 81.199 81.089 80.987 80.871 80.737 80.633 80.523 80.376 80.171 79.942 79.772 79.582 79.283 79.072 78.832 78.711 78.481 78.232 77.941 77.779 77.464 77.268 77.067 76.838 76.3 75.978 75.611 75.19 74.7 74.096 73.191 70.834 -7 ,15527 ,KEBNE ,17028359,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:35:48 CET,0.0 1.338 2.006 2.511 2.957 3.371 3.725 4.044 4.643 4.921 5.197 5.48 5.967 6.208 6.67 7.121 7.568 7.79 8.21 8.618 9.244 9.643 10.014 10.546 11.082 11.606 12.105 12.599 13.247 13.891 14.521 15.294 16.056 16.81 17.703 18.705 19.683 20.779 21.966 23.236 24.589 26.155 28.04 30.004 32.362 35.068 38.318 42.128 46.77 52.542 59.939 66.559 70.804 73.644 75.582 76.994 78.046 78.885 79.501 79.989 80.34 80.619 80.819 80.905 80.938 80.975 80.983 80.952 80.927 80.903 80.827 80.736 80.642 80.547 80.444 80.293 80.112 79.926 79.739 79.6 79.435 79.149 78.948 78.745 78.626 78.385 78.14 77.828 77.644 77.286 77.021 76.784 76.529 75.972 75.66 75.313 74.906 74.417 73.821 73.072 69.304 -8 ,17994 ,KEBNE ,17028360,Wed Dec 22 19:59:55 CET,Wed Dec 22 21:35:45 CET,0.0 1.394 1.961 2.423 2.84 3.267 3.678 4.039 4.714 5.009 5.27 5.535 6.026 6.281 6.785 7.257 7.692 7.904 8.316 8.707 9.288 9.681 10.068 10.632 11.176 11.699 12.217 12.743 13.429 14.076 14.706 15.476 16.225 16.963 17.837 18.842 19.83 20.942 22.157 23.482 24.907 26.534 28.487 30.508 32.921 35.657 38.866 42.605 47.177 52.851 60.23 66.831 71.013 73.882 75.902 77.406 78.478 79.252 79.8 80.274 80.636 80.879 81.069 81.231 81.322 81.354 81.354 81.315 81.236 81.132 81.051 80.963 80.841 80.714 80.601 80.456 80.274 80.062 79.838 79.681 79.515 79.243 79.025 78.782 78.652 78.384 78.106 77.788 77.606 77.259 77.037 76.844 76.641 76.179 75.908 75.578 75.206 74.757 74.157 73.38 70.75 -9 ,30193 ,KEBNE ,17028361,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:36:08 CET,0.0 1.394 2.002 2.48 2.89 3.255 3.593 3.912 4.499 4.769 5.03 5.314 5.806 6.036 6.497 6.976 7.452 7.694 8.164 8.601 9.246 9.67 10.068 10.624 11.173 11.717 12.243 12.745 13.389 14.022 14.656 15.443 16.213 16.961 17.832 18.817 19.772 20.855 22.04 23.315 24.673 26.226 28.105 30.045 32.415 35.17 38.444 42.199 46.821 52.65 60.172 66.873 71.029 73.818 75.779 77.213 78.244 79.043 79.611 80.062 80.404 80.654 80.817 80.922 81.002 81.064 81.078 81.052 81.002 80.921 80.821 80.712 80.591 80.459 80.346 80.199 80.011 79.805 79.582 79.422 79.255 78.985 78.787 78.557 78.428 78.174 77.933 77.69 77.539 77.193 76.959 76.72 76.456 75.89 75.556 75.216 74.861 74.4 73.849 73.12 70.433 -10 ,13434 ,KEBNE ,17028362,Wed Dec 22 19:59:55 CET,Wed Dec 22 21:37:36 CET,0.0 1.205 1.799 2.262 2.659 3.037 3.384 3.694 4.288 4.572 4.841 5.117 5.61 5.854 6.331 6.793 7.244 7.46 7.878 8.288 8.894 9.286 9.662 10.204 10.734 11.26 11.781 12.291 12.96 13.618 14.254 15.021 15.785 16.537 17.42 18.43 19.412 20.517 21.719 22.988 24.34 25.913 27.776 29.699 32.03 34.699 37.846 41.619 46.299 52.105 59.702 66.381 70.542 73.372 75.314 76.761 77.812 78.586 79.137 79.592 79.928 80.2 80.398 80.522 80.599 80.627 80.624 80.596 80.563 80.522 80.446 80.347 80.221 80.07 79.957 79.826 79.648 79.439 79.201 79.034 78.863 78.562 78.35 78.129 78.003 77.733 77.428 77.091 76.913 76.561 76.3 76.077 75.842 75.32 75.001 74.625 74.182 73.676 73.058 72.173 69.707 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index de5d53ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17875 ,KEBNE ,16750210,Thu Dec 2 03:14:40 CET,Thu Dec 2 04:52:21 CET,0.0 1.319 2.016 2.526 2.939 3.305 3.64 3.948 4.521 4.791 5.059 5.316 5.79 6.023 6.495 6.935 7.333 7.527 7.908 8.279 8.817 9.183 9.54 10.046 10.537 11.022 11.513 11.981 12.58 13.172 13.742 14.452 15.162 15.857 16.666 17.573 18.436 19.385 20.457 21.628 22.861 24.272 25.942 27.695 29.816 32.204 35.079 38.44 42.433 47.326 53.426 58.544 61.626 63.639 65.014 65.987 66.631 67.076 67.374 67.584 67.708 67.78 67.812 67.793 67.737 67.657 67.535 67.421 67.325 67.194 67.026 66.877 66.711 66.534 66.386 66.223 66.039 65.84 65.635 65.485 65.332 65.081 64.877 64.642 64.518 64.272 64.023 63.742 63.573 63.215 62.986 62.753 62.487 61.899 61.571 61.2 60.757 60.231 59.624 58.801 56.115 -2 ,14084 ,KEBNE ,16750211,Thu Dec 2 03:14:41 CET,Thu Dec 2 04:52:08 CET,0.0 1.656 2.323 2.846 3.312 3.743 4.109 4.418 4.998 5.27 5.525 5.768 6.241 6.464 6.895 7.299 7.695 7.894 8.28 8.648 9.179 9.532 9.904 10.444 10.943 11.436 11.914 12.373 12.993 13.614 14.208 14.934 15.639 16.306 17.082 17.972 18.857 19.849 20.914 22.064 23.298 24.708 26.38 28.104 30.177 32.547 35.336 38.589 42.554 47.426 53.481 58.606 61.713 63.737 65.091 66.023 66.668 67.116 67.394 67.581 67.698 67.763 67.774 67.746 67.693 67.61 67.482 67.357 67.236 67.094 66.943 66.806 66.647 66.472 66.316 66.146 65.967 65.771 65.559 65.396 65.218 64.937 64.739 64.521 64.411 64.194 63.94 63.633 63.456 63.097 62.863 62.629 62.349 61.7 61.357 60.999 60.606 60.126 59.537 58.677 56.758 -3 ,11345 ,KEBNE ,16750212,Thu Dec 2 03:15:48 CET,Thu Dec 2 04:51:10 CET,0.0 1.841 2.566 3.067 3.469 3.816 4.162 4.474 5.007 5.273 5.523 5.757 6.238 6.473 6.924 7.348 7.752 7.949 8.337 8.709 9.268 9.629 9.975 10.477 10.96 11.448 11.919 12.381 12.985 13.577 14.158 14.856 15.539 16.204 16.973 17.859 18.742 19.714 20.782 21.957 23.213 24.643 26.353 28.104 30.189 32.599 35.443 38.706 42.659 47.523 53.625 58.836 62.05 64.18 65.655 66.71 67.425 67.939 68.254 68.476 68.63 68.717 68.746 68.729 68.681 68.631 68.546 68.442 68.342 68.224 68.078 67.922 67.743 67.568 67.428 67.266 67.09 66.89 66.654 66.482 66.316 66.052 65.856 65.643 65.525 65.278 65.007 64.705 64.535 64.171 63.919 63.706 63.487 63.015 62.735 62.414 62.054 61.656 61.168 60.422 57.854 -4 ,11678 ,KEBNE ,16750213,Thu Dec 2 03:15:48 CET,Thu Dec 2 04:53:40 CET,0.0 1.193 1.802 2.248 2.648 3.012 3.33 3.624 4.177 4.438 4.69 4.919 5.382 5.612 6.05 6.458 6.883 7.088 7.473 7.855 8.412 8.777 9.131 9.639 10.129 10.6 11.071 11.546 12.162 12.756 13.329 14.016 14.683 15.359 16.163 17.037 17.889 18.864 19.937 21.108 22.359 23.8 25.502 27.228 29.293 31.669 34.478 37.733 41.722 46.532 52.605 57.844 60.993 63.043 64.414 65.395 66.049 66.515 66.822 67.028 67.143 67.189 67.201 67.174 67.113 67.04 66.937 66.829 66.717 66.571 66.394 66.26 66.113 65.923 65.757 65.559 65.342 65.129 64.902 64.742 64.579 64.282 64.052 63.805 63.683 63.438 63.153 62.836 62.663 62.32 62.098 61.861 61.605 61.017 60.672 60.274 59.849 59.392 58.812 58.022 55.314 -5 ,15048 ,KEBNE ,16750214,Thu Dec 2 03:17:56 CET,Thu Dec 2 04:55:34 CET,0.0 1.234 1.845 2.298 2.679 3.043 3.383 3.719 4.352 4.656 4.95 5.259 5.764 6.018 6.5 6.955 7.399 7.615 8.014 8.395 8.953 9.302 9.65 10.161 10.658 11.145 11.617 12.083 12.684 13.277 13.864 14.559 15.245 15.937 16.735 17.63 18.51 19.483 20.532 21.677 22.911 24.331 25.995 27.711 29.834 32.266 35.121 38.46 42.548 47.588 53.79 59.06 62.324 64.419 65.781 66.705 67.338 67.794 68.096 68.288 68.394 68.464 68.497 68.479 68.428 68.379 68.301 68.19 68.082 67.942 67.769 67.616 67.423 67.199 67.023 66.847 66.674 66.479 66.268 66.116 65.934 65.622 65.406 65.2 65.089 64.823 64.541 64.267 64.114 63.751 63.472 63.243 63.005 62.435 62.103 61.742 61.325 60.836 60.241 59.405 57.259 -6 ,14786 ,KEBNE ,16750215,Thu Dec 2 03:17:56 CET,Thu Dec 2 04:55:59 CET,0.0 1.864 2.486 2.942 3.355 3.723 4.059 4.376 4.955 5.223 5.484 5.731 6.202 6.431 6.873 7.283 7.678 7.876 8.294 8.732 9.351 9.722 10.068 10.586 11.083 11.567 12.05 12.509 13.114 13.735 14.335 15.043 15.735 16.415 17.211 18.096 18.966 19.962 21.062 22.23 23.467 24.904 26.627 28.393 30.496 32.916 35.786 39.085 43.02 47.869 54.017 59.262 62.431 64.542 65.988 66.962 67.599 68.069 68.375 68.605 68.742 68.812 68.835 68.825 68.783 68.705 68.585 68.448 68.321 68.178 68.008 67.86 67.685 67.463 67.282 67.097 66.915 66.723 66.514 66.367 66.21 65.968 65.78 65.571 65.46 65.217 64.956 64.64 64.456 64.091 63.832 63.589 63.334 62.755 62.424 62.065 61.643 61.132 60.486 59.599 57.482 -7 ,23321 ,KEBNE ,16750216,Thu Dec 2 03:17:56 CET,Thu Dec 2 04:55:42 CET,0.0 1.255 1.966 2.558 3.082 3.502 3.845 4.153 4.708 4.962 5.212 5.457 5.931 6.167 6.614 7.019 7.413 7.612 8.001 8.377 8.93 9.29 9.662 10.192 10.668 11.14 11.612 12.075 12.685 13.285 13.877 14.602 15.305 15.991 16.795 17.697 18.566 19.517 20.575 21.733 22.976 24.42 26.13 27.875 29.972 32.367 35.163 38.429 42.412 47.275 53.425 58.733 61.973 64.116 65.538 66.443 67.046 67.495 67.782 67.972 68.086 68.138 68.119 68.062 68.007 67.931 67.821 67.708 67.59 67.454 67.299 67.16 67.008 66.829 66.677 66.501 66.314 66.122 65.92 65.769 65.595 65.319 65.119 64.891 64.762 64.479 64.184 63.834 63.651 63.306 63.13 62.936 62.719 62.27 62.008 61.713 61.371 60.956 60.467 59.731 56.392 -8 ,21847 ,KEBNE ,16750217,Thu Dec 2 03:17:56 CET,Thu Dec 2 04:55:21 CET,0.0 1.132 1.761 2.227 2.644 3.029 3.35 3.632 4.173 4.436 4.69 4.927 5.402 5.632 6.087 6.55 6.995 7.201 7.594 7.972 8.502 8.839 9.179 9.687 10.188 10.668 11.133 11.596 12.212 12.813 13.391 14.094 14.784 15.469 16.27 17.162 18.029 19.0 20.07 21.243 22.494 23.942 25.705 27.485 29.555 31.979 34.915 38.267 42.294 47.233 53.436 58.802 62.012 64.101 65.518 66.502 67.162 67.624 67.906 68.083 68.18 68.229 68.241 68.222 68.17 68.1 68.024 67.93 67.816 67.682 67.541 67.409 67.243 67.066 66.926 66.766 66.577 66.357 66.125 65.975 65.817 65.552 65.369 65.182 65.078 64.835 64.563 64.257 64.092 63.738 63.475 63.247 63.028 62.549 62.259 61.938 61.581 61.169 60.607 59.75 57.457 -9 ,19428 ,KEBNE ,16750218,Thu Dec 2 03:22:09 CET,Thu Dec 2 04:59:48 CET,0.0 1.25 1.805 2.268 2.676 3.029 3.345 3.653 4.254 4.522 4.768 5.003 5.488 5.722 6.158 6.609 7.059 7.269 7.654 8.023 8.567 8.923 9.27 9.793 10.299 10.768 11.228 11.682 12.282 12.874 13.44 14.13 14.816 15.486 16.28 17.192 18.078 19.055 20.129 21.299 22.567 24.046 25.761 27.477 29.539 31.914 34.738 38.065 42.135 46.987 53.003 58.25 61.438 63.536 64.968 65.97 66.619 67.072 67.355 67.548 67.671 67.721 67.685 67.633 67.576 67.495 67.398 67.27 67.126 66.982 66.826 66.68 66.525 66.357 66.217 66.051 65.863 65.647 65.397 65.212 65.023 64.719 64.488 64.236 64.104 63.841 63.57 63.27 63.112 62.769 62.56 62.36 62.14 61.667 61.406 61.079 60.686 60.254 59.716 58.973 56.855 -10 ,7186 ,KEBNE ,16750219,Thu Dec 2 03:34:51 CET,Thu Dec 2 05:11:03 CET,0.0 1.183 1.769 2.218 2.595 2.933 3.259 3.577 4.185 4.471 4.74 4.986 5.47 5.722 6.216 6.679 7.115 7.32 7.701 8.08 8.632 8.977 9.316 9.815 10.294 10.77 11.243 11.711 12.32 12.924 13.519 14.225 14.921 15.601 16.385 17.29 18.167 19.16 20.246 21.425 22.712 24.155 25.841 27.635 29.81 32.257 35.166 38.549 42.664 47.742 54.191 59.66 62.883 64.997 66.47 67.537 68.243 68.748 69.114 69.375 69.521 69.61 69.657 69.643 69.596 69.528 69.435 69.339 69.228 69.096 68.928 68.769 68.605 68.436 68.294 68.13 67.954 67.757 67.531 67.364 67.197 66.932 66.742 66.528 66.399 66.13 65.856 65.553 65.397 65.064 64.848 64.637 64.415 63.922 63.63 63.304 62.925 62.421 61.782 60.963 58.761 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 34cc8abd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27771 ,KEBNE ,16750220,Thu Dec 2 03:34:51 CET,Thu Dec 2 05:11:20 CET,0.0 1.448 2.132 2.573 2.952 3.306 3.638 3.933 4.475 4.719 4.957 5.204 5.669 5.886 6.314 6.716 7.103 7.295 7.679 8.053 8.575 8.916 9.251 9.722 10.177 10.627 11.071 11.514 12.084 12.634 13.179 13.843 14.479 15.098 15.834 16.676 17.495 18.391 19.383 20.477 21.655 23.004 24.596 26.234 28.196 30.419 33.038 36.133 39.884 44.513 50.442 55.524 58.577 60.65 62.045 63.029 63.748 64.234 64.548 64.784 64.93 65.002 65.005 64.976 64.944 64.886 64.776 64.673 64.571 64.453 64.314 64.182 64.006 63.787 63.628 63.471 63.31 63.12 62.904 62.742 62.572 62.316 62.129 61.895 61.758 61.46 61.135 60.771 60.573 60.202 59.981 59.758 59.499 58.871 58.522 58.144 57.727 57.229 56.627 55.847 53.824 -2 ,19011 ,KEBNE ,16750221,Thu Dec 2 03:34:52 CET,Thu Dec 2 05:11:25 CET,0.0 1.34 2.037 2.592 3.057 3.473 3.868 4.241 4.919 5.222 5.485 5.728 6.201 6.419 6.833 7.239 7.624 7.813 8.183 8.542 9.063 9.395 9.716 10.197 10.667 11.116 11.564 12.011 12.575 13.112 13.646 14.307 14.96 15.599 16.34 17.181 17.995 18.886 19.87 20.942 22.098 23.43 25.033 26.675 28.614 30.836 33.438 36.439 40.105 44.657 50.342 55.26 58.307 60.384 61.773 62.72 63.397 63.867 64.173 64.381 64.475 64.536 64.558 64.54 64.507 64.453 64.368 64.27 64.159 64.038 63.882 63.703 63.525 63.348 63.176 62.993 62.806 62.596 62.377 62.196 61.979 61.631 61.389 61.151 61.034 60.792 60.524 60.233 60.061 59.675 59.401 59.148 58.869 58.274 57.951 57.581 57.131 56.574 55.937 55.157 53.288 -3 ,23932 ,KEBNE ,16750222,Thu Dec 2 03:34:52 CET,Thu Dec 2 05:11:14 CET,0.0 1.606 2.245 2.793 3.259 3.643 3.965 4.268 4.828 5.085 5.329 5.546 6.003 6.221 6.656 7.062 7.445 7.629 7.988 8.335 8.829 9.157 9.487 9.968 10.441 10.892 11.342 11.811 12.404 12.959 13.51 14.177 14.819 15.444 16.172 16.991 17.811 18.749 19.761 20.859 22.033 23.359 24.964 26.614 28.535 30.74 33.355 36.42 40.187 44.842 50.643 55.585 58.614 60.655 62.079 63.042 63.694 64.198 64.54 64.759 64.861 64.914 64.938 64.935 64.895 64.837 64.757 64.647 64.544 64.421 64.247 64.104 63.955 63.782 63.64 63.486 63.316 63.111 62.868 62.709 62.557 62.311 62.135 61.944 61.825 61.531 61.208 60.861 60.673 60.297 60.046 59.805 59.543 58.925 58.572 58.202 57.751 57.223 56.596 55.707 53.536 -4 ,6225 ,KEBNE ,16750223,Thu Dec 2 03:34:52 CET,Thu Dec 2 05:11:24 CET,0.0 1.644 2.374 2.861 3.224 3.555 3.858 4.15 4.708 4.977 5.242 5.539 6.057 6.307 6.736 7.142 7.523 7.707 8.077 8.439 8.959 9.297 9.623 10.098 10.561 11.021 11.473 11.921 12.493 13.047 13.603 14.269 14.905 15.53 16.261 17.086 17.899 18.811 19.812 20.907 22.047 23.321 24.869 26.475 28.408 30.65 33.301 36.347 40.04 44.599 50.461 55.512 58.556 60.562 61.923 62.905 63.586 64.053 64.381 64.619 64.764 64.871 64.911 64.892 64.851 64.796 64.708 64.599 64.467 64.29 64.117 63.972 63.795 63.606 63.458 63.297 63.114 62.914 62.685 62.523 62.368 62.118 61.925 61.707 61.598 61.361 61.103 60.821 60.665 60.322 60.133 59.926 59.69 59.123 58.8 58.442 58.003 57.468 56.833 55.959 53.741 -5 ,77 ,KEBNE ,16750224,Thu Dec 2 03:34:52 CET,Thu Dec 2 05:11:22 CET,0.0 1.595 2.277 2.818 3.289 3.706 4.088 4.442 5.024 5.286 5.533 5.76 6.228 6.44 6.85 7.256 7.668 7.876 8.261 8.613 9.126 9.464 9.796 10.286 10.771 11.242 11.691 12.12 12.684 13.231 13.758 14.409 15.046 15.669 16.409 17.251 18.063 18.973 19.988 21.087 22.247 23.567 25.159 26.803 28.749 30.993 33.672 36.792 40.584 45.209 51.056 56.213 59.33 61.346 62.732 63.731 64.403 64.861 65.169 65.407 65.545 65.623 65.646 65.618 65.571 65.508 65.419 65.33 65.226 65.09 64.947 64.814 64.66 64.491 64.347 64.196 64.028 63.842 63.623 63.462 63.298 63.035 62.841 62.632 62.527 62.28 62.012 61.75 61.603 61.26 61.018 60.768 60.503 59.916 59.595 59.237 58.789 58.281 57.702 56.96 54.446 -6 ,30299 ,KEBNE ,16750225,Thu Dec 2 03:34:51 CET,Thu Dec 2 05:10:48 CET,0.0 1.462 2.026 2.474 2.862 3.217 3.539 3.846 4.419 4.705 4.986 5.239 5.711 5.947 6.399 6.8 7.186 7.378 7.743 8.094 8.604 8.931 9.267 9.765 10.237 10.691 11.136 11.58 12.154 12.71 13.259 13.936 14.593 15.23 15.965 16.799 17.622 18.534 19.551 20.656 21.811 23.131 24.732 26.391 28.38 30.647 33.338 36.548 40.323 44.819 50.519 55.236 57.95 59.574 60.621 61.298 61.664 61.929 62.09 62.154 62.176 62.146 62.069 61.963 61.826 61.687 61.524 61.366 61.216 61.055 60.881 60.72 60.533 60.305 60.117 59.926 59.714 59.477 59.22 59.039 58.86 58.582 58.383 58.167 58.043 57.77 57.474 57.153 56.983 56.618 56.368 56.139 55.912 55.427 55.152 54.821 54.442 53.993 53.42 52.662 50.061 -7 ,5878 ,KEBNE ,16750226,Thu Dec 2 03:34:52 CET,Thu Dec 2 05:11:03 CET,0.0 1.212 1.763 2.18 2.583 2.943 3.261 3.559 4.099 4.349 4.599 4.836 5.309 5.534 5.963 6.379 6.771 6.956 7.321 7.674 8.193 8.533 8.868 9.356 9.825 10.273 10.707 11.151 11.736 12.289 12.82 13.47 14.1 14.716 15.46 16.308 17.118 18.033 19.031 20.116 21.29 22.625 24.211 25.839 27.77 29.987 32.623 35.67 39.368 44.0 49.899 54.971 58.09 60.109 61.458 62.422 63.094 63.587 63.924 64.142 64.248 64.285 64.294 64.295 64.271 64.218 64.138 64.046 63.927 63.788 63.638 63.503 63.341 63.148 62.995 62.837 62.665 62.464 62.242 62.095 61.936 61.638 61.409 61.163 61.027 60.712 60.359 59.987 59.795 59.442 59.253 59.054 58.848 58.332 58.027 57.704 57.354 56.91 56.307 55.501 53.258 -8 ,9157 ,KEBNE ,16750227,Thu Dec 2 03:34:51 CET,Thu Dec 2 05:12:01 CET,0.0 1.259 1.809 2.248 2.644 2.995 3.304 3.602 4.162 4.416 4.669 4.92 5.389 5.612 6.043 6.476 6.895 7.082 7.432 7.777 8.288 8.617 8.938 9.402 9.855 10.305 10.756 11.21 11.784 12.324 12.858 13.518 14.162 14.793 15.532 16.376 17.202 18.108 19.11 20.208 21.37 22.709 24.289 25.894 27.816 30.037 32.665 35.754 39.52 44.046 49.69 54.469 57.311 59.072 60.173 60.916 61.361 61.629 61.804 61.897 61.921 61.903 61.846 61.76 61.627 61.469 61.314 61.165 61.025 60.857 60.64 60.449 60.24 60.014 59.83 59.609 59.341 59.069 58.799 58.614 58.401 58.04 57.784 57.519 57.383 57.118 56.848 56.532 56.359 56.011 55.832 55.61 55.347 54.757 54.42 54.013 53.523 52.984 52.37 51.551 49.53 -9 ,11110 ,KEBNE ,16750228,Thu Dec 2 03:41:09 CET,Thu Dec 2 05:20:27 CET,0.0 1.139 1.743 2.245 2.65 2.998 3.337 3.661 4.23 4.482 4.738 5.028 5.508 5.722 6.132 6.529 6.903 7.087 7.457 7.818 8.348 8.689 9.014 9.485 9.961 10.449 10.913 11.348 11.919 12.464 12.997 13.667 14.313 14.935 15.675 16.508 17.319 18.237 19.238 20.337 21.507 22.846 24.427 26.057 28.003 30.242 32.885 35.871 39.558 44.203 50.067 55.127 58.206 60.252 61.657 62.617 63.289 63.783 64.095 64.335 64.491 64.564 64.589 64.592 64.553 64.489 64.394 64.28 64.154 63.988 63.786 63.609 63.437 63.258 63.116 62.964 62.789 62.595 62.384 62.217 62.014 61.658 61.405 61.145 61.012 60.738 60.442 60.127 59.958 59.604 59.389 59.173 58.949 58.423 58.096 57.728 57.294 56.794 56.22 55.499 53.262 -10 ,26214 ,KEBNE ,16750229,Thu Dec 2 03:41:09 CET,Thu Dec 2 05:19:28 CET,0.0 1.127 1.706 2.171 2.592 2.955 3.268 3.56 4.136 4.411 4.675 4.958 5.446 5.676 6.122 6.537 6.933 7.122 7.484 7.841 8.375 8.718 9.042 9.517 9.987 10.441 10.884 11.319 11.876 12.406 12.933 13.586 14.227 14.857 15.604 16.449 17.261 18.184 19.199 20.278 21.42 22.721 24.281 25.889 27.844 30.104 32.758 35.822 39.521 44.081 49.954 55.092 58.224 60.257 61.611 62.575 63.23 63.688 64.01 64.244 64.384 64.476 64.498 64.466 64.422 64.36 64.269 64.163 64.051 63.902 63.723 63.568 63.398 63.219 63.07 62.895 62.694 62.49 62.257 62.071 61.863 61.542 61.329 61.102 60.986 60.737 60.471 60.195 60.05 59.711 59.509 59.287 59.029 58.42 58.076 57.711 57.3 56.791 56.195 55.473 53.19 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index b55406ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6004 ,KEBNE ,16750230,Thu Dec 2 03:41:09 CET,Thu Dec 2 05:19:20 CET,0.0 2.358 3.218 3.789 4.242 4.621 4.956 5.257 5.791 6.04 6.282 6.529 6.96 7.159 7.545 7.954 8.364 8.542 8.864 9.164 9.578 9.86 10.145 10.55 10.925 11.287 11.637 11.966 12.392 12.821 13.234 13.725 14.2 14.641 15.145 15.715 16.279 16.894 17.533 18.202 18.928 19.746 20.686 21.64 22.75 23.949 25.28 26.746 28.349 30.177 32.179 33.417 33.791 33.788 33.631 33.325 32.963 32.577 32.189 31.745 31.313 30.903 30.502 30.102 29.712 29.385 29.034 28.679 28.361 28.036 27.695 27.394 27.062 26.715 26.441 26.149 25.833 25.461 25.072 24.834 24.583 24.152 23.847 23.536 23.373 23.036 22.663 22.258 22.045 21.619 21.311 21.035 20.74 20.069 19.687 19.23 18.662 17.966 17.109 15.988 11.759 -2 ,9869 ,KEBNE ,16750231,Thu Dec 2 03:41:09 CET,Thu Dec 2 05:17:51 CET,0.0 2.444 3.3 3.917 4.401 4.821 5.209 5.544 6.161 6.438 6.697 6.981 7.426 7.647 8.069 8.445 8.812 8.985 9.325 9.662 10.153 10.47 10.76 11.179 11.59 11.997 12.397 12.773 13.245 13.705 14.163 14.712 15.242 15.747 16.318 16.985 17.645 18.357 19.108 19.913 20.735 21.654 22.717 23.777 25.03 26.403 27.902 29.552 31.494 33.579 35.691 36.805 36.932 36.613 36.07 35.466 34.872 34.262 33.739 33.195 32.654 32.161 31.684 31.24 30.818 30.382 29.899 29.473 29.115 28.725 28.302 27.936 27.545 27.123 26.772 26.422 26.079 25.693 25.282 24.984 24.665 24.167 23.822 23.47 23.289 22.897 22.43 21.917 21.648 21.189 20.885 20.609 20.299 19.612 19.217 18.78 18.289 17.686 16.902 15.824 12.748 -3 ,4390 ,KEBNE ,16750232,Thu Dec 2 03:41:09 CET,Thu Dec 2 05:18:59 CET,0.0 2.239 2.99 3.565 4.039 4.437 4.802 5.131 5.714 5.988 6.256 6.546 7.003 7.234 7.67 8.104 8.505 8.686 9.029 9.351 9.806 10.108 10.414 10.848 11.246 11.632 12.023 12.399 12.869 13.34 13.784 14.302 14.813 15.304 15.876 16.54 17.2 17.944 18.722 19.515 20.338 21.28 22.381 23.451 24.698 26.102 27.681 29.291 31.041 33.07 35.117 36.26 36.506 36.23 35.802 35.283 34.618 33.985 33.449 32.837 32.286 31.771 31.254 30.768 30.3 29.838 29.372 28.943 28.542 28.142 27.745 27.401 27.016 26.618 26.308 25.99 25.658 25.297 24.917 24.649 24.365 23.923 23.581 23.188 22.987 22.591 22.202 21.769 21.542 21.123 20.851 20.571 20.271 19.631 19.263 18.838 18.378 17.848 17.175 16.123 12.799 -4 ,9794 ,KEBNE ,16750233,Thu Dec 2 03:41:09 CET,Thu Dec 2 05:17:29 CET,0.0 1.82 2.526 3.05 3.503 3.917 4.291 4.611 5.158 5.418 5.682 5.981 6.435 6.64 7.015 7.38 7.729 7.894 8.218 8.536 8.978 9.257 9.529 9.924 10.31 10.68 11.042 11.396 11.83 12.243 12.647 13.134 13.611 14.071 14.569 15.127 15.68 16.278 16.913 17.585 18.299 19.107 20.054 21.0 22.094 23.3 24.633 26.066 27.7 29.545 31.452 32.698 33.128 33.183 33.044 32.745 32.405 32.029 31.622 31.195 30.811 30.427 30.034 29.657 29.307 28.982 28.594 28.23 27.914 27.569 27.211 26.901 26.567 26.219 25.925 25.614 25.314 24.993 24.631 24.386 24.135 23.71 23.397 23.058 22.872 22.447 21.996 21.517 21.266 20.827 20.54 20.252 19.949 19.302 18.934 18.509 18.022 17.449 16.68 15.629 12.472 -5 ,4626 ,KEBNE ,16750234,Thu Dec 2 03:41:09 CET,Thu Dec 2 05:19:18 CET,0.0 2.078 2.94 3.52 3.952 4.334 4.683 4.996 5.595 5.887 6.179 6.494 6.947 7.167 7.592 7.993 8.36 8.533 8.874 9.21 9.69 10.003 10.327 10.805 11.267 11.702 12.099 12.472 12.944 13.408 13.844 14.364 14.893 15.402 15.981 16.617 17.237 17.939 18.671 19.446 20.298 21.263 22.333 23.39 24.661 26.08 27.67 29.383 31.258 33.236 35.182 36.181 36.278 36.044 35.657 35.193 34.64 34.024 33.474 32.874 32.304 31.791 31.302 30.817 30.337 29.894 29.424 29.006 28.638 28.232 27.795 27.441 27.06 26.638 26.314 25.988 25.646 25.268 24.876 24.611 24.343 23.904 23.569 23.208 23.005 22.57 22.111 21.597 21.319 20.83 20.413 20.081 19.723 18.901 18.442 17.918 17.313 16.631 15.824 14.671 11.324 -6 ,13131 ,KEBNE ,16750235,Thu Dec 2 03:41:09 CET,Thu Dec 2 05:18:38 CET,0.0 1.924 2.755 3.415 3.966 4.439 4.852 5.227 5.893 6.207 6.493 6.753 7.186 7.404 7.816 8.204 8.583 8.763 9.119 9.465 9.939 10.236 10.526 10.965 11.399 11.817 12.207 12.572 13.044 13.508 13.959 14.504 15.014 15.52 16.133 16.816 17.467 18.15 18.86 19.625 20.446 21.363 22.449 23.549 24.811 26.221 27.808 29.484 31.304 33.261 35.441 36.721 36.826 36.572 36.133 35.554 35.026 34.51 34.004 33.474 32.976 32.51 32.044 31.575 31.122 30.703 30.255 29.83 29.462 29.082 28.672 28.321 27.939 27.535 27.217 26.854 26.455 26.028 25.559 25.243 24.956 24.521 24.198 23.842 23.64 23.208 22.731 22.211 21.949 21.468 21.079 20.799 20.489 19.764 19.381 18.968 18.472 17.868 17.147 16.147 12.931 -7 ,24218 ,KEBNE ,16750236,Thu Dec 2 03:42:12 CET,Thu Dec 2 05:18:32 CET,0.0 2.091 2.952 3.625 4.171 4.665 5.112 5.51 6.167 6.456 6.743 7.068 7.539 7.785 8.272 8.715 9.121 9.321 9.717 10.114 10.671 11.005 11.337 11.817 12.26 12.69 13.086 13.455 13.924 14.376 14.818 15.371 15.911 16.423 17.012 17.671 18.281 18.97 19.732 20.528 21.381 22.336 23.428 24.512 25.758 27.095 28.619 30.372 32.383 34.491 36.414 37.405 37.606 37.424 36.994 36.446 35.901 35.331 34.794 34.273 33.75 33.189 32.667 32.204 31.767 31.352 30.901 30.444 30.032 29.629 29.219 28.873 28.499 28.12 27.824 27.516 27.17 26.788 26.41 26.153 25.878 25.427 25.114 24.786 24.608 24.237 23.845 23.429 23.198 22.726 22.292 21.956 21.611 20.818 20.36 19.838 19.241 18.542 17.711 16.622 12.832 -8 ,7158 ,KEBNE ,16750237,Thu Dec 2 03:47:27 CET,Thu Dec 2 05:26:40 CET,0.0 1.825 2.574 3.128 3.606 4.013 4.377 4.708 5.305 5.577 5.832 6.087 6.528 6.747 7.163 7.572 7.956 8.139 8.488 8.82 9.302 9.624 9.955 10.434 10.882 11.292 11.681 12.066 12.557 13.019 13.461 13.993 14.497 14.986 15.576 16.24 16.87 17.563 18.284 19.024 19.8 20.733 21.83 22.931 24.226 25.628 27.217 28.947 30.88 32.881 34.777 35.717 35.801 35.555 35.114 34.546 34.023 33.467 32.907 32.339 31.824 31.36 30.87 30.372 29.908 29.459 28.983 28.565 28.202 27.81 27.393 27.041 26.653 26.227 25.891 25.545 25.188 24.821 24.43 24.141 23.847 23.399 23.081 22.747 22.576 22.196 21.768 21.316 21.083 20.631 20.298 20.007 19.685 18.947 18.484 17.958 17.416 16.801 16.004 14.893 11.104 -9 ,21325 ,KEBNE ,16750238,Thu Dec 2 03:49:35 CET,Thu Dec 2 05:26:06 CET,0.0 2.008 2.717 3.308 3.79 4.197 4.545 4.873 5.491 5.77 6.019 6.282 6.731 6.947 7.356 7.768 8.155 8.332 8.672 9.005 9.491 9.808 10.117 10.552 10.96 11.354 11.742 12.116 12.591 13.046 13.49 14.032 14.567 15.081 15.66 16.311 16.936 17.617 18.381 19.199 20.031 20.97 22.049 23.13 24.402 25.785 27.374 29.11 30.985 32.974 34.85 35.97 36.205 35.944 35.507 35.018 34.54 33.984 33.42 32.857 32.358 31.875 31.367 30.874 30.425 30.02 29.571 29.14 28.778 28.383 27.962 27.635 27.283 26.885 26.575 26.266 25.935 25.572 25.172 24.891 24.61 24.146 23.816 23.483 23.298 22.899 22.483 22.012 21.748 21.261 20.867 20.551 20.22 19.516 19.138 18.724 18.215 17.598 16.819 15.763 12.464 -10 ,4936 ,KEBNE ,16750239,Thu Dec 2 03:51:47 CET,Thu Dec 2 05:29:39 CET,0.0 2.068 2.777 3.329 3.79 4.236 4.659 5.027 5.681 5.978 6.232 6.5 6.934 7.136 7.554 7.956 8.331 8.518 8.873 9.21 9.704 10.014 10.296 10.705 11.12 11.524 11.905 12.276 12.76 13.234 13.683 14.217 14.735 15.249 15.842 16.502 17.126 17.791 18.514 19.301 20.127 21.046 22.127 23.201 24.413 25.747 27.242 28.934 30.854 32.843 34.833 35.955 36.081 35.787 35.329 34.778 34.218 33.664 33.177 32.647 32.132 31.64 31.156 30.673 30.225 29.82 29.384 28.979 28.624 28.235 27.815 27.471 27.106 26.721 26.405 26.096 25.765 25.401 25.007 24.725 24.455 24.01 23.691 23.377 23.209 22.833 22.425 21.979 21.751 21.299 20.912 20.578 20.221 19.436 18.986 18.484 17.898 17.236 16.422 15.298 12.111 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 8c58821a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24007 ,KEBNE ,17028363,Wed Dec 22 19:59:58 CET,Wed Dec 22 21:42:22 CET,0.0 1.992 2.684 3.173 3.561 3.905 4.22 4.503 5.05 5.314 5.559 5.77 6.184 6.379 6.749 7.088 7.413 7.572 7.872 8.164 8.576 8.838 9.09 9.452 9.796 10.13 10.469 10.795 11.213 11.608 11.979 12.431 12.867 13.277 13.762 14.317 14.845 15.415 16.016 16.639 17.291 18.053 18.92 19.76 20.679 21.665 22.765 23.92 25.171 26.388 27.383 27.439 26.793 25.967 25.131 24.269 23.47 22.685 22.023 21.489 21.058 20.635 20.191 19.768 19.391 19.038 18.636 18.268 17.946 17.59 17.215 16.908 16.581 16.239 15.978 15.693 15.385 15.059 14.706 14.469 14.222 13.821 13.523 13.209 13.045 12.692 12.335 11.95 11.744 11.316 11.059 10.794 10.509 9.927 9.575 9.178 8.755 8.25 7.638 6.801 3.837 -2 ,10615 ,KEBNE ,17028364,Wed Dec 22 19:59:56 CET,Wed Dec 22 21:37:46 CET,0.0 1.821 2.546 3.03 3.436 3.787 4.083 4.378 4.96 5.214 5.439 5.643 6.06 6.256 6.62 6.954 7.315 7.508 7.864 8.175 8.599 8.859 9.112 9.484 9.838 10.179 10.505 10.819 11.228 11.63 12.018 12.485 12.921 13.335 13.83 14.391 14.935 15.527 16.142 16.782 17.437 18.162 19.008 19.84 20.764 21.753 22.814 23.919 25.121 26.451 27.591 27.597 27.03 26.312 25.466 24.572 23.749 22.943 22.221 21.461 20.757 20.112 19.498 18.954 18.418 17.9 17.388 16.922 16.502 16.065 15.597 15.2 14.774 14.316 13.969 13.613 13.234 12.847 12.442 12.157 11.858 11.385 11.043 10.684 10.509 10.127 9.71 9.284 9.064 8.613 8.299 8.024 7.737 7.116 6.76 6.336 5.792 5.137 4.359 3.312 0.515 -3 ,885 ,KEBNE ,17028365,Wed Dec 22 19:59:55 CET,Wed Dec 22 21:36:14 CET,0.0 1.729 2.391 2.852 3.278 3.654 3.978 4.267 4.741 4.951 5.152 5.297 5.69 5.865 6.193 6.497 6.783 6.915 7.163 7.398 7.748 7.981 8.194 8.486 8.761 9.024 9.296 9.574 9.919 10.234 10.539 10.901 11.251 11.593 11.99 12.422 12.848 13.387 14.003 14.652 15.306 16.026 16.854 17.676 18.635 19.667 20.754 21.93 23.169 24.325 25.24 25.262 24.726 23.967 23.147 22.272 21.434 20.638 19.892 19.122 18.45 17.84 17.252 16.653 16.087 15.564 15.021 14.538 14.103 13.658 13.182 12.773 12.348 11.914 11.581 11.239 10.872 10.469 10.038 9.747 9.452 8.969 8.643 8.304 8.121 7.735 7.308 6.86 6.625 6.154 5.835 5.567 5.267 4.616 4.259 3.859 3.418 2.908 2.266 1.412 -1.649 -4 ,31176 ,KEBNE ,17028366,Wed Dec 22 19:59:55 CET,Wed Dec 22 21:37:28 CET,0.0 1.686 2.327 2.771 3.156 3.539 3.913 4.236 4.791 5.045 5.276 5.478 5.889 6.074 6.43 6.776 7.102 7.263 7.574 7.874 8.305 8.573 8.817 9.216 9.638 10.012 10.348 10.662 11.068 11.464 11.846 12.295 12.724 13.145 13.63 14.175 14.716 15.299 15.912 16.557 17.241 18.01 18.852 19.67 20.592 21.584 22.712 23.921 25.096 26.193 27.118 27.118 26.56 25.788 24.888 23.992 23.144 22.305 21.546 20.762 20.096 19.519 18.954 18.384 17.825 17.307 16.749 16.244 15.816 15.374 14.91 14.517 14.097 13.65 13.307 12.949 12.569 12.162 11.736 11.459 11.164 10.674 10.346 10.01 9.817 9.379 8.914 8.4 8.125 7.651 7.361 7.088 6.778 6.091 5.678 5.201 4.682 4.086 3.34 2.362 -0.775 -5 ,28993 ,KEBNE ,17028367,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:37:17 CET,0.0 1.623 2.24 2.699 3.065 3.393 3.695 3.966 4.472 4.7 4.907 5.059 5.448 5.614 5.914 6.2 6.473 6.607 6.865 7.106 7.439 7.647 7.859 8.174 8.465 8.752 9.025 9.277 9.596 9.91 10.219 10.582 10.933 11.272 11.642 12.048 12.44 12.859 13.303 13.783 14.295 14.863 15.495 16.101 16.783 17.524 18.377 19.273 20.189 21.119 21.962 22.233 22.017 21.593 21.073 20.506 19.941 19.375 18.866 18.337 17.856 17.425 16.998 16.605 16.243 15.88 15.479 15.108 14.777 14.424 14.055 13.741 13.386 13.006 12.694 12.385 12.087 11.738 11.364 11.11 10.854 10.459 10.179 9.885 9.731 9.405 9.052 8.662 8.457 8.039 7.787 7.545 7.282 6.641 6.288 5.912 5.479 4.98 4.34 3.475 0.75 -6 ,16174 ,KEBNE ,17028368,Wed Dec 22 19:59:56 CET,Wed Dec 22 21:35:53 CET,0.0 1.608 2.319 2.865 3.298 3.675 4.022 4.34 4.904 5.175 5.416 5.595 5.993 6.162 6.485 6.81 7.138 7.298 7.604 7.884 8.239 8.457 8.678 8.981 9.259 9.537 9.81 10.066 10.4 10.718 11.017 11.379 11.723 12.049 12.42 12.832 13.219 13.629 14.071 14.545 15.034 15.582 16.213 16.837 17.519 18.206 18.968 19.817 20.76 21.713 22.496 22.625 22.359 21.953 21.441 20.868 20.312 19.782 19.297 18.79 18.33 17.895 17.479 17.086 16.688 16.321 15.947 15.584 15.256 14.895 14.524 14.218 13.886 13.548 13.282 12.996 12.7 12.397 12.064 11.827 11.59 11.21 10.923 10.619 10.464 10.141 9.794 9.423 9.226 8.798 8.534 8.277 8.009 7.424 7.089 6.696 6.248 5.712 5.011 4.061 1.264 -7 ,26173 ,KEBNE ,17028369,Wed Dec 22 19:59:55 CET,Wed Dec 22 21:38:02 CET,0.0 1.433 2.129 2.683 3.131 3.507 3.839 4.143 4.705 4.956 5.181 5.398 5.832 6.037 6.419 6.779 7.1 7.239 7.498 7.738 8.068 8.284 8.5 8.804 9.09 9.385 9.69 9.986 10.352 10.677 10.969 11.322 11.658 11.98 12.358 12.783 13.189 13.615 14.061 14.54 15.039 15.601 16.234 16.829 17.502 18.242 19.072 19.945 20.882 21.812 22.58 22.793 22.577 22.188 21.741 21.265 20.772 20.273 19.817 19.321 18.852 18.399 17.923 17.479 17.08 16.719 16.334 15.972 15.645 15.302 14.945 14.634 14.307 13.961 13.682 13.386 13.078 12.771 12.441 12.213 11.98 11.587 11.307 11.015 10.865 10.548 10.189 9.791 9.595 9.187 8.947 8.698 8.434 7.829 7.503 7.127 6.677 6.145 5.446 4.553 2.058 -8 ,31392 ,KEBNE ,17028370,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:39:23 CET,0.0 2.184 2.859 3.386 3.846 4.245 4.61 4.936 5.497 5.765 6.024 6.273 6.711 6.916 7.308 7.653 7.944 8.077 8.324 8.558 8.902 9.126 9.334 9.625 9.906 10.216 10.546 10.861 11.249 11.573 11.854 12.197 12.53 12.858 13.234 13.637 14.032 14.466 14.921 15.409 15.897 16.419 17.044 17.668 18.349 19.068 19.868 20.699 21.565 22.458 23.275 23.508 23.281 22.877 22.356 21.732 21.167 20.667 20.192 19.681 19.229 18.804 18.391 17.984 17.598 17.253 16.865 16.493 16.171 15.837 15.471 15.161 14.84 14.494 14.219 13.936 13.632 13.31 12.977 12.739 12.489 12.072 11.769 11.467 11.315 10.967 10.539 10.076 9.818 9.34 9.004 8.694 8.373 7.695 7.315 6.855 6.328 5.757 5.033 4.034 1.186 -9 ,26616 ,KEBNE ,17028371,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:36:16 CET,0.0 1.55 2.24 2.754 3.147 3.485 3.778 4.038 4.492 4.699 4.902 5.055 5.454 5.636 5.964 6.253 6.544 6.684 6.934 7.187 7.554 7.775 7.991 8.304 8.6 8.884 9.149 9.398 9.724 10.038 10.346 10.715 11.052 11.392 11.805 12.258 12.67 13.092 13.533 13.997 14.496 15.054 15.679 16.296 16.99 17.723 18.518 19.357 20.408 21.64 22.609 22.71 22.092 21.278 20.453 19.59 18.758 17.984 17.299 16.557 15.862 15.226 14.61 14.033 13.508 13.014 12.494 12.009 11.571 11.115 10.62 10.215 9.797 9.342 8.986 8.616 8.229 7.817 7.371 7.076 6.79 6.341 5.995 5.6 5.4 4.981 4.528 4.068 3.817 3.324 2.943 2.656 2.381 1.749 1.391 1.0 0.543 0.001 -0.642 -1.538 -4.571 -10 ,20966 ,KEBNE ,17028372,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:36:20 CET,0.0 1.925 2.66 3.238 3.716 4.142 4.514 4.818 5.35 5.618 5.874 6.138 6.58 6.778 7.14 7.478 7.805 7.979 8.327 8.656 9.137 9.422 9.674 10.043 10.392 10.744 11.092 11.429 11.865 12.285 12.689 13.15 13.571 13.982 14.462 14.997 15.517 16.082 16.673 17.305 17.982 18.727 19.587 20.421 21.346 22.354 23.452 24.646 25.894 27.016 27.915 28.027 27.586 26.83 25.993 25.178 24.355 23.561 22.857 22.083 21.39 20.78 20.185 19.621 19.08 18.561 18.017 17.537 17.111 16.645 16.165 15.775 15.361 14.913 14.561 14.182 13.774 13.36 12.938 12.651 12.355 11.898 11.585 11.257 11.079 10.701 10.302 9.889 9.669 9.227 8.938 8.648 8.341 7.682 7.299 6.887 6.434 5.895 5.239 4.377 1.296 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index 47ba2dd8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7912 ,KEBNE ,17028373,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:35:46 CET,0.0 1.022 1.607 2.071 2.487 2.844 3.16 3.454 3.987 4.234 4.468 4.697 5.141 5.342 5.703 6.05 6.386 6.542 6.849 7.15 7.588 7.869 8.155 8.575 8.972 9.357 9.717 10.06 10.495 10.902 11.309 11.788 12.221 12.648 13.161 13.75 14.312 14.927 15.58 16.261 16.975 17.811 18.8 19.76 20.884 22.153 23.606 25.2 27.037 29.207 31.588 33.138 33.84 34.134 34.141 33.985 33.771 33.493 33.196 32.866 32.537 32.198 31.864 31.565 31.271 30.972 30.649 30.367 30.115 29.823 29.502 29.223 28.932 28.633 28.393 28.137 27.833 27.504 27.185 26.967 26.743 26.407 26.162 25.894 25.761 25.473 25.163 24.826 24.636 24.228 23.925 23.66 23.384 22.75 22.383 21.986 21.556 21.055 20.468 19.579 15.396 -2 ,27915 ,KEBNE ,17028374,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:35:52 CET,0.0 1.451 2.056 2.487 2.837 3.152 3.445 3.717 4.192 4.406 4.625 4.801 5.207 5.387 5.763 6.141 6.5 6.668 6.973 7.249 7.66 7.933 8.188 8.575 8.955 9.299 9.626 9.945 10.366 10.784 11.189 11.661 12.105 12.549 13.073 13.637 14.191 14.818 15.471 16.159 16.896 17.711 18.654 19.599 20.705 21.965 23.44 25.094 26.988 29.185 31.72 33.576 34.466 34.883 35.027 35.034 34.934 34.725 34.501 34.213 33.895 33.598 33.329 33.036 32.719 32.442 32.136 31.829 31.555 31.281 30.978 30.706 30.43 30.135 29.902 29.644 29.34 29.01 28.684 28.471 28.238 27.824 27.532 27.229 27.072 26.728 26.348 25.95 25.74 25.317 25.013 24.735 24.465 23.87 23.513 23.115 22.661 22.141 21.493 20.618 18.538 -3 ,18047 ,KEBNE ,17028375,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:37:00 CET,0.0 1.375 1.935 2.354 2.709 3.023 3.296 3.546 4.014 4.246 4.485 4.726 5.161 5.351 5.705 6.034 6.355 6.512 6.803 7.076 7.476 7.727 7.976 8.37 8.758 9.11 9.431 9.739 10.15 10.594 11.038 11.542 11.997 12.432 12.932 13.486 14.045 14.658 15.307 15.993 16.713 17.53 18.509 19.515 20.655 21.898 23.362 25.029 26.96 29.199 31.787 33.651 34.515 34.883 34.963 34.915 34.802 34.613 34.383 34.119 33.869 33.618 33.348 33.052 32.77 32.482 32.129 31.785 31.511 31.245 30.955 30.693 30.365 29.997 29.717 29.425 29.117 28.816 28.517 28.313 28.103 27.728 27.426 27.103 26.937 26.592 26.215 25.785 25.567 25.144 24.838 24.559 24.28 23.642 23.283 22.901 22.428 21.905 21.304 20.458 18.431 -4 ,16708 ,KEBNE ,17028376,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:37:23 CET,0.0 1.316 1.963 2.468 2.897 3.281 3.586 3.844 4.323 4.536 4.729 4.866 5.269 5.448 5.787 6.12 6.446 6.597 6.897 7.19 7.61 7.888 8.159 8.538 8.893 9.24 9.572 9.895 10.316 10.715 11.1 11.555 11.988 12.414 12.906 13.458 14.009 14.618 15.27 15.96 16.677 17.494 18.474 19.456 20.608 21.896 23.394 25.069 26.945 29.121 31.607 33.468 34.404 34.817 34.959 34.959 34.837 34.596 34.338 34.064 33.768 33.462 33.162 32.871 32.592 32.334 32.027 31.719 31.461 31.189 30.895 30.649 30.372 30.066 29.807 29.525 29.244 28.935 28.573 28.32 28.056 27.619 27.322 27.017 26.852 26.521 26.199 25.857 25.665 25.276 25.071 24.822 24.542 23.929 23.595 23.221 22.815 22.379 21.819 20.938 18.267 -5 ,7121 ,KEBNE ,17028377,Wed Dec 22 19:59:55 CET,Wed Dec 22 21:37:18 CET,0.0 1.524 2.195 2.729 3.166 3.542 3.886 4.222 4.821 5.074 5.299 5.464 5.879 6.058 6.391 6.704 7.002 7.153 7.473 7.784 8.197 8.461 8.712 9.067 9.41 9.742 10.071 10.393 10.79 11.173 11.559 12.017 12.464 12.9 13.396 13.979 14.539 15.143 15.811 16.514 17.245 18.075 19.053 20.031 21.156 22.424 23.875 25.464 27.308 29.572 32.222 34.123 35.01 35.429 35.567 35.507 35.377 35.201 34.97 34.69 34.423 34.165 33.88 33.574 33.281 33.012 32.726 32.447 32.193 31.899 31.587 31.345 31.081 30.777 30.54 30.285 29.983 29.649 29.292 29.048 28.785 28.355 28.062 27.76 27.603 27.28 26.908 26.495 26.286 25.882 25.681 25.463 25.213 24.629 24.307 23.955 23.554 23.087 22.507 21.675 19.326 -6 ,27606 ,KEBNE ,17028378,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:37:40 CET,0.0 1.21 1.743 2.149 2.483 2.813 3.128 3.408 3.895 4.108 4.312 4.48 4.899 5.083 5.431 5.754 6.071 6.234 6.537 6.808 7.201 7.461 7.717 8.115 8.511 8.867 9.191 9.523 9.954 10.363 10.76 11.237 11.687 12.113 12.608 13.156 13.693 14.3 14.963 15.67 16.4 17.216 18.206 19.201 20.304 21.549 23.027 24.695 26.645 28.859 31.42 33.313 34.195 34.656 34.84 34.817 34.692 34.478 34.218 33.954 33.688 33.402 33.119 32.814 32.493 32.217 31.94 31.653 31.361 31.042 30.691 30.387 30.071 29.74 29.483 29.219 28.962 28.688 28.379 28.172 27.942 27.532 27.234 26.908 26.731 26.368 25.989 25.583 25.369 24.948 24.675 24.411 24.127 23.509 23.149 22.765 22.376 21.938 21.373 20.563 17.578 -7 ,2915 ,KEBNE ,17028379,Wed Dec 22 19:59:54 CET,Wed Dec 22 21:37:02 CET,0.0 1.377 2.106 2.632 3.045 3.419 3.755 4.048 4.53 4.747 4.955 5.124 5.539 5.72 6.061 6.389 6.713 6.875 7.184 7.469 7.877 8.145 8.402 8.763 9.114 9.446 9.778 10.102 10.51 10.911 11.29 11.742 12.208 12.645 13.14 13.719 14.289 14.909 15.558 16.259 17.003 17.847 18.844 19.836 20.989 22.275 23.747 25.372 27.273 29.504 32.082 33.942 34.839 35.224 35.327 35.304 35.164 34.961 34.735 34.453 34.171 33.874 33.556 33.259 32.951 32.637 32.306 32.014 31.774 31.487 31.14 30.858 30.561 30.25 30.015 29.763 29.476 29.155 28.81 28.564 28.325 27.961 27.67 27.35 27.186 26.846 26.457 26.025 25.812 25.4 25.128 24.873 24.604 23.991 23.636 23.239 22.786 22.248 21.605 20.766 18.358 -8 ,8358 ,KEBNE ,17028380,Wed Dec 22 19:59:55 CET,Wed Dec 22 21:37:40 CET,0.0 1.204 1.837 2.346 2.742 3.037 3.315 3.59 4.08 4.295 4.501 4.67 5.082 5.271 5.627 5.955 6.279 6.438 6.726 6.994 7.393 7.657 7.929 8.32 8.668 8.999 9.319 9.631 10.035 10.449 10.853 11.318 11.766 12.2 12.717 13.275 13.797 14.385 15.051 15.746 16.452 17.273 18.224 19.176 20.308 21.553 22.997 24.65 26.573 28.83 31.368 33.195 34.082 34.486 34.623 34.567 34.406 34.183 33.93 33.645 33.36 33.083 32.803 32.5 32.204 31.931 31.629 31.327 31.066 30.802 30.491 30.223 29.936 29.621 29.387 29.149 28.891 28.616 28.307 28.064 27.81 27.435 27.179 26.913 26.776 26.475 26.13 25.773 25.593 25.205 24.969 24.721 24.479 23.917 23.581 23.224 22.845 22.408 21.84 21.015 18.583 -9 ,24605 ,KEBNE ,17028381,Wed Dec 22 19:59:55 CET,Wed Dec 22 21:36:21 CET,0.0 1.315 1.884 2.296 2.655 2.995 3.297 3.563 4.049 4.283 4.509 4.709 5.145 5.34 5.682 6.026 6.346 6.491 6.782 7.093 7.55 7.828 8.099 8.469 8.811 9.143 9.463 9.787 10.201 10.594 10.979 11.44 11.892 12.319 12.799 13.37 13.92 14.507 15.153 15.836 16.549 17.363 18.33 19.3 20.432 21.707 23.182 24.852 26.8 29.014 31.493 33.343 34.241 34.589 34.682 34.695 34.568 34.292 34.008 33.711 33.436 33.184 32.917 32.642 32.37 32.088 31.746 31.408 31.1 30.798 30.505 30.242 29.965 29.683 29.455 29.209 28.939 28.648 28.348 28.139 27.917 27.545 27.266 26.943 26.772 26.421 26.038 25.621 25.411 24.988 24.684 24.439 24.21 23.661 23.305 22.897 22.418 21.898 21.299 20.487 17.756 -10 ,14195 ,KEBNE ,17028382,Wed Dec 22 19:59:55 CET,Wed Dec 22 21:37:44 CET,0.0 1.451 2.044 2.454 2.848 3.24 3.602 3.936 4.522 4.783 5.021 5.24 5.688 5.898 6.307 6.704 7.06 7.212 7.494 7.782 8.224 8.518 8.781 9.151 9.529 9.912 10.272 10.597 11.016 11.417 11.802 12.268 12.715 13.151 13.666 14.243 14.779 15.359 16.014 16.729 17.473 18.316 19.322 20.313 21.437 22.699 24.14 25.766 27.675 29.921 32.492 34.419 35.34 35.723 35.842 35.811 35.687 35.497 35.278 35.012 34.749 34.463 34.167 33.893 33.602 33.311 32.997 32.712 32.453 32.161 31.864 31.604 31.313 31.025 30.801 30.55 30.29 30.021 29.734 29.523 29.29 28.914 28.652 28.364 28.202 27.852 27.466 27.048 26.827 26.398 26.144 25.907 25.669 25.166 24.856 24.478 24.041 23.514 22.884 22.049 20.231 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt deleted file mode 100644 index e80332e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22438 ,KEBNE ,16750240,Thu Dec 2 03:57:02 CET,Thu Dec 2 05:33:18 CET,0.0 1.601 2.319 2.876 3.339 3.751 4.108 4.437 5.047 5.31 5.566 5.85 6.305 6.52 6.927 7.31 7.679 7.86 8.19 8.494 8.928 9.197 9.458 9.836 10.196 10.549 10.89 11.206 11.621 12.036 12.438 12.913 13.386 13.842 14.317 14.785 15.193 15.628 16.092 16.58 17.088 17.631 18.257 18.89 19.582 20.301 21.076 21.878 22.654 23.354 23.847 23.666 23.053 22.272 21.5 20.744 19.984 19.221 18.542 17.864 17.288 16.754 16.209 15.696 15.231 14.799 14.321 13.892 13.517 13.12 12.72 12.379 12.018 11.642 11.341 11.029 10.707 10.356 9.994 9.751 9.499 9.094 8.804 8.506 8.348 7.986 7.586 7.157 6.919 6.456 6.184 5.919 5.631 4.994 4.615 4.21 3.786 3.245 2.616 1.774 -0.171 -2 ,26661 ,KEBNE ,16750241,Thu Dec 2 04:02:31 CET,Thu Dec 2 05:34:04 CET,0.0 1.249 1.799 2.221 2.589 2.922 3.243 3.568 4.155 4.423 4.68 4.932 5.385 5.605 5.994 6.334 6.656 6.804 7.1 7.411 7.839 8.083 8.313 8.643 8.954 9.253 9.539 9.801 10.136 10.473 10.803 11.218 11.609 11.962 12.367 12.81 13.232 13.68 14.139 14.627 15.13 15.679 16.305 16.921 17.634 18.391 19.202 20.031 20.871 21.685 22.239 22.037 21.401 20.649 19.896 19.075 18.282 17.565 16.897 16.219 15.65 15.125 14.616 14.122 13.668 13.243 12.762 12.336 11.979 11.574 11.109 10.717 10.296 9.851 9.517 9.17 8.802 8.437 8.056 7.769 7.477 7.043 6.722 6.362 6.177 5.791 5.395 5.015 4.81 4.359 4.083 3.816 3.533 2.902 2.539 2.116 1.658 1.18 0.575 -0.248 -1.998 -3 ,5665 ,KEBNE ,16750242,Thu Dec 2 04:04:35 CET,Thu Dec 2 05:41:35 CET,0.0 1.392 1.999 2.488 2.883 3.195 3.447 3.7 4.155 4.358 4.567 4.719 5.114 5.278 5.593 5.889 6.184 6.339 6.638 6.924 7.34 7.605 7.851 8.198 8.541 8.86 9.156 9.443 9.795 10.095 10.381 10.751 11.11 11.449 11.839 12.263 12.658 13.101 13.577 14.066 14.564 15.13 15.776 16.39 17.085 17.841 18.656 19.481 20.294 21.05 21.554 21.46 21.03 20.431 19.745 19.032 18.351 17.684 17.084 16.449 15.895 15.404 14.903 14.397 13.94 13.499 12.998 12.574 12.216 11.84 11.449 11.117 10.766 10.398 10.094 9.758 9.407 9.051 8.659 8.367 8.064 7.6 7.274 6.924 6.757 6.437 6.1 5.731 5.514 5.06 4.781 4.536 4.284 3.66 3.291 2.896 2.46 1.969 1.429 0.705 -1.771 -4 ,1054 ,KEBNE ,16750243,Thu Dec 2 04:11:04 CET,Thu Dec 2 05:42:29 CET,0.0 1.336 1.927 2.363 2.721 3.038 3.333 3.589 4.077 4.324 4.57 4.832 5.289 5.508 5.92 6.301 6.659 6.849 7.217 7.554 8.042 8.349 8.628 9.016 9.383 9.741 10.075 10.371 10.745 11.095 11.414 11.787 12.151 12.506 12.919 13.364 13.8 14.275 14.74 15.207 15.71 16.286 16.927 17.566 18.285 19.031 19.821 20.654 21.529 22.302 22.756 22.579 22.009 21.262 20.52 19.781 19.1 18.437 17.798 17.122 16.523 16.002 15.503 15.03 14.563 14.116 13.656 13.237 12.867 12.477 12.059 11.717 11.36 10.953 10.623 10.278 9.917 9.542 9.16 8.907 8.634 8.154 7.81 7.455 7.266 6.891 6.517 6.133 5.927 5.47 5.183 4.907 4.617 3.993 3.645 3.26 2.829 2.322 1.735 0.994 -1.871 -5 ,1273 ,KEBNE ,16750244,Thu Dec 2 04:20:38 CET,Thu Dec 2 05:56:57 CET,0.0 1.265 1.746 2.122 2.443 2.739 3.021 3.28 3.735 3.925 4.109 4.274 4.705 4.908 5.279 5.626 5.953 6.102 6.362 6.599 6.948 7.173 7.38 7.688 7.986 8.264 8.527 8.773 9.086 9.397 9.702 10.051 10.375 10.698 11.081 11.507 11.907 12.336 12.804 13.307 13.817 14.373 15.01 15.636 16.313 17.035 17.829 18.627 19.495 20.299 20.826 20.771 20.322 19.698 19.008 18.308 17.662 17.024 16.429 15.831 15.303 14.82 14.355 13.893 13.435 13.003 12.552 12.146 11.792 11.427 11.043 10.715 10.373 10.014 9.729 9.436 9.123 8.787 8.436 8.203 7.961 7.521 7.2 6.9 6.752 6.437 6.09 5.718 5.526 5.107 4.86 4.594 4.303 3.678 3.334 2.931 2.477 1.966 1.355 0.5 -1.657 -6 ,26730 ,KEBNE ,16750245,Thu Dec 2 04:20:37 CET,Thu Dec 2 05:57:00 CET,0.0 1.207 1.663 2.048 2.428 2.76 3.037 3.278 3.68 3.865 4.061 4.218 4.641 4.838 5.207 5.539 5.856 6.005 6.255 6.508 6.891 7.116 7.32 7.619 7.92 8.206 8.47 8.714 9.04 9.36 9.65 10.007 10.359 10.696 11.082 11.5 11.898 12.321 12.778 13.293 13.809 14.354 14.971 15.563 16.24 16.95 17.715 18.528 19.364 20.108 20.554 20.375 19.864 19.221 18.514 17.82 17.179 16.556 16.003 15.437 14.913 14.42 13.931 13.44 12.963 12.527 12.08 11.672 11.314 10.939 10.547 10.226 9.893 9.524 9.234 8.936 8.618 8.285 7.924 7.669 7.405 7.003 6.726 6.429 6.263 5.898 5.511 5.126 4.926 4.492 4.219 3.959 3.687 3.098 2.786 2.442 2.067 1.613 1.03 0.281 -2.071 -7 ,15615 ,KEBNE ,16750246,Thu Dec 2 04:20:37 CET,Thu Dec 2 05:57:18 CET,0.0 1.396 1.964 2.404 2.768 3.063 3.312 3.547 3.985 4.193 4.389 4.506 4.888 5.045 5.356 5.661 5.948 6.078 6.317 6.549 6.896 7.119 7.343 7.673 7.971 8.247 8.511 8.758 9.077 9.395 9.703 10.07 10.419 10.751 11.13 11.555 11.965 12.42 12.896 13.4 13.923 14.474 15.082 15.672 16.35 17.075 17.868 18.69 19.508 20.253 20.785 20.653 20.155 19.499 18.788 18.112 17.451 16.789 16.201 15.592 15.055 14.565 14.077 13.613 13.168 12.744 12.299 11.878 11.482 11.072 10.671 10.352 10.015 9.651 9.373 9.071 8.741 8.39 8.026 7.787 7.534 7.088 6.754 6.405 6.231 5.895 5.542 5.156 4.956 4.539 4.344 4.113 3.867 3.324 2.98 2.579 2.132 1.645 1.07 0.347 -1.477 -8 ,4698 ,KEBNE ,16750247,Thu Dec 2 04:20:37 CET,Thu Dec 2 05:57:35 CET,0.0 1.373 2.04 2.581 3.043 3.422 3.754 4.074 4.626 4.864 5.09 5.273 5.695 5.909 6.35 6.763 7.162 7.35 7.675 7.987 8.438 8.719 9.005 9.443 9.849 10.217 10.566 10.895 11.312 11.722 12.131 12.626 13.076 13.463 13.854 14.272 14.674 15.136 15.63 16.14 16.659 17.207 17.843 18.485 19.214 19.99 20.829 21.655 22.507 23.291 23.734 23.482 22.892 22.154 21.335 20.554 19.839 19.144 18.527 17.9 17.343 16.818 16.279 15.772 15.3 14.855 14.392 13.974 13.612 13.219 12.778 12.377 11.946 11.509 11.16 10.8 10.433 10.06 9.689 9.439 9.172 8.736 8.41 8.054 7.871 7.489 7.077 6.643 6.416 5.965 5.701 5.417 5.12 4.534 4.23 3.899 3.491 2.967 2.352 1.61 -0.228 -9 ,20521 ,KEBNE ,16750248,Thu Dec 2 04:21:42 CET,Thu Dec 2 05:58:20 CET,0.0 1.275 1.907 2.392 2.803 3.155 3.486 3.808 4.36 4.6 4.831 5.04 5.463 5.649 6.019 6.388 6.715 6.851 7.103 7.35 7.731 7.969 8.177 8.49 8.796 9.09 9.366 9.628 9.971 10.291 10.605 10.989 11.341 11.671 12.049 12.471 12.876 13.322 13.785 14.268 14.776 15.324 15.946 16.559 17.23 17.948 18.74 19.563 20.435 21.259 21.86 21.773 21.298 20.675 19.973 19.269 18.604 17.927 17.311 16.693 16.157 15.659 15.144 14.653 14.187 13.722 13.213 12.759 12.358 11.937 11.521 11.19 10.845 10.478 10.183 9.868 9.547 9.224 8.86 8.582 8.295 7.835 7.501 7.157 6.981 6.625 6.282 5.919 5.719 5.298 5.087 4.856 4.612 4.046 3.721 3.36 2.941 2.438 1.863 1.12 -0.897 -10 ,20559 ,KEBNE ,16750249,Thu Dec 2 04:29:06 CET,Thu Dec 2 06:02:24 CET,0.0 1.459 2.149 2.683 3.106 3.479 3.81 4.08 4.517 4.725 4.922 5.054 5.462 5.66 6.041 6.388 6.701 6.851 7.142 7.416 7.826 8.072 8.281 8.578 8.867 9.149 9.418 9.677 10.007 10.324 10.632 11.0 11.346 11.663 12.037 12.454 12.844 13.259 13.698 14.161 14.641 15.187 15.812 16.425 17.095 17.776 18.551 19.409 20.291 21.075 21.573 21.332 20.719 20.032 19.326 18.628 17.987 17.353 16.784 16.181 15.608 15.073 14.531 14.022 13.563 13.141 12.698 12.283 11.904 11.484 11.044 10.708 10.364 10.009 9.727 9.421 9.116 8.802 8.439 8.162 7.864 7.416 7.134 6.848 6.696 6.366 5.999 5.579 5.346 4.896 4.619 4.326 4.025 3.393 3.032 2.644 2.212 1.698 1.074 0.26 -2.154 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt deleted file mode 100644 index cad0a532..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26718 ,KEBNE ,16750250,Thu Dec 2 04:31:12 CET,Thu Dec 2 06:06:02 CET,0.0 1.761 2.467 2.988 3.441 3.822 4.142 4.446 5.029 5.316 5.592 5.857 6.294 6.495 6.878 7.22 7.543 7.709 8.031 8.33 8.761 9.045 9.324 9.723 10.089 10.44 10.787 11.122 11.54 11.933 12.317 12.785 13.242 13.682 14.163 14.702 15.241 15.833 16.459 17.108 17.778 18.551 19.464 20.363 21.388 22.492 23.729 25.072 26.596 28.46 30.445 31.464 31.771 31.735 31.493 31.187 30.85 30.452 30.06 29.62 29.193 28.814 28.443 28.04 27.661 27.266 26.819 26.444 26.116 25.759 25.37 25.033 24.668 24.285 24.006 23.727 23.447 23.167 22.875 22.658 22.427 22.066 21.811 21.552 21.41 21.09 20.722 20.305 20.088 19.679 19.467 19.239 18.998 18.457 18.161 17.832 17.453 17.012 16.508 15.767 13.009 -2 ,1901 ,KEBNE ,16750251,Thu Dec 2 04:32:16 CET,Thu Dec 2 06:07:34 CET,0.0 1.974 2.767 3.363 3.877 4.354 4.755 5.093 5.699 5.982 6.242 6.502 6.954 7.177 7.639 8.048 8.419 8.6 8.956 9.292 9.732 10.004 10.261 10.632 11.002 11.354 11.69 12.034 12.484 12.913 13.323 13.814 14.282 14.737 15.274 15.848 16.372 16.942 17.558 18.239 18.953 19.73 20.597 21.449 22.444 23.546 24.773 26.073 27.552 29.151 30.731 31.64 31.864 31.72 31.382 30.988 30.538 30.043 29.582 29.1 28.683 28.278 27.87 27.48 27.095 26.749 26.373 26.005 25.672 25.312 24.916 24.585 24.259 23.892 23.583 23.259 22.945 22.647 22.333 22.115 21.887 21.486 21.152 20.803 20.635 20.284 19.907 19.523 19.326 18.89 18.598 18.344 18.105 17.637 17.352 17.016 16.661 16.176 15.551 14.807 13.199 -3 ,28897 ,KEBNE ,16750252,Thu Dec 2 04:35:22 CET,Thu Dec 2 06:12:55 CET,0.0 1.634 2.305 2.812 3.253 3.64 3.992 4.328 4.939 5.214 5.477 5.736 6.179 6.398 6.824 7.223 7.603 7.803 8.215 8.585 9.105 9.416 9.696 10.096 10.455 10.808 11.157 11.496 11.934 12.357 12.758 13.225 13.681 14.127 14.639 15.2 15.732 16.33 16.964 17.648 18.364 19.15 20.037 20.892 21.894 22.99 24.203 25.53 27.004 28.632 30.3 31.183 31.3 31.098 30.778 30.367 29.895 29.427 28.99 28.519 28.089 27.672 27.273 26.875 26.447 26.029 25.612 25.259 24.943 24.581 24.185 23.852 23.525 23.187 22.9 22.572 22.227 21.905 21.576 21.332 21.065 20.645 20.327 19.974 19.802 19.45 19.072 18.664 18.431 17.964 17.642 17.353 17.052 16.396 16.007 15.573 15.114 14.611 14.017 13.229 11.652 -4 ,26711 ,KEBNE ,16750253,Thu Dec 2 04:35:22 CET,Thu Dec 2 06:12:25 CET,0.0 1.707 2.461 3.072 3.565 3.988 4.367 4.725 5.395 5.704 5.975 6.227 6.678 6.906 7.364 7.784 8.158 8.337 8.689 9.022 9.505 9.821 10.118 10.558 10.993 11.407 11.805 12.188 12.677 13.154 13.62 14.165 14.701 15.227 15.84 16.523 17.155 17.875 18.632 19.342 20.033 20.787 21.651 22.525 23.518 24.61 25.856 27.2 28.699 30.346 32.055 33.027 33.233 33.099 32.785 32.341 31.856 31.384 30.957 30.464 29.986 29.561 29.149 28.737 28.355 27.993 27.581 27.183 26.819 26.449 26.085 25.791 25.479 25.13 24.846 24.559 24.258 23.95 23.609 23.345 23.094 22.674 22.362 22.051 21.877 21.475 21.051 20.619 20.394 19.95 19.658 19.385 19.089 18.44 18.088 17.712 17.289 16.805 16.211 15.449 11.138 -5 ,6911 ,KEBNE ,16750254,Thu Dec 2 04:35:22 CET,Thu Dec 2 06:12:21 CET,0.0 1.583 2.278 2.882 3.401 3.836 4.218 4.566 5.184 5.459 5.702 5.9 6.333 6.535 6.926 7.284 7.618 7.782 8.106 8.419 8.864 9.161 9.466 9.902 10.29 10.65 10.994 11.323 11.751 12.166 12.575 13.064 13.536 13.989 14.489 15.05 15.588 16.179 16.837 17.531 18.248 19.022 19.891 20.772 21.769 22.846 24.05 25.359 26.872 28.568 30.168 30.884 30.919 30.745 30.441 30.008 29.544 29.105 28.678 28.206 27.769 27.347 26.921 26.503 26.103 25.751 25.388 25.046 24.727 24.355 23.941 23.591 23.229 22.854 22.571 22.297 22.004 21.676 21.336 21.1 20.836 20.413 20.122 19.801 19.629 19.275 18.906 18.506 18.285 17.843 17.56 17.296 17.021 16.387 16.015 15.6 15.14 14.638 14.021 13.222 11.208 -6 ,30503 ,KEBNE ,16750255,Thu Dec 2 04:36:27 CET,Thu Dec 2 06:13:42 CET,0.0 1.47 2.179 2.754 3.261 3.724 4.144 4.528 5.207 5.502 5.781 6.096 6.58 6.83 7.297 7.737 8.139 8.326 8.695 9.039 9.502 9.796 10.064 10.452 10.836 11.207 11.557 11.886 12.319 12.73 13.124 13.622 14.109 14.549 15.049 15.612 16.153 16.736 17.358 18.029 18.721 19.498 20.413 21.317 22.361 23.47 24.681 26.05 27.6 29.234 30.904 31.809 31.965 31.815 31.528 31.141 30.719 30.252 29.746 29.187 28.72 28.286 27.846 27.413 26.983 26.596 26.167 25.743 25.389 25.057 24.725 24.433 24.102 23.767 23.505 23.2 22.869 22.514 22.122 21.823 21.523 21.128 20.865 20.59 20.451 20.155 19.805 19.405 19.211 18.809 18.624 18.416 18.188 17.674 17.348 16.971 16.571 16.113 15.548 14.77 13.07 -7 ,6789 ,KEBNE ,16750256,Thu Dec 2 04:37:32 CET,Thu Dec 2 06:14:44 CET,0.0 1.554 2.16 2.657 3.09 3.475 3.824 4.154 4.778 5.071 5.345 5.633 6.11 6.359 6.833 7.276 7.69 7.891 8.284 8.663 9.201 9.515 9.806 10.244 10.651 11.025 11.388 11.73 12.154 12.547 12.92 13.361 13.794 14.225 14.72 15.281 15.834 16.434 17.057 17.709 18.39 19.174 20.116 21.011 22.027 23.142 24.398 25.785 27.27 28.909 30.614 31.521 31.664 31.43 31.021 30.59 30.126 29.639 29.191 28.7 28.256 27.84 27.417 27.017 26.639 26.268 25.875 25.519 25.194 24.835 24.448 24.125 23.777 23.391 23.083 22.766 22.432 22.057 21.66 21.369 21.037 20.504 20.147 19.812 19.655 19.342 19.007 18.663 18.486 18.086 17.878 17.615 17.308 16.698 16.364 15.989 15.592 15.138 14.549 13.752 11.694 -8 ,3111 ,KEBNE ,16750257,Thu Dec 2 04:37:32 CET,Thu Dec 2 06:14:41 CET,0.0 1.683 2.477 3.055 3.526 3.934 4.324 4.684 5.305 5.585 5.872 6.182 6.643 6.869 7.304 7.717 8.116 8.295 8.625 8.944 9.406 9.705 9.987 10.413 10.822 11.187 11.528 11.861 12.292 12.7 13.092 13.557 13.999 14.434 14.931 15.499 16.039 16.599 17.207 17.862 18.548 19.312 20.198 21.051 22.049 23.148 24.363 25.729 27.251 28.911 30.731 31.825 32.144 32.169 32.0 31.685 31.326 30.939 30.583 30.213 29.839 29.459 29.087 28.675 28.242 27.854 27.441 27.062 26.729 26.395 26.058 25.755 25.419 25.062 24.757 24.415 24.065 23.709 23.333 23.061 22.776 22.372 22.084 21.773 21.627 21.337 21.02 20.664 20.464 20.045 19.799 19.55 19.279 18.67 18.335 17.954 17.529 17.07 16.52 15.796 14.06 -9 ,21978 ,KEBNE ,16750258,Thu Dec 2 04:39:42 CET,Thu Dec 2 06:16:53 CET,0.0 1.499 2.264 2.865 3.341 3.77 4.156 4.505 5.173 5.485 5.772 6.039 6.484 6.704 7.128 7.533 7.949 8.156 8.532 8.875 9.364 9.685 9.998 10.456 10.876 11.277 11.673 12.052 12.548 13.03 13.497 14.064 14.621 15.135 15.682 16.251 16.772 17.35 17.997 18.723 19.461 20.249 21.135 22.0 22.992 24.101 25.349 26.7 28.203 29.807 31.455 32.315 32.485 32.344 32.013 31.58 31.124 30.647 30.173 29.679 29.237 28.821 28.4 28.001 27.622 27.264 26.895 26.55 26.216 25.87 25.531 25.202 24.821 24.413 24.1 23.778 23.43 23.059 22.687 22.452 22.218 21.843 21.553 21.233 21.059 20.674 20.263 19.811 19.561 19.094 18.784 18.511 18.22 17.568 17.191 16.781 16.322 15.802 15.219 14.461 12.869 -10 ,29067 ,KEBNE ,16750259,Thu Dec 2 04:38:37 CET,Thu Dec 2 06:15:49 CET,0.0 1.544 2.176 2.685 3.13 3.515 3.862 4.188 4.773 5.033 5.273 5.493 5.944 6.175 6.616 7.012 7.409 7.595 7.959 8.324 8.84 9.15 9.442 9.86 10.24 10.603 10.963 11.306 11.715 12.115 12.514 12.995 13.454 13.9 14.415 14.971 15.498 16.08 16.716 17.378 18.065 18.838 19.76 20.684 21.703 22.829 24.085 25.424 26.886 28.428 30.007 30.903 31.111 30.97 30.66 30.256 29.817 29.366 28.927 28.445 27.995 27.586 27.199 26.808 26.416 26.037 25.624 25.248 24.92 24.581 24.216 23.899 23.569 23.223 22.968 22.707 22.424 22.096 21.714 21.451 21.172 20.716 20.407 20.1 19.942 19.609 19.254 18.851 18.63 18.182 17.892 17.648 17.379 16.784 16.475 16.157 15.8 15.36 14.773 13.977 11.787 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index a027d291..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5265 ,KEBNE ,16750260,Thu Dec 2 04:39:40 CET,Thu Dec 2 06:15:59 CET,0.0 1.312 1.996 2.539 2.95 3.284 3.592 3.868 4.368 4.594 4.807 5.006 5.405 5.587 5.92 6.221 6.509 6.655 6.937 7.203 7.582 7.822 8.059 8.415 8.77 9.083 9.366 9.643 10.003 10.346 10.68 11.094 11.493 11.873 12.297 12.766 13.207 13.677 14.201 14.758 15.345 16.008 16.758 17.495 18.336 19.244 20.253 21.383 22.621 23.92 25.221 25.904 25.989 25.833 25.536 25.172 24.74 24.274 23.836 23.402 22.999 22.601 22.224 21.85 21.467 21.082 20.703 20.371 20.071 19.74 19.376 19.087 18.788 18.46 18.199 17.923 17.623 17.305 16.972 16.737 16.491 16.094 15.803 15.5 15.343 15.004 14.654 14.266 14.047 13.611 13.27 12.965 12.645 11.965 11.598 11.205 10.76 10.237 9.564 8.616 6.024 -2 ,32582 ,KEBNE ,16750261,Thu Dec 2 04:39:42 CET,Thu Dec 2 06:16:38 CET,0.0 1.345 1.977 2.442 2.845 3.187 3.487 3.775 4.292 4.531 4.757 4.974 5.381 5.569 5.939 6.291 6.631 6.799 7.132 7.456 7.926 8.233 8.523 8.93 9.332 9.718 10.091 10.446 10.908 11.374 11.81 12.298 12.772 13.234 13.764 14.352 14.931 15.579 16.252 16.97 17.713 18.545 19.521 20.484 21.612 22.816 24.087 25.47 27.09 28.852 30.452 31.111 30.988 30.459 29.779 29.067 28.341 27.778 27.368 26.942 26.533 26.144 25.776 25.408 25.036 24.685 24.331 23.985 23.663 23.333 22.972 22.655 22.328 21.985 21.719 21.438 21.124 20.781 20.417 20.164 19.912 19.528 19.242 18.929 18.77 18.431 18.065 17.682 17.477 17.071 16.83 16.579 16.263 15.524 15.132 14.692 14.195 13.605 12.926 12.08 9.686 -3 ,1579 ,KEBNE ,16750262,Thu Dec 2 04:39:42 CET,Thu Dec 2 06:16:06 CET,0.0 1.463 2.165 2.698 3.102 3.453 3.799 4.111 4.656 4.905 5.14 5.368 5.769 5.958 6.344 6.713 7.059 7.225 7.548 7.85 8.298 8.597 8.885 9.286 9.672 10.047 10.402 10.743 11.187 11.611 12.019 12.518 13.004 13.49 14.046 14.654 15.238 15.865 16.528 17.229 17.966 18.793 19.763 20.715 21.797 23.019 24.391 25.827 27.393 29.107 30.704 31.184 30.951 30.446 29.86 29.167 28.427 27.693 26.99 26.333 25.781 25.21 24.615 24.053 23.546 23.066 22.508 21.992 21.545 21.09 20.625 20.199 19.743 19.296 18.949 18.589 18.229 17.847 17.425 17.113 16.781 16.269 15.93 15.576 15.383 14.999 14.592 14.145 13.907 13.473 13.176 12.885 12.582 11.917 11.519 11.044 10.481 9.832 9.071 8.125 5.343 -4 ,32103 ,KEBNE ,16750263,Thu Dec 2 04:39:40 CET,Thu Dec 2 06:16:04 CET,0.0 1.627 2.198 2.65 3.056 3.4 3.699 3.962 4.446 4.666 4.879 5.051 5.439 5.614 5.959 6.288 6.606 6.755 7.037 7.304 7.681 7.922 8.159 8.505 8.83 9.145 9.463 9.785 10.212 10.602 10.953 11.358 11.747 12.112 12.535 13.008 13.461 13.958 14.477 15.024 15.597 16.238 16.98 17.718 18.551 19.467 20.471 21.543 22.726 23.981 25.244 25.888 25.996 25.812 25.479 25.078 24.666 24.227 23.812 23.386 22.985 22.62 22.236 21.844 21.466 21.115 20.747 20.402 20.093 19.758 19.389 19.074 18.763 18.442 18.174 17.891 17.606 17.308 16.987 16.76 16.528 16.158 15.894 15.603 15.44 15.102 14.741 14.364 14.163 13.745 13.483 13.232 12.955 12.302 11.94 11.549 11.115 10.621 10.001 9.12 6.518 -5 ,15901 ,KEBNE ,16750264,Thu Dec 2 04:39:40 CET,Thu Dec 2 06:17:16 CET,0.0 1.363 2.019 2.489 2.902 3.273 3.594 3.873 4.376 4.612 4.845 5.088 5.508 5.705 6.073 6.438 6.796 6.96 7.28 7.591 8.016 8.284 8.57 8.995 9.378 9.757 10.125 10.475 10.925 11.357 11.764 12.25 12.72 13.181 13.734 14.365 14.961 15.603 16.263 16.977 17.758 18.621 19.618 20.582 21.684 22.911 24.266 25.714 27.347 29.005 30.468 31.114 30.944 30.358 29.702 28.975 28.213 27.514 26.882 26.168 25.515 24.941 24.383 23.839 23.307 22.813 22.292 21.813 21.397 20.95 20.484 20.093 19.679 19.244 18.901 18.555 18.188 17.807 17.416 17.124 16.817 16.347 16.02 15.687 15.512 15.124 14.669 14.17 13.92 13.47 13.126 12.812 12.464 11.688 11.251 10.769 10.215 9.578 8.813 7.772 4.604 -6 ,3620 ,KEBNE ,16750265,Thu Dec 2 04:39:40 CET,Thu Dec 2 06:17:36 CET,0.0 1.296 1.904 2.391 2.794 3.146 3.456 3.746 4.295 4.55 4.802 5.085 5.534 5.767 6.196 6.6 7.004 7.196 7.554 7.907 8.4 8.693 8.974 9.368 9.744 10.121 10.488 10.835 11.268 11.679 12.082 12.582 13.051 13.508 14.058 14.683 15.275 15.909 16.581 17.285 18.044 18.879 19.83 20.814 21.963 23.15 24.466 25.944 27.523 29.17 30.745 31.444 31.262 30.666 29.95 29.214 28.475 27.752 27.102 26.401 25.752 25.159 24.589 24.038 23.483 22.972 22.45 21.977 21.563 21.121 20.66 20.285 19.89 19.457 19.108 18.752 18.389 18.009 17.601 17.317 17.029 16.566 16.242 15.907 15.718 15.265 14.77 14.269 14.016 13.567 13.257 12.974 12.669 12.02 11.642 11.223 10.773 10.241 9.597 8.689 6.076 -7 ,16250 ,KEBNE ,16750266,Thu Dec 2 04:39:42 CET,Thu Dec 2 06:15:58 CET,0.0 1.654 2.399 2.885 3.265 3.589 3.878 4.151 4.688 4.96 5.202 5.381 5.773 5.946 6.278 6.596 6.896 7.039 7.323 7.585 7.976 8.247 8.509 8.892 9.245 9.569 9.869 10.149 10.504 10.842 11.179 11.586 11.967 12.326 12.736 13.186 13.623 14.111 14.624 15.168 15.733 16.364 17.094 17.803 18.625 19.541 20.548 21.62 22.803 24.064 25.325 26.01 26.071 25.871 25.526 25.117 24.68 24.181 23.741 23.316 22.937 22.539 22.13 21.741 21.362 21.001 20.614 20.254 19.923 19.555 19.168 18.851 18.522 18.179 17.912 17.65 17.361 17.049 16.719 16.491 16.266 15.866 15.571 15.275 15.123 14.799 14.44 14.054 13.847 13.431 13.181 12.935 12.668 12.067 11.73 11.341 10.848 10.248 9.516 8.527 5.783 -8 ,9955 ,KEBNE ,16750267,Thu Dec 2 04:39:41 CET,Thu Dec 2 06:16:05 CET,0.0 1.795 2.402 2.895 3.325 3.7 4.029 4.326 4.899 5.179 5.449 5.748 6.206 6.441 6.883 7.312 7.723 7.916 8.274 8.601 9.043 9.322 9.592 10.001 10.394 10.761 11.12 11.47 11.919 12.346 12.763 13.264 13.732 14.198 14.742 15.333 15.899 16.536 17.215 17.861 18.475 19.12 19.84 20.579 21.458 22.428 23.494 24.611 25.87 27.295 28.804 29.644 29.713 29.507 29.209 28.799 28.325 27.854 27.43 26.982 26.567 26.173 25.818 25.487 25.144 24.798 24.424 24.045 23.686 23.339 22.994 22.712 22.423 22.096 21.827 21.51 21.15 20.785 20.437 20.222 19.993 19.598 19.312 19.017 18.866 18.54 18.152 17.695 17.461 17.029 16.736 16.461 16.142 15.389 14.958 14.461 13.906 13.312 12.607 11.637 8.979 -9 ,1120 ,KEBNE ,16750268,Thu Dec 2 04:40:45 CET,Thu Dec 2 06:18:50 CET,0.0 1.469 2.117 2.668 3.12 3.535 3.918 4.273 4.901 5.174 5.421 5.65 6.072 6.282 6.68 7.063 7.459 7.642 7.982 8.322 8.811 9.117 9.404 9.816 10.198 10.565 10.934 11.291 11.737 12.167 12.579 13.081 13.561 14.008 14.525 15.107 15.677 16.309 16.98 17.692 18.441 19.265 20.224 21.171 22.212 23.235 24.291 25.452 26.886 28.585 30.206 30.916 30.671 30.105 29.378 28.641 28.134 27.72 27.319 26.879 26.461 26.092 25.724 25.33 24.963 24.614 24.225 23.848 23.512 23.179 22.817 22.515 22.204 21.867 21.598 21.307 20.998 20.691 20.371 20.139 19.876 19.443 19.15 18.848 18.691 18.365 18.004 17.604 17.401 16.993 16.733 16.471 16.195 15.587 15.249 14.859 14.397 13.877 13.231 12.311 9.605 -10 ,2063 ,KEBNE ,16750269,Thu Dec 2 04:40:45 CET,Thu Dec 2 06:19:13 CET,0.0 1.616 2.343 2.917 3.392 3.803 4.161 4.505 5.129 5.404 5.672 5.958 6.399 6.624 7.056 7.457 7.844 8.03 8.377 8.695 9.139 9.425 9.707 10.093 10.432 10.768 11.091 11.412 11.845 12.266 12.687 13.194 13.678 14.143 14.675 15.264 15.836 16.476 17.158 17.902 18.669 19.499 20.459 21.418 22.514 23.696 25.022 26.482 28.139 29.9 31.591 32.296 32.113 31.601 30.958 30.249 29.51 28.841 28.246 27.576 26.96 26.373 25.786 25.23 24.692 24.164 23.629 23.171 22.757 22.314 21.864 21.474 21.048 20.616 20.278 19.928 19.548 19.13 18.695 18.384 18.065 17.603 17.275 16.914 16.728 16.348 15.95 15.529 15.302 14.862 14.551 14.26 13.958 13.301 12.917 12.492 12.008 11.454 10.786 9.867 7.014 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt deleted file mode 100644 index 2fbfaea8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13091 ,KEBNE ,16750270,Thu Dec 2 04:41:47 CET,Thu Dec 2 06:20:09 CET,0.0 2.924 3.741 4.313 4.782 5.211 5.595 5.919 6.48 6.731 6.967 7.19 7.629 7.847 8.215 8.552 8.867 9.021 9.309 9.605 10.076 10.367 10.635 10.988 11.31 11.616 11.897 12.154 12.471 12.783 13.083 13.453 13.799 14.125 14.5 14.907 15.298 15.718 16.135 16.559 17.007 17.52 18.107 18.637 19.215 19.853 20.523 21.131 21.622 21.88 21.685 20.773 19.724 18.688 17.698 16.762 15.87 15.02 14.296 13.567 12.923 12.339 11.784 11.264 10.784 10.336 9.839 9.379 8.967 8.519 8.066 7.71 7.337 6.941 6.635 6.311 5.952 5.58 5.19 4.915 4.636 4.18 3.835 3.461 3.261 2.826 2.364 1.875 1.641 1.195 0.912 0.646 0.363 -0.283 -0.64 -1.021 -1.459 -1.969 -2.642 -3.568 -6.178 -2 ,14659 ,KEBNE ,16750271,Thu Dec 2 04:41:47 CET,Thu Dec 2 06:20:09 CET,0.0 3.075 3.959 4.579 5.093 5.506 5.856 6.18 6.753 7.002 7.262 7.581 8.041 8.272 8.705 9.11 9.476 9.644 9.957 10.252 10.646 10.894 11.138 11.473 11.782 12.078 12.363 12.633 12.985 13.324 13.635 14.005 14.356 14.683 15.063 15.5 15.895 16.303 16.735 17.173 17.627 18.136 18.702 19.243 19.85 20.456 21.075 21.685 22.196 22.539 22.399 21.542 20.468 19.401 18.403 17.439 16.556 15.758 15.068 14.331 13.655 13.045 12.464 11.914 11.389 10.895 10.378 9.938 9.55 9.123 8.68 8.327 7.952 7.55 7.234 6.9 6.549 6.185 5.808 5.543 5.264 4.813 4.486 4.148 3.976 3.621 3.249 2.854 2.636 2.188 1.927 1.678 1.413 0.784 0.408 0.003 -0.455 -0.968 -1.572 -2.412 -4.965 -3 ,8625 ,KEBNE ,16750272,Thu Dec 2 04:41:47 CET,Thu Dec 2 06:20:20 CET,0.0 2.763 3.518 4.114 4.645 5.119 5.527 5.873 6.472 6.753 7.016 7.272 7.688 7.884 8.257 8.619 8.962 9.115 9.395 9.67 10.065 10.315 10.557 10.879 11.174 11.464 11.746 12.017 12.366 12.698 13.009 13.377 13.718 14.041 14.409 14.822 15.228 15.658 16.096 16.553 17.027 17.542 18.089 18.611 19.238 19.878 20.486 21.095 21.657 22.092 22.14 21.426 20.407 19.377 18.395 17.509 16.686 15.9 15.201 14.492 13.872 13.266 12.675 12.13 11.633 11.178 10.688 10.249 9.866 9.465 9.047 8.689 8.311 7.916 7.604 7.277 6.938 6.594 6.24 5.998 5.738 5.307 4.999 4.684 4.523 4.179 3.8 3.398 3.196 2.762 2.473 2.171 1.837 1.14 0.758 0.342 -0.157 -0.764 -1.486 -2.475 -5.447 -4 ,29680 ,KEBNE ,16750273,Thu Dec 2 04:41:47 CET,Thu Dec 2 06:20:05 CET,0.0 2.868 3.781 4.509 5.085 5.566 6.0 6.393 7.101 7.415 7.694 8.011 8.466 8.668 9.021 9.367 9.714 9.876 10.171 10.473 10.939 11.235 11.516 11.89 12.207 12.496 12.801 13.11 13.489 13.846 14.174 14.553 14.904 15.231 15.598 16.014 16.428 16.85 17.267 17.719 18.214 18.733 19.282 19.797 20.342 20.892 21.489 22.125 22.685 23.003 22.808 21.939 20.88 19.76 18.752 17.844 16.982 16.162 15.452 14.736 14.079 13.476 12.896 12.331 11.804 11.317 10.804 10.351 9.964 9.556 9.124 8.757 8.365 7.953 7.614 7.275 6.948 6.596 6.214 5.952 5.683 5.242 4.94 4.62 4.444 4.091 3.727 3.328 3.109 2.658 2.377 2.103 1.822 1.215 0.856 0.464 0.041 -0.47 -1.148 -2.15 -5.251 -5 ,29993 ,KEBNE ,16750274,Thu Dec 2 04:41:47 CET,Thu Dec 2 06:20:35 CET,0.0 3.209 4.204 4.878 5.433 5.83 6.18 6.532 7.177 7.467 7.746 8.046 8.493 8.717 9.088 9.45 9.813 9.98 10.308 10.591 10.959 11.21 11.454 11.792 12.108 12.41 12.7 12.977 13.314 13.623 13.936 14.315 14.675 15.013 15.391 15.817 16.207 16.631 17.095 17.568 18.035 18.545 19.112 19.628 20.193 20.78 21.352 21.91 22.411 22.763 22.646 21.795 20.743 19.652 18.586 17.591 16.695 15.845 15.109 14.368 13.734 13.154 12.581 12.012 11.467 10.989 10.483 10.03 9.649 9.25 8.823 8.46 8.081 7.686 7.377 7.05 6.701 6.339 5.968 5.712 5.426 4.946 4.603 4.263 4.084 3.69 3.302 2.914 2.703 2.235 1.91 1.631 1.359 0.737 0.358 -0.06 -0.548 -1.097 -1.72 -2.524 -5.275 -6 ,14505 ,KEBNE ,16750275,Thu Dec 2 04:42:52 CET,Thu Dec 2 06:21:23 CET,0.0 2.865 3.727 4.343 4.834 5.249 5.618 5.946 6.512 6.77 7.015 7.248 7.663 7.854 8.227 8.6 8.925 9.07 9.362 9.643 10.031 10.296 10.579 10.971 11.299 11.59 11.875 12.147 12.494 12.824 13.134 13.505 13.86 14.193 14.585 15.011 15.393 15.809 16.246 16.687 17.141 17.631 18.147 18.635 19.169 19.714 20.285 20.819 21.301 21.596 21.439 20.572 19.499 18.478 17.475 16.547 15.699 14.897 14.191 13.442 12.774 12.174 11.581 10.979 10.419 9.923 9.414 8.947 8.537 8.115 7.668 7.299 6.922 6.515 6.184 5.859 5.519 5.152 4.773 4.509 4.237 3.821 3.535 3.227 3.063 2.704 2.299 1.85 1.611 1.147 0.84 0.555 0.261 -0.339 -0.669 -1.026 -1.44 -1.91 -2.438 -3.222 -5.869 -7 ,10894 ,KEBNE ,16750276,Thu Dec 2 04:42:52 CET,Thu Dec 2 06:21:25 CET,0.0 2.856 3.764 4.412 4.906 5.319 5.678 6.003 6.588 6.846 7.085 7.305 7.724 7.915 8.26 8.595 8.921 9.076 9.357 9.63 10.037 10.283 10.513 10.851 11.157 11.446 11.744 12.039 12.407 12.756 13.091 13.476 13.833 14.177 14.571 14.997 15.384 15.782 16.198 16.621 17.062 17.554 18.088 18.6 19.187 19.773 20.369 20.939 21.449 21.809 21.659 20.862 19.833 18.796 17.778 16.786 15.891 15.06 14.331 13.568 12.889 12.306 11.742 11.182 10.647 10.156 9.646 9.19 8.795 8.374 7.933 7.564 7.187 6.799 6.487 6.158 5.815 5.457 5.098 4.852 4.581 4.13 3.807 3.482 3.316 2.964 2.599 2.215 2.01 1.578 1.333 1.084 0.804 0.17 -0.181 -0.567 -1.003 -1.499 -2.146 -3.008 -5.498 -8 ,4246 ,KEBNE ,16750277,Thu Dec 2 04:42:52 CET,Thu Dec 2 06:22:50 CET,0.0 2.758 3.676 4.375 4.964 5.442 5.873 6.256 6.921 7.228 7.501 7.739 8.152 8.345 8.715 9.059 9.384 9.543 9.857 10.146 10.537 10.784 11.029 11.378 11.699 11.993 12.296 12.591 12.923 13.24 13.553 13.93 14.293 14.632 15.035 15.465 15.852 16.276 16.709 17.148 17.592 18.069 18.611 19.121 19.671 20.268 20.859 21.389 21.879 22.222 22.113 21.238 20.181 19.106 18.086 17.114 16.19 15.355 14.621 13.844 13.169 12.569 11.984 11.421 10.887 10.402 9.91 9.476 9.084 8.665 8.236 7.871 7.477 7.074 6.766 6.441 6.103 5.75 5.384 5.128 4.857 4.427 4.123 3.811 3.65 3.286 2.886 2.448 2.208 1.754 1.504 1.241 0.951 0.301 -0.052 -0.441 -0.873 -1.384 -2.04 -2.935 -5.43 -9 ,19577 ,KEBNE ,16750278,Thu Dec 2 04:42:51 CET,Thu Dec 2 06:21:29 CET,0.0 3.785 4.717 5.421 6.007 6.514 6.951 7.349 8.044 8.342 8.632 8.976 9.445 9.681 10.121 10.551 10.94 11.113 11.425 11.698 12.093 12.346 12.592 12.932 13.238 13.543 13.833 14.111 14.488 14.859 15.197 15.567 15.906 16.228 16.6 17.0 17.378 17.824 18.308 18.785 19.259 19.756 20.309 20.821 21.403 22.015 22.619 23.219 23.767 24.094 23.847 22.916 21.811 20.745 19.743 18.773 17.887 17.058 16.344 15.619 14.97 14.376 13.811 13.275 12.763 12.29 11.788 11.332 10.908 10.476 10.057 9.709 9.326 8.914 8.597 8.272 7.944 7.594 7.199 6.919 6.641 6.2 5.898 5.58 5.408 5.057 4.691 4.284 4.06 3.608 3.325 3.068 2.793 2.178 1.832 1.441 1.012 0.524 -0.09 -0.987 -4.194 -10 ,25379 ,KEBNE ,16750279,Thu Dec 2 04:42:52 CET,Thu Dec 2 06:21:38 CET,0.0 2.656 3.513 4.095 4.555 4.961 5.338 5.68 6.307 6.613 6.907 7.246 7.692 7.915 8.349 8.737 9.111 9.275 9.562 9.835 10.217 10.469 10.712 11.058 11.39 11.693 11.974 12.25 12.596 12.912 13.223 13.593 13.951 14.297 14.69 15.13 15.53 15.951 16.399 16.851 17.315 17.814 18.339 18.857 19.461 20.062 20.663 21.268 21.807 22.131 21.924 21.081 20.071 19.019 17.976 16.981 16.078 15.231 14.491 13.765 13.124 12.508 11.902 11.341 10.818 10.344 9.846 9.404 9.014 8.586 8.139 7.763 7.362 6.955 6.643 6.308 5.955 5.596 5.23 4.969 4.699 4.266 3.954 3.635 3.467 3.101 2.719 2.328 2.118 1.672 1.367 1.087 0.814 0.182 -0.193 -0.611 -1.06 -1.575 -2.22 -3.099 -6.015 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt deleted file mode 100644 index 2cf6fc3b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,840 ,KEBNE ,16750280,Thu Dec 2 04:44:02 CET,Thu Dec 2 06:16:19 CET,0.0 1.685 2.344 2.852 3.244 3.547 3.816 4.061 4.494 4.678 4.856 5.025 5.36 5.515 5.781 6.03 6.274 6.386 6.598 6.803 7.087 7.269 7.448 7.705 7.943 8.174 8.395 8.598 8.849 9.101 9.334 9.585 9.847 10.103 10.363 10.627 10.879 11.167 11.464 11.748 12.03 12.334 12.649 12.942 13.255 13.563 13.809 13.949 13.991 13.755 12.862 11.257 9.774 8.449 7.243 6.157 5.182 4.271 3.489 2.685 1.98 1.355 0.759 0.193 -0.348 -0.845 -1.357 -1.8 -2.192 -2.613 -3.043 -3.399 -3.766 -4.15 -4.442 -4.749 -5.096 -5.464 -5.832 -6.073 -6.33 -6.734 -7.012 -7.307 -7.456 -7.761 -8.084 -8.438 -8.631 -9.003 -9.211 -9.434 -9.675 -10.194 -10.503 -10.868 -11.254 -11.659 -12.149 -12.816 -14.467 -2 ,13484 ,KEBNE ,16750281,Thu Dec 2 04:45:02 CET,Thu Dec 2 06:23:25 CET,0.0 1.313 1.824 2.238 2.626 2.969 3.287 3.54 4.003 4.256 4.476 4.658 4.981 5.136 5.465 5.783 6.047 6.166 6.401 6.606 6.883 7.056 7.224 7.467 7.704 7.948 8.167 8.37 8.642 8.892 9.123 9.396 9.65 9.885 10.145 10.41 10.667 10.944 11.228 11.53 11.837 12.16 12.521 12.845 13.16 13.468 13.743 13.897 13.901 13.632 12.679 11.077 9.583 8.199 6.937 5.797 4.797 3.88 3.072 2.259 1.561 0.937 0.343 -0.212 -0.739 -1.217 -1.703 -2.158 -2.557 -2.97 -3.4 -3.748 -4.106 -4.496 -4.803 -5.107 -5.43 -5.773 -6.122 -6.364 -6.648 -7.14 -7.48 -7.814 -7.979 -8.295 -8.622 -8.987 -9.182 -9.577 -9.867 -10.134 -10.411 -10.968 -11.253 -11.569 -11.951 -12.395 -12.913 -13.589 -15.756 -3 ,6587 ,KEBNE ,16750282,Thu Dec 2 04:45:02 CET,Thu Dec 2 06:18:20 CET,0.0 1.371 1.894 2.298 2.657 2.983 3.251 3.494 3.936 4.139 4.325 4.464 4.781 4.935 5.216 5.479 5.721 5.837 6.058 6.269 6.561 6.736 6.911 7.154 7.388 7.616 7.833 8.036 8.324 8.6 8.823 9.103 9.369 9.598 9.85 10.118 10.362 10.636 10.94 11.226 11.496 11.803 12.114 12.36 12.635 12.932 13.199 13.366 13.373 13.107 12.176 10.611 9.087 7.714 6.513 5.394 4.398 3.505 2.722 1.927 1.237 0.635 0.069 -0.486 -1.004 -1.47 -1.975 -2.435 -2.837 -3.244 -3.654 -4.012 -4.396 -4.795 -5.106 -5.422 -5.751 -6.099 -6.461 -6.704 -6.955 -7.349 -7.629 -7.931 -8.088 -8.412 -8.751 -9.102 -9.287 -9.676 -9.908 -10.126 -10.36 -10.889 -11.197 -11.531 -11.912 -12.369 -12.963 -13.757 -15.529 -4 ,22119 ,KEBNE ,16750283,Thu Dec 2 04:45:04 CET,Thu Dec 2 06:17:46 CET,0.0 1.556 2.122 2.561 2.893 3.168 3.426 3.659 4.077 4.27 4.452 4.614 4.929 5.075 5.392 5.709 5.999 6.138 6.391 6.613 6.92 7.101 7.268 7.527 7.767 7.995 8.214 8.421 8.675 8.911 9.139 9.394 9.64 9.877 10.145 10.442 10.72 11.015 11.314 11.604 11.895 12.21 12.568 12.891 13.186 13.464 13.712 13.849 13.906 13.689 12.757 11.314 9.961 8.623 7.375 6.284 5.313 4.399 3.589 2.77 2.084 1.48 0.892 0.327 -0.207 -0.679 -1.179 -1.633 -2.004 -2.397 -2.837 -3.216 -3.607 -4.001 -4.305 -4.628 -4.956 -5.297 -5.664 -5.916 -6.167 -6.55 -6.826 -7.122 -7.273 -7.58 -7.913 -8.277 -8.468 -8.856 -9.123 -9.357 -9.596 -10.141 -10.437 -10.758 -11.127 -11.529 -12.008 -12.672 -14.384 -5 ,13834 ,KEBNE ,16750284,Thu Dec 2 04:49:13 CET,Thu Dec 2 06:25:47 CET,0.0 1.717 2.35 2.765 3.125 3.455 3.736 3.973 4.369 4.564 4.765 4.982 5.327 5.484 5.778 6.052 6.309 6.424 6.634 6.832 7.111 7.296 7.472 7.717 7.954 8.179 8.388 8.586 8.828 9.053 9.28 9.565 9.823 10.045 10.297 10.569 10.827 11.119 11.413 11.702 11.986 12.285 12.611 12.918 13.231 13.494 13.739 13.93 13.928 13.629 12.683 11.13 9.667 8.372 7.159 5.999 5.011 4.127 3.343 2.532 1.83 1.186 0.554 -0.026 -0.546 -1.018 -1.515 -1.979 -2.392 -2.822 -3.259 -3.609 -3.985 -4.369 -4.662 -4.989 -5.35 -5.718 -6.074 -6.313 -6.569 -6.971 -7.245 -7.534 -7.694 -8.056 -8.417 -8.777 -8.971 -9.354 -9.562 -9.777 -10.037 -10.663 -11.013 -11.381 -11.781 -12.253 -12.777 -13.388 -15.407 -6 ,8190 ,KEBNE ,16750285,Thu Dec 2 04:49:12 CET,Thu Dec 2 06:24:56 CET,0.0 1.55 2.208 2.705 3.096 3.426 3.715 3.968 4.416 4.608 4.793 4.971 5.318 5.502 5.828 6.103 6.356 6.474 6.683 6.883 7.175 7.357 7.533 7.778 8.01 8.246 8.466 8.664 8.915 9.149 9.369 9.637 9.891 10.131 10.392 10.671 10.931 11.194 11.475 11.756 12.049 12.375 12.712 13.018 13.323 13.573 13.812 13.997 13.979 13.597 12.549 10.973 9.416 7.966 6.737 5.63 4.612 3.662 2.841 2.047 1.393 0.797 0.206 -0.364 -0.877 -1.344 -1.844 -2.282 -2.675 -3.098 -3.525 -3.869 -4.218 -4.604 -4.914 -5.217 -5.534 -5.871 -6.249 -6.515 -6.788 -7.218 -7.529 -7.864 -8.036 -8.412 -8.812 -9.232 -9.46 -9.882 -10.212 -10.482 -10.747 -11.342 -11.671 -12.022 -12.425 -12.904 -13.509 -14.266 -16.456 -7 ,16143 ,KEBNE ,16750286,Thu Dec 2 04:49:13 CET,Thu Dec 2 06:24:59 CET,0.0 1.385 1.976 2.374 2.705 2.999 3.265 3.51 3.914 4.086 4.258 4.407 4.719 4.858 5.131 5.381 5.614 5.74 5.997 6.231 6.53 6.707 6.888 7.151 7.384 7.596 7.824 8.046 8.294 8.523 8.751 9.034 9.3 9.539 9.808 10.11 10.378 10.656 10.939 11.225 11.537 11.876 12.214 12.507 12.808 13.139 13.412 13.533 13.568 13.327 12.4 10.826 9.302 7.898 6.643 5.518 4.521 3.583 2.769 1.951 1.26 0.639 0.027 -0.543 -1.055 -1.513 -1.998 -2.446 -2.839 -3.252 -3.701 -4.076 -4.455 -4.849 -5.147 -5.461 -5.787 -6.135 -6.508 -6.759 -7.021 -7.452 -7.778 -8.116 -8.278 -8.595 -8.932 -9.317 -9.539 -9.96 -10.254 -10.528 -10.818 -11.413 -11.742 -12.088 -12.446 -12.845 -13.357 -14.084 -16.075 -8 ,9785 ,KEBNE ,16750287,Thu Dec 2 04:49:13 CET,Thu Dec 2 06:25:04 CET,0.0 1.35 1.947 2.372 2.715 3.029 3.293 3.529 3.947 4.143 4.331 4.491 4.815 4.966 5.247 5.504 5.757 5.888 6.126 6.331 6.63 6.818 6.995 7.247 7.487 7.715 7.928 8.138 8.401 8.649 8.891 9.169 9.422 9.649 9.916 10.22 10.492 10.774 11.056 11.339 11.629 11.938 12.264 12.568 12.869 13.136 13.362 13.499 13.497 13.199 12.222 10.613 9.122 7.786 6.584 5.459 4.435 3.532 2.781 2.01 1.332 0.732 0.139 -0.421 -0.937 -1.416 -1.941 -2.41 -2.794 -3.219 -3.662 -4.017 -4.405 -4.812 -5.136 -5.455 -5.763 -6.102 -6.474 -6.741 -7.013 -7.421 -7.699 -7.978 -8.127 -8.446 -8.787 -9.154 -9.348 -9.729 -9.949 -10.175 -10.424 -10.98 -11.288 -11.595 -11.931 -12.342 -12.835 -13.49 -15.118 -9 ,2012 ,KEBNE ,16750288,Thu Dec 2 04:49:13 CET,Thu Dec 2 06:24:58 CET,0.0 1.227 1.768 2.18 2.537 2.83 3.088 3.334 3.767 3.953 4.147 4.386 4.739 4.897 5.187 5.437 5.663 5.78 5.994 6.193 6.489 6.678 6.857 7.103 7.332 7.548 7.747 7.933 8.167 8.382 8.598 8.87 9.123 9.365 9.645 9.947 10.247 10.545 10.816 11.107 11.408 11.729 12.06 12.362 12.673 12.968 13.226 13.339 13.279 12.941 11.951 10.37 8.86 7.435 6.143 5.017 4.027 3.123 2.338 1.538 0.851 0.245 -0.349 -0.919 -1.442 -1.928 -2.444 -2.9 -3.288 -3.702 -4.134 -4.498 -4.872 -5.245 -5.547 -5.871 -6.199 -6.54 -6.9 -7.159 -7.42 -7.817 -8.105 -8.402 -8.55 -8.865 -9.211 -9.592 -9.802 -10.208 -10.511 -10.77 -11.014 -11.517 -11.811 -12.116 -12.454 -12.841 -13.28 -13.857 -15.646 -10 ,15770 ,KEBNE ,16750289,Thu Dec 2 04:49:13 CET,Thu Dec 2 06:25:03 CET,0.0 1.385 1.94 2.356 2.712 3.003 3.26 3.511 3.953 4.151 4.34 4.513 4.836 4.997 5.302 5.56 5.805 5.921 6.145 6.355 6.652 6.843 7.027 7.277 7.502 7.715 7.922 8.137 8.413 8.655 8.878 9.148 9.4 9.615 9.858 10.151 10.42 10.696 11.0 11.319 11.628 11.943 12.272 12.58 12.907 13.233 13.492 13.655 13.691 13.427 12.481 10.951 9.489 8.142 6.948 5.821 4.785 3.848 3.049 2.267 1.583 0.974 0.378 -0.215 -0.758 -1.253 -1.755 -2.197 -2.588 -2.996 -3.421 -3.778 -4.142 -4.511 -4.816 -5.139 -5.449 -5.768 -6.114 -6.356 -6.608 -7.015 -7.311 -7.613 -7.765 -8.087 -8.426 -8.784 -8.97 -9.346 -9.58 -9.802 -10.033 -10.544 -10.834 -11.145 -11.507 -11.942 -12.479 -13.178 -15.003 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 8c073e03..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3534 ,KEBNE ,16750290,Thu Dec 2 04:49:13 CET,Thu Dec 2 06:23:54 CET,0.0 1.383 1.93 2.306 2.643 2.942 3.206 3.439 3.841 4.025 4.212 4.416 4.733 4.882 5.157 5.407 5.649 5.769 5.992 6.201 6.516 6.726 6.917 7.169 7.416 7.655 7.883 8.1 8.372 8.621 8.852 9.123 9.392 9.651 9.921 10.22 10.505 10.811 11.134 11.445 11.761 12.087 12.428 12.77 13.116 13.445 13.789 14.038 14.109 13.87 12.979 11.48 9.993 8.584 7.36 6.228 5.195 4.251 3.447 2.65 1.962 1.364 0.795 0.25 -0.258 -0.716 -1.204 -1.654 -2.051 -2.465 -2.894 -3.25 -3.615 -3.972 -4.252 -4.564 -4.882 -5.224 -5.605 -5.87 -6.144 -6.58 -6.893 -7.221 -7.391 -7.753 -8.143 -8.536 -8.741 -9.132 -9.438 -9.678 -9.927 -10.497 -10.813 -11.173 -11.575 -12.03 -12.554 -13.208 -14.939 -2 ,9853 ,KEBNE ,16750291,Thu Dec 2 04:49:13 CET,Thu Dec 2 06:24:57 CET,0.0 1.801 2.465 2.929 3.335 3.688 4.003 4.309 4.845 5.069 5.275 5.494 5.822 5.97 6.25 6.517 6.76 6.872 7.085 7.29 7.589 7.778 7.959 8.225 8.475 8.713 8.931 9.13 9.396 9.651 9.893 10.183 10.441 10.675 10.936 11.227 11.502 11.806 12.1 12.38 12.683 13.015 13.392 13.725 14.064 14.412 14.729 14.932 14.982 14.725 13.829 12.337 10.758 9.321 8.091 6.954 5.989 5.098 4.297 3.5 2.786 2.153 1.547 0.978 0.462 -0.023 -0.545 -1.004 -1.386 -1.807 -2.244 -2.58 -2.94 -3.319 -3.616 -3.944 -4.301 -4.677 -5.076 -5.351 -5.625 -6.071 -6.392 -6.71 -6.878 -7.21 -7.528 -7.863 -8.048 -8.418 -8.657 -8.876 -9.099 -9.578 -9.846 -10.141 -10.453 -10.832 -11.295 -11.883 -13.34 -3 ,21480 ,KEBNE ,16750292,Thu Dec 2 04:50:16 CET,Thu Dec 2 06:26:19 CET,0.0 1.417 2.0 2.405 2.755 3.089 3.401 3.683 4.194 4.423 4.625 4.85 5.188 5.339 5.602 5.847 6.079 6.193 6.413 6.62 6.916 7.1 7.272 7.524 7.765 7.987 8.201 8.407 8.665 8.921 9.171 9.45 9.716 9.965 10.23 10.531 10.824 11.127 11.43 11.727 12.035 12.366 12.733 13.059 13.358 13.644 13.884 14.057 14.097 13.798 12.776 11.171 9.681 8.291 7.065 5.959 4.937 3.994 3.198 2.392 1.687 1.057 0.482 -0.061 -0.589 -1.067 -1.566 -2.013 -2.39 -2.79 -3.222 -3.58 -3.971 -4.396 -4.73 -5.063 -5.372 -5.691 -6.037 -6.272 -6.522 -6.926 -7.197 -7.469 -7.615 -7.942 -8.299 -8.674 -8.867 -9.234 -9.463 -9.676 -9.901 -10.412 -10.697 -10.992 -11.31 -11.687 -12.184 -12.901 -14.745 -4 ,31301 ,KEBNE ,16750293,Thu Dec 2 04:50:16 CET,Thu Dec 2 06:25:51 CET,0.0 1.544 2.287 2.832 3.256 3.618 3.934 4.236 4.727 4.941 5.167 5.425 5.751 5.889 6.167 6.439 6.693 6.811 7.032 7.243 7.54 7.724 7.908 8.174 8.407 8.619 8.831 9.033 9.284 9.528 9.759 10.032 10.287 10.523 10.801 11.105 11.388 11.696 12.002 12.311 12.608 12.91 13.258 13.586 13.93 14.267 14.538 14.715 14.763 14.498 13.588 12.108 10.642 9.27 8.047 6.921 5.918 5.003 4.191 3.397 2.726 2.114 1.53 0.964 0.435 -0.028 -0.512 -0.966 -1.362 -1.768 -2.196 -2.557 -2.926 -3.311 -3.622 -3.957 -4.303 -4.654 -5.018 -5.273 -5.533 -5.928 -6.199 -6.48 -6.625 -6.923 -7.236 -7.575 -7.753 -8.103 -8.346 -8.597 -8.872 -9.449 -9.764 -10.115 -10.537 -11.037 -11.626 -12.327 -13.818 -5 ,21050 ,KEBNE ,16750294,Thu Dec 2 04:50:16 CET,Thu Dec 2 06:25:54 CET,0.0 1.21 1.786 2.221 2.59 2.897 3.156 3.398 3.846 4.043 4.234 4.441 4.771 4.92 5.191 5.454 5.699 5.82 6.074 6.32 6.626 6.81 6.994 7.251 7.493 7.717 7.922 8.126 8.393 8.634 8.862 9.128 9.385 9.641 9.905 10.191 10.464 10.747 11.039 11.332 11.623 11.923 12.252 12.55 12.857 13.159 13.43 13.625 13.652 13.369 12.406 10.801 9.276 7.894 6.676 5.555 4.535 3.625 2.844 2.055 1.381 0.783 0.203 -0.35 -0.854 -1.331 -1.836 -2.276 -2.658 -3.05 -3.466 -3.812 -4.172 -4.545 -4.834 -5.134 -5.454 -5.791 -6.138 -6.38 -6.631 -7.076 -7.404 -7.728 -7.898 -8.259 -8.632 -9.037 -9.238 -9.601 -9.86 -10.116 -10.402 -10.967 -11.254 -11.565 -11.926 -12.351 -12.857 -13.603 -15.573 -6 ,14212 ,KEBNE ,16750295,Thu Dec 2 04:50:16 CET,Thu Dec 2 06:25:27 CET,0.0 1.133 1.679 2.114 2.468 2.773 3.036 3.278 3.735 3.935 4.144 4.409 4.753 4.921 5.209 5.454 5.686 5.802 6.026 6.251 6.586 6.791 6.967 7.217 7.456 7.686 7.899 8.095 8.35 8.58 8.805 9.087 9.337 9.569 9.841 10.153 10.452 10.767 11.089 11.383 11.698 12.046 12.409 12.749 13.079 13.393 13.692 13.907 13.938 13.666 12.771 11.184 9.634 8.219 6.945 5.788 4.729 3.784 2.996 2.207 1.504 0.873 0.304 -0.242 -0.783 -1.298 -1.817 -2.266 -2.656 -3.062 -3.48 -3.822 -4.17 -4.533 -4.827 -5.133 -5.453 -5.79 -6.135 -6.375 -6.627 -7.025 -7.299 -7.579 -7.728 -8.04 -8.369 -8.712 -8.899 -9.289 -9.564 -9.776 -10.009 -10.509 -10.771 -11.081 -11.455 -11.866 -12.318 -12.932 -14.783 -7 ,6773 ,KEBNE ,16750296,Thu Dec 2 04:50:20 CET,Thu Dec 2 06:25:44 CET,0.0 1.553 2.242 2.737 3.137 3.505 3.828 4.114 4.624 4.852 5.068 5.306 5.653 5.826 6.134 6.4 6.645 6.762 6.981 7.181 7.471 7.655 7.827 8.069 8.305 8.521 8.721 8.922 9.187 9.432 9.666 9.949 10.206 10.438 10.691 10.979 11.254 11.538 11.853 12.195 12.516 12.831 13.193 13.546 13.905 14.238 14.517 14.716 14.776 14.569 13.691 12.184 10.734 9.356 8.137 7.01 5.98 5.062 4.265 3.445 2.734 2.108 1.531 0.969 0.431 -0.059 -0.569 -1.014 -1.401 -1.811 -2.238 -2.582 -2.939 -3.323 -3.629 -3.94 -4.256 -4.584 -4.925 -5.163 -5.404 -5.78 -6.053 -6.346 -6.49 -6.784 -7.116 -7.466 -7.642 -7.994 -8.242 -8.481 -8.745 -9.337 -9.67 -10.027 -10.434 -10.885 -11.409 -12.101 -13.481 -8 ,25805 ,KEBNE ,16750297,Thu Dec 2 04:50:16 CET,Thu Dec 2 06:25:32 CET,0.0 1.252 1.811 2.231 2.574 2.87 3.137 3.383 3.818 4.009 4.189 4.348 4.653 4.796 5.067 5.325 5.576 5.694 5.931 6.159 6.452 6.633 6.818 7.091 7.336 7.58 7.836 8.062 8.333 8.586 8.812 9.079 9.341 9.594 9.87 10.16 10.44 10.752 11.066 11.365 11.68 12.007 12.338 12.659 12.985 13.278 13.564 13.798 13.883 13.682 12.867 11.311 9.781 8.441 7.293 6.23 5.252 4.352 3.574 2.778 2.063 1.437 0.851 0.272 -0.274 -0.757 -1.256 -1.703 -2.087 -2.49 -2.91 -3.266 -3.648 -4.039 -4.342 -4.656 -4.98 -5.308 -5.649 -5.899 -6.168 -6.61 -6.926 -7.255 -7.426 -7.772 -8.132 -8.512 -8.701 -9.056 -9.29 -9.51 -9.721 -10.175 -10.445 -10.754 -11.125 -11.58 -12.119 -12.841 -14.701 -9 ,24605 ,KEBNE ,16750298,Thu Dec 2 04:51:21 CET,Thu Dec 2 06:26:38 CET,0.0 1.681 2.386 2.922 3.342 3.65 3.914 4.153 4.561 4.741 4.916 5.089 5.397 5.54 5.822 6.112 6.402 6.532 6.759 6.97 7.274 7.479 7.675 7.934 8.207 8.472 8.693 8.898 9.17 9.433 9.668 9.95 10.219 10.472 10.764 11.084 11.388 11.697 12.006 12.327 12.661 13.004 13.365 13.693 14.052 14.405 14.695 14.921 15.002 14.75 13.827 12.301 10.86 9.518 8.291 7.194 6.23 5.336 4.552 3.752 3.055 2.413 1.807 1.251 0.725 0.245 -0.244 -0.671 -1.047 -1.451 -1.877 -2.243 -2.609 -2.987 -3.289 -3.596 -3.92 -4.262 -4.623 -4.871 -5.129 -5.535 -5.815 -6.097 -6.25 -6.568 -6.886 -7.244 -7.436 -7.797 -8.008 -8.215 -8.431 -8.903 -9.173 -9.478 -9.819 -10.202 -10.68 -11.284 -12.785 -10 ,12503 ,KEBNE ,16750299,Thu Dec 2 04:51:18 CET,Thu Dec 2 06:26:31 CET,0.0 1.114 1.599 1.972 2.285 2.575 2.837 3.068 3.512 3.716 3.889 4.048 4.364 4.514 4.796 5.072 5.331 5.449 5.685 5.922 6.258 6.461 6.647 6.911 7.18 7.438 7.658 7.886 8.203 8.471 8.703 8.977 9.232 9.47 9.746 10.048 10.318 10.607 10.898 11.197 11.52 11.844 12.19 12.509 12.835 13.144 13.417 13.628 13.719 13.555 12.762 11.265 9.695 8.266 7.027 5.888 4.885 3.999 3.234 2.459 1.797 1.192 0.595 0.021 -0.507 -0.988 -1.496 -1.936 -2.32 -2.726 -3.143 -3.493 -3.864 -4.255 -4.561 -4.866 -5.172 -5.497 -5.833 -6.068 -6.318 -6.718 -7.018 -7.356 -7.529 -7.871 -8.195 -8.528 -8.718 -9.084 -9.316 -9.532 -9.756 -10.24 -10.526 -10.835 -11.172 -11.572 -12.06 -12.709 -14.013 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index f7efa4af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23033 ,KEBNE ,16750300,Thu Dec 2 04:51:18 CET,Thu Dec 2 06:26:12 CET,0.0 1.46 2.052 2.489 2.863 3.18 3.449 3.694 4.14 4.338 4.526 4.706 5.018 5.173 5.485 5.77 6.036 6.161 6.387 6.593 6.871 7.039 7.194 7.431 7.656 7.874 8.09 8.291 8.546 8.786 9.031 9.332 9.582 9.801 10.066 10.35 10.594 10.838 11.077 11.319 11.545 11.79 12.062 12.282 12.489 12.655 12.746 12.74 12.495 11.768 10.222 8.081 6.178 4.545 3.142 1.879 0.764 -0.225 -1.051 -1.892 -2.644 -3.311 -3.937 -4.522 -5.082 -5.594 -6.117 -6.58 -6.984 -7.414 -7.857 -8.209 -8.57 -8.936 -9.222 -9.522 -9.838 -10.168 -10.497 -10.726 -10.971 -11.361 -11.65 -11.97 -12.123 -12.437 -12.773 -13.117 -13.298 -13.66 -13.879 -14.095 -14.325 -14.826 -15.103 -15.396 -15.732 -16.117 -16.563 -17.183 -18.715 -2 ,2744 ,KEBNE ,16750301,Thu Dec 2 04:51:18 CET,Thu Dec 2 06:27:04 CET,0.0 1.629 2.247 2.668 3.008 3.302 3.567 3.799 4.201 4.392 4.572 4.747 5.054 5.193 5.459 5.706 5.937 6.048 6.26 6.461 6.753 6.938 7.102 7.345 7.585 7.794 7.981 8.16 8.401 8.641 8.86 9.114 9.351 9.562 9.785 10.027 10.269 10.516 10.753 11.006 11.255 11.498 11.745 11.961 12.171 12.314 12.358 12.253 11.963 11.282 9.764 7.656 5.794 4.15 2.748 1.51 0.424 -0.543 -1.407 -2.284 -3.032 -3.678 -4.279 -4.848 -5.393 -5.894 -6.405 -6.865 -7.262 -7.672 -8.1 -8.455 -8.817 -9.195 -9.496 -9.832 -10.177 -10.497 -10.823 -11.068 -11.341 -11.761 -12.037 -12.314 -12.455 -12.747 -13.061 -13.403 -13.583 -13.948 -14.156 -14.356 -14.582 -15.09 -15.403 -15.775 -16.184 -16.612 -17.126 -17.811 -19.305 -3 ,11092 ,KEBNE ,16750302,Thu Dec 2 04:51:21 CET,Thu Dec 2 06:27:00 CET,0.0 1.76 2.442 2.949 3.383 3.741 4.012 4.248 4.673 4.872 5.058 5.25 5.563 5.712 6.038 6.355 6.642 6.781 7.053 7.298 7.604 7.781 7.954 8.221 8.497 8.76 8.983 9.168 9.394 9.611 9.813 10.058 10.294 10.51 10.751 11.01 11.255 11.517 11.772 12.033 12.285 12.527 12.776 12.987 13.165 13.3 13.375 13.304 12.996 12.251 10.685 8.568 6.673 5.0 3.517 2.221 1.122 0.128 -0.741 -1.608 -2.33 -2.967 -3.572 -4.155 -4.703 -5.187 -5.693 -6.14 -6.539 -6.973 -7.409 -7.765 -8.146 -8.54 -8.843 -9.152 -9.464 -9.791 -10.133 -10.366 -10.613 -10.998 -11.259 -11.539 -11.692 -12.029 -12.406 -12.781 -12.962 -13.319 -13.515 -13.714 -13.924 -14.397 -14.666 -14.969 -15.289 -15.642 -16.096 -16.638 -17.95 -4 ,30286 ,KEBNE ,16750303,Thu Dec 2 04:51:21 CET,Thu Dec 2 06:27:00 CET,0.0 1.454 2.085 2.506 2.824 3.105 3.377 3.627 4.048 4.235 4.407 4.574 4.89 5.046 5.316 5.559 5.79 5.901 6.119 6.324 6.621 6.806 6.978 7.218 7.439 7.65 7.842 8.025 8.26 8.486 8.705 8.955 9.177 9.397 9.64 9.917 10.172 10.419 10.657 10.876 11.103 11.331 11.59 11.832 12.037 12.179 12.289 12.247 11.927 11.24 9.684 7.51 5.583 3.91 2.478 1.184 0.039 -0.973 -1.83 -2.684 -3.427 -4.087 -4.719 -5.324 -5.879 -6.372 -6.877 -7.341 -7.741 -8.14 -8.561 -8.913 -9.28 -9.661 -9.959 -10.266 -10.577 -10.899 -11.243 -11.474 -11.713 -12.089 -12.354 -12.638 -12.777 -13.068 -13.384 -13.73 -13.909 -14.265 -14.463 -14.669 -14.894 -15.362 -15.617 -15.9 -16.219 -16.586 -17.006 -17.546 -18.962 -5 ,1840 ,KEBNE ,16750304,Thu Dec 2 04:51:19 CET,Thu Dec 2 06:27:07 CET,0.0 1.881 2.583 3.08 3.472 3.804 4.106 4.373 4.803 4.984 5.165 5.347 5.658 5.804 6.08 6.349 6.605 6.718 6.932 7.133 7.412 7.587 7.762 8.023 8.266 8.488 8.683 8.875 9.123 9.342 9.552 9.799 10.014 10.215 10.446 10.679 10.902 11.152 11.428 11.693 11.932 12.171 12.391 12.593 12.801 12.951 13.024 12.973 12.696 11.968 10.358 8.174 6.304 4.685 3.24 1.955 0.816 -0.194 -1.026 -1.855 -2.589 -3.242 -3.868 -4.464 -5.003 -5.492 -5.987 -6.431 -6.828 -7.235 -7.663 -8.016 -8.389 -8.779 -9.075 -9.386 -9.708 -10.046 -10.421 -10.682 -10.959 -11.401 -11.69 -11.978 -12.13 -12.466 -12.827 -13.199 -13.382 -13.736 -13.965 -14.199 -14.445 -14.964 -15.229 -15.515 -15.858 -16.233 -16.654 -17.197 -18.434 -6 ,6682 ,KEBNE ,16750305,Thu Dec 2 04:52:26 CET,Thu Dec 2 06:28:29 CET,0.0 1.319 1.882 2.342 2.701 2.998 3.256 3.489 3.912 4.111 4.303 4.488 4.803 4.958 5.242 5.486 5.724 5.84 6.054 6.267 6.587 6.801 6.999 7.281 7.55 7.783 7.979 8.159 8.394 8.623 8.832 9.077 9.32 9.54 9.769 10.026 10.268 10.499 10.717 10.942 11.157 11.397 11.684 11.901 12.069 12.233 12.311 12.189 11.831 11.095 9.523 7.384 5.529 3.891 2.46 1.169 0.046 -0.935 -1.773 -2.616 -3.329 -3.967 -4.58 -5.164 -5.716 -6.217 -6.743 -7.202 -7.594 -8.01 -8.437 -8.794 -9.158 -9.527 -9.821 -10.122 -10.44 -10.781 -11.129 -11.364 -11.604 -11.976 -12.24 -12.506 -12.643 -12.946 -13.263 -13.589 -13.764 -14.13 -14.342 -14.556 -14.802 -15.357 -15.679 -16.019 -16.401 -16.883 -17.44 -18.21 -20.083 -7 ,6610 ,KEBNE ,16750306,Thu Dec 2 04:52:26 CET,Thu Dec 2 06:29:27 CET,0.0 1.436 1.963 2.369 2.723 3.021 3.292 3.539 3.976 4.189 4.402 4.63 4.977 5.163 5.507 5.781 6.017 6.141 6.402 6.642 6.951 7.138 7.304 7.546 7.778 7.982 8.171 8.356 8.6 8.827 9.029 9.27 9.51 9.738 9.979 10.221 10.476 10.748 10.981 11.203 11.421 11.65 11.887 12.066 12.233 12.348 12.382 12.303 12.004 11.29 9.754 7.598 5.703 4.108 2.731 1.507 0.422 -0.591 -1.438 -2.268 -2.992 -3.635 -4.252 -4.842 -5.402 -5.912 -6.431 -6.889 -7.288 -7.701 -8.148 -8.506 -8.874 -9.27 -9.565 -9.867 -10.194 -10.543 -10.896 -11.128 -11.369 -11.777 -12.058 -12.333 -12.474 -12.769 -13.09 -13.443 -13.627 -13.986 -14.2 -14.407 -14.629 -15.124 -15.4 -15.708 -16.085 -16.535 -17.058 -17.707 -19.509 -8 ,27016 ,KEBNE ,16750307,Thu Dec 2 04:52:26 CET,Thu Dec 2 06:29:24 CET,0.0 1.994 2.714 3.2 3.594 3.97 4.311 4.616 5.118 5.34 5.562 5.811 6.141 6.298 6.577 6.828 7.062 7.174 7.386 7.585 7.876 8.077 8.267 8.508 8.729 8.945 9.155 9.356 9.606 9.834 10.042 10.279 10.503 10.714 10.966 11.261 11.515 11.768 12.046 12.323 12.579 12.844 13.097 13.321 13.534 13.672 13.716 13.626 13.357 12.725 11.233 9.125 7.181 5.45 3.969 2.67 1.537 0.496 -0.399 -1.272 -2.019 -2.68 -3.302 -3.884 -4.422 -4.915 -5.434 -5.888 -6.268 -6.67 -7.12 -7.493 -7.853 -8.211 -8.495 -8.797 -9.106 -9.432 -9.786 -10.024 -10.273 -10.684 -10.967 -11.257 -11.404 -11.699 -12.017 -12.356 -12.529 -12.904 -13.183 -13.433 -13.699 -14.268 -14.573 -14.895 -15.264 -15.697 -16.197 -16.883 -18.299 -9 ,17054 ,KEBNE ,16750308,Thu Dec 2 04:52:25 CET,Thu Dec 2 06:29:38 CET,0.0 1.617 2.216 2.676 3.033 3.321 3.579 3.82 4.237 4.42 4.592 4.763 5.075 5.219 5.476 5.714 5.952 6.068 6.29 6.494 6.77 6.942 7.104 7.345 7.575 7.797 7.999 8.197 8.469 8.703 8.925 9.187 9.414 9.627 9.867 10.113 10.337 10.585 10.827 11.045 11.272 11.523 11.788 12.017 12.203 12.308 12.349 12.298 12.047 11.365 9.824 7.681 5.812 4.213 2.804 1.536 0.422 -0.598 -1.475 -2.34 -3.091 -3.736 -4.342 -4.933 -5.476 -5.966 -6.483 -6.952 -7.344 -7.753 -8.189 -8.543 -8.91 -9.296 -9.598 -9.909 -10.224 -10.548 -10.89 -11.132 -11.379 -11.757 -12.02 -12.29 -12.429 -12.722 -13.033 -13.355 -13.525 -13.888 -14.102 -14.304 -14.528 -15.032 -15.299 -15.586 -15.901 -16.231 -16.636 -17.209 -18.767 -10 ,26666 ,KEBNE ,16750309,Thu Dec 2 04:53:28 CET,Thu Dec 2 06:30:45 CET,0.0 1.279 1.858 2.304 2.651 2.932 3.202 3.451 3.883 4.078 4.259 4.421 4.727 4.875 5.155 5.405 5.646 5.761 5.977 6.194 6.489 6.656 6.822 7.055 7.277 7.492 7.698 7.888 8.116 8.34 8.558 8.804 9.044 9.29 9.557 9.825 10.073 10.308 10.533 10.778 10.999 11.211 11.469 11.701 11.888 11.996 12.004 11.908 11.634 10.953 9.423 7.257 5.337 3.676 2.263 0.988 -0.109 -1.105 -1.989 -2.846 -3.551 -4.183 -4.802 -5.391 -5.939 -6.432 -6.949 -7.409 -7.805 -8.231 -8.691 -9.067 -9.443 -9.827 -10.124 -10.429 -10.738 -11.061 -11.405 -11.641 -11.887 -12.276 -12.544 -12.823 -12.969 -13.275 -13.588 -13.924 -14.104 -14.461 -14.672 -14.892 -15.118 -15.583 -15.876 -16.232 -16.617 -17.05 -17.56 -18.239 -19.686 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt deleted file mode 100644 index 6fe1fcc1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1633 ,KEBNE ,16750310,Thu Dec 2 04:53:28 CET,Thu Dec 2 06:30:13 CET,0.0 1.809 2.427 2.864 3.189 3.467 3.733 3.977 4.4 4.592 4.773 4.959 5.274 5.427 5.715 5.978 6.23 6.351 6.568 6.78 7.085 7.264 7.439 7.687 7.923 8.157 8.408 8.652 8.92 9.161 9.392 9.657 9.908 10.153 10.435 10.738 11.0 11.275 11.565 11.844 12.135 12.482 12.838 13.158 13.506 13.826 14.138 14.404 14.502 14.399 13.76 12.487 11.213 10.064 9.055 8.115 7.286 6.541 5.889 5.208 4.614 4.096 3.601 3.116 2.648 2.228 1.792 1.407 1.078 0.732 0.37 0.063 -0.252 -0.592 -0.862 -1.13 -1.421 -1.727 -2.055 -2.279 -2.497 -2.854 -3.117 -3.4 -3.552 -3.84 -4.129 -4.449 -4.612 -4.951 -5.141 -5.333 -5.528 -5.971 -6.246 -6.534 -6.868 -7.303 -7.788 -8.432 -9.849 -2 ,30546 ,KEBNE ,16750311,Thu Dec 2 04:53:28 CET,Thu Dec 2 06:30:18 CET,0.0 1.255 1.771 2.144 2.482 2.796 3.07 3.326 3.748 3.933 4.115 4.282 4.588 4.73 5.01 5.264 5.493 5.616 5.861 6.076 6.371 6.561 6.748 7.007 7.245 7.454 7.655 7.865 8.136 8.381 8.611 8.894 9.161 9.414 9.693 9.996 10.281 10.572 10.879 11.184 11.487 11.831 12.201 12.521 12.846 13.168 13.499 13.749 13.819 13.663 12.961 11.756 10.603 9.507 8.5 7.575 6.74 5.963 5.304 4.622 4.007 3.445 2.933 2.464 2.015 1.596 1.146 0.736 0.385 0.017 -0.356 -0.663 -0.994 -1.335 -1.6 -1.875 -2.154 -2.45 -2.766 -2.977 -3.196 -3.556 -3.834 -4.123 -4.259 -4.54 -4.847 -5.171 -5.342 -5.683 -5.887 -6.09 -6.31 -6.798 -7.051 -7.317 -7.645 -8.019 -8.445 -9.048 -10.31 -3 ,20303 ,KEBNE ,16750312,Thu Dec 2 04:53:28 CET,Thu Dec 2 06:29:41 CET,0.0 1.406 2.064 2.542 2.908 3.212 3.486 3.743 4.229 4.461 4.672 4.896 5.221 5.373 5.657 5.918 6.157 6.266 6.483 6.694 6.992 7.181 7.359 7.616 7.871 8.107 8.32 8.522 8.781 9.015 9.235 9.494 9.733 9.959 10.23 10.552 10.842 11.129 11.442 11.749 12.04 12.358 12.692 13.043 13.41 13.718 14.021 14.241 14.349 14.229 13.524 12.292 11.103 9.97 8.962 8.045 7.182 6.388 5.727 5.067 4.49 3.985 3.504 3.031 2.576 2.156 1.719 1.326 0.965 0.584 0.196 -0.13 -0.453 -0.778 -1.052 -1.345 -1.641 -1.931 -2.232 -2.446 -2.663 -3.009 -3.26 -3.525 -3.659 -3.931 -4.239 -4.568 -4.735 -5.078 -5.284 -5.479 -5.683 -6.134 -6.398 -6.683 -6.986 -7.35 -7.799 -8.426 -10.04 -4 ,26498 ,KEBNE ,16750313,Thu Dec 2 04:53:28 CET,Thu Dec 2 06:30:06 CET,0.0 1.327 1.862 2.276 2.618 2.909 3.161 3.406 3.826 4.005 4.175 4.328 4.629 4.791 5.13 5.453 5.729 5.846 6.075 6.282 6.559 6.74 6.916 7.164 7.395 7.62 7.832 8.036 8.299 8.547 8.788 9.063 9.311 9.557 9.846 10.163 10.446 10.733 11.041 11.359 11.676 12.027 12.393 12.729 13.085 13.394 13.673 13.918 14.055 13.925 13.252 12.03 10.786 9.618 8.586 7.635 6.793 6.032 5.355 4.672 4.071 3.54 3.044 2.557 2.113 1.707 1.273 0.891 0.55 0.183 -0.195 -0.501 -0.822 -1.163 -1.437 -1.723 -2.019 -2.317 -2.621 -2.838 -3.065 -3.414 -3.668 -3.944 -4.084 -4.385 -4.711 -5.052 -5.226 -5.577 -5.803 -6.025 -6.287 -6.869 -7.176 -7.485 -7.818 -8.213 -8.716 -9.441 -11.465 -5 ,1705 ,KEBNE ,16750314,Thu Dec 2 04:53:28 CET,Thu Dec 2 06:30:06 CET,0.0 1.174 1.715 2.128 2.491 2.818 3.11 3.364 3.799 3.991 4.175 4.357 4.663 4.807 5.099 5.366 5.594 5.714 5.978 6.203 6.489 6.674 6.851 7.103 7.346 7.573 7.786 7.995 8.251 8.493 8.719 8.981 9.255 9.514 9.789 10.08 10.351 10.634 10.937 11.26 11.577 11.912 12.253 12.565 12.9 13.238 13.582 13.841 13.931 13.817 13.267 12.133 10.96 9.878 8.877 7.95 7.151 6.407 5.723 5.03 4.448 3.919 3.396 2.914 2.467 2.059 1.645 1.27 0.934 0.588 0.23 -0.062 -0.369 -0.701 -0.948 -1.216 -1.527 -1.839 -2.144 -2.358 -2.588 -2.938 -3.176 -3.436 -3.57 -3.845 -4.149 -4.493 -4.687 -5.06 -5.317 -5.562 -5.826 -6.388 -6.71 -7.053 -7.383 -7.75 -8.202 -8.737 -9.974 -6 ,30895 ,KEBNE ,16750315,Thu Dec 2 04:53:33 CET,Thu Dec 2 06:30:24 CET,0.0 1.639 2.232 2.662 3.026 3.319 3.576 3.821 4.266 4.459 4.63 4.788 5.092 5.23 5.495 5.762 6.036 6.167 6.416 6.635 6.93 7.117 7.298 7.569 7.824 8.056 8.268 8.476 8.737 8.973 9.197 9.462 9.704 9.938 10.22 10.518 10.786 11.067 11.355 11.651 11.952 12.288 12.632 12.943 13.284 13.61 13.945 14.205 14.303 14.198 13.651 12.511 11.293 10.172 9.174 8.231 7.371 6.591 5.918 5.254 4.665 4.129 3.616 3.122 2.663 2.253 1.817 1.412 1.051 0.667 0.271 -0.045 -0.37 -0.703 -0.971 -1.252 -1.534 -1.825 -2.15 -2.385 -2.62 -2.981 -3.242 -3.521 -3.66 -3.943 -4.225 -4.521 -4.694 -5.066 -5.352 -5.596 -5.847 -6.402 -6.725 -7.072 -7.436 -7.86 -8.375 -9.1 -10.599 -7 ,6329 ,KEBNE ,16750316,Thu Dec 2 04:53:28 CET,Thu Dec 2 06:30:24 CET,0.0 1.412 2.04 2.454 2.767 3.059 3.345 3.619 4.088 4.288 4.471 4.641 4.951 5.093 5.365 5.625 5.873 5.987 6.202 6.412 6.714 6.912 7.11 7.406 7.672 7.917 8.149 8.352 8.604 8.847 9.085 9.367 9.632 9.876 10.145 10.437 10.715 11.013 11.315 11.641 11.972 12.317 12.675 13.004 13.389 13.748 14.068 14.336 14.479 14.407 13.817 12.638 11.46 10.317 9.282 8.348 7.507 6.729 6.066 5.395 4.807 4.28 3.776 3.279 2.817 2.421 1.999 1.593 1.234 0.877 0.491 0.172 -0.151 -0.496 -0.754 -1.021 -1.31 -1.604 -1.909 -2.125 -2.358 -2.744 -3.025 -3.313 -3.451 -3.729 -4.056 -4.439 -4.639 -4.991 -5.191 -5.394 -5.601 -6.085 -6.36 -6.656 -6.991 -7.372 -7.866 -8.525 -9.967 -8 ,23817 ,KEBNE ,16750317,Thu Dec 2 04:54:31 CET,Thu Dec 2 06:31:54 CET,0.0 1.752 2.472 2.993 3.4 3.764 4.085 4.377 4.885 5.114 5.341 5.599 5.943 6.126 6.464 6.786 7.091 7.234 7.493 7.716 8.011 8.19 8.359 8.602 8.835 9.059 9.284 9.502 9.777 10.04 10.286 10.562 10.824 11.068 11.334 11.626 11.895 12.19 12.491 12.809 13.134 13.48 13.865 14.204 14.568 14.942 15.259 15.488 15.575 15.401 14.688 13.452 12.27 11.165 10.14 9.177 8.326 7.555 6.859 6.163 5.571 5.034 4.528 4.046 3.579 3.14 2.683 2.285 1.938 1.579 1.218 0.907 0.58 0.238 -0.032 -0.313 -0.598 -0.888 -1.199 -1.41 -1.632 -1.999 -2.252 -2.511 -2.642 -2.925 -3.236 -3.572 -3.744 -4.088 -4.29 -4.496 -4.72 -5.19 -5.445 -5.723 -6.03 -6.387 -6.821 -7.377 -8.518 -9 ,22787 ,KEBNE ,16750318,Thu Dec 2 04:54:31 CET,Thu Dec 2 06:31:58 CET,0.0 2.06 2.763 3.215 3.567 3.856 4.122 4.395 4.892 5.109 5.301 5.473 5.79 5.944 6.216 6.467 6.704 6.813 7.036 7.254 7.555 7.736 7.916 8.192 8.447 8.684 8.911 9.124 9.389 9.645 9.888 10.164 10.421 10.66 10.916 11.189 11.468 11.763 12.051 12.367 12.678 12.985 13.319 13.64 13.97 14.285 14.588 14.819 14.94 14.815 14.148 12.945 11.804 10.719 9.676 8.709 7.849 7.078 6.426 5.775 5.205 4.675 4.157 3.685 3.242 2.836 2.388 1.97 1.612 1.243 0.882 0.582 0.255 -0.1 -0.372 -0.643 -0.921 -1.22 -1.564 -1.813 -2.07 -2.483 -2.783 -3.098 -3.257 -3.591 -3.953 -4.29 -4.449 -4.788 -4.997 -5.204 -5.419 -5.888 -6.137 -6.404 -6.728 -7.113 -7.588 -8.254 -9.89 -10 ,14174 ,KEBNE ,16750319,Thu Dec 2 04:54:31 CET,Thu Dec 2 06:31:45 CET,0.0 1.441 1.98 2.36 2.668 2.946 3.2 3.445 3.904 4.116 4.308 4.488 4.804 4.948 5.229 5.509 5.773 5.889 6.107 6.319 6.624 6.804 6.967 7.213 7.461 7.688 7.899 8.105 8.361 8.598 8.826 9.099 9.353 9.605 9.892 10.192 10.497 10.814 11.114 11.422 11.73 12.068 12.407 12.694 13.0 13.297 13.626 13.892 14.033 13.96 13.333 12.165 10.975 9.867 8.881 7.979 7.17 6.402 5.726 5.05 4.469 3.96 3.458 2.97 2.512 2.098 1.667 1.268 0.914 0.563 0.209 -0.084 -0.399 -0.735 -0.985 -1.257 -1.54 -1.832 -2.168 -2.402 -2.629 -2.98 -3.236 -3.498 -3.627 -3.896 -4.195 -4.523 -4.693 -5.034 -5.234 -5.436 -5.64 -6.084 -6.339 -6.605 -6.902 -7.257 -7.699 -8.321 -9.666 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt deleted file mode 100644 index bb802ca1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9659 ,KEBNE ,16750320,Thu Dec 2 04:54:31 CET,Thu Dec 2 06:31:04 CET,0.0 0.741 1.183 1.581 1.911 2.197 2.441 2.653 3.019 3.183 3.357 3.528 3.83 3.969 4.216 4.429 4.629 4.74 4.961 5.153 5.421 5.6 5.774 6.0 6.211 6.423 6.629 6.836 7.096 7.335 7.566 7.844 8.104 8.361 8.667 8.991 9.301 9.632 9.978 10.349 10.727 11.14 11.616 12.074 12.574 13.092 13.644 14.209 14.797 15.349 15.717 15.562 15.17 14.739 14.235 13.686 13.156 12.652 12.195 11.707 11.272 10.869 10.461 10.058 9.697 9.36 8.988 8.655 8.351 8.044 7.724 7.446 7.171 6.883 6.648 6.396 6.13 5.845 5.536 5.329 5.119 4.783 4.544 4.295 4.162 3.892 3.596 3.241 3.062 2.733 2.486 2.253 1.999 1.407 1.07 0.708 0.295 -0.175 -0.752 -1.558 -3.871 -2 ,14303 ,KEBNE ,16750321,Thu Dec 2 04:54:31 CET,Thu Dec 2 06:31:02 CET,0.0 1.124 1.633 2.025 2.323 2.572 2.796 2.995 3.349 3.509 3.66 3.805 4.112 4.244 4.499 4.745 4.974 5.083 5.294 5.485 5.742 5.911 6.078 6.321 6.563 6.793 7.01 7.213 7.465 7.711 7.951 8.231 8.496 8.748 9.045 9.373 9.668 9.996 10.339 10.701 11.085 11.5 11.975 12.416 12.905 13.444 14.049 14.652 15.259 15.854 16.163 15.99 15.566 15.05 14.519 13.972 13.448 12.917 12.443 11.963 11.542 11.143 10.731 10.344 9.991 9.665 9.305 8.972 8.676 8.372 8.055 7.781 7.499 7.191 6.938 6.663 6.374 6.077 5.767 5.556 5.343 5.005 4.758 4.492 4.353 4.083 3.802 3.466 3.284 2.951 2.704 2.484 2.237 1.659 1.331 0.974 0.59 0.157 -0.365 -1.099 -3.403 -3 ,8846 ,KEBNE ,16750322,Thu Dec 2 04:54:31 CET,Thu Dec 2 06:31:18 CET,0.0 0.882 1.281 1.603 1.862 2.103 2.325 2.52 2.888 3.06 3.225 3.376 3.674 3.806 4.059 4.309 4.54 4.645 4.849 5.044 5.327 5.506 5.68 5.932 6.175 6.4 6.607 6.815 7.072 7.319 7.562 7.845 8.104 8.351 8.651 8.976 9.28 9.624 9.98 10.341 10.718 11.134 11.607 12.068 12.586 13.126 13.721 14.342 14.982 15.565 15.932 15.812 15.389 14.917 14.42 13.892 13.374 12.865 12.398 11.912 11.485 11.073 10.662 10.281 9.921 9.584 9.218 8.886 8.6 8.301 7.981 7.694 7.382 7.051 6.791 6.515 6.227 5.947 5.664 5.462 5.253 4.934 4.7 4.439 4.31 4.047 3.755 3.427 3.253 2.917 2.664 2.445 2.221 1.734 1.442 1.131 0.783 0.35 -0.173 -0.879 -3.214 -4 ,23857 ,KEBNE ,16750323,Thu Dec 2 04:55:34 CET,Thu Dec 2 06:31:44 CET,0.0 1.084 1.499 1.833 2.133 2.369 2.57 2.767 3.135 3.3 3.471 3.618 3.923 4.063 4.318 4.552 4.768 4.876 5.083 5.269 5.544 5.726 5.897 6.143 6.382 6.612 6.831 7.037 7.29 7.533 7.769 8.042 8.29 8.537 8.829 9.151 9.453 9.774 10.121 10.498 10.875 11.289 11.779 12.236 12.752 13.301 13.891 14.528 15.17 15.752 16.174 16.047 15.62 15.115 14.609 14.092 13.609 13.129 12.653 12.152 11.714 11.328 10.958 10.58 10.202 9.86 9.505 9.175 8.889 8.599 8.277 7.99 7.699 7.376 7.12 6.862 6.596 6.315 6.012 5.8 5.575 5.229 4.998 4.751 4.621 4.367 4.092 3.774 3.598 3.269 3.046 2.828 2.608 2.123 1.849 1.565 1.223 0.796 0.314 -0.387 -2.901 -5 ,564 ,KEBNE ,16750324,Thu Dec 2 04:56:38 CET,Thu Dec 2 06:33:13 CET,0.0 1.234 1.665 1.971 2.259 2.505 2.725 2.919 3.249 3.41 3.568 3.712 4.02 4.157 4.401 4.641 4.867 4.971 5.166 5.366 5.655 5.826 5.991 6.229 6.452 6.67 6.884 7.088 7.348 7.59 7.828 8.12 8.388 8.634 8.913 9.236 9.545 9.877 10.235 10.613 11.009 11.446 11.936 12.394 12.896 13.427 14.004 14.634 15.28 15.824 16.136 16.009 15.599 15.109 14.6 14.076 13.567 13.063 12.61 12.137 11.692 11.245 10.811 10.418 10.048 9.709 9.361 9.048 8.76 8.459 8.157 7.866 7.548 7.248 7.01 6.764 6.495 6.2 5.904 5.701 5.494 5.157 4.909 4.653 4.519 4.24 3.944 3.62 3.448 3.116 2.897 2.682 2.44 1.897 1.594 1.281 0.931 0.536 0.066 -0.655 -3.358 -6 ,26172 ,KEBNE ,16750325,Thu Dec 2 04:56:38 CET,Thu Dec 2 06:33:09 CET,0.0 1.125 1.573 1.911 2.206 2.481 2.714 2.918 3.302 3.478 3.653 3.812 4.108 4.236 4.486 4.724 4.944 5.046 5.233 5.413 5.679 5.847 6.008 6.248 6.475 6.687 6.898 7.1 7.36 7.613 7.85 8.133 8.415 8.686 8.994 9.34 9.654 9.982 10.327 10.696 11.08 11.499 11.953 12.384 12.883 13.393 13.939 14.542 15.146 15.675 16.038 15.922 15.532 15.0 14.424 13.865 13.336 12.817 12.339 11.837 11.388 10.99 10.609 10.236 9.88 9.541 9.178 8.844 8.539 8.214 7.885 7.613 7.33 7.034 6.788 6.534 6.279 6.011 5.722 5.509 5.284 4.942 4.696 4.437 4.308 4.012 3.673 3.3 3.103 2.742 2.435 2.202 1.943 1.309 0.964 0.594 0.197 -0.247 -0.783 -1.473 -3.583 -7 ,16471 ,KEBNE ,16750326,Thu Dec 2 04:56:38 CET,Thu Dec 2 06:33:25 CET,0.0 1.133 1.619 1.962 2.243 2.477 2.679 2.857 3.2 3.371 3.532 3.677 3.97 4.1 4.353 4.603 4.851 4.963 5.166 5.354 5.616 5.791 5.963 6.195 6.414 6.635 6.849 7.047 7.295 7.532 7.763 8.038 8.294 8.549 8.855 9.193 9.497 9.812 10.159 10.535 10.909 11.31 11.77 12.218 12.71 13.223 13.781 14.369 14.965 15.536 15.926 15.799 15.381 14.841 14.307 13.778 13.267 12.761 12.31 11.86 11.431 11.022 10.623 10.239 9.882 9.55 9.202 8.88 8.576 8.254 7.91 7.605 7.285 6.966 6.719 6.462 6.189 5.914 5.647 5.459 5.25 4.919 4.688 4.425 4.286 4.009 3.7 3.355 3.174 2.838 2.617 2.399 2.169 1.642 1.348 1.037 0.675 0.257 -0.288 -1.001 -3.043 -8 ,25185 ,KEBNE ,16750327,Thu Dec 2 05:00:54 CET,Thu Dec 2 06:37:31 CET,0.0 0.821 1.261 1.597 1.873 2.13 2.385 2.613 2.982 3.154 3.326 3.476 3.772 3.903 4.161 4.402 4.623 4.73 4.933 5.115 5.382 5.562 5.728 5.957 6.184 6.404 6.611 6.798 7.039 7.283 7.527 7.819 8.086 8.34 8.627 8.931 9.227 9.55 9.884 10.241 10.634 11.072 11.562 12.028 12.526 13.083 13.71 14.357 14.984 15.529 15.845 15.638 15.196 14.655 14.091 13.534 13.007 12.475 12.012 11.548 11.131 10.752 10.358 9.962 9.591 9.244 8.885 8.568 8.293 7.994 7.685 7.44 7.162 6.848 6.6 6.341 6.061 5.784 5.51 5.315 5.11 4.771 4.52 4.251 4.112 3.798 3.441 3.07 2.875 2.515 2.233 1.991 1.734 1.152 0.823 0.49 0.108 -0.378 -0.981 -1.755 -4.644 -9 ,30678 ,KEBNE ,16750328,Thu Dec 2 05:11:24 CET,Thu Dec 2 06:46:13 CET,0.0 1.101 1.552 1.898 2.211 2.479 2.697 2.912 3.291 3.45 3.599 3.727 4.031 4.165 4.4 4.608 4.82 4.929 5.14 5.34 5.631 5.82 5.992 6.237 6.472 6.69 6.902 7.105 7.354 7.59 7.823 8.099 8.36 8.621 8.916 9.227 9.538 9.879 10.215 10.557 10.913 11.312 11.771 12.226 12.728 13.239 13.788 14.362 14.962 15.544 15.889 15.67 15.235 14.738 14.188 13.619 13.104 12.607 12.153 11.677 11.259 10.845 10.42 10.043 9.702 9.371 9.008 8.68 8.395 8.093 7.756 7.455 7.143 6.843 6.621 6.379 6.119 5.838 5.542 5.337 5.113 4.749 4.505 4.256 4.12 3.833 3.502 3.142 2.96 2.598 2.296 2.054 1.812 1.334 1.078 0.793 0.477 0.115 -0.375 -1.07 -2.95 -10 ,32765 ,KEBNE ,16750329,Thu Dec 2 05:11:24 CET,Thu Dec 2 06:46:12 CET,0.0 0.974 1.415 1.778 2.063 2.329 2.563 2.782 3.177 3.35 3.52 3.68 3.986 4.126 4.391 4.623 4.833 4.939 5.147 5.346 5.635 5.814 5.985 6.239 6.488 6.714 6.92 7.122 7.378 7.619 7.853 8.13 8.396 8.64 8.929 9.262 9.562 9.882 10.212 10.56 10.942 11.374 11.86 12.309 12.809 13.364 13.955 14.568 15.232 15.845 16.207 16.029 15.613 15.111 14.579 14.047 13.537 13.034 12.561 12.068 11.642 11.25 10.858 10.473 10.107 9.769 9.401 9.054 8.754 8.454 8.142 7.881 7.601 7.303 7.073 6.829 6.555 6.237 5.906 5.69 5.456 5.063 4.773 4.459 4.302 3.992 3.684 3.366 3.203 2.877 2.651 2.458 2.244 1.73 1.445 1.127 0.771 0.37 -0.114 -0.764 -2.625 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 9344d75a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27904 ,KEBNE ,16750330,Thu Dec 2 05:11:23 CET,Thu Dec 2 06:46:19 CET,0.0 1.176 1.701 2.134 2.481 2.787 3.076 3.358 3.888 4.122 4.33 4.548 4.945 5.144 5.523 5.883 6.214 6.373 6.675 6.955 7.339 7.58 7.81 8.123 8.428 8.732 9.018 9.285 9.626 9.949 10.255 10.631 10.997 11.354 11.771 12.228 12.658 13.13 13.646 14.201 14.787 15.439 16.169 16.878 17.692 18.603 19.648 20.788 22.062 23.502 25.092 26.122 26.492 26.569 26.526 26.372 26.158 25.938 25.691 25.364 25.058 24.787 24.522 24.264 24.001 23.737 23.443 23.184 22.96 22.712 22.47 22.274 22.045 21.792 21.605 21.412 21.203 20.976 20.729 20.555 20.381 20.114 19.91 19.695 19.588 19.356 19.102 18.84 18.711 18.387 18.194 17.983 17.746 17.24 16.972 16.668 16.348 15.974 15.465 14.77 13.245 -2 ,23903 ,KEBNE ,16750331,Thu Dec 2 05:11:23 CET,Thu Dec 2 06:46:27 CET,0.0 1.333 2.048 2.628 3.094 3.483 3.822 4.129 4.665 4.912 5.148 5.375 5.746 5.922 6.249 6.54 6.831 6.973 7.233 7.476 7.817 8.039 8.255 8.58 8.9 9.192 9.47 9.733 10.063 10.404 10.732 11.104 11.454 11.8 12.206 12.658 13.091 13.569 14.083 14.617 15.172 15.791 16.511 17.238 18.095 19.038 20.079 21.24 22.55 24.009 25.561 26.545 26.912 26.927 26.843 26.696 26.466 26.199 25.934 25.642 25.368 25.111 24.851 24.587 24.332 24.084 23.82 23.57 23.337 23.093 22.851 22.649 22.419 22.159 21.959 21.773 21.57 21.336 21.092 20.936 20.773 20.5 20.304 20.099 19.989 19.746 19.492 19.224 19.077 18.744 18.56 18.378 18.192 17.787 17.571 17.327 17.033 16.706 16.284 15.734 14.665 -3 ,10042 ,KEBNE ,16750332,Thu Dec 2 05:12:27 CET,Thu Dec 2 06:47:44 CET,0.0 1.318 1.903 2.352 2.729 3.054 3.343 3.598 4.046 4.257 4.453 4.63 4.985 5.152 5.471 5.765 6.044 6.173 6.422 6.671 7.046 7.281 7.51 7.841 8.138 8.436 8.723 8.997 9.352 9.674 9.984 10.366 10.744 11.098 11.488 11.921 12.353 12.829 13.354 13.924 14.505 15.138 15.874 16.606 17.425 18.33 19.365 20.471 21.724 23.152 24.717 25.78 26.17 26.237 26.151 25.99 25.77 25.525 25.288 24.998 24.708 24.413 24.114 23.844 23.6 23.345 23.071 22.833 22.614 22.379 22.12 21.901 21.674 21.439 21.255 21.06 20.853 20.635 20.396 20.234 20.068 19.777 19.563 19.354 19.242 19.004 18.764 18.503 18.361 18.031 17.853 17.656 17.436 16.936 16.661 16.359 15.998 15.617 15.201 14.632 13.371 -4 ,2755 ,KEBNE ,16750333,Thu Dec 2 05:12:27 CET,Thu Dec 2 06:48:04 CET,0.0 1.928 2.616 3.107 3.463 3.757 4.025 4.274 4.726 4.931 5.132 5.32 5.678 5.847 6.177 6.489 6.778 6.911 7.173 7.424 7.778 8.014 8.241 8.549 8.842 9.133 9.417 9.692 10.052 10.386 10.692 11.064 11.43 11.787 12.208 12.69 13.137 13.621 14.142 14.68 15.243 15.868 16.587 17.321 18.164 19.092 20.165 21.333 22.64 24.1 25.668 26.674 27.017 27.091 27.015 26.821 26.6 26.363 26.102 25.772 25.455 25.155 24.85 24.571 24.306 24.051 23.78 23.539 23.324 23.09 22.839 22.637 22.423 22.188 22.003 21.806 21.59 21.362 21.103 20.922 20.755 20.469 20.255 20.039 19.926 19.691 19.433 19.159 19.022 18.707 18.586 18.417 18.224 17.81 17.579 17.31 17.001 16.636 16.217 15.676 14.262 -5 ,24114 ,KEBNE ,16750334,Thu Dec 2 05:12:27 CET,Thu Dec 2 06:47:52 CET,0.0 1.319 1.978 2.481 2.916 3.288 3.613 3.916 4.48 4.741 4.99 5.257 5.656 5.854 6.203 6.506 6.791 6.936 7.219 7.48 7.845 8.072 8.305 8.652 8.956 9.25 9.548 9.836 10.212 10.583 10.924 11.295 11.662 12.029 12.438 12.903 13.346 13.823 14.333 14.877 15.454 16.076 16.804 17.538 18.359 19.267 20.302 21.444 22.705 24.075 25.631 26.646 26.951 26.984 26.868 26.669 26.427 26.177 25.925 25.627 25.365 25.107 24.839 24.579 24.325 24.071 23.801 23.555 23.327 23.082 22.82 22.602 22.371 22.124 21.933 21.738 21.531 21.296 21.046 20.881 20.714 20.45 20.226 19.959 19.822 19.537 19.229 18.908 18.736 18.377 18.158 17.95 17.731 17.231 16.933 16.625 16.301 15.913 15.441 14.735 13.053 -6 ,5108 ,KEBNE ,16750335,Thu Dec 2 05:12:27 CET,Thu Dec 2 06:47:46 CET,0.0 1.206 1.814 2.266 2.628 2.967 3.281 3.567 4.043 4.244 4.434 4.596 4.954 5.125 5.485 5.846 6.181 6.337 6.63 6.92 7.324 7.552 7.76 8.065 8.358 8.64 8.918 9.191 9.541 9.887 10.232 10.634 11.002 11.353 11.762 12.227 12.663 13.124 13.634 14.184 14.753 15.385 16.109 16.845 17.702 18.636 19.686 20.817 22.082 23.534 25.144 26.215 26.552 26.59 26.499 26.302 26.079 25.828 25.582 25.316 25.045 24.775 24.499 24.21 23.928 23.672 23.417 23.188 22.98 22.757 22.515 22.315 22.104 21.873 21.684 21.482 21.277 21.05 20.794 20.628 20.461 20.194 19.996 19.786 19.678 19.452 19.2 18.918 18.778 18.457 18.31 18.145 17.973 17.583 17.354 17.1 16.817 16.479 16.041 15.426 14.051 -7 ,767 ,KEBNE ,16750336,Thu Dec 2 05:12:26 CET,Thu Dec 2 06:48:11 CET,0.0 1.475 2.037 2.48 2.875 3.201 3.464 3.696 4.142 4.357 4.556 4.744 5.114 5.278 5.58 5.895 6.226 6.377 6.639 6.892 7.266 7.513 7.747 8.069 8.381 8.678 8.955 9.223 9.577 9.928 10.286 10.702 11.07 11.419 11.822 12.278 12.721 13.2 13.692 14.239 14.819 15.457 16.19 16.905 17.748 18.701 19.758 20.875 22.137 23.571 25.069 26.017 26.387 26.468 26.365 26.158 25.903 25.621 25.377 25.099 24.816 24.544 24.281 24.029 23.769 23.514 23.247 22.999 22.775 22.545 22.305 22.098 21.873 21.635 21.446 21.249 21.043 20.827 20.59 20.404 20.215 19.949 19.762 19.566 19.464 19.238 19.001 18.748 18.612 18.293 18.124 17.92 17.698 17.21 16.921 16.598 16.226 15.807 15.325 14.647 12.919 -8 ,15899 ,KEBNE ,16750337,Thu Dec 2 05:15:34 CET,Thu Dec 2 06:52:00 CET,0.0 1.653 2.419 2.97 3.366 3.695 3.97 4.213 4.66 4.886 5.094 5.274 5.635 5.802 6.127 6.429 6.707 6.838 7.1 7.358 7.706 7.916 8.131 8.455 8.767 9.063 9.343 9.612 9.958 10.297 10.615 10.98 11.335 11.687 12.082 12.51 12.926 13.382 13.893 14.449 15.021 15.66 16.411 17.137 17.969 18.901 19.939 21.082 22.399 23.909 25.553 26.604 27.011 27.122 27.037 26.876 26.678 26.408 26.136 25.828 25.528 25.257 24.995 24.73 24.458 24.198 23.936 23.708 23.492 23.261 23.016 22.799 22.566 22.317 22.122 21.929 21.729 21.512 21.283 21.12 20.946 20.672 20.479 20.277 20.172 19.949 19.7 19.428 19.283 18.952 18.803 18.634 18.458 18.067 17.837 17.555 17.219 16.826 16.354 15.734 14.354 -9 ,19967 ,KEBNE ,16750338,Thu Dec 2 05:15:34 CET,Thu Dec 2 06:52:21 CET,0.0 1.604 2.321 2.865 3.302 3.647 3.931 4.187 4.651 4.865 5.071 5.291 5.687 5.878 6.195 6.498 6.792 6.927 7.18 7.424 7.779 8.02 8.248 8.566 8.874 9.17 9.462 9.744 10.1 10.447 10.767 11.139 11.506 11.863 12.285 12.76 13.211 13.69 14.199 14.738 15.29 15.919 16.655 17.389 18.248 19.188 20.237 21.393 22.734 24.225 25.758 26.674 26.978 27.049 26.971 26.78 26.543 26.28 26.019 25.72 25.429 25.158 24.884 24.609 24.344 24.084 23.801 23.56 23.338 23.094 22.849 22.629 22.378 22.108 21.899 21.696 21.491 21.25 21.0 20.829 20.627 20.316 20.095 19.868 19.754 19.517 19.277 19.008 18.862 18.526 18.313 18.103 17.88 17.4 17.136 16.856 16.542 16.142 15.692 15.148 13.956 -10 ,27146 ,KEBNE ,16750339,Thu Dec 2 05:17:39 CET,Thu Dec 2 06:53:09 CET,0.0 1.181 1.751 2.188 2.534 2.843 3.121 3.375 3.845 4.06 4.268 4.478 4.848 5.022 5.347 5.64 5.924 6.059 6.332 6.619 7.041 7.298 7.52 7.83 8.136 8.433 8.719 8.995 9.342 9.667 9.971 10.346 10.718 11.075 11.5 11.989 12.452 12.947 13.473 14.034 14.605 15.218 15.964 16.737 17.62 18.553 19.589 20.748 22.063 23.513 25.045 26.102 26.535 26.613 26.482 26.265 26.011 25.718 25.457 25.171 24.883 24.617 24.358 24.103 23.845 23.591 23.323 23.085 22.868 22.636 22.394 22.184 21.96 21.719 21.525 21.313 21.083 20.859 20.634 20.473 20.303 20.032 19.842 19.643 19.539 19.322 19.081 18.799 18.653 18.325 18.15 17.956 17.731 17.229 16.939 16.632 16.334 15.99 15.571 15.034 13.783 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index 65f7c0ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8347 ,KEBNE ,16750340,Thu Dec 2 05:18:42 CET,Thu Dec 2 06:54:59 CET,0.0 1.567 2.145 2.553 2.9 3.202 3.479 3.743 4.193 4.392 4.584 4.772 5.115 5.267 5.553 5.825 6.09 6.222 6.485 6.739 7.096 7.314 7.515 7.808 8.102 8.38 8.636 8.874 9.175 9.462 9.742 10.088 10.419 10.73 11.095 11.495 11.863 12.27 12.72 13.188 13.65 14.175 14.774 15.356 16.019 16.735 17.55 18.428 19.378 20.36 21.195 21.474 21.359 21.071 20.712 20.316 19.913 19.525 19.179 18.793 18.424 18.076 17.745 17.435 17.137 16.844 16.533 16.235 15.978 15.717 15.441 15.195 14.919 14.643 14.438 14.22 13.994 13.768 13.522 13.338 13.147 12.85 12.635 12.409 12.299 12.079 11.823 11.544 11.401 11.069 10.887 10.698 10.503 10.07 9.824 9.559 9.265 8.909 8.441 7.813 5.94 -2 ,26073 ,KEBNE ,16750341,Thu Dec 2 05:18:42 CET,Thu Dec 2 06:54:36 CET,0.0 1.437 2.002 2.451 2.805 3.087 3.357 3.618 4.075 4.276 4.47 4.664 5.013 5.179 5.494 5.786 6.055 6.186 6.446 6.678 7.022 7.244 7.451 7.759 8.052 8.323 8.576 8.817 9.135 9.441 9.729 10.073 10.395 10.704 11.057 11.444 11.818 12.237 12.695 13.163 13.633 14.143 14.722 15.312 15.983 16.697 17.461 18.297 19.258 20.235 21.088 21.407 21.305 21.019 20.664 20.25 19.817 19.404 19.036 18.635 18.268 17.939 17.611 17.287 16.969 16.669 16.359 16.074 15.811 15.544 15.261 15.017 14.772 14.512 14.301 14.085 13.857 13.619 13.349 13.154 12.967 12.674 12.468 12.252 12.14 11.905 11.637 11.341 11.184 10.83 10.583 10.362 10.125 9.612 9.342 9.061 8.76 8.389 7.967 7.371 5.74 -3 ,31183 ,KEBNE ,16750342,Thu Dec 2 05:19:45 CET,Thu Dec 2 06:57:13 CET,0.0 1.633 2.273 2.721 3.099 3.422 3.704 3.961 4.402 4.604 4.799 4.969 5.307 5.461 5.745 6.024 6.295 6.423 6.666 6.899 7.239 7.475 7.707 8.012 8.312 8.598 8.855 9.095 9.417 9.722 10.006 10.363 10.704 11.025 11.384 11.781 12.151 12.555 12.997 13.468 13.953 14.464 15.042 15.62 16.296 17.027 17.82 18.664 19.592 20.526 21.374 21.726 21.612 21.347 21.015 20.63 20.251 19.88 19.507 19.075 18.705 18.397 18.079 17.748 17.442 17.164 16.869 16.6 16.355 16.092 15.812 15.577 15.333 15.087 14.887 14.662 14.427 14.188 13.946 13.785 13.619 13.313 13.078 12.84 12.721 12.488 12.245 11.968 11.808 11.452 11.2 10.969 10.732 10.209 9.91 9.585 9.226 8.795 8.272 7.639 6.195 -4 ,9623 ,KEBNE ,16750343,Thu Dec 2 05:19:45 CET,Thu Dec 2 06:57:27 CET,0.0 1.41 2.022 2.464 2.812 3.123 3.41 3.675 4.154 4.35 4.528 4.713 5.073 5.267 5.64 5.978 6.274 6.405 6.659 6.902 7.238 7.447 7.653 7.953 8.228 8.487 8.741 8.995 9.322 9.623 9.908 10.25 10.568 10.89 11.267 11.674 12.07 12.482 12.911 13.37 13.847 14.383 14.991 15.596 16.294 17.045 17.848 18.74 19.719 20.713 21.622 21.989 21.936 21.65 21.252 20.857 20.481 20.091 19.712 19.301 18.949 18.619 18.287 17.962 17.642 17.352 17.053 16.781 16.527 16.266 15.986 15.731 15.479 15.206 14.987 14.774 14.55 14.301 14.041 13.859 13.659 13.337 13.111 12.853 12.712 12.431 12.139 11.844 11.701 11.383 11.234 11.054 10.852 10.441 10.2 9.914 9.596 9.218 8.765 8.146 6.268 -5 ,23240 ,KEBNE ,16750344,Thu Dec 2 05:19:44 CET,Thu Dec 2 06:57:19 CET,0.0 1.329 1.894 2.314 2.684 2.989 3.256 3.512 3.944 4.143 4.339 4.522 4.868 5.024 5.33 5.613 5.878 6.023 6.316 6.566 6.9 7.116 7.319 7.611 7.894 8.166 8.432 8.687 9.003 9.308 9.593 9.926 10.261 10.589 10.949 11.342 11.712 12.119 12.561 13.012 13.48 14.005 14.605 15.179 15.847 16.569 17.355 18.218 19.161 20.146 21.034 21.357 21.232 20.971 20.638 20.219 19.81 19.401 19.017 18.624 18.262 17.926 17.604 17.284 16.981 16.694 16.39 16.112 15.865 15.606 15.319 15.084 14.838 14.58 14.386 14.181 13.955 13.714 13.461 13.277 13.089 12.806 12.595 12.375 12.26 12.012 11.753 11.482 11.337 11.012 10.854 10.679 10.49 10.043 9.791 9.509 9.177 8.799 8.38 7.864 6.65 -6 ,11063 ,KEBNE ,16750345,Thu Dec 2 05:19:44 CET,Thu Dec 2 06:57:23 CET,0.0 1.662 2.305 2.809 3.248 3.602 3.887 4.135 4.569 4.766 4.963 5.186 5.565 5.761 6.094 6.37 6.645 6.775 7.023 7.256 7.583 7.795 8.005 8.313 8.602 8.867 9.121 9.378 9.696 10.005 10.304 10.658 10.998 11.321 11.698 12.108 12.484 12.886 13.309 13.761 14.238 14.763 15.357 15.937 16.573 17.271 18.084 18.934 19.855 20.805 21.678 22.016 21.889 21.633 21.309 20.919 20.525 20.119 19.737 19.331 18.958 18.635 18.311 17.981 17.669 17.36 17.033 16.753 16.515 16.264 15.983 15.738 15.484 15.226 15.016 14.79 14.564 14.334 14.085 13.901 13.706 13.412 13.212 12.996 12.881 12.638 12.379 12.094 11.944 11.624 11.481 11.315 11.138 10.735 10.485 10.18 9.825 9.393 8.839 8.154 6.513 -7 ,8684 ,KEBNE ,16750346,Thu Dec 2 05:19:45 CET,Thu Dec 2 06:57:02 CET,0.0 1.411 2.008 2.467 2.839 3.152 3.424 3.666 4.089 4.276 4.458 4.64 4.987 5.156 5.479 5.765 6.03 6.156 6.395 6.629 6.966 7.189 7.412 7.726 8.014 8.292 8.563 8.82 9.138 9.441 9.737 10.093 10.423 10.731 11.093 11.49 11.875 12.296 12.727 13.18 13.658 14.174 14.753 15.352 16.023 16.748 17.568 18.424 19.352 20.33 21.275 21.668 21.605 21.347 20.994 20.613 20.238 19.842 19.457 19.059 18.71 18.367 18.006 17.666 17.344 17.034 16.731 16.476 16.248 15.994 15.727 15.497 15.243 14.968 14.746 14.515 14.279 14.033 13.774 13.595 13.409 13.118 12.907 12.681 12.564 12.319 12.057 11.778 11.636 11.318 11.162 10.985 10.789 10.328 10.068 9.797 9.496 9.153 8.721 8.164 6.871 -8 ,16660 ,KEBNE ,16750347,Thu Dec 2 05:20:50 CET,Thu Dec 2 06:59:28 CET,0.0 1.642 2.256 2.69 3.046 3.321 3.569 3.806 4.226 4.425 4.618 4.783 5.131 5.303 5.612 5.893 6.152 6.279 6.527 6.757 7.075 7.287 7.507 7.824 8.11 8.374 8.63 8.875 9.182 9.484 9.772 10.111 10.449 10.777 11.141 11.532 11.912 12.334 12.778 13.238 13.729 14.271 14.871 15.465 16.124 16.805 17.573 18.408 19.346 20.309 21.15 21.463 21.382 21.112 20.734 20.334 19.958 19.575 19.206 18.836 18.49 18.155 17.832 17.511 17.203 16.905 16.585 16.307 16.064 15.8 15.516 15.273 15.026 14.777 14.578 14.365 14.137 13.892 13.632 13.451 13.267 12.99 12.767 12.519 12.401 12.156 11.891 11.612 11.473 11.159 11.006 10.822 10.628 10.196 9.941 9.679 9.404 9.088 8.708 8.185 6.738 -9 ,11514 ,KEBNE ,16750348,Thu Dec 2 05:27:05 CET,Thu Dec 2 07:05:49 CET,0.0 1.319 1.848 2.258 2.623 2.948 3.245 3.546 4.134 4.393 4.628 4.906 5.282 5.455 5.769 6.06 6.34 6.474 6.728 6.975 7.32 7.539 7.75 8.04 8.316 8.575 8.828 9.074 9.391 9.69 9.973 10.312 10.647 10.99 11.37 11.778 12.165 12.567 12.998 13.464 13.938 14.476 15.106 15.707 16.371 17.11 17.941 18.834 19.798 20.767 21.712 22.106 22.0 21.727 21.394 21.011 20.633 20.235 19.859 19.474 19.123 18.783 18.435 18.108 17.795 17.497 17.188 16.914 16.669 16.412 16.136 15.898 15.639 15.376 15.182 14.976 14.748 14.471 14.162 13.956 13.754 13.452 13.24 13.001 12.869 12.601 12.339 12.059 11.911 11.579 11.364 11.145 10.92 10.392 10.08 9.766 9.433 9.036 8.566 8.022 6.776 -10 ,28398 ,KEBNE ,16750349,Thu Dec 2 05:27:05 CET,Thu Dec 2 07:03:02 CET,0.0 1.782 2.449 2.969 3.408 3.768 4.092 4.387 4.911 5.144 5.366 5.64 6.007 6.168 6.459 6.729 6.998 7.126 7.371 7.609 7.944 8.159 8.376 8.7 8.995 9.268 9.546 9.801 10.095 10.379 10.665 11.021 11.364 11.685 12.052 12.464 12.85 13.261 13.707 14.175 14.665 15.207 15.807 16.417 17.105 17.815 18.625 19.512 20.446 21.396 22.313 22.737 22.646 22.357 22.002 21.588 21.169 20.761 20.359 19.917 19.538 19.206 18.894 18.582 18.266 17.967 17.656 17.383 17.148 16.892 16.611 16.367 16.117 15.852 15.62 15.365 15.116 14.879 14.645 14.465 14.26 13.956 13.747 13.529 13.409 13.132 12.846 12.564 12.414 12.087 11.922 11.733 11.533 11.119 10.891 10.616 10.269 9.849 9.365 8.733 7.169 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index ddd6e75a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21925 ,KEBNE ,16750350,Thu Dec 2 05:30:16 CET,Thu Dec 2 07:07:11 CET,0.0 1.563 2.144 2.576 2.938 3.238 3.486 3.719 4.147 4.343 4.524 4.677 5.001 5.158 5.432 5.68 5.923 6.042 6.274 6.49 6.765 6.934 7.103 7.362 7.612 7.84 8.061 8.266 8.519 8.762 8.995 9.27 9.537 9.788 10.061 10.352 10.631 10.944 11.262 11.578 11.901 12.245 12.614 12.983 13.368 13.718 14.038 14.306 14.494 14.416 13.756 12.612 11.453 10.32 9.331 8.443 7.642 6.895 6.237 5.575 5.011 4.51 4.016 3.555 3.118 2.702 2.276 1.905 1.584 1.247 0.895 0.593 0.276 -0.053 -0.307 -0.568 -0.839 -1.114 -1.406 -1.611 -1.815 -2.137 -2.374 -2.619 -2.746 -3.009 -3.303 -3.65 -3.84 -4.219 -4.472 -4.701 -4.953 -5.491 -5.804 -6.143 -6.496 -6.922 -7.434 -8.092 -9.636 -2 ,28727 ,KEBNE ,16750351,Thu Dec 2 05:33:33 CET,Thu Dec 2 07:09:24 CET,0.0 1.732 2.416 2.903 3.265 3.554 3.808 4.047 4.465 4.669 4.889 5.09 5.413 5.56 5.84 6.098 6.332 6.446 6.67 6.883 7.193 7.39 7.569 7.813 8.053 8.29 8.522 8.743 9.0 9.241 9.491 9.788 10.06 10.313 10.592 10.903 11.211 11.526 11.842 12.173 12.497 12.849 13.238 13.587 13.962 14.296 14.607 14.885 15.044 14.903 14.213 13.043 11.87 10.797 9.81 8.888 8.085 7.349 6.684 6.016 5.441 4.91 4.411 3.951 3.511 3.101 2.666 2.278 1.946 1.595 1.227 0.927 0.619 0.276 -0.005 -0.291 -0.585 -0.886 -1.19 -1.394 -1.597 -1.919 -2.155 -2.408 -2.539 -2.815 -3.113 -3.435 -3.605 -3.958 -4.138 -4.325 -4.518 -4.974 -5.249 -5.54 -5.875 -6.287 -6.781 -7.504 -9.146 -3 ,20890 ,KEBNE ,16750352,Thu Dec 2 05:37:47 CET,Thu Dec 2 07:13:33 CET,0.0 1.464 2.187 2.664 3.061 3.385 3.671 3.937 4.398 4.593 4.77 4.939 5.26 5.398 5.663 5.911 6.148 6.269 6.502 6.717 7.008 7.201 7.389 7.657 7.904 8.129 8.358 8.575 8.838 9.086 9.331 9.618 9.874 10.119 10.401 10.718 11.039 11.365 11.656 11.983 12.338 12.696 13.095 13.457 13.806 14.167 14.53 14.796 14.952 14.856 14.115 12.878 11.696 10.585 9.59 8.683 7.873 7.133 6.488 5.831 5.254 4.741 4.27 3.82 3.397 3.005 2.581 2.193 1.857 1.519 1.168 0.871 0.564 0.244 -0.004 -0.262 -0.547 -0.841 -1.131 -1.338 -1.551 -1.874 -2.116 -2.367 -2.491 -2.748 -3.021 -3.318 -3.482 -3.828 -3.99 -4.189 -4.402 -4.846 -5.103 -5.37 -5.654 -5.994 -6.411 -6.947 -8.17 -4 ,5097 ,KEBNE ,16750353,Thu Dec 2 05:37:47 CET,Thu Dec 2 07:14:51 CET,0.0 1.363 2.105 2.657 3.093 3.457 3.774 4.07 4.58 4.786 4.968 5.151 5.485 5.638 5.921 6.176 6.415 6.533 6.759 6.966 7.252 7.434 7.609 7.865 8.113 8.339 8.547 8.755 9.022 9.277 9.517 9.811 10.095 10.352 10.629 10.929 11.213 11.528 11.868 12.208 12.525 12.865 13.25 13.604 13.958 14.305 14.665 14.932 15.066 14.993 14.352 13.149 11.982 10.899 9.898 8.96 8.12 7.363 6.698 6.032 5.458 4.94 4.452 3.981 3.535 3.133 2.717 2.341 2.015 1.663 1.287 0.989 0.676 0.345 0.095 -0.154 -0.424 -0.716 -1.013 -1.222 -1.435 -1.772 -2.014 -2.271 -2.414 -2.728 -3.071 -3.438 -3.615 -3.963 -4.157 -4.355 -4.558 -4.996 -5.24 -5.521 -5.845 -6.187 -6.584 -7.116 -8.26 -5 ,12513 ,KEBNE ,16750354,Thu Dec 2 05:37:47 CET,Thu Dec 2 07:13:29 CET,0.0 1.43 1.99 2.4 2.732 3.032 3.309 3.57 4.02 4.225 4.425 4.622 4.959 5.122 5.411 5.681 5.968 6.11 6.359 6.577 6.88 7.08 7.29 7.6 7.861 8.083 8.307 8.523 8.775 9.033 9.291 9.578 9.844 10.113 10.403 10.682 10.964 11.269 11.573 11.892 12.221 12.586 12.981 13.35 13.741 14.102 14.423 14.696 14.878 14.795 14.216 13.066 11.851 10.719 9.741 8.837 8.014 7.264 6.604 5.96 5.409 4.904 4.384 3.895 3.459 3.042 2.611 2.209 1.86 1.515 1.163 0.872 0.557 0.228 -0.029 -0.292 -0.569 -0.869 -1.177 -1.383 -1.597 -1.922 -2.146 -2.391 -2.527 -2.817 -3.108 -3.413 -3.571 -3.909 -4.092 -4.288 -4.497 -4.92 -5.138 -5.378 -5.653 -5.986 -6.408 -6.933 -8.211 -6 ,17552 ,KEBNE ,16750355,Thu Dec 2 05:37:47 CET,Thu Dec 2 07:14:42 CET,0.0 1.766 2.435 2.985 3.42 3.77 4.078 4.333 4.753 4.934 5.114 5.273 5.594 5.745 6.031 6.296 6.565 6.708 6.977 7.221 7.542 7.734 7.915 8.172 8.42 8.649 8.867 9.073 9.33 9.577 9.809 10.084 10.347 10.586 10.878 11.197 11.488 11.805 12.129 12.448 12.76 13.12 13.52 13.857 14.209 14.544 14.836 15.113 15.291 15.206 14.63 13.496 12.324 11.222 10.201 9.246 8.398 7.627 6.963 6.322 5.774 5.277 4.792 4.326 3.902 3.508 3.079 2.693 2.364 2.013 1.646 1.347 1.027 0.678 0.409 0.147 -0.124 -0.419 -0.725 -0.928 -1.145 -1.489 -1.727 -1.967 -2.097 -2.404 -2.714 -3.016 -3.191 -3.56 -3.811 -4.049 -4.304 -4.868 -5.17 -5.496 -5.859 -6.283 -6.791 -7.49 -9.019 -7 ,21474 ,KEBNE ,16750356,Thu Dec 2 05:37:51 CET,Thu Dec 2 07:07:50 CET,0.0 1.252 1.782 2.162 2.492 2.812 3.09 3.333 3.747 3.939 4.138 4.356 4.713 4.899 5.258 5.579 5.85 5.964 6.179 6.393 6.691 6.874 7.054 7.315 7.556 7.786 8.006 8.215 8.481 8.738 8.974 9.243 9.491 9.709 9.963 10.271 10.548 10.838 11.152 11.462 11.766 12.084 12.439 12.78 13.156 13.501 13.778 13.996 14.126 14.079 13.465 12.284 11.123 10.06 9.115 8.216 7.41 6.665 6.013 5.37 4.806 4.294 3.793 3.321 2.893 2.506 2.108 1.744 1.426 1.094 0.74 0.437 0.119 -0.202 -0.452 -0.728 -1.017 -1.309 -1.619 -1.826 -2.041 -2.388 -2.624 -2.862 -2.989 -3.266 -3.561 -3.887 -4.059 -4.41 -4.585 -4.771 -4.974 -5.414 -5.667 -5.942 -6.243 -6.611 -7.086 -7.65 -8.906 -8 ,1176 ,KEBNE ,16750357,Thu Dec 2 05:38:52 CET,Thu Dec 2 07:15:55 CET,0.0 1.436 2.074 2.59 3.01 3.326 3.595 3.839 4.238 4.439 4.671 4.92 5.27 5.445 5.783 6.111 6.412 6.547 6.788 7.003 7.305 7.495 7.673 7.937 8.208 8.452 8.675 8.888 9.142 9.378 9.602 9.882 10.174 10.442 10.721 11.002 11.275 11.572 11.863 12.163 12.473 12.79 13.153 13.498 13.843 14.198 14.508 14.731 14.846 14.739 14.124 12.953 11.744 10.647 9.651 8.713 7.909 7.179 6.532 5.878 5.295 4.781 4.288 3.798 3.339 2.935 2.515 2.14 1.822 1.493 1.147 0.861 0.549 0.222 -0.032 -0.3 -0.577 -0.864 -1.165 -1.384 -1.613 -1.969 -2.212 -2.461 -2.601 -2.886 -3.178 -3.494 -3.675 -4.051 -4.25 -4.441 -4.654 -5.125 -5.41 -5.736 -6.057 -6.406 -6.813 -7.382 -9.062 -9 ,18844 ,KEBNE ,16750358,Thu Dec 2 05:38:52 CET,Thu Dec 2 07:15:05 CET,0.0 1.645 2.276 2.691 3.032 3.328 3.606 3.859 4.304 4.5 4.678 4.83 5.158 5.31 5.578 5.842 6.1 6.218 6.435 6.632 6.924 7.114 7.285 7.532 7.768 7.999 8.221 8.434 8.702 8.959 9.222 9.525 9.785 10.025 10.297 10.599 10.883 11.178 11.497 11.828 12.162 12.495 12.847 13.186 13.516 13.822 14.082 14.305 14.475 14.362 13.719 12.507 11.3 10.185 9.167 8.245 7.433 6.677 6.014 5.329 4.746 4.236 3.719 3.218 2.77 2.372 1.945 1.559 1.23 0.884 0.534 0.252 -0.057 -0.384 -0.636 -0.9 -1.168 -1.459 -1.77 -1.98 -2.203 -2.564 -2.835 -3.112 -3.246 -3.519 -3.808 -4.138 -4.331 -4.71 -4.907 -5.101 -5.308 -5.76 -6.016 -6.316 -6.676 -7.108 -7.616 -8.273 -9.991 -10 ,20709 ,KEBNE ,16750359,Thu Dec 2 05:49:21 CET,Thu Dec 2 07:25:43 CET,0.0 1.339 1.916 2.3 2.622 2.939 3.233 3.499 3.968 4.162 4.337 4.49 4.814 4.967 5.242 5.505 5.751 5.867 6.095 6.304 6.589 6.765 6.936 7.189 7.429 7.656 7.883 8.103 8.37 8.623 8.858 9.129 9.384 9.623 9.907 10.22 10.504 10.802 11.118 11.453 11.792 12.142 12.513 12.844 13.187 13.537 13.873 14.142 14.319 14.244 13.588 12.394 11.231 10.124 9.101 8.154 7.328 6.601 5.953 5.294 4.729 4.209 3.701 3.232 2.805 2.412 1.969 1.563 1.237 0.914 0.563 0.273 -0.024 -0.347 -0.604 -0.902 -1.235 -1.546 -1.846 -2.057 -2.272 -2.607 -2.841 -3.081 -3.204 -3.46 -3.74 -4.058 -4.227 -4.573 -4.756 -4.96 -5.178 -5.686 -5.985 -6.294 -6.641 -7.095 -7.62 -8.23 -9.816 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index c5d0be5e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11858 ,KEBNE ,16750360,Thu Dec 2 05:49:23 CET,Thu Dec 2 07:20:37 CET,0.0 1.257 1.797 2.205 2.52 2.782 3.027 3.275 3.714 3.903 4.09 4.281 4.618 4.791 5.149 5.507 5.839 5.99 6.287 6.57 6.935 7.146 7.352 7.665 7.958 8.217 8.467 8.718 9.037 9.334 9.628 9.99 10.338 10.667 11.032 11.435 11.823 12.252 12.714 13.193 13.7 14.269 14.928 15.584 16.361 17.237 18.214 19.293 20.511 21.859 23.317 24.284 24.657 24.681 24.525 24.363 24.171 23.903 23.623 23.301 23.014 22.735 22.443 22.154 21.855 21.58 21.299 21.022 20.77 20.508 20.239 20.018 19.771 19.494 19.282 19.053 18.805 18.54 18.237 18.006 17.762 17.387 17.128 16.852 16.698 16.377 16.064 15.759 15.603 15.28 15.044 14.817 14.588 14.098 13.812 13.486 13.142 12.74 12.205 11.474 9.433 -2 ,10522 ,KEBNE ,16750361,Thu Dec 2 06:01:56 CET,Thu Dec 2 07:38:03 CET,0.0 1.684 2.276 2.727 3.131 3.478 3.764 4.014 4.444 4.631 4.814 5.003 5.334 5.498 5.805 6.086 6.34 6.476 6.748 6.99 7.331 7.553 7.758 8.034 8.3 8.564 8.832 9.083 9.402 9.712 10.004 10.347 10.677 11.014 11.411 11.854 12.278 12.741 13.228 13.729 14.255 14.837 15.494 16.161 16.943 17.798 18.751 19.812 21.021 22.353 23.856 24.859 25.217 25.251 25.164 24.977 24.713 24.448 24.18 23.856 23.553 23.244 22.949 22.661 22.346 22.047 21.731 21.436 21.193 20.934 20.637 20.394 20.132 19.853 19.641 19.421 19.187 18.939 18.682 18.501 18.303 17.98 17.737 17.472 17.333 17.012 16.646 16.27 16.074 15.711 15.425 15.177 14.913 14.324 13.993 13.623 13.212 12.744 12.198 11.425 9.351 -3 ,8061 ,KEBNE ,16750362,Thu Dec 2 06:01:56 CET,Thu Dec 2 07:37:54 CET,0.0 1.765 2.451 2.889 3.263 3.605 3.93 4.222 4.725 4.956 5.153 5.329 5.662 5.817 6.125 6.428 6.705 6.836 7.086 7.328 7.669 7.879 8.09 8.402 8.69 8.957 9.225 9.486 9.813 10.129 10.433 10.819 11.197 11.538 11.91 12.34 12.746 13.188 13.673 14.169 14.661 15.237 15.947 16.645 17.46 18.335 19.323 20.433 21.654 22.994 24.479 25.436 25.745 25.82 25.727 25.504 25.236 24.957 24.687 24.348 24.052 23.786 23.503 23.219 22.939 22.672 22.376 22.104 21.839 21.558 21.288 21.057 20.805 20.541 20.329 20.112 19.882 19.629 19.355 19.144 18.91 18.53 18.283 18.044 17.915 17.642 17.349 17.015 16.828 16.469 16.184 15.945 15.69 15.133 14.813 14.464 14.094 13.674 13.15 12.441 10.228 -4 ,11259 ,KEBNE ,16750363,Thu Dec 2 06:01:56 CET,Thu Dec 2 07:37:45 CET,0.0 1.112 1.668 2.079 2.476 2.824 3.123 3.419 3.971 4.213 4.445 4.695 5.036 5.201 5.519 5.8 6.067 6.192 6.432 6.666 7.002 7.22 7.427 7.728 8.011 8.275 8.531 8.776 9.116 9.454 9.757 10.111 10.457 10.798 11.182 11.611 12.024 12.47 12.952 13.458 13.984 14.568 15.217 15.863 16.627 17.46 18.419 19.515 20.758 22.119 23.555 24.447 24.761 24.814 24.692 24.489 24.277 24.041 23.764 23.42 23.092 22.769 22.465 22.199 21.942 21.68 21.364 21.075 20.829 20.565 20.293 20.063 19.81 19.513 19.262 19.009 18.76 18.498 18.214 18.016 17.811 17.5 17.28 17.022 16.883 16.595 16.303 15.993 15.812 15.462 15.219 14.984 14.713 14.121 13.799 13.438 13.05 12.58 11.982 11.183 9.139 -5 ,14226 ,KEBNE ,16750364,Thu Dec 2 06:01:56 CET,Thu Dec 2 07:38:14 CET,0.0 1.436 1.984 2.388 2.722 3.021 3.315 3.58 4.035 4.236 4.431 4.643 4.981 5.142 5.431 5.708 5.974 6.099 6.36 6.632 7.023 7.275 7.52 7.866 8.187 8.473 8.737 8.987 9.322 9.649 9.951 10.305 10.644 10.966 11.341 11.767 12.165 12.603 13.068 13.555 14.09 14.697 15.37 16.024 16.786 17.64 18.634 19.717 20.962 22.342 23.798 24.783 25.117 25.139 25.027 24.811 24.547 24.287 24.07 23.823 23.533 23.244 22.958 22.651 22.352 22.08 21.808 21.556 21.292 21.014 20.713 20.445 20.179 19.915 19.704 19.474 19.205 18.919 18.656 18.474 18.282 17.97 17.739 17.497 17.365 17.044 16.69 16.329 16.128 15.757 15.481 15.263 15.027 14.529 14.264 13.948 13.595 13.213 12.682 11.88 9.689 -6 ,20129 ,KEBNE ,16750365,Thu Dec 2 06:01:55 CET,Thu Dec 2 07:38:16 CET,0.0 1.451 1.99 2.391 2.721 3.013 3.284 3.533 4.007 4.215 4.399 4.581 4.911 5.069 5.364 5.621 5.866 5.991 6.233 6.469 6.822 7.043 7.248 7.536 7.803 8.063 8.319 8.559 8.857 9.156 9.461 9.828 10.18 10.511 10.887 11.31 11.716 12.172 12.659 13.165 13.686 14.258 14.915 15.576 16.36 17.219 18.168 19.219 20.436 21.779 23.204 24.111 24.486 24.583 24.512 24.329 24.093 23.835 23.574 23.275 22.969 22.658 22.336 22.012 21.705 21.428 21.125 20.855 20.61 20.349 20.084 19.846 19.58 19.29 19.049 18.796 18.531 18.246 17.965 17.777 17.584 17.246 16.987 16.733 16.607 16.346 16.051 15.735 15.568 15.232 15.015 14.814 14.606 14.147 13.87 13.565 13.255 12.87 12.327 11.607 9.598 -7 ,10182 ,KEBNE ,16750366,Thu Dec 2 06:04:07 CET,Thu Dec 2 07:36:43 CET,0.0 1.444 2.003 2.388 2.709 2.999 3.27 3.521 3.985 4.196 4.384 4.575 4.909 5.066 5.4 5.741 6.05 6.195 6.485 6.756 7.101 7.324 7.563 7.904 8.218 8.522 8.803 9.059 9.388 9.709 10.022 10.401 10.759 11.095 11.477 11.892 12.291 12.735 13.213 13.72 14.258 14.864 15.543 16.209 17.003 17.885 18.844 19.894 21.088 22.413 23.85 24.779 25.093 25.155 25.045 24.829 24.6 24.339 24.06 23.725 23.418 23.151 22.868 22.57 22.277 21.977 21.662 21.386 21.14 20.884 20.623 20.386 20.138 19.889 19.676 19.439 19.175 18.889 18.591 18.397 18.203 17.861 17.605 17.345 17.22 16.944 16.611 16.253 16.068 15.713 15.417 15.16 14.897 14.333 14.012 13.649 13.261 12.859 12.324 11.619 9.452 -8 ,2327 ,KEBNE ,16750367,Thu Dec 2 06:07:20 CET,Thu Dec 2 07:40:46 CET,0.0 1.143 1.678 2.119 2.54 2.922 3.25 3.54 4.019 4.224 4.438 4.679 5.016 5.175 5.481 5.759 6.016 6.143 6.39 6.621 6.948 7.152 7.348 7.634 7.912 8.192 8.464 8.72 9.051 9.381 9.693 10.051 10.39 10.72 11.099 11.506 11.906 12.352 12.842 13.369 13.912 14.524 15.224 15.907 16.699 17.566 18.523 19.585 20.761 22.07 23.56 24.594 24.936 24.964 24.853 24.672 24.467 24.225 23.945 23.622 23.33 23.046 22.755 22.464 22.17 21.902 21.635 21.384 21.158 20.892 20.567 20.29 20.0 19.679 19.423 19.152 18.858 18.552 18.258 18.061 17.856 17.529 17.296 17.045 16.912 16.607 16.269 15.923 15.73 15.367 15.093 14.856 14.611 14.077 13.766 13.417 13.017 12.51 11.875 11.054 8.661 -9 ,27579 ,KEBNE ,16750368,Thu Dec 2 06:08:25 CET,Thu Dec 2 07:42:51 CET,0.0 1.434 2.073 2.541 2.936 3.295 3.614 3.915 4.429 4.638 4.83 5.036 5.371 5.531 5.842 6.127 6.386 6.511 6.749 6.976 7.311 7.532 7.741 8.029 8.305 8.572 8.828 9.084 9.413 9.713 10.012 10.369 10.702 11.029 11.421 11.866 12.286 12.736 13.21 13.701 14.216 14.808 15.496 16.176 16.959 17.828 18.803 19.867 21.05 22.396 23.879 24.844 25.17 25.194 25.06 24.837 24.621 24.386 24.122 23.808 23.488 23.201 22.894 22.564 22.288 22.023 21.702 21.432 21.209 20.946 20.653 20.431 20.192 19.904 19.661 19.382 19.094 18.824 18.527 18.303 18.068 17.691 17.437 17.195 17.069 16.798 16.509 16.177 15.975 15.604 15.325 15.078 14.822 14.237 13.903 13.548 13.191 12.826 12.322 11.601 8.869 -10 ,21120 ,KEBNE ,16750369,Thu Dec 2 06:14:43 CET,Thu Dec 2 07:51:13 CET,0.0 1.404 1.997 2.449 2.79 3.094 3.385 3.675 4.226 4.469 4.691 4.932 5.278 5.457 5.806 6.103 6.37 6.503 6.746 6.97 7.296 7.509 7.706 7.99 8.275 8.54 8.808 9.066 9.377 9.683 9.988 10.371 10.74 11.091 11.495 11.93 12.321 12.757 13.247 13.758 14.293 14.879 15.544 16.19 16.919 17.739 18.701 19.76 20.923 22.267 23.773 24.738 25.045 25.091 25.022 24.869 24.628 24.34 24.03 23.681 23.374 23.096 22.819 22.525 22.245 21.969 21.655 21.375 21.131 20.841 20.544 20.329 20.089 19.833 19.634 19.416 19.176 18.907 18.627 18.435 18.239 17.942 17.717 17.467 17.332 17.036 16.71 16.339 16.145 15.793 15.519 15.3 15.078 14.558 14.259 13.96 13.63 13.249 12.783 12.065 9.773 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt deleted file mode 100644 index 21f5053f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25705 ,KEBNE ,16750370,Thu Dec 2 06:14:43 CET,Thu Dec 2 07:50:53 CET,0.0 1.335 1.948 2.403 2.757 3.087 3.373 3.611 4.033 4.231 4.415 4.576 4.907 5.07 5.384 5.694 6.015 6.169 6.45 6.695 7.038 7.259 7.468 7.759 8.036 8.308 8.566 8.816 9.141 9.463 9.774 10.138 10.479 10.798 11.173 11.592 11.993 12.444 12.922 13.417 13.938 14.516 15.173 15.835 16.627 17.481 18.409 19.433 20.583 21.803 23.064 23.854 24.085 24.061 23.863 23.598 23.289 22.93 22.627 22.293 21.98 21.695 21.396 21.094 20.783 20.48 20.166 19.883 19.615 19.345 19.071 18.837 18.595 18.331 18.122 17.89 17.621 17.331 17.053 16.875 16.678 16.338 16.098 15.86 15.733 15.424 15.087 14.75 14.569 14.205 13.954 13.723 13.479 12.983 12.701 12.37 11.999 11.556 11.031 10.267 8.386 -2 ,1293 ,KEBNE ,16750371,Thu Dec 2 06:14:43 CET,Thu Dec 2 07:49:54 CET,0.0 1.518 2.094 2.524 2.903 3.233 3.525 3.804 4.296 4.501 4.693 4.899 5.267 5.439 5.736 6.015 6.276 6.397 6.637 6.873 7.222 7.446 7.653 7.941 8.215 8.481 8.737 8.98 9.293 9.608 9.911 10.264 10.607 10.94 11.319 11.731 12.136 12.585 13.064 13.565 14.073 14.656 15.319 15.959 16.711 17.555 18.498 19.561 20.788 22.088 23.439 24.287 24.583 24.6 24.447 24.214 23.943 23.665 23.395 23.067 22.748 22.457 22.146 21.818 21.515 21.243 20.952 20.674 20.426 20.172 19.884 19.625 19.348 19.059 18.843 18.614 18.373 18.097 17.786 17.594 17.396 17.065 16.831 16.548 16.384 16.047 15.68 15.28 15.097 14.759 14.531 14.305 14.042 13.393 13.033 12.693 12.334 11.902 11.405 10.759 8.916 -3 ,28306 ,KEBNE ,16750372,Thu Dec 2 06:16:54 CET,Thu Dec 2 07:52:45 CET,0.0 1.391 1.997 2.487 2.886 3.223 3.545 3.861 4.417 4.658 4.892 5.153 5.527 5.713 6.051 6.344 6.639 6.788 7.06 7.303 7.63 7.848 8.051 8.334 8.609 8.889 9.179 9.442 9.76 10.067 10.366 10.725 11.073 11.403 11.771 12.19 12.592 13.029 13.499 14.001 14.521 15.102 15.763 16.414 17.198 18.056 18.976 19.947 21.076 22.379 23.73 24.51 24.747 24.746 24.58 24.321 24.033 23.742 23.446 23.111 22.805 22.507 22.203 21.894 21.593 21.316 21.017 20.729 20.476 20.197 19.905 19.678 19.409 19.1 18.876 18.649 18.393 18.125 17.847 17.647 17.446 17.137 16.898 16.624 16.489 16.202 15.892 15.583 15.413 15.059 14.809 14.568 14.322 13.817 13.536 13.237 12.89 12.448 11.886 11.154 8.916 -4 ,7711 ,KEBNE ,16750373,Thu Dec 2 06:16:54 CET,Thu Dec 2 07:53:16 CET,0.0 1.773 2.406 2.859 3.21 3.534 3.847 4.151 4.688 4.927 5.147 5.38 5.741 5.91 6.231 6.541 6.815 6.942 7.19 7.426 7.757 7.96 8.157 8.456 8.747 9.022 9.278 9.516 9.821 10.121 10.415 10.784 11.139 11.463 11.832 12.242 12.63 13.06 13.532 14.031 14.548 15.131 15.772 16.412 17.186 18.029 18.974 20.013 21.149 22.383 23.692 24.513 24.773 24.772 24.601 24.323 24.02 23.724 23.46 23.124 22.787 22.499 22.207 21.925 21.648 21.356 21.05 20.784 20.535 20.252 19.961 19.729 19.486 19.204 18.97 18.735 18.493 18.238 17.95 17.737 17.525 17.209 16.988 16.742 16.602 16.315 16.026 15.698 15.52 15.174 14.956 14.748 14.543 14.087 13.824 13.509 13.155 12.761 12.256 11.563 9.599 -5 ,28195 ,KEBNE ,16750374,Thu Dec 2 06:16:54 CET,Thu Dec 2 07:52:40 CET,0.0 1.483 2.145 2.615 3.017 3.386 3.698 3.961 4.401 4.594 4.773 4.945 5.298 5.463 5.757 6.03 6.302 6.436 6.694 6.933 7.265 7.474 7.669 7.96 8.255 8.53 8.794 9.057 9.391 9.698 9.99 10.342 10.688 11.025 11.391 11.801 12.226 12.671 13.13 13.623 14.125 14.679 15.314 15.959 16.693 17.5 18.46 19.515 20.654 21.918 23.277 24.104 24.353 24.315 24.133 23.867 23.585 23.276 22.97 22.64 22.307 21.992 21.694 21.397 21.107 20.827 20.535 20.25 19.988 19.724 19.434 19.188 18.94 18.661 18.422 18.175 17.93 17.671 17.387 17.184 16.976 16.651 16.42 16.179 16.056 15.795 15.514 15.206 15.031 14.676 14.445 14.236 14.012 13.485 13.196 12.893 12.518 12.063 11.565 10.876 8.927 -6 ,18021 ,KEBNE ,16750375,Thu Dec 2 06:16:58 CET,Thu Dec 2 07:48:40 CET,0.0 1.622 2.32 2.832 3.218 3.509 3.775 4.04 4.5 4.701 4.891 5.084 5.431 5.589 5.888 6.17 6.444 6.578 6.847 7.128 7.497 7.708 7.933 8.277 8.575 8.841 9.102 9.356 9.675 9.987 10.296 10.655 10.991 11.313 11.689 12.11 12.498 12.922 13.385 13.876 14.396 14.994 15.655 16.286 17.033 17.822 18.743 19.789 20.945 22.228 23.585 24.422 24.669 24.66 24.506 24.241 23.938 23.634 23.339 23.018 22.716 22.423 22.114 21.809 21.534 21.268 20.981 20.722 20.473 20.202 19.938 19.72 19.48 19.212 18.994 18.764 18.505 18.23 17.929 17.723 17.514 17.159 16.898 16.604 16.444 16.108 15.751 15.357 15.144 14.764 14.474 14.226 13.986 13.478 13.18 12.813 12.358 11.842 11.236 10.439 8.03 -7 ,21292 ,KEBNE ,16750376,Thu Dec 2 06:16:54 CET,Thu Dec 2 07:53:14 CET,0.0 1.69 2.282 2.691 3.031 3.331 3.601 3.858 4.364 4.596 4.825 5.075 5.451 5.639 5.972 6.272 6.558 6.692 6.948 7.196 7.529 7.732 7.934 8.234 8.511 8.776 9.039 9.289 9.603 9.911 10.209 10.555 10.898 11.227 11.598 12.029 12.448 12.88 13.345 13.852 14.379 14.957 15.644 16.328 17.096 17.948 18.893 19.95 21.144 22.442 23.802 24.693 25.024 25.005 24.842 24.586 24.27 23.969 23.685 23.363 23.069 22.779 22.483 22.203 21.908 21.601 21.285 20.986 20.719 20.447 20.159 19.916 19.648 19.368 19.146 18.915 18.674 18.405 18.09 17.856 17.607 17.236 17.002 16.743 16.59 16.236 15.863 15.471 15.26 14.874 14.579 14.331 14.094 13.577 13.276 12.966 12.622 12.2 11.671 10.964 8.912 -8 ,2450 ,KEBNE ,16750377,Thu Dec 2 06:16:54 CET,Thu Dec 2 07:52:58 CET,0.0 1.671 2.333 2.815 3.21 3.556 3.844 4.097 4.533 4.725 4.912 5.091 5.433 5.589 5.881 6.154 6.405 6.525 6.768 7.001 7.334 7.556 7.77 8.08 8.376 8.642 8.899 9.171 9.522 9.832 10.122 10.48 10.816 11.124 11.475 11.882 12.289 12.74 13.219 13.72 14.226 14.796 15.485 16.155 16.874 17.688 18.634 19.641 20.79 22.064 23.396 24.191 24.473 24.488 24.316 24.088 23.84 23.547 23.24 22.912 22.603 22.296 21.976 21.67 21.392 21.111 20.802 20.513 20.255 19.977 19.677 19.435 19.171 18.883 18.645 18.378 18.113 17.847 17.56 17.364 17.162 16.827 16.595 16.331 16.18 15.868 15.556 15.255 15.094 14.747 14.504 14.284 14.055 13.515 13.202 12.879 12.53 12.124 11.618 10.934 8.826 -9 ,6288 ,KEBNE ,16750378,Thu Dec 2 06:16:54 CET,Thu Dec 2 07:52:55 CET,0.0 1.758 2.457 3.024 3.469 3.847 4.168 4.451 4.928 5.144 5.357 5.594 5.955 6.114 6.446 6.791 7.085 7.216 7.471 7.714 8.068 8.279 8.488 8.789 9.058 9.329 9.6 9.862 10.186 10.477 10.76 11.104 11.427 11.758 12.14 12.552 12.95 13.405 13.895 14.385 14.888 15.452 16.109 16.741 17.483 18.311 19.255 20.321 21.477 22.703 24.005 24.821 25.071 25.053 24.911 24.649 24.347 24.068 23.759 23.418 23.135 22.861 22.575 22.296 22.034 21.767 21.474 21.215 20.97 20.669 20.36 20.126 19.839 19.529 19.308 19.073 18.821 18.561 18.294 18.11 17.898 17.523 17.266 17.014 16.888 16.61 16.269 15.852 15.637 15.261 15.018 14.813 14.586 14.103 13.829 13.477 13.063 12.578 12.004 11.251 9.348 -10 ,16944 ,KEBNE ,16750379,Thu Dec 2 06:16:54 CET,Thu Dec 2 07:52:59 CET,0.0 1.295 1.785 2.227 2.656 2.985 3.251 3.506 3.991 4.228 4.449 4.672 5.026 5.178 5.481 5.774 6.06 6.212 6.516 6.782 7.119 7.327 7.53 7.834 8.118 8.384 8.643 8.894 9.21 9.508 9.794 10.159 10.513 10.837 11.203 11.606 11.998 12.421 12.869 13.347 13.866 14.44 15.1 15.762 16.522 17.369 18.316 19.361 20.527 21.799 23.155 24.01 24.276 24.237 24.063 23.827 23.559 23.275 22.982 22.629 22.306 22.016 21.734 21.455 21.167 20.889 20.577 20.289 20.028 19.75 19.465 19.221 18.957 18.666 18.44 18.2 17.948 17.678 17.386 17.178 16.954 16.612 16.37 16.114 15.979 15.711 15.441 15.132 14.96 14.621 14.397 14.168 13.928 13.412 13.129 12.801 12.429 12.016 11.525 10.855 8.908 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt deleted file mode 100644 index 3b186e53..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18205 ,KEBNE ,16750380,Thu Dec 2 06:17:59 CET,Thu Dec 2 07:55:38 CET,0.0 1.98 2.618 3.07 3.423 3.727 4.007 4.277 4.763 4.968 5.156 5.347 5.695 5.854 6.163 6.464 6.771 6.93 7.211 7.453 7.786 7.995 8.195 8.487 8.787 9.106 9.418 9.687 9.994 10.294 10.608 10.982 11.317 11.643 12.024 12.441 12.834 13.258 13.727 14.216 14.725 15.299 15.921 16.53 17.21 17.966 18.835 19.757 20.76 21.856 22.951 23.474 23.552 23.429 23.199 22.898 22.565 22.176 21.796 21.42 21.085 20.781 20.465 20.16 19.862 19.57 19.28 19.03 18.803 18.552 18.275 18.04 17.797 17.538 17.336 17.131 16.912 16.651 16.356 16.171 15.99 15.683 15.469 15.249 15.129 14.883 14.621 14.328 14.168 13.819 13.558 13.332 13.102 12.602 12.318 11.995 11.617 11.195 10.691 10.033 8.229 -2 ,23170 ,KEBNE ,16750381,Thu Dec 2 06:18:01 CET,Thu Dec 2 07:51:33 CET,0.0 1.885 2.548 3.019 3.421 3.765 4.056 4.318 4.786 5.003 5.204 5.411 5.77 5.95 6.283 6.58 6.863 7.013 7.303 7.571 7.962 8.198 8.406 8.696 8.969 9.243 9.506 9.765 10.121 10.475 10.815 11.194 11.541 11.871 12.245 12.655 13.048 13.499 13.974 14.439 14.916 15.467 16.122 16.74 17.419 18.168 19.003 19.926 20.958 22.038 23.059 23.55 23.595 23.45 23.197 22.869 22.531 22.198 21.886 21.528 21.184 20.874 20.568 20.266 19.968 19.678 19.373 19.095 18.859 18.62 18.345 18.108 17.875 17.633 17.439 17.229 17.003 16.77 16.519 16.344 16.162 15.874 15.668 15.447 15.329 15.07 14.77 14.435 14.256 13.904 13.686 13.462 13.238 12.819 12.584 12.308 11.994 11.648 11.23 10.645 9.229 -3 ,31526 ,KEBNE ,16750382,Thu Dec 2 06:17:59 CET,Thu Dec 2 07:57:04 CET,0.0 1.558 2.198 2.686 3.071 3.384 3.672 3.927 4.368 4.578 4.776 4.966 5.312 5.473 5.789 6.098 6.376 6.507 6.76 7.001 7.384 7.651 7.898 8.245 8.565 8.842 9.097 9.347 9.663 9.97 10.262 10.619 10.981 11.324 11.702 12.119 12.518 12.947 13.412 13.91 14.428 15.021 15.662 16.264 16.954 17.699 18.544 19.486 20.515 21.539 22.517 23.063 23.15 22.983 22.73 22.429 22.09 21.723 21.363 21.008 20.711 20.403 20.096 19.814 19.516 19.219 18.913 18.639 18.401 18.144 17.866 17.639 17.401 17.139 16.932 16.723 16.507 16.286 16.038 15.85 15.664 15.368 15.152 14.932 14.815 14.556 14.281 14.002 13.836 13.478 13.229 13.008 12.776 12.23 11.929 11.629 11.264 10.845 10.358 9.682 8.039 -4 ,27230 ,KEBNE ,16750383,Thu Dec 2 06:17:59 CET,Thu Dec 2 07:56:01 CET,0.0 1.868 2.605 3.157 3.583 3.912 4.179 4.433 4.881 5.09 5.3 5.522 5.874 6.037 6.348 6.654 6.954 7.106 7.409 7.698 8.089 8.341 8.592 8.941 9.237 9.503 9.772 10.042 10.405 10.758 11.089 11.482 11.842 12.183 12.604 13.057 13.455 13.879 14.323 14.815 15.323 15.863 16.498 17.134 17.851 18.617 19.472 20.409 21.43 22.482 23.519 24.048 24.097 23.939 23.657 23.321 22.989 22.648 22.336 21.988 21.635 21.318 21.008 20.701 20.412 20.132 19.818 19.533 19.297 19.04 18.747 18.495 18.235 17.955 17.733 17.497 17.254 17.004 16.744 16.567 16.374 16.061 15.843 15.602 15.475 15.229 14.966 14.673 14.515 14.182 14.002 13.809 13.606 13.177 12.942 12.679 12.375 12.024 11.585 10.961 9.332 -5 ,32593 ,KEBNE ,16750384,Thu Dec 2 06:21:09 CET,Thu Dec 2 07:59:15 CET,0.0 1.79 2.417 2.867 3.258 3.619 3.915 4.178 4.644 4.857 5.084 5.336 5.709 5.901 6.27 6.623 6.943 7.088 7.376 7.665 8.068 8.313 8.53 8.839 9.157 9.477 9.775 10.039 10.363 10.666 10.958 11.311 11.644 11.965 12.34 12.749 13.137 13.565 14.028 14.506 14.992 15.556 16.221 16.873 17.592 18.347 19.23 20.2 21.229 22.297 23.329 23.842 23.842 23.647 23.379 23.078 22.74 22.379 22.038 21.674 21.335 21.001 20.686 20.389 20.097 19.823 19.532 19.261 19.017 18.76 18.483 18.247 18.0 17.737 17.53 17.312 17.079 16.849 16.608 16.433 16.25 15.939 15.713 15.477 15.354 15.105 14.84 14.524 14.343 14.01 13.838 13.652 13.456 12.986 12.701 12.394 12.057 11.654 11.126 10.462 9.091 -6 ,16501 ,KEBNE ,16750385,Thu Dec 2 06:21:09 CET,Thu Dec 2 07:59:22 CET,0.0 2.034 2.709 3.185 3.592 3.917 4.189 4.434 4.896 5.103 5.302 5.496 5.827 5.987 6.286 6.553 6.821 6.954 7.201 7.429 7.769 7.994 8.209 8.509 8.797 9.072 9.32 9.569 9.911 10.228 10.519 10.875 11.238 11.59 11.984 12.409 12.805 13.232 13.677 14.154 14.646 15.202 15.855 16.498 17.225 17.995 18.84 19.721 20.705 21.812 22.888 23.427 23.457 23.284 23.025 22.713 22.37 22.015 21.701 21.354 21.023 20.714 20.4 20.073 19.767 19.494 19.204 18.938 18.698 18.44 18.153 17.921 17.68 17.416 17.211 16.994 16.746 16.484 16.234 16.063 15.877 15.593 15.395 15.168 15.036 14.739 14.432 14.117 13.968 13.653 13.478 13.294 13.096 12.662 12.429 12.181 11.873 11.465 10.93 10.239 8.576 -7 ,71 ,KEBNE ,16750386,Thu Dec 2 06:21:09 CET,Thu Dec 2 07:59:02 CET,0.0 1.686 2.286 2.747 3.124 3.452 3.742 4.0 4.454 4.664 4.861 5.034 5.372 5.539 5.839 6.142 6.447 6.591 6.856 7.098 7.443 7.671 7.891 8.187 8.459 8.724 8.991 9.262 9.596 9.925 10.246 10.604 10.952 11.299 11.696 12.107 12.493 12.922 13.379 13.894 14.423 14.979 15.623 16.261 16.986 17.767 18.629 19.539 20.559 21.639 22.72 23.303 23.368 23.188 22.899 22.582 22.274 21.961 21.632 21.26 20.907 20.582 20.288 20.005 19.714 19.434 19.151 18.899 18.652 18.377 18.104 17.881 17.654 17.413 17.221 17.002 16.731 16.436 16.135 15.931 15.729 15.425 15.213 14.993 14.877 14.64 14.364 14.037 13.863 13.514 13.316 13.131 12.935 12.518 12.278 11.971 11.584 11.151 10.625 9.893 8.416 -8 ,24088 ,KEBNE ,16750387,Thu Dec 2 06:21:09 CET,Thu Dec 2 07:59:37 CET,0.0 1.608 2.317 2.852 3.286 3.651 3.98 4.288 4.817 5.056 5.266 5.444 5.782 5.947 6.272 6.563 6.832 6.963 7.232 7.485 7.833 8.053 8.257 8.543 8.821 9.092 9.349 9.609 9.942 10.249 10.552 10.907 11.239 11.573 11.979 12.416 12.808 13.229 13.682 14.169 14.676 15.232 15.87 16.484 17.184 17.959 18.821 19.729 20.706 21.738 22.765 23.325 23.432 23.28 23.014 22.69 22.351 22.014 21.709 21.386 21.073 20.76 20.448 20.139 19.838 19.556 19.251 18.975 18.738 18.484 18.202 17.974 17.738 17.474 17.255 17.015 16.764 16.517 16.267 16.084 15.864 15.493 15.244 14.975 14.839 14.579 14.319 14.035 13.882 13.55 13.346 13.138 12.892 12.355 12.069 11.746 11.38 10.953 10.403 9.67 7.804 -9 ,20149 ,KEBNE ,16750388,Thu Dec 2 06:21:09 CET,Thu Dec 2 07:55:13 CET,0.0 1.756 2.357 2.826 3.228 3.56 3.83 4.09 4.602 4.84 5.047 5.224 5.569 5.757 6.118 6.451 6.779 6.937 7.242 7.531 7.93 8.172 8.405 8.72 9.006 9.281 9.554 9.814 10.145 10.469 10.768 11.124 11.485 11.83 12.203 12.608 12.992 13.415 13.868 14.344 14.838 15.382 16.031 16.67 17.378 18.124 18.953 19.867 20.871 21.956 23.01 23.554 23.584 23.388 23.094 22.784 22.459 22.086 21.746 21.403 21.079 20.77 20.439 20.128 19.854 19.578 19.281 19.006 18.762 18.505 18.239 18.02 17.781 17.531 17.322 17.082 16.839 16.569 16.249 16.041 15.828 15.467 15.221 14.996 14.887 14.654 14.401 14.131 13.985 13.665 13.494 13.313 13.125 12.658 12.392 12.12 11.811 11.461 11.058 10.522 9.111 -10 ,26056 ,KEBNE ,16750389,Thu Dec 2 06:21:09 CET,Thu Dec 2 07:59:53 CET,0.0 1.904 2.515 3.055 3.542 3.947 4.288 4.61 5.171 5.43 5.669 5.893 6.27 6.474 6.841 7.185 7.512 7.67 7.957 8.205 8.583 8.848 9.093 9.414 9.705 9.973 10.229 10.498 10.836 11.151 11.453 11.799 12.131 12.448 12.808 13.206 13.598 14.035 14.497 15.006 15.54 16.091 16.707 17.324 18.011 18.775 19.662 20.63 21.665 22.739 23.799 24.311 24.325 24.211 24.011 23.694 23.348 22.987 22.653 22.275 21.931 21.629 21.303 20.979 20.685 20.417 20.138 19.872 19.629 19.371 19.081 18.836 18.584 18.317 18.116 17.911 17.687 17.441 17.184 17.001 16.799 16.482 16.271 16.061 15.946 15.675 15.393 15.101 14.95 14.629 14.456 14.268 14.064 13.558 13.259 12.953 12.609 12.232 11.787 11.193 9.678 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index 808d30fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29511 ,KEBNE ,16750390,Thu Dec 2 06:21:09 CET,Thu Dec 2 07:58:53 CET,0.0 1.514 2.143 2.608 2.997 3.321 3.595 3.869 4.396 4.638 4.882 5.158 5.561 5.77 6.139 6.454 6.752 6.888 7.141 7.391 7.764 8.014 8.257 8.597 8.924 9.252 9.577 9.879 10.243 10.59 10.935 11.362 11.764 12.146 12.598 13.114 13.622 14.177 14.773 15.405 16.071 16.821 17.668 18.522 19.54 20.64 21.892 23.306 24.889 26.611 28.376 29.482 29.863 29.862 29.688 29.458 29.171 28.847 28.512 28.152 27.826 27.506 27.195 26.906 26.624 26.353 26.038 25.735 25.481 25.22 24.941 24.71 24.462 24.195 23.978 23.722 23.454 23.169 22.863 22.667 22.47 22.15 21.919 21.689 21.57 21.312 21.024 20.674 20.481 20.115 19.864 19.643 19.428 18.974 18.708 18.426 18.123 17.745 17.258 16.583 15.318 -2 ,6770 ,KEBNE ,16750391,Thu Dec 2 06:21:09 CET,Thu Dec 2 08:00:10 CET,0.0 1.397 2.059 2.587 3.033 3.429 3.794 4.12 4.683 4.939 5.187 5.447 5.841 6.041 6.426 6.796 7.153 7.32 7.612 7.875 8.283 8.568 8.844 9.237 9.586 9.902 10.219 10.547 10.951 11.326 11.703 12.14 12.556 12.957 13.42 13.934 14.426 14.974 15.553 16.176 16.844 17.576 18.437 19.299 20.269 21.366 22.642 24.074 25.692 27.394 29.086 30.148 30.487 30.471 30.28 29.998 29.709 29.403 29.089 28.715 28.343 28.003 27.674 27.36 27.056 26.763 26.444 26.17 25.931 25.648 25.349 25.116 24.877 24.622 24.418 24.185 23.931 23.669 23.389 23.198 22.998 22.684 22.466 22.206 22.078 21.836 21.57 21.291 21.129 20.771 20.508 20.268 20.024 19.482 19.165 18.838 18.538 18.204 17.799 17.25 15.95 -3 ,17257 ,KEBNE ,16750392,Thu Dec 2 06:23:17 CET,Thu Dec 2 08:01:09 CET,0.0 1.427 1.985 2.384 2.72 3.029 3.315 3.582 4.032 4.238 4.439 4.615 4.973 5.139 5.456 5.766 6.074 6.223 6.51 6.781 7.154 7.393 7.624 7.965 8.317 8.679 9.028 9.364 9.791 10.172 10.533 10.958 11.365 11.761 12.206 12.708 13.194 13.736 14.336 14.969 15.622 16.36 17.249 18.135 19.128 20.219 21.447 22.763 24.305 26.107 28.053 29.239 29.556 29.473 29.256 29.004 28.704 28.369 28.037 27.668 27.328 27.006 26.695 26.393 26.105 25.809 25.469 25.161 24.909 24.641 24.33 24.064 23.768 23.437 23.185 22.943 22.703 22.451 22.169 21.969 21.768 21.446 21.213 20.978 20.862 20.616 20.346 20.05 19.891 19.55 19.364 19.175 18.974 18.519 18.248 17.957 17.643 17.314 16.896 16.235 14.737 -4 ,20134 ,KEBNE ,16750393,Thu Dec 2 06:23:16 CET,Thu Dec 2 08:01:35 CET,0.0 1.446 2.092 2.591 3.014 3.384 3.69 3.96 4.461 4.678 4.877 5.09 5.466 5.637 5.964 6.283 6.591 6.732 6.992 7.247 7.659 7.941 8.192 8.522 8.863 9.217 9.557 9.88 10.275 10.63 10.979 11.408 11.808 12.194 12.64 13.154 13.654 14.191 14.776 15.4 16.053 16.776 17.6 18.454 19.458 20.566 21.816 23.18 24.772 26.457 28.103 29.121 29.53 29.592 29.41 29.121 28.778 28.433 28.107 27.729 27.381 27.043 26.715 26.425 26.143 25.855 25.548 25.234 24.945 24.679 24.414 24.182 23.935 23.667 23.444 23.215 22.981 22.73 22.453 22.257 22.067 21.769 21.545 21.308 21.18 20.908 20.633 20.336 20.174 19.84 19.64 19.435 19.213 18.717 18.461 18.186 17.874 17.508 17.057 16.406 14.425 -5 ,13139 ,KEBNE ,16750394,Thu Dec 2 06:23:17 CET,Thu Dec 2 08:02:31 CET,0.0 1.282 1.782 2.178 2.573 2.946 3.279 3.585 4.132 4.394 4.64 4.91 5.32 5.523 5.867 6.166 6.453 6.593 6.86 7.121 7.499 7.734 7.976 8.357 8.707 9.025 9.322 9.606 9.974 10.338 10.693 11.11 11.511 11.903 12.362 12.878 13.37 13.918 14.508 15.13 15.795 16.546 17.398 18.256 19.251 20.335 21.571 22.928 24.442 26.136 27.948 29.089 29.439 29.456 29.323 29.066 28.747 28.428 28.113 27.737 27.403 27.091 26.758 26.43 26.102 25.772 25.437 25.148 24.895 24.634 24.363 24.119 23.847 23.555 23.334 23.117 22.879 22.632 22.358 22.156 21.954 21.634 21.41 21.159 21.021 20.743 20.456 20.145 19.985 19.65 19.462 19.268 19.066 18.595 18.298 17.96 17.605 17.164 16.6 15.839 13.919 -6 ,12659 ,KEBNE ,16750395,Thu Dec 2 06:23:16 CET,Thu Dec 2 08:01:25 CET,0.0 1.43 2.023 2.47 2.843 3.16 3.439 3.703 4.191 4.402 4.6 4.794 5.158 5.329 5.662 5.999 6.316 6.463 6.742 7.003 7.4 7.677 7.96 8.354 8.698 9.008 9.306 9.604 9.989 10.356 10.702 11.13 11.547 11.937 12.387 12.904 13.411 13.96 14.556 15.208 15.886 16.64 17.499 18.344 19.335 20.42 21.644 22.994 24.463 26.137 27.965 29.137 29.559 29.599 29.453 29.185 28.861 28.511 28.163 27.775 27.437 27.118 26.812 26.518 26.208 25.906 25.586 25.299 25.043 24.763 24.467 24.219 23.946 23.663 23.45 23.236 23.003 22.749 22.482 22.286 22.083 21.777 21.567 21.337 21.213 20.946 20.662 20.371 20.215 19.867 19.631 19.436 19.241 18.782 18.504 18.168 17.808 17.39 16.882 16.24 14.608 -7 ,28551 ,KEBNE ,16750396,Thu Dec 2 06:23:16 CET,Thu Dec 2 08:01:24 CET,0.0 1.255 1.894 2.375 2.753 3.056 3.324 3.58 4.034 4.246 4.456 4.663 5.031 5.207 5.555 5.891 6.195 6.339 6.615 6.872 7.245 7.478 7.707 8.039 8.364 8.689 8.992 9.278 9.656 10.024 10.366 10.788 11.227 11.647 12.108 12.629 13.134 13.702 14.313 14.948 15.606 16.307 17.137 17.978 18.991 20.137 21.353 22.726 24.312 26.019 27.801 28.855 29.193 29.175 28.955 28.681 28.375 28.033 27.708 27.352 26.996 26.646 26.311 25.993 25.682 25.397 25.091 24.781 24.497 24.225 23.947 23.704 23.457 23.196 22.975 22.726 22.46 22.184 21.91 21.712 21.484 21.128 20.903 20.679 20.559 20.305 20.034 19.734 19.575 19.242 19.054 18.856 18.636 18.153 17.904 17.645 17.344 16.971 16.506 15.847 14.452 -8 ,7043 ,KEBNE ,16750397,Thu Dec 2 06:24:22 CET,Thu Dec 2 08:03:33 CET,0.0 1.201 1.7 2.088 2.421 2.708 2.975 3.222 3.676 3.888 4.091 4.303 4.682 4.854 5.174 5.475 5.761 5.899 6.178 6.448 6.849 7.118 7.359 7.701 8.039 8.345 8.64 8.93 9.311 9.686 10.041 10.479 10.901 11.313 11.79 12.327 12.849 13.387 13.977 14.609 15.25 16.021 16.924 17.787 18.769 19.871 21.151 22.51 24.072 25.863 27.785 28.918 29.198 29.153 28.989 28.745 28.403 28.023 27.691 27.324 26.982 26.685 26.393 26.08 25.754 25.459 25.15 24.863 24.617 24.353 24.06 23.804 23.514 23.199 22.979 22.761 22.517 22.258 21.974 21.78 21.588 21.265 21.044 20.814 20.69 20.434 20.156 19.845 19.686 19.363 19.197 19.015 18.827 18.403 18.161 17.88 17.577 17.214 16.771 16.159 14.61 -9 ,17852 ,KEBNE ,16750398,Thu Dec 2 06:24:21 CET,Thu Dec 2 08:00:30 CET,0.0 1.565 2.282 2.832 3.267 3.636 3.982 4.277 4.746 4.949 5.147 5.353 5.725 5.9 6.237 6.556 6.857 7.003 7.287 7.556 7.939 8.193 8.433 8.764 9.086 9.399 9.702 9.987 10.348 10.709 11.065 11.498 11.917 12.327 12.799 13.317 13.818 14.382 15.007 15.644 16.303 17.043 17.924 18.831 19.815 20.857 22.073 23.476 25.082 26.84 28.616 29.605 29.871 29.84 29.655 29.35 28.993 28.613 28.276 27.9 27.542 27.212 26.861 26.521 26.217 25.921 25.6 25.32 25.062 24.773 24.49 24.255 23.977 23.676 23.45 23.207 22.935 22.646 22.363 22.187 22.001 21.7 21.482 21.253 21.133 20.884 20.625 20.342 20.191 19.859 19.664 19.459 19.249 18.819 18.578 18.297 17.978 17.618 17.202 16.642 15.175 -10 ,2139 ,KEBNE ,16750399,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:16:55 CET,0.0 1.061 1.613 2.045 2.39 2.71 2.997 3.269 3.757 3.983 4.201 4.407 4.773 4.947 5.281 5.6 5.901 6.046 6.33 6.603 6.976 7.218 7.462 7.797 8.113 8.431 8.745 9.047 9.428 9.801 10.166 10.614 11.069 11.5 11.98 12.522 13.03 13.569 14.147 14.781 15.431 16.142 16.98 17.806 18.774 19.877 21.106 22.453 23.953 25.597 27.353 28.417 28.796 28.792 28.589 28.311 28.005 27.699 27.393 27.046 26.717 26.411 26.103 25.797 25.499 25.205 24.874 24.571 24.314 24.034 23.739 23.504 23.256 22.989 22.779 22.553 22.296 22.02 21.723 21.521 21.321 21.011 20.781 20.531 20.405 20.15 19.88 19.586 19.438 19.119 18.973 18.804 18.621 18.182 17.924 17.639 17.306 16.924 16.458 15.783 14.139 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt deleted file mode 100644 index 6a15ac10..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4237 ,KEBNE ,16750400,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:17:11 CET,0.0 1.629 2.231 2.64 2.961 3.271 3.566 3.832 4.313 4.531 4.748 4.954 5.318 5.482 5.795 6.098 6.385 6.525 6.793 7.056 7.424 7.649 7.866 8.181 8.486 8.78 9.065 9.345 9.713 10.055 10.375 10.758 11.118 11.465 11.855 12.28 12.686 13.154 13.652 14.139 14.653 15.227 15.841 16.427 17.09 17.777 18.552 19.37 20.089 20.571 20.592 19.772 18.718 17.626 16.545 15.548 14.644 13.753 12.972 12.223 11.565 10.963 10.403 9.879 9.36 8.883 8.424 7.997 7.614 7.239 6.838 6.486 6.115 5.732 5.444 5.146 4.834 4.52 4.182 3.935 3.683 3.302 3.033 2.749 2.587 2.241 1.89 1.522 1.321 0.926 0.693 0.466 0.243 -0.245 -0.508 -0.811 -1.195 -1.652 -2.185 -2.868 -4.216 -2 ,27502 ,KEBNE ,16750401,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:16:12 CET,0.0 1.675 2.315 2.787 3.218 3.614 3.964 4.277 4.831 5.078 5.304 5.547 5.938 6.112 6.419 6.713 6.987 7.122 7.4 7.662 8.027 8.256 8.477 8.801 9.127 9.451 9.763 10.057 10.414 10.745 11.069 11.476 11.855 12.195 12.583 13.029 13.448 13.895 14.36 14.83 15.33 15.88 16.503 17.132 17.838 18.558 19.296 20.057 20.851 21.393 21.345 20.562 19.508 18.326 17.206 16.185 15.276 14.424 13.676 12.935 12.297 11.74 11.189 10.656 10.156 9.693 9.212 8.778 8.394 7.99 7.573 7.233 6.888 6.509 6.206 5.904 5.592 5.269 4.935 4.703 4.464 4.075 3.793 3.516 3.377 3.09 2.778 2.428 2.242 1.863 1.67 1.459 1.233 0.749 0.493 0.225 -0.085 -0.465 -0.928 -1.56 -2.842 -3 ,31354 ,KEBNE ,16750402,Thu Dec 2 06:39:00 CET,Thu Dec 2 08:15:53 CET,0.0 1.675 2.325 2.752 3.092 3.384 3.644 3.893 4.375 4.586 4.784 4.985 5.36 5.539 5.866 6.161 6.442 6.583 6.871 7.164 7.578 7.835 8.075 8.425 8.752 9.043 9.317 9.595 9.951 10.304 10.65 11.038 11.397 11.741 12.129 12.561 12.977 13.415 13.879 14.386 14.919 15.489 16.12 16.745 17.453 18.181 18.966 19.781 20.531 21.006 20.961 20.092 18.915 17.756 16.659 15.606 14.643 13.769 13.012 12.24 11.579 10.99 10.407 9.843 9.322 8.859 8.378 7.944 7.566 7.181 6.781 6.433 6.068 5.685 5.39 5.095 4.791 4.464 4.121 3.893 3.658 3.288 3.026 2.743 2.591 2.257 1.923 1.591 1.411 1.029 0.822 0.616 0.402 -0.081 -0.363 -0.664 -0.976 -1.321 -1.721 -2.265 -3.571 -4 ,31861 ,KEBNE ,16750403,Thu Dec 2 06:39:00 CET,Thu Dec 2 08:16:21 CET,0.0 1.171 1.722 2.182 2.563 2.869 3.143 3.395 3.857 4.07 4.278 4.469 4.828 4.989 5.3 5.604 5.882 6.023 6.298 6.543 6.889 7.113 7.337 7.661 7.967 8.256 8.526 8.783 9.122 9.446 9.745 10.109 10.462 10.797 11.181 11.607 12.012 12.453 12.929 13.431 13.939 14.498 15.127 15.731 16.411 17.151 17.927 18.671 19.433 19.982 19.924 19.084 18.025 16.931 15.869 14.878 13.987 13.147 12.398 11.646 10.991 10.38 9.799 9.256 8.748 8.285 7.784 7.346 6.982 6.591 6.167 5.807 5.428 5.03 4.731 4.431 4.116 3.792 3.449 3.191 2.942 2.577 2.314 2.035 1.893 1.604 1.298 0.967 0.792 0.424 0.236 0.023 -0.207 -0.744 -1.044 -1.371 -1.716 -2.094 -2.558 -3.137 -4.41 -5 ,30108 ,KEBNE ,16750404,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:15:40 CET,0.0 1.55 2.106 2.538 2.921 3.259 3.551 3.814 4.26 4.472 4.674 4.841 5.196 5.351 5.645 5.925 6.194 6.327 6.595 6.851 7.212 7.45 7.674 8.01 8.354 8.684 8.978 9.25 9.597 9.924 10.23 10.595 10.954 11.286 11.663 12.098 12.519 12.952 13.421 13.933 14.45 14.992 15.617 16.213 16.831 17.51 18.303 19.112 19.839 20.475 20.58 19.746 18.659 17.553 16.499 15.498 14.559 13.672 12.907 12.152 11.496 10.883 10.322 9.795 9.282 8.817 8.33 7.889 7.505 7.105 6.699 6.368 6.012 5.64 5.349 5.055 4.762 4.447 4.114 3.877 3.615 3.173 2.847 2.514 2.349 1.994 1.618 1.234 1.035 0.633 0.358 0.106 -0.149 -0.69 -0.971 -1.255 -1.579 -1.946 -2.367 -2.947 -4.239 -6 ,27254 ,KEBNE ,16750405,Thu Dec 2 06:39:02 CET,Thu Dec 2 08:17:19 CET,0.0 1.716 2.363 2.873 3.297 3.644 3.963 4.27 4.85 5.108 5.35 5.592 5.967 6.138 6.457 6.748 7.015 7.143 7.389 7.641 8.019 8.258 8.479 8.784 9.082 9.363 9.623 9.878 10.208 10.525 10.828 11.197 11.564 11.916 12.311 12.742 13.143 13.563 14.028 14.536 15.059 15.61 16.235 16.855 17.543 18.294 19.073 19.828 20.559 21.115 21.041 20.131 19.019 17.894 16.844 15.866 14.996 14.16 13.393 12.636 11.989 11.392 10.822 10.287 9.776 9.307 8.829 8.402 8.031 7.646 7.236 6.897 6.54 6.163 5.862 5.521 5.161 4.801 4.421 4.162 3.92 3.557 3.297 3.032 2.891 2.575 2.25 1.91 1.736 1.364 1.157 0.945 0.721 0.221 -0.056 -0.347 -0.648 -0.995 -1.464 -2.081 -3.572 -7 ,21158 ,KEBNE ,16750406,Thu Dec 2 06:39:03 CET,Thu Dec 2 08:17:51 CET,0.0 1.652 2.211 2.626 2.993 3.29 3.55 3.807 4.299 4.509 4.704 4.888 5.255 5.428 5.749 6.05 6.366 6.524 6.807 7.068 7.436 7.658 7.871 8.18 8.469 8.748 9.023 9.291 9.629 9.954 10.269 10.645 11.005 11.35 11.746 12.171 12.575 13.017 13.501 14.028 14.579 15.16 15.779 16.387 17.1 17.871 18.67 19.467 20.242 20.802 20.736 19.902 18.819 17.677 16.568 15.496 14.529 13.687 12.966 12.229 11.564 10.944 10.368 9.834 9.311 8.825 8.331 7.895 7.528 7.153 6.741 6.391 6.038 5.676 5.394 5.095 4.781 4.457 4.114 3.868 3.6 3.168 2.858 2.554 2.411 2.119 1.82 1.507 1.334 0.954 0.764 0.564 0.35 -0.093 -0.369 -0.724 -1.109 -1.489 -1.918 -2.479 -3.608 -8 ,16082 ,KEBNE ,16750407,Thu Dec 2 06:39:00 CET,Thu Dec 2 08:14:42 CET,0.0 1.373 1.998 2.524 2.971 3.339 3.661 3.958 4.499 4.751 4.996 5.267 5.665 5.863 6.221 6.53 6.815 6.951 7.207 7.453 7.815 8.038 8.241 8.551 8.867 9.168 9.458 9.741 10.085 10.412 10.727 11.108 11.479 11.829 12.223 12.665 13.084 13.546 14.035 14.541 15.069 15.616 16.238 16.887 17.638 18.398 19.199 19.979 20.71 21.269 21.216 20.444 19.373 18.19 17.067 16.061 15.179 14.359 13.619 12.856 12.194 11.59 11.013 10.476 9.987 9.539 9.064 8.616 8.212 7.813 7.417 7.096 6.747 6.366 6.071 5.765 5.456 5.138 4.805 4.573 4.332 3.95 3.681 3.401 3.254 2.953 2.64 2.32 2.152 1.777 1.592 1.389 1.17 0.681 0.412 0.123 -0.192 -0.551 -0.989 -1.579 -2.867 -9 ,1435 ,KEBNE ,16750408,Thu Dec 2 06:39:00 CET,Thu Dec 2 08:16:55 CET,0.0 1.254 1.793 2.2 2.528 2.823 3.102 3.361 3.817 4.03 4.256 4.496 4.884 5.08 5.437 5.775 6.105 6.266 6.58 6.866 7.241 7.465 7.678 7.999 8.303 8.582 8.853 9.124 9.462 9.79 10.111 10.486 10.844 11.2 11.608 12.048 12.463 12.906 13.372 13.852 14.355 14.924 15.579 16.201 16.9 17.668 18.42 19.15 19.861 20.453 20.7 20.01 18.945 17.816 16.736 15.749 14.837 13.998 13.271 12.503 11.824 11.227 10.678 10.159 9.654 9.191 8.714 8.288 7.901 7.496 7.075 6.717 6.36 5.998 5.714 5.415 5.116 4.808 4.479 4.252 4.004 3.598 3.32 3.049 2.914 2.618 2.303 1.982 1.808 1.431 1.242 1.033 0.819 0.367 0.099 -0.207 -0.545 -0.895 -1.294 -1.83 -3.133 -10 ,6359 ,KEBNE ,16750409,Thu Dec 2 06:39:00 CET,Thu Dec 2 08:15:48 CET,0.0 1.703 2.336 2.845 3.255 3.563 3.828 4.091 4.56 4.766 4.966 5.145 5.509 5.683 6.003 6.304 6.593 6.726 6.989 7.241 7.608 7.836 8.051 8.378 8.687 8.982 9.255 9.53 9.895 10.24 10.564 10.929 11.275 11.613 12.012 12.476 12.912 13.36 13.844 14.349 14.844 15.392 16.038 16.654 17.315 18.031 18.816 19.591 20.348 20.925 21.02 20.272 19.193 18.055 16.97 15.977 15.043 14.194 13.459 12.69 12.03 11.421 10.823 10.267 9.755 9.279 8.774 8.326 7.928 7.502 7.067 6.727 6.393 6.019 5.718 5.428 5.13 4.807 4.471 4.233 3.984 3.607 3.345 3.063 2.913 2.613 2.313 1.995 1.815 1.425 1.186 0.96 0.708 0.157 -0.138 -0.447 -0.813 -1.258 -1.777 -2.449 -3.791 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt deleted file mode 100644 index fd4959d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15781 ,KEBNE ,16750410,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:16:04 CET,0.0 1.282 1.924 2.427 2.86 3.236 3.595 3.939 4.515 4.78 5.041 5.336 5.73 5.91 6.25 6.579 6.894 7.053 7.358 7.642 8.088 8.394 8.672 9.069 9.447 9.8 10.147 10.485 10.937 11.369 11.778 12.278 12.752 13.212 13.757 14.373 14.98 15.665 16.388 17.161 17.991 18.909 19.985 21.088 22.374 23.817 25.484 27.386 29.679 32.328 35.31 37.596 38.834 39.575 40.04 40.262 40.299 40.281 40.223 40.12 39.993 39.849 39.692 39.517 39.352 39.187 38.995 38.819 38.644 38.452 38.249 38.087 37.908 37.7 37.544 37.379 37.201 37.01 36.8 36.654 36.499 36.233 36.017 35.772 35.645 35.374 35.069 34.748 34.59 34.271 34.083 33.896 33.682 33.191 32.913 32.613 32.273 31.863 31.337 30.686 29.036 -2 ,10402 ,KEBNE ,16750411,Thu Dec 2 06:39:02 CET,Thu Dec 2 08:17:32 CET,0.0 1.414 2.043 2.494 2.858 3.188 3.489 3.767 4.289 4.54 4.777 5.01 5.384 5.575 5.974 6.38 6.753 6.918 7.221 7.509 7.926 8.209 8.487 8.874 9.248 9.614 9.973 10.32 10.761 11.195 11.622 12.131 12.614 13.076 13.606 14.197 14.768 15.423 16.145 16.9 17.714 18.634 19.705 20.814 22.109 23.55 25.223 27.177 29.503 32.204 35.429 37.885 39.203 39.944 40.363 40.567 40.61 40.596 40.533 40.401 40.253 40.108 39.937 39.767 39.598 39.414 39.209 39.019 38.845 38.659 38.464 38.292 38.1 37.904 37.737 37.562 37.386 37.177 36.954 36.804 36.649 36.401 36.218 36.033 35.942 35.721 35.479 35.228 35.098 34.813 34.679 34.517 34.331 33.908 33.679 33.423 33.135 32.819 32.432 31.879 30.513 -3 ,5827 ,KEBNE ,16750412,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:15:51 CET,0.0 1.34 1.965 2.453 2.843 3.173 3.464 3.745 4.262 4.494 4.712 4.936 5.328 5.523 5.88 6.22 6.532 6.684 6.987 7.283 7.719 8.005 8.284 8.682 9.06 9.418 9.76 10.093 10.528 10.952 11.363 11.851 12.323 12.785 13.321 13.938 14.54 15.194 15.905 16.684 17.522 18.454 19.524 20.615 21.903 23.344 25.024 26.953 29.156 31.758 34.933 37.454 38.775 39.494 39.873 40.04 40.097 40.09 40.026 39.918 39.805 39.659 39.493 39.346 39.207 39.044 38.828 38.633 38.475 38.289 38.077 37.9 37.726 37.546 37.401 37.238 37.057 36.851 36.626 36.476 36.324 36.077 35.906 35.726 35.629 35.418 35.193 34.943 34.805 34.506 34.36 34.205 34.021 33.586 33.342 33.096 32.824 32.464 32.049 31.479 30.176 -4 ,31238 ,KEBNE ,16750413,Thu Dec 2 06:39:02 CET,Thu Dec 2 08:16:56 CET,0.0 1.677 2.36 2.872 3.325 3.723 4.071 4.374 4.89 5.122 5.342 5.57 5.953 6.151 6.538 6.894 7.225 7.387 7.698 8.0 8.432 8.702 8.972 9.366 9.751 10.123 10.482 10.826 11.265 11.701 12.121 12.622 13.115 13.588 14.137 14.75 15.327 15.982 16.703 17.477 18.318 19.29 20.397 21.479 22.757 24.215 25.903 27.823 30.114 32.763 35.935 38.426 39.708 40.423 40.823 40.995 41.058 41.057 40.985 40.846 40.704 40.555 40.387 40.227 40.034 39.849 39.668 39.492 39.325 39.153 38.976 38.811 38.624 38.424 38.263 38.077 37.884 37.694 37.482 37.331 37.176 36.922 36.734 36.532 36.415 36.141 35.849 35.553 35.402 35.083 34.877 34.677 34.468 34.031 33.801 33.534 33.213 32.853 32.404 31.809 30.431 -5 ,22421 ,KEBNE ,16750414,Thu Dec 2 06:39:02 CET,Thu Dec 2 08:16:37 CET,0.0 1.35 1.933 2.368 2.744 3.071 3.364 3.651 4.179 4.419 4.647 4.877 5.264 5.461 5.817 6.146 6.459 6.613 6.916 7.213 7.648 7.921 8.183 8.559 8.931 9.307 9.664 10.012 10.463 10.898 11.323 11.82 12.296 12.779 13.333 13.939 14.538 15.199 15.922 16.723 17.553 18.48 19.551 20.612 21.89 23.339 25.001 26.839 29.058 31.743 34.92 37.316 38.509 39.219 39.642 39.852 39.918 39.919 39.867 39.744 39.596 39.424 39.229 39.054 38.886 38.702 38.462 38.223 38.02 37.807 37.59 37.4 37.194 36.993 36.845 36.667 36.453 36.216 35.966 35.789 35.598 35.331 35.151 34.947 34.843 34.622 34.385 34.133 34.003 33.718 33.54 33.337 33.132 32.662 32.39 32.113 31.788 31.391 30.891 30.283 29.023 -6 ,32055 ,KEBNE ,16750415,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:16:10 CET,0.0 1.111 1.647 2.075 2.462 2.798 3.088 3.361 3.849 4.069 4.29 4.522 4.909 5.101 5.459 5.796 6.113 6.268 6.596 6.928 7.379 7.657 7.922 8.31 8.701 9.07 9.403 9.729 10.179 10.623 11.054 11.572 12.069 12.536 13.081 13.71 14.31 14.957 15.658 16.408 17.21 18.151 19.257 20.346 21.602 23.016 24.667 26.549 28.734 31.235 34.271 36.722 37.976 38.643 39.03 39.248 39.329 39.341 39.28 39.157 39.04 38.903 38.736 38.574 38.401 38.221 38.015 37.82 37.653 37.476 37.284 37.11 36.903 36.681 36.511 36.33 36.131 35.906 35.683 35.546 35.407 35.165 34.992 34.809 34.704 34.461 34.196 33.909 33.748 33.428 33.229 33.045 32.862 32.462 32.232 31.988 31.709 31.377 31.017 30.471 29.04 -7 ,30687 ,KEBNE ,16750416,Thu Dec 2 06:39:00 CET,Thu Dec 2 08:16:04 CET,0.0 1.361 2.059 2.596 3.024 3.424 3.781 4.096 4.692 4.968 5.23 5.531 5.942 6.155 6.579 6.955 7.284 7.44 7.744 8.049 8.472 8.73 8.99 9.383 9.758 10.133 10.503 10.843 11.284 11.721 12.139 12.631 13.11 13.574 14.115 14.729 15.319 15.992 16.721 17.489 18.298 19.226 20.341 21.462 22.765 24.202 25.833 27.7 29.953 32.635 35.898 38.455 39.759 40.507 40.906 41.131 41.235 41.244 41.159 41.025 40.895 40.759 40.61 40.445 40.274 40.087 39.899 39.736 39.577 39.402 39.203 39.026 38.825 38.612 38.455 38.293 38.113 37.925 37.71 37.552 37.389 37.129 36.958 36.781 36.679 36.457 36.217 35.972 35.85 35.557 35.368 35.193 35.028 34.652 34.431 34.186 33.921 33.615 33.209 32.635 31.197 -8 ,231 ,KEBNE ,16750417,Thu Dec 2 06:39:00 CET,Thu Dec 2 08:17:38 CET,0.0 1.553 2.207 2.677 3.058 3.39 3.697 3.983 4.478 4.694 4.904 5.1 5.472 5.656 6.017 6.391 6.76 6.925 7.234 7.532 7.955 8.232 8.506 8.903 9.276 9.641 10.016 10.38 10.833 11.265 11.68 12.196 12.698 13.174 13.728 14.337 14.918 15.577 16.293 17.049 17.849 18.767 19.85 20.949 22.258 23.742 25.481 27.443 29.699 32.304 35.309 37.621 38.839 39.482 39.804 39.98 40.067 40.08 40.015 39.888 39.764 39.616 39.44 39.272 39.102 38.929 38.735 38.55 38.387 38.218 38.006 37.788 37.571 37.337 37.163 36.98 36.747 36.486 36.203 36.027 35.866 35.611 35.43 35.221 35.117 34.918 34.685 34.429 34.281 33.956 33.724 33.515 33.308 32.856 32.596 32.304 31.967 31.572 31.086 30.418 28.856 -9 ,20518 ,KEBNE ,16750418,Thu Dec 2 06:39:00 CET,Thu Dec 2 08:17:26 CET,0.0 1.395 1.954 2.362 2.707 3.023 3.318 3.603 4.159 4.43 4.681 4.955 5.373 5.582 5.958 6.321 6.645 6.801 7.115 7.43 7.917 8.236 8.525 8.919 9.302 9.676 10.034 10.381 10.827 11.251 11.665 12.173 12.667 13.137 13.682 14.299 14.892 15.542 16.263 17.04 17.839 18.764 19.878 21.009 22.319 23.78 25.495 27.433 29.7 32.39 35.574 38.075 39.396 40.097 40.454 40.61 40.672 40.662 40.579 40.453 40.325 40.178 40.006 39.817 39.618 39.434 39.23 39.035 38.859 38.67 38.466 38.297 38.105 37.883 37.692 37.474 37.262 37.046 36.813 36.64 36.46 36.205 36.026 35.836 35.732 35.519 35.305 35.073 34.944 34.659 34.506 34.303 34.077 33.585 33.29 32.962 32.581 32.16 31.701 31.105 29.617 -10 ,14534 ,KEBNE ,16750419,Thu Dec 2 06:39:02 CET,Thu Dec 2 08:16:19 CET,0.0 1.349 1.982 2.459 2.852 3.184 3.492 3.785 4.298 4.532 4.759 4.976 5.353 5.543 5.894 6.228 6.55 6.708 7.018 7.322 7.754 8.027 8.285 8.662 9.033 9.388 9.726 10.057 10.504 10.958 11.397 11.904 12.397 12.886 13.449 14.081 14.684 15.336 16.053 16.834 17.649 18.589 19.687 20.786 22.106 23.563 25.233 27.109 29.296 31.85 34.863 37.277 38.611 39.356 39.743 39.945 40.006 39.974 39.916 39.837 39.722 39.564 39.384 39.2 39.02 38.837 38.619 38.421 38.257 38.075 37.88 37.714 37.527 37.313 37.14 36.969 36.772 36.55 36.299 36.115 35.93 35.633 35.441 35.245 35.133 34.884 34.63 34.385 34.256 33.961 33.831 33.683 33.514 33.094 32.838 32.584 32.319 31.985 31.569 31.045 29.674 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt deleted file mode 100644 index 9bbd8382..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3646 ,KEBNE ,16750420,Thu Dec 2 06:39:02 CET,Thu Dec 2 08:17:36 CET,0.0 2.021 2.739 3.256 3.718 4.122 4.481 4.813 5.398 5.662 5.91 6.192 6.611 6.815 7.177 7.518 7.86 8.035 8.373 8.693 9.153 9.439 9.722 10.139 10.536 10.92 11.289 11.645 12.119 12.578 13.025 13.573 14.102 14.635 15.26 15.934 16.575 17.274 18.046 18.874 19.74 20.732 21.879 23.045 24.472 26.096 27.96 30.118 32.619 35.532 39.099 41.925 43.446 44.336 44.864 45.147 45.259 45.302 45.281 45.185 45.074 44.955 44.816 44.664 44.512 44.36 44.185 44.013 43.849 43.661 43.444 43.255 43.059 42.849 42.679 42.508 42.324 42.127 41.917 41.769 41.613 41.355 41.174 40.981 40.882 40.675 40.459 40.207 40.059 39.754 39.601 39.43 39.255 38.891 38.675 38.418 38.129 37.774 37.285 36.64 35.373 -2 ,24996 ,KEBNE ,16750421,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:17:16 CET,0.0 1.362 1.905 2.302 2.676 3.036 3.357 3.643 4.161 4.419 4.666 4.905 5.309 5.516 5.912 6.293 6.649 6.822 7.156 7.473 7.937 8.242 8.545 8.985 9.397 9.785 10.16 10.519 10.981 11.432 11.878 12.413 12.927 13.422 13.996 14.672 15.328 16.035 16.817 17.651 18.529 19.528 20.698 21.902 23.35 24.982 26.877 29.003 31.443 34.343 37.798 40.591 42.187 43.089 43.601 43.882 44.0 44.004 43.959 43.913 43.827 43.716 43.589 43.424 43.239 43.064 42.872 42.679 42.501 42.306 42.074 41.845 41.587 41.326 41.138 40.94 40.709 40.486 40.281 40.137 39.97 39.688 39.491 39.291 39.194 38.985 38.765 38.533 38.398 38.089 37.925 37.765 37.601 37.216 36.981 36.719 36.444 36.133 35.743 35.224 33.714 -3 ,13012 ,KEBNE ,16750422,Thu Dec 2 06:39:02 CET,Thu Dec 2 08:15:38 CET,0.0 1.387 2.005 2.465 2.851 3.182 3.489 3.776 4.289 4.523 4.759 5.028 5.434 5.647 6.058 6.451 6.832 7.021 7.387 7.721 8.177 8.465 8.747 9.156 9.559 9.944 10.308 10.662 11.114 11.558 12.001 12.544 13.057 13.56 14.144 14.808 15.465 16.188 16.96 17.783 18.666 19.674 20.893 22.118 23.552 25.149 26.962 29.096 31.665 34.695 38.322 41.153 42.71 43.611 44.111 44.383 44.505 44.526 44.469 44.368 44.252 44.128 43.989 43.814 43.628 43.454 43.265 43.088 42.916 42.719 42.514 42.352 42.17 41.968 41.809 41.644 41.464 41.274 41.077 40.932 40.777 40.532 40.349 40.134 40.017 39.771 39.496 39.205 39.045 38.721 38.514 38.301 38.077 37.592 37.313 37.015 36.676 36.251 35.762 35.166 33.772 -4 ,25729 ,KEBNE ,16750423,Thu Dec 2 06:39:02 CET,Thu Dec 2 08:16:47 CET,0.0 1.199 1.827 2.293 2.672 3.027 3.36 3.65 4.171 4.418 4.651 4.921 5.332 5.535 5.935 6.34 6.731 6.918 7.263 7.583 8.028 8.314 8.599 9.005 9.406 9.8 10.174 10.546 11.027 11.484 11.927 12.456 12.97 13.475 14.069 14.74 15.368 16.072 16.864 17.705 18.597 19.621 20.802 21.993 23.399 25.0 26.864 28.952 31.426 34.365 37.885 40.625 42.095 42.971 43.514 43.782 43.852 43.843 43.793 43.69 43.562 43.433 43.298 43.123 42.937 42.761 42.537 42.337 42.166 41.98 41.776 41.596 41.416 41.234 41.084 40.919 40.726 40.499 40.245 40.076 39.917 39.662 39.472 39.267 39.163 38.952 38.711 38.454 38.319 38.019 37.872 37.703 37.526 37.144 36.921 36.644 36.288 35.867 35.365 34.669 33.096 -5 ,12158 ,KEBNE ,16750424,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:17:22 CET,0.0 1.672 2.337 2.846 3.299 3.666 3.966 4.246 4.756 4.981 5.196 5.421 5.814 6.014 6.376 6.733 7.09 7.261 7.594 7.915 8.379 8.67 8.95 9.372 9.774 10.147 10.511 10.877 11.351 11.806 12.24 12.775 13.304 13.817 14.408 15.067 15.7 16.403 17.164 17.99 18.893 19.913 21.08 22.234 23.598 25.174 27.057 29.24 31.785 34.677 38.195 41.054 42.504 43.366 43.852 44.101 44.224 44.234 44.18 44.08 43.952 43.808 43.658 43.487 43.297 43.113 42.906 42.725 42.562 42.376 42.167 41.988 41.804 41.605 41.441 41.266 41.089 40.898 40.692 40.552 40.397 40.132 39.945 39.752 39.653 39.426 39.155 38.853 38.682 38.363 38.196 38.023 37.853 37.484 37.284 37.046 36.753 36.424 36.039 35.498 34.006 -6 ,17801 ,KEBNE ,16750425,Thu Dec 2 06:39:00 CET,Thu Dec 2 08:15:58 CET,0.0 1.192 1.75 2.202 2.597 2.963 3.293 3.584 4.124 4.376 4.609 4.841 5.241 5.461 5.869 6.225 6.555 6.713 7.03 7.336 7.777 8.069 8.355 8.76 9.165 9.574 9.968 10.344 10.814 11.272 11.741 12.321 12.858 13.373 13.981 14.66 15.303 16.023 16.819 17.652 18.537 19.54 20.717 21.923 23.39 25.072 26.992 29.159 31.681 34.673 38.238 40.945 42.401 43.295 43.799 44.068 44.175 44.195 44.174 44.119 44.007 43.862 43.692 43.516 43.358 43.207 43.024 42.846 42.676 42.481 42.279 42.095 41.905 41.699 41.524 41.352 41.167 40.968 40.758 40.604 40.439 40.173 39.978 39.754 39.626 39.354 39.067 38.758 38.6 38.279 38.046 37.847 37.662 37.27 37.043 36.795 36.511 36.184 35.804 35.269 33.779 -7 ,16562 ,KEBNE ,16750426,Thu Dec 2 06:39:03 CET,Thu Dec 2 08:16:23 CET,0.0 1.364 1.96 2.418 2.798 3.134 3.437 3.716 4.231 4.48 4.714 4.948 5.336 5.529 5.921 6.276 6.6 6.772 7.133 7.478 7.943 8.23 8.508 8.919 9.327 9.72 10.098 10.463 10.934 11.39 11.838 12.399 12.948 13.457 14.041 14.709 15.353 16.071 16.86 17.687 18.554 19.561 20.756 21.97 23.415 25.029 26.875 28.997 31.49 34.448 37.938 40.746 42.338 43.273 43.811 44.116 44.251 44.274 44.26 44.207 44.11 43.986 43.826 43.665 43.503 43.327 43.131 42.945 42.772 42.579 42.378 42.208 42.024 41.819 41.63 41.425 41.23 41.032 40.817 40.642 40.448 40.135 39.91 39.695 39.593 39.348 39.063 38.757 38.587 38.253 38.063 37.898 37.712 37.311 37.104 36.878 36.614 36.306 35.907 35.371 33.984 -8 ,13545 ,KEBNE ,16750427,Thu Dec 2 06:39:08 CET,Thu Dec 2 08:16:04 CET,0.0 1.586 2.273 2.805 3.277 3.698 4.063 4.38 4.901 5.143 5.382 5.634 6.033 6.231 6.616 6.995 7.353 7.521 7.844 8.147 8.595 8.894 9.18 9.597 10.0 10.387 10.76 11.104 11.548 11.985 12.406 12.928 13.444 13.964 14.582 15.268 15.937 16.657 17.407 18.224 19.095 20.085 21.253 22.456 23.883 25.492 27.354 29.435 31.896 34.856 38.54 41.518 43.069 43.942 44.473 44.799 44.966 44.976 44.891 44.791 44.68 44.545 44.395 44.234 44.062 43.897 43.717 43.539 43.368 43.151 42.898 42.696 42.503 42.293 42.113 41.911 41.689 41.48 41.27 41.101 40.903 40.567 40.342 40.128 40.021 39.808 39.556 39.279 39.144 38.843 38.666 38.492 38.313 37.908 37.676 37.428 37.151 36.838 36.468 35.995 34.696 -9 ,10794 ,KEBNE ,16750428,Thu Dec 2 06:39:04 CET,Thu Dec 2 08:17:33 CET,0.0 1.26 1.829 2.248 2.598 2.903 3.197 3.471 3.973 4.2 4.418 4.67 5.073 5.274 5.647 5.995 6.336 6.504 6.818 7.131 7.594 7.875 8.149 8.56 8.955 9.335 9.71 10.072 10.546 11.003 11.45 12.003 12.532 13.042 13.641 14.316 14.949 15.66 16.438 17.256 18.143 19.155 20.318 21.508 22.926 24.516 26.364 28.467 30.891 33.716 37.118 40.023 41.636 42.478 42.954 43.228 43.343 43.387 43.355 43.287 43.204 43.066 42.916 42.774 42.6 42.434 42.262 42.082 41.91 41.727 41.515 41.328 41.138 40.934 40.775 40.607 40.42 40.225 40.01 39.856 39.693 39.431 39.245 39.047 38.933 38.661 38.361 38.047 37.884 37.553 37.36 37.197 37.004 36.523 36.261 36.014 35.759 35.448 35.036 34.444 33.056 -10 ,763 ,KEBNE ,16750429,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:15:49 CET,0.0 1.411 2.016 2.491 2.871 3.189 3.488 3.773 4.302 4.544 4.766 4.988 5.379 5.571 5.931 6.287 6.625 6.788 7.11 7.411 7.858 8.167 8.484 8.946 9.392 9.83 10.251 10.647 11.145 11.611 12.065 12.615 13.136 13.637 14.218 14.873 15.507 16.22 16.991 17.793 18.664 19.675 20.869 22.076 23.464 25.081 27.017 29.192 31.753 34.764 38.424 41.293 42.803 43.714 44.243 44.5 44.59 44.609 44.563 44.474 44.365 44.215 44.036 43.848 43.657 43.488 43.298 43.106 42.923 42.728 42.516 42.338 42.157 41.953 41.789 41.617 41.422 41.223 41.02 40.871 40.709 40.426 40.231 40.045 39.942 39.705 39.437 39.146 38.999 38.686 38.497 38.318 38.131 37.681 37.403 37.094 36.722 36.299 35.783 35.101 33.692 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index 4c5fc19f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25481 ,KEBNE ,16750430,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:17:10 CET,0.0 1.56 2.08 2.461 2.803 3.091 3.333 3.55 3.941 4.125 4.298 4.445 4.738 4.871 5.144 5.401 5.625 5.734 5.94 6.122 6.391 6.56 6.723 6.961 7.174 7.375 7.571 7.769 8.031 8.267 8.483 8.735 8.964 9.165 9.393 9.637 9.872 10.127 10.382 10.627 10.872 11.131 11.407 11.661 11.898 12.073 12.167 12.192 12.1 11.689 10.581 8.963 7.455 6.134 4.967 3.869 2.92 2.057 1.288 0.541 -0.094 -0.673 -1.23 -1.765 -2.259 -2.708 -3.177 -3.592 -3.967 -4.367 -4.778 -5.117 -5.469 -5.839 -6.123 -6.414 -6.721 -7.033 -7.36 -7.595 -7.825 -8.181 -8.446 -8.718 -8.861 -9.16 -9.461 -9.785 -9.964 -10.31 -10.498 -10.704 -10.933 -11.406 -11.658 -11.951 -12.296 -12.706 -13.166 -13.723 -14.966 -2 ,24134 ,KEBNE ,16750431,Thu Dec 2 06:39:02 CET,Thu Dec 2 08:15:48 CET,0.0 1.217 1.876 2.356 2.722 3.033 3.29 3.516 3.936 4.129 4.308 4.48 4.778 4.908 5.153 5.383 5.599 5.708 5.907 6.08 6.33 6.495 6.666 6.917 7.137 7.331 7.516 7.701 7.923 8.13 8.339 8.575 8.791 9.013 9.266 9.53 9.771 10.009 10.251 10.505 10.754 11.019 11.285 11.499 11.703 11.892 12.025 12.028 11.929 11.546 10.449 8.716 7.128 5.749 4.557 3.464 2.488 1.631 0.878 0.097 -0.561 -1.135 -1.687 -2.205 -2.708 -3.179 -3.662 -4.082 -4.443 -4.829 -5.231 -5.564 -5.901 -6.245 -6.521 -6.807 -7.098 -7.408 -7.748 -7.989 -8.226 -8.593 -8.85 -9.117 -9.255 -9.537 -9.853 -10.197 -10.378 -10.736 -10.981 -11.205 -11.43 -11.91 -12.182 -12.48 -12.805 -13.189 -13.665 -14.259 -15.644 -3 ,17411 ,KEBNE ,16750432,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:15:39 CET,0.0 1.174 1.641 1.981 2.288 2.582 2.835 3.047 3.445 3.619 3.776 3.945 4.265 4.416 4.673 4.914 5.145 5.25 5.477 5.705 6.023 6.224 6.414 6.698 6.979 7.233 7.472 7.701 7.946 8.154 8.36 8.613 8.85 9.067 9.293 9.519 9.731 9.965 10.198 10.445 10.686 10.931 11.203 11.426 11.632 11.832 12.001 12.02 11.848 11.38 10.283 8.68 7.193 5.874 4.708 3.653 2.712 1.85 1.098 0.349 -0.293 -0.864 -1.406 -1.928 -2.424 -2.866 -3.317 -3.717 -4.077 -4.475 -4.883 -5.219 -5.561 -5.905 -6.181 -6.498 -6.841 -7.199 -7.549 -7.768 -7.991 -8.341 -8.597 -8.868 -9.003 -9.319 -9.686 -10.066 -10.254 -10.606 -10.806 -11.001 -11.213 -11.688 -11.949 -12.235 -12.547 -12.906 -13.354 -13.982 -15.404 -4 ,22772 ,KEBNE ,16750433,Thu Dec 2 06:39:00 CET,Thu Dec 2 08:15:38 CET,0.0 1.381 1.976 2.404 2.728 2.999 3.254 3.477 3.878 4.059 4.226 4.371 4.666 4.801 5.046 5.277 5.499 5.599 5.78 5.957 6.216 6.374 6.532 6.762 6.973 7.176 7.368 7.55 7.768 7.978 8.186 8.422 8.635 8.839 9.074 9.34 9.595 9.845 10.097 10.341 10.588 10.851 11.1 11.319 11.554 11.775 11.956 12.02 11.889 11.409 10.236 8.558 7.008 5.653 4.484 3.402 2.44 1.58 0.847 0.089 -0.587 -1.182 -1.756 -2.289 -2.779 -3.217 -3.672 -4.103 -4.485 -4.88 -5.299 -5.637 -5.961 -6.311 -6.59 -6.875 -7.159 -7.46 -7.788 -8.013 -8.251 -8.635 -8.898 -9.165 -9.307 -9.605 -9.917 -10.251 -10.43 -10.79 -11.007 -11.216 -11.445 -11.941 -12.226 -12.551 -12.94 -13.379 -13.89 -14.62 -16.381 -5 ,24457 ,KEBNE ,16750434,Thu Dec 2 06:39:00 CET,Thu Dec 2 08:16:46 CET,0.0 1.744 2.325 2.705 3.016 3.279 3.516 3.739 4.172 4.373 4.547 4.708 5.008 5.139 5.38 5.614 5.855 5.977 6.215 6.425 6.717 6.893 7.052 7.296 7.536 7.764 7.987 8.205 8.471 8.728 8.972 9.216 9.43 9.637 9.87 10.125 10.364 10.616 10.876 11.136 11.401 11.667 11.919 12.127 12.337 12.531 12.69 12.735 12.616 12.198 11.094 9.454 7.93 6.563 5.371 4.287 3.334 2.48 1.726 0.972 0.319 -0.293 -0.867 -1.39 -1.879 -2.314 -2.773 -3.19 -3.54 -3.907 -4.299 -4.629 -4.973 -5.339 -5.62 -5.919 -6.246 -6.571 -6.897 -7.131 -7.38 -7.77 -8.04 -8.318 -8.46 -8.74 -9.059 -9.442 -9.654 -10.035 -10.254 -10.455 -10.675 -11.159 -11.428 -11.72 -12.051 -12.431 -12.867 -13.427 -14.896 -6 ,13510 ,KEBNE ,16750435,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:15:54 CET,0.0 1.423 1.967 2.336 2.636 2.911 3.16 3.387 3.798 3.985 4.158 4.305 4.609 4.751 5.014 5.267 5.498 5.603 5.81 6.012 6.291 6.463 6.627 6.862 7.082 7.279 7.469 7.647 7.864 8.075 8.277 8.506 8.737 8.965 9.198 9.437 9.665 9.904 10.124 10.366 10.617 10.851 11.099 11.325 11.56 11.751 11.914 11.988 11.853 11.421 10.319 8.694 7.223 5.927 4.75 3.672 2.739 1.875 1.118 0.357 -0.3 -0.883 -1.443 -1.967 -2.455 -2.896 -3.367 -3.823 -4.218 -4.61 -5.007 -5.339 -5.703 -6.075 -6.359 -6.677 -7.034 -7.405 -7.793 -8.04 -8.286 -8.705 -9.001 -9.295 -9.437 -9.73 -10.049 -10.383 -10.556 -10.908 -11.119 -11.316 -11.532 -12.009 -12.271 -12.563 -12.877 -13.242 -13.73 -14.347 -15.662 -7 ,29041 ,KEBNE ,16750436,Thu Dec 2 06:39:01 CET,Thu Dec 2 08:16:06 CET,0.0 1.093 1.58 1.926 2.227 2.49 2.727 2.947 3.324 3.494 3.658 3.805 4.106 4.241 4.479 4.714 4.939 5.04 5.234 5.431 5.714 5.89 6.065 6.339 6.579 6.774 6.955 7.129 7.36 7.588 7.809 8.061 8.29 8.517 8.775 9.035 9.265 9.518 9.78 10.029 10.266 10.51 10.779 11.029 11.268 11.458 11.581 11.628 11.564 11.191 10.158 8.512 6.994 5.66 4.462 3.38 2.458 1.61 0.865 0.106 -0.551 -1.149 -1.736 -2.271 -2.768 -3.225 -3.7 -4.119 -4.492 -4.895 -5.309 -5.647 -6.001 -6.372 -6.659 -6.96 -7.262 -7.584 -7.923 -8.153 -8.392 -8.765 -9.029 -9.303 -9.446 -9.747 -10.061 -10.392 -10.571 -10.928 -11.162 -11.379 -11.599 -12.072 -12.342 -12.622 -12.953 -13.347 -13.79 -14.407 -16.04 -8 ,32159 ,KEBNE ,16750437,Thu Dec 2 06:47:38 CET,Thu Dec 2 08:24:10 CET,0.0 1.268 1.904 2.371 2.771 3.137 3.459 3.749 4.262 4.469 4.642 4.795 5.096 5.242 5.507 5.744 5.961 6.065 6.259 6.437 6.687 6.855 7.017 7.24 7.454 7.668 7.879 8.064 8.279 8.481 8.673 8.89 9.096 9.292 9.546 9.827 10.051 10.293 10.554 10.814 11.062 11.317 11.583 11.821 12.065 12.243 12.37 12.445 12.332 11.887 10.795 9.176 7.697 6.363 5.169 4.103 3.163 2.281 1.52 0.773 0.114 -0.475 -1.033 -1.546 -2.027 -2.493 -2.978 -3.395 -3.761 -4.145 -4.549 -4.892 -5.244 -5.606 -5.904 -6.22 -6.526 -6.834 -7.164 -7.394 -7.636 -8.025 -8.294 -8.576 -8.723 -9.018 -9.347 -9.746 -9.958 -10.346 -10.6 -10.815 -11.04 -11.52 -11.794 -12.112 -12.459 -12.867 -13.382 -14.04 -15.842 -9 ,13441 ,KEBNE ,16750438,Thu Dec 2 06:47:38 CET,Thu Dec 2 08:24:13 CET,0.0 1.536 2.064 2.465 2.795 3.061 3.325 3.579 3.972 4.157 4.337 4.491 4.792 4.927 5.163 5.387 5.634 5.773 6.036 6.275 6.612 6.807 6.975 7.209 7.443 7.671 7.878 8.053 8.282 8.501 8.7 8.953 9.193 9.423 9.676 9.944 10.184 10.43 10.698 10.945 11.174 11.447 11.731 11.957 12.165 12.371 12.511 12.556 12.472 12.047 10.966 9.292 7.697 6.29 5.073 3.98 3.017 2.144 1.39 0.637 -0.021 -0.616 -1.188 -1.723 -2.219 -2.675 -3.147 -3.572 -3.942 -4.322 -4.703 -5.025 -5.384 -5.76 -6.045 -6.337 -6.645 -6.963 -7.292 -7.526 -7.766 -8.126 -8.378 -8.655 -8.793 -9.081 -9.415 -9.764 -9.94 -10.285 -10.47 -10.671 -10.89 -11.368 -11.64 -11.967 -12.365 -12.792 -13.223 -13.737 -15.117 -10 ,21793 ,KEBNE ,16750439,Thu Dec 2 06:47:37 CET,Thu Dec 2 08:23:31 CET,0.0 1.286 1.857 2.267 2.584 2.869 3.16 3.437 3.947 4.168 4.342 4.474 4.763 4.894 5.154 5.402 5.623 5.729 5.951 6.187 6.528 6.709 6.858 7.063 7.258 7.454 7.653 7.843 8.067 8.265 8.446 8.673 8.892 9.096 9.341 9.607 9.831 10.067 10.307 10.541 10.78 11.048 11.335 11.554 11.744 11.935 12.087 12.136 12.021 11.563 10.409 8.761 7.281 5.923 4.711 3.607 2.652 1.798 1.048 0.291 -0.375 -0.976 -1.548 -2.091 -2.585 -3.034 -3.509 -3.932 -4.301 -4.686 -5.079 -5.415 -5.768 -6.118 -6.389 -6.671 -6.961 -7.273 -7.587 -7.8 -8.033 -8.42 -8.692 -8.964 -9.111 -9.404 -9.695 -10.02 -10.189 -10.535 -10.733 -10.939 -11.159 -11.63 -11.9 -12.195 -12.515 -12.877 -13.338 -13.924 -15.417 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index b9c0d39b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20414 ,KEBNE ,17028383,Wed Dec 22 20:01:57 CET,Wed Dec 22 21:37:51 CET,0.0 1.38 2.005 2.471 2.881 3.209 3.469 3.697 4.083 4.259 4.428 4.618 4.952 5.117 5.436 5.736 5.995 6.104 6.308 6.502 6.75 6.914 7.083 7.312 7.516 7.707 7.887 8.057 8.273 8.472 8.655 8.86 9.055 9.246 9.461 9.683 9.89 10.109 10.309 10.503 10.703 10.897 11.063 11.184 11.294 11.339 11.278 11.095 10.722 9.888 8.129 5.792 3.779 2.045 0.548 -0.794 -1.952 -2.966 -3.826 -4.697 -5.462 -6.163 -6.826 -7.445 -8.022 -8.56 -9.109 -9.588 -9.995 -10.431 -10.886 -11.249 -11.64 -12.045 -12.348 -12.656 -12.981 -13.325 -13.685 -13.936 -14.199 -14.59 -14.865 -15.167 -15.319 -15.626 -15.967 -16.346 -16.544 -16.91 -17.119 -17.335 -17.558 -18.039 -18.316 -18.618 -18.945 -19.335 -19.794 -20.348 -21.73 -2 ,14518 ,KEBNE ,17028384,Wed Dec 22 20:01:57 CET,Wed Dec 22 21:38:15 CET,0.0 1.196 1.693 2.086 2.418 2.686 2.917 3.136 3.514 3.685 3.846 3.975 4.263 4.401 4.667 4.911 5.136 5.246 5.439 5.621 5.894 6.058 6.209 6.417 6.611 6.825 7.026 7.2 7.427 7.639 7.834 8.074 8.313 8.515 8.715 8.934 9.125 9.338 9.577 9.784 9.977 10.185 10.377 10.525 10.669 10.751 10.702 10.524 10.148 9.348 7.676 5.395 3.4 1.673 0.178 -1.176 -2.336 -3.399 -4.309 -5.208 -5.977 -6.658 -7.309 -7.912 -8.476 -9.016 -9.574 -10.054 -10.468 -10.886 -11.314 -11.678 -12.059 -12.462 -12.784 -13.122 -13.466 -13.814 -14.176 -14.427 -14.686 -15.094 -15.382 -15.67 -15.821 -16.141 -16.465 -16.808 -16.99 -17.357 -17.628 -17.877 -18.137 -18.696 -18.997 -19.345 -19.739 -20.181 -20.74 -21.468 -23.193 -3 ,8906 ,KEBNE ,17028385,Wed Dec 22 20:01:57 CET,Wed Dec 22 21:37:43 CET,0.0 1.33 1.833 2.223 2.561 2.84 3.083 3.308 3.701 3.884 4.058 4.2 4.494 4.651 4.964 5.254 5.518 5.642 5.886 6.097 6.367 6.532 6.691 6.917 7.128 7.328 7.513 7.682 7.884 8.073 8.267 8.477 8.648 8.823 9.053 9.32 9.547 9.761 9.962 10.166 10.358 10.543 10.742 10.897 11.018 11.076 11.056 10.871 10.43 9.604 7.968 5.761 3.823 2.136 0.662 -0.663 -1.858 -2.948 -3.844 -4.736 -5.523 -6.21 -6.861 -7.479 -8.067 -8.587 -9.113 -9.589 -9.996 -10.412 -10.844 -11.216 -11.604 -12.001 -12.32 -12.644 -12.964 -13.299 -13.655 -13.896 -14.153 -14.55 -14.842 -15.154 -15.299 -15.597 -15.91 -16.236 -16.414 -16.779 -17.005 -17.226 -17.457 -17.959 -18.248 -18.583 -18.972 -19.375 -19.856 -20.498 -22.244 -4 ,23908 ,KEBNE ,17028386,Wed Dec 22 20:01:57 CET,Wed Dec 22 21:37:47 CET,0.0 1.199 1.725 2.139 2.441 2.717 2.962 3.175 3.554 3.731 3.903 4.047 4.327 4.453 4.703 4.937 5.155 5.256 5.446 5.62 5.875 6.048 6.214 6.443 6.651 6.845 7.026 7.196 7.422 7.637 7.824 8.037 8.24 8.427 8.632 8.854 9.052 9.267 9.499 9.723 9.924 10.106 10.283 10.444 10.564 10.584 10.504 10.308 9.887 9.045 7.294 4.959 3.013 1.338 -0.154 -1.491 -2.625 -3.643 -4.509 -5.401 -6.177 -6.847 -7.48 -8.073 -8.635 -9.165 -9.72 -10.191 -10.609 -11.047 -11.496 -11.884 -12.277 -12.678 -13.009 -13.366 -13.72 -14.074 -14.438 -14.685 -14.941 -15.347 -15.639 -15.967 -16.137 -16.494 -16.877 -17.251 -17.437 -17.814 -18.048 -18.267 -18.502 -19.01 -19.292 -19.597 -19.932 -20.295 -20.769 -21.452 -23.217 -5 ,15028 ,KEBNE ,17028387,Wed Dec 22 20:01:57 CET,Wed Dec 22 21:37:59 CET,0.0 1.432 2.012 2.415 2.757 3.049 3.292 3.514 3.888 4.046 4.193 4.319 4.613 4.745 4.978 5.202 5.431 5.54 5.736 5.916 6.168 6.325 6.483 6.73 6.979 7.2 7.384 7.554 7.755 7.95 8.137 8.355 8.553 8.732 8.925 9.137 9.337 9.54 9.762 9.966 10.143 10.336 10.512 10.637 10.757 10.846 10.861 10.744 10.378 9.539 7.793 5.469 3.468 1.746 0.256 -1.049 -2.213 -3.281 -4.192 -5.095 -5.865 -6.542 -7.18 -7.79 -8.348 -8.851 -9.391 -9.884 -10.297 -10.714 -11.158 -11.525 -11.909 -12.318 -12.637 -12.963 -13.293 -13.632 -13.993 -14.245 -14.496 -14.891 -15.172 -15.484 -15.642 -15.955 -16.286 -16.63 -16.807 -17.168 -17.397 -17.611 -17.834 -18.313 -18.577 -18.876 -19.205 -19.609 -20.093 -20.761 -22.719 -6 ,10647 ,KEBNE ,17028388,Wed Dec 22 20:01:57 CET,Wed Dec 22 21:38:10 CET,0.0 1.282 1.763 2.121 2.433 2.718 2.969 3.195 3.601 3.785 3.956 4.109 4.404 4.537 4.776 5.012 5.25 5.359 5.557 5.744 5.995 6.153 6.311 6.529 6.73 6.92 7.108 7.284 7.488 7.677 7.863 8.082 8.283 8.464 8.675 8.909 9.111 9.314 9.522 9.752 9.971 10.168 10.366 10.509 10.62 10.711 10.712 10.549 10.167 9.365 7.726 5.453 3.418 1.676 0.172 -1.217 -2.404 -3.461 -4.387 -5.281 -6.037 -6.696 -7.324 -7.935 -8.497 -9.016 -9.571 -10.058 -10.472 -10.905 -11.353 -11.721 -12.104 -12.51 -12.815 -13.128 -13.467 -13.818 -14.184 -14.442 -14.712 -15.148 -15.461 -15.794 -15.971 -16.348 -16.728 -17.122 -17.342 -17.734 -17.967 -18.195 -18.462 -19.063 -19.391 -19.753 -20.144 -20.583 -21.124 -21.835 -23.337 -7 ,24971 ,KEBNE ,17028389,Wed Dec 22 20:01:57 CET,Wed Dec 22 21:38:03 CET,0.0 1.388 2.025 2.524 2.919 3.245 3.541 3.813 4.273 4.458 4.632 4.792 5.084 5.221 5.506 5.784 6.046 6.176 6.42 6.632 6.922 7.098 7.255 7.462 7.66 7.859 8.046 8.228 8.45 8.637 8.813 9.025 9.212 9.378 9.576 9.803 10.012 10.222 10.415 10.621 10.847 11.052 11.254 11.419 11.532 11.618 11.617 11.446 11.034 10.233 8.611 6.401 4.466 2.716 1.209 -0.13 -1.3 -2.369 -3.306 -4.203 -4.942 -5.586 -6.221 -6.839 -7.411 -7.935 -8.462 -8.918 -9.323 -9.762 -10.22 -10.61 -11.024 -11.441 -11.759 -12.085 -12.409 -12.744 -13.104 -13.352 -13.614 -14.019 -14.29 -14.591 -14.748 -15.051 -15.385 -15.768 -15.974 -16.348 -16.57 -16.785 -17.009 -17.495 -17.769 -18.092 -18.445 -18.823 -19.267 -19.838 -21.321 -8 ,9794 ,KEBNE ,17028390,Wed Dec 22 20:01:57 CET,Wed Dec 22 21:37:53 CET,0.0 1.331 1.925 2.377 2.715 2.986 3.227 3.444 3.84 4.008 4.172 4.337 4.646 4.794 5.046 5.274 5.487 5.588 5.796 5.984 6.242 6.407 6.554 6.762 6.971 7.178 7.354 7.512 7.715 7.905 8.086 8.306 8.523 8.726 8.951 9.187 9.387 9.599 9.849 10.104 10.327 10.545 10.752 10.922 11.066 11.134 11.112 10.937 10.515 9.674 7.925 5.611 3.623 1.886 0.4 -0.937 -2.123 -3.177 -4.063 -4.947 -5.698 -6.383 -7.061 -7.689 -8.256 -8.77 -9.317 -9.827 -10.253 -10.669 -11.102 -11.465 -11.84 -12.225 -12.53 -12.851 -13.181 -13.518 -13.876 -14.136 -14.402 -14.803 -15.082 -15.369 -15.517 -15.842 -16.176 -16.519 -16.712 -17.096 -17.336 -17.554 -17.777 -18.342 -18.693 -19.05 -19.467 -19.943 -20.487 -21.16 -22.506 -9 ,13130 ,KEBNE ,17028391,Wed Dec 22 20:01:57 CET,Wed Dec 22 21:38:20 CET,0.0 1.5 2.101 2.484 2.789 3.066 3.302 3.509 3.852 4.013 4.172 4.332 4.638 4.763 4.989 5.213 5.427 5.532 5.733 5.912 6.158 6.318 6.469 6.68 6.883 7.075 7.254 7.429 7.647 7.838 8.011 8.22 8.416 8.603 8.814 9.024 9.212 9.407 9.62 9.84 10.051 10.26 10.43 10.573 10.705 10.751 10.699 10.528 10.134 9.313 7.605 5.299 3.337 1.642 0.16 -1.183 -2.336 -3.364 -4.257 -5.145 -5.917 -6.603 -7.239 -7.839 -8.397 -8.898 -9.425 -9.912 -10.333 -10.765 -11.234 -11.611 -11.984 -12.378 -12.686 -13.004 -13.342 -13.691 -14.04 -14.284 -14.54 -14.934 -15.197 -15.475 -15.629 -15.941 -16.261 -16.607 -16.79 -17.154 -17.382 -17.602 -17.835 -18.335 -18.628 -18.95 -19.279 -19.65 -20.077 -20.714 -22.33 -10 ,31969 ,KEBNE ,17028392,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:52:22 CET,0.0 1.244 1.864 2.326 2.689 2.986 3.232 3.485 3.976 4.168 4.316 4.434 4.718 4.849 5.105 5.333 5.546 5.652 5.846 6.025 6.275 6.436 6.615 6.858 7.05 7.239 7.421 7.579 7.788 7.999 8.19 8.394 8.58 8.765 8.978 9.187 9.371 9.581 9.792 9.997 10.196 10.406 10.603 10.754 10.888 10.964 10.952 10.762 10.345 9.545 7.828 5.511 3.516 1.781 0.306 -0.988 -2.106 -3.148 -4.062 -4.97 -5.738 -6.4 -7.048 -7.664 -8.222 -8.727 -9.253 -9.704 -10.091 -10.501 -10.929 -11.295 -11.686 -12.133 -12.469 -12.782 -13.118 -13.459 -13.8 -14.044 -14.302 -14.701 -14.972 -15.255 -15.4 -15.694 -16.017 -16.38 -16.568 -16.933 -17.158 -17.371 -17.593 -18.076 -18.378 -18.748 -19.147 -19.582 -20.104 -20.792 -22.619 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index df891790..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28387 ,KEBNE ,16750440,Thu Dec 2 06:47:37 CET,Thu Dec 2 08:21:04 CET,0.0 1.056 1.521 1.884 2.172 2.409 2.629 2.838 3.197 3.354 3.508 3.622 3.93 4.058 4.305 4.545 4.772 4.878 5.091 5.298 5.594 5.781 5.963 6.23 6.492 6.745 6.991 7.238 7.553 7.848 8.13 8.482 8.829 9.154 9.524 9.954 10.372 10.838 11.342 11.872 12.424 13.067 13.833 14.586 15.515 16.595 17.815 19.244 20.98 23.036 25.583 27.66 28.84 29.58 30.029 30.294 30.455 30.557 30.609 30.61 30.55 30.456 30.335 30.207 30.1 29.981 29.838 29.705 29.581 29.446 29.299 29.171 29.03 28.869 28.74 28.614 28.48 28.326 28.149 28.021 27.89 27.68 27.538 27.383 27.301 27.128 26.919 26.695 26.571 26.293 26.169 26.019 25.866 25.536 25.335 25.111 24.847 24.518 24.102 23.518 22.118 -2 ,2274 ,KEBNE ,16750441,Thu Dec 2 06:48:43 CET,Thu Dec 2 08:22:34 CET,0.0 0.911 1.38 1.702 1.958 2.201 2.418 2.607 2.96 3.118 3.273 3.4 3.719 3.858 4.123 4.366 4.594 4.706 4.93 5.147 5.462 5.66 5.852 6.129 6.392 6.655 6.909 7.154 7.462 7.752 8.037 8.389 8.734 9.066 9.453 9.88 10.282 10.726 11.218 11.759 12.319 12.96 13.723 14.483 15.383 16.42 17.636 19.015 20.67 22.689 25.181 27.285 28.504 29.275 29.808 30.116 30.269 30.346 30.37 30.361 30.319 30.25 30.159 30.06 29.951 29.831 29.688 29.544 29.419 29.295 29.153 29.019 28.87 28.701 28.568 28.426 28.264 28.088 27.904 27.773 27.638 27.428 27.262 27.09 27.002 26.813 26.612 26.374 26.242 25.969 25.838 25.688 25.526 25.139 24.91 24.663 24.39 24.067 23.679 23.161 21.815 -3 ,8408 ,KEBNE ,16750442,Thu Dec 2 06:48:43 CET,Thu Dec 2 08:22:41 CET,0.0 0.883 1.322 1.662 1.95 2.192 2.409 2.61 3.001 3.18 3.347 3.452 3.758 3.887 4.137 4.382 4.62 4.74 4.965 5.179 5.489 5.686 5.874 6.142 6.395 6.637 6.882 7.121 7.438 7.751 8.036 8.369 8.695 9.012 9.4 9.837 10.243 10.7 11.196 11.734 12.29 12.921 13.673 14.428 15.337 16.381 17.625 19.036 20.703 22.75 25.308 27.38 28.565 29.304 29.762 30.068 30.24 30.333 30.374 30.367 30.321 30.25 30.172 30.085 29.965 29.851 29.736 29.625 29.51 29.378 29.24 29.12 28.984 28.817 28.688 28.549 28.388 28.216 28.041 27.914 27.764 27.534 27.379 27.215 27.124 26.926 26.721 26.501 26.376 26.084 25.931 25.789 25.622 25.22 24.999 24.766 24.522 24.242 23.863 23.309 21.777 -4 ,30684 ,KEBNE ,16750443,Thu Dec 2 06:48:43 CET,Thu Dec 2 08:22:17 CET,0.0 0.757 1.228 1.569 1.825 2.034 2.234 2.447 2.831 2.997 3.148 3.247 3.567 3.713 4.001 4.258 4.495 4.613 4.836 5.045 5.339 5.526 5.719 5.999 6.261 6.516 6.763 6.994 7.295 7.592 7.879 8.22 8.551 8.884 9.267 9.697 10.131 10.613 11.12 11.648 12.222 12.893 13.666 14.434 15.325 16.358 17.594 19.003 20.709 22.777 25.316 27.451 28.677 29.414 29.878 30.156 30.3 30.371 30.4 30.381 30.327 30.254 30.166 30.065 29.943 29.818 29.686 29.565 29.449 29.303 29.144 29.015 28.875 28.699 28.55 28.398 28.236 28.067 27.879 27.746 27.603 27.377 27.214 27.029 26.933 26.728 26.513 26.277 26.153 25.881 25.738 25.584 25.425 25.044 24.823 24.583 24.316 23.984 23.558 23.03 21.422 -5 ,2653 ,KEBNE ,16750444,Thu Dec 2 06:48:42 CET,Thu Dec 2 08:22:33 CET,0.0 0.92 1.372 1.684 1.937 2.149 2.339 2.52 2.859 3.028 3.185 3.309 3.629 3.761 4.012 4.257 4.498 4.608 4.821 5.03 5.329 5.517 5.695 5.967 6.229 6.48 6.73 6.97 7.262 7.548 7.828 8.169 8.504 8.826 9.201 9.629 10.05 10.509 10.998 11.542 12.126 12.773 13.536 14.321 15.238 16.261 17.493 18.896 20.526 22.544 25.103 27.228 28.434 29.168 29.64 29.943 30.133 30.254 30.289 30.264 30.217 30.144 30.059 29.962 29.85 29.738 29.605 29.468 29.341 29.2 29.04 28.909 28.765 28.603 28.468 28.312 28.162 28.009 27.82 27.687 27.553 27.332 27.171 27.001 26.912 26.724 26.537 26.325 26.207 25.943 25.827 25.668 25.503 25.155 24.94 24.717 24.448 24.115 23.707 23.072 20.825 -6 ,25922 ,KEBNE ,16750445,Thu Dec 2 06:48:42 CET,Thu Dec 2 08:22:53 CET,0.0 0.94 1.415 1.74 1.979 2.215 2.43 2.61 2.937 3.098 3.25 3.345 3.654 3.795 4.059 4.302 4.533 4.648 4.864 5.067 5.381 5.575 5.756 6.027 6.285 6.54 6.792 7.035 7.342 7.633 7.928 8.284 8.622 8.964 9.362 9.803 10.223 10.686 11.176 11.695 12.271 12.909 13.664 14.441 15.353 16.386 17.565 18.946 20.636 22.7 25.256 27.403 28.679 29.433 29.881 30.175 30.32 30.388 30.417 30.406 30.358 30.283 30.204 30.111 30.016 29.916 29.793 29.674 29.543 29.398 29.246 29.104 28.954 28.785 28.649 28.519 28.388 28.241 28.069 27.941 27.803 27.592 27.43 27.244 27.144 26.948 26.749 26.525 26.403 26.127 25.999 25.852 25.69 25.333 25.121 24.894 24.656 24.361 23.951 23.395 21.596 -7 ,1758 ,KEBNE ,16750446,Thu Dec 2 06:56:09 CET,Thu Dec 2 08:30:17 CET,0.0 0.954 1.457 1.789 2.051 2.286 2.498 2.695 3.056 3.23 3.386 3.475 3.782 3.918 4.176 4.415 4.647 4.762 4.992 5.209 5.506 5.695 5.876 6.135 6.396 6.648 6.889 7.137 7.472 7.777 8.06 8.41 8.754 9.091 9.472 9.892 10.3 10.751 11.246 11.785 12.344 12.992 13.785 14.573 15.488 16.519 17.771 19.217 20.909 22.953 25.509 27.666 28.895 29.636 30.113 30.406 30.6 30.703 30.731 30.728 30.672 30.591 30.488 30.392 30.299 30.189 30.064 29.946 29.83 29.7 29.556 29.412 29.258 29.11 28.988 28.855 28.704 28.54 28.373 28.248 28.111 27.902 27.741 27.563 27.479 27.319 27.139 26.911 26.78 26.492 26.343 26.185 26.018 25.668 25.457 25.204 24.93 24.604 24.179 23.529 21.457 -8 ,28805 ,KEBNE ,16750447,Thu Dec 2 06:56:09 CET,Thu Dec 2 08:29:58 CET,0.0 0.925 1.367 1.682 1.955 2.21 2.41 2.587 2.916 3.063 3.209 3.313 3.625 3.764 4.034 4.279 4.508 4.62 4.838 5.039 5.324 5.511 5.692 5.959 6.222 6.468 6.707 6.945 7.254 7.555 7.843 8.192 8.525 8.844 9.217 9.633 10.031 10.487 10.99 11.532 12.109 12.739 13.488 14.269 15.189 16.238 17.495 18.932 20.629 22.669 25.155 27.204 28.41 29.151 29.629 29.956 30.156 30.25 30.283 30.275 30.227 30.158 30.072 29.986 29.876 29.756 29.621 29.479 29.35 29.201 29.034 28.889 28.734 28.571 28.442 28.314 28.171 28.01 27.828 27.698 27.565 27.331 27.169 27.01 26.926 26.727 26.506 26.296 26.183 25.908 25.743 25.566 25.394 24.968 24.721 24.463 24.175 23.825 23.412 22.841 21.191 -9 ,11504 ,KEBNE ,16750448,Thu Dec 2 06:56:09 CET,Thu Dec 2 08:29:59 CET,0.0 0.867 1.241 1.567 1.862 2.104 2.326 2.534 2.875 3.033 3.196 3.323 3.64 3.772 4.022 4.261 4.482 4.589 4.807 5.023 5.338 5.543 5.737 5.998 6.246 6.502 6.758 6.999 7.306 7.607 7.89 8.239 8.596 8.934 9.317 9.754 10.17 10.636 11.153 11.696 12.255 12.886 13.665 14.471 15.414 16.491 17.739 19.136 20.822 22.861 25.37 27.444 28.647 29.374 29.836 30.174 30.395 30.5 30.529 30.537 30.525 30.471 30.384 30.296 30.197 30.091 29.968 29.838 29.713 29.584 29.435 29.295 29.146 28.99 28.873 28.748 28.599 28.432 28.255 28.126 27.989 27.765 27.599 27.425 27.334 27.141 26.926 26.688 26.568 26.3 26.188 26.041 25.877 25.501 25.285 25.04 24.743 24.404 24.028 23.473 21.958 -10 ,2828 ,KEBNE ,16750449,Thu Dec 2 06:56:09 CET,Thu Dec 2 08:31:18 CET,0.0 0.73 1.093 1.408 1.677 1.911 2.136 2.332 2.674 2.841 2.994 3.107 3.425 3.569 3.847 4.096 4.332 4.444 4.665 4.883 5.192 5.39 5.576 5.841 6.109 6.368 6.607 6.843 7.151 7.444 7.73 8.077 8.423 8.764 9.147 9.57 9.98 10.435 10.938 11.476 12.052 12.699 13.448 14.217 15.136 16.165 17.381 18.81 20.486 22.498 24.995 27.122 28.384 29.128 29.6 29.894 30.037 30.097 30.108 30.1 30.06 29.986 29.883 29.778 29.672 29.564 29.442 29.32 29.204 29.08 28.945 28.826 28.695 28.536 28.403 28.267 28.136 27.991 27.814 27.686 27.555 27.343 27.193 27.03 26.944 26.759 26.547 26.323 26.203 25.921 25.781 25.626 25.473 25.119 24.918 24.719 24.488 24.181 23.777 23.154 21.536 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index bcb340b7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11685 ,KEBNE ,16750450,Thu Dec 2 06:56:09 CET,Thu Dec 2 08:31:24 CET,0.0 0.793 1.125 1.398 1.651 1.885 2.095 2.279 2.604 2.745 2.88 2.987 3.249 3.352 3.565 3.77 3.962 4.055 4.232 4.394 4.627 4.771 4.907 5.108 5.296 5.472 5.644 5.817 6.051 6.268 6.465 6.702 6.92 7.141 7.397 7.665 7.917 8.192 8.496 8.811 9.124 9.475 9.893 10.312 10.794 11.322 11.857 12.389 12.979 13.572 14.03 14.051 13.847 13.542 13.159 12.768 12.395 12.029 11.702 11.342 10.993 10.674 10.368 10.073 9.795 9.534 9.248 8.979 8.748 8.512 8.263 8.055 7.822 7.554 7.347 7.142 6.932 6.702 6.449 6.277 6.098 5.815 5.614 5.398 5.283 5.037 4.769 4.491 4.348 4.051 3.871 3.687 3.493 3.069 2.84 2.585 2.275 1.922 1.495 0.921 -0.65 -2 ,31935 ,KEBNE ,16750451,Thu Dec 2 06:57:13 CET,Thu Dec 2 08:31:57 CET,0.0 0.695 1.073 1.386 1.639 1.852 2.041 2.214 2.54 2.68 2.815 2.921 3.193 3.309 3.533 3.751 3.959 4.051 4.221 4.389 4.619 4.755 4.9 5.122 5.324 5.512 5.691 5.861 6.082 6.291 6.484 6.713 6.939 7.152 7.404 7.688 7.956 8.238 8.536 8.864 9.208 9.575 9.988 10.389 10.835 11.316 11.817 12.352 12.947 13.525 14.028 14.167 14.008 13.7 13.332 12.931 12.533 12.122 11.761 11.403 11.055 10.726 10.402 10.081 9.793 9.535 9.252 8.994 8.767 8.519 8.249 8.021 7.787 7.545 7.356 7.157 6.941 6.71 6.47 6.303 6.123 5.827 5.626 5.432 5.326 5.092 4.855 4.606 4.461 4.149 3.962 3.785 3.601 3.2 2.975 2.716 2.43 2.085 1.643 1.061 -0.536 -3 ,20549 ,KEBNE ,16750452,Thu Dec 2 06:59:23 CET,Thu Dec 2 08:34:23 CET,0.0 1.095 1.538 1.881 2.182 2.433 2.636 2.811 3.132 3.277 3.412 3.527 3.801 3.922 4.154 4.342 4.509 4.59 4.751 4.906 5.132 5.274 5.411 5.618 5.815 5.998 6.173 6.348 6.564 6.772 6.975 7.206 7.423 7.648 7.911 8.182 8.439 8.715 9.01 9.332 9.666 10.024 10.435 10.849 11.318 11.807 12.348 12.94 13.575 14.215 14.676 14.721 14.48 14.107 13.729 13.344 12.959 12.577 12.228 11.879 11.545 11.218 10.911 10.625 10.353 10.093 9.82 9.569 9.329 9.079 8.821 8.597 8.358 8.112 7.915 7.706 7.496 7.267 7.018 6.849 6.674 6.399 6.198 5.986 5.88 5.663 5.412 5.132 4.988 4.691 4.521 4.342 4.143 3.734 3.503 3.239 2.946 2.62 2.262 1.746 0.078 -4 ,12396 ,KEBNE ,16750453,Thu Dec 2 06:59:23 CET,Thu Dec 2 08:34:56 CET,0.0 0.642 0.963 1.245 1.496 1.708 1.914 2.098 2.409 2.555 2.689 2.782 3.053 3.164 3.381 3.589 3.779 3.87 4.044 4.206 4.438 4.591 4.734 4.935 5.124 5.315 5.499 5.668 5.876 6.075 6.269 6.506 6.736 6.948 7.192 7.461 7.715 7.995 8.295 8.608 8.938 9.301 9.699 10.098 10.55 11.033 11.57 12.126 12.732 13.336 13.794 13.836 13.591 13.226 12.827 12.433 12.062 11.668 11.305 10.948 10.638 10.335 10.029 9.722 9.414 9.142 8.856 8.596 8.363 8.107 7.839 7.62 7.387 7.137 6.947 6.742 6.524 6.301 6.06 5.892 5.716 5.433 5.23 5.01 4.901 4.674 4.417 4.153 4.019 3.728 3.55 3.377 3.199 2.79 2.539 2.246 1.923 1.571 1.139 0.576 -0.979 -5 ,26426 ,KEBNE ,16750454,Thu Dec 2 06:59:23 CET,Thu Dec 2 08:34:37 CET,0.0 0.809 1.171 1.462 1.744 1.971 2.142 2.302 2.628 2.775 2.909 3.013 3.289 3.408 3.625 3.84 4.05 4.146 4.32 4.471 4.691 4.834 4.968 5.162 5.351 5.531 5.702 5.879 6.108 6.32 6.522 6.761 6.998 7.225 7.465 7.733 8.003 8.292 8.588 8.897 9.217 9.573 9.973 10.381 10.86 11.385 11.947 12.515 13.103 13.676 14.165 14.208 13.944 13.578 13.201 12.828 12.46 12.104 11.755 11.379 11.055 10.763 10.462 10.147 9.849 9.586 9.308 9.043 8.808 8.558 8.291 8.065 7.816 7.548 7.342 7.143 6.944 6.725 6.482 6.308 6.134 5.855 5.649 5.443 5.338 5.104 4.843 4.566 4.413 4.106 3.927 3.752 3.567 3.16 2.926 2.655 2.345 1.999 1.576 0.956 -1.025 -6 ,17312 ,KEBNE ,16750455,Thu Dec 2 06:59:23 CET,Thu Dec 2 08:34:51 CET,0.0 0.881 1.278 1.602 1.852 2.072 2.286 2.468 2.77 2.906 3.038 3.139 3.415 3.531 3.735 3.916 4.085 4.171 4.341 4.505 4.74 4.888 5.029 5.232 5.434 5.625 5.798 5.965 6.191 6.411 6.614 6.848 7.071 7.288 7.533 7.811 8.077 8.367 8.666 8.969 9.293 9.654 10.06 10.454 10.894 11.379 11.925 12.467 13.069 13.707 14.163 14.219 14.036 13.734 13.403 13.032 12.625 12.22 11.852 11.479 11.143 10.842 10.545 10.234 9.94 9.677 9.406 9.153 8.925 8.688 8.416 8.187 7.955 7.717 7.524 7.32 7.11 6.889 6.66 6.486 6.306 6.046 5.857 5.659 5.558 5.329 5.072 4.801 4.658 4.356 4.162 3.973 3.777 3.354 3.122 2.855 2.549 2.213 1.824 1.268 0.084 -7 ,29160 ,KEBNE ,16750456,Thu Dec 2 07:01:31 CET,Thu Dec 2 08:37:45 CET,0.0 0.601 0.9 1.189 1.436 1.645 1.84 2.035 2.368 2.51 2.64 2.72 2.987 3.096 3.295 3.473 3.656 3.749 3.928 4.096 4.333 4.477 4.622 4.84 5.04 5.223 5.392 5.558 5.768 5.972 6.172 6.406 6.63 6.845 7.101 7.385 7.651 7.932 8.231 8.56 8.903 9.273 9.682 10.106 10.579 11.057 11.596 12.197 12.858 13.49 14.011 14.137 13.937 13.571 13.196 12.787 12.358 11.957 11.605 11.222 10.873 10.558 10.244 9.944 9.653 9.365 9.069 8.804 8.577 8.334 8.069 7.847 7.606 7.345 7.146 6.946 6.746 6.528 6.284 6.124 5.949 5.671 5.492 5.295 5.189 4.971 4.726 4.464 4.323 4.032 3.877 3.702 3.518 3.094 2.829 2.536 2.244 1.899 1.478 0.952 -0.455 -8 ,26551 ,KEBNE ,16750457,Thu Dec 2 07:01:31 CET,Thu Dec 2 08:34:38 CET,0.0 0.78 1.115 1.41 1.667 1.893 2.091 2.261 2.564 2.708 2.85 2.957 3.227 3.335 3.551 3.748 3.926 4.011 4.172 4.327 4.562 4.712 4.856 5.063 5.255 5.444 5.629 5.795 6.002 6.206 6.399 6.626 6.852 7.068 7.301 7.568 7.827 8.103 8.397 8.707 9.035 9.396 9.806 10.204 10.662 11.17 11.716 12.285 12.9 13.517 14.007 14.036 13.787 13.432 13.044 12.63 12.226 11.854 11.513 11.163 10.839 10.53 10.238 9.94 9.64 9.362 9.078 8.82 8.596 8.363 8.094 7.864 7.618 7.353 7.163 6.972 6.763 6.547 6.323 6.164 5.996 5.724 5.529 5.319 5.207 4.972 4.715 4.435 4.286 3.989 3.85 3.694 3.505 3.068 2.822 2.564 2.272 1.923 1.558 1.034 -0.679 -9 ,3397 ,KEBNE ,16750458,Thu Dec 2 07:05:43 CET,Thu Dec 2 08:40:13 CET,0.0 0.882 1.264 1.534 1.748 1.961 2.165 2.334 2.646 2.786 2.922 3.028 3.304 3.414 3.609 3.801 3.988 4.076 4.24 4.4 4.646 4.801 4.944 5.158 5.352 5.534 5.711 5.874 6.084 6.284 6.489 6.733 6.964 7.189 7.424 7.673 7.918 8.2 8.504 8.817 9.141 9.496 9.896 10.299 10.764 11.27 11.828 12.4 13.024 13.674 14.249 14.338 14.124 13.823 13.451 13.045 12.644 12.252 11.895 11.519 11.179 10.864 10.543 10.235 9.957 9.702 9.42 9.158 8.917 8.647 8.362 8.127 7.887 7.629 7.428 7.219 6.999 6.78 6.546 6.38 6.201 5.932 5.74 5.515 5.402 5.184 4.946 4.676 4.536 4.246 4.095 3.931 3.756 3.345 3.112 2.848 2.543 2.201 1.786 1.19 -0.326 -10 ,16608 ,KEBNE ,16750459,Thu Dec 2 07:06:48 CET,Thu Dec 2 08:42:56 CET,0.0 0.783 1.18 1.475 1.729 1.959 2.149 2.326 2.655 2.811 2.957 3.053 3.33 3.447 3.656 3.855 4.035 4.127 4.301 4.461 4.707 4.864 5.008 5.21 5.405 5.589 5.766 5.933 6.144 6.352 6.543 6.765 6.985 7.2 7.452 7.721 7.981 8.273 8.576 8.877 9.19 9.543 9.956 10.361 10.814 11.307 11.863 12.459 13.063 13.656 14.12 14.133 13.875 13.562 13.203 12.804 12.416 12.028 11.676 11.326 11.006 10.709 10.407 10.108 9.82 9.542 9.262 9.017 8.785 8.529 8.254 8.024 7.784 7.522 7.323 7.118 6.902 6.677 6.423 6.249 6.069 5.765 5.558 5.341 5.225 4.994 4.753 4.492 4.356 4.069 3.904 3.726 3.531 3.097 2.867 2.617 2.327 2.007 1.618 1.096 -0.732 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt deleted file mode 100644 index e1f54694..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22454 ,KEBNE ,16750460,Thu Dec 2 07:10:04 CET,Thu Dec 2 08:39:26 CET,0.0 2.332 2.963 3.351 3.672 3.963 4.206 4.432 4.836 5.004 5.16 5.282 5.564 5.698 5.951 6.175 6.374 6.465 6.636 6.786 6.994 7.136 7.277 7.468 7.648 7.821 7.974 8.118 8.278 8.432 8.594 8.778 8.952 9.116 9.282 9.441 9.568 9.706 9.871 10.046 10.198 10.337 10.449 10.516 10.556 10.523 10.393 10.118 9.574 8.616 6.751 4.375 2.423 0.736 -0.691 -1.951 -3.035 -4.009 -4.865 -5.709 -6.427 -7.052 -7.644 -8.211 -8.732 -9.204 -9.696 -10.122 -10.482 -10.864 -11.265 -11.59 -11.929 -12.287 -12.573 -12.855 -13.131 -13.425 -13.749 -13.973 -14.199 -14.567 -14.824 -15.088 -15.225 -15.506 -15.809 -16.121 -16.277 -16.624 -16.812 -17.01 -17.224 -17.673 -17.912 -18.167 -18.472 -18.825 -19.259 -19.832 -21.052 -2 ,18320 ,KEBNE ,16750461,Thu Dec 2 07:14:12 CET,Thu Dec 2 08:48:22 CET,0.0 1.489 2.001 2.369 2.67 2.942 3.192 3.405 3.763 3.925 4.066 4.173 4.45 4.566 4.788 4.996 5.184 5.273 5.434 5.583 5.802 5.936 6.072 6.273 6.447 6.598 6.74 6.877 7.059 7.23 7.388 7.57 7.733 7.88 8.038 8.209 8.368 8.527 8.675 8.819 8.945 9.051 9.136 9.184 9.207 9.183 9.063 8.8 8.251 7.25 5.439 3.1 1.108 -0.559 -1.996 -3.266 -4.336 -5.287 -6.105 -6.922 -7.629 -8.247 -8.83 -9.377 -9.879 -10.332 -10.809 -11.24 -11.612 -11.993 -12.378 -12.714 -13.073 -13.438 -13.722 -14.011 -14.306 -14.609 -14.916 -15.131 -15.354 -15.693 -15.94 -16.216 -16.357 -16.631 -16.917 -17.235 -17.406 -17.749 -17.905 -18.095 -18.289 -18.698 -18.935 -19.182 -19.444 -19.738 -20.075 -20.523 -21.467 -3 ,13323 ,KEBNE ,16750462,Thu Dec 2 07:14:13 CET,Thu Dec 2 08:48:27 CET,0.0 1.281 1.798 2.177 2.484 2.724 2.933 3.135 3.499 3.658 3.816 3.973 4.263 4.384 4.586 4.774 4.969 5.063 5.238 5.399 5.635 5.782 5.92 6.115 6.301 6.468 6.612 6.753 6.939 7.114 7.264 7.445 7.616 7.775 7.952 8.131 8.304 8.478 8.627 8.771 8.901 9.036 9.179 9.272 9.327 9.309 9.194 8.908 8.372 7.431 5.625 3.323 1.37 -0.276 -1.687 -2.951 -4.042 -5.011 -5.841 -6.669 -7.361 -7.957 -8.542 -9.118 -9.63 -10.076 -10.541 -10.96 -11.328 -11.709 -12.104 -12.436 -12.79 -13.151 -13.432 -13.724 -14.021 -14.329 -14.649 -14.871 -15.104 -15.462 -15.711 -15.987 -16.132 -16.43 -16.731 -17.058 -17.228 -17.566 -17.729 -17.91 -18.105 -18.539 -18.79 -19.075 -19.394 -19.74 -20.239 -20.837 -21.96 -4 ,921 ,KEBNE ,16750463,Thu Dec 2 07:17:23 CET,Thu Dec 2 08:53:03 CET,0.0 1.445 1.957 2.355 2.665 2.917 3.149 3.375 3.77 3.938 4.092 4.197 4.468 4.582 4.809 5.025 5.225 5.32 5.493 5.65 5.871 6.019 6.163 6.356 6.538 6.715 6.866 6.998 7.173 7.336 7.496 7.689 7.863 8.024 8.196 8.374 8.527 8.676 8.816 8.944 9.064 9.186 9.307 9.405 9.451 9.429 9.31 9.015 8.47 7.477 5.668 3.393 1.477 -0.195 -1.634 -2.868 -3.941 -4.931 -5.773 -6.589 -7.292 -7.929 -8.51 -9.055 -9.578 -10.037 -10.509 -10.952 -11.336 -11.72 -12.103 -12.416 -12.756 -13.115 -13.386 -13.656 -13.935 -14.231 -14.551 -14.779 -15.012 -15.362 -15.598 -15.846 -15.98 -16.268 -16.57 -16.894 -17.059 -17.398 -17.568 -17.763 -17.971 -18.414 -18.663 -18.951 -19.249 -19.589 -20.004 -20.508 -21.722 -5 ,30944 ,KEBNE ,16750464,Thu Dec 2 07:17:23 CET,Thu Dec 2 08:52:57 CET,0.0 1.422 1.945 2.341 2.683 2.952 3.203 3.434 3.814 3.985 4.148 4.285 4.579 4.709 4.942 5.146 5.335 5.424 5.596 5.757 5.977 6.109 6.232 6.412 6.595 6.773 6.934 7.073 7.247 7.42 7.595 7.795 7.96 8.115 8.287 8.457 8.602 8.751 8.908 9.049 9.177 9.301 9.395 9.449 9.457 9.419 9.285 8.976 8.448 7.498 5.659 3.273 1.318 -0.32 -1.691 -2.931 -3.997 -4.915 -5.736 -6.569 -7.288 -7.922 -8.509 -9.053 -9.551 -10.01 -10.508 -10.949 -11.333 -11.726 -12.12 -12.453 -12.802 -13.173 -13.456 -13.741 -14.045 -14.367 -14.701 -14.932 -15.167 -15.533 -15.791 -16.054 -16.191 -16.482 -16.8 -17.131 -17.303 -17.66 -17.854 -18.053 -18.274 -18.764 -19.027 -19.325 -19.648 -20.027 -20.476 -21.06 -22.615 -6 ,23839 ,KEBNE ,16750465,Thu Dec 2 07:17:23 CET,Thu Dec 2 08:53:09 CET,0.0 1.95 2.526 2.941 3.274 3.554 3.816 4.056 4.472 4.652 4.815 4.971 5.265 5.39 5.624 5.834 6.018 6.107 6.275 6.441 6.683 6.828 6.969 7.162 7.341 7.504 7.655 7.799 7.981 8.146 8.3 8.476 8.623 8.778 8.958 9.139 9.296 9.468 9.642 9.79 9.918 10.026 10.087 10.135 10.156 10.092 9.944 9.66 9.127 8.177 6.395 4.17 2.316 0.689 -0.695 -1.935 -3.025 -3.998 -4.831 -5.636 -6.336 -6.965 -7.566 -8.128 -8.644 -9.126 -9.621 -10.05 -10.436 -10.841 -11.24 -11.562 -11.899 -12.253 -12.527 -12.814 -13.11 -13.413 -13.727 -13.956 -14.201 -14.573 -14.829 -15.102 -15.241 -15.52 -15.807 -16.102 -16.258 -16.609 -16.792 -16.977 -17.18 -17.616 -17.866 -18.126 -18.419 -18.769 -19.14 -19.607 -20.769 -7 ,27785 ,KEBNE ,16750466,Thu Dec 2 07:17:23 CET,Thu Dec 2 08:52:17 CET,0.0 1.17 1.671 2.014 2.304 2.557 2.777 2.987 3.324 3.476 3.629 3.75 4.033 4.154 4.373 4.576 4.77 4.862 5.035 5.189 5.394 5.528 5.66 5.838 6.011 6.173 6.327 6.482 6.664 6.827 6.98 7.162 7.33 7.49 7.667 7.839 7.994 8.146 8.304 8.461 8.6 8.721 8.817 8.878 8.901 8.858 8.741 8.5 7.939 6.897 5.09 2.792 0.832 -0.815 -2.208 -3.468 -4.557 -5.522 -6.358 -7.188 -7.883 -8.484 -9.081 -9.677 -10.221 -10.696 -11.188 -11.628 -12.006 -12.397 -12.797 -13.124 -13.462 -13.814 -14.086 -14.375 -14.671 -14.967 -15.279 -15.504 -15.747 -16.104 -16.355 -16.619 -16.75 -17.025 -17.313 -17.611 -17.773 -18.118 -18.282 -18.463 -18.669 -19.131 -19.384 -19.662 -19.961 -20.293 -20.662 -21.141 -22.203 -8 ,24829 ,KEBNE ,16750467,Thu Dec 2 07:24:47 CET,Thu Dec 2 08:59:06 CET,0.0 1.347 1.986 2.408 2.734 2.997 3.205 3.407 3.773 3.938 4.095 4.212 4.495 4.62 4.857 5.064 5.255 5.345 5.513 5.672 5.907 6.052 6.187 6.386 6.567 6.733 6.887 7.028 7.204 7.373 7.527 7.704 7.871 8.018 8.185 8.357 8.502 8.666 8.827 8.975 9.118 9.252 9.368 9.446 9.482 9.472 9.37 9.07 8.55 7.632 5.838 3.513 1.568 -0.115 -1.569 -2.828 -3.902 -4.88 -5.725 -6.556 -7.251 -7.868 -8.472 -9.04 -9.56 -10.035 -10.527 -10.961 -11.341 -11.728 -12.124 -12.459 -12.797 -13.144 -13.416 -13.692 -13.985 -14.298 -14.609 -14.827 -15.062 -15.423 -15.676 -15.941 -16.073 -16.336 -16.618 -16.94 -17.104 -17.449 -17.624 -17.818 -18.024 -18.452 -18.686 -18.936 -19.228 -19.557 -19.975 -20.518 -21.977 -9 ,7025 ,KEBNE ,16750468,Thu Dec 2 07:24:47 CET,Thu Dec 2 08:59:14 CET,0.0 1.658 2.204 2.57 2.863 3.132 3.384 3.596 3.945 4.1 4.251 4.373 4.657 4.785 5.026 5.248 5.451 5.545 5.718 5.879 6.102 6.248 6.394 6.578 6.759 6.95 7.123 7.27 7.443 7.604 7.751 7.932 8.107 8.273 8.433 8.606 8.775 8.942 9.113 9.264 9.405 9.534 9.646 9.745 9.801 9.761 9.617 9.359 8.841 7.861 6.092 3.829 1.88 0.208 -1.245 -2.528 -3.636 -4.63 -5.462 -6.287 -6.984 -7.586 -8.151 -8.681 -9.182 -9.653 -10.144 -10.585 -10.956 -11.331 -11.728 -12.068 -12.425 -12.791 -13.069 -13.363 -13.679 -13.992 -14.326 -14.566 -14.798 -15.15 -15.396 -15.651 -15.781 -16.046 -16.342 -16.658 -16.819 -17.16 -17.319 -17.51 -17.72 -18.149 -18.386 -18.646 -18.922 -19.253 -19.665 -20.192 -21.327 -10 ,23475 ,KEBNE ,16750469,Thu Dec 2 07:24:47 CET,Thu Dec 2 08:54:02 CET,0.0 1.725 2.221 2.601 2.911 3.163 3.384 3.586 3.942 4.092 4.232 4.34 4.626 4.752 4.97 5.168 5.354 5.439 5.61 5.792 6.028 6.159 6.283 6.465 6.649 6.821 6.974 7.12 7.296 7.453 7.594 7.759 7.92 8.071 8.242 8.414 8.561 8.711 8.856 8.992 9.129 9.276 9.405 9.484 9.512 9.475 9.325 8.985 8.412 7.454 5.676 3.336 1.438 -0.143 -1.523 -2.795 -3.888 -4.849 -5.673 -6.484 -7.202 -7.829 -8.418 -8.991 -9.51 -9.971 -10.469 -10.909 -11.284 -11.68 -12.081 -12.4 -12.739 -13.113 -13.397 -13.685 -13.974 -14.278 -14.599 -14.808 -15.029 -15.394 -15.643 -15.898 -16.032 -16.303 -16.592 -16.897 -17.053 -17.389 -17.557 -17.761 -17.988 -18.446 -18.69 -18.972 -19.295 -19.657 -20.135 -20.803 -22.321 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt deleted file mode 100644 index 176b52ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7195 ,KEBNE ,17028393,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:54:52 CET,0.0 2.124 2.684 3.075 3.39 3.68 3.939 4.176 4.618 4.809 4.999 5.203 5.553 5.723 6.031 6.32 6.601 6.737 6.992 7.242 7.6 7.821 8.035 8.332 8.612 8.895 9.182 9.447 9.767 10.094 10.412 10.78 11.153 11.52 11.919 12.343 12.741 13.176 13.664 14.181 14.722 15.331 16.038 16.747 17.508 18.289 19.16 20.159 21.247 22.212 23.078 23.508 23.508 23.327 22.994 22.646 22.29 21.902 21.532 21.127 20.78 20.454 20.131 19.832 19.537 19.263 18.977 18.699 18.454 18.19 17.892 17.647 17.401 17.141 16.944 16.741 16.524 16.3 16.063 15.897 15.724 15.425 15.208 15.0 14.892 14.659 14.425 14.183 14.051 13.752 13.6 13.42 13.223 12.797 12.562 12.312 12.02 11.669 11.26 10.703 8.766 -2 ,28598 ,KEBNE ,17028394,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:54:33 CET,0.0 1.814 2.394 2.814 3.15 3.406 3.652 3.893 4.329 4.54 4.744 4.971 5.335 5.511 5.828 6.121 6.396 6.531 6.795 7.046 7.4 7.624 7.846 8.172 8.477 8.771 9.058 9.317 9.652 9.988 10.312 10.701 11.067 11.426 11.834 12.277 12.67 13.066 13.501 13.993 14.517 15.087 15.738 16.402 17.181 18.045 19.043 20.11 21.195 22.313 23.421 23.777 23.677 23.276 22.764 22.302 21.845 21.405 21.033 20.629 20.268 19.937 19.604 19.266 18.933 18.633 18.307 18.016 17.774 17.518 17.25 17.026 16.789 16.539 16.344 16.134 15.909 15.675 15.421 15.243 15.063 14.79 14.587 14.363 14.249 13.998 13.733 13.463 13.318 13.007 12.85 12.672 12.488 12.112 11.897 11.652 11.376 11.035 10.585 10.016 8.992 -3 ,28401 ,KEBNE ,17028395,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:45:25 CET,0.0 1.498 2.016 2.399 2.764 3.066 3.311 3.552 4.011 4.216 4.408 4.603 4.948 5.118 5.446 5.752 6.028 6.163 6.428 6.685 7.041 7.262 7.487 7.811 8.099 8.39 8.681 8.952 9.3 9.635 9.957 10.339 10.7 11.046 11.446 11.884 12.306 12.766 13.268 13.811 14.346 14.95 15.647 16.288 16.981 17.713 18.581 19.48 20.379 21.349 22.235 22.674 22.625 22.409 22.14 21.787 21.417 21.035 20.663 20.22 19.797 19.464 19.172 18.886 18.588 18.285 17.972 17.695 17.435 17.171 16.911 16.701 16.482 16.239 16.043 15.837 15.619 15.382 15.131 14.959 14.775 14.453 14.24 14.032 13.922 13.698 13.439 13.146 12.994 12.688 12.556 12.4 12.218 11.799 11.578 11.339 11.056 10.735 10.351 9.792 8.638 -4 ,26226 ,KEBNE ,17028396,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:54:32 CET,0.0 1.555 2.123 2.517 2.854 3.165 3.459 3.73 4.211 4.423 4.617 4.833 5.191 5.359 5.662 5.947 6.233 6.372 6.638 6.89 7.248 7.47 7.688 8.007 8.299 8.599 8.897 9.163 9.505 9.847 10.158 10.523 10.868 11.206 11.6 12.044 12.473 12.93 13.435 13.977 14.523 15.071 15.661 16.266 16.952 17.681 18.493 19.411 20.504 21.679 22.707 22.991 22.783 22.491 22.152 21.749 21.323 20.903 20.503 20.081 19.726 19.391 19.049 18.727 18.416 18.126 17.812 17.522 17.274 17.015 16.748 16.524 16.287 16.021 15.811 15.59 15.369 15.134 14.875 14.706 14.538 14.276 14.082 13.866 13.75 13.502 13.235 12.959 12.814 12.496 12.326 12.144 11.926 11.439 11.204 10.985 10.748 10.442 10.003 9.492 6.744 -5 ,22674 ,KEBNE ,17028397,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:52:54 CET,0.0 1.38 1.915 2.334 2.704 3.033 3.3 3.546 4.01 4.231 4.443 4.645 4.993 5.164 5.468 5.761 6.043 6.177 6.439 6.69 7.054 7.283 7.5 7.811 8.103 8.37 8.641 8.925 9.287 9.619 9.927 10.292 10.655 11.016 11.419 11.877 12.302 12.731 13.196 13.701 14.221 14.807 15.507 16.17 16.89 17.667 18.561 19.545 20.552 21.544 22.614 23.103 23.07 22.859 22.549 22.146 21.749 21.35 20.955 20.515 20.125 19.766 19.405 19.061 18.712 18.389 18.074 17.79 17.541 17.271 16.995 16.768 16.514 16.244 16.036 15.832 15.618 15.381 15.129 14.949 14.764 14.475 14.259 14.028 13.909 13.653 13.378 13.094 12.946 12.63 12.445 12.261 12.071 11.677 11.467 11.228 10.967 10.653 10.261 9.77 8.647 -6 ,13469 ,KEBNE ,17028398,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:54:06 CET,0.0 1.505 2.04 2.472 2.867 3.214 3.476 3.699 4.124 4.328 4.526 4.724 5.06 5.214 5.517 5.818 6.1 6.239 6.511 6.765 7.126 7.356 7.577 7.883 8.154 8.428 8.713 8.978 9.318 9.652 9.963 10.334 10.712 11.059 11.439 11.894 12.327 12.77 13.234 13.731 14.262 14.854 15.534 16.2 16.899 17.63 18.45 19.286 20.209 21.227 22.165 22.512 22.423 22.138 21.735 21.296 20.893 20.479 20.073 19.647 19.273 18.947 18.638 18.347 18.083 17.83 17.57 17.323 17.078 16.814 16.541 16.309 16.058 15.784 15.578 15.374 15.162 14.933 14.686 14.52 14.347 14.053 13.838 13.621 13.51 13.282 13.028 12.743 12.595 12.287 12.139 11.966 11.776 11.326 11.081 10.826 10.556 10.245 9.874 9.281 7.192 -7 ,21852 ,KEBNE ,17028399,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:54:26 CET,0.0 1.648 2.183 2.573 2.879 3.178 3.458 3.721 4.195 4.388 4.574 4.769 5.113 5.282 5.615 5.928 6.206 6.335 6.581 6.818 7.16 7.376 7.591 7.91 8.213 8.497 8.772 9.043 9.386 9.704 10.008 10.377 10.728 11.065 11.462 11.897 12.312 12.766 13.236 13.752 14.326 14.982 15.715 16.385 17.11 17.908 18.876 19.898 20.974 22.175 23.292 23.658 23.574 23.378 23.095 22.724 22.34 21.957 21.593 21.191 20.807 20.432 20.072 19.741 19.409 19.099 18.803 18.533 18.289 18.043 17.778 17.553 17.316 17.058 16.851 16.635 16.408 16.151 15.879 15.7 15.52 15.235 15.037 14.835 14.723 14.476 14.198 13.897 13.751 13.446 13.297 13.133 12.948 12.51 12.294 12.055 11.768 11.445 11.057 10.569 8.885 -8 ,17717 ,KEBNE ,17028400,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:53:09 CET,0.0 1.582 2.18 2.601 2.935 3.232 3.49 3.729 4.172 4.361 4.538 4.715 5.051 5.209 5.513 5.811 6.097 6.231 6.486 6.738 7.094 7.315 7.531 7.846 8.156 8.452 8.733 9.005 9.349 9.671 9.99 10.38 10.742 11.088 11.485 11.929 12.344 12.805 13.326 13.857 14.397 15.009 15.728 16.447 17.261 18.115 19.041 20.048 21.075 22.062 22.997 23.487 23.459 23.109 22.702 22.307 21.895 21.471 21.082 20.681 20.312 19.957 19.609 19.29 18.985 18.706 18.402 18.111 17.854 17.59 17.321 17.087 16.829 16.566 16.363 16.151 15.911 15.658 15.397 15.206 15.019 14.712 14.499 14.294 14.181 13.929 13.664 13.396 13.255 12.946 12.803 12.637 12.439 12.022 11.799 11.553 11.288 10.97 10.562 10.006 8.553 -9 ,5128 ,KEBNE ,17028401,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:53:15 CET,0.0 1.632 2.193 2.666 3.026 3.313 3.589 3.844 4.283 4.486 4.679 4.862 5.198 5.362 5.679 5.995 6.3 6.441 6.718 6.978 7.326 7.546 7.759 8.055 8.339 8.627 8.9 9.154 9.496 9.826 10.128 10.497 10.851 11.174 11.56 12.005 12.431 12.899 13.381 13.852 14.356 14.96 15.658 16.31 16.962 17.681 18.464 19.311 20.311 21.211 21.994 22.402 22.34 22.094 21.737 21.316 20.913 20.553 20.255 19.908 19.56 19.241 18.938 18.653 18.388 18.129 17.807 17.49 17.23 16.964 16.676 16.437 16.192 15.948 15.739 15.503 15.266 15.021 14.763 14.586 14.4 14.119 13.917 13.703 13.593 13.352 13.094 12.828 12.684 12.366 12.204 12.033 11.838 11.428 11.209 10.967 10.716 10.402 9.986 9.466 7.681 -10 ,1791 ,KEBNE ,17028402,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:54:38 CET,0.0 1.762 2.329 2.737 3.078 3.376 3.632 3.869 4.316 4.537 4.746 4.936 5.27 5.426 5.73 6.026 6.306 6.444 6.71 6.96 7.323 7.545 7.758 8.079 8.371 8.652 8.931 9.2 9.557 9.889 10.203 10.576 10.925 11.255 11.651 12.094 12.513 12.969 13.442 13.94 14.448 15.008 15.683 16.363 17.136 17.948 18.848 19.789 20.79 21.85 22.715 22.973 22.92 22.693 22.309 21.84 21.385 20.952 20.558 20.126 19.727 19.391 19.045 18.702 18.397 18.094 17.761 17.467 17.218 16.958 16.671 16.43 16.188 15.932 15.732 15.527 15.312 15.092 14.862 14.69 14.509 14.207 13.988 13.773 13.662 13.432 13.176 12.897 12.738 12.4 12.216 12.04 11.848 11.449 11.235 11.015 10.758 10.439 10.055 9.607 8.568 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt deleted file mode 100644 index 78eb5cce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,250 ,KEBNE ,16750470,Thu Dec 2 07:25:56 CET,Thu Dec 2 09:05:26 CET,0.0 0.44 0.751 0.998 1.214 1.433 1.639 1.813 2.159 2.332 2.493 2.588 2.957 3.117 3.409 3.698 3.984 4.117 4.382 4.639 5.005 5.239 5.463 5.791 6.136 6.484 6.823 7.153 7.566 7.961 8.346 8.819 9.279 9.733 10.276 10.878 11.442 12.052 12.719 13.43 14.225 15.184 16.283 17.411 18.78 20.241 21.843 23.705 26.043 28.853 32.31 35.263 37.044 38.231 39.027 39.565 39.858 39.993 40.033 40.016 39.976 39.932 39.864 39.776 39.681 39.575 39.447 39.322 39.203 39.066 38.925 38.797 38.637 38.461 38.322 38.18 38.024 37.854 37.646 37.482 37.321 37.082 36.916 36.727 36.624 36.404 36.161 35.896 35.752 35.43 35.289 35.127 34.956 34.58 34.363 34.12 33.852 33.501 33.106 32.658 31.495 -2 ,17727 ,KEBNE ,16750471,Thu Dec 2 07:32:25 CET,Thu Dec 2 09:12:29 CET,0.0 0.432 0.733 1.0 1.244 1.475 1.691 1.905 2.323 2.508 2.681 2.797 3.159 3.305 3.604 3.9 4.191 4.336 4.61 4.872 5.248 5.495 5.731 6.074 6.424 6.756 7.053 7.349 7.749 8.137 8.51 8.969 9.425 9.86 10.36 10.932 11.498 12.121 12.791 13.505 14.264 15.145 16.203 17.314 18.616 20.061 21.878 24.012 26.447 29.402 33.16 36.423 38.399 39.625 40.398 40.944 41.286 41.488 41.632 41.72 41.745 41.724 41.67 41.602 41.516 41.419 41.278 41.131 41.0 40.864 40.721 40.59 40.443 40.278 40.142 39.996 39.831 39.654 39.465 39.333 39.194 38.943 38.75 38.548 38.446 38.239 38.024 37.769 37.638 37.33 37.179 37.008 36.825 36.447 36.217 35.966 35.685 35.357 34.97 34.481 33.197 -3 ,32050 ,KEBNE ,16750472,Thu Dec 2 07:39:56 CET,Thu Dec 2 09:18:33 CET,0.0 0.82 1.231 1.552 1.834 2.072 2.303 2.536 2.978 3.176 3.359 3.516 3.892 4.052 4.362 4.666 4.959 5.094 5.362 5.627 6.003 6.242 6.476 6.823 7.166 7.496 7.816 8.135 8.549 8.943 9.332 9.818 10.273 10.705 11.222 11.829 12.423 13.047 13.721 14.434 15.184 16.056 17.071 18.141 19.438 20.893 22.622 24.6 26.961 29.909 33.632 36.851 38.799 40.036 40.817 41.358 41.678 41.816 41.886 41.933 41.942 41.914 41.814 41.686 41.577 41.465 41.335 41.207 41.089 40.95 40.792 40.643 40.453 40.241 40.076 39.913 39.749 39.588 39.418 39.271 39.098 38.805 38.604 38.411 38.309 38.089 37.853 37.6 37.461 37.149 37.008 36.832 36.654 36.263 36.043 35.816 35.553 35.233 34.867 34.344 33.306 -4 ,24625 ,KEBNE ,16750473,Thu Dec 2 07:40:00 CET,Thu Dec 2 09:14:58 CET,0.0 0.898 1.368 1.719 1.996 2.226 2.455 2.675 3.069 3.255 3.431 3.569 3.945 4.097 4.402 4.7 4.977 5.114 5.388 5.651 6.033 6.267 6.497 6.846 7.188 7.53 7.863 8.18 8.589 8.995 9.384 9.853 10.31 10.771 11.309 11.888 12.46 13.101 13.772 14.458 15.185 16.037 17.065 18.121 19.351 20.78 22.469 24.4 26.712 29.547 33.133 36.186 38.003 39.18 39.953 40.45 40.759 40.945 41.051 41.115 41.123 41.078 41.0 40.905 40.794 40.684 40.556 40.404 40.261 40.12 39.961 39.825 39.672 39.501 39.368 39.215 39.049 38.87 38.694 38.567 38.414 38.176 38.018 37.852 37.767 37.586 37.37 37.12 36.985 36.678 36.525 36.353 36.182 35.788 35.573 35.339 35.063 34.723 34.341 33.822 31.788 -5 ,2611 ,KEBNE ,16750474,Thu Dec 2 07:39:56 CET,Thu Dec 2 09:18:21 CET,0.0 0.716 1.116 1.439 1.702 1.95 2.194 2.423 2.837 3.022 3.203 3.338 3.705 3.865 4.161 4.452 4.726 4.859 5.122 5.379 5.756 5.994 6.218 6.547 6.869 7.185 7.513 7.827 8.227 8.613 8.98 9.444 9.892 10.32 10.824 11.403 11.991 12.63 13.289 14.024 14.821 15.714 16.763 17.823 19.089 20.539 22.216 24.137 26.471 29.372 33.048 36.068 37.778 38.877 39.588 40.03 40.306 40.483 40.564 40.579 40.548 40.512 40.468 40.364 40.222 40.077 39.913 39.758 39.621 39.488 39.335 39.202 39.049 38.855 38.694 38.518 38.326 38.143 37.956 37.806 37.628 37.34 37.145 36.933 36.821 36.594 36.338 36.069 35.932 35.61 35.484 35.336 35.171 34.793 34.564 34.304 34.012 33.676 33.249 32.7 31.735 -6 ,13275 ,KEBNE ,16750475,Thu Dec 2 07:39:55 CET,Thu Dec 2 09:18:36 CET,0.0 0.706 1.077 1.392 1.695 1.965 2.207 2.431 2.816 2.986 3.161 3.295 3.655 3.806 4.112 4.42 4.715 4.852 5.111 5.355 5.715 5.967 6.215 6.555 6.902 7.254 7.58 7.896 8.319 8.729 9.116 9.576 10.022 10.447 10.937 11.494 12.045 12.686 13.37 14.073 14.827 15.696 16.733 17.831 19.133 20.607 22.376 24.413 26.843 29.823 33.583 36.756 38.662 39.826 40.564 41.076 41.373 41.522 41.572 41.574 41.535 41.45 41.335 41.214 41.121 41.022 40.892 40.767 40.641 40.496 40.329 40.189 40.039 39.869 39.729 39.575 39.4 39.22 39.026 38.876 38.712 38.443 38.257 38.067 37.97 37.758 37.525 37.254 37.105 36.791 36.678 36.528 36.36 35.984 35.772 35.544 35.277 34.963 34.578 34.078 32.776 -7 ,305 ,KEBNE ,16750476,Thu Dec 2 07:39:56 CET,Thu Dec 2 09:18:18 CET,0.0 0.695 1.03 1.291 1.536 1.765 1.957 2.136 2.506 2.681 2.843 2.943 3.303 3.437 3.691 3.95 4.195 4.313 4.563 4.818 5.196 5.446 5.684 6.024 6.365 6.694 7.009 7.331 7.747 8.137 8.51 8.972 9.424 9.863 10.382 10.97 11.533 12.164 12.859 13.591 14.383 15.279 16.311 17.376 18.635 20.081 21.788 23.773 26.226 29.21 32.922 36.07 37.958 39.183 39.913 40.356 40.672 40.896 41.006 41.004 40.966 40.916 40.853 40.771 40.664 40.551 40.405 40.273 40.157 40.008 39.848 39.705 39.532 39.338 39.182 39.006 38.804 38.599 38.391 38.251 38.101 37.859 37.674 37.471 37.366 37.132 36.889 36.664 36.536 36.221 36.086 35.914 35.731 35.32 35.067 34.805 34.527 34.179 33.736 33.253 32.151 -8 ,29275 ,KEBNE ,16750477,Thu Dec 2 07:39:55 CET,Thu Dec 2 09:18:31 CET,0.0 1.132 1.587 1.92 2.218 2.479 2.709 2.925 3.323 3.499 3.663 3.795 4.175 4.343 4.662 4.964 5.254 5.394 5.654 5.903 6.271 6.51 6.748 7.095 7.427 7.753 8.059 8.352 8.752 9.14 9.513 9.957 10.386 10.806 11.318 11.913 12.467 13.077 13.756 14.492 15.277 16.17 17.221 18.28 19.517 20.905 22.54 24.453 26.767 29.62 33.233 36.352 38.222 39.393 40.136 40.631 40.95 41.165 41.274 41.307 41.285 41.25 41.215 41.149 41.037 40.917 40.799 40.676 40.534 40.359 40.153 39.987 39.839 39.677 39.532 39.365 39.18 38.981 38.763 38.609 38.455 38.207 38.032 37.845 37.741 37.519 37.274 36.999 36.863 36.565 36.427 36.26 36.083 35.665 35.429 35.183 34.914 34.61 34.255 33.77 32.425 -9 ,10011 ,KEBNE ,16750478,Thu Dec 2 07:41:04 CET,Thu Dec 2 09:16:59 CET,0.0 0.361 0.646 0.93 1.193 1.417 1.628 1.839 2.244 2.436 2.609 2.725 3.091 3.239 3.521 3.811 4.103 4.24 4.503 4.757 5.146 5.397 5.634 5.968 6.291 6.619 6.941 7.238 7.62 8.011 8.404 8.868 9.312 9.755 10.279 10.881 11.447 12.078 12.759 13.478 14.27 15.17 16.216 17.296 18.569 20.021 21.709 23.568 25.818 28.606 32.134 35.08 36.812 37.896 38.558 39.031 39.366 39.563 39.65 39.681 39.678 39.646 39.583 39.495 39.349 39.184 39.029 38.906 38.792 38.646 38.48 38.322 38.159 38.003 37.862 37.68 37.474 37.256 37.032 36.872 36.711 36.47 36.295 36.108 36.01 35.795 35.549 35.295 35.156 34.832 34.675 34.509 34.338 33.955 33.736 33.485 33.199 32.892 32.551 32.082 31.049 -10 ,20721 ,KEBNE ,16750479,Thu Dec 2 07:43:15 CET,Thu Dec 2 09:20:01 CET,0.0 0.724 1.092 1.405 1.674 1.933 2.177 2.401 2.823 3.006 3.18 3.317 3.69 3.853 4.17 4.454 4.717 4.854 5.117 5.359 5.713 5.95 6.187 6.533 6.872 7.207 7.543 7.87 8.278 8.667 9.037 9.489 9.929 10.35 10.846 11.427 11.985 12.59 13.268 14.011 14.796 15.677 16.72 17.791 19.068 20.534 22.246 24.239 26.667 29.646 33.466 36.788 38.734 39.925 40.668 41.157 41.428 41.582 41.689 41.728 41.717 41.669 41.608 41.513 41.393 41.258 41.089 40.943 40.793 40.624 40.448 40.302 40.16 40.01 39.876 39.729 39.576 39.396 39.193 39.057 38.923 38.702 38.544 38.364 38.264 38.058 37.847 37.618 37.491 37.187 37.056 36.899 36.728 36.353 36.15 35.919 35.66 35.368 35.027 34.524 33.102 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index f9167b7d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9565 ,KEBNE ,16750480,Thu Dec 2 07:44:16 CET,Thu Dec 2 09:25:19 CET,0.0 0.891 1.304 1.654 1.982 2.269 2.525 2.776 3.26 3.488 3.698 3.886 4.296 4.492 4.874 5.251 5.609 5.779 6.117 6.449 6.91 7.21 7.503 7.932 8.359 8.772 9.169 9.55 10.057 10.56 11.049 11.663 12.252 12.816 13.48 14.219 14.943 15.762 16.671 17.662 18.715 19.914 21.384 22.91 24.685 26.71 29.146 32.003 35.516 39.93 45.593 50.6 53.764 55.918 57.417 58.505 59.283 59.858 60.253 60.564 60.8 61.009 61.149 61.213 61.259 61.269 61.23 61.178 61.119 61.047 60.969 60.899 60.813 60.701 60.604 60.497 60.367 60.226 60.084 59.978 59.857 59.673 59.542 59.39 59.302 59.122 58.934 58.729 58.613 58.341 58.225 58.061 57.879 57.5 57.288 57.059 56.807 56.53 56.178 55.697 54.245 -2 ,3249 ,KEBNE ,16750481,Thu Dec 2 07:44:16 CET,Thu Dec 2 09:22:44 CET,0.0 0.753 1.187 1.547 1.875 2.17 2.449 2.707 3.157 3.363 3.568 3.761 4.172 4.372 4.746 5.095 5.437 5.608 5.946 6.272 6.751 7.06 7.362 7.791 8.207 8.615 9.016 9.41 9.913 10.41 10.901 11.49 12.049 12.604 13.258 13.986 14.692 15.487 16.374 17.349 18.384 19.58 21.019 22.477 24.237 26.284 28.714 31.551 34.98 39.261 44.863 49.865 53.041 55.151 56.574 57.643 58.437 59.02 59.419 59.729 59.928 60.067 60.178 60.239 60.271 60.282 60.266 60.244 60.206 60.147 60.079 60.011 59.931 59.819 59.717 59.606 59.477 59.332 59.172 59.063 58.954 58.779 58.635 58.468 58.374 58.175 57.972 57.752 57.638 57.369 57.21 57.052 56.903 56.527 56.291 56.053 55.801 55.476 55.085 54.541 53.09 -3 ,2705 ,KEBNE ,16750482,Thu Dec 2 07:47:32 CET,Thu Dec 2 09:27:21 CET,0.0 0.654 1.105 1.446 1.764 2.073 2.348 2.596 3.073 3.303 3.516 3.713 4.117 4.305 4.671 5.031 5.375 5.535 5.84 6.14 6.58 6.868 7.155 7.579 7.989 8.39 8.788 9.178 9.674 10.163 10.656 11.262 11.839 12.393 13.051 13.829 14.596 15.428 16.316 17.269 18.316 19.533 20.966 22.443 24.245 26.314 28.761 31.62 35.049 39.287 44.795 49.673 52.726 54.768 56.212 57.293 58.102 58.703 59.122 59.46 59.691 59.874 60.002 60.072 60.113 60.13 60.119 60.073 60.014 59.945 59.851 59.769 59.679 59.566 59.473 59.363 59.242 59.119 58.97 58.856 58.734 58.504 58.338 58.19 58.111 57.92 57.723 57.51 57.392 57.126 56.994 56.847 56.699 56.314 56.103 55.874 55.598 55.298 54.908 54.375 52.783 -4 ,23516 ,KEBNE ,16750483,Thu Dec 2 07:47:32 CET,Thu Dec 2 09:27:16 CET,0.0 0.98 1.442 1.82 2.177 2.479 2.748 3.006 3.485 3.708 3.921 4.124 4.53 4.722 5.08 5.43 5.779 5.947 6.277 6.599 7.06 7.363 7.659 8.079 8.489 8.908 9.31 9.685 10.187 10.674 11.141 11.721 12.287 12.839 13.501 14.278 15.027 15.833 16.716 17.692 18.736 19.928 21.348 22.814 24.569 26.607 29.095 31.977 35.407 39.702 45.318 50.315 53.416 55.525 57.012 58.061 58.821 59.386 59.81 60.197 60.447 60.602 60.719 60.81 60.863 60.876 60.846 60.799 60.758 60.712 60.639 60.558 60.461 60.343 60.253 60.162 60.059 59.937 59.781 59.676 59.568 59.355 59.202 59.052 58.968 58.774 58.576 58.377 58.271 57.998 57.855 57.692 57.517 57.163 56.971 56.735 56.451 56.134 55.763 55.227 53.996 -5 ,1835 ,KEBNE ,16750484,Thu Dec 2 07:49:41 CET,Thu Dec 2 09:24:40 CET,0.0 0.759 1.172 1.508 1.814 2.101 2.356 2.598 3.057 3.278 3.497 3.716 4.124 4.314 4.682 5.031 5.37 5.531 5.851 6.173 6.63 6.924 7.213 7.633 8.045 8.446 8.847 9.234 9.717 10.194 10.671 11.253 11.823 12.376 13.03 13.798 14.529 15.336 16.235 17.199 18.215 19.408 20.851 22.326 24.107 26.193 28.646 31.493 35.011 39.365 44.985 50.019 53.162 55.248 56.69 57.693 58.423 59.002 59.42 59.772 60.005 60.158 60.256 60.32 60.379 60.401 60.402 60.395 60.353 60.289 60.214 60.149 60.059 59.932 59.833 59.729 59.611 59.489 59.349 59.233 59.111 58.925 58.783 58.61 58.521 58.348 58.159 57.947 57.828 57.548 57.431 57.294 57.124 56.733 56.511 56.27 56.013 55.706 55.325 54.768 52.766 -6 ,18518 ,KEBNE ,16750485,Thu Dec 2 07:50:39 CET,Thu Dec 2 09:28:26 CET,0.0 0.773 1.207 1.558 1.864 2.155 2.419 2.666 3.12 3.34 3.553 3.752 4.159 4.34 4.69 5.042 5.388 5.559 5.892 6.216 6.686 6.981 7.264 7.692 8.118 8.519 8.91 9.302 9.83 10.342 10.822 11.41 11.99 12.55 13.219 14.003 14.753 15.577 16.462 17.422 18.485 19.713 21.173 22.682 24.497 26.599 29.071 31.951 35.482 39.848 45.475 50.502 53.737 55.914 57.404 58.476 59.248 59.859 60.297 60.642 60.881 61.049 61.14 61.195 61.235 61.251 61.248 61.217 61.15 61.066 60.979 60.899 60.796 60.676 60.594 60.499 60.38 60.25 60.118 60.018 59.904 59.716 59.563 59.388 59.303 59.14 58.955 58.755 58.647 58.375 58.245 58.096 57.945 57.583 57.366 57.14 56.881 56.529 56.096 55.533 54.272 -7 ,32711 ,KEBNE ,16750486,Thu Dec 2 07:52:50 CET,Thu Dec 2 09:31:17 CET,0.0 0.753 1.209 1.595 1.911 2.174 2.429 2.674 3.146 3.372 3.584 3.776 4.175 4.362 4.726 5.069 5.4 5.57 5.906 6.216 6.668 6.969 7.261 7.672 8.076 8.486 8.892 9.289 9.798 10.286 10.768 11.359 11.935 12.504 13.164 13.918 14.668 15.49 16.4 17.401 18.468 19.685 21.108 22.562 24.292 26.304 28.768 31.604 35.042 39.374 44.897 49.82 52.948 55.098 56.614 57.742 58.516 59.079 59.518 59.883 60.121 60.284 60.407 60.486 60.528 60.534 60.505 60.461 60.422 60.379 60.305 60.226 60.132 60.021 59.941 59.855 59.744 59.618 59.487 59.39 59.283 59.113 58.986 58.849 58.777 58.618 58.445 58.239 58.129 57.876 57.758 57.607 57.447 57.039 56.81 56.574 56.308 55.99 55.591 55.069 53.369 -8 ,25932 ,KEBNE ,16750487,Thu Dec 2 07:52:50 CET,Thu Dec 2 09:31:28 CET,0.0 0.735 1.128 1.455 1.758 2.034 2.29 2.541 3.029 3.249 3.463 3.669 4.066 4.26 4.638 4.986 5.332 5.503 5.833 6.147 6.609 6.91 7.208 7.654 8.077 8.488 8.892 9.279 9.783 10.284 10.775 11.365 11.948 12.515 13.18 13.941 14.681 15.508 16.429 17.423 18.494 19.737 21.209 22.701 24.484 26.523 28.957 31.794 35.192 39.396 44.96 50.048 53.161 55.257 56.75 57.854 58.645 59.245 59.693 60.047 60.29 60.468 60.604 60.692 60.74 60.758 60.753 60.729 60.67 60.591 60.509 60.442 60.365 60.256 60.156 60.047 59.923 59.787 59.621 59.501 59.389 59.205 59.079 58.943 58.864 58.699 58.509 58.282 58.167 57.898 57.771 57.62 57.468 57.133 56.907 56.656 56.388 56.059 55.66 55.116 53.626 -9 ,13908 ,KEBNE ,16750488,Thu Dec 2 07:52:50 CET,Thu Dec 2 09:31:03 CET,0.0 0.648 1.095 1.449 1.761 2.058 2.35 2.611 3.064 3.284 3.508 3.7 4.094 4.285 4.643 4.982 5.313 5.479 5.796 6.103 6.561 6.856 7.14 7.554 7.954 8.351 8.746 9.128 9.634 10.131 10.613 11.202 11.776 12.342 13.021 13.787 14.516 15.338 16.242 17.225 18.284 19.505 20.99 22.502 24.29 26.347 28.779 31.603 35.0 39.169 44.715 49.761 52.908 55.037 56.524 57.661 58.499 59.109 59.549 59.91 60.124 60.238 60.307 60.367 60.412 60.43 60.432 60.416 60.387 60.328 60.241 60.176 60.11 60.024 59.944 59.841 59.727 59.605 59.465 59.36 59.24 59.047 58.912 58.764 58.69 58.529 58.34 58.139 58.029 57.758 57.64 57.502 57.352 57.001 56.787 56.543 56.278 55.989 55.649 55.146 53.545 -10 ,11215 ,KEBNE ,16750489,Thu Dec 2 07:52:52 CET,Thu Dec 2 09:28:18 CET,0.0 0.863 1.29 1.619 1.917 2.208 2.464 2.707 3.163 3.382 3.607 3.828 4.23 4.417 4.789 5.153 5.506 5.678 6.015 6.337 6.798 7.098 7.388 7.807 8.223 8.637 9.029 9.401 9.905 10.392 10.854 11.425 12.005 12.59 13.271 14.044 14.797 15.62 16.507 17.466 18.509 19.719 21.158 22.679 24.506 26.547 28.954 31.752 35.172 39.421 44.863 49.77 52.915 55.053 56.553 57.669 58.45 59.026 59.451 59.765 59.977 60.133 60.242 60.319 60.343 60.332 60.324 60.313 60.277 60.218 60.138 60.048 59.936 59.816 59.73 59.634 59.521 59.39 59.232 59.113 59.004 58.808 58.643 58.478 58.392 58.205 58.016 57.792 57.667 57.396 57.28 57.138 56.981 56.622 56.396 56.136 55.851 55.538 55.157 54.671 53.314 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt deleted file mode 100644 index f195bb17..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4832 ,KEBNE ,16750490,Thu Dec 2 07:54:58 CET,Thu Dec 2 09:32:18 CET,0.0 1.456 1.834 2.127 2.394 2.643 2.882 3.082 3.451 3.608 3.748 3.882 4.158 4.286 4.525 4.731 4.929 5.023 5.209 5.376 5.597 5.737 5.865 6.045 6.215 6.37 6.524 6.668 6.842 7.02 7.191 7.381 7.551 7.705 7.887 8.091 8.277 8.458 8.637 8.814 8.986 9.191 9.393 9.513 9.613 9.655 9.611 9.455 9.05 8.266 6.656 4.556 2.736 1.094 -0.318 -1.568 -2.688 -3.7 -4.572 -5.448 -6.183 -6.808 -7.384 -7.94 -8.472 -8.956 -9.457 -9.904 -10.284 -10.667 -11.073 -11.421 -11.787 -12.176 -12.472 -12.773 -13.084 -13.41 -13.751 -13.984 -14.226 -14.595 -14.857 -15.143 -15.288 -15.59 -15.905 -16.239 -16.416 -16.764 -16.957 -17.15 -17.359 -17.813 -18.059 -18.335 -18.633 -18.966 -19.364 -19.869 -20.886 -2 ,79 ,KEBNE ,16750491,Thu Dec 2 07:54:58 CET,Thu Dec 2 09:33:20 CET,0.0 0.947 1.365 1.682 1.946 2.169 2.365 2.542 2.851 2.998 3.132 3.253 3.533 3.651 3.873 4.081 4.278 4.37 4.545 4.726 4.96 5.097 5.242 5.449 5.619 5.78 5.93 6.06 6.23 6.401 6.562 6.746 6.921 7.084 7.275 7.489 7.667 7.843 8.029 8.23 8.436 8.61 8.742 8.853 8.954 9.004 9.004 8.883 8.498 7.734 6.106 3.901 1.962 0.251 -1.131 -2.34 -3.413 -4.358 -5.179 -5.996 -6.702 -7.36 -7.981 -8.541 -9.061 -9.545 -10.039 -10.467 -10.835 -11.223 -11.634 -11.972 -12.327 -12.708 -13.003 -13.307 -13.625 -13.949 -14.273 -14.495 -14.742 -15.135 -15.399 -15.68 -15.826 -16.12 -16.414 -16.72 -16.888 -17.233 -17.41 -17.589 -17.787 -18.213 -18.435 -18.677 -18.949 -19.267 -19.669 -20.179 -21.452 -3 ,21544 ,KEBNE ,16750492,Thu Dec 2 07:54:58 CET,Thu Dec 2 09:32:36 CET,0.0 0.94 1.386 1.713 1.993 2.233 2.433 2.615 2.947 3.093 3.24 3.39 3.682 3.811 4.037 4.234 4.419 4.513 4.69 4.85 5.074 5.218 5.347 5.545 5.737 5.911 6.077 6.228 6.425 6.623 6.791 6.971 7.14 7.291 7.465 7.672 7.87 8.044 8.207 8.395 8.594 8.785 8.948 9.085 9.172 9.194 9.139 8.949 8.544 7.746 6.276 4.313 2.54 0.955 -0.429 -1.652 -2.746 -3.749 -4.607 -5.468 -6.201 -6.853 -7.444 -7.989 -8.516 -9.008 -9.521 -9.966 -10.342 -10.732 -11.123 -11.458 -11.812 -12.17 -12.456 -12.755 -13.061 -13.364 -13.684 -13.918 -14.152 -14.515 -14.77 -15.024 -15.157 -15.437 -15.726 -16.028 -16.189 -16.531 -16.719 -16.903 -17.102 -17.551 -17.785 -18.032 -18.309 -18.644 -19.079 -19.594 -20.548 -4 ,22573 ,KEBNE ,16750493,Thu Dec 2 07:54:58 CET,Thu Dec 2 09:32:26 CET,0.0 1.262 1.69 1.995 2.238 2.467 2.702 2.91 3.239 3.39 3.527 3.635 3.902 4.018 4.242 4.445 4.634 4.726 4.899 5.062 5.291 5.432 5.555 5.726 5.919 6.114 6.291 6.454 6.653 6.849 7.03 7.218 7.376 7.52 7.676 7.842 7.995 8.157 8.361 8.551 8.701 8.868 9.041 9.175 9.281 9.356 9.329 9.153 8.755 7.964 6.455 4.313 2.401 0.754 -0.637 -1.895 -3.038 -4.032 -4.857 -5.672 -6.392 -7.056 -7.688 -8.265 -8.789 -9.263 -9.756 -10.206 -10.597 -11.006 -11.427 -11.774 -12.136 -12.498 -12.773 -13.063 -13.377 -13.7 -14.03 -14.261 -14.501 -14.876 -15.152 -15.448 -15.593 -15.872 -16.166 -16.47 -16.625 -16.967 -17.153 -17.328 -17.515 -17.951 -18.19 -18.448 -18.732 -19.049 -19.407 -19.789 -20.624 -5 ,27260 ,KEBNE ,16750494,Thu Dec 2 07:54:58 CET,Thu Dec 2 09:32:46 CET,0.0 1.226 1.646 1.972 2.244 2.484 2.695 2.862 3.167 3.317 3.463 3.58 3.851 3.974 4.209 4.417 4.609 4.702 4.879 5.043 5.268 5.416 5.554 5.742 5.927 6.117 6.305 6.474 6.686 6.887 7.079 7.278 7.43 7.582 7.745 7.915 8.087 8.284 8.496 8.668 8.805 8.945 9.058 9.124 9.2 9.27 9.284 9.168 8.817 8.077 6.534 4.392 2.49 0.881 -0.501 -1.764 -2.841 -3.815 -4.66 -5.474 -6.152 -6.763 -7.356 -7.926 -8.469 -8.963 -9.474 -9.92 -10.3 -10.695 -11.11 -11.467 -11.826 -12.187 -12.476 -12.781 -13.097 -13.427 -13.774 -14.017 -14.265 -14.651 -14.917 -15.18 -15.314 -15.592 -15.883 -16.183 -16.341 -16.686 -16.906 -17.107 -17.315 -17.759 -17.997 -18.263 -18.58 -18.944 -19.345 -19.832 -20.846 -6 ,28974 ,KEBNE ,16750495,Thu Dec 2 07:54:57 CET,Thu Dec 2 09:32:58 CET,0.0 1.095 1.515 1.78 2.028 2.268 2.487 2.674 3.011 3.151 3.273 3.391 3.665 3.775 3.989 4.196 4.39 4.484 4.656 4.816 5.05 5.202 5.346 5.553 5.751 5.94 6.114 6.266 6.452 6.634 6.807 7.004 7.18 7.335 7.503 7.674 7.831 7.991 8.155 8.329 8.499 8.652 8.797 8.955 9.092 9.141 9.123 8.961 8.566 7.783 6.195 4.179 2.377 0.773 -0.596 -1.854 -2.97 -3.947 -4.78 -5.613 -6.321 -6.962 -7.58 -8.138 -8.654 -9.148 -9.662 -10.099 -10.467 -10.851 -11.245 -11.57 -11.913 -12.263 -12.542 -12.835 -13.125 -13.428 -13.745 -13.958 -14.183 -14.533 -14.771 -15.026 -15.163 -15.449 -15.752 -16.072 -16.239 -16.59 -16.795 -16.986 -17.187 -17.617 -17.842 -18.087 -18.366 -18.666 -19.012 -19.452 -20.46 -7 ,13275 ,KEBNE ,16750496,Thu Dec 2 07:56:04 CET,Thu Dec 2 09:34:32 CET,0.0 0.815 1.225 1.54 1.834 2.096 2.316 2.505 2.828 2.964 3.09 3.207 3.484 3.6 3.803 3.995 4.179 4.273 4.45 4.601 4.81 4.95 5.096 5.293 5.478 5.661 5.829 5.983 6.161 6.317 6.462 6.633 6.813 6.988 7.168 7.361 7.533 7.7 7.867 8.039 8.188 8.345 8.529 8.66 8.739 8.748 8.681 8.491 8.041 7.166 5.507 3.448 1.681 0.138 -1.237 -2.5 -3.565 -4.487 -5.314 -6.153 -6.862 -7.489 -8.091 -8.652 -9.162 -9.642 -10.143 -10.574 -10.945 -11.347 -11.763 -12.103 -12.467 -12.845 -13.123 -13.406 -13.704 -14.005 -14.315 -14.535 -14.77 -15.136 -15.38 -15.634 -15.769 -16.056 -16.355 -16.669 -16.831 -17.163 -17.331 -17.522 -17.726 -18.146 -18.379 -18.641 -18.922 -19.228 -19.592 -20.098 -21.366 -8 ,7196 ,KEBNE ,16750497,Thu Dec 2 07:56:03 CET,Thu Dec 2 09:34:33 CET,0.0 1.195 1.603 1.94 2.223 2.489 2.733 2.936 3.279 3.433 3.58 3.71 3.975 4.083 4.297 4.505 4.714 4.811 5.001 5.163 5.359 5.5 5.64 5.824 6.0 6.173 6.331 6.486 6.676 6.844 6.987 7.159 7.34 7.507 7.69 7.876 8.029 8.191 8.347 8.499 8.65 8.807 8.996 9.164 9.273 9.335 9.309 9.078 8.641 7.826 6.184 4.069 2.237 0.636 -0.714 -1.901 -2.95 -3.913 -4.755 -5.585 -6.302 -6.964 -7.605 -8.196 -8.725 -9.191 -9.678 -10.133 -10.52 -10.917 -11.321 -11.644 -11.991 -12.362 -12.641 -12.921 -13.236 -13.563 -13.886 -14.11 -14.348 -14.721 -14.988 -15.27 -15.404 -15.691 -16.001 -16.313 -16.476 -16.807 -16.972 -17.159 -17.361 -17.768 -17.986 -18.232 -18.509 -18.852 -19.27 -19.785 -20.747 -9 ,11933 ,KEBNE ,16750498,Thu Dec 2 07:56:03 CET,Thu Dec 2 09:34:39 CET,0.0 0.981 1.429 1.741 2.004 2.243 2.467 2.686 3.054 3.203 3.343 3.462 3.73 3.838 4.045 4.256 4.452 4.538 4.704 4.864 5.091 5.233 5.368 5.571 5.771 5.955 6.119 6.28 6.49 6.688 6.855 7.02 7.177 7.334 7.512 7.706 7.876 8.047 8.232 8.416 8.587 8.757 8.92 9.071 9.217 9.293 9.287 9.175 8.867 8.171 6.695 4.537 2.615 0.994 -0.405 -1.597 -2.588 -3.508 -4.308 -5.11 -5.838 -6.483 -7.081 -7.644 -8.156 -8.632 -9.13 -9.56 -9.927 -10.307 -10.716 -11.058 -11.406 -11.779 -12.068 -12.362 -12.676 -12.996 -13.32 -13.539 -13.763 -14.128 -14.385 -14.642 -14.779 -15.065 -15.366 -15.679 -15.834 -16.173 -16.364 -16.543 -16.753 -17.223 -17.476 -17.759 -18.062 -18.379 -18.802 -19.413 -20.497 -10 ,15233 ,KEBNE ,16750499,Thu Dec 2 07:56:03 CET,Thu Dec 2 09:30:25 CET,0.0 0.961 1.362 1.671 1.921 2.144 2.339 2.526 2.862 3.012 3.144 3.222 3.482 3.601 3.818 4.003 4.174 4.26 4.435 4.605 4.837 4.971 5.105 5.293 5.467 5.645 5.811 5.95 6.119 6.28 6.438 6.625 6.798 6.958 7.133 7.334 7.523 7.729 7.928 8.088 8.254 8.445 8.627 8.74 8.803 8.808 8.727 8.511 8.127 7.434 5.971 3.986 2.228 0.666 -0.679 -1.87 -2.933 -3.912 -4.746 -5.571 -6.279 -6.885 -7.458 -8.016 -8.554 -9.048 -9.544 -9.993 -10.379 -10.785 -11.219 -11.58 -11.946 -12.317 -12.603 -12.908 -13.242 -13.58 -13.906 -14.132 -14.369 -14.728 -14.985 -15.267 -15.411 -15.707 -16.021 -16.351 -16.525 -16.87 -17.056 -17.246 -17.445 -17.854 -18.079 -18.325 -18.597 -18.895 -19.248 -19.765 -21.021 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt deleted file mode 100644 index 0f04c68d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26 ,KEBNE ,16750500,Thu Dec 2 07:59:13 CET,Thu Dec 2 09:38:56 CET,0.0 1.051 1.49 1.779 2.02 2.268 2.502 2.698 3.051 3.211 3.341 3.433 3.697 3.812 4.036 4.235 4.426 4.518 4.683 4.836 5.05 5.194 5.331 5.513 5.688 5.843 5.986 6.126 6.309 6.487 6.649 6.838 7.023 7.19 7.358 7.55 7.721 7.879 8.035 8.192 8.344 8.501 8.647 8.744 8.804 8.787 8.714 8.528 8.095 7.277 5.618 3.402 1.522 -0.136 -1.581 -2.841 -3.882 -4.81 -5.661 -6.521 -7.223 -7.842 -8.461 -9.053 -9.582 -10.06 -10.56 -11.011 -11.407 -11.797 -12.192 -12.525 -12.864 -13.212 -13.471 -13.743 -14.023 -14.311 -14.638 -14.864 -15.102 -15.472 -15.712 -15.969 -16.105 -16.377 -16.649 -16.91 -17.047 -17.366 -17.524 -17.703 -17.891 -18.265 -18.475 -18.706 -18.937 -19.188 -19.474 -19.825 -20.513 -2 ,4791 ,KEBNE ,16750501,Thu Dec 2 07:59:13 CET,Thu Dec 2 09:38:13 CET,0.0 0.931 1.339 1.65 1.899 2.109 2.308 2.496 2.816 2.965 3.102 3.187 3.453 3.57 3.783 3.972 4.165 4.265 4.448 4.601 4.811 4.942 5.071 5.27 5.449 5.603 5.748 5.888 6.059 6.206 6.333 6.494 6.649 6.795 6.966 7.136 7.283 7.439 7.606 7.76 7.911 8.045 8.161 8.227 8.222 8.19 8.085 7.826 7.324 6.389 4.591 2.319 0.364 -1.381 -2.832 -4.073 -5.165 -6.121 -6.919 -7.749 -8.464 -9.067 -9.645 -10.174 -10.669 -11.133 -11.616 -12.062 -12.445 -12.834 -13.248 -13.578 -13.903 -14.25 -14.517 -14.796 -15.088 -15.386 -15.699 -15.912 -16.128 -16.461 -16.691 -16.947 -17.085 -17.354 -17.637 -17.948 -18.106 -18.433 -18.626 -18.829 -19.046 -19.477 -19.705 -19.95 -20.211 -20.505 -20.859 -21.284 -22.12 -3 ,9084 ,KEBNE ,16750502,Thu Dec 2 07:59:13 CET,Thu Dec 2 09:39:24 CET,0.0 0.687 1.068 1.392 1.638 1.848 2.042 2.226 2.551 2.692 2.817 2.897 3.163 3.279 3.481 3.68 3.864 3.948 4.117 4.277 4.484 4.612 4.746 4.935 5.111 5.273 5.422 5.557 5.715 5.879 6.045 6.249 6.434 6.601 6.784 6.96 7.124 7.293 7.443 7.576 7.699 7.837 7.959 8.036 8.082 8.046 7.905 7.658 7.237 6.369 4.65 2.516 0.673 -0.945 -2.326 -3.555 -4.636 -5.61 -6.446 -7.277 -7.983 -8.635 -9.256 -9.826 -10.348 -10.824 -11.329 -11.786 -12.178 -12.567 -12.984 -13.342 -13.694 -14.065 -14.364 -14.651 -14.923 -15.197 -15.478 -15.674 -15.89 -16.236 -16.48 -16.723 -16.844 -17.102 -17.378 -17.667 -17.811 -18.136 -18.324 -18.512 -18.696 -19.088 -19.309 -19.551 -19.824 -20.097 -20.399 -20.812 -21.55 -4 ,27963 ,KEBNE ,16750503,Thu Dec 2 07:59:13 CET,Thu Dec 2 09:38:24 CET,0.0 1.135 1.625 1.982 2.244 2.463 2.677 2.884 3.27 3.435 3.586 3.692 3.964 4.092 4.319 4.526 4.704 4.79 4.966 5.125 5.347 5.49 5.617 5.806 5.986 6.151 6.304 6.448 6.623 6.796 6.959 7.142 7.314 7.466 7.631 7.804 7.956 8.105 8.269 8.445 8.592 8.715 8.808 8.853 8.836 8.763 8.63 8.305 7.681 6.652 4.79 2.467 0.495 -1.157 -2.57 -3.855 -4.929 -5.89 -6.737 -7.577 -8.283 -8.881 -9.461 -10.036 -10.553 -11.019 -11.507 -11.934 -12.31 -12.717 -13.153 -13.503 -13.851 -14.206 -14.469 -14.743 -15.043 -15.355 -15.671 -15.89 -16.115 -16.45 -16.681 -16.925 -17.049 -17.325 -17.619 -17.921 -18.082 -18.411 -18.6 -18.787 -18.972 -19.372 -19.593 -19.825 -20.071 -20.357 -20.679 -21.09 -21.918 -5 ,27775 ,KEBNE ,16750504,Thu Dec 2 08:01:21 CET,Thu Dec 2 09:39:02 CET,0.0 0.997 1.427 1.767 2.03 2.252 2.457 2.636 2.941 3.081 3.21 3.295 3.551 3.659 3.859 4.038 4.208 4.292 4.455 4.599 4.811 4.949 5.072 5.257 5.413 5.551 5.7 5.84 6.012 6.179 6.329 6.49 6.653 6.814 6.985 7.169 7.342 7.528 7.709 7.874 8.041 8.197 8.335 8.433 8.482 8.469 8.383 8.181 7.735 6.834 5.18 3.038 1.136 -0.5 -1.916 -3.152 -4.246 -5.242 -6.074 -6.874 -7.549 -8.163 -8.768 -9.339 -9.849 -10.32 -10.811 -11.249 -11.627 -12.016 -12.427 -12.762 -13.108 -13.475 -13.76 -14.051 -14.346 -14.658 -14.981 -15.2 -15.421 -15.763 -16.002 -16.262 -16.402 -16.697 -16.997 -17.292 -17.436 -17.747 -17.923 -18.106 -18.284 -18.648 -18.845 -19.07 -19.301 -19.539 -19.87 -20.312 -21.085 -6 ,30240 ,KEBNE ,16750505,Thu Dec 2 08:00:18 CET,Thu Dec 2 09:39:11 CET,0.0 0.959 1.379 1.706 1.956 2.162 2.357 2.543 2.845 2.983 3.12 3.245 3.522 3.637 3.842 4.039 4.228 4.318 4.49 4.647 4.865 5.004 5.135 5.316 5.495 5.67 5.826 5.964 6.133 6.3 6.444 6.589 6.734 6.886 7.059 7.255 7.43 7.599 7.756 7.917 8.071 8.203 8.326 8.397 8.428 8.41 8.288 8.038 7.599 6.731 5.006 2.823 0.95 -0.662 -2.017 -3.212 -4.279 -5.253 -6.075 -6.939 -7.69 -8.33 -8.932 -9.481 -9.993 -10.465 -10.95 -11.37 -11.727 -12.105 -12.521 -12.869 -13.208 -13.55 -13.826 -14.118 -14.414 -14.718 -15.042 -15.272 -15.501 -15.85 -16.098 -16.361 -16.497 -16.771 -17.048 -17.329 -17.48 -17.799 -17.967 -18.148 -18.335 -18.709 -18.904 -19.124 -19.37 -19.658 -20.018 -20.444 -21.254 -7 ,24471 ,KEBNE ,16750506,Thu Dec 2 08:00:18 CET,Thu Dec 2 09:39:21 CET,0.0 0.834 1.219 1.554 1.81 2.042 2.234 2.409 2.738 2.888 3.035 3.153 3.416 3.529 3.744 3.942 4.13 4.217 4.379 4.533 4.755 4.896 5.026 5.207 5.36 5.497 5.649 5.795 5.974 6.144 6.296 6.468 6.624 6.761 6.921 7.101 7.252 7.414 7.58 7.738 7.885 8.021 8.157 8.272 8.339 8.35 8.28 8.11 7.698 6.803 5.15 3.035 1.218 -0.398 -1.808 -3.064 -4.15 -5.131 -5.992 -6.837 -7.542 -8.162 -8.754 -9.308 -9.818 -10.283 -10.775 -11.205 -11.58 -11.981 -12.392 -12.73 -13.073 -13.435 -13.728 -14.022 -14.314 -14.636 -14.991 -15.222 -15.452 -15.809 -16.048 -16.299 -16.423 -16.677 -16.964 -17.264 -17.408 -17.717 -17.869 -18.055 -18.25 -18.682 -18.926 -19.199 -19.491 -19.779 -20.135 -20.584 -21.312 -8 ,18027 ,KEBNE ,16750507,Thu Dec 2 08:00:18 CET,Thu Dec 2 09:39:48 CET,0.0 0.916 1.313 1.605 1.844 2.071 2.284 2.475 2.802 2.947 3.091 3.213 3.48 3.603 3.816 4.008 4.189 4.275 4.444 4.592 4.79 4.929 5.062 5.23 5.392 5.551 5.694 5.827 6.005 6.167 6.309 6.473 6.638 6.802 6.973 7.155 7.327 7.484 7.617 7.745 7.859 7.939 8.057 8.145 8.193 8.256 8.194 7.97 7.469 6.515 4.783 2.574 0.689 -0.897 -2.289 -3.548 -4.608 -5.573 -6.413 -7.257 -7.978 -8.607 -9.185 -9.725 -10.225 -10.67 -11.139 -11.567 -11.934 -12.311 -12.703 -13.04 -13.386 -13.737 -14.012 -14.295 -14.583 -14.875 -15.176 -15.389 -15.609 -15.95 -16.191 -16.443 -16.578 -16.845 -17.127 -17.437 -17.59 -17.913 -18.082 -18.257 -18.452 -18.911 -19.152 -19.401 -19.679 -19.989 -20.336 -20.755 -21.59 -9 ,22893 ,KEBNE ,16750508,Thu Dec 2 08:00:18 CET,Thu Dec 2 09:40:01 CET,0.0 0.867 1.205 1.509 1.765 2.006 2.225 2.401 2.724 2.88 3.02 3.122 3.379 3.474 3.659 3.841 4.006 4.087 4.249 4.399 4.608 4.744 4.87 5.046 5.214 5.36 5.495 5.634 5.817 5.995 6.163 6.351 6.519 6.67 6.84 7.018 7.174 7.326 7.475 7.638 7.783 7.911 8.042 8.131 8.197 8.233 8.172 7.958 7.505 6.633 4.924 2.753 0.901 -0.692 -2.078 -3.353 -4.451 -5.429 -6.256 -7.058 -7.74 -8.343 -8.924 -9.483 -10.023 -10.514 -11.013 -11.452 -11.826 -12.217 -12.628 -12.963 -13.298 -13.64 -13.914 -14.214 -14.512 -14.799 -15.103 -15.321 -15.547 -15.886 -16.116 -16.367 -16.496 -16.751 -17.027 -17.326 -17.483 -17.807 -17.96 -18.134 -18.33 -18.736 -18.956 -19.191 -19.448 -19.744 -20.064 -20.508 -21.542 -10 ,6226 ,KEBNE ,16750509,Thu Dec 2 08:01:21 CET,Thu Dec 2 09:40:21 CET,0.0 0.941 1.28 1.529 1.749 1.966 2.171 2.362 2.696 2.852 2.992 3.078 3.333 3.45 3.682 3.876 4.043 4.127 4.3 4.463 4.692 4.844 4.984 5.161 5.333 5.507 5.665 5.803 5.976 6.141 6.301 6.481 6.64 6.786 6.943 7.112 7.267 7.437 7.622 7.783 7.933 8.091 8.24 8.354 8.415 8.414 8.315 8.078 7.614 6.734 5.009 2.755 0.853 -0.749 -2.104 -3.315 -4.402 -5.394 -6.236 -7.053 -7.754 -8.361 -8.915 -9.457 -9.958 -10.407 -10.886 -11.317 -11.681 -12.06 -12.459 -12.782 -13.106 -13.446 -13.714 -13.99 -14.279 -14.578 -14.884 -15.096 -15.322 -15.672 -15.921 -16.183 -16.312 -16.57 -16.84 -17.116 -17.26 -17.58 -17.741 -17.919 -18.109 -18.516 -18.731 -18.979 -19.248 -19.523 -19.831 -20.221 -20.895 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt deleted file mode 100644 index 9a359df6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26452 ,KEBNE ,16750510,Thu Dec 2 08:01:21 CET,Thu Dec 2 09:42:56 CET,0.0 0.859 1.413 1.897 2.352 2.785 3.194 3.565 4.249 4.591 4.925 5.195 5.823 6.116 6.681 7.22 7.744 8.013 8.544 9.046 9.777 10.249 10.707 11.384 12.051 12.71 13.363 14.006 14.857 15.691 16.49 17.464 18.448 19.435 20.609 21.952 23.269 24.738 26.341 28.068 29.918 32.053 34.623 37.318 40.61 44.447 49.038 54.478 61.342 70.168 82.002 93.149 100.603 105.962 109.9 112.924 115.253 117.182 118.69 120.054 121.122 121.984 122.747 123.415 123.974 124.434 124.882 125.255 125.557 125.833 126.087 126.277 126.441 126.582 126.677 126.779 126.875 126.948 127.015 127.061 127.082 127.101 127.117 127.108 127.103 127.094 127.073 127.017 126.982 126.745 126.877 126.829 126.771 126.584 126.456 126.337 126.218 126.06 125.844 125.502 124.805 -2 ,11452 ,KEBNE ,16750511,Thu Dec 2 08:02:25 CET,Thu Dec 2 09:42:49 CET,0.0 1.282 1.954 2.472 2.923 3.318 3.694 4.059 4.725 5.046 5.366 5.647 6.272 6.558 7.127 7.668 8.189 8.442 8.955 9.467 10.189 10.662 11.131 11.812 12.473 13.125 13.781 14.426 15.262 16.088 16.898 17.878 18.837 19.786 20.925 22.248 23.564 25.029 26.647 28.439 30.34 32.494 35.103 37.828 41.102 44.931 49.608 55.169 62.021 70.718 82.46 93.52 100.887 106.176 110.153 113.307 115.741 117.706 119.271 120.712 121.818 122.687 123.432 124.048 124.569 125.025 125.459 125.809 126.102 126.386 126.646 126.837 127.026 127.202 127.321 127.437 127.536 127.621 127.699 127.749 127.792 127.84 127.865 127.878 127.873 127.856 127.837 127.792 127.756 127.502 127.618 127.566 127.501 127.336 127.248 127.143 127.012 126.835 126.605 126.35 125.864 -3 ,25284 ,KEBNE ,16750512,Thu Dec 2 08:02:25 CET,Thu Dec 2 09:42:57 CET,0.0 0.9 1.486 1.991 2.443 2.855 3.24 3.602 4.261 4.58 4.898 5.175 5.802 6.09 6.648 7.183 7.712 7.969 8.468 8.957 9.671 10.136 10.6 11.295 11.964 12.613 13.261 13.915 14.782 15.627 16.454 17.449 18.425 19.405 20.557 21.851 23.128 24.581 26.17 27.885 29.729 31.887 34.489 37.196 40.483 44.255 48.82 54.341 61.202 69.817 81.497 92.609 100.01 105.342 109.34 112.453 114.87 116.829 118.379 119.793 120.853 121.701 122.46 123.117 123.679 124.146 124.582 124.941 125.234 125.519 125.768 125.933 126.092 126.269 126.386 126.477 126.567 126.662 126.738 126.783 126.825 126.866 126.881 126.877 126.874 126.866 126.843 126.792 126.756 126.509 126.616 126.548 126.484 126.35 126.263 126.156 126.026 125.845 125.607 125.235 124.549 -4 ,10915 ,KEBNE ,16750513,Thu Dec 2 08:02:26 CET,Thu Dec 2 09:43:06 CET,0.0 0.975 1.499 1.976 2.423 2.848 3.251 3.62 4.299 4.618 4.928 5.204 5.836 6.121 6.686 7.226 7.756 8.019 8.518 9.015 9.747 10.213 10.675 11.361 12.031 12.682 13.32 13.946 14.781 15.607 16.404 17.388 18.361 19.312 20.43 21.721 23.006 24.437 26.021 27.776 29.689 31.886 34.489 37.208 40.519 44.342 48.943 54.444 61.288 69.985 81.649 92.696 100.2 105.58 109.536 112.656 115.071 117.031 118.574 119.969 121.065 121.936 122.698 123.341 123.861 124.314 124.774 125.152 125.455 125.742 125.996 126.194 126.39 126.557 126.668 126.774 126.867 126.939 126.995 127.027 127.06 127.097 127.105 127.102 127.102 127.106 127.098 127.064 127.028 126.778 126.909 126.861 126.798 126.621 126.514 126.386 126.24 126.059 125.812 125.479 124.693 -5 ,14127 ,KEBNE ,16750514,Thu Dec 2 08:03:29 CET,Thu Dec 2 09:45:41 CET,0.0 1.168 1.78 2.274 2.722 3.125 3.505 3.862 4.556 4.888 5.212 5.525 6.167 6.457 7.024 7.55 8.055 8.314 8.831 9.344 10.094 10.578 11.052 11.741 12.413 13.068 13.708 14.344 15.185 16.0 16.806 17.791 18.75 19.689 20.798 22.092 23.35 24.755 26.313 27.997 29.836 31.993 34.597 37.312 40.59 44.392 49.011 54.501 61.325 70.076 81.85 92.92 100.347 105.747 109.706 112.749 115.116 117.033 118.526 119.889 120.977 121.893 122.689 123.374 123.959 124.416 124.844 125.21 125.5 125.773 126.031 126.221 126.401 126.575 126.683 126.778 126.873 126.961 127.035 127.065 127.08 127.096 127.099 127.101 127.1 127.09 127.062 127.022 126.997 126.755 126.869 126.808 126.729 126.538 126.434 126.312 126.163 125.999 125.802 125.518 124.958 -6 ,24428 ,KEBNE ,16750515,Thu Dec 2 08:04:33 CET,Thu Dec 2 09:46:03 CET,0.0 0.866 1.442 1.916 2.348 2.761 3.145 3.516 4.226 4.549 4.85 5.093 5.71 5.992 6.535 7.065 7.586 7.847 8.362 8.859 9.577 10.043 10.505 11.18 11.841 12.502 13.152 13.78 14.6 15.419 16.239 17.243 18.214 19.161 20.285 21.575 22.841 24.276 25.861 27.594 29.491 31.684 34.275 36.962 40.251 44.066 48.646 54.173 61.039 69.746 81.477 92.39 99.669 104.898 108.803 111.855 114.176 116.069 117.546 118.879 119.949 120.841 121.597 122.228 122.792 123.28 123.761 124.176 124.487 124.757 125.01 125.206 125.395 125.585 125.721 125.837 125.932 126.022 126.102 126.135 126.166 126.191 126.194 126.195 126.194 126.187 126.151 126.104 126.074 125.828 125.942 125.887 125.818 125.618 125.515 125.405 125.246 125.065 124.872 124.586 124.036 -7 ,29098 ,KEBNE ,16750516,Thu Dec 2 08:11:59 CET,Thu Dec 2 09:50:47 CET,0.0 0.863 1.453 1.948 2.361 2.744 3.101 3.448 4.101 4.423 4.748 5.037 5.667 5.943 6.485 7.018 7.541 7.8 8.309 8.799 9.504 9.972 10.432 11.106 11.78 12.429 13.063 13.695 14.521 15.328 16.113 17.083 18.067 19.043 20.189 21.512 22.803 24.253 25.862 27.627 29.527 31.718 34.375 37.136 40.452 44.268 48.879 54.406 61.268 70.059 81.797 92.825 100.288 105.648 109.636 112.703 115.075 117.055 118.623 120.058 121.143 122.0 122.756 123.397 123.93 124.374 124.817 125.179 125.456 125.722 125.972 126.161 126.349 126.535 126.66 126.78 126.888 126.977 127.061 127.107 127.134 127.159 127.182 127.185 127.177 127.17 127.15 127.117 127.099 126.873 127.013 126.975 126.923 126.75 126.644 126.509 126.347 126.154 125.909 125.63 124.947 -8 ,22165 ,KEBNE ,16750517,Thu Dec 2 08:11:59 CET,Thu Dec 2 09:52:26 CET,0.0 0.809 1.336 1.798 2.221 2.614 2.983 3.333 4.03 4.365 4.678 4.957 5.6 5.887 6.436 6.974 7.499 7.762 8.282 8.788 9.522 10.0 10.475 11.189 11.891 12.576 13.236 13.876 14.727 15.575 16.407 17.421 18.413 19.388 20.534 21.854 23.172 24.652 26.286 28.058 29.925 32.066 34.649 37.354 40.666 44.506 49.102 54.633 61.545 70.269 82.01 93.109 100.508 105.861 109.848 113.014 115.508 117.531 119.091 120.504 121.592 122.45 123.199 123.826 124.352 124.804 125.243 125.602 125.874 126.133 126.385 126.58 126.758 126.899 126.993 127.092 127.203 127.313 127.402 127.457 127.493 127.508 127.515 127.516 127.513 127.519 127.505 127.452 127.413 127.158 127.279 127.227 127.158 126.998 126.897 126.795 126.69 126.537 126.319 125.979 125.193 -9 ,21596 ,KEBNE ,16750518,Thu Dec 2 08:15:11 CET,Thu Dec 2 09:53:09 CET,0.0 0.938 1.51 1.983 2.418 2.833 3.209 3.578 4.282 4.603 4.92 5.189 5.817 6.114 6.698 7.263 7.821 8.087 8.589 9.071 9.782 10.262 10.732 11.411 12.078 12.73 13.369 14.0 14.838 15.655 16.463 17.471 18.459 19.424 20.555 21.85 23.104 24.494 26.051 27.783 29.675 31.868 34.478 37.181 40.434 44.221 48.809 54.287 61.143 69.866 81.625 92.531 99.684 104.87 108.77 111.8 114.138 116.039 117.518 118.836 119.859 120.726 121.491 122.126 122.695 123.195 123.65 124.02 124.301 124.558 124.801 124.989 125.167 125.346 125.476 125.581 125.676 125.762 125.819 125.844 125.871 125.902 125.914 125.915 125.902 125.862 125.815 125.761 125.726 125.478 125.587 125.519 125.455 125.303 125.202 125.087 124.943 124.743 124.495 124.167 123.297 -10 ,2450 ,KEBNE ,16750519,Thu Dec 2 08:20:28 CET,Thu Dec 2 10:00:33 CET,0.0 0.922 1.52 2.024 2.496 2.907 3.284 3.654 4.375 4.705 5.013 5.276 5.897 6.169 6.711 7.259 7.804 8.064 8.559 9.05 9.773 10.242 10.701 11.375 12.044 12.712 13.367 14.0 14.826 15.652 16.458 17.424 18.377 19.327 20.451 21.758 23.03 24.438 26.002 27.719 29.583 31.748 34.354 37.052 40.318 44.153 48.8 54.308 61.12 69.811 81.612 92.712 100.16 105.422 109.294 112.361 114.785 116.791 118.334 119.698 120.763 121.623 122.359 122.995 123.569 124.067 124.533 124.917 125.217 125.509 125.798 125.997 126.166 126.322 126.431 126.527 126.613 126.696 126.764 126.801 126.826 126.848 126.851 126.843 126.84 126.836 126.821 126.785 126.759 126.524 126.672 126.615 126.544 126.396 126.312 126.219 126.091 125.931 125.714 125.385 124.7 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 0fc050aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20174 ,KEBNE ,16750520,Thu Dec 2 08:20:29 CET,Thu Dec 2 10:00:08 CET,0.0 0.865 1.432 1.918 2.359 2.793 3.211 3.578 4.266 4.612 4.95 5.256 5.908 6.224 6.847 7.451 8.035 8.33 8.932 9.505 10.332 10.883 11.424 12.231 13.025 13.809 14.59 15.358 16.382 17.399 18.397 19.629 20.845 22.048 23.48 25.123 26.747 28.573 30.593 32.831 35.276 38.113 41.572 45.236 49.704 54.9 61.209 68.793 78.325 90.664 107.644 123.997 135.123 143.311 149.521 154.469 158.346 161.501 163.978 166.267 168.08 169.581 170.908 172.07 173.104 173.989 174.844 175.55 176.107 176.644 177.178 177.594 177.998 178.386 178.657 178.916 179.175 179.419 179.643 179.784 179.923 180.104 180.212 180.315 180.359 180.424 180.479 180.542 180.552 180.392 180.511 180.479 180.444 180.333 180.243 180.141 179.997 179.796 179.547 179.12 177.869 -2 ,7895 ,KEBNE ,16750521,Thu Dec 2 08:20:29 CET,Thu Dec 2 09:59:49 CET,0.0 1.082 1.639 2.1 2.521 2.938 3.339 3.715 4.436 4.787 5.128 5.454 6.114 6.431 7.058 7.665 8.255 8.545 9.12 9.685 10.511 11.055 11.604 12.413 13.189 13.961 14.741 15.521 16.551 17.573 18.575 19.798 21.012 22.224 23.655 25.307 26.946 28.786 30.837 33.088 35.518 38.378 41.873 45.54 49.992 55.183 61.549 69.197 78.799 91.198 108.192 124.542 135.666 143.812 149.964 154.898 158.798 161.962 164.463 166.765 168.582 170.082 171.423 172.61 173.642 174.519 175.353 176.056 176.646 177.213 177.744 178.154 178.562 178.953 179.233 179.498 179.746 179.995 180.234 180.391 180.536 180.705 180.801 180.912 180.97 181.052 181.115 181.155 181.16 181.009 181.143 181.13 181.096 180.984 180.907 180.813 180.693 180.527 180.287 179.958 178.879 -3 ,30448 ,KEBNE ,16750522,Thu Dec 2 08:20:27 CET,Thu Dec 2 09:58:35 CET,0.0 0.809 1.374 1.878 2.338 2.758 3.143 3.514 4.253 4.602 4.944 5.297 5.969 6.295 6.926 7.538 8.134 8.428 9.007 9.57 10.405 10.96 11.516 12.343 13.152 13.941 14.713 15.483 16.496 17.486 18.463 19.68 20.894 22.094 23.513 25.155 26.79 28.629 30.669 32.932 35.401 38.279 41.745 45.364 49.768 54.93 61.269 68.918 78.628 91.138 108.07 124.353 135.512 143.663 149.799 154.695 158.547 161.709 164.217 166.549 168.401 169.921 171.282 172.457 173.472 174.358 175.21 175.911 176.481 177.03 177.586 178.026 178.42 178.798 179.082 179.337 179.572 179.796 179.996 180.132 180.275 180.473 180.584 180.684 180.723 180.786 180.838 180.864 180.875 180.73 180.85 180.821 180.782 180.654 180.566 180.454 180.303 180.113 179.876 179.464 178.335 -4 ,9439 ,KEBNE ,16750523,Thu Dec 2 08:20:29 CET,Thu Dec 2 09:59:06 CET,0.0 0.755 1.285 1.768 2.209 2.63 3.038 3.43 4.152 4.497 4.832 5.128 5.783 6.101 6.716 7.321 7.912 8.203 8.789 9.358 10.189 10.737 11.275 12.074 12.868 13.652 14.43 15.195 16.213 17.225 18.207 19.422 20.634 21.832 23.243 24.868 26.484 28.308 30.342 32.588 35.01 37.84 41.316 44.981 49.443 54.677 61.088 68.772 78.419 90.871 107.966 124.355 135.455 143.611 149.796 154.66 158.482 161.638 164.148 166.473 168.309 169.81 171.145 172.335 173.361 174.229 175.07 175.77 176.349 176.913 177.449 177.869 178.276 178.665 178.954 179.232 179.492 179.742 179.957 180.085 180.213 180.383 180.48 180.568 180.606 180.672 180.72 180.747 180.751 180.599 180.71 180.672 180.618 180.479 180.394 180.292 180.172 180.022 179.824 179.469 178.296 -5 ,29183 ,KEBNE ,16750524,Thu Dec 2 08:20:27 CET,Thu Dec 2 09:58:22 CET,0.0 0.715 1.217 1.647 2.065 2.456 2.825 3.185 3.917 4.271 4.609 4.927 5.586 5.908 6.522 7.11 7.696 7.99 8.573 9.149 10.005 10.563 11.111 11.926 12.725 13.499 14.273 15.049 16.06 17.058 18.05 19.276 20.491 21.687 23.11 24.761 26.392 28.227 30.268 32.503 34.94 37.804 41.283 44.933 49.37 54.56 60.878 68.468 78.065 90.536 107.568 123.933 135.065 143.16 149.315 154.258 158.126 161.297 163.818 166.13 167.938 169.435 170.786 171.971 172.995 173.866 174.702 175.395 175.956 176.514 177.048 177.447 177.837 178.224 178.504 178.768 179.019 179.263 179.485 179.625 179.758 179.928 180.032 180.134 180.179 180.253 180.315 180.357 180.369 180.223 180.346 180.307 180.274 180.204 180.139 180.045 179.912 179.75 179.552 179.247 178.265 -6 ,31003 ,KEBNE ,16750525,Thu Dec 2 08:20:28 CET,Thu Dec 2 09:58:35 CET,0.0 0.808 1.314 1.766 2.199 2.596 2.97 3.338 4.036 4.383 4.723 5.054 5.714 6.043 6.681 7.279 7.85 8.136 8.711 9.278 10.109 10.647 11.191 11.991 12.761 13.536 14.32 15.087 16.091 17.083 18.052 19.262 20.472 21.67 23.086 24.72 26.337 28.173 30.213 32.439 34.883 37.749 41.235 44.882 49.301 54.519 60.87 68.48 78.101 90.554 107.613 124.018 135.234 143.403 149.537 154.408 158.247 161.419 163.909 166.191 168.006 169.499 170.842 172.023 173.046 173.917 174.764 175.48 176.06 176.617 177.156 177.564 177.953 178.334 178.607 178.869 179.122 179.372 179.601 179.734 179.854 180.025 180.132 180.22 180.26 180.339 180.398 180.426 180.427 180.269 180.379 180.355 180.334 180.242 180.165 180.075 179.949 179.781 179.558 179.24 177.976 -7 ,19343 ,KEBNE ,16750526,Thu Dec 2 08:20:27 CET,Thu Dec 2 09:59:23 CET,0.0 0.841 1.394 1.854 2.276 2.673 3.059 3.436 4.179 4.55 4.909 5.25 5.914 6.236 6.856 7.459 8.054 8.345 8.925 9.498 10.333 10.901 11.458 12.261 13.051 13.832 14.622 15.401 16.41 17.424 18.432 19.67 20.89 22.084 23.503 25.15 26.798 28.659 30.693 32.927 35.366 38.219 41.691 45.325 49.74 54.899 61.214 68.846 78.487 90.952 107.962 124.334 135.54 143.72 149.897 154.809 158.675 161.837 164.326 166.625 168.441 169.949 171.303 172.489 173.519 174.41 175.284 175.997 176.565 177.113 177.629 178.031 178.426 178.808 179.079 179.331 179.581 179.822 180.04 180.179 180.321 180.508 180.618 180.715 180.761 180.846 180.907 180.943 180.95 180.807 180.939 180.917 180.878 180.761 180.691 180.588 180.452 180.273 180.043 179.661 178.412 -8 ,11888 ,KEBNE ,16750527,Thu Dec 2 08:20:29 CET,Thu Dec 2 09:58:06 CET,0.0 0.672 1.189 1.664 2.074 2.46 2.853 3.224 3.928 4.27 4.604 4.911 5.569 5.899 6.541 7.163 7.766 8.061 8.651 9.228 10.064 10.616 11.159 11.961 12.753 13.536 14.307 15.067 16.081 17.092 18.09 19.331 20.561 21.762 23.167 24.802 26.425 28.243 30.262 32.483 34.922 37.779 41.229 44.833 49.223 54.374 60.661 68.26 77.842 90.202 107.147 123.422 134.562 142.745 148.938 153.874 157.726 160.885 163.4 165.733 167.578 169.081 170.422 171.605 172.621 173.497 174.364 175.063 175.634 176.191 176.707 177.099 177.49 177.882 178.146 178.394 178.639 178.88 179.119 179.261 179.386 179.546 179.646 179.734 179.771 179.839 179.887 179.926 179.934 179.781 179.919 179.916 179.89 179.736 179.624 179.512 179.397 179.25 179.002 178.613 177.747 -9 ,20290 ,KEBNE ,16750528,Thu Dec 2 08:20:29 CET,Thu Dec 2 09:59:41 CET,0.0 0.912 1.481 1.935 2.361 2.776 3.179 3.56 4.277 4.619 4.956 5.292 5.956 6.273 6.906 7.516 8.116 8.408 8.966 9.529 10.377 10.932 11.479 12.292 13.094 13.891 14.669 15.437 16.459 17.462 18.456 19.695 20.914 22.125 23.561 25.194 26.81 28.637 30.675 32.912 35.367 38.253 41.749 45.401 49.828 55.011 61.326 68.925 78.514 90.925 107.969 124.423 135.579 143.679 149.779 154.655 158.506 161.659 164.179 166.495 168.326 169.855 171.201 172.349 173.345 174.221 175.075 175.782 176.346 176.903 177.462 177.898 178.316 178.7 178.973 179.244 179.493 179.734 179.98 180.138 180.28 180.47 180.583 180.679 180.721 180.785 180.836 180.873 180.884 180.74 180.86 180.832 180.802 180.713 180.636 180.53 180.396 180.208 179.975 179.635 178.652 -10 ,7293 ,KEBNE ,16750529,Thu Dec 2 08:20:27 CET,Thu Dec 2 09:58:56 CET,0.0 0.863 1.417 1.874 2.298 2.71 3.107 3.484 4.2 4.543 4.88 5.21 5.873 6.186 6.812 7.433 8.036 8.328 8.909 9.491 10.343 10.902 11.458 12.285 13.1 13.882 14.649 15.424 16.451 17.455 18.449 19.683 20.903 22.118 23.563 25.21 26.83 28.685 30.758 33.012 35.448 38.307 41.76 45.37 49.772 54.941 61.277 68.939 78.651 91.131 108.107 124.474 135.647 143.795 149.947 154.822 158.671 161.85 164.357 166.66 168.499 170.005 171.336 172.504 173.514 174.382 175.227 175.923 176.5 177.061 177.59 178.0 178.406 178.796 179.061 179.323 179.586 179.834 180.053 180.194 180.319 180.475 180.57 180.667 180.717 180.799 180.87 180.919 180.926 180.769 180.888 180.859 180.823 180.706 180.609 180.488 180.369 180.203 179.921 179.477 178.423 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt deleted file mode 100644 index d8f21ce8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7120 ,KEBNE ,16750530,Thu Dec 2 08:20:27 CET,Thu Dec 2 09:58:55 CET,0.0 0.963 1.525 2.01 2.468 2.895 3.293 3.675 4.394 4.744 5.08 5.387 6.037 6.348 6.968 7.562 8.146 8.433 8.997 9.555 10.375 10.912 11.447 12.242 13.014 13.772 14.523 15.263 16.231 17.201 18.157 19.339 20.525 21.688 23.047 24.587 26.12 27.873 29.808 31.911 34.196 36.875 40.118 43.495 47.609 52.425 58.255 65.238 74.031 85.29 100.52 115.055 124.859 131.931 137.19 141.371 144.691 147.4 149.499 151.404 152.919 154.167 155.258 156.219 157.039 157.726 158.395 158.961 159.429 159.885 160.328 160.663 160.972 161.257 161.465 161.672 161.865 162.047 162.221 162.324 162.416 162.541 162.606 162.655 162.683 162.728 162.729 162.714 162.711 162.531 162.636 162.598 162.558 162.421 162.305 162.186 162.063 161.914 161.734 161.489 160.801 -2 ,30053 ,KEBNE ,16750531,Thu Dec 2 08:20:29 CET,Thu Dec 2 10:00:23 CET,0.0 0.884 1.438 1.905 2.337 2.743 3.127 3.5 4.202 4.538 4.873 5.189 5.843 6.155 6.769 7.359 7.942 8.234 8.803 9.364 10.182 10.712 11.237 12.014 12.79 13.552 14.29 15.032 16.02 16.979 17.921 19.093 20.258 21.408 22.761 24.316 25.846 27.58 29.532 31.667 33.968 36.661 39.906 43.259 47.34 52.138 57.959 64.906 73.651 84.933 100.272 114.795 124.575 131.656 136.925 141.093 144.352 147.006 149.086 150.984 152.484 153.727 154.81 155.747 156.563 157.243 157.904 158.452 158.899 159.341 159.762 160.085 160.393 160.683 160.9 161.122 161.334 161.522 161.7 161.814 161.918 162.058 162.13 162.182 162.202 162.242 162.263 162.261 162.259 162.075 162.178 162.134 162.086 161.982 161.905 161.802 161.671 161.488 161.254 160.961 160.3 -3 ,9423 ,KEBNE ,16750532,Thu Dec 2 08:20:27 CET,Thu Dec 2 09:59:24 CET,0.0 1.351 1.872 2.347 2.791 3.2 3.599 3.995 4.719 5.065 5.402 5.712 6.374 6.696 7.32 7.92 8.517 8.805 9.363 9.914 10.73 11.263 11.789 12.574 13.348 14.113 14.866 15.606 16.583 17.553 18.505 19.686 20.85 21.985 23.341 24.905 26.437 28.15 30.043 32.125 34.368 36.97 40.132 43.427 47.443 52.163 57.914 64.792 73.443 84.649 99.898 114.387 124.246 131.41 136.804 141.088 144.441 147.189 149.354 151.33 152.888 154.186 155.34 156.336 157.181 157.91 158.637 159.249 159.729 160.188 160.638 160.984 161.323 161.652 161.891 162.119 162.333 162.538 162.71 162.81 162.916 163.061 163.152 163.246 163.282 163.335 163.382 163.401 163.406 163.233 163.354 163.297 163.229 163.101 163.007 162.903 162.794 162.653 162.441 162.128 161.097 -4 ,694 ,KEBNE ,16750533,Thu Dec 2 08:20:29 CET,Thu Dec 2 09:59:12 CET,0.0 1.039 1.641 2.146 2.594 3.002 3.407 3.797 4.525 4.872 5.214 5.529 6.179 6.497 7.114 7.706 8.285 8.57 9.13 9.695 10.548 11.096 11.63 12.423 13.212 13.984 14.735 15.477 16.446 17.405 18.355 19.516 20.661 21.807 23.166 24.729 26.281 28.023 29.947 32.061 34.363 37.03 40.279 43.691 47.82 52.651 58.489 65.482 74.251 85.499 100.813 115.311 125.13 132.207 137.482 141.679 144.931 147.625 149.753 151.641 153.138 154.405 155.534 156.516 157.351 158.051 158.718 159.267 159.727 160.186 160.626 160.957 161.283 161.6 161.816 162.018 162.22 162.399 162.561 162.674 162.773 162.879 162.938 162.999 163.021 163.037 163.061 163.078 163.07 162.887 163.005 162.965 162.915 162.785 162.692 162.575 162.438 162.283 162.043 161.701 161.0 -5 ,28075 ,KEBNE ,16750534,Thu Dec 2 08:20:27 CET,Thu Dec 2 09:58:43 CET,0.0 0.871 1.492 2.052 2.555 2.999 3.412 3.807 4.565 4.926 5.286 5.666 6.349 6.679 7.327 7.96 8.581 8.89 9.493 10.084 10.953 11.524 12.085 12.895 13.695 14.495 15.278 16.046 17.06 18.062 19.025 20.195 21.341 22.455 23.785 25.333 26.872 28.577 30.459 32.537 34.786 37.419 40.611 43.938 47.971 52.698 58.471 65.386 74.095 85.251 100.477 115.093 125.032 132.275 137.74 142.05 145.389 148.14 150.316 152.311 153.871 155.12 156.205 157.172 158.025 158.736 159.422 160.0 160.463 160.899 161.322 161.648 161.959 162.265 162.473 162.67 162.855 163.011 163.157 163.258 163.351 163.464 163.526 163.584 163.612 163.651 163.656 163.647 163.635 163.447 163.562 163.52 163.479 163.348 163.242 163.109 162.981 162.822 162.582 162.254 161.549 -6 ,23418 ,KEBNE ,16750535,Thu Dec 2 08:20:27 CET,Thu Dec 2 10:00:03 CET,0.0 1.32 1.929 2.414 2.89 3.356 3.823 4.27 5.104 5.492 5.841 6.18 6.855 7.183 7.816 8.42 9.011 9.307 9.882 10.45 11.285 11.82 12.342 13.137 13.918 14.667 15.41 16.149 17.135 18.113 19.082 20.285 21.455 22.595 23.954 25.515 27.044 28.801 30.746 32.842 35.139 37.818 41.045 44.422 48.518 53.291 59.085 66.055 74.856 86.16 101.49 116.163 126.069 133.186 138.488 142.671 145.882 148.496 150.6 152.547 154.076 155.32 156.43 157.402 158.239 158.952 159.632 160.196 160.655 161.104 161.541 161.862 162.164 162.458 162.667 162.877 163.084 163.265 163.417 163.512 163.601 163.737 163.82 163.88 163.9 163.939 163.977 163.993 163.992 163.812 163.947 163.916 163.868 163.749 163.661 163.555 163.397 163.19 162.982 162.695 161.811 -7 ,23769 ,KEBNE ,16750536,Thu Dec 2 08:20:28 CET,Thu Dec 2 09:58:37 CET,0.0 1.237 1.97 2.536 3.028 3.51 4.002 4.45 5.249 5.628 6.0 6.367 7.041 7.377 8.03 8.653 9.268 9.564 10.12 10.655 11.46 11.993 12.517 13.301 14.069 14.826 15.589 16.34 17.323 18.291 19.249 20.418 21.566 22.705 24.056 25.602 27.13 28.889 30.871 33.047 35.4 38.095 41.339 44.724 48.826 53.648 59.487 66.466 75.231 86.543 101.97 116.743 126.719 133.898 139.3 143.588 146.95 149.708 151.859 153.831 155.409 156.714 157.883 158.915 159.807 160.552 161.266 161.86 162.342 162.817 163.269 163.615 163.945 164.26 164.497 164.724 164.937 165.129 165.29 165.386 165.479 165.602 165.666 165.728 165.756 165.791 165.792 165.783 165.783 165.597 165.703 165.67 165.639 165.545 165.48 165.406 165.297 165.139 164.886 164.493 163.45 -8 ,31817 ,KEBNE ,16750537,Thu Dec 2 08:20:27 CET,Thu Dec 2 09:58:39 CET,0.0 1.153 1.812 2.326 2.801 3.249 3.665 4.053 4.763 5.104 5.449 5.759 6.404 6.716 7.326 7.91 8.475 8.75 9.303 9.853 10.66 11.188 11.711 12.479 13.234 13.985 14.729 15.463 16.424 17.363 18.292 19.443 20.584 21.729 23.1 24.677 26.217 27.932 29.809 31.866 34.122 36.76 39.965 43.335 47.428 52.196 57.931 64.804 73.509 84.734 100.007 114.594 124.447 131.561 136.838 140.981 144.236 146.92 149.04 150.995 152.562 153.834 154.964 155.971 156.812 157.511 158.199 158.769 159.234 159.702 160.127 160.439 160.747 161.048 161.272 161.479 161.661 161.826 161.983 162.082 162.164 162.276 162.347 162.396 162.416 162.449 162.471 162.487 162.486 162.312 162.439 162.386 162.334 162.228 162.159 162.052 161.922 161.765 161.527 161.169 160.039 -9 ,5944 ,KEBNE ,16750538,Thu Dec 2 08:20:26 CET,Thu Dec 2 09:58:51 CET,0.0 0.995 1.619 2.133 2.586 3.009 3.396 3.777 4.517 4.86 5.195 5.508 6.158 6.466 7.075 7.684 8.278 8.561 9.126 9.687 10.504 11.037 11.559 12.322 13.08 13.836 14.581 15.313 16.284 17.239 18.178 19.334 20.46 21.587 22.946 24.512 26.061 27.796 29.712 31.828 34.128 36.815 40.077 43.454 47.569 52.374 58.189 65.16 73.913 85.176 100.453 114.997 124.82 131.944 137.271 141.462 144.735 147.397 149.482 151.385 152.904 154.174 155.277 156.237 157.08 157.799 158.497 159.069 159.52 159.95 160.368 160.692 161.003 161.3 161.517 161.725 161.903 162.058 162.221 162.339 162.437 162.557 162.633 162.703 162.735 162.789 162.834 162.864 162.864 162.685 162.794 162.766 162.739 162.62 162.525 162.395 162.248 162.052 161.77 161.384 160.655 -10 ,16176 ,KEBNE ,16750539,Thu Dec 2 08:20:28 CET,Thu Dec 2 10:00:13 CET,0.0 0.955 1.541 2.021 2.461 2.888 3.299 3.695 4.448 4.806 5.152 5.483 6.136 6.453 7.079 7.683 8.272 8.558 9.118 9.671 10.49 11.035 11.562 12.333 13.096 13.851 14.605 15.344 16.305 17.264 18.224 19.411 20.579 21.723 23.066 24.6 26.143 27.888 29.812 31.915 34.194 36.859 40.073 43.422 47.519 52.321 58.105 65.073 73.864 85.053 100.307 114.815 124.532 131.606 136.961 141.177 144.458 147.104 149.164 151.107 152.647 153.896 155.004 155.977 156.817 157.527 158.213 158.785 159.237 159.67 160.099 160.438 160.766 161.068 161.274 161.467 161.656 161.833 162.01 162.125 162.228 162.337 162.395 162.448 162.47 162.503 162.505 162.502 162.495 162.302 162.425 162.395 162.353 162.255 162.185 162.1 161.999 161.856 161.683 161.429 160.702 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index 54fba11d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17196 ,KEBNE ,16750540,Thu Dec 2 08:20:27 CET,Thu Dec 2 09:55:49 CET,0.0 0.863 1.269 1.547 1.781 1.984 2.151 2.306 2.62 2.767 2.906 3.012 3.292 3.414 3.648 3.855 4.051 4.15 4.336 4.51 4.755 4.915 5.077 5.313 5.54 5.749 5.94 6.127 6.379 6.62 6.841 7.102 7.35 7.593 7.879 8.185 8.473 8.786 9.128 9.481 9.842 10.256 10.751 11.252 11.809 12.435 13.153 13.854 14.599 15.263 15.636 15.566 15.213 14.775 14.313 13.829 13.376 12.92 12.458 11.978 11.55 11.141 10.744 10.333 9.939 9.614 9.25 8.903 8.615 8.315 8.004 7.738 7.449 7.147 6.9 6.634 6.366 6.087 5.786 5.571 5.35 5.011 4.763 4.474 4.327 4.035 3.722 3.39 3.203 2.872 2.634 2.435 2.224 1.692 1.404 1.073 0.718 0.336 -0.169 -1.002 -3.874 -2 ,3849 ,KEBNE ,16750541,Thu Dec 2 08:20:29 CET,Thu Dec 2 09:55:40 CET,0.0 0.563 0.889 1.16 1.41 1.634 1.832 2.011 2.332 2.466 2.593 2.681 2.969 3.089 3.305 3.513 3.718 3.819 4.007 4.176 4.409 4.565 4.721 4.941 5.151 5.357 5.554 5.739 5.985 6.218 6.449 6.717 6.957 7.186 7.448 7.752 8.052 8.372 8.724 9.093 9.455 9.881 10.366 10.821 11.366 11.949 12.586 13.289 14.029 14.818 15.55 15.688 15.355 14.936 14.501 14.027 13.542 13.055 12.613 12.136 11.711 11.326 10.961 10.595 10.216 9.857 9.507 9.189 8.894 8.581 8.268 8.012 7.736 7.446 7.211 6.957 6.701 6.433 6.135 5.933 5.728 5.393 5.151 4.894 4.762 4.487 4.191 3.863 3.679 3.345 3.084 2.857 2.606 2.035 1.729 1.389 0.994 0.54 -0.012 -0.746 -3.319 -3 ,6869 ,KEBNE ,16750542,Thu Dec 2 08:20:27 CET,Thu Dec 2 09:55:37 CET,0.0 0.558 0.959 1.279 1.518 1.723 1.901 2.064 2.364 2.496 2.627 2.713 2.991 3.111 3.346 3.562 3.762 3.861 4.048 4.213 4.455 4.615 4.768 4.994 5.207 5.404 5.592 5.773 6.017 6.253 6.474 6.741 7.006 7.257 7.547 7.876 8.184 8.52 8.87 9.242 9.637 10.067 10.566 11.066 11.619 12.185 12.814 13.476 14.172 14.913 15.501 15.469 15.109 14.7 14.242 13.692 13.145 12.674 12.256 11.777 11.351 10.969 10.604 10.246 9.888 9.551 9.194 8.87 8.588 8.289 7.982 7.72 7.439 7.153 6.92 6.666 6.392 6.094 5.788 5.584 5.374 5.046 4.805 4.534 4.393 4.114 3.821 3.509 3.338 3.006 2.759 2.54 2.311 1.808 1.535 1.242 0.891 0.453 -0.118 -0.855 -4.21 -4 ,17440 ,KEBNE ,16750543,Thu Dec 2 08:20:28 CET,Thu Dec 2 09:55:24 CET,0.0 0.68 1.034 1.318 1.559 1.762 1.949 2.116 2.424 2.565 2.703 2.813 3.099 3.219 3.439 3.635 3.828 3.929 4.124 4.303 4.551 4.714 4.866 5.084 5.299 5.51 5.703 5.883 6.126 6.368 6.599 6.87 7.127 7.371 7.639 7.944 8.25 8.571 8.923 9.282 9.63 10.048 10.549 11.061 11.66 12.257 12.877 13.576 14.32 15.02 15.558 15.459 15.118 14.701 14.243 13.748 13.217 12.711 12.276 11.838 11.425 11.003 10.569 10.175 9.84 9.51 9.14 8.816 8.532 8.232 7.925 7.656 7.359 7.038 6.782 6.525 6.263 5.991 5.683 5.466 5.247 4.893 4.63 4.357 4.22 3.917 3.602 3.271 3.09 2.75 2.497 2.283 2.025 1.418 1.101 0.758 0.38 -0.03 -0.514 -1.254 -7.203 -5 ,17188 ,KEBNE ,16750544,Thu Dec 2 08:21:30 CET,Thu Dec 2 09:56:23 CET,0.0 0.603 0.902 1.174 1.401 1.621 1.829 2.011 2.325 2.469 2.62 2.737 3.018 3.128 3.341 3.539 3.719 3.808 3.995 4.179 4.436 4.6 4.757 4.975 5.19 5.4 5.6 5.797 6.047 6.289 6.517 6.775 7.026 7.27 7.561 7.883 8.186 8.536 8.899 9.277 9.674 10.096 10.574 11.046 11.569 12.148 12.839 13.61 14.384 15.046 15.561 15.609 15.3 14.881 14.446 13.943 13.451 12.958 12.497 12.04 11.627 11.247 10.859 10.474 10.123 9.803 9.451 9.119 8.828 8.528 8.214 7.949 7.667 7.353 7.099 6.847 6.578 6.297 6.014 5.811 5.593 5.245 5.004 4.741 4.605 4.333 4.028 3.68 3.503 3.18 2.935 2.72 2.486 1.913 1.583 1.251 0.897 0.472 -0.139 -1.068 -5.271 -6 ,10081 ,KEBNE ,16750545,Thu Dec 2 08:33:00 CET,Thu Dec 2 10:07:58 CET,0.0 0.758 1.084 1.325 1.523 1.712 1.889 2.057 2.358 2.489 2.619 2.708 2.98 3.092 3.316 3.52 3.708 3.8 3.986 4.164 4.416 4.576 4.725 4.948 5.173 5.382 5.572 5.752 5.993 6.229 6.446 6.7 6.942 7.183 7.47 7.794 8.091 8.405 8.754 9.126 9.519 9.951 10.423 10.888 11.458 12.043 12.645 13.318 14.016 14.684 15.23 15.348 15.111 14.716 14.276 13.809 13.308 12.764 12.277 11.828 11.424 11.037 10.649 10.274 9.919 9.579 9.223 8.9 8.613 8.316 8.006 7.735 7.436 7.127 6.894 6.648 6.39 6.116 5.829 5.62 5.396 5.06 4.811 4.522 4.374 4.072 3.755 3.418 3.24 2.906 2.664 2.458 2.227 1.711 1.419 1.072 0.656 0.208 -0.28 -0.945 -4.185 -7 ,8778 ,KEBNE ,16750546,Thu Dec 2 08:33:00 CET,Thu Dec 2 10:08:17 CET,0.0 0.693 1.045 1.319 1.548 1.743 1.938 2.112 2.393 2.527 2.661 2.763 3.052 3.168 3.375 3.572 3.777 3.872 4.049 4.218 4.47 4.632 4.782 5.005 5.23 5.445 5.645 5.838 6.086 6.323 6.544 6.797 7.053 7.317 7.616 7.933 8.229 8.568 8.914 9.267 9.634 10.043 10.52 10.982 11.524 12.096 12.714 13.404 14.151 14.86 15.381 15.37 15.026 14.537 14.053 13.576 13.079 12.569 12.111 11.677 11.295 10.902 10.493 10.12 9.778 9.471 9.134 8.797 8.502 8.203 7.884 7.617 7.332 7.033 6.803 6.546 6.266 5.984 5.681 5.47 5.251 4.907 4.663 4.402 4.273 4.001 3.697 3.362 3.184 2.86 2.594 2.355 2.132 1.643 1.364 1.064 0.679 0.199 -0.327 -1.023 -5.373 -8 ,7745 ,KEBNE ,16750547,Thu Dec 2 08:33:00 CET,Thu Dec 2 10:07:58 CET,0.0 0.724 1.098 1.353 1.557 1.752 1.927 2.078 2.376 2.52 2.661 2.764 3.04 3.158 3.396 3.609 3.808 3.907 4.094 4.279 4.554 4.718 4.865 5.083 5.291 5.484 5.668 5.848 6.074 6.284 6.492 6.749 6.995 7.241 7.536 7.853 8.149 8.49 8.849 9.215 9.606 10.042 10.533 11.004 11.545 12.135 12.776 13.439 14.104 14.765 15.317 15.367 15.058 14.623 14.133 13.644 13.201 12.71 12.252 11.766 11.324 10.924 10.532 10.17 9.831 9.51 9.154 8.838 8.562 8.272 7.959 7.689 7.406 7.097 6.851 6.597 6.324 6.036 5.732 5.52 5.284 4.889 4.638 4.383 4.243 3.957 3.638 3.299 3.124 2.778 2.501 2.278 2.046 1.528 1.229 0.916 0.54 0.072 -0.552 -1.348 -4.342 -9 ,19250 ,KEBNE ,16750548,Thu Dec 2 08:33:00 CET,Thu Dec 2 10:09:06 CET,0.0 0.896 1.308 1.611 1.854 2.06 2.259 2.433 2.739 2.885 3.025 3.136 3.422 3.537 3.751 3.951 4.144 4.239 4.42 4.595 4.85 5.009 5.159 5.372 5.576 5.777 5.967 6.154 6.395 6.627 6.85 7.12 7.374 7.622 7.925 8.252 8.562 8.898 9.248 9.617 9.98 10.405 10.895 11.347 11.902 12.521 13.157 13.835 14.549 15.199 15.761 15.745 15.342 14.901 14.455 13.956 13.444 12.907 12.416 11.922 11.468 11.053 10.673 10.292 9.896 9.543 9.196 8.882 8.602 8.303 7.98 7.7 7.409 7.116 6.875 6.615 6.347 6.068 5.773 5.568 5.353 4.988 4.729 4.478 4.345 4.049 3.727 3.409 3.238 2.898 2.62 2.385 2.147 1.652 1.355 1.025 0.675 0.235 -0.311 -1.119 -4.848 -10 ,22747 ,KEBNE ,16750549,Thu Dec 2 08:33:00 CET,Thu Dec 2 10:07:59 CET,0.0 0.641 1.004 1.289 1.524 1.728 1.904 2.073 2.386 2.527 2.654 2.754 3.045 3.162 3.376 3.573 3.765 3.861 4.049 4.227 4.475 4.637 4.793 5.01 5.214 5.412 5.606 5.796 6.046 6.285 6.509 6.77 7.018 7.268 7.573 7.899 8.201 8.528 8.865 9.23 9.593 9.986 10.46 10.949 11.513 12.111 12.762 13.43 14.173 14.948 15.543 15.622 15.292 14.793 14.263 13.744 13.279 12.818 12.389 11.924 11.497 11.09 10.682 10.305 9.955 9.616 9.264 8.946 8.663 8.375 8.055 7.767 7.484 7.2 6.961 6.71 6.451 6.171 5.868 5.652 5.43 5.081 4.832 4.562 4.422 4.128 3.831 3.52 3.352 3.029 2.776 2.557 2.332 1.811 1.499 1.138 0.731 0.236 -0.375 -1.162 -4.469 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt deleted file mode 100644 index 64dd4ee2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,72 ,KEBNE ,16750550,Thu Dec 2 08:33:01 CET,Thu Dec 2 10:08:05 CET,0.0 0.713 1.133 1.486 1.798 2.081 2.32 2.519 2.879 3.041 3.193 3.336 3.639 3.775 4.048 4.299 4.52 4.628 4.847 5.058 5.35 5.536 5.712 5.972 6.223 6.458 6.68 6.89 7.159 7.425 7.676 7.956 8.218 8.478 8.787 9.127 9.434 9.761 10.118 10.504 10.911 11.354 11.862 12.342 12.838 13.358 13.955 14.599 15.216 15.769 16.075 15.815 15.268 14.622 13.963 13.311 12.717 12.158 11.67 11.143 10.654 10.204 9.77 9.363 8.962 8.591 8.228 7.908 7.619 7.298 6.957 6.679 6.382 6.054 5.804 5.544 5.271 4.995 4.697 4.471 4.243 3.897 3.648 3.405 3.279 3.003 2.712 2.394 2.213 1.87 1.627 1.42 1.205 0.723 0.446 0.126 -0.216 -0.612 -1.127 -1.798 -3.633 -2 ,6669 ,KEBNE ,16750551,Thu Dec 2 08:33:00 CET,Thu Dec 2 10:09:03 CET,0.0 1.191 1.65 1.952 2.212 2.463 2.683 2.876 3.243 3.412 3.574 3.709 4.012 4.152 4.408 4.638 4.861 4.971 5.178 5.37 5.648 5.826 6.004 6.263 6.506 6.737 6.957 7.17 7.442 7.692 7.931 8.226 8.509 8.766 9.064 9.407 9.735 10.11 10.522 10.918 11.306 11.755 12.287 12.793 13.336 13.933 14.569 15.162 15.788 16.374 16.637 16.348 15.77 15.091 14.398 13.683 13.011 12.43 11.913 11.349 10.844 10.395 9.957 9.551 9.185 8.832 8.441 8.072 7.753 7.424 7.069 6.774 6.471 6.142 5.88 5.62 5.352 5.079 4.795 4.589 4.372 4.032 3.797 3.547 3.41 3.114 2.806 2.496 2.328 1.98 1.755 1.55 1.308 0.776 0.502 0.208 -0.128 -0.488 -0.913 -1.49 -4.853 -3 ,9041 ,KEBNE ,16750552,Thu Dec 2 08:33:01 CET,Thu Dec 2 10:11:35 CET,0.0 0.764 1.205 1.541 1.823 2.086 2.324 2.541 2.938 3.121 3.287 3.426 3.724 3.86 4.125 4.365 4.591 4.7 4.903 5.102 5.393 5.577 5.762 6.022 6.255 6.489 6.712 6.911 7.176 7.441 7.69 7.989 8.274 8.538 8.84 9.176 9.507 9.88 10.261 10.65 11.047 11.471 11.948 12.43 12.963 13.552 14.215 14.894 15.582 16.209 16.574 16.37 15.869 15.257 14.649 14.056 13.485 12.925 12.414 11.886 11.402 10.973 10.545 10.13 9.759 9.398 9.029 8.69 8.367 8.03 7.68 7.391 7.092 6.768 6.504 6.23 5.944 5.664 5.367 5.154 4.94 4.607 4.378 4.116 3.98 3.712 3.409 3.081 2.915 2.594 2.374 2.156 1.921 1.442 1.161 0.849 0.502 0.093 -0.368 -1.017 -3.974 -4 ,20284 ,KEBNE ,16750553,Thu Dec 2 08:33:01 CET,Thu Dec 2 10:08:52 CET,0.0 0.936 1.343 1.665 1.928 2.159 2.385 2.591 2.961 3.137 3.291 3.412 3.712 3.844 4.11 4.363 4.599 4.715 4.924 5.121 5.403 5.575 5.744 5.994 6.238 6.46 6.665 6.869 7.131 7.383 7.634 7.931 8.218 8.495 8.801 9.137 9.458 9.808 10.191 10.577 10.972 11.427 11.948 12.467 13.026 13.581 14.192 14.878 15.6 16.226 16.566 16.374 15.895 15.298 14.668 14.002 13.357 12.783 12.275 11.734 11.261 10.82 10.365 9.935 9.542 9.195 8.814 8.454 8.154 7.841 7.496 7.181 6.859 6.538 6.292 6.038 5.751 5.443 5.144 4.942 4.729 4.362 4.091 3.833 3.703 3.403 3.056 2.691 2.509 2.176 1.935 1.713 1.485 0.955 0.661 0.357 -0.004 -0.394 -0.875 -1.585 -4.151 -5 ,29106 ,KEBNE ,16750554,Thu Dec 2 08:33:01 CET,Thu Dec 2 10:08:45 CET,0.0 0.982 1.409 1.731 2.021 2.273 2.495 2.709 3.092 3.258 3.418 3.552 3.852 3.99 4.253 4.49 4.716 4.829 5.036 5.225 5.5 5.676 5.84 6.083 6.312 6.528 6.743 6.956 7.229 7.488 7.736 8.015 8.297 8.571 8.869 9.196 9.503 9.852 10.223 10.598 10.997 11.43 11.936 12.44 12.97 13.547 14.197 14.859 15.516 16.075 16.301 15.975 15.426 14.8 14.176 13.554 12.954 12.347 11.786 11.251 10.809 10.381 9.936 9.505 9.096 8.713 8.32 7.978 7.679 7.361 7.021 6.726 6.428 6.132 5.905 5.655 5.387 5.097 4.786 4.57 4.339 3.991 3.743 3.474 3.34 3.049 2.741 2.418 2.239 1.905 1.677 1.469 1.259 0.725 0.42 0.136 -0.196 -0.605 -1.108 -1.705 -3.838 -6 ,28180 ,KEBNE ,16750555,Thu Dec 2 08:33:00 CET,Thu Dec 2 10:08:35 CET,0.0 0.901 1.29 1.604 1.914 2.204 2.455 2.665 3.015 3.176 3.334 3.466 3.77 3.915 4.18 4.428 4.671 4.79 5.012 5.209 5.493 5.675 5.848 6.1 6.34 6.573 6.803 7.025 7.292 7.541 7.781 8.059 8.34 8.623 8.926 9.254 9.573 9.901 10.252 10.643 11.033 11.465 11.97 12.462 13.008 13.597 14.233 14.854 15.507 16.042 16.36 16.065 15.498 14.934 14.34 13.731 13.145 12.573 12.068 11.554 11.109 10.68 10.225 9.8 9.4 9.014 8.615 8.265 7.959 7.626 7.273 6.985 6.686 6.368 6.112 5.847 5.577 5.295 4.992 4.777 4.555 4.168 3.904 3.646 3.503 3.203 2.893 2.58 2.413 2.073 1.851 1.641 1.396 0.888 0.616 0.319 -0.022 -0.407 -0.894 -1.57 -3.967 -7 ,25478 ,KEBNE ,16750556,Thu Dec 2 08:33:01 CET,Thu Dec 2 10:09:05 CET,0.0 0.776 1.253 1.547 1.805 2.072 2.316 2.523 2.906 3.077 3.236 3.375 3.686 3.835 4.11 4.36 4.59 4.698 4.919 5.133 5.409 5.582 5.746 5.99 6.232 6.462 6.685 6.899 7.167 7.427 7.677 7.972 8.245 8.493 8.784 9.117 9.431 9.771 10.128 10.501 10.879 11.302 11.791 12.271 12.822 13.4 14.011 14.65 15.325 15.977 16.444 16.305 15.836 15.209 14.51 13.877 13.275 12.689 12.184 11.64 11.143 10.711 10.294 9.892 9.503 9.105 8.71 8.382 8.075 7.739 7.377 7.082 6.766 6.435 6.191 5.935 5.652 5.348 5.041 4.828 4.608 4.245 3.98 3.716 3.585 3.309 3.012 2.671 2.492 2.171 1.961 1.763 1.559 1.09 0.825 0.536 0.206 -0.209 -0.732 -1.364 -2.923 -8 ,18790 ,KEBNE ,16750557,Thu Dec 2 08:33:01 CET,Thu Dec 2 10:10:04 CET,0.0 0.934 1.352 1.659 1.927 2.167 2.391 2.59 2.932 3.092 3.25 3.379 3.677 3.816 4.078 4.317 4.525 4.625 4.821 5.016 5.309 5.485 5.646 5.88 6.106 6.335 6.56 6.764 7.028 7.285 7.532 7.83 8.112 8.387 8.698 9.033 9.365 9.728 10.094 10.479 10.885 11.323 11.813 12.309 12.857 13.419 14.045 14.668 15.291 15.889 16.242 16.03 15.562 14.963 14.31 13.681 13.079 12.485 11.955 11.394 10.894 10.464 10.012 9.56 9.172 8.839 8.489 8.145 7.844 7.532 7.182 6.883 6.576 6.244 5.982 5.703 5.414 5.117 4.812 4.61 4.394 4.036 3.786 3.517 3.368 3.063 2.751 2.442 2.271 1.925 1.673 1.457 1.238 0.729 0.431 0.1 -0.26 -0.686 -1.224 -1.912 -4.296 -9 ,27702 ,KEBNE ,16750558,Thu Dec 2 08:33:01 CET,Thu Dec 2 10:10:16 CET,0.0 1.025 1.464 1.806 2.096 2.364 2.599 2.797 3.156 3.327 3.485 3.596 3.891 4.022 4.278 4.526 4.755 4.858 5.068 5.28 5.577 5.767 5.944 6.192 6.429 6.654 6.875 7.075 7.331 7.585 7.83 8.132 8.41 8.661 8.952 9.282 9.594 9.92 10.286 10.662 11.03 11.45 11.945 12.416 12.931 13.496 14.111 14.742 15.406 16.001 16.295 16.082 15.537 14.84 14.172 13.521 12.928 12.379 11.894 11.401 10.954 10.554 10.163 9.745 9.319 8.921 8.522 8.167 7.844 7.514 7.171 6.872 6.563 6.24 5.979 5.707 5.432 5.137 4.834 4.624 4.394 4.025 3.758 3.486 3.35 3.066 2.765 2.45 2.282 1.949 1.719 1.51 1.302 0.84 0.564 0.247 -0.116 -0.536 -0.997 -1.655 -5.019 -10 ,30617 ,KEBNE ,16750559,Thu Dec 2 08:36:08 CET,Thu Dec 2 10:13:10 CET,0.0 0.803 1.275 1.646 1.964 2.223 2.451 2.662 3.035 3.209 3.363 3.487 3.788 3.919 4.161 4.388 4.611 4.724 4.936 5.135 5.428 5.61 5.781 6.019 6.258 6.493 6.712 6.913 7.18 7.445 7.692 7.977 8.241 8.5 8.805 9.131 9.441 9.789 10.157 10.517 10.881 11.313 11.82 12.309 12.856 13.428 14.035 14.673 15.336 15.957 16.247 15.93 15.415 14.794 14.143 13.486 12.84 12.222 11.676 11.121 10.65 10.236 9.806 9.349 8.926 8.543 8.144 7.781 7.466 7.154 6.823 6.53 6.21 5.891 5.643 5.368 5.082 4.785 4.476 4.268 4.051 3.697 3.437 3.162 3.026 2.757 2.457 2.113 1.941 1.609 1.368 1.153 0.924 0.42 0.143 -0.151 -0.471 -0.848 -1.322 -1.971 -4.036 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index b9cf3bb3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5621 ,KEBNE ,16750560,Thu Dec 2 08:36:08 CET,Thu Dec 2 10:16:03 CET,0.0 0.766 1.201 1.536 1.831 2.105 2.338 2.526 2.874 3.048 3.216 3.359 3.678 3.825 4.106 4.379 4.647 4.77 5.005 5.249 5.618 5.849 6.067 6.384 6.681 6.967 7.243 7.515 7.863 8.198 8.524 8.921 9.312 9.685 10.12 10.611 11.087 11.606 12.153 12.753 13.39 14.095 14.903 15.714 16.678 17.766 19.019 20.408 21.996 23.788 25.869 27.554 28.371 28.716 28.821 28.807 28.739 28.603 28.415 28.187 27.942 27.681 27.431 27.2 26.951 26.706 26.456 26.23 26.038 25.831 25.592 25.395 25.179 24.941 24.756 24.56 24.356 24.144 23.91 23.752 23.591 23.321 23.131 22.933 22.83 22.603 22.367 22.13 21.993 21.695 21.526 21.364 21.198 20.815 20.578 20.331 20.068 19.747 19.35 18.873 17.79 -2 ,7159 ,KEBNE ,16750561,Thu Dec 2 08:36:08 CET,Thu Dec 2 10:15:45 CET,0.0 0.687 1.082 1.412 1.701 1.961 2.196 2.391 2.758 2.928 3.086 3.239 3.57 3.72 4.011 4.299 4.575 4.711 4.953 5.174 5.51 5.734 5.953 6.255 6.552 6.845 7.121 7.396 7.766 8.118 8.452 8.864 9.25 9.616 10.049 10.533 11.0 11.515 12.064 12.653 13.268 13.961 14.789 15.635 16.605 17.688 18.961 20.38 22.011 23.837 25.919 27.439 28.078 28.274 28.271 28.166 28.018 27.8 27.563 27.305 27.061 26.825 26.558 26.287 26.054 25.822 25.548 25.311 25.096 24.874 24.647 24.447 24.233 23.994 23.796 23.588 23.373 23.142 22.898 22.734 22.559 22.275 22.079 21.874 21.767 21.559 21.33 21.072 20.941 20.662 20.519 20.359 20.19 19.805 19.583 19.331 19.06 18.773 18.468 18.048 17.041 -3 ,28270 ,KEBNE ,16750562,Thu Dec 2 08:36:08 CET,Thu Dec 2 10:17:22 CET,0.0 0.612 0.985 1.283 1.548 1.779 1.977 2.163 2.538 2.733 2.912 3.051 3.368 3.516 3.812 4.097 4.371 4.496 4.734 4.972 5.327 5.556 5.769 6.078 6.374 6.657 6.938 7.215 7.558 7.889 8.22 8.626 9.024 9.405 9.841 10.327 10.785 11.284 11.827 12.394 12.985 13.653 14.422 15.209 16.141 17.168 18.319 19.597 21.058 22.757 24.746 26.206 26.935 27.259 27.367 27.342 27.235 27.112 26.955 26.736 26.521 26.299 26.062 25.828 25.581 25.344 25.095 24.87 24.661 24.443 24.212 23.996 23.776 23.547 23.356 23.152 22.952 22.747 22.521 22.366 22.202 21.933 21.748 21.556 21.453 21.231 20.989 20.726 20.582 20.294 20.144 19.976 19.797 19.391 19.174 18.94 18.679 18.389 18.013 17.505 16.465 -4 ,6132 ,KEBNE ,16750563,Thu Dec 2 08:38:15 CET,Thu Dec 2 10:18:52 CET,0.0 1.057 1.467 1.786 2.079 2.34 2.57 2.774 3.143 3.315 3.485 3.654 3.986 4.136 4.418 4.691 4.948 5.075 5.327 5.569 5.914 6.135 6.346 6.647 6.934 7.216 7.489 7.753 8.109 8.449 8.769 9.155 9.518 9.868 10.29 10.763 11.208 11.695 12.226 12.803 13.406 14.084 14.871 15.661 16.571 17.578 18.771 20.085 21.575 23.313 25.327 26.843 27.556 27.883 28.019 28.0 27.87 27.702 27.54 27.347 27.141 26.925 26.695 26.468 26.226 25.975 25.716 25.49 25.3 25.098 24.866 24.65 24.404 24.132 23.927 23.711 23.479 23.237 22.966 22.777 22.58 22.272 22.045 21.794 21.667 21.406 21.135 20.842 20.69 20.377 20.151 19.957 19.759 19.308 19.062 18.811 18.541 18.221 17.807 17.29 16.081 -5 ,4820 ,KEBNE ,16750564,Thu Dec 2 08:41:28 CET,Thu Dec 2 10:20:20 CET,0.0 0.619 1.02 1.351 1.65 1.916 2.155 2.369 2.755 2.928 3.085 3.227 3.551 3.704 4.005 4.288 4.554 4.679 4.929 5.176 5.514 5.728 5.939 6.246 6.534 6.802 7.064 7.324 7.667 7.999 8.321 8.707 9.069 9.425 9.838 10.291 10.73 11.22 11.743 12.289 12.866 13.532 14.306 15.076 16.003 17.052 18.243 19.569 21.09 22.843 24.839 26.328 27.067 27.392 27.489 27.485 27.371 27.189 27.023 26.805 26.564 26.337 26.083 25.808 25.54 25.27 24.98 24.729 24.502 24.241 23.968 23.741 23.494 23.231 23.024 22.809 22.59 22.344 22.07 21.874 21.661 21.348 21.139 20.917 20.796 20.541 20.287 20.018 19.881 19.601 19.45 19.285 19.115 18.759 18.547 18.31 18.034 17.706 17.304 16.827 15.649 -6 ,29928 ,KEBNE ,16750565,Thu Dec 2 08:41:31 CET,Thu Dec 2 10:14:12 CET,0.0 0.891 1.266 1.54 1.79 2.04 2.282 2.497 2.893 3.072 3.232 3.36 3.667 3.81 4.093 4.349 4.594 4.715 4.956 5.184 5.504 5.714 5.921 6.232 6.524 6.805 7.077 7.344 7.688 8.015 8.329 8.703 9.061 9.419 9.849 10.311 10.746 11.246 11.803 12.386 12.999 13.704 14.503 15.313 16.271 17.341 18.6 20.025 21.69 23.661 25.93 27.478 28.148 28.463 28.525 28.449 28.337 28.178 28.008 27.792 27.566 27.341 27.122 26.904 26.689 26.47 26.215 25.983 25.788 25.582 25.353 25.145 24.917 24.688 24.514 24.327 24.124 23.905 23.686 23.528 23.35 23.074 22.879 22.676 22.569 22.35 22.131 21.894 21.755 21.459 21.276 21.091 20.904 20.491 20.279 20.063 19.803 19.509 19.168 18.731 17.962 -7 ,8121 ,KEBNE ,16750566,Thu Dec 2 08:44:37 CET,Thu Dec 2 10:24:55 CET,0.0 1.15 1.558 1.863 2.102 2.325 2.546 2.75 3.144 3.33 3.501 3.664 3.999 4.157 4.455 4.728 4.983 5.106 5.34 5.572 5.918 6.145 6.356 6.67 6.973 7.249 7.52 7.792 8.152 8.49 8.818 9.223 9.609 9.981 10.409 10.885 11.369 11.892 12.442 13.037 13.666 14.377 15.211 16.061 17.038 18.113 19.375 20.83 22.529 24.449 26.533 28.07 28.792 29.105 29.206 29.171 29.058 28.892 28.714 28.493 28.272 28.045 27.819 27.597 27.357 27.123 26.892 26.674 26.462 26.243 26.013 25.816 25.6 25.366 25.176 24.98 24.776 24.565 24.347 24.19 24.019 23.75 23.546 23.33 23.227 23.013 22.784 22.539 22.41 22.122 21.981 21.827 21.646 21.207 20.975 20.729 20.457 20.137 19.771 19.313 18.108 -8 ,3885 ,KEBNE ,16750567,Thu Dec 2 08:48:52 CET,Thu Dec 2 10:26:34 CET,0.0 0.805 1.194 1.51 1.786 2.035 2.284 2.515 2.907 3.082 3.245 3.387 3.706 3.858 4.162 4.441 4.704 4.831 5.084 5.329 5.673 5.897 6.103 6.401 6.699 6.996 7.287 7.561 7.914 8.26 8.598 9.006 9.382 9.732 10.15 10.628 11.077 11.571 12.099 12.658 13.252 13.938 14.755 15.583 16.534 17.576 18.789 20.197 21.805 23.617 25.783 27.355 28.016 28.284 28.367 28.267 28.08 27.87 27.645 27.375 27.107 26.844 26.588 26.342 26.082 25.835 25.579 25.348 25.148 24.927 24.671 24.454 24.235 24.002 23.811 23.613 23.4 23.17 22.93 22.756 22.572 22.285 22.083 21.885 21.787 21.57 21.346 21.103 20.962 20.664 20.504 20.344 20.169 19.752 19.502 19.24 18.978 18.675 18.307 17.876 16.921 -9 ,26763 ,KEBNE ,16750568,Thu Dec 2 08:48:52 CET,Thu Dec 2 10:26:56 CET,0.0 1.001 1.37 1.686 1.98 2.23 2.447 2.645 3.029 3.221 3.403 3.562 3.892 4.049 4.35 4.629 4.895 5.027 5.284 5.53 5.879 6.1 6.313 6.629 6.933 7.225 7.506 7.774 8.128 8.477 8.817 9.233 9.633 10.006 10.446 10.944 11.427 11.952 12.518 13.121 13.745 14.439 15.246 16.081 17.045 18.107 19.334 20.683 22.215 23.964 25.953 27.45 28.137 28.424 28.536 28.484 28.358 28.176 27.949 27.695 27.446 27.226 27.001 26.761 26.528 26.308 26.076 25.859 25.657 25.421 25.176 24.976 24.768 24.544 24.363 24.179 23.984 23.784 23.582 23.442 23.277 23.004 22.814 22.592 22.476 22.255 22.008 21.727 21.58 21.282 21.117 20.951 20.783 20.409 20.199 19.978 19.739 19.467 19.117 18.661 17.446 -10 ,10049 ,KEBNE ,16750569,Thu Dec 2 08:53:12 CET,Thu Dec 2 10:32:35 CET,0.0 0.708 1.12 1.443 1.743 2.01 2.243 2.461 2.887 3.075 3.258 3.442 3.773 3.926 4.218 4.492 4.76 4.886 5.132 5.372 5.725 5.946 6.157 6.468 6.757 7.036 7.318 7.593 7.941 8.28 8.609 9.005 9.39 9.765 10.185 10.648 11.097 11.597 12.134 12.703 13.301 13.975 14.771 15.573 16.529 17.569 18.703 20.02 21.573 23.396 25.565 27.222 28.038 28.431 28.551 28.512 28.409 28.249 28.033 27.735 27.46 27.211 26.961 26.716 26.472 26.236 25.986 25.749 25.53 25.306 25.084 24.905 24.702 24.487 24.318 24.133 23.949 23.75 23.523 23.366 23.195 22.914 22.729 22.538 22.434 22.213 21.975 21.726 21.593 21.307 21.136 20.958 20.783 20.408 20.198 19.958 19.671 19.367 19.024 18.546 17.176 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt deleted file mode 100644 index 2e96e997..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2012 ,KEBNE ,16750570,Thu Dec 2 08:53:10 CET,Thu Dec 2 10:32:45 CET,0.0 1.178 1.596 1.962 2.273 2.547 2.783 2.997 3.36 3.538 3.724 3.902 4.225 4.363 4.63 4.873 5.09 5.195 5.393 5.592 5.881 6.049 6.214 6.456 6.694 6.925 7.146 7.364 7.631 7.884 8.129 8.414 8.681 8.939 9.226 9.544 9.852 10.181 10.524 10.873 11.244 11.636 12.056 12.481 12.976 13.513 14.039 14.5 14.926 15.244 15.281 14.793 13.99 13.143 12.418 11.681 10.896 10.157 9.523 8.868 8.301 7.794 7.312 6.863 6.439 6.037 5.606 5.226 4.891 4.531 4.166 3.874 3.563 3.244 3.006 2.744 2.45 2.15 1.859 1.657 1.431 1.09 0.862 0.621 0.493 0.213 -0.076 -0.371 -0.528 -0.855 -1.024 -1.21 -1.417 -1.871 -2.123 -2.406 -2.71 -3.054 -3.445 -3.88 -5.441 -2 ,6300 ,KEBNE ,16750571,Thu Dec 2 08:53:12 CET,Thu Dec 2 10:32:10 CET,0.0 1.221 1.663 2.027 2.313 2.554 2.773 2.976 3.352 3.534 3.705 3.845 4.15 4.288 4.545 4.776 5.012 5.125 5.338 5.547 5.826 5.993 6.174 6.434 6.666 6.891 7.111 7.32 7.575 7.816 8.034 8.293 8.569 8.836 9.118 9.422 9.707 10.018 10.359 10.707 11.077 11.486 11.937 12.353 12.777 13.269 13.798 14.309 14.824 15.17 15.208 14.78 14.136 13.373 12.59 11.809 11.034 10.301 9.655 9.013 8.456 7.94 7.443 6.973 6.542 6.142 5.719 5.336 5.009 4.675 4.317 4.018 3.717 3.404 3.16 2.911 2.653 2.372 2.077 1.869 1.637 1.274 1.03 0.774 0.642 0.376 0.094 -0.198 -0.35 -0.671 -0.846 -1.042 -1.264 -1.736 -1.972 -2.205 -2.467 -2.794 -3.192 -3.679 -4.923 -3 ,32656 ,KEBNE ,16750572,Thu Dec 2 08:53:12 CET,Thu Dec 2 10:31:07 CET,0.0 1.238 1.702 2.085 2.411 2.673 2.89 3.111 3.513 3.686 3.852 3.983 4.293 4.437 4.707 4.945 5.164 5.267 5.463 5.667 5.949 6.126 6.306 6.566 6.81 7.035 7.25 7.456 7.725 7.989 8.256 8.569 8.854 9.124 9.435 9.77 10.077 10.413 10.788 11.192 11.59 12.01 12.462 12.904 13.367 13.828 14.363 14.931 15.441 15.779 15.778 15.228 14.481 13.688 12.879 12.071 11.404 10.776 10.187 9.605 9.08 8.608 8.187 7.773 7.348 6.942 6.513 6.127 5.782 5.422 5.035 4.708 4.383 4.044 3.787 3.523 3.241 2.918 2.559 2.34 2.115 1.74 1.482 1.208 1.065 0.777 0.468 0.125 -0.054 -0.414 -0.671 -0.883 -1.096 -1.603 -1.874 -2.121 -2.4 -2.746 -3.209 -3.787 -5.019 -4 ,31350 ,KEBNE ,16750573,Thu Dec 2 08:53:12 CET,Thu Dec 2 10:33:13 CET,0.0 1.262 1.767 2.112 2.406 2.69 2.928 3.124 3.463 3.626 3.789 3.942 4.267 4.404 4.678 4.932 5.159 5.276 5.495 5.69 5.986 6.181 6.359 6.613 6.854 7.092 7.32 7.531 7.799 8.052 8.312 8.63 8.919 9.19 9.514 9.89 10.232 10.572 10.928 11.314 11.723 12.15 12.604 13.085 13.61 14.137 14.679 15.197 15.7 16.075 16.114 15.621 14.929 14.102 13.287 12.544 11.852 11.197 10.645 10.053 9.532 9.096 8.658 8.205 7.795 7.412 6.976 6.58 6.24 5.906 5.569 5.275 4.961 4.633 4.383 4.126 3.849 3.558 3.244 3.021 2.8 2.454 2.205 1.95 1.826 1.563 1.284 0.992 0.829 0.476 0.218 0.008 -0.199 -0.697 -0.978 -1.262 -1.566 -1.957 -2.425 -3.031 -4.711 -5 ,28574 ,KEBNE ,16750574,Thu Dec 2 08:56:23 CET,Thu Dec 2 10:36:01 CET,0.0 1.317 1.753 2.096 2.419 2.722 2.951 3.147 3.55 3.729 3.894 4.029 4.347 4.494 4.751 4.985 5.207 5.314 5.529 5.734 6.006 6.178 6.345 6.594 6.839 7.069 7.286 7.497 7.79 8.057 8.29 8.556 8.83 9.1 9.4 9.732 10.056 10.407 10.752 11.124 11.505 11.877 12.295 12.737 13.232 13.746 14.312 14.886 15.44 15.844 15.921 15.57 14.927 14.167 13.43 12.71 12.061 11.444 10.882 10.308 9.811 9.342 8.884 8.445 8.003 7.588 7.157 6.775 6.438 6.084 5.725 5.423 5.117 4.797 4.54 4.27 4.002 3.723 3.42 3.208 2.977 2.625 2.389 2.132 1.989 1.688 1.382 1.06 0.891 0.543 0.312 0.098 -0.131 -0.644 -0.929 -1.222 -1.535 -1.916 -2.397 -3.023 -4.433 -6 ,21845 ,KEBNE ,16750575,Thu Dec 2 08:56:25 CET,Thu Dec 2 10:29:19 CET,0.0 1.249 1.729 2.071 2.365 2.626 2.859 3.06 3.419 3.584 3.745 3.895 4.215 4.354 4.615 4.868 5.105 5.226 5.462 5.67 5.973 6.163 6.334 6.578 6.819 7.046 7.261 7.477 7.75 8.006 8.253 8.558 8.854 9.127 9.437 9.777 10.077 10.393 10.737 11.12 11.511 11.91 12.361 12.814 13.341 13.883 14.442 15.025 15.575 15.951 16.021 15.516 14.84 14.138 13.434 12.685 11.982 11.35 10.76 10.157 9.624 9.153 8.72 8.298 7.879 7.469 7.015 6.613 6.276 5.914 5.525 5.218 4.904 4.558 4.295 4.03 3.748 3.454 3.143 2.93 2.714 2.375 2.139 1.881 1.742 1.45 1.124 0.786 0.612 0.256 0.016 -0.193 -0.398 -0.838 -1.089 -1.355 -1.655 -1.99 -2.367 -2.909 -4.515 -7 ,23995 ,KEBNE ,16750576,Thu Dec 2 09:02:43 CET,Thu Dec 2 10:40:57 CET,0.0 1.431 1.937 2.332 2.654 2.927 3.163 3.387 3.768 3.936 4.108 4.258 4.573 4.72 4.977 5.212 5.441 5.548 5.752 5.951 6.239 6.422 6.599 6.852 7.104 7.344 7.566 7.772 8.049 8.324 8.58 8.881 9.15 9.41 9.709 10.031 10.341 10.672 11.04 11.425 11.787 12.167 12.617 13.075 13.554 14.016 14.466 14.928 15.425 15.842 15.908 15.426 14.807 14.061 13.27 12.522 11.893 11.292 10.687 10.084 9.575 9.094 8.641 8.205 7.791 7.43 7.043 6.665 6.339 6.014 5.674 5.381 5.063 4.736 4.487 4.218 3.934 3.65 3.362 3.16 2.931 2.567 2.328 2.071 1.942 1.69 1.418 1.119 0.967 0.641 0.476 0.308 0.119 -0.341 -0.611 -0.885 -1.147 -1.475 -1.891 -2.407 -5.097 -8 ,4606 ,KEBNE ,16750577,Thu Dec 2 09:02:43 CET,Thu Dec 2 10:40:35 CET,0.0 1.111 1.534 1.878 2.179 2.431 2.64 2.842 3.224 3.391 3.567 3.723 4.038 4.187 4.466 4.71 4.944 5.059 5.268 5.455 5.726 5.9 6.073 6.334 6.585 6.811 7.03 7.251 7.518 7.77 8.015 8.293 8.554 8.804 9.097 9.432 9.755 10.108 10.469 10.829 11.181 11.577 12.039 12.468 12.923 13.396 13.906 14.39 14.81 15.101 15.121 14.646 13.89 13.139 12.436 11.706 11.053 10.446 9.896 9.348 8.884 8.441 7.993 7.574 7.182 6.808 6.419 6.064 5.74 5.415 5.058 4.758 4.466 4.164 3.923 3.679 3.423 3.133 2.822 2.618 2.4 2.054 1.819 1.567 1.431 1.147 0.858 0.564 0.412 0.086 -0.09 -0.276 -0.477 -0.915 -1.147 -1.405 -1.739 -2.127 -2.525 -3.039 -4.582 -9 ,20241 ,KEBNE ,16750578,Thu Dec 2 09:04:51 CET,Thu Dec 2 10:41:48 CET,0.0 1.413 1.969 2.323 2.617 2.879 3.098 3.321 3.726 3.892 4.051 4.176 4.486 4.624 4.88 5.132 5.375 5.483 5.697 5.922 6.242 6.433 6.614 6.871 7.108 7.332 7.557 7.771 8.04 8.288 8.529 8.829 9.108 9.367 9.668 10.02 10.357 10.704 11.07 11.472 11.869 12.279 12.763 13.239 13.739 14.251 14.764 15.247 15.716 16.126 16.257 15.683 14.804 13.967 13.157 12.371 11.668 10.978 10.354 9.754 9.237 8.741 8.244 7.786 7.364 6.949 6.524 6.144 5.813 5.468 5.091 4.784 4.459 4.101 3.827 3.55 3.262 2.968 2.65 2.433 2.218 1.86 1.605 1.351 1.225 0.96 0.681 0.383 0.219 -0.114 -0.29 -0.477 -0.673 -1.096 -1.324 -1.575 -1.869 -2.24 -2.664 -3.215 -4.71 -10 ,10436 ,KEBNE ,16750579,Thu Dec 2 09:05:57 CET,Thu Dec 2 10:45:22 CET,0.0 1.463 1.961 2.344 2.683 2.967 3.202 3.412 3.805 3.991 4.162 4.302 4.619 4.758 5.008 5.242 5.465 5.575 5.791 5.988 6.248 6.419 6.591 6.839 7.076 7.302 7.513 7.712 7.971 8.216 8.448 8.725 8.983 9.236 9.523 9.832 10.133 10.46 10.808 11.18 11.568 11.975 12.447 12.933 13.441 13.97 14.535 15.066 15.568 15.946 15.983 15.449 14.723 14.02 13.307 12.561 11.841 11.193 10.614 10.014 9.514 9.041 8.568 8.122 7.694 7.305 6.909 6.549 6.245 5.919 5.572 5.284 4.98 4.643 4.356 4.062 3.773 3.468 3.132 2.902 2.66 2.289 2.035 1.757 1.622 1.359 1.063 0.721 0.542 0.188 -0.06 -0.283 -0.511 -0.979 -1.246 -1.565 -1.912 -2.265 -2.656 -3.129 -4.672 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index a137cf8d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19842 ,KEBNE ,16750580,Thu Dec 2 09:13:22 CET,Thu Dec 2 10:52:32 CET,0.0 1.58 2.218 2.689 3.063 3.394 3.7 3.98 4.408 4.579 4.748 4.906 5.206 5.35 5.621 5.87 6.101 6.21 6.424 6.628 6.908 7.089 7.259 7.518 7.766 7.976 8.175 8.37 8.616 8.854 9.085 9.363 9.631 9.871 10.136 10.444 10.739 11.056 11.386 11.719 12.04 12.38 12.765 13.138 13.552 13.942 14.281 14.552 14.729 14.648 14.014 12.844 11.495 10.131 8.819 7.589 6.5 5.494 4.587 3.639 2.855 2.185 1.511 0.877 0.305 -0.225 -0.759 -1.257 -1.712 -2.191 -2.704 -3.128 -3.564 -4.026 -4.377 -4.746 -5.135 -5.538 -5.971 -6.265 -6.562 -7.038 -7.365 -7.7 -7.884 -8.271 -8.672 -9.117 -9.342 -9.73 -10.103 -10.383 -10.664 -11.27 -11.608 -11.993 -12.435 -12.945 -13.543 -14.237 -16.34 -2 ,26492 ,KEBNE ,16750581,Thu Dec 2 09:13:24 CET,Thu Dec 2 10:49:58 CET,0.0 1.164 1.713 2.111 2.438 2.719 2.969 3.204 3.619 3.795 3.961 4.135 4.43 4.575 4.866 5.111 5.336 5.45 5.661 5.85 6.123 6.3 6.468 6.701 6.936 7.163 7.377 7.584 7.846 8.095 8.338 8.623 8.885 9.126 9.396 9.693 9.998 10.329 10.655 10.98 11.315 11.681 12.08 12.438 12.814 13.205 13.621 14.025 14.305 14.274 13.646 12.479 11.168 9.802 8.544 7.365 6.286 5.303 4.428 3.536 2.765 2.078 1.412 0.762 0.141 -0.416 -0.977 -1.495 -1.938 -2.387 -2.858 -3.266 -3.708 -4.166 -4.515 -4.872 -5.252 -5.651 -6.065 -6.348 -6.633 -7.099 -7.428 -7.774 -7.959 -8.35 -8.753 -9.152 -9.358 -9.734 -10.073 -10.334 -10.608 -11.254 -11.636 -12.057 -12.515 -13.042 -13.721 -14.567 -17.525 -3 ,14973 ,KEBNE ,16750582,Thu Dec 2 09:22:49 CET,Thu Dec 2 11:00:21 CET,0.0 1.153 1.684 2.106 2.444 2.733 2.976 3.192 3.603 3.798 3.987 4.163 4.464 4.615 4.923 5.231 5.505 5.628 5.853 6.063 6.362 6.54 6.713 6.956 7.188 7.405 7.612 7.827 8.112 8.384 8.63 8.92 9.197 9.455 9.743 10.068 10.361 10.658 10.963 11.269 11.592 11.954 12.355 12.726 13.119 13.536 13.926 14.249 14.49 14.439 13.738 12.229 10.725 9.322 8.061 6.937 5.892 4.928 4.077 3.213 2.473 1.801 1.139 0.495 -0.101 -0.669 -1.304 -1.857 -2.313 -2.781 -3.286 -3.721 -4.156 -4.607 -4.976 -5.351 -5.729 -6.133 -6.559 -6.865 -7.188 -7.679 -8.027 -8.398 -8.59 -8.995 -9.427 -9.877 -10.107 -10.491 -10.805 -11.073 -11.362 -11.997 -12.364 -12.751 -13.17 -13.654 -14.278 -15.152 -17.666 -4 ,23269 ,KEBNE ,16750583,Thu Dec 2 09:22:53 CET,Thu Dec 2 10:58:59 CET,0.0 1.093 1.562 1.958 2.312 2.597 2.852 3.089 3.491 3.659 3.828 3.997 4.296 4.439 4.717 4.969 5.196 5.31 5.53 5.744 6.051 6.24 6.411 6.656 6.913 7.151 7.362 7.56 7.814 8.052 8.261 8.505 8.755 9.012 9.286 9.569 9.843 10.145 10.461 10.8 11.159 11.54 11.967 12.382 12.811 13.222 13.625 13.919 14.041 13.93 13.234 11.872 10.522 9.223 8.028 6.912 5.915 4.97 4.099 3.197 2.409 1.672 0.947 0.287 -0.33 -0.895 -1.471 -1.986 -2.441 -2.918 -3.438 -3.885 -4.346 -4.824 -5.188 -5.55 -5.916 -6.31 -6.731 -7.02 -7.324 -7.812 -8.155 -8.512 -8.701 -9.097 -9.504 -9.931 -10.17 -10.581 -10.947 -11.215 -11.491 -12.128 -12.494 -12.9 -13.352 -13.87 -14.516 -15.471 -19.22 -5 ,21007 ,KEBNE ,16750584,Thu Dec 2 09:22:49 CET,Thu Dec 2 11:00:17 CET,0.0 1.425 2.015 2.425 2.76 3.065 3.349 3.605 4.036 4.221 4.408 4.6 4.91 5.057 5.322 5.584 5.863 6.004 6.258 6.476 6.795 7.01 7.206 7.483 7.764 8.028 8.257 8.461 8.717 8.96 9.191 9.476 9.763 10.019 10.291 10.604 10.895 11.194 11.481 11.79 12.103 12.425 12.803 13.139 13.485 13.811 14.112 14.337 14.402 14.168 13.288 11.795 10.227 8.738 7.45 6.247 5.154 4.152 3.256 2.347 1.565 0.889 0.252 -0.396 -1.022 -1.569 -2.139 -2.653 -3.104 -3.585 -4.094 -4.522 -4.961 -5.428 -5.8 -6.19 -6.594 -7.001 -7.412 -7.694 -7.986 -8.453 -8.768 -9.114 -9.304 -9.685 -10.085 -10.513 -10.737 -11.121 -11.451 -11.709 -11.995 -12.64 -12.992 -13.367 -13.782 -14.292 -14.931 -15.731 -18.033 -6 ,32247 ,KEBNE ,16750585,Thu Dec 2 09:22:49 CET,Thu Dec 2 11:00:50 CET,0.0 1.402 1.997 2.457 2.882 3.246 3.534 3.793 4.263 4.457 4.629 4.796 5.103 5.25 5.517 5.774 6.027 6.148 6.373 6.57 6.872 7.082 7.276 7.535 7.778 8.014 8.239 8.451 8.711 8.957 9.189 9.458 9.706 9.95 10.234 10.545 10.837 11.148 11.481 11.824 12.176 12.533 12.898 13.245 13.609 13.967 14.305 14.601 14.828 14.827 14.233 12.886 11.503 10.235 9.069 7.936 6.879 5.886 5.042 4.224 3.48 2.784 2.104 1.439 0.838 0.307 -0.27 -0.803 -1.255 -1.707 -2.177 -2.592 -3.028 -3.47 -3.817 -4.2 -4.611 -5.029 -5.461 -5.76 -6.065 -6.531 -6.841 -7.171 -7.353 -7.747 -8.164 -8.62 -8.871 -9.281 -9.65 -9.939 -10.241 -10.909 -11.289 -11.705 -12.177 -12.746 -13.443 -14.346 -17.363 -7 ,26012 ,KEBNE ,16750586,Thu Dec 2 09:22:49 CET,Thu Dec 2 11:00:16 CET,0.0 1.167 1.723 2.119 2.417 2.678 2.918 3.134 3.503 3.667 3.833 4.016 4.322 4.462 4.729 4.97 5.195 5.304 5.513 5.714 6.001 6.182 6.355 6.599 6.822 7.036 7.243 7.453 7.715 7.957 8.199 8.486 8.742 8.98 9.272 9.597 9.901 10.223 10.532 10.86 11.201 11.548 11.93 12.301 12.696 13.072 13.437 13.737 13.913 13.872 13.241 11.967 10.707 9.468 8.254 7.114 6.063 5.085 4.206 3.265 2.454 1.759 1.103 0.462 -0.146 -0.699 -1.279 -1.791 -2.229 -2.694 -3.187 -3.599 -4.031 -4.484 -4.827 -5.172 -5.555 -5.965 -6.385 -6.678 -6.997 -7.491 -7.82 -8.166 -8.351 -8.735 -9.125 -9.53 -9.753 -10.15 -10.5 -10.784 -11.062 -11.662 -12.027 -12.408 -12.845 -13.332 -13.914 -14.691 -16.743 -8 ,9368 ,KEBNE ,16750587,Thu Dec 2 09:22:49 CET,Thu Dec 2 11:00:34 CET,0.0 1.803 2.372 2.814 3.195 3.537 3.844 4.111 4.58 4.794 4.991 5.186 5.503 5.666 5.977 6.267 6.54 6.672 6.919 7.149 7.461 7.648 7.82 8.064 8.301 8.544 8.785 9.013 9.293 9.551 9.806 10.105 10.388 10.646 10.929 11.255 11.549 11.85 12.179 12.512 12.835 13.197 13.606 13.985 14.377 14.73 15.048 15.298 15.465 15.431 14.824 13.49 12.092 10.775 9.519 8.313 7.21 6.214 5.365 4.487 3.711 3.016 2.346 1.726 1.133 0.566 -0.037 -0.566 -1.014 -1.478 -1.952 -2.357 -2.785 -3.25 -3.627 -4.024 -4.425 -4.814 -5.222 -5.515 -5.822 -6.319 -6.653 -6.988 -7.168 -7.56 -7.979 -8.422 -8.656 -9.062 -9.402 -9.645 -9.91 -10.536 -10.888 -11.274 -11.702 -12.219 -12.871 -13.672 -15.971 -9 ,12487 ,KEBNE ,16750588,Thu Dec 2 09:23:52 CET,Thu Dec 2 11:01:32 CET,0.0 1.175 1.792 2.257 2.631 2.958 3.242 3.471 3.849 4.027 4.196 4.356 4.661 4.82 5.117 5.379 5.609 5.719 5.94 6.148 6.425 6.601 6.786 7.055 7.291 7.504 7.712 7.935 8.21 8.446 8.671 8.945 9.195 9.432 9.71 10.016 10.312 10.62 10.925 11.22 11.533 11.892 12.266 12.598 12.984 13.315 13.563 13.807 13.927 13.686 12.968 11.638 10.137 8.801 7.616 6.441 5.387 4.429 3.559 2.669 1.914 1.258 0.612 -0.038 -0.657 -1.205 -1.757 -2.263 -2.73 -3.227 -3.744 -4.19 -4.648 -5.094 -5.444 -5.825 -6.224 -6.625 -7.04 -7.336 -7.649 -8.119 -8.442 -8.779 -8.958 -9.348 -9.759 -10.202 -10.433 -10.83 -11.207 -11.497 -11.795 -12.433 -12.779 -13.176 -13.652 -14.243 -14.896 -15.727 -18.487 -10 ,4166 ,KEBNE ,16750589,Thu Dec 2 09:24:58 CET,Thu Dec 2 10:58:51 CET,0.0 1.474 2.023 2.486 2.88 3.208 3.492 3.735 4.159 4.347 4.523 4.703 5.017 5.16 5.439 5.7 5.933 6.042 6.244 6.435 6.708 6.886 7.061 7.315 7.562 7.794 8.004 8.207 8.464 8.707 8.935 9.2 9.467 9.721 9.996 10.303 10.606 10.936 11.254 11.575 11.902 12.226 12.549 12.847 13.174 13.514 13.823 14.047 14.166 13.949 12.95 11.337 9.818 8.391 7.121 5.944 4.898 3.925 3.093 2.266 1.504 0.813 0.17 -0.427 -1.002 -1.551 -2.146 -2.672 -3.117 -3.576 -4.059 -4.476 -4.914 -5.389 -5.762 -6.139 -6.539 -6.953 -7.383 -7.672 -7.966 -8.449 -8.809 -9.185 -9.378 -9.803 -10.24 -10.707 -10.946 -11.341 -11.673 -11.939 -12.228 -12.873 -13.231 -13.602 -14.007 -14.483 -15.06 -15.87 -18.675 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 048f2e99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25911 ,KEBNE ,16750590,Thu Dec 2 09:26:00 CET,Thu Dec 2 11:06:37 CET,0.0 0.769 1.221 1.578 1.856 2.069 2.283 2.488 2.853 3.024 3.184 3.324 3.623 3.77 4.056 4.308 4.535 4.645 4.875 5.091 5.381 5.568 5.751 6.023 6.277 6.512 6.747 6.98 7.277 7.556 7.818 8.142 8.457 8.748 9.081 9.458 9.814 10.2 10.606 11.036 11.478 11.948 12.472 12.977 13.603 14.295 14.993 15.64 16.242 16.743 16.933 16.515 15.806 15.028 14.275 13.519 12.804 12.147 11.559 10.933 10.383 9.879 9.389 8.923 8.473 8.036 7.56 7.131 6.754 6.364 5.964 5.635 5.294 4.908 4.594 4.287 3.982 3.659 3.305 3.049 2.784 2.367 2.073 1.753 1.588 1.27 0.916 0.517 0.321 -0.021 -0.299 -0.521 -0.748 -1.26 -1.553 -1.879 -2.29 -2.806 -3.406 -4.111 -6.207 -2 ,18756 ,KEBNE ,16750591,Thu Dec 2 09:28:08 CET,Thu Dec 2 11:07:33 CET,0.0 0.731 1.159 1.492 1.748 1.979 2.205 2.406 2.767 2.928 3.091 3.246 3.538 3.687 3.98 4.249 4.492 4.603 4.824 5.033 5.305 5.487 5.663 5.917 6.156 6.378 6.589 6.789 7.048 7.292 7.533 7.833 8.104 8.356 8.652 9.002 9.328 9.661 10.031 10.414 10.799 11.228 11.745 12.252 12.815 13.444 14.181 14.976 15.765 16.448 16.872 16.667 16.052 15.203 14.332 13.506 12.774 12.067 11.424 10.738 10.111 9.576 9.078 8.574 8.081 7.654 7.191 6.757 6.382 5.993 5.58 5.236 4.872 4.487 4.179 3.853 3.517 3.175 2.836 2.602 2.355 1.955 1.673 1.368 1.207 0.889 0.539 0.152 -0.039 -0.388 -0.695 -0.942 -1.188 -1.77 -2.096 -2.43 -2.798 -3.18 -3.665 -4.351 -6.548 -3 ,22292 ,KEBNE ,16750592,Thu Dec 2 09:28:10 CET,Thu Dec 2 11:07:51 CET,0.0 0.778 1.151 1.446 1.685 1.904 2.099 2.276 2.604 2.758 2.915 3.067 3.354 3.494 3.76 3.994 4.227 4.337 4.556 4.792 5.112 5.297 5.482 5.758 6.014 6.253 6.487 6.718 7.003 7.261 7.512 7.818 8.116 8.406 8.737 9.107 9.445 9.799 10.186 10.572 10.964 11.4 11.902 12.384 12.892 13.441 14.041 14.626 15.248 15.789 15.957 15.537 14.879 14.185 13.493 12.775 12.089 11.416 10.783 10.101 9.519 9.014 8.518 8.035 7.566 7.132 6.671 6.267 5.911 5.529 5.138 4.81 4.465 4.113 3.835 3.53 3.211 2.894 2.571 2.328 2.071 1.677 1.399 1.108 0.955 0.621 0.283 -0.042 -0.222 -0.584 -0.899 -1.14 -1.408 -1.999 -2.312 -2.671 -3.075 -3.521 -4.052 -4.843 -6.728 -4 ,19164 ,KEBNE ,16750593,Thu Dec 2 09:29:13 CET,Thu Dec 2 11:06:58 CET,0.0 0.621 1.008 1.328 1.588 1.816 2.022 2.206 2.557 2.726 2.877 2.991 3.278 3.403 3.637 3.874 4.105 4.218 4.437 4.65 4.966 5.166 5.356 5.628 5.883 6.137 6.387 6.628 6.933 7.219 7.492 7.814 8.123 8.417 8.747 9.12 9.483 9.863 10.269 10.685 11.085 11.543 12.098 12.643 13.224 13.845 14.537 15.205 15.856 16.464 16.852 16.664 16.143 15.511 14.851 14.167 13.47 12.784 12.159 11.492 10.909 10.393 9.894 9.418 8.954 8.523 8.066 7.663 7.326 6.964 6.562 6.21 5.838 5.441 5.143 4.833 4.507 4.173 3.814 3.557 3.289 2.874 2.584 2.282 2.13 1.829 1.51 1.149 0.955 0.61 0.35 0.133 -0.106 -0.623 -0.921 -1.234 -1.569 -1.98 -2.49 -3.145 -5.255 -5 ,5440 ,KEBNE ,16750594,Thu Dec 2 09:29:15 CET,Thu Dec 2 11:04:45 CET,0.0 0.914 1.388 1.728 2.01 2.236 2.44 2.633 2.977 3.139 3.294 3.422 3.712 3.844 4.081 4.308 4.527 4.634 4.832 5.02 5.297 5.472 5.643 5.879 6.097 6.319 6.534 6.735 7.004 7.277 7.53 7.82 8.101 8.387 8.724 9.076 9.417 9.783 10.148 10.532 10.922 11.35 11.858 12.358 12.928 13.54 14.184 14.82 15.436 15.929 16.128 15.729 15.056 14.31 13.584 12.864 12.188 11.547 10.973 10.36 9.8 9.274 8.728 8.2 7.708 7.263 6.808 6.405 6.038 5.656 5.272 4.93 4.556 4.167 3.866 3.556 3.224 2.877 2.512 2.251 1.975 1.549 1.25 0.93 0.758 0.409 0.073 -0.27 -0.452 -0.784 -1.042 -1.276 -1.517 -2.069 -2.389 -2.728 -3.127 -3.597 -4.1 -4.744 -6.25 -6 ,18092 ,KEBNE ,16750595,Thu Dec 2 09:31:20 CET,Thu Dec 2 11:09:29 CET,0.0 0.855 1.231 1.522 1.769 1.995 2.217 2.406 2.738 2.896 3.054 3.195 3.488 3.637 3.9 4.144 4.386 4.495 4.697 4.898 5.19 5.38 5.567 5.834 6.09 6.336 6.568 6.792 7.072 7.334 7.595 7.911 8.213 8.51 8.845 9.2 9.545 9.917 10.308 10.722 11.165 11.679 12.252 12.8 13.398 14.004 14.669 15.351 16.012 16.599 16.951 16.592 15.874 15.089 14.334 13.599 12.921 12.234 11.589 10.923 10.349 9.843 9.36 8.897 8.442 8.019 7.568 7.149 6.776 6.384 5.986 5.661 5.31 4.936 4.642 4.341 4.029 3.687 3.325 3.086 2.834 2.413 2.113 1.807 1.654 1.349 1.029 0.656 0.453 0.098 -0.181 -0.406 -0.654 -1.204 -1.503 -1.852 -2.258 -2.7 -3.245 -3.98 -5.962 -7 ,5500 ,KEBNE ,16750596,Thu Dec 2 09:31:20 CET,Thu Dec 2 11:06:50 CET,0.0 0.586 0.993 1.299 1.551 1.798 2.026 2.22 2.571 2.737 2.903 3.05 3.339 3.484 3.775 4.042 4.291 4.407 4.623 4.824 5.102 5.283 5.462 5.718 5.959 6.193 6.424 6.641 6.903 7.161 7.42 7.727 8.004 8.273 8.604 8.967 9.289 9.63 9.993 10.387 10.807 11.258 11.758 12.243 12.759 13.322 13.97 14.598 15.207 15.742 16.004 15.645 14.945 14.186 13.432 12.668 11.984 11.308 10.702 10.116 9.561 9.035 8.524 8.048 7.591 7.159 6.708 6.284 5.922 5.557 5.155 4.807 4.438 4.068 3.777 3.453 3.129 2.811 2.472 2.225 1.968 1.561 1.267 0.951 0.786 0.453 0.11 -0.254 -0.445 -0.798 -1.087 -1.331 -1.601 -2.185 -2.525 -2.872 -3.226 -3.686 -4.263 -4.933 -7.08 -8 ,13446 ,KEBNE ,16750597,Thu Dec 2 09:32:25 CET,Thu Dec 2 11:10:52 CET,0.0 0.939 1.348 1.664 1.925 2.153 2.373 2.586 2.963 3.138 3.294 3.452 3.758 3.901 4.182 4.432 4.673 4.792 5.016 5.233 5.538 5.721 5.9 6.157 6.396 6.617 6.831 7.041 7.297 7.54 7.783 8.09 8.365 8.603 8.884 9.207 9.503 9.817 10.165 10.537 10.915 11.33 11.788 12.257 12.791 13.346 13.914 14.509 15.219 15.96 16.451 16.271 15.789 15.168 14.394 13.523 12.733 12.035 11.415 10.768 10.205 9.682 9.173 8.649 8.142 7.71 7.24 6.799 6.426 6.043 5.63 5.28 4.916 4.542 4.256 3.968 3.678 3.363 3.028 2.792 2.534 2.106 1.809 1.518 1.375 1.068 0.71 0.329 0.134 -0.21 -0.48 -0.711 -0.957 -1.498 -1.797 -2.108 -2.461 -2.878 -3.39 -4.097 -5.858 -9 ,11108 ,KEBNE ,16750598,Thu Dec 2 09:32:25 CET,Thu Dec 2 11:10:50 CET,0.0 0.898 1.329 1.642 1.885 2.09 2.278 2.472 2.835 2.99 3.135 3.272 3.566 3.707 3.978 4.227 4.453 4.562 4.777 4.992 5.295 5.483 5.662 5.918 6.154 6.376 6.601 6.823 7.106 7.383 7.648 7.95 8.247 8.543 8.881 9.261 9.627 10.028 10.441 10.869 11.301 11.799 12.421 12.991 13.593 14.249 14.958 15.688 16.471 17.229 17.714 17.467 16.801 16.033 15.298 14.559 13.856 13.186 12.576 11.93 11.346 10.804 10.265 9.748 9.269 8.845 8.394 7.974 7.593 7.184 6.778 6.434 6.06 5.684 5.389 5.068 4.737 4.411 4.064 3.812 3.537 3.103 2.815 2.502 2.332 1.983 1.616 1.229 1.02 0.643 0.331 0.101 -0.137 -0.664 -0.96 -1.285 -1.652 -2.085 -2.644 -3.316 -5.211 -10 ,181 ,KEBNE ,16750599,Thu Dec 2 09:33:28 CET,Thu Dec 2 11:12:15 CET,0.0 0.811 1.282 1.628 1.898 2.137 2.356 2.564 2.949 3.123 3.288 3.43 3.72 3.859 4.121 4.367 4.602 4.714 4.936 5.151 5.459 5.665 5.866 6.162 6.44 6.682 6.904 7.133 7.443 7.737 8.011 8.33 8.635 8.923 9.264 9.654 10.017 10.393 10.789 11.207 11.632 12.077 12.563 13.052 13.598 14.152 14.776 15.508 16.289 17.013 17.494 17.196 16.478 15.666 14.878 14.095 13.329 12.615 12.016 11.405 10.866 10.362 9.848 9.345 8.867 8.412 7.917 7.468 7.082 6.708 6.336 6.014 5.662 5.287 5.006 4.714 4.402 4.079 3.735 3.49 3.236 2.823 2.525 2.209 2.043 1.716 1.387 1.044 0.849 0.487 0.168 -0.081 -0.341 -0.885 -1.204 -1.55 -1.905 -2.353 -2.923 -3.676 -5.593 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt deleted file mode 100644 index 5da2d566..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8909 ,TETRA ,17699182,Sat Dec 4 17:22:55 CET,Sat Dec 4 19:06:07 CET,0.0 0.196 0.302 0.383 0.47 0.563 0.644 0.727 0.887 0.964 1.034 0.979 1.235 1.3 1.433 1.568 1.693 1.751 1.862 1.967 2.119 2.218 2.316 2.456 2.597 2.735 2.866 3.004 3.186 3.359 3.536 3.76 3.964 4.151 4.37 4.618 4.856 5.138 5.447 5.773 6.126 6.548 7.065 7.577 8.18 8.893 9.758 10.771 11.989 13.499 15.393 16.952 17.893 18.531 18.983 19.309 19.517 19.63 19.683 19.705 19.708 19.699 19.665 19.624 19.602 19.568 19.508 19.43 19.35 19.281 19.212 19.146 19.058 18.961 18.902 18.85 18.773 18.676 18.59 18.527 18.456 18.347 18.269 18.194 18.154 18.066 17.966 17.852 17.795 17.569 17.604 17.542 17.474 17.292 17.189 17.082 16.961 16.839 16.691 16.441 15.71 -2 ,120 ,TETRA ,17699183,Sat Dec 4 17:22:55 CET,Sat Dec 4 19:16:26 CET,0.0 0.186 0.29 0.373 0.451 0.532 0.62 0.697 0.814 0.876 0.951 0.903 1.146 1.206 1.333 1.441 1.535 1.582 1.686 1.789 1.928 2.02 2.115 2.249 2.386 2.523 2.653 2.789 2.967 3.142 3.318 3.528 3.73 3.927 4.15 4.413 4.682 4.979 5.32 5.702 6.106 6.571 7.097 7.614 8.236 8.943 9.785 10.752 11.949 13.446 15.287 16.875 17.842 18.474 18.895 19.163 19.362 19.509 19.562 19.582 19.588 19.576 19.56 19.533 19.483 19.426 19.376 19.331 19.28 19.21 19.133 19.069 18.989 18.903 18.839 18.763 18.686 18.597 18.502 18.446 18.375 18.251 18.162 18.069 18.023 17.932 17.827 17.716 17.662 17.44 17.474 17.396 17.306 17.118 17.013 16.872 16.707 16.556 16.375 16.144 15.421 -3 ,29052 ,TETRA ,17699184,Sat Dec 4 17:22:57 CET,Sat Dec 4 19:17:59 CET,0.0 0.191 0.378 0.518 0.62 0.702 0.774 0.84 0.952 1.007 1.061 0.982 1.23 1.293 1.413 1.532 1.661 1.72 1.827 1.932 2.077 2.177 2.274 2.413 2.554 2.695 2.832 2.965 3.133 3.29 3.453 3.665 3.865 4.05 4.27 4.529 4.784 5.075 5.397 5.742 6.115 6.542 7.031 7.569 8.205 8.891 9.749 10.755 11.991 13.52 15.417 16.957 17.904 18.579 18.996 19.252 19.434 19.55 19.602 19.642 19.665 19.646 19.603 19.556 19.499 19.423 19.341 19.265 19.19 19.111 19.032 18.967 18.892 18.813 18.75 18.679 18.59 18.506 18.436 18.381 18.321 18.209 18.127 18.048 18.005 17.92 17.835 17.721 17.662 17.44 17.461 17.389 17.307 17.122 17.032 16.92 16.781 16.636 16.499 16.297 15.45 -4 ,14899 ,TETRA ,17699185,Sat Dec 4 17:22:59 CET,Sat Dec 4 19:17:20 CET,0.0 0.284 0.41 0.515 0.606 0.699 0.788 0.866 1.003 1.068 1.134 1.087 1.336 1.393 1.515 1.633 1.745 1.798 1.914 2.028 2.187 2.292 2.388 2.519 2.652 2.785 2.911 3.04 3.215 3.381 3.545 3.749 3.947 4.132 4.355 4.612 4.863 5.151 5.466 5.803 6.181 6.628 7.151 7.707 8.353 9.056 9.878 10.84 12.037 13.527 15.49 17.202 18.217 18.826 19.17 19.394 19.556 19.657 19.691 19.706 19.713 19.713 19.7 19.672 19.643 19.605 19.563 19.509 19.455 19.404 19.333 19.267 19.201 19.139 19.083 19.014 18.947 18.875 18.8 18.747 18.675 18.562 18.487 18.417 18.373 18.259 18.163 18.077 18.022 17.795 17.805 17.706 17.617 17.432 17.31 17.182 17.046 16.895 16.708 16.411 15.604 -5 ,28884 ,TETRA ,17699186,Sat Dec 4 17:22:55 CET,Sat Dec 4 19:06:09 CET,0.0 0.154 0.255 0.361 0.452 0.536 0.623 0.707 0.85 0.908 0.975 0.942 1.203 1.268 1.377 1.487 1.605 1.659 1.766 1.877 2.038 2.142 2.239 2.374 2.518 2.655 2.784 2.921 3.097 3.266 3.432 3.632 3.83 4.032 4.264 4.524 4.778 5.071 5.4 5.767 6.157 6.594 7.12 7.658 8.312 9.037 9.898 10.893 12.099 13.612 15.488 17.177 18.194 18.831 19.26 19.557 19.761 19.906 20.0 20.066 20.08 20.076 20.074 20.044 20.002 19.965 19.901 19.839 19.77 19.681 19.593 19.512 19.44 19.359 19.286 19.215 19.143 19.058 18.976 18.926 18.867 18.766 18.683 18.591 18.545 18.459 18.357 18.244 18.178 17.939 17.929 17.841 17.765 17.566 17.443 17.33 17.197 17.023 16.764 16.421 15.566 -6 ,23238 ,TETRA ,17699187,Sat Dec 4 17:26:51 CET,Sat Dec 4 19:11:12 CET,0.0 0.176 0.266 0.366 0.458 0.532 0.604 0.678 0.807 0.874 0.953 0.914 1.171 1.233 1.347 1.452 1.561 1.619 1.739 1.852 2.012 2.117 2.217 2.369 2.526 2.675 2.815 2.96 3.159 3.35 3.517 3.714 3.894 4.072 4.304 4.574 4.839 5.137 5.477 5.836 6.199 6.625 7.137 7.667 8.309 9.047 9.952 11.0 12.221 13.751 15.71 17.28 18.192 18.838 19.268 19.576 19.783 19.891 19.935 19.962 19.977 19.974 19.96 19.952 19.931 19.887 19.829 19.776 19.732 19.687 19.63 19.566 19.498 19.422 19.349 19.28 19.226 19.166 19.089 19.034 18.972 18.858 18.77 18.666 18.611 18.504 18.383 18.249 18.189 17.965 17.981 17.909 17.833 17.649 17.551 17.431 17.287 17.112 16.873 16.554 15.648 -7 ,368 ,TETRA ,17699188,Sat Dec 4 17:26:51 CET,Sat Dec 4 19:10:00 CET,0.0 0.321 0.458 0.574 0.67 0.749 0.816 0.891 1.046 1.117 1.185 1.125 1.373 1.434 1.555 1.664 1.765 1.814 1.923 2.027 2.172 2.273 2.366 2.509 2.648 2.783 2.925 3.063 3.232 3.401 3.569 3.768 3.968 4.184 4.444 4.722 4.984 5.275 5.591 5.923 6.283 6.719 7.231 7.754 8.385 9.097 9.96 10.962 12.151 13.615 15.513 17.147 18.082 18.684 19.134 19.467 19.669 19.793 19.844 19.84 19.818 19.801 19.786 19.761 19.715 19.668 19.622 19.562 19.504 19.44 19.362 19.289 19.209 19.127 19.068 19.01 18.945 18.865 18.777 18.72 18.663 18.567 18.49 18.412 18.376 18.299 18.211 18.111 18.04 17.799 17.825 17.755 17.669 17.466 17.354 17.228 17.098 16.956 16.759 16.45 15.362 -8 ,7294 ,TETRA ,17699189,Sat Dec 4 17:26:51 CET,Sat Dec 4 19:21:24 CET,0.0 0.189 0.36 0.479 0.587 0.692 0.774 0.848 0.986 1.051 1.118 1.066 1.318 1.38 1.499 1.616 1.736 1.794 1.907 2.019 2.18 2.275 2.361 2.487 2.614 2.749 2.881 3.001 3.164 3.337 3.507 3.707 3.894 4.077 4.302 4.562 4.831 5.133 5.45 5.794 6.179 6.625 7.14 7.651 8.27 8.986 9.831 10.844 12.031 13.456 15.309 16.914 17.895 18.563 19.002 19.275 19.437 19.533 19.587 19.599 19.582 19.562 19.547 19.516 19.471 19.433 19.385 19.326 19.269 19.194 19.122 19.065 19.004 18.945 18.887 18.808 18.718 18.61 18.501 18.43 18.35 18.228 18.146 18.056 18.009 17.924 17.813 17.659 17.592 17.359 17.369 17.285 17.191 16.935 16.806 16.693 16.544 16.356 16.163 15.918 15.103 -9 ,4389 ,TETRA ,17699190,Sat Dec 4 17:26:51 CET,Sat Dec 4 19:21:15 CET,0.0 0.174 0.318 0.448 0.535 0.608 0.675 0.744 0.875 0.936 1.0 0.95 1.205 1.267 1.397 1.523 1.64 1.698 1.822 1.938 2.093 2.199 2.301 2.455 2.598 2.729 2.857 2.982 3.148 3.309 3.469 3.671 3.863 4.052 4.285 4.547 4.794 5.08 5.406 5.758 6.151 6.589 7.096 7.632 8.257 8.971 9.808 10.808 12.006 13.428 15.233 16.778 17.716 18.318 18.66 18.852 18.999 19.117 19.194 19.248 19.245 19.218 19.194 19.165 19.122 19.074 19.026 18.981 18.932 18.866 18.801 18.737 18.652 18.562 18.505 18.448 18.383 18.307 18.217 18.157 18.094 17.979 17.895 17.819 17.782 17.697 17.604 17.504 17.449 17.226 17.278 17.218 17.146 16.956 16.844 16.726 16.587 16.403 16.2 15.942 15.175 -10 ,7494 ,TETRA ,17699191,Sat Dec 4 17:26:51 CET,Sat Dec 4 19:10:25 CET,0.0 0.181 0.292 0.387 0.473 0.541 0.614 0.684 0.811 0.873 0.934 0.862 1.112 1.18 1.305 1.424 1.536 1.589 1.694 1.8 1.951 2.052 2.156 2.306 2.455 2.6 2.738 2.865 3.031 3.211 3.382 3.583 3.779 3.965 4.192 4.462 4.736 5.029 5.354 5.714 6.089 6.514 7.036 7.582 8.198 8.883 9.708 10.679 11.866 13.377 15.263 16.834 17.728 18.255 18.598 18.836 19.02 19.137 19.188 19.215 19.198 19.159 19.147 19.135 19.091 19.038 18.98 18.914 18.861 18.809 18.739 18.669 18.602 18.527 18.458 18.392 18.334 18.275 18.205 18.147 18.076 17.962 17.885 17.803 17.758 17.654 17.545 17.442 17.39 17.172 17.204 17.116 17.018 16.824 16.717 16.585 16.433 16.246 15.996 15.678 15.038 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1a.txt deleted file mode 100644 index 97405438..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6069 ,TETRA ,17699192,Sat Dec 4 17:26:51 CET,Sat Dec 4 19:21:52 CET,0.0 0.172 0.285 0.376 0.451 0.52 0.596 0.674 0.81 0.869 0.928 0.858 1.081 1.132 1.232 1.334 1.423 1.463 1.541 1.606 1.709 1.785 1.864 1.989 2.107 2.209 2.305 2.403 2.536 2.664 2.797 2.959 3.109 3.253 3.419 3.606 3.787 3.993 4.218 4.448 4.698 4.986 5.308 5.628 6.005 6.451 6.976 7.534 8.19 8.994 9.932 10.564 10.794 10.828 10.795 10.736 10.633 10.491 10.307 10.101 9.933 9.803 9.665 9.483 9.3 9.151 9.018 8.882 8.742 8.603 8.453 8.32 8.174 8.035 7.938 7.822 7.672 7.51 7.352 7.228 7.087 6.894 6.771 6.623 6.551 6.426 6.274 6.072 5.966 5.696 5.635 5.523 5.409 5.176 5.04 4.872 4.643 4.374 4.07 3.625 1.339 -2 ,24492 ,TETRA ,17699193,Sat Dec 4 17:26:52 CET,Sat Dec 4 19:24:41 CET,0.0 0.239 0.355 0.444 0.526 0.605 0.665 0.721 0.821 0.87 0.921 0.848 1.068 1.116 1.2 1.278 1.36 1.403 1.485 1.557 1.658 1.723 1.784 1.88 1.983 2.075 2.162 2.248 2.368 2.482 2.599 2.745 2.876 3.0 3.149 3.332 3.504 3.7 3.912 4.124 4.357 4.628 4.948 5.271 5.653 6.087 6.581 7.144 7.807 8.582 9.476 10.116 10.363 10.456 10.461 10.325 10.163 10.051 9.942 9.815 9.71 9.624 9.51 9.363 9.217 9.06 8.892 8.753 8.623 8.495 8.368 8.252 8.133 8.01 7.905 7.793 7.677 7.536 7.377 7.275 7.17 7.006 6.891 6.775 6.717 6.579 6.452 6.32 6.228 5.964 5.917 5.821 5.703 5.437 5.288 5.105 4.875 4.598 4.273 3.675 1.155 -3 ,6565 ,TETRA ,17699194,Sat Dec 4 17:26:52 CET,Sat Dec 4 19:21:52 CET,0.0 0.091 0.159 0.225 0.297 0.364 0.431 0.515 0.691 0.764 0.821 0.749 0.974 1.025 1.124 1.216 1.308 1.357 1.457 1.54 1.658 1.73 1.794 1.892 1.997 2.101 2.192 2.284 2.412 2.531 2.646 2.784 2.917 3.047 3.202 3.378 3.545 3.733 3.95 4.188 4.425 4.674 4.973 5.288 5.666 6.103 6.601 7.174 7.846 8.598 9.472 10.106 10.376 10.473 10.475 10.42 10.331 10.208 10.071 9.911 9.755 9.62 9.486 9.348 9.222 9.098 8.944 8.801 8.679 8.558 8.431 8.321 8.178 8.013 7.874 7.73 7.572 7.406 7.271 7.169 7.06 6.883 6.734 6.584 6.513 6.348 6.173 6.001 5.899 5.626 5.57 5.441 5.293 4.961 4.795 4.655 4.485 4.237 3.935 3.427 1.59 -4 ,14986 ,TETRA ,17699195,Sat Dec 4 17:26:52 CET,Sat Dec 4 19:14:27 CET,0.0 0.51 0.627 0.714 0.789 0.861 0.932 0.998 1.131 1.199 1.26 1.198 1.424 1.473 1.57 1.658 1.734 1.777 1.866 1.948 2.059 2.136 2.221 2.342 2.453 2.554 2.645 2.737 2.859 2.968 3.09 3.246 3.391 3.531 3.684 3.857 4.043 4.248 4.456 4.681 4.937 5.24 5.585 5.922 6.328 6.785 7.3 7.862 8.541 9.376 10.278 10.907 11.21 11.319 11.317 11.236 11.169 11.074 10.91 10.756 10.642 10.497 10.341 10.201 10.073 9.962 9.816 9.654 9.511 9.369 9.243 9.125 8.984 8.83 8.712 8.596 8.452 8.294 8.128 7.999 7.868 7.679 7.543 7.392 7.317 7.18 7.051 6.913 6.832 6.568 6.529 6.416 6.287 6.032 5.898 5.715 5.488 5.247 4.947 4.478 2.888 -5 ,21126 ,TETRA ,17699196,Sat Dec 4 17:26:52 CET,Sat Dec 4 19:25:33 CET,0.0 0.275 0.391 0.484 0.553 0.632 0.713 0.771 0.869 0.923 0.984 0.924 1.148 1.192 1.272 1.365 1.459 1.5 1.582 1.669 1.805 1.887 1.96 2.074 2.186 2.291 2.395 2.49 2.604 2.72 2.834 2.97 3.104 3.233 3.381 3.549 3.721 3.91 4.115 4.338 4.583 4.861 5.191 5.541 5.946 6.378 6.876 7.468 8.18 8.994 9.933 10.57 10.792 10.847 10.832 10.773 10.7 10.608 10.486 10.33 10.181 10.035 9.886 9.757 9.64 9.506 9.351 9.209 9.092 8.971 8.841 8.736 8.613 8.464 8.347 8.229 8.097 7.964 7.836 7.746 7.646 7.484 7.376 7.257 7.188 7.028 6.852 6.693 6.608 6.336 6.284 6.181 6.072 5.839 5.695 5.529 5.307 5.067 4.784 4.427 2.939 -6 ,25738 ,TETRA ,17699197,Sat Dec 4 17:26:55 CET,Sat Dec 4 19:12:10 CET,0.0 0.329 0.426 0.503 0.597 0.676 0.737 0.799 0.915 0.97 1.027 0.959 1.181 1.226 1.309 1.389 1.469 1.508 1.588 1.676 1.805 1.878 1.952 2.06 2.162 2.262 2.36 2.459 2.576 2.679 2.783 2.923 3.064 3.198 3.357 3.538 3.715 3.916 4.133 4.35 4.574 4.838 5.161 5.489 5.864 6.313 6.846 7.414 8.072 8.841 9.718 10.403 10.767 10.926 10.94 10.893 10.789 10.659 10.547 10.418 10.297 10.181 10.031 9.887 9.769 9.644 9.516 9.399 9.292 9.166 9.009 8.888 8.77 8.638 8.543 8.436 8.31 8.192 8.072 7.978 7.882 7.737 7.626 7.504 7.442 7.329 7.227 7.114 7.04 6.792 6.77 6.673 6.571 6.36 6.234 6.045 5.812 5.591 5.327 4.882 3.071 -7 ,18125 ,TETRA ,17699198,Sat Dec 4 17:26:52 CET,Sat Dec 4 19:12:55 CET,0.0 0.165 0.261 0.365 0.457 0.546 0.616 0.663 0.758 0.809 0.86 0.778 1.004 1.046 1.111 1.185 1.263 1.298 1.371 1.441 1.539 1.602 1.67 1.776 1.871 1.968 2.074 2.182 2.311 2.419 2.526 2.673 2.814 2.947 3.094 3.265 3.442 3.638 3.848 4.071 4.301 4.559 4.866 5.181 5.555 5.966 6.461 7.036 7.706 8.47 9.345 10.005 10.206 10.205 10.172 10.082 9.964 9.841 9.7 9.542 9.398 9.247 9.107 8.98 8.852 8.688 8.502 8.363 8.224 8.06 7.908 7.79 7.66 7.511 7.388 7.268 7.155 7.031 6.874 6.768 6.664 6.486 6.365 6.249 6.192 6.057 5.876 5.681 5.588 5.323 5.239 5.11 5.01 4.825 4.697 4.513 4.336 4.134 3.829 3.396 1.553 -8 ,20205 ,TETRA ,17699199,Sat Dec 4 17:26:52 CET,Sat Dec 4 19:12:30 CET,0.0 0.335 0.461 0.602 0.715 0.798 0.877 0.961 1.097 1.153 1.205 1.134 1.36 1.408 1.511 1.6 1.681 1.723 1.807 1.886 1.998 2.075 2.152 2.261 2.365 2.478 2.585 2.674 2.796 2.91 3.029 3.18 3.331 3.48 3.636 3.809 3.983 4.185 4.388 4.599 4.846 5.141 5.479 5.805 6.185 6.625 7.138 7.726 8.416 9.237 10.242 10.999 11.325 11.465 11.509 11.498 11.431 11.344 11.24 11.105 10.973 10.846 10.72 10.585 10.451 10.32 10.171 10.038 9.928 9.813 9.698 9.586 9.452 9.289 9.158 9.042 8.906 8.762 8.625 8.526 8.418 8.248 8.107 7.953 7.885 7.743 7.574 7.368 7.262 6.996 6.964 6.849 6.719 6.386 6.183 5.977 5.742 5.508 5.213 4.747 3.238 -9 ,25514 ,TETRA ,17699200,Sat Dec 4 17:26:52 CET,Sat Dec 4 19:13:03 CET,0.0 0.105 0.22 0.32 0.393 0.468 0.546 0.616 0.75 0.812 0.868 0.808 1.04 1.089 1.195 1.303 1.393 1.433 1.514 1.605 1.717 1.783 1.859 1.971 2.083 2.193 2.296 2.407 2.547 2.668 2.779 2.924 3.079 3.228 3.397 3.574 3.748 3.957 4.182 4.42 4.676 4.96 5.283 5.609 6.016 6.489 7.018 7.604 8.306 9.144 10.128 10.776 11.046 11.147 11.115 11.073 11.004 10.89 10.753 10.604 10.484 10.364 10.234 10.109 9.991 9.868 9.701 9.548 9.41 9.256 9.112 8.992 8.855 8.705 8.591 8.473 8.355 8.241 8.11 8.008 7.906 7.729 7.616 7.492 7.414 7.269 7.104 6.894 6.786 6.521 6.459 6.342 6.226 5.945 5.782 5.602 5.4 5.163 4.882 4.446 2.646 -10 ,20436 ,TETRA ,17699201,Sat Dec 4 17:26:52 CET,Sat Dec 4 19:12:40 CET,0.0 0.185 0.313 0.407 0.491 0.58 0.663 0.733 0.861 0.918 0.983 0.941 1.172 1.216 1.307 1.399 1.476 1.515 1.592 1.663 1.779 1.855 1.924 2.033 2.132 2.228 2.33 2.432 2.553 2.671 2.792 2.937 3.08 3.22 3.374 3.546 3.733 3.937 4.135 4.352 4.6 4.881 5.224 5.564 5.945 6.378 6.88 7.474 8.199 9.001 9.92 10.59 10.922 11.039 11.024 10.97 10.878 10.767 10.629 10.458 10.307 10.131 9.928 9.765 9.621 9.462 9.278 9.114 8.968 8.798 8.614 8.488 8.373 8.238 8.119 7.988 7.872 7.737 7.574 7.475 7.373 7.201 7.086 6.961 6.898 6.763 6.591 6.388 6.285 6.014 5.94 5.812 5.651 5.269 5.09 4.898 4.667 4.408 4.115 3.619 1.581 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1b.txt deleted file mode 100644 index 488fb4b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18700 ,TETRA ,17699202,Sat Dec 4 17:26:53 CET,Sat Dec 4 19:13:30 CET,0.0 0.439 0.627 0.762 0.872 0.965 1.039 1.109 1.241 1.3 1.353 1.272 1.493 1.541 1.65 1.758 1.846 1.887 1.969 2.044 2.149 2.219 2.288 2.383 2.467 2.539 2.608 2.675 2.767 2.855 2.943 3.045 3.136 3.22 3.312 3.406 3.502 3.61 3.722 3.825 3.928 4.036 4.129 4.19 4.239 4.287 4.303 4.257 4.093 3.71 2.915 1.819 0.849 -0.002 -0.776 -1.473 -2.09 -2.662 -3.157 -3.632 -4.031 -4.385 -4.722 -5.067 -5.391 -5.673 -5.975 -6.241 -6.46 -6.692 -6.942 -7.146 -7.352 -7.568 -7.749 -7.93 -8.102 -8.292 -8.481 -8.605 -8.745 -8.97 -9.122 -9.286 -9.364 -9.529 -9.721 -9.926 -10.031 -10.324 -10.374 -10.508 -10.645 -10.925 -11.095 -11.273 -11.471 -11.703 -12.02 -12.378 -13.132 -2 ,6603 ,TETRA ,17699203,Sat Dec 4 17:26:53 CET,Sat Dec 4 19:24:48 CET,0.0 0.315 0.446 0.551 0.639 0.721 0.806 0.879 1.009 1.074 1.134 1.052 1.273 1.323 1.417 1.5 1.571 1.604 1.672 1.738 1.836 1.899 1.959 2.037 2.122 2.211 2.298 2.376 2.456 2.539 2.622 2.716 2.802 2.882 2.977 3.071 3.147 3.237 3.342 3.434 3.527 3.632 3.721 3.794 3.86 3.892 3.898 3.878 3.745 3.361 2.542 1.52 0.603 -0.227 -0.958 -1.62 -2.189 -2.704 -3.176 -3.668 -4.094 -4.465 -4.799 -5.101 -5.39 -5.649 -5.915 -6.173 -6.398 -6.611 -6.833 -7.028 -7.233 -7.455 -7.631 -7.796 -7.968 -8.151 -8.35 -8.509 -8.667 -8.88 -9.026 -9.185 -9.266 -9.425 -9.591 -9.766 -9.861 -10.162 -10.25 -10.382 -10.489 -10.705 -10.847 -11.018 -11.208 -11.428 -11.739 -12.186 -13.444 -3 ,12401 ,TETRA ,17699204,Sat Dec 4 17:28:36 CET,Sat Dec 4 19:15:22 CET,0.0 0.241 0.387 0.518 0.635 0.75 0.845 0.932 1.108 1.174 1.225 1.143 1.364 1.413 1.502 1.587 1.669 1.71 1.793 1.867 1.962 2.025 2.092 2.188 2.27 2.344 2.418 2.485 2.565 2.647 2.727 2.836 2.935 3.013 3.114 3.228 3.327 3.432 3.527 3.626 3.728 3.824 3.914 3.985 4.056 4.105 4.096 4.03 3.883 3.507 2.752 1.706 0.762 -0.085 -0.831 -1.516 -2.131 -2.682 -3.142 -3.607 -4.014 -4.37 -4.726 -5.06 -5.352 -5.621 -5.898 -6.153 -6.379 -6.612 -6.867 -7.074 -7.27 -7.464 -7.617 -7.789 -7.975 -8.162 -8.357 -8.5 -8.654 -8.903 -9.083 -9.266 -9.359 -9.541 -9.74 -9.953 -10.058 -10.355 -10.394 -10.512 -10.636 -10.931 -11.091 -11.262 -11.47 -11.704 -11.978 -12.348 -13.658 -4 ,3328 ,TETRA ,17699205,Sat Dec 4 17:26:53 CET,Sat Dec 4 19:23:58 CET,0.0 0.25 0.397 0.545 0.664 0.758 0.852 0.934 1.058 1.117 1.174 1.099 1.322 1.371 1.452 1.514 1.582 1.617 1.686 1.763 1.876 1.942 2.003 2.084 2.151 2.22 2.288 2.355 2.447 2.53 2.608 2.704 2.792 2.874 2.964 3.063 3.154 3.246 3.355 3.468 3.571 3.686 3.809 3.904 3.991 4.072 4.108 4.057 3.889 3.508 2.749 1.728 0.752 -0.174 -0.961 -1.616 -2.185 -2.728 -3.207 -3.671 -4.072 -4.443 -4.8 -5.125 -5.436 -5.731 -6.027 -6.281 -6.51 -6.74 -6.97 -7.172 -7.395 -7.631 -7.798 -7.978 -8.183 -8.388 -8.616 -8.769 -8.921 -9.157 -9.312 -9.469 -9.548 -9.724 -9.92 -10.111 -10.21 -10.503 -10.547 -10.66 -10.78 -11.1 -11.266 -11.475 -11.729 -12.028 -12.418 -12.975 -14.689 -5 ,4944 ,TETRA ,17699206,Sat Dec 4 17:26:53 CET,Sat Dec 4 19:14:06 CET,0.0 0.227 0.363 0.457 0.552 0.653 0.749 0.846 1.001 1.065 1.13 1.065 1.289 1.333 1.433 1.537 1.617 1.651 1.735 1.813 1.91 1.973 2.034 2.119 2.204 2.287 2.373 2.464 2.569 2.658 2.742 2.852 2.954 3.043 3.136 3.237 3.326 3.418 3.521 3.627 3.739 3.847 3.953 4.044 4.127 4.191 4.198 4.144 3.972 3.547 2.663 1.534 0.503 -0.429 -1.213 -1.911 -2.533 -3.099 -3.59 -4.049 -4.429 -4.781 -5.138 -5.468 -5.762 -6.046 -6.355 -6.611 -6.819 -7.059 -7.306 -7.496 -7.703 -7.924 -8.094 -8.28 -8.484 -8.692 -8.891 -9.026 -9.171 -9.393 -9.551 -9.713 -9.796 -9.98 -10.159 -10.352 -10.461 -10.756 -10.809 -10.94 -11.068 -11.361 -11.53 -11.708 -11.913 -12.159 -12.446 -12.888 -14.58 -6 ,19669 ,TETRA ,17699207,Sat Dec 4 17:26:53 CET,Sat Dec 4 19:13:57 CET,0.0 0.293 0.425 0.554 0.678 0.78 0.859 0.929 1.047 1.108 1.17 1.092 1.31 1.359 1.465 1.559 1.647 1.688 1.766 1.843 1.943 2.005 2.068 2.158 2.241 2.314 2.382 2.452 2.537 2.625 2.709 2.802 2.894 2.975 3.061 3.158 3.248 3.353 3.464 3.552 3.642 3.756 3.871 3.975 4.082 4.156 4.194 4.169 4.009 3.604 2.839 1.889 0.982 0.156 -0.563 -1.226 -1.812 -2.326 -2.776 -3.217 -3.59 -3.931 -4.259 -4.579 -4.865 -5.12 -5.399 -5.633 -5.83 -6.05 -6.272 -6.45 -6.65 -6.848 -7.008 -7.198 -7.408 -7.629 -7.854 -7.993 -8.128 -8.348 -8.499 -8.661 -8.748 -8.926 -9.122 -9.324 -9.425 -9.71 -9.754 -9.882 -10.011 -10.306 -10.474 -10.666 -10.856 -11.079 -11.366 -11.77 -12.95 -7 ,15582 ,TETRA ,17699208,Sat Dec 4 17:26:53 CET,Sat Dec 4 19:25:27 CET,0.0 0.328 0.465 0.584 0.69 0.781 0.866 0.945 1.079 1.139 1.199 1.136 1.364 1.411 1.5 1.584 1.659 1.695 1.775 1.85 1.943 2.008 2.071 2.161 2.243 2.312 2.376 2.443 2.54 2.62 2.692 2.791 2.886 2.971 3.059 3.14 3.216 3.299 3.382 3.478 3.587 3.691 3.792 3.873 3.925 3.956 3.97 3.903 3.727 3.401 2.643 1.574 0.593 -0.298 -1.041 -1.731 -2.351 -2.927 -3.421 -3.901 -4.313 -4.664 -4.993 -5.294 -5.578 -5.862 -6.168 -6.44 -6.669 -6.891 -7.114 -7.301 -7.513 -7.739 -7.91 -8.095 -8.288 -8.479 -8.662 -8.79 -8.928 -9.153 -9.327 -9.503 -9.595 -9.805 -10.008 -10.208 -10.313 -10.61 -10.658 -10.776 -10.914 -11.234 -11.398 -11.588 -11.793 -12.031 -12.324 -12.753 -14.453 -8 ,15028 ,TETRA ,17699209,Sat Dec 4 17:26:54 CET,Sat Dec 4 19:13:17 CET,0.0 0.328 0.497 0.622 0.729 0.842 0.924 0.992 1.124 1.187 1.24 1.159 1.384 1.429 1.526 1.623 1.711 1.753 1.833 1.908 2.003 2.061 2.115 2.191 2.277 2.361 2.437 2.508 2.596 2.675 2.746 2.826 2.909 2.995 3.083 3.18 3.272 3.361 3.447 3.536 3.629 3.721 3.805 3.881 3.958 4.01 4.042 4.031 3.883 3.51 2.74 1.699 0.756 -0.088 -0.834 -1.509 -2.102 -2.623 -3.065 -3.484 -3.839 -4.203 -4.577 -4.903 -5.194 -5.465 -5.754 -6.018 -6.246 -6.476 -6.715 -6.917 -7.127 -7.349 -7.505 -7.663 -7.834 -8.008 -8.183 -8.305 -8.449 -8.68 -8.835 -8.989 -9.073 -9.247 -9.43 -9.635 -9.737 -10.021 -10.053 -10.172 -10.293 -10.574 -10.736 -10.899 -11.081 -11.285 -11.509 -11.829 -12.606 -9 ,25969 ,TETRA ,17699210,Sat Dec 4 17:26:55 CET,Sat Dec 4 19:13:41 CET,0.0 0.372 0.521 0.646 0.753 0.85 0.944 1.034 1.174 1.24 1.305 1.231 1.455 1.504 1.597 1.684 1.768 1.807 1.887 1.963 2.056 2.107 2.162 2.237 2.306 2.377 2.454 2.537 2.634 2.727 2.826 2.947 3.05 3.141 3.239 3.359 3.461 3.562 3.673 3.773 3.865 3.971 4.085 4.158 4.22 4.292 4.344 4.341 4.215 3.87 3.133 2.106 1.18 0.33 -0.416 -1.066 -1.645 -2.21 -2.715 -3.204 -3.61 -3.96 -4.294 -4.637 -4.962 -5.226 -5.497 -5.754 -5.977 -6.229 -6.51 -6.744 -6.963 -7.186 -7.367 -7.549 -7.735 -7.942 -8.175 -8.325 -8.475 -8.726 -8.889 -9.051 -9.138 -9.315 -9.522 -9.755 -9.876 -10.186 -10.235 -10.359 -10.495 -10.796 -10.972 -11.178 -11.383 -11.595 -11.844 -12.176 -13.123 -10 ,14831 ,TETRA ,17699211,Sat Dec 4 17:26:55 CET,Sat Dec 4 19:25:18 CET,0.0 0.353 0.528 0.663 0.759 0.844 0.917 0.984 1.103 1.162 1.222 1.164 1.391 1.436 1.52 1.611 1.709 1.75 1.828 1.901 1.996 2.063 2.132 2.222 2.3 2.375 2.445 2.516 2.614 2.712 2.798 2.891 2.994 3.089 3.189 3.307 3.411 3.512 3.61 3.711 3.813 3.905 3.983 4.037 4.1 4.17 4.215 4.196 4.01 3.596 2.805 1.716 0.802 -0.008 -0.773 -1.472 -2.082 -2.629 -3.103 -3.585 -4.0 -4.376 -4.746 -5.089 -5.399 -5.68 -5.974 -6.227 -6.447 -6.692 -6.957 -7.169 -7.373 -7.595 -7.782 -7.972 -8.156 -8.356 -8.582 -8.725 -8.86 -9.08 -9.238 -9.397 -9.487 -9.7 -9.906 -10.097 -10.203 -10.512 -10.57 -10.705 -10.844 -11.152 -11.337 -11.527 -11.743 -12.036 -12.395 -12.791 -14.001 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt deleted file mode 100644 index 2972f10a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13657 ,KEBNE ,17077270,Sat Dec 25 10:27:07 CET,Sat Dec 25 12:11:36 CET,0.0 0.479 0.634 0.752 0.819 0.895 0.999 1.102 1.273 1.348 1.418 1.371 1.597 1.648 1.767 1.881 1.98 2.031 2.131 2.234 2.378 2.458 2.54 2.663 2.783 2.896 2.999 3.094 3.217 3.338 3.453 3.599 3.738 3.866 4.018 4.181 4.331 4.496 4.678 4.857 5.032 5.232 5.47 5.699 5.944 6.22 6.524 6.824 7.151 7.41 7.458 7.239 6.87 6.479 6.125 5.771 5.422 5.109 4.812 4.486 4.219 3.992 3.781 3.585 3.387 3.2 3.018 2.854 2.71 2.564 2.412 2.278 2.138 1.997 1.891 1.786 1.665 1.529 1.39 1.293 1.177 0.992 0.866 0.741 0.684 0.567 0.438 0.303 0.234 -0.015 -0.002 -0.097 -0.2 -0.42 -0.54 -0.654 -0.776 -0.918 -1.042 -1.214 -1.667 -2 ,8096 ,KEBNE ,17077271,Sat Dec 25 10:27:07 CET,Sat Dec 25 12:11:37 CET,0.0 0.254 0.368 0.472 0.592 0.695 0.772 0.85 1.011 1.084 1.152 1.103 1.337 1.402 1.52 1.623 1.706 1.748 1.837 1.934 2.08 2.161 2.238 2.352 2.457 2.554 2.652 2.744 2.866 2.987 3.1 3.24 3.373 3.494 3.625 3.782 3.942 4.103 4.259 4.414 4.586 4.809 5.047 5.249 5.505 5.764 6.049 6.329 6.541 6.712 6.665 6.355 5.999 5.579 5.189 4.819 4.451 4.111 3.831 3.547 3.28 3.039 2.812 2.599 2.396 2.197 2.001 1.844 1.706 1.556 1.397 1.265 1.135 0.994 0.889 0.783 0.664 0.54 0.412 0.322 0.226 0.067 -0.041 -0.149 -0.208 -0.323 -0.445 -0.591 -0.66 -0.909 -0.898 -0.974 -1.057 -1.252 -1.371 -1.486 -1.615 -1.751 -1.861 -2.019 -2.348 -3 ,24524 ,KEBNE ,17077272,Sat Dec 25 10:29:12 CET,Sat Dec 25 12:13:27 CET,0.0 0.479 0.683 0.826 0.941 1.047 1.144 1.231 1.398 1.486 1.568 1.542 1.777 1.839 1.961 2.079 2.19 2.241 2.33 2.413 2.533 2.62 2.709 2.832 2.958 3.086 3.193 3.284 3.416 3.545 3.669 3.827 3.979 4.109 4.234 4.377 4.525 4.687 4.867 5.057 5.258 5.489 5.72 5.925 6.176 6.46 6.756 7.046 7.329 7.537 7.535 7.207 6.8 6.425 6.075 5.722 5.394 5.077 4.799 4.498 4.217 3.96 3.708 3.466 3.258 3.083 2.903 2.745 2.597 2.421 2.249 2.105 1.949 1.81 1.695 1.568 1.438 1.295 1.151 1.055 0.956 0.801 0.692 0.584 0.535 0.424 0.299 0.165 0.1 -0.149 -0.144 -0.227 -0.306 -0.463 -0.563 -0.695 -0.829 -0.961 -1.123 -1.334 -1.697 -4 ,30181 ,KEBNE ,17077273,Sat Dec 25 10:30:15 CET,Sat Dec 25 12:14:55 CET,0.0 0.287 0.404 0.526 0.615 0.697 0.793 0.873 1.0 1.065 1.132 1.077 1.301 1.35 1.459 1.566 1.656 1.701 1.804 1.903 2.041 2.129 2.214 2.327 2.43 2.533 2.634 2.733 2.866 2.99 3.103 3.241 3.388 3.526 3.679 3.862 4.023 4.19 4.366 4.54 4.747 4.995 5.278 5.545 5.822 6.111 6.404 6.685 6.957 7.151 7.16 6.888 6.541 6.175 5.768 5.383 5.054 4.731 4.438 4.144 3.896 3.678 3.468 3.257 3.047 2.847 2.641 2.482 2.362 2.229 2.077 1.943 1.803 1.661 1.548 1.44 1.337 1.221 1.105 1.02 0.929 0.792 0.696 0.594 0.537 0.407 0.274 0.142 0.073 -0.162 -0.139 -0.226 -0.301 -0.458 -0.564 -0.675 -0.776 -0.89 -1.018 -1.174 -1.509 -5 ,21076 ,KEBNE ,17077274,Sat Dec 25 10:31:18 CET,Sat Dec 25 12:16:00 CET,0.0 0.18 0.298 0.409 0.522 0.616 0.691 0.765 0.936 1.011 1.071 1.016 1.24 1.29 1.391 1.493 1.584 1.625 1.717 1.805 1.929 2.009 2.088 2.195 2.298 2.389 2.473 2.567 2.69 2.813 2.931 3.061 3.188 3.313 3.461 3.634 3.789 3.954 4.137 4.337 4.539 4.749 4.995 5.228 5.469 5.717 5.975 6.229 6.437 6.498 6.365 5.993 5.597 5.219 4.857 4.5 4.158 3.846 3.541 3.223 2.972 2.734 2.484 2.249 2.038 1.84 1.634 1.461 1.31 1.152 0.983 0.836 0.69 0.551 0.433 0.297 0.163 0.023 -0.123 -0.223 -0.316 -0.456 -0.558 -0.668 -0.729 -0.851 -0.975 -1.097 -1.156 -1.394 -1.367 -1.442 -1.513 -1.654 -1.742 -1.844 -1.944 -2.053 -2.206 -2.432 -2.739 -6 ,30487 ,KEBNE ,17077275,Sat Dec 25 10:30:15 CET,Sat Dec 25 12:15:09 CET,0.0 0.218 0.371 0.493 0.591 0.681 0.756 0.815 0.946 1.023 1.093 1.05 1.291 1.354 1.465 1.574 1.683 1.736 1.835 1.921 2.063 2.16 2.242 2.346 2.451 2.554 2.654 2.748 2.878 3.012 3.137 3.28 3.412 3.533 3.67 3.84 4.011 4.19 4.366 4.533 4.716 4.914 5.138 5.381 5.643 5.903 6.202 6.512 6.793 6.991 6.977 6.71 6.303 5.845 5.445 5.117 4.799 4.484 4.226 3.944 3.692 3.464 3.248 3.043 2.836 2.644 2.451 2.27 2.093 1.922 1.753 1.607 1.461 1.306 1.183 1.06 0.941 0.815 0.688 0.597 0.502 0.355 0.244 0.14 0.088 -0.032 -0.148 -0.257 -0.314 -0.554 -0.54 -0.63 -0.723 -0.896 -0.996 -1.109 -1.21 -1.31 -1.442 -1.633 -2.079 -7 ,8296 ,KEBNE ,17077276,Sat Dec 25 10:30:15 CET,Sat Dec 25 12:15:11 CET,0.0 0.441 0.593 0.73 0.854 0.959 1.038 1.105 1.245 1.316 1.378 1.316 1.543 1.592 1.689 1.785 1.882 1.932 2.022 2.113 2.243 2.32 2.401 2.514 2.614 2.709 2.806 2.901 3.023 3.136 3.237 3.371 3.499 3.607 3.736 3.89 4.03 4.188 4.362 4.545 4.738 4.944 5.167 5.376 5.631 5.918 6.212 6.5 6.747 6.869 6.785 6.502 6.116 5.685 5.296 4.954 4.626 4.31 4.034 3.749 3.508 3.282 3.065 2.852 2.652 2.47 2.265 2.083 1.93 1.774 1.599 1.443 1.289 1.131 1.011 0.893 0.767 0.624 0.465 0.37 0.281 0.126 0.019 -0.087 -0.134 -0.24 -0.367 -0.501 -0.58 -0.841 -0.808 -0.88 -0.958 -1.144 -1.248 -1.357 -1.469 -1.587 -1.73 -1.874 -2.269 -8 ,12764 ,KEBNE ,17077277,Sat Dec 25 10:30:17 CET,Sat Dec 25 12:09:50 CET,0.0 0.336 0.49 0.622 0.725 0.816 0.892 0.964 1.113 1.176 1.236 1.184 1.419 1.478 1.582 1.682 1.778 1.825 1.913 1.992 2.097 2.169 2.243 2.349 2.448 2.537 2.621 2.723 2.859 2.98 3.096 3.239 3.369 3.488 3.634 3.79 3.944 4.119 4.309 4.503 4.709 4.933 5.171 5.419 5.701 5.986 6.306 6.632 6.963 7.291 7.436 7.229 6.916 6.555 6.165 5.79 5.442 5.106 4.812 4.528 4.275 4.025 3.776 3.552 3.354 3.165 2.972 2.793 2.638 2.487 2.315 2.164 2.001 1.834 1.71 1.588 1.469 1.34 1.2 1.106 1.021 0.891 0.785 0.663 0.601 0.484 0.37 0.244 0.176 -0.075 -0.073 -0.167 -0.255 -0.419 -0.503 -0.61 -0.74 -0.859 -0.984 -1.156 -1.493 -9 ,4458 ,KEBNE ,17077278,Sat Dec 25 10:30:15 CET,Sat Dec 25 12:15:08 CET,0.0 0.202 0.345 0.493 0.607 0.7 0.787 0.858 0.975 1.028 1.085 1.04 1.28 1.332 1.429 1.541 1.645 1.688 1.775 1.863 1.978 2.059 2.143 2.255 2.359 2.472 2.594 2.706 2.839 2.973 3.091 3.223 3.371 3.513 3.665 3.832 3.993 4.168 4.354 4.551 4.737 4.938 5.165 5.404 5.731 6.07 6.385 6.688 6.974 7.256 7.351 7.078 6.695 6.296 5.921 5.511 5.166 4.869 4.588 4.297 4.03 3.789 3.556 3.337 3.139 2.956 2.744 2.546 2.391 2.23 2.06 1.924 1.787 1.638 1.52 1.407 1.283 1.148 1.006 0.907 0.812 0.663 0.547 0.418 0.353 0.225 0.074 -0.071 -0.136 -0.378 -0.35 -0.428 -0.5 -0.672 -0.776 -0.912 -1.044 -1.161 -1.304 -1.523 -2.18 -10 ,1325 ,KEBNE ,17077279,Sat Dec 25 10:30:15 CET,Sat Dec 25 12:14:52 CET,0.0 0.238 0.372 0.476 0.584 0.692 0.782 0.857 0.982 1.046 1.108 1.046 1.274 1.326 1.438 1.547 1.652 1.703 1.792 1.879 2.01 2.091 2.168 2.28 2.39 2.512 2.629 2.733 2.857 2.969 3.084 3.217 3.339 3.469 3.618 3.781 3.937 4.115 4.305 4.496 4.706 4.935 5.179 5.404 5.676 5.97 6.272 6.58 6.867 7.072 7.053 6.714 6.314 5.952 5.611 5.299 5.019 4.73 4.466 4.194 3.944 3.695 3.461 3.254 3.062 2.877 2.695 2.531 2.386 2.245 2.085 1.947 1.796 1.636 1.523 1.407 1.284 1.161 1.032 0.948 0.856 0.696 0.593 0.492 0.431 0.3 0.166 0.032 -0.04 -0.287 -0.272 -0.363 -0.454 -0.66 -0.761 -0.857 -0.973 -1.108 -1.252 -1.415 -1.738 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_7.txt deleted file mode 100644 index 7d4fc264..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11282 ,TETRA ,17699212,Sat Dec 4 17:26:58 CET,Sat Dec 4 19:26:12 CET,0.0 0.133 0.249 0.361 0.469 0.562 0.636 0.697 0.828 0.903 0.977 0.94 1.184 1.252 1.379 1.5 1.607 1.657 1.754 1.843 1.98 2.083 2.184 2.329 2.461 2.581 2.702 2.822 2.991 3.158 3.317 3.51 3.697 3.879 4.093 4.33 4.564 4.833 5.12 5.425 5.761 6.147 6.588 7.036 7.582 8.191 8.877 9.638 10.528 11.597 12.738 13.473 13.815 13.96 14.007 13.996 13.945 13.826 13.679 13.521 13.376 13.23 13.041 12.863 12.706 12.542 12.376 12.215 12.065 11.914 11.75 11.617 11.486 11.332 11.214 11.097 10.975 10.845 10.71 10.624 10.529 10.36 10.233 10.11 10.043 9.901 9.758 9.602 9.512 9.256 9.233 9.139 9.035 8.81 8.704 8.591 8.464 8.309 8.106 7.881 7.277 -2 ,29233 ,TETRA ,17699213,Sat Dec 4 17:26:55 CET,Sat Dec 4 19:21:07 CET,0.0 0.272 0.429 0.524 0.631 0.726 0.809 0.894 1.034 1.097 1.165 1.129 1.369 1.43 1.548 1.66 1.765 1.811 1.909 2.012 2.16 2.256 2.349 2.5 2.645 2.775 2.909 3.038 3.214 3.389 3.552 3.751 3.954 4.157 4.378 4.63 4.874 5.131 5.411 5.716 6.037 6.401 6.83 7.292 7.861 8.483 9.173 9.946 10.878 11.968 13.189 14.12 14.574 14.718 14.696 14.606 14.419 14.227 14.062 13.883 13.735 13.574 13.402 13.249 13.124 12.995 12.85 12.721 12.597 12.471 12.335 12.223 12.108 11.994 11.905 11.804 11.712 11.614 11.497 11.41 11.319 11.173 11.077 10.982 10.926 10.804 10.67 10.533 10.457 10.204 10.2 10.103 10.003 9.779 9.662 9.544 9.414 9.274 9.14 8.952 8.548 -3 ,30081 ,TETRA ,17699214,Sat Dec 4 17:26:55 CET,Sat Dec 4 19:14:33 CET,0.0 0.212 0.344 0.447 0.534 0.621 0.709 0.785 0.94 1.017 1.086 1.052 1.298 1.364 1.491 1.61 1.729 1.787 1.903 2.02 2.182 2.285 2.394 2.552 2.693 2.835 2.981 3.119 3.288 3.456 3.624 3.818 4.001 4.171 4.365 4.611 4.843 5.079 5.343 5.629 5.948 6.313 6.73 7.16 7.663 8.218 8.871 9.698 10.71 11.799 13.042 13.977 14.497 14.694 14.71 14.617 14.437 14.266 14.083 13.853 13.641 13.433 13.231 13.061 12.91 12.756 12.566 12.403 12.269 12.132 12.005 11.894 11.754 11.599 11.491 11.37 11.23 11.079 10.908 10.788 10.666 10.499 10.386 10.258 10.198 10.081 9.937 9.772 9.684 9.438 9.419 9.319 9.238 9.001 8.865 8.737 8.601 8.44 8.277 8.104 7.683 -4 ,18177 ,TETRA ,17699215,Sat Dec 4 17:26:55 CET,Sat Dec 4 19:14:26 CET,0.0 0.188 0.332 0.448 0.532 0.607 0.694 0.785 0.944 1.021 1.092 1.041 1.279 1.344 1.467 1.573 1.675 1.727 1.823 1.91 2.052 2.154 2.249 2.386 2.533 2.679 2.812 2.936 3.09 3.234 3.381 3.564 3.742 3.932 4.16 4.408 4.645 4.905 5.189 5.498 5.84 6.248 6.731 7.223 7.806 8.469 9.178 9.954 10.963 12.157 13.394 14.137 14.45 14.618 14.7 14.707 14.686 14.651 14.567 14.448 14.361 14.256 14.117 13.965 13.796 13.635 13.463 13.304 13.163 13.026 12.871 12.72 12.573 12.423 12.3 12.183 12.067 11.927 11.793 11.692 11.579 11.411 11.293 11.164 11.096 10.969 10.83 10.672 10.592 10.341 10.349 10.251 10.142 9.923 9.808 9.673 9.526 9.378 9.213 9.008 8.671 -5 ,11634 ,TETRA ,17699216,Sat Dec 4 17:26:55 CET,Sat Dec 4 19:14:12 CET,0.0 0.262 0.423 0.529 0.652 0.777 0.876 0.953 1.11 1.188 1.257 1.219 1.463 1.525 1.642 1.759 1.868 1.923 2.038 2.154 2.329 2.432 2.52 2.658 2.807 2.945 3.074 3.204 3.372 3.531 3.682 3.87 4.06 4.253 4.475 4.706 4.919 5.161 5.443 5.766 6.132 6.532 6.994 7.472 8.043 8.685 9.394 10.207 11.163 12.28 13.574 14.526 15.05 15.287 15.36 15.372 15.33 15.239 15.132 14.987 14.792 14.595 14.418 14.24 14.059 13.906 13.751 13.617 13.502 13.364 13.208 13.092 12.97 12.819 12.692 12.558 12.422 12.291 12.167 12.079 11.978 11.811 11.689 11.566 11.5 11.352 11.219 11.089 11.021 10.772 10.767 10.686 10.597 10.416 10.319 10.206 10.082 9.959 9.835 9.655 9.357 -6 ,11501 ,TETRA ,17699217,Sat Dec 4 17:26:55 CET,Sat Dec 4 19:23:50 CET,0.0 0.264 0.352 0.43 0.502 0.586 0.673 0.741 0.874 0.942 1.005 0.962 1.198 1.259 1.37 1.468 1.574 1.629 1.734 1.834 1.997 2.109 2.208 2.347 2.493 2.63 2.761 2.889 3.06 3.225 3.375 3.56 3.748 3.931 4.149 4.409 4.657 4.918 5.192 5.485 5.806 6.161 6.569 6.981 7.487 8.062 8.733 9.547 10.469 11.509 12.619 13.428 13.807 13.856 13.827 13.759 13.607 13.452 13.308 13.144 13.0 12.856 12.663 12.459 12.302 12.164 12.003 11.856 11.73 11.587 11.432 11.309 11.172 11.026 10.921 10.812 10.701 10.583 10.447 10.339 10.219 10.057 9.943 9.813 9.746 9.618 9.485 9.335 9.259 9.015 9.021 8.945 8.857 8.629 8.497 8.365 8.228 8.055 7.848 7.618 7.276 -7 ,7218 ,TETRA ,17699218,Sat Dec 4 17:26:55 CET,Sat Dec 4 19:14:40 CET,0.0 0.128 0.234 0.351 0.465 0.549 0.634 0.714 0.865 0.936 1.005 0.984 1.233 1.295 1.416 1.536 1.657 1.722 1.843 1.94 2.089 2.192 2.294 2.445 2.585 2.725 2.863 2.989 3.157 3.329 3.499 3.709 3.901 4.089 4.315 4.566 4.823 5.116 5.419 5.74 6.08 6.47 6.944 7.438 7.982 8.552 9.223 10.009 10.926 11.949 13.213 14.192 14.572 14.685 14.725 14.709 14.642 14.55 14.475 14.343 14.157 13.965 13.787 13.63 13.48 13.327 13.161 13.012 12.868 12.708 12.538 12.4 12.26 12.097 11.973 11.853 11.733 11.6 11.449 11.346 11.25 11.105 10.996 10.88 10.815 10.667 10.501 10.344 10.268 10.01 9.997 9.908 9.804 9.558 9.434 9.304 9.159 9.011 8.864 8.683 8.141 -8 ,11009 ,TETRA ,17699219,Sat Dec 4 17:26:55 CET,Sat Dec 4 19:14:45 CET,0.0 0.267 0.4 0.519 0.598 0.664 0.732 0.804 0.945 1.008 1.074 1.035 1.266 1.321 1.432 1.546 1.652 1.704 1.807 1.899 2.044 2.145 2.246 2.396 2.541 2.675 2.805 2.935 3.101 3.266 3.428 3.621 3.821 4.018 4.242 4.505 4.765 5.039 5.337 5.657 5.994 6.394 6.865 7.333 7.884 8.493 9.215 10.029 10.96 12.029 13.327 14.269 14.654 14.843 14.898 14.811 14.639 14.457 14.34 14.225 14.1 13.969 13.809 13.658 13.536 13.408 13.251 13.099 12.967 12.835 12.694 12.591 12.491 12.379 12.294 12.191 12.085 11.972 11.822 11.711 11.59 11.399 11.278 11.163 11.101 10.953 10.799 10.645 10.569 10.325 10.327 10.233 10.127 9.893 9.779 9.658 9.487 9.317 9.148 8.909 8.419 -9 ,16693 ,TETRA ,17699220,Sat Dec 4 17:27:44 CET,Sat Dec 4 19:26:54 CET,0.0 0.095 0.181 0.28 0.387 0.484 0.554 0.617 0.759 0.826 0.891 0.844 1.075 1.136 1.251 1.351 1.451 1.499 1.596 1.692 1.836 1.929 2.019 2.155 2.278 2.397 2.532 2.666 2.844 3.026 3.197 3.396 3.588 3.77 3.989 4.247 4.504 4.786 5.071 5.368 5.704 6.109 6.582 7.038 7.57 8.184 8.873 9.624 10.481 11.54 12.858 13.773 14.163 14.335 14.359 14.258 14.096 13.92 13.77 13.608 13.44 13.274 13.121 12.978 12.816 12.654 12.473 12.305 12.157 12.01 11.87 11.755 11.63 11.48 11.364 11.254 11.141 11.016 10.883 10.793 10.699 10.535 10.417 10.303 10.245 10.122 9.98 9.841 9.774 9.53 9.513 9.412 9.317 9.119 8.999 8.871 8.74 8.595 8.442 8.251 7.753 -10 ,3096 ,TETRA ,17699221,Sat Dec 4 17:27:46 CET,Sat Dec 4 19:28:10 CET,0.0 0.135 0.24 0.341 0.453 0.547 0.632 0.727 0.906 0.974 1.031 0.999 1.247 1.312 1.437 1.564 1.685 1.744 1.855 1.966 2.129 2.222 2.314 2.454 2.594 2.729 2.865 3.004 3.169 3.319 3.48 3.688 3.886 4.078 4.309 4.561 4.801 5.059 5.333 5.635 5.954 6.315 6.73 7.158 7.658 8.209 8.847 9.572 10.453 11.538 12.862 13.794 14.242 14.518 14.601 14.586 14.56 14.478 14.382 14.299 14.202 14.105 14.014 13.934 13.84 13.717 13.553 13.378 13.223 13.054 12.874 12.738 12.609 12.472 12.356 12.238 12.125 12.006 11.883 11.789 11.692 11.537 11.42 11.309 11.251 11.12 10.984 10.837 10.758 10.519 10.52 10.425 10.341 10.18 10.093 9.987 9.852 9.684 9.489 9.275 8.468 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_1a.txt deleted file mode 100644 index e93bab9e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3330 ,KEBNE ,17028406,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:57:35 CET,0.0 0.153 0.32 0.48 0.589 0.691 0.795 0.888 1.041 1.118 1.2 1.155 1.436 1.523 1.668 1.808 1.951 2.013 2.128 2.244 2.433 2.562 2.689 2.871 3.038 3.207 3.384 3.55 3.761 3.971 4.18 4.443 4.7 4.946 5.227 5.556 5.901 6.293 6.707 7.134 7.593 8.127 8.747 9.364 10.138 11.09 12.232 13.508 14.991 16.859 19.289 21.478 22.808 23.7 24.354 24.828 25.141 25.351 25.511 25.644 25.732 25.806 25.857 25.868 25.872 25.865 25.852 25.846 25.838 25.818 25.793 25.77 25.732 25.686 25.648 25.589 25.513 25.43 25.337 25.276 25.206 25.091 25.019 24.93 24.871 24.746 24.623 24.507 24.444 24.206 24.203 24.115 24.013 23.75 23.594 23.44 23.244 23.023 22.806 22.404 20.667 -2 ,10285 ,KEBNE ,17028407,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:57:26 CET,0.0 0.334 0.492 0.596 0.699 0.812 0.911 1.01 1.212 1.301 1.381 1.326 1.597 1.669 1.818 1.971 2.101 2.174 2.323 2.448 2.632 2.753 2.872 3.047 3.225 3.401 3.564 3.722 3.933 4.147 4.363 4.623 4.876 5.133 5.436 5.788 6.134 6.527 6.976 7.46 7.965 8.537 9.222 9.916 10.76 11.759 12.967 14.375 15.981 17.955 20.577 22.951 24.44 25.402 26.074 26.576 26.92 27.203 27.423 27.583 27.689 27.738 27.772 27.789 27.784 27.772 27.749 27.721 27.697 27.661 27.618 27.569 27.507 27.463 27.418 27.352 27.296 27.242 27.151 27.071 27.003 26.91 26.846 26.768 26.724 26.636 26.529 26.398 26.317 26.068 26.055 25.953 25.85 25.573 25.415 25.285 25.133 24.91 24.602 24.238 23.073 -3 ,7788 ,KEBNE ,17028408,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:57:25 CET,0.0 0.371 0.511 0.644 0.786 0.891 0.97 1.063 1.24 1.313 1.384 1.327 1.603 1.689 1.844 1.99 2.13 2.192 2.322 2.451 2.631 2.762 2.899 3.086 3.257 3.426 3.596 3.753 3.957 4.17 4.394 4.673 4.937 5.193 5.491 5.844 6.191 6.575 7.003 7.463 7.949 8.496 9.182 9.922 10.752 11.704 12.872 14.199 15.841 17.875 20.517 22.899 24.318 25.233 25.905 26.403 26.709 26.919 27.057 27.15 27.208 27.254 27.29 27.292 27.274 27.255 27.23 27.195 27.155 27.103 27.044 27.005 26.961 26.889 26.829 26.768 26.713 26.657 26.586 26.526 26.453 26.344 26.264 26.174 26.133 26.045 25.926 25.766 25.68 25.431 25.407 25.298 25.174 24.932 24.8 24.632 24.455 24.249 23.988 23.597 21.372 -4 ,26341 ,KEBNE ,17028409,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:57:47 CET,0.0 0.225 0.337 0.443 0.54 0.629 0.726 0.815 0.978 1.063 1.142 1.101 1.379 1.453 1.588 1.72 1.855 1.92 2.046 2.173 2.361 2.475 2.586 2.758 2.928 3.1 3.273 3.442 3.661 3.864 4.062 4.317 4.58 4.838 5.124 5.457 5.798 6.189 6.605 7.031 7.502 8.064 8.749 9.478 10.316 11.228 12.358 13.758 15.457 17.51 20.136 22.478 23.925 24.93 25.571 26.01 26.365 26.587 26.748 26.908 27.037 27.121 27.149 27.149 27.166 27.182 27.173 27.145 27.098 27.028 26.934 26.871 26.816 26.754 26.69 26.603 26.516 26.428 26.338 26.272 26.196 26.073 25.989 25.904 25.859 25.768 25.673 25.541 25.453 25.194 25.131 25.009 24.896 24.616 24.461 24.32 24.147 23.918 23.664 23.353 21.863 -5 ,28372 ,KEBNE ,17028410,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:58:04 CET,0.0 0.627 0.761 0.867 0.977 1.083 1.18 1.259 1.424 1.507 1.584 1.546 1.824 1.898 2.041 2.188 2.33 2.401 2.536 2.657 2.838 2.959 3.075 3.251 3.426 3.599 3.762 3.935 4.175 4.395 4.608 4.875 5.147 5.412 5.718 6.07 6.417 6.815 7.242 7.691 8.2 8.785 9.453 10.144 10.99 11.956 13.085 14.41 16.06 18.142 20.788 23.114 24.535 25.511 26.222 26.731 27.093 27.371 27.568 27.713 27.771 27.806 27.855 27.871 27.86 27.849 27.821 27.786 27.749 27.697 27.64 27.594 27.529 27.447 27.385 27.322 27.254 27.171 27.089 27.042 26.989 26.893 26.837 26.786 26.753 26.674 26.58 26.476 26.414 26.169 26.148 26.056 25.96 25.732 25.58 25.417 25.267 25.062 24.774 24.43 22.997 -6 ,22815 ,KEBNE ,17028411,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:58:04 CET,0.0 0.229 0.345 0.456 0.561 0.66 0.75 0.836 0.985 1.062 1.141 1.09 1.365 1.443 1.588 1.72 1.836 1.894 2.018 2.147 2.344 2.476 2.603 2.771 2.936 3.106 3.277 3.443 3.649 3.866 4.085 4.334 4.586 4.848 5.143 5.468 5.783 6.143 6.548 6.991 7.482 8.045 8.706 9.393 10.216 11.152 12.287 13.662 15.308 17.244 19.709 21.912 23.377 24.452 25.197 25.712 26.058 26.324 26.487 26.602 26.707 26.794 26.843 26.84 26.825 26.822 26.797 26.768 26.744 26.7 26.651 26.616 26.57 26.516 26.473 26.428 26.379 26.324 26.269 26.223 26.162 26.039 25.959 25.895 25.86 25.77 25.654 25.541 25.488 25.271 25.324 25.245 25.158 24.979 24.889 24.788 24.673 24.53 24.365 24.115 22.142 -7 ,26948 ,KEBNE ,17028412,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:57:02 CET,0.0 0.214 0.347 0.463 0.565 0.663 0.754 0.837 0.992 1.074 1.156 1.106 1.379 1.448 1.587 1.729 1.86 1.928 2.058 2.182 2.376 2.503 2.621 2.795 2.97 3.147 3.326 3.497 3.717 3.937 4.149 4.417 4.678 4.93 5.231 5.574 5.909 6.277 6.679 7.129 7.598 8.127 8.8 9.52 10.387 11.355 12.472 13.775 15.44 17.553 20.234 22.554 23.952 24.877 25.512 25.985 26.363 26.635 26.85 27.03 27.097 27.131 27.152 27.171 27.174 27.17 27.172 27.149 27.117 27.065 27.003 26.967 26.931 26.858 26.776 26.706 26.641 26.549 26.46 26.39 26.315 26.183 26.087 25.999 25.956 25.865 25.737 25.604 25.539 25.299 25.314 25.236 25.155 24.957 24.824 24.665 24.456 24.183 23.892 23.569 21.973 -8 ,3880 ,KEBNE ,17028413,Wed Dec 22 20:16:23 CET,Wed Dec 22 21:58:21 CET,0.0 0.399 0.57 0.686 0.776 0.869 0.974 1.062 1.219 1.302 1.391 1.369 1.651 1.726 1.868 2.011 2.147 2.214 2.344 2.468 2.662 2.787 2.901 3.058 3.222 3.392 3.565 3.734 3.934 4.133 4.335 4.583 4.823 5.062 5.362 5.712 6.057 6.446 6.854 7.299 7.805 8.409 9.132 9.85 10.714 11.699 12.873 14.284 15.971 18.035 20.673 22.938 24.333 25.32 26.023 26.524 26.895 27.182 27.372 27.476 27.522 27.552 27.587 27.592 27.562 27.528 27.502 27.486 27.464 27.44 27.399 27.362 27.314 27.238 27.183 27.131 27.071 26.983 26.883 26.82 26.747 26.639 26.577 26.51 26.462 26.354 26.245 26.126 26.064 25.841 25.872 25.777 25.689 25.496 25.376 25.224 25.033 24.858 24.651 24.251 22.602 -9 ,13480 ,KEBNE ,17028414,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:57:31 CET,0.0 0.158 0.284 0.389 0.493 0.586 0.674 0.769 0.95 1.026 1.105 1.064 1.336 1.412 1.553 1.684 1.809 1.868 1.99 2.112 2.292 2.414 2.534 2.71 2.889 3.059 3.21 3.36 3.567 3.769 3.969 4.225 4.479 4.733 5.045 5.388 5.717 6.098 6.515 6.966 7.46 8.031 8.715 9.416 10.254 11.232 12.386 13.714 15.375 17.546 20.413 22.706 24.041 24.968 25.651 26.169 26.525 26.775 26.952 27.084 27.158 27.204 27.245 27.251 27.222 27.206 27.168 27.108 27.061 27.015 26.948 26.881 26.813 26.726 26.641 26.546 26.445 26.348 26.261 26.191 26.11 25.972 25.87 25.757 25.705 25.612 25.51 25.391 25.322 25.092 25.091 24.992 24.895 24.686 24.536 24.371 24.224 24.041 23.797 23.429 21.579 -10 ,9518 ,KEBNE ,17028415,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:57:20 CET,0.0 0.231 0.346 0.451 0.551 0.641 0.722 0.802 0.96 1.037 1.113 1.066 1.332 1.396 1.527 1.659 1.804 1.872 1.996 2.122 2.305 2.424 2.536 2.699 2.876 3.052 3.219 3.387 3.62 3.856 4.082 4.35 4.608 4.858 5.17 5.534 5.867 6.233 6.626 7.074 7.574 8.141 8.82 9.507 10.328 11.315 12.529 13.934 15.656 17.717 20.214 22.398 23.777 24.664 25.253 25.69 25.998 26.229 26.405 26.539 26.597 26.63 26.657 26.67 26.658 26.651 26.629 26.591 26.565 26.533 26.489 26.435 26.365 26.291 26.24 26.181 26.102 26.018 25.934 25.874 25.799 25.643 25.536 25.438 25.396 25.313 25.201 25.079 25.004 24.755 24.741 24.653 24.559 24.329 24.205 24.022 23.824 23.642 23.43 23.095 21.581 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_3a.txt deleted file mode 100644 index 8e1f8b6b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8955 ,TETRA ,17699222,Sat Dec 4 17:27:47 CET,Sat Dec 4 19:27:25 CET,0.0 0.828 1.104 1.317 1.501 1.659 1.813 1.952 2.184 2.293 2.404 2.416 2.712 2.815 3.028 3.217 3.389 3.475 3.651 3.831 4.077 4.234 4.383 4.59 4.799 5.01 5.205 5.39 5.648 5.898 6.124 6.398 6.678 6.952 7.262 7.62 7.974 8.363 8.772 9.192 9.655 10.21 10.866 11.503 12.22 13.061 14.111 15.294 16.625 18.175 20.068 21.636 22.475 22.953 23.241 23.448 23.581 23.679 23.714 23.711 23.704 23.701 23.705 23.693 23.657 23.608 23.569 23.541 23.503 23.453 23.395 23.345 23.285 23.225 23.185 23.136 23.075 23.005 22.929 22.876 22.823 22.745 22.7 22.646 22.617 22.57 22.506 22.436 22.401 22.182 22.251 22.198 22.152 22.069 22.015 21.937 21.848 21.764 21.667 21.515 21.141 -2 ,26085 ,TETRA ,17699223,Sat Dec 4 17:27:43 CET,Sat Dec 4 19:16:49 CET,0.0 0.561 0.789 0.995 1.19 1.358 1.514 1.661 1.901 2.011 2.121 2.149 2.457 2.562 2.768 2.966 3.146 3.228 3.391 3.545 3.774 3.928 4.072 4.274 4.473 4.665 4.859 5.052 5.296 5.541 5.779 6.063 6.345 6.616 6.917 7.267 7.651 8.063 8.453 8.874 9.309 9.818 10.434 11.048 11.741 12.445 13.279 14.259 15.378 16.718 18.393 19.776 20.566 21.005 21.293 21.524 21.665 21.751 21.807 21.831 21.82 21.792 21.757 21.724 21.68 21.62 21.553 21.487 21.438 21.386 21.323 21.273 21.227 21.173 21.122 21.073 21.022 20.958 20.89 20.847 20.804 20.739 20.683 20.615 20.583 20.519 20.447 20.368 20.328 20.116 20.222 20.185 20.134 20.014 19.945 19.876 19.821 19.756 19.657 19.549 19.336 -3 ,30162 ,TETRA ,17699224,Sat Dec 4 17:27:46 CET,Sat Dec 4 19:19:12 CET,0.0 0.394 0.65 0.839 1.003 1.175 1.339 1.474 1.716 1.839 1.966 1.996 2.291 2.393 2.585 2.76 2.932 3.013 3.167 3.322 3.558 3.712 3.867 4.085 4.291 4.496 4.699 4.902 5.15 5.377 5.616 5.916 6.184 6.445 6.758 7.111 7.45 7.825 8.233 8.642 9.081 9.617 10.262 10.918 11.664 12.478 13.342 14.237 15.273 16.627 18.285 19.65 20.461 20.896 21.125 21.284 21.415 21.5 21.527 21.52 21.514 21.5 21.467 21.437 21.396 21.344 21.287 21.233 21.182 21.129 21.082 21.049 21.009 20.954 20.908 20.853 20.789 20.724 20.664 20.621 20.572 20.495 20.441 20.38 20.35 20.289 20.216 20.135 20.099 19.889 19.972 19.926 19.874 19.744 19.672 19.619 19.568 19.497 19.415 19.289 18.851 -4 ,23346 ,TETRA ,17699225,Sat Dec 4 17:27:43 CET,Sat Dec 4 19:27:27 CET,0.0 0.372 0.582 0.766 0.95 1.144 1.306 1.439 1.675 1.79 1.903 1.919 2.23 2.337 2.522 2.706 2.893 2.986 3.161 3.331 3.578 3.733 3.886 4.112 4.339 4.556 4.759 4.959 5.221 5.476 5.722 6.029 6.338 6.622 6.922 7.251 7.561 7.895 8.268 8.666 9.077 9.564 10.16 10.759 11.449 12.206 13.129 14.277 15.549 16.963 18.791 20.228 21.022 21.517 21.841 22.06 22.203 22.287 22.313 22.32 22.322 22.309 22.279 22.247 22.21 22.172 22.128 22.08 22.044 22.003 21.952 21.909 21.855 21.799 21.758 21.71 21.662 21.6 21.536 21.502 21.456 21.386 21.343 21.288 21.259 21.194 21.119 21.028 20.983 20.765 20.846 20.787 20.723 20.613 20.541 20.464 20.388 20.295 20.181 20.052 19.827 -5 ,26718 ,TETRA ,17699226,Sat Dec 4 17:27:45 CET,Sat Dec 4 19:28:08 CET,0.0 0.482 0.765 0.986 1.137 1.281 1.461 1.633 1.883 1.994 2.114 2.129 2.434 2.538 2.73 2.925 3.114 3.204 3.363 3.516 3.758 3.91 4.062 4.288 4.509 4.718 4.913 5.109 5.36 5.6 5.838 6.131 6.413 6.691 7.021 7.392 7.748 8.143 8.558 9.01 9.478 9.997 10.603 11.196 11.861 12.596 13.524 14.557 15.703 17.084 18.774 20.13 20.86 21.317 21.64 21.857 21.989 22.065 22.1 22.131 22.161 22.162 22.124 22.082 22.049 22.007 21.965 21.942 21.918 21.884 21.839 21.793 21.755 21.715 21.676 21.639 21.594 21.539 21.48 21.437 21.39 21.326 21.273 21.209 21.183 21.125 21.067 21.012 20.973 20.763 20.868 20.814 20.765 20.689 20.651 20.607 20.546 20.472 20.399 20.303 20.085 -6 ,28323 ,TETRA ,17699227,Sat Dec 4 17:27:47 CET,Sat Dec 4 19:24:38 CET,0.0 0.537 0.822 1.041 1.23 1.395 1.545 1.701 1.979 2.101 2.224 2.253 2.549 2.65 2.854 3.062 3.257 3.352 3.537 3.708 3.943 4.088 4.235 4.457 4.674 4.885 5.085 5.278 5.545 5.794 6.02 6.307 6.581 6.84 7.152 7.51 7.845 8.205 8.615 9.071 9.549 10.078 10.699 11.311 12.006 12.788 13.708 14.791 16.058 17.528 19.301 20.821 21.679 22.142 22.386 22.546 22.666 22.734 22.737 22.73 22.722 22.685 22.643 22.603 22.562 22.516 22.452 22.386 22.325 22.258 22.208 22.173 22.126 22.076 22.043 22.001 21.945 21.877 21.801 21.755 21.707 21.632 21.592 21.551 21.519 21.44 21.362 21.294 21.258 21.035 21.12 21.081 21.032 20.907 20.847 20.799 20.737 20.66 20.578 20.418 20.057 -7 ,6276 ,TETRA ,17699228,Sat Dec 4 17:27:44 CET,Sat Dec 4 19:19:14 CET,0.0 0.638 0.937 1.11 1.257 1.432 1.599 1.733 1.941 2.046 2.164 2.179 2.484 2.59 2.79 2.998 3.2 3.29 3.458 3.622 3.865 4.016 4.172 4.411 4.617 4.804 4.993 5.183 5.438 5.693 5.922 6.198 6.466 6.704 6.973 7.292 7.611 7.949 8.323 8.771 9.25 9.768 10.391 11.023 11.743 12.568 13.521 14.579 15.882 17.405 19.095 20.413 21.151 21.602 21.895 22.106 22.197 22.22 22.248 22.241 22.221 22.209 22.186 22.157 22.132 22.091 22.04 21.999 21.959 21.922 21.869 21.813 21.734 21.652 21.599 21.54 21.489 21.436 21.368 21.314 21.259 21.178 21.124 21.073 21.044 20.987 20.919 20.835 20.787 20.565 20.65 20.604 20.553 20.442 20.389 20.319 20.239 20.167 20.063 19.93 19.693 -8 ,18013 ,TETRA ,17699229,Sat Dec 4 17:27:44 CET,Sat Dec 4 19:27:27 CET,0.0 0.488 0.726 0.931 1.111 1.263 1.394 1.538 1.802 1.917 2.019 2.021 2.319 2.419 2.609 2.782 2.953 3.041 3.22 3.387 3.61 3.761 3.909 4.101 4.307 4.532 4.748 4.951 5.216 5.477 5.712 5.982 6.251 6.518 6.838 7.192 7.507 7.859 8.265 8.702 9.17 9.716 10.355 10.964 11.685 12.486 13.328 14.3 15.49 16.886 18.626 20.032 20.837 21.344 21.666 21.888 21.996 22.073 22.11 22.11 22.113 22.1 22.062 22.017 21.96 21.908 21.868 21.819 21.773 21.732 21.68 21.625 21.574 21.518 21.471 21.416 21.354 21.294 21.233 21.184 21.131 21.049 20.986 20.919 20.886 20.828 20.774 20.703 20.661 20.439 20.519 20.475 20.434 20.329 20.254 20.178 20.113 20.036 19.913 19.771 19.486 -9 ,21252 ,TETRA ,17699230,Sat Dec 4 17:27:47 CET,Sat Dec 4 19:29:21 CET,0.0 0.624 0.852 1.029 1.186 1.33 1.46 1.573 1.791 1.895 1.99 1.961 2.239 2.326 2.516 2.702 2.86 2.945 3.107 3.251 3.463 3.599 3.739 3.95 4.157 4.355 4.535 4.7 4.922 5.139 5.339 5.62 5.885 6.115 6.412 6.762 7.088 7.455 7.855 8.258 8.7 9.193 9.734 10.267 10.926 11.708 12.629 13.682 14.881 16.297 18.048 19.478 20.248 20.727 21.064 21.298 21.442 21.524 21.566 21.59 21.604 21.597 21.588 21.578 21.546 21.509 21.484 21.462 21.427 21.388 21.334 21.278 21.231 21.181 21.138 21.093 21.04 20.978 20.92 20.881 20.84 20.782 20.742 20.686 20.66 20.606 20.533 20.454 20.422 20.21 20.305 20.275 20.242 20.15 20.094 20.032 19.967 19.889 19.81 19.722 19.544 -10 ,11822 ,TETRA ,17699231,Sat Dec 4 17:27:46 CET,Sat Dec 4 19:27:02 CET,0.0 0.598 0.893 1.115 1.277 1.43 1.579 1.721 1.987 2.117 2.236 2.255 2.557 2.662 2.854 3.034 3.208 3.292 3.472 3.655 3.904 4.059 4.213 4.436 4.655 4.857 5.058 5.266 5.528 5.762 5.98 6.265 6.551 6.812 7.103 7.457 7.825 8.208 8.603 9.042 9.509 10.032 10.637 11.215 11.881 12.626 13.511 14.597 15.807 17.143 18.829 20.289 21.155 21.698 22.025 22.237 22.388 22.473 22.505 22.533 22.542 22.519 22.49 22.459 22.415 22.366 22.327 22.298 22.265 22.225 22.177 22.128 22.082 22.033 21.992 21.947 21.895 21.838 21.769 21.728 21.686 21.622 21.577 21.527 21.497 21.431 21.373 21.312 21.272 21.055 21.168 21.137 21.087 20.973 20.917 20.854 20.79 20.718 20.621 20.529 20.348 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5a.txt deleted file mode 100644 index 376840be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26667 ,TETRA ,17699232,Sat Dec 4 17:27:46 CET,Sat Dec 4 19:26:04 CET,0.0 0.368 0.531 0.658 0.786 0.902 1.009 1.111 1.302 1.393 1.482 1.45 1.765 1.848 2.027 2.203 2.382 2.47 2.62 2.76 2.976 3.118 3.256 3.475 3.689 3.892 4.095 4.294 4.547 4.785 5.01 5.289 5.557 5.815 6.123 6.48 6.841 7.248 7.691 8.168 8.664 9.234 9.923 10.638 11.512 12.539 13.73 15.079 16.729 18.78 21.42 23.799 25.289 26.234 26.86 27.299 27.637 27.898 28.038 28.146 28.249 28.331 28.393 28.44 28.471 28.478 28.463 28.423 28.393 28.368 28.317 28.266 28.223 28.166 28.125 28.101 28.069 28.034 28.003 27.979 27.956 27.913 27.876 27.834 27.81 27.756 27.704 27.645 27.61 27.374 27.475 27.429 27.379 27.256 27.191 27.112 27.031 26.942 26.811 26.648 26.432 -2 ,5378 ,TETRA ,17699233,Sat Dec 4 17:27:46 CET,Sat Dec 4 19:26:41 CET,0.0 0.246 0.388 0.525 0.655 0.772 0.866 0.963 1.147 1.229 1.323 1.301 1.614 1.684 1.82 1.966 2.138 2.229 2.393 2.541 2.743 2.871 2.996 3.182 3.365 3.537 3.714 3.883 4.097 4.326 4.549 4.81 5.077 5.368 5.716 6.063 6.393 6.783 7.214 7.679 8.172 8.749 9.454 10.161 11.011 12.025 13.207 14.546 16.194 18.216 20.78 22.995 24.415 25.403 26.028 26.461 26.817 27.092 27.264 27.402 27.49 27.554 27.592 27.602 27.603 27.6 27.596 27.571 27.532 27.482 27.458 27.444 27.405 27.363 27.336 27.302 27.258 27.218 27.174 27.136 27.098 27.036 26.985 26.931 26.896 26.815 26.748 26.671 26.621 26.374 26.487 26.438 26.372 26.255 26.21 26.161 26.1 26.026 25.924 25.786 25.569 -3 ,5723 ,TETRA ,17699234,Sat Dec 4 17:27:47 CET,Sat Dec 4 19:27:13 CET,0.0 0.296 0.468 0.623 0.752 0.866 0.988 1.113 1.339 1.444 1.544 1.521 1.845 1.938 2.119 2.29 2.465 2.547 2.688 2.832 3.052 3.192 3.329 3.536 3.733 3.931 4.125 4.305 4.541 4.771 5.017 5.346 5.652 5.947 6.304 6.716 7.124 7.573 8.068 8.605 9.169 9.766 10.464 11.197 12.063 13.1 14.306 15.67 17.386 19.458 22.09 24.463 25.929 26.896 27.559 27.946 28.196 28.452 28.645 28.802 28.916 28.999 29.046 29.078 29.115 29.147 29.162 29.146 29.135 29.116 29.084 29.073 29.063 29.044 29.025 29.0 28.957 28.907 28.86 28.814 28.759 28.67 28.611 28.571 28.548 28.492 28.434 28.37 28.338 28.101 28.209 28.159 28.109 27.993 27.928 27.843 27.754 27.66 27.558 27.475 27.34 -4 ,18126 ,TETRA ,17699235,Sat Dec 4 17:27:46 CET,Sat Dec 4 19:31:35 CET,0.0 0.19 0.387 0.539 0.67 0.796 0.916 1.027 1.223 1.315 1.403 1.376 1.709 1.807 1.972 2.135 2.298 2.373 2.524 2.673 2.884 3.026 3.171 3.386 3.6 3.803 3.992 4.179 4.428 4.654 4.868 5.152 5.427 5.703 6.028 6.371 6.714 7.111 7.563 8.054 8.554 9.118 9.791 10.533 11.464 12.503 13.719 15.12 16.815 18.891 21.531 23.865 25.305 26.285 26.984 27.52 27.902 28.182 28.383 28.528 28.636 28.729 28.802 28.851 28.876 28.883 28.887 28.883 28.881 28.858 28.825 28.808 28.775 28.738 28.708 28.661 28.615 28.589 28.565 28.538 28.502 28.452 28.414 28.374 28.354 28.302 28.239 28.179 28.147 27.913 28.032 27.985 27.932 27.825 27.779 27.729 27.666 27.603 27.544 27.428 27.152 -5 ,28127 ,TETRA ,17699236,Sat Dec 4 17:27:46 CET,Sat Dec 4 19:27:20 CET,0.0 0.247 0.432 0.57 0.687 0.811 0.923 1.021 1.225 1.32 1.406 1.362 1.683 1.775 1.948 2.124 2.293 2.376 2.547 2.709 2.941 3.092 3.234 3.434 3.621 3.807 3.995 4.174 4.406 4.642 4.9 5.205 5.473 5.735 6.033 6.371 6.741 7.19 7.666 8.154 8.655 9.24 9.957 10.701 11.576 12.562 13.754 15.149 16.858 18.998 21.652 23.981 25.48 26.487 27.08 27.434 27.72 27.917 28.025 28.135 28.239 28.298 28.303 28.31 28.315 28.301 28.276 28.234 28.197 28.17 28.132 28.083 28.014 27.95 27.913 27.868 27.823 27.777 27.708 27.663 27.628 27.55 27.479 27.396 27.358 27.308 27.264 27.217 27.19 26.964 27.083 27.033 26.983 26.887 26.833 26.763 26.684 26.606 26.518 26.424 26.291 -6 ,30415 ,TETRA ,17699237,Sat Dec 4 17:27:47 CET,Sat Dec 4 19:27:48 CET,0.0 0.211 0.397 0.556 0.666 0.77 0.882 0.981 1.158 1.256 1.361 1.329 1.639 1.726 1.892 2.064 2.231 2.312 2.478 2.636 2.871 3.026 3.177 3.393 3.584 3.775 3.953 4.126 4.37 4.597 4.805 5.071 5.345 5.603 5.9 6.256 6.608 6.992 7.412 7.881 8.391 8.967 9.676 10.42 11.295 12.282 13.46 14.835 16.502 18.598 21.317 23.71 25.152 26.098 26.76 27.192 27.474 27.726 27.934 28.099 28.207 28.282 28.337 28.38 28.387 28.357 28.349 28.359 28.351 28.305 28.256 28.24 28.233 28.229 28.214 28.175 28.124 28.068 28.014 27.972 27.923 27.858 27.808 27.759 27.736 27.679 27.622 27.544 27.498 27.26 27.359 27.309 27.262 27.144 27.082 27.02 26.941 26.856 26.775 26.702 26.601 -7 ,14713 ,TETRA ,17699238,Sat Dec 4 17:27:46 CET,Sat Dec 4 19:33:13 CET,0.0 0.217 0.371 0.499 0.626 0.754 0.867 0.97 1.165 1.258 1.366 1.342 1.657 1.752 1.922 2.074 2.227 2.307 2.455 2.594 2.813 2.951 3.088 3.289 3.48 3.679 3.868 4.05 4.29 4.522 4.758 5.052 5.347 5.659 6.0 6.359 6.736 7.155 7.604 8.114 8.683 9.35 10.124 10.917 11.914 13.07 14.347 15.75 17.475 19.629 22.399 24.819 26.312 27.294 27.957 28.433 28.771 29.025 29.218 29.376 29.449 29.482 29.503 29.503 29.488 29.495 29.521 29.521 29.506 29.494 29.468 29.419 29.357 29.294 29.245 29.202 29.168 29.131 29.085 29.048 29.002 28.936 28.898 28.855 28.838 28.811 28.779 28.734 28.7 28.464 28.574 28.532 28.497 28.407 28.365 28.303 28.211 28.129 28.036 27.832 27.44 -8 ,855 ,TETRA ,17699239,Sat Dec 4 17:27:46 CET,Sat Dec 4 19:15:12 CET,0.0 0.233 0.433 0.609 0.756 0.885 0.998 1.106 1.336 1.459 1.573 1.546 1.863 1.953 2.13 2.289 2.451 2.533 2.684 2.826 3.063 3.217 3.355 3.571 3.784 4.006 4.227 4.436 4.684 4.91 5.147 5.431 5.704 5.969 6.279 6.663 7.043 7.452 7.891 8.365 8.905 9.515 10.212 10.949 11.852 12.885 14.094 15.477 17.133 19.189 21.87 24.245 25.726 26.703 27.402 27.916 28.256 28.492 28.659 28.82 28.954 29.055 29.111 29.127 29.124 29.105 29.078 29.064 29.053 29.017 28.959 28.924 28.889 28.84 28.806 28.786 28.763 28.717 28.661 28.633 28.608 28.544 28.478 28.409 28.383 28.327 28.263 28.181 28.138 27.905 28.012 27.963 27.924 27.814 27.743 27.658 27.566 27.469 27.35 27.221 27.028 -9 ,31742 ,TETRA ,17699240,Sat Dec 4 17:27:46 CET,Sat Dec 4 19:26:39 CET,0.0 0.37 0.534 0.674 0.777 0.883 0.999 1.101 1.27 1.35 1.434 1.404 1.727 1.819 1.999 2.167 2.317 2.391 2.525 2.655 2.862 3.0 3.139 3.359 3.576 3.775 3.971 4.17 4.432 4.687 4.938 5.246 5.531 5.786 6.08 6.415 6.769 7.196 7.645 8.093 8.609 9.238 9.954 10.676 11.533 12.508 13.672 15.068 16.755 18.786 21.522 24.009 25.529 26.531 27.219 27.697 27.978 28.171 28.323 28.452 28.574 28.684 28.743 28.777 28.807 28.829 28.828 28.818 28.815 28.808 28.793 28.753 28.687 28.618 28.581 28.551 28.528 28.512 28.461 28.425 28.393 28.328 28.284 28.228 28.199 28.152 28.109 28.047 28.003 27.76 27.867 27.816 27.765 27.681 27.627 27.546 27.449 27.354 27.248 27.138 26.914 -10 ,1758 ,TETRA ,17699241,Sat Dec 4 17:27:48 CET,Sat Dec 4 19:27:02 CET,0.0 0.225 0.364 0.488 0.61 0.709 0.81 0.907 1.074 1.156 1.241 1.189 1.497 1.581 1.738 1.899 2.068 2.15 2.307 2.454 2.682 2.838 2.983 3.204 3.42 3.62 3.82 4.014 4.278 4.546 4.791 5.078 5.348 5.595 5.886 6.238 6.618 7.064 7.539 8.058 8.591 9.172 9.884 10.621 11.493 12.468 13.669 15.063 16.716 18.829 21.47 23.764 25.223 26.192 26.83 27.228 27.538 27.813 28.01 28.158 28.248 28.309 28.364 28.415 28.437 28.448 28.451 28.447 28.439 28.411 28.382 28.36 28.33 28.294 28.262 28.239 28.204 28.162 28.135 28.1 28.056 28.002 27.946 27.881 27.85 27.773 27.706 27.653 27.619 27.379 27.481 27.433 27.382 27.273 27.209 27.129 27.024 26.879 26.756 26.658 26.36 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5c.txt deleted file mode 100644 index 0994e602..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9962 ,TETRA ,17699242,Sat Dec 4 17:27:46 CET,Sat Dec 4 19:27:11 CET,0.0 0.335 0.525 0.708 0.86 0.996 1.138 1.269 1.531 1.647 1.747 1.71 2.032 2.125 2.299 2.457 2.624 2.711 2.868 3.002 3.211 3.345 3.477 3.671 3.865 4.061 4.247 4.43 4.662 4.884 5.096 5.366 5.644 5.923 6.247 6.609 6.947 7.312 7.715 8.149 8.617 9.166 9.795 10.429 11.172 11.99 12.957 14.057 15.315 16.803 18.62 20.031 20.8 21.245 21.512 21.611 21.602 21.612 21.616 21.589 21.57 21.559 21.509 21.415 21.323 21.253 21.165 21.079 21.001 20.908 20.831 20.778 20.715 20.65 20.605 20.554 20.498 20.432 20.338 20.279 20.226 20.146 20.098 20.034 19.989 19.887 19.789 19.689 19.641 19.38 19.461 19.403 19.341 19.181 19.101 19.03 18.946 18.862 18.788 18.688 18.497 -2 ,4620 ,TETRA ,17699243,Sat Dec 4 17:27:48 CET,Sat Dec 4 19:27:44 CET,0.0 0.311 0.501 0.641 0.779 0.908 1.039 1.172 1.418 1.536 1.64 1.61 1.941 2.041 2.218 2.383 2.541 2.615 2.762 2.911 3.145 3.299 3.439 3.65 3.849 4.047 4.238 4.417 4.677 4.94 5.18 5.453 5.718 5.973 6.262 6.586 6.921 7.296 7.69 8.138 8.623 9.16 9.769 10.403 11.171 12.034 13.004 14.069 15.303 16.748 18.537 19.944 20.732 21.275 21.63 21.82 21.898 21.954 21.996 21.99 21.92 21.846 21.804 21.769 21.728 21.684 21.632 21.57 21.509 21.45 21.358 21.273 21.207 21.139 21.067 20.985 20.907 20.827 20.743 20.69 20.634 20.541 20.474 20.403 20.37 20.305 20.219 20.126 20.076 19.815 19.92 19.866 19.814 19.691 19.616 19.533 19.45 19.362 19.266 19.152 18.994 -3 ,27248 ,TETRA ,17699244,Sat Dec 4 17:27:46 CET,Sat Dec 4 19:15:05 CET,0.0 0.438 0.663 0.845 1.006 1.139 1.27 1.399 1.64 1.757 1.871 1.862 2.192 2.302 2.521 2.715 2.9 2.99 3.165 3.335 3.574 3.727 3.88 4.107 4.336 4.554 4.754 4.954 5.214 5.451 5.685 5.977 6.251 6.518 6.838 7.184 7.513 7.872 8.268 8.714 9.193 9.768 10.5 11.224 11.986 12.813 13.789 14.883 16.166 17.696 19.506 20.918 21.734 22.231 22.54 22.745 22.843 22.89 22.918 22.934 22.907 22.86 22.814 22.759 22.702 22.651 22.593 22.539 22.495 22.432 22.353 22.282 22.188 22.079 21.999 21.923 21.852 21.784 21.712 21.669 21.622 21.534 21.47 21.393 21.35 21.256 21.162 21.073 21.021 20.753 20.841 20.781 20.724 20.613 20.546 20.459 20.377 20.293 20.188 20.077 19.89 -4 ,23556 ,TETRA ,17699245,Sat Dec 4 17:27:47 CET,Sat Dec 4 19:15:23 CET,0.0 0.493 0.679 0.835 1.018 1.181 1.316 1.431 1.633 1.748 1.861 1.855 2.182 2.277 2.473 2.653 2.819 2.902 3.064 3.227 3.464 3.619 3.772 3.987 4.19 4.382 4.565 4.732 4.937 5.151 5.374 5.648 5.928 6.218 6.566 6.942 7.285 7.66 8.073 8.505 8.938 9.434 10.048 10.671 11.396 12.243 13.244 14.331 15.609 17.223 19.147 20.642 21.538 22.119 22.467 22.661 22.699 22.695 22.716 22.716 22.705 22.698 22.686 22.65 22.59 22.53 22.473 22.422 22.381 22.302 22.185 22.091 21.995 21.886 21.81 21.752 21.691 21.609 21.521 21.462 21.4 21.303 21.234 21.161 21.122 21.035 20.951 20.865 20.822 20.57 20.682 20.633 20.58 20.471 20.401 20.334 20.27 20.179 20.094 20.009 19.882 -5 ,23362 ,TETRA ,17699246,Sat Dec 4 17:27:47 CET,Sat Dec 4 19:15:04 CET,0.0 0.458 0.692 0.921 1.115 1.265 1.408 1.549 1.799 1.913 2.018 1.994 2.318 2.415 2.611 2.802 2.976 3.057 3.217 3.378 3.618 3.766 3.913 4.167 4.41 4.62 4.82 5.01 5.269 5.52 5.756 6.051 6.352 6.642 6.956 7.295 7.647 8.038 8.436 8.847 9.27 9.764 10.342 10.937 11.65 12.427 13.364 14.445 15.713 17.283 19.195 20.739 21.561 22.026 22.319 22.521 22.639 22.713 22.762 22.78 22.771 22.74 22.68 22.586 22.502 22.438 22.362 22.31 22.268 22.217 22.156 22.095 22.038 21.976 21.916 21.849 21.781 21.714 21.648 21.605 21.557 21.466 21.394 21.327 21.281 21.185 21.128 21.064 21.021 20.773 20.862 20.788 20.731 20.6 20.528 20.465 20.396 20.311 20.201 20.065 19.862 -6 ,29963 ,TETRA ,17699247,Sat Dec 4 17:27:47 CET,Sat Dec 4 19:15:24 CET,0.0 0.345 0.55 0.697 0.819 0.956 1.083 1.206 1.452 1.559 1.664 1.655 1.985 2.078 2.253 2.436 2.603 2.684 2.865 3.046 3.292 3.436 3.579 3.789 3.977 4.158 4.344 4.529 4.767 5.019 5.284 5.601 5.898 6.173 6.478 6.819 7.146 7.507 7.908 8.344 8.786 9.287 9.895 10.562 11.349 12.195 13.235 14.43 15.863 17.503 19.349 20.827 21.64 22.143 22.385 22.501 22.613 22.698 22.743 22.697 22.591 22.498 22.393 22.323 22.295 22.252 22.187 22.124 22.064 22.006 21.954 21.917 21.879 21.82 21.762 21.707 21.654 21.595 21.52 21.464 21.412 21.328 21.261 21.206 21.181 21.121 21.051 20.961 20.911 20.656 20.769 20.715 20.661 20.535 20.467 20.398 20.312 20.222 20.12 19.96 19.812 -7 ,22564 ,TETRA ,17699248,Sat Dec 4 17:27:47 CET,Sat Dec 4 19:15:05 CET,0.0 0.371 0.61 0.766 0.901 1.039 1.188 1.315 1.526 1.632 1.74 1.716 2.036 2.126 2.309 2.494 2.678 2.763 2.912 3.058 3.281 3.425 3.561 3.748 3.925 4.119 4.316 4.509 4.763 5.018 5.282 5.605 5.925 6.225 6.555 6.915 7.254 7.619 8.004 8.44 8.898 9.403 10.015 10.635 11.371 12.191 13.112 14.167 15.454 17.001 18.863 20.347 21.15 21.641 21.962 22.155 22.283 22.383 22.413 22.412 22.4 22.379 22.358 22.319 22.275 22.24 22.174 22.078 21.98 21.885 21.792 21.709 21.618 21.533 21.464 21.384 21.307 21.232 21.151 21.093 21.034 20.935 20.867 20.818 20.799 20.749 20.678 20.605 20.561 20.301 20.429 20.388 20.328 20.18 20.103 20.016 19.905 19.781 19.662 19.525 19.375 -8 ,30229 ,TETRA ,17699249,Sat Dec 4 17:28:37 CET,Sat Dec 4 19:28:59 CET,0.0 0.331 0.511 0.668 0.84 0.996 1.146 1.291 1.543 1.659 1.776 1.787 2.114 2.206 2.402 2.589 2.75 2.824 2.969 3.125 3.38 3.532 3.668 3.869 4.061 4.241 4.416 4.588 4.822 5.063 5.289 5.561 5.831 6.092 6.389 6.724 7.055 7.423 7.828 8.252 8.709 9.244 9.881 10.521 11.252 12.083 13.073 14.198 15.477 16.914 18.659 20.131 21.0 21.516 21.785 21.931 22.05 22.102 22.059 21.994 21.946 21.897 21.842 21.789 21.745 21.7 21.635 21.554 21.471 21.4 21.339 21.264 21.157 21.051 20.993 20.936 20.873 20.817 20.741 20.674 20.605 20.516 20.459 20.396 20.368 20.309 20.233 20.158 20.12 19.872 20.001 19.961 19.918 19.836 19.776 19.694 19.631 19.579 19.491 19.373 19.233 -9 ,10539 ,TETRA ,17699250,Sat Dec 4 17:28:39 CET,Sat Dec 4 19:29:01 CET,0.0 0.316 0.518 0.665 0.782 0.909 1.047 1.168 1.393 1.518 1.638 1.594 1.911 2.006 2.18 2.336 2.497 2.574 2.723 2.874 3.086 3.227 3.364 3.556 3.741 3.928 4.12 4.32 4.569 4.792 5.004 5.287 5.578 5.855 6.189 6.559 6.894 7.253 7.653 8.113 8.593 9.118 9.741 10.367 11.106 11.937 12.889 13.953 15.191 16.653 18.423 19.893 20.654 21.08 21.387 21.589 21.731 21.807 21.819 21.811 21.772 21.702 21.61 21.524 21.451 21.356 21.259 21.178 21.101 21.018 20.931 20.867 20.809 20.743 20.678 20.604 20.523 20.436 20.327 20.247 20.182 20.079 19.995 19.909 19.869 19.783 19.684 19.576 19.522 19.265 19.36 19.297 19.236 19.131 19.07 19.004 18.933 18.838 18.71 18.57 18.326 -10 ,5369 ,TETRA ,17699251,Sat Dec 4 17:28:41 CET,Sat Dec 4 19:30:54 CET,0.0 0.377 0.588 0.755 0.898 1.051 1.195 1.322 1.562 1.672 1.779 1.754 2.075 2.166 2.344 2.528 2.701 2.781 2.943 3.101 3.313 3.442 3.572 3.762 3.951 4.151 4.351 4.537 4.761 4.985 5.211 5.493 5.764 6.025 6.336 6.68 7.014 7.392 7.8 8.229 8.682 9.2 9.867 10.552 11.265 12.06 12.991 14.048 15.348 16.907 18.732 20.225 21.065 21.561 21.867 22.065 22.17 22.22 22.222 22.177 22.12 22.046 21.974 21.909 21.84 21.795 21.732 21.648 21.575 21.503 21.428 21.362 21.28 21.191 21.131 21.076 21.01 20.931 20.848 20.791 20.728 20.618 20.547 20.485 20.449 20.361 20.284 20.202 20.152 19.892 19.999 19.948 19.885 19.756 19.696 19.64 19.581 19.492 19.372 19.244 18.942 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_3b.txt deleted file mode 100644 index 003b6487..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22720 ,TETRA ,17699252,Sat Dec 4 17:28:42 CET,Sat Dec 4 19:30:39 CET,0.0 0.374 0.59 0.76 0.912 1.046 1.178 1.321 1.57 1.677 1.788 1.805 2.102 2.203 2.42 2.622 2.816 2.912 3.078 3.217 3.44 3.604 3.761 3.991 4.217 4.434 4.636 4.817 5.066 5.324 5.556 5.828 6.116 6.401 6.727 7.1 7.45 7.833 8.247 8.69 9.165 9.698 10.336 10.968 11.66 12.454 13.417 14.472 15.647 17.019 18.713 20.045 20.735 21.126 21.376 21.583 21.725 21.789 21.809 21.816 21.826 21.82 21.8 21.768 21.723 21.684 21.632 21.589 21.552 21.493 21.425 21.359 21.293 21.237 21.196 21.145 21.087 21.023 20.961 20.922 20.876 20.799 20.741 20.684 20.653 20.578 20.514 20.455 20.418 20.207 20.301 20.264 20.226 20.102 20.041 19.985 19.927 19.868 19.785 19.698 19.616 -2 ,22957 ,TETRA ,17699253,Sat Dec 4 17:28:37 CET,Sat Dec 4 19:16:30 CET,0.0 0.408 0.619 0.789 0.948 1.117 1.283 1.425 1.668 1.776 1.883 1.915 2.215 2.311 2.49 2.668 2.842 2.928 3.1 3.271 3.508 3.653 3.793 4.007 4.211 4.392 4.58 4.763 5.005 5.251 5.496 5.801 6.087 6.345 6.646 7.014 7.38 7.777 8.194 8.61 9.045 9.53 10.135 10.797 11.528 12.323 13.261 14.368 15.661 17.107 18.776 20.115 20.869 21.294 21.539 21.712 21.814 21.859 21.875 21.875 21.862 21.833 21.786 21.749 21.703 21.647 21.595 21.546 21.495 21.44 21.387 21.342 21.3 21.26 21.226 21.18 21.134 21.093 21.052 21.025 20.991 20.931 20.888 20.841 20.813 20.744 20.675 20.609 20.568 20.349 20.437 20.393 20.341 20.232 20.164 20.088 20.03 19.975 19.899 19.809 19.699 -3 ,6398 ,TETRA ,17699254,Sat Dec 4 17:28:37 CET,Sat Dec 4 19:32:37 CET,0.0 0.559 0.764 0.932 1.081 1.229 1.365 1.479 1.692 1.784 1.873 1.867 2.142 2.224 2.379 2.528 2.688 2.765 2.902 3.028 3.211 3.341 3.467 3.639 3.82 4.003 4.168 4.328 4.548 4.762 4.958 5.201 5.446 5.681 5.949 6.25 6.558 6.899 7.241 7.597 7.997 8.458 8.98 9.517 10.187 10.962 11.816 12.76 13.951 15.378 17.063 18.398 19.099 19.488 19.739 19.899 19.974 20.036 20.078 20.071 20.036 20.005 19.967 19.913 19.867 19.829 19.775 19.716 19.653 19.584 19.525 19.476 19.424 19.362 19.309 19.258 19.203 19.141 19.079 19.041 19.004 18.946 18.904 18.859 18.827 18.752 18.687 18.626 18.589 18.382 18.503 18.471 18.437 18.342 18.272 18.204 18.144 18.068 17.963 17.82 17.609 -4 ,7649 ,TETRA ,17699255,Sat Dec 4 17:28:38 CET,Sat Dec 4 19:32:56 CET,0.0 0.622 0.871 1.058 1.2 1.325 1.464 1.604 1.846 1.957 2.061 2.042 2.325 2.416 2.608 2.791 2.959 3.036 3.175 3.311 3.516 3.641 3.766 3.955 4.125 4.288 4.447 4.596 4.798 5.003 5.192 5.421 5.652 5.882 6.152 6.453 6.748 7.1 7.476 7.84 8.215 8.684 9.27 9.81 10.407 11.109 11.958 12.907 14.017 15.397 17.137 18.545 19.359 19.856 20.175 20.362 20.443 20.492 20.502 20.512 20.526 20.514 20.498 20.484 20.452 20.409 20.366 20.319 20.273 20.223 20.163 20.113 20.059 20.002 19.95 19.888 19.825 19.761 19.707 19.67 19.63 19.559 19.503 19.443 19.417 19.369 19.312 19.251 19.214 18.997 19.083 19.043 18.993 18.89 18.834 18.756 18.676 18.599 18.49 18.368 18.268 -5 ,24860 ,TETRA ,17699256,Sat Dec 4 17:28:38 CET,Sat Dec 4 19:28:08 CET,0.0 0.453 0.779 0.981 1.153 1.316 1.453 1.582 1.831 1.95 2.07 2.122 2.434 2.539 2.73 2.913 3.098 3.192 3.365 3.519 3.751 3.909 4.067 4.303 4.534 4.749 4.945 5.147 5.414 5.663 5.893 6.172 6.455 6.725 7.042 7.407 7.758 8.141 8.554 9.004 9.465 9.989 10.584 11.154 11.849 12.669 13.703 14.867 16.063 17.409 19.055 20.32 21.037 21.484 21.787 21.979 22.065 22.12 22.164 22.196 22.206 22.189 22.158 22.123 22.084 22.04 22.006 21.976 21.939 21.894 21.83 21.776 21.723 21.67 21.627 21.566 21.507 21.458 21.402 21.356 21.303 21.213 21.147 21.082 21.055 20.998 20.927 20.86 20.827 20.617 20.726 20.694 20.662 20.583 20.527 20.462 20.406 20.338 20.238 20.137 19.855 -6 ,8634 ,TETRA ,17699257,Sat Dec 4 17:28:39 CET,Sat Dec 4 19:28:18 CET,0.0 0.428 0.644 0.811 0.958 1.099 1.236 1.369 1.63 1.747 1.854 1.861 2.159 2.258 2.455 2.636 2.807 2.89 3.044 3.208 3.452 3.602 3.761 4.002 4.217 4.422 4.635 4.838 5.068 5.291 5.522 5.798 6.057 6.315 6.615 6.959 7.314 7.705 8.106 8.549 9.052 9.57 10.153 10.776 11.537 12.409 13.322 14.32 15.497 16.801 18.332 19.599 20.304 20.746 21.02 21.175 21.272 21.325 21.36 21.374 21.369 21.37 21.356 21.323 21.279 21.23 21.168 21.113 21.061 21.006 20.961 20.924 20.884 20.823 20.773 20.715 20.648 20.603 20.565 20.525 20.478 20.416 20.371 20.325 20.298 20.242 20.184 20.12 20.083 19.869 19.963 19.917 19.866 19.769 19.711 19.64 19.57 19.505 19.416 19.322 19.226 -7 ,5146 ,TETRA ,17699258,Sat Dec 4 17:28:38 CET,Sat Dec 4 19:27:30 CET,0.0 0.378 0.627 0.84 1.009 1.138 1.258 1.386 1.639 1.749 1.865 1.904 2.204 2.314 2.518 2.702 2.884 2.975 3.156 3.337 3.579 3.732 3.886 4.106 4.317 4.506 4.698 4.899 5.152 5.395 5.626 5.903 6.177 6.447 6.749 7.099 7.438 7.781 8.133 8.499 8.893 9.341 9.884 10.463 11.122 11.833 12.682 13.672 14.79 16.08 17.656 18.957 19.749 20.227 20.513 20.678 20.779 20.845 20.865 20.857 20.842 20.83 20.807 20.77 20.729 20.699 20.663 20.616 20.564 20.499 20.435 20.382 20.333 20.29 20.251 20.197 20.139 20.084 20.018 19.983 19.95 19.874 19.824 19.777 19.75 19.692 19.623 19.555 19.527 19.324 19.415 19.36 19.301 19.183 19.126 19.059 18.961 18.86 18.759 18.649 18.419 -8 ,9950 ,TETRA ,17699259,Sat Dec 4 17:28:39 CET,Sat Dec 4 19:28:54 CET,0.0 0.386 0.644 0.849 1.006 1.139 1.261 1.361 1.554 1.662 1.765 1.774 2.057 2.132 2.288 2.446 2.6 2.682 2.837 2.969 3.152 3.277 3.403 3.587 3.767 3.947 4.115 4.279 4.497 4.717 4.935 5.185 5.42 5.654 5.927 6.228 6.525 6.879 7.273 7.693 8.138 8.63 9.201 9.752 10.396 11.112 11.948 12.924 14.081 15.468 17.123 18.443 19.187 19.677 19.991 20.164 20.267 20.349 20.37 20.36 20.349 20.328 20.301 20.279 20.253 20.22 20.172 20.11 20.046 19.982 19.93 19.884 19.837 19.796 19.756 19.712 19.661 19.599 19.537 19.503 19.471 19.41 19.354 19.303 19.277 19.216 19.155 19.097 19.065 18.857 18.977 18.94 18.883 18.772 18.714 18.644 18.579 18.507 18.422 18.334 18.19 -9 ,21344 ,TETRA ,17699260,Sat Dec 4 17:28:38 CET,Sat Dec 4 19:25:37 CET,0.0 0.341 0.565 0.764 0.925 1.071 1.203 1.322 1.53 1.634 1.746 1.759 2.05 2.147 2.337 2.528 2.719 2.812 2.983 3.14 3.382 3.542 3.686 3.893 4.123 4.333 4.521 4.721 4.971 5.205 5.434 5.705 5.982 6.26 6.57 6.911 7.251 7.651 8.106 8.571 9.045 9.583 10.193 10.792 11.493 12.3 13.231 14.278 15.45 16.81 18.382 19.616 20.363 20.834 21.118 21.291 21.363 21.399 21.425 21.436 21.427 21.378 21.337 21.32 21.299 21.258 21.204 21.166 21.12 21.063 21.002 20.954 20.908 20.871 20.836 20.794 20.768 20.734 20.686 20.653 20.618 20.554 20.509 20.469 20.45 20.402 20.342 20.266 20.229 20.019 20.111 20.068 20.02 19.928 19.876 19.812 19.731 19.653 19.594 19.495 19.252 -10 ,15396 ,TETRA ,17699261,Sat Dec 4 17:29:21 CET,Sat Dec 4 19:30:14 CET,0.0 0.311 0.521 0.688 0.832 0.962 1.082 1.192 1.407 1.52 1.632 1.641 1.942 2.037 2.213 2.41 2.597 2.68 2.848 3.015 3.264 3.42 3.56 3.766 3.987 4.191 4.385 4.583 4.825 5.065 5.302 5.573 5.839 6.113 6.442 6.801 7.142 7.521 7.931 8.364 8.833 9.388 9.998 10.606 11.331 12.167 13.141 14.193 15.439 16.891 18.578 19.888 20.6 21.04 21.336 21.568 21.712 21.783 21.801 21.8 21.776 21.727 21.685 21.644 21.594 21.544 21.487 21.432 21.377 21.32 21.263 21.205 21.135 21.053 20.992 20.934 20.878 20.821 20.762 20.729 20.695 20.639 20.594 20.541 20.519 20.475 20.426 20.372 20.34 20.131 20.245 20.205 20.166 20.095 20.033 19.967 19.918 19.853 19.785 19.672 19.364 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5e.txt deleted file mode 100644 index 61d13401..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25938 ,TETRA ,17699262,Sat Dec 4 17:28:38 CET,Sat Dec 4 19:30:48 CET,0.0 0.486 0.768 0.994 1.141 1.266 1.385 1.492 1.679 1.754 1.827 1.771 2.037 2.108 2.238 2.357 2.47 2.527 2.653 2.779 2.941 3.032 3.112 3.229 3.335 3.425 3.525 3.632 3.773 3.912 4.05 4.217 4.355 4.466 4.588 4.724 4.853 5.004 5.172 5.33 5.525 5.752 5.992 6.228 6.427 6.566 6.679 6.823 6.957 6.935 6.59 5.851 5.168 4.609 4.106 3.649 3.212 2.803 2.452 2.09 1.808 1.57 1.328 1.1 0.884 0.671 0.445 0.221 0.01 -0.186 -0.369 -0.517 -0.661 -0.812 -0.932 -1.048 -1.162 -1.292 -1.432 -1.525 -1.632 -1.823 -1.958 -2.095 -2.165 -2.307 -2.447 -2.588 -2.653 -2.933 -2.926 -3.025 -3.111 -3.265 -3.354 -3.455 -3.573 -3.714 -3.855 -4.013 -4.225 -2 ,1643 ,TETRA ,17699263,Sat Dec 4 17:28:39 CET,Sat Dec 4 19:30:25 CET,0.0 0.574 0.849 1.057 1.205 1.332 1.446 1.555 1.741 1.811 1.877 1.821 2.09 2.167 2.295 2.402 2.512 2.56 2.652 2.743 2.863 2.941 3.03 3.142 3.236 3.342 3.451 3.547 3.668 3.781 3.896 4.043 4.165 4.279 4.414 4.565 4.697 4.834 4.984 5.14 5.292 5.46 5.645 5.81 5.988 6.163 6.354 6.516 6.587 6.507 6.112 5.414 4.701 4.088 3.59 3.088 2.648 2.271 1.898 1.486 1.13 0.8 0.482 0.202 -0.035 -0.235 -0.436 -0.607 -0.756 -0.91 -1.067 -1.216 -1.367 -1.509 -1.623 -1.746 -1.864 -1.978 -2.114 -2.219 -2.324 -2.486 -2.599 -2.721 -2.783 -2.914 -3.067 -3.213 -3.285 -3.557 -3.498 -3.579 -3.66 -3.851 -3.954 -4.064 -4.186 -4.336 -4.504 -4.694 -5.014 -3 ,28813 ,TETRA ,17699264,Sat Dec 4 17:28:42 CET,Sat Dec 4 19:27:51 CET,0.0 0.308 0.476 0.599 0.71 0.825 0.944 1.057 1.259 1.347 1.436 1.406 1.665 1.722 1.864 2.015 2.142 2.198 2.3 2.385 2.501 2.587 2.684 2.832 2.974 3.108 3.236 3.362 3.51 3.625 3.738 3.884 4.014 4.122 4.245 4.375 4.497 4.659 4.824 5.011 5.192 5.345 5.523 5.689 5.872 6.052 6.246 6.428 6.494 6.4 5.955 5.163 4.451 3.838 3.291 2.799 2.347 1.909 1.538 1.18 0.874 0.59 0.307 0.03 -0.224 -0.425 -0.616 -0.789 -0.942 -1.104 -1.273 -1.405 -1.563 -1.741 -1.871 -1.993 -2.114 -2.244 -2.375 -2.462 -2.555 -2.719 -2.835 -2.954 -3.013 -3.134 -3.269 -3.414 -3.489 -3.763 -3.682 -3.742 -3.805 -3.934 -4.008 -4.104 -4.211 -4.315 -4.41 -4.571 -4.898 -4 ,20363 ,TETRA ,17699265,Sat Dec 4 17:28:43 CET,Sat Dec 4 19:27:45 CET,0.0 0.819 1.028 1.152 1.287 1.408 1.492 1.571 1.731 1.806 1.877 1.84 2.099 2.156 2.275 2.386 2.489 2.541 2.647 2.749 2.898 2.984 3.059 3.171 3.277 3.381 3.48 3.577 3.698 3.801 3.899 4.019 4.131 4.261 4.431 4.617 4.776 4.932 5.103 5.308 5.53 5.767 6.054 6.291 6.498 6.729 6.984 7.252 7.421 7.346 6.934 6.168 5.474 4.856 4.305 3.825 3.405 3.011 2.653 2.322 2.037 1.773 1.54 1.324 1.116 0.92 0.711 0.523 0.358 0.167 -0.041 -0.209 -0.383 -0.555 -0.681 -0.804 -0.931 -1.059 -1.197 -1.296 -1.387 -1.531 -1.641 -1.755 -1.816 -1.943 -2.061 -2.176 -2.235 -2.501 -2.449 -2.529 -2.6 -2.753 -2.839 -2.919 -3.002 -3.126 -3.263 -3.384 -3.561 -5 ,29242 ,TETRA ,17699266,Sat Dec 4 17:28:39 CET,Sat Dec 4 19:28:06 CET,0.0 0.265 0.455 0.617 0.72 0.834 0.949 1.04 1.209 1.286 1.363 1.319 1.578 1.639 1.75 1.849 1.945 1.999 2.098 2.183 2.312 2.398 2.487 2.614 2.736 2.867 2.993 3.115 3.284 3.449 3.588 3.737 3.889 4.043 4.212 4.396 4.557 4.718 4.882 5.044 5.212 5.394 5.594 5.767 5.945 6.124 6.301 6.436 6.496 6.406 5.998 5.301 4.651 4.034 3.416 2.852 2.391 1.997 1.633 1.227 0.904 0.645 0.386 0.151 -0.064 -0.269 -0.479 -0.666 -0.822 -0.971 -1.135 -1.266 -1.389 -1.522 -1.626 -1.734 -1.844 -1.962 -2.09 -2.172 -2.26 -2.406 -2.501 -2.602 -2.658 -2.783 -2.906 -3.024 -3.081 -3.344 -3.286 -3.369 -3.446 -3.601 -3.703 -3.807 -3.901 -4.017 -4.161 -4.321 -4.569 -6 ,9351 ,TETRA ,17699267,Sat Dec 4 17:28:44 CET,Sat Dec 4 19:27:53 CET,0.0 0.261 0.444 0.621 0.775 0.905 1.017 1.114 1.289 1.384 1.481 1.457 1.734 1.801 1.935 2.065 2.18 2.238 2.347 2.447 2.592 2.678 2.758 2.875 3.0 3.132 3.26 3.385 3.542 3.695 3.828 3.973 4.13 4.267 4.402 4.544 4.675 4.824 4.995 5.224 5.481 5.719 5.927 6.114 6.282 6.412 6.543 6.634 6.626 6.507 6.149 5.452 4.756 4.101 3.495 2.978 2.545 2.163 1.836 1.487 1.166 0.88 0.626 0.385 0.15 -0.11 -0.373 -0.567 -0.733 -0.901 -1.085 -1.234 -1.397 -1.582 -1.73 -1.879 -2.031 -2.195 -2.37 -2.483 -2.59 -2.758 -2.876 -2.993 -3.052 -3.173 -3.304 -3.435 -3.499 -3.767 -3.707 -3.785 -3.869 -4.077 -4.198 -4.314 -4.422 -4.533 -4.655 -4.816 -5.113 -7 ,12861 ,TETRA ,17699268,Sat Dec 4 17:28:39 CET,Sat Dec 4 19:29:55 CET,0.0 0.33 0.526 0.671 0.761 0.845 0.936 1.03 1.206 1.278 1.346 1.31 1.585 1.66 1.784 1.89 1.99 2.039 2.138 2.226 2.362 2.453 2.544 2.676 2.788 2.885 2.973 3.068 3.194 3.311 3.419 3.547 3.681 3.802 3.964 4.168 4.365 4.579 4.752 4.904 5.06 5.213 5.366 5.52 5.681 5.846 6.016 6.126 6.191 6.145 5.728 4.971 4.288 3.661 3.044 2.401 1.881 1.491 1.156 0.819 0.505 0.214 -0.039 -0.286 -0.551 -0.793 -1.045 -1.26 -1.447 -1.657 -1.874 -2.046 -2.228 -2.424 -2.574 -2.72 -2.849 -2.986 -3.142 -3.249 -3.36 -3.529 -3.642 -3.753 -3.808 -3.929 -4.066 -4.221 -4.297 -4.576 -4.541 -4.62 -4.703 -4.881 -4.973 -5.082 -5.188 -5.292 -5.408 -5.565 -6.041 -8 ,24265 ,TETRA ,17699269,Sat Dec 4 17:28:41 CET,Sat Dec 4 19:29:42 CET,0.0 0.827 1.148 1.303 1.43 1.556 1.653 1.731 1.886 1.97 2.064 2.018 2.278 2.344 2.473 2.563 2.654 2.704 2.8 2.901 3.041 3.121 3.195 3.311 3.433 3.542 3.64 3.754 3.903 4.028 4.153 4.299 4.428 4.558 4.695 4.83 4.965 5.107 5.282 5.515 5.739 5.956 6.161 6.314 6.484 6.641 6.779 6.902 6.95 6.825 6.432 5.73 5.069 4.458 3.923 3.436 2.981 2.596 2.289 1.971 1.672 1.399 1.143 0.905 0.702 0.504 0.28 0.091 -0.069 -0.233 -0.397 -0.539 -0.692 -0.839 -0.953 -1.077 -1.201 -1.323 -1.449 -1.543 -1.649 -1.819 -1.924 -2.031 -2.086 -2.197 -2.314 -2.441 -2.509 -2.771 -2.701 -2.774 -2.855 -3.038 -3.129 -3.237 -3.355 -3.464 -3.571 -3.689 -3.949 -9 ,16999 ,TETRA ,17699270,Sat Dec 4 17:28:39 CET,Sat Dec 4 19:15:52 CET,0.0 0.514 0.707 0.857 0.985 1.102 1.221 1.342 1.554 1.63 1.708 1.673 1.938 1.998 2.108 2.213 2.318 2.375 2.477 2.574 2.72 2.81 2.897 3.024 3.148 3.268 3.369 3.471 3.606 3.729 3.841 3.957 4.079 4.199 4.326 4.472 4.611 4.753 4.886 5.031 5.209 5.414 5.619 5.791 5.976 6.17 6.351 6.476 6.532 6.445 6.045 5.379 4.73 4.083 3.517 3.016 2.545 2.094 1.677 1.244 0.867 0.523 0.23 -0.006 -0.22 -0.407 -0.591 -0.758 -0.909 -1.063 -1.214 -1.34 -1.512 -1.728 -1.898 -2.079 -2.264 -2.454 -2.649 -2.787 -2.928 -3.141 -3.286 -3.435 -3.513 -3.676 -3.84 -4.015 -4.112 -4.413 -4.418 -4.532 -4.638 -4.86 -4.964 -5.072 -5.199 -5.314 -5.415 -5.537 -5.715 -10 ,31921 ,TETRA ,17699271,Sat Dec 4 17:28:39 CET,Sat Dec 4 19:30:44 CET,0.0 0.226 0.401 0.567 0.698 0.821 0.949 1.056 1.235 1.322 1.409 1.377 1.644 1.707 1.848 1.972 2.094 2.154 2.267 2.384 2.551 2.646 2.724 2.84 2.937 3.03 3.128 3.217 3.333 3.463 3.614 3.802 3.975 4.148 4.343 4.554 4.76 4.991 5.242 5.491 5.695 5.865 6.054 6.229 6.394 6.568 6.742 6.872 6.94 6.932 6.659 6.094 5.466 4.825 4.271 3.768 3.336 2.951 2.565 2.131 1.738 1.418 1.122 0.825 0.545 0.279 0.002 -0.235 -0.404 -0.557 -0.724 -0.872 -1.024 -1.181 -1.315 -1.453 -1.592 -1.725 -1.859 -1.964 -2.07 -2.221 -2.318 -2.423 -2.478 -2.573 -2.674 -2.802 -2.868 -3.156 -3.126 -3.192 -3.241 -3.368 -3.446 -3.521 -3.601 -3.702 -3.851 -4.056 -4.223 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_7.txt deleted file mode 100644 index b0e6e779..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32700 ,TETRA ,17699272,Sat Dec 4 17:28:41 CET,Sat Dec 4 19:30:34 CET,0.0 0.272 0.402 0.516 0.65 0.806 0.938 1.055 1.283 1.391 1.491 1.493 1.791 1.882 2.058 2.239 2.413 2.496 2.666 2.83 3.06 3.216 3.373 3.596 3.793 3.983 4.179 4.374 4.612 4.854 5.105 5.393 5.654 5.925 6.251 6.62 6.981 7.359 7.78 8.248 8.745 9.332 10.045 10.771 11.643 12.673 13.881 15.271 17.001 19.158 21.866 24.24 25.713 26.729 27.473 28.043 28.459 28.775 29.009 29.148 29.252 29.371 29.446 29.483 29.5 29.501 29.505 29.497 29.456 29.399 29.339 29.288 29.236 29.203 29.186 29.152 29.122 29.081 29.019 28.967 28.923 28.865 28.809 28.754 28.727 28.662 28.583 28.493 28.443 28.228 28.326 28.296 28.252 28.165 28.125 28.076 28.007 27.908 27.823 27.738 27.488 -2 ,27000 ,TETRA ,17699273,Sat Dec 4 17:28:39 CET,Sat Dec 4 19:30:04 CET,0.0 0.356 0.532 0.665 0.775 0.891 1.008 1.109 1.294 1.387 1.48 1.457 1.74 1.824 1.985 2.164 2.348 2.426 2.578 2.728 2.936 3.078 3.218 3.42 3.617 3.799 3.983 4.167 4.395 4.622 4.852 5.134 5.417 5.692 6.015 6.394 6.771 7.194 7.653 8.149 8.711 9.414 10.208 10.936 11.808 12.819 14.037 15.496 17.304 19.524 22.309 24.755 26.342 27.421 28.18 28.745 29.137 29.412 29.611 29.768 29.855 29.941 30.034 30.113 30.17 30.197 30.218 30.229 30.233 30.219 30.191 30.177 30.171 30.157 30.129 30.092 30.061 30.033 29.996 29.97 29.952 29.917 29.884 29.836 29.81 29.759 29.701 29.637 29.593 29.381 29.464 29.423 29.387 29.293 29.231 29.153 29.079 28.994 28.896 28.755 28.533 -3 ,14304 ,TETRA ,17699274,Sat Dec 4 17:28:39 CET,Sat Dec 4 19:15:52 CET,0.0 0.519 0.685 0.841 0.978 1.11 1.221 1.32 1.52 1.617 1.706 1.699 1.986 2.065 2.219 2.383 2.545 2.623 2.785 2.943 3.161 3.307 3.461 3.689 3.896 4.105 4.314 4.508 4.743 4.978 5.235 5.551 5.859 6.161 6.522 6.942 7.327 7.757 8.24 8.763 9.319 9.938 10.658 11.372 12.24 13.243 14.419 15.806 17.501 19.644 22.455 24.897 26.375 27.405 28.119 28.654 29.04 29.317 29.534 29.718 29.844 29.916 29.955 29.992 30.044 30.082 30.075 30.04 29.999 29.97 29.964 29.943 29.896 29.835 29.786 29.72 29.653 29.595 29.516 29.465 29.426 29.382 29.348 29.302 29.279 29.225 29.164 29.093 29.055 28.854 28.934 28.885 28.826 28.717 28.673 28.625 28.577 28.503 28.358 28.185 27.99 -4 ,7597 ,TETRA ,17699275,Sat Dec 4 17:28:40 CET,Sat Dec 4 19:21:29 CET,0.0 0.303 0.463 0.609 0.725 0.837 0.958 1.067 1.25 1.342 1.437 1.429 1.712 1.792 1.966 2.142 2.311 2.396 2.551 2.696 2.916 3.076 3.235 3.446 3.661 3.885 4.102 4.309 4.575 4.828 5.057 5.322 5.584 5.849 6.152 6.5 6.846 7.235 7.703 8.229 8.78 9.405 10.124 10.834 11.691 12.702 13.93 15.367 17.102 19.23 21.986 24.434 25.968 27.035 27.773 28.239 28.489 28.65 28.761 28.898 29.031 29.123 29.191 29.231 29.255 29.285 29.311 29.296 29.254 29.215 29.18 29.142 29.087 29.019 28.963 28.903 28.84 28.778 28.716 28.657 28.59 28.494 28.431 28.376 28.352 28.287 28.216 28.153 28.122 27.919 28.008 27.963 27.928 27.854 27.806 27.744 27.669 27.586 27.469 27.298 27.019 -5 ,10252 ,TETRA ,17699276,Sat Dec 4 17:28:40 CET,Sat Dec 4 19:16:01 CET,0.0 0.216 0.347 0.464 0.58 0.681 0.777 0.873 1.064 1.165 1.261 1.253 1.531 1.61 1.774 1.951 2.123 2.202 2.357 2.509 2.737 2.878 3.009 3.209 3.402 3.582 3.762 3.952 4.207 4.441 4.666 4.968 5.275 5.559 5.898 6.29 6.664 7.085 7.544 8.017 8.521 9.106 9.804 10.535 11.414 12.428 13.674 15.121 16.828 18.939 21.684 24.061 25.565 26.653 27.396 27.92 28.296 28.584 28.796 28.957 29.01 29.026 29.082 29.143 29.182 29.213 29.23 29.223 29.222 29.222 29.208 29.186 29.154 29.127 29.097 29.05 28.996 28.942 28.889 28.85 28.802 28.723 28.685 28.65 28.628 28.578 28.512 28.431 28.391 28.176 28.24 28.192 28.152 28.045 27.967 27.889 27.82 27.747 27.658 27.512 27.267 -6 ,16696 ,TETRA ,17699277,Sat Dec 4 17:28:40 CET,Sat Dec 4 19:16:22 CET,0.0 0.148 0.279 0.39 0.505 0.614 0.701 0.777 0.943 1.033 1.122 1.098 1.384 1.47 1.64 1.799 1.954 2.035 2.184 2.327 2.53 2.663 2.794 2.982 3.176 3.364 3.548 3.737 3.98 4.225 4.463 4.761 5.062 5.34 5.647 6.009 6.393 6.843 7.343 7.864 8.428 9.094 9.885 10.695 11.674 12.765 13.94 15.278 17.0 19.147 21.847 24.278 25.82 26.867 27.605 28.153 28.559 28.872 29.097 29.289 29.43 29.525 29.577 29.628 29.681 29.718 29.754 29.774 29.781 29.764 29.735 29.731 29.731 29.7 29.659 29.628 29.602 29.572 29.535 29.5 29.45 29.366 29.318 29.279 29.253 29.18 29.122 29.082 29.061 28.859 28.943 28.892 28.854 28.78 28.725 28.656 28.589 28.53 28.457 28.371 28.215 -7 ,16734 ,TETRA ,17699278,Sat Dec 4 17:28:41 CET,Sat Dec 4 19:29:05 CET,0.0 0.175 0.313 0.437 0.563 0.693 0.817 0.952 1.191 1.289 1.381 1.354 1.646 1.739 1.919 2.093 2.263 2.353 2.517 2.666 2.893 3.046 3.19 3.391 3.575 3.757 3.947 4.13 4.373 4.615 4.84 5.109 5.379 5.655 5.986 6.349 6.701 7.1 7.532 7.994 8.493 9.081 9.803 10.576 11.493 12.51 13.714 15.108 16.772 18.828 21.484 23.834 25.239 26.183 26.874 27.398 27.8 28.087 28.296 28.467 28.578 28.685 28.772 28.825 28.856 28.873 28.86 28.846 28.846 28.838 28.829 28.825 28.822 28.816 28.807 28.79 28.763 28.731 28.698 28.667 28.637 28.587 28.542 28.485 28.454 28.397 28.337 28.26 28.222 28.026 28.13 28.088 28.039 27.952 27.899 27.831 27.76 27.687 27.578 27.445 27.116 -8 ,17956 ,TETRA ,17699279,Sat Dec 4 17:28:43 CET,Sat Dec 4 19:28:44 CET,0.0 0.221 0.401 0.564 0.689 0.81 0.915 1.019 1.24 1.345 1.439 1.41 1.69 1.78 1.946 2.091 2.235 2.318 2.492 2.657 2.898 3.039 3.174 3.376 3.575 3.754 3.917 4.087 4.331 4.577 4.822 5.128 5.429 5.717 6.029 6.376 6.716 7.097 7.54 8.062 8.618 9.263 10.053 10.87 11.793 12.783 13.949 15.323 17.05 19.208 22.002 24.443 26.009 27.064 27.757 28.293 28.687 28.951 29.162 29.36 29.502 29.595 29.653 29.703 29.758 29.806 29.818 29.82 29.83 29.838 29.846 29.842 29.823 29.8 29.789 29.78 29.766 29.742 29.725 29.718 29.699 29.67 29.645 29.614 29.594 29.557 29.515 29.457 29.429 29.223 29.308 29.274 29.232 29.127 29.065 28.992 28.91 28.813 28.68 28.528 28.109 -9 ,21434 ,TETRA ,17699280,Sat Dec 4 17:28:41 CET,Sat Dec 4 19:29:01 CET,0.0 0.162 0.366 0.55 0.672 0.772 0.875 0.974 1.175 1.28 1.376 1.359 1.643 1.729 1.896 2.07 2.242 2.33 2.509 2.667 2.888 3.042 3.195 3.41 3.616 3.818 4.011 4.196 4.438 4.676 4.917 5.215 5.497 5.774 6.102 6.497 6.909 7.373 7.85 8.35 8.901 9.531 10.292 11.093 12.044 13.135 14.46 16.006 17.825 20.021 22.828 25.345 26.954 28.042 28.79 29.369 29.793 30.103 30.338 30.536 30.664 30.768 30.857 30.902 30.911 30.914 30.91 30.92 30.929 30.927 30.921 30.906 30.881 30.864 30.854 30.825 30.783 30.732 30.675 30.632 30.587 30.515 30.463 30.407 30.38 30.332 30.283 30.231 30.203 30.002 30.089 30.05 30.001 29.898 29.856 29.802 29.729 29.66 29.592 29.417 29.177 -10 ,1087 ,TETRA ,17699281,Sat Dec 4 17:29:22 CET,Sat Dec 4 19:16:54 CET,0.0 0.308 0.455 0.595 0.729 0.853 0.977 1.09 1.291 1.391 1.491 1.467 1.746 1.833 2.03 2.224 2.398 2.479 2.641 2.807 3.062 3.221 3.368 3.581 3.79 3.996 4.186 4.374 4.618 4.858 5.104 5.399 5.697 5.98 6.296 6.668 7.03 7.414 7.818 8.282 8.791 9.366 10.043 10.739 11.594 12.578 13.751 15.133 16.83 18.954 21.714 24.103 25.585 26.564 27.154 27.592 27.889 28.06 28.199 28.331 28.439 28.534 28.62 28.673 28.67 28.65 28.622 28.585 28.545 28.519 28.52 28.53 28.528 28.484 28.43 28.375 28.324 28.279 28.224 28.178 28.129 28.065 28.02 27.962 27.929 27.872 27.813 27.73 27.687 27.471 27.541 27.498 27.455 27.355 27.281 27.198 27.108 27.003 26.896 26.789 26.646 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5e_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5e_5a.txt deleted file mode 100644 index ed80d597..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5e_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26801 ,TETRA ,17699282,Sat Dec 4 17:29:22 CET,Sat Dec 4 19:28:40 CET,0.0 0.306 0.524 0.702 0.841 0.957 1.06 1.168 1.364 1.441 1.504 1.434 1.695 1.747 1.86 1.981 2.094 2.15 2.263 2.37 2.536 2.643 2.755 2.925 3.074 3.207 3.329 3.455 3.62 3.775 3.937 4.136 4.311 4.476 4.682 4.918 5.132 5.365 5.61 5.866 6.125 6.432 6.807 7.165 7.582 8.076 8.606 9.15 9.798 10.44 11.086 11.475 11.497 11.329 11.099 10.872 10.679 10.406 10.131 9.88 9.625 9.36 9.103 8.891 8.706 8.523 8.333 8.177 8.046 7.904 7.737 7.599 7.451 7.271 7.134 7.002 6.861 6.712 6.554 6.446 6.334 6.157 6.039 5.914 5.849 5.715 5.565 5.382 5.294 5.008 4.998 4.894 4.794 4.591 4.479 4.348 4.203 4.048 3.824 3.514 2.91 -2 ,16021 ,TETRA ,17699283,Sat Dec 4 17:31:11 CET,Sat Dec 4 19:31:01 CET,0.0 0.384 0.532 0.633 0.723 0.81 0.889 0.97 1.124 1.191 1.252 1.19 1.459 1.519 1.644 1.753 1.852 1.896 1.986 2.081 2.21 2.293 2.372 2.483 2.606 2.739 2.87 2.996 3.149 3.305 3.459 3.629 3.807 3.976 4.152 4.36 4.566 4.78 5.012 5.266 5.527 5.81 6.161 6.551 6.996 7.439 7.91 8.445 9.137 9.911 10.639 11.005 11.023 10.878 10.697 10.518 10.309 10.066 9.83 9.563 9.321 9.101 8.877 8.669 8.481 8.303 8.099 7.908 7.747 7.57 7.383 7.227 7.074 6.926 6.808 6.698 6.599 6.48 6.336 6.222 6.082 5.866 5.734 5.601 5.526 5.365 5.205 5.044 4.962 4.668 4.65 4.544 4.431 4.186 4.059 3.931 3.8 3.633 3.417 3.109 2.558 -3 ,21038 ,TETRA ,17699284,Sat Dec 4 17:29:22 CET,Sat Dec 4 19:21:43 CET,0.0 0.223 0.409 0.54 0.643 0.731 0.831 0.924 1.073 1.149 1.23 1.171 1.435 1.491 1.607 1.723 1.834 1.895 2.03 2.162 2.355 2.475 2.58 2.734 2.892 3.02 3.133 3.237 3.373 3.544 3.72 3.914 4.109 4.314 4.551 4.811 5.061 5.306 5.541 5.799 6.062 6.362 6.702 7.017 7.408 7.864 8.367 8.913 9.525 10.177 10.766 10.966 10.872 10.611 10.293 10.002 9.714 9.422 9.182 8.955 8.744 8.499 8.279 8.085 7.895 7.727 7.524 7.339 7.185 7.03 6.852 6.681 6.489 6.283 6.139 6.001 5.855 5.706 5.56 5.45 5.33 5.159 5.034 4.892 4.817 4.66 4.493 4.305 4.21 3.93 3.943 3.856 3.781 3.615 3.505 3.36 3.203 3.033 2.824 2.519 1.441 -4 ,23482 ,TETRA ,17699285,Sat Dec 4 17:29:22 CET,Sat Dec 4 19:27:28 CET,0.0 0.283 0.424 0.512 0.606 0.707 0.8 0.888 1.064 1.145 1.217 1.153 1.424 1.491 1.631 1.77 1.892 1.942 2.043 2.146 2.283 2.372 2.458 2.581 2.703 2.817 2.928 3.034 3.177 3.317 3.443 3.617 3.81 3.991 4.18 4.387 4.579 4.793 5.057 5.345 5.611 5.88 6.199 6.546 6.971 7.437 7.94 8.524 9.204 9.898 10.579 10.915 10.873 10.699 10.494 10.286 10.084 9.837 9.603 9.369 9.144 8.937 8.74 8.53 8.318 8.122 7.886 7.636 7.424 7.238 7.068 6.928 6.778 6.603 6.463 6.31 6.137 5.962 5.775 5.643 5.499 5.265 5.118 4.975 4.899 4.748 4.594 4.415 4.312 4.011 3.981 3.861 3.744 3.509 3.382 3.226 3.05 2.86 2.634 2.348 1.562 -5 ,9812 ,TETRA ,17699286,Sat Dec 4 17:29:22 CET,Sat Dec 4 19:27:24 CET,0.0 0.145 0.286 0.448 0.581 0.696 0.797 0.884 1.046 1.123 1.196 1.137 1.416 1.487 1.61 1.705 1.802 1.851 1.951 2.062 2.21 2.296 2.384 2.521 2.659 2.799 2.926 3.043 3.211 3.382 3.531 3.71 3.882 4.045 4.247 4.463 4.663 4.893 5.121 5.373 5.657 5.99 6.395 6.771 7.158 7.596 8.111 8.669 9.308 9.937 10.454 10.62 10.509 10.364 10.178 9.978 9.742 9.462 9.22 8.969 8.745 8.541 8.348 8.183 8.025 7.86 7.687 7.523 7.355 7.164 6.941 6.74 6.518 6.293 6.139 5.988 5.833 5.67 5.5 5.377 5.246 5.053 4.923 4.79 4.718 4.57 4.424 4.27 4.182 3.886 3.881 3.784 3.687 3.442 3.32 3.201 3.041 2.852 2.667 2.444 2.075 -6 ,809 ,TETRA ,17699287,Sat Dec 4 17:29:22 CET,Sat Dec 4 19:28:34 CET,0.0 0.244 0.352 0.445 0.528 0.619 0.71 0.793 0.939 1.011 1.082 1.018 1.296 1.369 1.508 1.64 1.77 1.827 1.927 2.019 2.153 2.251 2.346 2.467 2.588 2.707 2.821 2.935 3.07 3.195 3.329 3.516 3.693 3.841 4.019 4.226 4.417 4.632 4.87 5.128 5.403 5.714 6.07 6.416 6.808 7.235 7.769 8.413 9.114 9.838 10.526 10.832 10.863 10.754 10.572 10.303 9.997 9.716 9.475 9.186 8.869 8.578 8.313 8.075 7.842 7.621 7.409 7.228 7.066 6.891 6.706 6.539 6.363 6.178 6.03 5.886 5.733 5.552 5.373 5.264 5.144 4.951 4.823 4.691 4.622 4.486 4.352 4.206 4.133 3.864 3.902 3.809 3.701 3.477 3.366 3.243 3.118 2.955 2.72 2.463 2.082 -7 ,6552 ,TETRA ,17699288,Sat Dec 4 17:29:22 CET,Sat Dec 4 19:28:06 CET,0.0 0.417 0.563 0.683 0.789 0.888 1.008 1.108 1.254 1.336 1.415 1.344 1.608 1.67 1.803 1.933 2.06 2.123 2.257 2.392 2.577 2.684 2.792 2.967 3.136 3.301 3.465 3.614 3.785 3.952 4.126 4.341 4.543 4.746 4.977 5.226 5.488 5.777 6.082 6.425 6.789 7.174 7.575 7.929 8.335 8.806 9.365 10.007 10.717 11.442 12.025 12.213 12.152 11.947 11.709 11.44 11.131 10.761 10.436 10.147 9.895 9.667 9.435 9.233 9.061 8.896 8.714 8.533 8.376 8.213 8.045 7.892 7.708 7.512 7.362 7.22 7.066 6.899 6.73 6.615 6.493 6.296 6.162 6.024 5.961 5.831 5.681 5.528 5.445 5.153 5.159 5.058 4.948 4.712 4.591 4.469 4.323 4.129 3.931 3.754 3.151 -8 ,17041 ,TETRA ,17699289,Sat Dec 4 17:29:24 CET,Sat Dec 4 19:28:54 CET,0.0 0.16 0.321 0.459 0.568 0.667 0.759 0.846 1.006 1.084 1.157 1.093 1.368 1.434 1.558 1.678 1.791 1.84 1.931 2.028 2.17 2.275 2.368 2.49 2.615 2.727 2.838 2.943 3.091 3.251 3.412 3.601 3.797 3.976 4.156 4.369 4.568 4.779 5.004 5.244 5.49 5.767 6.113 6.475 6.908 7.364 7.868 8.458 9.123 9.835 10.605 10.997 11.052 10.994 10.814 10.587 10.376 10.157 9.924 9.654 9.382 9.122 8.886 8.682 8.495 8.323 8.143 7.975 7.828 7.668 7.488 7.333 7.182 7.034 6.903 6.758 6.635 6.502 6.35 6.243 6.132 5.956 5.825 5.698 5.641 5.512 5.369 5.231 5.148 4.856 4.853 4.749 4.639 4.391 4.263 4.121 3.952 3.772 3.533 3.223 2.528 -9 ,1902 ,TETRA ,17699290,Sat Dec 4 17:29:26 CET,Sat Dec 4 19:28:45 CET,0.0 0.227 0.356 0.484 0.628 0.74 0.828 0.922 1.118 1.207 1.274 1.2 1.462 1.514 1.621 1.731 1.842 1.891 1.978 2.061 2.189 2.285 2.389 2.549 2.691 2.825 2.956 3.075 3.23 3.38 3.522 3.694 3.855 4.017 4.203 4.412 4.633 4.909 5.198 5.48 5.79 6.112 6.46 6.816 7.24 7.7 8.209 8.773 9.378 9.95 10.502 10.816 10.844 10.753 10.565 10.314 10.063 9.836 9.596 9.347 9.148 8.947 8.771 8.61 8.431 8.244 8.06 7.897 7.762 7.635 7.478 7.327 7.172 7.024 6.91 6.789 6.653 6.499 6.341 6.231 6.097 5.874 5.736 5.607 5.541 5.383 5.206 5.035 4.954 4.672 4.696 4.598 4.484 4.227 4.102 3.949 3.75 3.552 3.335 3.079 2.635 -10 ,10217 ,TETRA ,17699291,Sat Dec 4 17:29:23 CET,Sat Dec 4 19:29:04 CET,0.0 0.22 0.363 0.489 0.593 0.686 0.786 0.892 1.066 1.145 1.222 1.166 1.437 1.504 1.639 1.767 1.888 1.946 2.049 2.14 2.304 2.418 2.524 2.685 2.853 3.021 3.155 3.262 3.404 3.548 3.693 3.877 4.063 4.249 4.444 4.645 4.846 5.051 5.261 5.506 5.776 6.071 6.4 6.748 7.161 7.61 8.131 8.7 9.331 10.002 10.584 10.873 10.938 10.894 10.749 10.51 10.256 10.036 9.83 9.579 9.362 9.174 8.979 8.79 8.602 8.412 8.223 8.055 7.899 7.735 7.569 7.434 7.259 7.056 6.913 6.774 6.629 6.49 6.349 6.242 6.121 5.933 5.823 5.704 5.633 5.479 5.335 5.183 5.1 4.823 4.822 4.721 4.619 4.364 4.244 4.113 3.942 3.727 3.471 3.173 2.603 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5g.txt deleted file mode 100644 index c1a5b274..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7193 ,TETRA ,17699292,Sat Dec 4 17:29:26 CET,Sat Dec 4 19:28:31 CET,0.0 0.204 0.36 0.535 0.666 0.755 0.831 0.913 1.065 1.136 1.197 1.124 1.358 1.414 1.512 1.603 1.689 1.727 1.812 1.905 2.02 2.095 2.179 2.3 2.405 2.495 2.581 2.66 2.75 2.828 2.905 3.015 3.114 3.202 3.296 3.385 3.459 3.519 3.581 3.665 3.76 3.837 3.902 3.958 3.978 3.986 3.954 3.822 3.56 3.025 1.949 0.614 -0.512 -1.467 -2.285 -3.031 -3.69 -4.297 -4.813 -5.265 -5.634 -6.005 -6.349 -6.652 -6.96 -7.242 -7.495 -7.709 -7.898 -8.099 -8.32 -8.506 -8.701 -8.902 -9.06 -9.223 -9.38 -9.551 -9.725 -9.844 -9.966 -10.164 -10.307 -10.452 -10.523 -10.646 -10.771 -10.916 -10.991 -11.258 -11.218 -11.289 -11.367 -11.521 -11.6 -11.69 -11.791 -11.893 -11.988 -12.099 -12.43 -2 ,8269 ,TETRA ,17699293,Sat Dec 4 17:29:28 CET,Sat Dec 4 19:29:16 CET,0.0 0.137 0.237 0.323 0.418 0.523 0.63 0.735 0.881 0.952 1.026 0.977 1.224 1.293 1.405 1.502 1.587 1.631 1.722 1.811 1.924 1.987 2.052 2.15 2.249 2.346 2.435 2.528 2.644 2.742 2.837 2.944 3.027 3.091 3.181 3.288 3.385 3.483 3.57 3.643 3.73 3.832 3.92 3.97 4.0 4.013 3.985 3.896 3.656 3.153 2.148 0.832 -0.318 -1.305 -2.144 -2.874 -3.515 -4.086 -4.555 -5.029 -5.428 -5.767 -6.082 -6.362 -6.614 -6.856 -7.128 -7.377 -7.572 -7.761 -7.954 -8.111 -8.281 -8.468 -8.612 -8.752 -8.892 -9.047 -9.219 -9.326 -9.436 -9.617 -9.738 -9.86 -9.92 -10.045 -10.176 -10.295 -10.36 -10.624 -10.59 -10.661 -10.729 -10.913 -11.022 -11.12 -11.221 -11.35 -11.486 -11.631 -11.872 -3 ,24745 ,TETRA ,17699294,Sat Dec 4 17:29:24 CET,Sat Dec 4 19:28:59 CET,0.0 0.181 0.294 0.399 0.507 0.609 0.696 0.763 0.871 0.918 0.968 0.911 1.148 1.214 1.327 1.42 1.513 1.557 1.644 1.733 1.844 1.912 1.98 2.067 2.144 2.217 2.279 2.341 2.434 2.525 2.612 2.709 2.79 2.857 2.938 3.049 3.163 3.277 3.392 3.528 3.677 3.834 3.981 4.073 4.151 4.163 4.09 3.955 3.664 3.124 2.1 0.792 -0.36 -1.346 -2.145 -2.846 -3.436 -3.956 -4.403 -4.826 -5.176 -5.503 -5.85 -6.178 -6.462 -6.714 -6.967 -7.201 -7.402 -7.591 -7.78 -7.939 -8.112 -8.292 -8.434 -8.576 -8.73 -8.882 -9.025 -9.125 -9.225 -9.383 -9.496 -9.604 -9.654 -9.758 -9.877 -10.007 -10.076 -10.332 -10.284 -10.363 -10.446 -10.604 -10.687 -10.794 -10.921 -11.059 -11.233 -11.433 -11.772 -4 ,11946 ,TETRA ,17699295,Sat Dec 4 17:29:24 CET,Sat Dec 4 19:28:45 CET,0.0 0.275 0.459 0.608 0.72 0.807 0.894 0.979 1.143 1.211 1.282 1.234 1.47 1.532 1.649 1.758 1.859 1.911 2.016 2.119 2.272 2.358 2.427 2.525 2.614 2.685 2.76 2.839 2.936 3.019 3.093 3.179 3.257 3.332 3.424 3.512 3.589 3.688 3.782 3.855 3.927 4.019 4.118 4.193 4.251 4.248 4.175 4.035 3.728 3.156 2.033 0.634 -0.483 -1.44 -2.278 -3.01 -3.623 -4.162 -4.612 -5.055 -5.447 -5.783 -6.09 -6.389 -6.661 -6.909 -7.166 -7.392 -7.593 -7.787 -7.979 -8.155 -8.329 -8.496 -8.625 -8.755 -8.899 -9.046 -9.19 -9.303 -9.414 -9.569 -9.685 -9.814 -9.881 -10.01 -10.129 -10.267 -10.345 -10.601 -10.548 -10.633 -10.723 -10.913 -11.008 -11.106 -11.209 -11.327 -11.472 -11.625 -11.919 -5 ,30808 ,TETRA ,17699296,Sat Dec 4 17:29:24 CET,Sat Dec 4 19:16:49 CET,0.0 0.412 0.605 0.783 0.93 1.032 1.125 1.223 1.399 1.474 1.534 1.46 1.701 1.765 1.86 1.952 2.054 2.105 2.204 2.292 2.418 2.504 2.582 2.687 2.777 2.87 2.961 3.043 3.149 3.244 3.314 3.385 3.475 3.565 3.651 3.751 3.849 3.943 4.033 4.111 4.176 4.236 4.324 4.423 4.495 4.504 4.434 4.268 3.918 3.329 2.343 1.05 -0.04 -0.963 -1.775 -2.498 -3.121 -3.661 -4.112 -4.577 -5.019 -5.444 -5.828 -6.156 -6.447 -6.699 -6.946 -7.169 -7.368 -7.575 -7.789 -7.971 -8.154 -8.339 -8.482 -8.622 -8.765 -8.912 -9.066 -9.17 -9.263 -9.411 -9.52 -9.635 -9.691 -9.793 -9.903 -10.035 -10.102 -10.353 -10.308 -10.379 -10.461 -10.639 -10.729 -10.818 -10.899 -10.994 -11.118 -11.242 -11.417 -6 ,5610 ,TETRA ,17699297,Sat Dec 4 17:29:24 CET,Sat Dec 4 19:16:56 CET,0.0 0.19 0.361 0.486 0.56 0.613 0.702 0.8 0.932 0.993 1.047 0.986 1.218 1.265 1.364 1.465 1.561 1.603 1.69 1.775 1.905 1.984 2.055 2.166 2.281 2.39 2.489 2.581 2.683 2.786 2.896 3.018 3.128 3.233 3.345 3.458 3.559 3.683 3.798 3.878 3.962 4.071 4.162 4.191 4.198 4.158 4.052 3.876 3.54 3.008 2.056 0.69 -0.502 -1.512 -2.312 -2.975 -3.571 -4.112 -4.594 -5.073 -5.452 -5.808 -6.154 -6.483 -6.806 -7.092 -7.388 -7.65 -7.871 -8.081 -8.278 -8.445 -8.621 -8.815 -8.966 -9.112 -9.256 -9.395 -9.531 -9.625 -9.725 -9.873 -9.976 -10.078 -10.13 -10.251 -10.384 -10.517 -10.59 -10.857 -10.816 -10.887 -10.957 -11.109 -11.191 -11.288 -11.39 -11.494 -11.618 -11.76 -11.943 -7 ,5466 ,TETRA ,17699298,Sat Dec 4 17:29:24 CET,Sat Dec 4 19:16:35 CET,0.0 0.309 0.54 0.671 0.752 0.818 0.892 0.974 1.12 1.187 1.269 1.235 1.464 1.509 1.615 1.727 1.824 1.865 1.942 2.027 2.16 2.251 2.324 2.426 2.534 2.614 2.691 2.776 2.883 2.998 3.102 3.213 3.324 3.429 3.527 3.622 3.697 3.768 3.85 3.922 3.99 4.057 4.095 4.112 4.146 4.161 4.096 3.914 3.58 3.054 2.054 0.695 -0.482 -1.631 -2.577 -3.304 -3.925 -4.483 -4.962 -5.473 -5.945 -6.329 -6.657 -6.99 -7.283 -7.532 -7.829 -8.11 -8.346 -8.568 -8.771 -8.937 -9.117 -9.301 -9.447 -9.597 -9.749 -9.897 -10.042 -10.136 -10.23 -10.372 -10.482 -10.607 -10.67 -10.801 -10.936 -11.064 -11.134 -11.397 -11.357 -11.434 -11.506 -11.647 -11.733 -11.848 -11.967 -12.069 -12.192 -12.327 -12.49 -8 ,28327 ,TETRA ,17699299,Sat Dec 4 17:29:24 CET,Sat Dec 4 19:16:43 CET,0.0 0.268 0.391 0.49 0.579 0.685 0.8 0.882 1.027 1.09 1.156 1.143 1.387 1.441 1.543 1.628 1.694 1.73 1.83 1.925 2.046 2.117 2.165 2.237 2.32 2.41 2.504 2.6 2.702 2.782 2.867 2.976 3.085 3.192 3.297 3.409 3.527 3.637 3.71 3.776 3.865 3.968 4.034 4.087 4.206 4.304 4.268 4.125 3.825 3.254 2.245 0.906 -0.212 -1.171 -1.981 -2.681 -3.323 -3.898 -4.377 -4.843 -5.232 -5.568 -5.875 -6.162 -6.437 -6.692 -6.97 -7.239 -7.47 -7.702 -7.927 -8.088 -8.253 -8.424 -8.554 -8.688 -8.821 -8.957 -9.106 -9.206 -9.312 -9.476 -9.588 -9.712 -9.779 -9.913 -10.054 -10.209 -10.281 -10.545 -10.53 -10.616 -10.702 -10.901 -11.005 -11.094 -11.178 -11.28 -11.399 -11.556 -11.74 -9 ,22002 ,TETRA ,17699300,Sat Dec 4 17:29:24 CET,Sat Dec 4 19:16:48 CET,0.0 0.379 0.566 0.682 0.798 0.912 0.994 1.053 1.188 1.264 1.327 1.256 1.491 1.536 1.615 1.731 1.855 1.906 1.992 2.064 2.176 2.245 2.313 2.434 2.54 2.625 2.71 2.78 2.871 2.96 3.038 3.149 3.263 3.348 3.442 3.553 3.627 3.717 3.826 3.938 4.047 4.156 4.254 4.291 4.301 4.296 4.281 4.179 3.906 3.396 2.352 1.027 -0.099 -1.041 -1.883 -2.624 -3.191 -3.727 -4.198 -4.638 -5.022 -5.364 -5.703 -6.043 -6.35 -6.613 -6.876 -7.12 -7.324 -7.537 -7.766 -7.955 -8.168 -8.381 -8.525 -8.671 -8.813 -8.954 -9.127 -9.248 -9.366 -9.557 -9.676 -9.79 -9.851 -9.979 -10.114 -10.251 -10.313 -10.569 -10.531 -10.618 -10.713 -10.883 -10.966 -11.061 -11.171 -11.27 -11.407 -11.603 -12.035 -10 ,16981 ,TETRA ,17699301,Sat Dec 4 17:29:24 CET,Sat Dec 4 19:30:02 CET,0.0 0.261 0.446 0.567 0.674 0.774 0.859 0.925 1.057 1.136 1.209 1.154 1.391 1.452 1.557 1.655 1.745 1.79 1.867 1.941 2.052 2.125 2.196 2.286 2.376 2.466 2.539 2.606 2.709 2.81 2.907 3.021 3.118 3.207 3.324 3.445 3.524 3.594 3.678 3.767 3.856 3.944 4.024 4.069 4.094 4.124 4.144 4.073 3.813 3.283 2.29 0.997 -0.158 -1.166 -1.972 -2.644 -3.229 -3.757 -4.216 -4.644 -5.001 -5.33 -5.653 -5.96 -6.236 -6.482 -6.738 -6.949 -7.124 -7.317 -7.537 -7.721 -7.894 -8.06 -8.186 -8.323 -8.469 -8.613 -8.765 -8.877 -8.99 -9.161 -9.271 -9.383 -9.438 -9.543 -9.663 -9.79 -9.857 -10.117 -10.067 -10.146 -10.232 -10.41 -10.503 -10.61 -10.714 -10.835 -11.024 -11.232 -11.47 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5i.txt deleted file mode 100644 index c2ff6016..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24903 ,TETRA ,17699302,Sat Dec 4 17:29:25 CET,Sat Dec 4 19:18:00 CET,0.0 0.352 0.489 0.594 0.714 0.821 0.903 0.969 1.107 1.185 1.241 1.164 1.394 1.45 1.558 1.65 1.727 1.762 1.823 1.889 2.002 2.076 2.146 2.236 2.314 2.397 2.487 2.561 2.638 2.705 2.762 2.829 2.908 2.979 3.03 3.082 3.138 3.203 3.296 3.391 3.436 3.483 3.562 3.577 3.495 3.354 3.147 2.824 2.296 1.472 0.047 -1.713 -3.179 -4.354 -5.362 -6.278 -6.998 -7.621 -8.189 -8.759 -9.27 -9.694 -10.047 -10.401 -10.732 -11.036 -11.36 -11.625 -11.842 -12.069 -12.311 -12.506 -12.716 -12.95 -13.124 -13.282 -13.442 -13.597 -13.751 -13.86 -13.969 -14.155 -14.291 -14.423 -14.483 -14.599 -14.724 -14.865 -14.94 -15.212 -15.188 -15.277 -15.358 -15.551 -15.657 -15.752 -15.857 -15.972 -16.13 -16.304 -16.523 -2 ,24545 ,TETRA ,17699303,Sat Dec 4 17:29:25 CET,Sat Dec 4 19:17:55 CET,0.0 0.248 0.406 0.546 0.649 0.757 0.861 0.934 1.055 1.123 1.197 1.14 1.373 1.433 1.559 1.669 1.768 1.81 1.867 1.928 2.033 2.115 2.187 2.266 2.346 2.417 2.477 2.533 2.6 2.658 2.713 2.772 2.817 2.864 2.917 2.98 3.038 3.089 3.146 3.202 3.248 3.287 3.287 3.216 3.169 3.142 2.994 2.682 2.181 1.415 0.035 -1.683 -3.099 -4.253 -5.25 -6.121 -6.859 -7.506 -8.028 -8.548 -8.989 -9.369 -9.746 -10.131 -10.494 -10.831 -11.185 -11.483 -11.731 -11.981 -12.238 -12.449 -12.665 -12.884 -13.041 -13.192 -13.348 -13.513 -13.681 -13.796 -13.908 -14.067 -14.184 -14.309 -14.367 -14.487 -14.615 -14.733 -14.791 -15.052 -14.999 -15.069 -15.15 -15.335 -15.424 -15.529 -15.646 -15.757 -15.863 -15.951 -16.393 -3 ,9090 ,TETRA ,17699304,Sat Dec 4 17:29:25 CET,Sat Dec 4 19:18:13 CET,0.0 0.406 0.566 0.688 0.8 0.892 0.967 1.034 1.2 1.287 1.353 1.286 1.52 1.572 1.675 1.776 1.878 1.928 2.019 2.1 2.217 2.293 2.36 2.441 2.517 2.598 2.681 2.772 2.897 2.981 3.051 3.166 3.259 3.325 3.399 3.455 3.492 3.544 3.62 3.699 3.779 3.862 3.916 3.967 4.02 3.97 3.826 3.625 3.169 2.322 0.884 -0.896 -2.485 -3.778 -4.766 -5.627 -6.355 -7.004 -7.553 -8.088 -8.533 -8.936 -9.32 -9.656 -9.953 -10.229 -10.536 -10.801 -11.02 -11.242 -11.462 -11.644 -11.841 -12.038 -12.201 -12.378 -12.574 -12.783 -12.982 -13.112 -13.247 -13.462 -13.6 -13.722 -13.784 -13.914 -14.038 -14.175 -14.247 -14.51 -14.46 -14.552 -14.644 -14.82 -14.913 -15.027 -15.154 -15.269 -15.405 -15.563 -15.699 -4 ,28488 ,TETRA ,17699305,Sat Dec 4 17:29:25 CET,Sat Dec 4 19:18:02 CET,0.0 0.315 0.455 0.607 0.754 0.885 0.983 1.079 1.247 1.314 1.378 1.326 1.557 1.616 1.731 1.819 1.904 1.948 2.042 2.132 2.256 2.332 2.402 2.499 2.58 2.666 2.749 2.83 2.928 3.017 3.117 3.228 3.322 3.403 3.488 3.59 3.682 3.738 3.764 3.805 3.863 3.895 3.888 3.888 3.94 3.932 3.755 3.459 2.971 2.163 0.754 -0.955 -2.35 -3.517 -4.511 -5.393 -6.121 -6.739 -7.274 -7.846 -8.385 -8.856 -9.245 -9.583 -9.884 -10.147 -10.421 -10.67 -10.917 -11.189 -11.45 -11.659 -11.874 -12.076 -12.228 -12.395 -12.549 -12.707 -12.88 -12.998 -13.112 -13.287 -13.409 -13.534 -13.604 -13.749 -13.894 -14.044 -14.118 -14.375 -14.337 -14.421 -14.498 -14.673 -14.786 -14.897 -14.999 -15.115 -15.262 -15.419 -15.585 -5 ,26497 ,TETRA ,17699306,Sat Dec 4 17:29:25 CET,Sat Dec 4 19:30:41 CET,0.0 0.297 0.494 0.629 0.735 0.853 0.967 1.061 1.227 1.304 1.378 1.352 1.595 1.65 1.743 1.85 1.947 1.987 2.056 2.113 2.214 2.285 2.351 2.447 2.54 2.64 2.733 2.823 2.94 3.027 3.098 3.174 3.26 3.357 3.451 3.54 3.615 3.675 3.737 3.788 3.83 3.866 3.882 3.879 3.818 3.699 3.526 3.237 2.718 1.826 0.275 -1.514 -2.941 -4.158 -5.213 -6.115 -6.924 -7.619 -8.202 -8.821 -9.339 -9.778 -10.171 -10.529 -10.853 -11.153 -11.457 -11.714 -11.928 -12.142 -12.368 -12.544 -12.723 -12.918 -13.057 -13.19 -13.335 -13.486 -13.646 -13.765 -13.884 -14.079 -14.224 -14.368 -14.439 -14.588 -14.75 -14.914 -14.988 -15.244 -15.186 -15.268 -15.357 -15.523 -15.609 -15.707 -15.817 -15.931 -16.05 -16.207 -16.477 -6 ,27412 ,TETRA ,17699307,Sat Dec 4 17:29:26 CET,Sat Dec 4 19:30:38 CET,0.0 0.351 0.51 0.611 0.692 0.786 0.872 0.951 1.097 1.166 1.242 1.224 1.47 1.535 1.671 1.797 1.905 1.948 2.024 2.093 2.186 2.251 2.315 2.417 2.506 2.578 2.641 2.712 2.806 2.875 2.946 3.041 3.115 3.178 3.254 3.327 3.408 3.483 3.541 3.602 3.652 3.72 3.778 3.774 3.748 3.716 3.568 3.283 2.85 2.093 0.732 -0.943 -2.328 -3.523 -4.523 -5.365 -6.157 -6.917 -7.511 -8.065 -8.518 -8.904 -9.27 -9.605 -9.914 -10.235 -10.574 -10.848 -11.061 -11.279 -11.508 -11.689 -11.875 -12.05 -12.186 -12.34 -12.503 -12.672 -12.842 -12.952 -13.06 -13.234 -13.354 -13.477 -13.542 -13.67 -13.804 -13.954 -14.028 -14.29 -14.253 -14.339 -14.422 -14.632 -14.756 -14.877 -14.998 -15.119 -15.249 -15.382 -15.508 -7 ,16324 ,TETRA ,17699308,Sat Dec 4 17:29:28 CET,Sat Dec 4 19:30:53 CET,0.0 0.48 0.64 0.766 0.887 0.986 1.069 1.154 1.327 1.406 1.479 1.45 1.692 1.743 1.842 1.946 2.046 2.087 2.154 2.225 2.329 2.393 2.458 2.54 2.615 2.682 2.749 2.814 2.894 2.973 3.03 3.115 3.217 3.313 3.433 3.553 3.658 3.764 3.866 3.951 4.021 4.067 4.038 3.961 3.87 3.764 3.57 3.279 2.843 2.059 0.618 -1.135 -2.592 -3.807 -4.908 -5.866 -6.58 -7.182 -7.703 -8.215 -8.66 -9.059 -9.429 -9.761 -10.081 -10.393 -10.729 -11.032 -11.287 -11.546 -11.81 -12.03 -12.256 -12.473 -12.63 -12.792 -12.956 -13.117 -13.293 -13.42 -13.537 -13.706 -13.829 -13.967 -14.037 -14.175 -14.326 -14.498 -14.585 -14.869 -14.853 -14.929 -15.011 -15.215 -15.32 -15.418 -15.521 -15.68 -15.888 -16.061 -16.269 -8 ,10930 ,TETRA ,17699309,Sat Dec 4 17:29:31 CET,Sat Dec 4 19:30:15 CET,0.0 0.529 0.689 0.803 0.921 1.034 1.134 1.231 1.418 1.492 1.566 1.538 1.775 1.834 1.939 2.038 2.132 2.18 2.282 2.369 2.484 2.556 2.621 2.704 2.788 2.858 2.92 2.991 3.095 3.193 3.276 3.348 3.389 3.429 3.494 3.567 3.636 3.717 3.824 3.923 3.973 4.012 4.043 4.012 3.91 3.771 3.577 3.28 2.777 1.993 0.53 -1.231 -2.683 -3.916 -4.891 -5.726 -6.463 -7.135 -7.702 -8.275 -8.762 -9.195 -9.617 -10.024 -10.382 -10.675 -11.002 -11.316 -11.575 -11.814 -12.035 -12.215 -12.395 -12.574 -12.721 -12.89 -13.069 -13.244 -13.44 -13.58 -13.718 -13.924 -14.059 -14.203 -14.279 -14.429 -14.575 -14.729 -14.807 -15.085 -15.058 -15.144 -15.233 -15.424 -15.512 -15.586 -15.688 -15.826 -15.951 -16.104 -16.335 -9 ,10818 ,TETRA ,17699310,Sat Dec 4 17:29:25 CET,Sat Dec 4 19:17:48 CET,0.0 0.284 0.458 0.586 0.689 0.811 0.91 0.982 1.135 1.215 1.287 1.225 1.451 1.494 1.58 1.669 1.757 1.801 1.884 1.964 2.076 2.147 2.218 2.31 2.386 2.449 2.509 2.567 2.632 2.699 2.768 2.848 2.922 2.998 3.085 3.154 3.228 3.322 3.386 3.423 3.473 3.525 3.537 3.511 3.45 3.369 3.212 2.951 2.55 1.78 0.386 -1.283 -2.768 -3.991 -4.956 -5.797 -6.524 -7.176 -7.718 -8.251 -8.717 -9.129 -9.507 -9.872 -10.226 -10.532 -10.841 -11.124 -11.353 -11.566 -11.791 -11.981 -12.192 -12.412 -12.563 -12.704 -12.851 -12.999 -13.176 -13.32 -13.468 -13.684 -13.824 -13.973 -14.053 -14.214 -14.384 -14.54 -14.613 -14.885 -14.863 -14.945 -15.02 -15.182 -15.277 -15.379 -15.483 -15.621 -15.788 -15.967 -16.205 -10 ,822 ,TETRA ,17699311,Sat Dec 4 17:29:25 CET,Sat Dec 4 19:17:16 CET,0.0 0.382 0.505 0.61 0.715 0.791 0.863 0.931 1.047 1.116 1.187 1.138 1.375 1.44 1.556 1.656 1.749 1.795 1.876 1.94 2.039 2.111 2.18 2.261 2.336 2.416 2.487 2.554 2.642 2.725 2.799 2.886 2.978 3.068 3.179 3.318 3.443 3.573 3.663 3.699 3.746 3.782 3.779 3.772 3.74 3.629 3.424 3.147 2.734 1.985 0.578 -1.114 -2.501 -3.674 -4.661 -5.572 -6.322 -6.945 -7.502 -8.081 -8.57 -8.999 -9.406 -9.753 -10.056 -10.346 -10.644 -10.911 -11.158 -11.412 -11.67 -11.886 -12.097 -12.296 -12.447 -12.619 -12.798 -12.966 -13.124 -13.225 -13.334 -13.509 -13.626 -13.744 -13.807 -13.96 -14.123 -14.28 -14.361 -14.632 -14.6 -14.683 -14.771 -14.98 -15.088 -15.19 -15.303 -15.449 -15.609 -15.804 -16.039 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5g_5c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5g_5c.txt deleted file mode 100644 index 48cfbf63..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5g_5c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3001 ,TETRA ,17699312,Sat Dec 4 17:29:26 CET,Sat Dec 4 19:26:37 CET,0.0 0.247 0.43 0.578 0.693 0.816 0.931 1.019 1.164 1.24 1.315 1.256 1.5 1.551 1.647 1.741 1.83 1.877 1.965 2.041 2.144 2.207 2.272 2.388 2.506 2.607 2.701 2.788 2.899 2.994 3.088 3.197 3.27 3.323 3.391 3.49 3.577 3.658 3.74 3.807 3.852 3.881 3.891 3.869 3.763 3.593 3.362 2.994 2.406 1.442 -0.333 -2.406 -4.022 -5.38 -6.514 -7.485 -8.328 -9.067 -9.67 -10.315 -10.867 -11.301 -11.711 -12.114 -12.493 -12.818 -13.158 -13.49 -13.793 -14.097 -14.39 -14.624 -14.856 -15.089 -15.282 -15.483 -15.675 -15.874 -16.092 -16.248 -16.397 -16.643 -16.814 -16.982 -17.075 -17.266 -17.452 -17.645 -17.745 -18.054 -18.068 -18.177 -18.288 -18.535 -18.668 -18.809 -18.962 -19.147 -19.358 -19.653 -20.396 -2 ,18583 ,TETRA ,17699313,Sat Dec 4 17:30:16 CET,Sat Dec 4 19:30:04 CET,0.0 0.205 0.323 0.473 0.612 0.707 0.797 0.882 1.079 1.168 1.239 1.203 1.456 1.513 1.606 1.697 1.78 1.816 1.888 1.964 2.078 2.142 2.214 2.328 2.426 2.531 2.623 2.705 2.834 2.949 3.037 3.167 3.28 3.365 3.436 3.528 3.648 3.762 3.862 3.946 4.021 4.068 4.127 4.168 4.124 3.99 3.724 3.288 2.635 1.586 -0.169 -2.245 -3.935 -5.322 -6.524 -7.636 -8.546 -9.292 -9.937 -10.562 -11.083 -11.544 -11.956 -12.351 -12.734 -13.067 -13.407 -13.734 -14.011 -14.298 -14.604 -14.852 -15.121 -15.403 -15.595 -15.787 -15.997 -16.216 -16.455 -16.613 -16.766 -17.013 -17.17 -17.325 -17.409 -17.573 -17.744 -17.919 -18.008 -18.319 -18.341 -18.452 -18.561 -18.825 -18.968 -19.104 -19.247 -19.418 -19.635 -19.895 -20.314 -3 ,10068 ,TETRA ,17699314,Sat Dec 4 17:30:18 CET,Sat Dec 4 19:29:27 CET,0.0 0.563 0.88 1.074 1.232 1.375 1.487 1.586 1.759 1.845 1.943 1.934 2.199 2.274 2.401 2.514 2.627 2.682 2.788 2.895 3.062 3.166 3.259 3.38 3.471 3.551 3.635 3.721 3.826 3.925 4.024 4.128 4.231 4.343 4.456 4.57 4.672 4.752 4.814 4.876 4.932 4.989 5.055 5.097 5.122 5.072 4.899 4.618 4.105 3.183 1.583 -0.305 -1.905 -3.29 -4.4 -5.36 -6.15 -6.845 -7.439 -8.035 -8.581 -9.091 -9.549 -9.942 -10.313 -10.651 -10.981 -11.276 -11.541 -11.798 -12.054 -12.267 -12.49 -12.721 -12.899 -13.082 -13.275 -13.477 -13.687 -13.844 -14.005 -14.254 -14.43 -14.604 -14.683 -14.837 -15.003 -15.182 -15.274 -15.574 -15.571 -15.682 -15.784 -15.972 -16.079 -16.201 -16.328 -16.481 -16.67 -16.904 -17.51 -4 ,14801 ,TETRA ,17699315,Sat Dec 4 17:30:19 CET,Sat Dec 4 19:38:32 CET,0.0 0.272 0.426 0.548 0.651 0.768 0.871 0.969 1.155 1.236 1.326 1.311 1.569 1.634 1.74 1.831 1.927 1.974 2.065 2.175 2.353 2.465 2.57 2.724 2.874 3.022 3.156 3.27 3.4 3.488 3.552 3.634 3.728 3.819 3.911 4.018 4.11 4.174 4.213 4.243 4.265 4.284 4.277 4.301 4.337 4.221 3.942 3.524 2.952 2.071 0.44 -1.55 -3.164 -4.512 -5.674 -6.644 -7.456 -8.229 -8.906 -9.552 -10.087 -10.567 -11.036 -11.478 -11.874 -12.202 -12.53 -12.827 -13.084 -13.35 -13.619 -13.859 -14.102 -14.354 -14.577 -14.81 -15.03 -15.236 -15.434 -15.568 -15.71 -15.929 -16.082 -16.235 -16.312 -16.483 -16.684 -16.876 -16.963 -17.27 -17.26 -17.362 -17.481 -17.745 -17.88 -18.037 -18.206 -18.358 -18.535 -18.825 -19.342 -5 ,5570 ,TETRA ,17699316,Sat Dec 4 17:30:21 CET,Sat Dec 4 19:38:56 CET,0.0 0.4 0.603 0.786 0.966 1.126 1.259 1.37 1.55 1.645 1.742 1.72 1.971 2.031 2.147 2.255 2.37 2.425 2.534 2.622 2.718 2.775 2.832 2.924 3.013 3.088 3.157 3.241 3.349 3.437 3.51 3.604 3.688 3.74 3.798 3.858 3.898 3.944 3.987 4.01 4.036 4.075 4.104 4.078 3.981 3.849 3.662 3.333 2.767 1.827 0.165 -1.921 -3.648 -5.031 -6.187 -7.207 -8.066 -8.85 -9.514 -10.134 -10.663 -11.156 -11.647 -12.095 -12.486 -12.813 -13.123 -13.393 -13.648 -13.924 -14.201 -14.42 -14.635 -14.862 -15.046 -15.239 -15.434 -15.632 -15.837 -15.978 -16.127 -16.348 -16.492 -16.656 -16.738 -16.891 -17.036 -17.196 -17.282 -17.575 -17.588 -17.702 -17.816 -18.054 -18.172 -18.289 -18.399 -18.537 -18.696 -18.884 -19.233 -6 ,1366 ,TETRA ,17699317,Sat Dec 4 17:30:16 CET,Sat Dec 4 19:31:00 CET,0.0 0.475 0.73 0.935 1.077 1.212 1.339 1.446 1.629 1.718 1.814 1.806 2.072 2.141 2.281 2.421 2.568 2.628 2.723 2.821 2.953 3.041 3.124 3.223 3.328 3.429 3.526 3.627 3.737 3.833 3.932 4.039 4.135 4.226 4.329 4.438 4.518 4.584 4.634 4.666 4.682 4.72 4.78 4.78 4.739 4.642 4.412 4.086 3.558 2.589 0.888 -1.16 -2.839 -4.247 -5.455 -6.495 -7.399 -8.199 -8.846 -9.482 -10.048 -10.555 -11.009 -11.414 -11.788 -12.133 -12.5 -12.813 -13.064 -13.333 -13.635 -13.89 -14.137 -14.384 -14.577 -14.76 -14.947 -15.167 -15.398 -15.543 -15.683 -15.924 -16.085 -16.241 -16.328 -16.493 -16.662 -16.858 -16.968 -17.293 -17.317 -17.425 -17.527 -17.751 -17.879 -18.036 -18.218 -18.404 -18.575 -18.785 -19.391 -7 ,24859 ,TETRA ,17699318,Sat Dec 4 17:30:16 CET,Sat Dec 4 19:25:31 CET,0.0 0.224 0.371 0.477 0.578 0.673 0.758 0.84 1.014 1.102 1.181 1.13 1.382 1.456 1.591 1.694 1.781 1.827 1.911 1.991 2.114 2.202 2.283 2.371 2.448 2.522 2.602 2.684 2.781 2.87 2.954 3.052 3.149 3.234 3.326 3.415 3.48 3.547 3.606 3.651 3.687 3.729 3.758 3.751 3.709 3.606 3.419 3.025 2.346 1.384 -0.296 -2.377 -4.083 -5.488 -6.631 -7.645 -8.535 -9.301 -9.942 -10.553 -11.068 -11.509 -11.91 -12.296 -12.665 -13.002 -13.336 -13.627 -13.876 -14.131 -14.4 -14.633 -14.871 -15.118 -15.314 -15.51 -15.707 -15.916 -16.142 -16.285 -16.41 -16.6 -16.758 -16.939 -17.024 -17.205 -17.389 -17.567 -17.664 -17.971 -17.994 -18.112 -18.213 -18.42 -18.544 -18.677 -18.829 -19.007 -19.196 -19.418 -19.82 -8 ,10793 ,TETRA ,17699319,Sat Dec 4 17:30:16 CET,Sat Dec 4 19:31:56 CET,0.0 0.388 0.618 0.747 0.866 0.947 1.047 1.147 1.277 1.333 1.39 1.33 1.578 1.64 1.751 1.836 1.922 1.964 2.043 2.135 2.266 2.345 2.424 2.534 2.632 2.718 2.8 2.869 2.941 3.023 3.119 3.204 3.269 3.345 3.434 3.513 3.564 3.605 3.649 3.691 3.721 3.75 3.811 3.844 3.82 3.82 3.707 3.378 2.805 1.821 0.151 -1.814 -3.461 -4.839 -5.975 -7.022 -7.927 -8.679 -9.296 -9.918 -10.454 -10.92 -11.379 -11.826 -12.233 -12.574 -12.916 -13.225 -13.5 -13.776 -14.038 -14.274 -14.512 -14.742 -14.931 -15.137 -15.356 -15.582 -15.809 -15.957 -16.108 -16.355 -16.525 -16.692 -16.773 -16.928 -17.094 -17.295 -17.403 -17.71 -17.712 -17.815 -17.932 -18.2 -18.334 -18.464 -18.619 -18.803 -18.986 -19.206 -19.59 -9 ,27839 ,TETRA ,17699320,Sat Dec 4 17:30:18 CET,Sat Dec 4 19:31:30 CET,0.0 0.487 0.78 0.989 1.126 1.242 1.359 1.472 1.678 1.765 1.852 1.839 2.107 2.172 2.293 2.399 2.501 2.565 2.708 2.843 3.024 3.144 3.257 3.412 3.556 3.692 3.799 3.886 3.998 4.103 4.196 4.3 4.414 4.527 4.641 4.758 4.867 4.972 5.068 5.165 5.27 5.361 5.492 5.624 5.659 5.611 5.478 5.204 4.744 3.946 2.395 0.41 -1.198 -2.575 -3.755 -4.824 -5.741 -6.587 -7.301 -7.959 -8.507 -9.002 -9.471 -9.881 -10.253 -10.606 -10.971 -11.283 -11.558 -11.854 -12.143 -12.369 -12.614 -12.882 -13.085 -13.292 -13.488 -13.666 -13.862 -13.991 -14.125 -14.366 -14.534 -14.706 -14.792 -14.965 -15.143 -15.341 -15.441 -15.74 -15.709 -15.803 -15.908 -16.146 -16.302 -16.474 -16.652 -16.84 -17.029 -17.28 -17.926 -10 ,6829 ,TETRA ,17699321,Sat Dec 4 17:30:19 CET,Sat Dec 4 19:30:10 CET,0.0 0.554 0.656 0.747 0.847 0.942 1.045 1.15 1.322 1.393 1.463 1.421 1.674 1.739 1.84 1.926 2.022 2.074 2.177 2.274 2.405 2.499 2.599 2.73 2.842 2.942 3.034 3.112 3.208 3.3 3.384 3.468 3.555 3.664 3.762 3.838 3.904 3.988 4.103 4.223 4.326 4.462 4.575 4.565 4.538 4.476 4.258 3.891 3.313 2.312 0.571 -1.56 -3.354 -4.857 -6.009 -6.933 -7.758 -8.492 -9.115 -9.725 -10.224 -10.664 -11.083 -11.463 -11.814 -12.144 -12.489 -12.787 -13.048 -13.335 -13.643 -13.89 -14.126 -14.378 -14.573 -14.764 -14.954 -15.152 -15.361 -15.5 -15.647 -15.881 -16.045 -16.202 -16.279 -16.445 -16.621 -16.821 -16.919 -17.219 -17.211 -17.303 -17.395 -17.613 -17.73 -17.859 -18.015 -18.186 -18.378 -18.578 -18.978 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5f.txt deleted file mode 100644 index 4508203f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18826 ,TETRA ,17699322,Sat Dec 4 17:30:21 CET,Sat Dec 4 19:29:59 CET,0.0 0.145 0.274 0.395 0.486 0.571 0.654 0.725 0.859 0.932 0.992 0.919 1.16 1.227 1.34 1.448 1.561 1.613 1.706 1.797 1.942 2.035 2.124 2.27 2.399 2.507 2.606 2.706 2.833 2.942 3.044 3.162 3.277 3.408 3.566 3.715 3.842 3.992 4.162 4.334 4.516 4.701 4.901 5.097 5.301 5.529 5.814 6.097 6.298 6.362 6.204 5.702 5.038 4.354 3.65 2.953 2.292 1.641 1.062 0.528 0.119 -0.251 -0.627 -0.955 -1.253 -1.585 -1.955 -2.26 -2.494 -2.735 -2.995 -3.202 -3.423 -3.659 -3.843 -4.053 -4.274 -4.478 -4.697 -4.858 -5.025 -5.302 -5.496 -5.707 -5.813 -5.993 -6.158 -6.331 -6.419 -6.688 -6.736 -6.87 -7.032 -7.381 -7.56 -7.755 -7.96 -8.191 -8.445 -8.778 -9.744 -2 ,597 ,TETRA ,17699323,Sat Dec 4 17:30:17 CET,Sat Dec 4 19:18:41 CET,0.0 0.455 0.58 0.684 0.776 0.867 0.948 1.018 1.127 1.181 1.231 1.15 1.377 1.434 1.527 1.61 1.708 1.76 1.862 1.958 2.085 2.163 2.249 2.378 2.494 2.6 2.706 2.814 2.962 3.108 3.236 3.38 3.528 3.646 3.764 3.906 4.058 4.233 4.409 4.591 4.77 4.963 5.185 5.394 5.646 5.953 6.245 6.46 6.625 6.694 6.504 5.989 5.427 4.873 4.297 3.777 3.261 2.778 2.379 1.942 1.538 1.137 0.779 0.482 0.173 -0.134 -0.459 -0.759 -1.011 -1.273 -1.548 -1.773 -1.999 -2.222 -2.391 -2.581 -2.781 -2.983 -3.196 -3.338 -3.486 -3.718 -3.868 -4.018 -4.096 -4.264 -4.445 -4.63 -4.726 -5.005 -5.065 -5.197 -5.326 -5.588 -5.734 -5.903 -6.083 -6.285 -6.546 -6.873 -7.561 -3 ,7201 ,TETRA ,17699324,Sat Dec 4 17:30:17 CET,Sat Dec 4 19:30:56 CET,0.0 0.256 0.367 0.464 0.558 0.643 0.727 0.819 0.988 1.058 1.118 1.064 1.309 1.389 1.545 1.671 1.778 1.826 1.92 2.023 2.172 2.265 2.353 2.473 2.593 2.706 2.806 2.913 3.058 3.194 3.316 3.444 3.585 3.748 3.947 4.135 4.29 4.491 4.698 4.894 5.092 5.311 5.562 5.779 5.987 6.206 6.444 6.703 6.99 7.16 7.001 6.478 5.929 5.398 4.785 4.201 3.739 3.318 2.959 2.568 2.193 1.87 1.542 1.227 0.943 0.689 0.442 0.221 0.019 -0.201 -0.453 -0.658 -0.85 -1.061 -1.245 -1.434 -1.623 -1.836 -2.063 -2.206 -2.35 -2.581 -2.735 -2.886 -2.97 -3.142 -3.316 -3.507 -3.599 -3.877 -3.932 -4.044 -4.18 -4.511 -4.672 -4.841 -5.018 -5.219 -5.481 -5.81 -6.557 -4 ,22006 ,TETRA ,17699325,Sat Dec 4 17:30:17 CET,Sat Dec 4 19:31:04 CET,0.0 0.174 0.316 0.479 0.595 0.67 0.747 0.821 0.968 1.045 1.113 1.06 1.286 1.343 1.459 1.57 1.684 1.738 1.837 1.924 2.032 2.105 2.183 2.302 2.407 2.495 2.597 2.713 2.853 2.975 3.085 3.221 3.364 3.502 3.644 3.795 3.944 4.105 4.279 4.459 4.667 4.888 5.114 5.335 5.56 5.792 6.049 6.275 6.434 6.545 6.407 5.841 5.168 4.515 3.94 3.413 2.91 2.415 1.986 1.571 1.213 0.899 0.598 0.312 0.032 -0.261 -0.6 -0.89 -1.1 -1.324 -1.597 -1.811 -2.033 -2.289 -2.483 -2.674 -2.866 -3.077 -3.305 -3.459 -3.617 -3.861 -4.02 -4.173 -4.261 -4.449 -4.637 -4.821 -4.913 -5.182 -5.199 -5.316 -5.445 -5.718 -5.866 -6.032 -6.198 -6.366 -6.597 -6.898 -7.658 -5 ,5533 ,TETRA ,17699326,Sat Dec 4 17:30:19 CET,Sat Dec 4 19:30:39 CET,0.0 0.173 0.337 0.489 0.59 0.669 0.741 0.794 0.914 0.989 1.052 0.98 1.213 1.276 1.402 1.524 1.619 1.657 1.739 1.815 1.914 1.988 2.071 2.198 2.312 2.42 2.521 2.6 2.699 2.821 2.963 3.132 3.292 3.441 3.604 3.771 3.917 4.072 4.242 4.434 4.614 4.801 5.028 5.245 5.489 5.797 6.149 6.393 6.546 6.6 6.369 5.808 5.173 4.519 3.934 3.412 2.953 2.499 2.054 1.597 1.223 0.876 0.532 0.221 -0.065 -0.336 -0.615 -0.876 -1.103 -1.321 -1.546 -1.763 -1.98 -2.181 -2.348 -2.514 -2.683 -2.867 -3.068 -3.207 -3.349 -3.564 -3.706 -3.856 -3.933 -4.097 -4.266 -4.445 -4.542 -4.814 -4.854 -4.973 -5.096 -5.371 -5.53 -5.703 -5.876 -6.08 -6.298 -6.51 -6.879 -6 ,21998 ,TETRA ,17699327,Sat Dec 4 17:30:21 CET,Sat Dec 4 19:29:20 CET,0.0 0.327 0.555 0.716 0.819 0.915 1.009 1.084 1.188 1.242 1.305 1.244 1.467 1.519 1.616 1.711 1.806 1.851 1.938 2.013 2.126 2.218 2.311 2.427 2.518 2.601 2.681 2.763 2.866 2.971 3.078 3.203 3.332 3.445 3.561 3.69 3.81 3.934 4.074 4.229 4.395 4.58 4.803 5.006 5.24 5.52 5.755 5.936 6.117 6.253 6.141 5.667 5.06 4.462 3.918 3.402 2.905 2.41 1.973 1.559 1.186 0.813 0.461 0.141 -0.141 -0.391 -0.677 -0.948 -1.177 -1.413 -1.661 -1.884 -2.109 -2.317 -2.476 -2.644 -2.827 -3.025 -3.227 -3.359 -3.498 -3.717 -3.848 -3.995 -4.079 -4.236 -4.401 -4.597 -4.71 -5.002 -5.056 -5.169 -5.285 -5.556 -5.713 -5.881 -6.054 -6.238 -6.421 -6.685 -7.404 -7 ,7072 ,TETRA ,17699328,Sat Dec 4 17:30:17 CET,Sat Dec 4 19:23:32 CET,0.0 0.215 0.351 0.45 0.537 0.624 0.72 0.825 1.009 1.08 1.148 1.108 1.344 1.405 1.533 1.652 1.753 1.805 1.913 2.007 2.128 2.206 2.283 2.383 2.486 2.599 2.698 2.787 2.906 3.017 3.121 3.248 3.365 3.484 3.611 3.743 3.895 4.054 4.2 4.365 4.532 4.713 4.924 5.12 5.341 5.559 5.752 5.914 6.056 6.147 6.021 5.516 4.94 4.382 3.834 3.307 2.825 2.373 1.972 1.555 1.161 0.794 0.451 0.122 -0.212 -0.522 -0.803 -1.022 -1.22 -1.445 -1.69 -1.908 -2.127 -2.332 -2.503 -2.678 -2.84 -3.02 -3.237 -3.382 -3.521 -3.744 -3.884 -4.033 -4.125 -4.322 -4.531 -4.772 -4.899 -5.214 -5.33 -5.475 -5.596 -5.843 -6.003 -6.175 -6.341 -6.541 -6.819 -7.175 -7.864 -8 ,28148 ,TETRA ,17699329,Sat Dec 4 17:30:17 CET,Sat Dec 4 19:18:13 CET,0.0 0.219 0.378 0.486 0.595 0.695 0.767 0.836 0.979 1.039 1.095 1.044 1.28 1.336 1.433 1.52 1.62 1.661 1.729 1.801 1.898 1.964 2.038 2.146 2.251 2.356 2.442 2.518 2.632 2.748 2.863 2.997 3.113 3.227 3.356 3.527 3.728 3.942 4.164 4.376 4.584 4.851 5.156 5.442 5.73 5.983 6.22 6.43 6.609 6.717 6.606 6.145 5.579 4.936 4.338 3.826 3.333 2.844 2.397 1.945 1.568 1.238 0.934 0.653 0.398 0.157 -0.113 -0.354 -0.574 -0.816 -1.049 -1.248 -1.472 -1.69 -1.851 -2.033 -2.227 -2.426 -2.628 -2.756 -2.897 -3.118 -3.264 -3.435 -3.526 -3.691 -3.851 -4.043 -4.147 -4.42 -4.445 -4.564 -4.693 -4.958 -5.088 -5.237 -5.409 -5.596 -5.802 -6.047 -6.568 -9 ,6043 ,TETRA ,17699330,Sat Dec 4 17:30:17 CET,Sat Dec 4 19:35:17 CET,0.0 0.359 0.482 0.575 0.677 0.783 0.879 0.962 1.13 1.213 1.28 1.204 1.429 1.482 1.577 1.676 1.774 1.821 1.923 2.02 2.15 2.228 2.296 2.394 2.504 2.633 2.75 2.849 2.972 3.103 3.24 3.391 3.519 3.642 3.791 3.941 4.105 4.294 4.477 4.665 4.853 5.084 5.336 5.55 5.774 5.991 6.255 6.53 6.743 6.829 6.626 6.146 5.64 5.081 4.527 4.001 3.506 3.041 2.602 2.111 1.704 1.383 1.05 0.715 0.42 0.159 -0.11 -0.361 -0.582 -0.805 -1.041 -1.236 -1.447 -1.666 -1.827 -2.001 -2.192 -2.38 -2.579 -2.729 -2.882 -3.105 -3.273 -3.449 -3.535 -3.717 -3.897 -4.087 -4.182 -4.459 -4.51 -4.629 -4.754 -5.043 -5.201 -5.366 -5.555 -5.765 -5.999 -6.277 -7.265 -10 ,3251 ,TETRA ,17699331,Sat Dec 4 17:30:19 CET,Sat Dec 4 19:36:27 CET,0.0 0.336 0.519 0.653 0.782 0.887 0.971 1.064 1.25 1.33 1.397 1.332 1.566 1.63 1.758 1.874 1.971 2.022 2.132 2.228 2.345 2.41 2.485 2.599 2.707 2.811 2.912 3.021 3.17 3.316 3.444 3.602 3.747 3.882 4.043 4.216 4.376 4.553 4.731 4.91 5.098 5.318 5.587 5.818 6.079 6.358 6.641 6.907 7.091 7.194 7.058 6.491 5.88 5.309 4.768 4.225 3.707 3.216 2.753 2.284 1.884 1.527 1.189 0.883 0.622 0.365 0.112 -0.104 -0.316 -0.547 -0.784 -0.99 -1.222 -1.472 -1.668 -1.873 -2.085 -2.283 -2.483 -2.631 -2.785 -3.035 -3.223 -3.415 -3.506 -3.689 -3.889 -4.097 -4.2 -4.48 -4.529 -4.657 -4.79 -5.066 -5.217 -5.38 -5.553 -5.794 -6.108 -6.452 -7.106 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5i.txt deleted file mode 100644 index 1fb961f1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6748 ,TETRA ,17699332,Sat Dec 4 17:30:18 CET,Sat Dec 4 19:19:24 CET,0.0 0.378 0.548 0.713 0.797 0.882 0.983 1.068 1.195 1.244 1.296 1.218 1.438 1.489 1.6 1.679 1.739 1.773 1.853 1.926 2.03 2.098 2.15 2.236 2.318 2.378 2.44 2.507 2.596 2.675 2.731 2.799 2.872 2.928 2.981 3.043 3.097 3.126 3.145 3.196 3.225 3.198 3.124 3.02 2.904 2.721 2.491 2.209 1.604 0.572 -1.228 -3.444 -5.191 -6.61 -7.84 -8.947 -9.862 -10.647 -11.312 -11.957 -12.505 -12.995 -13.488 -13.96 -14.374 -14.731 -15.098 -15.421 -15.684 -15.97 -16.276 -16.527 -16.805 -17.079 -17.283 -17.503 -17.743 -17.993 -18.223 -18.368 -18.521 -18.762 -18.933 -19.108 -19.195 -19.371 -19.554 -19.745 -19.85 -20.157 -20.2 -20.315 -20.428 -20.689 -20.834 -20.979 -21.136 -21.344 -21.604 -21.915 -23.117 -2 ,17992 ,TETRA ,17699333,Sat Dec 4 17:30:18 CET,Sat Dec 4 19:18:56 CET,0.0 0.45 0.532 0.601 0.69 0.778 0.835 0.887 1.006 1.072 1.14 1.083 1.31 1.362 1.463 1.537 1.591 1.617 1.68 1.753 1.856 1.908 1.954 2.034 2.114 2.186 2.255 2.32 2.398 2.456 2.498 2.553 2.603 2.642 2.677 2.72 2.782 2.865 2.936 2.993 3.034 3.028 2.968 2.871 2.753 2.617 2.326 1.847 1.101 -0.047 -1.875 -3.993 -5.765 -7.302 -8.613 -9.747 -10.684 -11.467 -12.131 -12.812 -13.399 -13.939 -14.486 -14.995 -15.442 -15.822 -16.206 -16.563 -16.879 -17.211 -17.556 -17.828 -18.095 -18.369 -18.583 -18.816 -19.048 -19.275 -19.511 -19.669 -19.836 -20.097 -20.273 -20.449 -20.533 -20.708 -20.895 -21.101 -21.214 -21.524 -21.577 -21.706 -21.829 -22.084 -22.246 -22.411 -22.571 -22.759 -22.974 -23.23 -23.866 -3 ,6393 ,TETRA ,17699334,Sat Dec 4 17:30:18 CET,Sat Dec 4 19:19:24 CET,0.0 0.293 0.427 0.549 0.659 0.748 0.803 0.855 0.952 0.999 1.05 0.993 1.229 1.285 1.386 1.473 1.551 1.589 1.655 1.709 1.782 1.832 1.885 1.95 2.002 2.053 2.117 2.18 2.238 2.277 2.307 2.347 2.383 2.411 2.464 2.533 2.57 2.577 2.594 2.62 2.633 2.607 2.544 2.45 2.298 2.114 1.812 1.337 0.675 -0.319 -2.094 -4.231 -5.921 -7.34 -8.547 -9.618 -10.575 -11.46 -12.187 -12.87 -13.464 -13.973 -14.446 -14.896 -15.298 -15.663 -16.066 -16.431 -16.726 -17.015 -17.309 -17.559 -17.816 -18.076 -18.284 -18.496 -18.724 -18.971 -19.222 -19.398 -19.582 -19.845 -20.03 -20.217 -20.309 -20.521 -20.733 -20.96 -21.078 -21.375 -21.429 -21.564 -21.702 -22.028 -22.207 -22.365 -22.521 -22.707 -22.933 -23.194 -23.839 -4 ,581 ,TETRA ,17699335,Sat Dec 4 17:30:18 CET,Sat Dec 4 19:18:54 CET,0.0 0.643 0.799 0.93 1.064 1.184 1.282 1.367 1.533 1.589 1.63 1.54 1.749 1.787 1.865 1.936 2.0 2.03 2.09 2.153 2.247 2.305 2.355 2.427 2.496 2.553 2.6 2.644 2.687 2.731 2.774 2.814 2.854 2.889 2.927 2.96 2.978 3.006 3.035 3.045 3.045 3.034 2.996 2.948 2.835 2.632 2.373 1.94 1.223 0.147 -1.673 -3.838 -5.592 -7.037 -8.294 -9.456 -10.414 -11.206 -11.913 -12.684 -13.327 -13.843 -14.31 -14.731 -15.114 -15.468 -15.833 -16.152 -16.44 -16.759 -17.091 -17.362 -17.651 -17.941 -18.151 -18.367 -18.603 -18.844 -19.088 -19.264 -19.446 -19.708 -19.885 -20.081 -20.184 -20.4 -20.657 -20.92 -21.048 -21.373 -21.461 -21.601 -21.732 -22.045 -22.229 -22.401 -22.592 -22.828 -23.083 -23.362 -23.987 -5 ,6132 ,TETRA ,17699336,Sat Dec 4 17:30:18 CET,Sat Dec 4 19:18:58 CET,0.0 0.214 0.354 0.471 0.559 0.654 0.754 0.823 0.945 1.013 1.077 1.005 1.218 1.26 1.355 1.432 1.497 1.532 1.605 1.679 1.766 1.822 1.884 1.96 2.021 2.081 2.138 2.2 2.285 2.359 2.429 2.516 2.592 2.657 2.73 2.811 2.89 2.973 3.043 3.105 3.166 3.212 3.204 3.135 3.007 2.809 2.543 2.177 1.52 0.448 -1.311 -3.451 -5.199 -6.651 -7.884 -8.961 -9.883 -10.686 -11.357 -12.063 -12.705 -13.266 -13.757 -14.183 -14.591 -14.967 -15.353 -15.705 -16.006 -16.319 -16.655 -16.93 -17.19 -17.47 -17.696 -17.918 -18.149 -18.396 -18.644 -18.805 -18.971 -19.217 -19.396 -19.593 -19.691 -19.889 -20.091 -20.308 -20.428 -20.751 -20.815 -20.949 -21.085 -21.372 -21.55 -21.742 -21.93 -22.169 -22.459 -22.798 -23.348 -6 ,27581 ,TETRA ,17699337,Sat Dec 4 17:30:18 CET,Sat Dec 4 19:19:17 CET,0.0 0.147 0.295 0.431 0.513 0.622 0.732 0.819 0.964 1.03 1.08 0.982 1.204 1.253 1.337 1.409 1.484 1.519 1.59 1.653 1.738 1.799 1.866 1.964 2.038 2.096 2.141 2.178 2.227 2.283 2.354 2.439 2.488 2.519 2.573 2.634 2.672 2.708 2.742 2.757 2.756 2.755 2.712 2.618 2.49 2.313 2.016 1.562 0.877 -0.213 -2.041 -4.194 -5.903 -7.307 -8.514 -9.572 -10.474 -11.26 -11.912 -12.62 -13.252 -13.801 -14.324 -14.783 -15.21 -15.601 -15.999 -16.353 -16.65 -16.957 -17.284 -17.566 -17.852 -18.133 -18.351 -18.579 -18.81 -19.047 -19.286 -19.452 -19.625 -19.882 -20.06 -20.244 -20.343 -20.558 -20.779 -21.01 -21.128 -21.462 -21.536 -21.668 -21.81 -22.096 -22.25 -22.419 -22.612 -22.807 -23.029 -23.351 -24.046 -7 ,10481 ,TETRA ,17699338,Sat Dec 4 17:30:19 CET,Sat Dec 4 19:19:35 CET,0.0 0.417 0.607 0.727 0.812 0.876 0.924 0.983 1.098 1.144 1.196 1.099 1.308 1.341 1.419 1.512 1.606 1.643 1.698 1.757 1.856 1.92 1.985 2.066 2.118 2.165 2.22 2.267 2.321 2.401 2.479 2.543 2.605 2.657 2.708 2.753 2.767 2.757 2.751 2.749 2.73 2.71 2.666 2.576 2.471 2.284 1.955 1.531 0.885 -0.1 -1.745 -3.915 -5.73 -7.175 -8.388 -9.458 -10.377 -11.207 -11.913 -12.59 -13.146 -13.64 -14.127 -14.619 -15.073 -15.468 -15.868 -16.203 -16.49 -16.783 -17.083 -17.332 -17.597 -17.876 -18.088 -18.326 -18.572 -18.811 -19.05 -19.215 -19.383 -19.622 -19.793 -19.972 -20.062 -20.262 -20.468 -20.679 -20.796 -21.095 -21.113 -21.236 -21.387 -21.776 -21.987 -22.218 -22.489 -22.826 -23.244 -23.788 -24.977 -8 ,25555 ,TETRA ,17699339,Sat Dec 4 17:30:19 CET,Sat Dec 4 19:18:55 CET,0.0 0.243 0.367 0.446 0.514 0.571 0.632 0.698 0.815 0.866 0.909 0.821 1.047 1.103 1.218 1.306 1.361 1.39 1.45 1.513 1.6 1.659 1.719 1.797 1.858 1.903 1.953 2.017 2.098 2.183 2.267 2.347 2.423 2.5 2.574 2.638 2.692 2.724 2.743 2.759 2.758 2.749 2.722 2.674 2.595 2.457 2.23 1.824 1.165 0.12 -1.702 -3.812 -5.522 -6.95 -8.137 -9.181 -10.088 -10.893 -11.571 -12.237 -12.81 -13.316 -13.788 -14.253 -14.72 -15.133 -15.54 -15.891 -16.193 -16.507 -16.815 -17.07 -17.33 -17.593 -17.799 -18.02 -18.253 -18.491 -18.724 -18.869 -19.029 -19.293 -19.471 -19.668 -19.775 -19.977 -20.192 -20.429 -20.555 -20.884 -20.946 -21.073 -21.206 -21.51 -21.682 -21.867 -22.072 -22.315 -22.567 -22.855 -23.48 -9 ,9654 ,TETRA ,17699340,Sat Dec 4 17:30:19 CET,Sat Dec 4 19:19:06 CET,0.0 0.464 0.598 0.693 0.793 0.89 0.96 1.011 1.151 1.224 1.287 1.238 1.469 1.523 1.644 1.762 1.847 1.878 1.941 2.009 2.112 2.176 2.234 2.31 2.373 2.432 2.499 2.568 2.656 2.731 2.78 2.832 2.877 2.904 2.958 3.015 3.074 3.154 3.207 3.232 3.238 3.252 3.235 3.183 3.115 2.993 2.757 2.386 1.818 0.814 -0.943 -2.917 -4.593 -6.025 -7.197 -8.225 -9.138 -9.948 -10.612 -11.274 -11.87 -12.387 -12.849 -13.288 -13.695 -14.068 -14.521 -14.928 -15.228 -15.527 -15.839 -16.089 -16.343 -16.605 -16.811 -17.039 -17.289 -17.536 -17.782 -17.948 -18.104 -18.351 -18.524 -18.706 -18.805 -19.013 -19.218 -19.428 -19.538 -19.848 -19.898 -20.016 -20.15 -20.449 -20.604 -20.763 -20.929 -21.111 -21.332 -21.673 -22.343 -10 ,10805 ,TETRA ,17699341,Sat Dec 4 17:30:19 CET,Sat Dec 4 19:19:21 CET,0.0 0.286 0.443 0.538 0.63 0.712 0.775 0.845 0.982 1.035 1.09 1.021 1.255 1.32 1.423 1.513 1.585 1.618 1.685 1.741 1.82 1.872 1.929 2.009 2.067 2.113 2.166 2.227 2.293 2.343 2.388 2.434 2.465 2.497 2.538 2.59 2.643 2.707 2.748 2.751 2.745 2.711 2.648 2.558 2.399 2.186 1.925 1.528 0.885 -0.114 -1.854 -3.962 -5.686 -7.117 -8.331 -9.406 -10.36 -11.224 -11.911 -12.556 -13.132 -13.664 -14.166 -14.64 -15.069 -15.446 -15.845 -16.223 -16.547 -16.845 -17.142 -17.386 -17.645 -17.923 -18.148 -18.387 -18.62 -18.848 -19.092 -19.264 -19.433 -19.702 -19.884 -20.067 -20.168 -20.375 -20.582 -20.804 -20.926 -21.241 -21.305 -21.439 -21.59 -21.922 -22.088 -22.26 -22.447 -22.66 -22.923 -23.248 -23.915 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5g.txt deleted file mode 100644 index cdaacced..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,907 ,TETRA ,17699342,Sat Dec 4 17:30:19 CET,Sat Dec 4 19:18:45 CET,0.0 0.267 0.389 0.523 0.652 0.774 0.885 0.978 1.138 1.217 1.295 1.243 1.513 1.583 1.702 1.816 1.931 1.99 2.107 2.223 2.372 2.453 2.526 2.634 2.75 2.87 2.99 3.099 3.236 3.37 3.5 3.667 3.822 3.957 4.11 4.328 4.555 4.77 5.003 5.245 5.484 5.753 6.126 6.508 6.896 7.316 7.795 8.329 8.86 9.379 9.954 10.265 10.216 10.043 9.866 9.685 9.499 9.311 9.13 8.941 8.786 8.633 8.483 8.339 8.196 8.065 7.917 7.786 7.671 7.545 7.424 7.329 7.22 7.106 7.016 6.921 6.818 6.715 6.623 6.561 6.489 6.356 6.26 6.157 6.101 5.985 5.861 5.717 5.644 5.385 5.439 5.367 5.294 5.126 5.027 4.938 4.85 4.751 4.635 4.486 4.27 -2 ,23925 ,TETRA ,17699343,Sat Dec 4 17:30:19 CET,Sat Dec 4 19:18:36 CET,0.0 0.185 0.342 0.481 0.628 0.738 0.828 0.908 1.077 1.169 1.249 1.192 1.446 1.517 1.663 1.8 1.927 1.984 2.089 2.205 2.379 2.488 2.601 2.767 2.916 3.049 3.177 3.311 3.491 3.662 3.816 3.996 4.146 4.301 4.498 4.723 4.944 5.176 5.419 5.694 5.998 6.3 6.613 6.933 7.344 7.779 8.256 8.801 9.375 9.981 10.54 10.785 10.788 10.663 10.463 10.249 10.054 9.866 9.632 9.385 9.209 9.034 8.864 8.716 8.571 8.412 8.241 8.095 7.974 7.858 7.735 7.633 7.534 7.428 7.343 7.25 7.149 7.053 6.962 6.902 6.835 6.695 6.586 6.477 6.431 6.342 6.247 6.159 6.117 5.882 5.964 5.905 5.836 5.693 5.609 5.515 5.419 5.311 5.176 5.005 4.65 -3 ,22195 ,TETRA ,17699344,Sat Dec 4 17:31:13 CET,Sat Dec 4 19:19:32 CET,0.0 0.129 0.23 0.314 0.4 0.479 0.551 0.615 0.731 0.793 0.86 0.822 1.089 1.152 1.272 1.397 1.507 1.555 1.646 1.735 1.866 1.951 2.038 2.157 2.282 2.404 2.521 2.639 2.791 2.936 3.068 3.238 3.411 3.588 3.779 3.991 4.213 4.447 4.697 4.94 5.19 5.472 5.784 6.106 6.474 6.861 7.328 7.85 8.395 8.946 9.529 9.783 9.658 9.43 9.219 8.993 8.734 8.497 8.289 8.068 7.876 7.69 7.514 7.356 7.198 7.028 6.836 6.678 6.552 6.407 6.238 6.088 5.951 5.827 5.725 5.63 5.534 5.427 5.32 5.252 5.175 5.049 4.968 4.884 4.842 4.758 4.671 4.584 4.534 4.285 4.339 4.263 4.187 4.044 3.976 3.901 3.816 3.707 3.598 3.424 3.205 -4 ,16842 ,TETRA ,17699345,Sat Dec 4 17:34:10 CET,Sat Dec 4 19:31:37 CET,0.0 0.144 0.271 0.395 0.498 0.58 0.667 0.755 0.922 1.0 1.081 1.054 1.32 1.384 1.504 1.618 1.73 1.779 1.878 1.984 2.135 2.225 2.312 2.448 2.594 2.726 2.845 2.96 3.099 3.228 3.364 3.55 3.751 3.955 4.173 4.401 4.614 4.841 5.08 5.318 5.57 5.863 6.23 6.607 6.991 7.409 7.901 8.428 8.973 9.562 10.084 10.31 10.334 10.222 10.037 9.806 9.58 9.38 9.179 8.911 8.657 8.459 8.272 8.072 7.882 7.704 7.524 7.396 7.296 7.186 7.059 6.946 6.835 6.722 6.624 6.514 6.411 6.317 6.212 6.128 6.031 5.888 5.792 5.685 5.634 5.532 5.42 5.304 5.247 5.005 5.094 5.039 4.963 4.784 4.703 4.615 4.507 4.385 4.283 4.162 3.94 -5 ,16035 ,TETRA ,17699346,Sat Dec 4 17:32:08 CET,Sat Dec 4 19:32:12 CET,0.0 0.233 0.372 0.485 0.597 0.702 0.788 0.88 1.043 1.116 1.2 1.168 1.439 1.51 1.635 1.754 1.866 1.923 2.045 2.161 2.314 2.411 2.507 2.647 2.785 2.922 3.054 3.185 3.362 3.526 3.663 3.813 3.979 4.155 4.361 4.595 4.812 5.037 5.26 5.493 5.754 6.058 6.389 6.712 7.131 7.584 8.042 8.521 9.07 9.676 10.222 10.44 10.354 10.189 10.045 9.85 9.657 9.457 9.259 9.074 8.895 8.685 8.455 8.25 8.085 7.94 7.78 7.65 7.541 7.426 7.299 7.184 7.088 7.002 6.918 6.819 6.709 6.59 6.478 6.41 6.341 6.219 6.127 6.029 5.983 5.896 5.807 5.709 5.65 5.395 5.46 5.397 5.33 5.174 5.069 4.956 4.852 4.757 4.642 4.494 4.244 -6 ,29858 ,TETRA ,17699347,Sat Dec 4 17:31:13 CET,Sat Dec 4 19:19:52 CET,0.0 0.199 0.297 0.389 0.489 0.586 0.677 0.773 0.97 1.062 1.141 1.091 1.343 1.395 1.501 1.605 1.7 1.749 1.857 1.954 2.079 2.17 2.262 2.39 2.515 2.639 2.755 2.877 3.039 3.193 3.35 3.515 3.652 3.797 3.968 4.15 4.324 4.52 4.758 5.025 5.29 5.56 5.875 6.227 6.678 7.123 7.533 7.977 8.498 9.032 9.513 9.724 9.718 9.618 9.454 9.234 8.993 8.771 8.598 8.435 8.248 8.031 7.836 7.649 7.474 7.322 7.153 6.971 6.794 6.632 6.484 6.358 6.232 6.115 6.031 5.937 5.822 5.711 5.604 5.523 5.448 5.333 5.242 5.159 5.119 5.034 4.954 4.874 4.822 4.58 4.67 4.61 4.536 4.373 4.284 4.182 4.088 4.009 3.916 3.797 3.507 -7 ,17463 ,TETRA ,17699348,Sat Dec 4 17:31:13 CET,Sat Dec 4 19:19:36 CET,0.0 0.309 0.396 0.485 0.583 0.675 0.768 0.848 0.986 1.059 1.126 1.071 1.341 1.42 1.559 1.705 1.859 1.919 2.013 2.109 2.25 2.345 2.442 2.582 2.734 2.886 3.019 3.138 3.295 3.447 3.592 3.767 3.937 4.094 4.274 4.475 4.672 4.897 5.12 5.343 5.587 5.858 6.187 6.523 6.869 7.248 7.671 8.141 8.675 9.307 9.933 10.11 10.04 9.896 9.679 9.472 9.278 9.07 8.871 8.65 8.466 8.306 8.154 7.972 7.777 7.614 7.464 7.359 7.264 7.151 7.041 6.946 6.839 6.725 6.647 6.566 6.464 6.344 6.234 6.159 6.072 5.938 5.842 5.743 5.69 5.593 5.49 5.373 5.315 5.059 5.11 5.037 4.962 4.793 4.695 4.595 4.496 4.382 4.25 4.116 3.934 -8 ,15687 ,TETRA ,17699349,Sat Dec 4 17:31:13 CET,Sat Dec 4 19:19:47 CET,0.0 0.159 0.29 0.398 0.514 0.625 0.714 0.789 0.947 1.034 1.119 1.076 1.352 1.431 1.564 1.671 1.777 1.84 1.96 2.063 2.212 2.313 2.404 2.525 2.649 2.769 2.893 3.024 3.213 3.395 3.546 3.728 3.903 4.058 4.235 4.421 4.593 4.794 5.006 5.23 5.465 5.74 6.094 6.467 6.862 7.267 7.729 8.224 8.768 9.314 9.808 9.977 9.939 9.811 9.598 9.38 9.166 8.95 8.745 8.516 8.317 8.139 7.972 7.806 7.654 7.523 7.379 7.249 7.124 6.986 6.853 6.74 6.618 6.495 6.41 6.325 6.224 6.117 6.018 5.949 5.868 5.745 5.667 5.578 5.53 5.413 5.273 5.152 5.097 4.847 4.913 4.851 4.777 4.599 4.501 4.391 4.278 4.177 4.043 3.866 3.723 -9 ,18228 ,TETRA ,17699350,Sat Dec 4 17:31:13 CET,Sat Dec 4 19:19:33 CET,0.0 0.16 0.252 0.333 0.444 0.566 0.666 0.756 0.911 0.973 1.036 0.976 1.236 1.292 1.412 1.546 1.67 1.728 1.836 1.95 2.115 2.208 2.294 2.412 2.528 2.67 2.817 2.935 3.07 3.212 3.366 3.568 3.743 3.901 4.095 4.313 4.506 4.713 4.956 5.209 5.474 5.772 6.103 6.437 6.817 7.216 7.668 8.184 8.752 9.312 9.844 10.068 10.027 9.907 9.742 9.52 9.291 9.091 8.932 8.755 8.596 8.401 8.196 8.041 7.891 7.747 7.59 7.448 7.332 7.202 7.063 6.953 6.842 6.732 6.645 6.549 6.437 6.325 6.225 6.147 6.063 5.921 5.806 5.696 5.645 5.542 5.425 5.284 5.217 4.963 5.017 4.953 4.878 4.719 4.646 4.573 4.479 4.342 4.169 4.001 3.538 -10 ,20138 ,TETRA ,17699351,Sat Dec 4 17:31:12 CET,Sat Dec 4 19:19:32 CET,0.0 0.207 0.331 0.466 0.609 0.706 0.786 0.875 1.058 1.141 1.228 1.202 1.47 1.547 1.703 1.843 1.98 2.043 2.152 2.258 2.423 2.531 2.63 2.785 2.946 3.102 3.242 3.366 3.536 3.697 3.843 4.027 4.212 4.4 4.618 4.852 5.075 5.309 5.543 5.803 6.102 6.451 6.86 7.254 7.669 8.085 8.528 9.049 9.618 10.188 10.752 10.95 10.918 10.832 10.664 10.452 10.255 10.076 9.895 9.668 9.426 9.203 9.016 8.834 8.652 8.485 8.312 8.161 8.028 7.886 7.745 7.621 7.49 7.357 7.258 7.165 7.067 6.961 6.839 6.751 6.663 6.541 6.462 6.362 6.312 6.213 6.093 5.967 5.907 5.659 5.721 5.651 5.586 5.46 5.386 5.317 5.242 5.146 5.031 4.86 4.321 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5j_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5j_5b.txt deleted file mode 100644 index a9fc3fa0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5j_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20543 ,TETRA ,17699352,Sat Dec 4 17:31:12 CET,Sat Dec 4 19:18:34 CET,0.0 0.225 0.386 0.506 0.586 0.679 0.778 0.86 0.997 1.054 1.108 0.993 1.262 1.327 1.454 1.554 1.661 1.713 1.817 1.918 2.04 2.111 2.173 2.27 2.387 2.496 2.597 2.696 2.825 2.948 3.06 3.178 3.289 3.407 3.524 3.639 3.763 3.9 4.046 4.164 4.245 4.327 4.402 4.459 4.562 4.668 4.684 4.614 4.38 3.929 3.101 1.976 0.971 0.079 -0.697 -1.375 -1.958 -2.484 -2.949 -3.412 -3.802 -4.141 -4.459 -4.744 -5.001 -5.238 -5.501 -5.74 -5.938 -6.156 -6.386 -6.578 -6.794 -7.028 -7.186 -7.325 -7.482 -7.655 -7.824 -7.938 -8.048 -8.223 -8.366 -8.506 -8.568 -8.705 -8.848 -9.001 -9.082 -9.397 -9.352 -9.441 -9.535 -9.736 -9.836 -9.938 -10.063 -10.205 -10.346 -10.484 -10.704 -2 ,9702 ,TETRA ,17699353,Sat Dec 4 17:31:13 CET,Sat Dec 4 19:18:16 CET,0.0 0.243 0.368 0.465 0.568 0.66 0.745 0.835 0.977 1.061 1.154 1.067 1.335 1.387 1.491 1.585 1.664 1.699 1.768 1.845 1.968 2.045 2.114 2.2 2.277 2.359 2.427 2.494 2.584 2.663 2.733 2.821 2.905 2.982 3.079 3.194 3.289 3.379 3.478 3.575 3.658 3.75 3.85 3.913 3.965 4.001 4.013 3.95 3.778 3.424 2.624 1.457 0.428 -0.435 -1.19 -1.877 -2.448 -2.958 -3.428 -3.907 -4.308 -4.656 -4.974 -5.276 -5.551 -5.795 -6.039 -6.255 -6.445 -6.638 -6.842 -7.006 -7.185 -7.387 -7.544 -7.707 -7.869 -8.04 -8.222 -8.347 -8.472 -8.658 -8.795 -8.941 -9.013 -9.174 -9.328 -9.483 -9.562 -9.865 -9.817 -9.911 -10.003 -10.189 -10.284 -10.372 -10.473 -10.611 -10.789 -10.957 -11.247 -3 ,7700 ,TETRA ,17699354,Sat Dec 4 17:31:13 CET,Sat Dec 4 19:21:12 CET,0.0 0.123 0.241 0.325 0.407 0.491 0.57 0.64 0.771 0.836 0.9 0.815 1.088 1.135 1.214 1.29 1.36 1.398 1.471 1.548 1.671 1.753 1.832 1.933 2.035 2.139 2.239 2.32 2.415 2.521 2.611 2.698 2.779 2.849 2.948 3.074 3.182 3.326 3.492 3.612 3.695 3.771 3.846 3.918 3.972 3.992 4.004 3.96 3.744 3.301 2.369 1.179 0.164 -0.729 -1.498 -2.185 -2.777 -3.337 -3.815 -4.284 -4.667 -4.99 -5.311 -5.62 -5.903 -6.179 -6.499 -6.784 -7.041 -7.307 -7.572 -7.785 -8.01 -8.24 -8.412 -8.572 -8.715 -8.877 -9.048 -9.164 -9.298 -9.522 -9.658 -9.783 -9.854 -9.991 -10.129 -10.287 -10.368 -10.673 -10.607 -10.69 -10.782 -10.974 -11.071 -11.173 -11.298 -11.431 -11.568 -11.744 -11.995 -4 ,21330 ,TETRA ,17699355,Sat Dec 4 17:31:13 CET,Sat Dec 4 19:18:52 CET,0.0 0.225 0.356 0.464 0.55 0.621 0.683 0.737 0.839 0.885 0.938 0.833 1.094 1.132 1.215 1.313 1.409 1.454 1.532 1.606 1.705 1.763 1.817 1.882 1.955 2.035 2.104 2.178 2.274 2.353 2.422 2.508 2.59 2.666 2.744 2.829 2.908 2.991 3.078 3.16 3.244 3.34 3.436 3.511 3.57 3.61 3.621 3.524 3.275 2.833 1.938 0.718 -0.361 -1.332 -2.174 -2.876 -3.454 -3.967 -4.418 -4.875 -5.258 -5.6 -5.924 -6.216 -6.487 -6.733 -6.995 -7.238 -7.447 -7.665 -7.905 -8.113 -8.322 -8.526 -8.666 -8.81 -8.984 -9.173 -9.348 -9.457 -9.58 -9.762 -9.886 -10.034 -10.104 -10.244 -10.391 -10.54 -10.621 -10.922 -10.878 -10.988 -11.086 -11.28 -11.383 -11.491 -11.616 -11.752 -11.924 -12.165 -12.597 -5 ,2363 ,TETRA ,17699356,Sat Dec 4 17:31:13 CET,Sat Dec 4 19:18:08 CET,0.0 0.167 0.306 0.399 0.484 0.554 0.61 0.673 0.788 0.832 0.87 0.734 0.996 1.054 1.166 1.274 1.376 1.419 1.503 1.6 1.744 1.829 1.912 2.022 2.115 2.211 2.296 2.363 2.441 2.52 2.617 2.728 2.816 2.912 3.043 3.21 3.365 3.494 3.633 3.799 3.966 4.146 4.294 4.365 4.413 4.502 4.566 4.51 4.393 4.099 3.293 2.106 1.102 0.227 -0.553 -1.243 -1.857 -2.405 -2.858 -3.302 -3.67 -4.002 -4.351 -4.676 -4.967 -5.249 -5.542 -5.783 -5.984 -6.2 -6.422 -6.602 -6.787 -6.977 -7.122 -7.278 -7.453 -7.616 -7.768 -7.879 -8.0 -8.187 -8.315 -8.445 -8.512 -8.661 -8.814 -8.952 -9.035 -9.352 -9.306 -9.395 -9.491 -9.708 -9.829 -9.933 -10.023 -10.145 -10.293 -10.469 -10.821 -6 ,29532 ,TETRA ,17699357,Sat Dec 4 17:31:13 CET,Sat Dec 4 19:18:44 CET,0.0 0.126 0.255 0.377 0.477 0.574 0.657 0.721 0.832 0.892 0.95 0.836 1.098 1.152 1.255 1.334 1.395 1.425 1.497 1.565 1.653 1.709 1.758 1.827 1.902 1.996 2.099 2.182 2.274 2.369 2.461 2.573 2.687 2.813 2.945 3.055 3.141 3.219 3.317 3.415 3.492 3.577 3.654 3.708 3.756 3.796 3.797 3.703 3.462 2.959 2.011 0.786 -0.328 -1.336 -2.161 -2.847 -3.451 -3.981 -4.451 -4.915 -5.317 -5.676 -6.036 -6.398 -6.699 -6.96 -7.237 -7.474 -7.675 -7.887 -8.112 -8.29 -8.472 -8.67 -8.829 -8.988 -9.141 -9.3 -9.457 -9.566 -9.689 -9.893 -10.037 -10.175 -10.243 -10.383 -10.527 -10.68 -10.757 -11.058 -10.983 -11.05 -11.127 -11.304 -11.404 -11.517 -11.627 -11.737 -11.884 -12.083 -12.39 -7 ,23529 ,TETRA ,17699358,Sat Dec 4 17:31:13 CET,Sat Dec 4 19:30:07 CET,0.0 0.14 0.236 0.368 0.478 0.564 0.646 0.712 0.846 0.919 0.987 0.909 1.183 1.236 1.347 1.456 1.563 1.61 1.699 1.791 1.917 1.995 2.078 2.188 2.278 2.364 2.442 2.504 2.573 2.644 2.715 2.806 2.892 2.963 3.068 3.214 3.351 3.483 3.583 3.656 3.726 3.808 3.907 3.972 4.024 4.053 4.032 3.968 3.78 3.313 2.348 1.06 -0.019 -0.93 -1.697 -2.406 -3.096 -3.691 -4.154 -4.6 -4.987 -5.324 -5.642 -5.941 -6.213 -6.471 -6.742 -6.975 -7.16 -7.353 -7.559 -7.72 -7.887 -8.058 -8.196 -8.343 -8.499 -8.68 -8.876 -9.001 -9.119 -9.299 -9.425 -9.568 -9.644 -9.785 -9.923 -10.076 -10.159 -10.472 -10.425 -10.507 -10.601 -10.806 -10.916 -11.031 -11.168 -11.315 -11.452 -11.613 -12.201 -8 ,21070 ,TETRA ,17699359,Sat Dec 4 17:31:15 CET,Sat Dec 4 19:30:24 CET,0.0 0.217 0.36 0.497 0.599 0.71 0.814 0.886 1.014 1.072 1.128 1.014 1.272 1.318 1.42 1.514 1.603 1.647 1.732 1.816 1.948 2.042 2.125 2.237 2.33 2.404 2.488 2.57 2.68 2.791 2.891 3.002 3.101 3.194 3.284 3.359 3.432 3.524 3.612 3.683 3.745 3.822 3.891 3.927 3.97 3.998 3.993 3.974 3.854 3.465 2.606 1.429 0.408 -0.547 -1.475 -2.278 -2.947 -3.527 -4.037 -4.549 -4.928 -5.255 -5.586 -5.918 -6.216 -6.473 -6.75 -7.004 -7.214 -7.421 -7.638 -7.819 -8.0 -8.181 -8.312 -8.459 -8.625 -8.787 -8.944 -9.046 -9.151 -9.322 -9.448 -9.571 -9.633 -9.764 -9.905 -10.057 -10.132 -10.435 -10.376 -10.455 -10.542 -10.751 -10.852 -10.968 -11.09 -11.203 -11.325 -11.469 -11.63 -9 ,15919 ,TETRA ,17699360,Sat Dec 4 17:31:14 CET,Sat Dec 4 19:21:52 CET,0.0 0.258 0.347 0.442 0.535 0.611 0.677 0.751 0.884 0.947 1.009 0.898 1.157 1.195 1.269 1.359 1.439 1.47 1.527 1.592 1.688 1.749 1.808 1.894 1.972 2.055 2.131 2.192 2.265 2.364 2.461 2.539 2.617 2.708 2.799 2.878 2.964 3.052 3.147 3.254 3.349 3.439 3.534 3.591 3.646 3.679 3.664 3.616 3.448 3.005 2.01 0.643 -0.519 -1.512 -2.356 -3.139 -3.853 -4.461 -4.943 -5.427 -5.828 -6.183 -6.545 -6.882 -7.197 -7.469 -7.736 -7.979 -8.204 -8.44 -8.682 -8.885 -9.09 -9.307 -9.473 -9.645 -9.833 -10.025 -10.19 -10.297 -10.414 -10.608 -10.742 -10.885 -10.958 -11.104 -11.248 -11.386 -11.465 -11.766 -11.672 -11.74 -11.822 -12.009 -12.102 -12.199 -12.319 -12.461 -12.62 -12.789 -13.003 -10 ,7869 ,TETRA ,17699361,Sat Dec 4 17:31:14 CET,Sat Dec 4 19:18:20 CET,0.0 0.365 0.484 0.575 0.651 0.722 0.792 0.87 0.995 1.046 1.097 0.991 1.259 1.302 1.382 1.461 1.534 1.572 1.639 1.711 1.82 1.877 1.94 2.044 2.139 2.221 2.29 2.369 2.488 2.593 2.69 2.793 2.888 2.973 3.06 3.158 3.257 3.363 3.461 3.549 3.635 3.729 3.824 3.904 3.967 4.008 4.042 3.983 3.743 3.273 2.396 1.269 0.174 -0.782 -1.621 -2.358 -2.961 -3.496 -3.938 -4.376 -4.76 -5.151 -5.51 -5.803 -6.086 -6.352 -6.611 -6.847 -7.059 -7.29 -7.54 -7.727 -7.896 -8.077 -8.233 -8.398 -8.55 -8.691 -8.842 -8.962 -9.09 -9.294 -9.429 -9.554 -9.625 -9.765 -9.907 -10.057 -10.132 -10.435 -10.389 -10.474 -10.554 -10.734 -10.842 -10.954 -11.065 -11.193 -11.318 -11.45 -11.932 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5d.txt deleted file mode 100644 index 6a94c99b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25041 ,TETRA ,17699362,Sat Dec 4 17:31:15 CET,Sat Dec 4 19:18:40 CET,0.0 0.614 0.806 0.938 1.043 1.141 1.243 1.323 1.457 1.529 1.599 1.536 1.77 1.824 1.922 2.003 2.078 2.111 2.176 2.247 2.344 2.405 2.465 2.539 2.615 2.694 2.761 2.815 2.884 2.96 3.029 3.105 3.179 3.253 3.32 3.387 3.454 3.515 3.581 3.652 3.708 3.79 3.881 3.886 3.837 3.756 3.636 3.405 2.999 2.373 1.191 -0.286 -1.501 -2.556 -3.458 -4.228 -4.884 -5.48 -5.983 -6.449 -6.853 -7.238 -7.626 -7.985 -8.284 -8.547 -8.823 -9.089 -9.33 -9.564 -9.805 -10.007 -10.202 -10.386 -10.528 -10.673 -10.812 -10.979 -11.163 -11.276 -11.382 -11.56 -11.702 -11.838 -11.912 -12.072 -12.228 -12.396 -12.485 -12.773 -12.739 -12.822 -12.919 -13.144 -13.274 -13.419 -13.56 -13.685 -13.797 -13.983 -14.236 -2 ,7292 ,TETRA ,17699363,Sat Dec 4 17:31:15 CET,Sat Dec 4 19:18:49 CET,0.0 0.214 0.327 0.444 0.522 0.586 0.644 0.72 0.876 0.94 0.996 0.935 1.168 1.212 1.303 1.387 1.469 1.504 1.553 1.61 1.705 1.767 1.823 1.892 1.953 2.018 2.094 2.178 2.295 2.401 2.47 2.534 2.6 2.656 2.711 2.774 2.829 2.899 2.999 3.101 3.208 3.313 3.399 3.478 3.512 3.43 3.267 3.02 2.622 1.975 0.856 -0.629 -1.872 -2.881 -3.748 -4.507 -5.138 -5.709 -6.219 -6.772 -7.261 -7.662 -8.036 -8.39 -8.702 -8.991 -9.289 -9.559 -9.798 -10.017 -10.219 -10.395 -10.582 -10.769 -10.914 -11.068 -11.238 -11.425 -11.617 -11.745 -11.879 -12.092 -12.245 -12.404 -12.483 -12.64 -12.797 -12.964 -13.053 -13.347 -13.339 -13.432 -13.527 -13.72 -13.808 -13.9 -14.004 -14.124 -14.297 -14.5 -14.786 -3 ,8808 ,TETRA ,17699364,Sat Dec 4 17:31:15 CET,Sat Dec 4 19:18:46 CET,0.0 0.437 0.575 0.691 0.794 0.879 0.964 1.046 1.17 1.222 1.278 1.194 1.413 1.449 1.523 1.595 1.678 1.717 1.77 1.832 1.931 1.983 2.036 2.111 2.186 2.248 2.303 2.366 2.448 2.525 2.596 2.666 2.723 2.782 2.862 2.935 3.002 3.09 3.172 3.233 3.269 3.283 3.295 3.301 3.279 3.245 3.17 2.994 2.635 1.979 0.779 -0.704 -1.934 -2.968 -3.831 -4.639 -5.341 -5.937 -6.467 -6.998 -7.462 -7.887 -8.299 -8.705 -9.068 -9.377 -9.695 -9.973 -10.206 -10.449 -10.712 -10.924 -11.116 -11.332 -11.513 -11.677 -11.84 -12.029 -12.236 -12.375 -12.519 -12.721 -12.85 -12.982 -13.052 -13.199 -13.351 -13.508 -13.585 -13.863 -13.841 -13.925 -14.018 -14.241 -14.354 -14.454 -14.552 -14.675 -14.839 -15.036 -15.301 -4 ,15063 ,TETRA ,17699365,Sat Dec 4 17:31:15 CET,Sat Dec 4 19:18:40 CET,0.0 0.131 0.202 0.295 0.392 0.484 0.555 0.615 0.741 0.808 0.868 0.784 1.018 1.063 1.148 1.229 1.301 1.338 1.405 1.463 1.558 1.627 1.691 1.777 1.85 1.92 1.988 2.057 2.137 2.204 2.286 2.404 2.495 2.573 2.671 2.78 2.886 2.99 3.077 3.144 3.198 3.222 3.232 3.25 3.221 3.141 3.019 2.807 2.398 1.714 0.594 -0.772 -1.943 -2.941 -3.776 -4.554 -5.239 -5.81 -6.262 -6.735 -7.192 -7.613 -8.025 -8.412 -8.737 -9.016 -9.307 -9.564 -9.776 -10.0 -10.257 -10.485 -10.699 -10.902 -11.045 -11.183 -11.332 -11.484 -11.642 -11.751 -11.858 -12.026 -12.138 -12.249 -12.309 -12.453 -12.612 -12.757 -12.834 -13.115 -13.089 -13.178 -13.258 -13.42 -13.525 -13.637 -13.761 -13.928 -14.082 -14.22 -14.593 -5 ,10029 ,TETRA ,17699366,Sat Dec 4 17:31:15 CET,Sat Dec 4 19:30:11 CET,0.0 0.138 0.237 0.328 0.413 0.492 0.559 0.614 0.733 0.794 0.848 0.762 0.992 1.036 1.11 1.189 1.279 1.325 1.414 1.491 1.585 1.647 1.712 1.805 1.891 1.958 2.018 2.074 2.154 2.244 2.315 2.387 2.457 2.513 2.575 2.646 2.707 2.789 2.862 2.897 2.932 3.014 3.148 3.237 3.227 3.141 3.021 2.815 2.465 1.86 0.672 -0.834 -2.074 -3.105 -3.967 -4.737 -5.421 -6.025 -6.524 -7.018 -7.44 -7.833 -8.205 -8.531 -8.82 -9.085 -9.379 -9.642 -9.852 -10.055 -10.27 -10.453 -10.634 -10.824 -10.974 -11.124 -11.292 -11.478 -11.674 -11.808 -11.932 -12.113 -12.228 -12.336 -12.391 -12.506 -12.641 -12.782 -12.846 -13.104 -13.038 -13.104 -13.183 -13.397 -13.523 -13.644 -13.755 -13.88 -14.024 -14.157 -14.319 -6 ,22646 ,TETRA ,17699367,Sat Dec 4 17:31:17 CET,Sat Dec 4 19:30:17 CET,0.0 0.239 0.355 0.423 0.514 0.606 0.678 0.747 0.862 0.903 0.946 0.868 1.106 1.165 1.273 1.362 1.449 1.492 1.562 1.626 1.721 1.79 1.864 1.96 2.042 2.118 2.185 2.259 2.36 2.451 2.532 2.629 2.72 2.784 2.842 2.924 3.043 3.168 3.236 3.318 3.405 3.47 3.573 3.665 3.706 3.639 3.52 3.307 2.905 2.242 1.0 -0.591 -1.947 -3.104 -4.027 -4.777 -5.394 -5.951 -6.441 -6.911 -7.318 -7.667 -7.991 -8.296 -8.579 -8.837 -9.101 -9.329 -9.521 -9.733 -9.987 -10.211 -10.424 -10.637 -10.786 -10.925 -11.071 -11.226 -11.392 -11.517 -11.648 -11.834 -11.966 -12.103 -12.171 -12.301 -12.443 -12.616 -12.7 -12.968 -12.945 -13.045 -13.138 -13.317 -13.419 -13.53 -13.648 -13.761 -13.91 -14.119 -14.39 -7 ,14349 ,TETRA ,17699368,Sat Dec 4 17:31:19 CET,Sat Dec 4 19:29:33 CET,0.0 0.225 0.36 0.493 0.573 0.645 0.711 0.765 0.855 0.901 0.949 0.866 1.095 1.149 1.251 1.34 1.422 1.455 1.525 1.602 1.714 1.789 1.854 1.935 2.017 2.107 2.193 2.269 2.353 2.419 2.472 2.528 2.572 2.617 2.672 2.729 2.772 2.822 2.87 2.901 2.978 3.065 3.105 3.108 3.074 3.003 2.874 2.699 2.392 1.758 0.541 -0.867 -2.038 -3.063 -3.948 -4.72 -5.379 -5.955 -6.416 -6.886 -7.297 -7.645 -7.995 -8.329 -8.621 -8.879 -9.144 -9.388 -9.602 -9.81 -10.023 -10.208 -10.397 -10.596 -10.757 -10.925 -11.093 -11.264 -11.447 -11.573 -11.696 -11.894 -12.034 -12.177 -12.255 -12.415 -12.557 -12.706 -12.796 -13.084 -13.078 -13.175 -13.272 -13.469 -13.592 -13.711 -13.822 -13.95 -14.102 -14.302 -15.006 -8 ,1812 ,TETRA ,17699369,Sat Dec 4 17:31:15 CET,Sat Dec 4 19:18:50 CET,0.0 0.179 0.308 0.409 0.507 0.588 0.645 0.714 0.845 0.889 0.947 0.876 1.114 1.172 1.258 1.331 1.411 1.45 1.523 1.591 1.679 1.736 1.798 1.884 1.96 2.024 2.081 2.136 2.197 2.264 2.336 2.406 2.467 2.53 2.601 2.67 2.722 2.775 2.819 2.86 2.9 2.931 2.945 2.934 2.899 2.905 2.881 2.718 2.376 1.736 0.627 -0.833 -2.123 -3.166 -4.062 -4.88 -5.54 -6.148 -6.684 -7.19 -7.611 -7.99 -8.348 -8.666 -8.946 -9.21 -9.504 -9.778 -10.009 -10.233 -10.452 -10.638 -10.847 -11.068 -11.243 -11.419 -11.593 -11.768 -11.956 -12.078 -12.198 -12.401 -12.543 -12.679 -12.748 -12.901 -13.059 -13.222 -13.304 -13.595 -13.587 -13.662 -13.736 -13.919 -14.014 -14.104 -14.21 -14.358 -14.548 -14.747 -15.087 -9 ,16379 ,TETRA ,17699370,Sat Dec 4 17:32:08 CET,Sat Dec 4 19:19:35 CET,0.0 0.19 0.31 0.407 0.508 0.598 0.7 0.781 0.884 0.934 0.98 0.912 1.155 1.215 1.318 1.398 1.474 1.506 1.566 1.627 1.721 1.78 1.822 1.888 1.964 2.042 2.126 2.194 2.259 2.319 2.38 2.455 2.532 2.617 2.707 2.782 2.852 2.918 2.959 3.001 3.044 3.075 3.131 3.208 3.26 3.294 3.329 3.293 3.035 2.406 1.235 -0.164 -1.359 -2.427 -3.312 -4.031 -4.635 -5.182 -5.651 -6.159 -6.622 -7.035 -7.42 -7.767 -8.076 -8.346 -8.626 -8.88 -9.109 -9.348 -9.589 -9.788 -10.01 -10.232 -10.392 -10.55 -10.707 -10.886 -11.075 -11.199 -11.327 -11.522 -11.648 -11.775 -11.849 -12.017 -12.188 -12.352 -12.427 -12.698 -12.647 -12.723 -12.808 -12.972 -13.088 -13.235 -13.358 -13.477 -13.608 -13.775 -14.088 -10 ,16777 ,TETRA ,17699371,Sat Dec 4 17:32:08 CET,Sat Dec 4 19:29:00 CET,0.0 0.124 0.236 0.324 0.398 0.466 0.525 0.589 0.735 0.812 0.875 0.809 1.044 1.088 1.171 1.245 1.332 1.377 1.459 1.538 1.631 1.687 1.741 1.824 1.9 1.963 2.017 2.054 2.1 2.149 2.203 2.274 2.323 2.376 2.458 2.549 2.639 2.728 2.788 2.822 2.848 2.865 2.865 2.847 2.812 2.741 2.622 2.414 1.958 1.225 0.014 -1.481 -2.773 -3.88 -4.758 -5.546 -6.215 -6.774 -7.294 -7.816 -8.245 -8.613 -8.954 -9.285 -9.583 -9.849 -10.126 -10.367 -10.572 -10.781 -11.006 -11.21 -11.428 -11.643 -11.823 -12.006 -12.158 -12.314 -12.502 -12.634 -12.759 -12.958 -13.102 -13.24 -13.31 -13.457 -13.614 -13.768 -13.843 -14.126 -14.101 -14.189 -14.28 -14.475 -14.599 -14.735 -14.853 -14.989 -15.151 -15.357 -15.796 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5f.txt deleted file mode 100644 index 9ecc54e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16294 ,TETRA ,17699372,Sat Dec 4 17:32:08 CET,Sat Dec 4 19:19:04 CET,0.0 0.233 0.355 0.489 0.602 0.695 0.789 0.869 1.02 1.102 1.172 1.11 1.359 1.423 1.537 1.657 1.765 1.815 1.912 2.014 2.162 2.256 2.353 2.493 2.637 2.777 2.917 3.06 3.23 3.396 3.557 3.747 3.939 4.13 4.343 4.573 4.802 5.072 5.346 5.613 5.926 6.261 6.6 6.953 7.376 7.828 8.318 8.846 9.435 10.136 10.889 11.28 11.316 11.233 11.137 11.03 10.88 10.702 10.525 10.312 10.108 9.934 9.782 9.652 9.5 9.345 9.202 9.078 8.96 8.84 8.739 8.642 8.521 8.405 8.318 8.221 8.11 7.983 7.845 7.757 7.668 7.53 7.43 7.32 7.273 7.181 7.08 6.972 6.912 6.67 6.724 6.665 6.6 6.439 6.348 6.265 6.166 6.049 5.885 5.68 5.342 -2 ,14780 ,TETRA ,17699373,Sat Dec 4 17:34:11 CET,Sat Dec 4 19:36:24 CET,0.0 0.161 0.306 0.435 0.559 0.694 0.811 0.917 1.071 1.145 1.223 1.214 1.479 1.56 1.706 1.828 1.94 2.001 2.115 2.215 2.373 2.471 2.566 2.704 2.841 2.987 3.129 3.252 3.402 3.552 3.706 3.894 4.083 4.272 4.476 4.697 4.936 5.208 5.482 5.75 6.035 6.359 6.733 7.149 7.648 8.184 8.747 9.337 10.016 10.713 11.401 11.868 11.966 11.878 11.75 11.613 11.49 11.36 11.203 11.011 10.827 10.65 10.483 10.307 10.121 9.952 9.801 9.674 9.536 9.381 9.251 9.15 9.047 8.934 8.83 8.726 8.625 8.507 8.374 8.287 8.205 8.063 7.951 7.848 7.804 7.714 7.617 7.505 7.441 7.191 7.222 7.158 7.1 6.936 6.838 6.754 6.649 6.52 6.397 6.271 5.838 -3 ,13835 ,TETRA ,17699374,Sat Dec 4 17:34:12 CET,Sat Dec 4 19:36:04 CET,0.0 0.412 0.616 0.739 0.845 0.959 1.076 1.166 1.311 1.386 1.465 1.444 1.687 1.744 1.856 1.977 2.098 2.151 2.251 2.349 2.507 2.607 2.7 2.839 2.97 3.091 3.221 3.362 3.537 3.693 3.835 3.99 4.146 4.321 4.539 4.801 5.057 5.309 5.55 5.799 6.076 6.435 6.839 7.223 7.682 8.135 8.634 9.194 9.809 10.515 11.279 11.664 11.735 11.641 11.464 11.265 11.071 10.875 10.688 10.497 10.307 10.094 9.9 9.751 9.613 9.482 9.338 9.203 9.08 8.943 8.789 8.668 8.549 8.421 8.312 8.199 8.085 7.965 7.849 7.774 7.698 7.551 7.444 7.345 7.296 7.197 7.094 6.981 6.921 6.684 6.735 6.666 6.584 6.403 6.317 6.235 6.151 6.047 5.906 5.72 5.37 -4 ,8145 ,TETRA ,17699375,Sat Dec 4 17:34:11 CET,Sat Dec 4 19:31:55 CET,0.0 0.223 0.345 0.456 0.548 0.647 0.731 0.816 0.978 1.04 1.106 1.067 1.323 1.391 1.507 1.625 1.739 1.796 1.917 2.034 2.201 2.305 2.403 2.554 2.726 2.889 3.029 3.166 3.338 3.502 3.663 3.84 4.021 4.196 4.394 4.638 4.866 5.129 5.406 5.655 5.931 6.272 6.64 7.014 7.47 7.999 8.613 9.247 9.936 10.577 11.173 11.538 11.649 11.636 11.568 11.431 11.277 11.15 10.989 10.79 10.614 10.462 10.327 10.19 10.047 9.915 9.754 9.591 9.433 9.286 9.169 9.072 8.969 8.85 8.757 8.654 8.544 8.433 8.304 8.213 8.129 7.998 7.903 7.8 7.746 7.633 7.517 7.416 7.366 7.139 7.196 7.139 7.088 6.957 6.87 6.78 6.693 6.582 6.465 6.322 6.002 -5 ,9818 ,TETRA ,17699376,Sat Dec 4 17:34:11 CET,Sat Dec 4 19:34:04 CET,0.0 0.266 0.378 0.496 0.6 0.683 0.759 0.845 1.02 1.097 1.167 1.108 1.352 1.41 1.533 1.654 1.772 1.835 1.951 2.059 2.224 2.335 2.442 2.588 2.715 2.841 2.977 3.114 3.296 3.461 3.609 3.787 3.954 4.126 4.332 4.554 4.789 5.051 5.299 5.585 5.892 6.2 6.564 6.946 7.434 8.02 8.642 9.228 9.831 10.458 11.081 11.406 11.51 11.469 11.371 11.275 11.15 11.004 10.829 10.634 10.463 10.3 10.121 9.923 9.75 9.615 9.48 9.349 9.226 9.097 8.967 8.86 8.731 8.606 8.522 8.435 8.344 8.238 8.137 8.069 7.98 7.826 7.727 7.628 7.576 7.475 7.364 7.234 7.172 6.947 7.018 6.947 6.877 6.772 6.696 6.603 6.517 6.415 6.292 6.154 5.761 -6 ,11577 ,TETRA ,17699377,Sat Dec 4 17:34:11 CET,Sat Dec 4 19:40:13 CET,0.0 0.427 0.661 0.785 0.882 0.984 1.095 1.197 1.369 1.451 1.538 1.536 1.801 1.875 2.004 2.114 2.21 2.268 2.386 2.486 2.621 2.708 2.806 2.962 3.098 3.204 3.305 3.417 3.578 3.74 3.909 4.108 4.283 4.451 4.635 4.829 5.028 5.262 5.502 5.774 6.095 6.434 6.787 7.127 7.515 7.944 8.457 9.054 9.704 10.363 10.967 11.277 11.322 11.25 11.144 11.027 10.868 10.685 10.521 10.354 10.193 10.033 9.858 9.679 9.533 9.402 9.261 9.129 9.012 8.892 8.771 8.677 8.57 8.456 8.369 8.277 8.184 8.085 7.978 7.9 7.815 7.701 7.635 7.562 7.515 7.424 7.331 7.23 7.174 6.938 7.009 6.953 6.875 6.683 6.602 6.522 6.417 6.282 6.142 5.998 5.734 -7 ,13067 ,TETRA ,17699378,Sat Dec 4 17:55:07 CET,Sat Dec 4 19:54:30 CET,0.0 0.174 0.335 0.499 0.605 0.69 0.763 0.833 0.958 1.035 1.114 1.064 1.309 1.373 1.507 1.65 1.779 1.838 1.959 2.062 2.196 2.292 2.389 2.521 2.649 2.778 2.91 3.044 3.218 3.399 3.584 3.79 3.968 4.154 4.363 4.587 4.81 5.035 5.278 5.554 5.825 6.129 6.507 6.868 7.288 7.74 8.304 8.931 9.531 10.202 10.88 11.228 11.308 11.251 11.101 10.95 10.786 10.587 10.416 10.252 10.096 9.949 9.788 9.598 9.403 9.218 9.039 8.902 8.784 8.662 8.542 8.438 8.325 8.21 8.117 8.006 7.889 7.778 7.663 7.577 7.487 7.358 7.282 7.206 7.161 7.067 6.976 6.869 6.809 6.574 6.632 6.573 6.505 6.338 6.251 6.162 6.074 5.979 5.867 5.73 5.513 -8 ,12550 ,TETRA ,17699379,Sat Dec 4 17:55:09 CET,Sat Dec 4 19:55:35 CET,0.0 0.175 0.301 0.414 0.509 0.608 0.704 0.8 0.96 1.027 1.1 1.059 1.308 1.374 1.487 1.587 1.691 1.745 1.853 1.957 2.106 2.206 2.293 2.421 2.566 2.705 2.836 2.968 3.121 3.26 3.42 3.624 3.824 4.019 4.246 4.513 4.747 4.975 5.223 5.481 5.752 6.075 6.465 6.864 7.301 7.743 8.251 8.861 9.576 10.343 11.127 11.59 11.711 11.731 11.683 11.555 11.394 11.2 11.007 10.813 10.645 10.455 10.268 10.138 10.016 9.892 9.748 9.599 9.487 9.367 9.205 9.082 8.987 8.894 8.803 8.698 8.606 8.505 8.386 8.314 8.241 8.127 8.038 7.939 7.889 7.781 7.659 7.53 7.466 7.224 7.266 7.183 7.095 6.958 6.892 6.799 6.66 6.5 6.351 6.222 6.021 -9 ,1766 ,TETRA ,17699380,Sat Dec 4 17:55:08 CET,Sat Dec 4 19:54:44 CET,0.0 0.165 0.311 0.43 0.537 0.634 0.717 0.8 0.984 1.067 1.131 1.058 1.298 1.361 1.484 1.625 1.764 1.822 1.93 2.04 2.204 2.3 2.392 2.521 2.647 2.782 2.915 3.037 3.188 3.338 3.49 3.661 3.818 3.981 4.176 4.422 4.681 4.942 5.214 5.516 5.814 6.133 6.542 6.988 7.486 7.966 8.443 8.964 9.616 10.389 11.171 11.635 11.78 11.767 11.668 11.505 11.356 11.191 11.009 10.817 10.588 10.384 10.236 10.079 9.906 9.758 9.594 9.446 9.333 9.223 9.104 8.994 8.878 8.759 8.669 8.573 8.474 8.368 8.248 8.165 8.081 7.951 7.863 7.777 7.726 7.619 7.52 7.401 7.334 7.09 7.133 7.055 6.973 6.823 6.744 6.657 6.545 6.41 6.273 6.098 5.644 -10 ,4097 ,TETRA ,17699381,Sat Dec 4 17:55:08 CET,Sat Dec 4 19:57:55 CET,0.0 0.297 0.49 0.624 0.711 0.774 0.83 0.889 1.012 1.066 1.121 1.064 1.309 1.371 1.501 1.631 1.755 1.812 1.93 2.052 2.211 2.306 2.404 2.558 2.711 2.858 2.996 3.13 3.306 3.487 3.664 3.872 4.084 4.269 4.473 4.688 4.869 5.084 5.338 5.596 5.857 6.148 6.49 6.844 7.264 7.749 8.303 8.938 9.665 10.446 11.216 11.647 11.736 11.605 11.434 11.314 11.218 11.064 10.886 10.694 10.526 10.373 10.2 10.015 9.853 9.729 9.591 9.454 9.334 9.219 9.095 8.988 8.873 8.739 8.632 8.522 8.406 8.272 8.132 8.044 7.939 7.763 7.661 7.551 7.496 7.39 7.267 7.141 7.081 6.849 6.878 6.804 6.732 6.567 6.471 6.373 6.262 6.126 5.996 5.873 5.374 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5b.txt deleted file mode 100644 index e4595e48..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29602 ,TETRA ,17699382,Sat Dec 4 17:55:08 CET,Sat Dec 4 19:59:16 CET,0.0 0.109 0.217 0.295 0.362 0.409 0.467 0.523 0.634 0.681 0.714 0.577 0.812 0.849 0.907 0.963 1.012 1.026 1.065 1.107 1.154 1.19 1.222 1.247 1.278 1.316 1.35 1.374 1.408 1.431 1.43 1.43 1.439 1.438 1.42 1.412 1.403 1.36 1.301 1.241 1.173 1.102 0.98 0.83 0.599 0.223 -0.261 -0.895 -1.801 -3.133 -5.327 -7.836 -9.809 -11.469 -12.842 -14.006 -14.997 -15.872 -16.593 -17.278 -17.872 -18.404 -18.902 -19.356 -19.746 -20.094 -20.451 -20.749 -21.011 -21.295 -21.573 -21.807 -22.063 -22.325 -22.526 -22.731 -22.949 -23.168 -23.372 -23.515 -23.663 -23.88 -24.022 -24.172 -24.254 -24.416 -24.572 -24.75 -24.851 -25.181 -25.144 -25.241 -25.333 -25.523 -25.631 -25.763 -25.912 -26.04 -26.181 -26.392 -26.671 -2 ,20554 ,TETRA ,17699383,Sat Dec 4 17:55:09 CET,Sat Dec 4 19:59:17 CET,0.0 0.189 0.317 0.42 0.51 0.56 0.604 0.666 0.785 0.837 0.882 0.749 0.976 1.011 1.073 1.133 1.205 1.233 1.268 1.293 1.319 1.343 1.377 1.428 1.478 1.533 1.568 1.585 1.613 1.642 1.667 1.679 1.658 1.643 1.636 1.609 1.577 1.539 1.488 1.419 1.327 1.21 1.049 0.858 0.608 0.286 -0.183 -0.815 -1.686 -2.998 -5.14 -7.581 -9.549 -11.194 -12.534 -13.662 -14.6 -15.418 -16.116 -16.787 -17.357 -17.857 -18.319 -18.742 -19.122 -19.502 -19.9 -20.217 -20.492 -20.793 -21.101 -21.33 -21.553 -21.782 -21.964 -22.157 -22.356 -22.559 -22.763 -22.904 -23.044 -23.247 -23.39 -23.536 -23.615 -23.78 -23.941 -24.103 -24.19 -24.502 -24.459 -24.567 -24.663 -24.848 -24.954 -25.07 -25.188 -25.32 -25.494 -25.703 -25.957 -3 ,26378 ,TETRA ,17699384,Sat Dec 4 17:55:08 CET,Sat Dec 4 19:56:38 CET,0.0 0.247 0.408 0.511 0.599 0.677 0.738 0.787 0.9 0.944 0.984 0.859 1.093 1.132 1.192 1.217 1.245 1.271 1.317 1.35 1.397 1.426 1.449 1.483 1.522 1.558 1.602 1.649 1.689 1.728 1.786 1.846 1.89 1.944 2.011 2.073 2.1 2.089 2.051 2.011 1.992 1.958 1.898 1.813 1.668 1.433 0.977 0.298 -0.638 -2.014 -4.203 -6.762 -8.774 -10.405 -11.753 -12.876 -13.828 -14.683 -15.418 -16.149 -16.742 -17.228 -17.676 -18.102 -18.482 -18.815 -19.16 -19.479 -19.757 -20.046 -20.349 -20.575 -20.794 -21.035 -21.243 -21.451 -21.643 -21.844 -22.059 -22.212 -22.366 -22.608 -22.763 -22.904 -22.978 -23.133 -23.292 -23.463 -23.551 -23.87 -23.84 -23.934 -24.032 -24.249 -24.362 -24.496 -24.638 -24.762 -24.88 -25.004 -25.231 -4 ,18646 ,TETRA ,17699385,Sat Dec 4 17:55:09 CET,Sat Dec 4 19:55:40 CET,0.0 0.226 0.376 0.465 0.537 0.614 0.673 0.733 0.854 0.909 0.948 0.808 1.043 1.073 1.118 1.165 1.213 1.235 1.283 1.323 1.362 1.382 1.414 1.463 1.488 1.513 1.535 1.54 1.546 1.567 1.599 1.627 1.638 1.648 1.635 1.602 1.575 1.538 1.499 1.448 1.367 1.27 1.126 0.943 0.681 0.32 -0.166 -0.815 -1.774 -3.23 -5.558 -8.14 -10.134 -11.712 -13.018 -14.18 -15.133 -15.941 -16.623 -17.283 -17.837 -18.325 -18.78 -19.234 -19.667 -20.041 -20.418 -20.734 -21.008 -21.302 -21.61 -21.868 -22.123 -22.381 -22.587 -22.795 -23.0 -23.21 -23.42 -23.559 -23.709 -23.937 -24.1 -24.276 -24.362 -24.529 -24.694 -24.865 -24.943 -25.246 -25.19 -25.271 -25.361 -25.55 -25.652 -25.774 -25.908 -26.05 -26.195 -26.364 -26.664 -5 ,15788 ,TETRA ,17699386,Sat Dec 4 17:55:09 CET,Sat Dec 4 19:55:33 CET,0.0 0.158 0.316 0.455 0.541 0.619 0.699 0.77 0.881 0.926 0.973 0.855 1.087 1.116 1.171 1.226 1.283 1.308 1.355 1.412 1.495 1.542 1.584 1.635 1.678 1.717 1.762 1.808 1.865 1.92 1.96 1.992 2.029 2.067 2.086 2.081 2.07 2.044 1.99 1.933 1.871 1.809 1.696 1.5 1.242 0.954 0.551 -0.078 -1.022 -2.413 -4.586 -7.07 -9.039 -10.645 -11.954 -13.107 -14.109 -14.957 -15.647 -16.345 -16.926 -17.413 -17.894 -18.355 -18.757 -19.098 -19.458 -19.797 -20.1 -20.387 -20.646 -20.866 -21.093 -21.31 -21.482 -21.671 -21.857 -22.049 -22.264 -22.419 -22.57 -22.792 -22.946 -23.093 -23.165 -23.305 -23.469 -23.665 -23.756 -24.069 -24.026 -24.12 -24.232 -24.485 -24.6 -24.716 -24.853 -24.992 -25.141 -25.329 -25.618 -6 ,4616 ,TETRA ,17699387,Sat Dec 4 17:55:10 CET,Sat Dec 4 19:54:29 CET,0.0 0.152 0.239 0.319 0.389 0.471 0.551 0.613 0.704 0.736 0.774 0.642 0.87 0.9 0.96 1.0 1.038 1.066 1.114 1.156 1.214 1.236 1.248 1.268 1.301 1.34 1.375 1.396 1.418 1.429 1.436 1.447 1.463 1.477 1.486 1.485 1.484 1.499 1.499 1.488 1.474 1.412 1.289 1.129 0.867 0.497 -0.008 -0.698 -1.679 -3.131 -5.417 -7.991 -10.047 -11.725 -13.075 -14.258 -15.215 -16.023 -16.724 -17.391 -17.946 -18.432 -18.873 -19.269 -19.635 -19.974 -20.32 -20.638 -20.917 -21.198 -21.489 -21.737 -21.988 -22.237 -22.434 -22.642 -22.86 -23.076 -23.291 -23.425 -23.554 -23.752 -23.889 -24.033 -24.108 -24.261 -24.435 -24.628 -24.723 -25.044 -25.024 -25.132 -25.239 -25.436 -25.533 -25.637 -25.749 -25.885 -26.053 -26.222 -26.448 -7 ,15842 ,TETRA ,17699388,Sat Dec 4 17:55:08 CET,Sat Dec 4 19:55:24 CET,0.0 0.194 0.346 0.443 0.515 0.567 0.612 0.667 0.78 0.825 0.858 0.713 0.943 0.971 1.028 1.096 1.153 1.177 1.226 1.265 1.329 1.37 1.41 1.485 1.546 1.581 1.615 1.647 1.668 1.706 1.749 1.76 1.759 1.762 1.771 1.767 1.744 1.714 1.657 1.59 1.553 1.505 1.371 1.188 0.921 0.582 0.146 -0.491 -1.46 -2.878 -5.118 -7.695 -9.742 -11.384 -12.736 -13.887 -14.892 -15.759 -16.442 -17.111 -17.685 -18.192 -18.66 -19.119 -19.558 -19.941 -20.324 -20.64 -20.902 -21.174 -21.462 -21.7 -21.926 -22.178 -22.378 -22.575 -22.783 -22.979 -23.17 -23.305 -23.447 -23.659 -23.798 -23.951 -24.032 -24.199 -24.364 -24.557 -24.66 -24.986 -24.972 -25.074 -25.173 -25.379 -25.487 -25.601 -25.715 -25.82 -25.965 -26.172 -26.501 -8 ,10245 ,TETRA ,17699389,Sat Dec 4 17:55:09 CET,Sat Dec 4 19:54:16 CET,0.0 0.2 0.316 0.434 0.536 0.612 0.667 0.717 0.803 0.842 0.879 0.753 0.988 1.024 1.085 1.133 1.185 1.204 1.232 1.253 1.283 1.31 1.34 1.367 1.386 1.412 1.432 1.449 1.472 1.503 1.533 1.564 1.582 1.585 1.606 1.64 1.67 1.704 1.742 1.742 1.69 1.604 1.465 1.31 1.124 0.888 0.525 -0.054 -0.965 -2.32 -4.463 -6.958 -8.971 -10.611 -11.917 -13.039 -13.976 -14.784 -15.492 -16.204 -16.841 -17.422 -17.919 -18.345 -18.733 -19.082 -19.458 -19.799 -20.097 -20.4 -20.712 -20.969 -21.213 -21.444 -21.615 -21.801 -22.006 -22.216 -22.416 -22.545 -22.688 -22.927 -23.083 -23.231 -23.31 -23.478 -23.656 -23.844 -23.945 -24.27 -24.253 -24.362 -24.458 -24.644 -24.753 -24.891 -25.024 -25.137 -25.265 -25.438 -25.767 -9 ,14587 ,TETRA ,17699390,Sat Dec 4 17:55:09 CET,Sat Dec 4 19:54:57 CET,0.0 0.24 0.403 0.515 0.599 0.67 0.749 0.83 0.953 0.995 1.04 0.911 1.139 1.168 1.233 1.287 1.325 1.349 1.39 1.43 1.501 1.552 1.589 1.633 1.674 1.701 1.718 1.732 1.758 1.791 1.823 1.854 1.869 1.86 1.841 1.839 1.853 1.862 1.844 1.795 1.724 1.622 1.502 1.356 1.126 0.81 0.337 -0.294 -1.169 -2.534 -4.762 -7.294 -9.306 -10.889 -12.169 -13.287 -14.233 -15.06 -15.755 -16.433 -17.056 -17.627 -18.146 -18.618 -19.041 -19.41 -19.764 -20.069 -20.361 -20.685 -21.003 -21.246 -21.491 -21.745 -21.943 -22.159 -22.382 -22.587 -22.808 -22.965 -23.129 -23.382 -23.534 -23.684 -23.764 -23.933 -24.111 -24.291 -24.376 -24.682 -24.631 -24.739 -24.844 -25.048 -25.162 -25.29 -25.418 -25.554 -25.736 -25.947 -26.202 -10 ,22141 ,TETRA ,17699391,Sat Dec 4 17:55:09 CET,Sat Dec 4 19:55:23 CET,0.0 0.355 0.467 0.553 0.623 0.683 0.754 0.823 0.915 0.957 0.989 0.852 1.085 1.115 1.177 1.252 1.324 1.349 1.4 1.446 1.5 1.536 1.566 1.601 1.646 1.683 1.706 1.725 1.751 1.776 1.798 1.82 1.832 1.832 1.827 1.814 1.78 1.738 1.696 1.649 1.587 1.477 1.332 1.186 0.951 0.613 0.189 -0.414 -1.403 -2.876 -5.134 -7.602 -9.54 -11.165 -12.495 -13.608 -14.556 -15.388 -16.109 -16.833 -17.422 -17.933 -18.403 -18.82 -19.215 -19.579 -19.948 -20.261 -20.524 -20.812 -21.108 -21.338 -21.561 -21.786 -21.966 -22.152 -22.367 -22.6 -22.818 -22.959 -23.1 -23.313 -23.476 -23.65 -23.738 -23.919 -24.088 -24.244 -24.331 -24.658 -24.631 -24.738 -24.85 -25.062 -25.188 -25.339 -25.514 -25.741 -25.962 -26.154 -26.319 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5f.txt deleted file mode 100644 index 2efeee85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31790 ,KEBNE ,17077280,Sat Dec 25 10:31:17 CET,Sat Dec 25 12:15:33 CET,0.0 0.217 0.411 0.57 0.721 0.846 0.951 1.031 1.199 1.284 1.362 1.338 1.618 1.696 1.873 2.037 2.191 2.265 2.413 2.562 2.781 2.929 3.062 3.241 3.416 3.599 3.785 3.953 4.162 4.362 4.572 4.852 5.119 5.371 5.667 6.009 6.329 6.679 7.101 7.58 8.073 8.616 9.26 9.908 10.677 11.607 12.711 13.955 15.44 17.278 19.62 21.613 22.797 23.55 24.059 24.45 24.731 24.937 25.033 25.041 25.028 25.026 25.049 25.061 25.05 25.02 24.983 24.963 24.95 24.929 24.889 24.851 24.823 24.78 24.737 24.7 24.652 24.604 24.548 24.503 24.445 24.327 24.256 24.199 24.166 24.087 24.004 23.904 23.86 23.64 23.717 23.666 23.622 23.521 23.457 23.383 23.3 23.198 23.078 22.967 22.771 -2 ,26739 ,KEBNE ,17077281,Sat Dec 25 10:31:18 CET,Sat Dec 25 12:15:24 CET,0.0 0.17 0.334 0.51 0.642 0.75 0.863 0.974 1.199 1.305 1.401 1.384 1.685 1.776 1.945 2.119 2.277 2.344 2.471 2.603 2.795 2.923 3.055 3.261 3.467 3.661 3.831 4.001 4.23 4.458 4.68 4.938 5.199 5.451 5.75 6.112 6.47 6.88 7.329 7.797 8.292 8.853 9.523 10.2 10.969 11.869 12.933 14.155 15.662 17.502 19.832 21.838 23.075 23.885 24.377 24.727 24.985 25.161 25.29 25.384 25.444 25.498 25.505 25.458 25.404 25.37 25.355 25.332 25.285 25.226 25.167 25.11 25.046 24.982 24.931 24.884 24.838 24.784 24.749 24.727 24.684 24.602 24.553 24.49 24.45 24.37 24.285 24.198 24.149 23.922 23.993 23.935 23.874 23.747 23.674 23.589 23.507 23.413 23.304 23.183 23.055 -3 ,10506 ,KEBNE ,17077282,Sat Dec 25 10:33:23 CET,Sat Dec 25 12:17:24 CET,0.0 0.193 0.333 0.475 0.611 0.738 0.853 0.956 1.154 1.25 1.354 1.363 1.652 1.727 1.872 2.03 2.187 2.261 2.404 2.556 2.76 2.874 2.987 3.167 3.354 3.531 3.706 3.875 4.092 4.316 4.55 4.843 5.112 5.36 5.651 5.984 6.306 6.656 7.046 7.474 7.971 8.552 9.215 9.888 10.684 11.613 12.72 13.957 15.422 17.229 19.563 21.588 22.788 23.549 23.969 24.216 24.415 24.545 24.594 24.633 24.686 24.748 24.779 24.757 24.733 24.728 24.725 24.712 24.692 24.66 24.625 24.596 24.545 24.486 24.448 24.399 24.352 24.316 24.267 24.227 24.179 24.091 24.027 23.97 23.933 23.842 23.751 23.655 23.609 23.393 23.489 23.432 23.37 23.266 23.206 23.13 23.057 22.982 22.889 22.802 22.633 -4 ,24094 ,KEBNE ,17077283,Sat Dec 25 10:36:35 CET,Sat Dec 25 12:18:08 CET,0.0 0.154 0.306 0.473 0.647 0.789 0.91 1.017 1.224 1.325 1.422 1.408 1.693 1.776 1.944 2.108 2.27 2.351 2.509 2.671 2.88 3.005 3.138 3.336 3.524 3.704 3.873 4.025 4.238 4.451 4.662 4.927 5.183 5.445 5.754 6.092 6.417 6.782 7.167 7.581 8.049 8.585 9.22 9.871 10.644 11.532 12.566 13.753 15.21 17.029 19.388 21.456 22.714 23.502 24.02 24.411 24.689 24.888 25.018 25.117 25.184 25.228 25.236 25.241 25.253 25.234 25.196 25.159 25.128 25.087 25.041 24.994 24.92 24.843 24.791 24.745 24.705 24.659 24.599 24.559 24.521 24.457 24.397 24.329 24.297 24.231 24.161 24.089 24.058 23.85 23.944 23.899 23.848 23.741 23.672 23.595 23.506 23.401 23.27 23.13 22.871 -5 ,31036 ,KEBNE ,17077284,Sat Dec 25 10:37:34 CET,Sat Dec 25 12:21:26 CET,0.0 0.195 0.348 0.476 0.613 0.736 0.847 0.95 1.166 1.277 1.383 1.381 1.669 1.76 1.94 2.11 2.277 2.36 2.514 2.663 2.889 3.026 3.147 3.32 3.496 3.683 3.864 4.035 4.252 4.468 4.678 4.923 5.161 5.403 5.693 6.019 6.342 6.707 7.094 7.507 7.952 8.492 9.144 9.802 10.631 11.593 12.678 13.919 15.393 17.207 19.555 21.608 22.815 23.588 24.135 24.526 24.79 24.975 25.116 25.233 25.293 25.289 25.242 25.203 25.174 25.16 25.151 25.129 25.111 25.091 25.063 25.036 24.992 24.933 24.897 24.871 24.831 24.776 24.714 24.671 24.635 24.568 24.516 24.456 24.427 24.381 24.316 24.225 24.189 23.984 24.065 24.007 23.959 23.851 23.778 23.714 23.657 23.566 23.456 23.335 23.188 -6 ,32668 ,KEBNE ,17077285,Sat Dec 25 10:41:46 CET,Sat Dec 25 12:25:38 CET,0.0 0.178 0.313 0.437 0.558 0.69 0.808 0.911 1.114 1.21 1.293 1.238 1.502 1.572 1.721 1.868 2.009 2.078 2.213 2.335 2.514 2.641 2.769 2.962 3.157 3.368 3.579 3.778 4.036 4.281 4.502 4.758 5.011 5.249 5.534 5.867 6.183 6.536 6.928 7.344 7.774 8.272 8.888 9.549 10.381 11.324 12.382 13.589 15.057 16.874 19.165 21.205 22.465 23.304 23.883 24.263 24.505 24.699 24.838 24.93 24.999 25.047 25.085 25.105 25.126 25.137 25.099 25.058 25.034 24.99 24.916 24.836 24.768 24.696 24.631 24.582 24.55 24.508 24.452 24.41 24.362 24.281 24.219 24.165 24.146 24.085 23.992 23.903 23.864 23.646 23.733 23.676 23.613 23.502 23.448 23.385 23.317 23.242 23.141 23.024 22.629 -7 ,31645 ,KEBNE ,17077286,Sat Dec 25 10:43:51 CET,Sat Dec 25 12:27:34 CET,0.0 0.315 0.495 0.643 0.772 0.889 1.0 1.089 1.252 1.343 1.428 1.383 1.663 1.74 1.903 2.061 2.193 2.261 2.403 2.546 2.756 2.888 3.017 3.218 3.417 3.609 3.797 3.987 4.239 4.484 4.731 5.023 5.285 5.532 5.835 6.201 6.539 6.901 7.277 7.672 8.136 8.696 9.351 9.99 10.763 11.663 12.72 13.935 15.362 17.163 19.472 21.408 22.569 23.32 23.813 24.135 24.354 24.512 24.627 24.715 24.78 24.83 24.846 24.83 24.807 24.785 24.744 24.695 24.647 24.604 24.571 24.528 24.483 24.438 24.402 24.355 24.301 24.26 24.215 24.178 24.127 24.014 23.936 23.862 23.824 23.748 23.664 23.582 23.539 23.307 23.383 23.337 23.284 23.143 23.068 23.001 22.924 22.84 22.759 22.67 22.38 -8 ,3889 ,KEBNE ,17077287,Sat Dec 25 10:45:56 CET,Sat Dec 25 12:29:57 CET,0.0 0.261 0.436 0.583 0.691 0.807 0.929 1.044 1.25 1.34 1.426 1.392 1.666 1.738 1.899 2.065 2.216 2.296 2.443 2.593 2.821 2.949 3.079 3.271 3.444 3.617 3.802 3.998 4.231 4.442 4.655 4.923 5.183 5.43 5.715 6.032 6.358 6.732 7.123 7.541 8.008 8.547 9.179 9.854 10.655 11.536 12.597 13.802 15.278 17.16 19.58 21.666 22.911 23.694 24.196 24.566 24.839 25.037 25.175 25.262 25.321 25.374 25.402 25.419 25.432 25.432 25.417 25.403 25.375 25.325 25.271 25.24 25.209 25.168 25.135 25.086 25.029 24.964 24.888 24.838 24.8 24.755 24.716 24.676 24.651 24.589 24.523 24.458 24.409 24.182 24.249 24.187 24.132 24.007 23.939 23.85 23.753 23.664 23.559 23.421 23.214 -9 ,27472 ,KEBNE ,17077288,Sat Dec 25 10:55:25 CET,Sat Dec 25 12:34:15 CET,0.0 0.204 0.358 0.486 0.596 0.707 0.822 0.934 1.135 1.223 1.311 1.296 1.587 1.678 1.84 1.993 2.144 2.212 2.338 2.46 2.659 2.804 2.947 3.154 3.357 3.548 3.72 3.882 4.084 4.277 4.472 4.708 4.945 5.183 5.458 5.767 6.083 6.436 6.81 7.232 7.733 8.31 8.967 9.635 10.431 11.343 12.379 13.575 15.046 16.917 19.321 21.339 22.604 23.428 23.967 24.364 24.593 24.743 24.861 24.957 25.029 25.083 25.128 25.136 25.104 25.051 24.995 24.958 24.925 24.898 24.865 24.816 24.745 24.659 24.599 24.555 24.516 24.475 24.425 24.389 24.346 24.274 24.231 24.179 24.153 24.106 24.057 23.995 23.957 23.743 23.84 23.782 23.72 23.596 23.517 23.43 23.338 23.256 23.162 23.039 22.624 -10 ,3014 ,KEBNE ,17077289,Sat Dec 25 10:56:24 CET,Sat Dec 25 12:39:46 CET,0.0 0.254 0.388 0.5 0.627 0.756 0.878 0.995 1.216 1.313 1.405 1.369 1.655 1.737 1.906 2.08 2.246 2.325 2.487 2.652 2.858 2.982 3.114 3.308 3.487 3.657 3.833 4.014 4.251 4.483 4.694 4.948 5.228 5.505 5.814 6.154 6.518 6.932 7.343 7.796 8.282 8.816 9.462 10.169 11.03 11.99 13.083 14.321 15.813 17.608 19.907 21.889 23.107 23.942 24.491 24.858 25.102 25.279 25.395 25.514 25.585 25.601 25.585 25.565 25.551 25.529 25.503 25.479 25.447 25.403 25.354 25.293 25.243 25.203 25.158 25.121 25.086 25.041 24.984 24.936 24.887 24.811 24.756 24.69 24.658 24.598 24.517 24.436 24.395 24.173 24.268 24.216 24.157 24.041 23.968 23.863 23.746 23.639 23.508 23.306 22.913 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5j.txt deleted file mode 100644 index 39f1d8f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8765 ,TETRA ,17699392,Sat Dec 4 17:55:11 CET,Sat Dec 4 19:54:31 CET,0.0 0.465 0.646 0.737 0.821 0.918 1.011 1.089 1.205 1.261 1.313 1.225 1.475 1.515 1.614 1.729 1.825 1.864 1.937 2.016 2.126 2.199 2.274 2.365 2.439 2.522 2.626 2.723 2.82 2.897 2.968 3.047 3.133 3.237 3.36 3.477 3.591 3.711 3.826 3.944 4.056 4.146 4.203 4.244 4.254 4.214 4.143 4.016 3.68 3.057 2.011 0.6 -0.754 -1.946 -2.931 -3.782 -4.506 -5.163 -5.745 -6.347 -6.864 -7.326 -7.768 -8.181 -8.523 -8.784 -9.059 -9.307 -9.509 -9.744 -10.019 -10.222 -10.41 -10.595 -10.742 -10.906 -11.061 -11.214 -11.389 -11.516 -11.65 -11.856 -11.993 -12.135 -12.205 -12.339 -12.48 -12.636 -12.72 -13.027 -13.016 -13.106 -13.198 -13.382 -13.478 -13.567 -13.653 -13.758 -13.88 -14.019 -14.222 -2 ,17157 ,TETRA ,17699393,Sat Dec 4 17:55:10 CET,Sat Dec 4 19:52:29 CET,0.0 0.28 0.426 0.54 0.646 0.756 0.844 0.908 1.02 1.074 1.136 1.072 1.335 1.395 1.497 1.597 1.699 1.745 1.833 1.911 2.011 2.078 2.142 2.246 2.354 2.447 2.548 2.652 2.763 2.851 2.929 3.017 3.096 3.168 3.257 3.362 3.455 3.551 3.633 3.709 3.799 3.887 3.964 4.027 4.051 4.018 3.955 3.793 3.424 2.82 1.748 0.329 -0.92 -2.009 -2.972 -3.834 -4.553 -5.178 -5.711 -6.24 -6.693 -7.093 -7.473 -7.861 -8.222 -8.504 -8.773 -9.01 -9.218 -9.456 -9.703 -9.895 -10.101 -10.316 -10.476 -10.638 -10.798 -10.96 -11.123 -11.229 -11.346 -11.534 -11.667 -11.814 -11.889 -12.038 -12.189 -12.353 -12.438 -12.74 -12.73 -12.846 -12.949 -13.154 -13.269 -13.384 -13.485 -13.58 -13.745 -13.907 -14.079 -3 ,3282 ,TETRA ,17699394,Sat Dec 4 17:55:10 CET,Sat Dec 4 19:54:20 CET,0.0 0.27 0.435 0.537 0.615 0.691 0.755 0.819 0.959 1.019 1.068 0.989 1.261 1.321 1.432 1.563 1.681 1.737 1.834 1.9 1.991 2.072 2.159 2.28 2.389 2.498 2.613 2.719 2.85 2.977 3.097 3.221 3.336 3.458 3.602 3.735 3.837 3.942 4.048 4.141 4.217 4.27 4.333 4.417 4.506 4.601 4.621 4.492 4.202 3.649 2.531 0.977 -0.319 -1.386 -2.328 -3.166 -3.846 -4.447 -4.973 -5.495 -5.931 -6.296 -6.638 -6.976 -7.307 -7.599 -7.898 -8.168 -8.391 -8.618 -8.847 -9.049 -9.259 -9.45 -9.592 -9.743 -9.895 -10.041 -10.195 -10.302 -10.426 -10.62 -10.739 -10.862 -10.921 -11.045 -11.181 -11.316 -11.394 -11.688 -11.618 -11.699 -11.797 -12.014 -12.127 -12.236 -12.344 -12.493 -12.656 -12.858 -13.19 -4 ,7777 ,TETRA ,17699395,Sat Dec 4 17:55:09 CET,Sat Dec 4 19:56:24 CET,0.0 0.268 0.381 0.498 0.621 0.717 0.81 0.897 1.029 1.076 1.125 1.025 1.278 1.319 1.376 1.459 1.552 1.591 1.666 1.725 1.804 1.865 1.924 1.998 2.064 2.127 2.198 2.295 2.414 2.523 2.628 2.735 2.831 2.919 3.029 3.146 3.244 3.341 3.43 3.497 3.583 3.706 3.81 3.855 3.84 3.78 3.647 3.454 3.193 2.614 1.364 -0.196 -1.506 -2.638 -3.631 -4.486 -5.247 -5.998 -6.659 -7.289 -7.822 -8.283 -8.685 -9.045 -9.36 -9.627 -9.907 -10.17 -10.397 -10.634 -10.872 -11.053 -11.241 -11.444 -11.602 -11.763 -11.93 -12.095 -12.272 -12.399 -12.535 -12.748 -12.89 -13.051 -13.131 -13.276 -13.428 -13.592 -13.678 -13.972 -13.949 -14.055 -14.16 -14.377 -14.485 -14.594 -14.716 -14.85 -15.008 -15.216 -15.626 -5 ,8119 ,TETRA ,17699396,Sat Dec 4 17:55:10 CET,Sat Dec 4 19:46:55 CET,0.0 0.239 0.394 0.515 0.623 0.718 0.813 0.89 0.992 1.047 1.109 1.025 1.276 1.328 1.421 1.515 1.621 1.666 1.748 1.824 1.917 1.982 2.048 2.132 2.217 2.3 2.373 2.438 2.522 2.609 2.691 2.795 2.886 2.967 3.069 3.179 3.271 3.372 3.51 3.667 3.818 3.941 4.007 4.055 4.13 4.172 4.145 4.007 3.742 3.355 2.43 1.044 -0.211 -1.289 -2.171 -2.96 -3.634 -4.222 -4.723 -5.218 -5.644 -6.034 -6.401 -6.75 -7.08 -7.392 -7.726 -7.992 -8.211 -8.446 -8.676 -8.855 -9.061 -9.279 -9.434 -9.588 -9.754 -9.933 -10.109 -10.231 -10.365 -10.576 -10.728 -10.88 -10.953 -11.1 -11.247 -11.411 -11.504 -11.814 -11.762 -11.839 -11.921 -12.129 -12.249 -12.36 -12.466 -12.585 -12.718 -12.865 -13.161 -6 ,20846 ,TETRA ,17699397,Sat Dec 4 17:55:10 CET,Sat Dec 4 19:50:21 CET,0.0 0.206 0.379 0.522 0.605 0.684 0.777 0.867 1.031 1.099 1.157 1.081 1.344 1.408 1.533 1.65 1.764 1.82 1.923 2.023 2.168 2.267 2.363 2.488 2.594 2.679 2.756 2.836 2.924 2.995 3.063 3.17 3.296 3.419 3.537 3.64 3.733 3.832 3.936 4.038 4.127 4.21 4.277 4.314 4.343 4.321 4.223 4.039 3.727 3.166 2.023 0.575 -0.565 -1.569 -2.501 -3.357 -4.082 -4.687 -5.201 -5.71 -6.12 -6.471 -6.825 -7.167 -7.458 -7.715 -7.982 -8.218 -8.424 -8.645 -8.879 -9.059 -9.251 -9.456 -9.613 -9.783 -9.942 -10.096 -10.265 -10.384 -10.51 -10.716 -10.858 -10.997 -11.066 -11.209 -11.377 -11.551 -11.635 -11.94 -11.928 -12.038 -12.152 -12.372 -12.468 -12.571 -12.691 -12.819 -12.936 -13.065 -13.328 -7 ,7762 ,TETRA ,17699398,Sat Dec 4 17:55:10 CET,Sat Dec 4 19:56:41 CET,0.0 0.128 0.267 0.391 0.471 0.562 0.65 0.717 0.839 0.908 0.976 0.888 1.143 1.199 1.304 1.406 1.519 1.569 1.66 1.755 1.877 1.941 1.996 2.072 2.14 2.21 2.275 2.344 2.428 2.504 2.599 2.727 2.849 2.966 3.087 3.219 3.349 3.483 3.616 3.749 3.897 4.049 4.18 4.263 4.297 4.297 4.274 4.173 3.896 3.322 2.168 0.796 -0.351 -1.355 -2.287 -3.207 -4.013 -4.707 -5.294 -5.872 -6.342 -6.713 -7.043 -7.347 -7.624 -7.87 -8.119 -8.348 -8.559 -8.79 -9.031 -9.232 -9.428 -9.627 -9.787 -9.936 -10.087 -10.251 -10.416 -10.529 -10.648 -10.842 -10.961 -11.078 -11.141 -11.267 -11.43 -11.602 -11.677 -11.965 -11.917 -12.006 -12.114 -12.376 -12.492 -12.605 -12.726 -12.848 -12.991 -13.169 -13.547 -8 ,28061 ,TETRA ,17699399,Sat Dec 4 17:55:10 CET,Sat Dec 4 19:55:48 CET,0.0 0.243 0.455 0.579 0.661 0.737 0.826 0.919 1.076 1.129 1.181 1.105 1.359 1.406 1.49 1.559 1.631 1.665 1.738 1.812 1.914 1.981 2.031 2.109 2.193 2.278 2.355 2.425 2.52 2.63 2.732 2.826 2.914 3.001 3.098 3.202 3.294 3.378 3.462 3.548 3.619 3.676 3.733 3.814 3.917 3.959 3.882 3.704 3.4 2.775 1.603 0.234 -0.971 -2.053 -2.985 -3.788 -4.473 -5.084 -5.585 -6.107 -6.56 -6.967 -7.359 -7.697 -7.998 -8.275 -8.558 -8.802 -9.016 -9.246 -9.503 -9.72 -9.936 -10.155 -10.316 -10.472 -10.627 -10.784 -10.952 -11.071 -11.196 -11.396 -11.531 -11.655 -11.72 -11.869 -12.03 -12.208 -12.293 -12.586 -12.533 -12.62 -12.72 -12.937 -13.04 -13.157 -13.276 -13.395 -13.55 -13.725 -14.053 -9 ,26575 ,TETRA ,17699400,Sat Dec 4 17:55:10 CET,Sat Dec 4 19:42:46 CET,0.0 0.233 0.394 0.508 0.61 0.708 0.807 0.895 1.039 1.108 1.172 1.079 1.328 1.378 1.475 1.56 1.644 1.684 1.753 1.823 1.939 2.014 2.085 2.183 2.267 2.339 2.426 2.525 2.657 2.8 2.935 3.086 3.189 3.26 3.351 3.445 3.521 3.606 3.687 3.766 3.855 3.944 4.031 4.113 4.17 4.169 4.085 3.918 3.651 3.175 2.105 0.647 -0.544 -1.593 -2.561 -3.413 -4.136 -4.785 -5.302 -5.809 -6.249 -6.633 -7.005 -7.369 -7.726 -8.037 -8.321 -8.568 -8.79 -9.011 -9.233 -9.414 -9.595 -9.776 -9.922 -10.084 -10.248 -10.415 -10.584 -10.705 -10.843 -11.051 -11.191 -11.33 -11.4 -11.562 -11.719 -11.852 -11.916 -12.2 -12.148 -12.24 -12.333 -12.529 -12.62 -12.699 -12.797 -12.94 -13.125 -13.3 -13.553 -10 ,28076 ,TETRA ,17699401,Sat Dec 4 17:55:10 CET,Sat Dec 4 19:55:50 CET,0.0 0.338 0.514 0.622 0.712 0.807 0.9 0.992 1.138 1.201 1.272 1.22 1.489 1.552 1.659 1.752 1.841 1.879 1.949 2.024 2.143 2.232 2.319 2.427 2.528 2.627 2.725 2.82 2.939 3.051 3.155 3.3 3.447 3.565 3.688 3.828 3.943 4.025 4.113 4.216 4.302 4.393 4.466 4.518 4.556 4.547 4.477 4.333 4.04 3.499 2.432 0.953 -0.344 -1.472 -2.463 -3.281 -3.929 -4.522 -5.074 -5.659 -6.125 -6.516 -6.89 -7.223 -7.532 -7.818 -8.107 -8.354 -8.57 -8.803 -9.028 -9.209 -9.405 -9.607 -9.76 -9.912 -10.075 -10.263 -10.468 -10.599 -10.73 -10.948 -11.102 -11.255 -11.331 -11.471 -11.613 -11.777 -11.866 -12.166 -12.119 -12.199 -12.279 -12.482 -12.587 -12.681 -12.78 -12.872 -12.996 -13.178 -13.483 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5d.txt deleted file mode 100644 index bb7164c6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32001 ,KEBNE ,17077290,Sat Dec 25 10:56:24 CET,Sat Dec 25 12:40:51 CET,0.0 0.175 0.288 0.371 0.466 0.549 0.614 0.678 0.808 0.868 0.92 0.839 1.084 1.137 1.244 1.349 1.444 1.491 1.582 1.67 1.811 1.902 1.986 2.097 2.192 2.283 2.378 2.466 2.569 2.669 2.767 2.899 3.022 3.135 3.27 3.428 3.57 3.709 3.846 3.988 4.152 4.347 4.563 4.76 4.954 5.166 5.376 5.587 5.802 5.887 5.742 5.285 4.769 4.26 3.757 3.285 2.839 2.42 2.052 1.691 1.416 1.175 0.884 0.57 0.282 0.052 -0.172 -0.366 -0.53 -0.726 -0.935 -1.094 -1.249 -1.406 -1.544 -1.692 -1.846 -2.003 -2.158 -2.269 -2.39 -2.579 -2.698 -2.816 -2.875 -2.997 -3.141 -3.294 -3.375 -3.668 -3.677 -3.781 -3.895 -4.166 -4.302 -4.431 -4.569 -4.725 -4.928 -5.144 -5.806 -2 ,21630 ,KEBNE ,17077291,Sat Dec 25 10:58:28 CET,Sat Dec 25 12:42:25 CET,0.0 0.171 0.263 0.344 0.418 0.501 0.597 0.688 0.85 0.924 0.978 0.905 1.154 1.211 1.344 1.461 1.544 1.585 1.668 1.74 1.847 1.925 2.002 2.106 2.204 2.296 2.386 2.472 2.583 2.688 2.791 2.917 3.033 3.155 3.301 3.45 3.583 3.729 3.901 4.111 4.357 4.595 4.833 5.066 5.313 5.589 5.861 6.083 6.25 6.35 6.263 5.889 5.431 4.967 4.494 4.048 3.684 3.313 2.963 2.621 2.314 2.033 1.753 1.479 1.24 1.036 0.8 0.571 0.372 0.164 -0.06 -0.238 -0.401 -0.573 -0.711 -0.853 -1.005 -1.171 -1.357 -1.48 -1.606 -1.822 -1.972 -2.114 -2.183 -2.33 -2.483 -2.626 -2.701 -2.984 -2.97 -3.063 -3.165 -3.392 -3.51 -3.633 -3.795 -3.995 -4.183 -4.411 -5.108 -3 ,27690 ,KEBNE ,17077292,Sat Dec 25 10:58:28 CET,Sat Dec 25 12:43:34 CET,0.0 0.215 0.37 0.478 0.57 0.659 0.749 0.83 0.976 1.05 1.129 1.103 1.374 1.443 1.56 1.674 1.786 1.831 1.916 1.993 2.108 2.186 2.265 2.379 2.485 2.602 2.713 2.812 2.967 3.136 3.273 3.425 3.565 3.681 3.824 3.974 4.116 4.269 4.41 4.568 4.749 4.953 5.171 5.368 5.604 5.869 6.109 6.322 6.503 6.634 6.56 6.154 5.706 5.213 4.734 4.25 3.811 3.428 3.091 2.753 2.462 2.178 1.892 1.612 1.358 1.139 0.911 0.708 0.509 0.278 0.053 -0.13 -0.336 -0.572 -0.744 -0.904 -1.072 -1.243 -1.422 -1.544 -1.663 -1.84 -1.963 -2.099 -2.17 -2.325 -2.49 -2.646 -2.732 -3.017 -3.019 -3.122 -3.228 -3.467 -3.603 -3.732 -3.863 -4.034 -4.258 -4.529 -5.129 -4 ,6375 ,KEBNE ,17077293,Sat Dec 25 11:00:33 CET,Sat Dec 25 12:45:58 CET,0.0 0.523 0.677 0.778 0.874 0.966 1.062 1.152 1.298 1.363 1.416 1.322 1.571 1.634 1.74 1.834 1.931 1.976 2.061 2.149 2.303 2.38 2.441 2.543 2.641 2.738 2.833 2.938 3.071 3.186 3.309 3.446 3.564 3.68 3.822 3.989 4.14 4.29 4.452 4.616 4.774 4.977 5.237 5.478 5.716 5.963 6.217 6.441 6.682 6.864 6.787 6.458 6.046 5.625 5.206 4.813 4.452 4.114 3.817 3.505 3.24 2.99 2.731 2.464 2.187 1.963 1.764 1.587 1.436 1.258 1.069 0.924 0.76 0.578 0.44 0.297 0.148 0.003 -0.153 -0.273 -0.397 -0.604 -0.759 -0.917 -0.991 -1.132 -1.286 -1.475 -1.57 -1.839 -1.83 -1.933 -2.029 -2.244 -2.371 -2.499 -2.616 -2.759 -2.929 -3.113 -3.445 -5 ,17408 ,KEBNE ,17077294,Sat Dec 25 11:01:36 CET,Sat Dec 25 12:46:00 CET,0.0 0.253 0.435 0.547 0.647 0.728 0.799 0.872 1.031 1.109 1.175 1.126 1.397 1.449 1.539 1.631 1.71 1.751 1.837 1.919 2.017 2.073 2.14 2.244 2.344 2.45 2.552 2.657 2.794 2.916 3.035 3.174 3.302 3.424 3.558 3.704 3.863 4.047 4.244 4.426 4.585 4.782 5.006 5.222 5.455 5.689 5.938 6.17 6.349 6.425 6.322 5.795 5.201 4.682 4.201 3.753 3.354 2.933 2.534 2.121 1.757 1.438 1.141 0.841 0.561 0.322 0.084 -0.126 -0.329 -0.533 -0.729 -0.907 -1.104 -1.295 -1.43 -1.558 -1.693 -1.838 -1.981 -2.072 -2.164 -2.312 -2.417 -2.543 -2.614 -2.765 -2.927 -3.089 -3.174 -3.459 -3.436 -3.524 -3.621 -3.834 -3.951 -4.073 -4.21 -4.357 -4.543 -4.85 -5.521 -6 ,15786 ,KEBNE ,17077295,Sat Dec 25 11:01:35 CET,Sat Dec 25 12:46:49 CET,0.0 0.257 0.389 0.507 0.604 0.699 0.785 0.869 1.016 1.081 1.144 1.066 1.322 1.381 1.489 1.597 1.698 1.744 1.843 1.937 2.052 2.125 2.209 2.326 2.433 2.542 2.636 2.723 2.845 2.955 3.056 3.185 3.309 3.419 3.558 3.745 3.918 4.105 4.293 4.464 4.633 4.812 5.077 5.375 5.65 5.882 6.1 6.286 6.431 6.492 6.334 5.877 5.308 4.72 4.157 3.623 3.142 2.697 2.324 1.968 1.661 1.398 1.135 0.882 0.659 0.443 0.213 0.032 -0.121 -0.3 -0.5 -0.668 -0.85 -1.039 -1.175 -1.329 -1.498 -1.672 -1.843 -1.959 -2.078 -2.243 -2.37 -2.516 -2.591 -2.741 -2.9 -3.056 -3.13 -3.405 -3.383 -3.473 -3.569 -3.788 -3.908 -4.034 -4.186 -4.35 -4.498 -4.693 -5.147 -7 ,30496 ,KEBNE ,17077296,Sat Dec 25 11:01:36 CET,Sat Dec 25 12:46:33 CET,0.0 0.176 0.29 0.36 0.441 0.527 0.592 0.656 0.79 0.856 0.914 0.835 1.074 1.126 1.22 1.305 1.387 1.427 1.507 1.571 1.671 1.747 1.834 1.967 2.079 2.186 2.283 2.361 2.465 2.577 2.703 2.861 3.003 3.135 3.28 3.442 3.594 3.741 3.891 4.063 4.246 4.449 4.724 4.996 5.25 5.479 5.715 5.967 6.209 6.388 6.347 6.008 5.557 5.015 4.512 4.094 3.709 3.337 2.991 2.621 2.318 2.069 1.843 1.634 1.438 1.239 1.026 0.839 0.68 0.514 0.332 0.171 -0.014 -0.207 -0.36 -0.52 -0.673 -0.841 -1.015 -1.125 -1.227 -1.382 -1.491 -1.619 -1.692 -1.829 -1.968 -2.104 -2.174 -2.456 -2.422 -2.507 -2.602 -2.797 -2.901 -3.055 -3.22 -3.368 -3.584 -3.849 -4.714 -8 ,15212 ,KEBNE ,17077297,Sat Dec 25 11:02:38 CET,Sat Dec 25 12:47:36 CET,0.0 0.132 0.266 0.368 0.494 0.613 0.688 0.762 0.924 1.0 1.082 1.031 1.292 1.346 1.446 1.55 1.633 1.681 1.775 1.863 1.999 2.083 2.175 2.313 2.429 2.53 2.634 2.737 2.876 2.997 3.097 3.226 3.35 3.467 3.626 3.81 3.967 4.133 4.297 4.462 4.638 4.85 5.128 5.421 5.771 6.099 6.436 6.849 7.275 7.538 7.521 7.218 6.765 6.278 5.803 5.375 5.017 4.686 4.386 4.06 3.774 3.518 3.237 2.918 2.614 2.369 2.143 1.963 1.802 1.622 1.417 1.248 1.083 0.898 0.758 0.622 0.466 0.289 0.101 -0.023 -0.145 -0.338 -0.479 -0.624 -0.697 -0.847 -0.997 -1.149 -1.235 -1.521 -1.515 -1.617 -1.726 -1.959 -2.091 -2.246 -2.415 -2.56 -2.724 -2.973 -3.51 -9 ,30108 ,KEBNE ,17077298,Sat Dec 25 11:05:46 CET,Sat Dec 25 12:50:49 CET,0.0 0.569 0.763 0.916 1.034 1.132 1.23 1.322 1.479 1.549 1.604 1.503 1.741 1.785 1.877 1.979 2.084 2.137 2.232 2.306 2.408 2.49 2.573 2.694 2.802 2.895 3.014 3.131 3.267 3.423 3.582 3.763 3.934 4.08 4.223 4.38 4.531 4.684 4.842 5.007 5.168 5.351 5.565 5.783 6.023 6.271 6.546 6.756 6.969 7.173 7.093 6.672 6.222 5.721 5.231 4.756 4.302 3.875 3.48 3.071 2.704 2.374 2.062 1.758 1.484 1.232 0.957 0.719 0.527 0.317 0.102 -0.063 -0.251 -0.473 -0.645 -0.813 -0.988 -1.161 -1.346 -1.48 -1.615 -1.821 -1.962 -2.105 -2.179 -2.35 -2.525 -2.702 -2.789 -3.066 -3.053 -3.158 -3.267 -3.51 -3.649 -3.769 -3.907 -4.086 -4.284 -4.518 -5.139 -10 ,25228 ,KEBNE ,17077299,Sat Dec 25 11:08:54 CET,Sat Dec 25 12:53:23 CET,0.0 0.18 0.321 0.451 0.578 0.69 0.774 0.852 0.995 1.063 1.132 1.075 1.335 1.399 1.526 1.659 1.773 1.822 1.916 1.996 2.115 2.197 2.275 2.402 2.524 2.641 2.751 2.857 3.004 3.141 3.254 3.374 3.499 3.642 3.8 3.966 4.131 4.3 4.481 4.658 4.824 5.007 5.203 5.37 5.568 5.791 6.02 6.248 6.415 6.466 6.31 5.889 5.354 4.801 4.28 3.801 3.396 3.031 2.706 2.364 2.05 1.778 1.532 1.287 1.054 0.823 0.561 0.353 0.175 -0.031 -0.259 -0.432 -0.611 -0.819 -0.972 -1.112 -1.264 -1.413 -1.558 -1.675 -1.782 -1.928 -2.039 -2.155 -2.218 -2.352 -2.503 -2.661 -2.735 -3.012 -3.009 -3.113 -3.219 -3.458 -3.589 -3.736 -3.919 -4.09 -4.265 -4.49 -4.892 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5i.txt deleted file mode 100644 index b6073d5b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27693 ,KEBNE ,17077300,Sat Dec 25 11:08:54 CET,Sat Dec 25 12:54:49 CET,0.0 0.175 0.288 0.38 0.477 0.572 0.656 0.752 0.938 1.014 1.079 1.015 1.264 1.309 1.405 1.502 1.595 1.645 1.748 1.856 1.995 2.064 2.135 2.262 2.38 2.497 2.622 2.73 2.861 3.0 3.147 3.331 3.491 3.64 3.829 4.017 4.179 4.368 4.579 4.83 5.101 5.357 5.632 5.911 6.204 6.531 6.918 7.298 7.679 8.056 8.336 8.301 8.023 7.702 7.367 7.039 6.737 6.425 6.135 5.851 5.611 5.351 5.088 4.854 4.63 4.416 4.183 3.987 3.835 3.697 3.545 3.383 3.207 3.043 2.92 2.794 2.661 2.515 2.355 2.25 2.149 1.999 1.894 1.781 1.724 1.588 1.433 1.282 1.211 0.944 0.975 0.892 0.805 0.626 0.541 0.436 0.304 0.178 0.045 -0.116 -0.393 -2 ,27241 ,KEBNE ,17077301,Sat Dec 25 11:08:54 CET,Sat Dec 25 12:54:23 CET,0.0 0.216 0.316 0.419 0.519 0.615 0.701 0.788 0.942 1.0 1.072 1.011 1.259 1.319 1.431 1.547 1.668 1.725 1.841 1.951 2.093 2.175 2.25 2.37 2.488 2.603 2.716 2.815 2.944 3.071 3.211 3.406 3.604 3.778 3.984 4.233 4.44 4.667 4.907 5.108 5.29 5.507 5.77 6.049 6.372 6.709 7.046 7.371 7.726 7.985 8.097 7.95 7.661 7.336 6.94 6.539 6.2 5.853 5.54 5.243 4.995 4.761 4.504 4.251 4.019 3.828 3.641 3.455 3.28 3.111 2.942 2.803 2.659 2.503 2.391 2.286 2.173 2.061 1.938 1.84 1.745 1.615 1.522 1.414 1.355 1.232 1.092 0.943 0.871 0.607 0.663 0.581 0.498 0.351 0.261 0.16 0.055 -0.061 -0.223 -0.433 -0.793 -3 ,21105 ,KEBNE ,17077302,Sat Dec 25 11:09:56 CET,Sat Dec 25 12:55:21 CET,0.0 0.484 0.668 0.798 0.897 0.983 1.071 1.164 1.326 1.395 1.466 1.399 1.656 1.723 1.847 1.963 2.076 2.133 2.243 2.332 2.442 2.529 2.619 2.74 2.848 2.952 3.066 3.174 3.317 3.468 3.609 3.773 3.923 4.055 4.211 4.412 4.62 4.838 5.035 5.234 5.433 5.663 5.958 6.273 6.627 6.978 7.352 7.74 8.171 8.532 8.64 8.377 8.071 7.763 7.406 7.025 6.689 6.381 6.09 5.785 5.523 5.282 5.064 4.854 4.637 4.424 4.21 4.038 3.891 3.732 3.543 3.368 3.196 3.023 2.87 2.723 2.592 2.452 2.299 2.197 2.103 1.954 1.843 1.72 1.659 1.541 1.408 1.273 1.208 0.933 0.948 0.868 0.776 0.558 0.443 0.324 0.212 0.099 -0.058 -0.26 -0.782 -4 ,19912 ,KEBNE ,17077303,Sat Dec 25 11:09:57 CET,Sat Dec 25 12:55:12 CET,0.0 0.198 0.366 0.481 0.565 0.653 0.745 0.828 0.982 1.05 1.115 1.039 1.295 1.359 1.485 1.599 1.715 1.776 1.888 2.005 2.182 2.29 2.38 2.502 2.621 2.726 2.831 2.939 3.072 3.189 3.297 3.431 3.583 3.74 3.907 4.08 4.242 4.418 4.607 4.81 5.012 5.234 5.485 5.729 6.01 6.301 6.617 6.944 7.244 7.467 7.546 7.312 6.908 6.414 5.918 5.431 5.01 4.653 4.29 3.897 3.582 3.308 3.069 2.855 2.653 2.464 2.265 2.085 1.933 1.766 1.576 1.418 1.253 1.092 0.969 0.853 0.747 0.628 0.499 0.41 0.32 0.194 0.112 0.016 -0.038 -0.144 -0.242 -0.354 -0.415 -0.687 -0.69 -0.785 -0.878 -1.086 -1.198 -1.306 -1.431 -1.577 -1.722 -1.89 -2.185 -5 ,25586 ,KEBNE ,17077304,Sat Dec 25 11:11:00 CET,Sat Dec 25 12:56:40 CET,0.0 0.322 0.457 0.57 0.684 0.782 0.87 0.949 1.086 1.153 1.226 1.179 1.448 1.507 1.616 1.735 1.858 1.914 2.014 2.117 2.274 2.373 2.459 2.574 2.684 2.795 2.912 3.023 3.174 3.345 3.504 3.684 3.866 4.021 4.176 4.375 4.58 4.82 5.096 5.362 5.642 5.98 6.369 6.703 7.005 7.308 7.648 8.003 8.338 8.606 8.744 8.541 8.081 7.566 7.17 6.819 6.475 6.168 5.905 5.593 5.302 5.072 4.858 4.652 4.452 4.257 4.04 3.854 3.703 3.538 3.369 3.237 3.093 2.915 2.771 2.621 2.461 2.307 2.136 2.019 1.909 1.733 1.612 1.492 1.437 1.326 1.211 1.095 1.032 0.773 0.83 0.753 0.671 0.484 0.384 0.273 0.147 0.003 -0.142 -0.296 -0.867 -6 ,8101 ,KEBNE ,17077305,Sat Dec 25 11:11:00 CET,Sat Dec 25 12:56:17 CET,0.0 0.249 0.367 0.495 0.612 0.731 0.825 0.891 1.01 1.064 1.127 1.065 1.316 1.368 1.465 1.559 1.645 1.688 1.771 1.849 1.968 2.04 2.113 2.23 2.334 2.439 2.552 2.666 2.831 2.988 3.133 3.32 3.474 3.594 3.75 3.939 4.107 4.274 4.469 4.683 4.894 5.127 5.394 5.657 5.907 6.168 6.477 6.791 7.122 7.39 7.453 7.177 6.694 6.15 5.663 5.236 4.861 4.502 4.199 3.915 3.627 3.326 3.047 2.804 2.598 2.425 2.218 2.011 1.859 1.723 1.578 1.437 1.281 1.129 1.02 0.902 0.779 0.665 0.535 0.435 0.334 0.182 0.072 -0.059 -0.135 -0.293 -0.433 -0.571 -0.656 -0.936 -0.912 -1.001 -1.094 -1.288 -1.38 -1.494 -1.615 -1.737 -1.881 -2.057 -2.502 -7 ,28846 ,KEBNE ,17077306,Sat Dec 25 11:11:00 CET,Sat Dec 25 12:56:43 CET,0.0 0.254 0.437 0.641 0.782 0.869 0.969 1.072 1.228 1.29 1.35 1.273 1.522 1.575 1.684 1.8 1.91 1.964 2.07 2.168 2.318 2.418 2.521 2.667 2.799 2.934 3.059 3.175 3.327 3.488 3.645 3.816 3.976 4.109 4.252 4.428 4.622 4.85 5.076 5.304 5.525 5.739 5.945 6.147 6.453 6.783 7.053 7.348 7.687 7.954 8.055 7.829 7.421 7.006 6.602 6.184 5.743 5.333 4.961 4.572 4.285 4.057 3.85 3.649 3.438 3.251 3.057 2.873 2.711 2.523 2.335 2.187 2.037 1.897 1.788 1.68 1.558 1.405 1.261 1.18 1.091 0.935 0.826 0.72 0.669 0.547 0.408 0.282 0.223 -0.039 -0.003 -0.083 -0.163 -0.344 -0.454 -0.566 -0.691 -0.828 -0.974 -1.161 -1.725 -8 ,32516 ,KEBNE ,17077307,Sat Dec 25 11:11:00 CET,Sat Dec 25 12:55:56 CET,0.0 0.233 0.34 0.439 0.552 0.652 0.737 0.813 0.953 1.024 1.097 1.037 1.274 1.326 1.444 1.544 1.636 1.681 1.786 1.899 2.037 2.111 2.188 2.31 2.423 2.531 2.633 2.73 2.87 3.005 3.128 3.276 3.413 3.544 3.69 3.84 3.988 4.161 4.348 4.565 4.79 5.033 5.294 5.529 5.821 6.135 6.459 6.831 7.232 7.604 7.833 7.679 7.321 6.959 6.635 6.284 5.946 5.602 5.302 5.008 4.71 4.434 4.162 3.908 3.697 3.515 3.328 3.171 3.034 2.877 2.711 2.562 2.397 2.229 2.103 1.986 1.869 1.742 1.614 1.517 1.407 1.258 1.151 1.034 0.98 0.869 0.754 0.635 0.566 0.301 0.373 0.302 0.233 0.075 -0.027 -0.125 -0.212 -0.308 -0.446 -0.612 -0.969 -9 ,2739 ,KEBNE ,17077308,Sat Dec 25 11:13:05 CET,Sat Dec 25 12:58:44 CET,0.0 0.155 0.297 0.408 0.503 0.603 0.698 0.78 0.935 1.009 1.081 1.015 1.261 1.314 1.425 1.521 1.621 1.677 1.789 1.884 2.017 2.114 2.207 2.349 2.49 2.622 2.742 2.852 2.989 3.117 3.245 3.397 3.551 3.711 3.891 4.059 4.207 4.383 4.575 4.772 4.976 5.237 5.556 5.854 6.248 6.656 7.007 7.347 7.695 7.977 8.058 7.852 7.524 7.118 6.707 6.343 5.981 5.64 5.375 5.104 4.841 4.595 4.368 4.176 3.992 3.791 3.556 3.351 3.177 2.992 2.792 2.633 2.481 2.32 2.193 2.059 1.915 1.761 1.599 1.478 1.356 1.187 1.081 0.983 0.929 0.802 0.675 0.537 0.471 0.22 0.281 0.196 0.092 -0.112 -0.195 -0.28 -0.376 -0.496 -0.636 -0.814 -1.113 -10 ,17092 ,KEBNE ,17077309,Sat Dec 25 11:13:05 CET,Sat Dec 25 12:59:28 CET,0.0 0.258 0.45 0.578 0.679 0.775 0.864 0.946 1.107 1.178 1.251 1.203 1.466 1.54 1.668 1.781 1.907 1.97 2.08 2.188 2.342 2.436 2.519 2.646 2.782 2.909 3.028 3.146 3.299 3.447 3.578 3.738 3.899 4.04 4.186 4.366 4.558 4.758 4.983 5.197 5.401 5.651 5.952 6.247 6.544 6.849 7.193 7.541 7.858 8.176 8.363 8.204 7.902 7.537 7.141 6.733 6.377 6.083 5.82 5.542 5.308 5.06 4.802 4.602 4.425 4.24 4.037 3.857 3.708 3.541 3.344 3.181 3.011 2.837 2.694 2.531 2.371 2.229 2.079 1.962 1.839 1.666 1.55 1.432 1.378 1.26 1.148 1.034 0.963 0.691 0.718 0.625 0.526 0.32 0.214 0.114 -0.002 -0.154 -0.312 -0.505 -0.745 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5k.txt deleted file mode 100644 index dcd45932..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17771 ,TETRA ,17699402,Sat Dec 4 17:55:10 CET,Sat Dec 4 19:57:58 CET,0.0 0.268 0.4 0.511 0.613 0.703 0.808 0.922 1.103 1.184 1.273 1.252 1.521 1.586 1.711 1.828 1.944 2.007 2.12 2.226 2.393 2.495 2.59 2.731 2.873 3.024 3.181 3.332 3.515 3.698 3.896 4.135 4.361 4.568 4.806 5.07 5.324 5.624 5.959 6.298 6.633 7.043 7.553 8.072 8.686 9.349 10.122 10.96 11.855 12.847 13.962 14.863 15.281 15.379 15.358 15.313 15.236 15.108 14.977 14.833 14.695 14.586 14.464 14.316 14.191 14.078 13.955 13.859 13.767 13.647 13.525 13.439 13.345 13.233 13.145 13.031 12.897 12.777 12.657 12.565 12.48 12.361 12.273 12.179 12.13 12.014 11.899 11.783 11.724 11.487 11.535 11.461 11.384 11.208 11.106 11.004 10.888 10.749 10.586 10.419 10.122 -2 ,18382 ,TETRA ,17699403,Sat Dec 4 17:55:10 CET,Sat Dec 4 19:55:33 CET,0.0 0.188 0.322 0.441 0.548 0.641 0.724 0.805 0.959 1.028 1.093 1.057 1.331 1.396 1.508 1.635 1.769 1.831 1.942 2.046 2.206 2.305 2.4 2.546 2.691 2.853 3.021 3.191 3.407 3.588 3.777 4.022 4.263 4.497 4.76 5.073 5.351 5.635 5.945 6.267 6.599 6.975 7.484 7.975 8.462 9.029 9.703 10.475 11.42 12.495 13.715 14.558 14.892 15.023 15.075 15.091 15.05 14.971 14.91 14.842 14.756 14.654 14.54 14.419 14.302 14.2 14.093 14.002 13.92 13.819 13.704 13.589 13.464 13.34 13.238 13.136 13.03 12.913 12.808 12.74 12.673 12.559 12.465 12.355 12.298 12.186 12.077 11.981 11.923 11.685 11.762 11.699 11.636 11.463 11.373 11.309 11.215 11.106 10.992 10.812 10.212 -3 ,9331 ,TETRA ,17699404,Sat Dec 4 17:55:13 CET,Sat Dec 4 19:56:13 CET,0.0 0.251 0.427 0.583 0.716 0.82 0.896 0.979 1.131 1.197 1.264 1.212 1.481 1.552 1.689 1.818 1.931 1.988 2.111 2.229 2.379 2.473 2.576 2.735 2.896 3.074 3.244 3.384 3.558 3.727 3.886 4.074 4.253 4.435 4.65 4.891 5.125 5.412 5.735 6.07 6.409 6.771 7.205 7.654 8.185 8.779 9.448 10.166 10.986 12.005 13.159 13.899 14.285 14.498 14.586 14.598 14.544 14.445 14.35 14.171 13.968 13.824 13.709 13.587 13.444 13.323 13.21 13.09 12.962 12.814 12.665 12.549 12.427 12.285 12.171 12.065 11.959 11.839 11.71 11.621 11.529 11.381 11.277 11.17 11.112 10.982 10.855 10.731 10.661 10.408 10.426 10.345 10.273 10.109 10.019 9.93 9.835 9.711 9.549 9.349 9.035 -4 ,16668 ,TETRA ,17699405,Sat Dec 4 17:55:14 CET,Sat Dec 4 19:55:41 CET,0.0 0.221 0.387 0.51 0.603 0.705 0.803 0.908 1.118 1.206 1.284 1.235 1.501 1.583 1.748 1.89 2.018 2.086 2.22 2.333 2.494 2.603 2.705 2.863 3.035 3.2 3.352 3.5 3.69 3.864 4.025 4.22 4.414 4.609 4.833 5.086 5.339 5.612 5.9 6.209 6.55 6.94 7.391 7.888 8.469 9.093 9.794 10.583 11.526 12.591 13.839 14.782 15.238 15.436 15.494 15.493 15.443 15.338 15.206 15.087 14.99 14.877 14.753 14.646 14.547 14.445 14.323 14.179 14.037 13.886 13.724 13.595 13.463 13.326 13.227 13.113 12.99 12.861 12.713 12.625 12.539 12.391 12.298 12.193 12.137 12.044 11.953 11.841 11.78 11.539 11.594 11.523 11.439 11.236 11.123 11.011 10.898 10.768 10.638 10.503 10.217 -5 ,28213 ,TETRA ,17699406,Sat Dec 4 17:55:12 CET,Sat Dec 4 19:56:15 CET,0.0 0.197 0.299 0.401 0.515 0.632 0.747 0.844 1.013 1.088 1.169 1.14 1.413 1.482 1.617 1.738 1.857 1.916 2.031 2.139 2.308 2.429 2.538 2.67 2.813 2.983 3.147 3.301 3.516 3.726 3.92 4.163 4.398 4.604 4.812 5.038 5.287 5.567 5.848 6.198 6.598 7.011 7.51 8.03 8.622 9.32 10.096 10.865 11.727 12.742 13.999 14.968 15.394 15.554 15.594 15.572 15.526 15.434 15.305 15.145 14.97 14.811 14.675 14.547 14.423 14.3 14.168 14.039 13.933 13.82 13.691 13.588 13.488 13.371 13.276 13.193 13.105 13.005 12.893 12.812 12.728 12.6 12.523 12.436 12.384 12.284 12.161 12.013 11.948 11.694 11.74 11.668 11.578 11.384 11.284 11.151 10.995 10.844 10.694 10.519 10.288 -6 ,6868 ,TETRA ,17699407,Sat Dec 4 17:55:13 CET,Sat Dec 4 19:56:24 CET,0.0 0.318 0.463 0.599 0.734 0.844 0.94 1.041 1.236 1.321 1.397 1.345 1.613 1.683 1.815 1.941 2.046 2.102 2.225 2.348 2.535 2.656 2.763 2.91 3.066 3.23 3.392 3.548 3.747 3.94 4.122 4.346 4.572 4.803 5.079 5.397 5.686 5.961 6.237 6.556 6.951 7.388 7.841 8.321 8.89 9.464 10.133 10.9 11.797 12.941 14.217 15.039 15.457 15.668 15.758 15.781 15.726 15.585 15.444 15.305 15.168 15.048 14.938 14.834 14.731 14.626 14.504 14.362 14.219 14.071 13.933 13.832 13.729 13.625 13.548 13.472 13.386 13.282 13.158 13.068 12.979 12.846 12.742 12.626 12.573 12.465 12.347 12.226 12.162 11.921 11.977 11.905 11.827 11.649 11.552 11.449 11.328 11.202 11.062 10.871 10.285 -7 ,13938 ,TETRA ,17699408,Sat Dec 4 17:55:12 CET,Sat Dec 4 19:49:05 CET,0.0 0.107 0.191 0.281 0.397 0.512 0.611 0.708 0.896 0.984 1.061 1.005 1.273 1.346 1.478 1.595 1.725 1.794 1.911 2.012 2.165 2.269 2.367 2.519 2.682 2.84 2.987 3.127 3.312 3.496 3.674 3.881 4.072 4.249 4.454 4.695 4.918 5.17 5.449 5.746 6.08 6.477 6.962 7.473 8.023 8.603 9.289 10.064 10.974 11.973 13.141 14.011 14.378 14.549 14.589 14.563 14.464 14.266 14.063 13.885 13.716 13.557 13.419 13.288 13.171 13.053 12.895 12.739 12.609 12.472 12.327 12.215 12.104 11.981 11.893 11.806 11.709 11.61 11.501 11.427 11.356 11.237 11.142 11.041 10.993 10.903 10.8 10.677 10.619 10.371 10.408 10.329 10.25 10.091 9.996 9.893 9.781 9.676 9.56 9.362 8.898 -8 ,1944 ,TETRA ,17699409,Sat Dec 4 17:55:59 CET,Sat Dec 4 19:51:26 CET,0.0 0.219 0.366 0.506 0.608 0.72 0.844 0.959 1.157 1.234 1.318 1.316 1.607 1.685 1.831 1.978 2.108 2.17 2.288 2.394 2.55 2.66 2.765 2.917 3.064 3.212 3.361 3.507 3.703 3.906 4.102 4.326 4.526 4.704 4.928 5.178 5.402 5.672 5.972 6.268 6.577 6.941 7.388 7.863 8.401 8.963 9.622 10.375 11.236 12.211 13.345 14.177 14.568 14.728 14.753 14.73 14.681 14.554 14.387 14.25 14.148 14.031 13.896 13.772 13.651 13.525 13.399 13.26 13.133 13.021 12.9 12.794 12.672 12.544 12.463 12.377 12.281 12.156 11.994 11.892 11.797 11.645 11.538 11.431 11.379 11.262 11.142 11.013 10.942 10.686 10.716 10.638 10.554 10.374 10.281 10.165 10.023 9.878 9.722 9.5 9.038 -9 ,1241 ,TETRA ,17699410,Sat Dec 4 17:55:59 CET,Sat Dec 4 19:45:41 CET,0.0 0.192 0.382 0.547 0.667 0.777 0.886 0.977 1.171 1.272 1.366 1.327 1.591 1.665 1.821 1.982 2.143 2.219 2.359 2.485 2.663 2.778 2.893 3.077 3.257 3.428 3.584 3.732 3.938 4.147 4.366 4.623 4.856 5.093 5.354 5.615 5.871 6.153 6.443 6.748 7.056 7.411 7.882 8.355 8.868 9.449 10.111 10.857 11.734 12.754 13.956 14.912 15.35 15.427 15.399 15.353 15.277 15.191 15.091 14.963 14.838 14.721 14.608 14.504 14.414 14.311 14.194 14.095 13.993 13.882 13.776 13.677 13.57 13.454 13.351 13.239 13.132 13.037 12.935 12.859 12.773 12.62 12.514 12.413 12.364 12.261 12.143 12.021 11.95 11.688 11.708 11.628 11.542 11.355 11.255 11.145 11.019 10.879 10.709 10.475 10.227 -10 ,2699 ,TETRA ,17699411,Sat Dec 4 17:55:59 CET,Sat Dec 4 19:45:02 CET,0.0 0.391 0.578 0.715 0.841 0.955 1.092 1.209 1.374 1.441 1.506 1.459 1.728 1.799 1.944 2.101 2.234 2.289 2.398 2.503 2.683 2.819 2.942 3.105 3.27 3.438 3.604 3.752 3.945 4.142 4.325 4.557 4.785 4.992 5.215 5.459 5.693 5.97 6.281 6.604 6.935 7.303 7.737 8.174 8.723 9.388 10.119 10.895 11.81 12.847 13.99 14.916 15.377 15.503 15.487 15.448 15.381 15.271 15.133 14.96 14.78 14.593 14.426 14.278 14.108 13.943 13.78 13.64 13.524 13.399 13.273 13.177 13.076 12.976 12.899 12.814 12.713 12.598 12.484 12.407 12.315 12.164 12.061 11.955 11.906 11.812 11.705 11.582 11.522 11.286 11.349 11.279 11.208 11.058 10.989 10.913 10.823 10.728 10.58 10.373 9.986 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5n_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5n_3b.txt deleted file mode 100644 index 6d243817..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5n_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,556 ,KEBNE ,17028416,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:59:20 CET,0.0 0.298 0.502 0.655 0.766 0.871 0.966 1.05 1.237 1.324 1.406 1.381 1.647 1.72 1.869 2.008 2.136 2.198 2.323 2.442 2.605 2.707 2.811 2.956 3.101 3.247 3.392 3.539 3.727 3.913 4.088 4.306 4.516 4.701 4.906 5.156 5.401 5.661 5.957 6.264 6.569 6.913 7.338 7.795 8.338 8.948 9.612 10.363 11.144 11.94 12.877 13.312 13.204 12.96 12.64 12.28 11.97 11.633 11.301 10.948 10.649 10.371 10.091 9.829 9.582 9.34 9.069 8.843 8.656 8.453 8.247 8.053 7.84 7.63 7.459 7.283 7.113 6.944 6.734 6.577 6.433 6.185 5.983 5.78 5.679 5.481 5.258 5.017 4.894 4.591 4.512 4.381 4.232 3.891 3.704 3.516 3.314 3.098 2.785 2.215 -0.614 -2 ,31604 ,KEBNE ,17028417,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:58:39 CET,0.0 0.481 0.634 0.762 0.869 0.971 1.086 1.186 1.368 1.459 1.552 1.539 1.802 1.875 2.031 2.19 2.342 2.414 2.56 2.689 2.867 2.996 3.119 3.283 3.442 3.612 3.778 3.93 4.109 4.295 4.491 4.719 4.937 5.148 5.388 5.653 5.915 6.194 6.511 6.849 7.196 7.617 8.103 8.555 9.055 9.602 10.2 10.844 11.652 12.635 13.607 14.063 14.086 13.964 13.716 13.347 12.977 12.619 12.31 11.963 11.645 11.38 11.075 10.766 10.495 10.223 9.948 9.72 9.511 9.27 9.013 8.825 8.622 8.4 8.237 8.062 7.876 7.681 7.473 7.328 7.173 6.925 6.752 6.574 6.482 6.291 6.091 5.841 5.688 5.371 5.283 5.15 4.982 4.568 4.349 4.109 3.838 3.573 3.185 2.622 1.067 -3 ,29778 ,KEBNE ,17028418,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:59:40 CET,0.0 0.287 0.417 0.537 0.652 0.743 0.835 0.931 1.121 1.211 1.299 1.273 1.534 1.609 1.746 1.877 2.003 2.068 2.2 2.326 2.535 2.668 2.772 2.915 3.057 3.204 3.35 3.487 3.667 3.832 3.976 4.148 4.324 4.5 4.719 4.984 5.237 5.525 5.852 6.19 6.539 6.945 7.4 7.818 8.301 8.828 9.383 10.016 10.725 11.435 12.096 12.351 12.263 12.071 11.847 11.554 11.24 10.884 10.571 10.263 9.959 9.667 9.385 9.106 8.831 8.582 8.321 8.1 7.9 7.677 7.452 7.267 7.065 6.856 6.686 6.5 6.309 6.101 5.883 5.742 5.594 5.371 5.221 5.059 4.964 4.757 4.526 4.286 4.171 3.875 3.791 3.657 3.502 3.161 2.986 2.792 2.535 2.228 1.917 1.488 -0.717 -4 ,24593 ,KEBNE ,17028419,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:59:28 CET,0.0 0.275 0.418 0.554 0.677 0.784 0.887 0.985 1.16 1.236 1.321 1.307 1.57 1.642 1.784 1.93 2.073 2.139 2.27 2.4 2.589 2.699 2.799 2.936 3.071 3.216 3.348 3.472 3.645 3.821 3.985 4.178 4.37 4.553 4.765 5.013 5.255 5.526 5.824 6.143 6.475 6.853 7.29 7.738 8.265 8.781 9.339 9.942 10.595 11.275 11.937 12.276 12.203 11.972 11.676 11.354 11.023 10.7 10.425 10.1 9.794 9.511 9.21 8.923 8.669 8.422 8.157 7.914 7.711 7.501 7.267 7.072 6.864 6.617 6.422 6.237 6.05 5.862 5.672 5.535 5.378 5.111 4.933 4.745 4.634 4.415 4.211 4.007 3.889 3.58 3.423 3.24 3.041 2.587 2.351 2.11 1.823 1.486 1.07 0.501 -2.808 -5 ,7608 ,KEBNE ,17028420,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:58:40 CET,0.0 0.449 0.592 0.708 0.808 0.916 1.029 1.134 1.344 1.445 1.531 1.506 1.772 1.851 1.997 2.136 2.267 2.329 2.458 2.58 2.739 2.845 2.956 3.117 3.286 3.451 3.608 3.758 3.931 4.109 4.278 4.479 4.681 4.879 5.09 5.319 5.568 5.849 6.15 6.476 6.815 7.195 7.664 8.151 8.733 9.381 10.073 10.786 11.593 12.585 13.707 14.167 14.108 13.868 13.526 13.143 12.769 12.412 12.074 11.729 11.377 11.032 10.728 10.438 10.171 9.929 9.66 9.433 9.241 9.015 8.768 8.576 8.374 8.137 7.947 7.762 7.574 7.39 7.196 7.048 6.883 6.652 6.5 6.32 6.23 6.049 5.857 5.641 5.516 5.212 5.116 4.976 4.838 4.558 4.371 4.149 3.903 3.575 3.185 2.67 1.165 -6 ,1285 ,KEBNE ,17028421,Wed Dec 22 20:16:27 CET,Wed Dec 22 22:00:12 CET,0.0 0.302 0.443 0.546 0.641 0.733 0.825 0.92 1.112 1.198 1.279 1.25 1.499 1.561 1.687 1.826 1.962 2.026 2.159 2.29 2.459 2.576 2.691 2.854 3.013 3.163 3.315 3.458 3.642 3.821 3.994 4.207 4.416 4.613 4.835 5.098 5.367 5.649 5.948 6.267 6.612 7.012 7.475 7.946 8.497 9.103 9.815 10.601 11.499 12.481 13.515 14.156 14.171 13.933 13.624 13.267 12.941 12.611 12.258 11.906 11.599 11.32 11.042 10.79 10.561 10.306 10.014 9.771 9.554 9.314 9.057 8.821 8.579 8.335 8.15 7.962 7.756 7.545 7.314 7.146 6.977 6.7 6.499 6.315 6.216 5.958 5.698 5.449 5.321 5.011 4.855 4.656 4.436 3.99 3.757 3.502 3.236 2.935 2.622 2.217 0.124 -7 ,11227 ,KEBNE ,17028422,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:59:42 CET,0.0 0.157 0.29 0.428 0.563 0.672 0.771 0.869 1.053 1.126 1.191 1.138 1.399 1.472 1.6 1.733 1.867 1.932 2.064 2.188 2.374 2.495 2.608 2.779 2.945 3.103 3.257 3.411 3.594 3.769 3.945 4.162 4.382 4.593 4.834 5.106 5.363 5.633 5.946 6.302 6.649 7.036 7.52 8.002 8.591 9.23 9.928 10.706 11.529 12.518 13.359 13.591 13.588 13.414 13.214 12.943 12.582 12.201 11.849 11.484 11.163 10.859 10.552 10.26 9.978 9.73 9.484 9.259 9.07 8.869 8.635 8.437 8.241 8.012 7.839 7.674 7.492 7.282 7.071 6.93 6.779 6.548 6.387 6.208 6.108 5.901 5.707 5.498 5.369 5.07 5.01 4.88 4.737 4.395 4.19 3.977 3.726 3.428 3.026 2.423 0.192 -8 ,10434 ,KEBNE ,17028423,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:58:43 CET,0.0 0.222 0.353 0.461 0.557 0.68 0.8 0.891 1.068 1.151 1.241 1.249 1.527 1.6 1.735 1.853 1.975 2.043 2.17 2.294 2.474 2.588 2.702 2.866 3.025 3.183 3.333 3.472 3.651 3.823 3.993 4.2 4.388 4.58 4.813 5.074 5.334 5.608 5.913 6.247 6.578 6.921 7.286 7.662 8.131 8.636 9.14 9.659 10.261 10.886 11.371 11.37 11.064 10.669 10.269 9.892 9.53 9.145 8.768 8.432 8.153 7.882 7.608 7.323 7.072 6.836 6.556 6.345 6.168 5.957 5.725 5.532 5.343 5.156 4.999 4.821 4.638 4.436 4.23 4.103 3.971 3.77 3.623 3.448 3.365 3.211 3.03 2.802 2.675 2.377 2.282 2.147 2.001 1.697 1.518 1.335 1.107 0.791 0.446 -0.018 -3.381 -9 ,32177 ,KEBNE ,17028424,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:59:01 CET,0.0 0.497 0.669 0.825 0.955 1.064 1.157 1.239 1.4 1.481 1.563 1.543 1.813 1.886 2.017 2.144 2.274 2.341 2.468 2.591 2.772 2.891 3.01 3.194 3.377 3.546 3.72 3.892 4.101 4.289 4.468 4.68 4.875 5.066 5.296 5.557 5.804 6.085 6.408 6.757 7.116 7.498 7.935 8.379 8.9 9.466 10.063 10.72 11.476 12.321 13.118 13.36 13.212 12.904 12.56 12.266 11.937 11.491 11.095 10.728 10.413 10.164 9.937 9.69 9.441 9.22 8.978 8.74 8.547 8.35 8.135 7.962 7.788 7.595 7.426 7.243 7.056 6.845 6.627 6.485 6.33 6.114 5.953 5.745 5.637 5.433 5.225 4.988 4.873 4.594 4.522 4.392 4.242 3.843 3.592 3.35 3.119 2.793 2.406 1.831 -1.365 -10 ,26484 ,KEBNE ,17028425,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:59:22 CET,0.0 0.526 0.667 0.809 0.957 1.1 1.223 1.331 1.529 1.615 1.698 1.667 1.94 2.018 2.161 2.294 2.423 2.489 2.61 2.728 2.904 3.023 3.144 3.32 3.461 3.584 3.712 3.849 4.031 4.205 4.368 4.578 4.799 5.009 5.245 5.514 5.767 6.042 6.356 6.673 6.991 7.362 7.791 8.207 8.721 9.337 10.053 10.82 11.609 12.45 13.26 13.544 13.412 13.114 12.743 12.327 11.973 11.631 11.317 10.978 10.648 10.361 10.09 9.832 9.592 9.377 9.139 8.898 8.687 8.468 8.238 8.044 7.853 7.652 7.478 7.31 7.135 6.927 6.722 6.59 6.445 6.196 6.028 5.856 5.764 5.566 5.358 5.14 5.029 4.741 4.655 4.516 4.37 4.033 3.858 3.674 3.421 3.151 2.762 2.226 0.272 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5m.txt deleted file mode 100644 index bd94e137..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24577 ,TETRA ,17699412,Sat Dec 4 17:55:59 CET,Sat Dec 4 19:56:04 CET,0.0 0.26 0.358 0.455 0.541 0.629 0.707 0.768 0.868 0.927 0.984 0.898 1.137 1.187 1.279 1.364 1.446 1.489 1.575 1.646 1.75 1.833 1.92 2.043 2.157 2.267 2.371 2.471 2.593 2.705 2.815 2.963 3.1 3.218 3.356 3.514 3.675 3.839 3.993 4.168 4.359 4.557 4.741 4.895 5.068 5.233 5.356 5.397 5.295 4.963 4.169 2.889 1.62 0.434 -0.577 -1.461 -2.277 -3.038 -3.7 -4.306 -4.823 -5.31 -5.768 -6.223 -6.661 -7.053 -7.434 -7.788 -8.122 -8.473 -8.858 -9.176 -9.496 -9.856 -10.129 -10.385 -10.644 -10.952 -11.298 -11.522 -11.732 -12.061 -12.288 -12.527 -12.664 -12.945 -13.227 -13.512 -13.648 -13.984 -14.124 -14.299 -14.492 -14.903 -15.128 -15.403 -15.768 -16.202 -16.712 -17.402 -20.11 -2 ,28904 ,TETRA ,17699413,Sat Dec 4 17:55:59 CET,Sat Dec 4 19:54:45 CET,0.0 0.138 0.291 0.423 0.52 0.592 0.662 0.743 0.859 0.907 0.955 0.851 1.087 1.14 1.228 1.319 1.412 1.462 1.568 1.664 1.794 1.874 1.956 2.068 2.159 2.245 2.339 2.436 2.558 2.666 2.757 2.85 2.937 3.023 3.116 3.24 3.364 3.471 3.577 3.701 3.852 4.026 4.196 4.342 4.534 4.714 4.842 4.922 4.945 4.802 4.212 3.117 1.925 0.796 -0.205 -1.15 -1.994 -2.703 -3.288 -3.881 -4.453 -4.991 -5.514 -6.007 -6.449 -6.828 -7.202 -7.547 -7.827 -8.124 -8.456 -8.732 -9.03 -9.328 -9.559 -9.797 -10.041 -10.301 -10.576 -10.773 -10.966 -11.275 -11.494 -11.711 -11.828 -12.065 -12.286 -12.505 -12.616 -12.938 -13.082 -13.264 -13.467 -13.911 -14.152 -14.439 -14.754 -15.122 -15.613 -16.221 -19.315 -3 ,18972 ,TETRA ,17699414,Sat Dec 4 17:56:02 CET,Sat Dec 4 19:55:22 CET,0.0 0.358 0.497 0.616 0.715 0.814 0.89 0.957 1.085 1.147 1.207 1.117 1.353 1.402 1.494 1.581 1.67 1.714 1.797 1.876 2.0 2.074 2.142 2.245 2.345 2.435 2.513 2.589 2.711 2.832 2.942 3.082 3.207 3.315 3.431 3.558 3.692 3.841 4.008 4.167 4.319 4.491 4.694 4.892 5.087 5.264 5.382 5.47 5.464 5.198 4.419 3.296 2.2 1.105 0.163 -0.732 -1.56 -2.314 -2.945 -3.561 -4.083 -4.548 -5.004 -5.456 -5.887 -6.266 -6.656 -7.013 -7.329 -7.65 -7.976 -8.268 -8.588 -8.957 -9.259 -9.571 -9.92 -10.268 -10.635 -10.893 -11.151 -11.514 -11.733 -11.967 -12.083 -12.343 -12.639 -12.948 -13.123 -13.481 -13.622 -13.805 -13.99 -14.444 -14.697 -14.989 -15.327 -15.722 -16.238 -16.905 -20.902 -4 ,31378 ,TETRA ,17699415,Sat Dec 4 17:55:59 CET,Sat Dec 4 19:56:20 CET,0.0 0.225 0.378 0.48 0.563 0.64 0.712 0.768 0.877 0.936 0.996 0.931 1.17 1.222 1.309 1.386 1.462 1.503 1.592 1.68 1.798 1.87 1.939 2.045 2.15 2.246 2.336 2.419 2.523 2.62 2.721 2.853 2.967 3.067 3.195 3.345 3.465 3.588 3.743 3.907 4.065 4.243 4.423 4.607 4.823 5.0 5.16 5.367 5.549 5.417 4.702 3.546 2.509 1.558 0.632 -0.216 -0.929 -1.588 -2.19 -2.809 -3.348 -3.813 -4.247 -4.694 -5.117 -5.5 -5.914 -6.282 -6.602 -6.96 -7.316 -7.603 -7.91 -8.235 -8.496 -8.751 -9.032 -9.339 -9.631 -9.822 -10.024 -10.37 -10.614 -10.856 -10.986 -11.262 -11.566 -11.889 -12.054 -12.428 -12.648 -12.854 -13.058 -13.499 -13.765 -14.056 -14.37 -14.739 -15.208 -15.974 -20.31 -5 ,30070 ,TETRA ,17699416,Sat Dec 4 17:56:02 CET,Sat Dec 4 20:00:40 CET,0.0 0.119 0.213 0.305 0.402 0.491 0.568 0.643 0.766 0.816 0.868 0.787 1.023 1.067 1.163 1.258 1.344 1.39 1.469 1.541 1.667 1.742 1.807 1.906 2.003 2.098 2.195 2.282 2.41 2.538 2.633 2.746 2.858 2.966 3.102 3.251 3.376 3.513 3.671 3.832 3.99 4.149 4.314 4.499 4.699 4.886 5.076 5.213 5.241 5.094 4.539 3.471 2.363 1.274 0.369 -0.45 -1.183 -1.835 -2.418 -3.024 -3.548 -4.008 -4.425 -4.813 -5.181 -5.509 -5.894 -6.272 -6.6 -6.931 -7.272 -7.571 -7.886 -8.183 -8.399 -8.657 -8.937 -9.23 -9.561 -9.783 -10.0 -10.365 -10.604 -10.815 -10.948 -11.288 -11.629 -11.985 -12.161 -12.507 -12.65 -12.833 -13.039 -13.554 -13.833 -14.134 -14.473 -14.835 -15.258 -15.794 -19.865 -6 ,20124 ,TETRA ,17699417,Sat Dec 4 17:56:04 CET,Sat Dec 4 20:00:59 CET,0.0 0.283 0.439 0.544 0.642 0.732 0.805 0.879 1.004 1.067 1.13 1.047 1.291 1.346 1.448 1.557 1.664 1.709 1.782 1.847 1.942 2.009 2.073 2.162 2.264 2.373 2.47 2.55 2.643 2.742 2.843 2.95 3.054 3.164 3.286 3.42 3.554 3.695 3.86 4.042 4.231 4.443 4.67 4.868 5.078 5.31 5.569 5.814 5.936 5.827 5.309 4.244 3.195 2.231 1.399 0.674 -0.029 -0.706 -1.317 -1.972 -2.488 -2.942 -3.39 -3.788 -4.169 -4.577 -5.043 -5.46 -5.832 -6.169 -6.485 -6.776 -7.123 -7.487 -7.764 -8.067 -8.378 -8.69 -8.995 -9.206 -9.432 -9.795 -10.031 -10.257 -10.377 -10.622 -10.876 -11.167 -11.334 -11.688 -11.854 -12.039 -12.237 -12.701 -12.962 -13.273 -13.63 -14.02 -14.506 -15.14 -18.296 -7 ,23658 ,TETRA ,17699418,Sat Dec 4 17:55:59 CET,Sat Dec 4 19:51:15 CET,0.0 0.208 0.351 0.472 0.596 0.686 0.763 0.843 0.975 1.021 1.072 0.999 1.233 1.28 1.369 1.46 1.548 1.587 1.664 1.745 1.856 1.923 1.985 2.083 2.197 2.306 2.416 2.528 2.661 2.764 2.854 2.969 3.081 3.189 3.316 3.466 3.598 3.723 3.856 3.996 4.15 4.327 4.492 4.653 4.832 5.02 5.201 5.34 5.486 5.418 4.853 3.827 2.824 1.92 0.96 -0.025 -0.973 -1.913 -2.695 -3.463 -4.137 -4.716 -5.226 -5.694 -6.141 -6.554 -6.968 -7.298 -7.568 -7.867 -8.185 -8.439 -8.726 -9.046 -9.302 -9.574 -9.834 -10.12 -10.44 -10.658 -10.891 -11.241 -11.481 -11.75 -11.898 -12.191 -12.502 -12.861 -13.058 -13.445 -13.657 -13.875 -14.103 -14.626 -14.926 -15.252 -15.596 -16.013 -16.511 -17.154 -20.215 -8 ,413 ,TETRA ,17699419,Sat Dec 4 17:55:59 CET,Sat Dec 4 19:46:48 CET,0.0 0.248 0.34 0.419 0.496 0.569 0.644 0.724 0.891 0.963 1.022 0.942 1.184 1.237 1.331 1.416 1.504 1.553 1.646 1.72 1.825 1.897 1.972 2.096 2.214 2.311 2.404 2.501 2.616 2.714 2.825 2.968 3.101 3.217 3.342 3.488 3.632 3.788 3.938 4.078 4.228 4.397 4.583 4.79 5.023 5.191 5.324 5.44 5.439 5.311 4.822 3.778 2.753 1.691 0.636 -0.329 -1.142 -1.878 -2.561 -3.198 -3.686 -4.133 -4.62 -5.116 -5.59 -6.013 -6.444 -6.825 -7.151 -7.491 -7.84 -8.144 -8.463 -8.782 -9.018 -9.27 -9.551 -9.837 -10.113 -10.292 -10.479 -10.818 -11.08 -11.343 -11.472 -11.725 -11.991 -12.278 -12.438 -12.809 -12.987 -13.183 -13.393 -13.786 -14.019 -14.293 -14.562 -14.859 -15.274 -16.047 -18.914 -9 ,3564 ,TETRA ,17699420,Sat Dec 4 17:56:01 CET,Sat Dec 4 19:46:39 CET,0.0 0.19 0.285 0.375 0.461 0.544 0.631 0.715 0.845 0.903 0.964 0.888 1.126 1.18 1.299 1.409 1.497 1.537 1.625 1.714 1.825 1.89 1.955 2.048 2.139 2.227 2.317 2.403 2.507 2.631 2.744 2.861 2.988 3.106 3.231 3.378 3.511 3.666 3.867 4.062 4.225 4.397 4.592 4.788 5.024 5.302 5.546 5.632 5.655 5.539 4.879 3.623 2.491 1.515 0.605 -0.227 -0.93 -1.596 -2.18 -2.788 -3.337 -3.82 -4.285 -4.76 -5.223 -5.632 -6.036 -6.4 -6.719 -7.038 -7.375 -7.657 -7.942 -8.275 -8.561 -8.843 -9.121 -9.405 -9.718 -9.933 -10.153 -10.502 -10.76 -11.064 -11.213 -11.494 -11.79 -12.102 -12.272 -12.651 -12.827 -12.998 -13.198 -13.707 -13.992 -14.31 -14.657 -15.05 -15.538 -16.214 -20.288 -10 ,1714 ,TETRA ,17699421,Sat Dec 4 17:56:01 CET,Sat Dec 4 19:46:36 CET,0.0 0.243 0.389 0.485 0.577 0.661 0.724 0.791 0.921 0.981 1.038 0.936 1.164 1.21 1.298 1.376 1.455 1.495 1.569 1.641 1.755 1.835 1.908 2.012 2.109 2.194 2.286 2.369 2.468 2.57 2.663 2.774 2.888 2.988 3.11 3.243 3.348 3.476 3.624 3.78 3.945 4.106 4.275 4.423 4.562 4.656 4.707 4.716 4.614 4.26 3.36 2.022 0.89 -0.047 -0.903 -1.73 -2.551 -3.322 -3.932 -4.503 -5.038 -5.567 -6.078 -6.59 -7.096 -7.526 -7.948 -8.361 -8.69 -9.033 -9.441 -9.77 -10.106 -10.453 -10.727 -11.02 -11.314 -11.623 -11.919 -12.116 -12.322 -12.61 -12.823 -13.061 -13.192 -13.515 -13.878 -14.244 -14.424 -14.79 -14.974 -15.178 -15.409 -15.945 -16.237 -16.521 -16.829 -17.207 -17.63 -18.228 -21.752 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5n.txt deleted file mode 100644 index 6090caaf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27323 ,TETRA ,17699422,Sat Dec 4 17:56:01 CET,Sat Dec 4 19:51:31 CET,0.0 1.311 1.587 1.8 1.955 2.096 2.25 2.374 2.588 2.691 2.809 2.828 3.113 3.221 3.434 3.627 3.814 3.897 4.033 4.178 4.402 4.548 4.69 4.898 5.094 5.275 5.455 5.631 5.827 5.991 6.146 6.328 6.499 6.654 6.843 7.074 7.285 7.502 7.756 8.025 8.326 8.705 9.109 9.465 9.841 10.254 10.696 11.085 11.415 11.679 11.693 11.271 10.672 10.057 9.487 8.812 8.068 7.444 6.97 6.517 6.107 5.715 5.331 4.959 4.627 4.321 3.97 3.679 3.437 3.173 2.89 2.66 2.439 2.193 1.989 1.772 1.559 1.351 1.123 0.969 0.811 0.557 0.383 0.2 0.102 -0.095 -0.307 -0.529 -0.64 -0.947 -1.003 -1.142 -1.283 -1.555 -1.706 -1.866 -2.062 -2.314 -2.61 -3.012 -4.625 -2 ,1707 ,TETRA ,17699423,Sat Dec 4 17:56:01 CET,Sat Dec 4 19:46:43 CET,0.0 1.72 2.179 2.45 2.639 2.813 2.991 3.119 3.339 3.452 3.561 3.587 3.886 3.986 4.136 4.287 4.428 4.496 4.644 4.792 4.992 5.114 5.245 5.451 5.634 5.8 5.965 6.142 6.379 6.589 6.782 7.009 7.224 7.416 7.638 7.901 8.162 8.451 8.756 9.089 9.444 9.826 10.279 10.692 11.105 11.585 12.122 12.531 12.861 13.186 13.247 12.769 12.118 11.461 10.786 10.099 9.466 8.877 8.339 7.807 7.351 6.961 6.611 6.261 5.933 5.635 5.295 5.006 4.756 4.471 4.164 3.921 3.682 3.435 3.241 3.032 2.802 2.55 2.295 2.133 1.977 1.724 1.541 1.344 1.24 1.024 0.804 0.59 0.474 0.161 0.065 -0.088 -0.229 -0.485 -0.628 -0.804 -1.002 -1.224 -1.517 -1.924 -4.113 -3 ,29896 ,TETRA ,17699424,Sat Dec 4 17:56:01 CET,Sat Dec 4 19:47:05 CET,0.0 1.972 2.331 2.603 2.848 3.037 3.182 3.324 3.566 3.662 3.774 3.798 4.068 4.158 4.33 4.499 4.655 4.72 4.855 4.984 5.169 5.312 5.453 5.65 5.849 6.047 6.228 6.398 6.61 6.801 6.994 7.221 7.447 7.663 7.892 8.138 8.375 8.631 8.891 9.187 9.507 9.828 10.16 10.472 10.849 11.223 11.566 11.946 12.26 12.542 12.625 12.207 11.677 11.059 10.405 9.808 9.249 8.677 8.167 7.618 7.123 6.713 6.353 6.004 5.65 5.302 4.958 4.676 4.433 4.174 3.896 3.657 3.405 3.155 2.959 2.747 2.528 2.311 2.103 1.956 1.79 1.531 1.332 1.095 0.981 0.757 0.52 0.28 0.164 -0.144 -0.219 -0.355 -0.49 -0.801 -0.975 -1.148 -1.33 -1.566 -1.863 -2.214 -4.153 -4 ,3551 ,TETRA ,17699425,Sat Dec 4 17:56:01 CET,Sat Dec 4 19:47:07 CET,0.0 1.553 1.779 1.981 2.161 2.297 2.421 2.531 2.764 2.887 2.992 2.988 3.271 3.36 3.527 3.689 3.848 3.923 4.089 4.269 4.511 4.655 4.793 4.982 5.155 5.313 5.469 5.626 5.815 5.993 6.173 6.389 6.584 6.773 7.0 7.259 7.53 7.825 8.133 8.455 8.764 9.122 9.557 9.927 10.318 10.729 11.098 11.475 11.868 12.16 12.22 11.861 11.288 10.604 9.915 9.249 8.653 8.125 7.656 7.15 6.724 6.35 5.994 5.669 5.364 5.079 4.767 4.483 4.244 3.997 3.728 3.502 3.265 3.015 2.81 2.589 2.382 2.185 1.974 1.815 1.653 1.394 1.191 0.998 0.907 0.7 0.484 0.274 0.155 -0.158 -0.235 -0.372 -0.494 -0.762 -0.912 -1.086 -1.278 -1.481 -1.744 -2.081 -4.1 -5 ,3609 ,TETRA ,17699426,Sat Dec 4 17:56:01 CET,Sat Dec 4 19:55:54 CET,0.0 2.157 2.374 2.613 2.836 3.019 3.176 3.31 3.524 3.634 3.736 3.716 3.989 4.077 4.247 4.416 4.585 4.665 4.81 4.949 5.147 5.274 5.405 5.592 5.756 5.906 6.051 6.205 6.404 6.589 6.759 6.954 7.148 7.337 7.573 7.862 8.129 8.383 8.654 8.939 9.218 9.55 9.909 10.249 10.621 10.984 11.379 11.771 12.098 12.332 12.33 11.843 11.283 10.651 9.959 9.266 8.648 8.117 7.624 7.073 6.632 6.282 5.936 5.589 5.265 4.976 4.658 4.383 4.167 3.934 3.67 3.442 3.21 2.963 2.776 2.572 2.343 2.109 1.87 1.707 1.529 1.234 1.038 0.836 0.726 0.501 0.283 0.046 -0.098 -0.423 -0.477 -0.601 -0.725 -1.034 -1.235 -1.451 -1.681 -1.931 -2.25 -2.64 -4.445 -6 ,1310 ,TETRA ,17699427,Sat Dec 4 17:56:01 CET,Sat Dec 4 19:50:45 CET,0.0 1.352 1.582 1.769 1.956 2.139 2.279 2.394 2.583 2.678 2.79 2.834 3.143 3.251 3.425 3.593 3.761 3.837 3.996 4.158 4.381 4.515 4.63 4.806 4.995 5.177 5.352 5.533 5.793 6.024 6.228 6.468 6.684 6.901 7.164 7.461 7.716 7.972 8.228 8.47 8.731 9.036 9.384 9.724 10.095 10.507 10.991 11.465 11.887 12.196 12.194 11.786 11.259 10.719 10.202 9.71 9.239 8.782 8.335 7.876 7.484 7.135 6.781 6.413 6.08 5.778 5.478 5.203 4.965 4.72 4.428 4.192 3.967 3.727 3.542 3.349 3.143 2.923 2.699 2.546 2.382 2.131 1.966 1.79 1.692 1.49 1.278 1.049 0.92 0.585 0.486 0.348 0.206 -0.07 -0.256 -0.478 -0.714 -0.978 -1.29 -1.787 -3.336 -7 ,27140 ,TETRA ,17699428,Sat Dec 4 17:56:01 CET,Sat Dec 4 20:00:27 CET,0.0 2.154 2.462 2.721 2.903 3.074 3.222 3.355 3.586 3.683 3.787 3.809 4.096 4.188 4.363 4.527 4.673 4.755 4.931 5.081 5.273 5.401 5.523 5.706 5.89 6.066 6.243 6.408 6.615 6.806 6.981 7.182 7.377 7.561 7.786 8.067 8.33 8.614 8.91 9.216 9.536 9.858 10.237 10.675 11.122 11.568 12.034 12.402 12.76 13.036 13.023 12.621 12.114 11.573 10.977 10.377 9.836 9.358 8.946 8.541 8.195 7.838 7.474 7.162 6.871 6.585 6.258 5.934 5.654 5.35 5.036 4.788 4.53 4.279 4.09 3.881 3.649 3.415 3.165 3.0 2.845 2.61 2.443 2.258 2.166 1.985 1.794 1.598 1.5 1.213 1.171 1.038 0.894 0.55 0.371 0.168 -0.069 -0.373 -0.709 -1.129 -4.131 -8 ,18030 ,TETRA ,17699429,Sat Dec 4 17:56:04 CET,Sat Dec 4 20:00:42 CET,0.0 0.962 1.322 1.603 1.833 2.012 2.154 2.287 2.521 2.635 2.757 2.77 3.036 3.121 3.289 3.455 3.636 3.72 3.866 4.008 4.222 4.356 4.489 4.699 4.896 5.085 5.259 5.407 5.581 5.756 5.928 6.129 6.359 6.583 6.808 7.084 7.357 7.629 7.894 8.164 8.469 8.777 9.084 9.399 9.768 10.198 10.748 11.284 11.714 11.962 11.954 11.58 10.953 10.289 9.676 9.08 8.534 7.977 7.479 7.041 6.64 6.233 5.861 5.53 5.209 4.892 4.54 4.201 3.902 3.615 3.327 3.073 2.803 2.524 2.311 2.1 1.875 1.63 1.379 1.224 1.068 0.8 0.615 0.43 0.336 0.133 -0.08 -0.311 -0.436 -0.756 -0.848 -0.989 -1.142 -1.473 -1.656 -1.866 -2.126 -2.416 -2.777 -3.236 -4.709 -9 ,3922 ,TETRA ,17699430,Sat Dec 4 17:56:01 CET,Sat Dec 4 19:55:27 CET,0.0 1.207 1.495 1.715 1.908 2.065 2.228 2.367 2.581 2.697 2.798 2.795 3.09 3.19 3.345 3.504 3.693 3.777 3.913 4.042 4.236 4.368 4.487 4.659 4.837 5.004 5.162 5.311 5.48 5.643 5.834 6.06 6.274 6.493 6.739 7.007 7.253 7.518 7.794 8.056 8.334 8.687 9.089 9.465 9.834 10.174 10.569 10.963 11.393 11.781 11.828 11.448 10.98 10.374 9.722 9.149 8.597 8.078 7.64 7.169 6.739 6.339 5.978 5.632 5.312 5.018 4.682 4.369 4.109 3.857 3.59 3.361 3.11 2.86 2.682 2.494 2.293 2.102 1.909 1.769 1.63 1.405 1.235 1.051 0.953 0.74 0.524 0.299 0.191 -0.095 -0.165 -0.308 -0.461 -0.821 -1.023 -1.223 -1.423 -1.664 -1.961 -2.309 -3.485 -10 ,13361 ,TETRA ,17699431,Sat Dec 4 17:56:02 CET,Sat Dec 4 19:58:10 CET,0.0 1.983 2.336 2.532 2.685 2.84 2.98 3.105 3.363 3.475 3.593 3.639 3.92 4.016 4.221 4.4 4.548 4.627 4.78 4.914 5.087 5.208 5.334 5.505 5.678 5.839 5.992 6.149 6.347 6.532 6.705 6.9 7.079 7.262 7.506 7.792 8.058 8.347 8.645 8.967 9.315 9.686 10.038 10.375 10.795 11.255 11.734 12.171 12.578 12.951 12.963 12.361 11.665 11.006 10.364 9.729 9.15 8.625 8.201 7.742 7.321 6.939 6.573 6.229 5.874 5.549 5.211 4.901 4.633 4.354 4.065 3.814 3.566 3.322 3.115 2.901 2.698 2.489 2.269 2.128 1.978 1.729 1.558 1.371 1.274 1.069 0.844 0.611 0.499 0.195 0.118 -0.012 -0.141 -0.471 -0.682 -0.907 -1.177 -1.529 -1.928 -2.399 -4.112 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_3b.txt deleted file mode 100644 index 9657169b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8388 ,TETRA ,17699432,Sat Dec 4 17:56:01 CET,Sat Dec 4 19:47:00 CET,0.0 0.568 0.777 0.966 1.143 1.265 1.361 1.463 1.663 1.753 1.837 1.823 2.094 2.168 2.315 2.446 2.574 2.642 2.78 2.909 3.089 3.218 3.342 3.505 3.683 3.857 4.009 4.149 4.331 4.52 4.709 4.925 5.128 5.341 5.597 5.879 6.147 6.455 6.787 7.127 7.488 7.892 8.36 8.797 9.272 9.781 10.357 11.018 11.69 12.38 13.098 13.273 13.116 12.841 12.532 12.218 11.924 11.639 11.359 11.029 10.689 10.376 10.086 9.775 9.47 9.199 8.942 8.685 8.441 8.219 8.003 7.826 7.629 7.398 7.225 7.032 6.811 6.601 6.367 6.202 6.032 5.733 5.537 5.349 5.246 5.034 4.796 4.522 4.379 4.059 3.898 3.725 3.539 3.113 2.855 2.575 2.254 1.854 1.433 0.939 -1.717 -2 ,29787 ,TETRA ,17699433,Sat Dec 4 17:56:03 CET,Sat Dec 4 19:57:02 CET,0.0 0.329 0.495 0.631 0.753 0.863 0.962 1.055 1.232 1.311 1.392 1.37 1.643 1.726 1.866 2.0 2.134 2.197 2.304 2.413 2.595 2.707 2.809 2.963 3.113 3.254 3.399 3.548 3.746 3.942 4.128 4.353 4.571 4.782 5.018 5.273 5.525 5.801 6.098 6.434 6.794 7.165 7.579 7.992 8.494 9.09 9.716 10.382 11.164 11.989 12.709 12.876 12.762 12.565 12.27 11.932 11.569 11.224 10.929 10.603 10.295 10.012 9.723 9.419 9.121 8.869 8.607 8.351 8.12 7.872 7.629 7.437 7.226 7.007 6.841 6.636 6.402 6.176 5.95 5.78 5.604 5.326 5.119 4.91 4.805 4.584 4.358 4.135 4.01 3.71 3.618 3.471 3.301 2.89 2.619 2.322 2.036 1.736 1.322 0.632 -2.923 -3 ,3672 ,TETRA ,17699434,Sat Dec 4 17:56:03 CET,Sat Dec 4 19:42:36 CET,0.0 0.323 0.466 0.591 0.711 0.819 0.914 1.008 1.197 1.28 1.363 1.338 1.605 1.677 1.82 1.974 2.115 2.179 2.313 2.44 2.622 2.748 2.866 3.029 3.192 3.36 3.514 3.661 3.87 4.065 4.248 4.482 4.698 4.907 5.159 5.437 5.698 5.993 6.319 6.672 7.049 7.489 8.021 8.53 9.124 9.799 10.563 11.373 12.317 13.461 14.706 15.547 15.878 15.837 15.63 15.339 15.049 14.741 14.427 14.11 13.827 13.575 13.32 13.06 12.796 12.555 12.286 12.042 11.841 11.62 11.39 11.194 10.987 10.764 10.602 10.455 10.292 10.09 9.864 9.702 9.536 9.295 9.113 8.91 8.806 8.568 8.307 8.052 7.913 7.581 7.408 7.214 6.992 6.494 6.236 5.965 5.657 5.3 4.845 4.197 1.246 -4 ,13488 ,TETRA ,17699435,Sat Dec 4 17:56:03 CET,Sat Dec 4 19:52:14 CET,0.0 0.325 0.571 0.741 0.872 0.985 1.087 1.202 1.421 1.513 1.595 1.564 1.844 1.936 2.096 2.236 2.374 2.438 2.563 2.695 2.895 3.025 3.158 3.348 3.514 3.678 3.843 4.0 4.193 4.387 4.585 4.822 5.063 5.29 5.546 5.847 6.142 6.462 6.814 7.208 7.614 8.036 8.523 9.04 9.649 10.332 11.148 12.048 13.076 14.244 15.522 16.4 16.736 16.774 16.587 16.286 15.972 15.607 15.248 14.851 14.458 14.062 13.676 13.336 13.039 12.764 12.476 12.23 12.005 11.756 11.49 11.259 11.026 10.773 10.576 10.39 10.19 9.979 9.746 9.572 9.404 9.135 8.917 8.707 8.61 8.405 8.161 7.892 7.752 7.406 7.254 7.115 6.965 6.6 6.364 6.073 5.726 5.315 4.852 4.295 0.644 -5 ,11095 ,TETRA ,17699436,Sat Dec 4 17:56:03 CET,Sat Dec 4 19:54:56 CET,0.0 0.267 0.448 0.613 0.75 0.859 0.966 1.075 1.266 1.349 1.438 1.416 1.685 1.761 1.91 2.061 2.213 2.289 2.43 2.556 2.733 2.855 2.976 3.149 3.322 3.495 3.652 3.805 4.009 4.207 4.397 4.621 4.84 5.06 5.314 5.607 5.899 6.209 6.525 6.868 7.245 7.661 8.161 8.677 9.288 9.971 10.775 11.684 12.701 13.888 15.228 16.025 16.234 16.102 15.821 15.524 15.2 14.845 14.508 14.12 13.808 13.561 13.287 13.01 12.764 12.528 12.252 12.006 11.79 11.553 11.298 11.083 10.877 10.659 10.477 10.28 10.061 9.84 9.609 9.449 9.298 9.067 8.912 8.735 8.63 8.427 8.206 7.949 7.818 7.503 7.351 7.195 7.03 6.665 6.455 6.185 5.86 5.471 4.926 4.251 1.323 -6 ,9252 ,TETRA ,17699437,Sat Dec 4 17:56:04 CET,Sat Dec 4 19:54:24 CET,0.0 0.158 0.304 0.415 0.532 0.66 0.76 0.845 1.011 1.092 1.175 1.162 1.431 1.501 1.635 1.769 1.903 1.961 2.08 2.204 2.38 2.49 2.598 2.752 2.905 3.056 3.199 3.339 3.519 3.694 3.87 4.092 4.298 4.5 4.742 5.003 5.256 5.543 5.854 6.199 6.556 6.936 7.363 7.797 8.342 8.926 9.538 10.172 10.889 11.647 12.41 12.87 12.86 12.635 12.36 12.048 11.747 11.442 11.132 10.775 10.46 10.193 9.929 9.66 9.394 9.145 8.91 8.695 8.481 8.269 8.043 7.827 7.621 7.413 7.239 7.062 6.867 6.671 6.497 6.356 6.175 5.885 5.675 5.449 5.339 5.096 4.829 4.565 4.415 4.054 3.859 3.671 3.495 3.116 2.919 2.684 2.362 1.998 1.533 0.85 -1.865 -7 ,14353 ,TETRA ,17699438,Sat Dec 4 17:56:56 CET,Sat Dec 4 19:51:01 CET,0.0 0.496 0.704 0.861 1.021 1.182 1.327 1.439 1.631 1.728 1.818 1.79 2.06 2.139 2.295 2.444 2.591 2.66 2.794 2.939 3.145 3.268 3.382 3.557 3.73 3.906 4.072 4.223 4.418 4.602 4.767 4.961 5.171 5.39 5.639 5.906 6.144 6.391 6.66 6.971 7.304 7.671 8.131 8.614 9.2 9.831 10.463 11.109 11.881 12.844 13.872 14.445 14.6 14.457 14.131 13.744 13.33 12.975 12.666 12.296 11.988 11.708 11.407 11.113 10.83 10.544 10.255 10.002 9.771 9.538 9.292 9.075 8.845 8.613 8.439 8.266 8.077 7.845 7.596 7.423 7.215 6.888 6.664 6.421 6.304 6.072 5.857 5.615 5.466 5.153 5.014 4.828 4.645 4.305 4.109 3.868 3.608 3.253 2.668 1.778 -2.202 -8 ,17290 ,TETRA ,17699439,Sat Dec 4 17:56:56 CET,Sat Dec 4 19:55:25 CET,0.0 0.479 0.662 0.8 0.941 1.061 1.171 1.272 1.473 1.564 1.639 1.597 1.847 1.912 2.038 2.161 2.277 2.329 2.435 2.535 2.687 2.782 2.87 3.007 3.158 3.313 3.457 3.589 3.77 3.946 4.106 4.288 4.471 4.656 4.866 5.103 5.341 5.601 5.882 6.179 6.476 6.818 7.23 7.655 8.134 8.647 9.232 9.834 10.498 11.245 11.995 12.391 12.465 12.386 12.16 11.876 11.603 11.324 11.067 10.77 10.481 10.216 9.945 9.678 9.404 9.158 8.899 8.628 8.413 8.188 7.929 7.734 7.526 7.292 7.116 6.937 6.731 6.503 6.264 6.097 5.939 5.662 5.44 5.22 5.105 4.878 4.654 4.418 4.295 3.995 3.885 3.714 3.527 3.111 2.882 2.646 2.35 1.935 1.456 0.845 -2.684 -9 ,16048 ,TETRA ,17699440,Sat Dec 4 17:56:57 CET,Sat Dec 4 19:55:33 CET,0.0 0.287 0.45 0.585 0.699 0.816 0.937 1.044 1.245 1.341 1.43 1.414 1.686 1.76 1.906 2.041 2.171 2.234 2.363 2.499 2.676 2.788 2.898 3.051 3.215 3.379 3.525 3.666 3.852 4.029 4.184 4.39 4.608 4.812 5.063 5.348 5.615 5.9 6.208 6.536 6.88 7.273 7.713 8.13 8.612 9.158 9.775 10.454 11.155 11.793 12.558 13.065 13.068 12.832 12.525 12.216 11.955 11.698 11.432 11.101 10.792 10.494 10.162 9.819 9.505 9.24 8.972 8.727 8.495 8.244 7.987 7.772 7.558 7.329 7.141 6.948 6.75 6.554 6.355 6.208 6.052 5.806 5.615 5.409 5.308 5.08 4.815 4.543 4.42 4.115 3.973 3.829 3.66 3.248 3.014 2.72 2.393 2.035 1.599 0.935 -1.959 -10 ,27086 ,TETRA ,17699441,Sat Dec 4 17:57:00 CET,Sat Dec 4 19:48:10 CET,0.0 0.329 0.57 0.756 0.875 0.962 1.046 1.13 1.298 1.379 1.458 1.429 1.698 1.77 1.905 2.053 2.2 2.266 2.387 2.502 2.67 2.78 2.888 3.042 3.202 3.366 3.527 3.679 3.878 4.075 4.262 4.493 4.713 4.916 5.159 5.425 5.656 5.921 6.214 6.519 6.842 7.209 7.654 8.098 8.6 9.154 9.806 10.527 11.298 12.157 13.072 13.582 13.663 13.447 13.096 12.754 12.425 12.103 11.81 11.477 11.184 10.912 10.637 10.373 10.128 9.897 9.615 9.365 9.158 8.93 8.682 8.476 8.243 7.976 7.779 7.6 7.41 7.187 6.956 6.8 6.64 6.369 6.161 5.951 5.835 5.579 5.31 4.993 4.818 4.489 4.365 4.217 4.064 3.631 3.383 3.14 2.83 2.434 1.938 1.327 -1.503 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_5n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_5n.txt deleted file mode 100644 index 11f7899a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_5n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29285 ,TETRA ,17699442,Sat Dec 4 17:56:55 CET,Sat Dec 4 19:45:27 CET,0.0 0.501 0.727 0.92 1.075 1.221 1.384 1.522 1.752 1.862 1.97 1.985 2.265 2.355 2.529 2.689 2.842 2.922 3.08 3.226 3.427 3.542 3.652 3.828 4.019 4.201 4.383 4.567 4.788 5.0 5.199 5.436 5.66 5.859 6.079 6.323 6.552 6.796 7.073 7.384 7.711 8.046 8.435 8.826 9.226 9.666 10.179 10.717 11.287 11.895 12.441 12.465 12.122 11.708 11.316 10.953 10.597 10.213 9.843 9.448 9.068 8.704 8.364 8.036 7.703 7.408 7.128 6.863 6.621 6.365 6.085 5.866 5.655 5.42 5.229 5.032 4.81 4.58 4.358 4.206 4.048 3.779 3.605 3.439 3.343 3.128 2.913 2.68 2.553 2.24 2.185 2.062 1.916 1.557 1.336 1.118 0.899 0.623 0.28 -0.167 -1.725 -2 ,4652 ,TETRA ,17699443,Sat Dec 4 17:56:57 CET,Sat Dec 4 19:56:08 CET,0.0 0.4 0.632 0.834 1.021 1.199 1.347 1.469 1.726 1.848 1.938 1.914 2.194 2.29 2.457 2.601 2.725 2.784 2.905 3.027 3.221 3.357 3.49 3.678 3.869 4.044 4.221 4.398 4.593 4.781 4.968 5.199 5.433 5.663 5.907 6.156 6.397 6.649 6.952 7.289 7.604 7.969 8.387 8.802 9.297 9.829 10.442 11.106 11.816 12.515 13.063 13.169 12.979 12.707 12.375 11.988 11.592 11.159 10.723 10.256 9.844 9.512 9.243 8.97 8.687 8.416 8.126 7.859 7.643 7.426 7.177 6.963 6.726 6.467 6.282 6.102 5.903 5.715 5.54 5.397 5.237 4.985 4.808 4.643 4.56 4.369 4.168 3.962 3.848 3.555 3.516 3.39 3.248 2.954 2.784 2.553 2.314 2.07 1.774 1.423 0.171 -3 ,10789 ,TETRA ,17699444,Sat Dec 4 17:56:56 CET,Sat Dec 4 19:56:30 CET,0.0 0.373 0.626 0.84 1.004 1.146 1.279 1.383 1.559 1.652 1.74 1.725 1.996 2.075 2.216 2.339 2.474 2.552 2.704 2.845 3.038 3.158 3.271 3.43 3.592 3.754 3.904 4.055 4.255 4.439 4.612 4.828 5.034 5.24 5.495 5.773 6.05 6.343 6.678 7.047 7.385 7.759 8.192 8.676 9.241 9.805 10.383 11.026 11.744 12.398 12.796 12.676 12.363 11.976 11.552 11.145 10.786 10.417 10.052 9.637 9.291 9.006 8.704 8.388 8.081 7.806 7.517 7.258 7.016 6.75 6.484 6.265 6.051 5.82 5.639 5.467 5.273 5.062 4.859 4.722 4.567 4.315 4.127 3.928 3.825 3.62 3.396 3.142 3.013 2.69 2.593 2.446 2.293 1.981 1.806 1.631 1.451 1.243 0.991 0.645 -0.652 -4 ,18947 ,TETRA ,17699445,Sat Dec 4 17:56:56 CET,Sat Dec 4 19:57:01 CET,0.0 0.412 0.59 0.759 0.921 1.094 1.258 1.378 1.583 1.68 1.786 1.799 2.073 2.152 2.309 2.462 2.61 2.684 2.824 2.965 3.157 3.285 3.413 3.584 3.758 3.923 4.079 4.227 4.424 4.618 4.802 5.016 5.213 5.399 5.62 5.911 6.187 6.473 6.781 7.089 7.397 7.717 8.085 8.443 8.85 9.292 9.772 10.317 10.895 11.443 11.832 11.732 11.415 11.009 10.59 10.189 9.788 9.397 9.005 8.58 8.246 7.948 7.618 7.305 7.031 6.747 6.407 6.106 5.863 5.611 5.353 5.148 4.934 4.704 4.518 4.32 4.116 3.887 3.666 3.519 3.346 3.051 2.847 2.646 2.546 2.33 2.092 1.87 1.758 1.452 1.375 1.223 1.077 0.788 0.616 0.414 0.182 -0.081 -0.396 -0.788 -1.605 -5 ,30783 ,TETRA ,17699446,Sat Dec 4 17:56:57 CET,Sat Dec 4 19:44:20 CET,0.0 0.672 0.901 1.097 1.29 1.449 1.553 1.652 1.853 1.944 2.039 2.057 2.345 2.434 2.611 2.785 2.942 3.014 3.141 3.255 3.413 3.528 3.64 3.792 3.945 4.109 4.286 4.463 4.687 4.898 5.101 5.336 5.58 5.831 6.101 6.386 6.652 6.958 7.306 7.664 8.025 8.429 8.881 9.353 9.915 10.483 11.128 11.745 12.301 12.803 13.251 13.448 13.299 13.012 12.669 12.237 11.821 11.427 11.078 10.705 10.347 10.046 9.758 9.481 9.219 8.918 8.617 8.367 8.131 7.884 7.615 7.408 7.211 6.99 6.811 6.636 6.46 6.257 6.043 5.889 5.712 5.452 5.287 5.101 4.992 4.78 4.57 4.336 4.217 3.899 3.801 3.666 3.513 3.161 2.964 2.794 2.624 2.362 2.021 1.575 0.067 -6 ,3837 ,TETRA ,17699447,Sat Dec 4 17:56:57 CET,Sat Dec 4 19:52:08 CET,0.0 0.31 0.474 0.62 0.746 0.885 1.033 1.157 1.395 1.501 1.596 1.59 1.856 1.941 2.112 2.281 2.44 2.512 2.64 2.755 2.925 3.035 3.158 3.343 3.511 3.666 3.814 3.955 4.129 4.302 4.482 4.717 4.948 5.157 5.384 5.64 5.9 6.185 6.473 6.773 7.087 7.452 7.858 8.255 8.708 9.165 9.669 10.199 10.807 11.503 12.036 12.104 11.961 11.696 11.369 10.914 10.396 9.976 9.644 9.296 8.973 8.669 8.375 8.086 7.818 7.557 7.277 7.029 6.826 6.615 6.345 6.094 5.838 5.576 5.381 5.202 5.024 4.841 4.64 4.481 4.327 4.114 3.938 3.745 3.651 3.457 3.256 3.031 2.903 2.581 2.482 2.333 2.168 1.825 1.636 1.433 1.222 0.96 0.646 0.256 -1.06 -7 ,32308 ,TETRA ,17699448,Sat Dec 4 17:56:58 CET,Sat Dec 4 19:58:16 CET,0.0 0.372 0.57 0.721 0.858 0.995 1.142 1.304 1.573 1.684 1.788 1.796 2.094 2.191 2.35 2.52 2.715 2.802 2.957 3.111 3.323 3.452 3.568 3.734 3.899 4.07 4.24 4.392 4.603 4.809 5.004 5.237 5.462 5.692 5.949 6.223 6.454 6.7 6.979 7.292 7.603 7.938 8.32 8.689 9.118 9.616 10.22 10.93 11.663 12.289 12.829 12.913 12.701 12.375 11.946 11.456 11.004 10.631 10.329 10.006 9.693 9.377 9.055 8.742 8.424 8.122 7.807 7.532 7.3 7.046 6.769 6.555 6.349 6.138 5.972 5.803 5.61 5.386 5.162 5.015 4.865 4.624 4.457 4.283 4.193 4.023 3.85 3.654 3.544 3.238 3.164 3.021 2.881 2.585 2.418 2.24 2.041 1.804 1.508 1.145 -0.021 -8 ,22870 ,TETRA ,17699449,Sat Dec 4 17:56:57 CET,Sat Dec 4 19:56:00 CET,0.0 0.418 0.585 0.771 0.941 1.067 1.163 1.248 1.443 1.541 1.635 1.612 1.863 1.942 2.087 2.233 2.383 2.451 2.579 2.703 2.883 2.997 3.115 3.281 3.427 3.579 3.739 3.897 4.093 4.27 4.451 4.683 4.903 5.099 5.313 5.556 5.785 6.05 6.354 6.672 6.995 7.35 7.75 8.173 8.667 9.138 9.654 10.218 10.793 11.363 11.829 11.708 11.199 10.573 9.96 9.457 9.021 8.615 8.236 7.824 7.452 7.111 6.782 6.487 6.204 5.927 5.618 5.314 5.06 4.805 4.537 4.317 4.092 3.86 3.684 3.497 3.294 3.09 2.887 2.733 2.57 2.316 2.143 1.978 1.886 1.69 1.484 1.251 1.124 0.824 0.785 0.646 0.484 0.144 -0.032 -0.203 -0.385 -0.609 -0.893 -1.218 -2.225 -9 ,4218 ,TETRA ,17699450,Sat Dec 4 17:56:59 CET,Sat Dec 4 19:57:29 CET,0.0 0.377 0.58 0.772 0.941 1.089 1.252 1.407 1.662 1.774 1.885 1.897 2.18 2.274 2.464 2.651 2.823 2.91 3.084 3.232 3.441 3.584 3.722 3.93 4.119 4.282 4.44 4.61 4.845 5.048 5.222 5.446 5.67 5.872 6.108 6.381 6.633 6.906 7.18 7.459 7.781 8.154 8.543 8.927 9.374 9.853 10.401 10.965 11.549 12.168 12.677 12.681 12.445 12.151 11.812 11.437 11.019 10.571 10.186 9.781 9.402 9.048 8.666 8.318 8.035 7.78 7.512 7.254 7.02 6.784 6.543 6.341 6.134 5.911 5.738 5.564 5.365 5.139 4.924 4.783 4.61 4.312 4.114 3.911 3.815 3.617 3.397 3.155 3.021 2.696 2.601 2.465 2.332 2.051 1.901 1.711 1.491 1.236 0.89 0.437 -1.192 -10 ,12094 ,TETRA ,17699451,Sat Dec 4 17:57:01 CET,Sat Dec 4 19:57:02 CET,0.0 0.466 0.682 0.843 1.004 1.158 1.278 1.381 1.592 1.691 1.778 1.77 2.053 2.138 2.291 2.441 2.594 2.673 2.821 2.959 3.157 3.279 3.404 3.583 3.752 3.933 4.121 4.302 4.513 4.697 4.873 5.081 5.284 5.492 5.746 6.027 6.284 6.55 6.837 7.149 7.488 7.857 8.282 8.696 9.132 9.606 10.131 10.73 11.425 12.165 12.782 12.935 12.779 12.452 12.034 11.639 11.284 10.928 10.583 10.192 9.818 9.473 9.131 8.809 8.537 8.294 8.013 7.763 7.55 7.308 7.026 6.777 6.523 6.271 6.085 5.893 5.674 5.453 5.262 5.127 4.957 4.668 4.485 4.299 4.204 3.997 3.766 3.542 3.433 3.141 3.09 2.957 2.814 2.502 2.316 2.122 1.917 1.671 1.376 0.991 -0.257 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8b_8a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8b_8a.txt deleted file mode 100644 index 6c0d8fd8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8b_8a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2080 ,TETRA ,17699452,Sat Dec 4 17:56:58 CET,Sat Dec 4 19:44:50 CET,0.0 0.205 0.351 0.471 0.586 0.714 0.83 0.925 1.083 1.16 1.244 1.33 1.488 1.569 1.733 1.875 2.009 2.073 2.186 2.296 2.456 2.563 2.668 2.816 2.964 3.104 3.237 3.367 3.525 3.668 3.814 4.007 4.2 4.383 4.586 4.804 5.011 5.233 5.47 5.717 5.967 6.245 6.56 6.856 7.167 7.489 7.81 8.117 8.443 8.668 8.631 8.287 7.826 7.32 6.783 6.268 5.819 5.403 5.014 4.594 4.239 3.922 3.599 3.291 2.986 2.69 2.4 2.145 1.927 1.697 1.449 1.238 1.018 0.791 0.614 0.439 0.262 0.069 -0.125 -0.248 -0.372 -0.573 -0.718 -0.872 -0.955 -1.131 -1.309 -1.487 -1.583 -1.766 -1.906 -2.04 -2.179 -2.457 -2.592 -2.748 -2.932 -3.129 -3.339 -3.571 -4.12 -2 ,5449 ,TETRA ,17699453,Sat Dec 4 17:56:58 CET,Sat Dec 4 19:49:37 CET,0.0 0.345 0.506 0.644 0.766 0.863 0.952 1.046 1.258 1.362 1.451 1.526 1.692 1.768 1.894 2.007 2.132 2.191 2.304 2.419 2.575 2.676 2.78 2.93 3.08 3.233 3.376 3.507 3.673 3.839 3.996 4.184 4.375 4.555 4.739 4.95 5.16 5.398 5.654 5.912 6.168 6.463 6.801 7.129 7.503 7.856 8.205 8.542 8.889 9.187 9.273 8.971 8.481 7.929 7.388 6.85 6.337 5.892 5.523 5.147 4.823 4.515 4.224 3.945 3.68 3.444 3.181 2.939 2.73 2.518 2.298 2.106 1.896 1.675 1.512 1.35 1.187 1.012 0.819 0.691 0.556 0.332 0.179 0.023 -0.06 -0.234 -0.415 -0.615 -0.714 -0.896 -1.045 -1.169 -1.289 -1.524 -1.647 -1.81 -1.998 -2.172 -2.385 -2.655 -3.181 -3 ,15721 ,TETRA ,17699454,Sat Dec 4 17:56:58 CET,Sat Dec 4 19:57:27 CET,0.0 0.286 0.485 0.637 0.759 0.865 0.958 1.051 1.214 1.287 1.361 1.433 1.589 1.658 1.792 1.921 2.05 2.113 2.234 2.353 2.533 2.645 2.749 2.904 3.038 3.157 3.282 3.419 3.597 3.76 3.924 4.131 4.323 4.511 4.742 4.972 5.17 5.392 5.614 5.829 6.059 6.314 6.613 6.905 7.213 7.512 7.832 8.163 8.503 8.854 8.978 8.65 8.1 7.528 7.024 6.553 6.107 5.666 5.28 4.902 4.562 4.242 3.927 3.62 3.362 3.127 2.858 2.606 2.383 2.166 1.954 1.768 1.57 1.375 1.22 1.058 0.884 0.682 0.487 0.367 0.239 0.021 -0.135 -0.28 -0.355 -0.517 -0.684 -0.87 -0.969 -1.156 -1.293 -1.411 -1.539 -1.837 -1.996 -2.167 -2.353 -2.532 -2.742 -2.988 -3.773 -4 ,24958 ,TETRA ,17699455,Sat Dec 4 17:57:00 CET,Sat Dec 4 19:57:42 CET,0.0 0.322 0.511 0.672 0.814 0.93 1.052 1.164 1.353 1.443 1.533 1.615 1.773 1.851 2.006 2.148 2.272 2.331 2.454 2.577 2.742 2.847 2.957 3.126 3.278 3.418 3.562 3.701 3.874 4.035 4.189 4.369 4.546 4.719 4.896 5.081 5.27 5.488 5.713 5.94 6.174 6.432 6.726 7.02 7.34 7.664 8.024 8.369 8.675 8.965 9.055 8.749 8.24 7.635 7.034 6.493 6.041 5.634 5.239 4.806 4.444 4.133 3.828 3.519 3.216 2.935 2.642 2.402 2.198 1.971 1.736 1.544 1.327 1.112 0.956 0.779 0.599 0.415 0.228 0.104 -0.037 -0.258 -0.407 -0.561 -0.64 -0.789 -0.95 -1.139 -1.24 -1.436 -1.587 -1.705 -1.824 -2.069 -2.199 -2.346 -2.533 -2.724 -2.902 -3.128 -3.802 -5 ,31089 ,TETRA ,17699456,Sat Dec 4 17:56:58 CET,Sat Dec 4 20:00:25 CET,0.0 0.425 0.638 0.769 0.892 1.004 1.105 1.212 1.419 1.509 1.587 1.659 1.816 1.891 2.034 2.162 2.279 2.336 2.447 2.562 2.734 2.838 2.937 3.087 3.221 3.359 3.503 3.635 3.806 3.972 4.122 4.3 4.467 4.627 4.821 5.039 5.24 5.466 5.709 5.941 6.17 6.439 6.756 7.051 7.377 7.703 8.04 8.393 8.695 8.947 8.926 8.544 8.066 7.539 7.088 6.666 6.238 5.827 5.48 5.102 4.748 4.413 4.095 3.804 3.504 3.216 2.92 2.655 2.44 2.228 2.004 1.812 1.613 1.397 1.224 1.053 0.869 0.667 0.459 0.316 0.173 -0.04 -0.194 -0.349 -0.423 -0.587 -0.77 -0.951 -1.046 -1.24 -1.387 -1.505 -1.627 -1.878 -2.024 -2.182 -2.323 -2.506 -2.738 -3.045 -3.926 -6 ,16577 ,TETRA ,17699457,Sat Dec 4 17:57:00 CET,Sat Dec 4 19:59:51 CET,0.0 0.203 0.356 0.504 0.637 0.746 0.858 0.974 1.166 1.247 1.327 1.404 1.559 1.633 1.768 1.885 1.993 2.05 2.173 2.29 2.453 2.556 2.658 2.808 2.958 3.098 3.229 3.364 3.546 3.725 3.884 4.057 4.231 4.399 4.592 4.801 4.988 5.194 5.427 5.674 5.936 6.24 6.549 6.841 7.144 7.456 7.825 8.181 8.494 8.729 8.787 8.458 7.978 7.493 7.026 6.559 6.116 5.678 5.262 4.846 4.487 4.16 3.84 3.53 3.24 2.979 2.712 2.468 2.262 2.036 1.799 1.619 1.432 1.227 1.06 0.892 0.715 0.511 0.297 0.159 0.018 -0.225 -0.399 -0.594 -0.692 -0.879 -1.056 -1.223 -1.317 -1.507 -1.651 -1.779 -1.907 -2.152 -2.286 -2.426 -2.565 -2.724 -2.931 -3.208 -3.809 -7 ,5743 ,TETRA ,17699458,Sat Dec 4 17:56:59 CET,Sat Dec 4 19:58:04 CET,0.0 0.198 0.336 0.496 0.641 0.748 0.854 0.958 1.156 1.246 1.326 1.392 1.549 1.639 1.809 1.954 2.089 2.158 2.299 2.424 2.593 2.7 2.801 2.956 3.1 3.241 3.385 3.515 3.683 3.843 3.986 4.149 4.306 4.459 4.638 4.847 5.049 5.263 5.493 5.725 5.96 6.223 6.525 6.823 7.14 7.467 7.82 8.169 8.526 8.806 8.81 8.478 8.002 7.45 6.936 6.449 5.978 5.535 5.14 4.724 4.362 4.012 3.684 3.375 3.079 2.812 2.525 2.283 2.08 1.852 1.617 1.418 1.21 0.999 0.826 0.644 0.452 0.263 0.045 -0.111 -0.259 -0.5 -0.669 -0.837 -0.925 -1.101 -1.277 -1.469 -1.568 -1.756 -1.907 -2.031 -2.15 -2.411 -2.542 -2.691 -2.864 -3.058 -3.256 -3.526 -4.139 -8 ,20213 ,TETRA ,17699459,Sat Dec 4 17:56:59 CET,Sat Dec 4 19:45:39 CET,0.0 0.38 0.574 0.711 0.834 0.949 1.046 1.137 1.306 1.392 1.481 1.569 1.715 1.775 1.905 2.035 2.157 2.218 2.34 2.453 2.608 2.705 2.805 2.958 3.096 3.229 3.36 3.485 3.648 3.795 3.94 4.126 4.295 4.453 4.643 4.858 5.052 5.269 5.503 5.742 5.978 6.235 6.536 6.828 7.16 7.526 7.902 8.229 8.511 8.72 8.761 8.453 7.974 7.449 6.921 6.427 5.994 5.576 5.183 4.774 4.426 4.11 3.796 3.509 3.238 2.995 2.742 2.504 2.311 2.112 1.894 1.714 1.538 1.341 1.177 1.012 0.84 0.657 0.467 0.346 0.22 0.013 -0.126 -0.263 -0.332 -0.481 -0.649 -0.827 -0.919 -1.103 -1.241 -1.343 -1.449 -1.694 -1.826 -1.962 -2.126 -2.321 -2.539 -2.843 -3.381 -9 ,29762 ,TETRA ,17699460,Sat Dec 4 17:56:58 CET,Sat Dec 4 19:53:27 CET,0.0 0.202 0.37 0.553 0.698 0.812 0.909 1.007 1.175 1.248 1.325 1.395 1.557 1.633 1.771 1.912 2.048 2.111 2.232 2.35 2.518 2.626 2.739 2.899 3.04 3.189 3.346 3.483 3.638 3.79 3.948 4.142 4.32 4.48 4.656 4.868 5.072 5.29 5.513 5.738 5.99 6.27 6.575 6.87 7.208 7.526 7.815 8.145 8.487 8.74 8.74 8.347 7.87 7.339 6.797 6.293 5.813 5.334 4.915 4.486 4.113 3.792 3.463 3.143 2.845 2.573 2.3 2.051 1.843 1.631 1.397 1.197 1.0 0.798 0.637 0.47 0.289 0.092 -0.125 -0.275 -0.421 -0.634 -0.788 -0.94 -1.011 -1.164 -1.331 -1.524 -1.622 -1.801 -1.931 -2.051 -2.182 -2.448 -2.583 -2.722 -2.875 -3.071 -3.309 -3.555 -3.964 -10 ,18573 ,TETRA ,17699461,Sat Dec 4 17:56:59 CET,Sat Dec 4 19:45:34 CET,0.0 0.244 0.427 0.587 0.726 0.83 0.917 1.007 1.192 1.282 1.377 1.466 1.625 1.701 1.849 1.995 2.128 2.186 2.303 2.428 2.602 2.701 2.798 2.954 3.108 3.254 3.394 3.526 3.686 3.839 3.995 4.184 4.376 4.559 4.755 4.971 5.174 5.394 5.64 5.896 6.174 6.482 6.797 7.087 7.4 7.745 8.133 8.546 8.919 9.127 9.082 8.764 8.313 7.761 7.214 6.716 6.265 5.848 5.481 5.105 4.766 4.455 4.134 3.807 3.534 3.283 2.969 2.692 2.472 2.252 2.031 1.848 1.648 1.433 1.263 1.086 0.915 0.737 0.54 0.409 0.282 0.096 -0.044 -0.195 -0.272 -0.432 -0.594 -0.773 -0.865 -1.043 -1.18 -1.296 -1.405 -1.654 -1.786 -1.92 -2.067 -2.264 -2.487 -2.733 -3.449 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8d_8c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8d_8c.txt deleted file mode 100644 index da9fba16..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8d_8c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26930 ,KEBNE ,16836542,Sun Dec 5 16:34:46 CET,Sun Dec 5 18:19:54 CET,0.0 0.789 1.136 1.37 1.558 1.711 1.849 1.975 2.214 2.329 2.434 2.496 2.722 2.809 2.978 3.136 3.287 3.361 3.5 3.629 3.83 3.961 4.088 4.274 4.457 4.633 4.795 4.959 5.184 5.4 5.604 5.856 6.098 6.325 6.605 6.951 7.283 7.626 8.021 8.446 8.863 9.333 9.933 10.552 11.218 11.949 12.827 13.829 14.947 16.248 17.76 18.81 19.249 19.447 19.52 19.48 19.309 19.071 18.87 18.667 18.458 18.245 18.056 17.879 17.701 17.543 17.382 17.229 17.072 16.916 16.756 16.615 16.47 16.301 16.167 16.03 15.886 15.732 15.576 15.474 15.374 15.21 15.084 14.949 14.883 14.744 14.592 14.455 14.381 14.176 14.105 13.998 13.87 13.612 13.495 13.366 13.231 13.091 12.917 12.689 12.028 -2 ,6513 ,KEBNE ,16836543,Sun Dec 5 16:34:46 CET,Sun Dec 5 18:20:08 CET,0.0 0.861 1.185 1.414 1.582 1.742 1.894 2.028 2.295 2.411 2.517 2.585 2.805 2.897 3.077 3.246 3.416 3.499 3.654 3.803 4.036 4.186 4.324 4.514 4.701 4.886 5.063 5.22 5.415 5.618 5.808 6.039 6.275 6.505 6.777 7.077 7.362 7.673 8.01 8.368 8.765 9.212 9.702 10.197 10.773 11.412 12.147 12.96 13.823 14.813 16.096 16.879 17.03 16.997 16.824 16.621 16.434 16.193 15.936 15.661 15.436 15.252 15.044 14.836 14.636 14.43 14.22 14.023 13.825 13.622 13.432 13.286 13.126 12.947 12.818 12.688 12.552 12.407 12.253 12.15 12.039 11.851 11.729 11.614 11.544 11.382 11.23 11.06 10.968 10.76 10.698 10.593 10.49 10.261 10.129 9.996 9.842 9.661 9.447 9.194 8.514 -3 ,20754 ,KEBNE ,16836544,Sun Dec 5 16:34:46 CET,Sun Dec 5 18:19:20 CET,0.0 0.829 1.074 1.251 1.402 1.524 1.642 1.77 2.01 2.118 2.221 2.292 2.519 2.606 2.776 2.934 3.095 3.175 3.333 3.492 3.715 3.852 3.981 4.164 4.343 4.524 4.706 4.888 5.121 5.348 5.574 5.843 6.093 6.326 6.596 6.914 7.225 7.562 7.938 8.338 8.749 9.2 9.729 10.26 10.87 11.584 12.49 13.564 14.823 16.26 17.87 19.061 19.596 19.73 19.699 19.564 19.36 19.159 18.963 18.723 18.502 18.293 18.088 17.893 17.71 17.531 17.328 17.141 16.962 16.787 16.628 16.472 16.285 16.118 16.002 15.882 15.755 15.607 15.448 15.331 15.201 15.02 14.908 14.778 14.706 14.558 14.407 14.26 14.178 13.968 13.891 13.775 13.667 13.423 13.283 13.137 12.973 12.798 12.588 12.319 11.361 -4 ,18769 ,KEBNE ,16836545,Sun Dec 5 16:34:50 CET,Sun Dec 5 18:20:24 CET,0.0 0.813 1.169 1.448 1.646 1.797 1.932 2.063 2.308 2.436 2.567 2.662 2.888 2.99 3.189 3.366 3.536 3.614 3.758 3.904 4.12 4.259 4.393 4.587 4.782 4.973 5.155 5.344 5.564 5.738 5.93 6.184 6.407 6.618 6.864 7.143 7.417 7.727 8.065 8.426 8.811 9.293 9.91 10.491 11.174 11.985 12.92 13.923 15.01 16.171 17.361 18.16 18.366 18.311 18.202 18.035 17.829 17.606 17.391 17.179 16.985 16.786 16.574 16.37 16.184 16.015 15.852 15.7 15.555 15.4 15.224 15.081 14.935 14.769 14.638 14.509 14.38 14.235 14.085 13.977 13.865 13.71 13.596 13.47 13.398 13.251 13.106 12.953 12.871 12.676 12.628 12.54 12.434 12.22 12.103 11.956 11.821 11.662 11.436 11.124 10.177 -5 ,8011 ,KEBNE ,16836546,Sun Dec 5 16:34:46 CET,Sun Dec 5 18:19:20 CET,0.0 0.877 1.068 1.215 1.38 1.55 1.706 1.853 2.104 2.209 2.319 2.394 2.608 2.69 2.858 3.028 3.193 3.276 3.431 3.566 3.771 3.912 4.049 4.252 4.444 4.621 4.804 4.985 5.205 5.417 5.617 5.841 6.06 6.28 6.544 6.861 7.157 7.452 7.773 8.112 8.468 8.862 9.329 9.804 10.333 10.919 11.595 12.394 13.396 14.62 15.896 16.58 17.003 17.173 17.094 16.955 16.777 16.579 16.386 16.14 15.915 15.739 15.555 15.365 15.189 15.019 14.843 14.669 14.507 14.35 14.191 14.056 13.905 13.736 13.606 13.471 13.331 13.189 13.054 12.964 12.857 12.678 12.547 12.415 12.353 12.203 12.042 11.885 11.803 11.589 11.507 11.407 11.293 11.042 10.911 10.767 10.596 10.403 10.164 9.911 9.186 -6 ,9866 ,KEBNE ,16836547,Sun Dec 5 16:34:46 CET,Sun Dec 5 18:19:14 CET,0.0 0.66 0.899 1.104 1.259 1.409 1.563 1.71 1.954 2.052 2.149 2.229 2.46 2.565 2.779 2.963 3.123 3.207 3.368 3.518 3.732 3.868 4.01 4.224 4.423 4.605 4.791 4.973 5.205 5.441 5.669 5.928 6.176 6.418 6.712 7.048 7.37 7.731 8.113 8.504 8.907 9.379 9.952 10.54 11.194 11.935 12.817 13.805 14.957 16.191 17.597 18.7 19.128 19.19 19.082 18.902 18.71 18.528 18.337 18.087 17.877 17.689 17.502 17.327 17.148 16.991 16.834 16.667 16.511 16.353 16.199 16.08 15.964 15.839 15.74 15.633 15.499 15.352 15.21 15.109 15.011 14.86 14.741 14.623 14.561 14.42 14.281 14.137 14.06 13.867 13.836 13.753 13.65 13.421 13.317 13.205 13.06 12.9 12.726 12.501 11.854 -7 ,399 ,KEBNE ,16836548,Sun Dec 5 16:34:46 CET,Sun Dec 5 18:19:04 CET,0.0 0.878 1.097 1.277 1.426 1.539 1.648 1.768 2.005 2.1 2.183 2.246 2.472 2.559 2.722 2.875 3.024 3.097 3.253 3.405 3.616 3.752 3.884 4.071 4.253 4.433 4.617 4.802 5.026 5.236 5.456 5.722 5.967 6.22 6.516 6.833 7.138 7.482 7.861 8.261 8.68 9.179 9.771 10.349 11.028 11.735 12.458 13.261 14.204 15.366 16.505 16.996 17.08 16.944 16.775 16.585 16.386 16.168 15.91 15.627 15.395 15.19 14.976 14.747 14.537 14.376 14.201 14.037 13.905 13.758 13.598 13.458 13.296 13.133 13.007 12.873 12.742 12.605 12.445 12.324 12.205 12.018 11.894 11.778 11.705 11.545 11.403 11.237 11.152 10.954 10.875 10.778 10.68 10.457 10.332 10.196 10.052 9.894 9.698 9.485 8.664 -8 ,17010 ,KEBNE ,16836549,Sun Dec 5 16:34:46 CET,Sun Dec 5 18:19:17 CET,0.0 0.522 0.783 0.997 1.147 1.29 1.434 1.559 1.767 1.866 1.961 2.011 2.231 2.319 2.483 2.642 2.8 2.877 3.022 3.173 3.398 3.532 3.657 3.842 4.022 4.196 4.36 4.524 4.747 4.949 5.139 5.384 5.631 5.858 6.11 6.403 6.684 6.973 7.305 7.704 8.144 8.634 9.183 9.734 10.39 11.108 11.959 13.001 14.226 15.572 16.921 17.854 18.274 18.363 18.329 18.217 18.028 17.801 17.574 17.326 17.125 16.959 16.788 16.621 16.455 16.285 16.102 15.954 15.817 15.656 15.481 15.338 15.195 15.038 14.909 14.781 14.651 14.522 14.374 14.256 14.138 13.96 13.838 13.722 13.669 13.558 13.432 13.289 13.207 13.009 12.956 12.88 12.784 12.553 12.447 12.344 12.234 12.065 11.846 11.594 10.963 -9 ,13089 ,KEBNE ,16836550,Sun Dec 5 16:34:46 CET,Sun Dec 5 18:19:41 CET,0.0 0.697 0.979 1.175 1.338 1.501 1.641 1.758 1.966 2.076 2.187 2.261 2.495 2.599 2.77 2.939 3.102 3.178 3.343 3.5 3.701 3.831 3.959 4.145 4.337 4.528 4.71 4.876 5.079 5.281 5.491 5.739 5.966 6.201 6.476 6.772 7.057 7.37 7.744 8.155 8.589 9.099 9.671 10.229 10.898 11.631 12.459 13.381 14.506 15.792 17.162 18.194 18.681 18.854 18.808 18.65 18.405 18.158 17.923 17.677 17.449 17.246 17.066 16.884 16.702 16.514 16.331 16.165 15.992 15.824 15.657 15.5 15.332 15.171 15.053 14.931 14.803 14.659 14.496 14.385 14.274 14.109 14.004 13.883 13.817 13.672 13.525 13.379 13.307 13.114 13.061 12.969 12.866 12.65 12.538 12.406 12.267 12.103 11.898 11.646 10.864 -10 ,5230 ,KEBNE ,16836551,Sun Dec 5 16:34:46 CET,Sun Dec 5 18:20:18 CET,0.0 0.729 0.951 1.123 1.275 1.407 1.55 1.682 1.9 2.015 2.123 2.184 2.403 2.492 2.674 2.865 3.037 3.113 3.265 3.41 3.608 3.745 3.884 4.076 4.27 4.455 4.629 4.809 5.048 5.274 5.467 5.701 5.948 6.188 6.448 6.707 6.959 7.244 7.555 7.887 8.227 8.612 9.085 9.563 10.134 10.82 11.65 12.617 13.737 15.073 16.646 17.358 17.383 17.371 17.341 17.23 17.055 16.846 16.645 16.421 16.216 16.022 15.82 15.631 15.44 15.238 15.044 14.887 14.731 14.554 14.375 14.232 14.088 13.926 13.788 13.665 13.548 13.415 13.274 13.174 13.061 12.888 12.77 12.651 12.582 12.437 12.312 12.181 12.106 11.902 11.848 11.754 11.646 11.431 11.316 11.177 11.014 10.817 10.607 10.397 9.527 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8a.txt deleted file mode 100644 index 94ee620c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14068 ,TETRA ,17699472,Sat Dec 4 17:59:53 CET,Sat Dec 4 19:58:44 CET,0.0 0.63 0.917 1.145 1.341 1.505 1.641 1.769 2.019 2.135 2.236 2.348 2.547 2.641 2.803 2.962 3.121 3.196 3.33 3.457 3.648 3.782 3.925 4.151 4.367 4.567 4.754 4.942 5.191 5.408 5.607 5.844 6.09 6.341 6.618 6.937 7.253 7.596 7.961 8.363 8.793 9.267 9.821 10.38 11.044 11.794 12.645 13.625 14.745 15.999 17.546 18.749 19.351 19.644 19.777 19.841 19.797 19.722 19.641 19.537 19.436 19.319 19.188 19.068 18.965 18.864 18.747 18.645 18.556 18.45 18.319 18.2 18.084 17.976 17.888 17.796 17.705 17.599 17.487 17.414 17.337 17.206 17.105 17.017 16.977 16.881 16.776 16.675 16.628 16.49 16.438 16.37 16.292 16.099 15.983 15.853 15.715 15.567 15.412 15.266 15.091 -2 ,16646 ,TETRA ,17699473,Sat Dec 4 17:59:51 CET,Sat Dec 4 20:02:57 CET,0.0 0.562 0.818 1.034 1.221 1.403 1.569 1.704 1.952 2.073 2.192 2.337 2.54 2.656 2.868 3.058 3.244 3.336 3.515 3.681 3.929 4.082 4.229 4.438 4.627 4.816 5.009 5.195 5.42 5.644 5.866 6.139 6.415 6.686 7.005 7.347 7.679 8.059 8.456 8.87 9.297 9.788 10.365 10.926 11.584 12.312 13.104 14.0 15.048 16.262 17.654 18.666 19.122 19.348 19.492 19.557 19.549 19.491 19.419 19.336 19.217 19.079 18.95 18.831 18.705 18.578 18.433 18.295 18.178 18.062 17.959 17.878 17.781 17.674 17.595 17.507 17.412 17.315 17.229 17.169 17.096 16.977 16.894 16.805 16.755 16.663 16.562 16.457 16.406 16.27 16.244 16.182 16.12 15.978 15.887 15.795 15.698 15.571 15.417 15.202 14.967 -3 ,4229 ,TETRA ,17699474,Sat Dec 4 17:59:50 CET,Sat Dec 4 19:55:37 CET,0.0 0.665 0.936 1.202 1.441 1.612 1.769 1.921 2.204 2.331 2.452 2.587 2.79 2.887 3.077 3.261 3.447 3.536 3.708 3.876 4.119 4.276 4.442 4.685 4.89 5.077 5.254 5.419 5.627 5.827 6.019 6.263 6.513 6.751 7.026 7.334 7.628 7.956 8.315 8.704 9.104 9.552 10.091 10.619 11.229 11.912 12.692 13.579 14.594 15.723 16.994 17.893 18.298 18.433 18.457 18.451 18.417 18.322 18.216 18.095 17.962 17.837 17.728 17.62 17.496 17.38 17.256 17.142 17.042 16.936 16.805 16.686 16.578 16.473 16.391 16.305 16.209 16.116 16.002 15.909 15.818 15.684 15.591 15.49 15.436 15.313 15.185 15.045 14.979 14.824 14.736 14.629 14.518 14.282 14.152 14.014 13.881 13.744 13.568 13.308 12.727 -4 ,7570 ,TETRA ,17699475,Sat Dec 4 17:59:51 CET,Sat Dec 4 19:58:36 CET,0.0 0.565 0.882 1.131 1.338 1.516 1.697 1.858 2.127 2.253 2.376 2.528 2.72 2.819 3.029 3.227 3.41 3.493 3.649 3.791 3.989 4.122 4.253 4.449 4.648 4.849 5.043 5.231 5.464 5.677 5.889 6.158 6.41 6.648 6.929 7.26 7.59 7.945 8.334 8.736 9.156 9.64 10.177 10.73 11.388 12.101 12.937 13.841 14.837 15.952 17.191 18.129 18.568 18.745 18.807 18.819 18.768 18.645 18.521 18.4 18.281 18.181 18.095 18.012 17.925 17.828 17.712 17.595 17.483 17.37 17.263 17.171 17.066 16.934 16.839 16.764 16.68 16.578 16.46 16.381 16.308 16.207 16.132 16.051 16.009 15.905 15.802 15.695 15.632 15.484 15.435 15.366 15.298 15.144 15.046 14.953 14.856 14.735 14.603 14.467 14.131 -5 ,5937 ,TETRA ,17699476,Sat Dec 4 17:59:51 CET,Sat Dec 4 19:58:07 CET,0.0 0.338 0.531 0.678 0.822 0.953 1.095 1.237 1.473 1.583 1.689 1.789 1.97 2.053 2.212 2.374 2.531 2.61 2.765 2.912 3.123 3.252 3.383 3.588 3.792 3.983 4.166 4.357 4.601 4.827 5.059 5.354 5.63 5.876 6.174 6.537 6.885 7.257 7.658 8.06 8.452 8.9 9.436 9.99 10.624 11.317 12.132 13.039 14.053 15.218 16.534 17.471 17.914 18.136 18.229 18.222 18.171 18.106 18.049 17.941 17.806 17.698 17.595 17.492 17.391 17.281 17.152 17.04 16.948 16.839 16.718 16.621 16.516 16.399 16.303 16.204 16.113 16.017 15.907 15.83 15.745 15.612 15.529 15.432 15.382 15.291 15.186 15.075 15.019 14.881 14.821 14.749 14.668 14.484 14.402 14.301 14.2 14.112 14.006 13.874 13.532 -6 ,8067 ,TETRA ,17699477,Sat Dec 4 17:59:51 CET,Sat Dec 4 20:00:39 CET,0.0 0.635 0.93 1.169 1.372 1.57 1.769 1.935 2.201 2.329 2.469 2.626 2.824 2.935 3.139 3.353 3.554 3.643 3.829 4.002 4.243 4.409 4.568 4.783 5.0 5.226 5.434 5.624 5.864 6.103 6.341 6.637 6.937 7.217 7.533 7.887 8.21 8.584 9.022 9.463 9.919 10.447 11.033 11.582 12.234 12.964 13.797 14.77 15.883 17.127 18.475 19.432 19.906 20.12 20.208 20.221 20.15 20.01 19.87 19.75 19.622 19.485 19.367 19.248 19.111 18.975 18.839 18.716 18.609 18.506 18.397 18.304 18.219 18.12 18.022 17.916 17.807 17.689 17.562 17.478 17.396 17.276 17.189 17.096 17.056 16.967 16.85 16.714 16.642 16.494 16.439 16.372 16.297 16.108 16.003 15.906 15.799 15.658 15.531 15.391 14.833 -7 ,26580 ,TETRA ,17699478,Sat Dec 4 17:59:53 CET,Sat Dec 4 20:00:18 CET,0.0 0.416 0.588 0.767 0.929 1.07 1.208 1.349 1.6 1.706 1.799 1.879 2.053 2.145 2.331 2.503 2.658 2.731 2.885 3.044 3.253 3.387 3.526 3.72 3.908 4.087 4.258 4.428 4.652 4.883 5.104 5.349 5.584 5.82 6.103 6.418 6.725 7.065 7.425 7.814 8.24 8.743 9.304 9.85 10.493 11.218 12.06 12.969 14.014 15.249 16.677 17.666 18.128 18.366 18.469 18.475 18.432 18.355 18.243 18.119 18.009 17.899 17.783 17.671 17.572 17.473 17.364 17.254 17.147 17.038 16.917 16.815 16.706 16.598 16.522 16.44 16.348 16.232 16.112 16.033 15.947 15.822 15.735 15.636 15.583 15.465 15.337 15.219 15.15 14.984 14.892 14.809 14.725 14.568 14.466 14.351 14.24 14.135 14.048 13.918 13.665 -8 ,8423 ,TETRA ,17699479,Sat Dec 4 17:59:51 CET,Sat Dec 4 19:57:05 CET,0.0 0.405 0.598 0.79 0.943 1.076 1.218 1.354 1.577 1.671 1.778 1.916 2.106 2.201 2.389 2.562 2.735 2.821 2.971 3.112 3.325 3.465 3.6 3.79 3.968 4.147 4.328 4.506 4.728 4.949 5.185 5.486 5.752 5.988 6.273 6.597 6.928 7.281 7.651 8.047 8.456 8.911 9.428 9.945 10.567 11.26 12.074 12.97 13.992 15.187 16.581 17.71 18.261 18.494 18.578 18.562 18.502 18.429 18.334 18.2 18.073 17.957 17.838 17.731 17.617 17.51 17.41 17.309 17.211 17.108 16.99 16.89 16.789 16.669 16.574 16.479 16.378 16.27 16.163 16.096 16.022 15.883 15.784 15.688 15.631 15.505 15.382 15.26 15.202 15.053 14.99 14.923 14.853 14.679 14.584 14.48 14.365 14.196 13.991 13.788 13.449 -9 ,7162 ,TETRA ,17699480,Sat Dec 4 17:59:51 CET,Sat Dec 4 19:59:16 CET,0.0 0.772 1.099 1.283 1.438 1.592 1.734 1.864 2.108 2.215 2.315 2.427 2.619 2.728 2.933 3.108 3.272 3.354 3.508 3.653 3.887 4.046 4.203 4.418 4.61 4.81 5.017 5.211 5.449 5.674 5.887 6.152 6.405 6.643 6.929 7.266 7.588 7.92 8.292 8.711 9.141 9.624 10.19 10.744 11.399 12.18 13.03 13.916 14.958 16.139 17.397 18.287 18.706 18.892 18.95 18.896 18.819 18.759 18.676 18.574 18.464 18.346 18.234 18.116 18.009 17.898 17.754 17.631 17.518 17.391 17.26 17.141 17.005 16.879 16.787 16.673 16.543 16.405 16.259 16.147 16.033 15.878 15.762 15.629 15.564 15.438 15.303 15.155 15.075 14.918 14.823 14.709 14.592 14.344 14.228 14.107 13.957 13.782 13.554 13.31 12.714 -10 ,12573 ,TETRA ,17699481,Sat Dec 4 17:59:52 CET,Sat Dec 4 19:51:28 CET,0.0 0.405 0.701 0.91 1.078 1.232 1.381 1.534 1.792 1.899 2.007 2.142 2.346 2.456 2.676 2.894 3.086 3.167 3.32 3.474 3.707 3.864 4.025 4.27 4.497 4.712 4.923 5.121 5.368 5.601 5.839 6.129 6.4 6.658 6.947 7.286 7.619 7.974 8.348 8.727 9.111 9.558 10.075 10.612 11.255 11.932 12.684 13.52 14.454 15.49 16.701 17.506 17.898 18.13 18.172 18.154 18.118 18.064 17.998 17.914 17.833 17.744 17.64 17.527 17.416 17.311 17.2 17.084 16.969 16.848 16.733 16.629 16.518 16.421 16.35 16.275 16.187 16.086 15.984 15.914 15.844 15.743 15.66 15.573 15.532 15.429 15.308 15.166 15.088 14.925 14.868 14.801 14.718 14.509 14.413 14.319 14.207 14.081 13.925 13.784 13.574 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8c.txt deleted file mode 100644 index 9ec87026..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8c.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,81 ,KEBNE ,16836552,Sun Dec 5 16:34:46 CET,Sun Dec 5 18:16:48 CET,0.0 0.542 0.74 0.917 1.043 1.152 1.26 1.357 1.535 1.613 1.681 1.71 1.861 1.921 2.022 2.112 2.203 2.246 2.346 2.438 2.557 2.631 2.696 2.798 2.897 2.981 3.058 3.135 3.242 3.356 3.46 3.567 3.674 3.772 3.867 3.972 4.073 4.181 4.295 4.416 4.548 4.657 4.731 4.808 4.902 4.939 4.878 4.775 4.613 4.108 2.855 1.067 -0.547 -1.924 -3.097 -4.073 -4.983 -5.892 -6.591 -7.284 -7.953 -8.533 -9.079 -9.581 -10.054 -10.502 -10.941 -11.331 -11.686 -12.031 -12.379 -12.681 -12.987 -13.316 -13.562 -13.798 -14.053 -14.317 -14.594 -14.789 -14.981 -15.283 -15.493 -15.707 -15.81 -16.034 -16.284 -16.545 -16.681 -16.927 -17.096 -17.263 -17.427 -17.8 -18.008 -18.219 -18.451 -18.725 -19.076 -19.58 -21.265 -3 ,18708 ,KEBNE ,16836554,Sun Dec 5 16:34:46 CET,Sun Dec 5 18:17:38 CET,0.0 0.624 0.837 0.994 1.143 1.292 1.427 1.544 1.734 1.807 1.878 1.929 2.087 2.142 2.266 2.389 2.495 2.547 2.638 2.723 2.862 2.953 3.03 3.138 3.235 3.326 3.418 3.509 3.64 3.751 3.844 3.961 4.058 4.129 4.218 4.323 4.411 4.496 4.582 4.668 4.756 4.87 4.985 5.055 5.111 5.161 5.17 5.072 4.877 4.456 3.383 1.898 0.302 -1.223 -2.464 -3.639 -4.653 -5.531 -6.283 -7.03 -7.683 -8.259 -8.794 -9.284 -9.754 -10.178 -10.614 -11.013 -11.35 -11.689 -12.037 -12.322 -12.613 -12.905 -13.123 -13.362 -13.627 -13.909 -14.2 -14.391 -14.58 -14.886 -15.099 -15.314 -15.421 -15.638 -15.862 -16.084 -16.208 -16.476 -16.672 -16.829 -17.005 -17.354 -17.537 -17.759 -17.999 -18.284 -18.63 -19.064 -20.312 -4 ,17088 ,KEBNE ,16836555,Sun Dec 5 16:36:48 CET,Sun Dec 5 18:18:37 CET,0.0 0.951 1.19 1.368 1.511 1.64 1.753 1.847 2.014 2.091 2.163 2.201 2.356 2.414 2.512 2.61 2.707 2.756 2.857 2.937 3.038 3.103 3.165 3.26 3.338 3.412 3.478 3.546 3.644 3.739 3.832 3.938 4.047 4.147 4.254 4.371 4.453 4.513 4.586 4.694 4.825 4.939 5.038 5.124 5.203 5.296 5.418 5.481 5.348 4.817 3.767 2.4 1.019 -0.37 -1.728 -2.902 -3.805 -4.562 -5.227 -5.95 -6.589 -7.159 -7.699 -8.197 -8.651 -9.055 -9.484 -9.868 -10.171 -10.467 -10.794 -11.079 -11.359 -11.643 -11.884 -12.144 -12.402 -12.666 -12.934 -13.113 -13.308 -13.596 -13.788 -14.014 -14.126 -14.347 -14.571 -14.808 -14.943 -15.2 -15.36 -15.504 -15.655 -16.053 -16.276 -16.487 -16.714 -16.971 -17.295 -17.753 -19.32 -5 ,18160 ,KEBNE ,16836556,Sun Dec 5 16:36:48 CET,Sun Dec 5 18:19:53 CET,0.0 0.706 0.891 1.053 1.178 1.284 1.395 1.497 1.66 1.722 1.791 1.851 2.005 2.069 2.2 2.308 2.408 2.463 2.564 2.641 2.749 2.823 2.899 3.021 3.132 3.232 3.332 3.423 3.535 3.641 3.736 3.833 3.919 4.009 4.112 4.23 4.354 4.504 4.666 4.82 4.975 5.122 5.267 5.421 5.582 5.728 5.849 5.853 5.752 5.505 4.708 3.384 1.906 0.547 -0.56 -1.566 -2.455 -3.276 -3.941 -4.587 -5.2 -5.745 -6.228 -6.696 -7.16 -7.583 -7.999 -8.353 -8.66 -8.99 -9.334 -9.627 -9.929 -10.228 -10.453 -10.689 -10.933 -11.201 -11.465 -11.635 -11.821 -12.115 -12.326 -12.532 -12.639 -12.866 -13.104 -13.336 -13.455 -13.704 -13.884 -14.031 -14.185 -14.531 -14.726 -14.94 -15.177 -15.436 -15.751 -16.18 -17.475 -6 ,16694 ,KEBNE ,16836557,Sun Dec 5 16:36:48 CET,Sun Dec 5 18:20:04 CET,0.0 0.636 0.85 1.038 1.197 1.306 1.398 1.486 1.649 1.72 1.786 1.837 1.993 2.044 2.151 2.254 2.357 2.407 2.492 2.581 2.709 2.794 2.873 2.984 3.088 3.178 3.255 3.345 3.489 3.611 3.72 3.834 3.913 4.008 4.137 4.268 4.394 4.503 4.58 4.664 4.775 4.904 5.024 5.143 5.283 5.409 5.456 5.335 5.044 4.481 3.238 1.564 0.025 -1.329 -2.422 -3.314 -4.193 -5.143 -5.938 -6.719 -7.369 -7.92 -8.462 -8.938 -9.356 -9.751 -10.175 -10.568 -10.911 -11.261 -11.618 -11.91 -12.218 -12.535 -12.761 -12.995 -13.237 -13.484 -13.741 -13.916 -14.105 -14.407 -14.604 -14.811 -14.92 -15.131 -15.342 -15.569 -15.696 -15.962 -16.139 -16.274 -16.419 -16.766 -16.969 -17.175 -17.39 -17.64 -17.949 -18.379 -19.842 -7 ,8003 ,KEBNE ,16836558,Sun Dec 5 16:55:06 CET,Sun Dec 5 18:38:00 CET,0.0 0.911 1.178 1.38 1.532 1.655 1.748 1.846 2.038 2.116 2.187 2.226 2.38 2.442 2.553 2.648 2.732 2.776 2.867 2.965 3.1 3.171 3.246 3.343 3.433 3.526 3.611 3.687 3.778 3.876 3.969 4.066 4.162 4.261 4.362 4.458 4.531 4.61 4.671 4.696 4.735 4.793 4.839 4.845 4.868 4.954 4.999 4.95 4.841 4.529 3.616 1.981 0.523 -0.743 -1.9 -2.918 -3.843 -4.718 -5.479 -6.216 -6.882 -7.486 -8.049 -8.578 -9.057 -9.484 -9.925 -10.334 -10.682 -11.032 -11.387 -11.671 -11.976 -12.283 -12.501 -12.741 -13.01 -13.273 -13.543 -13.735 -13.921 -14.205 -14.397 -14.6 -14.716 -14.962 -15.196 -15.424 -15.549 -15.797 -15.983 -16.134 -16.293 -16.626 -16.806 -17.044 -17.314 -17.559 -17.804 -18.177 -20.05 -8 ,13684 ,KEBNE ,16836559,Sun Dec 5 16:55:06 CET,Sun Dec 5 18:36:40 CET,0.0 0.801 1.105 1.276 1.428 1.554 1.646 1.734 1.92 2.017 2.106 2.157 2.313 2.377 2.504 2.621 2.732 2.785 2.881 2.973 3.1 3.171 3.241 3.36 3.482 3.6 3.712 3.808 3.911 4.003 4.094 4.204 4.299 4.374 4.452 4.544 4.625 4.746 4.905 5.045 5.201 5.368 5.531 5.67 5.823 5.925 5.963 5.951 5.748 5.123 3.81 2.075 0.479 -0.952 -2.108 -3.017 -3.848 -4.626 -5.263 -5.896 -6.446 -6.962 -7.47 -7.931 -8.346 -8.735 -9.141 -9.487 -9.772 -10.082 -10.422 -10.703 -10.982 -11.275 -11.503 -11.741 -11.994 -12.245 -12.498 -12.678 -12.875 -13.189 -13.399 -13.616 -13.723 -13.928 -14.142 -14.385 -14.511 -14.755 -14.906 -15.068 -15.235 -15.574 -15.793 -16.04 -16.294 -16.568 -16.916 -17.407 -19.268 -10 ,13084 ,KEBNE ,16836561,Sun Dec 5 17:06:20 CET,Sun Dec 5 18:42:55 CET,0.0 0.657 0.838 0.998 1.149 1.272 1.381 1.486 1.671 1.749 1.833 1.888 2.035 2.103 2.222 2.314 2.411 2.468 2.574 2.663 2.785 2.872 2.953 3.065 3.178 3.277 3.369 3.457 3.563 3.669 3.776 3.899 4.018 4.115 4.208 4.294 4.356 4.425 4.502 4.58 4.641 4.671 4.707 4.735 4.717 4.646 4.564 4.44 4.119 3.45 2.127 0.376 -1.131 -2.399 -3.463 -4.502 -5.476 -6.348 -7.08 -7.788 -8.421 -8.964 -9.45 -9.899 -10.307 -10.681 -11.08 -11.459 -11.793 -12.103 -12.444 -12.755 -13.049 -13.34 -13.578 -13.83 -14.091 -14.355 -14.618 -14.803 -14.99 -15.289 -15.502 -15.724 -15.833 -16.051 -16.288 -16.534 -16.672 -16.929 -17.116 -17.275 -17.434 -17.762 -17.97 -18.207 -18.429 -18.695 -19.004 -19.382 -20.82 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8b.txt deleted file mode 100644 index e9eed156..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14652 ,TETRA ,17699492,Sat Dec 4 17:59:58 CET,Sat Dec 4 19:42:08 CET,0.0 0.642 0.946 1.18 1.392 1.572 1.734 1.889 2.153 2.273 2.4 2.553 2.78 2.898 3.13 3.348 3.555 3.662 3.855 4.031 4.279 4.446 4.615 4.858 5.095 5.328 5.558 5.775 6.078 6.363 6.624 6.952 7.274 7.589 7.965 8.39 8.795 9.241 9.738 10.273 10.833 11.489 12.261 13.038 13.972 15.061 16.361 17.876 19.696 21.841 24.453 26.734 28.189 29.085 29.577 29.912 30.139 30.298 30.4 30.452 30.488 30.51 30.521 30.521 30.498 30.449 30.387 30.341 30.297 30.248 30.188 30.12 30.051 29.988 29.94 29.886 29.824 29.767 29.704 29.648 29.59 29.514 29.473 29.42 29.383 29.295 29.21 29.126 29.081 28.944 28.915 28.856 28.784 28.625 28.545 28.465 28.375 28.276 28.122 27.915 27.435 -2 ,23159 ,TETRA ,17699493,Sat Dec 4 17:59:53 CET,Sat Dec 4 20:01:27 CET,0.0 0.369 0.543 0.725 0.908 1.051 1.181 1.303 1.55 1.67 1.773 1.873 2.079 2.188 2.395 2.583 2.779 2.876 3.059 3.244 3.519 3.689 3.864 4.127 4.364 4.582 4.795 5.013 5.311 5.606 5.891 6.221 6.552 6.867 7.209 7.599 7.994 8.439 8.914 9.42 9.968 10.591 11.329 12.087 12.955 13.946 15.155 16.547 18.169 20.119 22.537 24.569 25.751 26.527 27.05 27.404 27.643 27.787 27.871 27.948 27.987 28.005 28.01 27.989 27.966 27.95 27.911 27.853 27.799 27.735 27.674 27.625 27.563 27.5 27.455 27.397 27.319 27.228 27.139 27.09 27.032 26.933 26.87 26.798 26.757 26.674 26.578 26.459 26.389 26.243 26.19 26.112 26.031 25.861 25.752 25.643 25.54 25.415 25.262 25.101 24.624 -3 ,27180 ,TETRA ,17699494,Sat Dec 4 17:59:56 CET,Sat Dec 4 20:02:26 CET,0.0 0.572 0.798 0.985 1.162 1.33 1.481 1.623 1.882 1.997 2.109 2.213 2.406 2.509 2.718 2.917 3.105 3.196 3.369 3.552 3.843 4.026 4.193 4.424 4.657 4.891 5.129 5.363 5.646 5.92 6.206 6.554 6.882 7.211 7.592 8.014 8.425 8.887 9.388 9.92 10.491 11.145 11.936 12.746 13.682 14.742 15.985 17.392 19.058 21.048 23.534 25.7 26.974 27.76 28.304 28.661 28.861 28.998 29.086 29.148 29.206 29.243 29.255 29.252 29.242 29.24 29.23 29.203 29.178 29.159 29.136 29.107 29.065 29.001 28.94 28.885 28.831 28.76 28.684 28.639 28.593 28.509 28.441 28.372 28.339 28.252 28.15 28.054 28.004 27.875 27.831 27.771 27.716 27.587 27.504 27.422 27.332 27.225 27.14 27.044 26.735 -4 ,29983 ,TETRA ,17699495,Sat Dec 4 17:59:55 CET,Sat Dec 4 19:57:03 CET,0.0 0.538 0.847 1.103 1.302 1.481 1.652 1.818 2.133 2.272 2.403 2.562 2.789 2.914 3.142 3.366 3.602 3.718 3.925 4.12 4.418 4.61 4.782 5.02 5.264 5.49 5.697 5.908 6.171 6.427 6.689 7.01 7.329 7.633 7.969 8.365 8.764 9.198 9.662 10.169 10.72 11.356 12.102 12.85 13.78 14.843 16.033 17.46 19.153 21.115 23.552 25.635 26.898 27.693 28.221 28.619 28.906 29.112 29.237 29.315 29.371 29.412 29.429 29.425 29.424 29.411 29.358 29.296 29.255 29.213 29.159 29.113 29.063 29.006 28.959 28.905 28.843 28.786 28.718 28.667 28.61 28.515 28.453 28.386 28.351 28.278 28.203 28.116 28.062 27.93 27.885 27.822 27.754 27.584 27.488 27.377 27.263 27.149 27.016 26.83 26.258 -5 ,385 ,TETRA ,17699496,Sat Dec 4 17:59:54 CET,Sat Dec 4 19:45:35 CET,0.0 0.392 0.66 0.889 1.056 1.206 1.371 1.515 1.776 1.915 2.044 2.171 2.386 2.505 2.734 2.951 3.154 3.25 3.44 3.628 3.887 4.037 4.18 4.412 4.651 4.887 5.124 5.341 5.611 5.88 6.144 6.457 6.764 7.071 7.423 7.822 8.216 8.66 9.14 9.648 10.208 10.836 11.584 12.349 13.221 14.21 15.391 16.774 18.453 20.463 22.947 25.018 26.216 27.021 27.545 27.89 28.144 28.331 28.446 28.524 28.564 28.585 28.59 28.58 28.559 28.529 28.489 28.442 28.393 28.333 28.264 28.21 28.162 28.101 28.049 27.991 27.919 27.84 27.764 27.714 27.661 27.569 27.497 27.418 27.377 27.304 27.231 27.147 27.106 26.984 26.979 26.935 26.871 26.714 26.643 26.576 26.488 26.38 26.251 26.111 25.794 -6 ,17678 ,TETRA ,17699497,Sat Dec 4 17:59:54 CET,Sat Dec 4 20:03:30 CET,0.0 0.607 0.917 1.157 1.372 1.565 1.736 1.879 2.116 2.229 2.353 2.489 2.698 2.81 3.021 3.21 3.388 3.478 3.667 3.867 4.143 4.309 4.468 4.702 4.93 5.153 5.372 5.59 5.895 6.195 6.473 6.799 7.108 7.404 7.749 8.15 8.544 8.977 9.449 9.965 10.527 11.162 11.891 12.655 13.585 14.641 15.882 17.251 18.912 20.965 23.323 25.253 26.424 27.23 27.799 28.179 28.44 28.618 28.707 28.785 28.838 28.867 28.885 28.886 28.847 28.786 28.723 28.675 28.644 28.602 28.529 28.465 28.397 28.315 28.247 28.178 28.104 28.032 27.962 27.912 27.856 27.755 27.691 27.624 27.586 27.504 27.421 27.344 27.291 27.139 27.083 27.018 26.946 26.782 26.713 26.609 26.483 26.375 26.236 26.076 25.739 -7 ,8581 ,TETRA ,17699498,Sat Dec 4 17:59:57 CET,Sat Dec 4 20:03:37 CET,0.0 0.441 0.737 0.964 1.146 1.309 1.481 1.644 1.926 2.069 2.209 2.357 2.589 2.714 2.953 3.177 3.402 3.508 3.704 3.906 4.216 4.412 4.591 4.855 5.108 5.343 5.582 5.829 6.149 6.451 6.746 7.099 7.434 7.758 8.143 8.586 9.009 9.463 9.976 10.559 11.178 11.864 12.667 13.475 14.387 15.402 16.613 17.995 19.66 21.68 24.068 26.1 27.339 28.173 28.714 29.07 29.321 29.502 29.644 29.762 29.833 29.869 29.89 29.903 29.892 29.868 29.839 29.806 29.769 29.715 29.659 29.621 29.584 29.536 29.482 29.424 29.37 29.3 29.215 29.154 29.097 29.019 28.958 28.883 28.834 28.734 28.649 28.564 28.522 28.391 28.342 28.275 28.212 28.113 28.065 27.982 27.873 27.745 27.62 27.489 27.0 -8 ,22550 ,TETRA ,17699499,Sat Dec 4 17:59:54 CET,Sat Dec 4 20:01:50 CET,0.0 0.496 0.743 0.949 1.112 1.27 1.414 1.549 1.81 1.926 2.04 2.177 2.392 2.503 2.727 2.941 3.146 3.249 3.452 3.647 3.922 4.107 4.299 4.569 4.822 5.091 5.358 5.601 5.91 6.218 6.531 6.9 7.253 7.603 7.996 8.426 8.834 9.299 9.804 10.326 10.877 11.508 12.262 13.042 13.952 14.975 16.172 17.551 19.226 21.256 23.735 25.785 26.951 27.739 28.297 28.661 28.879 29.028 29.133 29.218 29.273 29.3 29.305 29.297 29.28 29.252 29.217 29.181 29.145 29.089 29.005 28.941 28.882 28.824 28.769 28.7 28.629 28.546 28.457 28.395 28.329 28.222 28.141 28.037 27.989 27.907 27.815 27.713 27.657 27.526 27.491 27.419 27.355 27.186 27.061 26.935 26.816 26.665 26.495 26.3 25.911 -9 ,27926 ,TETRA ,17699500,Sat Dec 4 18:02:47 CET,Sat Dec 4 19:55:38 CET,0.0 0.419 0.659 0.837 1.029 1.223 1.391 1.537 1.841 1.985 2.121 2.294 2.508 2.623 2.857 3.076 3.296 3.4 3.595 3.788 4.065 4.248 4.438 4.716 4.977 5.22 5.457 5.671 5.939 6.211 6.465 6.785 7.104 7.398 7.741 8.13 8.502 8.93 9.425 9.971 10.556 11.225 11.982 12.718 13.622 14.69 15.921 17.325 19.003 20.994 23.497 25.653 26.953 27.755 28.244 28.577 28.81 28.974 29.1 29.19 29.212 29.225 29.227 29.205 29.183 29.16 29.115 29.055 29.007 28.955 28.894 28.839 28.771 28.689 28.621 28.558 28.497 28.43 28.361 28.307 28.244 28.154 28.093 28.022 27.988 27.934 27.874 27.791 27.742 27.615 27.586 27.529 27.46 27.31 27.241 27.162 27.071 26.952 26.829 26.661 26.142 -10 ,2018 ,TETRA ,17699501,Sat Dec 4 18:02:47 CET,Sat Dec 4 20:02:18 CET,0.0 0.595 0.935 1.247 1.495 1.675 1.849 2.03 2.364 2.502 2.628 2.773 2.987 3.104 3.333 3.534 3.721 3.816 4.005 4.184 4.452 4.636 4.818 5.09 5.356 5.605 5.841 6.073 6.37 6.666 6.963 7.323 7.681 8.021 8.4 8.827 9.259 9.749 10.247 10.749 11.318 12.024 12.83 13.607 14.526 15.576 16.811 18.23 19.89 21.811 24.201 26.192 27.399 28.22 28.778 29.179 29.49 29.719 29.873 29.993 30.062 30.127 30.17 30.185 30.187 30.174 30.16 30.135 30.091 30.046 30.01 29.977 29.934 29.884 29.844 29.8 29.75 29.685 29.602 29.543 29.479 29.361 29.279 29.199 29.157 29.062 28.95 28.823 28.756 28.622 28.586 28.511 28.418 28.221 28.116 28.003 27.85 27.647 27.393 27.078 26.573 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8d.txt deleted file mode 100644 index 8a70e19d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12147 ,TETRA ,17699502,Sat Dec 4 18:02:47 CET,Sat Dec 4 19:46:42 CET,0.0 0.325 0.415 0.495 0.553 0.604 0.662 0.714 0.799 0.841 0.888 0.868 1.009 1.043 1.118 1.199 1.274 1.305 1.357 1.415 1.49 1.528 1.568 1.627 1.69 1.769 1.835 1.883 1.953 2.016 2.071 2.141 2.192 2.238 2.303 2.372 2.433 2.487 2.539 2.584 2.624 2.662 2.664 2.636 2.595 2.5 2.31 2.041 1.623 0.912 -0.328 -1.869 -3.21 -4.366 -5.36 -6.254 -7.062 -7.802 -8.402 -8.984 -9.516 -10.023 -10.474 -10.871 -11.253 -11.606 -11.999 -12.338 -12.609 -12.901 -13.192 -13.422 -13.675 -13.956 -14.183 -14.411 -14.635 -14.878 -15.131 -15.297 -15.482 -15.778 -15.97 -16.177 -16.288 -16.527 -16.788 -17.043 -17.163 -17.413 -17.555 -17.699 -17.853 -18.172 -18.348 -18.537 -18.767 -19.031 -19.33 -19.744 -21.063 -2 ,18355 ,TETRA ,17699503,Sat Dec 4 18:02:47 CET,Sat Dec 4 20:01:33 CET,0.0 0.21 0.402 0.54 0.629 0.712 0.789 0.861 0.992 1.051 1.096 1.051 1.19 1.225 1.283 1.333 1.385 1.414 1.468 1.51 1.572 1.616 1.657 1.725 1.787 1.842 1.903 1.96 2.023 2.079 2.139 2.211 2.271 2.325 2.392 2.449 2.48 2.517 2.559 2.596 2.632 2.657 2.649 2.622 2.555 2.439 2.299 2.054 1.604 0.875 -0.41 -2.029 -3.394 -4.544 -5.522 -6.397 -7.192 -7.917 -8.505 -9.12 -9.669 -10.148 -10.605 -11.024 -11.405 -11.76 -12.126 -12.445 -12.724 -13.021 -13.341 -13.616 -13.903 -14.203 -14.43 -14.661 -14.915 -15.186 -15.46 -15.634 -15.814 -16.111 -16.315 -16.55 -16.665 -16.881 -17.117 -17.354 -17.478 -17.739 -17.902 -18.04 -18.194 -18.556 -18.756 -18.973 -19.197 -19.446 -19.746 -20.157 -21.277 -3 ,9070 ,TETRA ,17699504,Sat Dec 4 18:02:49 CET,Sat Dec 4 20:03:25 CET,0.0 0.237 0.395 0.501 0.577 0.656 0.73 0.789 0.89 0.937 0.987 0.97 1.105 1.138 1.209 1.286 1.359 1.389 1.445 1.505 1.585 1.628 1.671 1.733 1.784 1.842 1.896 1.94 1.998 2.052 2.094 2.151 2.205 2.248 2.3 2.352 2.391 2.437 2.471 2.488 2.511 2.526 2.506 2.461 2.399 2.304 2.164 1.904 1.428 0.637 -0.773 -2.492 -3.883 -5.042 -6.044 -6.942 -7.729 -8.456 -9.052 -9.64 -10.141 -10.588 -11.037 -11.45 -11.821 -12.154 -12.511 -12.853 -13.152 -13.443 -13.756 -14.04 -14.308 -14.579 -14.79 -15.005 -15.232 -15.476 -15.721 -15.892 -16.078 -16.34 -16.516 -16.71 -16.819 -17.046 -17.287 -17.551 -17.68 -17.923 -18.067 -18.218 -18.358 -18.67 -18.843 -19.021 -19.237 -19.473 -19.784 -20.192 -21.476 -4 ,11808 ,TETRA ,17699505,Sat Dec 4 18:04:43 CET,Sat Dec 4 20:00:19 CET,0.0 0.355 0.481 0.564 0.657 0.749 0.835 0.894 0.992 1.045 1.09 1.072 1.212 1.251 1.313 1.375 1.436 1.471 1.533 1.581 1.653 1.693 1.73 1.785 1.831 1.872 1.914 1.954 2.011 2.076 2.128 2.178 2.235 2.285 2.342 2.402 2.438 2.47 2.498 2.523 2.551 2.563 2.553 2.536 2.513 2.427 2.228 1.954 1.524 0.799 -0.597 -2.31 -3.689 -4.875 -5.865 -6.754 -7.545 -8.247 -8.855 -9.479 -10.024 -10.503 -10.928 -11.31 -11.681 -12.03 -12.39 -12.731 -13.022 -13.32 -13.637 -13.884 -14.138 -14.394 -14.583 -14.792 -15.021 -15.263 -15.52 -15.693 -15.87 -16.178 -16.388 -16.591 -16.703 -16.943 -17.195 -17.431 -17.543 -17.778 -17.896 -18.035 -18.188 -18.531 -18.711 -18.913 -19.145 -19.398 -19.687 -20.105 -21.258 -5 ,25833 ,TETRA ,17699506,Sat Dec 4 18:02:49 CET,Sat Dec 4 19:51:18 CET,0.0 0.126 0.218 0.295 0.366 0.429 0.48 0.531 0.639 0.691 0.737 0.711 0.855 0.891 0.951 1.01 1.07 1.103 1.175 1.244 1.321 1.366 1.408 1.463 1.52 1.579 1.633 1.688 1.761 1.821 1.874 1.94 2.006 2.058 2.109 2.16 2.201 2.253 2.297 2.333 2.341 2.334 2.333 2.305 2.231 2.094 1.879 1.558 1.088 0.333 -0.983 -2.578 -3.935 -5.147 -6.171 -7.078 -7.868 -8.552 -9.154 -9.774 -10.3 -10.777 -11.216 -11.61 -11.983 -12.322 -12.666 -12.981 -13.259 -13.545 -13.857 -14.129 -14.408 -14.71 -14.949 -15.18 -15.414 -15.654 -15.895 -16.077 -16.273 -16.574 -16.763 -16.963 -17.074 -17.294 -17.518 -17.754 -17.882 -18.143 -18.307 -18.465 -18.639 -19.011 -19.213 -19.414 -19.636 -19.917 -20.235 -20.624 -21.881 -6 ,604 ,TETRA ,17699507,Sat Dec 4 18:02:49 CET,Sat Dec 4 20:00:58 CET,0.0 0.19 0.303 0.386 0.448 0.505 0.574 0.651 0.766 0.822 0.878 0.855 0.991 1.026 1.111 1.182 1.237 1.263 1.317 1.37 1.457 1.518 1.571 1.636 1.695 1.756 1.812 1.873 1.956 2.029 2.087 2.143 2.201 2.257 2.313 2.372 2.418 2.464 2.502 2.523 2.538 2.54 2.537 2.517 2.479 2.397 2.229 1.963 1.516 0.777 -0.519 -2.139 -3.473 -4.616 -5.604 -6.504 -7.313 -8.021 -8.611 -9.26 -9.846 -10.334 -10.772 -11.193 -11.597 -11.969 -12.362 -12.714 -13.017 -13.32 -13.634 -13.899 -14.166 -14.434 -14.642 -14.855 -15.083 -15.313 -15.534 -15.691 -15.859 -16.129 -16.324 -16.53 -16.638 -16.873 -17.12 -17.38 -17.513 -17.772 -17.94 -18.104 -18.255 -18.575 -18.773 -19.025 -19.312 -19.593 -19.895 -20.303 -21.408 -7 ,21722 ,TETRA ,17699508,Sat Dec 4 18:02:49 CET,Sat Dec 4 20:03:43 CET,0.0 0.277 0.406 0.47 0.525 0.578 0.633 0.701 0.833 0.881 0.93 0.929 1.076 1.118 1.197 1.268 1.334 1.362 1.416 1.472 1.541 1.585 1.628 1.692 1.754 1.818 1.876 1.924 1.978 2.034 2.098 2.171 2.233 2.284 2.34 2.396 2.43 2.459 2.499 2.541 2.567 2.573 2.564 2.535 2.475 2.364 2.208 1.954 1.5 0.764 -0.551 -2.263 -3.718 -4.913 -5.895 -6.746 -7.503 -8.214 -8.858 -9.489 -10.005 -10.46 -10.9 -11.314 -11.695 -12.028 -12.388 -12.714 -12.994 -13.302 -13.614 -13.872 -14.149 -14.425 -14.641 -14.878 -15.134 -15.39 -15.637 -15.804 -15.971 -16.23 -16.417 -16.634 -16.745 -16.946 -17.161 -17.419 -17.558 -17.825 -17.989 -18.129 -18.286 -18.649 -18.844 -19.053 -19.293 -19.56 -19.892 -20.313 -21.572 -8 ,10287 ,TETRA ,17699509,Sat Dec 4 18:02:49 CET,Sat Dec 4 20:03:42 CET,0.0 0.326 0.431 0.533 0.646 0.74 0.813 0.868 0.964 1.024 1.084 1.083 1.224 1.264 1.336 1.399 1.455 1.482 1.539 1.598 1.686 1.74 1.781 1.833 1.889 1.947 2.0 2.045 2.099 2.15 2.194 2.248 2.297 2.342 2.399 2.449 2.49 2.539 2.585 2.613 2.623 2.636 2.662 2.652 2.579 2.476 2.318 2.064 1.661 0.961 -0.321 -1.954 -3.33 -4.533 -5.546 -6.451 -7.259 -7.974 -8.603 -9.251 -9.776 -10.239 -10.693 -11.115 -11.519 -11.859 -12.2 -12.524 -12.806 -13.09 -13.377 -13.635 -13.906 -14.189 -14.419 -14.647 -14.885 -15.135 -15.387 -15.561 -15.744 -16.028 -16.222 -16.42 -16.53 -16.77 -17.01 -17.273 -17.408 -17.661 -17.801 -17.944 -18.107 -18.433 -18.603 -18.802 -19.047 -19.34 -19.657 -20.113 -21.428 -9 ,3641 ,TETRA ,17699510,Sat Dec 4 18:02:49 CET,Sat Dec 4 20:02:48 CET,0.0 0.208 0.341 0.432 0.515 0.591 0.65 0.704 0.808 0.864 0.918 0.895 1.031 1.07 1.137 1.2 1.257 1.287 1.349 1.4 1.484 1.536 1.579 1.644 1.71 1.771 1.822 1.864 1.909 1.953 1.996 2.054 2.103 2.132 2.166 2.218 2.258 2.293 2.332 2.359 2.386 2.407 2.417 2.431 2.418 2.316 2.161 1.926 1.492 0.726 -0.647 -2.325 -3.777 -5.013 -6.029 -6.918 -7.695 -8.433 -9.058 -9.653 -10.158 -10.617 -11.067 -11.477 -11.866 -12.218 -12.587 -12.913 -13.196 -13.508 -13.839 -14.111 -14.381 -14.649 -14.859 -15.083 -15.337 -15.612 -15.876 -16.052 -16.228 -16.507 -16.714 -16.919 -17.017 -17.231 -17.48 -17.731 -17.858 -18.119 -18.296 -18.45 -18.599 -18.927 -19.109 -19.326 -19.573 -19.85 -20.193 -20.644 -22.107 -10 ,10953 ,TETRA ,17699511,Sat Dec 4 18:02:49 CET,Sat Dec 4 20:04:41 CET,0.0 0.12 0.254 0.357 0.418 0.495 0.567 0.63 0.75 0.813 0.872 0.868 1.012 1.05 1.116 1.184 1.261 1.293 1.34 1.391 1.453 1.502 1.556 1.628 1.693 1.746 1.801 1.851 1.913 1.982 2.056 2.132 2.186 2.229 2.279 2.327 2.375 2.432 2.481 2.532 2.572 2.586 2.589 2.592 2.593 2.541 2.382 2.099 1.66 0.948 -0.375 -2.03 -3.381 -4.484 -5.469 -6.379 -7.185 -7.93 -8.556 -9.138 -9.641 -10.082 -10.509 -10.958 -11.36 -11.708 -12.078 -12.403 -12.702 -13.021 -13.346 -13.614 -13.878 -14.138 -14.336 -14.551 -14.784 -15.037 -15.294 -15.457 -15.626 -15.895 -16.085 -16.272 -16.365 -16.572 -16.791 -17.031 -17.156 -17.404 -17.567 -17.723 -17.877 -18.224 -18.425 -18.634 -18.857 -19.127 -19.456 -19.898 -21.282 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8e.txt deleted file mode 100644 index 3f939ae6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23692 ,TETRA ,17699512,Sat Dec 4 18:02:49 CET,Sat Dec 4 20:08:48 CET,0.0 0.194 0.335 0.426 0.503 0.588 0.674 0.755 0.899 0.966 1.041 1.093 1.263 1.324 1.44 1.559 1.662 1.71 1.82 1.925 2.07 2.165 2.251 2.38 2.51 2.636 2.76 2.885 3.051 3.203 3.337 3.507 3.689 3.866 4.067 4.303 4.526 4.766 5.026 5.312 5.613 5.951 6.351 6.764 7.276 7.829 8.44 9.162 10.024 10.971 12.054 12.895 13.302 13.475 13.522 13.499 13.412 13.303 13.188 13.068 12.97 12.851 12.701 12.54 12.399 12.294 12.18 12.052 11.943 11.838 11.739 11.662 11.579 11.493 11.42 11.337 11.254 11.169 11.065 10.993 10.921 10.797 10.711 10.623 10.582 10.507 10.427 10.324 10.265 10.123 10.086 10.015 9.943 9.8 9.728 9.637 9.541 9.428 9.311 9.168 8.937 -2 ,10314 ,TETRA ,17699513,Sat Dec 4 18:02:49 CET,Sat Dec 4 19:51:44 CET,0.0 0.2 0.301 0.381 0.454 0.538 0.619 0.696 0.865 0.943 1.012 1.062 1.238 1.3 1.423 1.541 1.66 1.722 1.838 1.942 2.097 2.197 2.291 2.433 2.566 2.686 2.801 2.919 3.074 3.224 3.379 3.569 3.743 3.916 4.129 4.372 4.593 4.831 5.083 5.355 5.668 6.021 6.416 6.817 7.292 7.834 8.444 9.085 9.85 10.776 11.875 12.693 13.039 13.181 13.203 13.151 13.082 12.989 12.899 12.809 12.707 12.605 12.516 12.434 12.346 12.251 12.142 12.038 11.935 11.827 11.717 11.628 11.545 11.455 11.372 11.274 11.175 11.079 10.985 10.917 10.846 10.739 10.665 10.581 10.533 10.433 10.342 10.26 10.216 10.075 10.034 9.966 9.901 9.732 9.645 9.553 9.453 9.349 9.247 9.158 8.936 -3 ,21870 ,TETRA ,17699514,Sat Dec 4 18:02:50 CET,Sat Dec 4 19:45:31 CET,0.0 0.325 0.515 0.653 0.77 0.87 0.949 1.028 1.192 1.269 1.335 1.377 1.549 1.609 1.72 1.833 1.964 2.034 2.155 2.25 2.39 2.488 2.585 2.722 2.851 2.983 3.119 3.251 3.422 3.589 3.75 3.939 4.125 4.311 4.531 4.778 5.011 5.272 5.55 5.843 6.15 6.495 6.906 7.308 7.781 8.318 8.931 9.612 10.398 11.331 12.384 13.168 13.574 13.765 13.818 13.758 13.67 13.578 13.467 13.326 13.207 13.104 13.002 12.911 12.812 12.707 12.597 12.496 12.4 12.297 12.178 12.076 11.98 11.879 11.805 11.735 11.657 11.567 11.469 11.398 11.325 11.204 11.123 11.041 11.0 10.924 10.825 10.71 10.656 10.508 10.483 10.419 10.346 10.179 10.109 10.022 9.895 9.771 9.643 9.483 9.057 -4 ,1080 ,TETRA ,17699515,Sat Dec 4 18:02:50 CET,Sat Dec 4 19:52:18 CET,0.0 0.149 0.265 0.378 0.493 0.591 0.685 0.791 0.994 1.087 1.164 1.192 1.36 1.423 1.546 1.653 1.758 1.807 1.903 2.009 2.158 2.248 2.341 2.485 2.618 2.747 2.869 2.981 3.142 3.314 3.479 3.664 3.858 4.045 4.251 4.484 4.72 4.991 5.259 5.545 5.859 6.223 6.646 7.055 7.538 8.078 8.697 9.395 10.193 11.127 12.265 13.128 13.502 13.642 13.678 13.632 13.567 13.531 13.483 13.401 13.303 13.211 13.134 13.057 12.979 12.888 12.765 12.658 12.57 12.461 12.341 12.25 12.159 12.046 11.956 11.874 11.778 11.674 11.59 11.541 11.489 11.397 11.331 11.256 11.214 11.125 11.029 10.931 10.874 10.724 10.697 10.638 10.578 10.439 10.366 10.273 10.147 10.024 9.927 9.789 9.384 -5 ,30475 ,TETRA ,17699516,Sat Dec 4 18:02:50 CET,Sat Dec 4 19:51:45 CET,0.0 0.239 0.366 0.484 0.594 0.696 0.788 0.874 1.038 1.124 1.205 1.246 1.413 1.478 1.604 1.713 1.822 1.884 1.999 2.1 2.257 2.362 2.458 2.585 2.718 2.867 3.005 3.13 3.293 3.443 3.587 3.759 3.932 4.107 4.303 4.519 4.726 4.963 5.233 5.532 5.837 6.177 6.599 7.024 7.512 8.047 8.648 9.317 10.102 11.035 12.097 12.78 13.075 13.211 13.262 13.274 13.249 13.205 13.131 13.017 12.907 12.801 12.702 12.589 12.471 12.369 12.254 12.147 12.059 11.966 11.864 11.781 11.699 11.603 11.527 11.453 11.366 11.269 11.171 11.107 11.046 10.955 10.868 10.768 10.717 10.607 10.512 10.411 10.355 10.21 10.195 10.148 10.092 9.943 9.848 9.755 9.655 9.54 9.426 9.257 8.916 -6 ,21879 ,TETRA ,17699517,Sat Dec 4 18:02:51 CET,Sat Dec 4 19:51:26 CET,0.0 0.126 0.236 0.357 0.468 0.571 0.66 0.748 0.916 1.005 1.09 1.141 1.313 1.375 1.503 1.647 1.783 1.843 1.949 2.059 2.236 2.344 2.446 2.595 2.741 2.897 3.042 3.164 3.326 3.481 3.633 3.843 4.039 4.225 4.443 4.677 4.896 5.138 5.425 5.747 6.07 6.411 6.818 7.236 7.737 8.287 8.917 9.645 10.474 11.369 12.402 13.277 13.761 13.96 14.048 14.062 14.011 13.949 13.842 13.71 13.596 13.475 13.357 13.238 13.121 13.008 12.874 12.756 12.664 12.566 12.454 12.368 12.273 12.165 12.077 11.989 11.895 11.8 11.708 11.645 11.59 11.49 11.399 11.294 11.244 11.141 11.039 10.935 10.88 10.73 10.718 10.671 10.617 10.49 10.417 10.326 10.223 10.128 10.024 9.858 9.433 -7 ,25935 ,TETRA ,17699518,Sat Dec 4 18:02:51 CET,Sat Dec 4 19:58:11 CET,0.0 0.248 0.336 0.427 0.523 0.609 0.686 0.761 0.924 0.993 1.05 1.062 1.228 1.292 1.403 1.516 1.637 1.69 1.795 1.908 2.062 2.157 2.25 2.393 2.53 2.656 2.779 2.898 3.057 3.209 3.354 3.542 3.731 3.913 4.112 4.338 4.57 4.831 5.11 5.405 5.708 6.053 6.461 6.869 7.355 7.931 8.59 9.291 10.12 11.066 12.135 13.04 13.497 13.696 13.783 13.796 13.746 13.654 13.549 13.432 13.321 13.208 13.099 12.983 12.851 12.733 12.626 12.519 12.426 12.321 12.198 12.099 12.001 11.917 11.849 11.776 11.697 11.601 11.489 11.404 11.317 11.209 11.138 11.039 10.983 10.895 10.832 10.747 10.689 10.542 10.515 10.445 10.373 10.255 10.185 10.102 9.999 9.873 9.76 9.606 9.204 -8 ,9678 ,TETRA ,17699519,Sat Dec 4 18:02:50 CET,Sat Dec 4 20:03:58 CET,0.0 0.204 0.294 0.393 0.492 0.567 0.645 0.729 0.903 0.977 1.032 1.037 1.199 1.255 1.359 1.465 1.572 1.63 1.736 1.836 1.977 2.067 2.154 2.276 2.394 2.515 2.638 2.764 2.932 3.102 3.264 3.436 3.607 3.781 3.983 4.202 4.42 4.682 4.962 5.259 5.569 5.921 6.329 6.746 7.245 7.797 8.431 9.146 9.959 10.919 12.075 12.89 13.295 13.488 13.522 13.496 13.429 13.308 13.174 13.033 12.911 12.798 12.692 12.599 12.51 12.411 12.278 12.152 12.058 11.967 11.853 11.746 11.653 11.569 11.496 11.416 11.333 11.236 11.139 11.067 10.985 10.867 10.784 10.697 10.653 10.559 10.46 10.353 10.296 10.147 10.109 10.044 9.979 9.834 9.753 9.645 9.515 9.377 9.22 9.014 7.716 -9 ,7582 ,TETRA ,17699520,Sat Dec 4 18:02:52 CET,Sat Dec 4 20:03:44 CET,0.0 0.106 0.192 0.274 0.356 0.424 0.5 0.579 0.723 0.794 0.862 0.898 1.063 1.129 1.268 1.395 1.504 1.557 1.672 1.787 1.954 2.061 2.156 2.293 2.423 2.547 2.668 2.786 2.935 3.086 3.245 3.441 3.638 3.819 4.032 4.277 4.497 4.737 5.003 5.279 5.573 5.925 6.33 6.73 7.207 7.732 8.362 9.097 9.925 10.84 11.825 12.579 12.951 13.096 13.12 13.098 13.024 12.913 12.812 12.671 12.545 12.434 12.326 12.225 12.115 12.007 11.899 11.801 11.708 11.6 11.496 11.401 11.287 11.178 11.1 11.019 10.93 10.835 10.738 10.664 10.583 10.466 10.382 10.281 10.228 10.113 10.009 9.9 9.835 9.683 9.66 9.584 9.501 9.314 9.214 9.101 8.966 8.843 8.731 8.571 8.174 -10 ,32208 ,TETRA ,17699521,Sat Dec 4 18:02:51 CET,Sat Dec 4 20:06:01 CET,0.0 0.283 0.45 0.559 0.669 0.772 0.869 0.959 1.113 1.198 1.284 1.33 1.497 1.559 1.678 1.804 1.931 1.985 2.088 2.193 2.339 2.424 2.514 2.655 2.791 2.92 3.037 3.154 3.32 3.488 3.638 3.816 3.989 4.147 4.341 4.576 4.803 5.053 5.328 5.608 5.89 6.207 6.608 7.028 7.504 8.036 8.676 9.395 10.207 11.126 12.19 12.984 13.33 13.486 13.512 13.495 13.463 13.398 13.329 13.245 13.146 13.027 12.905 12.787 12.697 12.619 12.518 12.423 12.328 12.227 12.122 12.032 11.943 11.843 11.761 11.678 11.585 11.485 11.382 11.314 11.24 11.107 11.004 10.9 10.845 10.736 10.643 10.544 10.486 10.331 10.281 10.222 10.164 10.017 9.929 9.831 9.731 9.629 9.524 9.364 8.95 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_1b_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_1b_1a.txt deleted file mode 100644 index 3033fd66..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_1b_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18031 ,TETRA ,17668450,Fri Dec 3 06:37:53 CET,Fri Dec 3 08:22:50 CET,0.0 0.605 0.825 0.988 1.113 1.215 1.322 1.43 1.611 1.695 1.785 1.792 2.038 2.112 2.24 2.366 2.495 2.552 2.665 2.781 2.945 3.044 3.14 3.288 3.437 3.573 3.709 3.845 4.021 4.189 4.358 4.567 4.758 4.945 5.167 5.422 5.675 5.959 6.263 6.591 6.943 7.334 7.802 8.288 8.875 9.566 10.369 11.308 12.443 13.8 15.524 16.945 17.781 18.326 18.674 18.914 19.074 19.153 19.171 19.159 19.139 19.115 19.079 19.034 18.978 18.911 18.831 18.76 18.701 18.632 18.542 18.466 18.399 18.315 18.238 18.164 18.095 18.009 17.896 17.819 17.745 17.62 17.518 17.408 17.356 17.226 17.086 16.956 16.889 16.671 16.647 16.542 16.433 16.186 16.047 15.896 15.708 15.493 15.214 14.804 13.395 -2 ,25009 ,TETRA ,17668451,Fri Dec 3 06:37:55 CET,Fri Dec 3 08:20:53 CET,0.0 0.695 0.928 1.096 1.224 1.323 1.423 1.516 1.696 1.785 1.869 1.858 2.099 2.169 2.308 2.442 2.566 2.619 2.723 2.833 3.002 3.115 3.22 3.376 3.524 3.662 3.796 3.924 4.097 4.268 4.427 4.624 4.814 5.0 5.218 5.474 5.724 5.994 6.295 6.625 6.976 7.393 7.879 8.363 8.941 9.611 10.392 11.297 12.404 13.773 15.491 16.907 17.74 18.273 18.607 18.806 18.918 18.99 19.011 19.014 18.999 18.965 18.908 18.842 18.79 18.731 18.648 18.569 18.492 18.392 18.291 18.212 18.125 18.039 17.97 17.891 17.794 17.694 17.599 17.527 17.457 17.342 17.242 17.139 17.09 16.971 16.836 16.691 16.614 16.387 16.389 16.301 16.192 15.956 15.83 15.689 15.52 15.297 15.033 14.686 13.303 -3 ,20528 ,TETRA ,17668452,Fri Dec 3 06:38:54 CET,Fri Dec 3 08:23:23 CET,0.0 0.251 0.409 0.539 0.662 0.786 0.89 0.981 1.145 1.225 1.31 1.307 1.547 1.618 1.76 1.879 1.992 2.05 2.164 2.284 2.454 2.558 2.66 2.81 2.952 3.081 3.217 3.358 3.536 3.705 3.872 4.078 4.28 4.471 4.68 4.918 5.161 5.44 5.743 6.074 6.428 6.823 7.295 7.778 8.362 9.043 9.833 10.756 11.865 13.187 14.843 16.252 17.076 17.583 17.905 18.127 18.256 18.329 18.364 18.362 18.354 18.334 18.29 18.231 18.159 18.089 18.016 17.943 17.873 17.785 17.694 17.614 17.526 17.448 17.379 17.288 17.198 17.103 17.002 16.94 16.872 16.748 16.656 16.556 16.507 16.398 16.268 16.124 16.05 15.834 15.826 15.731 15.628 15.396 15.271 15.132 14.946 14.729 14.452 14.07 12.733 -4 ,13325 ,TETRA ,17668453,Fri Dec 3 06:37:53 CET,Fri Dec 3 08:22:23 CET,0.0 0.643 0.922 1.125 1.29 1.424 1.528 1.621 1.797 1.88 1.96 1.949 2.192 2.261 2.38 2.497 2.616 2.679 2.81 2.933 3.097 3.196 3.294 3.438 3.585 3.733 3.872 4.003 4.179 4.348 4.513 4.714 4.904 5.097 5.324 5.579 5.824 6.104 6.406 6.711 7.049 7.456 7.929 8.413 8.992 9.653 10.447 11.373 12.502 13.877 15.522 16.89 17.733 18.244 18.561 18.773 18.902 18.975 18.982 18.97 18.953 18.913 18.858 18.804 18.753 18.703 18.642 18.582 18.522 18.447 18.367 18.289 18.206 18.117 18.04 17.961 17.881 17.796 17.706 17.63 17.548 17.422 17.32 17.225 17.18 17.08 16.973 16.856 16.788 16.568 16.574 16.492 16.397 16.169 16.033 15.886 15.706 15.5 15.235 14.786 13.731 -5 ,9082 ,TETRA ,17668454,Fri Dec 3 06:37:55 CET,Fri Dec 3 08:21:44 CET,0.0 0.361 0.569 0.754 0.924 1.05 1.148 1.24 1.431 1.521 1.603 1.592 1.835 1.911 2.049 2.182 2.305 2.365 2.486 2.6 2.756 2.851 2.949 3.106 3.257 3.401 3.544 3.686 3.881 4.063 4.225 4.424 4.614 4.793 5.004 5.257 5.514 5.791 6.091 6.418 6.772 7.174 7.649 8.156 8.765 9.44 10.215 11.126 12.218 13.547 15.22 16.628 17.484 18.021 18.324 18.518 18.626 18.684 18.719 18.718 18.676 18.634 18.599 18.542 18.472 18.403 18.312 18.225 18.153 18.073 17.984 17.893 17.801 17.719 17.646 17.559 17.462 17.372 17.285 17.219 17.144 17.021 16.929 16.826 16.773 16.648 16.51 16.364 16.289 16.072 16.05 15.938 15.825 15.588 15.454 15.304 15.119 14.885 14.578 14.139 12.941 -6 ,4561 ,TETRA ,17668455,Fri Dec 3 06:37:52 CET,Fri Dec 3 08:21:50 CET,0.0 0.277 0.431 0.587 0.725 0.839 0.936 1.025 1.202 1.288 1.358 1.317 1.552 1.623 1.752 1.878 2.004 2.061 2.171 2.271 2.414 2.51 2.607 2.753 2.908 3.059 3.209 3.351 3.527 3.701 3.858 4.052 4.253 4.44 4.661 4.92 5.17 5.445 5.737 6.056 6.405 6.805 7.267 7.745 8.329 8.991 9.768 10.693 11.803 13.146 14.85 16.288 17.119 17.622 17.948 18.165 18.3 18.363 18.371 18.375 18.357 18.308 18.253 18.194 18.145 18.098 18.029 17.949 17.879 17.81 17.718 17.64 17.561 17.465 17.393 17.318 17.224 17.124 17.021 16.945 16.863 16.74 16.652 16.552 16.5 16.398 16.283 16.135 16.053 15.826 15.806 15.704 15.582 15.323 15.19 15.049 14.882 14.661 14.346 13.87 12.285 -7 ,30309 ,TETRA ,17668456,Fri Dec 3 06:37:53 CET,Fri Dec 3 08:25:24 CET,0.0 0.651 0.861 1.007 1.131 1.258 1.37 1.468 1.64 1.728 1.813 1.801 2.035 2.113 2.274 2.407 2.53 2.587 2.688 2.785 2.923 3.014 3.11 3.252 3.39 3.537 3.683 3.822 3.992 4.159 4.33 4.53 4.717 4.897 5.119 5.377 5.627 5.906 6.204 6.523 6.869 7.27 7.741 8.216 8.778 9.435 10.262 11.228 12.324 13.669 15.362 16.824 17.698 18.205 18.5 18.675 18.773 18.839 18.878 18.894 18.866 18.801 18.74 18.7 18.65 18.587 18.512 18.447 18.386 18.305 18.211 18.125 18.035 17.935 17.852 17.773 17.679 17.576 17.475 17.401 17.321 17.197 17.112 17.024 16.971 16.862 16.758 16.629 16.557 16.335 16.318 16.233 16.147 15.925 15.795 15.653 15.488 15.277 15.023 14.688 13.517 -8 ,24059 ,TETRA ,17668457,Fri Dec 3 06:38:57 CET,Fri Dec 3 08:18:38 CET,0.0 0.643 0.838 0.961 1.082 1.199 1.307 1.411 1.588 1.666 1.751 1.742 1.979 2.051 2.18 2.296 2.402 2.456 2.571 2.683 2.845 2.953 3.056 3.194 3.323 3.452 3.584 3.724 3.904 4.064 4.217 4.418 4.615 4.803 5.025 5.275 5.522 5.801 6.108 6.435 6.782 7.188 7.666 8.157 8.745 9.406 10.197 11.126 12.229 13.583 15.284 16.714 17.563 18.083 18.41 18.62 18.742 18.789 18.787 18.786 18.778 18.75 18.699 18.643 18.593 18.527 18.44 18.367 18.303 18.226 18.138 18.058 17.968 17.858 17.774 17.699 17.613 17.514 17.419 17.347 17.265 17.14 17.049 16.946 16.893 16.775 16.647 16.517 16.447 16.23 16.199 16.09 15.976 15.728 15.592 15.45 15.283 15.066 14.799 14.432 13.182 -9 ,28827 ,TETRA ,17668458,Fri Dec 3 06:37:53 CET,Fri Dec 3 08:20:43 CET,0.0 0.687 0.898 1.063 1.187 1.312 1.412 1.501 1.692 1.783 1.863 1.847 2.082 2.143 2.269 2.398 2.521 2.58 2.683 2.784 2.936 3.039 3.141 3.278 3.407 3.546 3.688 3.818 3.981 4.143 4.301 4.491 4.676 4.858 5.069 5.316 5.568 5.847 6.14 6.453 6.798 7.197 7.668 8.15 8.721 9.361 10.133 11.046 12.163 13.546 15.221 16.635 17.479 18.017 18.361 18.58 18.706 18.773 18.795 18.78 18.746 18.708 18.661 18.609 18.552 18.489 18.416 18.347 18.278 18.196 18.109 18.039 17.963 17.865 17.791 17.72 17.631 17.521 17.41 17.336 17.254 17.114 17.01 16.904 16.848 16.728 16.607 16.477 16.413 16.199 16.182 16.087 15.985 15.758 15.627 15.477 15.307 15.101 14.843 14.453 13.093 -10 ,30963 ,TETRA ,17668459,Fri Dec 3 06:37:54 CET,Fri Dec 3 08:23:43 CET,0.0 0.591 0.824 0.984 1.107 1.222 1.329 1.43 1.615 1.697 1.771 1.738 1.969 2.033 2.159 2.288 2.411 2.468 2.58 2.687 2.856 2.966 3.07 3.231 3.376 3.508 3.641 3.766 3.927 4.089 4.251 4.457 4.661 4.849 5.076 5.338 5.58 5.85 6.15 6.483 6.85 7.267 7.736 8.214 8.799 9.474 10.264 11.203 12.334 13.67 15.372 16.735 17.537 18.041 18.351 18.578 18.707 18.766 18.784 18.78 18.761 18.733 18.694 18.625 18.541 18.468 18.394 18.326 18.255 18.185 18.114 18.035 17.946 17.846 17.758 17.675 17.59 17.491 17.386 17.311 17.226 17.101 17.019 16.913 16.849 16.729 16.614 16.487 16.414 16.185 16.182 16.107 16.014 15.762 15.617 15.471 15.307 15.103 14.835 14.426 12.956 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1a.txt deleted file mode 100644 index 0ab80584..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8679 ,TETRA ,17668460,Fri Dec 3 06:37:55 CET,Fri Dec 3 08:24:39 CET,0.0 0.437 0.647 0.778 0.893 1.001 1.102 1.192 1.348 1.412 1.473 1.428 1.636 1.685 1.771 1.852 1.932 1.972 2.054 2.137 2.257 2.332 2.397 2.497 2.607 2.704 2.795 2.886 3.0 3.115 3.219 3.337 3.467 3.597 3.727 3.869 4.023 4.195 4.372 4.565 4.779 5.009 5.266 5.533 5.864 6.225 6.613 7.037 7.524 8.081 8.664 8.957 8.996 8.937 8.829 8.684 8.506 8.313 8.136 7.935 7.749 7.574 7.397 7.21 7.017 6.854 6.679 6.519 6.386 6.243 6.106 5.969 5.801 5.635 5.518 5.401 5.263 5.118 4.978 4.877 4.756 4.559 4.428 4.293 4.224 4.059 3.883 3.704 3.611 3.36 3.284 3.165 3.029 2.743 2.562 2.361 2.11 1.808 1.487 0.961 -1.873 -2 ,28541 ,TETRA ,17668461,Fri Dec 3 06:37:53 CET,Fri Dec 3 08:23:04 CET,0.0 0.496 0.648 0.782 0.889 0.98 1.062 1.148 1.291 1.349 1.408 1.369 1.572 1.616 1.703 1.798 1.888 1.928 2.012 2.101 2.225 2.296 2.372 2.486 2.58 2.67 2.761 2.853 2.973 3.08 3.189 3.324 3.451 3.576 3.719 3.884 4.042 4.211 4.39 4.575 4.772 4.998 5.267 5.545 5.867 6.208 6.59 7.025 7.54 8.105 8.696 9.063 9.164 9.107 8.977 8.816 8.63 8.446 8.278 8.089 7.913 7.731 7.543 7.376 7.216 7.063 6.893 6.737 6.604 6.455 6.288 6.154 6.018 5.849 5.719 5.599 5.459 5.304 5.139 5.024 4.908 4.716 4.575 4.429 4.353 4.183 3.985 3.754 3.627 3.347 3.252 3.131 2.972 2.588 2.389 2.174 1.93 1.617 1.231 0.715 -2.741 -3 ,26828 ,TETRA ,17668462,Fri Dec 3 06:37:55 CET,Fri Dec 3 08:23:21 CET,0.0 0.297 0.437 0.55 0.663 0.763 0.849 0.935 1.075 1.134 1.197 1.171 1.382 1.436 1.536 1.625 1.713 1.755 1.834 1.912 2.04 2.117 2.189 2.294 2.388 2.486 2.585 2.685 2.806 2.914 3.022 3.156 3.297 3.428 3.572 3.724 3.872 4.046 4.229 4.43 4.644 4.872 5.14 5.413 5.723 6.087 6.502 6.936 7.436 8.025 8.634 8.949 9.007 8.957 8.859 8.72 8.57 8.386 8.187 7.987 7.804 7.636 7.469 7.29 7.122 6.97 6.794 6.625 6.475 6.323 6.156 6.025 5.882 5.732 5.617 5.489 5.355 5.193 5.024 4.918 4.815 4.626 4.489 4.351 4.274 4.112 3.927 3.735 3.639 3.384 3.286 3.152 3.008 2.724 2.552 2.318 2.028 1.687 1.261 0.637 -1.698 -4 ,18299 ,TETRA ,17668463,Fri Dec 3 06:37:57 CET,Fri Dec 3 08:23:32 CET,0.0 0.402 0.588 0.715 0.805 0.897 0.998 1.081 1.215 1.284 1.349 1.313 1.518 1.569 1.669 1.754 1.844 1.893 1.986 2.071 2.202 2.289 2.367 2.471 2.57 2.658 2.737 2.824 2.943 3.055 3.17 3.308 3.437 3.559 3.699 3.854 4.005 4.181 4.367 4.549 4.751 4.982 5.255 5.545 5.858 6.205 6.612 7.041 7.537 8.093 8.675 9.041 9.144 9.111 8.989 8.825 8.658 8.476 8.3 8.097 7.893 7.699 7.507 7.337 7.194 7.057 6.886 6.716 6.558 6.387 6.217 6.081 5.948 5.802 5.677 5.546 5.41 5.265 5.096 4.967 4.841 4.675 4.552 4.399 4.316 4.147 3.989 3.825 3.726 3.467 3.352 3.207 3.066 2.717 2.502 2.264 2.008 1.74 1.38 0.821 -3.151 -5 ,18660 ,TETRA ,17668464,Fri Dec 3 06:37:59 CET,Fri Dec 3 08:23:04 CET,0.0 0.604 0.802 0.942 1.063 1.162 1.257 1.338 1.477 1.534 1.588 1.545 1.75 1.795 1.883 1.977 2.058 2.099 2.185 2.264 2.373 2.444 2.517 2.622 2.73 2.836 2.925 3.011 3.133 3.25 3.354 3.478 3.596 3.709 3.847 4.016 4.178 4.345 4.526 4.719 4.917 5.158 5.448 5.713 6.018 6.364 6.748 7.19 7.688 8.211 8.767 9.091 9.156 9.092 8.943 8.773 8.602 8.428 8.258 8.053 7.861 7.681 7.498 7.311 7.123 6.945 6.752 6.574 6.418 6.249 6.077 5.939 5.788 5.628 5.508 5.378 5.239 5.097 4.94 4.827 4.704 4.506 4.375 4.25 4.177 4.008 3.829 3.643 3.536 3.282 3.237 3.128 2.988 2.688 2.518 2.319 2.061 1.727 1.316 0.817 -1.617 -6 ,10027 ,TETRA ,17668465,Fri Dec 3 06:37:54 CET,Fri Dec 3 08:25:09 CET,0.0 0.365 0.551 0.705 0.832 0.935 1.018 1.102 1.259 1.327 1.39 1.351 1.56 1.612 1.708 1.81 1.902 1.943 2.028 2.113 2.228 2.295 2.363 2.464 2.555 2.653 2.756 2.854 2.976 3.096 3.208 3.324 3.441 3.57 3.719 3.88 4.04 4.218 4.407 4.604 4.814 5.039 5.29 5.556 5.868 6.227 6.641 7.08 7.593 8.178 8.794 9.14 9.195 9.132 9.014 8.867 8.691 8.502 8.326 8.139 7.956 7.776 7.595 7.405 7.212 7.041 6.861 6.696 6.563 6.427 6.263 6.121 5.978 5.838 5.725 5.593 5.451 5.305 5.151 5.039 4.914 4.706 4.574 4.432 4.353 4.189 3.99 3.773 3.658 3.392 3.287 3.152 3.014 2.696 2.513 2.291 2.019 1.712 1.28 0.623 -1.784 -7 ,12486 ,TETRA ,17668466,Fri Dec 3 06:37:54 CET,Fri Dec 3 08:22:56 CET,0.0 0.382 0.56 0.696 0.82 0.937 1.036 1.127 1.272 1.325 1.376 1.344 1.564 1.626 1.732 1.83 1.922 1.964 2.046 2.122 2.232 2.309 2.384 2.482 2.573 2.661 2.75 2.85 2.996 3.117 3.22 3.354 3.482 3.6 3.748 3.91 4.064 4.238 4.433 4.635 4.833 5.064 5.332 5.585 5.885 6.238 6.64 7.077 7.58 8.113 8.674 9.023 9.079 9.041 8.916 8.75 8.595 8.426 8.261 8.081 7.892 7.71 7.52 7.327 7.146 6.974 6.796 6.641 6.505 6.359 6.21 6.077 5.925 5.765 5.646 5.527 5.392 5.244 5.091 4.988 4.884 4.698 4.546 4.395 4.326 4.164 3.981 3.773 3.658 3.401 3.303 3.163 3.019 2.709 2.542 2.328 2.052 1.753 1.378 0.853 -1.69 -8 ,9182 ,TETRA ,17668467,Fri Dec 3 06:37:56 CET,Fri Dec 3 08:24:31 CET,0.0 0.409 0.633 0.783 0.885 0.981 1.071 1.146 1.293 1.367 1.432 1.401 1.621 1.678 1.762 1.84 1.92 1.962 2.047 2.129 2.243 2.319 2.394 2.497 2.597 2.693 2.783 2.869 2.984 3.099 3.215 3.356 3.493 3.616 3.751 3.92 4.085 4.265 4.458 4.66 4.87 5.1 5.355 5.621 5.95 6.314 6.728 7.195 7.712 8.295 8.948 9.319 9.396 9.325 9.22 9.083 8.891 8.656 8.46 8.275 8.103 7.931 7.742 7.557 7.378 7.207 7.027 6.885 6.759 6.612 6.437 6.281 6.124 5.97 5.846 5.71 5.564 5.4 5.236 5.128 5.003 4.811 4.679 4.521 4.44 4.285 4.095 3.864 3.749 3.484 3.372 3.241 3.104 2.785 2.563 2.318 2.082 1.803 1.474 0.906 -2.358 -9 ,177 ,TETRA ,17668468,Fri Dec 3 06:37:53 CET,Fri Dec 3 08:22:59 CET,0.0 0.44 0.577 0.677 0.765 0.857 0.944 1.025 1.172 1.236 1.295 1.253 1.463 1.515 1.618 1.725 1.828 1.871 1.953 2.031 2.142 2.21 2.279 2.38 2.479 2.58 2.667 2.746 2.858 2.974 3.088 3.215 3.328 3.439 3.571 3.731 3.885 4.05 4.23 4.421 4.633 4.867 5.126 5.384 5.686 6.021 6.411 6.87 7.4 7.992 8.588 8.89 8.939 8.894 8.804 8.657 8.456 8.246 8.058 7.854 7.674 7.504 7.347 7.186 7.014 6.859 6.698 6.542 6.388 6.22 6.047 5.899 5.736 5.566 5.429 5.297 5.16 5.001 4.816 4.688 4.573 4.38 4.231 4.088 4.015 3.854 3.677 3.486 3.385 3.127 3.019 2.878 2.744 2.473 2.306 2.086 1.846 1.591 1.259 0.743 -1.949 -10 ,25312 ,TETRA ,17668469,Fri Dec 3 06:37:55 CET,Fri Dec 3 08:23:11 CET,0.0 0.483 0.679 0.805 0.901 0.991 1.087 1.176 1.325 1.398 1.466 1.42 1.632 1.693 1.794 1.889 1.977 2.022 2.108 2.185 2.295 2.371 2.447 2.543 2.632 2.725 2.821 2.915 3.035 3.142 3.246 3.373 3.496 3.622 3.767 3.928 4.079 4.245 4.431 4.631 4.842 5.081 5.369 5.653 5.972 6.322 6.732 7.197 7.715 8.268 8.829 9.134 9.154 9.048 8.898 8.709 8.513 8.336 8.166 7.974 7.798 7.635 7.475 7.306 7.126 6.953 6.759 6.563 6.395 6.246 6.101 5.964 5.814 5.661 5.535 5.405 5.277 5.125 4.962 4.867 4.753 4.536 4.389 4.235 4.151 3.978 3.816 3.63 3.53 3.28 3.192 3.075 2.935 2.581 2.381 2.159 1.922 1.612 1.238 0.711 -2.652 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1b.txt deleted file mode 100644 index 41cfdcf4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,680 ,TETRA ,17668470,Fri Dec 3 06:37:56 CET,Fri Dec 3 08:23:51 CET,0.0 0.556 0.857 1.059 1.192 1.292 1.391 1.481 1.628 1.698 1.77 1.751 1.965 2.014 2.115 2.215 2.304 2.346 2.432 2.513 2.623 2.696 2.767 2.863 2.951 3.038 3.116 3.187 3.277 3.366 3.45 3.548 3.639 3.716 3.807 3.901 3.989 4.088 4.179 4.266 4.35 4.428 4.491 4.527 4.553 4.547 4.527 4.435 4.171 3.721 2.82 1.605 0.55 -0.373 -1.147 -1.83 -2.452 -3.04 -3.54 -4.035 -4.472 -4.85 -5.208 -5.557 -5.877 -6.17 -6.48 -6.759 -6.989 -7.22 -7.479 -7.697 -7.928 -8.181 -8.363 -8.546 -8.737 -8.918 -9.114 -9.26 -9.41 -9.639 -9.801 -9.985 -10.084 -10.29 -10.511 -10.743 -10.861 -11.141 -11.231 -11.377 -11.522 -11.842 -12.016 -12.192 -12.4 -12.669 -13.023 -13.483 -14.887 -2 ,5845 ,TETRA ,17668471,Fri Dec 3 06:37:57 CET,Fri Dec 3 08:23:39 CET,0.0 0.586 0.825 0.991 1.117 1.241 1.36 1.456 1.619 1.699 1.778 1.767 1.988 2.051 2.155 2.253 2.348 2.393 2.477 2.557 2.686 2.761 2.823 2.92 3.013 3.097 3.172 3.24 3.33 3.419 3.5 3.589 3.67 3.739 3.809 3.889 3.972 4.049 4.111 4.179 4.254 4.327 4.385 4.416 4.436 4.458 4.426 4.271 3.998 3.556 2.688 1.506 0.429 -0.515 -1.335 -2.072 -2.711 -3.271 -3.759 -4.258 -4.689 -5.071 -5.425 -5.749 -6.043 -6.328 -6.627 -6.89 -7.131 -7.387 -7.642 -7.857 -8.088 -8.326 -8.516 -8.713 -8.909 -9.126 -9.353 -9.505 -9.666 -9.907 -10.072 -10.253 -10.348 -10.54 -10.728 -10.937 -11.05 -11.334 -11.427 -11.568 -11.727 -12.081 -12.263 -12.484 -12.754 -13.042 -13.358 -13.767 -15.134 -3 ,7305 ,TETRA ,17668472,Fri Dec 3 06:37:55 CET,Fri Dec 3 08:24:48 CET,0.0 0.592 0.836 1.018 1.169 1.284 1.398 1.499 1.657 1.732 1.809 1.805 2.015 2.068 2.184 2.295 2.388 2.432 2.515 2.595 2.71 2.778 2.845 2.942 3.032 3.115 3.195 3.274 3.368 3.448 3.524 3.621 3.711 3.794 3.889 3.99 4.08 4.16 4.244 4.338 4.418 4.491 4.556 4.597 4.64 4.656 4.603 4.459 4.197 3.758 2.881 1.694 0.671 -0.227 -0.996 -1.72 -2.341 -2.882 -3.368 -3.889 -4.323 -4.687 -5.056 -5.413 -5.712 -5.989 -6.295 -6.557 -6.791 -7.038 -7.297 -7.505 -7.722 -7.951 -8.131 -8.323 -8.518 -8.722 -8.937 -9.088 -9.244 -9.493 -9.664 -9.842 -9.937 -10.123 -10.317 -10.537 -10.655 -10.941 -11.023 -11.162 -11.32 -11.663 -11.843 -12.039 -12.27 -12.553 -12.901 -13.394 -14.972 -4 ,15014 ,TETRA ,17668473,Fri Dec 3 06:37:57 CET,Fri Dec 3 08:24:48 CET,0.0 0.742 1.014 1.224 1.375 1.498 1.618 1.718 1.902 1.973 2.04 2.019 2.222 2.276 2.387 2.491 2.597 2.648 2.739 2.816 2.927 2.998 3.07 3.175 3.263 3.343 3.421 3.494 3.587 3.679 3.771 3.862 3.928 3.999 4.084 4.165 4.239 4.321 4.41 4.483 4.555 4.636 4.705 4.757 4.795 4.783 4.721 4.604 4.376 3.944 3.069 1.837 0.762 -0.159 -0.966 -1.705 -2.357 -2.921 -3.412 -3.919 -4.337 -4.708 -5.06 -5.379 -5.675 -5.935 -6.207 -6.472 -6.712 -6.963 -7.233 -7.451 -7.665 -7.892 -8.079 -8.276 -8.461 -8.639 -8.84 -8.987 -9.146 -9.385 -9.549 -9.718 -9.805 -9.998 -10.206 -10.406 -10.513 -10.796 -10.883 -11.023 -11.171 -11.487 -11.658 -11.856 -12.069 -12.302 -12.631 -13.039 -14.664 -5 ,20185 ,TETRA ,17668474,Fri Dec 3 06:37:58 CET,Fri Dec 3 08:25:06 CET,0.0 0.754 1.061 1.243 1.395 1.524 1.627 1.721 1.88 1.948 2.019 1.989 2.203 2.267 2.376 2.463 2.545 2.592 2.675 2.751 2.868 2.94 3.005 3.11 3.214 3.303 3.387 3.474 3.574 3.661 3.742 3.837 3.918 3.998 4.088 4.183 4.267 4.347 4.428 4.505 4.578 4.648 4.72 4.776 4.808 4.8 4.755 4.653 4.424 3.965 3.083 1.893 0.792 -0.167 -0.974 -1.687 -2.323 -2.899 -3.384 -3.876 -4.299 -4.67 -5.018 -5.361 -5.684 -5.964 -6.255 -6.519 -6.764 -7.013 -7.271 -7.493 -7.714 -7.939 -8.116 -8.307 -8.507 -8.723 -8.951 -9.101 -9.258 -9.526 -9.717 -9.898 -9.988 -10.179 -10.376 -10.59 -10.701 -10.984 -11.075 -11.211 -11.348 -11.654 -11.834 -12.028 -12.253 -12.509 -12.852 -13.34 -15.508 -6 ,15107 ,TETRA ,17668475,Fri Dec 3 06:38:01 CET,Fri Dec 3 08:24:52 CET,0.0 0.638 0.89 1.073 1.211 1.331 1.446 1.555 1.742 1.822 1.893 1.86 2.072 2.134 2.248 2.363 2.473 2.523 2.612 2.7 2.821 2.893 2.96 3.053 3.147 3.225 3.29 3.355 3.44 3.516 3.592 3.683 3.757 3.829 3.915 4.01 4.092 4.177 4.263 4.345 4.42 4.49 4.564 4.631 4.686 4.712 4.692 4.58 4.321 3.839 2.886 1.644 0.587 -0.308 -1.079 -1.77 -2.398 -2.977 -3.484 -3.985 -4.407 -4.779 -5.13 -5.469 -5.8 -6.092 -6.393 -6.68 -6.931 -7.181 -7.44 -7.659 -7.867 -8.076 -8.253 -8.437 -8.621 -8.807 -9.015 -9.163 -9.306 -9.52 -9.688 -9.874 -9.969 -10.192 -10.408 -10.626 -10.751 -11.043 -11.136 -11.273 -11.429 -11.751 -11.912 -12.105 -12.322 -12.592 -12.971 -13.439 -14.672 -7 ,23916 ,TETRA ,17668476,Fri Dec 3 06:37:55 CET,Fri Dec 3 08:24:52 CET,0.0 0.488 0.739 0.931 1.071 1.192 1.293 1.387 1.569 1.641 1.71 1.7 1.922 1.977 2.073 2.168 2.254 2.294 2.379 2.458 2.573 2.645 2.708 2.799 2.884 2.965 3.037 3.111 3.204 3.289 3.364 3.445 3.526 3.606 3.701 3.791 3.868 3.948 4.03 4.104 4.181 4.266 4.332 4.387 4.441 4.459 4.413 4.298 4.06 3.586 2.668 1.459 0.392 -0.527 -1.3 -2.006 -2.641 -3.212 -3.713 -4.208 -4.623 -5.005 -5.374 -5.713 -6.037 -6.336 -6.646 -6.936 -7.174 -7.404 -7.648 -7.85 -8.07 -8.326 -8.51 -8.681 -8.864 -9.074 -9.298 -9.447 -9.597 -9.821 -9.978 -10.154 -10.245 -10.427 -10.616 -10.833 -10.95 -11.232 -11.326 -11.488 -11.65 -11.959 -12.151 -12.358 -12.581 -12.858 -13.154 -13.534 -14.936 -8 ,5824 ,TETRA ,17668477,Fri Dec 3 06:38:54 CET,Fri Dec 3 08:26:09 CET,0.0 0.528 0.842 1.041 1.198 1.332 1.446 1.55 1.727 1.814 1.903 1.889 2.105 2.164 2.271 2.379 2.48 2.526 2.617 2.704 2.825 2.898 2.962 3.048 3.133 3.217 3.299 3.38 3.492 3.596 3.681 3.777 3.855 3.939 4.034 4.12 4.199 4.288 4.382 4.473 4.558 4.634 4.695 4.742 4.794 4.806 4.752 4.641 4.426 3.978 3.041 1.795 0.73 -0.18 -0.959 -1.678 -2.329 -2.937 -3.456 -3.955 -4.384 -4.77 -5.133 -5.474 -5.794 -6.079 -6.378 -6.658 -6.903 -7.144 -7.383 -7.601 -7.84 -8.073 -8.25 -8.438 -8.64 -8.864 -9.08 -9.22 -9.371 -9.615 -9.781 -9.957 -10.052 -10.257 -10.478 -10.705 -10.813 -11.092 -11.175 -11.312 -11.463 -11.782 -11.951 -12.143 -12.355 -12.619 -12.941 -13.365 -14.682 -9 ,17869 ,TETRA ,17668478,Fri Dec 3 06:38:55 CET,Fri Dec 3 08:26:08 CET,0.0 0.516 0.797 0.964 1.086 1.188 1.301 1.409 1.559 1.626 1.703 1.694 1.908 1.962 2.062 2.162 2.259 2.305 2.386 2.464 2.585 2.654 2.718 2.819 2.913 2.999 3.075 3.146 3.233 3.311 3.389 3.476 3.545 3.612 3.697 3.799 3.897 3.987 4.068 4.148 4.231 4.311 4.375 4.408 4.432 4.444 4.402 4.276 4.013 3.549 2.637 1.428 0.407 -0.49 -1.303 -2.03 -2.665 -3.259 -3.761 -4.238 -4.648 -5.02 -5.39 -5.736 -6.051 -6.335 -6.62 -6.881 -7.114 -7.365 -7.619 -7.828 -8.046 -8.273 -8.46 -8.649 -8.841 -9.046 -9.28 -9.44 -9.585 -9.81 -9.978 -10.156 -10.253 -10.443 -10.632 -10.84 -10.95 -11.236 -11.337 -11.476 -11.617 -11.934 -12.109 -12.313 -12.565 -12.859 -13.175 -13.613 -15.077 -10 ,17560 ,TETRA ,17668479,Fri Dec 3 06:38:57 CET,Fri Dec 3 08:21:59 CET,0.0 0.722 0.953 1.129 1.268 1.383 1.498 1.6 1.788 1.877 1.956 1.935 2.151 2.208 2.317 2.427 2.532 2.579 2.666 2.748 2.853 2.916 2.98 3.071 3.161 3.252 3.333 3.404 3.487 3.563 3.641 3.743 3.834 3.924 4.021 4.101 4.174 4.252 4.332 4.414 4.485 4.559 4.625 4.676 4.719 4.73 4.685 4.549 4.288 3.802 2.859 1.615 0.52 -0.434 -1.244 -1.97 -2.585 -3.148 -3.641 -4.112 -4.527 -4.899 -5.263 -5.602 -5.909 -6.198 -6.49 -6.747 -6.973 -7.216 -7.481 -7.706 -7.944 -8.197 -8.385 -8.562 -8.74 -8.942 -9.169 -9.328 -9.494 -9.75 -9.921 -10.1 -10.19 -10.36 -10.538 -10.75 -10.865 -11.142 -11.212 -11.349 -11.495 -11.818 -12.009 -12.217 -12.468 -12.768 -13.105 -13.558 -14.97 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_3b_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_3b_3a.txt deleted file mode 100644 index b8fc7ba9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_3b_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26876 ,KEBNE ,17077310,Sat Dec 25 11:13:05 CET,Sat Dec 25 12:48:32 CET,0.0 0.577 0.745 0.931 1.109 1.253 1.372 1.472 1.65 1.732 1.812 1.802 2.026 2.105 2.243 2.363 2.479 2.53 2.628 2.718 2.85 2.94 3.035 3.168 3.282 3.385 3.486 3.59 3.722 3.843 3.958 4.094 4.231 4.369 4.514 4.674 4.821 4.967 5.13 5.318 5.513 5.735 5.982 6.222 6.48 6.728 7.001 7.261 7.495 7.672 7.648 7.329 6.896 6.45 6.041 5.641 5.278 4.952 4.671 4.362 4.085 3.847 3.624 3.422 3.225 3.036 2.84 2.658 2.506 2.348 2.184 2.046 1.892 1.739 1.616 1.493 1.372 1.242 1.103 1.012 0.919 0.758 0.643 0.529 0.47 0.348 0.229 0.09 0.016 -0.209 -0.219 -0.306 -0.399 -0.618 -0.734 -0.845 -0.981 -1.161 -1.406 -1.777 -2.39 -2 ,13899 ,KEBNE ,17077311,Sat Dec 25 11:14:07 CET,Sat Dec 25 12:48:54 CET,0.0 0.632 0.92 1.159 1.323 1.439 1.533 1.634 1.824 1.901 1.974 1.966 2.184 2.248 2.372 2.483 2.591 2.647 2.762 2.878 3.035 3.126 3.212 3.331 3.453 3.564 3.668 3.774 3.899 4.016 4.134 4.29 4.419 4.536 4.701 4.881 5.03 5.19 5.373 5.569 5.751 5.933 6.152 6.383 6.633 6.887 7.17 7.476 7.759 7.929 7.936 7.644 7.213 6.779 6.386 5.987 5.615 5.285 5.004 4.695 4.418 4.165 3.926 3.704 3.51 3.345 3.158 2.986 2.84 2.684 2.522 2.394 2.249 2.092 1.979 1.858 1.727 1.597 1.463 1.366 1.261 1.097 0.983 0.855 0.79 0.666 0.532 0.388 0.313 0.08 0.083 0.002 -0.083 -0.288 -0.407 -0.559 -0.723 -0.923 -1.142 -1.339 -1.65 -3 ,7998 ,KEBNE ,17077312,Sat Dec 25 11:15:14 CET,Sat Dec 25 12:43:51 CET,0.0 0.827 1.08 1.265 1.399 1.525 1.665 1.787 1.993 2.085 2.171 2.18 2.407 2.474 2.606 2.726 2.828 2.883 2.99 3.087 3.222 3.306 3.387 3.493 3.595 3.708 3.827 3.943 4.088 4.217 4.332 4.482 4.623 4.759 4.92 5.09 5.246 5.419 5.604 5.776 5.962 6.171 6.394 6.616 6.861 7.111 7.389 7.683 7.952 8.117 8.077 7.749 7.293 6.834 6.432 6.046 5.694 5.389 5.1 4.795 4.541 4.302 4.058 3.838 3.634 3.436 3.237 3.058 2.893 2.731 2.566 2.427 2.281 2.121 2.001 1.878 1.755 1.634 1.5 1.41 1.3 1.121 1.01 0.887 0.821 0.682 0.539 0.398 0.326 0.09 0.08 -0.005 -0.104 -0.328 -0.443 -0.569 -0.7 -0.838 -1.053 -1.389 -2.377 -4 ,481 ,KEBNE ,17077313,Sat Dec 25 11:18:18 CET,Sat Dec 25 12:52:54 CET,0.0 0.658 0.858 1.017 1.154 1.273 1.394 1.499 1.71 1.814 1.907 1.923 2.155 2.231 2.372 2.506 2.624 2.68 2.789 2.885 3.028 3.116 3.198 3.324 3.439 3.549 3.658 3.76 3.892 4.021 4.133 4.269 4.411 4.546 4.705 4.878 5.034 5.202 5.379 5.577 5.772 5.979 6.206 6.421 6.686 6.965 7.241 7.527 7.803 7.998 7.981 7.674 7.268 6.806 6.377 5.975 5.6 5.285 5.013 4.709 4.438 4.21 3.998 3.78 3.565 3.37 3.179 3.002 2.845 2.682 2.507 2.364 2.217 2.073 1.962 1.836 1.706 1.57 1.425 1.323 1.215 1.038 0.918 0.793 0.726 0.604 0.481 0.343 0.272 0.045 0.057 -0.021 -0.109 -0.308 -0.409 -0.518 -0.656 -0.829 -1.042 -1.293 -1.927 -5 ,17335 ,KEBNE ,17077314,Sat Dec 25 11:20:23 CET,Sat Dec 25 12:53:27 CET,0.0 0.51 0.73 0.913 1.105 1.289 1.427 1.544 1.752 1.844 1.925 1.926 2.149 2.222 2.36 2.479 2.588 2.645 2.756 2.86 3.004 3.099 3.193 3.31 3.427 3.548 3.655 3.752 3.877 4.0 4.118 4.262 4.397 4.526 4.678 4.846 5.005 5.164 5.326 5.503 5.691 5.912 6.173 6.408 6.656 6.906 7.192 7.458 7.663 7.822 7.811 7.516 7.158 6.749 6.342 5.957 5.596 5.24 4.929 4.627 4.367 4.13 3.899 3.669 3.459 3.271 3.06 2.876 2.73 2.588 2.426 2.285 2.145 1.993 1.873 1.756 1.635 1.496 1.35 1.252 1.148 0.98 0.862 0.739 0.677 0.56 0.427 0.286 0.219 -0.013 -0.019 -0.097 -0.186 -0.385 -0.493 -0.61 -0.748 -0.897 -1.06 -1.288 -1.881 -6 ,10711 ,KEBNE ,17077315,Sat Dec 25 11:21:25 CET,Sat Dec 25 12:54:34 CET,0.0 0.538 0.798 0.964 1.09 1.215 1.333 1.435 1.62 1.704 1.784 1.775 1.995 2.07 2.198 2.304 2.406 2.466 2.585 2.689 2.845 2.942 3.029 3.147 3.265 3.385 3.497 3.597 3.727 3.852 3.973 4.12 4.258 4.384 4.522 4.689 4.853 5.012 5.182 5.373 5.576 5.791 6.025 6.257 6.519 6.77 7.036 7.295 7.533 7.701 7.672 7.373 6.963 6.564 6.158 5.737 5.382 5.059 4.753 4.445 4.185 3.959 3.735 3.531 3.348 3.164 2.958 2.786 2.647 2.502 2.343 2.201 2.051 1.892 1.77 1.655 1.53 1.38 1.222 1.127 1.035 0.882 0.76 0.628 0.562 0.423 0.281 0.137 0.065 -0.163 -0.17 -0.272 -0.391 -0.615 -0.729 -0.853 -1.002 -1.178 -1.367 -1.635 -2.286 -7 ,14487 ,KEBNE ,17077316,Sat Dec 25 11:21:25 CET,Sat Dec 25 12:54:01 CET,0.0 0.664 0.963 1.123 1.267 1.398 1.507 1.62 1.824 1.91 1.984 1.985 2.222 2.294 2.421 2.548 2.663 2.72 2.84 2.951 3.099 3.196 3.284 3.399 3.525 3.657 3.762 3.857 3.986 4.108 4.228 4.371 4.5 4.627 4.772 4.939 5.102 5.269 5.438 5.608 5.789 5.998 6.227 6.453 6.717 6.989 7.265 7.536 7.767 7.915 7.935 7.652 7.229 6.795 6.377 5.971 5.612 5.273 4.97 4.677 4.422 4.186 3.965 3.764 3.567 3.372 3.174 2.999 2.85 2.692 2.515 2.374 2.231 2.071 1.954 1.835 1.702 1.555 1.403 1.299 1.195 1.038 0.929 0.813 0.749 0.617 0.467 0.301 0.216 -0.03 -0.062 -0.151 -0.243 -0.438 -0.547 -0.677 -0.804 -0.943 -1.126 -1.395 -1.817 -8 ,8692 ,KEBNE ,17077317,Sat Dec 25 11:22:29 CET,Sat Dec 25 12:55:38 CET,0.0 0.502 0.754 0.957 1.091 1.205 1.309 1.403 1.58 1.663 1.753 1.771 1.996 2.069 2.194 2.309 2.428 2.488 2.602 2.708 2.86 2.951 3.048 3.183 3.289 3.399 3.505 3.597 3.73 3.862 3.979 4.127 4.257 4.382 4.526 4.679 4.826 4.983 5.163 5.35 5.528 5.723 5.949 6.168 6.419 6.696 6.973 7.19 7.421 7.662 7.658 7.281 6.833 6.428 6.051 5.666 5.29 4.949 4.665 4.371 4.093 3.839 3.604 3.379 3.168 2.978 2.776 2.592 2.437 2.269 2.094 1.949 1.79 1.626 1.506 1.378 1.241 1.101 0.958 0.863 0.765 0.623 0.51 0.385 0.324 0.197 0.056 -0.096 -0.174 -0.408 -0.43 -0.524 -0.616 -0.805 -0.909 -1.048 -1.201 -1.345 -1.533 -1.797 -2.508 -9 ,14480 ,KEBNE ,17077318,Sat Dec 25 11:22:29 CET,Sat Dec 25 12:55:29 CET,0.0 0.673 0.958 1.166 1.314 1.447 1.566 1.676 1.87 1.948 2.017 2.002 2.211 2.271 2.399 2.521 2.63 2.685 2.792 2.884 3.018 3.1 3.18 3.299 3.417 3.535 3.646 3.75 3.882 4.007 4.116 4.253 4.395 4.534 4.695 4.859 5.012 5.195 5.39 5.585 5.778 5.983 6.218 6.444 6.672 6.907 7.184 7.446 7.671 7.861 7.865 7.559 7.141 6.689 6.299 5.933 5.575 5.249 4.949 4.647 4.405 4.175 3.939 3.715 3.521 3.341 3.151 2.986 2.831 2.664 2.493 2.356 2.224 2.079 1.953 1.825 1.692 1.546 1.389 1.282 1.18 1.022 0.905 0.787 0.729 0.605 0.46 0.297 0.225 0.005 0.0 -0.091 -0.182 -0.374 -0.49 -0.626 -0.758 -0.921 -1.109 -1.304 -1.779 -10 ,25486 ,KEBNE ,17077319,Sat Dec 25 11:22:29 CET,Sat Dec 25 12:57:19 CET,0.0 0.788 1.036 1.204 1.353 1.486 1.628 1.761 1.949 2.022 2.098 2.099 2.322 2.39 2.522 2.653 2.766 2.817 2.918 3.015 3.146 3.235 3.323 3.447 3.564 3.666 3.767 3.869 4.009 4.143 4.261 4.41 4.555 4.684 4.831 5.003 5.172 5.355 5.537 5.717 5.905 6.116 6.347 6.564 6.798 7.042 7.299 7.547 7.776 7.948 7.956 7.668 7.285 6.849 6.423 6.047 5.692 5.343 5.042 4.757 4.516 4.282 4.067 3.863 3.653 3.458 3.256 3.073 2.921 2.76 2.587 2.444 2.298 2.149 2.033 1.905 1.759 1.606 1.453 1.356 1.257 1.102 0.998 0.895 0.841 0.731 0.606 0.45 0.364 0.131 0.123 0.032 -0.062 -0.282 -0.398 -0.511 -0.635 -0.773 -0.955 -1.252 -2.053 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_3b_7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_3b_7.txt deleted file mode 100644 index 981df4c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_3b_7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3247 ,TETRA ,17668480,Fri Dec 3 06:39:25 CET,Fri Dec 3 08:25:57 CET,0.0 0.621 0.866 1.045 1.195 1.328 1.443 1.547 1.754 1.849 1.937 1.947 2.173 2.246 2.383 2.52 2.648 2.705 2.818 2.933 3.097 3.209 3.316 3.46 3.605 3.75 3.884 4.022 4.207 4.381 4.547 4.754 4.948 5.135 5.36 5.618 5.863 6.135 6.44 6.759 7.083 7.432 7.852 8.272 8.763 9.309 9.91 10.623 11.43 12.263 13.202 13.838 14.006 14.003 13.882 13.679 13.465 13.211 12.954 12.715 12.492 12.264 12.041 11.834 11.637 11.449 11.247 11.068 10.917 10.752 10.58 10.437 10.286 10.127 9.999 9.863 9.712 9.56 9.405 9.293 9.178 9.005 8.887 8.762 8.696 8.557 8.412 8.25 8.162 7.923 7.89 7.795 7.689 7.432 7.268 7.102 6.924 6.717 6.501 6.261 5.579 -2 ,24690 ,TETRA ,17668481,Fri Dec 3 06:38:55 CET,Fri Dec 3 08:25:45 CET,0.0 0.512 0.707 0.866 1.036 1.176 1.296 1.412 1.613 1.7 1.784 1.801 2.03 2.1 2.235 2.369 2.502 2.57 2.695 2.813 2.979 3.089 3.199 3.364 3.521 3.672 3.823 3.963 4.138 4.301 4.458 4.652 4.843 5.029 5.244 5.485 5.73 6.005 6.305 6.626 6.952 7.302 7.702 8.152 8.696 9.268 9.914 10.668 11.505 12.401 13.358 14.073 14.364 14.393 14.312 14.106 13.879 13.631 13.385 13.151 12.929 12.725 12.528 12.333 12.15 11.984 11.808 11.622 11.443 11.264 11.074 10.914 10.76 10.609 10.494 10.366 10.221 10.07 9.919 9.81 9.693 9.514 9.392 9.252 9.177 9.03 8.876 8.72 8.641 8.405 8.363 8.267 8.162 7.923 7.797 7.646 7.452 7.241 7.008 6.696 5.85 -3 ,31869 ,TETRA ,17668482,Fri Dec 3 06:38:57 CET,Fri Dec 3 08:26:59 CET,0.0 0.487 0.686 0.878 1.038 1.184 1.309 1.422 1.638 1.734 1.83 1.851 2.08 2.163 2.319 2.461 2.588 2.645 2.757 2.872 3.043 3.148 3.258 3.429 3.587 3.737 3.884 4.022 4.191 4.356 4.515 4.71 4.914 5.118 5.336 5.561 5.791 6.05 6.343 6.661 6.982 7.348 7.78 8.205 8.699 9.25 9.867 10.566 11.411 12.382 13.428 14.009 14.064 13.952 13.77 13.541 13.343 13.148 12.95 12.717 12.472 12.253 12.051 11.852 11.673 11.514 11.334 11.162 11.011 10.855 10.678 10.538 10.398 10.241 10.125 10.007 9.875 9.737 9.586 9.479 9.365 9.177 9.045 8.902 8.826 8.68 8.541 8.398 8.318 8.088 8.051 7.948 7.841 7.603 7.454 7.293 7.139 6.954 6.715 6.382 5.707 -4 ,29988 ,TETRA ,17668483,Fri Dec 3 06:39:00 CET,Fri Dec 3 08:25:34 CET,0.0 0.561 0.812 0.976 1.112 1.25 1.367 1.46 1.63 1.711 1.797 1.806 2.03 2.113 2.277 2.419 2.548 2.611 2.736 2.855 3.019 3.123 3.238 3.403 3.554 3.699 3.838 3.98 4.16 4.324 4.484 4.679 4.867 5.05 5.274 5.523 5.759 6.028 6.322 6.635 6.968 7.361 7.829 8.283 8.793 9.358 10.055 10.851 11.691 12.608 13.629 14.225 14.418 14.479 14.399 14.227 13.994 13.734 13.525 13.295 13.073 12.876 12.668 12.455 12.257 12.073 11.877 11.692 11.526 11.357 11.18 11.028 10.867 10.697 10.557 10.418 10.278 10.121 9.952 9.84 9.722 9.537 9.414 9.282 9.214 9.081 8.949 8.804 8.721 8.489 8.463 8.353 8.235 7.996 7.871 7.732 7.571 7.382 7.124 6.798 5.939 -5 ,17644 ,TETRA ,17668484,Fri Dec 3 06:38:55 CET,Fri Dec 3 08:24:47 CET,0.0 0.564 0.866 1.066 1.208 1.335 1.447 1.551 1.726 1.806 1.888 1.891 2.115 2.195 2.342 2.471 2.593 2.652 2.772 2.896 3.078 3.198 3.309 3.466 3.619 3.757 3.888 4.021 4.2 4.365 4.526 4.719 4.909 5.095 5.307 5.545 5.772 6.032 6.321 6.615 6.916 7.266 7.68 8.109 8.602 9.172 9.845 10.569 11.378 12.302 13.335 13.856 13.979 13.878 13.634 13.41 13.19 12.966 12.745 12.504 12.284 12.06 11.849 11.652 11.471 11.293 11.088 10.909 10.765 10.617 10.455 10.31 10.149 9.985 9.857 9.725 9.596 9.454 9.301 9.193 9.068 8.878 8.76 8.635 8.573 8.443 8.287 8.119 8.038 7.813 7.787 7.688 7.582 7.36 7.244 7.12 6.967 6.775 6.547 6.256 5.454 -6 ,5326 ,TETRA ,17668485,Fri Dec 3 06:38:57 CET,Fri Dec 3 08:24:55 CET,0.0 0.706 1.037 1.268 1.431 1.573 1.703 1.81 1.996 2.086 2.171 2.185 2.417 2.495 2.643 2.785 2.912 2.972 3.098 3.222 3.4 3.507 3.61 3.762 3.899 4.029 4.159 4.291 4.469 4.643 4.807 5.008 5.203 5.39 5.607 5.859 6.094 6.356 6.641 6.935 7.254 7.616 8.058 8.515 9.003 9.511 10.104 10.761 11.549 12.451 13.46 14.12 14.252 14.205 14.106 13.937 13.724 13.481 13.24 12.992 12.764 12.542 12.348 12.183 11.999 11.811 11.599 11.403 11.239 11.057 10.863 10.703 10.533 10.351 10.213 10.066 9.918 9.775 9.628 9.525 9.417 9.239 9.104 8.964 8.896 8.746 8.588 8.42 8.333 8.105 8.062 7.956 7.846 7.587 7.444 7.302 7.143 6.961 6.713 6.34 5.494 -7 ,978 ,TETRA ,17668486,Fri Dec 3 06:38:56 CET,Fri Dec 3 08:27:01 CET,0.0 0.561 0.841 1.089 1.28 1.406 1.514 1.621 1.837 1.934 2.024 2.049 2.283 2.359 2.502 2.633 2.758 2.824 2.949 3.074 3.262 3.372 3.482 3.651 3.81 3.955 4.091 4.229 4.414 4.587 4.75 4.953 5.146 5.333 5.56 5.819 6.064 6.327 6.604 6.906 7.232 7.594 8.021 8.45 8.942 9.5 10.17 10.95 11.801 12.76 13.863 14.529 14.709 14.685 14.541 14.354 14.15 13.947 13.75 13.495 13.254 13.058 12.876 12.678 12.493 12.309 12.084 11.886 11.725 11.56 11.384 11.238 11.085 10.917 10.796 10.671 10.523 10.367 10.201 10.078 9.952 9.757 9.628 9.493 9.419 9.273 9.135 8.985 8.903 8.667 8.616 8.514 8.402 8.153 8.02 7.88 7.726 7.546 7.284 6.922 6.192 -8 ,11354 ,TETRA ,17668487,Fri Dec 3 06:38:56 CET,Fri Dec 3 08:26:00 CET,0.0 0.502 0.717 0.886 1.039 1.168 1.277 1.367 1.536 1.625 1.715 1.711 1.931 2.001 2.141 2.276 2.391 2.447 2.56 2.673 2.846 2.955 3.057 3.216 3.367 3.503 3.647 3.793 3.979 4.16 4.335 4.545 4.739 4.919 5.136 5.384 5.621 5.883 6.15 6.437 6.775 7.147 7.577 8.027 8.537 9.107 9.8 10.573 11.445 12.415 13.422 13.993 14.153 14.141 14.031 13.822 13.565 13.335 13.143 12.903 12.657 12.454 12.257 12.046 11.838 11.649 11.446 11.264 11.096 10.923 10.753 10.611 10.468 10.309 10.179 10.039 9.896 9.761 9.608 9.49 9.366 9.166 9.028 8.887 8.819 8.684 8.544 8.375 8.275 8.02 7.967 7.866 7.754 7.502 7.353 7.187 7.007 6.824 6.634 6.38 5.709 -9 ,23002 ,TETRA ,17668488,Fri Dec 3 06:39:01 CET,Fri Dec 3 08:26:03 CET,0.0 0.674 0.904 1.062 1.196 1.33 1.457 1.573 1.778 1.87 1.957 1.965 2.198 2.279 2.425 2.56 2.691 2.753 2.868 2.984 3.151 3.259 3.364 3.516 3.671 3.819 3.955 4.087 4.262 4.432 4.594 4.797 4.997 5.185 5.393 5.631 5.868 6.123 6.402 6.71 7.038 7.396 7.818 8.245 8.725 9.273 9.915 10.649 11.471 12.346 13.216 13.78 13.992 13.981 13.875 13.701 13.517 13.313 13.084 12.818 12.586 12.391 12.195 11.992 11.789 11.608 11.404 11.205 11.041 10.888 10.725 10.567 10.394 10.216 10.091 9.966 9.829 9.691 9.542 9.437 9.329 9.163 9.04 8.907 8.837 8.69 8.54 8.382 8.294 8.054 7.996 7.891 7.794 7.585 7.465 7.329 7.169 6.994 6.785 6.509 5.84 -10 ,1999 ,TETRA ,17668489,Fri Dec 3 06:38:59 CET,Fri Dec 3 08:26:01 CET,0.0 0.656 0.88 1.035 1.15 1.258 1.363 1.454 1.625 1.714 1.802 1.806 2.033 2.105 2.249 2.381 2.494 2.55 2.66 2.767 2.941 3.06 3.177 3.344 3.504 3.656 3.802 3.933 4.099 4.259 4.422 4.629 4.826 5.022 5.24 5.478 5.719 5.976 6.236 6.526 6.84 7.197 7.628 8.057 8.557 9.118 9.757 10.466 11.273 12.211 13.237 13.913 14.129 14.111 13.97 13.729 13.478 13.238 12.987 12.716 12.485 12.283 12.072 11.859 11.661 11.466 11.246 11.053 10.888 10.717 10.538 10.38 10.207 10.029 9.888 9.736 9.583 9.43 9.281 9.18 9.066 8.863 8.722 8.588 8.519 8.369 8.218 8.075 7.992 7.756 7.72 7.618 7.496 7.209 7.076 6.943 6.758 6.545 6.309 6.052 5.232 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5a_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5a_1a.txt deleted file mode 100644 index ac9d893e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5a_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21154 ,KEBNE ,17028426,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:42:58 CET,0.0 0.579 0.831 1.014 1.183 1.338 1.467 1.565 1.741 1.828 1.919 1.909 2.168 2.253 2.412 2.554 2.685 2.747 2.873 3.008 3.198 3.314 3.429 3.608 3.798 3.977 4.146 4.314 4.526 4.728 4.934 5.192 5.447 5.694 5.977 6.304 6.622 6.985 7.389 7.824 8.293 8.836 9.484 10.142 10.954 11.897 12.987 14.247 15.766 17.595 19.932 21.93 23.095 23.855 24.35 24.703 24.943 25.086 25.167 25.232 25.252 25.245 25.225 25.183 25.139 25.094 25.022 24.975 24.94 24.881 24.802 24.721 24.641 24.548 24.478 24.398 24.279 24.166 24.057 23.97 23.884 23.749 23.639 23.52 23.455 23.314 23.173 23.004 22.912 22.675 22.652 22.562 22.459 22.188 21.993 21.799 21.632 21.433 21.078 20.539 17.558 -2 ,19167 ,KEBNE ,17028427,Wed Dec 22 20:16:28 CET,Wed Dec 22 21:40:37 CET,0.0 0.663 0.899 1.048 1.174 1.285 1.402 1.514 1.697 1.78 1.861 1.842 2.098 2.175 2.322 2.464 2.603 2.672 2.809 2.942 3.128 3.255 3.388 3.581 3.76 3.931 4.094 4.252 4.468 4.683 4.891 5.148 5.409 5.661 5.945 6.267 6.586 6.936 7.317 7.746 8.215 8.758 9.41 10.072 10.842 11.715 12.767 14.025 15.559 17.441 19.759 21.818 23.091 23.859 24.364 24.72 24.971 25.157 25.29 25.385 25.412 25.4 25.398 25.383 25.349 25.324 25.282 25.223 25.163 25.086 25.007 24.933 24.827 24.723 24.662 24.585 24.494 24.394 24.284 24.221 24.144 23.977 23.862 23.754 23.69 23.552 23.411 23.251 23.163 22.92 22.861 22.745 22.614 22.334 22.175 21.986 21.76 21.492 21.143 20.585 17.536 -3 ,29366 ,KEBNE ,17028428,Wed Dec 22 20:16:29 CET,Wed Dec 22 21:43:12 CET,0.0 0.366 0.606 0.778 0.886 0.982 1.088 1.191 1.393 1.488 1.574 1.568 1.824 1.895 2.043 2.206 2.36 2.428 2.559 2.688 2.888 3.023 3.142 3.306 3.469 3.639 3.805 3.961 4.169 4.382 4.595 4.845 5.097 5.35 5.633 5.953 6.271 6.628 7.031 7.462 7.922 8.463 9.108 9.783 10.563 11.421 12.473 13.754 15.305 17.21 19.663 21.752 23.001 23.806 24.326 24.683 24.953 25.126 25.227 25.3 25.327 25.329 25.306 25.276 25.236 25.189 25.133 25.066 25.014 24.955 24.86 24.778 24.693 24.596 24.521 24.439 24.356 24.263 24.128 24.026 23.933 23.802 23.715 23.605 23.545 23.428 23.298 23.145 23.052 22.807 22.764 22.67 22.557 22.286 22.137 21.954 21.696 21.371 20.983 20.436 17.271 -4 ,10800 ,KEBNE ,17028429,Wed Dec 22 20:16:30 CET,Wed Dec 22 21:42:25 CET,0.0 0.233 0.397 0.544 0.667 0.783 0.888 0.984 1.165 1.26 1.357 1.341 1.6 1.682 1.836 1.976 2.118 2.193 2.333 2.464 2.658 2.782 2.9 3.075 3.247 3.415 3.578 3.743 3.967 4.176 4.38 4.64 4.891 5.132 5.425 5.763 6.084 6.452 6.848 7.271 7.733 8.275 8.93 9.599 10.408 11.312 12.375 13.649 15.196 17.056 19.457 21.507 22.711 23.483 24.017 24.371 24.596 24.751 24.839 24.892 24.908 24.905 24.901 24.875 24.824 24.773 24.727 24.671 24.618 24.551 24.463 24.391 24.299 24.207 24.15 24.074 23.973 23.871 23.788 23.719 23.638 23.502 23.397 23.29 23.232 23.105 22.976 22.823 22.725 22.489 22.47 22.369 22.249 21.971 21.793 21.593 21.342 21.068 20.756 20.2 17.764 -5 ,22429 ,KEBNE ,17028430,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:43:05 CET,0.0 0.215 0.4 0.558 0.69 0.815 0.927 1.025 1.217 1.314 1.401 1.379 1.642 1.723 1.865 2.001 2.132 2.197 2.33 2.465 2.657 2.774 2.888 3.064 3.238 3.411 3.582 3.752 3.972 4.188 4.395 4.641 4.894 5.15 5.437 5.762 6.089 6.451 6.845 7.268 7.718 8.259 8.906 9.553 10.34 11.257 12.321 13.555 15.113 17.063 19.454 21.429 22.639 23.413 23.917 24.297 24.569 24.739 24.844 24.934 24.973 24.964 24.949 24.93 24.886 24.829 24.764 24.714 24.676 24.624 24.547 24.467 24.376 24.287 24.224 24.146 24.053 23.956 23.856 23.786 23.698 23.558 23.461 23.345 23.286 23.17 23.026 22.859 22.777 22.546 22.516 22.409 22.294 22.03 21.867 21.679 21.457 21.186 20.821 20.282 18.245 -6 ,30606 ,KEBNE ,17028431,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:47:45 CET,0.0 0.37 0.561 0.728 0.868 0.983 1.095 1.199 1.367 1.444 1.525 1.493 1.739 1.815 1.972 2.122 2.27 2.34 2.471 2.605 2.819 2.956 3.078 3.26 3.451 3.63 3.79 3.95 4.166 4.368 4.569 4.824 5.081 5.327 5.606 5.934 6.249 6.597 6.997 7.419 7.887 8.451 9.092 9.76 10.559 11.448 12.519 13.729 15.213 17.103 19.435 21.485 22.737 23.515 24.049 24.437 24.676 24.842 24.966 25.053 25.098 25.107 25.1 25.092 25.068 25.022 24.954 24.881 24.821 24.75 24.667 24.604 24.54 24.463 24.392 24.323 24.244 24.14 24.038 23.962 23.87 23.726 23.627 23.502 23.436 23.306 23.161 22.986 22.886 22.644 22.581 22.465 22.361 22.125 21.967 21.779 21.567 21.291 20.884 20.278 17.931 -7 ,4311 ,KEBNE ,17028432,Wed Dec 22 20:16:27 CET,Wed Dec 22 21:46:43 CET,0.0 0.646 0.827 0.982 1.126 1.228 1.329 1.434 1.628 1.717 1.806 1.797 2.058 2.138 2.295 2.448 2.593 2.663 2.804 2.933 3.114 3.234 3.353 3.531 3.706 3.881 4.044 4.202 4.421 4.639 4.85 5.112 5.371 5.623 5.91 6.233 6.551 6.909 7.303 7.723 8.177 8.717 9.351 10.007 10.803 11.716 12.79 14.048 15.597 17.53 19.967 22.018 23.214 23.964 24.474 24.81 25.017 25.178 25.283 25.353 25.383 25.371 25.346 25.335 25.303 25.26 25.219 25.167 25.114 25.044 24.961 24.878 24.794 24.712 24.638 24.556 24.474 24.406 24.313 24.229 24.146 24.018 23.914 23.806 23.756 23.642 23.503 23.348 23.26 23.022 22.976 22.862 22.741 22.464 22.302 22.119 21.911 21.637 21.213 20.592 17.69 -8 ,28908 ,KEBNE ,17028433,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:49:32 CET,0.0 0.416 0.626 0.804 0.947 1.082 1.207 1.315 1.521 1.617 1.698 1.68 1.94 2.024 2.181 2.321 2.455 2.519 2.65 2.782 2.968 3.088 3.212 3.392 3.569 3.741 3.902 4.055 4.26 4.47 4.685 4.948 5.192 5.426 5.71 6.036 6.36 6.743 7.157 7.597 8.07 8.602 9.227 9.877 10.657 11.567 12.631 13.864 15.398 17.238 19.559 21.567 22.765 23.571 24.101 24.478 24.721 24.885 25.008 25.089 25.133 25.15 25.134 25.114 25.088 25.042 24.99 24.934 24.881 24.825 24.753 24.695 24.629 24.542 24.475 24.395 24.306 24.206 24.091 24.015 23.938 23.813 23.71 23.588 23.512 23.357 23.21 23.056 22.969 22.736 22.705 22.61 22.506 22.235 22.088 21.925 21.733 21.504 21.179 20.6 18.416 -9 ,14896 ,KEBNE ,17028434,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:46:34 CET,0.0 0.38 0.539 0.692 0.84 0.974 1.081 1.179 1.385 1.48 1.58 1.599 1.86 1.938 2.094 2.23 2.366 2.439 2.576 2.711 2.908 3.038 3.163 3.34 3.517 3.693 3.865 4.03 4.239 4.447 4.659 4.918 5.175 5.418 5.697 6.018 6.336 6.7 7.093 7.515 7.975 8.515 9.158 9.821 10.616 11.524 12.581 13.843 15.367 17.245 19.665 21.69 22.923 23.724 24.233 24.576 24.819 24.977 25.064 25.117 25.137 25.127 25.12 25.108 25.069 25.024 24.969 24.908 24.832 24.747 24.663 24.598 24.523 24.442 24.367 24.27 24.177 24.091 23.982 23.902 23.811 23.673 23.58 23.482 23.437 23.311 23.171 23.021 22.933 22.701 22.658 22.546 22.443 22.172 21.991 21.802 21.579 21.293 20.947 20.433 18.039 -10 ,5544 ,KEBNE ,17028435,Wed Dec 22 20:16:27 CET,Wed Dec 22 21:46:32 CET,0.0 0.468 0.709 0.878 1.004 1.11 1.207 1.306 1.499 1.581 1.662 1.645 1.895 1.964 2.108 2.26 2.4 2.465 2.597 2.722 2.903 3.026 3.155 3.341 3.509 3.674 3.838 4.001 4.22 4.435 4.644 4.901 5.142 5.375 5.663 5.997 6.319 6.684 7.085 7.517 7.978 8.522 9.181 9.856 10.644 11.565 12.672 13.934 15.446 17.312 19.754 21.753 22.945 23.736 24.233 24.557 24.759 24.906 25.013 25.095 25.135 25.135 25.127 25.104 25.06 25.022 24.961 24.893 24.826 24.749 24.667 24.596 24.518 24.427 24.348 24.267 24.182 24.094 23.988 23.902 23.811 23.662 23.559 23.459 23.397 23.242 23.097 22.954 22.883 22.66 22.62 22.511 22.385 22.102 21.906 21.689 21.449 21.152 20.766 20.198 17.881 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5a_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5a_3a.txt deleted file mode 100644 index 579a097e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5a_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18195 ,TETRA ,17668490,Fri Dec 3 06:38:57 CET,Fri Dec 3 08:26:02 CET,0.0 0.653 0.986 1.231 1.461 1.68 1.86 2.01 2.291 2.422 2.547 2.608 2.891 2.99 3.191 3.378 3.546 3.633 3.815 3.989 4.226 4.372 4.512 4.723 4.935 5.139 5.342 5.535 5.792 6.043 6.272 6.56 6.838 7.099 7.416 7.774 8.111 8.492 8.897 9.318 9.776 10.316 10.959 11.581 12.315 13.19 14.17 15.221 16.478 17.973 19.731 21.147 21.932 22.412 22.735 22.945 23.066 23.149 23.194 23.201 23.182 23.163 23.145 23.115 23.076 23.042 22.989 22.927 22.873 22.817 22.767 22.724 22.675 22.609 22.546 22.479 22.415 22.35 22.275 22.222 22.164 22.071 22.003 21.932 21.897 21.819 21.718 21.608 21.561 21.352 21.382 21.316 21.25 21.12 21.045 20.947 20.839 20.718 20.564 20.391 20.16 -2 ,2159 ,TETRA ,17668491,Fri Dec 3 06:38:56 CET,Fri Dec 3 08:26:16 CET,0.0 0.858 1.155 1.379 1.592 1.775 1.948 2.108 2.37 2.495 2.629 2.69 2.969 3.072 3.27 3.454 3.634 3.725 3.892 4.052 4.291 4.437 4.584 4.81 5.018 5.214 5.41 5.608 5.857 6.097 6.34 6.635 6.918 7.193 7.516 7.861 8.187 8.565 8.968 9.4 9.873 10.414 11.058 11.697 12.415 13.19 14.103 15.171 16.416 17.834 19.481 20.833 21.653 22.176 22.486 22.689 22.84 22.931 22.971 22.992 22.997 22.981 22.947 22.905 22.868 22.835 22.78 22.726 22.682 22.621 22.554 22.494 22.415 22.338 22.29 22.242 22.181 22.118 22.059 22.013 21.963 21.882 21.822 21.755 21.722 21.652 21.571 21.468 21.407 21.191 21.223 21.157 21.092 20.954 20.874 20.788 20.678 20.547 20.375 20.149 19.695 -3 ,14880 ,TETRA ,17668492,Fri Dec 3 06:38:56 CET,Fri Dec 3 08:27:20 CET,0.0 0.622 0.925 1.175 1.373 1.56 1.731 1.893 2.196 2.331 2.449 2.48 2.761 2.864 3.065 3.263 3.446 3.535 3.711 3.89 4.16 4.316 4.464 4.682 4.889 5.092 5.294 5.489 5.734 5.971 6.198 6.48 6.758 7.03 7.343 7.668 7.988 8.374 8.792 9.231 9.699 10.225 10.842 11.454 12.199 13.012 13.914 14.98 16.237 17.75 19.623 21.114 21.925 22.401 22.691 22.861 22.958 23.027 23.077 23.091 23.06 23.02 22.989 22.96 22.925 22.886 22.844 22.796 22.746 22.7 22.643 22.587 22.518 22.444 22.393 22.334 22.272 22.211 22.148 22.103 22.046 21.957 21.898 21.829 21.792 21.721 21.655 21.574 21.518 21.307 21.357 21.297 21.231 21.1 21.03 20.942 20.815 20.668 20.5 20.205 19.489 -4 ,29332 ,TETRA ,17668493,Fri Dec 3 06:38:59 CET,Fri Dec 3 08:27:28 CET,0.0 1.212 1.603 1.875 2.108 2.305 2.478 2.634 2.93 3.069 3.197 3.251 3.54 3.65 3.863 4.053 4.229 4.32 4.497 4.66 4.906 5.065 5.215 5.437 5.652 5.849 6.038 6.227 6.486 6.747 6.988 7.276 7.561 7.839 8.171 8.544 8.888 9.275 9.685 10.104 10.548 11.056 11.678 12.322 13.06 13.906 14.875 15.933 17.189 18.657 20.436 21.949 22.808 23.34 23.672 23.872 23.98 24.018 24.039 24.051 24.047 24.028 23.995 23.978 23.95 23.895 23.821 23.762 23.71 23.653 23.599 23.557 23.508 23.453 23.407 23.347 23.279 23.2 23.113 23.063 23.013 22.918 22.846 22.772 22.731 22.649 22.56 22.465 22.421 22.222 22.267 22.205 22.141 21.98 21.884 21.794 21.691 21.554 21.387 21.158 20.595 -5 ,23298 ,TETRA ,17668494,Fri Dec 3 06:39:01 CET,Fri Dec 3 08:26:27 CET,0.0 0.821 1.17 1.425 1.654 1.824 1.974 2.121 2.395 2.518 2.629 2.671 2.964 3.081 3.294 3.5 3.69 3.775 3.95 4.121 4.38 4.54 4.684 4.904 5.123 5.335 5.539 5.728 5.971 6.216 6.46 6.766 7.061 7.345 7.671 8.041 8.388 8.779 9.204 9.653 10.136 10.667 11.304 11.949 12.677 13.496 14.456 15.498 16.714 18.199 19.937 21.302 22.049 22.527 22.807 22.96 23.059 23.133 23.172 23.171 23.152 23.131 23.117 23.095 23.066 23.035 22.977 22.925 22.889 22.839 22.774 22.716 22.65 22.588 22.535 22.47 22.403 22.336 22.272 22.228 22.18 22.086 22.014 21.952 21.922 21.851 21.771 21.674 21.623 21.417 21.463 21.4 21.33 21.189 21.099 21.003 20.874 20.707 20.555 20.39 19.874 -6 ,5055 ,TETRA ,17668495,Fri Dec 3 06:39:03 CET,Fri Dec 3 08:26:07 CET,0.0 0.791 1.083 1.298 1.485 1.662 1.821 1.967 2.249 2.378 2.497 2.557 2.847 2.951 3.166 3.38 3.577 3.67 3.846 4.014 4.258 4.405 4.545 4.753 4.962 5.176 5.396 5.601 5.843 6.085 6.329 6.618 6.893 7.16 7.471 7.834 8.196 8.587 8.995 9.444 9.922 10.454 11.057 11.684 12.439 13.242 14.209 15.354 16.628 18.057 19.799 21.216 22.002 22.498 22.812 22.988 23.087 23.172 23.228 23.239 23.219 23.193 23.158 23.108 23.065 23.026 22.975 22.927 22.883 22.842 22.796 22.755 22.713 22.66 22.613 22.564 22.505 22.439 22.368 22.309 22.249 22.161 22.096 22.027 21.991 21.913 21.834 21.757 21.711 21.507 21.563 21.506 21.43 21.273 21.189 21.102 21.01 20.904 20.766 20.557 19.967 -7 ,24214 ,TETRA ,17668496,Fri Dec 3 06:38:57 CET,Fri Dec 3 08:25:57 CET,0.0 0.813 1.118 1.371 1.592 1.781 1.937 2.082 2.361 2.495 2.616 2.651 2.935 3.046 3.257 3.446 3.634 3.727 3.895 4.058 4.311 4.467 4.614 4.832 5.048 5.257 5.462 5.667 5.935 6.196 6.444 6.747 7.042 7.327 7.646 7.99 8.328 8.7 9.107 9.566 10.035 10.564 11.185 11.796 12.52 13.35 14.318 15.404 16.685 18.201 19.968 21.336 22.136 22.651 22.962 23.166 23.287 23.341 23.371 23.367 23.344 23.316 23.278 23.24 23.197 23.149 23.099 23.048 22.997 22.949 22.884 22.816 22.745 22.673 22.615 22.548 22.481 22.41 22.335 22.283 22.228 22.144 22.081 22.006 21.965 21.891 21.818 21.741 21.695 21.487 21.526 21.467 21.409 21.276 21.203 21.117 21.003 20.867 20.707 20.514 19.976 -8 ,20526 ,TETRA ,17668497,Fri Dec 3 06:38:59 CET,Fri Dec 3 08:26:12 CET,0.0 0.863 1.211 1.471 1.67 1.838 1.994 2.136 2.39 2.513 2.637 2.68 2.966 3.081 3.297 3.493 3.684 3.771 3.941 4.109 4.342 4.49 4.64 4.862 5.069 5.263 5.455 5.651 5.903 6.146 6.388 6.689 6.977 7.253 7.577 7.941 8.303 8.691 9.097 9.541 10.023 10.555 11.169 11.815 12.579 13.413 14.408 15.52 16.776 18.292 20.096 21.53 22.336 22.826 23.116 23.288 23.399 23.471 23.499 23.497 23.477 23.455 23.421 23.386 23.356 23.311 23.251 23.195 23.147 23.086 23.027 22.984 22.932 22.868 22.811 22.756 22.694 22.614 22.521 22.46 22.4 22.3 22.229 22.153 22.109 22.025 21.947 21.861 21.814 21.609 21.644 21.578 21.508 21.362 21.276 21.191 21.106 21.005 20.858 20.642 20.034 -9 ,30862 ,TETRA ,17668498,Fri Dec 3 06:39:01 CET,Fri Dec 3 08:26:19 CET,0.0 0.762 1.121 1.402 1.649 1.837 1.998 2.148 2.413 2.541 2.663 2.723 3.013 3.11 3.3 3.489 3.663 3.75 3.928 4.099 4.342 4.498 4.652 4.885 5.116 5.33 5.529 5.722 5.977 6.227 6.462 6.739 7.011 7.293 7.626 7.988 8.339 8.724 9.135 9.575 10.028 10.542 11.164 11.791 12.545 13.356 14.258 15.352 16.605 18.009 19.688 21.107 21.919 22.371 22.687 22.9 23.024 23.106 23.13 23.131 23.117 23.094 23.062 23.025 22.989 22.933 22.86 22.797 22.737 22.681 22.615 22.551 22.496 22.44 22.396 22.35 22.294 22.229 22.157 22.109 22.06 21.979 21.917 21.851 21.816 21.739 21.647 21.551 21.51 21.309 21.348 21.283 21.209 21.05 20.968 20.861 20.727 20.559 20.366 20.155 19.682 -10 ,3108 ,TETRA ,17668499,Fri Dec 3 06:39:03 CET,Fri Dec 3 08:25:58 CET,0.0 0.747 1.047 1.279 1.478 1.657 1.825 1.979 2.248 2.37 2.492 2.564 2.86 2.97 3.182 3.386 3.579 3.673 3.853 4.034 4.299 4.462 4.616 4.839 5.048 5.253 5.46 5.665 5.921 6.16 6.402 6.691 6.97 7.261 7.59 7.937 8.276 8.655 9.087 9.546 10.027 10.584 11.238 11.895 12.635 13.465 14.431 15.495 16.8 18.345 20.105 21.519 22.322 22.808 23.117 23.288 23.358 23.408 23.445 23.461 23.468 23.455 23.404 23.355 23.311 23.269 23.22 23.172 23.131 23.075 23.013 22.97 22.922 22.86 22.812 22.762 22.69 22.612 22.541 22.495 22.441 22.347 22.27 22.2 22.169 22.092 22.01 21.92 21.871 21.668 21.708 21.647 21.575 21.407 21.313 21.208 21.106 20.995 20.853 20.677 20.172 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5a.txt deleted file mode 100644 index 01af7ec2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25143 ,TETRA ,17668500,Fri Dec 3 06:38:57 CET,Fri Dec 3 08:25:32 CET,0.0 0.721 1.017 1.227 1.431 1.618 1.788 1.937 2.173 2.298 2.42 2.423 2.731 2.832 3.023 3.209 3.375 3.455 3.62 3.783 4.027 4.18 4.321 4.532 4.737 4.934 5.126 5.31 5.568 5.843 6.116 6.433 6.731 7.038 7.399 7.77 8.115 8.507 8.936 9.384 9.871 10.472 11.186 11.89 12.75 13.73 14.85 16.171 17.815 19.868 22.471 24.725 26.095 26.993 27.609 28.045 28.363 28.599 28.762 28.859 28.91 28.96 29.013 29.052 29.058 29.041 29.001 28.934 28.883 28.862 28.826 28.783 28.739 28.679 28.616 28.549 28.475 28.397 28.305 28.236 28.173 28.065 27.983 27.9 27.856 27.777 27.702 27.612 27.557 27.321 27.376 27.318 27.256 27.106 27.015 26.893 26.741 26.591 26.399 26.096 25.336 -2 ,20045 ,TETRA ,17668501,Fri Dec 3 06:38:58 CET,Fri Dec 3 08:25:33 CET,0.0 1.016 1.355 1.576 1.773 1.955 2.11 2.245 2.496 2.616 2.729 2.745 3.046 3.136 3.313 3.491 3.674 3.761 3.921 4.084 4.308 4.463 4.624 4.833 5.052 5.277 5.478 5.672 5.944 6.214 6.472 6.774 7.059 7.336 7.655 8.02 8.379 8.77 9.196 9.651 10.15 10.739 11.427 12.125 12.963 13.914 15.06 16.405 18.014 20.044 22.619 24.802 26.152 27.054 27.703 28.193 28.536 28.797 28.986 29.13 29.227 29.281 29.316 29.336 29.339 29.335 29.328 29.32 29.308 29.291 29.268 29.238 29.203 29.16 29.115 29.055 28.988 28.914 28.834 28.78 28.713 28.615 28.547 28.463 28.425 28.366 28.302 28.216 28.167 27.94 28.013 27.949 27.876 27.697 27.593 27.475 27.346 27.204 27.038 26.87 26.391 -3 ,31381 ,TETRA ,17668502,Fri Dec 3 06:38:59 CET,Fri Dec 3 08:25:16 CET,0.0 0.935 1.198 1.422 1.633 1.822 1.979 2.124 2.383 2.496 2.606 2.616 2.918 3.019 3.225 3.406 3.583 3.672 3.833 3.986 4.224 4.387 4.547 4.757 4.966 5.189 5.409 5.62 5.881 6.126 6.38 6.716 7.022 7.308 7.645 8.013 8.377 8.777 9.203 9.674 10.202 10.805 11.491 12.194 13.036 14.002 15.156 16.513 18.16 20.167 22.751 25.009 26.396 27.329 27.987 28.447 28.768 29.001 29.161 29.263 29.298 29.332 29.364 29.379 29.39 29.384 29.357 29.326 29.29 29.255 29.228 29.198 29.167 29.122 29.074 29.019 28.953 28.871 28.787 28.735 28.681 28.595 28.528 28.448 28.404 28.309 28.221 28.144 28.098 27.866 27.902 27.821 27.747 27.613 27.528 27.415 27.282 27.123 26.933 26.622 25.805 -4 ,31927 ,TETRA ,17668503,Fri Dec 3 06:39:01 CET,Fri Dec 3 08:25:21 CET,0.0 0.589 0.887 1.108 1.301 1.477 1.638 1.785 2.064 2.187 2.294 2.286 2.6 2.713 2.914 3.086 3.253 3.339 3.512 3.672 3.882 4.028 4.183 4.411 4.622 4.83 5.056 5.278 5.557 5.808 6.046 6.339 6.609 6.868 7.177 7.55 7.911 8.291 8.716 9.195 9.701 10.27 10.951 11.645 12.476 13.438 14.572 15.907 17.549 19.589 22.21 24.523 25.969 26.92 27.585 28.025 28.302 28.47 28.584 28.708 28.802 28.84 28.824 28.798 28.761 28.743 28.733 28.711 28.699 28.681 28.654 28.627 28.588 28.539 28.481 28.407 28.344 28.281 28.21 28.153 28.083 27.987 27.921 27.848 27.808 27.715 27.615 27.503 27.448 27.221 27.274 27.2 27.123 26.961 26.859 26.711 26.537 26.355 26.131 25.811 24.931 -5 ,18501 ,TETRA ,17668504,Fri Dec 3 06:38:57 CET,Fri Dec 3 08:25:57 CET,0.0 0.778 1.081 1.341 1.541 1.709 1.861 1.992 2.243 2.353 2.453 2.449 2.751 2.856 3.06 3.244 3.428 3.517 3.68 3.835 4.078 4.243 4.404 4.635 4.869 5.083 5.269 5.464 5.742 5.999 6.226 6.502 6.779 7.053 7.381 7.762 8.158 8.599 9.045 9.534 10.053 10.626 11.324 12.041 12.891 13.865 14.998 16.309 17.919 19.959 22.592 24.839 26.21 27.161 27.844 28.324 28.622 28.837 29.005 29.153 29.261 29.326 29.362 29.391 29.406 29.411 29.412 29.395 29.367 29.331 29.285 29.243 29.188 29.118 29.062 28.999 28.937 28.861 28.769 28.714 28.66 28.566 28.495 28.412 28.371 28.293 28.212 28.123 28.075 27.839 27.865 27.779 27.697 27.54 27.446 27.339 27.223 27.067 26.85 26.556 25.718 -6 ,25053 ,TETRA ,17668506,Fri Dec 3 06:38:59 CET,Fri Dec 3 08:25:49 CET,0.0 0.883 1.211 1.443 1.638 1.808 1.978 2.14 2.444 2.584 2.708 2.733 3.043 3.139 3.333 3.531 3.719 3.806 3.973 4.148 4.409 4.564 4.716 4.969 5.209 5.407 5.597 5.796 6.065 6.344 6.624 6.955 7.257 7.543 7.89 8.3 8.702 9.116 9.554 10.043 10.574 11.156 11.828 12.52 13.35 14.312 15.458 16.787 18.403 20.459 23.068 25.321 26.718 27.619 28.218 28.658 28.995 29.254 29.436 29.547 29.598 29.657 29.691 29.66 29.644 29.652 29.638 29.589 29.555 29.533 29.495 29.46 29.422 29.375 29.329 29.276 29.227 29.176 29.094 29.027 28.961 28.863 28.799 28.727 28.689 28.61 28.531 28.448 28.393 28.153 28.202 28.128 28.04 27.871 27.784 27.675 27.541 27.398 27.227 26.93 26.156 -7 ,8677 ,TETRA ,17668507,Fri Dec 3 06:39:01 CET,Fri Dec 3 08:25:26 CET,0.0 0.535 0.795 1.009 1.204 1.393 1.557 1.696 1.972 2.1 2.215 2.219 2.534 2.644 2.834 3.013 3.198 3.288 3.468 3.646 3.898 4.062 4.231 4.465 4.685 4.9 5.095 5.283 5.53 5.781 6.024 6.316 6.62 6.905 7.226 7.641 8.058 8.494 8.957 9.435 9.924 10.495 11.192 11.909 12.762 13.781 14.991 16.362 18.056 20.107 22.665 24.911 26.322 27.245 27.901 28.405 28.77 29.032 29.201 29.335 29.432 29.491 29.526 29.542 29.548 29.556 29.554 29.545 29.528 29.495 29.457 29.418 29.371 29.325 29.293 29.248 29.194 29.136 29.073 29.028 28.965 28.86 28.781 28.695 28.653 28.558 28.464 28.382 28.335 28.102 28.19 28.143 28.067 27.862 27.752 27.628 27.494 27.349 27.138 26.817 25.732 -8 ,19424 ,TETRA ,17668508,Fri Dec 3 06:39:03 CET,Fri Dec 3 08:25:40 CET,0.0 0.68 0.972 1.17 1.351 1.522 1.664 1.801 2.041 2.148 2.253 2.248 2.552 2.647 2.831 3.014 3.191 3.276 3.458 3.642 3.874 4.021 4.176 4.387 4.59 4.79 4.987 5.196 5.465 5.722 5.965 6.257 6.535 6.81 7.133 7.494 7.851 8.246 8.675 9.171 9.721 10.361 11.126 11.862 12.719 13.692 14.857 16.228 17.892 19.93 22.513 24.79 26.184 27.107 27.753 28.214 28.519 28.74 28.917 29.047 29.131 29.198 29.246 29.261 29.255 29.249 29.241 29.212 29.164 29.093 28.996 28.924 28.859 28.791 28.744 28.689 28.637 28.588 28.536 28.498 28.452 28.355 28.276 28.195 28.152 28.054 27.944 27.842 27.797 27.566 27.605 27.528 27.451 27.274 27.153 27.025 26.891 26.755 26.586 26.284 25.31 -9 ,18376 ,TETRA ,17668509,Fri Dec 3 06:39:27 CET,Fri Dec 3 08:27:55 CET,0.0 0.546 0.817 1.014 1.204 1.375 1.538 1.699 2.014 2.147 2.268 2.297 2.612 2.723 2.94 3.137 3.311 3.393 3.552 3.712 3.952 4.1 4.244 4.457 4.665 4.862 5.049 5.233 5.483 5.731 5.962 6.253 6.54 6.809 7.112 7.461 7.824 8.227 8.654 9.131 9.665 10.27 10.975 11.694 12.532 13.495 14.636 15.95 17.544 19.591 22.297 24.646 26.069 27.009 27.643 28.116 28.454 28.695 28.869 29.02 29.114 29.17 29.212 29.222 29.223 29.227 29.226 29.218 29.178 29.122 29.078 29.038 28.992 28.94 28.894 28.842 28.785 28.719 28.642 28.584 28.517 28.422 28.368 28.313 28.278 28.205 28.118 28.013 27.961 27.73 27.787 27.715 27.629 27.415 27.295 27.172 27.047 26.914 26.736 26.482 25.703 -10 ,27654 ,TETRA ,17668510,Fri Dec 3 06:39:28 CET,Fri Dec 3 08:27:48 CET,0.0 0.73 1.034 1.276 1.474 1.642 1.798 1.945 2.232 2.366 2.484 2.502 2.812 2.912 3.106 3.3 3.493 3.584 3.756 3.913 4.133 4.291 4.462 4.699 4.911 5.107 5.306 5.522 5.802 6.05 6.277 6.553 6.86 7.186 7.552 7.939 8.293 8.714 9.176 9.641 10.161 10.774 11.511 12.282 13.175 14.157 15.322 16.686 18.333 20.359 22.933 25.205 26.612 27.572 28.222 28.63 28.926 29.124 29.219 29.319 29.41 29.472 29.472 29.444 29.411 29.393 29.37 29.337 29.307 29.267 29.22 29.18 29.151 29.098 29.044 28.997 28.944 28.888 28.842 28.803 28.744 28.65 28.587 28.52 28.489 28.438 28.365 28.282 28.239 28.008 28.059 27.986 27.908 27.747 27.655 27.545 27.429 27.278 27.102 26.878 26.217 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5c.txt deleted file mode 100644 index a1fdcc2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20912 ,TETRA ,17668511,Fri Dec 3 06:39:29 CET,Fri Dec 3 08:25:38 CET,0.0 0.526 0.815 1.021 1.207 1.385 1.545 1.695 1.991 2.129 2.254 2.267 2.574 2.685 2.884 3.073 3.274 3.376 3.57 3.742 3.984 4.141 4.284 4.494 4.718 4.944 5.174 5.388 5.655 5.926 6.176 6.451 6.701 6.952 7.268 7.619 7.969 8.352 8.73 9.132 9.57 10.061 10.642 11.24 11.922 12.703 13.646 14.691 15.893 17.363 19.145 20.5 21.285 21.769 22.07 22.276 22.394 22.418 22.404 22.383 22.342 22.296 22.246 22.193 22.099 21.992 21.912 21.84 21.76 21.671 21.583 21.506 21.422 21.319 21.241 21.177 21.099 21.004 20.904 20.84 20.782 20.683 20.6 20.518 20.476 20.386 20.288 20.183 20.123 19.872 19.961 19.905 19.831 19.67 19.586 19.489 19.382 19.268 19.098 18.837 18.061 -2 ,31637 ,TETRA ,17668512,Fri Dec 3 06:39:29 CET,Fri Dec 3 08:26:58 CET,0.0 0.472 0.769 0.992 1.191 1.372 1.542 1.709 2.02 2.152 2.277 2.328 2.649 2.748 2.926 3.11 3.302 3.391 3.562 3.738 3.998 4.153 4.295 4.51 4.727 4.937 5.134 5.327 5.608 5.885 6.149 6.463 6.753 7.028 7.33 7.66 7.986 8.38 8.8 9.219 9.666 10.179 10.767 11.351 12.066 12.889 13.829 14.889 16.127 17.566 19.32 20.736 21.507 21.96 22.23 22.393 22.483 22.543 22.558 22.549 22.505 22.422 22.347 22.27 22.195 22.133 22.06 21.967 21.871 21.766 21.665 21.586 21.491 21.373 21.278 21.196 21.113 21.018 20.925 20.867 20.815 20.727 20.642 20.538 20.484 20.378 20.27 20.163 20.107 19.85 19.885 19.809 19.726 19.539 19.427 19.284 19.132 18.978 18.818 18.624 18.085 -3 ,19137 ,TETRA ,17668513,Fri Dec 3 06:39:27 CET,Fri Dec 3 08:26:27 CET,0.0 0.557 0.811 0.989 1.175 1.356 1.534 1.687 1.974 2.114 2.248 2.31 2.637 2.749 2.963 3.168 3.367 3.458 3.632 3.794 4.047 4.221 4.399 4.651 4.871 5.075 5.263 5.453 5.713 5.97 6.211 6.514 6.832 7.122 7.447 7.83 8.192 8.564 8.958 9.418 9.912 10.447 11.076 11.691 12.39 13.173 14.074 15.098 16.298 17.762 19.553 20.934 21.721 22.168 22.411 22.556 22.608 22.632 22.652 22.66 22.645 22.613 22.577 22.515 22.45 22.387 22.318 22.261 22.21 22.144 22.059 21.991 21.914 21.808 21.715 21.608 21.493 21.383 21.267 21.187 21.109 20.978 20.884 20.786 20.735 20.627 20.514 20.383 20.319 20.069 20.118 20.048 19.963 19.779 19.681 19.58 19.478 19.351 19.201 19.025 18.644 -4 ,397 ,TETRA ,17668514,Fri Dec 3 06:39:29 CET,Fri Dec 3 08:27:08 CET,0.0 0.695 1.033 1.274 1.478 1.67 1.836 1.976 2.258 2.386 2.507 2.554 2.876 2.976 3.176 3.38 3.579 3.677 3.873 4.069 4.338 4.505 4.668 4.906 5.138 5.352 5.551 5.747 6.0 6.24 6.47 6.756 7.03 7.288 7.623 7.995 8.317 8.665 9.041 9.452 9.913 10.462 11.094 11.717 12.429 13.211 14.107 15.146 16.393 17.876 19.638 21.089 21.893 22.342 22.624 22.801 22.903 22.931 22.92 22.918 22.901 22.856 22.802 22.753 22.687 22.615 22.543 22.47 22.399 22.309 22.209 22.128 22.048 21.957 21.867 21.772 21.679 21.58 21.472 21.392 21.316 21.209 21.133 21.054 21.013 20.933 20.846 20.756 20.71 20.466 20.514 20.435 20.345 20.168 20.08 19.971 19.844 19.707 19.555 19.36 18.773 -5 ,23964 ,TETRA ,17668515,Fri Dec 3 06:39:31 CET,Fri Dec 3 08:25:58 CET,0.0 0.652 0.928 1.137 1.329 1.51 1.681 1.84 2.109 2.236 2.36 2.387 2.71 2.824 3.039 3.248 3.438 3.527 3.711 3.895 4.154 4.304 4.449 4.674 4.899 5.112 5.323 5.534 5.792 6.043 6.299 6.624 6.936 7.215 7.517 7.863 8.234 8.669 9.113 9.566 10.027 10.521 11.174 11.853 12.572 13.369 14.305 15.36 16.599 18.075 19.814 21.252 22.066 22.537 22.823 22.988 23.076 23.114 23.129 23.114 23.074 23.021 22.977 22.935 22.874 22.792 22.706 22.634 22.568 22.482 22.383 22.29 22.176 22.066 21.972 21.868 21.773 21.683 21.575 21.494 21.411 21.28 21.184 21.086 21.036 20.942 20.841 20.731 20.678 20.43 20.501 20.427 20.339 20.151 20.044 19.931 19.822 19.692 19.535 19.351 18.773 -6 ,1230 ,TETRA ,17668516,Fri Dec 3 06:39:27 CET,Fri Dec 3 08:26:33 CET,0.0 0.731 1.031 1.281 1.486 1.669 1.837 1.998 2.29 2.425 2.559 2.592 2.907 3.022 3.241 3.441 3.617 3.699 3.875 4.051 4.295 4.451 4.598 4.816 5.037 5.243 5.447 5.648 5.894 6.124 6.346 6.634 6.911 7.172 7.49 7.844 8.183 8.57 8.969 9.386 9.836 10.331 10.913 11.499 12.202 13.007 13.932 14.993 16.253 17.706 19.392 20.774 21.506 21.939 22.258 22.466 22.57 22.606 22.57 22.514 22.48 22.449 22.411 22.34 22.25 22.149 22.05 21.951 21.862 21.783 21.677 21.578 21.483 21.382 21.294 21.209 21.126 21.027 20.935 20.875 20.791 20.654 20.57 20.495 20.453 20.337 20.217 20.105 20.046 19.792 19.861 19.795 19.713 19.541 19.452 19.343 19.2 19.059 18.914 18.669 18.151 -7 ,14336 ,TETRA ,17668517,Fri Dec 3 06:39:31 CET,Fri Dec 3 08:26:24 CET,0.0 0.714 1.135 1.375 1.584 1.754 1.891 2.017 2.265 2.382 2.503 2.531 2.84 2.953 3.176 3.377 3.557 3.646 3.835 4.001 4.217 4.366 4.517 4.746 4.962 5.172 5.385 5.588 5.854 6.108 6.342 6.619 6.883 7.141 7.446 7.778 8.119 8.517 8.918 9.343 9.805 10.32 10.922 11.538 12.257 13.04 13.944 14.97 16.175 17.615 19.376 20.817 21.645 22.133 22.417 22.583 22.644 22.651 22.631 22.613 22.567 22.5 22.435 22.359 22.288 22.221 22.125 22.028 21.955 21.882 21.807 21.736 21.655 21.578 21.518 21.448 21.379 21.305 21.215 21.145 21.062 20.933 20.845 20.75 20.704 20.605 20.492 20.387 20.329 20.068 20.101 20.035 19.963 19.804 19.718 19.613 19.497 19.36 19.195 18.961 18.416 -8 ,3389 ,TETRA ,17668518,Fri Dec 3 06:39:29 CET,Fri Dec 3 08:25:14 CET,0.0 0.602 0.93 1.154 1.348 1.543 1.712 1.856 2.129 2.261 2.384 2.401 2.71 2.82 3.029 3.218 3.409 3.507 3.675 3.833 4.067 4.226 4.396 4.642 4.878 5.102 5.303 5.494 5.738 5.969 6.202 6.495 6.771 7.039 7.364 7.715 8.038 8.39 8.775 9.203 9.69 10.232 10.857 11.536 12.31 13.111 14.074 15.184 16.451 17.936 19.674 21.06 21.825 22.255 22.499 22.589 22.59 22.607 22.613 22.581 22.545 22.468 22.39 22.341 22.262 22.155 22.052 21.99 21.922 21.82 21.705 21.609 21.504 21.395 21.305 21.204 21.117 21.026 20.908 20.827 20.748 20.628 20.554 20.472 20.427 20.333 20.22 20.108 20.057 19.809 19.869 19.806 19.731 19.563 19.478 19.369 19.258 19.146 18.989 18.771 18.214 -9 ,17939 ,TETRA ,17668519,Fri Dec 3 06:39:27 CET,Fri Dec 3 08:28:33 CET,0.0 0.638 0.899 1.102 1.292 1.47 1.643 1.807 2.091 2.226 2.353 2.381 2.695 2.799 2.998 3.177 3.343 3.43 3.612 3.78 3.998 4.139 4.275 4.474 4.684 4.89 5.089 5.291 5.565 5.806 6.025 6.307 6.593 6.877 7.194 7.541 7.869 8.236 8.645 9.063 9.497 9.997 10.593 11.194 11.887 12.66 13.577 14.644 15.884 17.334 19.095 20.498 21.252 21.679 21.956 22.13 22.219 22.262 22.268 22.252 22.183 22.094 21.999 21.899 21.824 21.764 21.676 21.571 21.482 21.4 21.317 21.252 21.171 21.079 21.006 20.912 20.815 20.732 20.641 20.564 20.486 20.378 20.301 20.217 20.178 20.093 19.976 19.832 19.762 19.508 19.564 19.498 19.432 19.269 19.173 19.067 18.923 18.753 18.571 18.337 17.992 -10 ,14929 ,TETRA ,17668520,Fri Dec 3 06:39:28 CET,Fri Dec 3 08:26:35 CET,0.0 0.722 1.023 1.28 1.485 1.662 1.823 1.977 2.26 2.378 2.487 2.496 2.8 2.902 3.081 3.26 3.464 3.561 3.753 3.935 4.165 4.327 4.494 4.713 4.907 5.101 5.305 5.511 5.769 6.015 6.274 6.583 6.862 7.136 7.455 7.794 8.131 8.517 8.93 9.352 9.791 10.327 10.988 11.655 12.416 13.265 14.236 15.296 16.543 18.019 19.849 21.364 22.179 22.673 22.966 23.157 23.241 23.247 23.23 23.209 23.195 23.171 23.128 23.067 23.006 22.945 22.867 22.798 22.737 22.655 22.57 22.506 22.441 22.351 22.276 22.197 22.097 21.992 21.884 21.8 21.707 21.559 21.475 21.398 21.348 21.244 21.136 21.015 20.956 20.714 20.799 20.732 20.656 20.493 20.392 20.278 20.165 20.029 19.851 19.64 18.89 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5d_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5d_3b.txt deleted file mode 100644 index cdb2b50d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5d_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7015 ,TETRA ,17668521,Fri Dec 3 06:39:31 CET,Fri Dec 3 08:25:48 CET,0.0 0.934 1.241 1.478 1.65 1.807 1.987 2.153 2.432 2.558 2.673 2.724 3.003 3.1 3.31 3.522 3.712 3.804 3.983 4.154 4.401 4.559 4.716 4.936 5.137 5.349 5.559 5.753 6.005 6.261 6.511 6.802 7.08 7.345 7.657 8.018 8.367 8.736 9.131 9.577 10.056 10.575 11.187 11.847 12.608 13.434 14.409 15.473 16.743 18.265 20.042 21.446 22.262 22.74 23.029 23.243 23.409 23.511 23.561 23.588 23.592 23.582 23.562 23.538 23.498 23.453 23.4 23.339 23.291 23.249 23.188 23.133 23.083 23.035 22.985 22.927 22.875 22.807 22.728 22.675 22.618 22.515 22.44 22.366 22.325 22.246 22.166 22.075 22.03 21.833 21.867 21.801 21.732 21.582 21.506 21.421 21.311 21.16 20.982 20.801 20.424 -2 ,28642 ,TETRA ,17668522,Fri Dec 3 06:39:28 CET,Fri Dec 3 08:26:32 CET,0.0 0.733 1.081 1.345 1.556 1.744 1.909 2.054 2.328 2.452 2.575 2.638 2.921 3.023 3.215 3.403 3.586 3.677 3.853 4.018 4.263 4.42 4.573 4.797 5.014 5.226 5.425 5.619 5.873 6.113 6.343 6.621 6.894 7.161 7.473 7.825 8.15 8.514 8.934 9.393 9.882 10.435 11.09 11.748 12.474 13.267 14.246 15.383 16.631 18.107 19.897 21.337 22.149 22.655 22.957 23.135 23.267 23.335 23.375 23.407 23.4 23.377 23.359 23.336 23.297 23.257 23.211 23.158 23.112 23.065 23.018 22.97 22.905 22.844 22.796 22.745 22.68 22.608 22.545 22.499 22.459 22.393 22.335 22.273 22.244 22.181 22.093 21.995 21.946 21.745 21.792 21.739 21.68 21.539 21.442 21.325 21.196 21.069 20.92 20.686 20.006 -3 ,7451 ,TETRA ,17668523,Fri Dec 3 06:39:31 CET,Fri Dec 3 08:21:22 CET,0.0 0.932 1.216 1.439 1.627 1.797 1.957 2.105 2.361 2.474 2.579 2.615 2.907 3.016 3.222 3.429 3.625 3.716 3.896 4.078 4.326 4.483 4.632 4.844 5.066 5.284 5.491 5.69 5.946 6.194 6.428 6.713 6.998 7.276 7.596 7.955 8.307 8.688 9.093 9.513 9.998 10.549 11.155 11.776 12.513 13.334 14.24 15.239 16.407 17.861 19.648 21.075 21.897 22.414 22.743 22.953 23.085 23.163 23.195 23.211 23.213 23.205 23.184 23.154 23.122 23.063 22.992 22.935 22.879 22.809 22.734 22.673 22.616 22.563 22.512 22.457 22.4 22.332 22.256 22.198 22.132 22.036 21.967 21.884 21.845 21.76 21.668 21.584 21.535 21.333 21.386 21.326 21.259 21.11 21.019 20.921 20.827 20.714 20.579 20.427 20.015 -4 ,13549 ,TETRA ,17668524,Fri Dec 3 06:39:28 CET,Fri Dec 3 08:28:24 CET,0.0 0.786 1.14 1.369 1.569 1.756 1.935 2.091 2.369 2.488 2.602 2.658 2.931 3.032 3.235 3.433 3.615 3.696 3.87 4.046 4.28 4.426 4.57 4.787 4.997 5.195 5.396 5.593 5.85 6.092 6.318 6.601 6.877 7.147 7.466 7.832 8.172 8.547 8.968 9.41 9.881 10.402 11.014 11.653 12.376 13.179 14.125 15.216 16.545 18.084 19.885 21.354 22.195 22.728 23.036 23.231 23.377 23.465 23.485 23.473 23.457 23.439 23.409 23.376 23.353 23.324 23.276 23.22 23.175 23.126 23.063 23.015 22.962 22.895 22.842 22.79 22.73 22.665 22.6 22.555 22.506 22.433 22.38 22.32 22.286 22.218 22.158 22.082 22.039 21.839 21.884 21.832 21.768 21.61 21.507 21.398 21.29 21.146 20.95 20.714 20.171 -5 ,8030 ,TETRA ,17668525,Fri Dec 3 06:39:31 CET,Fri Dec 3 08:28:36 CET,0.0 0.602 0.89 1.126 1.323 1.498 1.669 1.828 2.118 2.251 2.374 2.429 2.71 2.821 3.027 3.212 3.386 3.475 3.654 3.819 4.056 4.212 4.369 4.59 4.805 5.011 5.21 5.412 5.682 5.929 6.167 6.473 6.767 7.045 7.369 7.718 8.056 8.441 8.849 9.282 9.743 10.278 10.908 11.55 12.307 13.148 14.099 15.166 16.474 17.968 19.698 21.099 21.882 22.35 22.665 22.863 22.977 23.052 23.076 23.076 23.075 23.063 23.035 23.005 22.976 22.946 22.895 22.845 22.796 22.734 22.673 22.628 22.582 22.516 22.467 22.427 22.375 22.309 22.235 22.186 22.129 22.023 21.952 21.884 21.849 21.781 21.704 21.614 21.567 21.36 21.371 21.298 21.229 21.074 20.981 20.878 20.779 20.649 20.475 20.248 19.915 -6 ,24280 ,TETRA ,17668526,Fri Dec 3 06:39:33 CET,Fri Dec 3 08:26:34 CET,0.0 0.687 1.009 1.252 1.418 1.593 1.781 1.935 2.193 2.314 2.432 2.486 2.768 2.867 3.074 3.271 3.461 3.551 3.726 3.904 4.166 4.328 4.478 4.687 4.888 5.085 5.286 5.477 5.718 5.949 6.172 6.463 6.754 7.027 7.337 7.687 8.032 8.418 8.839 9.292 9.776 10.343 10.979 11.601 12.37 13.216 14.149 15.204 16.459 17.909 19.547 20.884 21.671 22.133 22.411 22.598 22.724 22.781 22.804 22.833 22.832 22.805 22.78 22.75 22.699 22.649 22.604 22.562 22.518 22.469 22.425 22.376 22.313 22.248 22.193 22.137 22.075 22.008 21.931 21.872 21.816 21.733 21.673 21.605 21.57 21.502 21.426 21.345 21.305 21.101 21.113 21.043 20.972 20.834 20.742 20.634 20.518 20.382 20.18 19.85 19.211 -7 ,26104 ,TETRA ,17668527,Fri Dec 3 06:39:34 CET,Fri Dec 3 08:26:04 CET,0.0 0.737 1.05 1.303 1.518 1.719 1.909 2.068 2.321 2.443 2.57 2.632 2.922 3.03 3.227 3.42 3.6 3.686 3.866 4.037 4.276 4.434 4.588 4.812 5.02 5.225 5.425 5.621 5.882 6.124 6.363 6.673 6.975 7.271 7.594 7.937 8.259 8.628 9.051 9.508 9.989 10.53 11.177 11.815 12.546 13.366 14.289 15.341 16.602 18.067 19.827 21.261 22.064 22.527 22.834 23.059 23.189 23.277 23.328 23.341 23.327 23.321 23.3 23.25 23.198 23.146 23.079 23.029 22.991 22.932 22.855 22.787 22.724 22.655 22.6 22.544 22.483 22.424 22.369 22.324 22.273 22.196 22.142 22.073 22.035 21.958 21.877 21.801 21.758 21.553 21.582 21.512 21.446 21.307 21.235 21.167 21.057 20.91 20.751 20.493 19.7 -8 ,1341 ,TETRA ,17668528,Fri Dec 3 06:39:28 CET,Fri Dec 3 08:25:25 CET,0.0 0.668 0.921 1.138 1.361 1.564 1.719 1.853 2.106 2.232 2.357 2.416 2.701 2.806 3.01 3.205 3.387 3.473 3.65 3.819 4.06 4.219 4.366 4.582 4.798 5.008 5.203 5.397 5.662 5.905 6.13 6.413 6.692 6.961 7.273 7.614 7.954 8.317 8.718 9.163 9.627 10.158 10.786 11.442 12.218 13.068 14.038 15.116 16.376 17.861 19.634 21.063 21.898 22.44 22.782 23.007 23.146 23.248 23.309 23.308 23.264 23.229 23.206 23.186 23.161 23.11 23.053 23.008 22.954 22.89 22.817 22.754 22.689 22.631 22.588 22.533 22.469 22.399 22.327 22.278 22.221 22.126 22.067 22.008 21.972 21.9 21.836 21.762 21.715 21.511 21.539 21.476 21.415 21.272 21.184 21.073 20.952 20.847 20.736 20.604 20.152 -9 ,5097 ,TETRA ,17668529,Fri Dec 3 06:39:28 CET,Fri Dec 3 08:26:24 CET,0.0 0.602 0.886 1.102 1.314 1.501 1.657 1.808 2.092 2.218 2.339 2.419 2.709 2.818 3.041 3.238 3.42 3.513 3.706 3.892 4.14 4.296 4.449 4.671 4.887 5.102 5.308 5.493 5.733 5.965 6.194 6.474 6.741 6.999 7.306 7.675 8.036 8.43 8.847 9.292 9.758 10.288 10.902 11.532 12.309 13.158 14.09 15.176 16.5 18.019 19.823 21.267 22.074 22.575 22.914 23.132 23.265 23.345 23.382 23.384 23.369 23.346 23.315 23.282 23.24 23.198 23.146 23.089 23.04 22.985 22.925 22.871 22.815 22.755 22.707 22.651 22.585 22.522 22.459 22.408 22.354 22.26 22.189 22.118 22.08 22.006 21.916 21.816 21.762 21.556 21.592 21.53 21.464 21.331 21.248 21.13 20.993 20.848 20.642 20.376 19.73 -10 ,10028 ,TETRA ,17668530,Fri Dec 3 06:39:30 CET,Fri Dec 3 08:26:15 CET,0.0 0.821 1.09 1.282 1.47 1.651 1.814 1.975 2.28 2.406 2.521 2.558 2.838 2.945 3.145 3.328 3.512 3.608 3.784 3.946 4.182 4.338 4.493 4.71 4.921 5.138 5.349 5.554 5.798 6.039 6.281 6.565 6.837 7.099 7.421 7.795 8.141 8.516 8.926 9.377 9.857 10.394 11.019 11.615 12.319 13.158 14.135 15.23 16.497 17.974 19.72 21.121 21.953 22.48 22.781 22.985 23.115 23.189 23.23 23.245 23.248 23.24 23.228 23.197 23.148 23.092 23.037 22.991 22.942 22.888 22.833 22.794 22.748 22.683 22.626 22.562 22.495 22.423 22.344 22.296 22.249 22.17 22.111 22.045 22.009 21.943 21.872 21.797 21.759 21.566 21.605 21.544 21.481 21.338 21.254 21.154 21.028 20.874 20.669 20.317 19.534 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5e.txt deleted file mode 100644 index d7d51a62..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21340 ,TETRA ,17668531,Fri Dec 3 06:39:29 CET,Fri Dec 3 08:25:50 CET,0.0 0.798 1.034 1.233 1.406 1.56 1.699 1.827 2.053 2.153 2.242 2.239 2.499 2.578 2.735 2.882 3.015 3.076 3.197 3.325 3.5 3.604 3.711 3.863 3.996 4.124 4.246 4.352 4.472 4.582 4.681 4.807 4.938 5.051 5.185 5.343 5.482 5.63 5.773 5.902 6.046 6.205 6.363 6.501 6.672 6.841 6.977 7.061 7.1 7.064 6.729 6.029 5.312 4.666 4.072 3.501 2.983 2.544 2.181 1.748 1.361 1.069 0.816 0.58 0.329 0.064 -0.21 -0.457 -0.682 -0.893 -1.084 -1.255 -1.453 -1.644 -1.784 -1.939 -2.108 -2.279 -2.456 -2.581 -2.716 -2.923 -3.05 -3.166 -3.23 -3.383 -3.54 -3.694 -3.77 -4.032 -4.034 -4.13 -4.222 -4.408 -4.513 -4.632 -4.774 -4.94 -5.121 -5.354 -5.788 -2 ,5779 ,TETRA ,17668532,Fri Dec 3 06:39:32 CET,Fri Dec 3 08:25:52 CET,0.0 0.548 0.83 1.056 1.241 1.395 1.51 1.611 1.821 1.928 2.037 2.03 2.275 2.341 2.46 2.57 2.684 2.739 2.849 2.964 3.124 3.227 3.336 3.478 3.601 3.723 3.838 3.956 4.12 4.251 4.359 4.526 4.689 4.815 4.945 5.09 5.22 5.373 5.548 5.684 5.808 5.963 6.136 6.291 6.445 6.587 6.699 6.766 6.772 6.65 6.239 5.509 4.799 4.173 3.587 3.048 2.592 2.178 1.819 1.476 1.184 0.899 0.612 0.364 0.147 -0.054 -0.265 -0.457 -0.648 -0.869 -1.071 -1.225 -1.397 -1.581 -1.731 -1.885 -2.03 -2.182 -2.346 -2.453 -2.56 -2.721 -2.835 -2.968 -3.044 -3.201 -3.356 -3.501 -3.578 -3.845 -3.852 -3.96 -4.064 -4.261 -4.372 -4.512 -4.667 -4.854 -5.118 -5.444 -6.246 -3 ,28372 ,TETRA ,17668533,Fri Dec 3 06:39:34 CET,Fri Dec 3 08:24:49 CET,0.0 0.644 0.909 1.106 1.275 1.427 1.571 1.68 1.873 1.965 2.055 2.061 2.323 2.397 2.543 2.688 2.812 2.872 2.984 3.095 3.279 3.398 3.493 3.616 3.736 3.84 3.939 4.03 4.156 4.303 4.452 4.609 4.739 4.85 4.988 5.159 5.327 5.499 5.669 5.846 6.001 6.133 6.293 6.448 6.594 6.724 6.84 6.923 6.938 6.83 6.411 5.652 4.935 4.321 3.775 3.249 2.784 2.378 2.018 1.642 1.291 0.963 0.668 0.421 0.19 -0.062 -0.322 -0.522 -0.694 -0.873 -1.058 -1.215 -1.374 -1.539 -1.673 -1.815 -1.962 -2.105 -2.26 -2.366 -2.476 -2.642 -2.748 -2.878 -2.951 -3.086 -3.227 -3.359 -3.425 -3.696 -3.713 -3.813 -3.909 -4.123 -4.25 -4.391 -4.523 -4.652 -4.818 -5.004 -5.418 -4 ,21487 ,TETRA ,17668534,Fri Dec 3 06:39:30 CET,Fri Dec 3 08:26:29 CET,0.0 0.533 0.784 0.987 1.176 1.351 1.503 1.625 1.845 1.942 2.039 2.054 2.318 2.392 2.528 2.663 2.792 2.857 2.981 3.092 3.249 3.35 3.439 3.569 3.709 3.832 3.948 4.059 4.191 4.311 4.409 4.535 4.672 4.783 4.912 5.084 5.267 5.48 5.694 5.923 6.142 6.302 6.446 6.596 6.748 6.884 7.031 7.144 7.176 7.074 6.636 5.915 5.233 4.606 4.051 3.507 2.961 2.492 2.136 1.784 1.476 1.191 0.906 0.599 0.307 0.09 -0.125 -0.332 -0.528 -0.749 -0.963 -1.134 -1.323 -1.5 -1.618 -1.748 -1.896 -2.064 -2.241 -2.348 -2.455 -2.623 -2.735 -2.861 -2.935 -3.095 -3.25 -3.413 -3.499 -3.763 -3.746 -3.833 -3.932 -4.15 -4.268 -4.391 -4.53 -4.702 -4.904 -5.198 -6.32 -5 ,24374 ,TETRA ,17668535,Fri Dec 3 06:39:32 CET,Fri Dec 3 08:26:29 CET,0.0 0.498 0.806 1.018 1.165 1.297 1.427 1.544 1.748 1.848 1.952 1.952 2.202 2.281 2.415 2.53 2.652 2.717 2.851 2.97 3.123 3.21 3.297 3.426 3.541 3.637 3.741 3.85 3.989 4.116 4.221 4.349 4.475 4.602 4.737 4.883 5.058 5.255 5.429 5.582 5.731 5.882 6.042 6.195 6.353 6.491 6.592 6.666 6.663 6.48 6.004 5.296 4.62 3.971 3.349 2.791 2.328 1.894 1.513 1.114 0.775 0.454 0.155 -0.097 -0.331 -0.543 -0.784 -1.018 -1.223 -1.427 -1.638 -1.805 -1.981 -2.158 -2.293 -2.435 -2.582 -2.744 -2.893 -2.989 -3.094 -3.246 -3.35 -3.467 -3.533 -3.674 -3.816 -3.969 -4.051 -4.325 -4.339 -4.429 -4.521 -4.706 -4.802 -4.927 -5.08 -5.237 -5.396 -5.607 -5.985 -6 ,3879 ,TETRA ,17668536,Fri Dec 3 06:39:33 CET,Fri Dec 3 08:26:02 CET,0.0 0.524 0.773 0.973 1.155 1.294 1.402 1.511 1.722 1.814 1.896 1.887 2.147 2.213 2.334 2.453 2.565 2.618 2.724 2.824 2.957 3.041 3.136 3.286 3.418 3.535 3.641 3.737 3.864 4.004 4.13 4.273 4.391 4.496 4.662 4.856 5.017 5.159 5.293 5.441 5.591 5.748 5.9 6.028 6.169 6.301 6.415 6.482 6.479 6.299 5.826 5.133 4.453 3.789 3.178 2.627 2.138 1.722 1.365 1.011 0.697 0.369 0.035 -0.251 -0.488 -0.7 -0.934 -1.152 -1.337 -1.515 -1.689 -1.835 -1.986 -2.15 -2.282 -2.425 -2.582 -2.752 -2.932 -3.052 -3.17 -3.356 -3.487 -3.623 -3.686 -3.807 -3.938 -4.079 -4.152 -4.411 -4.406 -4.511 -4.619 -4.816 -4.928 -5.055 -5.194 -5.37 -5.566 -5.773 -6.193 -7 ,26396 ,TETRA ,17668537,Fri Dec 3 06:39:35 CET,Fri Dec 3 08:25:51 CET,0.0 0.57 0.843 1.034 1.197 1.364 1.501 1.606 1.802 1.892 1.982 1.987 2.253 2.341 2.521 2.674 2.788 2.845 2.956 3.051 3.193 3.291 3.379 3.508 3.634 3.739 3.839 3.944 4.066 4.181 4.31 4.486 4.64 4.763 4.907 5.062 5.187 5.308 5.446 5.592 5.734 5.887 6.064 6.228 6.38 6.512 6.673 6.811 6.853 6.718 6.195 5.445 4.752 4.125 3.568 3.058 2.554 2.096 1.733 1.38 1.042 0.722 0.458 0.227 -0.001 -0.221 -0.466 -0.674 -0.836 -1.006 -1.198 -1.36 -1.525 -1.713 -1.864 -2.021 -2.175 -2.337 -2.499 -2.596 -2.705 -2.892 -3.021 -3.164 -3.232 -3.373 -3.541 -3.703 -3.787 -4.055 -4.051 -4.145 -4.234 -4.429 -4.554 -4.695 -4.845 -5.011 -5.189 -5.494 -6.04 -8 ,16085 ,TETRA ,17668538,Fri Dec 3 06:40:26 CET,Fri Dec 3 08:26:59 CET,0.0 0.732 0.996 1.196 1.354 1.492 1.631 1.748 1.95 2.053 2.146 2.117 2.37 2.454 2.601 2.745 2.865 2.923 3.048 3.171 3.335 3.428 3.519 3.635 3.756 3.874 3.971 4.076 4.207 4.338 4.482 4.655 4.833 4.978 5.113 5.263 5.394 5.513 5.645 5.802 5.998 6.212 6.396 6.548 6.687 6.818 6.938 7.022 7.065 6.973 6.506 5.778 5.101 4.493 3.953 3.456 3.013 2.559 2.135 1.714 1.343 0.993 0.674 0.401 0.137 -0.137 -0.402 -0.606 -0.782 -0.964 -1.15 -1.293 -1.441 -1.592 -1.71 -1.842 -1.98 -2.124 -2.281 -2.383 -2.487 -2.655 -2.778 -2.919 -2.99 -3.144 -3.311 -3.485 -3.576 -3.851 -3.849 -3.946 -4.049 -4.258 -4.385 -4.51 -4.633 -4.783 -4.965 -5.216 -5.769 -9 ,12383 ,TETRA ,17668539,Fri Dec 3 06:40:27 CET,Fri Dec 3 08:26:46 CET,0.0 0.546 0.768 0.956 1.125 1.252 1.347 1.452 1.665 1.761 1.854 1.852 2.113 2.18 2.295 2.429 2.552 2.617 2.764 2.902 3.083 3.189 3.281 3.421 3.561 3.684 3.792 3.898 4.053 4.194 4.312 4.462 4.603 4.727 4.857 4.984 5.105 5.262 5.468 5.669 5.86 6.088 6.297 6.456 6.639 6.814 6.942 7.025 7.046 6.927 6.501 5.752 5.026 4.395 3.744 3.134 2.607 2.142 1.774 1.405 1.088 0.754 0.449 0.17 -0.112 -0.355 -0.589 -0.795 -0.972 -1.144 -1.342 -1.53 -1.704 -1.869 -1.996 -2.133 -2.279 -2.436 -2.612 -2.729 -2.84 -3.0 -3.109 -3.244 -3.318 -3.459 -3.63 -3.812 -3.901 -4.168 -4.141 -4.218 -4.288 -4.452 -4.562 -4.683 -4.807 -4.943 -5.111 -5.334 -5.721 -10 ,7380 ,TETRA ,17668540,Fri Dec 3 06:40:27 CET,Fri Dec 3 08:27:54 CET,0.0 0.474 0.766 0.976 1.126 1.243 1.367 1.49 1.721 1.82 1.896 1.87 2.126 2.211 2.367 2.508 2.646 2.711 2.833 2.945 3.102 3.2 3.287 3.412 3.542 3.664 3.793 3.933 4.103 4.246 4.364 4.491 4.619 4.745 4.865 5.022 5.21 5.399 5.552 5.688 5.845 6.017 6.175 6.32 6.469 6.587 6.677 6.745 6.745 6.592 6.141 5.419 4.678 4.0 3.433 2.921 2.438 2.003 1.636 1.245 0.885 0.584 0.305 0.036 -0.2 -0.414 -0.643 -0.871 -1.076 -1.254 -1.432 -1.588 -1.763 -1.944 -2.074 -2.22 -2.379 -2.534 -2.687 -2.79 -2.903 -3.092 -3.227 -3.362 -3.424 -3.547 -3.675 -3.83 -3.913 -4.181 -4.193 -4.29 -4.389 -4.61 -4.747 -4.898 -5.041 -5.204 -5.397 -5.616 -6.265 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5d_7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5d_7.txt deleted file mode 100644 index d0107e9e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5d_7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3127 ,TETRA ,17668541,Fri Dec 3 06:40:29 CET,Fri Dec 3 08:26:31 CET,0.0 0.915 1.227 1.459 1.646 1.808 1.957 2.108 2.376 2.497 2.61 2.661 2.95 3.058 3.269 3.484 3.7 3.795 3.97 4.147 4.405 4.569 4.726 4.943 5.146 5.347 5.542 5.745 6.019 6.278 6.536 6.846 7.152 7.463 7.806 8.171 8.522 8.948 9.456 10.008 10.572 11.191 11.903 12.618 13.476 14.454 15.614 16.98 18.64 20.673 23.25 25.5 26.9 27.775 28.365 28.813 29.123 29.35 29.505 29.62 29.695 29.76 29.812 29.836 29.846 29.845 29.787 29.727 29.702 29.669 29.633 29.592 29.539 29.483 29.422 29.351 29.277 29.186 29.093 29.035 28.964 28.85 28.78 28.712 28.68 28.604 28.503 28.4 28.348 28.141 28.147 28.07 27.993 27.83 27.741 27.634 27.519 27.408 27.264 27.064 26.228 -2 ,13033 ,TETRA ,17668542,Fri Dec 3 06:40:27 CET,Fri Dec 3 08:30:57 CET,0.0 0.382 0.622 0.817 0.98 1.131 1.287 1.431 1.676 1.789 1.91 1.956 2.233 2.336 2.531 2.712 2.886 2.971 3.137 3.295 3.522 3.666 3.817 4.042 4.249 4.454 4.676 4.884 5.125 5.361 5.6 5.905 6.2 6.485 6.829 7.23 7.629 8.052 8.504 8.996 9.497 10.074 10.766 11.475 12.378 13.414 14.588 15.987 17.696 19.742 22.272 24.506 25.874 26.782 27.407 27.818 28.105 28.323 28.496 28.655 28.743 28.763 28.747 28.718 28.689 28.665 28.632 28.578 28.531 28.499 28.445 28.381 28.312 28.248 28.197 28.132 28.062 27.989 27.915 27.866 27.811 27.715 27.646 27.569 27.529 27.451 27.351 27.24 27.191 26.988 27.005 26.939 26.874 26.735 26.66 26.57 26.461 26.341 26.2 26.002 25.333 -3 ,8953 ,TETRA ,17668543,Fri Dec 3 06:40:27 CET,Fri Dec 3 08:27:18 CET,0.0 0.617 0.875 1.126 1.316 1.473 1.627 1.789 2.09 2.218 2.336 2.391 2.672 2.771 2.961 3.154 3.345 3.439 3.624 3.8 4.04 4.197 4.36 4.596 4.826 5.034 5.226 5.415 5.659 5.899 6.141 6.434 6.721 7.012 7.371 7.796 8.179 8.588 9.037 9.509 10.028 10.625 11.322 12.031 12.866 13.842 15.005 16.331 17.955 20.002 22.56 24.755 26.132 27.053 27.659 28.083 28.391 28.62 28.783 28.901 28.956 28.986 28.986 28.977 28.955 28.936 28.914 28.866 28.807 28.741 28.664 28.587 28.506 28.443 28.407 28.359 28.311 28.249 28.172 28.125 28.074 27.971 27.892 27.811 27.771 27.696 27.623 27.541 27.49 27.291 27.333 27.281 27.206 27.026 26.935 26.832 26.709 26.551 26.355 26.054 25.313 -4 ,22131 ,TETRA ,17668544,Fri Dec 3 06:40:29 CET,Fri Dec 3 08:26:58 CET,0.0 0.517 0.807 1.047 1.262 1.435 1.602 1.767 2.063 2.199 2.322 2.373 2.654 2.754 2.953 3.145 3.317 3.404 3.584 3.763 4.031 4.2 4.366 4.593 4.811 5.02 5.221 5.424 5.675 5.919 6.166 6.465 6.759 7.053 7.385 7.746 8.108 8.516 8.957 9.482 10.039 10.617 11.3 12.018 12.888 13.894 15.082 16.428 18.081 20.15 22.74 25.012 26.415 27.332 27.984 28.449 28.762 28.941 29.012 29.078 29.151 29.205 29.264 29.307 29.292 29.256 29.226 29.207 29.189 29.162 29.119 29.063 29.011 28.954 28.887 28.82 28.769 28.702 28.632 28.589 28.524 28.413 28.331 28.225 28.174 28.076 27.959 27.846 27.794 27.597 27.64 27.574 27.497 27.305 27.205 27.111 26.994 26.827 26.602 26.261 25.188 -5 ,3269 ,TETRA ,17668545,Fri Dec 3 06:40:30 CET,Fri Dec 3 08:27:30 CET,0.0 0.715 1.052 1.287 1.479 1.648 1.803 1.96 2.225 2.343 2.46 2.517 2.802 2.9 3.092 3.277 3.461 3.548 3.716 3.887 4.127 4.29 4.453 4.678 4.874 5.064 5.255 5.448 5.712 5.975 6.225 6.53 6.836 7.125 7.451 7.835 8.206 8.621 9.058 9.521 10.039 10.635 11.392 12.18 13.086 14.139 15.358 16.721 18.364 20.379 22.88 25.08 26.432 27.316 27.935 28.367 28.658 28.881 29.037 29.144 29.22 29.273 29.303 29.324 29.335 29.334 29.297 29.233 29.171 29.101 29.045 29.012 28.975 28.902 28.833 28.771 28.718 28.667 28.6 28.551 28.489 28.371 28.284 28.2 28.158 28.058 27.943 27.827 27.769 27.559 27.568 27.493 27.409 27.2 27.089 26.985 26.875 26.751 26.588 26.393 25.816 -6 ,13620 ,TETRA ,17668546,Fri Dec 3 06:40:33 CET,Fri Dec 3 08:27:11 CET,0.0 0.627 0.954 1.2 1.42 1.605 1.752 1.89 2.15 2.275 2.392 2.435 2.71 2.8 2.993 3.197 3.383 3.477 3.667 3.848 4.1 4.267 4.432 4.653 4.861 5.067 5.267 5.475 5.766 6.047 6.323 6.654 6.971 7.283 7.658 8.07 8.426 8.823 9.275 9.753 10.241 10.805 11.484 12.182 13.057 14.06 15.21 16.565 18.272 20.329 22.807 24.989 26.337 27.275 27.876 28.283 28.608 28.836 28.983 29.102 29.191 29.257 29.279 29.272 29.233 29.18 29.156 29.148 29.124 29.092 29.058 29.027 28.974 28.892 28.827 28.772 28.704 28.611 28.511 28.446 28.381 28.275 28.197 28.111 28.075 27.999 27.901 27.798 27.738 27.524 27.526 27.452 27.379 27.211 27.112 27.007 26.881 26.723 26.557 26.352 25.644 -7 ,18904 ,TETRA ,17668547,Fri Dec 3 06:40:27 CET,Fri Dec 3 08:27:36 CET,0.0 0.645 1.037 1.283 1.455 1.622 1.789 1.936 2.215 2.351 2.479 2.536 2.815 2.907 3.076 3.242 3.42 3.508 3.667 3.824 4.063 4.226 4.386 4.611 4.83 5.046 5.27 5.483 5.727 5.967 6.213 6.521 6.828 7.124 7.48 7.876 8.241 8.634 9.066 9.521 10.008 10.598 11.291 11.993 12.867 13.889 15.119 16.508 18.099 20.081 22.661 24.897 26.238 27.122 27.702 28.105 28.414 28.648 28.796 28.916 28.99 29.019 29.037 29.023 28.976 28.951 28.924 28.882 28.856 28.819 28.762 28.713 28.656 28.598 28.557 28.509 28.459 28.407 28.349 28.3 28.248 28.168 28.096 28.013 27.968 27.864 27.751 27.629 27.57 27.363 27.37 27.297 27.222 27.062 26.967 26.859 26.738 26.609 26.464 26.242 25.677 -8 ,31318 ,TETRA ,17668548,Fri Dec 3 06:40:27 CET,Fri Dec 3 08:27:08 CET,0.0 0.584 0.868 1.129 1.363 1.553 1.702 1.834 2.095 2.224 2.348 2.398 2.675 2.773 2.957 3.144 3.33 3.422 3.608 3.793 4.057 4.223 4.383 4.622 4.853 5.067 5.265 5.452 5.717 5.981 6.229 6.543 6.844 7.115 7.446 7.826 8.173 8.569 9.026 9.509 10.001 10.574 11.279 12.025 12.954 14.064 15.307 16.664 18.335 20.359 22.887 25.123 26.547 27.495 28.127 28.553 28.843 29.093 29.284 29.42 29.511 29.56 29.557 29.526 29.501 29.468 29.437 29.42 29.369 29.303 29.254 29.217 29.176 29.133 29.103 29.063 28.987 28.87 28.758 28.709 28.667 28.581 28.505 28.421 28.377 28.291 28.204 28.093 28.032 27.819 27.816 27.738 27.653 27.444 27.335 27.235 27.12 26.971 26.811 26.563 26.054 -9 ,6038 ,TETRA ,17668549,Fri Dec 3 06:40:27 CET,Fri Dec 3 08:26:43 CET,0.0 0.593 0.882 1.072 1.238 1.399 1.556 1.707 1.979 2.098 2.214 2.239 2.511 2.615 2.815 3.017 3.205 3.294 3.466 3.635 3.88 4.042 4.203 4.429 4.647 4.86 5.062 5.258 5.526 5.795 6.045 6.334 6.619 6.9 7.224 7.597 7.972 8.38 8.826 9.331 9.857 10.443 11.13 11.871 12.8 13.814 14.946 16.31 18.031 20.148 22.677 24.809 26.154 27.066 27.66 28.051 28.306 28.509 28.674 28.791 28.859 28.909 28.941 28.947 28.944 28.947 28.94 28.924 28.896 28.848 28.779 28.712 28.66 28.621 28.579 28.516 28.444 28.361 28.277 28.22 28.155 28.049 27.971 27.888 27.842 27.746 27.655 27.564 27.507 27.297 27.302 27.224 27.143 26.96 26.858 26.752 26.638 26.514 26.359 26.164 25.615 -10 ,13522 ,TETRA ,17668550,Fri Dec 3 06:40:27 CET,Fri Dec 3 08:26:45 CET,0.0 0.915 1.23 1.474 1.649 1.805 1.938 2.055 2.303 2.433 2.557 2.59 2.855 2.945 3.124 3.302 3.494 3.59 3.766 3.942 4.209 4.377 4.529 4.734 4.93 5.129 5.332 5.534 5.78 6.031 6.297 6.61 6.914 7.221 7.553 7.911 8.265 8.657 9.097 9.577 10.094 10.675 11.343 12.059 12.931 13.906 15.027 16.389 18.049 20.017 22.509 24.692 26.044 26.959 27.573 27.989 28.308 28.551 28.729 28.862 28.942 28.997 29.032 29.047 29.045 29.037 29.003 28.94 28.904 28.881 28.851 28.83 28.787 28.715 28.663 28.622 28.576 28.524 28.471 28.416 28.343 28.235 28.168 28.092 28.048 27.952 27.861 27.766 27.711 27.505 27.539 27.475 27.397 27.228 27.137 27.04 26.925 26.782 26.614 26.388 25.787 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5e_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5e_5a.txt deleted file mode 100644 index f540c222..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5e_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32333 ,TETRA ,17668551,Fri Dec 3 06:40:30 CET,Fri Dec 3 08:27:05 CET,0.0 0.506 0.82 1.032 1.195 1.333 1.467 1.593 1.793 1.875 1.954 1.933 2.195 2.272 2.427 2.585 2.732 2.797 2.916 3.038 3.217 3.338 3.464 3.641 3.792 3.928 4.082 4.242 4.428 4.59 4.749 4.939 5.11 5.278 5.501 5.768 6.003 6.239 6.478 6.776 7.108 7.432 7.779 8.126 8.546 8.987 9.438 9.947 10.515 11.129 11.77 12.104 12.081 11.959 11.813 11.626 11.415 11.221 11.043 10.811 10.568 10.33 10.116 9.898 9.679 9.513 9.319 9.151 9.031 8.887 8.739 8.612 8.447 8.271 8.154 8.037 7.903 7.765 7.63 7.519 7.391 7.21 7.082 6.934 6.862 6.722 6.582 6.434 6.352 6.089 6.061 5.948 5.841 5.618 5.495 5.357 5.184 4.976 4.752 4.445 3.547 -2 ,10278 ,TETRA ,17668552,Fri Dec 3 06:40:32 CET,Fri Dec 3 08:30:19 CET,0.0 0.615 0.818 1.01 1.17 1.3 1.409 1.507 1.705 1.802 1.897 1.888 2.151 2.231 2.386 2.543 2.699 2.771 2.907 3.047 3.237 3.344 3.453 3.624 3.78 3.917 4.05 4.183 4.354 4.517 4.679 4.867 5.054 5.256 5.482 5.704 5.899 6.123 6.352 6.596 6.88 7.199 7.553 7.915 8.337 8.775 9.247 9.815 10.499 11.152 11.732 12.059 12.132 12.039 11.858 11.677 11.489 11.257 11.07 10.893 10.711 10.538 10.372 10.215 10.065 9.907 9.741 9.584 9.427 9.263 9.113 8.989 8.851 8.713 8.609 8.507 8.389 8.254 8.124 8.029 7.924 7.775 7.666 7.551 7.491 7.36 7.224 7.088 7.007 6.744 6.721 6.6 6.491 6.249 6.114 5.989 5.846 5.657 5.421 5.124 4.38 -3 ,22012 ,TETRA ,17668553,Fri Dec 3 06:40:27 CET,Fri Dec 3 08:28:24 CET,0.0 0.82 1.087 1.305 1.463 1.59 1.725 1.859 2.093 2.191 2.28 2.268 2.532 2.615 2.765 2.893 3.014 3.078 3.204 3.34 3.542 3.661 3.78 3.963 4.126 4.26 4.388 4.516 4.676 4.821 4.972 5.149 5.313 5.485 5.688 5.945 6.212 6.488 6.755 6.999 7.248 7.52 7.833 8.184 8.592 9.0 9.456 9.984 10.586 11.203 11.787 12.056 11.975 11.803 11.66 11.491 11.295 11.118 10.938 10.71 10.504 10.33 10.163 9.984 9.805 9.656 9.492 9.335 9.201 9.052 8.863 8.705 8.55 8.395 8.267 8.125 7.988 7.863 7.735 7.635 7.522 7.342 7.218 7.086 7.029 6.918 6.777 6.619 6.535 6.271 6.283 6.189 6.086 5.85 5.725 5.588 5.416 5.227 5.002 4.639 3.903 -4 ,14987 ,TETRA ,17668554,Fri Dec 3 06:40:27 CET,Fri Dec 3 08:26:55 CET,0.0 0.88 1.167 1.371 1.554 1.7 1.82 1.938 2.156 2.243 2.332 2.335 2.593 2.662 2.814 2.971 3.108 3.172 3.306 3.427 3.582 3.685 3.794 3.97 4.124 4.254 4.396 4.54 4.707 4.862 5.013 5.196 5.402 5.616 5.839 6.076 6.298 6.529 6.8 7.131 7.442 7.738 8.139 8.574 9.04 9.51 10.012 10.56 11.195 11.852 12.474 12.766 12.797 12.681 12.521 12.386 12.233 12.052 11.855 11.616 11.408 11.239 11.061 10.896 10.738 10.576 10.39 10.211 10.063 9.913 9.76 9.637 9.508 9.369 9.247 9.121 9.004 8.874 8.739 8.646 8.544 8.396 8.281 8.154 8.092 7.944 7.781 7.612 7.524 7.257 7.243 7.143 7.042 6.78 6.623 6.465 6.3 6.123 5.871 5.494 4.754 -5 ,7985 ,TETRA ,17668555,Fri Dec 3 06:40:29 CET,Fri Dec 3 08:26:44 CET,0.0 0.475 0.731 0.927 1.08 1.215 1.327 1.43 1.642 1.746 1.838 1.818 2.083 2.158 2.319 2.47 2.595 2.656 2.788 2.916 3.099 3.205 3.3 3.439 3.587 3.742 3.882 4.029 4.229 4.42 4.59 4.792 5.017 5.219 5.429 5.656 5.862 6.085 6.32 6.581 6.862 7.176 7.531 7.876 8.271 8.699 9.199 9.745 10.313 10.966 11.682 11.965 11.951 11.856 11.663 11.434 11.233 11.025 10.825 10.621 10.439 10.255 10.083 9.928 9.752 9.596 9.425 9.249 9.107 8.963 8.801 8.669 8.534 8.382 8.273 8.164 8.036 7.892 7.726 7.603 7.488 7.331 7.219 7.092 7.028 6.897 6.738 6.574 6.497 6.236 6.196 6.084 5.992 5.805 5.672 5.513 5.359 5.173 4.981 4.745 4.005 -6 ,2738 ,TETRA ,17668556,Fri Dec 3 06:40:32 CET,Fri Dec 3 08:27:01 CET,0.0 0.716 1.01 1.216 1.382 1.536 1.666 1.781 2.007 2.107 2.201 2.198 2.458 2.542 2.703 2.843 2.981 3.055 3.178 3.285 3.444 3.543 3.633 3.772 3.919 4.06 4.194 4.342 4.517 4.666 4.829 5.028 5.214 5.397 5.6 5.813 6.033 6.265 6.49 6.749 7.008 7.296 7.699 8.117 8.545 9.03 9.64 10.252 10.856 11.522 12.201 12.54 12.58 12.499 12.355 12.19 12.015 11.825 11.652 11.438 11.219 11.023 10.839 10.676 10.511 10.352 10.196 10.047 9.895 9.715 9.53 9.361 9.166 8.998 8.887 8.757 8.623 8.483 8.326 8.21 8.094 7.919 7.786 7.65 7.582 7.441 7.298 7.144 7.057 6.787 6.779 6.668 6.534 6.271 6.153 6.016 5.856 5.648 5.378 5.055 4.302 -7 ,17285 ,TETRA ,17668557,Fri Dec 3 06:40:33 CET,Fri Dec 3 08:26:55 CET,0.0 0.664 0.941 1.174 1.35 1.499 1.629 1.741 1.949 2.056 2.159 2.169 2.438 2.528 2.695 2.846 2.985 3.049 3.179 3.301 3.485 3.599 3.711 3.887 4.038 4.176 4.335 4.489 4.667 4.843 5.012 5.212 5.397 5.596 5.847 6.119 6.381 6.66 6.911 7.155 7.438 7.753 8.137 8.578 9.07 9.545 10.042 10.598 11.215 11.808 12.398 12.756 12.829 12.759 12.59 12.383 12.196 11.992 11.783 11.592 11.389 11.161 10.963 10.799 10.633 10.457 10.282 10.132 9.998 9.843 9.663 9.51 9.358 9.206 9.089 8.967 8.837 8.686 8.515 8.395 8.269 8.088 7.964 7.818 7.743 7.594 7.442 7.293 7.214 6.96 6.965 6.859 6.746 6.516 6.386 6.226 6.061 5.877 5.648 5.366 4.48 -8 ,7062 ,TETRA ,17668558,Fri Dec 3 06:40:28 CET,Fri Dec 3 08:27:52 CET,0.0 0.524 0.77 0.938 1.089 1.23 1.366 1.494 1.721 1.816 1.902 1.903 2.176 2.259 2.431 2.595 2.748 2.819 2.957 3.094 3.267 3.374 3.476 3.615 3.764 3.918 4.065 4.213 4.391 4.544 4.696 4.873 5.041 5.208 5.389 5.599 5.828 6.072 6.322 6.571 6.837 7.149 7.522 7.896 8.305 8.759 9.239 9.734 10.312 10.947 11.559 11.924 11.989 11.916 11.773 11.534 11.29 11.065 10.865 10.664 10.469 10.298 10.132 9.934 9.742 9.575 9.38 9.204 9.067 8.923 8.763 8.636 8.497 8.336 8.21 8.065 7.899 7.745 7.601 7.504 7.412 7.25 7.129 7.001 6.925 6.774 6.627 6.468 6.392 6.126 6.096 5.985 5.87 5.638 5.499 5.332 5.135 4.932 4.703 4.353 3.515 -9 ,26961 ,TETRA ,17668559,Fri Dec 3 06:40:29 CET,Fri Dec 3 08:27:52 CET,0.0 0.38 0.669 0.849 1.0 1.135 1.257 1.38 1.6 1.715 1.824 1.843 2.116 2.197 2.345 2.482 2.613 2.686 2.826 2.952 3.135 3.253 3.369 3.536 3.671 3.793 3.92 4.05 4.218 4.378 4.516 4.684 4.877 5.055 5.239 5.453 5.671 5.909 6.152 6.398 6.653 6.944 7.288 7.635 8.048 8.515 9.034 9.556 10.139 10.789 11.358 11.664 11.71 11.617 11.484 11.307 11.108 10.89 10.68 10.459 10.223 9.997 9.796 9.616 9.438 9.27 9.112 8.97 8.839 8.693 8.537 8.408 8.274 8.121 7.986 7.844 7.696 7.541 7.387 7.286 7.184 7.0 6.874 6.748 6.678 6.546 6.428 6.29 6.212 5.961 5.96 5.847 5.746 5.525 5.382 5.221 5.05 4.87 4.619 4.311 3.695 -10 ,16951 ,TETRA ,17668560,Fri Dec 3 06:40:29 CET,Fri Dec 3 08:28:07 CET,0.0 0.483 0.727 0.894 1.057 1.231 1.382 1.502 1.725 1.831 1.927 1.925 2.201 2.291 2.448 2.582 2.717 2.784 2.912 3.045 3.238 3.35 3.456 3.608 3.748 3.881 4.009 4.136 4.325 4.517 4.695 4.909 5.093 5.261 5.455 5.665 5.858 6.076 6.33 6.592 6.869 7.189 7.538 7.862 8.256 8.691 9.174 9.726 10.355 11.017 11.652 11.996 12.059 12.001 11.863 11.682 11.494 11.294 11.119 10.921 10.698 10.503 10.325 10.154 9.95 9.756 9.589 9.427 9.284 9.134 8.975 8.828 8.658 8.494 8.368 8.227 8.075 7.931 7.802 7.714 7.605 7.406 7.266 7.134 7.073 6.951 6.822 6.693 6.617 6.351 6.327 6.216 6.089 5.815 5.682 5.531 5.361 5.172 4.908 4.579 3.453 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5g.txt deleted file mode 100644 index e374b39a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16712 ,TETRA ,17668561,Fri Dec 3 06:40:29 CET,Fri Dec 3 08:27:39 CET,0.0 0.851 1.099 1.306 1.518 1.685 1.8 1.886 2.06 2.152 2.233 2.224 2.456 2.527 2.644 2.756 2.873 2.935 3.052 3.162 3.316 3.404 3.49 3.615 3.729 3.832 3.922 4.012 4.137 4.261 4.359 4.45 4.545 4.64 4.761 4.912 5.053 5.192 5.329 5.452 5.534 5.62 5.718 5.762 5.768 5.801 5.867 5.809 5.528 4.99 3.969 2.728 1.7 0.795 -0.008 -0.716 -1.351 -1.952 -2.437 -2.896 -3.299 -3.679 -4.027 -4.359 -4.648 -4.888 -5.139 -5.356 -5.552 -5.762 -6.0 -6.196 -6.391 -6.605 -6.777 -6.967 -7.163 -7.332 -7.489 -7.606 -7.736 -7.94 -8.083 -8.238 -8.315 -8.463 -8.621 -8.797 -8.888 -9.159 -9.202 -9.306 -9.415 -9.647 -9.78 -9.932 -10.091 -10.252 -10.457 -10.716 -11.167 -2 ,25272 ,TETRA ,17668562,Fri Dec 3 06:40:30 CET,Fri Dec 3 08:27:41 CET,0.0 0.925 1.237 1.464 1.648 1.798 1.933 2.056 2.284 2.386 2.48 2.49 2.711 2.779 2.909 3.03 3.148 3.201 3.311 3.411 3.542 3.614 3.679 3.785 3.882 3.982 4.086 4.171 4.282 4.397 4.516 4.668 4.791 4.893 5.03 5.189 5.315 5.436 5.542 5.639 5.731 5.815 5.894 5.955 5.989 5.975 5.927 5.821 5.554 5.05 4.076 2.807 1.734 0.816 0.039 -0.644 -1.254 -1.801 -2.257 -2.73 -3.124 -3.458 -3.786 -4.085 -4.359 -4.622 -4.883 -5.103 -5.32 -5.563 -5.801 -6.004 -6.212 -6.424 -6.594 -6.765 -6.932 -7.09 -7.257 -7.381 -7.524 -7.769 -7.931 -8.081 -8.158 -8.317 -8.483 -8.655 -8.739 -8.988 -8.977 -9.068 -9.18 -9.43 -9.58 -9.746 -9.927 -10.148 -10.393 -10.664 -11.322 -3 ,17993 ,TETRA ,17668563,Fri Dec 3 06:40:33 CET,Fri Dec 3 08:27:21 CET,0.0 0.516 0.749 0.957 1.137 1.278 1.421 1.559 1.785 1.882 1.966 1.96 2.191 2.26 2.386 2.502 2.608 2.659 2.752 2.846 2.98 3.068 3.151 3.249 3.356 3.467 3.552 3.632 3.739 3.841 3.935 4.035 4.137 4.252 4.379 4.5 4.603 4.702 4.798 4.883 4.961 5.047 5.117 5.18 5.242 5.249 5.178 5.037 4.773 4.271 3.311 2.051 0.965 0.032 -0.744 -1.414 -2.024 -2.559 -3.021 -3.482 -3.856 -4.198 -4.538 -4.871 -5.174 -5.447 -5.747 -6.016 -6.239 -6.467 -6.712 -6.924 -7.148 -7.377 -7.548 -7.706 -7.855 -8.017 -8.203 -8.335 -8.472 -8.68 -8.816 -8.963 -9.039 -9.192 -9.353 -9.512 -9.593 -9.846 -9.869 -9.966 -10.06 -10.264 -10.389 -10.52 -10.653 -10.82 -11.006 -11.286 -11.807 -4 ,25249 ,TETRA ,17668564,Fri Dec 3 06:41:27 CET,Fri Dec 3 08:28:07 CET,0.0 0.783 1.069 1.269 1.426 1.573 1.702 1.814 1.996 2.085 2.186 2.198 2.423 2.489 2.614 2.732 2.84 2.893 3.001 3.099 3.236 3.323 3.402 3.501 3.594 3.699 3.788 3.876 3.996 4.094 4.191 4.31 4.414 4.52 4.656 4.791 4.881 4.989 5.108 5.214 5.311 5.397 5.486 5.563 5.636 5.668 5.631 5.52 5.269 4.816 3.924 2.667 1.564 0.621 -0.175 -0.859 -1.446 -2.023 -2.566 -3.114 -3.526 -3.868 -4.216 -4.544 -4.827 -5.082 -5.355 -5.58 -5.774 -6.002 -6.255 -6.466 -6.685 -6.904 -7.066 -7.219 -7.373 -7.548 -7.736 -7.874 -8.017 -8.23 -8.381 -8.538 -8.619 -8.788 -8.954 -9.12 -9.207 -9.46 -9.466 -9.566 -9.683 -9.951 -10.082 -10.205 -10.346 -10.496 -10.666 -10.958 -11.914 -5 ,30232 ,TETRA ,17668565,Fri Dec 3 06:41:29 CET,Fri Dec 3 08:28:07 CET,0.0 0.858 1.258 1.501 1.673 1.847 1.987 2.102 2.296 2.376 2.453 2.447 2.678 2.743 2.859 2.97 3.082 3.136 3.242 3.359 3.539 3.654 3.76 3.887 3.996 4.096 4.184 4.271 4.383 4.476 4.571 4.704 4.831 4.946 5.064 5.184 5.29 5.404 5.513 5.622 5.726 5.834 5.93 6.003 6.071 6.107 6.136 6.108 5.855 5.328 4.357 3.101 2.027 1.074 0.25 -0.447 -1.059 -1.606 -2.053 -2.486 -2.865 -3.215 -3.534 -3.825 -4.123 -4.414 -4.686 -4.922 -5.124 -5.318 -5.53 -5.701 -5.889 -6.086 -6.219 -6.363 -6.51 -6.666 -6.847 -6.977 -7.109 -7.306 -7.445 -7.584 -7.652 -7.789 -7.938 -8.104 -8.188 -8.439 -8.448 -8.536 -8.635 -8.85 -8.956 -9.063 -9.194 -9.359 -9.552 -9.79 -10.392 -6 ,21830 ,TETRA ,17668566,Fri Dec 3 06:41:30 CET,Fri Dec 3 08:28:01 CET,0.0 0.608 0.872 1.093 1.284 1.44 1.566 1.701 1.936 2.034 2.139 2.158 2.384 2.449 2.563 2.678 2.788 2.843 2.949 3.054 3.196 3.279 3.377 3.537 3.676 3.784 3.878 3.965 4.069 4.159 4.258 4.393 4.524 4.63 4.726 4.83 4.945 5.101 5.236 5.341 5.44 5.537 5.625 5.68 5.738 5.755 5.723 5.621 5.38 4.9 3.934 2.628 1.551 0.629 -0.167 -0.846 -1.432 -1.964 -2.419 -2.866 -3.243 -3.567 -3.907 -4.255 -4.553 -4.824 -5.124 -5.395 -5.625 -5.877 -6.141 -6.333 -6.517 -6.705 -6.853 -7.003 -7.168 -7.346 -7.534 -7.666 -7.803 -8.024 -8.174 -8.323 -8.399 -8.56 -8.734 -8.897 -8.967 -9.22 -9.246 -9.344 -9.436 -9.644 -9.769 -9.901 -10.061 -10.246 -10.451 -10.713 -11.411 -7 ,8777 ,TETRA ,17668567,Fri Dec 3 06:41:33 CET,Fri Dec 3 08:27:40 CET,0.0 0.601 0.824 0.967 1.096 1.241 1.374 1.474 1.669 1.758 1.847 1.856 2.087 2.152 2.276 2.42 2.549 2.608 2.722 2.827 2.979 3.079 3.175 3.302 3.419 3.539 3.661 3.759 3.86 3.971 4.074 4.178 4.266 4.341 4.44 4.565 4.662 4.754 4.862 4.955 5.023 5.083 5.15 5.206 5.247 5.278 5.228 5.08 4.86 4.433 3.444 2.114 1.057 0.179 -0.637 -1.354 -1.975 -2.546 -3.015 -3.496 -3.911 -4.26 -4.595 -4.905 -5.186 -5.437 -5.686 -5.929 -6.138 -6.339 -6.566 -6.754 -6.939 -7.131 -7.299 -7.476 -7.636 -7.806 -7.997 -8.125 -8.256 -8.447 -8.576 -8.712 -8.779 -8.919 -9.07 -9.241 -9.332 -9.594 -9.635 -9.745 -9.86 -10.09 -10.224 -10.379 -10.542 -10.717 -10.909 -11.147 -11.525 -8 ,1721 ,TETRA ,17668568,Fri Dec 3 06:41:27 CET,Fri Dec 3 08:27:39 CET,0.0 0.607 0.929 1.128 1.262 1.385 1.523 1.655 1.859 1.952 2.049 2.067 2.306 2.383 2.529 2.665 2.779 2.826 2.914 2.997 3.127 3.22 3.31 3.441 3.56 3.672 3.783 3.882 3.982 4.064 4.145 4.249 4.375 4.506 4.62 4.727 4.826 4.923 5.013 5.098 5.181 5.253 5.305 5.343 5.39 5.414 5.394 5.321 5.104 4.637 3.696 2.455 1.381 0.449 -0.353 -1.068 -1.662 -2.187 -2.649 -3.095 -3.479 -3.819 -4.14 -4.431 -4.71 -5.003 -5.314 -5.579 -5.79 -6.001 -6.223 -6.418 -6.62 -6.838 -7.017 -7.195 -7.374 -7.555 -7.748 -7.889 -8.032 -8.258 -8.406 -8.55 -8.623 -8.76 -8.905 -9.076 -9.167 -9.421 -9.434 -9.533 -9.642 -9.891 -10.015 -10.127 -10.241 -10.366 -10.558 -10.851 -11.336 -9 ,14935 ,TETRA ,17668569,Fri Dec 3 06:41:29 CET,Fri Dec 3 08:28:18 CET,0.0 0.618 0.898 1.086 1.243 1.399 1.53 1.655 1.892 1.982 2.069 2.091 2.315 2.379 2.527 2.666 2.784 2.839 2.942 3.045 3.186 3.275 3.372 3.51 3.634 3.744 3.838 3.933 4.029 4.123 4.238 4.372 4.505 4.611 4.722 4.869 4.988 5.074 5.159 5.292 5.435 5.556 5.648 5.703 5.741 5.758 5.747 5.63 5.389 4.928 3.974 2.678 1.571 0.611 -0.199 -0.867 -1.439 -1.978 -2.444 -2.884 -3.256 -3.597 -3.921 -4.254 -4.582 -4.874 -5.208 -5.492 -5.713 -5.939 -6.148 -6.309 -6.483 -6.675 -6.826 -6.978 -7.129 -7.288 -7.464 -7.594 -7.73 -7.941 -8.091 -8.247 -8.329 -8.5 -8.673 -8.85 -8.939 -9.194 -9.205 -9.298 -9.397 -9.661 -9.809 -9.932 -10.056 -10.23 -10.447 -10.699 -11.424 -10 ,12485 ,TETRA ,17668570,Fri Dec 3 06:41:30 CET,Fri Dec 3 08:28:14 CET,0.0 0.791 1.038 1.237 1.41 1.59 1.754 1.89 2.12 2.222 2.309 2.312 2.549 2.621 2.749 2.866 2.979 3.035 3.136 3.24 3.403 3.506 3.601 3.742 3.854 3.936 4.019 4.111 4.224 4.322 4.413 4.53 4.659 4.784 4.898 5.02 5.124 5.241 5.381 5.499 5.632 5.8 5.958 6.103 6.262 6.322 6.247 6.116 5.862 5.387 4.461 3.182 2.085 1.141 0.357 -0.321 -0.911 -1.446 -1.935 -2.397 -2.753 -3.068 -3.371 -3.694 -4.0 -4.251 -4.545 -4.807 -5.001 -5.206 -5.43 -5.614 -5.796 -5.979 -6.127 -6.299 -6.488 -6.677 -6.867 -6.99 -7.127 -7.345 -7.486 -7.633 -7.707 -7.851 -8.005 -8.175 -8.255 -8.502 -8.522 -8.621 -8.718 -8.931 -9.047 -9.18 -9.335 -9.498 -9.669 -9.895 -10.302 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5i.txt deleted file mode 100644 index 2b8a8c7f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27298 ,TETRA ,17668571,Fri Dec 3 06:41:27 CET,Fri Dec 3 08:29:21 CET,0.0 0.753 1.037 1.263 1.452 1.6 1.737 1.852 2.051 2.14 2.227 2.23 2.446 2.51 2.653 2.779 2.897 2.956 3.061 3.165 3.31 3.397 3.479 3.575 3.663 3.769 3.871 3.951 4.056 4.163 4.26 4.369 4.46 4.532 4.607 4.687 4.774 4.903 5.006 5.07 5.138 5.202 5.243 5.255 5.225 5.147 5.0 4.808 4.48 3.756 2.426 0.732 -0.693 -1.87 -2.844 -3.708 -4.452 -5.098 -5.681 -6.278 -6.759 -7.173 -7.594 -7.996 -8.355 -8.66 -8.963 -9.22 -9.44 -9.67 -9.916 -10.127 -10.325 -10.542 -10.729 -10.905 -11.071 -11.241 -11.406 -11.527 -11.658 -11.856 -12.002 -12.158 -12.242 -12.417 -12.587 -12.74 -12.819 -13.084 -13.129 -13.251 -13.369 -13.619 -13.753 -13.892 -14.054 -14.247 -14.458 -14.747 -15.652 -2 ,22998 ,TETRA ,17668572,Fri Dec 3 06:41:27 CET,Fri Dec 3 08:28:40 CET,0.0 0.669 0.921 1.16 1.343 1.501 1.638 1.746 1.945 2.041 2.133 2.133 2.367 2.448 2.596 2.74 2.873 2.927 3.023 3.126 3.265 3.347 3.421 3.519 3.616 3.708 3.782 3.854 3.957 4.047 4.126 4.198 4.258 4.33 4.422 4.501 4.556 4.63 4.716 4.802 4.886 4.932 4.956 4.954 4.905 4.792 4.626 4.359 3.892 3.143 1.802 0.071 -1.32 -2.471 -3.435 -4.283 -5.01 -5.643 -6.217 -6.779 -7.249 -7.672 -8.053 -8.394 -8.718 -9.014 -9.309 -9.577 -9.841 -10.115 -10.383 -10.613 -10.835 -11.042 -11.202 -11.371 -11.541 -11.715 -11.899 -12.022 -12.146 -12.358 -12.523 -12.69 -12.768 -12.929 -13.091 -13.235 -13.317 -13.592 -13.622 -13.733 -13.852 -14.091 -14.22 -14.363 -14.517 -14.709 -14.978 -15.347 -16.184 -3 ,8545 ,TETRA ,17668573,Fri Dec 3 06:41:28 CET,Fri Dec 3 08:28:35 CET,0.0 0.621 0.801 0.975 1.149 1.29 1.423 1.555 1.775 1.858 1.938 1.953 2.189 2.258 2.373 2.484 2.597 2.657 2.774 2.872 3.007 3.103 3.188 3.28 3.353 3.436 3.521 3.596 3.676 3.739 3.803 3.89 3.964 4.031 4.124 4.229 4.311 4.403 4.532 4.667 4.769 4.828 4.839 4.829 4.785 4.707 4.564 4.325 3.872 3.068 1.663 -0.059 -1.488 -2.668 -3.611 -4.427 -5.162 -5.87 -6.503 -7.126 -7.619 -8.037 -8.442 -8.795 -9.107 -9.395 -9.691 -9.944 -10.169 -10.408 -10.656 -10.864 -11.069 -11.294 -11.473 -11.651 -11.83 -12.009 -12.204 -12.333 -12.465 -12.687 -12.852 -13.031 -13.118 -13.285 -13.455 -13.645 -13.742 -13.999 -14.0 -14.093 -14.189 -14.417 -14.55 -14.682 -14.819 -14.97 -15.165 -15.46 -15.965 -4 ,32263 ,TETRA ,17668574,Fri Dec 3 06:41:30 CET,Fri Dec 3 08:29:04 CET,0.0 0.812 1.055 1.244 1.395 1.538 1.671 1.792 1.992 2.068 2.142 2.138 2.361 2.428 2.557 2.672 2.787 2.849 2.965 3.075 3.223 3.302 3.366 3.467 3.579 3.669 3.742 3.833 3.955 4.078 4.219 4.373 4.496 4.603 4.687 4.758 4.844 4.956 5.047 5.091 5.131 5.171 5.191 5.186 5.154 5.117 5.006 4.751 4.309 3.551 2.195 0.524 -0.838 -2.021 -3.041 -3.904 -4.634 -5.335 -5.929 -6.46 -6.902 -7.301 -7.682 -8.074 -8.459 -8.769 -9.062 -9.322 -9.541 -9.762 -10.01 -10.218 -10.444 -10.677 -10.846 -11.036 -11.221 -11.388 -11.558 -11.676 -11.795 -11.973 -12.11 -12.26 -12.344 -12.524 -12.708 -12.896 -12.987 -13.251 -13.284 -13.398 -13.511 -13.751 -13.898 -14.071 -14.234 -14.39 -14.578 -14.858 -15.721 -5 ,3419 ,TETRA ,17668575,Fri Dec 3 06:41:33 CET,Fri Dec 3 08:28:47 CET,0.0 0.611 0.911 1.118 1.282 1.434 1.568 1.69 1.913 2.015 2.101 2.095 2.325 2.403 2.545 2.663 2.783 2.842 2.945 3.043 3.183 3.277 3.37 3.495 3.62 3.73 3.828 3.929 4.029 4.105 4.188 4.307 4.43 4.53 4.638 4.75 4.841 4.937 5.01 5.052 5.098 5.14 5.157 5.144 5.079 4.96 4.767 4.449 3.951 3.2 1.86 0.151 -1.253 -2.471 -3.505 -4.38 -5.124 -5.777 -6.336 -6.88 -7.377 -7.823 -8.213 -8.569 -8.886 -9.189 -9.513 -9.79 -10.033 -10.284 -10.546 -10.754 -10.963 -11.198 -11.387 -11.58 -11.764 -11.954 -12.159 -12.294 -12.426 -12.618 -12.764 -12.928 -13.011 -13.178 -13.349 -13.529 -13.617 -13.872 -13.891 -14.0 -14.12 -14.358 -14.49 -14.651 -14.823 -15.005 -15.213 -15.542 -16.347 -6 ,2104 ,TETRA ,17668576,Fri Dec 3 06:41:27 CET,Fri Dec 3 08:28:32 CET,0.0 0.724 1.036 1.265 1.438 1.578 1.708 1.82 2.012 2.095 2.186 2.194 2.417 2.489 2.628 2.756 2.879 2.929 3.022 3.122 3.258 3.348 3.438 3.548 3.648 3.755 3.862 3.964 4.084 4.183 4.261 4.342 4.42 4.488 4.568 4.652 4.72 4.795 4.875 4.926 4.956 5.01 5.086 5.121 5.09 5.004 4.853 4.653 4.271 3.482 2.128 0.479 -0.908 -2.096 -3.107 -3.976 -4.702 -5.359 -5.947 -6.526 -6.992 -7.433 -7.856 -8.205 -8.517 -8.811 -9.119 -9.394 -9.648 -9.918 -10.199 -10.423 -10.648 -10.868 -11.023 -11.189 -11.373 -11.572 -11.768 -11.91 -12.048 -12.239 -12.372 -12.519 -12.592 -12.725 -12.875 -13.044 -13.132 -13.404 -13.443 -13.549 -13.664 -13.928 -14.074 -14.23 -14.385 -14.544 -14.739 -14.997 -15.676 -7 ,6348 ,TETRA ,17668577,Fri Dec 3 06:41:29 CET,Fri Dec 3 08:29:08 CET,0.0 0.812 1.126 1.333 1.506 1.663 1.794 1.914 2.142 2.238 2.332 2.347 2.578 2.643 2.763 2.876 2.968 3.011 3.102 3.194 3.32 3.399 3.478 3.595 3.707 3.8 3.88 3.96 4.077 4.183 4.269 4.362 4.468 4.588 4.722 4.869 5.005 5.111 5.163 5.209 5.259 5.325 5.388 5.411 5.393 5.305 5.135 4.851 4.389 3.618 2.233 0.527 -0.858 -2.048 -3.057 -3.897 -4.594 -5.23 -5.772 -6.301 -6.762 -7.168 -7.547 -7.887 -8.213 -8.533 -8.869 -9.167 -9.417 -9.678 -9.931 -10.117 -10.312 -10.528 -10.689 -10.856 -11.05 -11.258 -11.463 -11.597 -11.738 -11.968 -12.125 -12.286 -12.368 -12.534 -12.706 -12.873 -12.963 -13.232 -13.244 -13.341 -13.444 -13.704 -13.847 -14.0 -14.176 -14.369 -14.577 -14.824 -15.458 -8 ,12784 ,TETRA ,17668578,Fri Dec 3 06:41:31 CET,Fri Dec 3 08:28:48 CET,0.0 0.536 0.796 1.012 1.205 1.388 1.522 1.644 1.836 1.916 2.0 1.983 2.202 2.281 2.419 2.528 2.644 2.701 2.791 2.875 2.998 3.072 3.151 3.285 3.408 3.517 3.607 3.688 3.783 3.874 3.961 4.045 4.134 4.202 4.265 4.35 4.424 4.49 4.556 4.622 4.665 4.741 4.859 4.885 4.856 4.776 4.586 4.279 3.84 3.101 1.715 0.053 -1.317 -2.504 -3.502 -4.365 -5.136 -5.836 -6.441 -7.018 -7.477 -7.868 -8.244 -8.603 -8.924 -9.215 -9.542 -9.842 -10.094 -10.356 -10.635 -10.859 -11.087 -11.329 -11.513 -11.697 -11.874 -12.058 -12.268 -12.406 -12.543 -12.759 -12.902 -13.057 -13.132 -13.281 -13.452 -13.633 -13.727 -13.994 -14.023 -14.133 -14.256 -14.533 -14.687 -14.853 -15.023 -15.199 -15.409 -15.689 -16.342 -9 ,2748 ,TETRA ,17668579,Fri Dec 3 06:41:27 CET,Fri Dec 3 08:31:11 CET,0.0 0.932 1.227 1.404 1.562 1.708 1.814 1.914 2.097 2.185 2.278 2.282 2.512 2.588 2.711 2.835 2.953 3.0 3.08 3.166 3.314 3.4 3.477 3.579 3.69 3.805 3.903 3.991 4.1 4.203 4.294 4.383 4.454 4.536 4.626 4.727 4.801 4.854 4.912 4.966 5.027 5.065 5.05 5.045 5.07 5.047 4.887 4.616 4.188 3.368 1.911 0.217 -1.171 -2.339 -3.337 -4.209 -4.966 -5.636 -6.176 -6.7 -7.202 -7.683 -8.105 -8.481 -8.832 -9.159 -9.506 -9.811 -10.073 -10.337 -10.583 -10.78 -10.98 -11.175 -11.342 -11.524 -11.701 -11.889 -12.097 -12.23 -12.358 -12.555 -12.7 -12.853 -12.923 -13.068 -13.229 -13.414 -13.512 -13.788 -13.827 -13.929 -14.039 -14.263 -14.385 -14.519 -14.663 -14.826 -15.031 -15.315 -16.066 -10 ,18196 ,TETRA ,17668580,Fri Dec 3 06:41:29 CET,Fri Dec 3 08:30:56 CET,0.0 0.699 1.004 1.246 1.433 1.59 1.727 1.843 2.063 2.167 2.259 2.267 2.506 2.58 2.716 2.86 2.992 3.057 3.167 3.26 3.378 3.44 3.507 3.624 3.74 3.84 3.93 4.02 4.118 4.205 4.287 4.38 4.462 4.538 4.624 4.707 4.783 4.856 4.916 4.956 5.005 5.06 5.084 5.079 5.01 4.96 4.968 4.784 4.306 3.534 2.143 0.413 -0.994 -2.14 -3.105 -3.966 -4.686 -5.324 -5.874 -6.404 -6.854 -7.263 -7.662 -8.055 -8.424 -8.718 -9.0 -9.268 -9.496 -9.72 -9.949 -10.146 -10.351 -10.556 -10.717 -10.899 -11.099 -11.294 -11.488 -11.622 -11.763 -11.995 -12.151 -12.302 -12.381 -12.547 -12.724 -12.902 -12.991 -13.263 -13.304 -13.408 -13.511 -13.743 -13.877 -14.002 -14.132 -14.309 -14.521 -14.799 -15.333 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5g_5c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5g_5c.txt deleted file mode 100644 index 1a1782c6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5g_5c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4170 ,TETRA ,17668581,Fri Dec 3 06:41:28 CET,Fri Dec 3 08:29:26 CET,0.0 0.871 1.223 1.443 1.622 1.769 1.893 2.005 2.2 2.288 2.369 2.343 2.586 2.66 2.804 2.942 3.056 3.114 3.227 3.322 3.469 3.566 3.645 3.75 3.848 3.948 4.052 4.135 4.233 4.327 4.415 4.523 4.651 4.783 4.882 4.967 5.064 5.146 5.222 5.317 5.431 5.545 5.631 5.654 5.652 5.628 5.458 5.122 4.573 3.681 2.105 0.169 -1.453 -2.769 -3.906 -4.932 -5.778 -6.52 -7.143 -7.755 -8.277 -8.783 -9.299 -9.758 -10.153 -10.494 -10.837 -11.134 -11.404 -11.688 -11.975 -12.227 -12.503 -12.781 -12.989 -13.202 -13.414 -13.622 -13.844 -13.993 -14.129 -14.345 -14.51 -14.684 -14.769 -14.957 -15.168 -15.396 -15.511 -15.811 -15.864 -15.991 -16.125 -16.425 -16.585 -16.759 -16.944 -17.144 -17.386 -17.694 -18.426 -2 ,28408 ,TETRA ,17668582,Fri Dec 3 06:41:29 CET,Fri Dec 3 08:29:29 CET,0.0 0.694 1.054 1.285 1.443 1.584 1.716 1.832 2.043 2.14 2.239 2.259 2.508 2.588 2.736 2.878 3.017 3.077 3.176 3.273 3.432 3.539 3.636 3.763 3.887 4.004 4.114 4.216 4.342 4.469 4.597 4.756 4.881 4.966 5.062 5.153 5.238 5.317 5.382 5.446 5.485 5.533 5.578 5.576 5.532 5.445 5.272 4.951 4.423 3.587 2.027 0.017 -1.645 -3.026 -4.146 -5.12 -5.963 -6.707 -7.351 -7.976 -8.51 -9.019 -9.485 -9.898 -10.283 -10.622 -10.966 -11.292 -11.598 -11.917 -12.243 -12.506 -12.767 -13.035 -13.251 -13.467 -13.696 -13.944 -14.178 -14.33 -14.471 -14.683 -14.834 -15.007 -15.104 -15.305 -15.503 -15.704 -15.804 -16.1 -16.168 -16.303 -16.436 -16.741 -16.907 -17.067 -17.24 -17.449 -17.716 -18.064 -19.25 -3 ,29539 ,TETRA ,17668583,Fri Dec 3 06:41:30 CET,Fri Dec 3 08:27:58 CET,0.0 0.856 1.156 1.354 1.529 1.69 1.83 1.953 2.148 2.233 2.311 2.307 2.561 2.644 2.789 2.921 3.034 3.083 3.186 3.3 3.461 3.556 3.653 3.785 3.905 4.035 4.157 4.267 4.404 4.521 4.614 4.714 4.825 4.923 5.029 5.173 5.32 5.462 5.559 5.635 5.706 5.782 5.843 5.854 5.817 5.726 5.544 5.229 4.711 3.801 2.151 0.142 -1.481 -2.825 -3.964 -4.938 -5.763 -6.515 -7.145 -7.746 -8.256 -8.709 -9.157 -9.559 -9.921 -10.28 -10.659 -10.983 -11.264 -11.559 -11.858 -12.106 -12.368 -12.652 -12.868 -13.071 -13.267 -13.476 -13.701 -13.863 -14.027 -14.271 -14.446 -14.616 -14.706 -14.908 -15.126 -15.348 -15.45 -15.748 -15.789 -15.907 -16.036 -16.32 -16.471 -16.626 -16.81 -17.051 -17.332 -17.645 -18.292 -4 ,7321 ,TETRA ,17668584,Fri Dec 3 06:41:34 CET,Fri Dec 3 08:27:50 CET,0.0 0.672 0.975 1.173 1.362 1.502 1.616 1.726 1.95 2.059 2.145 2.144 2.391 2.463 2.614 2.745 2.864 2.93 3.037 3.128 3.277 3.377 3.469 3.589 3.708 3.831 3.946 4.04 4.152 4.259 4.361 4.492 4.623 4.72 4.796 4.89 4.982 5.063 5.145 5.234 5.323 5.407 5.462 5.485 5.46 5.318 5.129 4.838 4.296 3.382 1.741 -0.261 -1.905 -3.269 -4.435 -5.415 -6.287 -7.127 -7.792 -8.402 -8.936 -9.424 -9.876 -10.293 -10.71 -11.075 -11.425 -11.729 -11.984 -12.256 -12.561 -12.809 -13.051 -13.316 -13.529 -13.754 -14.001 -14.249 -14.496 -14.66 -14.82 -15.07 -15.252 -15.423 -15.503 -15.69 -15.896 -16.095 -16.194 -16.49 -16.53 -16.652 -16.782 -17.082 -17.237 -17.398 -17.585 -17.793 -18.023 -18.334 -18.959 -5 ,24790 ,TETRA ,17668585,Fri Dec 3 06:41:29 CET,Fri Dec 3 08:28:22 CET,0.0 0.585 0.828 1.039 1.204 1.359 1.509 1.634 1.847 1.948 2.049 2.07 2.323 2.404 2.553 2.705 2.84 2.897 3.012 3.103 3.215 3.298 3.393 3.528 3.644 3.752 3.841 3.917 4.019 4.126 4.24 4.372 4.461 4.544 4.665 4.798 4.904 5.004 5.097 5.162 5.207 5.255 5.297 5.28 5.206 5.097 4.903 4.566 3.968 2.959 1.264 -0.728 -2.347 -3.677 -4.812 -5.809 -6.661 -7.4 -8.021 -8.659 -9.209 -9.726 -10.203 -10.636 -11.037 -11.376 -11.738 -12.077 -12.37 -12.655 -12.936 -13.175 -13.443 -13.727 -13.926 -14.124 -14.339 -14.547 -14.751 -14.894 -15.045 -15.287 -15.46 -15.648 -15.747 -15.949 -16.162 -16.401 -16.513 -16.809 -16.861 -16.994 -17.131 -17.418 -17.564 -17.738 -17.969 -18.214 -18.449 -18.735 -19.683 -6 ,26416 ,TETRA ,17668586,Fri Dec 3 06:41:34 CET,Fri Dec 3 08:28:19 CET,0.0 0.734 1.052 1.277 1.479 1.649 1.809 1.95 2.192 2.297 2.397 2.407 2.657 2.74 2.888 3.006 3.112 3.165 3.274 3.394 3.562 3.66 3.755 3.877 3.994 4.114 4.216 4.311 4.448 4.578 4.713 4.861 4.979 5.095 5.21 5.333 5.42 5.483 5.546 5.609 5.667 5.716 5.76 5.772 5.755 5.665 5.468 5.154 4.612 3.687 2.071 0.111 -1.518 -2.867 -3.986 -4.964 -5.809 -6.546 -7.173 -7.803 -8.343 -8.813 -9.251 -9.681 -10.064 -10.384 -10.726 -11.045 -11.318 -11.602 -11.903 -12.147 -12.392 -12.637 -12.831 -13.04 -13.239 -13.441 -13.663 -13.813 -13.961 -14.196 -14.353 -14.518 -14.609 -14.801 -14.994 -15.203 -15.312 -15.612 -15.667 -15.786 -15.918 -16.203 -16.348 -16.498 -16.667 -16.88 -17.161 -17.564 -18.56 -7 ,2246 ,TETRA ,17668587,Fri Dec 3 06:41:30 CET,Fri Dec 3 08:28:16 CET,0.0 0.69 0.965 1.19 1.389 1.544 1.657 1.769 2.002 2.104 2.2 2.205 2.451 2.523 2.648 2.762 2.882 2.942 3.056 3.164 3.295 3.361 3.427 3.526 3.613 3.708 3.815 3.91 4.025 4.152 4.261 4.368 4.47 4.556 4.648 4.752 4.871 4.997 5.089 5.164 5.237 5.299 5.317 5.303 5.253 5.144 4.965 4.629 4.065 3.135 1.476 -0.518 -2.12 -3.462 -4.602 -5.588 -6.415 -7.135 -7.784 -8.444 -8.971 -9.463 -9.948 -10.383 -10.766 -11.11 -11.507 -11.879 -12.177 -12.468 -12.75 -12.975 -13.224 -13.489 -13.683 -13.876 -14.079 -14.282 -14.497 -14.655 -14.809 -15.037 -15.199 -15.365 -15.447 -15.619 -15.815 -16.026 -16.126 -16.416 -16.45 -16.572 -16.699 -16.978 -17.137 -17.301 -17.483 -17.713 -18.009 -18.352 -18.844 -8 ,18868 ,TETRA ,17668588,Fri Dec 3 06:41:34 CET,Fri Dec 3 08:28:08 CET,0.0 0.735 1.074 1.327 1.502 1.639 1.764 1.888 2.107 2.208 2.309 2.328 2.573 2.647 2.793 2.926 3.048 3.101 3.208 3.321 3.463 3.539 3.614 3.72 3.821 3.943 4.07 4.177 4.312 4.426 4.521 4.664 4.804 4.928 5.049 5.184 5.313 5.417 5.5 5.578 5.659 5.737 5.78 5.777 5.738 5.638 5.453 5.147 4.601 3.695 2.118 0.139 -1.49 -2.841 -3.956 -4.994 -5.901 -6.692 -7.343 -7.959 -8.503 -8.978 -9.414 -9.819 -10.19 -10.526 -10.876 -11.18 -11.443 -11.736 -12.064 -12.333 -12.595 -12.873 -13.081 -13.291 -13.524 -13.763 -14.0 -14.16 -14.316 -14.558 -14.73 -14.908 -15.0 -15.184 -15.394 -15.613 -15.72 -16.029 -16.099 -16.225 -16.352 -16.615 -16.764 -16.93 -17.102 -17.306 -17.536 -17.812 -18.555 -9 ,21879 ,TETRA ,17668589,Fri Dec 3 06:41:29 CET,Fri Dec 3 08:29:04 CET,0.0 1.014 1.316 1.507 1.677 1.85 1.996 2.128 2.35 2.448 2.544 2.542 2.788 2.865 2.994 3.113 3.233 3.294 3.401 3.496 3.64 3.719 3.807 3.952 4.088 4.2 4.291 4.383 4.493 4.619 4.743 4.866 4.97 5.063 5.159 5.255 5.347 5.43 5.513 5.583 5.628 5.666 5.711 5.748 5.721 5.596 5.413 5.116 4.564 3.648 2.046 0.077 -1.544 -2.918 -4.078 -5.071 -5.927 -6.676 -7.301 -7.915 -8.457 -8.949 -9.403 -9.833 -10.231 -10.582 -10.932 -11.261 -11.571 -11.87 -12.173 -12.434 -12.689 -12.94 -13.129 -13.325 -13.528 -13.751 -13.998 -14.164 -14.334 -14.588 -14.754 -14.927 -15.019 -15.215 -15.421 -15.633 -15.745 -16.052 -16.115 -16.247 -16.382 -16.65 -16.799 -16.984 -17.175 -17.366 -17.617 -17.943 -18.544 -10 ,15112 ,TETRA ,17668590,Fri Dec 3 06:42:26 CET,Fri Dec 3 08:29:14 CET,0.0 0.835 1.147 1.384 1.562 1.685 1.796 1.926 2.172 2.27 2.349 2.332 2.575 2.651 2.792 2.933 3.075 3.135 3.234 3.324 3.476 3.578 3.658 3.771 3.875 3.98 4.1 4.214 4.33 4.417 4.508 4.635 4.759 4.862 4.976 5.088 5.168 5.252 5.374 5.504 5.574 5.62 5.657 5.66 5.619 5.512 5.281 4.936 4.381 3.442 1.833 -0.113 -1.74 -3.115 -4.291 -5.303 -6.142 -6.884 -7.538 -8.22 -8.757 -9.206 -9.673 -10.138 -10.571 -10.954 -11.345 -11.673 -11.942 -12.221 -12.505 -12.747 -13.009 -13.28 -13.485 -13.702 -13.928 -14.156 -14.387 -14.536 -14.699 -14.968 -15.162 -15.357 -15.453 -15.653 -15.859 -16.085 -16.201 -16.51 -16.587 -16.719 -16.844 -17.11 -17.274 -17.47 -17.662 -17.838 -18.088 -18.494 -19.568 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5f.txt deleted file mode 100644 index a5b6ce6c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3193 ,TETRA ,17668591,Fri Dec 3 06:42:28 CET,Fri Dec 3 08:30:15 CET,0.0 0.581 0.808 0.977 1.125 1.272 1.418 1.539 1.759 1.859 1.954 1.984 2.23 2.318 2.488 2.638 2.772 2.84 2.962 3.064 3.212 3.319 3.425 3.583 3.737 3.86 3.97 4.083 4.226 4.35 4.481 4.669 4.846 5.016 5.2 5.372 5.524 5.691 5.874 6.079 6.298 6.53 6.807 7.073 7.358 7.626 7.889 8.197 8.501 8.691 8.587 8.093 7.494 6.912 6.415 5.95 5.512 5.073 4.688 4.312 3.949 3.585 3.227 2.905 2.584 2.258 1.926 1.657 1.429 1.178 0.922 0.722 0.531 0.336 0.174 -0.003 -0.201 -0.422 -0.645 -0.781 -0.919 -1.154 -1.322 -1.477 -1.558 -1.758 -1.968 -2.173 -2.276 -2.54 -2.638 -2.769 -2.904 -3.249 -3.446 -3.658 -3.911 -4.197 -4.489 -4.849 -6.091 -2 ,15458 ,TETRA ,17668592,Fri Dec 3 06:42:30 CET,Fri Dec 3 08:30:21 CET,0.0 0.734 1.061 1.289 1.459 1.606 1.74 1.848 2.043 2.151 2.256 2.288 2.529 2.608 2.759 2.88 2.985 3.045 3.167 3.277 3.426 3.52 3.624 3.773 3.911 4.043 4.17 4.295 4.468 4.632 4.768 4.941 5.12 5.277 5.454 5.634 5.837 6.082 6.305 6.501 6.7 6.934 7.186 7.434 7.717 7.99 8.278 8.597 8.888 9.085 9.053 8.684 8.176 7.581 7.015 6.499 6.03 5.603 5.219 4.819 4.462 4.147 3.826 3.514 3.226 2.96 2.667 2.413 2.208 1.964 1.696 1.485 1.263 1.028 0.843 0.661 0.465 0.242 0.032 -0.114 -0.275 -0.512 -0.687 -0.869 -0.966 -1.213 -1.501 -1.814 -1.961 -2.238 -2.324 -2.458 -2.6 -2.926 -3.099 -3.281 -3.486 -3.705 -3.971 -4.343 -5.54 -3 ,24874 ,TETRA ,17668593,Fri Dec 3 06:42:31 CET,Fri Dec 3 08:29:56 CET,0.0 0.774 1.036 1.224 1.387 1.533 1.661 1.786 2.003 2.09 2.173 2.186 2.426 2.493 2.615 2.755 2.879 2.938 3.057 3.175 3.355 3.459 3.557 3.702 3.843 3.984 4.116 4.245 4.403 4.537 4.669 4.831 4.983 5.118 5.273 5.463 5.66 5.887 6.107 6.335 6.573 6.85 7.167 7.432 7.706 7.982 8.281 8.575 8.845 8.993 8.862 8.501 7.999 7.413 6.838 6.306 5.837 5.366 4.954 4.536 4.174 3.87 3.57 3.27 2.986 2.716 2.417 2.143 1.91 1.688 1.424 1.18 0.945 0.715 0.539 0.354 0.15 -0.074 -0.282 -0.412 -0.553 -0.783 -0.948 -1.113 -1.199 -1.375 -1.55 -1.752 -1.86 -2.139 -2.25 -2.386 -2.539 -2.835 -2.999 -3.2 -3.432 -3.681 -3.975 -4.42 -5.533 -4 ,28532 ,TETRA ,17668594,Fri Dec 3 06:42:26 CET,Fri Dec 3 08:29:42 CET,0.0 0.36 0.594 0.805 0.976 1.13 1.255 1.363 1.568 1.66 1.75 1.748 1.973 2.039 2.18 2.316 2.429 2.485 2.603 2.708 2.839 2.932 3.033 3.189 3.33 3.448 3.561 3.671 3.814 3.969 4.14 4.342 4.52 4.673 4.852 5.051 5.22 5.421 5.683 5.96 6.197 6.425 6.681 6.901 7.141 7.387 7.669 7.988 8.25 8.399 8.327 7.892 7.334 6.804 6.308 5.816 5.369 4.898 4.465 4.058 3.673 3.311 2.964 2.643 2.346 2.07 1.782 1.535 1.33 1.111 0.859 0.645 0.456 0.258 0.081 -0.125 -0.35 -0.572 -0.8 -0.981 -1.171 -1.461 -1.644 -1.826 -1.93 -2.148 -2.37 -2.606 -2.728 -3.01 -3.118 -3.262 -3.422 -3.745 -3.912 -4.099 -4.318 -4.568 -4.874 -5.293 -6.726 -5 ,7119 ,TETRA ,17668595,Fri Dec 3 06:42:27 CET,Fri Dec 3 08:29:36 CET,0.0 0.532 0.812 1.012 1.164 1.295 1.434 1.544 1.717 1.812 1.909 1.931 2.166 2.233 2.355 2.473 2.586 2.642 2.755 2.863 3.013 3.115 3.213 3.35 3.481 3.61 3.74 3.857 4.01 4.174 4.343 4.54 4.693 4.828 4.997 5.177 5.381 5.636 5.894 6.147 6.415 6.717 7.019 7.277 7.597 7.955 8.276 8.549 8.801 8.977 8.885 8.342 7.709 7.125 6.589 6.025 5.525 5.099 4.716 4.325 3.972 3.609 3.255 2.957 2.693 2.445 2.176 1.931 1.704 1.448 1.208 1.023 0.819 0.607 0.446 0.281 0.106 -0.086 -0.294 -0.437 -0.584 -0.817 -0.986 -1.178 -1.273 -1.466 -1.676 -1.892 -2.01 -2.285 -2.368 -2.5 -2.641 -2.955 -3.146 -3.388 -3.673 -4.002 -4.402 -4.903 -6.459 -6 ,26502 ,TETRA ,17668596,Fri Dec 3 06:42:27 CET,Fri Dec 3 08:30:03 CET,0.0 0.59 0.842 1.013 1.141 1.273 1.39 1.49 1.675 1.774 1.866 1.864 2.097 2.17 2.307 2.452 2.591 2.657 2.776 2.877 3.045 3.16 3.265 3.425 3.592 3.741 3.878 4.021 4.197 4.347 4.48 4.652 4.821 4.963 5.12 5.302 5.487 5.684 5.871 6.068 6.275 6.568 6.921 7.174 7.427 7.715 8.029 8.366 8.688 8.904 8.851 8.415 7.86 7.278 6.735 6.228 5.789 5.374 4.995 4.543 4.082 3.695 3.333 3.007 2.726 2.47 2.189 1.941 1.719 1.489 1.271 1.071 0.862 0.643 0.467 0.291 0.108 -0.078 -0.259 -0.391 -0.551 -0.819 -1.006 -1.191 -1.282 -1.486 -1.706 -1.917 -2.031 -2.31 -2.412 -2.545 -2.686 -3.003 -3.184 -3.386 -3.621 -3.905 -4.235 -4.712 -5.653 -7 ,3594 ,TETRA ,17668597,Fri Dec 3 06:42:28 CET,Fri Dec 3 08:29:46 CET,0.0 0.451 0.645 0.799 0.938 1.061 1.188 1.319 1.547 1.647 1.736 1.753 1.987 2.058 2.202 2.352 2.497 2.57 2.703 2.81 2.971 3.081 3.178 3.314 3.443 3.562 3.679 3.789 3.941 4.103 4.243 4.381 4.515 4.653 4.81 4.987 5.187 5.417 5.623 5.817 6.042 6.278 6.521 6.754 7.012 7.286 7.574 7.869 8.113 8.27 8.29 7.916 7.378 6.863 6.349 5.801 5.295 4.854 4.453 4.037 3.691 3.369 3.044 2.749 2.447 2.175 1.916 1.664 1.421 1.166 0.908 0.693 0.487 0.28 0.106 -0.092 -0.29 -0.482 -0.677 -0.813 -0.965 -1.202 -1.346 -1.503 -1.593 -1.769 -1.957 -2.177 -2.302 -2.591 -2.686 -2.811 -2.951 -3.245 -3.417 -3.624 -3.835 -4.067 -4.384 -4.795 -5.814 -8 ,826 ,TETRA ,17668598,Fri Dec 3 06:42:30 CET,Fri Dec 3 08:29:46 CET,0.0 0.391 0.595 0.749 0.907 1.066 1.202 1.312 1.531 1.639 1.731 1.742 1.976 2.046 2.178 2.312 2.436 2.491 2.584 2.679 2.842 2.953 3.049 3.186 3.338 3.495 3.639 3.764 3.913 4.042 4.162 4.305 4.436 4.572 4.735 4.921 5.092 5.274 5.472 5.671 5.871 6.076 6.297 6.516 6.782 7.057 7.332 7.625 7.894 8.041 7.95 7.502 6.933 6.366 5.84 5.336 4.851 4.399 4.001 3.558 3.155 2.81 2.47 2.15 1.864 1.613 1.356 1.086 0.846 0.627 0.397 0.193 -0.017 -0.226 -0.394 -0.565 -0.74 -0.944 -1.165 -1.317 -1.482 -1.744 -1.928 -2.11 -2.201 -2.404 -2.623 -2.844 -2.953 -3.218 -3.298 -3.427 -3.57 -3.893 -4.068 -4.258 -4.46 -4.688 -5.003 -5.536 -7.024 -9 ,18567 ,TETRA ,17668599,Fri Dec 3 06:42:32 CET,Fri Dec 3 08:29:58 CET,0.0 0.703 1.015 1.196 1.347 1.488 1.612 1.722 1.93 2.02 2.108 2.114 2.348 2.424 2.565 2.697 2.827 2.889 3.002 3.114 3.269 3.363 3.455 3.59 3.711 3.832 3.962 4.087 4.242 4.382 4.512 4.661 4.8 4.941 5.106 5.277 5.428 5.598 5.78 5.98 6.192 6.418 6.7 6.996 7.321 7.636 7.983 8.331 8.598 8.805 8.753 8.297 7.708 7.112 6.575 6.081 5.621 5.202 4.819 4.419 4.075 3.759 3.432 3.095 2.782 2.52 2.247 1.998 1.788 1.56 1.312 1.091 0.859 0.632 0.448 0.243 0.036 -0.18 -0.399 -0.545 -0.703 -0.958 -1.137 -1.314 -1.399 -1.582 -1.775 -1.989 -2.105 -2.372 -2.461 -2.604 -2.777 -3.162 -3.351 -3.561 -3.792 -4.032 -4.307 -4.641 -5.605 -10 ,30441 ,TETRA ,17668600,Fri Dec 3 06:42:27 CET,Fri Dec 3 08:30:08 CET,0.0 0.736 0.972 1.15 1.294 1.44 1.588 1.711 1.92 2.013 2.101 2.112 2.35 2.423 2.555 2.686 2.824 2.889 3.008 3.122 3.285 3.388 3.481 3.618 3.761 3.894 4.021 4.162 4.337 4.481 4.621 4.79 4.94 5.076 5.233 5.415 5.605 5.838 6.086 6.307 6.504 6.723 6.992 7.249 7.508 7.78 8.063 8.346 8.585 8.704 8.584 8.144 7.603 7.027 6.508 6.03 5.549 5.099 4.724 4.333 3.991 3.684 3.371 3.075 2.81 2.545 2.243 1.976 1.747 1.522 1.285 1.097 0.91 0.694 0.524 0.357 0.167 -0.057 -0.294 -0.446 -0.605 -0.869 -1.048 -1.235 -1.337 -1.554 -1.775 -2.01 -2.121 -2.386 -2.47 -2.598 -2.74 -3.052 -3.228 -3.429 -3.654 -3.895 -4.184 -4.639 -5.962 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5i.txt deleted file mode 100644 index 3cdbc474..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23924 ,TETRA ,17668601,Fri Dec 3 06:42:28 CET,Fri Dec 3 08:30:38 CET,0.0 0.629 0.885 1.071 1.223 1.364 1.479 1.578 1.761 1.833 1.899 1.877 2.092 2.15 2.272 2.379 2.476 2.529 2.621 2.704 2.826 2.89 2.946 3.043 3.14 3.218 3.281 3.335 3.413 3.496 3.582 3.695 3.795 3.884 4.004 4.139 4.229 4.295 4.354 4.397 4.426 4.437 4.469 4.499 4.451 4.329 4.105 3.787 3.277 2.353 0.738 -1.308 -3.017 -4.441 -5.625 -6.655 -7.54 -8.326 -9.008 -9.692 -10.283 -10.801 -11.282 -11.727 -12.129 -12.492 -12.906 -13.294 -13.629 -13.975 -14.302 -14.558 -14.833 -15.133 -15.357 -15.569 -15.794 -16.057 -16.32 -16.497 -16.687 -16.979 -17.187 -17.395 -17.504 -17.747 -17.997 -18.247 -18.372 -18.673 -18.766 -18.913 -19.07 -19.404 -19.574 -19.747 -19.952 -20.196 -20.486 -20.938 -21.835 -2 ,27714 ,TETRA ,17668602,Fri Dec 3 06:42:31 CET,Fri Dec 3 08:30:35 CET,0.0 0.601 0.862 1.05 1.213 1.341 1.467 1.579 1.76 1.84 1.924 1.92 2.146 2.21 2.328 2.459 2.584 2.632 2.717 2.797 2.918 2.994 3.064 3.165 3.245 3.326 3.411 3.479 3.556 3.632 3.716 3.831 3.93 4.002 4.071 4.137 4.201 4.269 4.319 4.369 4.419 4.449 4.451 4.405 4.318 4.194 3.998 3.657 3.066 2.117 0.462 -1.573 -3.245 -4.618 -5.757 -6.78 -7.671 -8.467 -9.154 -9.819 -10.382 -10.897 -11.385 -11.824 -12.216 -12.588 -13.008 -13.371 -13.677 -13.999 -14.322 -14.579 -14.852 -15.142 -15.363 -15.58 -15.816 -16.064 -16.316 -16.497 -16.683 -16.971 -17.173 -17.388 -17.493 -17.7 -17.918 -18.143 -18.268 -18.585 -18.706 -18.854 -19.001 -19.305 -19.481 -19.68 -19.901 -20.164 -20.476 -20.889 -21.809 -3 ,20721 ,TETRA ,17668603,Fri Dec 3 06:42:32 CET,Fri Dec 3 08:30:22 CET,0.0 0.635 0.918 1.091 1.246 1.397 1.513 1.613 1.811 1.893 1.973 1.967 2.185 2.249 2.374 2.492 2.601 2.644 2.738 2.831 2.966 3.057 3.142 3.245 3.325 3.412 3.506 3.594 3.705 3.81 3.886 3.951 4.012 4.084 4.158 4.216 4.271 4.327 4.366 4.392 4.431 4.482 4.517 4.489 4.385 4.244 4.05 3.727 3.169 2.216 0.554 -1.461 -3.141 -4.543 -5.741 -6.782 -7.665 -8.446 -9.106 -9.753 -10.334 -10.881 -11.378 -11.82 -12.219 -12.578 -12.975 -13.322 -13.599 -13.916 -14.265 -14.564 -14.89 -15.195 -15.419 -15.674 -15.937 -16.179 -16.414 -16.574 -16.753 -17.05 -17.251 -17.471 -17.585 -17.813 -18.066 -18.343 -18.48 -18.787 -18.907 -19.059 -19.212 -19.551 -19.737 -19.924 -20.117 -20.34 -20.628 -21.048 -21.858 -4 ,1935 ,TETRA ,17668604,Fri Dec 3 06:42:28 CET,Fri Dec 3 08:31:34 CET,0.0 0.639 0.922 1.099 1.255 1.388 1.497 1.612 1.828 1.926 2.021 2.03 2.25 2.309 2.428 2.534 2.634 2.684 2.783 2.87 2.992 3.078 3.16 3.254 3.333 3.407 3.487 3.591 3.73 3.843 3.927 4.0 4.07 4.134 4.188 4.244 4.309 4.368 4.408 4.441 4.459 4.469 4.486 4.477 4.414 4.293 4.091 3.764 3.261 2.386 0.706 -1.296 -2.907 -4.316 -5.52 -6.555 -7.445 -8.238 -8.915 -9.584 -10.17 -10.698 -11.182 -11.642 -12.079 -12.471 -12.88 -13.262 -13.592 -13.907 -14.248 -14.539 -14.804 -15.083 -15.32 -15.562 -15.798 -16.046 -16.305 -16.477 -16.649 -16.929 -17.129 -17.33 -17.436 -17.658 -17.884 -18.129 -18.265 -18.576 -18.689 -18.827 -18.978 -19.356 -19.56 -19.755 -19.973 -20.238 -20.54 -20.913 -21.697 -5 ,2161 ,TETRA ,17668605,Fri Dec 3 06:42:28 CET,Fri Dec 3 08:31:30 CET,0.0 0.742 1.013 1.188 1.33 1.461 1.586 1.714 1.914 1.99 2.057 2.03 2.259 2.328 2.486 2.625 2.728 2.774 2.863 2.943 3.049 3.114 3.175 3.279 3.376 3.462 3.555 3.64 3.74 3.844 3.931 3.995 4.061 4.141 4.228 4.314 4.393 4.465 4.531 4.619 4.722 4.819 4.893 4.889 4.788 4.648 4.453 4.114 3.526 2.579 0.966 -1.02 -2.683 -4.069 -5.258 -6.318 -7.244 -8.055 -8.714 -9.371 -9.945 -10.452 -10.918 -11.355 -11.784 -12.167 -12.563 -12.92 -13.221 -13.524 -13.829 -14.086 -14.365 -14.668 -14.903 -15.134 -15.364 -15.601 -15.839 -16.002 -16.18 -16.462 -16.651 -16.838 -16.934 -17.14 -17.368 -17.612 -17.74 -18.053 -18.175 -18.323 -18.484 -18.833 -19.01 -19.205 -19.419 -19.668 -20.012 -20.495 -21.679 -6 ,23413 ,TETRA ,17668606,Fri Dec 3 06:42:30 CET,Fri Dec 3 08:31:28 CET,0.0 1.024 1.259 1.429 1.553 1.666 1.782 1.888 2.063 2.15 2.236 2.234 2.463 2.54 2.675 2.783 2.892 2.946 3.043 3.132 3.26 3.341 3.415 3.512 3.614 3.705 3.767 3.841 3.945 4.04 4.134 4.208 4.266 4.349 4.466 4.584 4.654 4.716 4.788 4.826 4.837 4.858 4.879 4.913 4.908 4.77 4.565 4.252 3.7 2.773 1.096 -0.993 -2.713 -4.127 -5.289 -6.345 -7.269 -8.126 -8.825 -9.477 -10.04 -10.529 -10.998 -11.461 -11.899 -12.309 -12.732 -13.087 -13.386 -13.678 -13.977 -14.234 -14.494 -14.773 -14.997 -15.213 -15.441 -15.687 -15.95 -16.14 -16.349 -16.691 -16.916 -17.117 -17.221 -17.463 -17.705 -17.941 -18.068 -18.375 -18.478 -18.631 -18.789 -19.119 -19.29 -19.472 -19.674 -19.913 -20.208 -20.597 -21.62 -7 ,3353 ,TETRA ,17668607,Fri Dec 3 06:42:32 CET,Fri Dec 3 08:31:17 CET,0.0 0.717 0.976 1.197 1.361 1.492 1.606 1.718 1.912 1.995 2.069 2.055 2.282 2.355 2.489 2.603 2.714 2.768 2.863 2.944 3.064 3.149 3.224 3.318 3.393 3.466 3.547 3.628 3.726 3.813 3.901 4.014 4.107 4.174 4.241 4.304 4.367 4.458 4.577 4.661 4.7 4.723 4.73 4.711 4.65 4.552 4.407 4.155 3.602 2.628 0.989 -1.007 -2.676 -4.075 -5.259 -6.296 -7.19 -7.964 -8.633 -9.322 -9.905 -10.419 -10.937 -11.424 -11.886 -12.33 -12.745 -13.083 -13.393 -13.726 -14.055 -14.307 -14.569 -14.871 -15.105 -15.335 -15.581 -15.834 -16.096 -16.273 -16.458 -16.773 -17.003 -17.238 -17.357 -17.617 -17.894 -18.178 -18.322 -18.63 -18.714 -18.852 -19.022 -19.437 -19.675 -19.935 -20.237 -20.562 -20.887 -21.236 -22.156 -8 ,21934 ,TETRA ,17668608,Fri Dec 3 06:43:26 CET,Fri Dec 3 08:32:17 CET,0.0 0.483 0.707 0.869 1.011 1.149 1.286 1.403 1.582 1.667 1.742 1.712 1.927 1.987 2.098 2.211 2.33 2.389 2.489 2.579 2.714 2.784 2.835 2.902 2.971 3.042 3.122 3.213 3.312 3.385 3.458 3.552 3.657 3.739 3.788 3.846 3.922 4.013 4.087 4.125 4.196 4.341 4.435 4.422 4.361 4.238 4.013 3.653 3.076 2.117 0.459 -1.513 -3.148 -4.636 -5.886 -6.906 -7.777 -8.569 -9.263 -9.953 -10.536 -11.04 -11.532 -12.034 -12.479 -12.853 -13.236 -13.56 -13.854 -14.184 -14.51 -14.792 -15.09 -15.367 -15.594 -15.845 -16.108 -16.371 -16.638 -16.83 -17.025 -17.323 -17.525 -17.734 -17.845 -18.052 -18.257 -18.504 -18.634 -18.939 -19.056 -19.209 -19.366 -19.695 -19.871 -20.063 -20.273 -20.515 -20.808 -21.148 -22.282 -9 ,21099 ,TETRA ,17668609,Fri Dec 3 06:43:27 CET,Fri Dec 3 08:32:26 CET,0.0 0.838 1.114 1.318 1.494 1.648 1.774 1.881 2.094 2.189 2.281 2.292 2.526 2.607 2.744 2.855 2.957 3.008 3.101 3.193 3.323 3.39 3.461 3.575 3.681 3.768 3.837 3.911 4.011 4.119 4.233 4.344 4.452 4.557 4.658 4.76 4.85 4.951 5.048 5.163 5.276 5.337 5.358 5.366 5.34 5.234 5.047 4.745 4.168 3.179 1.479 -0.559 -2.167 -3.534 -4.717 -5.761 -6.702 -7.556 -8.26 -8.944 -9.524 -10.027 -10.508 -10.968 -11.407 -11.803 -12.188 -12.521 -12.807 -13.097 -13.405 -13.664 -13.931 -14.223 -14.455 -14.69 -14.937 -15.177 -15.395 -15.557 -15.737 -16.015 -16.205 -16.398 -16.497 -16.697 -16.904 -17.12 -17.239 -17.545 -17.661 -17.814 -17.972 -18.317 -18.498 -18.694 -18.916 -19.184 -19.493 -19.89 -21.156 -10 ,28839 ,TETRA ,17668610,Fri Dec 3 06:43:26 CET,Fri Dec 3 08:33:45 CET,0.0 0.811 1.054 1.261 1.435 1.581 1.719 1.824 1.981 2.055 2.135 2.126 2.346 2.401 2.515 2.634 2.736 2.778 2.873 2.97 3.096 3.167 3.237 3.342 3.426 3.494 3.558 3.618 3.686 3.752 3.819 3.888 3.951 4.03 4.11 4.179 4.241 4.304 4.372 4.424 4.502 4.56 4.531 4.482 4.409 4.293 4.106 3.768 3.202 2.329 0.716 -1.346 -2.982 -4.347 -5.534 -6.581 -7.477 -8.303 -8.975 -9.672 -10.282 -10.776 -11.265 -11.754 -12.219 -12.633 -13.046 -13.383 -13.668 -13.991 -14.33 -14.602 -14.878 -15.178 -15.419 -15.663 -15.899 -16.133 -16.392 -16.58 -16.776 -17.049 -17.228 -17.425 -17.528 -17.735 -17.967 -18.221 -18.348 -18.656 -18.749 -18.877 -19.013 -19.341 -19.539 -19.745 -19.972 -20.246 -20.573 -20.983 -22.127 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5g.txt deleted file mode 100644 index 47670852..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15939 ,TETRA ,17668611,Fri Dec 3 06:43:26 CET,Fri Dec 3 08:31:03 CET,0.0 0.684 0.937 1.164 1.317 1.465 1.611 1.735 1.943 2.043 2.146 2.17 2.438 2.528 2.697 2.848 2.991 3.068 3.222 3.354 3.526 3.638 3.754 3.933 4.098 4.25 4.407 4.56 4.749 4.923 5.09 5.304 5.525 5.715 5.919 6.168 6.396 6.625 6.913 7.241 7.563 7.893 8.227 8.546 8.933 9.352 9.817 10.351 10.956 11.578 12.168 12.435 12.435 12.297 12.138 11.961 11.753 11.556 11.383 11.186 11.016 10.868 10.686 10.472 10.27 10.076 9.884 9.733 9.602 9.454 9.289 9.137 8.982 8.826 8.7 8.573 8.44 8.312 8.193 8.111 8.018 7.859 7.742 7.622 7.563 7.445 7.331 7.217 7.154 6.915 6.925 6.839 6.755 6.577 6.467 6.346 6.209 6.048 5.867 5.655 5.015 -2 ,31822 ,TETRA ,17668612,Fri Dec 3 06:43:28 CET,Fri Dec 3 08:30:55 CET,0.0 0.572 0.852 1.034 1.18 1.327 1.468 1.583 1.802 1.89 1.976 1.986 2.248 2.339 2.512 2.677 2.837 2.912 3.052 3.196 3.398 3.513 3.622 3.788 3.968 4.137 4.278 4.41 4.599 4.784 4.956 5.178 5.402 5.597 5.802 6.026 6.225 6.441 6.732 7.082 7.413 7.742 8.077 8.407 8.787 9.202 9.749 10.362 10.917 11.486 12.055 12.323 12.315 12.187 12.02 11.799 11.555 11.326 11.133 10.924 10.737 10.548 10.367 10.208 10.05 9.879 9.678 9.476 9.286 9.104 8.93 8.795 8.656 8.505 8.381 8.257 8.148 8.029 7.892 7.794 7.686 7.506 7.375 7.244 7.178 7.054 6.911 6.756 6.679 6.431 6.437 6.356 6.273 6.076 5.952 5.812 5.652 5.453 5.225 4.936 3.991 -3 ,30845 ,TETRA ,17668613,Fri Dec 3 06:43:30 CET,Fri Dec 3 08:30:52 CET,0.0 0.989 1.289 1.512 1.713 1.905 2.066 2.209 2.455 2.558 2.648 2.642 2.9 2.986 3.15 3.301 3.438 3.502 3.626 3.741 3.918 4.038 4.157 4.336 4.5 4.658 4.82 4.973 5.181 5.393 5.583 5.774 5.931 6.099 6.321 6.574 6.794 7.017 7.253 7.489 7.74 8.034 8.376 8.715 9.11 9.532 9.985 10.459 10.973 11.574 12.174 12.374 12.319 12.195 11.999 11.789 11.615 11.447 11.275 11.035 10.817 10.635 10.45 10.28 10.097 9.907 9.724 9.55 9.382 9.22 9.071 8.946 8.798 8.643 8.532 8.422 8.311 8.186 8.056 7.968 7.873 7.731 7.628 7.513 7.452 7.332 7.213 7.079 7.005 6.76 6.755 6.656 6.545 6.326 6.235 6.139 6.02 5.886 5.713 5.477 4.994 -4 ,31655 ,TETRA ,17668614,Fri Dec 3 06:43:28 CET,Fri Dec 3 08:30:33 CET,0.0 0.824 1.122 1.336 1.5 1.649 1.779 1.89 2.114 2.223 2.323 2.331 2.586 2.667 2.836 3.011 3.165 3.236 3.379 3.511 3.684 3.802 3.914 4.059 4.206 4.34 4.464 4.605 4.794 4.969 5.143 5.346 5.546 5.74 5.949 6.197 6.433 6.673 6.928 7.2 7.505 7.82 8.15 8.487 8.889 9.349 9.912 10.51 11.094 11.704 12.244 12.448 12.418 12.301 12.116 11.918 11.714 11.478 11.265 11.028 10.775 10.571 10.388 10.209 10.048 9.882 9.707 9.551 9.394 9.221 9.044 8.89 8.723 8.557 8.428 8.296 8.155 8.011 7.887 7.801 7.707 7.559 7.445 7.321 7.261 7.141 7.012 6.861 6.784 6.534 6.53 6.445 6.353 6.141 6.03 5.918 5.782 5.627 5.44 5.212 4.81 -5 ,16625 ,TETRA ,17668615,Fri Dec 3 06:43:26 CET,Fri Dec 3 08:31:59 CET,0.0 0.569 0.879 1.115 1.295 1.45 1.588 1.702 1.893 1.985 2.08 2.102 2.362 2.44 2.611 2.786 2.939 3.005 3.149 3.297 3.494 3.612 3.73 3.898 4.053 4.202 4.356 4.498 4.656 4.829 5.009 5.236 5.447 5.617 5.808 6.033 6.244 6.468 6.707 6.961 7.268 7.645 8.045 8.416 8.856 9.366 9.919 10.507 11.16 11.785 12.391 12.654 12.59 12.438 12.264 12.031 11.786 11.577 11.382 11.163 10.986 10.836 10.676 10.496 10.295 10.087 9.898 9.749 9.624 9.506 9.372 9.247 9.12 8.984 8.87 8.751 8.631 8.497 8.348 8.247 8.145 7.994 7.898 7.792 7.727 7.581 7.427 7.276 7.194 6.938 6.938 6.851 6.755 6.558 6.453 6.329 6.181 6.028 5.863 5.603 4.895 -6 ,7209 ,TETRA ,17668616,Fri Dec 3 06:43:27 CET,Fri Dec 3 08:30:45 CET,0.0 0.461 0.671 0.858 1.016 1.168 1.312 1.457 1.703 1.803 1.903 1.905 2.156 2.235 2.389 2.529 2.645 2.705 2.838 2.958 3.139 3.259 3.377 3.536 3.687 3.854 4.02 4.167 4.331 4.482 4.638 4.846 5.058 5.248 5.434 5.635 5.84 6.061 6.3 6.553 6.815 7.107 7.425 7.749 8.188 8.695 9.222 9.76 10.339 10.96 11.581 11.9 11.918 11.81 11.663 11.493 11.319 11.139 10.96 10.752 10.52 10.283 10.097 9.947 9.76 9.587 9.416 9.232 9.084 8.949 8.808 8.681 8.542 8.408 8.31 8.201 8.07 7.946 7.817 7.721 7.627 7.46 7.343 7.229 7.172 7.071 6.952 6.812 6.734 6.479 6.48 6.396 6.303 6.11 6.016 5.897 5.749 5.586 5.36 5.053 4.307 -7 ,8768 ,TETRA ,17668617,Fri Dec 3 06:43:28 CET,Fri Dec 3 08:30:44 CET,0.0 0.765 0.984 1.221 1.43 1.594 1.731 1.862 2.107 2.208 2.299 2.301 2.553 2.622 2.767 2.909 3.04 3.106 3.233 3.342 3.503 3.628 3.753 3.907 4.066 4.238 4.406 4.574 4.781 4.966 5.145 5.369 5.576 5.774 6.005 6.239 6.438 6.665 6.933 7.235 7.548 7.869 8.247 8.651 9.08 9.503 9.986 10.515 11.088 11.693 12.262 12.477 12.44 12.324 12.154 11.958 11.76 11.57 11.392 11.187 10.999 10.789 10.568 10.386 10.203 10.0 9.776 9.592 9.426 9.246 9.056 8.904 8.75 8.591 8.473 8.333 8.195 8.069 7.948 7.859 7.757 7.606 7.507 7.406 7.348 7.222 7.086 6.931 6.856 6.613 6.607 6.524 6.443 6.267 6.171 6.046 5.899 5.74 5.551 5.33 4.587 -8 ,8118 ,TETRA ,17668618,Fri Dec 3 06:43:30 CET,Fri Dec 3 08:32:11 CET,0.0 0.713 0.997 1.204 1.397 1.55 1.675 1.8 2.015 2.113 2.209 2.234 2.504 2.595 2.762 2.926 3.081 3.154 3.303 3.454 3.661 3.785 3.897 4.039 4.182 4.346 4.514 4.67 4.854 5.01 5.155 5.327 5.513 5.693 5.882 6.11 6.325 6.563 6.814 7.065 7.328 7.612 7.982 8.368 8.758 9.183 9.669 10.19 10.78 11.421 11.987 12.231 12.268 12.168 12.001 11.83 11.635 11.41 11.211 11.023 10.837 10.638 10.458 10.276 10.102 9.936 9.76 9.607 9.449 9.296 9.161 9.036 8.882 8.716 8.596 8.461 8.309 8.16 8.015 7.912 7.804 7.632 7.513 7.399 7.346 7.237 7.098 6.936 6.861 6.619 6.621 6.532 6.448 6.273 6.161 6.04 5.906 5.752 5.555 5.301 4.61 -9 ,5176 ,TETRA ,17668619,Fri Dec 3 06:43:33 CET,Fri Dec 3 08:31:46 CET,0.0 0.858 1.18 1.419 1.571 1.7 1.837 1.972 2.21 2.31 2.403 2.416 2.683 2.773 2.915 3.049 3.186 3.259 3.414 3.557 3.755 3.891 4.008 4.157 4.3 4.45 4.6 4.732 4.893 5.041 5.178 5.346 5.518 5.692 5.897 6.125 6.333 6.559 6.817 7.088 7.339 7.623 7.953 8.265 8.642 9.078 9.566 10.1 10.705 11.308 11.852 12.12 12.122 11.984 11.747 11.504 11.295 11.097 10.917 10.683 10.427 10.227 10.036 9.816 9.627 9.476 9.306 9.141 9.009 8.873 8.733 8.627 8.51 8.378 8.267 8.131 7.983 7.85 7.731 7.644 7.54 7.361 7.232 7.114 7.058 6.931 6.802 6.665 6.594 6.353 6.354 6.267 6.178 5.982 5.885 5.77 5.624 5.458 5.249 4.997 4.321 -10 ,26496 ,TETRA ,17668620,Fri Dec 3 06:44:26 CET,Fri Dec 3 08:32:50 CET,0.0 0.856 1.181 1.403 1.591 1.747 1.887 2.026 2.272 2.384 2.488 2.499 2.758 2.844 3.008 3.169 3.322 3.393 3.532 3.67 3.854 3.97 4.085 4.234 4.379 4.53 4.677 4.82 5.025 5.219 5.372 5.546 5.726 5.892 6.069 6.274 6.474 6.701 6.942 7.19 7.48 7.851 8.304 8.712 9.1 9.501 9.962 10.478 11.035 11.63 12.225 12.489 12.473 12.362 12.201 11.992 11.773 11.484 11.178 10.947 10.791 10.634 10.472 10.313 10.164 10.021 9.872 9.736 9.611 9.474 9.333 9.214 9.087 8.96 8.862 8.764 8.658 8.524 8.388 8.302 8.215 8.087 7.988 7.883 7.828 7.714 7.579 7.428 7.357 7.121 7.112 7.007 6.904 6.69 6.58 6.465 6.334 6.174 5.962 5.68 5.138 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5j_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5j_5b.txt deleted file mode 100644 index 9eecff6f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5j_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9167 ,TETRA ,17668621,Fri Dec 3 06:44:28 CET,Fri Dec 3 08:32:07 CET,0.0 0.663 0.911 1.079 1.2 1.317 1.43 1.535 1.736 1.829 1.913 1.873 2.135 2.205 2.334 2.447 2.548 2.598 2.695 2.783 2.918 2.994 3.053 3.153 3.272 3.39 3.492 3.59 3.72 3.824 3.912 4.016 4.111 4.191 4.271 4.373 4.47 4.566 4.665 4.794 4.946 5.122 5.313 5.445 5.517 5.547 5.546 5.463 5.24 4.765 3.782 2.483 1.412 0.511 -0.274 -0.977 -1.59 -2.165 -2.657 -3.141 -3.553 -3.906 -4.231 -4.547 -4.873 -5.175 -5.464 -5.714 -5.927 -6.149 -6.378 -6.558 -6.765 -7.008 -7.196 -7.385 -7.57 -7.757 -7.944 -8.076 -8.214 -8.411 -8.546 -8.695 -8.774 -8.924 -9.07 -9.234 -9.326 -9.633 -9.629 -9.716 -9.798 -10.009 -10.151 -10.311 -10.474 -10.64 -10.862 -11.151 -11.87 -2 ,19603 ,TETRA ,17668622,Fri Dec 3 06:44:31 CET,Fri Dec 3 08:31:33 CET,0.0 0.587 0.823 0.98 1.117 1.245 1.359 1.464 1.629 1.702 1.779 1.715 1.963 2.022 2.149 2.271 2.39 2.448 2.539 2.62 2.739 2.819 2.901 3.02 3.139 3.24 3.34 3.448 3.583 3.705 3.824 3.969 4.098 4.22 4.353 4.472 4.558 4.652 4.794 4.95 5.06 5.152 5.266 5.358 5.412 5.441 5.426 5.342 5.148 4.736 3.855 2.639 1.571 0.612 -0.286 -1.066 -1.674 -2.221 -2.697 -3.164 -3.563 -3.925 -4.267 -4.612 -4.93 -5.2 -5.479 -5.725 -5.938 -6.18 -6.423 -6.621 -6.847 -7.078 -7.248 -7.416 -7.594 -7.771 -7.946 -8.076 -8.221 -8.442 -8.582 -8.731 -8.806 -8.967 -9.138 -9.303 -9.393 -9.688 -9.669 -9.767 -9.889 -10.178 -10.312 -10.454 -10.633 -10.833 -11.045 -11.303 -11.951 -3 ,3336 ,TETRA ,17668623,Fri Dec 3 06:44:31 CET,Fri Dec 3 08:31:25 CET,0.0 0.802 1.099 1.3 1.45 1.572 1.678 1.783 1.969 2.056 2.144 2.086 2.34 2.408 2.545 2.675 2.784 2.837 2.94 3.037 3.174 3.259 3.339 3.461 3.6 3.721 3.813 3.892 3.99 4.089 4.19 4.311 4.423 4.536 4.667 4.808 4.935 5.078 5.202 5.336 5.49 5.603 5.716 5.812 5.866 5.89 5.887 5.819 5.597 5.128 4.17 2.843 1.729 0.769 -0.06 -0.766 -1.381 -1.935 -2.419 -2.931 -3.373 -3.731 -4.063 -4.385 -4.676 -4.934 -5.212 -5.471 -5.716 -5.964 -6.194 -6.385 -6.576 -6.791 -6.971 -7.159 -7.362 -7.579 -7.798 -7.941 -8.093 -8.328 -8.482 -8.639 -8.715 -8.875 -9.059 -9.247 -9.34 -9.644 -9.657 -9.77 -9.882 -10.124 -10.259 -10.405 -10.558 -10.716 -10.915 -11.202 -11.746 -4 ,22008 ,TETRA ,17668624,Fri Dec 3 06:44:26 CET,Fri Dec 3 08:31:17 CET,0.0 0.455 0.73 0.93 1.072 1.197 1.311 1.417 1.624 1.716 1.803 1.773 2.043 2.112 2.243 2.365 2.482 2.537 2.639 2.741 2.887 2.967 3.037 3.132 3.217 3.309 3.388 3.46 3.565 3.665 3.765 3.882 3.985 4.076 4.184 4.309 4.426 4.539 4.648 4.763 4.887 5.022 5.128 5.24 5.364 5.418 5.414 5.326 5.123 4.68 3.693 2.392 1.306 0.341 -0.498 -1.249 -1.899 -2.463 -2.947 -3.429 -3.835 -4.181 -4.504 -4.82 -5.139 -5.464 -5.806 -6.091 -6.342 -6.577 -6.798 -6.992 -7.187 -7.392 -7.552 -7.706 -7.876 -8.067 -8.271 -8.409 -8.556 -8.788 -8.938 -9.093 -9.173 -9.34 -9.503 -9.673 -9.767 -10.072 -10.071 -10.173 -10.284 -10.524 -10.668 -10.813 -10.954 -11.134 -11.324 -11.526 -12.065 -5 ,6021 ,TETRA ,17668625,Fri Dec 3 06:44:31 CET,Fri Dec 3 08:31:08 CET,0.0 0.5 0.68 0.836 0.984 1.109 1.22 1.321 1.512 1.597 1.678 1.644 1.908 1.978 2.115 2.237 2.35 2.4 2.496 2.598 2.744 2.834 2.921 3.038 3.152 3.259 3.364 3.469 3.566 3.654 3.739 3.856 3.993 4.104 4.207 4.327 4.438 4.544 4.64 4.751 4.887 5.04 5.204 5.303 5.365 5.379 5.374 5.316 5.072 4.572 3.596 2.305 1.209 0.265 -0.53 -1.23 -1.868 -2.437 -2.924 -3.425 -3.864 -4.238 -4.579 -4.911 -5.237 -5.561 -5.899 -6.195 -6.445 -6.68 -6.919 -7.123 -7.321 -7.517 -7.674 -7.845 -8.031 -8.227 -8.425 -8.565 -8.711 -8.927 -9.083 -9.252 -9.336 -9.504 -9.676 -9.849 -9.939 -10.237 -10.25 -10.362 -10.463 -10.711 -10.853 -11.002 -11.185 -11.393 -11.613 -11.866 -12.512 -6 ,10346 ,TETRA ,17668626,Fri Dec 3 06:44:27 CET,Fri Dec 3 08:30:50 CET,0.0 0.661 0.896 1.062 1.199 1.326 1.445 1.56 1.766 1.849 1.925 1.871 2.132 2.195 2.318 2.439 2.552 2.609 2.708 2.785 2.887 2.959 3.037 3.148 3.259 3.358 3.455 3.548 3.65 3.752 3.837 3.918 4.01 4.11 4.217 4.335 4.446 4.55 4.654 4.759 4.853 4.938 5.026 5.105 5.158 5.163 5.107 4.985 4.77 4.322 3.401 2.111 1.001 0.05 -0.832 -1.618 -2.247 -2.805 -3.312 -3.839 -4.253 -4.589 -4.951 -5.322 -5.662 -5.955 -6.236 -6.477 -6.698 -6.941 -7.205 -7.423 -7.635 -7.845 -8.01 -8.199 -8.392 -8.581 -8.771 -8.907 -9.054 -9.279 -9.425 -9.563 -9.633 -9.784 -9.949 -10.146 -10.252 -10.564 -10.574 -10.688 -10.799 -11.036 -11.171 -11.311 -11.459 -11.629 -11.823 -12.107 -12.874 -7 ,2957 ,TETRA ,17668627,Fri Dec 3 06:44:28 CET,Fri Dec 3 08:30:36 CET,0.0 0.809 1.124 1.321 1.446 1.563 1.685 1.786 1.978 2.069 2.154 2.118 2.382 2.457 2.599 2.72 2.824 2.871 2.965 3.062 3.217 3.311 3.383 3.488 3.597 3.706 3.805 3.891 3.998 4.097 4.193 4.306 4.408 4.497 4.59 4.684 4.777 4.913 5.065 5.188 5.296 5.406 5.52 5.609 5.676 5.704 5.681 5.602 5.405 5.001 4.134 2.907 1.817 0.875 0.028 -0.723 -1.353 -1.923 -2.402 -2.89 -3.303 -3.661 -4.013 -4.333 -4.628 -4.921 -5.227 -5.509 -5.766 -6.024 -6.279 -6.494 -6.731 -6.978 -7.162 -7.349 -7.525 -7.694 -7.874 -7.994 -8.118 -8.32 -8.461 -8.604 -8.677 -8.838 -9.007 -9.19 -9.293 -9.597 -9.595 -9.711 -9.836 -10.09 -10.239 -10.408 -10.581 -10.773 -11.009 -11.318 -12.191 -8 ,10432 ,TETRA ,17668628,Fri Dec 3 06:45:27 CET,Fri Dec 3 08:32:03 CET,0.0 0.597 0.85 1.052 1.208 1.321 1.42 1.52 1.717 1.808 1.896 1.869 2.135 2.209 2.345 2.464 2.579 2.628 2.723 2.829 2.996 3.094 3.18 3.306 3.414 3.518 3.625 3.726 3.874 4.027 4.153 4.29 4.423 4.543 4.674 4.808 4.914 5.015 5.119 5.218 5.338 5.468 5.577 5.657 5.743 5.816 5.826 5.734 5.539 5.146 4.219 2.949 1.862 0.936 0.087 -0.682 -1.32 -1.876 -2.343 -2.806 -3.227 -3.595 -3.932 -4.261 -4.568 -4.862 -5.175 -5.444 -5.658 -5.868 -6.086 -6.291 -6.501 -6.697 -6.851 -7.018 -7.2 -7.394 -7.598 -7.732 -7.862 -8.073 -8.223 -8.378 -8.454 -8.6 -8.769 -8.951 -9.041 -9.339 -9.339 -9.452 -9.569 -9.811 -9.933 -10.067 -10.233 -10.423 -10.655 -10.934 -11.355 -9 ,14236 ,TETRA ,17668629,Fri Dec 3 06:45:29 CET,Fri Dec 3 08:32:03 CET,0.0 0.83 1.083 1.247 1.397 1.526 1.646 1.748 1.922 2.0 2.066 2.002 2.257 2.314 2.426 2.534 2.643 2.699 2.809 2.918 3.072 3.159 3.232 3.324 3.422 3.53 3.629 3.726 3.845 3.952 4.048 4.158 4.27 4.372 4.481 4.608 4.723 4.822 4.907 4.997 5.076 5.145 5.267 5.381 5.421 5.436 5.436 5.394 5.235 4.797 3.869 2.552 1.398 0.411 -0.422 -1.114 -1.726 -2.293 -2.807 -3.364 -3.839 -4.225 -4.575 -4.919 -5.256 -5.553 -5.829 -6.09 -6.325 -6.559 -6.813 -7.029 -7.252 -7.487 -7.664 -7.841 -8.021 -8.209 -8.416 -8.551 -8.675 -8.872 -9.017 -9.181 -9.271 -9.453 -9.646 -9.85 -9.951 -10.258 -10.259 -10.368 -10.49 -10.736 -10.855 -10.993 -11.16 -11.341 -11.544 -11.816 -12.535 -10 ,1505 ,TETRA ,17668630,Fri Dec 3 06:45:30 CET,Fri Dec 3 08:32:22 CET,0.0 0.64 0.853 0.989 1.119 1.274 1.408 1.504 1.659 1.733 1.805 1.743 1.997 2.057 2.171 2.271 2.376 2.43 2.531 2.635 2.789 2.887 2.971 3.088 3.212 3.326 3.433 3.524 3.616 3.711 3.819 3.951 4.055 4.137 4.23 4.336 4.456 4.619 4.763 4.862 4.952 5.035 5.131 5.209 5.264 5.279 5.287 5.249 5.034 4.587 3.614 2.329 1.227 0.255 -0.548 -1.256 -1.884 -2.458 -2.948 -3.432 -3.844 -4.203 -4.566 -4.929 -5.275 -5.59 -5.926 -6.202 -6.414 -6.639 -6.87 -7.061 -7.27 -7.492 -7.664 -7.839 -8.01 -8.195 -8.404 -8.538 -8.664 -8.864 -8.998 -9.145 -9.234 -9.423 -9.618 -9.819 -9.923 -10.226 -10.217 -10.335 -10.449 -10.674 -10.799 -10.945 -11.106 -11.276 -11.488 -11.761 -12.335 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5d.txt deleted file mode 100644 index 7de85d23..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13119 ,TETRA ,17668631,Fri Dec 3 06:45:33 CET,Fri Dec 3 08:32:03 CET,0.0 0.936 1.241 1.44 1.569 1.659 1.748 1.839 1.987 2.052 2.113 2.067 2.281 2.336 2.446 2.54 2.622 2.664 2.752 2.844 2.976 3.049 3.121 3.219 3.301 3.389 3.473 3.544 3.629 3.705 3.786 3.887 3.971 4.032 4.088 4.156 4.231 4.321 4.401 4.462 4.507 4.55 4.618 4.655 4.643 4.633 4.619 4.475 4.068 3.393 2.221 0.746 -0.526 -1.627 -2.519 -3.31 -4.087 -4.738 -5.262 -5.795 -6.229 -6.606 -6.967 -7.338 -7.696 -8.034 -8.373 -8.664 -8.907 -9.14 -9.374 -9.571 -9.77 -9.974 -10.134 -10.306 -10.482 -10.659 -10.855 -10.997 -11.142 -11.378 -11.545 -11.712 -11.794 -11.941 -12.09 -12.269 -12.363 -12.649 -12.711 -12.823 -12.931 -13.174 -13.304 -13.446 -13.618 -13.822 -14.045 -14.324 -15.105 -2 ,9749 ,TETRA ,17668632,Fri Dec 3 06:46:26 CET,Fri Dec 3 08:33:32 CET,0.0 0.562 0.821 0.975 1.109 1.249 1.368 1.471 1.638 1.707 1.785 1.773 1.996 2.047 2.141 2.226 2.294 2.326 2.405 2.495 2.622 2.69 2.745 2.829 2.918 2.992 3.041 3.085 3.154 3.23 3.3 3.384 3.477 3.583 3.71 3.822 3.905 3.99 4.062 4.113 4.152 4.188 4.222 4.235 4.204 4.161 4.061 3.812 3.395 2.698 1.467 -0.052 -1.287 -2.357 -3.291 -4.083 -4.74 -5.365 -5.907 -6.452 -6.909 -7.297 -7.683 -8.032 -8.374 -8.714 -9.069 -9.356 -9.568 -9.8 -10.063 -10.281 -10.491 -10.699 -10.857 -11.009 -11.177 -11.353 -11.528 -11.654 -11.794 -12.019 -12.166 -12.324 -12.404 -12.563 -12.743 -12.943 -13.043 -13.315 -13.339 -13.442 -13.551 -13.782 -13.909 -14.044 -14.176 -14.328 -14.533 -14.885 -15.747 -3 ,8767 ,TETRA ,17668633,Fri Dec 3 06:46:28 CET,Fri Dec 3 08:33:39 CET,0.0 0.829 1.045 1.203 1.341 1.461 1.564 1.657 1.811 1.878 1.944 1.907 2.125 2.177 2.275 2.365 2.457 2.51 2.614 2.716 2.848 2.926 3.004 3.095 3.172 3.234 3.297 3.373 3.451 3.519 3.603 3.71 3.806 3.897 3.987 4.055 4.123 4.219 4.304 4.348 4.389 4.429 4.43 4.399 4.368 4.34 4.23 4.025 3.704 3.098 1.916 0.425 -0.815 -1.839 -2.715 -3.517 -4.195 -4.792 -5.35 -5.907 -6.411 -6.869 -7.246 -7.581 -7.904 -8.206 -8.519 -8.779 -8.996 -9.24 -9.501 -9.726 -9.973 -10.209 -10.375 -10.555 -10.748 -10.945 -11.14 -11.278 -11.425 -11.66 -11.82 -11.977 -12.059 -12.235 -12.406 -12.582 -12.674 -12.947 -13.001 -13.121 -13.249 -13.513 -13.644 -13.786 -13.947 -14.129 -14.329 -14.562 -15.168 -4 ,16318 ,TETRA ,17668634,Fri Dec 3 06:46:30 CET,Fri Dec 3 08:33:39 CET,0.0 0.761 1.032 1.227 1.377 1.493 1.61 1.713 1.875 1.955 2.034 2.019 2.238 2.29 2.412 2.538 2.654 2.707 2.805 2.885 2.978 3.037 3.097 3.186 3.264 3.342 3.432 3.517 3.604 3.698 3.802 3.918 4.026 4.111 4.186 4.26 4.323 4.384 4.452 4.521 4.57 4.63 4.672 4.676 4.656 4.559 4.403 4.189 3.813 3.178 2.001 0.488 -0.779 -1.815 -2.693 -3.49 -4.195 -4.807 -5.311 -5.869 -6.375 -6.815 -7.205 -7.534 -7.838 -8.12 -8.42 -8.701 -8.941 -9.176 -9.417 -9.614 -9.815 -10.045 -10.227 -10.397 -10.566 -10.751 -10.959 -11.101 -11.239 -11.459 -11.619 -11.786 -11.869 -12.049 -12.236 -12.408 -12.495 -12.777 -12.811 -12.915 -13.028 -13.283 -13.434 -13.593 -13.77 -13.961 -14.196 -14.539 -15.374 -5 ,29436 ,TETRA ,17668635,Fri Dec 3 06:46:31 CET,Fri Dec 3 08:33:22 CET,0.0 0.661 0.932 1.104 1.261 1.403 1.54 1.665 1.863 1.935 2.001 1.962 2.18 2.243 2.37 2.476 2.564 2.605 2.682 2.756 2.872 2.963 3.05 3.158 3.254 3.345 3.421 3.497 3.603 3.696 3.772 3.867 3.986 4.091 4.182 4.262 4.336 4.418 4.497 4.557 4.593 4.623 4.686 4.744 4.727 4.643 4.507 4.288 3.898 3.283 2.115 0.61 -0.626 -1.7 -2.693 -3.553 -4.221 -4.816 -5.388 -5.973 -6.421 -6.799 -7.143 -7.465 -7.775 -8.06 -8.348 -8.61 -8.845 -9.073 -9.305 -9.495 -9.705 -9.935 -10.112 -10.286 -10.455 -10.628 -10.802 -10.925 -11.063 -11.281 -11.437 -11.597 -11.674 -11.832 -11.985 -12.15 -12.245 -12.517 -12.545 -12.653 -12.775 -13.06 -13.215 -13.383 -13.561 -13.773 -14.013 -14.24 -14.65 -6 ,22199 ,TETRA ,17668636,Fri Dec 3 06:46:27 CET,Fri Dec 3 08:34:49 CET,0.0 0.805 1.067 1.274 1.462 1.609 1.713 1.803 1.968 2.034 2.106 2.107 2.339 2.395 2.494 2.588 2.669 2.708 2.792 2.873 2.963 3.009 3.067 3.164 3.259 3.36 3.46 3.551 3.65 3.725 3.804 3.903 3.973 4.037 4.116 4.204 4.272 4.32 4.363 4.407 4.491 4.596 4.641 4.649 4.641 4.586 4.452 4.233 3.859 3.191 2.012 0.565 -0.67 -1.763 -2.68 -3.457 -4.128 -4.752 -5.264 -5.765 -6.194 -6.562 -6.914 -7.25 -7.557 -7.83 -8.105 -8.358 -8.597 -8.834 -9.062 -9.267 -9.498 -9.753 -9.95 -10.141 -10.326 -10.506 -10.699 -10.837 -10.979 -11.198 -11.35 -11.51 -11.593 -11.771 -11.955 -12.139 -12.237 -12.518 -12.56 -12.677 -12.798 -13.064 -13.202 -13.356 -13.549 -13.765 -14.049 -14.383 -14.853 -7 ,12958 ,TETRA ,17668637,Fri Dec 3 06:46:27 CET,Fri Dec 3 08:33:10 CET,0.0 0.72 0.984 1.177 1.328 1.466 1.589 1.692 1.865 1.947 2.024 2.007 2.238 2.3 2.41 2.5 2.58 2.627 2.726 2.818 2.949 3.026 3.102 3.208 3.298 3.385 3.469 3.554 3.66 3.762 3.853 3.928 3.996 4.063 4.13 4.215 4.295 4.365 4.42 4.506 4.602 4.631 4.642 4.66 4.644 4.564 4.394 4.16 3.798 3.128 1.9 0.39 -0.861 -1.949 -2.846 -3.605 -4.276 -4.892 -5.448 -5.994 -6.449 -6.864 -7.263 -7.652 -7.991 -8.28 -8.612 -8.919 -9.167 -9.403 -9.623 -9.8 -9.996 -10.224 -10.397 -10.559 -10.73 -10.912 -11.106 -11.241 -11.376 -11.586 -11.726 -11.865 -11.942 -12.101 -12.256 -12.425 -12.526 -12.812 -12.853 -12.965 -13.083 -13.313 -13.444 -13.595 -13.758 -13.95 -14.2 -14.504 -15.307 -8 ,10370 ,TETRA ,17668638,Fri Dec 3 06:46:28 CET,Fri Dec 3 08:33:00 CET,0.0 0.733 1.038 1.22 1.384 1.512 1.596 1.692 1.873 1.936 1.988 1.915 2.126 2.181 2.282 2.391 2.496 2.55 2.65 2.734 2.848 2.92 2.985 3.062 3.14 3.219 3.294 3.372 3.489 3.607 3.704 3.81 3.912 4.0 4.081 4.176 4.297 4.425 4.548 4.646 4.702 4.743 4.799 4.822 4.828 4.837 4.735 4.518 4.151 3.504 2.346 0.905 -0.333 -1.411 -2.306 -3.09 -3.781 -4.412 -4.939 -5.441 -5.881 -6.275 -6.639 -6.976 -7.283 -7.573 -7.885 -8.165 -8.407 -8.652 -8.896 -9.107 -9.352 -9.596 -9.766 -9.943 -10.13 -10.335 -10.566 -10.719 -10.862 -11.095 -11.272 -11.453 -11.537 -11.699 -11.867 -12.05 -12.151 -12.428 -12.462 -12.569 -12.675 -12.918 -13.053 -13.193 -13.368 -13.555 -13.761 -14.076 -15.023 -9 ,1792 ,TETRA ,17668639,Fri Dec 3 06:47:26 CET,Fri Dec 3 08:34:06 CET,0.0 0.509 0.674 0.836 0.989 1.126 1.247 1.352 1.523 1.59 1.658 1.639 1.857 1.906 2.008 2.101 2.184 2.228 2.327 2.417 2.529 2.592 2.658 2.781 2.89 2.977 3.062 3.148 3.26 3.363 3.455 3.581 3.681 3.763 3.87 3.969 4.054 4.13 4.181 4.244 4.298 4.34 4.381 4.4 4.396 4.336 4.246 4.092 3.734 3.111 1.932 0.41 -0.886 -1.981 -2.908 -3.729 -4.413 -5.026 -5.57 -6.106 -6.586 -7.002 -7.364 -7.706 -8.037 -8.337 -8.62 -8.877 -9.113 -9.343 -9.582 -9.779 -9.986 -10.208 -10.371 -10.532 -10.702 -10.877 -11.05 -11.183 -11.319 -11.529 -11.674 -11.821 -11.907 -12.083 -12.264 -12.46 -12.564 -12.847 -12.908 -13.03 -13.147 -13.405 -13.554 -13.708 -13.848 -14.027 -14.285 -14.624 -15.249 -10 ,18404 ,TETRA ,17668640,Fri Dec 3 06:47:28 CET,Fri Dec 3 08:34:05 CET,0.0 0.451 0.639 0.821 0.977 1.101 1.212 1.311 1.468 1.531 1.591 1.544 1.762 1.816 1.923 2.03 2.136 2.187 2.291 2.394 2.537 2.627 2.699 2.77 2.834 2.898 2.963 3.045 3.159 3.242 3.313 3.408 3.495 3.584 3.701 3.804 3.867 3.937 4.007 4.067 4.115 4.147 4.157 4.161 4.156 4.105 3.969 3.746 3.406 2.794 1.582 0.024 -1.288 -2.424 -3.382 -4.195 -4.879 -5.488 -5.997 -6.501 -6.931 -7.31 -7.671 -8.001 -8.309 -8.601 -8.886 -9.129 -9.353 -9.575 -9.8 -9.995 -10.219 -10.473 -10.669 -10.872 -11.067 -11.239 -11.42 -11.56 -11.697 -11.912 -12.076 -12.251 -12.336 -12.501 -12.692 -12.883 -12.968 -13.233 -13.252 -13.361 -13.48 -13.735 -13.862 -13.994 -14.146 -14.33 -14.563 -14.912 -15.903 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5f.txt deleted file mode 100644 index add847ed..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20048 ,TETRA ,17668641,Fri Dec 3 06:47:31 CET,Fri Dec 3 08:33:49 CET,0.0 0.598 0.859 1.098 1.252 1.392 1.532 1.655 1.885 1.98 2.08 2.13 2.388 2.478 2.647 2.814 2.977 3.061 3.219 3.351 3.532 3.644 3.757 3.938 4.098 4.249 4.394 4.522 4.705 4.891 5.061 5.243 5.434 5.637 5.847 6.065 6.272 6.495 6.734 6.999 7.279 7.625 8.022 8.385 8.824 9.307 9.836 10.436 11.121 11.809 12.5 12.832 12.837 12.724 12.603 12.488 12.331 12.151 11.97 11.779 11.616 11.469 11.326 11.182 11.047 10.922 10.783 10.652 10.535 10.405 10.245 10.1 9.959 9.821 9.71 9.602 9.489 9.359 9.226 9.133 9.036 8.885 8.795 8.708 8.651 8.518 8.382 8.236 8.167 7.942 7.931 7.84 7.744 7.527 7.403 7.284 7.143 6.946 6.719 6.415 5.907 -2 ,15499 ,TETRA ,17668642,Fri Dec 3 06:48:26 CET,Fri Dec 3 08:34:59 CET,0.0 0.706 0.951 1.111 1.237 1.364 1.477 1.58 1.765 1.863 1.968 1.995 2.238 2.318 2.491 2.661 2.805 2.873 3.003 3.121 3.285 3.401 3.518 3.686 3.844 3.984 4.117 4.253 4.418 4.577 4.755 4.971 5.168 5.339 5.525 5.75 5.981 6.265 6.554 6.821 7.101 7.435 7.804 8.151 8.604 9.099 9.6 10.166 10.791 11.46 12.175 12.527 12.579 12.525 12.397 12.224 12.073 11.917 11.761 11.597 11.416 11.252 11.107 10.97 10.838 10.695 10.511 10.333 10.201 10.079 9.956 9.841 9.715 9.599 9.506 9.397 9.282 9.167 9.036 8.931 8.815 8.635 8.513 8.389 8.328 8.201 8.054 7.905 7.821 7.574 7.574 7.492 7.395 7.179 7.071 6.943 6.791 6.621 6.395 6.093 5.451 -3 ,27711 ,TETRA ,17668643,Fri Dec 3 06:48:27 CET,Fri Dec 3 08:34:59 CET,0.0 0.602 0.9 1.095 1.268 1.428 1.546 1.652 1.865 1.97 2.068 2.083 2.327 2.419 2.612 2.762 2.888 2.952 3.074 3.19 3.356 3.474 3.592 3.741 3.86 3.992 4.129 4.269 4.461 4.643 4.811 4.998 5.166 5.345 5.568 5.802 6.014 6.243 6.49 6.754 7.047 7.375 7.734 8.09 8.516 8.981 9.485 10.02 10.655 11.347 12.027 12.427 12.507 12.449 12.32 12.17 12.012 11.849 11.678 11.479 11.317 11.166 11.023 10.891 10.757 10.622 10.469 10.339 10.217 10.049 9.869 9.743 9.625 9.48 9.354 9.229 9.111 8.988 8.856 8.769 8.673 8.524 8.417 8.31 8.251 8.114 7.979 7.837 7.757 7.512 7.483 7.387 7.286 7.091 6.985 6.859 6.715 6.544 6.349 6.09 5.291 -4 ,3717 ,TETRA ,17668644,Fri Dec 3 06:48:29 CET,Fri Dec 3 08:35:23 CET,0.0 0.718 0.969 1.176 1.37 1.525 1.665 1.784 1.982 2.076 2.157 2.148 2.383 2.459 2.602 2.753 2.909 2.976 3.096 3.214 3.39 3.504 3.62 3.776 3.921 4.071 4.222 4.374 4.569 4.765 4.966 5.197 5.411 5.601 5.79 6.004 6.23 6.494 6.761 7.03 7.306 7.612 7.974 8.343 8.765 9.221 9.761 10.347 10.966 11.657 12.383 12.778 12.854 12.752 12.609 12.459 12.306 12.153 11.955 11.761 11.604 11.439 11.288 11.142 10.988 10.815 10.627 10.458 10.301 10.144 10.007 9.877 9.725 9.589 9.477 9.356 9.252 9.138 8.999 8.91 8.819 8.661 8.542 8.42 8.357 8.223 8.092 7.954 7.877 7.645 7.653 7.566 7.465 7.282 7.189 7.061 6.9 6.717 6.499 6.184 5.44 -5 ,30723 ,TETRA ,17668645,Fri Dec 3 06:48:31 CET,Fri Dec 3 08:35:11 CET,0.0 0.527 0.744 0.891 1.035 1.183 1.32 1.433 1.631 1.729 1.825 1.849 2.097 2.179 2.338 2.498 2.653 2.726 2.862 2.991 3.19 3.326 3.45 3.622 3.792 3.946 4.074 4.189 4.354 4.539 4.723 4.94 5.127 5.288 5.487 5.727 5.955 6.185 6.418 6.685 6.964 7.278 7.66 8.022 8.454 8.939 9.504 10.095 10.745 11.493 12.2 12.573 12.658 12.582 12.454 12.33 12.202 12.053 11.877 11.689 11.535 11.375 11.199 11.033 10.889 10.752 10.608 10.484 10.363 10.221 10.065 9.935 9.808 9.671 9.563 9.461 9.354 9.233 9.099 8.992 8.882 8.736 8.64 8.521 8.455 8.309 8.153 7.988 7.906 7.667 7.649 7.557 7.452 7.24 7.128 6.992 6.849 6.693 6.495 6.219 5.509 -6 ,24561 ,TETRA ,17668646,Fri Dec 3 06:48:26 CET,Fri Dec 3 08:34:38 CET,0.0 0.597 0.869 1.102 1.283 1.429 1.57 1.705 1.93 2.024 2.122 2.159 2.411 2.488 2.642 2.808 2.964 3.036 3.166 3.285 3.474 3.6 3.713 3.868 4.006 4.139 4.293 4.448 4.624 4.801 4.983 5.193 5.383 5.554 5.756 6.015 6.258 6.495 6.749 7.019 7.313 7.662 8.041 8.435 8.907 9.415 10.005 10.604 11.242 11.911 12.588 12.999 13.104 13.062 12.929 12.718 12.51 12.33 12.157 11.965 11.786 11.627 11.473 11.308 11.148 10.995 10.835 10.701 10.563 10.396 10.217 10.083 9.953 9.821 9.719 9.61 9.484 9.338 9.184 9.081 8.976 8.808 8.683 8.548 8.481 8.356 8.217 8.053 7.974 7.74 7.726 7.636 7.541 7.317 7.186 7.057 6.93 6.776 6.579 6.323 5.701 -7 ,8458 ,TETRA ,17668647,Fri Dec 3 06:48:26 CET,Fri Dec 3 08:34:58 CET,0.0 0.712 0.988 1.172 1.339 1.493 1.625 1.731 1.926 2.027 2.128 2.145 2.395 2.482 2.651 2.805 2.928 2.99 3.115 3.241 3.419 3.533 3.646 3.815 3.985 4.133 4.264 4.406 4.59 4.769 4.936 5.123 5.31 5.501 5.73 5.984 6.236 6.492 6.765 7.083 7.43 7.792 8.166 8.538 8.957 9.416 9.931 10.489 11.126 11.799 12.493 12.904 12.965 12.912 12.806 12.643 12.471 12.266 12.028 11.808 11.639 11.467 11.294 11.135 10.992 10.856 10.695 10.544 10.412 10.27 10.12 9.986 9.833 9.674 9.551 9.424 9.291 9.159 9.024 8.918 8.81 8.64 8.518 8.404 8.346 8.202 8.057 7.922 7.845 7.61 7.614 7.519 7.411 7.207 7.111 6.993 6.84 6.673 6.444 6.148 5.611 -8 ,29214 ,TETRA ,17668648,Fri Dec 3 06:48:27 CET,Fri Dec 3 08:34:44 CET,0.0 0.579 0.874 1.09 1.263 1.402 1.509 1.632 1.874 1.966 2.058 2.094 2.346 2.43 2.579 2.735 2.893 2.966 3.107 3.245 3.424 3.535 3.651 3.812 3.96 4.115 4.277 4.424 4.598 4.772 4.945 5.151 5.362 5.574 5.789 6.001 6.225 6.505 6.815 7.113 7.384 7.674 8.031 8.396 8.814 9.251 9.749 10.306 10.896 11.568 12.255 12.616 12.703 12.639 12.499 12.323 12.157 12.003 11.848 11.634 11.409 11.207 11.028 10.877 10.72 10.555 10.374 10.21 10.078 9.95 9.799 9.656 9.511 9.359 9.243 9.116 8.978 8.837 8.689 8.595 8.5 8.353 8.253 8.151 8.102 7.993 7.86 7.709 7.631 7.396 7.394 7.311 7.213 6.984 6.858 6.716 6.56 6.412 6.226 5.956 5.204 -9 ,14899 ,TETRA ,17668649,Fri Dec 3 06:49:26 CET,Fri Dec 3 08:36:28 CET,0.0 0.578 0.816 0.984 1.124 1.258 1.391 1.527 1.749 1.848 1.949 1.98 2.223 2.302 2.456 2.606 2.747 2.811 2.929 3.048 3.222 3.335 3.452 3.614 3.757 3.901 4.048 4.183 4.351 4.511 4.655 4.822 4.995 5.165 5.362 5.594 5.81 6.031 6.268 6.534 6.83 7.187 7.592 7.989 8.44 8.911 9.456 10.04 10.665 11.392 12.128 12.513 12.577 12.502 12.328 12.133 11.967 11.805 11.628 11.439 11.271 11.112 10.925 10.708 10.504 10.326 10.155 9.995 9.853 9.72 9.583 9.463 9.347 9.211 9.085 8.954 8.827 8.705 8.583 8.504 8.418 8.255 8.136 8.026 7.968 7.845 7.708 7.555 7.48 7.246 7.24 7.152 7.064 6.874 6.763 6.629 6.471 6.275 6.023 5.683 4.715 -10 ,276 ,TETRA ,17668650,Fri Dec 3 06:49:27 CET,Fri Dec 3 08:36:05 CET,0.0 0.485 0.744 0.926 1.066 1.193 1.323 1.45 1.671 1.784 1.904 1.958 2.21 2.296 2.455 2.607 2.739 2.801 2.926 3.044 3.221 3.34 3.452 3.622 3.789 3.951 4.117 4.28 4.49 4.654 4.791 4.982 5.183 5.371 5.578 5.82 6.033 6.255 6.498 6.767 7.046 7.343 7.703 8.083 8.508 8.968 9.486 10.047 10.707 11.41 12.108 12.514 12.574 12.503 12.383 12.23 12.046 11.863 11.684 11.476 11.3 11.13 10.955 10.801 10.67 10.539 10.392 10.262 10.13 9.992 9.858 9.761 9.661 9.533 9.414 9.286 9.153 9.012 8.875 8.787 8.7 8.551 8.436 8.312 8.258 8.156 8.029 7.896 7.819 7.58 7.563 7.478 7.403 7.225 7.108 6.981 6.849 6.679 6.452 6.184 5.644 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5b.txt deleted file mode 100644 index 0137c644..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6399 ,TETRA ,17668651,Fri Dec 3 06:49:28 CET,Fri Dec 3 08:36:34 CET,0.0 0.696 0.956 1.163 1.325 1.445 1.537 1.611 1.744 1.796 1.849 1.785 2.019 2.062 2.137 2.22 2.303 2.346 2.434 2.498 2.557 2.599 2.639 2.708 2.787 2.846 2.897 2.938 2.974 3.018 3.064 3.101 3.152 3.213 3.241 3.243 3.229 3.205 3.191 3.161 3.141 3.125 3.027 2.873 2.639 2.31 1.868 1.27 0.387 -1.01 -3.286 -5.895 -7.956 -9.63 -11.032 -12.243 -13.279 -14.157 -14.857 -15.557 -16.169 -16.692 -17.179 -17.64 -18.058 -18.433 -18.825 -19.17 -19.477 -19.795 -20.104 -20.356 -20.6 -20.85 -21.05 -21.265 -21.505 -21.745 -21.976 -22.144 -22.324 -22.589 -22.761 -22.931 -23.023 -23.226 -23.43 -23.621 -23.731 -24.056 -24.088 -24.215 -24.359 -24.651 -24.794 -24.957 -25.136 -25.335 -25.544 -25.783 -26.31 -2 ,27660 ,TETRA ,17668652,Fri Dec 3 06:49:31 CET,Fri Dec 3 08:36:01 CET,0.0 0.659 0.908 1.059 1.179 1.291 1.397 1.494 1.644 1.696 1.757 1.726 1.973 2.039 2.147 2.245 2.349 2.392 2.473 2.548 2.647 2.693 2.722 2.768 2.812 2.867 2.936 2.999 3.07 3.14 3.221 3.295 3.318 3.323 3.332 3.352 3.39 3.424 3.449 3.435 3.366 3.272 3.138 2.964 2.698 2.347 1.892 1.252 0.29 -1.107 -3.329 -5.891 -7.921 -9.6 -10.939 -12.092 -13.113 -14.037 -14.804 -15.556 -16.191 -16.723 -17.204 -17.698 -18.146 -18.51 -18.891 -19.225 -19.509 -19.806 -20.119 -20.386 -20.675 -20.978 -21.202 -21.421 -21.643 -21.877 -22.131 -22.306 -22.473 -22.727 -22.903 -23.084 -23.175 -23.364 -23.58 -23.812 -23.922 -24.236 -24.269 -24.395 -24.523 -24.809 -24.967 -25.153 -25.352 -25.557 -25.791 -26.096 -26.606 -3 ,25767 ,TETRA ,17668653,Fri Dec 3 06:49:26 CET,Fri Dec 3 08:34:03 CET,0.0 0.489 0.721 0.868 1.017 1.138 1.24 1.339 1.493 1.552 1.617 1.583 1.826 1.886 1.995 2.094 2.184 2.221 2.282 2.345 2.439 2.501 2.563 2.655 2.743 2.808 2.848 2.873 2.926 2.992 3.059 3.119 3.142 3.153 3.168 3.191 3.233 3.264 3.255 3.221 3.153 3.042 2.887 2.727 2.503 2.182 1.72 1.081 0.172 -1.171 -3.392 -5.958 -8.014 -9.698 -11.083 -12.274 -13.274 -14.152 -14.877 -15.591 -16.2 -16.716 -17.209 -17.7 -18.14 -18.518 -18.931 -19.302 -19.612 -19.951 -20.304 -20.574 -20.836 -21.11 -21.322 -21.53 -21.74 -21.982 -22.254 -22.434 -22.611 -22.877 -23.069 -23.263 -23.353 -23.531 -23.724 -23.928 -24.039 -24.364 -24.407 -24.544 -24.679 -24.965 -25.126 -25.303 -25.497 -25.733 -25.999 -26.325 -26.994 -4 ,32044 ,TETRA ,17668654,Fri Dec 3 06:49:27 CET,Fri Dec 3 08:36:45 CET,0.0 0.743 0.977 1.112 1.206 1.287 1.376 1.461 1.595 1.67 1.743 1.697 1.933 1.978 2.051 2.131 2.227 2.269 2.349 2.417 2.496 2.54 2.58 2.649 2.723 2.788 2.837 2.884 2.957 3.016 3.059 3.118 3.168 3.201 3.221 3.226 3.228 3.252 3.283 3.295 3.26 3.165 3.035 2.862 2.604 2.278 1.839 1.187 0.234 -1.142 -3.394 -6.015 -8.065 -9.715 -11.141 -12.411 -13.446 -14.352 -15.114 -15.842 -16.435 -16.949 -17.432 -17.898 -18.355 -18.759 -19.189 -19.585 -19.889 -20.183 -20.494 -20.742 -20.996 -21.276 -21.514 -21.755 -22.003 -22.271 -22.515 -22.666 -22.827 -23.106 -23.3 -23.493 -23.59 -23.78 -23.975 -24.181 -24.288 -24.602 -24.635 -24.76 -24.898 -25.21 -25.373 -25.546 -25.734 -25.94 -26.203 -26.517 -27.263 -5 ,20489 ,TETRA ,17668655,Fri Dec 3 06:49:28 CET,Fri Dec 3 08:36:38 CET,0.0 0.994 1.259 1.444 1.64 1.786 1.879 1.962 2.113 2.174 2.23 2.175 2.42 2.472 2.551 2.635 2.718 2.757 2.828 2.892 2.995 3.053 3.096 3.145 3.196 3.246 3.286 3.324 3.381 3.433 3.465 3.489 3.529 3.567 3.575 3.57 3.561 3.547 3.525 3.493 3.457 3.368 3.218 3.035 2.779 2.439 1.959 1.338 0.449 -0.941 -3.191 -5.762 -7.816 -9.491 -10.86 -12.024 -13.011 -13.877 -14.615 -15.349 -15.962 -16.491 -17.006 -17.52 -17.977 -18.343 -18.702 -19.06 -19.39 -19.709 -20.007 -20.261 -20.548 -20.83 -21.046 -21.279 -21.506 -21.726 -21.963 -22.122 -22.278 -22.547 -22.738 -22.924 -23.019 -23.209 -23.401 -23.615 -23.731 -24.054 -24.08 -24.199 -24.325 -24.606 -24.771 -24.956 -25.15 -25.373 -25.64 -25.951 -26.904 -6 ,13022 ,TETRA ,17668656,Fri Dec 3 06:50:25 CET,Fri Dec 3 08:36:56 CET,0.0 0.417 0.618 0.768 0.912 1.046 1.148 1.234 1.394 1.466 1.533 1.475 1.708 1.763 1.853 1.923 2.002 2.046 2.119 2.193 2.288 2.327 2.368 2.44 2.492 2.528 2.562 2.603 2.659 2.719 2.781 2.838 2.859 2.887 2.94 2.96 2.96 2.955 2.926 2.871 2.821 2.778 2.658 2.469 2.211 1.856 1.382 0.765 -0.136 -1.491 -3.732 -6.352 -8.387 -10.017 -11.378 -12.552 -13.54 -14.445 -15.202 -15.959 -16.627 -17.203 -17.709 -18.15 -18.554 -18.919 -19.287 -19.61 -19.887 -20.17 -20.469 -20.715 -20.969 -21.251 -21.489 -21.727 -21.951 -22.174 -22.41 -22.573 -22.73 -22.988 -23.177 -23.365 -23.457 -23.644 -23.83 -24.032 -24.142 -24.455 -24.488 -24.616 -24.749 -25.032 -25.183 -25.338 -25.518 -25.762 -26.063 -26.477 -27.105 -7 ,23782 ,TETRA ,17668657,Fri Dec 3 06:50:26 CET,Fri Dec 3 08:36:44 CET,0.0 0.629 0.829 1.023 1.173 1.293 1.406 1.505 1.685 1.757 1.815 1.748 1.991 2.058 2.155 2.223 2.284 2.314 2.377 2.446 2.568 2.646 2.715 2.802 2.859 2.915 2.981 3.028 3.065 3.102 3.135 3.162 3.185 3.211 3.226 3.228 3.22 3.207 3.21 3.224 3.185 3.081 2.955 2.779 2.552 2.29 1.884 1.321 0.443 -0.95 -3.192 -5.774 -7.828 -9.517 -10.9 -12.099 -13.099 -13.935 -14.652 -15.372 -15.978 -16.495 -16.991 -17.457 -17.886 -18.28 -18.665 -19.0 -19.313 -19.649 -19.964 -20.218 -20.488 -20.767 -20.992 -21.217 -21.427 -21.655 -21.905 -22.059 -22.207 -22.45 -22.625 -22.814 -22.909 -23.106 -23.325 -23.559 -23.672 -23.991 -24.031 -24.158 -24.29 -24.594 -24.736 -24.871 -25.02 -25.195 -25.396 -25.674 -26.396 -8 ,7884 ,TETRA ,17668658,Fri Dec 3 06:50:29 CET,Fri Dec 3 08:36:34 CET,0.0 0.381 0.578 0.74 0.868 0.973 1.063 1.147 1.292 1.369 1.439 1.356 1.574 1.625 1.722 1.795 1.869 1.911 1.993 2.066 2.154 2.203 2.256 2.334 2.391 2.441 2.5 2.553 2.63 2.703 2.746 2.787 2.828 2.861 2.888 2.902 2.919 2.929 2.914 2.92 2.89 2.781 2.639 2.47 2.222 1.892 1.406 0.737 -0.207 -1.628 -3.887 -6.514 -8.57 -10.184 -11.526 -12.69 -13.679 -14.562 -15.304 -16.029 -16.629 -17.138 -17.635 -18.14 -18.626 -19.031 -19.429 -19.783 -20.079 -20.391 -20.737 -21.015 -21.265 -21.512 -21.701 -21.903 -22.12 -22.343 -22.565 -22.71 -22.874 -23.156 -23.345 -23.534 -23.634 -23.85 -24.069 -24.269 -24.369 -24.687 -24.733 -24.864 -24.998 -25.299 -25.459 -25.62 -25.809 -26.03 -26.333 -26.71 -27.523 -9 ,8398 ,TETRA ,17668659,Fri Dec 3 06:50:27 CET,Fri Dec 3 08:38:15 CET,0.0 0.818 1.08 1.274 1.413 1.532 1.624 1.709 1.852 1.915 1.971 1.893 2.114 2.164 2.266 2.351 2.452 2.5 2.568 2.625 2.7 2.74 2.783 2.857 2.923 2.966 3.019 3.084 3.162 3.228 3.282 3.344 3.397 3.417 3.435 3.457 3.46 3.46 3.467 3.448 3.387 3.286 3.144 3.027 2.829 2.478 1.994 1.346 0.403 -0.981 -3.244 -5.851 -7.878 -9.504 -10.85 -12.046 -13.037 -13.878 -14.604 -15.33 -15.929 -16.451 -16.945 -17.39 -17.788 -18.168 -18.562 -18.904 -19.208 -19.509 -19.811 -20.068 -20.338 -20.612 -20.827 -21.047 -21.257 -21.463 -21.686 -21.854 -22.02 -22.26 -22.431 -22.612 -22.702 -22.889 -23.088 -23.282 -23.384 -23.7 -23.729 -23.846 -23.976 -24.277 -24.44 -24.598 -24.761 -24.94 -25.155 -25.497 -26.372 -10 ,17185 ,TETRA ,17668660,Fri Dec 3 06:50:28 CET,Fri Dec 3 08:38:14 CET,0.0 0.416 0.628 0.796 0.945 1.056 1.156 1.26 1.424 1.496 1.566 1.505 1.73 1.786 1.898 1.991 2.074 2.115 2.193 2.256 2.355 2.423 2.481 2.559 2.62 2.671 2.713 2.75 2.807 2.855 2.895 2.933 2.969 2.995 3.004 3.012 2.997 2.975 2.942 2.883 2.824 2.727 2.563 2.388 2.139 1.815 1.364 0.803 -0.005 -1.402 -3.669 -6.224 -8.24 -9.878 -11.253 -12.434 -13.42 -14.282 -15.007 -15.703 -16.278 -16.798 -17.295 -17.757 -18.211 -18.615 -19.043 -19.425 -19.74 -20.073 -20.396 -20.649 -20.907 -21.171 -21.395 -21.627 -21.849 -22.062 -22.282 -22.44 -22.598 -22.85 -23.019 -23.183 -23.275 -23.467 -23.667 -23.865 -23.972 -24.3 -24.334 -24.462 -24.599 -24.904 -25.056 -25.22 -25.42 -25.647 -25.909 -26.251 -27.168 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5f.txt deleted file mode 100644 index a312d4b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5335 ,KEBNE ,17077320,Sat Dec 25 11:24:38 CET,Sat Dec 25 12:52:15 CET,0.0 0.637 0.913 1.127 1.323 1.496 1.647 1.797 2.058 2.178 2.291 2.324 2.604 2.698 2.875 3.044 3.207 3.295 3.48 3.645 3.875 4.024 4.174 4.403 4.618 4.829 5.021 5.212 5.476 5.715 5.937 6.207 6.493 6.786 7.119 7.468 7.799 8.198 8.651 9.138 9.632 10.157 10.82 11.551 12.376 13.254 14.283 15.447 16.863 18.627 20.839 22.742 23.873 24.57 25.039 25.38 25.602 25.749 25.841 25.905 25.955 25.992 26.003 25.987 25.966 25.941 25.878 25.792 25.716 25.65 25.58 25.509 25.446 25.387 25.34 25.29 25.22 25.149 25.086 25.036 24.989 24.908 24.839 24.754 24.701 24.598 24.495 24.379 24.325 24.112 24.123 24.049 23.97 23.788 23.685 23.571 23.444 23.261 23.024 22.752 22.156 -2 ,5852 ,KEBNE ,17077321,Sat Dec 25 11:38:11 CET,Sat Dec 25 13:10:10 CET,0.0 0.859 1.133 1.332 1.498 1.656 1.81 1.95 2.213 2.331 2.443 2.494 2.787 2.902 3.101 3.272 3.446 3.528 3.686 3.849 4.081 4.225 4.359 4.553 4.749 4.93 5.108 5.288 5.539 5.782 5.99 6.233 6.47 6.712 7.045 7.459 7.815 8.187 8.596 9.018 9.498 10.073 10.702 11.323 12.087 12.974 14.008 15.181 16.63 18.424 20.61 22.448 23.551 24.281 24.722 24.989 25.177 25.324 25.433 25.511 25.569 25.597 25.594 25.58 25.562 25.534 25.493 25.444 25.388 25.331 25.26 25.205 25.155 25.096 25.042 24.968 24.885 24.808 24.729 24.675 24.616 24.493 24.397 24.299 24.253 24.164 24.071 23.982 23.927 23.705 23.72 23.639 23.559 23.376 23.269 23.157 23.042 22.896 22.697 22.383 21.517 -3 ,3116 ,KEBNE ,17077322,Sat Dec 25 11:40:16 CET,Sat Dec 25 13:12:13 CET,0.0 0.808 1.155 1.376 1.556 1.721 1.868 1.996 2.245 2.37 2.489 2.519 2.796 2.899 3.094 3.274 3.456 3.54 3.705 3.863 4.103 4.258 4.393 4.598 4.805 4.999 5.185 5.363 5.608 5.864 6.099 6.365 6.629 6.891 7.202 7.55 7.89 8.261 8.655 9.094 9.564 10.085 10.695 11.353 12.147 13.044 14.104 15.304 16.758 18.529 20.738 22.623 23.713 24.417 24.869 25.196 25.417 25.541 25.595 25.655 25.689 25.688 25.687 25.653 25.618 25.585 25.541 25.489 25.417 25.33 25.243 25.196 25.167 25.127 25.075 25.012 24.951 24.872 24.791 24.741 24.67 24.549 24.463 24.377 24.339 24.252 24.143 24.03 23.972 23.751 23.753 23.668 23.576 23.389 23.296 23.195 23.082 22.965 22.835 22.563 21.744 -4 ,31705 ,KEBNE ,17077323,Sat Dec 25 11:42:22 CET,Sat Dec 25 13:12:01 CET,0.0 0.685 0.972 1.18 1.372 1.546 1.683 1.822 2.088 2.204 2.317 2.354 2.637 2.742 2.941 3.126 3.317 3.41 3.569 3.726 3.964 4.108 4.254 4.464 4.667 4.882 5.083 5.271 5.502 5.725 5.948 6.217 6.479 6.739 7.077 7.48 7.841 8.23 8.667 9.141 9.653 10.221 10.855 11.489 12.245 13.118 14.197 15.432 16.887 18.655 20.857 22.751 23.874 24.602 25.095 25.436 25.633 25.772 25.869 25.92 25.941 25.959 25.972 25.951 25.912 25.881 25.832 25.756 25.664 25.545 25.425 25.34 25.261 25.169 25.083 25.006 24.923 24.826 24.731 24.662 24.587 24.478 24.404 24.322 24.283 24.21 24.13 24.033 23.982 23.77 23.777 23.702 23.632 23.447 23.333 23.213 23.093 22.952 22.75 22.457 21.845 -5 ,23150 ,KEBNE ,17077324,Sat Dec 25 11:43:27 CET,Sat Dec 25 13:15:06 CET,0.0 0.821 1.104 1.315 1.484 1.645 1.799 1.939 2.205 2.332 2.447 2.485 2.772 2.882 3.089 3.281 3.459 3.538 3.686 3.835 4.064 4.217 4.372 4.59 4.791 4.98 5.158 5.347 5.614 5.866 6.099 6.38 6.641 6.888 7.189 7.538 7.87 8.225 8.619 9.036 9.479 10.01 10.651 11.33 12.142 13.012 14.031 15.219 16.656 18.389 20.602 22.56 23.717 24.49 25.014 25.345 25.531 25.649 25.75 25.832 25.864 25.832 25.772 25.714 25.652 25.596 25.557 25.516 25.478 25.439 25.375 25.302 25.23 25.165 25.122 25.076 25.005 24.934 24.862 24.799 24.731 24.631 24.558 24.477 24.429 24.33 24.225 24.089 24.014 23.785 23.783 23.705 23.621 23.437 23.322 23.192 23.071 22.948 22.779 22.519 21.927 -6 ,31950 ,KEBNE ,17077325,Sat Dec 25 11:44:25 CET,Sat Dec 25 13:18:26 CET,0.0 0.735 0.98 1.169 1.337 1.499 1.642 1.779 2.027 2.142 2.259 2.303 2.583 2.679 2.869 3.055 3.241 3.331 3.5 3.676 3.949 4.107 4.246 4.45 4.654 4.861 5.056 5.25 5.52 5.787 6.024 6.304 6.577 6.825 7.135 7.497 7.837 8.207 8.607 9.034 9.494 10.028 10.661 11.308 12.072 12.951 13.98 15.178 16.614 18.359 20.583 22.468 23.597 24.333 24.81 25.114 25.303 25.451 25.555 25.63 25.684 25.698 25.695 25.686 25.67 25.641 25.595 25.551 25.502 25.431 25.345 25.288 25.243 25.188 25.131 25.059 24.975 24.895 24.809 24.749 24.684 24.551 24.456 24.363 24.315 24.221 24.126 24.014 23.947 23.718 23.726 23.641 23.539 23.309 23.19 23.071 22.929 22.751 22.52 22.238 21.43 -7 ,31166 ,KEBNE ,17077326,Sat Dec 25 11:45:28 CET,Sat Dec 25 13:17:26 CET,0.0 0.811 1.149 1.383 1.556 1.718 1.876 2.018 2.293 2.425 2.541 2.568 2.848 2.941 3.117 3.304 3.473 3.547 3.698 3.849 4.081 4.229 4.363 4.555 4.759 4.978 5.184 5.377 5.621 5.86 6.099 6.388 6.655 6.925 7.261 7.65 8.03 8.409 8.79 9.208 9.664 10.19 10.838 11.551 12.395 13.326 14.407 15.624 17.089 18.878 21.09 22.942 24.066 24.798 25.274 25.603 25.835 25.973 26.06 26.139 26.191 26.199 26.156 26.09 26.042 25.993 25.908 25.822 25.737 25.645 25.559 25.49 25.428 25.36 25.304 25.252 25.189 25.095 24.984 24.911 24.842 24.739 24.659 24.571 24.527 24.443 24.361 24.264 24.201 23.977 23.997 23.917 23.819 23.618 23.525 23.417 23.304 23.17 22.966 22.666 22.129 -8 ,25497 ,KEBNE ,17077327,Sat Dec 25 11:45:32 CET,Sat Dec 25 13:12:57 CET,0.0 0.843 1.116 1.31 1.491 1.673 1.842 1.993 2.265 2.381 2.5 2.549 2.837 2.943 3.155 3.358 3.547 3.629 3.78 3.935 4.162 4.307 4.441 4.648 4.85 5.039 5.221 5.406 5.642 5.876 6.126 6.414 6.67 6.934 7.243 7.566 7.884 8.255 8.666 9.124 9.637 10.202 10.822 11.465 12.24 13.111 14.163 15.384 16.819 18.562 20.783 22.705 23.848 24.586 25.07 25.416 25.65 25.807 25.91 25.979 26.029 26.013 25.975 25.938 25.866 25.782 25.694 25.637 25.602 25.538 25.451 25.39 25.328 25.242 25.157 25.073 25.005 24.931 24.841 24.791 24.744 24.655 24.58 24.493 24.447 24.351 24.258 24.143 24.08 23.862 23.857 23.767 23.689 23.535 23.437 23.314 23.179 23.025 22.862 22.668 22.085 -9 ,27322 ,KEBNE ,17077328,Sat Dec 25 11:46:31 CET,Sat Dec 25 13:20:39 CET,0.0 1.127 1.502 1.718 1.911 2.08 2.223 2.367 2.612 2.732 2.853 2.894 3.175 3.265 3.436 3.606 3.779 3.863 4.012 4.158 4.388 4.528 4.654 4.842 5.041 5.242 5.439 5.63 5.879 6.112 6.341 6.642 6.931 7.221 7.55 7.894 8.24 8.659 9.138 9.614 10.079 10.598 11.226 11.884 12.662 13.558 14.611 15.811 17.235 18.977 21.202 23.145 24.316 25.074 25.585 25.928 26.107 26.233 26.32 26.371 26.414 26.442 26.457 26.47 26.463 26.431 26.37 26.305 26.239 26.162 26.097 26.027 25.929 25.83 25.767 25.711 25.647 25.583 25.511 25.459 25.398 25.302 25.233 25.159 25.122 25.04 24.936 24.82 24.762 24.539 24.531 24.445 24.358 24.191 24.104 24.001 23.869 23.697 23.515 23.268 22.758 -10 ,21118 ,KEBNE ,17077329,Sat Dec 25 11:48:36 CET,Sat Dec 25 13:22:41 CET,0.0 0.531 0.802 0.982 1.137 1.281 1.414 1.547 1.822 1.945 2.051 2.075 2.354 2.45 2.639 2.829 3.004 3.091 3.253 3.388 3.599 3.748 3.901 4.137 4.358 4.567 4.768 4.969 5.211 5.447 5.702 6.015 6.295 6.565 6.898 7.265 7.605 7.983 8.391 8.824 9.293 9.87 10.601 11.299 12.099 13.022 14.135 15.407 16.868 18.662 20.898 22.79 23.93 24.655 25.135 25.482 25.729 25.912 26.01 26.057 26.089 26.098 26.089 26.069 26.03 25.969 25.911 25.856 25.796 25.749 25.673 25.587 25.512 25.435 25.375 25.305 25.214 25.136 25.053 24.973 24.888 24.759 24.657 24.554 24.51 24.414 24.312 24.207 24.14 23.918 23.943 23.869 23.782 23.595 23.484 23.359 23.22 23.077 22.932 22.725 22.009 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5j.txt deleted file mode 100644 index bcd2d4b7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,602 ,TETRA ,17668661,Fri Dec 3 06:50:31 CET,Fri Dec 3 08:38:05 CET,0.0 0.574 0.855 1.035 1.193 1.334 1.46 1.572 1.779 1.868 1.945 1.929 2.178 2.248 2.375 2.485 2.593 2.647 2.75 2.849 2.997 3.092 3.176 3.295 3.412 3.522 3.641 3.761 3.901 4.025 4.122 4.222 4.345 4.467 4.584 4.714 4.838 4.972 5.087 5.17 5.258 5.351 5.429 5.487 5.506 5.479 5.433 5.273 4.925 4.296 3.091 1.551 0.158 -1.003 -1.949 -2.847 -3.608 -4.253 -4.804 -5.371 -5.853 -6.258 -6.629 -6.992 -7.332 -7.641 -7.989 -8.278 -8.511 -8.762 -9.044 -9.285 -9.517 -9.757 -9.95 -10.131 -10.308 -10.5 -10.702 -10.849 -11.002 -11.215 -11.362 -11.527 -11.61 -11.787 -11.968 -12.15 -12.242 -12.528 -12.546 -12.654 -12.756 -12.989 -13.115 -13.253 -13.414 -13.585 -13.786 -14.102 -14.687 -2 ,25838 ,TETRA ,17668662,Fri Dec 3 06:50:32 CET,Fri Dec 3 08:37:23 CET,0.0 0.353 0.573 0.707 0.817 0.958 1.1 1.205 1.381 1.472 1.565 1.564 1.819 1.887 1.999 2.099 2.203 2.251 2.354 2.467 2.621 2.713 2.806 2.942 3.068 3.177 3.278 3.392 3.532 3.633 3.718 3.812 3.9 3.985 4.075 4.173 4.261 4.356 4.452 4.568 4.71 4.838 4.917 4.967 4.995 5.015 4.991 4.824 4.522 3.954 2.787 1.355 0.08 -1.023 -1.987 -2.893 -3.633 -4.27 -4.811 -5.329 -5.773 -6.172 -6.552 -6.927 -7.3 -7.657 -8.022 -8.329 -8.605 -8.905 -9.205 -9.454 -9.707 -9.963 -10.147 -10.321 -10.506 -10.723 -10.95 -11.096 -11.251 -11.489 -11.633 -11.778 -11.861 -12.03 -12.2 -12.396 -12.505 -12.81 -12.845 -12.957 -13.061 -13.294 -13.439 -13.594 -13.767 -13.967 -14.176 -14.488 -15.36 -3 ,457 ,TETRA ,17668663,Fri Dec 3 06:50:27 CET,Fri Dec 3 08:36:58 CET,0.0 0.763 0.964 1.108 1.246 1.368 1.477 1.569 1.738 1.817 1.895 1.878 2.121 2.181 2.287 2.378 2.473 2.524 2.628 2.73 2.888 2.973 3.041 3.147 3.263 3.384 3.504 3.617 3.749 3.866 3.988 4.137 4.268 4.389 4.503 4.633 4.773 4.914 5.029 5.113 5.212 5.31 5.404 5.47 5.511 5.535 5.505 5.351 5.027 4.465 3.359 1.801 0.481 -0.608 -1.556 -2.371 -3.079 -3.714 -4.25 -4.781 -5.237 -5.648 -6.034 -6.416 -6.791 -7.115 -7.422 -7.698 -7.939 -8.186 -8.432 -8.628 -8.836 -9.063 -9.251 -9.457 -9.674 -9.877 -10.084 -10.222 -10.357 -10.586 -10.75 -10.908 -10.986 -11.139 -11.299 -11.482 -11.576 -11.871 -11.907 -12.011 -12.116 -12.378 -12.511 -12.642 -12.795 -12.968 -13.164 -13.391 -13.909 -4 ,21119 ,TETRA ,17668664,Fri Dec 3 06:50:29 CET,Fri Dec 3 08:36:58 CET,0.0 0.783 1.089 1.285 1.435 1.576 1.702 1.819 2.018 2.099 2.175 2.154 2.402 2.458 2.581 2.715 2.836 2.89 3.001 3.105 3.244 3.336 3.42 3.545 3.665 3.789 3.905 3.999 4.113 4.213 4.305 4.409 4.516 4.639 4.781 4.915 5.014 5.105 5.192 5.285 5.385 5.499 5.618 5.695 5.728 5.704 5.653 5.529 5.333 4.842 3.634 2.119 0.829 -0.277 -1.218 -2.08 -2.83 -3.473 -4.012 -4.556 -5.029 -5.443 -5.817 -6.199 -6.565 -6.875 -7.199 -7.488 -7.728 -7.97 -8.236 -8.46 -8.675 -8.897 -9.084 -9.283 -9.477 -9.67 -9.865 -9.998 -10.133 -10.352 -10.512 -10.676 -10.762 -10.933 -11.114 -11.314 -11.416 -11.714 -11.748 -11.868 -11.983 -12.202 -12.322 -12.455 -12.6 -12.778 -12.984 -13.244 -13.637 -5 ,4642 ,TETRA ,17668665,Fri Dec 3 06:50:27 CET,Fri Dec 3 08:38:46 CET,0.0 0.327 0.541 0.737 0.89 1.028 1.161 1.286 1.495 1.585 1.66 1.614 1.859 1.924 2.054 2.187 2.315 2.364 2.449 2.546 2.701 2.793 2.879 3.001 3.11 3.209 3.296 3.393 3.516 3.611 3.727 3.886 4.001 4.1 4.218 4.322 4.406 4.496 4.589 4.68 4.799 4.945 5.027 5.052 5.071 5.09 5.041 4.852 4.532 3.937 2.819 1.388 0.127 -0.947 -1.895 -2.757 -3.476 -4.109 -4.666 -5.251 -5.759 -6.178 -6.567 -6.958 -7.31 -7.627 -7.952 -8.232 -8.484 -8.753 -9.029 -9.243 -9.461 -9.703 -9.889 -10.068 -10.25 -10.442 -10.645 -10.788 -10.946 -11.174 -11.326 -11.496 -11.584 -11.758 -11.927 -12.11 -12.207 -12.493 -12.501 -12.606 -12.728 -13.01 -13.171 -13.336 -13.502 -13.694 -13.923 -14.194 -14.725 -6 ,26204 ,TETRA ,17668666,Fri Dec 3 06:50:29 CET,Fri Dec 3 08:38:36 CET,0.0 0.511 0.709 0.89 1.032 1.145 1.253 1.355 1.534 1.621 1.701 1.673 1.928 2.004 2.143 2.268 2.382 2.439 2.554 2.66 2.802 2.873 2.94 3.047 3.144 3.243 3.346 3.445 3.587 3.711 3.814 3.927 4.022 4.127 4.263 4.401 4.529 4.654 4.746 4.825 4.896 5.004 5.126 5.212 5.33 5.392 5.334 5.169 4.832 4.236 3.116 1.603 0.293 -0.808 -1.743 -2.605 -3.37 -4.041 -4.601 -5.151 -5.624 -6.035 -6.448 -6.888 -7.298 -7.667 -8.031 -8.323 -8.571 -8.837 -9.127 -9.342 -9.535 -9.75 -9.921 -10.102 -10.288 -10.482 -10.698 -10.846 -10.993 -11.217 -11.361 -11.493 -11.565 -11.728 -11.911 -12.104 -12.206 -12.497 -12.507 -12.615 -12.712 -12.905 -13.033 -13.199 -13.365 -13.522 -13.716 -14.024 -14.642 -7 ,16804 ,TETRA ,17668667,Fri Dec 3 06:50:27 CET,Fri Dec 3 08:37:11 CET,0.0 0.887 1.163 1.375 1.562 1.699 1.805 1.896 2.068 2.15 2.223 2.198 2.454 2.523 2.654 2.779 2.915 2.978 3.081 3.186 3.302 3.365 3.439 3.571 3.697 3.795 3.886 3.97 4.066 4.158 4.238 4.323 4.411 4.498 4.598 4.695 4.778 4.878 4.977 5.077 5.17 5.252 5.318 5.354 5.362 5.338 5.283 5.134 4.78 4.178 3.063 1.553 0.258 -0.846 -1.788 -2.629 -3.346 -3.983 -4.55 -5.097 -5.551 -5.96 -6.365 -6.735 -7.049 -7.375 -7.726 -7.999 -8.232 -8.475 -8.733 -8.955 -9.199 -9.454 -9.65 -9.839 -10.028 -10.231 -10.442 -10.578 -10.723 -10.975 -11.144 -11.318 -11.408 -11.584 -11.755 -11.955 -12.066 -12.362 -12.367 -12.48 -12.602 -12.872 -13.02 -13.16 -13.308 -13.503 -13.716 -13.97 -14.476 -8 ,15043 ,TETRA ,17668668,Fri Dec 3 06:50:28 CET,Fri Dec 3 08:36:53 CET,0.0 0.74 1.018 1.21 1.349 1.481 1.593 1.711 1.931 2.014 2.086 2.048 2.298 2.377 2.523 2.662 2.804 2.863 2.973 3.086 3.228 3.313 3.394 3.514 3.635 3.753 3.866 3.98 4.122 4.214 4.294 4.418 4.529 4.644 4.785 4.897 5.007 5.137 5.233 5.309 5.399 5.526 5.634 5.688 5.722 5.703 5.619 5.461 5.147 4.523 3.33 1.798 0.496 -0.607 -1.582 -2.449 -3.194 -3.839 -4.374 -4.915 -5.369 -5.769 -6.136 -6.473 -6.785 -7.082 -7.397 -7.671 -7.918 -8.173 -8.435 -8.653 -8.874 -9.097 -9.259 -9.424 -9.612 -9.827 -10.045 -10.183 -10.322 -10.539 -10.693 -10.851 -10.929 -11.094 -11.262 -11.427 -11.516 -11.805 -11.816 -11.931 -12.054 -12.296 -12.43 -12.576 -12.738 -12.932 -13.165 -13.496 -14.248 -9 ,4965 ,TETRA ,17668669,Fri Dec 3 06:50:31 CET,Fri Dec 3 08:37:25 CET,0.0 0.675 0.915 1.106 1.253 1.377 1.505 1.619 1.825 1.917 2.006 1.993 2.229 2.282 2.385 2.486 2.58 2.623 2.723 2.82 2.958 3.05 3.133 3.253 3.372 3.481 3.565 3.638 3.726 3.814 3.917 4.061 4.198 4.326 4.463 4.58 4.687 4.795 4.881 4.959 5.051 5.158 5.238 5.285 5.33 5.34 5.277 5.101 4.782 4.225 3.11 1.584 0.261 -0.834 -1.78 -2.669 -3.417 -4.034 -4.567 -5.111 -5.604 -6.042 -6.427 -6.793 -7.124 -7.409 -7.721 -8.024 -8.291 -8.546 -8.791 -9.001 -9.241 -9.498 -9.7 -9.906 -10.113 -10.317 -10.522 -10.661 -10.806 -11.022 -11.171 -11.337 -11.42 -11.589 -11.765 -11.953 -12.045 -12.329 -12.325 -12.437 -12.565 -12.846 -12.983 -13.105 -13.256 -13.446 -13.692 -13.965 -14.582 -10 ,25569 ,TETRA ,17668670,Fri Dec 3 06:50:32 CET,Fri Dec 3 08:36:53 CET,0.0 0.728 0.967 1.157 1.318 1.446 1.552 1.648 1.856 1.96 2.039 2.006 2.26 2.33 2.452 2.572 2.682 2.734 2.836 2.924 3.045 3.122 3.204 3.341 3.482 3.606 3.706 3.804 3.921 4.02 4.119 4.247 4.389 4.511 4.614 4.743 4.862 4.964 5.055 5.141 5.224 5.311 5.393 5.425 5.415 5.393 5.33 5.178 4.857 4.217 3.059 1.545 0.247 -0.843 -1.795 -2.666 -3.444 -4.126 -4.697 -5.256 -5.716 -6.124 -6.515 -6.871 -7.184 -7.496 -7.843 -8.14 -8.378 -8.615 -8.857 -9.058 -9.277 -9.513 -9.693 -9.866 -10.036 -10.212 -10.391 -10.521 -10.677 -10.934 -11.107 -11.278 -11.367 -11.56 -11.758 -11.95 -12.056 -12.357 -12.384 -12.499 -12.625 -12.886 -13.016 -13.161 -13.309 -13.474 -13.687 -13.963 -14.641 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5d.txt deleted file mode 100644 index 919dad7b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26255 ,KEBNE ,17077330,Sat Dec 25 11:48:38 CET,Sat Dec 25 13:16:27 CET,0.0 0.629 0.857 1.017 1.165 1.287 1.389 1.505 1.717 1.81 1.896 1.909 2.169 2.237 2.376 2.52 2.641 2.694 2.805 2.91 3.059 3.148 3.231 3.373 3.498 3.603 3.712 3.827 3.966 4.1 4.219 4.345 4.465 4.581 4.735 4.904 5.071 5.269 5.469 5.671 5.885 6.098 6.322 6.531 6.748 6.99 7.232 7.432 7.606 7.689 7.548 7.106 6.621 6.13 5.625 5.139 4.714 4.337 4.019 3.696 3.404 3.154 2.916 2.668 2.431 2.231 2.023 1.823 1.651 1.47 1.243 1.045 0.862 0.662 0.487 0.326 0.176 -0.006 -0.2 -0.326 -0.454 -0.623 -0.734 -0.877 -0.956 -1.107 -1.28 -1.463 -1.556 -1.836 -1.883 -1.998 -2.12 -2.364 -2.5 -2.672 -2.861 -3.075 -3.327 -3.629 -4.581 -2 ,2082 ,KEBNE ,17077331,Sat Dec 25 11:49:39 CET,Sat Dec 25 13:24:08 CET,0.0 0.634 0.898 1.076 1.205 1.321 1.447 1.564 1.763 1.862 1.948 1.919 2.165 2.241 2.387 2.506 2.6 2.646 2.76 2.873 3.01 3.097 3.184 3.307 3.421 3.539 3.654 3.764 3.893 4.016 4.135 4.27 4.399 4.522 4.68 4.86 5.004 5.159 5.337 5.51 5.687 5.903 6.175 6.416 6.65 6.872 7.094 7.34 7.559 7.676 7.519 7.057 6.569 6.098 5.633 5.182 4.768 4.373 4.026 3.695 3.415 3.164 2.921 2.666 2.405 2.189 1.983 1.793 1.609 1.388 1.163 0.97 0.766 0.572 0.424 0.269 0.107 -0.068 -0.246 -0.374 -0.521 -0.73 -0.855 -0.993 -1.066 -1.206 -1.361 -1.549 -1.651 -1.927 -1.961 -2.071 -2.197 -2.459 -2.593 -2.76 -2.956 -3.196 -3.478 -3.84 -4.794 -3 ,26055 ,KEBNE ,17077332,Sat Dec 25 11:49:39 CET,Sat Dec 25 13:23:21 CET,0.0 0.791 1.062 1.237 1.376 1.486 1.607 1.717 1.884 1.97 2.061 2.057 2.303 2.378 2.515 2.625 2.724 2.776 2.893 3.001 3.147 3.245 3.332 3.457 3.6 3.731 3.837 3.93 4.041 4.157 4.27 4.394 4.514 4.63 4.767 4.917 5.05 5.2 5.366 5.546 5.731 5.921 6.135 6.338 6.548 6.763 6.994 7.213 7.401 7.483 7.327 6.927 6.437 5.914 5.442 4.951 4.514 4.156 3.84 3.501 3.151 2.85 2.589 2.329 2.092 1.867 1.63 1.416 1.22 1.021 0.794 0.596 0.399 0.2 0.058 -0.077 -0.221 -0.385 -0.567 -0.701 -0.842 -1.048 -1.184 -1.324 -1.405 -1.582 -1.76 -1.941 -2.04 -2.319 -2.361 -2.48 -2.614 -2.902 -3.066 -3.239 -3.42 -3.643 -3.924 -4.247 -5.168 -4 ,1445 ,KEBNE ,17077333,Sat Dec 25 11:50:42 CET,Sat Dec 25 13:24:24 CET,0.0 0.524 0.751 0.891 1.01 1.118 1.223 1.321 1.486 1.569 1.655 1.646 1.899 1.974 2.124 2.266 2.387 2.443 2.543 2.625 2.754 2.842 2.93 3.076 3.208 3.311 3.4 3.488 3.607 3.714 3.816 3.962 4.101 4.227 4.39 4.57 4.735 4.933 5.126 5.286 5.435 5.615 5.836 6.03 6.234 6.468 6.705 6.89 7.016 7.107 7.016 6.559 6.001 5.471 4.998 4.56 4.136 3.706 3.343 3.001 2.701 2.413 2.131 1.874 1.629 1.376 1.093 0.875 0.699 0.493 0.278 0.105 -0.08 -0.298 -0.467 -0.619 -0.77 -0.945 -1.131 -1.248 -1.37 -1.588 -1.743 -1.91 -1.995 -2.164 -2.347 -2.526 -2.627 -2.905 -2.941 -3.072 -3.202 -3.467 -3.626 -3.805 -3.993 -4.209 -4.457 -4.812 -5.815 -5 ,3129 ,KEBNE ,17077334,Sat Dec 25 11:51:44 CET,Sat Dec 25 13:26:11 CET,0.0 0.766 1.086 1.304 1.454 1.595 1.706 1.791 1.968 2.059 2.141 2.111 2.357 2.436 2.581 2.705 2.814 2.861 2.953 3.042 3.17 3.269 3.375 3.512 3.639 3.766 3.893 4.015 4.169 4.305 4.421 4.552 4.675 4.811 5.003 5.207 5.374 5.545 5.718 5.912 6.117 6.319 6.537 6.773 7.028 7.264 7.544 7.806 8.02 8.101 7.963 7.526 6.967 6.423 5.943 5.515 5.136 4.788 4.462 4.119 3.812 3.538 3.258 2.979 2.708 2.441 2.175 1.946 1.742 1.527 1.316 1.127 0.92 0.715 0.556 0.391 0.214 0.036 -0.141 -0.262 -0.383 -0.573 -0.712 -0.86 -0.937 -1.1 -1.272 -1.448 -1.546 -1.827 -1.862 -1.962 -2.086 -2.377 -2.522 -2.695 -2.898 -3.111 -3.373 -3.721 -4.558 -6 ,2234 ,KEBNE ,17077335,Sat Dec 25 11:55:57 CET,Sat Dec 25 13:29:03 CET,0.0 0.798 1.109 1.289 1.434 1.548 1.659 1.769 1.978 2.071 2.145 2.119 2.374 2.452 2.588 2.717 2.838 2.897 3.011 3.11 3.255 3.355 3.454 3.607 3.743 3.853 3.956 4.066 4.226 4.372 4.49 4.632 4.778 4.916 5.067 5.222 5.394 5.575 5.732 5.912 6.1 6.313 6.54 6.734 6.947 7.166 7.401 7.619 7.784 7.858 7.728 7.276 6.78 6.312 5.867 5.434 5.032 4.673 4.351 4.002 3.698 3.44 3.2 2.957 2.736 2.531 2.323 2.143 1.965 1.779 1.575 1.391 1.21 1.016 0.87 0.708 0.528 0.363 0.202 0.079 -0.059 -0.276 -0.418 -0.565 -0.639 -0.799 -0.971 -1.153 -1.252 -1.524 -1.567 -1.687 -1.813 -2.095 -2.258 -2.42 -2.598 -2.822 -3.123 -3.505 -4.345 -7 ,461 ,KEBNE ,17077336,Sat Dec 25 11:55:57 CET,Sat Dec 25 13:31:01 CET,0.0 0.521 0.785 0.973 1.109 1.224 1.345 1.46 1.649 1.74 1.823 1.805 2.057 2.125 2.254 2.375 2.495 2.56 2.68 2.794 2.947 3.037 3.132 3.288 3.424 3.543 3.665 3.783 3.942 4.104 4.249 4.413 4.556 4.666 4.79 4.93 5.062 5.205 5.365 5.551 5.719 5.89 6.104 6.327 6.555 6.774 7.044 7.316 7.51 7.619 7.493 7.014 6.541 6.076 5.603 5.169 4.786 4.4 4.043 3.688 3.357 3.017 2.674 2.364 2.118 1.904 1.662 1.446 1.246 1.052 0.865 0.689 0.489 0.282 0.131 -0.025 -0.195 -0.386 -0.596 -0.727 -0.85 -1.041 -1.185 -1.34 -1.417 -1.583 -1.75 -1.922 -2.017 -2.279 -2.286 -2.392 -2.509 -2.799 -2.973 -3.149 -3.329 -3.555 -3.814 -4.123 -4.912 -8 ,21195 ,KEBNE ,17077337,Sat Dec 25 11:56:59 CET,Sat Dec 25 13:30:06 CET,0.0 0.731 1.005 1.179 1.336 1.451 1.568 1.685 1.877 1.968 2.054 2.055 2.312 2.382 2.517 2.655 2.787 2.848 2.961 3.067 3.213 3.306 3.407 3.546 3.657 3.762 3.853 3.947 4.094 4.245 4.389 4.557 4.727 4.895 5.077 5.262 5.415 5.568 5.742 5.913 6.074 6.243 6.424 6.608 6.818 7.02 7.225 7.432 7.633 7.746 7.651 7.248 6.713 6.199 5.724 5.233 4.808 4.438 4.109 3.773 3.468 3.183 2.929 2.678 2.43 2.212 1.984 1.784 1.604 1.415 1.229 1.068 0.893 0.713 0.567 0.405 0.216 0.016 -0.181 -0.309 -0.452 -0.681 -0.829 -0.979 -1.052 -1.225 -1.4 -1.568 -1.664 -1.936 -1.969 -2.078 -2.192 -2.46 -2.595 -2.727 -2.886 -3.073 -3.336 -3.723 -4.812 -9 ,14452 ,KEBNE ,17077338,Sat Dec 25 11:56:59 CET,Sat Dec 25 13:29:50 CET,0.0 0.443 0.709 0.931 1.102 1.236 1.351 1.45 1.598 1.668 1.748 1.739 1.984 2.059 2.219 2.371 2.509 2.57 2.681 2.789 2.942 3.037 3.127 3.264 3.413 3.544 3.662 3.782 3.932 4.072 4.213 4.382 4.53 4.658 4.817 5.014 5.167 5.315 5.504 5.693 5.859 6.069 6.313 6.529 6.797 7.074 7.293 7.505 7.716 7.843 7.741 7.315 6.797 6.249 5.761 5.335 4.928 4.552 4.239 3.908 3.558 3.238 2.968 2.714 2.488 2.284 2.032 1.796 1.589 1.37 1.151 0.966 0.758 0.538 0.374 0.218 0.067 -0.088 -0.254 -0.377 -0.507 -0.696 -0.82 -0.972 -1.06 -1.226 -1.381 -1.556 -1.649 -1.913 -1.94 -2.053 -2.171 -2.424 -2.569 -2.735 -2.943 -3.152 -3.375 -3.696 -4.368 -10 ,1129 ,KEBNE ,17077339,Sat Dec 25 11:56:59 CET,Sat Dec 25 13:29:40 CET,0.0 0.675 0.943 1.124 1.264 1.397 1.517 1.623 1.819 1.912 1.998 1.995 2.247 2.316 2.45 2.572 2.675 2.723 2.829 2.949 3.104 3.186 3.267 3.393 3.521 3.65 3.76 3.853 3.973 4.105 4.251 4.426 4.586 4.724 4.864 5.049 5.253 5.467 5.668 5.847 6.055 6.264 6.48 6.688 6.894 7.11 7.322 7.527 7.701 7.803 7.711 7.259 6.717 6.171 5.679 5.207 4.794 4.426 4.087 3.72 3.348 3.02 2.746 2.483 2.221 1.98 1.739 1.53 1.34 1.14 0.939 0.772 0.586 0.369 0.205 0.043 -0.13 -0.3 -0.482 -0.614 -0.744 -0.943 -1.073 -1.205 -1.279 -1.446 -1.635 -1.832 -1.929 -2.202 -2.229 -2.34 -2.455 -2.7 -2.851 -3.015 -3.192 -3.406 -3.642 -3.945 -4.977 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5i.txt deleted file mode 100644 index 9cee5bdd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25535 ,KEBNE ,17077340,Sat Dec 25 12:05:23 CET,Sat Dec 25 13:38:32 CET,0.0 0.469 0.756 0.946 1.078 1.196 1.32 1.435 1.641 1.728 1.818 1.838 2.103 2.185 2.334 2.479 2.618 2.68 2.808 2.938 3.099 3.202 3.303 3.442 3.581 3.722 3.869 4.015 4.191 4.352 4.493 4.656 4.816 4.966 5.143 5.33 5.507 5.697 5.884 6.093 6.314 6.556 6.866 7.158 7.471 7.831 8.198 8.558 8.903 9.258 9.527 9.406 9.101 8.787 8.441 8.107 7.824 7.54 7.252 6.96 6.69 6.401 6.128 5.894 5.689 5.511 5.295 5.102 4.947 4.774 4.579 4.411 4.236 4.04 3.883 3.728 3.58 3.424 3.26 3.156 3.049 2.868 2.746 2.628 2.569 2.453 2.319 2.16 2.072 1.812 1.816 1.724 1.622 1.402 1.286 1.156 1.006 0.844 0.665 0.368 -0.311 -2 ,13924 ,KEBNE ,17077341,Sat Dec 25 12:05:22 CET,Sat Dec 25 13:38:45 CET,0.0 0.415 0.649 0.829 0.978 1.12 1.249 1.361 1.531 1.614 1.695 1.692 1.948 2.028 2.162 2.291 2.427 2.483 2.59 2.7 2.862 2.975 3.086 3.239 3.383 3.519 3.659 3.792 3.949 4.098 4.23 4.39 4.554 4.713 4.901 5.097 5.28 5.5 5.738 5.967 6.193 6.442 6.713 7.009 7.374 7.715 8.064 8.449 8.842 9.195 9.45 9.317 9.005 8.643 8.289 7.954 7.632 7.33 7.07 6.794 6.535 6.299 6.078 5.863 5.642 5.432 5.216 5.035 4.88 4.708 4.503 4.32 4.134 3.941 3.804 3.674 3.54 3.391 3.211 3.087 2.973 2.791 2.659 2.519 2.446 2.314 2.188 2.038 1.952 1.693 1.692 1.599 1.501 1.273 1.159 1.048 0.925 0.766 0.549 0.246 -0.672 -3 ,20004 ,KEBNE ,17077342,Sat Dec 25 12:05:23 CET,Sat Dec 25 13:38:39 CET,0.0 0.772 0.978 1.151 1.315 1.464 1.595 1.698 1.891 1.989 2.079 2.061 2.307 2.385 2.534 2.674 2.798 2.854 2.968 3.08 3.248 3.363 3.471 3.612 3.744 3.869 4.003 4.147 4.326 4.477 4.602 4.753 4.897 5.032 5.205 5.413 5.601 5.805 6.018 6.261 6.524 6.783 7.07 7.338 7.629 7.938 8.297 8.683 9.07 9.426 9.63 9.498 9.221 8.851 8.486 8.149 7.821 7.521 7.262 6.97 6.699 6.447 6.217 5.999 5.787 5.589 5.378 5.199 5.046 4.889 4.719 4.583 4.451 4.29 4.149 4.003 3.854 3.708 3.574 3.481 3.375 3.202 3.083 2.949 2.875 2.728 2.58 2.418 2.329 2.057 2.047 1.963 1.858 1.622 1.495 1.349 1.17 0.963 0.72 0.429 -0.215 -4 ,28160 ,KEBNE ,17077343,Sat Dec 25 12:06:25 CET,Sat Dec 25 13:39:47 CET,0.0 0.518 0.762 0.95 1.121 1.259 1.372 1.479 1.676 1.766 1.854 1.823 2.059 2.131 2.275 2.409 2.54 2.604 2.727 2.853 3.038 3.159 3.273 3.415 3.549 3.679 3.805 3.927 4.108 4.293 4.441 4.63 4.83 5.02 5.231 5.435 5.63 5.871 6.123 6.359 6.615 6.887 7.167 7.446 7.789 8.173 8.557 8.936 9.354 9.714 9.884 9.708 9.347 8.962 8.611 8.242 7.908 7.585 7.246 6.928 6.677 6.446 6.219 5.984 5.77 5.58 5.381 5.196 5.013 4.81 4.601 4.444 4.302 4.159 4.038 3.91 3.773 3.632 3.496 3.404 3.314 3.155 3.042 2.928 2.866 2.727 2.566 2.397 2.31 2.058 2.057 1.956 1.852 1.626 1.492 1.341 1.177 1.007 0.794 0.54 0.006 -5 ,10233 ,KEBNE ,17077344,Sat Dec 25 12:06:25 CET,Sat Dec 25 13:39:55 CET,0.0 0.448 0.664 0.828 0.981 1.135 1.27 1.39 1.619 1.724 1.827 1.842 2.095 2.172 2.312 2.451 2.604 2.675 2.79 2.902 3.085 3.189 3.285 3.444 3.599 3.744 3.897 4.043 4.195 4.332 4.483 4.664 4.824 4.973 5.141 5.333 5.516 5.71 5.94 6.221 6.524 6.842 7.154 7.432 7.744 8.084 8.475 8.846 9.208 9.55 9.744 9.555 9.193 8.823 8.402 8.003 7.696 7.39 7.112 6.832 6.571 6.321 6.078 5.866 5.671 5.469 5.247 5.051 4.864 4.658 4.449 4.277 4.105 3.941 3.818 3.671 3.508 3.355 3.21 3.111 3.002 2.832 2.711 2.591 2.531 2.393 2.247 2.091 2.01 1.752 1.738 1.643 1.542 1.314 1.197 1.087 0.957 0.786 0.566 0.287 -0.615 -6 ,14647 ,KEBNE ,17077345,Sat Dec 25 12:06:25 CET,Sat Dec 25 13:40:56 CET,0.0 0.5 0.742 0.942 1.128 1.281 1.405 1.518 1.718 1.815 1.911 1.912 2.16 2.238 2.394 2.54 2.679 2.752 2.889 3.004 3.183 3.308 3.419 3.577 3.738 3.903 4.047 4.164 4.311 4.468 4.641 4.83 4.98 5.122 5.287 5.463 5.634 5.824 6.026 6.299 6.617 6.943 7.279 7.565 7.882 8.222 8.616 9.015 9.385 9.77 10.022 9.948 9.685 9.316 8.931 8.585 8.272 7.95 7.66 7.362 7.095 6.872 6.652 6.424 6.212 6.034 5.859 5.691 5.533 5.375 5.196 5.049 4.92 4.78 4.666 4.542 4.398 4.244 4.077 3.954 3.833 3.638 3.507 3.38 3.311 3.167 3.04 2.92 2.848 2.598 2.601 2.505 2.401 2.182 2.052 1.908 1.757 1.555 1.319 1.053 0.241 -7 ,27535 ,KEBNE ,17077346,Sat Dec 25 12:07:28 CET,Sat Dec 25 13:42:07 CET,0.0 0.699 0.935 1.129 1.278 1.391 1.517 1.648 1.898 2.011 2.109 2.121 2.376 2.45 2.601 2.749 2.877 2.936 3.053 3.169 3.333 3.424 3.509 3.652 3.799 3.924 4.042 4.161 4.327 4.495 4.655 4.851 5.033 5.189 5.353 5.54 5.718 5.903 6.125 6.365 6.617 6.899 7.178 7.451 7.806 8.169 8.515 8.911 9.362 9.785 10.042 9.932 9.619 9.251 8.906 8.569 8.266 7.96 7.679 7.403 7.16 6.933 6.695 6.479 6.286 6.096 5.866 5.646 5.481 5.333 5.153 4.987 4.832 4.682 4.566 4.45 4.317 4.166 4.012 3.899 3.778 3.609 3.497 3.374 3.313 3.182 3.029 2.848 2.75 2.484 2.476 2.383 2.276 2.054 1.932 1.791 1.62 1.437 1.243 0.942 0.314 -8 ,30419 ,KEBNE ,17077347,Sat Dec 25 12:07:28 CET,Sat Dec 25 13:42:04 CET,0.0 0.729 1.049 1.259 1.426 1.578 1.709 1.817 2.006 2.104 2.206 2.209 2.466 2.539 2.657 2.773 2.889 2.947 3.061 3.185 3.365 3.466 3.577 3.752 3.902 4.045 4.19 4.33 4.499 4.671 4.861 5.082 5.268 5.445 5.662 5.898 6.116 6.357 6.615 6.857 7.117 7.399 7.662 7.908 8.202 8.526 8.873 9.245 9.609 9.973 10.232 10.086 9.786 9.454 9.118 8.783 8.46 8.153 7.868 7.589 7.357 7.127 6.908 6.687 6.466 6.262 6.059 5.888 5.723 5.534 5.346 5.2 5.034 4.841 4.682 4.533 4.401 4.252 4.079 3.967 3.859 3.673 3.552 3.44 3.379 3.245 3.109 2.966 2.894 2.654 2.646 2.547 2.454 2.236 2.098 1.958 1.816 1.612 1.387 1.117 0.4 -9 ,8411 ,KEBNE ,17077348,Sat Dec 25 12:07:28 CET,Sat Dec 25 13:40:40 CET,0.0 0.485 0.74 0.957 1.125 1.254 1.385 1.508 1.714 1.803 1.896 1.897 2.14 2.202 2.331 2.45 2.564 2.617 2.717 2.809 2.953 3.061 3.171 3.331 3.486 3.646 3.806 3.954 4.131 4.301 4.461 4.625 4.769 4.912 5.083 5.282 5.492 5.722 5.943 6.182 6.435 6.688 6.984 7.269 7.582 7.927 8.312 8.736 9.14 9.464 9.683 9.63 9.37 9.035 8.674 8.316 7.997 7.712 7.45 7.158 6.902 6.662 6.4 6.135 5.91 5.728 5.535 5.344 5.172 4.997 4.827 4.69 4.543 4.392 4.28 4.152 4.006 3.864 3.713 3.6 3.482 3.31 3.194 3.057 2.982 2.838 2.679 2.502 2.413 2.151 2.14 2.039 1.915 1.66 1.537 1.396 1.245 1.065 0.813 0.486 -0.267 -10 ,20349 ,KEBNE ,17077349,Sat Dec 25 12:08:31 CET,Sat Dec 25 13:43:33 CET,0.0 0.612 0.866 1.079 1.254 1.389 1.499 1.606 1.815 1.92 2.009 1.992 2.236 2.31 2.464 2.617 2.756 2.822 2.959 3.094 3.282 3.381 3.475 3.634 3.786 3.931 4.066 4.19 4.359 4.52 4.666 4.844 5.006 5.166 5.34 5.521 5.696 5.884 6.093 6.313 6.544 6.792 7.062 7.346 7.688 8.058 8.418 8.752 9.125 9.454 9.651 9.56 9.211 8.786 8.36 7.971 7.642 7.331 7.062 6.792 6.552 6.297 6.023 5.763 5.527 5.332 5.141 4.962 4.811 4.658 4.496 4.355 4.185 4.004 3.871 3.73 3.603 3.466 3.314 3.22 3.122 2.953 2.827 2.691 2.623 2.493 2.357 2.205 2.128 1.878 1.899 1.818 1.719 1.483 1.351 1.222 1.076 0.892 0.686 0.443 -0.17 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5k.txt deleted file mode 100644 index f67b836a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18309 ,TETRA ,17668671,Fri Dec 3 06:51:26 CET,Fri Dec 3 08:38:46 CET,0.0 0.525 0.799 1.029 1.187 1.333 1.476 1.611 1.834 1.945 2.059 2.08 2.332 2.414 2.573 2.72 2.865 2.942 3.079 3.198 3.371 3.478 3.589 3.771 3.937 4.081 4.222 4.358 4.555 4.748 4.913 5.117 5.318 5.523 5.758 6.021 6.295 6.62 6.944 7.258 7.621 8.045 8.52 8.992 9.548 10.15 10.834 11.607 12.519 13.57 14.802 15.707 16.09 16.291 16.365 16.369 16.335 16.234 16.085 15.922 15.801 15.687 15.538 15.355 15.182 15.033 14.863 14.716 14.616 14.524 14.407 14.299 14.189 14.066 13.964 13.864 13.771 13.673 13.561 13.483 13.398 13.232 13.11 12.994 12.936 12.822 12.694 12.543 12.466 12.224 12.207 12.119 12.032 11.839 11.721 11.576 11.421 11.254 11.042 10.753 9.922 -2 ,23830 ,TETRA ,17668672,Fri Dec 3 06:51:29 CET,Fri Dec 3 08:38:54 CET,0.0 0.675 0.936 1.132 1.3 1.447 1.575 1.685 1.891 1.992 2.077 2.054 2.308 2.393 2.54 2.681 2.828 2.901 3.045 3.176 3.367 3.501 3.624 3.784 3.946 4.119 4.299 4.467 4.659 4.856 5.062 5.284 5.49 5.694 5.931 6.202 6.456 6.735 7.047 7.375 7.724 8.123 8.579 9.033 9.558 10.163 10.874 11.647 12.543 13.6 14.804 15.645 16.063 16.284 16.344 16.319 16.266 16.157 16.035 15.925 15.773 15.594 15.448 15.318 15.183 15.06 14.938 14.829 14.724 14.609 14.498 14.397 14.283 14.165 14.07 13.97 13.866 13.755 13.64 13.553 13.453 13.299 13.187 13.054 12.988 12.861 12.741 12.626 12.556 12.31 12.304 12.229 12.137 11.911 11.785 11.634 11.468 11.267 11.031 10.762 10.223 -3 ,644 ,TETRA ,17668673,Fri Dec 3 06:51:28 CET,Fri Dec 3 08:38:30 CET,0.0 0.524 0.785 0.974 1.123 1.272 1.401 1.517 1.733 1.828 1.923 1.973 2.253 2.337 2.497 2.664 2.824 2.898 3.045 3.197 3.415 3.552 3.679 3.865 4.051 4.221 4.378 4.529 4.727 4.915 5.085 5.284 5.501 5.725 5.974 6.245 6.491 6.77 7.077 7.394 7.727 8.106 8.564 9.011 9.533 10.131 10.833 11.632 12.513 13.543 14.74 15.546 15.918 16.103 16.17 16.142 16.077 15.995 15.868 15.735 15.62 15.504 15.36 15.206 15.078 14.951 14.794 14.668 14.577 14.463 14.322 14.204 14.092 13.965 13.847 13.731 13.61 13.483 13.368 13.291 13.205 13.066 12.963 12.84 12.775 12.656 12.523 12.385 12.316 12.073 12.059 11.957 11.839 11.598 11.459 11.32 11.173 10.982 10.751 10.442 9.673 -4 ,10449 ,TETRA ,17668674,Fri Dec 3 06:51:26 CET,Fri Dec 3 08:38:12 CET,0.0 0.686 0.938 1.157 1.349 1.489 1.602 1.719 1.928 2.024 2.132 2.163 2.426 2.517 2.696 2.861 3.014 3.087 3.231 3.373 3.572 3.701 3.832 4.025 4.202 4.358 4.506 4.652 4.837 5.023 5.204 5.408 5.611 5.819 6.068 6.343 6.597 6.874 7.194 7.534 7.867 8.265 8.763 9.254 9.82 10.427 11.112 11.887 12.817 13.904 15.107 16.038 16.474 16.65 16.724 16.72 16.654 16.573 16.493 16.386 16.272 16.166 16.053 15.935 15.826 15.727 15.607 15.481 15.376 15.26 15.134 15.036 14.922 14.811 14.735 14.623 14.487 14.349 14.216 14.132 14.037 13.876 13.771 13.661 13.6 13.476 13.347 13.203 13.126 12.893 12.906 12.817 12.697 12.422 12.294 12.179 12.052 11.902 11.705 11.454 10.817 -5 ,634 ,TETRA ,17668675,Fri Dec 3 06:51:28 CET,Fri Dec 3 08:38:11 CET,0.0 0.651 0.966 1.193 1.367 1.518 1.659 1.791 2.016 2.123 2.225 2.237 2.502 2.589 2.761 2.935 3.098 3.17 3.308 3.44 3.635 3.77 3.895 4.067 4.235 4.394 4.541 4.681 4.873 5.077 5.261 5.468 5.692 5.923 6.177 6.459 6.74 7.051 7.386 7.717 8.069 8.492 8.985 9.469 9.997 10.595 11.304 12.13 13.089 14.132 15.287 16.176 16.482 16.571 16.616 16.59 16.542 16.48 16.411 16.318 16.208 16.086 15.95 15.819 15.71 15.6 15.473 15.352 15.218 15.06 14.908 14.787 14.66 14.516 14.406 14.302 14.19 14.065 13.941 13.871 13.79 13.621 13.499 13.383 13.33 13.226 13.092 12.923 12.837 12.587 12.569 12.486 12.39 12.163 12.041 11.896 11.74 11.587 11.378 11.101 10.491 -6 ,30937 ,TETRA ,17668676,Fri Dec 3 06:51:26 CET,Fri Dec 3 08:39:23 CET,0.0 0.566 0.857 1.07 1.231 1.377 1.511 1.624 1.853 1.974 2.073 2.065 2.325 2.413 2.589 2.758 2.922 2.996 3.117 3.233 3.418 3.548 3.683 3.872 4.026 4.169 4.31 4.453 4.658 4.865 5.058 5.289 5.499 5.711 5.969 6.237 6.487 6.744 7.03 7.364 7.723 8.103 8.553 9.014 9.534 10.134 10.854 11.641 12.567 13.677 14.896 15.779 16.203 16.409 16.474 16.455 16.4 16.324 16.215 16.075 15.932 15.804 15.687 15.574 15.472 15.364 15.245 15.14 15.046 14.927 14.788 14.665 14.551 14.43 14.322 14.208 14.091 13.973 13.831 13.742 13.661 13.491 13.368 13.258 13.203 13.081 12.95 12.81 12.732 12.488 12.472 12.368 12.249 12.021 11.899 11.751 11.567 11.385 11.208 10.988 10.356 -7 ,30987 ,TETRA ,17668677,Fri Dec 3 06:51:26 CET,Fri Dec 3 08:39:18 CET,0.0 0.676 0.932 1.132 1.299 1.426 1.544 1.661 1.873 1.977 2.08 2.106 2.365 2.453 2.625 2.773 2.917 2.994 3.152 3.299 3.504 3.638 3.77 3.964 4.15 4.318 4.483 4.65 4.861 5.058 5.256 5.507 5.746 5.976 6.218 6.478 6.762 7.091 7.412 7.726 8.056 8.444 8.91 9.358 9.883 10.479 11.144 11.924 12.841 13.866 15.066 15.96 16.402 16.584 16.66 16.661 16.591 16.509 16.414 16.298 16.185 16.076 15.94 15.798 15.655 15.499 15.357 15.242 15.107 14.948 14.791 14.664 14.546 14.427 14.332 14.222 14.113 14.01 13.868 13.771 13.685 13.538 13.424 13.301 13.245 13.123 12.993 12.849 12.765 12.514 12.466 12.358 12.25 12.007 11.874 11.747 11.613 11.465 11.259 10.957 9.962 -8 ,21608 ,TETRA ,17668678,Fri Dec 3 06:51:28 CET,Fri Dec 3 08:39:04 CET,0.0 0.626 0.914 1.147 1.337 1.479 1.614 1.757 2.01 2.109 2.199 2.21 2.471 2.551 2.7 2.836 2.981 3.055 3.182 3.316 3.517 3.633 3.745 3.905 4.062 4.231 4.41 4.571 4.767 4.973 5.184 5.451 5.692 5.898 6.148 6.463 6.756 7.038 7.33 7.641 7.971 8.354 8.847 9.338 9.87 10.468 11.149 11.908 12.812 13.856 15.08 15.986 16.366 16.503 16.532 16.537 16.515 16.442 16.338 16.219 16.101 15.98 15.848 15.7 15.566 15.432 15.274 15.155 15.045 14.918 14.799 14.689 14.55 14.401 14.293 14.192 14.083 13.973 13.853 13.765 13.672 13.511 13.4 13.289 13.232 13.109 12.966 12.813 12.73 12.479 12.477 12.399 12.307 12.094 11.98 11.861 11.709 11.51 11.304 11.053 10.415 -9 ,17914 ,TETRA ,17668679,Fri Dec 3 06:51:29 CET,Fri Dec 3 08:38:36 CET,0.0 0.573 0.881 1.122 1.299 1.454 1.584 1.701 1.931 2.033 2.133 2.162 2.425 2.508 2.675 2.827 2.97 3.047 3.186 3.318 3.517 3.642 3.758 3.938 4.124 4.298 4.462 4.614 4.802 4.975 5.143 5.358 5.575 5.782 6.019 6.286 6.53 6.792 7.072 7.391 7.74 8.115 8.57 9.032 9.569 10.158 10.838 11.594 12.467 13.499 14.648 15.506 15.94 16.125 16.157 16.045 15.943 15.889 15.809 15.713 15.599 15.457 15.283 15.101 14.949 14.827 14.693 14.566 14.463 14.344 14.204 14.099 13.994 13.871 13.765 13.656 13.552 13.447 13.336 13.255 13.166 13.024 12.937 12.838 12.78 12.664 12.533 12.396 12.321 12.082 12.087 11.998 11.906 11.71 11.598 11.467 11.322 11.146 10.931 10.665 9.796 -10 ,19370 ,TETRA ,17668680,Fri Dec 3 06:51:26 CET,Fri Dec 3 08:38:25 CET,0.0 0.595 0.833 1.01 1.161 1.315 1.458 1.586 1.834 1.956 2.068 2.115 2.379 2.467 2.657 2.837 2.991 3.057 3.188 3.312 3.49 3.615 3.745 3.94 4.122 4.286 4.452 4.613 4.808 4.981 5.166 5.415 5.646 5.852 6.098 6.418 6.724 7.027 7.336 7.654 7.985 8.345 8.79 9.278 9.838 10.43 11.084 11.846 12.751 13.772 15.024 15.943 16.353 16.542 16.571 16.557 16.541 16.474 16.371 16.256 16.171 16.076 15.965 15.855 15.702 15.547 15.419 15.278 15.136 14.984 14.821 14.679 14.524 14.373 14.251 14.141 14.042 13.922 13.806 13.712 13.618 13.493 13.39 13.274 13.216 13.087 12.945 12.812 12.747 12.515 12.502 12.412 12.331 12.142 12.014 11.876 11.716 11.53 11.311 11.0 9.975 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5n_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5n_3b.txt deleted file mode 100644 index 9fb99140..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5n_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16494 ,KEBNE ,17028436,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:50:12 CET,0.0 0.465 0.655 0.81 0.965 1.106 1.238 1.368 1.572 1.652 1.734 1.735 1.989 2.073 2.235 2.384 2.519 2.584 2.714 2.852 3.061 3.188 3.312 3.49 3.651 3.801 3.949 4.102 4.299 4.481 4.654 4.878 5.107 5.314 5.542 5.809 6.077 6.369 6.687 7.024 7.378 7.768 8.201 8.61 9.062 9.566 10.141 10.793 11.532 12.301 12.968 13.189 13.135 12.986 12.758 12.428 12.084 11.773 11.498 11.202 10.912 10.633 10.38 10.144 9.906 9.661 9.376 9.13 8.944 8.762 8.556 8.371 8.158 7.938 7.765 7.562 7.369 7.197 7.004 6.856 6.708 6.463 6.29 6.113 6.019 5.831 5.644 5.434 5.316 5.036 4.9 4.747 4.587 4.267 4.101 3.904 3.656 3.374 3.004 2.476 0.709 -2 ,32585 ,KEBNE ,17028437,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:49:54 CET,0.0 0.427 0.647 0.836 1.001 1.129 1.25 1.367 1.59 1.695 1.791 1.803 2.045 2.121 2.259 2.389 2.526 2.593 2.729 2.864 3.05 3.165 3.279 3.445 3.614 3.776 3.92 4.063 4.248 4.417 4.599 4.825 5.041 5.266 5.515 5.763 6.005 6.306 6.633 6.979 7.343 7.737 8.174 8.584 9.072 9.643 10.266 10.889 11.57 12.327 13.084 13.477 13.374 13.018 12.677 12.349 12.022 11.687 11.367 11.018 10.709 10.446 10.189 9.92 9.65 9.41 9.189 8.987 8.796 8.576 8.316 8.098 7.879 7.668 7.509 7.336 7.161 6.981 6.793 6.658 6.509 6.276 6.117 5.942 5.846 5.659 5.471 5.264 5.151 4.881 4.77 4.632 4.48 4.123 3.92 3.695 3.455 3.18 2.854 2.377 0.737 -3 ,2365 ,KEBNE ,17028441,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:49:43 CET,0.0 0.461 0.731 0.94 1.113 1.26 1.39 1.509 1.736 1.843 1.941 1.945 2.192 2.276 2.426 2.58 2.729 2.797 2.931 3.065 3.28 3.414 3.537 3.7 3.862 4.02 4.164 4.318 4.523 4.719 4.909 5.128 5.325 5.514 5.742 6.008 6.273 6.563 6.884 7.211 7.523 7.864 8.28 8.729 9.236 9.787 10.442 11.149 11.878 12.586 13.146 13.323 13.207 12.901 12.549 12.243 11.951 11.639 11.335 10.994 10.704 10.429 10.13 9.837 9.568 9.318 9.058 8.835 8.644 8.451 8.233 8.025 7.822 7.636 7.48 7.305 7.124 6.924 6.7 6.554 6.424 6.211 6.054 5.887 5.794 5.591 5.36 5.123 5.002 4.726 4.619 4.474 4.307 3.946 3.741 3.505 3.236 2.93 2.604 2.142 -0.416 -4 ,9125 ,KEBNE ,17028442,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:51:33 CET,0.0 0.631 0.879 1.049 1.228 1.413 1.568 1.693 1.916 2.022 2.117 2.119 2.363 2.439 2.601 2.757 2.903 2.978 3.117 3.237 3.418 3.533 3.641 3.815 3.993 4.16 4.312 4.452 4.639 4.823 5.006 5.233 5.453 5.663 5.896 6.147 6.398 6.683 6.971 7.287 7.63 8.013 8.482 8.926 9.431 10.003 10.653 11.355 12.107 12.847 13.45 13.686 13.602 13.386 13.106 12.799 12.497 12.174 11.86 11.53 11.228 10.951 10.671 10.38 10.126 9.914 9.662 9.418 9.219 9.007 8.784 8.608 8.422 8.205 8.028 7.856 7.676 7.485 7.272 7.109 6.936 6.701 6.543 6.375 6.28 6.068 5.875 5.68 5.565 5.29 5.183 5.05 4.904 4.569 4.379 4.169 3.924 3.628 3.268 2.753 0.37 -5 ,13588 ,KEBNE ,17028443,Wed Dec 22 20:16:25 CET,Wed Dec 22 21:51:44 CET,0.0 0.327 0.536 0.712 0.878 0.996 1.112 1.239 1.45 1.547 1.652 1.685 1.939 2.015 2.154 2.299 2.451 2.526 2.671 2.804 3.001 3.128 3.246 3.425 3.587 3.746 3.904 4.059 4.262 4.453 4.643 4.866 5.068 5.272 5.496 5.746 6.016 6.307 6.613 6.951 7.306 7.709 8.142 8.566 9.052 9.568 10.186 10.856 11.583 12.335 12.945 13.035 12.801 12.529 12.249 11.901 11.536 11.178 10.838 10.489 10.181 9.886 9.603 9.331 9.057 8.807 8.565 8.357 8.169 7.954 7.725 7.528 7.316 7.093 6.927 6.76 6.584 6.402 6.193 6.045 5.895 5.667 5.5 5.319 5.228 5.024 4.81 4.589 4.475 4.206 4.112 3.964 3.793 3.425 3.212 2.979 2.741 2.457 2.04 1.437 -0.649 -6 ,30769 ,KEBNE ,17028444,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:51:43 CET,0.0 0.415 0.66 0.856 1.046 1.209 1.33 1.446 1.65 1.743 1.844 1.872 2.12 2.198 2.354 2.504 2.641 2.711 2.845 2.968 3.15 3.265 3.377 3.542 3.709 3.876 4.03 4.177 4.361 4.533 4.71 4.918 5.115 5.308 5.532 5.778 6.014 6.275 6.544 6.852 7.199 7.577 8.019 8.469 9.001 9.547 10.088 10.69 11.4 12.079 12.644 12.792 12.587 12.296 11.981 11.643 11.314 10.995 10.694 10.387 10.1 9.803 9.525 9.284 9.052 8.817 8.564 8.346 8.154 7.95 7.731 7.549 7.338 7.101 6.926 6.75 6.559 6.36 6.159 6.006 5.832 5.567 5.398 5.231 5.138 4.927 4.72 4.513 4.403 4.138 4.051 3.916 3.772 3.416 3.206 3.002 2.73 2.412 2.07 1.502 -0.916 -7 ,2076 ,KEBNE ,17028445,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:49:48 CET,0.0 0.442 0.664 0.858 1.023 1.158 1.287 1.411 1.637 1.735 1.824 1.828 2.074 2.159 2.324 2.467 2.596 2.665 2.809 2.94 3.117 3.23 3.341 3.513 3.687 3.849 4.001 4.153 4.343 4.521 4.698 4.904 5.117 5.339 5.599 5.878 6.128 6.391 6.677 6.976 7.296 7.69 8.131 8.568 9.085 9.644 10.275 10.983 11.744 12.545 13.283 13.527 13.457 13.233 12.895 12.534 12.205 11.886 11.574 11.233 10.955 10.703 10.438 10.168 9.918 9.684 9.441 9.239 9.052 8.841 8.621 8.445 8.248 8.031 7.864 7.693 7.515 7.322 7.118 6.974 6.824 6.602 6.447 6.276 6.189 6.012 5.799 5.574 5.466 5.199 5.093 4.935 4.761 4.376 4.179 3.986 3.761 3.453 3.069 2.571 0.44 -8 ,14008 ,KEBNE ,17028446,Wed Dec 22 20:16:26 CET,Wed Dec 22 21:49:33 CET,0.0 0.399 0.623 0.809 0.965 1.107 1.241 1.367 1.573 1.673 1.776 1.8 2.048 2.125 2.267 2.402 2.531 2.593 2.719 2.853 3.045 3.165 3.278 3.445 3.62 3.793 3.956 4.107 4.308 4.499 4.682 4.909 5.124 5.33 5.568 5.83 6.074 6.347 6.647 6.945 7.258 7.631 8.078 8.524 9.016 9.553 10.164 10.839 11.597 12.369 13.078 13.398 13.269 12.987 12.661 12.31 11.941 11.55 11.215 10.873 10.557 10.27 9.998 9.748 9.505 9.276 9.029 8.795 8.577 8.35 8.116 7.923 7.729 7.515 7.344 7.176 6.995 6.811 6.612 6.463 6.317 6.071 5.904 5.724 5.625 5.428 5.222 5.012 4.9 4.632 4.528 4.394 4.251 3.917 3.726 3.516 3.271 2.977 2.602 2.081 -0.336 -9 ,12069 ,KEBNE ,17028447,Wed Dec 22 20:16:24 CET,Wed Dec 22 21:50:15 CET,0.0 0.498 0.738 0.931 1.113 1.27 1.4 1.52 1.726 1.817 1.907 1.936 2.195 2.279 2.424 2.557 2.696 2.76 2.893 3.029 3.22 3.34 3.45 3.618 3.781 3.937 4.088 4.231 4.42 4.595 4.761 4.978 5.21 5.436 5.678 5.944 6.203 6.493 6.804 7.124 7.466 7.851 8.301 8.725 9.208 9.743 10.335 11.007 11.787 12.588 13.256 13.477 13.319 13.012 12.684 12.314 11.966 11.655 11.369 11.03 10.709 10.406 10.112 9.831 9.581 9.369 9.123 8.89 8.693 8.483 8.25 8.055 7.858 7.651 7.484 7.319 7.129 6.926 6.738 6.596 6.446 6.221 6.061 5.888 5.801 5.633 5.426 5.193 5.076 4.805 4.694 4.55 4.385 4.003 3.807 3.581 3.288 2.953 2.584 2.097 0.184 -10 ,28554 ,KEBNE ,17028448,Wed Dec 22 20:18:27 CET,Wed Dec 22 21:51:57 CET,0.0 0.408 0.646 0.846 1.027 1.173 1.295 1.418 1.652 1.748 1.832 1.841 2.09 2.174 2.338 2.473 2.595 2.664 2.801 2.925 3.088 3.189 3.293 3.465 3.633 3.79 3.94 4.08 4.263 4.432 4.593 4.8 5.002 5.197 5.43 5.689 5.931 6.201 6.486 6.772 7.071 7.423 7.836 8.248 8.73 9.3 9.943 10.638 11.349 11.959 12.535 12.701 12.582 12.365 12.078 11.724 11.344 10.982 10.666 10.331 10.043 9.802 9.56 9.302 9.045 8.818 8.548 8.299 8.099 7.895 7.679 7.481 7.276 7.077 6.929 6.763 6.575 6.383 6.184 6.04 5.884 5.659 5.505 5.332 5.245 5.053 4.82 4.598 4.481 4.195 4.066 3.923 3.774 3.447 3.267 3.08 2.862 2.574 2.186 1.607 -0.503 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5m.txt deleted file mode 100644 index bcf34691..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17915 ,TETRA ,17668681,Fri Dec 3 06:51:26 CET,Fri Dec 3 08:41:03 CET,0.0 0.501 0.726 0.887 1.0 1.098 1.19 1.274 1.453 1.539 1.621 1.614 1.841 1.898 1.994 2.094 2.202 2.25 2.348 2.437 2.564 2.652 2.734 2.846 2.965 3.08 3.181 3.273 3.398 3.52 3.637 3.775 3.899 4.013 4.138 4.267 4.365 4.477 4.639 4.816 4.963 5.097 5.257 5.432 5.627 5.788 5.9 5.896 5.718 5.318 4.382 3.034 1.79 0.709 -0.237 -1.073 -1.809 -2.497 -3.125 -3.775 -4.332 -4.825 -5.324 -5.799 -6.234 -6.615 -7.014 -7.394 -7.71 -8.028 -8.356 -8.638 -8.95 -9.269 -9.515 -9.768 -10.029 -10.301 -10.584 -10.785 -10.991 -11.311 -11.525 -11.748 -11.87 -12.133 -12.435 -12.766 -12.925 -13.265 -13.461 -13.654 -13.874 -14.37 -14.637 -14.928 -15.255 -15.62 -16.057 -16.687 -19.373 -2 ,28739 ,TETRA ,17668682,Fri Dec 3 06:51:28 CET,Fri Dec 3 08:40:54 CET,0.0 0.458 0.643 0.798 0.93 1.044 1.14 1.224 1.398 1.472 1.543 1.519 1.744 1.807 1.929 2.04 2.155 2.213 2.313 2.403 2.522 2.595 2.667 2.765 2.859 2.958 3.052 3.139 3.251 3.365 3.482 3.616 3.731 3.842 3.962 4.079 4.207 4.372 4.55 4.72 4.892 5.067 5.226 5.379 5.546 5.664 5.741 5.781 5.698 5.319 4.361 3.008 1.799 0.697 -0.286 -1.235 -2.107 -2.836 -3.467 -4.134 -4.711 -5.24 -5.738 -6.198 -6.625 -7.007 -7.396 -7.769 -8.105 -8.442 -8.806 -9.096 -9.383 -9.714 -9.98 -10.246 -10.531 -10.828 -11.116 -11.298 -11.512 -11.872 -12.123 -12.376 -12.505 -12.78 -13.057 -13.355 -13.502 -13.826 -13.983 -14.148 -14.34 -14.798 -15.045 -15.327 -15.635 -16.0 -16.513 -17.183 -19.738 -3 ,7800 ,TETRA ,17668683,Fri Dec 3 06:51:31 CET,Fri Dec 3 08:40:42 CET,0.0 0.399 0.592 0.717 0.828 0.95 1.072 1.171 1.354 1.446 1.527 1.511 1.742 1.806 1.914 2.025 2.137 2.19 2.289 2.377 2.491 2.567 2.647 2.752 2.85 2.96 3.065 3.156 3.283 3.404 3.505 3.632 3.778 3.916 4.056 4.198 4.33 4.481 4.643 4.791 4.911 5.052 5.247 5.412 5.578 5.71 5.787 5.831 5.756 5.419 4.562 3.256 2.001 0.915 -0.028 -0.903 -1.694 -2.404 -3.018 -3.634 -4.178 -4.685 -5.135 -5.552 -5.954 -6.318 -6.713 -7.085 -7.409 -7.746 -8.082 -8.354 -8.671 -8.994 -9.22 -9.456 -9.705 -9.961 -10.225 -10.421 -10.626 -10.975 -11.234 -11.478 -11.597 -11.858 -12.139 -12.451 -12.615 -12.938 -13.085 -13.248 -13.426 -13.87 -14.137 -14.428 -14.771 -15.143 -15.551 -16.117 -18.577 -4 ,17757 ,TETRA ,17668684,Fri Dec 3 06:51:32 CET,Fri Dec 3 08:40:26 CET,0.0 0.318 0.477 0.662 0.84 0.966 1.06 1.15 1.336 1.413 1.486 1.476 1.708 1.773 1.891 1.999 2.099 2.149 2.256 2.361 2.505 2.595 2.676 2.784 2.895 3.008 3.111 3.212 3.335 3.456 3.589 3.733 3.843 3.961 4.109 4.258 4.382 4.502 4.637 4.781 4.912 5.082 5.286 5.445 5.615 5.761 5.848 5.911 5.85 5.508 4.718 3.423 2.19 1.117 0.12 -0.79 -1.635 -2.443 -3.097 -3.759 -4.346 -4.859 -5.331 -5.805 -6.259 -6.631 -7.004 -7.375 -7.713 -8.053 -8.388 -8.661 -8.946 -9.257 -9.518 -9.782 -10.027 -10.285 -10.569 -10.759 -10.96 -11.289 -11.517 -11.75 -11.872 -12.117 -12.38 -12.672 -12.838 -13.184 -13.375 -13.551 -13.747 -14.217 -14.459 -14.711 -15.021 -15.424 -15.901 -16.561 -19.142 -5 ,11877 ,TETRA ,17668685,Fri Dec 3 06:51:26 CET,Fri Dec 3 08:40:32 CET,0.0 0.498 0.699 0.868 1.025 1.153 1.249 1.344 1.527 1.605 1.674 1.65 1.882 1.948 2.076 2.199 2.316 2.372 2.473 2.569 2.696 2.772 2.846 2.951 3.06 3.169 3.268 3.368 3.504 3.632 3.748 3.883 4.006 4.125 4.275 4.443 4.587 4.746 4.905 5.037 5.162 5.301 5.484 5.647 5.814 5.982 6.097 6.174 6.113 5.745 4.783 3.433 2.202 1.083 0.072 -0.874 -1.706 -2.472 -3.139 -3.76 -4.296 -4.828 -5.346 -5.833 -6.266 -6.633 -7.049 -7.445 -7.779 -8.101 -8.431 -8.704 -9.0 -9.331 -9.585 -9.835 -10.086 -10.354 -10.637 -10.842 -11.059 -11.409 -11.643 -11.876 -11.999 -12.259 -12.537 -12.842 -13.0 -13.341 -13.565 -13.765 -13.96 -14.424 -14.696 -14.977 -15.302 -15.71 -16.222 -16.927 -20.409 -6 ,31585 ,TETRA ,17668686,Fri Dec 3 06:51:28 CET,Fri Dec 3 08:40:19 CET,0.0 0.298 0.396 0.497 0.608 0.699 0.785 0.881 1.078 1.161 1.228 1.198 1.425 1.491 1.609 1.717 1.817 1.865 1.967 2.056 2.184 2.272 2.357 2.481 2.591 2.687 2.788 2.877 2.99 3.104 3.21 3.357 3.503 3.621 3.741 3.892 4.04 4.171 4.31 4.462 4.607 4.751 4.916 5.064 5.197 5.292 5.337 5.322 5.151 4.755 3.831 2.473 1.187 0.03 -0.989 -1.928 -2.751 -3.508 -4.144 -4.763 -5.291 -5.785 -6.274 -6.733 -7.143 -7.522 -7.947 -8.339 -8.689 -9.012 -9.342 -9.643 -9.952 -10.248 -10.468 -10.701 -10.961 -11.252 -11.546 -11.728 -11.929 -12.296 -12.551 -12.803 -12.935 -13.193 -13.454 -13.748 -13.901 -14.25 -14.472 -14.676 -14.88 -15.291 -15.531 -15.803 -16.095 -16.487 -17.029 -17.723 -21.054 -7 ,10146 ,TETRA ,17668687,Fri Dec 3 06:52:26 CET,Fri Dec 3 08:41:10 CET,0.0 0.276 0.462 0.635 0.754 0.868 0.959 1.044 1.224 1.305 1.377 1.346 1.566 1.622 1.728 1.835 1.934 1.979 2.073 2.17 2.31 2.398 2.484 2.61 2.722 2.821 2.911 2.99 3.101 3.217 3.323 3.441 3.574 3.705 3.837 3.99 4.137 4.284 4.433 4.6 4.744 4.877 5.059 5.224 5.351 5.452 5.564 5.643 5.529 5.116 4.276 3.029 1.828 0.716 -0.264 -1.172 -2.012 -2.804 -3.473 -4.118 -4.657 -5.153 -5.645 -6.12 -6.548 -6.933 -7.367 -7.768 -8.127 -8.506 -8.868 -9.162 -9.477 -9.781 -10.035 -10.31 -10.588 -10.877 -11.173 -11.376 -11.58 -11.893 -12.118 -12.366 -12.496 -12.776 -13.084 -13.397 -13.554 -13.887 -14.079 -14.274 -14.468 -14.891 -15.143 -15.427 -15.728 -16.096 -16.584 -17.236 -19.465 -8 ,3753 ,TETRA ,17668688,Fri Dec 3 06:52:26 CET,Fri Dec 3 08:42:28 CET,0.0 0.444 0.646 0.801 0.915 1.013 1.112 1.206 1.381 1.456 1.53 1.519 1.746 1.813 1.95 2.071 2.188 2.241 2.329 2.413 2.532 2.608 2.695 2.811 2.908 3.002 3.098 3.205 3.334 3.443 3.559 3.696 3.812 3.926 4.057 4.201 4.345 4.505 4.659 4.812 4.966 5.124 5.303 5.469 5.642 5.809 5.93 5.968 5.85 5.444 4.512 3.105 1.863 0.682 -0.367 -1.335 -2.203 -2.968 -3.607 -4.241 -4.81 -5.324 -5.828 -6.322 -6.766 -7.146 -7.547 -7.925 -8.252 -8.585 -8.926 -9.223 -9.544 -9.867 -10.118 -10.371 -10.626 -10.885 -11.162 -11.364 -11.582 -11.92 -12.167 -12.418 -12.543 -12.81 -13.084 -13.381 -13.536 -13.868 -14.039 -14.228 -14.438 -14.889 -15.149 -15.46 -15.788 -16.138 -16.605 -17.249 -20.935 -9 ,18445 ,TETRA ,17668689,Fri Dec 3 06:53:26 CET,Fri Dec 3 08:42:04 CET,0.0 0.526 0.729 0.893 1.044 1.16 1.252 1.331 1.463 1.525 1.592 1.584 1.824 1.887 1.992 2.093 2.188 2.232 2.318 2.403 2.525 2.603 2.673 2.773 2.873 2.969 3.07 3.163 3.269 3.37 3.469 3.591 3.704 3.803 3.919 4.077 4.238 4.393 4.538 4.688 4.839 5.015 5.202 5.348 5.503 5.635 5.693 5.738 5.727 5.411 4.562 3.183 1.866 0.703 -0.289 -1.16 -1.926 -2.661 -3.322 -3.98 -4.536 -5.022 -5.504 -5.984 -6.422 -6.815 -7.226 -7.595 -7.914 -8.248 -8.602 -8.89 -9.18 -9.49 -9.725 -9.971 -10.251 -10.547 -10.853 -11.054 -11.257 -11.579 -11.81 -12.058 -12.189 -12.47 -12.755 -13.057 -13.219 -13.561 -13.753 -13.953 -14.16 -14.581 -14.817 -15.074 -15.383 -15.78 -16.253 -16.95 -19.975 -10 ,30102 ,TETRA ,17668690,Fri Dec 3 06:53:27 CET,Fri Dec 3 08:42:14 CET,0.0 0.431 0.652 0.831 0.95 1.051 1.141 1.235 1.438 1.525 1.596 1.575 1.804 1.865 1.979 2.081 2.182 2.229 2.324 2.415 2.538 2.619 2.693 2.805 2.913 3.008 3.105 3.198 3.313 3.421 3.523 3.646 3.75 3.838 3.955 4.105 4.248 4.402 4.561 4.699 4.837 4.996 5.172 5.328 5.47 5.603 5.689 5.7 5.606 5.316 4.508 3.253 2.043 0.923 -0.009 -0.823 -1.56 -2.258 -2.935 -3.663 -4.278 -4.801 -5.285 -5.765 -6.224 -6.632 -7.037 -7.383 -7.693 -8.015 -8.336 -8.61 -8.91 -9.215 -9.462 -9.725 -9.981 -10.251 -10.531 -10.727 -10.941 -11.291 -11.534 -11.783 -11.915 -12.169 -12.424 -12.706 -12.869 -13.199 -13.379 -13.593 -13.82 -14.339 -14.615 -14.892 -15.236 -15.64 -16.129 -16.809 -19.786 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5n.txt deleted file mode 100644 index 4a366549..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7977 ,TETRA ,17668691,Fri Dec 3 06:53:29 CET,Fri Dec 3 08:43:33 CET,0.0 1.571 1.94 2.199 2.433 2.645 2.854 3.036 3.342 3.483 3.613 3.677 3.955 4.075 4.293 4.49 4.666 4.747 4.896 5.065 5.311 5.462 5.617 5.83 6.042 6.242 6.418 6.594 6.823 7.024 7.2 7.424 7.649 7.86 8.096 8.347 8.582 8.817 9.064 9.344 9.662 10.01 10.35 10.71 11.111 11.48 11.844 12.176 12.517 12.745 12.632 12.114 11.435 10.783 10.163 9.535 8.984 8.463 7.967 7.463 7.031 6.657 6.283 5.904 5.571 5.244 4.877 4.578 4.303 4.01 3.719 3.478 3.226 2.961 2.774 2.574 2.345 2.09 1.836 1.667 1.478 1.181 0.976 0.743 0.626 0.403 0.157 -0.117 -0.262 -0.574 -0.707 -0.871 -1.045 -1.39 -1.57 -1.793 -2.069 -2.361 -2.714 -3.227 -5.313 -2 ,28923 ,TETRA ,17668692,Fri Dec 3 06:53:32 CET,Fri Dec 3 08:43:04 CET,0.0 1.95 2.385 2.721 2.968 3.153 3.345 3.54 3.858 3.994 4.122 4.202 4.484 4.586 4.786 4.981 5.159 5.254 5.444 5.614 5.828 5.96 6.091 6.28 6.459 6.627 6.795 6.957 7.187 7.423 7.644 7.893 8.121 8.351 8.635 8.928 9.159 9.408 9.681 9.982 10.311 10.682 11.057 11.372 11.728 12.119 12.5 12.866 13.205 13.382 13.316 12.866 12.27 11.641 11.034 10.411 9.828 9.305 8.822 8.34 7.943 7.574 7.206 6.853 6.526 6.225 5.892 5.598 5.354 5.09 4.81 4.592 4.357 4.081 3.871 3.654 3.422 3.181 2.934 2.771 2.601 2.311 2.114 1.89 1.759 1.511 1.269 1.017 0.892 0.586 0.436 0.271 0.105 -0.246 -0.48 -0.791 -1.102 -1.455 -1.859 -2.387 -4.748 -3 ,14869 ,TETRA ,17668693,Fri Dec 3 06:53:26 CET,Fri Dec 3 08:43:09 CET,0.0 1.454 1.828 2.17 2.539 2.805 2.99 3.162 3.487 3.616 3.736 3.817 4.085 4.199 4.398 4.572 4.76 4.847 5.02 5.185 5.412 5.544 5.678 5.887 6.069 6.234 6.399 6.561 6.769 6.967 7.16 7.388 7.594 7.798 8.037 8.298 8.552 8.822 9.122 9.429 9.736 10.108 10.518 10.877 11.23 11.551 11.897 12.219 12.529 12.823 12.804 12.304 11.622 10.909 10.295 9.758 9.266 8.781 8.344 7.883 7.491 7.108 6.731 6.395 6.076 5.78 5.465 5.178 4.901 4.601 4.308 4.064 3.791 3.507 3.286 3.077 2.871 2.648 2.423 2.263 2.092 1.822 1.631 1.432 1.327 1.102 0.869 0.61 0.469 0.159 0.004 -0.162 -0.324 -0.662 -0.846 -1.06 -1.321 -1.693 -2.143 -2.611 -4.333 -4 ,29073 ,TETRA ,17668694,Fri Dec 3 06:53:29 CET,Fri Dec 3 08:43:05 CET,0.0 1.633 1.989 2.285 2.548 2.753 2.934 3.102 3.394 3.53 3.662 3.746 4.032 4.146 4.333 4.511 4.698 4.788 4.97 5.143 5.383 5.535 5.668 5.855 6.037 6.212 6.372 6.535 6.776 6.992 7.181 7.396 7.607 7.813 8.029 8.277 8.51 8.77 9.048 9.314 9.607 9.961 10.356 10.739 11.124 11.501 11.896 12.229 12.526 12.743 12.666 12.155 11.574 10.958 10.325 9.723 9.204 8.684 8.209 7.702 7.259 6.915 6.591 6.255 5.926 5.625 5.302 5.006 4.761 4.497 4.217 3.989 3.731 3.456 3.257 3.07 2.865 2.626 2.368 2.196 2.025 1.754 1.56 1.338 1.214 0.972 0.728 0.468 0.339 0.042 -0.085 -0.23 -0.37 -0.694 -0.895 -1.118 -1.36 -1.667 -2.021 -2.467 -4.918 -5 ,23035 ,TETRA ,17668695,Fri Dec 3 06:53:29 CET,Fri Dec 3 08:44:12 CET,0.0 1.824 2.175 2.447 2.694 2.923 3.121 3.273 3.605 3.775 3.921 4.007 4.281 4.396 4.613 4.805 4.986 5.074 5.244 5.394 5.601 5.741 5.878 6.062 6.249 6.434 6.602 6.754 6.952 7.14 7.327 7.553 7.779 7.994 8.201 8.447 8.696 8.961 9.271 9.586 9.872 10.174 10.526 10.909 11.308 11.687 12.09 12.488 12.903 13.236 13.198 12.579 11.856 11.145 10.464 9.82 9.216 8.645 8.137 7.662 7.274 6.892 6.52 6.186 5.847 5.534 5.2 4.915 4.682 4.415 4.135 3.903 3.644 3.368 3.148 2.927 2.705 2.476 2.233 2.047 1.849 1.551 1.352 1.142 1.032 0.822 0.585 0.309 0.163 -0.145 -0.288 -0.458 -0.634 -1.029 -1.26 -1.523 -1.795 -2.084 -2.441 -2.952 -4.989 -6 ,27479 ,TETRA ,17668696,Fri Dec 3 06:53:26 CET,Fri Dec 3 08:43:53 CET,0.0 1.827 2.243 2.563 2.835 3.047 3.236 3.416 3.707 3.839 3.989 4.073 4.342 4.447 4.655 4.876 5.071 5.154 5.306 5.453 5.684 5.838 5.979 6.193 6.391 6.589 6.789 6.967 7.19 7.395 7.58 7.804 8.032 8.261 8.501 8.733 8.957 9.201 9.439 9.725 10.007 10.289 10.634 10.939 11.283 11.723 12.155 12.561 12.994 13.288 13.312 12.822 12.167 11.471 10.852 10.258 9.697 9.18 8.701 8.21 7.775 7.37 6.99 6.644 6.281 5.953 5.644 5.352 5.096 4.826 4.534 4.297 4.046 3.766 3.556 3.344 3.107 2.851 2.594 2.427 2.248 1.933 1.719 1.518 1.415 1.173 0.91 0.654 0.521 0.231 0.11 -0.062 -0.249 -0.602 -0.78 -0.995 -1.263 -1.581 -2.045 -2.722 -4.766 -7 ,21257 ,TETRA ,17668697,Fri Dec 3 06:53:26 CET,Fri Dec 3 08:43:42 CET,0.0 1.297 1.69 2.07 2.374 2.585 2.766 2.939 3.257 3.396 3.51 3.571 3.842 3.947 4.173 4.396 4.597 4.683 4.838 4.98 5.192 5.334 5.473 5.673 5.862 6.037 6.197 6.36 6.563 6.771 6.99 7.241 7.471 7.708 7.968 8.23 8.485 8.757 9.046 9.381 9.742 10.078 10.391 10.732 11.122 11.469 11.851 12.232 12.559 12.773 12.697 12.231 11.619 11.02 10.38 9.699 9.127 8.609 8.133 7.64 7.215 6.833 6.46 6.115 5.796 5.489 5.126 4.787 4.503 4.217 3.923 3.661 3.38 3.11 2.911 2.683 2.445 2.208 1.942 1.747 1.556 1.28 1.09 0.891 0.78 0.541 0.287 0.031 -0.092 -0.391 -0.547 -0.716 -0.888 -1.277 -1.488 -1.715 -1.976 -2.268 -2.655 -3.159 -6.558 -8 ,3103 ,TETRA ,17668698,Fri Dec 3 06:53:28 CET,Fri Dec 3 08:43:40 CET,0.0 1.17 1.494 1.786 2.027 2.23 2.429 2.615 2.926 3.05 3.17 3.266 3.549 3.655 3.85 4.033 4.211 4.29 4.435 4.583 4.816 4.97 5.112 5.304 5.473 5.624 5.792 5.966 6.175 6.378 6.568 6.789 6.999 7.21 7.467 7.737 7.993 8.255 8.499 8.742 9.003 9.294 9.597 9.899 10.267 10.652 11.014 11.352 11.658 11.859 11.767 11.207 10.557 9.975 9.371 8.722 8.123 7.525 7.013 6.494 5.996 5.537 5.136 4.765 4.402 4.094 3.781 3.482 3.218 2.952 2.656 2.39 2.131 1.877 1.673 1.47 1.25 1.008 0.762 0.595 0.412 0.118 -0.079 -0.272 -0.374 -0.609 -0.844 -1.07 -1.188 -1.48 -1.607 -1.756 -1.894 -2.219 -2.423 -2.662 -2.929 -3.247 -3.64 -4.156 -6.568 -9 ,7634 ,TETRA ,17668699,Fri Dec 3 06:53:29 CET,Fri Dec 3 08:43:30 CET,0.0 1.796 2.247 2.59 2.849 3.051 3.243 3.432 3.743 3.868 3.984 4.043 4.326 4.437 4.634 4.821 4.985 5.056 5.194 5.34 5.579 5.74 5.882 6.07 6.262 6.45 6.617 6.795 7.027 7.252 7.459 7.672 7.891 8.109 8.364 8.649 8.889 9.135 9.411 9.706 10.0 10.32 10.681 11.085 11.538 11.908 12.255 12.611 12.968 13.232 13.19 12.597 11.839 11.113 10.415 9.794 9.215 8.619 8.098 7.614 7.202 6.812 6.449 6.076 5.7 5.394 5.08 4.781 4.513 4.218 3.914 3.677 3.442 3.19 2.992 2.788 2.576 2.345 2.099 1.928 1.734 1.412 1.206 1.013 0.909 0.687 0.464 0.233 0.101 -0.212 -0.329 -0.463 -0.611 -0.962 -1.158 -1.39 -1.669 -1.977 -2.356 -2.887 -5.319 -10 ,12811 ,TETRA ,17668700,Fri Dec 3 06:53:32 CET,Fri Dec 3 08:42:52 CET,0.0 1.633 2.0 2.267 2.508 2.702 2.853 3.009 3.312 3.454 3.596 3.678 3.948 4.065 4.274 4.455 4.636 4.72 4.867 5.013 5.237 5.386 5.547 5.766 5.953 6.127 6.295 6.476 6.713 6.94 7.143 7.356 7.58 7.824 8.112 8.406 8.662 8.929 9.207 9.504 9.811 10.104 10.438 10.81 11.193 11.602 12.029 12.433 12.828 13.096 13.031 12.513 11.93 11.287 10.612 9.947 9.342 8.808 8.335 7.828 7.401 7.019 6.632 6.281 5.95 5.621 5.254 4.934 4.675 4.415 4.141 3.893 3.609 3.339 3.145 2.932 2.711 2.483 2.238 2.073 1.913 1.657 1.464 1.258 1.154 0.929 0.693 0.454 0.318 0.009 -0.14 -0.307 -0.474 -0.87 -1.095 -1.344 -1.617 -1.956 -2.355 -2.842 -4.903 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5p_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5p_3b.txt deleted file mode 100644 index bc83f03c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5p_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14883 ,TETRA ,17668701,Fri Dec 3 06:55:26 CET,Fri Dec 3 08:44:45 CET,0.0 0.358 0.624 0.839 0.989 1.115 1.245 1.381 1.609 1.709 1.814 1.836 2.085 2.168 2.322 2.485 2.643 2.714 2.855 2.995 3.195 3.323 3.449 3.623 3.793 3.967 4.133 4.293 4.494 4.679 4.87 5.103 5.314 5.523 5.775 6.056 6.316 6.606 6.93 7.277 7.654 8.066 8.505 8.957 9.501 10.076 10.677 11.308 11.967 12.704 13.513 13.869 13.782 13.513 13.223 12.875 12.532 12.212 11.905 11.576 11.264 10.979 10.709 10.433 10.162 9.89 9.6 9.37 9.178 8.961 8.722 8.524 8.294 8.045 7.851 7.64 7.439 7.244 7.028 6.868 6.707 6.46 6.276 6.072 5.963 5.738 5.513 5.28 5.148 4.856 4.709 4.547 4.366 3.937 3.671 3.386 3.103 2.755 2.314 1.718 -1.418 -2 ,16848 ,TETRA ,17668702,Fri Dec 3 06:55:29 CET,Fri Dec 3 08:44:38 CET,0.0 0.422 0.653 0.87 1.029 1.161 1.299 1.432 1.64 1.73 1.817 1.823 2.065 2.141 2.297 2.444 2.582 2.648 2.787 2.922 3.117 3.239 3.355 3.533 3.706 3.865 4.013 4.161 4.353 4.537 4.72 4.933 5.146 5.374 5.637 5.922 6.189 6.475 6.785 7.102 7.434 7.842 8.32 8.795 9.324 9.871 10.526 11.269 12.033 12.848 13.624 13.92 13.872 13.668 13.364 13.005 12.642 12.291 11.964 11.591 11.26 10.976 10.691 10.425 10.185 9.949 9.705 9.484 9.278 9.06 8.827 8.63 8.427 8.217 8.05 7.871 7.683 7.478 7.243 7.076 6.909 6.655 6.458 6.238 6.131 5.904 5.646 5.383 5.246 4.95 4.802 4.639 4.457 4.036 3.792 3.567 3.301 2.943 2.489 1.812 -1.61 -3 ,7084 ,TETRA ,17668703,Fri Dec 3 06:55:27 CET,Fri Dec 3 08:45:25 CET,0.0 0.508 0.751 0.938 1.08 1.201 1.331 1.466 1.657 1.744 1.84 1.857 2.108 2.189 2.341 2.498 2.648 2.718 2.864 3.001 3.203 3.333 3.453 3.632 3.812 3.979 4.139 4.296 4.49 4.681 4.867 5.093 5.314 5.53 5.78 6.062 6.326 6.622 6.972 7.333 7.692 8.114 8.608 9.102 9.646 10.201 10.842 11.586 12.365 13.175 14.054 14.463 14.385 14.153 13.844 13.464 13.122 12.824 12.529 12.204 11.924 11.638 11.349 11.078 10.83 10.599 10.345 10.125 9.927 9.713 9.473 9.276 9.084 8.879 8.716 8.546 8.364 8.177 7.974 7.817 7.652 7.394 7.203 7.013 6.919 6.71 6.475 6.201 6.052 5.763 5.635 5.47 5.304 4.947 4.726 4.484 4.218 3.878 3.442 2.854 -0.34 -4 ,6853 ,TETRA ,17668704,Fri Dec 3 06:55:27 CET,Fri Dec 3 08:45:05 CET,0.0 0.631 0.868 1.073 1.237 1.376 1.513 1.638 1.867 1.972 2.077 2.095 2.345 2.427 2.577 2.724 2.861 2.926 3.062 3.193 3.387 3.515 3.64 3.826 4.002 4.174 4.337 4.485 4.671 4.866 5.064 5.302 5.531 5.746 5.995 6.281 6.541 6.819 7.135 7.483 7.846 8.248 8.692 9.144 9.659 10.195 10.84 11.526 12.268 13.084 13.885 14.309 14.282 13.987 13.609 13.251 12.945 12.642 12.327 11.988 11.685 11.403 11.122 10.842 10.571 10.329 10.076 9.84 9.625 9.398 9.173 8.982 8.776 8.561 8.396 8.229 8.053 7.851 7.626 7.472 7.312 7.07 6.905 6.712 6.607 6.385 6.156 5.915 5.787 5.502 5.347 5.183 5.016 4.658 4.438 4.188 3.915 3.604 3.216 2.642 -1.518 -5 ,7491 ,TETRA ,17668705,Fri Dec 3 06:56:26 CET,Fri Dec 3 08:46:34 CET,0.0 0.474 0.758 0.951 1.101 1.244 1.375 1.494 1.718 1.821 1.916 1.936 2.193 2.281 2.444 2.588 2.728 2.803 2.948 3.084 3.284 3.416 3.541 3.73 3.91 4.072 4.224 4.383 4.603 4.808 5.005 5.229 5.443 5.659 5.904 6.184 6.467 6.772 7.081 7.408 7.751 8.131 8.601 9.092 9.644 10.248 10.978 11.763 12.556 13.273 13.959 14.379 14.354 14.059 13.716 13.35 13.006 12.676 12.353 12.01 11.674 11.371 11.1 10.836 10.576 10.323 10.039 9.801 9.618 9.406 9.156 8.957 8.765 8.558 8.379 8.195 8.0 7.785 7.58 7.42 7.253 7.013 6.851 6.671 6.57 6.352 6.11 5.871 5.753 5.482 5.367 5.221 5.049 4.664 4.469 4.236 3.939 3.588 3.145 2.42 -0.531 -6 ,15383 ,TETRA ,17668706,Fri Dec 3 06:56:27 CET,Fri Dec 3 08:46:31 CET,0.0 0.412 0.627 0.788 0.939 1.088 1.217 1.329 1.541 1.645 1.747 1.76 2.003 2.086 2.254 2.424 2.591 2.664 2.786 2.904 3.09 3.219 3.343 3.521 3.695 3.862 4.019 4.185 4.396 4.585 4.772 4.988 5.201 5.418 5.667 5.945 6.203 6.483 6.778 7.094 7.452 7.857 8.332 8.811 9.329 9.883 10.528 11.207 11.89 12.602 13.281 13.596 13.537 13.285 12.962 12.595 12.251 11.91 11.576 11.216 10.908 10.628 10.352 10.11 9.877 9.64 9.371 9.117 8.9 8.684 8.457 8.265 8.053 7.825 7.663 7.494 7.302 7.118 6.92 6.771 6.61 6.365 6.187 5.983 5.878 5.66 5.437 5.174 5.03 4.741 4.576 4.42 4.255 3.848 3.622 3.363 3.061 2.664 2.199 1.531 -1.161 -7 ,20100 ,TETRA ,17668707,Fri Dec 3 06:56:28 CET,Fri Dec 3 08:46:21 CET,0.0 0.437 0.658 0.845 1.01 1.166 1.303 1.419 1.632 1.729 1.824 1.838 2.091 2.176 2.33 2.477 2.625 2.698 2.836 2.977 3.181 3.307 3.43 3.605 3.776 3.942 4.107 4.265 4.464 4.647 4.826 5.042 5.252 5.468 5.715 5.996 6.271 6.559 6.87 7.209 7.567 7.967 8.423 8.875 9.38 9.944 10.555 11.249 12.093 12.844 13.555 13.857 13.749 13.55 13.274 12.952 12.641 12.337 12.039 11.732 11.449 11.164 10.877 10.603 10.343 10.078 9.801 9.561 9.345 9.133 8.922 8.734 8.516 8.273 8.092 7.912 7.72 7.492 7.246 7.089 6.923 6.682 6.518 6.337 6.246 6.046 5.801 5.545 5.414 5.119 4.968 4.805 4.629 4.228 4.007 3.803 3.53 3.154 2.686 1.978 -1.535 -8 ,140 ,TETRA ,17668708,Fri Dec 3 06:56:29 CET,Fri Dec 3 08:46:01 CET,0.0 0.471 0.714 0.932 1.104 1.242 1.361 1.471 1.686 1.782 1.87 1.869 2.119 2.202 2.361 2.513 2.657 2.724 2.852 2.986 3.189 3.309 3.422 3.59 3.768 3.936 4.083 4.225 4.412 4.592 4.764 4.983 5.195 5.394 5.626 5.897 6.157 6.434 6.734 7.049 7.39 7.793 8.239 8.661 9.159 9.686 10.299 11.084 11.989 12.835 13.689 14.16 14.152 13.949 13.66 13.343 13.006 12.688 12.421 12.117 11.842 11.591 11.328 11.074 10.842 10.598 10.331 10.101 9.889 9.674 9.465 9.291 9.084 8.853 8.679 8.486 8.278 8.075 7.881 7.747 7.601 7.337 7.143 6.968 6.875 6.66 6.42 6.155 6.018 5.734 5.603 5.436 5.245 4.845 4.633 4.376 4.072 3.731 3.308 2.727 -1.13 -9 ,20748 ,TETRA ,17668709,Fri Dec 3 06:56:27 CET,Fri Dec 3 08:46:07 CET,0.0 0.347 0.545 0.698 0.854 0.982 1.103 1.224 1.429 1.516 1.604 1.606 1.854 1.94 2.114 2.283 2.449 2.525 2.666 2.796 2.97 3.088 3.209 3.392 3.571 3.741 3.905 4.061 4.262 4.459 4.652 4.876 5.097 5.319 5.574 5.855 6.12 6.419 6.755 7.105 7.442 7.827 8.323 8.805 9.351 9.957 10.577 11.209 11.98 12.823 13.51 13.721 13.637 13.391 13.07 12.767 12.486 12.189 11.889 11.553 11.245 10.962 10.67 10.383 10.133 9.911 9.648 9.396 9.184 8.94 8.676 8.474 8.269 8.055 7.881 7.691 7.495 7.303 7.098 6.947 6.783 6.512 6.312 6.106 6.011 5.811 5.58 5.333 5.201 4.916 4.794 4.626 4.455 4.105 3.899 3.685 3.409 3.002 2.526 1.815 -2.383 -10 ,30201 ,TETRA ,17668710,Fri Dec 3 06:56:29 CET,Fri Dec 3 08:45:49 CET,0.0 0.461 0.726 0.903 1.064 1.201 1.332 1.448 1.66 1.768 1.87 1.89 2.14 2.221 2.388 2.539 2.683 2.756 2.89 3.012 3.202 3.325 3.436 3.614 3.796 3.962 4.115 4.255 4.433 4.608 4.787 5.018 5.243 5.449 5.683 5.952 6.216 6.507 6.823 7.157 7.504 7.911 8.394 8.835 9.323 9.903 10.589 11.35 12.103 12.77 13.429 13.735 13.628 13.345 13.042 12.719 12.397 12.11 11.817 11.499 11.219 10.927 10.639 10.372 10.117 9.874 9.629 9.412 9.208 8.993 8.781 8.595 8.38 8.152 7.982 7.811 7.612 7.389 7.148 6.977 6.805 6.525 6.341 6.158 6.056 5.827 5.562 5.278 5.14 4.855 4.717 4.556 4.367 3.923 3.687 3.429 3.147 2.83 2.385 1.745 -1.999 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5p_5n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5p_5n.txt deleted file mode 100644 index 9ebfeec3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_5p_5n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,988 ,TETRA ,17668711,Fri Dec 3 06:56:30 CET,Fri Dec 3 08:46:57 CET,0.0 1.241 1.672 1.97 2.18 2.349 2.505 2.663 2.954 3.076 3.202 3.288 3.552 3.644 3.835 4.024 4.192 4.269 4.417 4.56 4.777 4.932 5.077 5.259 5.422 5.576 5.738 5.913 6.155 6.387 6.593 6.836 7.064 7.282 7.537 7.798 8.044 8.304 8.573 8.854 9.161 9.521 9.926 10.31 10.755 11.239 11.773 12.341 12.937 13.548 14.028 13.867 13.528 13.182 12.756 12.336 11.934 11.539 11.167 10.767 10.414 10.077 9.762 9.48 9.198 8.925 8.635 8.369 8.124 7.868 7.633 7.432 7.205 6.973 6.802 6.621 6.416 6.206 5.995 5.833 5.661 5.387 5.195 5.021 4.932 4.746 4.553 4.313 4.173 3.877 3.777 3.631 3.473 3.136 2.962 2.76 2.517 2.217 1.856 1.365 -0.442 -2 ,28347 ,TETRA ,17668712,Fri Dec 3 06:56:33 CET,Fri Dec 3 08:46:31 CET,0.0 0.82 1.141 1.341 1.532 1.723 1.889 2.042 2.31 2.43 2.556 2.625 2.892 2.993 3.204 3.401 3.584 3.666 3.815 3.975 4.208 4.339 4.46 4.642 4.82 4.998 5.163 5.311 5.514 5.704 5.88 6.102 6.313 6.529 6.776 7.038 7.295 7.598 7.918 8.214 8.517 8.859 9.278 9.693 10.146 10.646 11.166 11.693 12.307 12.938 13.385 13.415 13.145 12.699 12.24 11.767 11.347 10.965 10.619 10.271 9.939 9.626 9.301 8.964 8.657 8.37 8.075 7.811 7.58 7.33 7.082 6.89 6.675 6.455 6.267 6.064 5.857 5.637 5.416 5.262 5.098 4.851 4.676 4.493 4.4 4.193 3.979 3.737 3.608 3.328 3.242 3.095 2.941 2.625 2.44 2.208 1.95 1.67 1.315 0.832 -0.772 -3 ,32656 ,TETRA ,17668713,Fri Dec 3 06:56:27 CET,Fri Dec 3 08:47:03 CET,0.0 1.035 1.441 1.686 1.883 2.084 2.265 2.442 2.749 2.872 2.987 3.034 3.299 3.401 3.614 3.82 3.99 4.071 4.244 4.405 4.608 4.741 4.873 5.06 5.239 5.414 5.583 5.734 5.932 6.142 6.349 6.572 6.801 7.033 7.258 7.498 7.738 8.009 8.303 8.611 8.93 9.288 9.69 10.097 10.573 11.076 11.617 12.155 12.724 13.289 13.72 13.619 13.233 12.806 12.354 11.874 11.397 10.908 10.465 9.986 9.585 9.262 8.935 8.634 8.349 8.089 7.811 7.568 7.37 7.141 6.886 6.68 6.471 6.252 6.077 5.9 5.718 5.509 5.274 5.106 4.947 4.724 4.56 4.368 4.27 4.07 3.827 3.555 3.419 3.127 3.014 2.865 2.711 2.363 2.158 1.917 1.655 1.376 1.051 0.667 -0.647 -4 ,12386 ,TETRA ,17668714,Fri Dec 3 06:56:29 CET,Fri Dec 3 08:47:08 CET,0.0 0.913 1.226 1.442 1.637 1.83 1.989 2.129 2.395 2.522 2.639 2.688 2.96 3.061 3.256 3.44 3.611 3.692 3.851 4.005 4.2 4.328 4.458 4.638 4.814 4.989 5.154 5.306 5.505 5.729 5.938 6.155 6.369 6.571 6.81 7.078 7.325 7.609 7.916 8.248 8.604 8.987 9.412 9.804 10.221 10.677 11.233 11.862 12.488 13.065 13.502 13.532 13.262 12.896 12.442 11.922 11.455 11.011 10.586 10.183 9.851 9.532 9.184 8.845 8.529 8.264 8.007 7.749 7.524 7.285 7.038 6.839 6.626 6.384 6.194 5.997 5.784 5.564 5.331 5.158 4.988 4.755 4.582 4.374 4.27 4.059 3.826 3.58 3.44 3.138 3.028 2.873 2.701 2.324 2.117 1.87 1.598 1.33 0.973 0.433 -1.269 -5 ,14135 ,TETRA ,17668716,Fri Dec 3 06:56:30 CET,Fri Dec 3 08:46:36 CET,0.0 0.855 1.206 1.493 1.695 1.875 2.021 2.159 2.422 2.547 2.661 2.688 2.938 3.025 3.212 3.421 3.605 3.681 3.84 3.986 4.181 4.32 4.458 4.64 4.804 4.959 5.113 5.262 5.462 5.673 5.866 6.087 6.304 6.499 6.713 6.95 7.215 7.506 7.781 8.076 8.387 8.741 9.168 9.574 10.017 10.502 11.017 11.57 12.16 12.747 13.154 13.143 12.946 12.639 12.215 11.765 11.333 10.926 10.572 10.207 9.9 9.581 9.242 8.937 8.65 8.37 8.074 7.81 7.561 7.299 7.027 6.796 6.573 6.348 6.178 5.991 5.788 5.57 5.336 5.174 4.998 4.748 4.585 4.394 4.287 4.046 3.802 3.576 3.452 3.161 3.076 2.934 2.776 2.418 2.216 1.995 1.761 1.489 1.125 0.608 -1.011 -6 ,6540 ,TETRA ,17668717,Fri Dec 3 06:56:33 CET,Fri Dec 3 08:46:23 CET,0.0 1.014 1.333 1.547 1.75 1.937 2.099 2.253 2.546 2.692 2.825 2.89 3.16 3.255 3.442 3.623 3.78 3.857 4.009 4.156 4.387 4.527 4.649 4.825 5.003 5.186 5.363 5.535 5.746 5.944 6.127 6.349 6.581 6.798 7.056 7.339 7.584 7.853 8.138 8.445 8.772 9.138 9.563 9.975 10.453 10.937 11.487 12.113 12.738 13.275 13.683 13.68 13.366 13.008 12.567 12.071 11.635 11.24 10.858 10.44 10.083 9.773 9.458 9.146 8.871 8.631 8.351 8.081 7.831 7.556 7.29 7.076 6.871 6.653 6.461 6.264 6.08 5.889 5.665 5.503 5.341 5.079 4.891 4.695 4.593 4.385 4.167 3.921 3.81 3.533 3.423 3.273 3.116 2.773 2.569 2.321 2.049 1.764 1.41 0.947 -0.818 -7 ,7193 ,TETRA ,17668718,Fri Dec 3 06:56:27 CET,Fri Dec 3 08:46:31 CET,0.0 0.566 0.96 1.262 1.445 1.585 1.713 1.849 2.095 2.205 2.32 2.357 2.616 2.71 2.883 3.053 3.218 3.304 3.468 3.606 3.813 3.94 4.051 4.221 4.41 4.586 4.749 4.913 5.107 5.285 5.465 5.692 5.903 6.105 6.345 6.616 6.864 7.129 7.42 7.727 8.047 8.413 8.809 9.182 9.634 10.148 10.753 11.388 11.995 12.585 13.059 13.108 12.839 12.42 11.979 11.539 11.123 10.697 10.29 9.859 9.477 9.136 8.808 8.512 8.234 7.974 7.71 7.465 7.228 6.986 6.755 6.548 6.33 6.118 5.943 5.754 5.55 5.341 5.127 4.977 4.823 4.578 4.409 4.228 4.134 3.946 3.753 3.535 3.414 3.132 3.029 2.889 2.748 2.413 2.212 2.006 1.776 1.497 1.184 0.701 -0.868 -8 ,17545 ,TETRA ,17668719,Fri Dec 3 06:56:29 CET,Fri Dec 3 08:46:36 CET,0.0 0.92 1.265 1.479 1.703 1.923 2.102 2.253 2.525 2.644 2.759 2.823 3.102 3.21 3.409 3.59 3.766 3.852 4.006 4.163 4.376 4.496 4.616 4.799 4.978 5.159 5.331 5.491 5.699 5.906 6.103 6.332 6.55 6.755 6.995 7.271 7.531 7.817 8.107 8.423 8.768 9.127 9.536 9.929 10.358 10.83 11.364 11.939 12.545 13.116 13.664 13.765 13.565 13.259 12.888 12.477 12.087 11.723 11.39 11.03 10.692 10.351 10.003 9.683 9.376 9.107 8.813 8.536 8.3 8.042 7.775 7.555 7.327 7.092 6.908 6.727 6.527 6.305 6.098 5.95 5.793 5.534 5.358 5.178 5.077 4.871 4.663 4.412 4.273 3.98 3.885 3.74 3.566 3.223 3.03 2.798 2.527 2.21 1.865 1.355 -0.438 -9 ,19050 ,TETRA ,17668720,Fri Dec 3 06:56:30 CET,Fri Dec 3 08:46:49 CET,0.0 0.832 1.145 1.37 1.545 1.719 1.902 2.046 2.288 2.402 2.504 2.543 2.823 2.932 3.121 3.31 3.47 3.54 3.677 3.816 4.032 4.176 4.321 4.511 4.683 4.86 5.042 5.212 5.42 5.629 5.833 6.061 6.268 6.466 6.7 6.963 7.213 7.491 7.791 8.105 8.428 8.795 9.227 9.644 10.122 10.626 11.162 11.718 12.299 12.927 13.446 13.478 13.234 12.852 12.402 11.993 11.601 11.186 10.815 10.441 10.097 9.769 9.458 9.168 8.847 8.542 8.239 7.962 7.717 7.465 7.201 6.99 6.791 6.571 6.389 6.187 5.968 5.742 5.518 5.37 5.216 4.971 4.785 4.587 4.491 4.29 4.051 3.808 3.69 3.394 3.271 3.127 2.976 2.636 2.443 2.222 1.954 1.673 1.35 0.842 -1.11 -10 ,889 ,TETRA ,17668721,Fri Dec 3 06:56:33 CET,Fri Dec 3 08:46:38 CET,0.0 1.061 1.408 1.668 1.885 2.098 2.289 2.46 2.747 2.872 2.991 3.051 3.317 3.41 3.593 3.757 3.927 4.016 4.178 4.329 4.546 4.682 4.804 4.987 5.179 5.352 5.509 5.667 5.869 6.06 6.252 6.464 6.66 6.885 7.147 7.403 7.646 7.95 8.266 8.566 8.878 9.216 9.619 10.018 10.486 10.969 11.475 12.017 12.604 13.232 13.67 13.664 13.364 12.961 12.571 12.143 11.737 11.371 11.01 10.632 10.297 9.977 9.672 9.384 9.106 8.846 8.57 8.303 8.039 7.773 7.526 7.325 7.109 6.874 6.694 6.491 6.278 6.059 5.83 5.679 5.515 5.253 5.073 4.895 4.807 4.608 4.383 4.158 4.047 3.765 3.636 3.474 3.309 2.959 2.765 2.554 2.328 2.048 1.688 1.254 0.335 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8b_8a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8b_8a.txt deleted file mode 100644 index 703db014..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8b_8a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2680 ,TETRA ,17668722,Fri Dec 3 06:56:28 CET,Fri Dec 3 08:47:33 CET,0.0 0.385 0.621 0.801 0.971 1.13 1.272 1.404 1.608 1.703 1.801 1.82 2.037 2.116 2.265 2.408 2.551 2.623 2.752 2.864 3.032 3.143 3.252 3.419 3.574 3.718 3.861 3.989 4.148 4.307 4.456 4.629 4.792 4.95 5.14 5.359 5.561 5.768 5.985 6.215 6.454 6.722 7.006 7.274 7.585 7.907 8.239 8.535 8.803 8.966 8.845 8.358 7.809 7.233 6.643 6.09 5.618 5.157 4.739 4.311 3.929 3.586 3.26 2.941 2.641 2.383 2.124 1.87 1.642 1.411 1.175 0.976 0.758 0.532 0.357 0.178 -0.007 -0.205 -0.412 -0.547 -0.687 -0.926 -1.102 -1.268 -1.346 -1.522 -1.703 -1.886 -1.98 -2.225 -2.292 -2.407 -2.52 -2.777 -2.926 -3.069 -3.228 -3.411 -3.606 -3.85 -4.48 -2 ,9800 ,TETRA ,17668723,Fri Dec 3 06:56:30 CET,Fri Dec 3 08:47:37 CET,0.0 0.213 0.375 0.492 0.608 0.726 0.833 0.93 1.093 1.173 1.245 1.236 1.454 1.522 1.649 1.779 1.902 1.955 2.061 2.167 2.338 2.459 2.57 2.722 2.861 2.998 3.135 3.263 3.419 3.567 3.718 3.91 4.096 4.257 4.43 4.636 4.844 5.075 5.314 5.549 5.789 6.05 6.341 6.624 6.94 7.252 7.563 7.87 8.175 8.381 8.286 7.819 7.259 6.691 6.12 5.561 5.06 4.589 4.157 3.734 3.358 3.015 2.687 2.346 2.045 1.785 1.495 1.248 1.036 0.797 0.557 0.359 0.142 -0.078 -0.243 -0.416 -0.603 -0.804 -1.022 -1.179 -1.329 -1.552 -1.718 -1.897 -1.987 -2.182 -2.384 -2.577 -2.678 -2.933 -3.022 -3.154 -3.286 -3.571 -3.729 -3.889 -4.066 -4.265 -4.474 -4.736 -5.358 -3 ,9069 ,TETRA ,17668724,Fri Dec 3 06:56:32 CET,Fri Dec 3 08:47:35 CET,0.0 0.261 0.387 0.484 0.593 0.706 0.823 0.936 1.141 1.247 1.347 1.386 1.608 1.686 1.838 1.977 2.115 2.186 2.335 2.479 2.658 2.77 2.889 3.055 3.206 3.344 3.48 3.611 3.769 3.925 4.081 4.26 4.43 4.599 4.78 4.982 5.175 5.375 5.594 5.844 6.097 6.352 6.646 6.922 7.206 7.515 7.842 8.162 8.431 8.575 8.526 8.104 7.552 6.971 6.403 5.877 5.407 4.972 4.583 4.15 3.739 3.37 3.033 2.734 2.457 2.195 1.906 1.648 1.436 1.216 0.975 0.769 0.561 0.349 0.18 0.013 -0.168 -0.363 -0.575 -0.729 -0.883 -1.12 -1.275 -1.439 -1.528 -1.71 -1.908 -2.127 -2.237 -2.491 -2.564 -2.69 -2.813 -3.049 -3.186 -3.336 -3.495 -3.676 -3.876 -4.116 -4.617 -4 ,2926 ,TETRA ,17668725,Fri Dec 3 06:56:33 CET,Fri Dec 3 08:47:35 CET,0.0 0.519 0.696 0.822 0.944 1.054 1.158 1.26 1.435 1.515 1.592 1.605 1.825 1.89 2.011 2.13 2.247 2.302 2.401 2.501 2.651 2.748 2.84 2.972 3.106 3.23 3.347 3.462 3.625 3.786 3.932 4.097 4.245 4.392 4.586 4.81 5.018 5.244 5.471 5.69 5.915 6.176 6.488 6.8 7.138 7.49 7.867 8.279 8.707 9.107 9.268 8.929 8.339 7.666 6.963 6.291 5.753 5.301 4.917 4.51 4.134 3.788 3.458 3.145 2.838 2.558 2.257 1.992 1.767 1.535 1.296 1.088 0.874 0.652 0.484 0.314 0.131 -0.081 -0.304 -0.45 -0.601 -0.827 -0.988 -1.162 -1.251 -1.45 -1.643 -1.834 -1.935 -2.189 -2.276 -2.409 -2.543 -2.825 -2.962 -3.104 -3.271 -3.446 -3.64 -3.888 -4.35 -5 ,19935 ,TETRA ,17668726,Fri Dec 3 06:56:28 CET,Fri Dec 3 08:46:53 CET,0.0 0.372 0.593 0.758 0.92 1.075 1.216 1.346 1.596 1.691 1.781 1.804 2.029 2.117 2.283 2.428 2.562 2.627 2.744 2.848 3.008 3.112 3.21 3.356 3.506 3.649 3.79 3.926 4.09 4.259 4.42 4.593 4.76 4.929 5.126 5.329 5.51 5.707 5.913 6.145 6.4 6.67 6.959 7.238 7.539 7.859 8.19 8.516 8.813 8.985 8.916 8.446 7.855 7.246 6.65 6.109 5.62 5.161 4.754 4.326 3.942 3.61 3.276 2.953 2.669 2.408 2.122 1.853 1.633 1.409 1.163 0.955 0.75 0.538 0.374 0.22 0.052 -0.125 -0.309 -0.44 -0.576 -0.781 -0.92 -1.076 -1.158 -1.319 -1.489 -1.658 -1.746 -1.995 -2.043 -2.151 -2.269 -2.531 -2.674 -2.824 -2.991 -3.174 -3.409 -3.671 -4.267 -6 ,9590 ,TETRA ,17668727,Fri Dec 3 06:56:29 CET,Fri Dec 3 08:47:15 CET,0.0 0.181 0.348 0.503 0.62 0.724 0.818 0.905 1.058 1.131 1.208 1.213 1.43 1.515 1.675 1.822 1.963 2.028 2.152 2.273 2.448 2.564 2.679 2.845 3.005 3.154 3.295 3.431 3.606 3.771 3.919 4.096 4.267 4.428 4.608 4.816 5.016 5.223 5.446 5.676 5.912 6.178 6.48 6.762 7.073 7.405 7.765 8.113 8.419 8.625 8.587 8.183 7.636 7.045 6.48 5.929 5.397 4.909 4.486 4.049 3.683 3.377 3.076 2.76 2.452 2.182 1.906 1.645 1.404 1.174 0.941 0.732 0.519 0.293 0.114 -0.067 -0.256 -0.452 -0.655 -0.789 -0.928 -1.151 -1.302 -1.45 -1.521 -1.676 -1.85 -2.033 -2.126 -2.369 -2.433 -2.55 -2.667 -2.912 -3.042 -3.183 -3.333 -3.495 -3.716 -4.003 -4.666 -7 ,2959 ,TETRA ,17668728,Fri Dec 3 06:56:30 CET,Fri Dec 3 08:47:39 CET,0.0 0.49 0.689 0.863 1.04 1.185 1.302 1.418 1.633 1.73 1.826 1.876 2.113 2.19 2.323 2.455 2.591 2.663 2.801 2.926 3.106 3.22 3.327 3.476 3.623 3.77 3.904 4.024 4.178 4.343 4.495 4.656 4.812 4.974 5.169 5.374 5.569 5.79 6.024 6.271 6.515 6.781 7.087 7.365 7.669 7.988 8.333 8.651 8.948 9.117 8.955 8.453 7.887 7.3 6.732 6.202 5.723 5.303 4.919 4.498 4.14 3.818 3.5 3.202 2.908 2.61 2.315 2.073 1.854 1.619 1.368 1.161 0.959 0.745 0.575 0.402 0.221 0.035 -0.164 -0.306 -0.455 -0.703 -0.874 -1.046 -1.135 -1.311 -1.497 -1.695 -1.797 -2.049 -2.131 -2.251 -2.362 -2.577 -2.705 -2.845 -2.984 -3.159 -3.36 -3.606 -4.172 -8 ,27111 ,TETRA ,17668729,Fri Dec 3 06:56:33 CET,Fri Dec 3 08:47:24 CET,0.0 0.416 0.715 0.917 1.094 1.262 1.412 1.542 1.759 1.863 1.96 1.997 2.223 2.298 2.46 2.627 2.778 2.845 2.969 3.089 3.267 3.38 3.491 3.651 3.794 3.936 4.079 4.21 4.377 4.541 4.697 4.883 5.057 5.226 5.412 5.604 5.797 6.014 6.242 6.491 6.762 7.047 7.343 7.622 7.941 8.259 8.566 8.87 9.161 9.398 9.357 8.928 8.396 7.83 7.286 6.766 6.285 5.841 5.445 5.025 4.647 4.306 3.981 3.668 3.365 3.082 2.788 2.515 2.294 2.081 1.85 1.649 1.44 1.216 1.039 0.864 0.67 0.46 0.261 0.13 -0.015 -0.244 -0.407 -0.578 -0.661 -0.834 -1.03 -1.241 -1.357 -1.629 -1.719 -1.836 -1.959 -2.235 -2.39 -2.576 -2.79 -3.065 -3.403 -3.746 -4.328 -9 ,9576 ,TETRA ,17668730,Fri Dec 3 06:56:29 CET,Fri Dec 3 08:47:14 CET,0.0 0.209 0.351 0.454 0.548 0.651 0.749 0.832 0.982 1.057 1.13 1.132 1.35 1.415 1.538 1.668 1.798 1.857 1.963 2.066 2.217 2.315 2.405 2.533 2.659 2.791 2.925 3.045 3.207 3.379 3.545 3.739 3.909 4.077 4.276 4.478 4.655 4.851 5.077 5.32 5.563 5.813 6.1 6.398 6.709 7.01 7.324 7.66 7.967 8.131 8.044 7.634 7.083 6.484 5.903 5.364 4.887 4.438 4.023 3.611 3.251 2.92 2.594 2.278 1.981 1.703 1.424 1.172 0.956 0.726 0.476 0.269 0.036 -0.209 -0.385 -0.559 -0.743 -0.937 -1.141 -1.285 -1.437 -1.665 -1.825 -2.001 -2.089 -2.252 -2.434 -2.654 -2.766 -3.015 -3.092 -3.211 -3.343 -3.644 -3.797 -3.964 -4.143 -4.339 -4.597 -4.956 -5.783 -10 ,22848 ,TETRA ,17668731,Fri Dec 3 06:56:31 CET,Fri Dec 3 08:47:31 CET,0.0 0.938 1.196 1.373 1.515 1.653 1.778 1.891 2.115 2.221 2.311 2.351 2.579 2.66 2.825 2.968 3.09 3.152 3.282 3.416 3.594 3.695 3.793 3.939 4.082 4.222 4.356 4.493 4.669 4.831 4.988 5.181 5.367 5.541 5.733 5.939 6.13 6.344 6.554 6.765 7.001 7.257 7.541 7.824 8.128 8.426 8.751 9.049 9.327 9.532 9.425 8.916 8.351 7.764 7.188 6.641 6.146 5.702 5.289 4.841 4.472 4.143 3.814 3.513 3.237 2.975 2.684 2.416 2.194 1.974 1.73 1.516 1.295 1.068 0.886 0.699 0.514 0.32 0.115 -0.021 -0.16 -0.394 -0.555 -0.707 -0.792 -0.981 -1.177 -1.366 -1.458 -1.707 -1.795 -1.914 -2.054 -2.383 -2.553 -2.738 -2.927 -3.143 -3.399 -3.718 -4.54 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8d_8c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8d_8c.txt deleted file mode 100644 index 571c1cf7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8d_8c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18616 ,KEBNE ,16836562,Sun Dec 5 17:17:30 CET,Sun Dec 5 18:49:03 CET,0.0 0.71 0.971 1.184 1.371 1.543 1.703 1.845 2.104 2.224 2.334 2.354 2.641 2.741 2.942 3.143 3.325 3.404 3.552 3.695 3.911 4.056 4.198 4.395 4.581 4.774 4.969 5.142 5.355 5.572 5.784 6.03 6.27 6.509 6.794 7.107 7.409 7.754 8.133 8.536 8.968 9.451 10.009 10.58 11.254 11.969 12.752 13.628 14.608 15.701 16.905 17.685 17.94 17.984 17.944 17.864 17.755 17.609 17.469 17.316 17.167 17.023 16.876 16.711 16.519 16.34 16.157 15.974 15.806 15.63 15.441 15.283 15.125 14.95 14.81 14.665 14.521 14.375 14.227 14.128 14.014 13.831 13.698 13.56 13.487 13.333 13.17 13.003 12.914 12.644 12.628 12.516 12.392 12.133 11.992 11.844 11.673 11.46 11.242 10.875 9.996 -2 ,25745 ,KEBNE ,16836563,Sun Dec 5 17:18:28 CET,Sun Dec 5 18:55:03 CET,0.0 0.972 1.302 1.546 1.759 1.939 2.102 2.237 2.46 2.57 2.684 2.719 3.009 3.098 3.279 3.467 3.639 3.716 3.866 4.011 4.215 4.35 4.484 4.674 4.856 5.029 5.196 5.36 5.573 5.79 6.008 6.261 6.515 6.764 7.047 7.363 7.663 7.995 8.346 8.729 9.131 9.589 10.138 10.676 11.293 11.997 12.793 13.643 14.635 15.735 16.828 17.448 17.586 17.528 17.373 17.173 16.974 16.748 16.546 16.341 16.146 15.957 15.73 15.5 15.328 15.179 15.011 14.874 14.747 14.599 14.446 14.314 14.157 13.989 13.862 13.737 13.609 13.457 13.289 13.172 13.056 12.873 12.74 12.602 12.529 12.377 12.24 12.085 11.997 11.724 11.709 11.596 11.474 11.255 11.117 10.97 10.822 10.638 10.425 10.087 9.348 -3 ,12353 ,KEBNE ,16836564,Sun Dec 5 17:27:36 CET,Sun Dec 5 19:03:32 CET,0.0 0.883 1.196 1.428 1.608 1.778 1.938 2.071 2.306 2.426 2.545 2.558 2.845 2.944 3.131 3.315 3.49 3.567 3.722 3.875 4.094 4.24 4.38 4.576 4.753 4.933 5.116 5.299 5.537 5.753 5.966 6.226 6.471 6.699 6.948 7.239 7.542 7.88 8.242 8.639 9.073 9.559 10.099 10.639 11.262 11.929 12.679 13.523 14.532 15.65 16.901 17.655 17.876 17.929 17.905 17.852 17.738 17.606 17.466 17.303 17.163 17.017 16.872 16.731 16.576 16.411 16.22 16.053 15.908 15.755 15.587 15.419 15.252 15.098 14.975 14.842 14.698 14.556 14.405 14.299 14.195 14.02 13.882 13.731 13.653 13.498 13.332 13.169 13.083 12.809 12.789 12.682 12.572 12.3 12.143 11.982 11.809 11.613 11.379 11.064 9.95 -4 ,29210 ,KEBNE ,16836565,Sun Dec 5 17:27:36 CET,Sun Dec 5 19:03:17 CET,0.0 0.831 1.144 1.376 1.573 1.746 1.897 2.048 2.354 2.49 2.611 2.638 2.92 3.015 3.223 3.413 3.577 3.652 3.797 3.943 4.17 4.32 4.458 4.667 4.876 5.055 5.211 5.355 5.561 5.774 5.986 6.24 6.475 6.707 6.976 7.285 7.594 7.935 8.292 8.666 9.074 9.541 10.1 10.681 11.305 11.99 12.792 13.64 14.616 15.724 16.901 17.547 17.735 17.764 17.681 17.531 17.339 17.125 16.892 16.639 16.42 16.214 15.998 15.794 15.609 15.43 15.252 15.105 14.971 14.806 14.623 14.466 14.312 14.167 14.042 13.901 13.748 13.596 13.444 13.336 13.219 13.019 12.878 12.732 12.662 12.525 12.365 12.185 12.094 11.825 11.806 11.696 11.581 11.337 11.192 11.043 10.882 10.666 10.394 10.03 9.001 -5 ,5057 ,KEBNE ,16836566,Sun Dec 5 17:27:35 CET,Sun Dec 5 19:04:10 CET,0.0 0.941 1.179 1.399 1.601 1.767 1.915 2.071 2.356 2.471 2.581 2.6 2.892 2.996 3.183 3.351 3.522 3.604 3.76 3.914 4.132 4.262 4.391 4.584 4.766 4.952 5.127 5.298 5.523 5.737 5.95 6.198 6.434 6.674 6.964 7.296 7.613 7.962 8.329 8.705 9.117 9.586 10.105 10.622 11.193 11.831 12.609 13.484 14.493 15.58 16.686 17.325 17.537 17.561 17.423 17.221 17.027 16.783 16.519 16.26 16.042 15.845 15.66 15.471 15.266 15.067 14.851 14.666 14.509 14.344 14.174 14.025 13.883 13.738 13.62 13.494 13.36 13.218 13.078 12.983 12.875 12.708 12.591 12.461 12.39 12.246 12.089 11.911 11.818 11.552 11.538 11.434 11.309 11.046 10.92 10.758 10.581 10.384 10.15 9.845 9.067 -6 ,14961 ,KEBNE ,16836567,Sun Dec 5 17:29:37 CET,Sun Dec 5 19:05:46 CET,0.0 0.639 0.861 1.039 1.195 1.344 1.506 1.656 1.913 2.031 2.145 2.176 2.467 2.563 2.745 2.922 3.101 3.187 3.353 3.5 3.698 3.836 3.98 4.19 4.385 4.563 4.732 4.893 5.109 5.328 5.539 5.789 6.04 6.278 6.543 6.852 7.148 7.45 7.757 8.085 8.447 8.866 9.346 9.818 10.365 10.974 11.632 12.416 13.451 14.608 15.761 16.496 16.699 16.639 16.474 16.272 16.057 15.816 15.613 15.393 15.161 14.951 14.749 14.553 14.36 14.183 14.016 13.869 13.733 13.593 13.424 13.273 13.12 12.956 12.829 12.691 12.548 12.404 12.262 12.156 12.043 11.872 11.752 11.621 11.55 11.404 11.245 11.089 11.011 10.753 10.75 10.642 10.535 10.285 10.122 9.965 9.812 9.631 9.373 8.986 8.117 -7 ,21519 ,KEBNE ,16836568,Sun Dec 5 17:29:38 CET,Sun Dec 5 19:05:51 CET,0.0 1.025 1.287 1.493 1.672 1.851 2.024 2.168 2.431 2.545 2.647 2.653 2.939 3.039 3.226 3.396 3.566 3.654 3.827 3.995 4.216 4.35 4.484 4.687 4.878 5.052 5.22 5.391 5.617 5.839 6.064 6.345 6.616 6.87 7.159 7.481 7.795 8.131 8.489 8.878 9.31 9.794 10.327 10.862 11.496 12.209 13.038 13.936 14.879 15.92 17.13 17.927 18.143 18.104 17.97 17.771 17.523 17.271 17.039 16.788 16.577 16.378 16.15 15.972 15.808 15.625 15.428 15.257 15.103 14.922 14.733 14.582 14.426 14.269 14.153 14.026 13.878 13.727 13.565 13.46 13.364 13.183 13.055 12.929 12.859 12.713 12.55 12.379 12.281 12.003 11.97 11.846 11.729 11.489 11.334 11.141 10.948 10.746 10.462 10.15 9.443 -8 ,21880 ,KEBNE ,16836569,Sun Dec 5 17:31:39 CET,Sun Dec 5 19:07:21 CET,0.0 0.883 1.152 1.388 1.582 1.75 1.894 2.033 2.291 2.401 2.501 2.501 2.789 2.891 3.087 3.268 3.434 3.512 3.67 3.833 4.064 4.204 4.339 4.537 4.721 4.893 5.059 5.224 5.451 5.678 5.905 6.174 6.427 6.655 6.924 7.237 7.541 7.874 8.233 8.621 9.034 9.503 10.046 10.614 11.266 11.977 12.781 13.65 14.603 15.667 16.826 17.555 17.832 17.883 17.74 17.57 17.398 17.184 16.983 16.773 16.578 16.379 16.169 15.952 15.775 15.617 15.447 15.293 15.151 15.027 14.889 14.762 14.608 14.432 14.289 14.141 13.996 13.843 13.682 13.576 13.466 13.278 13.154 13.026 12.959 12.805 12.641 12.491 12.406 12.127 12.084 11.979 11.879 11.63 11.482 11.322 11.144 10.938 10.694 10.413 9.472 -9 ,21989 ,KEBNE ,16836570,Sun Dec 5 17:32:40 CET,Sun Dec 5 19:08:33 CET,0.0 0.578 0.842 1.045 1.229 1.401 1.572 1.727 1.985 2.096 2.2 2.215 2.503 2.604 2.804 2.975 3.129 3.207 3.362 3.511 3.738 3.89 4.035 4.241 4.426 4.604 4.774 4.951 5.178 5.381 5.587 5.834 6.066 6.292 6.542 6.831 7.126 7.431 7.755 8.118 8.514 8.968 9.503 10.059 10.716 11.428 12.206 13.061 14.027 15.069 16.234 16.979 17.18 17.14 17.003 16.809 16.587 16.357 16.141 15.922 15.735 15.551 15.362 15.172 14.982 14.804 14.627 14.472 14.331 14.17 13.987 13.84 13.693 13.524 13.389 13.252 13.099 12.944 12.791 12.674 12.554 12.395 12.294 12.166 12.089 11.93 11.754 11.577 11.493 11.224 11.189 11.075 10.966 10.717 10.567 10.419 10.251 10.046 9.813 9.523 8.59 -10 ,10469 ,KEBNE ,16836571,Sun Dec 5 17:33:41 CET,Sun Dec 5 19:08:44 CET,0.0 0.875 1.163 1.348 1.511 1.664 1.802 1.93 2.174 2.294 2.404 2.392 2.664 2.756 2.958 3.151 3.336 3.423 3.571 3.707 3.921 4.067 4.212 4.412 4.604 4.8 4.981 5.134 5.318 5.503 5.7 5.968 6.235 6.483 6.762 7.064 7.364 7.701 8.046 8.42 8.853 9.334 9.864 10.411 11.034 11.711 12.512 13.416 14.455 15.546 16.669 17.412 17.608 17.575 17.438 17.232 16.988 16.728 16.526 16.334 16.125 15.916 15.715 15.509 15.316 15.135 14.929 14.75 14.595 14.42 14.236 14.083 13.918 13.747 13.62 13.482 13.331 13.185 13.021 12.909 12.797 12.615 12.488 12.357 12.288 12.14 11.972 11.789 11.698 11.433 11.438 11.343 11.228 10.953 10.799 10.646 10.472 10.269 10.051 9.735 8.788 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8a.txt deleted file mode 100644 index 96010036..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2027 ,TETRA ,17668742,Fri Dec 3 07:02:26 CET,Fri Dec 3 08:52:43 CET,0.0 0.559 0.777 0.957 1.126 1.27 1.382 1.489 1.745 1.865 1.967 2.004 2.261 2.359 2.547 2.727 2.898 2.985 3.136 3.285 3.505 3.64 3.771 3.959 4.137 4.319 4.498 4.67 4.896 5.102 5.298 5.54 5.792 6.043 6.324 6.649 6.957 7.285 7.654 8.031 8.414 8.85 9.352 9.865 10.462 11.145 11.945 12.789 13.776 14.931 16.218 17.217 17.667 17.854 17.876 17.809 17.711 17.587 17.463 17.31 17.153 17.018 16.892 16.751 16.597 16.458 16.312 16.166 16.036 15.902 15.764 15.648 15.532 15.412 15.316 15.219 15.108 14.993 14.88 14.794 14.703 14.567 14.47 14.372 14.32 14.207 14.081 13.942 13.869 13.646 13.634 13.547 13.459 13.262 13.149 13.022 12.88 12.748 12.597 12.36 11.704 -2 ,24327 ,TETRA ,17668743,Fri Dec 3 07:02:28 CET,Fri Dec 3 08:52:59 CET,0.0 0.877 1.156 1.386 1.57 1.731 1.894 2.04 2.287 2.414 2.538 2.622 2.893 2.988 3.169 3.346 3.513 3.602 3.777 3.94 4.164 4.31 4.448 4.652 4.862 5.057 5.253 5.435 5.657 5.883 6.104 6.373 6.63 6.881 7.166 7.489 7.804 8.145 8.506 8.889 9.305 9.766 10.32 10.869 11.466 12.178 13.027 13.909 14.894 16.038 17.329 18.226 18.622 18.789 18.829 18.79 18.71 18.593 18.459 18.307 18.163 18.018 17.87 17.724 17.572 17.434 17.285 17.156 17.047 16.906 16.752 16.639 16.519 16.377 16.261 16.126 15.991 15.866 15.727 15.634 15.542 15.401 15.311 15.22 15.172 15.064 14.956 14.848 14.788 14.58 14.594 14.521 14.445 14.265 14.173 14.062 13.923 13.746 13.571 13.376 12.815 -3 ,24892 ,TETRA ,17668744,Fri Dec 3 07:02:30 CET,Fri Dec 3 08:53:03 CET,0.0 0.502 0.724 0.871 1.019 1.17 1.301 1.418 1.65 1.774 1.886 1.928 2.171 2.253 2.439 2.612 2.773 2.854 3.01 3.161 3.383 3.531 3.664 3.862 4.064 4.264 4.464 4.648 4.874 5.093 5.318 5.59 5.849 6.094 6.379 6.703 7.0 7.331 7.703 8.099 8.492 8.932 9.477 10.042 10.668 11.336 12.125 12.979 14.015 15.217 16.445 17.306 17.688 17.815 17.81 17.736 17.63 17.496 17.369 17.228 17.083 16.941 16.8 16.644 16.496 16.359 16.21 16.079 15.956 15.823 15.667 15.531 15.404 15.27 15.166 15.059 14.942 14.818 14.697 14.614 14.515 14.353 14.232 14.103 14.041 13.912 13.771 13.618 13.533 13.296 13.248 13.141 13.028 12.778 12.646 12.496 12.32 12.131 11.92 11.647 10.489 -4 ,22480 ,TETRA ,17668745,Fri Dec 3 07:02:32 CET,Fri Dec 3 08:52:58 CET,0.0 0.547 0.804 1.02 1.19 1.338 1.468 1.605 1.87 1.976 2.076 2.13 2.389 2.492 2.671 2.846 3.032 3.128 3.309 3.47 3.707 3.86 4.001 4.214 4.441 4.659 4.859 5.052 5.29 5.511 5.739 6.014 6.266 6.51 6.787 7.086 7.399 7.759 8.12 8.51 8.925 9.395 9.953 10.502 11.117 11.793 12.599 13.498 14.474 15.54 16.755 17.666 18.054 18.212 18.236 18.172 18.073 17.928 17.786 17.642 17.51 17.379 17.238 17.09 16.942 16.808 16.66 16.527 16.417 16.288 16.147 16.032 15.912 15.785 15.676 15.559 15.43 15.294 15.156 15.057 14.958 14.813 14.708 14.585 14.519 14.391 14.252 14.11 14.046 13.824 13.782 13.685 13.592 13.337 13.175 13.016 12.859 12.695 12.511 12.229 11.373 -5 ,21112 ,TETRA ,17668746,Fri Dec 3 07:05:25 CET,Fri Dec 3 08:53:27 CET,0.0 0.366 0.547 0.692 0.82 0.937 1.049 1.161 1.36 1.449 1.54 1.572 1.821 1.904 2.065 2.215 2.364 2.439 2.582 2.719 2.93 3.068 3.203 3.411 3.609 3.799 3.986 4.165 4.398 4.62 4.835 5.098 5.353 5.605 5.894 6.221 6.529 6.854 7.218 7.616 8.033 8.495 9.042 9.624 10.278 10.982 11.802 12.696 13.663 14.811 16.199 17.103 17.469 17.632 17.67 17.602 17.486 17.376 17.251 17.097 16.958 16.832 16.685 16.522 16.358 16.196 16.037 15.908 15.795 15.666 15.521 15.392 15.26 15.126 15.024 14.92 14.811 14.7 14.581 14.484 14.385 14.242 14.133 14.013 13.945 13.798 13.657 13.501 13.414 13.182 13.133 13.023 12.907 12.689 12.57 12.428 12.293 12.141 11.945 11.707 11.088 -6 ,18003 ,TETRA ,17668747,Fri Dec 3 07:07:26 CET,Fri Dec 3 08:57:18 CET,0.0 0.492 0.687 0.903 1.121 1.304 1.472 1.637 1.908 2.024 2.144 2.218 2.468 2.564 2.764 2.96 3.132 3.208 3.364 3.521 3.751 3.902 4.052 4.267 4.459 4.644 4.826 5.004 5.232 5.452 5.673 5.938 6.186 6.431 6.723 7.053 7.364 7.703 8.07 8.453 8.859 9.32 9.868 10.395 11.004 11.744 12.548 13.369 14.352 15.481 16.735 17.58 17.911 18.043 18.071 18.011 17.908 17.805 17.682 17.521 17.369 17.199 17.038 16.897 16.765 16.64 16.49 16.359 16.24 16.104 15.979 15.87 15.747 15.626 15.539 15.452 15.354 15.238 15.119 15.042 14.958 14.82 14.711 14.595 14.544 14.441 14.333 14.213 14.148 13.932 13.916 13.825 13.739 13.546 13.438 13.326 13.21 13.083 12.911 12.679 11.953 -7 ,18898 ,TETRA ,17668748,Fri Dec 3 07:12:51 CET,Fri Dec 3 09:05:07 CET,0.0 0.452 0.725 0.978 1.174 1.349 1.504 1.638 1.897 2.008 2.113 2.167 2.419 2.509 2.67 2.828 2.996 3.075 3.236 3.391 3.616 3.771 3.918 4.136 4.35 4.542 4.725 4.911 5.148 5.389 5.621 5.875 6.112 6.356 6.651 6.975 7.3 7.661 8.037 8.429 8.821 9.278 9.819 10.355 11.0 11.702 12.472 13.334 14.34 15.482 16.762 17.602 17.945 18.069 18.057 17.988 17.91 17.769 17.618 17.485 17.359 17.211 17.063 16.911 16.757 16.627 16.478 16.336 16.206 16.071 15.929 15.812 15.694 15.55 15.426 15.299 15.175 15.052 14.929 14.84 14.734 14.562 14.454 14.344 14.291 14.184 14.069 13.939 13.867 13.646 13.64 13.561 13.47 13.268 13.18 13.068 12.923 12.779 12.607 12.361 11.638 -8 ,23760 ,TETRA ,17668749,Fri Dec 3 07:12:51 CET,Fri Dec 3 09:03:24 CET,0.0 0.498 0.787 1.015 1.208 1.38 1.517 1.653 1.929 2.055 2.163 2.21 2.462 2.558 2.757 2.949 3.118 3.201 3.36 3.504 3.729 3.877 4.017 4.221 4.415 4.601 4.783 4.961 5.185 5.408 5.631 5.896 6.153 6.407 6.688 7.005 7.321 7.663 8.033 8.442 8.878 9.324 9.843 10.425 11.095 11.794 12.591 13.455 14.433 15.565 16.825 17.733 18.144 18.301 18.291 18.249 18.201 18.134 18.054 17.919 17.763 17.633 17.508 17.373 17.238 17.1 16.958 16.839 16.717 16.574 16.429 16.301 16.163 16.023 15.916 15.803 15.68 15.557 15.424 15.342 15.263 15.111 15.01 14.918 14.865 14.752 14.631 14.484 14.402 14.175 14.131 14.031 13.939 13.741 13.631 13.507 13.372 13.212 13.013 12.793 12.326 -9 ,19014 ,TETRA ,17668750,Fri Dec 3 07:12:52 CET,Fri Dec 3 09:03:19 CET,0.0 0.76 1.036 1.224 1.394 1.548 1.7 1.848 2.111 2.221 2.331 2.399 2.662 2.761 2.955 3.152 3.334 3.425 3.598 3.759 3.986 4.133 4.279 4.493 4.695 4.89 5.077 5.254 5.482 5.714 5.939 6.204 6.453 6.696 6.99 7.319 7.628 7.968 8.351 8.755 9.16 9.625 10.17 10.729 11.364 12.03 12.819 13.707 14.704 15.803 17.022 17.937 18.291 18.385 18.363 18.316 18.259 18.149 18.015 17.882 17.75 17.611 17.489 17.371 17.248 17.124 16.978 16.836 16.712 16.586 16.452 16.331 16.195 16.052 15.945 15.828 15.707 15.569 15.422 15.324 15.219 15.053 14.937 14.823 14.761 14.628 14.474 14.303 14.223 13.995 13.947 13.832 13.712 13.458 13.33 13.194 13.036 12.853 12.63 12.327 11.058 -10 ,16901 ,TETRA ,17668751,Fri Dec 3 07:12:55 CET,Fri Dec 3 09:03:34 CET,0.0 0.528 0.785 1.006 1.167 1.312 1.456 1.601 1.863 1.978 2.086 2.118 2.365 2.463 2.655 2.841 3.024 3.107 3.274 3.447 3.676 3.825 3.976 4.187 4.397 4.602 4.789 4.971 5.213 5.443 5.656 5.918 6.193 6.454 6.734 7.051 7.36 7.704 8.078 8.466 8.883 9.353 9.873 10.403 11.029 11.7 12.489 13.393 14.4 15.508 16.717 17.529 17.864 17.969 17.961 17.92 17.831 17.716 17.571 17.365 17.207 17.078 16.937 16.788 16.64 16.501 16.352 16.219 16.103 15.978 15.844 15.72 15.58 15.44 15.338 15.238 15.125 15.003 14.878 14.784 14.682 14.514 14.4 14.276 14.211 14.074 13.928 13.78 13.709 13.486 13.463 13.375 13.284 13.087 12.985 12.877 12.748 12.59 12.422 12.208 11.552 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8c.txt deleted file mode 100644 index f61acf2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10661 ,KEBNE ,16836572,Sun Dec 5 17:33:40 CET,Sun Dec 5 19:09:52 CET,0.0 0.876 1.15 1.369 1.527 1.65 1.761 1.857 2.026 2.106 2.177 2.162 2.396 2.468 2.579 2.687 2.791 2.841 2.932 3.027 3.169 3.248 3.324 3.423 3.506 3.586 3.671 3.755 3.851 3.946 4.044 4.158 4.265 4.359 4.461 4.566 4.674 4.789 4.884 4.97 5.045 5.111 5.17 5.222 5.26 5.259 5.186 4.999 4.639 3.919 2.56 0.73 -0.88 -2.193 -3.365 -4.457 -5.428 -6.267 -6.936 -7.644 -8.27 -8.812 -9.34 -9.827 -10.263 -10.658 -11.059 -11.407 -11.709 -12.024 -12.366 -12.653 -12.927 -13.212 -13.44 -13.666 -13.898 -14.152 -14.42 -14.598 -14.779 -15.065 -15.268 -15.478 -15.583 -15.806 -16.048 -16.308 -16.449 -16.763 -16.846 -16.985 -17.132 -17.485 -17.683 -17.88 -18.112 -18.389 -18.708 -19.1 -20.913 -2 ,18368 ,KEBNE ,16836573,Sun Dec 5 17:33:41 CET,Sun Dec 5 19:09:20 CET,0.0 0.736 1.1 1.354 1.535 1.667 1.787 1.905 2.118 2.212 2.281 2.252 2.476 2.539 2.651 2.75 2.84 2.89 3.0 3.093 3.21 3.298 3.384 3.483 3.568 3.648 3.732 3.824 3.929 4.025 4.125 4.244 4.36 4.47 4.572 4.67 4.763 4.862 4.97 5.069 5.156 5.235 5.335 5.421 5.474 5.517 5.463 5.274 4.917 4.291 3.066 1.187 -0.467 -1.847 -3.1 -4.198 -5.107 -5.931 -6.621 -7.309 -7.926 -8.463 -8.966 -9.44 -9.869 -10.255 -10.659 -11.016 -11.328 -11.658 -11.991 -12.263 -12.547 -12.843 -13.061 -13.278 -13.51 -13.764 -14.032 -14.207 -14.39 -14.68 -14.886 -15.094 -15.201 -15.426 -15.656 -15.882 -15.998 -16.306 -16.437 -16.594 -16.748 -17.093 -17.274 -17.488 -17.741 -18.007 -18.353 -18.831 -20.389 -3 ,20247 ,KEBNE ,16836574,Sun Dec 5 17:34:41 CET,Sun Dec 5 19:10:09 CET,0.0 0.761 0.973 1.153 1.328 1.461 1.577 1.675 1.838 1.915 1.989 1.987 2.218 2.286 2.391 2.494 2.604 2.653 2.739 2.823 2.952 3.028 3.103 3.21 3.302 3.398 3.497 3.583 3.683 3.787 3.877 3.969 4.061 4.151 4.248 4.35 4.458 4.565 4.667 4.77 4.849 4.896 4.958 5.022 5.051 5.04 4.986 4.816 4.424 3.729 2.441 0.701 -0.934 -2.327 -3.534 -4.63 -5.544 -6.381 -7.091 -7.768 -8.352 -8.869 -9.363 -9.841 -10.281 -10.674 -11.1 -11.467 -11.768 -12.105 -12.455 -12.729 -13.015 -13.31 -13.537 -13.772 -14.009 -14.265 -14.529 -14.712 -14.906 -15.184 -15.368 -15.562 -15.666 -15.897 -16.145 -16.393 -16.52 -16.831 -16.942 -17.1 -17.274 -17.606 -17.787 -18.011 -18.248 -18.499 -18.816 -19.275 -20.991 -4 ,12207 ,KEBNE ,16836575,Sun Dec 5 17:35:42 CET,Sun Dec 5 19:13:21 CET,0.0 0.917 1.205 1.385 1.518 1.643 1.753 1.86 2.046 2.135 2.218 2.203 2.428 2.499 2.632 2.74 2.832 2.883 2.983 3.074 3.216 3.299 3.372 3.476 3.585 3.692 3.781 3.863 3.969 4.067 4.151 4.249 4.338 4.434 4.537 4.631 4.72 4.8 4.859 4.908 4.958 5.021 5.086 5.139 5.175 5.171 5.108 4.912 4.534 3.798 2.443 0.658 -0.942 -2.372 -3.628 -4.72 -5.656 -6.489 -7.219 -7.951 -8.572 -9.117 -9.608 -10.075 -10.539 -10.948 -11.353 -11.71 -12.019 -12.326 -12.634 -12.895 -13.179 -13.473 -13.696 -13.935 -14.187 -14.444 -14.703 -14.888 -15.066 -15.333 -15.533 -15.744 -15.856 -16.079 -16.316 -16.575 -16.7 -17.008 -17.138 -17.311 -17.481 -17.809 -17.988 -18.176 -18.399 -18.656 -18.943 -19.352 -20.777 -5 ,16823 ,KEBNE ,16836576,Sun Dec 5 17:36:42 CET,Sun Dec 5 19:12:29 CET,0.0 0.702 0.977 1.19 1.343 1.468 1.585 1.684 1.878 1.971 2.042 2.033 2.253 2.318 2.452 2.561 2.666 2.722 2.827 2.921 3.044 3.13 3.205 3.308 3.419 3.507 3.572 3.64 3.753 3.856 3.949 4.062 4.157 4.257 4.361 4.448 4.528 4.615 4.719 4.842 4.956 5.058 5.161 5.232 5.253 5.249 5.207 5.047 4.674 4.046 2.777 0.973 -0.581 -1.942 -3.142 -4.227 -5.146 -5.971 -6.714 -7.452 -8.074 -8.641 -9.174 -9.647 -10.077 -10.482 -10.916 -11.291 -11.603 -11.917 -12.238 -12.517 -12.814 -13.123 -13.359 -13.585 -13.821 -14.082 -14.349 -14.537 -14.732 -15.039 -15.254 -15.471 -15.576 -15.792 -16.041 -16.298 -16.423 -16.731 -16.852 -17.015 -17.169 -17.529 -17.747 -17.971 -18.217 -18.523 -18.922 -19.404 -20.959 -6 ,26719 ,KEBNE ,16836577,Sun Dec 5 17:37:44 CET,Sun Dec 5 19:16:47 CET,0.0 0.958 1.243 1.439 1.599 1.72 1.817 1.917 2.117 2.203 2.281 2.274 2.494 2.558 2.68 2.795 2.903 2.955 3.043 3.129 3.257 3.33 3.397 3.502 3.601 3.684 3.768 3.857 3.974 4.082 4.185 4.304 4.407 4.499 4.605 4.72 4.843 4.965 5.06 5.14 5.225 5.328 5.422 5.486 5.523 5.523 5.468 5.288 4.907 4.231 2.802 0.821 -0.752 -2.022 -3.173 -4.272 -5.22 -6.06 -6.801 -7.529 -8.114 -8.632 -9.103 -9.548 -9.988 -10.405 -10.832 -11.193 -11.506 -11.821 -12.156 -12.44 -12.72 -13.011 -13.239 -13.466 -13.705 -13.959 -14.222 -14.4 -14.581 -14.874 -15.095 -15.325 -15.439 -15.672 -15.911 -16.159 -16.293 -16.619 -16.749 -16.913 -17.084 -17.43 -17.609 -17.819 -18.077 -18.355 -18.718 -19.202 -20.607 -7 ,8938 ,KEBNE ,16836578,Sun Dec 5 17:37:44 CET,Sun Dec 5 19:16:25 CET,0.0 0.506 0.77 1.014 1.205 1.328 1.424 1.514 1.678 1.763 1.849 1.844 2.058 2.114 2.234 2.346 2.458 2.518 2.622 2.719 2.856 2.938 3.016 3.118 3.201 3.297 3.406 3.504 3.619 3.715 3.807 3.916 4.013 4.107 4.209 4.322 4.413 4.486 4.593 4.71 4.817 4.92 5.006 5.067 5.1 5.107 5.068 4.911 4.604 4.047 2.767 1.071 -0.4 -1.629 -2.681 -3.656 -4.464 -5.186 -5.835 -6.535 -7.16 -7.719 -8.224 -8.679 -9.123 -9.52 -9.914 -10.278 -10.605 -10.925 -11.261 -11.553 -11.839 -12.133 -12.358 -12.593 -12.824 -13.062 -13.32 -13.494 -13.678 -13.978 -14.185 -14.387 -14.487 -14.69 -14.919 -15.166 -15.296 -15.609 -15.734 -15.895 -16.047 -16.378 -16.571 -16.797 -17.057 -17.348 -17.69 -18.107 -19.774 -8 ,22976 ,KEBNE ,16836579,Sun Dec 5 17:38:44 CET,Sun Dec 5 19:13:59 CET,0.0 0.774 1.063 1.277 1.468 1.625 1.751 1.86 2.04 2.122 2.2 2.194 2.415 2.477 2.611 2.741 2.847 2.899 2.995 3.079 3.207 3.293 3.367 3.465 3.573 3.672 3.759 3.845 3.962 4.072 4.168 4.282 4.398 4.498 4.588 4.68 4.77 4.869 4.975 5.072 5.174 5.264 5.331 5.391 5.428 5.435 5.395 5.267 4.917 4.192 2.814 0.968 -0.57 -1.946 -3.211 -4.334 -5.287 -6.114 -6.808 -7.513 -8.115 -8.643 -9.141 -9.623 -10.065 -10.436 -10.832 -11.192 -11.493 -11.808 -12.154 -12.443 -12.722 -13.011 -13.239 -13.468 -13.716 -13.984 -14.255 -14.431 -14.614 -14.918 -15.118 -15.309 -15.407 -15.619 -15.875 -16.146 -16.277 -16.588 -16.687 -16.836 -17.001 -17.388 -17.603 -17.804 -18.036 -18.297 -18.572 -18.991 -20.623 -9 ,12692 ,KEBNE ,16836580,Sun Dec 5 17:41:46 CET,Sun Dec 5 19:18:16 CET,0.0 0.773 1.052 1.234 1.382 1.527 1.659 1.771 1.955 2.04 2.121 2.106 2.32 2.388 2.521 2.636 2.742 2.787 2.88 2.976 3.103 3.188 3.272 3.379 3.481 3.571 3.657 3.75 3.859 3.962 4.054 4.144 4.231 4.322 4.435 4.546 4.626 4.708 4.818 4.928 5.031 5.143 5.257 5.335 5.385 5.393 5.357 5.236 4.904 4.221 2.948 1.282 -0.274 -1.595 -2.694 -3.709 -4.616 -5.418 -6.099 -6.76 -7.337 -7.869 -8.387 -8.848 -9.264 -9.676 -10.092 -10.449 -10.774 -11.116 -11.465 -11.762 -12.06 -12.372 -12.621 -12.868 -13.111 -13.359 -13.624 -13.807 -13.998 -14.296 -14.503 -14.714 -14.82 -15.05 -15.3 -15.572 -15.707 -16.023 -16.149 -16.319 -16.493 -16.837 -17.022 -17.231 -17.447 -17.678 -17.971 -18.417 -20.107 -10 ,16959 ,KEBNE ,16836581,Sun Dec 5 17:45:47 CET,Sun Dec 5 19:21:48 CET,0.0 0.913 1.217 1.414 1.578 1.719 1.84 1.947 2.137 2.227 2.314 2.305 2.52 2.583 2.709 2.825 2.925 2.971 3.06 3.146 3.275 3.357 3.433 3.543 3.652 3.747 3.827 3.913 4.022 4.127 4.23 4.339 4.433 4.527 4.625 4.722 4.809 4.878 4.967 5.074 5.172 5.281 5.371 5.399 5.421 5.436 5.366 5.193 4.879 4.236 2.816 0.984 -0.577 -2.016 -3.291 -4.379 -5.266 -6.097 -6.848 -7.559 -8.139 -8.665 -9.154 -9.61 -10.031 -10.409 -10.821 -11.192 -11.512 -11.838 -12.176 -12.459 -12.747 -13.053 -13.283 -13.516 -13.758 -14.011 -14.279 -14.462 -14.647 -14.952 -15.163 -15.371 -15.485 -15.709 -15.929 -16.164 -16.297 -16.62 -16.728 -16.878 -17.037 -17.373 -17.561 -17.763 -17.988 -18.263 -18.601 -19.041 -20.837 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8b.txt deleted file mode 100644 index 4d5dd0ad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4457 ,TETRA ,17668762,Fri Dec 3 07:13:53 CET,Fri Dec 3 09:05:49 CET,0.0 0.421 0.675 0.873 1.04 1.183 1.318 1.462 1.723 1.835 1.939 1.967 2.232 2.327 2.503 2.69 2.876 2.967 3.154 3.331 3.586 3.76 3.923 4.155 4.392 4.633 4.862 5.075 5.361 5.635 5.909 6.259 6.588 6.897 7.27 7.693 8.088 8.527 9.016 9.538 10.107 10.775 11.546 12.35 13.315 14.395 15.659 17.15 18.955 21.063 23.586 25.797 27.124 27.929 28.468 28.848 29.088 29.244 29.343 29.426 29.468 29.49 29.517 29.53 29.525 29.488 29.426 29.374 29.318 29.253 29.187 29.135 29.087 29.019 28.957 28.887 28.801 28.712 28.627 28.558 28.484 28.368 28.279 28.193 28.148 28.058 27.975 27.875 27.812 27.61 27.616 27.531 27.446 27.284 27.19 27.076 26.936 26.774 26.555 26.279 25.633 -2 ,23045 ,TETRA ,17668763,Fri Dec 3 07:13:55 CET,Fri Dec 3 09:05:26 CET,0.0 0.302 0.516 0.714 0.876 1.018 1.155 1.279 1.528 1.643 1.747 1.796 2.061 2.154 2.367 2.596 2.811 2.908 3.089 3.262 3.511 3.671 3.827 4.058 4.283 4.517 4.743 4.952 5.221 5.492 5.757 6.089 6.413 6.725 7.104 7.531 7.939 8.394 8.89 9.431 10.007 10.667 11.461 12.264 13.192 14.221 15.404 16.772 18.416 20.406 22.851 24.888 26.127 26.94 27.454 27.813 28.071 28.249 28.363 28.428 28.462 28.475 28.462 28.455 28.429 28.386 28.331 28.281 28.251 28.225 28.186 28.135 28.073 28.01 27.965 27.914 27.852 27.787 27.719 27.672 27.619 27.531 27.474 27.41 27.372 27.292 27.204 27.113 27.058 26.852 26.89 26.826 26.752 26.597 26.513 26.435 26.319 26.142 25.949 25.722 25.197 -3 ,1548 ,TETRA ,17668764,Fri Dec 3 07:15:45 CET,Fri Dec 3 09:07:57 CET,0.0 0.585 0.919 1.228 1.494 1.726 1.928 2.102 2.413 2.558 2.693 2.777 3.062 3.184 3.416 3.641 3.853 3.952 4.155 4.34 4.609 4.784 4.948 5.2 5.448 5.675 5.893 6.114 6.403 6.686 6.958 7.283 7.606 7.927 8.316 8.763 9.185 9.651 10.152 10.68 11.255 11.902 12.673 13.475 14.422 15.515 16.814 18.284 20.028 22.191 24.927 27.245 28.571 29.39 29.904 30.26 30.511 30.68 30.778 30.833 30.878 30.909 30.903 30.886 30.86 30.822 30.77 30.706 30.65 30.588 30.516 30.458 30.394 30.315 30.256 30.193 30.121 30.032 29.916 29.836 29.763 29.661 29.584 29.491 29.447 29.351 29.236 29.125 29.069 28.86 28.835 28.745 28.664 28.481 28.38 28.281 28.167 28.034 27.882 27.675 27.066 -4 ,14049 ,TETRA ,17668765,Fri Dec 3 07:15:45 CET,Fri Dec 3 09:07:50 CET,0.0 0.327 0.521 0.723 0.916 1.079 1.234 1.389 1.664 1.786 1.908 1.964 2.243 2.364 2.583 2.783 2.972 3.068 3.254 3.418 3.667 3.832 3.994 4.243 4.48 4.706 4.925 5.133 5.419 5.709 5.976 6.322 6.659 6.957 7.311 7.713 8.106 8.554 9.042 9.566 10.122 10.754 11.478 12.204 13.098 14.113 15.296 16.66 18.27 20.287 22.785 24.888 26.159 26.969 27.493 27.862 28.112 28.291 28.411 28.471 28.477 28.495 28.512 28.499 28.466 28.426 28.385 28.339 28.281 28.215 28.136 28.06 27.992 27.931 27.872 27.792 27.717 27.646 27.554 27.488 27.421 27.308 27.224 27.136 27.096 27.013 26.927 26.845 26.805 26.614 26.637 26.568 26.5 26.324 26.229 26.132 26.026 25.92 25.788 25.578 24.965 -5 ,17479 ,TETRA ,17668766,Fri Dec 3 07:15:47 CET,Fri Dec 3 09:07:58 CET,0.0 0.596 0.867 1.073 1.259 1.421 1.557 1.69 1.98 2.128 2.262 2.337 2.617 2.728 2.932 3.13 3.321 3.411 3.595 3.782 4.028 4.177 4.334 4.582 4.815 5.026 5.242 5.462 5.733 6.005 6.287 6.623 6.95 7.27 7.625 8.021 8.416 8.857 9.348 9.878 10.445 11.098 11.858 12.622 13.526 14.558 15.776 17.188 18.88 20.87 23.328 25.353 26.563 27.416 27.977 28.359 28.619 28.792 28.885 28.962 29.001 29.001 28.976 28.952 28.941 28.912 28.878 28.844 28.789 28.721 28.656 28.602 28.535 28.454 28.392 28.323 28.244 28.148 28.05 27.985 27.909 27.799 27.731 27.65 27.612 27.548 27.46 27.354 27.296 27.085 27.089 27.016 26.949 26.799 26.718 26.635 26.532 26.41 26.277 26.14 25.843 -6 ,21658 ,TETRA ,17668767,Fri Dec 3 07:15:49 CET,Fri Dec 3 09:08:03 CET,0.0 0.458 0.672 0.857 1.03 1.18 1.325 1.468 1.734 1.867 1.998 2.072 2.345 2.454 2.657 2.856 3.044 3.131 3.314 3.504 3.771 3.937 4.096 4.33 4.558 4.774 4.993 5.212 5.488 5.749 6.01 6.341 6.657 6.952 7.308 7.715 8.102 8.537 9.0 9.493 10.053 10.707 11.454 12.216 13.147 14.203 15.397 16.773 18.447 20.414 22.827 24.914 26.173 26.986 27.492 27.833 28.085 28.236 28.327 28.399 28.417 28.407 28.388 28.38 28.359 28.308 28.245 28.18 28.118 28.053 27.988 27.935 27.873 27.798 27.74 27.676 27.608 27.532 27.448 27.39 27.326 27.223 27.149 27.07 27.03 26.942 26.844 26.724 26.659 26.452 26.454 26.386 26.314 26.124 26.021 25.914 25.787 25.628 25.424 25.126 24.207 -7 ,25343 ,TETRA ,17668768,Fri Dec 3 07:15:45 CET,Fri Dec 3 09:07:41 CET,0.0 0.506 0.789 1.0 1.189 1.359 1.504 1.644 1.903 2.023 2.139 2.19 2.467 2.583 2.804 3.023 3.224 3.315 3.5 3.687 3.957 4.127 4.292 4.535 4.774 5.006 5.216 5.413 5.694 5.987 6.278 6.642 6.992 7.322 7.689 8.079 8.464 8.91 9.393 9.909 10.47 11.115 11.871 12.64 13.54 14.538 15.724 17.094 18.692 20.661 23.152 25.212 26.407 27.19 27.72 28.078 28.332 28.501 28.591 28.658 28.686 28.692 28.701 28.708 28.684 28.641 28.607 28.558 28.505 28.446 28.379 28.323 28.256 28.182 28.131 28.071 27.989 27.908 27.831 27.77 27.699 27.583 27.495 27.406 27.365 27.278 27.173 27.07 27.011 26.794 26.805 26.739 26.676 26.534 26.443 26.332 26.218 26.085 25.92 25.739 25.49 -8 ,1148 ,TETRA ,17668769,Fri Dec 3 07:15:45 CET,Fri Dec 3 09:07:30 CET,0.0 0.426 0.7 0.924 1.101 1.258 1.429 1.586 1.847 1.979 2.107 2.187 2.472 2.583 2.795 3.01 3.21 3.308 3.496 3.675 3.933 4.106 4.28 4.531 4.772 5.005 5.219 5.424 5.684 5.958 6.24 6.57 6.889 7.199 7.566 7.99 8.392 8.834 9.327 9.867 10.452 11.106 11.876 12.668 13.619 14.71 15.982 17.467 19.255 21.371 24.071 26.42 27.786 28.648 29.192 29.569 29.814 29.99 30.105 30.166 30.197 30.208 30.201 30.182 30.133 30.092 30.057 30.01 29.951 29.875 29.798 29.728 29.654 29.555 29.475 29.408 29.324 29.232 29.15 29.088 29.018 28.913 28.831 28.742 28.698 28.607 28.51 28.391 28.325 28.115 28.11 28.024 27.932 27.754 27.654 27.516 27.375 27.233 27.01 26.736 26.134 -9 ,4659 ,TETRA ,17668770,Fri Dec 3 07:15:47 CET,Fri Dec 3 09:07:43 CET,0.0 0.442 0.685 0.88 1.067 1.231 1.373 1.503 1.774 1.906 2.022 2.101 2.394 2.506 2.717 2.936 3.154 3.256 3.45 3.647 3.93 4.102 4.27 4.513 4.753 4.981 5.203 5.427 5.725 6.01 6.272 6.593 6.919 7.233 7.597 8.024 8.435 8.888 9.388 9.916 10.465 11.093 11.839 12.597 13.525 14.582 15.801 17.184 18.781 20.706 23.147 25.263 26.495 27.263 27.759 28.114 28.348 28.477 28.553 28.62 28.65 28.653 28.628 28.578 28.544 28.512 28.462 28.409 28.359 28.306 28.236 28.175 28.117 28.051 27.994 27.919 27.843 27.773 27.689 27.633 27.566 27.445 27.367 27.283 27.235 27.121 27.01 26.898 26.841 26.645 26.665 26.582 26.496 26.32 26.227 26.125 26.002 25.836 25.616 25.292 24.254 -10 ,32477 ,TETRA ,17668771,Fri Dec 3 07:15:49 CET,Fri Dec 3 09:07:33 CET,0.0 0.807 1.14 1.369 1.546 1.739 1.918 2.064 2.323 2.455 2.584 2.664 2.945 3.062 3.284 3.499 3.701 3.793 3.979 4.178 4.477 4.655 4.827 5.083 5.321 5.562 5.785 5.998 6.275 6.543 6.82 7.163 7.495 7.811 8.17 8.585 9.008 9.479 9.983 10.521 11.097 11.757 12.52 13.31 14.256 15.292 16.503 17.888 19.531 21.523 23.988 26.118 27.374 28.18 28.69 29.027 29.264 29.44 29.571 29.668 29.72 29.731 29.718 29.695 29.677 29.648 29.598 29.554 29.51 29.454 29.385 29.315 29.243 29.181 29.129 29.07 29.006 28.929 28.846 28.786 28.718 28.613 28.534 28.454 28.414 28.306 28.196 28.087 28.026 27.816 27.803 27.719 27.617 27.388 27.287 27.177 27.045 26.897 26.674 26.322 25.532 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8d.txt deleted file mode 100644 index 7821dfc1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27122 ,TETRA ,17668772,Fri Dec 3 07:15:46 CET,Fri Dec 3 09:08:01 CET,0.0 0.495 0.648 0.771 0.899 1.009 1.106 1.196 1.348 1.409 1.475 1.444 1.678 1.733 1.826 1.914 2.008 2.054 2.127 2.192 2.289 2.354 2.413 2.49 2.553 2.618 2.683 2.746 2.827 2.889 2.95 3.032 3.111 3.189 3.252 3.304 3.358 3.408 3.451 3.474 3.5 3.549 3.587 3.571 3.49 3.389 3.232 2.94 2.471 1.72 0.412 -1.203 -2.545 -3.692 -4.726 -5.669 -6.46 -7.158 -7.78 -8.409 -8.934 -9.407 -9.859 -10.291 -10.677 -11.022 -11.391 -11.716 -12.005 -12.31 -12.615 -12.868 -13.132 -13.393 -13.594 -13.822 -14.053 -14.287 -14.535 -14.707 -14.888 -15.163 -15.358 -15.573 -15.681 -15.904 -16.144 -16.39 -16.51 -16.818 -16.895 -17.045 -17.203 -17.546 -17.748 -17.966 -18.201 -18.463 -18.799 -19.275 -20.556 -2 ,347 ,TETRA ,17668773,Fri Dec 3 07:15:45 CET,Fri Dec 3 09:08:22 CET,0.0 0.419 0.624 0.792 0.922 1.01 1.089 1.161 1.283 1.349 1.423 1.395 1.614 1.671 1.778 1.862 1.936 1.975 2.051 2.118 2.207 2.267 2.318 2.382 2.451 2.51 2.56 2.609 2.669 2.746 2.819 2.884 2.941 2.993 3.044 3.099 3.144 3.188 3.234 3.278 3.327 3.35 3.343 3.33 3.285 3.194 3.034 2.74 2.28 1.554 0.232 -1.415 -2.794 -3.986 -4.986 -5.876 -6.649 -7.351 -7.963 -8.555 -9.065 -9.546 -10.007 -10.425 -10.814 -11.171 -11.538 -11.853 -12.119 -12.401 -12.719 -12.992 -13.25 -13.515 -13.727 -13.944 -14.171 -14.412 -14.67 -14.843 -15.018 -15.292 -15.479 -15.676 -15.775 -15.985 -16.217 -16.464 -16.587 -16.901 -16.996 -17.145 -17.303 -17.643 -17.849 -18.074 -18.303 -18.544 -18.841 -19.247 -20.403 -3 ,4863 ,TETRA ,17668774,Fri Dec 3 07:15:45 CET,Fri Dec 3 09:08:52 CET,0.0 0.728 1.006 1.174 1.277 1.378 1.479 1.575 1.756 1.83 1.892 1.847 2.071 2.122 2.212 2.294 2.368 2.404 2.471 2.548 2.644 2.701 2.754 2.822 2.89 2.948 3.01 3.069 3.134 3.197 3.267 3.351 3.413 3.462 3.509 3.563 3.622 3.681 3.732 3.782 3.822 3.837 3.844 3.823 3.75 3.651 3.497 3.202 2.706 1.957 0.605 -1.079 -2.461 -3.649 -4.697 -5.632 -6.432 -7.149 -7.755 -8.367 -8.91 -9.378 -9.818 -10.239 -10.633 -10.977 -11.307 -11.609 -11.891 -12.196 -12.513 -12.773 -13.024 -13.278 -13.478 -13.691 -13.937 -14.18 -14.417 -14.594 -14.78 -15.063 -15.257 -15.464 -15.567 -15.777 -15.992 -16.22 -16.347 -16.668 -16.764 -16.915 -17.078 -17.419 -17.609 -17.832 -18.081 -18.364 -18.689 -19.123 -20.196 -4 ,29129 ,TETRA ,17668775,Fri Dec 3 07:15:46 CET,Fri Dec 3 09:08:42 CET,0.0 0.304 0.454 0.578 0.694 0.79 0.868 0.939 1.063 1.128 1.195 1.147 1.366 1.418 1.503 1.574 1.645 1.682 1.758 1.831 1.926 1.984 2.033 2.099 2.165 2.233 2.297 2.36 2.438 2.506 2.571 2.646 2.71 2.765 2.83 2.877 2.911 2.966 3.025 3.072 3.098 3.131 3.168 3.165 3.114 3.008 2.823 2.539 2.099 1.367 0.031 -1.637 -2.983 -4.158 -5.18 -6.096 -6.898 -7.611 -8.219 -8.833 -9.378 -9.86 -10.317 -10.748 -11.128 -11.47 -11.833 -12.16 -12.443 -12.74 -13.038 -13.279 -13.531 -13.801 -14.024 -14.257 -14.487 -14.73 -14.996 -15.171 -15.347 -15.631 -15.826 -16.024 -16.129 -16.343 -16.562 -16.804 -16.933 -17.249 -17.313 -17.453 -17.599 -17.92 -18.113 -18.325 -18.59 -18.911 -19.245 -19.669 -21.085 -5 ,14840 ,TETRA ,17668776,Fri Dec 3 07:15:45 CET,Fri Dec 3 09:07:56 CET,0.0 0.807 1.101 1.289 1.422 1.53 1.613 1.687 1.875 1.956 2.016 1.971 2.193 2.249 2.361 2.465 2.558 2.598 2.669 2.737 2.839 2.907 2.963 3.033 3.106 3.169 3.223 3.274 3.34 3.408 3.471 3.544 3.616 3.669 3.712 3.771 3.829 3.87 3.909 3.936 3.957 3.984 3.991 3.969 3.929 3.842 3.669 3.411 2.962 2.172 0.774 -0.976 -2.402 -3.593 -4.653 -5.584 -6.355 -7.068 -7.699 -8.318 -8.843 -9.306 -9.747 -10.159 -10.542 -10.895 -11.273 -11.61 -11.897 -12.194 -12.504 -12.758 -13.016 -13.289 -13.495 -13.715 -13.935 -14.149 -14.379 -14.545 -14.725 -15.02 -15.222 -15.434 -15.545 -15.762 -15.99 -16.22 -16.335 -16.648 -16.762 -16.92 -17.07 -17.392 -17.574 -17.78 -18.014 -18.28 -18.611 -19.075 -20.14 -6 ,32516 ,TETRA ,17668777,Fri Dec 3 07:15:46 CET,Fri Dec 3 09:07:55 CET,0.0 0.575 0.756 0.885 1.006 1.136 1.253 1.343 1.494 1.574 1.64 1.586 1.802 1.851 1.954 2.039 2.1 2.134 2.207 2.266 2.358 2.417 2.468 2.551 2.628 2.703 2.774 2.83 2.906 2.975 3.043 3.128 3.203 3.268 3.333 3.393 3.448 3.492 3.514 3.543 3.571 3.59 3.574 3.528 3.479 3.379 3.203 2.931 2.475 1.725 0.333 -1.318 -2.665 -3.857 -4.874 -5.78 -6.578 -7.305 -7.929 -8.519 -9.011 -9.444 -9.866 -10.273 -10.649 -10.995 -11.355 -11.662 -11.937 -12.239 -12.541 -12.798 -13.071 -13.348 -13.568 -13.799 -14.029 -14.261 -14.5 -14.672 -14.864 -15.141 -15.322 -15.505 -15.604 -15.831 -16.056 -16.292 -16.419 -16.745 -16.848 -17.009 -17.174 -17.518 -17.711 -17.904 -18.135 -18.432 -18.76 -19.224 -20.553 -7 ,31144 ,TETRA ,17668778,Fri Dec 3 07:15:45 CET,Fri Dec 3 09:07:04 CET,0.0 0.509 0.738 0.888 1.013 1.124 1.226 1.303 1.411 1.48 1.558 1.525 1.749 1.806 1.9 1.972 2.041 2.081 2.166 2.238 2.33 2.388 2.439 2.51 2.576 2.638 2.692 2.744 2.806 2.866 2.933 2.995 3.05 3.115 3.194 3.265 3.317 3.369 3.407 3.432 3.44 3.449 3.457 3.44 3.399 3.307 3.138 2.854 2.385 1.615 0.279 -1.429 -2.846 -4.024 -5.057 -5.95 -6.741 -7.47 -8.079 -8.692 -9.233 -9.729 -10.19 -10.588 -10.94 -11.292 -11.661 -11.979 -12.262 -12.554 -12.863 -13.126 -13.395 -13.685 -13.908 -14.127 -14.356 -14.576 -14.803 -14.984 -15.178 -15.471 -15.676 -15.884 -15.988 -16.201 -16.417 -16.644 -16.761 -17.077 -17.175 -17.329 -17.486 -17.838 -18.031 -18.243 -18.493 -18.774 -19.107 -19.558 -20.824 -8 ,4680 ,TETRA ,17668779,Fri Dec 3 07:15:45 CET,Fri Dec 3 09:06:58 CET,0.0 0.448 0.65 0.807 0.924 1.033 1.135 1.217 1.355 1.42 1.48 1.429 1.652 1.713 1.811 1.89 1.978 2.023 2.103 2.175 2.259 2.31 2.371 2.453 2.53 2.61 2.677 2.739 2.814 2.875 2.935 3.004 3.067 3.137 3.216 3.278 3.331 3.385 3.43 3.472 3.497 3.51 3.501 3.471 3.431 3.354 3.196 2.918 2.449 1.659 0.253 -1.5 -2.966 -4.182 -5.204 -6.102 -6.851 -7.537 -8.153 -8.769 -9.291 -9.768 -10.222 -10.626 -11.01 -11.366 -11.72 -12.03 -12.309 -12.591 -12.888 -13.159 -13.447 -13.737 -13.947 -14.155 -14.379 -14.604 -14.831 -14.994 -15.165 -15.438 -15.644 -15.86 -15.963 -16.164 -16.385 -16.64 -16.772 -17.091 -17.185 -17.347 -17.517 -17.859 -18.047 -18.262 -18.496 -18.769 -19.083 -19.472 -20.867 -9 ,5052 ,TETRA ,17668780,Fri Dec 3 07:16:40 CET,Fri Dec 3 09:09:12 CET,0.0 0.464 0.681 0.867 1.012 1.13 1.24 1.333 1.469 1.531 1.587 1.53 1.752 1.811 1.913 2.0 2.083 2.121 2.186 2.247 2.341 2.405 2.457 2.528 2.592 2.657 2.721 2.777 2.854 2.925 2.986 3.056 3.113 3.165 3.214 3.257 3.298 3.339 3.378 3.415 3.453 3.485 3.497 3.475 3.409 3.317 3.152 2.875 2.43 1.652 0.27 -1.368 -2.725 -3.965 -5.047 -5.985 -6.796 -7.527 -8.154 -8.774 -9.268 -9.722 -10.181 -10.59 -10.962 -11.302 -11.667 -11.987 -12.26 -12.555 -12.866 -13.121 -13.381 -13.641 -13.843 -14.058 -14.279 -14.507 -14.754 -14.936 -15.119 -15.4 -15.591 -15.792 -15.905 -16.118 -16.322 -16.556 -16.683 -16.999 -17.084 -17.23 -17.385 -17.722 -17.898 -18.096 -18.332 -18.596 -18.926 -19.388 -20.79 -10 ,15075 ,TETRA ,17668781,Fri Dec 3 07:16:40 CET,Fri Dec 3 09:08:11 CET,0.0 0.437 0.684 0.899 1.059 1.154 1.239 1.318 1.457 1.53 1.594 1.549 1.774 1.824 1.903 1.977 2.062 2.103 2.177 2.247 2.329 2.376 2.427 2.496 2.561 2.632 2.696 2.749 2.821 2.888 2.956 3.032 3.094 3.153 3.218 3.277 3.334 3.394 3.437 3.466 3.474 3.488 3.484 3.45 3.387 3.273 3.091 2.781 2.29 1.535 0.201 -1.466 -2.868 -4.067 -5.071 -5.937 -6.722 -7.446 -8.064 -8.645 -9.123 -9.575 -10.0 -10.403 -10.798 -11.143 -11.502 -11.822 -12.1 -12.401 -12.713 -12.969 -13.225 -13.493 -13.706 -13.921 -14.138 -14.377 -14.64 -14.817 -14.989 -15.248 -15.426 -15.626 -15.726 -15.943 -16.187 -16.426 -16.554 -16.88 -16.966 -17.115 -17.288 -17.639 -17.83 -18.054 -18.291 -18.562 -18.875 -19.236 -20.288 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8e.txt deleted file mode 100644 index d1b2b631..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4194 ,TETRA ,17668782,Fri Dec 3 07:16:40 CET,Fri Dec 3 09:08:22 CET,0.0 0.417 0.632 0.808 0.946 1.063 1.168 1.27 1.485 1.586 1.683 1.682 1.912 1.98 2.118 2.252 2.386 2.451 2.575 2.698 2.874 2.977 3.078 3.225 3.363 3.508 3.655 3.797 3.976 4.138 4.286 4.479 4.678 4.864 5.077 5.32 5.556 5.812 6.072 6.361 6.676 7.026 7.443 7.872 8.359 8.889 9.525 10.251 11.096 12.061 13.113 13.876 14.23 14.377 14.401 14.342 14.267 14.181 14.087 13.99 13.891 13.781 13.647 13.507 13.385 13.279 13.163 13.057 12.948 12.807 12.673 12.572 12.468 12.352 12.256 12.156 12.057 11.953 11.836 11.76 11.689 11.573 11.472 11.374 11.329 11.23 11.119 10.984 10.91 10.676 10.673 10.588 10.496 10.303 10.193 10.066 9.927 9.762 9.552 9.299 8.657 -2 ,18216 ,TETRA ,17668783,Fri Dec 3 07:16:42 CET,Fri Dec 3 09:08:22 CET,0.0 0.517 0.76 0.937 1.066 1.177 1.288 1.404 1.621 1.724 1.817 1.828 2.075 2.149 2.282 2.414 2.548 2.609 2.733 2.859 3.029 3.131 3.238 3.404 3.559 3.708 3.847 3.979 4.147 4.312 4.466 4.654 4.836 5.012 5.232 5.469 5.689 5.944 6.235 6.538 6.846 7.193 7.607 8.039 8.528 9.065 9.674 10.337 11.154 12.121 13.17 13.888 14.248 14.418 14.491 14.515 14.485 14.412 14.3 14.162 14.041 13.925 13.804 13.67 13.551 13.436 13.306 13.195 13.095 12.995 12.877 12.761 12.642 12.514 12.417 12.324 12.222 12.113 11.995 11.907 11.815 11.677 11.583 11.478 11.424 11.323 11.212 11.088 11.025 10.812 10.836 10.763 10.701 10.573 10.492 10.399 10.303 10.194 10.062 9.923 9.672 -3 ,12697 ,TETRA ,17668784,Fri Dec 3 07:16:43 CET,Fri Dec 3 09:10:06 CET,0.0 0.461 0.732 0.948 1.091 1.202 1.325 1.445 1.627 1.712 1.791 1.757 1.996 2.071 2.198 2.317 2.443 2.504 2.62 2.733 2.902 3.012 3.112 3.257 3.396 3.534 3.667 3.8 3.971 4.132 4.284 4.481 4.677 4.858 5.071 5.315 5.546 5.8 6.081 6.374 6.678 7.024 7.426 7.847 8.33 8.879 9.515 10.207 11.041 12.014 13.105 13.883 14.227 14.357 14.404 14.389 14.321 14.223 14.12 14.01 13.903 13.785 13.675 13.562 13.437 13.33 13.215 13.113 13.029 12.927 12.803 12.702 12.603 12.486 12.381 12.281 12.182 12.071 11.95 11.869 11.793 11.666 11.571 11.479 11.428 11.312 11.19 11.07 11.003 10.771 10.766 10.681 10.595 10.388 10.281 10.19 10.076 9.895 9.675 9.391 8.595 -4 ,32086 ,TETRA ,17668785,Fri Dec 3 07:16:46 CET,Fri Dec 3 09:09:40 CET,0.0 0.203 0.329 0.423 0.497 0.574 0.662 0.755 0.921 0.996 1.068 1.023 1.243 1.296 1.412 1.516 1.609 1.659 1.765 1.87 2.018 2.112 2.208 2.355 2.499 2.635 2.773 2.905 3.066 3.227 3.399 3.619 3.811 3.986 4.2 4.455 4.708 4.981 5.274 5.585 5.905 6.275 6.691 7.086 7.569 8.114 8.719 9.421 10.254 11.212 12.3 13.038 13.351 13.48 13.499 13.467 13.402 13.311 13.214 13.097 12.983 12.886 12.795 12.703 12.608 12.503 12.394 12.309 12.236 12.148 12.047 11.954 11.853 11.759 11.694 11.624 11.54 11.454 11.357 11.293 11.231 11.13 11.057 10.981 10.943 10.853 10.762 10.662 10.606 10.392 10.408 10.335 10.259 10.064 9.966 9.877 9.774 9.647 9.51 9.365 9.057 -5 ,2489 ,TETRA ,17668786,Fri Dec 3 07:17:39 CET,Fri Dec 3 09:11:25 CET,0.0 0.416 0.593 0.724 0.861 1.011 1.141 1.256 1.473 1.573 1.666 1.675 1.918 1.993 2.136 2.288 2.432 2.494 2.61 2.719 2.89 2.999 3.101 3.25 3.399 3.549 3.693 3.837 4.014 4.184 4.352 4.543 4.723 4.899 5.105 5.35 5.593 5.859 6.149 6.433 6.723 7.073 7.51 7.94 8.436 9.014 9.645 10.316 11.087 12.031 13.124 13.848 14.191 14.35 14.39 14.371 14.318 14.239 14.14 14.031 13.902 13.758 13.645 13.532 13.404 13.285 13.162 13.055 12.97 12.881 12.792 12.718 12.636 12.539 12.461 12.38 12.29 12.21 12.123 12.056 11.993 11.878 11.802 11.73 11.69 11.602 11.504 11.398 11.343 11.131 11.16 11.095 11.027 10.876 10.801 10.727 10.639 10.54 10.452 10.335 9.905 -6 ,30690 ,TETRA ,17668787,Fri Dec 3 07:17:39 CET,Fri Dec 3 09:11:16 CET,0.0 0.217 0.372 0.475 0.562 0.638 0.721 0.788 0.914 0.988 1.057 1.016 1.24 1.297 1.424 1.54 1.647 1.701 1.805 1.901 2.041 2.134 2.228 2.361 2.48 2.596 2.712 2.821 2.96 3.108 3.268 3.455 3.638 3.825 4.043 4.295 4.531 4.793 5.072 5.352 5.653 6.004 6.427 6.869 7.38 7.925 8.558 9.301 10.17 11.148 12.213 12.972 13.312 13.429 13.448 13.397 13.324 13.242 13.131 12.999 12.888 12.786 12.675 12.557 12.437 12.318 12.188 12.066 11.964 11.858 11.738 11.64 11.549 11.455 11.371 11.278 11.177 11.076 10.975 10.906 10.839 10.722 10.635 10.542 10.5 10.421 10.327 10.235 10.18 9.962 10.017 9.962 9.903 9.755 9.673 9.584 9.49 9.386 9.264 9.134 8.753 -7 ,32297 ,TETRA ,17668788,Fri Dec 3 07:17:39 CET,Fri Dec 3 09:10:33 CET,0.0 0.577 0.824 0.998 1.153 1.295 1.421 1.521 1.694 1.784 1.86 1.845 2.083 2.156 2.303 2.45 2.596 2.662 2.78 2.895 3.071 3.185 3.29 3.442 3.597 3.745 3.883 4.02 4.2 4.366 4.531 4.743 4.948 5.143 5.366 5.608 5.84 6.107 6.396 6.702 7.018 7.375 7.795 8.23 8.734 9.292 9.952 10.649 11.479 12.457 13.507 14.268 14.602 14.751 14.819 14.806 14.75 14.667 14.547 14.403 14.287 14.175 14.051 13.931 13.818 13.714 13.601 13.498 13.406 13.302 13.193 13.101 13.01 12.908 12.81 12.712 12.623 12.52 12.407 12.326 12.237 12.095 11.992 11.894 11.843 11.733 11.615 11.487 11.42 11.197 11.201 11.123 11.04 10.837 10.742 10.629 10.479 10.322 10.152 9.883 8.85 -8 ,8913 ,TETRA ,17668789,Fri Dec 3 07:19:36 CET,Fri Dec 3 09:11:39 CET,0.0 0.157 0.258 0.345 0.427 0.532 0.652 0.76 0.964 1.06 1.15 1.16 1.403 1.472 1.61 1.748 1.88 1.945 2.073 2.204 2.393 2.505 2.611 2.777 2.938 3.084 3.234 3.381 3.549 3.724 3.893 4.075 4.263 4.459 4.684 4.934 5.179 5.443 5.722 6.022 6.329 6.666 7.067 7.493 8.004 8.556 9.209 9.942 10.782 11.767 12.893 13.695 14.002 14.122 14.139 14.083 14.018 13.92 13.826 13.739 13.63 13.501 13.387 13.272 13.153 13.047 12.926 12.817 12.717 12.604 12.488 12.4 12.312 12.209 12.116 12.02 11.921 11.817 11.717 11.642 11.562 11.445 11.373 11.291 11.249 11.171 11.067 10.965 10.908 10.681 10.715 10.656 10.592 10.437 10.343 10.236 10.109 9.997 9.879 9.718 9.311 -9 ,18133 ,TETRA ,17668790,Fri Dec 3 07:19:37 CET,Fri Dec 3 09:12:03 CET,0.0 0.412 0.603 0.759 0.896 1.023 1.149 1.263 1.461 1.55 1.645 1.653 1.89 1.961 2.097 2.223 2.349 2.418 2.555 2.674 2.83 2.932 3.037 3.186 3.327 3.477 3.62 3.748 3.914 4.087 4.251 4.457 4.666 4.858 5.077 5.318 5.543 5.788 6.065 6.36 6.644 6.98 7.396 7.797 8.266 8.825 9.483 10.207 11.041 12.016 13.115 13.865 14.17 14.287 14.298 14.239 14.171 14.098 13.994 13.865 13.748 13.626 13.51 13.387 13.261 13.145 13.018 12.908 12.816 12.714 12.6 12.496 12.377 12.247 12.15 12.052 11.953 11.851 11.738 11.655 11.56 11.401 11.299 11.2 11.15 11.047 10.943 10.842 10.795 10.593 10.64 10.587 10.532 10.378 10.295 10.216 10.128 10.022 9.866 9.699 9.271 -10 ,4762 ,TETRA ,17668791,Fri Dec 3 07:20:39 CET,Fri Dec 3 09:14:04 CET,0.0 0.232 0.333 0.43 0.526 0.609 0.68 0.747 0.87 0.931 0.997 0.973 1.204 1.266 1.385 1.496 1.607 1.663 1.775 1.893 2.06 2.168 2.277 2.434 2.587 2.733 2.868 2.991 3.164 3.343 3.513 3.709 3.892 4.072 4.291 4.535 4.766 5.025 5.299 5.594 5.895 6.238 6.642 7.059 7.544 8.085 8.732 9.458 10.281 11.223 12.279 13.03 13.389 13.523 13.507 13.451 13.405 13.323 13.212 13.097 13.012 12.913 12.803 12.694 12.585 12.486 12.375 12.269 12.179 12.089 11.999 11.925 11.851 11.768 11.699 11.625 11.542 11.461 11.38 11.314 11.25 11.16 11.095 11.026 10.991 10.905 10.802 10.701 10.651 10.445 10.489 10.428 10.363 10.199 10.099 9.992 9.878 9.762 9.651 9.507 9.099 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index b90d6b82..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14105 ,KEBNE ,17024389,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:46:50 CET,0.0 0.295 0.521 0.717 0.91 1.071 1.186 1.298 1.518 1.629 1.741 1.749 2.042 2.133 2.306 2.456 2.599 2.671 2.819 2.962 3.168 3.308 3.429 3.591 3.751 3.903 4.041 4.18 4.364 4.536 4.709 4.917 5.108 5.287 5.494 5.736 5.955 6.179 6.431 6.69 6.957 7.265 7.608 7.932 8.305 8.713 9.128 9.538 9.934 10.306 10.59 10.463 10.148 9.704 9.196 8.7 8.2 7.721 7.31 6.896 6.549 6.247 5.929 5.62 5.339 5.067 4.776 4.522 4.301 4.083 3.856 3.65 3.408 3.156 2.979 2.79 2.589 2.382 2.161 1.995 1.838 1.606 1.43 1.257 1.173 0.995 0.81 0.619 0.512 0.195 0.135 -0.002 -0.143 -0.471 -0.675 -0.906 -1.144 -1.382 -1.671 -2.141 -3.792 -2 ,28905 ,KEBNE ,17024390,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:47:04 CET,0.0 0.368 0.576 0.77 0.921 1.064 1.198 1.322 1.561 1.664 1.759 1.728 2.018 2.105 2.277 2.437 2.579 2.651 2.787 2.921 3.118 3.239 3.354 3.527 3.695 3.859 4.035 4.205 4.41 4.597 4.769 4.978 5.183 5.376 5.587 5.814 6.037 6.285 6.558 6.845 7.138 7.467 7.832 8.208 8.634 9.075 9.555 10.037 10.538 11.021 11.348 11.334 11.022 10.605 10.229 9.815 9.393 9.004 8.648 8.279 7.971 7.674 7.383 7.108 6.835 6.57 6.288 6.039 5.821 5.589 5.335 5.122 4.904 4.675 4.499 4.315 4.132 3.954 3.763 3.62 3.474 3.251 3.094 2.914 2.813 2.628 2.436 2.216 2.116 1.809 1.773 1.652 1.531 1.278 1.13 0.973 0.807 0.605 0.361 0.079 -0.452 -3 ,13803 ,KEBNE ,17024391,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:47:01 CET,0.0 0.557 0.787 0.973 1.146 1.291 1.423 1.557 1.791 1.888 1.984 1.958 2.246 2.343 2.535 2.702 2.86 2.935 3.074 3.209 3.38 3.487 3.599 3.768 3.942 4.109 4.262 4.408 4.589 4.761 4.925 5.122 5.312 5.495 5.715 5.967 6.207 6.443 6.693 6.968 7.241 7.553 7.933 8.297 8.695 9.12 9.576 10.035 10.469 10.864 11.125 10.923 10.547 10.106 9.648 9.212 8.804 8.397 8.028 7.627 7.256 6.913 6.594 6.309 6.026 5.754 5.485 5.239 5.01 4.785 4.554 4.36 4.158 3.934 3.76 3.575 3.382 3.192 2.977 2.826 2.68 2.458 2.301 2.149 2.077 1.911 1.728 1.535 1.421 1.09 1.037 0.917 0.788 0.482 0.326 0.167 -0.05 -0.275 -0.499 -0.775 -2.167 -4 ,26488 ,KEBNE ,17024392,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:47:43 CET,0.0 0.45 0.685 0.847 1.001 1.134 1.265 1.373 1.568 1.669 1.769 1.778 2.065 2.161 2.341 2.496 2.644 2.714 2.851 2.989 3.182 3.306 3.433 3.624 3.805 3.975 4.135 4.28 4.466 4.65 4.825 5.037 5.238 5.429 5.642 5.865 6.081 6.318 6.567 6.839 7.12 7.437 7.822 8.194 8.597 9.034 9.485 9.892 10.336 10.798 11.126 11.085 10.818 10.48 10.104 9.703 9.317 8.916 8.546 8.159 7.802 7.475 7.153 6.843 6.55 6.273 5.962 5.672 5.421 5.164 4.888 4.644 4.384 4.106 3.879 3.648 3.432 3.21 2.978 2.837 2.699 2.449 2.261 2.074 1.984 1.798 1.586 1.363 1.245 0.934 0.896 0.776 0.649 0.388 0.247 0.087 -0.124 -0.409 -0.712 -1.079 -2.427 -5 ,19772 ,KEBNE ,17024393,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:46:59 CET,0.0 0.284 0.525 0.721 0.861 0.99 1.126 1.249 1.47 1.581 1.687 1.675 1.969 2.068 2.245 2.4 2.552 2.627 2.755 2.87 3.039 3.159 3.282 3.471 3.65 3.804 3.952 4.096 4.297 4.501 4.687 4.902 5.11 5.306 5.52 5.76 5.998 6.252 6.528 6.833 7.139 7.451 7.805 8.147 8.546 8.981 9.431 9.886 10.392 10.921 11.296 11.323 11.09 10.724 10.33 9.91 9.499 9.119 8.764 8.371 8.019 7.701 7.398 7.118 6.86 6.623 6.36 6.125 5.937 5.732 5.522 5.341 5.128 4.905 4.74 4.569 4.387 4.199 4.007 3.875 3.731 3.496 3.329 3.156 3.072 2.903 2.703 2.458 2.334 2.008 1.964 1.842 1.71 1.437 1.293 1.115 0.914 0.718 0.484 0.171 -0.375 -6 ,28328 ,KEBNE ,17024394,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:47:06 CET,0.0 0.304 0.498 0.671 0.798 0.907 1.032 1.161 1.377 1.466 1.547 1.517 1.811 1.891 2.055 2.208 2.348 2.417 2.546 2.668 2.847 2.964 3.076 3.242 3.405 3.57 3.722 3.859 4.036 4.228 4.422 4.629 4.821 5.009 5.227 5.478 5.724 5.993 6.263 6.523 6.8 7.12 7.46 7.783 8.171 8.589 9.03 9.465 9.916 10.329 10.621 10.611 10.393 10.047 9.655 9.266 8.895 8.524 8.189 7.86 7.569 7.288 7.015 6.75 6.478 6.235 5.982 5.747 5.548 5.336 5.113 4.93 4.735 4.521 4.343 4.151 3.956 3.758 3.559 3.427 3.282 3.06 2.912 2.739 2.646 2.459 2.259 2.048 1.938 1.621 1.577 1.441 1.302 0.991 0.833 0.683 0.53 0.342 0.104 -0.203 -0.696 -7 ,12254 ,KEBNE ,17024395,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:47:04 CET,0.0 0.267 0.461 0.643 0.775 0.893 1.009 1.124 1.339 1.437 1.539 1.526 1.817 1.905 2.067 2.217 2.355 2.422 2.566 2.694 2.862 2.975 3.091 3.256 3.412 3.566 3.71 3.86 4.046 4.209 4.37 4.568 4.757 4.938 5.151 5.383 5.596 5.834 6.085 6.333 6.601 6.912 7.27 7.604 7.942 8.318 8.734 9.147 9.57 9.962 10.258 10.203 9.905 9.487 9.043 8.612 8.161 7.722 7.326 6.912 6.561 6.241 5.955 5.68 5.412 5.178 4.946 4.738 4.534 4.326 4.122 3.929 3.729 3.521 3.341 3.165 2.995 2.809 2.623 2.502 2.375 2.158 2.002 1.85 1.771 1.593 1.405 1.213 1.102 0.771 0.709 0.581 0.445 0.135 -0.038 -0.221 -0.43 -0.685 -0.969 -1.331 -2.413 -8 ,15785 ,KEBNE ,17024396,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:46:07 CET,0.0 0.304 0.515 0.709 0.866 0.995 1.121 1.25 1.483 1.584 1.683 1.665 1.95 2.032 2.19 2.335 2.477 2.549 2.695 2.83 3.019 3.139 3.256 3.426 3.574 3.719 3.865 4.009 4.191 4.369 4.544 4.757 4.946 5.117 5.304 5.508 5.719 5.95 6.198 6.467 6.755 7.079 7.441 7.786 8.169 8.588 9.037 9.52 10.032 10.505 10.899 10.864 10.624 10.324 9.974 9.583 9.215 8.847 8.507 8.187 7.887 7.594 7.316 7.051 6.792 6.55 6.299 6.055 5.839 5.633 5.41 5.208 4.997 4.782 4.622 4.456 4.277 4.091 3.898 3.769 3.637 3.432 3.29 3.129 3.042 2.866 2.676 2.475 2.371 2.068 2.074 1.961 1.839 1.562 1.411 1.249 1.061 0.873 0.705 0.501 -0.128 -9 ,18760 ,KEBNE ,17024397,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:47:26 CET,0.0 0.304 0.54 0.727 0.894 1.023 1.134 1.264 1.508 1.597 1.685 1.676 1.953 2.032 2.191 2.337 2.471 2.533 2.654 2.779 2.976 3.099 3.211 3.373 3.528 3.686 3.834 3.973 4.162 4.334 4.492 4.688 4.882 5.065 5.268 5.495 5.707 5.927 6.178 6.461 6.75 7.064 7.408 7.737 8.128 8.525 8.955 9.417 9.864 10.31 10.634 10.539 10.227 9.823 9.348 8.846 8.331 7.868 7.477 7.065 6.725 6.425 6.142 5.859 5.569 5.3 5.03 4.798 4.588 4.356 4.108 3.892 3.662 3.429 3.244 3.063 2.874 2.667 2.452 2.308 2.161 1.913 1.737 1.545 1.443 1.229 0.996 0.754 0.631 0.293 0.209 0.064 -0.084 -0.411 -0.582 -0.754 -0.951 -1.178 -1.468 -1.812 -2.459 -10 ,6256 ,KEBNE ,17024398,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:47:23 CET,0.0 0.394 0.628 0.809 0.984 1.156 1.315 1.461 1.699 1.804 1.914 1.911 2.199 2.275 2.428 2.587 2.74 2.815 2.955 3.085 3.274 3.401 3.521 3.697 3.859 4.007 4.158 4.302 4.477 4.649 4.825 5.034 5.231 5.43 5.655 5.891 6.102 6.327 6.578 6.842 7.121 7.425 7.771 8.137 8.554 8.986 9.436 9.908 10.419 10.914 11.237 11.165 10.876 10.453 10.023 9.613 9.189 8.762 8.411 8.063 7.715 7.362 7.02 6.691 6.37 6.075 5.78 5.528 5.305 5.074 4.836 4.651 4.465 4.25 4.076 3.902 3.727 3.538 3.317 3.176 3.057 2.865 2.722 2.559 2.471 2.287 2.095 1.899 1.796 1.491 1.48 1.36 1.22 0.935 0.791 0.632 0.44 0.222 -0.048 -0.393 -1.367 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 276692b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4541 ,TETRA ,17524718,Wed Nov 24 23:17:10 CET,Thu Nov 25 01:33:57 CET,0.0 0.683 0.919 1.091 1.28 1.467 1.629 1.782 2.067 2.201 2.316 2.325 2.626 2.725 2.922 3.105 3.276 3.362 3.535 3.702 3.928 4.073 4.21 4.393 4.564 4.73 4.886 5.035 5.224 5.41 5.6 5.84 6.063 6.257 6.465 6.711 6.95 7.19 7.424 7.663 7.918 8.206 8.538 8.851 9.196 9.535 9.884 10.242 10.536 10.712 10.664 10.237 9.627 8.977 8.35 7.695 7.08 6.545 6.072 5.551 5.102 4.723 4.338 3.94 3.562 3.221 2.868 2.544 2.265 1.968 1.635 1.378 1.13 0.866 0.647 0.411 0.172 -0.078 -0.351 -0.545 -0.732 -1.011 -1.211 -1.419 -1.53 -1.749 -1.972 -2.226 -2.365 -2.713 -2.821 -3.004 -3.206 -3.604 -3.828 -4.048 -4.262 -4.523 -4.855 -5.339 -6.48 -2 ,3113 ,TETRA ,17524719,Wed Nov 24 23:18:11 CET,Thu Nov 25 01:35:45 CET,0.0 0.53 0.772 0.968 1.126 1.244 1.352 1.474 1.685 1.776 1.863 1.824 2.107 2.188 2.349 2.521 2.664 2.728 2.858 2.977 3.145 3.26 3.378 3.547 3.705 3.848 3.983 4.106 4.263 4.416 4.564 4.738 4.899 5.062 5.251 5.453 5.652 5.874 6.094 6.311 6.523 6.74 6.986 7.233 7.518 7.812 8.119 8.429 8.705 8.815 8.597 8.089 7.484 6.845 6.202 5.551 4.913 4.276 3.721 3.163 2.677 2.248 1.829 1.423 1.048 0.715 0.385 0.106 -0.133 -0.402 -0.703 -0.972 -1.245 -1.514 -1.722 -1.924 -2.145 -2.372 -2.604 -2.769 -2.933 -3.209 -3.424 -3.643 -3.754 -3.988 -4.249 -4.515 -4.651 -4.986 -5.044 -5.195 -5.35 -5.676 -5.86 -6.065 -6.294 -6.567 -6.871 -7.305 -8.686 -3 ,4006 ,TETRA ,17524720,Wed Nov 24 23:19:09 CET,Thu Nov 25 01:34:52 CET,0.0 0.271 0.494 0.695 0.833 0.959 1.078 1.179 1.377 1.471 1.553 1.523 1.808 1.885 2.029 2.15 2.267 2.329 2.455 2.577 2.744 2.847 2.953 3.117 3.27 3.418 3.563 3.691 3.852 4.023 4.184 4.36 4.53 4.707 4.903 5.097 5.287 5.51 5.749 5.974 6.19 6.43 6.722 6.986 7.296 7.646 7.964 8.241 8.451 8.449 8.224 7.697 6.927 6.156 5.466 4.796 4.169 3.586 3.108 2.635 2.217 1.837 1.455 1.105 0.775 0.463 0.14 -0.171 -0.448 -0.748 -1.061 -1.325 -1.616 -1.907 -2.142 -2.417 -2.692 -2.969 -3.271 -3.478 -3.684 -4.0 -4.218 -4.438 -4.554 -4.796 -5.058 -5.346 -5.492 -5.842 -5.947 -6.125 -6.314 -6.73 -6.945 -7.151 -7.387 -7.662 -8.03 -8.546 -10.23 -4 ,3777 ,TETRA ,17524722,Wed Nov 24 23:19:09 CET,Thu Nov 25 01:37:32 CET,0.0 0.358 0.552 0.701 0.843 0.966 1.069 1.174 1.379 1.475 1.563 1.552 1.838 1.919 2.073 2.224 2.371 2.44 2.556 2.677 2.857 2.963 3.069 3.221 3.364 3.502 3.634 3.764 3.933 4.096 4.252 4.428 4.587 4.736 4.909 5.101 5.284 5.497 5.739 5.99 6.242 6.486 6.763 7.055 7.33 7.615 7.921 8.237 8.596 8.826 8.688 8.129 7.546 6.94 6.356 5.77 5.18 4.608 4.112 3.616 3.171 2.753 2.334 1.951 1.593 1.244 0.882 0.559 0.283 -0.011 -0.333 -0.609 -0.905 -1.207 -1.426 -1.644 -1.872 -2.108 -2.364 -2.559 -2.76 -3.062 -3.263 -3.479 -3.594 -3.813 -4.055 -4.306 -4.442 -4.803 -4.928 -5.096 -5.263 -5.615 -5.85 -6.116 -6.397 -6.705 -7.06 -7.533 -8.661 -5 ,30198 ,TETRA ,17524726,Wed Nov 24 23:19:15 CET,Thu Nov 25 01:36:05 CET,0.0 0.413 0.599 0.75 0.878 1.001 1.128 1.258 1.514 1.625 1.722 1.722 2.012 2.095 2.248 2.398 2.541 2.605 2.727 2.847 3.029 3.145 3.256 3.414 3.556 3.684 3.808 3.935 4.102 4.257 4.412 4.597 4.762 4.925 5.127 5.343 5.536 5.747 5.976 6.23 6.471 6.712 6.999 7.272 7.56 7.859 8.144 8.417 8.691 8.815 8.638 8.144 7.455 6.7 6.044 5.385 4.78 4.245 3.746 3.221 2.766 2.363 1.969 1.595 1.269 0.959 0.593 0.262 -0.021 -0.312 -0.603 -0.852 -1.111 -1.36 -1.551 -1.74 -1.94 -2.175 -2.422 -2.594 -2.771 -3.039 -3.233 -3.445 -3.553 -3.767 -3.988 -4.224 -4.355 -4.703 -4.781 -4.914 -5.056 -5.44 -5.659 -5.876 -6.119 -6.375 -6.671 -7.065 -8.196 -6 ,15107 ,TETRA ,17524728,Wed Nov 24 23:19:13 CET,Thu Nov 25 01:33:25 CET,0.0 0.385 0.598 0.768 0.903 1.023 1.138 1.255 1.475 1.569 1.665 1.644 1.931 2.02 2.183 2.321 2.444 2.506 2.633 2.751 2.922 3.037 3.146 3.295 3.437 3.576 3.717 3.86 4.04 4.225 4.406 4.607 4.809 5.009 5.225 5.441 5.651 5.886 6.13 6.376 6.618 6.861 7.135 7.396 7.674 7.994 8.33 8.631 8.9 9.073 8.95 8.304 7.608 7.008 6.43 5.805 5.216 4.634 4.094 3.551 3.08 2.665 2.264 1.867 1.48 1.125 0.77 0.462 0.189 -0.104 -0.415 -0.68 -0.961 -1.27 -1.524 -1.77 -2.021 -2.294 -2.586 -2.781 -2.968 -3.258 -3.462 -3.694 -3.818 -4.066 -4.332 -4.6 -4.739 -5.093 -5.223 -5.404 -5.62 -6.087 -6.324 -6.58 -6.866 -7.171 -7.506 -7.984 -9.874 -7 ,8850 ,TETRA ,17524729,Wed Nov 24 23:19:14 CET,Thu Nov 25 01:35:21 CET,0.0 0.152 0.322 0.497 0.645 0.792 0.926 1.05 1.274 1.374 1.471 1.44 1.72 1.805 1.962 2.106 2.241 2.308 2.452 2.59 2.762 2.877 2.993 3.149 3.293 3.427 3.557 3.686 3.851 4.012 4.168 4.356 4.528 4.692 4.883 5.097 5.296 5.495 5.704 5.939 6.18 6.416 6.692 6.961 7.245 7.538 7.84 8.132 8.402 8.548 8.356 7.687 6.906 6.196 5.509 4.83 4.218 3.627 3.123 2.62 2.179 1.796 1.399 1.003 0.635 0.299 -0.039 -0.339 -0.619 -0.921 -1.229 -1.485 -1.767 -2.055 -2.271 -2.512 -2.768 -3.023 -3.284 -3.483 -3.681 -3.983 -4.206 -4.446 -4.566 -4.812 -5.078 -5.353 -5.517 -5.897 -6.038 -6.198 -6.371 -6.779 -6.996 -7.227 -7.487 -7.772 -8.078 -8.43 -9.208 -8 ,11924 ,TETRA ,17524730,Wed Nov 24 23:19:11 CET,Thu Nov 25 01:35:47 CET,0.0 0.439 0.649 0.836 0.999 1.129 1.246 1.356 1.56 1.665 1.769 1.74 2.012 2.094 2.244 2.379 2.501 2.559 2.676 2.787 2.951 3.063 3.167 3.315 3.457 3.594 3.727 3.852 4.022 4.186 4.334 4.507 4.675 4.848 5.046 5.236 5.407 5.603 5.813 6.032 6.265 6.509 6.781 7.025 7.282 7.567 7.885 8.22 8.501 8.64 8.464 7.887 7.214 6.509 5.818 5.132 4.513 3.937 3.393 2.875 2.437 2.052 1.681 1.308 0.973 0.673 0.356 0.059 -0.205 -0.483 -0.786 -1.047 -1.307 -1.576 -1.792 -2.02 -2.257 -2.498 -2.739 -2.911 -3.106 -3.397 -3.593 -3.808 -3.92 -4.161 -4.408 -4.662 -4.816 -5.17 -5.279 -5.445 -5.625 -5.995 -6.177 -6.379 -6.642 -6.96 -7.326 -7.755 -9.062 -9 ,27932 ,TETRA ,17524731,Wed Nov 24 23:19:13 CET,Thu Nov 25 01:35:53 CET,0.0 0.259 0.478 0.663 0.819 0.982 1.124 1.257 1.499 1.602 1.705 1.709 2.009 2.096 2.256 2.419 2.576 2.642 2.779 2.911 3.096 3.215 3.33 3.495 3.649 3.795 3.941 4.082 4.256 4.421 4.574 4.755 4.933 5.106 5.305 5.509 5.691 5.907 6.164 6.436 6.701 6.981 7.266 7.528 7.849 8.176 8.479 8.755 8.995 9.143 9.005 8.355 7.603 6.888 6.247 5.622 5.013 4.44 3.931 3.44 3.015 2.637 2.276 1.886 1.488 1.14 0.786 0.469 0.188 -0.119 -0.439 -0.719 -1.013 -1.297 -1.52 -1.754 -2.001 -2.263 -2.525 -2.704 -2.88 -3.164 -3.369 -3.582 -3.699 -3.948 -4.202 -4.462 -4.593 -4.922 -5.035 -5.205 -5.383 -5.831 -6.07 -6.297 -6.539 -6.826 -7.182 -7.661 -9.468 -10 ,30243 ,TETRA ,17524732,Wed Nov 24 23:19:15 CET,Thu Nov 25 01:35:34 CET,0.0 0.496 0.707 0.889 1.061 1.217 1.345 1.456 1.678 1.783 1.882 1.873 2.155 2.248 2.432 2.602 2.758 2.831 2.968 3.107 3.307 3.428 3.549 3.726 3.892 4.045 4.178 4.308 4.491 4.661 4.833 5.066 5.297 5.513 5.728 5.959 6.176 6.405 6.655 6.912 7.167 7.469 7.852 8.234 8.632 8.989 9.308 9.619 9.898 10.06 9.956 9.406 8.709 8.044 7.405 6.749 6.139 5.523 4.961 4.447 3.999 3.565 3.15 2.739 2.35 2.008 1.66 1.356 1.079 0.772 0.43 0.137 -0.157 -0.459 -0.699 -0.941 -1.185 -1.44 -1.712 -1.913 -2.122 -2.447 -2.68 -2.926 -3.046 -3.289 -3.575 -3.886 -4.051 -4.416 -4.552 -4.717 -4.872 -5.262 -5.48 -5.698 -5.941 -6.213 -6.541 -6.981 -8.724 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt deleted file mode 100644 index a751acbf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10903 ,TETRA ,17524733,Wed Nov 24 23:19:12 CET,Thu Nov 25 01:37:19 CET,0.0 0.471 0.719 0.892 1.036 1.2 1.375 1.525 1.79 1.912 2.037 2.057 2.352 2.447 2.614 2.779 2.939 3.02 3.188 3.332 3.523 3.643 3.763 3.937 4.102 4.261 4.41 4.553 4.747 4.94 5.117 5.327 5.54 5.741 5.961 6.209 6.432 6.666 6.917 7.16 7.396 7.656 7.972 8.286 8.593 8.886 9.184 9.466 9.677 9.724 9.511 8.856 8.042 7.244 6.489 5.807 5.218 4.654 4.166 3.678 3.232 2.815 2.418 2.031 1.656 1.32 0.963 0.66 0.414 0.146 -0.136 -0.378 -0.634 -0.882 -1.064 -1.264 -1.481 -1.699 -1.931 -2.091 -2.249 -2.498 -2.686 -2.889 -2.99 -3.19 -3.392 -3.612 -3.733 -4.052 -4.13 -4.293 -4.468 -4.858 -5.052 -5.256 -5.477 -5.708 -5.983 -6.314 -7.165 -2 ,5135 ,TETRA ,17524734,Wed Nov 24 23:19:14 CET,Thu Nov 25 01:36:56 CET,0.0 1.09 1.378 1.638 1.85 2.026 2.2 2.345 2.581 2.694 2.801 2.834 3.149 3.253 3.458 3.642 3.813 3.905 4.087 4.251 4.478 4.614 4.742 4.941 5.126 5.295 5.47 5.642 5.851 6.045 6.235 6.462 6.676 6.885 7.125 7.379 7.609 7.854 8.115 8.377 8.627 8.902 9.225 9.538 9.862 10.153 10.432 10.695 10.906 10.965 10.674 9.978 9.15 8.343 7.594 6.858 6.207 5.615 5.055 4.49 3.998 3.552 3.131 2.714 2.334 1.997 1.623 1.274 0.982 0.671 0.331 0.059 -0.205 -0.482 -0.702 -0.929 -1.167 -1.414 -1.685 -1.881 -2.067 -2.362 -2.583 -2.817 -2.945 -3.201 -3.452 -3.716 -3.851 -4.2 -4.308 -4.466 -4.614 -4.955 -5.145 -5.315 -5.509 -5.741 -6.035 -6.449 -7.398 -3 ,11373 ,TETRA ,17524735,Wed Nov 24 23:19:16 CET,Thu Nov 25 01:37:20 CET,0.0 0.776 1.069 1.305 1.515 1.724 1.9 2.064 2.369 2.513 2.635 2.621 2.921 3.012 3.184 3.351 3.513 3.594 3.749 3.889 4.103 4.253 4.398 4.595 4.788 4.982 5.165 5.348 5.584 5.799 6.001 6.246 6.469 6.677 6.917 7.168 7.412 7.677 7.942 8.211 8.479 8.755 9.06 9.368 9.713 10.043 10.382 10.698 10.948 11.044 10.724 10.041 9.317 8.546 7.776 7.027 6.388 5.806 5.256 4.73 4.283 3.865 3.477 3.122 2.791 2.47 2.111 1.788 1.517 1.246 0.965 0.727 0.464 0.196 0.006 -0.204 -0.444 -0.682 -0.93 -1.106 -1.291 -1.599 -1.815 -2.027 -2.134 -2.356 -2.593 -2.831 -2.949 -3.289 -3.38 -3.527 -3.673 -3.999 -4.171 -4.348 -4.544 -4.776 -5.057 -5.398 -6.206 -4 ,18062 ,TETRA ,17524737,Wed Nov 24 23:19:13 CET,Thu Nov 25 01:40:03 CET,0.0 0.421 0.603 0.752 0.894 1.024 1.147 1.262 1.466 1.563 1.658 1.621 1.898 1.982 2.139 2.28 2.432 2.512 2.667 2.823 3.042 3.177 3.313 3.5 3.666 3.833 3.992 4.143 4.334 4.519 4.701 4.921 5.123 5.314 5.533 5.777 6.006 6.24 6.495 6.76 7.019 7.296 7.595 7.888 8.216 8.554 8.902 9.218 9.438 9.47 9.185 8.538 7.774 7.015 6.283 5.617 5.027 4.461 3.947 3.398 2.925 2.494 2.095 1.722 1.355 1.038 0.701 0.372 0.092 -0.193 -0.504 -0.756 -1.005 -1.283 -1.505 -1.717 -1.933 -2.17 -2.424 -2.59 -2.755 -3.01 -3.188 -3.393 -3.5 -3.721 -3.957 -4.217 -4.348 -4.681 -4.742 -4.889 -5.051 -5.378 -5.551 -5.736 -5.962 -6.231 -6.512 -6.925 -7.858 -5 ,26609 ,TETRA ,17524739,Wed Nov 24 23:19:13 CET,Thu Nov 25 01:34:15 CET,0.0 1.122 1.392 1.575 1.741 1.896 2.056 2.206 2.466 2.589 2.711 2.761 3.082 3.19 3.394 3.589 3.787 3.883 4.05 4.22 4.476 4.633 4.774 4.968 5.161 5.341 5.51 5.674 5.883 6.076 6.256 6.464 6.666 6.856 7.067 7.303 7.522 7.774 8.044 8.322 8.596 8.89 9.218 9.515 9.826 10.129 10.423 10.721 10.978 11.095 10.89 10.238 9.465 8.708 7.981 7.262 6.633 6.061 5.532 4.982 4.524 4.108 3.67 3.258 2.888 2.547 2.194 1.881 1.598 1.285 0.958 0.667 0.352 0.031 -0.208 -0.446 -0.692 -0.96 -1.251 -1.466 -1.698 -2.031 -2.249 -2.473 -2.587 -2.809 -3.038 -3.308 -3.446 -3.788 -3.883 -4.05 -4.24 -4.658 -4.881 -5.125 -5.385 -5.653 -6.042 -6.588 -8.549 -6 ,7143 ,TETRA ,17524741,Wed Nov 24 23:19:16 CET,Thu Nov 25 01:39:18 CET,0.0 1.011 1.381 1.654 1.863 2.05 2.222 2.382 2.683 2.806 2.918 2.94 3.243 3.347 3.552 3.757 3.951 4.042 4.217 4.385 4.618 4.753 4.879 5.071 5.261 5.442 5.621 5.789 6.001 6.204 6.388 6.606 6.808 6.994 7.217 7.465 7.698 7.936 8.183 8.448 8.716 9.006 9.312 9.587 9.88 10.201 10.53 10.769 10.941 10.997 10.629 9.835 9.059 8.26 7.509 6.817 6.201 5.642 5.147 4.601 4.106 3.685 3.304 2.94 2.586 2.245 1.889 1.573 1.296 1.018 0.735 0.498 0.244 -0.027 -0.23 -0.435 -0.666 -0.904 -1.12 -1.279 -1.461 -1.757 -1.96 -2.154 -2.255 -2.481 -2.723 -2.978 -3.115 -3.455 -3.532 -3.684 -3.835 -4.185 -4.409 -4.655 -4.908 -5.193 -5.501 -5.864 -6.603 -7 ,26094 ,TETRA ,17524743,Wed Nov 24 23:19:14 CET,Thu Nov 25 01:36:52 CET,0.0 0.673 1.011 1.261 1.48 1.669 1.824 1.969 2.222 2.337 2.44 2.44 2.73 2.822 3.003 3.169 3.312 3.379 3.528 3.669 3.866 3.999 4.125 4.293 4.455 4.611 4.76 4.931 5.156 5.352 5.536 5.753 5.958 6.154 6.385 6.634 6.855 7.091 7.361 7.64 7.91 8.219 8.562 8.868 9.193 9.516 9.831 10.102 10.312 10.397 10.177 9.406 8.567 7.818 7.105 6.406 5.774 5.197 4.678 4.123 3.649 3.243 2.837 2.449 2.068 1.711 1.345 1.026 0.753 0.452 0.137 -0.109 -0.368 -0.647 -0.861 -1.086 -1.33 -1.586 -1.843 -2.017 -2.207 -2.51 -2.725 -2.955 -3.078 -3.334 -3.592 -3.852 -3.983 -4.325 -4.417 -4.579 -4.74 -5.084 -5.284 -5.507 -5.762 -6.051 -6.362 -6.697 -7.687 -8 ,979 ,TETRA ,17524745,Wed Nov 24 23:19:43 CET,Thu Nov 25 01:37:10 CET,0.0 1.333 1.679 1.881 2.051 2.215 2.362 2.503 2.783 2.916 3.039 3.06 3.371 3.476 3.672 3.869 4.053 4.135 4.291 4.439 4.644 4.774 4.905 5.102 5.288 5.455 5.616 5.78 5.99 6.177 6.353 6.56 6.756 6.951 7.18 7.432 7.652 7.881 8.11 8.37 8.654 8.954 9.289 9.578 9.904 10.247 10.559 10.871 11.154 11.177 10.886 10.25 9.422 8.587 7.856 7.164 6.535 5.945 5.387 4.808 4.329 3.923 3.496 3.077 2.705 2.348 1.983 1.667 1.386 1.106 0.807 0.554 0.307 0.047 -0.177 -0.425 -0.652 -0.869 -1.099 -1.268 -1.453 -1.737 -1.938 -2.153 -2.269 -2.529 -2.778 -3.025 -3.16 -3.505 -3.608 -3.762 -3.92 -4.277 -4.488 -4.717 -4.955 -5.23 -5.567 -5.936 -6.922 -9 ,4390 ,TETRA ,17524746,Wed Nov 24 23:19:44 CET,Thu Nov 25 01:37:52 CET,0.0 0.534 0.774 0.987 1.166 1.293 1.403 1.54 1.802 1.925 2.046 2.065 2.369 2.474 2.674 2.859 3.022 3.104 3.271 3.418 3.627 3.76 3.889 4.079 4.266 4.458 4.634 4.795 4.996 5.186 5.374 5.599 5.799 6.0 6.242 6.505 6.74 6.978 7.231 7.488 7.756 8.041 8.338 8.614 8.916 9.213 9.493 9.744 9.982 10.073 9.809 9.175 8.412 7.692 6.987 6.281 5.689 5.147 4.646 4.134 3.677 3.268 2.883 2.502 2.138 1.811 1.475 1.175 0.903 0.631 0.346 0.096 -0.159 -0.421 -0.634 -0.853 -1.057 -1.281 -1.536 -1.706 -1.886 -2.164 -2.364 -2.582 -2.689 -2.903 -3.133 -3.38 -3.504 -3.841 -3.928 -4.089 -4.256 -4.605 -4.796 -5.001 -5.223 -5.469 -5.749 -6.124 -7.056 -10 ,6552 ,TETRA ,17524747,Wed Nov 24 23:19:47 CET,Thu Nov 25 01:37:35 CET,0.0 0.917 1.189 1.39 1.574 1.739 1.861 1.961 2.187 2.314 2.431 2.431 2.711 2.798 2.974 3.142 3.284 3.35 3.5 3.646 3.839 3.952 4.057 4.218 4.37 4.519 4.672 4.817 5.003 5.169 5.332 5.529 5.708 5.901 6.131 6.377 6.611 6.846 7.104 7.376 7.638 7.931 8.278 8.596 8.926 9.251 9.551 9.783 9.933 10.014 9.752 9.092 8.368 7.614 6.898 6.241 5.637 5.065 4.569 4.055 3.594 3.143 2.676 2.24 1.827 1.446 1.054 0.679 0.35 0.031 -0.287 -0.564 -0.86 -1.162 -1.399 -1.644 -1.902 -2.184 -2.478 -2.683 -2.901 -3.225 -3.428 -3.631 -3.74 -3.966 -4.214 -4.468 -4.6 -4.948 -5.067 -5.236 -5.422 -5.789 -5.968 -6.166 -6.38 -6.619 -6.897 -7.23 -8.178 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 970f71c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27280 ,TETRA ,17524748,Wed Nov 24 23:19:49 CET,Thu Nov 25 01:33:16 CET,0.0 0.648 0.856 1.036 1.169 1.288 1.418 1.54 1.76 1.874 1.975 1.96 2.228 2.311 2.474 2.616 2.748 2.809 2.94 3.075 3.254 3.366 3.474 3.622 3.765 3.906 4.037 4.157 4.318 4.477 4.629 4.797 4.963 5.13 5.322 5.522 5.698 5.892 6.075 6.252 6.43 6.625 6.885 7.114 7.297 7.476 7.67 7.803 7.763 7.477 6.657 5.379 4.142 3.123 2.332 1.604 0.977 0.436 -0.041 -0.566 -1.027 -1.447 -1.838 -2.187 -2.535 -2.853 -3.176 -3.48 -3.738 -4.0 -4.289 -4.544 -4.804 -5.055 -5.248 -5.444 -5.653 -5.886 -6.151 -6.344 -6.536 -6.825 -7.023 -7.221 -7.323 -7.537 -7.788 -8.068 -8.204 -8.531 -8.621 -8.777 -8.92 -9.229 -9.407 -9.621 -9.855 -10.145 -10.511 -10.881 -11.584 -2 ,18526 ,TETRA ,17524749,Wed Nov 24 23:19:45 CET,Thu Nov 25 01:35:18 CET,0.0 0.285 0.454 0.592 0.712 0.82 0.911 1.018 1.219 1.297 1.371 1.319 1.587 1.662 1.791 1.91 2.032 2.093 2.213 2.329 2.483 2.584 2.688 2.839 2.981 3.124 3.256 3.358 3.486 3.617 3.744 3.893 4.037 4.177 4.337 4.502 4.66 4.84 5.026 5.196 5.368 5.56 5.772 5.975 6.163 6.342 6.51 6.637 6.675 6.579 6.108 5.142 4.26 3.511 2.851 2.245 1.686 1.14 0.629 0.092 -0.383 -0.8 -1.196 -1.599 -1.956 -2.267 -2.599 -2.917 -3.195 -3.481 -3.787 -4.039 -4.297 -4.555 -4.76 -4.964 -5.173 -5.395 -5.609 -5.757 -5.916 -6.19 -6.392 -6.597 -6.7 -6.899 -7.131 -7.399 -7.521 -7.84 -7.907 -8.045 -8.192 -8.531 -8.714 -8.92 -9.155 -9.405 -9.694 -10.103 -11.332 -3 ,21031 ,TETRA ,17524750,Wed Nov 24 23:19:47 CET,Thu Nov 25 01:35:29 CET,0.0 0.299 0.463 0.607 0.726 0.836 0.943 1.047 1.239 1.313 1.389 1.36 1.624 1.687 1.81 1.935 2.055 2.116 2.236 2.344 2.496 2.599 2.694 2.812 2.929 3.047 3.163 3.279 3.426 3.557 3.672 3.804 3.938 4.08 4.226 4.365 4.494 4.615 4.747 4.891 5.031 5.186 5.35 5.471 5.57 5.671 5.756 5.754 5.601 5.199 4.27 2.948 1.727 0.628 -0.326 -1.151 -1.846 -2.451 -2.968 -3.481 -3.914 -4.318 -4.702 -5.05 -5.388 -5.702 -6.027 -6.318 -6.579 -6.85 -7.135 -7.377 -7.626 -7.875 -8.061 -8.264 -8.473 -8.693 -8.932 -9.1 -9.269 -9.517 -9.684 -9.862 -9.956 -10.155 -10.372 -10.629 -10.764 -11.087 -11.139 -11.275 -11.422 -11.745 -11.916 -12.106 -12.333 -12.601 -12.924 -13.272 -14.022 -4 ,22514 ,TETRA ,17524752,Wed Nov 24 23:19:45 CET,Thu Nov 25 01:32:13 CET,0.0 0.418 0.645 0.801 0.937 1.061 1.174 1.282 1.47 1.558 1.644 1.611 1.879 1.954 2.097 2.23 2.348 2.411 2.539 2.661 2.83 2.936 3.035 3.17 3.305 3.432 3.559 3.696 3.867 4.008 4.133 4.287 4.428 4.557 4.699 4.846 4.978 5.117 5.269 5.434 5.576 5.719 5.91 6.088 6.247 6.356 6.423 6.41 6.264 5.924 5.062 3.624 2.336 1.234 0.235 -0.689 -1.528 -2.317 -3.015 -3.706 -4.308 -4.844 -5.355 -5.864 -6.357 -6.766 -7.13 -7.429 -7.692 -7.966 -8.25 -8.483 -8.702 -8.931 -9.134 -9.345 -9.563 -9.802 -10.059 -10.236 -10.414 -10.695 -10.877 -11.06 -11.158 -11.369 -11.6 -11.842 -11.959 -12.266 -12.315 -12.463 -12.616 -12.928 -13.106 -13.301 -13.499 -13.725 -13.971 -14.325 -15.628 -5 ,20648 ,TETRA ,17524754,Wed Nov 24 23:19:49 CET,Thu Nov 25 01:34:14 CET,0.0 0.239 0.437 0.617 0.751 0.869 0.982 1.071 1.244 1.33 1.411 1.373 1.643 1.721 1.864 1.987 2.098 2.153 2.264 2.377 2.537 2.635 2.726 2.864 3.002 3.138 3.279 3.402 3.538 3.667 3.792 3.941 4.079 4.212 4.36 4.511 4.651 4.814 4.997 5.181 5.371 5.576 5.784 5.974 6.157 6.293 6.415 6.534 6.559 6.366 5.741 4.752 3.861 3.014 2.274 1.591 0.929 0.335 -0.17 -0.673 -1.108 -1.515 -1.9 -2.262 -2.596 -2.9 -3.256 -3.585 -3.853 -4.138 -4.439 -4.699 -4.984 -5.256 -5.462 -5.685 -5.909 -6.144 -6.382 -6.554 -6.735 -7.035 -7.245 -7.451 -7.557 -7.763 -7.973 -8.188 -8.304 -8.629 -8.687 -8.83 -8.982 -9.282 -9.467 -9.673 -9.87 -10.097 -10.369 -10.789 -12.097 -6 ,16306 ,TETRA ,17524757,Wed Nov 24 23:19:50 CET,Thu Nov 25 01:34:48 CET,0.0 0.391 0.578 0.714 0.869 0.997 1.112 1.22 1.405 1.5 1.592 1.567 1.836 1.903 2.016 2.147 2.282 2.338 2.444 2.56 2.723 2.823 2.916 3.06 3.205 3.322 3.429 3.533 3.662 3.785 3.904 4.042 4.171 4.289 4.418 4.57 4.718 4.867 5.039 5.228 5.393 5.58 5.796 5.974 6.158 6.303 6.409 6.482 6.472 6.315 5.74 4.707 3.74 2.871 2.107 1.412 0.778 0.18 -0.343 -0.847 -1.295 -1.691 -2.062 -2.423 -2.778 -3.136 -3.516 -3.845 -4.109 -4.366 -4.645 -4.886 -5.13 -5.395 -5.608 -5.826 -6.068 -6.316 -6.54 -6.691 -6.871 -7.173 -7.38 -7.587 -7.696 -7.922 -8.174 -8.466 -8.604 -8.945 -9.064 -9.214 -9.372 -9.738 -9.942 -10.178 -10.461 -10.772 -11.147 -11.612 -12.748 -7 ,25542 ,TETRA ,17524759,Wed Nov 24 23:19:48 CET,Thu Nov 25 01:34:45 CET,0.0 0.352 0.527 0.677 0.808 0.911 1.0 1.097 1.299 1.393 1.477 1.459 1.732 1.798 1.916 2.048 2.187 2.251 2.371 2.483 2.638 2.733 2.824 2.958 3.094 3.225 3.346 3.462 3.597 3.732 3.874 4.034 4.182 4.32 4.47 4.639 4.804 4.984 5.166 5.341 5.519 5.712 5.902 6.081 6.274 6.456 6.625 6.744 6.749 6.552 5.964 4.988 4.061 3.219 2.442 1.72 1.063 0.431 -0.132 -0.67 -1.098 -1.465 -1.818 -2.179 -2.537 -2.856 -3.193 -3.496 -3.743 -3.998 -4.271 -4.501 -4.755 -5.04 -5.276 -5.498 -5.696 -5.907 -6.124 -6.266 -6.422 -6.697 -6.889 -7.083 -7.185 -7.394 -7.633 -7.918 -8.068 -8.419 -8.507 -8.658 -8.821 -9.184 -9.386 -9.598 -9.826 -10.066 -10.32 -10.686 -11.709 -8 ,8845 ,TETRA ,17524761,Wed Nov 24 23:20:45 CET,Thu Nov 25 01:38:10 CET,0.0 0.307 0.547 0.74 0.903 1.056 1.206 1.331 1.521 1.607 1.703 1.687 1.963 2.038 2.179 2.317 2.453 2.518 2.655 2.788 2.963 3.071 3.176 3.331 3.49 3.643 3.78 3.913 4.077 4.221 4.358 4.52 4.673 4.813 4.965 5.142 5.312 5.491 5.671 5.843 6.021 6.201 6.414 6.616 6.797 6.971 7.117 7.223 7.163 6.774 5.822 4.491 3.309 2.2 1.225 0.339 -0.395 -1.011 -1.558 -2.102 -2.565 -2.993 -3.412 -3.81 -4.192 -4.549 -4.894 -5.192 -5.456 -5.737 -6.057 -6.319 -6.584 -6.86 -7.062 -7.276 -7.512 -7.773 -8.064 -8.254 -8.437 -8.735 -8.922 -9.098 -9.193 -9.4 -9.647 -9.92 -10.052 -10.389 -10.489 -10.641 -10.805 -11.198 -11.399 -11.609 -11.831 -12.046 -12.289 -12.622 -13.247 -9 ,7395 ,TETRA ,17524763,Wed Nov 24 23:20:46 CET,Thu Nov 25 01:33:12 CET,0.0 0.354 0.536 0.701 0.833 0.944 1.062 1.174 1.349 1.439 1.532 1.492 1.758 1.828 1.954 2.079 2.198 2.255 2.371 2.478 2.622 2.716 2.802 2.924 3.043 3.157 3.266 3.374 3.512 3.634 3.743 3.876 4.005 4.13 4.272 4.422 4.559 4.699 4.833 4.979 5.132 5.279 5.409 5.542 5.678 5.777 5.856 5.853 5.73 5.393 4.584 3.411 2.299 1.214 0.219 -0.729 -1.608 -2.419 -3.116 -3.801 -4.395 -4.934 -5.479 -6.032 -6.542 -7.004 -7.502 -7.946 -8.334 -8.737 -9.112 -9.399 -9.687 -9.993 -10.228 -10.471 -10.732 -10.996 -11.266 -11.438 -11.599 -11.858 -12.04 -12.235 -12.339 -12.56 -12.814 -13.083 -13.23 -13.593 -13.707 -13.88 -14.057 -14.414 -14.619 -14.855 -15.095 -15.334 -15.636 -16.085 -17.488 -10 ,9053 ,TETRA ,17524765,Wed Nov 24 23:20:46 CET,Thu Nov 25 01:35:44 CET,0.0 0.454 0.661 0.846 0.987 1.109 1.234 1.352 1.54 1.62 1.705 1.678 1.927 1.987 2.109 2.229 2.343 2.4 2.515 2.624 2.786 2.883 2.976 3.122 3.262 3.399 3.521 3.646 3.827 3.99 4.14 4.321 4.483 4.624 4.78 4.967 5.138 5.317 5.513 5.712 5.902 6.083 6.291 6.493 6.666 6.811 6.95 7.044 7.021 6.796 6.18 5.199 4.244 3.374 2.608 1.858 1.153 0.499 -0.107 -0.722 -1.233 -1.679 -2.103 -2.501 -2.873 -3.221 -3.589 -3.915 -4.192 -4.472 -4.757 -4.994 -5.251 -5.528 -5.737 -5.956 -6.183 -6.399 -6.621 -6.775 -6.926 -7.168 -7.341 -7.52 -7.62 -7.839 -8.061 -8.29 -8.408 -8.725 -8.77 -8.908 -9.047 -9.342 -9.498 -9.658 -9.869 -10.199 -10.591 -10.969 -11.621 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index e85e6ba2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28155 ,KEBNE ,17024399,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:48:33 CET,0.0 0.318 0.533 0.739 0.898 1.029 1.166 1.299 1.564 1.679 1.762 1.727 2.0 2.078 2.233 2.375 2.51 2.585 2.745 2.903 3.112 3.231 3.345 3.495 3.633 3.769 3.903 4.045 4.221 4.38 4.531 4.711 4.882 5.04 5.219 5.413 5.607 5.814 5.998 6.2 6.442 6.71 7.002 7.28 7.572 7.841 8.058 8.194 8.171 7.887 6.948 5.495 4.291 3.235 2.254 1.273 0.408 -0.322 -0.912 -1.503 -2.066 -2.585 -3.07 -3.512 -3.911 -4.266 -4.636 -4.96 -5.245 -5.564 -5.896 -6.171 -6.46 -6.75 -6.963 -7.184 -7.438 -7.708 -7.969 -8.138 -8.307 -8.56 -8.735 -8.928 -9.027 -9.231 -9.458 -9.707 -9.832 -10.158 -10.218 -10.361 -10.521 -10.868 -11.036 -11.214 -11.421 -11.644 -11.905 -12.195 -12.934 -2 ,22821 ,KEBNE ,17024400,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:48:13 CET,0.0 0.509 0.785 0.98 1.139 1.301 1.438 1.533 1.725 1.834 1.944 1.947 2.233 2.317 2.481 2.651 2.807 2.879 3.018 3.149 3.34 3.466 3.597 3.793 3.97 4.124 4.279 4.417 4.584 4.763 4.927 5.108 5.267 5.422 5.613 5.82 6.007 6.202 6.417 6.642 6.879 7.145 7.441 7.724 8.026 8.276 8.444 8.592 8.619 8.307 7.553 6.354 5.102 3.996 2.981 2.018 1.133 0.323 -0.343 -1.013 -1.581 -2.074 -2.538 -2.968 -3.37 -3.747 -4.13 -4.465 -4.763 -5.074 -5.411 -5.703 -5.996 -6.277 -6.485 -6.712 -6.956 -7.223 -7.508 -7.697 -7.884 -8.173 -8.37 -8.567 -8.667 -8.883 -9.125 -9.386 -9.514 -9.86 -9.962 -10.115 -10.269 -10.569 -10.732 -10.94 -11.188 -11.463 -11.762 -12.17 -13.833 -3 ,11173 ,KEBNE ,17024401,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:48:28 CET,0.0 0.859 1.125 1.325 1.516 1.667 1.795 1.922 2.17 2.284 2.398 2.402 2.665 2.737 2.89 3.044 3.193 3.263 3.389 3.507 3.691 3.817 3.942 4.117 4.284 4.447 4.599 4.746 4.943 5.136 5.303 5.476 5.641 5.794 5.985 6.218 6.433 6.659 6.909 7.151 7.369 7.616 7.907 8.165 8.433 8.695 8.896 9.011 9.057 8.925 8.256 7.041 5.921 4.912 4.014 3.219 2.486 1.745 1.122 0.547 0.053 -0.427 -0.909 -1.347 -1.757 -2.149 -2.557 -2.93 -3.243 -3.566 -3.92 -4.205 -4.494 -4.786 -5.008 -5.235 -5.466 -5.708 -5.976 -6.164 -6.36 -6.66 -6.854 -7.057 -7.169 -7.402 -7.643 -7.891 -8.02 -8.357 -8.4 -8.53 -8.681 -9.021 -9.21 -9.418 -9.622 -9.841 -10.1 -10.446 -11.577 -4 ,8922 ,KEBNE ,17024402,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:47:50 CET,0.0 0.813 0.986 1.148 1.318 1.465 1.62 1.769 2.028 2.15 2.258 2.262 2.546 2.636 2.81 2.977 3.138 3.208 3.33 3.445 3.634 3.748 3.851 4.015 4.172 4.323 4.47 4.598 4.746 4.893 5.033 5.205 5.371 5.527 5.697 5.864 6.026 6.229 6.446 6.65 6.848 7.078 7.348 7.583 7.783 7.962 8.128 8.227 8.113 7.694 6.794 5.387 4.034 2.815 1.722 0.683 -0.251 -1.147 -1.948 -2.742 -3.438 -4.038 -4.609 -5.171 -5.676 -6.131 -6.638 -7.102 -7.45 -7.769 -8.094 -8.365 -8.649 -8.938 -9.156 -9.369 -9.588 -9.832 -10.089 -10.254 -10.424 -10.701 -10.886 -11.075 -11.178 -11.391 -11.597 -11.811 -11.937 -12.276 -12.371 -12.529 -12.675 -12.954 -13.121 -13.315 -13.522 -13.747 -14.002 -14.29 -15.025 -5 ,17795 ,KEBNE ,17024403,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:48:08 CET,0.0 0.43 0.639 0.799 0.996 1.193 1.353 1.477 1.679 1.77 1.857 1.857 2.153 2.246 2.41 2.565 2.705 2.774 2.9 3.016 3.205 3.319 3.417 3.556 3.698 3.832 3.968 4.102 4.256 4.406 4.554 4.728 4.899 5.063 5.25 5.457 5.651 5.85 6.061 6.288 6.522 6.767 7.022 7.266 7.51 7.72 7.879 7.936 7.897 7.584 6.615 5.061 3.575 2.32 1.215 0.189 -0.734 -1.609 -2.384 -3.169 -3.77 -4.252 -4.731 -5.195 -5.617 -5.982 -6.359 -6.688 -6.967 -7.267 -7.591 -7.875 -8.175 -8.479 -8.714 -8.949 -9.176 -9.409 -9.668 -9.848 -10.012 -10.277 -10.482 -10.695 -10.802 -11.013 -11.25 -11.518 -11.655 -11.999 -12.088 -12.234 -12.383 -12.699 -12.87 -13.061 -13.279 -13.517 -13.774 -14.095 -14.864 -6 ,16216 ,KEBNE ,17024404,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:49:17 CET,0.0 0.677 0.943 1.153 1.334 1.471 1.581 1.684 1.911 2.03 2.14 2.142 2.428 2.522 2.707 2.877 3.03 3.097 3.23 3.362 3.542 3.658 3.777 3.947 4.103 4.255 4.401 4.534 4.713 4.882 5.032 5.209 5.378 5.533 5.715 5.927 6.137 6.366 6.585 6.816 7.059 7.287 7.509 7.714 7.945 8.173 8.385 8.538 8.568 8.378 7.605 6.231 4.957 3.882 2.945 2.06 1.296 0.595 -0.059 -0.73 -1.279 -1.777 -2.268 -2.698 -3.111 -3.508 -3.918 -4.287 -4.607 -4.933 -5.277 -5.559 -5.841 -6.143 -6.382 -6.629 -6.88 -7.141 -7.423 -7.616 -7.812 -8.12 -8.32 -8.515 -8.616 -8.843 -9.084 -9.327 -9.455 -9.802 -9.899 -10.048 -10.191 -10.505 -10.687 -10.893 -11.139 -11.402 -11.674 -12.003 -12.694 -7 ,23224 ,KEBNE ,17024405,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:48:08 CET,0.0 0.291 0.49 0.672 0.831 0.97 1.103 1.234 1.471 1.564 1.653 1.655 1.932 2.016 2.187 2.351 2.485 2.546 2.685 2.814 2.989 3.11 3.224 3.389 3.536 3.675 3.819 3.946 4.091 4.227 4.373 4.556 4.734 4.913 5.112 5.33 5.552 5.795 6.044 6.309 6.577 6.823 7.079 7.338 7.58 7.767 7.914 8.02 8.018 7.818 7.135 5.882 4.691 3.651 2.664 1.737 0.952 0.211 -0.458 -1.088 -1.601 -2.092 -2.587 -3.046 -3.47 -3.88 -4.282 -4.618 -4.923 -5.249 -5.614 -5.91 -6.202 -6.497 -6.725 -6.954 -7.191 -7.438 -7.672 -7.841 -8.028 -8.302 -8.489 -8.683 -8.783 -8.989 -9.215 -9.461 -9.588 -9.95 -10.059 -10.21 -10.36 -10.667 -10.83 -10.999 -11.18 -11.403 -11.652 -11.966 -12.615 -8 ,24916 ,KEBNE ,17024406,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:48:59 CET,0.0 0.416 0.536 0.667 0.814 0.969 1.103 1.211 1.402 1.501 1.602 1.594 1.875 1.95 2.074 2.186 2.314 2.377 2.484 2.6 2.783 2.893 2.996 3.138 3.269 3.399 3.536 3.674 3.837 3.98 4.123 4.305 4.483 4.647 4.827 5.03 5.211 5.394 5.585 5.77 5.957 6.177 6.422 6.625 6.812 6.994 7.145 7.238 7.233 6.998 6.255 5.04 3.915 2.872 1.927 1.052 0.239 -0.508 -1.125 -1.745 -2.3 -2.79 -3.262 -3.697 -4.112 -4.501 -4.913 -5.283 -5.586 -5.888 -6.196 -6.446 -6.71 -7.002 -7.23 -7.46 -7.691 -7.934 -8.197 -8.373 -8.545 -8.801 -8.984 -9.176 -9.274 -9.476 -9.687 -9.917 -10.038 -10.361 -10.418 -10.561 -10.707 -11.008 -11.168 -11.324 -11.488 -11.686 -11.937 -12.199 -12.809 -9 ,1320 ,KEBNE ,17024407,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:48:09 CET,0.0 0.28 0.454 0.622 0.766 0.905 1.029 1.145 1.376 1.487 1.596 1.595 1.874 1.952 2.092 2.225 2.362 2.43 2.559 2.693 2.888 3.017 3.143 3.315 3.483 3.633 3.768 3.899 4.062 4.213 4.357 4.528 4.68 4.821 5.005 5.21 5.398 5.602 5.807 6.015 6.23 6.441 6.655 6.872 7.131 7.368 7.519 7.546 7.446 7.131 6.153 4.612 3.222 1.967 0.812 -0.321 -1.357 -2.268 -3.042 -3.841 -4.538 -5.152 -5.748 -6.268 -6.677 -7.05 -7.452 -7.806 -8.106 -8.419 -8.766 -9.065 -9.366 -9.671 -9.9 -10.131 -10.388 -10.652 -10.916 -11.091 -11.27 -11.565 -11.776 -11.994 -12.101 -12.32 -12.567 -12.845 -12.979 -13.323 -13.403 -13.537 -13.672 -13.989 -14.191 -14.414 -14.636 -14.868 -15.138 -15.504 -16.446 -10 ,8879 ,KEBNE ,17024408,Wed Dec 22 09:54:06 CET,Wed Dec 22 11:49:35 CET,0.0 0.645 0.893 1.089 1.248 1.393 1.533 1.647 1.876 2.0 2.112 2.105 2.373 2.453 2.609 2.756 2.914 2.992 3.137 3.276 3.469 3.586 3.705 3.87 4.022 4.172 4.309 4.443 4.61 4.77 4.928 5.115 5.298 5.462 5.64 5.835 6.004 6.181 6.389 6.611 6.814 7.022 7.251 7.434 7.628 7.828 7.969 8.024 7.901 7.497 6.487 4.897 3.57 2.483 1.492 0.591 -0.21 -0.958 -1.625 -2.265 -2.818 -3.35 -3.835 -4.277 -4.689 -5.058 -5.445 -5.789 -6.092 -6.403 -6.707 -6.971 -7.269 -7.578 -7.809 -8.033 -8.273 -8.538 -8.803 -8.987 -9.177 -9.465 -9.672 -9.886 -9.993 -10.212 -10.441 -10.674 -10.794 -11.124 -11.188 -11.329 -11.482 -11.814 -11.999 -12.223 -12.457 -12.713 -13.011 -13.361 -14.053 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt deleted file mode 100644 index b9d86c60..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16508 ,TETRA ,17524768,Wed Nov 24 23:21:46 CET,Thu Nov 25 01:38:05 CET,0.0 0.666 0.938 1.17 1.335 1.479 1.604 1.72 1.934 2.026 2.126 2.136 2.42 2.5 2.66 2.816 2.959 3.032 3.176 3.307 3.503 3.637 3.777 3.962 4.107 4.257 4.412 4.559 4.749 4.933 5.105 5.293 5.474 5.676 5.913 6.159 6.397 6.669 6.949 7.228 7.52 7.84 8.198 8.559 8.998 9.447 9.885 10.288 10.646 10.977 11.059 10.656 10.148 9.556 8.978 8.463 7.919 7.368 6.882 6.418 6.034 5.685 5.339 4.967 4.636 4.348 4.01 3.689 3.414 3.137 2.864 2.629 2.372 2.129 1.941 1.731 1.508 1.29 1.074 0.924 0.754 0.488 0.331 0.175 0.093 -0.087 -0.28 -0.468 -0.569 -0.876 -0.928 -1.055 -1.179 -1.44 -1.577 -1.735 -1.898 -2.075 -2.286 -2.585 -3.36 -2 ,31236 ,TETRA ,17524769,Wed Nov 24 23:21:46 CET,Thu Nov 25 01:37:37 CET,0.0 0.565 0.861 1.036 1.188 1.347 1.49 1.616 1.853 1.961 2.067 2.085 2.38 2.478 2.653 2.812 2.958 3.033 3.183 3.337 3.571 3.713 3.854 4.058 4.26 4.45 4.629 4.802 5.01 5.202 5.381 5.6 5.809 6.0 6.215 6.469 6.709 6.947 7.198 7.467 7.721 7.989 8.333 8.69 9.057 9.404 9.766 10.088 10.339 10.477 10.2 9.423 8.783 8.187 7.596 7.029 6.475 5.959 5.522 5.098 4.724 4.351 3.977 3.641 3.358 3.112 2.836 2.576 2.352 2.114 1.861 1.65 1.442 1.236 1.066 0.881 0.698 0.518 0.325 0.181 0.031 -0.2 -0.357 -0.514 -0.599 -0.784 -0.968 -1.168 -1.273 -1.575 -1.626 -1.761 -1.9 -2.183 -2.316 -2.461 -2.617 -2.802 -3.016 -3.271 -3.844 -3 ,26418 ,TETRA ,17524770,Wed Nov 24 23:21:47 CET,Thu Nov 25 01:37:57 CET,0.0 0.694 0.983 1.22 1.423 1.588 1.739 1.864 2.1 2.228 2.344 2.349 2.636 2.737 2.932 3.113 3.272 3.35 3.507 3.66 3.862 3.982 4.103 4.28 4.444 4.594 4.741 4.89 5.085 5.266 5.442 5.655 5.862 6.053 6.272 6.496 6.706 6.952 7.235 7.547 7.866 8.224 8.612 8.964 9.337 9.726 10.166 10.644 11.113 11.504 11.664 11.263 10.709 10.2 9.654 9.117 8.577 8.059 7.62 7.177 6.797 6.417 6.033 5.689 5.372 5.079 4.766 4.477 4.234 3.987 3.744 3.538 3.324 3.089 2.893 2.696 2.488 2.263 2.027 1.876 1.73 1.497 1.331 1.149 1.054 0.865 0.664 0.455 0.349 0.037 -0.001 -0.131 -0.272 -0.568 -0.722 -0.891 -1.059 -1.242 -1.483 -1.784 -2.414 -4 ,4708 ,TETRA ,17524771,Wed Nov 24 23:21:47 CET,Thu Nov 25 01:35:38 CET,0.0 0.303 0.485 0.665 0.819 0.954 1.085 1.202 1.447 1.555 1.66 1.685 1.969 2.057 2.224 2.392 2.549 2.62 2.754 2.882 3.069 3.198 3.326 3.505 3.668 3.823 3.981 4.137 4.337 4.529 4.708 4.93 5.142 5.324 5.543 5.812 6.07 6.345 6.622 6.9 7.197 7.529 7.882 8.18 8.502 8.864 9.249 9.621 10.04 10.425 10.507 10.116 9.592 9.056 8.435 7.807 7.257 6.723 6.218 5.692 5.244 4.829 4.432 4.092 3.765 3.448 3.134 2.836 2.582 2.34 2.04 1.783 1.54 1.278 1.075 0.879 0.674 0.461 0.253 0.102 -0.06 -0.308 -0.481 -0.654 -0.738 -0.92 -1.118 -1.327 -1.442 -1.756 -1.781 -1.896 -2.028 -2.296 -2.424 -2.57 -2.757 -2.971 -3.192 -3.473 -4.219 -5 ,2316 ,TETRA ,17524772,Wed Nov 24 23:21:47 CET,Thu Nov 25 01:40:56 CET,0.0 0.301 0.521 0.7 0.898 1.1 1.241 1.374 1.666 1.81 1.937 1.963 2.249 2.346 2.532 2.706 2.866 2.951 3.118 3.279 3.498 3.627 3.753 3.918 4.069 4.227 4.402 4.57 4.778 4.988 5.187 5.429 5.668 5.902 6.174 6.452 6.703 6.989 7.29 7.593 7.884 8.234 8.669 9.067 9.479 9.886 10.359 10.876 11.38 11.749 11.745 11.328 10.808 10.229 9.667 9.101 8.566 8.081 7.645 7.171 6.736 6.334 5.955 5.61 5.278 4.963 4.645 4.364 4.111 3.849 3.567 3.329 3.096 2.863 2.692 2.51 2.309 2.094 1.861 1.705 1.542 1.288 1.112 0.927 0.837 0.642 0.434 0.213 0.09 -0.228 -0.245 -0.359 -0.49 -0.773 -0.917 -1.06 -1.236 -1.449 -1.681 -1.98 -2.589 -6 ,27620 ,TETRA ,17524773,Wed Nov 24 23:21:47 CET,Thu Nov 25 01:38:27 CET,0.0 0.838 1.142 1.381 1.6 1.764 1.897 2.029 2.302 2.42 2.539 2.597 2.896 3.013 3.246 3.448 3.62 3.705 3.868 4.023 4.252 4.402 4.554 4.769 4.964 5.138 5.322 5.502 5.714 5.918 6.106 6.325 6.542 6.749 6.995 7.275 7.541 7.821 8.103 8.391 8.677 8.999 9.364 9.695 10.08 10.485 10.862 11.225 11.576 11.799 11.65 11.035 10.199 9.327 8.527 7.726 6.953 6.203 5.556 4.933 4.391 3.916 3.479 3.044 2.608 2.2 1.774 1.39 1.054 0.701 0.327 0.012 -0.317 -0.665 -0.946 -1.239 -1.532 -1.826 -2.076 -2.225 -2.38 -2.612 -2.791 -2.986 -3.08 -3.28 -3.501 -3.741 -3.892 -4.234 -4.268 -4.388 -4.518 -4.798 -4.961 -5.122 -5.273 -5.452 -5.678 -5.961 -7.108 -7 ,14443 ,TETRA ,17524774,Wed Nov 24 23:21:47 CET,Thu Nov 25 01:39:19 CET,0.0 0.737 0.975 1.193 1.376 1.535 1.683 1.815 2.07 2.195 2.315 2.357 2.66 2.756 2.95 3.126 3.279 3.353 3.527 3.715 3.975 4.129 4.264 4.456 4.642 4.813 4.971 5.124 5.323 5.509 5.679 5.893 6.111 6.309 6.537 6.805 7.057 7.332 7.623 7.931 8.226 8.532 8.923 9.323 9.768 10.29 10.821 11.21 11.557 11.764 11.697 11.358 10.812 10.164 9.53 8.935 8.38 7.878 7.439 6.966 6.562 6.195 5.844 5.501 5.171 4.893 4.6 4.323 4.073 3.822 3.557 3.324 3.077 2.816 2.613 2.42 2.234 2.019 1.795 1.648 1.485 1.245 1.082 0.91 0.823 0.642 0.456 0.244 0.128 -0.19 -0.257 -0.401 -0.553 -0.884 -1.06 -1.244 -1.437 -1.681 -1.978 -2.3 -2.803 -8 ,23631 ,TETRA ,17524775,Wed Nov 24 23:22:41 CET,Thu Nov 25 01:39:19 CET,0.0 0.597 0.831 1.007 1.182 1.343 1.488 1.643 1.906 2.02 2.136 2.167 2.458 2.559 2.756 2.939 3.105 3.185 3.338 3.487 3.7 3.832 3.959 4.15 4.341 4.519 4.682 4.836 5.029 5.214 5.389 5.592 5.774 5.954 6.184 6.431 6.665 6.916 7.171 7.44 7.707 7.989 8.349 8.717 9.107 9.494 9.862 10.234 10.549 10.684 10.434 9.666 8.834 8.009 7.191 6.456 5.866 5.334 4.896 4.419 4.01 3.663 3.303 2.94 2.591 2.275 1.945 1.651 1.395 1.12 0.83 0.583 0.319 0.062 -0.138 -0.353 -0.556 -0.767 -0.999 -1.158 -1.311 -1.548 -1.727 -1.926 -2.03 -2.228 -2.438 -2.666 -2.776 -3.084 -3.107 -3.238 -3.392 -3.718 -3.9 -4.093 -4.28 -4.49 -4.738 -5.013 -6.649 -9 ,14884 ,TETRA ,17524776,Wed Nov 24 23:22:44 CET,Thu Nov 25 01:39:04 CET,0.0 0.341 0.612 0.803 0.949 1.101 1.25 1.38 1.593 1.697 1.81 1.81 2.093 2.186 2.351 2.514 2.667 2.736 2.883 3.025 3.212 3.331 3.451 3.631 3.792 3.938 4.079 4.233 4.445 4.625 4.804 5.041 5.259 5.469 5.701 5.93 6.16 6.434 6.711 6.98 7.251 7.544 7.894 8.229 8.556 8.872 9.223 9.549 9.837 9.921 9.55 8.659 7.731 6.943 6.279 5.668 5.102 4.573 4.085 3.585 3.199 2.862 2.508 2.169 1.85 1.553 1.249 0.983 0.754 0.511 0.251 0.034 -0.19 -0.414 -0.598 -0.807 -1.01 -1.214 -1.448 -1.605 -1.761 -1.998 -2.16 -2.33 -2.409 -2.558 -2.737 -2.938 -3.04 -3.336 -3.374 -3.5 -3.616 -3.862 -4.0 -4.149 -4.309 -4.502 -4.709 -4.958 -5.758 -10 ,22164 ,TETRA ,17524777,Wed Nov 24 23:22:46 CET,Thu Nov 25 01:38:36 CET,0.0 0.546 0.76 0.965 1.161 1.339 1.498 1.631 1.903 2.038 2.157 2.197 2.5 2.589 2.782 2.989 3.166 3.248 3.405 3.554 3.759 3.89 4.015 4.186 4.355 4.524 4.683 4.842 5.059 5.261 5.448 5.663 5.861 6.054 6.263 6.496 6.728 6.962 7.217 7.486 7.744 8.034 8.355 8.679 9.059 9.442 9.781 10.075 10.298 10.321 9.946 9.082 8.207 7.357 6.516 5.711 4.989 4.275 3.585 2.974 2.567 2.22 1.873 1.533 1.207 0.902 0.565 0.257 0.015 -0.217 -0.461 -0.663 -0.886 -1.138 -1.336 -1.532 -1.73 -1.932 -2.145 -2.292 -2.438 -2.673 -2.85 -3.031 -3.118 -3.304 -3.501 -3.696 -3.799 -4.109 -4.137 -4.267 -4.392 -4.673 -4.832 -4.974 -5.138 -5.311 -5.496 -5.749 -6.572 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index aff9425d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18352 ,TETRA ,17524778,Wed Nov 24 23:23:41 CET,Thu Nov 25 01:41:03 CET,0.0 0.826 1.065 1.276 1.466 1.626 1.773 1.896 2.097 2.207 2.328 2.336 2.623 2.722 2.914 3.078 3.245 3.33 3.496 3.657 3.872 4.023 4.159 4.335 4.509 4.677 4.843 5.008 5.221 5.421 5.609 5.825 6.043 6.257 6.501 6.755 6.991 7.296 7.702 8.167 8.635 9.138 9.691 10.229 10.846 11.524 12.287 13.111 13.991 14.901 15.783 16.216 16.15 15.894 15.615 15.348 15.053 14.724 14.427 14.097 13.775 13.466 13.195 12.944 12.679 12.438 12.197 11.974 11.765 11.543 11.326 11.143 10.958 10.763 10.6 10.443 10.28 10.087 9.876 9.739 9.596 9.372 9.216 9.033 8.942 8.756 8.544 8.317 8.19 7.866 7.824 7.71 7.572 7.263 7.104 6.945 6.777 6.579 6.308 5.973 5.063 -2 ,19457 ,TETRA ,17524779,Wed Nov 24 23:22:41 CET,Thu Nov 25 01:40:36 CET,0.0 0.451 0.763 0.975 1.121 1.261 1.392 1.509 1.726 1.832 1.929 1.914 2.194 2.288 2.491 2.676 2.858 2.944 3.095 3.244 3.45 3.573 3.691 3.875 4.059 4.226 4.376 4.528 4.74 4.938 5.127 5.36 5.597 5.818 6.05 6.298 6.537 6.816 7.121 7.43 7.748 8.097 8.477 8.877 9.344 9.829 10.344 10.889 11.513 12.118 12.627 12.784 12.731 12.594 12.327 12.027 11.749 11.449 11.16 10.865 10.592 10.328 10.087 9.863 9.638 9.431 9.204 8.988 8.788 8.578 8.366 8.178 7.984 7.795 7.645 7.469 7.276 7.084 6.881 6.742 6.605 6.384 6.222 6.05 5.962 5.784 5.598 5.405 5.297 4.984 4.922 4.791 4.651 4.337 4.173 3.994 3.807 3.596 3.328 2.981 1.911 -3 ,6153 ,TETRA ,17524780,Wed Nov 24 23:22:43 CET,Thu Nov 25 01:40:40 CET,0.0 0.33 0.538 0.698 0.842 0.987 1.126 1.264 1.511 1.618 1.725 1.73 2.029 2.128 2.324 2.502 2.663 2.74 2.899 3.051 3.263 3.4 3.544 3.75 3.929 4.094 4.26 4.42 4.61 4.788 4.966 5.174 5.388 5.599 5.832 6.086 6.334 6.597 6.877 7.183 7.511 7.873 8.256 8.647 9.116 9.614 10.178 10.774 11.379 11.953 12.509 12.743 12.568 12.242 11.912 11.556 11.214 10.869 10.544 10.226 9.919 9.609 9.306 9.025 8.758 8.509 8.259 8.031 7.824 7.603 7.374 7.181 6.974 6.756 6.573 6.385 6.188 5.981 5.772 5.632 5.491 5.271 5.116 4.943 4.853 4.678 4.488 4.283 4.175 3.869 3.827 3.691 3.545 3.229 3.066 2.893 2.724 2.534 2.278 1.93 1.155 -4 ,18573 ,TETRA ,17524781,Wed Nov 24 23:22:43 CET,Thu Nov 25 01:40:29 CET,0.0 0.332 0.571 0.773 0.961 1.127 1.305 1.474 1.732 1.841 1.943 1.937 2.233 2.33 2.497 2.653 2.816 2.902 3.074 3.229 3.457 3.602 3.728 3.902 4.065 4.229 4.391 4.564 4.786 4.986 5.179 5.4 5.61 5.85 6.207 6.642 7.048 7.494 7.956 8.437 8.939 9.484 10.114 10.756 11.491 12.289 13.189 14.05 14.948 15.914 16.806 17.265 17.261 17.018 16.675 16.331 16.008 15.69 15.393 15.09 14.821 14.574 14.34 14.107 13.865 13.636 13.392 13.166 12.962 12.74 12.507 12.307 12.097 11.873 11.699 11.517 11.331 11.134 10.925 10.787 10.64 10.406 10.245 10.075 9.988 9.809 9.619 9.407 9.295 9.001 8.975 8.864 8.754 8.502 8.341 8.155 7.952 7.746 7.526 7.216 6.515 -5 ,16149 ,TETRA ,17524782,Wed Nov 24 23:23:43 CET,Thu Nov 25 01:41:27 CET,0.0 0.513 0.864 1.108 1.272 1.446 1.612 1.744 1.979 2.102 2.229 2.259 2.544 2.641 2.85 3.059 3.238 3.32 3.486 3.648 3.872 4.023 4.176 4.406 4.629 4.817 4.989 5.152 5.356 5.556 5.744 5.974 6.199 6.402 6.629 6.888 7.133 7.409 7.711 8.023 8.357 8.739 9.163 9.554 10.003 10.48 10.987 11.529 12.081 12.609 12.977 12.919 12.629 12.249 11.874 11.489 11.104 10.739 10.44 10.13 9.836 9.553 9.277 9.021 8.778 8.533 8.275 8.056 7.865 7.677 7.468 7.272 7.079 6.879 6.726 6.57 6.399 6.216 6.03 5.901 5.759 5.542 5.392 5.225 5.131 4.922 4.704 4.467 4.346 4.047 4.032 3.92 3.8 3.52 3.367 3.201 3.007 2.776 2.528 2.21 1.219 -6 ,9481 ,TETRA ,17524784,Wed Nov 24 23:23:41 CET,Thu Nov 25 01:41:18 CET,0.0 0.54 0.874 1.057 1.246 1.428 1.583 1.723 1.964 2.094 2.222 2.226 2.507 2.582 2.746 2.894 3.035 3.116 3.289 3.442 3.642 3.772 3.897 4.074 4.251 4.429 4.606 4.779 5.003 5.215 5.416 5.655 5.899 6.131 6.379 6.651 6.905 7.179 7.469 7.776 8.089 8.437 8.85 9.259 9.737 10.242 10.774 11.343 11.97 12.638 13.235 13.399 13.184 12.845 12.46 12.09 11.761 11.408 11.114 10.82 10.554 10.31 10.061 9.819 9.59 9.378 9.142 8.928 8.736 8.517 8.286 8.107 7.921 7.72 7.567 7.409 7.246 7.075 6.893 6.772 6.632 6.392 6.227 6.059 5.974 5.796 5.596 5.371 5.254 4.937 4.887 4.77 4.64 4.367 4.221 4.055 3.837 3.583 3.358 3.124 2.362 -7 ,32408 ,TETRA ,17524785,Wed Nov 24 23:24:44 CET,Thu Nov 25 01:42:30 CET,0.0 0.418 0.624 0.836 1.0 1.133 1.259 1.368 1.565 1.672 1.783 1.794 2.092 2.203 2.411 2.581 2.736 2.806 2.964 3.132 3.35 3.469 3.578 3.758 3.937 4.1 4.262 4.421 4.622 4.803 4.981 5.207 5.433 5.651 5.908 6.213 6.488 6.763 7.053 7.373 7.706 8.052 8.446 8.842 9.288 9.759 10.297 10.871 11.521 12.223 12.833 13.119 13.065 12.875 12.634 12.35 12.023 11.705 11.439 11.136 10.849 10.598 10.368 10.148 9.926 9.713 9.486 9.275 9.08 8.881 8.677 8.498 8.308 8.133 7.995 7.831 7.653 7.474 7.297 7.175 7.039 6.811 6.652 6.483 6.392 6.222 6.046 5.846 5.743 5.447 5.442 5.324 5.193 4.922 4.767 4.598 4.423 4.208 3.995 3.742 3.123 -8 ,29902 ,TETRA ,17524787,Wed Nov 24 23:24:47 CET,Thu Nov 25 01:42:02 CET,0.0 0.545 0.832 1.048 1.242 1.425 1.579 1.698 1.908 2.008 2.115 2.112 2.402 2.497 2.692 2.865 3.014 3.087 3.231 3.378 3.601 3.739 3.877 4.082 4.267 4.425 4.576 4.739 4.961 5.158 5.329 5.543 5.764 5.976 6.235 6.546 6.846 7.163 7.478 7.783 8.084 8.428 8.815 9.167 9.586 10.078 10.606 11.163 11.721 12.232 12.655 12.692 12.507 12.292 12.015 11.672 11.309 10.941 10.617 10.275 9.97 9.699 9.452 9.21 8.946 8.68 8.417 8.194 7.986 7.761 7.51 7.29 7.074 6.846 6.668 6.489 6.319 6.156 5.965 5.822 5.677 5.455 5.286 5.119 5.042 4.869 4.677 4.464 4.351 4.047 3.996 3.868 3.741 3.454 3.29 3.122 2.959 2.741 2.49 2.231 1.714 -9 ,25749 ,TETRA ,17524789,Wed Nov 24 23:24:44 CET,Thu Nov 25 01:42:03 CET,0.0 0.523 0.782 0.987 1.173 1.351 1.511 1.667 1.934 2.057 2.177 2.214 2.529 2.625 2.789 2.95 3.12 3.21 3.394 3.576 3.823 3.969 4.106 4.303 4.487 4.658 4.816 4.962 5.138 5.317 5.512 5.749 5.972 6.181 6.416 6.669 6.906 7.17 7.464 7.78 8.083 8.404 8.778 9.198 9.73 10.287 10.895 11.532 12.204 12.967 13.745 14.105 14.056 13.875 13.604 13.224 12.854 12.514 12.212 11.887 11.593 11.313 11.008 10.707 10.433 10.184 9.923 9.687 9.479 9.256 9.023 8.84 8.663 8.468 8.296 8.112 7.927 7.732 7.533 7.398 7.255 7.024 6.863 6.696 6.608 6.429 6.242 6.026 5.912 5.608 5.597 5.494 5.384 5.142 4.975 4.764 4.546 4.339 4.093 3.793 2.941 -10 ,26717 ,TETRA ,17524791,Wed Nov 24 23:24:45 CET,Thu Nov 25 01:41:33 CET,0.0 0.51 0.695 0.84 0.974 1.104 1.231 1.356 1.59 1.698 1.8 1.823 2.133 2.247 2.47 2.651 2.821 2.907 3.071 3.223 3.45 3.608 3.772 4.007 4.201 4.384 4.57 4.729 4.926 5.123 5.306 5.526 5.741 5.947 6.197 6.548 6.957 7.406 7.858 8.328 8.813 9.348 9.972 10.563 11.21 11.913 12.679 13.504 14.395 15.331 16.259 16.7 16.763 16.669 16.474 16.225 15.951 15.616 15.281 14.935 14.628 14.335 14.04 13.765 13.488 13.216 12.929 12.687 12.487 12.281 12.062 11.881 11.699 11.502 11.339 11.155 10.955 10.757 10.549 10.408 10.268 10.043 9.89 9.729 9.644 9.468 9.291 9.108 9.013 8.719 8.688 8.569 8.435 8.13 7.972 7.826 7.672 7.479 7.229 6.935 6.34 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt deleted file mode 100644 index 4f960a0b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15683 ,TETRA ,17524794,Wed Nov 24 23:25:40 CET,Thu Nov 25 01:50:14 CET,0.0 1.327 1.673 1.913 2.107 2.317 2.533 2.726 3.04 3.194 3.343 3.411 3.731 3.85 4.099 4.318 4.496 4.571 4.71 4.851 5.054 5.183 5.304 5.465 5.618 5.783 5.94 6.081 6.262 6.445 6.63 6.839 7.024 7.205 7.419 7.648 7.864 8.114 8.379 8.641 8.9 9.182 9.497 9.801 10.133 10.481 10.801 11.004 11.098 11.15 11.128 10.671 10.041 9.381 8.701 8.026 7.425 6.883 6.397 5.907 5.488 5.096 4.706 4.346 4.046 3.782 3.492 3.223 2.977 2.713 2.446 2.222 1.978 1.724 1.525 1.322 1.116 0.898 0.67 0.511 0.352 0.095 -0.076 -0.247 -0.35 -0.582 -0.834 -1.125 -1.269 -1.598 -1.667 -1.839 -2.015 -2.396 -2.615 -2.821 -3.039 -3.328 -3.685 -4.121 -5.192 -2 ,13801 ,TETRA ,17524796,Wed Nov 24 23:25:42 CET,Thu Nov 25 01:44:20 CET,0.0 0.978 1.335 1.603 1.841 2.025 2.175 2.314 2.604 2.744 2.864 2.895 3.196 3.292 3.474 3.658 3.825 3.902 4.067 4.22 4.442 4.607 4.762 4.949 5.136 5.323 5.483 5.621 5.791 5.977 6.177 6.412 6.616 6.791 6.989 7.218 7.425 7.652 7.912 8.203 8.554 8.995 9.468 9.9 10.4 10.936 11.472 11.974 12.434 12.746 12.812 12.394 11.771 11.154 10.531 9.916 9.35 8.815 8.318 7.817 7.409 7.051 6.701 6.368 6.043 5.72 5.379 5.082 4.821 4.532 4.241 4.022 3.803 3.561 3.352 3.134 2.914 2.692 2.468 2.317 2.151 1.885 1.703 1.518 1.428 1.231 1.001 0.777 0.679 0.373 0.333 0.209 0.076 -0.197 -0.347 -0.532 -0.724 -0.933 -1.192 -1.561 -2.332 -3 ,16015 ,TETRA ,17524798,Wed Nov 24 23:25:42 CET,Thu Nov 25 01:53:00 CET,0.0 1.416 1.863 2.188 2.458 2.683 2.877 3.051 3.357 3.507 3.638 3.651 3.952 4.052 4.26 4.452 4.622 4.712 4.881 5.029 5.237 5.373 5.492 5.652 5.806 5.963 6.117 6.262 6.447 6.652 6.877 7.121 7.316 7.487 7.674 7.891 8.105 8.334 8.566 8.811 9.076 9.336 9.603 9.88 10.174 10.482 10.847 11.191 11.518 11.75 11.679 11.13 10.411 9.679 8.978 8.318 7.706 7.143 6.623 6.089 5.656 5.264 4.88 4.532 4.218 3.93 3.617 3.339 3.112 2.865 2.598 2.373 2.129 1.873 1.672 1.466 1.257 1.042 0.795 0.613 0.434 0.15 -0.046 -0.245 -0.348 -0.548 -0.749 -0.967 -1.099 -1.446 -1.525 -1.671 -1.819 -2.127 -2.303 -2.493 -2.705 -2.924 -3.169 -3.464 -4.561 -4 ,25551 ,TETRA ,17524800,Wed Nov 24 23:26:45 CET,Thu Nov 25 01:43:49 CET,0.0 1.525 1.946 2.241 2.483 2.721 2.91 3.044 3.281 3.38 3.475 3.484 3.781 3.888 4.097 4.284 4.476 4.576 4.746 4.885 5.067 5.189 5.314 5.481 5.643 5.81 5.968 6.117 6.308 6.493 6.658 6.842 7.024 7.203 7.404 7.622 7.827 8.048 8.27 8.478 8.697 8.941 9.21 9.488 9.783 10.036 10.291 10.596 10.832 10.883 10.612 9.901 9.153 8.431 7.704 6.988 6.335 5.765 5.298 4.802 4.354 3.965 3.582 3.212 2.886 2.588 2.274 1.983 1.727 1.476 1.222 1.011 0.794 0.564 0.376 0.198 0.013 -0.195 -0.396 -0.526 -0.674 -0.92 -1.082 -1.258 -1.349 -1.533 -1.731 -1.927 -2.031 -2.357 -2.414 -2.541 -2.662 -2.918 -3.058 -3.21 -3.379 -3.557 -3.747 -4.029 -4.657 -5 ,6791 ,TETRA ,17524802,Wed Nov 24 23:26:43 CET,Thu Nov 25 01:44:30 CET,0.0 0.941 1.294 1.56 1.772 1.926 2.081 2.25 2.553 2.686 2.81 2.807 3.1 3.212 3.43 3.616 3.792 3.885 4.054 4.205 4.415 4.541 4.668 4.866 5.053 5.235 5.402 5.588 5.887 6.181 6.451 6.771 7.069 7.353 7.688 8.056 8.4 8.772 9.164 9.574 9.993 10.421 10.869 11.289 11.744 12.236 12.746 13.209 13.635 13.919 13.926 13.534 12.997 12.436 11.884 11.259 10.644 10.11 9.618 9.109 8.683 8.313 7.962 7.633 7.316 6.989 6.633 6.324 6.063 5.783 5.502 5.278 5.037 4.787 4.595 4.404 4.218 4.021 3.791 3.631 3.484 3.259 3.086 2.904 2.815 2.622 2.427 2.218 2.096 1.761 1.682 1.533 1.365 0.971 0.762 0.587 0.418 0.237 0.02 -0.317 -1.099 -6 ,26253 ,TETRA ,17524803,Wed Nov 24 23:26:45 CET,Thu Nov 25 01:44:56 CET,0.0 1.357 1.747 2.04 2.282 2.505 2.683 2.853 3.202 3.356 3.485 3.536 3.84 3.956 4.186 4.364 4.516 4.601 4.773 4.922 5.131 5.262 5.392 5.586 5.772 5.948 6.102 6.253 6.458 6.653 6.843 7.057 7.238 7.41 7.61 7.838 8.057 8.279 8.518 8.778 9.033 9.321 9.667 9.977 10.262 10.545 10.838 11.072 11.234 11.252 10.882 10.076 9.278 8.563 7.897 7.261 6.688 6.137 5.63 5.131 4.692 4.301 3.93 3.565 3.225 2.922 2.608 2.319 2.078 1.825 1.551 1.324 1.083 0.84 0.655 0.465 0.273 0.065 -0.149 -0.289 -0.44 -0.678 -0.845 -1.025 -1.119 -1.346 -1.615 -1.894 -2.034 -2.373 -2.444 -2.59 -2.756 -3.103 -3.308 -3.561 -3.81 -4.073 -4.378 -4.742 -5.714 -7 ,24854 ,TETRA ,17524804,Wed Nov 24 23:26:44 CET,Thu Nov 25 01:43:35 CET,0.0 0.868 1.209 1.438 1.629 1.802 1.954 2.108 2.402 2.538 2.675 2.732 3.047 3.16 3.381 3.6 3.79 3.877 4.043 4.197 4.416 4.544 4.668 4.845 5.016 5.187 5.345 5.49 5.661 5.824 5.992 6.183 6.374 6.562 6.782 7.029 7.261 7.507 7.743 7.983 8.243 8.528 8.828 9.096 9.375 9.679 9.972 10.215 10.461 10.567 10.221 9.496 8.755 8.003 7.332 6.74 6.187 5.658 5.2 4.732 4.311 3.945 3.607 3.261 2.915 2.608 2.295 2.029 1.804 1.574 1.341 1.143 0.934 0.718 0.548 0.362 0.175 -0.018 -0.222 -0.372 -0.524 -0.743 -0.915 -1.103 -1.188 -1.371 -1.564 -1.764 -1.878 -2.188 -2.205 -2.321 -2.444 -2.726 -2.907 -3.088 -3.236 -3.425 -3.676 -3.996 -4.5 -8 ,4139 ,TETRA ,17524806,Wed Nov 24 23:26:44 CET,Thu Nov 25 01:43:53 CET,0.0 1.38 1.812 2.089 2.312 2.523 2.73 2.935 3.311 3.476 3.63 3.694 4.008 4.12 4.334 4.531 4.703 4.783 4.961 5.126 5.319 5.428 5.53 5.689 5.841 5.995 6.157 6.303 6.476 6.633 6.811 7.098 7.399 7.686 8.005 8.358 8.711 9.088 9.496 9.901 10.293 10.725 11.212 11.671 12.187 12.775 13.429 14.036 14.537 14.965 15.154 14.822 14.224 13.566 12.987 12.415 11.903 11.461 11.04 10.581 10.146 9.75 9.389 9.044 8.719 8.425 8.133 7.876 7.646 7.406 7.149 6.931 6.719 6.503 6.322 6.133 5.944 5.748 5.543 5.405 5.261 5.003 4.806 4.615 4.525 4.344 4.15 3.929 3.81 3.486 3.461 3.325 3.176 2.867 2.696 2.501 2.299 2.06 1.781 1.469 0.702 -9 ,32134 ,TETRA ,17524808,Wed Nov 24 23:26:44 CET,Thu Nov 25 01:44:34 CET,0.0 0.675 1.031 1.327 1.576 1.801 1.99 2.16 2.444 2.559 2.658 2.667 2.966 3.062 3.251 3.456 3.644 3.728 3.884 4.033 4.242 4.378 4.509 4.708 4.909 5.085 5.249 5.399 5.581 5.768 5.943 6.14 6.329 6.513 6.713 6.922 7.132 7.355 7.591 7.823 8.061 8.404 8.837 9.246 9.698 10.144 10.654 11.142 11.544 11.806 11.796 11.397 10.771 10.135 9.552 8.978 8.443 7.964 7.536 7.069 6.67 6.312 5.958 5.604 5.255 4.947 4.625 4.33 4.086 3.834 3.57 3.349 3.118 2.88 2.691 2.503 2.311 2.093 1.859 1.702 1.542 1.29 1.113 0.934 0.845 0.659 0.463 0.254 0.147 -0.165 -0.193 -0.326 -0.469 -0.794 -0.986 -1.187 -1.409 -1.666 -1.918 -2.183 -2.913 -10 ,29507 ,TETRA ,17524810,Wed Nov 24 23:26:45 CET,Thu Nov 25 01:50:14 CET,0.0 0.696 0.98 1.234 1.452 1.657 1.839 2.001 2.25 2.36 2.478 2.485 2.781 2.884 3.075 3.252 3.447 3.549 3.726 3.883 4.111 4.25 4.375 4.544 4.718 4.878 5.029 5.172 5.341 5.511 5.689 5.903 6.104 6.293 6.498 6.726 6.935 7.153 7.379 7.606 7.829 8.061 8.306 8.573 8.901 9.21 9.515 9.798 9.99 10.077 10.059 9.688 9.108 8.514 7.896 7.271 6.68 6.095 5.574 5.059 4.621 4.244 3.904 3.545 3.212 2.909 2.58 2.296 2.036 1.758 1.46 1.206 0.947 0.696 0.503 0.291 0.072 -0.163 -0.426 -0.606 -0.775 -1.039 -1.235 -1.442 -1.543 -1.742 -1.95 -2.169 -2.291 -2.639 -2.758 -2.931 -3.1 -3.416 -3.6 -3.817 -4.055 -4.331 -4.648 -5.088 -6.119 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt deleted file mode 100644 index b381289e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11699 ,TETRA ,17524816,Wed Nov 24 23:27:44 CET,Thu Nov 25 01:46:26 CET,0.0 0.756 1.036 1.25 1.429 1.593 1.773 1.957 2.275 2.401 2.514 2.527 2.812 2.903 3.072 3.247 3.421 3.515 3.704 3.866 4.086 4.223 4.359 4.575 4.782 4.96 5.127 5.289 5.481 5.672 5.858 6.067 6.273 6.486 6.74 7.011 7.259 7.518 7.796 8.104 8.427 8.776 9.152 9.518 9.947 10.405 10.884 11.375 11.852 12.321 12.685 12.621 12.314 11.922 11.498 11.079 10.668 10.25 9.88 9.511 9.18 8.863 8.544 8.244 7.971 7.723 7.461 7.229 7.017 6.77 6.51 6.301 6.093 5.859 5.671 5.493 5.304 5.096 4.882 4.741 4.581 4.312 4.144 3.974 3.872 3.662 3.46 3.236 3.111 2.791 2.729 2.6 2.471 2.184 2.03 1.868 1.71 1.534 1.316 0.979 0.259 -2 ,14202 ,TETRA ,17524818,Wed Nov 24 23:27:42 CET,Thu Nov 25 01:45:50 CET,0.0 0.741 1.045 1.251 1.431 1.592 1.745 1.897 2.152 2.273 2.397 2.426 2.724 2.824 3.032 3.25 3.438 3.519 3.684 3.853 4.094 4.244 4.391 4.6 4.793 4.969 5.135 5.304 5.522 5.726 5.917 6.15 6.373 6.583 6.823 7.092 7.346 7.617 7.911 8.225 8.553 8.899 9.278 9.674 10.144 10.639 11.183 11.74 12.319 12.855 13.2 13.124 12.814 12.397 11.922 11.439 11.005 10.576 10.156 9.71 9.313 8.957 8.601 8.264 7.937 7.624 7.309 7.029 6.77 6.516 6.265 6.047 5.832 5.601 5.419 5.236 5.036 4.811 4.582 4.441 4.301 4.062 3.888 3.707 3.614 3.422 3.221 3.012 2.901 2.584 2.528 2.403 2.268 1.983 1.831 1.657 1.443 1.186 0.914 0.596 -0.195 -3 ,24525 ,TETRA ,17524819,Wed Nov 24 23:27:42 CET,Thu Nov 25 01:46:22 CET,0.0 0.521 0.825 1.054 1.255 1.444 1.615 1.761 2.02 2.145 2.266 2.28 2.58 2.681 2.864 3.029 3.175 3.247 3.397 3.537 3.735 3.862 3.984 4.164 4.337 4.509 4.67 4.826 5.028 5.217 5.407 5.65 5.88 6.084 6.318 6.591 6.859 7.158 7.473 7.824 8.17 8.535 8.962 9.353 9.813 10.347 10.961 11.581 12.176 12.729 13.123 13.108 12.845 12.52 12.138 11.71 11.336 10.969 10.605 10.22 9.882 9.566 9.266 8.973 8.684 8.422 8.151 7.902 7.687 7.464 7.23 7.035 6.832 6.619 6.451 6.283 6.111 5.931 5.736 5.6 5.457 5.23 5.068 4.889 4.791 4.604 4.4 4.184 4.082 3.791 3.731 3.591 3.461 3.211 3.078 2.912 2.734 2.557 2.33 2.062 1.375 -4 ,22657 ,TETRA ,17524820,Wed Nov 24 23:27:43 CET,Thu Nov 25 01:46:52 CET,0.0 0.276 0.473 0.65 0.805 0.954 1.093 1.217 1.433 1.526 1.616 1.611 1.901 1.987 2.17 2.335 2.478 2.558 2.714 2.85 3.057 3.183 3.3 3.471 3.636 3.799 3.958 4.116 4.313 4.505 4.696 4.916 5.118 5.309 5.528 5.776 6.024 6.292 6.578 6.874 7.173 7.51 7.909 8.295 8.717 9.151 9.642 10.168 10.674 11.141 11.397 11.236 10.852 10.362 9.919 9.495 9.034 8.569 8.165 7.781 7.445 7.126 6.797 6.474 6.181 5.912 5.637 5.399 5.195 4.967 4.714 4.507 4.307 4.097 3.916 3.717 3.509 3.292 3.072 2.93 2.777 2.513 2.332 2.144 2.051 1.88 1.705 1.483 1.362 1.049 1.025 0.904 0.767 0.438 0.257 0.074 -0.128 -0.342 -0.602 -0.922 -1.457 -5 ,11654 ,TETRA ,17524823,Wed Nov 24 23:27:42 CET,Thu Nov 25 01:46:19 CET,0.0 0.37 0.629 0.828 0.995 1.17 1.344 1.504 1.767 1.887 2.005 2.029 2.327 2.428 2.616 2.791 2.958 3.042 3.209 3.36 3.567 3.696 3.82 4.009 4.192 4.367 4.536 4.704 4.918 5.112 5.294 5.519 5.75 5.97 6.207 6.48 6.731 6.983 7.252 7.55 7.862 8.202 8.6 8.988 9.41 9.855 10.366 10.885 11.381 11.875 12.213 12.103 11.778 11.335 10.866 10.405 10.009 9.627 9.198 8.763 8.44 8.148 7.85 7.565 7.287 6.998 6.705 6.462 6.253 6.05 5.847 5.662 5.45 5.215 5.03 4.834 4.627 4.4 4.164 4.019 3.861 3.605 3.429 3.236 3.134 2.939 2.754 2.567 2.464 2.157 2.1 1.971 1.835 1.583 1.434 1.25 1.061 0.846 0.584 0.226 -0.405 -6 ,9850 ,TETRA ,17524824,Wed Nov 24 23:28:41 CET,Thu Nov 25 01:47:51 CET,0.0 0.448 0.643 0.838 1.002 1.154 1.3 1.424 1.673 1.795 1.902 1.904 2.204 2.305 2.51 2.706 2.891 2.972 3.125 3.271 3.48 3.616 3.746 3.937 4.116 4.287 4.451 4.608 4.822 5.033 5.241 5.48 5.696 5.906 6.147 6.411 6.675 6.977 7.304 7.642 7.986 8.368 8.805 9.219 9.675 10.193 10.769 11.34 11.876 12.35 12.636 12.457 12.041 11.525 10.967 10.466 10.038 9.621 9.239 8.852 8.513 8.212 7.931 7.635 7.358 7.12 6.865 6.639 6.447 6.222 5.964 5.757 5.544 5.322 5.159 4.998 4.829 4.644 4.47 4.345 4.198 3.986 3.835 3.675 3.596 3.414 3.223 3.042 2.936 2.623 2.571 2.442 2.321 2.06 1.913 1.741 1.53 1.315 1.1 0.807 0.139 -7 ,540 ,TETRA ,17524825,Wed Nov 24 23:28:41 CET,Thu Nov 25 01:49:19 CET,0.0 0.401 0.613 0.803 0.972 1.117 1.275 1.426 1.664 1.783 1.902 1.914 2.202 2.286 2.446 2.615 2.776 2.853 3.008 3.152 3.371 3.511 3.634 3.816 3.997 4.16 4.312 4.474 4.686 4.882 5.077 5.312 5.534 5.749 6.003 6.281 6.539 6.836 7.14 7.45 7.775 8.108 8.484 8.844 9.24 9.686 10.196 10.729 11.246 11.695 12.053 11.956 11.588 11.227 10.874 10.503 10.13 9.745 9.401 9.063 8.755 8.482 8.207 7.914 7.626 7.349 7.066 6.831 6.633 6.403 6.154 5.948 5.715 5.466 5.28 5.088 4.885 4.673 4.452 4.302 4.158 3.929 3.755 3.574 3.486 3.306 3.117 2.922 2.818 2.519 2.486 2.363 2.238 1.971 1.811 1.634 1.433 1.24 1.02 0.723 0.109 -8 ,23411 ,TETRA ,17524826,Wed Nov 24 23:28:41 CET,Thu Nov 25 01:47:24 CET,0.0 0.518 0.739 0.904 1.067 1.228 1.403 1.563 1.817 1.933 2.05 2.112 2.421 2.513 2.687 2.848 3.001 3.078 3.23 3.377 3.584 3.719 3.856 4.051 4.245 4.43 4.595 4.763 4.996 5.218 5.437 5.697 5.923 6.138 6.398 6.69 6.954 7.229 7.527 7.851 8.193 8.562 8.967 9.35 9.73 10.123 10.611 11.136 11.678 12.225 12.65 12.668 12.414 12.043 11.6 11.192 10.836 10.497 10.19 9.816 9.442 9.091 8.776 8.498 8.225 7.965 7.695 7.448 7.228 6.989 6.747 6.545 6.32 6.095 5.918 5.731 5.542 5.349 5.146 5.002 4.852 4.613 4.449 4.273 4.179 3.975 3.755 3.528 3.408 3.095 3.059 2.939 2.813 2.563 2.432 2.282 2.117 1.925 1.664 1.3 0.657 -9 ,32546 ,TETRA ,17524828,Wed Nov 24 23:29:41 CET,Thu Nov 25 01:48:23 CET,0.0 0.493 0.782 1.008 1.203 1.355 1.496 1.62 1.854 1.977 2.106 2.125 2.399 2.479 2.637 2.797 2.951 3.024 3.168 3.318 3.549 3.686 3.812 3.997 4.182 4.351 4.511 4.671 4.896 5.104 5.292 5.511 5.725 5.937 6.166 6.416 6.665 6.945 7.248 7.572 7.917 8.287 8.7 9.107 9.534 9.992 10.499 10.972 11.473 12.02 12.426 12.284 11.883 11.474 11.09 10.726 10.357 9.974 9.623 9.267 8.96 8.684 8.399 8.112 7.854 7.626 7.365 7.104 6.868 6.62 6.348 6.126 5.901 5.661 5.483 5.291 5.075 4.853 4.635 4.487 4.339 4.107 3.943 3.773 3.684 3.497 3.298 3.076 2.965 2.663 2.586 2.452 2.312 2.028 1.896 1.742 1.562 1.361 1.167 0.941 0.532 -10 ,20888 ,TETRA ,17524830,Wed Nov 24 23:29:41 CET,Thu Nov 25 01:48:14 CET,0.0 0.279 0.463 0.64 0.81 0.981 1.14 1.276 1.539 1.661 1.76 1.751 2.044 2.135 2.288 2.443 2.609 2.691 2.853 3.02 3.225 3.342 3.462 3.632 3.801 3.965 4.126 4.293 4.518 4.732 4.935 5.178 5.424 5.657 5.915 6.209 6.487 6.806 7.138 7.465 7.812 8.222 8.7 9.14 9.622 10.135 10.68 11.241 11.846 12.402 12.791 12.811 12.55 12.168 11.753 11.305 10.848 10.423 10.063 9.691 9.342 9.012 8.694 8.401 8.133 7.883 7.611 7.365 7.14 6.878 6.611 6.392 6.152 5.892 5.693 5.493 5.287 5.057 4.798 4.643 4.511 4.293 4.123 3.948 3.862 3.685 3.502 3.303 3.185 2.867 2.817 2.699 2.571 2.299 2.142 1.97 1.8 1.625 1.406 1.134 0.721 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt deleted file mode 100644 index 96129d90..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8068 ,TETRA ,17524833,Wed Nov 24 23:30:42 CET,Thu Nov 25 01:49:34 CET,0.0 0.387 0.573 0.725 0.883 1.047 1.173 1.277 1.478 1.575 1.674 1.683 1.968 2.054 2.216 2.357 2.493 2.562 2.693 2.835 3.038 3.149 3.256 3.411 3.563 3.705 3.845 3.986 4.179 4.367 4.554 4.773 4.961 5.141 5.345 5.578 5.814 6.055 6.32 6.602 6.868 7.166 7.537 7.908 8.297 8.72 9.16 9.612 10.047 10.372 10.558 10.261 9.806 9.33 8.836 8.353 7.881 7.407 6.981 6.529 6.14 5.804 5.467 5.124 4.793 4.488 4.149 3.838 3.587 3.342 3.078 2.846 2.613 2.393 2.22 2.038 1.848 1.636 1.399 1.226 1.047 0.773 0.571 0.36 0.261 0.066 -0.147 -0.39 -0.521 -0.843 -0.908 -1.055 -1.195 -1.517 -1.702 -1.92 -2.161 -2.432 -2.768 -3.132 -3.92 -2 ,13625 ,TETRA ,17524835,Wed Nov 24 23:31:42 CET,Thu Nov 25 01:51:04 CET,0.0 0.613 0.868 1.052 1.206 1.364 1.526 1.668 1.932 2.064 2.182 2.215 2.531 2.646 2.864 3.046 3.213 3.294 3.44 3.578 3.782 3.918 4.054 4.242 4.412 4.577 4.739 4.896 5.101 5.295 5.498 5.76 5.996 6.213 6.445 6.699 6.954 7.22 7.497 7.791 8.095 8.452 8.876 9.268 9.7 10.168 10.64 11.104 11.609 12.084 12.347 12.123 11.704 11.226 10.687 10.146 9.59 9.048 8.608 8.15 7.735 7.363 6.996 6.63 6.276 5.946 5.588 5.276 5.002 4.711 4.407 4.159 3.909 3.647 3.446 3.231 3.001 2.753 2.487 2.31 2.133 1.834 1.608 1.376 1.262 1.028 0.789 0.548 0.411 0.071 -0.027 -0.2 -0.376 -0.733 -0.936 -1.166 -1.427 -1.707 -2.007 -2.378 -3.463 -3 ,26810 ,TETRA ,17524838,Wed Nov 24 23:33:42 CET,Thu Nov 25 01:53:13 CET,0.0 0.435 0.766 0.979 1.151 1.328 1.5 1.644 1.89 2.002 2.119 2.146 2.434 2.516 2.677 2.839 2.995 3.072 3.228 3.375 3.585 3.707 3.819 3.996 4.168 4.331 4.488 4.643 4.84 5.037 5.244 5.491 5.717 5.935 6.19 6.463 6.699 6.954 7.24 7.536 7.828 8.148 8.507 8.833 9.221 9.654 10.082 10.527 11.013 11.421 11.587 11.414 10.999 10.433 9.855 9.226 8.605 8.073 7.632 7.164 6.733 6.338 5.937 5.562 5.231 4.937 4.62 4.333 4.092 3.824 3.534 3.297 3.051 2.798 2.593 2.382 2.166 1.934 1.694 1.523 1.348 1.082 0.884 0.67 0.564 0.338 0.096 -0.145 -0.271 -0.596 -0.671 -0.807 -0.965 -1.355 -1.565 -1.78 -1.999 -2.264 -2.56 -2.866 -3.712 -4 ,2503 ,TETRA ,17524840,Wed Nov 24 23:33:42 CET,Thu Nov 25 01:53:35 CET,0.0 0.302 0.526 0.701 0.86 1.018 1.163 1.3 1.568 1.704 1.822 1.853 2.159 2.261 2.426 2.586 2.76 2.844 2.991 3.139 3.378 3.543 3.688 3.87 4.045 4.224 4.404 4.571 4.782 4.984 5.163 5.371 5.58 5.784 6.018 6.272 6.515 6.773 7.043 7.334 7.646 7.993 8.398 8.773 9.161 9.579 10.018 10.447 10.877 11.318 11.597 11.379 10.885 10.348 9.825 9.274 8.747 8.236 7.775 7.291 6.85 6.486 6.154 5.808 5.439 5.096 4.767 4.456 4.141 3.79 3.436 3.158 2.895 2.63 2.41 2.176 1.935 1.672 1.398 1.213 1.035 0.77 0.564 0.324 0.201 -0.029 -0.273 -0.548 -0.693 -1.031 -1.129 -1.285 -1.47 -1.93 -2.187 -2.443 -2.714 -3.059 -3.504 -4.096 -5.938 -5 ,10409 ,TETRA ,17524842,Wed Nov 24 23:33:42 CET,Thu Nov 25 01:52:49 CET,0.0 0.473 0.732 0.961 1.13 1.261 1.384 1.504 1.741 1.868 1.989 2.007 2.297 2.392 2.554 2.712 2.88 2.974 3.157 3.309 3.51 3.643 3.777 3.971 4.145 4.31 4.477 4.634 4.84 5.049 5.24 5.445 5.639 5.838 6.078 6.352 6.595 6.842 7.091 7.356 7.647 7.952 8.316 8.684 9.059 9.464 9.899 10.321 10.763 11.085 11.169 10.819 10.273 9.688 9.108 8.555 8.056 7.587 7.144 6.681 6.277 5.903 5.545 5.194 4.858 4.549 4.224 3.925 3.658 3.384 3.098 2.858 2.606 2.34 2.13 1.917 1.704 1.484 1.246 1.07 0.888 0.616 0.425 0.231 0.137 -0.067 -0.302 -0.569 -0.715 -1.053 -1.18 -1.361 -1.539 -1.937 -2.152 -2.39 -2.687 -3.035 -3.407 -3.858 -5.112 -6 ,22945 ,TETRA ,17524844,Wed Nov 24 23:34:43 CET,Thu Nov 25 01:54:19 CET,0.0 0.361 0.575 0.727 0.872 1.021 1.156 1.286 1.545 1.664 1.786 1.831 2.153 2.266 2.462 2.661 2.854 2.94 3.098 3.249 3.454 3.585 3.715 3.888 4.059 4.23 4.392 4.548 4.753 4.958 5.152 5.38 5.587 5.779 6.008 6.27 6.499 6.727 6.965 7.228 7.515 7.827 8.17 8.487 8.855 9.267 9.721 10.188 10.65 11.092 11.328 11.068 10.659 10.225 9.689 9.153 8.679 8.228 7.826 7.405 7.037 6.691 6.349 6.035 5.731 5.438 5.13 4.853 4.611 4.36 4.096 3.867 3.615 3.346 3.143 2.929 2.707 2.475 2.233 2.062 1.879 1.6 1.403 1.2 1.097 0.878 0.649 0.408 0.287 -0.045 -0.133 -0.281 -0.45 -0.859 -1.059 -1.259 -1.47 -1.686 -1.99 -2.462 -3.43 -7 ,19851 ,TETRA ,17524845,Wed Nov 24 23:34:42 CET,Thu Nov 25 01:53:14 CET,0.0 0.45 0.694 0.891 1.061 1.229 1.396 1.542 1.774 1.883 1.99 1.987 2.271 2.365 2.532 2.696 2.868 2.947 3.103 3.251 3.437 3.553 3.668 3.841 4.019 4.188 4.342 4.491 4.683 4.869 5.043 5.25 5.454 5.645 5.868 6.107 6.321 6.554 6.825 7.114 7.409 7.737 8.103 8.462 8.86 9.277 9.709 10.154 10.615 11.048 11.264 10.959 10.455 9.903 9.331 8.764 8.25 7.748 7.304 6.841 6.426 6.057 5.712 5.376 5.033 4.714 4.383 4.084 3.822 3.545 3.245 2.997 2.741 2.464 2.263 2.069 1.865 1.649 1.423 1.266 1.098 0.814 0.604 0.392 0.284 0.075 -0.158 -0.412 -0.527 -0.838 -0.901 -1.028 -1.164 -1.522 -1.725 -1.952 -2.176 -2.408 -2.733 -3.195 -4.18 -8 ,341 ,TETRA ,17524847,Wed Nov 24 23:34:45 CET,Thu Nov 25 01:53:26 CET,0.0 0.524 0.749 0.957 1.146 1.306 1.449 1.591 1.862 1.98 2.088 2.093 2.386 2.479 2.662 2.833 2.995 3.082 3.233 3.367 3.583 3.713 3.833 4.022 4.207 4.375 4.537 4.704 4.905 5.089 5.271 5.485 5.679 5.872 6.108 6.373 6.628 6.904 7.206 7.51 7.805 8.137 8.518 8.873 9.264 9.674 10.144 10.654 11.146 11.567 11.842 11.67 11.256 10.815 10.348 9.855 9.41 9.007 8.594 8.11 7.68 7.292 6.912 6.541 6.184 5.871 5.534 5.207 4.916 4.613 4.318 4.073 3.807 3.515 3.282 3.046 2.818 2.599 2.373 2.197 1.996 1.7 1.512 1.318 1.207 0.972 0.74 0.491 0.36 0.03 -0.074 -0.238 -0.415 -0.815 -1.028 -1.23 -1.473 -1.763 -2.083 -2.544 -3.571 -9 ,25824 ,TETRA ,17524849,Wed Nov 24 23:34:45 CET,Thu Nov 25 01:53:23 CET,0.0 0.381 0.625 0.816 0.991 1.132 1.253 1.375 1.614 1.726 1.839 1.855 2.145 2.237 2.414 2.573 2.722 2.802 2.974 3.127 3.332 3.474 3.607 3.794 3.987 4.189 4.379 4.55 4.753 4.941 5.125 5.348 5.567 5.773 6.007 6.287 6.536 6.79 7.066 7.35 7.663 8.012 8.4 8.752 9.126 9.545 10.014 10.504 10.974 11.37 11.607 11.389 10.922 10.382 9.831 9.299 8.824 8.381 7.993 7.564 7.162 6.806 6.456 6.124 5.823 5.545 5.241 4.974 4.736 4.478 4.206 3.967 3.723 3.465 3.268 3.061 2.839 2.621 2.397 2.233 2.069 1.794 1.589 1.398 1.297 1.07 0.842 0.591 0.456 0.141 0.06 -0.086 -0.231 -0.549 -0.723 -0.919 -1.139 -1.404 -1.721 -2.099 -3.175 -10 ,12106 ,TETRA ,17524851,Wed Nov 24 23:34:43 CET,Thu Nov 25 01:53:45 CET,0.0 0.527 0.782 0.999 1.17 1.33 1.483 1.608 1.833 1.959 2.087 2.118 2.409 2.496 2.67 2.845 3.028 3.117 3.287 3.458 3.682 3.815 3.937 4.106 4.278 4.447 4.614 4.785 5.001 5.206 5.408 5.654 5.884 6.093 6.332 6.621 6.887 7.148 7.433 7.733 8.036 8.381 8.786 9.174 9.61 10.069 10.545 11.052 11.609 12.135 12.434 12.265 11.835 11.316 10.778 10.233 9.72 9.22 8.778 8.326 7.932 7.573 7.201 6.845 6.537 6.238 5.897 5.588 5.323 5.052 4.768 4.533 4.289 4.049 3.866 3.673 3.469 3.249 3.009 2.843 2.673 2.416 2.238 2.015 1.896 1.68 1.47 1.232 1.109 0.782 0.651 0.471 0.292 -0.106 -0.334 -0.559 -0.784 -1.047 -1.356 -1.791 -2.904 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt deleted file mode 100644 index 29e4565a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13482 ,TETRA ,17524854,Wed Nov 24 23:34:46 CET,Thu Nov 25 01:56:26 CET,0.0 0.67 0.973 1.185 1.359 1.525 1.676 1.823 2.071 2.161 2.265 2.295 2.603 2.698 2.873 3.041 3.205 3.281 3.43 3.578 3.77 3.886 4.009 4.191 4.359 4.531 4.694 4.852 5.059 5.257 5.461 5.696 5.9 6.101 6.339 6.606 6.858 7.136 7.425 7.727 8.038 8.375 8.768 9.141 9.56 9.979 10.38 10.761 11.166 11.465 11.416 11.01 10.473 9.903 9.341 8.793 8.302 7.825 7.371 6.904 6.517 6.176 5.829 5.496 5.196 4.906 4.574 4.272 4.019 3.768 3.516 3.295 3.046 2.789 2.604 2.415 2.209 2.005 1.778 1.611 1.444 1.187 1.015 0.843 0.763 0.582 0.361 0.138 0.032 -0.277 -0.343 -0.489 -0.628 -0.976 -1.158 -1.313 -1.492 -1.696 -1.948 -2.293 -3.108 -2 ,4041 ,TETRA ,17524856,Wed Nov 24 23:35:43 CET,Thu Nov 25 01:56:12 CET,0.0 0.391 0.649 0.84 1.005 1.172 1.33 1.481 1.742 1.855 1.958 1.961 2.248 2.329 2.494 2.654 2.806 2.887 3.059 3.221 3.453 3.596 3.723 3.907 4.088 4.25 4.403 4.556 4.752 4.947 5.135 5.366 5.575 5.762 5.994 6.267 6.505 6.75 7.028 7.305 7.59 7.917 8.256 8.582 8.949 9.318 9.702 10.038 10.309 10.525 10.556 10.139 9.519 8.852 8.227 7.644 7.071 6.523 6.049 5.558 5.122 4.731 4.356 4.011 3.71 3.42 3.104 2.841 2.594 2.333 2.088 1.875 1.651 1.425 1.233 1.025 0.816 0.605 0.382 0.231 0.078 -0.175 -0.355 -0.548 -0.64 -0.817 -1.009 -1.213 -1.318 -1.616 -1.656 -1.802 -1.953 -2.259 -2.418 -2.585 -2.794 -3.036 -3.329 -3.63 -4.219 -3 ,19440 ,TETRA ,17524858,Wed Nov 24 23:35:43 CET,Thu Nov 25 01:56:03 CET,0.0 0.44 0.774 1.034 1.215 1.374 1.52 1.663 1.951 2.084 2.201 2.239 2.543 2.637 2.824 3.001 3.17 3.261 3.443 3.612 3.829 3.961 4.09 4.28 4.462 4.645 4.814 4.961 5.154 5.338 5.517 5.734 5.945 6.151 6.388 6.663 6.926 7.195 7.481 7.781 8.075 8.4 8.772 9.121 9.493 9.882 10.338 10.819 11.243 11.539 11.564 11.184 10.576 9.84 9.205 8.66 8.144 7.677 7.289 6.865 6.463 6.09 5.744 5.438 5.15 4.88 4.592 4.322 4.07 3.807 3.541 3.313 3.084 2.848 2.655 2.459 2.268 2.061 1.819 1.64 1.461 1.186 1.002 0.82 0.728 0.547 0.356 0.161 0.067 -0.223 -0.265 -0.398 -0.543 -0.884 -1.07 -1.252 -1.446 -1.658 -1.891 -2.184 -2.866 -4 ,30932 ,TETRA ,17524860,Wed Nov 24 23:35:42 CET,Thu Nov 25 01:56:16 CET,0.0 0.359 0.574 0.764 0.934 1.063 1.199 1.341 1.616 1.743 1.864 1.876 2.166 2.262 2.441 2.613 2.79 2.871 3.015 3.175 3.399 3.524 3.652 3.836 4.005 4.176 4.338 4.492 4.688 4.873 5.066 5.299 5.501 5.699 5.93 6.164 6.378 6.616 6.886 7.164 7.453 7.799 8.195 8.552 8.893 9.232 9.601 9.969 10.333 10.667 10.792 10.358 9.77 9.17 8.554 8.005 7.492 6.958 6.48 6.027 5.63 5.258 4.887 4.52 4.176 3.868 3.547 3.264 3.037 2.8 2.561 2.347 2.104 1.859 1.675 1.488 1.303 1.097 0.877 0.735 0.593 0.361 0.186 -0.002 -0.096 -0.274 -0.474 -0.696 -0.813 -1.124 -1.174 -1.307 -1.437 -1.724 -1.885 -2.056 -2.229 -2.44 -2.686 -2.973 -3.646 -5 ,28009 ,TETRA ,17524863,Wed Nov 24 23:35:43 CET,Thu Nov 25 01:57:21 CET,0.0 0.462 0.677 0.879 1.061 1.216 1.363 1.511 1.802 1.925 2.047 2.079 2.384 2.485 2.685 2.879 3.065 3.154 3.317 3.475 3.711 3.87 4.02 4.23 4.434 4.615 4.78 4.946 5.157 5.361 5.558 5.794 6.014 6.213 6.444 6.708 6.974 7.268 7.559 7.857 8.161 8.482 8.861 9.227 9.623 10.014 10.457 10.895 11.261 11.575 11.592 11.157 10.568 9.957 9.393 8.866 8.377 7.882 7.422 6.949 6.527 6.14 5.775 5.442 5.12 4.828 4.518 4.241 4.01 3.754 3.498 3.287 3.052 2.814 2.633 2.431 2.222 2.013 1.797 1.65 1.476 1.202 1.019 0.827 0.735 0.548 0.343 0.109 -0.003 -0.314 -0.362 -0.497 -0.638 -0.934 -1.1 -1.288 -1.501 -1.742 -2.03 -2.358 -3.233 -6 ,14930 ,TETRA ,17524864,Wed Nov 24 23:35:45 CET,Thu Nov 25 01:56:24 CET,0.0 0.343 0.576 0.772 0.962 1.133 1.292 1.447 1.694 1.813 1.935 1.97 2.268 2.359 2.53 2.697 2.858 2.938 3.103 3.262 3.482 3.614 3.746 3.949 4.136 4.304 4.474 4.642 4.858 5.067 5.261 5.498 5.724 5.927 6.152 6.396 6.622 6.876 7.166 7.464 7.751 8.072 8.411 8.74 9.127 9.503 9.927 10.371 10.729 10.916 10.857 10.363 9.664 8.983 8.357 7.778 7.239 6.715 6.258 5.798 5.394 5.026 4.667 4.324 4.018 3.733 3.415 3.121 2.871 2.607 2.339 2.127 1.888 1.632 1.44 1.248 1.055 0.856 0.647 0.504 0.353 0.11 -0.045 -0.197 -0.283 -0.464 -0.644 -0.854 -0.97 -1.276 -1.317 -1.442 -1.57 -1.848 -1.991 -2.149 -2.339 -2.553 -2.803 -3.192 -4.115 -7 ,22714 ,TETRA ,17524865,Wed Nov 24 23:36:45 CET,Thu Nov 25 01:58:55 CET,0.0 0.485 0.766 0.991 1.165 1.327 1.485 1.622 1.864 1.982 2.096 2.11 2.396 2.485 2.673 2.848 3.012 3.099 3.274 3.433 3.643 3.77 3.894 4.067 4.241 4.425 4.601 4.759 4.953 5.14 5.329 5.564 5.782 5.993 6.238 6.495 6.746 7.039 7.335 7.618 7.918 8.241 8.575 8.899 9.265 9.635 10.029 10.408 10.736 10.958 10.818 10.214 9.581 8.948 8.355 7.788 7.23 6.687 6.214 5.728 5.298 4.914 4.536 4.174 3.853 3.551 3.224 2.934 2.679 2.409 2.128 1.901 1.682 1.463 1.288 1.098 0.896 0.684 0.461 0.302 0.143 -0.097 -0.266 -0.444 -0.536 -0.714 -0.901 -1.097 -1.205 -1.509 -1.569 -1.702 -1.848 -2.181 -2.341 -2.498 -2.687 -2.883 -3.112 -3.434 -3.961 -8 ,20309 ,TETRA ,17524866,Wed Nov 24 23:36:49 CET,Thu Nov 25 01:59:31 CET,0.0 0.421 0.684 0.892 1.077 1.253 1.426 1.571 1.803 1.928 2.065 2.112 2.415 2.513 2.694 2.873 3.053 3.139 3.31 3.469 3.673 3.809 3.946 4.144 4.326 4.504 4.683 4.852 5.068 5.274 5.475 5.71 5.935 6.138 6.38 6.678 6.935 7.204 7.5 7.788 8.078 8.408 8.781 9.145 9.557 9.969 10.393 10.812 11.195 11.51 11.513 11.062 10.515 9.926 9.353 8.808 8.286 7.8 7.353 6.865 6.455 6.115 5.802 5.499 5.208 4.937 4.652 4.396 4.162 3.915 3.664 3.446 3.213 2.965 2.767 2.556 2.348 2.125 1.877 1.709 1.543 1.302 1.128 0.937 0.84 0.636 0.433 0.232 0.114 -0.213 -0.276 -0.414 -0.554 -0.878 -1.068 -1.28 -1.494 -1.739 -2.052 -2.469 -3.377 -9 ,5115 ,TETRA ,17524868,Wed Nov 24 23:36:47 CET,Thu Nov 25 01:58:39 CET,0.0 0.581 0.875 1.098 1.27 1.417 1.566 1.726 2.006 2.119 2.243 2.29 2.593 2.687 2.875 3.055 3.22 3.302 3.455 3.597 3.813 3.953 4.081 4.273 4.459 4.649 4.844 5.02 5.233 5.441 5.649 5.891 6.108 6.316 6.558 6.817 7.067 7.338 7.626 7.935 8.232 8.559 8.926 9.294 9.718 10.164 10.623 11.014 11.39 11.681 11.681 11.2 10.559 9.92 9.316 8.768 8.242 7.683 7.167 6.638 6.183 5.787 5.413 5.069 4.732 4.416 4.087 3.783 3.519 3.257 2.973 2.72 2.454 2.183 1.981 1.776 1.545 1.291 1.035 0.856 0.679 0.423 0.239 0.042 -0.065 -0.293 -0.537 -0.78 -0.888 -1.21 -1.283 -1.416 -1.554 -1.856 -2.051 -2.288 -2.534 -2.801 -3.154 -3.535 -4.267 -10 ,4627 ,TETRA ,17524871,Wed Nov 24 23:36:49 CET,Thu Nov 25 01:57:45 CET,0.0 0.483 0.78 0.986 1.194 1.381 1.54 1.683 1.929 2.044 2.149 2.138 2.436 2.534 2.719 2.879 3.028 3.109 3.276 3.43 3.651 3.798 3.938 4.124 4.295 4.458 4.617 4.775 4.977 5.171 5.361 5.582 5.812 6.038 6.292 6.574 6.829 7.102 7.388 7.662 7.937 8.251 8.594 8.9 9.24 9.623 10.01 10.386 10.799 11.136 11.151 10.75 10.226 9.716 9.189 8.645 8.146 7.671 7.258 6.837 6.432 6.066 5.73 5.397 5.085 4.803 4.499 4.227 3.992 3.739 3.488 3.295 3.084 2.853 2.67 2.474 2.276 2.089 1.891 1.738 1.575 1.329 1.162 0.995 0.902 0.7 0.503 0.292 0.175 -0.134 -0.142 -0.265 -0.404 -0.706 -0.879 -1.082 -1.29 -1.494 -1.718 -1.989 -2.776 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 6baa7cc6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25059 ,TETRA ,17524874,Wed Nov 24 23:36:46 CET,Thu Nov 25 01:53:28 CET,0.0 0.266 0.439 0.629 0.794 0.931 1.066 1.185 1.388 1.48 1.564 1.527 1.787 1.855 1.993 2.132 2.256 2.316 2.431 2.54 2.699 2.803 2.911 3.07 3.214 3.352 3.48 3.592 3.736 3.878 4.014 4.169 4.311 4.439 4.577 4.734 4.883 5.047 5.209 5.375 5.558 5.743 5.911 6.044 6.185 6.305 6.363 6.326 6.162 5.834 5.007 3.667 2.345 1.109 0.038 -0.939 -1.822 -2.66 -3.423 -4.176 -4.819 -5.416 -6.029 -6.616 -7.159 -7.652 -8.154 -8.596 -8.96 -9.294 -9.605 -9.848 -10.107 -10.398 -10.624 -10.849 -11.1 -11.385 -11.695 -11.908 -12.12 -12.446 -12.68 -12.908 -13.016 -13.25 -13.513 -13.792 -13.951 -14.331 -14.48 -14.666 -14.854 -15.224 -15.431 -15.65 -15.892 -16.175 -16.527 -16.988 -18.391 -2 ,18354 ,TETRA ,17524876,Wed Nov 24 23:36:50 CET,Thu Nov 25 01:53:45 CET,0.0 0.363 0.601 0.794 0.958 1.088 1.218 1.347 1.555 1.656 1.754 1.746 2.023 2.101 2.251 2.397 2.53 2.593 2.718 2.83 2.985 3.08 3.176 3.339 3.489 3.622 3.752 3.872 4.025 4.173 4.307 4.461 4.625 4.767 4.913 5.091 5.236 5.379 5.527 5.671 5.838 6.012 6.195 6.364 6.519 6.653 6.751 6.785 6.698 6.379 5.47 4.072 2.86 1.733 0.628 -0.357 -1.174 -1.927 -2.598 -3.299 -3.917 -4.491 -5.061 -5.559 -5.997 -6.37 -6.736 -7.083 -7.383 -7.7 -8.03 -8.304 -8.604 -8.945 -9.219 -9.505 -9.784 -10.063 -10.382 -10.614 -10.846 -11.192 -11.436 -11.695 -11.829 -12.098 -12.369 -12.667 -12.836 -13.222 -13.455 -13.694 -13.925 -14.441 -14.757 -15.075 -15.396 -15.749 -16.134 -16.634 -17.976 -3 ,219 ,TETRA ,17524878,Wed Nov 24 23:36:49 CET,Thu Nov 25 01:53:18 CET,0.0 0.479 0.678 0.842 0.987 1.124 1.257 1.376 1.611 1.722 1.822 1.804 2.077 2.158 2.335 2.488 2.628 2.695 2.824 2.945 3.114 3.223 3.322 3.455 3.592 3.732 3.868 4.006 4.176 4.327 4.473 4.644 4.805 4.956 5.12 5.307 5.494 5.701 5.917 6.126 6.337 6.566 6.811 7.039 7.272 7.479 7.667 7.811 7.775 7.39 6.467 5.102 3.73 2.408 1.26 0.218 -0.593 -1.258 -1.885 -2.511 -3.071 -3.584 -4.085 -4.576 -4.99 -5.347 -5.739 -6.096 -6.419 -6.763 -7.132 -7.434 -7.739 -8.057 -8.307 -8.578 -8.881 -9.19 -9.491 -9.695 -9.901 -10.223 -10.468 -10.742 -10.87 -11.131 -11.432 -11.74 -11.899 -12.29 -12.478 -12.688 -12.897 -13.296 -13.514 -13.761 -14.052 -14.377 -14.731 -15.274 -17.809 -4 ,26583 ,TETRA ,17524880,Wed Nov 24 23:36:47 CET,Thu Nov 25 01:53:34 CET,0.0 0.316 0.507 0.656 0.803 0.942 1.055 1.153 1.335 1.419 1.499 1.464 1.719 1.785 1.916 2.035 2.16 2.22 2.335 2.447 2.604 2.7 2.796 2.94 3.062 3.182 3.306 3.424 3.571 3.7 3.822 3.961 4.087 4.212 4.363 4.528 4.683 4.839 4.993 5.149 5.289 5.423 5.569 5.701 5.842 5.983 6.088 6.114 6.017 5.682 4.852 3.531 2.29 1.149 0.124 -0.842 -1.756 -2.496 -3.056 -3.642 -4.187 -4.676 -5.119 -5.511 -5.881 -6.245 -6.664 -7.039 -7.363 -7.699 -8.03 -8.329 -8.653 -8.992 -9.261 -9.548 -9.84 -10.123 -10.431 -10.645 -10.866 -11.229 -11.487 -11.741 -11.875 -12.136 -12.38 -12.673 -12.835 -13.189 -13.307 -13.493 -13.693 -14.106 -14.334 -14.571 -14.852 -15.201 -15.576 -16.107 -17.317 -5 ,9037 ,TETRA ,17524883,Wed Nov 24 23:37:18 CET,Thu Nov 25 01:56:27 CET,0.0 0.482 0.718 0.923 1.088 1.237 1.364 1.473 1.688 1.787 1.873 1.859 2.147 2.23 2.379 2.52 2.656 2.724 2.854 2.976 3.152 3.273 3.387 3.551 3.711 3.865 4.006 4.138 4.31 4.475 4.632 4.812 4.997 5.168 5.346 5.534 5.709 5.884 6.039 6.186 6.346 6.52 6.704 6.857 7.017 7.168 7.251 7.288 7.202 6.866 5.994 4.66 3.382 2.185 1.075 0.063 -0.853 -1.738 -2.501 -3.249 -3.893 -4.509 -5.114 -5.686 -6.239 -6.755 -7.299 -7.801 -8.251 -8.711 -9.171 -9.539 -9.926 -10.368 -10.734 -11.104 -11.491 -11.891 -12.315 -12.616 -12.927 -13.435 -13.779 -14.13 -14.314 -14.687 -15.074 -15.504 -15.742 -16.189 -16.414 -16.593 -16.799 -17.334 -17.612 -17.891 -18.178 -18.509 -18.922 -19.4 -20.69 -6 ,8839 ,TETRA ,17524884,Wed Nov 24 23:37:20 CET,Thu Nov 25 01:55:49 CET,0.0 0.398 0.559 0.706 0.835 0.972 1.104 1.205 1.369 1.456 1.549 1.513 1.784 1.858 2.001 2.133 2.25 2.304 2.403 2.498 2.627 2.719 2.814 2.951 3.078 3.193 3.303 3.411 3.549 3.675 3.799 3.951 4.085 4.208 4.339 4.467 4.583 4.709 4.85 4.985 5.118 5.271 5.429 5.56 5.694 5.801 5.852 5.813 5.613 5.173 4.137 2.681 1.408 0.17 -0.991 -2.031 -2.898 -3.684 -4.369 -5.081 -5.725 -6.309 -6.879 -7.405 -7.913 -8.418 -8.959 -9.426 -9.792 -10.161 -10.556 -10.869 -11.188 -11.509 -11.731 -11.957 -12.19 -12.432 -12.696 -12.89 -13.094 -13.389 -13.59 -13.799 -13.91 -14.136 -14.375 -14.642 -14.794 -15.14 -15.238 -15.408 -15.609 -16.078 -16.284 -16.48 -16.735 -17.063 -17.444 -17.943 -19.23 -7 ,30932 ,TETRA ,17524885,Wed Nov 24 23:37:17 CET,Thu Nov 25 01:52:56 CET,0.0 0.505 0.733 0.89 1.02 1.145 1.27 1.385 1.574 1.656 1.729 1.678 1.949 2.03 2.165 2.284 2.414 2.477 2.594 2.707 2.88 2.987 3.077 3.209 3.341 3.465 3.583 3.706 3.869 4.019 4.17 4.366 4.553 4.72 4.909 5.126 5.334 5.547 5.757 5.967 6.165 6.365 6.591 6.834 7.124 7.42 7.704 7.942 8.096 8.17 7.979 7.244 6.46 5.727 5.044 4.415 3.811 3.213 2.695 2.174 1.703 1.271 0.836 0.41 0.01 -0.371 -0.753 -1.083 -1.381 -1.692 -2.036 -2.327 -2.618 -2.93 -3.163 -3.39 -3.631 -3.869 -4.11 -4.302 -4.516 -4.829 -5.048 -5.29 -5.415 -5.675 -5.942 -6.222 -6.373 -6.73 -6.911 -7.129 -7.348 -7.798 -8.032 -8.299 -8.613 -9.002 -9.466 -10.243 -13.035 -8 ,11907 ,TETRA ,17524888,Wed Nov 24 23:37:23 CET,Thu Nov 25 01:53:57 CET,0.0 0.305 0.521 0.68 0.816 0.938 1.046 1.156 1.357 1.446 1.53 1.507 1.777 1.85 1.984 2.108 2.238 2.302 2.431 2.553 2.722 2.831 2.929 3.058 3.183 3.308 3.422 3.531 3.671 3.8 3.92 4.075 4.223 4.344 4.488 4.634 4.776 4.945 5.096 5.25 5.411 5.587 5.798 5.966 6.106 6.276 6.412 6.45 6.372 6.05 5.165 3.688 2.363 1.195 0.115 -0.913 -1.855 -2.741 -3.515 -4.255 -4.904 -5.51 -6.102 -6.679 -7.228 -7.717 -8.199 -8.635 -9.016 -9.422 -9.869 -10.246 -10.663 -11.093 -11.404 -11.719 -12.044 -12.401 -12.723 -12.909 -13.097 -13.399 -13.626 -13.854 -13.969 -14.233 -14.511 -14.763 -14.898 -15.249 -15.377 -15.563 -15.756 -16.175 -16.41 -16.682 -16.944 -17.232 -17.547 -18.021 -19.378 -9 ,32743 ,TETRA ,17524890,Wed Nov 24 23:37:19 CET,Thu Nov 25 01:53:39 CET,0.0 0.349 0.596 0.761 0.915 1.057 1.19 1.312 1.525 1.625 1.715 1.698 1.969 2.045 2.212 2.364 2.504 2.572 2.703 2.826 3.014 3.139 3.258 3.428 3.587 3.73 3.867 3.994 4.15 4.31 4.46 4.635 4.805 4.968 5.155 5.352 5.525 5.717 5.922 6.129 6.322 6.537 6.793 7.044 7.313 7.558 7.817 8.04 8.221 8.37 8.225 7.595 6.832 6.06 5.363 4.67 3.987 3.387 2.863 2.278 1.79 1.39 1.008 0.638 0.261 -0.093 -0.48 -0.844 -1.147 -1.463 -1.785 -2.044 -2.318 -2.613 -2.846 -3.074 -3.328 -3.614 -3.896 -4.087 -4.291 -4.61 -4.831 -5.066 -5.19 -5.44 -5.713 -6.016 -6.185 -6.554 -6.693 -6.884 -7.084 -7.482 -7.694 -7.927 -8.252 -8.709 -9.293 -10.07 -12.31 -10 ,3286 ,TETRA ,17524892,Wed Nov 24 23:37:23 CET,Thu Nov 25 01:57:36 CET,0.0 0.434 0.647 0.818 0.958 1.07 1.171 1.268 1.457 1.544 1.631 1.595 1.868 1.956 2.122 2.276 2.413 2.473 2.596 2.724 2.911 3.023 3.128 3.291 3.446 3.597 3.738 3.865 4.026 4.179 4.327 4.509 4.679 4.832 5.01 5.215 5.401 5.597 5.82 6.051 6.264 6.495 6.753 6.971 7.215 7.486 7.751 7.954 8.077 8.129 7.881 7.17 6.451 5.769 5.104 4.404 3.745 3.155 2.617 2.035 1.542 1.12 0.705 0.297 -0.084 -0.44 -0.817 -1.148 -1.44 -1.772 -2.127 -2.416 -2.712 -3.002 -3.222 -3.456 -3.698 -3.965 -4.258 -4.455 -4.674 -5.029 -5.278 -5.54 -5.678 -5.948 -6.235 -6.548 -6.705 -7.077 -7.255 -7.444 -7.624 -8.014 -8.246 -8.513 -8.825 -9.185 -9.623 -10.161 -11.758 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index c51c84a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17539 ,TETRA ,17524895,Wed Nov 24 23:37:23 CET,Thu Nov 25 01:55:36 CET,0.0 0.37 0.583 0.755 0.922 1.098 1.268 1.422 1.688 1.79 1.887 1.877 2.159 2.246 2.405 2.557 2.719 2.805 2.97 3.118 3.325 3.465 3.606 3.8 3.977 4.143 4.305 4.461 4.661 4.851 5.028 5.24 5.445 5.647 5.876 6.122 6.358 6.632 6.933 7.231 7.525 7.87 8.271 8.671 9.129 9.574 10.028 10.507 11.037 11.51 11.847 11.781 11.473 11.132 10.765 10.37 9.998 9.666 9.366 9.034 8.743 8.464 8.171 7.889 7.614 7.351 7.084 6.837 6.621 6.417 6.197 6.009 5.817 5.611 5.449 5.284 5.109 4.924 4.735 4.595 4.44 4.206 4.042 3.859 3.764 3.575 3.378 3.177 3.069 2.752 2.7 2.582 2.462 2.193 2.039 1.859 1.637 1.398 1.119 0.769 0.156 -2 ,2394 ,TETRA ,17524897,Wed Nov 24 23:37:19 CET,Thu Nov 25 01:57:33 CET,0.0 0.404 0.644 0.845 1.015 1.159 1.29 1.417 1.659 1.768 1.889 1.922 2.204 2.293 2.472 2.664 2.853 2.935 3.089 3.242 3.465 3.605 3.735 3.923 4.102 4.27 4.427 4.58 4.784 4.976 5.151 5.371 5.572 5.756 5.967 6.182 6.378 6.589 6.825 7.073 7.314 7.569 7.866 8.168 8.47 8.76 9.031 9.275 9.471 9.528 9.223 8.529 7.801 6.973 6.209 5.519 4.881 4.272 3.721 3.159 2.652 2.193 1.736 1.282 0.877 0.501 0.085 -0.281 -0.605 -0.969 -1.362 -1.676 -1.997 -2.339 -2.629 -2.93 -3.226 -3.542 -3.877 -4.121 -4.374 -4.734 -4.958 -5.163 -5.265 -5.478 -5.709 -5.965 -6.093 -6.416 -6.496 -6.638 -6.777 -7.098 -7.286 -7.526 -7.803 -8.084 -8.419 -8.788 -9.576 -3 ,17190 ,TETRA ,17524898,Wed Nov 24 23:37:23 CET,Thu Nov 25 01:56:24 CET,0.0 0.41 0.639 0.878 1.07 1.211 1.34 1.457 1.673 1.782 1.889 1.895 2.188 2.273 2.444 2.615 2.772 2.849 3.006 3.153 3.352 3.482 3.615 3.81 4.001 4.185 4.362 4.533 4.757 4.981 5.188 5.428 5.66 5.876 6.119 6.388 6.642 6.913 7.206 7.525 7.85 8.192 8.587 8.983 9.413 9.854 10.357 10.881 11.394 11.935 12.358 12.372 12.116 11.732 11.327 10.93 10.569 10.192 9.82 9.446 9.109 8.778 8.46 8.175 7.908 7.66 7.394 7.139 6.917 6.696 6.466 6.269 6.05 5.834 5.661 5.474 5.294 5.105 4.91 4.778 4.637 4.412 4.251 4.08 3.994 3.835 3.657 3.452 3.348 3.037 2.989 2.857 2.698 2.347 2.187 2.016 1.827 1.609 1.352 1.061 -0.134 -4 ,17116 ,TETRA ,17524901,Wed Nov 24 23:37:20 CET,Thu Nov 25 01:55:12 CET,0.0 0.278 0.47 0.632 0.763 0.886 1.009 1.129 1.356 1.473 1.576 1.566 1.853 1.942 2.108 2.263 2.414 2.482 2.609 2.734 2.914 3.029 3.144 3.311 3.477 3.649 3.818 3.97 4.159 4.345 4.531 4.752 4.956 5.152 5.381 5.64 5.882 6.144 6.425 6.722 7.038 7.363 7.723 8.077 8.489 8.959 9.422 9.903 10.456 10.941 11.258 11.229 10.969 10.636 10.231 9.774 9.375 9.021 8.659 8.289 7.995 7.733 7.461 7.2 6.973 6.753 6.51 6.296 6.118 5.919 5.696 5.514 5.324 5.13 4.98 4.826 4.67 4.506 4.338 4.225 4.111 3.924 3.776 3.621 3.537 3.351 3.155 2.946 2.84 2.542 2.493 2.365 2.253 2.022 1.894 1.733 1.563 1.399 1.188 0.946 0.214 -5 ,23556 ,TETRA ,17524903,Wed Nov 24 23:37:23 CET,Thu Nov 25 01:56:17 CET,0.0 0.39 0.663 0.878 1.057 1.24 1.415 1.583 1.887 2.013 2.131 2.16 2.462 2.563 2.757 2.941 3.118 3.202 3.355 3.502 3.729 3.874 4.019 4.232 4.427 4.606 4.769 4.92 5.125 5.328 5.511 5.728 5.959 6.188 6.436 6.717 6.973 7.238 7.521 7.826 8.146 8.487 8.892 9.303 9.736 10.188 10.698 11.231 11.742 12.234 12.671 12.717 12.522 12.261 11.943 11.541 11.145 10.804 10.509 10.192 9.897 9.607 9.304 9.016 8.756 8.515 8.252 8.018 7.821 7.611 7.39 7.195 6.949 6.686 6.487 6.271 6.048 5.813 5.578 5.413 5.23 4.95 4.755 4.55 4.447 4.242 4.028 3.771 3.637 3.334 3.297 3.151 2.993 2.657 2.468 2.251 2.01 1.787 1.527 1.104 -0.153 -6 ,27053 ,TETRA ,17524904,Wed Nov 24 23:37:23 CET,Thu Nov 25 01:55:38 CET,0.0 0.461 0.725 0.927 1.09 1.23 1.367 1.504 1.787 1.907 1.995 1.967 2.252 2.338 2.507 2.674 2.811 2.88 3.035 3.187 3.39 3.504 3.615 3.829 4.09 4.356 4.616 4.867 5.183 5.476 5.76 6.101 6.429 6.743 7.099 7.498 7.873 8.269 8.681 9.107 9.565 10.045 10.523 10.979 11.493 11.999 12.528 13.05 13.587 14.097 14.365 14.173 13.66 13.063 12.464 11.845 11.27 10.732 10.245 9.704 9.208 8.783 8.378 7.98 7.585 7.217 6.824 6.451 6.133 5.811 5.477 5.195 4.896 4.567 4.311 4.058 3.783 3.529 3.311 3.171 3.029 2.793 2.611 2.422 2.333 2.148 1.947 1.74 1.624 1.303 1.187 1.029 0.896 0.646 0.488 0.226 -0.11 -0.471 -0.91 -1.478 -3.269 -7 ,25826 ,TETRA ,17524905,Wed Nov 24 23:37:23 CET,Thu Nov 25 01:55:10 CET,0.0 0.301 0.552 0.745 0.887 1.029 1.177 1.327 1.601 1.718 1.84 1.895 2.203 2.29 2.467 2.638 2.806 2.886 3.061 3.231 3.439 3.574 3.705 3.902 4.082 4.241 4.393 4.545 4.756 4.949 5.138 5.384 5.615 5.83 6.082 6.368 6.641 6.927 7.23 7.547 7.867 8.188 8.565 8.97 9.416 9.879 10.394 10.914 11.449 11.975 12.28 12.224 12.045 11.725 11.305 10.88 10.51 10.164 9.841 9.498 9.176 8.888 8.612 8.345 8.094 7.844 7.581 7.349 7.144 6.928 6.7 6.502 6.295 6.093 5.92 5.734 5.53 5.319 5.115 4.962 4.798 4.516 4.304 4.091 3.973 3.732 3.503 3.249 3.111 2.774 2.66 2.504 2.363 2.055 1.86 1.644 1.422 1.181 0.874 0.453 -0.568 -8 ,30975 ,TETRA ,17524907,Wed Nov 24 23:37:23 CET,Thu Nov 25 01:55:29 CET,0.0 1.786 2.24 2.44 2.58 2.738 2.888 3.055 3.481 3.693 3.889 4.064 4.42 4.581 4.883 5.164 5.423 5.549 5.796 6.035 6.373 6.578 6.777 7.056 7.332 7.586 7.811 8.027 8.303 8.585 8.859 9.176 9.472 9.749 10.077 10.432 10.749 11.088 11.447 11.818 12.198 12.627 13.1 13.536 14.027 14.525 15.049 15.631 16.229 16.666 16.806 16.486 15.934 15.328 14.742 14.13 13.53 12.967 12.452 11.914 11.425 10.972 10.534 10.121 9.737 9.379 9.013 8.678 8.378 8.07 7.742 7.446 7.129 6.806 6.542 6.265 5.97 5.678 5.408 5.231 5.053 4.787 4.592 4.379 4.272 4.057 3.847 3.633 3.521 3.207 3.132 2.986 2.826 2.456 2.259 2.046 1.812 1.561 1.267 0.892 0.021 -9 ,4387 ,TETRA ,17524909,Wed Nov 24 23:37:24 CET,Thu Nov 25 02:00:09 CET,0.0 0.296 0.45 0.606 0.767 0.926 1.063 1.178 1.392 1.479 1.568 1.574 1.867 1.955 2.122 2.283 2.434 2.507 2.643 2.764 2.948 3.073 3.191 3.351 3.515 3.68 3.844 4.034 4.313 4.577 4.831 5.137 5.419 5.69 5.988 6.309 6.617 6.949 7.304 7.671 8.06 8.478 8.931 9.376 9.878 10.403 10.959 11.497 12.016 12.49 12.639 12.239 11.687 11.267 10.929 10.54 10.174 9.86 9.567 9.251 8.956 8.656 8.365 8.088 7.822 7.579 7.309 7.07 6.875 6.66 6.428 6.24 6.033 5.818 5.656 5.485 5.292 5.081 4.863 4.71 4.555 4.324 4.161 3.995 3.912 3.735 3.533 3.319 3.211 2.908 2.861 2.724 2.579 2.276 2.102 1.921 1.71 1.481 1.256 0.936 -0.046 -10 ,16709 ,TETRA ,17524911,Wed Nov 24 23:37:50 CET,Thu Nov 25 01:55:02 CET,0.0 0.999 1.28 1.483 1.668 1.852 2.026 2.164 2.367 2.462 2.554 2.547 2.842 2.942 3.134 3.314 3.466 3.531 3.673 3.819 4.033 4.155 4.259 4.404 4.55 4.703 4.849 4.99 5.179 5.357 5.515 5.767 6.071 6.351 6.67 7.03 7.367 7.725 8.103 8.479 8.866 9.296 9.772 10.222 10.719 11.248 11.791 12.305 12.823 13.298 13.477 13.185 12.713 12.112 11.5 10.94 10.394 9.85 9.379 8.889 8.446 8.037 7.635 7.227 6.835 6.46 6.057 5.694 5.375 5.052 4.697 4.394 4.092 3.771 3.526 3.253 2.965 2.737 2.528 2.37 2.218 1.986 1.823 1.657 1.567 1.386 1.193 0.96 0.829 0.506 0.455 0.321 0.165 -0.155 -0.306 -0.468 -0.671 -0.932 -1.267 -1.659 -2.296 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt deleted file mode 100644 index e73e6548..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10327 ,TETRA ,17524915,Wed Nov 24 23:37:50 CET,Thu Nov 25 02:01:27 CET,0.0 0.563 0.816 1.015 1.194 1.354 1.504 1.653 1.911 2.031 2.151 2.17 2.46 2.545 2.719 2.889 3.047 3.121 3.266 3.415 3.629 3.765 3.901 4.094 4.274 4.452 4.62 4.77 4.967 5.157 5.344 5.577 5.791 5.994 6.22 6.463 6.687 6.916 7.159 7.418 7.689 7.981 8.307 8.617 8.925 9.251 9.585 9.853 10.049 10.073 9.777 9.126 8.383 7.627 6.965 6.382 5.825 5.295 4.821 4.333 3.913 3.526 3.141 2.76 2.39 2.048 1.673 1.331 1.042 0.744 0.438 0.187 -0.088 -0.384 -0.605 -0.841 -1.104 -1.38 -1.654 -1.832 -2.036 -2.363 -2.581 -2.812 -2.934 -3.2 -3.508 -3.834 -3.983 -4.336 -4.472 -4.665 -4.866 -5.294 -5.513 -5.728 -5.992 -6.329 -6.731 -7.252 -8.662 -2 ,5844 ,TETRA ,17524917,Wed Nov 24 23:37:51 CET,Thu Nov 25 01:57:13 CET,0.0 1.065 1.364 1.575 1.742 1.908 2.069 2.203 2.42 2.517 2.615 2.598 2.88 2.975 3.165 3.329 3.485 3.57 3.728 3.871 4.08 4.209 4.319 4.463 4.614 4.767 4.901 5.031 5.21 5.39 5.564 5.775 5.968 6.146 6.342 6.556 6.773 7.0 7.257 7.534 7.799 8.067 8.35 8.637 8.958 9.251 9.505 9.721 9.879 9.899 9.565 8.844 8.069 7.272 6.533 5.888 5.304 4.704 4.156 3.616 3.146 2.729 2.325 1.933 1.57 1.244 0.892 0.559 0.277 -0.018 -0.325 -0.575 -0.834 -1.119 -1.344 -1.577 -1.828 -2.086 -2.364 -2.555 -2.738 -3.018 -3.219 -3.426 -3.547 -3.811 -4.068 -4.351 -4.505 -4.854 -4.951 -5.115 -5.291 -5.69 -5.917 -6.17 -6.456 -6.766 -7.132 -7.576 -8.902 -3 ,21069 ,TETRA ,17524918,Wed Nov 24 23:37:51 CET,Thu Nov 25 01:58:20 CET,0.0 0.836 1.154 1.399 1.554 1.688 1.824 1.957 2.2 2.314 2.426 2.452 2.746 2.848 3.044 3.221 3.375 3.446 3.591 3.744 3.974 4.114 4.252 4.462 4.654 4.828 4.986 5.136 5.33 5.517 5.698 5.9 6.08 6.258 6.472 6.711 6.933 7.157 7.379 7.623 7.875 8.151 8.474 8.779 9.077 9.333 9.587 9.815 9.987 10.026 9.684 8.808 7.86 7.032 6.31 5.629 5.01 4.444 3.945 3.419 2.929 2.469 2.054 1.651 1.276 0.927 0.53 0.175 -0.104 -0.381 -0.685 -0.942 -1.215 -1.507 -1.746 -1.977 -2.192 -2.419 -2.656 -2.816 -2.987 -3.261 -3.447 -3.636 -3.734 -3.935 -4.162 -4.407 -4.541 -4.895 -4.992 -5.155 -5.346 -5.753 -5.955 -6.2 -6.463 -6.73 -7.051 -7.465 -8.903 -4 ,26906 ,TETRA ,17524920,Wed Nov 24 23:37:51 CET,Thu Nov 25 01:58:04 CET,0.0 0.38 0.612 0.806 0.985 1.165 1.327 1.463 1.729 1.862 1.994 2.033 2.346 2.464 2.672 2.852 3.024 3.104 3.256 3.41 3.621 3.75 3.871 4.04 4.204 4.365 4.512 4.651 4.842 5.015 5.173 5.368 5.553 5.726 5.928 6.145 6.337 6.541 6.761 6.99 7.218 7.458 7.735 8.028 8.31 8.546 8.812 9.11 9.351 9.419 9.097 8.314 7.465 6.69 5.963 5.293 4.687 4.084 3.536 3.013 2.593 2.212 1.821 1.451 1.116 0.795 0.462 0.168 -0.084 -0.354 -0.652 -0.895 -1.151 -1.421 -1.652 -1.888 -2.1 -2.326 -2.576 -2.758 -2.958 -3.3 -3.558 -3.802 -3.919 -4.168 -4.42 -4.686 -4.835 -5.195 -5.313 -5.478 -5.656 -6.046 -6.276 -6.55 -6.835 -7.138 -7.505 -7.935 -9.001 -5 ,2307 ,TETRA ,17524922,Wed Nov 24 23:37:54 CET,Thu Nov 25 01:55:59 CET,0.0 0.3 0.477 0.655 0.816 0.973 1.117 1.273 1.577 1.697 1.801 1.797 2.081 2.162 2.315 2.46 2.598 2.662 2.79 2.923 3.103 3.212 3.327 3.496 3.651 3.801 3.95 4.101 4.277 4.431 4.58 4.761 4.942 5.112 5.3 5.512 5.712 5.926 6.143 6.359 6.567 6.795 7.071 7.338 7.631 7.933 8.205 8.413 8.546 8.563 8.264 7.505 6.724 5.999 5.302 4.623 4.055 3.531 3.051 2.575 2.176 1.829 1.47 1.117 0.779 0.458 0.143 -0.137 -0.38 -0.628 -0.913 -1.165 -1.426 -1.693 -1.892 -2.09 -2.307 -2.54 -2.781 -2.959 -3.148 -3.436 -3.625 -3.816 -3.927 -4.165 -4.366 -4.564 -4.67 -4.983 -5.052 -5.203 -5.356 -5.742 -5.962 -6.168 -6.368 -6.617 -6.956 -7.44 -8.9 -6 ,30012 ,TETRA ,17524924,Wed Nov 24 23:37:54 CET,Thu Nov 25 01:56:38 CET,0.0 0.209 0.424 0.635 0.821 0.965 1.096 1.209 1.423 1.531 1.628 1.604 1.893 1.98 2.136 2.286 2.424 2.491 2.632 2.764 2.963 3.089 3.204 3.37 3.527 3.668 3.804 3.935 4.11 4.275 4.425 4.604 4.769 4.92 5.096 5.298 5.492 5.715 5.942 6.145 6.341 6.571 6.833 7.096 7.369 7.591 7.795 7.974 8.091 8.116 7.874 7.26 6.495 5.663 4.935 4.29 3.73 3.19 2.65 2.052 1.516 1.05 0.618 0.189 -0.234 -0.625 -1.021 -1.369 -1.664 -1.967 -2.277 -2.521 -2.784 -3.084 -3.322 -3.561 -3.807 -4.072 -4.344 -4.526 -4.733 -5.057 -5.285 -5.532 -5.648 -5.882 -6.126 -6.385 -6.529 -6.873 -6.971 -7.163 -7.363 -7.77 -8.004 -8.261 -8.524 -8.819 -9.139 -9.568 -10.773 -7 ,30233 ,TETRA ,17524926,Wed Nov 24 23:37:58 CET,Thu Nov 25 01:56:41 CET,0.0 0.3 0.471 0.641 0.808 0.952 1.08 1.196 1.42 1.518 1.614 1.603 1.864 1.932 2.077 2.214 2.342 2.402 2.52 2.643 2.809 2.918 3.025 3.166 3.298 3.434 3.571 3.69 3.846 4.006 4.152 4.327 4.493 4.638 4.81 5.017 5.218 5.425 5.635 5.862 6.115 6.384 6.648 6.901 7.158 7.415 7.675 7.879 8.024 8.049 7.741 7.047 6.289 5.489 4.775 4.138 3.548 2.947 2.388 1.841 1.388 0.981 0.573 0.172 -0.221 -0.584 -0.965 -1.322 -1.617 -1.904 -2.224 -2.498 -2.781 -3.085 -3.34 -3.596 -3.843 -4.095 -4.358 -4.544 -4.732 -5.04 -5.27 -5.499 -5.597 -5.782 -5.981 -6.189 -6.3 -6.616 -6.654 -6.784 -6.931 -7.27 -7.449 -7.642 -7.846 -8.076 -8.413 -8.977 -10.551 -8 ,25206 ,TETRA ,17524928,Wed Nov 24 23:37:57 CET,Thu Nov 25 01:57:04 CET,0.0 0.84 1.087 1.289 1.453 1.578 1.676 1.777 1.994 2.093 2.197 2.206 2.49 2.584 2.764 2.937 3.114 3.194 3.336 3.479 3.683 3.813 3.937 4.102 4.261 4.424 4.578 4.72 4.9 5.073 5.241 5.423 5.579 5.74 5.949 6.172 6.387 6.637 6.892 7.141 7.37 7.603 7.882 8.165 8.472 8.782 9.084 9.312 9.496 9.574 9.254 8.462 7.624 6.903 6.285 5.634 5.004 4.417 3.918 3.412 2.955 2.537 2.128 1.739 1.379 1.058 0.706 0.383 0.095 -0.208 -0.513 -0.771 -1.038 -1.304 -1.519 -1.745 -1.975 -2.235 -2.527 -2.733 -2.934 -3.249 -3.457 -3.668 -3.784 -4.029 -4.278 -4.54 -4.692 -5.049 -5.186 -5.385 -5.581 -6.008 -6.245 -6.507 -6.817 -7.139 -7.514 -8.038 -9.752 -9 ,2575 ,TETRA ,17524930,Wed Nov 24 23:37:55 CET,Thu Nov 25 01:58:17 CET,0.0 0.897 1.229 1.443 1.627 1.801 1.972 2.123 2.386 2.504 2.613 2.628 2.928 3.027 3.211 3.386 3.559 3.64 3.784 3.928 4.147 4.28 4.406 4.584 4.743 4.898 5.055 5.204 5.388 5.562 5.725 5.921 6.104 6.271 6.473 6.695 6.907 7.154 7.392 7.617 7.841 8.085 8.371 8.645 8.937 9.217 9.502 9.749 9.92 9.974 9.637 8.916 8.185 7.427 6.715 6.051 5.428 4.842 4.327 3.81 3.364 2.957 2.585 2.259 1.948 1.618 1.244 0.912 0.625 0.329 0.026 -0.228 -0.505 -0.79 -1.008 -1.234 -1.465 -1.706 -1.971 -2.153 -2.35 -2.665 -2.871 -3.083 -3.193 -3.429 -3.683 -3.963 -4.116 -4.483 -4.621 -4.808 -5.028 -5.528 -5.774 -6.021 -6.306 -6.602 -6.929 -7.391 -8.654 -10 ,17455 ,TETRA ,17524932,Wed Nov 24 23:37:53 CET,Thu Nov 25 01:56:28 CET,0.0 0.516 0.758 0.966 1.139 1.287 1.427 1.562 1.806 1.906 2.013 2.02 2.304 2.402 2.587 2.754 2.928 3.009 3.154 3.298 3.502 3.622 3.743 3.927 4.097 4.272 4.447 4.611 4.809 4.983 5.151 5.35 5.539 5.714 5.913 6.144 6.369 6.618 6.869 7.122 7.38 7.657 7.968 8.253 8.532 8.8 9.073 9.312 9.488 9.562 9.345 8.726 8.011 7.317 6.674 6.056 5.492 4.897 4.377 3.898 3.446 3.012 2.614 2.261 1.944 1.651 1.348 1.071 0.83 0.56 0.251 -0.005 -0.271 -0.554 -0.784 -1.008 -1.231 -1.459 -1.692 -1.859 -2.046 -2.335 -2.543 -2.768 -2.877 -3.1 -3.339 -3.597 -3.738 -4.088 -4.186 -4.34 -4.483 -4.826 -5.032 -5.25 -5.494 -5.767 -6.113 -6.617 -8.36 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 4917dd63..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31787 ,TETRA ,17524935,Wed Nov 24 23:37:53 CET,Thu Nov 25 01:56:55 CET,0.0 0.552 0.812 1.03 1.233 1.419 1.585 1.734 2.009 2.126 2.236 2.27 2.58 2.694 2.906 3.101 3.287 3.378 3.548 3.702 3.919 4.055 4.189 4.396 4.591 4.774 4.952 5.117 5.34 5.573 5.801 6.071 6.324 6.558 6.837 7.15 7.429 7.725 8.036 8.368 8.735 9.158 9.631 10.089 10.622 11.203 11.828 12.482 13.211 14.003 14.696 14.95 14.904 14.692 14.396 14.075 13.732 13.369 13.069 12.745 12.427 12.141 11.853 11.566 11.308 11.072 10.822 10.611 10.403 10.18 9.957 9.757 9.555 9.35 9.185 9.021 8.863 8.692 8.486 8.331 8.18 7.966 7.807 7.634 7.552 7.38 7.183 6.991 6.9 6.61 6.579 6.438 6.284 5.996 5.866 5.728 5.559 5.331 5.066 4.752 3.465 -2 ,29535 ,TETRA ,17524937,Wed Nov 24 23:37:54 CET,Thu Nov 25 01:57:20 CET,0.0 1.367 1.62 1.86 2.07 2.231 2.378 2.507 2.748 2.872 2.99 3.024 3.331 3.433 3.62 3.811 3.984 4.062 4.22 4.389 4.633 4.772 4.916 5.132 5.322 5.517 5.711 5.901 6.14 6.362 6.577 6.837 7.091 7.322 7.589 7.911 8.213 8.523 8.844 9.19 9.575 9.989 10.445 10.901 11.41 11.916 12.476 13.115 13.796 14.486 15.104 15.325 15.176 14.862 14.573 14.281 13.95 13.632 13.315 12.929 12.581 12.268 11.969 11.679 11.391 11.106 10.805 10.553 10.338 10.137 9.937 9.75 9.55 9.349 9.183 8.992 8.798 8.608 8.397 8.246 8.094 7.856 7.691 7.528 7.439 7.243 7.033 6.809 6.696 6.395 6.345 6.225 6.085 5.714 5.526 5.331 5.082 4.8 4.452 4.03 2.356 -3 ,15909 ,TETRA ,17524939,Wed Nov 24 23:37:57 CET,Thu Nov 25 01:57:15 CET,0.0 0.417 0.667 0.89 1.097 1.29 1.454 1.603 1.869 1.995 2.118 2.145 2.443 2.55 2.742 2.935 3.12 3.206 3.383 3.551 3.789 3.943 4.09 4.317 4.534 4.729 4.919 5.101 5.33 5.544 5.76 6.021 6.269 6.509 6.801 7.147 7.451 7.743 8.039 8.342 8.654 8.988 9.387 9.791 10.261 10.794 11.327 11.84 12.388 12.9 13.195 13.022 12.654 12.234 11.817 11.375 10.909 10.485 10.095 9.68 9.315 8.961 8.641 8.332 8.013 7.72 7.433 7.169 6.929 6.691 6.436 6.22 5.997 5.753 5.563 5.369 5.175 4.974 4.756 4.61 4.468 4.229 4.033 3.823 3.722 3.535 3.332 3.072 2.94 2.615 2.553 2.417 2.258 1.9 1.701 1.466 1.17 0.87 0.52 0.051 -1.363 -4 ,9958 ,TETRA ,17524941,Wed Nov 24 23:38:23 CET,Thu Nov 25 01:58:16 CET,0.0 0.727 1.054 1.311 1.528 1.722 1.894 2.053 2.309 2.418 2.54 2.56 2.851 2.937 3.104 3.265 3.422 3.497 3.651 3.812 4.045 4.18 4.311 4.512 4.706 4.895 5.066 5.235 5.464 5.666 5.865 6.108 6.339 6.566 6.817 7.097 7.384 7.692 8.009 8.391 8.842 9.344 9.933 10.534 11.222 11.972 12.766 13.578 14.453 15.31 16.054 16.393 16.369 16.166 15.929 15.64 15.344 15.081 14.837 14.576 14.328 14.028 13.693 13.374 13.078 12.814 12.529 12.262 12.023 11.772 11.519 11.311 11.081 10.833 10.634 10.408 10.176 9.952 9.724 9.552 9.357 9.074 8.883 8.672 8.549 8.283 8.022 7.778 7.656 7.32 7.193 7.031 6.865 6.544 6.359 6.131 5.879 5.6 5.199 4.689 3.352 -5 ,26334 ,TETRA ,17524943,Wed Nov 24 23:38:26 CET,Thu Nov 25 02:01:09 CET,0.0 1.259 1.48 1.673 1.805 1.936 2.067 2.188 2.445 2.583 2.7 2.707 3.005 3.104 3.293 3.468 3.634 3.717 3.887 4.05 4.284 4.42 4.537 4.709 4.888 5.067 5.233 5.396 5.601 5.802 5.993 6.236 6.462 6.669 6.926 7.196 7.447 7.723 8.014 8.329 8.641 8.984 9.384 9.788 10.296 10.856 11.467 12.106 12.771 13.467 14.169 14.465 14.288 13.972 13.683 13.357 12.993 12.613 12.269 11.925 11.614 11.322 11.033 10.746 10.498 10.268 10.012 9.789 9.589 9.371 9.123 8.904 8.686 8.453 8.285 8.124 7.942 7.748 7.532 7.366 7.184 6.899 6.717 6.551 6.461 6.269 6.064 5.852 5.744 5.429 5.34 5.2 5.06 4.738 4.57 4.399 4.208 3.977 3.697 3.333 2.253 -6 ,593 ,TETRA ,17524944,Wed Nov 24 23:38:23 CET,Thu Nov 25 01:57:17 CET,0.0 0.828 1.181 1.399 1.578 1.755 1.915 2.061 2.361 2.508 2.642 2.687 2.998 3.115 3.311 3.5 3.696 3.788 3.958 4.112 4.326 4.462 4.589 4.779 4.969 5.154 5.332 5.503 5.728 5.938 6.133 6.37 6.598 6.824 7.081 7.361 7.653 7.99 8.347 8.728 9.114 9.53 9.97 10.373 10.85 11.384 11.996 12.679 13.447 14.243 14.976 15.371 15.398 15.232 14.954 14.671 14.396 14.094 13.811 13.523 13.263 12.995 12.716 12.428 12.137 11.859 11.571 11.338 11.137 10.927 10.692 10.487 10.291 10.089 9.935 9.783 9.621 9.449 9.263 9.149 9.032 8.821 8.667 8.495 8.41 8.234 8.044 7.857 7.757 7.455 7.42 7.304 7.19 6.909 6.73 6.537 6.351 6.161 5.898 5.497 3.87 -7 ,11759 ,TETRA ,17524946,Wed Nov 24 23:38:22 CET,Thu Nov 25 01:58:36 CET,0.0 0.373 0.627 0.856 1.024 1.164 1.296 1.437 1.706 1.827 1.948 2.007 2.313 2.42 2.627 2.819 3.006 3.099 3.264 3.413 3.633 3.774 3.918 4.142 4.347 4.556 4.745 4.911 5.16 5.407 5.633 5.895 6.146 6.409 6.722 7.057 7.366 7.689 8.076 8.566 9.073 9.606 10.21 10.788 11.411 12.084 12.877 13.687 14.57 15.523 16.474 17.034 17.106 17.037 16.879 16.578 16.244 15.934 15.614 15.249 14.912 14.588 14.27 13.969 13.689 13.424 13.136 12.851 12.592 12.315 12.019 11.785 11.548 11.3 11.095 10.881 10.668 10.439 10.172 9.989 9.816 9.566 9.401 9.234 9.144 8.956 8.763 8.543 8.417 8.099 8.002 7.844 7.685 7.367 7.213 7.04 6.828 6.561 6.287 5.94 4.664 -8 ,20870 ,TETRA ,17524947,Wed Nov 24 23:38:24 CET,Thu Nov 25 01:58:10 CET,0.0 0.323 0.515 0.685 0.825 0.962 1.097 1.229 1.465 1.569 1.674 1.673 1.971 2.072 2.264 2.444 2.598 2.682 2.844 2.996 3.236 3.388 3.543 3.767 3.964 4.152 4.335 4.519 4.764 4.983 5.186 5.433 5.704 6.006 6.361 6.754 7.126 7.533 7.965 8.409 8.868 9.366 9.922 10.474 11.119 11.797 12.515 13.28 14.069 14.888 15.789 16.321 16.379 16.242 16.053 15.8 15.521 15.253 14.951 14.627 14.362 14.105 13.84 13.577 13.333 13.112 12.866 12.629 12.429 12.221 11.992 11.797 11.586 11.362 11.187 10.997 10.791 10.587 10.374 10.216 10.061 9.84 9.686 9.519 9.43 9.246 9.037 8.802 8.679 8.362 8.282 8.144 7.989 7.639 7.466 7.293 7.088 6.841 6.555 6.21 5.237 -9 ,25418 ,TETRA ,17524949,Wed Nov 24 23:38:28 CET,Thu Nov 25 01:57:13 CET,0.0 0.568 0.809 1.019 1.217 1.388 1.544 1.684 1.948 2.065 2.172 2.193 2.499 2.597 2.771 2.946 3.132 3.215 3.353 3.486 3.688 3.824 3.956 4.147 4.33 4.507 4.676 4.845 5.054 5.247 5.44 5.666 5.877 6.083 6.325 6.61 6.878 7.162 7.479 7.799 8.131 8.504 8.899 9.265 9.682 10.143 10.669 11.265 11.977 12.688 13.258 13.442 13.307 13.075 12.746 12.353 11.97 11.527 11.073 10.604 10.219 9.899 9.565 9.232 8.914 8.622 8.33 8.073 7.838 7.584 7.313 7.084 6.851 6.597 6.402 6.197 5.97 5.745 5.527 5.378 5.218 4.965 4.779 4.549 4.427 4.198 3.967 3.726 3.593 3.27 3.191 3.037 2.863 2.464 2.243 2.015 1.792 1.524 1.18 0.711 -1.415 -10 ,31474 ,TETRA ,17524951,Wed Nov 24 23:38:24 CET,Thu Nov 25 01:57:15 CET,0.0 0.37 0.615 0.797 0.979 1.16 1.338 1.498 1.76 1.885 2.008 2.073 2.386 2.484 2.682 2.876 3.06 3.15 3.332 3.507 3.735 3.878 4.022 4.24 4.441 4.624 4.816 5.011 5.267 5.51 5.735 5.995 6.236 6.474 6.753 7.051 7.333 7.643 7.961 8.287 8.627 9.027 9.499 9.952 10.455 10.969 11.564 12.238 12.903 13.494 13.938 14.043 13.882 13.592 13.27 12.936 12.596 12.234 11.878 11.5 11.149 10.822 10.515 10.205 9.905 9.635 9.354 9.112 8.902 8.669 8.409 8.198 7.99 7.779 7.609 7.414 7.201 6.982 6.759 6.609 6.456 6.219 6.063 5.898 5.807 5.616 5.408 5.176 5.067 4.78 4.738 4.603 4.459 4.151 3.972 3.765 3.546 3.289 2.95 2.347 -0.139 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt deleted file mode 100644 index 8c24e9bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18797 ,TETRA ,17524954,Wed Nov 24 23:38:30 CET,Thu Nov 25 02:00:38 CET,0.0 0.805 1.059 1.282 1.493 1.671 1.826 1.954 2.198 2.32 2.442 2.444 2.744 2.837 3.035 3.232 3.413 3.495 3.646 3.791 4.011 4.143 4.259 4.439 4.617 4.788 4.954 5.11 5.295 5.474 5.651 5.849 6.035 6.236 6.49 6.773 7.03 7.295 7.565 7.822 8.072 8.347 8.668 8.998 9.358 9.704 10.046 10.322 10.553 10.701 10.438 9.634 8.814 8.07 7.372 6.711 6.058 5.412 4.821 4.225 3.733 3.306 2.889 2.485 2.126 1.82 1.493 1.179 0.909 0.635 0.351 0.111 -0.128 -0.368 -0.568 -0.779 -0.99 -1.209 -1.437 -1.591 -1.746 -2.002 -2.181 -2.376 -2.484 -2.688 -2.883 -3.104 -3.226 -3.573 -3.599 -3.733 -3.872 -4.201 -4.37 -4.536 -4.735 -4.978 -5.255 -5.629 -6.47 -2 ,10564 ,TETRA ,17524956,Wed Nov 24 23:38:26 CET,Thu Nov 25 01:58:56 CET,0.0 0.799 1.101 1.37 1.601 1.787 1.969 2.146 2.453 2.591 2.725 2.763 3.089 3.198 3.408 3.594 3.775 3.861 4.015 4.172 4.405 4.553 4.71 4.936 5.142 5.338 5.512 5.68 5.912 6.134 6.329 6.557 6.793 7.022 7.283 7.562 7.816 8.095 8.379 8.672 8.96 9.274 9.66 10.024 10.399 10.782 11.186 11.581 11.868 11.953 11.631 10.772 9.874 9.045 8.29 7.562 6.914 6.321 5.732 5.11 4.572 4.096 3.662 3.264 2.899 2.565 2.217 1.905 1.631 1.344 1.052 0.816 0.582 0.351 0.161 -0.04 -0.259 -0.516 -0.769 -0.937 -1.124 -1.407 -1.594 -1.797 -1.898 -2.111 -2.322 -2.543 -2.672 -3.027 -3.071 -3.205 -3.344 -3.667 -3.84 -4.021 -4.231 -4.483 -4.75 -5.037 -5.841 -3 ,7797 ,TETRA ,17524958,Wed Nov 24 23:38:26 CET,Thu Nov 25 01:59:17 CET,0.0 0.97 1.339 1.631 1.818 1.995 2.198 2.381 2.691 2.825 2.964 3.01 3.346 3.454 3.644 3.827 4.011 4.099 4.267 4.434 4.673 4.823 4.958 5.139 5.31 5.493 5.683 5.856 6.07 6.272 6.456 6.67 6.894 7.111 7.342 7.6 7.841 8.08 8.316 8.591 8.872 9.171 9.486 9.736 9.995 10.281 10.608 10.882 11.067 11.032 10.436 9.428 8.482 7.605 6.854 6.165 5.525 4.933 4.416 3.911 3.439 2.993 2.579 2.2 1.851 1.516 1.159 0.839 0.548 0.249 -0.032 -0.262 -0.5 -0.755 -0.961 -1.179 -1.412 -1.641 -1.883 -2.047 -2.216 -2.485 -2.665 -2.847 -2.938 -3.13 -3.346 -3.583 -3.71 -4.076 -4.147 -4.294 -4.438 -4.772 -4.942 -5.115 -5.313 -5.52 -5.754 -6.111 -6.749 -4 ,24606 ,TETRA ,17524960,Wed Nov 24 23:38:26 CET,Thu Nov 25 02:00:34 CET,0.0 0.975 1.346 1.593 1.8 1.993 2.184 2.346 2.585 2.692 2.807 2.82 3.147 3.255 3.461 3.646 3.831 3.926 4.108 4.287 4.53 4.67 4.796 4.97 5.152 5.333 5.502 5.673 5.915 6.137 6.322 6.541 6.774 7.002 7.256 7.525 7.769 8.051 8.341 8.633 8.95 9.297 9.631 9.879 10.121 10.395 10.673 10.832 10.888 10.786 10.24 9.189 8.192 7.214 6.319 5.484 4.716 4.023 3.45 2.913 2.458 2.025 1.586 1.157 0.752 0.388 0.014 -0.302 -0.567 -0.848 -1.134 -1.371 -1.637 -1.912 -2.121 -2.33 -2.537 -2.761 -2.996 -3.155 -3.315 -3.577 -3.761 -3.953 -4.054 -4.26 -4.478 -4.692 -4.801 -5.155 -5.208 -5.344 -5.472 -5.772 -5.949 -6.128 -6.316 -6.526 -6.791 -7.118 -7.763 -5 ,32081 ,TETRA ,17524962,Wed Nov 24 23:38:30 CET,Thu Nov 25 01:58:28 CET,0.0 0.622 0.957 1.176 1.384 1.578 1.734 1.875 2.177 2.325 2.459 2.477 2.8 2.89 3.048 3.212 3.371 3.452 3.612 3.751 3.938 4.062 4.187 4.384 4.576 4.756 4.936 5.12 5.36 5.58 5.786 6.027 6.262 6.485 6.74 7.045 7.328 7.609 7.895 8.173 8.453 8.757 9.059 9.344 9.71 10.099 10.468 10.796 11.045 11.086 10.729 9.802 8.903 8.09 7.224 6.423 5.785 5.185 4.603 3.999 3.496 3.064 2.657 2.253 1.859 1.51 1.152 0.818 0.531 0.228 -0.089 -0.348 -0.609 -0.875 -1.083 -1.302 -1.529 -1.763 -2.01 -2.175 -2.347 -2.632 -2.836 -3.051 -3.163 -3.393 -3.642 -3.914 -4.04 -4.385 -4.408 -4.539 -4.693 -5.051 -5.244 -5.449 -5.684 -5.978 -6.27 -6.612 -7.615 -6 ,9981 ,TETRA ,17524964,Wed Nov 24 23:38:26 CET,Thu Nov 25 01:57:44 CET,0.0 0.737 1.09 1.373 1.563 1.722 1.868 2.005 2.245 2.357 2.466 2.442 2.752 2.842 3.038 3.253 3.448 3.531 3.692 3.857 4.099 4.25 4.395 4.595 4.78 4.955 5.123 5.296 5.518 5.709 5.876 6.086 6.301 6.505 6.738 6.998 7.24 7.483 7.727 7.987 8.248 8.529 8.883 9.211 9.533 9.813 10.04 10.225 10.28 10.128 9.524 8.419 7.365 6.419 5.577 4.758 4.004 3.318 2.723 2.115 1.595 1.142 0.704 0.303 -0.082 -0.435 -0.793 -1.116 -1.394 -1.685 -1.985 -2.236 -2.502 -2.775 -2.987 -3.221 -3.455 -3.686 -3.933 -4.11 -4.293 -4.547 -4.723 -4.921 -5.024 -5.241 -5.471 -5.717 -5.848 -6.219 -6.256 -6.393 -6.532 -6.839 -7.015 -7.203 -7.409 -7.664 -7.946 -8.21 -9.016 -7 ,456 ,TETRA ,17524965,Wed Nov 24 23:38:26 CET,Thu Nov 25 01:58:31 CET,0.0 1.105 1.407 1.623 1.821 2.003 2.15 2.288 2.559 2.686 2.802 2.795 3.102 3.201 3.396 3.584 3.764 3.853 4.026 4.184 4.402 4.537 4.664 4.848 5.043 5.237 5.413 5.578 5.783 5.99 6.195 6.419 6.629 6.845 7.103 7.384 7.643 7.92 8.193 8.49 8.807 9.155 9.544 9.887 10.259 10.62 10.919 11.205 11.48 11.519 11.057 10.099 9.13 8.211 7.341 6.56 5.89 5.244 4.672 4.118 3.648 3.204 2.755 2.349 1.981 1.623 1.224 0.87 0.579 0.276 -0.046 -0.321 -0.597 -0.882 -1.097 -1.309 -1.542 -1.783 -2.016 -2.179 -2.345 -2.611 -2.813 -3.019 -3.123 -3.338 -3.566 -3.806 -3.93 -4.289 -4.311 -4.445 -4.591 -4.93 -5.107 -5.27 -5.432 -5.627 -5.895 -6.199 -6.893 -8 ,24957 ,TETRA ,17524969,Wed Nov 24 23:38:26 CET,Thu Nov 25 02:02:50 CET,0.0 1.103 1.408 1.626 1.83 2.021 2.187 2.342 2.63 2.76 2.879 2.887 3.22 3.319 3.519 3.707 3.88 3.96 4.125 4.286 4.492 4.625 4.761 4.954 5.149 5.321 5.478 5.628 5.819 5.99 6.141 6.339 6.532 6.715 6.945 7.193 7.401 7.657 7.951 8.272 8.567 8.831 9.149 9.461 9.785 10.059 10.258 10.396 10.438 10.246 9.507 8.365 7.344 6.434 5.606 4.826 4.146 3.502 2.901 2.307 1.782 1.319 0.893 0.474 0.087 -0.26 -0.61 -0.938 -1.225 -1.501 -1.791 -2.05 -2.305 -2.561 -2.781 -3.007 -3.236 -3.474 -3.726 -3.898 -4.063 -4.305 -4.481 -4.676 -4.772 -4.959 -5.153 -5.36 -5.464 -5.791 -5.811 -5.941 -6.065 -6.339 -6.491 -6.663 -6.843 -7.055 -7.328 -7.613 -8.277 -9 ,13320 ,TETRA ,17524971,Wed Nov 24 23:39:23 CET,Thu Nov 25 02:02:12 CET,0.0 0.955 1.231 1.444 1.645 1.827 1.998 2.154 2.445 2.583 2.718 2.76 3.096 3.201 3.408 3.607 3.799 3.897 4.064 4.205 4.435 4.601 4.749 4.952 5.152 5.348 5.532 5.711 5.929 6.13 6.33 6.557 6.755 6.923 7.119 7.359 7.583 7.816 8.063 8.334 8.625 8.935 9.258 9.555 9.87 10.177 10.507 10.825 11.052 11.052 10.547 9.61 8.683 7.749 6.82 5.951 5.216 4.554 3.998 3.454 2.981 2.566 2.17 1.785 1.41 1.067 0.726 0.422 0.162 -0.11 -0.396 -0.633 -0.897 -1.168 -1.371 -1.582 -1.801 -2.029 -2.257 -2.414 -2.583 -2.842 -3.019 -3.19 -3.276 -3.466 -3.65 -3.826 -3.93 -4.273 -4.291 -4.421 -4.546 -4.835 -4.985 -5.132 -5.296 -5.496 -5.729 -5.984 -6.679 -10 ,24743 ,TETRA ,17524973,Wed Nov 24 23:39:24 CET,Thu Nov 25 01:58:54 CET,0.0 0.883 1.211 1.477 1.671 1.857 2.037 2.215 2.552 2.691 2.815 2.831 3.164 3.267 3.465 3.664 3.86 3.952 4.128 4.305 4.556 4.709 4.854 5.07 5.284 5.482 5.665 5.833 6.043 6.257 6.475 6.73 6.949 7.136 7.369 7.635 7.861 8.12 8.41 8.673 8.937 9.236 9.558 9.842 10.117 10.403 10.691 10.954 11.106 11.053 10.559 9.556 8.567 7.598 6.743 5.956 5.234 4.604 4.06 3.493 2.991 2.542 2.112 1.704 1.317 0.949 0.572 0.246 -0.042 -0.355 -0.682 -0.925 -1.152 -1.398 -1.601 -1.811 -2.019 -2.232 -2.458 -2.611 -2.777 -3.05 -3.243 -3.454 -3.558 -3.744 -3.956 -4.19 -4.317 -4.672 -4.687 -4.823 -4.983 -5.32 -5.479 -5.662 -5.884 -6.104 -6.369 -6.747 -7.62 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt deleted file mode 100644 index 9f01441f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1680 ,TETRA ,17524975,Wed Nov 24 23:39:26 CET,Thu Nov 25 01:57:22 CET,0.0 0.316 0.489 0.595 0.703 0.796 0.862 0.922 1.023 1.059 1.089 0.931 1.172 1.188 1.208 1.219 1.245 1.262 1.271 1.266 1.25 1.238 1.227 1.217 1.189 1.133 1.069 1.011 0.958 0.897 0.799 0.657 0.505 0.345 0.155 -0.076 -0.322 -0.613 -0.961 -1.375 -1.848 -2.435 -3.187 -4.025 -5.116 -6.453 -8.2 -10.423 -13.348 -17.43 -23.628 -30.259 -35.174 -39.001 -42.102 -44.732 -46.937 -48.822 -50.356 -51.82 -53.035 -54.094 -55.083 -55.996 -56.832 -57.575 -58.308 -58.942 -59.494 -60.059 -60.637 -61.113 -61.586 -62.063 -62.442 -62.835 -63.219 -63.594 -63.987 -64.266 -64.558 -64.996 -65.288 -65.584 -65.732 -66.04 -66.359 -66.68 -66.847 -67.306 -67.355 -67.528 -67.713 -68.1 -68.297 -68.512 -68.733 -68.955 -69.244 -69.597 -70.517 -2 ,2478 ,TETRA ,17524977,Wed Nov 24 23:39:27 CET,Thu Nov 25 01:58:16 CET,0.0 0.538 0.679 0.808 0.945 1.052 1.135 1.206 1.324 1.369 1.407 1.27 1.513 1.542 1.583 1.605 1.64 1.654 1.678 1.691 1.686 1.671 1.652 1.636 1.61 1.553 1.494 1.434 1.337 1.243 1.149 1.023 0.891 0.745 0.548 0.293 0.034 -0.262 -0.611 -1.034 -1.526 -2.118 -2.878 -3.689 -4.744 -6.104 -7.843 -10.049 -13.081 -17.383 -23.895 -30.807 -35.928 -39.924 -43.132 -45.829 -48.06 -50.02 -51.659 -53.226 -54.536 -55.649 -56.656 -57.588 -58.442 -59.191 -59.959 -60.636 -61.213 -61.81 -62.405 -62.876 -63.356 -63.84 -64.214 -64.603 -64.999 -65.4 -65.809 -66.09 -66.378 -66.807 -67.099 -67.404 -67.565 -67.89 -68.208 -68.552 -68.727 -69.194 -69.278 -69.468 -69.673 -70.087 -70.316 -70.554 -70.798 -71.081 -71.416 -71.816 -72.716 -3 ,5610 ,TETRA ,17524979,Wed Nov 24 23:40:25 CET,Thu Nov 25 01:59:25 CET,0.0 0.779 0.989 1.143 1.274 1.396 1.491 1.565 1.688 1.739 1.794 1.681 1.933 1.961 2.007 2.037 2.063 2.075 2.092 2.107 2.112 2.105 2.097 2.078 2.053 2.027 1.997 1.953 1.881 1.807 1.732 1.622 1.494 1.351 1.165 0.93 0.681 0.384 0.012 -0.429 -0.927 -1.516 -2.258 -3.072 -4.103 -5.399 -7.12 -9.394 -12.462 -16.688 -23.116 -29.948 -34.916 -38.836 -42.039 -44.728 -46.955 -48.877 -50.452 -51.974 -53.239 -54.335 -55.352 -56.285 -57.139 -57.882 -58.641 -59.314 -59.878 -60.457 -61.048 -61.528 -62.026 -62.55 -62.942 -63.341 -63.756 -64.168 -64.581 -64.859 -65.151 -65.598 -65.905 -66.225 -66.384 -66.706 -67.03 -67.366 -67.536 -68.0 -68.093 -68.293 -68.501 -68.935 -69.166 -69.422 -69.702 -69.99 -70.26 -70.572 -71.2 -4 ,25948 ,TETRA ,17524981,Wed Nov 24 23:40:26 CET,Thu Nov 25 02:06:03 CET,0.0 1.009 1.198 1.32 1.436 1.546 1.644 1.711 1.811 1.864 1.921 1.795 2.048 2.087 2.142 2.186 2.242 2.268 2.297 2.321 2.352 2.365 2.371 2.368 2.357 2.34 2.314 2.282 2.229 2.148 2.054 1.933 1.803 1.658 1.466 1.237 0.982 0.675 0.331 -0.082 -0.586 -1.214 -2.009 -2.89 -4.01 -5.372 -7.122 -9.4 -12.531 -16.899 -23.408 -30.344 -35.517 -39.557 -42.794 -45.5 -47.729 -49.671 -51.29 -52.844 -54.115 -55.224 -56.271 -57.228 -58.107 -58.883 -59.659 -60.338 -60.904 -61.48 -62.074 -62.555 -63.032 -63.52 -63.914 -64.304 -64.681 -65.07 -65.469 -65.745 -66.031 -66.46 -66.764 -67.08 -67.238 -67.57 -67.912 -68.26 -68.435 -68.906 -68.983 -69.177 -69.382 -69.828 -70.054 -70.289 -70.528 -70.77 -71.064 -71.462 -72.219 -5 ,17088 ,TETRA ,17524983,Wed Nov 24 23:40:26 CET,Thu Nov 25 01:59:11 CET,0.0 0.57 0.766 0.905 0.993 1.078 1.174 1.243 1.381 1.44 1.477 1.313 1.548 1.571 1.599 1.62 1.646 1.658 1.661 1.658 1.668 1.663 1.646 1.628 1.601 1.557 1.516 1.471 1.398 1.328 1.246 1.123 0.999 0.865 0.672 0.433 0.189 -0.119 -0.479 -0.875 -1.335 -1.882 -2.607 -3.448 -4.508 -5.825 -7.509 -9.681 -12.645 -16.765 -22.993 -29.598 -34.498 -38.377 -41.475 -44.099 -46.298 -48.185 -49.78 -51.332 -52.603 -53.685 -54.677 -55.6 -56.445 -57.191 -57.978 -58.671 -59.241 -59.814 -60.395 -60.868 -61.343 -61.83 -62.215 -62.607 -63.01 -63.432 -63.856 -64.135 -64.419 -64.857 -65.158 -65.47 -65.632 -65.958 -66.307 -66.696 -66.895 -67.377 -67.483 -67.684 -67.884 -68.332 -68.572 -68.807 -69.055 -69.319 -69.62 -70.003 -71.022 -6 ,2532 ,TETRA ,17524984,Wed Nov 24 23:40:26 CET,Thu Nov 25 02:07:32 CET,0.0 0.69 0.822 0.943 1.058 1.183 1.29 1.362 1.483 1.543 1.594 1.447 1.689 1.708 1.752 1.797 1.824 1.84 1.87 1.879 1.885 1.878 1.875 1.872 1.838 1.78 1.73 1.679 1.609 1.537 1.446 1.328 1.197 1.051 0.879 0.663 0.418 0.117 -0.24 -0.66 -1.132 -1.721 -2.512 -3.389 -4.486 -5.823 -7.581 -9.869 -12.966 -17.349 -23.874 -30.798 -36.001 -40.072 -43.289 -46.007 -48.308 -50.282 -51.926 -53.526 -54.872 -56.056 -57.131 -58.114 -59.017 -59.819 -60.614 -61.289 -61.853 -62.431 -63.03 -63.52 -64.024 -64.535 -64.92 -65.306 -65.697 -66.104 -66.509 -66.783 -67.07 -67.498 -67.792 -68.109 -68.266 -68.567 -68.891 -69.24 -69.418 -69.894 -69.988 -70.189 -70.399 -70.844 -71.064 -71.284 -71.562 -71.899 -72.278 -72.7 -73.588 -7 ,28741 ,TETRA ,17524986,Wed Nov 24 23:41:21 CET,Thu Nov 25 02:00:52 CET,0.0 0.695 0.918 1.084 1.223 1.344 1.441 1.519 1.655 1.72 1.771 1.641 1.908 1.952 2.029 2.089 2.139 2.162 2.195 2.21 2.214 2.208 2.204 2.195 2.173 2.142 2.107 2.072 2.004 1.93 1.862 1.752 1.603 1.451 1.27 1.047 0.817 0.525 0.168 -0.239 -0.72 -1.311 -2.039 -2.842 -3.913 -5.283 -7.037 -9.223 -12.172 -16.315 -22.602 -29.371 -34.426 -38.421 -41.653 -44.368 -46.625 -48.57 -50.199 -51.77 -53.065 -54.195 -55.219 -56.149 -57.01 -57.797 -58.606 -59.305 -59.899 -60.494 -61.098 -61.586 -62.071 -62.572 -62.95 -63.337 -63.746 -64.168 -64.585 -64.872 -65.168 -65.64 -65.966 -66.287 -66.448 -66.778 -67.117 -67.461 -67.645 -68.117 -68.207 -68.403 -68.606 -69.053 -69.302 -69.558 -69.832 -70.154 -70.507 -70.862 -71.913 -8 ,1275 ,TETRA ,17524987,Wed Nov 24 23:41:22 CET,Thu Nov 25 02:01:35 CET,0.0 0.696 0.879 1.033 1.175 1.278 1.358 1.438 1.544 1.592 1.639 1.479 1.722 1.745 1.798 1.834 1.853 1.856 1.852 1.846 1.829 1.815 1.8 1.773 1.743 1.708 1.651 1.581 1.496 1.409 1.308 1.164 1.006 0.838 0.624 0.364 0.09 -0.242 -0.63 -1.063 -1.566 -2.179 -2.963 -3.838 -4.947 -6.323 -8.093 -10.367 -13.437 -17.666 -23.949 -30.644 -35.722 -39.74 -42.957 -45.639 -47.853 -49.769 -51.357 -52.875 -54.117 -55.179 -56.17 -57.077 -57.895 -58.634 -59.401 -60.07 -60.638 -61.223 -61.837 -62.344 -62.849 -63.353 -63.742 -64.141 -64.537 -64.927 -65.328 -65.61 -65.882 -66.286 -66.578 -66.889 -67.052 -67.385 -67.719 -68.065 -68.239 -68.707 -68.817 -69.017 -69.22 -69.667 -69.921 -70.198 -70.493 -70.795 -71.102 -71.495 -72.51 -9 ,25273 ,TETRA ,17524988,Wed Nov 24 23:41:22 CET,Thu Nov 25 02:00:39 CET,0.0 0.887 1.154 1.326 1.473 1.586 1.674 1.76 1.905 1.962 2.015 1.894 2.145 2.171 2.231 2.293 2.341 2.357 2.381 2.4 2.402 2.399 2.398 2.391 2.37 2.333 2.288 2.245 2.182 2.107 2.029 1.918 1.774 1.62 1.435 1.188 0.916 0.588 0.221 -0.189 -0.662 -1.245 -1.993 -2.816 -3.88 -5.231 -6.995 -9.298 -12.388 -16.704 -23.251 -30.169 -35.279 -39.258 -42.488 -45.188 -47.422 -49.363 -50.969 -52.505 -53.761 -54.857 -55.886 -56.831 -57.666 -58.41 -59.182 -59.843 -60.389 -60.955 -61.533 -62.0 -62.493 -62.994 -63.364 -63.736 -64.125 -64.532 -64.934 -65.199 -65.475 -65.91 -66.204 -66.494 -66.647 -66.959 -67.27 -67.591 -67.763 -68.231 -68.295 -68.485 -68.682 -69.085 -69.305 -69.542 -69.784 -70.054 -70.361 -70.74 -72.655 -10 ,31925 ,TETRA ,17524989,Wed Nov 24 23:41:22 CET,Thu Nov 25 01:59:01 CET,0.0 0.67 0.804 0.931 1.076 1.225 1.348 1.428 1.527 1.579 1.634 1.521 1.782 1.815 1.872 1.922 1.968 1.99 2.029 2.044 2.063 2.075 2.069 2.05 2.028 2.002 1.974 1.95 1.897 1.819 1.724 1.621 1.516 1.389 1.225 0.987 0.72 0.431 0.104 -0.307 -0.791 -1.379 -2.126 -2.96 -4.031 -5.365 -7.128 -9.397 -12.426 -16.652 -23.02 -29.693 -34.627 -38.58 -41.755 -44.399 -46.617 -48.544 -50.123 -51.647 -52.942 -54.057 -55.08 -56.018 -56.878 -57.649 -58.418 -59.099 -59.683 -60.283 -60.893 -61.369 -61.846 -62.322 -62.679 -63.063 -63.468 -63.882 -64.301 -64.589 -64.879 -65.323 -65.635 -65.953 -66.117 -66.458 -66.813 -67.153 -67.322 -67.807 -67.911 -68.106 -68.3 -68.722 -68.944 -69.158 -69.382 -69.647 -69.948 -70.333 -71.368 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt deleted file mode 100644 index de1cb6e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,391 ,TETRA ,17524991,Wed Nov 24 23:41:22 CET,Thu Nov 25 02:01:52 CET,0.0 0.599 0.916 1.096 1.262 1.402 1.513 1.615 1.78 1.851 1.907 1.789 2.042 2.066 2.113 2.164 2.189 2.194 2.207 2.208 2.203 2.197 2.18 2.144 2.102 2.047 1.995 1.929 1.824 1.721 1.61 1.45 1.27 1.104 0.903 0.628 0.335 -0.012 -0.423 -0.891 -1.438 -2.128 -3.013 -4.005 -5.232 -6.711 -8.671 -11.246 -14.765 -19.775 -27.361 -35.417 -41.406 -46.043 -49.787 -52.954 -55.547 -57.802 -59.705 -61.535 -63.051 -64.346 -65.521 -66.585 -67.544 -68.394 -69.25 -70.012 -70.656 -71.295 -71.956 -72.515 -73.085 -73.666 -74.123 -74.587 -75.05 -75.524 -76.007 -76.338 -76.675 -77.184 -77.529 -77.888 -78.078 -78.451 -78.841 -79.253 -79.465 -79.986 -80.101 -80.302 -80.522 -81.032 -81.298 -81.581 -81.873 -82.173 -82.504 -82.896 -83.818 -2 ,32636 ,TETRA ,17524992,Wed Nov 24 23:41:22 CET,Thu Nov 25 01:59:34 CET,0.0 0.934 1.249 1.434 1.58 1.694 1.794 1.889 2.014 2.088 2.147 1.985 2.226 2.26 2.295 2.31 2.306 2.305 2.316 2.314 2.288 2.268 2.244 2.214 2.167 2.111 2.058 1.989 1.899 1.803 1.69 1.533 1.367 1.21 1.018 0.753 0.445 0.066 -0.367 -0.859 -1.434 -2.163 -3.069 -4.048 -5.311 -6.808 -8.722 -11.235 -14.714 -19.585 -26.801 -34.424 -40.063 -44.478 -48.02 -50.997 -53.49 -55.667 -57.453 -59.182 -60.611 -61.826 -62.957 -63.999 -64.943 -65.779 -66.645 -67.418 -68.074 -68.732 -69.4 -69.965 -70.556 -71.143 -71.582 -72.027 -72.485 -72.953 -73.418 -73.733 -74.065 -74.587 -74.929 -75.27 -75.441 -75.802 -76.182 -76.574 -76.785 -77.308 -77.454 -77.68 -77.903 -78.37 -78.608 -78.838 -79.099 -79.39 -79.707 -80.069 -81.239 -3 ,3818 ,TETRA ,17524995,Wed Nov 24 23:42:25 CET,Thu Nov 25 02:01:05 CET,0.0 0.524 0.687 0.841 0.945 1.05 1.127 1.173 1.268 1.325 1.371 1.215 1.465 1.496 1.538 1.57 1.587 1.59 1.601 1.606 1.612 1.609 1.601 1.582 1.543 1.484 1.431 1.371 1.278 1.17 1.05 0.903 0.752 0.604 0.397 0.128 -0.156 -0.498 -0.884 -1.338 -1.888 -2.583 -3.459 -4.407 -5.621 -7.143 -9.085 -11.559 -14.958 -19.812 -27.234 -35.097 -40.944 -45.512 -49.177 -52.265 -54.833 -57.061 -58.905 -60.662 -62.102 -63.344 -64.48 -65.509 -66.451 -67.299 -68.176 -68.951 -69.618 -70.283 -70.968 -71.537 -72.098 -72.669 -73.107 -73.559 -74.018 -74.493 -74.985 -75.304 -75.622 -76.109 -76.437 -76.773 -76.95 -77.306 -77.66 -78.019 -78.217 -78.72 -78.824 -79.028 -79.251 -79.725 -79.959 -80.199 -80.475 -80.803 -81.182 -81.616 -82.476 -4 ,13755 ,TETRA ,17524997,Wed Nov 24 23:42:25 CET,Thu Nov 25 02:01:27 CET,0.0 0.881 1.113 1.312 1.487 1.607 1.704 1.795 1.927 1.983 2.037 1.888 2.14 2.174 2.212 2.243 2.268 2.281 2.306 2.331 2.325 2.297 2.282 2.268 2.243 2.202 2.15 2.087 1.989 1.891 1.792 1.667 1.525 1.36 1.149 0.883 0.592 0.221 -0.231 -0.739 -1.292 -1.975 -2.881 -3.865 -5.083 -6.613 -8.628 -11.138 -14.534 -19.446 -26.784 -34.606 -40.487 -45.081 -48.795 -51.879 -54.41 -56.619 -58.447 -60.178 -61.598 -62.854 -64.046 -65.119 -66.088 -66.958 -67.844 -68.614 -69.258 -69.909 -70.569 -71.114 -71.683 -72.265 -72.713 -73.163 -73.617 -74.091 -74.574 -74.902 -75.233 -75.736 -76.078 -76.421 -76.603 -76.974 -77.365 -77.775 -77.982 -78.5 -78.635 -78.859 -79.099 -79.592 -79.837 -80.079 -80.34 -80.646 -81.048 -81.482 -82.398 -5 ,18541 ,TETRA ,17524999,Wed Nov 24 23:43:22 CET,Thu Nov 25 02:02:18 CET,0.0 0.608 0.908 1.1 1.245 1.367 1.477 1.568 1.7 1.747 1.793 1.652 1.9 1.928 1.99 2.041 2.079 2.088 2.088 2.091 2.079 2.062 2.05 2.039 2.002 1.943 1.887 1.826 1.723 1.606 1.491 1.347 1.196 1.029 0.798 0.506 0.212 -0.123 -0.511 -1.003 -1.596 -2.308 -3.203 -4.193 -5.456 -6.982 -8.948 -11.482 -14.942 -19.908 -27.499 -35.569 -41.575 -46.199 -49.939 -53.099 -55.69 -57.941 -59.812 -61.614 -63.113 -64.384 -65.57 -66.683 -67.69 -68.574 -69.479 -70.282 -70.951 -71.628 -72.331 -72.897 -73.47 -74.054 -74.495 -74.951 -75.423 -75.891 -76.369 -76.707 -77.05 -77.58 -77.941 -78.311 -78.5 -78.889 -79.294 -79.692 -79.884 -80.379 -80.523 -80.76 -80.995 -81.502 -81.773 -82.037 -82.303 -82.618 -82.979 -83.383 -84.252 -6 ,26683 ,TETRA ,17525001,Wed Nov 24 23:43:22 CET,Thu Nov 25 02:04:07 CET,0.0 0.674 0.964 1.168 1.276 1.351 1.417 1.473 1.591 1.651 1.689 1.534 1.781 1.793 1.819 1.847 1.873 1.883 1.885 1.888 1.888 1.876 1.86 1.825 1.789 1.746 1.691 1.64 1.557 1.441 1.307 1.143 0.983 0.811 0.587 0.308 0.021 -0.313 -0.703 -1.158 -1.691 -2.343 -3.18 -4.14 -5.415 -6.948 -8.906 -11.485 -14.939 -19.727 -27.0 -34.686 -40.333 -44.755 -48.361 -51.473 -54.057 -56.283 -58.144 -59.88 -61.308 -62.547 -63.7 -64.773 -65.742 -66.632 -67.561 -68.358 -69.024 -69.702 -70.371 -70.906 -71.458 -72.029 -72.462 -72.901 -73.35 -73.815 -74.304 -74.633 -74.968 -75.482 -75.828 -76.17 -76.345 -76.706 -77.062 -77.441 -77.636 -78.131 -78.242 -78.45 -78.663 -79.106 -79.345 -79.606 -79.892 -80.198 -80.531 -80.965 -82.057 -7 ,25095 ,TETRA ,17525003,Wed Nov 24 23:43:22 CET,Thu Nov 25 02:05:13 CET,0.0 0.715 0.925 1.14 1.325 1.461 1.57 1.661 1.824 1.884 1.927 1.808 2.066 2.097 2.158 2.195 2.219 2.23 2.235 2.23 2.204 2.18 2.153 2.106 2.065 2.016 1.947 1.874 1.768 1.666 1.556 1.404 1.26 1.1 0.902 0.671 0.422 0.103 -0.285 -0.748 -1.281 -1.919 -2.774 -3.747 -5.001 -6.558 -8.587 -11.237 -14.827 -19.901 -27.665 -35.82 -41.862 -46.633 -50.46 -53.671 -56.315 -58.587 -60.459 -62.254 -63.755 -65.037 -66.218 -67.32 -68.312 -69.2 -70.115 -70.903 -71.565 -72.252 -72.958 -73.525 -74.107 -74.695 -75.132 -75.569 -76.02 -76.487 -76.97 -77.306 -77.637 -78.139 -78.481 -78.833 -79.016 -79.378 -79.745 -80.128 -80.326 -80.822 -80.945 -81.175 -81.406 -81.903 -82.167 -82.454 -82.773 -83.09 -83.456 -83.878 -84.76 -8 ,29398 ,TETRA ,17525006,Wed Nov 24 23:44:22 CET,Thu Nov 25 02:06:03 CET,0.0 0.499 0.708 0.841 0.956 1.057 1.125 1.207 1.354 1.415 1.468 1.312 1.558 1.581 1.612 1.625 1.638 1.64 1.64 1.635 1.599 1.563 1.529 1.483 1.424 1.364 1.305 1.242 1.136 1.011 0.877 0.707 0.541 0.358 0.114 -0.181 -0.487 -0.854 -1.294 -1.81 -2.383 -3.08 -3.971 -4.94 -6.138 -7.62 -9.636 -12.24 -15.714 -20.596 -28.053 -35.997 -41.831 -46.419 -50.096 -53.16 -55.708 -57.901 -59.696 -61.438 -62.888 -64.124 -65.281 -66.331 -67.282 -68.121 -68.964 -69.701 -70.33 -70.988 -71.653 -72.188 -72.745 -73.315 -73.758 -74.214 -74.671 -75.115 -75.572 -75.888 -76.2 -76.699 -77.058 -77.422 -77.599 -77.967 -78.369 -78.783 -78.995 -79.507 -79.643 -79.863 -80.092 -80.584 -80.853 -81.152 -81.468 -81.804 -82.159 -82.533 -83.702 -9 ,30490 ,TETRA ,17525008,Wed Nov 24 23:44:25 CET,Thu Nov 25 02:04:26 CET,0.0 0.666 0.885 1.018 1.118 1.217 1.317 1.382 1.434 1.45 1.465 1.29 1.52 1.534 1.556 1.573 1.579 1.573 1.559 1.552 1.526 1.488 1.448 1.395 1.336 1.277 1.223 1.154 1.036 0.902 0.759 0.573 0.381 0.191 -0.039 -0.311 -0.58 -0.901 -1.298 -1.791 -2.364 -3.07 -3.984 -4.983 -6.277 -7.901 -9.992 -12.63 -16.159 -21.099 -28.523 -36.301 -42.098 -46.7 -50.405 -53.484 -55.99 -58.121 -59.868 -61.555 -62.971 -64.213 -65.387 -66.465 -67.408 -68.223 -69.076 -69.843 -70.485 -71.131 -71.787 -72.313 -72.843 -73.398 -73.835 -74.291 -74.778 -75.272 -75.772 -76.102 -76.423 -76.932 -77.283 -77.63 -77.809 -78.169 -78.523 -78.912 -79.114 -79.598 -79.685 -79.901 -80.129 -80.56 -80.772 -81.016 -81.282 -81.577 -81.903 -82.284 -83.175 -10 ,32692 ,TETRA ,17525009,Wed Nov 24 23:44:27 CET,Thu Nov 25 02:03:20 CET,0.0 0.539 0.787 0.968 1.131 1.256 1.353 1.442 1.566 1.613 1.645 1.463 1.713 1.753 1.81 1.855 1.886 1.894 1.913 1.917 1.901 1.89 1.882 1.86 1.818 1.77 1.726 1.67 1.558 1.436 1.313 1.173 1.017 0.843 0.623 0.34 0.046 -0.326 -0.733 -1.181 -1.733 -2.436 -3.328 -4.298 -5.542 -7.115 -9.167 -11.804 -15.328 -20.206 -27.545 -35.309 -41.099 -45.682 -49.367 -52.461 -55.0 -57.181 -58.999 -60.741 -62.191 -63.47 -64.672 -65.77 -66.757 -67.629 -68.518 -69.306 -69.993 -70.689 -71.385 -71.946 -72.515 -73.118 -73.596 -74.07 -74.544 -75.016 -75.488 -75.809 -76.14 -76.668 -77.035 -77.409 -77.594 -77.97 -78.353 -78.747 -78.957 -79.487 -79.642 -79.865 -80.09 -80.594 -80.882 -81.176 -81.507 -81.898 -82.356 -82.903 -84.308 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt deleted file mode 100644 index 942b6ef1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9932 ,TETRA ,17525015,Wed Nov 24 23:45:24 CET,Thu Nov 25 02:04:50 CET,0.0 0.385 0.615 0.83 1.018 1.195 1.341 1.474 1.758 1.893 2.009 2.017 2.354 2.471 2.68 2.872 3.045 3.122 3.279 3.446 3.667 3.804 3.94 4.127 4.324 4.522 4.711 4.89 5.104 5.306 5.498 5.732 5.953 6.154 6.4 6.674 6.915 7.176 7.464 7.764 8.083 8.432 8.802 9.159 9.553 9.956 10.391 10.829 11.227 11.561 11.703 11.453 10.985 10.453 9.808 9.07 8.432 7.896 7.419 6.89 6.44 6.041 5.645 5.274 4.93 4.615 4.281 3.999 3.751 3.478 3.202 2.969 2.713 2.456 2.27 2.068 1.848 1.615 1.377 1.221 1.07 0.819 0.63 0.432 0.325 0.105 -0.11 -0.33 -0.446 -0.803 -0.841 -0.96 -1.097 -1.413 -1.58 -1.747 -1.939 -2.178 -2.494 -2.835 -3.482 -2 ,30423 ,TETRA ,17525016,Wed Nov 24 23:45:25 CET,Thu Nov 25 02:07:53 CET,0.0 0.673 0.96 1.154 1.335 1.508 1.687 1.855 2.145 2.276 2.397 2.418 2.744 2.849 3.063 3.266 3.454 3.539 3.698 3.842 4.038 4.173 4.311 4.505 4.694 4.872 5.054 5.24 5.463 5.662 5.856 6.1 6.336 6.553 6.797 7.069 7.333 7.636 7.957 8.301 8.647 8.996 9.35 9.667 10.074 10.567 11.11 11.598 11.958 12.161 12.2 11.745 10.953 10.078 9.219 8.451 7.791 7.179 6.625 6.058 5.551 5.089 4.646 4.228 3.839 3.484 3.106 2.741 2.439 2.147 1.837 1.583 1.319 1.038 0.812 0.59 0.364 0.115 -0.141 -0.319 -0.498 -0.79 -1.006 -1.221 -1.328 -1.555 -1.784 -2.01 -2.131 -2.485 -2.565 -2.714 -2.865 -3.205 -3.395 -3.591 -3.789 -4.04 -4.352 -4.702 -5.782 -3 ,5459 ,TETRA ,17525017,Wed Nov 24 23:45:24 CET,Thu Nov 25 02:04:27 CET,0.0 0.409 0.706 0.929 1.128 1.315 1.466 1.596 1.825 1.944 2.072 2.077 2.395 2.487 2.663 2.848 3.008 3.079 3.216 3.358 3.572 3.702 3.824 3.992 4.154 4.309 4.457 4.599 4.776 4.948 5.124 5.331 5.519 5.707 5.925 6.158 6.401 6.675 6.943 7.204 7.479 7.809 8.215 8.636 9.098 9.524 9.971 10.45 10.908 11.299 11.359 10.837 10.238 9.668 9.136 8.609 8.07 7.568 7.113 6.619 6.179 5.769 5.337 4.929 4.576 4.254 3.901 3.59 3.308 2.996 2.673 2.395 2.105 1.836 1.633 1.41 1.188 0.955 0.715 0.553 0.389 0.141 -0.036 -0.228 -0.333 -0.56 -0.776 -1.0 -1.124 -1.473 -1.517 -1.65 -1.789 -2.112 -2.285 -2.444 -2.626 -2.83 -3.069 -3.402 -4.115 -4 ,12861 ,TETRA ,17525019,Wed Nov 24 23:45:24 CET,Thu Nov 25 02:04:02 CET,0.0 0.36 0.616 0.861 1.088 1.267 1.419 1.563 1.858 1.985 2.097 2.081 2.395 2.496 2.698 2.885 3.059 3.142 3.315 3.473 3.664 3.792 3.923 4.104 4.28 4.458 4.62 4.778 4.979 5.165 5.348 5.567 5.784 5.993 6.248 6.542 6.816 7.108 7.398 7.701 7.998 8.307 8.675 9.032 9.445 9.89 10.333 10.68 10.942 11.094 10.92 10.303 9.561 8.744 8.003 7.395 6.876 6.406 5.944 5.422 4.975 4.593 4.241 3.899 3.57 3.253 2.876 2.539 2.263 1.98 1.661 1.376 1.098 0.84 0.641 0.425 0.211 -0.01 -0.239 -0.389 -0.546 -0.814 -0.998 -1.186 -1.289 -1.513 -1.751 -1.99 -2.108 -2.454 -2.478 -2.601 -2.74 -3.039 -3.187 -3.372 -3.599 -3.848 -4.114 -4.481 -5.772 -5 ,23905 ,TETRA ,17525020,Wed Nov 24 23:45:25 CET,Thu Nov 25 02:03:56 CET,0.0 0.399 0.593 0.764 0.931 1.101 1.275 1.452 1.758 1.881 1.994 1.978 2.29 2.388 2.563 2.723 2.874 2.949 3.113 3.277 3.505 3.65 3.785 3.978 4.154 4.323 4.488 4.64 4.835 5.037 5.215 5.439 5.698 5.926 6.187 6.482 6.742 7.034 7.348 7.666 7.992 8.358 8.778 9.189 9.626 10.059 10.512 10.955 11.401 11.794 11.909 11.503 10.913 10.269 9.633 9.03 8.485 7.99 7.533 7.06 6.639 6.245 5.865 5.487 5.124 4.809 4.483 4.178 3.917 3.655 3.38 3.145 2.898 2.643 2.435 2.22 2.009 1.792 1.558 1.397 1.237 0.949 0.742 0.559 0.465 0.265 0.048 -0.202 -0.339 -0.706 -0.738 -0.876 -1.041 -1.396 -1.586 -1.775 -1.965 -2.178 -2.42 -2.745 -3.621 -6 ,14260 ,TETRA ,17525022,Wed Nov 24 23:46:24 CET,Thu Nov 25 02:05:13 CET,0.0 0.5 0.776 1.02 1.207 1.4 1.584 1.723 1.96 2.059 2.154 2.124 2.446 2.549 2.734 2.896 3.057 3.136 3.282 3.413 3.612 3.76 3.9 4.087 4.266 4.442 4.631 4.814 5.027 5.229 5.438 5.683 5.893 6.106 6.356 6.617 6.857 7.102 7.357 7.639 7.93 8.239 8.627 9.017 9.416 9.831 10.286 10.766 11.297 11.798 12.049 11.862 11.468 10.943 10.311 9.728 9.182 8.63 8.156 7.627 7.109 6.647 6.205 5.777 5.373 5.013 4.624 4.263 3.98 3.701 3.404 3.152 2.887 2.6 2.387 2.179 1.957 1.721 1.475 1.304 1.125 0.859 0.672 0.46 0.349 0.129 -0.099 -0.346 -0.477 -0.842 -0.913 -1.062 -1.201 -1.502 -1.677 -1.865 -2.085 -2.331 -2.592 -2.889 -3.574 -7 ,17902 ,TETRA ,17525023,Wed Nov 24 23:46:24 CET,Thu Nov 25 02:04:27 CET,0.0 0.502 0.777 0.96 1.145 1.308 1.45 1.58 1.822 1.945 2.061 2.063 2.391 2.489 2.661 2.814 2.973 3.054 3.214 3.361 3.571 3.704 3.837 4.044 4.222 4.392 4.574 4.751 4.967 5.17 5.368 5.591 5.792 5.998 6.242 6.49 6.732 7.004 7.27 7.525 7.793 8.112 8.482 8.824 9.23 9.674 10.108 10.56 10.974 11.413 11.578 11.088 10.501 9.862 9.252 8.671 8.091 7.505 6.965 6.457 6.019 5.61 5.245 4.866 4.493 4.188 3.866 3.555 3.265 2.947 2.628 2.374 2.101 1.807 1.574 1.332 1.094 0.843 0.579 0.403 0.223 -0.064 -0.268 -0.48 -0.591 -0.828 -1.079 -1.332 -1.467 -1.836 -1.898 -2.046 -2.204 -2.531 -2.694 -2.866 -3.074 -3.303 -3.601 -3.956 -4.72 -8 ,25326 ,TETRA ,17525025,Wed Nov 24 23:46:25 CET,Thu Nov 25 02:04:33 CET,0.0 0.712 1.122 1.401 1.577 1.745 1.913 2.074 2.389 2.512 2.625 2.623 2.951 3.051 3.252 3.444 3.619 3.703 3.853 3.994 4.204 4.346 4.49 4.733 4.977 5.174 5.354 5.54 5.789 6.031 6.268 6.551 6.801 7.034 7.289 7.558 7.813 8.081 8.404 8.757 9.09 9.452 9.856 10.246 10.686 11.147 11.647 12.143 12.595 12.969 13.115 12.796 12.311 11.806 11.306 10.739 10.173 9.675 9.225 8.741 8.349 7.989 7.622 7.268 6.923 6.606 6.254 5.933 5.67 5.398 5.12 4.875 4.621 4.36 4.15 3.942 3.732 3.517 3.289 3.127 2.963 2.727 2.555 2.376 2.289 2.095 1.896 1.685 1.576 1.242 1.197 1.064 0.924 0.63 0.464 0.273 0.09 -0.114 -0.372 -0.716 -1.578 -9 ,30147 ,TETRA ,17525026,Wed Nov 24 23:46:25 CET,Thu Nov 25 02:05:18 CET,0.0 0.652 0.99 1.274 1.474 1.622 1.781 1.94 2.232 2.345 2.454 2.464 2.794 2.913 3.122 3.297 3.462 3.542 3.696 3.842 4.051 4.186 4.32 4.518 4.709 4.893 5.056 5.219 5.446 5.667 5.873 6.13 6.373 6.588 6.84 7.107 7.359 7.64 7.935 8.252 8.573 8.92 9.32 9.729 10.179 10.616 11.076 11.53 11.922 12.187 12.132 11.581 10.942 10.267 9.6 8.899 8.227 7.605 7.008 6.4 5.887 5.428 4.996 4.573 4.164 3.804 3.444 3.108 2.808 2.509 2.204 1.948 1.685 1.409 1.195 0.956 0.688 0.418 0.146 -0.025 -0.185 -0.446 -0.639 -0.846 -0.954 -1.166 -1.395 -1.647 -1.777 -2.135 -2.206 -2.364 -2.515 -2.838 -3.023 -3.219 -3.425 -3.65 -3.967 -4.358 -5.303 -10 ,7719 ,TETRA ,17525029,Wed Nov 24 23:46:25 CET,Thu Nov 25 02:05:24 CET,0.0 0.751 1.048 1.249 1.414 1.579 1.748 1.909 2.206 2.332 2.448 2.464 2.8 2.906 3.105 3.299 3.48 3.566 3.736 3.888 4.09 4.239 4.396 4.613 4.807 4.998 5.193 5.374 5.61 5.829 6.022 6.259 6.494 6.721 6.973 7.226 7.471 7.738 8.007 8.311 8.644 8.996 9.358 9.693 10.076 10.462 10.866 11.251 11.595 11.774 11.549 10.89 10.069 9.265 8.544 7.847 7.191 6.586 6.089 5.6 5.174 4.802 4.418 4.026 3.669 3.326 2.963 2.666 2.418 2.155 1.885 1.669 1.422 1.139 0.916 0.694 0.471 0.235 -0.007 -0.173 -0.37 -0.655 -0.821 -1.01 -1.113 -1.332 -1.564 -1.825 -1.966 -2.329 -2.364 -2.507 -2.671 -2.996 -3.164 -3.351 -3.565 -3.779 -3.987 -4.218 -4.888 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index 28c6832e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2619 ,TETRA ,17525031,Wed Nov 24 23:46:26 CET,Thu Nov 25 02:05:29 CET,0.0 0.7 1.015 1.28 1.508 1.691 1.871 2.055 2.378 2.528 2.671 2.729 3.083 3.217 3.464 3.707 3.951 4.066 4.289 4.517 4.838 5.034 5.223 5.507 5.776 6.03 6.287 6.531 6.844 7.139 7.432 7.81 8.169 8.513 8.928 9.387 9.814 10.25 10.693 11.18 11.698 12.267 12.951 13.646 14.391 15.191 16.173 17.37 18.754 20.224 21.726 22.744 23.15 23.234 23.157 22.998 22.77 22.491 22.23 21.984 21.772 21.563 21.356 21.151 20.938 20.717 20.452 20.218 20.018 19.809 19.603 19.419 19.217 19.016 18.86 18.681 18.491 18.297 18.102 17.972 17.833 17.6 17.427 17.256 17.176 17.006 16.805 16.581 16.462 16.137 16.132 16.02 15.886 15.562 15.357 15.142 14.941 14.702 14.42 14.126 13.33 -2 ,14575 ,TETRA ,17525034,Wed Nov 24 23:47:26 CET,Thu Nov 25 02:06:52 CET,0.0 0.633 0.909 1.168 1.395 1.602 1.79 1.966 2.289 2.445 2.596 2.656 3.006 3.136 3.371 3.597 3.844 3.957 4.157 4.36 4.66 4.865 5.072 5.358 5.62 5.871 6.121 6.356 6.653 6.931 7.202 7.541 7.879 8.203 8.594 9.025 9.421 9.889 10.403 10.935 11.493 12.108 12.813 13.503 14.286 15.155 16.186 17.353 18.656 20.189 21.775 22.693 22.947 22.93 22.863 22.719 22.491 22.224 21.983 21.74 21.49 21.242 21.006 20.728 20.456 20.213 19.937 19.692 19.47 19.259 19.036 18.814 18.603 18.378 18.208 18.037 17.843 17.641 17.422 17.273 17.105 16.843 16.673 16.498 16.415 16.243 16.053 15.853 15.743 15.432 15.414 15.285 15.147 14.869 14.723 14.536 14.341 14.16 13.929 13.595 13.044 -3 ,1974 ,TETRA ,17525036,Wed Nov 24 23:47:23 CET,Thu Nov 25 02:06:48 CET,0.0 0.505 0.754 0.954 1.128 1.29 1.452 1.614 1.912 2.048 2.164 2.18 2.512 2.621 2.84 3.045 3.236 3.331 3.522 3.707 3.978 4.154 4.317 4.548 4.771 4.996 5.215 5.433 5.719 5.989 6.257 6.577 6.881 7.183 7.541 7.945 8.318 8.722 9.17 9.666 10.195 10.792 11.493 12.183 12.978 13.864 14.911 16.105 17.398 18.747 20.147 20.99 21.319 21.363 21.219 21.041 20.828 20.557 20.319 20.05 19.779 19.512 19.25 19.013 18.745 18.477 18.223 18.021 17.86 17.686 17.489 17.313 17.126 16.935 16.788 16.632 16.458 16.281 16.081 15.936 15.806 15.621 15.482 15.329 15.24 15.038 14.827 14.635 14.544 14.239 14.257 14.155 14.033 13.731 13.572 13.404 13.216 13.034 12.826 12.568 12.071 -4 ,8771 ,TETRA ,17525041,Wed Nov 24 23:51:13 CET,Thu Nov 25 02:11:18 CET,0.0 0.717 1.027 1.277 1.488 1.696 1.887 2.049 2.366 2.526 2.679 2.733 3.083 3.216 3.454 3.679 3.908 4.017 4.219 4.427 4.733 4.932 5.123 5.39 5.66 5.925 6.172 6.409 6.716 7.007 7.281 7.611 7.938 8.249 8.605 9.033 9.442 9.873 10.365 10.895 11.416 11.984 12.656 13.324 14.071 14.889 15.839 16.931 18.17 19.518 21.041 21.933 22.187 22.292 22.253 22.063 21.86 21.674 21.488 21.243 21.011 20.786 20.556 20.33 20.08 19.852 19.642 19.465 19.313 19.142 18.943 18.776 18.606 18.421 18.283 18.14 17.995 17.853 17.687 17.569 17.451 17.259 17.123 16.974 16.896 16.74 16.561 16.356 16.25 15.941 15.926 15.808 15.672 15.369 15.219 15.065 14.884 14.661 14.405 14.123 13.241 -5 ,28154 ,TETRA ,17525043,Wed Nov 24 23:51:13 CET,Thu Nov 25 02:16:07 CET,0.0 0.685 0.97 1.229 1.464 1.674 1.86 2.018 2.328 2.469 2.6 2.633 2.972 3.092 3.316 3.536 3.749 3.855 4.071 4.28 4.575 4.776 4.97 5.226 5.466 5.704 5.939 6.161 6.455 6.746 7.007 7.304 7.594 7.887 8.236 8.633 9.019 9.44 9.895 10.395 10.913 11.472 12.102 12.735 13.521 14.417 15.373 16.41 17.652 18.944 20.256 21.1 21.374 21.343 21.208 21.036 20.833 20.593 20.36 20.071 19.773 19.497 19.201 18.88 18.573 18.342 18.118 17.906 17.716 17.511 17.293 17.112 16.921 16.705 16.545 16.386 16.223 16.052 15.867 15.738 15.584 15.338 15.174 14.99 14.903 14.729 14.527 14.312 14.206 13.884 13.829 13.693 13.559 13.279 13.098 12.881 12.633 12.383 12.091 11.724 10.599 -6 ,9078 ,TETRA ,17525044,Wed Nov 24 23:51:13 CET,Thu Nov 25 02:11:31 CET,0.0 0.646 0.93 1.176 1.372 1.55 1.721 1.863 2.152 2.302 2.438 2.463 2.81 2.935 3.171 3.393 3.599 3.699 3.894 4.094 4.411 4.62 4.816 5.089 5.364 5.632 5.877 6.111 6.42 6.729 7.029 7.381 7.728 8.06 8.415 8.811 9.18 9.57 10.009 10.488 10.991 11.559 12.22 12.888 13.652 14.486 15.421 16.404 17.532 18.832 20.189 20.874 21.087 21.158 21.115 21.0 20.801 20.538 20.291 20.032 19.768 19.494 19.209 18.932 18.676 18.442 18.197 17.973 17.794 17.613 17.399 17.209 17.013 16.817 16.65 16.461 16.27 16.075 15.886 15.75 15.599 15.362 15.209 15.059 14.974 14.806 14.642 14.443 14.327 14.013 13.985 13.872 13.741 13.447 13.319 13.188 13.032 12.858 12.652 12.394 11.77 -7 ,26169 ,TETRA ,17525045,Wed Nov 24 23:51:13 CET,Thu Nov 25 02:10:36 CET,0.0 0.574 0.835 1.037 1.227 1.418 1.601 1.767 2.058 2.192 2.323 2.367 2.704 2.82 3.05 3.284 3.526 3.638 3.838 4.029 4.306 4.491 4.686 4.966 5.212 5.449 5.683 5.92 6.231 6.524 6.799 7.126 7.443 7.759 8.129 8.526 8.901 9.312 9.745 10.216 10.723 11.281 11.94 12.59 13.326 14.155 15.096 16.148 17.359 18.737 20.288 21.291 21.688 21.818 21.757 21.583 21.376 21.183 20.992 20.716 20.425 20.165 19.932 19.681 19.412 19.157 18.89 18.648 18.428 18.195 17.958 17.763 17.55 17.327 17.159 16.993 16.829 16.657 16.472 16.347 16.224 16.028 15.888 15.734 15.647 15.464 15.251 15.031 14.93 14.615 14.597 14.472 14.339 14.042 13.874 13.698 13.512 13.313 13.093 12.801 11.848 -8 ,17922 ,TETRA ,17525047,Wed Nov 24 23:51:14 CET,Thu Nov 25 02:10:58 CET,0.0 0.675 0.928 1.159 1.389 1.589 1.764 1.936 2.274 2.436 2.588 2.663 3.015 3.149 3.413 3.648 3.869 3.981 4.2 4.406 4.698 4.877 5.059 5.336 5.612 5.876 6.13 6.377 6.697 7.004 7.288 7.64 7.987 8.308 8.683 9.096 9.456 9.859 10.305 10.785 11.296 11.843 12.444 13.038 13.732 14.517 15.409 16.407 17.602 18.893 20.262 21.278 21.621 21.695 21.652 21.511 21.344 21.155 20.922 20.658 20.444 20.233 20.016 19.783 19.534 19.317 19.104 18.907 18.733 18.556 18.347 18.16 17.974 17.784 17.629 17.454 17.277 17.111 16.93 16.788 16.651 16.44 16.281 16.116 16.023 15.825 15.643 15.451 15.335 15.009 14.947 14.81 14.686 14.358 14.154 13.945 13.744 13.536 13.239 12.854 11.414 -9 ,2781 ,TETRA ,17525050,Wed Nov 24 23:51:14 CET,Thu Nov 25 02:11:07 CET,0.0 0.498 0.725 0.949 1.149 1.301 1.444 1.58 1.842 1.979 2.104 2.11 2.438 2.532 2.703 2.885 3.069 3.157 3.325 3.481 3.709 3.867 4.018 4.221 4.425 4.637 4.844 5.041 5.288 5.549 5.814 6.127 6.434 6.726 7.057 7.416 7.777 8.197 8.657 9.134 9.636 10.233 10.918 11.562 12.28 13.088 14.042 15.106 16.268 17.474 18.732 19.503 19.702 19.654 19.525 19.342 19.118 18.882 18.628 18.355 18.104 17.855 17.606 17.387 17.188 16.979 16.747 16.537 16.344 16.149 15.949 15.764 15.569 15.351 15.164 14.976 14.796 14.606 14.406 14.272 14.128 13.909 13.747 13.561 13.465 13.289 13.1 12.901 12.81 12.497 12.453 12.318 12.17 11.86 11.693 11.519 11.333 11.118 10.856 10.444 9.375 -10 ,24029 ,TETRA ,17525051,Wed Nov 24 23:51:15 CET,Thu Nov 25 02:16:38 CET,0.0 0.495 0.75 0.979 1.197 1.391 1.55 1.693 1.968 2.118 2.268 2.288 2.609 2.716 2.92 3.119 3.312 3.405 3.591 3.776 4.033 4.197 4.371 4.623 4.855 5.073 5.292 5.503 5.77 6.03 6.282 6.595 6.92 7.234 7.583 7.983 8.368 8.79 9.239 9.699 10.193 10.765 11.433 12.12 12.89 13.708 14.668 15.746 16.918 18.151 19.487 20.44 20.811 20.908 20.856 20.744 20.559 20.301 20.059 19.784 19.545 19.332 19.113 18.885 18.654 18.46 18.247 18.056 17.902 17.72 17.515 17.346 17.169 16.981 16.839 16.699 16.557 16.399 16.228 16.107 15.98 15.776 15.628 15.48 15.403 15.237 15.064 14.89 14.795 14.482 14.47 14.353 14.22 13.949 13.807 13.644 13.464 13.258 13.005 12.712 12.233 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt deleted file mode 100644 index 9930ee9c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29178 ,TETRA ,17525053,Wed Nov 24 23:51:15 CET,Thu Nov 25 02:15:20 CET,0.0 1.114 1.446 1.676 1.871 2.057 2.223 2.363 2.637 2.768 2.89 2.861 3.285 3.394 3.609 3.81 4.002 4.097 4.27 4.446 4.682 4.816 4.948 5.14 5.344 5.527 5.694 5.874 6.103 6.309 6.505 6.745 6.967 7.162 7.385 7.639 7.873 8.129 8.39 8.639 8.89 9.142 9.414 9.686 9.95 10.177 10.391 10.541 10.564 10.328 9.553 8.339 7.143 6.052 5.076 4.2 3.437 2.733 2.135 1.519 0.954 0.457 0.001 -0.428 -0.83 -1.181 -1.549 -1.907 -2.219 -2.553 -2.908 -3.188 -3.491 -3.799 -4.014 -4.239 -4.476 -4.73 -4.999 -5.165 -5.333 -5.6 -5.787 -5.991 -6.099 -6.315 -6.553 -6.81 -6.944 -7.379 -7.336 -7.48 -7.631 -7.942 -8.101 -8.291 -8.505 -8.757 -9.04 -9.379 -10.355 -2 ,27817 ,TETRA ,17525055,Wed Nov 24 23:51:16 CET,Thu Nov 25 02:12:08 CET,0.0 0.621 0.931 1.218 1.468 1.672 1.853 2.04 2.364 2.478 2.579 2.498 2.881 2.979 3.196 3.396 3.567 3.648 3.815 3.986 4.227 4.381 4.52 4.707 4.905 5.099 5.281 5.447 5.649 5.849 6.032 6.237 6.433 6.625 6.86 7.113 7.342 7.579 7.798 8.041 8.298 8.546 8.791 9.006 9.261 9.559 9.812 9.915 9.863 9.585 8.833 7.612 6.445 5.389 4.439 3.546 2.746 2.01 1.39 0.788 0.255 -0.221 -0.696 -1.169 -1.601 -1.978 -2.382 -2.755 -3.062 -3.376 -3.71 -3.993 -4.282 -4.578 -4.811 -5.067 -5.344 -5.636 -5.924 -6.099 -6.274 -6.574 -6.794 -7.022 -7.134 -7.356 -7.6 -7.883 -8.025 -8.457 -8.43 -8.567 -8.722 -9.076 -9.273 -9.499 -9.741 -9.986 -10.303 -10.702 -11.567 -3 ,22713 ,TETRA ,17525056,Wed Nov 24 23:51:16 CET,Thu Nov 25 02:09:03 CET,0.0 0.692 0.997 1.313 1.546 1.744 1.939 2.087 2.359 2.481 2.593 2.517 2.903 2.991 3.147 3.298 3.438 3.513 3.674 3.824 4.032 4.162 4.277 4.437 4.603 4.755 4.901 5.044 5.216 5.374 5.545 5.753 5.933 6.099 6.298 6.513 6.721 6.951 7.174 7.412 7.646 7.874 8.117 8.327 8.53 8.715 8.902 9.032 9.013 8.79 8.04 6.822 5.735 4.727 3.812 2.963 2.198 1.479 0.843 0.201 -0.352 -0.807 -1.23 -1.637 -2.009 -2.354 -2.736 -3.091 -3.396 -3.696 -4.007 -4.273 -4.534 -4.8 -5.019 -5.239 -5.446 -5.67 -5.914 -6.085 -6.261 -6.531 -6.73 -6.93 -7.028 -7.225 -7.423 -7.632 -7.746 -8.171 -8.121 -8.252 -8.393 -8.715 -8.894 -9.078 -9.281 -9.506 -9.753 -10.028 -10.659 -4 ,14731 ,TETRA ,17525057,Wed Nov 24 23:51:16 CET,Thu Nov 25 02:09:42 CET,0.0 0.794 1.077 1.294 1.481 1.632 1.772 1.902 2.138 2.256 2.374 2.319 2.714 2.816 3.013 3.207 3.39 3.476 3.647 3.807 4.03 4.188 4.338 4.53 4.708 4.884 5.067 5.232 5.416 5.592 5.762 5.968 6.189 6.383 6.569 6.785 7.01 7.243 7.461 7.724 8.018 8.312 8.631 8.916 9.191 9.441 9.706 9.904 9.97 9.835 9.169 8.034 6.954 5.966 5.047 4.222 3.504 2.845 2.266 1.697 1.219 0.788 0.366 -0.043 -0.414 -0.744 -1.103 -1.432 -1.726 -2.041 -2.36 -2.625 -2.904 -3.193 -3.407 -3.622 -3.842 -4.064 -4.295 -4.46 -4.636 -4.893 -5.076 -5.287 -5.394 -5.614 -5.845 -6.083 -6.199 -6.619 -6.597 -6.736 -6.882 -7.182 -7.33 -7.501 -7.696 -7.918 -8.186 -8.496 -9.13 -5 ,14320 ,TETRA ,17525058,Wed Nov 24 23:51:16 CET,Thu Nov 25 02:10:20 CET,0.0 0.468 0.797 1.071 1.298 1.475 1.607 1.731 1.95 2.06 2.181 2.117 2.496 2.588 2.775 2.966 3.14 3.215 3.37 3.514 3.71 3.832 3.94 4.086 4.224 4.371 4.522 4.66 4.822 4.97 5.119 5.297 5.46 5.619 5.79 5.992 6.206 6.432 6.675 6.919 7.13 7.361 7.617 7.823 8.03 8.217 8.387 8.564 8.606 8.286 7.539 6.411 5.319 4.257 3.281 2.408 1.606 0.863 0.218 -0.415 -0.94 -1.399 -1.829 -2.234 -2.61 -2.953 -3.316 -3.636 -3.923 -4.227 -4.539 -4.792 -5.04 -5.298 -5.494 -5.697 -5.917 -6.137 -6.366 -6.532 -6.697 -6.929 -7.089 -7.262 -7.348 -7.528 -7.714 -7.905 -8.009 -8.427 -8.372 -8.487 -8.609 -8.89 -9.057 -9.24 -9.437 -9.648 -9.879 -10.205 -11.1 -6 ,19901 ,TETRA ,17525060,Wed Nov 24 23:51:19 CET,Thu Nov 25 02:13:35 CET,0.0 0.867 1.186 1.43 1.65 1.812 1.958 2.104 2.403 2.535 2.652 2.574 2.962 3.05 3.232 3.405 3.562 3.646 3.803 3.944 4.162 4.291 4.399 4.554 4.72 4.881 5.021 5.162 5.352 5.516 5.672 5.871 6.061 6.255 6.48 6.717 6.924 7.15 7.382 7.622 7.887 8.16 8.456 8.697 8.908 9.083 9.24 9.301 9.174 8.821 7.904 6.47 5.124 3.924 2.939 2.041 1.226 0.524 -0.073 -0.694 -1.251 -1.74 -2.184 -2.598 -2.977 -3.321 -3.677 -4.002 -4.292 -4.586 -4.888 -5.135 -5.389 -5.648 -5.854 -6.077 -6.311 -6.54 -6.768 -6.927 -7.094 -7.364 -7.545 -7.734 -7.831 -8.026 -8.225 -8.441 -8.559 -8.983 -8.941 -9.085 -9.23 -9.528 -9.687 -9.855 -10.064 -10.296 -10.533 -10.799 -11.326 -7 ,6671 ,TETRA ,17525061,Wed Nov 24 23:51:21 CET,Thu Nov 25 02:08:18 CET,0.0 0.722 1.06 1.327 1.548 1.753 1.919 2.088 2.387 2.516 2.644 2.598 3.0 3.094 3.283 3.476 3.658 3.744 3.937 4.118 4.329 4.458 4.585 4.772 4.962 5.148 5.324 5.48 5.66 5.846 6.045 6.279 6.483 6.657 6.853 7.076 7.291 7.496 7.699 7.945 8.245 8.547 8.845 9.146 9.434 9.622 9.716 9.78 9.749 9.428 8.532 7.026 5.702 4.642 3.669 2.759 1.933 1.192 0.592 -0.001 -0.52 -0.981 -1.421 -1.829 -2.205 -2.567 -2.94 -3.248 -3.519 -3.797 -4.074 -4.312 -4.569 -4.839 -5.05 -5.269 -5.484 -5.696 -5.926 -6.088 -6.254 -6.512 -6.687 -6.889 -6.995 -7.203 -7.415 -7.628 -7.739 -8.148 -8.086 -8.217 -8.359 -8.659 -8.824 -8.991 -9.157 -9.336 -9.535 -9.791 -10.273 -8 ,14023 ,TETRA ,17525063,Wed Nov 24 23:51:19 CET,Thu Nov 25 02:11:14 CET,0.0 0.832 1.12 1.335 1.541 1.7 1.86 2.024 2.301 2.424 2.535 2.437 2.816 2.9 3.068 3.234 3.376 3.447 3.593 3.736 3.947 4.073 4.184 4.346 4.518 4.686 4.849 5.01 5.213 5.394 5.563 5.766 5.941 6.099 6.291 6.501 6.704 6.919 7.145 7.393 7.624 7.855 8.123 8.346 8.605 8.884 9.081 9.213 9.215 8.928 8.202 7.029 5.812 4.721 3.76 2.896 2.154 1.483 0.902 0.301 -0.236 -0.722 -1.169 -1.575 -1.943 -2.298 -2.667 -2.975 -3.255 -3.559 -3.869 -4.12 -4.368 -4.623 -4.827 -5.041 -5.273 -5.525 -5.768 -5.924 -6.101 -6.381 -6.578 -6.791 -6.901 -7.108 -7.312 -7.525 -7.637 -8.06 -8.051 -8.204 -8.365 -8.71 -8.897 -9.081 -9.283 -9.564 -9.872 -10.228 -11.385 -9 ,30652 ,TETRA ,17525066,Wed Nov 24 23:51:49 CET,Thu Nov 25 02:09:39 CET,0.0 0.395 0.61 0.834 1.038 1.211 1.359 1.497 1.734 1.838 1.95 1.887 2.272 2.366 2.541 2.694 2.865 2.95 3.1 3.241 3.432 3.552 3.671 3.847 4.01 4.167 4.32 4.474 4.661 4.832 5.0 5.199 5.383 5.567 5.795 6.036 6.267 6.52 6.754 6.964 7.164 7.38 7.626 7.845 8.105 8.365 8.579 8.693 8.662 8.445 7.769 6.679 5.582 4.593 3.757 2.953 2.22 1.565 1.008 0.437 -0.082 -0.565 -1.047 -1.495 -1.909 -2.283 -2.673 -3.036 -3.345 -3.683 -4.035 -4.317 -4.617 -4.895 -5.103 -5.324 -5.536 -5.738 -5.947 -6.102 -6.264 -6.532 -6.721 -6.92 -7.027 -7.247 -7.482 -7.741 -7.875 -8.297 -8.24 -8.383 -8.538 -8.888 -9.081 -9.279 -9.499 -9.728 -9.981 -10.306 -10.9 -10 ,4998 ,TETRA ,17525067,Wed Nov 24 23:51:50 CET,Thu Nov 25 02:15:37 CET,0.0 0.659 0.982 1.21 1.397 1.578 1.74 1.896 2.179 2.296 2.404 2.316 2.702 2.795 2.977 3.166 3.352 3.433 3.579 3.733 3.966 4.102 4.231 4.416 4.581 4.737 4.889 5.042 5.242 5.415 5.584 5.797 6.002 6.199 6.408 6.628 6.851 7.085 7.314 7.553 7.809 8.101 8.396 8.652 8.949 9.211 9.401 9.506 9.484 9.225 8.244 6.851 5.774 4.778 3.828 2.968 2.23 1.519 0.882 0.258 -0.281 -0.763 -1.216 -1.641 -2.054 -2.437 -2.828 -3.173 -3.474 -3.761 -4.048 -4.302 -4.576 -4.863 -5.08 -5.308 -5.541 -5.766 -5.995 -6.151 -6.311 -6.588 -6.791 -7.0 -7.108 -7.325 -7.57 -7.83 -7.96 -8.392 -8.365 -8.522 -8.685 -8.998 -9.172 -9.363 -9.568 -9.776 -9.984 -10.291 -11.004 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt deleted file mode 100644 index a1d4c6a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15186 ,TETRA ,17525069,Wed Nov 24 23:51:50 CET,Thu Nov 25 02:11:44 CET,0.0 0.778 1.234 1.55 1.846 2.13 2.387 2.633 3.081 3.298 3.509 3.593 4.082 4.272 4.636 5.0 5.353 5.517 5.841 6.153 6.617 6.921 7.223 7.678 8.121 8.57 9.007 9.427 9.975 10.504 11.005 11.621 12.245 12.862 13.579 14.405 15.214 16.115 17.122 18.226 19.407 20.741 22.345 24.033 26.037 28.306 31.075 34.384 38.468 43.699 50.784 57.391 61.763 64.883 67.205 69.059 70.481 71.631 72.535 73.313 73.888 74.374 74.818 75.213 75.54 75.798 76.042 76.225 76.375 76.509 76.629 76.734 76.828 76.91 76.969 77.018 77.036 77.05 77.078 77.085 77.094 77.105 77.098 77.087 77.08 77.059 77.013 76.94 76.896 76.623 76.771 76.719 76.671 76.551 76.486 76.421 76.34 76.231 76.079 75.845 75.155 -2 ,20763 ,TETRA ,17525070,Wed Nov 24 23:51:52 CET,Thu Nov 25 02:13:15 CET,0.0 0.753 1.158 1.529 1.861 2.149 2.419 2.649 3.067 3.268 3.46 3.537 4.031 4.212 4.548 4.869 5.18 5.336 5.647 5.95 6.396 6.691 6.984 7.411 7.823 8.218 8.599 8.984 9.502 10.002 10.483 11.077 11.678 12.276 12.977 13.785 14.576 15.467 16.45 17.508 18.652 19.973 21.545 23.166 25.168 27.505 30.295 33.639 37.836 43.198 50.285 56.759 61.005 64.089 66.431 68.255 69.664 70.79 71.658 72.442 73.055 73.556 73.961 74.32 74.637 74.884 75.128 75.325 75.475 75.612 75.731 75.821 75.907 75.989 76.039 76.074 76.109 76.141 76.158 76.167 76.171 76.162 76.169 76.174 76.17 76.156 76.144 76.132 76.108 75.844 76.022 75.987 75.953 75.871 75.798 75.729 75.649 75.561 75.426 75.23 74.77 -3 ,22509 ,TETRA ,17525071,Wed Nov 24 23:51:50 CET,Thu Nov 25 02:08:12 CET,0.0 0.725 1.166 1.487 1.762 2.003 2.24 2.494 2.963 3.17 3.383 3.487 3.98 4.181 4.568 4.942 5.286 5.45 5.79 6.133 6.639 6.968 7.293 7.772 8.24 8.703 9.135 9.539 10.066 10.571 11.074 11.71 12.347 12.967 13.696 14.523 15.303 16.168 17.136 18.191 19.329 20.655 22.273 23.97 26.025 28.385 31.195 34.525 38.675 43.943 50.988 57.507 61.923 65.186 67.595 69.454 70.879 72.021 72.92 73.757 74.406 74.935 75.402 75.795 76.13 76.41 76.68 76.896 77.07 77.245 77.416 77.545 77.643 77.719 77.784 77.847 77.899 77.948 77.989 78.011 78.029 78.039 78.037 78.027 78.021 78.014 78.0 77.969 77.943 77.685 77.881 77.854 77.816 77.723 77.675 77.618 77.521 77.433 77.336 77.195 76.519 -4 ,28714 ,TETRA ,17525072,Wed Nov 24 23:52:46 CET,Thu Nov 25 02:11:20 CET,0.0 0.702 1.062 1.362 1.655 1.936 2.192 2.445 2.937 3.163 3.372 3.462 3.96 4.153 4.527 4.882 5.216 5.379 5.703 6.025 6.496 6.795 7.091 7.533 7.979 8.416 8.827 9.223 9.738 10.248 10.755 11.365 11.966 12.566 13.252 14.024 14.777 15.631 16.581 17.62 18.764 20.1 21.688 23.346 25.357 27.685 30.471 33.821 38.054 43.405 50.505 57.12 61.516 64.707 67.105 69.008 70.452 71.587 72.48 73.297 73.938 74.455 74.891 75.245 75.542 75.789 76.003 76.174 76.312 76.441 76.565 76.649 76.72 76.785 76.834 76.873 76.911 76.958 76.993 77.002 77.006 77.028 77.046 77.045 77.044 77.027 76.978 76.927 76.904 76.654 76.833 76.803 76.771 76.702 76.657 76.601 76.534 76.45 76.366 76.251 75.859 -5 ,21737 ,TETRA ,17525073,Wed Nov 24 23:52:47 CET,Thu Nov 25 02:11:33 CET,0.0 0.701 1.076 1.374 1.664 1.936 2.19 2.423 2.836 3.037 3.238 3.321 3.802 3.978 4.337 4.684 5.02 5.181 5.496 5.817 6.277 6.564 6.846 7.271 7.694 8.111 8.512 8.91 9.439 9.975 10.499 11.125 11.731 12.322 13.034 13.85 14.652 15.544 16.516 17.6 18.755 20.075 21.681 23.367 25.411 27.724 30.444 33.737 37.966 43.394 50.573 57.217 61.697 64.925 67.284 69.118 70.529 71.643 72.488 73.247 73.852 74.333 74.743 75.1 75.395 75.64 75.887 76.091 76.248 76.382 76.51 76.619 76.718 76.809 76.87 76.917 76.955 76.991 77.021 77.029 77.038 77.051 77.046 77.044 77.043 77.032 77.007 76.971 76.944 76.682 76.847 76.816 76.783 76.683 76.616 76.547 76.463 76.383 76.307 76.185 75.884 -6 ,3569 ,TETRA ,17525075,Wed Nov 24 23:52:49 CET,Thu Nov 25 02:11:05 CET,0.0 1.09 1.509 1.861 2.161 2.418 2.662 2.917 3.439 3.656 3.847 3.934 4.424 4.594 4.927 5.255 5.593 5.757 6.075 6.389 6.843 7.129 7.417 7.857 8.286 8.709 9.124 9.531 10.06 10.569 11.056 11.655 12.239 12.81 13.493 14.288 15.077 15.965 16.931 17.969 19.117 20.473 22.085 23.727 25.661 27.888 30.566 33.713 37.625 42.6 49.372 55.869 60.269 63.433 65.77 67.597 69.001 70.165 71.078 71.899 72.52 73.013 73.437 73.8 74.128 74.391 74.644 74.866 75.025 75.167 75.31 75.412 75.507 75.59 75.649 75.704 75.749 75.8 75.838 75.853 75.871 75.891 75.889 75.867 75.855 75.837 75.802 75.763 75.755 75.512 75.673 75.633 75.584 75.444 75.368 75.295 75.207 75.103 74.965 74.765 74.515 -7 ,16227 ,TETRA ,17525078,Wed Nov 24 23:52:47 CET,Thu Nov 25 02:09:33 CET,0.0 0.645 1.01 1.309 1.573 1.813 2.046 2.275 2.707 2.904 3.095 3.159 3.633 3.801 4.131 4.441 4.744 4.904 5.226 5.534 5.97 6.26 6.555 6.985 7.406 7.821 8.225 8.619 9.14 9.666 10.183 10.797 11.402 12.001 12.71 13.524 14.31 15.196 16.172 17.238 18.406 19.721 21.292 22.957 24.955 27.282 30.091 33.39 37.493 42.743 49.909 56.682 61.141 64.321 66.686 68.528 69.936 71.072 71.943 72.744 73.375 73.886 74.336 74.707 75.014 75.268 75.512 75.725 75.893 76.057 76.211 76.322 76.417 76.491 76.537 76.591 76.642 76.678 76.707 76.714 76.729 76.731 76.726 76.733 76.733 76.721 76.71 76.684 76.665 76.418 76.589 76.558 76.511 76.393 76.334 76.283 76.23 76.153 76.054 75.877 75.423 -8 ,21035 ,TETRA ,17525080,Wed Nov 24 23:52:50 CET,Thu Nov 25 02:12:07 CET,0.0 0.791 1.097 1.344 1.587 1.807 2.029 2.244 2.633 2.824 3.017 3.081 3.566 3.746 4.102 4.446 4.775 4.938 5.273 5.587 6.039 6.335 6.617 7.021 7.418 7.807 8.205 8.604 9.123 9.631 10.124 10.734 11.331 11.915 12.618 13.4 14.149 14.992 15.926 16.93 18.008 19.3 20.869 22.494 24.486 26.8 29.545 32.804 36.808 41.863 48.673 55.099 59.453 62.575 64.883 66.675 68.036 69.114 69.961 70.74 71.347 71.842 72.259 72.604 72.894 73.13 73.349 73.531 73.67 73.812 73.959 74.054 74.151 74.25 74.309 74.352 74.383 74.405 74.419 74.431 74.43 74.406 74.384 74.352 74.339 74.313 74.281 74.241 74.217 73.962 74.127 74.081 74.023 73.88 73.805 73.727 73.64 73.559 73.451 73.312 73.018 -9 ,32669 ,TETRA ,17525082,Wed Nov 24 23:52:49 CET,Thu Nov 25 02:21:23 CET,0.0 0.891 1.386 1.823 2.215 2.546 2.826 3.05 3.473 3.686 3.899 3.986 4.475 4.665 5.026 5.363 5.695 5.861 6.169 6.462 6.899 7.191 7.484 7.908 8.317 8.73 9.148 9.565 10.115 10.648 11.155 11.76 12.354 12.952 13.661 14.472 15.274 16.173 17.155 18.221 19.389 20.733 22.311 23.932 25.889 28.173 30.919 34.175 38.245 43.394 50.252 56.77 61.156 64.287 66.535 68.234 69.569 70.692 71.562 72.363 72.99 73.492 73.939 74.321 74.635 74.899 75.16 75.366 75.527 75.682 75.824 75.933 76.049 76.142 76.195 76.247 76.279 76.316 76.363 76.381 76.384 76.374 76.369 76.353 76.343 76.305 76.259 76.229 76.211 75.956 76.121 76.093 76.059 75.927 75.839 75.757 75.674 75.578 75.481 75.365 74.913 -10 ,12070 ,TETRA ,17525083,Wed Nov 24 23:52:48 CET,Thu Nov 25 02:13:03 CET,0.0 0.922 1.285 1.585 1.884 2.175 2.448 2.677 3.108 3.32 3.527 3.638 4.126 4.327 4.734 5.118 5.473 5.64 5.968 6.295 6.78 7.084 7.372 7.792 8.192 8.584 8.974 9.354 9.856 10.374 10.885 11.487 12.058 12.631 13.327 14.108 14.869 15.724 16.671 17.707 18.815 20.143 21.755 23.388 25.37 27.699 30.461 33.724 37.802 42.981 49.946 56.493 60.873 64.017 66.385 68.261 69.689 70.804 71.664 72.454 73.074 73.584 74.025 74.403 74.728 75.003 75.269 75.485 75.649 75.786 75.899 75.991 76.095 76.199 76.26 76.318 76.38 76.434 76.485 76.51 76.522 76.529 76.532 76.531 76.53 76.52 76.509 76.469 76.441 76.185 76.355 76.324 76.291 76.204 76.14 76.071 75.968 75.785 75.593 75.343 74.882 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt deleted file mode 100644 index b40070cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2062 ,TETRA ,17525085,Wed Nov 24 23:52:48 CET,Thu Nov 25 02:10:12 CET,0.0 0.858 1.242 1.567 1.874 2.155 2.409 2.665 3.138 3.364 3.591 3.709 4.222 4.429 4.823 5.195 5.563 5.739 6.094 6.46 6.988 7.322 7.645 8.112 8.56 9.0 9.429 9.845 10.391 10.926 11.463 12.136 12.788 13.426 14.167 15.006 15.831 16.759 17.779 18.883 20.086 21.46 23.085 24.796 26.859 29.247 32.169 35.664 39.993 45.473 52.817 59.7 64.313 67.672 70.164 72.105 73.602 74.818 75.773 76.631 77.299 77.836 78.314 78.712 79.035 79.311 79.587 79.809 79.976 80.129 80.267 80.369 80.46 80.536 80.591 80.642 80.678 80.701 80.72 80.737 80.752 80.75 80.736 80.718 80.708 80.689 80.647 80.59 80.562 80.297 80.409 80.365 80.329 80.222 80.157 80.063 79.957 79.843 79.72 79.539 79.146 -2 ,3405 ,TETRA ,17525089,Wed Nov 24 23:52:50 CET,Thu Nov 25 02:10:55 CET,0.0 0.549 0.91 1.225 1.473 1.683 1.889 2.083 2.46 2.651 2.829 2.868 3.334 3.51 3.853 4.172 4.488 4.639 4.944 5.247 5.684 5.979 6.267 6.673 7.073 7.476 7.871 8.258 8.773 9.288 9.789 10.394 10.986 11.573 12.275 13.08 13.874 14.774 15.775 16.857 18.025 19.398 21.066 22.801 24.882 27.29 30.217 33.7 38.064 43.628 51.009 58.021 62.816 66.257 68.774 70.735 72.239 73.442 74.365 75.212 75.868 76.397 76.871 77.276 77.621 77.906 78.183 78.409 78.587 78.762 78.927 79.042 79.143 79.243 79.305 79.355 79.406 79.443 79.461 79.476 79.489 79.494 79.478 79.453 79.436 79.39 79.35 79.303 79.277 79.028 79.195 79.157 79.118 78.988 78.885 78.785 78.704 78.611 78.473 78.276 77.848 -3 ,8384 ,TETRA ,17525090,Wed Nov 24 23:52:52 CET,Thu Nov 25 02:10:51 CET,0.0 0.632 1.023 1.303 1.594 1.853 2.074 2.287 2.672 2.855 3.035 3.094 3.573 3.75 4.113 4.467 4.81 4.979 5.308 5.622 6.075 6.372 6.667 7.108 7.537 7.947 8.36 8.766 9.291 9.817 10.349 11.008 11.634 12.24 12.966 13.796 14.615 15.539 16.569 17.694 18.902 20.312 21.981 23.686 25.761 28.182 31.078 34.519 38.889 44.497 51.953 58.967 63.706 67.083 69.562 71.491 72.991 74.192 75.133 75.997 76.685 77.23 77.69 78.096 78.431 78.715 78.991 79.212 79.384 79.536 79.667 79.773 79.871 79.952 80.015 80.066 80.104 80.138 80.162 80.16 80.157 80.162 80.155 80.142 80.136 80.129 80.107 80.071 80.044 79.787 79.949 79.903 79.847 79.735 79.652 79.551 79.412 79.242 79.078 78.857 78.419 -4 ,10003 ,TETRA ,17525091,Wed Nov 24 23:52:54 CET,Thu Nov 25 02:08:19 CET,0.0 0.715 1.085 1.378 1.664 1.934 2.182 2.419 2.871 3.086 3.289 3.373 3.855 4.035 4.383 4.728 5.071 5.245 5.584 5.909 6.396 6.71 7.022 7.486 7.919 8.328 8.74 9.155 9.694 10.215 10.713 11.322 11.929 12.533 13.254 14.075 14.884 15.801 16.81 17.895 19.065 20.439 22.078 23.775 25.843 28.245 31.178 34.637 38.889 44.414 51.922 58.915 63.594 66.973 69.495 71.466 72.942 74.118 75.047 75.854 76.479 77.007 77.465 77.851 78.153 78.405 78.658 78.877 79.061 79.245 79.419 79.539 79.652 79.748 79.807 79.864 79.91 79.951 79.989 80.005 80.022 80.028 80.02 80.02 80.01 79.967 79.918 79.851 79.814 79.547 79.661 79.607 79.548 79.394 79.293 79.173 79.031 78.86 78.713 78.563 78.151 -5 ,5241 ,TETRA ,17525092,Wed Nov 24 23:52:50 CET,Thu Nov 25 02:15:19 CET,0.0 0.665 0.999 1.266 1.505 1.732 1.943 2.163 2.585 2.778 2.968 3.039 3.523 3.7 4.046 4.381 4.694 4.848 5.163 5.477 5.941 6.246 6.545 6.98 7.402 7.824 8.243 8.661 9.202 9.72 10.242 10.892 11.524 12.134 12.84 13.656 14.469 15.371 16.358 17.444 18.615 19.974 21.634 23.363 25.433 27.84 30.745 34.208 38.53 44.038 51.529 58.643 63.398 66.836 69.39 71.361 72.903 74.141 75.101 75.964 76.63 77.191 77.674 78.073 78.416 78.716 78.991 79.211 79.38 79.526 79.668 79.774 79.858 79.945 80.018 80.085 80.149 80.194 80.218 80.221 80.222 80.228 80.238 80.24 80.234 80.227 80.211 80.187 80.158 79.895 80.04 79.997 79.951 79.811 79.738 79.649 79.528 79.417 79.304 79.096 78.354 -6 ,13000 ,TETRA ,17525094,Wed Nov 24 23:52:52 CET,Thu Nov 25 02:09:18 CET,0.0 0.764 1.16 1.521 1.801 2.052 2.304 2.561 3.066 3.296 3.513 3.648 4.167 4.384 4.802 5.197 5.577 5.766 6.13 6.476 6.986 7.319 7.637 8.103 8.559 9.0 9.431 9.853 10.397 10.924 11.444 12.077 12.689 13.285 13.996 14.819 15.624 16.508 17.48 18.561 19.74 21.1 22.77 24.518 26.623 29.136 32.174 35.735 40.19 45.879 53.442 60.503 65.228 68.559 71.007 72.947 74.457 75.67 76.583 77.416 78.073 78.601 79.059 79.456 79.801 80.08 80.339 80.561 80.744 80.904 81.046 81.15 81.249 81.346 81.417 81.474 81.518 81.564 81.599 81.615 81.626 81.631 81.624 81.602 81.591 81.577 81.554 81.518 81.491 81.222 81.364 81.327 81.285 81.168 81.087 80.99 80.876 80.737 80.581 80.354 79.725 -7 ,12831 ,TETRA ,17525095,Wed Nov 24 23:56:14 CET,Thu Nov 25 02:13:59 CET,0.0 0.53 0.865 1.14 1.398 1.626 1.838 2.051 2.467 2.669 2.868 2.939 3.413 3.586 3.917 4.234 4.547 4.701 5.006 5.314 5.763 6.047 6.328 6.75 7.161 7.573 7.985 8.372 8.867 9.366 9.86 10.463 11.056 11.646 12.339 13.134 13.916 14.792 15.758 16.816 17.961 19.265 20.85 22.538 24.582 26.96 29.838 33.254 37.535 42.966 50.299 57.286 61.926 65.236 67.708 69.667 71.17 72.396 73.369 74.238 74.918 75.474 75.949 76.345 76.693 76.996 77.274 77.502 77.686 77.852 78.0 78.104 78.203 78.289 78.343 78.4 78.463 78.499 78.51 78.522 78.542 78.57 78.574 78.565 78.561 78.546 78.522 78.491 78.468 78.221 78.39 78.35 78.306 78.178 78.11 78.027 77.953 77.869 77.745 77.539 76.978 -8 ,28415 ,TETRA ,17525098,Wed Nov 24 23:56:14 CET,Thu Nov 25 02:16:05 CET,0.0 0.63 1.009 1.286 1.562 1.802 2.046 2.269 2.667 2.859 3.046 3.114 3.588 3.75 4.083 4.426 4.75 4.91 5.226 5.527 5.975 6.266 6.543 6.947 7.345 7.748 8.151 8.553 9.075 9.566 10.043 10.641 11.263 11.897 12.631 13.47 14.283 15.188 16.204 17.318 18.512 19.886 21.543 23.275 25.409 27.875 30.805 34.281 38.591 44.052 51.422 58.416 63.114 66.449 68.881 70.838 72.399 73.65 74.631 75.524 76.193 76.728 77.191 77.577 77.898 78.162 78.412 78.615 78.77 78.917 79.067 79.174 79.261 79.335 79.369 79.395 79.432 79.449 79.45 79.449 79.434 79.412 79.395 79.376 79.36 79.317 79.271 79.223 79.198 78.921 79.016 78.954 78.891 78.738 78.667 78.587 78.473 78.337 78.2 78.011 77.169 -9 ,26029 ,TETRA ,17525100,Wed Nov 24 23:56:15 CET,Thu Nov 25 02:15:00 CET,0.0 0.756 1.141 1.454 1.786 2.101 2.383 2.642 3.12 3.341 3.564 3.712 4.217 4.418 4.81 5.184 5.545 5.726 6.08 6.417 6.897 7.201 7.504 7.935 8.336 8.733 9.129 9.527 10.055 10.571 11.065 11.681 12.281 12.867 13.566 14.377 15.179 16.076 17.059 18.131 19.287 20.621 22.228 23.901 25.943 28.319 31.168 34.557 38.842 44.314 51.659 58.623 63.256 66.58 69.068 71.015 72.504 73.709 74.672 75.541 76.197 76.725 77.182 77.565 77.892 78.166 78.434 78.644 78.795 78.949 79.095 79.197 79.292 79.384 79.445 79.496 79.529 79.562 79.605 79.628 79.645 79.662 79.659 79.651 79.652 79.645 79.623 79.584 79.554 79.299 79.448 79.413 79.375 79.282 79.233 79.16 79.063 78.953 78.794 78.534 77.49 -10 ,23562 ,TETRA ,17525102,Wed Nov 24 23:57:03 CET,Thu Nov 25 02:13:01 CET,0.0 0.421 0.722 0.979 1.214 1.431 1.638 1.854 2.263 2.452 2.63 2.68 3.152 3.324 3.66 3.987 4.303 4.463 4.772 5.068 5.511 5.796 6.082 6.518 6.954 7.375 7.77 8.17 8.704 9.212 9.717 10.351 10.995 11.625 12.351 13.183 13.998 14.931 15.961 17.078 18.282 19.689 21.397 23.173 25.293 27.712 30.638 34.131 38.443 43.887 51.216 58.112 62.682 65.964 68.43 70.408 71.924 73.091 73.99 74.809 75.436 75.938 76.394 76.805 77.16 77.457 77.742 77.967 78.127 78.28 78.439 78.549 78.648 78.729 78.773 78.823 78.888 78.933 78.968 78.996 79.011 79.023 79.022 79.015 79.007 78.971 78.936 78.9 78.871 78.618 78.753 78.698 78.633 78.504 78.419 78.316 78.222 78.088 77.872 77.568 76.519 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 02adc2c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17739 ,TETRA ,17525105,Wed Nov 24 23:56:16 CET,Thu Nov 25 02:12:52 CET,0.0 0.385 0.594 0.773 0.926 1.073 1.216 1.337 1.548 1.656 1.768 1.785 2.08 2.167 2.335 2.497 2.66 2.738 2.891 3.056 3.288 3.437 3.58 3.777 3.978 4.173 4.361 4.54 4.765 4.982 5.192 5.446 5.692 5.922 6.175 6.462 6.743 7.046 7.37 7.706 8.053 8.453 8.937 9.438 10.013 10.646 11.358 12.108 12.965 13.951 15.019 15.749 15.999 15.989 15.88 15.743 15.615 15.468 15.299 15.116 14.944 14.735 14.523 14.34 14.158 13.976 13.775 13.592 13.446 13.298 13.12 12.957 12.788 12.611 12.474 12.326 12.175 12.002 11.795 11.658 11.535 11.337 11.182 11.011 10.92 10.732 10.568 10.398 10.29 9.981 9.922 9.791 9.66 9.367 9.187 8.997 8.801 8.583 8.334 7.986 7.027 -2 ,20891 ,TETRA ,17525106,Wed Nov 24 23:56:19 CET,Thu Nov 25 02:14:42 CET,0.0 0.266 0.512 0.694 0.841 0.981 1.12 1.258 1.516 1.631 1.736 1.729 2.03 2.122 2.292 2.464 2.632 2.712 2.873 3.019 3.222 3.36 3.496 3.693 3.89 4.088 4.283 4.468 4.697 4.923 5.149 5.424 5.678 5.901 6.165 6.479 6.786 7.124 7.457 7.797 8.189 8.654 9.17 9.676 10.279 10.945 11.681 12.48 13.33 14.316 15.402 16.034 16.225 16.233 16.154 15.999 15.807 15.625 15.419 15.188 14.984 14.772 14.569 14.385 14.214 14.057 13.891 13.735 13.59 13.435 13.268 13.115 12.959 12.786 12.639 12.497 12.348 12.185 11.999 11.883 11.766 11.573 11.447 11.315 11.248 11.096 10.93 10.76 10.663 10.359 10.338 10.227 10.117 9.865 9.709 9.522 9.313 9.066 8.806 8.5 7.759 -3 ,18128 ,TETRA ,17525108,Wed Nov 24 23:56:16 CET,Thu Nov 25 02:11:43 CET,0.0 0.448 0.671 0.858 1.04 1.204 1.344 1.47 1.695 1.8 1.902 1.905 2.215 2.313 2.488 2.657 2.822 2.904 3.062 3.204 3.418 3.566 3.707 3.905 4.086 4.263 4.444 4.617 4.824 5.028 5.24 5.498 5.737 5.961 6.211 6.497 6.792 7.123 7.503 7.951 8.422 8.942 9.533 10.125 10.819 11.579 12.401 13.26 14.216 15.307 16.48 17.124 17.231 17.064 16.836 16.592 16.294 15.961 15.637 15.298 14.98 14.66 14.35 14.068 13.785 13.5 13.197 12.933 12.677 12.4 12.114 11.914 11.762 11.598 11.466 11.322 11.178 11.03 10.859 10.753 10.656 10.476 10.347 10.206 10.129 9.982 9.805 9.594 9.481 9.174 9.135 9.011 8.88 8.592 8.434 8.267 8.034 7.757 7.451 7.088 6.179 -4 ,24936 ,TETRA ,17525110,Wed Nov 24 23:56:17 CET,Thu Nov 25 02:14:32 CET,0.0 0.479 0.715 0.926 1.12 1.29 1.437 1.573 1.839 1.967 2.08 2.086 2.383 2.476 2.674 2.869 3.05 3.143 3.334 3.503 3.725 3.88 4.034 4.258 4.475 4.681 4.886 5.085 5.344 5.587 5.818 6.112 6.399 6.677 6.994 7.344 7.703 8.1 8.48 8.879 9.313 9.777 10.316 10.872 11.515 12.226 13.001 13.844 14.792 15.84 16.985 17.648 17.839 17.776 17.572 17.335 17.071 16.786 16.525 16.241 15.969 15.727 15.461 15.181 14.93 14.72 14.505 14.299 14.132 13.96 13.759 13.573 13.377 13.185 13.034 12.875 12.711 12.545 12.346 12.207 12.076 11.875 11.731 11.567 11.483 11.314 11.137 10.953 10.858 10.58 10.602 10.494 10.372 10.085 9.915 9.719 9.521 9.324 9.106 8.835 8.278 -5 ,25103 ,TETRA ,17525112,Wed Nov 24 23:56:21 CET,Thu Nov 25 02:11:42 CET,0.0 0.38 0.625 0.826 0.999 1.15 1.306 1.462 1.722 1.834 1.941 1.953 2.252 2.34 2.508 2.686 2.846 2.923 3.081 3.232 3.447 3.578 3.712 3.916 4.102 4.276 4.458 4.629 4.834 5.043 5.25 5.499 5.742 5.975 6.231 6.522 6.805 7.099 7.417 7.754 8.115 8.536 9.029 9.509 10.057 10.684 11.396 12.145 13.014 13.996 15.058 15.762 15.979 15.992 15.862 15.665 15.511 15.344 15.138 14.878 14.645 14.437 14.202 13.964 13.765 13.573 13.337 13.119 12.937 12.758 12.562 12.397 12.233 12.05 11.902 11.738 11.55 11.338 11.134 11.009 10.875 10.646 10.467 10.281 10.188 9.98 9.767 9.558 9.452 9.141 9.099 8.979 8.849 8.573 8.426 8.252 8.057 7.868 7.643 7.313 6.641 -6 ,415 ,TETRA ,17525113,Wed Nov 24 23:56:18 CET,Thu Nov 25 02:16:47 CET,0.0 0.454 0.645 0.828 1.014 1.171 1.316 1.442 1.657 1.77 1.867 1.846 2.144 2.234 2.413 2.58 2.737 2.813 2.961 3.105 3.316 3.451 3.595 3.821 4.03 4.227 4.412 4.595 4.833 5.05 5.248 5.476 5.708 5.937 6.202 6.498 6.795 7.127 7.482 7.861 8.252 8.689 9.188 9.691 10.272 10.907 11.62 12.413 13.341 14.313 15.276 15.978 16.275 16.318 16.25 16.105 15.913 15.732 15.574 15.384 15.212 15.053 14.882 14.699 14.502 14.329 14.143 13.985 13.844 13.68 13.504 13.346 13.189 13.017 12.882 12.757 12.606 12.427 12.235 12.104 11.979 11.782 11.638 11.494 11.416 11.257 11.1 10.924 10.825 10.516 10.472 10.343 10.187 9.842 9.672 9.49 9.266 8.997 8.709 8.391 7.618 -7 ,1839 ,TETRA ,17525114,Wed Nov 24 23:56:19 CET,Thu Nov 25 02:15:51 CET,0.0 0.419 0.624 0.8 0.959 1.107 1.249 1.379 1.631 1.76 1.893 1.924 2.224 2.33 2.541 2.734 2.921 3.017 3.193 3.357 3.583 3.721 3.85 4.048 4.268 4.489 4.691 4.889 5.141 5.359 5.56 5.815 6.079 6.334 6.627 6.943 7.264 7.62 7.997 8.391 8.789 9.26 9.817 10.367 10.987 11.659 12.415 13.209 14.114 15.145 16.276 17.049 17.31 17.321 17.16 16.931 16.724 16.508 16.269 15.985 15.73 15.479 15.236 15.016 14.808 14.609 14.392 14.184 14.015 13.833 13.625 13.458 13.288 13.107 12.957 12.797 12.629 12.458 12.282 12.147 11.999 11.779 11.621 11.444 11.353 11.161 10.962 10.759 10.644 10.331 10.308 10.191 10.057 9.747 9.58 9.387 9.177 8.95 8.685 8.314 7.31 -8 ,5929 ,TETRA ,17525115,Wed Nov 24 23:57:03 CET,Thu Nov 25 02:12:12 CET,0.0 0.719 0.951 1.121 1.263 1.405 1.541 1.678 1.93 2.044 2.155 2.177 2.482 2.581 2.772 2.954 3.129 3.215 3.374 3.535 3.773 3.921 4.06 4.26 4.448 4.629 4.806 4.973 5.193 5.407 5.63 5.897 6.128 6.346 6.598 6.893 7.181 7.495 7.837 8.197 8.569 8.984 9.456 9.905 10.416 11.017 11.691 12.419 13.259 14.187 15.231 15.878 16.06 16.073 15.985 15.836 15.652 15.449 15.259 15.064 14.889 14.71 14.535 14.353 14.162 13.992 13.795 13.622 13.475 13.301 13.123 12.971 12.807 12.641 12.514 12.382 12.236 12.054 11.849 11.728 11.617 11.418 11.275 11.131 11.056 10.902 10.736 10.551 10.447 10.145 10.085 9.96 9.842 9.58 9.451 9.337 9.191 9.012 8.833 8.615 7.926 -9 ,32657 ,TETRA ,17525117,Wed Nov 24 23:57:03 CET,Thu Nov 25 02:13:53 CET,0.0 0.341 0.606 0.819 0.999 1.167 1.33 1.487 1.761 1.875 1.984 2.021 2.341 2.455 2.658 2.842 3.031 3.123 3.301 3.472 3.714 3.863 4.009 4.246 4.483 4.688 4.885 5.093 5.352 5.587 5.806 6.065 6.328 6.588 6.882 7.217 7.536 7.871 8.234 8.628 9.028 9.474 10.007 10.524 11.094 11.702 12.369 13.069 13.896 14.793 15.541 15.889 15.834 15.539 15.19 14.835 14.478 14.103 13.735 13.322 12.948 12.624 12.316 12.015 11.717 11.433 11.128 10.836 10.612 10.431 10.261 10.108 9.932 9.755 9.614 9.461 9.296 9.12 8.934 8.804 8.668 8.45 8.31 8.174 8.096 7.931 7.767 7.607 7.527 7.231 7.171 7.044 6.931 6.7 6.554 6.395 6.224 6.033 5.834 5.629 5.183 -10 ,13170 ,TETRA ,17525119,Wed Nov 24 23:57:03 CET,Thu Nov 25 02:15:39 CET,0.0 0.227 0.405 0.596 0.768 0.926 1.075 1.209 1.436 1.54 1.648 1.646 1.953 2.057 2.245 2.418 2.582 2.661 2.818 2.979 3.224 3.379 3.53 3.763 3.98 4.179 4.376 4.569 4.818 5.059 5.285 5.552 5.811 6.066 6.364 6.697 7.011 7.35 7.718 8.109 8.535 9.018 9.554 10.099 10.735 11.425 12.21 13.088 14.107 15.209 16.25 16.815 16.943 16.848 16.624 16.327 16.002 15.675 15.374 15.014 14.73 14.53 14.33 14.141 13.958 13.773 13.581 13.401 13.241 13.078 12.909 12.772 12.6 12.406 12.275 12.147 12.011 11.857 11.696 11.571 11.437 11.255 11.134 11.001 10.924 10.77 10.61 10.432 10.341 10.06 10.066 9.943 9.803 9.506 9.37 9.219 9.013 8.792 8.571 8.238 7.437 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 46209dd4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6268 ,TETRA ,17525122,Wed Nov 24 23:57:03 CET,Thu Nov 25 02:22:56 CET,0.0 0.408 0.639 0.847 1.07 1.263 1.439 1.604 1.905 2.038 2.155 2.151 2.447 2.542 2.734 2.913 3.098 3.191 3.37 3.533 3.786 3.965 4.121 4.355 4.58 4.783 4.995 5.193 5.436 5.668 5.891 6.167 6.433 6.686 6.987 7.338 7.662 7.996 8.36 8.739 9.136 9.594 10.144 10.701 11.32 12.023 12.851 13.771 14.757 15.759 16.753 17.277 17.351 17.222 17.061 16.849 16.596 16.334 16.091 15.838 15.576 15.307 15.051 14.799 14.567 14.362 14.124 13.887 13.677 13.481 13.255 13.039 12.816 12.601 12.454 12.294 12.116 11.921 11.724 11.589 11.446 11.221 11.065 10.895 10.8 10.609 10.369 10.11 9.99 9.661 9.571 9.421 9.262 8.932 8.758 8.569 8.327 8.041 7.705 7.272 5.837 -2 ,14175 ,TETRA ,17525124,Wed Nov 24 23:57:04 CET,Thu Nov 25 02:18:09 CET,0.0 1.639 2.07 2.343 2.571 2.784 2.985 3.168 3.504 3.668 3.827 3.917 4.258 4.384 4.628 4.862 5.087 5.198 5.409 5.622 5.913 6.094 6.278 6.534 6.779 7.025 7.258 7.487 7.793 8.089 8.36 8.663 8.96 9.243 9.556 9.92 10.282 10.69 11.126 11.592 12.095 12.676 13.314 13.933 14.656 15.429 16.296 17.229 18.207 19.296 20.517 21.265 21.535 21.617 21.558 21.35 21.042 20.742 20.484 20.178 19.9 19.644 19.374 19.109 18.849 18.605 18.336 18.086 17.852 17.597 17.324 17.097 16.87 16.623 16.437 16.255 16.067 15.858 15.617 15.45 15.284 15.014 14.825 14.63 14.536 14.33 14.078 13.793 13.647 13.323 13.253 13.112 12.965 12.651 12.462 12.233 11.985 11.714 11.387 10.915 8.731 -3 ,29445 ,TETRA ,17525126,Wed Nov 24 23:57:03 CET,Thu Nov 25 02:16:13 CET,0.0 1.096 1.409 1.676 1.914 2.119 2.312 2.485 2.804 2.945 3.076 3.12 3.44 3.551 3.772 3.967 4.158 4.255 4.449 4.636 4.898 5.074 5.244 5.472 5.696 5.917 6.116 6.306 6.559 6.796 7.027 7.312 7.592 7.858 8.16 8.5 8.822 9.171 9.542 9.945 10.381 10.876 11.457 12.016 12.625 13.325 14.162 15.06 16.055 17.34 18.936 20.045 20.468 20.531 20.474 20.333 20.128 19.919 19.708 19.476 19.254 19.026 18.782 18.542 18.308 18.091 17.866 17.654 17.455 17.231 17.005 16.814 16.6 16.381 16.218 16.048 15.864 15.67 15.459 15.307 15.147 14.897 14.729 14.562 14.473 14.28 14.093 13.895 13.784 13.479 13.443 13.319 13.179 12.872 12.704 12.514 12.317 12.094 11.778 11.386 10.317 -4 ,14709 ,TETRA ,17525127,Wed Nov 24 23:57:03 CET,Thu Nov 25 02:11:27 CET,0.0 0.64 0.95 1.216 1.437 1.623 1.785 1.948 2.253 2.393 2.539 2.623 2.935 3.025 3.226 3.428 3.618 3.706 3.885 4.07 4.341 4.516 4.684 4.921 5.143 5.358 5.578 5.805 6.085 6.33 6.552 6.821 7.081 7.33 7.632 7.977 8.315 8.671 9.034 9.428 9.862 10.353 10.909 11.455 12.106 12.837 13.656 14.546 15.505 16.513 17.686 18.457 18.642 18.632 18.504 18.32 18.105 17.87 17.61 17.3 17.03 16.788 16.551 16.325 16.102 15.889 15.65 15.426 15.232 15.031 14.811 14.635 14.447 14.226 14.045 13.853 13.647 13.438 13.23 13.081 12.931 12.697 12.538 12.384 12.301 12.126 11.931 11.718 11.609 11.303 11.221 11.077 10.945 10.649 10.468 10.241 10.01 9.773 9.474 9.036 7.639 -5 ,29744 ,TETRA ,17525128,Wed Nov 24 23:57:04 CET,Thu Nov 25 02:15:12 CET,0.0 0.588 0.961 1.184 1.362 1.514 1.679 1.845 2.159 2.302 2.423 2.448 2.765 2.861 3.075 3.29 3.48 3.567 3.737 3.895 4.118 4.272 4.418 4.622 4.823 5.013 5.202 5.399 5.65 5.876 6.088 6.35 6.617 6.877 7.173 7.509 7.832 8.184 8.56 8.954 9.356 9.812 10.368 10.932 11.575 12.236 12.971 13.843 14.858 16.005 17.202 17.992 18.28 18.306 18.232 18.074 17.869 17.639 17.398 17.113 16.852 16.602 16.344 16.096 15.867 15.675 15.471 15.266 15.065 14.842 14.619 14.442 14.254 14.052 13.897 13.732 13.557 13.377 13.174 13.033 12.889 12.654 12.502 12.346 12.253 12.046 11.838 11.623 11.517 11.217 11.187 11.062 10.925 10.642 10.491 10.321 10.13 9.892 9.55 9.145 8.305 -6 ,13545 ,TETRA ,17525129,Wed Nov 24 23:57:04 CET,Thu Nov 25 02:16:18 CET,0.0 0.706 1.05 1.296 1.501 1.694 1.863 2.01 2.281 2.401 2.512 2.549 2.876 2.991 3.205 3.408 3.612 3.709 3.876 4.037 4.299 4.469 4.62 4.843 5.073 5.294 5.501 5.695 5.951 6.211 6.482 6.823 7.145 7.442 7.767 8.104 8.411 8.757 9.148 9.559 9.972 10.442 10.998 11.531 12.149 12.859 13.698 14.595 15.551 16.608 17.759 18.493 18.738 18.762 18.653 18.437 18.184 17.927 17.674 17.369 17.079 16.816 16.549 16.284 16.024 15.785 15.528 15.294 15.084 14.842 14.59 14.379 14.172 13.965 13.794 13.617 13.441 13.227 12.97 12.782 12.585 12.266 12.037 11.796 11.674 11.431 11.18 10.909 10.771 10.443 10.298 10.11 9.926 9.483 9.233 8.964 8.662 8.333 7.97 7.455 5.621 -7 ,8003 ,TETRA ,17525130,Wed Nov 24 23:57:04 CET,Thu Nov 25 02:22:21 CET,0.0 0.97 1.301 1.526 1.736 1.895 2.04 2.181 2.427 2.552 2.671 2.675 2.977 3.075 3.274 3.469 3.646 3.731 3.905 4.066 4.289 4.443 4.595 4.804 5.0 5.203 5.403 5.58 5.811 6.04 6.265 6.532 6.784 7.036 7.326 7.639 7.951 8.318 8.734 9.163 9.588 10.057 10.611 11.183 11.826 12.478 13.222 14.08 15.06 16.151 17.226 17.796 17.851 17.657 17.259 16.811 16.455 16.138 15.854 15.572 15.299 15.007 14.716 14.451 14.217 13.99 13.742 13.518 13.307 13.093 12.879 12.694 12.468 12.225 12.052 11.88 11.697 11.515 11.34 11.198 11.041 10.792 10.613 10.442 10.358 10.157 9.952 9.762 9.65 9.325 9.214 9.062 8.915 8.549 8.358 8.169 7.955 7.706 7.381 7.015 5.935 -8 ,16542 ,TETRA ,17525131,Wed Nov 24 23:57:06 CET,Thu Nov 25 02:17:04 CET,0.0 0.773 1.089 1.354 1.57 1.747 1.928 2.107 2.425 2.564 2.697 2.741 3.048 3.145 3.349 3.556 3.738 3.821 4.009 4.204 4.456 4.614 4.77 5.007 5.235 5.44 5.636 5.831 6.09 6.334 6.561 6.839 7.104 7.355 7.666 8.047 8.409 8.801 9.208 9.618 10.046 10.521 11.062 11.587 12.209 12.913 13.709 14.584 15.565 16.668 17.896 18.662 18.928 18.939 18.82 18.621 18.375 18.104 17.85 17.572 17.287 17.032 16.797 16.556 16.324 16.099 15.845 15.612 15.418 15.215 14.994 14.801 14.589 14.366 14.195 14.025 13.839 13.623 13.405 13.259 13.096 12.836 12.662 12.486 12.394 12.181 11.976 11.776 11.659 11.347 11.296 11.162 11.015 10.709 10.539 10.333 10.075 9.776 9.444 9.045 8.023 -9 ,3700 ,TETRA ,17525132,Wed Nov 24 23:57:05 CET,Thu Nov 25 02:20:43 CET,0.0 0.55 0.831 1.059 1.255 1.438 1.615 1.771 2.034 2.157 2.295 2.368 2.697 2.813 3.043 3.264 3.462 3.561 3.758 3.934 4.185 4.354 4.511 4.731 4.939 5.14 5.332 5.52 5.756 5.983 6.218 6.513 6.789 7.04 7.35 7.718 8.056 8.413 8.804 9.214 9.648 10.142 10.683 11.216 11.846 12.54 13.36 14.241 15.194 16.229 17.385 18.129 18.297 18.257 18.117 17.905 17.65 17.386 17.144 16.879 16.603 16.358 16.124 15.885 15.664 15.451 15.227 15.027 14.846 14.642 14.414 14.24 14.067 13.87 13.695 13.516 13.341 13.139 12.911 12.763 12.619 12.39 12.219 12.033 11.937 11.74 11.542 11.333 11.231 10.928 10.873 10.738 10.595 10.282 10.105 9.895 9.644 9.329 8.927 8.441 6.652 -10 ,16197 ,TETRA ,17525133,Wed Nov 24 23:57:04 CET,Thu Nov 25 02:22:57 CET,0.0 0.45 0.734 0.959 1.161 1.337 1.48 1.615 1.885 2.03 2.171 2.206 2.531 2.656 2.89 3.109 3.313 3.403 3.574 3.765 4.039 4.187 4.337 4.587 4.833 5.069 5.287 5.484 5.74 5.982 6.213 6.478 6.736 6.987 7.286 7.633 7.957 8.312 8.689 9.074 9.47 9.912 10.452 11.02 11.663 12.343 13.128 14.031 15.075 16.214 17.359 18.115 18.351 18.325 18.225 18.06 17.82 17.557 17.308 17.027 16.757 16.485 16.206 15.948 15.706 15.473 15.218 14.949 14.703 14.466 14.224 14.025 13.824 13.61 13.435 13.263 13.08 12.877 12.65 12.491 12.339 12.095 11.922 11.752 11.663 11.47 11.261 11.036 10.918 10.59 10.489 10.338 10.193 9.89 9.71 9.514 9.274 9.0 8.707 8.336 7.141 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index cb8ebd64..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27789 ,TETRA ,17525134,Wed Nov 24 23:57:04 CET,Thu Nov 25 02:13:49 CET,0.0 0.719 0.988 1.226 1.449 1.622 1.774 1.915 2.143 2.26 2.367 2.378 2.663 2.752 2.928 3.086 3.23 3.304 3.45 3.608 3.835 4.006 4.21 4.498 4.771 5.034 5.283 5.501 5.783 6.057 6.318 6.645 6.962 7.262 7.587 7.931 8.244 8.594 8.961 9.322 9.688 10.077 10.531 10.971 11.441 11.924 12.425 12.934 13.433 13.846 13.981 13.606 13.122 12.657 12.167 11.659 11.185 10.774 10.429 10.06 9.716 9.393 9.079 8.783 8.513 8.264 7.982 7.718 7.489 7.242 6.994 6.801 6.593 6.374 6.204 6.034 5.851 5.64 5.417 5.264 5.11 4.897 4.763 4.613 4.53 4.352 4.161 3.956 3.848 3.533 3.455 3.323 3.182 2.89 2.728 2.558 2.38 2.178 1.962 1.691 1.107 -2 ,3500 ,TETRA ,17525136,Wed Nov 24 23:57:08 CET,Thu Nov 25 02:14:19 CET,0.0 0.765 1.072 1.271 1.419 1.579 1.732 1.863 2.116 2.25 2.378 2.412 2.698 2.795 2.986 3.159 3.311 3.384 3.534 3.674 3.887 4.023 4.138 4.305 4.472 4.631 4.787 4.931 5.111 5.289 5.455 5.651 5.852 6.047 6.268 6.516 6.76 7.017 7.261 7.522 7.802 8.084 8.413 8.735 9.076 9.434 9.769 10.074 10.355 10.559 10.503 10.029 9.436 8.785 8.187 7.664 7.169 6.678 6.261 5.857 5.482 5.137 4.807 4.486 4.191 3.917 3.626 3.384 3.17 2.931 2.649 2.413 2.195 1.975 1.797 1.612 1.413 1.213 1.005 0.851 0.7 0.466 0.296 0.131 0.044 -0.152 -0.35 -0.562 -0.671 -0.974 -1.05 -1.188 -1.326 -1.624 -1.77 -1.914 -2.103 -2.311 -2.502 -2.805 -3.759 -3 ,18987 ,TETRA ,17525138,Wed Nov 24 23:57:07 CET,Thu Nov 25 02:15:56 CET,0.0 0.985 1.28 1.53 1.734 1.904 2.052 2.179 2.439 2.568 2.682 2.717 3.017 3.122 3.318 3.493 3.673 3.765 3.934 4.085 4.292 4.409 4.521 4.694 4.862 5.029 5.185 5.33 5.517 5.7 5.88 6.08 6.267 6.452 6.702 6.997 7.255 7.522 7.796 8.067 8.336 8.639 8.987 9.39 9.885 10.363 10.879 11.442 11.998 12.466 12.788 12.568 12.05 11.479 10.9 10.363 9.87 9.408 9.008 8.593 8.245 7.941 7.622 7.298 6.989 6.707 6.413 6.148 5.921 5.701 5.481 5.296 5.104 4.892 4.721 4.546 4.36 4.174 3.975 3.827 3.676 3.449 3.288 3.118 3.031 2.851 2.663 2.459 2.35 2.047 1.998 1.876 1.742 1.41 1.234 1.049 0.848 0.638 0.365 -0.069 -0.659 -4 ,23114 ,TETRA ,17525140,Wed Nov 24 23:57:08 CET,Thu Nov 25 02:13:23 CET,0.0 0.6 0.845 1.065 1.249 1.401 1.539 1.673 1.922 2.04 2.153 2.163 2.452 2.546 2.741 2.925 3.087 3.167 3.315 3.461 3.656 3.774 3.895 4.071 4.273 4.517 4.766 4.993 5.269 5.543 5.824 6.168 6.475 6.762 7.108 7.497 7.845 8.188 8.556 8.939 9.31 9.707 10.175 10.653 11.161 11.673 12.227 12.784 13.359 13.77 13.867 13.655 13.202 12.592 12.0 11.449 10.987 10.616 10.293 9.944 9.616 9.31 9.018 8.727 8.458 8.229 7.975 7.745 7.543 7.319 7.076 6.881 6.673 6.445 6.272 6.095 5.912 5.712 5.505 5.371 5.227 4.986 4.816 4.635 4.544 4.348 4.144 3.948 3.847 3.553 3.531 3.428 3.313 3.037 2.878 2.713 2.545 2.359 2.157 1.818 0.641 -5 ,16580 ,TETRA ,17525143,Wed Nov 24 23:57:09 CET,Thu Nov 25 02:12:35 CET,0.0 0.776 1.035 1.192 1.343 1.493 1.636 1.799 2.215 2.426 2.623 2.8 3.162 3.328 3.651 3.937 4.207 4.341 4.588 4.821 5.154 5.359 5.559 5.843 6.109 6.367 6.616 6.862 7.167 7.449 7.728 8.06 8.375 8.685 9.036 9.392 9.717 10.078 10.451 10.844 11.24 11.675 12.202 12.675 13.204 13.737 14.22 14.726 15.268 15.749 15.992 15.72 15.198 14.613 14.045 13.513 13.052 12.625 12.224 11.782 11.407 11.074 10.735 10.407 10.112 9.852 9.564 9.307 9.087 8.848 8.608 8.413 8.209 7.978 7.808 7.651 7.482 7.304 7.107 6.97 6.838 6.616 6.457 6.3 6.214 6.034 5.85 5.651 5.549 5.248 5.216 5.097 4.959 4.669 4.522 4.362 4.2 4.01 3.758 3.457 2.835 -6 ,1997 ,TETRA ,17525145,Wed Nov 24 23:57:35 CET,Thu Nov 25 02:14:09 CET,0.0 0.689 0.981 1.168 1.317 1.481 1.649 1.809 2.081 2.19 2.298 2.309 2.59 2.685 2.871 3.041 3.196 3.268 3.421 3.591 3.821 3.955 4.084 4.255 4.423 4.59 4.739 4.889 5.097 5.292 5.475 5.7 5.908 6.097 6.322 6.571 6.803 7.063 7.337 7.689 8.109 8.537 9.001 9.457 9.935 10.428 10.947 11.448 11.915 12.328 12.594 12.358 11.92 11.438 10.947 10.463 10.0 9.572 9.177 8.759 8.398 8.064 7.751 7.456 7.163 6.877 6.568 6.302 6.077 5.843 5.604 5.394 5.167 4.939 4.758 4.574 4.384 4.169 3.95 3.8 3.644 3.39 3.214 3.042 2.956 2.762 2.562 2.383 2.277 1.968 1.924 1.795 1.648 1.349 1.199 1.037 0.873 0.662 0.374 -0.02 -0.831 -7 ,17377 ,TETRA ,17525146,Wed Nov 24 23:57:33 CET,Thu Nov 25 02:16:51 CET,0.0 0.885 1.159 1.383 1.593 1.783 1.943 2.078 2.327 2.447 2.564 2.594 2.903 3.016 3.224 3.411 3.589 3.668 3.812 3.952 4.176 4.321 4.455 4.657 4.845 5.012 5.179 5.344 5.546 5.732 5.913 6.135 6.344 6.527 6.737 6.982 7.213 7.454 7.704 7.937 8.173 8.458 8.779 9.064 9.388 9.775 10.262 10.82 11.39 11.886 12.131 11.919 11.552 11.118 10.621 10.139 9.698 9.274 8.897 8.499 8.144 7.809 7.484 7.173 6.86 6.58 6.303 6.043 5.826 5.613 5.374 5.158 4.935 4.713 4.535 4.347 4.164 3.954 3.72 3.559 3.397 3.155 2.972 2.779 2.693 2.521 2.326 2.126 2.016 1.7 1.621 1.481 1.33 0.995 0.796 0.586 0.387 0.15 -0.105 -0.44 -1.607 -8 ,12612 ,TETRA ,17525148,Wed Nov 24 23:57:33 CET,Thu Nov 25 02:14:44 CET,0.0 0.454 0.731 0.958 1.158 1.341 1.51 1.651 1.912 2.042 2.177 2.245 2.551 2.651 2.832 2.999 3.151 3.225 3.368 3.519 3.754 3.894 4.023 4.203 4.374 4.551 4.735 4.947 5.261 5.559 5.855 6.208 6.531 6.826 7.17 7.556 7.905 8.298 8.699 9.089 9.486 9.923 10.427 10.905 11.444 11.998 12.548 13.128 13.678 14.118 14.371 14.163 13.758 13.275 12.767 12.273 11.827 11.403 11.007 10.609 10.248 9.897 9.563 9.231 8.909 8.627 8.346 8.098 7.876 7.64 7.404 7.203 6.992 6.782 6.61 6.434 6.249 6.049 5.843 5.694 5.535 5.28 5.1 4.917 4.825 4.648 4.46 4.243 4.133 3.833 3.761 3.622 3.498 3.242 3.061 2.87 2.674 2.45 2.21 1.802 0.685 -9 ,24985 ,TETRA ,17525150,Wed Nov 24 23:57:33 CET,Thu Nov 25 02:14:26 CET,0.0 0.464 0.651 0.836 0.993 1.133 1.279 1.403 1.615 1.724 1.827 1.851 2.141 2.23 2.399 2.558 2.717 2.795 2.94 3.078 3.288 3.42 3.548 3.739 3.908 4.069 4.226 4.367 4.541 4.727 4.916 5.129 5.322 5.505 5.712 5.949 6.191 6.436 6.672 6.94 7.219 7.545 7.989 8.448 8.977 9.519 10.062 10.604 11.138 11.646 11.963 11.738 11.251 10.653 10.013 9.42 8.897 8.386 7.948 7.507 7.114 6.757 6.402 6.071 5.78 5.506 5.191 4.91 4.681 4.45 4.205 3.989 3.764 3.54 3.361 3.183 3.004 2.801 2.598 2.461 2.324 2.115 1.948 1.765 1.679 1.503 1.302 1.095 0.973 0.646 0.583 0.462 0.328 0.024 -0.137 -0.31 -0.487 -0.682 -0.926 -1.248 -2.195 -10 ,14723 ,TETRA ,17525153,Wed Nov 24 23:57:35 CET,Thu Nov 25 02:15:05 CET,0.0 0.961 1.26 1.525 1.77 1.992 2.182 2.351 2.662 2.793 2.913 2.95 3.241 3.34 3.518 3.685 3.852 3.937 4.097 4.246 4.461 4.59 4.736 5.013 5.297 5.559 5.824 6.09 6.426 6.732 7.008 7.324 7.611 7.886 8.202 8.548 8.875 9.231 9.598 9.977 10.357 10.769 11.253 11.722 12.25 12.795 13.34 13.871 14.374 14.825 15.108 14.903 14.404 13.872 13.38 12.878 12.403 11.93 11.498 11.085 10.736 10.423 10.136 9.849 9.568 9.307 9.023 8.769 8.534 8.294 8.052 7.845 7.638 7.414 7.224 7.022 6.819 6.613 6.4 6.25 6.086 5.821 5.644 5.471 5.38 5.192 5.002 4.779 4.652 4.336 4.298 4.152 3.991 3.692 3.531 3.353 3.132 2.829 2.494 2.161 1.144 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt deleted file mode 100644 index 80ffef0f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5222 ,TETRA ,17525155,Wed Nov 24 23:57:36 CET,Thu Nov 25 02:17:39 CET,0.0 0.622 0.944 1.182 1.377 1.55 1.738 1.945 2.273 2.412 2.56 2.67 2.984 3.091 3.289 3.5 3.696 3.785 3.965 4.134 4.374 4.534 4.682 4.876 5.038 5.19 5.351 5.512 5.703 5.88 6.066 6.292 6.509 6.699 6.897 7.122 7.359 7.607 7.854 8.097 8.297 8.507 8.722 8.87 9.028 9.122 9.134 9.072 8.769 8.007 6.475 4.434 2.623 1.068 -0.281 -1.503 -2.54 -3.468 -4.258 -5.037 -5.709 -6.288 -6.821 -7.312 -7.767 -8.186 -8.62 -9.028 -9.381 -9.721 -10.072 -10.36 -10.661 -10.973 -11.211 -11.454 -11.703 -11.969 -12.257 -12.453 -12.652 -12.966 -13.19 -13.42 -13.537 -13.792 -14.054 -14.303 -14.43 -14.779 -14.881 -15.036 -15.181 -15.509 -15.694 -15.88 -16.096 -16.347 -16.626 -16.956 -17.411 -2 ,9622 ,TETRA ,17525156,Wed Nov 24 23:57:38 CET,Thu Nov 25 02:17:52 CET,0.0 0.526 0.868 1.124 1.331 1.513 1.662 1.79 2.038 2.155 2.267 2.298 2.594 2.7 2.911 3.099 3.265 3.35 3.523 3.688 3.908 4.034 4.157 4.359 4.555 4.73 4.887 5.035 5.218 5.395 5.57 5.762 5.953 6.163 6.387 6.596 6.785 6.971 7.16 7.359 7.559 7.77 7.986 8.164 8.313 8.406 8.453 8.383 8.004 7.252 5.803 3.776 1.991 0.465 -0.853 -2.08 -3.122 -4.009 -4.755 -5.524 -6.197 -6.789 -7.347 -7.862 -8.352 -8.799 -9.247 -9.648 -9.998 -10.355 -10.731 -11.061 -11.393 -11.723 -11.982 -12.251 -12.532 -12.819 -13.108 -13.309 -13.525 -13.865 -14.082 -14.294 -14.4 -14.615 -14.846 -15.09 -15.209 -15.545 -15.641 -15.797 -15.957 -16.31 -16.487 -16.667 -16.867 -17.109 -17.419 -17.743 -18.334 -3 ,11858 ,TETRA ,17525158,Wed Nov 24 23:57:34 CET,Thu Nov 25 02:17:39 CET,0.0 0.945 1.344 1.618 1.875 2.099 2.297 2.475 2.761 2.896 3.031 3.091 3.386 3.493 3.701 3.907 4.105 4.187 4.358 4.539 4.802 4.968 5.126 5.347 5.537 5.727 5.908 6.068 6.278 6.478 6.649 6.868 7.085 7.277 7.496 7.732 7.931 8.134 8.36 8.59 8.814 9.057 9.324 9.549 9.725 9.851 9.902 9.727 9.325 8.563 6.997 4.915 3.175 1.733 0.445 -0.745 -1.761 -2.685 -3.477 -4.246 -4.923 -5.53 -6.088 -6.617 -7.12 -7.567 -8.039 -8.446 -8.787 -9.15 -9.518 -9.814 -10.113 -10.426 -10.675 -10.931 -11.188 -11.459 -11.749 -11.937 -12.13 -12.444 -12.652 -12.873 -12.994 -13.232 -13.479 -13.754 -13.901 -14.241 -14.315 -14.457 -14.606 -14.957 -15.161 -15.377 -15.583 -15.803 -16.078 -16.482 -17.302 -4 ,32756 ,TETRA ,17525160,Wed Nov 24 23:57:35 CET,Thu Nov 25 02:18:22 CET,0.0 0.719 1.059 1.282 1.474 1.662 1.832 1.986 2.248 2.364 2.477 2.498 2.792 2.907 3.131 3.319 3.494 3.581 3.743 3.894 4.125 4.277 4.414 4.608 4.778 4.937 5.101 5.252 5.441 5.624 5.791 5.983 6.161 6.332 6.542 6.791 7.028 7.263 7.476 7.689 7.902 8.115 8.342 8.525 8.687 8.797 8.789 8.653 8.25 7.484 6.016 3.994 2.192 0.6 -0.757 -1.963 -2.978 -3.87 -4.63 -5.416 -6.094 -6.689 -7.272 -7.81 -8.3 -8.737 -9.191 -9.609 -9.966 -10.328 -10.715 -11.036 -11.348 -11.67 -11.922 -12.188 -12.459 -12.742 -13.049 -13.258 -13.472 -13.818 -14.061 -14.292 -14.407 -14.651 -14.894 -15.164 -15.315 -15.669 -15.764 -15.917 -16.069 -16.391 -16.571 -16.76 -16.965 -17.203 -17.479 -17.817 -18.27 -5 ,9231 ,TETRA ,17525161,Wed Nov 24 23:57:37 CET,Thu Nov 25 02:18:16 CET,0.0 0.449 0.706 0.929 1.146 1.32 1.478 1.636 1.891 2.001 2.128 2.193 2.496 2.609 2.827 3.024 3.186 3.267 3.44 3.602 3.812 3.943 4.069 4.265 4.469 4.657 4.817 4.96 5.15 5.34 5.532 5.754 5.947 6.131 6.333 6.532 6.733 6.946 7.143 7.343 7.539 7.77 8.034 8.219 8.38 8.512 8.563 8.52 8.234 7.519 6.017 4.049 2.35 0.801 -0.564 -1.748 -2.749 -3.662 -4.437 -5.202 -5.866 -6.456 -7.017 -7.534 -8.004 -8.442 -8.894 -9.284 -9.619 -9.972 -10.33 -10.634 -10.952 -11.277 -11.526 -11.776 -12.035 -12.294 -12.561 -12.746 -12.93 -13.201 -13.392 -13.605 -13.721 -13.957 -14.199 -14.454 -14.587 -14.936 -15.022 -15.166 -15.325 -15.674 -15.868 -16.082 -16.325 -16.566 -16.822 -17.115 -17.755 -6 ,221 ,TETRA ,17525163,Wed Nov 24 23:57:35 CET,Thu Nov 25 02:19:46 CET,0.0 0.512 0.828 1.095 1.321 1.517 1.699 1.861 2.13 2.248 2.361 2.376 2.657 2.751 2.933 3.119 3.287 3.364 3.516 3.678 3.922 4.065 4.206 4.408 4.58 4.75 4.907 5.046 5.227 5.388 5.549 5.752 5.935 6.09 6.267 6.479 6.679 6.872 7.042 7.237 7.443 7.643 7.869 8.028 8.183 8.354 8.419 8.343 8.031 7.303 5.771 3.663 1.94 0.464 -0.874 -2.063 -3.09 -3.979 -4.736 -5.514 -6.172 -6.753 -7.335 -7.877 -8.35 -8.801 -9.29 -9.705 -10.05 -10.416 -10.804 -11.125 -11.441 -11.746 -11.989 -12.249 -12.519 -12.82 -13.138 -13.333 -13.521 -13.863 -14.108 -14.322 -14.429 -14.658 -14.896 -15.143 -15.27 -15.607 -15.701 -15.855 -16.014 -16.355 -16.527 -16.699 -16.874 -17.108 -17.409 -17.762 -18.57 -7 ,226 ,TETRA ,17525165,Wed Nov 24 23:58:28 CET,Thu Nov 25 02:18:41 CET,0.0 0.793 1.185 1.45 1.686 1.892 2.057 2.212 2.496 2.632 2.768 2.829 3.132 3.239 3.447 3.641 3.838 3.942 4.124 4.282 4.522 4.687 4.847 5.058 5.25 5.43 5.614 5.792 6.01 6.207 6.39 6.621 6.834 7.023 7.232 7.489 7.787 8.102 8.408 8.715 9.023 9.359 9.7 9.949 10.23 10.531 10.705 10.71 10.464 9.866 8.457 6.447 4.656 3.019 1.572 0.265 -0.868 -1.871 -2.743 -3.653 -4.434 -5.116 -5.779 -6.411 -6.989 -7.513 -8.069 -8.564 -8.967 -9.353 -9.732 -10.047 -10.368 -10.694 -10.958 -11.221 -11.478 -11.752 -12.046 -12.245 -12.455 -12.792 -13.003 -13.208 -13.318 -13.551 -13.79 -14.035 -14.161 -14.493 -14.561 -14.712 -14.866 -15.194 -15.377 -15.59 -15.812 -16.031 -16.301 -16.639 -17.261 -8 ,1794 ,TETRA ,17525167,Wed Nov 24 23:58:28 CET,Thu Nov 25 02:18:07 CET,0.0 0.823 1.159 1.383 1.582 1.761 1.942 2.104 2.385 2.524 2.655 2.711 3.012 3.118 3.315 3.5 3.674 3.761 3.933 4.087 4.292 4.432 4.575 4.769 4.95 5.138 5.325 5.501 5.723 5.934 6.135 6.376 6.602 6.792 7.0 7.22 7.418 7.627 7.823 8.059 8.313 8.556 8.817 9.034 9.196 9.265 9.223 9.085 8.751 8.036 6.514 4.346 2.483 0.935 -0.392 -1.585 -2.63 -3.581 -4.398 -5.196 -5.865 -6.467 -7.043 -7.576 -8.065 -8.518 -9.003 -9.431 -9.793 -10.161 -10.549 -10.872 -11.195 -11.534 -11.795 -12.057 -12.331 -12.607 -12.882 -13.078 -13.288 -13.603 -13.823 -14.05 -14.164 -14.396 -14.629 -14.866 -14.99 -15.322 -15.417 -15.578 -15.738 -16.093 -16.299 -16.513 -16.731 -16.949 -17.201 -17.575 -18.259 -9 ,288 ,TETRA ,17525169,Wed Nov 24 23:58:31 CET,Thu Nov 25 02:18:13 CET,0.0 0.803 1.21 1.489 1.72 1.946 2.168 2.355 2.688 2.854 3.01 3.079 3.38 3.49 3.715 3.915 4.102 4.199 4.382 4.552 4.806 4.963 5.114 5.329 5.523 5.71 5.901 6.094 6.328 6.551 6.758 6.987 7.208 7.425 7.676 7.935 8.173 8.487 8.813 9.137 9.505 9.899 10.3 10.621 10.893 11.16 11.417 11.526 11.377 10.844 9.586 7.555 5.627 3.954 2.528 1.205 0.021 -1.02 -1.915 -2.844 -3.648 -4.353 -4.979 -5.523 -6.046 -6.517 -6.988 -7.425 -7.819 -8.226 -8.64 -8.98 -9.322 -9.684 -9.958 -10.239 -10.533 -10.826 -11.133 -11.345 -11.557 -11.891 -12.121 -12.362 -12.49 -12.746 -13.009 -13.279 -13.414 -13.757 -13.898 -14.072 -14.238 -14.578 -14.772 -14.983 -15.2 -15.468 -15.758 -16.065 -16.645 -10 ,21861 ,TETRA ,17525171,Wed Nov 24 23:58:28 CET,Thu Nov 25 02:19:44 CET,0.0 0.505 0.725 0.896 1.076 1.266 1.442 1.601 1.883 2.013 2.138 2.177 2.479 2.588 2.774 2.939 3.108 3.192 3.343 3.488 3.687 3.798 3.91 4.089 4.275 4.454 4.619 4.77 4.963 5.16 5.35 5.566 5.747 5.912 6.103 6.317 6.529 6.753 6.975 7.193 7.394 7.614 7.872 8.067 8.227 8.331 8.301 8.15 7.839 7.122 5.518 3.352 1.525 -0.032 -1.384 -2.578 -3.589 -4.503 -5.285 -6.058 -6.743 -7.341 -7.887 -8.399 -8.862 -9.286 -9.741 -10.158 -10.517 -10.888 -11.277 -11.602 -11.924 -12.253 -12.508 -12.768 -13.051 -13.359 -13.679 -13.896 -14.113 -14.436 -14.657 -14.889 -15.013 -15.261 -15.507 -15.755 -15.891 -16.243 -16.333 -16.493 -16.665 -17.007 -17.18 -17.353 -17.552 -17.783 -18.033 -18.351 -18.845 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 24288a21..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29662 ,TETRA ,17525174,Wed Nov 24 23:59:26 CET,Thu Nov 25 02:20:37 CET,0.0 0.444 0.689 0.872 1.024 1.145 1.261 1.376 1.566 1.643 1.722 1.696 1.968 2.048 2.19 2.338 2.482 2.546 2.66 2.757 2.901 2.988 3.083 3.226 3.351 3.486 3.604 3.704 3.836 3.959 4.063 4.191 4.319 4.434 4.554 4.706 4.858 4.991 5.108 5.213 5.317 5.409 5.497 5.595 5.701 5.736 5.665 5.457 5.058 4.353 2.999 1.137 -0.503 -1.934 -3.195 -4.302 -5.242 -6.091 -6.836 -7.581 -8.209 -8.79 -9.36 -9.863 -10.324 -10.745 -11.179 -11.581 -11.923 -12.276 -12.646 -12.955 -13.282 -13.614 -13.864 -14.115 -14.38 -14.641 -14.908 -15.105 -15.3 -15.593 -15.817 -16.041 -16.145 -16.36 -16.595 -16.86 -16.998 -17.342 -17.423 -17.578 -17.744 -18.085 -18.279 -18.5 -18.722 -18.944 -19.202 -19.494 -20.383 -2 ,4889 ,TETRA ,17525175,Wed Nov 24 23:59:26 CET,Thu Nov 25 02:19:24 CET,0.0 0.454 0.647 0.774 0.906 1.029 1.144 1.26 1.486 1.587 1.684 1.683 1.955 2.032 2.173 2.3 2.421 2.479 2.6 2.723 2.88 2.991 3.117 3.287 3.424 3.534 3.633 3.725 3.854 3.989 4.109 4.236 4.354 4.468 4.608 4.769 4.891 5.006 5.139 5.302 5.458 5.583 5.693 5.768 5.813 5.805 5.776 5.645 5.274 4.586 3.295 1.557 0.019 -1.304 -2.465 -3.507 -4.439 -5.296 -6.037 -6.76 -7.369 -7.92 -8.444 -8.924 -9.368 -9.768 -10.206 -10.604 -10.929 -11.254 -11.593 -11.872 -12.156 -12.466 -12.712 -12.95 -13.188 -13.463 -13.743 -13.923 -14.11 -14.395 -14.591 -14.785 -14.884 -15.11 -15.354 -15.61 -15.739 -16.068 -16.139 -16.278 -16.425 -16.759 -16.934 -17.115 -17.317 -17.53 -17.768 -18.082 -18.612 -3 ,8078 ,TETRA ,17525176,Wed Nov 24 23:59:26 CET,Thu Nov 25 02:18:16 CET,0.0 0.44 0.66 0.818 0.955 1.075 1.199 1.322 1.534 1.626 1.715 1.702 1.973 2.044 2.176 2.301 2.423 2.489 2.615 2.723 2.88 2.977 3.071 3.213 3.348 3.48 3.609 3.72 3.844 3.951 4.067 4.209 4.324 4.433 4.558 4.679 4.772 4.885 5.018 5.129 5.21 5.298 5.389 5.474 5.541 5.536 5.463 5.264 4.858 4.134 2.748 0.926 -0.619 -1.963 -3.148 -4.227 -5.138 -5.953 -6.664 -7.383 -8.017 -8.575 -9.093 -9.567 -10.011 -10.425 -10.862 -11.254 -11.585 -11.929 -12.294 -12.593 -12.895 -13.201 -13.43 -13.668 -13.927 -14.197 -14.463 -14.645 -14.832 -15.107 -15.3 -15.512 -15.619 -15.838 -16.101 -16.377 -16.509 -16.838 -16.907 -17.055 -17.213 -17.57 -17.755 -17.972 -18.206 -18.449 -18.753 -19.112 -19.755 -4 ,24979 ,TETRA ,17525177,Wed Nov 24 23:59:26 CET,Thu Nov 25 02:17:52 CET,0.0 0.438 0.655 0.826 0.997 1.149 1.273 1.38 1.562 1.642 1.722 1.694 1.946 2.015 2.143 2.274 2.408 2.472 2.582 2.682 2.827 2.914 3.008 3.149 3.287 3.415 3.533 3.644 3.77 3.886 4.005 4.157 4.285 4.392 4.514 4.655 4.798 4.937 5.053 5.159 5.272 5.402 5.527 5.608 5.666 5.682 5.618 5.467 5.137 4.459 3.171 1.39 -0.169 -1.521 -2.719 -3.768 -4.669 -5.508 -6.272 -7.017 -7.642 -8.209 -8.752 -9.244 -9.691 -10.092 -10.501 -10.881 -11.233 -11.598 -11.969 -12.285 -12.63 -12.984 -13.243 -13.503 -13.77 -14.053 -14.33 -14.508 -14.693 -14.989 -15.202 -15.421 -15.531 -15.755 -15.991 -16.242 -16.369 -16.687 -16.758 -16.907 -17.049 -17.33 -17.49 -17.672 -17.867 -18.069 -18.278 -18.585 -18.988 -5 ,21785 ,TETRA ,17525178,Wed Nov 24 23:59:28 CET,Thu Nov 25 02:18:19 CET,0.0 0.338 0.53 0.706 0.846 0.949 1.044 1.134 1.339 1.438 1.53 1.508 1.773 1.853 2.028 2.189 2.321 2.383 2.496 2.606 2.76 2.865 2.963 3.104 3.226 3.331 3.437 3.541 3.679 3.807 3.919 4.061 4.199 4.326 4.455 4.578 4.692 4.808 4.925 5.038 5.146 5.235 5.315 5.396 5.454 5.461 5.385 5.182 4.831 4.144 2.812 1.018 -0.569 -1.898 -3.063 -4.102 -4.999 -5.836 -6.572 -7.304 -7.923 -8.477 -8.999 -9.479 -9.922 -10.321 -10.734 -11.109 -11.429 -11.758 -12.101 -12.387 -12.68 -12.978 -13.212 -13.449 -13.697 -13.967 -14.232 -14.402 -14.579 -14.852 -15.037 -15.228 -15.327 -15.533 -15.75 -15.97 -16.083 -16.411 -16.494 -16.645 -16.794 -17.097 -17.261 -17.437 -17.639 -17.833 -18.049 -18.359 -18.865 -6 ,30898 ,TETRA ,17525179,Wed Nov 24 23:59:28 CET,Thu Nov 25 02:20:22 CET,0.0 0.331 0.586 0.785 0.955 1.113 1.259 1.378 1.601 1.716 1.809 1.795 2.083 2.179 2.322 2.47 2.617 2.682 2.805 2.917 3.089 3.201 3.315 3.494 3.636 3.758 3.886 4.001 4.136 4.278 4.422 4.581 4.72 4.842 4.953 5.068 5.19 5.319 5.451 5.572 5.682 5.814 5.939 6.028 6.087 6.077 6.02 5.854 5.492 4.816 3.517 1.81 0.291 -1.07 -2.272 -3.297 -4.189 -5.004 -5.704 -6.401 -6.997 -7.545 -8.08 -8.58 -9.044 -9.476 -9.918 -10.3 -10.644 -11.017 -11.405 -11.712 -12.015 -12.316 -12.553 -12.81 -13.067 -13.316 -13.573 -13.752 -13.944 -14.252 -14.455 -14.667 -14.78 -15.014 -15.243 -15.465 -15.582 -15.908 -15.968 -16.099 -16.226 -16.518 -16.69 -16.877 -17.079 -17.289 -17.547 -17.881 -18.438 -7 ,26184 ,TETRA ,17525180,Wed Nov 24 23:59:28 CET,Thu Nov 25 02:20:43 CET,0.0 0.701 0.942 1.128 1.279 1.407 1.519 1.624 1.817 1.917 2.015 1.99 2.255 2.333 2.493 2.622 2.743 2.804 2.922 3.037 3.197 3.292 3.379 3.511 3.631 3.733 3.834 3.938 4.07 4.181 4.284 4.417 4.552 4.671 4.798 4.94 5.064 5.196 5.338 5.493 5.64 5.761 5.885 5.968 6.025 6.03 5.975 5.813 5.406 4.704 3.487 1.728 0.12 -1.276 -2.479 -3.504 -4.395 -5.213 -5.951 -6.716 -7.357 -7.913 -8.439 -8.945 -9.433 -9.871 -10.307 -10.698 -11.035 -11.369 -11.718 -12.017 -12.315 -12.607 -12.842 -13.093 -13.358 -13.642 -13.937 -14.127 -14.317 -14.642 -14.87 -15.104 -15.224 -15.465 -15.708 -15.965 -16.112 -16.454 -16.508 -16.653 -16.812 -17.115 -17.281 -17.445 -17.611 -17.827 -18.067 -18.34 -18.791 -8 ,2448 ,TETRA ,17525183,Thu Nov 25 00:00:22 CET,Thu Nov 25 02:20:03 CET,0.0 0.532 0.78 0.986 1.169 1.319 1.452 1.592 1.835 1.932 2.027 2.017 2.291 2.38 2.553 2.71 2.86 2.933 3.069 3.188 3.352 3.46 3.564 3.711 3.847 3.968 4.081 4.198 4.358 4.502 4.622 4.759 4.887 5.014 5.152 5.291 5.428 5.557 5.678 5.81 5.928 6.05 6.201 6.326 6.401 6.415 6.375 6.254 5.948 5.288 3.951 2.138 0.533 -0.873 -2.091 -3.193 -4.144 -4.979 -5.706 -6.431 -7.067 -7.629 -8.155 -8.659 -9.129 -9.553 -9.987 -10.376 -10.72 -11.073 -11.409 -11.689 -11.992 -12.299 -12.536 -12.787 -13.051 -13.306 -13.577 -13.772 -13.973 -14.296 -14.51 -14.727 -14.838 -15.09 -15.351 -15.586 -15.707 -16.034 -16.104 -16.247 -16.405 -16.758 -16.934 -17.122 -17.315 -17.526 -17.797 -18.094 -18.669 -9 ,32666 ,TETRA ,17525185,Wed Nov 24 23:59:28 CET,Thu Nov 25 02:19:12 CET,0.0 0.326 0.579 0.801 0.962 1.09 1.213 1.323 1.509 1.591 1.671 1.664 1.937 2.014 2.157 2.293 2.43 2.499 2.628 2.737 2.876 2.974 3.071 3.206 3.331 3.436 3.537 3.646 3.782 3.916 4.031 4.154 4.273 4.397 4.593 4.864 5.109 5.365 5.619 5.836 6.04 6.265 6.504 6.715 6.904 7.015 7.072 7.062 6.852 6.298 5.025 3.121 1.418 -0.065 -1.38 -2.598 -3.662 -4.621 -5.478 -6.338 -7.072 -7.736 -8.367 -8.957 -9.504 -9.983 -10.499 -10.971 -11.345 -11.708 -12.076 -12.382 -12.696 -13.023 -13.272 -13.52 -13.78 -14.033 -14.308 -14.507 -14.703 -15.003 -15.209 -15.417 -15.526 -15.751 -15.982 -16.233 -16.36 -16.68 -16.77 -16.927 -17.094 -17.46 -17.661 -17.872 -18.093 -18.327 -18.577 -18.918 -19.807 -10 ,22158 ,TETRA ,17525186,Wed Nov 24 23:59:28 CET,Thu Nov 25 02:21:18 CET,0.0 0.679 0.916 1.08 1.234 1.377 1.507 1.626 1.855 1.957 2.047 2.029 2.291 2.364 2.497 2.629 2.756 2.818 2.952 3.065 3.215 3.32 3.414 3.532 3.645 3.752 3.86 3.976 4.124 4.259 4.387 4.538 4.681 4.816 4.972 5.139 5.286 5.422 5.544 5.667 5.779 5.887 5.992 6.038 6.035 6.018 5.962 5.783 5.388 4.669 3.311 1.506 -0.08 -1.459 -2.666 -3.751 -4.703 -5.563 -6.291 -7.008 -7.607 -8.144 -8.665 -9.139 -9.605 -10.041 -10.472 -10.855 -11.193 -11.539 -11.892 -12.19 -12.497 -12.812 -13.069 -13.329 -13.574 -13.822 -14.096 -14.287 -14.494 -14.811 -15.022 -15.259 -15.382 -15.623 -15.876 -16.151 -16.292 -16.643 -16.703 -16.845 -16.988 -17.293 -17.471 -17.668 -17.857 -18.059 -18.329 -18.689 -19.194 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 23ff2ca3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26729 ,TETRA ,17525189,Wed Nov 24 23:59:31 CET,Thu Nov 25 02:17:52 CET,0.0 1.535 1.847 2.132 2.389 2.639 2.877 3.091 3.454 3.617 3.774 3.844 4.195 4.322 4.565 4.807 5.054 5.169 5.39 5.602 5.896 6.091 6.278 6.543 6.802 7.066 7.324 7.56 7.862 8.161 8.454 8.807 9.134 9.46 9.836 10.231 10.625 11.098 11.598 12.119 12.656 13.224 13.893 14.589 15.382 16.246 17.24 18.307 19.531 20.994 22.697 23.84 24.411 24.679 24.688 24.661 24.628 24.554 24.45 24.305 24.172 24.057 23.931 23.769 23.597 23.451 23.3 23.159 23.02 22.872 22.731 22.609 22.481 22.336 22.217 22.094 21.96 21.816 21.659 21.543 21.421 21.23 21.096 20.958 20.884 20.739 20.601 20.446 20.352 20.054 20.061 19.972 19.876 19.64 19.521 19.403 19.267 19.099 18.916 18.653 17.813 -2 ,348 ,TETRA ,17525191,Wed Nov 24 23:59:30 CET,Thu Nov 25 02:16:02 CET,0.0 1.727 2.498 3.016 3.427 3.697 3.884 4.075 4.439 4.612 4.774 4.856 5.207 5.335 5.566 5.794 6.014 6.122 6.33 6.545 6.868 7.07 7.274 7.566 7.829 8.082 8.342 8.584 8.88 9.167 9.451 9.806 10.147 10.467 10.818 11.232 11.642 12.087 12.584 13.12 13.698 14.315 15.003 15.688 16.492 17.403 18.437 19.616 20.96 22.556 24.46 25.84 26.45 26.681 26.75 26.699 26.549 26.339 26.12 25.883 25.667 25.465 25.278 25.104 24.891 24.668 24.448 24.275 24.131 23.978 23.817 23.677 23.52 23.341 23.205 23.079 22.949 22.804 22.657 22.557 22.457 22.297 22.171 22.037 21.973 21.829 21.648 21.464 21.383 21.107 21.099 20.989 20.876 20.648 20.519 20.368 20.204 19.999 19.739 19.261 17.597 -3 ,3326 ,TETRA ,17525193,Thu Nov 25 00:00:22 CET,Thu Nov 25 02:17:13 CET,0.0 0.745 1.061 1.317 1.524 1.707 1.887 2.061 2.423 2.59 2.731 2.784 3.131 3.26 3.526 3.786 4.007 4.115 4.326 4.53 4.838 5.027 5.206 5.489 5.765 6.029 6.279 6.516 6.842 7.159 7.463 7.815 8.134 8.437 8.786 9.188 9.583 10.016 10.488 10.998 11.548 12.154 12.822 13.479 14.198 14.996 15.91 16.932 18.166 19.53 21.075 22.176 22.641 22.827 22.866 22.837 22.771 22.678 22.537 22.336 22.132 21.926 21.723 21.542 21.374 21.199 21.006 20.826 20.666 20.499 20.319 20.158 19.991 19.811 19.665 19.519 19.367 19.214 19.048 18.925 18.788 18.579 18.445 18.293 18.211 18.043 17.878 17.722 17.642 17.35 17.338 17.224 17.084 16.779 16.635 16.495 16.362 16.21 16.007 15.668 14.96 -4 ,23591 ,TETRA ,17525194,Thu Nov 25 00:00:24 CET,Thu Nov 25 02:17:31 CET,0.0 0.685 0.997 1.241 1.465 1.667 1.861 2.033 2.336 2.479 2.616 2.671 3.015 3.149 3.411 3.646 3.876 3.994 4.212 4.405 4.696 4.891 5.073 5.339 5.611 5.867 6.113 6.349 6.652 6.945 7.221 7.544 7.875 8.207 8.593 9.003 9.382 9.818 10.304 10.851 11.396 11.971 12.656 13.348 14.181 15.099 16.173 17.378 18.661 20.1 21.689 22.821 23.347 23.576 23.641 23.61 23.501 23.34 23.186 23.041 22.898 22.709 22.539 22.393 22.25 22.113 21.949 21.791 21.641 21.485 21.313 21.161 21.011 20.845 20.695 20.538 20.382 20.211 20.039 19.931 19.822 19.639 19.514 19.388 19.316 19.161 18.994 18.828 18.742 18.456 18.465 18.379 18.29 18.066 17.938 17.799 17.65 17.472 17.245 16.933 16.107 -5 ,21880 ,TETRA ,17525196,Thu Nov 25 00:00:24 CET,Thu Nov 25 02:17:19 CET,0.0 0.835 1.138 1.399 1.612 1.826 2.017 2.181 2.505 2.658 2.804 2.869 3.218 3.336 3.559 3.789 4.004 4.109 4.317 4.521 4.813 4.992 5.168 5.424 5.665 5.907 6.146 6.366 6.655 6.938 7.215 7.557 7.892 8.221 8.581 8.983 9.372 9.777 10.223 10.701 11.186 11.741 12.406 13.08 13.862 14.701 15.641 16.67 17.898 19.377 20.967 22.037 22.51 22.691 22.753 22.731 22.649 22.534 22.384 22.193 22.015 21.849 21.677 21.518 21.371 21.229 21.09 20.965 20.848 20.719 20.565 20.436 20.312 20.176 20.055 19.931 19.81 19.679 19.531 19.416 19.285 19.076 18.93 18.785 18.717 18.585 18.453 18.302 18.215 17.934 17.932 17.826 17.727 17.516 17.389 17.235 17.044 16.855 16.677 16.452 15.809 -6 ,29808 ,TETRA ,17525198,Thu Nov 25 00:00:24 CET,Thu Nov 25 02:20:06 CET,0.0 0.821 1.214 1.517 1.756 1.996 2.215 2.403 2.737 2.896 3.048 3.103 3.452 3.588 3.841 4.079 4.305 4.416 4.631 4.832 5.124 5.309 5.495 5.782 6.059 6.373 6.711 7.03 7.45 7.849 8.22 8.669 9.106 9.532 10.026 10.557 11.077 11.643 12.224 12.862 13.515 14.244 15.103 15.911 16.839 17.891 19.137 20.482 21.94 23.631 25.68 27.284 28.069 28.478 28.617 28.661 28.669 28.578 28.439 28.285 28.148 28.014 27.876 27.715 27.545 27.393 27.224 27.06 26.919 26.772 26.615 26.466 26.286 26.089 25.951 25.814 25.667 25.51 25.355 25.253 25.143 24.977 24.855 24.72 24.65 24.493 24.3 24.096 24.002 23.722 23.739 23.636 23.521 23.277 23.151 23.013 22.834 22.637 22.416 22.107 21.239 -7 ,27598 ,TETRA ,17525200,Thu Nov 25 00:00:24 CET,Thu Nov 25 02:18:26 CET,0.0 1.112 1.51 1.833 2.083 2.302 2.505 2.677 3.001 3.163 3.322 3.423 3.786 3.926 4.188 4.426 4.649 4.763 4.985 5.192 5.5 5.695 5.876 6.131 6.392 6.654 6.907 7.159 7.476 7.772 8.093 8.547 8.991 9.398 9.872 10.429 10.962 11.523 12.124 12.77 13.428 14.136 14.956 15.776 16.764 17.883 19.084 20.409 21.949 23.665 25.558 26.969 27.66 27.982 28.087 28.067 28.012 27.941 27.839 27.667 27.477 27.298 27.128 26.967 26.798 26.647 26.496 26.341 26.211 26.07 25.9 25.756 25.598 25.432 25.312 25.193 25.057 24.922 24.775 24.659 24.541 24.357 24.231 24.097 24.03 23.886 23.717 23.539 23.447 23.152 23.125 23.015 22.902 22.667 22.523 22.368 22.206 22.014 21.743 21.381 20.59 -8 ,5886 ,TETRA ,17525201,Thu Nov 25 00:00:26 CET,Thu Nov 25 02:17:52 CET,0.0 0.445 0.723 0.973 1.161 1.332 1.483 1.639 1.957 2.112 2.258 2.314 2.655 2.782 3.004 3.207 3.414 3.513 3.712 3.913 4.198 4.384 4.56 4.81 5.065 5.312 5.544 5.78 6.095 6.396 6.695 7.051 7.385 7.705 8.08 8.489 8.865 9.277 9.741 10.245 10.764 11.351 12.03 12.711 13.47 14.283 15.287 16.424 17.691 19.145 20.754 21.873 22.391 22.612 22.671 22.625 22.513 22.34 22.147 21.92 21.709 21.508 21.298 21.103 20.927 20.762 20.571 20.394 20.254 20.1 19.932 19.78 19.609 19.432 19.304 19.194 19.072 18.922 18.759 18.654 18.555 18.385 18.255 18.125 18.063 17.908 17.732 17.568 17.483 17.197 17.179 17.067 16.956 16.711 16.557 16.38 16.204 16.001 15.777 15.497 14.903 -9 ,18052 ,TETRA ,17525202,Thu Nov 25 00:00:24 CET,Thu Nov 25 02:17:54 CET,0.0 0.91 1.215 1.516 1.799 2.032 2.236 2.426 2.767 2.926 3.086 3.193 3.55 3.683 3.931 4.171 4.391 4.5 4.722 4.935 5.229 5.426 5.622 5.899 6.166 6.415 6.657 6.891 7.19 7.489 7.778 8.114 8.437 8.752 9.11 9.484 9.826 10.232 10.692 11.171 11.642 12.188 12.875 13.557 14.354 15.306 16.378 17.485 18.753 20.226 21.825 22.878 23.384 23.639 23.722 23.682 23.546 23.332 23.133 22.975 22.844 22.721 22.587 22.46 22.331 22.205 22.069 21.92 21.786 21.644 21.483 21.358 21.231 21.093 20.982 20.849 20.712 20.57 20.424 20.329 20.23 20.068 19.958 19.82 19.738 19.589 19.441 19.296 19.23 18.971 19.024 18.937 18.838 18.627 18.51 18.376 18.197 18.028 17.863 17.625 17.041 -10 ,26988 ,TETRA ,17525203,Thu Nov 25 00:00:24 CET,Thu Nov 25 02:19:47 CET,0.0 0.485 0.738 0.939 1.128 1.33 1.508 1.661 1.946 2.092 2.232 2.269 2.598 2.712 2.937 3.174 3.393 3.488 3.684 3.88 4.169 4.347 4.51 4.755 4.995 5.232 5.468 5.69 5.983 6.279 6.546 6.86 7.164 7.469 7.854 8.294 8.687 9.094 9.547 10.031 10.546 11.133 11.8 12.479 13.264 14.102 15.068 16.268 17.751 19.404 21.321 22.702 23.257 23.566 23.762 23.835 23.841 23.782 23.683 23.564 23.45 23.312 23.139 22.955 22.774 22.603 22.435 22.299 22.169 22.016 21.837 21.692 21.54 21.374 21.243 21.101 20.957 20.808 20.661 20.559 20.44 20.26 20.148 20.021 19.951 19.815 19.666 19.486 19.392 19.111 19.077 18.961 18.841 18.605 18.475 18.321 18.153 17.959 17.747 17.447 16.158 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt deleted file mode 100644 index 0d08518f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19990 ,TETRA ,17525204,Thu Nov 25 00:00:24 CET,Thu Nov 25 02:18:44 CET,0.0 0.703 1.003 1.249 1.472 1.689 1.886 2.055 2.345 2.484 2.63 2.711 3.064 3.193 3.441 3.681 3.916 4.035 4.25 4.449 4.743 4.931 5.122 5.402 5.67 5.931 6.171 6.402 6.717 7.01 7.284 7.624 7.965 8.298 8.67 9.06 9.444 9.897 10.413 10.963 11.514 12.15 12.921 13.658 14.464 15.359 16.436 17.624 18.975 20.653 22.603 24.059 24.804 25.194 25.42 25.529 25.528 25.492 25.431 25.333 25.235 25.138 25.018 24.884 24.761 24.639 24.495 24.359 24.255 24.144 24.004 23.882 23.756 23.623 23.51 23.391 23.261 23.123 22.996 22.91 22.809 22.646 22.541 22.425 22.358 22.215 22.071 21.918 21.833 21.555 21.588 21.508 21.414 21.17 21.04 20.909 20.76 20.593 20.396 20.207 19.857 -2 ,9595 ,TETRA ,17525206,Thu Nov 25 00:00:24 CET,Thu Nov 25 02:25:42 CET,0.0 0.385 0.601 0.838 1.064 1.261 1.436 1.587 1.889 2.04 2.173 2.22 2.557 2.672 2.905 3.141 3.369 3.475 3.686 3.892 4.174 4.352 4.532 4.8 5.053 5.295 5.528 5.753 6.063 6.376 6.672 7.021 7.364 7.699 8.094 8.527 8.941 9.402 9.885 10.413 10.986 11.618 12.325 13.07 13.973 14.888 15.919 17.113 18.51 20.148 22.036 23.45 24.153 24.55 24.76 24.856 24.855 24.784 24.692 24.56 24.445 24.351 24.248 24.136 24.013 23.898 23.777 23.665 23.57 23.459 23.319 23.194 23.058 22.92 22.819 22.712 22.602 22.483 22.359 22.269 22.172 22.028 21.92 21.789 21.719 21.578 21.433 21.298 21.229 20.971 20.986 20.891 20.798 20.587 20.469 20.34 20.206 20.042 19.861 19.654 19.252 -3 ,27503 ,TETRA ,17525209,Thu Nov 25 00:01:23 CET,Thu Nov 25 02:19:28 CET,0.0 0.433 0.708 0.899 1.077 1.261 1.43 1.573 1.839 1.989 2.136 2.186 2.534 2.651 2.87 3.094 3.316 3.417 3.613 3.813 4.105 4.296 4.477 4.737 4.976 5.195 5.417 5.631 5.91 6.184 6.456 6.814 7.164 7.483 7.84 8.257 8.65 9.081 9.556 10.045 10.562 11.179 11.91 12.609 13.413 14.316 15.364 16.528 17.879 19.494 21.421 22.9 23.672 24.087 24.265 24.353 24.341 24.273 24.18 24.046 23.923 23.805 23.677 23.541 23.419 23.294 23.16 23.041 22.931 22.816 22.695 22.584 22.465 22.346 22.244 22.123 21.996 21.874 21.757 21.681 21.593 21.446 21.345 21.233 21.167 21.015 20.839 20.664 20.58 20.307 20.323 20.228 20.128 19.892 19.766 19.611 19.435 19.27 19.111 18.906 18.462 -4 ,25153 ,TETRA ,17525211,Thu Nov 25 00:01:22 CET,Thu Nov 25 02:19:52 CET,0.0 0.489 0.767 1.047 1.273 1.476 1.655 1.798 2.088 2.242 2.382 2.436 2.793 2.93 3.168 3.387 3.6 3.701 3.9 4.104 4.397 4.587 4.772 5.029 5.285 5.528 5.768 5.998 6.279 6.56 6.858 7.223 7.562 7.886 8.254 8.675 9.1 9.572 10.059 10.57 11.118 11.729 12.439 13.127 13.908 14.827 15.934 17.192 18.621 20.291 22.242 23.673 24.432 24.852 25.063 25.131 25.123 25.081 25.033 24.96 24.851 24.741 24.634 24.517 24.388 24.258 24.127 24.005 23.878 23.73 23.57 23.434 23.294 23.142 23.028 22.919 22.803 22.684 22.554 22.457 22.355 22.189 22.061 21.932 21.867 21.729 21.583 21.425 21.35 21.089 21.112 21.024 20.925 20.726 20.601 20.451 20.329 20.217 20.09 19.914 19.652 -5 ,10934 ,TETRA ,17525213,Thu Nov 25 00:01:22 CET,Thu Nov 25 02:10:43 CET,0.0 0.861 1.19 1.447 1.636 1.808 1.977 2.156 2.482 2.624 2.762 2.82 3.154 3.266 3.489 3.698 3.904 4.014 4.227 4.44 4.746 4.932 5.119 5.393 5.65 5.894 6.135 6.367 6.682 6.998 7.292 7.643 7.973 8.278 8.627 9.046 9.454 9.896 10.357 10.834 11.344 11.947 12.672 13.36 14.16 15.126 16.254 17.458 18.832 20.524 22.575 24.13 24.921 25.374 25.591 25.686 25.715 25.675 25.59 25.481 25.378 25.264 25.133 24.998 24.873 24.75 24.604 24.468 24.351 24.224 24.091 23.974 23.856 23.743 23.642 23.525 23.41 23.293 23.165 23.074 22.975 22.826 22.724 22.612 22.548 22.407 22.266 22.121 22.043 21.77 21.802 21.715 21.62 21.41 21.274 21.127 20.991 20.849 20.671 20.448 20.141 -6 ,30445 ,TETRA ,17525215,Thu Nov 25 00:02:22 CET,Thu Nov 25 02:21:28 CET,0.0 0.369 0.629 0.818 0.973 1.11 1.248 1.38 1.631 1.756 1.875 1.886 2.209 2.322 2.52 2.704 2.881 2.966 3.148 3.334 3.61 3.785 3.948 4.19 4.418 4.649 4.885 5.118 5.405 5.672 5.93 6.245 6.565 6.873 7.216 7.606 7.994 8.429 8.884 9.37 9.9 10.497 11.18 11.869 12.679 13.586 14.639 15.84 17.237 18.877 20.862 22.346 23.123 23.572 23.827 23.952 23.986 23.957 23.9 23.82 23.719 23.602 23.482 23.342 23.204 23.083 22.926 22.779 22.666 22.544 22.404 22.277 22.138 22.0 21.892 21.776 21.649 21.509 21.376 21.29 21.203 21.071 20.971 20.862 20.801 20.676 20.547 20.402 20.336 20.078 20.118 20.034 19.948 19.769 19.648 19.514 19.377 19.216 19.03 18.841 18.597 -7 ,27468 ,TETRA ,17525217,Thu Nov 25 00:02:22 CET,Thu Nov 25 02:24:35 CET,0.0 0.763 1.111 1.333 1.521 1.706 1.889 2.059 2.37 2.522 2.659 2.692 3.027 3.155 3.396 3.601 3.798 3.898 4.092 4.279 4.557 4.733 4.9 5.156 5.42 5.682 5.928 6.159 6.456 6.748 7.023 7.34 7.648 7.957 8.331 8.752 9.152 9.598 10.063 10.551 11.117 11.761 12.501 13.221 14.043 15.008 16.123 17.35 18.827 20.575 22.582 24.088 24.89 25.317 25.558 25.691 25.717 25.697 25.654 25.573 25.489 25.413 25.307 25.166 25.044 24.956 24.837 24.71 24.609 24.503 24.375 24.262 24.148 24.007 23.884 23.77 23.665 23.549 23.433 23.356 23.271 23.13 23.032 22.942 22.897 22.786 22.664 22.544 22.478 22.21 22.25 22.177 22.099 21.913 21.806 21.698 21.584 21.467 21.321 21.107 20.833 -8 ,24425 ,TETRA ,17525219,Thu Nov 25 00:02:24 CET,Thu Nov 25 02:19:51 CET,0.0 0.3 0.535 0.785 1.033 1.25 1.445 1.602 1.867 2.005 2.144 2.202 2.543 2.656 2.884 3.117 3.352 3.462 3.659 3.851 4.13 4.306 4.483 4.757 5.009 5.242 5.474 5.704 6.006 6.299 6.59 6.945 7.277 7.613 7.998 8.398 8.788 9.222 9.71 10.236 10.784 11.417 12.155 12.895 13.754 14.703 15.809 17.11 18.608 20.236 22.122 23.62 24.402 24.843 25.068 25.14 25.114 25.026 24.94 24.813 24.657 24.507 24.365 24.225 24.086 23.955 23.819 23.685 23.571 23.454 23.308 23.176 23.038 22.9 22.795 22.678 22.552 22.425 22.287 22.184 22.089 21.943 21.832 21.721 21.661 21.534 21.389 21.24 21.172 20.902 20.912 20.821 20.708 20.463 20.351 20.23 20.089 19.916 19.759 19.612 19.282 -9 ,24368 ,TETRA ,17525221,Thu Nov 25 00:02:22 CET,Thu Nov 25 02:21:14 CET,0.0 0.758 1.163 1.431 1.678 1.894 2.082 2.272 2.623 2.769 2.903 2.946 3.272 3.388 3.638 3.86 4.064 4.172 4.392 4.59 4.861 5.041 5.214 5.473 5.728 5.972 6.216 6.457 6.763 7.054 7.339 7.676 7.992 8.317 8.724 9.179 9.595 10.054 10.545 11.054 11.597 12.223 12.955 13.688 14.516 15.429 16.527 17.782 19.233 20.884 22.852 24.372 25.098 25.488 25.683 25.775 25.765 25.686 25.609 25.528 25.453 25.38 25.3 25.194 25.08 24.961 24.818 24.698 24.597 24.485 24.375 24.286 24.168 24.03 23.928 23.831 23.737 23.632 23.5 23.409 23.327 23.198 23.102 22.989 22.934 22.836 22.735 22.621 22.554 22.3 22.361 22.298 22.228 22.05 21.95 21.853 21.754 21.627 21.48 21.314 21.053 -10 ,13660 ,TETRA ,17525223,Thu Nov 25 00:02:25 CET,Thu Nov 25 02:19:53 CET,0.0 0.413 0.72 0.988 1.196 1.386 1.565 1.726 2.046 2.202 2.346 2.395 2.734 2.868 3.118 3.354 3.595 3.71 3.917 4.106 4.381 4.569 4.749 5.0 5.251 5.497 5.734 5.967 6.267 6.551 6.824 7.153 7.476 7.796 8.166 8.597 9.014 9.469 9.953 10.464 10.994 11.6 12.315 13.034 13.864 14.756 15.796 16.96 18.291 19.831 21.633 23.062 23.789 24.185 24.427 24.55 24.579 24.572 24.529 24.455 24.388 24.293 24.181 24.062 23.928 23.79 23.65 23.519 23.4 23.284 23.157 23.049 22.922 22.78 22.675 22.555 22.41 22.273 22.149 22.056 21.958 21.784 21.649 21.524 21.46 21.333 21.206 21.065 20.985 20.716 20.725 20.631 20.54 20.356 20.262 20.16 20.034 19.888 19.747 19.524 19.074 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index d5998a76..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30217 ,TETRA ,17525224,Thu Nov 25 00:02:23 CET,Thu Nov 25 02:20:54 CET,0.0 0.498 0.789 0.968 1.137 1.289 1.42 1.539 1.769 1.884 1.994 1.996 2.324 2.43 2.615 2.782 2.929 3.006 3.169 3.32 3.523 3.639 3.757 3.94 4.117 4.295 4.477 4.663 4.903 5.133 5.39 5.765 6.136 6.496 6.913 7.373 7.798 8.248 8.735 9.256 9.801 10.394 11.077 11.749 12.513 13.353 14.317 15.357 16.457 17.561 18.675 19.374 19.549 19.47 19.287 19.032 18.735 18.435 18.109 17.74 17.419 17.124 16.839 16.58 16.322 16.061 15.792 15.55 15.331 15.114 14.892 14.699 14.512 14.328 14.186 14.053 13.91 13.744 13.579 13.466 13.349 13.161 13.03 12.899 12.832 12.689 12.527 12.362 12.27 11.976 12.007 11.907 11.801 11.581 11.447 11.292 11.136 10.964 10.789 10.567 10.198 -2 ,12692 ,TETRA ,17525225,Thu Nov 25 00:02:24 CET,Thu Nov 25 02:19:43 CET,0.0 0.63 0.867 1.087 1.286 1.451 1.602 1.741 1.995 2.115 2.233 2.259 2.595 2.703 2.908 3.109 3.31 3.404 3.573 3.728 3.959 4.123 4.287 4.511 4.71 4.91 5.109 5.3 5.554 5.803 6.043 6.335 6.673 7.057 7.502 7.974 8.406 8.869 9.358 9.895 10.447 11.045 11.749 12.454 13.253 14.095 15.021 16.015 17.122 18.325 19.511 20.153 20.318 20.26 20.072 19.78 19.439 19.122 18.837 18.517 18.229 17.992 17.782 17.564 17.353 17.161 16.967 16.788 16.621 16.45 16.273 16.13 15.979 15.814 15.687 15.557 15.42 15.286 15.149 15.048 14.923 14.716 14.586 14.456 14.383 14.24 14.097 13.927 13.832 13.532 13.521 13.409 13.3 13.101 12.98 12.833 12.677 12.51 12.336 12.134 11.771 -3 ,17030 ,TETRA ,17525226,Thu Nov 25 00:02:24 CET,Thu Nov 25 02:26:40 CET,0.0 0.347 0.563 0.741 0.886 1.025 1.17 1.316 1.559 1.676 1.794 1.808 2.133 2.246 2.441 2.629 2.805 2.894 3.07 3.23 3.454 3.601 3.753 3.979 4.191 4.391 4.586 4.777 5.008 5.222 5.445 5.767 6.146 6.514 6.909 7.351 7.764 8.217 8.701 9.203 9.716 10.302 10.976 11.623 12.376 13.176 14.038 14.965 16.046 17.218 18.43 19.135 19.269 19.174 19.038 18.901 18.703 18.491 18.314 18.111 17.887 17.65 17.417 17.182 16.955 16.75 16.533 16.332 16.152 15.968 15.79 15.643 15.485 15.313 15.179 15.047 14.896 14.723 14.543 14.424 14.291 14.077 13.941 13.802 13.727 13.566 13.405 13.24 13.152 12.86 12.853 12.752 12.647 12.415 12.284 12.132 11.978 11.833 11.66 11.442 11.094 -4 ,30301 ,TETRA ,17525227,Thu Nov 25 00:02:26 CET,Thu Nov 25 02:26:57 CET,0.0 0.607 0.83 1.033 1.199 1.346 1.487 1.615 1.861 1.983 2.1 2.114 2.443 2.558 2.767 2.941 3.117 3.207 3.378 3.544 3.804 3.973 4.141 4.384 4.604 4.801 4.997 5.204 5.454 5.687 5.912 6.185 6.446 6.705 7.004 7.298 7.589 7.938 8.303 8.682 9.076 9.47 9.921 10.39 10.92 11.49 12.13 12.868 13.721 14.576 15.41 15.859 15.847 15.645 15.362 15.064 14.79 14.51 14.26 14.002 13.745 13.486 13.255 13.038 12.822 12.617 12.386 12.169 12.005 11.848 11.674 11.525 11.359 11.176 11.038 10.902 10.763 10.618 10.461 10.347 10.23 10.056 9.927 9.767 9.689 9.544 9.394 9.255 9.184 8.897 8.909 8.81 8.717 8.487 8.361 8.223 8.071 7.911 7.687 7.405 6.794 -5 ,26861 ,TETRA ,17525228,Thu Nov 25 00:02:28 CET,Thu Nov 25 02:19:01 CET,0.0 0.735 0.954 1.167 1.353 1.499 1.641 1.784 2.054 2.189 2.315 2.331 2.654 2.762 2.964 3.15 3.322 3.411 3.586 3.752 4.007 4.172 4.331 4.553 4.768 5.021 5.308 5.604 5.99 6.359 6.712 7.117 7.498 7.857 8.265 8.721 9.158 9.626 10.125 10.656 11.213 11.831 12.537 13.245 14.031 14.872 15.811 16.826 17.944 19.11 20.424 21.318 21.651 21.723 21.616 21.44 21.23 20.995 20.767 20.518 20.275 20.024 19.784 19.55 19.304 19.09 18.881 18.683 18.512 18.322 18.112 17.948 17.781 17.603 17.454 17.291 17.124 16.952 16.774 16.662 16.552 16.364 16.229 16.09 16.018 15.868 15.708 15.537 15.445 15.136 15.133 15.032 14.928 14.67 14.525 14.39 14.225 14.052 13.88 13.674 13.218 -6 ,28983 ,TETRA ,17525230,Thu Nov 25 00:03:18 CET,Thu Nov 25 02:21:23 CET,0.0 1.021 1.28 1.517 1.711 1.874 2.027 2.175 2.464 2.595 2.723 2.757 3.074 3.181 3.391 3.581 3.754 3.842 4.017 4.199 4.458 4.623 4.789 5.018 5.244 5.473 5.69 5.887 6.137 6.389 6.623 6.912 7.186 7.457 7.784 8.13 8.445 8.811 9.218 9.623 10.036 10.501 11.056 11.614 12.265 12.957 13.721 14.57 15.514 16.503 17.501 18.037 18.086 17.927 17.671 17.399 17.102 16.794 16.519 16.215 15.933 15.687 15.46 15.243 15.03 14.819 14.575 14.352 14.155 13.944 13.725 13.548 13.365 13.178 13.035 12.878 12.716 12.545 12.37 12.249 12.112 11.887 11.74 11.589 11.507 11.329 11.145 10.97 10.883 10.603 10.615 10.502 10.389 10.161 10.049 9.924 9.779 9.625 9.412 9.147 8.673 -7 ,21314 ,TETRA ,17525232,Thu Nov 25 00:05:12 CET,Thu Nov 25 02:24:55 CET,0.0 1.643 1.952 2.169 2.331 2.468 2.607 2.742 3.003 3.129 3.251 3.267 3.586 3.691 3.878 4.055 4.22 4.293 4.44 4.596 4.841 4.996 5.142 5.354 5.566 5.768 5.95 6.123 6.362 6.603 6.825 7.08 7.34 7.622 8.002 8.444 8.852 9.294 9.78 10.289 10.812 11.405 12.103 12.777 13.526 14.333 15.193 16.136 17.216 18.421 19.704 20.446 20.653 20.603 20.446 20.288 20.11 19.89 19.654 19.393 19.165 18.944 18.719 18.502 18.29 18.084 17.867 17.684 17.535 17.375 17.193 17.035 16.866 16.69 16.561 16.432 16.294 16.126 15.93 15.811 15.701 15.508 15.374 15.239 15.168 15.025 14.859 14.694 14.614 14.319 14.313 14.207 14.106 13.9 13.788 13.658 13.51 13.335 13.128 12.87 12.443 -8 ,4280 ,TETRA ,17525234,Thu Nov 25 00:03:18 CET,Thu Nov 25 02:22:31 CET,0.0 0.769 1.003 1.201 1.383 1.55 1.705 1.839 2.071 2.187 2.302 2.308 2.624 2.734 2.954 3.157 3.348 3.44 3.62 3.789 4.017 4.162 4.301 4.514 4.736 4.947 5.138 5.323 5.567 5.846 6.163 6.556 6.924 7.273 7.692 8.153 8.571 9.02 9.49 9.98 10.484 11.032 11.665 12.304 13.055 13.881 14.811 15.857 16.989 18.177 19.442 20.168 20.359 20.332 20.217 20.032 19.782 19.513 19.287 19.044 18.832 18.658 18.469 18.268 18.089 17.925 17.735 17.551 17.385 17.22 17.047 16.896 16.723 16.541 16.396 16.245 16.089 15.913 15.731 15.617 15.5 15.31 15.177 15.034 14.963 14.823 14.657 14.479 14.398 14.102 14.111 14.006 13.886 13.624 13.491 13.339 13.159 12.95 12.719 12.49 12.049 -9 ,2409 ,TETRA ,17525236,Thu Nov 25 00:03:18 CET,Thu Nov 25 02:22:57 CET,0.0 0.929 1.164 1.377 1.566 1.76 1.954 2.12 2.395 2.524 2.648 2.661 2.985 3.087 3.276 3.469 3.648 3.729 3.897 4.075 4.335 4.496 4.647 4.873 5.117 5.345 5.545 5.755 6.022 6.269 6.516 6.8 7.072 7.331 7.627 7.975 8.325 8.696 9.122 9.627 10.14 10.714 11.4 12.076 12.823 13.647 14.574 15.565 16.66 17.866 19.142 19.93 20.068 19.968 19.822 19.594 19.347 19.092 18.854 18.583 18.321 18.086 17.852 17.618 17.388 17.18 16.961 16.748 16.565 16.379 16.165 15.983 15.814 15.63 15.476 15.316 15.148 14.974 14.808 14.692 14.559 14.351 14.203 14.055 13.981 13.816 13.635 13.45 13.352 13.039 13.018 12.899 12.77 12.494 12.355 12.206 12.024 11.798 11.553 11.281 9.711 -10 ,18898 ,TETRA ,17525238,Thu Nov 25 00:04:12 CET,Thu Nov 25 02:23:10 CET,0.0 0.523 0.809 1.081 1.288 1.474 1.639 1.77 2.01 2.131 2.254 2.284 2.601 2.701 2.89 3.071 3.254 3.344 3.568 3.831 4.205 4.449 4.686 5.032 5.364 5.678 5.978 6.264 6.629 6.97 7.294 7.681 8.049 8.403 8.809 9.268 9.701 10.165 10.663 11.186 11.738 12.36 13.041 13.697 14.477 15.289 16.174 17.185 18.329 19.602 20.856 21.601 21.889 21.866 21.713 21.501 21.245 20.983 20.728 20.446 20.223 20.018 19.802 19.572 19.335 19.135 18.933 18.737 18.552 18.363 18.184 18.029 17.854 17.674 17.54 17.396 17.242 17.091 16.931 16.812 16.673 16.422 16.256 16.108 16.033 15.871 15.702 15.543 15.468 15.185 15.218 15.127 15.016 14.738 14.572 14.4 14.225 14.035 13.82 13.58 12.767 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 7887b208..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7800 ,TETRA ,17525241,Thu Nov 25 00:04:11 CET,Thu Nov 25 02:22:24 CET,0.0 0.314 0.556 0.747 0.893 1.026 1.165 1.281 1.473 1.582 1.687 1.669 1.949 2.03 2.193 2.362 2.504 2.559 2.667 2.782 2.955 3.059 3.156 3.307 3.464 3.613 3.753 3.878 4.034 4.2 4.354 4.538 4.717 4.889 5.098 5.308 5.491 5.687 5.901 6.125 6.33 6.544 6.809 7.063 7.317 7.604 7.876 8.088 8.19 8.054 7.537 6.595 5.62 4.696 3.859 3.1 2.457 1.869 1.351 0.829 0.377 -0.03 -0.426 -0.794 -1.125 -1.43 -1.76 -2.067 -2.337 -2.62 -2.928 -3.176 -3.427 -3.682 -3.876 -4.08 -4.285 -4.491 -4.714 -4.857 -4.999 -5.241 -5.414 -5.593 -5.683 -5.857 -6.018 -6.184 -6.279 -6.594 -6.598 -6.721 -6.847 -7.113 -7.281 -7.469 -7.645 -7.83 -8.048 -8.292 -8.919 -2 ,13987 ,TETRA ,17525243,Thu Nov 25 00:04:13 CET,Thu Nov 25 02:22:10 CET,0.0 0.43 0.65 0.843 1.019 1.171 1.294 1.419 1.643 1.733 1.822 1.794 2.074 2.157 2.329 2.492 2.644 2.718 2.848 2.966 3.163 3.288 3.402 3.562 3.714 3.862 4.0 4.133 4.301 4.47 4.638 4.827 5.001 5.163 5.358 5.577 5.769 5.964 6.158 6.37 6.588 6.813 7.06 7.278 7.517 7.729 7.909 8.083 8.18 8.073 7.525 6.57 5.655 4.739 3.91 3.178 2.494 1.883 1.372 0.848 0.394 -0.02 -0.421 -0.807 -1.148 -1.441 -1.76 -2.049 -2.302 -2.56 -2.83 -3.057 -3.29 -3.535 -3.732 -3.939 -4.141 -4.344 -4.558 -4.699 -4.841 -5.071 -5.242 -5.422 -5.514 -5.698 -5.887 -6.081 -6.181 -6.497 -6.561 -6.699 -6.827 -7.099 -7.255 -7.424 -7.59 -7.774 -7.996 -8.331 -8.921 -3 ,1232 ,TETRA ,17525245,Thu Nov 25 00:05:11 CET,Thu Nov 25 02:21:35 CET,0.0 0.453 0.606 0.742 0.888 1.022 1.138 1.245 1.449 1.542 1.619 1.549 1.822 1.902 2.049 2.17 2.291 2.361 2.5 2.622 2.774 2.879 2.987 3.144 3.286 3.421 3.551 3.678 3.85 4.012 4.16 4.34 4.507 4.663 4.852 5.074 5.261 5.441 5.655 5.874 6.069 6.286 6.532 6.764 7.011 7.214 7.402 7.546 7.595 7.468 6.928 6.001 5.076 4.201 3.429 2.733 2.126 1.582 1.101 0.603 0.166 -0.22 -0.594 -0.951 -1.279 -1.58 -1.916 -2.224 -2.481 -2.752 -3.019 -3.228 -3.449 -3.674 -3.847 -4.027 -4.227 -4.445 -4.663 -4.803 -4.948 -5.195 -5.368 -5.53 -5.612 -5.781 -5.956 -6.149 -6.253 -6.562 -6.592 -6.712 -6.827 -7.1 -7.257 -7.434 -7.652 -7.883 -8.118 -8.407 -8.928 -4 ,29818 ,TETRA ,17525247,Thu Nov 25 00:05:15 CET,Thu Nov 25 02:22:32 CET,0.0 0.493 0.672 0.818 0.955 1.08 1.212 1.346 1.581 1.687 1.787 1.774 2.062 2.151 2.317 2.477 2.633 2.705 2.831 2.95 3.132 3.252 3.368 3.518 3.661 3.821 3.98 4.129 4.306 4.47 4.631 4.826 5.016 5.187 5.366 5.563 5.744 5.935 6.144 6.351 6.558 6.796 7.036 7.25 7.487 7.724 7.938 8.133 8.26 8.17 7.66 6.72 5.832 5.009 4.259 3.567 2.935 2.352 1.848 1.325 0.861 0.451 0.07 -0.272 -0.593 -0.895 -1.207 -1.49 -1.741 -1.997 -2.256 -2.471 -2.698 -2.944 -3.125 -3.302 -3.483 -3.686 -3.902 -4.046 -4.189 -4.406 -4.553 -4.712 -4.798 -4.969 -5.15 -5.342 -5.439 -5.739 -5.76 -5.882 -5.998 -6.23 -6.36 -6.504 -6.64 -6.802 -6.991 -7.22 -7.626 -5 ,20765 ,TETRA ,17525248,Thu Nov 25 00:04:12 CET,Thu Nov 25 02:21:27 CET,0.0 0.311 0.491 0.638 0.772 0.894 0.999 1.106 1.325 1.434 1.527 1.49 1.767 1.849 2.034 2.209 2.346 2.41 2.536 2.657 2.827 2.94 3.047 3.212 3.375 3.521 3.656 3.785 3.957 4.126 4.283 4.471 4.655 4.83 5.032 5.236 5.425 5.634 5.847 6.065 6.279 6.517 6.764 6.989 7.25 7.472 7.651 7.774 7.828 7.756 7.222 6.125 5.086 4.145 3.297 2.538 1.881 1.281 0.756 0.255 -0.166 -0.557 -0.936 -1.294 -1.658 -1.998 -2.341 -2.65 -2.912 -3.186 -3.468 -3.688 -3.912 -4.14 -4.31 -4.499 -4.708 -4.933 -5.162 -5.306 -5.45 -5.683 -5.86 -6.05 -6.141 -6.33 -6.535 -6.76 -6.872 -7.191 -7.216 -7.332 -7.446 -7.702 -7.831 -7.985 -8.162 -8.329 -8.515 -8.822 -9.349 -6 ,30525 ,TETRA ,17525250,Thu Nov 25 00:05:18 CET,Thu Nov 25 02:22:05 CET,0.0 0.396 0.589 0.722 0.838 0.952 1.066 1.176 1.384 1.476 1.57 1.543 1.82 1.897 2.03 2.154 2.287 2.356 2.482 2.613 2.813 2.934 3.05 3.207 3.35 3.494 3.641 3.775 3.94 4.106 4.249 4.394 4.555 4.723 4.898 5.093 5.282 5.491 5.714 5.938 6.169 6.406 6.665 6.921 7.157 7.373 7.634 7.856 7.901 7.73 7.199 6.219 5.285 4.429 3.646 2.926 2.254 1.628 1.11 0.603 0.179 -0.214 -0.6 -0.941 -1.255 -1.543 -1.85 -2.131 -2.372 -2.611 -2.853 -3.059 -3.278 -3.498 -3.662 -3.846 -4.039 -4.236 -4.439 -4.583 -4.737 -4.961 -5.102 -5.244 -5.33 -5.522 -5.698 -5.877 -5.979 -6.301 -6.311 -6.416 -6.513 -6.706 -6.832 -6.961 -7.085 -7.239 -7.416 -7.616 -7.883 -7 ,21850 ,TETRA ,17525254,Thu Nov 25 00:05:16 CET,Thu Nov 25 02:21:15 CET,0.0 0.284 0.501 0.67 0.814 0.933 1.05 1.163 1.371 1.463 1.547 1.516 1.795 1.869 2.006 2.147 2.295 2.362 2.484 2.603 2.778 2.896 3.007 3.159 3.3 3.447 3.593 3.739 3.942 4.136 4.31 4.513 4.702 4.87 5.058 5.273 5.482 5.693 5.892 6.114 6.35 6.59 6.854 7.084 7.35 7.625 7.852 8.01 8.081 7.924 7.31 6.278 5.256 4.364 3.582 2.855 2.199 1.59 1.058 0.516 0.06 -0.342 -0.754 -1.146 -1.487 -1.799 -2.12 -2.402 -2.657 -2.92 -3.181 -3.397 -3.628 -3.862 -4.045 -4.249 -4.449 -4.673 -4.91 -5.06 -5.214 -5.454 -5.623 -5.798 -5.887 -6.073 -6.278 -6.494 -6.609 -6.927 -6.95 -7.08 -7.213 -7.512 -7.681 -7.866 -8.041 -8.221 -8.462 -8.753 -9.272 -8 ,3291 ,TETRA ,17525256,Thu Nov 25 00:05:16 CET,Thu Nov 25 02:15:30 CET,0.0 0.446 0.652 0.827 0.976 1.113 1.238 1.354 1.552 1.64 1.74 1.738 2.033 2.119 2.279 2.425 2.556 2.618 2.739 2.866 3.054 3.168 3.273 3.431 3.593 3.747 3.903 4.051 4.224 4.395 4.57 4.77 4.949 5.117 5.311 5.518 5.714 5.925 6.149 6.375 6.575 6.786 7.043 7.289 7.53 7.752 7.979 8.154 8.223 8.099 7.526 6.548 5.57 4.713 3.948 3.253 2.644 2.092 1.605 1.09 0.617 0.176 -0.225 -0.579 -0.911 -1.224 -1.558 -1.85 -2.101 -2.366 -2.647 -2.905 -3.16 -3.415 -3.616 -3.82 -4.031 -4.251 -4.467 -4.607 -4.755 -4.995 -5.162 -5.324 -5.408 -5.608 -5.825 -6.032 -6.143 -6.48 -6.518 -6.634 -6.76 -7.042 -7.196 -7.353 -7.527 -7.716 -7.924 -8.161 -8.608 -9 ,28386 ,TETRA ,17525258,Thu Nov 25 00:05:15 CET,Thu Nov 25 02:21:40 CET,0.0 0.29 0.487 0.653 0.801 0.942 1.077 1.192 1.397 1.502 1.612 1.624 1.922 2.011 2.177 2.323 2.46 2.525 2.66 2.791 2.965 3.077 3.189 3.352 3.512 3.657 3.798 3.947 4.145 4.322 4.474 4.653 4.815 4.982 5.188 5.408 5.606 5.826 6.042 6.265 6.527 6.817 7.105 7.347 7.613 7.872 8.115 8.301 8.37 8.272 7.724 6.776 5.89 5.097 4.341 3.607 2.954 2.355 1.825 1.299 0.853 0.433 0.012 -0.372 -0.721 -1.042 -1.361 -1.64 -1.887 -2.146 -2.411 -2.639 -2.874 -3.096 -3.265 -3.442 -3.633 -3.831 -4.034 -4.182 -4.331 -4.57 -4.74 -4.908 -4.988 -5.143 -5.315 -5.509 -5.611 -5.923 -5.95 -6.059 -6.172 -6.422 -6.553 -6.69 -6.842 -7.017 -7.208 -7.402 -7.687 -10 ,29602 ,TETRA ,17525260,Thu Nov 25 00:05:18 CET,Thu Nov 25 02:21:20 CET,0.0 0.457 0.695 0.873 1.026 1.168 1.289 1.409 1.644 1.735 1.827 1.821 2.105 2.195 2.381 2.534 2.661 2.725 2.854 2.973 3.145 3.259 3.371 3.544 3.709 3.854 3.992 4.131 4.309 4.467 4.619 4.818 5.017 5.209 5.414 5.618 5.809 6.013 6.218 6.415 6.613 6.822 7.067 7.324 7.592 7.824 8.023 8.172 8.233 8.125 7.649 6.774 5.867 5.028 4.269 3.58 2.971 2.393 1.884 1.379 0.944 0.554 0.186 -0.162 -0.511 -0.834 -1.166 -1.453 -1.707 -1.974 -2.248 -2.481 -2.721 -2.966 -3.15 -3.339 -3.539 -3.76 -3.998 -4.153 -4.299 -4.528 -4.701 -4.878 -4.964 -5.139 -5.318 -5.499 -5.595 -5.908 -5.89 -5.994 -6.11 -6.342 -6.466 -6.608 -6.766 -6.938 -7.133 -7.361 -7.737 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt deleted file mode 100644 index 8b9de895..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2533 ,TETRA ,17525262,Thu Nov 25 00:06:12 CET,Thu Nov 25 02:23:21 CET,0.0 0.414 0.614 0.787 0.956 1.109 1.245 1.372 1.631 1.759 1.876 1.879 2.175 2.273 2.458 2.644 2.83 2.92 3.096 3.26 3.5 3.649 3.795 4.015 4.225 4.43 4.629 4.826 5.071 5.3 5.53 5.809 6.087 6.348 6.629 6.945 7.258 7.615 8.005 8.432 8.89 9.4 9.976 10.544 11.217 11.961 12.825 13.809 14.949 16.286 17.756 18.783 19.253 19.46 19.533 19.504 19.423 19.312 19.184 19.021 18.857 18.695 18.547 18.393 18.229 18.062 17.875 17.714 17.583 17.449 17.309 17.178 17.017 16.843 16.71 16.58 16.442 16.295 16.143 16.041 15.941 15.781 15.662 15.533 15.462 15.319 15.187 15.055 14.987 14.737 14.748 14.648 14.545 14.329 14.203 14.077 13.948 13.786 13.598 13.351 12.766 -2 ,18469 ,TETRA ,17525264,Thu Nov 25 00:06:10 CET,Thu Nov 25 02:21:28 CET,0.0 0.454 0.674 0.855 1.006 1.147 1.3 1.472 1.762 1.873 1.979 1.993 2.293 2.39 2.579 2.762 2.939 3.029 3.217 3.405 3.677 3.842 3.993 4.211 4.425 4.639 4.842 5.032 5.28 5.528 5.767 6.055 6.328 6.585 6.89 7.245 7.6 7.991 8.406 8.847 9.303 9.816 10.411 10.986 11.643 12.388 13.224 14.162 15.289 16.54 17.949 19.032 19.529 19.755 19.806 19.778 19.706 19.574 19.434 19.303 19.179 19.049 18.894 18.729 18.589 18.455 18.309 18.186 18.063 17.924 17.785 17.672 17.539 17.382 17.262 17.155 17.054 16.937 16.79 16.68 16.565 16.395 16.29 16.178 16.12 16.007 15.883 15.737 15.659 15.391 15.406 15.31 15.211 15.022 14.896 14.746 14.608 14.475 14.304 14.079 13.64 -3 ,18364 ,TETRA ,17525266,Thu Nov 25 00:06:11 CET,Thu Nov 25 02:32:36 CET,0.0 0.348 0.588 0.778 0.929 1.093 1.237 1.356 1.594 1.703 1.813 1.84 2.138 2.233 2.425 2.608 2.772 2.857 3.041 3.222 3.481 3.645 3.806 4.038 4.243 4.435 4.63 4.825 5.083 5.328 5.566 5.852 6.118 6.385 6.696 7.041 7.376 7.743 8.161 8.618 9.076 9.572 10.155 10.758 11.448 12.179 13.028 14.011 15.175 16.479 17.934 19.032 19.491 19.676 19.742 19.723 19.654 19.549 19.408 19.233 19.077 18.927 18.766 18.609 18.458 18.316 18.16 18.016 17.888 17.74 17.572 17.428 17.266 17.092 16.969 16.85 16.72 16.582 16.444 16.348 16.242 16.077 15.966 15.846 15.78 15.649 15.525 15.399 15.332 15.079 15.102 15.019 14.924 14.697 14.577 14.446 14.285 14.111 13.935 13.754 13.328 -4 ,10552 ,TETRA ,17525267,Thu Nov 25 00:06:10 CET,Thu Nov 25 02:22:32 CET,0.0 0.498 0.796 1.005 1.186 1.35 1.506 1.666 1.956 2.08 2.198 2.215 2.52 2.633 2.847 3.044 3.226 3.313 3.488 3.66 3.91 4.069 4.221 4.449 4.676 4.891 5.096 5.287 5.533 5.794 6.048 6.332 6.608 6.884 7.205 7.574 7.916 8.285 8.696 9.131 9.584 10.108 10.727 11.356 12.066 12.861 13.791 14.797 15.931 17.211 18.663 19.719 20.156 20.349 20.377 20.307 20.22 20.102 19.946 19.747 19.578 19.412 19.229 19.053 18.888 18.738 18.563 18.382 18.226 18.069 17.899 17.76 17.622 17.474 17.343 17.187 17.032 16.883 16.724 16.61 16.5 16.328 16.193 16.05 15.982 15.847 15.698 15.525 15.436 15.163 15.163 15.072 14.983 14.768 14.631 14.476 14.322 14.159 13.959 13.717 13.186 -5 ,11396 ,TETRA ,17525268,Thu Nov 25 00:06:13 CET,Thu Nov 25 02:24:56 CET,0.0 0.589 0.856 1.072 1.27 1.446 1.586 1.726 1.994 2.111 2.241 2.284 2.598 2.72 2.95 3.158 3.357 3.45 3.619 3.782 4.026 4.177 4.328 4.555 4.767 4.958 5.149 5.35 5.611 5.864 6.105 6.402 6.69 6.962 7.271 7.615 7.949 8.307 8.693 9.112 9.546 10.032 10.625 11.225 11.904 12.666 13.525 14.468 15.551 16.792 18.213 19.259 19.777 19.989 20.012 19.972 19.907 19.814 19.694 19.533 19.383 19.238 19.076 18.911 18.743 18.586 18.419 18.259 18.123 17.988 17.842 17.713 17.568 17.408 17.289 17.178 17.062 16.932 16.786 16.682 16.565 16.381 16.26 16.141 16.077 15.945 15.819 15.675 15.594 15.318 15.314 15.219 15.135 14.944 14.831 14.704 14.548 14.382 14.189 13.971 13.492 -6 ,5200 ,TETRA ,17525269,Thu Nov 25 00:06:13 CET,Thu Nov 25 02:22:20 CET,0.0 0.418 0.647 0.854 1.056 1.225 1.368 1.502 1.775 1.896 2.012 2.05 2.365 2.472 2.687 2.906 3.107 3.195 3.368 3.534 3.767 3.916 4.062 4.287 4.511 4.733 4.956 5.168 5.439 5.693 5.937 6.225 6.506 6.785 7.112 7.468 7.794 8.158 8.574 9.029 9.485 10.006 10.613 11.199 11.885 12.676 13.616 14.606 15.705 16.928 18.26 19.217 19.705 19.958 20.048 20.012 19.91 19.791 19.666 19.489 19.333 19.191 19.023 18.865 18.709 18.562 18.405 18.246 18.099 17.941 17.77 17.639 17.509 17.353 17.239 17.123 16.994 16.862 16.724 16.624 16.515 16.345 16.221 16.088 16.025 15.904 15.773 15.636 15.568 15.306 15.322 15.219 15.103 14.863 14.748 14.635 14.497 14.337 14.142 13.939 13.54 -7 ,14715 ,TETRA ,17525270,Thu Nov 25 00:07:07 CET,Thu Nov 25 02:23:26 CET,0.0 0.419 0.694 0.922 1.125 1.28 1.414 1.558 1.834 1.954 2.059 2.064 2.357 2.447 2.645 2.846 3.037 3.13 3.312 3.49 3.746 3.906 4.058 4.277 4.48 4.678 4.881 5.079 5.334 5.585 5.833 6.131 6.413 6.694 7.02 7.374 7.717 8.091 8.495 8.934 9.382 9.898 10.51 11.122 11.838 12.612 13.464 14.399 15.508 16.804 18.299 19.336 19.839 20.067 20.097 20.028 19.934 19.825 19.7 19.521 19.348 19.209 19.074 18.931 18.782 18.643 18.483 18.328 18.185 18.022 17.862 17.729 17.587 17.439 17.326 17.21 17.071 16.92 16.778 16.67 16.551 16.37 16.245 16.121 16.054 15.903 15.748 15.579 15.489 15.225 15.226 15.127 15.028 14.81 14.676 14.527 14.379 14.198 13.966 13.712 13.178 -8 ,30454 ,TETRA ,17525271,Thu Nov 25 00:07:05 CET,Thu Nov 25 02:13:25 CET,0.0 0.284 0.467 0.624 0.782 0.942 1.083 1.207 1.449 1.563 1.662 1.655 1.946 2.041 2.228 2.42 2.592 2.673 2.84 3.02 3.284 3.442 3.6 3.839 4.055 4.265 4.465 4.659 4.912 5.157 5.402 5.694 5.971 6.239 6.547 6.886 7.212 7.576 7.971 8.394 8.845 9.363 9.966 10.538 11.209 11.979 12.86 13.842 14.948 16.179 17.552 18.566 19.059 19.273 19.323 19.265 19.167 19.031 18.878 18.707 18.532 18.352 18.192 18.037 17.866 17.705 17.523 17.348 17.194 17.029 16.857 16.716 16.557 16.39 16.259 16.124 15.987 15.851 15.71 15.6 15.49 15.331 15.214 15.085 15.017 14.888 14.76 14.615 14.537 14.284 14.292 14.202 14.107 13.857 13.725 13.606 13.481 13.364 13.2 12.983 12.745 -9 ,179 ,TETRA ,17525272,Thu Nov 25 00:07:07 CET,Thu Nov 25 02:23:44 CET,0.0 0.425 0.639 0.834 1.008 1.17 1.322 1.452 1.673 1.778 1.883 1.896 2.209 2.32 2.523 2.724 2.91 2.998 3.176 3.335 3.565 3.727 3.893 4.133 4.366 4.586 4.799 5.011 5.277 5.534 5.778 6.082 6.378 6.659 7.0 7.365 7.703 8.084 8.495 8.918 9.377 9.901 10.497 11.119 11.868 12.692 13.615 14.634 15.792 17.102 18.605 19.659 20.103 20.291 20.351 20.303 20.227 20.131 19.992 19.828 19.688 19.538 19.376 19.221 19.059 18.916 18.765 18.614 18.468 18.313 18.162 18.036 17.909 17.77 17.651 17.527 17.39 17.252 17.113 17.007 16.899 16.741 16.628 16.501 16.432 16.296 16.146 15.991 15.914 15.651 15.651 15.55 15.458 15.26 15.129 14.991 14.835 14.648 14.471 14.292 14.037 -10 ,13628 ,TETRA ,17525273,Thu Nov 25 00:07:07 CET,Thu Nov 25 02:20:13 CET,0.0 0.402 0.666 0.867 1.042 1.205 1.358 1.487 1.711 1.827 1.943 1.952 2.271 2.39 2.617 2.813 2.991 3.086 3.278 3.451 3.691 3.849 4.011 4.252 4.478 4.684 4.886 5.078 5.315 5.555 5.804 6.115 6.41 6.689 7.003 7.344 7.661 8.013 8.393 8.812 9.259 9.746 10.319 10.914 11.601 12.344 13.21 14.196 15.323 16.626 18.141 19.208 19.661 19.837 19.874 19.831 19.717 19.555 19.408 19.255 19.088 18.922 18.766 18.604 18.434 18.273 18.094 17.931 17.792 17.637 17.48 17.349 17.215 17.081 16.964 16.84 16.713 16.579 16.44 16.337 16.222 16.042 15.911 15.781 15.718 15.569 15.41 15.244 15.162 14.889 14.892 14.801 14.705 14.509 14.396 14.282 14.148 13.994 13.817 13.585 12.987 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 5580feba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7609 ,TETRA ,17525274,Thu Nov 25 00:07:07 CET,Thu Nov 25 02:19:49 CET,0.0 0.69 0.949 1.14 1.326 1.495 1.63 1.768 2.032 2.15 2.272 2.282 2.578 2.68 2.873 3.04 3.202 3.284 3.43 3.564 3.75 3.861 3.968 4.128 4.287 4.441 4.587 4.728 4.909 5.078 5.244 5.429 5.588 5.746 5.934 6.139 6.339 6.565 6.807 7.059 7.305 7.567 7.838 8.075 8.347 8.612 8.87 9.151 9.42 9.473 9.144 8.468 7.693 6.892 6.153 5.489 4.925 4.415 3.956 3.433 2.963 2.584 2.242 1.925 1.626 1.351 1.056 0.774 0.521 0.271 0.022 -0.183 -0.4 -0.62 -0.798 -0.992 -1.2 -1.415 -1.626 -1.765 -1.903 -2.103 -2.243 -2.406 -2.497 -2.687 -2.879 -3.072 -3.172 -3.484 -3.513 -3.651 -3.784 -4.044 -4.195 -4.351 -4.505 -4.683 -4.924 -5.219 -6.175 -2 ,10238 ,TETRA ,17525275,Thu Nov 25 00:07:07 CET,Thu Nov 25 02:27:26 CET,0.0 1.041 1.42 1.669 1.878 2.066 2.218 2.352 2.606 2.726 2.845 2.876 3.168 3.266 3.448 3.632 3.824 3.913 4.075 4.237 4.466 4.612 4.741 4.921 5.103 5.266 5.408 5.537 5.711 5.887 6.053 6.249 6.434 6.607 6.795 7.008 7.214 7.435 7.674 7.929 8.186 8.458 8.754 9.009 9.267 9.549 9.872 10.153 10.441 10.737 10.735 10.24 9.567 8.918 8.302 7.678 7.085 6.551 6.094 5.615 5.202 4.834 4.46 4.097 3.74 3.419 3.12 2.863 2.632 2.386 2.131 1.921 1.7 1.471 1.291 1.105 0.916 0.719 0.508 0.357 0.198 -0.049 -0.213 -0.378 -0.46 -0.63 -0.815 -0.998 -1.082 -1.387 -1.428 -1.559 -1.682 -1.907 -2.038 -2.186 -2.341 -2.547 -2.816 -3.12 -3.692 -3 ,22876 ,TETRA ,17525277,Thu Nov 25 00:08:05 CET,Thu Nov 25 02:25:39 CET,0.0 1.069 1.315 1.509 1.688 1.844 1.986 2.123 2.375 2.477 2.579 2.586 2.88 2.98 3.168 3.331 3.479 3.559 3.72 3.856 4.048 4.179 4.298 4.454 4.621 4.829 5.078 5.335 5.663 5.966 6.251 6.58 6.888 7.189 7.529 7.899 8.244 8.601 8.975 9.357 9.744 10.16 10.612 11.056 11.537 12.012 12.502 12.99 13.466 13.811 13.824 13.34 12.725 12.13 11.536 10.957 10.438 9.942 9.475 9.006 8.602 8.221 7.852 7.503 7.189 6.902 6.592 6.313 6.075 5.835 5.588 5.381 5.163 4.947 4.79 4.617 4.421 4.21 3.996 3.847 3.699 3.469 3.297 3.127 3.041 2.855 2.645 2.418 2.315 2.009 2.0 1.887 1.767 1.497 1.348 1.182 0.983 0.761 0.513 0.21 -0.273 -4 ,8433 ,TETRA ,17525279,Thu Nov 25 00:08:06 CET,Thu Nov 25 02:26:40 CET,0.0 1.658 1.956 2.19 2.375 2.531 2.682 2.834 3.129 3.265 3.397 3.438 3.747 3.85 4.039 4.212 4.377 4.459 4.607 4.758 4.99 5.126 5.255 5.443 5.62 5.803 5.985 6.145 6.335 6.523 6.716 6.951 7.18 7.387 7.605 7.916 8.284 8.688 9.124 9.586 10.042 10.534 11.068 11.57 12.112 12.673 13.265 13.842 14.38 14.721 14.838 14.495 13.862 13.228 12.617 11.987 11.434 10.968 10.534 10.074 9.68 9.321 8.965 8.624 8.293 7.978 7.651 7.369 7.131 6.872 6.586 6.344 6.113 5.9 5.733 5.555 5.377 5.186 4.981 4.836 4.684 4.466 4.302 4.113 4.019 3.828 3.629 3.425 3.318 3.011 2.983 2.863 2.731 2.45 2.295 2.124 1.943 1.713 1.462 1.206 0.569 -5 ,11851 ,TETRA ,17525281,Thu Nov 25 00:08:06 CET,Thu Nov 25 02:25:29 CET,0.0 0.734 1.054 1.26 1.455 1.637 1.808 1.966 2.228 2.339 2.445 2.442 2.74 2.831 3.002 3.163 3.311 3.39 3.551 3.694 3.903 4.03 4.145 4.318 4.492 4.652 4.806 4.951 5.121 5.292 5.451 5.631 5.815 5.992 6.195 6.416 6.618 6.841 7.089 7.351 7.617 7.901 8.215 8.509 8.799 9.076 9.352 9.551 9.693 9.649 9.209 8.437 7.595 6.753 5.965 5.245 4.597 3.98 3.447 2.907 2.451 2.04 1.618 1.208 0.83 0.487 0.16 -0.093 -0.316 -0.555 -0.796 -1.006 -1.223 -1.435 -1.603 -1.767 -1.933 -2.124 -2.33 -2.468 -2.61 -2.843 -3.007 -3.194 -3.295 -3.488 -3.669 -3.85 -3.945 -4.245 -4.249 -4.364 -4.494 -4.771 -4.914 -5.064 -5.222 -5.395 -5.599 -5.826 -6.164 -6 ,1902 ,TETRA ,17525283,Thu Nov 25 00:08:08 CET,Thu Nov 25 02:25:46 CET,0.0 0.364 0.611 0.822 1.043 1.243 1.405 1.544 1.783 1.897 2.02 2.05 2.349 2.441 2.617 2.782 2.941 3.016 3.162 3.313 3.509 3.624 3.745 3.917 4.098 4.288 4.453 4.608 4.793 4.963 5.133 5.329 5.517 5.692 5.891 6.126 6.346 6.576 6.815 7.062 7.323 7.599 7.91 8.219 8.517 8.785 9.056 9.253 9.394 9.386 8.979 8.184 7.405 6.658 5.94 5.266 4.645 4.057 3.54 2.999 2.549 2.17 1.802 1.455 1.125 0.807 0.477 0.201 -0.024 -0.251 -0.496 -0.698 -0.901 -1.126 -1.303 -1.476 -1.659 -1.857 -2.073 -2.228 -2.38 -2.621 -2.78 -2.932 -3.015 -3.184 -3.363 -3.56 -3.664 -3.972 -3.977 -4.085 -4.206 -4.534 -4.708 -4.87 -5.071 -5.32 -5.58 -5.867 -6.34 -7 ,29459 ,TETRA ,17525285,Thu Nov 25 00:09:04 CET,Thu Nov 25 02:31:03 CET,0.0 0.849 1.148 1.352 1.547 1.713 1.862 1.991 2.215 2.333 2.459 2.509 2.814 2.917 3.107 3.28 3.45 3.539 3.708 3.853 4.052 4.182 4.311 4.514 4.709 4.878 5.042 5.197 5.403 5.607 5.79 6.008 6.206 6.445 6.788 7.16 7.521 7.923 8.325 8.721 9.125 9.555 10.032 10.481 10.971 11.502 12.058 12.581 13.045 13.397 13.542 13.177 12.631 12.008 11.319 10.647 10.04 9.487 9.015 8.5 8.052 7.683 7.318 6.982 6.688 6.403 6.082 5.799 5.573 5.34 5.097 4.894 4.689 4.483 4.319 4.147 3.966 3.767 3.571 3.447 3.309 3.092 2.922 2.737 2.65 2.473 2.294 2.1 1.991 1.671 1.669 1.55 1.413 1.114 0.964 0.807 0.637 0.435 0.215 -0.039 -0.532 -8 ,9804 ,TETRA ,17525287,Thu Nov 25 00:09:07 CET,Thu Nov 25 02:25:59 CET,0.0 0.975 1.291 1.527 1.729 1.909 2.067 2.207 2.476 2.607 2.734 2.752 3.045 3.14 3.344 3.539 3.721 3.808 3.968 4.105 4.309 4.447 4.579 4.757 4.916 5.061 5.205 5.366 5.57 5.756 5.932 6.141 6.344 6.532 6.741 6.961 7.166 7.388 7.624 7.869 8.118 8.381 8.651 8.905 9.206 9.507 9.92 10.442 10.888 11.153 11.119 10.686 10.064 9.364 8.724 8.174 7.657 7.168 6.738 6.298 5.91 5.557 5.231 4.911 4.595 4.313 4.041 3.79 3.548 3.303 3.064 2.865 2.65 2.414 2.228 2.046 1.867 1.687 1.492 1.349 1.202 0.964 0.807 0.656 0.574 0.399 0.197 -0.009 -0.103 -0.407 -0.404 -0.508 -0.616 -0.864 -1.025 -1.201 -1.384 -1.601 -1.845 -2.099 -2.534 -9 ,19068 ,TETRA ,17525289,Thu Nov 25 00:09:04 CET,Thu Nov 25 02:25:55 CET,0.0 0.648 0.952 1.188 1.359 1.502 1.657 1.806 2.048 2.158 2.259 2.27 2.572 2.671 2.856 3.033 3.193 3.265 3.411 3.588 3.898 4.097 4.296 4.586 4.854 5.109 5.347 5.583 5.879 6.141 6.401 6.735 7.048 7.329 7.655 8.017 8.352 8.721 9.104 9.475 9.855 10.28 10.725 11.121 11.58 12.051 12.458 12.847 13.249 13.599 13.626 13.15 12.547 11.874 11.238 10.624 10.076 9.549 9.036 8.515 8.083 7.697 7.316 6.941 6.599 6.294 5.99 5.726 5.486 5.23 4.949 4.703 4.447 4.202 4.016 3.822 3.632 3.439 3.239 3.104 2.97 2.752 2.587 2.416 2.326 2.144 1.955 1.747 1.643 1.333 1.298 1.176 1.053 0.827 0.707 0.58 0.422 0.225 0.027 -0.234 -0.825 -10 ,3527 ,TETRA ,17525291,Thu Nov 25 00:09:06 CET,Thu Nov 25 02:26:24 CET,0.0 0.58 0.901 1.125 1.324 1.504 1.692 1.867 2.127 2.242 2.347 2.333 2.626 2.715 2.874 3.031 3.204 3.286 3.432 3.572 3.774 3.894 4.008 4.185 4.348 4.498 4.647 4.794 4.974 5.143 5.32 5.547 5.759 5.935 6.127 6.363 6.589 6.824 7.077 7.32 7.548 7.823 8.134 8.411 8.709 9.032 9.375 9.674 9.858 9.831 9.43 8.596 7.747 6.942 6.207 5.516 4.893 4.341 3.841 3.303 2.828 2.43 2.057 1.665 1.276 0.937 0.609 0.325 0.078 -0.18 -0.438 -0.635 -0.831 -1.043 -1.212 -1.389 -1.575 -1.755 -1.943 -2.087 -2.236 -2.464 -2.627 -2.776 -2.847 -3.009 -3.177 -3.349 -3.439 -3.731 -3.729 -3.831 -3.928 -4.14 -4.271 -4.422 -4.579 -4.774 -5.03 -5.288 -5.872 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 17618b9f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12008 ,TETRA ,17525294,Thu Nov 25 00:09:06 CET,Thu Nov 25 02:24:40 CET,0.0 1.576 1.864 2.088 2.283 2.438 2.578 2.712 2.937 3.039 3.138 3.127 3.422 3.513 3.697 3.866 4.012 4.085 4.231 4.361 4.55 4.679 4.807 4.997 5.173 5.333 5.49 5.649 5.868 6.087 6.294 6.541 6.751 6.934 7.147 7.38 7.612 7.854 8.108 8.372 8.657 8.975 9.313 9.651 10.049 10.483 10.926 11.349 11.719 11.982 11.945 11.468 10.877 10.232 9.586 8.959 8.408 7.869 7.417 6.981 6.591 6.249 5.9 5.581 5.289 5.01 4.705 4.408 4.151 3.889 3.618 3.392 3.152 2.905 2.717 2.526 2.339 2.133 1.899 1.746 1.596 1.362 1.192 1.016 0.926 0.734 0.526 0.316 0.204 -0.115 -0.144 -0.281 -0.414 -0.688 -0.835 -0.982 -1.158 -1.375 -1.672 -2.021 -2.829 -2 ,7697 ,TETRA ,17525295,Thu Nov 25 00:09:06 CET,Thu Nov 25 02:27:40 CET,0.0 0.775 1.055 1.25 1.426 1.573 1.709 1.83 2.047 2.158 2.255 2.225 2.53 2.63 2.809 2.979 3.152 3.232 3.381 3.528 3.741 3.867 3.994 4.208 4.417 4.616 4.798 4.951 5.134 5.318 5.503 5.716 5.914 6.107 6.341 6.611 6.866 7.145 7.43 7.726 8.026 8.35 8.73 9.096 9.485 9.891 10.321 10.73 11.086 11.288 11.228 10.746 10.198 9.653 9.087 8.555 8.091 7.642 7.217 6.784 6.401 6.045 5.719 5.402 5.069 4.761 4.453 4.19 3.972 3.731 3.472 3.254 3.03 2.804 2.631 2.451 2.252 2.052 1.843 1.694 1.542 1.291 1.108 0.929 0.844 0.667 0.477 0.281 0.177 -0.141 -0.18 -0.309 -0.435 -0.719 -0.882 -1.06 -1.261 -1.479 -1.749 -2.104 -2.82 -3 ,11709 ,TETRA ,17525296,Thu Nov 25 00:09:06 CET,Thu Nov 25 02:33:26 CET,0.0 0.827 1.042 1.221 1.385 1.541 1.665 1.78 2.001 2.091 2.188 2.193 2.503 2.604 2.803 2.995 3.159 3.241 3.417 3.567 3.772 3.896 4.013 4.193 4.382 4.557 4.691 4.814 4.993 5.17 5.339 5.536 5.716 5.885 6.09 6.323 6.541 6.788 7.046 7.294 7.528 7.79 8.106 8.402 8.733 9.076 9.425 9.736 9.964 10.018 9.655 8.819 7.936 7.147 6.496 5.908 5.342 4.827 4.398 3.962 3.566 3.188 2.831 2.508 2.201 1.907 1.58 1.267 0.994 0.723 0.445 0.213 -0.021 -0.255 -0.445 -0.651 -0.853 -1.067 -1.301 -1.451 -1.603 -1.853 -2.017 -2.19 -2.29 -2.494 -2.689 -2.885 -2.998 -3.329 -3.399 -3.532 -3.66 -3.957 -4.134 -4.329 -4.548 -4.792 -5.101 -5.475 -6.094 -4 ,18639 ,TETRA ,17525298,Thu Nov 25 00:10:05 CET,Thu Nov 25 02:30:24 CET,0.0 0.369 0.6 0.813 0.969 1.091 1.205 1.322 1.554 1.67 1.777 1.759 2.061 2.164 2.362 2.542 2.709 2.795 2.953 3.084 3.29 3.427 3.55 3.738 3.929 4.113 4.294 4.464 4.676 4.889 5.095 5.339 5.561 5.762 5.994 6.258 6.513 6.782 7.055 7.34 7.656 7.996 8.38 8.766 9.145 9.52 9.904 10.268 10.612 10.826 10.775 10.341 9.785 9.128 8.421 7.731 7.147 6.643 6.216 5.788 5.386 5.026 4.692 4.379 4.076 3.779 3.477 3.213 2.975 2.717 2.443 2.221 1.982 1.74 1.561 1.376 1.184 0.967 0.724 0.568 0.415 0.166 -0.012 -0.197 -0.292 -0.497 -0.699 -0.898 -1.015 -1.344 -1.378 -1.506 -1.641 -1.924 -2.09 -2.268 -2.449 -2.652 -2.891 -3.178 -4.424 -5 ,12086 ,TETRA ,17525300,Thu Nov 25 00:10:07 CET,Thu Nov 25 02:27:51 CET,0.0 0.563 0.778 0.992 1.172 1.326 1.474 1.605 1.843 1.952 2.051 2.034 2.325 2.411 2.57 2.715 2.862 2.94 3.089 3.24 3.465 3.601 3.723 3.896 4.058 4.212 4.368 4.527 4.75 4.984 5.183 5.392 5.582 5.762 5.977 6.23 6.485 6.754 7.029 7.306 7.594 7.932 8.357 8.751 9.172 9.613 10.108 10.642 11.086 11.429 11.569 11.279 10.779 10.192 9.622 9.073 8.544 8.021 7.568 7.129 6.735 6.367 6.015 5.681 5.362 5.059 4.73 4.43 4.183 3.931 3.658 3.434 3.204 2.964 2.763 2.55 2.332 2.107 1.885 1.734 1.577 1.34 1.168 0.985 0.897 0.7 0.475 0.253 0.144 -0.188 -0.243 -0.38 -0.512 -0.8 -0.964 -1.154 -1.378 -1.609 -1.847 -2.133 -2.944 -6 ,29208 ,TETRA ,17525302,Thu Nov 25 00:11:09 CET,Thu Nov 25 02:29:29 CET,0.0 0.552 0.791 0.973 1.133 1.285 1.432 1.574 1.842 1.963 2.076 2.084 2.391 2.496 2.68 2.845 3.008 3.087 3.238 3.387 3.604 3.742 3.873 4.066 4.268 4.463 4.636 4.799 4.999 5.192 5.386 5.597 5.8 6.01 6.239 6.476 6.719 7.009 7.316 7.608 7.886 8.198 8.571 8.918 9.254 9.597 9.97 10.326 10.62 10.707 10.322 9.471 8.535 7.638 6.839 6.103 5.411 4.738 4.095 3.424 2.865 2.366 1.884 1.428 0.987 0.558 0.121 -0.257 -0.599 -0.91 -1.168 -1.381 -1.607 -1.846 -2.027 -2.205 -2.395 -2.593 -2.8 -2.949 -3.113 -3.365 -3.53 -3.715 -3.815 -4.012 -4.236 -4.49 -4.609 -4.918 -4.975 -5.134 -5.287 -5.589 -5.78 -6.0 -6.211 -6.438 -6.711 -7.001 -7.692 -7 ,9070 ,TETRA ,17525304,Thu Nov 25 00:10:07 CET,Thu Nov 25 02:28:35 CET,0.0 0.676 0.877 1.081 1.278 1.459 1.63 1.786 2.028 2.125 2.225 2.209 2.523 2.636 2.828 2.986 3.15 3.231 3.385 3.537 3.742 3.885 4.021 4.219 4.405 4.573 4.75 4.929 5.138 5.33 5.523 5.759 5.977 6.174 6.407 6.695 6.962 7.233 7.531 7.854 8.19 8.554 8.957 9.342 9.756 10.183 10.622 11.077 11.519 11.839 11.833 11.343 10.744 10.094 9.475 8.9 8.38 7.91 7.467 6.971 6.514 6.115 5.764 5.447 5.164 4.907 4.625 4.375 4.153 3.905 3.637 3.415 3.192 2.97 2.799 2.622 2.436 2.239 2.029 1.886 1.745 1.515 1.348 1.176 1.087 0.902 0.718 0.526 0.423 0.107 0.062 -0.068 -0.2 -0.499 -0.674 -0.857 -1.052 -1.272 -1.531 -1.866 -2.76 -8 ,376 ,TETRA ,17525306,Thu Nov 25 00:11:10 CET,Thu Nov 25 02:31:21 CET,0.0 0.885 1.104 1.283 1.458 1.596 1.722 1.848 2.09 2.198 2.297 2.28 2.583 2.686 2.879 3.057 3.208 3.275 3.409 3.54 3.727 3.848 3.969 4.15 4.325 4.5 4.663 4.812 5.008 5.209 5.407 5.631 5.843 6.039 6.249 6.47 6.704 6.982 7.252 7.505 7.75 8.033 8.357 8.661 8.995 9.327 9.667 9.947 10.206 10.421 10.262 9.533 8.729 7.924 7.142 6.454 5.834 5.218 4.678 4.137 3.645 3.197 2.759 2.316 1.882 1.485 1.071 0.677 0.358 0.083 -0.188 -0.404 -0.628 -0.861 -1.025 -1.212 -1.411 -1.605 -1.805 -1.943 -2.091 -2.322 -2.486 -2.647 -2.733 -2.934 -3.138 -3.359 -3.481 -3.805 -3.819 -3.94 -4.074 -4.386 -4.552 -4.739 -4.954 -5.18 -5.405 -5.669 -6.826 -9 ,24465 ,TETRA ,17525308,Thu Nov 25 00:11:10 CET,Thu Nov 25 02:35:49 CET,0.0 0.687 0.942 1.118 1.256 1.378 1.498 1.626 1.865 1.97 2.069 2.059 2.356 2.433 2.582 2.726 2.863 2.936 3.092 3.232 3.419 3.537 3.655 3.825 3.98 4.134 4.285 4.427 4.61 4.795 4.969 5.195 5.422 5.63 5.875 6.145 6.394 6.678 6.98 7.284 7.592 7.913 8.282 8.673 9.138 9.61 10.042 10.456 10.872 11.184 11.258 10.971 10.539 10.084 9.611 9.127 8.671 8.232 7.851 7.484 7.161 6.853 6.537 6.221 5.921 5.651 5.371 5.11 4.896 4.682 4.447 4.245 4.029 3.8 3.617 3.437 3.26 3.076 2.876 2.731 2.576 2.324 2.144 1.964 1.864 1.649 1.433 1.208 1.095 0.782 0.771 0.644 0.507 0.233 0.093 -0.062 -0.232 -0.412 -0.614 -0.847 -1.444 -10 ,11200 ,TETRA ,17525309,Thu Nov 25 00:11:09 CET,Thu Nov 25 02:43:32 CET,0.0 0.886 1.15 1.344 1.52 1.666 1.805 1.953 2.211 2.328 2.44 2.44 2.752 2.851 3.005 3.155 3.303 3.376 3.522 3.665 3.878 4.015 4.14 4.317 4.487 4.658 4.834 5.011 5.226 5.422 5.612 5.845 6.067 6.268 6.491 6.743 6.964 7.213 7.496 7.762 8.041 8.353 8.692 9.002 9.356 9.732 10.091 10.417 10.708 10.868 10.624 9.902 9.065 8.282 7.471 6.665 5.928 5.224 4.634 4.014 3.449 2.951 2.448 1.951 1.561 1.263 0.936 0.632 0.385 0.133 -0.14 -0.36 -0.581 -0.817 -1.015 -1.218 -1.419 -1.637 -1.862 -2.024 -2.197 -2.449 -2.619 -2.795 -2.893 -3.093 -3.293 -3.512 -3.627 -3.957 -4.001 -4.14 -4.274 -4.553 -4.718 -4.883 -5.073 -5.298 -5.573 -5.852 -6.788 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt deleted file mode 100644 index bf537b65..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22066 ,TETRA ,17525313,Thu Nov 25 00:12:53 CET,Thu Nov 25 02:38:01 CET,0.0 0.877 1.137 1.358 1.563 1.736 1.876 2.015 2.309 2.452 2.589 2.65 2.973 3.082 3.295 3.504 3.717 3.827 4.051 4.261 4.556 4.745 4.933 5.198 5.439 5.668 5.888 6.1 6.376 6.648 6.898 7.197 7.487 7.769 8.108 8.498 8.875 9.309 9.805 10.332 10.859 11.458 12.178 12.903 13.765 14.709 15.794 17.026 18.495 20.225 22.255 23.895 24.867 25.433 25.695 25.834 25.899 25.896 25.85 25.776 25.709 25.625 25.501 25.368 25.235 25.097 24.929 24.765 24.625 24.484 24.332 24.198 24.063 23.918 23.799 23.666 23.538 23.398 23.243 23.143 23.023 22.838 22.711 22.563 22.487 22.338 22.173 21.996 21.909 21.629 21.582 21.467 21.347 21.089 20.949 20.807 20.666 20.503 20.315 20.094 19.604 -2 ,12296 ,TETRA ,17525315,Thu Nov 25 00:12:56 CET,Thu Nov 25 02:31:31 CET,0.0 0.573 0.906 1.133 1.339 1.51 1.673 1.831 2.1 2.218 2.335 2.358 2.669 2.783 3.029 3.277 3.511 3.613 3.801 3.987 4.254 4.425 4.591 4.83 5.059 5.281 5.496 5.705 5.984 6.255 6.526 6.865 7.192 7.512 7.899 8.349 8.774 9.228 9.708 10.207 10.727 11.329 12.069 12.793 13.623 14.573 15.645 16.826 18.22 19.868 21.816 23.338 24.223 24.76 25.036 25.19 25.262 25.29 25.26 25.181 25.098 25.011 24.909 24.808 24.702 24.586 24.459 24.351 24.249 24.14 24.024 23.918 23.803 23.679 23.589 23.492 23.376 23.263 23.133 23.029 22.924 22.767 22.657 22.549 22.492 22.358 22.224 22.094 22.022 21.759 21.786 21.687 21.586 21.374 21.263 21.148 21.02 20.856 20.67 20.452 19.94 -3 ,10797 ,TETRA ,17525316,Thu Nov 25 00:12:55 CET,Thu Nov 25 02:31:39 CET,0.0 0.465 0.756 0.99 1.182 1.35 1.515 1.68 2.014 2.18 2.334 2.376 2.704 2.816 3.024 3.235 3.454 3.559 3.746 3.929 4.215 4.4 4.556 4.78 5.009 5.228 5.445 5.659 5.939 6.22 6.487 6.814 7.138 7.443 7.801 8.221 8.624 9.047 9.511 10.015 10.546 11.143 11.818 12.49 13.297 14.225 15.276 16.429 17.752 19.234 20.918 22.1 22.677 23.117 23.376 23.483 23.529 23.507 23.461 23.404 23.325 23.216 23.078 22.934 22.789 22.654 22.534 22.418 22.297 22.165 22.022 21.898 21.77 21.631 21.517 21.404 21.284 21.155 21.019 20.917 20.812 20.641 20.527 20.411 20.345 20.213 20.087 19.933 19.85 19.581 19.583 19.488 19.394 19.145 18.998 18.84 18.665 18.486 18.287 18.03 17.159 -4 ,21837 ,TETRA ,17525317,Thu Nov 25 00:56:40 CET,Thu Nov 25 03:12:15 CET,0.0 0.871 1.132 1.341 1.633 1.981 2.289 2.568 3.026 3.234 3.428 3.507 3.818 3.925 4.146 4.353 4.531 4.622 4.799 4.958 5.199 5.363 5.526 5.77 5.998 6.212 6.429 6.646 6.924 7.197 7.466 7.794 8.104 8.409 8.776 9.176 9.553 9.967 10.415 10.904 11.456 12.101 12.828 13.553 14.414 15.366 16.48 17.753 19.269 21.049 23.107 24.718 25.568 26.016 26.244 26.345 26.387 26.377 26.32 26.23 26.122 26.017 25.911 25.81 25.696 25.561 25.4 25.245 25.119 24.983 24.827 24.694 24.545 24.39 24.268 24.144 24.01 23.854 23.706 23.614 23.521 23.36 23.245 23.129 23.068 22.933 22.783 22.635 22.556 22.275 22.252 22.161 22.055 21.798 21.653 21.502 21.36 21.19 20.954 20.666 19.972 -5 ,7585 ,TETRA ,17525318,Thu Nov 25 00:12:53 CET,Thu Nov 25 02:33:45 CET,0.0 1.187 1.471 1.659 1.857 2.036 2.208 2.367 2.646 2.776 2.897 2.927 3.245 3.364 3.601 3.818 4.019 4.114 4.318 4.518 4.782 4.944 5.099 5.347 5.589 5.814 6.033 6.248 6.52 6.774 7.019 7.318 7.615 7.905 8.245 8.638 9.03 9.456 9.911 10.403 10.94 11.553 12.257 12.994 13.842 14.78 15.893 17.132 18.611 20.374 22.422 24.034 24.863 25.337 25.669 25.866 25.956 25.975 25.915 25.766 25.591 25.413 25.261 25.153 25.045 24.927 24.789 24.662 24.535 24.389 24.248 24.124 23.987 23.837 23.717 23.595 23.473 23.344 23.208 23.112 23.003 22.758 22.577 22.436 22.377 22.257 22.118 21.966 21.884 21.618 21.611 21.506 21.403 21.172 21.037 20.897 20.743 20.568 20.366 20.133 19.651 -6 ,16808 ,TETRA ,17525319,Thu Nov 25 00:56:40 CET,Thu Nov 25 03:16:00 CET,0.0 0.612 0.884 1.116 1.302 1.479 1.641 1.785 2.084 2.23 2.37 2.43 2.765 2.897 3.134 3.359 3.562 3.659 3.854 4.041 4.305 4.486 4.67 4.92 5.17 5.418 5.655 5.883 6.157 6.416 6.675 6.991 7.311 7.622 7.982 8.377 8.753 9.198 9.688 10.195 10.729 11.36 12.073 12.745 13.522 14.37 15.335 16.388 17.619 19.067 20.704 21.879 22.419 22.619 22.63 22.517 22.312 22.086 21.852 21.586 21.336 21.1 20.867 20.619 20.36 20.12 19.926 19.793 19.671 19.525 19.381 19.263 19.127 18.986 18.878 18.769 18.655 18.529 18.397 18.302 18.199 18.051 17.947 17.84 17.786 17.663 17.531 17.39 17.314 17.057 17.082 16.994 16.896 16.66 16.525 16.398 16.264 16.114 15.926 15.644 14.726 -7 ,19957 ,TETRA ,17525320,Thu Nov 25 00:56:40 CET,Thu Nov 25 03:14:04 CET,0.0 0.579 0.806 0.969 1.137 1.308 1.458 1.592 1.832 1.944 2.06 2.076 2.38 2.489 2.698 2.902 3.1 3.197 3.385 3.561 3.813 3.977 4.142 4.382 4.619 4.857 5.081 5.298 5.571 5.837 6.096 6.404 6.71 7.015 7.379 7.793 8.192 8.618 9.073 9.549 10.047 10.649 11.388 12.129 12.958 13.873 14.973 16.216 17.645 19.26 21.172 22.728 23.583 24.084 24.33 24.428 24.471 24.465 24.392 24.288 24.203 24.13 24.049 23.937 23.813 23.696 23.566 23.441 23.329 23.197 23.033 22.891 22.741 22.602 22.502 22.39 22.265 22.127 21.982 21.878 21.772 21.621 21.518 21.402 21.337 21.202 21.063 20.919 20.846 20.597 20.628 20.534 20.439 20.224 20.088 19.948 19.806 19.674 19.505 19.25 18.647 -8 ,13645 ,TETRA ,17525321,Thu Nov 25 00:56:40 CET,Thu Nov 25 03:07:59 CET,0.0 1.759 2.063 2.291 2.483 2.656 2.82 2.987 3.331 3.481 3.602 3.611 3.926 4.033 4.246 4.44 4.645 4.752 4.955 5.16 5.46 5.649 5.819 6.059 6.294 6.514 6.723 6.935 7.222 7.504 7.777 8.112 8.43 8.763 9.164 9.6 10.013 10.463 10.961 11.502 12.08 12.743 13.507 14.243 15.104 16.099 17.246 18.493 19.931 21.657 23.578 24.895 25.513 25.868 26.051 26.156 26.21 26.205 26.156 26.044 25.935 25.846 25.751 25.641 25.525 25.41 25.282 25.154 25.019 24.882 24.747 24.629 24.504 24.37 24.253 24.129 23.999 23.854 23.715 23.622 23.518 23.343 23.223 23.107 23.046 22.903 22.768 22.607 22.513 22.251 22.251 22.148 22.051 21.816 21.674 21.53 21.395 21.247 21.035 20.775 20.304 -9 ,26999 ,TETRA ,17525322,Thu Nov 25 00:58:33 CET,Thu Nov 25 03:16:23 CET,0.0 0.407 0.647 0.834 1.019 1.192 1.333 1.462 1.706 1.816 1.923 1.929 2.241 2.351 2.565 2.76 2.951 3.048 3.238 3.423 3.685 3.862 4.033 4.268 4.497 4.727 4.949 5.157 5.433 5.715 5.988 6.317 6.64 6.95 7.317 7.729 8.121 8.557 9.021 9.497 9.989 10.547 11.205 11.885 12.662 13.547 14.62 15.785 17.17 18.864 20.792 22.287 23.08 23.52 23.759 23.872 23.919 23.925 23.885 23.79 23.687 23.594 23.499 23.414 23.335 23.238 23.114 23.003 22.905 22.801 22.676 22.568 22.462 22.35 22.256 22.153 22.057 21.952 21.809 21.699 21.602 21.471 21.379 21.273 21.216 21.077 20.919 20.771 20.686 20.411 20.429 20.335 20.235 20.006 19.864 19.715 19.538 19.346 19.182 18.973 18.39 -10 ,8705 ,TETRA ,17525324,Thu Nov 25 00:58:33 CET,Thu Nov 25 03:15:32 CET,0.0 0.589 0.894 1.13 1.343 1.535 1.71 1.886 2.203 2.349 2.481 2.514 2.837 2.952 3.182 3.408 3.616 3.718 3.917 4.12 4.413 4.589 4.766 5.016 5.249 5.482 5.699 5.908 6.189 6.462 6.714 7.017 7.315 7.597 7.951 8.367 8.752 9.182 9.644 10.128 10.643 11.224 11.928 12.656 13.516 14.478 15.541 16.729 18.105 19.609 21.29 22.638 23.394 23.81 24.039 24.184 24.233 24.189 24.121 24.045 23.961 23.867 23.756 23.63 23.515 23.418 23.315 23.201 23.097 22.992 22.85 22.708 22.573 22.438 22.329 22.208 22.081 21.946 21.798 21.7 21.608 21.454 21.346 21.227 21.161 21.035 20.898 20.736 20.653 20.394 20.416 20.313 20.185 19.93 19.809 19.676 19.521 19.36 19.148 18.852 18.176 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt deleted file mode 100644 index f3e32f28..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31073 ,TETRA ,17525326,Thu Nov 25 00:58:34 CET,Thu Nov 25 03:14:09 CET,0.0 0.522 0.849 1.094 1.278 1.444 1.6 1.756 2.024 2.124 2.217 2.212 2.507 2.591 2.754 2.905 3.057 3.141 3.296 3.434 3.641 3.773 3.898 4.073 4.233 4.398 4.564 4.716 4.917 5.093 5.235 5.407 5.587 5.765 5.988 6.244 6.475 6.724 6.981 7.251 7.537 7.851 8.188 8.507 8.853 9.178 9.473 9.737 9.947 10.013 9.706 8.922 8.034 7.14 6.269 5.46 4.75 4.075 3.5 2.93 2.411 1.917 1.436 0.983 0.546 0.131 -0.326 -0.686 -0.933 -1.178 -1.454 -1.692 -1.925 -2.159 -2.347 -2.554 -2.768 -2.978 -3.191 -3.335 -3.493 -3.741 -3.91 -4.095 -4.193 -4.4 -4.604 -4.819 -4.932 -5.261 -5.325 -5.467 -5.623 -5.964 -6.147 -6.347 -6.549 -6.778 -7.073 -7.415 -8.973 -2 ,31230 ,TETRA ,17525328,Thu Nov 25 00:58:36 CET,Thu Nov 25 03:18:22 CET,0.0 0.372 0.649 0.861 1.03 1.17 1.289 1.392 1.604 1.702 1.8 1.803 2.111 2.203 2.359 2.526 2.687 2.749 2.888 3.048 3.28 3.42 3.542 3.715 3.87 4.02 4.167 4.31 4.493 4.669 4.843 5.051 5.256 5.452 5.663 5.903 6.157 6.44 6.732 7.042 7.36 7.673 8.011 8.333 8.683 9.05 9.419 9.802 10.144 10.357 10.359 10.0 9.444 8.868 8.314 7.779 7.293 6.835 6.401 5.945 5.554 5.214 4.892 4.583 4.296 4.012 3.716 3.467 3.246 3.03 2.815 2.625 2.418 2.189 1.996 1.788 1.58 1.355 1.121 0.967 0.808 0.542 0.349 0.152 0.062 -0.118 -0.318 -0.538 -0.652 -0.978 -1.036 -1.171 -1.307 -1.594 -1.755 -1.96 -2.215 -2.477 -2.739 -3.109 -4.757 -3 ,7169 ,TETRA ,17525330,Thu Nov 25 00:59:29 CET,Thu Nov 25 03:14:57 CET,0.0 0.28 0.51 0.672 0.799 0.926 1.051 1.16 1.356 1.45 1.535 1.52 1.825 1.909 2.076 2.233 2.372 2.444 2.59 2.735 2.943 3.062 3.182 3.355 3.505 3.651 3.794 3.928 4.106 4.281 4.456 4.655 4.838 5.017 5.228 5.467 5.699 5.932 6.162 6.413 6.666 6.949 7.287 7.606 7.944 8.274 8.6 8.925 9.212 9.29 8.954 8.193 7.313 6.426 5.541 4.659 3.904 3.238 2.719 2.254 1.864 1.513 1.154 0.833 0.544 0.256 -0.054 -0.321 -0.54 -0.754 -0.981 -1.195 -1.429 -1.668 -1.844 -2.034 -2.232 -2.426 -2.64 -2.786 -2.935 -3.176 -3.342 -3.51 -3.601 -3.802 -4.002 -4.214 -4.343 -4.693 -4.754 -4.891 -5.039 -5.388 -5.593 -5.809 -6.051 -6.311 -6.614 -7.042 -8.747 -4 ,16679 ,TETRA ,17525332,Thu Nov 25 00:59:29 CET,Thu Nov 25 03:17:34 CET,0.0 0.515 0.735 0.878 1.0 1.121 1.237 1.351 1.573 1.693 1.808 1.791 2.081 2.166 2.335 2.495 2.647 2.713 2.831 2.956 3.164 3.29 3.413 3.59 3.746 3.918 4.088 4.231 4.406 4.587 4.76 4.948 5.137 5.334 5.553 5.786 6.006 6.251 6.507 6.777 7.066 7.393 7.749 8.065 8.438 8.836 9.19 9.495 9.785 9.922 9.631 8.917 8.124 7.289 6.504 5.772 5.11 4.465 3.864 3.234 2.684 2.206 1.744 1.264 0.808 0.427 0.083 -0.185 -0.412 -0.647 -0.905 -1.127 -1.346 -1.572 -1.753 -1.937 -2.13 -2.34 -2.572 -2.739 -2.908 -3.172 -3.352 -3.528 -3.612 -3.787 -3.985 -4.202 -4.321 -4.662 -4.728 -4.857 -4.988 -5.269 -5.406 -5.57 -5.765 -5.986 -6.244 -6.59 -8.399 -5 ,25954 ,TETRA ,17525334,Thu Nov 25 00:59:30 CET,Thu Nov 25 03:10:05 CET,0.0 1.501 1.728 1.913 2.093 2.254 2.407 2.564 2.823 2.945 3.057 3.052 3.361 3.447 3.603 3.756 3.907 3.978 4.118 4.259 4.45 4.567 4.696 4.882 5.042 5.201 5.354 5.505 5.724 5.942 6.154 6.397 6.608 6.801 7.02 7.259 7.488 7.733 8.009 8.311 8.598 8.901 9.25 9.566 9.904 10.288 10.645 10.93 11.111 11.19 10.965 10.225 9.336 8.436 7.644 6.935 6.252 5.583 5.008 4.429 3.907 3.421 2.956 2.534 2.133 1.736 1.313 0.93 0.586 0.227 -0.156 -0.489 -0.85 -1.242 -1.546 -1.843 -2.148 -2.478 -2.779 -2.943 -3.104 -3.359 -3.552 -3.749 -3.84 -4.042 -4.264 -4.492 -4.608 -4.941 -4.978 -5.116 -5.27 -5.6 -5.764 -5.928 -6.133 -6.396 -6.702 -7.029 -9.232 -6 ,8268 ,TETRA ,17525336,Thu Nov 25 01:00:29 CET,Thu Nov 25 03:12:46 CET,0.0 0.64 0.894 1.095 1.26 1.393 1.51 1.627 1.839 1.935 2.025 1.986 2.275 2.356 2.526 2.702 2.876 2.952 3.075 3.191 3.356 3.465 3.578 3.755 3.931 4.084 4.222 4.36 4.55 4.739 4.928 5.15 5.35 5.541 5.763 5.996 6.208 6.457 6.737 7.028 7.307 7.623 7.968 8.262 8.598 8.947 9.303 9.664 9.999 10.231 10.217 9.788 9.214 8.61 8.021 7.47 6.969 6.493 6.037 5.554 5.128 4.716 4.333 4.002 3.681 3.369 3.049 2.778 2.545 2.301 2.053 1.846 1.627 1.408 1.238 1.042 0.841 0.631 0.385 0.217 0.059 -0.188 -0.366 -0.552 -0.644 -0.828 -1.044 -1.284 -1.402 -1.731 -1.78 -1.925 -2.075 -2.422 -2.607 -2.765 -2.938 -3.162 -3.43 -3.79 -5.355 -7 ,30219 ,TETRA ,17525338,Thu Nov 25 01:00:29 CET,Thu Nov 25 03:18:56 CET,0.0 0.465 0.705 0.885 1.043 1.182 1.302 1.421 1.655 1.758 1.856 1.843 2.132 2.209 2.356 2.506 2.657 2.732 2.892 3.039 3.221 3.35 3.484 3.663 3.827 3.973 4.109 4.245 4.415 4.585 4.755 4.959 5.144 5.307 5.508 5.738 5.948 6.179 6.435 6.711 6.996 7.299 7.629 7.934 8.256 8.576 8.914 9.289 9.642 9.872 9.846 9.347 8.711 8.034 7.41 6.838 6.33 5.869 5.454 5.017 4.607 4.232 3.872 3.527 3.21 2.916 2.605 2.331 2.089 1.847 1.603 1.397 1.188 0.973 0.802 0.613 0.415 0.211 -0.018 -0.183 -0.341 -0.577 -0.739 -0.903 -0.987 -1.152 -1.322 -1.51 -1.614 -1.931 -1.946 -2.083 -2.224 -2.506 -2.69 -2.899 -3.107 -3.357 -3.621 -3.906 -5.087 -8 ,24413 ,TETRA ,17525340,Thu Nov 25 01:00:29 CET,Thu Nov 25 03:20:38 CET,0.0 0.466 0.675 0.864 1.029 1.191 1.332 1.455 1.709 1.829 1.929 1.901 2.193 2.282 2.472 2.655 2.805 2.872 3.007 3.137 3.331 3.456 3.572 3.741 3.908 4.069 4.224 4.377 4.568 4.739 4.914 5.119 5.305 5.508 5.752 6.018 6.273 6.528 6.772 7.025 7.294 7.602 7.939 8.223 8.535 8.841 9.128 9.412 9.636 9.662 9.277 8.443 7.5 6.595 5.743 4.93 4.208 3.548 2.957 2.372 1.87 1.396 0.928 0.465 0.005 -0.443 -0.849 -1.135 -1.386 -1.645 -1.918 -2.157 -2.392 -2.635 -2.831 -3.017 -3.221 -3.455 -3.681 -3.833 -4.003 -4.265 -4.429 -4.61 -4.712 -4.915 -5.113 -5.336 -5.457 -5.793 -5.838 -5.968 -6.112 -6.423 -6.588 -6.773 -6.981 -7.225 -7.573 -8.026 -9.727 -9 ,7042 ,TETRA ,17525342,Thu Nov 25 00:57:31 CET,Thu Nov 25 03:17:25 CET,0.0 0.331 0.515 0.689 0.863 1.006 1.144 1.297 1.565 1.686 1.805 1.804 2.103 2.184 2.34 2.5 2.66 2.741 2.893 3.035 3.24 3.378 3.497 3.657 3.827 4.002 4.167 4.313 4.5 4.695 4.884 5.11 5.322 5.511 5.726 5.955 6.179 6.424 6.66 6.891 7.122 7.377 7.67 7.943 8.213 8.477 8.749 9.056 9.346 9.386 8.971 8.123 7.286 6.458 5.651 4.904 4.204 3.536 2.97 2.401 1.97 1.626 1.289 0.971 0.666 0.391 0.102 -0.183 -0.438 -0.704 -0.979 -1.199 -1.428 -1.674 -1.862 -2.05 -2.26 -2.493 -2.738 -2.905 -3.078 -3.359 -3.558 -3.764 -3.864 -4.078 -4.301 -4.513 -4.628 -4.956 -4.983 -5.117 -5.252 -5.55 -5.725 -5.905 -6.099 -6.333 -6.61 -6.943 -8.193 -10 ,15168 ,TETRA ,17525343,Thu Nov 25 01:01:30 CET,Thu Nov 25 03:16:47 CET,0.0 0.968 1.24 1.459 1.643 1.811 1.965 2.086 2.302 2.402 2.495 2.46 2.757 2.84 2.994 3.138 3.287 3.357 3.488 3.62 3.807 3.932 4.06 4.239 4.4 4.551 4.689 4.827 5.028 5.213 5.393 5.619 5.83 6.034 6.242 6.46 6.677 6.926 7.184 7.454 7.747 8.032 8.338 8.636 8.942 9.229 9.493 9.742 9.901 9.886 9.463 8.541 7.595 6.672 5.832 5.021 4.295 3.667 3.203 2.787 2.408 2.046 1.679 1.349 1.063 0.792 0.488 0.219 -0.019 -0.275 -0.535 -0.746 -0.972 -1.218 -1.407 -1.6 -1.79 -1.982 -2.188 -2.336 -2.494 -2.737 -2.913 -3.103 -3.199 -3.393 -3.588 -3.783 -3.891 -4.211 -4.243 -4.386 -4.519 -4.784 -4.941 -5.127 -5.34 -5.574 -5.848 -6.193 -8.076 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 92f63d8c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29986 ,TETRA ,17525344,Thu Nov 25 01:01:30 CET,Thu Nov 25 03:20:50 CET,0.0 0.283 0.49 0.648 0.81 0.976 1.104 1.225 1.459 1.574 1.699 1.697 1.984 2.068 2.247 2.422 2.597 2.683 2.848 3.005 3.21 3.339 3.464 3.651 3.842 4.035 4.218 4.373 4.562 4.761 4.957 5.187 5.405 5.607 5.84 6.115 6.411 6.746 7.101 7.467 7.812 8.179 8.606 9.027 9.51 10.021 10.591 11.188 11.816 12.536 13.278 13.568 13.461 13.283 13.07 12.791 12.51 12.245 12.009 11.731 11.459 11.208 10.978 10.763 10.553 10.353 10.128 9.923 9.758 9.571 9.354 9.179 9.004 8.822 8.679 8.526 8.359 8.174 7.978 7.851 7.72 7.511 7.366 7.213 7.131 6.966 6.792 6.618 6.525 6.205 6.168 6.057 5.936 5.673 5.533 5.361 5.165 4.959 4.721 4.362 3.157 -2 ,21724 ,TETRA ,17525345,Thu Nov 25 00:57:32 CET,Thu Nov 25 03:15:20 CET,0.0 0.369 0.596 0.808 0.96 1.09 1.217 1.342 1.567 1.665 1.764 1.76 2.06 2.147 2.296 2.451 2.612 2.686 2.823 2.957 3.148 3.272 3.391 3.559 3.741 3.928 4.106 4.268 4.462 4.646 4.835 5.083 5.313 5.52 5.751 6.009 6.255 6.534 6.833 7.144 7.48 7.848 8.258 8.677 9.163 9.689 10.279 10.899 11.561 12.241 12.981 13.41 13.428 13.27 13.001 12.69 12.369 12.024 11.727 11.432 11.157 10.898 10.662 10.426 10.171 9.929 9.684 9.468 9.276 9.058 8.818 8.616 8.409 8.199 8.025 7.852 7.676 7.489 7.312 7.18 7.032 6.782 6.618 6.472 6.393 6.222 6.027 5.809 5.687 5.357 5.333 5.209 5.071 4.784 4.628 4.434 4.213 3.947 3.628 3.217 1.692 -3 ,22532 ,TETRA ,17525346,Thu Nov 25 00:57:32 CET,Thu Nov 25 03:14:23 CET,0.0 0.319 0.521 0.702 0.857 0.986 1.118 1.251 1.481 1.586 1.693 1.69 1.985 2.078 2.293 2.49 2.64 2.712 2.859 2.998 3.2 3.338 3.463 3.634 3.807 3.973 4.134 4.296 4.5 4.758 5.073 5.444 5.797 6.131 6.5 6.888 7.237 7.608 8.004 8.426 8.848 9.29 9.805 10.326 10.927 11.571 12.257 13.016 13.816 14.606 15.346 15.541 15.315 14.968 14.583 14.14 13.674 13.216 12.801 12.362 11.982 11.667 11.359 11.061 10.803 10.569 10.317 10.081 9.869 9.653 9.423 9.226 9.017 8.798 8.619 8.416 8.197 7.977 7.762 7.62 7.478 7.235 7.065 6.883 6.783 6.585 6.383 6.169 6.062 5.756 5.725 5.599 5.457 5.117 4.941 4.773 4.606 4.403 4.156 3.84 2.626 -4 ,14489 ,TETRA ,17525347,Thu Nov 25 00:57:32 CET,Thu Nov 25 03:14:23 CET,0.0 0.804 1.05 1.262 1.442 1.605 1.759 1.91 2.173 2.286 2.407 2.431 2.733 2.83 3.017 3.205 3.386 3.495 3.738 3.965 4.285 4.488 4.686 4.971 5.231 5.474 5.716 5.955 6.259 6.55 6.819 7.123 7.424 7.717 8.052 8.427 8.777 9.156 9.553 9.966 10.395 10.848 11.362 11.857 12.419 13.033 13.702 14.403 15.156 15.923 16.611 16.751 16.54 16.287 16.016 15.69 15.367 15.07 14.797 14.506 14.212 13.933 13.681 13.448 13.225 12.998 12.749 12.532 12.358 12.174 11.962 11.786 11.606 11.422 11.284 11.123 10.943 10.767 10.599 10.473 10.32 10.089 9.934 9.779 9.701 9.533 9.348 9.158 9.051 8.716 8.671 8.539 8.402 8.128 7.973 7.776 7.569 7.357 7.102 6.76 5.609 -5 ,14144 ,TETRA ,17525348,Thu Nov 25 00:57:32 CET,Thu Nov 25 03:15:06 CET,0.0 0.47 0.718 0.893 1.048 1.204 1.369 1.505 1.715 1.815 1.91 1.88 2.179 2.267 2.434 2.609 2.778 2.849 2.983 3.118 3.32 3.448 3.571 3.755 3.925 4.091 4.26 4.417 4.617 4.816 5.011 5.243 5.459 5.663 5.885 6.129 6.38 6.666 6.97 7.282 7.608 7.981 8.421 8.864 9.358 9.882 10.44 11.059 11.827 12.656 13.359 13.523 13.25 12.782 12.284 11.822 11.363 10.902 10.458 9.996 9.638 9.315 8.984 8.674 8.382 8.116 7.846 7.602 7.385 7.136 6.864 6.641 6.414 6.176 5.98 5.773 5.551 5.339 5.144 5.004 4.853 4.594 4.422 4.251 4.157 3.967 3.752 3.522 3.417 3.104 3.072 2.936 2.791 2.498 2.324 2.112 1.881 1.619 1.269 0.824 -0.434 -6 ,15204 ,TETRA ,17525349,Thu Nov 25 00:57:32 CET,Thu Nov 25 03:18:29 CET,0.0 0.813 1.035 1.21 1.384 1.543 1.714 1.884 2.16 2.272 2.375 2.37 2.669 2.762 2.945 3.132 3.317 3.399 3.539 3.684 3.906 4.041 4.17 4.412 4.69 4.945 5.192 5.434 5.748 6.039 6.306 6.634 6.948 7.245 7.587 7.963 8.311 8.683 9.075 9.494 9.948 10.456 11.025 11.573 12.164 12.8 13.497 14.232 15.049 15.863 16.563 16.718 16.501 16.169 15.764 15.305 14.866 14.43 13.982 13.523 13.121 12.727 12.323 11.935 11.557 11.196 10.817 10.519 10.316 10.115 9.892 9.697 9.495 9.292 9.138 8.967 8.78 8.591 8.395 8.257 8.112 7.884 7.732 7.564 7.466 7.26 7.037 6.794 6.662 6.328 6.24 6.098 5.948 5.6 5.415 5.206 4.96 4.688 4.38 3.966 2.329 -7 ,12445 ,TETRA ,17525350,Thu Nov 25 00:57:32 CET,Thu Nov 25 03:17:50 CET,0.0 0.879 1.13 1.319 1.497 1.657 1.813 1.964 2.248 2.377 2.486 2.49 2.807 2.917 3.116 3.302 3.472 3.551 3.702 3.848 4.056 4.191 4.318 4.498 4.673 4.855 5.031 5.18 5.372 5.562 5.759 5.995 6.256 6.551 6.88 7.258 7.621 7.992 8.383 8.808 9.248 9.726 10.286 10.826 11.408 12.033 12.73 13.451 14.228 15.063 15.807 16.028 15.878 15.553 15.156 14.725 14.302 13.856 13.42 13.032 12.725 12.438 12.174 11.918 11.66 11.42 11.167 10.95 10.761 10.558 10.349 10.176 9.995 9.789 9.619 9.427 9.21 9.006 8.798 8.657 8.516 8.279 8.123 7.968 7.884 7.701 7.503 7.274 7.152 6.822 6.746 6.588 6.423 6.088 5.904 5.687 5.451 5.228 4.981 4.56 2.431 -8 ,25641 ,TETRA ,17525351,Thu Nov 25 01:02:31 CET,Thu Nov 25 03:23:18 CET,0.0 0.534 0.807 1.008 1.186 1.333 1.476 1.623 1.892 2.014 2.119 2.106 2.407 2.502 2.679 2.848 3.007 3.082 3.22 3.346 3.552 3.691 3.815 3.991 4.161 4.331 4.497 4.654 4.862 5.068 5.264 5.488 5.71 5.933 6.181 6.468 6.73 7.019 7.35 7.691 8.036 8.423 8.876 9.307 9.799 10.343 10.931 11.538 12.196 12.927 13.585 13.777 13.675 13.465 13.203 12.936 12.668 12.362 12.068 11.75 11.47 11.23 10.977 10.723 10.477 10.236 9.975 9.732 9.528 9.317 9.089 8.916 8.74 8.548 8.403 8.242 8.068 7.888 7.69 7.56 7.428 7.217 7.072 6.921 6.841 6.654 6.461 6.276 6.175 5.873 5.865 5.744 5.615 5.347 5.197 5.037 4.837 4.57 4.245 3.854 2.384 -9 ,26505 ,TETRA ,17525352,Thu Nov 25 00:57:32 CET,Thu Nov 25 03:15:49 CET,0.0 0.484 0.652 0.816 0.97 1.11 1.251 1.393 1.666 1.788 1.893 1.867 2.178 2.282 2.46 2.621 2.801 2.896 3.069 3.231 3.448 3.587 3.736 3.948 4.159 4.371 4.579 4.76 4.974 5.189 5.377 5.594 5.812 6.038 6.311 6.596 6.864 7.161 7.481 7.811 8.139 8.524 8.969 9.387 9.868 10.37 10.932 11.549 12.211 12.893 13.506 13.718 13.599 13.339 13.055 12.725 12.394 12.083 11.774 11.44 11.141 10.888 10.641 10.394 10.168 9.96 9.723 9.504 9.302 9.083 8.865 8.686 8.501 8.298 8.133 7.971 7.796 7.614 7.437 7.302 7.156 6.927 6.78 6.632 6.55 6.381 6.203 6.01 5.897 5.571 5.548 5.427 5.298 5.034 4.884 4.714 4.529 4.311 4.025 3.61 2.144 -10 ,14777 ,TETRA ,17525353,Thu Nov 25 00:57:32 CET,Thu Nov 25 03:17:28 CET,0.0 0.496 0.711 0.899 1.055 1.185 1.31 1.423 1.623 1.721 1.816 1.8 2.094 2.174 2.341 2.514 2.689 2.767 2.91 3.056 3.266 3.393 3.52 3.724 3.976 4.256 4.519 4.767 5.078 5.377 5.671 6.021 6.347 6.646 6.976 7.355 7.717 8.103 8.518 8.954 9.405 9.893 10.44 10.962 11.536 12.16 12.856 13.616 14.427 15.232 15.939 16.143 15.983 15.669 15.257 14.822 14.382 13.935 13.513 13.073 12.682 12.27 11.848 11.472 11.169 10.922 10.656 10.418 10.212 9.983 9.745 9.548 9.34 9.123 8.948 8.774 8.591 8.401 8.201 8.051 7.889 7.637 7.479 7.309 7.217 7.037 6.834 6.622 6.516 6.18 6.086 5.936 5.777 5.457 5.288 5.088 4.849 4.6 4.295 3.918 2.585 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt deleted file mode 100644 index 7cfa054a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6390 ,TETRA ,17525354,Thu Nov 25 00:57:34 CET,Thu Nov 25 03:15:34 CET,0.0 0.385 0.57 0.767 0.937 1.07 1.181 1.298 1.507 1.592 1.681 1.656 1.911 1.986 2.12 2.262 2.39 2.443 2.548 2.648 2.809 2.913 3.007 3.142 3.262 3.37 3.474 3.567 3.687 3.818 3.93 4.041 4.148 4.263 4.388 4.512 4.637 4.783 4.918 5.036 5.146 5.274 5.404 5.491 5.538 5.509 5.407 5.186 4.752 4.031 2.767 1.052 -0.455 -1.784 -2.928 -3.961 -4.906 -5.751 -6.437 -7.135 -7.775 -8.35 -8.879 -9.391 -9.868 -10.274 -10.675 -11.04 -11.363 -11.688 -12.014 -12.279 -12.554 -12.836 -13.054 -13.283 -13.528 -13.78 -14.018 -14.172 -14.322 -14.556 -14.724 -14.897 -14.989 -15.177 -15.372 -15.599 -15.733 -16.072 -16.138 -16.262 -16.376 -16.651 -16.802 -16.951 -17.128 -17.33 -17.565 -17.885 -18.63 -2 ,26398 ,TETRA ,17525355,Thu Nov 25 00:57:34 CET,Thu Nov 25 03:15:39 CET,0.0 0.877 1.123 1.336 1.521 1.676 1.827 1.968 2.222 2.342 2.443 2.41 2.681 2.765 2.941 3.093 3.217 3.283 3.409 3.518 3.677 3.787 3.893 4.027 4.156 4.285 4.42 4.556 4.709 4.845 4.971 5.112 5.253 5.377 5.513 5.666 5.804 5.959 6.095 6.208 6.319 6.437 6.568 6.642 6.68 6.691 6.636 6.509 6.199 5.567 4.347 2.607 1.033 -0.347 -1.557 -2.616 -3.523 -4.338 -5.022 -5.704 -6.326 -6.903 -7.439 -7.915 -8.327 -8.711 -9.102 -9.429 -9.722 -10.032 -10.367 -10.64 -10.913 -11.2 -11.42 -11.645 -11.886 -12.146 -12.404 -12.57 -12.737 -13.015 -13.21 -13.418 -13.529 -13.744 -13.966 -14.213 -14.346 -14.676 -14.737 -14.871 -15.008 -15.319 -15.483 -15.651 -15.841 -16.079 -16.354 -16.615 -17.217 -3 ,2410 ,TETRA ,17525356,Thu Nov 25 00:57:34 CET,Thu Nov 25 03:16:26 CET,0.0 0.772 1.014 1.19 1.374 1.523 1.629 1.724 1.916 2.007 2.09 2.073 2.345 2.422 2.562 2.701 2.826 2.885 3.0 3.108 3.264 3.369 3.477 3.621 3.75 3.875 3.986 4.083 4.208 4.34 4.468 4.619 4.761 4.895 5.037 5.168 5.289 5.421 5.545 5.647 5.727 5.817 5.926 6.022 6.077 6.056 5.95 5.76 5.375 4.605 3.201 1.302 -0.458 -1.908 -3.079 -4.164 -5.097 -5.914 -6.623 -7.315 -7.911 -8.442 -8.935 -9.392 -9.822 -10.218 -10.628 -10.981 -11.278 -11.609 -11.964 -12.24 -12.526 -12.82 -13.043 -13.267 -13.495 -13.736 -13.996 -14.187 -14.374 -14.646 -14.842 -15.04 -15.144 -15.376 -15.623 -15.865 -15.979 -16.3 -16.369 -16.507 -16.636 -16.917 -17.084 -17.266 -17.463 -17.665 -17.885 -18.16 -19.054 -4 ,26979 ,TETRA ,17525357,Thu Nov 25 00:57:34 CET,Thu Nov 25 03:16:23 CET,0.0 0.679 0.936 1.128 1.281 1.435 1.596 1.743 1.993 2.098 2.202 2.21 2.489 2.571 2.728 2.885 3.026 3.086 3.208 3.325 3.483 3.59 3.703 3.86 3.996 4.124 4.24 4.338 4.48 4.637 4.773 4.913 5.043 5.183 5.345 5.501 5.632 5.767 5.924 6.08 6.194 6.289 6.409 6.507 6.57 6.603 6.564 6.399 6.036 5.391 4.073 2.26 0.612 -0.762 -1.873 -2.879 -3.818 -4.656 -5.361 -6.059 -6.634 -7.151 -7.658 -8.154 -8.613 -9.015 -9.427 -9.808 -10.136 -10.466 -10.813 -11.115 -11.405 -11.69 -11.919 -12.149 -12.39 -12.644 -12.907 -13.097 -13.293 -13.593 -13.802 -14.004 -14.106 -14.331 -14.586 -14.852 -14.981 -15.314 -15.346 -15.48 -15.625 -15.92 -16.07 -16.223 -16.403 -16.627 -16.882 -17.228 -18.204 -5 ,16459 ,TETRA ,17525358,Thu Nov 25 00:57:36 CET,Thu Nov 25 03:16:29 CET,0.0 0.45 0.702 0.913 1.097 1.25 1.392 1.55 1.814 1.916 2.015 2.026 2.311 2.39 2.527 2.651 2.77 2.828 2.937 3.039 3.189 3.283 3.375 3.51 3.626 3.745 3.867 3.973 4.1 4.219 4.321 4.432 4.533 4.631 4.753 4.894 5.007 5.132 5.258 5.359 5.449 5.549 5.652 5.714 5.749 5.772 5.711 5.52 5.147 4.505 3.25 1.543 0.108 -1.167 -2.269 -3.263 -4.161 -4.954 -5.667 -6.383 -6.961 -7.484 -7.993 -8.473 -8.904 -9.289 -9.687 -10.055 -10.383 -10.72 -11.085 -11.38 -11.671 -11.965 -12.189 -12.416 -12.648 -12.897 -13.153 -13.33 -13.513 -13.791 -13.989 -14.205 -14.313 -14.522 -14.743 -14.967 -15.083 -15.413 -15.459 -15.597 -15.741 -16.039 -16.188 -16.347 -16.522 -16.708 -16.91 -17.213 -18.083 -6 ,31196 ,TETRA ,17525359,Thu Nov 25 00:57:37 CET,Thu Nov 25 03:02:04 CET,0.0 0.467 0.733 0.944 1.103 1.234 1.369 1.501 1.762 1.882 1.989 1.984 2.25 2.331 2.504 2.656 2.802 2.878 3.01 3.14 3.323 3.429 3.528 3.68 3.823 3.947 4.069 4.181 4.323 4.46 4.576 4.71 4.847 4.977 5.127 5.289 5.413 5.518 5.62 5.736 5.838 5.922 5.98 5.997 5.985 5.938 5.855 5.621 5.141 4.383 3.05 1.312 -0.227 -1.551 -2.685 -3.718 -4.648 -5.475 -6.169 -6.858 -7.411 -7.893 -8.37 -8.81 -9.213 -9.569 -9.941 -10.298 -10.607 -10.907 -11.203 -11.456 -11.719 -11.985 -12.19 -12.399 -12.616 -12.842 -13.083 -13.247 -13.404 -13.65 -13.824 -14.002 -14.089 -14.268 -14.463 -14.671 -14.784 -15.083 -15.121 -15.244 -15.37 -15.643 -15.79 -15.937 -16.105 -16.31 -16.524 -16.779 -17.622 -7 ,26368 ,TETRA ,17525360,Thu Nov 25 01:02:31 CET,Thu Nov 25 03:15:08 CET,0.0 0.546 0.802 0.989 1.144 1.285 1.421 1.565 1.834 1.952 2.065 2.06 2.33 2.414 2.561 2.699 2.847 2.915 3.027 3.137 3.307 3.41 3.513 3.684 3.846 3.988 4.125 4.25 4.394 4.536 4.672 4.827 4.958 5.074 5.203 5.331 5.458 5.601 5.741 5.879 6.007 6.118 6.234 6.339 6.404 6.422 6.385 6.23 5.858 5.144 3.816 2.106 0.635 -0.699 -1.905 -2.998 -3.926 -4.766 -5.493 -6.203 -6.824 -7.396 -7.931 -8.428 -8.876 -9.247 -9.617 -9.953 -10.233 -10.508 -10.797 -11.039 -11.299 -11.584 -11.806 -12.031 -12.263 -12.504 -12.773 -12.966 -13.144 -13.405 -13.596 -13.803 -13.908 -14.119 -14.325 -14.534 -14.639 -14.954 -15.01 -15.144 -15.282 -15.583 -15.725 -15.872 -16.048 -16.23 -16.444 -16.789 -17.385 -8 ,4397 ,TETRA ,17525361,Thu Nov 25 01:02:32 CET,Thu Nov 25 03:21:19 CET,0.0 0.83 1.104 1.317 1.489 1.634 1.767 1.894 2.145 2.253 2.353 2.332 2.593 2.671 2.818 2.963 3.105 3.167 3.29 3.398 3.527 3.615 3.702 3.833 3.952 4.067 4.192 4.311 4.453 4.584 4.711 4.86 4.996 5.13 5.284 5.441 5.589 5.736 5.87 6.002 6.128 6.259 6.389 6.513 6.634 6.695 6.68 6.566 6.282 5.663 4.291 2.494 1.019 -0.283 -1.47 -2.536 -3.424 -4.244 -4.976 -5.71 -6.341 -6.868 -7.385 -7.881 -8.316 -8.724 -9.156 -9.538 -9.862 -10.177 -10.483 -10.743 -11.021 -11.316 -11.537 -11.763 -12.004 -12.245 -12.491 -12.66 -12.833 -13.11 -13.311 -13.512 -13.613 -13.829 -14.06 -14.292 -14.418 -14.762 -14.843 -14.99 -15.145 -15.476 -15.661 -15.856 -16.049 -16.269 -16.517 -16.8 -17.576 -9 ,1806 ,TETRA ,17525362,Thu Nov 25 01:02:32 CET,Thu Nov 25 03:20:03 CET,0.0 0.444 0.687 0.867 1.003 1.136 1.269 1.399 1.622 1.709 1.791 1.783 2.051 2.115 2.246 2.384 2.503 2.558 2.675 2.791 2.952 3.047 3.13 3.259 3.391 3.506 3.612 3.712 3.84 3.969 4.081 4.184 4.298 4.411 4.525 4.662 4.791 4.934 5.076 5.19 5.291 5.388 5.487 5.563 5.635 5.684 5.675 5.555 5.268 4.638 3.372 1.561 -0.051 -1.381 -2.519 -3.516 -4.383 -5.14 -5.774 -6.445 -7.046 -7.605 -8.138 -8.633 -9.094 -9.493 -9.901 -10.26 -10.567 -10.885 -11.22 -11.504 -11.793 -12.101 -12.326 -12.549 -12.803 -13.064 -13.32 -13.496 -13.673 -13.948 -14.133 -14.33 -14.436 -14.651 -14.865 -15.085 -15.202 -15.53 -15.576 -15.71 -15.857 -16.164 -16.328 -16.502 -16.668 -16.853 -17.078 -17.352 -17.864 -10 ,2048 ,TETRA ,17525363,Thu Nov 25 01:02:34 CET,Thu Nov 25 03:20:33 CET,0.0 0.467 0.629 0.817 0.985 1.116 1.247 1.357 1.514 1.595 1.674 1.655 1.914 1.992 2.133 2.262 2.385 2.447 2.553 2.644 2.803 2.905 2.995 3.126 3.255 3.374 3.475 3.576 3.701 3.809 3.924 4.076 4.205 4.323 4.438 4.562 4.693 4.821 4.951 5.079 5.176 5.25 5.36 5.458 5.496 5.491 5.425 5.281 4.938 4.205 2.84 1.028 -0.573 -1.954 -3.154 -4.201 -5.107 -5.942 -6.693 -7.48 -8.154 -8.732 -9.236 -9.668 -10.06 -10.443 -10.883 -11.269 -11.593 -11.926 -12.258 -12.536 -12.833 -13.144 -13.38 -13.621 -13.866 -14.108 -14.358 -14.53 -14.704 -14.977 -15.173 -15.38 -15.49 -15.716 -15.947 -16.179 -16.301 -16.641 -16.707 -16.839 -16.978 -17.318 -17.51 -17.706 -17.912 -18.112 -18.34 -18.683 -19.322 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 9663bd71..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15640 ,TETRA ,17525365,Thu Nov 25 01:03:33 CET,Thu Nov 25 03:28:08 CET,0.0 0.455 0.681 0.888 1.072 1.235 1.377 1.51 1.765 1.887 2.012 2.055 2.371 2.479 2.693 2.881 3.052 3.141 3.33 3.513 3.761 3.927 4.097 4.327 4.55 4.772 4.978 5.18 5.453 5.716 5.966 6.268 6.558 6.851 7.208 7.614 8.022 8.485 8.979 9.494 10.048 10.674 11.38 12.083 12.911 13.793 14.778 15.874 17.104 18.51 20.103 21.269 21.817 22.043 22.088 22.051 21.982 21.833 21.627 21.394 21.171 20.969 20.769 20.566 20.377 20.192 20.001 19.82 19.645 19.462 19.261 19.082 18.9 18.703 18.546 18.376 18.181 17.972 17.761 17.623 17.477 17.238 17.067 16.882 16.787 16.6 16.398 16.18 16.07 15.768 15.728 15.599 15.453 15.13 14.956 14.779 14.574 14.297 14.01 13.659 12.773 -2 ,15884 ,TETRA ,17525367,Thu Nov 25 01:03:33 CET,Thu Nov 25 03:23:42 CET,0.0 0.595 0.89 1.161 1.385 1.58 1.767 1.955 2.278 2.401 2.511 2.529 2.847 2.958 3.148 3.331 3.516 3.606 3.791 3.968 4.238 4.415 4.583 4.832 5.061 5.284 5.517 5.745 6.032 6.311 6.571 6.88 7.184 7.479 7.817 8.19 8.554 8.958 9.391 9.855 10.339 10.887 11.547 12.223 13.025 13.914 14.901 16.019 17.355 18.866 20.507 21.775 22.364 22.587 22.692 22.703 22.624 22.478 22.307 22.09 21.872 21.658 21.451 21.254 21.053 20.868 20.679 20.496 20.321 20.13 19.936 19.766 19.57 19.374 19.223 19.045 18.863 18.693 18.504 18.369 18.24 18.024 17.869 17.713 17.625 17.429 17.219 16.994 16.882 16.587 16.525 16.401 16.265 15.943 15.782 15.616 15.424 15.231 14.991 14.663 13.806 -3 ,28357 ,TETRA ,17525369,Thu Nov 25 01:03:34 CET,Thu Nov 25 03:25:26 CET,0.0 0.528 0.792 0.97 1.143 1.306 1.456 1.609 1.92 2.053 2.182 2.229 2.559 2.678 2.919 3.138 3.349 3.452 3.655 3.846 4.108 4.278 4.454 4.73 4.984 5.224 5.462 5.693 5.969 6.238 6.507 6.837 7.145 7.43 7.771 8.157 8.522 8.922 9.352 9.799 10.284 10.857 11.53 12.22 13.011 13.876 14.858 15.937 17.205 18.747 20.584 21.963 22.626 22.96 23.071 23.069 23.007 22.895 22.743 22.561 22.405 22.236 22.043 21.859 21.675 21.489 21.294 21.101 20.93 20.748 20.548 20.389 20.217 20.023 19.869 19.714 19.552 19.386 19.212 19.077 18.939 18.718 18.562 18.404 18.315 18.133 17.943 17.732 17.619 17.315 17.269 17.131 16.981 16.693 16.536 16.35 16.156 15.941 15.663 15.306 14.402 -4 ,25913 ,TETRA ,17525371,Thu Nov 25 01:03:38 CET,Thu Nov 25 03:11:37 CET,0.0 0.465 0.659 0.868 1.053 1.211 1.364 1.508 1.764 1.888 2.027 2.1 2.425 2.54 2.766 2.978 3.178 3.273 3.463 3.659 3.929 4.088 4.262 4.532 4.778 5.01 5.232 5.446 5.721 5.992 6.269 6.598 6.911 7.221 7.592 8.012 8.414 8.841 9.289 9.781 10.284 10.855 11.527 12.182 12.954 13.811 14.817 15.984 17.332 18.87 20.65 21.958 22.592 22.878 22.941 22.894 22.819 22.717 22.566 22.361 22.158 21.958 21.758 21.538 21.31 21.1 20.872 20.662 20.47 20.267 20.047 19.864 19.665 19.46 19.297 19.114 18.918 18.715 18.513 18.366 18.21 17.965 17.791 17.606 17.513 17.321 17.125 16.914 16.791 16.481 16.39 16.245 16.106 15.808 15.641 15.451 15.236 14.966 14.658 14.237 12.82 -5 ,1870 ,TETRA ,17525374,Thu Nov 25 01:05:31 CET,Thu Nov 25 03:19:03 CET,0.0 0.723 1.061 1.336 1.548 1.725 1.884 2.045 2.355 2.508 2.65 2.689 3.021 3.141 3.362 3.557 3.738 3.831 4.03 4.229 4.517 4.697 4.868 5.137 5.403 5.653 5.882 6.098 6.368 6.627 6.88 7.195 7.52 7.836 8.198 8.62 9.031 9.476 9.947 10.446 10.983 11.62 12.362 13.088 13.944 14.884 15.936 17.111 18.453 19.993 21.814 23.263 23.985 24.288 24.355 24.305 24.229 24.108 23.955 23.754 23.555 23.35 23.14 22.933 22.729 22.534 22.308 22.109 21.923 21.709 21.48 21.291 21.105 20.912 20.749 20.578 20.409 20.225 20.027 19.887 19.732 19.492 19.327 19.157 19.071 18.883 18.687 18.488 18.382 18.075 18.005 17.862 17.712 17.375 17.204 17.003 16.768 16.521 16.238 15.863 14.484 -6 ,10139 ,TETRA ,17525375,Thu Nov 25 01:05:31 CET,Thu Nov 25 03:24:44 CET,0.0 0.359 0.641 0.895 1.109 1.284 1.459 1.632 1.935 2.081 2.227 2.277 2.615 2.739 2.968 3.175 3.384 3.492 3.681 3.862 4.147 4.335 4.512 4.76 4.987 5.206 5.427 5.644 5.926 6.199 6.455 6.752 7.043 7.318 7.65 8.032 8.393 8.796 9.237 9.71 10.22 10.816 11.504 12.174 12.964 13.876 14.927 16.052 17.365 18.957 20.813 22.162 22.801 23.127 23.241 23.239 23.181 23.043 22.882 22.69 22.493 22.314 22.122 21.926 21.742 21.567 21.378 21.203 21.051 20.877 20.682 20.526 20.366 20.178 20.027 19.878 19.71 19.542 19.359 19.229 19.109 18.909 18.755 18.595 18.516 18.336 18.127 17.924 17.835 17.538 17.473 17.348 17.219 16.912 16.738 16.536 16.298 16.034 15.707 15.283 13.965 -7 ,5143 ,TETRA ,17525377,Thu Nov 25 01:05:31 CET,Thu Nov 25 03:25:10 CET,0.0 0.388 0.626 0.841 1.038 1.213 1.384 1.538 1.82 1.958 2.089 2.122 2.45 2.569 2.788 2.997 3.207 3.309 3.509 3.698 3.97 4.153 4.33 4.583 4.829 5.072 5.297 5.51 5.793 6.072 6.348 6.679 6.988 7.273 7.611 8.02 8.41 8.808 9.232 9.687 10.182 10.749 11.387 12.041 12.809 13.69 14.775 15.963 17.274 18.764 20.465 21.726 22.33 22.563 22.613 22.536 22.402 22.247 22.043 21.799 21.587 21.38 21.164 20.946 20.732 20.529 20.296 20.074 19.875 19.67 19.458 19.272 19.066 18.849 18.687 18.511 18.313 18.107 17.891 17.736 17.575 17.316 17.141 16.956 16.858 16.657 16.443 16.204 16.078 15.759 15.674 15.543 15.391 15.041 14.847 14.633 14.415 14.179 13.892 13.525 12.48 -8 ,21652 ,TETRA ,17525379,Thu Nov 25 01:06:32 CET,Thu Nov 25 03:25:42 CET,0.0 0.522 0.896 1.16 1.371 1.58 1.763 1.94 2.284 2.447 2.605 2.692 3.033 3.155 3.376 3.586 3.793 3.892 4.086 4.277 4.543 4.722 4.909 5.167 5.412 5.644 5.853 6.053 6.327 6.601 6.862 7.172 7.465 7.754 8.089 8.458 8.818 9.22 9.646 10.123 10.644 11.212 11.857 12.532 13.334 14.22 15.241 16.407 17.794 19.42 21.26 22.549 23.159 23.423 23.477 23.456 23.384 23.245 23.09 22.891 22.685 22.483 22.286 22.107 21.92 21.702 21.457 21.262 21.085 20.881 20.666 20.487 20.297 20.09 19.924 19.744 19.561 19.367 19.159 19.017 18.863 18.614 18.432 18.236 18.133 17.934 17.739 17.516 17.394 17.074 16.995 16.855 16.695 16.337 16.154 15.972 15.746 15.47 15.176 14.882 13.922 -9 ,27600 ,TETRA ,17525381,Thu Nov 25 01:06:32 CET,Thu Nov 25 03:21:56 CET,0.0 0.458 0.667 0.882 1.082 1.248 1.384 1.518 1.793 1.92 2.033 2.065 2.386 2.484 2.666 2.848 3.025 3.112 3.289 3.462 3.714 3.878 4.043 4.284 4.508 4.721 4.93 5.14 5.406 5.655 5.902 6.2 6.487 6.774 7.109 7.472 7.826 8.216 8.645 9.122 9.612 10.157 10.814 11.473 12.221 13.046 14.003 15.094 16.36 17.817 19.486 20.782 21.386 21.621 21.689 21.659 21.573 21.446 21.273 21.061 20.873 20.668 20.449 20.229 19.995 19.763 19.525 19.317 19.134 18.923 18.693 18.509 18.316 18.105 17.93 17.752 17.572 17.378 17.166 17.017 16.866 16.619 16.438 16.239 16.139 15.952 15.748 15.522 15.398 15.073 14.976 14.824 14.677 14.372 14.2 13.999 13.78 13.548 13.276 12.947 12.319 -10 ,4409 ,TETRA ,17525383,Thu Nov 25 01:07:30 CET,Thu Nov 25 03:30:14 CET,0.0 0.609 0.881 1.1 1.298 1.472 1.643 1.806 2.077 2.206 2.329 2.347 2.666 2.784 3.009 3.208 3.397 3.492 3.679 3.868 4.144 4.319 4.487 4.735 4.974 5.203 5.432 5.665 5.948 6.203 6.455 6.753 7.034 7.322 7.665 8.038 8.404 8.823 9.288 9.785 10.287 10.849 11.506 12.168 12.946 13.782 14.752 15.856 17.148 18.647 20.334 21.599 22.261 22.575 22.675 22.668 22.598 22.509 22.387 22.201 22.019 21.828 21.639 21.468 21.302 21.144 20.974 20.801 20.63 20.454 20.271 20.107 19.927 19.739 19.595 19.444 19.277 19.106 18.94 18.819 18.681 18.454 18.305 18.147 18.058 17.88 17.701 17.516 17.413 17.113 17.078 16.955 16.822 16.51 16.341 16.15 15.928 15.695 15.412 15.06 13.903 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index cdf1f296..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9657 ,TETRA ,17525384,Thu Nov 25 01:07:30 CET,Thu Nov 25 03:29:02 CET,0.0 0.599 0.937 1.231 1.434 1.626 1.819 1.976 2.241 2.375 2.5 2.529 2.85 2.971 3.209 3.432 3.635 3.74 3.949 4.135 4.402 4.575 4.745 5.001 5.259 5.515 5.758 5.977 6.245 6.504 6.759 7.065 7.36 7.634 7.95 8.329 8.696 9.094 9.52 9.959 10.427 10.968 11.626 12.313 13.049 13.796 14.694 15.759 16.982 18.347 19.793 20.855 21.272 21.334 21.236 21.041 20.798 20.539 20.303 20.025 19.748 19.488 19.225 18.958 18.698 18.44 18.172 17.94 17.736 17.53 17.313 17.118 16.912 16.688 16.513 16.332 16.143 15.931 15.687 15.521 15.358 15.107 14.929 14.726 14.615 14.394 14.148 13.877 13.725 13.383 13.266 13.109 12.931 12.505 12.285 12.044 11.774 11.485 11.14 10.673 9.09 -2 ,16884 ,TETRA ,17525385,Thu Nov 25 01:07:30 CET,Thu Nov 25 03:24:50 CET,0.0 0.523 0.791 1.029 1.249 1.442 1.625 1.807 2.11 2.243 2.377 2.445 2.803 2.948 3.187 3.422 3.647 3.756 3.976 4.18 4.462 4.642 4.81 5.048 5.276 5.487 5.69 5.891 6.166 6.445 6.705 7.01 7.306 7.605 7.958 8.349 8.733 9.149 9.605 10.123 10.657 11.214 11.846 12.494 13.258 14.101 15.107 16.258 17.591 19.111 20.838 22.048 22.595 22.834 22.886 22.821 22.648 22.365 22.05 21.69 21.403 21.166 20.92 20.703 20.488 20.266 20.004 19.769 19.58 19.371 19.133 18.929 18.709 18.482 18.309 18.127 17.942 17.746 17.534 17.383 17.203 16.923 16.749 16.549 16.43 16.182 15.927 15.642 15.489 15.151 15.022 14.845 14.667 14.294 14.089 13.879 13.646 13.363 13.036 12.639 11.353 -3 ,11554 ,TETRA ,17525386,Thu Nov 25 01:07:32 CET,Thu Nov 25 03:27:19 CET,0.0 0.566 0.813 1.025 1.22 1.413 1.596 1.77 2.101 2.256 2.393 2.427 2.753 2.87 3.082 3.281 3.469 3.563 3.751 3.943 4.244 4.438 4.614 4.864 5.116 5.346 5.565 5.786 6.085 6.37 6.631 6.949 7.261 7.569 7.931 8.331 8.719 9.156 9.614 10.09 10.583 11.129 11.785 12.458 13.2 14.024 14.956 15.965 17.175 18.541 19.978 20.942 21.372 21.54 21.523 21.359 21.093 20.804 20.525 20.216 19.919 19.622 19.34 19.058 18.765 18.485 18.195 17.911 17.659 17.399 17.109 16.872 16.633 16.367 16.148 15.945 15.734 15.49 15.248 15.084 14.91 14.639 14.436 14.217 14.113 13.888 13.619 13.35 13.22 12.881 12.724 12.538 12.344 11.942 11.697 11.418 11.139 10.823 10.416 9.859 8.71 -4 ,14236 ,TETRA ,17525387,Thu Nov 25 01:08:29 CET,Thu Nov 25 03:31:14 CET,0.0 0.687 1.008 1.359 1.633 1.833 2.018 2.18 2.494 2.64 2.778 2.831 3.157 3.268 3.497 3.731 3.965 4.079 4.282 4.473 4.765 4.951 5.131 5.384 5.623 5.852 6.076 6.293 6.591 6.889 7.158 7.477 7.806 8.13 8.486 8.894 9.293 9.729 10.219 10.718 11.23 11.827 12.515 13.188 13.947 14.801 15.79 16.849 18.05 19.452 21.153 22.348 22.877 23.115 23.166 23.089 22.94 22.789 22.618 22.394 22.173 21.956 21.727 21.503 21.271 21.024 20.732 20.432 20.151 19.885 19.636 19.428 19.201 18.956 18.766 18.57 18.364 18.167 17.963 17.823 17.681 17.404 17.192 16.99 16.891 16.69 16.47 16.202 16.043 15.692 15.536 15.356 15.181 14.833 14.616 14.341 14.057 13.766 13.378 12.806 9.835 -5 ,15452 ,TETRA ,17525390,Thu Nov 25 01:08:30 CET,Thu Nov 25 03:27:58 CET,0.0 0.563 0.8 1.023 1.22 1.397 1.568 1.728 2.023 2.156 2.281 2.339 2.668 2.796 3.059 3.295 3.506 3.607 3.815 4.016 4.298 4.483 4.663 4.924 5.163 5.393 5.63 5.853 6.131 6.401 6.667 6.985 7.278 7.562 7.898 8.263 8.607 8.997 9.417 9.874 10.372 10.921 11.559 12.198 12.932 13.785 14.757 15.833 17.127 18.608 20.301 21.645 22.299 22.557 22.623 22.581 22.483 22.381 22.227 21.994 21.713 21.414 21.136 20.865 20.593 20.316 20.026 19.768 19.538 19.288 19.014 18.795 18.564 18.319 18.131 17.929 17.716 17.494 17.252 17.086 16.917 16.63 16.429 16.217 16.1 15.85 15.581 15.293 15.148 14.819 14.702 14.525 14.341 13.968 13.748 13.519 13.292 13.008 12.66 12.147 10.334 -6 ,19477 ,TETRA ,17525392,Thu Nov 25 01:09:28 CET,Thu Nov 25 03:30:46 CET,0.0 0.452 0.782 1.026 1.23 1.396 1.535 1.676 1.942 2.072 2.206 2.26 2.579 2.686 2.897 3.094 3.298 3.401 3.584 3.766 4.035 4.213 4.382 4.618 4.862 5.094 5.326 5.553 5.837 6.108 6.374 6.695 6.997 7.296 7.628 7.987 8.358 8.793 9.263 9.78 10.306 10.837 11.456 12.09 12.829 13.63 14.494 15.458 16.663 18.149 19.788 20.867 21.262 21.384 21.406 21.315 21.139 20.938 20.716 20.453 20.214 20.005 19.805 19.598 19.4 19.19 18.958 18.746 18.552 18.349 18.125 17.943 17.758 17.568 17.414 17.231 17.042 16.841 16.611 16.46 16.317 16.095 15.933 15.753 15.65 15.429 15.198 14.956 14.825 14.497 14.341 14.147 13.967 13.603 13.369 13.095 12.792 12.458 12.082 11.517 9.644 -7 ,21491 ,TETRA ,17525394,Thu Nov 25 01:09:28 CET,Thu Nov 25 03:26:52 CET,0.0 0.668 0.922 1.13 1.307 1.484 1.636 1.78 2.078 2.218 2.343 2.364 2.674 2.786 3.007 3.212 3.411 3.502 3.677 3.85 4.098 4.261 4.424 4.664 4.884 5.091 5.309 5.533 5.808 6.058 6.308 6.608 6.905 7.203 7.547 7.934 8.305 8.715 9.166 9.647 10.15 10.71 11.361 12.028 12.825 13.711 14.669 15.765 17.08 18.558 20.232 21.477 22.073 22.289 22.317 22.194 21.969 21.689 21.422 21.153 20.889 20.613 20.331 20.06 19.79 19.525 19.242 18.976 18.75 18.517 18.257 18.035 17.806 17.572 17.389 17.185 16.968 16.735 16.492 16.336 16.168 15.875 15.656 15.436 15.321 15.086 14.845 14.597 14.466 14.137 14.019 13.851 13.671 13.289 13.09 12.887 12.665 12.386 12.044 11.587 10.516 -8 ,28433 ,TETRA ,17525396,Thu Nov 25 01:09:29 CET,Thu Nov 25 03:30:47 CET,0.0 0.781 1.108 1.358 1.55 1.723 1.894 2.057 2.374 2.523 2.665 2.729 3.058 3.175 3.395 3.587 3.782 3.882 4.077 4.275 4.568 4.749 4.918 5.164 5.404 5.65 5.906 6.138 6.407 6.665 6.911 7.201 7.482 7.761 8.086 8.45 8.802 9.173 9.574 10.017 10.489 11.026 11.657 12.297 13.043 13.893 14.882 16.023 17.371 18.898 20.505 21.546 21.971 22.08 22.041 21.933 21.765 21.551 21.348 21.126 20.917 20.712 20.514 20.316 20.126 19.953 19.743 19.533 19.366 19.185 18.968 18.785 18.591 18.38 18.23 18.073 17.894 17.698 17.485 17.343 17.193 16.959 16.799 16.619 16.533 16.342 16.126 15.898 15.78 15.478 15.417 15.278 15.12 14.752 14.566 14.396 14.162 13.862 13.534 13.13 11.98 -9 ,7434 ,TETRA ,17525398,Thu Nov 25 01:09:32 CET,Thu Nov 25 03:16:08 CET,0.0 0.702 0.972 1.192 1.361 1.505 1.635 1.743 2.001 2.127 2.234 2.225 2.509 2.604 2.793 2.968 3.137 3.216 3.381 3.546 3.783 3.945 4.111 4.339 4.541 4.74 4.941 5.137 5.387 5.636 5.877 6.167 6.452 6.733 7.056 7.418 7.766 8.145 8.559 9.014 9.511 10.069 10.715 11.365 12.138 13.023 14.005 15.06 16.261 17.68 19.432 20.733 21.343 21.586 21.672 21.661 21.568 21.416 21.253 21.049 20.831 20.619 20.383 20.148 19.918 19.69 19.443 19.226 19.055 18.865 18.647 18.461 18.278 18.107 17.965 17.794 17.62 17.443 17.242 17.102 16.954 16.72 16.554 16.366 16.26 16.042 15.82 15.577 15.448 15.156 15.095 14.959 14.806 14.478 14.285 14.073 13.836 13.551 13.225 12.754 11.579 -10 ,13989 ,TETRA ,17525400,Thu Nov 25 01:10:31 CET,Thu Nov 25 03:31:10 CET,0.0 0.794 1.134 1.42 1.687 1.888 2.045 2.197 2.47 2.605 2.746 2.808 3.145 3.278 3.522 3.766 4.01 4.119 4.306 4.485 4.741 4.9 5.066 5.315 5.557 5.787 6.003 6.208 6.472 6.732 6.988 7.301 7.603 7.9 8.244 8.625 8.995 9.389 9.807 10.272 10.77 11.313 11.942 12.572 13.336 14.204 15.147 16.233 17.53 18.953 20.47 21.424 21.762 21.815 21.702 21.491 21.208 20.919 20.642 20.312 20.001 19.691 19.37 19.082 18.809 18.546 18.252 17.984 17.763 17.526 17.271 17.062 16.847 16.609 16.417 16.204 15.973 15.739 15.5 15.334 15.158 14.873 14.658 14.417 14.299 14.056 13.782 13.509 13.368 13.032 12.885 12.702 12.499 12.074 11.843 11.601 11.364 11.07 10.635 10.021 8.326 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt deleted file mode 100644 index e188c945..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14160 ,TETRA ,17525403,Thu Nov 25 01:11:30 CET,Thu Nov 25 03:28:38 CET,0.0 0.92 1.386 1.677 1.937 2.191 2.411 2.627 3.04 3.21 3.353 3.427 3.764 3.892 4.146 4.375 4.581 4.678 4.873 5.071 5.358 5.544 5.723 6.001 6.28 6.535 6.771 6.996 7.27 7.537 7.803 8.132 8.46 8.772 9.099 9.42 9.713 10.044 10.418 10.8 11.182 11.611 12.103 12.595 13.143 13.643 14.154 14.682 15.188 15.532 15.491 14.945 14.219 13.477 12.751 12.068 11.453 10.828 10.255 9.671 9.159 8.725 8.33 7.94 7.581 7.247 6.872 6.552 6.28 5.989 5.677 5.406 5.116 4.809 4.574 4.336 4.106 3.866 3.591 3.401 3.202 2.884 2.662 2.432 2.314 2.054 1.769 1.475 1.325 0.959 0.844 0.692 0.546 0.219 0.028 -0.192 -0.439 -0.685 -0.991 -1.335 -2.098 -2 ,32585 ,TETRA ,17525405,Thu Nov 25 01:12:29 CET,Thu Nov 25 03:34:39 CET,0.0 0.706 1.001 1.258 1.472 1.663 1.857 2.048 2.394 2.54 2.678 2.747 3.063 3.17 3.386 3.601 3.808 3.907 4.1 4.291 4.561 4.743 4.928 5.177 5.426 5.669 5.891 6.1 6.356 6.602 6.826 7.089 7.36 7.62 7.918 8.261 8.574 8.905 9.24 9.604 9.987 10.384 10.838 11.278 11.754 12.235 12.745 13.226 13.664 13.998 14.073 13.609 12.935 12.22 11.496 10.841 10.247 9.67 9.172 8.691 8.245 7.83 7.443 7.068 6.712 6.381 6.013 5.69 5.42 5.125 4.807 4.539 4.249 3.952 3.73 3.493 3.235 2.965 2.679 2.48 2.274 1.954 1.743 1.533 1.418 1.162 0.909 0.655 0.519 0.169 0.068 -0.115 -0.291 -0.623 -0.819 -1.036 -1.286 -1.582 -1.929 -2.425 -3.794 -3 ,10152 ,TETRA ,17525406,Thu Nov 25 01:13:28 CET,Thu Nov 25 03:35:51 CET,0.0 0.785 1.195 1.502 1.767 1.995 2.204 2.403 2.756 2.905 3.043 3.091 3.413 3.54 3.782 4.011 4.221 4.316 4.514 4.721 4.994 5.163 5.341 5.602 5.846 6.078 6.302 6.531 6.831 7.108 7.357 7.645 7.912 8.168 8.474 8.797 9.096 9.425 9.774 10.144 10.526 10.936 11.408 11.857 12.335 12.815 13.349 13.908 14.377 14.747 14.834 14.287 13.572 12.843 12.11 11.375 10.711 10.109 9.55 8.988 8.514 8.067 7.651 7.271 6.912 6.591 6.258 5.946 5.667 5.369 5.024 4.722 4.421 4.113 3.856 3.579 3.297 3.002 2.714 2.522 2.317 2.002 1.764 1.479 1.338 1.057 0.74 0.421 0.26 -0.118 -0.278 -0.452 -0.622 -1.014 -1.234 -1.493 -1.814 -2.153 -2.54 -3.063 -4.056 -4 ,7757 ,TETRA ,17525407,Thu Nov 25 01:12:31 CET,Thu Nov 25 03:35:07 CET,0.0 1.054 1.405 1.719 1.996 2.247 2.456 2.631 2.932 3.066 3.213 3.311 3.658 3.791 4.014 4.217 4.431 4.537 4.734 4.939 5.235 5.413 5.578 5.807 6.03 6.254 6.467 6.669 6.93 7.182 7.43 7.713 7.972 8.214 8.514 8.88 9.22 9.568 9.941 10.336 10.723 11.123 11.568 12.024 12.561 13.122 13.748 14.359 14.914 15.352 15.385 14.911 14.328 13.731 13.075 12.437 11.85 11.293 10.802 10.298 9.869 9.462 9.059 8.661 8.252 7.876 7.478 7.104 6.777 6.44 6.091 5.799 5.498 5.173 4.924 4.68 4.415 4.147 3.861 3.647 3.423 3.07 2.838 2.603 2.492 2.263 1.978 1.671 1.521 1.165 1.03 0.838 0.65 0.272 0.069 -0.163 -0.408 -0.687 -1.017 -1.426 -2.881 -5 ,19145 ,TETRA ,17525408,Thu Nov 25 01:12:30 CET,Thu Nov 25 03:37:53 CET,0.0 0.827 1.218 1.513 1.728 1.923 2.11 2.286 2.636 2.803 2.964 3.043 3.359 3.478 3.731 3.974 4.202 4.314 4.523 4.729 5.029 5.229 5.424 5.685 5.928 6.157 6.384 6.604 6.888 7.156 7.402 7.7 7.977 8.234 8.537 8.87 9.179 9.498 9.84 10.203 10.581 11.018 11.532 12.034 12.592 13.128 13.647 14.186 14.695 15.12 15.248 14.792 14.144 13.467 12.808 12.145 11.54 10.98 10.436 9.838 9.291 8.774 8.281 7.854 7.462 7.092 6.712 6.372 6.076 5.774 5.466 5.204 4.928 4.643 4.425 4.201 3.965 3.707 3.43 3.252 3.082 2.802 2.594 2.374 2.256 1.993 1.713 1.429 1.292 0.945 0.846 0.686 0.509 0.125 -0.079 -0.316 -0.6 -0.902 -1.21 -1.6 -2.459 -6 ,25418 ,TETRA ,17525409,Thu Nov 25 01:12:30 CET,Thu Nov 25 03:35:16 CET,0.0 0.944 1.357 1.659 1.886 2.096 2.293 2.472 2.787 2.947 3.108 3.185 3.499 3.615 3.834 4.061 4.282 4.388 4.607 4.806 5.082 5.265 5.439 5.684 5.92 6.142 6.352 6.576 6.87 7.119 7.342 7.629 7.913 8.195 8.51 8.833 9.145 9.477 9.811 10.168 10.558 11.015 11.535 12.005 12.547 13.155 13.747 14.301 14.849 15.286 15.453 15.155 14.632 14.042 13.475 12.862 12.225 11.626 11.104 10.566 10.102 9.673 9.232 8.805 8.4 8.016 7.608 7.258 6.955 6.629 6.273 5.966 5.598 5.18 4.868 4.554 4.253 3.945 3.609 3.369 3.129 2.751 2.486 2.227 2.1 1.848 1.59 1.268 1.074 0.66 0.464 0.271 0.074 -0.326 -0.543 -0.785 -1.037 -1.359 -1.759 -2.253 -3.827 -7 ,11741 ,TETRA ,17525410,Thu Nov 25 01:12:30 CET,Thu Nov 25 03:37:58 CET,0.0 0.888 1.24 1.531 1.756 1.964 2.162 2.361 2.786 2.976 3.153 3.255 3.577 3.688 3.919 4.159 4.385 4.499 4.72 4.924 5.228 5.41 5.578 5.836 6.076 6.299 6.513 6.712 6.964 7.204 7.445 7.743 8.033 8.299 8.594 8.949 9.281 9.617 9.981 10.358 10.764 11.228 11.749 12.243 12.76 13.329 13.957 14.564 15.2 15.78 15.972 15.55 14.891 14.174 13.502 12.828 12.157 11.476 10.863 10.258 9.746 9.299 8.849 8.426 8.046 7.692 7.299 6.944 6.657 6.365 6.052 5.782 5.505 5.206 4.974 4.744 4.506 4.245 3.95 3.755 3.568 3.265 3.044 2.815 2.698 2.435 2.15 1.851 1.692 1.323 1.184 1.016 0.845 0.437 0.177 -0.099 -0.403 -0.755 -1.114 -1.554 -2.988 -8 ,28089 ,TETRA ,17525411,Thu Nov 25 01:13:30 CET,Thu Nov 25 03:35:53 CET,0.0 0.97 1.315 1.586 1.829 2.054 2.264 2.448 2.811 2.979 3.135 3.244 3.604 3.747 4.027 4.281 4.511 4.636 4.887 5.126 5.463 5.659 5.838 6.097 6.353 6.609 6.855 7.081 7.357 7.621 7.899 8.238 8.541 8.82 9.142 9.501 9.858 10.27 10.7 11.138 11.58 12.044 12.553 13.078 13.665 14.252 14.898 15.557 16.248 16.869 17.193 16.947 16.376 15.653 14.916 14.197 13.545 12.955 12.442 11.912 11.442 11.027 10.638 10.259 9.869 9.5 9.106 8.774 8.489 8.174 7.838 7.558 7.268 6.948 6.7 6.447 6.172 5.885 5.602 5.4 5.189 4.854 4.618 4.379 4.251 3.987 3.705 3.41 3.269 2.92 2.787 2.611 2.439 2.073 1.851 1.595 1.339 1.057 0.737 0.337 -1.2 -9 ,22130 ,TETRA ,17525412,Thu Nov 25 01:13:28 CET,Thu Nov 25 03:36:29 CET,0.0 0.992 1.458 1.805 2.057 2.299 2.511 2.704 3.063 3.234 3.402 3.501 3.846 3.985 4.271 4.558 4.836 4.959 5.191 5.424 5.74 5.931 6.123 6.393 6.644 6.876 7.1 7.326 7.64 7.945 8.215 8.538 8.847 9.146 9.478 9.83 10.191 10.58 10.969 11.399 11.836 12.289 12.786 13.266 13.86 14.491 15.091 15.635 16.129 16.519 16.586 16.114 15.499 14.835 14.179 13.571 13.005 12.434 11.903 11.374 10.889 10.443 10.025 9.626 9.254 8.901 8.53 8.184 7.853 7.509 7.167 6.874 6.578 6.286 6.056 5.805 5.542 5.262 4.958 4.75 4.533 4.2 3.977 3.749 3.629 3.38 3.105 2.801 2.639 2.268 2.125 1.928 1.729 1.319 1.09 0.84 0.574 0.277 -0.111 -0.61 -1.628 -10 ,21464 ,TETRA ,17525413,Thu Nov 25 01:13:28 CET,Thu Nov 25 03:31:51 CET,0.0 0.843 1.224 1.547 1.76 1.965 2.178 2.358 2.681 2.834 2.963 2.998 3.32 3.453 3.718 3.954 4.177 4.287 4.5 4.699 4.992 5.183 5.367 5.633 5.888 6.127 6.354 6.574 6.846 7.103 7.353 7.633 7.891 8.15 8.464 8.814 9.153 9.546 9.934 10.318 10.724 11.156 11.647 12.163 12.728 13.246 13.748 14.22 14.695 15.141 15.301 14.775 14.01 13.175 12.299 11.442 10.684 10.001 9.415 8.826 8.302 7.801 7.313 6.841 6.381 5.982 5.576 5.217 4.915 4.582 4.207 3.89 3.552 3.167 2.852 2.538 2.226 1.895 1.535 1.275 1.003 0.572 0.281 -0.007 -0.159 -0.478 -0.811 -1.163 -1.353 -1.738 -1.889 -2.104 -2.329 -2.811 -3.08 -3.373 -3.698 -4.052 -4.493 -5.01 -6.231 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index c98e9bbc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31196 ,TETRA ,17525414,Thu Nov 25 01:13:28 CET,Thu Nov 25 03:40:14 CET,0.0 0.87 1.223 1.488 1.705 1.905 2.096 2.295 2.656 2.81 2.954 3.009 3.35 3.479 3.73 3.958 4.177 4.293 4.528 4.752 5.061 5.253 5.439 5.713 5.985 6.249 6.5 6.744 7.067 7.38 7.678 8.044 8.398 8.74 9.138 9.578 10.003 10.49 11.038 11.605 12.164 12.814 13.638 14.462 15.424 16.538 17.833 19.286 21.001 23.054 25.412 27.211 28.19 28.743 29.019 29.133 29.139 29.074 28.968 28.819 28.643 28.451 28.246 28.037 27.832 27.632 27.419 27.215 27.018 26.809 26.567 26.343 26.127 25.913 25.727 25.525 25.319 25.089 24.833 24.659 24.487 24.209 23.998 23.775 23.661 23.412 23.132 22.855 22.724 22.395 22.281 22.092 21.874 21.413 21.154 20.891 20.608 20.301 19.956 19.452 16.924 -2 ,23411 ,TETRA ,17525416,Thu Nov 25 01:13:30 CET,Thu Nov 25 03:41:38 CET,0.0 0.588 0.875 1.098 1.294 1.479 1.664 1.828 2.124 2.257 2.382 2.411 2.733 2.851 3.08 3.296 3.51 3.612 3.815 4.022 4.32 4.502 4.679 4.951 5.212 5.458 5.705 5.962 6.289 6.59 6.881 7.232 7.565 7.889 8.273 8.711 9.131 9.61 10.126 10.65 11.218 11.869 12.649 13.463 14.415 15.496 16.789 18.229 19.903 21.904 24.384 26.402 27.454 28.041 28.315 28.435 28.502 28.5 28.425 28.284 28.139 27.969 27.779 27.614 27.425 27.206 26.969 26.769 26.605 26.42 26.208 26.025 25.821 25.61 25.44 25.254 25.051 24.841 24.627 24.461 24.288 24.011 23.793 23.568 23.461 23.234 22.99 22.734 22.597 22.262 22.108 21.918 21.712 21.242 20.986 20.708 20.372 19.983 19.556 18.936 16.543 -3 ,25459 ,TETRA ,17525418,Thu Nov 25 01:14:30 CET,Thu Nov 25 03:40:16 CET,0.0 0.6 0.822 1.015 1.211 1.408 1.593 1.764 2.076 2.213 2.345 2.386 2.707 2.822 3.064 3.286 3.494 3.601 3.803 4.0 4.311 4.513 4.709 4.988 5.248 5.494 5.729 5.956 6.257 6.561 6.852 7.195 7.524 7.852 8.237 8.657 9.071 9.522 10.016 10.565 11.138 11.769 12.498 13.26 14.2 15.264 16.483 17.87 19.537 21.585 23.99 25.759 26.664 27.168 27.426 27.517 27.506 27.446 27.326 27.14 26.942 26.762 26.579 26.407 26.231 26.056 25.864 25.68 25.524 25.339 25.133 24.945 24.738 24.526 24.359 24.158 23.936 23.693 23.407 23.206 23.022 22.741 22.528 22.3 22.183 21.941 21.656 21.345 21.198 20.854 20.724 20.556 20.36 19.913 19.683 19.453 19.14 18.783 18.391 17.744 14.226 -4 ,20204 ,TETRA ,17525420,Thu Nov 25 01:14:30 CET,Thu Nov 25 03:38:42 CET,0.0 0.647 0.91 1.129 1.311 1.494 1.66 1.809 2.088 2.216 2.354 2.412 2.756 2.883 3.127 3.371 3.621 3.741 3.972 4.202 4.517 4.712 4.906 5.206 5.507 5.786 6.044 6.301 6.654 6.98 7.283 7.655 8.034 8.388 8.774 9.21 9.63 10.108 10.622 11.151 11.742 12.402 13.16 13.959 14.886 15.915 17.124 18.499 20.099 22.015 24.376 26.157 27.072 27.624 27.892 27.967 27.953 27.889 27.787 27.621 27.445 27.28 27.114 26.948 26.764 26.58 26.363 26.159 25.978 25.782 25.582 25.413 25.222 25.02 24.863 24.695 24.505 24.275 24.014 23.826 23.636 23.351 23.157 22.946 22.835 22.598 22.328 22.077 21.954 21.634 21.567 21.421 21.245 20.86 20.654 20.409 20.1 19.705 19.275 18.794 16.436 -5 ,15875 ,TETRA ,17525422,Thu Nov 25 01:14:30 CET,Thu Nov 25 03:40:06 CET,0.0 0.489 0.782 1.026 1.223 1.403 1.569 1.721 1.999 2.134 2.267 2.316 2.658 2.774 2.999 3.207 3.397 3.492 3.69 3.89 4.181 4.365 4.545 4.801 5.048 5.29 5.527 5.76 6.065 6.359 6.636 6.973 7.307 7.638 8.03 8.469 8.886 9.342 9.836 10.355 10.902 11.522 12.259 13.012 13.91 14.955 16.191 17.577 19.25 21.307 23.812 25.912 27.014 27.638 28.024 28.212 28.256 28.213 28.139 28.049 27.937 27.779 27.578 27.379 27.185 27.011 26.815 26.602 26.404 26.179 25.917 25.7 25.482 25.247 25.065 24.878 24.677 24.471 24.259 24.116 23.976 23.755 23.579 23.39 23.283 23.036 22.796 22.564 22.446 22.12 21.98 21.805 21.636 21.272 21.037 20.779 20.514 20.242 19.916 19.501 18.06 -6 ,14681 ,TETRA ,17525424,Thu Nov 25 01:15:29 CET,Thu Nov 25 03:44:56 CET,0.0 0.403 0.681 0.952 1.175 1.363 1.526 1.675 1.981 2.127 2.264 2.321 2.666 2.793 3.029 3.256 3.474 3.582 3.798 3.995 4.266 4.451 4.635 4.897 5.145 5.388 5.632 5.87 6.174 6.464 6.743 7.077 7.405 7.725 8.103 8.535 8.964 9.429 9.92 10.452 11.017 11.649 12.4 13.17 14.077 15.109 16.295 17.687 19.363 21.342 23.771 25.719 26.773 27.384 27.759 28.003 28.121 28.134 28.064 27.958 27.854 27.727 27.54 27.343 27.168 26.991 26.762 26.537 26.341 26.103 25.866 25.7 25.531 25.346 25.195 25.03 24.828 24.588 24.362 24.211 24.036 23.799 23.622 23.421 23.32 23.092 22.859 22.604 22.465 22.124 22.001 21.837 21.655 21.273 21.066 20.827 20.547 20.241 19.908 19.422 16.912 -7 ,24123 ,TETRA ,17525426,Thu Nov 25 01:15:30 CET,Thu Nov 25 03:40:05 CET,0.0 0.35 0.649 0.895 1.111 1.305 1.463 1.62 1.915 2.059 2.208 2.286 2.623 2.736 2.967 3.19 3.413 3.521 3.717 3.912 4.191 4.367 4.548 4.811 5.075 5.33 5.572 5.804 6.1 6.41 6.72 7.088 7.448 7.793 8.18 8.609 9.019 9.482 9.995 10.526 11.094 11.751 12.518 13.32 14.267 15.302 16.509 17.912 19.568 21.498 23.822 25.648 26.654 27.256 27.563 27.691 27.725 27.668 27.58 27.483 27.34 27.2 27.087 26.967 26.812 26.639 26.415 26.19 25.98 25.724 25.46 25.273 25.082 24.842 24.647 24.456 24.261 24.049 23.822 23.676 23.523 23.277 23.097 22.891 22.785 22.542 22.283 22.029 21.879 21.543 21.428 21.275 21.115 20.722 20.495 20.243 19.952 19.635 19.251 18.713 16.495 -8 ,32105 ,TETRA ,17525429,Thu Nov 25 01:15:27 CET,Thu Nov 25 03:42:27 CET,0.0 0.787 1.024 1.219 1.378 1.544 1.707 1.855 2.159 2.31 2.446 2.501 2.844 2.957 3.179 3.415 3.641 3.746 3.951 4.147 4.413 4.579 4.738 4.984 5.231 5.467 5.712 5.956 6.267 6.57 6.866 7.228 7.574 7.916 8.327 8.79 9.222 9.718 10.272 10.842 11.438 12.117 12.939 13.779 14.751 15.837 17.124 18.563 20.18 22.107 24.479 26.395 27.379 27.882 28.142 28.256 28.255 28.186 28.073 27.921 27.764 27.574 27.366 27.157 26.946 26.741 26.515 26.306 26.104 25.851 25.569 25.346 25.114 24.89 24.723 24.535 24.33 24.109 23.847 23.667 23.494 23.198 22.982 22.758 22.649 22.428 22.156 21.868 21.735 21.4 21.227 21.027 20.825 20.399 20.165 19.883 19.568 19.222 18.818 18.374 15.991 -9 ,7442 ,TETRA ,17525431,Thu Nov 25 01:17:28 CET,Thu Nov 25 03:36:09 CET,0.0 0.415 0.659 0.862 1.034 1.192 1.352 1.508 1.816 1.959 2.09 2.153 2.491 2.61 2.859 3.085 3.283 3.382 3.586 3.791 4.072 4.259 4.451 4.717 4.971 5.22 5.452 5.672 5.967 6.254 6.539 6.906 7.268 7.608 7.99 8.43 8.853 9.313 9.808 10.336 10.906 11.566 12.332 13.103 14.041 15.089 16.3 17.695 19.352 21.38 23.87 25.747 26.727 27.309 27.621 27.773 27.814 27.786 27.716 27.567 27.39 27.25 27.041 26.784 26.567 26.343 26.091 25.859 25.661 25.471 25.28 25.099 24.867 24.608 24.407 24.194 23.983 23.764 23.507 23.318 23.129 22.82 22.601 22.38 22.275 22.081 21.871 21.625 21.48 21.137 21.0 20.836 20.658 20.237 19.982 19.705 19.423 19.128 18.728 18.148 15.991 -10 ,10263 ,TETRA ,17525433,Thu Nov 25 01:18:27 CET,Thu Nov 25 03:44:09 CET,0.0 0.554 0.8 1.049 1.257 1.428 1.585 1.732 2.03 2.171 2.315 2.383 2.723 2.839 3.066 3.292 3.516 3.622 3.829 4.028 4.294 4.469 4.648 4.906 5.152 5.384 5.625 5.87 6.179 6.481 6.767 7.103 7.425 7.742 8.126 8.562 8.984 9.449 9.938 10.486 11.078 11.721 12.475 13.239 14.162 15.224 16.428 17.772 19.38 21.244 23.441 25.242 26.24 26.795 27.085 27.196 27.181 27.082 26.969 26.824 26.66 26.519 26.363 26.193 26.04 25.872 25.645 25.445 25.266 25.076 24.868 24.666 24.449 24.206 24.008 23.819 23.628 23.429 23.224 23.066 22.897 22.639 22.446 22.235 22.123 21.878 21.619 21.362 21.232 20.907 20.791 20.635 20.468 20.073 19.846 19.604 19.371 19.133 18.824 18.332 15.632 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt deleted file mode 100644 index bb25ab87..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27479 ,TETRA ,17525434,Thu Nov 25 01:18:27 CET,Thu Nov 25 03:46:03 CET,0.0 0.769 1.111 1.37 1.585 1.778 1.958 2.141 2.518 2.682 2.825 2.879 3.206 3.321 3.568 3.81 4.028 4.132 4.334 4.536 4.835 5.034 5.224 5.48 5.728 5.971 6.194 6.409 6.692 6.966 7.232 7.551 7.869 8.169 8.496 8.85 9.188 9.568 9.984 10.443 10.919 11.444 12.022 12.56 13.2 13.904 14.674 15.525 16.453 17.452 18.397 18.765 18.659 18.397 18.042 17.62 17.192 16.768 16.388 15.982 15.602 15.276 14.964 14.629 14.309 14.0 13.658 13.348 13.088 12.827 12.553 12.328 12.093 11.842 11.634 11.415 11.179 10.931 10.685 10.504 10.309 10.023 9.822 9.614 9.505 9.281 9.023 8.735 8.601 8.255 8.133 7.965 7.772 7.298 7.05 6.768 6.434 6.066 5.65 5.104 3.463 -2 ,14952 ,TETRA ,17525435,Thu Nov 25 01:19:25 CET,Thu Nov 25 03:50:21 CET,0.0 0.777 1.121 1.426 1.698 1.904 2.097 2.277 2.591 2.744 2.886 2.941 3.29 3.424 3.68 3.911 4.122 4.227 4.437 4.632 4.895 5.072 5.251 5.502 5.742 5.977 6.205 6.423 6.706 6.978 7.236 7.544 7.841 8.134 8.48 8.865 9.223 9.616 10.035 10.458 10.903 11.417 11.996 12.552 13.175 13.856 14.625 15.385 16.185 17.105 17.966 18.185 17.996 17.681 17.289 16.844 16.393 15.952 15.562 15.151 14.788 14.43 14.07 13.72 13.388 13.07 12.727 12.421 12.126 11.818 11.528 11.294 11.051 10.799 10.589 10.356 10.107 9.859 9.592 9.403 9.228 8.962 8.758 8.55 8.447 8.205 7.931 7.645 7.508 7.173 7.061 6.879 6.692 6.302 6.101 5.84 5.511 5.14 4.726 4.2 2.28 -3 ,20731 ,TETRA ,17525436,Thu Nov 25 01:19:25 CET,Thu Nov 25 03:47:28 CET,0.0 0.593 0.926 1.214 1.433 1.621 1.782 1.943 2.256 2.395 2.534 2.587 2.924 3.06 3.314 3.533 3.739 3.845 4.057 4.255 4.538 4.714 4.88 5.139 5.395 5.623 5.828 6.033 6.308 6.574 6.83 7.127 7.423 7.711 8.033 8.398 8.748 9.134 9.541 9.973 10.43 10.946 11.531 12.093 12.721 13.436 14.254 15.107 16.051 17.032 17.982 18.41 18.411 18.201 17.869 17.513 17.129 16.729 16.368 15.997 15.663 15.349 15.04 14.727 14.422 14.127 13.817 13.497 13.175 12.858 12.545 12.312 12.073 11.811 11.586 11.351 11.123 10.86 10.563 10.36 10.17 9.889 9.678 9.449 9.329 9.057 8.766 8.481 8.338 7.981 7.83 7.636 7.451 7.049 6.828 6.604 6.371 6.086 5.711 5.241 3.15 -4 ,30535 ,TETRA ,17525437,Thu Nov 25 01:19:26 CET,Thu Nov 25 03:47:33 CET,0.0 0.711 0.99 1.225 1.406 1.583 1.766 1.933 2.243 2.385 2.512 2.542 2.875 2.995 3.228 3.46 3.691 3.805 4.027 4.231 4.518 4.707 4.893 5.146 5.377 5.602 5.819 6.039 6.326 6.611 6.883 7.182 7.475 7.767 8.093 8.451 8.798 9.183 9.607 10.055 10.509 11.018 11.615 12.208 12.884 13.58 14.33 15.165 16.109 17.119 18.077 18.518 18.494 18.176 17.744 17.287 16.859 16.457 16.053 15.619 15.227 14.869 14.52 14.176 13.846 13.525 13.191 12.876 12.604 12.323 12.037 11.808 11.554 11.289 11.091 10.889 10.661 10.409 10.152 9.973 9.782 9.468 9.248 9.029 8.913 8.653 8.378 8.076 7.916 7.545 7.408 7.236 7.054 6.63 6.392 6.115 5.803 5.46 5.017 4.47 2.861 -5 ,8796 ,TETRA ,17525438,Thu Nov 25 01:19:29 CET,Thu Nov 25 03:47:52 CET,0.0 1.016 1.278 1.513 1.735 1.919 2.098 2.278 2.573 2.715 2.865 2.929 3.254 3.372 3.608 3.822 4.017 4.118 4.324 4.52 4.814 4.999 5.165 5.394 5.618 5.836 6.054 6.272 6.554 6.82 7.063 7.359 7.66 7.957 8.302 8.667 9.017 9.413 9.834 10.262 10.695 11.171 11.713 12.261 12.884 13.575 14.349 15.163 16.057 17.008 17.953 18.416 18.428 18.266 18.023 17.718 17.388 17.067 16.75 16.387 16.062 15.769 15.452 15.082 14.714 14.384 14.035 13.727 13.46 13.18 12.885 12.632 12.356 12.065 11.834 11.593 11.357 11.101 10.814 10.619 10.423 10.117 9.903 9.68 9.56 9.307 9.073 8.825 8.687 8.34 8.225 8.024 7.798 7.348 7.1 6.817 6.512 6.171 5.798 5.333 3.349 -6 ,32103 ,TETRA ,17525439,Thu Nov 25 01:19:27 CET,Thu Nov 25 03:33:01 CET,0.0 0.631 0.92 1.144 1.356 1.564 1.74 1.901 2.208 2.346 2.474 2.524 2.861 2.98 3.216 3.442 3.654 3.766 3.985 4.193 4.491 4.683 4.868 5.133 5.377 5.612 5.843 6.065 6.348 6.622 6.877 7.187 7.487 7.776 8.108 8.469 8.811 9.188 9.611 10.066 10.538 11.057 11.636 12.208 12.897 13.655 14.464 15.288 16.154 17.052 17.896 18.199 18.066 17.777 17.458 17.105 16.725 16.33 15.946 15.534 15.158 14.796 14.427 14.078 13.758 13.467 13.152 12.85 12.596 12.325 11.987 11.712 11.463 11.193 10.956 10.704 10.459 10.21 9.947 9.74 9.531 9.239 9.046 8.849 8.729 8.434 8.149 7.91 7.777 7.414 7.273 7.103 6.92 6.541 6.339 6.1 5.811 5.478 5.072 4.499 2.866 -7 ,7793 ,TETRA ,17525440,Thu Nov 25 01:20:27 CET,Thu Nov 25 03:49:30 CET,0.0 0.739 1.025 1.241 1.44 1.626 1.782 1.938 2.224 2.349 2.484 2.554 2.9 3.022 3.264 3.5 3.722 3.827 4.016 4.203 4.483 4.654 4.818 5.064 5.311 5.548 5.774 5.993 6.269 6.531 6.793 7.11 7.405 7.696 8.033 8.396 8.748 9.141 9.566 10.029 10.494 10.997 11.592 12.165 12.814 13.54 14.363 15.246 16.165 17.065 17.897 18.312 18.247 17.942 17.565 17.18 16.764 16.315 15.924 15.538 15.166 14.811 14.475 14.159 13.844 13.552 13.253 12.953 12.68 12.398 12.115 11.878 11.612 11.324 11.099 10.875 10.642 10.401 10.157 9.982 9.797 9.5 9.284 9.057 8.938 8.684 8.417 8.137 7.993 7.642 7.567 7.423 7.255 6.885 6.663 6.432 6.187 5.886 5.533 5.075 3.015 -8 ,6242 ,TETRA ,17525441,Thu Nov 25 01:21:27 CET,Thu Nov 25 03:47:28 CET,0.0 0.72 1.094 1.358 1.577 1.802 2.013 2.205 2.548 2.702 2.86 2.936 3.269 3.399 3.651 3.864 4.077 4.183 4.392 4.597 4.891 5.084 5.269 5.534 5.781 6.01 6.23 6.451 6.74 7.006 7.264 7.589 7.883 8.157 8.476 8.837 9.198 9.59 9.998 10.434 10.895 11.395 11.965 12.534 13.218 13.975 14.763 15.578 16.41 17.243 18.02 18.213 18.01 17.683 17.272 16.804 16.372 15.972 15.6 15.196 14.832 14.506 14.192 13.88 13.585 13.304 12.982 12.672 12.411 12.15 11.878 11.653 11.408 11.129 10.909 10.697 10.463 10.224 9.983 9.801 9.586 9.219 8.986 8.764 8.652 8.419 8.17 7.9 7.756 7.396 7.286 7.096 6.884 6.433 6.185 5.931 5.649 5.331 4.889 4.266 1.551 -9 ,32631 ,TETRA ,17525442,Thu Nov 25 01:21:27 CET,Thu Nov 25 03:48:02 CET,0.0 0.757 1.07 1.324 1.544 1.75 1.93 2.103 2.411 2.538 2.66 2.688 3.026 3.139 3.373 3.602 3.811 3.915 4.128 4.331 4.603 4.785 4.968 5.23 5.469 5.689 5.906 6.118 6.398 6.664 6.915 7.224 7.528 7.831 8.181 8.553 8.916 9.321 9.727 10.141 10.578 11.054 11.611 12.204 12.866 13.542 14.263 15.02 15.857 16.699 17.384 17.571 17.382 17.041 16.664 16.282 15.874 15.417 15.005 14.566 14.184 13.834 13.48 13.166 12.865 12.573 12.272 12.008 11.77 11.516 11.249 11.013 10.767 10.515 10.32 10.091 9.837 9.575 9.29 9.086 8.874 8.558 8.349 8.124 7.998 7.758 7.495 7.181 7.028 6.668 6.535 6.352 6.156 5.716 5.446 5.166 4.881 4.555 4.178 3.685 1.308 -10 ,25882 ,TETRA ,17525443,Thu Nov 25 01:21:26 CET,Thu Nov 25 03:48:55 CET,0.0 0.794 1.102 1.34 1.561 1.785 2.001 2.207 2.588 2.756 2.903 2.968 3.311 3.432 3.678 3.915 4.138 4.253 4.485 4.697 4.999 5.197 5.382 5.643 5.89 6.128 6.348 6.566 6.85 7.121 7.385 7.706 8.004 8.277 8.601 8.979 9.339 9.717 10.127 10.558 11.01 11.523 12.103 12.681 13.315 14.014 14.813 15.677 16.595 17.407 18.081 18.242 18.055 17.738 17.33 16.9 16.441 15.987 15.597 15.198 14.825 14.475 14.131 13.793 13.494 13.216 12.912 12.635 12.386 12.129 11.843 11.593 11.339 11.053 10.818 10.577 10.32 10.051 9.797 9.626 9.434 9.112 8.87 8.637 8.519 8.266 7.98 7.675 7.523 7.15 7.018 6.848 6.674 6.282 6.059 5.79 5.489 5.137 4.706 4.081 1.835 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 6a6f6818..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11472 ,KEBNE ,17024409,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:48:37 CET,0.0 0.413 0.587 0.774 0.971 1.156 1.375 1.574 1.836 1.965 2.088 2.102 2.413 2.527 2.742 2.924 3.079 3.161 3.346 3.515 3.754 3.907 4.052 4.249 4.428 4.607 4.792 4.972 5.189 5.389 5.603 5.853 6.082 6.315 6.581 6.854 7.114 7.402 7.693 7.997 8.32 8.674 9.07 9.456 9.881 10.363 10.888 11.417 12.009 12.523 12.799 12.673 12.335 11.868 11.344 10.802 10.32 9.91 9.532 9.145 8.807 8.484 8.15 7.82 7.528 7.258 6.965 6.705 6.469 6.216 5.957 5.754 5.547 5.303 5.101 4.9 4.697 4.492 4.277 4.118 3.947 3.689 3.499 3.277 3.165 2.949 2.725 2.482 2.353 2.019 1.95 1.792 1.605 1.211 1.018 0.792 0.539 0.291 -0.008 -0.414 -1.788 -2 ,18491 ,KEBNE ,17024410,Wed Dec 22 09:54:05 CET,Wed Dec 22 11:48:41 CET,0.0 0.426 0.725 0.956 1.172 1.357 1.503 1.637 1.89 2.007 2.129 2.154 2.456 2.546 2.725 2.893 3.049 3.131 3.287 3.426 3.616 3.743 3.88 4.087 4.285 4.462 4.628 4.796 4.999 5.184 5.372 5.606 5.845 6.079 6.333 6.618 6.898 7.205 7.534 7.887 8.243 8.629 9.082 9.522 10.019 10.559 11.143 11.72 12.278 12.763 13.033 12.87 12.509 12.101 11.671 11.219 10.779 10.328 9.887 9.416 9.022 8.676 8.317 7.958 7.619 7.32 7.014 6.736 6.496 6.25 5.987 5.743 5.498 5.263 5.078 4.879 4.664 4.445 4.212 4.052 3.895 3.625 3.436 3.263 3.174 2.977 2.762 2.537 2.432 2.106 2.03 1.867 1.694 1.348 1.128 0.885 0.628 0.342 0.036 -0.381 -1.587 -3 ,14329 ,KEBNE ,17024411,Wed Dec 22 09:55:08 CET,Wed Dec 22 11:49:29 CET,0.0 0.519 0.723 0.91 1.075 1.221 1.369 1.515 1.784 1.912 2.035 2.053 2.364 2.466 2.681 2.876 3.051 3.134 3.291 3.436 3.647 3.78 3.9 4.082 4.267 4.453 4.639 4.807 5.033 5.268 5.479 5.741 6.019 6.28 6.556 6.846 7.116 7.406 7.736 8.089 8.459 8.868 9.342 9.809 10.257 10.68 11.118 11.583 12.046 12.467 12.839 12.68 12.17 11.642 11.132 10.641 10.159 9.667 9.207 8.695 8.244 7.845 7.455 7.082 6.743 6.431 6.111 5.84 5.593 5.33 5.052 4.823 4.587 4.329 4.136 3.94 3.716 3.481 3.224 3.034 2.83 2.522 2.307 2.062 1.94 1.703 1.452 1.163 1.006 0.646 0.519 0.353 0.17 -0.242 -0.461 -0.689 -0.937 -1.2 -1.518 -1.971 -3.417 -4 ,30246 ,KEBNE ,17024412,Wed Dec 22 09:55:07 CET,Wed Dec 22 11:48:33 CET,0.0 0.776 1.156 1.41 1.628 1.823 1.99 2.146 2.449 2.587 2.714 2.737 3.045 3.149 3.338 3.52 3.699 3.786 3.958 4.119 4.347 4.489 4.627 4.834 5.02 5.192 5.376 5.567 5.808 6.021 6.212 6.44 6.662 6.879 7.124 7.409 7.682 7.972 8.27 8.585 8.927 9.303 9.731 10.142 10.611 11.134 11.678 12.201 12.735 13.21 13.391 13.122 12.676 12.234 11.812 11.352 10.88 10.4 9.972 9.556 9.191 8.828 8.464 8.125 7.83 7.584 7.319 7.048 6.791 6.531 6.284 6.095 5.867 5.616 5.423 5.214 4.997 4.75 4.479 4.292 4.09 3.745 3.504 3.285 3.173 2.925 2.645 2.342 2.185 1.801 1.64 1.453 1.257 0.85 0.604 0.301 -0.033 -0.425 -0.851 -1.428 -3.203 -5 ,4777 ,KEBNE ,17024413,Wed Dec 22 09:55:07 CET,Wed Dec 22 11:48:43 CET,0.0 0.969 1.269 1.526 1.707 1.891 2.084 2.244 2.485 2.595 2.701 2.711 3.016 3.121 3.312 3.479 3.649 3.737 3.901 4.06 4.291 4.436 4.574 4.764 4.941 5.118 5.286 5.438 5.631 5.832 6.027 6.258 6.491 6.71 6.953 7.212 7.466 7.747 8.036 8.348 8.699 9.118 9.595 10.032 10.527 11.077 11.682 12.304 12.967 13.681 14.221 14.188 13.81 13.388 12.961 12.494 12.039 11.583 11.181 10.791 10.453 10.155 9.841 9.505 9.176 8.866 8.537 8.226 7.974 7.728 7.458 7.223 6.98 6.737 6.567 6.387 6.175 5.934 5.656 5.479 5.329 5.092 4.927 4.779 4.69 4.5 4.332 4.142 4.036 3.73 3.66 3.524 3.381 3.049 2.879 2.692 2.459 2.23 2.013 1.704 0.602 -6 ,8717 ,KEBNE ,17024414,Wed Dec 22 09:55:07 CET,Wed Dec 22 11:48:30 CET,0.0 0.754 1.003 1.219 1.419 1.601 1.772 1.905 2.149 2.271 2.381 2.403 2.704 2.804 2.994 3.163 3.357 3.46 3.636 3.8 4.054 4.211 4.35 4.568 4.786 4.974 5.146 5.32 5.54 5.768 5.99 6.219 6.437 6.668 6.935 7.233 7.536 7.845 8.147 8.483 8.828 9.191 9.621 10.038 10.5 11.045 11.676 12.289 12.891 13.502 13.919 13.883 13.527 13.045 12.564 12.064 11.598 11.17 10.745 10.279 9.862 9.484 9.143 8.838 8.549 8.262 7.981 7.755 7.529 7.267 7.007 6.798 6.564 6.324 6.147 5.952 5.734 5.494 5.244 5.077 4.906 4.652 4.486 4.312 4.213 3.999 3.772 3.537 3.418 3.099 3.072 2.946 2.803 2.474 2.284 2.063 1.817 1.549 1.255 0.911 -0.161 -7 ,27718 ,KEBNE ,17024415,Wed Dec 22 09:55:07 CET,Wed Dec 22 11:48:32 CET,0.0 0.381 0.652 0.833 0.996 1.126 1.241 1.351 1.561 1.644 1.71 1.676 1.95 2.021 2.173 2.321 2.465 2.542 2.678 2.8 2.99 3.111 3.228 3.41 3.586 3.742 3.889 4.039 4.233 4.414 4.593 4.827 5.058 5.268 5.496 5.743 5.997 6.279 6.562 6.889 7.245 7.621 8.07 8.514 8.981 9.481 10.033 10.571 11.136 11.715 12.052 11.966 11.635 11.206 10.764 10.307 9.877 9.44 9.0 8.537 8.123 7.76 7.431 7.125 6.831 6.542 6.232 5.954 5.715 5.465 5.189 4.948 4.695 4.446 4.256 4.053 3.841 3.617 3.393 3.227 3.059 2.789 2.566 2.319 2.189 1.921 1.635 1.354 1.214 0.862 0.748 0.59 0.443 0.124 -0.068 -0.278 -0.548 -0.842 -1.121 -1.485 -2.368 -8 ,11935 ,KEBNE ,17024416,Wed Dec 22 09:56:11 CET,Wed Dec 22 11:50:16 CET,0.0 0.344 0.571 0.779 0.963 1.139 1.273 1.402 1.678 1.802 1.923 1.938 2.233 2.324 2.499 2.663 2.83 2.912 3.067 3.216 3.453 3.604 3.747 3.951 4.125 4.284 4.443 4.61 4.836 5.037 5.22 5.467 5.716 5.944 6.215 6.541 6.876 7.23 7.569 7.912 8.287 8.697 9.145 9.609 10.147 10.692 11.295 11.953 12.637 13.324 13.796 13.771 13.51 13.136 12.689 12.189 11.696 11.226 10.794 10.343 9.946 9.604 9.278 8.95 8.653 8.392 8.102 7.837 7.602 7.35 7.075 6.839 6.599 6.348 6.148 5.935 5.713 5.491 5.262 5.097 4.92 4.631 4.418 4.193 4.079 3.868 3.653 3.42 3.294 2.951 2.862 2.712 2.551 2.188 1.973 1.729 1.452 1.157 0.796 0.285 -1.543 -9 ,22539 ,KEBNE ,17024417,Wed Dec 22 09:56:11 CET,Wed Dec 22 11:49:36 CET,0.0 0.382 0.613 0.837 1.029 1.21 1.378 1.538 1.825 1.956 2.074 2.076 2.383 2.47 2.63 2.79 2.939 3.014 3.162 3.311 3.521 3.652 3.779 3.962 4.14 4.312 4.468 4.61 4.81 5.012 5.193 5.417 5.63 5.834 6.08 6.355 6.64 6.978 7.336 7.687 8.02 8.38 8.847 9.31 9.815 10.372 10.966 11.587 12.202 12.7 12.979 12.779 12.325 11.782 11.244 10.703 10.219 9.776 9.374 8.974 8.607 8.219 7.832 7.492 7.181 6.886 6.568 6.297 6.077 5.848 5.592 5.366 5.123 4.87 4.678 4.492 4.29 4.073 3.86 3.704 3.542 3.263 3.055 2.853 2.745 2.522 2.304 2.057 1.924 1.582 1.488 1.327 1.161 0.786 0.571 0.355 0.141 -0.113 -0.396 -0.794 -2.48 -10 ,13678 ,KEBNE ,17024418,Wed Dec 22 09:56:10 CET,Wed Dec 22 11:50:33 CET,0.0 0.906 1.178 1.439 1.659 1.832 1.984 2.108 2.326 2.431 2.536 2.566 2.861 2.936 3.109 3.3 3.487 3.576 3.733 3.892 4.131 4.278 4.42 4.612 4.789 4.988 5.198 5.392 5.636 5.859 6.074 6.327 6.554 6.778 7.06 7.368 7.635 7.906 8.176 8.482 8.826 9.203 9.612 9.985 10.437 10.951 11.491 12.056 12.639 13.191 13.649 13.681 13.373 12.934 12.511 12.1 11.694 11.26 10.872 10.461 10.049 9.684 9.332 8.984 8.662 8.364 8.034 7.732 7.466 7.181 6.889 6.638 6.375 6.105 5.883 5.642 5.399 5.158 4.898 4.72 4.554 4.301 4.122 3.939 3.838 3.622 3.407 3.186 3.076 2.753 2.667 2.506 2.335 2.013 1.845 1.652 1.463 1.267 1.002 0.62 -0.531 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 266d9c7c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12885 ,TETRA ,17525444,Thu Nov 25 01:22:28 CET,Thu Nov 25 03:42:30 CET,0.0 0.39 0.648 0.848 1.025 1.187 1.339 1.482 1.742 1.867 1.993 2.026 2.326 2.43 2.652 2.873 3.072 3.167 3.358 3.555 3.825 3.988 4.152 4.395 4.631 4.871 5.092 5.299 5.586 5.868 6.132 6.451 6.766 7.074 7.423 7.822 8.2 8.597 9.028 9.512 10.029 10.599 11.265 11.93 12.701 13.557 14.538 15.668 16.999 18.558 20.3 21.572 22.201 22.455 22.596 22.664 22.629 22.539 22.395 22.24 22.125 21.986 21.811 21.621 21.439 21.273 21.102 20.956 20.831 20.677 20.501 20.362 20.205 20.03 19.894 19.743 19.587 19.429 19.264 19.159 19.052 18.874 18.753 18.632 18.568 18.427 18.264 18.093 18.01 17.735 17.74 17.657 17.569 17.353 17.217 17.062 16.892 16.726 16.51 16.239 15.796 -2 ,29138 ,TETRA ,17525445,Thu Nov 25 01:22:28 CET,Thu Nov 25 03:42:08 CET,0.0 0.555 0.821 1.044 1.261 1.448 1.624 1.801 2.094 2.228 2.356 2.412 2.742 2.863 3.091 3.304 3.51 3.608 3.801 3.989 4.258 4.435 4.611 4.867 5.108 5.346 5.587 5.824 6.13 6.421 6.697 7.03 7.345 7.645 7.997 8.391 8.763 9.168 9.613 10.113 10.646 11.225 11.895 12.563 13.342 14.183 15.11 16.142 17.361 18.737 20.256 21.289 21.696 21.851 21.891 21.825 21.681 21.519 21.379 21.225 21.057 20.896 20.721 20.531 20.367 20.217 20.036 19.868 19.712 19.549 19.39 19.251 19.098 18.942 18.83 18.712 18.596 18.478 18.345 18.248 18.138 17.959 17.839 17.716 17.654 17.511 17.357 17.195 17.103 16.82 16.84 16.75 16.645 16.404 16.269 16.138 16.002 15.831 15.626 15.402 14.91 -3 ,1324 ,TETRA ,17525446,Thu Nov 25 01:22:28 CET,Thu Nov 25 03:40:42 CET,0.0 0.639 0.852 1.051 1.267 1.462 1.639 1.798 2.077 2.204 2.325 2.361 2.687 2.81 3.032 3.235 3.438 3.533 3.709 3.888 4.144 4.309 4.471 4.694 4.903 5.118 5.332 5.543 5.818 6.085 6.345 6.653 6.96 7.272 7.625 8.01 8.384 8.798 9.274 9.784 10.3 10.891 11.602 12.344 13.18 14.052 15.046 16.156 17.428 18.864 20.446 21.555 22.042 22.251 22.305 22.258 22.168 22.074 21.964 21.813 21.694 21.583 21.443 21.291 21.138 20.998 20.848 20.7 20.574 20.453 20.328 20.224 20.104 19.97 19.865 19.761 19.658 19.547 19.43 19.336 19.232 19.083 18.982 18.887 18.841 18.732 18.61 18.468 18.391 18.145 18.187 18.123 18.044 17.853 17.764 17.663 17.529 17.377 17.21 16.969 16.7 -4 ,1765 ,TETRA ,17525447,Thu Nov 25 01:22:28 CET,Thu Nov 25 03:41:05 CET,0.0 0.674 0.905 1.1 1.281 1.46 1.651 1.813 2.092 2.227 2.357 2.399 2.725 2.836 3.046 3.26 3.465 3.567 3.774 3.963 4.249 4.443 4.627 4.89 5.142 5.389 5.621 5.837 6.111 6.392 6.675 7.017 7.353 7.684 8.056 8.444 8.809 9.232 9.714 10.217 10.734 11.333 12.047 12.739 13.496 14.338 15.307 16.379 17.652 19.092 20.694 21.809 22.259 22.452 22.454 22.37 22.259 22.085 21.906 21.735 21.559 21.391 21.238 21.073 20.901 20.732 20.568 20.424 20.281 20.112 19.943 19.814 19.673 19.513 19.385 19.258 19.121 18.973 18.817 18.704 18.58 18.405 18.291 18.167 18.102 17.965 17.829 17.688 17.615 17.348 17.356 17.256 17.158 16.913 16.777 16.643 16.48 16.302 16.106 15.872 15.528 -5 ,32094 ,TETRA ,17525448,Thu Nov 25 01:22:31 CET,Thu Nov 25 03:26:56 CET,0.0 0.678 0.968 1.177 1.37 1.563 1.738 1.889 2.187 2.335 2.484 2.544 2.86 2.978 3.218 3.456 3.683 3.795 4.004 4.185 4.463 4.659 4.851 5.104 5.337 5.558 5.766 5.968 6.243 6.522 6.784 7.1 7.407 7.705 8.055 8.452 8.823 9.236 9.687 10.165 10.686 11.269 11.95 12.641 13.422 14.283 15.261 16.335 17.576 18.925 20.415 21.497 22.035 22.3 22.349 22.322 22.272 22.201 22.069 21.906 21.774 21.639 21.471 21.306 21.171 21.035 20.883 20.758 20.656 20.54 20.404 20.289 20.169 20.042 19.939 19.83 19.705 19.573 19.445 19.356 19.261 19.112 18.997 18.871 18.816 18.712 18.589 18.45 18.379 18.118 18.125 18.036 17.95 17.73 17.612 17.509 17.407 17.287 17.126 16.947 16.655 -6 ,15047 ,TETRA ,17525449,Thu Nov 25 01:23:57 CET,Thu Nov 25 03:41:35 CET,0.0 0.545 0.757 0.927 1.099 1.273 1.433 1.6 1.939 2.094 2.234 2.28 2.599 2.713 2.936 3.166 3.386 3.491 3.7 3.899 4.184 4.371 4.557 4.823 5.084 5.336 5.565 5.781 6.06 6.332 6.602 6.941 7.276 7.58 7.923 8.309 8.683 9.106 9.569 10.05 10.524 11.077 11.763 12.432 13.218 14.068 15.021 16.135 17.381 18.734 20.221 21.263 21.669 21.813 21.814 21.726 21.585 21.402 21.211 21.014 20.844 20.665 20.484 20.309 20.131 19.955 19.753 19.569 19.415 19.249 19.071 18.932 18.789 18.632 18.501 18.368 18.246 18.104 17.947 17.838 17.726 17.553 17.432 17.311 17.247 17.109 16.948 16.784 16.705 16.425 16.434 16.343 16.246 16.041 15.923 15.787 15.619 15.439 15.262 15.03 14.564 -7 ,11463 ,TETRA ,17525450,Thu Nov 25 01:23:57 CET,Thu Nov 25 03:40:50 CET,0.0 0.56 0.813 1.009 1.16 1.301 1.448 1.582 1.829 1.968 2.101 2.156 2.497 2.625 2.85 3.058 3.264 3.363 3.533 3.704 3.97 4.135 4.293 4.53 4.767 4.994 5.226 5.456 5.748 6.031 6.316 6.671 7.008 7.332 7.681 8.073 8.46 8.87 9.316 9.799 10.351 10.997 11.705 12.411 13.23 14.1 15.083 16.257 17.528 18.892 20.472 21.567 22.05 22.201 22.211 22.127 21.979 21.782 21.57 21.356 21.162 21.003 20.855 20.686 20.519 20.361 20.172 20.006 19.878 19.732 19.565 19.428 19.272 19.102 18.973 18.842 18.714 18.573 18.411 18.303 18.201 18.052 17.95 17.844 17.782 17.639 17.506 17.36 17.277 17.01 17.036 16.944 16.844 16.632 16.519 16.39 16.243 16.088 15.884 15.644 15.226 -8 ,29218 ,TETRA ,17525451,Thu Nov 25 01:23:57 CET,Thu Nov 25 03:41:11 CET,0.0 0.726 1.157 1.46 1.675 1.871 2.046 2.195 2.509 2.673 2.809 2.832 3.136 3.241 3.463 3.706 3.95 4.07 4.298 4.505 4.787 4.962 5.138 5.395 5.641 5.874 6.085 6.299 6.589 6.862 7.129 7.463 7.791 8.095 8.458 8.876 9.261 9.696 10.174 10.663 11.152 11.713 12.375 13.063 13.879 14.756 15.708 16.735 17.951 19.358 20.882 21.976 22.439 22.595 22.605 22.509 22.364 22.199 22.031 21.845 21.66 21.489 21.312 21.116 20.924 20.755 20.579 20.41 20.252 20.083 19.91 19.767 19.612 19.437 19.312 19.196 19.075 18.941 18.793 18.696 18.589 18.413 18.288 18.147 18.073 17.928 17.785 17.62 17.537 17.273 17.289 17.201 17.114 16.914 16.798 16.661 16.502 16.315 16.093 15.835 14.762 -9 ,6412 ,TETRA ,17525452,Thu Nov 25 01:23:57 CET,Thu Nov 25 03:39:22 CET,0.0 0.497 0.751 0.93 1.102 1.272 1.423 1.571 1.895 2.038 2.165 2.199 2.511 2.628 2.838 3.022 3.21 3.306 3.487 3.659 3.916 4.083 4.249 4.489 4.725 4.955 5.169 5.37 5.623 5.872 6.132 6.455 6.758 7.051 7.399 7.781 8.148 8.555 9.004 9.485 9.964 10.502 11.143 11.787 12.541 13.38 14.298 15.289 16.473 17.761 19.137 20.146 20.599 20.799 20.886 20.86 20.807 20.756 20.663 20.533 20.388 20.246 20.115 19.99 19.863 19.741 19.591 19.441 19.32 19.182 19.018 18.894 18.765 18.618 18.51 18.399 18.275 18.157 18.048 17.974 17.892 17.713 17.563 17.41 17.336 17.192 17.05 16.911 16.833 16.573 16.591 16.499 16.402 16.213 16.097 15.978 15.853 15.703 15.504 15.281 14.906 -10 ,3955 ,TETRA ,17525453,Thu Nov 25 01:23:57 CET,Thu Nov 25 03:40:58 CET,0.0 0.857 1.188 1.453 1.66 1.877 2.093 2.268 2.601 2.762 2.91 2.971 3.314 3.45 3.69 3.932 4.168 4.277 4.488 4.688 4.971 5.163 5.349 5.615 5.879 6.139 6.377 6.605 6.901 7.187 7.478 7.827 8.153 8.486 8.881 9.284 9.656 10.102 10.586 11.071 11.597 12.184 12.861 13.537 14.275 15.106 16.109 17.215 18.514 20.041 21.676 22.802 23.23 23.361 23.408 23.356 23.233 23.086 22.939 22.766 22.598 22.44 22.274 22.103 21.921 21.747 21.569 21.402 21.251 21.087 20.914 20.775 20.626 20.47 20.35 20.232 20.109 19.973 19.83 19.731 19.617 19.432 19.313 19.192 19.132 18.997 18.859 18.702 18.616 18.363 18.365 18.256 18.144 17.929 17.818 17.701 17.576 17.453 17.309 17.129 16.83 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt deleted file mode 100644 index f476d3cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12879 ,TETRA ,17525454,Thu Nov 25 01:23:57 CET,Thu Nov 25 03:41:09 CET,0.0 0.514 0.705 0.841 0.977 1.11 1.245 1.379 1.601 1.692 1.787 1.758 2.033 2.11 2.253 2.393 2.532 2.609 2.756 2.883 3.056 3.164 3.274 3.451 3.619 3.769 3.911 4.045 4.205 4.35 4.484 4.651 4.823 4.983 5.161 5.364 5.567 5.812 6.051 6.264 6.48 6.714 6.964 7.151 7.353 7.567 7.761 7.884 7.867 7.557 6.604 5.118 3.763 2.622 1.654 0.74 -0.098 -0.838 -1.44 -2.032 -2.553 -3.023 -3.472 -3.894 -4.28 -4.644 -5.043 -5.416 -5.737 -6.057 -6.39 -6.648 -6.896 -7.15 -7.363 -7.599 -7.83 -8.052 -8.284 -8.446 -8.603 -8.845 -9.022 -9.191 -9.272 -9.46 -9.655 -9.852 -9.957 -10.263 -10.253 -10.363 -10.471 -10.688 -10.801 -10.931 -11.098 -11.29 -11.475 -11.71 -12.292 -2 ,8906 ,TETRA ,17525455,Thu Nov 25 01:23:57 CET,Thu Nov 25 03:41:12 CET,0.0 0.698 0.971 1.176 1.365 1.544 1.7 1.843 2.089 2.196 2.303 2.294 2.597 2.688 2.866 3.036 3.2 3.279 3.435 3.573 3.749 3.86 3.967 4.114 4.25 4.376 4.503 4.64 4.812 4.969 5.125 5.306 5.474 5.639 5.836 6.055 6.25 6.46 6.681 6.902 7.128 7.365 7.637 7.88 8.125 8.32 8.413 8.475 8.413 8.04 7.083 5.674 4.423 3.325 2.312 1.356 0.573 -0.098 -0.683 -1.283 -1.798 -2.263 -2.716 -3.14 -3.533 -3.893 -4.283 -4.618 -4.909 -5.199 -5.483 -5.722 -5.96 -6.2 -6.39 -6.594 -6.82 -7.059 -7.302 -7.468 -7.633 -7.898 -8.076 -8.257 -8.352 -8.544 -8.749 -8.957 -9.063 -9.392 -9.435 -9.563 -9.685 -9.962 -10.106 -10.272 -10.474 -10.683 -10.899 -11.151 -11.672 -3 ,18387 ,TETRA ,17525456,Thu Nov 25 01:23:57 CET,Thu Nov 25 03:42:11 CET,0.0 0.613 0.898 1.121 1.304 1.453 1.572 1.677 1.885 1.981 2.08 2.075 2.377 2.47 2.639 2.785 2.928 2.998 3.128 3.255 3.446 3.557 3.67 3.86 4.038 4.201 4.359 4.507 4.686 4.851 5.013 5.2 5.368 5.53 5.714 5.919 6.118 6.33 6.561 6.783 6.998 7.222 7.444 7.639 7.857 8.076 8.227 8.224 8.067 7.645 6.702 5.266 3.986 2.816 1.727 0.777 -0.022 -0.74 -1.393 -2.041 -2.587 -3.083 -3.538 -3.954 -4.344 -4.691 -5.057 -5.391 -5.67 -5.972 -6.287 -6.528 -6.763 -7.011 -7.226 -7.443 -7.651 -7.857 -8.076 -8.238 -8.413 -8.682 -8.864 -9.055 -9.147 -9.329 -9.516 -9.72 -9.833 -10.166 -10.193 -10.313 -10.444 -10.726 -10.881 -11.045 -11.222 -11.4 -11.575 -11.824 -12.518 -4 ,14202 ,TETRA ,17525457,Thu Nov 25 01:23:57 CET,Thu Nov 25 03:40:57 CET,0.0 0.448 0.77 1.059 1.247 1.391 1.522 1.642 1.849 1.955 2.057 2.032 2.322 2.411 2.566 2.705 2.838 2.91 3.049 3.17 3.349 3.462 3.575 3.742 3.902 4.051 4.202 4.35 4.535 4.704 4.842 5.0 5.158 5.303 5.474 5.673 5.864 6.064 6.283 6.519 6.745 6.989 7.277 7.529 7.788 8.048 8.243 8.327 8.231 7.838 6.863 5.5 4.293 3.172 2.153 1.202 0.366 -0.371 -0.983 -1.614 -2.193 -2.726 -3.239 -3.69 -4.095 -4.483 -4.885 -5.234 -5.542 -5.887 -6.245 -6.527 -6.814 -7.105 -7.315 -7.511 -7.708 -7.92 -8.139 -8.299 -8.476 -8.761 -8.953 -9.141 -9.238 -9.441 -9.642 -9.85 -9.971 -10.31 -10.348 -10.477 -10.612 -10.88 -11.022 -11.175 -11.341 -11.526 -11.758 -12.042 -12.471 -5 ,12331 ,TETRA ,17525458,Thu Nov 25 01:23:58 CET,Thu Nov 25 03:38:50 CET,0.0 0.387 0.574 0.716 0.819 0.912 1.007 1.127 1.372 1.468 1.565 1.577 1.848 1.922 2.077 2.229 2.371 2.431 2.547 2.657 2.809 2.913 3.004 3.13 3.269 3.404 3.533 3.662 3.845 4.029 4.19 4.381 4.564 4.72 4.878 5.075 5.267 5.458 5.666 5.874 6.064 6.262 6.449 6.666 6.922 7.128 7.318 7.385 7.285 6.971 6.06 4.716 3.476 2.302 1.278 0.343 -0.47 -1.198 -1.854 -2.504 -3.034 -3.502 -3.949 -4.363 -4.743 -5.087 -5.444 -5.762 -6.052 -6.358 -6.653 -6.89 -7.149 -7.427 -7.64 -7.848 -8.047 -8.247 -8.459 -8.606 -8.747 -8.967 -9.117 -9.275 -9.363 -9.557 -9.759 -9.965 -10.067 -10.377 -10.413 -10.543 -10.678 -10.941 -11.076 -11.237 -11.415 -11.586 -11.775 -12.116 -12.857 -6 ,7361 ,TETRA ,17525459,Thu Nov 25 01:23:58 CET,Thu Nov 25 03:36:59 CET,0.0 0.452 0.706 0.909 1.093 1.268 1.427 1.571 1.794 1.895 1.998 1.983 2.285 2.39 2.574 2.731 2.887 2.962 3.109 3.255 3.454 3.566 3.672 3.834 4.002 4.153 4.29 4.428 4.6 4.764 4.919 5.103 5.29 5.458 5.63 5.808 5.974 6.149 6.343 6.567 6.786 7.007 7.257 7.479 7.649 7.746 7.801 7.787 7.601 7.152 6.185 4.771 3.485 2.304 1.25 0.292 -0.55 -1.28 -1.908 -2.535 -3.065 -3.541 -3.993 -4.407 -4.782 -5.119 -5.469 -5.784 -6.068 -6.369 -6.67 -6.917 -7.173 -7.431 -7.631 -7.851 -8.071 -8.292 -8.529 -8.688 -8.85 -9.112 -9.291 -9.473 -9.573 -9.782 -9.993 -10.211 -10.32 -10.648 -10.673 -10.791 -10.915 -11.231 -11.403 -11.577 -11.768 -11.994 -12.224 -12.454 -13.088 -7 ,24716 ,TETRA ,17525460,Thu Nov 25 01:23:58 CET,Thu Nov 25 03:41:38 CET,0.0 0.419 0.65 0.837 1.008 1.151 1.261 1.379 1.572 1.656 1.743 1.708 1.976 2.045 2.171 2.295 2.413 2.472 2.588 2.706 2.885 2.99 3.09 3.233 3.369 3.499 3.623 3.746 3.897 4.034 4.168 4.326 4.482 4.626 4.79 4.975 5.132 5.297 5.47 5.63 5.81 6.002 6.193 6.395 6.582 6.752 6.889 6.925 6.873 6.53 5.468 3.91 2.601 1.435 0.341 -0.629 -1.433 -2.119 -2.724 -3.384 -3.91 -4.371 -4.845 -5.307 -5.739 -6.119 -6.511 -6.857 -7.163 -7.497 -7.831 -8.105 -8.38 -8.654 -8.86 -9.08 -9.319 -9.551 -9.78 -9.939 -10.102 -10.357 -10.535 -10.72 -10.822 -11.043 -11.252 -11.457 -11.565 -11.879 -11.905 -12.038 -12.178 -12.46 -12.6 -12.755 -12.943 -13.157 -13.372 -13.65 -14.162 -8 ,14264 ,TETRA ,17525461,Thu Nov 25 01:23:59 CET,Thu Nov 25 03:40:27 CET,0.0 0.68 0.995 1.185 1.339 1.475 1.597 1.722 1.921 2.003 2.097 2.085 2.356 2.429 2.556 2.681 2.808 2.868 3.008 3.145 3.313 3.414 3.52 3.688 3.846 3.999 4.126 4.242 4.392 4.529 4.668 4.842 4.998 5.139 5.313 5.506 5.677 5.863 6.062 6.274 6.491 6.691 6.871 7.048 7.247 7.449 7.627 7.697 7.647 7.3 6.427 5.109 3.755 2.59 1.564 0.643 -0.131 -0.88 -1.573 -2.252 -2.801 -3.293 -3.758 -4.171 -4.549 -4.916 -5.313 -5.653 -5.952 -6.268 -6.583 -6.849 -7.138 -7.427 -7.651 -7.884 -8.119 -8.368 -8.642 -8.835 -9.03 -9.342 -9.552 -9.76 -9.865 -10.066 -10.28 -10.508 -10.621 -10.965 -11.031 -11.174 -11.321 -11.641 -11.811 -11.998 -12.195 -12.414 -12.703 -13.039 -13.8 -9 ,22862 ,TETRA ,17525462,Thu Nov 25 01:23:59 CET,Thu Nov 25 03:43:32 CET,0.0 0.585 0.803 0.992 1.166 1.329 1.479 1.59 1.759 1.85 1.931 1.899 2.188 2.27 2.42 2.56 2.695 2.767 2.901 3.022 3.188 3.298 3.409 3.58 3.737 3.877 4.016 4.156 4.337 4.499 4.646 4.825 4.998 5.156 5.325 5.509 5.69 5.878 6.077 6.262 6.428 6.595 6.784 7.002 7.237 7.443 7.646 7.837 7.899 7.593 6.559 5.035 3.718 2.529 1.443 0.479 -0.368 -1.107 -1.742 -2.415 -2.99 -3.502 -3.988 -4.445 -4.862 -5.233 -5.627 -5.987 -6.289 -6.601 -6.917 -7.182 -7.477 -7.775 -7.99 -8.22 -8.477 -8.741 -9.003 -9.172 -9.335 -9.597 -9.786 -9.978 -10.079 -10.299 -10.523 -10.742 -10.863 -11.2 -11.209 -11.33 -11.456 -11.734 -11.912 -12.09 -12.241 -12.408 -12.628 -12.896 -13.656 -10 ,26576 ,TETRA ,17525463,Thu Nov 25 01:23:58 CET,Thu Nov 25 03:40:50 CET,0.0 1.141 1.44 1.665 1.844 1.995 2.131 2.244 2.488 2.606 2.711 2.719 3.022 3.11 3.279 3.452 3.614 3.684 3.823 3.954 4.139 4.267 4.383 4.543 4.702 4.852 4.993 5.123 5.288 5.461 5.628 5.811 5.977 6.145 6.327 6.516 6.702 6.915 7.142 7.349 7.55 7.799 8.047 8.276 8.542 8.78 8.971 9.101 9.141 8.811 7.825 6.366 5.014 3.837 2.795 1.884 1.068 0.282 -0.385 -1.053 -1.637 -2.157 -2.645 -3.094 -3.511 -3.885 -4.28 -4.647 -4.958 -5.274 -5.601 -5.864 -6.125 -6.395 -6.61 -6.825 -7.039 -7.262 -7.505 -7.679 -7.859 -8.125 -8.304 -8.495 -8.593 -8.785 -8.985 -9.214 -9.331 -9.666 -9.695 -9.827 -9.959 -10.237 -10.394 -10.55 -10.732 -10.936 -11.133 -11.416 -12.206 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt deleted file mode 100644 index 13a07a8c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23681 ,TETRA ,17525465,Thu Nov 25 01:23:58 CET,Thu Nov 25 03:39:36 CET,0.0 0.595 0.895 1.145 1.371 1.581 1.779 1.968 2.373 2.567 2.748 2.885 3.242 3.394 3.693 4.0 4.297 4.439 4.73 5.012 5.422 5.697 5.961 6.345 6.727 7.11 7.489 7.859 8.352 8.841 9.338 9.963 10.582 11.173 11.864 12.675 13.477 14.37 15.368 16.474 17.642 18.978 20.607 22.305 24.329 26.673 29.537 32.995 37.243 42.536 49.695 56.555 61.095 64.277 66.634 68.458 69.845 70.973 71.834 72.549 73.059 73.472 73.852 74.172 74.415 74.598 74.74 74.845 74.954 75.055 75.129 75.185 75.219 75.266 75.309 75.317 75.313 75.313 75.318 75.319 75.305 75.274 75.244 75.199 75.185 75.152 75.077 75.0 74.96 74.782 74.818 74.754 74.691 74.537 74.435 74.349 74.253 74.11 73.931 73.685 72.72 -2 ,7351 ,TETRA ,17525466,Thu Nov 25 01:23:58 CET,Thu Nov 25 03:40:29 CET,0.0 0.693 1.047 1.324 1.558 1.777 2.003 2.229 2.647 2.85 3.063 3.248 3.644 3.831 4.159 4.473 4.795 4.964 5.286 5.584 6.028 6.338 6.646 7.086 7.513 7.945 8.371 8.784 9.303 9.807 10.299 10.903 11.515 12.11 12.802 13.596 14.372 15.268 16.29 17.385 18.555 19.918 21.58 23.281 25.307 27.718 30.627 34.047 38.298 43.758 50.982 57.735 62.274 65.458 67.811 69.631 70.985 72.048 72.885 73.643 74.188 74.618 75.012 75.34 75.606 75.823 76.017 76.178 76.311 76.437 76.545 76.616 76.679 76.735 76.764 76.783 76.797 76.813 76.84 76.851 76.842 76.829 76.816 76.798 76.788 76.769 76.747 76.701 76.672 76.518 76.565 76.512 76.447 76.302 76.232 76.142 76.032 75.936 75.795 75.563 75.097 -3 ,6148 ,TETRA ,17525467,Thu Nov 25 01:24:54 CET,Thu Nov 25 03:46:34 CET,0.0 0.604 0.926 1.188 1.412 1.633 1.852 2.046 2.406 2.579 2.748 2.88 3.244 3.413 3.74 4.041 4.345 4.502 4.808 5.104 5.535 5.817 6.105 6.544 6.966 7.366 7.755 8.14 8.658 9.165 9.658 10.258 10.847 11.429 12.108 12.886 13.647 14.493 15.427 16.48 17.639 18.976 20.577 22.212 24.17 26.469 29.255 32.588 36.735 42.009 49.058 55.506 59.729 62.805 65.086 66.805 68.119 69.141 69.971 70.72 71.251 71.699 72.084 72.4 72.673 72.907 73.129 73.311 73.45 73.559 73.66 73.746 73.816 73.866 73.909 73.939 73.962 73.994 74.007 74.011 74.018 74.017 74.005 73.989 73.982 73.963 73.928 73.888 73.863 73.706 73.768 73.725 73.677 73.559 73.483 73.39 73.295 73.159 72.992 72.85 72.537 -4 ,29404 ,TETRA ,17525468,Thu Nov 25 01:24:56 CET,Thu Nov 25 03:42:17 CET,0.0 0.789 1.123 1.406 1.664 1.927 2.17 2.38 2.759 2.946 3.142 3.309 3.684 3.862 4.195 4.528 4.875 5.035 5.34 5.646 6.089 6.379 6.67 7.098 7.515 7.915 8.306 8.699 9.207 9.701 10.192 10.792 11.392 11.997 12.717 13.56 14.39 15.334 16.407 17.566 18.802 20.233 21.938 23.664 25.724 28.11 31.007 34.436 38.662 44.056 51.288 58.11 62.561 65.774 68.115 69.853 71.2 72.287 73.11 73.853 74.422 74.864 75.257 75.602 75.889 76.132 76.366 76.549 76.685 76.809 76.946 77.049 77.136 77.211 77.259 77.301 77.33 77.355 77.378 77.39 77.394 77.393 77.394 77.384 77.367 77.328 77.3 77.26 77.225 77.062 77.129 77.092 77.044 76.934 76.851 76.769 76.694 76.614 76.516 76.373 75.808 -5 ,23912 ,TETRA ,17525469,Thu Nov 25 01:24:56 CET,Thu Nov 25 03:42:44 CET,0.0 0.708 1.089 1.408 1.669 1.915 2.149 2.368 2.766 2.968 3.163 3.328 3.707 3.877 4.221 4.578 4.919 5.07 5.361 5.651 6.068 6.343 6.61 7.016 7.406 7.783 8.165 8.535 9.023 9.522 10.016 10.613 11.196 11.784 12.493 13.283 14.044 14.906 15.853 16.885 18.024 19.361 20.974 22.633 24.643 26.973 29.77 33.131 37.278 42.523 49.573 56.139 60.483 63.525 65.8 67.617 69.008 70.126 70.965 71.693 72.237 72.654 73.009 73.297 73.519 73.703 73.87 74.004 74.114 74.216 74.326 74.41 74.483 74.545 74.574 74.585 74.592 74.602 74.602 74.602 74.594 74.565 74.54 74.486 74.453 74.401 74.346 74.303 74.29 74.153 74.243 74.198 74.14 74.02 73.938 73.818 73.681 73.537 73.343 73.149 72.664 -6 ,22579 ,TETRA ,17525470,Thu Nov 25 01:24:57 CET,Thu Nov 25 03:42:22 CET,0.0 0.779 1.058 1.339 1.632 1.874 2.099 2.313 2.714 2.895 3.074 3.252 3.627 3.783 4.107 4.423 4.736 4.895 5.198 5.49 5.922 6.208 6.489 6.915 7.35 7.77 8.171 8.572 9.1 9.619 10.132 10.757 11.35 11.907 12.555 13.301 14.046 14.914 15.905 17.022 18.196 19.503 21.082 22.74 24.748 27.043 29.905 33.386 37.626 43.01 50.109 56.654 61.024 64.15 66.424 68.13 69.473 70.574 71.362 72.033 72.562 73.003 73.381 73.706 73.962 74.162 74.366 74.527 74.65 74.772 74.884 74.961 75.037 75.093 75.122 75.159 75.194 75.215 75.223 75.225 75.234 75.234 75.216 75.181 75.16 75.11 75.052 75.004 74.977 74.819 74.862 74.816 74.77 74.667 74.607 74.542 74.472 74.381 74.271 74.07 73.435 -7 ,30715 ,TETRA ,17525471,Thu Nov 25 01:24:56 CET,Thu Nov 25 03:41:05 CET,0.0 0.681 1.032 1.369 1.661 1.912 2.139 2.362 2.805 3.021 3.233 3.443 3.84 4.021 4.405 4.783 5.149 5.323 5.647 5.959 6.425 6.734 7.033 7.462 7.88 8.286 8.683 9.08 9.578 10.051 10.532 11.132 11.703 12.257 12.93 13.738 14.519 15.366 16.361 17.478 18.671 20.083 21.807 23.559 25.662 28.113 31.03 34.469 38.793 44.315 51.586 58.206 62.566 65.775 68.058 69.759 71.046 72.07 72.861 73.537 74.061 74.487 74.848 75.141 75.373 75.574 75.768 75.897 75.986 76.083 76.181 76.259 76.321 76.361 76.396 76.426 76.434 76.436 76.431 76.426 76.426 76.416 76.4 76.383 76.373 76.342 76.302 76.254 76.22 76.059 76.117 76.069 76.017 75.902 75.837 75.754 75.666 75.568 75.427 75.208 74.792 -8 ,16925 ,TETRA ,17525472,Thu Nov 25 01:24:56 CET,Thu Nov 25 03:42:11 CET,0.0 0.696 1.05 1.326 1.567 1.822 2.078 2.303 2.705 2.886 3.059 3.206 3.592 3.768 4.111 4.434 4.746 4.904 5.225 5.535 5.998 6.301 6.597 7.049 7.487 7.9 8.31 8.704 9.22 9.741 10.255 10.876 11.459 12.046 12.772 13.605 14.414 15.318 16.31 17.391 18.564 19.937 21.607 23.328 25.422 27.859 30.746 34.176 38.381 43.719 50.829 57.476 61.801 64.75 66.876 68.49 69.772 70.875 71.719 72.45 72.999 73.44 73.835 74.164 74.439 74.662 74.859 75.014 75.135 75.244 75.34 75.418 75.5 75.585 75.644 75.669 75.689 75.718 75.739 75.753 75.763 75.758 75.746 75.736 75.724 75.688 75.656 75.616 75.587 75.425 75.467 75.404 75.33 75.183 75.106 75.022 74.924 74.816 74.699 74.575 74.266 -9 ,11410 ,TETRA ,17525473,Thu Nov 25 01:24:56 CET,Thu Nov 25 03:41:46 CET,0.0 0.452 0.788 1.083 1.325 1.53 1.73 1.927 2.339 2.54 2.73 2.902 3.293 3.477 3.824 4.166 4.505 4.664 4.972 5.277 5.729 6.028 6.329 6.759 7.169 7.583 7.979 8.354 8.853 9.34 9.816 10.409 11.001 11.598 12.297 13.087 13.867 14.748 15.736 16.826 17.999 19.369 21.024 22.728 24.761 27.163 30.059 33.44 37.723 43.24 50.512 57.071 61.346 64.397 66.68 68.478 69.858 70.949 71.801 72.554 73.097 73.515 73.9 74.238 74.508 74.735 74.961 75.131 75.265 75.378 75.475 75.558 75.632 75.696 75.722 75.741 75.772 75.787 75.781 75.78 75.784 75.78 75.753 75.709 75.692 75.666 75.634 75.567 75.526 75.358 75.387 75.341 75.301 75.227 75.173 75.086 74.98 74.873 74.746 74.487 74.006 -10 ,16640 ,TETRA ,17525474,Thu Nov 25 01:24:56 CET,Thu Nov 25 03:41:47 CET,0.0 0.393 0.668 0.911 1.136 1.357 1.568 1.768 2.125 2.285 2.443 2.561 2.907 3.057 3.361 3.663 3.964 4.113 4.397 4.677 5.094 5.373 5.656 6.075 6.474 6.868 7.261 7.64 8.141 8.644 9.151 9.771 10.377 10.979 11.687 12.49 13.266 14.169 15.176 16.232 17.354 18.678 20.269 21.947 23.991 26.309 29.118 32.514 36.743 42.08 49.177 55.79 60.125 63.197 65.494 67.265 68.626 69.72 70.533 71.264 71.844 72.31 72.695 73.037 73.342 73.594 73.814 73.992 74.127 74.24 74.353 74.422 74.472 74.516 74.548 74.58 74.613 74.635 74.635 74.628 74.626 74.613 74.584 74.556 74.536 74.479 74.417 74.331 74.284 74.115 74.15 74.071 73.982 73.829 73.737 73.635 73.521 73.387 73.211 72.973 72.492 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index eaab50da..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5562 ,TETRA ,17525475,Thu Nov 25 01:24:56 CET,Thu Nov 25 03:41:40 CET,0.0 0.548 0.862 1.132 1.347 1.527 1.694 1.861 2.178 2.328 2.48 2.543 2.89 3.023 3.273 3.512 3.733 3.84 4.051 4.265 4.567 4.753 4.934 5.21 5.486 5.752 6.01 6.273 6.615 6.937 7.236 7.596 7.95 8.288 8.688 9.149 9.597 10.087 10.616 11.203 11.822 12.528 13.391 14.244 15.249 16.41 17.751 19.275 21.084 23.239 25.929 28.267 29.597 30.444 30.991 31.342 31.591 31.728 31.797 31.842 31.847 31.834 31.813 31.774 31.724 31.672 31.615 31.564 31.513 31.436 31.335 31.26 31.18 31.091 31.027 30.948 30.853 30.76 30.653 30.569 30.476 30.33 30.232 30.123 30.064 29.953 29.835 29.714 29.65 29.388 29.396 29.304 29.22 29.053 28.956 28.835 28.711 28.562 28.38 28.197 27.633 -2 ,26065 ,TETRA ,17525476,Thu Nov 25 01:24:56 CET,Thu Nov 25 03:41:48 CET,0.0 0.458 0.771 0.981 1.17 1.335 1.486 1.64 1.891 2.005 2.126 2.169 2.497 2.617 2.833 3.042 3.241 3.338 3.53 3.716 4.006 4.194 4.371 4.64 4.916 5.175 5.423 5.674 5.994 6.293 6.568 6.924 7.295 7.644 8.024 8.448 8.874 9.354 9.88 10.43 11.027 11.738 12.575 13.409 14.387 15.516 16.875 18.432 20.225 22.358 24.997 27.261 28.622 29.508 30.089 30.452 30.67 30.829 30.923 30.978 31.022 31.023 30.995 30.965 30.911 30.853 30.808 30.765 30.722 30.665 30.606 30.548 30.472 30.403 30.357 30.305 30.23 30.151 30.07 30.006 29.944 29.86 29.792 29.709 29.669 29.574 29.474 29.384 29.332 29.103 29.146 29.084 29.028 28.913 28.842 28.753 28.649 28.531 28.425 28.328 28.021 -3 ,8204 ,TETRA ,17525477,Thu Nov 25 01:26:01 CET,Thu Nov 25 03:44:00 CET,0.0 0.938 1.316 1.575 1.818 2.033 2.205 2.37 2.7 2.847 2.989 3.081 3.439 3.569 3.811 4.043 4.271 4.381 4.595 4.797 5.087 5.283 5.481 5.767 6.048 6.332 6.613 6.884 7.231 7.567 7.889 8.282 8.671 9.049 9.501 10.014 10.509 11.044 11.592 12.182 12.846 13.6 14.446 15.309 16.325 17.466 18.816 20.35 22.174 24.372 27.095 29.48 30.911 31.721 32.256 32.679 32.945 33.078 33.144 33.186 33.191 33.154 33.098 33.059 33.033 32.991 32.923 32.841 32.756 32.67 32.571 32.484 32.378 32.25 32.164 32.092 32.012 31.923 31.817 31.738 31.661 31.531 31.436 31.344 31.295 31.182 31.056 30.922 30.862 30.616 30.674 30.603 30.532 30.367 30.26 30.13 29.963 29.782 29.58 29.373 28.428 -4 ,445 ,TETRA ,17525478,Thu Nov 25 01:26:03 CET,Thu Nov 25 03:47:57 CET,0.0 0.524 0.843 1.112 1.327 1.533 1.728 1.905 2.257 2.425 2.573 2.628 2.96 3.074 3.316 3.558 3.779 3.885 4.1 4.3 4.59 4.781 4.968 5.237 5.506 5.77 6.017 6.259 6.586 6.895 7.177 7.538 7.895 8.229 8.617 9.067 9.505 9.99 10.524 11.081 11.661 12.324 13.1 13.911 14.886 15.967 17.243 18.73 20.497 22.627 25.226 27.389 28.718 29.562 30.087 30.456 30.682 30.787 30.864 30.918 30.923 30.911 30.864 30.798 30.725 30.627 30.528 30.447 30.37 30.292 30.207 30.125 30.032 29.944 29.874 29.794 29.708 29.623 29.525 29.45 29.375 29.26 29.175 29.085 29.042 28.953 28.834 28.691 28.622 28.369 28.426 28.357 28.272 28.086 27.988 27.869 27.751 27.646 27.515 27.333 26.903 -5 ,31164 ,TETRA ,17525479,Thu Nov 25 01:26:02 CET,Thu Nov 25 03:43:43 CET,0.0 0.982 1.297 1.553 1.761 1.975 2.183 2.354 2.678 2.842 2.994 3.038 3.394 3.525 3.779 4.029 4.267 4.38 4.594 4.808 5.138 5.346 5.536 5.825 6.112 6.39 6.665 6.933 7.281 7.609 7.925 8.319 8.698 9.067 9.502 9.976 10.428 10.941 11.504 12.094 12.729 13.45 14.31 15.196 16.205 17.344 18.683 20.22 22.097 24.351 27.096 29.416 30.854 31.76 32.294 32.651 32.868 33.027 33.131 33.171 33.187 33.191 33.179 33.154 33.109 33.044 32.966 32.902 32.841 32.757 32.667 32.596 32.5 32.394 32.304 32.218 32.137 32.028 31.905 31.808 31.701 31.547 31.444 31.331 31.269 31.14 31.008 30.868 30.786 30.506 30.507 30.422 30.335 30.149 30.035 29.902 29.769 29.608 29.407 29.167 28.698 -6 ,21500 ,TETRA ,17525480,Thu Nov 25 01:26:02 CET,Thu Nov 25 03:42:44 CET,0.0 0.641 0.91 1.097 1.294 1.524 1.719 1.878 2.205 2.366 2.519 2.603 2.962 3.094 3.355 3.609 3.855 3.978 4.206 4.412 4.714 4.916 5.113 5.389 5.666 5.941 6.194 6.451 6.793 7.112 7.427 7.807 8.172 8.544 9.0 9.496 9.96 10.464 11.011 11.618 12.267 13.005 13.859 14.696 15.679 16.78 18.023 19.411 21.116 23.276 26.02 28.282 29.551 30.32 30.842 31.213 31.443 31.59 31.679 31.724 31.744 31.759 31.744 31.7 31.645 31.581 31.513 31.443 31.367 31.276 31.172 31.089 30.992 30.88 30.797 30.713 30.628 30.53 30.423 30.347 30.268 30.144 30.048 29.948 29.9 29.805 29.688 29.533 29.438 29.15 29.147 29.039 28.922 28.676 28.555 28.437 28.295 28.144 27.976 27.715 26.889 -7 ,15711 ,TETRA ,17525481,Thu Nov 25 01:26:03 CET,Thu Nov 25 03:44:06 CET,0.0 0.409 0.733 1.006 1.243 1.454 1.645 1.837 2.173 2.308 2.437 2.498 2.855 2.994 3.26 3.497 3.742 3.863 4.09 4.31 4.624 4.816 5.005 5.305 5.602 5.879 6.151 6.412 6.733 7.047 7.361 7.739 8.105 8.466 8.878 9.348 9.805 10.321 10.88 11.454 12.077 12.786 13.581 14.385 15.367 16.527 17.862 19.351 21.166 23.422 26.213 28.464 29.833 30.721 31.282 31.632 31.843 31.966 32.025 32.049 32.041 32.008 31.967 31.92 31.86 31.787 31.685 31.591 31.521 31.451 31.362 31.282 31.19 31.093 31.018 30.93 30.837 30.736 30.612 30.529 30.467 30.357 30.274 30.182 30.125 30.009 29.894 29.775 29.706 29.441 29.449 29.352 29.26 29.113 29.023 28.924 28.808 28.648 28.439 28.167 27.78 -8 ,13136 ,TETRA ,17525482,Thu Nov 25 01:26:03 CET,Thu Nov 25 03:42:14 CET,0.0 0.631 0.949 1.223 1.458 1.668 1.859 2.036 2.354 2.503 2.665 2.743 3.089 3.225 3.475 3.708 3.935 4.049 4.279 4.51 4.83 5.036 5.242 5.526 5.809 6.088 6.365 6.641 7.004 7.351 7.681 8.075 8.453 8.832 9.272 9.786 10.29 10.812 11.384 12.032 12.705 13.435 14.287 15.18 16.244 17.424 18.816 20.45 22.399 24.644 27.268 29.398 30.669 31.458 31.931 32.281 32.5 32.602 32.672 32.723 32.743 32.73 32.692 32.653 32.61 32.561 32.504 32.439 32.362 32.272 32.186 32.115 32.029 31.932 31.856 31.765 31.654 31.543 31.427 31.346 31.26 31.123 31.017 30.9 30.84 30.717 30.596 30.459 30.388 30.132 30.178 30.1 30.025 29.833 29.721 29.615 29.507 29.396 29.263 29.092 28.785 -9 ,24490 ,TETRA ,17525483,Thu Nov 25 01:26:02 CET,Thu Nov 25 03:45:59 CET,0.0 0.666 0.906 1.123 1.344 1.544 1.723 1.882 2.197 2.352 2.5 2.566 2.912 3.036 3.277 3.52 3.748 3.865 4.101 4.312 4.622 4.823 5.028 5.334 5.617 5.899 6.172 6.437 6.771 7.078 7.385 7.777 8.155 8.512 8.927 9.418 9.881 10.377 10.924 11.518 12.141 12.827 13.668 14.526 15.51 16.63 17.934 19.428 21.267 23.47 26.145 28.479 29.884 30.719 31.268 31.658 31.878 32.009 32.098 32.168 32.193 32.163 32.115 32.072 32.038 31.991 31.919 31.854 31.792 31.721 31.634 31.542 31.438 31.325 31.239 31.137 31.017 30.9 30.787 30.706 30.615 30.484 30.389 30.286 30.231 30.114 29.992 29.867 29.802 29.537 29.555 29.462 29.358 29.138 29.022 28.899 28.761 28.603 28.427 28.195 27.567 -10 ,27022 ,TETRA ,17525484,Thu Nov 25 01:26:04 CET,Thu Nov 25 03:45:28 CET,0.0 0.435 0.73 0.976 1.191 1.399 1.599 1.754 2.054 2.214 2.354 2.416 2.77 2.914 3.196 3.451 3.692 3.803 4.015 4.231 4.541 4.752 4.96 5.241 5.506 5.771 6.038 6.303 6.664 7.016 7.344 7.738 8.122 8.498 8.935 9.446 9.942 10.484 11.068 11.692 12.378 13.151 14.017 14.859 15.854 16.988 18.333 19.921 21.807 24.096 26.979 29.4 30.822 31.747 32.361 32.769 33.015 33.155 33.239 33.293 33.308 33.274 33.206 33.158 33.115 33.037 32.949 32.884 32.818 32.749 32.664 32.583 32.511 32.413 32.323 32.24 32.169 32.09 31.988 31.907 31.822 31.696 31.603 31.501 31.45 31.348 31.231 31.095 31.025 30.772 30.817 30.746 30.655 30.44 30.308 30.163 30.033 29.907 29.768 29.575 29.2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt deleted file mode 100644 index 4c50ddeb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3602 ,TETRA ,17525485,Thu Nov 25 01:26:07 CET,Thu Nov 25 03:42:46 CET,0.0 0.51 0.69 0.834 0.951 1.032 1.096 1.16 1.273 1.326 1.38 1.334 1.485 1.501 1.537 1.568 1.59 1.593 1.6 1.608 1.595 1.578 1.564 1.532 1.472 1.413 1.366 1.297 1.176 1.045 0.919 0.765 0.606 0.458 0.272 0.013 -0.259 -0.607 -1.035 -1.518 -2.062 -2.721 -3.573 -4.499 -5.688 -7.176 -9.077 -11.476 -14.726 -19.294 -26.092 -33.315 -38.654 -42.833 -46.224 -49.052 -51.356 -53.323 -54.958 -56.519 -57.808 -58.927 -59.975 -60.932 -61.809 -62.593 -63.376 -64.048 -64.611 -65.179 -65.766 -66.252 -66.741 -67.231 -67.599 -67.99 -68.389 -68.778 -69.182 -69.471 -69.767 -70.193 -70.481 -70.78 -70.928 -71.224 -71.539 -71.874 -72.038 -72.407 -72.605 -72.808 -72.986 -73.341 -73.526 -73.72 -73.923 -74.159 -74.44 -74.735 -75.485 -2 ,29206 ,TETRA ,17525486,Thu Nov 25 01:26:03 CET,Thu Nov 25 03:45:38 CET,0.0 0.731 1.009 1.151 1.274 1.395 1.468 1.534 1.669 1.718 1.75 1.676 1.826 1.851 1.891 1.919 1.936 1.941 1.943 1.943 1.946 1.943 1.924 1.876 1.819 1.746 1.666 1.592 1.499 1.39 1.276 1.138 0.983 0.814 0.598 0.339 0.088 -0.207 -0.563 -0.99 -1.506 -2.131 -2.934 -3.815 -4.917 -6.302 -8.134 -10.48 -13.635 -18.214 -25.184 -32.485 -37.974 -42.343 -45.793 -48.668 -51.059 -53.115 -54.826 -56.476 -57.829 -58.977 -60.022 -60.985 -61.869 -62.639 -63.43 -64.124 -64.703 -65.286 -65.881 -66.376 -66.87 -67.37 -67.757 -68.155 -68.568 -68.999 -69.425 -69.701 -69.975 -70.399 -70.694 -70.991 -71.147 -71.462 -71.778 -72.115 -72.283 -72.651 -72.786 -72.957 -73.123 -73.484 -73.69 -73.912 -74.147 -74.396 -74.66 -74.972 -75.503 -3 ,31800 ,TETRA ,17525487,Thu Nov 25 01:26:05 CET,Thu Nov 25 03:45:03 CET,0.0 0.625 0.86 1.046 1.177 1.282 1.364 1.431 1.545 1.583 1.604 1.53 1.698 1.718 1.747 1.755 1.753 1.757 1.758 1.751 1.732 1.722 1.71 1.671 1.608 1.541 1.475 1.414 1.331 1.223 1.099 0.934 0.767 0.596 0.382 0.121 -0.159 -0.494 -0.91 -1.406 -1.953 -2.599 -3.43 -4.339 -5.492 -6.939 -8.766 -11.118 -14.404 -18.99 -25.84 -33.161 -38.69 -43.067 -46.563 -49.447 -51.807 -53.877 -55.605 -57.265 -58.636 -59.809 -60.9 -61.887 -62.763 -63.538 -64.325 -64.998 -65.559 -66.138 -66.732 -67.219 -67.716 -68.219 -68.598 -68.981 -69.369 -69.766 -70.187 -70.475 -70.756 -71.189 -71.502 -71.815 -71.972 -72.3 -72.632 -72.963 -73.136 -73.516 -73.666 -73.848 -74.044 -74.469 -74.686 -74.898 -75.142 -75.407 -75.68 -76.008 -76.68 -4 ,3470 ,TETRA ,17525488,Thu Nov 25 01:26:04 CET,Thu Nov 25 03:43:31 CET,0.0 1.132 1.397 1.598 1.734 1.857 1.973 2.073 2.229 2.289 2.326 2.262 2.416 2.435 2.479 2.515 2.54 2.558 2.587 2.592 2.588 2.565 2.532 2.48 2.418 2.362 2.304 2.242 2.144 2.029 1.908 1.756 1.59 1.405 1.19 0.93 0.638 0.304 -0.075 -0.524 -1.048 -1.705 -2.54 -3.471 -4.674 -6.152 -8.034 -10.452 -13.777 -18.396 -25.242 -32.486 -37.859 -42.023 -45.366 -48.209 -50.565 -52.57 -54.21 -55.792 -57.111 -58.257 -59.311 -60.264 -61.133 -61.907 -62.694 -63.392 -63.997 -64.616 -65.243 -65.746 -66.253 -66.764 -67.148 -67.538 -67.938 -68.356 -68.781 -69.058 -69.332 -69.76 -70.059 -70.359 -70.515 -70.842 -71.174 -71.524 -71.707 -72.094 -72.248 -72.431 -72.623 -73.043 -73.25 -73.463 -73.687 -73.93 -74.22 -74.559 -75.206 -5 ,20484 ,TETRA ,17525489,Thu Nov 25 01:26:03 CET,Thu Nov 25 03:42:24 CET,0.0 0.547 0.716 0.854 0.963 1.031 1.084 1.138 1.216 1.236 1.245 1.138 1.253 1.262 1.281 1.279 1.267 1.261 1.238 1.206 1.144 1.095 1.051 0.984 0.905 0.818 0.729 0.643 0.518 0.377 0.23 0.048 -0.152 -0.362 -0.622 -0.939 -1.256 -1.639 -2.092 -2.6 -3.18 -3.886 -4.783 -5.773 -7.04 -8.602 -10.608 -13.16 -16.552 -21.24 -28.272 -35.695 -41.177 -45.461 -48.866 -51.71 -54.06 -56.088 -57.774 -59.371 -60.693 -61.834 -62.867 -63.807 -64.658 -65.416 -66.173 -66.828 -67.391 -67.967 -68.55 -69.02 -69.496 -69.972 -70.327 -70.685 -71.049 -71.419 -71.8 -72.062 -72.325 -72.718 -72.987 -73.256 -73.386 -73.662 -73.962 -74.259 -74.414 -74.76 -74.876 -75.038 -75.199 -75.53 -75.705 -75.889 -76.109 -76.352 -76.582 -76.844 -77.25 -6 ,22633 ,TETRA ,17525490,Thu Nov 25 01:26:37 CET,Thu Nov 25 03:42:33 CET,0.0 0.6 0.752 0.838 0.889 0.941 0.982 1.026 1.114 1.137 1.165 1.091 1.234 1.247 1.243 1.242 1.236 1.226 1.207 1.183 1.118 1.074 1.038 0.973 0.903 0.826 0.741 0.647 0.507 0.372 0.23 0.034 -0.158 -0.365 -0.63 -0.944 -1.272 -1.665 -2.127 -2.659 -3.263 -3.971 -4.861 -5.841 -7.092 -8.645 -10.66 -13.216 -16.614 -21.361 -28.392 -35.761 -41.225 -45.469 -48.859 -51.731 -54.108 -56.117 -57.758 -59.341 -60.657 -61.782 -62.798 -63.738 -64.601 -65.366 -66.143 -66.81 -67.367 -67.928 -68.512 -68.994 -69.485 -69.967 -70.32 -70.685 -71.059 -71.445 -71.844 -72.111 -72.376 -72.787 -73.072 -73.361 -73.503 -73.792 -74.083 -74.379 -74.532 -74.878 -75.01 -75.179 -75.345 -75.674 -75.829 -76.002 -76.203 -76.447 -76.737 -77.034 -77.597 -7 ,27450 ,TETRA ,17525491,Thu Nov 25 01:26:37 CET,Thu Nov 25 03:44:31 CET,0.0 0.675 0.934 1.088 1.197 1.282 1.382 1.484 1.629 1.688 1.739 1.71 1.886 1.921 1.973 2.027 2.056 2.058 2.068 2.075 2.077 2.077 2.065 2.038 2.01 1.97 1.92 1.856 1.76 1.648 1.523 1.369 1.204 1.014 0.779 0.487 0.186 -0.159 -0.56 -1.02 -1.559 -2.243 -3.102 -4.028 -5.235 -6.699 -8.597 -11.079 -14.396 -19.01 -25.995 -33.386 -38.782 -42.958 -46.316 -49.113 -51.392 -53.365 -55.007 -56.572 -57.865 -58.975 -60.008 -60.968 -61.845 -62.621 -63.388 -64.041 -64.593 -65.164 -65.756 -66.232 -66.714 -67.219 -67.596 -67.976 -68.369 -68.744 -69.11 -69.372 -69.646 -70.068 -70.358 -70.654 -70.8 -71.095 -71.401 -71.708 -71.864 -72.222 -72.367 -72.555 -72.729 -73.078 -73.286 -73.514 -73.72 -73.928 -74.177 -74.496 -75.575 -8 ,18731 ,TETRA ,17525492,Thu Nov 25 01:26:37 CET,Thu Nov 25 03:43:23 CET,0.0 0.817 1.051 1.234 1.359 1.451 1.552 1.642 1.794 1.853 1.9 1.869 2.047 2.077 2.128 2.162 2.195 2.213 2.235 2.23 2.202 2.192 2.178 2.139 2.074 2.001 1.927 1.853 1.767 1.665 1.536 1.359 1.183 1.002 0.771 0.491 0.193 -0.154 -0.559 -1.025 -1.556 -2.224 -3.097 -4.075 -5.333 -6.893 -8.874 -11.366 -14.703 -19.262 -26.15 -33.572 -39.03 -43.317 -46.761 -49.641 -52.038 -54.095 -55.774 -57.38 -58.738 -59.904 -60.982 -61.964 -62.841 -63.641 -64.452 -65.136 -65.719 -66.336 -66.967 -67.464 -67.962 -68.474 -68.867 -69.259 -69.662 -70.075 -70.497 -70.785 -71.068 -71.506 -71.819 -72.125 -72.279 -72.597 -72.935 -73.282 -73.454 -73.841 -74.01 -74.208 -74.398 -74.791 -75.012 -75.242 -75.482 -75.741 -76.012 -76.373 -77.334 -9 ,21538 ,TETRA ,17525493,Thu Nov 25 01:26:37 CET,Thu Nov 25 03:43:29 CET,0.0 0.615 0.752 0.839 0.93 1.018 1.092 1.154 1.235 1.267 1.305 1.224 1.383 1.415 1.452 1.472 1.47 1.466 1.46 1.465 1.461 1.439 1.421 1.403 1.353 1.272 1.193 1.12 1.025 0.931 0.83 0.688 0.547 0.388 0.174 -0.082 -0.334 -0.619 -0.978 -1.404 -1.879 -2.494 -3.3 -4.177 -5.33 -6.805 -8.74 -11.193 -14.487 -19.121 -26.034 -33.418 -38.934 -43.193 -46.632 -49.521 -51.881 -53.912 -55.593 -57.21 -58.546 -59.704 -60.772 -61.746 -62.632 -63.418 -64.226 -64.935 -65.529 -66.132 -66.743 -67.237 -67.744 -68.263 -68.659 -69.055 -69.46 -69.867 -70.266 -70.542 -70.83 -71.276 -71.591 -71.909 -72.066 -72.379 -72.697 -73.028 -73.195 -73.557 -73.707 -73.905 -74.103 -74.496 -74.696 -74.91 -75.14 -75.394 -75.701 -76.04 -76.698 -10 ,20688 ,TETRA ,17525494,Thu Nov 25 01:26:37 CET,Thu Nov 25 03:43:06 CET,0.0 0.836 1.067 1.231 1.371 1.461 1.529 1.597 1.709 1.753 1.788 1.724 1.866 1.891 1.918 1.929 1.939 1.939 1.931 1.913 1.894 1.899 1.884 1.837 1.772 1.694 1.625 1.557 1.456 1.351 1.239 1.09 0.938 0.769 0.535 0.246 -0.055 -0.421 -0.845 -1.323 -1.859 -2.502 -3.309 -4.243 -5.455 -6.935 -8.849 -11.294 -14.618 -19.195 -25.952 -33.172 -38.604 -42.83 -46.174 -49.004 -51.34 -53.34 -54.989 -56.567 -57.881 -59.023 -60.078 -61.063 -61.967 -62.747 -63.536 -64.217 -64.786 -65.367 -65.957 -66.444 -66.937 -67.44 -67.829 -68.231 -68.65 -69.07 -69.491 -69.785 -70.091 -70.542 -70.841 -71.163 -71.326 -71.654 -72.002 -72.353 -72.529 -72.924 -73.09 -73.279 -73.481 -73.883 -74.102 -74.335 -74.579 -74.875 -75.154 -75.486 -76.237 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index cea4997c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7613 ,TETRA ,17525495,Thu Nov 25 01:26:37 CET,Thu Nov 25 03:47:12 CET,0.0 0.426 0.66 0.85 1.007 1.143 1.277 1.415 1.659 1.758 1.852 1.847 2.142 2.233 2.409 2.572 2.723 2.799 2.942 3.074 3.274 3.409 3.548 3.765 3.969 4.148 4.313 4.47 4.682 4.889 5.069 5.278 5.481 5.68 5.919 6.179 6.425 6.699 7.006 7.325 7.629 7.975 8.385 8.762 9.171 9.618 10.075 10.479 10.84 11.094 11.091 10.656 10.085 9.512 8.947 8.398 7.923 7.466 7.046 6.638 6.265 5.909 5.589 5.299 5.015 4.75 4.479 4.237 4.026 3.797 3.555 3.354 3.139 2.909 2.719 2.505 2.287 2.068 1.848 1.706 1.56 1.329 1.162 0.982 0.882 0.674 0.473 0.276 0.165 -0.155 -0.19 -0.308 -0.438 -0.747 -0.922 -1.097 -1.27 -1.494 -1.766 -2.104 -3.04 -2 ,22779 ,TETRA ,17525496,Thu Nov 25 01:26:39 CET,Thu Nov 25 03:47:23 CET,0.0 0.734 0.984 1.161 1.326 1.469 1.585 1.709 1.941 2.039 2.137 2.145 2.462 2.558 2.723 2.884 3.037 3.106 3.247 3.388 3.579 3.702 3.816 3.983 4.155 4.319 4.465 4.605 4.788 4.968 5.142 5.356 5.561 5.744 5.953 6.204 6.432 6.676 6.945 7.212 7.486 7.788 8.133 8.461 8.801 9.135 9.493 9.859 10.177 10.377 10.314 9.808 9.15 8.513 7.893 7.306 6.777 6.287 5.854 5.411 5.022 4.653 4.295 3.963 3.651 3.36 3.054 2.785 2.548 2.291 2.02 1.8 1.574 1.331 1.145 0.945 0.734 0.523 0.294 0.132 -0.027 -0.265 -0.44 -0.624 -0.719 -0.921 -1.12 -1.325 -1.434 -1.757 -1.802 -1.925 -2.07 -2.411 -2.586 -2.769 -2.983 -3.208 -3.428 -3.668 -4.201 -3 ,26621 ,TETRA ,17525497,Thu Nov 25 01:26:39 CET,Thu Nov 25 03:47:35 CET,0.0 0.316 0.524 0.763 0.967 1.12 1.253 1.382 1.636 1.757 1.877 1.895 2.187 2.269 2.435 2.608 2.78 2.867 3.039 3.189 3.4 3.529 3.662 3.87 4.061 4.232 4.39 4.541 4.731 4.915 5.1 5.326 5.522 5.702 5.932 6.194 6.423 6.664 6.936 7.226 7.513 7.835 8.2 8.538 8.893 9.228 9.6 10.025 10.38 10.59 10.549 10.059 9.49 8.93 8.344 7.782 7.259 6.749 6.299 5.839 5.44 5.08 4.749 4.429 4.107 3.79 3.471 3.195 2.936 2.671 2.412 2.205 1.975 1.73 1.543 1.347 1.149 0.948 0.746 0.605 0.451 0.213 0.056 -0.107 -0.194 -0.386 -0.599 -0.831 -0.938 -1.249 -1.275 -1.391 -1.516 -1.81 -1.963 -2.11 -2.273 -2.471 -2.729 -3.042 -3.744 -4 ,16322 ,TETRA ,17525498,Thu Nov 25 01:26:39 CET,Thu Nov 25 03:49:19 CET,0.0 0.589 0.854 1.071 1.251 1.402 1.526 1.642 1.852 1.953 2.057 2.064 2.367 2.458 2.62 2.774 2.932 3.011 3.152 3.291 3.524 3.667 3.792 3.97 4.141 4.318 4.492 4.665 4.882 5.087 5.3 5.553 5.8 6.032 6.28 6.565 6.858 7.169 7.486 7.806 8.131 8.475 8.857 9.249 9.676 10.092 10.519 10.914 11.298 11.609 11.614 11.226 10.706 10.154 9.62 9.107 8.62 8.163 7.757 7.336 6.972 6.633 6.301 5.991 5.692 5.405 5.098 4.829 4.587 4.316 4.041 3.814 3.582 3.345 3.156 2.959 2.752 2.532 2.312 2.159 1.987 1.723 1.551 1.375 1.281 1.066 0.826 0.579 0.457 0.131 0.082 -0.056 -0.206 -0.505 -0.667 -0.838 -1.01 -1.196 -1.411 -1.779 -2.902 -5 ,16760 ,TETRA ,17525499,Thu Nov 25 01:26:39 CET,Thu Nov 25 03:49:45 CET,0.0 0.545 0.814 0.99 1.147 1.292 1.408 1.522 1.751 1.866 1.98 1.966 2.253 2.345 2.534 2.692 2.846 2.921 3.058 3.184 3.363 3.485 3.603 3.773 3.947 4.115 4.27 4.416 4.606 4.795 4.981 5.205 5.416 5.632 5.88 6.136 6.379 6.65 6.949 7.268 7.579 7.894 8.249 8.602 8.994 9.386 9.765 10.151 10.54 10.81 10.808 10.444 9.943 9.387 8.862 8.333 7.87 7.447 7.031 6.584 6.173 5.823 5.514 5.204 4.918 4.652 4.376 4.146 3.943 3.731 3.496 3.297 3.088 2.864 2.69 2.499 2.309 2.129 1.941 1.807 1.657 1.419 1.263 1.114 1.041 0.88 0.695 0.503 0.403 0.09 0.078 -0.048 -0.188 -0.478 -0.637 -0.806 -0.996 -1.217 -1.451 -1.712 -2.488 -6 ,9937 ,TETRA ,17525500,Thu Nov 25 01:26:39 CET,Thu Nov 25 03:48:19 CET,0.0 0.41 0.704 0.978 1.183 1.345 1.49 1.622 1.893 2.008 2.104 2.081 2.375 2.465 2.645 2.818 2.975 3.052 3.215 3.39 3.629 3.758 3.883 4.06 4.217 4.361 4.503 4.645 4.829 5.014 5.206 5.435 5.634 5.824 6.059 6.334 6.581 6.836 7.112 7.403 7.7 8.034 8.397 8.736 9.116 9.513 9.911 10.287 10.64 10.923 10.938 10.465 9.837 9.23 8.675 8.1 7.549 7.05 6.576 6.065 5.666 5.33 5.003 4.681 4.364 4.071 3.769 3.496 3.246 2.978 2.701 2.488 2.279 2.042 1.84 1.62 1.381 1.135 0.89 0.722 0.546 0.247 0.024 -0.205 -0.312 -0.499 -0.696 -0.894 -0.979 -1.273 -1.284 -1.397 -1.524 -1.795 -1.938 -2.085 -2.243 -2.439 -2.687 -3.041 -4.153 -7 ,31674 ,TETRA ,17525501,Thu Nov 25 01:26:39 CET,Thu Nov 25 03:51:33 CET,0.0 0.437 0.639 0.801 0.963 1.116 1.264 1.402 1.658 1.773 1.877 1.885 2.187 2.278 2.451 2.628 2.791 2.861 3.009 3.157 3.348 3.464 3.582 3.769 3.955 4.126 4.284 4.434 4.625 4.813 4.988 5.194 5.394 5.575 5.787 6.032 6.282 6.539 6.785 7.059 7.36 7.683 8.029 8.361 8.718 9.085 9.499 9.939 10.332 10.617 10.556 10.093 9.556 8.965 8.384 7.806 7.293 6.799 6.361 5.944 5.565 5.204 4.844 4.502 4.163 3.847 3.53 3.247 2.993 2.723 2.445 2.215 1.972 1.718 1.517 1.312 1.112 0.904 0.691 0.541 0.379 0.124 -0.05 -0.234 -0.328 -0.52 -0.726 -0.935 -1.049 -1.363 -1.395 -1.521 -1.654 -1.939 -2.087 -2.251 -2.45 -2.687 -2.924 -3.182 -3.808 -8 ,24675 ,TETRA ,17525502,Thu Nov 25 01:26:39 CET,Thu Nov 25 03:46:48 CET,0.0 0.357 0.547 0.727 0.887 1.032 1.16 1.277 1.499 1.595 1.682 1.644 1.936 2.025 2.198 2.348 2.486 2.554 2.697 2.841 3.04 3.163 3.273 3.438 3.609 3.778 3.946 4.098 4.283 4.461 4.639 4.866 5.07 5.265 5.486 5.73 5.969 6.227 6.489 6.746 7.015 7.324 7.663 7.959 8.313 8.703 9.101 9.497 9.873 10.186 10.197 9.72 9.127 8.518 7.96 7.436 6.94 6.441 6.01 5.609 5.243 4.905 4.585 4.288 4.014 3.758 3.48 3.224 3.006 2.767 2.5 2.274 2.037 1.788 1.594 1.403 1.197 0.968 0.744 0.6 0.452 0.215 0.043 -0.137 -0.225 -0.399 -0.587 -0.787 -0.892 -1.223 -1.28 -1.421 -1.557 -1.816 -1.974 -2.148 -2.347 -2.567 -2.802 -3.052 -3.571 -9 ,13709 ,TETRA ,17525503,Thu Nov 25 01:27:39 CET,Thu Nov 25 03:49:27 CET,0.0 0.333 0.513 0.657 0.786 0.913 1.036 1.142 1.361 1.468 1.565 1.54 1.855 1.949 2.117 2.276 2.429 2.506 2.649 2.777 2.957 3.071 3.19 3.368 3.53 3.684 3.836 3.988 4.187 4.373 4.544 4.751 4.932 5.1 5.313 5.551 5.755 5.984 6.247 6.511 6.79 7.101 7.439 7.771 8.113 8.441 8.792 9.153 9.494 9.717 9.676 9.182 8.598 8.006 7.459 6.929 6.433 5.993 5.59 5.165 4.786 4.429 4.073 3.723 3.408 3.126 2.834 2.58 2.35 2.099 1.843 1.633 1.41 1.19 1.012 0.821 0.627 0.428 0.22 0.064 -0.099 -0.329 -0.488 -0.661 -0.751 -0.923 -1.103 -1.323 -1.449 -1.776 -1.83 -1.964 -2.092 -2.374 -2.537 -2.699 -2.863 -3.05 -3.26 -3.513 -4.036 -10 ,2556 ,TETRA ,17525504,Thu Nov 25 01:27:40 CET,Thu Nov 25 03:44:27 CET,0.0 0.717 0.969 1.163 1.335 1.489 1.624 1.737 1.941 2.045 2.144 2.12 2.412 2.504 2.698 2.881 3.044 3.128 3.283 3.414 3.615 3.742 3.855 4.022 4.194 4.362 4.516 4.66 4.856 5.047 5.237 5.47 5.673 5.846 6.058 6.301 6.524 6.76 6.991 7.218 7.461 7.73 8.044 8.355 8.687 9.021 9.357 9.705 10.033 10.241 10.202 9.748 9.153 8.528 7.929 7.347 6.817 6.333 5.895 5.457 5.073 4.719 4.38 4.06 3.76 3.491 3.195 2.925 2.689 2.435 2.179 1.974 1.749 1.517 1.34 1.16 0.981 0.79 0.583 0.432 0.268 0.015 -0.161 -0.345 -0.441 -0.638 -0.85 -1.077 -1.193 -1.516 -1.562 -1.691 -1.832 -2.104 -2.25 -2.426 -2.64 -2.885 -3.124 -3.371 -3.98 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt deleted file mode 100644 index 692d1017..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16012 ,TETRA ,17525505,Thu Nov 25 01:27:40 CET,Thu Nov 25 03:51:11 CET,0.0 0.346 0.599 0.787 0.958 1.129 1.292 1.428 1.694 1.826 1.943 1.976 2.287 2.392 2.594 2.771 2.942 3.032 3.218 3.396 3.64 3.802 3.956 4.17 4.397 4.633 4.843 5.031 5.289 5.563 5.831 6.15 6.463 6.758 7.099 7.488 7.873 8.306 8.754 9.222 9.71 10.264 10.907 11.555 12.334 13.205 14.192 15.297 16.602 18.131 19.963 21.325 21.985 22.306 22.458 22.545 22.555 22.487 22.395 22.263 22.122 21.983 21.814 21.644 21.51 21.373 21.223 21.092 20.955 20.817 20.672 20.545 20.408 20.251 20.116 19.982 19.858 19.725 19.57 19.463 19.365 19.208 19.083 18.941 18.87 18.732 18.57 18.4 18.322 18.058 18.073 17.976 17.87 17.615 17.476 17.336 17.195 17.011 16.795 16.509 15.612 -2 ,2973 ,TETRA ,17525506,Thu Nov 25 01:27:41 CET,Thu Nov 25 03:51:05 CET,0.0 0.349 0.59 0.812 1.016 1.204 1.382 1.541 1.804 1.928 2.049 2.105 2.435 2.549 2.751 2.937 3.123 3.225 3.431 3.622 3.892 4.066 4.238 4.488 4.726 4.952 5.172 5.382 5.658 5.923 6.175 6.497 6.818 7.128 7.474 7.854 8.224 8.621 9.056 9.533 10.038 10.611 11.27 11.929 12.704 13.568 14.54 15.582 16.765 18.123 19.729 20.966 21.563 21.867 22.038 22.119 22.095 21.988 21.879 21.781 21.691 21.587 21.457 21.324 21.193 21.066 20.913 20.761 20.633 20.495 20.335 20.188 20.032 19.881 19.767 19.646 19.514 19.365 19.206 19.103 18.989 18.798 18.663 18.513 18.437 18.291 18.126 17.947 17.858 17.583 17.559 17.458 17.366 17.187 17.085 16.98 16.856 16.69 16.507 16.293 15.659 -3 ,16353 ,TETRA ,17525507,Thu Nov 25 01:27:40 CET,Thu Nov 25 03:48:30 CET,0.0 0.361 0.613 0.835 1.012 1.179 1.339 1.498 1.796 1.935 2.067 2.089 2.4 2.516 2.761 2.994 3.205 3.313 3.507 3.696 3.989 4.164 4.33 4.581 4.832 5.067 5.293 5.512 5.79 6.055 6.301 6.61 6.92 7.211 7.557 7.973 8.357 8.764 9.209 9.696 10.216 10.776 11.428 12.12 12.931 13.822 14.858 16.036 17.376 18.902 20.707 22.069 22.748 23.105 23.285 23.378 23.369 23.282 23.223 23.147 23.03 22.889 22.735 22.585 22.44 22.299 22.122 21.956 21.821 21.676 21.527 21.408 21.279 21.138 21.029 20.898 20.762 20.635 20.495 20.385 20.269 20.092 19.969 19.844 19.781 19.658 19.529 19.379 19.3 19.034 19.052 18.961 18.859 18.628 18.508 18.379 18.226 18.049 17.828 17.581 16.931 -4 ,24034 ,TETRA ,17525508,Thu Nov 25 01:27:40 CET,Thu Nov 25 03:49:52 CET,0.0 0.58 0.848 1.063 1.275 1.441 1.608 1.764 2.054 2.18 2.308 2.387 2.727 2.861 3.104 3.331 3.544 3.643 3.845 4.04 4.317 4.503 4.684 4.938 5.185 5.434 5.669 5.9 6.206 6.496 6.769 7.101 7.451 7.782 8.148 8.567 8.969 9.407 9.9 10.431 10.978 11.589 12.267 12.956 13.774 14.658 15.682 16.829 18.179 19.763 21.572 22.948 23.666 24.034 24.216 24.273 24.276 24.244 24.166 24.046 23.913 23.776 23.617 23.44 23.283 23.13 22.952 22.777 22.606 22.426 22.255 22.12 21.977 21.823 21.699 21.56 21.418 21.275 21.119 21.022 20.925 20.759 20.632 20.501 20.443 20.329 20.196 20.01 19.912 19.647 19.651 19.551 19.429 19.14 19.001 18.845 18.645 18.432 18.186 17.908 17.245 -5 ,5509 ,TETRA ,17525509,Thu Nov 25 01:28:39 CET,Thu Nov 25 03:53:54 CET,0.0 0.428 0.66 0.858 1.057 1.254 1.441 1.587 1.862 1.997 2.109 2.129 2.441 2.55 2.755 2.946 3.131 3.225 3.413 3.594 3.843 4.001 4.166 4.407 4.641 4.882 5.102 5.299 5.554 5.808 6.068 6.387 6.695 7.001 7.357 7.754 8.135 8.547 8.982 9.453 9.963 10.523 11.175 11.835 12.579 13.407 14.347 15.418 16.739 18.276 20.039 21.369 22.045 22.385 22.546 22.61 22.578 22.533 22.494 22.414 22.309 22.189 22.061 21.926 21.802 21.684 21.552 21.426 21.303 21.164 21.01 20.883 20.759 20.639 20.532 20.41 20.283 20.144 20.002 19.907 19.81 19.657 19.536 19.415 19.349 19.192 19.043 18.914 18.844 18.577 18.567 18.465 18.375 18.151 18.026 17.906 17.777 17.637 17.457 17.222 16.79 -6 ,2094 ,TETRA ,17525510,Thu Nov 25 01:28:39 CET,Thu Nov 25 03:50:29 CET,0.0 0.394 0.642 0.855 1.034 1.193 1.33 1.454 1.727 1.862 1.973 1.982 2.303 2.414 2.617 2.811 2.997 3.089 3.265 3.444 3.717 3.887 4.051 4.286 4.511 4.734 4.952 5.164 5.429 5.692 5.953 6.271 6.581 6.874 7.216 7.615 7.998 8.415 8.867 9.364 9.89 10.459 11.119 11.771 12.534 13.4 14.416 15.587 16.952 18.548 20.404 21.829 22.561 22.906 23.086 23.189 23.212 23.154 23.048 22.901 22.774 22.647 22.498 22.351 22.206 22.072 21.932 21.787 21.658 21.53 21.389 21.263 21.109 20.94 20.815 20.687 20.56 20.441 20.3 20.193 20.086 19.908 19.772 19.633 19.568 19.442 19.287 19.108 19.012 18.719 18.695 18.596 18.478 18.208 18.094 17.953 17.78 17.616 17.405 17.1 16.358 -7 ,8430 ,TETRA ,17525511,Thu Nov 25 01:28:39 CET,Thu Nov 25 03:49:46 CET,0.0 0.474 0.711 0.889 1.068 1.221 1.359 1.491 1.734 1.86 1.993 2.034 2.338 2.438 2.621 2.803 2.992 3.085 3.254 3.419 3.652 3.802 3.961 4.196 4.415 4.616 4.808 5.002 5.243 5.472 5.708 6.025 6.348 6.659 7.017 7.416 7.795 8.205 8.65 9.133 9.634 10.186 10.816 11.447 12.211 13.075 14.064 15.166 16.479 18.012 19.845 21.29 22.025 22.42 22.653 22.791 22.813 22.769 22.709 22.628 22.523 22.397 22.26 22.111 21.961 21.812 21.654 21.511 21.383 21.236 21.067 20.933 20.809 20.683 20.569 20.453 20.331 20.199 20.063 19.96 19.856 19.691 19.573 19.462 19.404 19.266 19.123 18.977 18.894 18.62 18.596 18.482 18.37 18.14 18.021 17.891 17.724 17.537 17.283 16.98 16.398 -8 ,16611 ,TETRA ,17525512,Thu Nov 25 01:28:40 CET,Thu Nov 25 03:51:50 CET,0.0 0.42 0.678 0.915 1.116 1.299 1.481 1.643 1.916 2.039 2.163 2.2 2.525 2.641 2.862 3.077 3.293 3.395 3.589 3.765 4.012 4.178 4.337 4.576 4.818 5.051 5.267 5.484 5.767 6.021 6.26 6.549 6.838 7.129 7.471 7.865 8.258 8.689 9.133 9.614 10.122 10.692 11.372 12.056 12.848 13.73 14.735 15.871 17.163 18.581 20.271 21.633 22.317 22.66 22.859 22.957 22.986 22.967 22.877 22.728 22.606 22.489 22.342 22.196 22.054 21.922 21.795 21.672 21.544 21.407 21.254 21.12 20.986 20.845 20.722 20.583 20.434 20.275 20.117 20.001 19.884 19.71 19.586 19.462 19.395 19.258 19.126 18.969 18.876 18.6 18.597 18.488 18.377 18.139 18.015 17.895 17.764 17.606 17.393 17.136 16.67 -9 ,15537 ,TETRA ,17525513,Thu Nov 25 01:28:40 CET,Thu Nov 25 03:51:01 CET,0.0 0.507 0.774 1.025 1.236 1.425 1.579 1.727 2.025 2.162 2.295 2.349 2.664 2.774 2.99 3.181 3.364 3.462 3.659 3.837 4.09 4.265 4.441 4.697 4.941 5.172 5.398 5.63 5.933 6.202 6.458 6.772 7.074 7.371 7.724 8.12 8.48 8.877 9.334 9.81 10.287 10.842 11.501 12.188 13.005 13.892 14.891 16.026 17.367 18.894 20.662 21.958 22.603 22.963 23.118 23.173 23.156 23.084 22.973 22.809 22.657 22.497 22.338 22.186 22.019 21.859 21.682 21.525 21.389 21.238 21.091 20.972 20.84 20.684 20.556 20.425 20.294 20.162 20.007 19.904 19.81 19.652 19.537 19.411 19.351 19.238 19.122 18.994 18.919 18.66 18.663 18.565 18.439 18.199 18.09 17.966 17.831 17.665 17.462 17.214 16.731 -10 ,26161 ,TETRA ,17525514,Thu Nov 25 01:28:40 CET,Thu Nov 25 03:50:07 CET,0.0 0.623 0.848 1.048 1.247 1.416 1.583 1.746 2.023 2.146 2.272 2.308 2.625 2.746 2.978 3.189 3.392 3.486 3.661 3.828 4.075 4.244 4.413 4.663 4.9 5.133 5.361 5.573 5.85 6.123 6.376 6.687 7.007 7.317 7.674 8.075 8.463 8.888 9.344 9.825 10.328 10.88 11.537 12.239 13.077 13.98 15.016 16.199 17.511 19.024 20.842 22.301 23.099 23.469 23.631 23.732 23.776 23.749 23.692 23.626 23.52 23.398 23.271 23.129 22.983 22.84 22.692 22.55 22.413 22.28 22.147 22.026 21.898 21.773 21.671 21.562 21.444 21.301 21.139 21.025 20.91 20.748 20.639 20.52 20.456 20.311 20.166 20.026 19.945 19.671 19.68 19.58 19.473 19.233 19.103 18.971 18.824 18.667 18.49 18.258 17.643 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt deleted file mode 100644 index 2818469c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20341 ,TETRA ,17525515,Thu Nov 25 01:28:41 CET,Thu Nov 25 03:50:46 CET,0.0 0.988 1.275 1.462 1.652 1.825 1.975 2.121 2.401 2.535 2.658 2.687 3.0 3.11 3.326 3.528 3.706 3.802 3.998 4.18 4.45 4.615 4.776 5.017 5.248 5.461 5.653 5.838 6.076 6.295 6.51 6.786 7.042 7.281 7.566 7.897 8.186 8.49 8.838 9.178 9.534 9.961 10.451 10.93 11.469 12.054 12.699 13.378 14.132 14.96 15.763 16.029 15.953 15.781 15.514 15.204 14.891 14.564 14.274 13.983 13.703 13.412 13.114 12.852 12.614 12.38 12.136 11.92 11.727 11.515 11.303 11.138 10.962 10.768 10.617 10.462 10.29 10.098 9.902 9.767 9.619 9.395 9.251 9.105 9.031 8.858 8.671 8.486 8.392 8.09 8.05 7.916 7.782 7.503 7.357 7.193 6.992 6.763 6.519 6.221 5.206 -2 ,11563 ,TETRA ,17525516,Thu Nov 25 01:28:41 CET,Thu Nov 25 03:51:04 CET,0.0 0.716 0.967 1.185 1.367 1.535 1.69 1.85 2.159 2.292 2.421 2.461 2.791 2.896 3.101 3.295 3.466 3.555 3.749 3.928 4.171 4.331 4.482 4.693 4.902 5.103 5.297 5.481 5.718 5.97 6.199 6.459 6.725 6.974 7.273 7.589 7.876 8.191 8.516 8.86 9.226 9.643 10.113 10.565 11.092 11.659 12.289 12.969 13.734 14.546 15.294 15.615 15.478 15.176 14.836 14.487 14.163 13.828 13.532 13.212 12.919 12.647 12.365 12.111 11.882 11.66 11.404 11.16 10.951 10.744 10.533 10.348 10.149 9.934 9.764 9.592 9.413 9.212 8.988 8.845 8.703 8.471 8.308 8.141 8.055 7.87 7.671 7.469 7.361 7.047 6.98 6.84 6.684 6.353 6.2 6.046 5.878 5.665 5.414 5.146 4.224 -3 ,14855 ,TETRA ,17525517,Thu Nov 25 01:28:41 CET,Thu Nov 25 03:51:07 CET,0.0 1.081 1.361 1.616 1.861 2.056 2.219 2.381 2.68 2.812 2.938 2.964 3.277 3.381 3.573 3.755 3.955 4.049 4.222 4.39 4.645 4.803 4.949 5.166 5.368 5.56 5.747 5.93 6.166 6.395 6.62 6.888 7.137 7.384 7.689 8.031 8.343 8.674 9.033 9.397 9.762 10.166 10.615 11.053 11.604 12.193 12.815 13.475 14.175 14.88 15.551 15.798 15.711 15.495 15.213 14.921 14.612 14.282 13.988 13.686 13.414 13.162 12.918 12.677 12.44 12.215 11.974 11.76 11.564 11.357 11.148 10.959 10.754 10.545 10.391 10.23 10.058 9.875 9.685 9.559 9.421 9.203 9.059 8.907 8.825 8.66 8.48 8.304 8.206 7.891 7.866 7.75 7.63 7.356 7.193 7.007 6.805 6.596 6.386 6.054 5.059 -4 ,11221 ,TETRA ,17525518,Thu Nov 25 01:28:43 CET,Thu Nov 25 03:50:29 CET,0.0 1.117 1.466 1.746 1.998 2.224 2.432 2.638 3.015 3.181 3.328 3.416 3.75 3.867 4.086 4.287 4.484 4.58 4.762 4.95 5.226 5.392 5.552 5.78 5.999 6.213 6.415 6.612 6.857 7.088 7.298 7.551 7.812 8.064 8.337 8.625 8.907 9.218 9.55 9.904 10.296 10.721 11.198 11.662 12.189 12.781 13.407 14.05 14.75 15.511 16.246 16.521 16.472 16.295 16.047 15.742 15.428 15.128 14.854 14.555 14.278 14.031 13.795 13.552 13.31 13.072 12.817 12.597 12.4 12.184 11.954 11.773 11.593 11.401 11.246 11.073 10.893 10.72 10.537 10.406 10.275 10.074 9.929 9.777 9.695 9.52 9.342 9.143 9.026 8.704 8.668 8.544 8.41 8.119 7.962 7.794 7.602 7.372 7.088 6.743 6.096 -5 ,14468 ,TETRA ,17525519,Thu Nov 25 01:28:41 CET,Thu Nov 25 03:49:30 CET,0.0 0.711 0.962 1.228 1.476 1.674 1.839 1.987 2.277 2.416 2.54 2.59 2.901 3.003 3.2 3.399 3.591 3.69 3.876 4.05 4.297 4.444 4.594 4.819 5.032 5.229 5.404 5.574 5.809 6.039 6.253 6.509 6.771 7.034 7.334 7.656 7.967 8.305 8.63 8.951 9.296 9.699 10.169 10.63 11.157 11.724 12.355 13.019 13.708 14.427 15.094 15.404 15.405 15.264 15.048 14.749 14.427 14.115 13.843 13.56 13.3 13.054 12.81 12.576 12.342 12.121 11.888 11.679 11.482 11.269 11.049 10.85 10.649 10.443 10.28 10.127 9.951 9.753 9.561 9.431 9.286 9.049 8.885 8.704 8.609 8.412 8.209 8.006 7.891 7.575 7.532 7.395 7.261 7.007 6.852 6.672 6.482 6.282 6.038 5.702 4.64 -6 ,27169 ,TETRA ,17525520,Thu Nov 25 01:28:42 CET,Thu Nov 25 03:49:59 CET,0.0 1.247 1.611 1.887 2.094 2.267 2.409 2.547 2.842 2.984 3.113 3.153 3.472 3.573 3.772 3.981 4.171 4.26 4.431 4.6 4.849 5.004 5.156 5.375 5.59 5.797 5.998 6.191 6.427 6.661 6.893 7.176 7.439 7.67 7.935 8.235 8.522 8.846 9.201 9.58 9.963 10.384 10.863 11.317 11.849 12.437 13.054 13.721 14.443 15.162 15.868 16.156 16.058 15.84 15.599 15.326 15.011 14.723 14.46 14.121 13.795 13.511 13.256 13.019 12.785 12.559 12.326 12.119 11.927 11.728 11.519 11.336 11.13 10.909 10.747 10.581 10.409 10.23 10.036 9.891 9.738 9.509 9.351 9.199 9.121 8.944 8.751 8.556 8.456 8.149 8.075 7.939 7.806 7.51 7.36 7.207 7.035 6.832 6.572 6.223 4.764 -7 ,4621 ,TETRA ,17525521,Thu Nov 25 01:29:38 CET,Thu Nov 25 03:52:01 CET,0.0 0.921 1.221 1.444 1.629 1.789 1.935 2.095 2.389 2.51 2.626 2.651 2.979 3.093 3.302 3.504 3.681 3.762 3.936 4.109 4.352 4.513 4.673 4.91 5.128 5.321 5.489 5.644 5.87 6.102 6.322 6.585 6.838 7.088 7.381 7.699 7.996 8.306 8.614 8.958 9.329 9.733 10.212 10.696 11.253 11.814 12.382 13.034 13.772 14.557 15.319 15.602 15.549 15.347 15.081 14.774 14.495 14.217 13.934 13.623 13.347 13.11 12.893 12.676 12.453 12.246 12.031 11.838 11.667 11.48 11.274 11.102 10.935 10.759 10.613 10.466 10.315 10.161 9.994 9.866 9.731 9.535 9.4 9.25 9.173 9.016 8.846 8.656 8.551 8.237 8.22 8.112 7.992 7.74 7.615 7.455 7.276 7.104 6.875 6.609 5.706 -8 ,5725 ,TETRA ,17525522,Thu Nov 25 01:48:37 CET,Thu Nov 25 04:10:33 CET,0.0 1.139 1.433 1.647 1.827 2.003 2.187 2.353 2.622 2.734 2.851 2.891 3.197 3.303 3.514 3.714 3.911 4.004 4.186 4.366 4.613 4.77 4.921 5.142 5.365 5.576 5.769 5.954 6.198 6.427 6.635 6.904 7.174 7.413 7.68 7.986 8.292 8.632 9.009 9.4 9.797 10.238 10.741 11.23 11.756 12.322 12.989 13.684 14.459 15.32 16.128 16.501 16.465 16.285 16.062 15.787 15.489 15.195 14.925 14.626 14.357 14.098 13.838 13.591 13.362 13.141 12.894 12.666 12.466 12.258 12.024 11.808 11.592 11.385 11.215 11.037 10.846 10.653 10.451 10.314 10.178 9.952 9.791 9.611 9.512 9.323 9.134 8.938 8.828 8.505 8.443 8.316 8.184 7.878 7.696 7.506 7.298 7.051 6.722 6.253 4.875 -9 ,31735 ,TETRA ,17525523,Thu Nov 25 01:48:37 CET,Thu Nov 25 04:10:31 CET,0.0 0.777 1.132 1.423 1.632 1.814 2.004 2.173 2.464 2.606 2.725 2.748 3.062 3.164 3.369 3.564 3.759 3.856 4.044 4.219 4.478 4.654 4.811 5.024 5.234 5.437 5.632 5.832 6.092 6.334 6.556 6.822 7.09 7.33 7.601 7.918 8.208 8.518 8.857 9.212 9.573 9.98 10.471 10.957 11.497 12.056 12.676 13.35 14.084 14.861 15.595 15.855 15.762 15.53 15.238 14.929 14.619 14.3 14.015 13.728 13.47 13.243 13.028 12.804 12.578 12.373 12.164 11.961 11.769 11.566 11.357 11.191 11.016 10.82 10.666 10.513 10.36 10.196 9.986 9.837 9.696 9.471 9.305 9.127 9.036 8.837 8.633 8.447 8.363 8.081 8.081 7.969 7.84 7.538 7.379 7.206 7.002 6.77 6.533 6.254 5.359 -10 ,783 ,TETRA ,17525524,Thu Nov 25 01:48:37 CET,Thu Nov 25 04:10:47 CET,0.0 0.833 1.091 1.355 1.596 1.809 2.006 2.184 2.464 2.598 2.726 2.735 3.058 3.172 3.391 3.596 3.774 3.86 4.031 4.213 4.476 4.632 4.787 5.03 5.261 5.479 5.697 5.897 6.132 6.358 6.571 6.825 7.066 7.308 7.607 7.938 8.241 8.573 8.919 9.274 9.651 10.051 10.529 11.037 11.615 12.196 12.797 13.461 14.168 14.888 15.558 15.817 15.763 15.574 15.319 15.002 14.631 14.254 13.958 13.663 13.37 13.097 12.815 12.541 12.268 12.013 11.761 11.529 11.301 11.045 10.798 10.607 10.404 10.188 10.023 9.846 9.659 9.47 9.27 9.13 8.984 8.763 8.621 8.46 8.374 8.203 8.01 7.807 7.703 7.407 7.39 7.263 7.123 6.807 6.637 6.45 6.255 6.06 5.79 5.438 4.387 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt deleted file mode 100644 index 44911201..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5205 ,TETRA ,17525526,Thu Nov 25 01:48:38 CET,Thu Nov 25 04:08:51 CET,0.0 0.48 0.724 0.935 1.142 1.335 1.505 1.649 1.909 2.037 2.163 2.167 2.485 2.598 2.82 3.011 3.169 3.251 3.419 3.571 3.787 3.92 4.051 4.236 4.417 4.604 4.782 4.95 5.159 5.36 5.572 5.824 6.056 6.283 6.541 6.826 7.109 7.407 7.735 8.086 8.427 8.807 9.256 9.711 10.226 10.732 11.284 11.891 12.504 13.079 13.532 13.595 13.364 13.024 12.645 12.254 11.845 11.428 11.041 10.616 10.263 9.936 9.611 9.306 9.012 8.737 8.47 8.248 8.05 7.835 7.608 7.441 7.278 7.074 6.895 6.695 6.479 6.267 6.036 5.858 5.679 5.411 5.217 4.995 4.863 4.58 4.3 4.019 3.875 3.519 3.432 3.276 3.107 2.698 2.459 2.201 1.915 1.582 1.136 0.58 -1.249 -2 ,2431 ,TETRA ,17525528,Thu Nov 25 01:48:38 CET,Thu Nov 25 04:07:39 CET,0.0 0.625 0.914 1.133 1.319 1.462 1.587 1.724 2.008 2.139 2.256 2.271 2.59 2.69 2.861 3.021 3.201 3.288 3.444 3.597 3.807 3.94 4.08 4.286 4.477 4.654 4.821 4.982 5.2 5.42 5.631 5.883 6.118 6.344 6.607 6.891 7.149 7.44 7.75 8.072 8.42 8.818 9.281 9.73 10.245 10.794 11.359 11.927 12.512 12.973 13.2 13.087 12.746 12.288 11.819 11.372 10.931 10.529 10.192 9.797 9.428 9.092 8.742 8.416 8.145 7.897 7.626 7.377 7.152 6.906 6.656 6.448 6.219 5.989 5.813 5.631 5.415 5.178 4.94 4.766 4.595 4.357 4.187 4.013 3.928 3.749 3.541 3.294 3.156 2.815 2.762 2.607 2.452 2.11 1.909 1.697 1.487 1.263 0.996 0.594 -1.206 -3 ,21034 ,TETRA ,17525529,Thu Nov 25 01:48:38 CET,Thu Nov 25 04:06:36 CET,0.0 0.51 0.757 1.039 1.294 1.507 1.704 1.869 2.187 2.331 2.457 2.512 2.846 2.954 3.186 3.414 3.619 3.714 3.887 4.064 4.311 4.458 4.596 4.8 4.993 5.178 5.374 5.558 5.786 6.0 6.199 6.432 6.652 6.875 7.147 7.448 7.713 7.998 8.316 8.65 9.003 9.391 9.835 10.246 10.682 11.13 11.636 12.189 12.745 13.262 13.681 13.724 13.474 13.113 12.727 12.295 11.856 11.455 11.107 10.74 10.391 10.062 9.76 9.48 9.192 8.914 8.636 8.388 8.175 7.956 7.702 7.487 7.271 7.033 6.836 6.64 6.446 6.252 6.037 5.863 5.691 5.448 5.263 5.05 4.945 4.744 4.541 4.326 4.213 3.888 3.818 3.669 3.527 3.234 3.077 2.884 2.644 2.375 2.054 1.565 -0.648 -4 ,25259 ,TETRA ,17525530,Thu Nov 25 01:48:38 CET,Thu Nov 25 04:07:22 CET,0.0 0.345 0.554 0.737 0.9 1.037 1.162 1.292 1.519 1.632 1.738 1.707 2.012 2.104 2.277 2.442 2.607 2.688 2.83 2.965 3.176 3.312 3.452 3.662 3.848 4.013 4.177 4.35 4.572 4.779 4.98 5.214 5.436 5.651 5.886 6.145 6.394 6.664 6.973 7.323 7.687 8.082 8.513 8.907 9.314 9.747 10.275 10.838 11.412 11.937 12.229 12.027 11.585 11.13 10.661 10.142 9.674 9.236 8.839 8.445 8.084 7.746 7.416 7.077 6.786 6.537 6.24 5.966 5.721 5.445 5.161 4.909 4.632 4.363 4.155 3.922 3.672 3.437 3.204 3.022 2.817 2.489 2.281 2.072 1.953 1.703 1.447 1.194 1.062 0.706 0.602 0.435 0.248 -0.126 -0.323 -0.558 -0.859 -1.259 -1.699 -2.289 -4.356 -5 ,17239 ,TETRA ,17525531,Thu Nov 25 01:48:38 CET,Thu Nov 25 04:08:33 CET,0.0 0.358 0.596 0.811 0.993 1.146 1.281 1.413 1.68 1.807 1.929 1.93 2.24 2.343 2.53 2.707 2.881 2.973 3.145 3.297 3.512 3.644 3.774 3.958 4.137 4.314 4.473 4.634 4.85 5.051 5.249 5.494 5.725 5.935 6.179 6.473 6.754 7.032 7.332 7.67 8.029 8.43 8.878 9.311 9.791 10.292 10.856 11.448 12.004 12.527 12.959 12.953 12.64 12.218 11.768 11.321 10.905 10.495 10.101 9.677 9.306 8.974 8.642 8.318 8.01 7.725 7.425 7.141 6.883 6.601 6.29 6.043 5.783 5.477 5.246 5.014 4.772 4.512 4.235 4.041 3.854 3.576 3.366 3.135 3.008 2.752 2.491 2.208 2.065 1.715 1.662 1.503 1.317 0.88 0.617 0.326 0.033 -0.272 -0.688 -1.298 -3.082 -6 ,10175 ,TETRA ,17525532,Thu Nov 25 01:48:38 CET,Thu Nov 25 04:10:53 CET,0.0 0.44 0.685 0.892 1.051 1.18 1.301 1.433 1.706 1.829 1.949 1.968 2.28 2.375 2.561 2.746 2.934 3.015 3.158 3.296 3.495 3.625 3.757 3.951 4.132 4.297 4.465 4.641 4.862 5.062 5.248 5.473 5.698 5.91 6.141 6.4 6.644 6.891 7.152 7.447 7.749 8.075 8.492 8.911 9.37 9.88 10.411 10.924 11.434 11.931 12.384 12.372 11.996 11.578 11.165 10.722 10.313 9.907 9.509 9.081 8.714 8.383 8.067 7.767 7.481 7.231 6.968 6.729 6.515 6.283 6.01 5.779 5.538 5.268 5.057 4.844 4.616 4.362 4.092 3.902 3.714 3.423 3.219 3.009 2.904 2.692 2.465 2.217 2.091 1.758 1.656 1.468 1.265 0.867 0.657 0.413 0.117 -0.234 -0.619 -1.17 -3.549 -7 ,13340 ,TETRA ,17525533,Thu Nov 25 01:49:38 CET,Thu Nov 25 04:09:20 CET,0.0 0.653 0.961 1.203 1.403 1.563 1.71 1.867 2.15 2.264 2.387 2.464 2.811 2.902 3.082 3.264 3.446 3.538 3.709 3.874 4.111 4.249 4.386 4.593 4.806 5.0 5.184 5.374 5.607 5.815 6.005 6.239 6.469 6.677 6.926 7.224 7.5 7.811 8.15 8.491 8.848 9.216 9.633 10.078 10.566 11.065 11.604 12.141 12.733 13.32 13.757 13.761 13.43 12.969 12.468 11.982 11.558 11.146 10.749 10.356 9.995 9.632 9.269 8.934 8.626 8.358 8.09 7.837 7.608 7.367 7.113 6.889 6.633 6.363 6.165 5.962 5.763 5.557 5.298 5.1 4.901 4.581 4.351 4.117 4.005 3.786 3.56 3.309 3.176 2.82 2.706 2.539 2.369 2.018 1.81 1.566 1.325 1.034 0.613 0.061 -1.839 -8 ,21375 ,TETRA ,17525534,Thu Nov 25 01:49:39 CET,Thu Nov 25 04:10:28 CET,0.0 0.57 0.831 1.048 1.234 1.403 1.548 1.696 1.968 2.095 2.223 2.248 2.575 2.683 2.874 3.051 3.22 3.299 3.45 3.599 3.83 3.969 4.096 4.283 4.463 4.651 4.84 5.004 5.209 5.417 5.603 5.827 6.067 6.295 6.536 6.795 7.033 7.295 7.586 7.882 8.19 8.539 8.945 9.323 9.723 10.201 10.753 11.281 11.811 12.338 12.804 12.908 12.716 12.393 11.998 11.567 11.093 10.61 10.221 9.848 9.519 9.182 8.831 8.467 8.115 7.835 7.572 7.342 7.134 6.919 6.67 6.422 6.174 5.929 5.716 5.494 5.282 5.043 4.774 4.59 4.402 4.129 3.934 3.719 3.608 3.376 3.113 2.79 2.615 2.219 2.025 1.833 1.634 1.139 0.862 0.612 0.369 0.113 -0.187 -0.585 -1.929 -9 ,28082 ,TETRA ,17525535,Thu Nov 25 01:49:39 CET,Thu Nov 25 04:10:30 CET,0.0 0.559 0.844 1.059 1.247 1.415 1.57 1.705 1.97 2.094 2.199 2.183 2.493 2.59 2.789 2.979 3.142 3.222 3.391 3.552 3.766 3.899 4.038 4.245 4.436 4.615 4.793 4.969 5.193 5.405 5.59 5.813 6.034 6.245 6.495 6.785 7.061 7.364 7.69 8.025 8.374 8.772 9.239 9.671 10.134 10.62 11.149 11.754 12.387 12.91 13.262 13.235 12.938 12.514 12.019 11.502 11.001 10.537 10.152 9.759 9.4 9.073 8.73 8.389 8.067 7.774 7.469 7.177 6.912 6.651 6.378 6.115 5.844 5.596 5.413 5.227 5.03 4.811 4.585 4.441 4.287 4.04 3.871 3.696 3.602 3.377 3.098 2.827 2.678 2.291 2.174 1.992 1.808 1.417 1.197 0.959 0.709 0.432 0.052 -0.561 -2.638 -10 ,24306 ,TETRA ,17525536,Thu Nov 25 01:49:39 CET,Thu Nov 25 04:12:11 CET,0.0 0.259 0.532 0.776 0.962 1.121 1.263 1.399 1.686 1.828 1.968 2.013 2.344 2.453 2.646 2.839 3.035 3.12 3.267 3.398 3.6 3.737 3.873 4.071 4.258 4.442 4.617 4.786 5.007 5.229 5.445 5.679 5.887 6.097 6.329 6.614 6.908 7.209 7.522 7.846 8.168 8.539 8.972 9.392 9.874 10.37 10.929 11.524 12.16 12.8 13.215 13.103 12.685 12.184 11.732 11.264 10.8 10.348 9.937 9.533 9.19 8.869 8.548 8.219 7.893 7.595 7.289 7.016 6.774 6.523 6.24 5.987 5.735 5.467 5.256 5.038 4.821 4.592 4.327 4.147 3.97 3.682 3.476 3.263 3.155 2.932 2.684 2.43 2.294 1.94 1.876 1.74 1.597 1.262 1.064 0.801 0.473 0.098 -0.362 -1.018 -3.275 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index 8ccd2e8d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27706 ,TETRA ,17525537,Thu Nov 25 01:49:39 CET,Thu Nov 25 04:10:15 CET,0.0 0.542 0.801 1.027 1.231 1.427 1.612 1.786 2.106 2.241 2.372 2.408 2.731 2.842 3.061 3.266 3.468 3.56 3.741 3.922 4.181 4.356 4.513 4.718 4.935 5.151 5.352 5.544 5.787 6.037 6.279 6.552 6.825 7.11 7.43 7.771 8.103 8.481 8.898 9.321 9.734 10.19 10.712 11.23 11.825 12.466 13.192 13.982 14.828 15.778 16.722 17.199 17.281 17.232 17.1 16.87 16.6 16.335 16.079 15.792 15.526 15.303 15.099 14.875 14.653 14.448 14.226 14.016 13.826 13.639 13.441 13.267 13.093 12.903 12.748 12.582 12.405 12.218 12.025 11.895 11.746 11.505 11.341 11.169 11.082 10.914 10.744 10.544 10.434 10.126 10.071 9.928 9.785 9.445 9.242 9.035 8.781 8.501 8.172 7.736 6.683 -2 ,10128 ,TETRA ,17525538,Thu Nov 25 01:49:39 CET,Thu Nov 25 04:09:48 CET,0.0 0.889 1.16 1.39 1.587 1.76 1.931 2.085 2.341 2.465 2.592 2.626 2.958 3.065 3.278 3.483 3.683 3.772 3.932 4.1 4.359 4.53 4.697 4.925 5.139 5.335 5.534 5.734 5.988 6.237 6.461 6.734 6.998 7.259 7.581 7.941 8.268 8.632 9.04 9.435 9.823 10.273 10.809 11.337 11.939 12.595 13.339 14.166 15.031 15.889 16.624 16.888 16.821 16.633 16.426 16.181 15.896 15.584 15.256 14.943 14.7 14.448 14.169 13.891 13.618 13.363 13.114 12.892 12.694 12.489 12.256 12.04 11.808 11.58 11.408 11.219 11.015 10.806 10.586 10.442 10.313 10.075 9.891 9.719 9.626 9.402 9.181 8.983 8.867 8.526 8.434 8.291 8.153 7.797 7.606 7.41 7.181 6.917 6.593 6.201 5.174 -3 ,18257 ,TETRA ,17525539,Thu Nov 25 01:50:35 CET,Thu Nov 25 04:10:30 CET,0.0 1.355 1.722 1.976 2.2 2.389 2.554 2.699 3.003 3.156 3.289 3.323 3.649 3.747 3.956 4.164 4.349 4.435 4.613 4.781 5.02 5.177 5.325 5.54 5.746 5.949 6.166 6.382 6.649 6.905 7.153 7.43 7.672 7.902 8.178 8.502 8.816 9.148 9.5 9.862 10.243 10.668 11.141 11.607 12.125 12.664 13.267 13.974 14.819 15.702 16.486 16.812 16.737 16.518 16.271 16.04 15.767 15.46 15.184 14.886 14.624 14.369 14.12 13.904 13.688 13.476 13.264 13.071 12.89 12.698 12.505 12.329 12.134 11.922 11.737 11.549 11.372 11.192 11.003 10.859 10.708 10.496 10.354 10.206 10.124 9.957 9.772 9.552 9.447 9.133 9.08 8.935 8.784 8.489 8.334 8.152 7.961 7.786 7.56 7.246 6.615 -4 ,2262 ,TETRA ,17525540,Thu Nov 25 01:50:35 CET,Thu Nov 25 04:17:18 CET,0.0 0.837 1.121 1.378 1.615 1.815 1.973 2.129 2.439 2.585 2.72 2.737 3.059 3.168 3.386 3.601 3.803 3.902 4.092 4.27 4.527 4.683 4.835 5.064 5.294 5.519 5.724 5.913 6.165 6.407 6.642 6.919 7.171 7.406 7.685 8.014 8.327 8.666 9.029 9.415 9.812 10.251 10.762 11.279 11.867 12.463 13.145 13.933 14.785 15.644 16.44 16.808 16.85 16.72 16.459 16.161 15.849 15.527 15.248 14.968 14.725 14.504 14.281 14.048 13.82 13.582 13.308 13.08 12.889 12.681 12.457 12.277 12.088 11.887 11.733 11.573 11.405 11.227 11.026 10.886 10.742 10.526 10.363 10.182 10.093 9.912 9.714 9.509 9.409 9.099 9.056 8.916 8.767 8.47 8.314 8.121 7.928 7.725 7.492 7.162 6.041 -5 ,10093 ,TETRA ,17525541,Thu Nov 25 01:50:35 CET,Thu Nov 25 04:08:56 CET,0.0 1.369 1.708 1.995 2.245 2.434 2.597 2.738 2.975 3.099 3.223 3.233 3.561 3.669 3.849 4.042 4.251 4.351 4.542 4.731 4.997 5.164 5.328 5.561 5.782 5.997 6.192 6.385 6.639 6.872 7.095 7.376 7.653 7.911 8.22 8.579 8.913 9.295 9.703 10.09 10.487 10.936 11.472 11.985 12.519 13.095 13.779 14.545 15.385 16.262 16.974 17.194 17.109 16.83 16.521 16.256 15.998 15.709 15.405 15.084 14.803 14.538 14.279 14.044 13.812 13.578 13.325 13.1 12.9 12.69 12.461 12.277 12.092 11.886 11.729 11.571 11.415 11.243 11.053 10.929 10.799 10.571 10.418 10.272 10.193 10.035 9.869 9.68 9.568 9.256 9.232 9.097 8.965 8.686 8.494 8.287 8.1 7.875 7.608 7.284 6.597 -6 ,26457 ,TETRA ,17525542,Thu Nov 25 01:50:35 CET,Thu Nov 25 04:12:30 CET,0.0 0.708 1.038 1.301 1.523 1.739 1.944 2.123 2.442 2.589 2.732 2.806 3.157 3.285 3.513 3.736 3.977 4.092 4.297 4.482 4.743 4.92 5.096 5.339 5.556 5.769 5.98 6.184 6.462 6.734 7.002 7.326 7.621 7.922 8.272 8.654 9.017 9.415 9.845 10.277 10.714 11.193 11.727 12.249 12.861 13.515 14.216 14.996 15.828 16.658 17.469 17.799 17.707 17.442 17.129 16.756 16.414 16.115 15.817 15.507 15.214 14.911 14.626 14.364 14.105 13.872 13.627 13.395 13.185 12.966 12.743 12.541 12.324 12.123 11.965 11.784 11.594 11.406 11.212 11.068 10.921 10.68 10.503 10.332 10.242 10.05 9.862 9.659 9.543 9.229 9.202 9.07 8.931 8.649 8.485 8.305 8.112 7.879 7.563 7.167 5.991 -7 ,21904 ,TETRA ,17525543,Thu Nov 25 01:50:37 CET,Thu Nov 25 04:16:48 CET,0.0 0.637 0.854 1.061 1.241 1.41 1.57 1.722 2.019 2.152 2.272 2.319 2.672 2.788 2.995 3.203 3.408 3.504 3.686 3.856 4.108 4.276 4.426 4.642 4.856 5.052 5.239 5.42 5.66 5.906 6.143 6.423 6.703 6.976 7.285 7.634 7.963 8.313 8.685 9.076 9.482 9.937 10.482 11.029 11.621 12.266 12.983 13.782 14.668 15.528 16.351 16.695 16.661 16.496 16.279 15.996 15.681 15.387 15.14 14.887 14.645 14.41 14.163 13.91 13.676 13.464 13.236 13.022 12.814 12.592 12.38 12.206 12.022 11.814 11.65 11.489 11.327 11.157 10.971 10.837 10.692 10.476 10.327 10.165 10.079 9.903 9.718 9.527 9.431 9.117 9.092 8.961 8.807 8.462 8.296 8.131 7.934 7.715 7.487 7.159 6.223 -8 ,18428 ,TETRA ,17525544,Thu Nov 25 01:50:37 CET,Thu Nov 25 04:16:59 CET,0.0 1.289 1.667 1.926 2.139 2.332 2.523 2.7 3.019 3.174 3.318 3.365 3.693 3.799 4.01 4.22 4.429 4.529 4.728 4.915 5.181 5.354 5.504 5.712 5.928 6.15 6.369 6.562 6.806 7.062 7.319 7.627 7.908 8.171 8.473 8.803 9.122 9.48 9.866 10.264 10.675 11.142 11.664 12.197 12.818 13.445 14.12 14.831 15.633 16.586 17.482 17.859 17.901 17.774 17.556 17.303 17.028 16.74 16.462 16.143 15.868 15.617 15.37 15.129 14.884 14.653 14.412 14.203 14.007 13.786 13.553 13.36 13.164 12.968 12.821 12.669 12.505 12.322 12.126 11.988 11.843 11.617 11.459 11.294 11.214 11.044 10.836 10.62 10.518 10.198 10.161 10.023 9.87 9.549 9.376 9.209 9.03 8.765 8.419 7.969 6.021 -9 ,21111 ,TETRA ,17525545,Thu Nov 25 01:50:37 CET,Thu Nov 25 04:10:45 CET,0.0 1.162 1.498 1.745 1.975 2.208 2.389 2.531 2.81 2.947 3.067 3.079 3.411 3.53 3.756 3.961 4.16 4.262 4.467 4.663 4.929 5.089 5.25 5.487 5.697 5.893 6.087 6.287 6.544 6.779 7.006 7.291 7.569 7.829 8.121 8.452 8.774 9.108 9.474 9.875 10.289 10.765 11.34 11.929 12.619 13.334 14.078 14.814 15.648 16.679 17.746 18.323 18.482 18.438 18.242 17.981 17.715 17.433 17.174 16.899 16.633 16.384 16.137 15.899 15.656 15.428 15.19 14.976 14.775 14.552 14.319 14.131 13.947 13.749 13.579 13.396 13.212 13.021 12.822 12.668 12.503 12.266 12.094 11.908 11.814 11.623 11.403 11.146 11.02 10.696 10.661 10.531 10.392 10.096 9.922 9.722 9.545 9.36 9.103 8.783 7.247 -10 ,14999 ,TETRA ,17525546,Thu Nov 25 01:50:36 CET,Thu Nov 25 04:16:37 CET,0.0 0.675 1.029 1.281 1.47 1.65 1.814 1.964 2.239 2.375 2.495 2.484 2.797 2.895 3.07 3.236 3.393 3.478 3.663 3.821 4.035 4.192 4.348 4.569 4.78 4.988 5.19 5.386 5.641 5.886 6.116 6.394 6.664 6.918 7.203 7.522 7.834 8.182 8.54 8.887 9.252 9.669 10.138 10.603 11.159 11.757 12.398 13.069 13.798 14.552 15.273 15.608 15.594 15.433 15.147 14.781 14.406 14.051 13.727 13.402 13.107 12.828 12.556 12.297 12.051 11.817 11.571 11.351 11.159 10.948 10.71 10.508 10.311 10.122 9.972 9.801 9.62 9.423 9.201 9.06 8.925 8.691 8.536 8.391 8.315 8.143 7.94 7.73 7.623 7.312 7.304 7.19 7.062 6.756 6.597 6.437 6.246 6.032 5.81 5.446 4.352 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt deleted file mode 100644 index a00977d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7801 ,TETRA ,17525547,Thu Nov 25 01:51:38 CET,Thu Nov 25 04:16:22 CET,0.0 0.789 1.158 1.416 1.631 1.844 2.039 2.204 2.486 2.609 2.721 2.738 3.088 3.209 3.427 3.642 3.849 3.946 4.137 4.333 4.619 4.788 4.949 5.183 5.402 5.621 5.838 6.038 6.282 6.528 6.776 7.059 7.325 7.592 7.917 8.301 8.667 9.03 9.418 9.823 10.238 10.713 11.267 11.819 12.439 13.135 13.94 14.821 15.792 16.898 18.097 18.755 18.971 18.996 18.888 18.707 18.477 18.224 17.959 17.663 17.404 17.151 16.914 16.703 16.496 16.292 16.076 15.883 15.712 15.531 15.35 15.196 15.02 14.824 14.67 14.506 14.332 14.165 13.993 13.871 13.75 13.553 13.411 13.269 13.2 13.05 12.88 12.701 12.612 12.314 12.285 12.164 12.046 11.806 11.659 11.492 11.311 11.122 10.909 10.623 9.889 -2 ,13722 ,TETRA ,17525548,Thu Nov 25 01:51:38 CET,Thu Nov 25 04:12:58 CET,0.0 1.241 1.64 1.953 2.219 2.436 2.662 2.882 3.28 3.446 3.588 3.653 4.001 4.135 4.372 4.598 4.823 4.931 5.144 5.338 5.605 5.781 5.941 6.16 6.392 6.629 6.862 7.093 7.386 7.669 7.923 8.195 8.458 8.715 9.028 9.405 9.77 10.164 10.569 10.966 11.384 11.862 12.411 12.952 13.57 14.245 14.969 15.736 16.603 17.554 18.623 19.276 19.416 19.377 19.273 19.075 18.809 18.55 18.294 18.016 17.787 17.542 17.31 17.11 16.908 16.716 16.514 16.324 16.157 15.982 15.778 15.606 15.431 15.238 15.09 14.931 14.76 14.587 14.401 14.276 14.144 13.931 13.779 13.619 13.541 13.377 13.206 13.023 12.922 12.619 12.612 12.5 12.39 12.141 12.001 11.848 11.666 11.446 11.183 10.911 10.164 -3 ,1790 ,TETRA ,17525549,Thu Nov 25 01:51:38 CET,Thu Nov 25 04:13:22 CET,0.0 1.031 1.354 1.584 1.754 1.917 2.09 2.264 2.574 2.701 2.827 2.867 3.2 3.314 3.512 3.697 3.897 3.995 4.175 4.347 4.597 4.757 4.915 5.147 5.366 5.577 5.779 5.981 6.238 6.485 6.729 7.014 7.302 7.568 7.856 8.196 8.522 8.87 9.253 9.652 10.065 10.533 11.044 11.569 12.182 12.835 13.571 14.407 15.342 16.294 17.267 17.837 17.948 17.886 17.729 17.522 17.286 17.053 16.84 16.607 16.377 16.149 15.927 15.712 15.494 15.29 15.078 14.88 14.708 14.538 14.357 14.209 14.045 13.85 13.697 13.557 13.423 13.26 13.085 12.964 12.827 12.591 12.434 12.289 12.207 12.028 11.849 11.677 11.587 11.287 11.271 11.145 11.001 10.73 10.595 10.438 10.283 10.126 9.948 9.638 8.684 -4 ,8828 ,TETRA ,17525550,Thu Nov 25 01:51:38 CET,Thu Nov 25 04:15:08 CET,0.0 0.857 1.18 1.485 1.732 1.944 2.125 2.292 2.594 2.73 2.867 2.923 3.262 3.382 3.627 3.867 4.092 4.195 4.38 4.561 4.839 5.014 5.188 5.431 5.66 5.884 6.095 6.3 6.555 6.796 7.038 7.334 7.631 7.921 8.24 8.578 8.89 9.265 9.658 10.036 10.45 10.92 11.463 12.019 12.683 13.417 14.207 15.055 16.039 17.121 18.288 19.041 19.289 19.342 19.245 19.011 18.774 18.543 18.316 18.069 17.837 17.621 17.392 17.174 16.984 16.794 16.585 16.402 16.233 16.059 15.856 15.675 15.494 15.304 15.166 15.023 14.852 14.664 14.47 14.342 14.214 14.0 13.845 13.681 13.601 13.43 13.252 13.071 12.971 12.67 12.653 12.523 12.397 12.167 12.049 11.917 11.771 11.577 11.371 11.152 10.071 -5 ,19439 ,TETRA ,17525551,Thu Nov 25 01:51:38 CET,Thu Nov 25 04:13:46 CET,0.0 0.962 1.337 1.648 1.868 2.085 2.284 2.468 2.827 2.977 3.118 3.174 3.501 3.617 3.847 4.061 4.256 4.352 4.54 4.724 4.985 5.147 5.32 5.562 5.774 5.973 6.172 6.374 6.62 6.854 7.081 7.364 7.646 7.92 8.24 8.592 8.927 9.299 9.691 10.104 10.541 11.037 11.598 12.141 12.757 13.417 14.173 14.981 15.879 16.89 17.971 18.622 18.813 18.794 18.675 18.506 18.317 18.089 17.84 17.596 17.352 17.104 16.879 16.681 16.489 16.294 16.078 15.883 15.708 15.535 15.37 15.229 15.072 14.886 14.748 14.607 14.444 14.274 14.098 13.979 13.851 13.656 13.516 13.358 13.288 13.144 12.986 12.839 12.754 12.465 12.476 12.374 12.268 12.044 11.913 11.761 11.605 11.433 11.199 10.89 10.128 -6 ,10959 ,TETRA ,17525552,Thu Nov 25 01:52:37 CET,Thu Nov 25 04:23:11 CET,0.0 0.592 0.896 1.172 1.415 1.601 1.741 1.892 2.223 2.373 2.515 2.565 2.902 3.02 3.24 3.461 3.669 3.758 3.937 4.11 4.353 4.506 4.655 4.88 5.09 5.297 5.502 5.696 5.959 6.207 6.43 6.724 7.0 7.241 7.533 7.874 8.188 8.528 8.9 9.302 9.728 10.2 10.751 11.303 11.927 12.595 13.32 14.071 14.901 15.876 16.985 17.728 17.928 17.905 17.798 17.65 17.504 17.316 17.097 16.861 16.65 16.449 16.265 16.076 15.889 15.714 15.51 15.306 15.12 14.937 14.757 14.605 14.442 14.268 14.127 13.978 13.821 13.649 13.471 13.357 13.231 13.022 12.87 12.717 12.64 12.489 12.337 12.166 12.074 11.766 11.747 11.637 11.53 11.265 11.089 10.903 10.708 10.481 10.221 9.885 8.779 -7 ,32591 ,TETRA ,17525554,Thu Nov 25 01:52:38 CET,Thu Nov 25 04:15:41 CET,0.0 0.686 1.036 1.344 1.569 1.764 1.948 2.12 2.414 2.541 2.669 2.724 3.061 3.175 3.396 3.612 3.817 3.914 4.103 4.286 4.55 4.724 4.885 5.101 5.315 5.53 5.732 5.919 6.162 6.414 6.664 6.949 7.217 7.486 7.813 8.162 8.472 8.817 9.184 9.581 10.005 10.476 11.02 11.534 12.162 12.892 13.649 14.406 15.255 16.207 17.185 17.79 17.972 17.938 17.816 17.633 17.399 17.152 16.905 16.62 16.382 16.169 15.938 15.72 15.528 15.342 15.124 14.911 14.725 14.522 14.308 14.136 13.963 13.79 13.654 13.508 13.357 13.18 12.986 12.86 12.732 12.523 12.38 12.227 12.149 11.982 11.808 11.622 11.519 11.213 11.196 11.076 10.949 10.653 10.481 10.294 10.111 9.933 9.716 9.446 8.907 -8 ,12062 ,TETRA ,17525555,Thu Nov 25 01:52:38 CET,Thu Nov 25 04:15:32 CET,0.0 0.919 1.228 1.46 1.674 1.859 2.009 2.159 2.447 2.578 2.7 2.721 3.048 3.167 3.379 3.559 3.735 3.826 4.015 4.193 4.444 4.608 4.758 4.974 5.195 5.413 5.614 5.801 6.032 6.257 6.495 6.793 7.072 7.348 7.674 8.005 8.315 8.675 9.063 9.471 9.926 10.44 11.003 11.549 12.205 12.925 13.705 14.574 15.509 16.511 17.595 18.266 18.415 18.366 18.247 18.01 17.747 17.498 17.263 17.023 16.791 16.571 16.352 16.134 15.959 15.8 15.608 15.429 15.26 15.073 14.876 14.709 14.539 14.361 14.22 14.063 13.894 13.717 13.525 13.394 13.256 13.026 12.865 12.689 12.595 12.416 12.24 12.067 11.977 11.682 11.672 11.556 11.44 11.192 11.042 10.881 10.701 10.499 10.288 10.044 9.166 -9 ,30105 ,TETRA ,17525556,Thu Nov 25 01:52:38 CET,Thu Nov 25 04:14:16 CET,0.0 0.96 1.276 1.536 1.764 1.957 2.135 2.293 2.558 2.683 2.811 2.838 3.17 3.287 3.482 3.665 3.852 3.941 4.116 4.29 4.559 4.739 4.902 5.132 5.346 5.544 5.76 5.974 6.24 6.507 6.764 7.041 7.291 7.543 7.832 8.152 8.46 8.814 9.224 9.62 10.003 10.457 10.993 11.54 12.163 12.831 13.582 14.411 15.341 16.335 17.436 18.153 18.344 18.316 18.227 18.048 17.817 17.539 17.292 17.058 16.845 16.648 16.435 16.2 15.977 15.791 15.583 15.382 15.211 15.044 14.866 14.709 14.551 14.37 14.22 14.071 13.917 13.733 13.535 13.402 13.261 13.058 12.915 12.758 12.683 12.536 12.372 12.201 12.117 11.813 11.807 11.679 11.537 11.23 11.065 10.903 10.719 10.523 10.312 9.968 8.891 -10 ,23657 ,TETRA ,17525557,Thu Nov 25 01:52:38 CET,Thu Nov 25 04:13:09 CET,0.0 0.681 1.015 1.254 1.454 1.665 1.879 2.064 2.4 2.543 2.674 2.715 3.055 3.166 3.375 3.59 3.795 3.896 4.095 4.282 4.553 4.722 4.88 5.112 5.331 5.539 5.738 5.93 6.188 6.445 6.691 6.975 7.25 7.523 7.817 8.149 8.478 8.842 9.239 9.644 10.058 10.55 11.123 11.67 12.272 12.933 13.701 14.521 15.374 16.276 17.187 17.662 17.785 17.703 17.513 17.308 17.058 16.781 16.539 16.293 16.076 15.863 15.647 15.445 15.249 15.055 14.849 14.666 14.501 14.329 14.149 13.989 13.802 13.602 13.456 13.306 13.141 12.974 12.796 12.67 12.547 12.35 12.207 12.053 11.973 11.81 11.628 11.435 11.334 11.032 10.988 10.861 10.723 10.427 10.279 10.115 9.932 9.736 9.477 9.07 6.438 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt deleted file mode 100644 index 251a495d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12846 ,KEBNE ,17024419,Wed Dec 22 09:56:10 CET,Wed Dec 22 11:51:41 CET,0.0 0.466 0.631 0.724 0.8 0.875 0.941 0.989 1.06 1.088 1.12 0.983 1.172 1.181 1.209 1.225 1.214 1.202 1.187 1.161 1.101 1.072 1.042 0.983 0.914 0.83 0.74 0.638 0.491 0.336 0.179 -0.029 -0.254 -0.486 -0.77 -1.118 -1.488 -1.935 -2.441 -2.998 -3.651 -4.441 -5.455 -6.588 -8.023 -9.825 -12.177 -15.17 -19.163 -24.728 -33.025 -41.747 -48.244 -53.43 -57.628 -61.13 -64.016 -66.468 -68.491 -70.443 -72.056 -73.446 -74.741 -75.934 -76.999 -77.95 -78.911 -79.734 -80.442 -81.166 -81.896 -82.499 -83.12 -83.745 -84.207 -84.658 -85.127 -85.627 -86.136 -86.484 -86.847 -87.396 -87.753 -88.109 -88.29 -88.666 -89.059 -89.458 -89.664 -90.176 -90.351 -90.592 -90.857 -91.4 -91.679 -91.976 -92.304 -92.649 -93.015 -93.47 -94.407 -2 ,11831 ,KEBNE ,17024420,Wed Dec 22 09:56:10 CET,Wed Dec 22 11:52:19 CET,0.0 0.585 0.783 0.913 1.03 1.136 1.212 1.267 1.359 1.419 1.49 1.384 1.603 1.626 1.65 1.674 1.693 1.695 1.699 1.708 1.692 1.668 1.654 1.609 1.543 1.468 1.4 1.32 1.169 1.037 0.916 0.731 0.527 0.288 -0.024 -0.385 -0.764 -1.197 -1.696 -2.29 -2.965 -3.788 -4.829 -5.97 -7.458 -9.325 -11.697 -14.684 -18.749 -24.348 -32.561 -41.298 -47.789 -52.853 -56.933 -60.35 -63.177 -65.586 -67.559 -69.45 -71.008 -72.353 -73.615 -74.792 -75.851 -76.774 -77.692 -78.488 -79.168 -79.867 -80.574 -81.142 -81.727 -82.331 -82.782 -83.232 -83.688 -84.165 -84.665 -85.004 -85.339 -85.832 -86.162 -86.499 -86.673 -87.023 -87.387 -87.769 -87.963 -88.448 -88.581 -88.806 -89.026 -89.455 -89.696 -89.966 -90.25 -90.577 -90.936 -91.295 -91.863 -3 ,25367 ,KEBNE ,17024421,Wed Dec 22 09:56:10 CET,Wed Dec 22 11:53:11 CET,0.0 0.323 0.524 0.625 0.683 0.751 0.808 0.847 0.939 0.978 1.012 0.866 1.087 1.11 1.148 1.171 1.166 1.165 1.167 1.151 1.097 1.065 1.045 1.004 0.94 0.873 0.802 0.723 0.608 0.482 0.34 0.147 -0.055 -0.263 -0.538 -0.886 -1.238 -1.649 -2.14 -2.709 -3.365 -4.204 -5.267 -6.433 -7.93 -9.735 -12.038 -14.924 -18.798 -24.283 -32.544 -41.224 -47.619 -52.678 -56.707 -60.056 -62.849 -65.294 -67.326 -69.268 -70.853 -72.197 -73.469 -74.653 -75.704 -76.634 -77.581 -78.386 -79.074 -79.783 -80.499 -81.085 -81.678 -82.283 -82.736 -83.182 -83.648 -84.129 -84.613 -84.94 -85.265 -85.766 -86.105 -86.449 -86.626 -86.996 -87.385 -87.771 -87.961 -88.454 -88.611 -88.84 -89.079 -89.595 -89.857 -90.117 -90.367 -90.625 -90.909 -91.26 -92.145 -4 ,30015 ,KEBNE ,17024422,Wed Dec 22 09:56:10 CET,Wed Dec 22 11:52:04 CET,0.0 0.452 0.607 0.707 0.794 0.861 0.903 0.949 1.026 1.05 1.072 0.895 1.098 1.104 1.088 1.067 1.05 1.039 1.007 0.965 0.901 0.866 0.829 0.762 0.691 0.594 0.471 0.359 0.214 0.052 -0.128 -0.358 -0.584 -0.824 -1.124 -1.504 -1.91 -2.374 -2.907 -3.527 -4.21 -5.051 -6.13 -7.284 -8.759 -10.602 -12.979 -15.925 -19.836 -25.489 -34.01 -42.806 -49.286 -54.45 -58.576 -61.958 -64.747 -67.176 -69.194 -71.121 -72.703 -74.058 -75.315 -76.484 -77.548 -78.482 -79.439 -80.297 -81.005 -81.711 -82.444 -83.026 -83.604 -84.211 -84.683 -85.155 -85.631 -86.134 -86.65 -86.996 -87.35 -87.875 -88.224 -88.588 -88.771 -89.141 -89.531 -89.933 -90.133 -90.632 -90.781 -91.009 -91.227 -91.674 -91.933 -92.208 -92.5 -92.803 -93.098 -93.498 -94.258 -5 ,31224 ,KEBNE ,17024423,Wed Dec 22 09:56:10 CET,Wed Dec 22 11:53:17 CET,0.0 0.487 0.653 0.799 0.906 0.992 1.063 1.116 1.166 1.189 1.219 1.079 1.297 1.314 1.333 1.36 1.399 1.401 1.393 1.384 1.341 1.313 1.266 1.172 1.091 1.007 0.909 0.807 0.672 0.537 0.385 0.18 -0.027 -0.256 -0.542 -0.858 -1.183 -1.612 -2.139 -2.737 -3.407 -4.227 -5.273 -6.428 -7.885 -9.656 -11.944 -14.884 -18.871 -24.416 -32.595 -41.333 -47.824 -52.835 -56.838 -60.173 -62.951 -65.329 -67.281 -69.168 -70.738 -72.107 -73.346 -74.458 -75.467 -76.365 -77.289 -78.093 -78.764 -79.445 -80.144 -80.716 -81.296 -81.878 -82.321 -82.774 -83.235 -83.715 -84.215 -84.543 -84.87 -85.406 -85.769 -86.131 -86.317 -86.671 -87.032 -87.413 -87.613 -88.111 -88.257 -88.472 -88.686 -89.113 -89.347 -89.616 -89.94 -90.295 -90.642 -91.002 -91.663 -6 ,10869 ,KEBNE ,17024424,Wed Dec 22 09:57:13 CET,Wed Dec 22 11:53:48 CET,0.0 0.377 0.525 0.643 0.745 0.821 0.88 0.939 1.034 1.07 1.094 0.923 1.137 1.154 1.161 1.166 1.18 1.186 1.184 1.165 1.123 1.084 1.05 1.007 0.96 0.909 0.845 0.756 0.623 0.501 0.368 0.165 -0.049 -0.266 -0.533 -0.864 -1.214 -1.616 -2.085 -2.647 -3.3 -4.113 -5.151 -6.283 -7.713 -9.466 -11.729 -14.624 -18.596 -24.141 -32.302 -40.9 -47.301 -52.33 -56.421 -59.866 -62.69 -65.117 -67.097 -68.988 -70.568 -71.968 -73.272 -74.418 -75.446 -76.372 -77.315 -78.146 -78.864 -79.59 -80.307 -80.886 -81.479 -82.075 -82.523 -82.983 -83.445 -83.912 -84.392 -84.726 -85.071 -85.571 -85.9 -86.259 -86.446 -86.809 -87.194 -87.605 -87.822 -88.33 -88.428 -88.632 -88.857 -89.318 -89.547 -89.769 -90.012 -90.283 -90.593 -90.99 -91.644 -7 ,5675 ,KEBNE ,17024425,Wed Dec 22 09:57:13 CET,Wed Dec 22 11:54:25 CET,0.0 1.041 1.302 1.449 1.554 1.62 1.676 1.731 1.822 1.852 1.873 1.694 1.901 1.915 1.94 1.959 1.962 1.957 1.952 1.927 1.883 1.852 1.815 1.757 1.671 1.585 1.498 1.392 1.245 1.1 0.959 0.757 0.543 0.329 0.065 -0.255 -0.583 -0.977 -1.447 -1.997 -2.635 -3.402 -4.394 -5.518 -6.928 -8.711 -11.027 -13.861 -17.71 -23.116 -31.252 -39.844 -46.158 -51.12 -55.138 -58.538 -61.375 -63.778 -65.709 -67.561 -69.105 -70.441 -71.678 -72.821 -73.856 -74.764 -75.686 -76.503 -77.182 -77.86 -78.548 -79.103 -79.675 -80.262 -80.702 -81.147 -81.602 -82.076 -82.574 -82.897 -83.212 -83.719 -84.08 -84.45 -84.638 -85.015 -85.385 -85.76 -85.962 -86.465 -86.635 -86.864 -87.103 -87.599 -87.834 -88.079 -88.365 -88.684 -88.991 -89.333 -89.973 -8 ,23689 ,KEBNE ,17024426,Wed Dec 22 09:57:13 CET,Wed Dec 22 11:54:06 CET,0.0 0.377 0.593 0.758 0.854 0.907 0.943 0.97 1.035 1.078 1.124 0.999 1.213 1.213 1.201 1.197 1.186 1.182 1.173 1.159 1.124 1.095 1.063 1.0 0.926 0.846 0.755 0.652 0.505 0.351 0.19 -0.02 -0.25 -0.504 -0.787 -1.125 -1.491 -1.917 -2.42 -3.009 -3.662 -4.469 -5.516 -6.647 -8.12 -9.976 -12.373 -15.39 -19.398 -24.926 -33.053 -41.604 -48.017 -53.051 -57.11 -60.5 -63.266 -65.629 -67.591 -69.472 -71.017 -72.356 -73.623 -74.792 -75.846 -76.804 -77.762 -78.577 -79.282 -80.004 -80.747 -81.362 -81.973 -82.577 -83.04 -83.514 -83.988 -84.467 -84.956 -85.284 -85.612 -86.105 -86.45 -86.807 -86.985 -87.342 -87.706 -88.079 -88.273 -88.758 -88.87 -89.087 -89.304 -89.76 -89.994 -90.225 -90.462 -90.719 -90.984 -91.323 -91.908 -9 ,25155 ,KEBNE ,17024427,Wed Dec 22 09:57:13 CET,Wed Dec 22 11:53:24 CET,0.0 0.432 0.572 0.684 0.78 0.891 0.995 1.069 1.171 1.21 1.236 1.098 1.313 1.329 1.355 1.38 1.422 1.428 1.398 1.356 1.279 1.239 1.218 1.182 1.134 1.076 1.007 0.926 0.805 0.662 0.503 0.29 0.064 -0.158 -0.418 -0.762 -1.137 -1.566 -2.063 -2.644 -3.338 -4.193 -5.239 -6.415 -7.894 -9.626 -11.895 -14.836 -18.794 -24.301 -32.589 -41.437 -47.979 -53.047 -57.1 -60.504 -63.351 -65.816 -67.824 -69.756 -71.362 -72.743 -74.022 -75.198 -76.266 -77.248 -78.253 -79.117 -79.849 -80.585 -81.336 -81.948 -82.572 -83.206 -83.688 -84.182 -84.681 -85.192 -85.721 -86.068 -86.416 -86.953 -87.314 -87.669 -87.845 -88.207 -88.585 -88.99 -89.205 -89.718 -89.889 -90.113 -90.333 -90.77 -91.005 -91.256 -91.518 -91.785 -92.074 -92.459 -93.276 -10 ,5154 ,KEBNE ,17024428,Wed Dec 22 09:57:14 CET,Wed Dec 22 11:52:54 CET,0.0 0.338 0.475 0.604 0.734 0.819 0.865 0.916 1.029 1.067 1.088 0.945 1.164 1.177 1.189 1.19 1.201 1.205 1.2 1.183 1.129 1.096 1.069 1.01 0.938 0.872 0.797 0.709 0.597 0.486 0.368 0.176 -0.046 -0.262 -0.522 -0.857 -1.223 -1.669 -2.198 -2.806 -3.512 -4.354 -5.397 -6.52 -7.924 -9.695 -11.99 -14.911 -18.882 -24.419 -32.683 -41.432 -47.848 -52.848 -56.887 -60.23 -62.992 -65.396 -67.354 -69.23 -70.796 -72.178 -73.446 -74.582 -75.627 -76.546 -77.466 -78.263 -78.948 -79.663 -80.38 -80.978 -81.594 -82.197 -82.657 -83.122 -83.593 -84.075 -84.573 -84.91 -85.244 -85.762 -86.115 -86.485 -86.681 -87.079 -87.467 -87.857 -88.068 -88.57 -88.703 -88.936 -89.166 -89.581 -89.807 -90.059 -90.327 -90.623 -90.959 -91.357 -92.042 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt deleted file mode 100644 index e6062bdb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/protein/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15700 ,TETRA ,17525558,Thu Nov 25 01:52:38 CET,Thu Nov 25 04:12:28 CET,0.0 0.638 0.928 1.18 1.382 1.567 1.736 1.91 2.22 2.354 2.486 2.543 2.86 2.98 3.202 3.405 3.598 3.688 3.863 4.037 4.288 4.444 4.59 4.805 5.024 5.248 5.467 5.676 5.945 6.188 6.419 6.695 6.955 7.217 7.527 7.861 8.184 8.541 8.929 9.341 9.758 10.24 10.824 11.372 12.028 12.757 13.544 14.445 15.471 16.674 18.04 18.928 19.259 19.379 19.392 19.284 19.164 19.049 18.925 18.78 18.621 18.441 18.241 18.033 17.858 17.694 17.508 17.339 17.179 17.027 16.875 16.739 16.594 16.44 16.33 16.214 16.085 15.964 15.818 15.719 15.624 15.454 15.327 15.193 15.124 14.973 14.82 14.677 14.601 14.33 14.303 14.192 14.081 13.846 13.732 13.615 13.483 13.336 13.119 12.809 11.812 -2 ,7962 ,TETRA ,17525559,Thu Nov 25 01:52:38 CET,Thu Nov 25 04:14:15 CET,0.0 0.664 0.942 1.196 1.416 1.611 1.799 1.982 2.278 2.401 2.527 2.557 2.872 2.995 3.215 3.414 3.593 3.689 3.886 4.07 4.324 4.479 4.633 4.864 5.076 5.287 5.499 5.702 5.97 6.21 6.428 6.711 6.986 7.247 7.553 7.916 8.276 8.663 9.072 9.504 9.987 10.526 11.114 11.709 12.386 13.111 13.961 14.918 16.001 17.172 18.434 19.314 19.718 19.866 19.817 19.718 19.616 19.484 19.351 19.199 19.004 18.804 18.621 18.435 18.256 18.1 17.931 17.766 17.613 17.445 17.281 17.139 16.991 16.833 16.693 16.555 16.419 16.27 16.116 16.017 15.908 15.72 15.6 15.474 15.401 15.25 15.094 14.93 14.843 14.566 14.557 14.466 14.374 14.153 14.02 13.873 13.703 13.48 13.224 12.934 12.03 -3 ,5823 ,TETRA ,17525560,Thu Nov 25 01:53:37 CET,Thu Nov 25 04:13:06 CET,0.0 0.822 1.177 1.444 1.658 1.858 2.039 2.193 2.466 2.594 2.725 2.796 3.117 3.236 3.455 3.669 3.875 3.976 4.172 4.342 4.593 4.773 4.944 5.186 5.436 5.664 5.876 6.085 6.345 6.591 6.832 7.127 7.407 7.663 7.96 8.316 8.656 9.022 9.419 9.827 10.243 10.706 11.263 11.845 12.527 13.261 14.075 14.982 15.983 17.127 18.426 19.292 19.657 19.795 19.807 19.724 19.568 19.39 19.247 19.073 18.891 18.715 18.537 18.371 18.216 18.047 17.852 17.686 17.532 17.375 17.217 17.081 16.922 16.734 16.594 16.453 16.32 16.187 16.042 15.933 15.808 15.591 15.435 15.282 15.204 15.027 14.835 14.658 14.572 14.294 14.277 14.167 14.053 13.802 13.663 13.532 13.393 13.196 12.994 12.802 12.159 -4 ,3388 ,TETRA ,17525561,Thu Nov 25 01:53:39 CET,Thu Nov 25 04:12:59 CET,0.0 0.685 0.952 1.155 1.318 1.49 1.659 1.8 2.06 2.176 2.289 2.318 2.626 2.741 2.963 3.174 3.356 3.441 3.624 3.798 4.051 4.214 4.369 4.591 4.804 5.015 5.223 5.425 5.673 5.912 6.153 6.448 6.73 7.009 7.333 7.691 8.041 8.431 8.855 9.297 9.717 10.173 10.729 11.297 11.952 12.695 13.522 14.423 15.468 16.62 17.942 18.865 19.274 19.412 19.405 19.343 19.205 19.036 18.856 18.674 18.527 18.366 18.184 18.005 17.842 17.662 17.46 17.295 17.137 16.962 16.809 16.69 16.552 16.384 16.238 16.097 15.975 15.846 15.701 15.592 15.469 15.284 15.172 15.05 14.98 14.829 14.665 14.486 14.384 14.103 14.078 13.959 13.839 13.599 13.467 13.317 13.146 12.95 12.705 12.35 10.097 -5 ,14901 ,TETRA ,17525562,Thu Nov 25 01:53:38 CET,Thu Nov 25 04:13:09 CET,0.0 0.697 0.997 1.222 1.437 1.634 1.812 1.976 2.282 2.419 2.546 2.584 2.878 2.986 3.21 3.419 3.612 3.704 3.885 4.055 4.315 4.472 4.618 4.845 5.059 5.267 5.477 5.681 5.93 6.175 6.419 6.709 6.978 7.249 7.58 7.934 8.266 8.63 9.004 9.422 9.867 10.36 10.952 11.537 12.207 12.935 13.74 14.631 15.637 16.735 17.976 18.811 19.129 19.191 19.155 19.05 18.873 18.679 18.5 18.32 18.144 17.937 17.722 17.529 17.34 17.161 16.973 16.808 16.672 16.518 16.339 16.184 16.04 15.884 15.755 15.637 15.506 15.351 15.185 15.064 14.947 14.767 14.628 14.488 14.413 14.259 14.107 13.928 13.824 13.546 13.536 13.432 13.317 13.054 12.906 12.747 12.553 12.329 12.112 11.802 10.736 -6 ,9645 ,TETRA ,17525563,Thu Nov 25 01:53:38 CET,Thu Nov 25 04:11:42 CET,0.0 0.707 0.968 1.164 1.358 1.536 1.684 1.819 2.075 2.21 2.35 2.41 2.728 2.837 3.046 3.235 3.402 3.49 3.664 3.834 4.066 4.21 4.359 4.573 4.76 4.943 5.133 5.324 5.576 5.832 6.076 6.374 6.661 6.912 7.218 7.577 7.9 8.263 8.659 9.076 9.522 10.033 10.628 11.203 11.864 12.593 13.425 14.362 15.411 16.583 17.898 18.739 19.033 19.103 19.065 18.947 18.777 18.57 18.385 18.183 17.992 17.806 17.615 17.427 17.233 17.05 16.855 16.677 16.512 16.343 16.181 16.045 15.89 15.712 15.575 15.438 15.287 15.118 14.93 14.808 14.689 14.479 14.335 14.193 14.115 13.943 13.76 13.578 13.486 13.211 13.202 13.086 12.94 12.643 12.494 12.34 12.19 11.993 11.742 11.394 10.387 -7 ,14731 ,TETRA ,17525564,Thu Nov 25 01:53:38 CET,Thu Nov 25 04:11:44 CET,0.0 1.412 1.747 1.982 2.159 2.35 2.548 2.718 3.033 3.19 3.313 3.319 3.614 3.708 3.898 4.095 4.302 4.404 4.581 4.747 5.001 5.168 5.33 5.568 5.814 6.041 6.245 6.44 6.684 6.919 7.152 7.439 7.717 7.984 8.293 8.643 9.003 9.405 9.808 10.204 10.637 11.148 11.721 12.277 12.907 13.609 14.385 15.218 16.203 17.351 18.624 19.518 19.897 20.028 20.056 20.003 19.886 19.73 19.541 19.289 19.08 18.907 18.712 18.529 18.345 18.171 18.002 17.829 17.678 17.504 17.297 17.128 16.955 16.79 16.653 16.501 16.352 16.193 16.019 15.904 15.776 15.562 15.425 15.276 15.202 15.055 14.898 14.724 14.627 14.35 14.336 14.235 14.141 13.914 13.779 13.632 13.47 13.296 13.086 12.8 12.11 -8 ,8434 ,TETRA ,17525565,Thu Nov 25 01:53:38 CET,Thu Nov 25 04:12:27 CET,0.0 0.573 0.85 1.079 1.255 1.392 1.52 1.66 1.921 2.033 2.141 2.155 2.443 2.536 2.715 2.884 3.056 3.148 3.326 3.492 3.724 3.875 4.019 4.224 4.431 4.639 4.837 5.026 5.256 5.473 5.682 5.948 6.214 6.464 6.764 7.095 7.406 7.745 8.109 8.509 8.919 9.346 9.848 10.368 10.953 11.607 12.381 13.24 14.175 15.214 16.459 17.351 17.673 17.714 17.652 17.522 17.359 17.18 16.994 16.783 16.595 16.408 16.218 16.05 15.872 15.7 15.526 15.358 15.205 15.036 14.859 14.719 14.561 14.401 14.277 14.151 14.008 13.835 13.666 13.559 13.443 13.257 13.127 12.982 12.908 12.766 12.607 12.435 12.351 12.083 12.073 11.967 11.857 11.601 11.442 11.284 11.146 11.004 10.808 10.477 9.711 -9 ,26793 ,TETRA ,17525566,Thu Nov 25 01:53:38 CET,Thu Nov 25 04:14:32 CET,0.0 1.483 1.849 2.054 2.224 2.382 2.534 2.679 2.947 3.084 3.225 3.284 3.589 3.697 3.923 4.138 4.335 4.426 4.603 4.786 5.059 5.225 5.384 5.618 5.849 6.062 6.26 6.467 6.74 6.997 7.24 7.54 7.823 8.096 8.415 8.76 9.1 9.468 9.858 10.289 10.739 11.252 11.844 12.414 13.073 13.778 14.568 15.443 16.447 17.598 18.885 19.855 20.317 20.479 20.472 20.37 20.238 20.065 19.861 19.66 19.496 19.347 19.19 19.011 18.834 18.664 18.472 18.303 18.155 18.007 17.854 17.713 17.555 17.392 17.276 17.146 17.014 16.889 16.747 16.632 16.514 16.339 16.206 16.071 16.001 15.848 15.706 15.552 15.473 15.21 15.223 15.121 15.013 14.766 14.626 14.494 14.311 14.085 13.828 13.52 12.614 -10 ,3434 ,TETRA ,17525567,Thu Nov 25 01:53:39 CET,Thu Nov 25 04:12:43 CET,0.0 2.135 2.386 2.587 2.758 2.924 3.091 3.245 3.534 3.669 3.801 3.845 4.149 4.262 4.462 4.65 4.84 4.931 5.11 5.29 5.536 5.689 5.853 6.081 6.287 6.498 6.717 6.932 7.182 7.409 7.635 7.914 8.171 8.414 8.702 9.018 9.341 9.707 10.086 10.493 10.928 11.415 11.974 12.518 13.14 13.85 14.658 15.517 16.51 17.64 18.806 19.539 19.878 20.041 20.044 19.965 19.835 19.651 19.459 19.25 19.05 18.876 18.717 18.529 18.335 18.182 18.014 17.85 17.704 17.526 17.327 17.164 17.007 16.858 16.738 16.608 16.472 16.334 16.195 16.092 15.978 15.802 15.679 15.534 15.465 15.332 15.186 15.016 14.92 14.641 14.629 14.537 14.449 14.243 14.115 13.965 13.802 13.632 13.378 13.045 12.105 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index bfd5663e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13b_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2975 ,KEBNE ,17024429,Wed Dec 22 09:57:13 CET,Wed Dec 22 11:30:40 CET,0.0 0.176 0.306 0.404 0.503 0.594 0.673 0.75 0.912 0.991 1.062 1.066 1.25 1.307 1.428 1.543 1.642 1.691 1.79 1.886 2.019 2.105 2.191 2.311 2.43 2.546 2.659 2.771 2.917 3.054 3.182 3.341 3.492 3.63 3.794 3.977 4.153 4.351 4.572 4.812 5.066 5.363 5.707 6.022 6.361 6.714 7.096 7.489 7.859 8.192 8.423 8.337 8.02 7.621 7.23 6.837 6.467 6.096 5.726 5.362 5.069 4.796 4.514 4.244 4.001 3.774 3.525 3.29 3.092 2.894 2.679 2.503 2.326 2.147 2.001 1.845 1.694 1.531 1.355 1.239 1.115 0.914 0.767 0.617 0.539 0.379 0.22 0.039 -0.051 -0.263 -0.333 -0.423 -0.517 -0.723 -0.837 -0.955 -1.094 -1.272 -1.458 -1.661 -2.151 -2 ,9448 ,KEBNE ,17024430,Wed Dec 22 09:57:12 CET,Wed Dec 22 11:30:10 CET,0.0 0.256 0.393 0.514 0.611 0.695 0.788 0.879 1.026 1.094 1.163 1.174 1.36 1.418 1.528 1.632 1.741 1.793 1.887 1.985 2.142 2.241 2.337 2.475 2.598 2.718 2.841 2.962 3.112 3.249 3.38 3.545 3.719 3.886 4.07 4.273 4.466 4.691 4.925 5.152 5.397 5.691 6.022 6.341 6.691 7.058 7.455 7.831 8.219 8.619 8.854 8.627 8.27 7.905 7.523 7.168 6.842 6.493 6.188 5.879 5.584 5.304 5.028 4.759 4.504 4.283 4.047 3.814 3.606 3.404 3.203 3.031 2.846 2.655 2.504 2.348 2.185 2.017 1.845 1.718 1.577 1.354 1.204 1.043 0.964 0.802 0.629 0.453 0.361 0.144 0.084 -0.003 -0.097 -0.297 -0.396 -0.523 -0.665 -0.82 -0.981 -1.162 -1.733 -3 ,32412 ,KEBNE ,17024431,Wed Dec 22 09:57:13 CET,Wed Dec 22 11:32:08 CET,0.0 0.221 0.376 0.487 0.6 0.707 0.795 0.88 1.031 1.101 1.169 1.18 1.382 1.464 1.615 1.763 1.893 1.952 2.076 2.204 2.381 2.487 2.591 2.736 2.876 3.014 3.141 3.265 3.433 3.588 3.731 3.91 4.084 4.241 4.428 4.639 4.835 5.046 5.271 5.513 5.755 6.023 6.362 6.684 7.024 7.376 7.759 8.162 8.584 8.974 9.189 9.029 8.668 8.294 7.897 7.49 7.121 6.741 6.4 6.077 5.791 5.524 5.268 5.031 4.795 4.573 4.354 4.158 3.975 3.782 3.585 3.414 3.243 3.068 2.921 2.759 2.596 2.43 2.256 2.131 2.01 1.829 1.677 1.516 1.436 1.274 1.102 0.906 0.803 0.588 0.534 0.442 0.339 0.123 0.005 -0.124 -0.261 -0.415 -0.598 -0.832 -1.302 -4 ,27846 ,KEBNE ,17024432,Wed Dec 22 09:57:13 CET,Wed Dec 22 11:30:03 CET,0.0 0.232 0.381 0.524 0.639 0.722 0.801 0.876 1.018 1.092 1.168 1.174 1.355 1.411 1.525 1.638 1.748 1.801 1.899 1.99 2.12 2.207 2.297 2.42 2.539 2.657 2.766 2.867 2.992 3.112 3.241 3.409 3.577 3.736 3.922 4.144 4.34 4.541 4.769 5.014 5.265 5.542 5.86 6.183 6.53 6.901 7.296 7.677 8.076 8.428 8.63 8.437 8.042 7.633 7.274 6.908 6.539 6.189 5.849 5.501 5.219 4.955 4.692 4.444 4.207 3.989 3.76 3.567 3.391 3.182 2.971 2.803 2.632 2.446 2.303 2.158 2.013 1.873 1.724 1.614 1.5 1.34 1.229 1.11 1.04 0.884 0.738 0.594 0.51 0.304 0.265 0.163 0.052 -0.176 -0.287 -0.397 -0.533 -0.689 -0.864 -1.097 -1.664 -5 ,4386 ,KEBNE ,17024433,Wed Dec 22 09:57:13 CET,Wed Dec 22 11:31:42 CET,0.0 0.261 0.4 0.501 0.594 0.683 0.766 0.839 0.98 1.052 1.126 1.15 1.337 1.391 1.504 1.638 1.769 1.827 1.952 2.094 2.294 2.409 2.516 2.669 2.808 2.943 3.076 3.192 3.343 3.508 3.676 3.869 4.047 4.215 4.409 4.626 4.819 5.018 5.221 5.439 5.682 5.968 6.296 6.622 6.994 7.386 7.794 8.188 8.624 9.037 9.275 9.185 8.875 8.443 8.032 7.635 7.265 6.932 6.63 6.306 6.007 5.715 5.426 5.142 4.887 4.658 4.409 4.192 4.005 3.813 3.607 3.435 3.266 3.083 2.927 2.756 2.579 2.4 2.226 2.104 1.963 1.745 1.604 1.462 1.396 1.267 1.126 0.971 0.893 0.693 0.641 0.54 0.433 0.206 0.094 -0.022 -0.165 -0.329 -0.519 -0.801 -1.87 -6 ,3788 ,KEBNE ,17024434,Wed Dec 22 09:57:13 CET,Wed Dec 22 11:30:05 CET,0.0 0.228 0.36 0.457 0.554 0.637 0.712 0.801 0.963 1.033 1.1 1.098 1.282 1.337 1.464 1.588 1.696 1.75 1.855 1.949 2.086 2.176 2.269 2.409 2.548 2.684 2.811 2.93 3.075 3.231 3.384 3.557 3.725 3.887 4.083 4.305 4.498 4.698 4.925 5.176 5.431 5.7 6.016 6.319 6.639 7.009 7.423 7.827 8.256 8.682 8.942 8.858 8.578 8.218 7.849 7.488 7.131 6.772 6.431 6.077 5.773 5.498 5.24 4.979 4.72 4.493 4.26 4.06 3.886 3.679 3.455 3.272 3.079 2.878 2.72 2.558 2.396 2.233 2.065 1.949 1.818 1.595 1.449 1.305 1.225 1.063 0.891 0.703 0.606 0.385 0.296 0.182 0.07 -0.169 -0.311 -0.471 -0.662 -0.871 -1.12 -1.463 -2.282 -7 ,12945 ,KEBNE ,17024435,Wed Dec 22 09:57:13 CET,Wed Dec 22 11:31:25 CET,0.0 0.188 0.314 0.425 0.523 0.613 0.697 0.784 0.945 1.017 1.091 1.118 1.319 1.383 1.479 1.586 1.696 1.748 1.851 1.944 2.079 2.164 2.254 2.396 2.539 2.677 2.807 2.932 3.111 3.285 3.448 3.648 3.832 3.999 4.184 4.39 4.587 4.796 5.0 5.228 5.471 5.741 6.06 6.354 6.679 7.03 7.423 7.845 8.312 8.775 9.044 8.959 8.63 8.248 7.866 7.503 7.171 6.816 6.47 6.126 5.826 5.542 5.273 5.015 4.779 4.575 4.355 4.147 3.971 3.796 3.61 3.45 3.281 3.097 2.963 2.836 2.701 2.554 2.399 2.285 2.16 1.975 1.854 1.723 1.652 1.5 1.349 1.194 1.11 0.9 0.837 0.734 0.624 0.384 0.268 0.152 0.018 -0.13 -0.301 -0.509 -1.163 -8 ,8348 ,KEBNE ,17024436,Wed Dec 22 10:01:21 CET,Wed Dec 22 11:34:41 CET,0.0 0.644 0.86 1.05 1.233 1.38 1.5 1.625 1.878 1.994 2.095 2.142 2.342 2.416 2.562 2.714 2.858 2.925 3.056 3.179 3.347 3.456 3.562 3.712 3.861 4.002 4.136 4.258 4.412 4.571 4.723 4.904 5.076 5.243 5.43 5.629 5.835 6.057 6.273 6.514 6.763 7.039 7.377 7.702 8.048 8.398 8.786 9.205 9.623 10.0 10.238 10.184 9.906 9.532 9.168 8.84 8.528 8.21 7.899 7.545 7.23 6.944 6.677 6.433 6.213 5.999 5.751 5.52 5.322 5.13 4.926 4.757 4.595 4.418 4.276 4.141 3.994 3.837 3.68 3.573 3.467 3.288 3.161 3.033 2.969 2.829 2.675 2.514 2.423 2.209 2.149 2.047 1.95 1.75 1.636 1.496 1.353 1.205 1.004 0.752 0.096 -9 ,6012 ,KEBNE ,17024437,Wed Dec 22 10:01:22 CET,Wed Dec 22 11:34:27 CET,0.0 0.186 0.334 0.453 0.559 0.653 0.735 0.808 0.943 1.012 1.087 1.101 1.29 1.354 1.464 1.569 1.678 1.738 1.862 1.977 2.136 2.235 2.339 2.502 2.653 2.792 2.922 3.049 3.22 3.388 3.541 3.729 3.919 4.089 4.276 4.489 4.693 4.913 5.147 5.392 5.644 5.923 6.24 6.545 6.9 7.292 7.693 8.094 8.506 8.882 9.116 8.924 8.552 8.17 7.779 7.358 6.949 6.579 6.266 5.935 5.646 5.396 5.142 4.901 4.677 4.464 4.237 4.036 3.865 3.682 3.501 3.351 3.199 3.042 2.917 2.787 2.635 2.473 2.308 2.193 2.077 1.894 1.759 1.622 1.547 1.386 1.235 1.085 1.007 0.807 0.746 0.639 0.53 0.304 0.188 0.057 -0.086 -0.238 -0.423 -0.661 -1.165 -10 ,32515 ,KEBNE ,17024438,Wed Dec 22 10:01:22 CET,Wed Dec 22 11:34:17 CET,0.0 0.155 0.267 0.395 0.503 0.585 0.675 0.768 0.927 1.004 1.081 1.136 1.357 1.445 1.598 1.734 1.862 1.921 2.044 2.168 2.346 2.464 2.579 2.742 2.885 3.025 3.162 3.286 3.439 3.584 3.736 3.916 4.083 4.248 4.435 4.652 4.85 5.056 5.282 5.527 5.781 6.053 6.364 6.669 7.037 7.448 7.87 8.294 8.726 9.122 9.336 9.211 8.914 8.489 8.043 7.635 7.254 6.895 6.57 6.259 5.985 5.716 5.46 5.207 4.974 4.772 4.554 4.353 4.161 3.956 3.749 3.571 3.375 3.167 3.021 2.876 2.71 2.54 2.364 2.235 2.107 1.919 1.78 1.627 1.554 1.408 1.254 1.114 1.042 0.833 0.782 0.696 0.609 0.396 0.275 0.14 -0.01 -0.181 -0.399 -0.683 -1.293 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 0af2ecd3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32703 ,TETRA ,17525568,Thu Nov 25 01:53:39 CET,Thu Nov 25 03:42:07 CET,0.0 0.245 0.403 0.523 0.616 0.706 0.79 0.867 1.025 1.102 1.176 1.2 1.377 1.43 1.533 1.624 1.715 1.764 1.863 1.963 2.135 2.245 2.343 2.484 2.621 2.752 2.883 3.005 3.153 3.289 3.421 3.581 3.732 3.876 4.047 4.251 4.439 4.637 4.835 5.043 5.266 5.493 5.747 6.003 6.264 6.504 6.79 7.102 7.372 7.518 7.368 6.864 6.203 5.53 4.917 4.335 3.788 3.278 2.833 2.369 1.963 1.6 1.257 0.925 0.595 0.306 0.016 -0.274 -0.544 -0.807 -1.074 -1.307 -1.552 -1.801 -1.985 -2.172 -2.365 -2.564 -2.767 -2.902 -3.036 -3.257 -3.419 -3.59 -3.677 -3.853 -4.049 -4.259 -4.364 -4.593 -4.717 -4.854 -4.997 -5.314 -5.477 -5.635 -5.827 -6.059 -6.329 -6.697 -7.535 -2 ,11821 ,TETRA ,17525569,Thu Nov 25 01:53:38 CET,Thu Nov 25 03:41:54 CET,0.0 0.252 0.384 0.504 0.628 0.736 0.831 0.925 1.122 1.216 1.303 1.359 1.564 1.648 1.797 1.936 2.067 2.123 2.233 2.348 2.506 2.606 2.706 2.84 2.97 3.103 3.237 3.357 3.5 3.642 3.778 3.944 4.097 4.227 4.374 4.55 4.72 4.915 5.133 5.358 5.585 5.817 6.067 6.31 6.583 6.86 7.148 7.425 7.67 7.79 7.617 7.082 6.475 5.829 5.168 4.562 4.005 3.475 3.02 2.539 2.119 1.735 1.352 0.983 0.624 0.314 -0.004 -0.296 -0.555 -0.823 -1.086 -1.315 -1.56 -1.807 -1.996 -2.173 -2.349 -2.552 -2.775 -2.925 -3.084 -3.338 -3.528 -3.714 -3.8 -3.976 -4.163 -4.376 -4.482 -4.706 -4.797 -4.924 -5.068 -5.397 -5.566 -5.739 -5.938 -6.144 -6.394 -6.735 -7.51 -3 ,32172 ,TETRA ,17525570,Thu Nov 25 01:53:39 CET,Thu Nov 25 03:42:30 CET,0.0 0.284 0.445 0.562 0.673 0.779 0.86 0.931 1.074 1.152 1.23 1.242 1.416 1.472 1.594 1.705 1.804 1.853 1.948 2.046 2.184 2.266 2.341 2.451 2.56 2.669 2.778 2.888 3.031 3.17 3.304 3.461 3.612 3.762 3.935 4.126 4.303 4.482 4.69 4.914 5.129 5.362 5.617 5.87 6.145 6.398 6.656 6.94 7.198 7.345 7.194 6.625 5.967 5.305 4.697 4.117 3.588 3.083 2.626 2.147 1.728 1.346 0.974 0.626 0.278 -0.047 -0.369 -0.666 -0.932 -1.204 -1.48 -1.719 -1.98 -2.244 -2.441 -2.629 -2.804 -2.986 -3.19 -3.328 -3.474 -3.727 -3.907 -4.087 -4.186 -4.379 -4.562 -4.771 -4.883 -5.108 -5.213 -5.35 -5.489 -5.802 -5.971 -6.15 -6.363 -6.621 -6.867 -7.128 -8.01 -4 ,15164 ,TETRA ,17525571,Thu Nov 25 01:53:38 CET,Thu Nov 25 03:46:35 CET,0.0 0.143 0.279 0.386 0.487 0.571 0.652 0.733 0.894 0.981 1.058 1.064 1.241 1.301 1.416 1.52 1.619 1.663 1.751 1.84 1.984 2.084 2.177 2.309 2.434 2.543 2.648 2.745 2.871 2.997 3.107 3.246 3.394 3.521 3.655 3.822 3.993 4.165 4.337 4.532 4.734 4.943 5.188 5.432 5.696 5.967 6.279 6.596 6.828 6.934 6.784 6.265 5.629 4.946 4.322 3.736 3.192 2.646 2.178 1.732 1.315 0.919 0.52 0.163 -0.136 -0.436 -0.771 -1.069 -1.315 -1.556 -1.83 -2.052 -2.26 -2.474 -2.639 -2.828 -3.03 -3.237 -3.459 -3.615 -3.78 -4.04 -4.221 -4.417 -4.516 -4.711 -4.921 -5.122 -5.229 -5.472 -5.589 -5.712 -5.851 -6.148 -6.313 -6.5 -6.678 -6.896 -7.199 -7.54 -8.577 -5 ,14957 ,TETRA ,17525572,Thu Nov 25 01:54:37 CET,Thu Nov 25 03:43:17 CET,0.0 0.416 0.679 0.911 1.092 1.255 1.394 1.509 1.71 1.797 1.875 1.916 2.111 2.183 2.322 2.452 2.569 2.624 2.735 2.841 2.991 3.086 3.181 3.325 3.47 3.609 3.74 3.856 4.006 4.166 4.313 4.475 4.625 4.765 4.939 5.138 5.309 5.497 5.704 5.914 6.134 6.38 6.662 6.928 7.196 7.475 7.771 8.061 8.319 8.414 8.219 7.691 7.014 6.32 5.698 5.111 4.561 4.064 3.627 3.182 2.793 2.431 2.085 1.755 1.43 1.131 0.84 0.571 0.308 0.031 -0.251 -0.497 -0.758 -1.033 -1.244 -1.447 -1.671 -1.892 -2.099 -2.263 -2.443 -2.719 -2.898 -3.065 -3.154 -3.335 -3.529 -3.743 -3.853 -4.083 -4.191 -4.316 -4.438 -4.714 -4.876 -5.046 -5.246 -5.45 -5.68 -6.054 -6.976 -6 ,20536 ,TETRA ,17525573,Thu Nov 25 01:54:39 CET,Thu Nov 25 03:43:58 CET,0.0 0.697 0.937 1.115 1.268 1.4 1.515 1.621 1.822 1.911 1.986 2.009 2.202 2.28 2.431 2.576 2.715 2.782 2.905 3.019 3.187 3.296 3.399 3.544 3.682 3.818 3.956 4.087 4.238 4.373 4.509 4.68 4.841 4.994 5.173 5.37 5.558 5.769 5.988 6.197 6.403 6.633 6.903 7.159 7.413 7.646 7.894 8.169 8.405 8.517 8.401 7.943 7.317 6.654 5.971 5.323 4.772 4.269 3.82 3.348 2.94 2.585 2.247 1.922 1.619 1.341 1.034 0.751 0.504 0.243 -0.023 -0.244 -0.476 -0.739 -0.952 -1.159 -1.377 -1.601 -1.828 -1.997 -2.172 -2.432 -2.607 -2.781 -2.872 -3.062 -3.269 -3.484 -3.589 -3.818 -3.923 -4.049 -4.19 -4.492 -4.649 -4.812 -5.004 -5.251 -5.541 -5.902 -6.621 -7 ,5342 ,TETRA ,17525574,Thu Nov 25 01:54:38 CET,Thu Nov 25 03:44:01 CET,0.0 0.195 0.358 0.494 0.591 0.684 0.757 0.829 0.978 1.051 1.122 1.122 1.3 1.36 1.478 1.588 1.686 1.736 1.838 1.942 2.089 2.168 2.241 2.35 2.465 2.578 2.687 2.792 2.925 3.069 3.215 3.381 3.533 3.679 3.839 4.024 4.21 4.41 4.617 4.832 5.043 5.258 5.535 5.804 6.074 6.36 6.675 6.969 7.191 7.314 7.198 6.698 6.084 5.461 4.834 4.23 3.72 3.252 2.809 2.348 1.952 1.596 1.265 0.958 0.655 0.357 0.048 -0.223 -0.466 -0.712 -0.976 -1.205 -1.435 -1.666 -1.846 -2.039 -2.249 -2.47 -2.7 -2.856 -3.015 -3.263 -3.433 -3.646 -3.768 -3.985 -4.192 -4.432 -4.566 -4.82 -4.978 -5.129 -5.296 -5.674 -5.869 -6.044 -6.216 -6.438 -6.705 -7.03 -7.588 -8 ,5654 ,TETRA ,17525575,Thu Nov 25 01:54:38 CET,Thu Nov 25 03:44:09 CET,0.0 0.161 0.276 0.376 0.476 0.573 0.662 0.741 0.883 0.955 1.022 1.022 1.202 1.264 1.388 1.52 1.661 1.728 1.855 1.978 2.144 2.244 2.339 2.478 2.609 2.737 2.87 2.998 3.162 3.307 3.437 3.597 3.748 3.889 4.051 4.238 4.418 4.612 4.811 5.028 5.254 5.492 5.75 5.998 6.284 6.569 6.862 7.13 7.369 7.497 7.297 6.747 6.065 5.373 4.732 4.09 3.572 3.114 2.669 2.197 1.784 1.424 1.075 0.744 0.422 0.109 -0.215 -0.508 -0.773 -1.038 -1.294 -1.5 -1.724 -1.964 -2.148 -2.341 -2.548 -2.783 -3.047 -3.209 -3.385 -3.673 -3.854 -4.061 -4.171 -4.382 -4.602 -4.82 -4.921 -5.152 -5.26 -5.377 -5.494 -5.757 -5.911 -6.093 -6.272 -6.473 -6.766 -7.107 -7.905 -9 ,3523 ,TETRA ,17525576,Thu Nov 25 01:54:38 CET,Thu Nov 25 03:44:00 CET,0.0 0.168 0.282 0.39 0.486 0.573 0.662 0.744 0.913 1.009 1.11 1.176 1.375 1.447 1.579 1.707 1.837 1.903 2.034 2.151 2.308 2.405 2.492 2.626 2.758 2.886 3.011 3.125 3.274 3.422 3.566 3.73 3.886 4.036 4.203 4.395 4.59 4.799 5.021 5.252 5.474 5.722 6.002 6.252 6.501 6.761 7.01 7.241 7.47 7.628 7.516 6.968 6.319 5.638 5.035 4.492 3.977 3.454 2.991 2.525 2.118 1.749 1.404 1.095 0.796 0.509 0.208 -0.06 -0.297 -0.564 -0.845 -1.079 -1.316 -1.558 -1.745 -1.937 -2.144 -2.367 -2.609 -2.763 -2.904 -3.119 -3.275 -3.443 -3.532 -3.734 -3.955 -4.172 -4.276 -4.508 -4.617 -4.751 -4.904 -5.194 -5.332 -5.505 -5.705 -5.924 -6.183 -6.485 -7.435 -10 ,25583 ,TETRA ,17525577,Thu Nov 25 01:54:37 CET,Thu Nov 25 03:41:48 CET,0.0 0.237 0.352 0.446 0.529 0.602 0.673 0.742 0.867 0.937 1.016 1.032 1.209 1.267 1.374 1.468 1.565 1.618 1.714 1.805 1.949 2.036 2.114 2.227 2.345 2.472 2.596 2.71 2.851 2.988 3.117 3.268 3.414 3.572 3.756 3.949 4.128 4.326 4.529 4.72 4.922 5.15 5.397 5.639 5.928 6.211 6.49 6.756 7.008 7.142 6.969 6.428 5.789 5.137 4.522 3.95 3.397 2.883 2.456 2.01 1.617 1.283 0.937 0.59 0.276 -0.011 -0.319 -0.599 -0.845 -1.115 -1.397 -1.627 -1.882 -2.138 -2.334 -2.538 -2.75 -2.966 -3.179 -3.327 -3.48 -3.728 -3.883 -4.027 -4.104 -4.291 -4.497 -4.71 -4.82 -5.041 -5.134 -5.269 -5.426 -5.751 -5.919 -6.108 -6.318 -6.535 -6.797 -7.146 -8.285 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt deleted file mode 100644 index 04f89695..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13c_CAT-13b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13433 ,TETRA ,17525578,Thu Nov 25 01:54:37 CET,Thu Nov 25 03:43:37 CET,0.0 0.244 0.364 0.475 0.587 0.686 0.79 0.889 1.076 1.171 1.265 1.329 1.532 1.617 1.782 1.932 2.079 2.149 2.283 2.403 2.576 2.689 2.791 2.94 3.089 3.233 3.373 3.509 3.678 3.846 4.006 4.193 4.378 4.547 4.745 4.965 5.16 5.366 5.592 5.816 6.026 6.274 6.577 6.859 7.151 7.458 7.759 8.027 8.278 8.393 8.162 7.554 6.911 6.266 5.635 5.024 4.461 3.945 3.479 2.994 2.576 2.196 1.822 1.486 1.176 0.875 0.542 0.251 0.027 -0.205 -0.447 -0.634 -0.827 -1.024 -1.163 -1.306 -1.458 -1.618 -1.79 -1.916 -2.051 -2.247 -2.385 -2.536 -2.614 -2.767 -2.915 -3.063 -3.14 -3.353 -3.415 -3.511 -3.614 -3.835 -3.96 -4.112 -4.268 -4.447 -4.649 -4.859 -5.314 -2 ,29565 ,TETRA ,17525579,Thu Nov 25 01:54:39 CET,Thu Nov 25 03:45:21 CET,0.0 0.246 0.372 0.475 0.58 0.679 0.767 0.852 1.016 1.092 1.181 1.265 1.471 1.555 1.73 1.897 2.051 2.123 2.26 2.396 2.59 2.712 2.827 2.985 3.141 3.291 3.434 3.571 3.733 3.904 4.078 4.258 4.417 4.573 4.763 4.985 5.204 5.445 5.696 5.948 6.194 6.449 6.736 7.035 7.341 7.622 7.887 8.109 8.309 8.418 8.274 7.674 6.968 6.272 5.583 4.968 4.413 3.862 3.4 2.938 2.533 2.17 1.795 1.437 1.11 0.804 0.481 0.194 -0.052 -0.304 -0.567 -0.782 -1.004 -1.245 -1.432 -1.627 -1.844 -2.057 -2.26 -2.403 -2.559 -2.81 -2.98 -3.164 -3.264 -3.461 -3.663 -3.872 -3.974 -4.194 -4.271 -4.379 -4.482 -4.702 -4.829 -4.976 -5.152 -5.344 -5.538 -5.775 -6.284 -3 ,8835 ,TETRA ,17525580,Thu Nov 25 01:54:39 CET,Thu Nov 25 03:39:15 CET,0.0 0.284 0.428 0.534 0.626 0.715 0.799 0.891 1.07 1.157 1.237 1.252 1.44 1.508 1.633 1.76 1.893 1.963 2.102 2.229 2.409 2.53 2.649 2.809 2.961 3.107 3.24 3.368 3.543 3.719 3.877 4.053 4.225 4.391 4.581 4.797 4.995 5.194 5.413 5.638 5.865 6.122 6.403 6.667 6.953 7.247 7.53 7.791 8.02 8.107 7.865 7.199 6.455 5.751 5.109 4.491 3.931 3.418 2.954 2.5 2.123 1.762 1.401 1.058 0.743 0.448 0.141 -0.139 -0.383 -0.631 -0.894 -1.105 -1.33 -1.571 -1.755 -1.955 -2.17 -2.386 -2.608 -2.761 -2.919 -3.144 -3.295 -3.459 -3.535 -3.697 -3.873 -4.05 -4.14 -4.351 -4.42 -4.528 -4.642 -4.889 -5.02 -5.171 -5.344 -5.534 -5.733 -5.946 -6.396 -4 ,21167 ,TETRA ,17525581,Thu Nov 25 01:54:39 CET,Thu Nov 25 03:44:46 CET,0.0 0.264 0.403 0.515 0.621 0.721 0.81 0.89 1.045 1.117 1.177 1.164 1.332 1.383 1.49 1.597 1.697 1.742 1.84 1.934 2.061 2.15 2.242 2.389 2.525 2.655 2.78 2.887 3.035 3.182 3.33 3.516 3.688 3.846 4.017 4.204 4.379 4.564 4.758 4.951 5.162 5.397 5.654 5.911 6.177 6.439 6.746 7.027 7.232 7.36 7.214 6.594 5.852 5.161 4.516 3.881 3.325 2.821 2.379 1.916 1.506 1.132 0.769 0.435 0.139 -0.147 -0.455 -0.721 -0.946 -1.188 -1.467 -1.708 -1.939 -2.139 -2.289 -2.451 -2.623 -2.804 -2.978 -3.099 -3.223 -3.422 -3.567 -3.708 -3.774 -3.927 -4.122 -4.327 -4.417 -4.631 -4.702 -4.813 -4.935 -5.194 -5.329 -5.466 -5.626 -5.804 -6.009 -6.281 -7.202 -5 ,22939 ,TETRA ,17525582,Thu Nov 25 01:54:41 CET,Thu Nov 25 03:44:23 CET,0.0 0.618 0.82 0.982 1.1 1.191 1.285 1.384 1.565 1.651 1.733 1.756 1.943 2.009 2.136 2.25 2.363 2.42 2.528 2.638 2.796 2.887 2.969 3.088 3.204 3.324 3.448 3.57 3.727 3.895 4.066 4.261 4.445 4.615 4.806 5.021 5.229 5.446 5.657 5.888 6.121 6.366 6.647 6.917 7.214 7.522 7.821 8.087 8.303 8.373 8.165 7.565 6.867 6.193 5.558 4.975 4.458 3.964 3.498 3.023 2.63 2.276 1.931 1.6 1.282 0.985 0.668 0.383 0.138 -0.113 -0.373 -0.591 -0.819 -1.069 -1.256 -1.45 -1.65 -1.852 -2.074 -2.231 -2.382 -2.59 -2.729 -2.886 -2.973 -3.146 -3.313 -3.502 -3.602 -3.827 -3.913 -4.017 -4.13 -4.368 -4.513 -4.678 -4.853 -5.023 -5.209 -5.489 -6.191 -6 ,30166 ,TETRA ,17525583,Thu Nov 25 01:54:39 CET,Thu Nov 25 03:43:35 CET,0.0 0.449 0.597 0.7 0.797 0.897 0.997 1.088 1.247 1.322 1.393 1.406 1.59 1.657 1.801 1.924 2.03 2.082 2.182 2.279 2.41 2.497 2.588 2.714 2.829 2.945 3.058 3.17 3.321 3.459 3.595 3.754 3.895 4.033 4.199 4.391 4.573 4.765 4.975 5.201 5.424 5.669 5.945 6.19 6.439 6.702 7.01 7.289 7.498 7.586 7.381 6.784 6.103 5.431 4.787 4.18 3.635 3.138 2.668 2.179 1.766 1.384 1.024 0.689 0.369 0.072 -0.23 -0.501 -0.746 -1.003 -1.268 -1.492 -1.722 -1.968 -2.162 -2.357 -2.555 -2.766 -2.989 -3.141 -3.291 -3.518 -3.677 -3.826 -3.897 -4.056 -4.228 -4.414 -4.525 -4.759 -4.861 -4.973 -5.08 -5.312 -5.431 -5.568 -5.717 -5.871 -6.036 -6.264 -6.784 -7 ,12225 ,TETRA ,17525584,Thu Nov 25 01:54:39 CET,Thu Nov 25 03:43:39 CET,0.0 0.209 0.354 0.502 0.635 0.751 0.847 0.928 1.088 1.165 1.241 1.268 1.452 1.519 1.647 1.766 1.879 1.931 2.032 2.14 2.305 2.398 2.482 2.609 2.739 2.864 2.973 3.084 3.23 3.373 3.521 3.712 3.895 4.062 4.253 4.477 4.68 4.877 5.084 5.305 5.539 5.786 6.053 6.328 6.609 6.869 7.175 7.5 7.796 7.911 7.664 7.094 6.44 5.742 5.068 4.452 3.872 3.317 2.842 2.378 1.99 1.614 1.229 0.882 0.558 0.27 -0.002 -0.249 -0.477 -0.706 -0.955 -1.157 -1.339 -1.528 -1.671 -1.822 -1.984 -2.153 -2.328 -2.454 -2.579 -2.771 -2.906 -3.038 -3.108 -3.246 -3.395 -3.572 -3.664 -3.887 -3.983 -4.095 -4.211 -4.463 -4.587 -4.703 -4.846 -5.021 -5.218 -5.454 -6.068 -8 ,20602 ,TETRA ,17525585,Thu Nov 25 01:54:39 CET,Thu Nov 25 03:44:06 CET,0.0 0.227 0.354 0.478 0.582 0.677 0.758 0.843 1.011 1.085 1.151 1.18 1.374 1.441 1.559 1.676 1.792 1.846 1.953 2.056 2.206 2.303 2.395 2.527 2.655 2.785 2.912 3.042 3.217 3.378 3.531 3.708 3.879 4.043 4.228 4.43 4.618 4.829 5.054 5.29 5.524 5.762 6.041 6.323 6.622 6.91 7.211 7.5 7.698 7.761 7.556 6.888 6.101 5.33 4.642 4.019 3.464 2.946 2.472 1.983 1.552 1.176 0.834 0.487 0.151 -0.147 -0.464 -0.762 -1.008 -1.248 -1.503 -1.7 -1.895 -2.106 -2.27 -2.45 -2.637 -2.821 -3.004 -3.129 -3.256 -3.453 -3.594 -3.729 -3.796 -3.948 -4.102 -4.276 -4.373 -4.598 -4.688 -4.789 -4.901 -5.152 -5.284 -5.412 -5.54 -5.709 -5.945 -6.188 -6.628 -9 ,2795 ,TETRA ,17525586,Thu Nov 25 01:54:39 CET,Thu Nov 25 03:44:23 CET,0.0 0.307 0.481 0.589 0.682 0.766 0.85 0.942 1.11 1.183 1.256 1.278 1.466 1.531 1.655 1.769 1.87 1.923 2.039 2.148 2.289 2.386 2.482 2.626 2.774 2.923 3.074 3.204 3.366 3.531 3.69 3.879 4.051 4.211 4.389 4.586 4.777 4.976 5.197 5.438 5.655 5.901 6.195 6.449 6.737 7.03 7.326 7.614 7.845 7.983 7.861 7.24 6.52 5.858 5.234 4.649 4.091 3.56 3.101 2.636 2.237 1.857 1.483 1.153 0.832 0.537 0.235 -0.04 -0.276 -0.53 -0.798 -1.019 -1.256 -1.513 -1.708 -1.913 -2.121 -2.336 -2.576 -2.741 -2.905 -3.167 -3.341 -3.506 -3.588 -3.759 -3.953 -4.144 -4.235 -4.45 -4.5 -4.599 -4.714 -4.956 -5.077 -5.221 -5.386 -5.556 -5.766 -6.005 -6.512 -10 ,32719 ,TETRA ,17525587,Thu Nov 25 01:54:39 CET,Thu Nov 25 03:44:16 CET,0.0 0.169 0.308 0.417 0.514 0.618 0.715 0.795 0.959 1.031 1.101 1.117 1.307 1.379 1.497 1.609 1.723 1.78 1.908 2.044 2.233 2.341 2.446 2.607 2.756 2.903 3.051 3.202 3.398 3.566 3.717 3.889 4.052 4.21 4.394 4.614 4.828 5.056 5.292 5.526 5.748 5.997 6.302 6.585 6.877 7.187 7.506 7.792 8.034 8.096 7.823 7.213 6.501 5.804 5.204 4.631 4.1 3.604 3.156 2.691 2.284 1.937 1.605 1.285 0.964 0.669 0.36 0.066 -0.184 -0.429 -0.682 -0.896 -1.104 -1.316 -1.485 -1.656 -1.838 -2.023 -2.214 -2.347 -2.486 -2.71 -2.859 -3.003 -3.079 -3.245 -3.41 -3.573 -3.663 -3.882 -3.973 -4.092 -4.205 -4.432 -4.558 -4.696 -4.845 -5.004 -5.18 -5.394 -5.828 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index 9040137a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4572 ,TETRA ,17525588,Thu Nov 25 01:55:38 CET,Thu Nov 25 03:44:00 CET,0.0 0.189 0.302 0.411 0.497 0.568 0.643 0.723 0.854 0.916 0.98 1.005 1.194 1.265 1.397 1.519 1.623 1.673 1.782 1.884 2.016 2.103 2.187 2.307 2.423 2.53 2.624 2.719 2.847 2.964 3.068 3.189 3.311 3.429 3.567 3.73 3.876 4.023 4.164 4.294 4.425 4.561 4.71 4.864 5.032 5.163 5.22 5.213 5.159 4.911 4.235 3.187 2.17 1.261 0.474 -0.248 -0.86 -1.445 -1.979 -2.506 -2.96 -3.351 -3.724 -4.097 -4.448 -4.762 -5.08 -5.367 -5.622 -5.891 -6.159 -6.384 -6.618 -6.843 -7.013 -7.202 -7.392 -7.584 -7.786 -7.928 -8.081 -8.312 -8.478 -8.659 -8.751 -8.934 -9.113 -9.306 -9.41 -9.641 -9.769 -9.899 -10.022 -10.28 -10.423 -10.581 -10.78 -10.999 -11.224 -11.547 -12.333 -2 ,29102 ,TETRA ,17525589,Thu Nov 25 01:55:38 CET,Thu Nov 25 03:43:47 CET,0.0 0.22 0.347 0.452 0.537 0.622 0.704 0.774 0.903 0.966 1.023 1.019 1.183 1.228 1.314 1.401 1.494 1.536 1.614 1.695 1.819 1.892 1.959 2.076 2.189 2.289 2.386 2.488 2.616 2.729 2.842 2.98 3.108 3.226 3.356 3.497 3.626 3.764 3.906 4.044 4.174 4.309 4.458 4.622 4.808 4.949 5.022 5.038 4.976 4.742 4.1 3.136 2.23 1.359 0.58 -0.166 -0.801 -1.35 -1.849 -2.35 -2.778 -3.171 -3.553 -3.928 -4.293 -4.616 -4.944 -5.25 -5.505 -5.76 -6.056 -6.3 -6.533 -6.775 -6.958 -7.141 -7.338 -7.549 -7.759 -7.9 -8.045 -8.272 -8.426 -8.596 -8.681 -8.85 -9.032 -9.23 -9.335 -9.569 -9.698 -9.827 -9.949 -10.211 -10.353 -10.498 -10.663 -10.86 -11.108 -11.557 -13.955 -3 ,6430 ,TETRA ,17525590,Thu Nov 25 01:55:38 CET,Thu Nov 25 03:45:43 CET,0.0 0.499 0.706 0.842 0.973 1.104 1.207 1.291 1.426 1.488 1.545 1.545 1.711 1.758 1.856 1.953 2.043 2.082 2.156 2.228 2.339 2.419 2.493 2.583 2.665 2.754 2.846 2.936 3.055 3.167 3.274 3.406 3.539 3.656 3.778 3.909 4.031 4.169 4.32 4.474 4.609 4.756 4.932 5.078 5.194 5.294 5.413 5.475 5.403 5.154 4.56 3.494 2.478 1.571 0.748 0.053 -0.533 -1.088 -1.598 -2.102 -2.546 -2.962 -3.35 -3.72 -4.065 -4.377 -4.708 -5.005 -5.267 -5.537 -5.805 -6.042 -6.304 -6.561 -6.76 -6.969 -7.185 -7.403 -7.616 -7.767 -7.938 -8.211 -8.401 -8.596 -8.694 -8.909 -9.152 -9.389 -9.507 -9.75 -9.894 -10.03 -10.16 -10.404 -10.538 -10.71 -10.881 -11.075 -11.318 -11.666 -12.542 -4 ,20225 ,TETRA ,17525591,Thu Nov 25 01:55:37 CET,Thu Nov 25 03:42:41 CET,0.0 0.137 0.25 0.35 0.451 0.556 0.646 0.724 0.873 0.941 1.004 1.03 1.209 1.273 1.394 1.507 1.616 1.67 1.774 1.87 1.992 2.07 2.154 2.27 2.373 2.476 2.58 2.684 2.81 2.923 3.034 3.156 3.263 3.37 3.505 3.659 3.8 3.951 4.1 4.241 4.388 4.549 4.72 4.892 5.051 5.151 5.229 5.282 5.242 4.975 4.312 3.333 2.382 1.519 0.744 0.02 -0.626 -1.194 -1.692 -2.205 -2.649 -3.06 -3.466 -3.858 -4.207 -4.507 -4.828 -5.134 -5.401 -5.664 -5.921 -6.129 -6.347 -6.572 -6.748 -6.931 -7.118 -7.315 -7.517 -7.652 -7.797 -8.015 -8.168 -8.345 -8.429 -8.595 -8.779 -8.99 -9.105 -9.343 -9.431 -9.545 -9.676 -9.955 -10.104 -10.266 -10.451 -10.656 -10.882 -11.163 -11.972 -5 ,19702 ,TETRA ,17525592,Thu Nov 25 01:55:39 CET,Thu Nov 25 03:43:46 CET,0.0 0.223 0.354 0.467 0.535 0.593 0.654 0.726 0.855 0.905 0.952 0.93 1.093 1.146 1.253 1.341 1.419 1.459 1.538 1.617 1.728 1.792 1.857 1.97 2.084 2.199 2.31 2.414 2.534 2.641 2.75 2.889 3.017 3.128 3.267 3.413 3.546 3.688 3.835 3.973 4.097 4.247 4.418 4.58 4.738 4.884 5.023 5.089 5.025 4.686 3.944 2.901 1.935 1.08 0.302 -0.424 -1.064 -1.628 -2.164 -2.702 -3.154 -3.577 -3.958 -4.344 -4.723 -5.038 -5.362 -5.661 -5.903 -6.136 -6.391 -6.619 -6.85 -7.081 -7.26 -7.445 -7.63 -7.819 -8.017 -8.15 -8.292 -8.522 -8.68 -8.847 -8.94 -9.132 -9.329 -9.536 -9.642 -9.873 -9.987 -10.117 -10.259 -10.603 -10.797 -10.979 -11.193 -11.433 -11.658 -11.948 -12.744 -6 ,25860 ,TETRA ,17525593,Thu Nov 25 01:55:39 CET,Thu Nov 25 03:44:02 CET,0.0 0.236 0.342 0.434 0.533 0.622 0.702 0.771 0.913 0.979 1.038 1.044 1.213 1.263 1.354 1.438 1.516 1.554 1.627 1.697 1.805 1.876 1.948 2.046 2.131 2.208 2.289 2.371 2.472 2.57 2.661 2.764 2.862 2.941 3.024 3.135 3.244 3.37 3.513 3.65 3.771 3.891 4.022 4.144 4.27 4.366 4.435 4.486 4.47 4.236 3.592 2.621 1.639 0.702 -0.094 -0.81 -1.486 -2.077 -2.583 -3.108 -3.559 -3.963 -4.341 -4.719 -5.072 -5.365 -5.662 -5.938 -6.177 -6.402 -6.637 -6.853 -7.083 -7.328 -7.519 -7.715 -7.924 -8.15 -8.384 -8.529 -8.668 -8.884 -9.054 -9.244 -9.332 -9.504 -9.685 -9.887 -10.005 -10.255 -10.379 -10.507 -10.642 -10.914 -11.051 -11.203 -11.372 -11.564 -11.795 -12.152 -12.94 -7 ,3261 ,TETRA ,17525594,Thu Nov 25 01:55:39 CET,Thu Nov 25 03:44:35 CET,0.0 0.238 0.361 0.467 0.561 0.647 0.725 0.799 0.937 1.001 1.062 1.07 1.236 1.282 1.372 1.461 1.55 1.595 1.681 1.761 1.871 1.934 1.996 2.086 2.171 2.259 2.351 2.442 2.554 2.669 2.778 2.908 3.029 3.138 3.262 3.397 3.522 3.652 3.79 3.93 4.065 4.213 4.376 4.526 4.673 4.803 4.926 4.994 4.947 4.72 4.079 3.037 2.052 1.133 0.329 -0.377 -1.006 -1.604 -2.125 -2.671 -3.151 -3.565 -3.95 -4.318 -4.675 -4.987 -5.311 -5.608 -5.862 -6.124 -6.405 -6.627 -6.853 -7.099 -7.3 -7.511 -7.729 -7.956 -8.182 -8.347 -8.519 -8.771 -8.955 -9.156 -9.259 -9.476 -9.706 -9.944 -10.067 -10.315 -10.45 -10.594 -10.741 -11.002 -11.144 -11.309 -11.5 -11.72 -11.992 -12.307 -13.048 -8 ,26112 ,TETRA ,17525595,Thu Nov 25 01:55:40 CET,Thu Nov 25 03:48:15 CET,0.0 0.204 0.37 0.509 0.612 0.688 0.76 0.838 0.99 1.052 1.107 1.089 1.251 1.298 1.384 1.475 1.563 1.604 1.685 1.765 1.875 1.937 2.001 2.111 2.216 2.31 2.397 2.477 2.587 2.704 2.824 2.957 3.078 3.199 3.322 3.451 3.578 3.712 3.855 4.001 4.122 4.253 4.43 4.574 4.693 4.806 4.889 4.901 4.841 4.6 3.918 2.904 1.926 1.05 0.271 -0.478 -1.132 -1.733 -2.245 -2.756 -3.223 -3.633 -4.028 -4.398 -4.721 -5.018 -5.344 -5.634 -5.887 -6.158 -6.428 -6.649 -6.888 -7.128 -7.313 -7.514 -7.721 -7.933 -8.141 -8.279 -8.433 -8.677 -8.844 -9.017 -9.101 -9.279 -9.471 -9.677 -9.789 -10.026 -10.131 -10.253 -10.388 -10.677 -10.833 -11.011 -11.184 -11.372 -11.632 -11.974 -13.099 -9 ,981 ,TETRA ,17525596,Thu Nov 25 01:56:38 CET,Thu Nov 25 03:45:42 CET,0.0 0.237 0.383 0.491 0.574 0.644 0.712 0.779 0.913 0.974 1.033 1.041 1.211 1.26 1.34 1.421 1.502 1.538 1.608 1.688 1.801 1.865 1.927 2.026 2.126 2.214 2.293 2.366 2.46 2.565 2.671 2.788 2.895 3.003 3.135 3.289 3.428 3.559 3.698 3.85 3.989 4.114 4.256 4.4 4.546 4.675 4.783 4.8 4.681 4.376 3.608 2.432 1.405 0.493 -0.309 -1.039 -1.679 -2.243 -2.752 -3.286 -3.757 -4.161 -4.54 -4.896 -5.221 -5.534 -5.865 -6.141 -6.384 -6.636 -6.904 -7.128 -7.34 -7.566 -7.751 -7.938 -8.129 -8.328 -8.547 -8.697 -8.844 -9.081 -9.261 -9.44 -9.521 -9.675 -9.837 -10.027 -10.133 -10.369 -10.496 -10.634 -10.777 -11.07 -11.223 -11.382 -11.559 -11.76 -12.014 -12.351 -13.238 -10 ,28737 ,TETRA ,17525597,Thu Nov 25 01:56:38 CET,Thu Nov 25 03:45:01 CET,0.0 0.223 0.369 0.486 0.572 0.658 0.741 0.822 0.962 1.025 1.093 1.121 1.3 1.368 1.507 1.634 1.755 1.807 1.904 2.009 2.154 2.247 2.334 2.454 2.572 2.681 2.784 2.878 2.993 3.109 3.224 3.348 3.465 3.593 3.731 3.865 3.995 4.144 4.292 4.414 4.537 4.691 4.862 4.993 5.123 5.254 5.351 5.413 5.395 5.161 4.446 3.347 2.372 1.47 0.649 -0.076 -0.727 -1.313 -1.812 -2.341 -2.814 -3.233 -3.618 -3.974 -4.316 -4.654 -5.01 -5.312 -5.572 -5.846 -6.122 -6.35 -6.588 -6.832 -7.019 -7.203 -7.38 -7.559 -7.76 -7.904 -8.048 -8.272 -8.439 -8.613 -8.704 -8.891 -9.08 -9.275 -9.38 -9.618 -9.731 -9.851 -9.977 -10.256 -10.421 -10.594 -10.78 -11.006 -11.249 -11.54 -12.603 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 5a6d2d55..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22524 ,KEBNE ,17024439,Wed Dec 22 10:02:24 CET,Wed Dec 22 11:36:55 CET,0.0 0.232 0.402 0.547 0.66 0.755 0.841 0.927 1.085 1.154 1.222 1.246 1.427 1.488 1.6 1.715 1.82 1.873 1.975 2.064 2.181 2.259 2.338 2.458 2.564 2.66 2.757 2.847 2.967 3.09 3.202 3.315 3.428 3.552 3.694 3.86 4.025 4.202 4.391 4.577 4.76 4.961 5.184 5.35 5.491 5.635 5.752 5.811 5.733 5.393 4.542 3.288 2.126 1.022 0.031 -0.847 -1.625 -2.344 -2.987 -3.662 -4.231 -4.73 -5.231 -5.685 -6.084 -6.451 -6.823 -7.142 -7.412 -7.689 -7.978 -8.236 -8.509 -8.775 -8.973 -9.167 -9.364 -9.583 -9.82 -9.99 -10.169 -10.436 -10.625 -10.818 -10.915 -11.11 -11.317 -11.535 -11.65 -11.9 -12.022 -12.141 -12.262 -12.52 -12.671 -12.84 -13.012 -13.205 -13.43 -13.729 -14.61 -2 ,11217 ,KEBNE ,17024440,Wed Dec 22 10:02:24 CET,Wed Dec 22 11:36:12 CET,0.0 0.401 0.523 0.633 0.752 0.846 0.927 1.001 1.135 1.204 1.271 1.275 1.444 1.499 1.619 1.721 1.809 1.86 1.962 2.052 2.168 2.238 2.326 2.469 2.602 2.725 2.827 2.933 3.091 3.237 3.365 3.518 3.666 3.806 3.969 4.14 4.285 4.439 4.617 4.81 4.973 5.125 5.302 5.46 5.639 5.815 5.961 6.035 5.987 5.72 4.833 3.478 2.262 1.096 0.022 -0.927 -1.734 -2.474 -3.127 -3.784 -4.337 -4.826 -5.297 -5.74 -6.14 -6.504 -6.874 -7.201 -7.481 -7.779 -8.1 -8.362 -8.626 -8.908 -9.132 -9.367 -9.608 -9.852 -10.106 -10.286 -10.481 -10.785 -10.988 -11.182 -11.279 -11.482 -11.694 -11.92 -12.027 -12.273 -12.402 -12.523 -12.645 -12.938 -13.108 -13.281 -13.467 -13.681 -13.919 -14.272 -15.086 -3 ,14637 ,KEBNE ,17024441,Wed Dec 22 10:02:23 CET,Wed Dec 22 11:36:31 CET,0.0 0.31 0.47 0.612 0.718 0.822 0.92 1.002 1.148 1.209 1.269 1.267 1.43 1.488 1.598 1.689 1.77 1.814 1.912 2.009 2.126 2.195 2.27 2.383 2.485 2.586 2.687 2.79 2.941 3.081 3.211 3.382 3.547 3.692 3.841 3.991 4.129 4.297 4.472 4.638 4.816 5.005 5.215 5.418 5.62 5.775 5.874 5.906 5.809 5.407 4.495 3.155 1.857 0.692 -0.317 -1.22 -2.06 -2.849 -3.498 -4.111 -4.664 -5.184 -5.665 -6.099 -6.502 -6.875 -7.278 -7.651 -7.954 -8.252 -8.564 -8.827 -9.109 -9.394 -9.606 -9.841 -10.096 -10.338 -10.569 -10.732 -10.903 -11.161 -11.335 -11.522 -11.623 -11.827 -12.039 -12.277 -12.392 -12.631 -12.73 -12.864 -13.007 -13.309 -13.464 -13.619 -13.787 -14.011 -14.281 -14.563 -15.244 -4 ,30763 ,KEBNE ,17024442,Wed Dec 22 10:02:24 CET,Wed Dec 22 11:39:07 CET,0.0 0.342 0.506 0.641 0.766 0.875 0.978 1.086 1.254 1.319 1.392 1.43 1.618 1.692 1.836 1.955 2.043 2.086 2.175 2.259 2.373 2.448 2.531 2.638 2.728 2.828 2.93 3.03 3.152 3.268 3.385 3.519 3.647 3.782 3.946 4.132 4.305 4.474 4.65 4.836 4.999 5.179 5.384 5.561 5.752 5.93 6.083 6.165 6.078 5.736 4.818 3.401 2.162 1.049 0.033 -0.907 -1.776 -2.564 -3.235 -3.933 -4.552 -5.09 -5.587 -6.048 -6.464 -6.836 -7.214 -7.55 -7.847 -8.148 -8.47 -8.76 -9.065 -9.367 -9.594 -9.82 -10.055 -10.316 -10.592 -10.776 -10.957 -11.251 -11.456 -11.653 -11.754 -11.957 -12.168 -12.409 -12.54 -12.797 -12.932 -13.079 -13.225 -13.495 -13.652 -13.848 -14.043 -14.247 -14.489 -14.767 -15.769 -5 ,32305 ,KEBNE ,17024443,Wed Dec 22 10:02:24 CET,Wed Dec 22 11:36:53 CET,0.0 0.37 0.549 0.707 0.819 0.923 1.033 1.137 1.315 1.393 1.473 1.506 1.687 1.745 1.832 1.913 1.996 2.04 2.138 2.234 2.376 2.478 2.575 2.71 2.836 2.957 3.067 3.16 3.304 3.446 3.566 3.7 3.819 3.952 4.128 4.31 4.449 4.588 4.755 4.934 5.093 5.263 5.477 5.674 5.836 5.952 6.035 6.038 5.942 5.663 4.741 3.232 1.935 0.781 -0.294 -1.261 -2.081 -2.835 -3.488 -4.145 -4.722 -5.251 -5.757 -6.199 -6.605 -6.985 -7.397 -7.786 -8.1 -8.399 -8.701 -8.956 -9.233 -9.524 -9.756 -9.993 -10.215 -10.448 -10.705 -10.883 -11.054 -11.304 -11.481 -11.668 -11.764 -11.96 -12.169 -12.382 -12.489 -12.73 -12.871 -13.017 -13.156 -13.44 -13.584 -13.746 -13.938 -14.159 -14.378 -14.626 -15.389 -6 ,27318 ,KEBNE ,17024444,Wed Dec 22 10:02:23 CET,Wed Dec 22 11:36:47 CET,0.0 0.35 0.543 0.709 0.836 0.947 1.051 1.136 1.275 1.35 1.428 1.458 1.639 1.697 1.792 1.891 1.986 2.034 2.133 2.237 2.384 2.468 2.547 2.661 2.76 2.854 2.943 3.036 3.171 3.309 3.447 3.608 3.76 3.898 4.051 4.224 4.382 4.565 4.75 4.931 5.126 5.323 5.523 5.692 5.87 6.035 6.158 6.236 6.218 5.898 5.017 3.712 2.455 1.247 0.187 -0.746 -1.594 -2.329 -2.945 -3.574 -4.144 -4.645 -5.099 -5.547 -5.963 -6.333 -6.718 -7.057 -7.337 -7.629 -7.943 -8.2 -8.466 -8.759 -8.984 -9.221 -9.471 -9.718 -9.97 -10.145 -10.324 -10.601 -10.799 -11.004 -11.102 -11.291 -11.475 -11.679 -11.793 -12.042 -12.18 -12.323 -12.461 -12.737 -12.893 -13.069 -13.251 -13.464 -13.725 -14.091 -14.842 -7 ,13425 ,KEBNE ,17024445,Wed Dec 22 10:02:24 CET,Wed Dec 22 11:36:34 CET,0.0 0.407 0.563 0.684 0.791 0.889 0.984 1.069 1.213 1.284 1.356 1.369 1.538 1.591 1.706 1.837 1.963 2.011 2.1 2.188 2.298 2.37 2.438 2.54 2.642 2.746 2.858 2.962 3.083 3.19 3.283 3.403 3.527 3.645 3.783 3.932 4.073 4.248 4.434 4.625 4.815 4.985 5.149 5.314 5.48 5.598 5.692 5.73 5.65 5.355 4.546 3.273 1.989 0.798 -0.23 -1.14 -1.92 -2.633 -3.276 -3.929 -4.48 -4.984 -5.473 -5.941 -6.371 -6.741 -7.114 -7.46 -7.763 -8.066 -8.396 -8.674 -8.963 -9.275 -9.516 -9.759 -10.011 -10.272 -10.535 -10.709 -10.886 -11.186 -11.398 -11.604 -11.711 -11.935 -12.164 -12.387 -12.491 -12.737 -12.888 -13.026 -13.162 -13.461 -13.632 -13.809 -13.981 -14.193 -14.47 -14.828 -15.7 -8 ,30858 ,KEBNE ,17024446,Wed Dec 22 10:02:24 CET,Wed Dec 22 11:36:39 CET,0.0 0.242 0.349 0.465 0.583 0.679 0.77 0.859 1.03 1.103 1.169 1.188 1.377 1.451 1.56 1.657 1.773 1.83 1.942 2.056 2.228 2.339 2.437 2.586 2.728 2.859 2.984 3.094 3.229 3.363 3.496 3.653 3.806 3.945 4.098 4.252 4.392 4.539 4.694 4.869 5.047 5.235 5.421 5.593 5.788 5.953 6.1 6.182 6.137 5.81 4.88 3.405 2.003 0.842 -0.168 -1.107 -1.947 -2.717 -3.376 -4.029 -4.601 -5.113 -5.587 -6.016 -6.413 -6.781 -7.19 -7.562 -7.855 -8.162 -8.502 -8.785 -9.076 -9.386 -9.619 -9.855 -10.109 -10.358 -10.607 -10.793 -10.981 -11.275 -11.494 -11.715 -11.833 -12.076 -12.305 -12.556 -12.693 -12.962 -13.131 -13.289 -13.441 -13.761 -13.964 -14.196 -14.436 -14.682 -14.957 -15.287 -16.267 -9 ,13438 ,KEBNE ,17024447,Wed Dec 22 10:02:24 CET,Wed Dec 22 11:36:23 CET,0.0 0.292 0.443 0.54 0.649 0.757 0.833 0.918 1.078 1.15 1.228 1.277 1.463 1.521 1.629 1.736 1.844 1.891 1.973 2.054 2.178 2.262 2.348 2.479 2.585 2.663 2.752 2.841 2.939 3.061 3.201 3.351 3.468 3.565 3.683 3.833 3.973 4.134 4.327 4.522 4.718 4.916 5.118 5.285 5.449 5.63 5.76 5.82 5.778 5.463 4.638 3.279 2.024 0.897 -0.079 -1.013 -1.875 -2.683 -3.384 -4.061 -4.64 -5.15 -5.637 -6.108 -6.549 -6.931 -7.31 -7.672 -7.999 -8.336 -8.684 -8.967 -9.246 -9.516 -9.739 -9.984 -10.23 -10.483 -10.743 -10.918 -11.094 -11.389 -11.598 -11.8 -11.902 -12.112 -12.322 -12.523 -12.625 -12.873 -12.994 -13.126 -13.26 -13.537 -13.693 -13.857 -14.036 -14.23 -14.459 -14.756 -15.401 -10 ,21672 ,KEBNE ,17024448,Wed Dec 22 10:02:23 CET,Wed Dec 22 11:36:37 CET,0.0 0.502 0.7 0.844 0.952 1.06 1.158 1.244 1.412 1.496 1.581 1.627 1.81 1.87 1.991 2.093 2.174 2.218 2.3 2.383 2.514 2.599 2.684 2.8 2.913 3.034 3.154 3.268 3.422 3.576 3.717 3.885 4.047 4.191 4.35 4.503 4.635 4.806 5.015 5.214 5.388 5.574 5.762 5.921 6.084 6.204 6.303 6.377 6.296 5.933 5.077 3.78 2.598 1.519 0.478 -0.453 -1.259 -2.02 -2.686 -3.329 -3.854 -4.341 -4.823 -5.272 -5.672 -6.044 -6.43 -6.756 -7.048 -7.365 -7.696 -7.962 -8.242 -8.535 -8.76 -8.983 -9.194 -9.421 -9.647 -9.8 -9.971 -10.234 -10.42 -10.625 -10.721 -10.908 -11.119 -11.344 -11.463 -11.712 -11.818 -11.95 -12.097 -12.413 -12.569 -12.731 -12.908 -13.105 -13.308 -13.573 -14.263 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt deleted file mode 100644 index 4b44e7dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13d_CAT-17h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26195 ,TETRA ,17525598,Thu Nov 25 01:30:42 CET,Thu Nov 25 03:16:53 CET,0.0 0.352 0.523 0.676 0.827 0.948 1.044 1.138 1.336 1.421 1.493 1.544 1.74 1.817 1.96 2.086 2.206 2.264 2.374 2.481 2.644 2.747 2.853 3.016 3.182 3.36 3.529 3.674 3.868 4.059 4.237 4.449 4.656 4.852 5.057 5.267 5.466 5.693 5.938 6.196 6.469 6.782 7.133 7.455 7.812 8.201 8.606 9.013 9.392 9.72 9.826 9.493 9.016 8.464 7.958 7.433 6.89 6.398 5.977 5.523 5.136 4.816 4.493 4.156 3.846 3.573 3.29 3.026 2.79 2.554 2.319 2.13 1.923 1.683 1.502 1.321 1.119 0.916 0.721 0.579 0.427 0.199 0.048 -0.116 -0.202 -0.372 -0.558 -0.746 -0.843 -1.066 -1.173 -1.3 -1.429 -1.697 -1.859 -2.03 -2.221 -2.463 -2.745 -3.104 -3.781 -2 ,4572 ,TETRA ,17525599,Thu Nov 25 01:30:44 CET,Thu Nov 25 03:22:57 CET,0.0 0.544 0.768 0.932 1.054 1.165 1.285 1.405 1.607 1.695 1.773 1.809 1.997 2.068 2.197 2.33 2.458 2.513 2.618 2.727 2.9 3.012 3.115 3.258 3.388 3.518 3.65 3.769 3.925 4.081 4.228 4.409 4.578 4.735 4.917 5.142 5.378 5.628 5.891 6.179 6.469 6.781 7.137 7.48 7.86 8.229 8.632 9.065 9.452 9.752 9.817 9.419 8.797 8.181 7.606 7.069 6.566 6.057 5.612 5.167 4.773 4.425 4.094 3.777 3.494 3.253 2.985 2.732 2.53 2.33 2.121 1.953 1.779 1.588 1.424 1.255 1.096 0.938 0.762 0.636 0.505 0.307 0.183 0.053 -0.017 -0.161 -0.301 -0.449 -0.525 -0.719 -0.781 -0.882 -0.979 -1.17 -1.274 -1.404 -1.55 -1.714 -1.896 -2.129 -2.546 -3 ,13743 ,TETRA ,17525600,Thu Nov 25 01:30:44 CET,Thu Nov 25 03:20:45 CET,0.0 0.492 0.637 0.749 0.854 0.977 1.102 1.194 1.378 1.467 1.561 1.611 1.799 1.869 1.995 2.113 2.233 2.287 2.398 2.518 2.676 2.772 2.877 3.046 3.191 3.333 3.489 3.636 3.812 3.983 4.16 4.368 4.552 4.711 4.896 5.111 5.332 5.587 5.853 6.125 6.398 6.7 7.021 7.339 7.718 8.104 8.491 8.869 9.238 9.495 9.478 9.11 8.546 7.967 7.418 6.824 6.277 5.774 5.331 4.878 4.441 4.061 3.744 3.431 3.11 2.822 2.532 2.269 2.024 1.774 1.539 1.341 1.124 0.901 0.731 0.55 0.365 0.179 -0.021 -0.15 -0.274 -0.481 -0.624 -0.777 -0.855 -1.026 -1.215 -1.379 -1.454 -1.648 -1.704 -1.804 -1.911 -2.154 -2.279 -2.415 -2.578 -2.75 -2.906 -3.12 -3.61 -4 ,5651 ,TETRA ,17525601,Thu Nov 25 01:30:44 CET,Thu Nov 25 03:22:50 CET,0.0 0.479 0.73 0.941 1.107 1.253 1.388 1.522 1.781 1.892 1.994 2.095 2.317 2.422 2.592 2.743 2.881 2.951 3.087 3.213 3.401 3.52 3.636 3.798 3.954 4.117 4.278 4.429 4.625 4.816 4.997 5.197 5.386 5.569 5.776 6.018 6.252 6.519 6.801 7.076 7.36 7.681 8.029 8.386 8.799 9.202 9.592 9.976 10.395 10.762 10.888 10.569 10.011 9.408 8.82 8.253 7.734 7.251 6.823 6.406 6.065 5.739 5.414 5.107 4.833 4.577 4.277 4.004 3.791 3.56 3.307 3.102 2.874 2.629 2.451 2.274 2.09 1.889 1.675 1.531 1.374 1.132 0.97 0.799 0.705 0.513 0.326 0.119 0.014 -0.218 -0.351 -0.481 -0.626 -0.955 -1.147 -1.346 -1.54 -1.734 -1.931 -2.171 -2.823 -5 ,13468 ,TETRA ,17525602,Thu Nov 25 01:31:37 CET,Thu Nov 25 03:19:56 CET,0.0 0.324 0.503 0.674 0.825 0.938 1.039 1.146 1.344 1.431 1.529 1.608 1.802 1.882 2.02 2.135 2.266 2.331 2.435 2.533 2.696 2.809 2.922 3.089 3.244 3.394 3.544 3.685 3.869 4.033 4.185 4.396 4.596 4.767 4.968 5.209 5.447 5.69 5.933 6.195 6.471 6.78 7.112 7.419 7.763 8.123 8.524 8.904 9.277 9.657 9.923 9.643 9.065 8.411 7.782 7.229 6.724 6.235 5.798 5.361 4.972 4.627 4.302 3.981 3.663 3.354 3.043 2.787 2.554 2.315 2.082 1.88 1.664 1.428 1.246 1.063 0.86 0.654 0.444 0.295 0.133 -0.125 -0.297 -0.469 -0.555 -0.738 -0.938 -1.131 -1.217 -1.423 -1.501 -1.604 -1.71 -1.942 -2.068 -2.203 -2.343 -2.487 -2.659 -2.887 -3.32 -6 ,17623 ,TETRA ,17525603,Thu Nov 25 01:31:37 CET,Thu Nov 25 03:20:23 CET,0.0 0.572 0.754 0.91 1.043 1.169 1.276 1.375 1.573 1.669 1.765 1.817 2.007 2.075 2.198 2.313 2.436 2.503 2.625 2.719 2.845 2.943 3.049 3.19 3.317 3.463 3.617 3.758 3.948 4.135 4.304 4.514 4.716 4.908 5.125 5.373 5.617 5.874 6.142 6.44 6.741 7.064 7.441 7.775 8.146 8.564 9.011 9.458 9.923 10.276 10.309 9.954 9.425 8.823 8.232 7.644 7.126 6.653 6.197 5.711 5.308 4.962 4.636 4.332 4.045 3.77 3.49 3.246 3.017 2.761 2.514 2.32 2.115 1.895 1.717 1.527 1.334 1.142 0.948 0.814 0.667 0.44 0.288 0.126 0.042 -0.134 -0.319 -0.525 -0.636 -0.86 -0.965 -1.072 -1.181 -1.428 -1.568 -1.72 -1.871 -2.023 -2.188 -2.422 -3.06 -7 ,22960 ,TETRA ,17525604,Thu Nov 25 01:32:39 CET,Thu Nov 25 03:22:06 CET,0.0 0.36 0.508 0.671 0.814 0.927 1.027 1.134 1.336 1.422 1.51 1.558 1.739 1.802 1.936 2.066 2.181 2.235 2.344 2.45 2.603 2.703 2.8 2.939 3.066 3.186 3.299 3.412 3.557 3.713 3.876 4.062 4.228 4.373 4.555 4.751 4.93 5.135 5.361 5.605 5.856 6.141 6.486 6.82 7.184 7.573 7.989 8.389 8.747 9.043 9.04 8.554 7.939 7.306 6.74 6.208 5.722 5.251 4.832 4.4 4.02 3.689 3.36 3.064 2.818 2.578 2.327 2.116 1.924 1.722 1.509 1.328 1.135 0.945 0.808 0.661 0.496 0.334 0.168 0.05 -0.078 -0.294 -0.442 -0.589 -0.664 -0.835 -1.02 -1.207 -1.295 -1.488 -1.547 -1.65 -1.753 -1.955 -2.07 -2.195 -2.328 -2.497 -2.755 -3.062 -3.677 -8 ,3705 ,TETRA ,17525605,Thu Nov 25 01:32:39 CET,Thu Nov 25 03:24:38 CET,0.0 0.335 0.5 0.614 0.738 0.865 0.983 1.09 1.277 1.362 1.447 1.503 1.694 1.762 1.894 2.016 2.123 2.18 2.301 2.422 2.59 2.685 2.77 2.921 3.074 3.194 3.309 3.428 3.579 3.746 3.912 4.078 4.232 4.382 4.558 4.763 4.949 5.146 5.374 5.625 5.896 6.201 6.56 6.911 7.297 7.7 8.123 8.524 8.889 9.187 9.216 8.834 8.253 7.627 7.059 6.503 5.986 5.451 4.97 4.523 4.13 3.783 3.465 3.144 2.822 2.529 2.228 1.949 1.711 1.48 1.24 1.037 0.818 0.591 0.41 0.22 0.027 -0.167 -0.373 -0.517 -0.651 -0.838 -0.965 -1.117 -1.195 -1.342 -1.503 -1.67 -1.755 -1.963 -2.017 -2.108 -2.206 -2.408 -2.512 -2.628 -2.773 -2.94 -3.11 -3.321 -3.988 -9 ,31096 ,TETRA ,17525606,Thu Nov 25 01:32:39 CET,Thu Nov 25 03:21:37 CET,0.0 0.435 0.606 0.734 0.853 0.989 1.11 1.22 1.435 1.534 1.618 1.632 1.815 1.895 2.048 2.197 2.329 2.385 2.496 2.609 2.769 2.868 2.958 3.074 3.191 3.301 3.412 3.534 3.688 3.839 3.986 4.161 4.355 4.554 4.774 5.015 5.239 5.473 5.72 5.974 6.226 6.5 6.816 7.129 7.495 7.858 8.231 8.649 9.018 9.222 9.204 8.842 8.257 7.591 6.998 6.461 5.93 5.437 4.987 4.529 4.161 3.825 3.484 3.146 2.844 2.573 2.282 2.018 1.785 1.552 1.318 1.119 0.914 0.704 0.525 0.348 0.174 0.003 -0.161 -0.279 -0.408 -0.628 -0.781 -0.939 -1.016 -1.16 -1.299 -1.455 -1.538 -1.731 -1.798 -1.91 -2.026 -2.249 -2.353 -2.474 -2.613 -2.76 -2.932 -3.14 -3.621 -10 ,17527 ,TETRA ,17525607,Thu Nov 25 01:32:39 CET,Thu Nov 25 03:21:05 CET,0.0 0.671 0.878 1.075 1.279 1.456 1.596 1.742 2.026 2.143 2.254 2.354 2.573 2.68 2.86 3.017 3.183 3.265 3.408 3.546 3.747 3.87 3.99 4.183 4.357 4.511 4.666 4.815 5.005 5.185 5.352 5.54 5.722 5.898 6.106 6.352 6.581 6.82 7.076 7.345 7.602 7.897 8.275 8.614 8.988 9.408 9.81 10.208 10.619 10.945 11.062 10.726 10.181 9.628 9.075 8.523 7.994 7.495 7.079 6.646 6.258 5.903 5.562 5.243 4.951 4.687 4.417 4.18 3.978 3.763 3.545 3.373 3.204 3.024 2.861 2.699 2.545 2.39 2.234 2.114 1.984 1.802 1.69 1.57 1.503 1.349 1.174 1.001 0.921 0.717 0.646 0.551 0.469 0.283 0.165 0.049 -0.064 -0.19 -0.333 -0.519 -0.992 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index e7e4429a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23739 ,TETRA ,17525608,Thu Nov 25 01:33:40 CET,Thu Nov 25 03:25:25 CET,0.0 0.546 0.785 0.953 1.069 1.181 1.3 1.413 1.603 1.684 1.759 1.784 1.973 2.041 2.163 2.281 2.396 2.456 2.592 2.722 2.888 2.982 3.08 3.226 3.366 3.526 3.697 3.87 4.084 4.268 4.449 4.677 4.894 5.103 5.323 5.573 5.828 6.101 6.396 6.7 7.013 7.375 7.79 8.175 8.628 9.131 9.671 10.25 10.892 11.565 12.198 12.466 12.404 12.2 11.971 11.715 11.42 11.124 10.866 10.591 10.348 10.128 9.892 9.66 9.463 9.295 9.098 8.898 8.724 8.54 8.343 8.175 8.002 7.84 7.729 7.61 7.483 7.35 7.197 7.089 6.984 6.815 6.695 6.575 6.511 6.381 6.247 6.08 5.996 5.81 5.759 5.671 5.579 5.34 5.203 5.068 4.942 4.814 4.636 4.413 4.034 -2 ,27533 ,TETRA ,17525609,Thu Nov 25 01:33:40 CET,Thu Nov 25 03:23:55 CET,0.0 0.424 0.596 0.708 0.823 0.952 1.086 1.203 1.405 1.5 1.594 1.647 1.839 1.915 2.071 2.224 2.364 2.431 2.56 2.67 2.839 2.958 3.07 3.23 3.39 3.539 3.691 3.842 4.019 4.181 4.339 4.52 4.694 4.869 5.064 5.279 5.497 5.736 6.012 6.32 6.632 6.951 7.312 7.697 8.144 8.632 9.178 9.785 10.479 11.18 11.752 12.047 12.02 11.819 11.575 11.303 11.044 10.783 10.53 10.271 10.032 9.781 9.536 9.314 9.111 8.922 8.734 8.576 8.432 8.28 8.131 8.005 7.867 7.715 7.595 7.479 7.355 7.225 7.086 6.984 6.885 6.747 6.649 6.532 6.466 6.322 6.18 6.031 5.94 5.731 5.661 5.578 5.496 5.283 5.16 5.027 4.873 4.701 4.52 4.299 3.617 -3 ,17756 ,TETRA ,17525610,Thu Nov 25 01:33:40 CET,Thu Nov 25 03:12:46 CET,0.0 0.329 0.532 0.684 0.795 0.904 1.018 1.133 1.347 1.435 1.512 1.539 1.723 1.793 1.945 2.081 2.214 2.277 2.384 2.492 2.673 2.795 2.903 3.052 3.19 3.322 3.453 3.58 3.741 3.907 4.068 4.253 4.434 4.602 4.8 5.028 5.261 5.517 5.772 6.037 6.326 6.692 7.122 7.523 7.981 8.5 9.056 9.664 10.328 10.993 11.611 11.836 11.784 11.626 11.411 11.147 10.889 10.626 10.367 10.112 9.881 9.658 9.423 9.193 8.985 8.803 8.607 8.414 8.246 8.078 7.888 7.722 7.558 7.381 7.232 7.077 6.927 6.771 6.6 6.477 6.36 6.177 6.05 5.917 5.841 5.669 5.495 5.324 5.226 4.999 4.86 4.735 4.616 4.379 4.22 4.023 3.798 3.561 3.32 2.963 1.911 -4 ,31159 ,TETRA ,17525611,Thu Nov 25 01:33:40 CET,Thu Nov 25 03:12:12 CET,0.0 0.45 0.607 0.744 0.897 1.03 1.138 1.241 1.422 1.504 1.578 1.598 1.785 1.859 2.015 2.166 2.323 2.405 2.574 2.749 2.983 3.121 3.251 3.445 3.638 3.81 3.973 4.133 4.337 4.539 4.722 4.933 5.147 5.353 5.593 5.874 6.152 6.451 6.772 7.101 7.411 7.765 8.168 8.573 9.057 9.566 10.141 10.744 11.374 12.065 12.726 13.047 13.044 12.863 12.645 12.4 12.126 11.866 11.622 11.327 11.026 10.76 10.517 10.28 10.042 9.816 9.591 9.391 9.214 9.031 8.846 8.675 8.486 8.278 8.112 7.958 7.796 7.618 7.422 7.284 7.153 6.96 6.832 6.69 6.618 6.491 6.355 6.212 6.135 5.931 5.865 5.778 5.684 5.474 5.354 5.238 5.113 4.983 4.856 4.658 4.216 -5 ,29539 ,TETRA ,17525612,Thu Nov 25 01:33:40 CET,Thu Nov 25 03:22:44 CET,0.0 0.786 0.981 1.138 1.277 1.387 1.498 1.617 1.85 1.954 2.044 2.075 2.272 2.344 2.47 2.613 2.755 2.826 2.97 3.095 3.256 3.362 3.461 3.608 3.757 3.899 4.028 4.152 4.319 4.486 4.641 4.842 5.058 5.27 5.523 5.797 6.046 6.319 6.605 6.897 7.204 7.54 7.928 8.346 8.806 9.281 9.832 10.43 11.09 11.742 12.369 12.622 12.55 12.343 12.054 11.734 11.466 11.219 10.963 10.681 10.433 10.2 9.974 9.75 9.536 9.353 9.161 8.979 8.811 8.636 8.448 8.287 8.12 7.944 7.812 7.678 7.534 7.361 7.162 7.026 6.887 6.674 6.516 6.367 6.301 6.158 6.022 5.895 5.835 5.646 5.582 5.473 5.363 5.173 5.077 4.953 4.82 4.674 4.504 4.284 3.718 -6 ,2735 ,TETRA ,17525613,Thu Nov 25 01:34:41 CET,Thu Nov 25 03:24:42 CET,0.0 0.466 0.674 0.823 0.946 1.058 1.156 1.251 1.421 1.506 1.601 1.657 1.847 1.91 2.035 2.176 2.311 2.371 2.493 2.611 2.794 2.911 3.029 3.212 3.375 3.542 3.717 3.889 4.105 4.299 4.493 4.722 4.921 5.118 5.35 5.611 5.857 6.133 6.425 6.73 7.042 7.389 7.804 8.19 8.632 9.13 9.684 10.274 10.888 11.545 12.162 12.411 12.366 12.169 11.95 11.706 11.443 11.172 10.92 10.674 10.452 10.237 10.033 9.846 9.679 9.523 9.355 9.196 9.045 8.896 8.75 8.615 8.476 8.341 8.222 8.101 7.983 7.844 7.685 7.572 7.458 7.301 7.196 7.08 7.021 6.897 6.76 6.623 6.552 6.358 6.307 6.228 6.155 5.985 5.887 5.775 5.635 5.464 5.254 4.997 4.384 -7 ,22849 ,TETRA ,17525614,Thu Nov 25 01:34:41 CET,Thu Nov 25 03:20:54 CET,0.0 0.656 0.88 1.041 1.181 1.315 1.436 1.539 1.709 1.787 1.855 1.872 2.053 2.118 2.262 2.382 2.495 2.554 2.665 2.778 2.953 3.06 3.157 3.307 3.47 3.64 3.802 3.959 4.162 4.352 4.542 4.776 4.995 5.19 5.414 5.669 5.923 6.222 6.535 6.859 7.18 7.536 7.972 8.387 8.83 9.325 9.88 10.466 11.099 11.789 12.451 12.716 12.649 12.481 12.267 11.997 11.738 11.495 11.257 10.996 10.774 10.564 10.341 10.121 9.898 9.688 9.472 9.274 9.092 8.891 8.691 8.521 8.325 8.115 7.96 7.809 7.639 7.461 7.276 7.159 7.059 6.899 6.788 6.678 6.621 6.509 6.395 6.258 6.183 5.991 5.91 5.814 5.722 5.518 5.396 5.252 5.11 4.97 4.792 4.545 3.964 -8 ,23610 ,TETRA ,17525615,Thu Nov 25 01:34:41 CET,Thu Nov 25 03:24:37 CET,0.0 0.893 1.089 1.23 1.333 1.423 1.522 1.627 1.829 1.928 2.014 2.073 2.265 2.332 2.47 2.598 2.724 2.79 2.92 3.042 3.247 3.39 3.52 3.704 3.88 4.04 4.195 4.347 4.549 4.756 4.958 5.197 5.416 5.607 5.828 6.076 6.308 6.563 6.844 7.136 7.44 7.794 8.229 8.654 9.11 9.61 10.205 10.845 11.508 12.185 12.818 13.098 13.072 12.884 12.59 12.296 12.05 11.823 11.589 11.338 11.097 10.841 10.596 10.35 10.097 9.882 9.678 9.496 9.32 9.125 8.944 8.799 8.629 8.447 8.309 8.163 8.001 7.819 7.625 7.491 7.364 7.177 7.028 6.864 6.78 6.613 6.442 6.26 6.169 5.966 5.88 5.773 5.663 5.413 5.276 5.134 4.987 4.849 4.657 4.384 3.591 -9 ,10087 ,TETRA ,17525616,Thu Nov 25 01:34:43 CET,Thu Nov 25 03:25:32 CET,0.0 0.344 0.583 0.749 0.889 1.005 1.109 1.196 1.351 1.428 1.508 1.544 1.738 1.803 1.91 2.026 2.155 2.219 2.326 2.433 2.609 2.722 2.822 2.973 3.127 3.28 3.424 3.556 3.747 3.947 4.142 4.37 4.583 4.787 5.002 5.252 5.498 5.758 6.046 6.35 6.675 7.042 7.442 7.824 8.261 8.754 9.316 9.88 10.454 11.095 11.717 12.016 11.984 11.803 11.613 11.412 11.162 10.878 10.619 10.355 10.113 9.865 9.616 9.378 9.16 8.965 8.76 8.571 8.383 8.189 8.005 7.841 7.666 7.488 7.339 7.172 7.007 6.853 6.698 6.581 6.452 6.239 6.08 5.915 5.833 5.665 5.486 5.286 5.177 4.962 4.848 4.713 4.564 4.273 4.126 3.987 3.782 3.529 3.288 2.984 2.112 -10 ,16707 ,TETRA ,17525617,Thu Nov 25 01:34:41 CET,Thu Nov 25 03:24:58 CET,0.0 0.592 0.836 1.014 1.151 1.275 1.391 1.49 1.668 1.754 1.838 1.898 2.104 2.197 2.366 2.533 2.714 2.792 2.929 3.065 3.265 3.4 3.538 3.727 3.898 4.068 4.242 4.4 4.589 4.773 4.946 5.168 5.398 5.62 5.876 6.152 6.393 6.651 6.94 7.255 7.582 7.937 8.357 8.768 9.22 9.738 10.308 10.881 11.51 12.198 12.815 13.004 12.947 12.783 12.553 12.248 11.925 11.642 11.381 11.096 10.851 10.651 10.456 10.236 10.013 9.796 9.569 9.367 9.185 8.994 8.788 8.619 8.436 8.235 8.078 7.912 7.749 7.562 7.362 7.235 7.103 6.888 6.734 6.584 6.5 6.319 6.121 5.908 5.811 5.611 5.554 5.453 5.345 5.145 5.042 4.925 4.8 4.65 4.486 4.297 3.764 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt deleted file mode 100644 index 1fddb9bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13e_CAT-17a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14691 ,TETRA ,17525618,Thu Nov 25 01:34:42 CET,Thu Nov 25 03:25:25 CET,0.0 0.539 0.827 1.046 1.22 1.369 1.518 1.661 1.922 2.045 2.141 2.191 2.394 2.477 2.626 2.764 2.901 2.974 3.113 3.238 3.406 3.511 3.609 3.731 3.853 3.975 4.095 4.225 4.395 4.554 4.715 4.899 5.067 5.23 5.411 5.627 5.847 6.076 6.325 6.595 6.868 7.136 7.435 7.753 8.088 8.408 8.741 9.083 9.386 9.57 9.529 9.049 8.428 7.832 7.289 6.762 6.273 5.824 5.436 5.044 4.69 4.357 4.035 3.748 3.478 3.197 2.888 2.62 2.388 2.146 1.892 1.693 1.487 1.267 1.093 0.912 0.73 0.529 0.304 0.156 0.016 -0.185 -0.338 -0.5 -0.573 -0.735 -0.911 -1.094 -1.188 -1.401 -1.446 -1.538 -1.64 -1.824 -1.929 -2.049 -2.181 -2.328 -2.477 -2.662 -3.135 -2 ,9220 ,TETRA ,17525619,Thu Nov 25 01:34:41 CET,Thu Nov 25 03:23:18 CET,0.0 0.6 0.772 0.956 1.119 1.255 1.378 1.48 1.676 1.783 1.897 1.983 2.187 2.27 2.437 2.602 2.766 2.845 2.987 3.143 3.379 3.518 3.643 3.818 3.985 4.152 4.323 4.473 4.676 4.881 5.056 5.252 5.439 5.624 5.84 6.068 6.277 6.515 6.78 7.049 7.294 7.56 7.879 8.171 8.492 8.823 9.15 9.502 9.814 9.995 9.893 9.383 8.811 8.244 7.704 7.175 6.672 6.199 5.786 5.378 5.015 4.657 4.302 3.974 3.664 3.381 3.102 2.86 2.649 2.428 2.188 1.968 1.737 1.515 1.345 1.168 0.978 0.775 0.573 0.441 0.297 0.058 -0.095 -0.248 -0.333 -0.516 -0.693 -0.873 -0.971 -1.187 -1.274 -1.393 -1.528 -1.848 -2.008 -2.177 -2.385 -2.636 -2.88 -3.142 -3.762 -3 ,16298 ,TETRA ,17525620,Thu Nov 25 01:34:41 CET,Thu Nov 25 03:24:39 CET,0.0 0.79 1.087 1.312 1.493 1.645 1.779 1.904 2.118 2.209 2.3 2.376 2.597 2.688 2.858 3.018 3.159 3.225 3.353 3.485 3.678 3.803 3.922 4.09 4.251 4.422 4.596 4.757 4.964 5.16 5.337 5.548 5.735 5.912 6.123 6.34 6.554 6.806 7.061 7.325 7.62 7.92 8.247 8.547 8.853 9.167 9.496 9.785 10.055 10.258 10.158 9.657 9.023 8.451 7.933 7.402 6.909 6.446 6.039 5.643 5.295 4.966 4.652 4.336 4.016 3.735 3.462 3.207 2.978 2.746 2.519 2.338 2.16 1.986 1.841 1.686 1.534 1.375 1.195 1.08 0.977 0.818 0.709 0.586 0.523 0.392 0.228 0.044 -0.043 -0.248 -0.319 -0.424 -0.521 -0.758 -0.886 -1.035 -1.217 -1.4 -1.596 -1.845 -2.47 -4 ,20352 ,TETRA ,17525621,Thu Nov 25 01:35:39 CET,Thu Nov 25 03:26:39 CET,0.0 0.575 0.766 0.953 1.14 1.306 1.442 1.562 1.795 1.915 2.03 2.105 2.308 2.39 2.543 2.696 2.849 2.915 3.027 3.152 3.347 3.469 3.586 3.757 3.904 4.041 4.182 4.313 4.47 4.61 4.748 4.925 5.092 5.244 5.409 5.596 5.788 5.996 6.228 6.482 6.742 7.037 7.349 7.651 8.002 8.335 8.653 8.92 9.182 9.445 9.466 9.015 8.466 7.927 7.412 6.933 6.466 6.021 5.633 5.219 4.865 4.549 4.231 3.92 3.613 3.337 3.064 2.824 2.623 2.391 2.114 1.894 1.697 1.5 1.338 1.16 0.981 0.796 0.59 0.43 0.245 -0.003 -0.147 -0.307 -0.396 -0.585 -0.775 -0.956 -1.056 -1.287 -1.403 -1.534 -1.666 -1.944 -2.104 -2.277 -2.473 -2.698 -2.974 -3.312 -4.127 -5 ,3644 ,TETRA ,17525622,Thu Nov 25 01:35:39 CET,Thu Nov 25 03:26:14 CET,0.0 0.637 0.826 0.989 1.151 1.294 1.413 1.523 1.755 1.87 1.971 2.033 2.233 2.318 2.485 2.627 2.753 2.812 2.941 3.076 3.278 3.405 3.526 3.698 3.859 4.004 4.125 4.242 4.402 4.585 4.758 4.937 5.104 5.273 5.476 5.692 5.897 6.119 6.34 6.567 6.791 7.034 7.291 7.539 7.858 8.196 8.544 8.889 9.183 9.398 9.453 9.062 8.453 7.837 7.252 6.65 6.105 5.621 5.195 4.768 4.406 4.057 3.698 3.369 3.071 2.808 2.538 2.275 2.035 1.788 1.53 1.309 1.076 0.832 0.637 0.454 0.275 0.072 -0.138 -0.286 -0.453 -0.71 -0.891 -1.064 -1.143 -1.308 -1.469 -1.628 -1.709 -1.92 -1.996 -2.094 -2.187 -2.373 -2.478 -2.609 -2.763 -2.935 -3.142 -3.377 -3.962 -6 ,17426 ,TETRA ,17525623,Thu Nov 25 01:35:39 CET,Thu Nov 25 03:23:20 CET,0.0 0.659 0.952 1.16 1.303 1.434 1.565 1.693 1.945 2.063 2.163 2.235 2.449 2.544 2.722 2.881 3.018 3.086 3.218 3.333 3.481 3.581 3.683 3.829 3.963 4.081 4.198 4.326 4.488 4.634 4.78 4.958 5.121 5.283 5.48 5.699 5.885 6.092 6.345 6.579 6.835 7.153 7.487 7.782 8.104 8.455 8.796 9.11 9.43 9.693 9.66 9.262 8.684 8.074 7.504 6.932 6.43 5.97 5.555 5.14 4.805 4.505 4.217 3.95 3.69 3.434 3.142 2.849 2.591 2.338 2.073 1.86 1.641 1.396 1.206 1.022 0.839 0.668 0.507 0.393 0.273 0.082 -0.053 -0.198 -0.271 -0.419 -0.568 -0.722 -0.801 -1.002 -1.063 -1.165 -1.273 -1.525 -1.684 -1.848 -2.006 -2.186 -2.433 -2.746 -3.416 -7 ,27181 ,TETRA ,17525624,Thu Nov 25 01:35:39 CET,Thu Nov 25 03:25:54 CET,0.0 0.644 0.869 1.043 1.177 1.285 1.389 1.506 1.724 1.828 1.939 2.015 2.222 2.308 2.454 2.606 2.76 2.833 2.98 3.113 3.286 3.406 3.527 3.694 3.877 4.045 4.198 4.35 4.541 4.727 4.909 5.114 5.301 5.481 5.673 5.908 6.138 6.396 6.669 6.923 7.166 7.418 7.712 8.022 8.347 8.652 9.013 9.369 9.677 9.891 9.854 9.4 8.845 8.28 7.717 7.186 6.7 6.223 5.785 5.331 4.946 4.607 4.27 3.95 3.681 3.445 3.188 2.958 2.749 2.52 2.285 2.085 1.859 1.621 1.439 1.246 1.05 0.851 0.646 0.515 0.386 0.18 0.037 -0.106 -0.18 -0.336 -0.507 -0.692 -0.786 -1.004 -1.076 -1.174 -1.268 -1.458 -1.553 -1.665 -1.795 -1.934 -2.087 -2.307 -2.961 -8 ,21468 ,TETRA ,17525625,Thu Nov 25 01:35:40 CET,Thu Nov 25 03:27:10 CET,0.0 0.749 1.043 1.275 1.451 1.612 1.764 1.886 2.089 2.178 2.269 2.325 2.521 2.597 2.741 2.887 3.027 3.097 3.243 3.389 3.6 3.72 3.833 4.001 4.164 4.32 4.472 4.62 4.804 4.991 5.17 5.38 5.59 5.8 6.029 6.267 6.47 6.682 6.926 7.197 7.459 7.699 8.006 8.324 8.67 9.053 9.44 9.817 10.136 10.303 10.188 9.651 9.035 8.454 7.903 7.367 6.878 6.447 6.081 5.69 5.313 4.954 4.621 4.312 4.004 3.709 3.387 3.101 2.883 2.649 2.386 2.178 1.958 1.719 1.537 1.356 1.175 1.001 0.818 0.689 0.565 0.371 0.225 0.076 0.001 -0.176 -0.366 -0.555 -0.646 -0.856 -0.913 -1.006 -1.109 -1.328 -1.446 -1.571 -1.697 -1.864 -2.075 -2.322 -2.63 -9 ,23957 ,TETRA ,17525626,Thu Nov 25 01:35:40 CET,Thu Nov 25 03:25:33 CET,0.0 0.607 0.866 1.079 1.241 1.389 1.522 1.631 1.831 1.93 2.027 2.101 2.311 2.416 2.625 2.801 2.956 3.034 3.195 3.357 3.584 3.715 3.825 3.991 4.182 4.364 4.519 4.676 4.879 5.069 5.246 5.454 5.662 5.856 6.079 6.309 6.52 6.763 7.02 7.29 7.574 7.874 8.208 8.519 8.823 9.138 9.471 9.793 10.101 10.317 10.272 9.782 9.175 8.592 8.06 7.534 7.044 6.599 6.204 5.796 5.449 5.146 4.86 4.578 4.321 4.11 3.888 3.675 3.486 3.286 3.07 2.907 2.74 2.565 2.434 2.279 2.112 1.947 1.782 1.678 1.57 1.394 1.274 1.142 1.069 0.915 0.742 0.557 0.471 0.27 0.213 0.112 0.012 -0.207 -0.339 -0.471 -0.584 -0.701 -0.878 -1.085 -1.453 -10 ,21168 ,TETRA ,17525627,Thu Nov 25 01:35:42 CET,Thu Nov 25 03:24:50 CET,0.0 0.61 0.814 0.99 1.151 1.292 1.415 1.521 1.708 1.791 1.876 1.927 2.137 2.227 2.378 2.538 2.702 2.78 2.95 3.113 3.314 3.437 3.572 3.779 3.949 4.106 4.275 4.432 4.622 4.802 4.984 5.213 5.407 5.575 5.782 6.023 6.261 6.518 6.775 7.032 7.316 7.616 7.912 8.221 8.553 8.874 9.198 9.495 9.746 9.888 9.773 9.299 8.748 8.156 7.593 7.102 6.635 6.164 5.729 5.294 4.933 4.612 4.316 4.035 3.765 3.511 3.24 2.998 2.783 2.551 2.302 2.091 1.875 1.654 1.485 1.31 1.117 0.919 0.723 0.591 0.456 0.238 0.081 -0.079 -0.166 -0.348 -0.522 -0.706 -0.81 -1.044 -1.154 -1.266 -1.368 -1.589 -1.717 -1.863 -2.028 -2.201 -2.389 -2.601 -3.182 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt deleted file mode 100644 index 6f2c5459..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13f_CAT-13e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24964 ,TETRA ,17525628,Thu Nov 25 01:35:40 CET,Thu Nov 25 03:27:17 CET,0.0 0.202 0.312 0.402 0.506 0.601 0.692 0.779 0.917 0.978 1.039 1.05 1.242 1.312 1.433 1.546 1.658 1.715 1.827 1.94 2.123 2.244 2.356 2.515 2.674 2.829 2.971 3.109 3.288 3.456 3.625 3.827 4.012 4.188 4.392 4.616 4.833 5.077 5.33 5.584 5.847 6.146 6.488 6.8 7.152 7.531 7.942 8.373 8.808 9.253 9.64 9.613 9.319 8.937 8.534 8.139 7.754 7.357 7.004 6.66 6.347 6.059 5.785 5.521 5.268 5.033 4.777 4.54 4.336 4.122 3.899 3.719 3.535 3.329 3.158 2.993 2.837 2.67 2.487 2.35 2.214 2.02 1.875 1.717 1.634 1.468 1.3 1.118 1.021 0.812 0.723 0.603 0.474 0.216 0.088 -0.033 -0.162 -0.307 -0.478 -0.692 -1.044 -2 ,18891 ,TETRA ,17525629,Thu Nov 25 01:36:40 CET,Thu Nov 25 03:28:21 CET,0.0 0.304 0.49 0.65 0.769 0.872 0.96 1.029 1.156 1.229 1.304 1.317 1.501 1.569 1.699 1.822 1.934 1.988 2.085 2.181 2.321 2.41 2.509 2.648 2.768 2.887 3.024 3.162 3.328 3.492 3.656 3.848 4.032 4.2 4.39 4.623 4.842 5.061 5.311 5.57 5.833 6.117 6.428 6.751 7.11 7.501 7.957 8.4 8.843 9.287 9.551 9.481 9.233 8.898 8.48 8.066 7.709 7.362 7.048 6.699 6.386 6.103 5.836 5.599 5.361 5.117 4.868 4.655 4.461 4.248 4.018 3.828 3.627 3.421 3.267 3.104 2.934 2.762 2.568 2.42 2.285 2.1 1.963 1.805 1.718 1.542 1.371 1.209 1.121 0.904 0.794 0.677 0.583 0.415 0.303 0.173 0.061 -0.063 -0.228 -0.452 -0.851 -3 ,8852 ,TETRA ,17525630,Thu Nov 25 01:36:40 CET,Thu Nov 25 03:27:57 CET,0.0 0.23 0.356 0.456 0.551 0.641 0.731 0.814 0.945 1.014 1.096 1.133 1.319 1.379 1.492 1.601 1.704 1.754 1.854 1.954 2.094 2.188 2.278 2.401 2.531 2.656 2.769 2.877 3.029 3.193 3.359 3.56 3.754 3.947 4.167 4.391 4.589 4.807 5.049 5.319 5.589 5.861 6.161 6.489 6.875 7.261 7.699 8.163 8.607 8.994 9.244 9.165 8.869 8.514 8.176 7.817 7.466 7.08 6.707 6.352 6.037 5.758 5.504 5.258 5.015 4.771 4.511 4.289 4.101 3.901 3.683 3.507 3.331 3.127 2.97 2.82 2.66 2.503 2.355 2.252 2.141 1.962 1.847 1.735 1.676 1.553 1.419 1.27 1.183 0.979 0.936 0.846 0.751 0.577 0.482 0.38 0.261 0.129 -0.024 -0.218 -0.559 -4 ,17335 ,TETRA ,17525631,Thu Nov 25 01:35:40 CET,Thu Nov 25 03:27:45 CET,0.0 0.85 1.145 1.351 1.548 1.725 1.889 2.028 2.256 2.359 2.462 2.537 2.735 2.809 2.968 3.115 3.247 3.315 3.442 3.57 3.768 3.889 3.998 4.148 4.294 4.443 4.586 4.719 4.896 5.068 5.221 5.404 5.588 5.763 5.974 6.213 6.427 6.652 6.897 7.155 7.415 7.72 8.093 8.451 8.841 9.248 9.679 10.125 10.577 10.973 11.213 11.118 10.817 10.44 10.043 9.635 9.262 8.897 8.562 8.204 7.891 7.604 7.321 7.055 6.796 6.554 6.299 6.068 5.874 5.675 5.471 5.307 5.141 4.975 4.847 4.716 4.575 4.427 4.273 4.158 4.048 3.884 3.76 3.629 3.562 3.433 3.306 3.165 3.086 2.897 2.868 2.789 2.705 2.511 2.403 2.296 2.191 2.082 1.947 1.79 1.534 -5 ,14084 ,TETRA ,17525632,Thu Nov 25 01:35:40 CET,Thu Nov 25 03:26:58 CET,0.0 0.18 0.33 0.464 0.588 0.692 0.791 0.885 1.051 1.126 1.201 1.222 1.403 1.461 1.577 1.689 1.812 1.879 2.009 2.143 2.338 2.45 2.558 2.725 2.889 3.039 3.183 3.322 3.505 3.676 3.836 4.027 4.205 4.38 4.578 4.796 5.004 5.23 5.475 5.731 6.005 6.305 6.64 6.976 7.335 7.711 8.13 8.554 8.979 9.393 9.693 9.615 9.32 8.951 8.556 8.149 7.763 7.39 7.038 6.663 6.342 6.048 5.766 5.503 5.263 5.061 4.835 4.634 4.465 4.28 4.091 3.939 3.779 3.601 3.468 3.334 3.194 3.056 2.906 2.796 2.68 2.516 2.408 2.28 2.213 2.085 1.941 1.797 1.731 1.546 1.493 1.403 1.323 1.13 1.017 0.91 0.787 0.651 0.52 0.327 -0.017 -6 ,26036 ,TETRA ,17525633,Thu Nov 25 01:35:40 CET,Thu Nov 25 03:27:21 CET,0.0 0.207 0.342 0.453 0.562 0.655 0.74 0.826 0.986 1.06 1.136 1.17 1.355 1.423 1.567 1.716 1.873 1.946 2.082 2.208 2.382 2.49 2.598 2.75 2.901 3.061 3.211 3.351 3.527 3.694 3.854 4.051 4.255 4.449 4.669 4.913 5.14 5.373 5.618 5.889 6.159 6.444 6.774 7.112 7.49 7.89 8.336 8.799 9.274 9.713 9.978 9.868 9.55 9.142 8.738 8.345 7.977 7.629 7.324 7.003 6.714 6.437 6.165 5.932 5.697 5.454 5.209 4.989 4.798 4.595 4.374 4.197 4.006 3.798 3.641 3.467 3.279 3.101 2.93 2.809 2.673 2.465 2.325 2.171 2.087 1.919 1.75 1.573 1.474 1.254 1.166 1.066 0.961 0.732 0.618 0.51 0.385 0.247 0.084 -0.114 -0.543 -7 ,26040 ,TETRA ,17525634,Thu Nov 25 01:35:40 CET,Thu Nov 25 03:26:58 CET,0.0 0.29 0.437 0.572 0.69 0.801 0.902 0.989 1.148 1.232 1.319 1.381 1.579 1.658 1.818 1.991 2.156 2.225 2.358 2.489 2.669 2.784 2.895 3.053 3.221 3.387 3.533 3.672 3.844 3.998 4.167 4.387 4.583 4.772 4.984 5.199 5.408 5.633 5.874 6.135 6.403 6.715 7.052 7.36 7.724 8.128 8.575 9.048 9.494 9.907 10.18 10.062 9.748 9.368 8.976 8.592 8.223 7.833 7.477 7.139 6.831 6.54 6.25 5.965 5.695 5.459 5.225 5.007 4.818 4.611 4.381 4.186 3.991 3.793 3.633 3.465 3.302 3.137 2.954 2.825 2.69 2.469 2.308 2.14 2.055 1.875 1.677 1.478 1.383 1.171 1.062 0.94 0.814 0.546 0.389 0.209 0.036 -0.143 -0.366 -0.632 -1.192 -8 ,26096 ,TETRA ,17525635,Thu Nov 25 01:35:40 CET,Thu Nov 25 03:27:33 CET,0.0 0.324 0.45 0.552 0.648 0.745 0.833 0.913 1.094 1.185 1.276 1.341 1.538 1.61 1.751 1.89 2.033 2.103 2.234 2.36 2.545 2.665 2.777 2.939 3.091 3.232 3.371 3.507 3.686 3.862 4.019 4.201 4.378 4.566 4.784 4.993 5.196 5.43 5.681 5.935 6.2 6.496 6.834 7.177 7.559 7.954 8.381 8.83 9.29 9.754 10.121 10.089 9.813 9.472 9.114 8.719 8.328 7.978 7.679 7.348 7.044 6.768 6.493 6.235 5.999 5.766 5.503 5.28 5.076 4.864 4.662 4.479 4.288 4.093 3.937 3.778 3.614 3.46 3.317 3.211 3.102 2.943 2.824 2.686 2.621 2.494 2.352 2.203 2.129 1.928 1.869 1.782 1.7 1.533 1.44 1.338 1.216 1.074 0.947 0.798 0.405 -9 ,19621 ,TETRA ,17525636,Thu Nov 25 01:36:40 CET,Thu Nov 25 03:28:13 CET,0.0 0.334 0.44 0.531 0.63 0.729 0.824 0.919 1.108 1.188 1.261 1.277 1.461 1.53 1.653 1.766 1.869 1.919 2.029 2.137 2.278 2.37 2.468 2.617 2.757 2.878 2.994 3.106 3.253 3.397 3.53 3.696 3.861 4.035 4.242 4.468 4.696 4.925 5.146 5.387 5.663 5.979 6.325 6.66 7.049 7.439 7.849 8.302 8.788 9.235 9.519 9.409 9.097 8.73 8.302 7.867 7.486 7.106 6.758 6.399 6.091 5.813 5.532 5.257 5.002 4.76 4.5 4.277 4.078 3.868 3.668 3.507 3.344 3.171 3.037 2.906 2.769 2.623 2.469 2.364 2.242 2.051 1.929 1.805 1.742 1.607 1.469 1.334 1.261 1.064 1.016 0.925 0.825 0.625 0.529 0.429 0.315 0.198 0.067 -0.107 -0.489 -10 ,27435 ,TETRA ,17525637,Thu Nov 25 01:36:40 CET,Thu Nov 25 03:29:38 CET,0.0 0.355 0.508 0.642 0.742 0.823 0.905 0.992 1.163 1.246 1.337 1.405 1.605 1.688 1.852 2.011 2.17 2.24 2.363 2.48 2.648 2.759 2.866 3.028 3.194 3.355 3.507 3.638 3.801 3.967 4.13 4.316 4.487 4.666 4.877 5.097 5.31 5.561 5.823 6.082 6.361 6.673 7.025 7.375 7.754 8.156 8.62 9.087 9.551 9.981 10.235 10.124 9.837 9.504 9.133 8.736 8.333 7.935 7.581 7.225 6.92 6.64 6.36 6.087 5.826 5.601 5.374 5.148 4.938 4.732 4.527 4.349 4.16 3.952 3.793 3.64 3.483 3.317 3.128 2.992 2.847 2.631 2.49 2.336 2.256 2.098 1.948 1.787 1.692 1.476 1.392 1.298 1.207 1.004 0.898 0.791 0.678 0.565 0.427 0.227 -0.185 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt deleted file mode 100644 index 26165a61..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27608 ,TETRA ,17525638,Thu Nov 25 01:36:41 CET,Thu Nov 25 03:30:10 CET,0.0 0.261 0.399 0.522 0.628 0.719 0.796 0.872 1.02 1.092 1.169 1.195 1.372 1.425 1.534 1.645 1.752 1.804 1.903 2.009 2.165 2.264 2.369 2.532 2.686 2.826 2.967 3.103 3.271 3.44 3.608 3.814 4.0 4.17 4.359 4.576 4.803 5.041 5.289 5.546 5.802 6.091 6.431 6.754 7.115 7.485 7.881 8.275 8.636 8.989 9.214 9.059 8.669 8.17 7.695 7.224 6.772 6.358 5.998 5.608 5.263 4.948 4.64 4.359 4.081 3.805 3.523 3.276 3.047 2.804 2.545 2.339 2.137 1.929 1.768 1.596 1.423 1.252 1.085 0.962 0.826 0.616 0.468 0.315 0.237 0.081 -0.082 -0.26 -0.36 -0.584 -0.676 -0.778 -0.884 -1.121 -1.251 -1.409 -1.602 -1.811 -2.041 -2.343 -2.97 -2 ,3498 ,TETRA ,17525639,Thu Nov 25 01:36:41 CET,Thu Nov 25 03:28:44 CET,0.0 0.213 0.34 0.443 0.534 0.623 0.701 0.771 0.905 0.971 1.032 1.026 1.209 1.277 1.4 1.522 1.643 1.703 1.809 1.908 2.074 2.188 2.295 2.447 2.586 2.719 2.86 2.999 3.169 3.338 3.503 3.712 3.911 4.091 4.293 4.512 4.731 4.972 5.217 5.476 5.749 6.039 6.349 6.669 7.039 7.402 7.797 8.241 8.684 9.022 9.153 8.907 8.477 7.974 7.499 7.054 6.624 6.215 5.846 5.47 5.13 4.814 4.519 4.244 3.977 3.725 3.481 3.271 3.08 2.871 2.655 2.47 2.271 2.068 1.91 1.753 1.584 1.408 1.23 1.102 0.975 0.784 0.639 0.483 0.407 0.257 0.098 -0.074 -0.169 -0.39 -0.473 -0.596 -0.733 -0.994 -1.14 -1.286 -1.423 -1.58 -1.778 -2.025 -2.69 -3 ,5860 ,TETRA ,17525640,Thu Nov 25 01:36:41 CET,Thu Nov 25 03:28:30 CET,0.0 0.213 0.347 0.451 0.547 0.64 0.728 0.808 0.942 1.004 1.067 1.082 1.26 1.318 1.436 1.547 1.661 1.716 1.814 1.909 2.054 2.148 2.238 2.384 2.539 2.687 2.835 2.99 3.188 3.358 3.511 3.698 3.885 4.055 4.258 4.501 4.724 4.954 5.2 5.455 5.724 6.019 6.352 6.687 7.067 7.462 7.868 8.286 8.694 9.087 9.348 9.27 8.991 8.536 8.011 7.502 7.03 6.586 6.216 5.856 5.523 5.208 4.907 4.617 4.34 4.092 3.829 3.579 3.361 3.142 2.913 2.71 2.512 2.312 2.146 1.981 1.801 1.601 1.393 1.239 1.084 0.86 0.708 0.539 0.446 0.269 0.073 -0.146 -0.259 -0.495 -0.612 -0.73 -0.853 -1.13 -1.301 -1.488 -1.67 -1.882 -2.138 -2.462 -3.073 -4 ,4275 ,TETRA ,17525641,Thu Nov 25 01:36:41 CET,Thu Nov 25 03:28:26 CET,0.0 0.226 0.349 0.458 0.567 0.664 0.755 0.844 0.999 1.069 1.135 1.14 1.315 1.375 1.491 1.607 1.718 1.771 1.879 1.981 2.123 2.213 2.295 2.414 2.538 2.664 2.793 2.915 3.068 3.224 3.381 3.564 3.741 3.915 4.126 4.358 4.568 4.793 5.024 5.271 5.532 5.827 6.14 6.436 6.79 7.177 7.594 7.999 8.38 8.675 8.821 8.608 8.194 7.736 7.259 6.78 6.351 5.959 5.585 5.197 4.845 4.513 4.198 3.899 3.626 3.366 3.088 2.842 2.624 2.397 2.144 1.926 1.704 1.481 1.307 1.128 0.952 0.764 0.56 0.417 0.269 0.053 -0.101 -0.266 -0.352 -0.543 -0.743 -0.955 -1.062 -1.28 -1.371 -1.477 -1.585 -1.818 -1.938 -2.065 -2.22 -2.411 -2.614 -2.865 -3.493 -5 ,25497 ,TETRA ,17525642,Thu Nov 25 01:36:41 CET,Thu Nov 25 03:30:55 CET,0.0 0.255 0.396 0.505 0.603 0.7 0.792 0.877 1.025 1.098 1.175 1.188 1.367 1.434 1.564 1.696 1.824 1.883 2.005 2.129 2.304 2.415 2.527 2.686 2.828 2.966 3.099 3.232 3.4 3.551 3.71 3.909 4.094 4.269 4.462 4.67 4.864 5.083 5.333 5.59 5.85 6.152 6.494 6.818 7.166 7.534 7.955 8.393 8.84 9.202 9.383 9.2 8.8 8.357 7.908 7.479 7.079 6.652 6.257 5.87 5.538 5.222 4.912 4.63 4.361 4.1 3.821 3.577 3.359 3.129 2.893 2.706 2.529 2.346 2.203 2.062 1.917 1.755 1.563 1.434 1.318 1.127 0.981 0.833 0.76 0.608 0.458 0.301 0.207 -0.018 -0.124 -0.235 -0.348 -0.615 -0.769 -0.933 -1.1 -1.293 -1.516 -1.731 -2.213 -6 ,7687 ,TETRA ,17525643,Thu Nov 25 01:36:41 CET,Thu Nov 25 03:17:50 CET,0.0 0.196 0.319 0.421 0.52 0.615 0.706 0.791 0.936 0.999 1.058 1.077 1.261 1.317 1.428 1.539 1.643 1.694 1.802 1.9 2.04 2.135 2.224 2.348 2.469 2.586 2.705 2.835 3.003 3.159 3.307 3.507 3.713 3.887 4.077 4.301 4.518 4.747 4.998 5.279 5.579 5.881 6.193 6.491 6.826 7.205 7.625 8.051 8.469 8.825 9.01 8.803 8.431 7.981 7.479 6.989 6.552 6.108 5.711 5.333 4.976 4.645 4.34 4.048 3.788 3.536 3.248 3.005 2.81 2.592 2.336 2.128 1.917 1.698 1.532 1.356 1.179 1.0 0.796 0.65 0.504 0.271 0.115 -0.048 -0.133 -0.308 -0.488 -0.662 -0.756 -0.972 -1.04 -1.15 -1.261 -1.481 -1.616 -1.765 -1.918 -2.058 -2.239 -2.479 -3.076 -7 ,32597 ,TETRA ,17525644,Thu Nov 25 01:36:41 CET,Thu Nov 25 03:28:27 CET,0.0 0.284 0.433 0.548 0.648 0.729 0.808 0.895 1.06 1.129 1.191 1.201 1.379 1.444 1.588 1.731 1.86 1.925 2.047 2.165 2.355 2.475 2.583 2.742 2.903 3.049 3.191 3.333 3.5 3.655 3.809 4.002 4.183 4.354 4.553 4.784 5.01 5.241 5.476 5.732 6.001 6.305 6.642 6.963 7.331 7.724 8.137 8.556 9.005 9.375 9.482 9.23 8.804 8.327 7.868 7.429 7.023 6.631 6.253 5.843 5.49 5.163 4.84 4.538 4.251 3.996 3.719 3.463 3.244 3.016 2.773 2.57 2.351 2.118 1.949 1.792 1.631 1.456 1.284 1.171 1.057 0.865 0.727 0.59 0.519 0.375 0.211 0.034 -0.054 -0.26 -0.327 -0.429 -0.544 -0.775 -0.907 -1.057 -1.213 -1.38 -1.586 -1.834 -2.299 -8 ,27328 ,TETRA ,17525645,Thu Nov 25 01:36:43 CET,Thu Nov 25 03:28:30 CET,0.0 0.253 0.363 0.486 0.615 0.731 0.854 0.972 1.156 1.258 1.363 1.414 1.607 1.683 1.819 1.959 2.105 2.174 2.304 2.422 2.597 2.71 2.82 2.991 3.147 3.292 3.44 3.576 3.753 3.926 4.08 4.265 4.445 4.613 4.802 5.017 5.217 5.422 5.66 5.924 6.193 6.479 6.794 7.112 7.484 7.881 8.308 8.746 9.189 9.574 9.8 9.656 9.24 8.746 8.264 7.788 7.345 6.938 6.56 6.15 5.787 5.47 5.172 4.891 4.636 4.389 4.126 3.894 3.679 3.456 3.212 2.993 2.777 2.557 2.387 2.212 2.022 1.824 1.625 1.495 1.359 1.142 1.005 0.853 0.772 0.612 0.437 0.253 0.153 -0.071 -0.151 -0.243 -0.353 -0.617 -0.764 -0.911 -1.044 -1.218 -1.446 -1.762 -2.355 -9 ,5152 ,TETRA ,17525646,Thu Nov 25 01:36:41 CET,Thu Nov 25 03:17:50 CET,0.0 0.284 0.409 0.518 0.633 0.742 0.849 0.941 1.091 1.168 1.246 1.27 1.451 1.512 1.644 1.793 1.942 2.019 2.163 2.286 2.453 2.555 2.658 2.817 2.982 3.134 3.268 3.407 3.591 3.756 3.91 4.085 4.258 4.439 4.656 4.889 5.103 5.332 5.577 5.837 6.096 6.377 6.697 7.019 7.393 7.803 8.247 8.657 9.044 9.431 9.701 9.573 9.157 8.658 8.181 7.722 7.296 6.884 6.488 6.085 5.741 5.44 5.135 4.815 4.516 4.244 3.96 3.708 3.493 3.272 3.042 2.851 2.646 2.415 2.237 2.058 1.879 1.695 1.494 1.354 1.229 1.058 0.935 0.808 0.733 0.574 0.424 0.26 0.164 -0.049 -0.125 -0.234 -0.344 -0.593 -0.733 -0.869 -1.011 -1.172 -1.382 -1.67 -2.228 -10 ,13452 ,TETRA ,17525647,Thu Nov 25 01:36:42 CET,Thu Nov 25 03:28:23 CET,0.0 0.249 0.367 0.477 0.589 0.687 0.777 0.867 1.046 1.115 1.18 1.194 1.369 1.425 1.53 1.623 1.722 1.775 1.888 1.996 2.135 2.226 2.311 2.431 2.549 2.663 2.773 2.882 3.024 3.165 3.316 3.502 3.677 3.853 4.06 4.289 4.493 4.711 4.94 5.179 5.438 5.735 6.071 6.397 6.768 7.16 7.555 7.964 8.368 8.737 9.023 8.922 8.541 8.05 7.552 7.059 6.616 6.242 5.903 5.502 5.164 4.86 4.544 4.247 3.976 3.733 3.476 3.233 3.01 2.773 2.523 2.315 2.113 1.906 1.726 1.547 1.383 1.198 1.0 0.862 0.716 0.48 0.313 0.145 0.058 -0.13 -0.327 -0.517 -0.611 -0.817 -0.909 -1.022 -1.132 -1.372 -1.496 -1.623 -1.762 -1.947 -2.16 -2.4 -2.926 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt deleted file mode 100644 index 32871379..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13g_CAT-13f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18599 ,TETRA ,17525648,Thu Nov 25 01:36:44 CET,Thu Nov 25 03:29:26 CET,0.0 0.188 0.325 0.447 0.549 0.641 0.725 0.802 0.929 0.987 1.057 1.077 1.256 1.316 1.438 1.567 1.689 1.745 1.86 1.973 2.113 2.202 2.289 2.409 2.523 2.644 2.774 2.892 3.033 3.163 3.29 3.455 3.628 3.808 3.997 4.199 4.406 4.621 4.847 5.1 5.347 5.604 5.903 6.196 6.52 6.887 7.282 7.645 7.959 8.177 8.195 7.807 7.291 6.746 6.225 5.733 5.282 4.873 4.498 4.116 3.794 3.5 3.21 2.921 2.649 2.404 2.154 1.932 1.739 1.534 1.318 1.141 0.951 0.743 0.586 0.427 0.264 0.093 -0.107 -0.238 -0.364 -0.579 -0.723 -0.873 -0.955 -1.122 -1.3 -1.475 -1.559 -1.772 -1.855 -1.957 -2.071 -2.327 -2.461 -2.603 -2.778 -2.971 -3.171 -3.392 -3.744 -2 ,7508 ,TETRA ,17525649,Thu Nov 25 01:37:41 CET,Thu Nov 25 03:33:08 CET,0.0 0.374 0.62 0.821 0.984 1.137 1.261 1.38 1.62 1.727 1.822 1.888 2.088 2.172 2.325 2.472 2.599 2.658 2.785 2.903 3.073 3.186 3.3 3.459 3.597 3.737 3.875 4.013 4.205 4.381 4.539 4.732 4.912 5.085 5.288 5.519 5.738 5.965 6.197 6.437 6.713 7.011 7.323 7.628 7.95 8.281 8.636 8.974 9.33 9.619 9.635 9.315 8.861 8.35 7.838 7.353 6.905 6.465 6.073 5.656 5.287 4.978 4.671 4.366 4.087 3.846 3.59 3.362 3.169 2.958 2.721 2.518 2.323 2.125 1.967 1.798 1.628 1.467 1.303 1.186 1.069 0.909 0.797 0.679 0.621 0.494 0.353 0.196 0.112 -0.088 -0.128 -0.215 -0.312 -0.508 -0.604 -0.696 -0.8 -0.936 -1.102 -1.303 -1.6 -3 ,5987 ,TETRA ,17525650,Thu Nov 25 01:37:40 CET,Thu Nov 25 03:33:41 CET,0.0 0.337 0.615 0.806 0.951 1.101 1.251 1.378 1.584 1.675 1.768 1.836 2.037 2.121 2.277 2.428 2.575 2.645 2.773 2.893 3.068 3.182 3.294 3.446 3.596 3.739 3.873 4.004 4.182 4.356 4.51 4.682 4.85 5.012 5.196 5.412 5.611 5.819 6.05 6.302 6.557 6.831 7.143 7.432 7.767 8.123 8.478 8.851 9.196 9.425 9.464 9.159 8.68 8.15 7.615 7.109 6.662 6.214 5.826 5.457 5.128 4.828 4.53 4.24 3.97 3.721 3.47 3.244 3.044 2.841 2.63 2.445 2.252 2.053 1.897 1.737 1.576 1.404 1.225 1.108 0.988 0.795 0.645 0.492 0.417 0.25 0.079 -0.103 -0.2 -0.419 -0.505 -0.615 -0.721 -0.902 -1.007 -1.125 -1.247 -1.385 -1.527 -1.68 -2.03 -4 ,10488 ,TETRA ,17525651,Thu Nov 25 01:37:40 CET,Thu Nov 25 03:30:05 CET,0.0 0.204 0.338 0.442 0.542 0.633 0.725 0.817 0.968 1.027 1.089 1.107 1.292 1.352 1.467 1.581 1.694 1.75 1.85 1.94 2.065 2.147 2.228 2.349 2.471 2.587 2.701 2.809 2.949 3.093 3.238 3.407 3.557 3.713 3.896 4.087 4.285 4.522 4.764 5.008 5.265 5.553 5.886 6.212 6.576 6.936 7.285 7.609 7.913 8.168 8.224 7.879 7.382 6.863 6.379 5.886 5.42 5.0 4.619 4.227 3.877 3.56 3.269 2.984 2.715 2.483 2.246 2.036 1.849 1.656 1.461 1.3 1.134 0.961 0.826 0.692 0.559 0.412 0.249 0.135 0.016 -0.161 -0.283 -0.417 -0.486 -0.613 -0.736 -0.88 -0.957 -1.152 -1.194 -1.278 -1.361 -1.553 -1.649 -1.743 -1.845 -1.967 -2.107 -2.267 -2.535 -5 ,13073 ,TETRA ,17525652,Thu Nov 25 01:37:42 CET,Thu Nov 25 03:30:43 CET,0.0 0.296 0.421 0.534 0.645 0.74 0.825 0.911 1.065 1.136 1.211 1.245 1.43 1.495 1.621 1.735 1.845 1.895 1.991 2.085 2.219 2.308 2.394 2.512 2.634 2.765 2.886 3.008 3.182 3.359 3.526 3.714 3.885 4.062 4.268 4.481 4.688 4.912 5.143 5.375 5.618 5.886 6.197 6.516 6.872 7.223 7.563 7.913 8.271 8.494 8.438 8.071 7.557 6.994 6.448 5.93 5.459 5.046 4.685 4.298 3.959 3.661 3.364 3.065 2.789 2.544 2.292 2.047 1.825 1.605 1.38 1.199 1.016 0.82 0.655 0.487 0.323 0.146 -0.035 -0.16 -0.292 -0.502 -0.652 -0.807 -0.885 -1.038 -1.193 -1.349 -1.432 -1.638 -1.68 -1.765 -1.861 -2.071 -2.178 -2.291 -2.406 -2.526 -2.658 -2.811 -3.097 -6 ,17484 ,TETRA ,17525653,Thu Nov 25 01:37:42 CET,Thu Nov 25 03:29:49 CET,0.0 0.174 0.273 0.357 0.446 0.526 0.604 0.69 0.851 0.925 0.996 1.015 1.2 1.272 1.421 1.561 1.699 1.763 1.896 2.03 2.209 2.323 2.435 2.604 2.771 2.926 3.076 3.223 3.404 3.576 3.734 3.921 4.108 4.286 4.491 4.724 4.931 5.146 5.385 5.639 5.889 6.171 6.497 6.836 7.223 7.574 7.927 8.264 8.569 8.837 8.885 8.612 8.176 7.683 7.202 6.723 6.29 5.879 5.494 5.087 4.733 4.424 4.119 3.824 3.562 3.322 3.078 2.854 2.648 2.445 2.232 2.055 1.876 1.685 1.535 1.393 1.243 1.087 0.939 0.833 0.721 0.552 0.439 0.321 0.263 0.145 0.017 -0.133 -0.214 -0.407 -0.451 -0.543 -0.633 -0.831 -0.95 -1.067 -1.182 -1.308 -1.46 -1.632 -1.975 -7 ,29526 ,TETRA ,17525654,Thu Nov 25 01:37:43 CET,Thu Nov 25 03:29:57 CET,0.0 0.242 0.374 0.486 0.583 0.667 0.752 0.838 0.979 1.045 1.116 1.131 1.312 1.37 1.486 1.602 1.714 1.766 1.866 1.97 2.117 2.207 2.292 2.417 2.538 2.653 2.772 2.89 3.049 3.202 3.346 3.538 3.727 3.902 4.11 4.336 4.54 4.765 4.994 5.223 5.463 5.735 6.048 6.371 6.734 7.085 7.461 7.847 8.22 8.503 8.539 8.188 7.718 7.237 6.75 6.271 5.829 5.416 5.043 4.645 4.299 3.979 3.672 3.379 3.102 2.868 2.626 2.401 2.192 1.97 1.739 1.552 1.377 1.195 1.039 0.87 0.688 0.506 0.336 0.223 0.113 -0.061 -0.178 -0.293 -0.358 -0.491 -0.624 -0.768 -0.841 -1.041 -1.092 -1.17 -1.248 -1.43 -1.528 -1.627 -1.745 -1.872 -2.004 -2.175 -2.462 -8 ,25518 ,TETRA ,17525655,Thu Nov 25 01:38:37 CET,Thu Nov 25 03:30:50 CET,0.0 0.309 0.443 0.57 0.673 0.762 0.843 0.92 1.072 1.141 1.204 1.21 1.386 1.45 1.581 1.72 1.858 1.925 2.062 2.193 2.376 2.489 2.594 2.749 2.905 3.065 3.215 3.348 3.512 3.676 3.841 4.032 4.206 4.37 4.554 4.765 4.982 5.216 5.446 5.684 5.942 6.229 6.557 6.869 7.205 7.554 7.918 8.28 8.645 8.921 8.959 8.673 8.196 7.638 7.092 6.567 6.101 5.675 5.289 4.899 4.566 4.262 3.984 3.713 3.44 3.194 2.932 2.71 2.522 2.31 2.077 1.886 1.692 1.485 1.322 1.154 0.986 0.81 0.642 0.537 0.429 0.261 0.131 -0.005 -0.069 -0.202 -0.34 -0.484 -0.552 -0.734 -0.752 -0.837 -0.931 -1.117 -1.216 -1.331 -1.466 -1.61 -1.758 -1.929 -2.253 -9 ,12361 ,TETRA ,17525656,Thu Nov 25 01:38:39 CET,Thu Nov 25 03:31:59 CET,0.0 0.294 0.428 0.542 0.638 0.726 0.811 0.903 1.087 1.185 1.295 1.391 1.599 1.69 1.852 1.999 2.143 2.216 2.352 2.49 2.68 2.789 2.9 3.049 3.195 3.343 3.48 3.612 3.779 3.941 4.1 4.284 4.465 4.646 4.838 5.032 5.223 5.425 5.645 5.9 6.165 6.441 6.769 7.102 7.461 7.819 8.195 8.59 8.941 9.185 9.24 8.896 8.428 7.932 7.43 6.955 6.525 6.118 5.744 5.354 5.007 4.699 4.406 4.11 3.847 3.608 3.344 3.11 2.911 2.705 2.487 2.312 2.147 1.975 1.837 1.703 1.57 1.43 1.27 1.154 1.041 0.859 0.74 0.619 0.553 0.421 0.282 0.14 0.064 -0.136 -0.193 -0.279 -0.364 -0.547 -0.653 -0.77 -0.896 -1.032 -1.178 -1.363 -1.745 -10 ,959 ,TETRA ,17525657,Thu Nov 25 01:38:39 CET,Thu Nov 25 03:32:26 CET,0.0 0.152 0.285 0.401 0.493 0.584 0.678 0.755 0.873 0.942 1.018 1.034 1.209 1.259 1.376 1.512 1.658 1.725 1.851 1.981 2.166 2.282 2.385 2.535 2.694 2.849 3.001 3.137 3.307 3.479 3.639 3.822 3.998 4.17 4.363 4.575 4.789 5.014 5.245 5.508 5.785 6.065 6.365 6.656 6.995 7.358 7.724 8.071 8.389 8.639 8.701 8.328 7.754 7.19 6.664 6.147 5.676 5.242 4.87 4.468 4.113 3.814 3.527 3.253 3.014 2.8 2.58 2.38 2.202 2.018 1.82 1.653 1.477 1.308 1.184 1.047 0.908 0.757 0.584 0.462 0.349 0.188 0.07 -0.07 -0.138 -0.256 -0.393 -0.544 -0.615 -0.805 -0.838 -0.913 -0.988 -1.155 -1.25 -1.36 -1.483 -1.608 -1.736 -1.909 -2.264 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt deleted file mode 100644 index f4c60447..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20505 ,TETRA ,17525658,Thu Nov 25 01:38:39 CET,Thu Nov 25 03:30:41 CET,0.0 0.181 0.298 0.383 0.482 0.595 0.705 0.806 0.983 1.066 1.136 1.155 1.329 1.389 1.506 1.625 1.741 1.795 1.9 1.993 2.131 2.231 2.323 2.445 2.562 2.68 2.79 2.894 3.03 3.158 3.273 3.403 3.523 3.645 3.785 3.931 4.07 4.219 4.372 4.528 4.694 4.892 5.088 5.222 5.368 5.52 5.64 5.673 5.636 5.44 4.79 3.832 2.937 2.13 1.375 0.645 -0.006 -0.589 -1.135 -1.735 -2.254 -2.71 -3.166 -3.589 -3.959 -4.293 -4.666 -5.011 -5.285 -5.573 -5.884 -6.146 -6.416 -6.69 -6.898 -7.133 -7.384 -7.626 -7.889 -8.077 -8.262 -8.55 -8.754 -8.969 -9.076 -9.286 -9.518 -9.77 -9.901 -10.159 -10.319 -10.478 -10.646 -10.991 -11.182 -11.374 -11.583 -11.825 -12.142 -12.593 -14.064 -2 ,28743 ,TETRA ,17525659,Thu Nov 25 01:38:39 CET,Thu Nov 25 03:27:18 CET,0.0 0.331 0.46 0.563 0.662 0.751 0.832 0.911 1.052 1.111 1.164 1.163 1.334 1.387 1.498 1.607 1.695 1.735 1.817 1.898 2.014 2.087 2.158 2.263 2.37 2.472 2.572 2.679 2.809 2.917 3.028 3.172 3.322 3.467 3.615 3.766 3.903 4.056 4.22 4.388 4.563 4.747 4.931 5.1 5.271 5.41 5.518 5.591 5.614 5.482 4.923 3.88 2.892 1.974 1.141 0.384 -0.297 -0.913 -1.459 -2.016 -2.482 -2.922 -3.341 -3.718 -4.079 -4.424 -4.779 -5.081 -5.347 -5.619 -5.923 -6.191 -6.46 -6.739 -6.964 -7.191 -7.427 -7.67 -7.922 -8.099 -8.285 -8.607 -8.828 -9.041 -9.151 -9.378 -9.624 -9.904 -10.042 -10.308 -10.481 -10.633 -10.798 -11.136 -11.325 -11.551 -11.786 -12.048 -12.379 -12.794 -13.747 -3 ,12230 ,TETRA ,17525660,Thu Nov 25 01:38:41 CET,Thu Nov 25 03:27:26 CET,0.0 0.267 0.39 0.514 0.608 0.681 0.752 0.817 0.943 1.003 1.061 1.058 1.23 1.282 1.376 1.473 1.565 1.608 1.697 1.784 1.908 1.982 2.051 2.149 2.244 2.341 2.43 2.519 2.644 2.771 2.905 3.056 3.186 3.32 3.479 3.644 3.782 3.93 4.091 4.259 4.437 4.606 4.79 4.971 5.156 5.343 5.505 5.653 5.735 5.618 5.225 4.344 3.386 2.517 1.697 0.888 0.193 -0.39 -0.911 -1.45 -1.926 -2.361 -2.778 -3.19 -3.576 -3.91 -4.243 -4.558 -4.837 -5.113 -5.427 -5.7 -5.965 -6.251 -6.484 -6.719 -6.96 -7.2 -7.452 -7.634 -7.823 -8.134 -8.353 -8.575 -8.684 -8.902 -9.154 -9.429 -9.57 -9.836 -10.002 -10.165 -10.341 -10.746 -10.975 -11.206 -11.486 -11.817 -12.17 -12.602 -13.668 -4 ,19138 ,TETRA ,17525661,Thu Nov 25 01:38:39 CET,Thu Nov 25 03:29:15 CET,0.0 0.408 0.601 0.745 0.859 0.971 1.074 1.165 1.346 1.427 1.506 1.543 1.725 1.793 1.929 2.061 2.173 2.225 2.323 2.42 2.555 2.648 2.747 2.869 2.964 3.063 3.174 3.282 3.415 3.53 3.641 3.78 3.915 4.044 4.19 4.349 4.489 4.635 4.796 4.966 5.136 5.328 5.547 5.731 5.906 6.086 6.266 6.388 6.433 6.323 5.837 4.972 4.134 3.329 2.579 1.889 1.271 0.656 0.088 -0.479 -0.956 -1.392 -1.817 -2.222 -2.609 -2.947 -3.288 -3.604 -3.888 -4.179 -4.474 -4.723 -4.978 -5.235 -5.445 -5.656 -5.871 -6.1 -6.341 -6.516 -6.688 -6.965 -7.164 -7.371 -7.476 -7.704 -7.961 -8.197 -8.311 -8.561 -8.722 -8.868 -9.01 -9.344 -9.55 -9.779 -9.998 -10.224 -10.543 -10.988 -12.286 -5 ,27921 ,TETRA ,17525662,Thu Nov 25 01:38:39 CET,Thu Nov 25 03:17:08 CET,0.0 0.251 0.358 0.459 0.556 0.638 0.715 0.784 0.904 0.964 1.019 1.012 1.181 1.231 1.32 1.414 1.512 1.555 1.628 1.709 1.822 1.895 1.972 2.084 2.185 2.284 2.384 2.479 2.601 2.706 2.803 2.928 3.042 3.148 3.279 3.437 3.594 3.76 3.929 4.114 4.3 4.491 4.7 4.887 5.081 5.254 5.406 5.526 5.569 5.422 4.897 3.971 3.037 2.186 1.389 0.616 -0.04 -0.636 -1.171 -1.701 -2.171 -2.626 -3.066 -3.476 -3.873 -4.237 -4.595 -4.904 -5.183 -5.47 -5.764 -6.02 -6.299 -6.573 -6.776 -7.003 -7.245 -7.506 -7.771 -7.947 -8.144 -8.445 -8.646 -8.863 -8.98 -9.231 -9.494 -9.763 -9.89 -10.147 -10.339 -10.519 -10.71 -11.095 -11.319 -11.568 -11.84 -12.151 -12.545 -13.075 -14.081 -6 ,1483 ,TETRA ,17525663,Thu Nov 25 01:38:39 CET,Thu Nov 25 03:17:19 CET,0.0 0.225 0.337 0.439 0.529 0.62 0.711 0.789 0.938 1.008 1.075 1.084 1.251 1.301 1.394 1.491 1.581 1.625 1.715 1.806 1.935 2.014 2.086 2.189 2.285 2.375 2.462 2.549 2.67 2.787 2.897 3.027 3.148 3.265 3.402 3.554 3.709 3.874 4.037 4.205 4.373 4.562 4.779 4.964 5.12 5.272 5.422 5.533 5.569 5.413 4.86 3.903 2.906 2.028 1.298 0.607 -0.015 -0.619 -1.211 -1.81 -2.312 -2.746 -3.178 -3.602 -3.993 -4.356 -4.721 -5.063 -5.368 -5.661 -5.963 -6.223 -6.491 -6.761 -6.982 -7.227 -7.478 -7.741 -8.002 -8.181 -8.384 -8.716 -8.939 -9.172 -9.286 -9.507 -9.741 -9.974 -10.099 -10.364 -10.536 -10.689 -10.847 -11.196 -11.386 -11.585 -11.794 -12.019 -12.326 -12.771 -13.966 -7 ,27726 ,TETRA ,17525664,Thu Nov 25 01:39:39 CET,Thu Nov 25 03:28:29 CET,0.0 0.151 0.243 0.336 0.438 0.519 0.591 0.654 0.762 0.814 0.875 0.881 1.048 1.101 1.183 1.26 1.346 1.387 1.465 1.547 1.665 1.738 1.806 1.9 1.985 2.061 2.144 2.234 2.34 2.44 2.543 2.659 2.759 2.861 2.983 3.113 3.236 3.367 3.513 3.659 3.802 3.962 4.139 4.3 4.484 4.65 4.781 4.875 4.863 4.652 4.066 3.139 2.168 1.295 0.543 -0.178 -0.829 -1.429 -1.997 -2.568 -3.017 -3.401 -3.789 -4.199 -4.584 -4.928 -5.29 -5.614 -5.883 -6.155 -6.456 -6.712 -6.98 -7.251 -7.451 -7.66 -7.884 -8.118 -8.353 -8.512 -8.677 -8.943 -9.137 -9.335 -9.43 -9.639 -9.865 -10.105 -10.233 -10.486 -10.614 -10.759 -10.927 -11.3 -11.508 -11.745 -12.001 -12.276 -12.602 -13.013 -13.986 -8 ,4235 ,TETRA ,17525665,Thu Nov 25 01:39:39 CET,Thu Nov 25 03:29:49 CET,0.0 0.305 0.442 0.561 0.667 0.754 0.831 0.896 1.033 1.102 1.166 1.164 1.335 1.389 1.481 1.566 1.644 1.686 1.774 1.857 1.973 2.045 2.111 2.209 2.307 2.398 2.485 2.575 2.694 2.8 2.91 3.055 3.181 3.301 3.451 3.618 3.766 3.927 4.099 4.272 4.447 4.636 4.863 5.057 5.228 5.4 5.572 5.682 5.736 5.651 5.136 4.246 3.412 2.626 1.86 1.146 0.496 -0.105 -0.624 -1.166 -1.629 -2.047 -2.453 -2.843 -3.219 -3.557 -3.913 -4.244 -4.533 -4.823 -5.105 -5.343 -5.603 -5.885 -6.105 -6.323 -6.543 -6.77 -7.015 -7.187 -7.366 -7.629 -7.807 -8.008 -8.112 -8.326 -8.54 -8.788 -8.922 -9.166 -9.302 -9.447 -9.616 -10.016 -10.219 -10.426 -10.662 -10.937 -11.253 -11.712 -12.846 -9 ,9851 ,TETRA ,17525666,Thu Nov 25 01:39:40 CET,Thu Nov 25 03:29:02 CET,0.0 0.179 0.279 0.367 0.434 0.491 0.568 0.651 0.784 0.845 0.906 0.905 1.071 1.125 1.224 1.32 1.409 1.447 1.527 1.618 1.754 1.844 1.933 2.057 2.176 2.288 2.39 2.493 2.627 2.752 2.872 3.013 3.152 3.285 3.425 3.584 3.739 3.903 4.06 4.21 4.374 4.552 4.734 4.916 5.145 5.352 5.519 5.626 5.632 5.498 4.992 4.094 3.186 2.367 1.624 0.927 0.286 -0.334 -0.859 -1.367 -1.828 -2.275 -2.717 -3.127 -3.508 -3.858 -4.211 -4.539 -4.821 -5.102 -5.38 -5.609 -5.861 -6.133 -6.35 -6.581 -6.822 -7.063 -7.32 -7.505 -7.698 -8.011 -8.228 -8.44 -8.546 -8.769 -9.051 -9.35 -9.494 -9.765 -9.968 -10.135 -10.318 -10.733 -10.966 -11.214 -11.466 -11.722 -12.026 -12.433 -13.681 -10 ,28005 ,TETRA ,17525667,Thu Nov 25 01:39:39 CET,Thu Nov 25 03:28:43 CET,0.0 0.188 0.315 0.43 0.517 0.591 0.662 0.738 0.878 0.941 1.004 1.011 1.183 1.235 1.334 1.435 1.537 1.585 1.676 1.76 1.879 1.96 2.034 2.147 2.264 2.365 2.454 2.539 2.649 2.758 2.863 2.982 3.095 3.208 3.347 3.504 3.657 3.823 3.997 4.173 4.365 4.589 4.822 5.006 5.194 5.392 5.576 5.714 5.763 5.617 5.038 4.025 3.042 2.14 1.307 0.568 -0.066 -0.658 -1.172 -1.713 -2.178 -2.578 -2.986 -3.381 -3.743 -4.078 -4.428 -4.747 -5.035 -5.335 -5.64 -5.889 -6.157 -6.441 -6.664 -6.89 -7.112 -7.355 -7.611 -7.773 -7.94 -8.213 -8.399 -8.599 -8.701 -8.906 -9.125 -9.365 -9.489 -9.741 -9.897 -10.046 -10.217 -10.611 -10.812 -11.014 -11.258 -11.539 -11.864 -12.291 -13.646 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index dceedb58..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13h_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31970 ,TETRA ,17525668,Thu Nov 25 01:39:39 CET,Thu Nov 25 03:28:59 CET,0.0 0.289 0.483 0.627 0.733 0.838 0.943 1.035 1.201 1.277 1.359 1.425 1.623 1.714 1.891 2.047 2.202 2.277 2.416 2.548 2.733 2.853 2.968 3.14 3.306 3.466 3.624 3.777 3.969 4.148 4.326 4.537 4.739 4.936 5.155 5.399 5.63 5.888 6.17 6.469 6.773 7.107 7.488 7.856 8.268 8.724 9.234 9.761 10.326 10.83 11.143 11.086 10.776 10.392 10.004 9.618 9.257 8.901 8.563 8.217 7.881 7.559 7.242 6.937 6.672 6.425 6.163 5.938 5.757 5.557 5.322 5.134 4.946 4.732 4.562 4.396 4.22 4.035 3.845 3.717 3.585 3.366 3.204 3.038 2.949 2.75 2.549 2.345 2.236 2.009 1.872 1.736 1.591 1.281 1.101 0.893 0.671 0.445 0.174 -0.217 -1.258 -2 ,10650 ,TETRA ,17525669,Thu Nov 25 01:39:41 CET,Thu Nov 25 03:29:06 CET,0.0 0.259 0.405 0.535 0.658 0.767 0.88 0.978 1.153 1.238 1.322 1.38 1.576 1.66 1.827 1.984 2.141 2.22 2.359 2.486 2.684 2.821 2.951 3.126 3.296 3.456 3.607 3.756 3.942 4.121 4.302 4.517 4.717 4.914 5.142 5.387 5.617 5.883 6.171 6.449 6.738 7.056 7.428 7.803 8.225 8.679 9.158 9.654 10.198 10.721 11.096 11.106 10.869 10.498 10.079 9.671 9.287 8.918 8.599 8.243 7.925 7.639 7.344 7.06 6.793 6.549 6.298 6.075 5.871 5.654 5.422 5.232 5.041 4.841 4.683 4.504 4.318 4.133 3.943 3.801 3.646 3.425 3.264 3.102 3.027 2.867 2.68 2.472 2.366 2.137 1.984 1.842 1.691 1.37 1.196 1.009 0.809 0.593 0.379 0.14 -0.305 -3 ,137 ,TETRA ,17525670,Thu Nov 25 01:39:43 CET,Thu Nov 25 03:29:44 CET,0.0 0.171 0.338 0.461 0.569 0.675 0.774 0.865 1.037 1.114 1.195 1.246 1.435 1.5 1.632 1.761 1.886 1.949 2.079 2.219 2.42 2.544 2.668 2.849 3.025 3.186 3.349 3.519 3.708 3.88 4.051 4.255 4.457 4.658 4.884 5.119 5.353 5.612 5.885 6.168 6.46 6.784 7.146 7.518 7.942 8.368 8.817 9.317 9.824 10.196 10.387 10.216 9.81 9.372 8.947 8.522 8.114 7.714 7.356 6.975 6.653 6.377 6.1 5.846 5.617 5.404 5.154 4.904 4.694 4.471 4.236 4.04 3.827 3.609 3.442 3.271 3.098 2.899 2.678 2.529 2.382 2.159 2.007 1.856 1.781 1.615 1.42 1.207 1.081 0.841 0.717 0.595 0.467 0.172 0.014 -0.143 -0.319 -0.486 -0.672 -0.922 -1.552 -4 ,6240 ,TETRA ,17525671,Thu Nov 25 01:39:40 CET,Thu Nov 25 03:28:43 CET,0.0 0.341 0.482 0.596 0.721 0.839 0.941 1.028 1.197 1.276 1.354 1.396 1.591 1.667 1.8 1.917 2.029 2.087 2.201 2.313 2.473 2.568 2.659 2.807 2.951 3.088 3.216 3.337 3.502 3.662 3.815 4.003 4.189 4.368 4.567 4.794 5.025 5.286 5.562 5.844 6.134 6.47 6.858 7.229 7.643 8.079 8.523 8.996 9.504 9.968 10.265 10.12 9.729 9.28 8.863 8.436 8.031 7.671 7.335 6.989 6.684 6.374 6.079 5.803 5.519 5.261 5.006 4.769 4.567 4.356 4.129 3.943 3.746 3.524 3.331 3.132 2.94 2.747 2.542 2.405 2.254 2.007 1.849 1.69 1.603 1.421 1.21 0.978 0.866 0.644 0.5 0.352 0.211 -0.072 -0.247 -0.433 -0.614 -0.841 -1.117 -1.496 -2.525 -5 ,11379 ,TETRA ,17525672,Thu Nov 25 01:39:40 CET,Thu Nov 25 03:29:34 CET,0.0 0.242 0.395 0.535 0.649 0.761 0.871 0.967 1.131 1.214 1.317 1.418 1.628 1.727 1.926 2.097 2.25 2.329 2.486 2.635 2.839 2.957 3.073 3.238 3.405 3.565 3.714 3.865 4.065 4.255 4.435 4.653 4.85 5.042 5.264 5.52 5.756 5.994 6.267 6.542 6.81 7.125 7.469 7.78 8.146 8.569 9.046 9.517 9.991 10.473 10.825 10.727 10.352 9.942 9.549 9.136 8.73 8.313 7.938 7.594 7.318 7.048 6.795 6.585 6.366 6.149 5.923 5.719 5.538 5.355 5.162 4.99 4.802 4.608 4.451 4.289 4.139 3.982 3.822 3.705 3.578 3.379 3.248 3.126 3.06 2.919 2.769 2.602 2.516 2.322 2.263 2.17 2.076 1.858 1.735 1.595 1.434 1.255 1.05 0.821 0.306 -6 ,19749 ,TETRA ,17525673,Thu Nov 25 01:39:40 CET,Thu Nov 25 03:18:54 CET,0.0 0.365 0.562 0.722 0.831 0.934 1.043 1.142 1.307 1.383 1.457 1.484 1.667 1.732 1.852 1.975 2.098 2.167 2.302 2.415 2.57 2.672 2.782 2.946 3.102 3.244 3.385 3.528 3.717 3.893 4.064 4.287 4.501 4.696 4.922 5.161 5.39 5.637 5.888 6.15 6.416 6.726 7.087 7.431 7.826 8.259 8.687 9.142 9.65 10.097 10.338 10.149 9.788 9.364 8.924 8.503 8.086 7.664 7.279 6.88 6.537 6.221 5.917 5.653 5.409 5.184 4.951 4.74 4.575 4.402 4.195 4.021 3.844 3.661 3.517 3.365 3.213 3.051 2.878 2.753 2.629 2.436 2.295 2.157 2.084 1.925 1.77 1.609 1.522 1.32 1.225 1.122 1.023 0.795 0.664 0.52 0.366 0.195 0.002 -0.215 -0.757 -7 ,11697 ,TETRA ,17525674,Thu Nov 25 01:39:40 CET,Thu Nov 25 03:18:41 CET,0.0 0.26 0.393 0.522 0.626 0.727 0.82 0.903 1.061 1.139 1.212 1.243 1.429 1.49 1.618 1.747 1.87 1.927 2.032 2.129 2.277 2.374 2.471 2.615 2.756 2.891 3.012 3.127 3.272 3.414 3.56 3.723 3.88 4.035 4.217 4.419 4.609 4.837 5.073 5.311 5.551 5.821 6.153 6.467 6.841 7.292 7.746 8.176 8.612 9.046 9.345 9.194 8.823 8.424 8.022 7.572 7.154 6.782 6.447 6.096 5.773 5.488 5.211 4.936 4.685 4.443 4.171 3.91 3.692 3.488 3.28 3.095 2.903 2.7 2.533 2.359 2.171 1.979 1.79 1.654 1.513 1.287 1.121 0.952 0.861 0.676 0.495 0.283 0.178 -0.034 -0.173 -0.307 -0.44 -0.726 -0.89 -1.06 -1.199 -1.336 -1.488 -1.686 -2.226 -8 ,20989 ,TETRA ,17525675,Thu Nov 25 01:40:42 CET,Thu Nov 25 03:32:20 CET,0.0 0.197 0.319 0.461 0.604 0.712 0.815 0.93 1.132 1.214 1.295 1.336 1.526 1.602 1.744 1.875 1.999 2.056 2.169 2.284 2.457 2.577 2.7 2.879 3.044 3.204 3.356 3.508 3.716 3.896 4.057 4.261 4.462 4.654 4.876 5.122 5.349 5.594 5.858 6.142 6.436 6.76 7.131 7.47 7.858 8.314 8.792 9.255 9.744 10.244 10.589 10.549 10.292 9.931 9.54 9.137 8.739 8.364 8.037 7.697 7.379 7.076 6.804 6.559 6.317 6.079 5.809 5.554 5.325 5.106 4.883 4.692 4.498 4.282 4.12 3.969 3.821 3.665 3.497 3.377 3.253 3.069 2.936 2.799 2.729 2.57 2.405 2.226 2.136 1.933 1.865 1.774 1.68 1.446 1.322 1.203 1.077 0.935 0.749 0.524 -0.085 -9 ,8622 ,TETRA ,17525676,Thu Nov 25 01:41:39 CET,Thu Nov 25 03:31:05 CET,0.0 0.282 0.443 0.572 0.69 0.805 0.914 1.012 1.175 1.258 1.348 1.399 1.576 1.637 1.755 1.884 2.019 2.083 2.201 2.315 2.474 2.573 2.67 2.812 2.948 3.085 3.218 3.351 3.538 3.719 3.893 4.096 4.292 4.492 4.713 4.94 5.154 5.4 5.663 5.938 6.218 6.517 6.883 7.255 7.652 8.067 8.542 9.062 9.586 10.077 10.425 10.362 10.089 9.705 9.31 8.934 8.562 8.204 7.856 7.482 7.149 6.849 6.557 6.268 5.993 5.732 5.464 5.219 4.988 4.746 4.503 4.298 4.076 3.859 3.704 3.537 3.354 3.163 2.972 2.837 2.682 2.447 2.29 2.13 2.048 1.888 1.739 1.578 1.481 1.274 1.21 1.105 0.996 0.79 0.662 0.515 0.369 0.22 0.052 -0.187 -0.714 -10 ,224 ,TETRA ,17525677,Thu Nov 25 01:40:42 CET,Thu Nov 25 03:30:38 CET,0.0 0.311 0.463 0.582 0.709 0.84 0.95 1.046 1.224 1.306 1.395 1.44 1.626 1.698 1.837 1.965 2.088 2.147 2.26 2.366 2.534 2.64 2.733 2.87 3.006 3.138 3.265 3.392 3.56 3.738 3.904 4.07 4.239 4.418 4.612 4.835 5.068 5.339 5.633 5.926 6.222 6.555 6.912 7.231 7.63 8.063 8.509 9.005 9.499 9.959 10.287 10.255 9.99 9.673 9.307 8.898 8.514 8.127 7.764 7.386 7.062 6.8 6.543 6.29 6.068 5.868 5.668 5.476 5.293 5.097 4.888 4.703 4.501 4.308 4.176 4.039 3.893 3.732 3.559 3.442 3.323 3.155 3.035 2.892 2.819 2.678 2.524 2.369 2.286 2.078 2.004 1.906 1.807 1.571 1.426 1.28 1.121 0.927 0.719 0.437 -0.246 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt deleted file mode 100644 index 814c3ab2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16485 ,TETRA ,17525678,Thu Nov 25 01:40:42 CET,Thu Nov 25 03:29:50 CET,0.0 0.157 0.266 0.373 0.463 0.558 0.644 0.711 0.844 0.911 0.974 0.995 1.18 1.244 1.354 1.454 1.547 1.597 1.699 1.799 1.945 2.038 2.127 2.241 2.361 2.49 2.613 2.739 2.904 3.058 3.21 3.392 3.562 3.726 3.919 4.139 4.329 4.518 4.718 4.928 5.135 5.349 5.589 5.818 6.066 6.31 6.529 6.688 6.79 6.761 6.326 5.451 4.62 3.849 3.159 2.551 1.964 1.406 0.917 0.422 -0.005 -0.39 -0.761 -1.107 -1.423 -1.722 -2.046 -2.341 -2.59 -2.853 -3.127 -3.339 -3.556 -3.789 -3.966 -4.14 -4.318 -4.511 -4.729 -4.881 -5.03 -5.261 -5.433 -5.609 -5.695 -5.884 -6.08 -6.268 -6.366 -6.597 -6.702 -6.83 -6.968 -7.249 -7.391 -7.54 -7.712 -7.918 -8.174 -8.486 -9.195 -2 ,27866 ,TETRA ,17525679,Thu Nov 25 01:40:42 CET,Thu Nov 25 03:31:15 CET,0.0 0.253 0.373 0.496 0.615 0.71 0.797 0.88 1.036 1.109 1.186 1.217 1.396 1.452 1.56 1.661 1.768 1.826 1.947 2.065 2.233 2.342 2.447 2.594 2.739 2.882 3.012 3.137 3.297 3.435 3.571 3.745 3.911 4.068 4.249 4.444 4.625 4.819 5.017 5.216 5.412 5.623 5.866 6.082 6.294 6.513 6.726 6.895 6.996 6.95 6.519 5.669 4.831 4.046 3.352 2.695 2.118 1.594 1.116 0.626 0.192 -0.205 -0.588 -0.947 -1.289 -1.584 -1.893 -2.188 -2.434 -2.694 -2.98 -3.211 -3.443 -3.697 -3.898 -4.103 -4.317 -4.53 -4.759 -4.919 -5.077 -5.333 -5.535 -5.756 -5.863 -6.071 -6.281 -6.514 -6.639 -6.89 -7.042 -7.175 -7.31 -7.607 -7.759 -7.928 -8.111 -8.301 -8.551 -8.878 -9.913 -3 ,7527 ,TETRA ,17525680,Thu Nov 25 01:40:43 CET,Thu Nov 25 03:30:17 CET,0.0 0.247 0.388 0.495 0.609 0.724 0.825 0.902 1.032 1.1 1.168 1.172 1.352 1.418 1.544 1.665 1.776 1.82 1.908 1.997 2.126 2.211 2.3 2.429 2.558 2.685 2.797 2.917 3.076 3.231 3.39 3.565 3.716 3.86 4.044 4.239 4.42 4.612 4.8 5.013 5.234 5.453 5.699 5.937 6.172 6.411 6.656 6.86 6.923 6.818 6.456 5.67 4.852 4.049 3.304 2.645 2.062 1.549 1.09 0.59 0.183 -0.171 -0.521 -0.854 -1.171 -1.467 -1.763 -2.023 -2.258 -2.497 -2.742 -2.948 -3.166 -3.39 -3.558 -3.724 -3.902 -4.092 -4.292 -4.423 -4.557 -4.785 -4.95 -5.105 -5.188 -5.368 -5.536 -5.721 -5.817 -6.032 -6.121 -6.234 -6.343 -6.588 -6.727 -6.873 -7.043 -7.271 -7.543 -7.854 -8.72 -4 ,15123 ,TETRA ,17525681,Thu Nov 25 01:40:43 CET,Thu Nov 25 03:29:53 CET,0.0 0.437 0.714 0.936 1.108 1.25 1.384 1.514 1.763 1.874 1.972 2.033 2.231 2.318 2.472 2.615 2.754 2.826 2.974 3.112 3.301 3.413 3.522 3.673 3.816 3.96 4.098 4.225 4.389 4.541 4.684 4.852 5.01 5.174 5.364 5.547 5.709 5.907 6.116 6.329 6.542 6.76 7.009 7.231 7.47 7.711 7.931 8.092 8.205 8.197 7.776 6.94 6.087 5.285 4.561 3.912 3.331 2.793 2.322 1.823 1.39 1.008 0.648 0.3 -0.043 -0.359 -0.679 -0.955 -1.202 -1.474 -1.749 -1.979 -2.23 -2.484 -2.682 -2.877 -3.076 -3.296 -3.528 -3.69 -3.863 -4.134 -4.306 -4.472 -4.561 -4.735 -4.915 -5.112 -5.215 -5.452 -5.569 -5.7 -5.839 -6.145 -6.312 -6.488 -6.68 -6.876 -7.093 -7.364 -9.017 -5 ,9311 ,TETRA ,17525682,Thu Nov 25 01:40:43 CET,Thu Nov 25 03:31:51 CET,0.0 0.532 0.792 0.979 1.147 1.302 1.452 1.591 1.813 1.913 2.007 2.078 2.284 2.374 2.53 2.672 2.81 2.884 3.024 3.138 3.287 3.392 3.506 3.667 3.818 3.952 4.073 4.187 4.337 4.486 4.639 4.829 4.994 5.15 5.335 5.534 5.718 5.903 6.085 6.284 6.484 6.705 6.944 7.147 7.393 7.64 7.863 8.019 8.103 8.083 7.708 6.878 6.05 5.273 4.549 3.912 3.345 2.789 2.284 1.781 1.335 0.944 0.577 0.204 -0.136 -0.447 -0.78 -1.067 -1.302 -1.539 -1.793 -2.001 -2.212 -2.436 -2.615 -2.805 -3.016 -3.226 -3.435 -3.577 -3.715 -3.93 -4.085 -4.243 -4.321 -4.483 -4.652 -4.83 -4.922 -5.145 -5.222 -5.333 -5.465 -5.801 -5.963 -6.12 -6.313 -6.503 -6.684 -6.923 -7.725 -6 ,13693 ,TETRA ,17525683,Thu Nov 25 01:41:40 CET,Thu Nov 25 03:32:16 CET,0.0 0.657 0.958 1.123 1.274 1.43 1.57 1.699 1.933 2.045 2.147 2.209 2.414 2.51 2.677 2.812 2.939 3.003 3.135 3.256 3.413 3.517 3.628 3.783 3.941 4.091 4.229 4.365 4.529 4.681 4.828 5.009 5.171 5.316 5.496 5.694 5.868 6.056 6.268 6.486 6.711 6.941 7.173 7.394 7.634 7.869 8.078 8.228 8.298 8.259 7.881 7.037 6.176 5.43 4.725 4.081 3.495 2.932 2.451 1.958 1.513 1.113 0.734 0.368 0.025 -0.278 -0.577 -0.849 -1.096 -1.349 -1.626 -1.864 -2.102 -2.365 -2.573 -2.786 -3.007 -3.234 -3.472 -3.631 -3.79 -4.059 -4.248 -4.435 -4.539 -4.764 -4.995 -5.244 -5.377 -5.63 -5.756 -5.894 -6.044 -6.327 -6.487 -6.71 -6.961 -7.175 -7.407 -7.699 -10.071 -7 ,24357 ,TETRA ,17525684,Thu Nov 25 01:41:40 CET,Thu Nov 25 03:32:48 CET,0.0 0.38 0.536 0.654 0.77 0.87 0.947 1.024 1.153 1.205 1.258 1.247 1.413 1.463 1.558 1.646 1.732 1.773 1.86 1.949 2.067 2.141 2.217 2.33 2.439 2.543 2.642 2.736 2.873 3.03 3.177 3.335 3.487 3.637 3.817 4.019 4.197 4.391 4.607 4.82 5.033 5.245 5.473 5.703 5.942 6.161 6.367 6.56 6.663 6.599 6.161 5.322 4.491 3.725 3.036 2.375 1.762 1.209 0.747 0.28 -0.152 -0.546 -0.892 -1.208 -1.515 -1.808 -2.117 -2.383 -2.605 -2.843 -3.106 -3.317 -3.539 -3.775 -3.952 -4.14 -4.335 -4.519 -4.701 -4.832 -4.975 -5.196 -5.339 -5.489 -5.566 -5.734 -5.903 -6.076 -6.179 -6.402 -6.494 -6.603 -6.707 -6.974 -7.11 -7.248 -7.426 -7.634 -7.86 -8.141 -9.229 -8 ,14327 ,TETRA ,17525685,Thu Nov 25 01:41:40 CET,Thu Nov 25 03:32:55 CET,0.0 0.232 0.382 0.506 0.615 0.709 0.795 0.875 1.017 1.086 1.151 1.162 1.335 1.388 1.499 1.604 1.706 1.759 1.86 1.944 2.082 2.18 2.265 2.379 2.49 2.614 2.729 2.836 3.001 3.163 3.317 3.502 3.667 3.814 3.983 4.174 4.347 4.548 4.771 4.986 5.195 5.417 5.647 5.867 6.094 6.292 6.498 6.68 6.78 6.747 6.397 5.658 4.872 4.112 3.425 2.803 2.215 1.661 1.156 0.641 0.222 -0.149 -0.521 -0.873 -1.214 -1.531 -1.857 -2.154 -2.407 -2.668 -2.939 -3.168 -3.403 -3.639 -3.821 -4.011 -4.209 -4.426 -4.661 -4.819 -4.982 -5.242 -5.419 -5.607 -5.709 -5.906 -6.106 -6.315 -6.418 -6.644 -6.738 -6.855 -6.968 -7.219 -7.374 -7.53 -7.687 -7.888 -8.205 -8.561 -9.441 -9 ,20153 ,TETRA ,17525686,Thu Nov 25 01:41:39 CET,Thu Nov 25 03:31:35 CET,0.0 0.349 0.52 0.641 0.733 0.82 0.899 0.969 1.108 1.178 1.239 1.224 1.394 1.451 1.555 1.649 1.735 1.776 1.856 1.936 2.052 2.129 2.209 2.316 2.407 2.506 2.614 2.714 2.827 2.926 3.027 3.141 3.247 3.356 3.479 3.607 3.739 3.894 4.053 4.225 4.425 4.629 4.84 5.037 5.24 5.436 5.63 5.791 5.869 5.805 5.423 4.664 3.81 3.023 2.357 1.733 1.151 0.612 0.17 -0.278 -0.699 -1.069 -1.42 -1.777 -2.1 -2.377 -2.661 -2.904 -3.112 -3.319 -3.537 -3.736 -3.94 -4.163 -4.335 -4.498 -4.682 -4.887 -5.1 -5.241 -5.375 -5.594 -5.747 -5.9 -5.978 -6.154 -6.335 -6.516 -6.62 -6.855 -6.97 -7.098 -7.215 -7.484 -7.646 -7.805 -7.954 -8.132 -8.335 -8.583 -9.46 -10 ,17037 ,TETRA ,17525687,Thu Nov 25 01:41:40 CET,Thu Nov 25 03:31:09 CET,0.0 0.235 0.358 0.473 0.575 0.646 0.721 0.803 0.945 1.009 1.072 1.075 1.253 1.322 1.451 1.574 1.702 1.762 1.869 1.97 2.119 2.213 2.296 2.413 2.529 2.653 2.785 2.913 3.073 3.222 3.366 3.533 3.687 3.837 4.014 4.2 4.381 4.58 4.775 4.983 5.196 5.435 5.701 5.944 6.206 6.447 6.638 6.773 6.866 6.814 6.402 5.672 4.902 4.179 3.491 2.828 2.231 1.662 1.177 0.696 0.275 -0.111 -0.476 -0.834 -1.19 -1.503 -1.825 -2.125 -2.393 -2.652 -2.909 -3.14 -3.392 -3.655 -3.85 -4.051 -4.273 -4.495 -4.723 -4.89 -5.06 -5.333 -5.533 -5.745 -5.85 -6.049 -6.253 -6.488 -6.61 -6.865 -7.05 -7.217 -7.38 -7.7 -7.891 -8.08 -8.29 -8.535 -8.791 -9.146 -11.053 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index aef96a92..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13i_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11578 ,TETRA ,17525688,Thu Nov 25 01:41:41 CET,Thu Nov 25 03:31:17 CET,0.0 0.554 0.741 0.913 1.066 1.201 1.328 1.451 1.666 1.756 1.84 1.863 2.049 2.122 2.26 2.401 2.544 2.61 2.738 2.859 3.038 3.16 3.285 3.476 3.658 3.829 3.998 4.161 4.362 4.552 4.729 4.943 5.148 5.344 5.577 5.833 6.078 6.354 6.653 6.962 7.29 7.664 8.089 8.505 8.989 9.51 10.052 10.622 11.252 11.884 12.448 12.663 12.61 12.418 12.161 11.879 11.586 11.292 11.021 10.741 10.489 10.248 9.988 9.726 9.475 9.238 8.982 8.755 8.562 8.356 8.141 7.968 7.779 7.569 7.405 7.246 7.085 6.914 6.718 6.579 6.444 6.231 6.067 5.897 5.817 5.667 5.517 5.359 5.28 5.085 5.029 4.933 4.827 4.586 4.454 4.317 4.143 3.941 3.702 3.384 2.281 -2 ,13762 ,TETRA ,17525689,Thu Nov 25 01:41:43 CET,Thu Nov 25 03:31:40 CET,0.0 0.297 0.472 0.612 0.77 0.902 1.013 1.125 1.33 1.411 1.482 1.511 1.696 1.762 1.897 2.025 2.152 2.218 2.363 2.495 2.661 2.781 2.898 3.073 3.242 3.402 3.56 3.715 3.921 4.114 4.303 4.528 4.742 4.95 5.179 5.43 5.681 5.944 6.214 6.507 6.82 7.174 7.586 8.009 8.471 8.951 9.484 10.049 10.677 11.314 11.919 12.208 12.18 11.956 11.64 11.311 11.002 10.734 10.489 10.219 9.972 9.726 9.46 9.179 8.916 8.702 8.485 8.267 8.082 7.904 7.697 7.522 7.339 7.143 6.991 6.829 6.654 6.476 6.305 6.177 6.039 5.817 5.669 5.521 5.447 5.307 5.148 4.99 4.908 4.71 4.653 4.56 4.466 4.263 4.151 4.037 3.908 3.706 3.434 3.117 2.066 -3 ,26702 ,TETRA ,17525690,Thu Nov 25 01:41:41 CET,Thu Nov 25 03:31:05 CET,0.0 0.411 0.556 0.682 0.802 0.93 1.042 1.145 1.347 1.439 1.531 1.595 1.791 1.86 1.998 2.136 2.268 2.334 2.474 2.605 2.789 2.919 3.049 3.228 3.402 3.569 3.72 3.88 4.092 4.3 4.499 4.735 4.946 5.145 5.398 5.668 5.919 6.198 6.505 6.84 7.18 7.528 7.927 8.335 8.8 9.298 9.864 10.482 11.109 11.733 12.332 12.599 12.509 12.3 12.047 11.712 11.393 11.111 10.802 10.441 10.145 9.889 9.646 9.403 9.14 8.893 8.651 8.437 8.259 8.074 7.876 7.722 7.561 7.385 7.256 7.118 6.97 6.807 6.634 6.523 6.414 6.232 6.096 5.961 5.895 5.75 5.593 5.444 5.363 5.155 5.058 4.951 4.852 4.637 4.51 4.384 4.259 4.124 3.949 3.666 2.744 -4 ,28629 ,TETRA ,17525691,Thu Nov 25 01:41:41 CET,Thu Nov 25 03:20:38 CET,0.0 0.634 0.806 0.937 1.055 1.154 1.238 1.332 1.537 1.633 1.724 1.809 2.025 2.116 2.28 2.447 2.605 2.679 2.829 2.979 3.175 3.292 3.414 3.614 3.805 3.976 4.14 4.298 4.491 4.672 4.846 5.053 5.264 5.481 5.737 6.004 6.238 6.493 6.778 7.076 7.382 7.736 8.162 8.586 9.053 9.552 10.105 10.689 11.313 11.946 12.452 12.617 12.54 12.315 12.031 11.741 11.436 11.131 10.85 10.551 10.299 10.057 9.815 9.581 9.342 9.114 8.897 8.71 8.549 8.372 8.19 8.046 7.889 7.727 7.608 7.477 7.334 7.185 7.028 6.915 6.796 6.599 6.471 6.345 6.276 6.141 6.008 5.851 5.764 5.563 5.486 5.384 5.277 5.07 4.968 4.853 4.71 4.528 4.304 3.996 2.988 -5 ,317 ,TETRA ,17525692,Thu Nov 25 01:41:41 CET,Thu Nov 25 03:32:07 CET,0.0 0.437 0.636 0.805 0.957 1.088 1.202 1.315 1.565 1.689 1.801 1.905 2.121 2.217 2.4 2.561 2.716 2.798 2.954 3.1 3.318 3.467 3.607 3.806 4.004 4.189 4.367 4.531 4.725 4.917 5.115 5.342 5.55 5.758 5.999 6.277 6.547 6.829 7.125 7.427 7.743 8.126 8.572 8.999 9.488 10.01 10.559 11.148 11.794 12.459 13.068 13.253 13.137 12.881 12.592 12.273 11.972 11.685 11.426 11.156 10.901 10.66 10.42 10.188 9.97 9.767 9.56 9.38 9.224 9.067 8.896 8.75 8.597 8.431 8.305 8.178 8.041 7.906 7.766 7.657 7.545 7.374 7.26 7.126 7.055 6.923 6.778 6.615 6.524 6.316 6.254 6.152 6.025 5.752 5.615 5.465 5.298 5.111 4.895 4.65 4.082 -6 ,17130 ,TETRA ,17525693,Thu Nov 25 01:42:37 CET,Thu Nov 25 03:32:38 CET,0.0 0.464 0.665 0.879 1.087 1.261 1.419 1.578 1.863 1.985 2.107 2.217 2.43 2.536 2.729 2.9 3.071 3.156 3.312 3.457 3.67 3.804 3.934 4.125 4.308 4.488 4.666 4.83 5.043 5.246 5.438 5.676 5.903 6.114 6.364 6.645 6.898 7.172 7.477 7.816 8.167 8.551 8.999 9.412 9.877 10.422 11.005 11.581 12.224 12.93 13.547 13.698 13.575 13.362 13.058 12.74 12.436 12.13 11.837 11.527 11.259 11.002 10.742 10.497 10.273 10.072 9.87 9.687 9.521 9.343 9.15 8.983 8.799 8.608 8.454 8.289 8.126 7.96 7.798 7.682 7.546 7.337 7.194 7.036 6.953 6.801 6.648 6.483 6.4 6.202 6.13 6.029 5.923 5.673 5.54 5.399 5.224 5.017 4.759 4.462 3.99 -7 ,29590 ,TETRA ,17525694,Thu Nov 25 01:42:37 CET,Thu Nov 25 03:31:47 CET,0.0 0.303 0.478 0.636 0.777 0.884 0.983 1.083 1.274 1.365 1.457 1.513 1.709 1.784 1.924 2.065 2.206 2.271 2.4 2.529 2.712 2.825 2.935 3.101 3.26 3.407 3.549 3.684 3.848 3.995 4.133 4.291 4.458 4.639 4.849 5.087 5.325 5.597 5.887 6.19 6.529 6.908 7.323 7.738 8.23 8.761 9.317 9.931 10.604 11.304 11.851 12.009 11.935 11.78 11.545 11.266 10.981 10.69 10.394 10.092 9.853 9.608 9.368 9.14 8.921 8.729 8.513 8.297 8.115 7.937 7.739 7.568 7.393 7.217 7.07 6.908 6.745 6.574 6.37 6.231 6.092 5.865 5.721 5.57 5.487 5.311 5.114 4.885 4.77 4.535 4.381 4.263 4.147 3.906 3.772 3.638 3.496 3.326 3.092 2.636 1.338 -8 ,20864 ,TETRA ,17525695,Thu Nov 25 01:42:37 CET,Thu Nov 25 03:31:42 CET,0.0 0.253 0.431 0.584 0.726 0.838 0.942 1.04 1.241 1.336 1.423 1.473 1.674 1.76 1.911 2.055 2.197 2.261 2.392 2.512 2.685 2.808 2.945 3.135 3.302 3.469 3.633 3.795 4.014 4.227 4.421 4.653 4.883 5.103 5.357 5.642 5.897 6.173 6.481 6.807 7.148 7.518 7.926 8.326 8.786 9.281 9.833 10.428 11.072 11.761 12.371 12.575 12.443 12.149 11.838 11.509 11.199 10.911 10.642 10.359 10.086 9.823 9.576 9.342 9.116 8.897 8.669 8.468 8.298 8.118 7.927 7.762 7.585 7.409 7.282 7.152 6.999 6.845 6.69 6.584 6.484 6.314 6.182 6.042 5.971 5.825 5.664 5.478 5.386 5.186 5.109 5.014 4.913 4.685 4.557 4.431 4.29 4.116 3.902 3.62 2.677 -9 ,3416 ,TETRA ,17525696,Thu Nov 25 01:42:38 CET,Thu Nov 25 03:32:48 CET,0.0 0.618 0.841 1.031 1.177 1.318 1.449 1.566 1.78 1.884 1.983 2.036 2.229 2.305 2.457 2.6 2.744 2.816 2.953 3.091 3.279 3.4 3.524 3.685 3.835 3.995 4.171 4.351 4.564 4.751 4.936 5.17 5.391 5.609 5.873 6.157 6.417 6.697 6.997 7.313 7.644 8.011 8.419 8.827 9.3 9.797 10.342 10.932 11.622 12.355 12.967 13.12 12.971 12.755 12.496 12.182 11.871 11.55 11.255 10.981 10.698 10.409 10.146 9.899 9.651 9.418 9.179 8.959 8.774 8.573 8.347 8.169 8.001 7.825 7.687 7.535 7.366 7.2 7.031 6.91 6.787 6.585 6.436 6.282 6.206 6.039 5.851 5.651 5.543 5.321 5.201 5.086 4.965 4.665 4.483 4.312 4.138 3.904 3.612 3.096 1.61 -10 ,22916 ,TETRA ,17525697,Thu Nov 25 01:42:40 CET,Thu Nov 25 03:32:03 CET,0.0 0.251 0.413 0.556 0.676 0.789 0.901 1.004 1.193 1.279 1.363 1.395 1.585 1.663 1.814 1.953 2.089 2.158 2.296 2.424 2.589 2.698 2.814 2.982 3.123 3.25 3.385 3.518 3.687 3.842 3.997 4.201 4.39 4.569 4.773 4.997 5.221 5.465 5.731 6.03 6.334 6.688 7.103 7.508 7.977 8.449 8.971 9.555 10.211 10.909 11.504 11.687 11.568 11.332 11.068 10.762 10.467 10.196 9.915 9.607 9.345 9.109 8.87 8.633 8.397 8.186 7.972 7.754 7.56 7.37 7.181 7.01 6.824 6.637 6.489 6.345 6.19 6.009 5.829 5.72 5.616 5.432 5.297 5.171 5.108 4.954 4.767 4.566 4.46 4.241 4.157 4.052 3.949 3.719 3.575 3.43 3.289 3.14 2.878 2.506 1.616 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt deleted file mode 100644 index 52f929d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16077 ,TETRA ,17525698,Thu Nov 25 01:42:37 CET,Thu Nov 25 03:32:11 CET,0.0 0.613 0.817 0.988 1.168 1.309 1.418 1.541 1.779 1.873 1.969 1.997 2.22 2.299 2.438 2.575 2.713 2.774 2.896 3.027 3.231 3.361 3.491 3.68 3.859 4.029 4.195 4.345 4.521 4.703 4.894 5.11 5.317 5.518 5.721 5.947 6.169 6.417 6.682 6.947 7.203 7.462 7.755 8.029 8.31 8.594 8.861 9.111 9.302 9.308 8.849 7.863 6.852 5.928 5.115 4.369 3.672 3.031 2.489 1.934 1.449 1.03 0.632 0.251 -0.109 -0.459 -0.827 -1.147 -1.426 -1.701 -1.981 -2.224 -2.475 -2.722 -2.902 -3.083 -3.268 -3.464 -3.667 -3.807 -3.953 -4.175 -4.336 -4.515 -4.599 -4.764 -4.943 -5.129 -5.225 -5.465 -5.519 -5.623 -5.742 -6.015 -6.16 -6.307 -6.464 -6.639 -6.839 -7.096 -7.633 -2 ,27106 ,TETRA ,17525699,Thu Nov 25 01:42:37 CET,Thu Nov 25 03:33:14 CET,0.0 0.444 0.679 0.888 1.054 1.187 1.295 1.391 1.576 1.676 1.774 1.789 2.0 2.085 2.255 2.398 2.531 2.594 2.724 2.858 3.066 3.208 3.351 3.556 3.747 3.927 4.088 4.249 4.443 4.607 4.76 4.947 5.132 5.305 5.527 5.767 5.975 6.205 6.448 6.721 7.026 7.353 7.713 8.061 8.416 8.746 9.05 9.27 9.391 9.407 8.996 8.006 7.064 6.165 5.28 4.436 3.733 3.124 2.602 2.086 1.637 1.257 0.9 0.537 0.182 -0.132 -0.455 -0.756 -1.005 -1.264 -1.537 -1.751 -1.978 -2.215 -2.4 -2.585 -2.78 -2.984 -3.175 -3.314 -3.474 -3.713 -3.868 -4.033 -4.115 -4.288 -4.466 -4.642 -4.735 -4.98 -5.047 -5.17 -5.293 -5.539 -5.675 -5.829 -5.994 -6.151 -6.323 -6.562 -7.225 -3 ,20460 ,TETRA ,17525700,Thu Nov 25 01:43:39 CET,Thu Nov 25 03:32:52 CET,0.0 0.593 0.818 1.023 1.215 1.384 1.535 1.677 1.961 2.087 2.199 2.264 2.506 2.607 2.803 2.989 3.155 3.236 3.373 3.5 3.701 3.831 3.964 4.159 4.335 4.512 4.685 4.84 5.041 5.237 5.411 5.619 5.837 6.037 6.257 6.511 6.757 7.02 7.307 7.609 7.883 8.158 8.522 8.886 9.183 9.452 9.753 9.981 10.083 10.004 9.506 8.492 7.455 6.503 5.59 4.728 3.982 3.315 2.769 2.216 1.754 1.356 0.96 0.582 0.215 -0.13 -0.475 -0.763 -1.015 -1.281 -1.552 -1.781 -2.013 -2.24 -2.412 -2.578 -2.746 -2.932 -3.127 -3.255 -3.384 -3.595 -3.747 -3.9 -3.977 -4.137 -4.311 -4.499 -4.596 -4.829 -4.864 -4.967 -5.073 -5.318 -5.448 -5.573 -5.717 -5.895 -6.079 -6.302 -6.927 -4 ,19700 ,TETRA ,17525701,Thu Nov 25 01:42:38 CET,Thu Nov 25 03:34:24 CET,0.0 0.332 0.548 0.728 0.877 1.006 1.128 1.244 1.439 1.531 1.621 1.649 1.873 1.947 2.103 2.255 2.402 2.469 2.596 2.727 2.908 3.019 3.132 3.296 3.462 3.638 3.809 3.97 4.173 4.365 4.552 4.774 4.976 5.168 5.395 5.644 5.866 6.102 6.366 6.643 6.899 7.17 7.493 7.792 8.112 8.456 8.806 9.101 9.318 9.322 8.858 7.991 7.144 6.34 5.553 4.779 4.083 3.446 2.901 2.377 1.92 1.494 1.078 0.67 0.291 -0.041 -0.395 -0.723 -0.998 -1.27 -1.561 -1.803 -2.043 -2.281 -2.461 -2.66 -2.86 -3.037 -3.233 -3.383 -3.536 -3.761 -3.916 -4.081 -4.161 -4.329 -4.515 -4.706 -4.803 -5.052 -5.13 -5.249 -5.365 -5.603 -5.74 -5.884 -6.037 -6.229 -6.445 -6.747 -7.326 -5 ,4415 ,TETRA ,17525702,Thu Nov 25 01:43:38 CET,Thu Nov 25 03:35:00 CET,0.0 0.569 0.819 0.996 1.153 1.281 1.407 1.526 1.71 1.793 1.878 1.903 2.127 2.205 2.343 2.486 2.623 2.69 2.833 2.981 3.188 3.313 3.442 3.65 3.843 4.02 4.189 4.342 4.543 4.733 4.921 5.148 5.344 5.526 5.74 5.978 6.195 6.397 6.602 6.833 7.07 7.33 7.599 7.851 8.115 8.438 8.833 9.147 9.338 9.319 8.908 8.061 7.094 6.137 5.305 4.57 3.932 3.372 2.866 2.33 1.871 1.475 1.086 0.697 0.334 0.001 -0.341 -0.634 -0.882 -1.133 -1.397 -1.617 -1.832 -2.058 -2.23 -2.395 -2.56 -2.73 -2.925 -3.06 -3.193 -3.407 -3.561 -3.723 -3.8 -3.956 -4.127 -4.313 -4.414 -4.664 -4.739 -4.85 -4.968 -5.21 -5.331 -5.466 -5.606 -5.765 -5.946 -6.191 -6.683 -6 ,575 ,TETRA ,17525703,Thu Nov 25 01:44:38 CET,Thu Nov 25 03:34:24 CET,0.0 0.421 0.647 0.814 0.969 1.126 1.275 1.403 1.634 1.731 1.828 1.874 2.099 2.177 2.323 2.466 2.601 2.668 2.795 2.913 3.106 3.241 3.375 3.572 3.766 3.934 4.073 4.205 4.383 4.563 4.73 4.922 5.102 5.288 5.532 5.799 6.041 6.298 6.576 6.865 7.15 7.466 7.783 8.044 8.367 8.735 9.079 9.442 9.72 9.647 9.099 8.115 7.085 6.065 5.181 4.398 3.682 3.01 2.425 1.827 1.298 0.835 0.395 -0.006 -0.373 -0.725 -1.1 -1.425 -1.697 -1.977 -2.278 -2.528 -2.783 -3.058 -3.283 -3.509 -3.714 -3.902 -4.108 -4.265 -4.439 -4.713 -4.897 -5.089 -5.186 -5.361 -5.54 -5.75 -5.858 -6.112 -6.172 -6.276 -6.396 -6.632 -6.772 -6.927 -7.087 -7.277 -7.454 -7.634 -8.17 -7 ,30610 ,TETRA ,17525704,Thu Nov 25 01:43:38 CET,Thu Nov 25 03:33:13 CET,0.0 0.498 0.683 0.853 1.0 1.136 1.251 1.349 1.554 1.662 1.761 1.781 1.995 2.075 2.243 2.401 2.553 2.624 2.771 2.901 3.069 3.174 3.279 3.446 3.607 3.752 3.895 4.035 4.22 4.406 4.599 4.831 5.05 5.259 5.484 5.715 5.926 6.169 6.421 6.665 6.925 7.219 7.56 7.889 8.228 8.551 8.858 9.156 9.415 9.447 9.005 8.109 7.18 6.3 5.498 4.729 4.039 3.412 2.864 2.318 1.836 1.383 0.957 0.582 0.235 -0.1 -0.453 -0.748 -0.998 -1.272 -1.559 -1.791 -2.035 -2.297 -2.503 -2.709 -2.907 -3.1 -3.294 -3.43 -3.579 -3.814 -3.971 -4.141 -4.227 -4.39 -4.557 -4.736 -4.836 -5.08 -5.12 -5.231 -5.348 -5.578 -5.701 -5.835 -5.97 -6.121 -6.315 -6.563 -7.171 -8 ,18059 ,TETRA ,17525705,Thu Nov 25 01:44:38 CET,Thu Nov 25 03:34:32 CET,0.0 0.552 0.781 0.956 1.098 1.231 1.357 1.468 1.656 1.744 1.836 1.878 2.107 2.187 2.342 2.488 2.619 2.681 2.799 2.907 3.075 3.199 3.333 3.534 3.715 3.88 4.048 4.21 4.418 4.617 4.795 5.019 5.231 5.424 5.642 5.884 6.123 6.374 6.636 6.911 7.187 7.492 7.825 8.112 8.412 8.735 9.049 9.309 9.499 9.544 9.19 8.307 7.405 6.59 5.814 5.008 4.273 3.633 3.093 2.548 2.075 1.664 1.3 0.955 0.62 0.314 -0.005 -0.292 -0.537 -0.793 -1.06 -1.284 -1.511 -1.753 -1.944 -2.134 -2.326 -2.522 -2.744 -2.894 -3.034 -3.248 -3.404 -3.57 -3.653 -3.815 -3.987 -4.176 -4.275 -4.524 -4.585 -4.686 -4.787 -5.029 -5.163 -5.287 -5.437 -5.649 -5.865 -6.089 -6.728 -9 ,31304 ,TETRA ,17525706,Thu Nov 25 01:44:39 CET,Thu Nov 25 03:34:17 CET,0.0 0.475 0.705 0.926 1.152 1.342 1.487 1.647 1.934 2.053 2.158 2.237 2.48 2.57 2.758 2.935 3.089 3.166 3.32 3.469 3.678 3.815 3.946 4.124 4.304 4.479 4.637 4.779 4.966 5.155 5.34 5.556 5.753 5.934 6.131 6.357 6.573 6.824 7.1 7.359 7.605 7.865 8.151 8.433 8.733 9.039 9.347 9.603 9.807 9.882 9.533 8.597 7.614 6.674 5.801 5.014 4.322 3.679 3.116 2.537 2.044 1.579 1.133 0.727 0.36 0.041 -0.305 -0.628 -0.904 -1.187 -1.484 -1.737 -1.995 -2.259 -2.456 -2.668 -2.893 -3.113 -3.338 -3.493 -3.654 -3.914 -4.099 -4.281 -4.371 -4.582 -4.815 -5.036 -5.151 -5.41 -5.519 -5.654 -5.792 -6.094 -6.257 -6.429 -6.626 -6.869 -7.135 -7.47 -8.216 -10 ,16754 ,TETRA ,17525707,Thu Nov 25 01:44:40 CET,Thu Nov 25 03:34:59 CET,0.0 0.375 0.577 0.726 0.859 0.979 1.108 1.229 1.427 1.513 1.589 1.618 1.845 1.928 2.089 2.245 2.394 2.465 2.612 2.749 2.92 3.03 3.136 3.279 3.415 3.543 3.674 3.807 3.971 4.116 4.258 4.432 4.593 4.759 4.966 5.188 5.384 5.602 5.844 6.077 6.306 6.56 6.848 7.129 7.457 7.818 8.15 8.436 8.558 8.376 7.784 6.737 5.744 4.867 4.093 3.382 2.724 2.099 1.571 1.06 0.607 0.208 -0.148 -0.507 -0.856 -1.152 -1.453 -1.713 -1.935 -2.164 -2.405 -2.605 -2.806 -3.026 -3.195 -3.374 -3.569 -3.768 -3.961 -4.094 -4.238 -4.456 -4.618 -4.783 -4.861 -5.03 -5.212 -5.395 -5.483 -5.72 -5.779 -5.889 -5.995 -6.232 -6.348 -6.48 -6.64 -6.799 -6.977 -7.191 -7.611 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt deleted file mode 100644 index 440a9c4b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12590 ,TETRA ,17525708,Thu Nov 25 01:44:38 CET,Thu Nov 25 03:36:47 CET,0.0 0.47 0.664 0.812 0.93 1.024 1.104 1.186 1.338 1.394 1.433 1.35 1.511 1.532 1.562 1.592 1.616 1.627 1.645 1.642 1.624 1.614 1.596 1.56 1.52 1.482 1.433 1.366 1.27 1.177 1.082 0.953 0.814 0.667 0.5 0.282 0.032 -0.261 -0.598 -0.995 -1.451 -2.005 -2.731 -3.556 -4.614 -5.909 -7.61 -9.813 -12.752 -16.858 -23.098 -29.79 -34.737 -38.618 -41.751 -44.401 -46.571 -48.455 -50.037 -51.558 -52.809 -53.882 -54.869 -55.781 -56.627 -57.37 -58.127 -58.793 -59.353 -59.931 -60.508 -60.973 -61.44 -61.891 -62.236 -62.584 -62.929 -63.296 -63.679 -63.937 -64.192 -64.584 -64.859 -65.135 -65.276 -65.559 -65.854 -66.152 -66.302 -66.67 -66.783 -66.948 -67.11 -67.464 -67.651 -67.836 -68.033 -68.252 -68.498 -68.81 -69.387 -2 ,27285 ,TETRA ,17525709,Thu Nov 25 01:44:38 CET,Thu Nov 25 03:34:32 CET,0.0 0.383 0.501 0.563 0.642 0.726 0.789 0.829 0.871 0.89 0.91 0.779 0.916 0.912 0.893 0.874 0.855 0.842 0.815 0.781 0.738 0.712 0.672 0.604 0.54 0.483 0.433 0.382 0.296 0.202 0.108 -0.028 -0.177 -0.328 -0.507 -0.726 -0.966 -1.26 -1.615 -2.028 -2.509 -3.075 -3.801 -4.648 -5.733 -7.052 -8.766 -11.0 -14.048 -18.263 -24.575 -31.299 -36.335 -40.316 -43.464 -46.096 -48.302 -50.202 -51.749 -53.269 -54.548 -55.633 -56.65 -57.589 -58.43 -59.178 -59.932 -60.576 -61.127 -61.682 -62.255 -62.739 -63.232 -63.734 -64.11 -64.491 -64.876 -65.257 -65.657 -65.93 -66.209 -66.645 -66.939 -67.249 -67.402 -67.71 -68.038 -68.381 -68.557 -68.955 -69.114 -69.303 -69.489 -69.835 -70.023 -70.228 -70.438 -70.669 -70.898 -71.132 -71.822 -3 ,9851 ,TETRA ,17525710,Thu Nov 25 01:44:38 CET,Thu Nov 25 03:34:24 CET,0.0 0.246 0.407 0.519 0.586 0.628 0.67 0.707 0.745 0.759 0.775 0.654 0.816 0.832 0.842 0.842 0.839 0.832 0.809 0.783 0.719 0.674 0.639 0.59 0.529 0.453 0.384 0.319 0.219 0.112 -0.003 -0.16 -0.342 -0.533 -0.755 -1.017 -1.292 -1.616 -1.982 -2.404 -2.895 -3.5 -4.289 -5.144 -6.221 -7.56 -9.246 -11.382 -14.272 -18.384 -24.685 -31.411 -36.37 -40.253 -43.401 -46.034 -48.204 -50.098 -51.665 -53.159 -54.417 -55.493 -56.491 -57.414 -58.255 -59.009 -59.763 -60.414 -60.972 -61.537 -62.12 -62.598 -63.072 -63.559 -63.936 -64.315 -64.705 -65.116 -65.539 -65.825 -66.111 -66.551 -66.847 -67.147 -67.299 -67.6 -67.911 -68.227 -68.402 -68.801 -68.963 -69.152 -69.352 -69.771 -69.982 -70.206 -70.429 -70.652 -70.899 -71.198 -71.879 -4 ,9744 ,TETRA ,17525711,Thu Nov 25 01:45:37 CET,Thu Nov 25 03:36:42 CET,0.0 0.403 0.515 0.595 0.66 0.721 0.77 0.816 0.913 0.951 1.002 0.966 1.142 1.181 1.253 1.314 1.349 1.359 1.385 1.409 1.425 1.424 1.421 1.399 1.351 1.297 1.237 1.185 1.121 1.032 0.923 0.79 0.651 0.491 0.292 0.06 -0.187 -0.486 -0.854 -1.284 -1.764 -2.352 -3.099 -3.928 -4.975 -6.27 -7.975 -10.191 -13.159 -17.26 -23.443 -30.101 -35.036 -38.908 -42.029 -44.648 -46.829 -48.717 -50.291 -51.82 -53.073 -54.141 -55.141 -56.07 -56.908 -57.655 -58.407 -59.054 -59.603 -60.153 -60.72 -61.191 -61.681 -62.188 -62.567 -62.95 -63.339 -63.735 -64.137 -64.404 -64.688 -65.142 -65.44 -65.733 -65.89 -66.228 -66.574 -66.917 -67.084 -67.467 -67.633 -67.824 -68.017 -68.437 -68.667 -68.907 -69.178 -69.489 -69.804 -70.171 -71.203 -5 ,25876 ,TETRA ,17525712,Thu Nov 25 01:44:38 CET,Thu Nov 25 03:34:34 CET,0.0 0.233 0.335 0.442 0.534 0.586 0.611 0.639 0.675 0.693 0.71 0.589 0.747 0.761 0.766 0.756 0.752 0.748 0.734 0.719 0.682 0.645 0.604 0.568 0.536 0.477 0.409 0.346 0.259 0.168 0.063 -0.087 -0.236 -0.378 -0.552 -0.777 -1.026 -1.317 -1.65 -2.043 -2.493 -3.051 -3.783 -4.604 -5.656 -6.974 -8.688 -10.894 -13.89 -18.053 -24.292 -30.946 -35.917 -39.819 -42.954 -45.578 -47.738 -49.578 -51.096 -52.574 -53.81 -54.877 -55.891 -56.837 -57.688 -58.437 -59.192 -59.869 -60.455 -61.036 -61.617 -62.083 -62.562 -63.059 -63.433 -63.813 -64.207 -64.612 -65.031 -65.306 -65.578 -66.004 -66.294 -66.59 -66.739 -67.04 -67.331 -67.615 -67.763 -68.131 -68.227 -68.395 -68.573 -68.925 -69.113 -69.313 -69.518 -69.742 -69.994 -70.271 -70.887 -6 ,2058 ,TETRA ,17525713,Thu Nov 25 01:44:40 CET,Thu Nov 25 03:34:37 CET,0.0 0.757 0.989 1.158 1.316 1.457 1.548 1.618 1.75 1.809 1.862 1.826 1.999 2.028 2.081 2.126 2.151 2.159 2.171 2.162 2.151 2.148 2.133 2.097 2.058 2.008 1.951 1.904 1.84 1.758 1.668 1.551 1.419 1.273 1.082 0.841 0.595 0.308 -0.042 -0.449 -0.912 -1.488 -2.241 -3.081 -4.137 -5.438 -7.143 -9.328 -12.289 -16.46 -22.723 -29.368 -34.352 -38.305 -41.476 -44.135 -46.365 -48.295 -49.871 -51.366 -52.603 -53.693 -54.7 -55.606 -56.43 -57.16 -57.897 -58.534 -59.081 -59.649 -60.219 -60.689 -61.163 -61.636 -61.997 -62.355 -62.73 -63.116 -63.506 -63.769 -64.029 -64.431 -64.693 -64.95 -65.085 -65.373 -65.669 -65.964 -66.107 -66.459 -66.555 -66.716 -66.889 -67.262 -67.457 -67.664 -67.881 -68.117 -68.373 -68.642 -69.33 -7 ,22302 ,TETRA ,17525714,Thu Nov 25 01:44:40 CET,Thu Nov 25 03:35:15 CET,0.0 0.275 0.385 0.458 0.517 0.573 0.615 0.648 0.712 0.746 0.776 0.669 0.827 0.829 0.823 0.804 0.781 0.776 0.758 0.736 0.708 0.675 0.647 0.621 0.574 0.497 0.424 0.345 0.222 0.094 -0.031 -0.181 -0.341 -0.508 -0.72 -0.976 -1.228 -1.531 -1.888 -2.288 -2.749 -3.327 -4.066 -4.878 -5.928 -7.233 -8.932 -11.095 -14.02 -18.097 -24.203 -30.776 -35.661 -39.482 -42.6 -45.232 -47.387 -49.247 -50.783 -52.271 -53.507 -54.568 -55.576 -56.488 -57.303 -58.028 -58.754 -59.386 -59.912 -60.449 -61.008 -61.46 -61.911 -62.375 -62.73 -63.082 -63.45 -63.826 -64.201 -64.455 -64.706 -65.089 -65.356 -65.634 -65.775 -66.044 -66.321 -66.611 -66.762 -67.133 -67.227 -67.384 -67.546 -67.874 -68.054 -68.255 -68.469 -68.683 -68.943 -69.299 -69.879 -8 ,21309 ,TETRA ,17525715,Thu Nov 25 01:44:40 CET,Thu Nov 25 03:36:46 CET,0.0 0.286 0.382 0.454 0.528 0.618 0.702 0.762 0.839 0.865 0.89 0.799 0.957 0.971 0.981 0.973 0.965 0.959 0.942 0.923 0.896 0.868 0.833 0.78 0.721 0.661 0.602 0.539 0.435 0.321 0.202 0.044 -0.117 -0.287 -0.497 -0.753 -1.033 -1.367 -1.744 -2.179 -2.659 -3.23 -3.97 -4.791 -5.822 -7.125 -8.857 -11.054 -14.01 -18.136 -24.316 -30.878 -35.824 -39.725 -42.841 -45.45 -47.587 -49.408 -50.942 -52.455 -53.701 -54.768 -55.748 -56.661 -57.495 -58.23 -59.006 -59.675 -60.232 -60.806 -61.385 -61.86 -62.357 -62.855 -63.221 -63.596 -63.987 -64.399 -64.812 -65.081 -65.366 -65.803 -66.092 -66.388 -66.538 -66.848 -67.182 -67.537 -67.715 -68.093 -68.229 -68.419 -68.614 -69.015 -69.243 -69.508 -69.789 -70.067 -70.37 -70.756 -71.824 -9 ,20112 ,TETRA ,17525716,Thu Nov 25 01:44:40 CET,Thu Nov 25 03:33:47 CET,0.0 0.29 0.409 0.496 0.57 0.624 0.678 0.724 0.768 0.787 0.806 0.681 0.822 0.828 0.839 0.84 0.83 0.824 0.816 0.799 0.752 0.714 0.67 0.605 0.532 0.46 0.393 0.316 0.211 0.119 0.018 -0.121 -0.262 -0.401 -0.578 -0.806 -1.047 -1.338 -1.671 -2.074 -2.557 -3.143 -3.887 -4.715 -5.769 -7.063 -8.775 -10.963 -13.894 -17.978 -24.096 -30.697 -35.618 -39.458 -42.536 -45.148 -47.309 -49.17 -50.712 -52.183 -53.418 -54.471 -55.434 -56.335 -57.143 -57.86 -58.587 -59.221 -59.763 -60.311 -60.871 -61.325 -61.791 -62.265 -62.62 -62.981 -63.342 -63.712 -64.091 -64.35 -64.61 -65.008 -65.281 -65.553 -65.693 -65.98 -66.268 -66.553 -66.703 -67.071 -67.15 -67.307 -67.47 -67.825 -68.027 -68.247 -68.464 -68.679 -68.924 -69.213 -70.224 -10 ,11336 ,TETRA ,17525717,Thu Nov 25 01:45:37 CET,Thu Nov 25 03:35:11 CET,0.0 0.316 0.433 0.524 0.597 0.65 0.699 0.74 0.795 0.81 0.824 0.723 0.878 0.884 0.883 0.88 0.88 0.875 0.855 0.833 0.789 0.757 0.725 0.681 0.626 0.558 0.494 0.425 0.317 0.209 0.113 0.001 -0.127 -0.272 -0.448 -0.687 -0.954 -1.261 -1.605 -1.999 -2.483 -3.083 -3.835 -4.661 -5.743 -7.097 -8.8 -10.947 -13.854 -17.939 -24.135 -30.772 -35.76 -39.699 -42.862 -45.506 -47.689 -49.6 -51.189 -52.692 -53.966 -55.084 -56.093 -56.995 -57.827 -58.579 -59.334 -59.995 -60.552 -61.119 -61.704 -62.187 -62.673 -63.163 -63.547 -63.936 -64.315 -64.712 -65.132 -65.41 -65.684 -66.121 -66.426 -66.734 -66.893 -67.229 -67.564 -67.887 -68.056 -68.451 -68.623 -68.816 -69.014 -69.471 -69.707 -69.935 -70.174 -70.42 -70.669 -70.932 -71.359 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt deleted file mode 100644 index 4babcd9a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19254 ,TETRA ,17525718,Thu Nov 25 01:45:39 CET,Thu Nov 25 03:35:11 CET,0.0 0.352 0.45 0.531 0.591 0.629 0.671 0.707 0.771 0.791 0.798 0.66 0.803 0.803 0.795 0.772 0.741 0.735 0.739 0.723 0.67 0.644 0.619 0.567 0.526 0.476 0.406 0.333 0.223 0.1 -0.027 -0.205 -0.384 -0.567 -0.821 -1.138 -1.45 -1.808 -2.215 -2.691 -3.258 -3.952 -4.852 -5.847 -7.114 -8.696 -10.745 -13.314 -16.781 -21.733 -29.118 -36.986 -42.896 -47.464 -51.089 -54.152 -56.719 -58.928 -60.741 -62.504 -63.965 -65.233 -66.41 -67.489 -68.459 -69.324 -70.228 -71.009 -71.679 -72.36 -73.042 -73.605 -74.172 -74.726 -75.149 -75.591 -76.049 -76.528 -77.003 -77.302 -77.6 -78.058 -78.378 -78.701 -78.861 -79.185 -79.525 -79.863 -80.035 -80.444 -80.597 -80.789 -80.991 -81.408 -81.607 -81.817 -82.059 -82.301 -82.552 -82.839 -83.473 -2 ,19428 ,TETRA ,17525719,Thu Nov 25 01:45:41 CET,Thu Nov 25 03:34:59 CET,0.0 0.431 0.546 0.637 0.708 0.772 0.818 0.841 0.872 0.88 0.883 0.737 0.882 0.883 0.877 0.861 0.84 0.828 0.807 0.802 0.774 0.732 0.695 0.654 0.606 0.545 0.468 0.384 0.273 0.151 0.028 -0.124 -0.296 -0.488 -0.731 -1.025 -1.339 -1.704 -2.126 -2.627 -3.174 -3.843 -4.752 -5.75 -7.011 -8.588 -10.622 -13.22 -16.708 -21.596 -29.12 -37.112 -42.896 -47.449 -51.173 -54.318 -56.921 -59.189 -61.06 -62.828 -64.307 -65.592 -66.78 -67.868 -68.841 -69.703 -70.578 -71.344 -72.005 -72.678 -73.361 -73.909 -74.46 -75.021 -75.453 -75.892 -76.338 -76.789 -77.25 -77.572 -77.899 -78.379 -78.691 -78.996 -79.149 -79.459 -79.794 -80.144 -80.32 -80.72 -80.846 -81.03 -81.229 -81.643 -81.87 -82.111 -82.356 -82.593 -82.872 -83.196 -83.742 -3 ,13690 ,TETRA ,17525720,Thu Nov 25 01:45:37 CET,Thu Nov 25 03:35:46 CET,0.0 0.533 0.687 0.837 0.954 1.055 1.142 1.228 1.372 1.425 1.459 1.363 1.519 1.533 1.554 1.564 1.572 1.571 1.567 1.56 1.53 1.499 1.474 1.441 1.39 1.327 1.26 1.18 1.07 0.957 0.827 0.654 0.473 0.281 0.043 -0.245 -0.551 -0.919 -1.364 -1.876 -2.453 -3.161 -4.068 -5.059 -6.332 -7.902 -9.966 -12.626 -16.168 -21.074 -28.471 -36.361 -42.207 -46.838 -50.57 -53.705 -56.308 -58.558 -60.426 -62.234 -63.735 -65.017 -66.182 -67.243 -68.215 -69.079 -69.96 -70.735 -71.39 -72.022 -72.655 -73.184 -73.708 -74.236 -74.645 -75.065 -75.492 -75.914 -76.356 -76.659 -76.955 -77.403 -77.706 -78.013 -78.172 -78.496 -78.83 -79.175 -79.348 -79.751 -79.903 -80.097 -80.284 -80.656 -80.858 -81.08 -81.32 -81.564 -81.827 -82.174 -82.788 -4 ,4330 ,TETRA ,17525721,Thu Nov 25 01:45:38 CET,Thu Nov 25 03:34:38 CET,0.0 0.354 0.47 0.556 0.609 0.662 0.713 0.747 0.807 0.828 0.838 0.699 0.845 0.852 0.854 0.843 0.821 0.802 0.76 0.715 0.654 0.614 0.569 0.496 0.421 0.337 0.24 0.141 0.016 -0.12 -0.266 -0.458 -0.659 -0.851 -1.077 -1.343 -1.629 -1.97 -2.373 -2.866 -3.42 -4.068 -4.882 -5.823 -7.081 -8.633 -10.62 -13.239 -16.83 -21.749 -29.088 -36.988 -42.891 -47.519 -51.189 -54.238 -56.775 -58.983 -60.818 -62.551 -64.006 -65.271 -66.426 -67.506 -68.512 -69.391 -70.274 -71.058 -71.706 -72.366 -73.045 -73.594 -74.149 -74.712 -75.156 -75.609 -76.054 -76.516 -76.991 -77.309 -77.639 -78.126 -78.455 -78.805 -78.983 -79.336 -79.698 -80.08 -80.274 -80.695 -80.9 -81.114 -81.332 -81.778 -82.013 -82.257 -82.512 -82.765 -83.033 -83.352 -83.914 -5 ,2413 ,TETRA ,17525722,Thu Nov 25 01:45:37 CET,Thu Nov 25 03:36:06 CET,0.0 0.477 0.616 0.71 0.775 0.833 0.88 0.91 0.956 0.967 0.985 0.866 1.014 1.019 1.036 1.039 1.019 1.006 0.977 0.947 0.899 0.861 0.812 0.728 0.648 0.553 0.453 0.354 0.214 0.074 -0.079 -0.283 -0.491 -0.697 -0.957 -1.283 -1.62 -2.016 -2.477 -3.003 -3.589 -4.295 -5.18 -6.156 -7.405 -8.971 -10.999 -13.588 -17.137 -22.095 -29.514 -37.394 -43.238 -47.812 -51.462 -54.565 -57.185 -59.436 -61.319 -63.144 -64.663 -65.988 -67.178 -68.238 -69.197 -70.054 -70.919 -71.663 -72.289 -72.932 -73.598 -74.134 -74.679 -75.235 -75.671 -76.117 -76.574 -77.046 -77.519 -77.837 -78.153 -78.651 -78.993 -79.324 -79.493 -79.828 -80.149 -80.482 -80.656 -81.06 -81.2 -81.376 -81.56 -81.968 -82.194 -82.411 -82.636 -82.893 -83.184 -83.509 -84.076 -6 ,27137 ,TETRA ,17525723,Thu Nov 25 01:45:37 CET,Thu Nov 25 03:35:04 CET,0.0 0.222 0.306 0.389 0.475 0.537 0.572 0.595 0.627 0.646 0.655 0.518 0.652 0.637 0.624 0.615 0.604 0.603 0.608 0.606 0.598 0.595 0.577 0.535 0.487 0.423 0.347 0.268 0.157 0.03 -0.103 -0.266 -0.442 -0.626 -0.849 -1.13 -1.429 -1.781 -2.198 -2.694 -3.268 -3.97 -4.849 -5.819 -7.076 -8.63 -10.632 -13.215 -16.687 -21.49 -28.767 -36.577 -42.409 -46.98 -50.627 -53.707 -56.284 -58.504 -60.356 -62.142 -63.645 -64.937 -66.118 -67.212 -68.205 -69.08 -69.963 -70.732 -71.384 -72.038 -72.71 -73.27 -73.839 -74.412 -74.85 -75.285 -75.714 -76.166 -76.637 -76.949 -77.26 -77.742 -78.081 -78.428 -78.599 -78.945 -79.308 -79.676 -79.858 -80.272 -80.435 -80.634 -80.839 -81.256 -81.465 -81.673 -81.902 -82.156 -82.418 -82.704 -83.378 -7 ,16362 ,TETRA ,17525724,Thu Nov 25 01:45:39 CET,Thu Nov 25 03:35:21 CET,0.0 0.313 0.383 0.434 0.486 0.528 0.568 0.61 0.678 0.693 0.7 0.575 0.717 0.708 0.689 0.675 0.649 0.631 0.591 0.553 0.501 0.459 0.417 0.354 0.279 0.193 0.099 0.0 -0.146 -0.294 -0.436 -0.63 -0.845 -1.06 -1.319 -1.618 -1.91 -2.276 -2.72 -3.231 -3.81 -4.513 -5.39 -6.368 -7.663 -9.296 -11.364 -13.969 -17.493 -22.389 -29.677 -37.509 -43.406 -47.984 -51.69 -54.802 -57.384 -59.638 -61.5 -63.283 -64.752 -66.024 -67.204 -68.296 -69.271 -70.126 -71.01 -71.784 -72.441 -73.099 -73.754 -74.295 -74.853 -75.413 -75.845 -76.287 -76.74 -77.209 -77.675 -77.992 -78.317 -78.8 -79.121 -79.434 -79.59 -79.916 -80.25 -80.582 -80.755 -81.159 -81.314 -81.513 -81.722 -82.153 -82.374 -82.62 -82.875 -83.11 -83.385 -83.733 -84.397 -8 ,14264 ,TETRA ,17525725,Thu Nov 25 01:45:39 CET,Thu Nov 25 03:35:55 CET,0.0 0.294 0.435 0.538 0.616 0.658 0.697 0.736 0.774 0.791 0.807 0.674 0.819 0.822 0.822 0.813 0.791 0.785 0.785 0.786 0.768 0.743 0.713 0.668 0.609 0.551 0.493 0.42 0.305 0.174 0.04 -0.134 -0.319 -0.51 -0.744 -1.023 -1.324 -1.685 -2.107 -2.602 -3.164 -3.845 -4.731 -5.724 -6.994 -8.543 -10.526 -13.1 -16.589 -21.436 -28.759 -36.616 -42.489 -47.106 -50.789 -53.889 -56.506 -58.756 -60.592 -62.373 -63.852 -65.112 -66.277 -67.338 -68.291 -69.151 -70.012 -70.767 -71.424 -72.092 -72.768 -73.313 -73.859 -74.416 -74.843 -75.277 -75.73 -76.201 -76.683 -76.993 -77.303 -77.786 -78.109 -78.446 -78.621 -78.97 -79.314 -79.649 -79.82 -80.222 -80.368 -80.549 -80.74 -81.165 -81.375 -81.575 -81.79 -82.048 -82.341 -82.691 -83.266 -9 ,8229 ,TETRA ,17525726,Thu Nov 25 01:45:39 CET,Thu Nov 25 03:28:06 CET,0.0 0.444 0.643 0.786 0.912 1.015 1.085 1.15 1.276 1.314 1.343 1.275 1.441 1.456 1.486 1.523 1.555 1.567 1.574 1.567 1.547 1.525 1.501 1.453 1.409 1.361 1.29 1.207 1.086 0.968 0.842 0.671 0.507 0.332 0.077 -0.243 -0.561 -0.94 -1.391 -1.909 -2.494 -3.21 -4.144 -5.168 -6.429 -7.975 -9.969 -12.568 -16.143 -21.07 -28.403 -36.227 -42.084 -46.738 -50.458 -53.566 -56.168 -58.417 -60.263 -62.037 -63.495 -64.745 -65.912 -66.995 -67.986 -68.874 -69.757 -70.506 -71.14 -71.791 -72.478 -73.036 -73.573 -74.113 -74.541 -74.973 -75.417 -75.874 -76.328 -76.625 -76.922 -77.392 -77.718 -78.049 -78.213 -78.548 -78.89 -79.237 -79.419 -79.83 -79.995 -80.18 -80.36 -80.755 -80.955 -81.163 -81.401 -81.664 -81.938 -82.246 -82.895 -10 ,22745 ,TETRA ,17525727,Thu Nov 25 01:45:39 CET,Thu Nov 25 03:30:04 CET,0.0 0.281 0.377 0.439 0.484 0.52 0.539 0.556 0.595 0.609 0.618 0.483 0.62 0.614 0.639 0.659 0.669 0.678 0.674 0.667 0.642 0.623 0.61 0.572 0.521 0.451 0.362 0.273 0.156 0.03 -0.107 -0.284 -0.467 -0.657 -0.904 -1.208 -1.519 -1.89 -2.329 -2.842 -3.417 -4.114 -5.035 -6.039 -7.286 -8.854 -10.824 -13.332 -16.813 -21.603 -28.813 -36.563 -42.399 -47.017 -50.741 -53.871 -56.484 -58.731 -60.557 -62.306 -63.753 -65.009 -66.177 -67.24 -68.224 -69.126 -70.028 -70.803 -71.459 -72.134 -72.809 -73.349 -73.898 -74.449 -74.865 -75.287 -75.713 -76.134 -76.554 -76.852 -77.168 -77.649 -77.973 -78.292 -78.449 -78.765 -79.095 -79.434 -79.603 -80.009 -80.174 -80.366 -80.553 -80.927 -81.13 -81.338 -81.544 -81.771 -82.051 -82.381 -83.184 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt deleted file mode 100644 index 61d0ed32..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-13o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6503 ,TETRA ,17525728,Thu Nov 25 01:45:39 CET,Thu Nov 25 03:34:53 CET,0.0 0.411 0.571 0.717 0.855 0.983 1.102 1.213 1.41 1.497 1.575 1.582 1.797 1.868 2.007 2.14 2.269 2.336 2.461 2.578 2.753 2.862 2.967 3.141 3.313 3.474 3.643 3.809 4.013 4.199 4.375 4.593 4.805 5.013 5.251 5.52 5.775 6.037 6.314 6.607 6.906 7.243 7.603 7.939 8.345 8.766 9.241 9.704 10.038 10.309 10.344 9.898 9.232 8.529 7.875 7.277 6.739 6.176 5.64 5.093 4.641 4.235 3.811 3.42 3.08 2.77 2.441 2.133 1.859 1.583 1.298 1.067 0.838 0.591 0.393 0.188 -0.042 -0.281 -0.514 -0.677 -0.836 -1.071 -1.223 -1.372 -1.449 -1.604 -1.771 -1.953 -2.042 -2.275 -2.313 -2.411 -2.518 -2.772 -2.917 -3.047 -3.173 -3.324 -3.508 -3.73 -4.205 -2 ,9938 ,TETRA ,17525729,Thu Nov 25 01:45:39 CET,Thu Nov 25 03:34:30 CET,0.0 0.214 0.4 0.552 0.681 0.808 0.925 1.023 1.196 1.292 1.394 1.44 1.661 1.732 1.877 2.023 2.171 2.235 2.35 2.472 2.646 2.762 2.871 3.023 3.16 3.295 3.433 3.563 3.74 3.91 4.069 4.275 4.467 4.641 4.849 5.107 5.357 5.607 5.87 6.146 6.429 6.752 7.13 7.46 7.81 8.25 8.701 9.068 9.387 9.576 9.346 8.585 7.841 7.085 6.331 5.645 5.015 4.401 3.889 3.384 2.943 2.544 2.163 1.784 1.403 1.07 0.732 0.421 0.15 -0.126 -0.399 -0.612 -0.83 -1.058 -1.235 -1.419 -1.615 -1.814 -2.025 -2.168 -2.311 -2.542 -2.685 -2.823 -2.898 -3.079 -3.271 -3.463 -3.56 -3.804 -3.894 -4.007 -4.118 -4.368 -4.5 -4.64 -4.782 -4.939 -5.132 -5.351 -5.936 -3 ,23646 ,TETRA ,17525730,Thu Nov 25 01:45:40 CET,Thu Nov 25 03:35:02 CET,0.0 0.421 0.648 0.831 1.005 1.149 1.28 1.428 1.694 1.817 1.934 2.015 2.263 2.362 2.547 2.71 2.864 2.932 3.059 3.198 3.416 3.551 3.677 3.846 4.002 4.16 4.314 4.461 4.643 4.822 5.003 5.232 5.458 5.658 5.881 6.128 6.37 6.628 6.899 7.176 7.455 7.776 8.141 8.487 8.836 9.217 9.604 9.955 10.343 10.659 10.577 9.979 9.273 8.543 7.837 7.138 6.503 5.897 5.354 4.846 4.404 4.005 3.629 3.247 2.883 2.562 2.24 1.945 1.688 1.419 1.137 0.908 0.654 0.381 0.177 -0.033 -0.249 -0.473 -0.704 -0.866 -1.031 -1.3 -1.484 -1.666 -1.76 -1.961 -2.183 -2.39 -2.493 -2.741 -2.801 -2.912 -3.025 -3.257 -3.387 -3.54 -3.72 -3.911 -4.133 -4.374 -4.933 -4 ,9673 ,TETRA ,17525731,Thu Nov 25 01:45:40 CET,Thu Nov 25 03:34:51 CET,0.0 0.434 0.571 0.709 0.832 0.938 1.05 1.163 1.362 1.461 1.552 1.567 1.784 1.855 1.996 2.118 2.234 2.297 2.424 2.544 2.718 2.84 2.961 3.14 3.32 3.501 3.672 3.823 4.015 4.208 4.395 4.613 4.82 5.028 5.262 5.52 5.755 5.998 6.258 6.53 6.816 7.146 7.521 7.862 8.244 8.636 9.051 9.429 9.796 10.146 10.253 9.914 9.355 8.732 8.107 7.52 6.959 6.376 5.825 5.289 4.838 4.416 4.011 3.64 3.292 2.961 2.617 2.324 2.062 1.785 1.504 1.274 1.046 0.803 0.612 0.412 0.208 0.005 -0.228 -0.395 -0.549 -0.772 -0.928 -1.087 -1.166 -1.328 -1.493 -1.67 -1.762 -1.996 -2.055 -2.16 -2.27 -2.512 -2.65 -2.797 -2.954 -3.122 -3.327 -3.584 -4.057 -5 ,17154 ,TETRA ,17525732,Thu Nov 25 01:45:40 CET,Thu Nov 25 03:36:10 CET,0.0 0.313 0.509 0.68 0.805 0.922 1.031 1.136 1.338 1.43 1.523 1.557 1.78 1.856 2.006 2.151 2.301 2.376 2.504 2.625 2.809 2.928 3.043 3.204 3.36 3.506 3.643 3.773 3.948 4.132 4.308 4.521 4.72 4.904 5.112 5.324 5.522 5.761 6.013 6.289 6.623 6.985 7.382 7.79 8.222 8.63 9.049 9.509 9.905 10.009 9.637 8.784 7.962 7.193 6.506 5.839 5.223 4.634 4.097 3.581 3.135 2.725 2.346 2.02 1.718 1.409 1.067 0.762 0.493 0.22 -0.056 -0.296 -0.546 -0.796 -0.989 -1.187 -1.401 -1.615 -1.817 -1.954 -2.087 -2.298 -2.441 -2.586 -2.668 -2.831 -3.002 -3.191 -3.286 -3.523 -3.572 -3.677 -3.79 -4.047 -4.196 -4.357 -4.544 -4.727 -4.897 -5.124 -5.572 -6 ,8294 ,TETRA ,17525733,Thu Nov 25 01:45:40 CET,Thu Nov 25 03:35:11 CET,0.0 0.304 0.537 0.7 0.826 0.945 1.065 1.17 1.367 1.471 1.572 1.608 1.842 1.928 2.086 2.249 2.401 2.477 2.634 2.784 3.004 3.142 3.27 3.464 3.64 3.799 3.959 4.113 4.305 4.494 4.679 4.892 5.091 5.289 5.507 5.739 5.966 6.228 6.499 6.767 7.056 7.361 7.699 8.035 8.43 8.816 9.173 9.531 9.837 10.017 9.881 9.281 8.53 7.752 7.035 6.361 5.734 5.166 4.664 4.133 3.68 3.281 2.866 2.475 2.125 1.822 1.524 1.253 1.03 0.793 0.54 0.329 0.1 -0.154 -0.352 -0.533 -0.711 -0.896 -1.09 -1.229 -1.372 -1.589 -1.736 -1.89 -1.973 -2.164 -2.364 -2.554 -2.649 -2.885 -2.94 -3.035 -3.119 -3.32 -3.441 -3.58 -3.735 -3.9 -4.091 -4.374 -4.875 -7 ,1831 ,TETRA ,17525734,Thu Nov 25 01:45:40 CET,Thu Nov 25 03:34:16 CET,0.0 0.245 0.426 0.565 0.686 0.791 0.903 1.016 1.255 1.38 1.498 1.572 1.813 1.913 2.097 2.266 2.42 2.492 2.645 2.803 3.015 3.15 3.283 3.472 3.649 3.816 3.971 4.131 4.345 4.532 4.714 4.93 5.133 5.327 5.546 5.789 6.027 6.297 6.583 6.892 7.21 7.534 7.918 8.318 8.705 9.067 9.473 9.883 10.266 10.399 10.148 9.395 8.476 7.654 6.918 6.19 5.502 4.856 4.307 3.778 3.301 2.878 2.49 2.115 1.75 1.431 1.102 0.804 0.561 0.312 0.049 -0.189 -0.449 -0.704 -0.905 -1.12 -1.334 -1.557 -1.789 -1.944 -2.108 -2.369 -2.554 -2.744 -2.84 -3.031 -3.235 -3.466 -3.58 -3.839 -3.962 -4.097 -4.233 -4.544 -4.722 -4.898 -5.085 -5.313 -5.59 -5.948 -6.633 -8 ,5288 ,TETRA ,17525735,Thu Nov 25 01:45:40 CET,Thu Nov 25 03:35:20 CET,0.0 0.298 0.486 0.644 0.762 0.889 1.008 1.111 1.307 1.411 1.522 1.566 1.784 1.856 2.001 2.136 2.257 2.32 2.453 2.576 2.762 2.875 2.977 3.127 3.276 3.431 3.579 3.716 3.901 4.085 4.254 4.448 4.633 4.803 4.989 5.187 5.383 5.607 5.875 6.194 6.512 6.839 7.215 7.587 7.994 8.415 8.852 9.303 9.764 10.093 10.117 9.589 8.888 8.125 7.374 6.661 6.02 5.444 4.921 4.379 3.914 3.516 3.142 2.763 2.39 2.051 1.708 1.403 1.136 0.865 0.59 0.366 0.132 -0.113 -0.305 -0.508 -0.713 -0.926 -1.148 -1.294 -1.435 -1.655 -1.804 -1.962 -2.043 -2.197 -2.355 -2.525 -2.62 -2.854 -2.894 -2.993 -3.107 -3.346 -3.469 -3.596 -3.741 -3.919 -4.103 -4.357 -4.959 -9 ,22449 ,TETRA ,17525736,Thu Nov 25 01:45:42 CET,Thu Nov 25 03:34:48 CET,0.0 0.316 0.486 0.633 0.774 0.913 1.049 1.165 1.372 1.464 1.54 1.549 1.767 1.84 1.977 2.111 2.251 2.327 2.467 2.601 2.816 2.954 3.076 3.248 3.423 3.59 3.745 3.894 4.089 4.281 4.465 4.686 4.9 5.11 5.358 5.611 5.855 6.13 6.387 6.666 6.971 7.318 7.726 8.103 8.455 8.791 9.156 9.436 9.599 9.584 9.264 8.572 7.75 6.95 6.226 5.539 4.927 4.387 3.874 3.356 2.927 2.528 2.144 1.782 1.448 1.146 0.826 0.553 0.322 0.075 -0.177 -0.392 -0.631 -0.864 -1.042 -1.231 -1.421 -1.622 -1.824 -1.96 -2.091 -2.308 -2.474 -2.637 -2.721 -2.901 -3.078 -3.246 -3.336 -3.576 -3.633 -3.747 -3.87 -4.142 -4.289 -4.439 -4.597 -4.78 -4.972 -5.22 -5.806 -10 ,10580 ,TETRA ,17525737,Thu Nov 25 01:46:39 CET,Thu Nov 25 03:35:37 CET,0.0 0.543 0.764 0.929 1.066 1.219 1.377 1.488 1.665 1.752 1.841 1.876 2.104 2.186 2.337 2.477 2.612 2.673 2.798 2.929 3.119 3.234 3.342 3.507 3.67 3.823 3.966 4.099 4.276 4.439 4.594 4.793 4.979 5.156 5.367 5.618 5.858 6.124 6.405 6.69 6.986 7.312 7.681 8.048 8.455 8.879 9.311 9.696 10.052 10.232 10.001 9.26 8.416 7.572 6.811 6.127 5.485 4.904 4.4 3.877 3.414 2.982 2.564 2.183 1.842 1.532 1.204 0.9 0.625 0.331 0.033 -0.206 -0.449 -0.699 -0.889 -1.089 -1.309 -1.535 -1.768 -1.935 -2.111 -2.363 -2.532 -2.725 -2.825 -3.014 -3.211 -3.444 -3.566 -3.833 -3.97 -4.112 -4.251 -4.561 -4.721 -4.89 -5.096 -5.346 -5.621 -6.004 -6.765 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index 48c941f2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13k_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5212 ,TETRA ,17525738,Thu Nov 25 01:46:40 CET,Thu Nov 25 03:38:05 CET,0.0 0.361 0.577 0.752 0.917 1.069 1.195 1.303 1.504 1.609 1.716 1.751 1.974 2.061 2.225 2.384 2.545 2.626 2.782 2.931 3.16 3.308 3.447 3.642 3.838 4.039 4.228 4.406 4.646 4.872 5.085 5.352 5.625 5.898 6.211 6.583 6.94 7.312 7.723 8.179 8.665 9.213 9.872 10.513 11.243 12.055 12.965 13.99 15.178 16.534 18.009 18.916 19.224 19.205 19.039 18.798 18.528 18.254 17.995 17.735 17.474 17.242 17.0 16.733 16.492 16.273 16.041 15.824 15.624 15.404 15.189 15.02 14.833 14.64 14.494 14.332 14.157 13.979 13.794 13.662 13.524 13.315 13.16 12.992 12.907 12.726 12.542 12.347 12.245 12.019 11.946 11.827 11.686 11.413 11.27 11.109 10.948 10.764 10.556 10.273 9.648 -2 ,10654 ,TETRA ,17525739,Thu Nov 25 01:46:40 CET,Thu Nov 25 03:36:43 CET,0.0 0.374 0.568 0.716 0.844 0.961 1.089 1.214 1.431 1.532 1.628 1.694 1.938 2.039 2.241 2.428 2.629 2.729 2.906 3.08 3.324 3.478 3.632 3.85 4.068 4.29 4.502 4.703 4.969 5.239 5.492 5.801 6.101 6.385 6.713 7.096 7.472 7.875 8.308 8.783 9.297 9.879 10.519 11.136 11.881 12.743 13.737 14.79 15.93 17.18 18.513 19.383 19.722 19.785 19.654 19.412 19.14 18.847 18.566 18.245 17.938 17.675 17.434 17.211 17.005 16.797 16.56 16.35 16.169 15.976 15.781 15.6 15.404 15.224 15.09 14.948 14.795 14.644 14.497 14.384 14.271 14.107 13.982 13.851 13.784 13.635 13.461 13.276 13.189 12.971 12.904 12.806 12.694 12.444 12.325 12.213 12.074 11.893 11.695 11.424 10.681 -3 ,11010 ,TETRA ,17525740,Thu Nov 25 01:46:40 CET,Thu Nov 25 03:36:10 CET,0.0 0.401 0.634 0.803 0.955 1.103 1.241 1.368 1.615 1.729 1.833 1.887 2.124 2.218 2.408 2.585 2.759 2.846 3.017 3.174 3.388 3.528 3.67 3.878 4.086 4.291 4.488 4.673 4.916 5.16 5.397 5.682 5.96 6.237 6.555 6.926 7.29 7.701 8.153 8.631 9.142 9.7 10.358 11.04 11.805 12.632 13.601 14.682 15.945 17.312 18.731 19.665 19.95 19.95 19.814 19.619 19.414 19.188 18.948 18.696 18.445 18.195 17.963 17.736 17.501 17.284 17.057 16.831 16.626 16.433 16.242 16.073 15.896 15.721 15.581 15.433 15.279 15.128 14.975 14.865 14.749 14.562 14.434 14.312 14.249 14.108 13.953 13.783 13.688 13.464 13.405 13.296 13.181 12.961 12.829 12.681 12.535 12.355 12.112 11.801 11.167 -4 ,27785 ,TETRA ,17525741,Thu Nov 25 01:46:40 CET,Thu Nov 25 03:36:36 CET,0.0 0.276 0.44 0.582 0.715 0.858 0.989 1.114 1.347 1.469 1.602 1.719 1.978 2.088 2.299 2.503 2.693 2.782 2.964 3.144 3.413 3.589 3.756 3.998 4.23 4.449 4.666 4.871 5.128 5.391 5.648 5.959 6.27 6.568 6.901 7.278 7.659 8.08 8.522 8.99 9.499 10.103 10.788 11.43 12.206 13.086 14.066 15.15 16.41 17.813 19.315 20.239 20.466 20.52 20.476 20.304 20.078 19.797 19.499 19.197 18.946 18.701 18.47 18.26 18.043 17.851 17.653 17.457 17.274 17.086 16.912 16.761 16.597 16.423 16.288 16.145 16.001 15.858 15.701 15.585 15.465 15.282 15.159 15.025 14.957 14.815 14.655 14.484 14.399 14.188 14.149 14.055 13.949 13.747 13.622 13.475 13.322 13.148 12.952 12.683 11.99 -5 ,1607 ,TETRA ,17525742,Thu Nov 25 01:46:40 CET,Thu Nov 25 03:37:26 CET,0.0 0.318 0.531 0.692 0.834 0.96 1.09 1.216 1.451 1.569 1.684 1.75 1.992 2.087 2.263 2.424 2.588 2.674 2.837 2.994 3.232 3.386 3.538 3.755 3.959 4.16 4.359 4.553 4.806 5.067 5.33 5.645 5.944 6.237 6.575 6.941 7.297 7.694 8.127 8.572 9.029 9.563 10.188 10.814 11.535 12.319 13.204 14.211 15.33 16.551 17.876 18.641 18.869 18.823 18.648 18.431 18.195 17.943 17.695 17.407 17.127 16.882 16.636 16.391 16.161 15.939 15.71 15.51 15.321 15.122 14.929 14.781 14.629 14.442 14.295 14.147 13.992 13.838 13.678 13.565 13.45 13.271 13.145 13.016 12.947 12.79 12.619 12.442 12.352 12.131 12.072 11.969 11.86 11.637 11.504 11.347 11.181 11.011 10.824 10.545 9.751 -6 ,23058 ,TETRA ,17525743,Thu Nov 25 01:46:40 CET,Thu Nov 25 03:36:43 CET,0.0 0.372 0.562 0.718 0.88 1.015 1.136 1.253 1.475 1.583 1.68 1.728 1.965 2.061 2.257 2.442 2.616 2.709 2.901 3.082 3.343 3.505 3.664 3.905 4.132 4.35 4.56 4.773 5.059 5.328 5.594 5.918 6.225 6.517 6.857 7.241 7.619 8.054 8.507 8.977 9.489 10.05 10.709 11.396 12.186 13.051 14.048 15.122 16.365 17.791 19.286 20.358 20.762 20.77 20.646 20.469 20.258 20.017 19.781 19.518 19.277 19.052 18.835 18.612 18.395 18.202 18.005 17.828 17.662 17.481 17.298 17.151 16.994 16.824 16.686 16.541 16.4 16.259 16.101 15.982 15.86 15.699 15.585 15.451 15.381 15.236 15.085 14.92 14.828 14.606 14.568 14.464 14.349 14.141 14.021 13.877 13.723 13.543 13.301 13.007 12.178 -7 ,13856 ,TETRA ,17525744,Thu Nov 25 01:46:40 CET,Thu Nov 25 03:36:35 CET,0.0 0.325 0.539 0.705 0.86 1.002 1.131 1.271 1.517 1.625 1.737 1.795 2.029 2.114 2.302 2.488 2.667 2.753 2.91 3.065 3.297 3.447 3.6 3.841 4.077 4.296 4.511 4.725 5.008 5.283 5.536 5.836 6.136 6.432 6.769 7.143 7.501 7.898 8.333 8.785 9.25 9.804 10.462 11.093 11.813 12.642 13.611 14.653 15.795 17.058 18.5 19.341 19.557 19.566 19.397 19.141 18.9 18.666 18.396 18.073 17.804 17.565 17.319 17.08 16.847 16.621 16.382 16.158 15.967 15.776 15.561 15.383 15.205 15.016 14.867 14.715 14.558 14.38 14.19 14.063 13.93 13.712 13.559 13.417 13.347 13.197 13.042 12.872 12.773 12.547 12.486 12.388 12.277 11.999 11.864 11.725 11.56 11.374 11.175 10.925 10.277 -8 ,28482 ,TETRA ,17525745,Thu Nov 25 01:46:40 CET,Thu Nov 25 03:37:15 CET,0.0 0.351 0.555 0.721 0.859 0.995 1.13 1.262 1.507 1.618 1.723 1.784 2.03 2.137 2.361 2.581 2.773 2.863 3.032 3.197 3.451 3.625 3.788 4.012 4.239 4.46 4.676 4.89 5.159 5.414 5.671 5.975 6.266 6.564 6.911 7.288 7.655 8.058 8.494 8.954 9.413 9.924 10.568 11.222 11.977 12.816 13.727 14.744 15.898 17.187 18.546 19.395 19.675 19.629 19.449 19.209 18.928 18.631 18.344 18.034 17.765 17.529 17.286 17.036 16.81 16.598 16.358 16.141 15.954 15.758 15.561 15.395 15.213 15.027 14.875 14.712 14.545 14.382 14.204 14.066 13.93 13.735 13.604 13.471 13.406 13.269 13.115 12.937 12.845 12.623 12.559 12.451 12.332 12.091 11.967 11.82 11.675 11.534 11.314 10.997 10.199 -9 ,17526 ,TETRA ,17525746,Thu Nov 25 01:46:41 CET,Thu Nov 25 03:36:52 CET,0.0 0.456 0.628 0.802 0.949 1.077 1.195 1.303 1.529 1.635 1.748 1.847 2.092 2.192 2.4 2.601 2.789 2.886 3.076 3.25 3.505 3.672 3.825 4.05 4.263 4.475 4.693 4.898 5.161 5.432 5.701 6.022 6.326 6.619 6.957 7.327 7.679 8.075 8.503 8.957 9.452 10.049 10.736 11.394 12.158 13.025 14.003 15.053 16.296 17.694 19.227 20.239 20.545 20.584 20.521 20.312 20.049 19.779 19.541 19.277 18.993 18.737 18.511 18.278 18.044 17.834 17.621 17.418 17.228 17.034 16.83 16.651 16.459 16.255 16.096 15.929 15.756 15.574 15.374 15.246 15.121 14.897 14.733 14.564 14.484 14.31 14.119 13.931 13.836 13.609 13.533 13.438 13.334 13.098 12.971 12.833 12.682 12.507 12.297 12.02 11.394 -10 ,13814 ,TETRA ,17525747,Thu Nov 25 01:47:37 CET,Thu Nov 25 03:38:54 CET,0.0 0.419 0.613 0.796 0.956 1.101 1.244 1.382 1.621 1.731 1.836 1.881 2.117 2.214 2.408 2.597 2.789 2.885 3.072 3.257 3.521 3.686 3.839 4.077 4.31 4.52 4.723 4.936 5.213 5.471 5.72 6.026 6.324 6.618 6.957 7.336 7.707 8.122 8.57 9.034 9.527 10.073 10.705 11.343 12.073 12.936 13.94 14.994 16.219 17.614 19.075 20.002 20.217 20.15 20.04 19.867 19.604 19.326 19.084 18.814 18.573 18.353 18.11 17.873 17.663 17.454 17.207 16.984 16.808 16.639 16.464 16.312 16.141 15.969 15.84 15.696 15.56 15.418 15.26 15.15 15.03 14.841 14.713 14.563 14.49 14.342 14.173 14.018 13.938 13.716 13.64 13.528 13.42 13.213 13.101 12.971 12.835 12.676 12.43 12.089 11.293 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt deleted file mode 100644 index f0765fb5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13m_CAT-13n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25199 ,TETRA ,17525748,Thu Nov 25 01:47:38 CET,Thu Nov 25 03:37:05 CET,0.0 0.523 0.784 0.951 1.085 1.202 1.307 1.411 1.617 1.708 1.795 1.747 2.046 2.132 2.285 2.415 2.539 2.601 2.721 2.836 3.022 3.142 3.255 3.421 3.571 3.717 3.868 4.006 4.177 4.338 4.497 4.704 4.887 5.045 5.228 5.415 5.583 5.773 5.981 6.195 6.413 6.65 6.885 7.096 7.294 7.473 7.654 7.736 7.681 7.357 6.404 4.907 3.448 2.188 1.136 0.206 -0.619 -1.406 -2.099 -2.784 -3.359 -3.86 -4.351 -4.835 -5.289 -5.705 -6.126 -6.5 -6.822 -7.139 -7.46 -7.738 -8.024 -8.305 -8.511 -8.729 -8.959 -9.181 -9.409 -9.571 -9.734 -9.97 -10.138 -10.317 -10.408 -10.601 -10.803 -11.013 -11.117 -11.435 -11.427 -11.556 -11.684 -11.932 -12.074 -12.215 -12.371 -12.569 -12.777 -13.033 -14.006 -2 ,3874 ,TETRA ,17525749,Thu Nov 25 01:47:39 CET,Thu Nov 25 03:36:40 CET,0.0 0.544 0.776 0.944 1.076 1.207 1.336 1.45 1.657 1.756 1.849 1.816 2.119 2.201 2.359 2.51 2.647 2.709 2.827 2.937 3.086 3.193 3.305 3.455 3.595 3.727 3.846 3.962 4.109 4.253 4.391 4.555 4.724 4.875 5.04 5.226 5.397 5.583 5.78 5.995 6.221 6.44 6.673 6.89 7.092 7.279 7.449 7.575 7.581 7.274 6.364 4.978 3.669 2.448 1.366 0.394 -0.474 -1.262 -1.942 -2.611 -3.167 -3.673 -4.17 -4.625 -5.054 -5.453 -5.856 -6.215 -6.529 -6.84 -7.161 -7.424 -7.692 -7.972 -8.204 -8.448 -8.675 -8.902 -9.164 -9.348 -9.527 -9.811 -10.02 -10.235 -10.342 -10.556 -10.786 -11.028 -11.151 -11.499 -11.522 -11.651 -11.772 -11.992 -12.113 -12.248 -12.396 -12.547 -12.712 -12.926 -13.378 -3 ,26738 ,TETRA ,17525750,Thu Nov 25 01:47:40 CET,Thu Nov 25 03:36:48 CET,0.0 0.478 0.734 0.91 1.04 1.164 1.28 1.393 1.604 1.698 1.785 1.734 2.024 2.097 2.243 2.369 2.488 2.549 2.663 2.769 2.928 3.031 3.125 3.27 3.405 3.538 3.673 3.813 4.009 4.189 4.352 4.55 4.734 4.9 5.097 5.323 5.531 5.747 5.975 6.203 6.435 6.662 6.89 7.109 7.321 7.498 7.638 7.722 7.658 7.347 6.497 5.063 3.672 2.427 1.292 0.277 -0.545 -1.284 -1.95 -2.618 -3.195 -3.701 -4.185 -4.652 -5.087 -5.469 -5.859 -6.211 -6.518 -6.838 -7.167 -7.436 -7.699 -7.992 -8.226 -8.464 -8.714 -8.948 -9.172 -9.329 -9.492 -9.739 -9.92 -10.105 -10.19 -10.376 -10.575 -10.77 -10.873 -11.202 -11.199 -11.32 -11.445 -11.696 -11.826 -11.965 -12.116 -12.301 -12.502 -12.767 -13.713 -4 ,22122 ,TETRA ,17525751,Thu Nov 25 01:47:42 CET,Thu Nov 25 03:37:14 CET,0.0 0.521 0.766 0.955 1.096 1.233 1.356 1.469 1.692 1.785 1.869 1.806 2.102 2.186 2.346 2.5 2.651 2.718 2.844 2.98 3.165 3.267 3.372 3.525 3.665 3.802 3.928 4.04 4.184 4.325 4.467 4.632 4.786 4.944 5.126 5.322 5.498 5.697 5.91 6.132 6.365 6.595 6.826 7.015 7.194 7.369 7.518 7.611 7.609 7.322 6.431 4.935 3.504 2.268 1.18 0.209 -0.649 -1.468 -2.159 -2.818 -3.376 -3.891 -4.391 -4.857 -5.294 -5.66 -6.034 -6.389 -6.693 -7.004 -7.305 -7.543 -7.798 -8.065 -8.274 -8.487 -8.712 -8.942 -9.169 -9.317 -9.47 -9.714 -9.875 -10.048 -10.137 -10.312 -10.495 -10.677 -10.777 -11.11 -11.125 -11.243 -11.364 -11.633 -11.763 -11.895 -12.036 -12.181 -12.354 -12.588 -12.957 -5 ,732 ,TETRA ,17525752,Thu Nov 25 01:47:40 CET,Thu Nov 25 03:41:18 CET,0.0 0.426 0.663 0.846 0.989 1.117 1.228 1.346 1.556 1.637 1.724 1.697 2.002 2.087 2.231 2.371 2.501 2.561 2.681 2.802 2.978 3.079 3.176 3.338 3.484 3.622 3.759 3.902 4.093 4.261 4.42 4.61 4.789 4.969 5.169 5.372 5.558 5.762 5.975 6.197 6.435 6.698 6.982 7.243 7.461 7.638 7.821 7.919 7.866 7.552 6.666 5.18 3.783 2.589 1.538 0.585 -0.252 -1.04 -1.732 -2.427 -3.02 -3.547 -4.027 -4.475 -4.903 -5.286 -5.66 -5.984 -6.276 -6.587 -6.901 -7.155 -7.432 -7.715 -7.928 -8.138 -8.345 -8.552 -8.783 -8.951 -9.129 -9.404 -9.592 -9.785 -9.873 -10.052 -10.244 -10.448 -10.559 -10.887 -10.86 -10.966 -11.085 -11.345 -11.475 -11.607 -11.76 -11.933 -12.155 -12.477 -13.099 -6 ,25838 ,TETRA ,17525753,Thu Nov 25 01:47:39 CET,Thu Nov 25 03:36:55 CET,0.0 0.487 0.684 0.844 0.985 1.1 1.206 1.322 1.531 1.608 1.689 1.666 1.969 2.049 2.195 2.337 2.488 2.556 2.687 2.812 2.981 3.081 3.17 3.3 3.425 3.555 3.687 3.824 4.012 4.197 4.373 4.574 4.754 4.924 5.113 5.305 5.487 5.705 5.945 6.165 6.356 6.58 6.83 7.031 7.218 7.346 7.48 7.544 7.414 6.977 5.956 4.537 3.196 1.976 0.935 -0.043 -0.936 -1.718 -2.367 -3.034 -3.621 -4.14 -4.658 -5.137 -5.565 -5.962 -6.358 -6.68 -6.952 -7.246 -7.528 -7.756 -8.001 -8.245 -8.435 -8.633 -8.845 -9.072 -9.302 -9.457 -9.625 -9.876 -10.037 -10.216 -10.309 -10.488 -10.679 -10.881 -10.99 -11.329 -11.333 -11.449 -11.566 -11.814 -11.95 -12.097 -12.258 -12.418 -12.602 -12.826 -13.26 -7 ,25243 ,TETRA ,17525754,Thu Nov 25 01:47:40 CET,Thu Nov 25 03:36:49 CET,0.0 0.529 0.797 0.985 1.141 1.279 1.391 1.511 1.749 1.841 1.936 1.893 2.171 2.244 2.38 2.517 2.651 2.713 2.84 2.959 3.117 3.22 3.324 3.48 3.628 3.763 3.889 4.016 4.164 4.309 4.453 4.629 4.823 5.006 5.213 5.431 5.637 5.857 6.064 6.261 6.444 6.637 6.868 7.087 7.303 7.499 7.66 7.737 7.639 7.255 6.332 4.895 3.609 2.478 1.386 0.419 -0.373 -1.147 -1.82 -2.473 -3.03 -3.513 -4.0 -4.456 -4.873 -5.254 -5.64 -6.006 -6.324 -6.649 -6.992 -7.266 -7.551 -7.859 -8.089 -8.326 -8.566 -8.789 -9.015 -9.174 -9.346 -9.606 -9.779 -9.958 -10.048 -10.228 -10.415 -10.611 -10.711 -11.045 -11.042 -11.158 -11.284 -11.547 -11.692 -11.837 -11.993 -12.196 -12.403 -12.62 -13.028 -8 ,24000 ,TETRA ,17525755,Thu Nov 25 01:47:40 CET,Thu Nov 25 03:36:51 CET,0.0 0.376 0.598 0.764 0.894 1.017 1.132 1.242 1.438 1.526 1.614 1.57 1.861 1.941 2.082 2.217 2.356 2.427 2.567 2.705 2.897 3.019 3.14 3.305 3.464 3.623 3.773 3.914 4.098 4.265 4.42 4.622 4.81 4.977 5.162 5.37 5.579 5.809 6.051 6.28 6.486 6.716 6.962 7.204 7.449 7.649 7.81 7.879 7.836 7.546 6.634 5.23 3.934 2.729 1.677 0.724 -0.103 -0.838 -1.496 -2.19 -2.787 -3.291 -3.771 -4.218 -4.62 -4.984 -5.365 -5.697 -5.986 -6.302 -6.635 -6.917 -7.191 -7.469 -7.696 -7.946 -8.201 -8.451 -8.699 -8.855 -9.017 -9.27 -9.442 -9.627 -9.721 -9.892 -10.072 -10.282 -10.383 -10.697 -10.68 -10.795 -10.9 -11.132 -11.271 -11.422 -11.59 -11.766 -11.951 -12.172 -12.679 -9 ,18355 ,TETRA ,17525756,Thu Nov 25 01:47:41 CET,Thu Nov 25 03:37:02 CET,0.0 0.398 0.63 0.805 0.957 1.081 1.188 1.292 1.497 1.598 1.689 1.639 1.934 2.023 2.201 2.362 2.512 2.587 2.741 2.895 3.117 3.25 3.382 3.559 3.714 3.87 4.03 4.184 4.364 4.524 4.676 4.861 5.038 5.207 5.395 5.595 5.794 6.006 6.23 6.472 6.725 6.977 7.219 7.462 7.703 7.92 8.099 8.161 8.085 7.702 6.679 5.07 3.673 2.517 1.495 0.569 -0.234 -0.96 -1.61 -2.275 -2.829 -3.337 -3.834 -4.3 -4.733 -5.134 -5.535 -5.878 -6.18 -6.494 -6.827 -7.109 -7.385 -7.661 -7.89 -8.126 -8.373 -8.621 -8.863 -9.036 -9.217 -9.483 -9.662 -9.868 -9.978 -10.176 -10.379 -10.596 -10.701 -11.032 -11.029 -11.138 -11.25 -11.504 -11.645 -11.783 -11.925 -12.093 -12.276 -12.476 -12.973 -10 ,19937 ,TETRA ,17525757,Thu Nov 25 01:47:41 CET,Thu Nov 25 03:40:37 CET,0.0 0.464 0.683 0.858 0.997 1.12 1.225 1.336 1.563 1.664 1.758 1.71 2.001 2.086 2.251 2.415 2.585 2.664 2.808 2.956 3.162 3.273 3.384 3.558 3.722 3.87 4.021 4.171 4.352 4.518 4.668 4.858 5.045 5.217 5.407 5.611 5.804 6.021 6.236 6.441 6.647 6.863 7.091 7.304 7.533 7.73 7.867 7.895 7.823 7.527 6.621 5.239 3.929 2.752 1.768 0.872 0.041 -0.734 -1.397 -2.052 -2.619 -3.126 -3.598 -4.053 -4.48 -4.864 -5.272 -5.629 -5.925 -6.237 -6.56 -6.816 -7.071 -7.338 -7.548 -7.766 -8.007 -8.247 -8.475 -8.636 -8.811 -9.08 -9.27 -9.473 -9.59 -9.825 -10.051 -10.302 -10.428 -10.767 -10.803 -10.942 -11.081 -11.386 -11.54 -11.692 -11.842 -12.008 -12.222 -12.488 -12.877 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt deleted file mode 100644 index 6b1a9331..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32083 ,TETRA ,17525758,Thu Nov 25 01:48:37 CET,Thu Nov 25 03:37:49 CET,0.0 0.427 0.678 0.901 1.117 1.327 1.524 1.713 2.096 2.278 2.452 2.554 2.933 3.088 3.388 3.696 3.995 4.138 4.42 4.701 5.126 5.396 5.662 6.066 6.45 6.827 7.199 7.561 8.048 8.522 8.993 9.581 10.15 10.718 11.393 12.157 12.912 13.783 14.762 15.82 16.957 18.275 19.881 21.561 23.582 25.934 28.731 32.031 36.175 41.502 48.702 55.455 59.929 63.159 65.578 67.472 68.932 70.122 71.056 71.895 72.56 73.114 73.603 74.036 74.418 74.744 75.065 75.335 75.546 75.742 75.931 76.076 76.213 76.354 76.46 76.553 76.639 76.727 76.821 76.874 76.913 76.961 76.995 77.024 77.036 77.069 77.1 77.125 77.128 76.983 77.117 77.092 77.062 76.998 76.965 76.92 76.857 76.8 76.73 76.598 76.392 -2 ,17770 ,TETRA ,17525759,Thu Nov 25 01:56:39 CET,Thu Nov 25 03:46:08 CET,0.0 0.426 0.72 0.957 1.171 1.373 1.567 1.751 2.121 2.323 2.521 2.676 3.074 3.245 3.584 3.92 4.242 4.4 4.712 5.022 5.479 5.773 6.064 6.496 6.911 7.321 7.732 8.134 8.662 9.173 9.676 10.292 10.904 11.502 12.202 13.013 13.8 14.705 15.704 16.774 17.939 19.289 20.918 22.601 24.634 26.972 29.756 33.055 37.163 42.516 49.8 56.567 61.052 64.293 66.703 68.569 70.004 71.182 72.107 72.939 73.588 74.127 74.585 74.967 75.301 75.585 75.868 76.113 76.306 76.468 76.623 76.751 76.855 76.94 77.01 77.087 77.166 77.258 77.341 77.387 77.439 77.522 77.573 77.616 77.632 77.653 77.665 77.666 77.662 77.519 77.671 77.662 77.651 77.632 77.628 77.619 77.59 77.55 77.497 77.442 77.333 -3 ,27667 ,TETRA ,17525760,Thu Nov 25 01:56:39 CET,Thu Nov 25 03:45:21 CET,0.0 0.531 0.82 1.047 1.256 1.452 1.632 1.803 2.15 2.321 2.485 2.587 2.968 3.138 3.468 3.785 4.108 4.27 4.593 4.91 5.36 5.656 5.942 6.346 6.757 7.165 7.567 7.962 8.495 9.028 9.535 10.139 10.738 11.339 12.045 12.848 13.631 14.514 15.494 16.56 17.701 19.023 20.653 22.368 24.46 26.871 29.751 33.168 37.438 42.89 50.093 56.875 61.511 64.886 67.389 69.361 70.9 72.112 73.056 73.927 74.591 75.131 75.612 76.027 76.371 76.657 76.93 77.157 77.333 77.485 77.64 77.773 77.903 78.038 78.136 78.222 78.3 78.382 78.463 78.509 78.545 78.588 78.613 78.642 78.662 78.685 78.698 78.726 78.739 78.59 78.726 78.728 78.729 78.726 78.713 78.689 78.661 78.622 78.56 78.474 78.268 -4 ,25612 ,TETRA ,17525761,Thu Nov 25 01:56:39 CET,Thu Nov 25 03:46:31 CET,0.0 0.417 0.682 0.924 1.136 1.333 1.523 1.702 2.086 2.273 2.441 2.542 2.925 3.085 3.397 3.702 4.001 4.147 4.43 4.711 5.127 5.393 5.651 6.035 6.42 6.806 7.188 7.57 8.064 8.529 8.993 9.58 10.16 10.732 11.406 12.188 12.965 13.868 14.861 15.905 17.04 18.376 20.001 21.681 23.74 26.146 29.01 32.411 36.687 42.18 49.498 56.314 60.952 64.307 66.751 68.639 70.09 71.278 72.211 73.061 73.725 74.267 74.747 75.161 75.517 75.808 76.074 76.302 76.495 76.681 76.848 76.971 77.096 77.223 77.314 77.4 77.474 77.534 77.59 77.612 77.621 77.638 77.646 77.646 77.644 77.636 77.62 77.582 77.553 77.398 77.537 77.527 77.519 77.482 77.456 77.435 77.407 77.369 77.316 77.24 77.118 -5 ,7039 ,TETRA ,17525762,Thu Nov 25 01:56:39 CET,Thu Nov 25 03:45:55 CET,0.0 0.417 0.671 0.913 1.142 1.337 1.53 1.73 2.091 2.253 2.416 2.515 2.899 3.067 3.392 3.694 3.993 4.135 4.415 4.706 5.14 5.425 5.711 6.141 6.566 6.982 7.383 7.774 8.302 8.821 9.318 9.919 10.496 11.061 11.729 12.518 13.308 14.196 15.178 16.242 17.394 18.732 20.34 22.017 24.035 26.377 29.221 32.587 36.821 42.269 49.678 56.712 61.338 64.566 66.913 68.768 70.213 71.379 72.295 73.126 73.771 74.306 74.775 75.181 75.542 75.847 76.124 76.344 76.534 76.727 76.914 77.048 77.169 77.28 77.366 77.459 77.536 77.604 77.674 77.719 77.757 77.819 77.874 77.908 77.917 77.934 77.947 77.96 77.964 77.825 77.968 77.959 77.947 77.911 77.877 77.835 77.788 77.732 77.658 77.568 77.392 -6 ,8534 ,TETRA ,17525763,Thu Nov 25 01:56:39 CET,Thu Nov 25 03:46:17 CET,0.0 0.761 1.19 1.533 1.809 2.072 2.322 2.557 2.983 3.186 3.379 3.543 3.952 4.125 4.467 4.807 5.127 5.283 5.601 5.915 6.373 6.671 6.964 7.395 7.82 8.234 8.624 9.009 9.519 10.018 10.502 11.094 11.676 12.242 12.919 13.726 14.528 15.42 16.409 17.492 18.645 19.957 21.538 23.194 25.221 27.597 30.449 33.834 38.006 43.252 50.268 56.887 61.313 64.529 66.88 68.7 70.127 71.297 72.204 73.023 73.678 74.205 74.671 75.075 75.411 75.68 75.943 76.174 76.348 76.507 76.661 76.779 76.892 77.011 77.1 77.179 77.261 77.341 77.421 77.469 77.504 77.554 77.59 77.62 77.633 77.654 77.656 77.658 77.663 77.516 77.644 77.632 77.622 77.607 77.579 77.544 77.504 77.452 77.393 77.319 77.162 -7 ,22356 ,TETRA ,17525764,Thu Nov 25 01:56:39 CET,Thu Nov 25 03:46:39 CET,0.0 0.537 0.776 1.007 1.231 1.426 1.599 1.797 2.178 2.351 2.529 2.656 3.04 3.196 3.509 3.814 4.116 4.261 4.555 4.852 5.299 5.602 5.901 6.335 6.757 7.166 7.563 7.968 8.49 8.98 9.479 10.094 10.689 11.286 12.0 12.819 13.614 14.486 15.437 16.469 17.569 18.876 20.473 22.119 24.126 26.484 29.296 32.599 36.736 41.964 49.023 55.729 60.205 63.443 65.856 67.741 69.204 70.38 71.298 72.145 72.805 73.34 73.815 74.233 74.591 74.9 75.202 75.451 75.651 75.844 76.035 76.186 76.332 76.48 76.585 76.681 76.769 76.852 76.946 77.006 77.057 77.115 77.145 77.177 77.188 77.199 77.22 77.243 77.243 77.096 77.242 77.239 77.238 77.232 77.217 77.199 77.169 77.113 77.057 76.993 76.713 -8 ,4848 ,TETRA ,17525765,Thu Nov 25 01:56:39 CET,Thu Nov 25 03:46:30 CET,0.0 0.44 0.721 0.987 1.229 1.45 1.645 1.827 2.198 2.374 2.542 2.647 3.029 3.181 3.49 3.803 4.097 4.24 4.522 4.803 5.22 5.495 5.759 6.154 6.547 6.925 7.301 7.672 8.171 8.669 9.15 9.733 10.306 10.88 11.573 12.367 13.143 14.027 14.989 16.045 17.213 18.555 20.195 21.918 23.99 26.394 29.264 32.622 36.786 42.111 49.251 55.953 60.449 63.689 66.025 67.832 69.257 70.401 71.301 72.126 72.763 73.28 73.735 74.124 74.459 74.744 75.019 75.26 75.462 75.655 75.836 75.974 76.111 76.241 76.34 76.43 76.51 76.596 76.676 76.724 76.764 76.825 76.865 76.896 76.906 76.922 76.938 76.947 76.944 76.797 76.941 76.932 76.917 76.884 76.853 76.816 76.766 76.711 76.642 76.538 76.267 -9 ,22806 ,TETRA ,17525766,Thu Nov 25 01:56:40 CET,Thu Nov 25 03:45:00 CET,0.0 0.369 0.623 0.854 1.066 1.261 1.448 1.64 2.002 2.17 2.34 2.457 2.837 2.988 3.296 3.59 3.877 4.023 4.312 4.593 5.001 5.269 5.529 5.911 6.286 6.665 7.047 7.413 7.902 8.388 8.878 9.493 10.081 10.671 11.371 12.136 12.898 13.768 14.727 15.79 16.941 18.282 19.915 21.589 23.615 25.965 28.793 32.221 36.505 41.839 48.866 55.485 59.938 63.167 65.552 67.415 68.864 70.043 70.989 71.846 72.496 73.027 73.502 73.904 74.239 74.516 74.773 74.99 75.171 75.344 75.512 75.633 75.739 75.845 75.93 76.012 76.095 76.17 76.222 76.264 76.314 76.375 76.416 76.447 76.458 76.477 76.488 76.48 76.476 76.332 76.459 76.451 76.449 76.418 76.391 76.357 76.3 76.242 76.199 76.134 76.004 -10 ,8926 ,TETRA ,17525767,Thu Nov 25 01:56:39 CET,Thu Nov 25 03:46:13 CET,0.0 0.605 0.873 1.122 1.358 1.578 1.764 1.945 2.303 2.465 2.618 2.705 3.089 3.244 3.551 3.879 4.197 4.344 4.631 4.91 5.318 5.595 5.86 6.244 6.638 7.03 7.413 7.782 8.263 8.742 9.219 9.812 10.408 11.0 11.709 12.51 13.283 14.146 15.101 16.162 17.337 18.693 20.281 21.921 23.914 26.238 29.046 32.407 36.597 41.881 48.907 55.529 59.978 63.167 65.514 67.331 68.753 69.919 70.823 71.627 72.256 72.798 73.275 73.673 74.016 74.298 74.55 74.76 74.935 75.1 75.261 75.389 75.502 75.605 75.682 75.75 75.809 75.861 75.906 75.934 75.955 75.979 75.991 76.002 76.007 76.007 75.979 75.935 75.911 75.753 75.882 75.861 75.845 75.827 75.797 75.759 75.722 75.682 75.635 75.576 75.463 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt deleted file mode 100644 index 0b72e4b7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-13n_CAT-13o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30575 ,TETRA ,17525768,Thu Nov 25 01:56:41 CET,Thu Nov 25 03:45:43 CET,0.0 0.508 0.792 1.019 1.228 1.432 1.626 1.815 2.173 2.339 2.508 2.625 3.012 3.17 3.481 3.796 4.092 4.239 4.521 4.808 5.252 5.544 5.834 6.269 6.698 7.096 7.491 7.891 8.406 8.915 9.409 10.015 10.62 11.214 11.931 12.762 13.564 14.474 15.484 16.585 17.789 19.161 20.774 22.45 24.471 26.855 29.801 33.268 37.572 43.115 50.66 57.872 62.686 66.139 68.71 70.702 72.214 73.423 74.389 75.295 76.011 76.596 77.104 77.548 77.919 78.228 78.527 78.78 78.988 79.187 79.37 79.503 79.623 79.729 79.801 79.872 79.943 80.02 80.104 80.15 80.187 80.234 80.259 80.287 80.298 80.306 80.312 80.317 80.318 80.177 80.315 80.305 80.288 80.242 80.223 80.196 80.15 80.086 80.01 79.92 79.553 -2 ,25554 ,TETRA ,17525769,Thu Nov 25 01:56:39 CET,Thu Nov 25 03:46:28 CET,0.0 0.537 0.863 1.142 1.368 1.568 1.739 1.909 2.247 2.414 2.577 2.661 3.034 3.185 3.486 3.781 4.066 4.211 4.488 4.762 5.179 5.447 5.709 6.106 6.498 6.886 7.284 7.691 8.226 8.748 9.259 9.874 10.473 11.067 11.772 12.592 13.4 14.301 15.29 16.372 17.555 18.922 20.556 22.26 24.346 26.786 29.721 33.199 37.544 43.149 50.755 57.795 62.467 65.885 68.426 70.425 71.962 73.177 74.15 75.046 75.738 76.289 76.763 77.174 77.523 77.808 78.094 78.339 78.525 78.697 78.86 78.978 79.094 79.215 79.303 79.389 79.465 79.546 79.629 79.673 79.714 79.768 79.796 79.821 79.834 79.856 79.853 79.848 79.852 79.723 79.875 79.87 79.864 79.827 79.798 79.765 79.721 79.651 79.552 79.428 79.143 -3 ,23057 ,TETRA ,17525770,Thu Nov 25 01:56:39 CET,Thu Nov 25 03:45:46 CET,0.0 0.437 0.795 1.074 1.339 1.613 1.874 2.1 2.531 2.747 2.953 3.105 3.498 3.675 4.02 4.354 4.682 4.841 5.153 5.447 5.883 6.168 6.446 6.863 7.269 7.672 8.071 8.464 8.976 9.476 9.974 10.599 11.206 11.798 12.495 13.291 14.093 14.993 15.976 17.069 18.257 19.627 21.279 22.986 25.044 27.413 30.256 33.711 38.099 43.753 51.381 58.568 63.399 66.9 69.499 71.497 73.067 74.351 75.329 76.203 76.893 77.453 77.936 78.353 78.709 79.01 79.308 79.548 79.728 79.896 80.04 80.146 80.266 80.387 80.47 80.557 80.65 80.738 80.821 80.869 80.905 80.96 81.003 81.035 81.047 81.071 81.085 81.102 81.104 80.958 81.096 81.09 81.081 81.046 81.009 80.949 80.892 80.832 80.748 80.652 80.361 -4 ,18385 ,TETRA ,17525771,Thu Nov 25 01:57:38 CET,Thu Nov 25 03:47:03 CET,0.0 0.944 1.272 1.561 1.796 1.988 2.175 2.353 2.702 2.88 3.06 3.202 3.616 3.802 4.154 4.491 4.806 4.961 5.29 5.613 6.051 6.334 6.616 7.051 7.488 7.899 8.299 8.705 9.235 9.744 10.242 10.854 11.457 12.05 12.749 13.545 14.328 15.206 16.18 17.263 18.436 19.787 21.449 23.223 25.358 27.811 30.771 34.265 38.594 44.147 51.663 58.815 63.502 66.799 69.269 71.205 72.695 73.921 74.898 75.78 76.474 77.051 77.554 77.994 78.4 78.752 79.079 79.351 79.563 79.754 79.939 80.079 80.217 80.349 80.442 80.539 80.637 80.725 80.803 80.848 80.894 80.95 80.973 81.002 81.013 81.028 81.048 81.055 81.051 80.904 81.034 81.027 81.008 80.96 80.931 80.891 80.85 80.798 80.728 80.639 80.414 -5 ,21461 ,TETRA ,17525772,Thu Nov 25 01:57:38 CET,Thu Nov 25 03:47:50 CET,0.0 0.387 0.644 0.878 1.092 1.286 1.469 1.651 2.002 2.168 2.335 2.434 2.809 2.966 3.286 3.593 3.891 4.036 4.324 4.628 5.084 5.38 5.665 6.085 6.508 6.914 7.318 7.73 8.272 8.792 9.293 9.916 10.528 11.124 11.836 12.647 13.45 14.38 15.406 16.51 17.698 19.065 20.709 22.414 24.483 26.868 29.742 33.221 37.61 43.219 50.78 57.86 62.526 65.859 68.338 70.272 71.76 72.971 73.938 74.808 75.473 76.014 76.493 76.917 77.273 77.57 77.854 78.091 78.276 78.449 78.618 78.73 78.834 78.936 79.002 79.067 79.132 79.199 79.258 79.287 79.309 79.33 79.331 79.333 79.338 79.34 79.326 79.295 79.286 79.14 79.269 79.263 79.253 79.225 79.196 79.159 79.12 79.044 78.938 78.807 78.543 -6 ,939 ,TETRA ,17525773,Thu Nov 25 01:57:38 CET,Thu Nov 25 03:47:24 CET,0.0 0.511 0.79 1.032 1.226 1.416 1.611 1.81 2.191 2.382 2.57 2.677 3.054 3.2 3.495 3.806 4.108 4.256 4.559 4.859 5.301 5.585 5.859 6.273 6.68 7.082 7.485 7.867 8.366 8.871 9.381 10.005 10.602 11.189 11.893 12.693 13.49 14.391 15.371 16.459 17.632 18.969 20.598 22.302 24.336 26.712 29.581 33.016 37.386 42.899 50.217 57.188 61.848 65.209 67.697 69.608 71.103 72.327 73.278 74.146 74.828 75.383 75.871 76.287 76.638 76.932 77.209 77.445 77.63 77.801 77.963 78.091 78.215 78.326 78.404 78.483 78.553 78.61 78.669 78.704 78.727 78.748 78.755 78.748 78.745 78.743 78.724 78.701 78.696 78.551 78.665 78.645 78.622 78.553 78.506 78.462 78.427 78.38 78.313 78.209 77.816 -7 ,6367 ,TETRA ,17525774,Thu Nov 25 01:57:40 CET,Thu Nov 25 03:46:39 CET,0.0 0.397 0.659 0.887 1.097 1.319 1.535 1.727 2.088 2.268 2.452 2.602 3.007 3.193 3.553 3.901 4.234 4.396 4.708 5.022 5.479 5.767 6.062 6.505 6.929 7.338 7.737 8.141 8.68 9.194 9.684 10.29 10.89 11.476 12.174 12.971 13.754 14.653 15.67 16.771 17.952 19.344 21.028 22.775 24.884 27.303 30.191 33.658 38.035 43.628 51.156 58.268 62.949 66.252 68.677 70.576 72.054 73.282 74.287 75.168 75.851 76.428 76.924 77.333 77.681 77.977 78.25 78.472 78.657 78.845 79.026 79.153 79.285 79.406 79.479 79.549 79.612 79.664 79.698 79.715 79.724 79.73 79.735 79.726 79.722 79.703 79.668 79.642 79.63 79.472 79.56 79.525 79.471 79.367 79.298 79.205 79.098 78.973 78.838 78.639 78.063 -8 ,25360 ,TETRA ,17525775,Thu Nov 25 01:57:38 CET,Thu Nov 25 03:47:03 CET,0.0 0.647 0.918 1.135 1.326 1.52 1.702 1.883 2.258 2.445 2.633 2.788 3.198 3.376 3.724 4.053 4.366 4.527 4.84 5.133 5.558 5.84 6.116 6.53 6.948 7.365 7.776 8.178 8.686 9.184 9.68 10.306 10.927 11.519 12.225 13.054 13.868 14.768 15.757 16.841 18.024 19.406 21.07 22.807 24.903 27.324 30.243 33.685 38.035 43.694 51.337 58.544 63.365 66.865 69.463 71.449 72.976 74.221 75.185 76.066 76.75 77.301 77.785 78.199 78.546 78.832 79.098 79.32 79.499 79.677 79.849 79.982 80.116 80.24 80.331 80.422 80.509 80.576 80.614 80.629 80.643 80.686 80.729 80.766 80.775 80.788 80.787 80.778 80.777 80.636 80.771 80.758 80.739 80.675 80.633 80.586 80.539 80.475 80.401 80.291 79.908 -9 ,1645 ,TETRA ,17525776,Thu Nov 25 01:57:38 CET,Thu Nov 25 03:47:04 CET,0.0 0.43 0.708 0.938 1.133 1.322 1.505 1.687 2.06 2.254 2.45 2.607 3.008 3.176 3.521 3.865 4.187 4.349 4.672 4.977 5.426 5.726 6.02 6.454 6.886 7.31 7.721 8.125 8.66 9.19 9.71 10.335 10.957 11.582 12.317 13.156 13.956 14.828 15.797 16.871 18.051 19.412 21.032 22.745 24.843 27.293 30.291 33.87 38.319 43.934 51.516 58.801 63.691 67.185 69.746 71.708 73.238 74.513 75.528 76.431 77.107 77.654 78.122 78.523 78.868 79.15 79.427 79.67 79.86 80.035 80.206 80.333 80.448 80.549 80.621 80.69 80.752 80.802 80.847 80.877 80.906 80.943 80.968 80.984 80.991 81.007 81.019 81.02 81.021 80.884 80.992 80.959 80.929 80.882 80.859 80.81 80.747 80.674 80.57 80.392 79.842 -10 ,6726 ,TETRA ,17525777,Thu Nov 25 01:57:38 CET,Thu Nov 25 03:46:17 CET,0.0 0.432 0.675 0.898 1.113 1.318 1.51 1.697 2.074 2.251 2.44 2.59 2.98 3.151 3.492 3.841 4.179 4.338 4.654 4.962 5.407 5.706 5.999 6.417 6.84 7.25 7.649 8.059 8.597 9.113 9.605 10.207 10.815 11.412 12.115 12.923 13.725 14.626 15.588 16.661 17.864 19.255 20.906 22.583 24.615 26.986 29.88 33.377 37.731 43.275 50.76 57.882 62.624 66.02 68.581 70.578 72.143 73.432 74.432 75.327 76.025 76.603 77.11 77.532 77.887 78.201 78.516 78.767 78.961 79.148 79.323 79.455 79.592 79.726 79.825 79.925 80.018 80.1 80.167 80.211 80.255 80.318 80.358 80.398 80.418 80.449 80.462 80.46 80.458 80.293 80.387 80.376 80.363 80.339 80.318 80.276 80.207 80.124 80.041 79.932 79.71 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index d71c566f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17a_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12919 ,TETRA ,17525778,Thu Nov 25 01:57:38 CET,Thu Nov 25 03:46:26 CET,0.0 0.289 0.433 0.538 0.633 0.736 0.832 0.925 1.095 1.175 1.25 1.261 1.452 1.514 1.64 1.764 1.882 1.941 2.069 2.194 2.369 2.475 2.578 2.74 2.901 3.051 3.198 3.34 3.512 3.68 3.844 4.037 4.226 4.408 4.633 4.892 5.146 5.439 5.75 6.074 6.423 6.834 7.297 7.744 8.262 8.86 9.548 10.278 11.062 11.907 12.816 13.416 13.577 13.499 13.345 13.18 13.0 12.778 12.552 12.333 12.131 11.932 11.734 11.534 11.326 11.124 10.922 10.739 10.571 10.387 10.194 10.041 9.877 9.705 9.564 9.41 9.252 9.084 8.917 8.811 8.71 8.561 8.455 8.341 8.285 8.171 8.039 7.887 7.81 7.624 7.584 7.486 7.379 7.206 7.107 6.99 6.865 6.715 6.532 6.316 5.819 -2 ,554 ,TETRA ,17525779,Thu Nov 25 01:57:39 CET,Thu Nov 25 03:46:56 CET,0.0 0.278 0.449 0.579 0.697 0.811 0.918 1.015 1.193 1.281 1.366 1.392 1.585 1.654 1.801 1.983 2.154 2.227 2.373 2.516 2.728 2.868 3.003 3.182 3.357 3.546 3.721 3.869 4.063 4.265 4.467 4.712 4.95 5.168 5.402 5.663 5.92 6.207 6.538 6.91 7.283 7.676 8.148 8.62 9.156 9.741 10.395 11.11 11.906 12.778 13.725 14.219 14.32 14.261 14.087 13.894 13.696 13.503 13.321 13.111 12.906 12.717 12.532 12.35 12.17 11.994 11.792 11.597 11.446 11.305 11.152 11.022 10.89 10.752 10.643 10.524 10.399 10.274 10.139 10.053 9.961 9.805 9.689 9.571 9.518 9.404 9.266 9.12 9.038 8.842 8.809 8.725 8.628 8.434 8.322 8.185 8.054 7.902 7.726 7.526 6.809 -3 ,8237 ,TETRA ,17525780,Thu Nov 25 01:57:38 CET,Thu Nov 25 03:47:29 CET,0.0 0.186 0.347 0.493 0.631 0.746 0.844 0.941 1.138 1.223 1.303 1.351 1.554 1.63 1.785 1.937 2.076 2.14 2.264 2.389 2.583 2.7 2.813 2.987 3.146 3.3 3.471 3.653 3.887 4.107 4.311 4.546 4.779 5.017 5.3 5.616 5.901 6.202 6.526 6.872 7.251 7.668 8.129 8.599 9.148 9.773 10.487 11.238 12.071 12.981 13.908 14.396 14.517 14.475 14.298 14.063 13.833 13.625 13.431 13.183 12.946 12.743 12.553 12.352 12.156 11.97 11.757 11.571 11.396 11.206 11.009 10.85 10.695 10.533 10.414 10.285 10.147 10.006 9.865 9.763 9.653 9.502 9.399 9.284 9.223 9.095 8.969 8.837 8.759 8.56 8.513 8.42 8.325 8.125 8.0 7.871 7.754 7.611 7.427 7.23 6.522 -4 ,14564 ,TETRA ,17525781,Thu Nov 25 01:57:39 CET,Thu Nov 25 03:46:38 CET,0.0 0.229 0.36 0.464 0.565 0.669 0.765 0.86 1.037 1.108 1.18 1.218 1.422 1.498 1.629 1.765 1.889 1.948 2.069 2.185 2.357 2.468 2.581 2.746 2.906 3.062 3.212 3.356 3.53 3.706 3.88 4.078 4.276 4.495 4.753 5.036 5.305 5.59 5.901 6.238 6.58 6.952 7.408 7.873 8.403 9.005 9.694 10.418 11.221 12.119 13.043 13.619 13.776 13.669 13.495 13.308 13.112 12.92 12.725 12.5 12.277 12.063 11.857 11.672 11.505 11.34 11.157 10.996 10.855 10.702 10.524 10.378 10.234 10.056 9.9 9.732 9.567 9.411 9.245 9.137 9.029 8.834 8.675 8.526 8.459 8.313 8.155 7.985 7.913 7.728 7.655 7.56 7.469 7.283 7.177 7.058 6.941 6.798 6.636 6.451 5.769 -5 ,26565 ,TETRA ,17525782,Thu Nov 25 01:57:40 CET,Thu Nov 25 03:47:14 CET,0.0 0.293 0.428 0.54 0.645 0.747 0.85 0.948 1.132 1.223 1.298 1.311 1.507 1.581 1.724 1.856 1.986 2.048 2.172 2.304 2.51 2.647 2.774 2.963 3.152 3.329 3.498 3.661 3.863 4.07 4.272 4.501 4.723 4.933 5.173 5.457 5.738 6.035 6.35 6.668 7.004 7.394 7.842 8.295 8.819 9.382 10.04 10.779 11.567 12.46 13.439 14.043 14.198 14.17 14.055 13.882 13.695 13.487 13.263 13.046 12.866 12.677 12.461 12.247 12.051 11.865 11.679 11.522 11.39 11.245 11.081 10.951 10.823 10.695 10.604 10.509 10.405 10.284 10.145 10.037 9.932 9.788 9.692 9.596 9.543 9.424 9.295 9.165 9.093 8.894 8.845 8.768 8.672 8.463 8.354 8.244 8.117 7.95 7.736 7.493 6.837 -6 ,23822 ,TETRA ,17525783,Thu Nov 25 01:57:42 CET,Thu Nov 25 03:47:22 CET,0.0 0.459 0.712 0.914 1.095 1.261 1.42 1.568 1.821 1.932 2.057 2.176 2.389 2.474 2.649 2.822 2.993 3.073 3.226 3.378 3.583 3.718 3.856 4.048 4.23 4.412 4.587 4.752 4.953 5.15 5.344 5.559 5.774 5.991 6.241 6.53 6.809 7.104 7.416 7.752 8.102 8.502 8.981 9.454 9.975 10.539 11.19 11.924 12.725 13.574 14.4 14.846 14.972 14.971 14.889 14.744 14.58 14.377 14.189 13.982 13.755 13.55 13.352 13.165 12.991 12.82 12.638 12.476 12.34 12.195 12.058 11.96 11.855 11.731 11.63 11.525 11.403 11.269 11.139 11.047 10.956 10.814 10.708 10.608 10.553 10.437 10.313 10.177 10.109 9.921 9.885 9.801 9.708 9.505 9.381 9.233 9.083 8.93 8.749 8.536 8.047 -7 ,28198 ,TETRA ,17525784,Thu Nov 25 01:57:40 CET,Thu Nov 25 03:46:51 CET,0.0 0.19 0.359 0.499 0.625 0.745 0.867 0.973 1.143 1.228 1.312 1.344 1.544 1.618 1.758 1.899 2.03 2.099 2.235 2.355 2.525 2.64 2.752 2.903 3.047 3.194 3.335 3.474 3.652 3.819 3.986 4.19 4.397 4.599 4.852 5.141 5.398 5.684 6.0 6.333 6.683 7.08 7.551 8.027 8.58 9.168 9.813 10.548 11.386 12.273 13.197 13.786 13.96 13.906 13.76 13.578 13.392 13.196 13.005 12.799 12.595 12.388 12.167 11.954 11.76 11.575 11.393 11.234 11.077 10.909 10.739 10.593 10.43 10.249 10.112 9.967 9.823 9.674 9.52 9.422 9.309 9.123 8.992 8.854 8.785 8.635 8.462 8.278 8.177 7.957 7.846 7.725 7.606 7.332 7.19 7.033 6.837 6.616 6.354 5.951 4.657 -8 ,25567 ,TETRA ,17525785,Thu Nov 25 01:57:40 CET,Thu Nov 25 03:45:50 CET,0.0 0.259 0.411 0.568 0.703 0.812 0.918 1.017 1.2 1.297 1.384 1.409 1.611 1.686 1.834 1.988 2.123 2.187 2.332 2.492 2.73 2.867 2.986 3.165 3.343 3.511 3.674 3.833 4.039 4.237 4.433 4.674 4.902 5.13 5.397 5.701 5.995 6.287 6.6 6.939 7.281 7.667 8.149 8.622 9.151 9.731 10.395 11.148 11.99 12.857 13.754 14.258 14.397 14.39 14.274 14.111 13.908 13.678 13.455 13.214 13.011 12.819 12.604 12.4 12.225 12.063 11.879 11.702 11.559 11.425 11.284 11.173 11.044 10.903 10.806 10.704 10.596 10.482 10.365 10.28 10.188 10.051 9.949 9.836 9.772 9.643 9.515 9.359 9.268 9.062 9.016 8.943 8.868 8.702 8.604 8.499 8.384 8.24 8.08 7.876 7.278 -9 ,14812 ,TETRA ,17525786,Thu Nov 25 01:57:40 CET,Thu Nov 25 03:47:03 CET,0.0 0.289 0.439 0.574 0.734 0.894 1.044 1.174 1.41 1.528 1.641 1.735 1.956 2.056 2.234 2.408 2.58 2.66 2.816 2.973 3.202 3.34 3.473 3.673 3.869 4.06 4.233 4.4 4.62 4.822 5.012 5.232 5.441 5.643 5.877 6.15 6.418 6.72 7.041 7.385 7.749 8.144 8.612 9.08 9.603 10.183 10.859 11.576 12.397 13.322 14.273 14.789 14.9 14.857 14.724 14.553 14.379 14.186 13.991 13.786 13.587 13.386 13.188 12.992 12.81 12.633 12.441 12.286 12.154 11.988 11.792 11.641 11.497 11.343 11.213 11.078 10.944 10.803 10.66 10.556 10.437 10.262 10.144 10.003 9.928 9.766 9.578 9.39 9.302 9.106 9.031 8.921 8.808 8.562 8.414 8.261 8.097 7.914 7.725 7.528 7.03 -10 ,32016 ,TETRA ,17525787,Thu Nov 25 01:57:40 CET,Thu Nov 25 03:45:46 CET,0.0 0.236 0.381 0.507 0.629 0.752 0.857 0.953 1.136 1.215 1.291 1.309 1.498 1.567 1.706 1.842 1.969 2.027 2.148 2.262 2.436 2.55 2.659 2.815 2.96 3.101 3.234 3.37 3.544 3.711 3.888 4.124 4.36 4.594 4.871 5.173 5.461 5.789 6.141 6.502 6.889 7.304 7.76 8.227 8.769 9.362 10.022 10.761 11.599 12.477 13.407 14.05 14.256 14.243 14.106 13.899 13.7 13.509 13.304 13.078 12.876 12.68 12.483 12.28 12.087 11.902 11.702 11.514 11.355 11.197 11.032 10.886 10.735 10.579 10.444 10.31 10.169 10.01 9.845 9.744 9.638 9.452 9.319 9.169 9.089 8.933 8.77 8.599 8.503 8.285 8.165 8.041 7.907 7.634 7.487 7.322 7.151 6.962 6.739 6.49 5.982 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 8ac7879b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17b_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19630 ,TETRA ,17525788,Thu Nov 25 01:57:40 CET,Thu Nov 25 03:46:57 CET,0.0 0.38 0.588 0.76 0.895 1.017 1.15 1.288 1.542 1.651 1.749 1.808 2.032 2.131 2.312 2.478 2.634 2.705 2.849 2.99 3.184 3.31 3.44 3.633 3.82 4.011 4.188 4.345 4.55 4.755 4.958 5.219 5.479 5.726 6.026 6.371 6.686 7.009 7.355 7.728 8.133 8.605 9.14 9.657 10.267 10.948 11.745 12.636 13.621 14.711 15.847 16.472 16.652 16.562 16.32 16.067 15.811 15.552 15.313 15.02 14.754 14.52 14.27 14.023 13.807 13.6 13.356 13.127 12.941 12.767 12.578 12.411 12.243 12.049 11.888 11.734 11.569 11.386 11.184 11.036 10.889 10.667 10.509 10.349 10.271 10.094 9.884 9.66 9.543 9.317 9.227 9.11 8.979 8.702 8.56 8.418 8.26 8.057 7.838 7.602 6.762 -2 ,13760 ,TETRA ,17525789,Thu Nov 25 01:57:40 CET,Thu Nov 25 03:48:13 CET,0.0 0.74 0.969 1.171 1.333 1.469 1.578 1.674 1.878 1.986 2.088 2.15 2.364 2.452 2.615 2.775 2.931 3.006 3.154 3.292 3.498 3.635 3.78 3.997 4.191 4.381 4.572 4.764 5.015 5.255 5.477 5.741 5.999 6.262 6.572 6.907 7.207 7.535 7.889 8.27 8.673 9.127 9.656 10.167 10.779 11.471 12.234 13.066 14.026 15.076 16.14 16.817 17.035 16.984 16.788 16.529 16.267 16.012 15.754 15.473 15.239 15.014 14.764 14.522 14.299 14.098 13.886 13.68 13.518 13.358 13.177 13.02 12.85 12.669 12.532 12.4 12.265 12.114 11.949 11.847 11.739 11.547 11.417 11.283 11.21 11.048 10.875 10.705 10.605 10.386 10.308 10.206 10.084 9.817 9.684 9.547 9.39 9.19 8.961 8.673 7.767 -3 ,8516 ,TETRA ,17525790,Thu Nov 25 01:58:40 CET,Thu Nov 25 03:48:37 CET,0.0 0.37 0.586 0.774 0.95 1.085 1.203 1.316 1.511 1.607 1.705 1.768 1.989 2.075 2.236 2.393 2.559 2.639 2.776 2.911 3.115 3.243 3.364 3.54 3.726 3.907 4.081 4.261 4.5 4.731 4.948 5.209 5.472 5.736 6.039 6.371 6.695 7.04 7.404 7.789 8.194 8.679 9.23 9.757 10.371 11.046 11.778 12.585 13.512 14.553 15.699 16.381 16.528 16.428 16.231 15.981 15.705 15.424 15.162 14.845 14.545 14.274 14.009 13.771 13.561 13.345 13.098 12.889 12.695 12.466 12.233 12.048 11.844 11.628 11.459 11.275 11.082 10.892 10.721 10.613 10.5 10.308 10.17 10.015 9.934 9.782 9.629 9.472 9.384 9.179 9.132 9.035 8.917 8.65 8.493 8.322 8.159 7.996 7.777 7.472 6.653 -4 ,18581 ,TETRA ,17525791,Thu Nov 25 01:58:38 CET,Thu Nov 25 03:51:07 CET,0.0 0.408 0.598 0.736 0.877 1.011 1.125 1.244 1.467 1.559 1.65 1.725 1.936 2.006 2.157 2.305 2.467 2.551 2.701 2.844 3.045 3.17 3.291 3.464 3.634 3.812 3.984 4.146 4.36 4.563 4.749 4.969 5.187 5.397 5.649 5.953 6.235 6.532 6.872 7.246 7.638 8.093 8.638 9.185 9.813 10.485 11.23 12.046 12.982 14.01 15.118 15.811 16.004 15.965 15.806 15.595 15.35 15.066 14.831 14.585 14.323 14.063 13.798 13.558 13.335 13.131 12.918 12.723 12.538 12.336 12.122 11.926 11.712 11.501 11.341 11.172 10.995 10.813 10.62 10.486 10.353 10.139 9.984 9.818 9.725 9.535 9.343 9.137 9.034 8.813 8.685 8.545 8.407 8.125 7.95 7.746 7.509 7.21 6.852 6.438 5.651 -5 ,9135 ,TETRA ,17525792,Thu Nov 25 01:58:38 CET,Thu Nov 25 03:49:34 CET,0.0 0.507 0.692 0.86 0.992 1.121 1.256 1.387 1.614 1.712 1.797 1.829 2.034 2.108 2.267 2.444 2.606 2.676 2.802 2.93 3.139 3.276 3.402 3.592 3.791 3.992 4.184 4.369 4.598 4.815 5.03 5.291 5.549 5.796 6.06 6.363 6.68 7.03 7.396 7.785 8.186 8.617 9.125 9.638 10.217 10.868 11.607 12.425 13.37 14.413 15.531 16.204 16.349 16.25 16.025 15.784 15.551 15.283 15.051 14.786 14.495 14.22 13.96 13.703 13.459 13.231 13.003 12.809 12.632 12.424 12.186 11.999 11.815 11.621 11.463 11.296 11.109 10.921 10.728 10.595 10.462 10.243 10.082 9.899 9.805 9.606 9.395 9.165 9.038 8.801 8.628 8.479 8.336 8.009 7.841 7.689 7.513 7.295 7.057 6.777 6.076 -6 ,28499 ,TETRA ,17525793,Thu Nov 25 01:58:38 CET,Thu Nov 25 03:50:39 CET,0.0 0.481 0.702 0.906 1.107 1.251 1.371 1.49 1.684 1.772 1.86 1.896 2.1 2.176 2.332 2.485 2.638 2.711 2.857 3.003 3.197 3.319 3.446 3.628 3.795 3.959 4.112 4.267 4.483 4.703 4.919 5.17 5.418 5.659 5.949 6.278 6.599 6.943 7.306 7.71 8.12 8.589 9.155 9.699 10.317 11.021 11.853 12.772 13.762 14.791 15.816 16.488 16.669 16.642 16.503 16.264 16.026 15.753 15.478 15.202 14.942 14.705 14.476 14.242 14.015 13.79 13.554 13.349 13.168 12.964 12.75 12.574 12.386 12.19 12.034 11.873 11.703 11.526 11.352 11.241 11.118 10.91 10.77 10.635 10.568 10.431 10.284 10.132 10.057 9.86 9.783 9.678 9.566 9.304 9.15 8.997 8.828 8.616 8.398 8.165 7.655 -7 ,12808 ,TETRA ,17525794,Thu Nov 25 01:58:38 CET,Thu Nov 25 03:49:33 CET,0.0 0.515 0.781 0.981 1.155 1.294 1.423 1.552 1.766 1.862 1.951 1.991 2.203 2.282 2.441 2.608 2.757 2.824 2.955 3.077 3.258 3.391 3.528 3.716 3.875 4.03 4.194 4.361 4.59 4.822 5.056 5.346 5.621 5.872 6.159 6.48 6.777 7.103 7.464 7.847 8.26 8.727 9.254 9.775 10.373 11.037 11.801 12.647 13.606 14.687 15.838 16.497 16.705 16.707 16.58 16.369 16.102 15.842 15.618 15.368 15.097 14.834 14.608 14.39 14.149 13.918 13.684 13.469 13.278 13.077 12.874 12.705 12.517 12.306 12.143 11.965 11.768 11.586 11.405 11.264 11.116 10.9 10.758 10.612 10.544 10.397 10.231 10.061 9.969 9.759 9.67 9.564 9.46 9.219 9.073 8.893 8.705 8.512 8.267 7.933 6.692 -8 ,19247 ,TETRA ,17525795,Thu Nov 25 01:58:38 CET,Thu Nov 25 03:48:46 CET,0.0 0.513 0.72 0.898 1.056 1.188 1.32 1.45 1.669 1.774 1.872 1.912 2.113 2.196 2.377 2.55 2.703 2.777 2.93 3.082 3.296 3.43 3.569 3.771 3.956 4.137 4.316 4.491 4.725 4.957 5.18 5.433 5.671 5.922 6.213 6.529 6.849 7.209 7.579 7.945 8.332 8.788 9.327 9.855 10.466 11.157 11.957 12.833 13.808 14.876 15.994 16.686 16.903 16.893 16.738 16.509 16.275 16.038 15.805 15.546 15.293 15.046 14.799 14.54 14.282 14.048 13.806 13.592 13.409 13.22 13.011 12.831 12.656 12.457 12.282 12.096 11.909 11.715 11.498 11.342 11.177 10.915 10.746 10.578 10.491 10.308 10.101 9.87 9.754 9.527 9.368 9.216 9.066 8.746 8.569 8.371 8.124 7.837 7.528 7.113 6.02 -9 ,9681 ,TETRA ,17525796,Thu Nov 25 01:58:39 CET,Thu Nov 25 03:49:46 CET,0.0 0.417 0.689 0.92 1.058 1.188 1.305 1.414 1.642 1.737 1.826 1.878 2.083 2.163 2.347 2.541 2.724 2.814 2.981 3.137 3.367 3.519 3.676 3.9 4.112 4.322 4.498 4.661 4.897 5.133 5.363 5.641 5.888 6.112 6.387 6.707 7.009 7.333 7.689 8.076 8.466 8.897 9.407 9.907 10.487 11.143 11.885 12.688 13.622 14.664 15.739 16.386 16.577 16.569 16.407 16.139 15.89 15.657 15.394 15.123 14.878 14.642 14.425 14.193 13.96 13.76 13.545 13.337 13.152 12.96 12.751 12.578 12.409 12.226 12.074 11.935 11.8 11.657 11.5 11.384 11.267 11.094 10.969 10.837 10.768 10.615 10.46 10.301 10.217 10.019 9.962 9.862 9.751 9.508 9.37 9.225 9.063 8.864 8.663 8.455 7.666 -10 ,7700 ,TETRA ,17525797,Thu Nov 25 01:58:39 CET,Thu Nov 25 03:48:45 CET,0.0 0.65 0.861 1.008 1.151 1.289 1.409 1.535 1.777 1.885 1.986 2.028 2.241 2.332 2.499 2.666 2.843 2.928 3.083 3.224 3.418 3.553 3.685 3.867 4.055 4.231 4.381 4.526 4.721 4.918 5.112 5.361 5.602 5.817 6.077 6.386 6.688 7.044 7.455 7.892 8.324 8.814 9.389 9.924 10.526 11.204 11.988 12.848 13.817 14.847 15.923 16.569 16.73 16.661 16.494 16.274 16.027 15.778 15.532 15.261 14.995 14.748 14.518 14.295 14.062 13.827 13.596 13.399 13.213 13.006 12.792 12.627 12.443 12.233 12.076 11.915 11.737 11.538 11.349 11.235 11.103 10.889 10.763 10.63 10.555 10.398 10.245 10.087 10.004 9.801 9.735 9.644 9.542 9.309 9.179 9.017 8.84 8.659 8.421 8.096 7.252 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 45405000..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17c_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22109 ,TETRA ,17525798,Thu Nov 25 01:58:39 CET,Thu Nov 25 03:49:23 CET,0.0 0.406 0.647 0.872 1.02 1.115 1.213 1.307 1.501 1.601 1.698 1.76 1.947 2.017 2.161 2.293 2.411 2.469 2.585 2.706 2.883 3.006 3.129 3.281 3.411 3.535 3.653 3.763 3.916 4.062 4.197 4.366 4.521 4.666 4.828 5.013 5.2 5.406 5.624 5.861 6.118 6.403 6.75 7.098 7.45 7.795 8.157 8.539 8.879 9.078 9.059 8.596 7.966 7.327 6.737 6.207 5.725 5.24 4.8 4.378 4.003 3.666 3.353 3.049 2.759 2.493 2.214 1.961 1.745 1.527 1.295 1.104 0.893 0.672 0.509 0.343 0.171 -0.034 -0.259 -0.406 -0.547 -0.769 -0.922 -1.078 -1.16 -1.33 -1.524 -1.744 -1.857 -2.086 -2.213 -2.32 -2.439 -2.713 -2.872 -3.045 -3.259 -3.523 -3.811 -4.177 -4.838 -2 ,13759 ,TETRA ,17525799,Thu Nov 25 01:58:39 CET,Thu Nov 25 03:47:59 CET,0.0 0.581 0.83 1.029 1.191 1.317 1.409 1.496 1.671 1.746 1.824 1.867 2.062 2.142 2.293 2.437 2.582 2.648 2.755 2.87 3.035 3.134 3.235 3.375 3.508 3.633 3.753 3.876 4.029 4.182 4.336 4.526 4.712 4.887 5.073 5.263 5.44 5.631 5.854 6.088 6.332 6.605 6.901 7.177 7.496 7.823 8.151 8.493 8.79 8.98 8.949 8.53 7.976 7.411 6.837 6.276 5.784 5.308 4.885 4.445 4.065 3.742 3.432 3.121 2.818 2.551 2.274 2.023 1.804 1.575 1.336 1.144 0.96 0.75 0.575 0.404 0.228 0.049 -0.124 -0.237 -0.345 -0.523 -0.662 -0.797 -0.87 -1.029 -1.185 -1.356 -1.446 -1.654 -1.725 -1.809 -1.911 -2.186 -2.331 -2.472 -2.621 -2.798 -3.015 -3.286 -3.817 -3 ,25308 ,TETRA ,17525800,Thu Nov 25 01:58:39 CET,Thu Nov 25 03:47:03 CET,0.0 0.367 0.51 0.647 0.772 0.888 0.982 1.077 1.288 1.384 1.472 1.524 1.719 1.788 1.929 2.08 2.224 2.291 2.416 2.524 2.675 2.784 2.877 2.999 3.131 3.265 3.396 3.524 3.678 3.822 3.965 4.145 4.339 4.522 4.73 4.976 5.212 5.464 5.725 5.982 6.254 6.555 6.873 7.158 7.473 7.845 8.213 8.553 8.876 9.057 8.989 8.526 7.934 7.346 6.789 6.268 5.772 5.313 4.903 4.461 4.073 3.748 3.443 3.134 2.851 2.595 2.326 2.08 1.869 1.649 1.416 1.213 1.008 0.808 0.652 0.5 0.343 0.174 0.01 -0.098 -0.208 -0.394 -0.524 -0.645 -0.709 -0.848 -0.989 -1.128 -1.2 -1.394 -1.48 -1.586 -1.684 -1.868 -1.974 -2.091 -2.209 -2.369 -2.582 -2.82 -3.53 -4 ,2549 ,TETRA ,17525801,Thu Nov 25 01:58:40 CET,Thu Nov 25 03:48:25 CET,0.0 0.459 0.649 0.795 0.928 1.06 1.175 1.275 1.474 1.569 1.67 1.767 1.983 2.079 2.251 2.42 2.593 2.675 2.842 2.995 3.188 3.324 3.454 3.636 3.81 3.979 4.141 4.288 4.47 4.634 4.796 4.995 5.188 5.365 5.569 5.807 6.018 6.231 6.471 6.734 7.013 7.316 7.63 7.921 8.256 8.613 8.978 9.328 9.638 9.853 9.828 9.422 8.904 8.359 7.814 7.292 6.802 6.315 5.892 5.504 5.199 4.9 4.628 4.396 4.157 3.939 3.706 3.489 3.314 3.13 2.915 2.746 2.574 2.367 2.207 2.042 1.869 1.702 1.53 1.4 1.278 1.102 0.977 0.851 0.783 0.637 0.479 0.309 0.224 0.017 -0.062 -0.159 -0.249 -0.445 -0.561 -0.694 -0.836 -0.986 -1.175 -1.444 -2.262 -5 ,413 ,TETRA ,17525802,Thu Nov 25 01:59:38 CET,Thu Nov 25 03:49:20 CET,0.0 0.561 0.765 0.964 1.108 1.213 1.308 1.416 1.623 1.719 1.819 1.884 2.081 2.164 2.321 2.475 2.613 2.674 2.785 2.896 3.056 3.16 3.278 3.455 3.625 3.793 3.954 4.106 4.301 4.487 4.655 4.847 5.042 5.24 5.453 5.655 5.85 6.069 6.313 6.596 6.906 7.21 7.512 7.8 8.119 8.45 8.789 9.118 9.396 9.61 9.579 9.18 8.606 8.038 7.528 7.036 6.581 6.132 5.723 5.303 4.954 4.651 4.34 4.038 3.759 3.502 3.237 2.997 2.787 2.571 2.33 2.115 1.89 1.663 1.491 1.323 1.158 0.989 0.796 0.655 0.531 0.36 0.229 0.087 0.016 -0.139 -0.299 -0.465 -0.543 -0.734 -0.807 -0.915 -1.017 -1.231 -1.351 -1.467 -1.596 -1.756 -1.939 -2.205 -2.711 -6 ,9814 ,TETRA ,17525803,Thu Nov 25 01:59:40 CET,Thu Nov 25 03:48:56 CET,0.0 0.253 0.411 0.552 0.692 0.838 0.966 1.074 1.273 1.368 1.455 1.502 1.689 1.762 1.911 2.069 2.226 2.3 2.442 2.58 2.752 2.846 2.943 3.091 3.232 3.368 3.484 3.593 3.747 3.895 4.038 4.214 4.383 4.535 4.717 4.939 5.164 5.402 5.628 5.874 6.149 6.433 6.735 7.033 7.375 7.746 8.079 8.354 8.622 8.857 8.867 8.43 7.845 7.258 6.745 6.263 5.801 5.377 4.986 4.577 4.23 3.895 3.565 3.267 2.985 2.74 2.5 2.264 2.041 1.802 1.563 1.384 1.21 1.034 0.893 0.748 0.603 0.445 0.283 0.173 0.064 -0.094 -0.211 -0.338 -0.401 -0.538 -0.683 -0.834 -0.917 -1.113 -1.173 -1.266 -1.365 -1.56 -1.656 -1.765 -1.892 -2.052 -2.244 -2.441 -3.194 -7 ,19000 ,TETRA ,17525804,Thu Nov 25 01:59:39 CET,Thu Nov 25 03:50:30 CET,0.0 0.467 0.694 0.841 0.96 1.072 1.178 1.279 1.464 1.571 1.676 1.726 1.905 1.965 2.093 2.219 2.332 2.391 2.505 2.607 2.756 2.848 2.93 3.063 3.209 3.341 3.457 3.581 3.757 3.908 4.04 4.204 4.36 4.508 4.677 4.879 5.084 5.298 5.522 5.769 6.023 6.296 6.636 6.975 7.312 7.645 8.002 8.353 8.656 8.85 8.819 8.406 7.85 7.28 6.731 6.203 5.708 5.262 4.882 4.49 4.159 3.858 3.568 3.277 2.991 2.726 2.449 2.21 2.021 1.841 1.649 1.48 1.295 1.101 0.964 0.82 0.668 0.517 0.358 0.238 0.117 -0.059 -0.178 -0.305 -0.374 -0.503 -0.637 -0.78 -0.865 -1.073 -1.147 -1.238 -1.32 -1.5 -1.61 -1.735 -1.865 -2.011 -2.188 -2.446 -3.006 -8 ,30292 ,TETRA ,17525805,Thu Nov 25 01:59:39 CET,Thu Nov 25 03:49:07 CET,0.0 0.48 0.667 0.834 0.989 1.113 1.237 1.352 1.533 1.616 1.7 1.732 1.919 1.991 2.129 2.27 2.409 2.48 2.607 2.709 2.852 2.948 3.047 3.197 3.331 3.453 3.58 3.7 3.845 3.985 4.136 4.314 4.466 4.626 4.805 4.992 5.169 5.351 5.547 5.75 5.949 6.162 6.452 6.771 7.119 7.48 7.843 8.16 8.464 8.737 8.705 8.297 7.767 7.211 6.679 6.159 5.685 5.234 4.831 4.41 4.059 3.753 3.462 3.179 2.882 2.606 2.331 2.093 1.889 1.675 1.444 1.242 1.032 0.828 0.688 0.556 0.416 0.267 0.105 -0.007 -0.112 -0.284 -0.406 -0.546 -0.621 -0.758 -0.903 -1.052 -1.135 -1.34 -1.401 -1.496 -1.6 -1.829 -1.951 -2.054 -2.154 -2.282 -2.479 -2.704 -3.141 -9 ,14629 ,TETRA ,17525806,Thu Nov 25 01:59:38 CET,Thu Nov 25 03:48:43 CET,0.0 0.496 0.654 0.784 0.909 1.03 1.127 1.224 1.428 1.517 1.597 1.63 1.817 1.887 2.026 2.159 2.295 2.371 2.503 2.612 2.777 2.883 2.98 3.123 3.268 3.406 3.542 3.681 3.861 4.043 4.217 4.414 4.61 4.808 5.039 5.292 5.526 5.774 6.028 6.296 6.572 6.843 7.14 7.419 7.711 8.052 8.449 8.837 9.191 9.419 9.333 8.854 8.223 7.574 6.993 6.474 6.009 5.565 5.161 4.744 4.36 4.03 3.738 3.464 3.201 2.945 2.681 2.461 2.274 2.077 1.873 1.7 1.534 1.369 1.239 1.101 0.951 0.792 0.622 0.513 0.405 0.232 0.115 -0.024 -0.1 -0.25 -0.405 -0.555 -0.644 -0.859 -0.93 -1.025 -1.112 -1.303 -1.429 -1.553 -1.684 -1.849 -2.034 -2.23 -2.788 -10 ,5319 ,TETRA ,17525807,Thu Nov 25 01:59:39 CET,Thu Nov 25 03:48:47 CET,0.0 0.577 0.797 0.981 1.145 1.303 1.448 1.56 1.732 1.815 1.9 1.934 2.118 2.19 2.324 2.45 2.573 2.637 2.759 2.869 3.024 3.125 3.233 3.399 3.549 3.679 3.798 3.927 4.11 4.302 4.482 4.666 4.847 5.029 5.242 5.478 5.692 5.914 6.158 6.428 6.712 7.017 7.354 7.695 8.061 8.407 8.733 9.081 9.416 9.617 9.49 8.892 8.233 7.631 7.073 6.525 6.057 5.61 5.211 4.828 4.476 4.151 3.841 3.555 3.292 3.032 2.751 2.518 2.312 2.082 1.835 1.641 1.449 1.235 1.066 0.908 0.747 0.564 0.371 0.239 0.106 -0.088 -0.229 -0.384 -0.461 -0.632 -0.819 -0.999 -1.094 -1.308 -1.372 -1.462 -1.564 -1.771 -1.879 -1.994 -2.125 -2.283 -2.46 -2.739 -3.486 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt deleted file mode 100644 index d5f94f9c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18351 ,TETRA ,17525808,Thu Nov 25 01:59:38 CET,Thu Nov 25 03:50:40 CET,0.0 0.844 1.266 1.565 1.812 2.015 2.191 2.356 2.649 2.781 2.921 3.06 3.271 3.371 3.558 3.728 3.887 3.959 4.105 4.258 4.474 4.604 4.723 4.895 5.078 5.244 5.391 5.535 5.725 5.889 6.023 6.193 6.37 6.538 6.719 6.91 7.077 7.252 7.433 7.613 7.781 7.928 8.074 8.191 8.287 8.315 8.237 8.051 7.695 6.963 5.406 3.334 1.547 0.01 -1.311 -2.505 -3.518 -4.39 -5.131 -5.878 -6.509 -7.07 -7.605 -8.086 -8.523 -8.921 -9.344 -9.729 -10.053 -10.38 -10.722 -11.005 -11.286 -11.572 -11.789 -12.015 -12.26 -12.509 -12.737 -12.884 -13.045 -13.307 -13.475 -13.641 -13.731 -13.916 -14.119 -14.333 -14.434 -14.667 -14.778 -14.892 -15.018 -15.304 -15.444 -15.581 -15.734 -15.9 -16.074 -16.289 -16.681 -2 ,30596 ,TETRA ,17525809,Thu Nov 25 01:59:38 CET,Thu Nov 25 03:51:18 CET,0.0 0.506 0.729 0.9 1.049 1.205 1.347 1.477 1.711 1.81 1.899 1.965 2.154 2.23 2.387 2.532 2.661 2.719 2.831 2.941 3.122 3.246 3.356 3.51 3.658 3.794 3.929 4.06 4.216 4.355 4.484 4.646 4.799 4.945 5.123 5.312 5.475 5.666 5.887 6.095 6.281 6.465 6.618 6.725 6.838 6.879 6.83 6.682 6.265 5.435 3.792 1.717 -0.045 -1.567 -2.854 -4.033 -5.062 -5.976 -6.758 -7.525 -8.177 -8.756 -9.31 -9.813 -10.268 -10.68 -11.107 -11.486 -11.813 -12.15 -12.499 -12.789 -13.083 -13.392 -13.63 -13.865 -14.111 -14.369 -14.635 -14.81 -14.989 -15.278 -15.482 -15.69 -15.788 -15.975 -16.167 -16.369 -16.474 -16.71 -16.815 -16.939 -17.059 -17.291 -17.413 -17.535 -17.662 -17.815 -18.013 -18.265 -18.728 -3 ,16935 ,TETRA ,17525810,Thu Nov 25 01:59:40 CET,Thu Nov 25 03:49:42 CET,0.0 0.437 0.648 0.808 0.932 1.04 1.155 1.275 1.484 1.581 1.668 1.745 1.949 2.028 2.17 2.316 2.456 2.514 2.627 2.743 2.918 3.033 3.143 3.295 3.438 3.568 3.684 3.791 3.925 4.061 4.192 4.337 4.473 4.603 4.739 4.916 5.093 5.267 5.444 5.607 5.765 5.914 6.047 6.144 6.217 6.287 6.297 6.119 5.694 4.915 3.36 1.268 -0.502 -2.041 -3.355 -4.495 -5.467 -6.335 -7.095 -7.846 -8.498 -9.069 -9.593 -10.09 -10.552 -10.962 -11.372 -11.756 -12.1 -12.44 -12.771 -13.045 -13.335 -13.638 -13.872 -14.125 -14.386 -14.651 -14.936 -15.128 -15.318 -15.623 -15.828 -16.02 -16.113 -16.295 -16.466 -16.643 -16.736 -16.95 -17.014 -17.12 -17.226 -17.444 -17.571 -17.709 -17.859 -18.03 -18.222 -18.463 -19.005 -4 ,20344 ,TETRA ,17525811,Thu Nov 25 01:59:40 CET,Thu Nov 25 03:50:19 CET,0.0 0.76 0.996 1.174 1.331 1.473 1.601 1.706 1.922 2.037 2.157 2.271 2.479 2.578 2.763 2.935 3.088 3.162 3.313 3.462 3.681 3.811 3.923 4.084 4.242 4.389 4.528 4.663 4.847 5.02 5.172 5.366 5.551 5.709 5.874 6.044 6.194 6.359 6.543 6.734 6.907 7.075 7.234 7.348 7.432 7.466 7.45 7.313 6.931 6.171 4.593 2.554 0.811 -0.751 -2.082 -3.248 -4.244 -5.15 -5.94 -6.717 -7.397 -7.998 -8.552 -9.072 -9.558 -9.982 -10.41 -10.822 -11.177 -11.512 -11.83 -12.085 -12.347 -12.604 -12.812 -13.038 -13.279 -13.527 -13.762 -13.922 -14.09 -14.358 -14.553 -14.745 -14.842 -15.032 -15.216 -15.412 -15.517 -15.748 -15.848 -15.971 -16.101 -16.376 -16.526 -16.678 -16.834 -17.019 -17.219 -17.456 -17.864 -5 ,8133 ,TETRA ,17525812,Thu Nov 25 02:00:40 CET,Thu Nov 25 03:51:51 CET,0.0 0.305 0.511 0.675 0.81 0.928 1.043 1.155 1.344 1.424 1.499 1.525 1.696 1.761 1.898 2.045 2.186 2.245 2.347 2.445 2.599 2.691 2.777 2.926 3.08 3.223 3.357 3.487 3.651 3.805 3.957 4.133 4.288 4.451 4.643 4.829 4.991 5.171 5.357 5.528 5.675 5.827 5.99 6.097 6.149 6.172 6.138 5.953 5.516 4.695 3.063 0.921 -0.922 -2.526 -3.885 -5.065 -6.074 -6.968 -7.736 -8.497 -9.131 -9.689 -10.226 -10.726 -11.191 -11.63 -12.095 -12.509 -12.847 -13.178 -13.523 -13.821 -14.128 -14.43 -14.658 -14.892 -15.137 -15.385 -15.653 -15.854 -16.061 -16.35 -16.528 -16.704 -16.789 -16.966 -17.157 -17.357 -17.454 -17.676 -17.752 -17.865 -17.981 -18.214 -18.328 -18.447 -18.581 -18.73 -18.905 -19.109 -19.544 -6 ,23355 ,TETRA ,17525813,Thu Nov 25 01:59:40 CET,Thu Nov 25 03:51:07 CET,0.0 0.781 1.109 1.349 1.582 1.774 1.935 2.083 2.378 2.521 2.648 2.789 3.009 3.117 3.322 3.507 3.687 3.77 3.92 4.067 4.264 4.389 4.506 4.665 4.821 4.973 5.123 5.269 5.46 5.628 5.777 5.964 6.143 6.305 6.476 6.668 6.847 7.02 7.204 7.39 7.588 7.787 7.935 8.056 8.15 8.16 8.089 7.948 7.619 6.873 5.345 3.241 1.413 -0.116 -1.421 -2.577 -3.577 -4.487 -5.262 -5.993 -6.624 -7.183 -7.708 -8.21 -8.656 -9.053 -9.482 -9.859 -10.169 -10.495 -10.841 -11.12 -11.41 -11.712 -11.944 -12.183 -12.438 -12.7 -12.962 -13.146 -13.34 -13.631 -13.834 -14.048 -14.154 -14.365 -14.588 -14.839 -14.975 -15.239 -15.41 -15.566 -15.716 -15.976 -16.104 -16.256 -16.432 -16.612 -16.794 -17.003 -17.465 -7 ,20918 ,TETRA ,17525814,Thu Nov 25 01:59:41 CET,Thu Nov 25 03:51:14 CET,0.0 1.061 1.335 1.526 1.691 1.849 1.979 2.094 2.342 2.463 2.58 2.716 2.933 3.038 3.258 3.457 3.647 3.737 3.892 4.049 4.28 4.405 4.526 4.706 4.865 5.01 5.154 5.296 5.467 5.618 5.755 5.927 6.102 6.258 6.428 6.624 6.803 6.972 7.144 7.34 7.514 7.674 7.853 7.998 8.127 8.156 8.1 7.942 7.509 6.699 5.155 3.14 1.366 -0.214 -1.58 -2.774 -3.801 -4.716 -5.474 -6.209 -6.863 -7.452 -7.979 -8.455 -8.922 -9.367 -9.823 -10.218 -10.545 -10.882 -11.24 -11.532 -11.829 -12.129 -12.361 -12.609 -12.865 -13.133 -13.418 -13.606 -13.787 -14.053 -14.23 -14.404 -14.495 -14.69 -14.877 -15.055 -15.153 -15.387 -15.477 -15.587 -15.697 -15.953 -16.106 -16.257 -16.394 -16.553 -16.724 -16.965 -17.536 -8 ,24085 ,TETRA ,17525815,Thu Nov 25 01:59:40 CET,Thu Nov 25 03:50:46 CET,0.0 0.502 0.671 0.835 1.004 1.146 1.265 1.361 1.533 1.615 1.697 1.749 1.935 2.007 2.137 2.26 2.376 2.441 2.57 2.69 2.848 2.943 3.045 3.189 3.321 3.464 3.605 3.734 3.912 4.081 4.241 4.44 4.614 4.772 4.953 5.138 5.296 5.461 5.63 5.809 5.984 6.154 6.312 6.428 6.521 6.573 6.543 6.396 6.044 5.235 3.648 1.616 -0.159 -1.712 -3.041 -4.187 -5.193 -6.114 -6.878 -7.622 -8.276 -8.852 -9.38 -9.868 -10.333 -10.761 -11.193 -11.591 -11.935 -12.284 -12.643 -12.931 -13.213 -13.501 -13.73 -13.969 -14.21 -14.459 -14.728 -14.911 -15.093 -15.372 -15.575 -15.788 -15.897 -16.124 -16.372 -16.641 -16.781 -17.045 -17.206 -17.348 -17.501 -17.867 -18.078 -18.298 -18.554 -18.825 -19.113 -19.406 -19.751 -9 ,27156 ,TETRA ,17525816,Thu Nov 25 01:59:40 CET,Thu Nov 25 03:50:20 CET,0.0 0.475 0.664 0.844 1.016 1.139 1.245 1.356 1.566 1.666 1.765 1.82 2.001 2.076 2.202 2.314 2.427 2.485 2.603 2.715 2.875 2.982 3.1 3.28 3.451 3.606 3.749 3.893 4.07 4.249 4.423 4.613 4.791 4.955 5.135 5.319 5.481 5.66 5.827 5.986 6.155 6.334 6.51 6.659 6.771 6.81 6.822 6.714 6.36 5.598 4.075 2.017 0.252 -1.265 -2.568 -3.709 -4.701 -5.577 -6.326 -7.09 -7.752 -8.321 -8.851 -9.355 -9.806 -10.207 -10.645 -11.038 -11.368 -11.709 -12.057 -12.355 -12.655 -12.941 -13.183 -13.44 -13.686 -13.934 -14.182 -14.345 -14.514 -14.788 -14.978 -15.167 -15.26 -15.442 -15.627 -15.82 -15.924 -16.156 -16.238 -16.342 -16.447 -16.699 -16.835 -16.962 -17.093 -17.245 -17.438 -17.696 -18.167 -10 ,15956 ,TETRA ,17525817,Thu Nov 25 02:00:40 CET,Thu Nov 25 03:54:41 CET,0.0 0.253 0.484 0.647 0.784 0.911 1.038 1.16 1.38 1.479 1.572 1.644 1.839 1.916 2.059 2.199 2.331 2.392 2.519 2.644 2.832 2.961 3.082 3.244 3.39 3.531 3.676 3.818 3.988 4.144 4.293 4.483 4.666 4.82 4.987 5.175 5.352 5.544 5.741 5.925 6.092 6.261 6.461 6.614 6.736 6.823 6.82 6.703 6.38 5.629 4.047 1.929 0.129 -1.413 -2.758 -3.931 -4.914 -5.787 -6.547 -7.316 -7.956 -8.521 -9.063 -9.565 -10.015 -10.424 -10.853 -11.224 -11.531 -11.839 -12.153 -12.417 -12.693 -12.974 -13.188 -13.419 -13.653 -13.881 -14.111 -14.272 -14.447 -14.711 -14.882 -15.057 -15.146 -15.324 -15.516 -15.713 -15.811 -16.043 -16.128 -16.24 -16.364 -16.636 -16.78 -16.927 -17.078 -17.244 -17.432 -17.651 -17.994 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 50579141..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17e_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9781 ,TETRA ,17525818,Thu Nov 25 02:00:40 CET,Thu Nov 25 03:51:40 CET,0.0 0.4 0.556 0.674 0.786 0.874 0.944 1.01 1.131 1.186 1.234 1.209 1.367 1.425 1.529 1.618 1.708 1.747 1.807 1.868 1.97 2.033 2.097 2.189 2.264 2.347 2.44 2.528 2.651 2.757 2.839 2.944 3.043 3.137 3.248 3.357 3.45 3.538 3.629 3.736 3.837 3.907 3.96 4.01 4.025 3.979 3.874 3.656 3.262 2.521 1.014 -0.926 -2.512 -3.879 -5.07 -6.143 -7.079 -7.912 -8.635 -9.336 -9.942 -10.48 -10.976 -11.442 -11.873 -12.267 -12.683 -13.054 -13.367 -13.692 -14.041 -14.335 -14.617 -14.907 -15.133 -15.361 -15.596 -15.848 -16.111 -16.295 -16.489 -16.791 -16.996 -17.216 -17.33 -17.567 -17.819 -18.088 -18.229 -18.493 -18.649 -18.802 -18.966 -19.318 -19.491 -19.673 -19.902 -20.18 -20.511 -20.941 -22.747 -2 ,18168 ,TETRA ,17525819,Thu Nov 25 02:00:41 CET,Thu Nov 25 03:54:35 CET,0.0 0.296 0.436 0.543 0.645 0.734 0.81 0.876 1.008 1.074 1.131 1.129 1.282 1.325 1.409 1.486 1.559 1.591 1.656 1.727 1.831 1.89 1.943 2.028 2.107 2.174 2.238 2.296 2.369 2.441 2.513 2.598 2.672 2.739 2.808 2.884 2.958 3.041 3.118 3.191 3.272 3.348 3.403 3.438 3.462 3.462 3.393 3.201 2.819 2.107 0.689 -1.185 -2.775 -4.133 -5.297 -6.346 -7.26 -8.059 -8.781 -9.507 -10.089 -10.599 -11.103 -11.579 -12.007 -12.417 -12.846 -13.204 -13.508 -13.815 -14.139 -14.408 -14.673 -14.941 -15.151 -15.372 -15.59 -15.808 -16.032 -16.19 -16.361 -16.615 -16.779 -16.958 -17.055 -17.246 -17.435 -17.646 -17.751 -17.976 -18.071 -18.184 -18.288 -18.505 -18.646 -18.802 -18.948 -19.108 -19.333 -19.683 -20.323 -3 ,15327 ,TETRA ,17525820,Thu Nov 25 02:00:41 CET,Thu Nov 25 03:50:53 CET,0.0 0.105 0.221 0.325 0.407 0.468 0.533 0.597 0.715 0.777 0.835 0.822 0.975 1.018 1.107 1.191 1.271 1.312 1.38 1.442 1.541 1.609 1.679 1.773 1.844 1.913 1.979 2.048 2.143 2.222 2.303 2.41 2.498 2.56 2.634 2.724 2.794 2.856 2.92 2.998 3.097 3.19 3.24 3.278 3.293 3.239 3.106 2.893 2.489 1.685 0.149 -1.751 -3.368 -4.765 -5.984 -7.076 -8.022 -8.867 -9.59 -10.316 -10.954 -11.51 -12.025 -12.5 -12.939 -13.361 -13.793 -14.171 -14.5 -14.845 -15.21 -15.506 -15.803 -16.101 -16.332 -16.578 -16.845 -17.115 -17.381 -17.566 -17.751 -18.043 -18.237 -18.428 -18.53 -18.728 -18.939 -19.163 -19.27 -19.504 -19.598 -19.719 -19.843 -20.092 -20.228 -20.382 -20.546 -20.726 -20.949 -21.214 -21.737 -4 ,26305 ,TETRA ,17525821,Thu Nov 25 02:00:43 CET,Thu Nov 25 03:50:59 CET,0.0 0.504 0.699 0.834 0.949 1.047 1.126 1.197 1.317 1.38 1.442 1.439 1.599 1.651 1.757 1.859 1.946 1.989 2.076 2.156 2.267 2.336 2.409 2.511 2.596 2.673 2.747 2.821 2.916 3.001 3.08 3.171 3.254 3.345 3.442 3.54 3.626 3.711 3.793 3.869 3.947 4.033 4.1 4.125 4.145 4.105 3.949 3.677 3.224 2.463 1.011 -0.907 -2.538 -3.936 -5.126 -6.201 -7.146 -7.98 -8.669 -9.359 -9.97 -10.504 -11.006 -11.493 -11.941 -12.332 -12.747 -13.103 -13.409 -13.731 -14.066 -14.357 -14.651 -14.952 -15.18 -15.402 -15.648 -15.915 -16.182 -16.357 -16.533 -16.821 -17.021 -17.212 -17.306 -17.499 -17.712 -17.949 -18.064 -18.303 -18.437 -18.58 -18.709 -18.955 -19.084 -19.216 -19.374 -19.552 -19.758 -20.032 -20.423 -5 ,25276 ,TETRA ,17525822,Thu Nov 25 02:00:45 CET,Thu Nov 25 03:51:38 CET,0.0 0.324 0.473 0.583 0.664 0.729 0.797 0.862 0.977 1.029 1.079 1.07 1.225 1.275 1.378 1.465 1.544 1.579 1.649 1.725 1.846 1.911 1.962 2.037 2.119 2.195 2.267 2.332 2.403 2.473 2.545 2.625 2.699 2.783 2.877 2.979 3.081 3.174 3.269 3.364 3.433 3.513 3.607 3.672 3.702 3.668 3.552 3.305 2.849 2.101 0.688 -1.222 -2.842 -4.232 -5.442 -6.51 -7.413 -8.226 -8.934 -9.629 -10.225 -10.761 -11.283 -11.773 -12.214 -12.601 -13.006 -13.386 -13.72 -14.056 -14.392 -14.668 -14.957 -15.25 -15.472 -15.711 -15.957 -16.195 -16.426 -16.575 -16.726 -16.973 -17.148 -17.322 -17.413 -17.611 -17.814 -18.007 -18.109 -18.344 -18.44 -18.562 -18.675 -18.905 -19.049 -19.199 -19.362 -19.535 -19.727 -19.927 -20.311 -6 ,20585 ,TETRA ,17525823,Thu Nov 25 02:00:41 CET,Thu Nov 25 03:51:53 CET,0.0 0.16 0.27 0.361 0.449 0.549 0.645 0.729 0.877 0.949 1.017 1.026 1.191 1.246 1.341 1.435 1.529 1.573 1.67 1.766 1.907 1.993 2.067 2.175 2.283 2.388 2.478 2.559 2.679 2.812 2.931 3.031 3.114 3.205 3.317 3.43 3.526 3.638 3.764 3.881 3.975 4.074 4.193 4.254 4.247 4.204 4.083 3.86 3.469 2.687 1.222 -0.65 -2.267 -3.643 -4.805 -5.855 -6.765 -7.575 -8.281 -8.99 -9.59 -10.112 -10.603 -11.064 -11.492 -11.892 -12.307 -12.674 -12.995 -13.327 -13.666 -13.941 -14.227 -14.517 -14.737 -14.957 -15.191 -15.451 -15.704 -15.864 -16.023 -16.271 -16.441 -16.613 -16.701 -16.89 -17.087 -17.285 -17.384 -17.613 -17.701 -17.808 -17.932 -18.229 -18.382 -18.537 -18.705 -18.893 -19.081 -19.313 -19.69 -7 ,10499 ,TETRA ,17525824,Thu Nov 25 02:00:40 CET,Thu Nov 25 03:50:49 CET,0.0 0.262 0.386 0.486 0.583 0.677 0.758 0.831 0.957 1.018 1.069 1.058 1.224 1.278 1.372 1.456 1.536 1.575 1.665 1.778 1.926 2.008 2.088 2.193 2.299 2.413 2.526 2.622 2.723 2.825 2.921 3.035 3.149 3.257 3.368 3.482 3.587 3.687 3.784 3.891 4.001 4.101 4.205 4.278 4.305 4.259 4.128 3.91 3.532 2.791 1.349 -0.554 -2.231 -3.621 -4.759 -5.779 -6.694 -7.491 -8.183 -8.905 -9.495 -10.005 -10.496 -10.947 -11.372 -11.784 -12.198 -12.556 -12.865 -13.184 -13.532 -13.815 -14.092 -14.381 -14.603 -14.837 -15.077 -15.327 -15.591 -15.776 -15.96 -16.237 -16.446 -16.659 -16.756 -16.946 -17.137 -17.341 -17.447 -17.685 -17.798 -17.911 -18.03 -18.293 -18.437 -18.586 -18.755 -18.936 -19.117 -19.323 -19.731 -8 ,611 ,TETRA ,17525825,Thu Nov 25 02:01:39 CET,Thu Nov 25 03:52:35 CET,0.0 0.389 0.544 0.64 0.722 0.79 0.856 0.927 1.045 1.104 1.162 1.149 1.304 1.351 1.43 1.502 1.567 1.602 1.682 1.756 1.87 1.943 2.002 2.083 2.171 2.27 2.361 2.424 2.493 2.559 2.623 2.701 2.786 2.878 2.959 3.031 3.102 3.179 3.256 3.334 3.42 3.507 3.602 3.662 3.67 3.659 3.595 3.397 3.01 2.3 0.876 -0.967 -2.532 -3.944 -5.18 -6.26 -7.176 -7.997 -8.703 -9.399 -10.016 -10.567 -11.081 -11.555 -11.995 -12.402 -12.821 -13.186 -13.494 -13.817 -14.166 -14.445 -14.724 -15.011 -15.238 -15.482 -15.722 -15.968 -16.231 -16.397 -16.561 -16.822 -17.006 -17.189 -17.282 -17.475 -17.667 -17.861 -17.964 -18.193 -18.282 -18.402 -18.519 -18.766 -18.928 -19.095 -19.273 -19.488 -19.707 -19.977 -20.521 -9 ,6075 ,TETRA ,17525826,Thu Nov 25 02:01:39 CET,Thu Nov 25 03:45:49 CET,0.0 0.237 0.367 0.475 0.562 0.642 0.715 0.784 0.912 0.965 1.017 0.998 1.151 1.205 1.302 1.389 1.471 1.508 1.579 1.645 1.726 1.778 1.832 1.909 1.989 2.069 2.133 2.2 2.288 2.366 2.44 2.524 2.594 2.652 2.724 2.8 2.859 2.937 3.019 3.082 3.14 3.203 3.253 3.265 3.24 3.154 2.974 2.693 2.23 1.469 0.082 -1.72 -3.262 -4.62 -5.77 -6.767 -7.646 -8.425 -9.112 -9.814 -10.416 -10.955 -11.462 -11.924 -12.35 -12.749 -13.159 -13.511 -13.815 -14.135 -14.471 -14.753 -15.035 -15.318 -15.543 -15.778 -16.019 -16.269 -16.516 -16.68 -16.857 -17.134 -17.314 -17.487 -17.578 -17.775 -17.982 -18.189 -18.289 -18.517 -18.608 -18.719 -18.839 -19.073 -19.201 -19.348 -19.501 -19.678 -19.876 -20.106 -20.411 -10 ,19656 ,TETRA ,17525827,Thu Nov 25 02:01:39 CET,Thu Nov 25 03:51:15 CET,0.0 0.176 0.284 0.387 0.471 0.55 0.63 0.706 0.837 0.888 0.937 0.925 1.082 1.132 1.234 1.339 1.432 1.468 1.546 1.625 1.729 1.796 1.86 1.943 2.022 2.091 2.147 2.215 2.308 2.387 2.458 2.536 2.625 2.714 2.817 2.93 3.031 3.137 3.26 3.385 3.467 3.534 3.592 3.642 3.687 3.664 3.557 3.323 2.898 2.172 0.761 -1.098 -2.682 -4.028 -5.213 -6.275 -7.217 -8.064 -8.758 -9.445 -10.045 -10.578 -11.081 -11.556 -11.991 -12.4 -12.833 -13.209 -13.524 -13.84 -14.17 -14.443 -14.725 -15.032 -15.281 -15.54 -15.795 -16.049 -16.312 -16.496 -16.687 -16.967 -17.164 -17.374 -17.487 -17.731 -17.974 -18.217 -18.342 -18.594 -18.759 -18.91 -19.059 -19.396 -19.585 -19.784 -19.995 -20.258 -20.577 -20.979 -22.033 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt deleted file mode 100644 index 3fe06297..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-13d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15463 ,TETRA ,17525828,Thu Nov 25 02:01:39 CET,Thu Nov 25 03:50:35 CET,0.0 0.519 0.771 0.973 1.165 1.335 1.492 1.638 1.906 2.012 2.114 2.186 2.422 2.518 2.701 2.89 3.091 3.185 3.36 3.545 3.801 3.958 4.115 4.349 4.568 4.788 5.011 5.214 5.47 5.72 5.957 6.255 6.558 6.85 7.197 7.588 7.974 8.405 8.864 9.342 9.849 10.446 11.141 11.812 12.565 13.43 14.469 15.582 16.769 18.157 19.663 20.638 21.092 21.268 21.335 21.343 21.27 21.169 21.039 20.878 20.733 20.57 20.392 20.223 20.068 19.921 19.769 19.645 19.551 19.473 19.376 19.28 19.169 19.057 18.971 18.874 18.784 18.691 18.584 18.508 18.426 18.301 18.225 18.14 18.095 18.004 17.9 17.79 17.739 17.571 17.561 17.49 17.416 17.207 17.08 16.952 16.826 16.69 16.52 16.342 16.011 -2 ,31170 ,TETRA ,17525829,Thu Nov 25 02:01:39 CET,Thu Nov 25 03:52:04 CET,0.0 0.511 0.788 0.994 1.167 1.308 1.445 1.577 1.834 1.963 2.101 2.254 2.51 2.627 2.856 3.077 3.293 3.396 3.597 3.787 4.06 4.232 4.389 4.625 4.868 5.106 5.342 5.568 5.856 6.123 6.385 6.721 7.044 7.345 7.691 8.074 8.434 8.827 9.253 9.704 10.195 10.765 11.412 12.059 12.832 13.701 14.695 15.814 17.097 18.567 20.24 21.513 22.105 22.357 22.453 22.463 22.409 22.291 22.155 22.032 21.916 21.785 21.633 21.483 21.334 21.174 21.01 20.885 20.777 20.637 20.493 20.379 20.26 20.124 20.013 19.901 19.78 19.662 19.55 19.475 19.4 19.283 19.203 19.113 19.06 18.941 18.828 18.736 18.679 18.487 18.44 18.356 18.265 18.071 17.967 17.835 17.679 17.5 17.298 17.043 16.472 -3 ,6665 ,TETRA ,17525830,Thu Nov 25 02:01:39 CET,Thu Nov 25 03:51:34 CET,0.0 0.556 0.79 0.974 1.13 1.273 1.402 1.528 1.785 1.907 2.025 2.12 2.357 2.458 2.683 2.909 3.126 3.222 3.411 3.607 3.874 4.047 4.226 4.471 4.71 4.963 5.197 5.407 5.692 5.973 6.236 6.552 6.857 7.156 7.507 7.906 8.281 8.688 9.14 9.622 10.136 10.742 11.44 12.112 12.919 13.814 14.808 15.927 17.205 18.627 20.209 21.387 21.946 22.181 22.247 22.226 22.149 22.036 21.926 21.78 21.621 21.47 21.31 21.144 20.994 20.85 20.673 20.503 20.346 20.185 20.028 19.908 19.793 19.666 19.556 19.441 19.317 19.193 19.07 18.985 18.898 18.742 18.613 18.482 18.422 18.297 18.169 18.034 17.969 17.795 17.786 17.718 17.638 17.479 17.374 17.233 17.086 16.961 16.856 16.695 16.224 -4 ,25953 ,TETRA ,17525831,Thu Nov 25 02:02:43 CET,Thu Nov 25 03:52:28 CET,0.0 0.537 0.84 1.043 1.244 1.425 1.569 1.694 1.945 2.07 2.177 2.273 2.527 2.637 2.845 3.04 3.224 3.316 3.494 3.664 3.932 4.111 4.284 4.546 4.776 4.976 5.169 5.357 5.614 5.86 6.099 6.398 6.688 6.974 7.307 7.669 8.004 8.37 8.8 9.259 9.734 10.294 10.959 11.619 12.364 13.201 14.158 15.229 16.494 17.845 19.356 20.549 21.084 21.251 21.303 21.266 21.136 21.022 20.896 20.724 20.582 20.447 20.292 20.143 20.001 19.862 19.708 19.565 19.451 19.322 19.169 19.043 18.906 18.76 18.654 18.544 18.42 18.296 18.16 18.063 17.956 17.778 17.655 17.523 17.456 17.317 17.175 17.018 16.932 16.728 16.658 16.563 16.455 16.22 16.094 15.959 15.792 15.634 15.5 15.345 14.99 -5 ,16333 ,TETRA ,17525832,Thu Nov 25 02:02:43 CET,Thu Nov 25 03:51:31 CET,0.0 0.784 1.039 1.268 1.445 1.6 1.748 1.885 2.142 2.266 2.378 2.467 2.711 2.829 3.091 3.34 3.562 3.666 3.874 4.064 4.333 4.511 4.693 4.955 5.19 5.419 5.658 5.885 6.17 6.453 6.726 7.069 7.403 7.719 8.075 8.455 8.816 9.223 9.663 10.132 10.631 11.2 11.872 12.541 13.314 14.182 15.195 16.303 17.551 18.97 20.589 21.753 22.233 22.475 22.568 22.537 22.473 22.326 22.141 21.982 21.837 21.692 21.546 21.371 21.202 21.061 20.911 20.76 20.62 20.476 20.322 20.195 20.064 19.909 19.78 19.65 19.517 19.398 19.281 19.182 19.067 18.888 18.769 18.645 18.579 18.448 18.309 18.171 18.093 17.892 17.827 17.736 17.641 17.432 17.303 17.15 16.978 16.77 16.515 16.17 15.448 -6 ,12139 ,TETRA ,17525833,Thu Nov 25 02:02:43 CET,Thu Nov 25 03:51:01 CET,0.0 0.395 0.626 0.834 1.023 1.183 1.327 1.456 1.68 1.794 1.915 2.006 2.25 2.358 2.556 2.746 2.938 3.025 3.188 3.349 3.587 3.738 3.887 4.104 4.307 4.512 4.73 4.943 5.213 5.48 5.734 6.052 6.364 6.661 7.003 7.393 7.769 8.189 8.641 9.115 9.618 10.183 10.88 11.609 12.431 13.329 14.311 15.381 16.651 18.088 19.707 20.881 21.39 21.622 21.729 21.754 21.705 21.582 21.444 21.306 21.155 21.012 20.884 20.751 20.63 20.501 20.357 20.22 20.078 19.935 19.805 19.685 19.534 19.38 19.255 19.12 18.982 18.828 18.666 18.559 18.449 18.268 18.14 18.015 17.955 17.83 17.706 17.585 17.52 17.332 17.282 17.194 17.093 16.908 16.819 16.716 16.605 16.481 16.361 16.225 15.811 -7 ,29992 ,TETRA ,17525834,Thu Nov 25 02:02:43 CET,Thu Nov 25 03:52:50 CET,0.0 0.636 0.877 1.069 1.255 1.423 1.566 1.705 1.98 2.112 2.236 2.336 2.591 2.705 2.908 3.092 3.262 3.351 3.538 3.716 3.962 4.128 4.3 4.556 4.8 5.045 5.297 5.518 5.789 6.063 6.329 6.646 6.956 7.271 7.637 8.045 8.415 8.841 9.335 9.847 10.375 10.956 11.631 12.306 13.086 13.935 14.894 16.028 17.359 18.831 20.351 21.488 22.109 22.421 22.565 22.57 22.505 22.381 22.228 22.058 21.876 21.702 21.535 21.375 21.229 21.083 20.927 20.785 20.643 20.494 20.345 20.218 20.084 19.943 19.833 19.71 19.58 19.435 19.287 19.197 19.104 18.933 18.818 18.715 18.66 18.542 18.404 18.25 18.177 17.991 17.943 17.857 17.784 17.612 17.497 17.374 17.26 17.156 17.031 16.831 16.081 -8 ,15323 ,TETRA ,17525835,Thu Nov 25 02:02:43 CET,Thu Nov 25 03:52:49 CET,0.0 0.56 0.831 1.024 1.208 1.394 1.566 1.719 1.958 2.085 2.215 2.312 2.564 2.672 2.862 3.056 3.269 3.38 3.602 3.814 4.101 4.289 4.475 4.727 4.969 5.207 5.433 5.66 5.949 6.222 6.482 6.818 7.154 7.471 7.836 8.222 8.585 8.985 9.412 9.871 10.386 10.97 11.668 12.408 13.232 14.097 15.078 16.171 17.428 18.883 20.529 21.631 22.141 22.397 22.494 22.495 22.43 22.34 22.234 22.088 21.946 21.82 21.682 21.528 21.377 21.243 21.099 20.965 20.847 20.716 20.579 20.458 20.312 20.146 20.021 19.899 19.761 19.611 19.473 19.372 19.269 19.138 19.055 18.961 18.905 18.777 18.654 18.53 18.465 18.294 18.281 18.21 18.133 17.961 17.866 17.763 17.657 17.545 17.384 17.147 16.773 -9 ,24027 ,TETRA ,17525836,Thu Nov 25 02:02:43 CET,Thu Nov 25 03:51:43 CET,0.0 0.674 0.974 1.21 1.455 1.694 1.926 2.131 2.454 2.603 2.747 2.869 3.122 3.232 3.451 3.663 3.892 4.005 4.193 4.375 4.656 4.835 5.0 5.232 5.475 5.722 5.961 6.192 6.489 6.792 7.086 7.411 7.713 8.011 8.357 8.733 9.097 9.507 9.943 10.403 10.901 11.472 12.147 12.808 13.6 14.511 15.511 16.584 17.828 19.292 20.914 22.023 22.519 22.766 22.865 22.863 22.797 22.675 22.542 22.357 22.157 21.983 21.837 21.703 21.536 21.368 21.231 21.105 20.986 20.854 20.706 20.594 20.478 20.328 20.209 20.092 19.968 19.835 19.695 19.595 19.486 19.324 19.214 19.087 19.016 18.867 18.704 18.543 18.456 18.246 18.154 18.049 17.942 17.692 17.556 17.435 17.287 17.092 16.857 16.548 15.773 -10 ,8639 ,TETRA ,17525837,Thu Nov 25 02:03:40 CET,Thu Nov 25 03:52:27 CET,0.0 0.526 0.776 0.973 1.141 1.289 1.434 1.578 1.859 1.983 2.105 2.192 2.426 2.52 2.691 2.848 3.018 3.113 3.299 3.483 3.754 3.92 4.08 4.326 4.571 4.807 5.04 5.264 5.544 5.819 6.086 6.409 6.717 7.011 7.365 7.762 8.13 8.526 8.969 9.453 9.941 10.472 11.116 11.78 12.555 13.397 14.332 15.391 16.628 18.074 19.739 20.861 21.362 21.599 21.654 21.594 21.509 21.433 21.339 21.204 21.045 20.882 20.712 20.545 20.392 20.238 20.054 19.883 19.75 19.61 19.485 19.395 19.289 19.189 19.11 19.002 18.887 18.787 18.696 18.621 18.53 18.397 18.316 18.223 18.17 18.069 17.967 17.841 17.775 17.592 17.533 17.443 17.359 17.189 17.069 16.941 16.813 16.675 16.535 16.323 15.706 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt deleted file mode 100644 index 5e014772..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12693 ,TETRA ,17525838,Thu Nov 25 02:03:41 CET,Thu Nov 25 03:55:22 CET,0.0 0.683 1.082 1.352 1.55 1.732 1.901 2.073 2.406 2.54 2.657 2.765 3.023 3.149 3.386 3.6 3.8 3.897 4.106 4.3 4.572 4.753 4.926 5.169 5.402 5.632 5.848 6.054 6.331 6.598 6.851 7.167 7.465 7.743 8.071 8.45 8.801 9.197 9.66 10.168 10.69 11.256 11.92 12.612 13.447 14.343 15.366 16.601 18.046 19.667 21.535 23.001 23.758 24.145 24.339 24.399 24.417 24.403 24.349 24.265 24.186 24.106 24.002 23.883 23.759 23.642 23.526 23.428 23.344 23.259 23.172 23.093 23.02 22.949 22.892 22.831 22.764 22.697 22.632 22.581 22.516 22.429 22.364 22.285 22.244 22.157 22.07 21.992 21.954 21.799 21.807 21.745 21.685 21.569 21.512 21.434 21.324 21.213 21.092 20.913 20.629 -2 ,13673 ,TETRA ,17525839,Thu Nov 25 02:03:41 CET,Thu Nov 25 03:54:34 CET,0.0 0.344 0.569 0.753 0.925 1.076 1.204 1.327 1.543 1.64 1.744 1.819 2.052 2.152 2.339 2.505 2.663 2.74 2.894 3.046 3.279 3.436 3.592 3.831 4.058 4.284 4.499 4.701 4.986 5.27 5.548 5.882 6.199 6.507 6.855 7.247 7.622 8.033 8.469 8.931 9.428 9.994 10.67 11.342 12.108 12.969 14.016 15.206 16.542 18.109 19.923 21.352 22.151 22.586 22.804 22.909 22.933 22.925 22.889 22.812 22.71 22.607 22.508 22.404 22.299 22.199 22.081 21.973 21.879 21.766 21.638 21.535 21.443 21.351 21.279 21.187 21.068 20.945 20.825 20.745 20.657 20.504 20.403 20.301 20.24 20.107 19.979 19.852 19.787 19.611 19.584 19.51 19.433 19.258 19.146 19.004 18.857 18.678 18.438 18.14 17.284 -3 ,2058 ,TETRA ,17525840,Thu Nov 25 02:04:43 CET,Thu Nov 25 03:54:22 CET,0.0 0.345 0.571 0.741 0.867 1.018 1.177 1.308 1.559 1.686 1.794 1.851 2.084 2.183 2.377 2.558 2.737 2.824 2.991 3.16 3.41 3.562 3.71 3.934 4.156 4.369 4.57 4.773 5.047 5.322 5.596 5.932 6.242 6.537 6.903 7.309 7.677 8.095 8.565 9.067 9.585 10.157 10.847 11.57 12.402 13.3 14.327 15.527 16.926 18.542 20.417 21.855 22.625 23.028 23.224 23.329 23.376 23.372 23.338 23.282 23.222 23.14 23.059 22.975 22.878 22.771 22.643 22.532 22.43 22.329 22.226 22.133 22.038 21.928 21.834 21.738 21.639 21.542 21.445 21.38 21.318 21.229 21.158 21.075 21.034 20.963 20.887 20.796 20.752 20.594 20.604 20.549 20.496 20.378 20.303 20.219 20.129 20.05 19.967 19.841 19.608 -4 ,29108 ,TETRA ,17525841,Thu Nov 25 02:04:43 CET,Thu Nov 25 04:01:09 CET,0.0 0.46 0.807 1.105 1.354 1.573 1.769 1.924 2.206 2.352 2.499 2.646 2.906 3.02 3.223 3.433 3.631 3.729 3.931 4.123 4.393 4.571 4.745 4.988 5.227 5.459 5.681 5.905 6.187 6.451 6.72 7.061 7.387 7.688 8.034 8.409 8.771 9.179 9.623 10.103 10.614 11.193 11.87 12.559 13.36 14.238 15.232 16.347 17.682 19.299 21.204 22.612 23.381 23.817 24.044 24.131 24.14 24.115 24.055 23.959 23.852 23.761 23.655 23.533 23.416 23.298 23.164 23.047 22.952 22.848 22.723 22.623 22.52 22.401 22.311 22.212 22.108 22.002 21.881 21.794 21.702 21.575 21.49 21.388 21.336 21.215 21.081 20.954 20.892 20.712 20.653 20.554 20.461 20.286 20.177 20.058 19.939 19.784 19.585 19.287 18.37 -5 ,5885 ,TETRA ,17525842,Thu Nov 25 02:04:45 CET,Thu Nov 25 04:01:38 CET,0.0 0.721 1.044 1.305 1.537 1.743 1.927 2.109 2.45 2.606 2.746 2.871 3.134 3.257 3.478 3.681 3.884 3.982 4.16 4.335 4.608 4.784 4.95 5.191 5.428 5.67 5.894 6.115 6.402 6.663 6.92 7.247 7.564 7.851 8.189 8.571 8.928 9.339 9.788 10.25 10.733 11.282 11.932 12.586 13.373 14.296 15.32 16.41 17.736 19.344 21.204 22.622 23.375 23.819 24.102 24.264 24.307 24.275 24.215 24.152 24.1 24.032 23.951 23.846 23.731 23.625 23.502 23.406 23.322 23.218 23.114 23.02 22.918 22.803 22.71 22.617 22.521 22.41 22.28 22.193 22.108 21.98 21.897 21.803 21.754 21.645 21.506 21.373 21.31 21.124 21.089 21.009 20.933 20.794 20.722 20.657 20.585 20.489 20.381 20.246 20.02 -6 ,5600 ,TETRA ,17525843,Thu Nov 25 02:04:43 CET,Thu Nov 25 03:54:21 CET,0.0 0.366 0.623 0.809 0.949 1.078 1.207 1.339 1.566 1.663 1.755 1.817 2.058 2.156 2.339 2.529 2.704 2.784 2.95 3.116 3.374 3.54 3.704 3.95 4.18 4.399 4.629 4.854 5.125 5.387 5.65 5.96 6.254 6.541 6.881 7.28 7.676 8.098 8.549 9.037 9.558 10.152 10.832 11.503 12.277 13.116 14.073 15.173 16.503 18.127 20.031 21.512 22.346 22.832 23.082 23.199 23.23 23.224 23.199 23.123 23.04 22.966 22.866 22.766 22.68 22.583 22.451 22.328 22.234 22.131 22.012 21.905 21.789 21.686 21.608 21.515 21.413 21.309 21.187 21.103 21.034 20.906 20.807 20.715 20.662 20.554 20.453 20.354 20.301 20.131 20.149 20.094 20.038 19.933 19.874 19.808 19.737 19.666 19.593 19.464 19.282 -7 ,29432 ,TETRA ,17525844,Thu Nov 25 02:04:43 CET,Thu Nov 25 03:52:10 CET,0.0 0.392 0.598 0.789 0.948 1.092 1.221 1.341 1.561 1.675 1.786 1.848 2.078 2.179 2.379 2.566 2.761 2.859 3.046 3.229 3.495 3.663 3.829 4.063 4.287 4.513 4.733 4.951 5.227 5.489 5.737 6.036 6.334 6.624 6.978 7.385 7.771 8.199 8.646 9.112 9.608 10.186 10.849 11.494 12.265 13.146 14.14 15.253 16.557 18.087 19.901 21.278 22.011 22.443 22.678 22.779 22.805 22.773 22.72 22.644 22.544 22.436 22.323 22.198 22.079 21.978 21.862 21.754 21.656 21.546 21.422 21.306 21.19 21.072 20.976 20.868 20.753 20.639 20.523 20.447 20.368 20.241 20.153 20.062 20.013 19.909 19.791 19.662 19.59 19.405 19.349 19.248 19.149 18.955 18.843 18.711 18.57 18.377 18.155 17.914 17.47 -8 ,21693 ,TETRA ,17525845,Thu Nov 25 02:04:43 CET,Thu Nov 25 03:52:35 CET,0.0 0.347 0.55 0.721 0.9 1.089 1.271 1.453 1.797 1.939 2.062 2.186 2.451 2.567 2.771 2.962 3.14 3.233 3.424 3.6 3.85 4.011 4.17 4.412 4.649 4.863 5.076 5.297 5.579 5.84 6.106 6.445 6.779 7.106 7.465 7.863 8.269 8.718 9.18 9.666 10.173 10.757 11.472 12.172 12.993 13.96 15.058 16.262 17.648 19.267 21.141 22.529 23.238 23.641 23.893 24.023 24.052 24.044 24.0 23.919 23.828 23.723 23.626 23.526 23.427 23.342 23.239 23.131 23.04 22.945 22.84 22.755 22.656 22.56 22.481 22.387 22.303 22.223 22.144 22.083 22.016 21.912 21.832 21.749 21.706 21.628 21.558 21.474 21.425 21.264 21.256 21.19 21.131 21.011 20.946 20.878 20.81 20.738 20.648 20.53 20.25 -9 ,25928 ,TETRA ,17525846,Thu Nov 25 02:10:41 CET,Thu Nov 25 04:00:47 CET,0.0 0.577 0.804 1.015 1.194 1.33 1.453 1.57 1.795 1.904 2.016 2.1 2.333 2.426 2.612 2.79 2.958 3.043 3.217 3.387 3.628 3.777 3.924 4.153 4.366 4.558 4.747 4.938 5.193 5.444 5.673 5.937 6.201 6.474 6.796 7.145 7.495 7.897 8.339 8.828 9.339 9.899 10.542 11.216 12.003 12.884 13.935 15.117 16.433 17.919 19.705 21.062 21.722 22.089 22.299 22.399 22.421 22.411 22.378 22.316 22.24 22.147 22.051 21.966 21.869 21.767 21.648 21.528 21.438 21.362 21.289 21.229 21.17 21.106 21.053 20.992 20.919 20.833 20.736 20.68 20.627 20.536 20.467 20.4 20.364 20.274 20.187 20.1 20.058 19.899 19.912 19.857 19.792 19.662 19.594 19.508 19.413 19.312 19.204 19.081 18.926 -10 ,26981 ,TETRA ,17525847,Thu Nov 25 02:10:41 CET,Thu Nov 25 04:00:01 CET,0.0 0.43 0.658 0.858 1.018 1.178 1.314 1.437 1.675 1.779 1.885 1.955 2.186 2.283 2.463 2.63 2.787 2.866 3.023 3.182 3.422 3.574 3.723 3.938 4.145 4.355 4.549 4.73 4.981 5.237 5.484 5.787 6.08 6.367 6.715 7.098 7.475 7.894 8.352 8.857 9.377 9.953 10.624 11.313 12.132 13.039 14.061 15.225 16.647 18.31 20.232 21.667 22.399 22.856 23.108 23.217 23.254 23.258 23.233 23.178 23.12 23.041 22.945 22.838 22.723 22.608 22.493 22.381 22.272 22.165 22.081 22.018 21.94 21.853 21.783 21.714 21.637 21.55 21.455 21.395 21.33 21.223 21.159 21.087 21.042 20.952 20.866 20.77 20.723 20.563 20.559 20.491 20.421 20.286 20.217 20.13 20.025 19.921 19.826 19.709 19.498 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index f4d6d6f4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17f_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15235 ,TETRA ,17525848,Thu Nov 25 02:10:41 CET,Thu Nov 25 04:00:02 CET,0.0 0.474 0.726 0.878 1.006 1.129 1.25 1.366 1.573 1.686 1.797 1.844 2.056 2.137 2.311 2.49 2.652 2.724 2.861 3.012 3.221 3.335 3.447 3.605 3.751 3.903 4.062 4.211 4.386 4.567 4.757 4.982 5.195 5.391 5.627 5.895 6.147 6.421 6.706 7.016 7.365 7.781 8.271 8.746 9.305 9.921 10.606 11.389 12.285 13.233 14.143 14.63 14.693 14.572 14.373 14.148 13.91 13.661 13.423 13.177 12.951 12.727 12.513 12.3 12.083 11.9 11.704 11.51 11.336 11.156 10.971 10.821 10.67 10.515 10.396 10.264 10.126 9.986 9.824 9.705 9.578 9.38 9.245 9.097 9.018 8.878 8.761 8.631 8.557 8.354 8.338 8.264 8.184 8.016 7.917 7.815 7.709 7.581 7.43 7.253 6.884 -2 ,15932 ,TETRA ,17525849,Thu Nov 25 02:10:41 CET,Thu Nov 25 04:00:36 CET,0.0 0.394 0.604 0.791 0.952 1.095 1.225 1.349 1.565 1.664 1.755 1.784 1.994 2.08 2.26 2.41 2.559 2.631 2.77 2.899 3.098 3.232 3.356 3.553 3.758 3.961 4.153 4.342 4.572 4.798 5.029 5.297 5.533 5.754 6.03 6.353 6.657 6.98 7.327 7.684 8.072 8.508 8.992 9.492 10.081 10.719 11.443 12.21 13.052 13.954 14.897 15.432 15.538 15.499 15.329 15.092 14.831 14.551 14.286 13.999 13.736 13.489 13.256 13.042 12.83 12.633 12.418 12.211 12.031 11.842 11.653 11.509 11.346 11.182 11.063 10.935 10.796 10.656 10.521 10.43 10.348 10.215 10.109 9.992 9.923 9.794 9.674 9.54 9.477 9.285 9.271 9.191 9.105 8.918 8.812 8.711 8.604 8.485 8.339 8.131 7.72 -3 ,23296 ,TETRA ,17525850,Thu Nov 25 02:10:43 CET,Thu Nov 25 04:01:01 CET,0.0 0.427 0.657 0.85 1.008 1.156 1.294 1.422 1.649 1.748 1.85 1.919 2.143 2.237 2.403 2.526 2.654 2.721 2.845 2.957 3.123 3.256 3.39 3.556 3.709 3.866 4.02 4.186 4.423 4.64 4.83 5.065 5.294 5.51 5.767 6.056 6.333 6.645 6.998 7.385 7.8 8.239 8.713 9.185 9.77 10.428 11.143 11.924 12.835 13.849 14.825 15.284 15.324 15.138 14.879 14.611 14.361 14.102 13.841 13.574 13.334 13.111 12.873 12.621 12.39 12.183 11.971 11.782 11.6 11.416 11.239 11.082 10.908 10.735 10.59 10.431 10.272 10.115 9.958 9.841 9.726 9.56 9.447 9.335 9.283 9.171 9.044 8.91 8.843 8.647 8.627 8.555 8.469 8.273 8.151 8.023 7.917 7.8 7.661 7.493 7.129 -4 ,9727 ,TETRA ,17525851,Thu Nov 25 02:10:42 CET,Thu Nov 25 03:59:21 CET,0.0 0.502 0.709 0.859 1.01 1.167 1.31 1.442 1.657 1.747 1.84 1.902 2.13 2.209 2.347 2.486 2.651 2.733 2.89 3.04 3.222 3.342 3.461 3.629 3.812 4.012 4.195 4.348 4.54 4.725 4.907 5.135 5.357 5.578 5.842 6.131 6.402 6.711 7.045 7.389 7.749 8.153 8.635 9.122 9.668 10.281 10.971 11.693 12.511 13.419 14.283 14.783 14.893 14.78 14.594 14.369 14.117 13.879 13.663 13.424 13.19 12.965 12.751 12.529 12.307 12.105 11.881 11.67 11.504 11.345 11.166 11.021 10.867 10.701 10.587 10.47 10.337 10.199 10.058 9.964 9.864 9.699 9.602 9.499 9.437 9.306 9.167 9.029 8.966 8.779 8.77 8.686 8.601 8.449 8.374 8.303 8.216 8.117 8.009 7.839 7.501 -5 ,5984 ,TETRA ,17525852,Thu Nov 25 02:11:38 CET,Thu Nov 25 04:01:10 CET,0.0 0.451 0.638 0.779 0.922 1.054 1.16 1.265 1.48 1.586 1.681 1.724 1.951 2.037 2.207 2.376 2.537 2.617 2.782 2.943 3.156 3.287 3.42 3.606 3.787 3.97 4.146 4.316 4.529 4.731 4.925 5.159 5.393 5.607 5.847 6.124 6.412 6.742 7.091 7.445 7.798 8.202 8.713 9.228 9.793 10.425 11.14 11.887 12.693 13.597 14.472 14.823 14.864 14.705 14.443 14.14 13.821 13.534 13.285 13.012 12.749 12.507 12.264 12.026 11.805 11.612 11.417 11.249 11.115 10.967 10.813 10.689 10.548 10.398 10.281 10.157 10.029 9.896 9.764 9.681 9.596 9.447 9.334 9.216 9.158 9.03 8.891 8.762 8.695 8.498 8.461 8.377 8.278 8.053 7.941 7.811 7.685 7.578 7.461 7.275 6.171 -6 ,12388 ,TETRA ,17525853,Thu Nov 25 02:11:38 CET,Thu Nov 25 04:01:34 CET,0.0 0.355 0.522 0.67 0.829 0.988 1.131 1.275 1.512 1.601 1.695 1.744 1.965 2.064 2.258 2.44 2.627 2.713 2.868 3.027 3.253 3.394 3.533 3.738 3.929 4.108 4.281 4.438 4.651 4.872 5.077 5.326 5.589 5.843 6.121 6.422 6.707 7.019 7.372 7.766 8.185 8.635 9.124 9.627 10.222 10.86 11.571 12.329 13.167 14.103 15.02 15.491 15.568 15.466 15.292 15.046 14.778 14.505 14.271 14.059 13.837 13.605 13.386 13.177 12.984 12.8 12.59 12.404 12.237 12.054 11.868 11.718 11.558 11.395 11.284 11.174 11.045 10.913 10.78 10.683 10.588 10.445 10.344 10.242 10.189 10.067 9.926 9.774 9.692 9.482 9.48 9.416 9.34 9.183 9.099 8.981 8.839 8.696 8.54 8.347 7.852 -7 ,29267 ,TETRA ,17525854,Thu Nov 25 02:12:36 CET,Thu Nov 25 04:01:14 CET,0.0 0.464 0.688 0.867 1.022 1.157 1.28 1.399 1.643 1.743 1.842 1.917 2.141 2.237 2.427 2.596 2.762 2.848 3.011 3.155 3.362 3.486 3.6 3.769 3.936 4.099 4.26 4.426 4.652 4.863 5.057 5.29 5.517 5.757 6.046 6.375 6.682 6.991 7.344 7.724 8.109 8.532 9.023 9.535 10.11 10.728 11.44 12.239 13.12 13.977 14.829 15.237 15.282 15.174 14.958 14.728 14.481 14.243 14.048 13.827 13.609 13.389 13.185 12.983 12.776 12.591 12.398 12.23 12.077 11.905 11.727 11.576 11.412 11.261 11.154 11.043 10.924 10.8 10.653 10.556 10.464 10.304 10.203 10.102 10.049 9.935 9.816 9.688 9.62 9.427 9.412 9.338 9.261 9.075 8.96 8.851 8.748 8.634 8.506 8.354 8.012 -8 ,16174 ,TETRA ,17525855,Thu Nov 25 02:11:37 CET,Thu Nov 25 04:01:09 CET,0.0 0.336 0.494 0.635 0.758 0.872 0.984 1.095 1.299 1.396 1.498 1.533 1.748 1.835 2.002 2.155 2.306 2.381 2.526 2.659 2.848 2.974 3.096 3.28 3.456 3.624 3.79 3.95 4.16 4.359 4.55 4.783 5.013 5.242 5.515 5.826 6.123 6.45 6.801 7.18 7.571 7.988 8.468 8.964 9.533 10.134 10.82 11.548 12.354 13.263 14.196 14.634 14.674 14.546 14.316 14.063 13.795 13.522 13.287 13.023 12.786 12.579 12.361 12.156 11.948 11.746 11.552 11.386 11.237 11.069 10.911 10.787 10.656 10.524 10.417 10.307 10.195 10.062 9.918 9.828 9.721 9.534 9.416 9.312 9.257 9.131 8.995 8.849 8.778 8.567 8.493 8.403 8.318 8.128 8.027 7.906 7.755 7.574 7.382 7.184 6.648 -9 ,31528 ,TETRA ,17525856,Thu Nov 25 02:11:38 CET,Thu Nov 25 04:00:32 CET,0.0 0.34 0.536 0.711 0.868 0.999 1.121 1.249 1.486 1.597 1.699 1.747 1.962 2.044 2.22 2.393 2.548 2.625 2.776 2.912 3.096 3.215 3.337 3.521 3.705 3.887 4.062 4.232 4.449 4.663 4.869 5.115 5.37 5.603 5.859 6.167 6.465 6.777 7.124 7.506 7.902 8.357 8.908 9.485 10.136 10.802 11.529 12.316 13.212 14.188 15.119 15.539 15.567 15.455 15.263 15.043 14.796 14.552 14.323 14.06 13.828 13.605 13.372 13.145 12.917 12.711 12.519 12.343 12.178 11.999 11.797 11.631 11.479 11.328 11.202 11.071 10.93 10.783 10.64 10.544 10.451 10.316 10.215 10.103 10.048 9.938 9.823 9.687 9.615 9.415 9.4 9.336 9.256 9.063 8.964 8.853 8.719 8.568 8.418 8.212 7.812 -10 ,4928 ,TETRA ,17525857,Thu Nov 25 02:11:38 CET,Thu Nov 25 04:01:05 CET,0.0 0.353 0.534 0.72 0.898 1.049 1.186 1.313 1.543 1.649 1.746 1.801 2.038 2.13 2.28 2.436 2.599 2.669 2.799 2.943 3.175 3.318 3.443 3.61 3.78 3.945 4.091 4.244 4.472 4.681 4.867 5.11 5.354 5.59 5.876 6.211 6.521 6.847 7.191 7.565 7.964 8.383 8.865 9.356 9.92 10.558 11.28 12.057 12.934 13.905 14.837 15.274 15.354 15.258 15.069 14.834 14.589 14.347 14.079 13.789 13.544 13.307 13.072 12.86 12.652 12.447 12.236 12.039 11.868 11.697 11.512 11.354 11.195 11.02 10.882 10.745 10.597 10.434 10.273 10.163 10.043 9.863 9.738 9.595 9.525 9.376 9.207 9.047 8.966 8.749 8.661 8.559 8.472 8.286 8.191 8.094 7.989 7.872 7.716 7.545 7.313 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 60e082af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20777 ,TETRA ,17525858,Thu Nov 25 02:11:39 CET,Thu Nov 25 04:00:00 CET,0.0 0.222 0.338 0.428 0.511 0.593 0.67 0.74 0.856 0.909 0.958 0.93 1.098 1.142 1.232 1.32 1.405 1.448 1.545 1.636 1.753 1.818 1.875 1.965 2.061 2.156 2.235 2.301 2.388 2.49 2.609 2.761 2.9 3.018 3.154 3.307 3.471 3.646 3.795 3.953 4.131 4.29 4.453 4.6 4.732 4.861 4.969 5.014 4.96 4.715 3.967 2.843 1.808 0.878 0.07 -0.679 -1.35 -1.95 -2.467 -2.959 -3.382 -3.77 -4.156 -4.52 -4.862 -5.208 -5.548 -5.825 -6.076 -6.342 -6.609 -6.818 -7.04 -7.277 -7.451 -7.626 -7.817 -8.006 -8.186 -8.312 -8.441 -8.641 -8.779 -8.923 -9.002 -9.156 -9.299 -9.467 -9.561 -9.778 -9.82 -9.912 -10.017 -10.251 -10.364 -10.48 -10.599 -10.744 -10.937 -11.144 -11.662 -2 ,18559 ,TETRA ,17525859,Thu Nov 25 02:11:38 CET,Thu Nov 25 03:59:58 CET,0.0 0.235 0.311 0.383 0.461 0.542 0.631 0.71 0.844 0.904 0.958 0.937 1.108 1.163 1.265 1.365 1.463 1.505 1.576 1.649 1.75 1.811 1.872 1.952 2.032 2.108 2.194 2.301 2.439 2.575 2.712 2.871 3.007 3.119 3.254 3.426 3.587 3.741 3.912 4.094 4.275 4.466 4.666 4.854 5.039 5.186 5.276 5.307 5.25 4.995 4.328 3.176 2.039 1.024 0.179 -0.556 -1.228 -1.823 -2.333 -2.855 -3.3 -3.692 -4.065 -4.444 -4.797 -5.11 -5.444 -5.736 -5.976 -6.226 -6.479 -6.685 -6.911 -7.151 -7.331 -7.504 -7.671 -7.834 -8.002 -8.117 -8.245 -8.445 -8.588 -8.738 -8.811 -8.975 -9.145 -9.308 -9.39 -9.598 -9.642 -9.742 -9.853 -10.086 -10.229 -10.36 -10.503 -10.684 -10.886 -11.129 -11.599 -3 ,18606 ,TETRA ,17525860,Thu Nov 25 02:11:41 CET,Thu Nov 25 04:00:12 CET,0.0 0.166 0.282 0.384 0.469 0.553 0.634 0.707 0.835 0.896 0.95 0.927 1.092 1.138 1.246 1.346 1.434 1.477 1.56 1.636 1.733 1.798 1.864 1.956 2.047 2.136 2.224 2.326 2.463 2.601 2.739 2.883 3.019 3.157 3.297 3.446 3.599 3.755 3.912 4.074 4.244 4.414 4.584 4.753 4.926 5.068 5.173 5.223 5.154 4.869 4.118 2.975 1.94 1.013 0.202 -0.565 -1.246 -1.87 -2.42 -2.953 -3.397 -3.78 -4.162 -4.532 -4.871 -5.186 -5.519 -5.813 -6.059 -6.314 -6.601 -6.837 -7.063 -7.296 -7.47 -7.633 -7.799 -7.977 -8.149 -8.266 -8.389 -8.598 -8.742 -8.889 -8.969 -9.136 -9.311 -9.483 -9.567 -9.785 -9.862 -9.968 -10.064 -10.263 -10.378 -10.492 -10.631 -10.79 -10.949 -11.143 -11.651 -4 ,26572 ,TETRA ,17525861,Thu Nov 25 02:11:38 CET,Thu Nov 25 04:01:00 CET,0.0 0.176 0.316 0.431 0.53 0.616 0.684 0.747 0.879 0.949 1.015 1.007 1.179 1.229 1.321 1.41 1.499 1.543 1.632 1.71 1.821 1.901 1.983 2.094 2.191 2.274 2.346 2.421 2.515 2.605 2.697 2.814 2.915 3.003 3.113 3.228 3.331 3.451 3.593 3.748 3.898 4.065 4.234 4.386 4.532 4.636 4.726 4.769 4.668 4.35 3.587 2.408 1.332 0.401 -0.435 -1.192 -1.839 -2.432 -2.969 -3.52 -4.0 -4.418 -4.799 -5.17 -5.522 -5.838 -6.17 -6.464 -6.723 -7.002 -7.289 -7.515 -7.739 -7.97 -8.138 -8.304 -8.476 -8.659 -8.858 -8.998 -9.137 -9.337 -9.465 -9.603 -9.681 -9.843 -9.995 -10.163 -10.26 -10.481 -10.531 -10.627 -10.729 -10.949 -11.073 -11.214 -11.37 -11.532 -11.696 -11.917 -12.356 -5 ,20710 ,TETRA ,17525862,Thu Nov 25 02:12:37 CET,Thu Nov 25 04:01:54 CET,0.0 0.126 0.243 0.341 0.424 0.556 0.707 0.793 0.897 0.957 1.018 1.007 1.179 1.225 1.318 1.407 1.5 1.55 1.649 1.747 1.883 1.974 2.064 2.186 2.313 2.426 2.518 2.608 2.732 2.861 2.984 3.131 3.278 3.417 3.57 3.729 3.86 3.988 4.13 4.289 4.446 4.607 4.775 4.931 5.085 5.219 5.303 5.315 5.254 4.97 4.219 3.098 2.064 1.122 0.274 -0.487 -1.171 -1.795 -2.333 -2.879 -3.352 -3.77 -4.166 -4.55 -4.906 -5.208 -5.515 -5.787 -6.007 -6.222 -6.449 -6.645 -6.85 -7.06 -7.218 -7.367 -7.517 -7.678 -7.855 -7.987 -8.121 -8.306 -8.427 -8.566 -8.635 -8.769 -8.913 -9.074 -9.164 -9.385 -9.441 -9.536 -9.637 -9.842 -9.959 -10.083 -10.229 -10.397 -10.584 -10.813 -11.443 -6 ,24099 ,TETRA ,17525863,Thu Nov 25 02:12:39 CET,Thu Nov 25 04:01:55 CET,0.0 1.033 1.363 1.597 1.797 1.955 2.095 2.22 2.423 2.51 2.597 2.627 2.816 2.893 3.018 3.15 3.277 3.334 3.443 3.543 3.701 3.799 3.891 4.024 4.146 4.264 4.381 4.494 4.634 4.776 4.91 5.061 5.197 5.323 5.471 5.627 5.774 5.939 6.115 6.28 6.415 6.567 6.742 6.901 7.043 7.15 7.256 7.302 7.222 6.904 6.108 4.997 3.96 3.045 2.237 1.483 0.819 0.223 -0.29 -0.811 -1.268 -1.671 -2.048 -2.405 -2.749 -3.08 -3.406 -3.694 -3.955 -4.222 -4.512 -4.753 -4.992 -5.231 -5.411 -5.604 -5.804 -6.002 -6.195 -6.323 -6.461 -6.682 -6.833 -6.984 -7.067 -7.23 -7.382 -7.551 -7.636 -7.851 -7.904 -8.013 -8.129 -8.341 -8.452 -8.582 -8.724 -8.865 -9.017 -9.184 -9.587 -7 ,4405 ,TETRA ,17525864,Thu Nov 25 02:12:36 CET,Thu Nov 25 04:01:06 CET,0.0 0.167 0.288 0.39 0.483 0.556 0.621 0.68 0.784 0.837 0.888 0.869 1.039 1.088 1.186 1.273 1.362 1.403 1.483 1.561 1.673 1.749 1.827 1.965 2.104 2.222 2.33 2.432 2.573 2.719 2.852 2.992 3.124 3.247 3.385 3.532 3.661 3.789 3.936 4.096 4.247 4.42 4.596 4.738 4.869 4.996 5.115 5.166 5.105 4.798 3.977 2.78 1.72 0.796 -0.04 -0.807 -1.488 -2.086 -2.611 -3.135 -3.587 -4.004 -4.41 -4.809 -5.16 -5.461 -5.78 -6.075 -6.331 -6.589 -6.854 -7.081 -7.321 -7.56 -7.741 -7.927 -8.115 -8.306 -8.51 -8.661 -8.83 -9.095 -9.269 -9.445 -9.535 -9.712 -9.896 -10.082 -10.174 -10.391 -10.441 -10.537 -10.642 -10.85 -10.952 -11.084 -11.23 -11.372 -11.548 -11.748 -12.169 -8 ,23683 ,TETRA ,17525865,Thu Nov 25 02:12:37 CET,Thu Nov 25 04:01:53 CET,0.0 0.211 0.36 0.466 0.547 0.621 0.694 0.774 0.927 0.997 1.063 1.071 1.258 1.322 1.425 1.528 1.625 1.666 1.745 1.824 1.941 2.02 2.099 2.202 2.298 2.403 2.502 2.588 2.7 2.81 2.917 3.044 3.161 3.28 3.42 3.58 3.734 3.864 4.008 4.176 4.335 4.516 4.697 4.839 4.994 5.149 5.309 5.425 5.4 5.135 4.406 3.208 2.161 1.271 0.409 -0.375 -1.067 -1.712 -2.242 -2.776 -3.219 -3.624 -4.04 -4.407 -4.746 -5.056 -5.37 -5.644 -5.889 -6.164 -6.433 -6.642 -6.858 -7.072 -7.226 -7.384 -7.55 -7.727 -7.916 -8.059 -8.202 -8.405 -8.55 -8.705 -8.783 -8.94 -9.111 -9.292 -9.382 -9.607 -9.659 -9.754 -9.848 -10.062 -10.204 -10.363 -10.518 -10.651 -10.827 -11.045 -11.555 -9 ,23208 ,TETRA ,17525866,Thu Nov 25 02:12:38 CET,Thu Nov 25 04:01:20 CET,0.0 0.174 0.272 0.356 0.436 0.534 0.646 0.736 0.872 0.931 0.99 0.984 1.158 1.207 1.297 1.374 1.454 1.494 1.565 1.64 1.752 1.823 1.889 1.98 2.066 2.151 2.247 2.344 2.461 2.573 2.685 2.818 2.935 3.048 3.176 3.304 3.421 3.551 3.691 3.831 3.963 4.113 4.286 4.439 4.623 4.8 4.927 4.975 4.92 4.699 4.007 2.874 1.845 0.883 0.003 -0.796 -1.511 -2.126 -2.67 -3.239 -3.718 -4.145 -4.532 -4.87 -5.187 -5.492 -5.812 -6.087 -6.318 -6.561 -6.811 -7.008 -7.211 -7.417 -7.573 -7.737 -7.912 -8.084 -8.253 -8.372 -8.495 -8.683 -8.817 -8.967 -9.042 -9.199 -9.368 -9.541 -9.624 -9.841 -9.914 -10.022 -10.135 -10.377 -10.503 -10.628 -10.776 -10.932 -11.108 -11.328 -11.684 -10 ,19491 ,TETRA ,17525867,Thu Nov 25 02:12:38 CET,Thu Nov 25 04:02:08 CET,0.0 0.296 0.436 0.537 0.626 0.719 0.794 0.851 0.964 1.022 1.078 1.06 1.227 1.271 1.366 1.459 1.544 1.588 1.67 1.742 1.848 1.918 1.982 2.075 2.168 2.272 2.38 2.488 2.625 2.752 2.874 3.009 3.133 3.253 3.396 3.55 3.695 3.866 4.039 4.215 4.384 4.549 4.737 4.932 5.123 5.271 5.393 5.438 5.348 5.015 4.254 3.157 2.11 1.109 0.234 -0.572 -1.278 -1.9 -2.424 -2.942 -3.393 -3.801 -4.195 -4.562 -4.901 -5.219 -5.555 -5.853 -6.112 -6.375 -6.651 -6.886 -7.125 -7.37 -7.566 -7.763 -7.958 -8.162 -8.381 -8.536 -8.692 -8.928 -9.088 -9.25 -9.33 -9.485 -9.641 -9.819 -9.92 -10.156 -10.231 -10.334 -10.443 -10.671 -10.799 -10.924 -11.075 -11.271 -11.485 -11.746 -12.277 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt deleted file mode 100644 index 4c90764e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6077 ,TETRA ,17525868,Thu Nov 25 02:12:38 CET,Thu Nov 25 04:01:22 CET,0.0 0.276 0.457 0.592 0.704 0.804 0.896 1.0 1.198 1.278 1.355 1.394 1.59 1.663 1.808 1.963 2.13 2.209 2.365 2.512 2.706 2.831 2.959 3.153 3.337 3.515 3.69 3.861 4.096 4.324 4.542 4.802 5.045 5.278 5.545 5.849 6.158 6.483 6.816 7.181 7.575 8.037 8.569 9.103 9.747 10.445 11.242 12.14 13.176 14.366 15.685 16.589 16.982 17.16 17.217 17.18 17.112 17.037 16.933 16.774 16.601 16.46 16.334 16.207 16.076 15.957 15.828 15.69 15.568 15.442 15.3 15.18 15.061 14.952 14.869 14.785 14.708 14.629 14.535 14.462 14.392 14.287 14.201 14.104 14.064 13.991 13.911 13.817 13.766 13.601 13.549 13.461 13.38 13.239 13.17 13.088 12.984 12.882 12.754 12.596 12.231 -2 ,26351 ,TETRA ,17525869,Thu Nov 25 02:12:37 CET,Thu Nov 25 04:01:29 CET,0.0 0.205 0.381 0.51 0.616 0.728 0.838 0.942 1.139 1.223 1.299 1.335 1.531 1.602 1.735 1.869 2.014 2.084 2.214 2.343 2.527 2.647 2.761 2.907 3.066 3.236 3.408 3.577 3.798 4.017 4.224 4.479 4.735 4.976 5.239 5.523 5.801 6.133 6.519 6.931 7.347 7.809 8.35 8.899 9.547 10.252 11.053 11.937 12.933 14.127 15.479 16.47 16.934 17.107 17.138 17.106 17.034 16.916 16.786 16.646 16.504 16.356 16.215 16.068 15.926 15.802 15.666 15.549 15.448 15.342 15.226 15.132 15.033 14.923 14.836 14.749 14.664 14.578 14.473 14.393 14.321 14.203 14.112 14.009 13.956 13.861 13.768 13.672 13.625 13.466 13.453 13.393 13.315 13.145 13.061 12.967 12.856 12.735 12.608 12.432 11.889 -3 ,4252 ,TETRA ,17525870,Thu Nov 25 02:12:38 CET,Thu Nov 25 04:01:11 CET,0.0 0.203 0.353 0.49 0.611 0.722 0.83 0.937 1.137 1.226 1.309 1.342 1.538 1.606 1.744 1.888 2.026 2.094 2.224 2.356 2.55 2.671 2.784 2.949 3.113 3.277 3.431 3.577 3.768 3.957 4.141 4.354 4.575 4.803 5.056 5.355 5.665 6.006 6.373 6.765 7.175 7.633 8.181 8.741 9.385 10.071 10.877 11.822 12.869 14.043 15.33 16.243 16.705 16.89 16.889 16.804 16.702 16.56 16.417 16.261 16.088 15.92 15.75 15.576 15.408 15.248 15.072 14.922 14.793 14.658 14.522 14.393 14.261 14.124 14.008 13.891 13.769 13.646 13.511 13.407 13.302 13.151 13.044 12.925 12.861 12.722 12.567 12.403 12.327 12.152 12.085 11.979 11.873 11.653 11.544 11.436 11.317 11.201 11.076 10.867 10.461 -4 ,18700 ,TETRA ,17525871,Thu Nov 25 02:13:38 CET,Thu Nov 25 04:02:51 CET,0.0 0.238 0.366 0.499 0.616 0.716 0.809 0.907 1.098 1.183 1.265 1.315 1.518 1.599 1.755 1.901 2.034 2.099 2.241 2.388 2.594 2.729 2.864 3.062 3.248 3.429 3.61 3.783 4.004 4.221 4.436 4.693 4.942 5.185 5.457 5.748 6.032 6.354 6.723 7.114 7.499 7.919 8.437 8.968 9.572 10.254 11.021 11.87 12.877 14.074 15.411 16.35 16.77 16.935 16.982 16.915 16.783 16.653 16.521 16.375 16.25 16.12 15.988 15.866 15.742 15.604 15.451 15.322 15.212 15.102 14.974 14.852 14.711 14.565 14.465 14.36 14.23 14.092 13.971 13.894 13.829 13.729 13.654 13.564 13.51 13.407 13.303 13.199 13.141 12.975 12.945 12.879 12.816 12.671 12.578 12.468 12.351 12.228 12.104 11.957 11.61 -5 ,27654 ,TETRA ,17525872,Thu Nov 25 02:13:38 CET,Thu Nov 25 04:01:50 CET,0.0 0.278 0.407 0.534 0.659 0.761 0.856 0.95 1.147 1.233 1.306 1.329 1.533 1.613 1.75 1.892 2.027 2.088 2.214 2.345 2.531 2.644 2.757 2.934 3.106 3.263 3.4 3.533 3.723 3.92 4.113 4.346 4.575 4.81 5.091 5.39 5.669 5.979 6.331 6.712 7.107 7.561 8.087 8.601 9.218 9.93 10.718 11.563 12.53 13.63 14.904 15.84 16.26 16.418 16.46 16.453 16.389 16.273 16.143 15.995 15.841 15.695 15.54 15.391 15.252 15.103 14.943 14.797 14.668 14.553 14.443 14.338 14.218 14.078 13.954 13.837 13.714 13.577 13.445 13.345 13.23 13.065 12.98 12.903 12.858 12.771 12.672 12.56 12.502 12.335 12.307 12.237 12.161 11.983 11.895 11.806 11.704 11.6 11.469 11.299 10.881 -6 ,6660 ,TETRA ,17525873,Thu Nov 25 02:13:38 CET,Thu Nov 25 03:54:24 CET,0.0 0.533 0.748 0.961 1.147 1.306 1.458 1.606 1.886 2.017 2.136 2.251 2.479 2.582 2.773 2.955 3.135 3.22 3.376 3.525 3.728 3.864 4.002 4.19 4.357 4.529 4.706 4.874 5.09 5.308 5.522 5.776 6.021 6.257 6.533 6.845 7.136 7.455 7.803 8.157 8.528 8.975 9.494 10.024 10.675 11.384 12.171 13.054 14.085 15.266 16.597 17.48 17.863 18.039 18.077 18.046 17.948 17.827 17.723 17.607 17.486 17.371 17.268 17.162 17.048 16.924 16.785 16.664 16.561 16.457 16.351 16.258 16.156 16.049 15.968 15.88 15.786 15.691 15.586 15.509 15.437 15.326 15.242 15.154 15.113 15.024 14.913 14.801 14.751 14.592 14.584 14.519 14.455 14.316 14.225 14.119 14.01 13.875 13.7 13.518 13.129 -7 ,18534 ,TETRA ,17525874,Thu Nov 25 02:13:38 CET,Thu Nov 25 04:02:16 CET,0.0 0.294 0.448 0.578 0.689 0.785 0.875 0.964 1.147 1.232 1.308 1.341 1.537 1.61 1.75 1.891 2.047 2.124 2.258 2.383 2.543 2.648 2.754 2.906 3.069 3.23 3.383 3.536 3.733 3.923 4.097 4.303 4.517 4.74 5.014 5.324 5.619 5.938 6.282 6.644 7.038 7.489 8.01 8.54 9.147 9.83 10.61 11.462 12.459 13.594 14.891 15.866 16.285 16.396 16.373 16.346 16.268 16.147 16.032 15.888 15.736 15.586 15.447 15.304 15.137 14.991 14.864 14.735 14.611 14.489 14.364 14.256 14.152 14.051 13.977 13.895 13.805 13.712 13.605 13.529 13.462 13.357 13.275 13.19 13.145 13.039 12.918 12.794 12.729 12.558 12.533 12.464 12.389 12.235 12.147 12.059 11.981 11.898 11.802 11.663 10.982 -8 ,20475 ,TETRA ,17525875,Thu Nov 25 02:13:38 CET,Thu Nov 25 04:03:15 CET,0.0 0.224 0.391 0.532 0.64 0.739 0.846 0.946 1.117 1.199 1.28 1.316 1.514 1.592 1.743 1.881 2.006 2.074 2.212 2.338 2.528 2.655 2.778 2.956 3.126 3.291 3.447 3.604 3.815 4.018 4.217 4.455 4.7 4.947 5.227 5.539 5.855 6.211 6.591 6.983 7.393 7.876 8.445 9.003 9.639 10.357 11.196 12.097 13.14 14.333 15.656 16.596 17.002 17.172 17.204 17.15 17.044 16.895 16.729 16.548 16.392 16.251 16.107 15.979 15.85 15.723 15.588 15.46 15.341 15.207 15.057 14.93 14.799 14.664 14.569 14.465 14.351 14.244 14.127 14.039 13.937 13.763 13.652 13.552 13.507 13.407 13.301 13.195 13.137 12.973 12.965 12.891 12.806 12.638 12.54 12.439 12.339 12.235 12.088 11.91 11.337 -9 ,9524 ,TETRA ,17525876,Thu Nov 25 02:13:38 CET,Thu Nov 25 04:02:45 CET,0.0 0.291 0.48 0.641 0.764 0.874 0.974 1.073 1.265 1.352 1.433 1.466 1.655 1.73 1.885 2.048 2.21 2.29 2.445 2.596 2.822 2.966 3.095 3.269 3.446 3.627 3.806 3.98 4.212 4.442 4.666 4.951 5.22 5.457 5.725 6.03 6.332 6.669 7.023 7.4 7.793 8.236 8.752 9.266 9.873 10.547 11.305 12.153 13.186 14.361 15.666 16.609 17.047 17.251 17.32 17.322 17.248 17.134 17.021 16.888 16.757 16.637 16.515 16.389 16.266 16.149 16.008 15.876 15.763 15.632 15.481 15.354 15.227 15.075 14.949 14.846 14.746 14.641 14.532 14.453 14.37 14.242 14.16 14.076 14.031 13.938 13.841 13.74 13.68 13.499 13.453 13.376 13.297 13.133 13.045 12.952 12.863 12.763 12.633 12.468 12.103 -10 ,11861 ,TETRA ,17525877,Thu Nov 25 02:13:38 CET,Thu Nov 25 04:02:04 CET,0.0 0.659 0.822 0.927 1.031 1.138 1.246 1.349 1.534 1.616 1.694 1.737 1.936 2.009 2.141 2.273 2.412 2.476 2.59 2.708 2.888 3.007 3.132 3.321 3.52 3.73 3.93 4.11 4.339 4.559 4.774 5.031 5.267 5.496 5.757 6.044 6.33 6.663 7.013 7.378 7.759 8.186 8.707 9.22 9.81 10.534 11.365 12.233 13.247 14.421 15.738 16.65 17.052 17.214 17.215 17.136 17.053 16.95 16.834 16.687 16.52 16.371 16.247 16.09 15.907 15.755 15.61 15.47 15.351 15.23 15.09 14.973 14.847 14.697 14.579 14.465 14.341 14.212 14.073 13.986 13.906 13.779 13.697 13.61 13.559 13.452 13.349 13.251 13.201 13.038 13.017 12.951 12.884 12.708 12.601 12.501 12.403 12.302 12.187 12.038 11.66 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 82d49ebe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17h_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11621 ,TETRA ,17525878,Thu Nov 25 02:14:38 CET,Thu Nov 25 04:02:18 CET,0.0 0.433 0.64 0.792 0.926 1.061 1.182 1.278 1.457 1.545 1.632 1.688 1.888 1.969 2.112 2.227 2.33 2.386 2.499 2.605 2.75 2.848 2.944 3.078 3.212 3.335 3.434 3.536 3.667 3.792 3.935 4.108 4.264 4.405 4.573 4.763 4.949 5.167 5.389 5.589 5.782 6.002 6.258 6.512 6.8 7.099 7.395 7.647 7.838 7.894 7.551 6.854 6.138 5.417 4.757 4.114 3.524 3.015 2.58 2.143 1.769 1.441 1.131 0.812 0.493 0.219 -0.056 -0.32 -0.553 -0.797 -1.055 -1.263 -1.47 -1.678 -1.847 -2.027 -2.214 -2.401 -2.57 -2.685 -2.803 -2.974 -3.108 -3.248 -3.309 -3.44 -3.576 -3.717 -3.792 -3.995 -4.038 -4.127 -4.218 -4.437 -4.554 -4.666 -4.812 -4.975 -5.142 -5.308 -5.831 -2 ,23488 ,TETRA ,17525879,Thu Nov 25 02:14:40 CET,Thu Nov 25 04:18:34 CET,0.0 0.592 0.799 0.964 1.087 1.205 1.321 1.435 1.631 1.721 1.807 1.856 2.059 2.139 2.276 2.404 2.536 2.6 2.712 2.807 2.944 3.036 3.127 3.259 3.379 3.501 3.635 3.764 3.909 4.049 4.192 4.361 4.516 4.663 4.816 4.968 5.112 5.277 5.47 5.662 5.857 6.085 6.293 6.467 6.668 6.889 7.143 7.38 7.529 7.551 7.279 6.603 5.873 5.174 4.539 3.929 3.399 2.917 2.473 2.012 1.603 1.232 0.887 0.562 0.259 -0.019 -0.317 -0.564 -0.77 -0.997 -1.241 -1.439 -1.633 -1.837 -1.994 -2.159 -2.342 -2.528 -2.733 -2.881 -3.028 -3.251 -3.399 -3.554 -3.64 -3.827 -4.036 -4.227 -4.32 -4.555 -4.68 -4.806 -4.929 -5.192 -5.328 -5.46 -5.594 -5.718 -5.844 -6.039 -6.443 -3 ,18713 ,TETRA ,17525880,Thu Nov 25 02:14:40 CET,Thu Nov 25 04:03:59 CET,0.0 0.378 0.565 0.721 0.852 0.969 1.073 1.18 1.382 1.463 1.536 1.566 1.759 1.827 1.953 2.074 2.188 2.247 2.35 2.455 2.613 2.709 2.798 2.929 3.064 3.182 3.292 3.403 3.546 3.695 3.858 4.056 4.234 4.4 4.583 4.768 4.94 5.129 5.333 5.541 5.755 6.008 6.266 6.486 6.72 6.966 7.225 7.45 7.638 7.637 7.307 6.629 5.855 5.09 4.416 3.772 3.23 2.773 2.343 1.923 1.567 1.243 0.936 0.643 0.373 0.103 -0.199 -0.464 -0.678 -0.893 -1.129 -1.335 -1.551 -1.766 -1.922 -2.077 -2.248 -2.438 -2.631 -2.772 -2.91 -3.087 -3.207 -3.339 -3.415 -3.579 -3.728 -3.885 -3.976 -4.196 -4.238 -4.308 -4.395 -4.616 -4.74 -4.845 -4.94 -5.078 -5.25 -5.447 -6.384 -4 ,19158 ,TETRA ,17525881,Thu Nov 25 02:14:39 CET,Thu Nov 25 04:03:46 CET,0.0 0.498 0.731 0.93 1.093 1.217 1.322 1.4 1.565 1.649 1.736 1.786 1.973 2.037 2.154 2.26 2.369 2.425 2.535 2.644 2.803 2.897 2.988 3.125 3.256 3.377 3.491 3.607 3.776 3.934 4.069 4.226 4.38 4.532 4.716 4.911 5.068 5.23 5.416 5.632 5.861 6.104 6.35 6.593 6.856 7.098 7.347 7.562 7.731 7.728 7.38 6.718 5.999 5.289 4.626 3.988 3.41 2.88 2.421 1.964 1.561 1.192 0.843 0.508 0.198 -0.075 -0.345 -0.582 -0.805 -1.039 -1.271 -1.462 -1.661 -1.863 -2.021 -2.184 -2.342 -2.5 -2.66 -2.773 -2.895 -3.088 -3.223 -3.351 -3.413 -3.552 -3.71 -3.867 -3.945 -4.151 -4.19 -4.275 -4.366 -4.556 -4.669 -4.802 -4.946 -5.095 -5.258 -5.461 -6.035 -5 ,1684 ,TETRA ,17525882,Thu Nov 25 02:14:40 CET,Thu Nov 25 04:03:59 CET,0.0 0.435 0.631 0.792 0.937 1.058 1.17 1.273 1.439 1.515 1.597 1.629 1.815 1.882 2.017 2.142 2.26 2.32 2.457 2.591 2.77 2.884 3.004 3.173 3.323 3.478 3.616 3.742 3.908 4.06 4.208 4.382 4.559 4.735 4.928 5.136 5.328 5.534 5.75 5.987 6.238 6.497 6.757 7.013 7.297 7.589 7.856 8.069 8.288 8.414 8.168 7.504 6.756 6.013 5.318 4.68 4.102 3.58 3.152 2.716 2.298 1.921 1.614 1.327 1.039 0.782 0.504 0.248 0.043 -0.147 -0.361 -0.555 -0.762 -0.965 -1.111 -1.253 -1.397 -1.558 -1.724 -1.832 -1.942 -2.115 -2.232 -2.366 -2.439 -2.587 -2.733 -2.862 -2.929 -3.13 -3.16 -3.249 -3.345 -3.541 -3.649 -3.78 -3.924 -4.052 -4.184 -4.342 -4.754 -6 ,12905 ,TETRA ,17525883,Thu Nov 25 02:14:40 CET,Thu Nov 25 04:03:45 CET,0.0 0.314 0.51 0.691 0.826 0.923 1.032 1.145 1.315 1.385 1.452 1.464 1.638 1.697 1.807 1.909 2.038 2.109 2.228 2.326 2.48 2.596 2.714 2.871 3.003 3.137 3.256 3.348 3.473 3.597 3.713 3.849 3.982 4.112 4.269 4.463 4.656 4.851 5.058 5.286 5.497 5.721 5.972 6.22 6.515 6.792 7.04 7.253 7.385 7.36 7.024 6.314 5.546 4.849 4.256 3.702 3.194 2.746 2.348 1.917 1.522 1.164 0.84 0.544 0.251 -0.034 -0.329 -0.584 -0.815 -1.048 -1.288 -1.487 -1.687 -1.899 -2.065 -2.237 -2.414 -2.599 -2.779 -2.904 -3.045 -3.25 -3.39 -3.533 -3.599 -3.744 -3.894 -4.044 -4.125 -4.333 -4.371 -4.457 -4.548 -4.742 -4.84 -4.951 -5.067 -5.191 -5.325 -5.495 -5.938 -7 ,26653 ,TETRA ,17525884,Thu Nov 25 02:14:39 CET,Thu Nov 25 04:03:48 CET,0.0 0.453 0.654 0.796 0.919 1.036 1.15 1.261 1.465 1.552 1.639 1.702 1.906 1.98 2.117 2.252 2.38 2.438 2.546 2.646 2.796 2.897 3.002 3.145 3.262 3.369 3.471 3.573 3.708 3.849 3.982 4.14 4.3 4.442 4.604 4.793 4.994 5.209 5.402 5.604 5.815 6.049 6.319 6.587 6.871 7.165 7.464 7.672 7.78 7.75 7.365 6.613 5.861 5.1 4.396 3.803 3.277 2.761 2.315 1.876 1.51 1.181 0.857 0.552 0.266 0.012 -0.263 -0.506 -0.725 -0.972 -1.218 -1.417 -1.616 -1.83 -2.006 -2.179 -2.347 -2.519 -2.716 -2.857 -3.006 -3.234 -3.377 -3.531 -3.623 -3.8 -3.982 -4.168 -4.256 -4.486 -4.599 -4.718 -4.848 -5.133 -5.271 -5.43 -5.63 -5.834 -6.063 -6.398 -7.409 -8 ,27314 ,TETRA ,17525885,Thu Nov 25 02:14:41 CET,Thu Nov 25 04:05:44 CET,0.0 0.404 0.617 0.789 0.936 1.058 1.177 1.287 1.469 1.558 1.645 1.675 1.87 1.941 2.074 2.204 2.326 2.384 2.488 2.593 2.757 2.86 2.966 3.122 3.275 3.429 3.567 3.693 3.866 4.056 4.232 4.428 4.617 4.799 5.012 5.234 5.432 5.66 5.899 6.139 6.371 6.61 6.87 7.106 7.353 7.595 7.836 8.035 8.149 8.144 7.834 7.129 6.362 5.635 5.005 4.427 3.902 3.4 2.933 2.491 2.138 1.81 1.491 1.194 0.934 0.715 0.479 0.261 0.079 -0.115 -0.317 -0.483 -0.662 -0.848 -0.981 -1.116 -1.253 -1.4 -1.555 -1.663 -1.772 -1.952 -2.086 -2.223 -2.299 -2.464 -2.633 -2.78 -2.848 -3.054 -3.11 -3.21 -3.32 -3.538 -3.645 -3.754 -3.884 -4.022 -4.168 -4.335 -4.717 -9 ,29190 ,TETRA ,17525886,Thu Nov 25 02:15:40 CET,Thu Nov 25 04:04:41 CET,0.0 0.567 0.763 0.902 1.054 1.216 1.357 1.487 1.736 1.849 1.951 2.031 2.249 2.345 2.513 2.666 2.816 2.883 3.026 3.173 3.368 3.491 3.61 3.777 3.931 4.074 4.203 4.332 4.507 4.678 4.841 5.021 5.197 5.373 5.561 5.77 5.969 6.164 6.358 6.568 6.797 7.044 7.3 7.529 7.78 8.044 8.302 8.548 8.728 8.739 8.406 7.641 6.846 6.114 5.469 4.862 4.294 3.769 3.318 2.866 2.472 2.13 1.809 1.507 1.231 0.955 0.659 0.405 0.184 -0.034 -0.266 -0.464 -0.664 -0.864 -1.007 -1.163 -1.332 -1.506 -1.693 -1.822 -1.965 -2.182 -2.324 -2.479 -2.554 -2.692 -2.832 -2.977 -3.056 -3.266 -3.329 -3.431 -3.523 -3.695 -3.806 -3.941 -4.079 -4.25 -4.414 -4.562 -4.812 -10 ,10056 ,TETRA ,17525887,Thu Nov 25 02:15:39 CET,Thu Nov 25 04:04:44 CET,0.0 0.395 0.592 0.745 0.873 0.977 1.069 1.16 1.313 1.378 1.446 1.474 1.665 1.745 1.904 2.041 2.167 2.226 2.33 2.42 2.54 2.621 2.699 2.808 2.921 3.04 3.167 3.281 3.42 3.556 3.683 3.85 4.016 4.186 4.399 4.614 4.809 5.023 5.237 5.444 5.641 5.862 6.113 6.365 6.635 6.886 7.124 7.343 7.541 7.588 7.232 6.455 5.665 4.897 4.222 3.59 3.042 2.579 2.165 1.748 1.366 1.0 0.674 0.367 0.067 -0.204 -0.48 -0.717 -0.925 -1.159 -1.398 -1.583 -1.76 -1.929 -2.072 -2.222 -2.353 -2.48 -2.614 -2.706 -2.809 -2.974 -3.089 -3.216 -3.28 -3.399 -3.53 -3.677 -3.747 -3.946 -3.986 -4.068 -4.148 -4.346 -4.461 -4.597 -4.726 -4.854 -5.01 -5.223 -5.607 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 079ca1dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,251 ,TETRA ,17525888,Thu Nov 25 02:15:40 CET,Thu Nov 25 04:06:20 CET,0.0 0.466 0.647 0.803 0.925 1.012 1.1 1.184 1.32 1.387 1.456 1.462 1.649 1.709 1.824 1.941 2.056 2.113 2.228 2.323 2.458 2.556 2.649 2.776 2.9 3.02 3.132 3.246 3.389 3.528 3.661 3.799 3.955 4.099 4.235 4.386 4.531 4.699 4.875 5.065 5.272 5.518 5.805 6.05 6.312 6.596 6.869 7.089 7.231 7.285 7.112 6.544 5.876 5.208 4.575 3.974 3.389 2.833 2.384 1.955 1.592 1.28 0.97 0.678 0.419 0.184 -0.065 -0.287 -0.485 -0.703 -0.927 -1.108 -1.299 -1.499 -1.645 -1.8 -1.977 -2.171 -2.374 -2.51 -2.653 -2.9 -3.064 -3.21 -3.287 -3.457 -3.627 -3.817 -3.921 -4.164 -4.278 -4.4 -4.526 -4.785 -4.934 -5.084 -5.247 -5.433 -5.645 -5.966 -6.774 -2 ,18312 ,TETRA ,17525889,Thu Nov 25 02:15:39 CET,Thu Nov 25 04:03:00 CET,0.0 0.342 0.517 0.652 0.779 0.893 0.983 1.065 1.228 1.305 1.375 1.375 1.57 1.637 1.77 1.91 2.036 2.084 2.177 2.281 2.455 2.568 2.67 2.824 2.98 3.137 3.287 3.431 3.62 3.794 3.945 4.118 4.303 4.469 4.64 4.83 5.007 5.203 5.422 5.641 5.889 6.225 6.595 6.927 7.258 7.556 7.857 8.147 8.406 8.508 8.306 7.749 7.058 6.375 5.771 5.216 4.707 4.223 3.798 3.351 2.952 2.587 2.24 1.925 1.621 1.339 1.019 0.742 0.524 0.282 0.023 -0.204 -0.438 -0.664 -0.836 -1.01 -1.188 -1.379 -1.576 -1.708 -1.838 -2.052 -2.208 -2.361 -2.441 -2.615 -2.806 -2.999 -3.094 -3.329 -3.411 -3.527 -3.664 -3.951 -4.096 -4.251 -4.419 -4.591 -4.798 -5.08 -5.973 -3 ,5988 ,TETRA ,17525890,Thu Nov 25 02:15:40 CET,Thu Nov 25 04:06:22 CET,0.0 0.425 0.596 0.72 0.819 0.921 1.032 1.129 1.285 1.348 1.421 1.453 1.652 1.721 1.862 1.996 2.116 2.171 2.271 2.374 2.524 2.625 2.728 2.866 2.99 3.12 3.247 3.365 3.513 3.655 3.789 3.942 4.081 4.22 4.383 4.565 4.757 4.973 5.194 5.411 5.624 5.883 6.205 6.536 6.881 7.211 7.548 7.845 8.078 8.172 7.911 7.198 6.463 5.807 5.217 4.646 4.135 3.653 3.197 2.739 2.34 1.983 1.634 1.285 0.972 0.697 0.418 0.157 -0.079 -0.313 -0.581 -0.814 -1.043 -1.278 -1.456 -1.628 -1.813 -2.017 -2.232 -2.386 -2.54 -2.771 -2.935 -3.105 -3.194 -3.388 -3.582 -3.792 -3.909 -4.155 -4.27 -4.388 -4.502 -4.725 -4.857 -5.002 -5.158 -5.325 -5.538 -5.847 -6.509 -4 ,4194 ,TETRA ,17525891,Thu Nov 25 02:15:39 CET,Thu Nov 25 04:04:00 CET,0.0 0.541 0.681 0.769 0.881 0.988 1.072 1.146 1.28 1.36 1.444 1.476 1.688 1.767 1.898 2.025 2.144 2.198 2.31 2.426 2.592 2.703 2.806 2.943 3.075 3.203 3.327 3.444 3.584 3.703 3.814 3.96 4.119 4.282 4.474 4.673 4.849 5.047 5.265 5.483 5.697 5.936 6.207 6.463 6.73 6.998 7.276 7.519 7.697 7.763 7.551 6.911 6.218 5.597 4.976 4.377 3.85 3.373 2.977 2.548 2.143 1.769 1.42 1.104 0.817 0.553 0.253 -0.025 -0.256 -0.499 -0.769 -0.995 -1.218 -1.442 -1.623 -1.807 -1.988 -2.172 -2.364 -2.51 -2.66 -2.877 -3.024 -3.168 -3.246 -3.412 -3.59 -3.788 -3.885 -4.098 -4.143 -4.247 -4.359 -4.6 -4.745 -4.91 -5.079 -5.259 -5.475 -5.746 -6.565 -5 ,25336 ,TETRA ,17525892,Thu Nov 25 02:15:41 CET,Thu Nov 25 04:05:02 CET,0.0 0.597 0.772 0.892 1.005 1.099 1.189 1.27 1.405 1.47 1.544 1.558 1.755 1.829 1.97 2.101 2.202 2.25 2.349 2.462 2.634 2.731 2.812 2.932 3.051 3.174 3.313 3.447 3.595 3.732 3.863 4.006 4.138 4.269 4.408 4.575 4.749 4.926 5.106 5.297 5.507 5.74 6.004 6.256 6.538 6.87 7.211 7.505 7.763 7.956 7.797 7.178 6.477 5.758 5.125 4.547 3.994 3.448 2.97 2.497 2.072 1.696 1.351 1.024 0.736 0.464 0.144 -0.141 -0.372 -0.601 -0.842 -1.044 -1.251 -1.475 -1.648 -1.823 -2.015 -2.224 -2.434 -2.568 -2.698 -2.902 -3.054 -3.214 -3.303 -3.492 -3.662 -3.836 -3.936 -4.166 -4.21 -4.312 -4.432 -4.696 -4.838 -4.985 -5.158 -5.332 -5.519 -5.805 -6.597 -6 ,20550 ,TETRA ,17525893,Thu Nov 25 02:15:41 CET,Thu Nov 25 04:03:16 CET,0.0 0.305 0.474 0.609 0.731 0.838 0.957 1.083 1.284 1.368 1.439 1.444 1.626 1.685 1.811 1.934 2.054 2.112 2.228 2.353 2.538 2.654 2.778 2.951 3.096 3.242 3.383 3.515 3.678 3.832 3.997 4.207 4.391 4.55 4.745 4.972 5.155 5.353 5.565 5.782 6.032 6.304 6.598 6.865 7.137 7.41 7.676 7.929 8.164 8.238 7.984 7.325 6.595 5.9 5.274 4.719 4.192 3.702 3.286 2.856 2.483 2.148 1.816 1.492 1.164 0.859 0.564 0.296 0.062 -0.18 -0.435 -0.655 -0.88 -1.103 -1.291 -1.48 -1.657 -1.846 -2.045 -2.173 -2.309 -2.529 -2.675 -2.818 -2.893 -3.06 -3.236 -3.422 -3.515 -3.734 -3.802 -3.914 -4.026 -4.256 -4.387 -4.538 -4.696 -4.863 -5.07 -5.365 -5.955 -7 ,26819 ,TETRA ,17525894,Thu Nov 25 02:16:37 CET,Thu Nov 25 04:05:53 CET,0.0 0.27 0.478 0.65 0.763 0.87 0.956 1.047 1.221 1.284 1.345 1.355 1.556 1.632 1.765 1.872 1.982 2.032 2.126 2.223 2.363 2.456 2.549 2.681 2.804 2.919 3.03 3.14 3.277 3.406 3.55 3.74 3.922 4.09 4.276 4.483 4.688 4.899 5.105 5.327 5.545 5.758 6.009 6.268 6.536 6.802 7.079 7.347 7.583 7.671 7.508 6.969 6.304 5.649 5.046 4.464 3.915 3.405 2.949 2.507 2.136 1.787 1.454 1.161 0.889 0.642 0.382 0.143 -0.059 -0.269 -0.484 -0.665 -0.85 -1.05 -1.202 -1.367 -1.558 -1.746 -1.926 -2.051 -2.182 -2.388 -2.534 -2.702 -2.791 -2.973 -3.159 -3.35 -3.453 -3.694 -3.806 -3.924 -4.034 -4.277 -4.427 -4.592 -4.748 -4.923 -5.144 -5.431 -6.376 -8 ,31038 ,TETRA ,17525895,Thu Nov 25 02:16:38 CET,Thu Nov 25 04:05:02 CET,0.0 0.282 0.415 0.512 0.608 0.715 0.825 0.916 1.071 1.153 1.238 1.258 1.455 1.523 1.637 1.755 1.882 1.94 2.052 2.164 2.337 2.446 2.539 2.658 2.776 2.899 3.011 3.117 3.257 3.39 3.513 3.665 3.821 3.964 4.109 4.284 4.465 4.655 4.848 5.056 5.262 5.479 5.731 5.989 6.285 6.56 6.852 7.147 7.382 7.474 7.286 6.724 6.05 5.383 4.734 4.139 3.611 3.124 2.698 2.234 1.821 1.47 1.121 0.786 0.491 0.215 -0.092 -0.379 -0.622 -0.865 -1.106 -1.308 -1.511 -1.717 -1.877 -2.031 -2.198 -2.391 -2.595 -2.733 -2.865 -3.069 -3.222 -3.376 -3.458 -3.617 -3.763 -3.918 -4.008 -4.232 -4.296 -4.425 -4.562 -4.81 -4.935 -5.08 -5.264 -5.475 -5.733 -6.025 -6.937 -9 ,1207 ,TETRA ,17525896,Thu Nov 25 02:16:37 CET,Thu Nov 25 04:06:10 CET,0.0 0.161 0.292 0.399 0.498 0.604 0.704 0.788 0.966 1.049 1.123 1.147 1.35 1.414 1.527 1.639 1.745 1.8 1.912 2.012 2.151 2.244 2.339 2.468 2.586 2.697 2.799 2.903 3.06 3.207 3.345 3.518 3.665 3.786 3.925 4.084 4.237 4.416 4.621 4.842 5.077 5.331 5.595 5.851 6.135 6.403 6.686 6.965 7.203 7.316 7.032 6.392 5.734 5.058 4.433 3.848 3.321 2.827 2.39 1.953 1.563 1.214 0.88 0.56 0.241 -0.064 -0.361 -0.608 -0.82 -1.056 -1.307 -1.514 -1.723 -1.94 -2.107 -2.28 -2.465 -2.66 -2.865 -2.994 -3.13 -3.378 -3.552 -3.733 -3.828 -4.01 -4.18 -4.346 -4.443 -4.686 -4.799 -4.921 -5.049 -5.335 -5.486 -5.642 -5.817 -5.998 -6.215 -6.483 -7.356 -10 ,8968 ,TETRA ,17525897,Thu Nov 25 02:16:37 CET,Thu Nov 25 04:06:05 CET,0.0 0.301 0.456 0.575 0.688 0.79 0.888 0.982 1.125 1.197 1.275 1.314 1.528 1.611 1.763 1.889 2.013 2.079 2.197 2.311 2.487 2.598 2.707 2.867 3.015 3.147 3.274 3.391 3.536 3.699 3.855 4.026 4.196 4.366 4.565 4.784 4.981 5.183 5.392 5.603 5.819 6.06 6.332 6.59 6.868 7.121 7.361 7.619 7.814 7.85 7.657 7.021 6.284 5.596 4.977 4.395 3.838 3.329 2.896 2.458 2.082 1.761 1.467 1.178 0.894 0.642 0.385 0.149 -0.064 -0.272 -0.483 -0.668 -0.855 -1.045 -1.184 -1.344 -1.518 -1.696 -1.885 -2.001 -2.118 -2.315 -2.461 -2.605 -2.675 -2.821 -2.988 -3.171 -3.267 -3.496 -3.575 -3.686 -3.799 -4.031 -4.156 -4.294 -4.44 -4.616 -4.857 -5.162 -6.014 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt deleted file mode 100644 index 1ba59bec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-17i_CAT-17g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15789 ,TETRA ,17525898,Thu Nov 25 02:16:37 CET,Thu Nov 25 04:05:38 CET,0.0 0.415 0.637 0.784 0.912 1.07 1.246 1.405 1.698 1.834 1.958 2.074 2.315 2.429 2.661 2.864 3.047 3.146 3.336 3.514 3.783 3.938 4.081 4.297 4.516 4.736 4.94 5.14 5.401 5.649 5.886 6.164 6.443 6.733 7.076 7.449 7.794 8.182 8.617 9.098 9.605 10.151 10.782 11.436 12.205 13.05 14.02 15.092 16.381 17.942 19.789 21.23 21.976 22.392 22.595 22.691 22.712 22.653 22.569 22.46 22.352 22.25 22.132 22.0 21.866 21.729 21.573 21.43 21.303 21.175 21.05 20.93 20.796 20.664 20.545 20.42 20.3 20.186 20.078 20.007 19.921 19.764 19.656 19.539 19.477 19.354 19.204 19.038 18.963 18.774 18.709 18.623 18.532 18.334 18.224 18.11 17.995 17.837 17.634 17.419 16.933 -2 ,32302 ,TETRA ,17525899,Thu Nov 25 02:16:39 CET,Thu Nov 25 04:07:44 CET,0.0 0.463 0.606 0.743 0.875 0.999 1.11 1.217 1.425 1.522 1.61 1.666 1.893 1.985 2.151 2.322 2.492 2.573 2.735 2.9 3.124 3.257 3.388 3.589 3.802 4.021 4.236 4.443 4.707 4.957 5.199 5.488 5.767 6.05 6.375 6.736 7.095 7.494 7.914 8.352 8.812 9.354 10.022 10.679 11.422 12.258 13.236 14.335 15.64 17.195 19.099 20.608 21.367 21.748 21.933 22.027 22.098 22.104 22.038 21.947 21.842 21.74 21.628 21.516 21.406 21.295 21.166 21.053 20.964 20.86 20.748 20.652 20.556 20.457 20.37 20.277 20.174 20.05 19.928 19.85 19.766 19.642 19.552 19.454 19.402 19.299 19.185 19.052 18.993 18.821 18.76 18.668 18.585 18.428 18.328 18.216 18.094 17.931 17.729 17.488 16.313 -3 ,17485 ,TETRA ,17525900,Thu Nov 25 02:16:38 CET,Thu Nov 25 04:05:12 CET,0.0 0.308 0.498 0.618 0.73 0.845 0.954 1.065 1.288 1.388 1.49 1.561 1.774 1.864 2.054 2.24 2.412 2.49 2.634 2.767 2.96 3.099 3.237 3.426 3.609 3.795 3.987 4.173 4.406 4.634 4.847 5.109 5.389 5.68 6.018 6.378 6.748 7.164 7.604 8.082 8.577 9.135 9.77 10.397 11.135 11.99 12.969 14.044 15.315 16.866 18.75 20.182 20.927 21.309 21.471 21.507 21.496 21.45 21.381 21.292 21.188 21.072 20.965 20.861 20.744 20.624 20.481 20.356 20.267 20.171 20.053 19.956 19.855 19.739 19.654 19.575 19.49 19.396 19.295 19.223 19.15 19.03 18.946 18.856 18.8 18.678 18.567 18.453 18.39 18.22 18.18 18.103 18.02 17.83 17.729 17.617 17.505 17.393 17.261 17.079 16.49 -4 ,7573 ,TETRA ,17525901,Thu Nov 25 02:16:38 CET,Thu Nov 25 04:07:16 CET,0.0 0.291 0.484 0.669 0.859 1.003 1.128 1.251 1.496 1.602 1.7 1.777 1.996 2.079 2.23 2.382 2.525 2.592 2.734 2.871 3.06 3.191 3.328 3.522 3.705 3.898 4.091 4.257 4.471 4.697 4.929 5.206 5.463 5.721 6.033 6.382 6.728 7.124 7.554 8.014 8.508 9.071 9.706 10.339 11.122 12.001 12.98 14.043 15.307 16.856 18.747 20.208 20.974 21.412 21.662 21.813 21.887 21.898 21.863 21.796 21.728 21.643 21.539 21.433 21.331 21.236 21.118 21.005 20.901 20.773 20.648 20.552 20.452 20.361 20.286 20.209 20.138 20.059 19.958 19.875 19.782 19.646 19.565 19.476 19.426 19.337 19.25 19.141 19.071 18.893 18.865 18.791 18.715 18.552 18.441 18.327 18.229 18.105 17.969 17.814 17.217 -5 ,5980 ,TETRA ,17525902,Thu Nov 25 02:16:38 CET,Thu Nov 25 04:04:56 CET,0.0 0.442 0.63 0.83 1.007 1.163 1.284 1.381 1.581 1.684 1.78 1.836 2.05 2.132 2.276 2.417 2.577 2.657 2.808 2.948 3.143 3.269 3.41 3.632 3.82 3.987 4.139 4.298 4.527 4.752 4.979 5.249 5.497 5.756 6.08 6.437 6.778 7.156 7.576 8.021 8.492 9.056 9.695 10.318 11.071 11.905 12.868 13.959 15.256 16.797 18.612 20.04 20.79 21.204 21.458 21.575 21.588 21.572 21.54 21.475 21.393 21.293 21.189 21.088 20.995 20.9 20.782 20.667 20.548 20.419 20.292 20.194 20.093 19.972 19.866 19.73 19.583 19.472 19.377 19.313 19.24 19.124 19.041 18.957 18.914 18.805 18.676 18.539 18.473 18.299 18.247 18.168 18.09 17.92 17.829 17.726 17.61 17.476 17.315 17.135 16.713 -6 ,23016 ,TETRA ,17525903,Thu Nov 25 02:16:39 CET,Thu Nov 25 04:08:33 CET,0.0 0.564 0.723 0.854 0.985 1.109 1.242 1.383 1.632 1.738 1.839 1.916 2.13 2.214 2.386 2.552 2.714 2.799 2.961 3.103 3.313 3.453 3.59 3.795 3.991 4.192 4.391 4.588 4.85 5.103 5.347 5.642 5.94 6.229 6.555 6.908 7.257 7.656 8.098 8.574 9.047 9.581 10.236 10.908 11.695 12.563 13.55 14.673 15.997 17.542 19.424 20.924 21.712 22.163 22.416 22.572 22.625 22.592 22.511 22.401 22.298 22.202 22.085 21.961 21.851 21.742 21.628 21.503 21.378 21.258 21.128 21.024 20.907 20.764 20.67 20.57 20.454 20.328 20.181 20.075 19.965 19.806 19.702 19.594 19.543 19.45 19.345 19.216 19.147 18.98 18.943 18.861 18.778 18.614 18.537 18.448 18.338 18.211 18.079 17.923 17.362 -7 ,13576 ,TETRA ,17525904,Thu Nov 25 02:17:40 CET,Thu Nov 25 04:09:38 CET,0.0 0.284 0.464 0.603 0.741 0.85 0.952 1.057 1.245 1.338 1.431 1.495 1.72 1.812 1.997 2.173 2.333 2.411 2.559 2.7 2.931 3.081 3.209 3.376 3.554 3.753 3.95 4.146 4.408 4.664 4.912 5.21 5.504 5.791 6.125 6.489 6.834 7.231 7.667 8.131 8.618 9.157 9.786 10.429 11.18 12.028 13.007 14.085 15.372 16.93 18.753 20.218 21.069 21.515 21.735 21.833 21.829 21.787 21.725 21.654 21.592 21.519 21.436 21.355 21.257 21.146 21.034 20.939 20.828 20.697 20.572 20.458 20.341 20.212 20.098 19.984 19.879 19.766 19.644 19.567 19.485 19.345 19.252 19.152 19.103 19.008 18.897 18.762 18.69 18.512 18.459 18.366 18.283 18.101 17.996 17.898 17.781 17.647 17.476 17.243 16.737 -8 ,3498 ,TETRA ,17525905,Thu Nov 25 02:17:40 CET,Thu Nov 25 04:06:37 CET,0.0 0.896 1.209 1.419 1.621 1.798 1.951 2.11 2.427 2.564 2.685 2.794 3.035 3.142 3.339 3.526 3.712 3.807 3.995 4.174 4.414 4.569 4.726 4.951 5.168 5.385 5.595 5.795 6.052 6.302 6.548 6.843 7.131 7.408 7.731 8.1 8.451 8.844 9.27 9.725 10.219 10.775 11.424 12.081 12.832 13.675 14.658 15.771 17.083 18.669 20.595 22.074 22.852 23.275 23.479 23.578 23.607 23.588 23.549 23.49 23.395 23.267 23.121 22.956 22.823 22.706 22.577 22.466 22.362 22.246 22.111 21.991 21.867 21.745 21.647 21.535 21.423 21.3 21.148 21.036 20.923 20.745 20.627 20.504 20.441 20.323 20.202 20.07 19.998 19.821 19.794 19.72 19.639 19.474 19.366 19.253 19.139 19.02 18.886 18.674 18.109 -9 ,17645 ,TETRA ,17525906,Thu Nov 25 02:17:40 CET,Thu Nov 25 04:07:23 CET,0.0 0.416 0.579 0.718 0.861 0.978 1.088 1.197 1.404 1.509 1.61 1.667 1.877 1.959 2.132 2.308 2.478 2.555 2.707 2.855 3.071 3.222 3.373 3.594 3.809 4.021 4.232 4.439 4.706 4.947 5.172 5.462 5.749 6.021 6.333 6.687 7.032 7.408 7.809 8.25 8.717 9.242 9.86 10.496 11.255 12.091 13.042 14.152 15.479 17.064 18.972 20.518 21.371 21.813 22.019 22.117 22.14 22.126 22.103 22.038 21.945 21.846 21.764 21.673 21.578 21.512 21.418 21.322 21.231 21.115 20.995 20.908 20.828 20.735 20.653 20.567 20.485 20.398 20.3 20.234 20.167 20.045 19.947 19.845 19.801 19.695 19.564 19.451 19.395 19.23 19.206 19.138 19.057 18.889 18.809 18.709 18.606 18.468 18.276 18.029 17.459 -10 ,10950 ,TETRA ,17525907,Thu Nov 25 02:17:40 CET,Thu Nov 25 04:07:01 CET,0.0 0.586 0.783 0.9 1.004 1.115 1.215 1.317 1.503 1.602 1.707 1.757 1.967 2.062 2.248 2.403 2.556 2.629 2.78 2.938 3.16 3.295 3.429 3.629 3.828 4.032 4.234 4.444 4.726 4.989 5.242 5.54 5.833 6.131 6.477 6.846 7.195 7.595 8.062 8.544 9.016 9.555 10.2 10.871 11.669 12.537 13.553 14.717 16.095 17.696 19.519 20.954 21.724 22.144 22.357 22.45 22.454 22.388 22.287 22.152 22.018 21.888 21.76 21.635 21.525 21.421 21.301 21.187 21.084 20.977 20.854 20.759 20.667 20.549 20.449 20.35 20.253 20.166 20.078 20.007 19.925 19.793 19.71 19.63 19.581 19.478 19.38 19.275 19.214 19.039 19.004 18.92 18.829 18.625 18.526 18.447 18.342 18.197 18.038 17.849 17.219 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt deleted file mode 100644 index d976b076..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5187 ,TETRA ,17525908,Thu Nov 25 02:17:39 CET,Thu Nov 25 04:07:33 CET,0.0 0.551 0.706 0.84 0.947 1.038 1.135 1.231 1.401 1.473 1.547 1.587 1.786 1.852 1.989 2.128 2.249 2.306 2.429 2.535 2.693 2.795 2.881 2.998 3.129 3.269 3.407 3.547 3.747 3.932 4.091 4.277 4.457 4.626 4.814 5.049 5.278 5.516 5.753 5.993 6.252 6.504 6.789 7.077 7.368 7.657 7.922 8.125 8.297 8.315 7.956 7.225 6.404 5.665 4.92 4.204 3.617 3.079 2.593 2.06 1.586 1.15 0.735 0.371 0.035 -0.279 -0.608 -0.885 -1.113 -1.362 -1.622 -1.824 -2.027 -2.24 -2.404 -2.581 -2.783 -2.993 -3.204 -3.353 -3.506 -3.751 -3.922 -4.111 -4.212 -4.42 -4.633 -4.847 -4.973 -5.229 -5.32 -5.442 -5.573 -5.843 -5.995 -6.186 -6.393 -6.637 -6.935 -7.334 -8.882 -2 ,30027 ,TETRA ,17525909,Thu Nov 25 02:17:40 CET,Thu Nov 25 04:10:31 CET,0.0 0.476 0.665 0.793 0.892 0.986 1.075 1.153 1.298 1.383 1.469 1.501 1.705 1.776 1.914 2.044 2.159 2.214 2.335 2.461 2.614 2.697 2.784 2.911 3.023 3.131 3.261 3.397 3.557 3.713 3.868 4.058 4.226 4.383 4.57 4.778 4.971 5.186 5.409 5.621 5.846 6.12 6.443 6.727 7.046 7.356 7.632 7.865 8.046 8.093 7.762 6.97 6.104 5.333 4.618 3.92 3.277 2.698 2.208 1.683 1.237 0.847 0.477 0.129 -0.214 -0.532 -0.834 -1.1 -1.33 -1.566 -1.809 -2.015 -2.238 -2.472 -2.662 -2.863 -3.067 -3.274 -3.496 -3.649 -3.813 -4.079 -4.258 -4.433 -4.521 -4.696 -4.875 -5.074 -5.181 -5.428 -5.553 -5.697 -5.839 -6.133 -6.286 -6.458 -6.682 -6.931 -7.221 -7.642 -9.533 -3 ,20482 ,TETRA ,17525910,Thu Nov 25 02:17:41 CET,Thu Nov 25 04:09:48 CET,0.0 1.129 1.442 1.653 1.792 1.92 2.026 2.112 2.268 2.333 2.398 2.41 2.603 2.678 2.807 2.914 3.017 3.063 3.161 3.258 3.393 3.489 3.586 3.713 3.835 3.959 4.07 4.173 4.31 4.45 4.581 4.742 4.911 5.075 5.264 5.455 5.628 5.826 6.046 6.272 6.482 6.72 6.982 7.233 7.512 7.785 8.094 8.402 8.596 8.603 8.26 7.588 6.846 6.067 5.349 4.613 3.948 3.348 2.805 2.296 1.871 1.486 1.102 0.739 0.419 0.119 -0.215 -0.513 -0.77 -1.029 -1.316 -1.578 -1.835 -2.094 -2.302 -2.512 -2.728 -2.939 -3.147 -3.318 -3.506 -3.79 -3.978 -4.167 -4.264 -4.475 -4.705 -4.95 -5.08 -5.338 -5.467 -5.611 -5.757 -6.07 -6.249 -6.472 -6.744 -7.037 -7.404 -7.846 -8.989 -4 ,10689 ,TETRA ,17525911,Thu Nov 25 02:18:39 CET,Thu Nov 25 04:07:10 CET,0.0 0.285 0.489 0.615 0.731 0.822 0.891 0.959 1.115 1.195 1.273 1.306 1.51 1.575 1.689 1.799 1.898 1.946 2.054 2.162 2.317 2.424 2.536 2.701 2.855 3.002 3.15 3.294 3.469 3.639 3.816 4.026 4.208 4.382 4.577 4.785 4.979 5.186 5.41 5.644 5.893 6.174 6.467 6.731 7.021 7.304 7.611 7.891 8.032 8.012 7.715 6.998 6.232 5.443 4.68 4.014 3.446 2.907 2.411 1.911 1.482 1.103 0.712 0.319 -0.011 -0.296 -0.592 -0.858 -1.106 -1.38 -1.656 -1.883 -2.116 -2.35 -2.54 -2.74 -2.949 -3.17 -3.397 -3.557 -3.725 -3.968 -4.141 -4.325 -4.418 -4.61 -4.804 -5.018 -5.137 -5.389 -5.498 -5.637 -5.787 -6.101 -6.275 -6.456 -6.628 -6.813 -7.078 -7.512 -9.309 -5 ,22271 ,TETRA ,17525912,Thu Nov 25 02:18:39 CET,Thu Nov 25 04:07:03 CET,0.0 0.435 0.604 0.757 0.886 1.005 1.116 1.209 1.367 1.451 1.535 1.593 1.815 1.897 2.043 2.176 2.29 2.343 2.436 2.527 2.671 2.773 2.884 3.054 3.21 3.363 3.523 3.661 3.822 3.989 4.142 4.31 4.474 4.63 4.803 5.005 5.191 5.392 5.601 5.822 6.052 6.302 6.6 6.889 7.168 7.416 7.668 7.909 8.078 8.102 7.827 7.105 6.273 5.498 4.774 4.067 3.399 2.806 2.303 1.777 1.315 0.9 0.517 0.149 -0.203 -0.52 -0.845 -1.139 -1.4 -1.68 -1.977 -2.22 -2.47 -2.729 -2.929 -3.136 -3.363 -3.594 -3.829 -3.988 -4.15 -4.422 -4.61 -4.808 -4.915 -5.12 -5.339 -5.593 -5.724 -5.989 -6.152 -6.306 -6.449 -6.745 -6.907 -7.094 -7.287 -7.514 -7.811 -8.245 -10.515 -6 ,2709 ,TETRA ,17525913,Thu Nov 25 02:18:40 CET,Thu Nov 25 04:08:02 CET,0.0 0.469 0.646 0.792 0.942 1.072 1.188 1.302 1.492 1.569 1.647 1.677 1.87 1.942 2.091 2.201 2.303 2.356 2.458 2.55 2.679 2.781 2.877 3.002 3.13 3.255 3.373 3.481 3.617 3.753 3.895 4.071 4.239 4.387 4.553 4.761 4.974 5.194 5.4 5.62 5.858 6.12 6.404 6.667 6.932 7.227 7.542 7.816 8.027 8.03 7.667 6.938 6.156 5.379 4.673 4.042 3.473 2.914 2.421 1.92 1.484 1.108 0.753 0.392 0.049 -0.241 -0.55 -0.833 -1.068 -1.321 -1.605 -1.833 -2.069 -2.336 -2.558 -2.779 -2.996 -3.216 -3.445 -3.611 -3.775 -4.016 -4.178 -4.36 -4.467 -4.71 -4.958 -5.192 -5.323 -5.589 -5.719 -5.854 -5.984 -6.279 -6.44 -6.609 -6.799 -7.01 -7.248 -7.571 -8.905 -7 ,30401 ,TETRA ,17525914,Thu Nov 25 02:18:40 CET,Thu Nov 25 04:07:59 CET,0.0 0.272 0.435 0.594 0.724 0.821 0.934 1.036 1.2 1.28 1.368 1.435 1.648 1.713 1.831 1.945 2.06 2.122 2.23 2.32 2.463 2.553 2.638 2.761 2.877 2.999 3.112 3.229 3.373 3.487 3.598 3.76 3.916 4.055 4.219 4.4 4.585 4.776 4.986 5.219 5.46 5.715 5.982 6.228 6.502 6.757 6.992 7.24 7.426 7.46 7.172 6.45 5.671 4.938 4.21 3.527 2.929 2.372 1.889 1.404 0.958 0.536 0.135 -0.229 -0.581 -0.913 -1.25 -1.549 -1.803 -2.075 -2.367 -2.607 -2.859 -3.103 -3.294 -3.506 -3.719 -3.936 -4.161 -4.317 -4.485 -4.741 -4.915 -5.105 -5.195 -5.386 -5.596 -5.801 -5.911 -6.17 -6.308 -6.447 -6.605 -6.922 -7.075 -7.246 -7.447 -7.683 -7.974 -8.386 -10.4 -8 ,23393 ,TETRA ,17525915,Thu Nov 25 02:18:40 CET,Thu Nov 25 04:08:05 CET,0.0 0.286 0.437 0.569 0.698 0.813 0.924 1.033 1.194 1.268 1.339 1.341 1.537 1.614 1.76 1.876 1.974 2.019 2.115 2.219 2.363 2.446 2.533 2.654 2.768 2.89 3.002 3.106 3.251 3.405 3.568 3.757 3.944 4.125 4.316 4.516 4.695 4.896 5.128 5.406 5.677 5.915 6.172 6.435 6.731 7.036 7.31 7.534 7.746 7.822 7.495 6.748 5.923 5.097 4.373 3.691 3.08 2.556 2.106 1.631 1.213 0.83 0.459 0.099 -0.227 -0.523 -0.863 -1.161 -1.41 -1.672 -1.957 -2.194 -2.439 -2.686 -2.874 -3.06 -3.246 -3.45 -3.657 -3.796 -3.945 -4.183 -4.345 -4.52 -4.606 -4.784 -4.986 -5.205 -5.312 -5.558 -5.682 -5.817 -5.953 -6.251 -6.416 -6.582 -6.756 -6.968 -7.206 -7.504 -8.897 -9 ,9290 ,TETRA ,17525916,Thu Nov 25 02:18:41 CET,Thu Nov 25 04:08:07 CET,0.0 0.441 0.608 0.73 0.852 0.964 1.065 1.159 1.322 1.393 1.465 1.49 1.69 1.763 1.898 2.021 2.142 2.203 2.315 2.428 2.602 2.705 2.792 2.928 3.064 3.191 3.313 3.43 3.575 3.706 3.831 3.981 4.126 4.267 4.424 4.586 4.747 4.932 5.13 5.33 5.547 5.809 6.09 6.339 6.622 6.925 7.209 7.425 7.596 7.669 7.332 6.549 5.785 5.036 4.334 3.658 3.038 2.467 1.982 1.49 1.061 0.668 0.269 -0.105 -0.441 -0.744 -1.081 -1.389 -1.646 -1.919 -2.211 -2.457 -2.725 -2.987 -3.182 -3.377 -3.565 -3.773 -3.995 -4.151 -4.317 -4.583 -4.767 -4.953 -5.052 -5.274 -5.516 -5.782 -5.914 -6.168 -6.333 -6.495 -6.648 -6.992 -7.202 -7.42 -7.647 -7.922 -8.279 -8.769 -10.344 -10 ,5934 ,TETRA ,17525917,Thu Nov 25 02:18:40 CET,Thu Nov 25 04:06:37 CET,0.0 0.457 0.634 0.773 0.916 1.056 1.174 1.298 1.548 1.652 1.736 1.763 1.961 2.037 2.193 2.342 2.499 2.568 2.686 2.814 3.005 3.119 3.227 3.388 3.531 3.672 3.822 3.971 4.158 4.342 4.51 4.693 4.876 5.06 5.271 5.511 5.721 5.912 6.099 6.292 6.513 6.764 7.018 7.248 7.499 7.754 8.016 8.257 8.45 8.499 8.185 7.472 6.684 5.884 5.158 4.487 3.901 3.359 2.865 2.365 1.944 1.548 1.117 0.703 0.352 0.038 -0.284 -0.562 -0.805 -1.068 -1.33 -1.527 -1.722 -1.937 -2.115 -2.291 -2.479 -2.684 -2.882 -3.028 -3.19 -3.43 -3.604 -3.79 -3.878 -4.048 -4.217 -4.4 -4.506 -4.745 -4.833 -4.959 -5.093 -5.361 -5.501 -5.681 -5.919 -6.187 -6.432 -6.746 -7.956 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt deleted file mode 100644 index 9909d0ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-24_CAT-17i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27681 ,TETRA ,17525919,Thu Nov 25 02:18:40 CET,Thu Nov 25 04:08:42 CET,0.0 0.181 0.317 0.471 0.605 0.7 0.791 0.88 1.051 1.128 1.198 1.211 1.403 1.477 1.62 1.748 1.871 1.924 2.033 2.15 2.314 2.414 2.51 2.66 2.803 2.932 3.066 3.203 3.364 3.509 3.659 3.839 4.032 4.228 4.433 4.666 4.891 5.129 5.386 5.655 5.949 6.286 6.643 6.99 7.407 7.843 8.298 8.793 9.317 9.773 10.069 9.966 9.655 9.306 8.952 8.566 8.218 7.876 7.539 7.204 6.919 6.659 6.402 6.156 5.904 5.675 5.425 5.192 5.014 4.835 4.646 4.486 4.323 4.159 4.015 3.868 3.722 3.56 3.392 3.28 3.167 2.987 2.857 2.717 2.64 2.488 2.343 2.174 2.069 1.837 1.758 1.658 1.55 1.286 1.132 0.968 0.782 0.593 0.377 0.069 -1.22 -2 ,8082 ,TETRA ,17525920,Thu Nov 25 02:18:40 CET,Thu Nov 25 04:08:44 CET,0.0 0.235 0.367 0.464 0.558 0.659 0.756 0.847 1.006 1.073 1.141 1.144 1.332 1.401 1.546 1.675 1.787 1.84 1.942 2.04 2.189 2.286 2.378 2.511 2.654 2.799 2.927 3.045 3.201 3.357 3.51 3.692 3.86 4.019 4.196 4.4 4.607 4.856 5.137 5.421 5.707 6.024 6.398 6.741 7.109 7.516 7.931 8.362 8.872 9.401 9.811 9.789 9.476 9.066 8.673 8.299 7.948 7.61 7.28 6.923 6.626 6.345 6.051 5.787 5.549 5.324 5.078 4.851 4.661 4.461 4.239 4.052 3.863 3.681 3.538 3.384 3.227 3.066 2.893 2.773 2.644 2.445 2.324 2.193 2.123 1.962 1.781 1.627 1.553 1.332 1.224 1.106 1.005 0.761 0.608 0.445 0.259 0.058 -0.15 -0.413 -1.546 -3 ,20667 ,TETRA ,17525921,Thu Nov 25 02:18:40 CET,Thu Nov 25 04:08:41 CET,0.0 0.203 0.316 0.43 0.519 0.601 0.688 0.782 0.966 1.047 1.116 1.111 1.301 1.362 1.476 1.594 1.711 1.766 1.881 1.991 2.142 2.243 2.337 2.47 2.602 2.725 2.842 2.957 3.114 3.271 3.427 3.616 3.792 3.968 4.178 4.41 4.653 4.931 5.216 5.507 5.785 6.103 6.462 6.79 7.196 7.647 8.138 8.618 9.089 9.506 9.749 9.666 9.389 9.04 8.641 8.248 7.847 7.454 7.118 6.795 6.49 6.192 5.91 5.623 5.379 5.168 4.947 4.765 4.59 4.393 4.195 4.034 3.87 3.697 3.562 3.42 3.275 3.129 2.971 2.867 2.765 2.586 2.455 2.324 2.257 2.116 1.97 1.824 1.741 1.53 1.486 1.38 1.265 1.018 0.87 0.705 0.513 0.279 0.018 -0.294 -1.316 -4 ,7907 ,TETRA ,17525922,Thu Nov 25 02:18:40 CET,Thu Nov 25 04:09:05 CET,0.0 0.608 0.822 0.959 1.08 1.189 1.277 1.362 1.527 1.619 1.725 1.782 1.983 2.064 2.21 2.355 2.498 2.562 2.697 2.823 2.988 3.095 3.203 3.371 3.54 3.689 3.843 3.993 4.162 4.327 4.488 4.679 4.844 5.008 5.212 5.443 5.654 5.882 6.133 6.409 6.704 7.023 7.383 7.736 8.103 8.489 8.947 9.436 9.948 10.41 10.677 10.558 10.201 9.807 9.449 9.07 8.716 8.364 8.042 7.715 7.417 7.123 6.834 6.573 6.308 6.059 5.802 5.576 5.389 5.192 4.992 4.829 4.653 4.45 4.298 4.152 3.982 3.795 3.593 3.462 3.316 3.068 2.905 2.738 2.656 2.474 2.268 2.075 1.982 1.74 1.605 1.489 1.38 1.158 1.032 0.886 0.696 0.467 0.213 -0.125 -1.706 -5 ,27228 ,TETRA ,17525923,Thu Nov 25 02:18:40 CET,Thu Nov 25 04:09:04 CET,0.0 0.27 0.426 0.563 0.69 0.8 0.896 0.98 1.138 1.211 1.28 1.285 1.476 1.542 1.674 1.798 1.914 1.97 2.082 2.191 2.343 2.447 2.551 2.686 2.804 2.93 3.083 3.253 3.458 3.636 3.8 3.992 4.18 4.363 4.573 4.815 5.04 5.276 5.533 5.806 6.093 6.401 6.749 7.108 7.509 7.939 8.402 8.855 9.327 9.744 9.994 9.945 9.694 9.347 8.981 8.614 8.287 7.965 7.653 7.308 6.984 6.688 6.41 6.173 5.951 5.725 5.474 5.258 5.067 4.865 4.659 4.485 4.316 4.153 4.016 3.874 3.726 3.565 3.408 3.302 3.177 2.967 2.826 2.683 2.61 2.464 2.313 2.164 2.083 1.864 1.804 1.702 1.594 1.346 1.204 1.056 0.91 0.754 0.55 0.246 -1.098 -6 ,10408 ,TETRA ,17525924,Thu Nov 25 02:18:41 CET,Thu Nov 25 04:09:06 CET,0.0 0.225 0.359 0.457 0.545 0.63 0.72 0.807 0.969 1.045 1.119 1.126 1.312 1.371 1.501 1.624 1.734 1.79 1.907 2.012 2.151 2.245 2.338 2.472 2.595 2.716 2.835 2.952 3.104 3.243 3.38 3.549 3.709 3.867 4.049 4.251 4.459 4.7 4.957 5.222 5.498 5.812 6.164 6.511 6.887 7.3 7.781 8.296 8.825 9.27 9.569 9.539 9.289 8.936 8.569 8.192 7.829 7.469 7.148 6.831 6.535 6.246 5.958 5.691 5.445 5.211 4.968 4.744 4.539 4.34 4.147 3.978 3.8 3.621 3.475 3.324 3.154 2.978 2.806 2.676 2.534 2.32 2.163 2.0 1.917 1.728 1.531 1.331 1.233 1.014 0.93 0.819 0.711 0.482 0.343 0.185 0.016 -0.173 -0.406 -0.751 -2.851 -7 ,30855 ,TETRA ,17525925,Thu Nov 25 02:05:39 CET,Thu Nov 25 03:55:43 CET,0.0 0.204 0.325 0.449 0.569 0.666 0.767 0.868 1.036 1.114 1.186 1.181 1.371 1.435 1.563 1.685 1.803 1.861 1.972 2.081 2.231 2.329 2.424 2.563 2.701 2.837 2.964 3.088 3.244 3.383 3.525 3.711 3.888 4.073 4.293 4.506 4.707 4.922 5.149 5.395 5.643 5.913 6.245 6.586 6.965 7.361 7.813 8.301 8.762 9.228 9.592 9.505 9.201 8.834 8.433 8.034 7.675 7.335 7.018 6.668 6.365 6.106 5.853 5.618 5.381 5.142 4.896 4.672 4.479 4.283 4.062 3.876 3.691 3.491 3.328 3.161 2.988 2.803 2.608 2.475 2.345 2.132 1.969 1.8 1.712 1.529 1.331 1.113 1.001 0.766 0.627 0.476 0.342 0.096 -0.044 -0.192 -0.364 -0.568 -0.79 -1.093 -2.151 -8 ,25905 ,TETRA ,17525926,Thu Nov 25 02:05:39 CET,Thu Nov 25 03:56:03 CET,0.0 0.177 0.316 0.445 0.544 0.641 0.743 0.853 1.043 1.121 1.203 1.228 1.419 1.486 1.615 1.729 1.832 1.878 1.969 2.075 2.237 2.33 2.421 2.557 2.693 2.83 2.963 3.089 3.244 3.393 3.537 3.721 3.906 4.079 4.271 4.487 4.687 4.905 5.134 5.371 5.634 5.942 6.296 6.634 7.021 7.415 7.86 8.361 8.842 9.302 9.673 9.648 9.358 9.015 8.649 8.248 7.848 7.462 7.134 6.789 6.479 6.208 5.952 5.718 5.474 5.243 4.996 4.758 4.559 4.363 4.153 3.965 3.77 3.577 3.425 3.256 3.08 2.895 2.699 2.57 2.448 2.265 2.14 2.015 1.95 1.795 1.641 1.466 1.365 1.148 1.095 0.997 0.871 0.579 0.43 0.285 0.094 -0.148 -0.399 -0.74 -2.361 -9 ,3568 ,TETRA ,17525927,Thu Nov 25 02:05:39 CET,Thu Nov 25 03:57:06 CET,0.0 0.227 0.387 0.52 0.631 0.732 0.842 0.963 1.19 1.29 1.37 1.412 1.629 1.715 1.892 2.05 2.195 2.264 2.394 2.509 2.673 2.799 2.928 3.099 3.264 3.416 3.556 3.706 3.902 4.094 4.29 4.519 4.72 4.913 5.135 5.356 5.56 5.796 6.058 6.328 6.594 6.879 7.208 7.553 7.934 8.323 8.763 9.227 9.718 10.171 10.471 10.438 10.168 9.82 9.467 9.08 8.704 8.349 8.012 7.66 7.368 7.105 6.83 6.555 6.31 6.092 5.854 5.638 5.453 5.264 5.056 4.872 4.69 4.51 4.364 4.207 4.037 3.868 3.696 3.57 3.45 3.252 3.099 2.953 2.88 2.728 2.58 2.434 2.356 2.149 2.097 1.998 1.889 1.638 1.49 1.345 1.188 0.974 0.71 0.409 -0.54 -10 ,10094 ,TETRA ,17525928,Thu Nov 25 02:05:39 CET,Thu Nov 25 03:56:26 CET,0.0 0.21 0.363 0.522 0.664 0.767 0.862 0.953 1.116 1.191 1.266 1.29 1.49 1.564 1.71 1.844 1.973 2.034 2.139 2.246 2.401 2.494 2.582 2.711 2.835 2.955 3.075 3.191 3.342 3.489 3.632 3.8 3.963 4.122 4.306 4.511 4.706 4.939 5.188 5.432 5.686 5.963 6.274 6.584 6.961 7.373 7.788 8.225 8.716 9.203 9.566 9.544 9.313 9.001 8.675 8.34 7.985 7.675 7.402 7.091 6.798 6.536 6.287 6.033 5.79 5.562 5.314 5.103 4.916 4.712 4.494 4.316 4.12 3.912 3.758 3.59 3.42 3.246 3.06 2.931 2.804 2.61 2.47 2.304 2.215 2.037 1.854 1.667 1.572 1.342 1.257 1.153 1.039 0.796 0.681 0.549 0.381 0.178 -0.052 -0.397 -1.734 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt deleted file mode 100644 index ab618fe9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4a_CAT-4i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28362 ,TETRA ,17525929,Thu Nov 25 02:05:39 CET,Thu Nov 25 03:54:56 CET,0.0 0.507 0.754 0.911 1.019 1.108 1.186 1.271 1.438 1.5 1.557 1.565 1.736 1.792 1.901 2.011 2.116 2.166 2.263 2.351 2.485 2.58 2.667 2.788 2.901 3.005 3.101 3.194 3.318 3.425 3.524 3.65 3.759 3.848 3.948 4.064 4.182 4.296 4.391 4.476 4.556 4.655 4.745 4.791 4.815 4.797 4.707 4.544 4.187 3.472 2.142 0.397 -1.126 -2.473 -3.629 -4.65 -5.541 -6.303 -6.962 -7.638 -8.207 -8.708 -9.188 -9.631 -10.04 -10.406 -10.787 -11.143 -11.436 -11.727 -12.032 -12.273 -12.52 -12.788 -12.997 -13.207 -13.424 -13.65 -13.882 -14.05 -14.231 -14.502 -14.677 -14.841 -14.921 -15.095 -15.271 -15.457 -15.552 -15.787 -15.865 -15.96 -16.054 -16.271 -16.394 -16.526 -16.669 -16.819 -16.995 -17.239 -17.8 -2 ,12468 ,TETRA ,17525930,Thu Nov 25 02:05:39 CET,Thu Nov 25 03:56:03 CET,0.0 0.711 0.904 1.033 1.132 1.221 1.295 1.366 1.496 1.551 1.6 1.594 1.76 1.812 1.895 1.978 2.074 2.126 2.214 2.287 2.393 2.46 2.522 2.613 2.701 2.779 2.862 2.94 3.035 3.116 3.182 3.264 3.354 3.438 3.534 3.656 3.763 3.863 3.967 4.078 4.168 4.244 4.33 4.377 4.399 4.388 4.307 4.118 3.754 3.101 1.852 0.111 -1.413 -2.708 -3.854 -4.859 -5.713 -6.487 -7.156 -7.817 -8.368 -8.85 -9.313 -9.754 -10.164 -10.531 -10.904 -11.247 -11.548 -11.854 -12.167 -12.426 -12.691 -12.952 -13.153 -13.37 -13.59 -13.815 -14.041 -14.185 -14.334 -14.565 -14.729 -14.903 -14.987 -15.149 -15.311 -15.481 -15.574 -15.799 -15.878 -15.994 -16.111 -16.339 -16.464 -16.587 -16.721 -16.867 -17.034 -17.269 -17.958 -3 ,29921 ,TETRA ,17525931,Thu Nov 25 02:05:39 CET,Thu Nov 25 03:51:21 CET,0.0 0.653 0.825 0.947 1.042 1.135 1.227 1.317 1.472 1.545 1.612 1.624 1.793 1.847 1.952 2.066 2.189 2.249 2.36 2.469 2.622 2.711 2.796 2.906 2.999 3.089 3.181 3.268 3.38 3.484 3.574 3.68 3.774 3.879 4.003 4.117 4.221 4.333 4.436 4.522 4.602 4.677 4.763 4.805 4.792 4.774 4.681 4.467 4.077 3.362 2.023 0.315 -1.176 -2.487 -3.606 -4.607 -5.491 -6.269 -6.93 -7.588 -8.168 -8.681 -9.142 -9.579 -9.99 -10.367 -10.78 -11.15 -11.455 -11.746 -12.034 -12.27 -12.516 -12.775 -12.977 -13.19 -13.403 -13.605 -13.815 -13.958 -14.092 -14.295 -14.443 -14.606 -14.691 -14.86 -15.025 -15.198 -15.288 -15.509 -15.57 -15.675 -15.783 -15.992 -16.107 -16.237 -16.383 -16.55 -16.744 -16.948 -17.365 -4 ,19665 ,TETRA ,17525932,Thu Nov 25 02:05:39 CET,Thu Nov 25 03:54:07 CET,0.0 0.682 0.913 1.026 1.12 1.217 1.31 1.384 1.493 1.562 1.629 1.626 1.791 1.839 1.934 2.027 2.105 2.146 2.223 2.294 2.409 2.486 2.552 2.64 2.725 2.805 2.874 2.933 3.011 3.09 3.168 3.254 3.337 3.419 3.514 3.639 3.747 3.85 3.953 4.058 4.158 4.25 4.351 4.432 4.486 4.506 4.456 4.293 3.931 3.188 1.798 -0.017 -1.554 -2.855 -3.992 -5.012 -5.887 -6.644 -7.314 -7.995 -8.567 -9.076 -9.548 -9.997 -10.423 -10.797 -11.159 -11.483 -11.784 -12.104 -12.421 -12.682 -12.951 -13.216 -13.415 -13.613 -13.824 -14.043 -14.26 -14.403 -14.558 -14.807 -14.962 -15.114 -15.19 -15.351 -15.531 -15.723 -15.828 -16.055 -16.109 -16.208 -16.318 -16.558 -16.681 -16.812 -16.968 -17.139 -17.3 -17.49 -18.027 -5 ,9349 ,TETRA ,17525933,Thu Nov 25 02:05:39 CET,Thu Nov 25 03:52:53 CET,0.0 0.368 0.537 0.663 0.798 0.918 1.011 1.094 1.242 1.308 1.365 1.355 1.512 1.563 1.662 1.747 1.827 1.872 1.964 2.059 2.21 2.3 2.378 2.495 2.608 2.714 2.814 2.902 3.001 3.101 3.203 3.328 3.452 3.559 3.676 3.803 3.902 4.009 4.127 4.231 4.324 4.404 4.477 4.535 4.568 4.559 4.493 4.298 3.9 3.238 1.951 0.216 -1.262 -2.576 -3.728 -4.722 -5.575 -6.339 -6.997 -7.682 -8.265 -8.776 -9.263 -9.704 -10.098 -10.464 -10.858 -11.205 -11.495 -11.799 -12.118 -12.377 -12.639 -12.904 -13.109 -13.317 -13.537 -13.761 -13.989 -14.15 -14.315 -14.567 -14.746 -14.931 -15.022 -15.207 -15.408 -15.62 -15.721 -15.944 -15.996 -16.091 -16.196 -16.429 -16.574 -16.731 -16.897 -17.081 -17.265 -17.489 -18.101 -6 ,28861 ,TETRA ,17525934,Thu Nov 25 02:05:39 CET,Thu Nov 25 03:56:42 CET,0.0 0.388 0.562 0.661 0.741 0.828 0.9 0.983 1.143 1.205 1.27 1.283 1.449 1.501 1.596 1.682 1.78 1.829 1.906 1.975 2.08 2.147 2.215 2.309 2.404 2.493 2.582 2.665 2.755 2.839 2.927 3.042 3.147 3.254 3.376 3.486 3.585 3.694 3.791 3.877 3.945 4.01 4.095 4.139 4.126 4.09 3.996 3.762 3.348 2.619 1.285 -0.473 -1.999 -3.33 -4.509 -5.554 -6.458 -7.251 -7.918 -8.576 -9.138 -9.639 -10.118 -10.558 -10.958 -11.335 -11.733 -12.07 -12.351 -12.637 -12.935 -13.176 -13.435 -13.717 -13.926 -14.136 -14.357 -14.583 -14.813 -14.978 -15.148 -15.405 -15.579 -15.748 -15.833 -15.996 -16.172 -16.356 -16.445 -16.66 -16.704 -16.805 -16.923 -17.191 -17.327 -17.473 -17.632 -17.823 -18.048 -18.271 -18.762 -7 ,15990 ,TETRA ,17525935,Thu Nov 25 02:05:39 CET,Thu Nov 25 03:57:40 CET,0.0 0.252 0.435 0.576 0.682 0.79 0.896 0.998 1.184 1.255 1.324 1.345 1.506 1.561 1.67 1.768 1.867 1.91 1.992 2.079 2.211 2.298 2.383 2.5 2.605 2.703 2.784 2.861 2.975 3.082 3.18 3.293 3.401 3.493 3.595 3.715 3.826 3.943 4.063 4.195 4.32 4.434 4.557 4.642 4.659 4.614 4.505 4.313 3.938 3.19 1.781 -0.002 -1.535 -2.829 -3.936 -4.951 -5.807 -6.557 -7.207 -7.851 -8.421 -8.922 -9.373 -9.788 -10.157 -10.481 -10.824 -11.132 -11.4 -11.676 -11.956 -12.186 -12.422 -12.669 -12.86 -13.062 -13.261 -13.448 -13.652 -13.803 -13.956 -14.183 -14.34 -14.497 -14.576 -14.726 -14.882 -15.064 -15.155 -15.373 -15.449 -15.557 -15.676 -15.933 -16.075 -16.225 -16.369 -16.533 -16.718 -16.941 -17.307 -8 ,3551 ,TETRA ,17525936,Thu Nov 25 02:06:40 CET,Thu Nov 25 03:58:51 CET,0.0 0.533 0.666 0.782 0.887 0.974 1.05 1.112 1.222 1.288 1.355 1.344 1.507 1.566 1.673 1.771 1.863 1.905 1.979 2.037 2.128 2.184 2.24 2.325 2.409 2.497 2.574 2.649 2.756 2.862 2.968 3.094 3.208 3.314 3.426 3.531 3.621 3.715 3.813 3.914 4.011 4.092 4.178 4.245 4.287 4.298 4.228 4.071 3.727 3.047 1.747 0.026 -1.471 -2.83 -4.016 -5.054 -5.952 -6.74 -7.408 -8.071 -8.647 -9.151 -9.612 -10.026 -10.398 -10.731 -11.092 -11.406 -11.662 -11.934 -12.21 -12.436 -12.672 -12.913 -13.104 -13.307 -13.501 -13.697 -13.91 -14.047 -14.183 -14.407 -14.562 -14.714 -14.791 -14.96 -15.134 -15.311 -15.402 -15.624 -15.679 -15.779 -15.892 -16.138 -16.263 -16.39 -16.515 -16.649 -16.852 -17.113 -17.841 -9 ,32452 ,TETRA ,17525937,Thu Nov 25 02:06:40 CET,Thu Nov 25 04:01:47 CET,0.0 0.357 0.523 0.665 0.789 0.895 0.986 1.072 1.216 1.278 1.346 1.367 1.533 1.583 1.685 1.781 1.862 1.904 1.987 2.065 2.17 2.235 2.304 2.415 2.525 2.623 2.718 2.804 2.915 3.025 3.133 3.249 3.349 3.442 3.544 3.654 3.743 3.841 3.952 4.054 4.157 4.235 4.285 4.326 4.324 4.303 4.246 4.042 3.642 2.893 1.502 -0.302 -1.87 -3.23 -4.384 -5.379 -6.246 -7.031 -7.699 -8.359 -8.899 -9.374 -9.838 -10.272 -10.669 -11.022 -11.394 -11.73 -12.019 -12.318 -12.626 -12.881 -13.145 -13.418 -13.638 -13.851 -14.061 -14.286 -14.53 -14.702 -14.869 -15.13 -15.306 -15.484 -15.576 -15.771 -15.96 -16.142 -16.236 -16.458 -16.508 -16.599 -16.701 -16.934 -17.049 -17.185 -17.337 -17.493 -17.658 -17.855 -18.221 -10 ,14383 ,TETRA ,17525938,Thu Nov 25 02:06:40 CET,Thu Nov 25 03:57:00 CET,0.0 0.538 0.696 0.823 0.936 1.034 1.125 1.212 1.393 1.471 1.553 1.611 1.788 1.846 1.947 2.028 2.108 2.148 2.237 2.329 2.459 2.545 2.626 2.737 2.839 2.936 3.032 3.124 3.235 3.337 3.438 3.56 3.672 3.776 3.891 4.011 4.115 4.209 4.308 4.407 4.479 4.543 4.599 4.648 4.665 4.616 4.537 4.332 3.917 3.243 1.903 0.106 -1.422 -2.728 -3.862 -4.853 -5.7 -6.475 -7.131 -7.801 -8.372 -8.862 -9.335 -9.771 -10.175 -10.533 -10.902 -11.24 -11.518 -11.79 -12.074 -12.317 -12.569 -12.826 -13.028 -13.224 -13.423 -13.63 -13.832 -13.971 -14.115 -14.343 -14.492 -14.645 -14.724 -14.887 -15.066 -15.244 -15.332 -15.559 -15.629 -15.73 -15.834 -16.048 -16.177 -16.323 -16.472 -16.619 -16.784 -17.011 -17.553 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 16811ff0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4b_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28732 ,TETRA ,17525939,Thu Nov 25 02:06:40 CET,Thu Nov 25 03:57:50 CET,0.0 0.802 1.08 1.254 1.445 1.618 1.779 1.93 2.203 2.342 2.472 2.585 2.82 2.927 3.134 3.325 3.501 3.588 3.761 3.927 4.154 4.299 4.449 4.667 4.873 5.09 5.299 5.492 5.747 5.981 6.208 6.493 6.768 7.036 7.356 7.714 8.051 8.413 8.8 9.221 9.676 10.175 10.755 11.351 12.044 12.816 13.687 14.661 15.801 17.112 18.612 19.679 20.155 20.293 20.253 20.124 19.924 19.682 19.457 19.24 19.048 18.853 18.649 18.43 18.212 18.018 17.802 17.606 17.438 17.258 17.088 16.944 16.778 16.604 16.464 16.309 16.143 15.979 15.803 15.668 15.545 15.37 15.234 15.086 15.007 14.837 14.655 14.474 14.377 14.165 14.069 13.954 13.834 13.582 13.446 13.278 13.079 12.858 12.603 12.295 10.849 -2 ,22146 ,TETRA ,17525940,Thu Nov 25 02:07:38 CET,Thu Nov 25 04:00:34 CET,0.0 0.318 0.539 0.716 0.862 0.975 1.089 1.199 1.393 1.488 1.582 1.643 1.855 1.931 2.084 2.237 2.388 2.465 2.618 2.758 2.953 3.082 3.205 3.389 3.575 3.76 3.943 4.127 4.366 4.594 4.819 5.099 5.381 5.647 5.946 6.287 6.624 6.976 7.353 7.773 8.218 8.739 9.364 9.978 10.675 11.445 12.338 13.343 14.494 15.77 17.148 18.13 18.534 18.642 18.599 18.459 18.323 18.149 17.969 17.768 17.545 17.323 17.089 16.854 16.642 16.45 16.236 16.03 15.842 15.642 15.425 15.242 15.063 14.873 14.716 14.553 14.378 14.189 13.99 13.85 13.716 13.491 13.328 13.168 13.078 12.888 12.696 12.497 12.389 12.162 12.038 11.898 11.745 11.485 11.354 11.183 10.983 10.762 10.491 10.128 8.984 -3 ,4529 ,TETRA ,17525941,Thu Nov 25 02:07:37 CET,Thu Nov 25 03:58:34 CET,0.0 0.359 0.53 0.672 0.809 0.925 1.035 1.136 1.329 1.425 1.512 1.557 1.761 1.836 1.995 2.159 2.317 2.394 2.552 2.692 2.888 3.02 3.147 3.332 3.511 3.683 3.852 4.027 4.259 4.481 4.689 4.936 5.186 5.429 5.712 6.042 6.367 6.727 7.134 7.579 8.031 8.529 9.109 9.716 10.425 11.194 12.088 13.096 14.261 15.548 16.961 17.976 18.43 18.57 18.551 18.448 18.303 18.123 17.947 17.749 17.55 17.362 17.155 16.918 16.691 16.487 16.277 16.09 15.914 15.729 15.54 15.38 15.181 14.961 14.8 14.625 14.435 14.236 14.041 13.897 13.748 13.531 13.382 13.237 13.157 12.987 12.814 12.626 12.526 12.317 12.211 12.091 11.965 11.682 11.531 11.38 11.212 10.987 10.702 10.342 9.014 -4 ,27825 ,TETRA ,17525942,Thu Nov 25 02:07:38 CET,Thu Nov 25 04:00:23 CET,0.0 0.254 0.433 0.589 0.73 0.853 0.967 1.075 1.282 1.382 1.477 1.521 1.733 1.817 1.97 2.135 2.302 2.377 2.511 2.644 2.845 2.979 3.119 3.323 3.508 3.685 3.86 4.029 4.244 4.448 4.647 4.907 5.171 5.423 5.713 6.027 6.33 6.679 7.074 7.517 7.977 8.473 9.069 9.693 10.408 11.175 12.066 13.105 14.287 15.66 17.211 18.256 18.625 18.712 18.705 18.605 18.464 18.279 18.082 17.89 17.708 17.495 17.271 17.071 16.867 16.66 16.435 16.237 16.056 15.857 15.666 15.519 15.359 15.19 15.06 14.914 14.75 14.577 14.405 14.29 14.177 13.986 13.843 13.698 13.619 13.445 13.263 13.077 12.978 12.77 12.674 12.563 12.447 12.184 12.033 11.857 11.664 11.446 11.205 10.9 9.823 -5 ,18170 ,TETRA ,17525943,Thu Nov 25 02:07:38 CET,Thu Nov 25 04:01:44 CET,0.0 0.201 0.366 0.5 0.619 0.739 0.847 0.954 1.169 1.269 1.372 1.474 1.717 1.828 2.023 2.207 2.389 2.475 2.642 2.799 3.031 3.18 3.332 3.552 3.757 3.959 4.155 4.344 4.59 4.839 5.082 5.366 5.641 5.908 6.212 6.558 6.891 7.265 7.662 8.082 8.535 9.038 9.622 10.228 10.938 11.713 12.611 13.621 14.81 16.178 17.708 18.828 19.331 19.488 19.431 19.302 19.164 18.98 18.756 18.515 18.295 18.065 17.836 17.614 17.399 17.191 16.965 16.767 16.576 16.368 16.159 15.979 15.788 15.582 15.418 15.239 15.058 14.877 14.676 14.535 14.391 14.153 13.968 13.78 13.688 13.489 13.263 13.034 12.925 12.695 12.538 12.4 12.247 11.926 11.748 11.545 11.339 11.107 10.832 10.481 9.604 -6 ,16933 ,TETRA ,17525944,Thu Nov 25 02:08:39 CET,Thu Nov 25 03:59:19 CET,0.0 0.408 0.607 0.823 1.032 1.207 1.372 1.515 1.756 1.869 1.985 2.075 2.302 2.401 2.6 2.799 2.974 3.055 3.217 3.382 3.621 3.778 3.933 4.147 4.351 4.556 4.756 4.952 5.204 5.443 5.672 5.961 6.249 6.522 6.843 7.197 7.524 7.906 8.324 8.76 9.215 9.719 10.322 10.917 11.612 12.372 13.21 14.18 15.357 16.739 18.257 19.293 19.721 19.836 19.825 19.721 19.538 19.333 19.125 18.868 18.62 18.384 18.148 17.92 17.705 17.497 17.275 17.085 16.903 16.695 16.464 16.26 16.058 15.849 15.678 15.501 15.322 15.124 14.912 14.768 14.61 14.351 14.174 13.988 13.891 13.702 13.517 13.312 13.204 12.988 12.863 12.747 12.629 12.351 12.195 12.019 11.828 11.59 11.267 10.891 8.992 -7 ,13551 ,TETRA ,17525945,Thu Nov 25 02:08:40 CET,Thu Nov 25 04:01:25 CET,0.0 0.237 0.385 0.529 0.671 0.809 0.93 1.032 1.23 1.333 1.432 1.489 1.697 1.776 1.941 2.09 2.238 2.309 2.443 2.581 2.788 2.922 3.053 3.246 3.426 3.6 3.78 3.956 4.184 4.412 4.633 4.908 5.177 5.444 5.768 6.138 6.482 6.846 7.24 7.667 8.12 8.627 9.24 9.836 10.514 11.309 12.236 13.249 14.392 15.681 17.155 18.166 18.591 18.726 18.663 18.51 18.34 18.162 17.965 17.738 17.502 17.253 17.028 16.818 16.604 16.401 16.174 15.969 15.797 15.612 15.414 15.245 15.073 14.882 14.715 14.543 14.369 14.192 14.016 13.902 13.787 13.58 13.429 13.275 13.193 13.026 12.861 12.7 12.608 12.403 12.325 12.216 12.092 11.805 11.64 11.443 11.233 11.012 10.715 10.335 9.275 -8 ,26459 ,TETRA ,17525946,Thu Nov 25 02:08:40 CET,Thu Nov 25 04:04:36 CET,0.0 0.346 0.552 0.688 0.814 0.939 1.063 1.176 1.364 1.449 1.538 1.592 1.801 1.885 2.058 2.22 2.37 2.449 2.611 2.762 2.998 3.162 3.31 3.522 3.725 3.923 4.125 4.323 4.577 4.818 5.051 5.338 5.615 5.876 6.175 6.513 6.85 7.232 7.635 8.049 8.491 8.999 9.588 10.175 10.848 11.621 12.53 13.515 14.647 15.971 17.423 18.402 18.805 18.95 18.909 18.783 18.641 18.48 18.293 18.069 17.849 17.637 17.417 17.196 16.991 16.794 16.58 16.377 16.208 16.032 15.825 15.644 15.464 15.275 15.117 14.941 14.748 14.552 14.36 14.217 14.065 13.843 13.684 13.505 13.411 13.211 13.02 12.821 12.717 12.508 12.404 12.293 12.178 11.887 11.738 11.588 11.395 11.155 10.892 10.511 9.617 -9 ,2283 ,TETRA ,17525947,Thu Nov 25 02:08:41 CET,Thu Nov 25 03:59:52 CET,0.0 0.373 0.512 0.617 0.73 0.844 0.959 1.077 1.289 1.381 1.47 1.512 1.724 1.807 1.973 2.132 2.282 2.355 2.498 2.638 2.848 2.987 3.127 3.319 3.506 3.685 3.856 4.034 4.274 4.513 4.74 5.013 5.285 5.559 5.876 6.215 6.544 6.905 7.319 7.753 8.198 8.72 9.318 9.912 10.626 11.417 12.341 13.417 14.636 15.954 17.361 18.34 18.775 18.933 18.929 18.837 18.655 18.416 18.201 17.979 17.788 17.606 17.39 17.171 16.966 16.765 16.537 16.33 16.16 15.984 15.789 15.612 15.418 15.214 15.057 14.895 14.722 14.527 14.308 14.162 14.016 13.784 13.625 13.48 13.406 13.249 13.074 12.878 12.781 12.573 12.478 12.374 12.261 11.996 11.855 11.691 11.505 11.316 11.07 10.745 9.241 -10 ,19676 ,TETRA ,17525948,Thu Nov 25 02:08:41 CET,Thu Nov 25 03:59:19 CET,0.0 0.418 0.579 0.731 0.868 0.99 1.094 1.207 1.456 1.572 1.677 1.763 2.001 2.101 2.292 2.479 2.661 2.754 2.934 3.105 3.336 3.484 3.631 3.835 4.034 4.234 4.438 4.64 4.898 5.146 5.382 5.66 5.935 6.215 6.537 6.886 7.217 7.585 7.983 8.415 8.862 9.362 9.964 10.567 11.284 12.087 12.989 13.982 15.155 16.469 17.941 18.949 19.341 19.465 19.471 19.405 19.231 19.016 18.83 18.605 18.377 18.162 17.952 17.763 17.571 17.374 17.171 16.992 16.829 16.655 16.474 16.324 16.178 16.007 15.874 15.74 15.583 15.428 15.257 15.135 15.014 14.818 14.677 14.531 14.457 14.289 14.102 13.92 13.837 13.638 13.534 13.414 13.297 13.029 12.847 12.665 12.484 12.261 12.004 11.615 10.516 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 7dbd7091..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24287 ,TETRA ,17525949,Thu Nov 25 02:08:40 CET,Thu Nov 25 03:59:30 CET,0.0 0.366 0.527 0.68 0.837 0.98 1.109 1.233 1.472 1.579 1.675 1.74 1.967 2.08 2.299 2.492 2.675 2.758 2.93 3.108 3.358 3.524 3.689 3.919 4.134 4.345 4.543 4.737 4.995 5.241 5.484 5.779 6.051 6.321 6.642 6.988 7.326 7.711 8.133 8.578 9.053 9.582 10.203 10.824 11.532 12.306 13.215 14.261 15.431 16.738 18.172 19.156 19.592 19.746 19.731 19.632 19.467 19.27 19.061 18.81 18.581 18.369 18.141 17.886 17.651 17.447 17.219 17.012 16.824 16.628 16.41 16.223 16.046 15.858 15.707 15.555 15.384 15.205 15.032 14.92 14.81 14.612 14.466 14.317 14.232 14.054 13.876 13.685 13.581 13.36 13.267 13.162 13.035 12.741 12.578 12.403 12.199 11.954 11.686 11.408 9.941 -2 ,5856 ,TETRA ,17525950,Thu Nov 25 02:34:40 CET,Thu Nov 25 04:27:58 CET,0.0 0.34 0.565 0.718 0.848 0.966 1.074 1.174 1.344 1.438 1.528 1.574 1.793 1.88 2.046 2.206 2.381 2.467 2.631 2.789 3.024 3.183 3.328 3.548 3.773 3.986 4.186 4.389 4.654 4.911 5.149 5.419 5.677 5.93 6.234 6.577 6.913 7.297 7.715 8.145 8.593 9.119 9.735 10.338 11.04 11.82 12.7 13.699 14.864 16.161 17.628 18.744 19.261 19.453 19.45 19.322 19.14 18.936 18.716 18.467 18.233 18.006 17.789 17.566 17.342 17.135 16.907 16.698 16.516 16.318 16.127 15.974 15.787 15.581 15.408 15.221 15.028 14.829 14.637 14.505 14.372 14.149 13.989 13.83 13.739 13.556 13.38 13.186 13.083 12.864 12.765 12.643 12.508 12.219 12.031 11.816 11.605 11.352 11.056 10.674 9.028 -3 ,1653 ,TETRA ,17525951,Thu Nov 25 02:09:40 CET,Thu Nov 25 04:00:01 CET,0.0 0.491 0.664 0.801 0.939 1.07 1.196 1.315 1.514 1.617 1.71 1.751 1.964 2.052 2.221 2.381 2.539 2.618 2.776 2.926 3.146 3.281 3.412 3.613 3.804 3.982 4.165 4.345 4.571 4.799 5.034 5.319 5.599 5.876 6.185 6.533 6.873 7.246 7.65 8.087 8.552 9.098 9.749 10.397 11.131 11.946 12.912 13.97 15.165 16.569 18.109 19.087 19.497 19.667 19.685 19.591 19.438 19.262 19.077 18.846 18.619 18.393 18.165 17.955 17.742 17.538 17.313 17.1 16.916 16.716 16.508 16.34 16.161 15.974 15.83 15.668 15.498 15.324 15.143 15.019 14.892 14.688 14.536 14.378 14.298 14.136 13.976 13.802 13.702 13.481 13.368 13.245 13.108 12.811 12.64 12.458 12.259 12.036 11.754 11.349 10.12 -4 ,14150 ,TETRA ,17525952,Thu Nov 25 02:36:44 CET,Thu Nov 25 04:30:27 CET,0.0 0.367 0.539 0.691 0.844 0.98 1.089 1.201 1.413 1.522 1.636 1.72 1.95 2.055 2.249 2.437 2.62 2.703 2.863 3.018 3.243 3.398 3.554 3.772 3.989 4.206 4.41 4.608 4.872 5.128 5.364 5.645 5.927 6.202 6.52 6.871 7.207 7.58 7.98 8.419 8.888 9.418 10.03 10.624 11.328 12.114 13.008 14.044 15.24 16.595 18.125 19.187 19.639 19.78 19.745 19.64 19.482 19.28 19.081 18.839 18.592 18.369 18.159 17.944 17.723 17.518 17.3 17.092 16.906 16.713 16.51 16.338 16.158 15.962 15.801 15.625 15.444 15.245 15.026 14.888 14.752 14.539 14.384 14.217 14.136 13.987 13.824 13.63 13.528 13.311 13.195 13.067 12.939 12.605 12.416 12.235 12.037 11.813 11.551 11.186 10.145 -5 ,10924 ,TETRA ,17525953,Thu Nov 25 02:09:41 CET,Thu Nov 25 04:00:16 CET,0.0 0.338 0.521 0.669 0.805 0.93 1.043 1.148 1.375 1.495 1.603 1.648 1.855 1.939 2.114 2.284 2.448 2.525 2.669 2.816 3.049 3.193 3.327 3.528 3.716 3.888 4.059 4.23 4.453 4.67 4.883 5.154 5.416 5.662 5.956 6.291 6.618 6.99 7.389 7.811 8.274 8.793 9.384 9.965 10.636 11.414 12.321 13.346 14.57 15.937 17.396 18.394 18.793 18.917 18.915 18.807 18.629 18.414 18.212 17.979 17.742 17.514 17.279 17.045 16.81 16.592 16.36 16.141 15.955 15.757 15.556 15.383 15.191 14.993 14.848 14.7 14.551 14.402 14.247 14.128 13.996 13.787 13.642 13.485 13.399 13.232 13.043 12.845 12.738 12.508 12.372 12.246 12.112 11.824 11.673 11.5 11.315 11.112 10.876 10.568 9.654 -6 ,29911 ,TETRA ,17525954,Thu Nov 25 02:09:41 CET,Thu Nov 25 04:00:39 CET,0.0 0.363 0.556 0.705 0.837 0.966 1.097 1.216 1.42 1.519 1.618 1.672 1.892 1.98 2.14 2.302 2.468 2.55 2.708 2.853 3.075 3.213 3.341 3.542 3.743 3.952 4.16 4.369 4.626 4.863 5.103 5.387 5.656 5.934 6.27 6.631 6.972 7.348 7.765 8.199 8.646 9.164 9.771 10.39 11.116 11.922 12.845 13.863 15.034 16.382 17.904 18.914 19.302 19.416 19.409 19.317 19.155 18.941 18.727 18.507 18.296 18.097 17.897 17.679 17.467 17.249 17.013 16.822 16.65 16.456 16.25 16.072 15.871 15.648 15.472 15.286 15.087 14.883 14.67 14.523 14.376 14.133 13.953 13.768 13.676 13.488 13.28 13.045 12.922 12.688 12.53 12.376 12.197 11.811 11.588 11.365 11.132 10.839 10.527 10.152 9.078 -7 ,27090 ,TETRA ,17525955,Thu Nov 25 02:36:44 CET,Thu Nov 25 04:16:49 CET,0.0 0.348 0.499 0.645 0.779 0.902 1.035 1.161 1.388 1.494 1.589 1.645 1.86 1.947 2.117 2.29 2.449 2.523 2.672 2.814 3.01 3.136 3.267 3.46 3.66 3.85 4.033 4.21 4.422 4.629 4.84 5.108 5.371 5.629 5.932 6.257 6.577 6.943 7.318 7.732 8.184 8.685 9.293 9.907 10.616 11.403 12.274 13.261 14.424 15.686 17.088 18.081 18.469 18.605 18.588 18.459 18.303 18.129 17.912 17.671 17.457 17.228 16.992 16.78 16.574 16.354 16.117 15.913 15.728 15.53 15.313 15.128 14.936 14.726 14.567 14.407 14.234 14.045 13.838 13.696 13.561 13.362 13.223 13.082 13.004 12.83 12.641 12.443 12.347 12.139 12.044 11.92 11.787 11.494 11.329 11.169 10.973 10.721 10.429 10.065 9.054 -8 ,13475 ,TETRA ,17525956,Thu Nov 25 02:38:42 CET,Thu Nov 25 04:31:36 CET,0.0 0.426 0.612 0.754 0.894 1.034 1.163 1.295 1.526 1.622 1.721 1.801 2.027 2.119 2.293 2.449 2.605 2.687 2.849 3.002 3.221 3.362 3.497 3.685 3.872 4.062 4.248 4.425 4.647 4.865 5.083 5.347 5.603 5.85 6.133 6.462 6.788 7.158 7.573 8.016 8.479 9.006 9.642 10.268 10.965 11.753 12.667 13.67 14.854 16.25 17.854 18.95 19.436 19.619 19.599 19.504 19.358 19.149 18.92 18.665 18.444 18.224 17.978 17.731 17.5 17.289 17.064 16.856 16.67 16.465 16.245 16.06 15.862 15.664 15.508 15.347 15.171 14.97 14.746 14.587 14.433 14.187 14.011 13.831 13.74 13.549 13.341 13.129 13.007 12.771 12.637 12.519 12.399 12.112 11.952 11.793 11.596 11.35 11.093 10.729 10.03 -9 ,20867 ,TETRA ,17525957,Thu Nov 25 02:38:42 CET,Thu Nov 25 04:32:34 CET,0.0 0.527 0.71 0.863 1.009 1.14 1.267 1.383 1.613 1.721 1.822 1.891 2.108 2.189 2.361 2.534 2.695 2.773 2.926 3.067 3.276 3.415 3.546 3.742 3.94 4.124 4.291 4.464 4.697 4.913 5.115 5.369 5.625 5.876 6.179 6.52 6.827 7.168 7.556 7.951 8.361 8.853 9.449 10.063 10.788 11.594 12.496 13.533 14.743 16.067 17.56 18.544 18.935 19.071 19.084 18.993 18.812 18.606 18.395 18.169 17.96 17.745 17.528 17.319 17.105 16.905 16.692 16.483 16.304 16.117 15.909 15.731 15.538 15.341 15.177 15.01 14.849 14.676 14.483 14.352 14.218 14.0 13.854 13.701 13.615 13.434 13.252 13.062 12.963 12.751 12.646 12.518 12.377 12.089 11.924 11.737 11.526 11.315 11.059 10.674 9.557 -10 ,24928 ,TETRA ,17525958,Thu Nov 25 02:39:40 CET,Thu Nov 25 04:29:36 CET,0.0 0.555 0.755 0.906 1.043 1.168 1.293 1.409 1.6 1.696 1.792 1.846 2.065 2.154 2.318 2.475 2.622 2.692 2.836 2.978 3.187 3.325 3.46 3.661 3.868 4.075 4.277 4.477 4.73 4.978 5.219 5.507 5.792 6.066 6.381 6.738 7.084 7.455 7.857 8.29 8.757 9.288 9.889 10.494 11.193 11.949 12.844 13.857 14.984 16.284 17.758 18.735 19.118 19.206 19.175 19.071 18.905 18.716 18.486 18.225 18.009 17.793 17.565 17.343 17.122 16.901 16.673 16.471 16.293 16.101 15.884 15.702 15.513 15.303 15.144 14.982 14.808 14.617 14.411 14.269 14.111 13.85 13.673 13.485 13.39 13.202 12.98 12.747 12.635 12.401 12.257 12.117 11.945 11.573 11.381 11.173 10.91 10.587 10.194 9.617 7.946 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt deleted file mode 100644 index 8524a33a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4c_CAT-4b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,373 ,TETRA ,17525959,Thu Nov 25 02:39:39 CET,Thu Nov 25 04:20:25 CET,0.0 1.14 1.423 1.642 1.872 2.082 2.261 2.424 2.727 2.862 2.992 3.097 3.329 3.432 3.639 3.841 4.024 4.11 4.28 4.448 4.688 4.852 5.021 5.249 5.471 5.69 5.899 6.106 6.361 6.609 6.849 7.129 7.402 7.674 7.983 8.31 8.626 8.975 9.333 9.717 10.116 10.542 11.033 11.51 12.016 12.548 13.149 13.778 14.402 14.959 15.27 15.05 14.559 13.994 13.422 12.831 12.271 11.755 11.296 10.822 10.394 10.0 9.629 9.274 8.941 8.637 8.298 7.999 7.752 7.489 7.189 6.933 6.679 6.417 6.206 5.981 5.745 5.516 5.281 5.105 4.918 4.632 4.435 4.241 4.143 3.929 3.705 3.466 3.331 3.064 2.918 2.796 2.678 2.419 2.267 2.102 1.911 1.71 1.508 1.179 -0.01 -2 ,9690 ,TETRA ,17525960,Thu Nov 25 02:40:40 CET,Thu Nov 25 04:32:43 CET,0.0 0.624 0.911 1.124 1.297 1.453 1.606 1.754 2.028 2.162 2.3 2.417 2.655 2.759 2.944 3.12 3.294 3.381 3.547 3.703 3.939 4.088 4.242 4.475 4.684 4.884 5.073 5.264 5.518 5.759 5.997 6.286 6.561 6.822 7.12 7.449 7.769 8.117 8.489 8.885 9.283 9.729 10.245 10.732 11.273 11.85 12.476 13.121 13.744 14.197 14.402 14.127 13.576 13.016 12.462 11.911 11.362 10.827 10.355 9.876 9.439 9.027 8.631 8.249 7.889 7.571 7.24 6.93 6.66 6.383 6.11 5.886 5.643 5.38 5.179 4.966 4.735 4.492 4.227 4.05 3.873 3.595 3.398 3.195 3.091 2.865 2.61 2.342 2.202 1.929 1.752 1.598 1.447 1.129 0.934 0.713 0.471 0.182 -0.191 -0.752 -2.339 -3 ,1913 ,TETRA ,17525962,Thu Nov 25 02:43:39 CET,Thu Nov 25 04:36:03 CET,0.0 0.847 1.18 1.421 1.615 1.805 1.972 2.155 2.466 2.586 2.717 2.813 3.039 3.142 3.342 3.536 3.715 3.802 3.981 4.149 4.386 4.55 4.716 4.946 5.17 5.382 5.588 5.792 6.046 6.303 6.559 6.86 7.145 7.411 7.72 8.058 8.369 8.714 9.078 9.439 9.827 10.262 10.734 11.184 11.689 12.211 12.758 13.337 13.965 14.544 14.869 14.639 14.122 13.545 12.959 12.367 11.828 11.311 10.826 10.338 9.924 9.552 9.176 8.827 8.499 8.184 7.874 7.582 7.317 7.044 6.75 6.501 6.243 5.982 5.788 5.585 5.381 5.166 4.945 4.8 4.651 4.417 4.256 4.088 4.0 3.813 3.625 3.442 3.346 3.109 3.012 2.891 2.768 2.495 2.343 2.187 2.007 1.824 1.62 1.327 0.45 -4 ,2829 ,TETRA ,17525964,Thu Nov 25 02:44:42 CET,Thu Nov 25 04:47:37 CET,0.0 0.834 1.15 1.384 1.567 1.731 1.893 2.033 2.279 2.395 2.514 2.611 2.841 2.945 3.164 3.36 3.546 3.64 3.815 3.974 4.197 4.35 4.502 4.709 4.901 5.085 5.26 5.434 5.665 5.884 6.106 6.376 6.627 6.886 7.195 7.534 7.863 8.211 8.567 8.95 9.343 9.776 10.257 10.743 11.326 11.918 12.546 13.184 13.794 14.33 14.621 14.418 13.913 13.345 12.797 12.206 11.633 11.114 10.65 10.157 9.705 9.302 8.919 8.562 8.232 7.927 7.59 7.283 7.025 6.742 6.445 6.206 5.952 5.692 5.49 5.271 5.035 4.8 4.567 4.406 4.236 3.958 3.76 3.55 3.441 3.212 2.97 2.706 2.572 2.321 2.16 1.994 1.824 1.475 1.283 1.059 0.795 0.527 0.219 -0.248 -1.969 -5 ,19512 ,TETRA ,17525966,Thu Nov 25 02:45:43 CET,Thu Nov 25 04:38:10 CET,0.0 1.342 1.77 2.107 2.395 2.627 2.831 3.015 3.342 3.506 3.657 3.794 4.048 4.16 4.382 4.62 4.841 4.937 5.118 5.296 5.556 5.721 5.867 6.09 6.312 6.528 6.746 6.96 7.238 7.49 7.736 8.044 8.314 8.577 8.899 9.241 9.554 9.898 10.254 10.606 10.975 11.409 11.92 12.407 12.958 13.517 14.084 14.691 15.318 15.856 16.109 15.855 15.342 14.763 14.165 13.595 13.076 12.556 12.079 11.597 11.178 10.789 10.406 10.038 9.695 9.389 9.059 8.751 8.48 8.208 7.919 7.666 7.414 7.167 6.989 6.813 6.628 6.434 6.231 6.097 5.958 5.712 5.534 5.345 5.248 5.058 4.856 4.631 4.52 4.286 4.195 4.078 3.965 3.724 3.586 3.427 3.246 3.052 2.792 2.345 1.402 -6 ,21313 ,TETRA ,17525968,Thu Nov 25 02:45:42 CET,Thu Nov 25 04:37:53 CET,0.0 0.83 1.14 1.373 1.568 1.767 1.953 2.117 2.398 2.522 2.633 2.712 2.947 3.054 3.258 3.449 3.629 3.711 3.874 4.051 4.304 4.454 4.592 4.798 5.015 5.215 5.402 5.59 5.828 6.059 6.285 6.549 6.802 7.043 7.316 7.628 7.924 8.24 8.575 8.93 9.305 9.732 10.238 10.731 11.27 11.833 12.425 13.013 13.564 14.097 14.375 14.045 13.484 12.876 12.283 11.69 11.116 10.577 10.106 9.638 9.214 8.829 8.46 8.11 7.779 7.475 7.147 6.847 6.616 6.38 6.122 5.905 5.677 5.44 5.255 5.057 4.851 4.644 4.433 4.291 4.143 3.913 3.754 3.582 3.487 3.298 3.114 2.905 2.793 2.551 2.45 2.331 2.206 1.926 1.784 1.64 1.456 1.253 1.057 0.788 -0.083 -7 ,9677 ,TETRA ,17525970,Thu Nov 25 02:46:41 CET,Thu Nov 25 04:35:35 CET,0.0 0.953 1.299 1.579 1.797 1.963 2.125 2.282 2.562 2.689 2.804 2.893 3.123 3.22 3.405 3.594 3.785 3.869 4.031 4.19 4.417 4.569 4.709 4.935 5.165 5.363 5.548 5.722 5.937 6.159 6.375 6.632 6.885 7.13 7.408 7.729 8.045 8.391 8.757 9.13 9.514 9.931 10.404 10.855 11.366 11.915 12.489 13.057 13.645 14.224 14.518 14.176 13.599 13.014 12.444 11.834 11.242 10.712 10.226 9.717 9.266 8.852 8.47 8.106 7.759 7.465 7.153 6.846 6.593 6.335 6.056 5.819 5.575 5.318 5.116 4.91 4.701 4.478 4.238 4.076 3.897 3.613 3.423 3.214 3.099 2.873 2.651 2.404 2.272 2.016 1.854 1.698 1.533 1.162 0.983 0.813 0.635 0.453 0.229 -0.135 -0.901 -8 ,26728 ,TETRA ,17525971,Thu Nov 25 02:46:41 CET,Thu Nov 25 04:39:01 CET,0.0 1.128 1.561 1.859 2.105 2.343 2.555 2.746 3.08 3.229 3.381 3.534 3.787 3.907 4.126 4.326 4.529 4.629 4.846 5.068 5.35 5.512 5.661 5.874 6.091 6.292 6.49 6.698 6.948 7.18 7.402 7.658 7.914 8.166 8.457 8.785 9.09 9.415 9.767 10.147 10.533 10.954 11.451 11.934 12.46 13.027 13.652 14.265 14.887 15.456 15.7 15.415 14.897 14.338 13.777 13.197 12.642 12.161 11.737 11.275 10.839 10.438 10.078 9.737 9.406 9.078 8.738 8.441 8.169 7.886 7.596 7.354 7.109 6.855 6.653 6.443 6.222 5.995 5.767 5.613 5.46 5.241 5.086 4.914 4.827 4.651 4.477 4.288 4.18 3.943 3.851 3.742 3.618 3.324 3.166 2.994 2.785 2.534 2.277 2.026 1.256 -9 ,9848 ,TETRA ,17525973,Thu Nov 25 02:47:45 CET,Thu Nov 25 04:40:51 CET,0.0 0.766 1.105 1.367 1.577 1.764 1.93 2.08 2.365 2.511 2.651 2.756 2.986 3.09 3.284 3.472 3.656 3.741 3.91 4.08 4.322 4.482 4.628 4.828 5.029 5.226 5.414 5.592 5.824 6.068 6.313 6.61 6.891 7.159 7.462 7.796 8.122 8.473 8.828 9.207 9.612 10.049 10.564 11.045 11.575 12.153 12.762 13.406 14.036 14.592 14.949 14.677 14.102 13.518 12.896 12.261 11.695 11.154 10.657 10.146 9.706 9.309 8.944 8.589 8.238 7.918 7.575 7.272 7.018 6.75 6.469 6.239 5.998 5.746 5.553 5.341 5.12 4.896 4.653 4.489 4.324 4.05 3.847 3.653 3.556 3.349 3.136 2.943 2.843 2.602 2.475 2.348 2.225 1.964 1.83 1.691 1.53 1.333 1.087 0.766 -0.388 -10 ,23493 ,TETRA ,17525975,Thu Nov 25 02:48:43 CET,Thu Nov 25 04:35:25 CET,0.0 1.134 1.58 1.946 2.193 2.401 2.605 2.799 3.145 3.308 3.469 3.642 3.907 4.044 4.28 4.497 4.717 4.825 5.027 5.212 5.485 5.657 5.828 6.081 6.322 6.552 6.751 6.945 7.209 7.46 7.694 7.971 8.242 8.501 8.796 9.123 9.431 9.756 10.093 10.461 10.85 11.28 11.777 12.241 12.769 13.325 13.874 14.452 15.086 15.652 15.892 15.578 15.057 14.458 13.849 13.233 12.677 12.158 11.698 11.209 10.768 10.376 10.0 9.642 9.304 8.98 8.635 8.314 8.019 7.734 7.451 7.193 6.931 6.668 6.46 6.236 6.002 5.77 5.539 5.382 5.21 4.955 4.788 4.608 4.512 4.324 4.126 3.909 3.799 3.56 3.448 3.316 3.172 2.872 2.704 2.536 2.338 2.085 1.799 1.418 0.348 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index c96d3920..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2169 ,TETRA ,17525977,Thu Nov 25 02:50:43 CET,Thu Nov 25 04:41:51 CET,0.0 0.265 0.401 0.533 0.665 0.783 0.895 0.995 1.185 1.279 1.376 1.433 1.654 1.749 1.942 2.12 2.288 2.368 2.523 2.675 2.908 3.065 3.213 3.422 3.624 3.819 4.011 4.212 4.47 4.711 4.953 5.243 5.534 5.825 6.164 6.553 6.933 7.356 7.826 8.321 8.835 9.434 10.126 10.831 11.669 12.604 13.723 15.014 16.482 18.185 20.212 21.826 22.686 23.106 23.268 23.286 23.229 23.128 22.982 22.761 22.53 22.34 22.154 21.946 21.741 21.545 21.338 21.153 20.982 20.786 20.555 20.355 20.162 19.949 19.775 19.59 19.389 19.188 18.958 18.782 18.612 18.336 18.138 17.933 17.831 17.631 17.397 17.131 16.991 16.734 16.543 16.377 16.201 15.8 15.58 15.343 15.069 14.757 14.395 13.838 11.563 -2 ,12618 ,TETRA ,17525979,Thu Nov 25 02:50:43 CET,Thu Nov 25 04:42:58 CET,0.0 0.208 0.394 0.57 0.691 0.806 0.922 1.046 1.277 1.381 1.475 1.526 1.763 1.861 2.031 2.206 2.379 2.455 2.609 2.769 2.997 3.151 3.302 3.514 3.722 3.933 4.133 4.319 4.569 4.814 5.055 5.368 5.663 5.931 6.253 6.631 6.986 7.372 7.809 8.301 8.844 9.467 10.182 10.907 11.776 12.75 13.826 15.045 16.504 18.202 20.204 21.844 22.711 23.089 23.225 23.273 23.24 23.131 23.006 22.856 22.698 22.537 22.342 22.113 21.878 21.683 21.51 21.344 21.182 21.002 20.794 20.624 20.466 20.282 20.121 19.96 19.786 19.608 19.438 19.314 19.169 18.916 18.735 18.564 18.475 18.276 18.062 17.823 17.694 17.455 17.293 17.138 16.985 16.637 16.425 16.191 15.926 15.638 15.35 14.913 12.568 -3 ,5470 ,TETRA ,17525981,Thu Nov 25 02:51:46 CET,Thu Nov 25 04:43:04 CET,0.0 0.443 0.674 0.832 0.978 1.112 1.234 1.365 1.594 1.697 1.799 1.862 2.09 2.183 2.376 2.554 2.729 2.82 2.988 3.154 3.406 3.569 3.732 3.967 4.202 4.427 4.643 4.855 5.119 5.381 5.643 5.96 6.267 6.573 6.925 7.315 7.705 8.138 8.598 9.072 9.555 10.114 10.79 11.503 12.345 13.279 14.398 15.665 17.116 18.814 20.866 22.513 23.327 23.717 23.914 23.97 23.911 23.79 23.602 23.373 23.202 23.043 22.841 22.623 22.401 22.2 21.99 21.778 21.593 21.4 21.19 21.007 20.807 20.593 20.427 20.253 20.078 19.911 19.745 19.626 19.474 19.212 19.029 18.844 18.749 18.552 18.358 18.13 18.009 17.775 17.619 17.488 17.342 16.973 16.777 16.59 16.377 16.088 15.706 15.183 12.858 -4 ,10067 ,TETRA ,17525983,Thu Nov 25 02:52:43 CET,Thu Nov 25 04:46:10 CET,0.0 0.371 0.554 0.676 0.816 0.956 1.069 1.17 1.36 1.465 1.569 1.631 1.858 1.946 2.12 2.291 2.453 2.531 2.687 2.837 3.054 3.196 3.333 3.525 3.714 3.905 4.095 4.281 4.529 4.77 5.009 5.312 5.605 5.885 6.218 6.612 6.994 7.41 7.867 8.368 8.893 9.483 10.194 10.905 11.716 12.647 13.708 14.874 16.282 18.044 20.23 21.879 22.706 23.139 23.281 23.277 23.215 23.082 22.951 22.804 22.594 22.371 22.162 21.956 21.752 21.563 21.357 21.174 21.002 20.81 20.618 20.455 20.257 20.032 19.872 19.712 19.533 19.331 19.113 18.96 18.793 18.53 18.346 18.142 18.039 17.826 17.601 17.349 17.2 16.939 16.734 16.559 16.392 16.004 15.79 15.578 15.331 15.021 14.641 14.161 11.974 -5 ,30105 ,TETRA ,17525985,Thu Nov 25 02:52:43 CET,Thu Nov 25 04:45:44 CET,0.0 0.262 0.458 0.612 0.75 0.879 1.016 1.143 1.372 1.48 1.581 1.646 1.874 1.962 2.133 2.325 2.521 2.61 2.783 2.953 3.201 3.364 3.531 3.773 3.998 4.21 4.419 4.626 4.897 5.163 5.414 5.713 6.005 6.299 6.647 7.041 7.434 7.869 8.331 8.814 9.33 9.924 10.624 11.325 12.164 13.119 14.214 15.465 16.922 18.591 20.565 22.136 22.964 23.401 23.601 23.672 23.641 23.519 23.368 23.191 23.007 22.82 22.628 22.444 22.262 22.082 21.889 21.7 21.511 21.308 21.105 20.934 20.736 20.523 20.351 20.169 19.971 19.766 19.558 19.411 19.259 19.031 18.882 18.711 18.617 18.428 18.216 17.974 17.849 17.609 17.441 17.287 17.106 16.721 16.534 16.304 16.045 15.76 15.388 14.779 10.685 -6 ,19173 ,TETRA ,17525987,Thu Nov 25 02:53:49 CET,Thu Nov 25 04:45:00 CET,0.0 0.223 0.399 0.525 0.658 0.779 0.884 0.997 1.231 1.336 1.434 1.49 1.724 1.828 2.023 2.22 2.418 2.509 2.686 2.869 3.122 3.278 3.432 3.658 3.888 4.116 4.331 4.542 4.82 5.082 5.341 5.668 5.985 6.292 6.65 7.049 7.429 7.85 8.316 8.814 9.328 9.905 10.6 11.308 12.141 13.069 14.144 15.393 16.874 18.593 20.597 22.185 22.986 23.336 23.465 23.502 23.468 23.382 23.27 23.1 22.917 22.727 22.525 22.34 22.165 21.98 21.764 21.569 21.405 21.22 21.018 20.842 20.657 20.468 20.308 20.13 19.943 19.752 19.575 19.465 19.327 19.105 18.954 18.804 18.727 18.552 18.359 18.14 18.021 17.788 17.659 17.534 17.38 17.026 16.848 16.652 16.388 16.054 15.669 15.173 13.016 -7 ,6024 ,TETRA ,17525989,Thu Nov 25 02:54:42 CET,Thu Nov 25 04:46:28 CET,0.0 0.32 0.491 0.639 0.78 0.909 1.026 1.144 1.379 1.49 1.595 1.651 1.874 1.969 2.158 2.329 2.491 2.572 2.731 2.889 3.129 3.288 3.449 3.697 3.932 4.151 4.362 4.571 4.856 5.13 5.384 5.689 5.99 6.285 6.642 7.037 7.406 7.83 8.295 8.786 9.302 9.895 10.592 11.3 12.145 13.088 14.187 15.422 16.867 18.585 20.548 22.08 22.919 23.35 23.55 23.578 23.486 23.35 23.211 23.046 22.879 22.727 22.556 22.376 22.195 22.007 21.791 21.586 21.404 21.215 21.02 20.855 20.687 20.52 20.387 20.235 20.047 19.849 19.65 19.504 19.361 19.147 18.982 18.796 18.701 18.49 18.256 17.998 17.877 17.658 17.505 17.356 17.198 16.853 16.671 16.46 16.198 15.92 15.573 15.069 12.822 -8 ,17635 ,TETRA ,17525991,Thu Nov 25 02:55:46 CET,Thu Nov 25 04:48:27 CET,0.0 0.254 0.431 0.579 0.726 0.871 1.0 1.118 1.346 1.463 1.586 1.7 1.949 2.066 2.277 2.471 2.663 2.76 2.948 3.133 3.399 3.564 3.722 3.952 4.175 4.39 4.611 4.818 5.077 5.336 5.588 5.897 6.199 6.492 6.833 7.226 7.609 8.036 8.5 9.0 9.535 10.122 10.81 11.527 12.382 13.333 14.405 15.62 17.061 18.754 20.762 22.274 23.113 23.583 23.756 23.833 23.843 23.768 23.644 23.465 23.283 23.13 22.969 22.795 22.63 22.479 22.31 22.132 21.95 21.754 21.557 21.387 21.216 21.023 20.864 20.713 20.561 20.401 20.208 20.057 19.912 19.69 19.535 19.36 19.269 19.09 18.907 18.71 18.594 18.351 18.167 18.004 17.837 17.485 17.313 17.141 16.91 16.659 16.345 15.758 13.39 -9 ,14841 ,TETRA ,17525993,Thu Nov 25 02:56:44 CET,Thu Nov 25 04:49:26 CET,0.0 0.407 0.566 0.702 0.824 0.948 1.06 1.168 1.381 1.477 1.571 1.641 1.869 1.961 2.149 2.329 2.518 2.614 2.796 2.982 3.244 3.405 3.562 3.795 4.04 4.276 4.495 4.711 4.978 5.221 5.467 5.78 6.08 6.371 6.713 7.108 7.485 7.899 8.363 8.863 9.38 9.963 10.676 11.412 12.251 13.189 14.293 15.559 17.04 18.734 20.708 22.249 23.022 23.413 23.54 23.538 23.48 23.374 23.219 23.021 22.833 22.636 22.427 22.209 21.999 21.817 21.608 21.393 21.205 21.014 20.813 20.639 20.45 20.247 20.078 19.891 19.699 19.5 19.274 19.114 18.944 18.674 18.485 18.297 18.201 17.977 17.745 17.499 17.377 17.142 16.971 16.813 16.654 16.306 16.096 15.842 15.554 15.26 14.897 14.382 11.416 -10 ,10969 ,TETRA ,17525995,Thu Nov 25 02:57:43 CET,Thu Nov 25 04:50:09 CET,0.0 0.294 0.499 0.664 0.827 0.961 1.081 1.201 1.409 1.502 1.597 1.653 1.877 1.971 2.154 2.322 2.486 2.565 2.714 2.867 3.09 3.232 3.366 3.561 3.757 3.95 4.137 4.316 4.559 4.805 5.055 5.36 5.643 5.917 6.246 6.635 6.997 7.389 7.84 8.337 8.862 9.46 10.15 10.844 11.689 12.639 13.728 14.99 16.47 18.106 20.029 21.611 22.454 22.889 23.099 23.174 23.142 23.049 22.923 22.749 22.571 22.384 22.181 21.975 21.781 21.594 21.375 21.169 20.974 20.791 20.608 20.442 20.264 20.06 19.896 19.714 19.527 19.348 19.15 18.994 18.821 18.55 18.375 18.187 18.089 17.88 17.647 17.419 17.304 17.083 16.955 16.798 16.623 16.263 16.067 15.855 15.602 15.277 14.87 14.359 11.26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt deleted file mode 100644 index 39a8b263..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4d_CAT-4b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21278 ,TETRA ,17525998,Thu Nov 25 02:59:44 CET,Thu Nov 25 04:54:11 CET,0.0 0.379 0.592 0.752 0.903 1.059 1.21 1.335 1.56 1.673 1.779 1.844 2.069 2.162 2.335 2.507 2.682 2.769 2.949 3.135 3.408 3.571 3.726 3.95 4.164 4.37 4.57 4.775 5.03 5.263 5.494 5.769 6.025 6.276 6.569 6.902 7.219 7.553 7.911 8.297 8.704 9.155 9.678 10.196 10.786 11.429 12.162 12.949 13.755 14.559 15.332 15.63 15.544 15.309 14.987 14.612 14.242 13.906 13.573 13.177 12.829 12.521 12.205 11.881 11.597 11.344 11.056 10.782 10.55 10.303 10.032 9.799 9.561 9.344 9.173 8.993 8.81 8.609 8.398 8.249 8.091 7.857 7.69 7.509 7.422 7.241 7.041 6.821 6.708 6.464 6.348 6.215 6.067 5.73 5.54 5.365 5.179 4.963 4.714 4.411 2.962 -2 ,6903 ,TETRA ,17526000,Thu Nov 25 03:00:44 CET,Thu Nov 25 04:54:39 CET,0.0 0.403 0.605 0.778 0.947 1.093 1.239 1.378 1.634 1.749 1.845 1.896 2.114 2.2 2.37 2.527 2.685 2.765 2.917 3.081 3.329 3.488 3.638 3.849 4.06 4.265 4.466 4.656 4.895 5.132 5.36 5.646 5.93 6.18 6.465 6.803 7.106 7.44 7.83 8.22 8.611 9.054 9.574 10.097 10.691 11.332 12.027 12.777 13.573 14.334 15.051 15.363 15.258 14.995 14.667 14.275 13.9 13.532 13.178 12.805 12.471 12.15 11.837 11.539 11.258 10.986 10.688 10.433 10.215 9.988 9.748 9.531 9.285 9.039 8.854 8.654 8.449 8.24 8.026 7.879 7.726 7.487 7.315 7.135 7.045 6.865 6.685 6.487 6.379 6.145 6.038 5.907 5.769 5.463 5.295 5.101 4.895 4.666 4.408 4.091 2.898 -3 ,15910 ,TETRA ,17526001,Thu Nov 25 03:00:45 CET,Thu Nov 25 04:54:40 CET,0.0 0.911 1.235 1.457 1.654 1.846 2.045 2.228 2.535 2.675 2.803 2.936 3.199 3.326 3.551 3.765 3.987 4.102 4.304 4.477 4.725 4.884 5.04 5.266 5.477 5.682 5.885 6.089 6.353 6.61 6.857 7.133 7.405 7.673 7.987 8.331 8.637 8.988 9.364 9.738 10.135 10.591 11.12 11.641 12.215 12.814 13.491 14.252 15.102 15.949 16.678 16.976 16.911 16.645 16.318 15.972 15.598 15.233 14.914 14.551 14.211 13.896 13.597 13.301 13.002 12.731 12.44 12.169 11.945 11.716 11.461 11.225 10.977 10.737 10.554 10.368 10.17 9.952 9.723 9.569 9.411 9.163 8.986 8.809 8.72 8.528 8.334 8.137 8.036 7.809 7.704 7.58 7.445 7.123 6.945 6.759 6.569 6.373 6.15 5.809 4.597 -4 ,19824 ,TETRA ,17526003,Thu Nov 25 03:00:45 CET,Thu Nov 25 04:53:02 CET,0.0 0.399 0.62 0.815 0.992 1.181 1.373 1.541 1.821 1.96 2.099 2.222 2.473 2.589 2.803 3.008 3.209 3.304 3.495 3.681 3.943 4.113 4.271 4.498 4.723 4.931 5.126 5.318 5.572 5.815 6.039 6.302 6.566 6.825 7.127 7.464 7.786 8.141 8.525 8.932 9.347 9.801 10.306 10.818 11.411 12.054 12.771 13.519 14.329 15.157 15.841 16.109 15.989 15.662 15.328 14.968 14.585 14.226 13.901 13.529 13.157 12.826 12.537 12.27 12.002 11.731 11.43 11.156 10.92 10.673 10.412 10.192 9.963 9.734 9.557 9.364 9.165 8.964 8.751 8.595 8.431 8.176 8.003 7.822 7.725 7.516 7.273 7.004 6.878 6.618 6.444 6.282 6.105 5.702 5.48 5.254 5.02 4.746 4.401 3.995 1.947 -5 ,22748 ,TETRA ,17526005,Thu Nov 25 03:01:44 CET,Thu Nov 25 04:54:24 CET,0.0 0.619 0.861 1.062 1.22 1.359 1.489 1.612 1.843 1.944 2.042 2.089 2.312 2.408 2.595 2.765 2.917 2.994 3.138 3.275 3.492 3.636 3.77 3.968 4.162 4.357 4.548 4.741 4.997 5.232 5.472 5.757 6.036 6.302 6.592 6.931 7.254 7.595 7.972 8.389 8.812 9.257 9.752 10.255 10.861 11.505 12.184 12.92 13.689 14.459 15.127 15.293 15.153 14.863 14.525 14.158 13.774 13.384 12.997 12.597 12.239 11.903 11.587 11.289 11.011 10.752 10.474 10.208 9.967 9.732 9.481 9.252 9.013 8.771 8.588 8.396 8.196 7.981 7.738 7.573 7.422 7.203 7.056 6.889 6.798 6.614 6.414 6.206 6.093 5.851 5.751 5.628 5.504 5.247 5.096 4.923 4.721 4.49 4.214 3.855 2.575 -6 ,20799 ,TETRA ,17526007,Thu Nov 25 03:01:45 CET,Thu Nov 25 04:54:47 CET,0.0 0.457 0.68 0.879 1.068 1.217 1.353 1.481 1.71 1.807 1.9 1.958 2.182 2.272 2.462 2.642 2.815 2.898 3.054 3.203 3.424 3.572 3.705 3.894 4.076 4.244 4.416 4.602 4.861 5.109 5.343 5.622 5.874 6.117 6.398 6.712 7.024 7.378 7.766 8.161 8.561 9.015 9.517 10.012 10.622 11.273 11.975 12.729 13.513 14.314 15.024 15.227 15.106 14.838 14.492 14.123 13.751 13.383 13.033 12.648 12.31 11.992 11.698 11.419 11.126 10.866 10.62 10.389 10.162 9.921 9.666 9.437 9.201 8.967 8.788 8.612 8.428 8.227 8.025 7.88 7.725 7.486 7.316 7.138 7.047 6.87 6.694 6.489 6.377 6.132 6.019 5.893 5.763 5.502 5.35 5.167 4.971 4.737 4.44 4.045 3.044 -7 ,32160 ,TETRA ,17526010,Thu Nov 25 03:02:44 CET,Thu Nov 25 04:55:33 CET,0.0 0.762 1.092 1.354 1.581 1.778 1.963 2.14 2.451 2.581 2.706 2.836 3.092 3.212 3.425 3.632 3.837 3.938 4.13 4.306 4.544 4.705 4.865 5.095 5.314 5.529 5.734 5.927 6.177 6.408 6.635 6.924 7.199 7.454 7.755 8.102 8.423 8.767 9.135 9.513 9.903 10.346 10.875 11.407 12.019 12.667 13.38 14.127 14.925 15.781 16.534 16.827 16.716 16.395 16.035 15.666 15.301 14.928 14.566 14.163 13.831 13.54 13.215 12.884 12.573 12.308 12.038 11.789 11.567 11.322 11.067 10.856 10.635 10.396 10.198 9.997 9.803 9.599 9.369 9.198 9.016 8.74 8.558 8.377 8.277 8.061 7.849 7.631 7.508 7.259 7.122 6.973 6.816 6.496 6.335 6.161 5.966 5.757 5.53 5.23 4.098 -8 ,18326 ,TETRA ,17526012,Thu Nov 25 03:03:44 CET,Thu Nov 25 04:56:35 CET,0.0 0.343 0.552 0.709 0.859 1.006 1.148 1.285 1.511 1.617 1.725 1.79 2.014 2.099 2.278 2.472 2.656 2.735 2.886 3.03 3.236 3.366 3.496 3.691 3.889 4.077 4.246 4.421 4.654 4.863 5.064 5.317 5.563 5.791 6.063 6.396 6.729 7.097 7.489 7.898 8.326 8.8 9.318 9.833 10.436 11.073 11.79 12.547 13.383 14.256 15.015 15.347 15.244 14.977 14.657 14.302 13.939 13.57 13.203 12.783 12.414 12.078 11.744 11.431 11.13 10.853 10.562 10.298 10.075 9.837 9.59 9.381 9.157 8.916 8.73 8.531 8.317 8.096 7.867 7.717 7.564 7.328 7.153 6.968 6.879 6.697 6.507 6.299 6.185 5.944 5.835 5.706 5.585 5.326 5.153 4.959 4.765 4.514 4.19 3.79 1.868 -9 ,19688 ,TETRA ,17526014,Thu Nov 25 03:04:45 CET,Thu Nov 25 04:58:37 CET,0.0 0.391 0.613 0.787 0.947 1.098 1.213 1.318 1.53 1.629 1.731 1.805 2.033 2.121 2.305 2.487 2.654 2.731 2.875 3.015 3.229 3.371 3.507 3.703 3.896 4.084 4.275 4.458 4.679 4.886 5.086 5.331 5.563 5.788 6.054 6.343 6.624 6.959 7.341 7.745 8.178 8.657 9.186 9.721 10.318 10.952 11.666 12.436 13.267 14.13 14.931 15.244 15.128 14.791 14.404 14.035 13.653 13.288 12.96 12.598 12.276 11.973 11.666 11.37 11.083 10.807 10.511 10.254 10.024 9.776 9.523 9.316 9.088 8.846 8.667 8.485 8.296 8.09 7.875 7.735 7.59 7.359 7.191 7.011 6.914 6.72 6.516 6.29 6.181 5.947 5.845 5.722 5.588 5.301 5.153 4.987 4.783 4.559 4.304 3.968 2.802 -10 ,27500 ,TETRA ,17526016,Thu Nov 25 03:08:41 CET,Thu Nov 25 05:02:19 CET,0.0 0.353 0.55 0.719 0.885 1.038 1.176 1.315 1.563 1.676 1.781 1.834 2.06 2.148 2.304 2.465 2.635 2.714 2.866 3.019 3.225 3.363 3.506 3.706 3.893 4.086 4.271 4.44 4.664 4.88 5.107 5.393 5.669 5.934 6.235 6.576 6.9 7.245 7.608 7.996 8.389 8.816 9.308 9.807 10.375 11.003 11.717 12.464 13.266 14.081 14.831 15.106 14.998 14.733 14.395 14.03 13.655 13.297 12.998 12.662 12.335 12.03 11.725 11.427 11.147 10.891 10.615 10.351 10.115 9.869 9.604 9.378 9.148 8.929 8.756 8.572 8.395 8.209 8.014 7.879 7.736 7.506 7.349 7.189 7.105 6.912 6.699 6.504 6.399 6.161 6.045 5.906 5.766 5.475 5.321 5.147 4.941 4.722 4.428 4.015 2.469 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt deleted file mode 100644 index 65df22fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-17d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24307 ,KEBNE ,17024449,Wed Dec 22 10:02:24 CET,Wed Dec 22 11:38:45 CET,0.0 0.333 0.513 0.666 0.809 0.93 1.036 1.136 1.305 1.388 1.472 1.501 1.704 1.783 1.931 2.064 2.195 2.264 2.401 2.524 2.705 2.813 2.917 3.089 3.252 3.393 3.531 3.679 3.864 4.051 4.238 4.454 4.67 4.878 5.107 5.356 5.608 5.886 6.171 6.471 6.78 7.132 7.515 7.862 8.245 8.672 9.147 9.632 10.105 10.489 10.661 10.351 9.853 9.337 8.794 8.259 7.759 7.287 6.869 6.427 6.045 5.696 5.346 5.019 4.728 4.452 4.173 3.927 3.708 3.476 3.239 3.043 2.826 2.606 2.43 2.254 2.087 1.913 1.732 1.6 1.459 1.257 1.115 0.948 0.859 0.685 0.497 0.297 0.192 -0.045 -0.124 -0.231 -0.352 -0.644 -0.795 -0.94 -1.106 -1.306 -1.594 -1.938 -3.062 -2 ,7224 ,KEBNE ,17024450,Wed Dec 22 10:03:26 CET,Wed Dec 22 11:39:47 CET,0.0 0.509 0.709 0.864 0.988 1.091 1.213 1.333 1.514 1.59 1.673 1.723 1.935 2.011 2.155 2.308 2.455 2.52 2.637 2.755 2.924 3.035 3.143 3.303 3.467 3.63 3.791 3.951 4.157 4.347 4.522 4.73 4.936 5.131 5.353 5.605 5.832 6.069 6.336 6.625 6.923 7.262 7.652 8.024 8.426 8.859 9.302 9.753 10.207 10.529 10.589 10.262 9.782 9.231 8.715 8.247 7.824 7.388 6.974 6.558 6.21 5.892 5.579 5.291 5.005 4.738 4.488 4.272 4.076 3.862 3.628 3.424 3.213 3.0 2.831 2.663 2.498 2.322 2.129 1.994 1.854 1.622 1.458 1.297 1.216 1.042 0.848 0.651 0.55 0.321 0.248 0.134 0.013 -0.246 -0.384 -0.546 -0.737 -0.942 -1.204 -1.57 -2.827 -3 ,17530 ,KEBNE ,17024451,Wed Dec 22 10:03:25 CET,Wed Dec 22 11:39:35 CET,0.0 0.47 0.647 0.789 0.921 1.042 1.156 1.266 1.494 1.6 1.697 1.737 1.947 2.028 2.182 2.324 2.462 2.53 2.651 2.774 2.954 3.073 3.189 3.35 3.51 3.655 3.788 3.917 4.09 4.269 4.443 4.652 4.846 5.029 5.244 5.495 5.735 5.979 6.236 6.526 6.839 7.187 7.556 7.9 8.279 8.68 9.142 9.588 10.009 10.341 10.484 10.17 9.631 9.061 8.499 7.946 7.429 6.948 6.525 6.085 5.701 5.348 5.011 4.69 4.389 4.114 3.827 3.572 3.347 3.108 2.865 2.661 2.434 2.199 2.023 1.849 1.665 1.469 1.254 1.094 0.93 0.691 0.522 0.342 0.251 0.057 -0.167 -0.399 -0.506 -0.742 -0.855 -0.982 -1.114 -1.422 -1.599 -1.781 -1.956 -2.148 -2.402 -2.759 -4.084 -4 ,11856 ,KEBNE ,17024452,Wed Dec 22 10:03:26 CET,Wed Dec 22 11:37:33 CET,0.0 0.994 1.156 1.287 1.425 1.563 1.685 1.787 1.968 2.05 2.141 2.192 2.401 2.482 2.645 2.782 2.91 2.978 3.109 3.234 3.41 3.532 3.651 3.827 4.012 4.178 4.331 4.48 4.669 4.851 5.026 5.236 5.452 5.663 5.888 6.133 6.37 6.631 6.926 7.223 7.531 7.886 8.257 8.603 8.991 9.408 9.864 10.298 10.71 11.06 11.239 10.975 10.497 9.993 9.471 8.921 8.413 7.962 7.566 7.158 6.801 6.466 6.13 5.812 5.509 5.227 4.935 4.682 4.459 4.228 3.989 3.793 3.582 3.339 3.147 2.959 2.774 2.58 2.375 2.232 2.081 1.845 1.685 1.523 1.44 1.27 1.074 0.864 0.76 0.525 0.412 0.281 0.158 -0.124 -0.299 -0.479 -0.683 -0.931 -1.236 -1.594 -2.778 -5 ,11129 ,KEBNE ,17024453,Wed Dec 22 10:03:25 CET,Wed Dec 22 11:37:45 CET,0.0 0.261 0.439 0.601 0.736 0.867 0.992 1.09 1.283 1.388 1.49 1.565 1.792 1.878 2.035 2.187 2.325 2.391 2.529 2.664 2.833 2.95 3.077 3.261 3.439 3.597 3.743 3.892 4.076 4.252 4.412 4.597 4.79 4.98 5.21 5.481 5.725 5.974 6.243 6.521 6.83 7.175 7.538 7.896 8.277 8.673 9.083 9.484 9.896 10.269 10.382 10.051 9.599 9.06 8.502 7.989 7.541 7.096 6.676 6.245 5.872 5.533 5.195 4.855 4.539 4.261 3.972 3.725 3.508 3.259 2.986 2.761 2.53 2.285 2.095 1.914 1.736 1.544 1.343 1.212 1.071 0.846 0.697 0.545 0.465 0.289 0.096 -0.114 -0.225 -0.468 -0.586 -0.715 -0.847 -1.14 -1.306 -1.488 -1.682 -1.9 -2.173 -2.56 -3.836 -6 ,9412 ,KEBNE ,17024454,Wed Dec 22 10:03:25 CET,Wed Dec 22 11:37:26 CET,0.0 0.235 0.389 0.528 0.642 0.747 0.846 0.948 1.146 1.247 1.342 1.386 1.589 1.655 1.793 1.93 2.059 2.119 2.238 2.346 2.507 2.622 2.73 2.887 3.038 3.189 3.338 3.467 3.636 3.805 3.945 4.127 4.306 4.462 4.662 4.91 5.158 5.432 5.705 5.968 6.233 6.533 6.91 7.268 7.639 8.04 8.47 8.886 9.29 9.596 9.583 9.184 8.664 8.076 7.552 7.08 6.616 6.166 5.751 5.314 4.955 4.637 4.313 4.009 3.7 3.417 3.149 2.893 2.672 2.467 2.262 2.089 1.894 1.69 1.538 1.373 1.198 1.015 0.825 0.68 0.526 0.302 0.144 -0.029 -0.121 -0.318 -0.519 -0.72 -0.828 -1.062 -1.127 -1.224 -1.336 -1.619 -1.777 -1.954 -2.15 -2.345 -2.573 -2.887 -3.991 -7 ,21308 ,KEBNE ,17024455,Wed Dec 22 10:03:25 CET,Wed Dec 22 11:37:31 CET,0.0 0.262 0.436 0.577 0.713 0.84 0.941 1.039 1.228 1.321 1.417 1.463 1.674 1.752 1.89 2.016 2.154 2.221 2.344 2.473 2.65 2.768 2.897 3.065 3.211 3.344 3.47 3.599 3.766 3.923 4.07 4.253 4.443 4.63 4.836 5.067 5.298 5.566 5.839 6.107 6.4 6.738 7.12 7.482 7.876 8.275 8.682 9.081 9.486 9.794 9.769 9.338 8.801 8.229 7.64 7.088 6.623 6.171 5.76 5.356 4.986 4.641 4.313 3.992 3.693 3.418 3.129 2.865 2.629 2.384 2.121 1.91 1.687 1.458 1.275 1.069 0.873 0.682 0.478 0.336 0.184 -0.062 -0.234 -0.421 -0.527 -0.742 -0.945 -1.155 -1.274 -1.524 -1.646 -1.782 -1.934 -2.282 -2.473 -2.678 -2.898 -3.146 -3.438 -3.818 -4.916 -8 ,27148 ,KEBNE ,17024456,Wed Dec 22 10:04:27 CET,Wed Dec 22 11:39:05 CET,0.0 0.643 0.848 0.997 1.142 1.256 1.367 1.481 1.69 1.787 1.88 1.918 2.128 2.207 2.357 2.506 2.657 2.723 2.845 2.971 3.158 3.281 3.405 3.579 3.73 3.871 4.016 4.156 4.336 4.51 4.677 4.88 5.076 5.264 5.477 5.719 5.949 6.192 6.469 6.763 7.04 7.347 7.707 8.056 8.461 8.889 9.314 9.751 10.186 10.571 10.768 10.494 9.977 9.461 8.946 8.415 7.912 7.43 7.04 6.644 6.27 5.944 5.619 5.296 5.004 4.728 4.428 4.154 3.921 3.688 3.448 3.231 3.007 2.782 2.593 2.402 2.212 2.016 1.81 1.661 1.509 1.267 1.088 0.901 0.808 0.631 0.437 0.214 0.101 -0.142 -0.279 -0.424 -0.569 -0.901 -1.102 -1.31 -1.542 -1.863 -2.267 -2.748 -3.938 -9 ,20332 ,KEBNE ,17024457,Wed Dec 22 10:04:27 CET,Wed Dec 22 11:39:21 CET,0.0 0.239 0.411 0.554 0.672 0.783 0.879 0.976 1.175 1.262 1.347 1.38 1.583 1.657 1.813 1.956 2.084 2.145 2.263 2.384 2.565 2.678 2.781 2.923 3.092 3.258 3.408 3.549 3.716 3.872 4.029 4.234 4.44 4.638 4.85 5.077 5.302 5.554 5.832 6.137 6.435 6.745 7.132 7.505 7.892 8.293 8.706 9.117 9.526 9.92 10.054 9.711 9.178 8.585 8.052 7.547 7.063 6.57 6.14 5.701 5.301 4.961 4.645 4.344 4.058 3.799 3.529 3.284 3.077 2.86 2.628 2.432 2.219 1.993 1.831 1.665 1.49 1.307 1.118 0.995 0.874 0.666 0.504 0.34 0.258 0.071 -0.13 -0.347 -0.465 -0.699 -0.796 -0.925 -1.058 -1.332 -1.498 -1.675 -1.844 -2.062 -2.335 -2.724 -3.992 -10 ,17035 ,KEBNE ,17024458,Wed Dec 22 10:04:27 CET,Wed Dec 22 11:39:39 CET,0.0 0.704 0.918 1.059 1.202 1.337 1.428 1.529 1.743 1.835 1.925 1.945 2.145 2.227 2.376 2.509 2.641 2.703 2.832 2.956 3.141 3.255 3.359 3.511 3.664 3.832 4.001 4.17 4.384 4.578 4.751 4.969 5.187 5.392 5.615 5.869 6.116 6.349 6.599 6.882 7.174 7.502 7.883 8.251 8.637 9.052 9.515 9.971 10.402 10.696 10.84 10.635 10.165 9.595 9.011 8.484 8.018 7.567 7.18 6.76 6.348 5.982 5.631 5.309 5.014 4.74 4.456 4.191 3.951 3.71 3.456 3.247 3.033 2.796 2.617 2.429 2.231 2.024 1.79 1.638 1.49 1.228 1.043 0.862 0.764 0.559 0.362 0.149 0.037 -0.199 -0.28 -0.397 -0.533 -0.84 -1.009 -1.199 -1.415 -1.647 -1.903 -2.231 -3.555 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index 4fb665ba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28365 ,TETRA ,17526020,Thu Nov 25 03:10:44 CET,Thu Nov 25 05:01:12 CET,0.0 0.328 0.551 0.711 0.857 1.0 1.139 1.26 1.485 1.597 1.693 1.749 1.975 2.075 2.264 2.44 2.618 2.703 2.859 3.009 3.235 3.38 3.524 3.738 3.941 4.148 4.354 4.558 4.833 5.09 5.332 5.635 5.93 6.214 6.559 6.96 7.338 7.748 8.189 8.651 9.134 9.697 10.359 11.02 11.795 12.648 13.602 14.674 15.91 17.315 18.864 19.934 20.398 20.55 20.6 20.603 20.534 20.422 20.309 20.173 20.026 19.877 19.707 19.542 19.399 19.256 19.103 18.961 18.836 18.711 18.575 18.458 18.34 18.219 18.124 18.031 17.929 17.806 17.678 17.597 17.51 17.376 17.291 17.201 17.153 17.049 16.937 16.807 16.745 16.579 16.572 16.502 16.428 16.289 16.21 16.117 16.018 15.905 15.796 15.676 15.462 -2 ,8575 ,TETRA ,17526021,Thu Nov 25 03:12:42 CET,Thu Nov 25 05:01:33 CET,0.0 0.613 0.809 0.986 1.155 1.302 1.442 1.571 1.804 1.909 2.018 2.094 2.316 2.418 2.635 2.841 3.033 3.13 3.321 3.504 3.771 3.938 4.095 4.336 4.582 4.813 5.031 5.244 5.515 5.775 6.033 6.344 6.649 6.932 7.249 7.629 7.994 8.387 8.826 9.329 9.87 10.439 11.097 11.731 12.472 13.33 14.321 15.445 16.667 18.027 19.55 20.619 21.099 21.294 21.338 21.299 21.224 21.115 20.982 20.815 20.663 20.517 20.361 20.223 20.085 19.934 19.783 19.641 19.51 19.365 19.217 19.105 18.99 18.866 18.758 18.642 18.525 18.407 18.282 18.192 18.094 17.938 17.834 17.725 17.67 17.548 17.4 17.24 17.161 16.972 16.912 16.832 16.749 16.568 16.469 16.375 16.283 16.181 16.085 15.992 15.784 -3 ,18758 ,TETRA ,17526023,Thu Nov 25 03:12:41 CET,Thu Nov 25 04:52:03 CET,0.0 0.35 0.55 0.724 0.878 1.021 1.154 1.278 1.51 1.619 1.719 1.802 2.041 2.139 2.324 2.508 2.678 2.761 2.927 3.086 3.314 3.456 3.605 3.828 4.031 4.234 4.437 4.63 4.882 5.136 5.395 5.704 5.991 6.284 6.633 7.005 7.354 7.75 8.189 8.661 9.168 9.756 10.403 11.036 11.819 12.674 13.613 14.676 15.896 17.259 18.868 20.075 20.625 20.843 20.916 20.919 20.854 20.751 20.634 20.482 20.325 20.161 20.004 19.872 19.746 19.622 19.48 19.347 19.237 19.118 18.997 18.902 18.81 18.723 18.649 18.569 18.485 18.384 18.283 18.22 18.147 18.028 17.95 17.869 17.824 17.73 17.636 17.542 17.492 17.327 17.332 17.271 17.205 17.067 16.994 16.911 16.828 16.741 16.619 16.438 16.134 -4 ,27408 ,TETRA ,17526025,Thu Nov 25 03:13:41 CET,Thu Nov 25 04:59:39 CET,0.0 0.952 1.127 1.31 1.472 1.611 1.741 1.864 2.082 2.191 2.302 2.393 2.629 2.726 2.899 3.06 3.236 3.325 3.491 3.659 3.909 4.074 4.236 4.469 4.695 4.911 5.118 5.32 5.585 5.839 6.089 6.406 6.705 6.992 7.334 7.718 8.094 8.503 8.939 9.4 9.882 10.429 11.062 11.722 12.484 13.321 14.291 15.323 16.522 17.915 19.456 20.585 21.131 21.301 21.335 21.312 21.234 21.127 21.019 20.902 20.759 20.605 20.45 20.296 20.147 20.009 19.877 19.763 19.654 19.523 19.381 19.263 19.132 18.999 18.904 18.798 18.677 18.555 18.43 18.337 18.243 18.095 17.983 17.869 17.816 17.717 17.631 17.546 17.495 17.325 17.302 17.236 17.178 17.039 16.958 16.875 16.792 16.701 16.586 16.456 16.147 -5 ,9081 ,TETRA ,17526026,Thu Nov 25 03:13:41 CET,Thu Nov 25 04:53:22 CET,0.0 0.344 0.565 0.733 0.873 0.998 1.126 1.244 1.467 1.576 1.679 1.761 2.004 2.107 2.288 2.469 2.65 2.744 2.933 3.113 3.371 3.534 3.691 3.913 4.13 4.35 4.571 4.783 5.06 5.338 5.606 5.937 6.253 6.54 6.861 7.231 7.584 7.968 8.405 8.886 9.381 9.941 10.593 11.236 11.986 12.851 13.857 14.943 16.14 17.428 18.879 19.887 20.32 20.498 20.528 20.485 20.411 20.33 20.216 20.06 19.913 19.768 19.616 19.465 19.315 19.179 19.037 18.904 18.784 18.664 18.538 18.427 18.324 18.214 18.122 18.029 17.941 17.848 17.746 17.68 17.613 17.508 17.436 17.363 17.325 17.244 17.146 17.033 16.978 16.816 16.817 16.751 16.676 16.507 16.412 16.316 16.223 16.127 16.006 15.869 15.628 -6 ,5153 ,TETRA ,17526028,Thu Nov 25 03:14:40 CET,Thu Nov 25 05:06:38 CET,0.0 0.32 0.508 0.695 0.857 0.999 1.127 1.248 1.467 1.577 1.684 1.766 1.997 2.09 2.281 2.468 2.636 2.711 2.862 3.015 3.236 3.38 3.522 3.743 3.959 4.153 4.345 4.533 4.773 5.006 5.236 5.517 5.792 6.079 6.425 6.812 7.186 7.593 8.046 8.534 9.031 9.582 10.228 10.869 11.587 12.388 13.311 14.356 15.606 17.042 18.626 19.65 20.069 20.235 20.312 20.302 20.226 20.139 20.031 19.886 19.761 19.634 19.491 19.34 19.183 19.044 18.907 18.775 18.645 18.507 18.372 18.252 18.129 18.009 17.902 17.779 17.66 17.536 17.409 17.319 17.23 17.096 16.998 16.887 16.828 16.703 16.579 16.464 16.407 16.245 16.232 16.162 16.096 15.957 15.873 15.772 15.67 15.565 15.45 15.293 15.005 -7 ,869 ,TETRA ,17526030,Thu Nov 25 03:14:42 CET,Thu Nov 25 05:05:29 CET,0.0 0.574 0.775 0.955 1.106 1.243 1.362 1.481 1.705 1.807 1.914 2.008 2.245 2.34 2.52 2.707 2.883 2.963 3.127 3.285 3.511 3.66 3.805 4.012 4.208 4.405 4.604 4.794 5.041 5.289 5.532 5.833 6.136 6.435 6.773 7.145 7.52 7.942 8.397 8.864 9.33 9.866 10.507 11.146 11.915 12.799 13.759 14.798 15.983 17.344 18.869 19.885 20.332 20.503 20.54 20.498 20.418 20.305 20.181 20.04 19.896 19.747 19.597 19.454 19.31 19.166 19.0 18.862 18.751 18.626 18.484 18.357 18.222 18.085 17.989 17.891 17.785 17.678 17.577 17.511 17.443 17.323 17.232 17.145 17.1 17.015 16.934 16.837 16.787 16.621 16.616 16.558 16.494 16.35 16.271 16.184 16.078 15.957 15.832 15.667 15.344 -8 ,12059 ,TETRA ,17526031,Thu Nov 25 03:14:42 CET,Thu Nov 25 05:05:40 CET,0.0 0.39 0.611 0.806 0.955 1.096 1.243 1.372 1.61 1.723 1.827 1.882 2.103 2.194 2.37 2.542 2.712 2.802 2.963 3.108 3.327 3.465 3.598 3.804 4.012 4.21 4.393 4.571 4.812 5.047 5.291 5.593 5.874 6.135 6.43 6.778 7.133 7.524 7.945 8.4 8.893 9.471 10.134 10.79 11.553 12.387 13.344 14.4 15.609 16.975 18.439 19.419 19.868 20.103 20.191 20.169 20.093 19.984 19.87 19.723 19.559 19.409 19.263 19.117 18.971 18.831 18.686 18.549 18.428 18.303 18.171 18.053 17.924 17.795 17.687 17.567 17.448 17.319 17.187 17.104 17.022 16.897 16.812 16.722 16.674 16.578 16.478 16.378 16.326 16.161 16.152 16.09 16.028 15.892 15.819 15.738 15.652 15.54 15.408 15.26 14.914 -9 ,25223 ,TETRA ,17526033,Thu Nov 25 03:15:40 CET,Thu Nov 25 05:07:11 CET,0.0 0.492 0.712 0.876 1.015 1.157 1.293 1.417 1.646 1.75 1.859 1.941 2.17 2.263 2.445 2.624 2.792 2.871 3.031 3.195 3.432 3.582 3.728 3.95 4.162 4.353 4.54 4.735 4.989 5.225 5.46 5.761 6.064 6.359 6.694 7.054 7.408 7.818 8.27 8.749 9.242 9.786 10.401 11.008 11.724 12.567 13.567 14.664 15.888 17.262 18.808 19.87 20.292 20.443 20.488 20.45 20.353 20.234 20.099 19.94 19.802 19.677 19.535 19.38 19.243 19.114 18.971 18.842 18.73 18.61 18.479 18.375 18.253 18.118 18.017 17.909 17.794 17.674 17.551 17.468 17.379 17.241 17.154 17.066 17.019 16.921 16.812 16.701 16.651 16.483 16.463 16.401 16.338 16.199 16.12 16.041 15.969 15.859 15.727 15.609 15.418 -10 ,10308 ,TETRA ,17526035,Thu Nov 25 02:18:42 CET,Thu Nov 25 04:09:18 CET,0.0 0.515 0.758 0.955 1.126 1.269 1.399 1.514 1.737 1.853 1.957 2.013 2.236 2.332 2.509 2.676 2.838 2.918 3.077 3.229 3.439 3.577 3.721 3.946 4.166 4.371 4.576 4.77 5.018 5.279 5.534 5.835 6.124 6.394 6.724 7.102 7.456 7.854 8.291 8.752 9.242 9.789 10.418 11.054 11.803 12.666 13.647 14.695 15.917 17.334 18.93 20.015 20.479 20.694 20.737 20.689 20.609 20.482 20.369 20.252 20.131 20.007 19.845 19.662 19.511 19.382 19.231 19.095 18.971 18.833 18.693 18.57 18.44 18.319 18.229 18.139 18.043 17.944 17.846 17.778 17.708 17.587 17.495 17.394 17.342 17.244 17.14 17.038 16.982 16.815 16.81 16.742 16.677 16.546 16.459 16.378 16.299 16.188 16.074 15.949 15.79 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt deleted file mode 100644 index 821a9d2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9085 ,TETRA ,17526038,Thu Nov 25 02:19:38 CET,Thu Nov 25 04:10:08 CET,0.0 0.435 0.628 0.826 1.013 1.18 1.328 1.465 1.711 1.827 1.936 2.006 2.234 2.329 2.485 2.63 2.764 2.832 2.97 3.103 3.276 3.377 3.48 3.636 3.781 3.912 4.039 4.161 4.316 4.473 4.616 4.786 4.954 5.109 5.278 5.479 5.672 5.865 6.057 6.241 6.452 6.67 6.876 7.082 7.292 7.469 7.613 7.657 7.502 7.108 6.113 4.55 3.199 1.992 0.889 -0.104 -0.924 -1.655 -2.287 -2.909 -3.463 -3.962 -4.424 -4.85 -5.252 -5.62 -5.997 -6.338 -6.631 -6.924 -7.236 -7.495 -7.753 -8.015 -8.218 -8.423 -8.639 -8.868 -9.101 -9.273 -9.45 -9.703 -9.875 -10.057 -10.152 -10.35 -10.561 -10.776 -10.884 -11.14 -11.241 -11.362 -11.477 -11.703 -11.828 -11.97 -12.109 -12.236 -12.406 -12.613 -13.078 -2 ,19865 ,TETRA ,17526040,Thu Nov 25 02:19:39 CET,Thu Nov 25 04:09:48 CET,0.0 0.306 0.489 0.625 0.746 0.843 0.93 1.017 1.179 1.256 1.333 1.363 1.562 1.635 1.777 1.893 1.989 2.044 2.155 2.251 2.395 2.485 2.568 2.688 2.801 2.906 3.025 3.137 3.266 3.392 3.51 3.654 3.789 3.908 4.049 4.206 4.348 4.506 4.659 4.819 5.001 5.201 5.409 5.589 5.759 5.915 6.039 6.108 6.103 5.739 4.692 3.131 1.709 0.459 -0.606 -1.553 -2.407 -3.168 -3.825 -4.497 -5.053 -5.526 -5.983 -6.422 -6.833 -7.206 -7.587 -7.929 -8.227 -8.526 -8.84 -9.097 -9.356 -9.639 -9.852 -10.057 -10.266 -10.485 -10.725 -10.889 -11.043 -11.277 -11.436 -11.601 -11.684 -11.851 -12.021 -12.188 -12.282 -12.524 -12.569 -12.664 -12.766 -12.995 -13.115 -13.232 -13.356 -13.497 -13.652 -13.859 -14.31 -3 ,19220 ,TETRA ,17526042,Thu Nov 25 02:19:38 CET,Thu Nov 25 04:10:03 CET,0.0 0.445 0.599 0.727 0.859 0.979 1.072 1.145 1.295 1.374 1.443 1.44 1.64 1.713 1.847 1.968 2.073 2.125 2.238 2.338 2.476 2.566 2.651 2.785 2.92 3.043 3.161 3.271 3.39 3.504 3.62 3.756 3.885 4.008 4.145 4.302 4.458 4.615 4.767 4.924 5.088 5.276 5.492 5.692 5.905 6.108 6.267 6.316 6.174 5.747 4.781 3.24 1.861 0.685 -0.362 -1.301 -2.119 -2.859 -3.499 -4.145 -4.696 -5.19 -5.657 -6.101 -6.521 -6.881 -7.247 -7.583 -7.869 -8.157 -8.467 -8.729 -8.993 -9.259 -9.472 -9.705 -9.931 -10.143 -10.367 -10.528 -10.692 -10.952 -11.136 -11.318 -11.406 -11.593 -11.781 -11.964 -12.057 -12.295 -12.346 -12.441 -12.544 -12.737 -12.843 -12.965 -13.094 -13.258 -13.451 -13.634 -13.892 -4 ,1272 ,TETRA ,17526044,Thu Nov 25 02:20:40 CET,Thu Nov 25 04:12:42 CET,0.0 0.454 0.646 0.808 0.934 1.038 1.146 1.261 1.501 1.625 1.73 1.774 1.993 2.083 2.249 2.408 2.551 2.62 2.752 2.867 3.026 3.133 3.237 3.373 3.517 3.664 3.796 3.929 4.096 4.251 4.397 4.571 4.731 4.875 5.044 5.231 5.401 5.579 5.764 5.963 6.165 6.366 6.574 6.741 6.895 7.027 7.147 7.233 7.156 6.775 5.743 4.219 2.819 1.539 0.454 -0.503 -1.33 -2.066 -2.703 -3.359 -3.93 -4.424 -4.891 -5.34 -5.761 -6.147 -6.527 -6.846 -7.129 -7.419 -7.719 -7.967 -8.227 -8.5 -8.702 -8.907 -9.135 -9.371 -9.61 -9.774 -9.94 -10.196 -10.367 -10.539 -10.619 -10.782 -10.96 -11.138 -11.231 -11.464 -11.506 -11.61 -11.72 -11.934 -12.042 -12.165 -12.301 -12.451 -12.599 -12.763 -13.157 -5 ,1713 ,TETRA ,17526046,Thu Nov 25 02:20:40 CET,Thu Nov 25 04:10:59 CET,0.0 0.174 0.325 0.464 0.577 0.67 0.762 0.855 1.029 1.102 1.171 1.176 1.363 1.428 1.553 1.662 1.771 1.821 1.917 2.009 2.159 2.255 2.337 2.453 2.561 2.675 2.792 2.89 3.023 3.168 3.303 3.474 3.644 3.807 3.978 4.156 4.33 4.522 4.714 4.898 5.111 5.354 5.557 5.75 5.944 6.064 6.163 6.201 6.107 5.707 4.723 3.231 1.861 0.663 -0.433 -1.412 -2.246 -3.005 -3.668 -4.328 -4.886 -5.369 -5.819 -6.257 -6.662 -7.019 -7.392 -7.737 -8.029 -8.315 -8.617 -8.857 -9.103 -9.384 -9.597 -9.809 -10.01 -10.213 -10.432 -10.572 -10.716 -10.943 -11.103 -11.265 -11.348 -11.531 -11.715 -11.893 -11.984 -12.228 -12.302 -12.406 -12.511 -12.722 -12.825 -12.944 -13.072 -13.203 -13.342 -13.51 -13.777 -6 ,4459 ,TETRA ,17526048,Thu Nov 25 02:20:40 CET,Thu Nov 25 04:11:42 CET,0.0 0.39 0.567 0.695 0.81 0.916 1.023 1.123 1.286 1.366 1.434 1.435 1.63 1.694 1.814 1.936 2.06 2.114 2.199 2.285 2.432 2.524 2.611 2.745 2.866 2.98 3.091 3.199 3.34 3.481 3.628 3.795 3.949 4.098 4.26 4.442 4.62 4.801 4.989 5.192 5.402 5.622 5.861 6.074 6.282 6.47 6.619 6.675 6.558 6.149 5.167 3.688 2.328 1.128 0.066 -0.883 -1.718 -2.491 -3.165 -3.83 -4.39 -4.899 -5.379 -5.822 -6.232 -6.605 -6.988 -7.312 -7.588 -7.866 -8.141 -8.361 -8.587 -8.824 -9.014 -9.208 -9.403 -9.613 -9.832 -9.973 -10.115 -10.335 -10.487 -10.642 -10.72 -10.877 -11.042 -11.215 -11.31 -11.553 -11.62 -11.73 -11.84 -12.068 -12.188 -12.312 -12.442 -12.595 -12.758 -12.958 -13.446 -7 ,21069 ,TETRA ,17526050,Thu Nov 25 02:20:41 CET,Thu Nov 25 04:11:29 CET,0.0 0.461 0.618 0.746 0.861 0.965 1.046 1.131 1.306 1.389 1.467 1.48 1.679 1.751 1.871 1.986 2.099 2.154 2.267 2.372 2.524 2.628 2.729 2.879 3.021 3.153 3.282 3.403 3.545 3.694 3.848 4.018 4.18 4.343 4.523 4.721 4.902 5.087 5.277 5.472 5.672 5.868 6.095 6.32 6.527 6.696 6.841 6.929 6.867 6.454 5.426 3.942 2.577 1.393 0.36 -0.587 -1.449 -2.221 -2.86 -3.513 -4.077 -4.571 -5.048 -5.487 -5.892 -6.261 -6.64 -6.978 -7.266 -7.563 -7.868 -8.115 -8.369 -8.637 -8.844 -9.057 -9.279 -9.503 -9.739 -9.904 -10.065 -10.307 -10.479 -10.661 -10.758 -10.955 -11.154 -11.374 -11.481 -11.728 -11.81 -11.914 -12.013 -12.221 -12.342 -12.467 -12.599 -12.756 -12.947 -13.208 -13.927 -8 ,32277 ,TETRA ,17526052,Thu Nov 25 02:20:41 CET,Thu Nov 25 04:10:41 CET,0.0 0.355 0.518 0.656 0.768 0.873 0.977 1.065 1.219 1.293 1.365 1.364 1.557 1.622 1.745 1.875 2.0 2.054 2.164 2.272 2.418 2.508 2.595 2.718 2.83 2.941 3.06 3.175 3.33 3.492 3.647 3.831 3.994 4.131 4.299 4.491 4.666 4.851 5.027 5.194 5.39 5.618 5.846 6.039 6.221 6.397 6.549 6.619 6.557 6.103 4.983 3.569 2.246 1.032 -0.058 -1.013 -1.814 -2.575 -3.222 -3.86 -4.419 -4.911 -5.373 -5.81 -6.225 -6.607 -7.01 -7.355 -7.641 -7.929 -8.233 -8.492 -8.751 -9.023 -9.229 -9.442 -9.674 -9.907 -10.134 -10.283 -10.436 -10.669 -10.821 -10.979 -11.064 -11.238 -11.4 -11.572 -11.665 -11.901 -11.965 -12.066 -12.168 -12.409 -12.542 -12.669 -12.797 -12.923 -13.062 -13.243 -13.584 -9 ,9236 ,TETRA ,17526054,Thu Nov 25 02:20:41 CET,Thu Nov 25 04:11:14 CET,0.0 0.416 0.621 0.784 0.931 1.05 1.143 1.228 1.378 1.445 1.524 1.545 1.747 1.814 1.93 2.047 2.158 2.208 2.306 2.402 2.549 2.643 2.726 2.843 2.956 3.069 3.178 3.287 3.436 3.579 3.713 3.872 4.033 4.194 4.367 4.544 4.715 4.891 5.073 5.272 5.473 5.68 5.883 6.043 6.208 6.38 6.501 6.537 6.43 6.04 5.077 3.575 2.166 0.943 -0.099 -1.052 -1.898 -2.633 -3.288 -3.959 -4.514 -5.012 -5.5 -5.966 -6.387 -6.741 -7.108 -7.453 -7.744 -8.033 -8.344 -8.607 -8.884 -9.161 -9.35 -9.54 -9.739 -9.949 -10.163 -10.304 -10.448 -10.669 -10.825 -10.982 -11.064 -11.242 -11.424 -11.61 -11.704 -11.939 -11.987 -12.086 -12.19 -12.411 -12.53 -12.658 -12.774 -12.895 -13.041 -13.232 -13.596 -10 ,27488 ,TETRA ,17526056,Thu Nov 25 02:20:42 CET,Thu Nov 25 04:10:19 CET,0.0 0.337 0.522 0.662 0.778 0.872 0.975 1.088 1.287 1.367 1.431 1.418 1.607 1.671 1.8 1.916 2.03 2.079 2.178 2.282 2.417 2.497 2.581 2.707 2.833 2.975 3.122 3.254 3.41 3.553 3.679 3.839 3.991 4.13 4.302 4.498 4.683 4.884 5.092 5.302 5.522 5.76 5.977 6.173 6.391 6.581 6.721 6.78 6.688 6.319 5.378 3.969 2.671 1.461 0.406 -0.547 -1.395 -2.14 -2.756 -3.383 -3.933 -4.41 -4.848 -5.262 -5.657 -6.02 -6.393 -6.729 -7.024 -7.311 -7.6 -7.839 -8.075 -8.325 -8.527 -8.731 -8.923 -9.123 -9.338 -9.477 -9.615 -9.833 -9.978 -10.131 -10.214 -10.38 -10.562 -10.751 -10.843 -11.077 -11.135 -11.248 -11.353 -11.568 -11.7 -11.834 -11.975 -12.122 -12.27 -12.448 -12.778 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt deleted file mode 100644 index 7b2a28f4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4j_CAT-4l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30941 ,TETRA ,17526058,Thu Nov 25 02:21:41 CET,Thu Nov 25 04:13:16 CET,0.0 0.702 0.997 1.227 1.432 1.621 1.803 1.973 2.303 2.474 2.645 2.837 3.125 3.281 3.575 3.855 4.128 4.264 4.54 4.801 5.189 5.455 5.719 6.107 6.484 6.856 7.221 7.585 8.066 8.536 9.007 9.603 10.18 10.751 11.439 12.24 13.024 13.883 14.84 15.898 17.054 18.403 20.014 21.719 23.781 26.135 28.986 32.412 36.628 41.911 49.004 55.544 59.789 62.731 64.837 66.458 67.73 68.774 69.543 70.222 70.751 71.162 71.548 71.896 72.175 72.402 72.63 72.816 72.954 73.094 73.233 73.338 73.447 73.546 73.612 73.663 73.706 73.749 73.784 73.802 73.817 73.848 73.863 73.861 73.856 73.86 73.864 73.851 73.846 73.789 73.82 73.802 73.783 73.732 73.696 73.653 73.579 73.466 73.357 73.241 73.044 -2 ,4216 ,TETRA ,17526059,Thu Nov 25 02:21:41 CET,Thu Nov 25 04:11:28 CET,0.0 0.346 0.614 0.835 1.048 1.242 1.414 1.584 1.914 2.078 2.237 2.415 2.695 2.849 3.155 3.447 3.742 3.884 4.164 4.446 4.855 5.121 5.38 5.754 6.125 6.503 6.877 7.242 7.72 8.204 8.689 9.268 9.828 10.389 11.058 11.835 12.614 13.5 14.476 15.537 16.688 18.036 19.65 21.351 23.41 25.75 28.587 31.963 36.155 41.513 48.654 55.172 59.389 62.4 64.615 66.326 67.6 68.614 69.394 70.07 70.596 71.018 71.37 71.675 71.953 72.209 72.465 72.667 72.815 72.959 73.105 73.214 73.308 73.403 73.475 73.524 73.573 73.624 73.661 73.68 73.695 73.719 73.73 73.746 73.752 73.748 73.733 73.712 73.699 73.631 73.658 73.631 73.591 73.506 73.454 73.393 73.35 73.303 73.202 73.061 72.816 -3 ,18591 ,TETRA ,17526061,Thu Nov 25 02:21:42 CET,Thu Nov 25 04:11:59 CET,0.0 0.366 0.62 0.845 1.046 1.232 1.401 1.582 1.947 2.112 2.267 2.45 2.736 2.894 3.211 3.509 3.795 3.934 4.215 4.494 4.897 5.159 5.42 5.801 6.171 6.547 6.913 7.269 7.74 8.203 8.673 9.26 9.834 10.398 11.07 11.849 12.61 13.484 14.477 15.566 16.732 18.095 19.747 21.445 23.497 25.903 28.782 32.189 36.415 41.72 48.735 55.242 59.566 62.631 64.79 66.447 67.757 68.772 69.547 70.243 70.768 71.207 71.595 71.927 72.199 72.417 72.597 72.74 72.865 72.978 73.085 73.162 73.231 73.296 73.34 73.369 73.384 73.394 73.387 73.371 73.356 73.359 73.371 73.38 73.378 73.364 73.361 73.353 73.336 73.247 73.247 73.226 73.203 73.132 73.086 73.037 72.97 72.893 72.786 72.633 72.185 -4 ,25735 ,TETRA ,17526062,Thu Nov 25 02:21:42 CET,Thu Nov 25 04:12:45 CET,0.0 0.32 0.558 0.754 0.948 1.129 1.313 1.488 1.813 1.976 2.138 2.333 2.624 2.776 3.07 3.363 3.647 3.786 4.071 4.359 4.794 5.074 5.344 5.751 6.169 6.579 6.974 7.359 7.865 8.375 8.868 9.454 10.028 10.603 11.3 12.12 12.921 13.793 14.753 15.83 16.994 18.339 19.979 21.662 23.69 26.048 28.865 32.223 36.447 41.767 48.755 55.26 59.537 62.523 64.719 66.421 67.752 68.817 69.6 70.31 70.865 71.291 71.671 72.005 72.272 72.496 72.701 72.859 72.99 73.102 73.201 73.292 73.372 73.419 73.449 73.481 73.505 73.513 73.521 73.535 73.557 73.586 73.595 73.608 73.614 73.609 73.588 73.566 73.555 73.482 73.51 73.499 73.478 73.406 73.365 73.331 73.302 73.242 73.148 73.035 72.737 -5 ,30039 ,TETRA ,17526064,Thu Nov 25 02:21:41 CET,Thu Nov 25 04:12:02 CET,0.0 0.454 0.717 0.941 1.153 1.338 1.518 1.694 2.029 2.19 2.345 2.532 2.812 2.96 3.252 3.529 3.794 3.93 4.195 4.449 4.832 5.091 5.344 5.707 6.073 6.439 6.788 7.135 7.612 8.088 8.557 9.139 9.718 10.29 10.981 11.793 12.593 13.488 14.461 15.53 16.696 18.019 19.59 21.256 23.314 25.674 28.495 31.862 36.063 41.39 48.443 55.02 59.415 62.489 64.686 66.427 67.792 68.889 69.683 70.379 70.921 71.342 71.698 72.021 72.304 72.531 72.744 72.911 73.049 73.181 73.303 73.383 73.445 73.503 73.548 73.6 73.653 73.7 73.74 73.757 73.776 73.789 73.791 73.801 73.804 73.793 73.776 73.759 73.749 73.678 73.696 73.671 73.631 73.57 73.536 73.48 73.424 73.363 73.27 73.09 72.741 -6 ,22312 ,TETRA ,17526066,Thu Nov 25 02:21:41 CET,Thu Nov 25 04:12:07 CET,0.0 0.385 0.675 0.898 1.107 1.304 1.484 1.67 2.029 2.191 2.348 2.53 2.813 2.97 3.272 3.554 3.829 3.961 4.227 4.496 4.899 5.163 5.424 5.817 6.209 6.596 6.974 7.339 7.813 8.278 8.734 9.31 9.877 10.442 11.132 11.924 12.714 13.605 14.582 15.674 16.871 18.249 19.904 21.604 23.658 26.04 28.893 32.309 36.516 41.85 48.917 55.417 59.714 62.705 64.873 66.514 67.765 68.776 69.565 70.256 70.773 71.22 71.618 71.953 72.23 72.457 72.683 72.865 72.998 73.118 73.224 73.296 73.366 73.428 73.469 73.507 73.527 73.544 73.559 73.567 73.57 73.547 73.53 73.511 73.498 73.484 73.469 73.431 73.412 73.345 73.353 73.316 73.278 73.205 73.165 73.118 73.066 72.999 72.917 72.8 72.415 -7 ,18365 ,TETRA ,17526068,Thu Nov 25 02:22:41 CET,Thu Nov 25 04:15:24 CET,0.0 0.482 0.715 0.958 1.171 1.369 1.561 1.732 2.069 2.236 2.401 2.593 2.87 3.014 3.307 3.588 3.853 3.98 4.248 4.517 4.898 5.151 5.397 5.747 6.092 6.445 6.796 7.142 7.608 8.061 8.499 9.054 9.6 10.122 10.745 11.474 12.185 12.979 13.87 14.857 15.93 17.166 18.671 20.276 22.23 24.547 27.397 30.817 35.044 40.306 47.384 53.963 58.285 61.36 63.582 65.282 66.589 67.622 68.419 69.179 69.757 70.182 70.561 70.887 71.151 71.384 71.597 71.755 71.89 72.022 72.121 72.179 72.247 72.317 72.366 72.396 72.414 72.44 72.459 72.462 72.459 72.455 72.435 72.397 72.379 72.341 72.281 72.219 72.187 72.096 72.074 72.028 71.968 71.814 71.726 71.643 71.544 71.432 71.285 71.07 70.65 -8 ,11678 ,TETRA ,17526070,Thu Nov 25 02:22:41 CET,Thu Nov 25 04:15:02 CET,0.0 0.347 0.575 0.782 0.985 1.193 1.398 1.584 1.899 2.053 2.209 2.374 2.647 2.787 3.072 3.356 3.629 3.759 4.012 4.264 4.637 4.887 5.132 5.477 5.818 6.166 6.521 6.87 7.321 7.766 8.203 8.741 9.272 9.8 10.444 11.184 11.913 12.743 13.66 14.671 15.762 17.053 18.658 20.339 22.384 24.774 27.633 31.043 35.312 40.675 47.812 54.39 58.72 61.803 63.988 65.664 66.99 68.047 68.848 69.568 70.129 70.573 70.941 71.257 71.519 71.728 71.926 72.084 72.214 72.343 72.463 72.551 72.627 72.691 72.737 72.773 72.792 72.807 72.825 72.837 72.847 72.863 72.879 72.891 72.891 72.89 72.884 72.865 72.841 72.759 72.781 72.758 72.727 72.637 72.587 72.547 72.481 72.385 72.276 72.147 71.668 -9 ,21142 ,TETRA ,17526072,Thu Nov 25 02:22:41 CET,Thu Nov 25 04:13:53 CET,0.0 0.425 0.692 0.937 1.122 1.312 1.511 1.717 2.103 2.273 2.433 2.621 2.907 3.065 3.382 3.681 3.965 4.104 4.382 4.655 5.061 5.332 5.6 5.99 6.387 6.777 7.144 7.503 7.985 8.465 8.942 9.533 10.122 10.703 11.397 12.213 13.003 13.888 14.87 15.938 17.096 18.45 20.109 21.82 23.861 26.252 29.103 32.457 36.665 42.031 49.087 55.576 59.865 62.909 65.139 66.818 68.098 69.137 69.894 70.561 71.096 71.53 71.924 72.265 72.527 72.736 72.939 73.102 73.225 73.327 73.413 73.475 73.527 73.571 73.608 73.65 73.698 73.752 73.791 73.815 73.841 73.863 73.865 73.863 73.867 73.87 73.855 73.835 73.826 73.762 73.781 73.745 73.717 73.663 73.61 73.547 73.485 73.406 73.308 73.196 73.025 -10 ,20896 ,TETRA ,17526074,Thu Nov 25 02:22:41 CET,Thu Nov 25 04:13:32 CET,0.0 0.521 0.751 0.977 1.185 1.378 1.546 1.71 2.033 2.186 2.337 2.515 2.794 2.939 3.23 3.526 3.818 3.958 4.225 4.497 4.904 5.158 5.408 5.775 6.13 6.486 6.837 7.19 7.654 8.1 8.542 9.1 9.671 10.226 10.872 11.625 12.373 13.212 14.174 15.245 16.385 17.706 19.317 20.998 23.013 25.394 28.301 31.75 35.986 41.406 48.594 55.107 59.26 62.201 64.416 66.114 67.429 68.455 69.228 69.96 70.54 71.004 71.383 71.703 71.978 72.199 72.412 72.584 72.716 72.841 72.956 73.03 73.097 73.161 73.204 73.239 73.262 73.289 73.308 73.308 73.301 73.284 73.273 73.268 73.268 73.265 73.252 73.228 73.21 73.13 73.156 73.149 73.132 73.066 73.021 72.965 72.915 72.85 72.745 72.593 72.25 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt deleted file mode 100644 index edcedbe4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4k_CAT-4a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29914 ,TETRA ,17526075,Thu Nov 25 02:22:42 CET,Thu Nov 25 04:13:37 CET,0.0 0.383 0.581 0.742 0.916 1.084 1.242 1.402 1.683 1.806 1.923 2.011 2.27 2.386 2.601 2.798 2.992 3.086 3.262 3.441 3.711 3.883 4.052 4.288 4.518 4.75 4.991 5.237 5.552 5.868 6.179 6.555 6.925 7.283 7.702 8.174 8.627 9.133 9.684 10.289 10.931 11.643 12.474 13.325 14.333 15.462 16.787 18.365 20.275 22.522 25.263 27.604 28.987 29.875 30.454 30.817 31.04 31.2 31.333 31.438 31.486 31.507 31.508 31.495 31.483 31.475 31.459 31.438 31.412 31.378 31.328 31.281 31.232 31.178 31.137 31.099 31.057 31.008 30.95 30.904 30.858 30.789 30.741 30.686 30.657 30.593 30.525 30.437 30.39 30.239 30.28 30.234 30.179 30.046 29.979 29.916 29.85 29.789 29.684 29.531 29.343 -2 ,27410 ,TETRA ,17526077,Thu Nov 25 02:23:39 CET,Thu Nov 25 04:15:50 CET,0.0 0.333 0.536 0.732 0.905 1.07 1.22 1.353 1.615 1.745 1.867 1.953 2.21 2.319 2.523 2.722 2.913 3.011 3.216 3.417 3.687 3.856 4.027 4.288 4.547 4.789 5.02 5.252 5.562 5.857 6.139 6.488 6.837 7.177 7.566 8.014 8.45 8.94 9.464 10.022 10.613 11.297 12.138 13.001 14.027 15.176 16.529 18.063 19.914 22.176 24.883 27.213 28.602 29.456 30.037 30.446 30.748 30.98 31.109 31.188 31.23 31.257 31.267 31.254 31.232 31.198 31.157 31.105 31.053 31.006 30.96 30.916 30.847 30.761 30.69 30.612 30.53 30.451 30.379 30.33 30.281 30.201 30.144 30.091 30.064 29.996 29.912 29.812 29.764 29.604 29.611 29.556 29.496 29.373 29.303 29.225 29.131 29.043 28.972 28.838 28.56 -3 ,14124 ,TETRA ,17526079,Thu Nov 25 02:23:39 CET,Thu Nov 25 04:14:32 CET,0.0 0.342 0.556 0.738 0.891 1.045 1.197 1.338 1.589 1.708 1.828 1.927 2.185 2.295 2.502 2.708 2.909 3.007 3.209 3.413 3.69 3.86 4.025 4.261 4.501 4.752 4.995 5.225 5.532 5.848 6.171 6.56 6.934 7.292 7.693 8.141 8.576 9.068 9.628 10.23 10.854 11.569 12.421 13.285 14.307 15.46 16.826 18.396 20.267 22.521 25.242 27.566 28.946 29.834 30.432 30.837 31.09 31.233 31.319 31.389 31.437 31.472 31.483 31.471 31.444 31.41 31.373 31.324 31.267 31.211 31.146 31.074 30.994 30.918 30.856 30.786 30.719 30.638 30.555 30.501 30.439 30.351 30.298 30.24 30.207 30.149 30.089 30.022 29.981 29.819 29.831 29.778 29.733 29.639 29.577 29.507 29.425 29.321 29.198 29.074 28.802 -4 ,13877 ,TETRA ,17526081,Thu Nov 25 02:23:39 CET,Thu Nov 25 04:13:51 CET,0.0 0.384 0.627 0.807 0.957 1.103 1.252 1.385 1.631 1.758 1.877 1.975 2.23 2.337 2.541 2.743 2.936 3.029 3.221 3.41 3.681 3.853 4.03 4.287 4.529 4.768 5.002 5.234 5.537 5.831 6.119 6.477 6.84 7.203 7.619 8.087 8.546 9.044 9.604 10.205 10.822 11.554 12.434 13.315 14.335 15.495 16.876 18.447 20.294 22.541 25.343 27.622 28.954 29.853 30.435 30.777 30.996 31.164 31.272 31.358 31.416 31.444 31.444 31.419 31.39 31.36 31.317 31.272 31.227 31.175 31.113 31.057 30.989 30.917 30.861 30.799 30.722 30.634 30.54 30.48 30.415 30.29 30.206 30.136 30.104 30.034 29.967 29.891 29.85 29.698 29.72 29.676 29.631 29.506 29.431 29.363 29.271 29.163 29.063 28.93 28.648 -5 ,7230 ,TETRA ,17526083,Thu Nov 25 02:23:40 CET,Thu Nov 25 04:16:27 CET,0.0 0.269 0.478 0.639 0.788 0.931 1.074 1.218 1.5 1.629 1.754 1.868 2.136 2.261 2.498 2.725 2.947 3.056 3.262 3.452 3.742 3.94 4.134 4.417 4.69 4.953 5.203 5.446 5.777 6.096 6.398 6.765 7.131 7.491 7.902 8.363 8.813 9.326 9.891 10.504 11.161 11.895 12.75 13.612 14.633 15.772 17.105 18.648 20.469 22.663 25.369 27.642 28.974 29.849 30.448 30.851 31.12 31.313 31.453 31.549 31.585 31.6 31.604 31.588 31.559 31.519 31.456 31.412 31.381 31.333 31.276 31.236 31.202 31.152 31.105 31.053 30.995 30.94 30.886 30.844 30.795 30.698 30.637 30.583 30.555 30.5 30.429 30.339 30.298 30.151 30.168 30.11 30.057 29.962 29.896 29.798 29.7 29.591 29.465 29.331 29.085 -6 ,30259 ,TETRA ,17526086,Thu Nov 25 02:23:40 CET,Thu Nov 25 04:15:20 CET,0.0 0.437 0.648 0.845 1.024 1.194 1.342 1.479 1.729 1.857 1.989 2.113 2.39 2.524 2.774 3.014 3.248 3.359 3.575 3.79 4.102 4.297 4.487 4.781 5.06 5.318 5.573 5.819 6.139 6.45 6.763 7.153 7.513 7.86 8.269 8.745 9.208 9.717 10.269 10.862 11.496 12.204 13.055 13.939 14.976 16.152 17.509 19.051 20.897 23.14 25.844 28.094 29.494 30.395 30.942 31.303 31.554 31.724 31.837 31.908 31.938 31.947 31.937 31.916 31.868 31.818 31.779 31.749 31.721 31.69 31.655 31.619 31.586 31.552 31.515 31.471 31.427 31.373 31.303 31.256 31.208 31.131 31.085 31.038 31.005 30.926 30.852 30.786 30.75 30.593 30.603 30.55 30.503 30.393 30.329 30.263 30.187 30.097 29.999 29.886 29.542 -7 ,6598 ,TETRA ,17526087,Thu Nov 25 02:24:38 CET,Thu Nov 25 04:15:01 CET,0.0 0.315 0.52 0.696 0.865 1.026 1.17 1.298 1.555 1.679 1.798 1.922 2.199 2.32 2.576 2.837 3.066 3.174 3.384 3.589 3.881 4.066 4.254 4.521 4.772 5.028 5.284 5.536 5.85 6.169 6.482 6.839 7.189 7.539 7.946 8.406 8.85 9.349 9.894 10.475 11.121 11.858 12.721 13.588 14.607 15.765 17.117 18.693 20.543 22.795 25.591 27.972 29.427 30.321 30.899 31.314 31.573 31.743 31.862 31.941 31.975 31.988 31.98 31.958 31.916 31.872 31.816 31.763 31.722 31.665 31.596 31.548 31.499 31.44 31.394 31.348 31.301 31.255 31.211 31.178 31.127 31.031 30.976 30.916 30.88 30.808 30.74 30.672 30.638 30.492 30.516 30.462 30.401 30.267 30.199 30.125 30.05 29.961 29.846 29.675 29.427 -8 ,5083 ,TETRA ,17526090,Thu Nov 25 02:25:41 CET,Thu Nov 25 04:17:32 CET,0.0 0.495 0.693 0.883 1.061 1.225 1.384 1.535 1.818 1.945 2.077 2.222 2.505 2.639 2.883 3.107 3.331 3.447 3.673 3.88 4.185 4.388 4.583 4.86 5.125 5.375 5.62 5.86 6.172 6.488 6.798 7.166 7.53 7.893 8.321 8.802 9.262 9.774 10.336 10.941 11.586 12.332 13.2 14.072 15.091 16.224 17.568 19.105 20.959 23.197 25.957 28.27 29.604 30.466 31.026 31.414 31.682 31.874 32.01 32.084 32.122 32.153 32.166 32.165 32.142 32.098 32.049 32.006 31.964 31.92 31.883 31.862 31.83 31.776 31.733 31.69 31.643 31.585 31.516 31.469 31.417 31.343 31.291 31.227 31.194 31.126 31.053 30.973 30.931 30.781 30.803 30.744 30.683 30.547 30.474 30.404 30.312 30.192 30.05 29.902 29.673 -9 ,30029 ,TETRA ,17526092,Thu Nov 25 02:25:41 CET,Thu Nov 25 04:18:19 CET,0.0 0.31 0.488 0.664 0.837 1.002 1.135 1.252 1.503 1.626 1.746 1.848 2.099 2.21 2.433 2.637 2.827 2.919 3.11 3.302 3.583 3.765 3.942 4.224 4.494 4.747 5.011 5.26 5.563 5.86 6.162 6.533 6.889 7.24 7.65 8.125 8.598 9.099 9.621 10.201 10.848 11.562 12.372 13.251 14.289 15.414 16.742 18.277 20.124 22.359 25.126 27.384 28.758 29.672 30.262 30.685 30.965 31.156 31.303 31.399 31.415 31.408 31.397 31.374 31.345 31.308 31.26 31.203 31.146 31.083 31.013 30.948 30.883 30.805 30.74 30.678 30.604 30.517 30.425 30.359 30.284 30.174 30.101 30.018 29.97 29.873 29.775 29.664 29.61 29.448 29.436 29.359 29.267 29.075 28.975 28.855 28.724 28.602 28.456 28.276 27.673 -10 ,16947 ,TETRA ,17526094,Thu Nov 25 02:25:41 CET,Thu Nov 25 04:17:03 CET,0.0 0.321 0.548 0.756 0.923 1.074 1.235 1.376 1.619 1.741 1.857 1.928 2.176 2.278 2.469 2.661 2.846 2.94 3.13 3.314 3.58 3.748 3.918 4.176 4.427 4.66 4.888 5.127 5.445 5.766 6.077 6.434 6.794 7.161 7.57 8.025 8.496 9.016 9.566 10.161 10.79 11.489 12.311 13.171 14.197 15.354 16.708 18.308 20.209 22.418 25.155 27.468 28.848 29.724 30.273 30.623 30.874 31.071 31.196 31.267 31.281 31.28 31.28 31.256 31.227 31.197 31.149 31.108 31.057 30.989 30.921 30.859 30.791 30.715 30.653 30.591 30.522 30.443 30.371 30.324 30.264 30.15 30.069 29.99 29.947 29.85 29.746 29.632 29.568 29.392 29.38 29.317 29.256 29.127 29.044 28.95 28.831 28.692 28.563 28.401 28.082 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt deleted file mode 100644 index 80cdd3e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4l_CAT-4i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25089 ,TETRA ,17526097,Thu Nov 25 02:26:41 CET,Thu Nov 25 04:16:14 CET,0.0 0.522 0.651 0.757 0.855 0.928 0.972 1.021 1.093 1.101 1.107 1.068 1.129 1.141 1.171 1.181 1.18 1.172 1.151 1.141 1.115 1.08 1.045 1.001 0.944 0.881 0.816 0.743 0.645 0.547 0.434 0.273 0.107 -0.069 -0.296 -0.559 -0.827 -1.144 -1.513 -1.965 -2.508 -3.182 -4.029 -4.958 -6.167 -7.647 -9.534 -11.974 -15.268 -19.888 -26.852 -34.235 -39.711 -43.978 -47.372 -50.196 -52.524 -54.511 -56.145 -57.729 -59.044 -60.179 -61.231 -62.196 -63.063 -63.829 -64.607 -65.276 -65.849 -66.428 -67.005 -67.471 -67.952 -68.452 -68.823 -69.202 -69.579 -69.94 -70.295 -70.534 -70.779 -71.154 -71.409 -71.67 -71.804 -72.075 -72.361 -72.678 -72.832 -73.111 -73.288 -73.438 -73.593 -73.908 -74.082 -74.272 -74.465 -74.652 -74.859 -75.156 -75.584 -2 ,23301 ,TETRA ,17526099,Thu Nov 25 02:26:41 CET,Thu Nov 25 04:15:59 CET,0.0 0.501 0.65 0.755 0.825 0.872 0.927 0.981 1.057 1.08 1.1 1.074 1.143 1.158 1.173 1.174 1.163 1.154 1.134 1.116 1.068 1.029 0.996 0.961 0.927 0.881 0.821 0.743 0.639 0.526 0.404 0.244 0.083 -0.092 -0.314 -0.57 -0.851 -1.208 -1.62 -2.079 -2.601 -3.228 -4.046 -4.976 -6.2 -7.714 -9.625 -12.072 -15.351 -19.943 -26.862 -34.157 -39.569 -43.795 -47.168 -49.984 -52.315 -54.337 -55.986 -57.536 -58.829 -59.954 -61.0 -61.958 -62.821 -63.591 -64.369 -65.038 -65.6 -66.181 -66.775 -67.247 -67.717 -68.206 -68.588 -68.964 -69.339 -69.736 -70.149 -70.424 -70.702 -71.125 -71.411 -71.706 -71.856 -72.16 -72.481 -72.811 -72.971 -73.26 -73.498 -73.686 -73.875 -74.263 -74.47 -74.71 -74.968 -75.252 -75.556 -75.973 -76.815 -3 ,25893 ,TETRA ,17526101,Thu Nov 25 02:26:41 CET,Thu Nov 25 04:17:36 CET,0.0 0.435 0.589 0.705 0.795 0.843 0.868 0.901 0.996 1.024 1.04 1.008 1.074 1.085 1.096 1.084 1.057 1.046 1.039 1.027 0.986 0.947 0.91 0.861 0.799 0.734 0.666 0.584 0.46 0.339 0.217 0.059 -0.095 -0.264 -0.492 -0.787 -1.088 -1.431 -1.845 -2.314 -2.841 -3.486 -4.337 -5.277 -6.458 -7.947 -9.883 -12.357 -15.657 -20.272 -27.195 -34.468 -39.854 -44.092 -47.448 -50.242 -52.552 -54.542 -56.193 -57.773 -59.077 -60.201 -61.255 -62.219 -63.074 -63.825 -64.591 -65.263 -65.83 -66.398 -66.972 -67.445 -67.926 -68.417 -68.792 -69.175 -69.568 -69.962 -70.371 -70.646 -70.911 -71.313 -71.574 -71.83 -71.96 -72.224 -72.494 -72.782 -72.929 -73.205 -73.37 -73.516 -73.666 -73.997 -74.17 -74.343 -74.519 -74.701 -74.913 -75.182 -75.703 -4 ,24393 ,TETRA ,17526103,Thu Nov 25 02:27:40 CET,Thu Nov 25 04:18:05 CET,0.0 0.205 0.36 0.494 0.599 0.673 0.728 0.777 0.845 0.863 0.873 0.83 0.889 0.892 0.887 0.873 0.867 0.864 0.857 0.857 0.848 0.823 0.796 0.758 0.718 0.662 0.59 0.516 0.407 0.295 0.19 0.038 -0.131 -0.29 -0.497 -0.759 -1.047 -1.394 -1.797 -2.278 -2.829 -3.483 -4.314 -5.244 -6.436 -7.916 -9.81 -12.231 -15.49 -20.016 -26.859 -34.132 -39.524 -43.741 -47.083 -49.899 -52.229 -54.217 -55.867 -57.427 -58.704 -59.822 -60.873 -61.834 -62.699 -63.452 -64.21 -64.863 -65.394 -65.929 -66.48 -66.931 -67.387 -67.849 -68.199 -68.557 -68.927 -69.289 -69.653 -69.903 -70.153 -70.539 -70.803 -71.066 -71.198 -71.471 -71.742 -72.017 -72.16 -72.442 -72.624 -72.785 -72.949 -73.261 -73.426 -73.592 -73.777 -74.0 -74.233 -74.493 -75.218 -5 ,1855 ,TETRA ,17526104,Thu Nov 25 02:27:40 CET,Thu Nov 25 04:16:36 CET,0.0 0.547 0.727 0.881 0.961 1.021 1.066 1.108 1.189 1.208 1.215 1.193 1.272 1.29 1.309 1.334 1.347 1.354 1.377 1.381 1.365 1.344 1.322 1.289 1.244 1.187 1.124 1.066 0.984 0.886 0.773 0.617 0.449 0.267 0.039 -0.236 -0.531 -0.895 -1.305 -1.763 -2.29 -2.944 -3.773 -4.672 -5.826 -7.278 -9.16 -11.596 -14.898 -19.465 -26.315 -33.655 -39.086 -43.318 -46.703 -49.539 -51.881 -53.876 -55.501 -57.057 -58.363 -59.481 -60.51 -61.457 -62.317 -63.087 -63.873 -64.542 -65.102 -65.684 -66.264 -66.728 -67.204 -67.676 -68.027 -68.388 -68.761 -69.127 -69.49 -69.738 -69.993 -70.387 -70.651 -70.91 -71.041 -71.309 -71.578 -71.851 -71.994 -72.272 -72.447 -72.605 -72.765 -73.116 -73.297 -73.469 -73.653 -73.852 -74.105 -74.389 -74.819 -6 ,23034 ,TETRA ,17526105,Thu Nov 25 02:27:40 CET,Thu Nov 25 04:16:15 CET,0.0 0.775 0.929 1.06 1.157 1.238 1.311 1.356 1.397 1.42 1.441 1.409 1.473 1.482 1.489 1.517 1.541 1.543 1.54 1.536 1.532 1.514 1.493 1.46 1.415 1.363 1.292 1.217 1.115 0.994 0.871 0.713 0.542 0.364 0.142 -0.131 -0.412 -0.748 -1.148 -1.617 -2.163 -2.823 -3.663 -4.602 -5.809 -7.271 -9.139 -11.548 -14.795 -19.379 -26.347 -33.642 -39.007 -43.24 -46.626 -49.446 -51.756 -53.746 -55.389 -56.968 -58.271 -59.383 -60.407 -61.366 -62.232 -62.979 -63.742 -64.417 -64.986 -65.551 -66.121 -66.58 -67.036 -67.497 -67.845 -68.197 -68.552 -68.905 -69.258 -69.497 -69.742 -70.123 -70.395 -70.676 -70.815 -71.082 -71.354 -71.636 -71.781 -72.066 -72.232 -72.383 -72.538 -72.869 -73.046 -73.216 -73.386 -73.562 -73.778 -74.081 -74.543 -7 ,30496 ,TETRA ,17526107,Thu Nov 25 02:27:41 CET,Thu Nov 25 04:21:25 CET,0.0 0.471 0.676 0.8 0.896 0.972 1.023 1.085 1.185 1.206 1.214 1.165 1.219 1.224 1.24 1.236 1.225 1.222 1.218 1.206 1.172 1.153 1.133 1.082 1.019 0.95 0.891 0.832 0.732 0.606 0.47 0.315 0.151 -0.035 -0.267 -0.543 -0.84 -1.175 -1.551 -2.022 -2.568 -3.24 -4.107 -5.04 -6.211 -7.684 -9.602 -12.015 -15.265 -19.837 -26.757 -34.119 -39.501 -43.704 -47.067 -49.872 -52.21 -54.207 -55.842 -57.427 -58.737 -59.87 -60.923 -61.876 -62.735 -63.51 -64.292 -64.951 -65.509 -66.071 -66.645 -67.117 -67.598 -68.085 -68.452 -68.828 -69.214 -69.599 -69.981 -70.235 -70.483 -70.87 -71.135 -71.402 -71.544 -71.822 -72.092 -72.372 -72.515 -72.796 -72.975 -73.145 -73.312 -73.634 -73.802 -73.975 -74.157 -74.368 -74.599 -74.838 -75.315 -8 ,6040 ,TETRA ,17526109,Thu Nov 25 02:28:40 CET,Thu Nov 25 04:19:09 CET,0.0 0.961 1.15 1.239 1.286 1.324 1.367 1.418 1.473 1.481 1.488 1.45 1.516 1.534 1.55 1.549 1.555 1.553 1.519 1.48 1.419 1.37 1.322 1.265 1.2 1.11 1.028 0.958 0.861 0.746 0.617 0.449 0.277 0.1 -0.121 -0.396 -0.687 -1.024 -1.419 -1.879 -2.427 -3.088 -3.906 -4.8 -5.967 -7.434 -9.292 -11.721 -15.024 -19.568 -26.415 -33.716 -39.179 -43.432 -46.804 -49.607 -51.917 -53.909 -55.555 -57.149 -58.473 -59.604 -60.655 -61.614 -62.473 -63.233 -63.995 -64.644 -65.186 -65.732 -66.281 -66.734 -67.196 -67.664 -68.014 -68.361 -68.717 -69.082 -69.453 -69.696 -69.94 -70.31 -70.565 -70.826 -70.96 -71.247 -71.531 -71.813 -71.96 -72.243 -72.432 -72.58 -72.737 -73.084 -73.27 -73.471 -73.685 -73.89 -74.09 -74.336 -74.798 -9 ,16680 ,TETRA ,17526111,Thu Nov 25 02:28:40 CET,Thu Nov 25 04:17:50 CET,0.0 0.495 0.652 0.737 0.788 0.825 0.877 0.931 1.049 1.099 1.14 1.169 1.256 1.285 1.334 1.364 1.379 1.386 1.39 1.386 1.357 1.33 1.313 1.276 1.216 1.145 1.083 1.027 0.923 0.8 0.673 0.5 0.322 0.151 -0.064 -0.318 -0.591 -0.928 -1.312 -1.755 -2.276 -2.929 -3.774 -4.707 -5.897 -7.411 -9.363 -11.788 -15.056 -19.687 -26.583 -33.787 -39.181 -43.428 -46.802 -49.616 -51.933 -53.9 -55.534 -57.133 -58.453 -59.589 -60.638 -61.576 -62.411 -63.17 -63.956 -64.634 -65.205 -65.779 -66.356 -66.823 -67.304 -67.797 -68.168 -68.537 -68.892 -69.242 -69.605 -69.855 -70.109 -70.488 -70.742 -71.005 -71.142 -71.414 -71.69 -71.981 -72.127 -72.405 -72.577 -72.735 -72.895 -73.246 -73.435 -73.616 -73.788 -73.982 -74.191 -74.433 -75.009 -10 ,1874 ,TETRA ,17526113,Thu Nov 25 02:30:41 CET,Thu Nov 25 04:20:34 CET,0.0 0.549 0.665 0.793 0.873 0.911 0.948 0.976 1.019 1.051 1.074 1.024 1.08 1.082 1.088 1.091 1.085 1.092 1.108 1.106 1.094 1.087 1.077 1.049 0.991 0.913 0.837 0.772 0.676 0.553 0.429 0.273 0.094 -0.094 -0.332 -0.622 -0.897 -1.222 -1.607 -2.066 -2.607 -3.27 -4.11 -5.066 -6.298 -7.78 -9.727 -12.224 -15.511 -20.063 -26.876 -34.14 -39.542 -43.777 -47.179 -49.99 -52.307 -54.292 -55.951 -57.539 -58.835 -59.956 -60.991 -61.944 -62.805 -63.575 -64.348 -65.015 -65.591 -66.166 -66.753 -67.233 -67.706 -68.178 -68.533 -68.894 -69.265 -69.644 -70.019 -70.273 -70.532 -70.906 -71.166 -71.444 -71.582 -71.856 -72.13 -72.411 -72.56 -72.843 -73.028 -73.184 -73.336 -73.631 -73.812 -74.028 -74.239 -74.445 -74.642 -74.934 -75.716 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index 1b26b360..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21273 ,TETRA ,17526116,Thu Nov 25 02:31:38 CET,Thu Nov 25 04:24:38 CET,0.0 0.59 0.891 1.102 1.249 1.381 1.504 1.612 1.828 1.934 2.035 2.082 2.283 2.365 2.515 2.647 2.772 2.831 2.947 3.07 3.25 3.356 3.454 3.613 3.765 3.9 4.041 4.173 4.329 4.476 4.617 4.779 4.931 5.085 5.263 5.446 5.619 5.811 6.021 6.248 6.471 6.705 6.955 7.192 7.448 7.713 7.981 8.197 8.353 8.418 8.14 7.467 6.725 6.001 5.366 4.77 4.225 3.729 3.292 2.839 2.446 2.093 1.771 1.473 1.194 0.933 0.674 0.439 0.22 -0.001 -0.223 -0.404 -0.586 -0.768 -0.908 -1.061 -1.223 -1.382 -1.544 -1.664 -1.792 -1.985 -2.121 -2.265 -2.338 -2.488 -2.659 -2.839 -2.925 -3.139 -3.194 -3.295 -3.401 -3.646 -3.786 -3.928 -4.074 -4.242 -4.421 -4.632 -5.302 -2 ,3824 ,TETRA ,17526118,Thu Nov 25 02:32:39 CET,Thu Nov 25 04:24:09 CET,0.0 0.26 0.466 0.59 0.695 0.783 0.867 0.944 1.085 1.156 1.224 1.218 1.398 1.455 1.566 1.673 1.773 1.82 1.908 1.994 2.12 2.201 2.277 2.383 2.499 2.617 2.736 2.857 3.006 3.143 3.276 3.445 3.611 3.76 3.934 4.146 4.341 4.53 4.731 4.953 5.174 5.405 5.664 5.904 6.173 6.457 6.747 7.021 7.231 7.308 7.012 6.338 5.646 4.935 4.273 3.663 3.124 2.607 2.142 1.693 1.309 0.951 0.598 0.274 -0.018 -0.302 -0.597 -0.839 -1.056 -1.305 -1.566 -1.766 -1.974 -2.208 -2.392 -2.572 -2.752 -2.941 -3.143 -3.285 -3.44 -3.681 -3.845 -4.013 -4.099 -4.281 -4.46 -4.64 -4.733 -4.955 -5.007 -5.103 -5.213 -5.457 -5.605 -5.758 -5.89 -6.038 -6.238 -6.466 -7.061 -3 ,20976 ,TETRA ,17526120,Thu Nov 25 02:33:37 CET,Thu Nov 25 04:32:17 CET,0.0 0.263 0.401 0.523 0.614 0.7 0.788 0.866 1.032 1.143 1.244 1.284 1.492 1.571 1.715 1.852 1.979 2.039 2.163 2.287 2.468 2.577 2.676 2.819 2.956 3.094 3.226 3.352 3.534 3.711 3.857 4.019 4.178 4.337 4.52 4.712 4.886 5.091 5.315 5.548 5.775 6.008 6.277 6.53 6.793 7.029 7.256 7.471 7.644 7.69 7.426 6.799 6.111 5.456 4.813 4.188 3.662 3.184 2.735 2.284 1.899 1.556 1.219 0.881 0.567 0.289 0.004 -0.26 -0.496 -0.744 -1.005 -1.217 -1.433 -1.65 -1.826 -2.014 -2.194 -2.371 -2.549 -2.67 -2.8 -3.002 -3.134 -3.266 -3.332 -3.477 -3.645 -3.83 -3.923 -4.142 -4.213 -4.33 -4.448 -4.667 -4.773 -4.892 -5.034 -5.194 -5.378 -5.633 -6.215 -4 ,8117 ,TETRA ,17526122,Thu Nov 25 03:15:42 CET,Thu Nov 25 05:06:42 CET,0.0 0.257 0.428 0.567 0.664 0.75 0.829 0.9 1.023 1.08 1.143 1.142 1.325 1.383 1.502 1.605 1.7 1.752 1.852 1.946 2.078 2.158 2.243 2.376 2.501 2.629 2.757 2.876 3.034 3.187 3.331 3.508 3.672 3.831 4.006 4.198 4.392 4.593 4.786 4.983 5.204 5.451 5.721 6.002 6.297 6.585 6.912 7.205 7.425 7.524 7.29 6.662 6.003 5.337 4.701 4.117 3.586 3.11 2.682 2.217 1.808 1.457 1.126 0.811 0.523 0.254 -0.051 -0.327 -0.554 -0.782 -1.013 -1.212 -1.417 -1.617 -1.772 -1.94 -2.122 -2.32 -2.524 -2.667 -2.814 -3.029 -3.183 -3.355 -3.442 -3.628 -3.827 -4.019 -4.118 -4.352 -4.449 -4.575 -4.704 -4.963 -5.107 -5.25 -5.389 -5.549 -5.759 -6.021 -6.72 -5 ,5949 ,TETRA ,17526124,Thu Nov 25 03:15:42 CET,Thu Nov 25 05:06:21 CET,0.0 0.244 0.333 0.434 0.527 0.607 0.691 0.771 0.937 1.014 1.084 1.091 1.275 1.331 1.447 1.571 1.692 1.743 1.835 1.924 2.051 2.136 2.224 2.346 2.461 2.575 2.684 2.792 2.95 3.101 3.238 3.406 3.573 3.728 3.9 4.101 4.286 4.487 4.698 4.915 5.138 5.386 5.668 5.934 6.217 6.473 6.722 6.963 7.169 7.25 6.986 6.324 5.638 4.933 4.238 3.616 3.084 2.598 2.147 1.677 1.283 0.938 0.612 0.294 -0.001 -0.274 -0.568 -0.826 -1.062 -1.307 -1.549 -1.75 -1.953 -2.161 -2.332 -2.508 -2.693 -2.873 -3.047 -3.17 -3.291 -3.479 -3.622 -3.775 -3.85 -3.997 -4.152 -4.308 -4.382 -4.595 -4.661 -4.77 -4.879 -5.106 -5.232 -5.374 -5.536 -5.698 -5.886 -6.117 -6.784 -6 ,31215 ,TETRA ,17526125,Thu Nov 25 03:15:43 CET,Thu Nov 25 05:06:07 CET,0.0 0.346 0.486 0.59 0.672 0.765 0.86 0.938 1.069 1.142 1.216 1.207 1.387 1.45 1.575 1.691 1.802 1.851 1.948 2.046 2.182 2.277 2.375 2.519 2.658 2.787 2.919 3.05 3.208 3.36 3.508 3.683 3.853 4.021 4.204 4.401 4.592 4.801 5.021 5.245 5.476 5.732 6.01 6.246 6.506 6.801 7.131 7.433 7.613 7.663 7.446 6.833 6.141 5.456 4.832 4.244 3.69 3.176 2.739 2.293 1.916 1.581 1.252 0.955 0.667 0.388 0.104 -0.148 -0.373 -0.606 -0.838 -1.035 -1.243 -1.459 -1.621 -1.784 -1.947 -2.11 -2.29 -2.408 -2.514 -2.686 -2.826 -2.975 -3.047 -3.196 -3.371 -3.562 -3.653 -3.876 -3.957 -4.061 -4.176 -4.427 -4.55 -4.677 -4.808 -4.963 -5.162 -5.429 -6.152 -7 ,25755 ,TETRA ,17526126,Thu Nov 25 03:16:43 CET,Thu Nov 25 05:07:13 CET,0.0 0.926 1.263 1.465 1.656 1.811 1.934 2.047 2.254 2.349 2.446 2.507 2.708 2.782 2.927 3.062 3.185 3.249 3.38 3.507 3.685 3.79 3.896 4.05 4.193 4.326 4.453 4.587 4.749 4.908 5.058 5.228 5.399 5.559 5.735 5.933 6.117 6.31 6.511 6.723 6.948 7.189 7.463 7.723 8.006 8.285 8.541 8.798 8.986 9.026 8.793 8.211 7.528 6.844 6.234 5.663 5.155 4.683 4.249 3.792 3.391 3.045 2.733 2.447 2.177 1.924 1.675 1.444 1.228 1.013 0.789 0.595 0.402 0.211 0.055 -0.107 -0.269 -0.435 -0.608 -0.726 -0.844 -1.023 -1.166 -1.311 -1.384 -1.541 -1.702 -1.873 -1.959 -2.177 -2.227 -2.323 -2.426 -2.646 -2.754 -2.879 -3.037 -3.222 -3.414 -3.63 -4.31 -8 ,26101 ,TETRA ,17526128,Thu Nov 25 03:15:42 CET,Thu Nov 25 05:03:13 CET,0.0 0.213 0.335 0.425 0.502 0.587 0.67 0.751 0.902 0.973 1.042 1.041 1.224 1.279 1.389 1.499 1.599 1.646 1.737 1.829 1.968 2.056 2.135 2.25 2.357 2.461 2.564 2.664 2.805 2.949 3.089 3.257 3.425 3.582 3.742 3.924 4.104 4.308 4.525 4.734 4.939 5.156 5.414 5.667 5.95 6.226 6.508 6.781 6.954 7.024 6.826 6.201 5.498 4.836 4.218 3.661 3.152 2.633 2.182 1.73 1.328 0.973 0.629 0.308 0.029 -0.233 -0.52 -0.781 -1.013 -1.248 -1.501 -1.715 -1.937 -2.164 -2.333 -2.517 -2.716 -2.915 -3.109 -3.237 -3.361 -3.554 -3.692 -3.831 -3.9 -4.055 -4.231 -4.403 -4.483 -4.695 -4.753 -4.85 -4.951 -5.176 -5.307 -5.446 -5.576 -5.729 -5.916 -6.153 -6.996 -9 ,10555 ,TETRA ,17526130,Thu Nov 25 03:16:41 CET,Thu Nov 25 05:08:31 CET,0.0 0.419 0.71 0.94 1.117 1.271 1.424 1.562 1.801 1.909 2.008 2.066 2.276 2.366 2.537 2.692 2.834 2.902 3.031 3.154 3.33 3.441 3.549 3.71 3.85 3.973 4.102 4.233 4.396 4.557 4.704 4.869 5.048 5.216 5.387 5.576 5.758 5.957 6.18 6.405 6.634 6.872 7.126 7.374 7.636 7.902 8.166 8.434 8.659 8.717 8.456 7.865 7.168 6.464 5.814 5.217 4.695 4.205 3.759 3.293 2.896 2.541 2.204 1.887 1.58 1.297 0.996 0.722 0.492 0.258 0.001 -0.223 -0.444 -0.671 -0.85 -1.029 -1.223 -1.43 -1.634 -1.763 -1.904 -2.139 -2.301 -2.477 -2.573 -2.767 -2.964 -3.176 -3.288 -3.527 -3.618 -3.731 -3.856 -4.145 -4.316 -4.494 -4.676 -4.895 -5.196 -5.621 -6.647 -10 ,12228 ,TETRA ,17526132,Thu Nov 25 03:16:42 CET,Thu Nov 25 05:08:02 CET,0.0 0.168 0.31 0.428 0.532 0.644 0.764 0.866 1.033 1.113 1.193 1.206 1.391 1.449 1.56 1.664 1.771 1.828 1.924 2.018 2.175 2.279 2.38 2.531 2.678 2.816 2.938 3.057 3.217 3.371 3.522 3.697 3.861 4.013 4.18 4.37 4.56 4.769 4.982 5.195 5.417 5.661 5.936 6.19 6.445 6.713 6.992 7.224 7.399 7.467 7.199 6.552 5.845 5.172 4.552 3.944 3.39 2.872 2.414 1.945 1.54 1.187 0.859 0.55 0.262 -0.008 -0.302 -0.567 -0.798 -1.047 -1.308 -1.526 -1.743 -1.963 -2.134 -2.302 -2.471 -2.65 -2.831 -2.953 -3.078 -3.274 -3.418 -3.569 -3.646 -3.809 -3.977 -4.151 -4.24 -4.463 -4.537 -4.647 -4.759 -5.005 -5.143 -5.288 -5.443 -5.643 -5.859 -6.065 -6.609 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt deleted file mode 100644 index edb59e21..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3199 ,TETRA ,17526135,Thu Nov 25 03:16:44 CET,Thu Nov 25 05:07:48 CET,0.0 0.341 0.502 0.627 0.746 0.855 0.969 1.079 1.258 1.349 1.445 1.514 1.74 1.853 2.055 2.232 2.403 2.487 2.657 2.825 3.069 3.217 3.366 3.584 3.781 3.973 4.164 4.343 4.585 4.836 5.072 5.347 5.617 5.882 6.192 6.55 6.884 7.247 7.661 8.095 8.542 9.045 9.64 10.255 10.981 11.789 12.721 13.787 15.026 16.465 18.147 19.447 20.161 20.514 20.67 20.727 20.706 20.649 20.558 20.434 20.307 20.183 20.048 19.894 19.744 19.617 19.488 19.361 19.252 19.133 18.989 18.863 18.743 18.627 18.531 18.424 18.307 18.178 18.043 17.953 17.857 17.699 17.589 17.468 17.404 17.269 17.123 16.972 16.902 16.729 16.707 16.638 16.565 16.396 16.303 16.202 16.092 15.974 15.832 15.632 15.14 -2 ,15442 ,TETRA ,17526137,Thu Nov 25 03:17:39 CET,Thu Nov 25 05:09:02 CET,0.0 0.216 0.379 0.523 0.651 0.782 0.901 1.009 1.225 1.324 1.41 1.441 1.649 1.733 1.895 2.055 2.211 2.283 2.422 2.561 2.765 2.9 3.04 3.271 3.493 3.699 3.892 4.075 4.308 4.538 4.774 5.05 5.319 5.586 5.909 6.284 6.627 6.994 7.4 7.84 8.293 8.813 9.439 10.054 10.762 11.562 12.494 13.554 14.781 16.225 17.959 19.262 19.911 20.24 20.37 20.415 20.399 20.33 20.247 20.122 20.003 19.902 19.812 19.73 19.636 19.545 19.446 19.353 19.26 19.149 19.038 18.945 18.847 18.738 18.65 18.567 18.473 18.37 18.274 18.208 18.14 18.032 17.949 17.858 17.808 17.702 17.593 17.483 17.421 17.252 17.233 17.153 17.073 16.912 16.823 16.726 16.597 16.462 16.316 16.136 15.68 -3 ,32192 ,TETRA ,17526138,Thu Nov 25 03:17:39 CET,Thu Nov 25 05:08:09 CET,0.0 0.472 0.675 0.829 0.956 1.066 1.179 1.28 1.468 1.564 1.654 1.71 1.922 2.013 2.196 2.352 2.495 2.563 2.692 2.829 3.058 3.207 3.35 3.559 3.763 3.962 4.156 4.342 4.584 4.823 5.064 5.369 5.652 5.917 6.222 6.571 6.91 7.32 7.792 8.284 8.814 9.378 9.984 10.602 11.343 12.174 13.125 14.198 15.447 16.891 18.58 19.851 20.516 20.872 21.021 21.089 21.114 21.079 21.001 20.886 20.767 20.653 20.527 20.397 20.269 20.139 19.999 19.856 19.728 19.602 19.47 19.352 19.23 19.111 19.022 18.922 18.797 18.665 18.54 18.458 18.365 18.212 18.097 17.968 17.902 17.776 17.639 17.488 17.412 17.222 17.148 17.053 16.948 16.71 16.566 16.405 16.232 16.03 15.829 15.624 15.22 -4 ,32059 ,TETRA ,17526140,Thu Nov 25 03:17:39 CET,Thu Nov 25 05:08:10 CET,0.0 0.347 0.522 0.672 0.78 0.884 0.991 1.095 1.28 1.37 1.473 1.553 1.763 1.845 2.009 2.167 2.319 2.386 2.516 2.655 2.858 2.989 3.12 3.314 3.506 3.689 3.868 4.05 4.296 4.532 4.768 5.056 5.326 5.587 5.896 6.249 6.59 6.972 7.383 7.814 8.265 8.776 9.369 9.944 10.665 11.501 12.449 13.527 14.739 16.142 17.802 19.01 19.59 19.928 20.114 20.18 20.173 20.115 20.039 19.952 19.857 19.756 19.648 19.509 19.362 19.253 19.135 18.999 18.879 18.762 18.635 18.524 18.4 18.271 18.167 18.058 17.95 17.831 17.691 17.596 17.499 17.331 17.203 17.078 17.023 16.907 16.788 16.657 16.598 16.437 16.403 16.332 16.259 16.061 15.958 15.866 15.758 15.634 15.513 15.324 14.941 -5 ,3339 ,TETRA ,17526142,Thu Nov 25 03:17:40 CET,Thu Nov 25 04:57:56 CET,0.0 0.216 0.359 0.482 0.6 0.723 0.846 0.955 1.153 1.237 1.312 1.345 1.548 1.63 1.799 1.945 2.095 2.17 2.312 2.462 2.681 2.82 2.965 3.179 3.394 3.604 3.805 4.008 4.27 4.514 4.748 5.028 5.297 5.557 5.856 6.199 6.552 6.943 7.343 7.772 8.222 8.737 9.35 9.971 10.708 11.526 12.455 13.501 14.734 16.198 17.907 19.166 19.825 20.219 20.412 20.445 20.419 20.375 20.311 20.225 20.143 20.035 19.91 19.799 19.668 19.528 19.394 19.276 19.159 19.036 18.899 18.78 18.657 18.508 18.386 18.275 18.164 18.031 17.885 17.789 17.689 17.526 17.414 17.299 17.237 17.104 16.976 16.848 16.766 16.564 16.477 16.38 16.265 16.03 15.914 15.795 15.672 15.559 15.45 15.28 14.844 -6 ,12254 ,TETRA ,17526144,Thu Nov 25 03:18:43 CET,Thu Nov 25 05:12:19 CET,0.0 0.718 1.008 1.227 1.407 1.578 1.74 1.886 2.164 2.289 2.406 2.507 2.731 2.843 3.052 3.227 3.402 3.491 3.651 3.809 4.039 4.185 4.334 4.558 4.778 4.984 5.185 5.382 5.626 5.88 6.126 6.406 6.681 6.953 7.265 7.616 7.955 8.329 8.747 9.194 9.653 10.178 10.79 11.407 12.136 12.958 13.893 14.912 16.127 17.571 19.24 20.545 21.194 21.523 21.654 21.69 21.671 21.584 21.485 21.379 21.261 21.119 20.974 20.847 20.718 20.593 20.464 20.339 20.231 20.122 19.987 19.865 19.732 19.593 19.496 19.391 19.27 19.138 18.996 18.903 18.798 18.624 18.509 18.393 18.336 18.221 18.097 17.946 17.858 17.67 17.599 17.495 17.38 17.147 17.021 16.883 16.72 16.55 16.36 16.135 15.606 -7 ,13378 ,TETRA ,17526145,Thu Nov 25 03:18:44 CET,Thu Nov 25 05:09:05 CET,0.0 0.313 0.512 0.703 0.859 0.987 1.1 1.217 1.439 1.543 1.642 1.689 1.893 1.973 2.141 2.295 2.439 2.516 2.665 2.796 2.981 3.104 3.242 3.456 3.655 3.845 4.023 4.193 4.419 4.633 4.834 5.083 5.348 5.617 5.912 6.239 6.577 6.948 7.35 7.793 8.247 8.762 9.389 10.01 10.715 11.527 12.472 13.52 14.708 16.057 17.688 18.965 19.649 20.044 20.23 20.302 20.298 20.239 20.157 20.045 19.918 19.792 19.664 19.536 19.404 19.268 19.128 18.999 18.883 18.754 18.611 18.504 18.391 18.259 18.155 18.042 17.924 17.805 17.672 17.575 17.479 17.342 17.242 17.133 17.075 16.949 16.819 16.669 16.59 16.405 16.317 16.221 16.131 15.942 15.83 15.685 15.531 15.379 15.166 14.827 13.772 -8 ,16818 ,TETRA ,17526148,Thu Nov 25 03:18:44 CET,Thu Nov 25 04:58:33 CET,0.0 0.295 0.471 0.605 0.733 0.844 0.943 1.04 1.239 1.336 1.44 1.502 1.703 1.779 1.939 2.109 2.279 2.361 2.515 2.669 2.905 3.054 3.197 3.412 3.624 3.834 4.034 4.222 4.468 4.703 4.927 5.205 5.482 5.749 6.049 6.41 6.769 7.143 7.547 7.981 8.452 8.972 9.571 10.184 10.905 11.753 12.722 13.764 14.992 16.454 18.117 19.399 20.099 20.434 20.558 20.582 20.556 20.515 20.44 20.308 20.165 20.042 19.933 19.799 19.661 19.541 19.401 19.267 19.147 19.004 18.841 18.712 18.594 18.491 18.41 18.318 18.214 18.113 18.002 17.914 17.827 17.696 17.603 17.503 17.453 17.358 17.252 17.132 17.073 16.904 16.897 16.833 16.76 16.587 16.473 16.352 16.231 16.111 15.983 15.815 15.091 -9 ,11211 ,TETRA ,17526150,Thu Nov 25 03:19:41 CET,Thu Nov 25 05:11:55 CET,0.0 0.678 0.965 1.206 1.409 1.57 1.716 1.863 2.119 2.237 2.353 2.451 2.678 2.787 2.99 3.189 3.374 3.462 3.638 3.798 4.041 4.197 4.344 4.565 4.783 4.989 5.183 5.373 5.609 5.844 6.074 6.344 6.616 6.877 7.174 7.531 7.871 8.242 8.66 9.092 9.538 10.037 10.626 11.231 11.945 12.745 13.663 14.697 15.903 17.341 19.016 20.278 20.949 21.31 21.45 21.482 21.461 21.403 21.331 21.23 21.116 20.99 20.86 20.735 20.618 20.512 20.39 20.269 20.153 20.025 19.897 19.784 19.66 19.539 19.436 19.326 19.214 19.095 18.965 18.865 18.762 18.605 18.497 18.377 18.313 18.17 18.0 17.837 17.759 17.57 17.499 17.404 17.31 17.112 17.011 16.918 16.813 16.68 16.497 16.273 15.736 -10 ,22893 ,TETRA ,17526152,Thu Nov 25 03:19:41 CET,Thu Nov 25 04:59:40 CET,0.0 0.355 0.553 0.697 0.808 0.912 1.012 1.113 1.32 1.421 1.518 1.587 1.801 1.884 2.042 2.198 2.344 2.417 2.565 2.697 2.889 3.026 3.174 3.398 3.611 3.814 4.014 4.204 4.447 4.693 4.928 5.209 5.491 5.763 6.061 6.403 6.75 7.124 7.514 7.94 8.401 8.904 9.503 10.131 10.863 11.656 12.56 13.618 14.87 16.275 17.93 19.218 19.856 20.206 20.392 20.48 20.474 20.412 20.334 20.235 20.147 20.054 19.918 19.78 19.653 19.509 19.346 19.217 19.111 18.999 18.868 18.753 18.626 18.492 18.398 18.303 18.197 18.072 17.942 17.854 17.766 17.62 17.507 17.389 17.325 17.187 17.052 16.914 16.841 16.661 16.601 16.511 16.416 16.188 16.085 15.988 15.87 15.751 15.623 15.457 14.897 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt deleted file mode 100644 index 7cd3e4d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4m_CAT-4p.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9732 ,TETRA ,17526154,Thu Nov 25 03:20:43 CET,Thu Nov 25 05:10:36 CET,0.0 0.57 0.782 0.926 1.098 1.266 1.394 1.506 1.712 1.81 1.911 1.98 2.185 2.257 2.409 2.568 2.721 2.791 2.931 3.064 3.243 3.354 3.475 3.653 3.822 3.983 4.144 4.298 4.483 4.668 4.85 5.067 5.267 5.452 5.67 5.934 6.177 6.428 6.712 7.016 7.334 7.711 8.165 8.603 9.097 9.649 10.268 10.928 11.646 12.417 13.141 13.477 13.473 13.303 13.097 12.872 12.632 12.389 12.158 11.891 11.645 11.43 11.204 10.972 10.748 10.54 10.321 10.118 9.936 9.749 9.572 9.423 9.257 9.086 8.945 8.795 8.647 8.511 8.382 8.291 8.197 8.04 7.933 7.828 7.77 7.644 7.504 7.359 7.291 7.097 7.044 6.952 6.85 6.645 6.543 6.418 6.251 6.061 5.871 5.655 4.882 -2 ,26112 ,TETRA ,17526156,Thu Nov 25 03:21:43 CET,Thu Nov 25 05:11:29 CET,0.0 0.684 0.928 1.109 1.262 1.403 1.52 1.622 1.796 1.886 1.977 2.04 2.257 2.335 2.478 2.618 2.754 2.824 2.955 3.081 3.262 3.374 3.481 3.644 3.805 3.967 4.121 4.263 4.447 4.634 4.821 5.047 5.274 5.504 5.76 6.055 6.356 6.667 6.994 7.324 7.658 8.045 8.526 8.982 9.482 10.034 10.637 11.264 11.948 12.688 13.355 13.67 13.652 13.481 13.262 13.002 12.732 12.467 12.209 11.931 11.672 11.424 11.194 10.978 10.778 10.59 10.385 10.201 10.048 9.895 9.719 9.567 9.414 9.242 9.103 8.947 8.791 8.65 8.491 8.384 8.267 8.059 7.919 7.791 7.728 7.598 7.47 7.341 7.273 7.082 7.04 6.954 6.86 6.66 6.56 6.449 6.302 6.133 5.932 5.706 4.766 -3 ,2592 ,TETRA ,17526158,Thu Nov 25 03:21:42 CET,Thu Nov 25 05:12:07 CET,0.0 0.8 1.04 1.256 1.418 1.541 1.655 1.763 1.954 2.04 2.119 2.159 2.361 2.438 2.593 2.737 2.871 2.939 3.075 3.201 3.378 3.497 3.617 3.792 3.962 4.131 4.297 4.456 4.65 4.832 5.008 5.225 5.434 5.633 5.863 6.113 6.364 6.648 6.97 7.306 7.639 8.044 8.507 8.955 9.476 10.034 10.669 11.372 12.111 12.863 13.6 13.88 13.801 13.623 13.392 13.159 12.92 12.629 12.359 12.092 11.828 11.592 11.37 11.139 10.923 10.73 10.537 10.366 10.203 10.024 9.84 9.678 9.507 9.343 9.22 9.077 8.914 8.756 8.603 8.492 8.388 8.239 8.124 8.008 7.952 7.829 7.699 7.553 7.474 7.276 7.243 7.168 7.076 6.863 6.749 6.63 6.497 6.334 6.161 5.938 5.139 -4 ,29115 ,TETRA ,17526161,Thu Nov 25 03:21:44 CET,Thu Nov 25 05:13:11 CET,0.0 0.535 0.784 0.992 1.176 1.332 1.473 1.587 1.807 1.915 2.009 2.047 2.247 2.325 2.475 2.618 2.765 2.839 2.984 3.111 3.301 3.424 3.533 3.706 3.883 4.06 4.237 4.407 4.626 4.835 5.043 5.289 5.517 5.734 5.983 6.26 6.526 6.818 7.119 7.439 7.792 8.184 8.627 9.068 9.551 10.096 10.735 11.393 12.091 12.844 13.549 13.843 13.805 13.659 13.433 13.155 12.867 12.586 12.326 12.061 11.844 11.646 11.437 11.241 11.065 10.903 10.731 10.577 10.427 10.265 10.106 9.975 9.84 9.681 9.562 9.449 9.324 9.184 9.044 8.957 8.872 8.728 8.625 8.52 8.461 8.332 8.188 8.046 7.97 7.769 7.71 7.625 7.541 7.337 7.218 7.102 6.978 6.834 6.662 6.419 5.85 -5 ,14619 ,TETRA ,17526163,Thu Nov 25 03:21:44 CET,Thu Nov 25 05:12:08 CET,0.0 0.493 0.742 0.942 1.101 1.255 1.401 1.546 1.816 1.928 2.034 2.122 2.342 2.439 2.639 2.82 2.989 3.072 3.235 3.392 3.616 3.759 3.892 4.076 4.249 4.43 4.617 4.785 4.993 5.193 5.39 5.62 5.852 6.077 6.314 6.582 6.843 7.137 7.46 7.81 8.16 8.561 9.019 9.447 9.95 10.499 11.092 11.765 12.526 13.307 14.08 14.396 14.417 14.32 14.109 13.823 13.549 13.294 13.043 12.779 12.578 12.394 12.192 11.999 11.812 11.643 11.464 11.288 11.125 10.958 10.786 10.652 10.52 10.372 10.25 10.114 9.971 9.836 9.695 9.593 9.5 9.364 9.252 9.132 9.078 8.965 8.838 8.7 8.634 8.444 8.39 8.3 8.209 8.011 7.906 7.791 7.654 7.506 7.331 7.085 6.315 -6 ,8774 ,TETRA ,17526165,Thu Nov 25 03:21:44 CET,Thu Nov 25 05:12:41 CET,0.0 0.503 0.74 0.927 1.094 1.241 1.36 1.463 1.671 1.772 1.868 1.936 2.15 2.236 2.392 2.54 2.698 2.78 2.943 3.103 3.329 3.467 3.598 3.794 3.985 4.177 4.356 4.525 4.745 4.962 5.169 5.412 5.652 5.884 6.158 6.458 6.739 7.054 7.393 7.731 8.085 8.477 8.925 9.368 9.876 10.412 10.993 11.642 12.341 13.057 13.776 14.11 14.078 13.907 13.692 13.459 13.227 13.011 12.793 12.557 12.339 12.123 11.909 11.725 11.561 11.392 11.208 11.045 10.899 10.747 10.586 10.458 10.328 10.184 10.064 9.944 9.823 9.696 9.557 9.461 9.375 9.24 9.127 8.999 8.936 8.813 8.694 8.574 8.512 8.322 8.285 8.203 8.11 7.905 7.804 7.692 7.555 7.414 7.261 7.065 6.403 -7 ,21081 ,TETRA ,17526166,Thu Nov 25 03:22:43 CET,Thu Nov 25 05:10:04 CET,0.0 0.592 0.859 1.11 1.31 1.468 1.629 1.785 2.047 2.171 2.294 2.395 2.624 2.731 2.938 3.123 3.279 3.354 3.518 3.683 3.917 4.061 4.202 4.404 4.587 4.752 4.917 5.077 5.292 5.508 5.708 5.939 6.162 6.394 6.659 6.948 7.219 7.508 7.816 8.147 8.506 8.9 9.339 9.769 10.269 10.825 11.439 12.109 12.853 13.61 14.331 14.668 14.652 14.496 14.258 13.976 13.711 13.428 13.167 12.898 12.663 12.459 12.255 12.05 11.839 11.644 11.44 11.256 11.108 10.946 10.758 10.593 10.428 10.257 10.109 9.969 9.827 9.661 9.489 9.365 9.235 9.039 8.904 8.768 8.693 8.547 8.397 8.217 8.131 7.932 7.88 7.803 7.713 7.498 7.382 7.268 7.143 7.012 6.847 6.611 5.672 -8 ,11617 ,TETRA ,17526167,Thu Nov 25 03:22:43 CET,Thu Nov 25 05:13:21 CET,0.0 0.53 0.786 0.981 1.122 1.244 1.367 1.479 1.677 1.767 1.856 1.909 2.12 2.205 2.358 2.499 2.642 2.714 2.854 2.977 3.164 3.283 3.392 3.568 3.747 3.91 4.058 4.201 4.393 4.6 4.812 5.057 5.29 5.516 5.776 6.06 6.337 6.651 6.994 7.335 7.668 8.051 8.523 8.981 9.503 10.076 10.713 11.388 12.131 12.9 13.587 13.901 13.853 13.713 13.483 13.205 12.933 12.65 12.387 12.113 11.875 11.653 11.433 11.214 11.0 10.795 10.58 10.38 10.211 10.038 9.853 9.688 9.516 9.36 9.237 9.104 8.958 8.792 8.617 8.495 8.372 8.182 8.042 7.907 7.848 7.727 7.593 7.451 7.379 7.19 7.156 7.078 6.994 6.789 6.665 6.535 6.409 6.269 6.096 5.847 5.197 -9 ,7094 ,TETRA ,17526170,Thu Nov 25 03:23:41 CET,Thu Nov 25 05:12:08 CET,0.0 0.547 0.758 0.955 1.121 1.26 1.384 1.501 1.705 1.796 1.886 1.928 2.124 2.196 2.337 2.466 2.604 2.673 2.805 2.935 3.126 3.251 3.379 3.563 3.723 3.879 4.029 4.175 4.363 4.541 4.711 4.922 5.127 5.329 5.577 5.858 6.14 6.451 6.745 7.05 7.373 7.728 8.154 8.601 9.132 9.695 10.299 10.961 11.723 12.491 13.18 13.499 13.493 13.379 13.164 12.879 12.595 12.315 12.065 11.78 11.511 11.274 11.053 10.835 10.628 10.443 10.238 10.05 9.892 9.728 9.556 9.403 9.22 9.027 8.891 8.752 8.604 8.457 8.283 8.143 8.008 7.802 7.651 7.503 7.43 7.276 7.109 6.91 6.805 6.595 6.534 6.448 6.344 6.121 6.008 5.887 5.766 5.611 5.428 5.193 4.52 -10 ,662 ,TETRA ,17526172,Thu Nov 25 03:23:41 CET,Thu Nov 25 05:14:10 CET,0.0 0.896 1.116 1.273 1.438 1.596 1.743 1.875 2.109 2.217 2.316 2.363 2.571 2.649 2.819 2.977 3.118 3.193 3.338 3.474 3.666 3.791 3.92 4.12 4.302 4.474 4.649 4.819 5.039 5.248 5.451 5.692 5.903 6.116 6.382 6.675 6.943 7.229 7.54 7.869 8.202 8.582 9.029 9.465 9.967 10.507 11.137 11.821 12.56 13.336 14.052 14.391 14.361 14.158 13.911 13.611 13.289 12.994 12.716 12.413 12.167 11.955 11.731 11.533 11.365 11.181 10.98 10.815 10.667 10.505 10.345 10.218 10.085 9.935 9.817 9.7 9.563 9.424 9.292 9.2 9.107 8.959 8.848 8.733 8.673 8.54 8.409 8.28 8.208 8.021 7.995 7.913 7.824 7.658 7.56 7.424 7.271 7.115 6.956 6.741 5.738 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt deleted file mode 100644 index 8d4e0f70..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-17f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20702 ,TETRA ,17526177,Thu Nov 25 03:23:41 CET,Thu Nov 25 05:13:09 CET,0.0 0.535 0.727 0.874 1.029 1.169 1.279 1.379 1.57 1.666 1.753 1.789 2.004 2.078 2.238 2.393 2.519 2.577 2.693 2.803 2.968 3.078 3.187 3.345 3.495 3.64 3.784 3.92 4.097 4.289 4.479 4.71 4.947 5.159 5.393 5.657 5.912 6.192 6.486 6.787 7.093 7.435 7.834 8.217 8.62 9.079 9.578 10.051 10.546 10.997 11.255 11.121 10.728 10.22 9.704 9.193 8.707 8.254 7.864 7.464 7.099 6.753 6.426 6.114 5.824 5.55 5.241 4.977 4.749 4.507 4.239 4.016 3.796 3.567 3.394 3.21 3.003 2.789 2.578 2.437 2.286 2.039 1.869 1.706 1.616 1.433 1.265 1.077 0.967 0.714 0.618 0.502 0.381 0.119 -0.038 -0.235 -0.446 -0.676 -0.944 -1.3 -2.402 -2 ,12873 ,TETRA ,17526179,Thu Nov 25 03:24:40 CET,Thu Nov 25 05:14:50 CET,0.0 1.044 1.247 1.385 1.51 1.628 1.728 1.83 2.034 2.128 2.223 2.283 2.51 2.601 2.776 2.945 3.11 3.185 3.326 3.468 3.678 3.812 3.94 4.134 4.312 4.481 4.646 4.798 4.985 5.172 5.365 5.599 5.815 6.019 6.268 6.536 6.78 7.051 7.33 7.616 7.923 8.258 8.635 9.002 9.4 9.83 10.308 10.794 11.271 11.701 11.922 11.702 11.315 10.884 10.397 9.881 9.38 8.919 8.514 8.11 7.78 7.466 7.117 6.8 6.536 6.286 6.017 5.767 5.566 5.369 5.155 4.97 4.778 4.584 4.432 4.267 4.085 3.898 3.708 3.579 3.451 3.248 3.087 2.928 2.849 2.677 2.503 2.305 2.194 1.941 1.814 1.68 1.544 1.239 1.078 0.906 0.674 0.413 0.135 -0.288 -1.883 -3 ,19416 ,TETRA ,17526181,Thu Nov 25 03:25:44 CET,Thu Nov 25 05:18:46 CET,0.0 0.511 0.707 0.851 0.99 1.14 1.27 1.389 1.622 1.718 1.818 1.88 2.107 2.197 2.362 2.529 2.697 2.771 2.908 3.042 3.236 3.35 3.453 3.615 3.786 3.956 4.127 4.293 4.5 4.696 4.875 5.103 5.328 5.535 5.778 6.049 6.295 6.568 6.885 7.199 7.494 7.815 8.17 8.534 8.983 9.471 9.966 10.454 10.959 11.398 11.597 11.367 10.925 10.416 9.913 9.423 8.955 8.522 8.131 7.716 7.352 7.019 6.687 6.37 6.078 5.813 5.534 5.276 5.044 4.796 4.525 4.303 4.084 3.864 3.691 3.503 3.311 3.11 2.895 2.741 2.584 2.336 2.161 1.982 1.886 1.685 1.458 1.233 1.129 0.9 0.83 0.703 0.563 0.255 0.089 -0.099 -0.294 -0.505 -0.787 -1.158 -2.48 -4 ,6483 ,TETRA ,17526183,Thu Nov 25 03:25:44 CET,Thu Nov 25 05:16:48 CET,0.0 0.425 0.663 0.847 0.996 1.125 1.239 1.347 1.558 1.664 1.762 1.795 2.013 2.092 2.231 2.371 2.497 2.56 2.68 2.791 2.943 3.042 3.142 3.277 3.411 3.546 3.686 3.826 4.011 4.193 4.378 4.632 4.85 5.034 5.255 5.511 5.749 6.003 6.272 6.556 6.862 7.195 7.572 7.942 8.372 8.841 9.31 9.772 10.222 10.598 10.828 10.646 10.211 9.749 9.269 8.753 8.257 7.813 7.423 7.022 6.663 6.316 5.976 5.671 5.395 5.137 4.865 4.621 4.414 4.197 3.961 3.769 3.588 3.399 3.244 3.076 2.901 2.709 2.502 2.359 2.225 2.031 1.893 1.731 1.647 1.479 1.29 1.085 0.972 0.734 0.666 0.542 0.404 0.126 -0.018 -0.194 -0.406 -0.642 -0.914 -1.251 -2.905 -5 ,626 ,TETRA ,17526185,Thu Nov 25 03:26:42 CET,Thu Nov 25 05:16:41 CET,0.0 0.481 0.665 0.809 0.953 1.104 1.225 1.322 1.504 1.592 1.679 1.698 1.915 1.992 2.129 2.263 2.385 2.452 2.583 2.699 2.874 2.979 3.08 3.23 3.377 3.533 3.681 3.822 4.001 4.174 4.364 4.599 4.815 5.021 5.271 5.534 5.753 5.981 6.238 6.538 6.848 7.171 7.542 7.927 8.354 8.808 9.298 9.766 10.245 10.64 10.819 10.687 10.357 9.868 9.362 8.881 8.421 7.969 7.554 7.137 6.78 6.446 6.123 5.817 5.528 5.26 4.972 4.709 4.477 4.242 4.002 3.801 3.588 3.356 3.177 2.997 2.808 2.623 2.428 2.29 2.149 1.924 1.753 1.571 1.485 1.302 1.118 0.933 0.829 0.591 0.524 0.405 0.267 -0.042 -0.197 -0.363 -0.577 -0.831 -1.134 -1.514 -2.407 -6 ,23307 ,TETRA ,17526186,Thu Nov 25 03:25:45 CET,Thu Nov 25 05:15:54 CET,0.0 0.587 0.753 0.904 1.042 1.184 1.312 1.421 1.621 1.718 1.815 1.873 2.102 2.184 2.329 2.455 2.573 2.64 2.789 2.933 3.133 3.25 3.352 3.504 3.657 3.804 3.946 4.085 4.262 4.436 4.62 4.857 5.082 5.295 5.523 5.764 6.004 6.251 6.518 6.815 7.116 7.458 7.843 8.216 8.676 9.159 9.621 10.068 10.558 10.989 11.171 10.923 10.497 10.003 9.526 9.086 8.633 8.192 7.807 7.409 7.045 6.713 6.401 6.084 5.771 5.493 5.221 4.975 4.751 4.519 4.271 4.068 3.848 3.617 3.441 3.257 3.062 2.861 2.65 2.498 2.346 2.111 1.947 1.777 1.682 1.489 1.289 1.069 0.959 0.712 0.617 0.51 0.388 0.083 -0.072 -0.227 -0.392 -0.58 -0.806 -1.12 -2.43 -7 ,29703 ,TETRA ,17526187,Thu Nov 25 03:25:45 CET,Thu Nov 25 05:15:44 CET,0.0 0.352 0.586 0.716 0.829 0.936 1.043 1.139 1.289 1.364 1.451 1.493 1.716 1.8 1.955 2.087 2.201 2.267 2.41 2.527 2.679 2.781 2.876 3.026 3.183 3.337 3.496 3.646 3.84 4.025 4.191 4.382 4.583 4.782 5.009 5.278 5.523 5.775 6.046 6.331 6.628 6.952 7.326 7.7 8.106 8.524 8.985 9.427 9.848 10.237 10.456 10.267 9.824 9.32 8.864 8.424 7.991 7.568 7.165 6.767 6.424 6.094 5.768 5.45 5.156 4.897 4.624 4.37 4.158 3.929 3.662 3.444 3.226 2.993 2.813 2.618 2.421 2.224 2.023 1.887 1.744 1.529 1.379 1.227 1.15 0.968 0.779 0.567 0.447 0.195 0.09 -0.032 -0.16 -0.434 -0.587 -0.767 -0.961 -1.194 -1.473 -1.818 -3.054 -8 ,12913 ,TETRA ,17526189,Thu Nov 25 03:25:45 CET,Thu Nov 25 05:14:47 CET, -9 ,10490 ,TETRA ,17526192,Thu Nov 25 03:26:42 CET,Thu Nov 25 05:17:24 CET,0.0 0.359 0.556 0.692 0.822 0.936 1.049 1.169 1.392 1.493 1.582 1.617 1.845 1.931 2.071 2.213 2.345 2.41 2.541 2.657 2.822 2.928 3.032 3.179 3.325 3.467 3.592 3.722 3.904 4.078 4.259 4.484 4.688 4.886 5.119 5.373 5.608 5.87 6.153 6.445 6.754 7.08 7.452 7.844 8.276 8.705 9.178 9.68 10.245 10.78 11.024 10.829 10.484 10.057 9.559 9.086 8.658 8.216 7.791 7.349 6.97 6.648 6.34 6.038 5.761 5.527 5.275 5.037 4.837 4.612 4.366 4.173 3.976 3.775 3.614 3.44 3.26 3.059 2.866 2.735 2.596 2.373 2.216 2.058 1.969 1.775 1.576 1.375 1.281 1.048 0.95 0.814 0.659 0.356 0.182 -0.017 -0.232 -0.458 -0.694 -1.019 -2.315 -10 ,18341 ,TETRA ,17526194,Thu Nov 25 03:26:42 CET,Thu Nov 25 05:16:50 CET,0.0 0.351 0.547 0.71 0.838 0.95 1.054 1.158 1.358 1.454 1.55 1.598 1.822 1.907 2.044 2.16 2.277 2.337 2.458 2.571 2.731 2.845 2.954 3.11 3.262 3.392 3.51 3.626 3.775 3.915 4.06 4.252 4.444 4.635 4.849 5.073 5.287 5.529 5.783 6.051 6.326 6.635 7.014 7.404 7.86 8.352 8.908 9.446 9.929 10.388 10.662 10.459 9.994 9.493 9.019 8.54 8.085 7.644 7.24 6.835 6.479 6.135 5.813 5.532 5.26 5.004 4.754 4.531 4.338 4.122 3.884 3.689 3.489 3.283 3.116 2.943 2.765 2.583 2.403 2.279 2.152 1.954 1.815 1.667 1.58 1.399 1.2 0.969 0.852 0.593 0.464 0.33 0.198 -0.081 -0.238 -0.424 -0.605 -0.797 -1.036 -1.418 -2.844 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt deleted file mode 100644 index 52564565..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9436 ,TETRA ,17526196,Thu Nov 25 03:26:43 CET,Thu Nov 25 05:17:10 CET,0.0 0.843 1.165 1.404 1.599 1.775 1.929 2.072 2.356 2.474 2.573 2.652 2.886 2.983 3.179 3.349 3.515 3.598 3.754 3.913 4.161 4.315 4.46 4.658 4.839 5.025 5.215 5.394 5.62 5.842 6.058 6.307 6.544 6.776 7.039 7.319 7.594 7.899 8.235 8.593 8.953 9.363 9.837 10.337 10.908 11.499 12.164 12.867 13.625 14.465 15.187 15.344 15.133 14.79 14.415 14.028 13.663 13.31 12.986 12.641 12.314 12.02 11.741 11.455 11.183 10.937 10.683 10.457 10.26 10.046 9.808 9.616 9.403 9.169 8.987 8.803 8.619 8.417 8.226 8.112 7.986 7.775 7.633 7.488 7.399 7.187 6.954 6.729 6.619 6.369 6.236 6.104 5.96 5.603 5.42 5.222 5.004 4.791 4.518 4.13 2.97 -2 ,31598 ,TETRA ,17526198,Thu Nov 25 03:27:39 CET,Thu Nov 25 05:17:39 CET, -3 ,10709 ,TETRA ,17526200,Thu Nov 25 03:27:40 CET,Thu Nov 25 05:17:32 CET,0.0 0.493 0.667 0.805 0.927 1.048 1.17 1.286 1.486 1.574 1.661 1.704 1.928 2.012 2.166 2.312 2.456 2.527 2.672 2.809 2.99 3.102 3.218 3.385 3.545 3.7 3.849 3.999 4.191 4.378 4.558 4.781 5.013 5.248 5.498 5.777 6.066 6.381 6.71 7.063 7.439 7.868 8.377 8.862 9.407 9.973 10.573 11.231 11.983 12.772 13.447 13.66 13.546 13.304 13.01 12.648 12.262 11.889 11.552 11.178 10.863 10.602 10.331 10.063 9.806 9.569 9.312 9.083 8.892 8.683 8.469 8.284 8.083 7.869 7.697 7.516 7.319 7.125 6.908 6.76 6.628 6.415 6.272 6.119 6.036 5.889 5.741 5.56 5.465 5.232 5.125 5.004 4.883 4.626 4.486 4.321 4.127 3.927 3.686 3.4 2.085 -4 ,27068 ,TETRA ,17526202,Thu Nov 25 03:27:40 CET,Thu Nov 25 05:17:59 CET,0.0 0.448 0.65 0.828 0.976 1.112 1.24 1.374 1.639 1.773 1.903 1.998 2.238 2.344 2.546 2.738 2.924 3.011 3.166 3.32 3.535 3.666 3.8 3.997 4.197 4.386 4.555 4.722 4.947 5.171 5.38 5.62 5.849 6.068 6.328 6.627 6.907 7.212 7.551 7.925 8.297 8.696 9.175 9.655 10.194 10.756 11.374 12.084 12.85 13.574 14.153 14.27 14.13 13.885 13.547 13.162 12.806 12.468 12.139 11.794 11.479 11.171 10.875 10.586 10.309 10.068 9.816 9.591 9.399 9.189 8.963 8.769 8.584 8.381 8.212 8.037 7.857 7.665 7.457 7.32 7.169 6.92 6.749 6.588 6.509 6.339 6.163 5.978 5.883 5.664 5.593 5.48 5.354 5.077 4.919 4.757 4.577 4.379 4.156 3.773 2.796 -5 ,30783 ,TETRA ,17526204,Thu Nov 25 03:27:40 CET,Thu Nov 25 05:06:59 CET,0.0 0.665 0.869 1.058 1.211 1.33 1.446 1.563 1.756 1.834 1.919 1.949 2.163 2.237 2.369 2.501 2.636 2.699 2.826 2.959 3.157 3.274 3.388 3.571 3.755 3.914 4.056 4.202 4.4 4.589 4.772 4.992 5.206 5.412 5.647 5.908 6.171 6.482 6.815 7.155 7.509 7.903 8.359 8.819 9.337 9.875 10.488 11.16 11.875 12.597 13.243 13.446 13.245 12.88 12.504 12.143 11.757 11.379 11.058 10.71 10.39 10.087 9.8 9.529 9.277 9.031 8.779 8.565 8.356 8.133 7.908 7.707 7.504 7.299 7.129 6.951 6.764 6.573 6.373 6.234 6.09 5.864 5.727 5.584 5.507 5.353 5.176 4.998 4.903 4.671 4.586 4.475 4.36 4.097 3.958 3.8 3.62 3.398 3.157 2.902 1.906 -6 ,19118 ,TETRA ,17526206,Thu Nov 25 03:27:40 CET,Thu Nov 25 05:17:36 CET, -7 ,18441 ,TETRA ,17526207,Thu Nov 25 03:27:40 CET,Thu Nov 25 05:18:19 CET,0.0 0.446 0.64 0.855 1.04 1.184 1.331 1.462 1.667 1.758 1.847 1.896 2.12 2.199 2.347 2.502 2.661 2.74 2.884 3.037 3.268 3.402 3.532 3.733 3.936 4.128 4.305 4.472 4.688 4.898 5.097 5.339 5.576 5.797 6.052 6.334 6.615 6.926 7.251 7.608 7.984 8.385 8.855 9.331 9.851 10.414 11.048 11.743 12.49 13.237 13.88 14.071 13.849 13.493 13.141 12.776 12.381 11.993 11.65 11.286 10.951 10.642 10.362 10.088 9.797 9.533 9.269 9.034 8.836 8.627 8.387 8.196 7.998 7.782 7.623 7.465 7.286 7.089 6.885 6.751 6.617 6.397 6.253 6.119 6.047 5.903 5.748 5.557 5.452 5.215 5.131 5.025 4.916 4.687 4.57 4.405 4.206 4.005 3.754 3.437 2.2 -8 ,8383 ,TETRA ,17526208,Thu Nov 25 03:27:42 CET,Thu Nov 25 05:17:56 CET,0.0 0.549 0.781 0.975 1.123 1.253 1.38 1.496 1.697 1.787 1.882 1.932 2.151 2.235 2.388 2.527 2.668 2.731 2.846 2.965 3.14 3.257 3.372 3.545 3.71 3.867 4.021 4.174 4.374 4.568 4.757 4.973 5.18 5.383 5.614 5.869 6.114 6.402 6.734 7.099 7.482 7.896 8.358 8.818 9.342 9.899 10.505 11.159 11.875 12.631 13.297 13.488 13.314 13.003 12.649 12.282 11.901 11.514 11.188 10.838 10.521 10.236 9.946 9.662 9.408 9.181 8.933 8.687 8.47 8.266 8.044 7.853 7.666 7.472 7.309 7.133 6.969 6.803 6.63 6.505 6.371 6.175 6.03 5.862 5.777 5.615 5.457 5.278 5.179 4.954 4.878 4.771 4.66 4.397 4.245 4.052 3.829 3.612 3.356 3.018 1.477 -9 ,28908 ,TETRA ,17526209,Thu Nov 25 03:28:43 CET,Thu Nov 25 05:18:53 CET,0.0 0.42 0.61 0.777 0.924 1.05 1.181 1.304 1.55 1.66 1.76 1.836 2.069 2.166 2.364 2.558 2.733 2.816 2.982 3.151 3.388 3.518 3.653 3.856 4.05 4.243 4.421 4.591 4.814 5.026 5.235 5.499 5.752 5.986 6.244 6.529 6.808 7.115 7.452 7.817 8.191 8.597 9.064 9.508 10.017 10.584 11.204 11.906 12.65 13.362 14.012 14.235 14.087 13.8 13.457 13.091 12.713 12.352 12.03 11.678 11.361 11.067 10.771 10.474 10.194 9.947 9.687 9.447 9.235 9.014 8.791 8.61 8.422 8.222 8.064 7.901 7.731 7.558 7.384 7.254 7.11 6.9 6.759 6.614 6.545 6.393 6.219 6.016 5.913 5.684 5.607 5.487 5.352 5.085 4.94 4.791 4.614 4.407 4.181 3.886 2.683 -10 ,11638 ,TETRA ,17526210,Thu Nov 25 03:28:43 CET,Thu Nov 25 05:18:57 CET,0.0 0.31 0.47 0.613 0.75 0.869 0.984 1.093 1.303 1.403 1.488 1.516 1.731 1.824 2.011 2.178 2.352 2.439 2.606 2.761 2.98 3.129 3.276 3.487 3.684 3.851 4.016 4.19 4.422 4.641 4.842 5.084 5.32 5.541 5.796 6.098 6.38 6.696 7.041 7.397 7.775 8.176 8.635 9.096 9.628 10.201 10.837 11.536 12.26 12.936 13.624 13.901 13.722 13.414 13.05 12.661 12.278 11.923 11.605 11.257 10.946 10.654 10.366 10.099 9.829 9.568 9.297 9.05 8.846 8.632 8.392 8.208 8.017 7.797 7.619 7.428 7.234 7.032 6.82 6.676 6.534 6.313 6.163 6.0 5.912 5.746 5.583 5.416 5.331 5.11 5.039 4.922 4.805 4.544 4.392 4.242 4.094 3.902 3.666 3.337 2.183 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt deleted file mode 100644 index bfe03ee8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4n_CAT-4m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2878 ,TETRA ,17526212,Thu Nov 25 03:28:43 CET,Thu Nov 25 05:19:53 CET,0.0 0.771 0.995 1.191 1.363 1.504 1.662 1.822 2.063 2.174 2.279 2.324 2.545 2.63 2.8 2.97 3.135 3.221 3.4 3.568 3.814 3.97 4.116 4.322 4.527 4.737 4.932 5.115 5.364 5.605 5.831 6.099 6.355 6.602 6.884 7.201 7.497 7.819 8.172 8.566 8.994 9.47 10.024 10.582 11.197 11.855 12.617 13.449 14.419 15.487 16.52 17.068 17.148 17.058 16.906 16.723 16.498 16.227 15.982 15.725 15.475 15.251 15.04 14.829 14.623 14.429 14.232 14.06 13.899 13.716 13.535 13.381 13.216 13.053 12.923 12.787 12.642 12.47 12.292 12.179 12.067 11.889 11.756 11.613 11.544 11.403 11.244 11.078 10.997 10.79 10.72 10.617 10.508 10.238 10.088 9.924 9.742 9.538 9.254 8.943 8.128 -2 ,26474 ,TETRA ,17526214,Thu Nov 25 03:28:44 CET,Thu Nov 25 05:19:59 CET,0.0 0.679 0.917 1.109 1.26 1.398 1.535 1.655 1.884 1.999 2.106 2.173 2.404 2.494 2.67 2.836 2.996 3.073 3.225 3.369 3.565 3.696 3.829 4.013 4.185 4.359 4.527 4.695 4.917 5.121 5.314 5.57 5.832 6.072 6.358 6.688 7.0 7.351 7.718 8.104 8.526 8.995 9.529 10.066 10.679 11.371 12.147 12.967 13.902 14.933 16.012 16.623 16.773 16.716 16.554 16.335 16.095 15.848 15.61 15.376 15.163 14.947 14.747 14.556 14.371 14.202 14.029 13.877 13.746 13.61 13.456 13.325 13.188 13.053 12.945 12.831 12.719 12.596 12.467 12.378 12.276 12.111 12.002 11.88 11.812 11.681 11.547 11.396 11.321 11.121 11.082 11.007 10.921 10.711 10.593 10.483 10.371 10.194 9.988 9.768 9.182 -3 ,13720 ,TETRA ,17526216,Thu Nov 25 03:28:43 CET,Thu Nov 25 05:20:36 CET,0.0 0.777 1.039 1.243 1.4 1.519 1.646 1.777 2.012 2.121 2.214 2.265 2.495 2.58 2.738 2.888 3.041 3.118 3.271 3.412 3.609 3.733 3.852 4.028 4.203 4.383 4.558 4.723 4.931 5.136 5.336 5.582 5.835 6.088 6.387 6.702 6.99 7.327 7.689 8.08 8.502 8.947 9.48 10.038 10.681 11.362 12.113 12.962 13.923 15.003 16.076 16.619 16.745 16.704 16.532 16.314 16.105 15.883 15.639 15.369 15.14 14.91 14.677 14.469 14.267 14.08 13.88 13.689 13.526 13.354 13.156 12.996 12.838 12.658 12.52 12.382 12.238 12.085 11.928 11.815 11.695 11.522 11.385 11.227 11.153 11.013 10.857 10.694 10.612 10.401 10.337 10.227 10.115 9.897 9.771 9.631 9.487 9.336 9.19 8.93 8.343 -4 ,8507 ,TETRA ,17526218,Thu Nov 25 03:28:44 CET,Thu Nov 25 05:18:36 CET, -5 ,10927 ,TETRA ,17526220,Thu Nov 25 03:28:44 CET,Thu Nov 25 05:17:02 CET, -6 ,3049 ,TETRA ,17526222,Thu Nov 25 03:29:40 CET,Thu Nov 25 05:09:47 CET,0.0 0.703 0.93 1.109 1.256 1.393 1.528 1.651 1.869 1.963 2.059 2.118 2.34 2.436 2.633 2.809 2.96 3.031 3.17 3.309 3.532 3.673 3.801 3.986 4.161 4.32 4.474 4.636 4.853 5.055 5.242 5.469 5.706 5.94 6.202 6.488 6.761 7.069 7.412 7.81 8.234 8.705 9.261 9.805 10.419 11.082 11.858 12.725 13.654 14.695 15.819 16.524 16.72 16.667 16.509 16.31 16.103 15.871 15.641 15.392 15.178 14.986 14.771 14.553 14.345 14.15 13.954 13.779 13.627 13.467 13.289 13.129 12.967 12.805 12.672 12.529 12.382 12.227 12.077 11.969 11.846 11.65 11.512 11.372 11.301 11.157 11.002 10.818 10.717 10.494 10.422 10.327 10.229 9.985 9.831 9.672 9.505 9.292 9.042 8.768 8.155 -7 ,9108 ,TETRA ,17526224,Thu Nov 25 03:29:42 CET,Thu Nov 25 05:16:15 CET, -8 ,13277 ,TETRA ,17526226,Thu Nov 25 03:29:42 CET,Thu Nov 25 05:20:54 CET,0.0 0.476 0.693 0.861 0.996 1.132 1.266 1.381 1.602 1.706 1.809 1.865 2.08 2.16 2.325 2.489 2.645 2.72 2.863 3.004 3.221 3.362 3.494 3.687 3.878 4.059 4.236 4.417 4.648 4.861 5.062 5.3 5.528 5.76 6.045 6.381 6.689 7.003 7.347 7.721 8.117 8.571 9.106 9.648 10.272 10.96 11.75 12.624 13.563 14.531 15.51 16.105 16.234 16.157 16.019 15.851 15.629 15.4 15.208 14.963 14.735 14.523 14.3 14.093 13.896 13.701 13.496 13.323 13.168 12.994 12.805 12.645 12.485 12.32 12.186 12.044 11.897 11.74 11.58 11.466 11.34 11.162 11.054 10.957 10.901 10.767 10.634 10.51 10.443 10.244 10.231 10.147 10.051 9.83 9.693 9.555 9.427 9.292 9.129 8.928 8.579 -9 ,4177 ,TETRA ,17526228,Thu Nov 25 03:29:44 CET,Thu Nov 25 05:20:47 CET,0.0 0.649 0.945 1.129 1.282 1.407 1.534 1.663 1.902 2.014 2.122 2.18 2.411 2.503 2.659 2.806 2.958 3.043 3.206 3.347 3.557 3.695 3.828 4.023 4.203 4.381 4.559 4.735 4.971 5.198 5.424 5.704 5.977 6.236 6.528 6.852 7.154 7.486 7.844 8.221 8.617 9.072 9.617 10.156 10.784 11.49 12.264 13.115 14.121 15.215 16.258 16.793 16.896 16.834 16.688 16.472 16.237 16.014 15.793 15.54 15.296 15.069 14.862 14.665 14.465 14.272 14.069 13.883 13.724 13.543 13.342 13.18 13.025 12.861 12.723 12.575 12.425 12.272 12.125 12.03 11.927 11.781 11.679 11.566 11.506 11.384 11.254 11.109 11.036 10.833 10.79 10.708 10.63 10.452 10.334 10.219 10.098 9.955 9.77 9.527 8.791 -10 ,29017 ,TETRA ,17526230,Thu Nov 25 03:29:42 CET,Thu Nov 25 05:20:16 CET, diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt deleted file mode 100644 index e6cdd520..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-13m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26332 ,KEBNE ,17024459,Wed Dec 22 10:04:27 CET,Wed Dec 22 11:39:27 CET,0.0 0.532 0.777 0.915 1.03 1.114 1.189 1.243 1.353 1.404 1.434 1.363 1.496 1.509 1.515 1.506 1.51 1.508 1.482 1.443 1.375 1.337 1.297 1.216 1.129 1.046 0.948 0.836 0.686 0.529 0.36 0.148 -0.069 -0.294 -0.577 -0.929 -1.314 -1.772 -2.268 -2.848 -3.532 -4.376 -5.453 -6.631 -8.128 -9.943 -12.291 -15.281 -19.287 -24.853 -33.162 -41.945 -48.408 -53.503 -57.64 -61.108 -63.967 -66.407 -68.424 -70.379 -71.986 -73.354 -74.622 -75.775 -76.826 -77.77 -78.714 -79.536 -80.237 -80.944 -81.67 -82.254 -82.841 -83.447 -83.902 -84.358 -84.823 -85.282 -85.74 -86.056 -86.373 -86.861 -87.202 -87.546 -87.719 -88.066 -88.411 -88.755 -88.933 -89.334 -89.513 -89.713 -89.914 -90.312 -90.53 -90.762 -91.025 -91.312 -91.585 -91.891 -92.463 -2 ,29197 ,KEBNE ,17024460,Wed Dec 22 10:04:27 CET,Wed Dec 22 11:39:27 CET,0.0 0.417 0.582 0.66 0.713 0.748 0.765 0.784 0.823 0.824 0.819 0.688 0.804 0.802 0.779 0.747 0.696 0.665 0.611 0.558 0.474 0.406 0.334 0.223 0.107 -0.011 -0.14 -0.275 -0.45 -0.608 -0.777 -1.015 -1.254 -1.5 -1.799 -2.158 -2.546 -3.0 -3.519 -4.11 -4.777 -5.602 -6.653 -7.793 -9.242 -11.041 -13.395 -16.384 -20.358 -25.87 -34.107 -42.855 -49.407 -54.506 -58.579 -62.066 -64.954 -67.405 -69.427 -71.376 -72.983 -74.349 -75.628 -76.797 -77.837 -78.777 -79.736 -80.56 -81.262 -81.978 -82.7 -83.282 -83.858 -84.43 -84.868 -85.312 -85.756 -86.206 -86.671 -86.981 -87.294 -87.785 -88.12 -88.458 -88.626 -88.963 -89.312 -89.683 -89.873 -90.269 -90.424 -90.621 -90.821 -91.241 -91.472 -91.711 -91.976 -92.257 -92.552 -92.889 -93.451 -3 ,26904 ,KEBNE ,17024461,Wed Dec 22 10:04:27 CET,Wed Dec 22 11:39:17 CET,0.0 0.385 0.547 0.623 0.699 0.748 0.755 0.77 0.79 0.791 0.791 0.662 0.77 0.755 0.735 0.706 0.668 0.654 0.629 0.602 0.556 0.522 0.483 0.408 0.32 0.236 0.152 0.054 -0.086 -0.24 -0.402 -0.605 -0.805 -1.027 -1.309 -1.649 -2.035 -2.486 -2.998 -3.574 -4.221 -5.027 -6.041 -7.179 -8.64 -10.401 -12.693 -15.674 -19.737 -25.333 -33.631 -42.412 -48.921 -54.058 -58.161 -61.578 -64.404 -66.844 -68.869 -70.806 -72.404 -73.778 -75.03 -76.176 -77.22 -78.164 -79.126 -79.936 -80.622 -81.322 -82.036 -82.621 -83.217 -83.821 -84.279 -84.753 -85.225 -85.691 -86.173 -86.508 -86.852 -87.359 -87.687 -88.018 -88.185 -88.52 -88.863 -89.221 -89.409 -89.812 -89.982 -90.174 -90.373 -90.818 -91.051 -91.282 -91.531 -91.789 -92.063 -92.365 -93.019 -4 ,24089 ,KEBNE ,17024462,Wed Dec 22 10:05:28 CET,Wed Dec 22 11:40:35 CET,0.0 0.365 0.513 0.569 0.607 0.636 0.655 0.675 0.732 0.753 0.76 0.649 0.761 0.748 0.71 0.664 0.618 0.596 0.544 0.485 0.386 0.317 0.249 0.141 0.023 -0.104 -0.227 -0.356 -0.529 -0.697 -0.883 -1.13 -1.381 -1.624 -1.936 -2.331 -2.73 -3.203 -3.746 -4.354 -5.025 -5.843 -6.884 -8.003 -9.45 -11.227 -13.552 -16.536 -20.464 -26.022 -34.375 -43.144 -49.746 -54.916 -59.036 -62.5 -65.345 -67.761 -69.752 -71.686 -73.298 -74.68 -75.956 -77.11 -78.152 -79.077 -80.01 -80.829 -81.516 -82.203 -82.904 -83.477 -84.047 -84.621 -85.064 -85.511 -85.965 -86.418 -86.882 -87.2 -87.515 -87.986 -88.312 -88.645 -88.815 -89.17 -89.538 -89.916 -90.103 -90.503 -90.682 -90.881 -91.077 -91.48 -91.695 -91.924 -92.165 -92.422 -92.677 -92.979 -93.719 -5 ,10038 ,KEBNE ,17024463,Wed Dec 22 10:05:28 CET,Wed Dec 22 11:40:08 CET,0.0 0.151 0.249 0.333 0.392 0.438 0.462 0.459 0.44 0.442 0.448 0.322 0.432 0.429 0.417 0.383 0.345 0.329 0.283 0.229 0.132 0.069 0.008 -0.099 -0.216 -0.337 -0.464 -0.589 -0.764 -0.949 -1.124 -1.364 -1.623 -1.874 -2.188 -2.572 -2.949 -3.398 -3.923 -4.518 -5.202 -6.021 -7.058 -8.213 -9.704 -11.52 -13.849 -16.849 -20.848 -26.403 -34.721 -43.507 -50.016 -55.11 -59.192 -62.644 -65.534 -68.021 -70.037 -71.951 -73.557 -74.932 -76.204 -77.379 -78.439 -79.388 -80.331 -81.16 -81.876 -82.593 -83.322 -83.905 -84.504 -85.133 -85.609 -86.084 -86.57 -87.072 -87.576 -87.908 -88.238 -88.744 -89.097 -89.457 -89.64 -90.008 -90.385 -90.772 -90.974 -91.402 -91.628 -91.85 -92.068 -92.514 -92.76 -93.008 -93.25 -93.487 -93.75 -94.057 -94.534 -6 ,24945 ,KEBNE ,17024464,Wed Dec 22 10:05:28 CET,Wed Dec 22 11:39:54 CET,0.0 0.326 0.393 0.46 0.524 0.558 0.58 0.626 0.747 0.786 0.804 0.696 0.814 0.822 0.834 0.837 0.82 0.81 0.792 0.762 0.702 0.654 0.604 0.531 0.459 0.372 0.28 0.188 0.042 -0.116 -0.276 -0.473 -0.695 -0.945 -1.245 -1.595 -1.958 -2.41 -2.942 -3.535 -4.219 -5.037 -6.064 -7.214 -8.689 -10.511 -12.837 -15.795 -19.794 -25.312 -33.61 -42.409 -48.931 -54.07 -58.153 -61.569 -64.427 -66.894 -68.918 -70.869 -72.491 -73.876 -75.156 -76.321 -77.38 -78.339 -79.298 -80.127 -80.839 -81.568 -82.301 -82.896 -83.498 -84.095 -84.547 -85.003 -85.466 -85.966 -86.48 -86.811 -87.146 -87.658 -88.002 -88.358 -88.541 -88.917 -89.317 -89.724 -89.92 -90.317 -90.489 -90.693 -90.897 -91.319 -91.542 -91.765 -91.987 -92.23 -92.505 -92.835 -93.551 -7 ,17133 ,KEBNE ,17024465,Wed Dec 22 10:05:28 CET,Wed Dec 22 11:40:39 CET,0.0 0.233 0.339 0.445 0.518 0.57 0.607 0.629 0.673 0.686 0.684 0.557 0.677 0.673 0.641 0.6 0.565 0.553 0.529 0.509 0.469 0.431 0.393 0.31 0.204 0.104 0.013 -0.07 -0.209 -0.373 -0.537 -0.758 -0.984 -1.229 -1.543 -1.926 -2.323 -2.773 -3.289 -3.887 -4.572 -5.388 -6.42 -7.582 -9.088 -10.96 -13.31 -16.264 -20.239 -25.758 -34.104 -42.961 -49.478 -54.596 -58.68 -62.125 -64.997 -67.465 -69.511 -71.462 -73.065 -74.447 -75.729 -76.897 -77.95 -78.883 -79.816 -80.636 -81.333 -82.043 -82.766 -83.351 -83.952 -84.555 -85.013 -85.483 -85.956 -86.444 -86.944 -87.278 -87.616 -88.129 -88.487 -88.853 -89.039 -89.42 -89.8 -90.164 -90.346 -90.749 -90.908 -91.097 -91.292 -91.715 -91.933 -92.157 -92.405 -92.667 -92.943 -93.287 -93.954 -8 ,22854 ,KEBNE ,17024466,Wed Dec 22 10:05:28 CET,Wed Dec 22 11:40:17 CET,0.0 0.635 0.767 0.808 0.845 0.878 0.89 0.889 0.877 0.874 0.876 0.742 0.854 0.857 0.861 0.861 0.851 0.847 0.831 0.796 0.736 0.697 0.645 0.552 0.468 0.375 0.269 0.161 0.027 -0.093 -0.231 -0.445 -0.686 -0.929 -1.233 -1.608 -1.985 -2.433 -2.963 -3.568 -4.241 -5.042 -6.066 -7.207 -8.666 -10.471 -12.771 -15.714 -19.692 -25.255 -33.561 -42.377 -48.919 -54.017 -58.128 -61.559 -64.362 -66.801 -68.816 -70.72 -72.303 -73.687 -74.964 -76.136 -77.187 -78.096 -79.029 -79.861 -80.558 -81.272 -82.006 -82.595 -83.196 -83.802 -84.248 -84.705 -85.179 -85.654 -86.144 -86.479 -86.815 -87.34 -87.703 -88.062 -88.237 -88.582 -88.918 -89.268 -89.445 -89.834 -89.999 -90.196 -90.405 -90.85 -91.064 -91.284 -91.532 -91.801 -92.091 -92.399 -92.933 -9 ,20642 ,KEBNE ,17024467,Wed Dec 22 10:05:28 CET,Wed Dec 22 11:40:55 CET,0.0 0.436 0.582 0.654 0.687 0.725 0.767 0.79 0.809 0.82 0.832 0.725 0.831 0.819 0.794 0.752 0.696 0.666 0.614 0.561 0.464 0.4 0.334 0.231 0.122 0.007 -0.112 -0.239 -0.428 -0.631 -0.827 -1.061 -1.304 -1.556 -1.863 -2.243 -2.631 -3.086 -3.624 -4.233 -4.927 -5.761 -6.795 -7.952 -9.415 -11.213 -13.549 -16.531 -20.539 -26.116 -34.485 -43.321 -49.938 -55.086 -59.153 -62.596 -65.445 -67.894 -69.923 -71.881 -73.515 -74.909 -76.191 -77.387 -78.45 -79.39 -80.345 -81.164 -81.853 -82.545 -83.259 -83.841 -84.428 -85.027 -85.482 -85.951 -86.432 -86.921 -87.42 -87.754 -88.085 -88.578 -88.91 -89.245 -89.412 -89.738 -90.079 -90.449 -90.636 -91.031 -91.185 -91.374 -91.575 -91.988 -92.206 -92.427 -92.647 -92.872 -93.129 -93.448 -94.029 -10 ,3716 ,KEBNE ,17024468,Wed Dec 22 10:05:28 CET,Wed Dec 22 11:40:00 CET,0.0 0.369 0.512 0.591 0.626 0.654 0.664 0.675 0.698 0.693 0.687 0.566 0.678 0.674 0.651 0.619 0.586 0.563 0.512 0.461 0.36 0.293 0.228 0.117 -0.004 -0.13 -0.255 -0.375 -0.533 -0.716 -0.908 -1.154 -1.405 -1.656 -1.969 -2.337 -2.716 -3.149 -3.654 -4.263 -4.949 -5.776 -6.836 -8.021 -9.535 -11.353 -13.673 -16.62 -20.588 -26.153 -34.496 -43.241 -49.728 -54.834 -58.919 -62.362 -65.206 -67.631 -69.626 -71.563 -73.19 -74.574 -75.838 -76.997 -78.034 -78.947 -79.884 -80.714 -81.422 -82.13 -82.825 -83.387 -83.971 -84.563 -85.002 -85.456 -85.922 -86.378 -86.838 -87.148 -87.463 -87.951 -88.287 -88.618 -88.792 -89.142 -89.48 -89.835 -90.02 -90.424 -90.614 -90.815 -91.017 -91.442 -91.669 -91.901 -92.149 -92.425 -92.723 -93.074 -93.617 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt deleted file mode 100644 index 81507e11..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/BACE/water/Summary_FEP_CAT-4p_CAT-4o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2448 ,TETRA ,17526232,Thu Nov 25 03:29:44 CET,Thu Nov 25 05:20:00 CET,0.0 0.696 0.909 1.078 1.238 1.389 1.536 1.664 1.889 1.987 2.08 2.142 2.348 2.437 2.596 2.742 2.882 2.953 3.094 3.224 3.408 3.524 3.643 3.823 3.994 4.161 4.326 4.489 4.693 4.886 5.08 5.314 5.56 5.804 6.075 6.396 6.707 7.045 7.422 7.824 8.24 8.682 9.198 9.726 10.335 11.018 11.778 12.619 13.592 14.679 15.849 16.586 16.867 16.95 16.902 16.799 16.67 16.507 16.326 16.109 15.916 15.738 15.538 15.34 15.16 14.985 14.815 14.667 14.532 14.399 14.274 14.164 14.041 13.917 13.824 13.721 13.612 13.495 13.364 13.278 13.191 13.04 12.932 12.819 12.762 12.637 12.503 12.374 12.306 12.128 12.073 11.983 11.893 11.725 11.63 11.502 11.344 11.182 11.013 10.79 9.651 -2 ,12933 ,TETRA ,17526234,Thu Nov 25 03:29:42 CET,Thu Nov 25 05:19:25 CET,0.0 0.615 0.81 0.987 1.122 1.255 1.397 1.527 1.742 1.832 1.914 1.978 2.185 2.268 2.436 2.603 2.756 2.827 2.961 3.096 3.308 3.442 3.569 3.752 3.93 4.108 4.279 4.437 4.636 4.828 5.011 5.228 5.448 5.653 5.898 6.185 6.458 6.763 7.089 7.455 7.853 8.292 8.792 9.286 9.86 10.521 11.292 12.146 13.112 14.186 15.377 16.178 16.487 16.567 16.534 16.434 16.303 16.146 15.971 15.796 15.63 15.451 15.258 15.075 14.917 14.764 14.599 14.453 14.31 14.149 13.981 13.831 13.665 13.5 13.379 13.252 13.121 12.981 12.836 12.738 12.641 12.497 12.388 12.273 12.208 12.074 11.947 11.811 11.744 11.568 11.529 11.454 11.372 11.175 11.065 10.946 10.83 10.694 10.522 10.307 9.812 -3 ,6067 ,TETRA ,17526236,Thu Nov 25 03:30:43 CET,Thu Nov 25 05:20:24 CET,0.0 0.518 0.697 0.847 0.994 1.144 1.273 1.391 1.618 1.718 1.811 1.879 2.084 2.168 2.328 2.484 2.636 2.708 2.836 2.971 3.162 3.28 3.402 3.578 3.751 3.928 4.101 4.259 4.447 4.629 4.82 5.043 5.258 5.473 5.72 5.998 6.268 6.556 6.86 7.202 7.554 7.942 8.404 8.857 9.415 10.056 10.767 11.563 12.483 13.546 14.685 15.393 15.646 15.668 15.575 15.436 15.269 15.078 14.898 14.704 14.507 14.324 14.147 13.981 13.804 13.631 13.459 13.29 13.149 12.999 12.839 12.709 12.554 12.387 12.265 12.125 11.963 11.801 11.644 11.538 11.435 11.281 11.182 11.08 11.025 10.93 10.823 10.686 10.616 10.439 10.392 10.316 10.239 10.062 9.957 9.823 9.671 9.502 9.325 9.127 8.63 -4 ,3073 ,TETRA ,17526238,Thu Nov 25 03:30:43 CET,Thu Nov 25 05:12:58 CET,0.0 0.512 0.704 0.87 1.026 1.158 1.272 1.375 1.572 1.667 1.761 1.815 2.013 2.1 2.267 2.41 2.546 2.628 2.807 2.971 3.213 3.367 3.508 3.714 3.914 4.105 4.285 4.458 4.678 4.896 5.121 5.388 5.623 5.847 6.123 6.447 6.755 7.072 7.411 7.785 8.168 8.603 9.129 9.646 10.223 10.859 11.574 12.385 13.343 14.411 15.569 16.329 16.595 16.646 16.577 16.431 16.268 16.105 15.92 15.729 15.551 15.377 15.213 15.048 14.89 14.738 14.574 14.423 14.277 14.125 13.971 13.844 13.712 13.567 13.447 13.304 13.156 13.024 12.899 12.815 12.729 12.588 12.477 12.365 12.308 12.18 12.046 11.922 11.86 11.684 11.639 11.557 11.477 11.308 11.191 11.076 10.944 10.773 10.579 10.294 9.454 -5 ,18766 ,TETRA ,17526239,Thu Nov 25 03:30:43 CET,Thu Nov 25 05:16:01 CET, -6 ,11321 ,TETRA ,17526242,Thu Nov 25 03:30:43 CET,Thu Nov 25 05:20:18 CET,0.0 0.751 0.916 1.088 1.24 1.373 1.502 1.622 1.853 1.964 2.067 2.122 2.322 2.408 2.566 2.724 2.907 2.999 3.159 3.308 3.535 3.688 3.823 4.013 4.205 4.389 4.581 4.769 5.002 5.223 5.438 5.699 5.944 6.179 6.464 6.803 7.114 7.444 7.819 8.219 8.628 9.077 9.597 10.118 10.726 11.403 12.168 13.007 13.943 14.986 16.134 16.893 17.148 17.191 17.155 17.059 16.915 16.719 16.525 16.344 16.173 16.007 15.832 15.649 15.48 15.323 15.156 15.004 14.874 14.735 14.573 14.43 14.272 14.105 13.974 13.839 13.708 13.564 13.397 13.28 13.166 12.983 12.856 12.72 12.649 12.5 12.341 12.166 12.079 11.895 11.828 11.743 11.653 11.418 11.301 11.193 11.058 10.906 10.735 10.463 9.683 -7 ,295 ,TETRA ,17526244,Thu Nov 25 03:30:43 CET,Thu Nov 25 05:13:48 CET, -8 ,6707 ,TETRA ,17526246,Thu Nov 25 03:30:47 CET,Thu Nov 25 05:20:48 CET,0.0 0.438 0.634 0.808 0.962 1.101 1.23 1.355 1.57 1.662 1.752 1.808 2.004 2.087 2.25 2.402 2.547 2.621 2.762 2.904 3.117 3.253 3.399 3.609 3.805 3.99 4.175 4.354 4.571 4.787 5.004 5.265 5.508 5.74 6.023 6.34 6.637 6.963 7.31 7.692 8.093 8.535 9.059 9.589 10.181 10.82 11.588 12.403 13.289 14.314 15.408 16.183 16.513 16.607 16.556 16.443 16.308 16.138 15.958 15.761 15.585 15.427 15.264 15.088 14.917 14.751 14.562 14.372 14.217 14.074 13.917 13.779 13.626 13.465 13.343 13.217 13.078 12.928 12.764 12.65 12.527 12.336 12.207 12.071 12.0 11.865 11.732 11.585 11.5 11.295 11.204 11.103 10.987 10.737 10.589 10.427 10.262 10.077 9.838 9.527 8.905 -9 ,12347 ,TETRA ,17526248,Thu Nov 25 03:31:42 CET,Thu Nov 25 05:16:16 CET, -10 ,25481 ,TETRA ,17526250,Thu Nov 25 03:31:41 CET,Thu Nov 25 05:14:41 CET, diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_17_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_17_1h1q.txt deleted file mode 100644 index b2773cbe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_17_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13170 ,TETRA ,17525961,Thu Nov 25 02:42:38 CET,Thu Nov 25 05:42:08 CET,0.0 0.707 0.976 1.182 1.372 1.551 1.707 1.855 2.133 2.254 2.361 2.264 2.679 2.763 2.933 3.105 3.263 3.338 3.484 3.622 3.832 3.978 4.115 4.303 4.483 4.651 4.811 4.962 5.158 5.344 5.526 5.752 5.961 6.152 6.378 6.625 6.861 7.12 7.402 7.716 8.04 8.377 8.75 9.117 9.537 10.025 10.553 11.062 11.648 12.24 12.665 12.76 12.607 12.268 11.878 11.55 11.222 10.886 10.59 10.262 9.933 9.626 9.351 9.083 8.825 8.575 8.321 8.081 7.856 7.637 7.415 7.239 7.067 6.879 6.713 6.527 6.317 6.087 5.856 5.696 5.533 5.274 5.094 4.912 4.816 4.607 4.377 4.158 4.05 3.623 3.686 3.545 3.386 3.06 2.863 2.644 2.419 2.152 1.811 1.363 0.515 -2 ,2724 ,TETRA ,17525963,Thu Nov 25 02:43:39 CET,Thu Nov 25 05:46:05 CET,0.0 0.433 0.709 0.901 1.079 1.248 1.407 1.549 1.82 1.942 2.049 1.931 2.348 2.442 2.61 2.766 2.916 2.992 3.139 3.277 3.477 3.604 3.721 3.888 4.053 4.207 4.354 4.483 4.66 4.846 5.015 5.229 5.433 5.626 5.852 6.102 6.338 6.59 6.85 7.125 7.417 7.737 8.096 8.425 8.788 9.229 9.705 10.121 10.541 10.933 11.163 11.093 10.755 10.359 10.012 9.657 9.306 8.977 8.675 8.341 8.032 7.755 7.485 7.229 6.995 6.765 6.514 6.289 6.087 5.876 5.64 5.412 5.169 4.923 4.734 4.551 4.348 4.128 3.908 3.749 3.587 3.34 3.166 2.986 2.884 2.666 2.444 2.23 2.123 1.691 1.714 1.548 1.381 0.994 0.768 0.539 0.289 -0.023 -0.382 -0.754 -1.716 -3 ,21058 ,TETRA ,17525965,Thu Nov 25 02:44:41 CET,Thu Nov 25 05:41:23 CET,0.0 0.472 0.758 0.979 1.159 1.304 1.432 1.555 1.79 1.912 2.037 1.936 2.341 2.426 2.598 2.765 2.92 2.994 3.133 3.274 3.488 3.622 3.744 3.921 4.086 4.249 4.412 4.563 4.759 4.95 5.133 5.349 5.546 5.745 5.982 6.225 6.461 6.729 7.014 7.321 7.63 7.965 8.345 8.737 9.207 9.705 10.232 10.771 11.387 12.032 12.657 13.015 13.043 12.92 12.706 12.427 12.084 11.698 11.36 11.008 10.701 10.415 10.118 9.833 9.563 9.32 9.084 8.873 8.682 8.476 8.269 8.115 7.949 7.756 7.597 7.444 7.289 7.108 6.901 6.764 6.64 6.441 6.283 6.128 6.053 5.894 5.698 5.448 5.325 4.885 4.91 4.771 4.614 4.269 4.057 3.836 3.646 3.424 3.15 2.798 2.064 -4 ,25464 ,TETRA ,17525967,Thu Nov 25 02:45:42 CET,Thu Nov 25 05:46:04 CET,0.0 0.355 0.591 0.787 0.966 1.144 1.31 1.458 1.713 1.828 1.929 1.796 2.202 2.292 2.46 2.621 2.776 2.85 2.999 3.146 3.356 3.489 3.609 3.769 3.919 4.071 4.233 4.386 4.573 4.756 4.938 5.165 5.378 5.582 5.824 6.089 6.327 6.577 6.858 7.155 7.453 7.791 8.173 8.548 8.974 9.449 9.982 10.567 11.25 11.953 12.611 12.785 12.623 12.35 11.992 11.628 11.253 10.869 10.539 10.205 9.911 9.627 9.349 9.09 8.857 8.638 8.387 8.163 7.961 7.746 7.537 7.365 7.164 6.941 6.779 6.626 6.459 6.277 6.077 5.927 5.773 5.514 5.332 5.149 5.058 4.89 4.709 4.497 4.369 3.942 4.047 3.936 3.809 3.498 3.322 3.131 2.935 2.719 2.464 2.154 1.131 -5 ,1156 ,TETRA ,17525969,Thu Nov 25 02:46:41 CET,Thu Nov 25 05:47:53 CET,0.0 0.313 0.52 0.708 0.875 1.034 1.194 1.331 1.596 1.72 1.838 1.745 2.159 2.251 2.426 2.59 2.742 2.812 2.946 3.083 3.281 3.406 3.524 3.689 3.853 4.028 4.2 4.356 4.552 4.737 4.906 5.114 5.321 5.521 5.757 6.013 6.243 6.493 6.755 7.027 7.301 7.621 8.012 8.392 8.83 9.321 9.847 10.418 11.065 11.718 12.291 12.465 12.3 12.012 11.695 11.319 10.927 10.546 10.193 9.835 9.53 9.272 9.026 8.776 8.502 8.249 8.02 7.813 7.633 7.448 7.254 7.091 6.906 6.697 6.523 6.35 6.167 5.969 5.783 5.653 5.504 5.275 5.124 4.974 4.898 4.74 4.575 4.398 4.307 3.899 3.969 3.831 3.683 3.337 3.144 2.945 2.732 2.5 2.252 1.912 1.302 -8 ,1062 ,TETRA ,17525976,Thu Nov 25 02:48:43 CET,Thu Nov 25 05:47:17 CET,0.0 0.503 0.789 1.049 1.249 1.408 1.56 1.692 1.928 2.038 2.143 2.034 2.454 2.546 2.72 2.894 3.056 3.129 3.279 3.423 3.62 3.748 3.873 4.06 4.237 4.398 4.559 4.711 4.899 5.077 5.242 5.449 5.651 5.845 6.075 6.337 6.587 6.859 7.146 7.454 7.778 8.145 8.564 8.959 9.397 9.859 10.394 10.995 11.622 12.234 12.757 12.798 12.633 12.386 12.065 11.726 11.387 11.026 10.687 10.31 9.98 9.7 9.42 9.161 8.919 8.681 8.426 8.194 7.98 7.723 7.439 7.214 6.991 6.758 6.573 6.384 6.185 5.971 5.743 5.589 5.441 5.205 5.025 4.838 4.743 4.546 4.337 4.092 3.96 3.515 3.548 3.405 3.264 2.949 2.763 2.541 2.303 2.038 1.732 1.376 0.512 -9 ,27601 ,TETRA ,17525978,Thu Nov 25 02:50:43 CET,Thu Nov 25 05:51:19 CET,0.0 0.564 0.821 1.02 1.185 1.342 1.496 1.635 1.873 1.984 2.086 1.951 2.362 2.455 2.618 2.778 2.924 2.992 3.137 3.285 3.491 3.616 3.74 3.915 4.072 4.217 4.358 4.496 4.687 4.875 5.052 5.271 5.479 5.67 5.893 6.163 6.422 6.691 6.982 7.277 7.567 7.892 8.264 8.642 9.104 9.589 10.111 10.668 11.244 11.872 12.47 12.66 12.467 12.158 11.898 11.654 11.4 11.088 10.791 10.475 10.184 9.902 9.605 9.335 9.106 8.917 8.711 8.497 8.297 8.089 7.848 7.644 7.442 7.229 7.06 6.884 6.694 6.476 6.24 6.082 5.923 5.668 5.489 5.31 5.211 5.001 4.788 4.568 4.448 3.998 4.021 3.876 3.718 3.38 3.204 3.019 2.795 2.521 2.189 1.778 0.981 -10 ,27140 ,TETRA ,17525980,Thu Nov 25 02:50:43 CET,Thu Nov 25 05:52:40 CET,0.0 0.342 0.598 0.798 1.017 1.222 1.359 1.479 1.706 1.809 1.915 1.791 2.198 2.289 2.452 2.611 2.769 2.842 2.986 3.128 3.328 3.456 3.577 3.755 3.929 4.09 4.253 4.415 4.619 4.817 5.004 5.212 5.417 5.619 5.855 6.127 6.388 6.657 6.93 7.225 7.535 7.877 8.257 8.622 9.068 9.552 10.063 10.58 11.159 11.741 12.17 12.139 11.934 11.673 11.336 10.945 10.535 10.157 9.843 9.521 9.221 8.939 8.67 8.39 8.114 7.857 7.584 7.366 7.187 6.997 6.806 6.644 6.464 6.26 6.103 5.941 5.753 5.557 5.343 5.183 5.02 4.781 4.622 4.43 4.328 4.141 3.943 3.736 3.624 3.191 3.217 3.057 2.896 2.578 2.419 2.216 1.968 1.696 1.365 0.924 -0.026 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_17.txt deleted file mode 100644 index e96fdb1a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_17.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28739 ,TETRA ,17525982,Thu Nov 25 02:51:46 CET,Thu Nov 25 05:53:55 CET,0.0 0.355 0.59 0.781 0.96 1.142 1.323 1.481 1.752 1.892 2.018 1.909 2.327 2.422 2.622 2.806 2.961 3.039 3.209 3.373 3.591 3.733 3.867 4.043 4.205 4.362 4.534 4.692 4.874 5.051 5.217 5.421 5.62 5.817 6.06 6.321 6.545 6.782 7.057 7.358 7.649 7.991 8.384 8.734 9.165 9.659 10.204 10.779 11.378 11.977 12.528 12.799 12.787 12.598 12.379 12.146 11.903 11.659 11.404 11.119 10.868 10.641 10.425 10.218 10.033 9.859 9.67 9.491 9.327 9.134 8.941 8.816 8.683 8.53 8.413 8.286 8.141 7.98 7.817 7.714 7.611 7.443 7.302 7.16 7.098 6.96 6.82 6.673 6.593 6.191 6.311 6.218 6.122 5.908 5.781 5.643 5.512 5.334 5.117 4.839 4.2 -2 ,10974 ,TETRA ,17525984,Thu Nov 25 02:52:43 CET,Thu Nov 25 05:55:24 CET,0.0 0.605 0.891 1.114 1.335 1.516 1.671 1.817 2.088 2.222 2.36 2.277 2.699 2.794 2.972 3.147 3.306 3.385 3.537 3.68 3.903 4.044 4.167 4.346 4.532 4.703 4.86 5.014 5.208 5.396 5.578 5.786 5.985 6.182 6.41 6.654 6.878 7.142 7.421 7.722 8.049 8.388 8.763 9.144 9.588 10.045 10.526 11.024 11.582 12.163 12.674 12.858 12.766 12.591 12.405 12.17 11.912 11.667 11.459 11.251 11.054 10.867 10.679 10.479 10.296 10.12 9.936 9.776 9.636 9.498 9.349 9.217 9.076 8.916 8.785 8.65 8.517 8.37 8.205 8.097 7.993 7.817 7.689 7.554 7.484 7.346 7.203 7.05 6.96 6.54 6.66 6.564 6.467 6.237 6.11 5.966 5.802 5.612 5.361 5.045 4.339 -6 ,564 ,TETRA ,17525992,Thu Nov 25 02:55:46 CET,Thu Nov 25 05:58:01 CET,0.0 0.629 0.927 1.146 1.332 1.503 1.668 1.833 2.149 2.294 2.426 2.349 2.785 2.883 3.076 3.264 3.433 3.516 3.683 3.83 4.03 4.158 4.285 4.465 4.643 4.823 4.989 5.146 5.358 5.567 5.759 5.985 6.206 6.41 6.655 6.948 7.217 7.492 7.789 8.096 8.4 8.739 9.126 9.511 9.952 10.436 10.97 11.505 12.092 12.676 13.171 13.376 13.33 13.162 12.926 12.65 12.37 12.104 11.886 11.668 11.449 11.222 10.998 10.788 10.579 10.377 10.184 10.02 9.865 9.693 9.504 9.34 9.18 9.014 8.886 8.764 8.638 8.498 8.349 8.246 8.139 7.973 7.83 7.679 7.609 7.463 7.311 7.151 7.064 6.652 6.744 6.63 6.523 6.278 6.139 5.998 5.848 5.661 5.434 5.129 4.466 -7 ,7258 ,TETRA ,17525994,Thu Nov 25 02:57:42 CET,Thu Nov 25 05:55:49 CET,0.0 0.447 0.698 0.902 1.088 1.262 1.438 1.601 1.884 2.005 2.12 2.032 2.451 2.541 2.721 2.896 3.059 3.135 3.291 3.454 3.695 3.835 3.967 4.164 4.34 4.51 4.678 4.85 5.052 5.233 5.421 5.646 5.852 6.046 6.273 6.513 6.737 6.993 7.281 7.596 7.925 8.293 8.72 9.144 9.61 10.088 10.615 11.168 11.737 12.337 12.876 13.05 12.943 12.694 12.401 12.135 11.901 11.674 11.469 11.258 11.04 10.825 10.637 10.449 10.261 10.092 9.915 9.755 9.613 9.463 9.297 9.156 9.005 8.834 8.709 8.574 8.435 8.309 8.168 8.057 7.945 7.773 7.651 7.513 7.44 7.301 7.144 6.973 6.891 6.499 6.631 6.531 6.433 6.209 6.067 5.904 5.727 5.558 5.388 5.156 4.546 -8 ,234 ,TETRA ,17525996,Thu Nov 25 02:58:43 CET,Thu Nov 25 06:03:32 CET,0.0 0.588 0.886 1.1 1.297 1.48 1.644 1.786 2.035 2.146 2.257 2.16 2.58 2.666 2.83 2.999 3.175 3.262 3.429 3.582 3.788 3.917 4.037 4.21 4.375 4.541 4.7 4.858 5.067 5.257 5.431 5.639 5.834 6.019 6.24 6.486 6.712 6.956 7.222 7.503 7.798 8.13 8.514 8.89 9.307 9.745 10.251 10.784 11.351 11.94 12.488 12.729 12.642 12.437 12.186 11.912 11.671 11.442 11.237 10.998 10.765 10.567 10.371 10.179 9.999 9.818 9.622 9.445 9.286 9.127 8.967 8.836 8.689 8.523 8.395 8.263 8.132 7.998 7.849 7.742 7.635 7.469 7.336 7.2 7.13 6.971 6.8 6.632 6.54 6.125 6.245 6.143 6.039 5.803 5.68 5.545 5.386 5.201 4.987 4.712 4.284 -9 ,8395 ,TETRA ,17525997,Thu Nov 25 02:58:43 CET,Thu Nov 25 05:59:13 CET,0.0 0.442 0.691 0.928 1.14 1.322 1.477 1.608 1.816 1.919 2.02 1.894 2.3 2.385 2.557 2.721 2.871 2.947 3.096 3.232 3.441 3.584 3.721 3.912 4.089 4.26 4.431 4.589 4.776 4.954 5.123 5.326 5.537 5.752 5.989 6.232 6.462 6.726 7.007 7.305 7.617 7.968 8.36 8.733 9.148 9.598 10.132 10.703 11.312 11.907 12.404 12.594 12.533 12.314 12.054 11.783 11.503 11.252 11.018 10.745 10.509 10.292 10.089 9.9 9.718 9.556 9.368 9.184 9.034 8.871 8.685 8.535 8.379 8.209 8.078 7.94 7.79 7.633 7.47 7.364 7.256 7.076 6.961 6.836 6.772 6.646 6.514 6.374 6.293 5.889 5.997 5.889 5.788 5.575 5.466 5.333 5.166 4.967 4.756 4.541 4.129 -10 ,28966 ,TETRA ,17525999,Thu Nov 25 03:00:44 CET,Thu Nov 25 06:01:52 CET,0.0 0.518 0.8 1.058 1.266 1.438 1.594 1.721 1.971 2.094 2.21 2.134 2.569 2.662 2.825 2.997 3.161 3.242 3.4 3.538 3.728 3.856 3.983 4.173 4.355 4.523 4.679 4.824 5.029 5.237 5.425 5.642 5.836 6.023 6.244 6.482 6.705 6.943 7.196 7.465 7.744 8.068 8.439 8.792 9.216 9.704 10.248 10.81 11.364 11.89 12.377 12.573 12.465 12.252 11.99 11.696 11.422 11.171 10.944 10.722 10.527 10.323 10.091 9.877 9.688 9.514 9.326 9.153 8.997 8.836 8.679 8.538 8.385 8.236 8.119 7.99 7.857 7.715 7.554 7.432 7.305 7.127 7.001 6.864 6.796 6.663 6.523 6.361 6.269 5.854 5.968 5.867 5.772 5.551 5.412 5.253 5.094 4.928 4.731 4.473 3.725 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 59a42cb0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28227 ,TETRA ,17526002,Thu Nov 25 03:00:47 CET,Thu Nov 25 06:04:28 CET,0.0 0.638 0.908 1.149 1.345 1.503 1.644 1.766 2.009 2.146 2.271 2.155 2.569 2.661 2.841 3.002 3.154 3.236 3.396 3.54 3.74 3.869 3.993 4.162 4.332 4.505 4.669 4.821 5.018 5.21 5.392 5.611 5.822 6.037 6.283 6.544 6.805 7.096 7.411 7.761 8.123 8.51 8.978 9.449 9.978 10.54 11.155 11.822 12.571 13.391 14.261 14.823 15.001 14.944 14.786 14.604 14.4 14.198 14.015 13.814 13.607 13.407 13.196 12.986 12.801 12.622 12.411 12.213 12.062 11.911 11.728 11.574 11.413 11.245 11.118 10.99 10.859 10.706 10.53 10.408 10.281 10.067 9.917 9.746 9.659 9.486 9.28 9.067 8.968 8.559 8.644 8.517 8.393 8.124 7.961 7.79 7.618 7.434 7.204 6.928 6.418 -2 ,29241 ,TETRA ,17526004,Thu Nov 25 03:00:44 CET,Thu Nov 25 06:00:27 CET,0.0 0.342 0.601 0.813 0.992 1.131 1.253 1.375 1.628 1.744 1.859 1.761 2.182 2.285 2.477 2.643 2.812 2.898 3.057 3.209 3.421 3.556 3.688 3.878 4.067 4.24 4.397 4.559 4.768 4.96 5.142 5.37 5.595 5.817 6.076 6.361 6.639 6.936 7.233 7.544 7.874 8.257 8.696 9.142 9.682 10.277 10.917 11.582 12.34 13.222 14.138 14.701 14.9 14.862 14.717 14.562 14.377 14.201 14.028 13.817 13.64 13.485 13.312 13.128 12.962 12.802 12.632 12.477 12.334 12.18 12.014 11.884 11.744 11.58 11.451 11.316 11.184 11.052 10.907 10.805 10.693 10.528 10.41 10.277 10.215 10.078 9.918 9.755 9.67 9.264 9.365 9.266 9.17 8.944 8.804 8.644 8.478 8.294 8.038 7.68 7.003 -3 ,652 ,TETRA ,17526006,Thu Nov 25 03:01:45 CET,Thu Nov 25 06:02:49 CET,0.0 0.452 0.727 0.947 1.13 1.292 1.439 1.569 1.83 1.946 2.055 1.958 2.373 2.466 2.656 2.835 3.0 3.075 3.213 3.356 3.578 3.714 3.844 4.037 4.224 4.404 4.577 4.739 4.942 5.143 5.342 5.584 5.805 6.01 6.253 6.527 6.785 7.078 7.383 7.692 8.042 8.439 8.878 9.307 9.801 10.349 10.967 11.663 12.447 13.312 14.238 14.742 14.827 14.754 14.632 14.466 14.292 14.11 13.935 13.736 13.55 13.361 13.166 12.996 12.832 12.669 12.497 12.334 12.187 12.019 11.819 11.66 11.509 11.342 11.213 11.085 10.951 10.809 10.65 10.527 10.411 10.242 10.112 9.977 9.908 9.767 9.608 9.432 9.336 8.924 9.009 8.88 8.759 8.51 8.356 8.178 7.964 7.73 7.473 7.16 6.571 -6 ,4891 ,TETRA ,17526011,Thu Nov 25 03:02:44 CET,Thu Nov 25 05:45:53 CET,0.0 0.539 0.832 1.024 1.188 1.331 1.455 1.575 1.821 1.942 2.05 1.933 2.349 2.436 2.603 2.772 2.927 3.004 3.15 3.285 3.494 3.628 3.754 3.946 4.121 4.289 4.458 4.623 4.831 5.012 5.184 5.395 5.604 5.801 6.031 6.29 6.534 6.813 7.124 7.461 7.814 8.179 8.615 9.054 9.525 10.053 10.657 11.336 12.145 13.035 13.907 14.436 14.614 14.621 14.475 14.236 14.0 13.748 13.495 13.255 13.027 12.791 12.589 12.418 12.245 12.058 11.86 11.688 11.52 11.349 11.176 11.02 10.845 10.651 10.519 10.394 10.243 10.078 9.903 9.779 9.645 9.428 9.278 9.127 9.047 8.874 8.688 8.508 8.417 8.009 8.091 7.959 7.818 7.532 7.361 7.148 6.936 6.707 6.439 6.126 5.7 -7 ,13226 ,TETRA ,17526015,Thu Nov 25 03:04:47 CET,Thu Nov 25 06:01:56 CET,0.0 0.401 0.682 0.879 1.052 1.203 1.339 1.467 1.725 1.855 1.974 1.885 2.315 2.423 2.611 2.776 2.945 3.021 3.175 3.333 3.563 3.706 3.828 4.003 4.182 4.355 4.523 4.684 4.886 5.085 5.277 5.501 5.717 5.92 6.147 6.405 6.656 6.942 7.26 7.581 7.916 8.277 8.699 9.147 9.642 10.182 10.778 11.417 12.174 12.968 13.692 14.122 14.224 14.151 13.966 13.718 13.447 13.164 12.935 12.709 12.471 12.225 11.983 11.752 11.528 11.322 11.12 10.935 10.751 10.557 10.352 10.179 10.003 9.825 9.689 9.536 9.377 9.222 9.059 8.938 8.809 8.609 8.469 8.324 8.248 8.094 7.928 7.75 7.664 7.26 7.336 7.208 7.086 6.835 6.687 6.506 6.308 6.083 5.845 5.553 5.056 -8 ,12068 ,TETRA ,17526017,Thu Nov 25 03:05:44 CET,Thu Nov 25 06:10:08 CET,0.0 0.642 0.934 1.146 1.33 1.498 1.656 1.801 2.067 2.188 2.304 2.198 2.609 2.702 2.894 3.068 3.227 3.301 3.444 3.589 3.791 3.913 4.04 4.231 4.406 4.579 4.751 4.908 5.107 5.3 5.487 5.702 5.918 6.133 6.38 6.664 6.928 7.214 7.514 7.835 8.18 8.566 9.046 9.515 10.004 10.557 11.224 11.985 12.845 13.786 14.702 15.226 15.404 15.348 15.211 15.004 14.74 14.464 14.207 13.935 13.675 13.433 13.187 12.936 12.693 12.461 12.205 11.973 11.77 11.539 11.297 11.097 10.874 10.658 10.502 10.335 10.144 9.94 9.735 9.593 9.449 9.233 9.09 8.935 8.851 8.68 8.515 8.343 8.24 7.811 7.872 7.735 7.601 7.309 7.153 6.972 6.727 6.461 6.2 5.828 5.223 -9 ,14631 ,TETRA ,17526018,Thu Nov 25 03:09:43 CET,Thu Nov 25 06:10:28 CET,0.0 0.33 0.578 0.77 0.946 1.089 1.233 1.38 1.643 1.753 1.854 1.721 2.129 2.225 2.41 2.583 2.747 2.825 2.981 3.135 3.354 3.489 3.617 3.802 3.988 4.17 4.334 4.486 4.679 4.863 5.048 5.277 5.503 5.71 5.939 6.21 6.462 6.73 7.025 7.332 7.647 8.01 8.45 8.888 9.381 9.944 10.575 11.254 12.044 12.894 13.74 14.202 14.246 14.176 13.971 13.682 13.421 13.169 12.937 12.692 12.458 12.229 11.999 11.769 11.557 11.364 11.164 10.984 10.805 10.599 10.372 10.181 9.998 9.811 9.662 9.502 9.324 9.136 8.956 8.845 8.726 8.525 8.391 8.258 8.182 8.023 7.865 7.689 7.594 7.185 7.28 7.161 7.038 6.765 6.621 6.455 6.279 6.067 5.798 5.495 4.8 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt deleted file mode 100644 index 80f4d8b4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,989 ,TETRA ,17526027,Thu Nov 25 03:14:40 CET,Thu Nov 25 06:15:25 CET,0.0 1.841 2.478 2.99 3.44 3.812 4.146 4.471 5.11 5.388 5.639 5.581 6.337 6.567 6.971 7.358 7.752 7.948 8.309 8.645 9.138 9.467 9.791 10.26 10.731 11.204 11.668 12.104 12.647 13.17 13.683 14.315 14.925 15.508 16.194 16.975 17.752 18.636 19.611 20.611 21.658 22.913 24.412 25.965 27.772 29.78 32.173 34.949 38.181 41.968 46.633 50.46 52.592 53.677 54.246 54.616 54.791 54.759 54.614 54.474 54.343 54.18 54.009 53.845 53.69 53.559 53.427 53.271 53.099 52.916 52.735 52.595 52.438 52.222 52.032 51.846 51.661 51.466 51.26 51.114 50.958 50.714 50.531 50.34 50.238 50.01 49.782 49.517 49.376 48.745 48.89 48.731 48.569 48.156 47.906 47.665 47.385 47.068 46.697 46.126 43.373 -4 ,1899 ,TETRA ,17526029,Thu Nov 25 03:14:42 CET,Thu Nov 25 06:16:08 CET,0.0 1.548 2.1 2.554 2.927 3.244 3.538 3.85 4.451 4.725 4.982 4.912 5.65 5.856 6.266 6.659 7.033 7.216 7.564 7.92 8.446 8.784 9.112 9.58 10.036 10.48 10.911 11.327 11.877 12.406 12.946 13.591 14.196 14.793 15.494 16.285 17.054 17.952 18.958 20.035 21.143 22.392 23.904 25.432 27.225 29.235 31.633 34.465 37.675 41.364 45.974 49.595 51.374 52.412 52.934 53.17 53.317 53.374 53.36 53.246 53.085 52.936 52.75 52.529 52.306 52.085 51.851 51.605 51.363 51.116 50.852 50.608 50.344 50.094 49.902 49.697 49.479 49.221 48.944 48.768 48.59 48.28 48.053 47.83 47.717 47.482 47.224 46.94 46.797 46.164 46.328 46.153 45.96 45.535 45.29 44.992 44.638 44.222 43.751 43.04 40.415 -6 ,15514 ,TETRA ,17526034,Thu Nov 25 03:15:42 CET,Thu Nov 25 06:10:43 CET,0.0 1.277 1.834 2.255 2.633 2.995 3.328 3.608 4.116 4.376 4.62 4.525 5.263 5.461 5.84 6.217 6.59 6.776 7.124 7.458 7.956 8.267 8.571 9.057 9.532 9.963 10.379 10.802 11.352 11.866 12.359 12.966 13.592 14.21 14.908 15.707 16.514 17.403 18.339 19.338 20.437 21.735 23.278 24.815 26.614 28.625 30.858 33.37 36.534 40.48 45.259 49.045 51.022 52.079 52.688 52.98 53.066 53.034 52.92 52.743 52.55 52.392 52.235 52.066 51.847 51.621 51.367 51.116 50.915 50.683 50.409 50.183 49.942 49.676 49.472 49.243 48.978 48.706 48.428 48.227 48.019 47.699 47.464 47.223 47.099 46.837 46.557 46.255 46.086 45.408 45.484 45.273 45.053 44.569 44.286 43.991 43.66 43.226 42.692 42.023 39.65 -7 ,24081 ,TETRA ,17526036,Thu Nov 25 02:19:38 CET,Thu Nov 25 05:21:30 CET,0.0 3.401 4.077 4.523 4.883 5.244 5.614 5.944 6.511 6.755 6.991 6.941 7.697 7.906 8.329 8.732 9.132 9.333 9.683 10.004 10.495 10.806 11.1 11.547 11.992 12.429 12.847 13.251 13.821 14.389 14.914 15.552 16.151 16.718 17.388 18.146 18.903 19.773 20.689 21.663 22.711 23.961 25.516 27.025 28.746 30.785 33.135 35.649 38.598 42.117 46.356 49.762 51.604 52.605 53.142 53.462 53.583 53.582 53.521 53.406 53.285 53.198 53.085 52.926 52.74 52.535 52.313 52.112 51.927 51.725 51.509 51.332 51.145 50.933 50.766 50.584 50.392 50.194 49.977 49.822 49.654 49.397 49.221 49.005 48.883 48.616 48.313 47.993 47.848 47.214 47.355 47.166 46.974 46.541 46.304 46.058 45.749 45.334 44.858 44.278 42.207 -8 ,5794 ,TETRA ,17526037,Thu Nov 25 02:19:39 CET,Thu Nov 25 05:21:51 CET,0.0 1.227 1.803 2.282 2.667 3.007 3.331 3.629 4.162 4.393 4.632 4.551 5.282 5.494 5.884 6.253 6.633 6.815 7.152 7.48 7.981 8.321 8.658 9.121 9.579 10.04 10.46 10.868 11.425 11.972 12.505 13.155 13.794 14.404 15.094 15.868 16.643 17.537 18.474 19.436 20.466 21.668 23.088 24.572 26.347 28.319 30.633 33.325 36.54 40.392 45.161 48.671 50.561 51.735 52.325 52.575 52.648 52.69 52.694 52.634 52.534 52.375 52.176 52.014 51.844 51.626 51.39 51.182 50.975 50.758 50.508 50.279 50.04 49.771 49.549 49.325 49.111 48.877 48.606 48.414 48.207 47.895 47.694 47.474 47.358 47.124 46.888 46.645 46.502 45.841 45.925 45.725 45.534 45.082 44.805 44.513 44.16 43.704 43.184 42.579 40.534 -9 ,19546 ,TETRA ,17526039,Thu Nov 25 02:19:39 CET,Thu Nov 25 05:18:43 CET,0.0 1.514 2.111 2.558 2.967 3.331 3.645 3.936 4.476 4.734 4.97 4.889 5.638 5.854 6.284 6.7 7.065 7.251 7.64 7.987 8.471 8.796 9.114 9.594 10.062 10.508 10.953 11.378 11.94 12.5 13.051 13.714 14.328 14.922 15.643 16.457 17.243 18.115 19.047 20.042 21.116 22.356 23.842 25.346 27.062 28.999 31.288 33.849 36.748 40.202 44.578 47.813 49.196 50.007 50.488 50.758 50.89 50.847 50.734 50.586 50.45 50.328 50.161 49.961 49.766 49.578 49.383 49.172 48.979 48.799 48.597 48.412 48.195 47.934 47.746 47.57 47.373 47.154 46.92 46.761 46.579 46.293 46.104 45.892 45.783 45.564 45.323 45.029 44.876 44.233 44.367 44.188 43.993 43.551 43.309 43.038 42.718 42.354 41.897 41.301 39.401 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt deleted file mode 100644 index 1f4fd091..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,9257 ,TETRA ,17526049,Thu Nov 25 02:20:40 CET,Thu Nov 25 05:23:19 CET,0.0 0.938 1.374 1.77 2.171 2.539 2.878 3.208 3.795 4.073 4.343 4.333 5.119 5.374 5.854 6.323 6.792 7.025 7.486 7.937 8.592 9.021 9.441 10.058 10.669 11.279 11.887 12.482 13.245 14.002 14.745 15.649 16.55 17.447 18.511 19.744 20.978 22.362 23.88 25.552 27.389 29.537 32.136 34.855 38.09 41.837 46.433 51.924 58.836 67.891 80.147 91.554 99.218 104.765 108.914 112.187 114.772 116.927 118.606 120.114 121.281 122.246 123.123 123.897 124.577 125.123 125.629 126.064 126.42 126.764 127.087 127.342 127.594 127.827 127.987 128.133 128.276 128.413 128.527 128.597 128.663 128.768 128.821 128.858 128.875 128.896 128.908 128.916 128.906 128.495 128.799 128.766 128.726 128.607 128.518 128.399 128.258 128.089 127.903 127.628 126.724 -5 ,28730 ,TETRA ,17526051,Thu Nov 25 02:20:41 CET,Thu Nov 25 05:23:23 CET,0.0 0.645 1.048 1.409 1.764 2.104 2.412 2.713 3.297 3.583 3.859 3.852 4.637 4.887 5.385 5.869 6.337 6.57 7.021 7.467 8.129 8.547 8.968 9.585 10.173 10.759 11.36 11.966 12.755 13.528 14.278 15.223 16.15 17.045 18.11 19.344 20.559 21.917 23.425 25.124 26.986 29.115 31.688 34.406 37.755 41.651 46.39 52.041 59.118 68.197 80.404 91.912 99.64 105.267 109.419 112.707 115.311 117.431 119.082 120.555 121.738 122.714 123.576 124.33 124.978 125.53 126.071 126.525 126.884 127.222 127.538 127.787 128.027 128.239 128.382 128.513 128.649 128.782 128.909 128.994 129.069 129.138 129.169 129.197 129.204 129.227 129.243 129.259 129.259 128.86 129.197 129.157 129.114 128.968 128.88 128.795 128.682 128.536 128.358 128.092 127.119 -6 ,22603 ,TETRA ,17526053,Thu Nov 25 02:20:41 CET,Thu Nov 25 05:21:35 CET,0.0 0.937 1.438 1.822 2.162 2.495 2.809 3.107 3.67 3.933 4.19 4.169 4.938 5.177 5.656 6.119 6.565 6.786 7.219 7.642 8.274 8.699 9.129 9.754 10.357 10.952 11.546 12.133 12.9 13.659 14.41 15.336 16.243 17.132 18.202 19.441 20.679 22.057 23.572 25.282 27.109 29.254 31.899 34.68 38.071 41.929 46.565 52.128 59.03 67.83 79.828 91.41 99.169 104.662 108.74 111.974 114.547 116.674 118.318 119.775 120.91 121.872 122.741 123.457 124.068 124.597 125.114 125.549 125.888 126.209 126.522 126.764 127.005 127.226 127.368 127.495 127.589 127.685 127.788 127.841 127.892 127.974 128.02 128.052 128.066 128.078 128.056 128.015 127.985 127.563 127.886 127.843 127.795 127.689 127.623 127.543 127.432 127.293 127.098 126.78 125.651 -8 ,13042 ,TETRA ,17526057,Thu Nov 25 02:20:42 CET,Thu Nov 25 05:27:05 CET,0.0 0.867 1.292 1.685 2.043 2.366 2.665 2.961 3.551 3.827 4.092 4.079 4.866 5.112 5.577 6.02 6.456 6.673 7.107 7.54 8.179 8.603 9.028 9.662 10.274 10.867 11.46 12.042 12.807 13.554 14.302 15.257 16.191 17.09 18.157 19.413 20.649 22.034 23.578 25.268 27.106 29.255 31.851 34.595 37.963 41.879 46.643 52.277 59.185 67.97 79.994 91.448 99.261 105.015 109.244 112.55 115.14 117.207 118.834 120.321 121.476 122.417 123.248 123.995 124.625 125.145 125.665 126.094 126.435 126.768 127.083 127.315 127.544 127.767 127.912 128.052 128.189 128.328 128.449 128.508 128.556 128.595 128.624 128.667 128.685 128.694 128.701 128.713 128.707 128.302 128.628 128.583 128.531 128.419 128.34 128.246 128.137 128.004 127.823 127.499 126.83 -9 ,2305 ,TETRA ,17526060,Thu Nov 25 02:21:41 CET,Thu Nov 25 05:33:47 CET,0.0 1.184 1.738 2.164 2.535 2.884 3.23 3.565 4.163 4.444 4.721 4.726 5.518 5.783 6.301 6.796 7.251 7.469 7.898 8.326 8.967 9.383 9.79 10.395 10.994 11.588 12.179 12.776 13.573 14.341 15.091 16.008 16.92 17.837 18.93 20.199 21.461 22.876 24.426 26.121 27.968 30.139 32.781 35.527 38.839 42.634 47.158 52.665 59.621 68.598 80.891 92.651 100.462 106.105 110.38 113.701 116.284 118.361 119.981 121.422 122.576 123.548 124.366 125.071 125.699 126.246 126.771 127.195 127.537 127.878 128.216 128.466 128.696 128.922 129.079 129.222 129.348 129.454 129.525 129.562 129.622 129.72 129.777 129.814 129.82 129.832 129.831 129.799 129.778 129.374 129.696 129.649 129.602 129.477 129.401 129.315 129.205 129.061 128.855 128.569 127.856 -10 ,6453 ,TETRA ,17526063,Thu Nov 25 02:21:41 CET,Thu Nov 25 05:24:44 CET,0.0 0.914 1.402 1.823 2.221 2.567 2.891 3.205 3.767 4.037 4.303 4.284 5.065 5.307 5.807 6.296 6.753 6.979 7.426 7.86 8.506 8.939 9.367 9.989 10.592 11.18 11.77 12.359 13.134 13.917 14.684 15.642 16.583 17.502 18.615 19.892 21.129 22.52 24.066 25.742 27.551 29.657 32.204 34.865 38.148 42.025 46.767 52.419 59.391 68.285 80.333 91.808 99.472 105.087 109.236 112.424 114.941 117.073 118.791 120.336 121.556 122.572 123.474 124.262 124.924 125.486 126.028 126.483 126.86 127.231 127.596 127.854 128.095 128.341 128.516 128.681 128.836 128.98 129.107 129.184 129.245 129.324 129.376 129.41 129.424 129.461 129.476 129.451 129.432 129.026 129.343 129.31 129.278 129.177 129.1 129.01 128.89 128.73 128.525 128.248 127.18 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt deleted file mode 100644 index dcc86c8e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29427 ,TETRA ,17526065,Thu Nov 25 02:21:43 CET,Thu Nov 25 05:23:19 CET,0.0 0.541 0.847 1.066 1.263 1.448 1.628 1.796 2.097 2.235 2.366 2.292 2.751 2.86 3.067 3.269 3.463 3.556 3.739 3.917 4.173 4.343 4.504 4.732 4.968 5.194 5.411 5.622 5.891 6.146 6.392 6.7 6.989 7.266 7.596 7.964 8.337 8.771 9.242 9.735 10.25 10.844 11.55 12.219 12.96 13.781 14.777 16.002 17.417 18.979 20.837 22.283 23.055 23.493 23.706 23.787 23.795 23.77 23.715 23.617 23.511 23.39 23.252 23.122 22.991 22.87 22.749 22.637 22.532 22.418 22.282 22.168 22.055 21.941 21.845 21.74 21.635 21.517 21.397 21.315 21.216 21.056 20.95 20.826 20.757 20.617 20.467 20.308 20.227 19.834 19.969 19.872 19.769 19.547 19.428 19.285 19.101 18.912 18.679 18.385 17.902 -2 ,11716 ,TETRA ,17526067,Thu Nov 25 02:21:42 CET,Thu Nov 25 05:21:47 CET,0.0 0.357 0.606 0.832 1.028 1.233 1.407 1.551 1.839 1.975 2.099 2.0 2.453 2.563 2.757 2.962 3.164 3.263 3.447 3.615 3.859 4.017 4.179 4.412 4.629 4.838 5.044 5.246 5.509 5.757 5.997 6.292 6.574 6.846 7.158 7.505 7.837 8.204 8.625 9.072 9.54 10.092 10.77 11.443 12.226 13.112 14.128 15.293 16.581 18.041 19.701 20.997 21.653 21.954 22.118 22.191 22.192 22.156 22.097 22.033 21.928 21.777 21.618 21.463 21.31 21.171 21.019 20.867 20.736 20.593 20.431 20.299 20.168 20.029 19.918 19.817 19.714 19.588 19.441 19.339 19.234 19.074 18.963 18.84 18.776 18.635 18.485 18.335 18.254 17.865 17.992 17.879 17.769 17.54 17.402 17.236 17.051 16.843 16.588 16.323 15.818 -3 ,17879 ,TETRA ,17526069,Thu Nov 25 02:22:41 CET,Thu Nov 25 05:24:56 CET,0.0 0.402 0.694 0.949 1.197 1.404 1.561 1.716 2.024 2.159 2.283 2.16 2.608 2.726 2.946 3.159 3.367 3.461 3.628 3.797 4.055 4.215 4.37 4.601 4.82 5.026 5.222 5.42 5.678 5.916 6.149 6.447 6.744 7.038 7.365 7.728 8.088 8.487 8.909 9.366 9.874 10.446 11.12 11.802 12.581 13.44 14.442 15.543 16.84 18.44 20.25 21.566 22.218 22.532 22.646 22.63 22.562 22.477 22.378 22.252 22.134 22.031 21.914 21.772 21.628 21.504 21.384 21.259 21.145 21.038 20.918 20.813 20.705 20.586 20.494 20.399 20.296 20.187 20.069 19.979 19.888 19.724 19.604 19.494 19.434 19.317 19.198 19.054 18.973 18.568 18.684 18.587 18.475 18.243 18.13 18.001 17.839 17.661 17.455 17.187 16.475 -4 ,14674 ,TETRA ,17526071,Thu Nov 25 02:22:41 CET,Thu Nov 25 05:23:54 CET,0.0 0.685 0.985 1.229 1.435 1.606 1.781 1.943 2.215 2.352 2.484 2.39 2.839 2.955 3.19 3.407 3.604 3.697 3.88 4.061 4.324 4.495 4.661 4.903 5.137 5.36 5.564 5.765 6.024 6.277 6.532 6.842 7.138 7.416 7.746 8.136 8.514 8.926 9.38 9.878 10.397 10.976 11.663 12.349 13.138 14.021 15.062 16.317 17.841 19.58 21.526 23.002 23.786 24.193 24.393 24.453 24.418 24.353 24.284 24.204 24.123 24.021 23.894 23.78 23.665 23.544 23.416 23.302 23.191 23.066 22.946 22.84 22.723 22.604 22.509 22.404 22.289 22.16 22.004 21.894 21.788 21.611 21.49 21.375 21.312 21.179 21.05 20.905 20.827 20.441 20.576 20.48 20.376 20.13 19.994 19.843 19.669 19.456 19.203 18.908 18.336 -6 ,4124 ,TETRA ,17526076,Thu Nov 25 02:22:41 CET,Thu Nov 25 05:27:24 CET,0.0 0.497 0.785 1.015 1.241 1.457 1.66 1.836 2.132 2.265 2.394 2.308 2.754 2.868 3.079 3.283 3.488 3.584 3.766 3.941 4.192 4.354 4.516 4.772 5.024 5.265 5.497 5.717 5.987 6.235 6.469 6.756 7.042 7.318 7.642 8.022 8.375 8.73 9.139 9.601 10.086 10.646 11.284 11.938 12.735 13.6 14.636 15.859 17.272 18.88 20.626 21.849 22.565 22.941 23.069 23.126 23.111 23.024 22.928 22.827 22.691 22.551 22.417 22.279 22.156 22.029 21.889 21.774 21.651 21.497 21.332 21.2 21.061 20.924 20.823 20.708 20.588 20.46 20.309 20.197 20.085 19.912 19.798 19.676 19.608 19.468 19.331 19.183 19.101 18.7 18.794 18.685 18.585 18.362 18.226 18.077 17.923 17.723 17.452 17.125 16.604 -7 ,12938 ,TETRA ,17526078,Thu Nov 25 02:23:38 CET,Thu Nov 25 05:25:25 CET,0.0 0.79 1.127 1.392 1.613 1.813 1.986 2.146 2.442 2.597 2.745 2.672 3.14 3.256 3.469 3.681 3.878 3.97 4.166 4.348 4.593 4.753 4.91 5.141 5.359 5.578 5.794 6.003 6.272 6.528 6.784 7.097 7.409 7.714 8.058 8.434 8.807 9.222 9.656 10.121 10.608 11.143 11.769 12.408 13.163 14.045 15.054 16.196 17.571 19.162 21.072 22.476 23.178 23.513 23.643 23.661 23.578 23.47 23.38 23.3 23.235 23.18 23.102 22.998 22.909 22.83 22.724 22.612 22.508 22.389 22.252 22.142 22.035 21.921 21.827 21.71 21.586 21.453 21.298 21.193 21.093 20.927 20.794 20.665 20.599 20.451 20.298 20.142 20.068 19.68 19.819 19.722 19.625 19.42 19.297 19.152 18.998 18.823 18.617 18.388 18.005 -8 ,189 ,TETRA ,17526080,Thu Nov 25 02:23:38 CET,Thu Nov 25 05:24:55 CET,0.0 0.424 0.725 1.009 1.267 1.47 1.633 1.78 2.064 2.195 2.315 2.226 2.674 2.782 2.979 3.167 3.356 3.444 3.611 3.782 4.039 4.205 4.364 4.592 4.815 5.03 5.235 5.437 5.703 5.952 6.188 6.476 6.761 7.033 7.35 7.704 8.03 8.395 8.791 9.212 9.684 10.225 10.845 11.473 12.205 13.042 14.05 15.23 16.56 18.077 19.844 21.147 21.781 22.126 22.262 22.27 22.249 22.2 22.105 21.991 21.889 21.778 21.645 21.505 21.394 21.293 21.171 21.073 20.99 20.875 20.739 20.634 20.531 20.422 20.315 20.188 20.071 19.963 19.837 19.729 19.603 19.423 19.31 19.187 19.123 18.973 18.811 18.656 18.582 18.188 18.321 18.235 18.132 17.871 17.73 17.597 17.464 17.317 17.135 16.903 16.378 -9 ,5965 ,TETRA ,17526082,Thu Nov 25 02:23:40 CET,Thu Nov 25 05:28:03 CET,0.0 0.392 0.643 0.87 1.054 1.221 1.395 1.572 1.893 2.024 2.154 2.083 2.542 2.659 2.88 3.097 3.294 3.38 3.552 3.737 4.005 4.174 4.338 4.57 4.797 5.022 5.238 5.448 5.723 5.987 6.242 6.57 6.876 7.145 7.474 7.88 8.266 8.668 9.107 9.605 10.115 10.679 11.364 12.03 12.812 13.703 14.727 15.92 17.326 18.965 20.914 22.423 23.243 23.741 24.019 24.147 24.176 24.154 24.084 23.957 23.833 23.737 23.635 23.528 23.431 23.337 23.215 23.104 23.003 22.893 22.779 22.667 22.544 22.417 22.321 22.212 22.087 21.967 21.836 21.741 21.646 21.496 21.388 21.271 21.206 21.081 20.955 20.807 20.732 20.344 20.465 20.351 20.234 19.99 19.85 19.696 19.555 19.412 19.223 18.976 18.417 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt deleted file mode 100644 index c7b7b11d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28005 ,TETRA ,17526085,Thu Nov 25 02:23:42 CET,Thu Nov 25 05:24:49 CET,0.0 1.034 1.534 1.942 2.307 2.667 3.017 3.366 4.046 4.354 4.649 4.749 5.522 5.802 6.369 6.927 7.46 7.714 8.211 8.693 9.389 9.853 10.313 10.99 11.655 12.322 12.992 13.644 14.512 15.376 16.22 17.262 18.312 19.364 20.6 22.023 23.427 25.028 26.811 28.745 30.831 33.284 36.229 39.287 43.006 47.357 52.659 58.987 66.958 77.11 90.748 103.563 112.08 118.282 122.876 126.465 129.344 131.711 133.544 135.2 136.493 137.545 138.466 139.269 139.975 140.567 141.14 141.637 142.036 142.412 142.775 143.031 143.278 143.526 143.699 143.871 144.028 144.158 144.27 144.338 144.409 144.523 144.582 144.609 144.614 144.628 144.614 144.57 144.546 144.198 144.426 144.362 144.285 144.099 143.968 143.781 143.574 143.362 143.027 142.493 140.112 -2 ,19180 ,TETRA ,17526088,Thu Nov 25 02:24:38 CET,Thu Nov 25 05:23:16 CET,0.0 0.843 1.349 1.797 2.211 2.587 2.923 3.25 3.89 4.196 4.507 4.629 5.398 5.675 6.217 6.741 7.253 7.512 8.024 8.52 9.232 9.704 10.18 10.865 11.549 12.229 12.891 13.55 14.428 15.291 16.137 17.177 18.192 19.232 20.469 21.865 23.236 24.785 26.513 28.385 30.422 32.805 35.715 38.777 42.525 46.941 52.289 58.652 66.636 76.868 90.5 103.363 112.064 118.279 122.902 126.482 129.274 131.556 133.282 134.833 136.105 137.157 138.096 138.954 139.671 140.25 140.811 141.282 141.658 142.008 142.364 142.644 142.905 143.155 143.325 143.481 143.618 143.722 143.838 143.934 144.01 144.078 144.112 144.146 144.157 144.174 144.161 144.1 144.069 143.714 143.95 143.896 143.824 143.659 143.548 143.411 143.226 142.983 142.655 142.093 140.348 -4 ,4364 ,TETRA ,17526091,Thu Nov 25 02:25:41 CET,Thu Nov 25 05:25:49 CET,0.0 0.662 1.166 1.597 1.964 2.313 2.668 3.018 3.649 3.937 4.238 4.347 5.108 5.378 5.898 6.412 6.927 7.183 7.681 8.175 8.904 9.385 9.874 10.569 11.249 11.936 12.612 13.284 14.168 15.037 15.906 16.978 18.026 19.067 20.303 21.754 23.193 24.794 26.575 28.54 30.656 33.088 36.051 39.188 42.996 47.372 52.646 58.941 66.661 76.44 89.734 102.294 110.704 116.741 121.251 124.818 127.606 129.872 131.634 133.232 134.474 135.528 136.471 137.24 137.882 138.441 138.985 139.425 139.781 140.156 140.512 140.756 140.979 141.197 141.35 141.501 141.668 141.818 141.935 142.005 142.081 142.166 142.204 142.248 142.261 142.251 142.205 142.14 142.116 141.773 142.03 141.983 141.916 141.756 141.662 141.53 141.362 141.14 140.827 140.369 138.932 -5 ,5682 ,TETRA ,17526093,Thu Nov 25 02:25:41 CET,Thu Nov 25 05:26:12 CET,0.0 0.809 1.282 1.754 2.202 2.584 2.937 3.277 3.924 4.249 4.564 4.684 5.477 5.77 6.342 6.892 7.422 7.681 8.194 8.705 9.453 9.938 10.413 11.125 11.828 12.519 13.196 13.859 14.746 15.632 16.512 17.609 18.686 19.73 20.984 22.452 23.875 25.461 27.265 29.275 31.385 33.786 36.705 39.777 43.537 47.903 53.255 59.726 67.72 77.876 91.372 104.126 112.796 119.03 123.701 127.401 130.224 132.516 134.345 136.006 137.308 138.369 139.299 140.114 140.793 141.343 141.902 142.403 142.79 143.141 143.473 143.724 143.985 144.252 144.443 144.599 144.732 144.88 145.002 145.059 145.122 145.185 145.199 145.208 145.207 145.229 145.247 145.207 145.18 144.833 145.062 145.009 144.935 144.733 144.612 144.446 144.225 143.98 143.702 143.23 140.435 -6 ,24174 ,TETRA ,17526095,Thu Nov 25 02:26:40 CET,Thu Nov 25 05:27:04 CET,0.0 1.231 1.731 2.15 2.535 2.925 3.322 3.67 4.304 4.616 4.917 5.002 5.765 6.051 6.615 7.155 7.666 7.918 8.428 8.933 9.667 10.156 10.635 11.335 12.026 12.712 13.382 14.043 14.931 15.787 16.626 17.685 18.72 19.734 20.952 22.391 23.808 25.375 27.103 29.023 31.146 33.602 36.487 39.484 43.193 47.587 52.964 59.249 67.044 77.261 91.078 103.998 112.759 119.037 123.62 127.134 129.799 131.998 133.774 135.373 136.603 137.626 138.512 139.278 139.977 140.583 141.16 141.648 142.038 142.41 142.746 142.985 143.236 143.482 143.663 143.85 144.007 144.142 144.278 144.367 144.448 144.562 144.631 144.669 144.674 144.685 144.709 144.696 144.669 144.322 144.599 144.559 144.486 144.326 144.218 144.045 143.851 143.609 143.246 142.708 140.688 -9 ,15492 ,TETRA ,17526100,Thu Nov 25 02:26:40 CET,Thu Nov 25 05:26:21 CET,0.0 0.907 1.407 1.821 2.205 2.564 2.909 3.265 3.912 4.217 4.518 4.625 5.389 5.655 6.189 6.731 7.259 7.514 8.015 8.51 9.235 9.707 10.174 10.865 11.54 12.219 12.904 13.58 14.464 15.328 16.18 17.223 18.252 19.281 20.525 21.945 23.342 24.931 26.686 28.609 30.691 33.118 36.085 39.175 42.898 47.287 52.652 59.028 66.998 77.096 90.842 103.804 112.251 118.304 122.782 126.317 129.063 131.288 133.054 134.677 135.946 136.99 137.93 138.725 139.375 139.962 140.541 140.998 141.375 141.736 142.056 142.303 142.558 142.793 142.955 143.121 143.266 143.371 143.466 143.521 143.586 143.68 143.715 143.735 143.735 143.738 143.73 143.704 143.689 143.331 143.543 143.482 143.416 143.218 143.085 142.925 142.683 142.419 142.161 141.682 139.195 -10 ,18026 ,TETRA ,17526102,Thu Nov 25 02:26:40 CET,Thu Nov 25 05:38:07 CET,0.0 1.138 1.62 2.075 2.488 2.891 3.285 3.63 4.263 4.588 4.91 5.037 5.8 6.075 6.626 7.171 7.699 7.956 8.465 8.968 9.733 10.221 10.688 11.379 12.074 12.767 13.452 14.142 15.057 15.941 16.801 17.86 18.929 19.997 21.272 22.752 24.193 25.809 27.581 29.496 31.576 34.012 36.981 40.124 43.927 48.288 53.576 59.844 67.641 77.5 90.982 103.866 112.247 118.294 122.969 126.66 129.443 131.664 133.421 135.05 136.331 137.4 138.374 139.222 139.931 140.52 141.094 141.559 141.936 142.304 142.658 142.935 143.187 143.422 143.585 143.722 143.849 143.976 144.091 144.164 144.229 144.312 144.367 144.409 144.421 144.451 144.461 144.442 144.425 144.09 144.345 144.28 144.206 144.014 143.897 143.776 143.594 143.347 143.069 142.663 139.642 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt deleted file mode 100644 index 1c63f8b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,20273 ,TETRA ,17526108,Thu Nov 25 02:27:43 CET,Thu Nov 25 05:35:13 CET,0.0 0.494 0.779 1.037 1.282 1.501 1.701 1.879 2.212 2.37 2.521 2.434 2.962 3.109 3.404 3.682 3.949 4.081 4.334 4.577 4.923 5.149 5.372 5.7 6.023 6.34 6.653 6.953 7.342 7.723 8.092 8.562 9.025 9.49 10.074 10.751 11.417 12.11 12.814 13.604 14.463 15.45 16.621 17.8 19.229 20.863 22.781 25.065 27.905 31.415 35.924 39.978 42.408 44.055 45.19 45.921 46.449 46.83 47.078 47.272 47.387 47.435 47.43 47.397 47.364 47.319 47.251 47.208 47.172 47.122 47.052 46.978 46.884 46.771 46.69 46.596 46.48 46.351 46.207 46.103 45.984 45.818 45.699 45.541 45.463 45.297 45.119 44.929 44.804 44.351 44.474 44.346 44.196 43.848 43.659 43.455 43.207 42.903 42.516 42.061 40.437 -3 ,7489 ,TETRA ,17526110,Thu Nov 25 02:28:40 CET,Thu Nov 25 05:29:40 CET,0.0 0.512 0.857 1.114 1.325 1.531 1.744 1.952 2.325 2.488 2.647 2.59 3.127 3.271 3.557 3.831 4.085 4.21 4.457 4.701 5.068 5.297 5.521 5.841 6.143 6.446 6.751 7.041 7.407 7.776 8.149 8.618 9.076 9.521 10.061 10.692 11.313 11.999 12.727 13.513 14.357 15.341 16.522 17.726 19.183 20.854 22.819 25.109 27.927 31.437 36.041 40.079 42.456 44.044 45.177 45.948 46.46 46.877 47.166 47.353 47.449 47.492 47.519 47.541 47.53 47.463 47.385 47.333 47.26 47.142 47.026 46.941 46.852 46.734 46.627 46.522 46.407 46.279 46.122 46.008 45.896 45.71 45.585 45.44 45.358 45.174 44.945 44.723 44.605 44.129 44.165 44.005 43.837 43.454 43.244 43.022 42.765 42.451 42.087 41.572 39.929 -4 ,10209 ,TETRA ,17526112,Thu Nov 25 02:29:38 CET,Thu Nov 25 05:29:06 CET,0.0 0.599 0.945 1.205 1.418 1.634 1.827 2.008 2.355 2.514 2.669 2.577 3.096 3.219 3.478 3.747 3.998 4.116 4.353 4.604 4.967 5.182 5.395 5.711 6.021 6.349 6.668 6.963 7.354 7.746 8.115 8.567 9.018 9.46 9.995 10.606 11.199 11.858 12.588 13.385 14.237 15.226 16.417 17.651 19.117 20.784 22.796 25.189 28.085 31.699 36.397 40.547 43.128 44.823 46.021 46.939 47.592 48.024 48.356 48.622 48.743 48.814 48.899 48.968 48.982 48.962 48.899 48.811 48.761 48.708 48.598 48.505 48.418 48.308 48.212 48.101 47.973 47.838 47.685 47.581 47.487 47.362 47.246 47.097 47.019 46.831 46.632 46.429 46.315 45.867 45.932 45.782 45.645 45.326 45.134 44.894 44.633 44.369 43.993 43.443 41.826 -8 ,32098 ,TETRA ,17526119,Thu Nov 25 02:32:41 CET,Thu Nov 25 05:33:52 CET,0.0 0.715 1.09 1.354 1.585 1.826 2.05 2.247 2.614 2.781 2.945 2.88 3.416 3.55 3.806 4.076 4.336 4.464 4.721 4.969 5.337 5.577 5.793 6.102 6.415 6.729 7.044 7.356 7.765 8.167 8.552 9.022 9.487 9.937 10.455 11.031 11.6 12.252 12.964 13.73 14.542 15.48 16.614 17.799 19.23 20.843 22.795 25.139 27.997 31.556 36.158 40.156 42.569 44.149 45.228 46.013 46.551 46.907 47.148 47.335 47.464 47.56 47.628 47.684 47.695 47.649 47.579 47.503 47.408 47.305 47.166 47.034 46.935 46.826 46.719 46.593 46.437 46.264 46.094 45.986 45.875 45.685 45.56 45.403 45.314 45.123 44.93 44.768 44.68 44.245 44.344 44.215 44.063 43.717 43.538 43.344 43.126 42.862 42.53 42.036 40.605 -10 ,29133 ,TETRA ,17526123,Thu Nov 25 03:15:42 CET,Thu Nov 25 06:14:24 CET,0.0 0.499 0.817 1.101 1.373 1.619 1.826 2.026 2.443 2.637 2.808 2.748 3.295 3.456 3.756 4.048 4.329 4.466 4.74 5.011 5.404 5.656 5.901 6.265 6.617 6.965 7.287 7.59 7.992 8.378 8.753 9.199 9.638 10.067 10.571 11.153 11.718 12.355 13.051 13.808 14.632 15.598 16.797 18.033 19.499 21.175 23.14 25.402 28.155 31.596 36.041 40.056 42.507 44.142 45.257 46.033 46.556 46.902 47.128 47.311 47.424 47.51 47.581 47.61 47.617 47.59 47.527 47.476 47.431 47.359 47.248 47.158 47.07 46.947 46.843 46.734 46.619 46.497 46.368 46.257 46.118 45.918 45.786 45.635 45.544 45.375 45.204 44.986 44.866 44.41 44.47 44.311 44.153 43.815 43.619 43.394 43.178 42.917 42.566 42.039 40.308 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_20_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_20_17.txt deleted file mode 100644 index 36aa69dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_20_17.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31793 ,TETRA ,17526127,Thu Nov 25 03:16:42 CET,Thu Nov 25 06:17:21 CET,0.0 0.709 1.102 1.382 1.617 1.859 2.055 2.223 2.558 2.705 2.843 2.798 3.259 3.381 3.627 3.861 4.073 4.174 4.376 4.57 4.829 4.995 5.17 5.419 5.649 5.881 6.108 6.323 6.584 6.836 7.091 7.38 7.678 7.991 8.328 8.685 9.021 9.378 9.779 10.198 10.603 11.084 11.674 12.27 12.948 13.696 14.521 15.381 16.389 17.487 18.389 18.755 18.733 18.501 18.187 17.839 17.492 17.179 16.885 16.548 16.233 15.933 15.642 15.375 15.128 14.883 14.62 14.375 14.153 13.916 13.674 13.486 13.286 13.073 12.914 12.743 12.562 12.386 12.192 12.038 11.87 11.636 11.478 11.292 11.195 11.01 10.808 10.578 10.447 9.998 10.05 9.902 9.736 9.391 9.212 9.007 8.794 8.539 8.192 7.72 6.832 -3 ,9602 ,TETRA ,17526131,Thu Nov 25 03:16:41 CET,Thu Nov 25 06:17:19 CET,0.0 0.636 0.969 1.245 1.511 1.777 1.998 2.188 2.557 2.744 2.918 2.882 3.346 3.481 3.757 4.008 4.235 4.349 4.561 4.774 5.086 5.271 5.447 5.705 5.962 6.207 6.435 6.66 6.968 7.241 7.484 7.809 8.141 8.443 8.762 9.137 9.528 9.957 10.442 10.949 11.453 12.022 12.667 13.289 14.001 14.76 15.525 16.305 17.194 18.211 19.26 19.734 19.685 19.552 19.402 19.168 18.849 18.542 18.263 17.883 17.54 17.253 16.983 16.714 16.452 16.222 15.979 15.76 15.563 15.35 15.135 14.953 14.761 14.558 14.393 14.224 14.055 13.881 13.689 13.543 13.392 13.148 12.959 12.772 12.677 12.474 12.283 12.072 11.955 11.522 11.587 11.454 11.306 10.969 10.778 10.565 10.33 10.041 9.694 9.257 8.158 -4 ,11307 ,TETRA ,17526133,Thu Nov 25 03:16:41 CET,Thu Nov 25 06:13:11 CET,0.0 1.047 1.499 1.859 2.168 2.458 2.72 2.972 3.387 3.559 3.707 3.651 4.114 4.237 4.471 4.704 4.924 5.026 5.235 5.447 5.752 5.934 6.097 6.36 6.643 6.905 7.147 7.378 7.689 7.998 8.286 8.635 8.975 9.291 9.647 10.04 10.413 10.818 11.266 11.743 12.255 12.831 13.456 14.05 14.714 15.5 16.465 17.531 18.686 19.866 21.049 21.536 21.397 21.068 20.758 20.524 20.269 19.958 19.65 19.34 19.053 18.784 18.522 18.276 18.028 17.772 17.498 17.253 17.058 16.839 16.606 16.424 16.233 16.022 15.847 15.654 15.449 15.254 15.037 14.886 14.737 14.491 14.33 14.17 14.078 13.893 13.712 13.492 13.369 12.932 12.995 12.866 12.729 12.361 12.164 11.993 11.806 11.558 11.273 10.919 9.846 -6 ,21357 ,TETRA ,17526136,Thu Nov 25 03:16:42 CET,Thu Nov 25 05:58:28 CET,0.0 0.848 1.285 1.557 1.8 2.04 2.259 2.47 2.836 3.008 3.171 3.123 3.587 3.73 4.023 4.307 4.561 4.676 4.904 5.128 5.461 5.671 5.878 6.171 6.437 6.695 6.946 7.195 7.52 7.817 8.093 8.441 8.772 9.083 9.434 9.829 10.205 10.629 11.129 11.661 12.207 12.819 13.507 14.19 15.006 15.917 16.913 17.931 19.025 20.113 20.975 21.313 21.264 21.052 20.755 20.379 19.998 19.596 19.241 18.888 18.575 18.302 18.005 17.66 17.33 17.044 16.745 16.496 16.281 16.045 15.797 15.59 15.382 15.161 14.981 14.793 14.61 14.415 14.203 14.062 13.913 13.674 13.507 13.333 13.245 13.06 12.864 12.656 12.532 12.086 12.132 11.981 11.842 11.512 11.309 11.104 10.851 10.538 10.241 9.872 8.917 -7 ,2285 ,TETRA ,17526139,Thu Nov 25 03:17:40 CET,Thu Nov 25 06:13:21 CET,0.0 0.904 1.31 1.59 1.876 2.122 2.342 2.554 2.945 3.121 3.292 3.283 3.771 3.913 4.185 4.46 4.726 4.846 5.098 5.337 5.645 5.847 6.042 6.327 6.592 6.845 7.096 7.347 7.661 7.951 8.246 8.584 8.888 9.195 9.55 9.964 10.376 10.82 11.289 11.788 12.313 12.844 13.416 13.997 14.655 15.322 16.073 16.933 17.82 18.62 19.208 19.273 19.079 18.738 18.336 17.93 17.532 17.165 16.84 16.516 16.231 15.964 15.689 15.398 15.145 14.929 14.686 14.457 14.24 14.019 13.791 13.591 13.395 13.196 13.025 12.839 12.66 12.479 12.27 12.127 11.984 11.739 11.568 11.398 11.31 11.12 10.923 10.715 10.595 10.157 10.242 10.113 9.972 9.661 9.461 9.25 9.028 8.75 8.456 8.071 7.103 -9 ,7867 ,TETRA ,17526143,Thu Nov 25 03:18:44 CET,Thu Nov 25 06:17:01 CET,0.0 0.75 1.067 1.336 1.594 1.795 1.967 2.139 2.463 2.623 2.778 2.732 3.216 3.36 3.611 3.852 4.1 4.219 4.451 4.664 4.978 5.189 5.391 5.68 5.951 6.214 6.452 6.662 6.948 7.232 7.498 7.805 8.105 8.405 8.756 9.143 9.502 9.895 10.342 10.836 11.336 11.871 12.496 13.101 13.797 14.562 15.403 16.297 17.262 18.363 19.499 20.094 20.11 19.907 19.699 19.443 19.134 18.794 18.441 18.053 17.731 17.433 17.14 16.877 16.626 16.374 16.123 15.894 15.671 15.434 15.185 14.976 14.762 14.543 14.358 14.158 13.953 13.745 13.537 13.396 13.247 13.006 12.838 12.672 12.584 12.395 12.191 11.95 11.823 11.389 11.433 11.289 11.151 10.843 10.663 10.445 10.196 9.929 9.626 9.231 8.573 -10 ,28329 ,TETRA ,17526146,Thu Nov 25 03:18:43 CET,Thu Nov 25 06:17:03 CET,0.0 1.091 1.539 1.897 2.176 2.408 2.637 2.841 3.169 3.319 3.495 3.519 3.997 4.129 4.412 4.687 4.933 5.044 5.242 5.449 5.787 6.001 6.196 6.471 6.717 6.943 7.162 7.388 7.677 7.94 8.215 8.583 8.926 9.213 9.541 9.909 10.243 10.598 10.976 11.395 11.854 12.394 13.017 13.626 14.344 15.128 16.017 17.037 18.16 19.364 20.542 21.177 21.311 21.137 20.858 20.525 20.149 19.765 19.402 19.023 18.692 18.418 18.147 17.894 17.654 17.403 17.143 16.897 16.693 16.499 16.278 16.086 15.888 15.67 15.503 15.342 15.173 14.982 14.782 14.638 14.48 14.248 14.093 13.925 13.826 13.626 13.436 13.221 13.112 12.69 12.751 12.607 12.457 12.129 11.952 11.77 11.552 11.313 11.032 10.637 9.742 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_20_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_20_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 96962c64..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_20_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20953 ,TETRA ,17526147,Thu Nov 25 03:18:43 CET,Thu Nov 25 06:01:48 CET,0.0 0.851 1.194 1.441 1.662 1.89 2.086 2.247 2.563 2.726 2.881 2.832 3.287 3.406 3.643 3.881 4.109 4.218 4.424 4.621 4.903 5.085 5.26 5.516 5.754 5.991 6.243 6.481 6.764 7.016 7.264 7.568 7.862 8.15 8.473 8.834 9.169 9.528 9.947 10.409 10.866 11.343 11.853 12.374 13.019 13.707 14.502 15.416 16.313 17.084 17.737 17.933 17.746 17.359 16.88 16.427 16.028 15.618 15.244 14.881 14.545 14.227 13.916 13.63 13.364 13.093 12.816 12.58 12.371 12.155 11.92 11.717 11.493 11.25 11.079 10.909 10.725 10.53 10.322 10.16 9.976 9.713 9.547 9.366 9.27 9.077 8.876 8.675 8.569 8.12 8.167 8.019 7.871 7.566 7.374 7.149 6.895 6.614 6.276 5.862 5.19 -2 ,22266 ,TETRA ,17526149,Thu Nov 25 03:19:41 CET,Thu Nov 25 06:20:40 CET,0.0 0.627 0.935 1.183 1.396 1.584 1.771 1.942 2.263 2.409 2.542 2.488 2.948 3.068 3.299 3.518 3.707 3.796 3.977 4.161 4.445 4.628 4.784 5.007 5.228 5.437 5.641 5.842 6.113 6.377 6.634 6.94 7.222 7.476 7.779 8.138 8.5 8.883 9.283 9.715 10.144 10.597 11.107 11.643 12.275 12.889 13.497 14.212 15.078 16.053 16.879 17.025 16.785 16.359 15.903 15.456 15.011 14.584 14.206 13.803 13.435 13.097 12.781 12.492 12.2 11.946 11.703 11.459 11.242 11.027 10.808 10.621 10.419 10.205 10.033 9.861 9.682 9.488 9.294 9.151 8.997 8.765 8.592 8.386 8.28 8.083 7.873 7.654 7.535 7.095 7.174 7.039 6.902 6.599 6.418 6.203 5.968 5.688 5.347 4.927 3.844 -4 ,30265 ,TETRA ,17526153,Thu Nov 25 03:19:41 CET,Thu Nov 25 06:01:38 CET,0.0 0.878 1.291 1.588 1.813 2.013 2.21 2.407 2.773 2.948 3.11 3.057 3.508 3.633 3.875 4.096 4.311 4.414 4.612 4.799 5.055 5.236 5.42 5.669 5.913 6.168 6.414 6.645 6.942 7.224 7.485 7.797 8.118 8.42 8.75 9.133 9.485 9.86 10.281 10.711 11.141 11.631 12.154 12.637 13.206 13.811 14.484 15.142 15.699 16.22 16.628 16.406 15.957 15.465 14.943 14.413 13.944 13.528 13.161 12.812 12.5 12.195 11.894 11.596 11.323 11.078 10.812 10.58 10.372 10.159 9.934 9.724 9.505 9.274 9.093 8.915 8.74 8.559 8.365 8.226 8.078 7.839 7.664 7.472 7.373 7.18 6.974 6.745 6.631 6.194 6.244 6.094 5.933 5.599 5.435 5.255 5.029 4.759 4.469 4.11 3.228 -6 ,2136 ,TETRA ,17526157,Thu Nov 25 03:21:42 CET,Thu Nov 25 06:21:52 CET,0.0 0.739 1.138 1.436 1.713 1.938 2.126 2.307 2.624 2.756 2.882 2.812 3.27 3.402 3.647 3.871 4.102 4.214 4.417 4.614 4.901 5.078 5.261 5.539 5.784 6.006 6.221 6.422 6.694 6.964 7.211 7.507 7.805 8.099 8.432 8.791 9.119 9.474 9.877 10.284 10.665 11.09 11.608 12.113 12.686 13.329 14.044 14.821 15.635 16.303 16.753 16.835 16.5 16.065 15.654 15.215 14.809 14.434 14.096 13.718 13.36 13.034 12.711 12.4 12.131 11.892 11.628 11.383 11.173 10.936 10.683 10.478 10.267 10.044 9.853 9.665 9.479 9.261 9.024 8.869 8.719 8.473 8.301 8.118 8.023 7.833 7.64 7.422 7.307 6.867 6.928 6.803 6.673 6.368 6.191 5.994 5.778 5.534 5.231 4.831 4.008 -7 ,20876 ,TETRA ,17526159,Thu Nov 25 03:21:42 CET,Thu Nov 25 06:15:30 CET,0.0 0.85 1.16 1.401 1.609 1.841 2.059 2.243 2.585 2.735 2.886 2.837 3.291 3.423 3.659 3.875 4.09 4.194 4.371 4.543 4.813 4.986 5.15 5.381 5.597 5.809 6.024 6.231 6.502 6.782 7.064 7.369 7.657 7.937 8.245 8.592 8.936 9.295 9.665 10.065 10.494 10.97 11.472 11.975 12.599 13.272 13.953 14.644 15.397 16.153 16.736 16.821 16.571 16.119 15.608 15.089 14.631 14.206 13.841 13.469 13.115 12.788 12.483 12.205 11.936 11.662 11.373 11.12 10.905 10.68 10.421 10.214 10.008 9.767 9.575 9.376 9.184 9.009 8.816 8.667 8.504 8.264 8.098 7.918 7.826 7.619 7.396 7.175 7.06 6.632 6.695 6.551 6.407 6.084 5.898 5.71 5.486 5.222 4.928 4.477 3.254 -8 ,29628 ,TETRA ,17526160,Thu Nov 25 03:21:44 CET,Thu Nov 25 06:15:25 CET,0.0 0.51 0.821 1.1 1.363 1.594 1.794 1.991 2.326 2.469 2.611 2.56 3.023 3.155 3.416 3.647 3.851 3.957 4.183 4.4 4.68 4.861 5.049 5.308 5.541 5.767 5.968 6.159 6.426 6.683 6.928 7.212 7.482 7.751 8.062 8.411 8.746 9.134 9.566 10.012 10.457 10.919 11.445 11.971 12.584 13.254 13.963 14.63 15.318 16.133 16.65 16.595 16.286 15.789 15.295 14.779 14.281 13.846 13.446 13.065 12.743 12.425 12.111 11.823 11.543 11.273 10.975 10.718 10.496 10.268 10.039 9.827 9.598 9.356 9.172 8.99 8.804 8.603 8.375 8.214 8.053 7.792 7.615 7.436 7.332 7.116 6.905 6.672 6.551 6.114 6.193 6.064 5.915 5.58 5.416 5.239 5.02 4.749 4.426 3.997 2.862 -9 ,8651 ,TETRA ,17526162,Thu Nov 25 03:21:44 CET,Thu Nov 25 05:59:51 CET,0.0 0.525 0.852 1.124 1.345 1.538 1.716 1.897 2.256 2.412 2.552 2.485 2.932 3.046 3.275 3.496 3.71 3.812 4.01 4.196 4.471 4.657 4.839 5.099 5.338 5.573 5.819 6.048 6.345 6.628 6.873 7.158 7.441 7.727 8.055 8.425 8.791 9.189 9.605 10.043 10.481 10.958 11.52 12.082 12.731 13.437 14.127 14.752 15.344 15.91 16.486 16.632 16.363 15.951 15.521 15.091 14.677 14.281 13.924 13.549 13.216 12.91 12.616 12.338 12.066 11.815 11.546 11.296 11.085 10.872 10.639 10.445 10.259 10.055 9.885 9.71 9.521 9.319 9.106 8.965 8.824 8.58 8.393 8.203 8.108 7.921 7.728 7.501 7.383 6.944 7.016 6.888 6.742 6.402 6.229 6.055 5.858 5.644 5.382 5.009 3.894 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_21_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_21_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 437c7b8a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_21_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15369 ,TETRA ,17667686,Fri Dec 3 06:00:12 CET,Fri Dec 3 09:05:35 CET,0.0 0.289 0.539 0.746 0.924 1.111 1.268 1.409 1.677 1.798 1.908 1.783 2.223 2.328 2.539 2.751 2.94 3.03 3.206 3.369 3.606 3.768 3.918 4.134 4.356 4.574 4.783 4.985 5.239 5.483 5.72 6.012 6.301 6.565 6.868 7.226 7.563 7.93 8.334 8.764 9.234 9.776 10.38 10.967 11.665 12.433 13.342 14.408 15.632 17.088 18.806 19.98 20.558 20.826 20.902 20.861 20.739 20.589 20.41 20.208 20.016 19.826 19.638 19.434 19.231 19.036 18.804 18.587 18.404 18.216 18.025 17.874 17.716 17.527 17.371 17.206 17.02 16.826 16.619 16.481 16.348 16.14 15.992 15.842 15.765 15.593 15.396 15.195 15.087 14.654 14.73 14.597 14.469 14.195 14.038 13.847 13.63 13.379 13.096 12.681 11.325 -2 ,24439 ,TETRA ,17667687,Fri Dec 3 06:00:14 CET,Fri Dec 3 09:02:40 CET,0.0 0.56 0.88 1.116 1.281 1.451 1.621 1.781 2.057 2.177 2.295 2.191 2.639 2.747 2.943 3.116 3.274 3.354 3.526 3.691 3.914 4.049 4.193 4.415 4.623 4.824 5.019 5.211 5.463 5.707 5.94 6.219 6.487 6.753 7.064 7.412 7.748 8.108 8.502 8.929 9.373 9.871 10.46 11.059 11.762 12.544 13.443 14.455 15.649 17.015 18.583 19.671 20.039 20.128 20.049 19.847 19.663 19.514 19.368 19.196 19.045 18.891 18.718 18.55 18.379 18.202 18.009 17.83 17.663 17.491 17.304 17.144 16.983 16.814 16.684 16.55 16.406 16.246 16.077 15.96 15.835 15.624 15.475 15.317 15.228 15.032 14.834 14.641 14.527 14.097 14.221 14.108 13.986 13.692 13.527 13.357 13.144 12.868 12.508 12.056 10.716 -3 ,1788 ,TETRA ,17667688,Fri Dec 3 06:00:12 CET,Fri Dec 3 09:06:37 CET,0.0 0.587 0.829 1.055 1.265 1.461 1.629 1.77 2.043 2.174 2.306 2.221 2.674 2.793 3.028 3.252 3.467 3.57 3.753 3.916 4.154 4.309 4.456 4.661 4.855 5.048 5.249 5.448 5.696 5.933 6.169 6.46 6.732 6.995 7.313 7.666 7.986 8.33 8.731 9.173 9.617 10.132 10.747 11.333 12.031 12.807 13.685 14.702 15.904 17.286 18.821 19.894 20.456 20.751 20.855 20.816 20.741 20.627 20.461 20.26 20.092 19.948 19.775 19.576 19.364 19.171 18.963 18.792 18.655 18.498 18.323 18.166 17.962 17.739 17.579 17.416 17.25 17.077 16.887 16.753 16.624 16.41 16.261 16.09 15.997 15.831 15.657 15.469 15.374 14.952 15.046 14.924 14.789 14.484 14.308 14.092 13.855 13.612 13.328 12.921 11.284 -4 ,32355 ,TETRA ,17667689,Fri Dec 3 06:00:14 CET,Fri Dec 3 09:06:09 CET,0.0 0.512 0.798 1.015 1.216 1.394 1.546 1.69 1.965 2.098 2.23 2.135 2.584 2.688 2.888 3.079 3.26 3.354 3.537 3.702 3.929 4.079 4.229 4.446 4.651 4.846 5.048 5.244 5.49 5.737 5.971 6.239 6.507 6.773 7.083 7.445 7.785 8.165 8.573 8.98 9.421 9.936 10.526 11.113 11.832 12.662 13.582 14.607 15.751 17.063 18.617 19.661 20.151 20.359 20.381 20.311 20.198 20.061 19.913 19.725 19.543 19.368 19.192 19.009 18.811 18.6 18.377 18.199 18.034 17.855 17.674 17.518 17.35 17.178 17.032 16.869 16.693 16.518 16.346 16.216 16.071 15.839 15.678 15.524 15.442 15.251 15.023 14.773 14.649 14.213 14.268 14.118 13.974 13.647 13.469 13.27 13.057 12.777 12.437 12.075 10.911 -5 ,27624 ,TETRA ,17667690,Fri Dec 3 06:00:13 CET,Fri Dec 3 08:58:29 CET,0.0 0.745 1.05 1.322 1.554 1.757 1.929 2.089 2.402 2.544 2.674 2.567 3.019 3.132 3.35 3.554 3.751 3.847 4.031 4.207 4.469 4.634 4.788 5.016 5.234 5.438 5.637 5.829 6.081 6.329 6.564 6.829 7.092 7.363 7.677 8.019 8.344 8.702 9.093 9.52 9.983 10.514 11.125 11.716 12.392 13.171 14.054 15.01 16.124 17.426 18.894 20.042 20.638 20.887 20.986 20.951 20.817 20.641 20.478 20.314 20.144 19.948 19.743 19.544 19.344 19.148 18.926 18.747 18.59 18.409 18.223 18.056 17.88 17.701 17.569 17.43 17.267 17.095 16.92 16.785 16.644 16.443 16.307 16.151 16.052 15.827 15.614 15.423 15.323 14.891 14.923 14.764 14.607 14.276 14.095 13.877 13.632 13.348 12.978 12.532 11.281 -6 ,10435 ,TETRA ,17667691,Fri Dec 3 06:00:14 CET,Fri Dec 3 09:03:40 CET,0.0 0.379 0.578 0.783 0.993 1.173 1.338 1.499 1.798 1.935 2.05 1.917 2.353 2.45 2.63 2.809 2.984 3.071 3.252 3.418 3.655 3.811 3.954 4.15 4.341 4.522 4.701 4.875 5.102 5.326 5.547 5.815 6.072 6.316 6.593 6.917 7.239 7.59 7.974 8.389 8.817 9.299 9.87 10.46 11.17 11.934 12.771 13.72 14.896 16.337 17.917 19.01 19.532 19.752 19.801 19.805 19.74 19.604 19.457 19.266 19.095 18.947 18.788 18.623 18.461 18.311 18.143 17.978 17.826 17.662 17.486 17.344 17.196 17.034 16.9 16.759 16.608 16.441 16.263 16.142 16.02 15.823 15.695 15.553 15.477 15.319 15.148 14.962 14.862 14.445 14.545 14.417 14.284 13.986 13.805 13.587 13.369 13.139 12.821 12.407 11.075 -7 ,12207 ,TETRA ,17667692,Fri Dec 3 06:00:15 CET,Fri Dec 3 09:03:38 CET,0.0 0.447 0.752 0.977 1.16 1.318 1.468 1.609 1.864 1.983 2.093 1.974 2.411 2.509 2.701 2.865 3.027 3.113 3.279 3.439 3.664 3.808 3.942 4.141 4.339 4.539 4.739 4.923 5.157 5.391 5.625 5.892 6.142 6.388 6.664 6.988 7.299 7.625 7.991 8.396 8.829 9.323 9.89 10.456 11.12 11.866 12.751 13.742 14.829 16.11 17.616 18.666 19.173 19.319 19.3 19.227 19.098 18.941 18.77 18.585 18.4 18.225 18.072 17.905 17.73 17.57 17.39 17.218 17.07 16.912 16.75 16.616 16.454 16.258 16.111 15.962 15.798 15.631 15.449 15.325 15.195 14.992 14.853 14.706 14.623 14.436 14.242 14.03 13.919 13.486 13.561 13.434 13.299 12.987 12.817 12.633 12.412 12.153 11.841 11.393 10.152 -8 ,3212 ,TETRA ,17667693,Fri Dec 3 06:00:17 CET,Fri Dec 3 09:03:38 CET,0.0 0.635 0.918 1.169 1.373 1.555 1.739 1.897 2.171 2.307 2.431 2.315 2.763 2.87 3.074 3.266 3.457 3.548 3.719 3.881 4.123 4.281 4.441 4.683 4.91 5.125 5.338 5.544 5.795 6.041 6.281 6.568 6.864 7.153 7.469 7.813 8.139 8.507 8.909 9.342 9.792 10.313 10.94 11.56 12.289 13.113 14.067 15.137 16.373 17.855 19.578 20.908 21.644 22.02 22.212 22.237 22.157 22.055 21.936 21.776 21.581 21.362 21.152 20.941 20.74 20.569 20.406 20.273 20.147 20.004 19.828 19.673 19.521 19.365 19.241 19.105 18.961 18.801 18.619 18.494 18.375 18.182 18.033 17.879 17.797 17.632 17.437 17.206 17.082 16.644 16.706 16.571 16.441 16.152 15.985 15.784 15.545 15.284 14.985 14.603 13.202 -9 ,15122 ,TETRA ,17667694,Fri Dec 3 06:00:19 CET,Fri Dec 3 09:03:46 CET,0.0 0.574 0.834 1.05 1.232 1.407 1.585 1.737 2.012 2.152 2.283 2.157 2.595 2.705 2.902 3.089 3.269 3.354 3.525 3.686 3.929 4.088 4.236 4.455 4.661 4.853 5.037 5.217 5.458 5.688 5.905 6.163 6.411 6.655 6.946 7.283 7.606 7.946 8.314 8.734 9.187 9.688 10.237 10.795 11.477 12.212 13.036 14.001 15.155 16.46 17.957 19.094 19.667 19.875 19.905 19.846 19.726 19.591 19.424 19.216 19.034 18.854 18.67 18.482 18.283 18.109 17.935 17.779 17.645 17.494 17.328 17.188 17.043 16.906 16.79 16.635 16.483 16.327 16.153 16.035 15.908 15.709 15.574 15.436 15.355 15.175 14.984 14.786 14.683 14.253 14.329 14.21 14.09 13.764 13.558 13.355 13.136 12.883 12.606 12.194 10.804 -10 ,2813 ,TETRA ,17667695,Fri Dec 3 06:00:13 CET,Fri Dec 3 09:00:35 CET,0.0 0.427 0.677 0.903 1.077 1.234 1.38 1.517 1.779 1.902 2.014 1.89 2.32 2.414 2.604 2.787 2.96 3.048 3.22 3.381 3.613 3.755 3.885 4.075 4.267 4.467 4.656 4.834 5.082 5.324 5.542 5.806 6.077 6.335 6.624 6.955 7.265 7.609 7.97 8.353 8.786 9.271 9.843 10.426 11.111 11.896 12.789 13.805 14.958 16.251 17.755 18.814 19.334 19.587 19.679 19.695 19.638 19.526 19.402 19.259 19.109 18.961 18.797 18.631 18.484 18.332 18.156 17.995 17.844 17.682 17.498 17.332 17.171 17.011 16.869 16.716 16.564 16.4 16.228 16.111 15.989 15.79 15.649 15.506 15.427 15.256 15.088 14.908 14.804 14.374 14.48 14.358 14.209 13.888 13.724 13.549 13.346 13.106 12.821 12.407 10.566 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_21_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_21_22.txt deleted file mode 100644 index 9b612116..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_21_22.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,25705 ,TETRA ,17526169,Thu Nov 25 03:23:41 CET,Thu Nov 25 06:20:28 CET,0.0 1.428 1.924 2.304 2.633 2.9 3.136 3.346 3.681 3.827 3.976 3.928 4.399 4.53 4.778 5.023 5.266 5.38 5.592 5.792 6.078 6.279 6.47 6.701 6.913 7.133 7.358 7.562 7.813 8.082 8.335 8.626 8.909 9.183 9.505 9.845 10.186 10.576 10.965 11.373 11.781 12.227 12.774 13.322 13.918 14.592 15.365 16.173 17.091 18.16 19.313 20.062 20.34 20.31 20.166 20.044 19.902 19.703 19.482 19.233 18.99 18.76 18.548 18.34 18.144 17.967 17.773 17.591 17.433 17.262 17.068 16.893 16.724 16.557 16.426 16.3 16.166 16.003 15.831 15.711 15.584 15.386 15.253 15.116 15.038 14.873 14.704 14.528 14.436 14.009 14.117 13.98 13.829 13.533 13.366 13.183 12.994 12.798 12.564 12.261 11.735 -3 ,26608 ,TETRA ,17526171,Thu Nov 25 03:23:41 CET,Thu Nov 25 06:27:24 CET,0.0 0.87 1.274 1.578 1.875 2.134 2.351 2.542 2.888 3.059 3.216 3.155 3.636 3.782 4.055 4.296 4.513 4.618 4.828 5.025 5.291 5.454 5.608 5.831 6.061 6.293 6.502 6.7 6.959 7.207 7.457 7.749 8.012 8.264 8.556 8.887 9.19 9.514 9.89 10.304 10.714 11.171 11.7 12.237 12.869 13.554 14.333 15.204 16.132 17.087 18.138 18.754 18.906 18.896 18.784 18.611 18.381 18.12 17.862 17.574 17.323 17.064 16.821 16.621 16.42 16.238 16.059 15.889 15.723 15.524 15.31 15.129 14.935 14.732 14.572 14.402 14.224 14.048 13.863 13.732 13.597 13.384 13.241 13.091 13.011 12.816 12.609 12.421 12.325 11.9 12.005 11.882 11.759 11.494 11.337 11.148 10.953 10.767 10.545 10.212 9.502 -4 ,17476 ,TETRA ,17526173,Thu Nov 25 03:23:41 CET,Thu Nov 25 06:33:38 CET,0.0 0.962 1.437 1.759 2.031 2.291 2.53 2.737 3.106 3.284 3.461 3.444 3.925 4.057 4.292 4.511 4.712 4.806 4.998 5.198 5.496 5.687 5.87 6.112 6.332 6.54 6.734 6.926 7.187 7.438 7.676 7.97 8.248 8.51 8.811 9.154 9.491 9.859 10.259 10.681 11.108 11.568 12.123 12.706 13.351 14.029 14.783 15.645 16.608 17.601 18.653 19.342 19.611 19.633 19.521 19.34 19.13 18.918 18.716 18.486 18.268 18.072 17.879 17.68 17.481 17.301 17.129 16.959 16.779 16.586 16.393 16.239 16.079 15.898 15.748 15.601 15.46 15.311 15.141 15.028 14.915 14.725 14.59 14.455 14.386 14.237 14.072 13.892 13.8 13.381 13.493 13.378 13.246 12.953 12.809 12.652 12.491 12.286 12.012 11.646 10.36 -5 ,17183 ,TETRA ,17526174,Thu Nov 25 03:23:41 CET,Thu Nov 25 06:23:03 CET,0.0 0.986 1.289 1.521 1.731 1.959 2.166 2.363 2.772 2.956 3.107 3.067 3.554 3.706 4.007 4.266 4.472 4.567 4.754 4.927 5.176 5.354 5.537 5.789 6.028 6.261 6.48 6.686 6.936 7.192 7.439 7.718 8.003 8.279 8.591 8.932 9.248 9.59 9.959 10.367 10.806 11.285 11.828 12.333 12.904 13.57 14.349 15.206 16.114 17.101 18.097 18.761 19.041 19.083 18.984 18.799 18.634 18.487 18.319 18.099 17.884 17.665 17.446 17.245 17.058 16.885 16.685 16.496 16.319 16.129 15.942 15.78 15.614 15.455 15.314 15.159 15.006 14.839 14.66 14.545 14.432 14.239 14.097 13.953 13.875 13.712 13.545 13.355 13.259 12.828 12.936 12.817 12.688 12.427 12.289 12.122 11.906 11.671 11.406 11.028 10.062 -7 ,6967 ,TETRA ,17526178,Thu Nov 25 03:24:40 CET,Thu Nov 25 06:27:35 CET,0.0 0.929 1.309 1.639 1.899 2.119 2.337 2.544 2.931 3.115 3.287 3.272 3.753 3.896 4.172 4.441 4.69 4.807 5.039 5.261 5.577 5.764 5.941 6.18 6.402 6.621 6.829 7.035 7.294 7.543 7.79 8.088 8.385 8.664 8.986 9.353 9.678 10.022 10.395 10.789 11.185 11.597 12.116 12.647 13.234 13.892 14.679 15.518 16.425 17.515 18.662 19.4 19.691 19.773 19.763 19.617 19.426 19.264 19.1 18.895 18.698 18.51 18.31 18.109 17.925 17.754 17.562 17.394 17.247 17.079 16.884 16.731 16.585 16.428 16.301 16.153 15.994 15.849 15.676 15.555 15.435 15.226 15.084 14.943 14.872 14.714 14.547 14.388 14.307 13.894 14.025 13.917 13.801 13.539 13.385 13.219 13.053 12.873 12.64 12.313 11.681 -8 ,6251 ,TETRA ,17526180,Thu Nov 25 03:25:44 CET,Thu Nov 25 06:25:20 CET,0.0 0.998 1.361 1.639 1.883 2.095 2.295 2.476 2.793 2.929 3.068 3.008 3.479 3.611 3.848 4.053 4.255 4.361 4.568 4.761 5.022 5.194 5.376 5.629 5.865 6.102 6.326 6.536 6.813 7.074 7.314 7.583 7.849 8.111 8.424 8.772 9.091 9.461 9.869 10.279 10.707 11.193 11.755 12.317 12.97 13.669 14.429 15.27 16.271 17.387 18.487 19.196 19.445 19.45 19.348 19.209 19.038 18.821 18.603 18.381 18.175 17.989 17.812 17.625 17.423 17.21 16.958 16.731 16.553 16.383 16.19 16.015 15.841 15.641 15.481 15.313 15.126 14.935 14.735 14.592 14.436 14.197 14.048 13.889 13.797 13.599 13.381 13.133 13.004 12.551 12.626 12.503 12.375 12.08 11.901 11.716 11.524 11.329 11.094 10.771 10.111 -9 ,30623 ,TETRA ,17526182,Thu Nov 25 03:25:44 CET,Thu Nov 25 06:26:29 CET,0.0 0.88 1.323 1.668 1.93 2.146 2.339 2.504 2.815 2.971 3.111 3.046 3.526 3.664 3.91 4.131 4.353 4.464 4.67 4.855 5.108 5.279 5.448 5.683 5.906 6.129 6.343 6.539 6.796 7.047 7.277 7.546 7.816 8.078 8.374 8.722 9.055 9.406 9.777 10.173 10.607 11.102 11.658 12.193 12.82 13.534 14.323 15.146 16.044 17.055 18.153 18.838 19.02 18.998 18.891 18.717 18.465 18.156 17.886 17.62 17.37 17.158 16.937 16.681 16.438 16.21 15.96 15.75 15.572 15.359 15.15 15.001 14.83 14.643 14.507 14.363 14.198 14.005 13.804 13.672 13.535 13.336 13.192 13.033 12.954 12.799 12.64 12.459 12.357 11.921 12.031 11.923 11.8 11.508 11.35 11.171 10.97 10.748 10.479 10.087 8.926 -10 ,8126 ,TETRA ,17526184,Thu Nov 25 03:25:44 CET,Thu Nov 25 06:24:58 CET,0.0 1.348 1.824 2.137 2.423 2.668 2.882 3.087 3.453 3.616 3.763 3.698 4.172 4.312 4.565 4.806 5.036 5.144 5.369 5.589 5.876 6.061 6.249 6.502 6.742 6.988 7.213 7.411 7.666 7.916 8.15 8.435 8.738 9.027 9.337 9.685 10.011 10.359 10.738 11.14 11.551 12.003 12.54 13.072 13.697 14.392 15.152 16.003 16.976 17.988 19.04 19.716 19.914 19.873 19.748 19.586 19.384 19.168 18.962 18.74 18.543 18.354 18.155 17.956 17.757 17.577 17.396 17.231 17.081 16.921 16.745 16.593 16.438 16.27 16.141 16.015 15.858 15.663 15.476 15.365 15.241 15.03 14.891 14.749 14.67 14.511 14.339 14.141 14.039 13.609 13.728 13.62 13.504 13.236 13.079 12.922 12.756 12.548 12.305 12.017 11.175 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_22_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_22_1h1r.txt deleted file mode 100644 index dfa489d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_22_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,862 ,TETRA ,17526190,Thu Nov 25 03:25:44 CET,Thu Nov 25 06:23:43 CET,0.0 0.692 0.964 1.2 1.392 1.556 1.712 1.848 2.108 2.234 2.35 2.237 2.679 2.779 2.955 3.129 3.298 3.375 3.52 3.664 3.87 4.001 4.128 4.313 4.495 4.674 4.843 5.003 5.21 5.405 5.584 5.798 6.015 6.22 6.446 6.705 6.964 7.24 7.52 7.822 8.14 8.496 8.92 9.341 9.821 10.361 10.953 11.632 12.429 13.226 13.933 14.22 14.176 13.988 13.7 13.394 13.069 12.759 12.499 12.201 11.914 11.634 11.359 11.096 10.828 10.576 10.325 10.064 9.829 9.605 9.369 9.179 8.971 8.751 8.579 8.389 8.201 8.011 7.789 7.622 7.45 7.163 6.971 6.778 6.678 6.463 6.224 5.957 5.827 5.386 5.424 5.264 5.081 4.656 4.429 4.177 3.867 3.522 3.162 2.692 1.573 -3 ,8588 ,TETRA ,17526191,Thu Nov 25 03:26:43 CET,Thu Nov 25 06:31:05 CET,0.0 0.661 0.932 1.162 1.343 1.507 1.661 1.807 2.089 2.213 2.327 2.235 2.679 2.783 2.975 3.148 3.316 3.397 3.54 3.677 3.88 4.02 4.158 4.341 4.51 4.673 4.831 4.986 5.184 5.372 5.559 5.793 6.014 6.23 6.482 6.761 7.026 7.306 7.602 7.905 8.228 8.606 9.037 9.466 9.957 10.47 11.007 11.583 12.282 13.041 13.736 14.021 13.891 13.641 13.416 13.162 12.88 12.548 12.218 11.885 11.606 11.367 11.111 10.856 10.609 10.359 10.1 9.86 9.649 9.423 9.172 8.96 8.738 8.504 8.325 8.156 7.978 7.788 7.593 7.448 7.291 7.035 6.86 6.684 6.596 6.401 6.198 5.989 5.867 5.412 5.423 5.256 5.086 4.653 4.412 4.189 3.936 3.644 3.322 2.893 0.57 -5 ,7091 ,TETRA ,17526195,Thu Nov 25 03:26:43 CET,Thu Nov 25 06:24:37 CET,0.0 0.552 0.856 1.084 1.272 1.434 1.581 1.716 1.958 2.076 2.18 2.057 2.483 2.563 2.724 2.883 3.041 3.116 3.259 3.402 3.608 3.748 3.883 4.063 4.241 4.412 4.562 4.711 4.925 5.136 5.333 5.553 5.766 5.985 6.233 6.493 6.74 7.014 7.312 7.635 7.969 8.35 8.791 9.201 9.669 10.189 10.769 11.397 12.048 12.784 13.532 13.881 13.888 13.669 13.406 13.158 12.907 12.642 12.369 12.063 11.809 11.584 11.337 11.069 10.804 10.566 10.318 10.074 9.85 9.63 9.399 9.185 8.962 8.731 8.553 8.364 8.16 7.97 7.786 7.648 7.503 7.265 7.091 6.925 6.843 6.658 6.446 6.227 6.098 5.635 5.674 5.528 5.362 4.984 4.784 4.566 4.317 4.025 3.722 3.359 2.235 -6 ,4860 ,TETRA ,17526197,Thu Nov 25 03:27:40 CET,Thu Nov 25 06:25:24 CET,0.0 0.395 0.588 0.759 0.918 1.077 1.225 1.344 1.561 1.67 1.775 1.645 2.061 2.148 2.304 2.452 2.602 2.671 2.804 2.939 3.139 3.266 3.397 3.584 3.758 3.922 4.075 4.213 4.387 4.573 4.753 4.967 5.183 5.384 5.602 5.852 6.109 6.395 6.695 7.008 7.313 7.631 8.016 8.42 8.874 9.346 9.847 10.402 11.002 11.606 12.278 12.558 12.459 12.284 12.005 11.666 11.349 11.062 10.789 10.489 10.226 9.941 9.659 9.394 9.133 8.891 8.625 8.362 8.122 7.874 7.607 7.391 7.183 6.971 6.797 6.617 6.445 6.273 6.057 5.899 5.744 5.504 5.322 5.12 5.024 4.811 4.532 4.248 4.122 3.672 3.674 3.506 3.328 2.891 2.637 2.37 2.113 1.796 1.36 0.749 -1.944 -7 ,5445 ,TETRA ,17526199,Thu Nov 25 03:27:39 CET,Thu Nov 25 06:27:03 CET,0.0 0.599 0.85 1.048 1.231 1.395 1.526 1.64 1.865 1.975 2.099 1.998 2.429 2.526 2.696 2.854 3.009 3.088 3.237 3.373 3.58 3.72 3.853 4.037 4.212 4.376 4.539 4.7 4.899 5.088 5.286 5.53 5.754 5.959 6.182 6.446 6.701 6.972 7.268 7.584 7.92 8.297 8.707 9.112 9.583 10.115 10.716 11.355 12.039 12.76 13.51 13.863 13.833 13.652 13.39 13.062 12.738 12.434 12.155 11.842 11.558 11.284 11.01 10.753 10.513 10.296 10.038 9.786 9.576 9.36 9.139 8.944 8.718 8.487 8.308 8.118 7.916 7.708 7.488 7.33 7.161 6.897 6.731 6.555 6.456 6.254 6.055 5.837 5.719 5.271 5.308 5.151 4.988 4.632 4.43 4.212 3.954 3.66 3.339 2.91 1.585 -8 ,8575 ,TETRA ,17526201,Thu Nov 25 03:27:40 CET,Thu Nov 25 06:26:23 CET,0.0 0.438 0.672 0.875 1.043 1.187 1.329 1.458 1.672 1.786 1.908 1.801 2.221 2.314 2.482 2.636 2.79 2.862 2.999 3.135 3.335 3.481 3.624 3.815 3.987 4.149 4.304 4.447 4.636 4.825 4.998 5.219 5.436 5.646 5.909 6.187 6.425 6.686 6.995 7.331 7.651 8.005 8.418 8.815 9.276 9.781 10.349 10.938 11.518 12.156 12.861 13.196 13.145 12.954 12.706 12.429 12.178 11.946 11.689 11.393 11.148 10.892 10.64 10.417 10.179 9.944 9.705 9.501 9.308 9.078 8.828 8.589 8.342 8.101 7.909 7.724 7.531 7.31 7.076 6.916 6.745 6.476 6.296 6.099 5.992 5.772 5.54 5.28 5.138 4.684 4.724 4.565 4.389 3.962 3.731 3.498 3.252 2.977 2.626 2.137 1.13 -10 ,24100 ,TETRA ,17526205,Thu Nov 25 03:27:41 CET,Thu Nov 25 06:29:47 CET,0.0 0.454 0.696 0.88 1.033 1.196 1.342 1.476 1.744 1.862 1.973 1.86 2.286 2.382 2.563 2.723 2.875 2.95 3.107 3.257 3.463 3.597 3.724 3.898 4.068 4.24 4.403 4.56 4.761 4.955 5.144 5.371 5.579 5.777 6.021 6.295 6.548 6.827 7.132 7.44 7.747 8.106 8.531 8.947 9.444 10.006 10.573 11.154 11.857 12.652 13.409 13.769 13.812 13.683 13.457 13.191 12.914 12.596 12.301 11.999 11.704 11.421 11.154 10.904 10.67 10.443 10.189 9.96 9.757 9.55 9.329 9.132 8.925 8.703 8.537 8.368 8.161 7.939 7.745 7.605 7.437 7.182 7.004 6.819 6.73 6.539 6.311 6.065 5.941 5.489 5.513 5.353 5.181 4.788 4.585 4.344 4.081 3.809 3.443 2.98 1.873 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 1c12471b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24262 ,KEBNE ,17069800,Fri Dec 24 08:36:08 CET,Fri Dec 24 10:48:17 CET,0.0 0.513 0.799 1.027 1.216 1.372 1.518 1.652 1.899 2.025 2.144 2.039 2.464 2.566 2.751 2.919 3.075 3.15 3.295 3.436 3.629 3.748 3.868 4.052 4.234 4.408 4.562 4.712 4.913 5.098 5.276 5.5 5.705 5.9 6.137 6.41 6.668 6.931 7.212 7.523 7.856 8.229 8.664 9.091 9.563 10.082 10.672 11.273 11.92 12.658 13.442 13.75 13.634 13.344 12.989 12.626 12.252 11.867 11.518 11.17 10.86 10.58 10.306 10.047 9.806 9.563 9.283 9.032 8.816 8.579 8.307 8.083 7.851 7.606 7.427 7.228 7.016 6.793 6.557 6.397 6.23 5.982 5.804 5.605 5.492 5.257 5.024 4.772 4.645 4.201 4.202 4.035 3.876 3.535 3.336 3.128 2.878 2.569 2.2 1.725 0.131 -2 ,15815 ,KEBNE ,17069801,Fri Dec 24 08:40:20 CET,Fri Dec 24 10:52:09 CET,0.0 0.43 0.66 0.856 1.045 1.226 1.38 1.511 1.768 1.886 1.987 1.87 2.294 2.392 2.586 2.771 2.934 3.01 3.165 3.32 3.538 3.676 3.805 3.98 4.16 4.336 4.502 4.659 4.846 5.028 5.22 5.448 5.658 5.869 6.112 6.391 6.667 6.951 7.254 7.586 7.934 8.3 8.734 9.202 9.725 10.277 10.916 11.607 12.296 13.027 13.758 14.091 14.067 13.833 13.549 13.268 12.97 12.647 12.337 12.017 11.703 11.393 11.103 10.81 10.511 10.237 9.946 9.672 9.431 9.193 8.937 8.713 8.481 8.216 7.996 7.785 7.582 7.371 7.14 6.974 6.799 6.534 6.354 6.173 6.079 5.878 5.661 5.426 5.3 4.856 4.868 4.704 4.529 4.136 3.925 3.7 3.461 3.217 2.828 2.264 0.884 -3 ,11814 ,KEBNE ,17125448,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:46:54 CET,0.0 0.509 0.817 1.047 1.226 1.373 1.5 1.625 1.889 2.015 2.13 2.022 2.438 2.528 2.714 2.895 3.065 3.145 3.293 3.442 3.657 3.789 3.912 4.095 4.274 4.443 4.604 4.768 4.974 5.168 5.353 5.566 5.78 5.993 6.236 6.496 6.753 7.038 7.336 7.65 7.983 8.334 8.742 9.183 9.702 10.275 10.883 11.561 12.306 13.02 13.735 14.091 14.07 13.858 13.541 13.165 12.796 12.418 12.059 11.696 11.374 11.069 10.765 10.464 10.165 9.902 9.639 9.396 9.163 8.9 8.631 8.396 8.144 7.903 7.712 7.504 7.278 7.035 6.791 6.622 6.445 6.162 5.943 5.723 5.621 5.393 5.139 4.85 4.696 4.236 4.205 4.024 3.825 3.399 3.17 2.903 2.576 2.166 1.77 1.332 -0.259 -4 ,20830 ,KEBNE ,17069803,Fri Dec 24 08:40:23 CET,Fri Dec 24 10:48:00 CET,0.0 0.593 0.83 1.033 1.21 1.377 1.533 1.669 1.91 2.029 2.14 2.019 2.44 2.535 2.711 2.876 3.027 3.1 3.245 3.393 3.618 3.757 3.879 4.059 4.228 4.387 4.548 4.708 4.907 5.097 5.277 5.48 5.675 5.88 6.107 6.357 6.611 6.883 7.181 7.506 7.858 8.244 8.655 9.068 9.561 10.093 10.728 11.452 12.2 12.97 13.8 14.187 14.042 13.721 13.368 12.931 12.514 12.191 11.913 11.594 11.299 11.023 10.742 10.483 10.225 9.979 9.723 9.482 9.28 9.061 8.842 8.649 8.409 8.147 7.949 7.758 7.552 7.345 7.142 6.995 6.829 6.556 6.372 6.19 6.088 5.851 5.594 5.34 5.203 4.746 4.763 4.597 4.416 4.025 3.804 3.526 3.178 2.811 2.384 1.795 -0.143 -5 ,24921 ,KEBNE ,17069804,Fri Dec 24 08:42:33 CET,Fri Dec 24 10:53:03 CET,0.0 0.692 0.996 1.221 1.41 1.582 1.745 1.891 2.148 2.279 2.401 2.314 2.746 2.851 3.062 3.264 3.445 3.525 3.676 3.823 4.024 4.159 4.293 4.471 4.644 4.821 4.991 5.149 5.351 5.537 5.712 5.933 6.149 6.343 6.567 6.834 7.092 7.366 7.637 7.932 8.249 8.611 9.063 9.527 10.039 10.595 11.225 11.873 12.581 13.333 14.045 14.268 14.16 13.915 13.589 13.247 12.928 12.598 12.28 11.923 11.599 11.311 11.018 10.741 10.471 10.221 9.963 9.723 9.507 9.275 9.032 8.824 8.596 8.346 8.153 7.963 7.754 7.52 7.272 7.104 6.942 6.678 6.48 6.268 6.153 5.915 5.669 5.404 5.262 4.821 4.858 4.69 4.51 4.144 3.946 3.714 3.456 3.168 2.803 2.277 0.784 -6 ,24750 ,KEBNE ,17125451,Thu Dec 30 16:35:27 CET,Thu Dec 30 18:48:52 CET,0.0 0.373 0.604 0.821 0.991 1.139 1.29 1.439 1.711 1.823 1.93 1.809 2.222 2.313 2.484 2.652 2.808 2.88 3.024 3.152 3.34 3.474 3.613 3.803 3.965 4.128 4.293 4.451 4.645 4.83 5.02 5.243 5.453 5.659 5.893 6.162 6.422 6.696 6.978 7.284 7.63 8.02 8.453 8.885 9.387 9.936 10.518 11.138 11.848 12.563 13.218 13.506 13.392 13.084 12.767 12.391 11.993 11.618 11.281 10.932 10.618 10.311 10.027 9.768 9.495 9.231 8.946 8.694 8.475 8.208 7.923 7.716 7.512 7.286 7.091 6.896 6.705 6.48 6.234 6.059 5.872 5.581 5.387 5.196 5.097 4.89 4.674 4.43 4.313 3.882 3.875 3.703 3.521 3.095 2.876 2.642 2.364 2.062 1.7 1.192 -0.331 -7 ,27025 ,KEBNE ,17069806,Fri Dec 24 08:45:41 CET,Fri Dec 24 10:57:16 CET,0.0 0.64 0.949 1.22 1.433 1.601 1.752 1.893 2.153 2.266 2.373 2.276 2.702 2.806 2.998 3.173 3.341 3.417 3.558 3.702 3.91 4.046 4.185 4.381 4.568 4.741 4.913 5.083 5.289 5.485 5.678 5.918 6.152 6.364 6.597 6.863 7.137 7.438 7.741 8.056 8.405 8.812 9.252 9.684 10.214 10.79 11.431 12.121 12.829 13.591 14.354 14.682 14.67 14.506 14.189 13.793 13.414 13.049 12.715 12.345 12.001 11.704 11.418 11.148 10.9 10.665 10.394 10.133 9.916 9.693 9.464 9.273 9.045 8.802 8.62 8.436 8.25 8.057 7.856 7.704 7.536 7.289 7.093 6.878 6.784 6.589 6.364 6.105 5.968 5.524 5.58 5.441 5.282 4.945 4.753 4.485 4.175 3.884 3.53 3.096 2.194 -8 ,26993 ,KEBNE ,17125453,Thu Dec 30 16:35:38 CET,Thu Dec 30 18:48:23 CET,0.0 0.468 0.722 0.921 1.092 1.244 1.391 1.535 1.796 1.914 2.02 1.889 2.296 2.393 2.584 2.759 2.916 2.99 3.136 3.279 3.494 3.632 3.759 3.954 4.149 4.336 4.515 4.676 4.88 5.071 5.257 5.505 5.745 5.96 6.202 6.49 6.771 7.048 7.354 7.695 8.046 8.443 8.94 9.43 9.935 10.465 11.077 11.749 12.428 13.097 13.826 14.138 14.0 13.721 13.382 13.052 12.71 12.358 12.023 11.676 11.38 11.083 10.783 10.486 10.164 9.887 9.617 9.364 9.139 8.901 8.658 8.446 8.234 8.02 7.838 7.64 7.446 7.239 7.021 6.871 6.695 6.406 6.211 6.003 5.897 5.695 5.486 5.236 5.1 4.645 4.64 4.469 4.289 3.88 3.64 3.406 3.181 2.912 2.551 2.056 1.098 -9 ,11426 ,KEBNE ,17125454,Thu Dec 30 16:35:38 CET,Thu Dec 30 18:42:55 CET,0.0 0.397 0.638 0.824 0.995 1.149 1.291 1.43 1.701 1.821 1.926 1.808 2.236 2.342 2.525 2.68 2.836 2.918 3.073 3.219 3.416 3.534 3.655 3.845 4.033 4.206 4.38 4.546 4.735 4.92 5.101 5.32 5.537 5.747 5.986 6.252 6.506 6.788 7.094 7.415 7.773 8.17 8.591 9.003 9.479 9.99 10.543 11.128 11.811 12.531 13.148 13.362 13.297 13.115 12.833 12.514 12.182 11.835 11.534 11.217 10.911 10.635 10.363 10.089 9.823 9.575 9.303 9.068 8.869 8.645 8.408 8.207 7.991 7.763 7.566 7.364 7.168 6.956 6.722 6.558 6.4 6.158 5.978 5.776 5.671 5.467 5.235 4.981 4.859 4.414 4.437 4.29 4.125 3.762 3.567 3.353 3.088 2.762 2.415 1.981 0.653 -10 ,27281 ,KEBNE ,17069809,Fri Dec 24 08:48:56 CET,Fri Dec 24 10:59:45 CET,0.0 0.519 0.767 0.977 1.18 1.37 1.536 1.682 1.953 2.081 2.202 2.108 2.535 2.637 2.823 2.993 3.167 3.252 3.408 3.555 3.764 3.896 4.022 4.198 4.375 4.551 4.724 4.88 5.078 5.284 5.484 5.71 5.916 6.117 6.354 6.619 6.871 7.152 7.46 7.79 8.124 8.488 8.92 9.351 9.839 10.362 10.97 11.634 12.318 13.034 13.693 13.915 13.833 13.586 13.228 12.885 12.535 12.147 11.796 11.432 11.106 10.809 10.527 10.225 9.93 9.672 9.407 9.164 8.94 8.712 8.47 8.265 8.042 7.794 7.606 7.419 7.222 6.993 6.748 6.589 6.424 6.171 5.984 5.77 5.659 5.432 5.208 4.961 4.825 4.369 4.353 4.182 3.995 3.561 3.313 3.036 2.758 2.462 2.065 1.457 -0.557 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1oi9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1oi9.txt deleted file mode 100644 index ee07bb0c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_26_1oi9.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,2719 ,TETRA ,17526213,Thu Nov 25 03:28:43 CET,Thu Nov 25 06:30:40 CET,0.0 0.516 0.803 1.03 1.202 1.344 1.494 1.653 1.924 2.028 2.131 2.021 2.434 2.519 2.69 2.846 2.98 3.044 3.186 3.31 3.472 3.577 3.678 3.829 3.976 4.115 4.244 4.367 4.524 4.67 4.801 4.941 5.077 5.214 5.365 5.53 5.678 5.829 5.991 6.165 6.341 6.511 6.683 6.857 7.04 7.242 7.425 7.518 7.53 7.337 6.645 5.572 4.568 3.585 2.717 1.957 1.284 0.644 0.026 -0.623 -1.177 -1.653 -2.139 -2.624 -3.056 -3.45 -3.863 -4.234 -4.566 -4.925 -5.286 -5.577 -5.883 -6.197 -6.429 -6.683 -6.968 -7.276 -7.633 -7.883 -8.126 -8.512 -8.782 -9.044 -9.178 -9.478 -9.812 -10.168 -10.358 -10.889 -10.961 -11.191 -11.434 -11.962 -12.258 -12.561 -12.886 -13.266 -13.747 -14.386 -16.26 -3 ,10612 ,TETRA ,17526215,Thu Nov 25 03:29:40 CET,Thu Nov 25 06:31:22 CET,0.0 0.453 0.722 0.937 1.136 1.314 1.474 1.619 1.869 1.97 2.064 1.923 2.33 2.414 2.569 2.73 2.907 2.986 3.118 3.24 3.398 3.509 3.629 3.781 3.912 4.05 4.195 4.325 4.489 4.655 4.795 4.941 5.089 5.232 5.399 5.579 5.738 5.927 6.138 6.347 6.538 6.732 6.932 7.098 7.261 7.422 7.558 7.607 7.512 7.138 6.277 5.044 3.92 2.782 1.684 0.607 -0.428 -1.364 -2.173 -2.979 -3.637 -4.194 -4.752 -5.278 -5.737 -6.171 -6.648 -7.072 -7.442 -7.847 -8.25 -8.579 -8.918 -9.254 -9.525 -9.818 -10.132 -10.431 -10.723 -10.934 -11.156 -11.491 -11.721 -11.971 -12.096 -12.368 -12.67 -12.971 -13.136 -13.659 -13.72 -13.934 -14.156 -14.616 -14.874 -15.14 -15.434 -15.808 -16.261 -16.867 -18.229 -4 ,24152 ,TETRA ,17526217,Thu Nov 25 03:28:44 CET,Thu Nov 25 06:21:12 CET,0.0 0.596 0.864 1.094 1.282 1.429 1.556 1.687 1.938 2.047 2.152 2.018 2.424 2.504 2.651 2.801 2.938 3.002 3.135 3.253 3.404 3.501 3.603 3.752 3.887 4.001 4.121 4.245 4.402 4.55 4.681 4.837 4.986 5.117 5.256 5.432 5.595 5.752 5.908 6.065 6.224 6.388 6.574 6.77 6.99 7.188 7.335 7.414 7.373 7.144 6.408 5.122 3.788 2.56 1.455 0.371 -0.598 -1.427 -2.125 -2.862 -3.491 -4.037 -4.57 -5.065 -5.495 -5.907 -6.346 -6.759 -7.146 -7.539 -7.941 -8.269 -8.605 -8.959 -9.238 -9.528 -9.833 -10.143 -10.456 -10.664 -10.888 -11.276 -11.544 -11.82 -11.964 -12.269 -12.595 -12.938 -13.117 -13.641 -13.711 -13.904 -14.12 -14.631 -14.909 -15.2 -15.536 -15.94 -16.378 -16.89 -17.866 -5 ,5089 ,TETRA ,17526219,Thu Nov 25 03:28:45 CET,Thu Nov 25 06:20:02 CET,0.0 0.723 1.004 1.203 1.367 1.513 1.66 1.811 2.055 2.156 2.254 2.122 2.53 2.608 2.759 2.892 3.005 3.064 3.192 3.314 3.487 3.591 3.689 3.834 3.965 4.082 4.196 4.3 4.431 4.557 4.676 4.818 4.954 5.085 5.217 5.364 5.521 5.688 5.843 5.997 6.169 6.339 6.524 6.737 6.95 7.13 7.294 7.397 7.399 7.197 6.555 5.539 4.531 3.588 2.791 2.037 1.281 0.52 -0.167 -0.835 -1.445 -2.002 -2.525 -3.022 -3.501 -3.951 -4.414 -4.819 -5.192 -5.599 -6.016 -6.36 -6.727 -7.086 -7.345 -7.609 -7.878 -8.162 -8.455 -8.646 -8.843 -9.193 -9.455 -9.721 -9.849 -10.103 -10.373 -10.68 -10.855 -11.373 -11.431 -11.642 -11.853 -12.308 -12.568 -12.841 -13.151 -13.519 -13.96 -14.532 -15.59 -8 ,29467 ,TETRA ,17526225,Thu Nov 25 03:29:42 CET,Thu Nov 25 06:20:46 CET,0.0 0.535 0.835 1.042 1.213 1.371 1.491 1.608 1.833 1.935 2.046 1.924 2.332 2.419 2.576 2.721 2.86 2.926 3.062 3.207 3.395 3.496 3.591 3.731 3.873 4.012 4.148 4.275 4.431 4.581 4.724 4.888 5.037 5.168 5.321 5.498 5.672 5.847 6.0 6.155 6.33 6.526 6.726 6.908 7.117 7.321 7.488 7.593 7.637 7.473 6.772 5.65 4.45 3.378 2.522 1.722 0.961 0.231 -0.411 -1.078 -1.654 -2.164 -2.682 -3.125 -3.512 -3.896 -4.318 -4.702 -5.02 -5.373 -5.749 -6.058 -6.389 -6.736 -7.017 -7.297 -7.567 -7.852 -8.16 -8.383 -8.611 -8.967 -9.207 -9.443 -9.568 -9.838 -10.146 -10.457 -10.619 -11.139 -11.195 -11.4 -11.603 -12.07 -12.322 -12.575 -12.892 -13.264 -13.701 -14.261 -15.298 -9 ,17645 ,TETRA ,17526227,Thu Nov 25 03:29:42 CET,Thu Nov 25 06:28:15 CET,0.0 0.321 0.543 0.724 0.888 1.038 1.161 1.279 1.489 1.576 1.662 1.516 1.918 1.997 2.153 2.296 2.423 2.484 2.594 2.698 2.851 2.955 3.06 3.212 3.351 3.483 3.615 3.742 3.903 4.034 4.146 4.28 4.404 4.526 4.684 4.875 5.041 5.223 5.432 5.64 5.853 6.094 6.329 6.504 6.699 6.909 7.086 7.19 7.202 6.954 6.156 4.987 3.782 2.638 1.716 0.948 0.206 -0.588 -1.377 -2.144 -2.786 -3.374 -3.924 -4.439 -4.912 -5.373 -5.87 -6.323 -6.718 -7.116 -7.531 -7.867 -8.21 -8.546 -8.822 -9.121 -9.406 -9.714 -10.04 -10.259 -10.491 -10.849 -11.12 -11.419 -11.572 -11.901 -12.223 -12.56 -12.749 -13.288 -13.363 -13.599 -13.833 -14.284 -14.552 -14.838 -15.151 -15.551 -16.018 -16.561 -17.787 -10 ,13644 ,TETRA ,17526229,Thu Nov 25 03:29:42 CET,Thu Nov 25 06:28:52 CET,0.0 0.584 0.911 1.137 1.319 1.478 1.62 1.747 1.983 2.093 2.197 2.08 2.488 2.572 2.729 2.884 3.041 3.113 3.263 3.405 3.578 3.691 3.816 3.994 4.138 4.264 4.381 4.492 4.633 4.768 4.898 5.06 5.209 5.355 5.556 5.765 5.934 6.111 6.319 6.568 6.827 7.1 7.381 7.612 7.829 7.997 8.132 8.215 8.17 7.935 7.307 6.255 5.142 4.123 3.186 2.283 1.485 0.777 0.191 -0.413 -0.968 -1.465 -1.911 -2.368 -2.808 -3.183 -3.617 -4.024 -4.334 -4.668 -5.04 -5.342 -5.677 -6.007 -6.261 -6.556 -6.865 -7.178 -7.509 -7.747 -7.994 -8.372 -8.643 -8.932 -9.078 -9.386 -9.717 -10.064 -10.246 -10.763 -10.802 -11.022 -11.269 -11.762 -12.029 -12.343 -12.696 -13.065 -13.487 -14.055 -15.656 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_26_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_26_21.txt deleted file mode 100644 index 861db4c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_26_21.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22811 ,TETRA ,17526231,Thu Nov 25 03:29:42 CET,Thu Nov 25 06:20:47 CET,0.0 1.377 1.859 2.261 2.589 2.884 3.117 3.307 3.674 3.827 3.983 3.972 4.424 4.545 4.789 5.009 5.225 5.332 5.527 5.716 5.971 6.146 6.332 6.597 6.832 7.039 7.22 7.389 7.599 7.804 8.016 8.252 8.463 8.652 8.882 9.134 9.339 9.541 9.758 9.99 10.227 10.476 10.676 10.848 11.039 11.158 11.155 11.026 10.718 9.988 8.524 6.644 4.994 3.516 2.246 1.11 0.085 -0.831 -1.608 -2.365 -2.996 -3.586 -4.134 -4.63 -5.095 -5.515 -5.94 -6.326 -6.659 -7.005 -7.36 -7.643 -7.941 -8.255 -8.516 -8.776 -9.034 -9.318 -9.606 -9.803 -10.007 -10.323 -10.538 -10.755 -10.871 -11.121 -11.369 -11.61 -11.752 -12.243 -12.21 -12.376 -12.553 -12.96 -13.194 -13.418 -13.647 -13.905 -14.194 -14.557 -15.473 -3 ,24821 ,TETRA ,17526235,Thu Nov 25 03:30:43 CET,Thu Nov 25 06:26:45 CET,0.0 0.9 1.304 1.651 1.948 2.196 2.398 2.569 2.904 3.06 3.19 3.093 3.527 3.643 3.86 4.068 4.248 4.331 4.492 4.646 4.868 5.005 5.138 5.332 5.522 5.697 5.865 6.038 6.249 6.432 6.618 6.865 7.084 7.246 7.399 7.568 7.726 7.907 8.101 8.29 8.456 8.601 8.719 8.815 8.907 8.96 8.942 8.804 8.479 7.801 6.401 4.528 2.879 1.458 0.276 -0.765 -1.72 -2.616 -3.348 -4.075 -4.734 -5.327 -5.87 -6.349 -6.789 -7.206 -7.635 -8.011 -8.334 -8.67 -9.015 -9.3 -9.611 -9.94 -10.193 -10.442 -10.692 -10.952 -11.222 -11.411 -11.61 -11.906 -12.104 -12.315 -12.44 -12.717 -12.994 -13.277 -13.419 -13.901 -13.892 -14.069 -14.253 -14.683 -14.909 -15.153 -15.43 -15.716 -16.078 -16.585 -17.442 -4 ,14995 ,TETRA ,17526237,Thu Nov 25 03:30:43 CET,Thu Nov 25 06:33:02 CET,0.0 1.99 2.587 2.954 3.293 3.652 3.937 4.167 4.588 4.775 4.949 4.952 5.416 5.557 5.808 6.026 6.25 6.363 6.573 6.755 7.031 7.205 7.37 7.603 7.814 8.022 8.203 8.375 8.591 8.787 8.969 9.185 9.397 9.593 9.812 10.048 10.226 10.366 10.503 10.639 10.788 10.971 11.144 11.276 11.373 11.414 11.395 11.263 10.969 10.404 9.144 7.339 5.734 4.329 3.135 2.06 1.103 0.263 -0.455 -1.181 -1.815 -2.395 -2.947 -3.487 -3.979 -4.408 -4.857 -5.256 -5.622 -6.006 -6.374 -6.676 -6.996 -7.319 -7.573 -7.843 -8.107 -8.388 -8.699 -8.906 -9.127 -9.476 -9.723 -9.991 -10.128 -10.413 -10.718 -11.033 -11.196 -11.687 -11.659 -11.831 -12.011 -12.434 -12.693 -12.978 -13.263 -13.586 -13.934 -14.482 -16.03 -5 ,3151 ,TETRA ,17526240,Thu Nov 25 03:30:44 CET,Thu Nov 25 06:32:34 CET,0.0 1.716 2.236 2.622 2.919 3.195 3.435 3.667 4.077 4.266 4.467 4.493 4.963 5.124 5.381 5.586 5.774 5.856 6.019 6.188 6.432 6.589 6.741 6.967 7.202 7.412 7.583 7.729 7.885 8.033 8.197 8.389 8.553 8.708 8.876 9.055 9.235 9.446 9.66 9.873 10.099 10.317 10.505 10.647 10.79 10.914 10.935 10.823 10.55 9.892 8.415 6.451 4.767 3.225 1.894 0.763 -0.244 -1.166 -1.961 -2.769 -3.458 -4.073 -4.658 -5.19 -5.673 -6.119 -6.596 -7.024 -7.385 -7.746 -8.116 -8.425 -8.737 -9.064 -9.317 -9.578 -9.855 -10.133 -10.415 -10.62 -10.828 -11.153 -11.38 -11.611 -11.731 -11.979 -12.232 -12.5 -12.643 -13.132 -13.111 -13.283 -13.465 -13.865 -14.068 -14.275 -14.499 -14.757 -15.068 -15.496 -16.77 -6 ,11839 ,TETRA ,17526241,Thu Nov 25 03:30:44 CET,Thu Nov 25 06:27:58 CET,0.0 2.007 2.517 2.88 3.181 3.424 3.645 3.845 4.212 4.381 4.55 4.538 4.996 5.131 5.372 5.596 5.807 5.907 6.104 6.289 6.548 6.71 6.86 7.098 7.352 7.594 7.799 7.986 8.239 8.462 8.668 8.917 9.144 9.353 9.615 9.936 10.237 10.551 10.856 11.134 11.413 11.689 11.944 12.168 12.373 12.507 12.565 12.532 12.284 11.534 9.957 7.916 6.175 4.64 3.299 2.091 1.059 0.177 -0.595 -1.374 -2.028 -2.602 -3.137 -3.632 -4.084 -4.506 -4.949 -5.334 -5.659 -5.995 -6.358 -6.659 -6.971 -7.299 -7.564 -7.847 -8.15 -8.457 -8.743 -8.933 -9.145 -9.513 -9.774 -10.039 -10.18 -10.468 -10.754 -11.062 -11.221 -11.719 -11.714 -11.899 -12.123 -12.574 -12.794 -13.032 -13.296 -13.603 -13.936 -14.359 -15.141 -7 ,17379 ,TETRA ,17526243,Thu Nov 25 03:30:43 CET,Thu Nov 25 06:31:44 CET,0.0 0.974 1.48 1.938 2.328 2.65 2.882 3.072 3.394 3.545 3.686 3.605 4.045 4.162 4.38 4.566 4.729 4.813 4.98 5.128 5.321 5.444 5.561 5.726 5.901 6.081 6.233 6.373 6.558 6.73 6.904 7.107 7.28 7.444 7.633 7.83 8.017 8.217 8.443 8.674 8.88 9.08 9.274 9.444 9.626 9.762 9.8 9.734 9.389 8.709 7.365 5.426 3.758 2.36 1.197 0.149 -0.776 -1.633 -2.377 -3.103 -3.716 -4.251 -4.781 -5.306 -5.771 -6.194 -6.645 -7.05 -7.419 -7.781 -8.124 -8.408 -8.714 -9.031 -9.277 -9.54 -9.803 -10.07 -10.344 -10.531 -10.734 -11.06 -11.285 -11.507 -11.612 -11.833 -12.067 -12.31 -12.445 -12.936 -12.952 -13.124 -13.308 -13.721 -13.933 -14.167 -14.437 -14.76 -15.206 -15.792 -16.815 -8 ,27289 ,TETRA ,17526245,Thu Nov 25 03:30:45 CET,Thu Nov 25 06:20:55 CET,0.0 1.896 2.478 2.903 3.215 3.476 3.698 3.898 4.31 4.489 4.649 4.635 5.106 5.245 5.505 5.732 5.938 6.041 6.237 6.414 6.653 6.806 6.956 7.167 7.363 7.557 7.767 7.975 8.205 8.396 8.582 8.815 9.041 9.245 9.455 9.678 9.894 10.133 10.364 10.57 10.771 10.999 11.254 11.483 11.719 11.86 11.929 11.911 11.626 10.984 9.664 7.835 6.194 4.755 3.509 2.395 1.429 0.543 -0.23 -1.001 -1.649 -2.234 -2.794 -3.321 -3.803 -4.227 -4.685 -5.074 -5.407 -5.774 -6.166 -6.503 -6.852 -7.216 -7.483 -7.741 -8.021 -8.333 -8.667 -8.892 -9.12 -9.463 -9.696 -9.936 -10.063 -10.351 -10.638 -10.931 -11.093 -11.596 -11.601 -11.776 -11.954 -12.347 -12.565 -12.801 -13.065 -13.385 -13.767 -14.267 -15.302 -9 ,26029 ,TETRA ,17526247,Thu Nov 25 03:31:41 CET,Thu Nov 25 06:32:22 CET,0.0 1.546 2.016 2.383 2.654 2.874 3.073 3.271 3.623 3.768 3.907 3.853 4.293 4.405 4.632 4.856 5.072 5.172 5.359 5.534 5.775 5.924 6.073 6.281 6.478 6.677 6.857 7.03 7.256 7.469 7.675 7.893 8.081 8.255 8.463 8.708 8.924 9.137 9.365 9.588 9.792 10.027 10.302 10.54 10.71 10.754 10.719 10.603 10.315 9.682 8.249 6.277 4.561 3.065 1.811 0.718 -0.258 -1.133 -1.88 -2.627 -3.254 -3.795 -4.299 -4.779 -5.219 -5.625 -6.06 -6.445 -6.776 -7.104 -7.435 -7.711 -8.014 -8.333 -8.574 -8.825 -9.075 -9.334 -9.613 -9.813 -10.015 -10.31 -10.514 -10.725 -10.837 -11.082 -11.337 -11.597 -11.737 -12.229 -12.224 -12.388 -12.551 -12.906 -13.104 -13.317 -13.554 -13.814 -14.182 -14.672 -15.405 -10 ,14317 ,TETRA ,17526249,Thu Nov 25 03:31:41 CET,Thu Nov 25 06:24:45 CET,0.0 1.525 1.968 2.306 2.552 2.759 2.945 3.13 3.479 3.624 3.762 3.699 4.144 4.273 4.494 4.679 4.858 4.943 5.094 5.241 5.456 5.597 5.744 5.94 6.125 6.297 6.448 6.592 6.765 6.937 7.104 7.299 7.482 7.65 7.852 8.048 8.235 8.464 8.696 8.912 9.116 9.335 9.553 9.755 9.9 9.937 9.932 9.808 9.474 8.799 7.315 5.283 3.533 2.019 0.755 -0.378 -1.399 -2.303 -3.078 -3.855 -4.497 -5.052 -5.58 -6.102 -6.605 -7.055 -7.508 -7.92 -8.279 -8.646 -9.025 -9.342 -9.665 -9.998 -10.261 -10.526 -10.792 -11.072 -11.376 -11.592 -11.798 -12.105 -12.325 -12.549 -12.663 -12.908 -13.18 -13.456 -13.599 -14.09 -14.062 -14.235 -14.418 -14.8 -15.016 -15.254 -15.528 -15.831 -16.135 -16.572 -17.561 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_28_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_28_1h1s.txt deleted file mode 100644 index d393c40a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_28_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6589 ,TETRA ,17526251,Thu Nov 25 03:31:41 CET,Thu Nov 25 06:32:52 CET,0.0 0.377 0.594 0.778 0.931 1.052 1.169 1.279 1.472 1.554 1.63 1.284 1.824 1.891 2.033 2.15 2.241 2.279 2.351 2.433 2.548 2.62 2.687 2.777 2.864 2.93 2.983 3.032 3.077 3.107 3.132 3.153 3.155 3.162 3.164 3.138 3.103 3.059 2.99 2.898 2.774 2.602 2.346 2.03 1.63 1.117 0.366 -0.704 -2.192 -4.351 -7.824 -11.771 -14.836 -17.323 -19.434 -21.26 -22.772 -24.182 -25.487 -26.782 -27.824 -28.752 -29.68 -30.525 -31.296 -32.033 -32.791 -33.429 -33.984 -34.544 -35.114 -35.605 -36.086 -36.567 -36.946 -37.365 -37.805 -38.224 -38.622 -38.867 -39.121 -39.525 -39.793 -40.074 -40.226 -40.532 -40.859 -41.221 -41.408 -42.14 -42.085 -42.318 -42.532 -42.961 -43.24 -43.546 -43.834 -44.183 -44.602 -45.16 -47.17 -2 ,18100 ,TETRA ,17526252,Thu Nov 25 03:31:42 CET,Thu Nov 25 06:24:16 CET,0.0 0.758 1.037 1.21 1.368 1.509 1.642 1.769 1.97 2.053 2.128 1.796 2.333 2.395 2.524 2.629 2.711 2.748 2.821 2.897 2.996 3.056 3.113 3.194 3.281 3.367 3.437 3.501 3.561 3.595 3.619 3.638 3.646 3.645 3.65 3.648 3.625 3.574 3.496 3.388 3.246 3.071 2.849 2.562 2.134 1.596 0.853 -0.211 -1.717 -3.883 -7.382 -11.458 -14.612 -17.121 -19.195 -20.988 -22.535 -23.954 -25.173 -26.356 -27.326 -28.168 -28.941 -29.655 -30.343 -30.984 -31.625 -32.177 -32.68 -33.197 -33.753 -34.243 -34.742 -35.238 -35.606 -35.967 -36.33 -36.691 -37.054 -37.311 -37.575 -37.993 -38.303 -38.618 -38.777 -39.122 -39.493 -39.89 -40.087 -40.821 -40.739 -40.965 -41.2 -41.694 -41.966 -42.255 -42.555 -42.915 -43.359 -43.917 -45.605 -4 ,29603 ,TETRA ,17526254,Thu Nov 25 03:31:42 CET,Thu Nov 25 06:26:29 CET,0.0 0.402 0.63 0.778 0.903 1.01 1.119 1.225 1.403 1.479 1.551 1.21 1.757 1.827 1.939 2.034 2.116 2.152 2.228 2.305 2.419 2.484 2.537 2.608 2.666 2.72 2.766 2.807 2.856 2.901 2.938 2.966 2.975 2.968 2.967 2.966 2.945 2.896 2.812 2.713 2.593 2.413 2.168 1.879 1.482 0.971 0.234 -0.797 -2.261 -4.403 -7.891 -11.971 -15.185 -17.749 -19.863 -21.683 -23.191 -24.535 -25.68 -26.821 -27.836 -28.717 -29.54 -30.319 -31.026 -31.639 -32.263 -32.839 -33.337 -33.855 -34.395 -34.822 -35.251 -35.719 -36.09 -36.479 -36.879 -37.285 -37.699 -37.97 -38.257 -38.687 -38.99 -39.333 -39.516 -39.874 -40.234 -40.617 -40.823 -41.56 -41.476 -41.712 -41.964 -42.48 -42.758 -43.065 -43.404 -43.813 -44.312 -44.92 -46.452 -6 ,7426 ,TETRA ,17526256,Thu Nov 25 03:31:42 CET,Thu Nov 25 06:26:19 CET,0.0 0.502 0.829 1.055 1.198 1.323 1.438 1.553 1.779 1.866 1.943 1.612 2.154 2.225 2.377 2.491 2.575 2.62 2.704 2.776 2.872 2.931 2.992 3.074 3.135 3.187 3.239 3.282 3.339 3.395 3.434 3.487 3.533 3.549 3.554 3.548 3.526 3.511 3.497 3.423 3.297 3.115 2.87 2.574 2.127 1.581 0.875 -0.12 -1.557 -3.692 -7.205 -11.203 -14.351 -16.917 -18.998 -20.834 -22.406 -23.791 -24.984 -26.137 -27.113 -28.0 -28.821 -29.572 -30.286 -30.927 -31.57 -32.115 -32.599 -33.138 -33.696 -34.162 -34.643 -35.118 -35.479 -35.835 -36.179 -36.53 -36.896 -37.158 -37.442 -37.877 -38.178 -38.485 -38.641 -38.972 -39.309 -39.659 -39.869 -40.622 -40.557 -40.797 -41.046 -41.569 -41.824 -42.107 -42.449 -42.878 -43.402 -44.057 -46.1 -8 ,17330 ,TETRA ,17526258,Thu Nov 25 03:31:42 CET,Thu Nov 25 06:31:34 CET,0.0 0.504 0.774 0.965 1.129 1.274 1.41 1.525 1.739 1.84 1.917 1.579 2.117 2.167 2.283 2.404 2.516 2.565 2.657 2.745 2.856 2.926 2.992 3.075 3.142 3.189 3.223 3.269 3.333 3.384 3.426 3.453 3.484 3.515 3.521 3.505 3.48 3.441 3.374 3.292 3.175 3.013 2.783 2.465 2.052 1.53 0.797 -0.232 -1.741 -3.972 -7.52 -11.558 -14.709 -17.327 -19.486 -21.267 -22.78 -24.136 -25.286 -26.392 -27.326 -28.155 -28.949 -29.669 -30.324 -30.933 -31.558 -32.14 -32.64 -33.144 -33.677 -34.117 -34.568 -35.025 -35.385 -35.752 -36.137 -36.536 -36.917 -37.185 -37.469 -37.895 -38.189 -38.495 -38.657 -39.002 -39.373 -39.741 -39.927 -40.647 -40.528 -40.738 -40.958 -41.45 -41.726 -42.024 -42.357 -42.75 -43.187 -43.714 -45.658 -9 ,26540 ,TETRA ,17526259,Thu Nov 25 03:31:43 CET,Thu Nov 25 06:32:17 CET,0.0 0.414 0.635 0.801 0.966 1.117 1.236 1.339 1.532 1.626 1.72 1.392 1.938 2.003 2.13 2.255 2.363 2.415 2.497 2.564 2.667 2.745 2.818 2.884 2.936 2.995 3.055 3.106 3.163 3.211 3.237 3.251 3.268 3.267 3.267 3.266 3.238 3.198 3.139 3.047 2.933 2.758 2.497 2.204 1.831 1.334 0.574 -0.449 -1.861 -3.999 -7.481 -11.437 -14.587 -17.157 -19.288 -21.12 -22.686 -24.107 -25.286 -26.411 -27.353 -28.179 -28.935 -29.646 -30.331 -30.949 -31.59 -32.184 -32.695 -33.218 -33.776 -34.26 -34.739 -35.211 -35.563 -35.923 -36.295 -36.657 -37.044 -37.331 -37.65 -38.167 -38.524 -38.861 -39.026 -39.37 -39.734 -40.112 -40.3 -41.025 -40.985 -41.259 -41.531 -42.111 -42.426 -42.768 -43.156 -43.594 -44.114 -44.889 -47.423 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_28_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_28_30.txt deleted file mode 100644 index d7980994..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_28_30.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,32310 ,TETRA ,17526262,Thu Nov 25 03:32:39 CET,Thu Nov 25 06:31:15 CET,0.0 0.925 1.39 1.739 2.044 2.339 2.619 2.869 3.318 3.523 3.723 3.639 4.312 4.5 4.85 5.18 5.494 5.638 5.933 6.232 6.645 6.905 7.159 7.526 7.886 8.243 8.603 8.955 9.4 9.84 10.271 10.789 11.291 11.781 12.367 13.033 13.675 14.397 15.178 16.038 16.981 18.036 19.295 20.605 22.152 23.935 26.111 28.668 31.79 35.689 40.722 45.219 48.021 49.984 51.428 52.542 53.375 54.009 54.478 54.861 55.132 55.364 55.552 55.692 55.807 55.887 55.958 55.988 55.998 56.023 56.034 56.02 55.993 55.967 55.947 55.903 55.84 55.78 55.711 55.64 55.559 55.435 55.333 55.214 55.152 55.015 54.873 54.722 54.638 54.138 54.359 54.239 54.081 53.736 53.578 53.413 53.228 52.981 52.709 52.409 51.227 -3 ,11023 ,TETRA ,17526263,Thu Nov 25 03:32:39 CET,Thu Nov 25 06:30:15 CET,0.0 0.93 1.355 1.685 1.995 2.285 2.56 2.821 3.284 3.504 3.715 3.63 4.306 4.489 4.836 5.164 5.48 5.643 5.962 6.258 6.689 6.981 7.27 7.682 8.072 8.443 8.814 9.182 9.665 10.128 10.573 11.134 11.685 12.208 12.822 13.521 14.219 15.008 15.86 16.782 17.775 18.903 20.216 21.541 23.119 24.928 27.085 29.604 32.671 36.458 41.303 45.701 48.535 50.498 51.884 52.91 53.645 54.185 54.577 54.924 55.178 55.361 55.504 55.611 55.674 55.7 55.71 55.698 55.68 55.672 55.656 55.638 55.602 55.542 55.493 55.439 55.39 55.341 55.283 55.232 55.16 55.024 54.912 54.789 54.726 54.587 54.44 54.283 54.189 53.665 53.877 53.773 53.649 53.354 53.206 53.034 52.813 52.558 52.266 51.908 50.552 -4 ,9962 ,TETRA ,17526264,Thu Nov 25 03:32:40 CET,Thu Nov 25 06:37:23 CET,0.0 0.761 1.149 1.495 1.791 2.038 2.268 2.478 2.871 3.057 3.231 3.092 3.738 3.904 4.23 4.53 4.817 4.959 5.221 5.482 5.869 6.127 6.387 6.758 7.12 7.473 7.818 8.168 8.618 9.063 9.503 10.049 10.57 11.06 11.641 12.295 12.931 13.647 14.447 15.326 16.264 17.34 18.63 19.979 21.575 23.385 25.56 28.09 31.097 34.824 39.744 44.152 46.97 48.918 50.316 51.361 52.14 52.755 53.196 53.565 53.827 54.033 54.207 54.335 54.448 54.53 54.596 54.643 54.667 54.68 54.685 54.688 54.68 54.663 54.633 54.587 54.541 54.485 54.413 54.367 54.319 54.232 54.174 54.109 54.07 53.986 53.89 53.784 53.728 53.259 53.537 53.453 53.357 53.142 53.007 52.857 52.708 52.521 52.273 51.927 50.812 -5 ,4164 ,TETRA ,17526265,Thu Nov 25 03:32:39 CET,Thu Nov 25 06:27:11 CET,0.0 0.537 0.914 1.217 1.454 1.685 1.907 2.109 2.483 2.659 2.833 2.707 3.343 3.504 3.836 4.134 4.416 4.561 4.845 5.109 5.5 5.75 5.989 6.344 6.703 7.054 7.397 7.747 8.197 8.638 9.077 9.61 10.128 10.624 11.212 11.878 12.515 13.221 14.025 14.899 15.786 16.825 18.133 19.456 20.995 22.816 24.967 27.485 30.587 34.355 39.249 43.642 46.445 48.401 49.797 50.856 51.654 52.253 52.678 53.066 53.369 53.592 53.748 53.882 53.999 54.069 54.132 54.2 54.229 54.217 54.207 54.209 54.205 54.181 54.144 54.095 54.048 53.994 53.925 53.872 53.802 53.676 53.596 53.511 53.459 53.352 53.239 53.117 53.056 52.575 52.851 52.77 52.676 52.486 52.359 52.207 52.033 51.827 51.585 51.213 49.938 -6 ,8275 ,TETRA ,17526266,Thu Nov 25 03:32:40 CET,Thu Nov 25 06:35:01 CET,0.0 0.961 1.38 1.726 2.05 2.344 2.594 2.822 3.263 3.465 3.671 3.596 4.258 4.422 4.768 5.117 5.448 5.613 5.948 6.274 6.725 7.018 7.311 7.736 8.139 8.526 8.893 9.248 9.692 10.113 10.541 11.066 11.58 12.085 12.665 13.337 13.991 14.726 15.538 16.406 17.321 18.379 19.67 20.98 22.541 24.37 26.49 28.907 31.951 35.81 40.727 45.179 48.094 50.078 51.491 52.567 53.332 53.935 54.398 54.791 55.083 55.291 55.448 55.575 55.674 55.737 55.792 55.836 55.855 55.853 55.837 55.825 55.802 55.762 55.724 55.673 55.609 55.539 55.472 55.413 55.344 55.243 55.167 55.073 55.017 54.908 54.797 54.657 54.579 54.079 54.315 54.223 54.13 53.885 53.729 53.562 53.376 53.174 52.894 52.549 51.836 -7 ,17362 ,TETRA ,17526267,Thu Nov 25 03:32:39 CET,Thu Nov 25 06:33:43 CET,0.0 0.483 0.856 1.159 1.404 1.631 1.844 2.054 2.452 2.644 2.828 2.691 3.332 3.499 3.821 4.123 4.416 4.559 4.838 5.112 5.512 5.774 6.035 6.41 6.758 7.105 7.455 7.781 8.192 8.616 9.049 9.563 10.064 10.568 11.155 11.807 12.45 13.177 13.973 14.828 15.736 16.808 18.096 19.406 20.99 22.78 24.885 27.402 30.513 34.377 39.325 43.769 46.653 48.66 50.081 51.18 52.009 52.646 53.088 53.447 53.71 53.91 54.061 54.165 54.225 54.277 54.324 54.332 54.335 54.339 54.344 54.342 54.316 54.265 54.219 54.178 54.133 54.084 54.027 53.978 53.927 53.841 53.778 53.706 53.664 53.571 53.474 53.364 53.296 52.801 53.04 52.947 52.854 52.632 52.504 52.357 52.166 51.939 51.669 51.311 50.51 -8 ,21847 ,TETRA ,17526268,Thu Nov 25 03:32:42 CET,Thu Nov 25 06:25:48 CET,0.0 0.752 1.145 1.444 1.717 1.996 2.265 2.518 2.975 3.18 3.379 3.286 3.935 4.098 4.442 4.784 5.102 5.259 5.577 5.871 6.281 6.554 6.818 7.212 7.611 7.999 8.373 8.735 9.207 9.67 10.113 10.647 11.165 11.663 12.255 12.95 13.622 14.358 15.164 16.038 16.982 18.06 19.353 20.682 22.3 24.198 26.403 28.941 32.027 35.831 40.85 45.407 48.212 50.127 51.532 52.585 53.367 53.992 54.459 54.858 55.158 55.398 55.596 55.752 55.869 55.949 55.999 56.037 56.055 56.054 56.061 56.057 56.037 56.016 55.996 55.966 55.932 55.894 55.849 55.806 55.746 55.649 55.582 55.512 55.476 55.385 55.274 55.148 55.083 54.595 54.819 54.713 54.604 54.352 54.214 54.068 53.887 53.668 53.409 53.057 52.08 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_29_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_29_28.txt deleted file mode 100644 index 99aef162..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_29_28.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30223 ,TETRA ,17526271,Thu Nov 25 03:32:42 CET,Thu Nov 25 06:23:25 CET,0.0 0.615 0.976 1.249 1.472 1.661 1.833 1.993 2.281 2.39 2.477 2.235 2.76 2.854 3.042 3.179 3.273 3.319 3.404 3.493 3.64 3.734 3.814 3.907 3.989 4.057 4.117 4.18 4.24 4.273 4.299 4.323 4.352 4.387 4.416 4.431 4.457 4.5 4.539 4.586 4.581 4.507 4.325 4.022 3.582 2.994 2.218 1.175 -0.3 -2.513 -6.111 -10.181 -13.369 -15.983 -18.282 -20.301 -21.993 -23.482 -24.714 -25.958 -27.027 -27.897 -28.7 -29.482 -30.199 -30.845 -31.526 -32.166 -32.707 -33.226 -33.765 -34.217 -34.686 -35.165 -35.527 -35.917 -36.339 -36.775 -37.201 -37.49 -37.778 -38.229 -38.56 -38.885 -39.049 -39.399 -39.78 -40.184 -40.382 -41.06 -41.001 -41.224 -41.464 -41.995 -42.295 -42.597 -42.929 -43.303 -43.689 -44.199 -45.428 -2 ,8332 ,TETRA ,17526272,Thu Nov 25 03:32:42 CET,Thu Nov 25 06:21:30 CET,0.0 0.636 0.897 1.108 1.259 1.384 1.501 1.605 1.775 1.85 1.92 1.626 2.129 2.193 2.316 2.427 2.514 2.553 2.625 2.681 2.761 2.819 2.873 2.949 3.015 3.067 3.11 3.15 3.208 3.25 3.283 3.311 3.324 3.334 3.318 3.288 3.246 3.174 3.091 2.991 2.851 2.634 2.333 2.009 1.584 1.012 0.222 -0.846 -2.315 -4.453 -7.934 -11.958 -15.147 -17.672 -19.735 -21.547 -23.111 -24.568 -25.803 -26.975 -27.971 -28.84 -29.62 -30.314 -30.94 -31.528 -32.167 -32.74 -33.236 -33.717 -34.196 -34.611 -35.06 -35.525 -35.889 -36.263 -36.648 -37.048 -37.465 -37.772 -38.085 -38.525 -38.823 -39.138 -39.303 -39.648 -40.013 -40.402 -40.602 -41.28 -41.223 -41.444 -41.68 -42.238 -42.541 -42.862 -43.224 -43.606 -44.04 -44.604 -45.892 -3 ,3350 ,TETRA ,17526273,Thu Nov 25 03:32:42 CET,Thu Nov 25 06:29:57 CET,0.0 0.805 1.126 1.393 1.609 1.779 1.929 2.07 2.321 2.426 2.527 2.292 2.807 2.885 3.026 3.15 3.269 3.327 3.426 3.52 3.671 3.752 3.822 3.908 3.98 4.055 4.113 4.159 4.218 4.261 4.288 4.315 4.317 4.314 4.316 4.311 4.279 4.215 4.145 4.072 3.965 3.804 3.591 3.303 2.873 2.313 1.562 0.528 -0.98 -3.186 -6.692 -10.624 -13.709 -16.249 -18.308 -20.033 -21.531 -22.914 -24.138 -25.333 -26.323 -27.195 -28.017 -28.805 -29.554 -30.236 -30.919 -31.515 -32.023 -32.536 -33.072 -33.506 -33.953 -34.417 -34.767 -35.139 -35.534 -35.959 -36.379 -36.641 -36.918 -37.361 -37.673 -37.997 -38.152 -38.459 -38.789 -39.136 -39.322 -39.99 -39.906 -40.12 -40.355 -40.864 -41.142 -41.432 -41.729 -42.093 -42.535 -43.087 -44.563 -6 ,29757 ,TETRA ,17526276,Thu Nov 25 03:33:45 CET,Thu Nov 25 06:31:14 CET,0.0 0.403 0.704 0.94 1.121 1.269 1.402 1.531 1.744 1.826 1.902 1.608 2.101 2.17 2.318 2.443 2.54 2.584 2.67 2.744 2.825 2.879 2.937 3.004 3.057 3.1 3.145 3.188 3.229 3.268 3.301 3.315 3.33 3.339 3.327 3.293 3.265 3.227 3.164 3.053 2.893 2.688 2.392 2.048 1.599 1.031 0.248 -0.812 -2.266 -4.426 -7.929 -11.96 -15.126 -17.771 -19.997 -21.919 -23.498 -24.873 -26.071 -27.228 -28.194 -29.033 -29.849 -30.6 -31.249 -31.85 -32.475 -33.05 -33.548 -34.033 -34.538 -34.961 -35.39 -35.83 -36.169 -36.517 -36.889 -37.289 -37.698 -37.971 -38.251 -38.682 -38.969 -39.256 -39.414 -39.761 -40.131 -40.521 -40.72 -41.41 -41.391 -41.628 -41.879 -42.405 -42.676 -42.96 -43.312 -43.715 -44.145 -44.724 -46.064 -7 ,10843 ,TETRA ,17526277,Thu Nov 25 03:33:45 CET,Thu Nov 25 06:30:26 CET,0.0 0.508 0.76 0.931 1.09 1.222 1.32 1.418 1.64 1.732 1.803 1.53 2.032 2.096 2.212 2.323 2.422 2.465 2.549 2.632 2.749 2.819 2.885 2.971 3.061 3.141 3.188 3.228 3.276 3.318 3.354 3.396 3.426 3.428 3.415 3.408 3.382 3.318 3.23 3.117 2.983 2.818 2.573 2.269 1.859 1.316 0.556 -0.489 -1.97 -4.16 -7.73 -11.735 -14.852 -17.348 -19.369 -21.142 -22.745 -24.197 -25.394 -26.554 -27.571 -28.449 -29.267 -30.028 -30.713 -31.344 -31.989 -32.562 -33.05 -33.553 -34.069 -34.492 -34.949 -35.421 -35.793 -36.177 -36.566 -36.984 -37.439 -37.748 -38.037 -38.461 -38.756 -39.066 -39.23 -39.559 -39.907 -40.294 -40.495 -41.169 -41.132 -41.369 -41.609 -42.138 -42.426 -42.734 -43.08 -43.448 -43.888 -44.452 -45.854 -8 ,1810 ,TETRA ,17526278,Thu Nov 25 03:33:45 CET,Thu Nov 25 06:24:03 CET,0.0 0.541 0.787 0.958 1.112 1.264 1.385 1.481 1.639 1.716 1.79 1.489 1.978 2.032 2.134 2.235 2.318 2.356 2.428 2.493 2.586 2.636 2.678 2.755 2.832 2.892 2.944 2.99 3.049 3.097 3.124 3.16 3.173 3.157 3.138 3.114 3.071 2.989 2.894 2.777 2.63 2.451 2.185 1.868 1.447 0.899 0.134 -0.927 -2.444 -4.687 -8.24 -12.231 -15.339 -17.835 -19.96 -21.882 -23.51 -24.898 -26.002 -27.073 -28.045 -28.934 -29.777 -30.531 -31.198 -31.784 -32.428 -33.034 -33.53 -34.023 -34.543 -34.988 -35.434 -35.891 -36.254 -36.63 -37.009 -37.395 -37.799 -38.075 -38.369 -38.847 -39.182 -39.537 -39.725 -40.081 -40.433 -40.81 -40.999 -41.673 -41.632 -41.86 -42.08 -42.565 -42.854 -43.139 -43.434 -43.764 -44.175 -44.748 -45.974 -9 ,30572 ,TETRA ,17526279,Thu Nov 25 03:33:46 CET,Thu Nov 25 06:34:29 CET,0.0 0.595 0.906 1.125 1.281 1.393 1.5 1.6 1.762 1.839 1.92 1.649 2.151 2.215 2.332 2.439 2.522 2.556 2.625 2.691 2.78 2.832 2.867 2.897 2.929 2.977 3.023 3.061 3.094 3.107 3.125 3.13 3.121 3.111 3.085 3.042 2.987 2.905 2.795 2.668 2.519 2.297 1.999 1.683 1.251 0.666 -0.132 -1.235 -2.758 -4.99 -8.546 -12.485 -15.563 -18.061 -20.128 -21.969 -23.565 -24.992 -26.249 -27.516 -28.585 -29.49 -30.317 -31.082 -31.809 -32.475 -33.139 -33.733 -34.246 -34.776 -35.336 -35.78 -36.215 -36.666 -37.025 -37.421 -37.814 -38.201 -38.62 -38.908 -39.201 -39.674 -40.005 -40.338 -40.51 -40.874 -41.246 -41.622 -41.842 -42.554 -42.541 -42.777 -43.029 -43.562 -43.848 -44.161 -44.525 -44.929 -45.36 -45.907 -47.16 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_29_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_29_30.txt deleted file mode 100644 index 0f5b5af7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_29_30.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16648 ,TETRA ,17526281,Thu Nov 25 03:33:47 CET,Thu Nov 25 06:27:48 CET,0.0 0.515 0.854 1.134 1.327 1.502 1.669 1.813 2.077 2.215 2.338 2.144 2.689 2.812 3.033 3.237 3.429 3.523 3.707 3.87 4.114 4.272 4.419 4.637 4.839 5.043 5.253 5.45 5.696 5.928 6.159 6.443 6.716 6.965 7.258 7.613 7.942 8.281 8.636 9.036 9.468 9.944 10.474 10.978 11.553 12.184 12.907 13.731 14.648 15.574 16.5 17.024 17.097 16.975 16.76 16.481 16.182 15.898 15.623 15.305 15.021 14.753 14.475 14.231 14.012 13.794 13.545 13.319 13.119 12.899 12.661 12.458 12.265 12.066 11.892 11.699 11.488 11.268 11.036 10.861 10.687 10.447 10.282 10.1 9.998 9.782 9.527 9.233 9.095 8.541 8.666 8.491 8.305 7.93 7.736 7.524 7.272 6.975 6.647 6.249 4.916 -3 ,11604 ,TETRA ,17526283,Thu Nov 25 03:33:46 CET,Thu Nov 25 06:13:58 CET,0.0 0.342 0.552 0.757 0.969 1.165 1.334 1.484 1.771 1.908 2.035 1.841 2.376 2.483 2.702 2.919 3.111 3.198 3.36 3.519 3.772 3.936 4.09 4.295 4.495 4.698 4.892 5.085 5.328 5.566 5.794 6.059 6.323 6.583 6.866 7.169 7.463 7.797 8.176 8.587 8.993 9.428 9.934 10.457 11.089 11.782 12.568 13.433 14.346 15.311 16.296 16.806 16.924 16.899 16.74 16.489 16.195 15.883 15.584 15.277 15.009 14.742 14.492 14.247 13.971 13.693 13.416 13.182 12.989 12.774 12.537 12.344 12.137 11.925 11.75 11.563 11.368 11.162 10.942 10.777 10.611 10.357 10.163 9.949 9.838 9.613 9.384 9.14 9.004 8.451 8.571 8.4 8.228 7.803 7.55 7.309 7.024 6.682 6.328 5.841 4.552 -5 ,3859 ,TETRA ,17526285,Thu Nov 25 03:34:42 CET,Thu Nov 25 06:27:17 CET,0.0 0.552 0.863 1.143 1.391 1.57 1.735 1.91 2.222 2.366 2.499 2.323 2.877 2.995 3.232 3.457 3.666 3.77 3.962 4.14 4.397 4.563 4.729 4.962 5.182 5.409 5.613 5.798 6.052 6.304 6.541 6.839 7.115 7.373 7.69 8.039 8.346 8.694 9.081 9.449 9.829 10.306 10.852 11.365 11.976 12.67 13.437 14.254 15.171 16.163 17.23 17.885 18.044 17.94 17.737 17.5 17.266 17.035 16.789 16.507 16.242 15.996 15.735 15.473 15.223 14.998 14.778 14.562 14.355 14.142 13.902 13.693 13.479 13.254 13.06 12.849 12.659 12.46 12.228 12.068 11.903 11.644 11.474 11.295 11.193 10.98 10.756 10.516 10.389 9.837 9.961 9.799 9.623 9.269 9.08 8.826 8.516 8.187 7.784 7.204 5.331 -6 ,25050 ,TETRA ,17526286,Thu Nov 25 03:34:42 CET,Thu Nov 25 06:31:40 CET,0.0 0.423 0.637 0.803 0.99 1.177 1.333 1.48 1.715 1.83 1.954 1.789 2.349 2.462 2.681 2.885 3.064 3.152 3.318 3.489 3.747 3.901 4.055 4.291 4.506 4.719 4.942 5.147 5.395 5.628 5.854 6.121 6.388 6.656 6.949 7.268 7.572 7.915 8.283 8.661 9.068 9.536 10.054 10.554 11.156 11.814 12.528 13.335 14.254 15.248 16.355 17.063 17.212 17.1 16.925 16.709 16.452 16.148 15.867 15.587 15.338 15.102 14.857 14.629 14.412 14.193 13.967 13.772 13.578 13.369 13.158 12.963 12.776 12.601 12.429 12.234 12.05 11.866 11.674 11.536 11.377 11.116 10.941 10.763 10.677 10.479 10.247 9.994 9.862 9.318 9.449 9.288 9.124 8.787 8.588 8.357 8.112 7.813 7.431 6.993 5.783 -7 ,583 ,TETRA ,17526287,Thu Nov 25 03:35:40 CET,Thu Nov 25 06:29:02 CET,0.0 0.655 0.913 1.124 1.332 1.532 1.721 1.88 2.165 2.314 2.454 2.261 2.806 2.919 3.131 3.335 3.524 3.616 3.802 3.979 4.214 4.363 4.512 4.728 4.93 5.125 5.325 5.524 5.77 5.996 6.225 6.515 6.775 7.011 7.297 7.626 7.933 8.257 8.608 8.983 9.38 9.83 10.35 10.883 11.5 12.169 12.901 13.72 14.684 15.695 16.683 17.216 17.361 17.371 17.227 16.966 16.682 16.385 16.136 15.892 15.635 15.394 15.166 14.936 14.704 14.462 14.179 13.914 13.699 13.477 13.206 12.982 12.774 12.56 12.39 12.208 12.013 11.813 11.605 11.459 11.304 11.052 10.885 10.682 10.566 10.353 10.141 9.882 9.737 9.177 9.285 9.134 8.976 8.606 8.402 8.17 7.896 7.595 7.26 6.849 5.435 -8 ,32767 ,TETRA ,17526288,Thu Nov 25 03:34:43 CET,Thu Nov 25 06:34:25 CET,0.0 0.63 1.004 1.28 1.512 1.708 1.894 2.061 2.35 2.496 2.634 2.465 3.015 3.145 3.381 3.599 3.808 3.897 4.063 4.22 4.449 4.596 4.743 4.968 5.175 5.367 5.572 5.778 6.039 6.278 6.495 6.756 7.013 7.249 7.509 7.822 8.141 8.503 8.887 9.292 9.696 10.152 10.683 11.183 11.774 12.471 13.28 14.148 15.207 16.361 17.468 18.071 18.167 18.043 17.824 17.589 17.333 17.046 16.773 16.476 16.212 15.942 15.639 15.33 15.035 14.794 14.551 14.327 14.129 13.917 13.702 13.534 13.349 13.14 12.968 12.802 12.633 12.444 12.252 12.122 11.98 11.753 11.588 11.4 11.298 11.083 10.851 10.598 10.472 9.93 10.032 9.853 9.669 9.275 9.069 8.849 8.597 8.291 7.933 7.521 6.389 -9 ,7352 ,TETRA ,17526289,Thu Nov 25 03:34:43 CET,Thu Nov 25 06:33:48 CET,0.0 0.929 1.223 1.424 1.607 1.788 1.964 2.128 2.422 2.545 2.662 2.5 3.048 3.154 3.366 3.557 3.733 3.822 3.994 4.158 4.398 4.549 4.695 4.911 5.123 5.322 5.501 5.665 5.894 6.122 6.342 6.63 6.89 7.136 7.441 7.774 8.072 8.393 8.749 9.136 9.553 10.011 10.55 11.094 11.695 12.364 13.149 13.986 14.871 15.809 16.801 17.389 17.438 17.279 17.093 16.851 16.588 16.321 16.059 15.797 15.547 15.295 15.031 14.758 14.498 14.255 13.968 13.688 13.448 13.194 12.926 12.723 12.528 12.325 12.155 11.965 11.772 11.558 11.334 11.173 11.003 10.745 10.557 10.359 10.262 10.056 9.808 9.544 9.412 8.854 8.969 8.814 8.658 8.311 8.104 7.888 7.668 7.408 7.079 6.649 5.019 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_30_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_30_1h1s.txt deleted file mode 100644 index 61cf1835..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_30_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,7715 ,TETRA ,17526293,Thu Nov 25 03:35:40 CET,Thu Nov 25 06:36:45 CET,0.0 0.486 0.781 0.967 1.096 1.22 1.32 1.4 1.516 1.555 1.592 1.226 1.661 1.681 1.706 1.73 1.739 1.726 1.684 1.643 1.585 1.536 1.474 1.369 1.263 1.163 1.069 0.967 0.816 0.654 0.481 0.26 0.031 -0.222 -0.527 -0.888 -1.271 -1.732 -2.271 -2.892 -3.603 -4.463 -5.559 -6.746 -8.256 -10.132 -12.527 -15.514 -19.536 -25.122 -33.34 -42.102 -48.779 -53.987 -58.06 -61.513 -64.37 -66.833 -68.941 -70.961 -72.612 -74.04 -75.377 -76.638 -77.765 -78.759 -79.791 -80.685 -81.443 -82.228 -83.017 -83.644 -84.29 -84.964 -85.476 -86.002 -86.536 -87.063 -87.601 -87.966 -88.347 -88.956 -89.372 -89.801 -90.014 -90.421 -90.834 -91.263 -91.494 -92.261 -92.228 -92.493 -92.78 -93.372 -93.68 -94.018 -94.383 -94.775 -95.21 -95.733 -97.023 -3 ,6481 ,TETRA ,17526294,Thu Nov 25 03:35:41 CET,Thu Nov 25 06:36:42 CET,0.0 0.388 0.565 0.713 0.855 0.975 1.062 1.122 1.207 1.246 1.285 0.933 1.378 1.401 1.409 1.412 1.421 1.416 1.397 1.371 1.317 1.271 1.212 1.118 1.029 0.931 0.814 0.698 0.543 0.369 0.186 -0.06 -0.307 -0.561 -0.888 -1.268 -1.662 -2.146 -2.693 -3.299 -4.002 -4.854 -5.892 -7.026 -8.51 -10.326 -12.635 -15.601 -19.623 -25.278 -33.669 -42.475 -48.946 -54.058 -58.219 -61.722 -64.656 -67.19 -69.305 -71.384 -73.11 -74.599 -75.985 -77.227 -78.316 -79.296 -80.316 -81.187 -81.919 -82.667 -83.447 -84.097 -84.755 -85.423 -85.928 -86.429 -86.941 -87.486 -88.045 -88.421 -88.791 -89.344 -89.714 -90.103 -90.311 -90.742 -91.185 -91.636 -91.871 -92.638 -92.623 -92.882 -93.137 -93.666 -93.949 -94.265 -94.603 -94.969 -95.379 -95.879 -97.349 -4 ,25296 ,TETRA ,17526295,Thu Nov 25 03:35:42 CET,Thu Nov 25 06:36:26 CET,0.0 0.331 0.512 0.657 0.764 0.873 0.969 1.029 1.12 1.148 1.18 0.835 1.272 1.285 1.294 1.292 1.296 1.294 1.285 1.265 1.202 1.156 1.106 1.038 0.973 0.873 0.753 0.635 0.473 0.303 0.133 -0.085 -0.329 -0.594 -0.908 -1.263 -1.623 -2.05 -2.559 -3.16 -3.842 -4.659 -5.685 -6.835 -8.335 -10.155 -12.48 -15.455 -19.453 -24.984 -33.347 -42.233 -48.787 -54.025 -58.262 -61.854 -64.82 -67.346 -69.463 -71.539 -73.268 -74.734 -76.102 -77.375 -78.477 -79.445 -80.455 -81.346 -82.105 -82.866 -83.645 -84.289 -84.952 -85.628 -86.152 -86.684 -87.216 -87.756 -88.31 -88.684 -89.065 -89.653 -90.057 -90.478 -90.698 -91.146 -91.608 -92.103 -92.347 -93.11 -93.108 -93.376 -93.668 -94.248 -94.547 -94.876 -95.222 -95.601 -96.022 -96.508 -97.459 -5 ,4204 ,TETRA ,17526296,Thu Nov 25 03:35:44 CET,Thu Nov 25 06:37:33 CET,0.0 0.795 1.052 1.229 1.384 1.509 1.605 1.68 1.779 1.808 1.827 1.452 1.876 1.877 1.879 1.887 1.891 1.885 1.863 1.837 1.784 1.736 1.682 1.596 1.497 1.374 1.248 1.125 0.96 0.794 0.61 0.38 0.154 -0.097 -0.424 -0.804 -1.19 -1.653 -2.205 -2.851 -3.578 -4.437 -5.541 -6.758 -8.269 -10.107 -12.448 -15.45 -19.542 -25.196 -33.593 -42.541 -49.23 -54.539 -58.879 -62.541 -65.529 -68.091 -70.209 -72.248 -73.939 -75.399 -76.805 -78.104 -79.265 -80.291 -81.331 -82.25 -83.036 -83.836 -84.647 -85.301 -85.948 -86.611 -87.136 -87.687 -88.267 -88.861 -89.46 -89.862 -90.279 -90.907 -91.333 -91.768 -91.98 -92.427 -92.913 -93.409 -93.659 -94.446 -94.456 -94.745 -95.036 -95.65 -95.973 -96.306 -96.659 -97.045 -97.487 -98.005 -99.261 -6 ,10073 ,TETRA ,17526297,Thu Nov 25 03:35:41 CET,Thu Nov 25 06:37:14 CET,0.0 0.579 0.807 0.965 1.088 1.189 1.273 1.346 1.451 1.485 1.518 1.166 1.597 1.607 1.616 1.632 1.636 1.629 1.606 1.576 1.524 1.49 1.456 1.384 1.311 1.229 1.117 1.0 0.835 0.644 0.448 0.203 -0.038 -0.272 -0.564 -0.935 -1.332 -1.801 -2.33 -2.94 -3.631 -4.479 -5.559 -6.715 -8.186 -10.007 -12.361 -15.388 -19.441 -24.951 -33.18 -42.119 -48.86 -54.134 -58.344 -61.824 -64.729 -67.298 -69.457 -71.498 -73.188 -74.679 -76.067 -77.349 -78.504 -79.53 -80.591 -81.513 -82.302 -83.098 -83.898 -84.557 -85.23 -85.914 -86.43 -86.947 -87.459 -88.003 -88.585 -88.957 -89.336 -89.932 -90.343 -90.766 -90.98 -91.422 -91.881 -92.354 -92.605 -93.39 -93.379 -93.638 -93.915 -94.527 -94.853 -95.213 -95.607 -96.023 -96.489 -97.075 -98.496 -8 ,19275 ,TETRA ,17526300,Thu Nov 25 03:35:42 CET,Thu Nov 25 06:40:51 CET,0.0 0.476 0.741 0.901 0.992 1.07 1.139 1.211 1.332 1.368 1.4 1.03 1.463 1.481 1.495 1.497 1.499 1.492 1.467 1.437 1.389 1.362 1.326 1.232 1.133 1.037 0.926 0.806 0.646 0.486 0.329 0.122 -0.113 -0.341 -0.626 -1.005 -1.39 -1.84 -2.379 -2.997 -3.693 -4.539 -5.605 -6.764 -8.245 -10.07 -12.411 -15.434 -19.463 -24.983 -33.246 -42.113 -48.739 -53.903 -58.103 -61.679 -64.618 -67.133 -69.219 -71.347 -73.117 -74.559 -75.908 -77.131 -78.238 -79.241 -80.24 -81.119 -81.898 -82.73 -83.583 -84.283 -85.016 -85.741 -86.281 -86.833 -87.377 -87.918 -88.489 -88.895 -89.323 -89.971 -90.407 -90.845 -91.066 -91.51 -91.944 -92.404 -92.644 -93.413 -93.397 -93.661 -93.933 -94.528 -94.835 -95.132 -95.448 -95.842 -96.311 -96.888 -98.422 -9 ,28555 ,TETRA ,17526301,Thu Nov 25 03:35:44 CET,Thu Nov 25 06:36:44 CET,0.0 0.286 0.447 0.595 0.722 0.824 0.893 0.954 1.082 1.139 1.179 0.802 1.235 1.245 1.239 1.223 1.205 1.2 1.184 1.153 1.105 1.062 1.018 0.989 0.95 0.868 0.785 0.687 0.547 0.405 0.235 0.013 -0.229 -0.483 -0.779 -1.154 -1.545 -1.998 -2.527 -3.13 -3.808 -4.626 -5.685 -6.866 -8.357 -10.187 -12.512 -15.465 -19.43 -24.842 -33.006 -41.767 -48.292 -53.448 -57.612 -61.04 -63.886 -66.391 -68.477 -70.525 -72.224 -73.665 -75.018 -76.264 -77.376 -78.397 -79.447 -80.346 -81.116 -81.89 -82.689 -83.357 -84.026 -84.701 -85.222 -85.762 -86.313 -86.873 -87.431 -87.806 -88.191 -88.782 -89.194 -89.62 -89.836 -90.283 -90.734 -91.193 -91.43 -92.2 -92.195 -92.46 -92.734 -93.296 -93.589 -93.905 -94.274 -94.688 -95.14 -95.63 -96.516 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_30_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_30_26.txt deleted file mode 100644 index 089f7e52..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_30_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1998 ,KEBNE ,17125456,Thu Dec 30 16:35:32 CET,Thu Dec 30 18:45:59 CET,0.0 1.072 1.544 1.944 2.302 2.625 2.938 3.231 3.778 4.04 4.289 4.326 4.965 5.187 5.618 6.035 6.442 6.641 7.023 7.408 7.999 8.375 8.732 9.247 9.74 10.238 10.721 11.185 11.796 12.397 12.98 13.697 14.428 15.154 16.01 16.999 17.951 19.003 20.166 21.434 22.813 24.4 26.293 28.28 30.676 33.495 36.936 40.903 45.804 52.109 60.607 68.642 73.892 77.556 80.253 82.374 83.989 85.261 86.267 87.154 87.812 88.356 88.821 89.212 89.541 89.827 90.107 90.341 90.511 90.631 90.732 90.809 90.882 90.95 90.999 91.037 91.067 91.091 91.095 91.091 91.077 91.035 90.993 90.94 90.895 90.79 90.681 90.564 90.507 90.109 90.236 90.12 89.988 89.707 89.53 89.315 89.076 88.804 88.505 88.123 86.293 -2 ,20846 ,KEBNE ,17069811,Fri Dec 24 08:52:11 CET,Fri Dec 24 11:01:25 CET,0.0 0.775 1.155 1.494 1.824 2.131 2.426 2.712 3.216 3.447 3.675 3.703 4.335 4.539 4.95 5.361 5.749 5.942 6.313 6.663 7.199 7.554 7.898 8.403 8.903 9.394 9.888 10.366 10.982 11.596 12.195 12.92 13.627 14.342 15.2 16.166 17.117 18.191 19.373 20.665 22.045 23.64 25.547 27.503 29.883 32.635 35.953 39.947 44.962 51.391 59.998 68.126 73.463 77.186 79.907 82.015 83.62 84.906 85.911 86.815 87.512 88.069 88.558 88.971 89.294 89.559 89.794 89.954 90.103 90.263 90.391 90.483 90.593 90.685 90.728 90.758 90.779 90.783 90.755 90.736 90.724 90.678 90.631 90.576 90.544 90.47 90.376 90.27 90.197 89.79 89.885 89.762 89.653 89.364 89.173 88.964 88.736 88.49 88.18 87.685 86.329 -3 ,3191 ,KEBNE ,17125458,Thu Dec 30 16:35:30 CET,Thu Dec 30 18:45:58 CET,0.0 0.899 1.442 1.84 2.195 2.526 2.821 3.087 3.595 3.837 4.069 4.121 4.757 4.959 5.35 5.742 6.13 6.317 6.683 7.046 7.58 7.922 8.258 8.769 9.271 9.757 10.235 10.716 11.345 11.947 12.544 13.286 14.015 14.724 15.558 16.507 17.443 18.507 19.673 20.947 22.328 23.935 25.893 27.929 30.321 33.084 36.47 40.478 45.421 51.643 59.897 67.601 72.695 76.275 78.935 81.057 82.667 83.913 84.904 85.83 86.522 87.033 87.448 87.813 88.129 88.373 88.61 88.82 88.957 89.073 89.198 89.294 89.372 89.427 89.456 89.482 89.5 89.502 89.496 89.497 89.492 89.469 89.443 89.406 89.383 89.307 89.201 89.079 89.014 88.621 88.762 88.666 88.569 88.322 88.177 87.989 87.759 87.487 87.171 86.741 85.121 -4 ,10705 ,KEBNE ,17069813,Fri Dec 24 08:53:17 CET,Fri Dec 24 11:05:11 CET,0.0 0.878 1.309 1.67 2.005 2.309 2.607 2.879 3.36 3.579 3.801 3.825 4.454 4.672 5.078 5.467 5.846 6.037 6.414 6.769 7.294 7.64 7.973 8.465 8.953 9.429 9.893 10.344 10.949 11.551 12.135 12.85 13.553 14.248 15.076 16.028 16.963 18.005 19.166 20.451 21.828 23.428 25.374 27.408 29.902 32.768 36.174 40.277 45.355 51.574 59.732 67.459 72.585 76.228 78.965 81.093 82.745 84.044 85.029 85.948 86.65 87.183 87.648 88.065 88.416 88.689 88.952 89.178 89.362 89.535 89.671 89.748 89.824 89.908 89.959 89.996 90.03 90.043 90.043 90.039 90.01 89.953 89.912 89.864 89.849 89.816 89.766 89.706 89.673 89.316 89.517 89.448 89.368 89.188 89.078 88.925 88.74 88.479 88.163 87.796 86.269 -5 ,12772 ,KEBNE ,17125460,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:49:08 CET,0.0 0.928 1.388 1.772 2.153 2.51 2.815 3.107 3.676 3.948 4.204 4.262 4.9 5.118 5.544 5.963 6.372 6.572 6.949 7.307 7.849 8.211 8.565 9.085 9.587 10.072 10.547 11.014 11.626 12.221 12.808 13.549 14.282 14.993 15.841 16.824 17.795 18.883 20.063 21.332 22.721 24.353 26.309 28.352 30.8 33.6 37.008 41.023 46.057 52.547 61.161 69.326 74.714 78.401 81.129 83.232 84.844 86.141 87.139 88.072 88.783 89.333 89.807 90.207 90.531 90.802 91.067 91.283 91.461 91.617 91.742 91.83 91.901 91.944 91.95 91.951 91.95 91.948 91.962 91.978 91.986 91.969 91.939 91.916 91.904 91.857 91.801 91.716 91.653 91.264 91.447 91.373 91.292 91.089 90.96 90.811 90.626 90.395 90.117 89.804 88.777 -6 ,12199 ,KEBNE ,17069815,Fri Dec 24 09:04:04 CET,Fri Dec 24 11:13:53 CET,0.0 0.909 1.379 1.764 2.087 2.405 2.716 2.996 3.505 3.763 4.015 4.064 4.699 4.912 5.335 5.742 6.134 6.329 6.715 7.087 7.618 7.963 8.303 8.807 9.305 9.797 10.28 10.749 11.36 11.967 12.552 13.271 13.988 14.701 15.55 16.515 17.442 18.493 19.674 20.959 22.341 23.931 25.842 27.84 30.266 33.066 36.429 40.483 45.536 51.888 60.531 68.621 73.932 77.757 80.459 82.5 84.099 85.372 86.363 87.236 87.898 88.443 88.927 89.35 89.709 90.005 90.271 90.475 90.639 90.769 90.878 90.971 91.063 91.143 91.164 91.186 91.229 91.256 91.271 91.272 91.259 91.226 91.203 91.165 91.134 91.06 90.996 90.924 90.877 90.503 90.666 90.561 90.438 90.187 90.014 89.779 89.539 89.29 88.989 88.551 86.818 -7 ,9344 ,KEBNE ,17125462,Thu Dec 30 16:35:37 CET,Thu Dec 30 19:03:09 CET,0.0 0.882 1.345 1.725 2.05 2.361 2.658 2.941 3.498 3.765 4.006 4.033 4.668 4.897 5.331 5.735 6.121 6.307 6.673 7.048 7.598 7.942 8.288 8.806 9.312 9.8 10.285 10.772 11.415 12.029 12.619 13.342 14.054 14.764 15.607 16.576 17.536 18.612 19.78 21.056 22.444 24.057 26.002 28.033 30.465 33.281 36.688 40.773 45.904 52.384 60.955 68.814 74.041 77.753 80.415 82.451 84.05 85.338 86.312 87.15 87.796 88.323 88.789 89.202 89.542 89.824 90.086 90.279 90.427 90.557 90.679 90.766 90.833 90.896 90.946 90.98 90.989 90.971 90.965 90.962 90.941 90.905 90.885 90.845 90.81 90.723 90.597 90.461 90.387 89.992 90.166 90.074 89.981 89.769 89.624 89.452 89.249 88.984 88.627 88.174 86.74 -8 ,10286 ,KEBNE ,17069817,Fri Dec 24 09:19:01 CET,Fri Dec 24 11:27:46 CET,0.0 0.806 1.231 1.632 1.995 2.321 2.623 2.905 3.408 3.642 3.874 3.912 4.543 4.757 5.172 5.574 5.972 6.17 6.558 6.923 7.431 7.776 8.117 8.618 9.112 9.585 10.054 10.522 11.146 11.764 12.346 13.071 13.812 14.534 15.363 16.297 17.208 18.239 19.397 20.662 22.034 23.643 25.576 27.587 29.998 32.767 36.135 40.167 45.144 51.353 59.582 67.353 72.548 76.132 78.743 80.768 82.274 83.466 84.42 85.275 85.913 86.408 86.849 87.261 87.603 87.872 88.104 88.272 88.422 88.565 88.684 88.779 88.852 88.911 88.942 88.958 88.963 88.963 88.959 88.951 88.936 88.902 88.872 88.823 88.788 88.681 88.562 88.419 88.333 87.915 88.012 87.898 87.773 87.477 87.311 87.135 86.926 86.689 86.398 85.993 84.543 -9 ,8702 ,KEBNE ,17069818,Fri Dec 24 09:22:14 CET,Fri Dec 24 11:34:32 CET,0.0 1.062 1.602 2.012 2.376 2.728 3.046 3.341 3.88 4.131 4.373 4.415 5.05 5.277 5.709 6.123 6.53 6.725 7.091 7.461 8.013 8.364 8.711 9.222 9.72 10.216 10.699 11.178 11.811 12.424 13.033 13.778 14.503 15.23 16.083 17.039 17.978 19.054 20.246 21.521 22.904 24.512 26.456 28.503 30.972 33.825 37.276 41.397 46.468 52.758 61.024 68.771 73.889 77.454 80.13 82.237 83.818 85.057 85.992 86.818 87.446 87.951 88.398 88.78 89.099 89.365 89.603 89.772 89.897 90.026 90.157 90.246 90.315 90.367 90.401 90.426 90.45 90.469 90.469 90.465 90.453 90.41 90.375 90.33 90.296 90.23 90.163 90.082 90.031 89.645 89.792 89.695 89.596 89.329 89.161 88.997 88.807 88.53 88.192 87.782 86.177 -10 ,17487 ,KEBNE ,17069819,Fri Dec 24 09:24:24 CET,Fri Dec 24 11:38:11 CET,0.0 0.859 1.399 1.866 2.215 2.512 2.803 3.08 3.613 3.867 4.11 4.13 4.755 4.965 5.371 5.766 6.15 6.338 6.71 7.074 7.6 7.948 8.288 8.79 9.283 9.753 10.215 10.679 11.295 11.896 12.482 13.203 13.918 14.622 15.442 16.382 17.306 18.337 19.468 20.703 22.072 23.672 25.583 27.574 29.982 32.802 36.231 40.263 45.21 51.521 59.871 67.488 72.591 76.21 78.808 80.849 82.433 83.682 84.636 85.504 86.167 86.681 87.124 87.482 87.761 87.991 88.225 88.396 88.508 88.626 88.756 88.841 88.877 88.895 88.926 88.958 88.974 88.983 88.971 88.945 88.921 88.867 88.792 88.701 88.662 88.602 88.532 88.398 88.318 87.926 88.112 88.034 87.92 87.65 87.497 87.316 87.118 86.924 86.69 86.273 84.843 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_30_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_30_31.txt deleted file mode 100644 index df3c8132..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_30_31.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22584 ,TETRA ,17526303,Thu Nov 25 03:35:42 CET,Thu Nov 25 06:31:43 CET,0.0 0.562 0.998 1.362 1.662 1.932 2.182 2.402 2.795 2.974 3.152 3.082 3.659 3.814 4.107 4.384 4.65 4.786 5.057 5.312 5.677 5.916 6.148 6.489 6.838 7.187 7.516 7.829 8.252 8.676 9.106 9.62 10.093 10.564 11.133 11.786 12.417 13.127 13.908 14.751 15.668 16.732 18.006 19.349 20.974 22.805 24.96 27.422 30.356 34.025 38.742 42.951 45.66 47.546 48.921 49.964 50.758 51.359 51.796 52.176 52.453 52.672 52.859 52.998 53.102 53.181 53.243 53.289 53.327 53.354 53.351 53.328 53.308 53.285 53.26 53.242 53.215 53.163 53.101 53.068 53.028 52.934 52.85 52.759 52.711 52.606 52.5 52.37 52.29 51.839 52.033 51.949 51.859 51.653 51.537 51.419 51.245 51.017 50.793 50.487 49.916 -3 ,15152 ,TETRA ,17526305,Thu Nov 25 03:35:43 CET,Thu Nov 25 06:37:15 CET,0.0 0.694 1.05 1.311 1.538 1.751 1.957 2.16 2.578 2.774 2.94 2.818 3.391 3.554 3.86 4.148 4.414 4.543 4.798 5.056 5.438 5.685 5.921 6.264 6.601 6.944 7.28 7.604 8.033 8.452 8.85 9.338 9.814 10.274 10.818 11.462 12.112 12.819 13.568 14.386 15.242 16.205 17.369 18.572 20.031 21.722 23.755 26.147 29.027 32.616 37.459 41.898 44.601 46.461 47.79 48.768 49.542 50.166 50.601 50.971 51.246 51.451 51.627 51.767 51.877 51.961 52.037 52.072 52.078 52.093 52.096 52.065 52.03 52.005 51.976 51.929 51.868 51.801 51.735 51.686 51.635 51.557 51.485 51.403 51.357 51.256 51.128 50.988 50.917 50.473 50.672 50.583 50.486 50.29 50.167 50.023 49.847 49.629 49.369 49.023 48.305 -6 ,12598 ,TETRA ,17526309,Thu Nov 25 03:35:45 CET,Thu Nov 25 06:36:46 CET,0.0 0.517 0.869 1.197 1.455 1.686 1.908 2.119 2.513 2.705 2.881 2.783 3.364 3.537 3.848 4.151 4.46 4.607 4.895 5.17 5.561 5.824 6.073 6.43 6.788 7.134 7.467 7.795 8.213 8.636 9.066 9.574 10.06 10.567 11.183 11.855 12.502 13.237 14.059 14.945 15.877 16.943 18.215 19.52 21.092 22.851 24.964 27.466 30.447 34.167 39.02 43.48 46.292 48.121 49.419 50.425 51.159 51.71 52.093 52.441 52.713 52.923 53.091 53.218 53.32 53.368 53.415 53.46 53.476 53.477 53.475 53.474 53.449 53.391 53.336 53.276 53.208 53.129 53.051 52.997 52.931 52.815 52.731 52.651 52.609 52.516 52.415 52.299 52.23 51.788 51.974 51.87 51.76 51.513 51.364 51.223 51.07 50.843 50.578 50.189 49.393 -7 ,2015 ,TETRA ,17526310,Thu Nov 25 03:35:46 CET,Thu Nov 25 06:37:32 CET,0.0 0.821 1.111 1.368 1.571 1.782 2.005 2.204 2.563 2.729 2.892 2.796 3.368 3.519 3.808 4.087 4.361 4.494 4.742 4.985 5.35 5.584 5.812 6.154 6.485 6.8 7.108 7.422 7.837 8.251 8.654 9.153 9.64 10.111 10.668 11.309 11.944 12.661 13.43 14.248 15.13 16.155 17.382 18.637 20.162 21.912 24.015 26.524 29.598 33.362 38.239 42.713 45.582 47.581 49.005 50.087 50.908 51.528 52.0 52.397 52.7 52.943 53.142 53.293 53.399 53.498 53.594 53.665 53.696 53.709 53.72 53.716 53.701 53.664 53.634 53.616 53.591 53.557 53.507 53.469 53.426 53.326 53.251 53.175 53.136 53.048 52.947 52.83 52.774 52.35 52.581 52.507 52.412 52.157 52.016 51.88 51.743 51.569 51.343 51.049 50.074 -8 ,5224 ,TETRA ,17526311,Thu Nov 25 03:35:48 CET,Thu Nov 25 06:36:03 CET,0.0 0.636 0.993 1.284 1.539 1.763 1.986 2.2 2.583 2.763 2.931 2.821 3.394 3.556 3.858 4.139 4.418 4.556 4.819 5.074 5.441 5.68 5.914 6.268 6.625 6.966 7.295 7.623 8.05 8.452 8.838 9.335 9.841 10.341 10.93 11.574 12.2 12.914 13.706 14.554 15.445 16.468 17.684 18.931 20.453 22.233 24.31 26.688 29.66 33.527 38.567 42.908 45.639 47.53 48.864 49.821 50.522 51.068 51.482 51.876 52.177 52.391 52.546 52.665 52.761 52.822 52.874 52.923 52.951 52.951 52.934 52.931 52.918 52.877 52.84 52.791 52.726 52.652 52.571 52.503 52.43 52.326 52.253 52.159 52.108 52.016 51.926 51.839 51.783 51.348 51.555 51.474 51.386 51.155 51.028 50.897 50.745 50.566 50.338 50.041 49.575 -9 ,15203 ,TETRA ,17526312,Thu Nov 25 03:35:43 CET,Thu Nov 25 06:35:56 CET,0.0 0.89 1.315 1.693 1.994 2.22 2.432 2.645 3.024 3.207 3.385 3.292 3.866 4.024 4.329 4.619 4.9 5.042 5.324 5.597 5.986 6.233 6.463 6.799 7.143 7.471 7.785 8.094 8.507 8.922 9.329 9.83 10.321 10.794 11.342 11.957 12.57 13.274 14.044 14.874 15.77 16.82 18.075 19.349 20.902 22.715 24.787 27.179 30.171 33.937 38.843 43.212 46.025 48.035 49.472 50.504 51.241 51.799 52.187 52.512 52.763 52.976 53.154 53.27 53.352 53.423 53.495 53.537 53.56 53.564 53.558 53.543 53.505 53.458 53.43 53.386 53.325 53.264 53.191 53.133 53.063 52.971 52.903 52.808 52.755 52.659 52.529 52.388 52.318 51.879 52.068 51.961 51.841 51.585 51.455 51.303 51.128 50.948 50.756 50.502 49.697 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_31_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_31_26.txt deleted file mode 100644 index 8d97d065..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_31_26.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,15367 ,TETRA ,17526317,Thu Nov 25 03:35:49 CET,Thu Nov 25 06:28:03 CET,0.0 0.72 1.081 1.395 1.652 1.866 2.08 2.291 2.687 2.885 3.085 3.081 3.622 3.792 4.094 4.379 4.659 4.796 5.065 5.326 5.692 5.919 6.145 6.485 6.805 7.119 7.435 7.744 8.137 8.508 8.877 9.334 9.789 10.23 10.733 11.302 11.839 12.446 13.117 13.828 14.584 15.439 16.461 17.509 18.756 20.195 21.926 23.983 26.417 29.315 32.983 36.141 38.058 39.268 40.063 40.638 41.059 41.355 41.515 41.638 41.746 41.817 41.862 41.871 41.85 41.822 41.759 41.688 41.626 41.535 41.411 41.309 41.225 41.132 41.032 40.907 40.783 40.673 40.554 40.46 40.358 40.199 40.076 39.942 39.873 39.74 39.594 39.415 39.324 38.904 38.996 38.879 38.761 38.515 38.385 38.219 38.015 37.773 37.508 37.19 36.641 -3 ,15197 ,TETRA ,17526318,Thu Nov 25 03:35:44 CET,Thu Nov 25 06:46:36 CET,0.0 0.767 1.195 1.57 1.894 2.174 2.411 2.625 3.028 3.206 3.372 3.336 3.849 3.998 4.311 4.605 4.885 5.024 5.285 5.54 5.924 6.173 6.409 6.747 7.085 7.414 7.723 8.014 8.382 8.752 9.122 9.562 9.995 10.417 10.889 11.43 11.964 12.557 13.216 13.931 14.706 15.593 16.625 17.715 19.016 20.428 22.092 24.07 26.475 29.352 33.036 36.302 38.284 39.569 40.371 40.96 41.416 41.738 41.976 42.165 42.267 42.329 42.377 42.391 42.367 42.301 42.194 42.092 41.997 41.91 41.813 41.717 41.632 41.543 41.463 41.368 41.263 41.153 41.042 40.977 40.911 40.793 40.69 40.584 40.534 40.401 40.238 40.061 39.969 39.558 39.678 39.578 39.463 39.155 38.994 38.827 38.649 38.462 38.232 37.879 37.081 -4 ,563 ,TETRA ,17526319,Thu Nov 25 03:35:49 CET,Thu Nov 25 06:47:31 CET,0.0 0.769 1.23 1.565 1.839 2.109 2.361 2.581 2.977 3.167 3.353 3.342 3.868 4.028 4.341 4.636 4.929 5.075 5.35 5.605 5.969 6.212 6.447 6.792 7.133 7.471 7.793 8.108 8.526 8.93 9.322 9.788 10.239 10.67 11.177 11.77 12.343 12.991 13.731 14.519 15.337 16.249 17.298 18.351 19.598 21.027 22.79 24.9 27.407 30.423 34.101 37.277 39.16 40.407 41.315 41.968 42.405 42.707 42.934 43.119 43.21 43.21 43.197 43.204 43.2 43.175 43.122 43.065 43.018 42.96 42.864 42.771 42.678 42.569 42.472 42.364 42.26 42.16 42.042 41.954 41.862 41.69 41.558 41.429 41.357 41.206 41.054 40.885 40.799 40.391 40.531 40.432 40.302 40.028 39.902 39.745 39.54 39.312 39.034 38.61 37.695 -5 ,27820 ,TETRA ,17526320,Thu Nov 25 03:35:44 CET,Thu Nov 25 06:35:35 CET,0.0 0.668 1.076 1.425 1.734 2.022 2.273 2.48 2.878 3.089 3.284 3.276 3.808 3.958 4.234 4.517 4.801 4.938 5.212 5.479 5.862 6.112 6.348 6.707 7.077 7.422 7.74 8.051 8.474 8.884 9.281 9.773 10.241 10.689 11.213 11.799 12.365 13.009 13.71 14.47 15.282 16.183 17.264 18.35 19.619 21.056 22.741 24.754 27.206 30.133 33.804 36.945 38.868 40.161 41.05 41.691 42.142 42.465 42.691 42.887 43.005 43.05 43.095 43.146 43.144 43.115 43.07 43.015 42.925 42.82 42.726 42.628 42.52 42.399 42.289 42.177 42.059 41.92 41.769 41.663 41.539 41.336 41.198 41.044 40.963 40.815 40.668 40.491 40.396 39.97 40.065 39.94 39.809 39.525 39.355 39.17 38.958 38.719 38.441 38.121 37.03 -8 ,6256 ,TETRA ,17526323,Thu Nov 25 03:35:47 CET,Thu Nov 25 06:32:44 CET,0.0 0.903 1.29 1.641 1.945 2.202 2.454 2.706 3.165 3.366 3.557 3.568 4.111 4.279 4.591 4.897 5.184 5.317 5.574 5.831 6.224 6.482 6.728 7.071 7.402 7.725 8.036 8.345 8.744 9.132 9.51 9.975 10.439 10.889 11.411 11.995 12.562 13.199 13.888 14.617 15.378 16.254 17.322 18.425 19.712 21.191 22.934 24.911 27.279 30.161 33.813 36.859 38.669 39.883 40.701 41.291 41.708 41.968 42.109 42.22 42.324 42.418 42.478 42.499 42.494 42.478 42.432 42.351 42.266 42.161 42.061 41.988 41.88 41.752 41.665 41.58 41.488 41.37 41.23 41.135 41.039 40.9 40.807 40.697 40.633 40.507 40.38 40.23 40.145 39.725 39.782 39.654 39.548 39.308 39.161 38.979 38.772 38.545 38.279 37.944 37.171 -9 ,9039 ,TETRA ,17526324,Thu Nov 25 03:36:13 CET,Thu Nov 25 06:31:55 CET,0.0 0.991 1.407 1.758 2.08 2.36 2.613 2.84 3.252 3.448 3.642 3.664 4.208 4.379 4.691 4.98 5.263 5.4 5.668 5.929 6.317 6.558 6.788 7.139 7.479 7.8 8.108 8.421 8.835 9.221 9.585 10.026 10.448 10.851 11.337 11.908 12.462 13.076 13.737 14.447 15.233 16.152 17.228 18.324 19.612 21.045 22.702 24.638 27.016 29.921 33.68 36.865 38.763 40.02 40.858 41.449 41.84 42.114 42.302 42.447 42.544 42.601 42.629 42.651 42.661 42.632 42.573 42.503 42.438 42.385 42.321 42.238 42.135 42.03 41.946 41.851 41.743 41.637 41.538 41.459 41.364 41.218 41.098 40.954 40.879 40.739 40.6 40.432 40.346 39.93 40.051 39.946 39.822 39.555 39.423 39.262 39.04 38.806 38.573 38.261 37.183 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1h1s.txt deleted file mode 100644 index 76460e69..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12732 ,TETRA ,17526326,Thu Nov 25 03:36:13 CET,Thu Nov 25 06:36:06 CET,0.0 0.547 0.898 1.207 1.469 1.708 1.94 2.162 2.592 2.806 3.011 2.794 3.538 3.716 4.062 4.376 4.679 4.827 5.111 5.383 5.775 6.031 6.286 6.656 7.016 7.374 7.731 8.085 8.546 8.988 9.411 9.946 10.484 11.005 11.602 12.28 12.954 13.717 14.56 15.477 16.475 17.625 18.984 20.392 22.067 24.007 26.329 29.101 32.511 36.736 42.119 46.758 49.594 51.48 52.778 53.699 54.302 54.707 54.994 55.23 55.401 55.524 55.589 55.624 55.619 55.568 55.485 55.41 55.352 55.283 55.189 55.1 55.006 54.872 54.761 54.648 54.519 54.384 54.239 54.134 54.018 53.822 53.685 53.528 53.442 53.265 53.078 52.891 52.781 52.12 52.369 52.226 52.088 51.822 51.663 51.473 51.235 50.965 50.669 50.251 48.785 -2 ,29858 ,TETRA ,17526327,Thu Nov 25 03:36:14 CET,Thu Nov 25 06:36:36 CET,0.0 0.453 0.742 0.975 1.183 1.405 1.624 1.835 2.227 2.416 2.596 2.346 3.102 3.275 3.588 3.874 4.159 4.302 4.584 4.857 5.253 5.519 5.778 6.144 6.5 6.852 7.202 7.553 8.03 8.479 8.902 9.421 9.941 10.46 11.065 11.761 12.438 13.181 14.01 14.932 15.921 17.052 18.409 19.824 21.488 23.354 25.569 28.186 31.366 35.289 40.326 44.707 47.49 49.415 50.731 51.623 52.255 52.766 53.146 53.401 53.539 53.629 53.681 53.708 53.719 53.721 53.669 53.587 53.508 53.401 53.265 53.146 53.013 52.886 52.788 52.664 52.528 52.384 52.232 52.114 51.974 51.763 51.626 51.472 51.383 51.202 51.016 50.807 50.696 50.052 50.307 50.151 50.0 49.677 49.493 49.27 48.999 48.682 48.289 47.699 46.082 -6 ,4821 ,TETRA ,17526331,Thu Nov 25 03:36:14 CET,Thu Nov 25 06:35:57 CET,0.0 0.513 0.847 1.159 1.442 1.677 1.916 2.148 2.578 2.771 2.967 2.757 3.508 3.68 4.017 4.344 4.654 4.81 5.126 5.424 5.863 6.149 6.418 6.811 7.188 7.557 7.93 8.304 8.789 9.262 9.732 10.295 10.84 11.356 11.958 12.67 13.367 14.141 14.984 15.893 16.856 17.966 19.34 20.755 22.425 24.348 26.638 29.341 32.687 36.862 42.108 46.698 49.596 51.497 52.741 53.603 54.217 54.687 55.029 55.282 55.387 55.445 55.495 55.471 55.409 55.357 55.307 55.277 55.239 55.162 55.056 54.969 54.866 54.745 54.656 54.54 54.397 54.26 54.108 54.002 53.877 53.673 53.54 53.377 53.292 53.12 52.925 52.703 52.583 51.924 52.175 52.018 51.852 51.495 51.296 51.07 50.812 50.509 50.108 49.596 47.598 -7 ,11997 ,TETRA ,17526332,Thu Nov 25 03:36:16 CET,Thu Nov 25 06:37:02 CET,0.0 0.789 1.159 1.471 1.737 1.963 2.177 2.383 2.77 2.962 3.147 2.91 3.659 3.834 4.19 4.526 4.826 4.975 5.265 5.547 5.983 6.254 6.501 6.877 7.256 7.627 7.993 8.351 8.826 9.303 9.754 10.297 10.833 11.356 11.966 12.66 13.345 14.113 14.961 15.868 16.842 17.97 19.307 20.68 22.303 24.176 26.397 29.001 32.202 36.192 41.382 45.972 48.815 50.663 51.895 52.709 53.214 53.594 53.837 53.984 54.094 54.155 54.16 54.139 54.114 54.054 53.949 53.845 53.739 53.63 53.523 53.413 53.261 53.098 52.968 52.827 52.686 52.521 52.344 52.218 52.094 51.912 51.769 51.608 51.523 51.349 51.176 50.976 50.861 50.217 50.522 50.388 50.253 49.959 49.773 49.542 49.285 49.005 48.67 48.198 46.711 -8 ,3018 ,TETRA ,17526333,Thu Nov 25 03:36:18 CET,Thu Nov 25 06:30:59 CET,0.0 0.622 0.935 1.204 1.456 1.693 1.912 2.099 2.438 2.606 2.786 2.577 3.334 3.501 3.823 4.136 4.434 4.578 4.858 5.128 5.513 5.772 6.035 6.422 6.794 7.165 7.54 7.895 8.346 8.796 9.24 9.795 10.341 10.866 11.486 12.196 12.896 13.684 14.534 15.446 16.428 17.567 18.928 20.345 22.05 24.031 26.38 29.095 32.372 36.363 41.555 46.205 49.104 51.02 52.356 53.371 54.104 54.612 54.967 55.273 55.481 55.623 55.711 55.753 55.753 55.722 55.694 55.67 55.618 55.529 55.426 55.345 55.262 55.168 55.093 55.002 54.895 54.794 54.682 54.598 54.506 54.322 54.182 54.037 53.96 53.794 53.596 53.38 53.271 52.641 52.938 52.809 52.662 52.373 52.223 52.02 51.782 51.499 51.133 50.699 49.312 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1oiu.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1oiu.txt deleted file mode 100644 index 85bde484..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_32_1oiu.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28118 ,TETRA ,17526336,Thu Nov 25 03:36:18 CET,Thu Nov 25 06:36:44 CET,0.0 1.257 1.856 2.342 2.766 3.171 3.541 3.885 4.54 4.851 5.149 5.116 5.959 6.214 6.724 7.21 7.675 7.909 8.378 8.84 9.492 9.918 10.348 10.984 11.618 12.23 12.809 13.375 14.1 14.801 15.503 16.346 17.161 17.999 19.025 20.185 21.292 22.54 23.934 25.477 27.144 29.068 31.392 33.786 36.609 39.843 43.816 48.509 54.201 61.375 70.505 78.352 83.092 86.372 88.854 90.762 92.288 93.466 94.254 94.854 95.283 95.59 95.793 95.983 96.17 96.357 96.52 96.569 96.566 96.561 96.519 96.437 96.313 96.176 96.087 95.98 95.823 95.634 95.445 95.304 95.138 94.889 94.709 94.513 94.419 94.207 93.943 93.648 93.498 92.857 93.027 92.87 92.698 92.282 92.017 91.748 91.465 91.09 90.488 89.519 84.61 -2 ,10886 ,TETRA ,17526337,Thu Nov 25 03:36:16 CET,Thu Nov 25 06:40:38 CET,0.0 1.325 1.831 2.319 2.793 3.183 3.524 3.877 4.549 4.848 5.131 5.126 5.993 6.264 6.791 7.276 7.751 7.988 8.426 8.864 9.549 10.001 10.44 11.09 11.725 12.348 12.944 13.527 14.314 15.079 15.816 16.73 17.637 18.506 19.517 20.684 21.847 23.15 24.606 26.185 27.842 29.784 32.105 34.483 37.451 40.928 45.013 49.847 55.791 62.993 72.094 80.404 85.754 89.284 91.67 93.329 94.592 95.631 96.382 97.023 97.473 97.802 98.118 98.405 98.65 98.826 98.946 99.028 99.099 99.139 99.126 99.089 99.01 98.901 98.796 98.696 98.599 98.459 98.283 98.152 98.019 97.807 97.645 97.458 97.367 97.167 96.93 96.667 96.518 95.895 96.076 95.901 95.703 95.233 94.95 94.619 94.244 93.823 93.304 92.477 89.364 -3 ,12618 ,TETRA ,17526338,Thu Nov 25 03:36:17 CET,Thu Nov 25 06:40:27 CET,0.0 1.942 2.523 3.031 3.463 3.836 4.188 4.531 5.187 5.478 5.765 5.73 6.567 6.818 7.32 7.804 8.284 8.522 8.99 9.435 10.069 10.487 10.894 11.495 12.079 12.665 13.253 13.822 14.568 15.29 16.007 16.912 17.782 18.636 19.672 20.876 22.053 23.337 24.717 26.211 27.823 29.729 32.014 34.32 37.122 40.453 44.485 49.149 54.738 61.455 70.188 78.156 83.268 86.829 89.315 91.163 92.627 93.81 94.673 95.396 95.877 96.255 96.583 96.833 96.993 97.095 97.218 97.314 97.353 97.307 97.233 97.203 97.14 97.048 96.979 96.903 96.819 96.732 96.621 96.522 96.401 96.166 96.0 95.821 95.721 95.531 95.339 95.098 94.955 94.338 94.519 94.339 94.167 93.773 93.52 93.241 92.901 92.435 91.852 91.052 88.438 -4 ,19453 ,TETRA ,17526339,Thu Nov 25 03:36:15 CET,Thu Nov 25 06:37:31 CET,0.0 1.506 2.148 2.651 3.077 3.45 3.805 4.158 4.789 5.093 5.394 5.386 6.244 6.499 7.0 7.503 7.987 8.224 8.695 9.146 9.798 10.24 10.669 11.291 11.878 12.46 13.062 13.656 14.407 15.146 15.894 16.78 17.664 18.562 19.594 20.741 21.871 23.167 24.564 26.102 27.804 29.734 32.034 34.372 37.156 40.406 44.428 49.189 54.915 62.017 71.107 79.193 84.34 87.819 90.221 92.0 93.242 94.183 94.89 95.47 95.905 96.274 96.538 96.621 96.6 96.603 96.632 96.643 96.629 96.604 96.558 96.465 96.324 96.199 96.089 95.929 95.772 95.612 95.435 95.307 95.167 94.946 94.753 94.528 94.421 94.167 93.866 93.562 93.41 92.772 92.928 92.737 92.527 92.006 91.72 91.451 91.132 90.7 90.161 89.424 86.057 -5 ,6455 ,TETRA ,17526340,Thu Nov 25 03:36:18 CET,Thu Nov 25 06:36:43 CET,0.0 1.74 2.386 2.917 3.386 3.823 4.217 4.594 5.305 5.624 5.936 5.993 6.881 7.177 7.732 8.232 8.729 8.99 9.497 9.982 10.69 11.143 11.578 12.206 12.827 13.431 14.034 14.639 15.447 16.231 16.964 17.839 18.694 19.556 20.589 21.756 22.886 24.168 25.569 27.074 28.701 30.616 32.941 35.305 38.064 41.253 45.04 49.426 54.765 61.388 70.129 78.07 83.359 87.016 89.508 91.38 92.765 93.825 94.615 95.258 95.768 96.159 96.455 96.69 96.875 97.039 97.134 97.145 97.165 97.184 97.159 97.101 97.036 96.999 96.976 96.952 96.904 96.788 96.614 96.485 96.353 96.139 95.985 95.813 95.723 95.568 95.354 95.08 94.953 94.317 94.428 94.229 94.029 93.6 93.337 93.029 92.661 92.218 91.658 90.864 88.067 -8 ,4283 ,TETRA ,17526344,Thu Nov 25 03:36:16 CET,Thu Nov 25 06:31:06 CET,0.0 1.274 1.806 2.255 2.683 3.096 3.461 3.788 4.426 4.734 5.008 4.971 5.847 6.125 6.666 7.193 7.692 7.926 8.393 8.854 9.527 9.964 10.4 11.059 11.686 12.286 12.869 13.421 14.151 14.924 15.697 16.593 17.471 18.348 19.374 20.571 21.746 23.032 24.446 26.043 27.807 29.823 32.244 34.705 37.564 40.854 44.804 49.433 55.296 62.637 71.926 80.233 85.648 89.442 92.047 93.959 95.392 96.502 97.319 98.0 98.459 98.805 99.115 99.37 99.561 99.708 99.82 99.865 99.863 99.803 99.712 99.649 99.589 99.515 99.438 99.338 99.235 99.1 98.946 98.858 98.755 98.571 98.413 98.237 98.155 97.971 97.763 97.539 97.416 96.796 96.962 96.787 96.593 96.102 95.836 95.57 95.251 94.876 94.395 93.609 88.982 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_32_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_32_30.txt deleted file mode 100644 index 75e587b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/protein/Summary_FEP_32_30.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,31542 ,KEBNE ,17024475,Wed Dec 22 10:05:28 CET,Wed Dec 22 12:15:20 CET,0.0 1.533 2.217 2.753 3.231 3.707 4.165 4.592 5.357 5.721 6.088 6.202 7.112 7.451 8.137 8.798 9.437 9.738 10.297 10.84 11.637 12.166 12.677 13.398 14.105 14.818 15.522 16.202 17.098 17.974 18.81 19.836 20.859 21.888 23.122 24.541 25.928 27.478 29.21 31.086 33.169 35.622 38.54 41.584 45.252 49.507 54.705 61.005 68.861 78.872 92.601 105.746 114.691 121.184 126.028 129.854 132.86 135.333 137.274 139.073 140.488 141.65 142.681 143.576 144.363 145.042 145.677 146.188 146.602 147.011 147.417 147.729 148.039 148.325 148.527 148.723 148.894 149.043 149.182 149.271 149.351 149.484 149.572 149.639 149.654 149.67 149.686 149.687 149.666 149.228 149.592 149.551 149.502 149.355 149.259 149.153 149.028 148.886 148.699 148.343 147.186 -3 ,23791 ,KEBNE ,17024476,Wed Dec 22 10:05:28 CET,Wed Dec 22 12:15:07 CET,0.0 1.407 1.946 2.404 2.796 3.177 3.56 3.925 4.574 4.888 5.22 5.288 6.169 6.467 7.05 7.603 8.14 8.403 8.919 9.437 10.198 10.69 11.181 11.918 12.654 13.37 14.06 14.75 15.681 16.584 17.459 18.535 19.583 20.614 21.838 23.263 24.672 26.273 28.059 29.997 32.078 34.493 37.426 40.513 44.273 48.693 54.086 60.491 68.552 79.056 93.327 106.991 116.297 123.075 128.184 132.284 135.492 138.061 140.082 141.919 143.361 144.584 145.664 146.558 147.339 148.007 148.649 149.187 149.623 150.055 150.469 150.807 151.133 151.428 151.639 151.845 152.039 152.222 152.39 152.454 152.504 152.581 152.588 152.577 152.576 152.553 152.51 152.476 152.448 152.005 152.354 152.298 152.221 152.043 151.927 151.774 151.61 151.386 151.068 150.626 148.911 -4 ,29545 ,KEBNE ,17024477,Wed Dec 22 10:05:28 CET,Wed Dec 22 12:14:28 CET,0.0 1.163 1.728 2.168 2.561 2.93 3.295 3.654 4.359 4.692 4.999 5.019 5.891 6.169 6.713 7.258 7.781 8.04 8.57 9.091 9.813 10.28 10.762 11.452 12.127 12.808 13.478 14.143 15.027 15.911 16.782 17.832 18.863 19.887 21.111 22.523 23.903 25.454 27.173 29.076 31.159 33.545 36.446 39.568 43.369 47.759 53.022 59.236 67.038 77.132 91.022 104.181 112.97 119.404 124.256 128.111 131.157 133.629 135.576 137.398 138.868 140.071 141.117 142.018 142.785 143.453 144.113 144.669 145.128 145.572 146.009 146.326 146.606 146.89 147.108 147.314 147.492 147.652 147.808 147.913 148.004 148.124 148.188 148.235 148.256 148.298 148.344 148.37 148.365 147.945 148.332 148.299 148.254 148.149 148.075 147.974 147.81 147.584 147.262 146.837 145.722 -5 ,1190 ,KEBNE ,17024478,Wed Dec 22 10:05:28 CET,Wed Dec 22 12:16:46 CET,0.0 1.026 1.496 1.913 2.311 2.693 3.055 3.379 3.987 4.284 4.581 4.586 5.446 5.725 6.28 6.813 7.325 7.581 8.107 8.617 9.345 9.828 10.315 11.044 11.747 12.425 13.098 13.767 14.628 15.469 16.317 17.366 18.397 19.409 20.609 21.973 23.318 24.875 26.578 28.436 30.463 32.83 35.698 38.696 42.324 46.52 51.66 57.865 65.703 75.836 89.534 102.691 111.71 118.281 123.233 127.144 130.243 132.843 134.873 136.696 138.15 139.365 140.44 141.381 142.174 142.819 143.433 143.944 144.37 144.788 145.163 145.465 145.76 146.028 146.216 146.372 146.517 146.673 146.818 146.911 147.003 147.118 147.188 147.239 147.255 147.288 147.31 147.3 147.296 146.88 147.288 147.262 147.222 147.111 147.033 146.937 146.791 146.605 146.338 145.883 144.24 -6 ,29823 ,KEBNE ,17024479,Wed Dec 22 10:05:27 CET,Wed Dec 22 12:16:04 CET,0.0 1.16 1.692 2.167 2.627 3.05 3.435 3.81 4.519 4.849 5.167 5.209 6.086 6.369 6.937 7.52 8.093 8.371 8.914 9.439 10.202 10.683 11.148 11.849 12.549 13.243 13.932 14.599 15.486 16.378 17.263 18.356 19.427 20.507 21.792 23.233 24.632 26.226 28.019 29.97 32.031 34.415 37.297 40.267 43.906 48.184 53.391 59.615 67.345 77.315 90.945 103.988 112.87 119.367 124.216 128.017 130.995 133.454 135.409 137.199 138.637 139.818 140.874 141.79 142.563 143.238 143.877 144.401 144.83 145.242 145.658 145.984 146.289 146.577 146.784 146.991 147.15 147.288 147.441 147.529 147.609 147.721 147.793 147.842 147.851 147.85 147.829 147.791 147.77 147.332 147.684 147.641 147.583 147.41 147.294 147.167 147.019 146.852 146.643 146.308 144.834 -7 ,14180 ,KEBNE ,17125472,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:48:56 CET,0.0 1.271 1.802 2.27 2.68 3.062 3.409 3.748 4.391 4.677 4.955 4.933 5.791 6.076 6.644 7.194 7.722 7.982 8.489 8.969 9.693 10.172 10.649 11.362 12.052 12.729 13.397 14.068 14.975 15.846 16.675 17.726 18.787 19.819 21.042 22.455 23.851 25.448 27.223 29.136 31.162 33.582 36.528 39.562 43.281 47.612 52.814 59.05 66.994 77.271 91.052 104.156 113.011 119.411 124.27 128.188 131.25 133.715 135.661 137.466 138.903 140.092 141.13 142.049 142.849 143.505 144.142 144.646 145.045 145.452 145.834 146.122 146.399 146.669 146.866 147.028 147.164 147.305 147.431 147.507 147.578 147.638 147.691 147.755 147.778 147.836 147.893 147.903 147.891 147.461 147.798 147.736 147.684 147.548 147.472 147.388 147.266 147.107 146.878 146.52 145.072 -8 ,2143 ,KEBNE ,17125473,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:49:32 CET,0.0 0.946 1.432 1.897 2.321 2.694 3.038 3.362 4.0 4.318 4.624 4.621 5.481 5.766 6.304 6.837 7.374 7.64 8.159 8.667 9.412 9.89 10.362 11.059 11.743 12.434 13.117 13.802 14.699 15.583 16.453 17.503 18.548 19.579 20.788 22.179 23.564 25.112 26.845 28.758 30.822 33.241 36.158 39.204 42.859 47.083 52.255 58.512 66.444 76.638 90.462 103.759 112.724 119.179 124.031 127.896 130.951 133.403 135.338 137.109 138.475 139.621 140.612 141.471 142.216 142.844 143.458 143.973 144.427 144.875 145.288 145.608 145.911 146.193 146.392 146.562 146.74 146.937 147.114 147.212 147.297 147.419 147.492 147.528 147.534 147.557 147.587 147.593 147.571 147.131 147.513 147.489 147.463 147.382 147.319 147.196 147.038 146.869 146.629 146.225 144.888 -9 ,1572 ,KEBNE ,17125474,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:50:21 CET,0.0 0.976 1.516 1.979 2.397 2.765 3.117 3.464 4.109 4.421 4.737 4.752 5.602 5.881 6.45 6.985 7.505 7.761 8.274 8.79 9.539 10.034 10.51 11.193 11.869 12.546 13.222 13.885 14.754 15.62 16.471 17.514 18.548 19.572 20.795 22.207 23.582 25.114 26.837 28.769 30.896 33.335 36.253 39.334 43.088 47.439 52.709 58.983 66.786 76.88 90.653 103.818 112.736 119.122 123.935 127.797 130.847 133.376 135.365 137.191 138.662 139.871 140.92 141.83 142.63 143.299 143.961 144.532 144.96 145.366 145.766 146.063 146.331 146.587 146.795 147.0 147.197 147.409 147.602 147.695 147.779 147.897 147.969 148.028 148.056 148.117 148.145 148.145 148.146 147.725 148.085 148.031 147.957 147.786 147.693 147.578 147.443 147.268 147.021 146.574 144.601 -10 ,8178 ,KEBNE ,17125475,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:49:20 CET,0.0 1.022 1.558 2.009 2.394 2.786 3.193 3.565 4.229 4.549 4.849 4.832 5.69 5.979 6.538 7.074 7.608 7.869 8.382 8.882 9.647 10.148 10.623 11.325 12.016 12.708 13.387 14.045 14.931 15.823 16.682 17.735 18.779 19.816 21.037 22.458 23.875 25.444 27.186 29.135 31.258 33.749 36.752 39.83 43.537 47.864 53.063 59.22 67.024 77.109 90.85 103.888 112.615 118.936 123.706 127.49 130.456 132.87 134.725 136.416 137.761 138.854 139.817 140.677 141.416 142.04 142.658 143.178 143.585 143.965 144.333 144.622 144.909 145.186 145.389 145.576 145.741 145.897 146.037 146.113 146.179 146.278 146.331 146.372 146.386 146.405 146.396 146.372 146.363 145.936 146.323 146.29 146.238 146.113 146.038 145.929 145.788 145.589 145.323 144.978 143.948 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_17_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_17_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 25a6d479..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_17_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,18023 ,TETRA ,17526349,Thu Nov 25 03:36:20 CET,Thu Nov 25 05:27:58 CET,0.0 0.84 1.208 1.471 1.669 1.849 2.028 2.183 2.444 2.572 2.699 2.644 3.057 3.156 3.364 3.569 3.757 3.848 4.021 4.177 4.407 4.548 4.68 4.885 5.074 5.252 5.427 5.591 5.796 6.003 6.207 6.447 6.66 6.86 7.092 7.342 7.577 7.829 8.103 8.408 8.725 9.065 9.45 9.836 10.294 10.789 11.337 11.965 12.627 13.285 13.924 14.182 14.114 13.862 13.573 13.249 12.921 12.633 12.37 12.09 11.84 11.597 11.351 11.134 10.929 10.719 10.486 10.27 10.088 9.891 9.685 9.512 9.328 9.137 8.975 8.801 8.617 8.422 8.224 8.088 7.944 7.718 7.554 7.383 7.295 7.091 6.877 6.665 6.543 6.113 6.172 6.05 5.91 5.553 5.344 5.134 4.909 4.639 4.299 3.802 2.385 -4 ,26902 ,TETRA ,17526350,Thu Nov 25 03:36:21 CET,Thu Nov 25 05:26:21 CET,0.0 0.586 0.906 1.195 1.434 1.635 1.829 1.997 2.275 2.402 2.53 2.462 2.877 2.987 3.193 3.385 3.561 3.647 3.814 3.971 4.203 4.343 4.47 4.664 4.853 5.026 5.196 5.353 5.549 5.75 5.944 6.172 6.396 6.614 6.854 7.123 7.388 7.67 7.967 8.271 8.594 8.973 9.41 9.846 10.347 10.887 11.481 12.087 12.742 13.479 14.176 14.498 14.459 14.238 13.957 13.672 13.422 13.144 12.862 12.557 12.275 12.024 11.785 11.56 11.349 11.155 10.934 10.724 10.549 10.367 10.163 9.981 9.783 9.562 9.404 9.244 9.066 8.88 8.677 8.535 8.384 8.136 7.978 7.825 7.741 7.572 7.378 7.16 7.044 6.617 6.67 6.544 6.414 6.115 5.941 5.718 5.439 5.124 4.764 4.309 2.803 -5 ,1019 ,TETRA ,17526351,Thu Nov 25 03:36:17 CET,Thu Nov 25 05:25:58 CET,0.0 0.657 0.995 1.244 1.453 1.632 1.801 1.953 2.221 2.339 2.45 2.379 2.801 2.902 3.091 3.272 3.44 3.515 3.662 3.813 4.039 4.179 4.303 4.487 4.673 4.849 5.02 5.191 5.408 5.605 5.79 6.029 6.272 6.505 6.771 7.051 7.308 7.579 7.864 8.173 8.502 8.86 9.274 9.672 10.127 10.642 11.178 11.736 12.404 13.098 13.693 13.906 13.828 13.645 13.398 13.13 12.83 12.502 12.22 11.94 11.692 11.471 11.241 11.002 10.78 10.577 10.35 10.143 9.967 9.773 9.567 9.403 9.223 9.017 8.837 8.652 8.484 8.312 8.107 7.962 7.817 7.59 7.435 7.263 7.172 6.997 6.82 6.621 6.517 6.109 6.164 6.027 5.87 5.504 5.326 5.135 4.909 4.652 4.308 3.799 2.328 -6 ,329 ,TETRA ,17526352,Thu Nov 25 03:36:17 CET,Thu Nov 25 05:27:23 CET,0.0 0.791 1.135 1.399 1.596 1.782 1.954 2.099 2.359 2.484 2.611 2.548 2.968 3.079 3.274 3.46 3.649 3.741 3.905 4.057 4.273 4.41 4.547 4.753 4.94 5.119 5.295 5.457 5.66 5.859 6.038 6.235 6.425 6.624 6.857 7.095 7.324 7.593 7.895 8.205 8.533 8.9 9.29 9.674 10.117 10.579 11.105 11.68 12.284 12.953 13.58 13.782 13.728 13.558 13.28 12.966 12.697 12.435 12.168 11.868 11.602 11.371 11.151 10.936 10.72 10.512 10.29 10.083 9.908 9.725 9.526 9.359 9.188 8.99 8.827 8.66 8.483 8.307 8.115 7.972 7.817 7.583 7.433 7.265 7.17 6.968 6.767 6.542 6.423 5.997 6.011 5.875 5.742 5.427 5.25 5.038 4.79 4.507 4.169 3.728 2.519 -7 ,22688 ,TETRA ,17526353,Thu Nov 25 03:36:19 CET,Thu Nov 25 05:27:24 CET,0.0 0.501 0.797 1.038 1.252 1.461 1.649 1.81 2.106 2.234 2.357 2.278 2.698 2.815 3.02 3.201 3.368 3.448 3.611 3.77 4.011 4.164 4.311 4.526 4.727 4.914 5.093 5.257 5.464 5.669 5.865 6.106 6.342 6.57 6.819 7.096 7.369 7.648 7.95 8.276 8.606 8.976 9.397 9.814 10.303 10.821 11.418 12.091 12.802 13.496 14.124 14.389 14.311 14.097 13.848 13.548 13.25 12.955 12.694 12.414 12.148 11.897 11.634 11.392 11.172 10.965 10.75 10.548 10.36 10.164 9.957 9.786 9.605 9.41 9.259 9.101 8.925 8.736 8.544 8.414 8.283 8.064 7.904 7.746 7.655 7.446 7.235 7.012 6.886 6.457 6.491 6.347 6.193 5.836 5.629 5.405 5.163 4.883 4.526 3.995 2.594 -9 ,30874 ,TETRA ,17526355,Thu Nov 25 03:36:49 CET,Thu Nov 25 05:26:28 CET,0.0 0.696 1.118 1.477 1.746 1.928 2.097 2.254 2.541 2.687 2.824 2.757 3.188 3.307 3.508 3.7 3.881 3.964 4.12 4.271 4.499 4.647 4.786 4.97 5.139 5.315 5.49 5.662 5.888 6.106 6.302 6.525 6.743 6.946 7.175 7.421 7.654 7.921 8.215 8.519 8.826 9.176 9.583 9.978 10.418 10.92 11.498 12.122 12.805 13.46 14.074 14.38 14.321 14.084 13.806 13.512 13.227 12.944 12.678 12.395 12.128 11.896 11.679 11.443 11.221 11.021 10.803 10.596 10.402 10.208 10.009 9.836 9.659 9.468 9.324 9.18 9.031 8.868 8.671 8.53 8.382 8.145 7.988 7.824 7.733 7.532 7.318 7.105 6.998 6.575 6.597 6.45 6.305 5.996 5.807 5.584 5.327 5.014 4.649 4.169 2.569 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_17.txt deleted file mode 100644 index 21950eec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_17.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6618 ,TETRA ,17526357,Thu Nov 25 03:36:48 CET,Thu Nov 25 05:27:55 CET,0.0 1.115 1.54 1.814 2.044 2.257 2.434 2.576 2.844 2.975 3.095 3.015 3.425 3.523 3.72 3.915 4.104 4.189 4.352 4.505 4.717 4.849 4.983 5.193 5.387 5.553 5.71 5.864 6.069 6.266 6.447 6.654 6.846 7.037 7.264 7.524 7.806 8.151 8.504 8.813 9.099 9.417 9.763 10.116 10.535 10.999 11.506 12.008 12.543 13.068 13.477 13.561 13.406 13.114 12.8 12.519 12.258 11.983 11.723 11.445 11.205 10.997 10.801 10.618 10.424 10.24 10.049 9.864 9.692 9.512 9.34 9.194 9.035 8.873 8.744 8.619 8.492 8.35 8.186 8.063 7.938 7.757 7.627 7.49 7.424 7.285 7.125 6.959 6.873 6.477 6.566 6.444 6.317 6.021 5.852 5.676 5.501 5.309 5.077 4.761 4.129 -5 ,10365 ,TETRA ,17526362,Thu Nov 25 03:36:50 CET,Thu Nov 25 05:26:29 CET,0.0 1.199 1.595 1.891 2.118 2.328 2.521 2.691 3.01 3.157 3.299 3.256 3.686 3.807 4.032 4.232 4.425 4.513 4.678 4.834 5.05 5.193 5.33 5.533 5.729 5.912 6.09 6.258 6.47 6.667 6.852 7.071 7.283 7.487 7.717 7.997 8.27 8.563 8.861 9.136 9.415 9.729 10.093 10.456 10.889 11.377 11.896 12.42 12.977 13.563 14.059 14.15 14.002 13.782 13.517 13.239 12.963 12.662 12.369 12.072 11.831 11.622 11.403 11.19 11.004 10.826 10.633 10.466 10.319 10.161 9.989 9.828 9.65 9.482 9.359 9.229 9.097 8.961 8.812 8.706 8.605 8.436 8.306 8.178 8.11 7.952 7.784 7.611 7.52 7.11 7.187 7.061 6.926 6.64 6.474 6.292 6.108 5.907 5.649 5.272 4.484 -7 ,8492 ,TETRA ,17526364,Thu Nov 25 03:36:49 CET,Thu Nov 25 05:26:24 CET,0.0 1.07 1.473 1.777 2.012 2.226 2.422 2.607 2.913 3.049 3.192 3.156 3.577 3.683 3.894 4.087 4.262 4.346 4.516 4.672 4.895 5.046 5.189 5.385 5.574 5.759 5.933 6.095 6.303 6.501 6.687 6.899 7.099 7.299 7.525 7.787 8.032 8.298 8.584 8.872 9.171 9.489 9.851 10.19 10.591 11.053 11.522 12.014 12.555 13.095 13.561 13.684 13.505 13.259 13.006 12.732 12.452 12.158 11.905 11.651 11.423 11.216 11.003 10.788 10.57 10.362 10.176 10.012 9.857 9.697 9.511 9.337 9.161 8.978 8.84 8.701 8.546 8.377 8.189 8.058 7.93 7.73 7.596 7.464 7.385 7.214 7.031 6.841 6.741 6.326 6.421 6.301 6.159 5.874 5.716 5.543 5.367 5.144 4.88 4.587 4.091 -8 ,23259 ,TETRA ,17526365,Thu Nov 25 03:37:21 CET,Thu Nov 25 05:28:28 CET,0.0 1.242 1.674 1.966 2.204 2.406 2.589 2.758 3.053 3.171 3.281 3.203 3.613 3.715 3.916 4.116 4.314 4.402 4.556 4.7 4.916 5.066 5.218 5.419 5.6 5.788 5.963 6.125 6.326 6.512 6.709 6.945 7.145 7.336 7.562 7.814 8.054 8.316 8.589 8.882 9.18 9.494 9.869 10.251 10.686 11.158 11.676 12.189 12.705 13.221 13.688 13.832 13.717 13.484 13.219 12.881 12.532 12.227 11.969 11.717 11.484 11.261 11.042 10.817 10.6 10.407 10.201 10.013 9.851 9.676 9.483 9.314 9.145 8.987 8.858 8.703 8.542 8.389 8.236 8.119 7.993 7.806 7.67 7.52 7.441 7.271 7.083 6.896 6.805 6.408 6.525 6.427 6.319 6.037 5.874 5.704 5.525 5.312 5.052 4.736 3.963 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt deleted file mode 100644 index e06dbc0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1h1r_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,16351 ,TETRA ,17526369,Thu Nov 25 03:36:54 CET,Thu Nov 25 05:28:47 CET,0.0 0.553 0.875 1.166 1.406 1.618 1.82 2.01 2.345 2.486 2.604 2.51 2.925 3.025 3.215 3.406 3.604 3.698 3.878 4.047 4.29 4.438 4.565 4.744 4.921 5.086 5.243 5.404 5.611 5.806 5.995 6.229 6.464 6.698 6.954 7.243 7.506 7.78 8.081 8.415 8.775 9.157 9.608 10.067 10.576 11.132 11.756 12.454 13.273 14.16 15.071 15.599 15.733 15.7 15.593 15.421 15.212 15.003 14.797 14.568 14.357 14.166 13.99 13.805 13.624 13.462 13.287 13.12 12.977 12.831 12.657 12.502 12.339 12.149 12.007 11.872 11.736 11.609 11.454 11.324 11.179 10.951 10.795 10.636 10.559 10.389 10.192 9.997 9.907 9.511 9.597 9.477 9.344 9.038 8.861 8.682 8.481 8.226 7.926 7.496 6.242 -5 ,23193 ,TETRA ,17526372,Thu Nov 25 03:36:50 CET,Thu Nov 25 05:25:49 CET,0.0 0.84 1.224 1.541 1.816 2.042 2.229 2.395 2.697 2.841 2.975 2.896 3.309 3.421 3.644 3.846 4.037 4.125 4.299 4.468 4.702 4.858 5.007 5.213 5.417 5.608 5.784 5.949 6.157 6.361 6.562 6.799 7.02 7.237 7.493 7.769 8.022 8.317 8.658 8.998 9.336 9.719 10.196 10.658 11.146 11.681 12.291 12.968 13.736 14.593 15.494 15.994 16.094 16.027 15.885 15.705 15.503 15.279 15.057 14.828 14.63 14.436 14.242 14.045 13.854 13.653 13.442 13.281 13.131 12.955 12.761 12.611 12.463 12.298 12.168 12.033 11.882 11.713 11.536 11.414 11.29 11.093 10.952 10.8 10.721 10.548 10.342 10.124 10.013 9.601 9.691 9.564 9.428 9.152 8.997 8.813 8.577 8.3 7.987 7.562 6.683 -8 ,19022 ,TETRA ,17526375,Thu Nov 25 03:36:53 CET,Thu Nov 25 05:26:03 CET,0.0 0.607 0.941 1.243 1.495 1.701 1.864 2.019 2.291 2.405 2.518 2.44 2.855 2.957 3.154 3.321 3.481 3.563 3.724 3.886 4.108 4.248 4.387 4.583 4.776 4.962 5.138 5.301 5.509 5.72 5.921 6.159 6.387 6.605 6.852 7.128 7.394 7.686 7.997 8.319 8.664 9.047 9.482 9.918 10.413 10.95 11.574 12.262 13.018 13.881 14.819 15.399 15.563 15.522 15.387 15.203 15.018 14.816 14.606 14.381 14.152 13.939 13.722 13.513 13.322 13.149 12.973 12.781 12.606 12.434 12.246 12.082 11.906 11.714 11.559 11.395 11.216 11.039 10.859 10.737 10.613 10.406 10.262 10.109 10.023 9.838 9.662 9.476 9.374 8.965 9.024 8.876 8.721 8.379 8.192 7.997 7.77 7.518 7.23 6.775 5.508 -9 ,27405 ,TETRA ,17526376,Thu Nov 25 03:36:54 CET,Thu Nov 25 05:27:52 CET,0.0 0.915 1.282 1.558 1.787 1.975 2.158 2.33 2.638 2.782 2.916 2.866 3.296 3.406 3.605 3.792 3.978 4.07 4.234 4.392 4.63 4.779 4.921 5.12 5.307 5.475 5.632 5.801 6.018 6.214 6.408 6.642 6.871 7.089 7.328 7.605 7.873 8.161 8.474 8.797 9.146 9.558 10.024 10.469 10.982 11.535 12.153 12.829 13.585 14.451 15.385 15.973 16.15 16.105 15.945 15.763 15.59 15.378 15.171 14.948 14.734 14.536 14.331 14.136 13.961 13.782 13.57 13.38 13.236 13.088 12.911 12.752 12.593 12.433 12.293 12.137 11.973 11.796 11.619 11.494 11.369 11.164 11.015 10.869 10.787 10.595 10.38 10.16 10.051 9.637 9.683 9.545 9.403 9.083 8.92 8.745 8.548 8.289 7.967 7.567 6.601 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt deleted file mode 100644 index 6960b4ff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiu.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12387 ,TETRA ,17526378,Thu Nov 25 03:36:50 CET,Thu Nov 25 05:28:18 CET,0.0 2.043 2.695 3.224 3.664 4.026 4.36 4.661 5.204 5.461 5.702 5.655 6.391 6.61 7.031 7.421 7.793 7.968 8.316 8.673 9.189 9.512 9.826 10.291 10.735 11.152 11.56 11.978 12.524 13.053 13.558 14.171 14.76 15.327 15.997 16.746 17.5 18.342 19.258 20.252 21.326 22.523 23.891 25.323 27.059 28.971 31.206 33.877 37.077 40.793 45.198 48.716 50.527 51.567 52.254 52.673 52.879 52.955 52.953 52.876 52.714 52.511 52.314 52.129 51.927 51.721 51.509 51.32 51.13 50.92 50.711 50.519 50.315 50.11 49.934 49.742 49.544 49.344 49.104 48.931 48.762 48.47 48.273 48.075 47.973 47.774 47.549 47.28 47.145 46.539 46.745 46.595 46.412 45.97 45.709 45.445 45.146 44.777 44.306 43.579 41.069 -2 ,14038 ,TETRA ,17526379,Thu Nov 25 03:36:52 CET,Thu Nov 25 05:28:28 CET,0.0 2.286 2.998 3.535 3.957 4.326 4.655 4.928 5.476 5.759 6.015 5.961 6.685 6.9 7.322 7.72 8.104 8.292 8.669 9.031 9.54 9.875 10.189 10.641 11.11 11.565 11.999 12.42 12.958 13.5 14.021 14.648 15.257 15.824 16.479 17.222 17.975 18.828 19.734 20.699 21.764 22.959 24.334 25.814 27.551 29.578 31.986 34.563 37.608 41.357 45.698 49.027 50.918 51.963 52.522 52.774 52.842 52.847 52.782 52.616 52.421 52.257 52.085 51.878 51.665 51.457 51.224 51.009 50.827 50.63 50.395 50.181 49.957 49.727 49.551 49.372 49.181 48.971 48.745 48.592 48.426 48.13 47.932 47.76 47.661 47.435 47.185 46.897 46.753 46.137 46.303 46.147 45.99 45.599 45.376 45.135 44.83 44.468 44.002 43.368 40.941 -3 ,8470 ,TETRA ,17526380,Thu Nov 25 03:36:53 CET,Thu Nov 25 05:28:26 CET,0.0 1.819 2.465 2.983 3.407 3.794 4.176 4.508 5.047 5.29 5.534 5.494 6.223 6.441 6.88 7.292 7.676 7.862 8.211 8.558 9.058 9.377 9.7 10.188 10.658 11.12 11.569 11.981 12.528 13.084 13.621 14.288 14.928 15.506 16.167 16.957 17.737 18.574 19.487 20.475 21.541 22.792 24.24 25.705 27.443 29.394 31.696 34.339 37.452 41.051 45.386 48.796 50.538 51.552 52.195 52.544 52.687 52.662 52.551 52.435 52.306 52.133 51.96 51.779 51.556 51.338 51.132 50.96 50.771 50.538 50.3 50.116 49.92 49.691 49.503 49.298 49.081 48.859 48.617 48.45 48.277 48.009 47.823 47.603 47.49 47.273 47.033 46.763 46.621 46.0 46.165 46.006 45.802 45.35 45.11 44.838 44.537 44.21 43.766 43.163 41.526 -4 ,8257 ,TETRA ,17526381,Thu Nov 25 03:36:56 CET,Thu Nov 25 05:28:26 CET,0.0 1.353 1.921 2.34 2.721 3.096 3.429 3.715 4.248 4.519 4.769 4.707 5.435 5.653 6.08 6.487 6.886 7.076 7.437 7.79 8.307 8.628 8.931 9.395 9.839 10.262 10.665 11.065 11.605 12.136 12.645 13.259 13.862 14.446 15.115 15.893 16.654 17.472 18.383 19.369 20.414 21.603 23.066 24.542 26.241 28.211 30.482 33.068 36.186 39.903 44.256 47.617 49.397 50.334 50.853 51.172 51.335 51.367 51.3 51.119 50.923 50.737 50.555 50.36 50.153 49.956 49.734 49.516 49.333 49.153 48.94 48.753 48.558 48.347 48.181 48.001 47.815 47.611 47.384 47.225 47.042 46.76 46.581 46.402 46.302 46.086 45.856 45.581 45.436 44.82 44.955 44.768 44.581 44.15 43.891 43.609 43.301 42.935 42.469 41.796 39.936 -5 ,10272 ,TETRA ,17526382,Thu Nov 25 03:36:57 CET,Thu Nov 25 05:28:39 CET,0.0 1.701 2.323 2.837 3.256 3.617 3.97 4.275 4.797 5.047 5.302 5.294 6.037 6.264 6.699 7.096 7.463 7.658 8.034 8.385 8.9 9.226 9.559 10.052 10.515 10.952 11.372 11.783 12.308 12.825 13.337 13.944 14.512 15.064 15.747 16.535 17.304 18.192 19.173 20.199 21.237 22.399 23.819 25.322 27.085 29.071 31.408 34.014 37.046 40.656 45.095 48.669 50.584 51.712 52.243 52.488 52.612 52.646 52.595 52.465 52.352 52.229 52.048 51.834 51.598 51.393 51.175 50.95 50.763 50.554 50.324 50.136 49.936 49.714 49.544 49.381 49.214 49.029 48.815 48.65 48.475 48.175 47.966 47.771 47.666 47.439 47.188 46.931 46.802 46.19 46.351 46.185 46.007 45.591 45.351 45.095 44.806 44.457 43.979 43.321 41.062 -6 ,12655 ,TETRA ,17526383,Thu Nov 25 03:36:52 CET,Thu Nov 25 05:28:53 CET,0.0 1.815 2.46 2.967 3.396 3.782 4.117 4.395 4.902 5.148 5.379 5.307 6.042 6.259 6.656 7.041 7.43 7.62 7.983 8.345 8.868 9.193 9.518 10.007 10.476 10.924 11.35 11.775 12.334 12.878 13.41 14.046 14.627 15.193 15.874 16.647 17.429 18.29 19.212 20.207 21.243 22.435 23.9 25.43 27.207 29.231 31.601 34.189 37.202 40.828 45.102 48.373 50.205 51.193 51.748 52.074 52.169 52.135 52.049 51.951 51.797 51.606 51.432 51.271 51.08 50.875 50.634 50.406 50.216 50.015 49.793 49.597 49.379 49.145 48.979 48.808 48.611 48.397 48.182 48.027 47.856 47.585 47.38 47.16 47.056 46.841 46.602 46.325 46.183 45.565 45.705 45.532 45.338 44.872 44.616 44.316 43.987 43.633 43.176 42.599 40.826 -7 ,32353 ,TETRA ,17526384,Thu Nov 25 03:36:54 CET,Thu Nov 25 05:28:50 CET,0.0 2.083 2.761 3.256 3.694 4.064 4.397 4.724 5.294 5.54 5.778 5.738 6.476 6.686 7.083 7.49 7.888 8.08 8.446 8.791 9.295 9.621 9.943 10.41 10.856 11.276 11.687 12.096 12.633 13.158 13.649 14.247 14.857 15.451 16.121 16.878 17.617 18.449 19.379 20.389 21.472 22.698 24.133 25.607 27.353 29.328 31.608 34.236 37.366 41.107 45.463 48.616 50.296 51.307 51.862 52.115 52.235 52.264 52.2 52.08 51.944 51.781 51.577 51.396 51.221 51.041 50.831 50.622 50.452 50.286 50.091 49.902 49.693 49.469 49.3 49.117 48.916 48.716 48.5 48.346 48.185 47.914 47.72 47.536 47.436 47.195 46.957 46.691 46.544 45.921 46.057 45.887 45.698 45.291 45.064 44.8 44.454 44.074 43.661 42.986 40.28 -9 ,9761 ,TETRA ,17526386,Thu Nov 25 03:36:55 CET,Thu Nov 25 05:28:49 CET,0.0 1.52 2.133 2.634 3.035 3.402 3.743 4.041 4.563 4.815 5.062 5.006 5.731 5.951 6.369 6.759 7.157 7.352 7.716 8.071 8.598 8.943 9.273 9.732 10.169 10.598 11.038 11.462 11.986 12.508 13.019 13.621 14.21 14.8 15.487 16.256 17.014 17.87 18.807 19.817 20.889 22.089 23.5 24.928 26.644 28.625 30.919 33.535 36.709 40.433 44.707 48.02 49.648 50.572 51.097 51.418 51.576 51.561 51.482 51.382 51.227 51.037 50.874 50.702 50.524 50.358 50.119 49.872 49.691 49.507 49.274 49.074 48.865 48.633 48.464 48.292 48.117 47.918 47.686 47.524 47.34 47.028 46.805 46.57 46.456 46.205 45.945 45.675 45.526 44.902 45.025 44.836 44.639 44.249 44.009 43.732 43.453 43.119 42.709 42.105 39.907 -10 ,29406 ,TETRA ,17526387,Thu Nov 25 03:36:53 CET,Thu Nov 25 05:26:10 CET,0.0 1.964 2.548 3.004 3.441 3.835 4.161 4.465 5.052 5.317 5.56 5.531 6.276 6.497 6.934 7.344 7.739 7.934 8.312 8.668 9.151 9.466 9.782 10.229 10.663 11.11 11.54 11.966 12.525 13.058 13.579 14.209 14.817 15.397 16.07 16.815 17.547 18.396 19.314 20.305 21.362 22.573 23.992 25.387 27.086 29.051 31.313 33.901 36.946 40.499 44.901 48.286 50.028 51.057 51.66 51.995 52.078 52.046 51.996 51.899 51.777 51.622 51.446 51.278 51.102 50.936 50.716 50.485 50.309 50.123 49.926 49.751 49.55 49.341 49.172 48.975 48.76 48.539 48.303 48.125 47.946 47.663 47.469 47.259 47.15 46.946 46.719 46.477 46.346 45.739 45.916 45.755 45.563 45.076 44.793 44.493 44.172 43.821 43.381 42.748 40.78 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt deleted file mode 100644 index 61540a7a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1h1s_1oiy.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,24328 ,TETRA ,17526390,Thu Nov 25 03:37:22 CET,Thu Nov 25 05:27:40 CET,0.0 1.04 1.7 2.19 2.611 2.983 3.319 3.628 4.244 4.551 4.837 4.877 5.648 5.9 6.396 6.89 7.369 7.604 8.07 8.537 9.236 9.682 10.118 10.76 11.393 12.031 12.665 13.284 14.082 14.873 15.67 16.662 17.634 18.583 19.736 21.083 22.376 23.796 25.344 27.032 28.852 30.983 33.567 36.279 39.612 43.525 48.294 53.897 60.816 69.688 81.734 93.13 100.617 106.026 110.108 113.313 115.852 117.92 119.518 120.979 122.138 123.102 123.943 124.652 125.255 125.781 126.293 126.695 127.011 127.318 127.606 127.837 128.066 128.279 128.418 128.531 128.637 128.752 128.863 128.915 128.96 129.036 129.081 129.111 129.122 129.143 129.144 129.124 129.112 128.731 129.045 129.002 128.953 128.808 128.685 128.55 128.413 128.231 128.0 127.651 126.283 -4 ,29999 ,TETRA ,17526391,Thu Nov 25 03:37:21 CET,Thu Nov 25 05:28:47 CET,0.0 0.76 1.232 1.625 1.965 2.3 2.619 2.922 3.518 3.809 4.101 4.145 4.913 5.169 5.68 6.173 6.649 6.879 7.339 7.804 8.512 8.983 9.436 10.097 10.747 11.379 12.001 12.626 13.456 14.264 15.054 16.043 17.004 17.948 19.078 20.352 21.603 23.014 24.603 26.385 28.311 30.482 33.105 35.871 39.211 43.108 47.803 53.371 60.273 69.133 81.167 92.468 99.992 105.431 109.492 112.683 115.158 117.168 118.755 120.215 121.381 122.315 123.121 123.844 124.472 125.01 125.536 125.964 126.313 126.641 126.945 127.184 127.405 127.612 127.764 127.893 128.006 128.125 128.235 128.298 128.354 128.423 128.469 128.503 128.506 128.506 128.5 128.476 128.459 128.059 128.344 128.292 128.215 128.046 127.951 127.835 127.693 127.49 127.223 126.854 125.851 -5 ,11401 ,TETRA ,17526392,Thu Nov 25 03:37:24 CET,Thu Nov 25 05:29:10 CET,0.0 1.305 1.846 2.316 2.746 3.16 3.528 3.867 4.483 4.778 5.07 5.098 5.872 6.141 6.661 7.167 7.663 7.91 8.405 8.887 9.602 10.078 10.543 11.213 11.855 12.481 13.101 13.719 14.546 15.354 16.147 17.132 18.099 19.062 20.201 21.488 22.762 24.22 25.86 27.647 29.515 31.665 34.307 37.091 40.45 44.341 49.099 54.794 61.842 70.754 82.658 93.931 101.496 106.919 110.922 114.093 116.589 118.621 120.211 121.674 122.852 123.809 124.627 125.35 125.986 126.522 127.04 127.488 127.859 128.193 128.494 128.731 128.979 129.211 129.362 129.492 129.609 129.729 129.837 129.899 129.96 130.051 130.089 130.11 130.12 130.131 130.136 130.137 130.125 129.734 130.045 130.0 129.952 129.842 129.765 129.663 129.52 129.341 129.125 128.763 127.617 -6 ,9735 ,TETRA ,17526393,Thu Nov 25 03:37:25 CET,Thu Nov 25 05:29:42 CET,0.0 0.993 1.511 1.942 2.337 2.696 3.031 3.35 3.943 4.238 4.523 4.56 5.34 5.598 6.091 6.579 7.062 7.295 7.746 8.196 8.873 9.323 9.77 10.437 11.081 11.711 12.332 12.946 13.758 14.56 15.348 16.307 17.267 18.219 19.34 20.634 21.899 23.335 24.958 26.699 28.551 30.721 33.377 36.155 39.48 43.409 48.155 53.725 60.676 69.525 81.423 92.656 100.229 105.721 109.829 113.043 115.52 117.525 119.099 120.541 121.687 122.634 123.458 124.17 124.807 125.354 125.879 126.311 126.656 126.991 127.306 127.543 127.756 127.96 128.105 128.251 128.407 128.534 128.629 128.688 128.746 128.814 128.853 128.888 128.904 128.914 128.906 128.868 128.841 128.45 128.761 128.726 128.656 128.455 128.336 128.195 128.044 127.869 127.661 127.347 126.275 -7 ,12774 ,TETRA ,17526394,Thu Nov 25 03:37:27 CET,Thu Nov 25 05:29:20 CET,0.0 0.945 1.495 1.92 2.332 2.7 3.031 3.334 3.908 4.199 4.487 4.525 5.31 5.562 6.048 6.549 7.051 7.296 7.77 8.238 8.923 9.377 9.826 10.485 11.14 11.788 12.424 13.049 13.874 14.687 15.492 16.488 17.447 18.387 19.505 20.802 22.098 23.549 25.149 26.931 28.877 31.07 33.675 36.452 39.828 43.701 48.4 54.001 60.954 69.869 81.93 93.155 100.672 106.135 110.19 113.392 115.923 117.991 119.608 121.081 122.232 123.18 124.016 124.726 125.309 125.819 126.335 126.754 127.095 127.428 127.743 127.99 128.222 128.428 128.577 128.735 128.877 128.991 129.099 129.163 129.221 129.309 129.356 129.387 129.394 129.41 129.43 129.431 129.414 129.009 129.304 129.272 129.231 129.104 129.019 128.899 128.746 128.598 128.367 127.951 126.947 -8 ,2465 ,TETRA ,17526395,Thu Nov 25 03:37:21 CET,Thu Nov 25 05:29:01 CET,0.0 0.794 1.23 1.649 2.047 2.399 2.711 3.019 3.615 3.909 4.203 4.257 5.034 5.291 5.799 6.307 6.793 7.032 7.517 7.996 8.684 9.129 9.58 10.256 10.886 11.482 12.08 12.687 13.503 14.305 15.086 16.046 16.989 17.914 19.028 20.32 21.587 23.011 24.6 26.342 28.249 30.482 33.142 35.885 39.208 43.103 47.822 53.401 60.419 69.418 81.288 92.532 100.163 105.641 109.717 112.954 115.467 117.487 119.085 120.561 121.71 122.638 123.477 124.223 124.866 125.405 125.92 126.355 126.711 127.062 127.396 127.636 127.867 128.091 128.251 128.394 128.529 128.664 128.776 128.845 128.912 128.962 128.978 129.0 129.007 129.002 128.97 128.92 128.894 128.489 128.782 128.735 128.667 128.506 128.418 128.299 128.159 127.971 127.711 127.344 126.172 -10 ,16055 ,TETRA ,17526397,Thu Nov 25 03:37:25 CET,Thu Nov 25 05:29:02 CET,0.0 0.639 1.134 1.557 1.905 2.228 2.538 2.832 3.405 3.686 3.965 3.983 4.749 5.009 5.527 6.024 6.505 6.744 7.223 7.689 8.36 8.79 9.221 9.876 10.529 11.165 11.771 12.372 13.168 13.95 14.744 15.715 16.643 17.559 18.666 19.951 21.223 22.664 24.268 26.013 27.91 30.134 32.819 35.621 38.966 42.812 47.502 53.091 60.092 68.987 80.835 92.121 99.652 105.111 109.259 112.485 114.986 117.024 118.63 120.108 121.242 122.196 123.065 123.814 124.456 124.995 125.507 125.913 126.254 126.59 126.904 127.153 127.397 127.623 127.781 127.938 128.084 128.22 128.355 128.442 128.525 128.609 128.643 128.674 128.678 128.687 128.682 128.649 128.624 128.221 128.515 128.459 128.38 128.188 128.066 127.942 127.811 127.617 127.37 127.046 125.96 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 1eb35277..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1oi9_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,28197 ,TETRA ,17526400,Thu Nov 25 03:37:23 CET,Thu Nov 25 05:26:42 CET,0.0 0.83 1.214 1.5 1.74 1.97 2.19 2.381 2.717 2.869 3.012 2.97 3.435 3.568 3.813 4.035 4.243 4.35 4.562 4.761 5.029 5.197 5.365 5.61 5.84 6.059 6.274 6.491 6.767 7.03 7.292 7.62 7.928 8.209 8.524 8.886 9.247 9.646 10.085 10.549 11.033 11.577 12.201 12.833 13.582 14.427 15.38 16.429 17.681 19.163 20.839 21.96 22.498 22.774 22.883 22.868 22.789 22.712 22.622 22.474 22.31 22.172 22.028 21.875 21.731 21.598 21.439 21.268 21.12 20.962 20.793 20.657 20.518 20.376 20.264 20.144 20.011 19.85 19.671 19.548 19.43 19.26 19.12 18.955 18.877 18.724 18.565 18.39 18.303 17.905 17.978 17.865 17.75 17.466 17.296 17.12 16.932 16.694 16.405 15.916 14.256 -7 ,30867 ,TETRA ,17526405,Thu Nov 25 03:37:26 CET,Thu Nov 25 05:27:02 CET,0.0 0.968 1.418 1.755 2.037 2.301 2.526 2.705 3.043 3.207 3.361 3.314 3.764 3.894 4.151 4.396 4.622 4.721 4.906 5.088 5.354 5.529 5.701 5.963 6.209 6.444 6.668 6.875 7.143 7.399 7.647 7.946 8.237 8.525 8.868 9.246 9.594 9.976 10.387 10.826 11.292 11.818 12.434 13.076 13.834 14.666 15.638 16.718 17.918 19.261 20.784 21.908 22.457 22.684 22.739 22.732 22.672 22.574 22.465 22.323 22.182 22.042 21.894 21.746 21.595 21.444 21.272 21.115 20.974 20.826 20.669 20.532 20.369 20.186 20.044 19.906 19.76 19.609 19.454 19.336 19.215 19.019 18.876 18.72 18.642 18.485 18.319 18.129 18.026 17.626 17.698 17.575 17.442 17.135 16.966 16.803 16.613 16.359 16.047 15.612 14.73 -8 ,12102 ,TETRA ,17526406,Thu Nov 25 03:37:27 CET,Thu Nov 25 05:27:35 CET,0.0 1.106 1.543 1.863 2.098 2.31 2.51 2.703 3.059 3.227 3.387 3.335 3.784 3.908 4.154 4.38 4.586 4.684 4.876 5.082 5.367 5.535 5.701 5.94 6.165 6.377 6.597 6.814 7.098 7.369 7.623 7.934 8.236 8.532 8.868 9.244 9.606 9.996 10.422 10.885 11.382 11.942 12.6 13.275 14.061 14.902 15.866 16.984 18.245 19.616 21.114 22.205 22.716 22.942 22.964 22.903 22.827 22.728 22.629 22.514 22.388 22.243 22.083 21.919 21.763 21.617 21.457 21.305 21.178 21.056 20.921 20.791 20.641 20.485 20.369 20.255 20.13 19.981 19.835 19.742 19.637 19.474 19.358 19.223 19.15 18.993 18.832 18.664 18.579 18.179 18.271 18.17 18.068 17.825 17.678 17.513 17.305 17.073 16.827 16.431 15.132 -9 ,32380 ,TETRA ,17526407,Thu Nov 25 03:37:29 CET,Thu Nov 25 05:27:25 CET,0.0 0.973 1.381 1.734 2.039 2.307 2.553 2.762 3.117 3.278 3.425 3.373 3.822 3.94 4.162 4.38 4.604 4.711 4.914 5.11 5.387 5.569 5.743 5.998 6.245 6.479 6.696 6.899 7.172 7.436 7.686 7.994 8.29 8.558 8.873 9.232 9.566 9.932 10.344 10.792 11.269 11.823 12.466 13.117 13.858 14.638 15.541 16.58 17.747 19.081 20.671 21.826 22.371 22.663 22.784 22.767 22.699 22.598 22.474 22.353 22.224 22.079 21.913 21.753 21.629 21.508 21.345 21.187 21.047 20.9 20.746 20.609 20.467 20.312 20.186 20.065 19.939 19.795 19.646 19.538 19.419 19.234 19.101 18.952 18.874 18.728 18.581 18.411 18.315 17.919 18.03 17.927 17.813 17.552 17.411 17.261 17.08 16.871 16.602 16.193 15.237 -10 ,6054 ,TETRA ,17526408,Thu Nov 25 03:37:24 CET,Thu Nov 25 05:28:02 CET,0.0 0.954 1.386 1.743 2.032 2.263 2.475 2.672 3.017 3.173 3.325 3.287 3.739 3.873 4.125 4.357 4.581 4.685 4.884 5.073 5.358 5.554 5.734 5.973 6.21 6.437 6.643 6.845 7.099 7.345 7.592 7.891 8.177 8.448 8.77 9.131 9.478 9.869 10.284 10.726 11.197 11.717 12.347 12.991 13.719 14.528 15.433 16.467 17.706 19.11 20.656 21.742 22.239 22.446 22.525 22.516 22.453 22.367 22.265 22.135 22.0 21.856 21.712 21.569 21.42 21.274 21.116 20.981 20.867 20.74 20.602 20.476 20.334 20.196 20.086 19.962 19.84 19.706 19.563 19.46 19.337 19.141 19.016 18.888 18.816 18.667 18.517 18.355 18.266 17.872 17.981 17.872 17.755 17.515 17.379 17.211 17.008 16.774 16.467 16.031 15.25 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 3db8eae3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1oiu_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,1363 ,TETRA ,17526410,Thu Nov 25 03:37:27 CET,Thu Nov 25 05:28:15 CET,0.0 1.061 1.661 2.158 2.581 2.978 3.344 3.686 4.337 4.63 4.912 4.991 5.738 6.019 6.56 7.082 7.596 7.847 8.342 8.822 9.526 9.992 10.448 11.121 11.782 12.443 13.101 13.749 14.61 15.453 16.274 17.29 18.313 19.342 20.562 21.959 23.322 24.848 26.539 28.391 30.408 32.758 35.573 38.483 42.027 46.233 51.295 57.27 64.71 74.21 87.036 99.134 107.241 113.105 117.463 120.909 123.595 125.726 127.401 128.928 130.114 131.1 131.99 132.762 133.442 134.021 134.557 135.003 135.347 135.657 135.964 136.208 136.436 136.643 136.787 136.936 137.081 137.201 137.314 137.387 137.45 137.544 137.591 137.601 137.595 137.579 137.547 137.505 137.487 137.158 137.383 137.326 137.256 137.05 136.906 136.732 136.548 136.348 136.054 135.658 133.622 -4 ,18928 ,TETRA ,17526412,Thu Nov 25 03:37:25 CET,Thu Nov 25 05:28:45 CET,0.0 1.227 1.753 2.178 2.56 2.937 3.307 3.629 4.228 4.522 4.804 4.884 5.629 5.895 6.421 6.932 7.428 7.677 8.164 8.633 9.324 9.79 10.256 10.931 11.596 12.261 12.926 13.587 14.439 15.285 16.121 17.143 18.158 19.16 20.364 21.778 23.173 24.71 26.4 28.285 30.334 32.73 35.625 38.617 42.243 46.46 51.599 57.765 65.383 75.063 88.189 100.521 108.654 114.449 118.747 122.114 124.748 126.923 128.645 130.206 131.46 132.459 133.311 134.08 134.742 135.297 135.813 136.233 136.57 136.904 137.224 137.461 137.693 137.911 138.065 138.203 138.332 138.458 138.581 138.654 138.719 138.782 138.799 138.828 138.837 138.838 138.814 138.762 138.731 138.387 138.607 138.546 138.478 138.318 138.19 138.03 137.845 137.597 137.228 136.696 134.467 -6 ,22233 ,TETRA ,17526414,Thu Nov 25 03:37:29 CET,Thu Nov 25 05:27:44 CET,0.0 1.34 1.896 2.354 2.728 3.076 3.41 3.75 4.39 4.682 4.972 5.084 5.842 6.116 6.639 7.142 7.642 7.889 8.381 8.875 9.611 10.087 10.546 11.22 11.887 12.558 13.232 13.888 14.729 15.56 16.402 17.425 18.42 19.427 20.623 21.992 23.337 24.859 26.56 28.417 30.417 32.721 35.523 38.487 42.054 46.19 51.267 57.422 65.007 74.627 87.595 99.626 107.636 113.386 117.702 121.089 123.723 125.863 127.565 129.143 130.376 131.377 132.262 133.055 133.733 134.295 134.852 135.313 135.686 136.045 136.393 136.66 136.914 137.154 137.32 137.476 137.61 137.718 137.818 137.873 137.909 137.964 137.999 138.02 138.019 137.991 137.964 137.947 137.926 137.583 137.8 137.74 137.662 137.462 137.322 137.178 137.008 136.779 136.431 135.902 133.953 -9 ,16665 ,TETRA ,17526417,Thu Nov 25 03:37:28 CET,Thu Nov 25 05:26:38 CET,0.0 1.127 1.654 2.08 2.488 2.881 3.229 3.544 4.16 4.46 4.76 4.874 5.612 5.876 6.404 6.923 7.436 7.687 8.172 8.65 9.358 9.823 10.277 10.94 11.605 12.266 12.921 13.567 14.414 15.254 16.092 17.116 18.113 19.112 20.306 21.662 23.009 24.526 26.183 28.013 30.034 32.389 35.211 38.184 41.789 45.918 50.932 56.988 64.577 74.334 87.465 99.6 107.684 113.547 117.922 121.299 123.886 126.01 127.666 129.197 130.422 131.427 132.32 133.065 133.686 134.22 134.748 135.18 135.517 135.849 136.18 136.435 136.685 136.9 137.046 137.189 137.315 137.44 137.556 137.616 137.657 137.718 137.748 137.763 137.77 137.784 137.761 137.702 137.671 137.321 137.525 137.459 137.395 137.232 137.095 136.922 136.726 136.446 136.094 135.585 133.286 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt deleted file mode 100644 index 7cfb18f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_1oiy_1oi9.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1822 ,TETRA ,17526420,Thu Nov 25 03:37:32 CET,Thu Nov 25 05:27:41 CET,0.0 0.804 1.231 1.606 1.897 2.144 2.397 2.638 3.044 3.221 3.393 3.368 3.898 4.05 4.354 4.639 4.911 5.044 5.301 5.554 5.912 6.137 6.365 6.697 7.006 7.316 7.62 7.916 8.304 8.682 9.059 9.531 10.005 10.444 10.945 11.534 12.112 12.78 13.538 14.379 15.247 16.184 17.312 18.479 19.886 21.515 23.443 25.699 28.491 31.978 36.376 40.299 42.725 44.345 45.495 46.322 46.829 47.155 47.426 47.645 47.735 47.738 47.739 47.751 47.71 47.641 47.561 47.478 47.39 47.293 47.2 47.132 47.042 46.915 46.814 46.713 46.614 46.504 46.375 46.292 46.203 46.041 45.919 45.792 45.72 45.56 45.396 45.22 45.115 44.678 44.757 44.626 44.489 44.176 43.997 43.793 43.57 43.304 42.967 42.477 41.094 -2 ,14471 ,TETRA ,17526421,Thu Nov 25 03:37:53 CET,Thu Nov 25 05:28:37 CET,0.0 0.816 1.311 1.681 1.964 2.215 2.436 2.65 3.055 3.238 3.426 3.413 3.953 4.117 4.445 4.761 5.047 5.189 5.483 5.767 6.163 6.403 6.63 6.958 7.271 7.591 7.916 8.226 8.626 9.017 9.386 9.86 10.329 10.781 11.305 11.891 12.469 13.108 13.821 14.588 15.399 16.335 17.473 18.665 20.073 21.676 23.619 25.893 28.66 32.103 36.477 40.262 42.628 44.183 45.195 45.956 46.545 46.971 47.273 47.545 47.732 47.828 47.873 47.881 47.845 47.817 47.793 47.731 47.679 47.633 47.542 47.442 47.34 47.233 47.153 47.049 46.906 46.739 46.573 46.474 46.369 46.208 46.091 45.958 45.887 45.731 45.555 45.356 45.247 44.809 44.883 44.759 44.627 44.322 44.139 43.961 43.765 43.49 43.128 42.588 40.738 -3 ,11252 ,TETRA ,17526422,Thu Nov 25 03:37:54 CET,Thu Nov 25 05:28:24 CET,0.0 0.829 1.27 1.616 1.905 2.146 2.369 2.592 3.009 3.195 3.366 3.314 3.846 4.004 4.289 4.558 4.829 4.967 5.241 5.495 5.866 6.122 6.37 6.72 7.067 7.406 7.731 8.044 8.464 8.884 9.296 9.787 10.253 10.698 11.232 11.852 12.435 13.074 13.781 14.549 15.371 16.317 17.459 18.642 20.051 21.682 23.627 25.936 28.735 32.169 36.541 40.336 42.715 44.286 45.291 46.032 46.617 47.041 47.328 47.571 47.733 47.794 47.809 47.829 47.832 47.822 47.805 47.774 47.738 47.685 47.603 47.527 47.442 47.33 47.241 47.161 47.063 46.949 46.817 46.702 46.575 46.378 46.229 46.072 45.997 45.828 45.631 45.412 45.29 44.849 44.916 44.779 44.648 44.372 44.2 43.977 43.724 43.423 43.044 42.53 41.224 -7 ,16548 ,TETRA ,17526426,Thu Nov 25 03:37:55 CET,Thu Nov 25 05:26:32 CET,0.0 0.834 1.253 1.605 1.904 2.179 2.441 2.687 3.137 3.353 3.557 3.529 4.054 4.213 4.529 4.835 5.127 5.267 5.541 5.79 6.157 6.409 6.65 6.993 7.327 7.653 7.974 8.284 8.685 9.079 9.464 9.941 10.405 10.856 11.407 12.051 12.663 13.327 14.057 14.85 15.705 16.678 17.834 19.041 20.498 22.15 24.113 26.425 29.196 32.607 37.037 40.981 43.403 44.954 46.026 46.843 47.43 47.86 48.087 48.197 48.295 48.389 48.462 48.5 48.513 48.491 48.445 48.4 48.347 48.269 48.171 48.087 47.986 47.864 47.769 47.676 47.556 47.408 47.244 47.125 47.024 46.877 46.766 46.64 46.569 46.41 46.221 45.986 45.862 45.424 45.49 45.352 45.203 44.871 44.685 44.49 44.284 44.052 43.754 43.285 41.78 -9 ,14303 ,TETRA ,17526428,Thu Nov 25 03:37:59 CET,Thu Nov 25 05:29:04 CET,0.0 0.899 1.333 1.653 1.933 2.189 2.424 2.646 3.051 3.24 3.424 3.399 3.936 4.102 4.431 4.743 5.034 5.173 5.448 5.72 6.109 6.365 6.608 6.948 7.28 7.604 7.914 8.223 8.644 9.05 9.437 9.915 10.378 10.826 11.353 11.948 12.529 13.18 13.919 14.736 15.583 16.556 17.709 18.903 20.386 22.091 24.071 26.312 29.059 32.538 36.912 40.69 43.088 44.735 45.762 46.405 46.852 47.203 47.487 47.709 47.86 47.96 48.009 47.993 47.93 47.884 47.837 47.781 47.718 47.655 47.562 47.454 47.349 47.228 47.112 46.981 46.845 46.711 46.562 46.445 46.323 46.14 46.004 45.867 45.794 45.619 45.428 45.214 45.096 44.652 44.726 44.579 44.431 44.12 43.928 43.696 43.428 43.096 42.699 42.219 40.847 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_20_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_20_17.txt deleted file mode 100644 index 87c7160e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_20_17.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,6619 ,TETRA ,17526432,Thu Nov 25 03:37:58 CET,Thu Nov 25 05:27:51 CET,0.0 1.056 1.533 1.891 2.217 2.517 2.746 2.935 3.313 3.489 3.642 3.63 4.101 4.241 4.499 4.751 4.987 5.094 5.321 5.544 5.834 6.014 6.19 6.436 6.68 6.923 7.149 7.359 7.626 7.883 8.133 8.433 8.708 8.972 9.293 9.646 9.971 10.316 10.695 11.102 11.525 11.992 12.525 13.055 13.644 14.271 14.984 15.695 16.409 17.185 17.87 18.027 17.832 17.481 17.095 16.686 16.252 15.821 15.442 15.038 14.669 14.343 14.037 13.754 13.488 13.236 12.96 12.707 12.49 12.245 11.982 11.777 11.557 11.326 11.151 10.97 10.777 10.566 10.339 10.18 10.008 9.732 9.55 9.364 9.267 9.055 8.837 8.611 8.492 8.064 8.099 7.944 7.784 7.454 7.274 7.072 6.844 6.571 6.256 5.851 4.774 -5 ,24485 ,TETRA ,17526434,Thu Nov 25 03:37:56 CET,Thu Nov 25 05:29:13 CET,0.0 1.041 1.552 1.933 2.236 2.467 2.68 2.886 3.271 3.448 3.612 3.603 4.058 4.193 4.432 4.638 4.84 4.941 5.137 5.321 5.579 5.747 5.905 6.126 6.34 6.55 6.769 6.984 7.252 7.499 7.734 8.007 8.265 8.53 8.847 9.205 9.529 9.868 10.252 10.662 11.079 11.541 12.085 12.641 13.194 13.759 14.461 15.208 15.976 16.792 17.49 17.7 17.577 17.293 16.924 16.509 16.116 15.734 15.38 15.005 14.685 14.402 14.122 13.86 13.601 13.345 13.083 12.871 12.682 12.465 12.237 12.037 11.827 11.619 11.45 11.282 11.11 10.921 10.705 10.552 10.397 10.14 9.959 9.767 9.666 9.467 9.267 9.036 8.9 8.457 8.478 8.323 8.164 7.82 7.625 7.403 7.167 6.884 6.563 6.155 4.975 -7 ,11506 ,TETRA ,17526436,Thu Nov 25 03:38:00 CET,Thu Nov 25 05:28:37 CET,0.0 1.076 1.541 1.892 2.172 2.424 2.647 2.87 3.291 3.483 3.654 3.632 4.093 4.226 4.468 4.684 4.884 4.989 5.201 5.39 5.65 5.812 5.965 6.186 6.4 6.602 6.806 7.023 7.299 7.548 7.786 8.078 8.349 8.615 8.926 9.257 9.566 9.909 10.3 10.727 11.157 11.615 12.142 12.67 13.257 13.915 14.68 15.473 16.273 17.039 17.722 17.903 17.713 17.401 17.046 16.656 16.273 15.901 15.545 15.162 14.825 14.533 14.254 13.98 13.711 13.457 13.195 12.952 12.732 12.515 12.293 12.105 11.9 11.678 11.503 11.321 11.127 10.917 10.707 10.564 10.407 10.166 9.997 9.814 9.715 9.513 9.303 9.071 8.946 8.516 8.562 8.407 8.244 7.902 7.711 7.496 7.238 6.959 6.642 6.247 5.164 -8 ,8926 ,TETRA ,17526437,Thu Nov 25 03:37:54 CET,Thu Nov 25 05:28:26 CET,0.0 1.371 1.862 2.197 2.457 2.695 2.901 3.099 3.487 3.656 3.812 3.769 4.209 4.329 4.555 4.775 5.002 5.116 5.313 5.493 5.761 5.93 6.088 6.308 6.52 6.726 6.925 7.116 7.368 7.611 7.841 8.127 8.4 8.664 8.975 9.324 9.649 9.983 10.346 10.733 11.136 11.601 12.133 12.661 13.302 14.015 14.807 15.638 16.469 17.238 17.869 18.042 17.834 17.475 17.098 16.718 16.321 15.914 15.572 15.219 14.887 14.593 14.313 14.036 13.77 13.538 13.289 13.051 12.849 12.623 12.373 12.177 11.971 11.742 11.554 11.356 11.156 10.949 10.75 10.619 10.471 10.232 10.057 9.864 9.771 9.593 9.409 9.199 9.086 8.659 8.71 8.574 8.418 8.071 7.884 7.681 7.448 7.166 6.844 6.334 5.283 -9 ,30197 ,TETRA ,17526438,Thu Nov 25 03:37:56 CET,Thu Nov 25 05:28:33 CET,0.0 1.643 2.195 2.601 2.911 3.172 3.421 3.622 3.922 4.069 4.22 4.176 4.625 4.75 4.987 5.212 5.421 5.523 5.727 5.927 6.229 6.427 6.605 6.845 7.083 7.31 7.525 7.738 7.998 8.239 8.483 8.78 9.061 9.319 9.609 9.955 10.279 10.615 10.98 11.367 11.756 12.205 12.734 13.25 13.819 14.404 15.11 15.879 16.615 17.368 18.11 18.351 18.219 17.928 17.538 17.108 16.723 16.328 15.956 15.58 15.235 14.918 14.615 14.304 14.008 13.745 13.475 13.231 13.01 12.787 12.55 12.335 12.109 11.888 11.708 11.519 11.329 11.13 10.916 10.761 10.605 10.363 10.196 10.002 9.901 9.701 9.477 9.243 9.123 8.691 8.716 8.573 8.423 8.047 7.83 7.618 7.401 7.149 6.844 6.436 5.679 -10 ,24373 ,TETRA ,17526439,Thu Nov 25 03:37:59 CET,Thu Nov 25 05:29:08 CET,0.0 1.277 1.682 2.014 2.271 2.503 2.758 2.98 3.373 3.556 3.712 3.67 4.13 4.273 4.526 4.761 4.977 5.081 5.294 5.496 5.786 5.969 6.144 6.389 6.626 6.848 7.059 7.277 7.552 7.807 8.042 8.314 8.595 8.874 9.173 9.495 9.823 10.184 10.573 10.999 11.418 11.865 12.389 12.919 13.507 14.146 14.899 15.687 16.511 17.369 18.053 18.217 18.054 17.749 17.405 17.024 16.629 16.247 15.909 15.547 15.234 14.967 14.685 14.4 14.14 13.903 13.629 13.366 13.162 12.957 12.718 12.527 12.325 12.091 11.906 11.705 11.503 11.298 11.074 10.921 10.776 10.543 10.367 10.187 10.1 9.929 9.747 9.532 9.417 8.998 9.048 8.899 8.749 8.439 8.259 8.026 7.76 7.483 7.167 6.758 5.48 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_20_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_20_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 2a42e219..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_20_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26602 ,TETRA ,17526440,Thu Nov 25 03:38:00 CET,Thu Nov 25 05:28:36 CET,0.0 1.15 1.528 1.811 2.051 2.269 2.468 2.651 2.948 3.081 3.223 3.167 3.609 3.728 3.941 4.152 4.366 4.464 4.644 4.818 5.077 5.237 5.386 5.594 5.798 6.014 6.215 6.403 6.644 6.869 7.089 7.36 7.626 7.887 8.18 8.488 8.764 9.069 9.392 9.748 10.133 10.523 10.962 11.419 11.958 12.496 13.063 13.712 14.38 14.913 15.263 15.174 14.761 14.271 13.788 13.295 12.826 12.406 12.04 11.653 11.315 10.998 10.68 10.38 10.084 9.821 9.564 9.334 9.126 8.902 8.672 8.475 8.261 8.025 7.849 7.677 7.495 7.293 7.073 6.93 6.781 6.527 6.352 6.162 6.056 5.859 5.656 5.422 5.295 4.846 4.87 4.726 4.573 4.2 4.0 3.799 3.548 3.246 2.883 2.396 1.088 -2 ,30997 ,TETRA ,17526441,Thu Nov 25 03:37:56 CET,Thu Nov 25 05:28:34 CET,0.0 1.404 1.856 2.154 2.398 2.63 2.86 3.066 3.393 3.543 3.699 3.691 4.145 4.263 4.49 4.711 4.916 5.014 5.209 5.404 5.672 5.831 5.989 6.224 6.44 6.646 6.845 7.036 7.283 7.52 7.749 8.04 8.317 8.568 8.845 9.162 9.495 9.868 10.23 10.602 10.986 11.388 11.867 12.332 12.837 13.379 13.984 14.615 15.257 15.858 16.305 16.265 15.846 15.347 14.836 14.357 13.934 13.468 13.024 12.608 12.258 11.924 11.596 11.278 10.977 10.709 10.404 10.112 9.873 9.647 9.403 9.183 8.957 8.731 8.555 8.365 8.167 7.967 7.742 7.575 7.39 7.11 6.922 6.722 6.625 6.443 6.247 6.027 5.909 5.476 5.491 5.326 5.168 4.82 4.603 4.364 4.117 3.857 3.53 3.117 2.063 -3 ,17018 ,TETRA ,17526442,Thu Nov 25 03:38:00 CET,Thu Nov 25 05:28:34 CET,0.0 0.947 1.357 1.669 1.916 2.147 2.34 2.533 2.89 3.037 3.173 3.101 3.539 3.656 3.879 4.084 4.284 4.385 4.583 4.758 4.999 5.152 5.297 5.515 5.725 5.93 6.141 6.328 6.556 6.779 6.988 7.227 7.452 7.675 7.925 8.211 8.486 8.77 9.071 9.403 9.766 10.159 10.6 11.028 11.512 12.054 12.661 13.287 13.933 14.545 14.962 14.874 14.443 13.952 13.454 12.966 12.518 12.077 11.68 11.295 10.965 10.639 10.309 9.991 9.708 9.467 9.191 8.925 8.706 8.476 8.22 8.005 7.794 7.565 7.379 7.191 6.985 6.769 6.561 6.415 6.247 5.993 5.82 5.625 5.521 5.298 5.083 4.862 4.742 4.312 4.349 4.21 4.073 3.735 3.541 3.342 3.127 2.882 2.576 2.178 1.087 -4 ,15122 ,TETRA ,17526443,Thu Nov 25 03:37:57 CET,Thu Nov 25 05:28:33 CET,0.0 1.006 1.54 1.905 2.186 2.432 2.652 2.84 3.185 3.334 3.477 3.42 3.865 3.994 4.228 4.436 4.64 4.739 4.929 5.11 5.371 5.541 5.706 5.938 6.135 6.333 6.537 6.734 6.973 7.178 7.373 7.626 7.879 8.122 8.391 8.685 8.968 9.266 9.595 9.942 10.294 10.697 11.15 11.591 12.094 12.639 13.242 13.823 14.42 15.035 15.52 15.407 15.001 14.556 14.066 13.564 13.093 12.637 12.229 11.804 11.424 11.081 10.75 10.405 10.078 9.801 9.513 9.253 9.025 8.783 8.52 8.301 8.07 7.827 7.647 7.456 7.257 7.059 6.839 6.683 6.514 6.24 6.056 5.881 5.791 5.593 5.387 5.167 5.048 4.608 4.63 4.487 4.324 3.973 3.781 3.565 3.326 3.026 2.656 2.227 1.229 -5 ,24500 ,TETRA ,17526444,Thu Nov 25 03:37:59 CET,Thu Nov 25 05:28:16 CET,0.0 1.278 1.692 1.999 2.225 2.432 2.635 2.817 3.144 3.3 3.45 3.402 3.836 3.951 4.179 4.398 4.605 4.708 4.912 5.107 5.368 5.528 5.687 5.913 6.133 6.352 6.548 6.723 6.946 7.173 7.397 7.667 7.911 8.136 8.402 8.711 9.006 9.315 9.657 10.02 10.386 10.801 11.279 11.764 12.29 12.84 13.443 13.997 14.535 15.078 15.442 15.269 14.826 14.324 13.836 13.327 12.859 12.399 11.976 11.566 11.196 10.842 10.5 10.187 9.903 9.635 9.347 9.078 8.838 8.586 8.318 8.095 7.862 7.636 7.458 7.254 7.035 6.827 6.632 6.495 6.346 6.109 5.946 5.766 5.671 5.463 5.24 5.013 4.894 4.465 4.525 4.397 4.253 3.917 3.739 3.517 3.255 2.965 2.609 2.145 0.883 -6 ,4841 ,TETRA ,17526445,Thu Nov 25 03:37:56 CET,Thu Nov 25 05:28:24 CET,0.0 0.936 1.414 1.78 2.062 2.273 2.47 2.654 2.984 3.129 3.263 3.202 3.645 3.766 4.002 4.207 4.394 4.484 4.671 4.855 5.124 5.288 5.424 5.625 5.826 6.028 6.234 6.423 6.665 6.902 7.127 7.404 7.666 7.909 8.2 8.522 8.822 9.148 9.489 9.86 10.261 10.692 11.184 11.639 12.14 12.698 13.295 13.935 14.632 15.249 15.642 15.561 15.152 14.658 14.166 13.671 13.203 12.782 12.397 11.973 11.613 11.286 10.974 10.677 10.367 10.083 9.797 9.546 9.33 9.103 8.855 8.639 8.417 8.167 7.964 7.762 7.567 7.365 7.151 7.0 6.842 6.596 6.416 6.223 6.129 5.931 5.712 5.474 5.34 4.896 4.904 4.757 4.614 4.276 4.09 3.894 3.676 3.428 3.106 2.712 1.765 -7 ,10458 ,TETRA ,17526446,Thu Nov 25 03:37:58 CET,Thu Nov 25 05:28:23 CET,0.0 1.108 1.555 1.899 2.17 2.388 2.587 2.777 3.114 3.263 3.404 3.34 3.787 3.916 4.143 4.348 4.546 4.651 4.852 5.018 5.262 5.426 5.574 5.779 5.992 6.199 6.383 6.556 6.776 6.995 7.212 7.468 7.706 7.93 8.186 8.473 8.751 9.066 9.41 9.758 10.112 10.492 10.924 11.354 11.837 12.343 12.937 13.571 14.211 14.858 15.267 15.133 14.743 14.285 13.813 13.346 12.931 12.507 12.107 11.722 11.363 11.024 10.721 10.414 10.11 9.836 9.548 9.287 9.053 8.81 8.56 8.348 8.129 7.899 7.718 7.524 7.319 7.102 6.855 6.682 6.512 6.252 6.07 5.874 5.775 5.586 5.381 5.164 5.048 4.613 4.642 4.486 4.33 3.981 3.759 3.531 3.294 3.002 2.66 2.148 0.965 -8 ,24443 ,TETRA ,17526447,Thu Nov 25 03:38:00 CET,Thu Nov 25 05:28:35 CET,0.0 1.001 1.448 1.773 2.043 2.267 2.485 2.691 3.072 3.23 3.375 3.356 3.804 3.929 4.165 4.38 4.597 4.702 4.89 5.062 5.327 5.499 5.655 5.889 6.116 6.328 6.542 6.753 7.007 7.236 7.462 7.742 8.002 8.245 8.529 8.846 9.146 9.473 9.808 10.157 10.524 10.941 11.401 11.828 12.331 12.881 13.466 14.104 14.788 15.409 15.805 15.686 15.318 14.848 14.309 13.793 13.327 12.863 12.457 12.043 11.658 11.297 10.952 10.638 10.331 10.042 9.764 9.499 9.261 9.013 8.745 8.527 8.301 8.07 7.883 7.687 7.485 7.288 7.089 6.942 6.793 6.558 6.383 6.198 6.103 5.906 5.699 5.485 5.373 4.942 4.978 4.841 4.691 4.321 4.118 3.891 3.654 3.403 3.077 2.637 1.594 -9 ,29018 ,TETRA ,17526448,Thu Nov 25 03:38:02 CET,Thu Nov 25 05:28:32 CET,0.0 0.731 1.124 1.411 1.656 1.867 2.069 2.26 2.588 2.731 2.878 2.84 3.286 3.4 3.619 3.837 4.043 4.142 4.325 4.487 4.723 4.873 5.016 5.229 5.439 5.641 5.843 6.045 6.295 6.527 6.76 7.049 7.312 7.563 7.842 8.128 8.401 8.721 9.058 9.402 9.77 10.174 10.618 11.049 11.557 12.112 12.732 13.377 14.033 14.642 14.995 14.83 14.434 13.982 13.476 12.956 12.506 12.082 11.677 11.265 10.911 10.572 10.233 9.915 9.611 9.317 9.033 8.773 8.526 8.278 8.019 7.801 7.583 7.355 7.171 6.981 6.775 6.557 6.326 6.159 5.998 5.771 5.604 5.423 5.327 5.121 4.898 4.657 4.532 4.094 4.112 3.961 3.79 3.406 3.198 2.976 2.731 2.449 2.144 1.743 0.627 -10 ,15059 ,TETRA ,17526449,Thu Nov 25 03:37:57 CET,Thu Nov 25 05:28:15 CET,0.0 0.847 1.303 1.63 1.89 2.127 2.341 2.526 2.873 3.028 3.173 3.139 3.592 3.729 3.955 4.154 4.357 4.452 4.634 4.81 5.069 5.218 5.363 5.597 5.812 6.011 6.207 6.395 6.639 6.869 7.091 7.354 7.593 7.839 8.123 8.416 8.689 8.986 9.338 9.704 10.052 10.433 10.885 11.349 11.869 12.392 12.926 13.545 14.21 14.784 15.216 15.162 14.808 14.317 13.825 13.347 12.855 12.395 12.005 11.603 11.227 10.899 10.587 10.269 9.958 9.67 9.385 9.121 8.881 8.632 8.375 8.172 7.957 7.723 7.541 7.351 7.15 6.939 6.708 6.543 6.376 6.138 5.974 5.788 5.692 5.479 5.255 5.019 4.889 4.45 4.493 4.352 4.193 3.825 3.615 3.386 3.116 2.82 2.507 2.052 0.903 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_21_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_21_1h1r.txt deleted file mode 100644 index 2dabcb3f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_21_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8097 ,TETRA ,17667696,Fri Dec 3 06:00:16 CET,Fri Dec 3 07:51:16 CET,0.0 0.931 1.313 1.624 1.881 2.087 2.283 2.476 2.813 2.959 3.089 3.015 3.465 3.587 3.817 4.024 4.232 4.331 4.513 4.69 4.938 5.1 5.254 5.477 5.696 5.905 6.104 6.306 6.576 6.827 7.061 7.335 7.609 7.889 8.209 8.551 8.884 9.247 9.647 10.08 10.532 11.042 11.626 12.204 12.879 13.638 14.501 15.473 16.646 18.016 19.579 20.732 21.269 21.496 21.591 21.613 21.545 21.444 21.328 21.181 21.013 20.833 20.639 20.441 20.263 20.096 19.91 19.726 19.545 19.35 19.155 18.982 18.797 18.599 18.44 18.273 18.101 17.926 17.739 17.603 17.456 17.231 17.07 16.897 16.809 16.612 16.4 16.18 16.056 15.615 15.64 15.5 15.359 15.019 14.808 14.571 14.316 14.031 13.679 13.177 12.22 -2 ,18760 ,TETRA ,17667697,Fri Dec 3 06:00:17 CET,Fri Dec 3 07:50:58 CET,0.0 1.0 1.527 1.947 2.298 2.61 2.88 3.122 3.53 3.709 3.883 3.883 4.349 4.468 4.699 4.918 5.115 5.204 5.376 5.542 5.778 5.933 6.09 6.332 6.572 6.801 7.019 7.225 7.479 7.718 7.95 8.248 8.533 8.797 9.094 9.434 9.778 10.149 10.545 10.988 11.436 11.923 12.521 13.115 13.798 14.591 15.502 16.526 17.698 19.007 20.536 21.71 22.267 22.507 22.538 22.485 22.4 22.274 22.135 21.983 21.83 21.676 21.497 21.316 21.148 20.986 20.809 20.643 20.484 20.29 20.091 19.93 19.765 19.595 19.438 19.273 19.127 18.967 18.788 18.668 18.537 18.31 18.13 17.937 17.839 17.634 17.416 17.181 17.061 16.624 16.656 16.512 16.356 15.987 15.78 15.561 15.328 15.062 14.687 14.175 12.737 -3 ,9221 ,TETRA ,17667698,Fri Dec 3 06:00:19 CET,Fri Dec 3 07:50:32 CET,0.0 1.002 1.394 1.669 1.909 2.114 2.308 2.496 2.849 3.01 3.158 3.078 3.527 3.654 3.877 4.085 4.295 4.395 4.582 4.764 5.024 5.187 5.345 5.576 5.804 6.038 6.262 6.481 6.759 7.0 7.243 7.529 7.79 8.047 8.347 8.683 9.006 9.379 9.773 10.175 10.611 11.12 11.723 12.321 13.019 13.798 14.676 15.679 16.862 18.227 19.866 21.087 21.644 21.896 22.004 22.008 21.921 21.781 21.62 21.437 21.263 21.092 20.911 20.733 20.545 20.365 20.177 19.98 19.801 19.627 19.43 19.245 19.057 18.863 18.704 18.538 18.381 18.222 18.032 17.888 17.75 17.551 17.407 17.251 17.171 16.994 16.797 16.595 16.484 16.057 16.11 15.964 15.81 15.48 15.288 15.077 14.86 14.596 14.282 13.839 12.561 -4 ,17184 ,TETRA ,17667699,Fri Dec 3 06:00:14 CET,Fri Dec 3 07:51:30 CET,0.0 1.197 1.694 2.031 2.306 2.555 2.764 2.944 3.285 3.429 3.554 3.474 3.916 4.033 4.264 4.481 4.691 4.808 5.037 5.219 5.463 5.626 5.798 6.044 6.269 6.49 6.702 6.909 7.187 7.446 7.682 7.959 8.23 8.502 8.835 9.202 9.543 9.926 10.341 10.783 11.248 11.758 12.352 12.948 13.615 14.368 15.242 16.214 17.374 18.747 20.284 21.325 21.789 21.988 22.04 22.0 21.891 21.755 21.606 21.43 21.252 21.071 20.874 20.667 20.481 20.303 20.112 19.925 19.747 19.557 19.354 19.191 19.018 18.828 18.681 18.519 18.35 18.192 18.019 17.886 17.745 17.499 17.314 17.125 17.03 16.838 16.63 16.39 16.26 15.821 15.845 15.689 15.521 15.158 14.962 14.734 14.477 14.2 13.853 13.357 11.971 -5 ,8440 ,TETRA ,17667700,Fri Dec 3 06:00:14 CET,Fri Dec 3 07:51:27 CET,0.0 0.85 1.232 1.536 1.813 2.057 2.279 2.476 2.819 2.975 3.118 3.052 3.501 3.622 3.843 4.048 4.253 4.352 4.544 4.737 5.013 5.192 5.36 5.599 5.828 6.038 6.24 6.434 6.681 6.915 7.155 7.451 7.718 7.976 8.277 8.617 8.954 9.327 9.724 10.155 10.61 11.122 11.725 12.334 13.06 13.845 14.716 15.735 16.93 18.311 19.857 20.959 21.513 21.786 21.878 21.868 21.772 21.62 21.425 21.215 21.044 20.875 20.701 20.518 20.349 20.187 20.005 19.844 19.684 19.492 19.286 19.121 18.948 18.756 18.608 18.452 18.28 18.099 17.901 17.772 17.651 17.445 17.273 17.089 17.008 16.847 16.668 16.462 16.351 15.928 15.982 15.853 15.719 15.398 15.219 15.034 14.816 14.539 14.169 13.651 12.058 -6 ,17306 ,TETRA ,17667701,Fri Dec 3 06:00:16 CET,Fri Dec 3 07:51:11 CET,0.0 1.019 1.435 1.77 2.022 2.247 2.456 2.648 2.993 3.151 3.305 3.253 3.689 3.806 4.047 4.26 4.457 4.551 4.731 4.918 5.19 5.35 5.506 5.726 5.94 6.152 6.346 6.532 6.776 7.006 7.229 7.508 7.775 8.036 8.344 8.692 9.021 9.375 9.772 10.188 10.624 11.148 11.759 12.351 13.057 13.858 14.744 15.725 16.855 18.204 19.803 20.979 21.557 21.817 21.839 21.759 21.637 21.45 21.248 21.041 20.871 20.702 20.52 20.33 20.158 20.018 19.858 19.694 19.531 19.356 19.184 19.032 18.868 18.691 18.554 18.415 18.263 18.084 17.885 17.738 17.588 17.351 17.188 17.032 16.954 16.793 16.619 16.422 16.314 15.901 15.972 15.841 15.697 15.34 15.144 14.943 14.709 14.387 13.99 13.496 11.142 -7 ,16872 ,TETRA ,17667702,Fri Dec 3 06:00:17 CET,Fri Dec 3 07:50:39 CET,0.0 1.32 1.744 2.038 2.285 2.509 2.697 2.86 3.183 3.337 3.485 3.446 3.903 4.023 4.259 4.489 4.703 4.801 4.992 5.167 5.417 5.59 5.765 6.016 6.252 6.478 6.696 6.905 7.183 7.445 7.676 7.961 8.238 8.501 8.809 9.149 9.485 9.853 10.253 10.692 11.153 11.668 12.257 12.839 13.5 14.252 15.139 16.114 17.279 18.688 20.247 21.345 21.864 22.106 22.173 22.166 22.115 22.03 21.898 21.725 21.576 21.422 21.262 21.084 20.898 20.725 20.527 20.336 20.175 20.012 19.829 19.666 19.497 19.32 19.182 19.041 18.89 18.713 18.513 18.386 18.261 18.06 17.909 17.736 17.646 17.458 17.262 17.068 16.968 16.553 16.598 16.442 16.285 15.94 15.747 15.544 15.323 15.059 14.757 14.319 13.087 -8 ,32681 ,TETRA ,17667703,Fri Dec 3 06:00:42 CET,Fri Dec 3 07:51:26 CET,0.0 1.143 1.531 1.822 2.085 2.319 2.522 2.703 3.051 3.209 3.356 3.321 3.78 3.902 4.126 4.34 4.554 4.658 4.862 5.06 5.334 5.508 5.679 5.917 6.142 6.368 6.593 6.811 7.087 7.349 7.596 7.899 8.182 8.452 8.774 9.12 9.451 9.811 10.209 10.644 11.079 11.568 12.146 12.74 13.455 14.243 15.137 16.142 17.318 18.689 20.249 21.364 21.893 22.131 22.179 22.126 22.011 21.877 21.754 21.592 21.415 21.25 21.078 20.909 20.739 20.563 20.38 20.219 20.08 19.93 19.746 19.567 19.393 19.225 19.092 18.949 18.787 18.61 18.424 18.296 18.156 17.929 17.771 17.62 17.546 17.379 17.203 17.004 16.889 16.451 16.475 16.336 16.189 15.859 15.661 15.45 15.251 15.008 14.697 14.281 13.279 -9 ,21326 ,TETRA ,17667704,Fri Dec 3 06:00:42 CET,Fri Dec 3 07:51:48 CET,0.0 1.047 1.348 1.63 1.871 2.07 2.244 2.394 2.671 2.808 2.954 2.881 3.321 3.434 3.659 3.872 4.066 4.162 4.346 4.529 4.788 4.943 5.094 5.304 5.505 5.712 5.912 6.094 6.335 6.582 6.825 7.126 7.414 7.688 8.008 8.376 8.73 9.109 9.514 9.944 10.374 10.85 11.43 12.024 12.723 13.489 14.382 15.395 16.554 17.924 19.509 20.648 21.178 21.435 21.484 21.417 21.302 21.144 20.995 20.822 20.63 20.438 20.262 20.068 19.869 19.679 19.457 19.249 19.062 18.877 18.689 18.526 18.352 18.168 18.022 17.865 17.682 17.48 17.278 17.142 16.997 16.771 16.617 16.444 16.347 16.152 15.949 15.717 15.592 15.148 15.17 15.022 14.878 14.561 14.365 14.14 13.892 13.635 13.308 12.819 11.551 -10 ,28084 ,TETRA ,17667705,Fri Dec 3 06:00:42 CET,Fri Dec 3 07:52:08 CET,0.0 0.664 0.975 1.227 1.456 1.667 1.846 2.004 2.302 2.441 2.586 2.524 2.963 3.076 3.301 3.519 3.707 3.797 3.987 4.167 4.423 4.59 4.741 4.96 5.178 5.382 5.582 5.788 6.041 6.271 6.497 6.761 7.014 7.263 7.565 7.905 8.236 8.607 8.996 9.402 9.837 10.353 10.945 11.523 12.211 12.985 13.873 14.866 16.024 17.381 18.979 20.132 20.654 20.94 21.062 21.06 20.985 20.843 20.687 20.518 20.326 20.123 19.938 19.761 19.579 19.396 19.192 19.002 18.843 18.666 18.482 18.327 18.161 17.991 17.839 17.664 17.486 17.308 17.12 16.982 16.826 16.583 16.415 16.24 16.148 15.951 15.742 15.509 15.39 14.956 14.984 14.841 14.685 14.326 14.134 13.927 13.684 13.398 13.075 12.605 11.378 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_21_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_21_22.txt deleted file mode 100644 index 20b2785b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_21_22.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,8433 ,TETRA ,17526451,Thu Nov 25 03:38:25 CET,Thu Nov 25 05:30:13 CET,0.0 1.055 1.487 1.816 2.079 2.321 2.529 2.706 3.052 3.213 3.362 3.315 3.767 3.891 4.144 4.372 4.581 4.688 4.895 5.085 5.352 5.52 5.686 5.925 6.138 6.329 6.52 6.716 6.969 7.227 7.475 7.755 8.026 8.299 8.617 8.958 9.269 9.602 9.975 10.396 10.835 11.306 11.827 12.353 12.964 13.627 14.356 15.141 16.063 17.047 18.047 18.703 18.914 18.901 18.745 18.505 18.284 18.072 17.847 17.597 17.376 17.175 16.98 16.781 16.592 16.404 16.184 15.987 15.809 15.601 15.372 15.178 14.973 14.759 14.595 14.423 14.247 14.069 13.883 13.751 13.612 13.391 13.225 13.055 12.971 12.792 12.599 12.399 12.293 11.855 11.893 11.753 11.61 11.309 11.129 10.934 10.739 10.508 10.197 9.745 8.845 -3 ,16620 ,TETRA ,17526452,Thu Nov 25 03:38:27 CET,Thu Nov 25 05:30:10 CET,0.0 1.18 1.587 1.891 2.169 2.41 2.631 2.854 3.24 3.408 3.563 3.511 3.972 4.109 4.367 4.6 4.81 4.912 5.117 5.313 5.586 5.751 5.902 6.126 6.357 6.579 6.791 6.996 7.255 7.498 7.734 8.014 8.278 8.533 8.825 9.154 9.476 9.814 10.173 10.576 10.981 11.404 11.892 12.39 12.994 13.651 14.384 15.199 16.067 17.031 18.02 18.543 18.704 18.676 18.5 18.267 18.044 17.795 17.535 17.291 17.086 16.88 16.662 16.43 16.201 15.975 15.739 15.534 15.358 15.159 14.918 14.733 14.564 14.368 14.215 14.062 13.896 13.717 13.526 13.387 13.25 13.036 12.881 12.72 12.63 12.43 12.241 12.054 11.946 11.515 11.588 11.461 11.323 11.023 10.855 10.663 10.447 10.192 9.902 9.452 8.222 -7 ,19539 ,TETRA ,17526456,Thu Nov 25 03:38:27 CET,Thu Nov 25 05:28:21 CET,0.0 1.251 1.704 2.042 2.316 2.522 2.73 2.935 3.283 3.447 3.597 3.559 4.024 4.155 4.41 4.64 4.858 4.96 5.163 5.367 5.655 5.825 5.983 6.215 6.439 6.659 6.866 7.062 7.304 7.536 7.784 8.079 8.361 8.621 8.905 9.225 9.546 9.902 10.28 10.682 11.08 11.526 12.055 12.579 13.175 13.829 14.554 15.339 16.231 17.248 18.3 18.882 19.038 18.993 18.829 18.617 18.38 18.156 17.946 17.688 17.476 17.279 17.077 16.874 16.679 16.505 16.298 16.101 15.914 15.712 15.509 15.332 15.134 14.912 14.742 14.577 14.411 14.223 14.017 13.877 13.721 13.472 13.305 13.123 13.031 12.849 12.653 12.438 12.321 11.884 11.929 11.787 11.652 11.336 11.151 10.934 10.691 10.431 10.098 9.679 8.962 -8 ,25797 ,TETRA ,17526457,Thu Nov 25 03:38:26 CET,Thu Nov 25 05:30:11 CET,0.0 1.369 1.769 2.111 2.404 2.671 2.917 3.127 3.476 3.63 3.787 3.775 4.237 4.359 4.589 4.805 5.012 5.108 5.288 5.47 5.748 5.926 6.097 6.358 6.601 6.826 7.047 7.267 7.549 7.812 8.058 8.343 8.625 8.903 9.207 9.544 9.858 10.189 10.551 10.95 11.35 11.793 12.329 12.885 13.51 14.142 14.879 15.723 16.691 17.76 18.824 19.448 19.619 19.572 19.399 19.181 18.965 18.719 18.456 18.182 17.934 17.718 17.493 17.266 17.039 16.824 16.6 16.381 16.184 15.986 15.779 15.609 15.434 15.243 15.103 14.96 14.806 14.644 14.473 14.348 14.222 14.034 13.899 13.757 13.68 13.507 13.325 13.131 13.025 12.602 12.687 12.562 12.44 12.158 11.994 11.806 11.587 11.329 11.0 10.574 9.504 -10 ,21416 ,TETRA ,17526459,Thu Nov 25 03:38:28 CET,Thu Nov 25 05:28:08 CET,0.0 1.586 2.026 2.374 2.682 2.948 3.175 3.382 3.752 3.922 4.088 4.071 4.532 4.655 4.889 5.104 5.318 5.426 5.627 5.81 6.069 6.237 6.401 6.641 6.862 7.076 7.286 7.486 7.746 8.0 8.227 8.49 8.754 9.013 9.309 9.643 9.951 10.286 10.661 11.061 11.487 11.969 12.514 13.038 13.632 14.286 15.044 15.858 16.755 17.778 18.854 19.49 19.658 19.603 19.426 19.175 18.898 18.646 18.409 18.142 17.902 17.682 17.457 17.242 17.038 16.833 16.615 16.408 16.209 15.999 15.787 15.597 15.395 15.189 15.023 14.849 14.673 14.491 14.285 14.138 13.99 13.742 13.57 13.394 13.299 13.108 12.897 12.672 12.553 12.119 12.173 12.025 11.867 11.551 11.389 11.2 10.978 10.714 10.373 9.921 8.988 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_22_1h1r.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_22_1h1r.txt deleted file mode 100644 index faac987d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_22_1h1r.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9076 ,TETRA ,17526460,Thu Nov 25 03:38:31 CET,Thu Nov 25 05:29:24 CET,0.0 0.796 1.106 1.349 1.58 1.788 1.997 2.2 2.508 2.645 2.782 2.726 3.155 3.261 3.47 3.674 3.864 3.953 4.129 4.294 4.521 4.674 4.823 5.032 5.221 5.397 5.568 5.731 5.942 6.146 6.331 6.553 6.772 6.996 7.246 7.497 7.749 8.033 8.343 8.671 9.006 9.373 9.789 10.2 10.678 11.197 11.773 12.402 13.126 13.917 14.702 15.052 15.041 14.922 14.677 14.354 14.041 13.74 13.464 13.169 12.907 12.671 12.42 12.158 11.911 11.68 11.443 11.239 11.055 10.858 10.64 10.446 10.238 10.028 9.87 9.7 9.516 9.317 9.112 8.977 8.829 8.587 8.428 8.264 8.173 7.976 7.764 7.536 7.42 6.989 7.04 6.907 6.766 6.424 6.206 5.966 5.694 5.37 5.001 4.539 2.784 -3 ,4685 ,TETRA ,17526462,Thu Nov 25 03:38:26 CET,Thu Nov 25 05:29:22 CET,0.0 0.684 0.99 1.203 1.406 1.593 1.745 1.885 2.145 2.273 2.396 2.295 2.712 2.81 2.993 3.172 3.361 3.446 3.606 3.769 4.014 4.169 4.307 4.504 4.697 4.885 5.056 5.215 5.431 5.644 5.845 6.084 6.307 6.524 6.772 7.041 7.306 7.603 7.908 8.214 8.528 8.88 9.302 9.735 10.217 10.738 11.324 11.949 12.59 13.279 13.989 14.28 14.295 14.23 14.029 13.746 13.471 13.183 12.903 12.598 12.337 12.105 11.862 11.615 11.37 11.15 10.933 10.726 10.536 10.312 10.081 9.893 9.688 9.475 9.311 9.139 8.945 8.752 8.549 8.411 8.277 8.052 7.892 7.727 7.639 7.46 7.255 7.044 6.939 6.52 6.573 6.427 6.28 5.952 5.758 5.544 5.301 5.012 4.652 4.152 2.038 -4 ,7293 ,TETRA ,17526463,Thu Nov 25 03:38:28 CET,Thu Nov 25 05:29:30 CET,0.0 0.874 1.22 1.483 1.7 1.881 2.048 2.207 2.5 2.644 2.783 2.717 3.148 3.259 3.458 3.644 3.827 3.915 4.076 4.223 4.435 4.573 4.701 4.883 5.062 5.238 5.421 5.607 5.818 5.997 6.187 6.419 6.635 6.845 7.087 7.357 7.623 7.913 8.214 8.55 8.902 9.282 9.726 10.167 10.641 11.15 11.715 12.306 12.973 13.72 14.469 14.852 14.94 14.823 14.576 14.32 14.067 13.811 13.552 13.252 13.007 12.782 12.547 12.309 12.085 11.879 11.656 11.455 11.276 11.096 10.916 10.756 10.573 10.379 10.235 10.082 9.911 9.719 9.519 9.387 9.254 9.04 8.878 8.705 8.617 8.431 8.225 7.992 7.857 7.419 7.474 7.335 7.196 6.885 6.714 6.509 6.266 5.992 5.676 5.232 2.748 -8 ,16938 ,TETRA ,17526467,Thu Nov 25 03:38:32 CET,Thu Nov 25 05:28:08 CET,0.0 0.507 0.779 1.032 1.259 1.456 1.64 1.807 2.087 2.208 2.325 2.236 2.664 2.776 2.981 3.175 3.357 3.44 3.588 3.734 3.957 4.103 4.236 4.422 4.602 4.776 4.945 5.099 5.301 5.498 5.682 5.907 6.125 6.326 6.556 6.826 7.095 7.38 7.676 7.989 8.312 8.672 9.09 9.513 10.018 10.562 11.161 11.8 12.484 13.227 13.969 14.356 14.336 14.155 13.931 13.644 13.324 13.002 12.702 12.403 12.134 11.885 11.661 11.444 11.222 11.007 10.763 10.547 10.361 10.16 9.957 9.778 9.58 9.361 9.194 9.02 8.84 8.65 8.441 8.303 8.151 7.92 7.76 7.58 7.489 7.292 7.088 6.869 6.752 6.328 6.36 6.213 6.059 5.719 5.54 5.344 5.131 4.884 4.56 4.048 2.201 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_26_1h1q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_26_1h1q.txt deleted file mode 100644 index 47de521a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_26_1h1q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22436 ,KEBNE ,17069830,Fri Dec 24 09:44:41 CET,Fri Dec 24 11:22:26 CET,0.0 0.921 1.274 1.576 1.822 2.049 2.267 2.445 2.726 2.857 2.977 2.873 3.281 3.376 3.554 3.724 3.902 3.993 4.172 4.345 4.576 4.724 4.865 5.056 5.244 5.438 5.632 5.812 6.031 6.237 6.436 6.675 6.899 7.107 7.338 7.602 7.861 8.138 8.423 8.738 9.082 9.445 9.845 10.232 10.688 11.18 11.727 12.319 12.926 13.552 14.108 14.184 13.949 13.633 13.266 12.881 12.523 12.159 11.821 11.465 11.138 10.821 10.503 10.211 9.929 9.651 9.354 9.08 8.831 8.566 8.294 8.062 7.817 7.559 7.35 7.137 6.927 6.707 6.471 6.298 6.111 5.811 5.586 5.367 5.261 5.036 4.787 4.519 4.376 3.934 3.949 3.781 3.591 3.145 2.885 2.617 2.324 1.98 1.553 0.97 -0.73 -2 ,4248 ,KEBNE ,17125477,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:14:29 CET,0.0 0.904 1.302 1.594 1.807 1.995 2.189 2.352 2.629 2.772 2.909 2.833 3.252 3.354 3.546 3.744 3.928 4.01 4.174 4.335 4.566 4.716 4.867 5.081 5.269 5.449 5.627 5.802 6.016 6.216 6.421 6.667 6.893 7.113 7.366 7.653 7.933 8.231 8.544 8.882 9.227 9.59 10.024 10.445 10.909 11.417 11.977 12.603 13.268 13.932 14.503 14.618 14.414 14.091 13.726 13.335 12.944 12.566 12.235 11.863 11.506 11.185 10.873 10.571 10.292 10.042 9.77 9.505 9.261 9.022 8.784 8.573 8.353 8.115 7.916 7.706 7.484 7.264 7.044 6.882 6.703 6.408 6.199 5.993 5.885 5.659 5.424 5.169 5.035 4.598 4.627 4.468 4.281 3.851 3.591 3.326 3.063 2.739 2.338 1.756 0.383 -3 ,29118 ,KEBNE ,17125478,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:12:54 CET,0.0 0.758 1.088 1.334 1.542 1.742 1.922 2.088 2.385 2.513 2.622 2.522 2.936 3.031 3.216 3.403 3.577 3.658 3.811 3.965 4.2 4.359 4.507 4.705 4.887 5.055 5.212 5.38 5.607 5.819 6.03 6.272 6.513 6.749 6.997 7.275 7.539 7.834 8.154 8.473 8.807 9.184 9.625 10.075 10.57 11.083 11.684 12.309 12.922 13.533 14.098 14.298 14.114 13.778 13.398 12.982 12.586 12.217 11.874 11.505 11.17 10.865 10.55 10.242 9.964 9.687 9.39 9.143 8.926 8.688 8.429 8.217 8.002 7.761 7.568 7.369 7.152 6.922 6.685 6.515 6.331 6.017 5.801 5.59 5.477 5.224 4.969 4.71 4.568 4.116 4.116 3.957 3.787 3.381 3.147 2.898 2.601 2.237 1.779 1.183 -1.084 -4 ,13060 ,KEBNE ,17069833,Fri Dec 24 09:46:47 CET,Fri Dec 24 11:23:57 CET,0.0 1.106 1.524 1.819 2.061 2.27 2.447 2.596 2.872 3.01 3.138 3.065 3.481 3.579 3.777 3.998 4.203 4.296 4.478 4.642 4.886 5.04 5.18 5.381 5.577 5.765 5.94 6.105 6.326 6.546 6.748 6.998 7.241 7.468 7.732 8.015 8.275 8.555 8.848 9.158 9.475 9.833 10.246 10.655 11.122 11.626 12.192 12.791 13.391 13.99 14.487 14.542 14.294 13.929 13.534 13.129 12.718 12.318 11.965 11.594 11.24 10.879 10.537 10.236 9.952 9.673 9.378 9.128 8.904 8.662 8.403 8.176 7.947 7.713 7.521 7.334 7.139 6.918 6.687 6.513 6.329 6.067 5.895 5.711 5.604 5.379 5.158 4.909 4.776 4.33 4.316 4.155 3.977 3.596 3.385 3.144 2.87 2.536 2.141 1.563 -0.506 -5 ,5768 ,KEBNE ,17125480,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:15:32 CET,0.0 0.621 0.985 1.253 1.479 1.685 1.876 2.035 2.289 2.405 2.525 2.443 2.854 2.952 3.129 3.306 3.482 3.566 3.721 3.859 4.059 4.186 4.317 4.52 4.71 4.888 5.052 5.204 5.406 5.6 5.798 6.034 6.253 6.47 6.713 6.976 7.227 7.495 7.773 8.07 8.388 8.746 9.158 9.574 10.05 10.554 11.129 11.746 12.385 13.002 13.507 13.658 13.496 13.175 12.791 12.38 11.971 11.554 11.181 10.803 10.447 10.107 9.783 9.479 9.188 8.909 8.623 8.365 8.117 7.86 7.597 7.364 7.131 6.881 6.673 6.47 6.257 6.027 5.782 5.606 5.424 5.134 4.925 4.694 4.577 4.345 4.092 3.829 3.696 3.249 3.22 3.046 2.87 2.479 2.252 2.004 1.72 1.357 0.93 0.359 -1.05 -6 ,6434 ,KEBNE ,17125481,Thu Dec 30 16:35:27 CET,Thu Dec 30 18:13:08 CET,0.0 0.996 1.341 1.637 1.893 2.122 2.327 2.508 2.818 2.953 3.083 3.037 3.47 3.582 3.784 3.966 4.142 4.23 4.397 4.556 4.782 4.923 5.054 5.241 5.414 5.588 5.763 5.927 6.132 6.33 6.521 6.758 6.986 7.199 7.439 7.707 7.97 8.254 8.555 8.881 9.228 9.603 9.996 10.392 10.868 11.357 11.865 12.435 13.08 13.739 14.235 14.252 13.976 13.614 13.205 12.772 12.391 12.015 11.649 11.246 10.873 10.554 10.237 9.906 9.586 9.281 8.975 8.71 8.476 8.239 7.987 7.77 7.54 7.293 7.101 6.897 6.672 6.436 6.198 6.033 5.855 5.576 5.377 5.152 5.037 4.802 4.55 4.278 4.143 3.7 3.681 3.504 3.314 2.894 2.651 2.396 2.096 1.717 1.263 0.613 -0.978 -7 ,10901 ,KEBNE ,17069836,Fri Dec 24 09:54:14 CET,Fri Dec 24 11:30:33 CET,0.0 1.077 1.543 1.892 2.181 2.445 2.678 2.882 3.243 3.41 3.569 3.557 4.009 4.138 4.385 4.609 4.821 4.935 5.164 5.382 5.647 5.794 5.928 6.111 6.301 6.487 6.661 6.821 7.022 7.219 7.404 7.618 7.833 8.042 8.268 8.524 8.779 9.052 9.34 9.667 10.01 10.371 10.804 11.219 11.69 12.225 12.816 13.427 14.054 14.666 15.173 15.247 14.975 14.569 14.155 13.719 13.298 12.912 12.564 12.193 11.858 11.551 11.242 10.944 10.656 10.385 10.096 9.82 9.592 9.366 9.107 8.893 8.676 8.422 8.216 8.004 7.783 7.541 7.285 7.117 6.954 6.69 6.486 6.252 6.131 5.894 5.651 5.407 5.27 4.822 4.806 4.629 4.447 4.033 3.806 3.581 3.317 3.009 2.675 2.178 0.047 -8 ,9463 ,KEBNE ,17069837,Fri Dec 24 09:57:26 CET,Fri Dec 24 11:34:08 CET,0.0 1.079 1.472 1.76 2.022 2.26 2.462 2.634 2.924 3.054 3.185 3.12 3.541 3.654 3.86 4.061 4.253 4.341 4.511 4.67 4.894 5.037 5.17 5.353 5.529 5.705 5.877 6.04 6.258 6.467 6.656 6.893 7.127 7.355 7.613 7.891 8.157 8.434 8.715 9.009 9.321 9.668 10.066 10.469 10.952 11.473 12.018 12.607 13.24 13.841 14.315 14.45 14.24 13.865 13.471 13.105 12.744 12.367 12.022 11.647 11.309 10.987 10.672 10.397 10.131 9.875 9.594 9.332 9.108 8.869 8.609 8.376 8.135 7.898 7.703 7.488 7.27 7.057 6.835 6.67 6.488 6.207 6.008 5.794 5.685 5.454 5.227 4.982 4.843 4.394 4.372 4.208 4.043 3.665 3.439 3.188 2.906 2.572 2.149 1.59 0.26 -9 ,15975 ,KEBNE ,17125484,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:12:58 CET,0.0 0.632 0.919 1.13 1.321 1.493 1.663 1.819 2.092 2.216 2.338 2.256 2.674 2.779 2.973 3.149 3.31 3.388 3.547 3.713 3.954 4.099 4.232 4.425 4.611 4.8 4.99 5.165 5.381 5.599 5.815 6.065 6.293 6.512 6.761 7.027 7.294 7.576 7.861 8.164 8.489 8.861 9.3 9.754 10.267 10.797 11.376 12.007 12.704 13.349 13.867 14.003 13.83 13.557 13.205 12.804 12.402 12.007 11.654 11.289 10.961 10.662 10.363 10.076 9.798 9.534 9.26 9.007 8.782 8.547 8.295 8.081 7.855 7.615 7.423 7.22 7.004 6.775 6.537 6.359 6.176 5.901 5.709 5.506 5.395 5.16 4.905 4.63 4.483 4.019 3.976 3.798 3.617 3.218 2.986 2.734 2.466 2.165 1.791 1.246 -0.528 -10 ,16607 ,KEBNE ,17125485,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:13:18 CET,0.0 0.431 0.757 1.023 1.226 1.409 1.581 1.737 2.007 2.134 2.257 2.183 2.604 2.708 2.896 3.063 3.229 3.314 3.477 3.619 3.824 3.959 4.089 4.279 4.473 4.656 4.822 4.984 5.195 5.401 5.6 5.832 6.053 6.267 6.511 6.785 7.045 7.325 7.631 7.936 8.246 8.605 9.022 9.426 9.91 10.462 11.034 11.654 12.336 12.989 13.482 13.549 13.386 13.085 12.678 12.269 11.895 11.525 11.186 10.822 10.489 10.169 9.85 9.553 9.26 8.98 8.694 8.448 8.228 7.966 7.693 7.484 7.244 6.982 6.767 6.534 6.3 6.048 5.795 5.633 5.457 5.173 4.973 4.769 4.662 4.413 4.154 3.895 3.751 3.289 3.262 3.092 2.911 2.5 2.269 2.008 1.71 1.401 1.033 0.551 -0.701 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_26_1oi9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_26_1oi9.txt deleted file mode 100644 index 27c00ae7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_26_1oi9.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10594 ,TETRA ,17526470,Thu Nov 25 03:38:28 CET,Thu Nov 25 05:29:39 CET,0.0 1.016 1.401 1.668 1.883 2.077 2.256 2.405 2.676 2.81 2.927 2.8 3.201 3.287 3.462 3.631 3.775 3.844 3.988 4.129 4.32 4.436 4.545 4.701 4.836 4.964 5.088 5.205 5.353 5.499 5.646 5.822 5.973 6.124 6.296 6.464 6.63 6.808 6.997 7.186 7.368 7.572 7.795 7.985 8.158 8.319 8.455 8.539 8.544 8.313 7.635 6.589 5.618 4.693 3.746 2.816 1.971 1.186 0.545 -0.104 -0.7 -1.194 -1.648 -2.105 -2.544 -2.936 -3.341 -3.714 -4.026 -4.348 -4.687 -4.974 -5.276 -5.593 -5.852 -6.126 -6.414 -6.694 -6.979 -7.181 -7.393 -7.741 -7.973 -8.211 -8.336 -8.589 -8.855 -9.155 -9.316 -9.81 -9.857 -10.043 -10.235 -10.671 -10.938 -11.242 -11.573 -11.929 -12.314 -12.841 -14.587 -2 ,31853 ,TETRA ,17526471,Thu Nov 25 03:38:31 CET,Thu Nov 25 05:29:40 CET,0.0 1.335 1.691 1.954 2.2 2.393 2.544 2.687 2.939 3.061 3.177 3.06 3.458 3.55 3.735 3.917 4.088 4.167 4.318 4.459 4.647 4.763 4.878 5.043 5.192 5.329 5.448 5.554 5.689 5.828 5.974 6.14 6.287 6.427 6.586 6.772 6.949 7.135 7.317 7.488 7.669 7.857 8.05 8.238 8.424 8.593 8.723 8.798 8.789 8.566 7.862 6.773 5.756 4.795 3.911 3.017 2.214 1.544 0.968 0.351 -0.19 -0.699 -1.2 -1.673 -2.12 -2.531 -2.981 -3.376 -3.715 -4.063 -4.422 -4.724 -5.033 -5.365 -5.633 -5.91 -6.192 -6.492 -6.805 -7.016 -7.237 -7.603 -7.864 -8.121 -8.254 -8.546 -8.852 -9.16 -9.321 -9.821 -9.9 -10.103 -10.321 -10.817 -11.084 -11.358 -11.661 -12.033 -12.479 -13.088 -14.666 -3 ,22046 ,TETRA ,17526472,Thu Nov 25 03:38:32 CET,Thu Nov 25 05:29:26 CET,0.0 1.055 1.474 1.74 1.936 2.099 2.245 2.394 2.666 2.784 2.89 2.772 3.182 3.292 3.494 3.653 3.805 3.883 4.032 4.173 4.367 4.495 4.619 4.797 4.959 5.098 5.232 5.355 5.513 5.673 5.821 5.981 6.136 6.291 6.472 6.66 6.837 7.024 7.2 7.378 7.551 7.722 7.9 8.069 8.25 8.451 8.648 8.749 8.731 8.539 7.913 6.812 5.691 4.631 3.648 2.786 2.035 1.364 0.73 0.058 -0.516 -1.038 -1.533 -1.998 -2.428 -2.821 -3.251 -3.647 -3.968 -4.297 -4.645 -4.929 -5.235 -5.571 -5.84 -6.114 -6.383 -6.672 -6.99 -7.203 -7.421 -7.771 -8.006 -8.245 -8.365 -8.616 -8.902 -9.196 -9.348 -9.833 -9.858 -10.041 -10.229 -10.624 -10.854 -11.123 -11.42 -11.735 -12.127 -12.666 -14.239 -5 ,20607 ,TETRA ,17526474,Thu Nov 25 03:38:28 CET,Thu Nov 25 05:29:45 CET,0.0 0.922 1.273 1.526 1.725 1.905 2.064 2.197 2.445 2.553 2.656 2.558 2.964 3.06 3.234 3.396 3.546 3.616 3.758 3.89 4.067 4.181 4.291 4.45 4.59 4.719 4.843 4.97 5.136 5.289 5.432 5.587 5.734 5.867 6.02 6.206 6.377 6.552 6.74 6.934 7.117 7.301 7.491 7.664 7.86 8.052 8.189 8.287 8.33 8.092 7.383 6.321 5.205 4.189 3.279 2.398 1.584 0.83 0.179 -0.492 -1.09 -1.609 -2.106 -2.593 -3.046 -3.455 -3.872 -4.24 -4.571 -4.933 -5.304 -5.605 -5.909 -6.219 -6.46 -6.73 -7.034 -7.34 -7.653 -7.877 -8.118 -8.489 -8.729 -8.98 -9.108 -9.368 -9.639 -9.932 -10.102 -10.6 -10.668 -10.886 -11.092 -11.544 -11.799 -12.073 -12.397 -12.775 -13.19 -13.797 -15.393 -6 ,9984 ,TETRA ,17526475,Thu Nov 25 03:38:30 CET,Thu Nov 25 05:29:30 CET,0.0 0.944 1.359 1.652 1.862 2.049 2.24 2.419 2.687 2.8 2.926 2.861 3.267 3.348 3.501 3.649 3.799 3.867 4.004 4.141 4.318 4.431 4.539 4.674 4.809 4.95 5.08 5.209 5.375 5.541 5.71 5.887 6.027 6.158 6.328 6.513 6.682 6.858 7.022 7.2 7.397 7.601 7.83 8.051 8.259 8.451 8.654 8.797 8.829 8.675 7.991 6.715 5.564 4.531 3.53 2.582 1.803 1.151 0.564 -0.077 -0.675 -1.187 -1.674 -2.154 -2.579 -2.984 -3.417 -3.798 -4.149 -4.511 -4.882 -5.205 -5.55 -5.896 -6.155 -6.424 -6.705 -6.996 -7.297 -7.521 -7.761 -8.137 -8.391 -8.645 -8.784 -9.076 -9.373 -9.673 -9.827 -10.307 -10.328 -10.517 -10.717 -11.147 -11.392 -11.667 -12.001 -12.425 -12.893 -13.471 -15.041 -9 ,1039 ,TETRA ,17526478,Thu Nov 25 03:38:30 CET,Thu Nov 25 05:30:40 CET,0.0 0.752 1.062 1.337 1.586 1.793 1.96 2.107 2.365 2.48 2.578 2.451 2.852 2.951 3.133 3.278 3.41 3.476 3.616 3.744 3.912 4.03 4.143 4.301 4.465 4.623 4.767 4.911 5.093 5.266 5.431 5.611 5.775 5.928 6.106 6.294 6.47 6.66 6.835 7.023 7.216 7.422 7.661 7.901 8.142 8.319 8.463 8.546 8.539 8.345 7.698 6.609 5.513 4.434 3.442 2.535 1.692 0.927 0.289 -0.372 -0.988 -1.541 -2.048 -2.525 -2.952 -3.355 -3.801 -4.188 -4.534 -4.907 -5.304 -5.627 -5.944 -6.272 -6.536 -6.816 -7.116 -7.433 -7.753 -7.97 -8.182 -8.509 -8.75 -9.007 -9.137 -9.404 -9.684 -9.984 -10.147 -10.649 -10.725 -10.932 -11.153 -11.673 -11.975 -12.299 -12.678 -13.114 -13.644 -14.483 -16.779 -10 ,23113 ,TETRA ,17526479,Thu Nov 25 03:38:35 CET,Thu Nov 25 05:30:37 CET,0.0 0.994 1.34 1.615 1.881 2.09 2.249 2.406 2.702 2.825 2.932 2.837 3.25 3.354 3.543 3.72 3.885 3.962 4.109 4.238 4.406 4.507 4.617 4.791 4.951 5.106 5.253 5.395 5.573 5.74 5.89 6.055 6.212 6.367 6.557 6.758 6.945 7.15 7.357 7.567 7.752 7.95 8.174 8.374 8.574 8.745 8.907 8.981 8.942 8.729 8.056 6.965 5.842 4.771 3.851 3.035 2.309 1.591 0.938 0.309 -0.249 -0.754 -1.23 -1.7 -2.148 -2.566 -2.989 -3.366 -3.7 -4.061 -4.459 -4.794 -5.127 -5.474 -5.753 -6.034 -6.328 -6.651 -6.996 -7.235 -7.467 -7.823 -8.078 -8.338 -8.475 -8.749 -9.045 -9.358 -9.526 -10.033 -10.101 -10.314 -10.535 -10.989 -11.256 -11.572 -11.92 -12.327 -12.86 -13.522 -15.018 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_26_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_26_21.txt deleted file mode 100644 index a2cb5ade..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_26_21.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22086 ,TETRA ,17526480,Thu Nov 25 03:38:33 CET,Thu Nov 25 05:30:10 CET,0.0 2.249 2.865 3.263 3.579 3.857 4.079 4.271 4.618 4.777 4.909 4.82 5.256 5.383 5.598 5.79 5.988 6.081 6.246 6.41 6.632 6.766 6.887 7.076 7.27 7.438 7.585 7.721 7.892 8.055 8.217 8.407 8.572 8.71 8.871 9.06 9.223 9.378 9.527 9.676 9.833 9.981 10.109 10.201 10.283 10.325 10.229 10.007 9.611 8.845 7.305 5.273 3.503 1.921 0.593 -0.592 -1.634 -2.542 -3.344 -4.137 -4.789 -5.385 -5.958 -6.482 -6.962 -7.398 -7.865 -8.279 -8.634 -9.01 -9.394 -9.709 -10.036 -10.374 -10.633 -10.902 -11.188 -11.488 -11.799 -12.001 -12.204 -12.523 -12.744 -12.977 -13.105 -13.381 -13.673 -13.993 -14.149 -14.629 -14.646 -14.828 -15.02 -15.441 -15.68 -15.945 -16.211 -16.463 -16.779 -17.255 -18.534 -2 ,8675 ,TETRA ,17526481,Thu Nov 25 03:38:32 CET,Thu Nov 25 05:29:52 CET,0.0 1.435 1.938 2.315 2.623 2.904 3.159 3.395 3.788 3.955 4.113 4.078 4.523 4.648 4.86 5.066 5.28 5.374 5.54 5.695 5.916 6.065 6.208 6.412 6.593 6.748 6.883 7.012 7.186 7.352 7.506 7.676 7.832 7.968 8.117 8.295 8.454 8.603 8.762 8.937 9.105 9.24 9.345 9.428 9.495 9.5 9.377 9.133 8.707 7.938 6.45 4.393 2.629 1.132 -0.206 -1.399 -2.424 -3.337 -4.108 -4.862 -5.503 -6.08 -6.621 -7.132 -7.616 -8.043 -8.483 -8.883 -9.233 -9.596 -9.978 -10.29 -10.612 -10.942 -11.195 -11.465 -11.742 -12.02 -12.327 -12.554 -12.784 -13.131 -13.377 -13.629 -13.756 -14.028 -14.311 -14.607 -14.761 -15.245 -15.251 -15.441 -15.642 -16.042 -16.274 -16.528 -16.801 -17.12 -17.501 -18.002 -19.229 -4 ,16842 ,TETRA ,17526483,Thu Nov 25 03:39:00 CET,Thu Nov 25 05:30:36 CET,0.0 1.291 1.773 2.111 2.387 2.64 2.866 3.069 3.424 3.593 3.752 3.731 4.17 4.29 4.514 4.727 4.915 5.009 5.18 5.32 5.533 5.668 5.806 6.02 6.212 6.392 6.548 6.681 6.854 7.01 7.156 7.328 7.482 7.645 7.83 8.01 8.165 8.316 8.47 8.638 8.822 8.993 9.12 9.2 9.287 9.329 9.24 9.029 8.602 7.81 6.283 4.182 2.407 0.918 -0.374 -1.506 -2.492 -3.404 -4.189 -4.983 -5.67 -6.258 -6.803 -7.317 -7.802 -8.255 -8.72 -9.133 -9.501 -9.876 -10.26 -10.575 -10.9 -11.243 -11.51 -11.779 -12.051 -12.329 -12.632 -12.849 -13.066 -13.422 -13.675 -13.925 -14.053 -14.324 -14.608 -14.895 -15.035 -15.512 -15.504 -15.668 -15.857 -16.273 -16.502 -16.744 -17.031 -17.391 -17.743 -18.203 -19.174 -5 ,14699 ,TETRA ,17526484,Thu Nov 25 03:39:01 CET,Thu Nov 25 05:30:07 CET,0.0 1.473 1.964 2.338 2.667 2.947 3.162 3.351 3.694 3.845 3.987 3.944 4.372 4.491 4.733 4.969 5.163 5.248 5.408 5.565 5.795 5.935 6.063 6.244 6.419 6.587 6.744 6.899 7.1 7.287 7.466 7.662 7.829 7.98 8.15 8.324 8.476 8.643 8.812 8.978 9.127 9.271 9.417 9.524 9.608 9.665 9.635 9.443 9.029 8.255 6.689 4.6 2.819 1.28 -0.059 -1.193 -2.173 -3.063 -3.824 -4.614 -5.288 -5.868 -6.394 -6.888 -7.359 -7.784 -8.219 -8.602 -8.948 -9.301 -9.663 -9.977 -10.313 -10.666 -10.934 -11.2 -11.485 -11.782 -12.08 -12.281 -12.48 -12.798 -13.015 -13.25 -13.379 -13.642 -13.899 -14.163 -14.304 -14.775 -14.783 -14.966 -15.152 -15.557 -15.783 -16.016 -16.262 -16.566 -16.951 -17.468 -18.659 -8 ,11048 ,TETRA ,17526487,Thu Nov 25 03:39:00 CET,Thu Nov 25 05:28:36 CET,0.0 1.559 2.003 2.405 2.711 2.969 3.195 3.39 3.727 3.881 4.032 4.012 4.44 4.538 4.733 4.926 5.103 5.189 5.35 5.501 5.711 5.832 5.954 6.134 6.301 6.457 6.609 6.753 6.926 7.088 7.243 7.41 7.558 7.714 7.914 8.134 8.315 8.481 8.628 8.791 8.955 9.098 9.255 9.352 9.404 9.45 9.405 9.206 8.793 8.003 6.488 4.505 2.787 1.286 -0.024 -1.176 -2.178 -3.086 -3.863 -4.648 -5.354 -5.962 -6.509 -7.038 -7.557 -8.021 -8.481 -8.886 -9.236 -9.596 -9.97 -10.282 -10.603 -10.929 -11.187 -11.47 -11.762 -12.054 -12.363 -12.572 -12.775 -13.108 -13.343 -13.588 -13.721 -13.989 -14.285 -14.601 -14.76 -15.255 -15.283 -15.467 -15.662 -16.073 -16.301 -16.562 -16.835 -17.13 -17.469 -17.927 -19.193 -10 ,8810 ,TETRA ,17526489,Thu Nov 25 03:39:03 CET,Thu Nov 25 05:27:55 CET,0.0 1.921 2.43 2.772 3.081 3.359 3.587 3.789 4.161 4.316 4.473 4.468 4.901 5.017 5.229 5.445 5.652 5.737 5.905 6.068 6.278 6.412 6.542 6.732 6.92 7.089 7.242 7.389 7.571 7.73 7.878 8.051 8.214 8.367 8.541 8.732 8.891 9.037 9.187 9.336 9.482 9.617 9.71 9.775 9.833 9.84 9.747 9.556 9.163 8.358 6.772 4.715 2.985 1.484 0.165 -0.996 -2.012 -2.914 -3.687 -4.464 -5.125 -5.717 -6.266 -6.765 -7.216 -7.634 -8.074 -8.464 -8.803 -9.154 -9.525 -9.829 -10.136 -10.464 -10.723 -10.992 -11.276 -11.568 -11.871 -12.077 -12.297 -12.664 -12.914 -13.167 -13.301 -13.582 -13.879 -14.177 -14.334 -14.83 -14.843 -15.017 -15.218 -15.65 -15.886 -16.152 -16.426 -16.747 -17.159 -17.698 -18.91 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_28_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_28_1h1s.txt deleted file mode 100644 index 616c998e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_28_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9739 ,TETRA ,17526490,Thu Nov 25 03:39:00 CET,Thu Nov 25 05:32:30 CET,0.0 0.672 0.99 1.229 1.41 1.574 1.745 1.906 2.176 2.289 2.395 2.141 2.69 2.778 2.941 3.091 3.229 3.283 3.378 3.47 3.609 3.698 3.778 3.896 4.002 4.088 4.155 4.212 4.285 4.353 4.407 4.459 4.513 4.552 4.568 4.576 4.573 4.552 4.507 4.436 4.337 4.184 3.933 3.613 3.178 2.63 1.88 0.844 -0.658 -2.869 -6.389 -10.433 -13.643 -16.238 -18.35 -20.181 -21.78 -23.206 -24.397 -25.554 -26.547 -27.451 -28.288 -29.05 -29.758 -30.401 -31.064 -31.631 -32.119 -32.637 -33.172 -33.608 -34.063 -34.562 -34.959 -35.353 -35.744 -36.151 -36.571 -36.855 -37.153 -37.619 -37.943 -38.288 -38.458 -38.796 -39.157 -39.538 -39.735 -40.447 -40.38 -40.621 -40.882 -41.427 -41.735 -42.073 -42.422 -42.775 -43.212 -43.805 -45.628 -2 ,6970 ,TETRA ,17526491,Thu Nov 25 03:39:02 CET,Thu Nov 25 05:32:45 CET,0.0 0.866 1.229 1.507 1.704 1.87 2.039 2.181 2.402 2.506 2.606 2.324 2.873 2.953 3.087 3.206 3.323 3.381 3.476 3.547 3.659 3.723 3.792 3.886 3.966 4.04 4.095 4.146 4.195 4.231 4.275 4.325 4.361 4.384 4.4 4.398 4.379 4.347 4.29 4.189 4.033 3.846 3.598 3.288 2.853 2.288 1.53 0.495 -0.992 -3.264 -6.942 -11.071 -14.229 -16.768 -18.929 -20.805 -22.43 -23.902 -25.11 -26.271 -27.259 -28.109 -28.915 -29.687 -30.388 -30.996 -31.635 -32.225 -32.723 -33.242 -33.779 -34.211 -34.655 -35.126 -35.5 -35.879 -36.251 -36.627 -37.032 -37.323 -37.628 -38.097 -38.418 -38.738 -38.906 -39.255 -39.627 -40.03 -40.235 -40.954 -40.907 -41.165 -41.44 -42.073 -42.429 -42.799 -43.183 -43.669 -44.316 -45.131 -47.0 -4 ,31484 ,TETRA ,17526493,Thu Nov 25 03:39:00 CET,Thu Nov 25 05:29:50 CET,0.0 0.863 1.276 1.579 1.791 1.962 2.106 2.242 2.497 2.606 2.697 2.391 2.917 2.974 3.096 3.213 3.304 3.348 3.438 3.525 3.647 3.707 3.764 3.858 3.942 4.002 4.054 4.111 4.17 4.195 4.208 4.227 4.237 4.24 4.233 4.222 4.21 4.199 4.201 4.145 4.0 3.812 3.594 3.333 2.925 2.352 1.576 0.514 -1.009 -3.197 -6.685 -10.75 -13.975 -16.57 -18.788 -20.714 -22.268 -23.634 -24.821 -25.984 -26.966 -27.798 -28.567 -29.323 -30.031 -30.666 -31.321 -31.893 -32.394 -32.912 -33.447 -33.901 -34.342 -34.808 -35.185 -35.567 -35.96 -36.364 -36.781 -37.072 -37.372 -37.818 -38.144 -38.491 -38.662 -39.029 -39.432 -39.849 -40.058 -40.783 -40.748 -40.991 -41.246 -41.827 -42.158 -42.507 -42.865 -43.291 -43.814 -44.444 -46.279 -5 ,27386 ,TETRA ,17526494,Thu Nov 25 03:39:02 CET,Thu Nov 25 05:32:11 CET,0.0 0.838 1.247 1.55 1.762 1.947 2.124 2.269 2.504 2.611 2.715 2.445 3.002 3.1 3.262 3.405 3.526 3.573 3.662 3.752 3.88 3.965 4.046 4.148 4.245 4.341 4.409 4.47 4.551 4.617 4.684 4.744 4.776 4.8 4.808 4.793 4.767 4.726 4.67 4.592 4.456 4.276 4.046 3.762 3.346 2.783 2.027 0.978 -0.524 -2.746 -6.295 -10.308 -13.472 -16.107 -18.261 -20.086 -21.64 -23.027 -24.212 -25.345 -26.291 -27.166 -27.988 -28.701 -29.391 -30.055 -30.731 -31.339 -31.865 -32.408 -32.965 -33.425 -33.908 -34.417 -34.79 -35.153 -35.543 -35.936 -36.334 -36.625 -36.938 -37.384 -37.697 -38.031 -38.2 -38.552 -38.935 -39.344 -39.543 -40.259 -40.2 -40.451 -40.71 -41.257 -41.576 -41.922 -42.282 -42.683 -43.184 -43.778 -45.284 -6 ,24571 ,TETRA ,17526495,Thu Nov 25 03:39:03 CET,Thu Nov 25 05:31:39 CET,0.0 1.048 1.401 1.66 1.845 2.009 2.164 2.323 2.605 2.721 2.822 2.539 3.088 3.167 3.307 3.43 3.538 3.593 3.697 3.799 3.935 4.001 4.055 4.135 4.213 4.287 4.362 4.427 4.493 4.55 4.592 4.644 4.689 4.707 4.716 4.714 4.679 4.645 4.622 4.564 4.455 4.298 4.095 3.818 3.395 2.844 2.113 1.129 -0.32 -2.489 -5.989 -10.001 -13.243 -15.948 -18.135 -20.014 -21.618 -23.024 -24.254 -25.472 -26.493 -27.377 -28.199 -28.999 -29.743 -30.396 -31.094 -31.719 -32.222 -32.725 -33.275 -33.739 -34.197 -34.672 -35.041 -35.421 -35.828 -36.232 -36.623 -36.898 -37.196 -37.651 -37.957 -38.281 -38.45 -38.813 -39.196 -39.598 -39.816 -40.548 -40.498 -40.736 -40.985 -41.526 -41.834 -42.186 -42.584 -43.02 -43.502 -44.14 -45.867 -8 ,22937 ,TETRA ,17526497,Thu Nov 25 03:39:07 CET,Thu Nov 25 05:31:18 CET,0.0 0.834 1.208 1.508 1.711 1.905 2.095 2.247 2.503 2.626 2.738 2.456 2.997 3.084 3.257 3.391 3.507 3.555 3.658 3.761 3.867 3.927 3.991 4.077 4.133 4.181 4.236 4.288 4.356 4.412 4.453 4.495 4.531 4.563 4.573 4.562 4.537 4.508 4.456 4.355 4.22 4.027 3.773 3.471 3.049 2.478 1.698 0.645 -0.851 -3.081 -6.668 -10.726 -13.935 -16.603 -18.831 -20.717 -22.298 -23.686 -24.846 -25.983 -26.967 -27.84 -28.658 -29.455 -30.192 -30.827 -31.489 -32.067 -32.547 -33.047 -33.61 -34.096 -34.568 -35.049 -35.424 -35.802 -36.178 -36.573 -36.984 -37.277 -37.587 -38.044 -38.354 -38.66 -38.816 -39.155 -39.523 -39.893 -40.084 -40.81 -40.735 -40.961 -41.202 -41.728 -42.018 -42.336 -42.7 -43.148 -43.672 -44.267 -45.968 -10 ,7412 ,TETRA ,17526499,Thu Nov 25 03:39:02 CET,Thu Nov 25 05:30:43 CET,0.0 0.957 1.326 1.587 1.785 1.968 2.127 2.261 2.501 2.602 2.697 2.434 2.987 3.064 3.203 3.348 3.498 3.567 3.676 3.764 3.891 3.972 4.055 4.156 4.237 4.32 4.394 4.461 4.542 4.605 4.657 4.709 4.753 4.791 4.82 4.822 4.802 4.767 4.736 4.681 4.577 4.41 4.159 3.865 3.446 2.903 2.158 1.149 -0.352 -2.565 -6.118 -10.223 -13.421 -16.025 -18.183 -20.044 -21.575 -22.993 -24.226 -25.378 -26.366 -27.248 -28.106 -28.903 -29.616 -30.28 -30.985 -31.61 -32.141 -32.705 -33.278 -33.724 -34.184 -34.704 -35.112 -35.511 -35.917 -36.329 -36.753 -37.04 -37.352 -37.831 -38.152 -38.501 -38.685 -39.058 -39.438 -39.848 -40.064 -40.79 -40.748 -40.992 -41.237 -41.735 -42.005 -42.305 -42.667 -43.078 -43.556 -44.226 -46.246 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_28_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_28_30.txt deleted file mode 100644 index 1cbeb321..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_28_30.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3965 ,TETRA ,17526501,Thu Nov 25 03:39:03 CET,Thu Nov 25 05:32:08 CET,0.0 1.03 1.532 1.923 2.266 2.557 2.817 3.049 3.486 3.689 3.892 3.836 4.484 4.662 4.992 5.315 5.627 5.776 6.059 6.345 6.761 7.031 7.299 7.682 8.05 8.407 8.756 9.106 9.565 10.003 10.435 10.973 11.509 12.014 12.616 13.309 13.972 14.726 15.544 16.427 17.376 18.45 19.714 21.026 22.591 24.384 26.52 28.991 31.959 35.617 40.463 44.915 47.759 49.707 51.114 52.176 52.954 53.552 53.988 54.368 54.664 54.893 55.062 55.201 55.314 55.395 55.469 55.515 55.502 55.448 55.391 55.358 55.329 55.293 55.268 55.233 55.182 55.128 55.067 55.016 54.959 54.85 54.765 54.674 54.62 54.519 54.405 54.246 54.166 53.69 53.918 53.811 53.701 53.474 53.352 53.218 53.065 52.879 52.627 52.265 51.107 -2 ,1226 ,TETRA ,17526503,Thu Nov 25 03:39:06 CET,Thu Nov 25 05:31:40 CET,0.0 1.096 1.569 1.955 2.274 2.54 2.796 3.052 3.519 3.735 3.947 3.884 4.54 4.727 5.086 5.424 5.725 5.872 6.17 6.467 6.885 7.169 7.454 7.845 8.227 8.605 8.968 9.33 9.797 10.233 10.665 11.201 11.723 12.228 12.815 13.504 14.181 14.923 15.727 16.611 17.563 18.643 19.932 21.235 22.782 24.581 26.7 29.182 32.242 36.039 40.978 45.389 48.183 50.093 51.462 52.502 53.243 53.818 54.244 54.617 54.891 55.075 55.235 55.362 55.452 55.519 55.581 55.621 55.635 55.648 55.647 55.627 55.593 55.551 55.508 55.458 55.394 55.316 55.229 55.155 55.073 54.948 54.849 54.741 54.691 54.585 54.47 54.348 54.283 53.809 54.041 53.944 53.835 53.583 53.429 53.248 53.045 52.792 52.489 52.096 50.992 -3 ,13536 ,TETRA ,17526504,Thu Nov 25 03:39:03 CET,Thu Nov 25 05:32:35 CET,0.0 0.744 1.17 1.557 1.888 2.17 2.431 2.686 3.114 3.302 3.506 3.449 4.088 4.26 4.588 4.903 5.204 5.351 5.637 5.91 6.303 6.557 6.801 7.163 7.53 7.88 8.225 8.568 9.012 9.444 9.862 10.396 10.91 11.387 11.96 12.627 13.299 14.052 14.857 15.719 16.625 17.664 18.919 20.203 21.744 23.533 25.703 28.264 31.32 35.072 39.95 44.336 47.117 49.043 50.439 51.492 52.263 52.865 53.315 53.698 53.975 54.184 54.359 54.492 54.596 54.673 54.724 54.749 54.766 54.777 54.763 54.743 54.72 54.671 54.621 54.573 54.524 54.466 54.398 54.337 54.257 54.132 54.05 53.97 53.923 53.812 53.708 53.582 53.506 53.018 53.208 53.097 52.984 52.747 52.606 52.43 52.216 51.977 51.677 51.216 50.019 -4 ,10056 ,TETRA ,17526505,Thu Nov 25 03:39:06 CET,Thu Nov 25 05:32:46 CET,0.0 1.038 1.415 1.742 2.066 2.348 2.6 2.844 3.259 3.454 3.65 3.546 4.179 4.347 4.68 5.002 5.312 5.461 5.754 6.05 6.489 6.77 7.041 7.433 7.802 8.159 8.507 8.853 9.311 9.753 10.184 10.711 11.23 11.735 12.321 12.987 13.654 14.399 15.184 16.012 16.92 17.974 19.198 20.483 22.053 23.857 25.995 28.49 31.595 35.348 40.121 44.453 47.204 49.109 50.507 51.542 52.298 52.893 53.33 53.688 53.954 54.161 54.317 54.434 54.51 54.55 54.59 54.63 54.648 54.641 54.618 54.6 54.576 54.534 54.492 54.453 54.404 54.332 54.25 54.178 54.104 54.015 53.948 53.864 53.814 53.709 53.597 53.453 53.373 52.892 53.118 53.019 52.907 52.644 52.474 52.278 52.086 51.846 51.532 51.057 49.79 -5 ,13950 ,TETRA ,17526506,Thu Nov 25 03:39:08 CET,Thu Nov 25 05:32:09 CET,0.0 1.024 1.5 1.878 2.141 2.383 2.608 2.831 3.259 3.454 3.643 3.559 4.197 4.355 4.678 4.995 5.285 5.424 5.705 5.984 6.39 6.667 6.943 7.311 7.659 8.009 8.355 8.696 9.143 9.573 9.997 10.534 11.056 11.552 12.111 12.751 13.392 14.099 14.867 15.712 16.616 17.647 18.905 20.232 21.803 23.583 25.745 28.273 31.307 35.102 39.936 44.271 47.061 49.009 50.414 51.445 52.227 52.817 53.243 53.634 53.925 54.138 54.321 54.462 54.57 54.649 54.719 54.769 54.8 54.819 54.83 54.835 54.828 54.789 54.737 54.68 54.627 54.567 54.481 54.413 54.349 54.243 54.158 54.056 54.009 53.923 53.801 53.655 53.566 53.057 53.269 53.177 53.077 52.811 52.644 52.464 52.275 52.055 51.761 51.335 50.141 -6 ,6501 ,TETRA ,17526507,Thu Nov 25 03:39:03 CET,Thu Nov 25 05:31:32 CET,0.0 1.1 1.589 1.999 2.343 2.643 2.908 3.16 3.621 3.829 4.025 3.943 4.586 4.766 5.105 5.416 5.714 5.86 6.147 6.431 6.85 7.116 7.381 7.766 8.13 8.488 8.843 9.184 9.619 10.052 10.489 11.026 11.551 12.053 12.629 13.291 13.938 14.658 15.444 16.296 17.225 18.305 19.563 20.841 22.393 24.19 26.315 28.803 31.888 35.673 40.538 44.964 47.785 49.717 51.088 52.136 52.913 53.53 54.006 54.406 54.696 54.921 55.121 55.273 55.372 55.434 55.487 55.521 55.534 55.538 55.529 55.505 55.467 55.428 55.391 55.338 55.261 55.186 55.122 55.064 54.996 54.871 54.776 54.68 54.628 54.515 54.373 54.199 54.106 53.607 53.8 53.699 53.602 53.38 53.259 53.109 52.93 52.71 52.44 52.095 51.061 -7 ,22293 ,TETRA ,17526508,Thu Nov 25 03:39:03 CET,Thu Nov 25 05:31:38 CET,0.0 0.922 1.401 1.734 2.017 2.295 2.559 2.815 3.269 3.487 3.686 3.608 4.253 4.42 4.747 5.072 5.385 5.533 5.821 6.097 6.503 6.774 7.041 7.439 7.826 8.192 8.542 8.888 9.337 9.775 10.217 10.751 11.278 11.796 12.391 13.067 13.724 14.455 15.269 16.153 17.089 18.159 19.439 20.786 22.392 24.184 26.294 28.825 31.941 35.738 40.636 45.008 47.806 49.736 51.152 52.182 52.903 53.482 53.931 54.32 54.6 54.806 54.969 55.075 55.151 55.216 55.259 55.277 55.286 55.29 55.27 55.24 55.22 55.185 55.144 55.105 55.066 55.003 54.92 54.865 54.809 54.708 54.63 54.551 54.509 54.412 54.292 54.142 54.051 53.553 53.703 53.574 53.47 53.228 53.069 52.899 52.712 52.519 52.28 51.921 50.758 -9 ,16862 ,TETRA ,17526510,Thu Nov 25 03:39:06 CET,Thu Nov 25 05:31:23 CET,0.0 1.134 1.637 2.055 2.416 2.717 2.98 3.23 3.689 3.892 4.105 4.079 4.735 4.911 5.251 5.581 5.903 6.057 6.369 6.664 7.073 7.348 7.61 7.984 8.364 8.734 9.084 9.444 9.91 10.345 10.782 11.315 11.819 12.311 12.889 13.555 14.211 14.943 15.743 16.58 17.477 18.53 19.786 21.064 22.599 24.349 26.419 28.87 31.857 35.531 40.309 44.599 47.343 49.298 50.693 51.695 52.438 53.039 53.48 53.85 54.126 54.344 54.521 54.66 54.779 54.867 54.941 54.977 54.988 54.997 54.999 54.988 54.971 54.944 54.92 54.894 54.858 54.81 54.752 54.699 54.637 54.534 54.452 54.364 54.319 54.223 54.108 53.978 53.9 53.424 53.678 53.589 53.495 53.282 53.165 53.028 52.862 52.661 52.375 51.961 50.992 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_29_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_29_28.txt deleted file mode 100644 index ccb656f4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_29_28.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12785 ,TETRA ,17526512,Thu Nov 25 03:39:10 CET,Thu Nov 25 05:31:35 CET,0.0 0.569 0.81 0.999 1.153 1.285 1.407 1.503 1.648 1.737 1.829 1.563 2.044 2.117 2.259 2.371 2.465 2.514 2.601 2.676 2.784 2.856 2.92 2.994 3.06 3.122 3.177 3.217 3.262 3.31 3.35 3.378 3.41 3.437 3.446 3.437 3.414 3.364 3.283 3.179 3.053 2.872 2.621 2.302 1.847 1.266 0.47 -0.591 -2.117 -4.372 -7.896 -11.851 -14.932 -17.478 -19.59 -21.398 -22.988 -24.391 -25.508 -26.577 -27.509 -28.356 -29.186 -29.952 -30.644 -31.291 -31.955 -32.529 -33.025 -33.554 -34.107 -34.562 -35.03 -35.503 -35.856 -36.208 -36.581 -36.964 -37.35 -37.627 -37.911 -38.322 -38.599 -38.896 -39.051 -39.383 -39.733 -40.091 -40.277 -40.921 -40.856 -41.072 -41.296 -41.77 -42.026 -42.296 -42.604 -42.956 -43.372 -43.926 -45.295 -2 ,23400 ,TETRA ,17526513,Thu Nov 25 03:39:03 CET,Thu Nov 25 05:33:18 CET,0.0 0.896 1.281 1.52 1.721 1.902 2.054 2.189 2.417 2.521 2.615 2.373 2.847 2.914 3.045 3.163 3.268 3.314 3.407 3.491 3.6 3.671 3.737 3.821 3.895 3.957 4.012 4.058 4.103 4.141 4.173 4.219 4.248 4.26 4.272 4.265 4.247 4.225 4.184 4.108 3.988 3.815 3.578 3.295 2.86 2.251 1.461 0.382 -1.167 -3.384 -6.912 -10.883 -13.934 -16.49 -18.631 -20.462 -22.007 -23.382 -24.55 -25.658 -26.58 -27.406 -28.213 -28.961 -29.634 -30.243 -30.865 -31.419 -31.903 -32.397 -32.89 -33.291 -33.723 -34.182 -34.537 -34.891 -35.256 -35.637 -36.018 -36.288 -36.573 -37.018 -37.333 -37.649 -37.81 -38.15 -38.513 -38.899 -39.104 -39.776 -39.741 -39.966 -40.226 -40.77 -41.06 -41.37 -41.731 -42.165 -42.639 -43.306 -45.113 -3 ,6277 ,TETRA ,17526514,Thu Nov 25 03:39:05 CET,Thu Nov 25 05:33:43 CET,0.0 0.535 0.797 0.993 1.156 1.287 1.399 1.505 1.698 1.785 1.863 1.605 2.095 2.16 2.271 2.362 2.454 2.503 2.59 2.664 2.749 2.794 2.847 2.918 2.969 3.022 3.083 3.145 3.214 3.272 3.327 3.378 3.408 3.419 3.41 3.398 3.375 3.327 3.268 3.171 3.021 2.827 2.554 2.208 1.765 1.178 0.356 -0.724 -2.271 -4.56 -8.143 -12.127 -15.218 -17.772 -19.878 -21.69 -23.26 -24.65 -25.843 -27.017 -27.959 -28.791 -29.596 -30.352 -31.032 -31.631 -32.256 -32.807 -33.289 -33.811 -34.347 -34.786 -35.242 -35.687 -36.03 -36.39 -36.762 -37.154 -37.566 -37.853 -38.138 -38.567 -38.869 -39.18 -39.34 -39.673 -40.028 -40.405 -40.604 -41.271 -41.23 -41.441 -41.664 -42.163 -42.433 -42.723 -43.045 -43.412 -43.87 -44.405 -45.478 -4 ,7663 ,TETRA ,17526515,Thu Nov 25 03:39:07 CET,Thu Nov 25 05:33:30 CET,0.0 0.838 1.19 1.456 1.663 1.842 1.965 2.079 2.308 2.422 2.532 2.297 2.784 2.857 3.007 3.148 3.272 3.328 3.425 3.525 3.65 3.708 3.765 3.844 3.921 3.988 4.039 4.091 4.157 4.202 4.235 4.263 4.273 4.287 4.298 4.29 4.272 4.235 4.173 4.071 3.94 3.76 3.509 3.203 2.749 2.156 1.376 0.308 -1.197 -3.384 -6.917 -10.916 -14.028 -16.557 -18.673 -20.502 -22.04 -23.376 -24.489 -25.583 -26.532 -27.387 -28.186 -28.919 -29.608 -30.248 -30.901 -31.471 -31.939 -32.428 -32.958 -33.371 -33.801 -34.27 -34.631 -34.99 -35.377 -35.783 -36.194 -36.477 -36.762 -37.206 -37.513 -37.829 -37.99 -38.314 -38.659 -39.019 -39.208 -39.874 -39.835 -40.063 -40.309 -40.806 -41.07 -41.356 -41.683 -42.074 -42.498 -43.019 -44.386 -5 ,12912 ,TETRA ,17526516,Thu Nov 25 03:39:34 CET,Thu Nov 25 05:34:12 CET,0.0 0.602 0.859 1.028 1.182 1.327 1.447 1.549 1.729 1.813 1.896 1.62 2.092 2.148 2.263 2.37 2.464 2.51 2.601 2.676 2.769 2.83 2.884 2.942 3.012 3.07 3.106 3.134 3.169 3.199 3.216 3.229 3.232 3.219 3.199 3.167 3.127 3.074 3.005 2.893 2.738 2.545 2.275 1.953 1.511 0.904 0.083 -0.983 -2.458 -4.675 -8.233 -12.162 -15.182 -17.792 -19.97 -21.74 -23.23 -24.564 -25.72 -26.879 -27.865 -28.718 -29.485 -30.187 -30.84 -31.432 -32.06 -32.611 -33.088 -33.581 -34.09 -34.523 -34.985 -35.454 -35.796 -36.154 -36.525 -36.896 -37.285 -37.563 -37.857 -38.336 -38.675 -39.011 -39.181 -39.516 -39.859 -40.252 -40.465 -41.128 -41.075 -41.295 -41.521 -42.046 -42.353 -42.654 -42.964 -43.288 -43.668 -44.189 -45.377 -6 ,18794 ,TETRA ,17526517,Thu Nov 25 03:39:34 CET,Thu Nov 25 05:33:50 CET,0.0 0.844 1.193 1.441 1.641 1.844 2.021 2.146 2.354 2.466 2.565 2.288 2.768 2.835 2.945 3.032 3.113 3.158 3.245 3.313 3.396 3.451 3.501 3.581 3.662 3.727 3.788 3.837 3.88 3.901 3.926 3.958 3.969 3.97 3.959 3.929 3.877 3.799 3.707 3.609 3.476 3.265 2.978 2.651 2.193 1.612 0.847 -0.213 -1.73 -3.909 -7.367 -11.347 -14.452 -16.956 -19.056 -20.868 -22.38 -23.76 -24.918 -26.034 -26.993 -27.83 -28.627 -29.365 -30.05 -30.652 -31.263 -31.816 -32.283 -32.763 -33.254 -33.66 -34.093 -34.546 -34.904 -35.274 -35.642 -36.006 -36.389 -36.656 -36.929 -37.351 -37.647 -37.982 -38.154 -38.487 -38.836 -39.21 -39.418 -40.084 -40.029 -40.245 -40.47 -40.965 -41.231 -41.525 -41.878 -42.289 -42.713 -43.193 -44.594 -7 ,3948 ,TETRA ,17526518,Thu Nov 25 03:39:36 CET,Thu Nov 25 05:33:31 CET,0.0 0.943 1.339 1.623 1.846 2.017 2.137 2.239 2.458 2.555 2.641 2.383 2.869 2.934 3.056 3.147 3.233 3.277 3.356 3.436 3.55 3.609 3.659 3.748 3.826 3.872 3.914 3.957 3.995 4.02 4.039 4.055 4.063 4.067 4.052 4.015 3.969 3.9 3.825 3.735 3.609 3.41 3.136 2.821 2.38 1.785 0.956 -0.122 -1.624 -3.83 -7.311 -11.239 -14.353 -16.922 -19.038 -20.879 -22.459 -23.818 -24.982 -26.109 -27.065 -27.931 -28.73 -29.486 -30.19 -30.82 -31.46 -32.028 -32.51 -32.988 -33.478 -33.898 -34.335 -34.783 -35.129 -35.49 -35.868 -36.255 -36.653 -36.931 -37.221 -37.661 -37.958 -38.261 -38.425 -38.783 -39.158 -39.566 -39.789 -40.46 -40.412 -40.632 -40.864 -41.355 -41.638 -41.97 -42.323 -42.705 -43.118 -43.691 -44.975 -8 ,13322 ,TETRA ,17526519,Thu Nov 25 03:39:38 CET,Thu Nov 25 05:33:22 CET,0.0 0.625 0.967 1.255 1.461 1.651 1.808 1.928 2.134 2.229 2.321 2.079 2.567 2.631 2.744 2.844 2.941 2.992 3.087 3.178 3.286 3.351 3.417 3.499 3.576 3.65 3.705 3.743 3.779 3.814 3.855 3.888 3.896 3.901 3.892 3.858 3.824 3.773 3.687 3.583 3.432 3.226 2.957 2.634 2.183 1.587 0.792 -0.267 -1.762 -4.004 -7.564 -11.531 -14.639 -17.178 -19.277 -21.084 -22.575 -23.927 -25.128 -26.317 -27.346 -28.267 -29.098 -29.847 -30.537 -31.164 -31.828 -32.403 -32.884 -33.398 -33.927 -34.365 -34.823 -35.286 -35.625 -35.97 -36.337 -36.717 -37.133 -37.41 -37.692 -38.154 -38.458 -38.76 -38.918 -39.254 -39.62 -40.002 -40.199 -40.869 -40.86 -41.101 -41.35 -41.855 -42.114 -42.403 -42.732 -43.093 -43.509 -44.097 -45.603 -9 ,32435 ,TETRA ,17526520,Thu Nov 25 03:39:34 CET,Thu Nov 25 05:33:29 CET,0.0 0.765 1.121 1.378 1.563 1.737 1.882 2.021 2.283 2.394 2.493 2.257 2.751 2.828 2.968 3.092 3.206 3.264 3.365 3.441 3.531 3.583 3.635 3.709 3.772 3.826 3.874 3.911 3.941 3.969 4.0 4.028 4.051 4.07 4.065 4.033 3.987 3.919 3.844 3.757 3.637 3.455 3.177 2.865 2.452 1.865 1.06 -0.026 -1.56 -3.739 -7.253 -11.213 -14.32 -16.866 -18.956 -20.766 -22.272 -23.559 -24.658 -25.791 -26.757 -27.6 -28.392 -29.117 -29.795 -30.418 -31.056 -31.62 -32.107 -32.597 -33.102 -33.55 -34.015 -34.471 -34.82 -35.188 -35.568 -35.957 -36.352 -36.616 -36.888 -37.317 -37.611 -37.919 -38.078 -38.405 -38.759 -39.12 -39.301 -39.946 -39.896 -40.109 -40.332 -40.85 -41.136 -41.439 -41.79 -42.201 -42.667 -43.238 -44.793 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_29_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_29_30.txt deleted file mode 100644 index 6f5ce49f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_29_30.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1874 ,TETRA ,17526522,Thu Nov 25 03:39:35 CET,Thu Nov 25 05:32:10 CET,0.0 0.705 1.077 1.38 1.625 1.837 2.04 2.218 2.514 2.656 2.806 2.662 3.185 3.291 3.506 3.706 3.893 3.982 4.153 4.315 4.534 4.678 4.828 5.046 5.248 5.445 5.639 5.834 6.081 6.313 6.546 6.832 7.105 7.361 7.651 7.973 8.28 8.622 8.984 9.336 9.697 10.13 10.622 11.118 11.714 12.354 13.086 13.856 14.688 15.59 16.483 16.992 17.085 16.978 16.799 16.563 16.307 16.044 15.766 15.475 15.216 14.973 14.725 14.463 14.219 13.984 13.707 13.468 13.266 13.041 12.788 12.574 12.363 12.155 11.987 11.801 11.618 11.421 11.196 11.034 10.859 10.569 10.368 10.161 10.054 9.851 9.632 9.377 9.233 8.687 8.797 8.63 8.449 8.045 7.798 7.529 7.25 6.896 6.483 5.975 4.422 -3 ,6560 ,TETRA ,17526524,Thu Nov 25 03:39:35 CET,Thu Nov 25 05:34:15 CET,0.0 0.46 0.789 1.066 1.277 1.471 1.647 1.795 2.05 2.169 2.283 2.089 2.61 2.715 2.898 3.066 3.244 3.336 3.512 3.678 3.926 4.083 4.243 4.493 4.713 4.921 5.129 5.313 5.543 5.771 6.001 6.269 6.519 6.768 7.042 7.33 7.626 7.968 8.345 8.741 9.168 9.647 10.168 10.672 11.228 11.825 12.493 13.262 14.148 15.042 15.928 16.479 16.549 16.377 16.159 15.943 15.686 15.401 15.126 14.812 14.54 14.278 13.998 13.73 13.49 13.264 13.001 12.755 12.541 12.307 12.082 11.902 11.692 11.464 11.275 11.071 10.869 10.674 10.463 10.3 10.123 9.86 9.682 9.495 9.386 9.149 8.924 8.699 8.574 8.038 8.155 7.994 7.816 7.426 7.216 6.991 6.713 6.381 5.992 5.429 3.33 -4 ,10942 ,TETRA ,17526525,Thu Nov 25 03:39:37 CET,Thu Nov 25 05:34:26 CET,0.0 0.65 0.991 1.267 1.487 1.686 1.878 2.049 2.343 2.476 2.599 2.421 2.955 3.068 3.27 3.46 3.644 3.73 3.898 4.07 4.319 4.477 4.629 4.852 5.067 5.273 5.466 5.646 5.874 6.095 6.321 6.598 6.847 7.089 7.377 7.696 8.004 8.345 8.703 9.059 9.418 9.828 10.297 10.757 11.308 11.902 12.574 13.347 14.208 15.131 16.045 16.498 16.589 16.481 16.274 16.03 15.748 15.432 15.139 14.844 14.56 14.285 14.0 13.701 13.425 13.186 12.927 12.687 12.475 12.24 11.99 11.772 11.551 11.336 11.152 10.951 10.744 10.523 10.296 10.143 9.981 9.71 9.518 9.313 9.206 9.001 8.784 8.512 8.359 7.811 7.895 7.717 7.536 7.136 6.89 6.63 6.391 6.116 5.731 5.241 3.828 -5 ,12624 ,TETRA ,17526526,Thu Nov 25 03:39:36 CET,Thu Nov 25 05:33:23 CET,0.0 0.819 1.146 1.372 1.568 1.77 1.961 2.122 2.399 2.544 2.686 2.529 3.065 3.179 3.395 3.609 3.81 3.905 4.084 4.253 4.514 4.684 4.836 5.055 5.278 5.491 5.689 5.874 6.118 6.355 6.569 6.833 7.094 7.356 7.663 8.003 8.33 8.671 9.041 9.44 9.861 10.358 10.929 11.466 12.051 12.699 13.431 14.186 15.029 15.945 16.832 17.3 17.383 17.256 17.037 16.736 16.419 16.146 15.889 15.591 15.314 15.051 14.805 14.555 14.284 14.049 13.821 13.594 13.392 13.183 12.961 12.757 12.524 12.292 12.117 11.925 11.719 11.503 11.272 11.104 10.941 10.689 10.492 10.283 10.172 9.935 9.701 9.436 9.29 8.739 8.818 8.641 8.451 8.016 7.787 7.554 7.311 7.025 6.672 6.18 4.745 -6 ,17502 ,TETRA ,17526527,Thu Nov 25 03:39:40 CET,Thu Nov 25 05:33:18 CET,0.0 0.469 0.746 0.954 1.132 1.304 1.465 1.614 1.892 2.017 2.143 1.991 2.518 2.619 2.834 3.032 3.197 3.275 3.426 3.585 3.832 3.983 4.12 4.322 4.525 4.724 4.906 5.084 5.331 5.57 5.788 6.032 6.277 6.526 6.801 7.102 7.391 7.727 8.113 8.497 8.872 9.323 9.856 10.339 10.897 11.552 12.279 13.056 13.932 14.93 15.916 16.373 16.426 16.303 16.072 15.815 15.577 15.307 15.05 14.772 14.486 14.216 13.964 13.712 13.46 13.22 12.949 12.702 12.494 12.272 12.033 11.823 11.602 11.371 11.184 10.977 10.757 10.551 10.336 10.171 9.995 9.716 9.512 9.296 9.193 8.986 8.736 8.472 8.348 7.826 7.945 7.776 7.603 7.194 6.964 6.717 6.418 6.071 5.691 5.187 3.647 -8 ,29509 ,TETRA ,17526529,Thu Nov 25 03:39:37 CET,Thu Nov 25 05:32:37 CET,0.0 0.352 0.601 0.817 1.019 1.19 1.351 1.499 1.763 1.894 2.034 1.907 2.437 2.547 2.755 2.954 3.149 3.244 3.429 3.611 3.873 4.036 4.194 4.418 4.634 4.851 5.065 5.268 5.509 5.731 5.948 6.201 6.446 6.692 6.965 7.266 7.564 7.896 8.258 8.642 9.053 9.498 10.011 10.512 11.098 11.745 12.437 13.198 14.063 15.0 15.911 16.416 16.462 16.276 16.028 15.769 15.496 15.2 14.92 14.606 14.29 14.005 13.698 13.392 13.124 12.863 12.572 12.306 12.092 11.877 11.633 11.421 11.204 10.991 10.817 10.628 10.429 10.218 10.006 9.849 9.676 9.409 9.231 9.033 8.921 8.687 8.448 8.226 8.104 7.557 7.642 7.489 7.333 6.961 6.763 6.541 6.288 5.956 5.499 4.982 3.36 -9 ,26455 ,TETRA ,17526530,Thu Nov 25 03:39:37 CET,Thu Nov 25 05:33:13 CET,0.0 0.475 0.784 1.023 1.224 1.408 1.561 1.702 1.973 2.102 2.223 2.061 2.589 2.694 2.901 3.102 3.304 3.402 3.588 3.765 4.033 4.194 4.338 4.554 4.763 4.961 5.153 5.342 5.585 5.817 6.04 6.311 6.564 6.806 7.095 7.407 7.693 8.013 8.364 8.736 9.123 9.556 10.049 10.551 11.158 11.831 12.544 13.318 14.167 15.09 16.077 16.592 16.667 16.541 16.31 16.069 15.839 15.549 15.228 14.9 14.642 14.384 14.112 13.828 13.558 13.333 13.1 12.868 12.659 12.452 12.209 11.991 11.769 11.541 11.359 11.169 10.976 10.775 10.566 10.418 10.256 9.993 9.812 9.628 9.532 9.33 9.104 8.843 8.712 8.183 8.302 8.14 7.974 7.636 7.432 7.187 6.932 6.659 6.31 5.832 4.251 -10 ,18232 ,TETRA ,17526531,Thu Nov 25 03:39:38 CET,Thu Nov 25 05:33:22 CET,0.0 0.722 1.055 1.326 1.55 1.74 1.922 2.09 2.378 2.513 2.648 2.489 3.022 3.132 3.327 3.517 3.713 3.813 4.013 4.197 4.446 4.608 4.768 5.0 5.215 5.418 5.618 5.82 6.083 6.317 6.543 6.844 7.113 7.351 7.649 7.984 8.307 8.676 9.051 9.423 9.806 10.267 10.815 11.32 11.885 12.514 13.227 13.992 14.854 15.823 16.82 17.333 17.392 17.252 16.998 16.694 16.374 16.042 15.741 15.431 15.156 14.897 14.624 14.338 14.064 13.818 13.553 13.311 13.101 12.873 12.629 12.425 12.215 11.989 11.788 11.575 11.381 11.172 10.923 10.757 10.597 10.338 10.145 9.924 9.813 9.606 9.379 9.112 8.973 8.419 8.489 8.315 8.126 7.722 7.508 7.264 6.98 6.615 6.191 5.641 3.883 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_30_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_30_1h1s.txt deleted file mode 100644 index af5cb9b8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_30_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3590 ,TETRA ,17526532,Thu Nov 25 03:39:40 CET,Thu Nov 25 05:30:13 CET,0.0 1.12 1.437 1.663 1.833 1.952 2.045 2.131 2.251 2.29 2.325 1.972 2.403 2.428 2.463 2.498 2.53 2.536 2.523 2.496 2.433 2.389 2.342 2.27 2.2 2.11 2.008 1.91 1.789 1.647 1.496 1.312 1.114 0.897 0.59 0.21 -0.179 -0.628 -1.138 -1.748 -2.446 -3.288 -4.351 -5.501 -6.977 -8.806 -11.166 -14.179 -18.222 -23.819 -32.128 -40.911 -47.448 -52.619 -56.852 -60.431 -63.373 -65.888 -67.963 -69.941 -71.609 -73.071 -74.433 -75.688 -76.834 -77.858 -78.872 -79.766 -80.542 -81.327 -82.119 -82.755 -83.405 -84.077 -84.583 -85.107 -85.648 -86.19 -86.746 -87.125 -87.511 -88.101 -88.507 -88.914 -89.12 -89.542 -89.968 -90.424 -90.67 -91.435 -91.429 -91.691 -91.957 -92.532 -92.857 -93.203 -93.591 -94.007 -94.44 -94.944 -96.254 -3 ,24452 ,TETRA ,17526534,Thu Nov 25 03:39:37 CET,Thu Nov 25 05:30:02 CET,0.0 0.804 0.989 1.117 1.227 1.344 1.441 1.517 1.66 1.717 1.77 1.475 1.907 1.921 1.954 1.977 1.968 1.966 1.961 1.932 1.868 1.818 1.766 1.687 1.613 1.534 1.435 1.323 1.169 1.015 0.847 0.605 0.363 0.12 -0.201 -0.578 -0.954 -1.406 -1.928 -2.518 -3.182 -3.991 -5.056 -6.241 -7.747 -9.586 -11.926 -14.93 -18.96 -24.566 -32.928 -41.723 -48.306 -53.53 -57.709 -61.209 -64.124 -66.637 -68.73 -70.749 -72.401 -73.832 -75.175 -76.397 -77.51 -78.508 -79.519 -80.394 -81.13 -81.889 -82.669 -83.313 -83.979 -84.648 -85.145 -85.656 -86.189 -86.724 -87.263 -87.641 -88.026 -88.603 -89.007 -89.422 -89.631 -90.067 -90.508 -90.964 -91.208 -91.968 -91.948 -92.2 -92.467 -93.041 -93.355 -93.69 -94.038 -94.411 -94.867 -95.47 -96.737 -5 ,14857 ,TETRA ,17526536,Thu Nov 25 03:39:39 CET,Thu Nov 25 05:32:22 CET,0.0 0.433 0.679 0.856 0.987 1.089 1.182 1.254 1.339 1.375 1.419 1.083 1.502 1.51 1.526 1.527 1.523 1.525 1.532 1.517 1.458 1.417 1.378 1.312 1.229 1.136 1.039 0.935 0.794 0.651 0.511 0.323 0.102 -0.125 -0.412 -0.778 -1.151 -1.607 -2.123 -2.706 -3.394 -4.248 -5.325 -6.487 -7.997 -9.849 -12.19 -15.142 -19.135 -24.723 -33.044 -41.836 -48.372 -53.539 -57.714 -61.237 -64.153 -66.713 -68.877 -70.963 -72.676 -74.139 -75.504 -76.767 -77.906 -78.902 -79.921 -80.804 -81.541 -82.309 -83.095 -83.724 -84.374 -85.052 -85.565 -86.079 -86.605 -87.155 -87.724 -88.106 -88.49 -89.093 -89.515 -89.938 -90.155 -90.597 -91.053 -91.535 -91.782 -92.547 -92.567 -92.846 -93.129 -93.716 -94.024 -94.362 -94.737 -95.159 -95.65 -96.242 -97.662 -6 ,19276 ,TETRA ,17526537,Thu Nov 25 03:39:42 CET,Thu Nov 25 05:32:14 CET,0.0 1.004 1.46 1.803 2.062 2.267 2.421 2.519 2.651 2.702 2.744 2.412 2.835 2.846 2.856 2.851 2.842 2.837 2.831 2.818 2.785 2.759 2.731 2.674 2.605 2.526 2.431 2.321 2.17 2.011 1.842 1.631 1.425 1.198 0.909 0.545 0.153 -0.298 -0.816 -1.414 -2.113 -2.968 -4.046 -5.233 -6.759 -8.639 -11.011 -13.983 -18.018 -23.626 -31.882 -40.681 -47.33 -52.569 -56.729 -60.243 -63.177 -65.685 -67.781 -69.858 -71.543 -72.972 -74.325 -75.584 -76.731 -77.74 -78.759 -79.656 -80.415 -81.183 -81.953 -82.573 -83.211 -83.87 -84.375 -84.891 -85.408 -85.933 -86.472 -86.836 -87.209 -87.782 -88.182 -88.601 -88.822 -89.269 -89.712 -90.185 -90.435 -91.201 -91.243 -91.532 -91.817 -92.407 -92.725 -93.067 -93.451 -93.893 -94.427 -95.098 -96.282 -7 ,26774 ,TETRA ,17526538,Thu Nov 25 03:39:38 CET,Thu Nov 25 05:31:14 CET,0.0 0.639 0.886 1.046 1.174 1.289 1.38 1.454 1.577 1.613 1.648 1.305 1.731 1.746 1.763 1.77 1.762 1.757 1.738 1.707 1.66 1.624 1.577 1.495 1.418 1.342 1.246 1.143 0.993 0.825 0.657 0.428 0.169 -0.091 -0.407 -0.784 -1.17 -1.625 -2.159 -2.782 -3.49 -4.363 -5.449 -6.607 -8.095 -9.929 -12.276 -15.253 -19.257 -24.828 -33.121 -41.94 -48.539 -53.765 -57.952 -61.451 -64.397 -66.933 -69.032 -71.059 -72.739 -74.202 -75.571 -76.82 -77.93 -78.933 -79.975 -80.885 -81.663 -82.458 -83.245 -83.881 -84.528 -85.193 -85.7 -86.215 -86.746 -87.284 -87.829 -88.2 -88.583 -89.188 -89.599 -90.001 -90.203 -90.626 -91.078 -91.536 -91.768 -92.528 -92.527 -92.784 -93.072 -93.714 -94.048 -94.376 -94.729 -95.144 -95.628 -96.199 -97.578 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_30_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_30_26.txt deleted file mode 100644 index 73c80696..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_30_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29998 ,KEBNE ,17125486,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:16:24 CET,0.0 0.948 1.474 1.923 2.317 2.698 3.035 3.345 3.906 4.16 4.417 4.499 5.126 5.351 5.796 6.226 6.625 6.819 7.2 7.579 8.152 8.526 8.893 9.43 9.95 10.455 10.936 11.413 12.038 12.632 13.221 13.95 14.672 15.391 16.221 17.16 18.089 19.14 20.31 21.595 22.971 24.573 26.531 28.512 30.87 33.627 36.995 41.01 45.91 52.14 60.427 68.088 73.182 76.838 79.482 81.497 83.074 84.363 85.36 86.255 86.952 87.505 87.973 88.381 88.736 89.025 89.286 89.472 89.625 89.782 89.905 89.981 90.053 90.114 90.158 90.203 90.231 90.254 90.26 90.244 90.224 90.181 90.152 90.122 90.101 90.042 89.969 89.885 89.836 89.465 89.62 89.543 89.456 89.246 89.12 88.978 88.795 88.564 88.234 87.725 86.29 -2 ,727 ,KEBNE ,17125487,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:14:22 CET,0.0 1.02 1.523 1.945 2.306 2.641 2.973 3.277 3.846 4.106 4.342 4.421 5.06 5.294 5.766 6.21 6.622 6.824 7.208 7.579 8.132 8.492 8.839 9.342 9.844 10.344 10.828 11.299 11.925 12.546 13.163 13.928 14.675 15.403 16.249 17.211 18.16 19.214 20.366 21.63 23.003 24.608 26.547 28.554 30.991 33.805 37.126 41.106 46.074 52.299 60.517 68.14 73.165 76.663 79.219 81.222 82.788 84.062 85.035 85.892 86.552 87.08 87.535 87.925 88.247 88.499 88.741 88.934 89.068 89.196 89.315 89.407 89.49 89.552 89.589 89.616 89.649 89.682 89.697 89.698 89.678 89.637 89.61 89.557 89.524 89.471 89.413 89.331 89.277 88.904 89.068 88.99 88.911 88.711 88.588 88.451 88.291 88.059 87.711 87.266 85.836 -3 ,883 ,KEBNE ,17125488,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:14:38 CET,0.0 1.441 1.975 2.439 2.829 3.161 3.463 3.747 4.267 4.527 4.793 4.904 5.545 5.764 6.191 6.614 7.033 7.235 7.622 8.001 8.562 8.929 9.29 9.822 10.339 10.839 11.32 11.792 12.399 12.994 13.601 14.35 15.07 15.766 16.592 17.551 18.491 19.546 20.712 21.983 23.372 25.012 26.956 28.951 31.37 34.142 37.458 41.429 46.369 52.629 60.99 68.603 73.607 77.128 79.67 81.636 83.173 84.422 85.384 86.259 86.922 87.453 87.91 88.29 88.606 88.859 89.1 89.309 89.471 89.612 89.738 89.83 89.925 90.012 90.061 90.094 90.104 90.104 90.103 90.092 90.059 89.992 89.945 89.873 89.829 89.747 89.661 89.56 89.502 89.128 89.252 89.145 89.043 88.808 88.655 88.47 88.269 88.063 87.745 87.195 85.341 -4 ,26005 ,KEBNE ,17125489,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:15:05 CET,0.0 1.088 1.633 2.067 2.425 2.74 3.041 3.344 3.899 4.151 4.391 4.441 5.062 5.288 5.729 6.15 6.549 6.737 7.119 7.495 8.038 8.392 8.748 9.269 9.765 10.265 10.763 11.246 11.861 12.464 13.062 13.795 14.518 15.235 16.088 17.079 18.042 19.092 20.24 21.515 22.902 24.485 26.39 28.389 30.798 33.6 36.971 40.926 45.831 52.052 60.305 67.902 72.898 76.437 79.046 81.081 82.619 83.836 84.789 85.651 86.324 86.867 87.336 87.752 88.089 88.359 88.614 88.822 88.997 89.156 89.284 89.368 89.439 89.495 89.541 89.585 89.615 89.635 89.64 89.627 89.609 89.574 89.533 89.482 89.45 89.379 89.297 89.199 89.145 88.784 88.985 88.915 88.827 88.608 88.453 88.282 88.088 87.853 87.569 87.115 85.099 -5 ,5875 ,KEBNE ,17125490,Thu Dec 30 16:35:27 CET,Thu Dec 30 18:14:35 CET,0.0 1.217 1.809 2.248 2.606 2.952 3.28 3.569 4.102 4.362 4.615 4.691 5.312 5.532 5.978 6.404 6.812 7.014 7.411 7.788 8.343 8.715 9.077 9.592 10.098 10.6 11.094 11.581 12.215 12.832 13.439 14.191 14.922 15.648 16.498 17.456 18.398 19.473 20.666 21.957 23.363 24.987 26.922 28.936 31.356 34.157 37.517 41.476 46.398 52.625 60.926 68.541 73.551 77.128 79.727 81.728 83.249 84.442 85.363 86.221 86.899 87.416 87.842 88.22 88.542 88.817 89.055 89.232 89.378 89.513 89.636 89.712 89.776 89.829 89.858 89.883 89.901 89.897 89.874 89.861 89.84 89.784 89.745 89.699 89.666 89.596 89.508 89.385 89.317 88.945 89.097 89.006 88.917 88.71 88.583 88.412 88.211 87.996 87.687 87.257 85.448 -6 ,14175 ,KEBNE ,17125491,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:13:45 CET,0.0 0.935 1.417 1.827 2.175 2.506 2.843 3.149 3.676 3.916 4.147 4.199 4.831 5.055 5.495 5.893 6.268 6.465 6.859 7.238 7.794 8.144 8.489 8.999 9.505 10.002 10.476 10.944 11.57 12.182 12.773 13.493 14.215 14.928 15.762 16.732 17.684 18.74 19.897 21.165 22.564 24.182 26.104 28.084 30.481 33.232 36.57 40.633 45.662 51.965 60.277 68.014 73.089 76.587 79.159 81.148 82.7 83.955 84.916 85.791 86.463 87.009 87.473 87.859 88.183 88.437 88.686 88.874 89.018 89.156 89.274 89.36 89.434 89.511 89.554 89.583 89.607 89.612 89.601 89.579 89.552 89.503 89.464 89.412 89.378 89.311 89.242 89.136 89.077 88.71 88.879 88.794 88.702 88.438 88.274 88.106 87.913 87.681 87.369 86.923 85.899 -7 ,21224 ,KEBNE ,17125492,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:14:48 CET,0.0 1.57 2.153 2.62 3.001 3.34 3.652 3.939 4.466 4.718 4.978 5.055 5.684 5.914 6.356 6.771 7.178 7.375 7.76 8.141 8.707 9.076 9.431 9.943 10.446 10.948 11.447 11.929 12.551 13.169 13.781 14.538 15.285 16.026 16.891 17.875 18.836 19.916 21.123 22.423 23.815 25.42 27.338 29.324 31.769 34.579 37.904 41.858 46.75 52.968 61.25 68.894 73.889 77.428 80.045 82.052 83.557 84.778 85.729 86.588 87.246 87.757 88.203 88.591 88.933 89.207 89.447 89.642 89.791 89.915 90.036 90.126 90.202 90.278 90.31 90.325 90.346 90.348 90.338 90.324 90.296 90.234 90.182 90.135 90.105 90.03 89.954 89.872 89.815 89.429 89.562 89.459 89.351 89.123 88.985 88.808 88.58 88.297 87.977 87.558 86.167 -8 ,28516 ,KEBNE ,17125493,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:14:09 CET,0.0 1.116 1.706 2.157 2.533 2.846 3.135 3.416 3.965 4.218 4.461 4.519 5.14 5.357 5.783 6.201 6.616 6.822 7.219 7.604 8.162 8.516 8.865 9.389 9.908 10.411 10.903 11.375 11.99 12.6 13.203 13.941 14.665 15.38 16.227 17.2 18.147 19.216 20.416 21.717 23.119 24.745 26.67 28.675 31.104 33.901 37.236 41.19 46.137 52.359 60.53 68.156 73.185 76.72 79.329 81.334 82.874 84.119 85.095 85.979 86.643 87.159 87.586 87.941 88.245 88.496 88.727 88.916 89.065 89.227 89.375 89.456 89.528 89.613 89.667 89.7 89.709 89.703 89.691 89.683 89.679 89.667 89.646 89.593 89.564 89.505 89.411 89.307 89.246 88.865 89.045 88.966 88.871 88.631 88.475 88.31 88.143 87.96 87.711 87.346 85.988 -9 ,8820 ,KEBNE ,17125494,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:14:58 CET,0.0 0.901 1.402 1.787 2.122 2.457 2.775 3.062 3.587 3.843 4.083 4.125 4.756 4.981 5.406 5.813 6.213 6.412 6.803 7.168 7.702 8.056 8.398 8.901 9.417 9.927 10.415 10.888 11.513 12.135 12.744 13.492 14.243 14.99 15.852 16.844 17.801 18.849 20.0 21.248 22.607 24.202 26.129 28.113 30.515 33.299 36.653 40.596 45.427 51.571 59.773 67.334 72.359 75.945 78.555 80.577 82.134 83.361 84.307 85.185 85.862 86.383 86.833 87.223 87.55 87.812 88.041 88.236 88.398 88.55 88.694 88.782 88.854 88.927 88.984 89.039 89.073 89.087 89.091 89.082 89.064 89.042 89.011 88.957 88.927 88.858 88.767 88.665 88.615 88.235 88.372 88.291 88.19 87.958 87.818 87.628 87.411 87.175 86.854 86.354 84.431 -10 ,16330 ,KEBNE ,17125495,Thu Dec 30 16:35:29 CET,Thu Dec 30 18:13:57 CET,0.0 1.117 1.715 2.235 2.644 2.97 3.276 3.584 4.145 4.41 4.668 4.736 5.362 5.59 6.042 6.489 6.91 7.11 7.511 7.904 8.457 8.809 9.155 9.672 10.193 10.692 11.173 11.653 12.272 12.876 13.481 14.219 14.935 15.64 16.474 17.444 18.392 19.44 20.589 21.849 23.213 24.804 26.74 28.73 31.127 33.921 37.295 41.246 46.061 52.233 60.627 68.425 73.541 77.122 79.732 81.736 83.26 84.488 85.447 86.338 87.027 87.575 88.051 88.463 88.8 89.051 89.268 89.443 89.592 89.719 89.82 89.895 89.964 90.03 90.064 90.077 90.086 90.09 90.078 90.059 90.036 90.003 89.975 89.935 89.9 89.817 89.713 89.571 89.496 89.115 89.27 89.176 89.07 88.835 88.683 88.523 88.321 88.025 87.657 87.136 85.609 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_30_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_30_31.txt deleted file mode 100644 index 2c21d108..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_30_31.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15201 ,TETRA ,17526542,Thu Nov 25 03:39:39 CET,Thu Nov 25 05:32:14 CET,0.0 0.983 1.344 1.658 1.943 2.212 2.446 2.646 3.03 3.206 3.385 3.338 3.911 4.08 4.419 4.751 5.059 5.206 5.518 5.824 6.225 6.489 6.762 7.141 7.514 7.899 8.259 8.598 9.044 9.482 9.918 10.443 10.947 11.441 12.011 12.658 13.298 14.015 14.797 15.636 16.546 17.607 18.882 20.19 21.761 23.568 25.717 28.232 31.287 35.119 40.129 44.665 47.506 49.431 50.798 51.793 52.523 53.052 53.436 53.765 54.03 54.257 54.406 54.508 54.612 54.711 54.794 54.848 54.88 54.9 54.914 54.907 54.878 54.838 54.809 54.782 54.731 54.642 54.547 54.478 54.396 54.274 54.189 54.091 54.035 53.926 53.829 53.703 53.632 53.202 53.367 53.262 53.14 52.895 52.738 52.565 52.362 52.105 51.819 51.429 50.053 -2 ,18370 ,TETRA ,17526600,Thu Nov 25 03:39:41 CET,Thu Nov 25 05:32:27 CET,0.0 0.935 1.346 1.681 1.95 2.179 2.398 2.622 3.044 3.25 3.437 3.379 3.956 4.125 4.445 4.769 5.087 5.229 5.489 5.744 6.128 6.375 6.622 6.994 7.354 7.725 8.085 8.421 8.87 9.299 9.711 10.24 10.781 11.285 11.873 12.557 13.207 13.928 14.741 15.64 16.576 17.64 18.908 20.191 21.747 23.552 25.688 28.208 31.318 35.064 39.866 44.214 46.982 48.908 50.301 51.354 52.079 52.622 53.045 53.411 53.683 53.885 54.036 54.154 54.24 54.296 54.329 54.352 54.366 54.358 54.335 54.308 54.276 54.245 54.221 54.196 54.156 54.087 54.002 53.935 53.862 53.762 53.698 53.621 53.579 53.487 53.374 53.26 53.204 52.783 52.931 52.816 52.694 52.412 52.256 52.097 51.881 51.64 51.394 50.986 49.471 -4 ,24007 ,TETRA ,17526609,Thu Nov 25 03:39:44 CET,Thu Nov 25 05:31:14 CET,0.0 1.205 1.681 2.051 2.372 2.639 2.886 3.135 3.592 3.796 4.003 4.001 4.594 4.785 5.15 5.499 5.816 5.962 6.25 6.53 6.935 7.194 7.452 7.848 8.231 8.604 8.976 9.338 9.79 10.218 10.646 11.178 11.716 12.223 12.777 13.415 14.071 14.816 15.624 16.524 17.492 18.581 19.84 21.134 22.709 24.5 26.65 29.184 32.229 36.0 40.904 45.269 48.068 50.019 51.428 52.495 53.265 53.862 54.3 54.655 54.927 55.147 55.334 55.46 55.543 55.618 55.684 55.744 55.763 55.75 55.737 55.707 55.655 55.609 55.579 55.54 55.483 55.407 55.31 55.242 55.177 55.071 54.986 54.898 54.849 54.741 54.626 54.505 54.43 53.991 54.127 54.006 53.882 53.615 53.484 53.345 53.162 52.961 52.697 52.3 51.211 -6 ,21 ,TETRA ,17526612,Thu Nov 25 03:39:39 CET,Thu Nov 25 05:31:16 CET,0.0 1.202 1.633 1.98 2.278 2.565 2.832 3.083 3.553 3.77 3.976 3.971 4.573 4.753 5.078 5.407 5.737 5.899 6.211 6.508 6.945 7.222 7.477 7.865 8.262 8.646 9.018 9.37 9.806 10.239 10.658 11.162 11.674 12.191 12.795 13.466 14.104 14.815 15.606 16.471 17.386 18.438 19.729 21.066 22.638 24.452 26.575 29.055 32.158 35.949 40.788 45.072 47.749 49.656 51.018 51.968 52.65 53.194 53.606 53.956 54.212 54.4 54.56 54.673 54.746 54.801 54.852 54.886 54.907 54.921 54.928 54.923 54.896 54.857 54.817 54.749 54.68 54.621 54.539 54.458 54.369 54.24 54.135 54.004 53.939 53.801 53.652 53.497 53.42 52.991 53.149 53.045 52.919 52.621 52.439 52.226 51.985 51.725 51.452 51.049 50.036 -7 ,25502 ,TETRA ,17526614,Thu Nov 25 03:40:07 CET,Thu Nov 25 05:32:14 CET,0.0 0.978 1.482 1.85 2.175 2.454 2.722 2.99 3.454 3.665 3.868 3.862 4.45 4.627 4.976 5.306 5.63 5.787 6.098 6.391 6.796 7.068 7.338 7.736 8.117 8.466 8.784 9.093 9.503 9.909 10.307 10.811 11.308 11.778 12.339 12.988 13.614 14.306 15.067 15.921 16.873 17.975 19.292 20.613 22.173 23.98 26.138 28.647 31.726 35.516 40.228 44.422 47.107 48.973 50.335 51.374 52.144 52.74 53.189 53.563 53.833 54.045 54.222 54.36 54.467 54.541 54.598 54.653 54.677 54.676 54.647 54.619 54.608 54.579 54.52 54.442 54.352 54.257 54.158 54.088 54.019 53.902 53.804 53.716 53.668 53.547 53.427 53.284 53.2 52.773 52.939 52.83 52.724 52.447 52.265 52.067 51.858 51.612 51.32 50.962 49.924 -8 ,20606 ,TETRA ,17526617,Thu Nov 25 03:40:08 CET,Thu Nov 25 05:32:14 CET,0.0 0.912 1.356 1.756 2.082 2.362 2.62 2.861 3.336 3.549 3.741 3.691 4.257 4.42 4.757 5.086 5.408 5.57 5.871 6.154 6.577 6.852 7.119 7.518 7.908 8.286 8.651 9.009 9.459 9.903 10.346 10.893 11.43 11.928 12.502 13.166 13.8 14.516 15.321 16.175 17.084 18.142 19.395 20.672 22.201 24.001 26.183 28.707 31.733 35.425 40.303 44.757 47.516 49.392 50.746 51.787 52.553 53.114 53.514 53.855 54.116 54.321 54.472 54.58 54.66 54.722 54.775 54.806 54.827 54.835 54.842 54.841 54.825 54.801 54.773 54.717 54.641 54.566 54.495 54.442 54.381 54.264 54.167 54.077 54.031 53.942 53.844 53.705 53.627 53.199 53.379 53.286 53.178 52.921 52.764 52.561 52.361 52.162 51.902 51.565 50.602 -9 ,23688 ,TETRA ,17526618,Thu Nov 25 03:40:11 CET,Thu Nov 25 05:32:22 CET,0.0 1.277 1.775 2.179 2.494 2.773 3.029 3.279 3.744 3.954 4.164 4.165 4.762 4.945 5.308 5.654 5.972 6.127 6.428 6.708 7.106 7.369 7.627 8.01 8.369 8.724 9.074 9.414 9.88 10.335 10.775 11.296 11.795 12.291 12.872 13.529 14.19 14.928 15.733 16.621 17.562 18.618 19.865 21.18 22.766 24.567 26.74 29.302 32.413 36.219 41.087 45.453 48.269 50.176 51.52 52.55 53.279 53.812 54.23 54.582 54.836 55.033 55.193 55.319 55.417 55.484 55.532 55.549 55.547 55.546 55.55 55.55 55.54 55.511 55.459 55.401 55.347 55.265 55.178 55.126 55.061 54.944 54.867 54.778 54.728 54.623 54.507 54.385 54.307 53.861 54.005 53.909 53.792 53.523 53.371 53.205 53.027 52.828 52.595 52.276 51.03 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_31_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_31_26.txt deleted file mode 100644 index ae2b89bd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_31_26.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5130 ,TETRA ,17526661,Thu Nov 25 03:40:08 CET,Thu Nov 25 05:31:18 CET,0.0 1.194 1.699 2.085 2.409 2.702 2.985 3.238 3.664 3.867 4.063 4.081 4.596 4.757 5.069 5.362 5.658 5.8 6.077 6.354 6.739 6.976 7.21 7.556 7.896 8.238 8.568 8.889 9.317 9.726 10.107 10.57 11.027 11.464 11.981 12.577 13.138 13.723 14.353 15.042 15.798 16.676 17.692 18.722 19.946 21.335 22.975 24.935 27.279 30.012 33.455 36.459 38.257 39.351 40.079 40.634 41.044 41.3 41.417 41.479 41.485 41.454 41.397 41.334 41.294 41.264 41.211 41.139 41.058 40.958 40.862 40.77 40.652 40.527 40.433 40.332 40.212 40.076 39.934 39.831 39.72 39.553 39.425 39.282 39.209 39.06 38.901 38.724 38.626 38.212 38.311 38.192 38.06 37.726 37.532 37.325 37.083 36.802 36.445 35.991 34.542 -3 ,9622 ,TETRA ,17526664,Thu Nov 25 03:40:09 CET,Thu Nov 25 05:32:14 CET,0.0 0.946 1.404 1.796 2.13 2.417 2.681 2.907 3.326 3.533 3.72 3.711 4.223 4.383 4.697 4.995 5.282 5.421 5.693 5.963 6.353 6.609 6.857 7.205 7.546 7.863 8.173 8.484 8.891 9.288 9.673 10.144 10.602 11.038 11.54 12.108 12.665 13.278 13.949 14.675 15.455 16.344 17.39 18.479 19.758 21.192 22.898 24.836 27.155 29.959 33.377 36.283 38.058 39.186 39.913 40.4 40.718 40.942 41.109 41.235 41.299 41.327 41.351 41.336 41.279 41.219 41.148 41.072 41.002 40.927 40.836 40.751 40.659 40.551 40.46 40.378 40.289 40.171 40.052 39.977 39.888 39.715 39.582 39.453 39.391 39.255 39.1 38.917 38.824 38.421 38.504 38.387 38.268 37.986 37.809 37.622 37.436 37.207 36.836 36.361 35.342 -4 ,11456 ,TETRA ,17526666,Thu Nov 25 03:40:09 CET,Thu Nov 25 05:31:13 CET,0.0 0.711 1.128 1.466 1.764 2.031 2.27 2.487 2.88 3.077 3.288 3.331 3.845 4.004 4.315 4.615 4.907 5.052 5.322 5.582 5.971 6.218 6.46 6.804 7.13 7.453 7.774 8.087 8.506 8.917 9.308 9.757 10.173 10.59 11.093 11.683 12.252 12.873 13.558 14.291 15.047 15.896 16.931 18.003 19.261 20.683 22.337 24.259 26.661 29.614 33.227 36.22 37.957 39.097 39.873 40.426 40.836 41.136 41.323 41.44 41.479 41.496 41.506 41.481 41.412 41.342 41.286 41.223 41.141 41.046 40.938 40.824 40.716 40.617 40.53 40.429 40.316 40.205 40.083 39.99 39.896 39.751 39.637 39.5 39.429 39.277 39.103 38.905 38.805 38.394 38.475 38.34 38.198 37.894 37.714 37.506 37.285 37.045 36.747 36.358 35.047 -6 ,32198 ,TETRA ,17526679,Thu Nov 25 03:40:12 CET,Thu Nov 25 05:33:16 CET,0.0 0.869 1.352 1.708 2.025 2.297 2.539 2.774 3.187 3.367 3.543 3.546 4.063 4.222 4.517 4.813 5.095 5.226 5.485 5.739 6.089 6.306 6.525 6.859 7.182 7.495 7.799 8.107 8.517 8.896 9.263 9.713 10.166 10.622 11.151 11.755 12.326 12.961 13.688 14.443 15.201 16.046 17.032 18.065 19.292 20.696 22.36 24.262 26.512 29.261 32.778 35.698 37.314 38.402 39.186 39.726 40.061 40.277 40.442 40.575 40.631 40.643 40.657 40.651 40.618 40.572 40.503 40.421 40.344 40.252 40.14 40.047 39.935 39.794 39.688 39.562 39.432 39.304 39.152 39.053 38.949 38.776 38.661 38.535 38.468 38.333 38.186 38.007 37.903 37.494 37.613 37.512 37.398 37.132 36.971 36.797 36.619 36.407 36.176 35.848 35.019 -7 ,32533 ,TETRA ,17526685,Thu Nov 25 03:40:14 CET,Thu Nov 25 05:32:46 CET,0.0 1.039 1.558 1.997 2.358 2.633 2.879 3.118 3.573 3.774 3.944 3.933 4.448 4.607 4.939 5.264 5.564 5.708 5.985 6.24 6.615 6.858 7.09 7.435 7.766 8.087 8.407 8.715 9.112 9.511 9.886 10.33 10.775 11.211 11.723 12.317 12.883 13.496 14.159 14.873 15.619 16.475 17.518 18.583 19.856 21.303 23.003 24.959 27.285 30.101 33.482 36.345 38.142 39.296 40.024 40.501 40.807 41.022 41.159 41.255 41.286 41.259 41.233 41.198 41.151 41.077 40.971 40.891 40.824 40.73 40.622 40.537 40.441 40.323 40.232 40.134 40.011 39.873 39.733 39.631 39.519 39.351 39.231 39.095 39.024 38.88 38.712 38.536 38.445 38.028 38.075 37.942 37.807 37.495 37.319 37.094 36.831 36.542 36.163 35.661 34.539 -8 ,26788 ,TETRA ,17526698,Thu Nov 25 03:40:09 CET,Thu Nov 25 05:32:47 CET,0.0 1.045 1.591 1.946 2.254 2.529 2.78 3.013 3.446 3.65 3.829 3.82 4.333 4.486 4.789 5.092 5.388 5.534 5.809 6.07 6.454 6.701 6.94 7.294 7.627 7.948 8.268 8.579 8.983 9.377 9.769 10.239 10.691 11.132 11.638 12.212 12.777 13.396 14.068 14.774 15.517 16.383 17.393 18.414 19.644 21.052 22.703 24.601 26.871 29.585 33.004 35.937 37.671 38.779 39.508 40.038 40.407 40.633 40.754 40.828 40.848 40.84 40.817 40.78 40.742 40.697 40.629 40.551 40.469 40.371 40.26 40.142 40.01 39.894 39.796 39.669 39.52 39.383 39.252 39.147 39.031 38.843 38.701 38.57 38.506 38.339 38.13 37.923 37.833 37.423 37.498 37.361 37.218 36.927 36.756 36.565 36.345 36.071 35.712 35.226 33.735 -9 ,32201 ,TETRA ,17526705,Thu Nov 25 03:40:10 CET,Thu Nov 25 05:32:30 CET,0.0 0.855 1.314 1.675 1.992 2.277 2.552 2.812 3.288 3.507 3.708 3.708 4.225 4.389 4.686 4.976 5.257 5.392 5.651 5.904 6.273 6.502 6.729 7.072 7.408 7.725 8.027 8.323 8.71 9.092 9.473 9.926 10.356 10.78 11.272 11.819 12.354 12.971 13.639 14.346 15.118 15.982 16.976 18.0 19.197 20.58 22.244 24.169 26.506 29.375 32.866 35.735 37.463 38.632 39.414 39.923 40.243 40.431 40.513 40.593 40.665 40.71 40.73 40.712 40.68 40.632 40.564 40.484 40.389 40.286 40.185 40.092 39.991 39.886 39.796 39.689 39.573 39.448 39.312 39.219 39.118 38.958 38.846 38.711 38.639 38.489 38.335 38.155 38.056 37.659 37.738 37.592 37.436 37.103 36.921 36.718 36.502 36.264 35.939 35.498 34.253 -10 ,22779 ,TETRA ,17526712,Thu Nov 25 03:40:11 CET,Thu Nov 25 05:32:20 CET,0.0 0.815 1.218 1.552 1.848 2.112 2.34 2.553 2.954 3.149 3.341 3.353 3.874 4.041 4.342 4.638 4.934 5.076 5.35 5.609 5.973 6.207 6.432 6.765 7.095 7.416 7.721 8.023 8.422 8.805 9.188 9.663 10.124 10.573 11.091 11.667 12.214 12.817 13.465 14.173 14.933 15.802 16.84 17.899 19.148 20.535 22.166 24.113 26.393 29.131 32.629 35.562 37.36 38.539 39.315 39.868 40.253 40.501 40.656 40.755 40.8 40.816 40.795 40.753 40.699 40.628 40.555 40.481 40.393 40.278 40.143 40.036 39.911 39.772 39.666 39.549 39.418 39.296 39.173 39.076 38.97 38.797 38.662 38.518 38.446 38.287 38.129 37.948 37.837 37.415 37.516 37.401 37.245 36.927 36.774 36.613 36.393 36.111 35.81 35.42 34.423 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_32_1h1s.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_32_1h1s.txt deleted file mode 100644 index ad47e8d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_32_1h1s.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22197 ,TETRA ,17526737,Thu Nov 25 03:40:13 CET,Thu Nov 25 05:33:08 CET,0.0 0.74 1.208 1.59 1.905 2.173 2.421 2.643 3.066 3.276 3.476 3.275 4.01 4.177 4.517 4.848 5.178 5.338 5.643 5.95 6.414 6.714 6.991 7.389 7.765 8.132 8.49 8.846 9.317 9.761 10.19 10.73 11.271 11.794 12.425 13.154 13.855 14.627 15.46 16.369 17.355 18.486 19.829 21.216 22.88 24.824 27.159 29.857 33.168 37.271 42.596 47.352 50.308 52.335 53.749 54.743 55.474 56.027 56.402 56.698 56.909 57.038 57.118 57.17 57.204 57.22 57.191 57.147 57.116 57.076 57.008 56.934 56.818 56.663 56.557 56.438 56.304 56.179 56.018 55.897 55.793 55.631 55.504 55.378 55.305 55.128 54.941 54.734 54.616 53.976 54.218 54.08 53.929 53.555 53.346 53.123 52.885 52.584 52.191 51.626 49.797 -3 ,18622 ,TETRA ,17526748,Thu Nov 25 03:40:09 CET,Thu Nov 25 05:32:49 CET,0.0 0.778 1.251 1.598 1.902 2.185 2.451 2.682 3.095 3.292 3.487 3.294 4.032 4.21 4.552 4.874 5.183 5.333 5.635 5.942 6.37 6.636 6.91 7.307 7.679 8.046 8.417 8.777 9.229 9.668 10.103 10.635 11.208 11.829 12.557 13.371 14.104 14.864 15.718 16.68 17.696 18.831 20.171 21.541 23.216 25.157 27.495 30.225 33.482 37.544 42.941 47.774 50.716 52.662 54.036 55.034 55.729 56.252 56.651 57.001 57.211 57.331 57.413 57.46 57.482 57.494 57.5 57.469 57.429 57.383 57.313 57.254 57.176 57.057 56.943 56.835 56.725 56.593 56.46 56.363 56.254 56.084 55.948 55.79 55.707 55.537 55.377 55.196 55.083 54.449 54.703 54.555 54.39 54.04 53.806 53.516 53.203 52.88 52.456 51.808 49.385 -6 ,24801 ,TETRA ,17526761,Thu Nov 25 03:40:12 CET,Thu Nov 25 05:32:56 CET,0.0 0.845 1.3 1.655 1.957 2.229 2.47 2.697 3.12 3.33 3.536 3.342 4.087 4.263 4.6 4.922 5.228 5.376 5.677 5.975 6.389 6.659 6.92 7.301 7.701 8.099 8.482 8.859 9.351 9.827 10.294 10.868 11.442 12.003 12.651 13.384 14.075 14.84 15.679 16.594 17.594 18.746 20.121 21.518 23.163 25.085 27.44 30.191 33.572 37.743 43.012 47.766 50.745 52.727 54.092 55.07 55.809 56.374 56.761 57.09 57.329 57.478 57.58 57.652 57.683 57.688 57.663 57.616 57.578 57.51 57.396 57.277 57.169 57.06 56.964 56.856 56.718 56.588 56.449 56.337 56.232 56.055 55.908 55.748 55.66 55.482 55.301 55.102 54.989 54.344 54.569 54.421 54.266 53.898 53.69 53.473 53.233 52.935 52.525 51.934 50.537 -7 ,29561 ,TETRA ,17526768,Thu Nov 25 03:40:15 CET,Thu Nov 25 05:32:45 CET,0.0 0.794 1.231 1.569 1.857 2.113 2.353 2.599 3.02 3.207 3.404 3.223 3.963 4.126 4.44 4.747 5.06 5.214 5.516 5.811 6.239 6.516 6.792 7.182 7.566 7.947 8.302 8.668 9.165 9.634 10.09 10.643 11.182 11.721 12.366 13.079 13.763 14.534 15.375 16.3 17.31 18.443 19.804 21.236 22.952 24.907 27.206 29.92 33.229 37.336 42.683 47.566 50.606 52.614 54.007 55.015 55.731 56.24 56.603 56.93 57.165 57.321 57.45 57.544 57.601 57.632 57.62 57.574 57.528 57.484 57.412 57.332 57.236 57.119 57.027 56.928 56.771 56.553 56.315 56.148 56.005 55.817 55.677 55.523 55.444 55.282 55.082 54.88 54.777 54.139 54.369 54.215 54.054 53.677 53.462 53.236 52.968 52.539 51.92 51.287 49.641 -9 ,29149 ,TETRA ,17526789,Thu Nov 25 03:40:11 CET,Thu Nov 25 05:31:52 CET,0.0 0.897 1.297 1.679 2.015 2.289 2.559 2.84 3.331 3.533 3.735 3.581 4.341 4.526 4.876 5.222 5.556 5.713 6.021 6.328 6.783 7.067 7.333 7.715 8.088 8.452 8.824 9.199 9.676 10.127 10.563 11.103 11.63 12.146 12.762 13.476 14.173 14.941 15.789 16.749 17.838 19.039 20.379 21.795 23.486 25.393 27.673 30.348 33.661 37.795 43.175 47.91 50.783 52.708 54.069 55.097 55.851 56.422 56.798 57.076 57.274 57.416 57.528 57.608 57.651 57.668 57.66 57.643 57.608 57.558 57.487 57.394 57.287 57.191 57.114 57.002 56.859 56.707 56.515 56.367 56.221 55.989 55.831 55.679 55.595 55.401 55.203 54.979 54.866 54.225 54.429 54.267 54.093 53.718 53.52 53.314 53.066 52.763 52.374 51.79 49.781 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_32_1oiu.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_32_1oiu.txt deleted file mode 100644 index 3ed74f6f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_32_1oiu.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4565 ,TETRA ,17526864,Thu Nov 25 03:40:15 CET,Thu Nov 25 05:30:38 CET,0.0 2.478 3.167 3.727 4.19 4.617 4.991 5.35 6.064 6.388 6.675 6.632 7.455 7.719 8.231 8.723 9.212 9.456 9.92 10.36 10.999 11.423 11.841 12.455 13.061 13.669 14.264 14.836 15.592 16.331 17.056 17.953 18.841 19.715 20.729 21.866 22.989 24.269 25.681 27.262 28.986 30.928 33.248 35.663 38.564 41.91 45.899 50.577 56.351 63.538 72.91 81.148 86.359 89.985 92.553 94.501 95.952 97.077 97.908 98.6 99.116 99.507 99.786 99.977 100.116 100.226 100.298 100.334 100.368 100.39 100.376 100.33 100.276 100.235 100.183 100.102 100.014 99.908 99.788 99.676 99.539 99.347 99.198 99.005 98.91 98.716 98.48 98.193 98.03 97.402 97.575 97.409 97.216 96.816 96.573 96.271 95.939 95.526 94.999 94.16 91.107 -3 ,7668 ,TETRA ,17526938,Thu Nov 25 03:40:12 CET,Thu Nov 25 05:32:14 CET,0.0 1.634 2.263 2.818 3.27 3.666 4.031 4.378 5.015 5.321 5.624 5.621 6.453 6.724 7.243 7.726 8.194 8.431 8.892 9.33 9.966 10.386 10.799 11.415 12.036 12.647 13.231 13.807 14.571 15.317 16.044 16.921 17.785 18.646 19.678 20.858 22.007 23.289 24.675 26.188 27.885 29.855 32.172 34.58 37.472 40.802 44.797 49.549 55.352 62.486 71.872 80.333 85.641 89.263 91.832 93.755 95.161 96.245 97.077 97.814 98.332 98.675 98.938 99.175 99.358 99.489 99.606 99.701 99.729 99.716 99.685 99.646 99.618 99.576 99.528 99.47 99.393 99.302 99.198 99.091 98.963 98.786 98.67 98.535 98.463 98.287 98.079 97.855 97.725 97.122 97.266 97.09 96.925 96.534 96.278 95.993 95.7 95.306 94.806 94.025 90.99 -6 ,30817 ,TETRA ,17526969,Thu Nov 25 03:40:15 CET,Thu Nov 25 05:34:09 CET,0.0 1.378 1.985 2.459 2.865 3.247 3.616 3.971 4.612 4.909 5.195 5.162 5.981 6.239 6.735 7.229 7.717 7.949 8.403 8.855 9.526 9.96 10.377 10.991 11.603 12.194 12.769 13.344 14.095 14.839 15.572 16.489 17.397 18.286 19.319 20.468 21.616 22.915 24.34 25.917 27.634 29.585 31.893 34.271 37.128 40.439 44.44 49.224 55.129 62.405 71.812 80.071 85.283 88.966 91.578 93.558 94.951 95.997 96.811 97.494 97.98 98.359 98.662 98.891 99.046 99.16 99.278 99.355 99.389 99.398 99.365 99.333 99.303 99.249 99.201 99.146 99.084 98.995 98.888 98.804 98.691 98.51 98.391 98.27 98.207 98.046 97.861 97.654 97.539 96.941 97.138 96.972 96.772 96.341 96.095 95.813 95.48 95.095 94.49 93.712 90.416 -7 ,8254 ,TETRA ,17526984,Thu Nov 25 03:40:17 CET,Thu Nov 25 05:33:43 CET,0.0 1.542 2.15 2.654 3.084 3.458 3.815 4.16 4.786 5.087 5.394 5.415 6.255 6.522 7.022 7.48 7.925 8.152 8.618 9.07 9.701 10.106 10.51 11.118 11.729 12.342 12.954 13.538 14.265 14.985 15.723 16.608 17.471 18.347 19.373 20.533 21.655 22.916 24.319 25.87 27.572 29.55 31.859 34.189 37.054 40.436 44.502 49.228 55.0 62.211 71.645 80.115 85.406 89.054 91.531 93.365 94.794 95.87 96.636 97.294 97.782 98.134 98.413 98.621 98.768 98.892 98.98 99.026 99.059 99.072 99.06 99.039 99.004 98.947 98.901 98.861 98.775 98.654 98.535 98.44 98.34 98.165 98.023 97.875 97.802 97.628 97.429 97.221 97.103 96.498 96.655 96.498 96.326 95.897 95.635 95.338 94.992 94.567 94.06 93.282 89.009 -9 ,30497 ,TETRA ,17527017,Thu Nov 25 03:41:52 CET,Thu Nov 25 05:35:24 CET,0.0 1.848 2.574 3.125 3.571 3.972 4.333 4.663 5.322 5.635 5.929 5.927 6.764 7.019 7.52 8.013 8.488 8.732 9.215 9.671 10.331 10.755 11.174 11.797 12.392 12.969 13.541 14.096 14.857 15.603 16.314 17.201 18.07 18.933 19.953 21.108 22.243 23.513 24.909 26.418 28.058 29.986 32.292 34.671 37.513 40.804 44.827 49.64 55.574 62.874 72.318 80.926 86.265 89.867 92.467 94.356 95.75 96.86 97.692 98.417 98.93 99.319 99.637 99.876 100.075 100.225 100.301 100.348 100.36 100.33 100.289 100.235 100.161 100.076 100.005 99.902 99.793 99.688 99.584 99.507 99.408 99.219 99.054 98.883 98.806 98.639 98.453 98.229 98.11 97.522 97.71 97.552 97.357 96.862 96.586 96.288 95.953 95.523 95.014 94.326 89.879 -10 ,29327 ,TETRA ,17527026,Thu Nov 25 03:40:41 CET,Thu Nov 25 05:33:26 CET,0.0 2.233 3.039 3.685 4.266 4.781 5.179 5.507 6.134 6.445 6.748 6.734 7.563 7.819 8.317 8.799 9.262 9.49 9.947 10.391 11.04 11.463 11.872 12.465 13.061 13.654 14.232 14.798 15.554 16.3 17.007 17.883 18.753 19.63 20.674 21.847 22.986 24.26 25.682 27.219 28.876 30.811 33.101 35.452 38.303 41.649 45.689 50.465 56.316 63.604 72.997 81.251 86.441 90.052 92.668 94.62 96.05 97.123 97.934 98.629 99.162 99.592 99.924 100.173 100.345 100.432 100.468 100.493 100.512 100.522 100.527 100.508 100.445 100.352 100.291 100.215 100.116 100.017 99.882 99.762 99.628 99.442 99.309 99.143 99.07 98.92 98.695 98.432 98.299 97.687 97.827 97.642 97.453 97.018 96.765 96.507 96.163 95.722 95.243 94.494 91.484 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_32_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_32_30.txt deleted file mode 100644 index 9361651c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/CDK2/water/Summary_FEP_32_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29235 ,KEBNE ,17125496,Thu Dec 30 16:36:29 CET,Thu Dec 30 18:16:43 CET,0.0 1.089 1.666 2.155 2.569 2.953 3.308 3.654 4.332 4.661 4.971 4.987 5.837 6.126 6.725 7.316 7.876 8.152 8.688 9.204 9.954 10.437 10.927 11.659 12.387 13.099 13.777 14.457 15.36 16.229 17.076 18.136 19.189 20.222 21.439 22.84 24.244 25.83 27.575 29.514 31.618 34.015 36.918 39.984 43.686 48.04 53.332 59.664 67.665 77.906 91.842 105.103 114.064 120.639 125.587 129.521 132.627 135.149 137.157 139.024 140.491 141.692 142.763 143.715 144.531 145.216 145.893 146.457 146.881 147.295 147.703 147.998 148.291 148.584 148.793 148.984 149.175 149.367 149.525 149.621 149.711 149.806 149.854 149.894 149.914 149.941 149.918 149.877 149.843 149.402 149.73 149.666 149.593 149.407 149.291 149.167 148.984 148.735 148.429 147.933 145.352 -2 ,6987 ,KEBNE ,17024485,Wed Dec 22 10:06:29 CET,Wed Dec 22 11:45:40 CET,0.0 1.049 1.621 2.091 2.508 2.885 3.259 3.631 4.312 4.63 4.947 4.997 5.86 6.151 6.722 7.268 7.793 8.05 8.557 9.063 9.817 10.305 10.79 11.51 12.203 12.887 13.576 14.269 15.175 16.057 16.921 17.968 19.005 20.049 21.295 22.719 24.125 25.705 27.442 29.357 31.441 33.854 36.774 39.87 43.604 47.916 53.166 59.401 67.254 77.406 91.265 104.499 113.433 119.961 124.905 128.856 131.942 134.446 136.447 138.283 139.699 140.838 141.874 142.821 143.628 144.306 144.95 145.496 145.948 146.376 146.797 147.13 147.442 147.744 147.976 148.186 148.372 148.558 148.724 148.801 148.877 148.981 149.022 149.056 149.071 149.084 149.093 149.098 149.086 148.662 148.999 148.963 148.923 148.809 148.738 148.633 148.468 148.289 148.062 147.7 146.467 -3 ,20855 ,KEBNE ,17125498,Thu Dec 30 16:36:30 CET,Thu Dec 30 18:17:42 CET,0.0 1.176 1.666 2.138 2.58 2.963 3.316 3.659 4.308 4.617 4.918 4.932 5.786 6.079 6.645 7.184 7.718 7.997 8.56 9.094 9.852 10.343 10.83 11.561 12.282 12.993 13.696 14.389 15.29 16.163 17.028 18.105 19.16 20.191 21.429 22.873 24.294 25.883 27.61 29.512 31.596 34.01 36.937 39.994 43.679 48.006 53.315 59.655 67.557 77.731 91.636 105.022 114.131 120.73 125.697 129.66 132.759 135.257 137.235 139.078 140.549 141.762 142.837 143.792 144.607 145.284 145.952 146.504 146.96 147.406 147.82 148.147 148.451 148.727 148.936 149.13 149.316 149.509 149.684 149.79 149.897 150.022 150.081 150.133 150.154 150.182 150.198 150.186 150.167 149.752 150.094 150.05 150.018 149.894 149.767 149.612 149.454 149.265 148.988 148.565 146.879 -4 ,5071 ,KEBNE ,17024487,Wed Dec 22 10:06:29 CET,Wed Dec 22 11:43:54 CET,0.0 1.014 1.551 2.0 2.424 2.815 3.173 3.514 4.158 4.467 4.776 4.803 5.652 5.948 6.521 7.07 7.614 7.881 8.404 8.917 9.662 10.161 10.66 11.374 12.064 12.753 13.449 14.133 15.028 15.918 16.787 17.853 18.923 19.99 21.24 22.686 24.117 25.722 27.492 29.397 31.461 33.862 36.754 39.782 43.455 47.765 53.054 59.362 67.227 77.334 91.066 104.177 113.121 119.679 124.607 128.522 131.596 134.078 136.041 137.892 139.352 140.562 141.653 142.602 143.43 144.139 144.813 145.37 145.819 146.237 146.648 146.969 147.268 147.564 147.78 147.975 148.144 148.309 148.466 148.558 148.643 148.764 148.824 148.871 148.897 148.949 148.985 148.956 148.933 148.513 148.853 148.804 148.739 148.577 148.486 148.39 148.242 147.999 147.653 147.184 145.701 -5 ,6478 ,KEBNE ,17125500,Thu Dec 30 16:36:29 CET,Thu Dec 30 18:16:11 CET,0.0 1.179 1.805 2.304 2.744 3.137 3.506 3.86 4.507 4.836 5.158 5.181 6.047 6.344 6.911 7.459 7.987 8.248 8.766 9.279 10.052 10.551 11.034 11.764 12.484 13.177 13.856 14.536 15.437 16.332 17.199 18.253 19.318 20.374 21.622 23.034 24.425 26.041 27.807 29.713 31.79 34.191 37.104 40.162 43.883 48.209 53.513 59.938 67.912 78.092 91.928 105.077 114.043 120.615 125.552 129.504 132.596 135.071 137.03 138.81 140.222 141.415 142.491 143.409 144.195 144.881 145.521 146.053 146.489 146.917 147.329 147.658 147.987 148.272 148.483 148.691 148.893 149.097 149.278 149.387 149.49 149.628 149.693 149.734 149.753 149.778 149.785 149.768 149.756 149.343 149.709 149.669 149.615 149.495 149.407 149.301 149.149 148.915 148.631 148.304 146.443 -6 ,3567 ,KEBNE ,17024489,Wed Dec 22 10:06:29 CET,Wed Dec 22 11:44:13 CET,0.0 1.145 1.724 2.196 2.635 3.033 3.4 3.773 4.497 4.83 5.151 5.215 6.087 6.394 6.992 7.549 8.094 8.364 8.893 9.404 10.139 10.624 11.109 11.828 12.534 13.226 13.899 14.56 15.45 16.336 17.199 18.248 19.289 20.331 21.576 22.995 24.364 25.928 27.71 29.633 31.655 34.02 36.934 39.993 43.7 48.053 53.329 59.623 67.522 77.706 91.599 104.934 113.952 120.517 125.449 129.359 132.448 134.999 137.015 138.843 140.284 141.479 142.545 143.468 144.247 144.934 145.625 146.189 146.633 147.064 147.48 147.811 148.139 148.445 148.662 148.874 149.07 149.26 149.44 149.539 149.631 149.741 149.799 149.856 149.88 149.895 149.886 149.899 149.896 149.478 149.848 149.815 149.761 149.62 149.531 149.405 149.232 149.022 148.755 148.252 146.39 -7 ,17682 ,KEBNE ,17024490,Wed Dec 22 10:06:29 CET,Wed Dec 22 11:44:03 CET,0.0 1.057 1.65 2.139 2.547 2.929 3.294 3.631 4.279 4.596 4.91 4.943 5.802 6.096 6.669 7.23 7.768 8.025 8.529 9.025 9.764 10.271 10.772 11.501 12.216 12.917 13.61 14.283 15.163 16.044 16.916 17.983 19.034 20.057 21.288 22.717 24.096 25.655 27.389 29.293 31.367 33.78 36.711 39.776 43.523 47.91 53.205 59.512 67.433 77.649 91.546 104.768 113.736 120.334 125.305 129.246 132.347 134.881 136.867 138.679 140.124 141.313 142.359 143.29 144.095 144.765 145.417 145.978 146.451 146.905 147.325 147.656 147.99 148.283 148.476 148.665 148.857 149.026 149.174 149.275 149.37 149.5 149.558 149.602 149.622 149.645 149.657 149.658 149.654 149.241 149.599 149.548 149.498 149.398 149.32 149.208 149.023 148.755 148.461 147.987 145.489 -8 ,11010 ,KEBNE ,17024491,Wed Dec 22 10:06:29 CET,Wed Dec 22 11:43:34 CET,0.0 1.112 1.726 2.201 2.635 3.042 3.404 3.756 4.456 4.78 5.093 5.14 5.992 6.271 6.825 7.37 7.909 8.167 8.678 9.193 9.947 10.437 10.916 11.632 12.34 13.035 13.721 14.398 15.295 16.183 17.051 18.122 19.176 20.217 21.44 22.856 24.252 25.8 27.539 29.439 31.51 33.942 36.875 39.94 43.644 47.944 53.198 59.529 67.518 77.857 91.926 105.372 114.377 120.897 125.831 129.748 132.837 135.376 137.386 139.224 140.686 141.887 142.946 143.877 144.676 145.368 146.042 146.587 147.028 147.464 147.88 148.196 148.515 148.806 149.015 149.224 149.417 149.599 149.769 149.869 149.958 150.084 150.146 150.2 150.221 150.248 150.268 150.286 150.292 149.89 150.286 150.272 150.219 150.045 149.955 149.838 149.689 149.491 149.192 148.774 147.35 -9 ,27682 ,KEBNE ,17125504,Thu Dec 30 16:36:27 CET,Thu Dec 30 18:16:50 CET,0.0 1.047 1.559 2.001 2.416 2.795 3.137 3.471 4.144 4.468 4.773 4.807 5.665 5.953 6.541 7.11 7.649 7.912 8.437 8.94 9.659 10.134 10.608 11.322 12.031 12.722 13.396 14.057 14.935 15.799 16.655 17.72 18.766 19.803 21.036 22.458 23.857 25.414 27.139 29.027 31.085 33.492 36.401 39.428 43.115 47.447 52.696 59.018 66.936 77.104 91.083 104.364 113.414 120.049 124.986 128.899 132.004 134.531 136.501 138.314 139.759 140.94 141.966 142.898 143.73 144.426 145.111 145.684 146.141 146.573 146.977 147.298 147.613 147.91 148.127 148.342 148.533 148.691 148.857 148.964 149.045 149.169 149.257 149.332 149.359 149.392 149.415 149.431 149.433 149.024 149.412 149.379 149.321 149.176 149.077 148.963 148.844 148.678 148.375 147.803 145.331 -10 ,25324 ,KEBNE ,17024493,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:46:47 CET,0.0 1.163 1.667 2.131 2.585 3.006 3.384 3.743 4.408 4.722 5.031 5.068 5.924 6.203 6.752 7.295 7.821 8.078 8.579 9.075 9.832 10.333 10.831 11.585 12.323 13.028 13.722 14.409 15.298 16.172 17.047 18.115 19.157 20.189 21.406 22.829 24.257 25.846 27.62 29.561 31.647 34.064 36.981 40.037 43.762 48.096 53.354 59.692 67.652 77.879 91.726 105.069 114.181 120.811 125.806 129.784 132.905 135.469 137.491 139.314 140.735 141.913 142.979 143.921 144.731 145.419 146.084 146.627 147.067 147.48 147.882 148.206 148.503 148.788 148.992 149.18 149.366 149.527 149.671 149.77 149.868 149.994 150.059 150.118 150.147 150.201 150.235 150.251 150.247 149.831 150.196 150.148 150.08 149.961 149.888 149.772 149.612 149.415 149.166 148.781 146.835 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18631-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18631-1.txt deleted file mode 100644 index c83bb8c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18631-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10385 ,KEBNE ,17024511,Wed Dec 22 10:07:30 CET,Wed Dec 22 11:57:22 CET,0.0 0.761 1.135 1.412 1.657 1.867 2.09 2.293 2.632 2.793 2.959 2.903 3.418 3.555 3.804 4.036 4.282 4.401 4.62 4.827 5.122 5.32 5.511 5.761 5.981 6.189 6.405 6.613 6.887 7.157 7.404 7.699 7.99 8.269 8.603 8.969 9.315 9.692 10.107 10.555 10.984 11.476 12.034 12.574 13.206 13.89 14.632 15.387 16.171 16.916 17.423 17.382 17.041 16.542 15.965 15.412 14.896 14.382 13.915 13.378 12.871 12.417 11.979 11.532 11.114 10.758 10.357 9.976 9.644 9.291 8.905 8.572 8.216 7.863 7.601 7.304 6.978 6.659 6.329 6.092 5.842 5.46 5.205 4.901 4.741 4.436 4.123 3.79 3.605 3.038 2.957 2.719 2.469 1.938 1.648 1.304 0.928 0.469 -0.097 -0.839 -2.99 -2 ,901 ,KEBNE ,17024512,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:58:12 CET,0.0 1.139 1.586 1.913 2.202 2.447 2.669 2.878 3.257 3.437 3.599 3.534 4.034 4.156 4.41 4.662 4.904 5.014 5.217 5.428 5.736 5.929 6.115 6.382 6.643 6.912 7.177 7.426 7.749 8.051 8.331 8.671 8.999 9.322 9.694 10.082 10.44 10.821 11.232 11.656 12.066 12.516 13.026 13.535 14.151 14.854 15.621 16.411 17.216 17.976 18.68 18.844 18.519 18.056 17.536 16.955 16.363 15.808 15.281 14.686 14.161 13.667 13.184 12.722 12.281 11.881 11.434 11.013 10.668 10.315 9.932 9.609 9.227 8.815 8.53 8.22 7.887 7.547 7.19 6.939 6.691 6.299 5.987 5.653 5.488 5.168 4.837 4.464 4.269 3.712 3.667 3.441 3.21 2.699 2.384 2.024 1.61 1.138 0.586 -0.091 -1.814 -3 ,11210 ,KEBNE ,17024513,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:57:23 CET,0.0 0.83 1.222 1.548 1.825 2.072 2.294 2.488 2.845 3.002 3.139 3.04 3.553 3.688 3.949 4.199 4.428 4.537 4.749 4.957 5.252 5.432 5.598 5.854 6.102 6.329 6.547 6.753 7.026 7.292 7.541 7.832 8.121 8.406 8.721 9.06 9.38 9.739 10.123 10.528 10.946 11.408 11.966 12.536 13.177 13.872 14.634 15.446 16.297 17.037 17.57 17.656 17.407 16.975 16.424 15.792 15.149 14.524 13.973 13.412 12.935 12.483 12.044 11.64 11.255 10.883 10.457 10.066 9.71 9.34 8.948 8.608 8.266 7.893 7.611 7.33 7.038 6.745 6.423 6.179 5.922 5.545 5.287 4.997 4.847 4.548 4.227 3.847 3.641 3.067 2.999 2.771 2.529 1.943 1.628 1.309 0.934 0.475 -0.103 -0.834 -3.062 -4 ,19435 ,KEBNE ,17024514,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:57:23 CET,0.0 1.012 1.418 1.731 2.005 2.255 2.482 2.71 3.139 3.321 3.479 3.405 3.932 4.081 4.362 4.605 4.845 4.958 5.153 5.336 5.609 5.807 5.996 6.25 6.488 6.71 6.934 7.155 7.433 7.694 7.959 8.275 8.574 8.883 9.225 9.577 9.918 10.298 10.707 11.128 11.552 12.015 12.562 13.093 13.693 14.37 15.126 15.93 16.733 17.529 18.137 18.114 17.765 17.254 16.681 16.101 15.563 15.036 14.501 13.947 13.477 13.022 12.561 12.129 11.731 11.374 10.989 10.638 10.329 10.008 9.629 9.291 8.97 8.615 8.339 8.046 7.727 7.407 7.086 6.864 6.609 6.19 5.905 5.604 5.452 5.148 4.82 4.47 4.275 3.708 3.674 3.445 3.198 2.642 2.314 1.958 1.539 1.065 0.527 -0.217 -2.31 -5 ,14952 ,KEBNE ,17024515,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:57:56 CET,0.0 0.814 1.21 1.528 1.791 2.014 2.228 2.424 2.766 2.932 3.09 3.006 3.504 3.635 3.889 4.119 4.338 4.448 4.671 4.899 5.211 5.395 5.578 5.857 6.123 6.375 6.627 6.866 7.153 7.425 7.688 8.01 8.319 8.626 8.962 9.32 9.687 10.077 10.472 10.892 11.328 11.77 12.293 12.829 13.429 14.08 14.826 15.641 16.46 17.245 17.901 18.014 17.746 17.345 16.893 16.376 15.83 15.323 14.837 14.3 13.845 13.431 12.982 12.525 12.107 11.728 11.318 10.926 10.579 10.22 9.838 9.517 9.18 8.827 8.556 8.27 7.968 7.66 7.332 7.089 6.835 6.447 6.195 5.92 5.76 5.437 5.107 4.764 4.566 3.971 3.869 3.623 3.38 2.856 2.548 2.203 1.786 1.337 0.874 0.183 -2.141 -6 ,25595 ,KEBNE ,17024516,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:57:36 CET,0.0 0.741 1.085 1.355 1.612 1.873 2.094 2.274 2.652 2.825 2.979 2.913 3.429 3.565 3.841 4.117 4.369 4.487 4.713 4.937 5.26 5.454 5.637 5.898 6.145 6.393 6.629 6.853 7.145 7.427 7.702 8.029 8.352 8.647 8.96 9.323 9.666 10.018 10.405 10.835 11.293 11.778 12.307 12.851 13.47 14.098 14.769 15.487 16.259 16.991 17.548 17.569 17.189 16.684 16.166 15.603 15.051 14.512 14.003 13.443 12.958 12.525 12.056 11.6 11.206 10.828 10.419 10.041 9.714 9.371 8.979 8.661 8.337 7.99 7.7 7.387 7.071 6.752 6.417 6.181 5.938 5.536 5.255 4.972 4.816 4.485 4.136 3.758 3.56 2.983 2.929 2.698 2.443 1.853 1.538 1.219 0.846 0.378 -0.238 -1.077 -3.594 -7 ,883 ,KEBNE ,17024517,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:57:26 CET,0.0 1.196 1.696 2.071 2.33 2.565 2.783 2.984 3.372 3.548 3.704 3.624 4.141 4.281 4.547 4.785 5.006 5.109 5.311 5.502 5.778 5.975 6.16 6.411 6.649 6.885 7.106 7.308 7.568 7.819 8.059 8.36 8.65 8.92 9.238 9.609 9.944 10.305 10.708 11.106 11.529 12.02 12.569 13.119 13.73 14.397 15.134 15.954 16.851 17.68 18.342 18.413 18.062 17.556 17.011 16.412 15.802 15.167 14.594 14.074 13.614 13.163 12.697 12.243 11.844 11.47 11.064 10.701 10.352 9.981 9.618 9.294 8.931 8.553 8.259 7.95 7.631 7.291 6.937 6.681 6.41 6.017 5.739 5.447 5.289 4.954 4.611 4.242 4.042 3.47 3.401 3.162 2.914 2.358 2.044 1.689 1.27 0.78 0.2 -0.498 -2.87 -8 ,16681 ,KEBNE ,17024518,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:56:54 CET,0.0 0.456 0.811 1.106 1.342 1.563 1.767 1.955 2.327 2.508 2.691 2.647 3.164 3.296 3.543 3.783 3.989 4.087 4.296 4.504 4.819 5.011 5.199 5.454 5.681 5.903 6.114 6.328 6.613 6.885 7.152 7.474 7.773 8.057 8.395 8.79 9.174 9.551 9.903 10.297 10.723 11.193 11.767 12.34 12.969 13.646 14.381 15.186 16.089 16.901 17.527 17.622 17.297 16.767 16.198 15.645 15.112 14.583 14.119 13.612 13.111 12.657 12.197 11.73 11.3 10.926 10.544 10.183 9.856 9.483 9.074 8.755 8.446 8.121 7.84 7.53 7.207 6.867 6.512 6.277 6.03 5.634 5.365 5.081 4.923 4.59 4.256 3.901 3.703 3.13 3.087 2.878 2.643 2.102 1.779 1.407 0.997 0.528 -0.059 -0.859 -2.952 -9 ,12795 ,KEBNE ,17024519,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:57:43 CET,0.0 0.877 1.264 1.603 1.882 2.1 2.311 2.511 2.867 3.04 3.213 3.165 3.684 3.83 4.133 4.417 4.659 4.773 5.01 5.236 5.536 5.726 5.919 6.204 6.469 6.708 6.938 7.17 7.464 7.747 8.02 8.353 8.682 8.984 9.318 9.691 10.055 10.445 10.863 11.319 11.75 12.217 12.813 13.387 14.042 14.752 15.47 16.219 16.978 17.733 18.303 18.273 17.905 17.388 16.771 16.116 15.498 14.918 14.417 13.892 13.4 12.968 12.57 12.144 11.698 11.294 10.873 10.485 10.161 9.836 9.483 9.175 8.853 8.499 8.223 7.94 7.639 7.323 6.991 6.764 6.527 6.101 5.795 5.491 5.328 4.993 4.641 4.274 4.077 3.5 3.45 3.234 2.992 2.434 2.116 1.76 1.366 0.919 0.356 -0.359 -2.213 -10 ,10372 ,KEBNE ,17024520,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:57:35 CET,0.0 1.152 1.557 1.873 2.135 2.385 2.619 2.83 3.19 3.347 3.512 3.473 3.994 4.136 4.394 4.637 4.873 4.988 5.198 5.393 5.682 5.876 6.063 6.324 6.572 6.804 7.026 7.25 7.526 7.774 8.029 8.354 8.648 8.923 9.248 9.618 9.981 10.371 10.794 11.23 11.68 12.182 12.762 13.346 13.979 14.655 15.395 16.179 17.007 17.815 18.463 18.556 18.162 17.648 17.093 16.457 15.891 15.35 14.821 14.267 13.8 13.368 12.931 12.505 12.064 11.634 11.188 10.797 10.449 10.076 9.687 9.376 9.039 8.664 8.373 8.065 7.723 7.386 7.091 6.856 6.592 6.198 5.907 5.617 5.472 5.176 4.852 4.496 4.299 3.709 3.608 3.37 3.117 2.576 2.26 1.88 1.472 0.994 0.413 -0.354 -2.971 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index 01e3422c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,11013 ,TETRA ,17527896,Thu Nov 25 03:40:41 CET,Thu Nov 25 05:53:24 CET,0.0 1.282 1.768 2.137 2.451 2.731 2.984 3.2 3.608 3.793 3.954 3.907 4.431 4.575 4.86 5.133 5.391 5.516 5.753 5.974 6.276 6.469 6.648 6.904 7.153 7.385 7.613 7.825 8.091 8.352 8.595 8.882 9.154 9.416 9.709 10.014 10.305 10.626 10.957 11.297 11.662 12.04 12.451 12.857 13.297 13.726 14.109 14.452 14.739 14.851 14.501 13.598 12.534 11.502 10.536 9.621 8.797 8.036 7.356 6.628 6.014 5.475 4.936 4.405 3.92 3.453 2.947 2.511 2.13 1.725 1.289 0.926 0.565 0.174 -0.128 -0.435 -0.774 -1.134 -1.519 -1.775 -2.039 -2.472 -2.773 -3.082 -3.237 -3.572 -3.941 -4.321 -4.511 -5.097 -5.141 -5.368 -5.613 -6.215 -6.55 -6.887 -7.239 -7.596 -8.024 -8.636 -10.156 -3 ,32663 ,TETRA ,17527897,Thu Nov 25 03:40:43 CET,Thu Nov 25 05:53:37 CET,0.0 1.422 1.975 2.376 2.695 2.976 3.241 3.483 3.908 4.091 4.267 4.231 4.773 4.93 5.215 5.478 5.737 5.864 6.104 6.332 6.642 6.839 7.035 7.318 7.571 7.801 8.015 8.216 8.483 8.743 8.996 9.3 9.568 9.806 10.094 10.399 10.665 10.972 11.325 11.685 12.04 12.426 12.828 13.19 13.604 14.017 14.387 14.772 15.121 15.279 14.963 14.056 13.083 12.093 11.109 10.133 9.277 8.518 7.836 7.103 6.452 5.86 5.266 4.717 4.23 3.776 3.306 2.882 2.495 2.092 1.682 1.346 0.986 0.596 0.3 -0.001 -0.308 -0.638 -1.003 -1.25 -1.495 -1.909 -2.185 -2.448 -2.593 -2.906 -3.27 -3.66 -3.86 -4.436 -4.459 -4.681 -4.911 -5.449 -5.769 -6.12 -6.536 -6.983 -7.434 -8.011 -9.511 -5 ,931 ,TETRA ,17527906,Thu Nov 25 03:41:52 CET,Thu Nov 25 05:55:03 CET,0.0 1.452 1.888 2.218 2.52 2.811 3.069 3.31 3.75 3.943 4.125 4.071 4.593 4.736 4.997 5.249 5.485 5.592 5.812 6.025 6.327 6.512 6.697 6.969 7.212 7.437 7.651 7.856 8.118 8.358 8.578 8.854 9.118 9.371 9.672 9.989 10.28 10.6 10.922 11.259 11.591 11.945 12.35 12.719 13.109 13.484 13.853 14.19 14.478 14.564 14.068 13.062 11.996 10.909 9.933 9.025 8.226 7.502 6.812 6.088 5.494 4.968 4.427 3.911 3.422 2.956 2.469 2.049 1.709 1.361 0.971 0.621 0.258 -0.115 -0.406 -0.707 -1.047 -1.405 -1.734 -1.949 -2.2 -2.627 -2.908 -3.188 -3.334 -3.645 -3.967 -4.3 -4.475 -5.031 -5.02 -5.247 -5.5 -6.004 -6.293 -6.608 -6.946 -7.33 -7.759 -8.309 -9.466 -6 ,29657 ,TETRA ,17527912,Thu Nov 25 03:40:41 CET,Thu Nov 25 05:53:46 CET,0.0 1.343 1.846 2.219 2.521 2.787 3.035 3.275 3.691 3.859 4.023 3.967 4.492 4.632 4.918 5.199 5.444 5.557 5.79 6.01 6.303 6.494 6.674 6.944 7.205 7.443 7.678 7.902 8.167 8.416 8.673 8.972 9.238 9.483 9.765 10.077 10.353 10.674 11.021 11.348 11.666 12.016 12.429 12.818 13.241 13.653 14.037 14.383 14.626 14.77 14.564 13.707 12.71 11.704 10.787 9.935 9.137 8.405 7.776 7.135 6.555 5.989 5.442 4.933 4.443 4.002 3.539 3.114 2.733 2.342 1.954 1.62 1.27 0.91 0.619 0.308 -0.022 -0.393 -0.783 -1.039 -1.287 -1.666 -1.966 -2.288 -2.447 -2.789 -3.154 -3.551 -3.742 -4.304 -4.329 -4.587 -4.897 -5.531 -5.847 -6.212 -6.589 -6.96 -7.443 -8.081 -9.488 -7 ,21226 ,TETRA ,17527921,Thu Nov 25 03:40:45 CET,Thu Nov 25 05:52:53 CET,0.0 1.511 2.073 2.45 2.773 3.038 3.252 3.456 3.833 4.017 4.202 4.15 4.662 4.811 5.087 5.322 5.535 5.644 5.846 6.033 6.307 6.483 6.664 6.921 7.152 7.36 7.557 7.758 8.034 8.328 8.594 8.893 9.183 9.445 9.756 10.09 10.377 10.686 11.01 11.344 11.679 12.04 12.439 12.819 13.261 13.697 14.114 14.502 14.835 14.905 14.456 13.469 12.384 11.369 10.462 9.598 8.804 8.095 7.483 6.819 6.244 5.735 5.227 4.742 4.288 3.885 3.475 3.075 2.696 2.31 1.912 1.59 1.259 0.908 0.65 0.385 0.091 -0.213 -0.537 -0.781 -1.031 -1.406 -1.676 -1.966 -2.114 -2.415 -2.723 -3.062 -3.247 -3.804 -3.81 -4.016 -4.229 -4.714 -4.99 -5.288 -5.628 -6.014 -6.429 -6.984 -8.229 -8 ,4684 ,TETRA ,17527923,Thu Nov 25 03:40:42 CET,Thu Nov 25 05:53:15 CET,0.0 1.307 1.863 2.326 2.704 3.017 3.29 3.538 3.94 4.113 4.277 4.237 4.775 4.912 5.154 5.409 5.678 5.815 6.069 6.303 6.632 6.836 7.033 7.317 7.574 7.819 8.057 8.291 8.593 8.865 9.13 9.439 9.715 9.985 10.284 10.589 10.894 11.242 11.602 11.948 12.299 12.696 13.104 13.466 13.853 14.241 14.662 15.059 15.347 15.476 15.211 14.36 13.361 12.353 11.364 10.458 9.667 8.906 8.227 7.523 6.922 6.393 5.875 5.37 4.865 4.407 3.943 3.522 3.161 2.784 2.394 2.059 1.697 1.332 1.05 0.759 0.463 0.129 -0.221 -0.457 -0.7 -1.067 -1.32 -1.605 -1.751 -2.04 -2.36 -2.72 -2.92 -3.508 -3.55 -3.766 -3.991 -4.5 -4.789 -5.12 -5.527 -6.009 -6.589 -7.295 -8.735 -9 ,23413 ,TETRA ,17527930,Thu Nov 25 03:40:43 CET,Thu Nov 25 05:53:39 CET,0.0 1.077 1.502 1.835 2.113 2.382 2.651 2.903 3.341 3.536 3.714 3.665 4.195 4.346 4.621 4.879 5.114 5.222 5.431 5.638 5.922 6.107 6.288 6.536 6.776 7.011 7.234 7.456 7.741 7.997 8.24 8.535 8.811 9.078 9.377 9.706 10.022 10.354 10.721 11.067 11.378 11.726 12.114 12.468 12.843 13.254 13.667 14.029 14.325 14.442 14.008 13.014 12.018 11.027 10.089 9.213 8.419 7.655 6.98 6.304 5.715 5.18 4.661 4.174 3.71 3.293 2.863 2.466 2.126 1.786 1.429 1.125 0.796 0.438 0.151 -0.142 -0.445 -0.755 -1.07 -1.294 -1.516 -1.844 -2.091 -2.371 -2.512 -2.788 -3.091 -3.419 -3.593 -4.148 -4.135 -4.365 -4.62 -5.101 -5.346 -5.616 -5.95 -6.364 -6.859 -7.496 -8.696 -10 ,6541 ,TETRA ,17527939,Thu Nov 25 03:40:41 CET,Thu Nov 25 05:50:36 CET,0.0 1.112 1.657 2.067 2.4 2.693 2.961 3.205 3.607 3.802 3.98 3.908 4.434 4.569 4.809 5.052 5.278 5.386 5.608 5.827 6.145 6.345 6.533 6.79 7.026 7.252 7.46 7.663 7.937 8.208 8.45 8.721 8.985 9.238 9.533 9.848 10.138 10.444 10.765 11.115 11.48 11.861 12.264 12.615 12.983 13.354 13.709 14.055 14.321 14.396 14.043 13.124 12.11 11.095 10.109 9.188 8.37 7.632 6.975 6.298 5.732 5.226 4.703 4.195 3.739 3.331 2.902 2.499 2.13 1.746 1.351 1.032 0.698 0.35 0.079 -0.211 -0.508 -0.816 -1.142 -1.389 -1.654 -2.026 -2.265 -2.525 -2.665 -2.951 -3.283 -3.643 -3.816 -4.368 -4.379 -4.597 -4.818 -5.302 -5.587 -5.893 -6.221 -6.632 -7.081 -7.662 -9.246 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt deleted file mode 100644 index 97685d79..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,10968 ,TETRA ,17527967,Thu Nov 25 03:40:41 CET,Thu Nov 25 05:51:20 CET,0.0 1.692 2.213 2.603 2.929 3.205 3.436 3.657 4.097 4.288 4.461 4.423 4.944 5.092 5.391 5.666 5.908 6.027 6.266 6.492 6.812 7.018 7.221 7.504 7.77 8.036 8.31 8.577 8.913 9.226 9.513 9.868 10.218 10.554 10.969 11.431 11.842 12.286 12.773 13.306 13.903 14.574 15.325 16.064 16.877 17.76 18.761 19.811 20.874 22.012 23.264 23.939 23.935 23.635 23.239 22.746 22.26 21.795 21.349 20.876 20.45 20.019 19.57 19.153 18.754 18.387 17.974 17.553 17.19 16.861 16.539 16.253 15.94 15.606 15.328 15.044 14.761 14.44 14.075 13.817 13.58 13.218 12.934 12.606 12.427 12.071 11.728 11.366 11.161 10.583 10.457 10.182 9.893 9.291 8.966 8.612 8.204 7.715 7.17 6.342 3.705 -3 ,26927 ,TETRA ,17527978,Thu Nov 25 03:40:42 CET,Thu Nov 25 05:51:47 CET,0.0 1.243 1.747 2.164 2.533 2.836 3.097 3.356 3.818 4.018 4.211 4.213 4.755 4.917 5.22 5.482 5.721 5.844 6.075 6.315 6.666 6.868 7.072 7.39 7.691 7.97 8.238 8.497 8.822 9.136 9.452 9.843 10.196 10.533 10.929 11.372 11.82 12.3 12.791 13.312 13.836 14.394 15.037 15.709 16.508 17.335 18.247 19.264 20.388 21.585 22.725 23.185 23.013 22.612 22.109 21.529 20.95 20.401 19.939 19.489 19.1 18.731 18.351 17.985 17.608 17.232 16.853 16.493 16.177 15.829 15.436 15.105 14.753 14.405 14.12 13.783 13.445 13.107 12.76 12.531 12.28 11.868 11.565 11.246 11.083 10.723 10.341 9.938 9.731 9.162 9.024 8.746 8.477 7.896 7.563 7.204 6.768 6.252 5.597 4.682 1.94 -7 ,16494 ,TETRA ,17528013,Thu Nov 25 03:40:42 CET,Thu Nov 25 05:47:45 CET,0.0 1.843 2.469 2.893 3.232 3.575 3.872 4.106 4.535 4.759 4.966 4.956 5.492 5.653 5.977 6.277 6.536 6.663 6.908 7.13 7.459 7.674 7.877 8.175 8.473 8.767 9.049 9.317 9.649 9.958 10.271 10.651 10.999 11.332 11.724 12.174 12.588 13.027 13.511 14.02 14.532 15.102 15.768 16.409 17.167 18.049 19.03 20.106 21.332 22.571 23.759 24.353 24.385 24.188 23.874 23.409 22.914 22.483 22.058 21.529 21.063 20.677 20.269 19.855 19.459 19.093 18.728 18.38 18.059 17.731 17.394 17.121 16.829 16.52 16.264 15.992 15.723 15.44 15.147 14.947 14.738 14.388 14.123 13.824 13.669 13.353 12.998 12.638 12.456 11.893 11.837 11.615 11.36 10.841 10.545 10.201 9.821 9.376 8.793 8.018 5.948 -8 ,2987 ,TETRA ,17528015,Thu Nov 25 03:40:44 CET,Thu Nov 25 05:51:43 CET,0.0 2.822 3.426 3.8 4.151 4.467 4.71 4.936 5.366 5.561 5.74 5.695 6.221 6.387 6.706 6.98 7.226 7.359 7.626 7.863 8.206 8.426 8.628 8.915 9.197 9.469 9.73 9.99 10.334 10.662 10.951 11.309 11.665 11.997 12.385 12.799 13.183 13.616 14.095 14.597 15.11 15.704 16.404 17.085 17.857 18.692 19.625 20.59 21.645 22.816 24.026 24.788 24.874 24.596 24.215 23.792 23.327 22.852 22.417 21.932 21.477 21.051 20.661 20.259 19.815 19.413 19.012 18.625 18.288 17.951 17.573 17.247 16.914 16.561 16.285 15.98 15.66 15.322 14.946 14.688 14.416 13.973 13.637 13.29 13.121 12.755 12.36 11.926 11.686 11.083 10.966 10.722 10.462 9.836 9.437 8.994 8.507 7.984 7.35 6.432 3.303 -9 ,22220 ,TETRA ,17528026,Thu Nov 25 03:40:46 CET,Thu Nov 25 05:51:49 CET,0.0 1.513 2.236 2.73 3.042 3.344 3.607 3.849 4.3 4.489 4.653 4.615 5.146 5.297 5.582 5.858 6.125 6.257 6.509 6.737 7.076 7.3 7.507 7.807 8.097 8.387 8.676 8.95 9.306 9.635 9.941 10.336 10.726 11.081 11.48 11.913 12.304 12.72 13.195 13.708 14.248 14.869 15.576 16.292 17.111 17.946 18.839 19.856 21.004 22.167 23.331 23.904 23.9 23.653 23.289 22.857 22.399 21.962 21.568 21.152 20.752 20.367 19.952 19.512 19.119 18.759 18.365 17.994 17.667 17.33 16.97 16.652 16.31 15.961 15.705 15.434 15.139 14.831 14.502 14.263 14.007 13.599 13.309 13.024 12.878 12.553 12.199 11.818 11.624 11.074 11.0 10.779 10.538 9.938 9.611 9.261 8.864 8.424 7.875 7.109 4.091 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18626-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18626-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 324284aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18626-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9423 ,KEBNE ,17024521,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:56:30 CET,0.0 1.159 1.528 1.813 2.082 2.313 2.517 2.705 3.024 3.169 3.312 3.214 3.685 3.799 4.027 4.237 4.422 4.514 4.7 4.882 5.149 5.316 5.475 5.704 5.916 6.128 6.335 6.528 6.762 6.988 7.214 7.478 7.723 7.959 8.245 8.569 8.871 9.201 9.548 9.896 10.258 10.669 11.129 11.567 12.096 12.699 13.33 13.982 14.706 15.446 16.14 16.509 16.538 16.403 16.196 15.919 15.632 15.39 15.162 14.879 14.614 14.368 14.107 13.849 13.618 13.414 13.186 12.955 12.746 12.533 12.306 12.115 11.925 11.722 11.566 11.394 11.186 10.972 10.758 10.612 10.458 10.193 10.018 9.848 9.763 9.58 9.369 9.117 8.976 8.502 8.614 8.468 8.316 8.002 7.809 7.598 7.388 7.133 6.812 6.383 4.809 -2 ,5645 ,KEBNE ,17024522,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:55:54 CET,0.0 1.075 1.468 1.737 1.964 2.161 2.343 2.512 2.797 2.919 3.037 2.906 3.362 3.468 3.671 3.86 4.039 4.128 4.299 4.466 4.704 4.854 5.011 5.239 5.463 5.685 5.883 6.072 6.317 6.534 6.74 6.994 7.226 7.437 7.675 7.952 8.225 8.506 8.805 9.122 9.458 9.85 10.321 10.765 11.256 11.813 12.432 13.082 13.816 14.681 15.509 15.856 15.893 15.712 15.424 15.12 14.815 14.518 14.238 13.945 13.689 13.436 13.185 12.938 12.698 12.48 12.242 12.037 11.844 11.629 11.418 11.226 11.013 10.798 10.621 10.437 10.257 10.066 9.871 9.733 9.593 9.375 9.213 9.032 8.935 8.747 8.559 8.357 8.251 7.794 7.874 7.733 7.602 7.247 7.004 6.762 6.536 6.271 5.893 5.297 3.479 -3 ,27034 ,KEBNE ,17024523,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:56:26 CET,0.0 0.734 1.058 1.313 1.53 1.727 1.903 2.071 2.382 2.512 2.644 2.562 3.035 3.141 3.346 3.563 3.766 3.862 4.055 4.228 4.465 4.616 4.759 4.978 5.191 5.385 5.571 5.75 5.987 6.22 6.426 6.664 6.898 7.127 7.407 7.729 8.023 8.322 8.646 8.998 9.365 9.778 10.249 10.682 11.162 11.712 12.308 12.911 13.559 14.268 14.947 15.226 15.222 15.043 14.761 14.459 14.173 13.873 13.591 13.286 13.017 12.776 12.538 12.328 12.129 11.93 11.699 11.476 11.284 11.077 10.862 10.682 10.485 10.272 10.097 9.906 9.706 9.503 9.311 9.174 9.022 8.783 8.622 8.453 8.359 8.168 7.968 7.734 7.614 7.141 7.181 7.016 6.863 6.534 6.368 6.171 5.909 5.579 5.16 4.596 2.818 -4 ,17334 ,KEBNE ,17024524,Wed Dec 22 10:07:31 CET,Wed Dec 22 11:56:36 CET,0.0 0.813 1.179 1.48 1.766 1.995 2.197 2.402 2.756 2.905 3.043 2.949 3.428 3.539 3.75 3.962 4.19 4.292 4.467 4.633 4.872 5.039 5.198 5.396 5.588 5.79 5.995 6.2 6.462 6.697 6.919 7.189 7.453 7.712 8.019 8.329 8.601 8.925 9.291 9.657 10.029 10.468 10.939 11.388 11.901 12.479 13.15 13.82 14.535 15.286 15.972 16.283 16.274 16.138 15.946 15.65 15.362 15.108 14.842 14.559 14.279 14.01 13.744 13.484 13.242 13.024 12.8 12.592 12.414 12.236 12.029 11.839 11.647 11.455 11.291 11.098 10.919 10.737 10.547 10.419 10.275 10.06 9.911 9.741 9.645 9.448 9.227 9.005 8.905 8.451 8.548 8.407 8.268 7.95 7.766 7.551 7.307 7.064 6.769 6.254 5.06 -5 ,24967 ,KEBNE ,17024525,Wed Dec 22 10:08:32 CET,Wed Dec 22 11:57:24 CET,0.0 0.675 0.989 1.258 1.494 1.693 1.868 2.043 2.361 2.501 2.637 2.528 3.003 3.118 3.36 3.586 3.794 3.894 4.084 4.269 4.537 4.72 4.897 5.125 5.327 5.531 5.735 5.931 6.185 6.43 6.656 6.924 7.182 7.425 7.715 8.032 8.325 8.672 9.059 9.455 9.828 10.228 10.704 11.176 11.711 12.27 12.881 13.562 14.325 15.143 15.92 16.226 16.203 16.051 15.822 15.554 15.254 14.952 14.685 14.398 14.111 13.853 13.615 13.385 13.162 12.942 12.707 12.508 12.32 12.094 11.847 11.643 11.429 11.204 11.05 10.894 10.725 10.546 10.345 10.204 10.07 9.839 9.644 9.443 9.354 9.171 8.965 8.745 8.63 8.153 8.205 8.048 7.896 7.593 7.409 7.216 6.993 6.679 6.303 5.806 3.994 -6 ,9916 ,KEBNE ,17024526,Wed Dec 22 10:08:32 CET,Wed Dec 22 11:57:57 CET,0.0 1.454 1.886 2.181 2.439 2.638 2.804 2.982 3.305 3.448 3.589 3.504 3.992 4.11 4.32 4.54 4.754 4.85 5.03 5.206 5.466 5.638 5.799 6.022 6.228 6.433 6.631 6.814 7.056 7.293 7.518 7.791 8.046 8.276 8.559 8.854 9.133 9.461 9.806 10.166 10.523 10.924 11.397 11.872 12.4 12.94 13.557 14.244 14.976 15.712 16.388 16.616 16.488 16.262 16.0 15.67 15.33 15.025 14.73 14.406 14.124 13.875 13.638 13.413 13.193 12.975 12.741 12.533 12.343 12.139 11.908 11.689 11.451 11.219 11.049 10.87 10.691 10.506 10.297 10.152 9.998 9.752 9.577 9.397 9.307 9.115 8.919 8.704 8.579 8.088 8.153 8.007 7.858 7.532 7.348 7.14 6.913 6.639 6.316 5.896 4.568 -7 ,13300 ,KEBNE ,17024527,Wed Dec 22 10:08:32 CET,Wed Dec 22 11:57:13 CET,0.0 0.676 1.013 1.307 1.574 1.792 1.973 2.141 2.476 2.635 2.77 2.663 3.144 3.262 3.488 3.702 3.901 4.0 4.193 4.373 4.628 4.791 4.958 5.217 5.461 5.681 5.885 6.088 6.354 6.596 6.827 7.109 7.364 7.601 7.877 8.184 8.47 8.783 9.124 9.491 9.864 10.256 10.705 11.173 11.726 12.3 12.953 13.654 14.323 15.032 15.749 16.039 15.983 15.811 15.58 15.309 15.039 14.783 14.562 14.291 14.005 13.757 13.531 13.302 13.079 12.862 12.639 12.433 12.248 12.057 11.848 11.678 11.499 11.301 11.145 10.989 10.828 10.66 10.465 10.317 10.17 9.933 9.768 9.614 9.532 9.338 9.137 8.94 8.827 8.354 8.461 8.328 8.165 7.839 7.667 7.483 7.284 7.056 6.805 6.431 5.208 -8 ,31938 ,KEBNE ,17024528,Wed Dec 22 10:08:32 CET,Wed Dec 22 11:57:59 CET,0.0 1.108 1.569 1.863 2.127 2.38 2.625 2.834 3.175 3.343 3.497 3.433 3.93 4.057 4.301 4.526 4.744 4.859 5.074 5.264 5.537 5.708 5.877 6.121 6.348 6.557 6.758 6.95 7.182 7.407 7.633 7.897 8.14 8.381 8.657 8.944 9.225 9.546 9.884 10.244 10.619 11.028 11.507 11.979 12.511 13.092 13.716 14.366 15.113 15.88 16.562 16.836 16.788 16.609 16.349 16.056 15.751 15.459 15.2 14.927 14.68 14.444 14.188 13.923 13.676 13.462 13.229 13.011 12.817 12.599 12.357 12.161 11.959 11.76 11.613 11.458 11.285 11.081 10.866 10.71 10.532 10.278 10.113 9.929 9.829 9.624 9.428 9.214 9.093 8.622 8.698 8.549 8.401 8.082 7.904 7.707 7.466 7.186 6.847 6.381 5.074 -9 ,10896 ,KEBNE ,17024529,Wed Dec 22 10:08:32 CET,Wed Dec 22 11:57:50 CET,0.0 0.716 1.064 1.356 1.63 1.877 2.072 2.243 2.558 2.709 2.854 2.764 3.242 3.358 3.571 3.777 3.983 4.071 4.232 4.399 4.635 4.788 4.953 5.189 5.4 5.598 5.797 5.986 6.22 6.448 6.666 6.921 7.166 7.389 7.649 7.965 8.253 8.549 8.869 9.206 9.572 9.966 10.401 10.85 11.36 11.921 12.558 13.233 13.957 14.715 15.455 15.828 15.845 15.695 15.508 15.254 14.975 14.692 14.413 14.108 13.841 13.607 13.371 13.125 12.858 12.613 12.385 12.187 11.997 11.788 11.577 11.396 11.205 10.996 10.831 10.668 10.505 10.323 10.12 9.985 9.849 9.624 9.458 9.271 9.173 8.987 8.798 8.572 8.44 7.95 8.027 7.884 7.719 7.408 7.253 7.022 6.735 6.429 6.009 5.425 3.874 -10 ,29225 ,KEBNE ,17024530,Wed Dec 22 10:08:33 CET,Wed Dec 22 11:57:43 CET,0.0 0.889 1.263 1.542 1.752 1.951 2.145 2.328 2.643 2.776 2.902 2.774 3.241 3.361 3.599 3.809 3.99 4.075 4.243 4.406 4.649 4.813 4.969 5.18 5.38 5.572 5.772 5.973 6.206 6.408 6.606 6.848 7.089 7.323 7.575 7.872 8.167 8.481 8.821 9.175 9.541 9.94 10.39 10.823 11.306 11.839 12.452 13.097 13.831 14.674 15.487 15.821 15.833 15.736 15.542 15.294 15.037 14.797 14.535 14.212 13.892 13.59 13.326 13.06 12.809 12.594 12.366 12.159 11.972 11.759 11.518 11.313 11.109 10.883 10.694 10.504 10.31 10.113 9.907 9.753 9.598 9.356 9.168 8.964 8.862 8.652 8.426 8.197 8.078 7.612 7.715 7.569 7.401 7.041 6.852 6.656 6.436 6.192 5.884 5.469 4.197 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index ddfd4997..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22757 ,TETRA ,17528060,Thu Nov 25 03:40:44 CET,Thu Nov 25 05:50:09 CET,0.0 0.722 1.017 1.266 1.494 1.704 1.894 2.049 2.331 2.479 2.628 2.533 3.0 3.096 3.296 3.493 3.666 3.751 3.924 4.09 4.335 4.5 4.653 4.854 5.034 5.209 5.384 5.552 5.764 5.976 6.187 6.428 6.655 6.878 7.14 7.43 7.704 8.006 8.336 8.675 9.015 9.412 9.86 10.255 10.709 11.226 11.829 12.496 13.173 13.822 14.441 14.672 14.532 14.233 13.907 13.584 13.269 12.965 12.676 12.368 12.08 11.802 11.533 11.274 11.023 10.789 10.54 10.305 10.097 9.883 9.662 9.474 9.283 9.073 8.906 8.738 8.568 8.386 8.184 8.041 7.896 7.671 7.505 7.32 7.226 7.043 6.847 6.632 6.523 6.06 6.148 6.012 5.874 5.58 5.424 5.239 5.021 4.764 4.432 4.009 3.03 -3 ,16007 ,TETRA ,17528069,Thu Nov 25 03:40:47 CET,Thu Nov 25 05:47:26 CET,0.0 0.946 1.257 1.47 1.647 1.803 1.962 2.14 2.442 2.575 2.703 2.59 3.066 3.176 3.375 3.571 3.772 3.869 4.052 4.226 4.467 4.622 4.768 4.97 5.18 5.379 5.544 5.72 5.95 6.16 6.36 6.589 6.824 7.053 7.313 7.607 7.898 8.217 8.534 8.854 9.185 9.553 9.973 10.393 10.871 11.36 11.898 12.479 13.116 13.783 14.376 14.555 14.454 14.22 13.951 13.677 13.403 13.11 12.824 12.532 12.279 12.035 11.789 11.536 11.281 11.046 10.798 10.582 10.4 10.201 9.997 9.816 9.615 9.424 9.278 9.115 8.944 8.757 8.567 8.435 8.29 8.074 7.918 7.754 7.668 7.481 7.274 7.046 6.933 6.463 6.563 6.436 6.294 5.972 5.805 5.633 5.426 5.16 4.845 4.453 3.683 -4 ,545 ,TETRA ,17528071,Thu Nov 25 03:40:44 CET,Thu Nov 25 05:51:20 CET,0.0 0.567 0.861 1.09 1.268 1.437 1.606 1.762 2.039 2.166 2.293 2.181 2.659 2.77 2.995 3.197 3.39 3.489 3.684 3.86 4.094 4.246 4.384 4.578 4.761 4.946 5.124 5.29 5.501 5.687 5.872 6.108 6.325 6.535 6.804 7.122 7.418 7.718 8.015 8.329 8.649 9.011 9.43 9.854 10.336 10.855 11.435 12.025 12.668 13.371 13.962 14.17 14.12 13.96 13.696 13.361 13.055 12.747 12.469 12.192 11.931 11.692 11.455 11.205 10.972 10.768 10.533 10.312 10.124 9.922 9.701 9.501 9.298 9.095 8.939 8.783 8.617 8.449 8.272 8.126 7.964 7.716 7.547 7.38 7.294 7.104 6.9 6.675 6.551 6.07 6.167 6.031 5.884 5.568 5.381 5.179 4.987 4.768 4.469 4.081 3.064 -5 ,25761 ,TETRA ,17528083,Thu Nov 25 03:40:47 CET,Thu Nov 25 05:51:21 CET,0.0 0.984 1.358 1.648 1.862 2.039 2.207 2.358 2.629 2.758 2.889 2.773 3.234 3.343 3.556 3.766 3.968 4.064 4.245 4.417 4.66 4.815 4.963 5.158 5.343 5.523 5.69 5.851 6.06 6.26 6.45 6.674 6.889 7.091 7.337 7.622 7.907 8.214 8.529 8.877 9.254 9.657 10.095 10.532 11.015 11.525 12.099 12.73 13.398 14.1 14.767 14.943 14.797 14.517 14.168 13.806 13.459 13.116 12.801 12.48 12.189 11.908 11.619 11.324 11.055 10.821 10.587 10.381 10.191 9.985 9.763 9.578 9.38 9.166 8.999 8.811 8.616 8.416 8.197 8.04 7.882 7.641 7.465 7.294 7.207 7.016 6.802 6.562 6.439 5.975 6.084 5.946 5.797 5.483 5.298 5.09 4.858 4.614 4.356 3.913 2.659 -6 ,28894 ,TETRA ,17528094,Thu Nov 25 03:40:49 CET,Thu Nov 25 05:53:36 CET,0.0 0.807 1.075 1.301 1.522 1.732 1.93 2.085 2.343 2.472 2.587 2.451 2.913 3.025 3.241 3.431 3.616 3.703 3.849 3.995 4.21 4.35 4.488 4.682 4.863 5.045 5.234 5.4 5.611 5.817 6.015 6.266 6.515 6.757 7.025 7.308 7.578 7.867 8.178 8.514 8.833 9.161 9.566 9.994 10.461 10.945 11.497 12.11 12.746 13.345 13.872 14.05 13.958 13.73 13.454 13.141 12.815 12.503 12.236 11.946 11.653 11.399 11.163 10.918 10.669 10.419 10.157 9.927 9.734 9.542 9.323 9.121 8.915 8.694 8.516 8.334 8.146 7.947 7.731 7.579 7.411 7.146 6.978 6.792 6.694 6.492 6.293 6.084 5.963 5.491 5.574 5.422 5.268 4.939 4.727 4.487 4.248 4.001 3.707 3.325 2.393 -7 ,20894 ,TETRA ,17528095,Thu Nov 25 03:40:44 CET,Thu Nov 25 05:52:55 CET,0.0 0.705 1.03 1.328 1.593 1.794 1.956 2.11 2.386 2.52 2.653 2.531 2.997 3.113 3.321 3.502 3.658 3.733 3.89 4.051 4.274 4.411 4.546 4.747 4.941 5.131 5.326 5.5 5.709 5.912 6.106 6.349 6.586 6.809 7.076 7.364 7.625 7.907 8.2 8.517 8.853 9.249 9.708 10.119 10.542 11.013 11.594 12.234 12.914 13.604 14.234 14.42 14.268 14.003 13.689 13.366 13.039 12.698 12.392 12.106 11.862 11.622 11.345 11.071 10.826 10.607 10.385 10.161 9.95 9.713 9.463 9.269 9.072 8.878 8.724 8.545 8.356 8.151 7.946 7.806 7.636 7.361 7.189 7.012 6.92 6.745 6.556 6.341 6.232 5.771 5.864 5.722 5.567 5.249 5.081 4.876 4.649 4.42 4.145 3.734 2.767 -9 ,17768 ,TETRA ,17528115,Thu Nov 25 03:40:47 CET,Thu Nov 25 05:50:17 CET,0.0 0.603 0.924 1.158 1.367 1.554 1.724 1.894 2.22 2.348 2.461 2.349 2.823 2.92 3.086 3.266 3.461 3.551 3.722 3.891 4.12 4.259 4.394 4.593 4.789 4.972 5.145 5.301 5.511 5.738 5.947 6.195 6.448 6.673 6.912 7.18 7.442 7.736 8.055 8.381 8.709 9.06 9.443 9.829 10.291 10.798 11.386 12.031 12.667 13.294 13.842 13.982 13.843 13.554 13.224 12.912 12.6 12.272 11.953 11.597 11.291 11.023 10.761 10.487 10.206 9.987 9.784 9.567 9.355 9.138 8.91 8.723 8.535 8.335 8.162 7.983 7.824 7.652 7.458 7.323 7.188 6.967 6.795 6.618 6.527 6.337 6.136 5.919 5.8 5.33 5.419 5.275 5.122 4.787 4.612 4.412 4.162 3.903 3.65 3.269 2.216 -10 ,20015 ,TETRA ,17528128,Thu Nov 25 03:40:49 CET,Thu Nov 25 05:50:41 CET,0.0 0.995 1.353 1.635 1.854 2.035 2.209 2.373 2.643 2.759 2.873 2.751 3.223 3.334 3.55 3.76 3.952 4.043 4.222 4.389 4.624 4.774 4.923 5.14 5.33 5.498 5.662 5.843 6.08 6.292 6.492 6.736 6.985 7.208 7.454 7.73 8.002 8.294 8.6 8.928 9.25 9.594 10.004 10.397 10.82 11.268 11.781 12.346 12.933 13.551 14.151 14.398 14.324 14.12 13.873 13.577 13.283 13.03 12.777 12.475 12.19 11.93 11.682 11.453 11.226 10.996 10.759 10.543 10.334 10.101 9.873 9.691 9.499 9.305 9.16 9.01 8.841 8.65 8.451 8.31 8.157 7.904 7.731 7.57 7.478 7.233 6.981 6.749 6.634 6.172 6.258 6.095 5.922 5.549 5.364 5.184 4.965 4.714 4.468 4.162 3.331 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index c92cb4c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,19913 ,TETRA ,17528158,Thu Nov 25 03:41:53 CET,Thu Nov 25 05:55:12 CET,0.0 1.933 2.424 2.757 3.032 3.27 3.493 3.705 4.067 4.22 4.361 4.266 4.742 4.859 5.08 5.276 5.472 5.569 5.752 5.928 6.183 6.343 6.485 6.691 6.893 7.092 7.294 7.484 7.703 7.911 8.123 8.384 8.633 8.864 9.124 9.4 9.676 9.979 10.29 10.603 10.897 11.229 11.617 11.988 12.419 12.863 13.299 13.763 14.251 14.586 14.639 14.281 13.734 13.137 12.555 12.014 11.519 11.063 10.67 10.261 9.881 9.51 9.168 8.862 8.558 8.26 7.951 7.697 7.466 7.196 6.912 6.687 6.444 6.192 5.995 5.779 5.557 5.335 5.099 4.927 4.746 4.461 4.26 4.035 3.923 3.712 3.475 3.218 3.086 2.59 2.674 2.528 2.367 2.0 1.788 1.56 1.3 0.996 0.619 0.142 -0.749 -5 ,21730 ,TETRA ,17528160,Thu Nov 25 03:41:52 CET,Thu Nov 25 05:54:23 CET,0.0 1.227 1.646 1.944 2.196 2.436 2.66 2.855 3.214 3.396 3.566 3.478 3.942 4.043 4.25 4.462 4.665 4.764 4.954 5.127 5.395 5.575 5.741 5.964 6.163 6.355 6.531 6.708 6.95 7.191 7.4 7.616 7.83 8.056 8.326 8.605 8.864 9.132 9.397 9.673 9.983 10.344 10.728 11.053 11.403 11.792 12.194 12.572 12.937 13.24 13.345 13.013 12.522 12.041 11.594 11.135 10.643 10.164 9.761 9.36 9.01 8.705 8.421 8.136 7.838 7.558 7.254 6.979 6.753 6.534 6.296 6.077 5.853 5.635 5.459 5.269 5.079 4.882 4.677 4.533 4.389 4.145 3.97 3.8 3.706 3.502 3.27 3.028 2.9 2.403 2.462 2.298 2.134 1.81 1.627 1.414 1.171 0.885 0.545 0.1 -1.29 -6 ,21771 ,TETRA ,17528162,Thu Nov 25 03:41:54 CET,Thu Nov 25 05:54:39 CET,0.0 1.227 1.7 2.066 2.362 2.594 2.778 2.947 3.294 3.444 3.58 3.539 4.036 4.159 4.39 4.594 4.785 4.878 5.061 5.235 5.469 5.612 5.758 5.996 6.213 6.403 6.583 6.773 7.018 7.23 7.433 7.685 7.945 8.175 8.413 8.673 8.908 9.163 9.453 9.756 10.045 10.373 10.763 11.151 11.599 12.035 12.424 12.799 13.21 13.548 13.655 13.306 12.791 12.254 11.733 11.215 10.718 10.263 9.861 9.452 9.109 8.802 8.479 8.184 7.918 7.654 7.371 7.096 6.845 6.579 6.311 6.102 5.878 5.637 5.452 5.266 5.082 4.882 4.654 4.491 4.32 4.048 3.855 3.657 3.552 3.333 3.106 2.864 2.729 2.226 2.294 2.144 1.99 1.645 1.442 1.212 0.962 0.689 0.359 -0.031 -0.939 -10 ,8208 ,TETRA ,17528177,Thu Nov 25 03:41:55 CET,Thu Nov 25 05:54:56 CET,0.0 1.445 1.93 2.231 2.467 2.691 2.9 3.088 3.446 3.606 3.756 3.68 4.16 4.289 4.525 4.743 4.94 5.032 5.201 5.367 5.645 5.82 5.98 6.219 6.43 6.624 6.833 7.033 7.275 7.501 7.709 7.952 8.187 8.425 8.694 8.985 9.261 9.528 9.802 10.097 10.396 10.742 11.124 11.501 11.953 12.395 12.815 13.208 13.549 13.875 14.004 13.643 13.097 12.523 11.994 11.481 10.999 10.527 10.093 9.647 9.239 8.836 8.439 8.094 7.778 7.482 7.162 6.869 6.623 6.357 6.072 5.837 5.583 5.317 5.115 4.898 4.674 4.445 4.211 4.058 3.895 3.636 3.453 3.241 3.126 2.898 2.662 2.409 2.277 1.791 1.863 1.709 1.545 1.188 1.011 0.817 0.598 0.349 0.069 -0.322 -1.279 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 90f36fd8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30234 ,KEBNE ,17024531,Wed Dec 22 10:08:33 CET,Wed Dec 22 11:57:41 CET,0.0 0.941 1.323 1.554 1.77 1.955 2.104 2.242 2.512 2.645 2.773 2.642 3.083 3.178 3.371 3.544 3.707 3.788 3.946 4.093 4.293 4.425 4.547 4.714 4.875 5.029 5.182 5.328 5.529 5.748 5.955 6.195 6.415 6.619 6.851 7.113 7.373 7.644 7.925 8.224 8.521 8.817 9.173 9.522 9.88 10.288 10.712 11.114 11.5 11.806 11.863 11.546 11.055 10.505 9.972 9.431 8.927 8.448 8.028 7.589 7.181 6.805 6.448 6.118 5.817 5.538 5.209 4.902 4.65 4.399 4.125 3.893 3.645 3.373 3.168 2.952 2.708 2.443 2.182 2.011 1.828 1.526 1.318 1.12 1.022 0.812 0.564 0.284 0.143 -0.351 -0.306 -0.463 -0.621 -1.002 -1.234 -1.491 -1.755 -2.057 -2.442 -2.912 -3.971 -2 ,12447 ,KEBNE ,17024532,Wed Dec 22 10:09:36 CET,Wed Dec 22 11:58:32 CET,0.0 1.039 1.329 1.547 1.766 1.975 2.19 2.383 2.706 2.858 2.998 2.902 3.359 3.461 3.659 3.838 4.01 4.092 4.246 4.403 4.653 4.821 4.975 5.179 5.367 5.558 5.741 5.921 6.153 6.362 6.558 6.798 7.022 7.222 7.46 7.724 7.971 8.238 8.521 8.827 9.136 9.474 9.865 10.244 10.67 11.11 11.595 12.072 12.518 12.9 13.059 12.846 12.442 11.922 11.362 10.833 10.332 9.853 9.42 8.971 8.563 8.195 7.845 7.496 7.17 6.884 6.579 6.284 6.01 5.732 5.463 5.246 5.023 4.784 4.582 4.36 4.117 3.876 3.663 3.508 3.337 3.059 2.852 2.644 2.535 2.304 2.066 1.794 1.645 1.152 1.199 1.03 0.841 0.436 0.23 -0.01 -0.293 -0.616 -0.999 -1.468 -2.7 -3 ,4866 ,KEBNE ,17024533,Wed Dec 22 10:09:36 CET,Wed Dec 22 11:58:28 CET,0.0 0.948 1.272 1.503 1.695 1.877 2.041 2.189 2.448 2.572 2.69 2.564 3.012 3.107 3.3 3.478 3.657 3.745 3.903 4.051 4.269 4.41 4.549 4.736 4.912 5.087 5.246 5.396 5.585 5.759 5.922 6.128 6.332 6.538 6.779 7.042 7.291 7.54 7.789 8.055 8.336 8.647 8.999 9.348 9.735 10.131 10.522 10.902 11.254 11.574 11.717 11.401 10.934 10.44 9.896 9.375 8.921 8.467 8.039 7.601 7.199 6.808 6.445 6.098 5.77 5.458 5.112 4.799 4.528 4.241 3.946 3.709 3.455 3.194 2.987 2.757 2.5 2.22 1.94 1.763 1.591 1.317 1.11 0.888 0.773 0.519 0.213 -0.097 -0.244 -0.758 -0.758 -0.942 -1.143 -1.579 -1.809 -2.056 -2.327 -2.621 -2.981 -3.474 -4.675 -4 ,12877 ,KEBNE ,17024534,Wed Dec 22 10:09:36 CET,Wed Dec 22 11:59:30 CET,0.0 0.564 0.817 1.031 1.244 1.436 1.609 1.757 2.018 2.165 2.307 2.183 2.641 2.744 2.941 3.122 3.288 3.369 3.537 3.705 3.929 4.059 4.187 4.383 4.564 4.738 4.914 5.084 5.292 5.486 5.669 5.897 6.114 6.312 6.544 6.804 7.054 7.329 7.616 7.921 8.235 8.571 8.939 9.276 9.65 10.075 10.538 11.008 11.452 11.802 11.966 11.695 11.234 10.699 10.118 9.562 9.057 8.558 8.123 7.681 7.269 6.891 6.504 6.115 5.749 5.429 5.108 4.793 4.5 4.217 3.909 3.646 3.401 3.159 2.963 2.75 2.53 2.302 2.063 1.893 1.716 1.426 1.221 1.023 0.917 0.688 0.441 0.164 0.02 -0.48 -0.431 -0.596 -0.79 -1.188 -1.389 -1.621 -1.861 -2.11 -2.474 -2.962 -4.017 -5 ,2126 ,KEBNE ,17024535,Wed Dec 22 10:09:36 CET,Wed Dec 22 12:00:00 CET,0.0 0.509 0.795 1.031 1.228 1.425 1.591 1.727 1.959 2.063 2.168 2.05 2.5 2.597 2.798 2.972 3.132 3.218 3.391 3.55 3.774 3.904 4.02 4.205 4.389 4.553 4.709 4.867 5.06 5.227 5.401 5.631 5.856 6.062 6.289 6.533 6.77 7.043 7.302 7.564 7.848 8.151 8.495 8.84 9.25 9.683 10.109 10.495 10.855 11.164 11.277 10.962 10.466 9.933 9.443 8.974 8.519 8.089 7.734 7.356 6.973 6.619 6.298 5.996 5.703 5.413 5.106 4.846 4.62 4.367 4.09 3.873 3.653 3.417 3.236 3.039 2.828 2.601 2.368 2.212 2.038 1.753 1.554 1.352 1.247 1.013 0.771 0.509 0.367 -0.135 -0.127 -0.302 -0.482 -0.91 -1.145 -1.383 -1.649 -1.955 -2.268 -2.664 -3.723 -6 ,4139 ,KEBNE ,17024536,Wed Dec 22 10:10:37 CET,Wed Dec 22 12:01:51 CET,0.0 0.674 1.005 1.258 1.479 1.681 1.859 2.01 2.268 2.376 2.489 2.369 2.819 2.917 3.102 3.279 3.448 3.527 3.676 3.818 4.022 4.156 4.278 4.449 4.62 4.778 4.925 5.074 5.278 5.477 5.674 5.898 6.098 6.301 6.539 6.795 7.038 7.308 7.587 7.869 8.154 8.459 8.806 9.135 9.497 9.876 10.276 10.679 11.132 11.521 11.62 11.224 10.696 10.139 9.581 9.054 8.541 8.052 7.628 7.186 6.807 6.47 6.129 5.789 5.472 5.187 4.869 4.575 4.316 4.051 3.789 3.565 3.334 3.103 2.913 2.697 2.477 2.253 2.01 1.834 1.648 1.359 1.15 0.92 0.802 0.559 0.305 0.039 -0.107 -0.598 -0.523 -0.665 -0.831 -1.22 -1.424 -1.633 -1.887 -2.184 -2.545 -3.081 -4.402 -7 ,10399 ,KEBNE ,17024537,Wed Dec 22 10:11:39 CET,Wed Dec 22 12:02:28 CET,0.0 0.885 1.248 1.53 1.757 1.954 2.138 2.297 2.586 2.714 2.85 2.744 3.202 3.316 3.511 3.698 3.879 3.967 4.129 4.285 4.506 4.647 4.796 4.99 5.177 5.364 5.522 5.661 5.844 6.039 6.228 6.444 6.663 6.869 7.104 7.368 7.613 7.881 8.129 8.371 8.632 8.931 9.282 9.607 9.946 10.326 10.711 11.038 11.343 11.63 11.768 11.463 10.974 10.414 9.873 9.369 8.862 8.415 8.014 7.557 7.182 6.837 6.482 6.141 5.806 5.501 5.161 4.841 4.576 4.302 3.987 3.723 3.468 3.206 3.001 2.784 2.555 2.325 2.086 1.91 1.725 1.408 1.173 0.957 0.851 0.626 0.385 0.131 -0.005 -0.499 -0.414 -0.554 -0.713 -1.103 -1.327 -1.553 -1.799 -2.101 -2.47 -2.938 -4.125 -8 ,17581 ,KEBNE ,17024538,Wed Dec 22 10:11:39 CET,Wed Dec 22 12:02:15 CET,0.0 0.543 0.899 1.236 1.492 1.71 1.902 2.076 2.408 2.557 2.697 2.604 3.068 3.173 3.38 3.572 3.745 3.825 3.977 4.129 4.356 4.51 4.652 4.842 5.025 5.198 5.368 5.533 5.746 5.951 6.147 6.373 6.583 6.791 7.042 7.324 7.585 7.847 8.112 8.414 8.739 9.09 9.501 9.867 10.248 10.63 11.024 11.458 11.854 12.184 12.262 11.851 11.304 10.743 10.191 9.636 9.109 8.612 8.179 7.738 7.335 6.963 6.613 6.27 5.929 5.577 5.201 4.893 4.608 4.306 4.001 3.74 3.467 3.19 2.964 2.719 2.465 2.204 1.936 1.746 1.551 1.242 1.014 0.797 0.69 0.432 0.149 -0.145 -0.29 -0.794 -0.795 -0.984 -1.186 -1.604 -1.824 -2.091 -2.411 -2.758 -3.172 -3.754 -5.182 -9 ,10893 ,KEBNE ,17024539,Wed Dec 22 10:11:39 CET,Wed Dec 22 12:01:31 CET,0.0 1.034 1.339 1.588 1.821 2.041 2.248 2.428 2.743 2.881 3.004 2.9 3.366 3.481 3.688 3.895 4.095 4.184 4.353 4.503 4.718 4.854 4.979 5.163 5.336 5.486 5.63 5.78 5.971 6.17 6.381 6.611 6.81 7.002 7.225 7.464 7.688 7.928 8.173 8.444 8.736 9.046 9.378 9.695 10.058 10.46 10.885 11.278 11.636 11.903 11.958 11.592 11.069 10.547 9.98 9.436 8.957 8.499 8.061 7.605 7.22 6.868 6.513 6.17 5.836 5.535 5.257 5.012 4.779 4.507 4.221 3.993 3.736 3.443 3.219 3.002 2.779 2.527 2.264 2.098 1.924 1.639 1.437 1.223 1.11 0.87 0.618 0.349 0.212 -0.263 -0.192 -0.355 -0.526 -0.899 -1.117 -1.36 -1.635 -1.974 -2.373 -2.845 -4.29 -10 ,16022 ,KEBNE ,17024540,Wed Dec 22 10:11:39 CET,Wed Dec 22 12:02:40 CET,0.0 0.784 1.105 1.344 1.536 1.694 1.845 1.987 2.247 2.362 2.47 2.35 2.805 2.901 3.087 3.273 3.444 3.527 3.704 3.874 4.111 4.243 4.356 4.531 4.709 4.875 5.035 5.179 5.349 5.525 5.685 5.898 6.122 6.322 6.543 6.767 6.979 7.226 7.493 7.753 8.003 8.295 8.636 8.963 9.336 9.711 10.121 10.565 10.988 11.303 11.398 11.132 10.657 10.128 9.637 9.159 8.667 8.18 7.759 7.341 6.932 6.533 6.147 5.774 5.436 5.134 4.833 4.569 4.328 4.049 3.735 3.484 3.242 3.001 2.798 2.586 2.384 2.165 1.915 1.736 1.546 1.246 1.037 0.825 0.722 0.516 0.271 -0.005 -0.13 -0.604 -0.554 -0.723 -0.889 -1.257 -1.481 -1.695 -1.923 -2.218 -2.558 -3.011 -4.485 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt deleted file mode 100644 index 424ef1f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5069 ,TETRA ,17528194,Thu Nov 25 03:41:57 CET,Thu Nov 25 05:54:08 CET,0.0 1.53 2.034 2.371 2.661 2.933 3.184 3.399 3.742 3.909 4.08 4.015 4.482 4.607 4.833 5.052 5.264 5.362 5.551 5.727 5.983 6.141 6.288 6.494 6.687 6.883 7.08 7.258 7.477 7.68 7.863 8.068 8.252 8.444 8.686 8.939 9.171 9.43 9.701 9.979 10.271 10.572 10.88 11.142 11.41 11.681 11.937 12.166 12.306 12.263 11.807 10.948 10.098 9.207 8.369 7.609 6.902 6.234 5.653 5.06 4.541 4.081 3.66 3.253 2.866 2.519 2.165 1.837 1.532 1.232 0.922 0.648 0.385 0.107 -0.123 -0.364 -0.628 -0.893 -1.169 -1.369 -1.568 -1.863 -2.08 -2.316 -2.433 -2.659 -2.902 -3.176 -3.327 -3.845 -3.826 -4.002 -4.185 -4.6 -4.836 -5.1 -5.384 -5.685 -6.08 -6.605 -8.305 -3 ,10357 ,TETRA ,17528205,Thu Nov 25 03:41:53 CET,Thu Nov 25 05:54:15 CET,0.0 1.494 2.031 2.405 2.719 2.953 3.178 3.4 3.767 3.929 4.071 4.015 4.498 4.621 4.849 5.069 5.269 5.361 5.547 5.711 5.944 6.096 6.237 6.431 6.616 6.797 6.959 7.138 7.368 7.566 7.739 7.939 8.148 8.332 8.551 8.794 9.021 9.269 9.502 9.738 9.976 10.235 10.529 10.809 11.113 11.416 11.669 11.878 12.012 11.942 11.535 10.715 9.839 9.033 8.298 7.619 6.997 6.421 5.911 5.369 4.913 4.511 4.115 3.725 3.346 2.996 2.644 2.322 2.024 1.728 1.425 1.161 0.87 0.561 0.329 0.08 -0.177 -0.424 -0.671 -0.847 -1.039 -1.342 -1.573 -1.813 -1.924 -2.143 -2.392 -2.686 -2.835 -3.342 -3.329 -3.507 -3.69 -4.089 -4.33 -4.592 -4.849 -5.144 -5.541 -6.065 -8.049 -4 ,8038 ,TETRA ,17528215,Thu Nov 25 03:41:57 CET,Thu Nov 25 05:54:04 CET,0.0 1.558 2.204 2.618 2.939 3.216 3.421 3.605 3.95 4.106 4.251 4.178 4.652 4.78 5.011 5.215 5.407 5.5 5.689 5.86 6.098 6.255 6.406 6.619 6.826 7.021 7.191 7.357 7.601 7.812 7.996 8.215 8.418 8.613 8.829 9.058 9.287 9.551 9.819 10.081 10.347 10.639 10.933 11.189 11.47 11.769 12.048 12.264 12.418 12.426 12.078 11.24 10.359 9.523 8.695 7.94 7.278 6.689 6.205 5.664 5.176 4.75 4.335 3.94 3.577 3.254 2.921 2.61 2.344 2.08 1.789 1.539 1.266 0.963 0.733 0.493 0.243 -0.011 -0.299 -0.499 -0.696 -1.019 -1.236 -1.45 -1.563 -1.812 -2.082 -2.38 -2.531 -3.038 -3.01 -3.189 -3.379 -3.79 -4.014 -4.281 -4.58 -4.892 -5.295 -5.892 -7.815 -5 ,15678 ,TETRA ,17528216,Thu Nov 25 03:41:53 CET,Thu Nov 25 05:52:11 CET,0.0 2.194 2.832 3.191 3.485 3.742 3.976 4.186 4.569 4.734 4.902 4.867 5.341 5.464 5.7 5.915 6.124 6.213 6.367 6.526 6.777 6.929 7.084 7.315 7.514 7.7 7.886 8.065 8.269 8.453 8.656 8.911 9.131 9.336 9.558 9.786 10.002 10.24 10.485 10.719 10.953 11.229 11.537 11.786 12.023 12.278 12.531 12.718 12.784 12.703 12.282 11.357 10.456 9.638 8.88 8.154 7.482 6.871 6.342 5.807 5.357 4.924 4.475 4.074 3.7 3.347 2.973 2.636 2.349 2.052 1.752 1.494 1.22 0.932 0.704 0.48 0.249 -0.003 -0.29 -0.494 -0.701 -0.993 -1.187 -1.417 -1.536 -1.786 -2.058 -2.342 -2.492 -3.0 -2.961 -3.139 -3.329 -3.722 -3.933 -4.171 -4.448 -4.766 -5.157 -5.684 -7.395 -7 ,30375 ,TETRA ,17528231,Thu Nov 25 03:41:54 CET,Thu Nov 25 05:52:59 CET,0.0 1.568 2.117 2.531 2.808 3.04 3.276 3.508 3.875 4.016 4.151 4.082 4.555 4.672 4.891 5.096 5.292 5.382 5.56 5.737 5.983 6.148 6.3 6.508 6.701 6.886 7.058 7.217 7.428 7.622 7.793 7.998 8.198 8.383 8.596 8.837 9.054 9.278 9.526 9.796 10.058 10.325 10.637 10.923 11.192 11.456 11.724 11.916 11.997 11.93 11.395 10.453 9.548 8.649 7.844 7.128 6.477 5.861 5.326 4.784 4.321 3.902 3.495 3.104 2.743 2.403 2.037 1.714 1.428 1.132 0.822 0.558 0.283 0.003 -0.223 -0.46 -0.705 -0.973 -1.265 -1.463 -1.654 -1.951 -2.169 -2.398 -2.513 -2.758 -3.013 -3.293 -3.438 -3.935 -3.872 -4.041 -4.219 -4.624 -4.857 -5.109 -5.376 -5.68 -6.069 -6.611 -8.296 -9 ,30317 ,TETRA ,17528234,Thu Nov 25 03:41:16 CET,Thu Nov 25 05:49:13 CET,0.0 2.104 2.75 3.155 3.458 3.725 4.008 4.25 4.649 4.848 5.015 4.951 5.426 5.544 5.767 5.976 6.18 6.277 6.469 6.654 6.916 7.077 7.229 7.439 7.625 7.802 7.982 8.165 8.396 8.603 8.802 9.036 9.247 9.445 9.677 9.928 10.152 10.392 10.642 10.92 11.198 11.465 11.746 12.011 12.323 12.661 12.975 13.238 13.417 13.415 12.978 12.065 11.145 10.247 9.425 8.673 8.004 7.366 6.818 6.283 5.763 5.306 4.91 4.53 4.149 3.773 3.408 3.099 2.812 2.495 2.155 1.87 1.562 1.252 1.02 0.762 0.495 0.226 -0.042 -0.22 -0.418 -0.746 -0.97 -1.206 -1.334 -1.595 -1.854 -2.137 -2.287 -2.79 -2.757 -2.94 -3.13 -3.541 -3.771 -4.036 -4.322 -4.645 -5.051 -5.572 -7.131 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index ecb96f71..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,13539 ,TETRA ,17528272,Thu Nov 25 03:41:19 CET,Thu Nov 25 05:53:51 CET,0.0 0.786 1.126 1.359 1.56 1.756 1.933 2.098 2.416 2.569 2.715 2.619 3.096 3.212 3.405 3.596 3.792 3.885 4.059 4.229 4.464 4.606 4.748 4.966 5.183 5.392 5.603 5.806 6.059 6.3 6.531 6.806 7.083 7.353 7.648 7.967 8.273 8.621 8.974 9.313 9.656 10.062 10.559 11.043 11.594 12.163 12.789 13.503 14.268 15.085 15.939 16.435 16.506 16.348 16.123 15.872 15.573 15.27 14.997 14.705 14.442 14.193 13.96 13.723 13.507 13.317 13.087 12.87 12.684 12.48 12.258 12.066 11.869 11.664 11.491 11.313 11.139 10.971 10.792 10.66 10.522 10.292 10.133 9.965 9.874 9.683 9.467 9.228 9.117 8.663 8.795 8.673 8.509 8.154 7.994 7.819 7.584 7.297 6.971 6.54 5.194 -6 ,25124 ,TETRA ,17528284,Thu Nov 25 03:41:22 CET,Thu Nov 25 05:51:38 CET,0.0 0.569 0.893 1.143 1.372 1.577 1.754 1.912 2.196 2.328 2.462 2.369 2.843 2.952 3.16 3.35 3.533 3.621 3.785 3.956 4.199 4.346 4.491 4.695 4.897 5.091 5.279 5.473 5.711 5.927 6.138 6.402 6.655 6.893 7.182 7.495 7.774 8.094 8.447 8.811 9.192 9.601 10.057 10.509 11.007 11.543 12.162 12.842 13.574 14.365 15.201 15.682 15.743 15.665 15.505 15.295 15.063 14.784 14.507 14.225 13.96 13.708 13.469 13.231 13.014 12.828 12.62 12.415 12.24 12.07 11.894 11.733 11.56 11.367 11.2 11.033 10.878 10.714 10.529 10.383 10.222 9.994 9.838 9.661 9.568 9.394 9.202 8.992 8.875 8.402 8.482 8.335 8.178 7.843 7.652 7.432 7.196 6.961 6.637 6.159 4.985 -8 ,1100 ,TETRA ,17528300,Thu Nov 25 03:41:17 CET,Thu Nov 25 05:51:27 CET,0.0 0.589 0.953 1.287 1.548 1.752 1.944 2.11 2.424 2.566 2.692 2.576 3.04 3.146 3.377 3.583 3.778 3.876 4.066 4.242 4.488 4.651 4.807 5.029 5.238 5.448 5.644 5.817 6.051 6.278 6.49 6.739 6.98 7.228 7.512 7.818 8.096 8.387 8.712 9.071 9.458 9.882 10.361 10.825 11.354 11.929 12.567 13.259 14.023 14.85 15.671 16.143 16.217 16.127 15.995 15.765 15.471 15.175 14.929 14.695 14.472 14.256 14.016 13.79 13.578 13.359 13.137 12.946 12.765 12.571 12.384 12.219 12.022 11.802 11.628 11.465 11.293 11.093 10.894 10.758 10.614 10.401 10.248 10.058 9.961 9.785 9.587 9.372 9.257 8.776 8.832 8.692 8.557 8.213 8.023 7.844 7.645 7.439 7.175 6.822 6.02 -9 ,13757 ,TETRA ,17528315,Thu Nov 25 03:41:17 CET,Thu Nov 25 05:48:37 CET,0.0 1.008 1.36 1.633 1.874 2.083 2.276 2.456 2.779 2.922 3.064 2.971 3.448 3.564 3.772 3.962 4.164 4.264 4.441 4.605 4.86 5.027 5.174 5.384 5.594 5.788 5.975 6.158 6.392 6.622 6.839 7.097 7.347 7.589 7.876 8.186 8.477 8.805 9.15 9.507 9.893 10.316 10.789 11.259 11.772 12.322 12.95 13.609 14.337 15.148 15.963 16.391 16.449 16.362 16.22 16.027 15.78 15.51 15.26 14.991 14.74 14.525 14.337 14.136 13.915 13.701 13.487 13.295 13.131 12.962 12.769 12.597 12.412 12.233 12.103 11.959 11.802 11.634 11.434 11.285 11.143 10.912 10.739 10.561 10.465 10.254 10.034 9.797 9.679 9.209 9.306 9.178 9.023 8.648 8.452 8.236 7.984 7.719 7.404 6.939 5.722 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index ad42eb7e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,25295 ,TETRA ,17528346,Thu Nov 25 03:41:19 CET,Thu Nov 25 05:50:53 CET,0.0 0.815 1.19 1.575 1.869 2.149 2.388 2.588 2.986 3.169 3.338 3.259 3.735 3.844 4.08 4.327 4.55 4.651 4.84 5.022 5.276 5.442 5.608 5.848 6.061 6.254 6.432 6.613 6.851 7.074 7.279 7.529 7.769 7.998 8.259 8.535 8.821 9.128 9.429 9.739 10.05 10.397 10.793 11.199 11.661 12.125 12.62 13.141 13.663 14.118 14.427 14.295 13.983 13.619 13.207 12.794 12.423 12.052 11.693 11.323 10.995 10.694 10.381 10.08 9.81 9.548 9.265 9.006 8.778 8.537 8.287 8.084 7.86 7.62 7.438 7.231 7.01 6.774 6.533 6.369 6.186 5.9 5.718 5.533 5.432 5.227 5.004 4.749 4.611 4.109 4.154 3.982 3.809 3.455 3.257 3.032 2.766 2.427 2.025 1.539 -0.14 -5 ,9760 ,TETRA ,17528360,Thu Nov 25 03:41:22 CET,Thu Nov 25 05:51:10 CET,0.0 1.497 1.986 2.337 2.599 2.813 3.038 3.254 3.597 3.757 3.915 3.852 4.336 4.46 4.693 4.921 5.132 5.231 5.422 5.61 5.887 6.047 6.204 6.43 6.632 6.845 7.041 7.232 7.492 7.722 7.943 8.216 8.459 8.684 8.942 9.221 9.502 9.81 10.131 10.467 10.824 11.224 11.658 12.076 12.547 13.029 13.524 14.02 14.519 15.005 15.373 15.341 15.038 14.691 14.312 13.879 13.479 13.085 12.715 12.306 11.908 11.577 11.269 10.966 10.705 10.457 10.172 9.92 9.701 9.464 9.218 9.019 8.812 8.594 8.417 8.222 8.018 7.801 7.59 7.445 7.285 7.034 6.859 6.665 6.564 6.358 6.133 5.869 5.734 5.248 5.322 5.167 5.001 4.662 4.452 4.187 3.909 3.602 3.208 2.722 1.205 -6 ,16243 ,TETRA ,17528361,Thu Nov 25 03:41:19 CET,Thu Nov 25 05:52:39 CET,0.0 1.934 2.439 2.824 3.156 3.433 3.669 3.888 4.283 4.469 4.644 4.604 5.117 5.259 5.521 5.778 6.025 6.142 6.37 6.584 6.873 7.046 7.208 7.447 7.683 7.909 8.12 8.332 8.6 8.834 9.072 9.374 9.654 9.915 10.176 10.441 10.701 10.978 11.276 11.612 11.989 12.428 12.92 13.388 13.901 14.377 14.833 15.287 15.774 16.27 16.683 16.712 16.468 16.132 15.785 15.398 15.023 14.67 14.327 13.978 13.657 13.359 13.059 12.754 12.479 12.221 11.94 11.686 11.46 11.227 10.982 10.775 10.565 10.345 10.178 9.999 9.794 9.567 9.347 9.189 9.018 8.763 8.571 8.376 8.276 8.069 7.856 7.592 7.451 6.962 7.023 6.846 6.659 6.271 6.061 5.831 5.556 5.255 4.885 4.321 2.309 -7 ,4700 ,TETRA ,17528378,Thu Nov 25 03:41:21 CET,Thu Nov 25 05:52:53 CET,0.0 1.428 1.928 2.281 2.594 2.838 3.041 3.237 3.591 3.749 3.9 3.825 4.308 4.426 4.654 4.872 5.071 5.163 5.332 5.503 5.755 5.905 6.069 6.319 6.524 6.722 6.915 7.101 7.352 7.576 7.798 8.08 8.334 8.578 8.854 9.14 9.401 9.674 9.975 10.278 10.574 10.952 11.419 11.824 12.246 12.705 13.174 13.652 14.213 14.766 15.057 14.896 14.52 14.087 13.655 13.23 12.821 12.439 12.086 11.722 11.441 11.18 10.905 10.612 10.332 10.086 9.833 9.585 9.362 9.14 8.922 8.741 8.538 8.321 8.146 7.95 7.744 7.536 7.319 7.17 7.021 6.758 6.565 6.388 6.289 6.081 5.877 5.64 5.517 5.037 5.097 4.935 4.762 4.396 4.187 3.952 3.691 3.397 3.079 2.654 1.094 -8 ,6748 ,TETRA ,17528379,Thu Nov 25 03:41:23 CET,Thu Nov 25 05:53:56 CET,0.0 1.186 1.643 1.994 2.275 2.479 2.672 2.862 3.179 3.33 3.492 3.412 3.891 4.009 4.246 4.473 4.685 4.783 4.98 5.162 5.408 5.567 5.719 5.939 6.142 6.333 6.522 6.705 6.928 7.126 7.319 7.57 7.811 8.04 8.305 8.58 8.835 9.103 9.392 9.697 10.012 10.368 10.772 11.173 11.636 12.099 12.553 13.038 13.531 13.925 14.187 14.133 13.833 13.477 13.113 12.715 12.276 11.878 11.569 11.239 10.906 10.583 10.298 10.024 9.751 9.494 9.228 8.977 8.76 8.556 8.321 8.103 7.883 7.656 7.462 7.251 7.032 6.817 6.605 6.457 6.3 6.042 5.852 5.664 5.573 5.375 5.158 4.916 4.792 4.311 4.376 4.208 4.036 3.703 3.509 3.283 3.022 2.712 2.355 1.888 0.306 -9 ,669 ,TETRA ,17528381,Thu Nov 25 03:41:20 CET,Thu Nov 25 05:52:41 CET,0.0 1.925 2.367 2.717 3.007 3.244 3.461 3.671 4.052 4.223 4.378 4.296 4.787 4.92 5.177 5.411 5.62 5.717 5.899 6.071 6.331 6.497 6.649 6.877 7.108 7.319 7.517 7.691 7.905 8.125 8.329 8.586 8.819 9.019 9.278 9.574 9.857 10.163 10.461 10.77 11.076 11.429 11.857 12.256 12.689 13.112 13.535 14.026 14.582 15.085 15.457 15.49 15.317 15.0 14.615 14.19 13.746 13.337 12.992 12.65 12.359 12.075 11.791 11.538 11.287 11.046 10.798 10.565 10.35 10.09 9.821 9.621 9.415 9.208 9.043 8.863 8.665 8.447 8.22 8.077 7.926 7.675 7.488 7.285 7.19 6.991 6.75 6.498 6.36 5.859 5.933 5.781 5.625 5.255 5.061 4.856 4.58 4.283 3.938 3.413 2.017 -10 ,25830 ,TETRA ,17528391,Thu Nov 25 03:41:20 CET,Thu Nov 25 05:54:03 CET,0.0 1.441 1.93 2.271 2.521 2.717 2.901 3.073 3.377 3.514 3.644 3.541 4.023 4.147 4.387 4.607 4.793 4.877 5.062 5.249 5.519 5.684 5.835 6.051 6.264 6.47 6.664 6.848 7.078 7.301 7.521 7.76 7.971 8.188 8.439 8.698 8.941 9.224 9.536 9.845 10.157 10.506 10.902 11.32 11.779 12.231 12.708 13.176 13.649 14.124 14.468 14.423 14.185 13.8 13.346 12.91 12.496 12.11 11.781 11.423 11.095 10.8 10.483 10.166 9.87 9.612 9.344 9.092 8.898 8.701 8.467 8.26 8.062 7.864 7.71 7.546 7.353 7.142 6.906 6.749 6.593 6.342 6.163 5.961 5.852 5.641 5.411 5.153 5.022 4.524 4.568 4.4 4.232 3.889 3.689 3.458 3.205 2.898 2.552 2.095 -0.053 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 17be7ed6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,2859 ,TETRA ,17528420,Thu Nov 25 03:41:20 CET,Thu Nov 25 05:52:35 CET,0.0 0.874 1.242 1.521 1.753 1.947 2.14 2.33 2.653 2.791 2.921 2.791 3.25 3.357 3.582 3.794 3.978 4.066 4.23 4.394 4.65 4.804 4.95 5.163 5.354 5.547 5.745 5.93 6.16 6.363 6.565 6.812 7.048 7.289 7.565 7.863 8.146 8.458 8.791 9.153 9.53 9.919 10.339 10.757 11.267 11.841 12.442 13.066 13.763 14.475 15.146 15.515 15.548 15.367 15.1 14.835 14.574 14.304 14.032 13.72 13.419 13.133 12.876 12.631 12.377 12.132 11.879 11.652 11.45 11.247 11.036 10.859 10.661 10.452 10.296 10.129 9.947 9.758 9.56 9.411 9.252 9.01 8.839 8.658 8.565 8.363 8.146 7.918 7.802 7.324 7.41 7.26 7.088 6.745 6.565 6.364 6.143 5.876 5.555 5.169 4.141 -4 ,8114 ,TETRA ,17528421,Thu Nov 25 03:41:24 CET,Thu Nov 25 05:54:13 CET,0.0 0.847 1.138 1.359 1.572 1.766 1.919 2.056 2.322 2.455 2.588 2.495 2.971 3.078 3.274 3.462 3.658 3.754 3.941 4.119 4.354 4.492 4.626 4.82 5.011 5.201 5.384 5.564 5.799 6.025 6.232 6.468 6.7 6.927 7.185 7.48 7.763 8.051 8.357 8.685 9.025 9.429 9.894 10.34 10.881 11.481 12.119 12.762 13.467 14.221 14.966 15.307 15.283 15.142 14.946 14.7 14.434 14.164 13.895 13.618 13.373 13.127 12.87 12.618 12.388 12.17 11.931 11.709 11.519 11.306 11.068 10.881 10.679 10.474 10.311 10.142 9.977 9.807 9.627 9.486 9.327 9.083 8.921 8.757 8.672 8.485 8.272 8.041 7.93 7.462 7.541 7.391 7.24 6.9 6.689 6.477 6.252 5.999 5.718 5.294 4.297 -5 ,282 ,TETRA ,17528422,Thu Nov 25 03:41:20 CET,Thu Nov 25 05:54:06 CET,0.0 0.725 1.068 1.357 1.584 1.764 1.923 2.073 2.329 2.455 2.58 2.466 2.927 3.031 3.252 3.462 3.638 3.718 3.883 4.045 4.267 4.419 4.57 4.784 4.992 5.186 5.364 5.551 5.803 6.015 6.219 6.487 6.742 6.977 7.231 7.502 7.767 8.074 8.392 8.721 9.065 9.442 9.889 10.328 10.811 11.348 11.935 12.528 13.19 13.93 14.681 15.051 15.044 14.895 14.679 14.41 14.115 13.832 13.599 13.329 13.066 12.823 12.573 12.316 12.084 11.888 11.66 11.421 11.211 10.999 10.774 10.588 10.399 10.212 10.056 9.882 9.702 9.516 9.326 9.19 9.04 8.791 8.624 8.448 8.355 8.159 7.963 7.776 7.671 7.199 7.273 7.128 6.974 6.614 6.429 6.236 6.006 5.739 5.458 5.134 3.904 -6 ,28744 ,TETRA ,17528433,Thu Nov 25 03:41:23 CET,Thu Nov 25 05:52:42 CET,0.0 0.7 1.038 1.31 1.553 1.789 1.972 2.123 2.414 2.556 2.682 2.549 3.02 3.13 3.324 3.525 3.714 3.796 3.965 4.138 4.375 4.528 4.676 4.886 5.082 5.274 5.458 5.627 5.858 6.084 6.282 6.528 6.766 6.985 7.252 7.551 7.821 8.106 8.411 8.728 9.064 9.448 9.87 10.295 10.779 11.287 11.847 12.447 13.11 13.808 14.567 14.995 15.035 14.905 14.688 14.458 14.204 13.941 13.665 13.352 13.096 12.872 12.656 12.427 12.177 11.95 11.711 11.481 11.288 11.057 10.798 10.614 10.421 10.205 10.03 9.845 9.654 9.477 9.319 9.194 9.054 8.855 8.698 8.525 8.437 8.237 8.027 7.803 7.684 7.208 7.276 7.139 7.011 6.711 6.536 6.32 6.072 5.813 5.536 5.149 4.164 -10 ,26243 ,TETRA ,17528449,Thu Nov 25 03:41:53 CET,Thu Nov 25 05:51:44 CET,0.0 0.955 1.299 1.577 1.823 2.034 2.213 2.386 2.719 2.877 3.028 2.931 3.415 3.532 3.75 3.96 4.153 4.249 4.439 4.608 4.836 4.99 5.139 5.345 5.54 5.732 5.926 6.114 6.362 6.591 6.809 7.075 7.317 7.546 7.809 8.088 8.358 8.658 8.976 9.321 9.675 10.047 10.462 10.917 11.458 12.014 12.627 13.289 13.981 14.683 15.395 15.723 15.743 15.621 15.391 15.125 14.864 14.605 14.357 14.076 13.801 13.533 13.286 13.045 12.804 12.588 12.368 12.157 11.973 11.783 11.578 11.41 11.225 11.028 10.878 10.702 10.509 10.313 10.106 9.949 9.789 9.569 9.41 9.223 9.118 8.909 8.692 8.449 8.326 7.852 7.94 7.8 7.671 7.412 7.234 7.033 6.828 6.562 6.219 5.762 4.475 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt deleted file mode 100644 index fbdda8c2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20959 ,TETRA ,17528456,Thu Nov 25 03:41:55 CET,Thu Nov 25 05:52:51 CET,0.0 1.007 1.407 1.705 1.934 2.114 2.274 2.431 2.725 2.859 2.986 2.863 3.328 3.437 3.649 3.851 4.033 4.117 4.278 4.435 4.659 4.787 4.913 5.103 5.276 5.431 5.59 5.757 5.972 6.163 6.34 6.563 6.771 6.975 7.214 7.475 7.72 7.995 8.307 8.624 8.932 9.258 9.627 10.013 10.463 10.914 11.395 11.897 12.402 12.857 13.154 13.068 12.744 12.394 12.029 11.61 11.209 10.838 10.493 10.131 9.813 9.523 9.254 8.981 8.713 8.464 8.207 7.991 7.798 7.581 7.348 7.151 6.941 6.733 6.578 6.39 6.186 5.995 5.803 5.665 5.522 5.289 5.123 4.946 4.854 4.663 4.467 4.265 4.151 3.674 3.761 3.629 3.499 3.19 3.007 2.816 2.605 2.364 2.109 1.648 0.664 -2 ,31613 ,TETRA ,17528459,Thu Nov 25 03:41:57 CET,Thu Nov 25 05:53:05 CET,0.0 1.124 1.417 1.675 1.923 2.141 2.325 2.48 2.749 2.876 2.995 2.838 3.296 3.394 3.572 3.741 3.892 3.98 4.16 4.322 4.567 4.721 4.856 5.034 5.21 5.384 5.544 5.699 5.905 6.106 6.304 6.542 6.776 6.992 7.239 7.51 7.772 8.066 8.38 8.687 9.01 9.377 9.78 10.186 10.612 11.032 11.504 12.02 12.544 12.992 13.283 13.218 12.941 12.556 12.164 11.796 11.443 11.082 10.735 10.366 10.038 9.74 9.448 9.166 8.901 8.658 8.392 8.146 7.94 7.72 7.469 7.257 7.05 6.843 6.679 6.495 6.298 6.104 5.891 5.739 5.583 5.322 5.148 4.982 4.9 4.736 4.564 4.365 4.257 3.779 3.857 3.716 3.565 3.257 3.095 2.912 2.713 2.481 2.218 1.844 0.795 -3 ,22422 ,TETRA ,17528461,Thu Nov 25 03:41:58 CET,Thu Nov 25 05:52:34 CET,0.0 0.648 0.982 1.247 1.465 1.66 1.83 1.98 2.272 2.422 2.551 2.422 2.889 2.997 3.197 3.398 3.615 3.711 3.88 4.034 4.254 4.402 4.546 4.755 4.951 5.131 5.3 5.472 5.691 5.894 6.091 6.318 6.529 6.721 6.94 7.218 7.485 7.745 8.011 8.292 8.585 8.906 9.271 9.647 10.075 10.524 11.003 11.484 11.982 12.414 12.694 12.664 12.328 11.893 11.523 11.131 10.767 10.421 10.107 9.778 9.482 9.222 8.972 8.733 8.49 8.261 8.008 7.773 7.571 7.361 7.158 6.975 6.763 6.552 6.39 6.216 6.026 5.83 5.623 5.49 5.362 5.142 4.97 4.789 4.695 4.49 4.275 4.058 3.955 3.498 3.633 3.49 3.337 2.994 2.781 2.558 2.323 2.091 1.862 1.51 0.498 -5 ,10105 ,TETRA ,17528470,Thu Nov 25 03:41:54 CET,Thu Nov 25 05:52:35 CET,0.0 0.954 1.349 1.647 1.894 2.094 2.254 2.397 2.655 2.779 2.902 2.78 3.256 3.373 3.583 3.779 3.958 4.039 4.198 4.358 4.589 4.73 4.866 5.071 5.269 5.458 5.638 5.804 6.009 6.196 6.393 6.658 6.889 7.103 7.352 7.607 7.853 8.12 8.396 8.685 9.009 9.363 9.717 10.079 10.513 10.959 11.451 11.991 12.514 12.974 13.304 13.186 12.875 12.547 12.176 11.771 11.4 11.032 10.71 10.415 10.147 9.901 9.66 9.395 9.136 8.898 8.633 8.411 8.229 8.019 7.795 7.606 7.416 7.228 7.073 6.908 6.732 6.548 6.337 6.188 6.033 5.788 5.633 5.473 5.388 5.211 5.018 4.799 4.691 4.236 4.347 4.211 4.086 3.809 3.658 3.493 3.299 3.056 2.787 2.441 1.181 -6 ,9211 ,TETRA ,17528471,Thu Nov 25 03:42:26 CET,Thu Nov 25 05:53:08 CET,0.0 0.826 1.183 1.472 1.699 1.909 2.111 2.274 2.58 2.723 2.85 2.742 3.212 3.33 3.574 3.784 3.968 4.057 4.21 4.352 4.579 4.736 4.888 5.084 5.274 5.474 5.643 5.804 6.045 6.26 6.448 6.664 6.88 7.096 7.328 7.592 7.839 8.09 8.358 8.631 8.907 9.251 9.655 10.026 10.443 10.855 11.289 11.76 12.272 12.735 13.066 13.088 12.808 12.45 12.105 11.757 11.39 11.045 10.756 10.42 10.103 9.822 9.556 9.3 9.037 8.783 8.54 8.308 8.091 7.887 7.686 7.524 7.348 7.154 7.0 6.843 6.68 6.501 6.309 6.176 6.043 5.837 5.689 5.517 5.426 5.252 5.062 4.854 4.739 4.259 4.356 4.222 4.07 3.727 3.558 3.376 3.16 2.933 2.692 2.382 1.546 -7 ,25090 ,TETRA ,17528473,Thu Nov 25 03:41:56 CET,Thu Nov 25 05:54:25 CET,0.0 1.135 1.548 1.85 2.092 2.284 2.476 2.671 2.989 3.12 3.246 3.117 3.567 3.664 3.877 4.073 4.261 4.354 4.537 4.712 4.949 5.096 5.229 5.432 5.629 5.811 5.994 6.167 6.364 6.542 6.738 6.97 7.17 7.355 7.59 7.878 8.135 8.41 8.696 8.983 9.31 9.67 10.043 10.416 10.863 11.337 11.832 12.342 12.868 13.358 13.659 13.585 13.276 12.865 12.462 12.095 11.721 11.345 11.005 10.634 10.314 10.051 9.792 9.531 9.289 9.065 8.817 8.577 8.379 8.176 7.951 7.766 7.569 7.359 7.181 6.991 6.813 6.629 6.431 6.289 6.133 5.895 5.739 5.575 5.482 5.28 5.071 4.854 4.739 4.269 4.382 4.255 4.125 3.806 3.63 3.449 3.262 3.054 2.822 2.528 2.054 -8 ,21920 ,TETRA ,17528482,Thu Nov 25 03:41:58 CET,Thu Nov 25 05:55:11 CET,0.0 0.507 0.905 1.209 1.419 1.599 1.768 1.94 2.275 2.421 2.554 2.451 2.932 3.047 3.262 3.467 3.662 3.755 3.929 4.093 4.332 4.491 4.635 4.824 5.009 5.186 5.361 5.539 5.766 5.976 6.166 6.411 6.649 6.862 7.096 7.389 7.674 7.957 8.26 8.555 8.843 9.162 9.532 9.906 10.318 10.736 11.199 11.674 12.154 12.604 12.917 12.863 12.589 12.214 11.801 11.359 10.968 10.619 10.29 9.951 9.635 9.345 9.061 8.774 8.519 8.284 8.034 7.807 7.596 7.375 7.151 6.96 6.749 6.53 6.37 6.19 6.0 5.799 5.58 5.43 5.275 5.038 4.875 4.705 4.618 4.439 4.229 4.024 3.93 3.471 3.603 3.487 3.36 3.095 2.954 2.788 2.588 2.337 2.046 1.684 0.754 -9 ,6091 ,TETRA ,17528483,Thu Nov 25 03:42:00 CET,Thu Nov 25 05:54:10 CET,0.0 0.859 1.172 1.451 1.676 1.865 2.042 2.202 2.494 2.634 2.765 2.649 3.123 3.241 3.467 3.68 3.88 3.971 4.151 4.319 4.546 4.691 4.822 5.011 5.203 5.402 5.585 5.737 5.939 6.131 6.306 6.52 6.732 6.921 7.129 7.373 7.619 7.891 8.171 8.45 8.737 9.069 9.434 9.77 10.166 10.631 11.179 11.681 12.118 12.552 12.887 12.856 12.596 12.257 11.901 11.557 11.191 10.815 10.478 10.125 9.825 9.541 9.237 8.957 8.691 8.446 8.2 7.974 7.771 7.542 7.302 7.113 6.934 6.737 6.577 6.408 6.225 6.032 5.824 5.688 5.553 5.334 5.173 5.013 4.932 4.758 4.584 4.379 4.258 3.785 3.902 3.775 3.636 3.325 3.151 2.962 2.749 2.521 2.259 1.884 0.971 -10 ,28126 ,TETRA ,17528491,Thu Nov 25 03:42:02 CET,Thu Nov 25 05:54:34 CET,0.0 0.846 1.302 1.566 1.788 2.031 2.256 2.449 2.801 2.955 3.09 2.984 3.46 3.576 3.774 3.959 4.142 4.229 4.407 4.571 4.79 4.939 5.092 5.296 5.498 5.699 5.877 6.039 6.253 6.463 6.653 6.895 7.136 7.354 7.604 7.867 8.108 8.387 8.69 9.006 9.331 9.704 10.12 10.497 10.922 11.375 11.877 12.392 12.894 13.331 13.625 13.533 13.268 12.943 12.607 12.252 11.886 11.498 11.14 10.785 10.459 10.141 9.844 9.574 9.3 9.057 8.814 8.594 8.409 8.212 7.983 7.772 7.566 7.363 7.201 7.047 6.889 6.719 6.542 6.412 6.266 6.023 5.855 5.683 5.591 5.393 5.184 4.964 4.848 4.375 4.484 4.354 4.223 3.92 3.751 3.567 3.362 3.131 2.849 2.425 1.483 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 26ac9fe6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,895 ,KEBNE ,17024541,Wed Dec 22 10:11:39 CET,Wed Dec 22 12:02:15 CET,0.0 1.641 2.147 2.481 2.764 2.998 3.199 3.392 3.716 3.879 4.049 3.951 4.45 4.581 4.847 5.089 5.315 5.427 5.624 5.831 6.142 6.32 6.496 6.755 7.003 7.241 7.476 7.705 7.999 8.297 8.582 8.915 9.236 9.551 9.898 10.278 10.648 11.072 11.527 12.021 12.562 13.139 13.781 14.409 15.115 15.912 16.843 17.903 19.142 20.534 22.111 23.236 23.676 23.851 23.817 23.586 23.319 23.023 22.72 22.413 22.112 21.808 21.5 21.208 20.909 20.625 20.356 20.107 19.878 19.615 19.336 19.121 18.897 18.65 18.449 18.229 17.986 17.74 17.488 17.327 17.148 16.835 16.634 16.415 16.296 16.046 15.772 15.476 15.32 14.805 14.792 14.616 14.435 14.035 13.81 13.544 13.23 12.861 12.367 11.767 9.931 -2 ,24440 ,KEBNE ,17024542,Wed Dec 22 10:11:39 CET,Wed Dec 22 12:02:10 CET,0.0 1.314 1.719 2.063 2.349 2.588 2.812 3.006 3.36 3.54 3.714 3.647 4.147 4.279 4.53 4.757 4.972 5.076 5.285 5.483 5.753 5.934 6.11 6.354 6.589 6.838 7.083 7.309 7.588 7.854 8.107 8.425 8.745 9.046 9.399 9.797 10.178 10.588 11.023 11.48 11.972 12.537 13.188 13.831 14.582 15.442 16.432 17.529 18.833 20.316 21.857 22.834 23.226 23.373 23.356 23.213 23.026 22.821 22.607 22.309 21.992 21.71 21.428 21.149 20.887 20.625 20.32 20.044 19.798 19.547 19.277 19.036 18.782 18.53 18.329 18.101 17.858 17.58 17.282 17.081 16.869 16.524 16.299 16.088 15.972 15.717 15.466 15.203 15.052 14.536 14.533 14.338 14.121 13.632 13.348 13.009 12.628 12.218 11.701 10.982 8.092 -3 ,14817 ,KEBNE ,17024543,Wed Dec 22 10:21:02 CET,Wed Dec 22 12:10:59 CET,0.0 1.101 1.559 1.889 2.197 2.451 2.654 2.825 3.158 3.325 3.478 3.398 3.899 4.026 4.292 4.549 4.785 4.904 5.134 5.354 5.669 5.859 6.044 6.324 6.583 6.811 7.033 7.255 7.545 7.833 8.109 8.45 8.783 9.089 9.429 9.813 10.187 10.589 11.01 11.446 11.906 12.423 13.043 13.661 14.347 15.123 16.03 17.043 18.278 19.699 21.245 22.263 22.59 22.687 22.706 22.641 22.534 22.383 22.188 21.937 21.7 21.467 21.229 20.991 20.74 20.487 20.224 19.986 19.771 19.543 19.309 19.119 18.909 18.699 18.543 18.351 18.132 17.93 17.706 17.527 17.344 17.067 16.854 16.597 16.455 16.177 15.913 15.624 15.461 14.931 14.903 14.712 14.502 14.013 13.751 13.477 13.162 12.812 12.386 11.809 9.409 -4 ,22399 ,KEBNE ,17024544,Wed Dec 22 10:21:02 CET,Wed Dec 22 12:10:19 CET,0.0 0.974 1.389 1.714 1.984 2.234 2.438 2.616 2.941 3.089 3.242 3.196 3.698 3.828 4.099 4.343 4.553 4.661 4.88 5.075 5.353 5.537 5.709 5.951 6.198 6.467 6.737 6.983 7.272 7.548 7.822 8.136 8.432 8.718 9.047 9.413 9.753 10.131 10.565 11.015 11.466 11.973 12.55 13.152 13.865 14.63 15.554 16.605 17.74 19.049 20.588 21.593 22.037 22.24 22.302 22.266 22.15 22.01 21.857 21.643 21.413 21.181 20.936 20.675 20.423 20.19 19.917 19.64 19.385 19.149 18.93 18.732 18.521 18.284 18.09 17.901 17.703 17.492 17.254 17.074 16.895 16.607 16.388 16.153 16.034 15.787 15.505 15.201 15.051 14.54 14.548 14.364 14.148 13.676 13.391 13.082 12.749 12.357 11.921 11.225 8.124 -5 ,18829 ,KEBNE ,17024545,Wed Dec 22 10:22:03 CET,Wed Dec 22 12:11:46 CET,0.0 1.393 1.893 2.259 2.531 2.782 3.005 3.205 3.555 3.714 3.868 3.787 4.285 4.428 4.682 4.908 5.119 5.219 5.417 5.606 5.871 6.035 6.215 6.48 6.709 6.932 7.158 7.378 7.644 7.907 8.167 8.471 8.761 9.032 9.346 9.713 10.079 10.472 10.878 11.319 11.797 12.336 12.937 13.525 14.24 15.048 15.959 16.934 18.046 19.328 20.847 21.857 22.24 22.369 22.287 22.053 21.738 21.409 21.112 20.804 20.508 20.222 19.923 19.617 19.322 19.032 18.722 18.44 18.2 17.941 17.653 17.418 17.16 16.883 16.67 16.461 16.238 15.971 15.699 15.517 15.321 15.007 14.784 14.554 14.433 14.18 13.915 13.651 13.51 12.99 12.955 12.771 12.572 12.12 11.888 11.611 11.278 10.919 10.468 9.89 7.835 -6 ,23537 ,KEBNE ,17024546,Wed Dec 22 10:22:04 CET,Wed Dec 22 12:12:28 CET,0.0 1.529 2.003 2.359 2.655 2.933 3.172 3.373 3.716 3.875 4.036 3.959 4.462 4.596 4.855 5.091 5.323 5.435 5.641 5.844 6.155 6.347 6.522 6.775 7.022 7.261 7.494 7.725 8.024 8.315 8.592 8.922 9.225 9.51 9.853 10.242 10.595 10.98 11.419 11.885 12.375 12.913 13.54 14.184 14.93 15.783 16.75 17.843 19.107 20.529 22.055 23.04 23.444 23.501 23.401 23.231 22.997 22.751 22.499 22.189 21.888 21.623 21.379 21.116 20.85 20.591 20.307 20.041 19.811 19.573 19.302 19.061 18.809 18.546 18.33 18.084 17.827 17.574 17.3 17.105 16.9 16.548 16.29 16.023 15.887 15.607 15.324 15.004 14.825 14.312 14.34 14.149 13.926 13.413 13.155 12.887 12.553 12.166 11.67 10.861 7.215 -7 ,26754 ,KEBNE ,17024547,Wed Dec 22 10:22:04 CET,Wed Dec 22 12:11:36 CET,0.0 0.817 1.187 1.465 1.695 1.921 2.106 2.287 2.646 2.806 2.954 2.872 3.386 3.525 3.773 4.027 4.271 4.379 4.578 4.775 5.062 5.245 5.419 5.673 5.908 6.137 6.373 6.595 6.88 7.167 7.432 7.744 8.049 8.314 8.622 8.996 9.369 9.776 10.204 10.658 11.128 11.666 12.294 12.92 13.647 14.451 15.344 16.335 17.512 18.852 20.344 21.281 21.68 21.84 21.808 21.69 21.464 21.192 20.913 20.589 20.321 20.079 19.827 19.55 19.266 18.996 18.734 18.524 18.319 18.075 17.808 17.585 17.368 17.143 16.945 16.725 16.505 16.269 16.006 15.814 15.622 15.344 15.138 14.91 14.794 14.56 14.304 14.011 13.851 13.336 13.31 13.115 12.92 12.473 12.214 11.919 11.615 11.257 10.818 10.24 7.566 -8 ,8143 ,KEBNE ,17024548,Wed Dec 22 10:22:04 CET,Wed Dec 22 12:12:54 CET,0.0 1.573 2.01 2.322 2.572 2.799 2.992 3.195 3.526 3.677 3.828 3.74 4.234 4.35 4.566 4.785 5.019 5.132 5.354 5.571 5.859 6.039 6.23 6.508 6.741 6.958 7.173 7.385 7.654 7.916 8.169 8.475 8.783 9.088 9.438 9.807 10.163 10.565 11.002 11.471 11.955 12.484 13.096 13.713 14.435 15.207 16.056 17.015 18.134 19.459 21.009 22.077 22.485 22.597 22.57 22.427 22.194 21.941 21.659 21.325 21.041 20.771 20.48 20.185 19.921 19.671 19.409 19.178 18.971 18.749 18.479 18.219 17.954 17.712 17.525 17.324 17.123 16.911 16.679 16.505 16.303 15.997 15.774 15.5 15.371 15.115 14.831 14.534 14.372 13.85 13.863 13.685 13.495 13.053 12.782 12.477 12.135 11.742 11.265 10.636 8.862 -9 ,7817 ,KEBNE ,17024549,Wed Dec 22 10:22:03 CET,Wed Dec 22 12:11:23 CET,0.0 1.156 1.514 1.754 2.018 2.269 2.461 2.647 2.993 3.157 3.314 3.244 3.751 3.884 4.125 4.348 4.56 4.672 4.895 5.09 5.351 5.527 5.708 5.975 6.231 6.472 6.7 6.928 7.217 7.487 7.757 8.088 8.409 8.712 9.058 9.459 9.845 10.277 10.739 11.209 11.717 12.313 12.979 13.638 14.423 15.303 16.332 17.469 18.75 20.172 21.813 23.073 23.56 23.635 23.539 23.39 23.202 22.996 22.786 22.527 22.288 22.028 21.739 21.454 21.193 20.947 20.65 20.358 20.106 19.854 19.574 19.341 19.105 18.84 18.62 18.393 18.162 17.905 17.632 17.441 17.234 16.907 16.675 16.421 16.292 16.025 15.73 15.412 15.245 14.72 14.685 14.473 14.234 13.719 13.427 13.12 12.808 12.429 11.983 11.452 8.39 -10 ,18401 ,KEBNE ,17024550,Wed Dec 22 10:22:04 CET,Wed Dec 22 12:12:05 CET,0.0 0.959 1.253 1.513 1.78 1.997 2.159 2.311 2.627 2.78 2.927 2.843 3.339 3.467 3.702 3.909 4.104 4.204 4.408 4.59 4.844 5.018 5.194 5.448 5.689 5.922 6.148 6.366 6.641 6.908 7.177 7.509 7.805 8.076 8.403 8.775 9.127 9.521 9.942 10.382 10.838 11.354 11.952 12.548 13.249 14.03 14.922 15.914 17.083 18.38 19.804 20.753 21.16 21.258 21.152 20.98 20.758 20.51 20.286 20.045 19.793 19.48 19.155 18.869 18.586 18.347 18.143 17.909 17.657 17.379 17.077 16.827 16.561 16.27 16.03 15.775 15.523 15.291 15.05 14.875 14.695 14.415 14.21 13.983 13.862 13.612 13.338 13.027 12.871 12.361 12.374 12.196 12.006 11.607 11.367 11.085 10.763 10.406 9.977 9.453 7.443 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt deleted file mode 100644 index b5e0667b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27116 ,TETRA ,17528508,Thu Nov 25 03:42:26 CET,Thu Nov 25 05:52:20 CET,0.0 1.173 1.598 1.959 2.271 2.509 2.724 2.947 3.348 3.52 3.692 3.637 4.14 4.274 4.524 4.763 4.991 5.097 5.297 5.497 5.779 5.959 6.153 6.435 6.676 6.904 7.118 7.321 7.598 7.859 8.106 8.414 8.703 8.988 9.331 9.711 10.089 10.5 10.91 11.324 11.762 12.266 12.836 13.377 14.036 14.782 15.585 16.471 17.48 18.551 19.682 20.344 20.501 20.472 20.295 19.989 19.672 19.37 19.068 18.692 18.32 18.007 17.731 17.435 17.13 16.865 16.595 16.331 16.101 15.858 15.594 15.377 15.135 14.865 14.646 14.426 14.2 13.946 13.675 13.485 13.29 12.981 12.76 12.524 12.406 12.17 11.91 11.646 11.507 11.008 11.041 10.868 10.69 10.26 9.997 9.711 9.379 9.005 8.573 7.941 5.333 -3 ,5300 ,TETRA ,17528521,Thu Nov 25 03:42:28 CET,Thu Nov 25 05:52:59 CET,0.0 0.828 1.264 1.638 1.908 2.149 2.373 2.582 2.934 3.096 3.254 3.178 3.678 3.804 4.068 4.325 4.551 4.666 4.9 5.113 5.42 5.615 5.793 6.046 6.288 6.52 6.741 6.958 7.242 7.521 7.807 8.168 8.496 8.787 9.119 9.494 9.861 10.283 10.737 11.191 11.64 12.149 12.753 13.345 14.021 14.765 15.589 16.463 17.414 18.432 19.511 20.127 20.216 20.094 19.895 19.606 19.297 18.977 18.663 18.301 17.945 17.587 17.22 16.888 16.564 16.257 15.922 15.612 15.331 15.028 14.704 14.428 14.158 13.878 13.664 13.443 13.196 12.916 12.62 12.416 12.203 11.876 11.643 11.4 11.272 10.995 10.715 10.426 10.266 9.733 9.698 9.485 9.272 8.806 8.53 8.199 7.824 7.404 6.871 6.042 2.44 -4 ,12360 ,TETRA ,17528523,Thu Nov 25 03:42:27 CET,Thu Nov 25 05:53:54 CET,0.0 1.402 1.914 2.213 2.45 2.669 2.873 3.067 3.408 3.558 3.722 3.658 4.148 4.276 4.514 4.748 4.977 5.083 5.283 5.477 5.767 5.954 6.139 6.409 6.679 6.937 7.186 7.428 7.73 8.026 8.293 8.61 8.92 9.206 9.537 9.891 10.236 10.646 11.077 11.518 11.98 12.498 13.082 13.65 14.323 15.093 15.948 16.866 17.871 18.911 20.058 20.711 20.832 20.732 20.488 20.174 19.803 19.42 19.087 18.731 18.381 18.033 17.707 17.387 17.05 16.736 16.435 16.155 15.89 15.616 15.317 15.075 14.85 14.617 14.417 14.207 13.985 13.739 13.476 13.301 13.123 12.824 12.619 12.42 12.312 12.061 11.789 11.497 11.348 10.84 10.872 10.706 10.527 10.129 9.903 9.62 9.286 8.948 8.556 7.994 5.958 -5 ,17386 ,TETRA ,17528533,Thu Nov 25 03:42:27 CET,Thu Nov 25 05:52:14 CET,0.0 1.304 1.807 2.193 2.475 2.718 2.949 3.151 3.507 3.688 3.861 3.806 4.317 4.455 4.705 4.962 5.229 5.351 5.567 5.766 6.072 6.268 6.449 6.711 6.958 7.19 7.425 7.658 7.956 8.238 8.506 8.824 9.118 9.406 9.744 10.122 10.484 10.897 11.347 11.769 12.197 12.696 13.266 13.834 14.495 15.201 15.981 16.848 17.839 18.891 19.991 20.541 20.56 20.406 20.14 19.831 19.515 19.202 18.901 18.553 18.197 17.869 17.568 17.271 16.972 16.685 16.373 16.078 15.828 15.574 15.295 15.054 14.806 14.559 14.358 14.131 13.892 13.654 13.399 13.21 13.025 12.742 12.523 12.276 12.151 11.911 11.639 11.332 11.193 10.696 10.705 10.512 10.316 9.871 9.607 9.318 9.003 8.627 8.15 7.502 5.405 -6 ,15505 ,TETRA ,17528542,Thu Nov 25 03:42:27 CET,Thu Nov 25 05:53:59 CET,0.0 1.482 2.034 2.427 2.724 2.981 3.209 3.414 3.775 3.928 4.078 4.022 4.524 4.661 4.94 5.192 5.421 5.53 5.737 5.941 6.235 6.425 6.609 6.872 7.129 7.393 7.647 7.89 8.21 8.501 8.767 9.092 9.416 9.733 10.09 10.467 10.84 11.253 11.702 12.179 12.64 13.156 13.749 14.319 14.976 15.715 16.581 17.526 18.569 19.684 20.826 21.448 21.616 21.515 21.282 20.992 20.67 20.342 20.029 19.684 19.356 19.07 18.802 18.524 18.25 18.008 17.749 17.496 17.267 17.024 16.761 16.533 16.3 16.052 15.855 15.644 15.418 15.169 14.901 14.719 14.523 14.207 13.975 13.711 13.579 13.314 13.036 12.741 12.574 12.045 12.047 11.855 11.646 11.202 10.933 10.627 10.297 9.919 9.409 8.656 5.827 -7 ,17316 ,TETRA ,17528549,Thu Nov 25 03:42:28 CET,Thu Nov 25 05:53:50 CET,0.0 1.058 1.512 1.847 2.144 2.401 2.633 2.85 3.208 3.365 3.518 3.439 3.933 4.076 4.357 4.612 4.871 4.983 5.188 5.408 5.738 5.945 6.134 6.413 6.691 6.934 7.153 7.372 7.664 7.945 8.212 8.526 8.828 9.131 9.501 9.906 10.262 10.644 11.064 11.532 12.021 12.535 13.126 13.709 14.371 15.112 15.975 16.939 17.962 19.04 20.106 20.644 20.726 20.578 20.342 20.044 19.708 19.353 19.024 18.702 18.409 18.126 17.829 17.511 17.198 16.921 16.639 16.36 16.106 15.844 15.563 15.315 15.039 14.747 14.52 14.296 14.072 13.847 13.617 13.449 13.26 12.951 12.731 12.501 12.381 12.135 11.87 11.558 11.397 10.885 10.932 10.751 10.545 10.096 9.842 9.571 9.267 8.906 8.45 7.785 5.392 -8 ,19710 ,TETRA ,17528561,Thu Nov 25 03:42:27 CET,Thu Nov 25 05:55:26 CET,0.0 0.906 1.313 1.616 1.919 2.174 2.398 2.615 2.993 3.171 3.343 3.295 3.794 3.922 4.195 4.476 4.735 4.863 5.091 5.282 5.535 5.705 5.888 6.162 6.433 6.681 6.91 7.125 7.391 7.649 7.913 8.241 8.529 8.793 9.121 9.48 9.822 10.204 10.59 10.997 11.447 11.961 12.54 13.101 13.762 14.502 15.343 16.201 17.087 18.04 18.979 19.504 19.499 19.227 18.88 18.535 18.191 17.83 17.478 17.082 16.742 16.45 16.159 15.872 15.6 15.352 15.088 14.815 14.563 14.291 13.972 13.708 13.432 13.144 12.935 12.716 12.493 12.271 12.027 11.859 11.677 11.339 11.086 10.849 10.73 10.483 10.225 9.916 9.754 9.242 9.216 9.022 8.839 8.428 8.184 7.913 7.569 7.183 6.75 6.09 2.9 -9 ,32480 ,TETRA ,17528571,Thu Nov 25 03:42:28 CET,Thu Nov 25 05:52:00 CET,0.0 1.224 1.696 2.092 2.443 2.718 2.957 3.188 3.627 3.83 4.019 4.0 4.53 4.689 4.968 5.211 5.459 5.575 5.788 5.99 6.294 6.498 6.679 6.936 7.2 7.446 7.682 7.922 8.246 8.552 8.834 9.165 9.47 9.766 10.11 10.475 10.819 11.203 11.583 11.978 12.425 12.927 13.507 14.06 14.675 15.376 16.196 17.109 18.106 19.192 20.405 21.159 21.369 21.314 21.14 20.888 20.569 20.207 19.849 19.454 19.124 18.823 18.52 18.224 17.927 17.64 17.344 17.086 16.832 16.55 16.267 16.032 15.766 15.473 15.248 15.004 14.748 14.482 14.218 14.025 13.811 13.5 13.281 13.053 12.927 12.658 12.378 12.082 11.919 11.391 11.412 11.232 11.025 10.581 10.351 10.107 9.835 9.492 9.006 8.31 5.413 -10 ,13628 ,TETRA ,17528582,Thu Nov 25 03:42:28 CET,Thu Nov 25 05:53:29 CET,0.0 1.099 1.478 1.772 2.014 2.244 2.461 2.655 2.999 3.153 3.307 3.247 3.752 3.893 4.163 4.405 4.625 4.725 4.939 5.154 5.451 5.642 5.821 6.089 6.353 6.603 6.843 7.072 7.352 7.631 7.899 8.23 8.572 8.905 9.264 9.626 9.964 10.331 10.72 11.148 11.613 12.133 12.726 13.31 13.993 14.742 15.547 16.441 17.486 18.572 19.614 20.107 20.173 20.07 19.836 19.528 19.22 18.915 18.614 18.272 17.949 17.639 17.341 17.052 16.762 16.5 16.237 16.006 15.802 15.572 15.334 15.15 14.947 14.703 14.505 14.296 14.07 13.844 13.62 13.457 13.273 12.972 12.768 12.548 12.433 12.21 11.973 11.709 11.567 11.075 11.109 10.92 10.715 10.28 10.052 9.806 9.538 9.241 8.857 8.28 6.508 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index 9b8815c4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10281 ,TETRA ,17528614,Thu Nov 25 03:42:31 CET,Thu Nov 25 05:54:11 CET,0.0 1.617 2.145 2.492 2.779 3.05 3.29 3.494 3.893 4.085 4.271 4.268 4.803 4.958 5.252 5.548 5.822 5.944 6.17 6.393 6.729 6.948 7.152 7.442 7.732 8.006 8.263 8.511 8.827 9.139 9.429 9.769 10.109 10.43 10.781 11.17 11.548 11.969 12.448 12.967 13.507 14.091 14.755 15.44 16.23 17.089 18.058 19.155 20.418 21.87 23.375 24.295 24.637 24.776 24.777 24.664 24.506 24.262 24.014 23.764 23.525 23.3 23.071 22.822 22.576 22.351 22.116 21.899 21.699 21.494 21.262 21.057 20.854 20.629 20.444 20.254 20.068 19.889 19.678 19.523 19.36 19.088 18.892 18.69 18.588 18.382 18.163 17.906 17.772 17.28 17.308 17.138 16.964 16.599 16.384 16.157 15.929 15.646 15.297 14.745 12.962 -5 ,7107 ,TETRA ,17528635,Thu Nov 25 03:42:29 CET,Thu Nov 25 05:51:20 CET,0.0 1.329 1.869 2.199 2.49 2.778 3.05 3.28 3.682 3.877 4.057 4.014 4.532 4.68 4.943 5.189 5.445 5.571 5.814 6.057 6.405 6.629 6.835 7.11 7.363 7.61 7.842 8.079 8.432 8.755 9.033 9.36 9.67 9.986 10.351 10.744 11.134 11.552 11.982 12.507 13.081 13.658 14.323 14.992 15.779 16.652 17.639 18.752 20.007 21.501 23.252 24.479 25.022 25.22 25.275 25.236 25.126 24.995 24.84 24.639 24.414 24.18 23.936 23.691 23.476 23.289 23.085 22.895 22.719 22.53 22.326 22.147 21.96 21.745 21.556 21.35 21.131 20.899 20.662 20.514 20.359 20.1 19.905 19.69 19.586 19.38 19.16 18.931 18.8 18.307 18.359 18.193 18.009 17.609 17.386 17.132 16.85 16.525 16.159 15.721 14.617 -7 ,15042 ,TETRA ,17528640,Thu Nov 25 03:42:32 CET,Thu Nov 25 05:55:47 CET,0.0 1.049 1.456 1.78 2.075 2.327 2.546 2.762 3.164 3.338 3.505 3.461 3.98 4.125 4.388 4.657 4.916 5.038 5.273 5.495 5.817 6.028 6.226 6.494 6.753 7.014 7.256 7.479 7.789 8.109 8.43 8.825 9.186 9.517 9.88 10.27 10.642 11.063 11.54 12.05 12.581 13.166 13.837 14.504 15.295 16.207 17.227 18.353 19.657 21.153 22.823 23.982 24.463 24.633 24.608 24.494 24.374 24.181 23.939 23.681 23.431 23.171 22.92 22.683 22.445 22.208 21.951 21.724 21.515 21.279 21.039 20.838 20.618 20.387 20.216 20.046 19.863 19.651 19.412 19.249 19.083 18.837 18.662 18.461 18.351 18.118 17.878 17.611 17.476 16.988 17.05 16.904 16.737 16.325 16.097 15.861 15.574 15.208 14.793 14.273 12.221 -8 ,8985 ,TETRA ,17528647,Thu Nov 25 03:42:34 CET,Thu Nov 25 05:56:14 CET,0.0 1.225 1.742 2.148 2.453 2.7 2.929 3.129 3.486 3.65 3.811 3.775 4.307 4.458 4.721 4.973 5.217 5.334 5.564 5.795 6.129 6.334 6.528 6.806 7.087 7.362 7.623 7.884 8.202 8.519 8.826 9.171 9.508 9.828 10.214 10.656 11.069 11.526 12.009 12.512 13.032 13.646 14.403 15.132 15.926 16.824 17.823 18.889 20.157 21.56 22.997 23.979 24.335 24.321 24.231 24.121 23.923 23.632 23.36 23.104 22.864 22.608 22.372 22.17 21.969 21.753 21.501 21.274 21.059 20.829 20.584 20.371 20.148 19.918 19.738 19.551 19.363 19.151 18.918 18.76 18.606 18.373 18.188 17.983 17.876 17.64 17.407 17.182 17.067 16.597 16.663 16.508 16.338 15.962 15.744 15.515 15.291 15.019 14.703 14.281 13.327 -9 ,27973 ,TETRA ,17528657,Thu Nov 25 03:42:29 CET,Thu Nov 25 05:54:52 CET,0.0 1.247 1.673 2.002 2.305 2.585 2.846 3.075 3.496 3.677 3.839 3.813 4.339 4.494 4.773 5.023 5.268 5.387 5.612 5.824 6.157 6.38 6.586 6.861 7.143 7.433 7.687 7.918 8.243 8.556 8.848 9.213 9.549 9.878 10.268 10.675 11.056 11.468 11.931 12.45 12.986 13.586 14.309 15.008 15.778 16.635 17.609 18.698 20.004 21.525 23.231 24.343 24.777 24.905 24.917 24.871 24.72 24.503 24.275 24.05 23.836 23.599 23.383 23.196 23.012 22.842 22.633 22.423 22.229 22.019 21.82 21.636 21.43 21.205 21.024 20.846 20.655 20.464 20.256 20.09 19.917 19.673 19.509 19.323 19.235 19.061 18.857 18.631 18.502 18.003 18.05 17.894 17.719 17.353 17.162 16.952 16.717 16.428 16.063 15.587 14.166 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index c8ed19ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20939 ,KEBNE ,17024551,Wed Dec 22 10:22:04 CET,Wed Dec 22 12:10:07 CET,0.0 1.518 1.99 2.356 2.645 2.891 3.104 3.288 3.623 3.78 3.946 3.892 4.401 4.548 4.809 5.048 5.283 5.389 5.57 5.751 6.04 6.216 6.384 6.632 6.882 7.141 7.369 7.57 7.833 8.1 8.365 8.676 8.973 9.262 9.586 9.939 10.277 10.625 10.999 11.413 11.839 12.311 12.852 13.383 14.002 14.676 15.454 16.332 17.34 18.422 19.429 20.017 20.101 19.915 19.654 19.332 19.001 18.677 18.35 17.963 17.612 17.304 17.008 16.728 16.443 16.159 15.859 15.593 15.338 15.064 14.803 14.578 14.331 14.075 13.873 13.662 13.445 13.213 12.954 12.781 12.605 12.314 12.107 11.897 11.789 11.553 11.29 11.015 10.871 10.36 10.4 10.236 10.056 9.645 9.419 9.166 8.86 8.474 8.028 7.507 5.085 -2 ,7290 ,KEBNE ,17024552,Wed Dec 22 10:22:04 CET,Wed Dec 22 12:09:34 CET,0.0 1.593 2.089 2.425 2.701 2.925 3.128 3.33 3.702 3.878 4.042 3.981 4.495 4.631 4.871 5.105 5.335 5.438 5.637 5.831 6.101 6.279 6.456 6.7 6.922 7.146 7.364 7.576 7.856 8.108 8.328 8.618 8.919 9.203 9.508 9.82 10.122 10.461 10.842 11.257 11.668 12.138 12.672 13.178 13.745 14.39 15.173 15.979 16.828 17.758 18.707 19.214 19.238 19.062 18.8 18.513 18.22 17.913 17.594 17.264 16.978 16.701 16.421 16.128 15.805 15.486 15.179 14.938 14.737 14.509 14.241 14.007 13.761 13.513 13.316 13.108 12.878 12.642 12.397 12.212 12.027 11.731 11.508 11.286 11.17 10.923 10.676 10.41 10.255 9.733 9.73 9.529 9.323 8.901 8.673 8.408 8.11 7.777 7.356 6.835 5.109 -3 ,27224 ,KEBNE ,17024553,Wed Dec 22 10:22:08 CET,Wed Dec 22 12:05:08 CET,0.0 1.674 2.171 2.551 2.808 3.044 3.265 3.456 3.824 3.987 4.136 4.053 4.549 4.676 4.912 5.123 5.316 5.413 5.614 5.808 6.064 6.227 6.403 6.652 6.888 7.124 7.352 7.573 7.855 8.128 8.384 8.684 8.96 9.214 9.506 9.825 10.125 10.435 10.774 11.177 11.597 12.051 12.565 13.062 13.665 14.327 15.02 15.757 16.557 17.465 18.443 18.862 18.856 18.708 18.475 18.202 17.865 17.496 17.17 16.833 16.503 16.193 15.888 15.574 15.264 14.98 14.691 14.426 14.174 13.893 13.595 13.347 13.094 12.834 12.636 12.427 12.19 11.948 11.7 11.516 11.311 10.986 10.778 10.56 10.443 10.177 9.884 9.589 9.436 8.912 8.926 8.758 8.579 8.144 7.893 7.629 7.336 6.967 6.57 6.084 4.238 -4 ,8100 ,KEBNE ,17024554,Wed Dec 22 10:23:05 CET,Wed Dec 22 12:10:25 CET,0.0 1.368 1.81 2.136 2.429 2.69 2.912 3.118 3.502 3.663 3.813 3.723 4.23 4.368 4.617 4.851 5.078 5.187 5.388 5.575 5.85 6.019 6.183 6.433 6.667 6.907 7.144 7.349 7.599 7.825 8.045 8.353 8.663 8.947 9.262 9.592 9.886 10.204 10.55 10.935 11.33 11.75 12.248 12.749 13.302 13.946 14.695 15.473 16.335 17.274 18.243 18.783 18.81 18.588 18.25 17.892 17.539 17.126 16.717 16.309 15.953 15.602 15.24 14.904 14.572 14.259 13.957 13.672 13.405 13.116 12.801 12.557 12.309 12.028 11.804 11.573 11.337 11.092 10.841 10.667 10.487 10.211 9.998 9.754 9.634 9.396 9.135 8.86 8.712 8.211 8.271 8.094 7.898 7.506 7.269 6.989 6.697 6.384 5.971 5.389 3.908 -5 ,24329 ,KEBNE ,17024555,Wed Dec 22 10:23:05 CET,Wed Dec 22 12:11:52 CET,0.0 1.784 2.196 2.495 2.764 3.012 3.232 3.429 3.762 3.92 4.063 3.961 4.471 4.604 4.864 5.099 5.321 5.436 5.665 5.883 6.173 6.352 6.535 6.807 7.062 7.29 7.492 7.697 7.961 8.217 8.461 8.743 9.012 9.258 9.532 9.872 10.222 10.598 10.98 11.384 11.814 12.282 12.816 13.338 13.931 14.567 15.239 15.967 16.773 17.616 18.352 18.6 18.562 18.363 18.03 17.641 17.259 16.867 16.474 16.051 15.69 15.375 15.051 14.702 14.366 14.084 13.796 13.538 13.307 13.053 12.779 12.528 12.278 12.025 11.809 11.578 11.345 11.115 10.861 10.674 10.491 10.221 10.009 9.777 9.665 9.43 9.203 8.942 8.786 8.265 8.301 8.113 7.918 7.525 7.276 6.998 6.693 6.332 5.917 5.335 3.455 -6 ,3455 ,KEBNE ,17024556,Wed Dec 22 10:23:05 CET,Wed Dec 22 12:10:14 CET,0.0 1.199 1.592 1.877 2.13 2.378 2.6 2.814 3.176 3.331 3.499 3.446 3.962 4.101 4.333 4.563 4.786 4.886 5.075 5.257 5.542 5.734 5.912 6.153 6.39 6.632 6.862 7.075 7.362 7.642 7.887 8.169 8.442 8.702 9.014 9.364 9.688 10.06 10.463 10.849 11.27 11.759 12.307 12.853 13.441 14.078 14.818 15.628 16.493 17.431 18.353 18.806 18.849 18.677 18.405 18.07 17.683 17.3 16.964 16.603 16.249 15.925 15.613 15.297 15.002 14.724 14.423 14.15 13.904 13.644 13.382 13.149 12.884 12.598 12.373 12.142 11.888 11.624 11.35 11.16 10.965 10.646 10.41 10.172 10.05 9.79 9.53 9.248 9.095 8.58 8.61 8.433 8.242 7.811 7.56 7.303 7.035 6.684 6.213 5.609 3.805 -7 ,31727 ,KEBNE ,17024557,Wed Dec 22 10:23:07 CET,Wed Dec 22 12:09:14 CET,0.0 1.674 2.159 2.561 2.904 3.139 3.349 3.547 3.878 4.023 4.172 4.102 4.603 4.745 5.023 5.27 5.494 5.604 5.817 6.018 6.305 6.488 6.668 6.932 7.186 7.418 7.643 7.85 8.095 8.354 8.622 8.939 9.246 9.536 9.862 10.202 10.501 10.834 11.22 11.618 12.003 12.468 13.028 13.54 14.127 14.773 15.477 16.265 17.158 18.121 19.02 19.476 19.568 19.431 19.159 18.806 18.449 18.071 17.692 17.279 16.954 16.643 16.33 16.049 15.767 15.494 15.199 14.949 14.717 14.47 14.228 14.003 13.74 13.487 13.303 13.118 12.909 12.655 12.375 12.195 12.006 11.707 11.495 11.285 11.18 10.944 10.682 10.378 10.216 9.717 9.795 9.616 9.422 8.997 8.761 8.518 8.241 7.919 7.522 7.019 5.911 -8 ,29487 ,KEBNE ,17024558,Wed Dec 22 10:23:06 CET,Wed Dec 22 12:10:39 CET,0.0 1.212 1.634 1.967 2.24 2.494 2.702 2.888 3.238 3.387 3.525 3.441 3.94 4.08 4.353 4.607 4.837 4.944 5.165 5.381 5.682 5.867 6.041 6.279 6.502 6.73 6.956 7.165 7.417 7.652 7.898 8.208 8.483 8.755 9.078 9.423 9.77 10.142 10.547 10.995 11.43 11.888 12.411 12.92 13.493 14.113 14.805 15.574 16.406 17.315 18.242 18.733 18.78 18.631 18.368 18.047 17.721 17.407 17.118 16.784 16.461 16.129 15.785 15.463 15.153 14.872 14.578 14.287 14.046 13.805 13.541 13.306 13.047 12.774 12.567 12.353 12.128 11.889 11.634 11.466 11.281 10.991 10.782 10.539 10.419 10.162 9.9 9.636 9.481 8.973 9.034 8.868 8.692 8.278 8.038 7.799 7.54 7.256 6.917 6.39 4.565 -9 ,24356 ,KEBNE ,17024559,Wed Dec 22 10:23:06 CET,Wed Dec 22 12:09:54 CET,0.0 1.336 1.796 2.072 2.319 2.552 2.776 2.991 3.38 3.559 3.728 3.641 4.123 4.255 4.524 4.749 4.955 5.063 5.282 5.481 5.758 5.939 6.116 6.373 6.615 6.852 7.08 7.286 7.531 7.77 8.022 8.316 8.6 8.887 9.209 9.552 9.859 10.206 10.577 10.945 11.329 11.777 12.309 12.821 13.381 13.966 14.627 15.373 16.231 17.22 18.173 18.64 18.654 18.408 18.114 17.759 17.362 16.969 16.612 16.237 15.896 15.583 15.287 14.999 14.716 14.463 14.196 13.929 13.668 13.403 13.143 12.926 12.671 12.39 12.173 11.95 11.719 11.471 11.217 11.04 10.849 10.542 10.325 10.099 9.993 9.758 9.483 9.199 9.04 8.516 8.511 8.315 8.109 7.656 7.421 7.158 6.845 6.463 6.036 5.557 4.112 -10 ,25026 ,KEBNE ,17024560,Wed Dec 22 10:23:06 CET,Wed Dec 22 12:11:03 CET,0.0 1.501 2.07 2.474 2.794 3.086 3.328 3.52 3.851 4.006 4.151 4.053 4.554 4.695 4.965 5.195 5.414 5.517 5.718 5.924 6.202 6.386 6.578 6.83 7.047 7.26 7.478 7.686 7.954 8.211 8.451 8.737 9.009 9.259 9.531 9.843 10.154 10.485 10.832 11.234 11.66 12.117 12.652 13.18 13.768 14.394 15.099 15.887 16.752 17.646 18.555 19.098 19.155 18.966 18.682 18.392 18.104 17.77 17.428 17.073 16.757 16.439 16.091 15.733 15.403 15.112 14.8 14.504 14.255 13.991 13.688 13.436 13.19 12.939 12.744 12.536 12.312 12.062 11.791 11.612 11.423 11.121 10.91 10.67 10.543 10.294 10.038 9.761 9.617 9.109 9.119 8.93 8.745 8.341 8.11 7.875 7.612 7.275 6.811 6.231 4.795 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt deleted file mode 100644 index bbafb61d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20460 ,TETRA ,17528706,Thu Nov 25 03:42:32 CET,Thu Nov 25 05:53:01 CET,0.0 1.769 2.219 2.539 2.809 3.06 3.286 3.489 3.829 3.97 4.108 4.027 4.523 4.65 4.91 5.164 5.389 5.494 5.703 5.913 6.225 6.41 6.584 6.835 7.069 7.292 7.501 7.711 7.994 8.27 8.538 8.842 9.128 9.398 9.717 10.082 10.414 10.77 11.154 11.579 12.008 12.444 12.939 13.429 13.998 14.61 15.307 16.063 16.885 17.795 18.72 19.127 19.068 18.826 18.482 18.086 17.733 17.381 17.034 16.652 16.305 15.995 15.696 15.412 15.09 14.784 14.487 14.22 13.995 13.756 13.506 13.293 13.056 12.798 12.602 12.394 12.169 11.931 11.685 11.5 11.302 11.011 10.802 10.58 10.461 10.195 9.913 9.633 9.48 8.951 8.938 8.739 8.539 8.141 7.898 7.614 7.312 6.955 6.519 5.902 4.076 -3 ,32362 ,TETRA ,17528720,Thu Nov 25 03:42:29 CET,Thu Nov 25 05:50:28 CET,0.0 1.428 1.912 2.253 2.561 2.809 3.034 3.248 3.64 3.819 3.991 3.921 4.423 4.557 4.81 5.044 5.267 5.382 5.619 5.826 6.104 6.273 6.442 6.714 6.966 7.206 7.444 7.667 7.936 8.187 8.429 8.724 9.013 9.271 9.585 9.939 10.271 10.651 11.031 11.438 11.867 12.303 12.796 13.305 13.898 14.517 15.171 15.845 16.581 17.381 18.12 18.359 18.21 17.93 17.569 17.203 16.829 16.428 16.076 15.724 15.396 15.09 14.763 14.459 14.165 13.858 13.538 13.238 12.984 12.718 12.425 12.175 11.92 11.667 11.457 11.233 11.0 10.77 10.536 10.359 10.166 9.874 9.667 9.444 9.324 9.063 8.793 8.511 8.356 7.838 7.853 7.671 7.476 7.066 6.831 6.547 6.233 5.894 5.476 4.855 1.449 -4 ,6207 ,TETRA ,17528734,Thu Nov 25 03:42:29 CET,Thu Nov 25 05:52:21 CET,0.0 1.322 1.788 2.128 2.438 2.717 2.947 3.146 3.536 3.723 3.879 3.787 4.286 4.419 4.677 4.921 5.151 5.264 5.479 5.686 5.996 6.179 6.348 6.61 6.87 7.111 7.338 7.567 7.873 8.145 8.39 8.681 8.951 9.221 9.551 9.909 10.258 10.63 10.989 11.377 11.785 12.222 12.717 13.204 13.786 14.42 15.154 15.958 16.752 17.575 18.376 18.708 18.685 18.47 18.075 17.636 17.245 16.88 16.537 16.135 15.772 15.452 15.137 14.836 14.568 14.299 13.978 13.682 13.418 13.133 12.849 12.622 12.38 12.095 11.86 11.612 11.342 11.074 10.785 10.573 10.358 10.041 9.817 9.589 9.474 9.225 8.967 8.689 8.529 8.014 8.013 7.797 7.568 7.116 6.872 6.563 6.186 5.764 5.277 4.644 3.051 -6 ,24000 ,TETRA ,17528743,Thu Nov 25 03:42:30 CET,Thu Nov 25 05:53:01 CET,0.0 2.351 2.864 3.282 3.623 3.899 4.138 4.339 4.731 4.917 5.07 4.984 5.497 5.623 5.846 6.087 6.334 6.443 6.657 6.868 7.156 7.345 7.517 7.76 8.001 8.241 8.483 8.715 8.991 9.251 9.509 9.805 10.093 10.367 10.669 10.997 11.302 11.645 12.012 12.395 12.788 13.233 13.745 14.248 14.835 15.483 16.227 17.015 17.826 18.663 19.415 19.759 19.767 19.594 19.355 19.073 18.751 18.424 18.118 17.778 17.457 17.13 16.773 16.436 16.129 15.829 15.498 15.195 14.948 14.695 14.395 14.157 13.943 13.692 13.461 13.216 12.964 12.717 12.472 12.311 12.142 11.831 11.607 11.367 11.246 11.007 10.737 10.426 10.268 9.753 9.765 9.591 9.417 9.027 8.797 8.557 8.294 7.956 7.55 7.037 4.988 -7 ,17308 ,TETRA ,17528754,Thu Nov 25 03:42:32 CET,Thu Nov 25 05:52:23 CET,0.0 1.308 1.722 2.07 2.397 2.677 2.885 3.071 3.413 3.573 3.733 3.681 4.192 4.332 4.592 4.813 5.02 5.125 5.343 5.547 5.838 6.031 6.219 6.488 6.743 6.974 7.192 7.418 7.712 7.981 8.237 8.546 8.858 9.154 9.473 9.825 10.181 10.559 10.932 11.306 11.707 12.181 12.713 13.229 13.808 14.428 15.132 15.888 16.748 17.654 18.508 18.815 18.643 18.322 17.94 17.493 17.091 16.724 16.349 15.952 15.615 15.306 14.978 14.647 14.294 13.949 13.616 13.319 13.054 12.792 12.515 12.272 12.024 11.753 11.528 11.288 11.052 10.831 10.575 10.39 10.213 9.92 9.7 9.45 9.329 9.1 8.85 8.575 8.432 7.929 7.963 7.785 7.593 7.169 6.914 6.613 6.309 5.954 5.556 5.044 2.844 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18627-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18627-1.txt deleted file mode 100644 index fbadaae2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18627-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7476 ,KEBNE ,17024561,Wed Dec 22 10:23:06 CET,Wed Dec 22 12:10:57 CET,0.0 1.124 1.54 1.878 2.15 2.37 2.563 2.724 3.008 3.16 3.303 3.222 3.723 3.837 4.058 4.264 4.45 4.547 4.739 4.92 5.18 5.34 5.5 5.718 5.931 6.144 6.348 6.528 6.741 6.958 7.172 7.435 7.687 7.928 8.202 8.513 8.81 9.125 9.466 9.849 10.248 10.682 11.151 11.618 12.188 12.772 13.41 14.087 14.802 15.558 16.182 16.376 16.165 15.82 15.481 15.131 14.78 14.421 14.099 13.765 13.465 13.195 12.908 12.628 12.369 12.123 11.837 11.568 11.338 11.086 10.818 10.583 10.327 10.072 9.874 9.666 9.448 9.225 8.987 8.812 8.641 8.381 8.186 7.967 7.856 7.644 7.423 7.182 7.048 6.554 6.61 6.447 6.268 5.868 5.653 5.403 5.141 4.882 4.581 4.175 3.162 -2 ,11658 ,KEBNE ,17024562,Wed Dec 22 10:23:06 CET,Wed Dec 22 12:12:27 CET,0.0 0.549 0.816 1.059 1.274 1.475 1.691 1.884 2.193 2.332 2.446 2.302 2.779 2.887 3.109 3.334 3.546 3.638 3.818 4.003 4.253 4.41 4.563 4.789 5.003 5.199 5.392 5.585 5.847 6.095 6.318 6.572 6.821 7.074 7.356 7.648 7.927 8.24 8.576 8.937 9.319 9.742 10.232 10.713 11.254 11.868 12.544 13.24 13.985 14.706 15.344 15.532 15.368 15.089 14.757 14.401 14.081 13.751 13.426 13.088 12.75 12.438 12.147 11.86 11.579 11.302 11.001 10.722 10.463 10.202 9.947 9.73 9.495 9.242 9.028 8.799 8.569 8.319 8.039 7.858 7.668 7.344 7.131 6.918 6.812 6.59 6.329 6.056 5.918 5.423 5.458 5.273 5.09 4.701 4.472 4.205 3.909 3.589 3.224 2.79 1.633 -3 ,13336 ,KEBNE ,17024563,Wed Dec 22 10:23:06 CET,Wed Dec 22 12:12:06 CET,0.0 1.295 1.7 1.958 2.191 2.41 2.598 2.789 3.134 3.285 3.431 3.339 3.828 3.948 4.18 4.4 4.612 4.714 4.89 5.057 5.296 5.45 5.598 5.813 6.032 6.24 6.446 6.652 6.905 7.134 7.365 7.632 7.87 8.1 8.371 8.664 8.957 9.3 9.662 10.039 10.425 10.86 11.37 11.843 12.365 12.972 13.654 14.375 15.177 16.009 16.706 16.92 16.813 16.539 16.18 15.792 15.396 15.017 14.688 14.338 13.992 13.681 13.397 13.101 12.799 12.507 12.177 11.899 11.678 11.429 11.168 10.946 10.7 10.451 10.242 10.029 9.824 9.591 9.345 9.193 9.025 8.72 8.515 8.299 8.184 7.952 7.714 7.477 7.342 6.846 6.925 6.771 6.588 6.15 5.916 5.672 5.401 5.077 4.681 4.227 2.802 -4 ,7640 ,KEBNE ,17024564,Wed Dec 22 10:23:06 CET,Wed Dec 22 12:13:31 CET,0.0 0.837 1.218 1.531 1.823 2.082 2.313 2.524 2.887 3.052 3.209 3.13 3.624 3.745 3.964 4.172 4.382 4.485 4.694 4.904 5.171 5.333 5.497 5.732 5.945 6.144 6.351 6.557 6.813 7.059 7.299 7.577 7.843 8.097 8.383 8.706 9.007 9.355 9.73 10.101 10.473 10.883 11.363 11.829 12.345 12.918 13.588 14.329 15.105 15.887 16.624 16.944 16.903 16.662 16.308 15.871 15.443 15.075 14.758 14.398 14.066 13.764 13.458 13.151 12.848 12.567 12.291 12.037 11.809 11.58 11.337 11.114 10.87 10.638 10.472 10.293 10.093 9.872 9.635 9.474 9.302 9.023 8.835 8.653 8.561 8.343 8.097 7.864 7.74 7.239 7.257 7.078 6.904 6.517 6.286 6.042 5.774 5.479 5.087 4.539 2.759 -5 ,7866 ,KEBNE ,17024565,Wed Dec 22 10:23:06 CET,Wed Dec 22 12:11:44 CET,0.0 0.749 1.09 1.346 1.606 1.83 2.022 2.197 2.511 2.672 2.823 2.727 3.222 3.345 3.573 3.785 3.965 4.054 4.241 4.415 4.656 4.812 4.949 5.154 5.389 5.609 5.796 5.987 6.236 6.461 6.681 6.958 7.24 7.515 7.809 8.122 8.42 8.74 9.08 9.442 9.793 10.175 10.659 11.152 11.686 12.247 12.876 13.545 14.297 15.111 15.838 16.094 16.003 15.735 15.381 15.009 14.652 14.27 13.911 13.552 13.245 12.961 12.661 12.38 12.117 11.855 11.565 11.306 11.079 10.842 10.589 10.377 10.158 9.911 9.71 9.509 9.279 9.022 8.786 8.627 8.452 8.175 7.969 7.755 7.648 7.424 7.186 6.911 6.77 6.271 6.301 6.131 5.955 5.556 5.329 5.086 4.835 4.56 4.221 3.763 2.257 -6 ,9143 ,KEBNE ,17024566,Wed Dec 22 10:23:06 CET,Wed Dec 22 12:11:49 CET,0.0 0.742 1.063 1.338 1.596 1.813 2.002 2.176 2.5 2.64 2.768 2.696 3.19 3.297 3.506 3.72 3.926 4.019 4.2 4.381 4.643 4.814 4.98 5.228 5.459 5.661 5.86 6.057 6.32 6.591 6.848 7.141 7.404 7.656 7.958 8.282 8.584 8.907 9.253 9.626 10.008 10.418 10.866 11.32 11.833 12.371 12.972 13.619 14.29 15.001 15.687 15.912 15.805 15.552 15.244 14.899 14.55 14.197 13.866 13.536 13.23 12.949 12.68 12.413 12.162 11.923 11.669 11.421 11.189 10.949 10.711 10.509 10.282 10.03 9.836 9.642 9.414 9.171 8.928 8.749 8.562 8.273 8.07 7.857 7.745 7.511 7.272 7.02 6.878 6.364 6.406 6.248 6.089 5.743 5.549 5.344 5.121 4.844 4.474 3.988 2.923 -7 ,30293 ,KEBNE ,17024567,Wed Dec 22 10:23:06 CET,Wed Dec 22 12:12:34 CET,0.0 0.599 0.867 1.128 1.378 1.581 1.744 1.905 2.239 2.384 2.514 2.401 2.881 2.989 3.224 3.438 3.628 3.727 3.905 4.062 4.296 4.452 4.602 4.821 5.03 5.23 5.424 5.605 5.849 6.086 6.314 6.589 6.843 7.081 7.345 7.63 7.908 8.224 8.56 8.898 9.237 9.639 10.101 10.54 11.08 11.653 12.266 12.943 13.67 14.412 15.133 15.437 15.386 15.19 14.876 14.503 14.121 13.733 13.388 13.008 12.655 12.353 12.065 11.789 11.51 11.244 10.97 10.719 10.49 10.233 9.965 9.739 9.5 9.258 9.07 8.879 8.673 8.447 8.215 8.051 7.881 7.608 7.416 7.227 7.13 6.905 6.665 6.414 6.272 5.781 5.856 5.687 5.49 5.083 4.875 4.654 4.4 4.112 3.747 3.255 2.146 -8 ,14894 ,KEBNE ,17024568,Wed Dec 22 10:23:06 CET,Wed Dec 22 12:11:15 CET,0.0 0.875 1.23 1.466 1.676 1.883 2.054 2.209 2.507 2.648 2.78 2.66 3.146 3.26 3.466 3.68 3.882 3.975 4.158 4.317 4.542 4.699 4.859 5.085 5.304 5.519 5.72 5.9 6.116 6.335 6.555 6.815 7.075 7.338 7.631 7.942 8.23 8.55 8.914 9.299 9.691 10.123 10.616 11.079 11.604 12.191 12.782 13.438 14.184 14.946 15.727 16.002 15.916 15.689 15.401 15.039 14.638 14.258 13.904 13.523 13.169 12.842 12.537 12.247 11.957 11.693 11.405 11.132 10.904 10.676 10.435 10.227 9.991 9.734 9.55 9.353 9.125 8.888 8.648 8.484 8.316 8.045 7.847 7.632 7.532 7.356 7.163 6.94 6.818 6.327 6.393 6.222 6.031 5.64 5.431 5.199 4.948 4.679 4.331 3.871 2.759 -9 ,19615 ,KEBNE ,17024569,Wed Dec 22 10:24:08 CET,Wed Dec 22 12:12:52 CET,0.0 1.096 1.454 1.718 1.97 2.199 2.385 2.57 2.91 3.064 3.215 3.136 3.628 3.749 3.973 4.176 4.379 4.475 4.663 4.851 5.122 5.288 5.449 5.676 5.896 6.11 6.287 6.454 6.693 6.923 7.141 7.414 7.67 7.909 8.191 8.506 8.804 9.131 9.474 9.812 10.178 10.6 11.058 11.505 12.02 12.578 13.201 13.867 14.589 15.38 16.101 16.384 16.282 16.012 15.713 15.38 15.049 14.749 14.45 14.095 13.759 13.425 13.107 12.798 12.501 12.229 11.938 11.681 11.458 11.208 10.952 10.75 10.545 10.32 10.129 9.929 9.712 9.481 9.224 9.042 8.866 8.578 8.369 8.152 8.037 7.814 7.605 7.39 7.266 6.771 6.819 6.661 6.504 6.15 5.932 5.692 5.452 5.175 4.842 4.474 3.785 -10 ,15523 ,KEBNE ,17024570,Wed Dec 22 10:25:13 CET,Wed Dec 22 12:13:44 CET,0.0 0.777 1.135 1.411 1.613 1.811 2.007 2.18 2.491 2.642 2.79 2.692 3.18 3.304 3.542 3.763 3.991 4.093 4.289 4.486 4.72 4.875 5.034 5.247 5.47 5.687 5.876 6.048 6.293 6.534 6.748 7.012 7.27 7.515 7.791 8.09 8.372 8.675 8.998 9.346 9.709 10.125 10.58 11.013 11.521 12.083 12.71 13.403 14.146 14.899 15.617 15.921 15.849 15.644 15.351 14.974 14.584 14.21 13.874 13.496 13.135 12.796 12.469 12.165 11.876 11.61 11.311 11.002 10.747 10.482 10.204 10.003 9.791 9.534 9.325 9.121 8.903 8.666 8.423 8.261 8.074 7.769 7.567 7.359 7.243 7.004 6.772 6.522 6.406 5.93 5.969 5.803 5.617 5.221 5.005 4.766 4.519 4.196 3.772 3.264 2.066 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt deleted file mode 100644 index 82203872..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,14760 ,TETRA ,17528830,Thu Nov 25 03:43:00 CET,Thu Nov 25 05:55:17 CET,0.0 0.955 1.39 1.669 1.884 2.103 2.322 2.509 2.823 2.962 3.099 2.981 3.466 3.596 3.847 4.07 4.26 4.353 4.548 4.741 5.014 5.177 5.34 5.567 5.788 6.011 6.228 6.445 6.722 6.958 7.167 7.444 7.732 8.012 8.315 8.636 8.925 9.23 9.548 9.901 10.281 10.69 11.156 11.627 12.176 12.722 13.32 14.029 14.755 15.439 15.993 16.077 15.94 15.668 15.333 14.958 14.589 14.214 13.846 13.46 13.122 12.811 12.501 12.221 11.954 11.697 11.416 11.145 10.927 10.697 10.452 10.229 9.987 9.744 9.545 9.338 9.125 8.908 8.679 8.518 8.352 8.082 7.894 7.698 7.59 7.358 7.114 6.843 6.692 6.179 6.231 6.08 5.915 5.53 5.307 5.061 4.807 4.511 4.132 3.667 2.598 -3 ,9258 ,TETRA ,17528839,Thu Nov 25 03:43:00 CET,Thu Nov 25 05:54:02 CET,0.0 1.244 1.665 1.98 2.227 2.451 2.666 2.875 3.261 3.431 3.586 3.508 4.003 4.132 4.368 4.588 4.791 4.886 5.077 5.276 5.55 5.716 5.883 6.118 6.347 6.569 6.766 6.94 7.166 7.409 7.646 7.903 8.144 8.384 8.669 8.984 9.272 9.588 9.931 10.277 10.627 11.038 11.501 11.929 12.424 12.969 13.564 14.184 14.868 15.548 16.065 16.163 15.962 15.659 15.316 14.92 14.519 14.122 13.779 13.413 13.056 12.701 12.38 12.101 11.82 11.549 11.254 10.982 10.754 10.517 10.269 10.054 9.823 9.578 9.382 9.171 8.932 8.676 8.416 8.249 8.087 7.82 7.628 7.418 7.308 7.095 6.877 6.644 6.514 6.022 6.06 5.899 5.732 5.346 5.116 4.908 4.681 4.371 4.022 3.528 2.131 -4 ,5397 ,TETRA ,17528847,Thu Nov 25 03:43:36 CET,Thu Nov 25 05:56:39 CET,0.0 1.113 1.488 1.774 2.02 2.22 2.395 2.566 2.868 3.006 3.145 3.031 3.517 3.635 3.848 4.048 4.232 4.313 4.476 4.65 4.914 5.076 5.225 5.432 5.632 5.845 6.044 6.227 6.483 6.729 6.967 7.236 7.466 7.694 7.957 8.234 8.502 8.833 9.2 9.547 9.887 10.289 10.766 11.248 11.814 12.381 12.951 13.519 14.144 14.803 15.327 15.389 15.146 14.807 14.419 14.002 13.607 13.221 12.855 12.457 12.082 11.716 11.375 11.064 10.753 10.444 10.119 9.83 9.574 9.323 9.07 8.85 8.62 8.386 8.212 8.011 7.775 7.532 7.295 7.145 6.981 6.688 6.497 6.305 6.198 5.985 5.756 5.495 5.357 4.852 4.914 4.758 4.595 4.264 4.071 3.85 3.616 3.34 3.006 2.534 1.492 -7 ,19508 ,TETRA ,17528881,Thu Nov 25 03:43:01 CET,Thu Nov 25 05:55:11 CET,0.0 0.785 1.179 1.495 1.744 1.991 2.24 2.454 2.836 3.0 3.157 3.104 3.621 3.767 4.035 4.275 4.517 4.634 4.842 5.037 5.317 5.5 5.684 5.94 6.174 6.417 6.641 6.85 7.133 7.387 7.611 7.877 8.145 8.408 8.704 9.019 9.325 9.685 10.033 10.378 10.747 11.14 11.615 12.084 12.59 13.13 13.748 14.414 15.088 15.727 16.268 16.349 16.109 15.765 15.373 14.971 14.578 14.154 13.746 13.325 12.975 12.649 12.32 11.995 11.672 11.37 11.063 10.782 10.515 10.233 9.955 9.724 9.472 9.222 9.031 8.826 8.603 8.369 8.141 7.991 7.823 7.529 7.329 7.135 7.036 6.821 6.58 6.333 6.204 5.708 5.75 5.577 5.41 5.018 4.781 4.556 4.304 3.998 3.614 3.084 2.014 -8 ,21628 ,TETRA ,17528893,Thu Nov 25 03:43:02 CET,Thu Nov 25 05:55:52 CET,0.0 0.883 1.266 1.581 1.838 2.062 2.246 2.414 2.753 2.92 3.069 2.956 3.444 3.566 3.799 4.018 4.21 4.294 4.471 4.651 4.89 5.034 5.183 5.413 5.626 5.818 6.009 6.211 6.459 6.696 6.928 7.197 7.448 7.694 7.977 8.255 8.517 8.816 9.152 9.519 9.902 10.308 10.749 11.169 11.609 12.099 12.642 13.248 13.904 14.551 15.126 15.222 15.013 14.682 14.302 13.914 13.53 13.161 12.816 12.463 12.149 11.837 11.521 11.214 10.924 10.647 10.352 10.074 9.837 9.609 9.367 9.164 8.942 8.681 8.484 8.292 8.093 7.881 7.654 7.497 7.332 7.087 6.914 6.725 6.619 6.385 6.16 5.912 5.76 5.254 5.291 5.113 4.935 4.567 4.379 4.169 3.933 3.666 3.311 2.764 1.44 -9 ,2527 ,TETRA ,17528915,Thu Nov 25 03:43:04 CET,Thu Nov 25 05:54:35 CET,0.0 0.942 1.297 1.61 1.852 2.056 2.252 2.426 2.742 2.886 3.015 2.882 3.36 3.485 3.727 3.952 4.153 4.249 4.435 4.616 4.874 5.03 5.188 5.423 5.655 5.879 6.083 6.27 6.513 6.751 6.985 7.26 7.511 7.753 8.035 8.361 8.671 9.002 9.347 9.699 10.059 10.466 10.918 11.36 11.863 12.42 13.075 13.744 14.414 15.092 15.617 15.684 15.427 15.029 14.587 14.134 13.697 13.288 12.918 12.546 12.213 11.879 11.557 11.246 10.95 10.692 10.409 10.128 9.872 9.605 9.317 9.073 8.827 8.577 8.382 8.181 7.963 7.715 7.461 7.292 7.125 6.858 6.661 6.448 6.338 6.107 5.871 5.628 5.49 4.983 5.033 4.868 4.692 4.301 4.072 3.817 3.525 3.207 2.877 2.444 1.244 -10 ,11454 ,TETRA ,17528917,Thu Nov 25 03:43:06 CET,Thu Nov 25 05:54:14 CET,0.0 1.085 1.555 1.862 2.132 2.35 2.531 2.698 3.014 3.179 3.32 3.208 3.689 3.804 4.037 4.257 4.468 4.574 4.779 4.966 5.211 5.372 5.527 5.743 5.963 6.182 6.387 6.575 6.809 7.038 7.261 7.535 7.8 8.053 8.338 8.64 8.912 9.231 9.59 9.959 10.357 10.792 11.268 11.737 12.293 12.93 13.584 14.219 14.891 15.509 15.97 16.021 15.82 15.498 15.147 14.731 14.3 13.891 13.515 13.129 12.78 12.456 12.125 11.803 11.515 11.241 10.939 10.66 10.408 10.145 9.866 9.62 9.368 9.112 8.917 8.728 8.522 8.291 8.048 7.879 7.708 7.438 7.254 7.067 6.966 6.761 6.544 6.301 6.153 5.638 5.688 5.529 5.368 5.024 4.816 4.587 4.313 3.985 3.607 3.153 1.613 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt deleted file mode 100644 index d002d7ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,21223 ,TETRA ,17528931,Thu Nov 25 03:43:03 CET,Thu Nov 25 05:53:52 CET,0.0 1.499 2.101 2.509 2.833 3.144 3.434 3.685 4.107 4.292 4.464 4.417 4.934 5.079 5.349 5.595 5.824 5.931 6.143 6.355 6.667 6.859 7.033 7.287 7.544 7.784 7.999 8.216 8.498 8.742 8.97 9.265 9.543 9.806 10.112 10.461 10.785 11.127 11.499 11.875 12.223 12.587 13.056 13.543 14.011 14.462 14.96 15.443 15.877 16.169 16.101 15.491 14.768 13.975 13.17 12.44 11.769 11.153 10.611 10.052 9.552 9.111 8.69 8.275 7.895 7.542 7.162 6.805 6.502 6.205 5.87 5.591 5.324 5.041 4.813 4.565 4.297 4.023 3.753 3.575 3.385 3.063 2.829 2.588 2.468 2.226 1.959 1.656 1.507 1.002 1.049 0.85 0.643 0.244 0.02 -0.225 -0.497 -0.826 -1.248 -1.838 -3.157 -3 ,25568 ,TETRA ,17528933,Thu Nov 25 03:43:02 CET,Thu Nov 25 05:57:32 CET,0.0 2.227 2.916 3.403 3.809 4.178 4.472 4.755 5.256 5.468 5.662 5.676 6.227 6.395 6.702 6.971 7.213 7.331 7.556 7.774 8.086 8.287 8.49 8.78 9.031 9.272 9.509 9.732 10.007 10.272 10.533 10.84 11.133 11.425 11.753 12.098 12.443 12.793 13.124 13.503 13.899 14.325 14.799 15.207 15.636 16.121 16.612 17.077 17.582 17.98 18.082 17.64 16.985 16.252 15.504 14.805 14.181 13.607 13.06 12.463 11.921 11.418 10.961 10.519 10.119 9.78 9.41 9.05 8.735 8.4 8.037 7.718 7.384 7.037 6.77 6.492 6.204 5.923 5.61 5.389 5.178 4.844 4.598 4.346 4.227 3.954 3.634 3.297 3.124 2.579 2.577 2.382 2.184 1.763 1.514 1.221 0.869 0.437 -0.092 -0.717 -2.339 -4 ,1696 ,TETRA ,17528942,Thu Nov 25 03:43:03 CET,Thu Nov 25 05:57:05 CET,0.0 2.194 2.798 3.245 3.631 3.95 4.249 4.532 5.009 5.201 5.361 5.309 5.831 5.984 6.252 6.49 6.72 6.836 7.068 7.291 7.602 7.8 7.982 8.232 8.477 8.714 8.943 9.169 9.438 9.69 9.936 10.226 10.498 10.77 11.092 11.429 11.759 12.125 12.496 12.865 13.251 13.68 14.173 14.64 15.157 15.671 16.145 16.621 17.058 17.315 17.129 16.292 15.37 14.511 13.73 13.0 12.325 11.69 11.105 10.465 9.928 9.48 9.017 8.529 8.096 7.722 7.314 6.946 6.63 6.314 5.972 5.685 5.4 5.093 4.846 4.587 4.31 4.04 3.763 3.553 3.332 2.983 2.749 2.519 2.398 2.13 1.825 1.511 1.343 0.788 0.75 0.545 0.333 -0.131 -0.368 -0.628 -0.948 -1.334 -1.794 -2.471 -4.212 -5 ,20079 ,TETRA ,17528950,Thu Nov 25 03:43:06 CET,Thu Nov 25 05:55:25 CET,0.0 1.205 1.677 2.12 2.461 2.741 2.971 3.185 3.598 3.786 3.955 3.919 4.44 4.6 4.885 5.147 5.396 5.508 5.729 5.933 6.231 6.432 6.629 6.913 7.179 7.436 7.673 7.903 8.209 8.497 8.766 9.088 9.402 9.694 10.018 10.353 10.667 11.027 11.4 11.783 12.156 12.576 13.065 13.492 13.929 14.387 14.863 15.347 15.789 16.045 15.948 15.331 14.556 13.738 12.957 12.204 11.542 10.984 10.463 9.891 9.394 8.957 8.548 8.133 7.728 7.356 6.968 6.6 6.242 5.866 5.498 5.223 4.956 4.631 4.36 4.091 3.812 3.514 3.214 3.008 2.796 2.468 2.229 1.972 1.838 1.543 1.208 0.867 0.684 0.129 0.086 -0.134 -0.342 -0.813 -1.087 -1.39 -1.716 -2.075 -2.556 -3.244 -5.281 -6 ,24546 ,TETRA ,17528958,Thu Nov 25 03:43:07 CET,Thu Nov 25 05:55:06 CET,0.0 2.033 2.687 3.155 3.5 3.786 4.056 4.309 4.725 4.903 5.088 5.08 5.604 5.751 6.028 6.296 6.542 6.658 6.87 7.08 7.399 7.608 7.793 8.018 8.237 8.459 8.678 8.894 9.154 9.411 9.664 9.944 10.211 10.453 10.732 11.048 11.343 11.671 12.013 12.369 12.725 13.121 13.591 14.017 14.477 14.958 15.448 15.912 16.342 16.663 16.671 16.077 15.249 14.365 13.555 12.818 12.129 11.526 10.995 10.444 9.957 9.531 9.122 8.688 8.293 7.949 7.574 7.204 6.867 6.536 6.201 5.916 5.63 5.356 5.129 4.866 4.583 4.287 3.997 3.812 3.618 3.311 3.076 2.819 2.691 2.417 2.146 1.847 1.678 1.143 1.162 0.987 0.81 0.435 0.226 -0.025 -0.338 -0.691 -1.106 -1.667 -3.381 -8 ,9389 ,TETRA ,17528968,Thu Nov 25 03:43:03 CET,Thu Nov 25 05:53:54 CET,0.0 1.9 2.433 2.779 3.068 3.358 3.622 3.862 4.317 4.522 4.713 4.71 5.234 5.368 5.625 5.867 6.116 6.242 6.482 6.714 7.019 7.196 7.383 7.653 7.911 8.151 8.366 8.587 8.865 9.117 9.365 9.697 10.019 10.299 10.605 10.936 11.24 11.553 11.911 12.306 12.682 13.095 13.579 14.038 14.568 15.079 15.557 16.036 16.509 16.824 16.766 16.225 15.52 14.8 14.104 13.436 12.777 12.165 11.614 11.053 10.553 10.085 9.667 9.253 8.86 8.506 8.138 7.821 7.522 7.213 6.892 6.618 6.325 6.008 5.766 5.526 5.27 4.994 4.72 4.54 4.344 4.02 3.806 3.59 3.479 3.236 2.973 2.7 2.553 2.03 2.052 1.871 1.688 1.279 1.034 0.775 0.505 0.196 -0.17 -0.642 -2.336 -9 ,28582 ,TETRA ,17528975,Thu Nov 25 03:43:05 CET,Thu Nov 25 05:57:20 CET,0.0 1.62 2.098 2.457 2.761 3.027 3.272 3.513 3.943 4.129 4.31 4.286 4.813 4.958 5.218 5.473 5.706 5.813 6.026 6.229 6.506 6.691 6.881 7.143 7.396 7.637 7.85 8.04 8.297 8.563 8.816 9.112 9.384 9.637 9.924 10.251 10.561 10.885 11.233 11.586 11.95 12.377 12.864 13.314 13.814 14.331 14.825 15.289 15.757 16.067 15.994 15.352 14.567 13.801 13.083 12.369 11.694 11.07 10.483 9.882 9.39 8.97 8.561 8.133 7.715 7.339 6.955 6.6 6.292 5.969 5.619 5.331 5.026 4.703 4.46 4.218 3.961 3.695 3.422 3.231 3.027 2.715 2.501 2.266 2.139 1.87 1.599 1.312 1.154 0.615 0.602 0.411 0.223 -0.195 -0.44 -0.726 -1.031 -1.376 -1.811 -2.363 -3.904 -10 ,19114 ,TETRA ,17528984,Thu Nov 25 03:43:07 CET,Thu Nov 25 05:57:18 CET,0.0 1.79 2.378 2.803 3.158 3.423 3.661 3.918 4.389 4.578 4.737 4.699 5.22 5.363 5.65 5.908 6.135 6.243 6.447 6.66 6.976 7.175 7.384 7.671 7.913 8.152 8.377 8.592 8.888 9.168 9.423 9.742 10.07 10.377 10.709 11.05 11.362 11.736 12.139 12.526 12.895 13.315 13.82 14.311 14.855 15.411 15.944 16.436 16.91 17.216 17.103 16.556 15.88 15.152 14.453 13.785 13.162 12.543 11.971 11.339 10.796 10.348 9.913 9.519 9.16 8.803 8.424 8.09 7.8 7.476 7.092 6.777 6.47 6.162 5.924 5.667 5.378 5.07 4.759 4.551 4.34 4.002 3.75 3.494 3.377 3.133 2.84 2.503 2.336 1.805 1.832 1.654 1.446 0.968 0.731 0.48 0.216 -0.083 -0.456 -0.976 -2.498 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt deleted file mode 100644 index 6f7cc680..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27480 ,TETRA ,17529006,Thu Nov 25 03:43:02 CET,Thu Nov 25 05:54:04 CET,0.0 0.895 1.314 1.657 1.943 2.172 2.401 2.622 2.998 3.167 3.324 3.249 3.778 3.924 4.198 4.44 4.669 4.784 5.011 5.232 5.554 5.765 5.977 6.299 6.596 6.869 7.126 7.363 7.676 7.988 8.28 8.628 8.953 9.268 9.65 10.054 10.429 10.846 11.295 11.777 12.28 12.835 13.47 14.108 14.842 15.666 16.625 17.62 18.722 19.961 21.253 22.097 22.278 22.14 21.91 21.57 21.183 20.808 20.464 20.107 19.767 19.414 19.055 18.712 18.374 18.052 17.719 17.436 17.185 16.896 16.572 16.296 16.01 15.734 15.535 15.307 15.054 14.795 14.518 14.315 14.097 13.763 13.541 13.291 13.16 12.909 12.634 12.322 12.146 11.605 11.6 11.401 11.205 10.799 10.557 10.268 9.944 9.511 8.988 8.371 6.696 -2 ,2608 ,TETRA ,17529012,Thu Nov 25 03:43:03 CET,Thu Nov 25 05:53:36 CET,0.0 0.802 1.192 1.5 1.79 2.05 2.263 2.465 2.843 3.022 3.205 3.175 3.706 3.846 4.117 4.381 4.639 4.756 4.984 5.22 5.554 5.755 5.942 6.216 6.49 6.757 7.001 7.244 7.555 7.858 8.164 8.521 8.844 9.154 9.513 9.908 10.279 10.701 11.158 11.631 12.135 12.734 13.42 14.068 14.822 15.606 16.499 17.526 18.672 19.931 21.115 21.729 21.891 21.745 21.51 21.268 20.915 20.496 20.127 19.743 19.402 19.076 18.74 18.407 18.103 17.821 17.496 17.203 16.959 16.693 16.409 16.176 15.898 15.595 15.372 15.141 14.898 14.644 14.381 14.185 13.971 13.626 13.378 13.126 13.0 12.75 12.443 12.104 11.943 11.4 11.411 11.233 11.032 10.567 10.316 10.035 9.701 9.361 8.939 8.321 6.438 -4 ,29695 ,TETRA ,17529030,Thu Nov 25 03:43:04 CET,Thu Nov 25 05:53:48 CET,0.0 0.823 1.168 1.464 1.731 1.938 2.127 2.32 2.691 2.863 3.031 2.963 3.486 3.63 3.901 4.153 4.398 4.519 4.741 4.96 5.29 5.495 5.693 5.973 6.238 6.505 6.759 6.996 7.309 7.619 7.914 8.264 8.593 8.897 9.243 9.65 10.058 10.493 10.944 11.423 11.938 12.524 13.202 13.89 14.675 15.503 16.467 17.51 18.594 19.77 21.071 21.845 22.007 21.903 21.683 21.376 21.063 20.738 20.417 20.086 19.771 19.455 19.118 18.797 18.489 18.212 17.905 17.602 17.339 17.065 16.772 16.51 16.227 15.919 15.668 15.409 15.14 14.857 14.555 14.343 14.125 13.783 13.543 13.29 13.162 12.896 12.62 12.316 12.148 11.61 11.613 11.413 11.192 10.675 10.396 10.099 9.751 9.348 8.816 8.11 6.293 -5 ,6176 ,TETRA ,17529031,Thu Nov 25 03:43:05 CET,Thu Nov 25 05:54:04 CET,0.0 1.738 2.219 2.572 2.903 3.164 3.378 3.586 3.967 4.125 4.273 4.177 4.679 4.809 5.073 5.317 5.554 5.665 5.87 6.075 6.395 6.606 6.813 7.104 7.374 7.636 7.887 8.132 8.452 8.764 9.055 9.404 9.746 10.069 10.449 10.877 11.284 11.723 12.198 12.726 13.258 13.818 14.497 15.201 15.981 16.797 17.717 18.712 19.794 20.973 22.22 22.952 23.099 22.966 22.726 22.417 22.082 21.709 21.362 21.009 20.622 20.259 19.945 19.633 19.311 18.99 18.662 18.363 18.093 17.8 17.47 17.185 16.904 16.608 16.374 16.148 15.915 15.651 15.354 15.149 14.93 14.592 14.369 14.138 14.01 13.739 13.436 13.094 12.913 12.364 12.376 12.186 11.986 11.508 11.228 10.94 10.631 10.251 9.761 9.096 7.75 -7 ,13869 ,TETRA ,17529061,Thu Nov 25 03:43:10 CET,Thu Nov 25 05:52:22 CET,0.0 1.121 1.611 1.917 2.201 2.463 2.695 2.917 3.344 3.522 3.682 3.609 4.146 4.3 4.572 4.815 5.051 5.169 5.406 5.64 5.964 6.168 6.367 6.647 6.899 7.141 7.4 7.645 7.939 8.219 8.491 8.808 9.12 9.459 9.85 10.255 10.642 11.062 11.505 11.966 12.447 13.003 13.672 14.361 15.144 15.94 16.822 17.845 18.981 20.212 21.487 22.216 22.34 22.213 22.004 21.725 21.394 21.046 20.706 20.318 19.951 19.618 19.304 18.971 18.634 18.312 17.957 17.632 17.369 17.106 16.821 16.576 16.309 16.016 15.776 15.521 15.252 14.984 14.696 14.49 14.288 13.975 13.739 13.48 13.341 13.05 12.748 12.414 12.248 11.716 11.715 11.513 11.275 10.756 10.499 10.201 9.853 9.449 8.926 8.269 6.63 -8 ,17895 ,TETRA ,17529072,Thu Nov 25 03:43:04 CET,Thu Nov 25 05:49:55 CET,0.0 1.2 1.701 2.051 2.33 2.558 2.784 2.999 3.397 3.597 3.785 3.737 4.26 4.403 4.689 4.965 5.22 5.339 5.567 5.777 6.08 6.283 6.478 6.775 7.053 7.301 7.543 7.786 8.117 8.438 8.754 9.139 9.495 9.835 10.225 10.652 11.064 11.526 11.993 12.469 12.96 13.535 14.273 14.996 15.767 16.59 17.525 18.536 19.685 20.943 22.198 22.92 23.002 22.808 22.53 22.189 21.806 21.444 21.108 20.716 20.351 20.005 19.653 19.32 19.015 18.716 18.379 18.05 17.759 17.468 17.151 16.886 16.631 16.367 16.149 15.918 15.683 15.416 15.128 14.936 14.734 14.412 14.17 13.908 13.778 13.51 13.22 12.903 12.731 12.187 12.184 11.988 11.768 11.257 10.983 10.689 10.319 9.86 9.359 8.749 6.777 -9 ,10254 ,TETRA ,17529079,Thu Nov 25 03:43:05 CET,Thu Nov 25 05:54:17 CET,0.0 0.992 1.411 1.727 2.018 2.262 2.485 2.696 3.041 3.198 3.349 3.259 3.779 3.921 4.194 4.44 4.674 4.796 5.044 5.278 5.592 5.78 5.967 6.245 6.504 6.762 7.014 7.255 7.558 7.843 8.107 8.441 8.767 9.076 9.448 9.855 10.246 10.679 11.139 11.615 12.128 12.719 13.38 14.033 14.797 15.648 16.58 17.596 18.752 20.042 21.442 22.268 22.47 22.422 22.192 21.864 21.501 21.128 20.765 20.361 20.014 19.696 19.379 19.044 18.728 18.449 18.131 17.847 17.601 17.32 16.998 16.747 16.483 16.199 15.98 15.727 15.456 15.177 14.871 14.643 14.419 14.074 13.827 13.579 13.455 13.203 12.928 12.626 12.45 11.896 11.903 11.706 11.497 11.065 10.829 10.557 10.219 9.838 9.377 8.691 6.676 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt deleted file mode 100644 index c7cfec5f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29739 ,TETRA ,17529130,Thu Nov 25 03:43:08 CET,Thu Nov 25 05:54:59 CET,0.0 2.006 2.514 2.915 3.257 3.579 3.868 4.124 4.585 4.797 5.008 5.03 5.586 5.759 6.076 6.36 6.635 6.778 7.06 7.327 7.713 7.954 8.199 8.558 8.878 9.187 9.493 9.801 10.205 10.592 10.938 11.343 11.746 12.132 12.609 13.153 13.635 14.153 14.722 15.317 15.919 16.623 17.483 18.312 19.297 20.431 21.697 23.057 24.574 26.229 28.106 29.478 30.062 30.286 30.294 30.152 29.958 29.711 29.416 29.1 28.807 28.505 28.188 27.856 27.528 27.214 26.916 26.665 26.412 26.137 25.842 25.589 25.314 25.001 24.758 24.511 24.249 23.995 23.713 23.498 23.277 22.915 22.653 22.4 22.281 22.004 21.669 21.3 21.104 20.52 20.397 20.143 19.871 19.29 18.956 18.563 18.099 17.554 16.924 16.12 13.436 -3 ,1635 ,TETRA ,17529147,Thu Nov 25 03:43:05 CET,Thu Nov 25 05:54:08 CET,0.0 1.782 2.386 2.888 3.274 3.617 3.921 4.186 4.673 4.888 5.081 5.077 5.634 5.811 6.146 6.453 6.748 6.895 7.192 7.46 7.821 8.047 8.26 8.563 8.873 9.175 9.456 9.743 10.117 10.467 10.795 11.205 11.613 12.006 12.47 12.971 13.445 13.981 14.54 15.131 15.737 16.401 17.215 18.036 18.956 20.0 21.222 22.543 23.996 25.624 27.443 28.767 29.326 29.446 29.356 29.204 28.974 28.653 28.304 27.93 27.644 27.371 27.061 26.767 26.483 26.197 25.864 25.553 25.291 25.009 24.714 24.453 24.172 23.877 23.634 23.393 23.148 22.878 22.599 22.394 22.165 21.788 21.532 21.242 21.076 20.778 20.472 20.146 19.981 19.439 19.357 19.094 18.794 18.109 17.731 17.32 16.886 16.421 15.856 14.981 11.329 -5 ,19422 ,TETRA ,17529154,Thu Nov 25 03:43:36 CET,Thu Nov 25 05:58:28 CET,0.0 1.851 2.426 2.848 3.187 3.5 3.785 4.036 4.555 4.793 5.019 5.081 5.649 5.811 6.144 6.5 6.821 6.963 7.249 7.528 7.929 8.187 8.432 8.781 9.11 9.418 9.727 10.04 10.429 10.794 11.158 11.59 11.989 12.414 12.925 13.454 13.916 14.413 14.978 15.567 16.194 16.897 17.695 18.499 19.423 20.446 21.697 23.128 24.738 26.592 28.613 30.017 30.572 30.637 30.511 30.301 29.964 29.592 29.283 28.943 28.593 28.249 27.895 27.518 27.145 26.813 26.457 26.118 25.826 25.515 25.185 24.888 24.57 24.251 23.981 23.683 23.372 23.043 22.7 22.465 22.216 21.784 21.476 21.175 21.02 20.69 20.335 19.975 19.781 19.208 19.114 18.856 18.593 18.031 17.684 17.303 16.873 16.307 15.645 14.797 8.939 -7 ,26909 ,TETRA ,17529167,Thu Nov 25 03:43:36 CET,Thu Nov 25 05:54:37 CET,0.0 1.689 2.218 2.608 2.974 3.304 3.609 3.891 4.378 4.607 4.838 4.865 5.428 5.599 5.902 6.192 6.502 6.65 6.935 7.196 7.576 7.839 8.079 8.413 8.726 9.015 9.3 9.579 9.944 10.296 10.62 11.015 11.38 11.725 12.137 12.595 13.041 13.545 14.094 14.675 15.259 15.89 16.62 17.354 18.246 19.256 20.415 21.659 22.979 24.473 26.254 27.319 27.657 27.7 27.486 27.158 26.802 26.465 26.143 25.716 25.277 24.901 24.55 24.194 23.838 23.499 23.12 22.765 22.454 22.106 21.746 21.465 21.183 20.867 20.596 20.331 20.063 19.771 19.452 19.208 18.927 18.485 18.197 17.877 17.706 17.36 16.979 16.575 16.355 15.738 15.566 15.288 15.011 14.409 14.021 13.621 13.199 12.646 12.008 11.249 9.025 -9 ,25135 ,TETRA ,17529183,Thu Nov 25 03:43:39 CET,Thu Nov 25 05:58:00 CET,0.0 1.824 2.35 2.803 3.157 3.402 3.628 3.853 4.292 4.495 4.679 4.632 5.172 5.333 5.624 5.901 6.175 6.314 6.586 6.845 7.222 7.455 7.683 8.031 8.359 8.664 8.963 9.239 9.586 9.924 10.26 10.659 11.055 11.446 11.882 12.373 12.847 13.351 13.874 14.433 15.03 15.713 16.516 17.329 18.268 19.275 20.384 21.606 23.037 24.722 26.595 27.834 28.328 28.491 28.449 28.247 28.017 27.754 27.462 27.118 26.787 26.496 26.204 25.888 25.56 25.237 24.903 24.592 24.298 24.008 23.693 23.422 23.156 22.844 22.574 22.292 22.005 21.716 21.396 21.161 20.911 20.515 20.24 19.947 19.784 19.439 19.088 18.671 18.437 17.839 17.731 17.497 17.253 16.674 16.305 15.924 15.53 15.025 14.438 13.622 9.559 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index 00083dd1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,820 ,TETRA ,17529236,Thu Nov 25 03:43:38 CET,Thu Nov 25 05:55:04 CET,0.0 1.526 2.044 2.416 2.695 2.944 3.189 3.414 3.797 3.971 4.127 4.072 4.583 4.738 5.005 5.258 5.512 5.639 5.881 6.101 6.406 6.594 6.776 7.031 7.265 7.496 7.724 7.942 8.224 8.511 8.783 9.081 9.367 9.646 9.958 10.289 10.6 10.942 11.312 11.691 12.078 12.518 13.006 13.505 14.091 14.713 15.388 16.086 16.868 17.645 18.382 18.653 18.515 18.244 17.913 17.578 17.208 16.775 16.395 16.032 15.707 15.408 15.094 14.765 14.453 14.171 13.886 13.604 13.347 13.092 12.821 12.609 12.39 12.146 11.959 11.754 11.517 11.265 11.008 10.838 10.66 10.374 10.175 9.954 9.839 9.599 9.351 9.084 8.939 8.444 8.453 8.274 8.085 7.695 7.488 7.228 6.924 6.57 6.142 5.588 3.442 -4 ,20823 ,TETRA ,17529241,Thu Nov 25 03:43:40 CET,Thu Nov 25 05:54:33 CET,0.0 1.037 1.548 1.933 2.237 2.481 2.714 2.921 3.287 3.466 3.637 3.594 4.109 4.263 4.551 4.831 5.089 5.22 5.474 5.7 6.015 6.213 6.399 6.677 6.95 7.199 7.432 7.663 7.958 8.239 8.512 8.839 9.162 9.475 9.817 10.189 10.528 10.877 11.263 11.704 12.191 12.723 13.28 13.799 14.37 14.97 15.664 16.432 17.224 18.021 18.778 19.121 19.041 18.798 18.488 18.117 17.749 17.411 17.094 16.747 16.403 16.04 15.699 15.424 15.165 14.885 14.575 14.297 14.058 13.812 13.555 13.338 13.124 12.893 12.686 12.473 12.263 12.033 11.78 11.599 11.409 11.116 10.912 10.693 10.571 10.32 10.08 9.811 9.653 9.141 9.157 8.975 8.792 8.408 8.171 7.919 7.663 7.334 6.851 6.168 4.468 -5 ,31961 ,TETRA ,17529242,Thu Nov 25 03:43:37 CET,Thu Nov 25 05:56:38 CET,0.0 1.118 1.585 1.923 2.219 2.487 2.74 2.97 3.345 3.517 3.683 3.641 4.137 4.267 4.517 4.76 5.009 5.128 5.345 5.541 5.836 6.026 6.211 6.477 6.724 6.969 7.205 7.433 7.717 7.971 8.223 8.522 8.801 9.071 9.364 9.699 10.036 10.402 10.806 11.224 11.664 12.156 12.677 13.18 13.772 14.418 15.099 15.814 16.582 17.396 18.21 18.565 18.516 18.273 17.973 17.672 17.291 16.884 16.534 16.166 15.832 15.52 15.225 14.941 14.668 14.406 14.095 13.798 13.538 13.262 12.996 12.79 12.566 12.303 12.085 11.869 11.65 11.417 11.179 11.013 10.843 10.597 10.424 10.227 10.118 9.9 9.678 9.435 9.299 8.802 8.843 8.69 8.525 8.139 7.906 7.649 7.399 7.121 6.756 6.224 4.658 -7 ,10229 ,TETRA ,17529263,Thu Nov 25 03:43:42 CET,Thu Nov 25 05:52:47 CET,0.0 1.1 1.49 1.823 2.108 2.364 2.574 2.75 3.078 3.233 3.382 3.312 3.785 3.917 4.148 4.364 4.589 4.693 4.876 5.042 5.29 5.456 5.613 5.848 6.077 6.287 6.472 6.65 6.891 7.112 7.317 7.571 7.811 8.051 8.327 8.625 8.918 9.237 9.579 9.933 10.296 10.699 11.167 11.624 12.124 12.654 13.247 13.878 14.565 15.314 15.952 16.174 16.169 16.011 15.77 15.517 15.231 14.931 14.676 14.384 14.09 13.812 13.53 13.272 13.041 12.815 12.556 12.306 12.083 11.842 11.586 11.381 11.167 10.929 10.743 10.538 10.303 10.053 9.796 9.629 9.468 9.19 8.983 8.772 8.666 8.45 8.228 7.991 7.849 7.344 7.351 7.179 7.004 6.613 6.382 6.111 5.82 5.484 5.08 4.52 3.093 -9 ,4401 ,TETRA ,17529274,Thu Nov 25 03:43:38 CET,Thu Nov 25 05:55:58 CET,0.0 1.009 1.431 1.776 2.062 2.306 2.513 2.701 3.039 3.196 3.345 3.271 3.765 3.907 4.167 4.405 4.646 4.766 4.991 5.205 5.504 5.699 5.889 6.152 6.393 6.624 6.846 7.056 7.333 7.599 7.865 8.187 8.474 8.745 9.056 9.397 9.731 10.084 10.44 10.81 11.197 11.625 12.108 12.595 13.142 13.715 14.351 15.03 15.743 16.453 17.068 17.257 17.11 16.842 16.568 16.228 15.834 15.47 15.155 14.793 14.418 14.079 13.795 13.511 13.232 12.966 12.677 12.429 12.206 11.957 11.674 11.443 11.218 10.971 10.779 10.564 10.338 10.123 9.889 9.723 9.554 9.262 9.056 8.857 8.749 8.497 8.236 7.96 7.8 7.293 7.285 7.095 6.903 6.47 6.226 5.963 5.656 5.298 4.902 4.372 2.607 -10 ,29460 ,TETRA ,17529291,Thu Nov 25 03:43:40 CET,Thu Nov 25 05:57:29 CET,0.0 1.434 1.938 2.291 2.587 2.83 3.043 3.246 3.593 3.738 3.875 3.82 4.338 4.485 4.731 4.972 5.213 5.331 5.549 5.741 6.015 6.196 6.371 6.603 6.828 7.05 7.268 7.486 7.751 8.015 8.271 8.553 8.82 9.076 9.364 9.683 9.984 10.303 10.653 11.02 11.411 11.845 12.321 12.779 13.317 13.931 14.598 15.287 16.055 16.781 17.445 17.772 17.729 17.474 17.142 16.819 16.51 16.212 15.927 15.593 15.272 14.979 14.697 14.437 14.191 13.948 13.661 13.385 13.152 12.906 12.641 12.43 12.223 11.988 11.784 11.571 11.36 11.136 10.9 10.734 10.55 10.246 10.021 9.78 9.653 9.407 9.157 8.875 8.726 8.222 8.241 8.061 7.872 7.476 7.244 6.984 6.715 6.395 5.953 5.339 3.537 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt deleted file mode 100644 index aedc2db3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2398 ,TETRA ,17529317,Thu Nov 25 03:43:38 CET,Thu Nov 25 05:54:28 CET,0.0 1.231 1.586 1.886 2.159 2.404 2.623 2.817 3.145 3.297 3.435 3.335 3.811 3.927 4.146 4.366 4.584 4.684 4.874 5.055 5.294 5.446 5.602 5.829 6.042 6.24 6.424 6.607 6.85 7.077 7.286 7.524 7.764 8.009 8.272 8.57 8.85 9.144 9.462 9.809 10.169 10.525 10.927 11.339 11.792 12.283 12.788 13.29 13.816 14.308 14.633 14.503 14.125 13.653 13.133 12.588 12.055 11.499 11.014 10.583 10.205 9.829 9.456 9.118 8.793 8.468 8.127 7.804 7.51 7.223 6.915 6.659 6.407 6.139 5.931 5.71 5.479 5.24 4.982 4.8 4.611 4.311 4.087 3.856 3.74 3.502 3.257 2.991 2.85 2.342 2.358 2.169 1.957 1.51 1.22 0.875 0.579 0.258 -0.191 -0.802 -2.906 -3 ,25600 ,TETRA ,17529346,Thu Nov 25 03:43:38 CET,Thu Nov 25 05:54:06 CET,0.0 1.413 1.825 2.136 2.414 2.624 2.812 2.996 3.355 3.511 3.658 3.597 4.08 4.209 4.452 4.655 4.84 4.929 5.114 5.299 5.556 5.718 5.867 6.085 6.309 6.516 6.712 6.909 7.156 7.382 7.588 7.835 8.065 8.281 8.539 8.833 9.095 9.373 9.675 9.988 10.319 10.678 11.084 11.478 11.885 12.324 12.803 13.267 13.728 14.126 14.273 14.033 13.573 13.043 12.534 12.026 11.541 11.064 10.647 10.208 9.807 9.442 9.081 8.737 8.405 8.083 7.74 7.431 7.158 6.881 6.584 6.336 6.099 5.84 5.616 5.367 5.121 4.873 4.614 4.439 4.237 3.885 3.639 3.405 3.284 3.038 2.778 2.472 2.316 1.801 1.806 1.624 1.442 1.06 0.825 0.563 0.248 -0.118 -0.542 -1.272 -4.07 -10 ,29406 ,TETRA ,17529388,Thu Nov 25 03:43:43 CET,Thu Nov 25 05:49:43 CET,0.0 1.304 1.826 2.154 2.429 2.679 2.908 3.115 3.433 3.581 3.729 3.63 4.118 4.253 4.496 4.723 4.936 5.046 5.264 5.456 5.723 5.906 6.087 6.323 6.541 6.759 6.969 7.16 7.396 7.633 7.859 8.114 8.363 8.606 8.879 9.186 9.474 9.786 10.127 10.469 10.812 11.168 11.538 11.896 12.318 12.777 13.285 13.791 14.293 14.724 14.907 14.679 14.283 13.788 13.305 12.826 12.363 11.875 11.391 10.932 10.554 10.212 9.881 9.569 9.239 8.906 8.561 8.244 7.954 7.653 7.353 7.104 6.855 6.591 6.374 6.156 5.931 5.686 5.451 5.284 5.091 4.781 4.557 4.331 4.22 4.009 3.768 3.493 3.348 2.828 2.818 2.611 2.389 1.958 1.704 1.413 1.121 0.767 0.284 -0.321 -2.882 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18636-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18636-1.txt deleted file mode 100644 index aa483a10..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18635-1_18636-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26147 ,KEBNE ,17024571,Wed Dec 22 10:25:13 CET,Wed Dec 22 12:14:35 CET,0.0 1.431 1.855 2.149 2.384 2.579 2.746 2.903 3.202 3.331 3.457 3.337 3.807 3.927 4.15 4.353 4.541 4.631 4.803 4.964 5.197 5.353 5.495 5.683 5.871 6.055 6.221 6.376 6.578 6.79 6.999 7.242 7.451 7.643 7.885 8.169 8.437 8.719 9.017 9.325 9.635 9.976 10.355 10.707 11.073 11.481 11.925 12.316 12.656 12.881 12.764 12.096 11.311 10.555 9.861 9.23 8.662 8.087 7.556 7.055 6.627 6.219 5.807 5.428 5.093 4.78 4.436 4.118 3.838 3.542 3.252 3.02 2.763 2.498 2.283 2.052 1.818 1.581 1.333 1.158 0.979 0.715 0.538 0.36 0.265 0.046 -0.195 -0.471 -0.615 -1.117 -1.088 -1.252 -1.417 -1.797 -1.997 -2.207 -2.486 -2.807 -3.164 -3.665 -5.151 -2 ,27786 ,KEBNE ,17024572,Wed Dec 22 10:25:13 CET,Wed Dec 22 12:14:07 CET,0.0 0.821 1.195 1.482 1.709 1.902 2.081 2.264 2.631 2.787 2.925 2.828 3.308 3.43 3.666 3.883 4.103 4.21 4.405 4.601 4.869 5.025 5.174 5.384 5.572 5.76 5.946 6.121 6.348 6.569 6.792 7.069 7.32 7.545 7.816 8.111 8.387 8.697 8.997 9.271 9.554 9.891 10.271 10.594 10.905 11.247 11.675 12.099 12.433 12.682 12.676 12.193 11.563 10.922 10.313 9.728 9.134 8.564 8.12 7.689 7.278 6.886 6.517 6.168 5.831 5.523 5.197 4.905 4.642 4.359 4.087 3.876 3.639 3.378 3.183 2.987 2.768 2.538 2.306 2.143 1.982 1.729 1.547 1.36 1.26 1.052 0.823 0.572 0.438 -0.06 -0.005 -0.154 -0.311 -0.659 -0.837 -1.018 -1.227 -1.484 -1.783 -2.124 -3.121 -3 ,24107 ,KEBNE ,17024573,Wed Dec 22 10:25:13 CET,Wed Dec 22 12:13:51 CET,0.0 0.685 0.987 1.271 1.552 1.793 2.013 2.207 2.534 2.683 2.828 2.721 3.192 3.31 3.516 3.693 3.863 3.947 4.133 4.333 4.587 4.746 4.906 5.122 5.322 5.517 5.718 5.898 6.117 6.332 6.541 6.774 6.991 7.205 7.435 7.672 7.91 8.181 8.483 8.792 9.089 9.41 9.778 10.157 10.566 10.971 11.401 11.826 12.137 12.288 12.163 11.631 11.008 10.342 9.689 9.06 8.481 7.936 7.449 6.959 6.516 6.125 5.771 5.421 5.074 4.773 4.464 4.165 3.881 3.579 3.287 3.051 2.804 2.558 2.361 2.143 1.919 1.69 1.455 1.297 1.131 0.871 0.699 0.517 0.42 0.208 -0.022 -0.257 -0.389 -0.883 -0.81 -0.966 -1.112 -1.416 -1.595 -1.814 -2.064 -2.337 -2.635 -3.05 -4.211 -4 ,17329 ,KEBNE ,17024574,Wed Dec 22 10:26:14 CET,Wed Dec 22 12:14:43 CET,0.0 0.753 1.025 1.305 1.579 1.81 2.023 2.22 2.567 2.712 2.854 2.786 3.263 3.375 3.591 3.786 3.979 4.076 4.263 4.45 4.732 4.899 5.05 5.275 5.504 5.732 5.936 6.108 6.328 6.55 6.763 7.025 7.282 7.525 7.796 8.098 8.381 8.694 9.028 9.337 9.651 10.032 10.446 10.803 11.194 11.587 11.967 12.354 12.7 12.933 12.801 12.185 11.47 10.809 10.19 9.546 8.963 8.421 7.943 7.461 7.052 6.675 6.304 5.971 5.671 5.396 5.113 4.835 4.567 4.292 4.027 3.807 3.558 3.293 3.081 2.843 2.604 2.361 2.102 1.927 1.747 1.468 1.269 1.065 0.962 0.752 0.538 0.3 0.168 -0.326 -0.256 -0.411 -0.575 -0.952 -1.152 -1.36 -1.593 -1.887 -2.265 -2.681 -4.118 -5 ,18904 ,KEBNE ,17024575,Wed Dec 22 10:26:18 CET,Wed Dec 22 12:09:58 CET,0.0 0.86 1.172 1.449 1.695 1.894 2.074 2.241 2.538 2.672 2.791 2.665 3.147 3.277 3.51 3.712 3.891 3.975 4.149 4.329 4.581 4.728 4.87 5.072 5.248 5.414 5.581 5.735 5.939 6.135 6.321 6.53 6.715 6.923 7.179 7.452 7.711 7.977 8.251 8.537 8.801 9.082 9.422 9.751 10.108 10.467 10.797 11.129 11.491 11.731 11.679 11.177 10.483 9.788 9.172 8.588 8.049 7.545 7.085 6.573 6.129 5.738 5.378 5.039 4.704 4.393 4.051 3.754 3.517 3.271 2.99 2.75 2.524 2.303 2.133 1.942 1.734 1.528 1.314 1.159 1.003 0.764 0.575 0.365 0.253 0.025 -0.222 -0.489 -0.619 -1.122 -1.057 -1.2 -1.346 -1.682 -1.865 -2.065 -2.297 -2.562 -2.911 -3.332 -4.4 -6 ,4955 ,KEBNE ,17024576,Wed Dec 22 10:27:15 CET,Wed Dec 22 12:14:46 CET,0.0 0.706 1.033 1.305 1.538 1.748 1.956 2.151 2.52 2.674 2.804 2.695 3.172 3.295 3.531 3.741 3.945 4.043 4.235 4.438 4.709 4.874 5.047 5.284 5.496 5.702 5.901 6.091 6.324 6.54 6.749 6.981 7.188 7.403 7.657 7.924 8.158 8.429 8.744 9.047 9.339 9.705 10.14 10.507 10.897 11.305 11.706 12.059 12.365 12.538 12.344 11.762 11.121 10.403 9.695 9.021 8.417 7.837 7.316 6.813 6.371 5.956 5.576 5.226 4.87 4.536 4.187 3.871 3.582 3.288 2.988 2.737 2.491 2.244 2.049 1.847 1.633 1.402 1.159 0.994 0.83 0.57 0.392 0.203 0.102 -0.117 -0.356 -0.611 -0.749 -1.252 -1.196 -1.349 -1.502 -1.867 -2.068 -2.269 -2.485 -2.733 -3.033 -3.411 -4.501 -7 ,17577 ,KEBNE ,17024577,Wed Dec 22 10:28:17 CET,Wed Dec 22 12:16:40 CET,0.0 0.687 1.063 1.333 1.598 1.865 2.081 2.244 2.563 2.715 2.851 2.757 3.231 3.354 3.582 3.792 3.993 4.081 4.254 4.421 4.635 4.757 4.884 5.066 5.243 5.412 5.59 5.774 5.984 6.193 6.391 6.623 6.862 7.072 7.289 7.556 7.812 8.08 8.367 8.665 8.966 9.285 9.637 9.984 10.37 10.75 11.146 11.518 11.827 12.048 11.938 11.396 10.791 10.167 9.565 8.989 8.436 7.935 7.481 6.994 6.548 6.126 5.726 5.36 5.029 4.737 4.443 4.177 3.935 3.692 3.428 3.183 2.923 2.663 2.457 2.239 2.018 1.782 1.529 1.353 1.179 0.895 0.67 0.424 0.312 0.097 -0.132 -0.371 -0.509 -1.013 -0.934 -1.08 -1.235 -1.587 -1.8 -2.034 -2.287 -2.557 -2.871 -3.28 -5.023 -8 ,30804 ,KEBNE ,17024578,Wed Dec 22 10:28:17 CET,Wed Dec 22 12:16:33 CET,0.0 0.846 1.213 1.498 1.731 1.94 2.127 2.27 2.549 2.688 2.812 2.702 3.181 3.326 3.605 3.837 4.038 4.132 4.303 4.464 4.711 4.878 5.038 5.268 5.491 5.7 5.893 6.071 6.303 6.522 6.727 6.986 7.251 7.491 7.737 8.007 8.265 8.538 8.82 9.108 9.4 9.721 10.068 10.379 10.717 11.077 11.47 11.849 12.144 12.282 12.122 11.515 10.839 10.165 9.507 8.881 8.309 7.771 7.271 6.749 6.329 5.955 5.575 5.216 4.88 4.568 4.222 3.884 3.606 3.351 3.075 2.821 2.559 2.294 2.085 1.868 1.648 1.42 1.188 1.026 0.85 0.565 0.356 0.138 0.031 -0.193 -0.431 -0.688 -0.819 -1.314 -1.248 -1.407 -1.573 -1.916 -2.11 -2.348 -2.594 -2.84 -3.165 -3.566 -4.335 -9 ,11409 ,KEBNE ,17024579,Wed Dec 22 10:27:19 CET,Wed Dec 22 12:12:06 CET,0.0 0.6 0.911 1.208 1.441 1.634 1.815 1.983 2.305 2.44 2.567 2.483 2.973 3.089 3.311 3.538 3.739 3.826 4.002 4.188 4.46 4.635 4.799 5.019 5.235 5.425 5.61 5.811 6.048 6.265 6.462 6.701 6.937 7.149 7.393 7.664 7.937 8.233 8.55 8.877 9.212 9.588 9.948 10.274 10.648 11.019 11.408 11.731 11.982 12.188 12.16 11.624 10.967 10.291 9.603 8.927 8.318 7.763 7.257 6.727 6.282 5.881 5.476 5.096 4.744 4.424 4.083 3.762 3.489 3.212 2.922 2.66 2.393 2.144 1.949 1.729 1.505 1.28 1.028 0.852 0.673 0.371 0.159 -0.049 -0.157 -0.383 -0.621 -0.885 -1.02 -1.524 -1.484 -1.645 -1.802 -2.147 -2.329 -2.514 -2.742 -3.01 -3.329 -3.785 -5.026 -10 ,8918 ,KEBNE ,17024580,Wed Dec 22 10:27:15 CET,Wed Dec 22 12:15:16 CET,0.0 0.804 1.166 1.439 1.658 1.858 2.057 2.263 2.617 2.765 2.908 2.808 3.27 3.364 3.556 3.731 3.911 4.005 4.187 4.374 4.646 4.808 4.941 5.131 5.322 5.506 5.697 5.875 6.091 6.297 6.504 6.753 6.978 7.199 7.452 7.742 8.001 8.276 8.6 8.918 9.188 9.472 9.81 10.14 10.494 10.815 11.121 11.445 11.757 11.878 11.694 11.088 10.361 9.648 9.015 8.418 7.826 7.264 6.767 6.272 5.857 5.466 5.077 4.721 4.408 4.121 3.807 3.515 3.251 2.968 2.692 2.466 2.221 1.969 1.765 1.569 1.367 1.14 0.896 0.724 0.548 0.263 0.07 -0.131 -0.24 -0.449 -0.653 -0.901 -1.039 -1.533 -1.433 -1.583 -1.745 -2.099 -2.322 -2.567 -2.81 -3.071 -3.383 -3.823 -5.079 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index c4cf196e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,16643 ,TETRA ,17529413,Thu Nov 25 03:43:40 CET,Thu Nov 25 05:56:45 CET,0.0 2.296 2.994 3.472 3.823 4.084 4.31 4.521 4.902 5.07 5.227 5.169 5.662 5.801 6.066 6.307 6.543 6.657 6.872 7.084 7.409 7.618 7.828 8.129 8.392 8.637 8.871 9.102 9.401 9.689 9.961 10.279 10.582 10.867 11.195 11.557 11.904 12.286 12.71 13.16 13.618 14.116 14.696 15.304 15.976 16.684 17.506 18.429 19.463 20.56 21.689 22.22 22.324 22.265 22.085 21.853 21.593 21.335 21.096 20.81 20.552 20.314 20.052 19.787 19.53 19.302 19.059 18.825 18.627 18.413 18.185 17.992 17.776 17.537 17.363 17.186 16.973 16.757 16.541 16.383 16.215 15.95 15.755 15.546 15.441 15.205 14.946 14.674 14.541 14.041 14.041 13.865 13.677 13.228 12.996 12.74 12.463 12.158 11.737 11.153 8.801 -3 ,23227 ,TETRA ,17529415,Thu Nov 25 03:43:41 CET,Thu Nov 25 05:56:51 CET,0.0 1.853 2.384 2.816 3.164 3.457 3.711 3.936 4.351 4.543 4.73 4.713 5.22 5.35 5.622 5.896 6.146 6.259 6.484 6.714 7.036 7.23 7.419 7.692 7.965 8.232 8.476 8.709 8.995 9.287 9.584 9.934 10.246 10.537 10.888 11.285 11.653 12.047 12.468 12.888 13.314 13.817 14.442 15.062 15.775 16.523 17.329 18.233 19.252 20.339 21.36 21.913 22.011 21.876 21.651 21.334 21.028 20.737 20.442 20.122 19.823 19.538 19.244 18.973 18.718 18.451 18.159 17.898 17.691 17.465 17.207 16.983 16.746 16.506 16.322 16.142 15.965 15.766 15.53 15.357 15.181 14.915 14.725 14.524 14.416 14.2 13.954 13.659 13.502 12.991 12.981 12.768 12.544 12.125 11.913 11.628 11.293 10.952 10.577 10.057 7.97 -5 ,13725 ,TETRA ,17529433,Thu Nov 25 03:44:11 CET,Thu Nov 25 05:55:37 CET,0.0 1.542 2.023 2.396 2.703 2.943 3.162 3.373 3.764 3.936 4.095 4.027 4.52 4.652 4.912 5.163 5.412 5.539 5.773 6.001 6.355 6.578 6.775 7.031 7.28 7.535 7.78 8.012 8.311 8.614 8.904 9.262 9.594 9.884 10.217 10.588 10.955 11.364 11.784 12.225 12.698 13.206 13.761 14.327 14.968 15.695 16.543 17.437 18.467 19.601 20.767 21.441 21.592 21.443 21.226 20.981 20.703 20.429 20.165 19.885 19.619 19.351 19.069 18.804 18.555 18.309 18.06 17.834 17.615 17.377 17.122 16.894 16.656 16.428 16.249 16.046 15.839 15.63 15.401 15.249 15.078 14.741 14.505 14.277 14.163 13.933 13.672 13.372 13.203 12.679 12.657 12.456 12.254 11.804 11.575 11.337 11.042 10.693 10.213 9.5 6.837 -7 ,1745 ,TETRA ,17529445,Thu Nov 25 03:44:14 CET,Thu Nov 25 05:53:20 CET,0.0 1.15 1.648 2.026 2.321 2.595 2.861 3.118 3.564 3.75 3.935 3.916 4.418 4.562 4.835 5.104 5.363 5.488 5.726 5.951 6.274 6.489 6.708 7.012 7.294 7.57 7.828 8.075 8.386 8.66 8.941 9.301 9.622 9.942 10.309 10.672 11.017 11.429 11.853 12.283 12.74 13.276 13.904 14.488 15.149 15.901 16.787 17.746 18.778 19.904 21.175 21.98 22.17 22.11 21.933 21.661 21.361 21.03 20.735 20.447 20.181 19.91 19.635 19.393 19.15 18.914 18.671 18.432 18.215 18.01 17.787 17.581 17.38 17.162 16.977 16.792 16.595 16.372 16.125 15.941 15.759 15.492 15.296 15.082 14.971 14.73 14.481 14.23 14.098 13.608 13.636 13.459 13.232 12.761 12.537 12.26 11.951 11.617 11.114 10.447 8.402 -9 ,9476 ,TETRA ,17529449,Thu Nov 25 03:44:11 CET,Thu Nov 25 05:51:11 CET,0.0 1.1 1.597 2.036 2.379 2.661 2.925 3.179 3.606 3.79 3.959 3.922 4.448 4.608 4.906 5.167 5.411 5.531 5.77 6.004 6.326 6.528 6.724 7.014 7.291 7.546 7.803 8.046 8.334 8.617 8.901 9.228 9.536 9.85 10.213 10.619 11.002 11.416 11.868 12.355 12.875 13.425 14.008 14.593 15.28 16.012 16.844 17.758 18.741 19.82 20.967 21.664 21.79 21.674 21.457 21.185 20.883 20.531 20.186 19.86 19.606 19.36 19.096 18.849 18.596 18.353 18.114 17.888 17.677 17.461 17.229 17.022 16.799 16.552 16.362 16.169 15.936 15.692 15.44 15.267 15.085 14.786 14.573 14.346 14.24 14.003 13.734 13.466 13.331 12.838 12.871 12.707 12.522 12.095 11.85 11.589 11.315 10.978 10.55 9.957 7.727 -10 ,14567 ,TETRA ,17529451,Thu Nov 25 03:44:11 CET,Thu Nov 25 05:55:03 CET,0.0 1.652 2.204 2.596 2.89 3.148 3.381 3.589 3.97 4.166 4.343 4.293 4.804 4.951 5.217 5.463 5.691 5.796 6.01 6.21 6.476 6.661 6.859 7.142 7.4 7.651 7.899 8.147 8.465 8.758 9.045 9.393 9.703 10.003 10.356 10.74 11.117 11.522 11.949 12.395 12.843 13.352 13.959 14.579 15.277 15.985 16.777 17.662 18.683 19.823 21.01 21.729 21.973 21.963 21.791 21.545 21.259 20.952 20.656 20.343 20.07 19.827 19.587 19.324 19.07 18.812 18.526 18.294 18.083 17.857 17.623 17.417 17.198 16.974 16.811 16.637 16.437 16.224 15.945 15.723 15.53 15.251 15.044 14.828 14.705 14.449 14.176 13.898 13.749 13.224 13.171 12.969 12.775 12.331 12.088 11.835 11.519 11.126 10.728 10.168 7.469 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index 10b6d75c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5581 ,TETRA ,17529466,Thu Nov 25 03:44:11 CET,Thu Nov 25 05:50:38 CET,0.0 1.189 1.712 2.144 2.531 2.88 3.204 3.509 4.089 4.357 4.606 4.643 5.314 5.537 5.979 6.412 6.841 7.049 7.435 7.809 8.356 8.703 9.045 9.546 10.03 10.494 10.949 11.397 11.988 12.565 13.139 13.87 14.583 15.248 16.023 16.901 17.743 18.708 19.754 20.866 22.066 23.445 25.085 26.752 28.719 30.981 33.623 36.735 40.563 45.263 51.208 56.305 59.466 61.547 63.002 64.044 64.737 65.213 65.501 65.711 65.837 65.906 65.926 65.909 65.867 65.779 65.673 65.591 65.493 65.348 65.154 64.98 64.818 64.636 64.478 64.322 64.15 63.955 63.717 63.539 63.358 63.034 62.8 62.567 62.448 62.189 61.894 61.542 61.36 60.81 60.788 60.561 60.324 59.821 59.521 59.21 58.857 58.425 57.902 57.167 54.974 -2 ,5219 ,TETRA ,17529468,Thu Nov 25 03:44:11 CET,Thu Nov 25 05:55:49 CET,0.0 1.293 1.89 2.351 2.719 3.056 3.37 3.665 4.257 4.545 4.795 4.833 5.489 5.701 6.126 6.55 6.958 7.155 7.542 7.913 8.454 8.805 9.151 9.653 10.134 10.607 11.068 11.513 12.092 12.648 13.201 13.895 14.563 15.204 15.949 16.825 17.695 18.629 19.662 20.803 21.984 23.344 24.956 26.588 28.548 30.802 33.489 36.637 40.484 45.271 51.38 56.578 59.658 61.592 62.879 63.835 64.491 64.926 65.212 65.441 65.551 65.568 65.558 65.533 65.49 65.428 65.321 65.193 65.098 64.977 64.812 64.674 64.495 64.273 64.108 63.921 63.718 63.498 63.238 63.051 62.86 62.58 62.38 62.154 62.042 61.8 61.514 61.218 61.059 60.503 60.459 60.245 60.022 59.509 59.211 58.875 58.471 57.971 57.41 56.743 54.828 -3 ,26670 ,TETRA ,17529475,Thu Nov 25 03:44:11 CET,Thu Nov 25 05:56:09 CET,0.0 1.377 1.973 2.416 2.8 3.15 3.51 3.85 4.402 4.654 4.906 4.968 5.652 5.881 6.317 6.743 7.151 7.349 7.75 8.149 8.747 9.115 9.476 10.008 10.509 10.995 11.462 11.911 12.493 13.065 13.623 14.295 14.964 15.619 16.374 17.25 18.143 19.135 20.191 21.366 22.622 24.048 25.744 27.449 29.466 31.764 34.525 37.759 41.611 46.236 52.185 57.379 60.473 62.496 63.822 64.722 65.325 65.784 66.111 66.338 66.47 66.535 66.566 66.559 66.481 66.366 66.241 66.103 65.966 65.822 65.657 65.516 65.378 65.185 65.014 64.848 64.658 64.451 64.215 64.046 63.887 63.597 63.361 63.107 62.973 62.707 62.419 62.112 61.963 61.437 61.432 61.216 60.954 60.399 60.14 59.839 59.443 58.956 58.397 57.594 55.414 -6 ,13398 ,TETRA ,17529484,Thu Nov 25 03:44:15 CET,Thu Nov 25 05:53:56 CET,0.0 1.311 1.951 2.45 2.842 3.195 3.553 3.895 4.482 4.754 5.028 5.122 5.806 6.039 6.485 6.895 7.298 7.495 7.9 8.299 8.864 9.228 9.577 10.097 10.6 11.072 11.533 11.976 12.552 13.123 13.672 14.356 15.043 15.705 16.464 17.317 18.157 19.114 20.159 21.27 22.44 23.768 25.369 27.037 29.029 31.323 34.085 37.316 41.194 45.88 51.691 56.695 59.775 61.748 63.036 63.923 64.528 64.979 65.275 65.463 65.517 65.524 65.514 65.486 65.413 65.324 65.24 65.118 64.988 64.835 64.657 64.509 64.345 64.166 64.019 63.855 63.675 63.485 63.269 63.098 62.917 62.633 62.408 62.176 62.065 61.806 61.514 61.215 61.051 60.505 60.503 60.284 60.061 59.578 59.275 58.906 58.515 58.1 57.576 56.836 53.614 -7 ,9949 ,TETRA ,17529495,Thu Nov 25 03:44:17 CET,Thu Nov 25 06:01:10 CET,0.0 0.929 1.434 1.895 2.295 2.636 2.969 3.289 3.834 4.095 4.355 4.41 5.082 5.301 5.724 6.132 6.533 6.739 7.138 7.506 8.053 8.416 8.768 9.274 9.773 10.267 10.751 11.235 11.869 12.49 13.091 13.809 14.493 15.13 15.892 16.784 17.631 18.599 19.68 20.835 22.059 23.42 25.037 26.72 28.755 31.063 33.748 36.862 40.678 45.318 51.152 56.166 59.242 61.288 62.639 63.613 64.284 64.738 65.031 65.253 65.388 65.426 65.414 65.388 65.355 65.303 65.203 65.048 64.887 64.725 64.553 64.403 64.243 64.057 63.904 63.739 63.552 63.345 63.106 62.92 62.715 62.412 62.209 61.969 61.836 61.565 61.251 60.884 60.694 60.133 60.092 59.868 59.631 59.106 58.829 58.516 58.149 57.728 57.147 56.286 53.836 -8 ,7463 ,TETRA ,17529496,Thu Nov 25 03:44:13 CET,Thu Nov 25 06:00:30 CET,0.0 1.167 1.691 2.123 2.509 2.849 3.156 3.435 3.956 4.202 4.443 4.482 5.149 5.377 5.823 6.243 6.657 6.858 7.252 7.624 8.161 8.525 8.888 9.401 9.875 10.347 10.831 11.307 11.914 12.484 13.031 13.709 14.358 15.004 15.783 16.652 17.487 18.413 19.445 20.591 21.812 23.196 24.812 26.484 28.502 30.791 33.407 36.445 40.204 44.821 50.644 55.7 58.823 60.865 62.252 63.205 63.829 64.268 64.567 64.785 64.918 65.004 65.019 65.008 64.977 64.911 64.83 64.707 64.585 64.457 64.284 64.122 63.957 63.766 63.614 63.451 63.258 63.056 62.826 62.65 62.458 62.158 61.936 61.706 61.583 61.322 61.054 60.754 60.594 60.05 60.029 59.785 59.511 58.962 58.654 58.326 57.968 57.543 57.057 56.385 54.44 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt deleted file mode 100644 index e3b40f84..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9277 ,TETRA ,17529526,Thu Nov 25 03:44:15 CET,Thu Nov 25 05:53:16 CET,0.0 1.671 2.328 2.78 3.153 3.477 3.807 4.116 4.623 4.855 5.089 5.095 5.725 5.899 6.214 6.515 6.809 6.955 7.253 7.524 7.87 8.064 8.246 8.531 8.8 9.046 9.286 9.515 9.815 10.103 10.358 10.635 10.886 11.131 11.415 11.702 11.945 12.199 12.452 12.707 12.96 13.179 13.343 13.467 13.599 13.635 13.523 13.21 12.396 10.836 8.008 4.505 1.466 -1.207 -3.501 -5.524 -7.309 -8.897 -10.24 -11.579 -12.758 -13.816 -14.801 -15.739 -16.601 -17.383 -18.223 -18.966 -19.599 -20.261 -20.935 -21.484 -22.049 -22.642 -23.111 -23.585 -24.073 -24.582 -25.115 -25.47 -25.841 -26.457 -26.883 -27.308 -27.518 -27.95 -28.421 -28.919 -29.183 -29.937 -30.036 -30.346 -30.672 -31.347 -31.717 -32.12 -32.564 -33.079 -33.648 -34.382 -36.314 -2 ,20825 ,TETRA ,17529530,Thu Nov 25 03:44:17 CET,Thu Nov 25 05:57:48 CET,0.0 2.153 2.881 3.4 3.83 4.184 4.486 4.752 5.199 5.399 5.602 5.596 6.23 6.397 6.708 7.025 7.353 7.495 7.751 8.023 8.386 8.589 8.786 9.06 9.316 9.569 9.831 10.076 10.387 10.692 10.954 11.234 11.494 11.752 12.043 12.346 12.619 12.911 13.21 13.455 13.669 13.867 14.024 14.145 14.214 14.206 14.047 13.599 12.757 11.395 8.86 5.222 2.037 -0.733 -3.063 -5.071 -6.854 -8.418 -9.735 -11.078 -12.218 -13.241 -14.245 -15.196 -16.039 -16.776 -17.591 -18.356 -19.004 -19.653 -20.328 -20.9 -21.473 -22.071 -22.556 -23.043 -23.529 -24.042 -24.581 -24.956 -25.346 -25.951 -26.373 -26.816 -27.044 -27.491 -27.957 -28.46 -28.723 -29.487 -29.634 -29.955 -30.289 -31.029 -31.431 -31.843 -32.275 -32.76 -33.351 -34.095 -36.027 -3 ,32335 ,TETRA ,17529544,Thu Nov 25 03:44:16 CET,Thu Nov 25 05:58:09 CET,0.0 2.002 2.686 3.199 3.657 4.005 4.338 4.671 5.24 5.488 5.721 5.752 6.404 6.592 6.929 7.258 7.589 7.753 8.071 8.348 8.709 8.942 9.179 9.516 9.827 10.151 10.456 10.729 11.072 11.377 11.666 12.016 12.351 12.65 12.984 13.363 13.711 14.083 14.428 14.741 15.037 15.305 15.525 15.71 15.866 15.948 15.871 15.553 14.825 13.451 10.817 7.313 4.31 1.624 -0.696 -2.792 -4.597 -6.186 -7.552 -8.935 -10.111 -11.112 -12.065 -12.982 -13.838 -14.616 -15.419 -16.124 -16.729 -17.366 -18.035 -18.594 -19.172 -19.757 -20.206 -20.674 -21.169 -21.701 -22.252 -22.612 -22.976 -23.569 -23.98 -24.412 -24.646 -25.123 -25.612 -26.132 -26.396 -27.148 -27.263 -27.567 -27.872 -28.569 -28.98 -29.42 -29.896 -30.411 -30.988 -31.771 -33.802 -5 ,7338 ,TETRA ,17529568,Thu Nov 25 03:44:14 CET,Thu Nov 25 05:56:22 CET,0.0 1.466 2.088 2.594 2.989 3.337 3.681 4.008 4.574 4.844 5.088 5.061 5.68 5.854 6.218 6.57 6.864 7.009 7.316 7.586 7.952 8.195 8.414 8.699 8.982 9.242 9.495 9.732 10.013 10.286 10.541 10.861 11.17 11.43 11.695 11.975 12.248 12.54 12.811 13.064 13.326 13.593 13.841 14.065 14.235 14.258 14.101 13.664 12.846 11.423 8.729 5.045 1.932 -0.681 -2.938 -4.96 -6.7 -8.276 -9.671 -11.057 -12.26 -13.328 -14.334 -15.29 -16.169 -16.948 -17.745 -18.465 -19.102 -19.742 -20.412 -20.97 -21.529 -22.129 -22.582 -23.04 -23.535 -24.034 -24.553 -24.924 -25.307 -25.91 -26.334 -26.764 -26.971 -27.38 -27.84 -28.338 -28.59 -29.333 -29.467 -29.781 -30.102 -30.822 -31.22 -31.633 -32.075 -32.591 -33.21 -34.001 -36.283 -6 ,28976 ,TETRA ,17529570,Thu Nov 25 03:44:13 CET,Thu Nov 25 05:54:44 CET,0.0 1.918 2.578 3.111 3.546 3.932 4.291 4.61 5.135 5.374 5.611 5.648 6.312 6.513 6.868 7.193 7.503 7.657 7.938 8.194 8.548 8.777 9.006 9.314 9.585 9.863 10.149 10.424 10.723 10.992 11.264 11.545 11.846 12.161 12.475 12.789 13.064 13.327 13.565 13.797 14.054 14.32 14.54 14.709 14.892 15.047 15.037 14.78 14.113 12.748 9.98 6.25 3.104 0.437 -1.841 -3.866 -5.641 -7.201 -8.486 -9.786 -10.939 -11.959 -12.909 -13.788 -14.617 -15.38 -16.193 -16.944 -17.582 -18.22 -18.875 -19.404 -19.948 -20.536 -20.996 -21.467 -21.948 -22.443 -22.962 -23.322 -23.697 -24.297 -24.707 -25.114 -25.322 -25.774 -26.242 -26.695 -26.934 -27.664 -27.768 -28.068 -28.376 -29.069 -29.476 -29.92 -30.401 -30.958 -31.581 -32.343 -34.004 -7 ,8870 ,TETRA ,17529572,Thu Nov 25 03:44:16 CET,Thu Nov 25 05:58:00 CET,0.0 1.751 2.486 2.98 3.337 3.665 3.98 4.292 4.828 5.052 5.274 5.267 5.919 6.122 6.471 6.796 7.104 7.241 7.503 7.772 8.162 8.383 8.599 8.93 9.231 9.513 9.765 9.994 10.272 10.537 10.811 11.15 11.42 11.658 11.973 12.261 12.488 12.768 13.051 13.317 13.585 13.845 14.08 14.249 14.34 14.281 14.074 13.702 12.891 11.399 8.616 4.95 1.857 -0.774 -3.017 -5.025 -6.8 -8.427 -9.805 -11.147 -12.343 -13.406 -14.377 -15.309 -16.168 -16.929 -17.709 -18.399 -19.008 -19.642 -20.3 -20.829 -21.387 -21.998 -22.46 -22.928 -23.414 -23.926 -24.459 -24.822 -25.202 -25.789 -26.193 -26.619 -26.842 -27.301 -27.778 -28.296 -28.559 -29.297 -29.432 -29.765 -30.097 -30.833 -31.252 -31.694 -32.174 -32.679 -33.264 -34.091 -36.41 -8 ,4567 ,TETRA ,17529580,Thu Nov 25 03:44:14 CET,Thu Nov 25 05:58:10 CET,0.0 2.451 3.229 3.764 4.146 4.494 4.837 5.135 5.641 5.88 6.103 6.12 6.772 6.979 7.358 7.695 7.993 8.124 8.367 8.602 8.953 9.172 9.38 9.684 9.971 10.227 10.461 10.686 10.978 11.269 11.545 11.837 12.099 12.341 12.614 12.927 13.195 13.473 13.77 14.047 14.27 14.478 14.697 14.825 14.879 14.873 14.689 14.277 13.523 12.064 9.141 5.226 2.016 -0.649 -2.904 -4.915 -6.677 -8.269 -9.637 -10.965 -12.093 -13.105 -14.06 -14.972 -15.829 -16.607 -17.405 -18.09 -18.699 -19.357 -20.039 -20.599 -21.18 -21.782 -22.247 -22.73 -23.224 -23.735 -24.28 -24.673 -25.065 -25.633 -26.043 -26.478 -26.695 -27.134 -27.601 -28.105 -28.375 -29.138 -29.264 -29.595 -29.927 -30.644 -31.062 -31.509 -31.988 -32.485 -33.052 -33.804 -35.757 -9 ,7997 ,TETRA ,17529582,Thu Nov 25 03:44:15 CET,Thu Nov 25 05:57:40 CET,0.0 2.257 2.902 3.319 3.678 3.987 4.26 4.539 5.031 5.245 5.444 5.368 5.964 6.121 6.426 6.725 7.044 7.197 7.464 7.72 8.094 8.327 8.554 8.857 9.141 9.426 9.688 9.923 10.207 10.478 10.739 11.037 11.299 11.547 11.814 12.105 12.392 12.685 12.955 13.201 13.46 13.703 13.949 14.171 14.308 14.39 14.327 13.974 13.239 11.92 9.355 5.804 2.777 0.115 -2.171 -4.155 -5.887 -7.443 -8.799 -10.156 -11.295 -12.331 -13.343 -14.272 -15.12 -15.893 -16.699 -17.419 -18.036 -18.668 -19.309 -19.84 -20.394 -20.971 -21.429 -21.923 -22.43 -22.933 -23.456 -23.818 -24.18 -24.743 -25.127 -25.533 -25.75 -26.2 -26.669 -27.143 -27.39 -28.11 -28.179 -28.473 -28.779 -29.46 -29.83 -30.232 -30.67 -31.176 -31.817 -32.637 -34.564 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt deleted file mode 100644 index 473e8e38..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10353 ,TETRA ,17529586,Thu Nov 25 03:44:17 CET,Thu Nov 25 05:55:38 CET,0.0 1.964 2.667 3.243 3.762 4.198 4.574 4.945 5.667 5.995 6.304 6.446 7.161 7.43 7.947 8.446 8.934 9.155 9.581 10.005 10.611 11.006 11.391 11.951 12.495 13.016 13.518 14.015 14.668 15.318 15.956 16.712 17.438 18.139 18.934 19.814 20.694 21.705 22.799 23.958 25.223 26.689 28.4 30.118 32.123 34.38 37.06 40.167 43.819 48.246 53.78 58.385 61.07 62.757 63.821 64.495 64.91 65.195 65.347 65.369 65.325 65.274 65.188 65.072 64.93 64.759 64.547 64.318 64.1 63.889 63.684 63.507 63.312 63.095 62.91 62.688 62.432 62.172 61.889 61.677 61.463 61.14 60.89 60.616 60.478 60.169 59.818 59.422 59.217 58.632 58.604 58.355 58.079 57.498 57.164 56.767 56.293 55.745 55.091 54.269 51.285 -2 ,30821 ,TETRA ,17529599,Thu Nov 25 03:44:15 CET,Thu Nov 25 05:54:14 CET,0.0 1.741 2.445 3.024 3.469 3.852 4.203 4.543 5.193 5.501 5.792 5.89 6.575 6.823 7.297 7.746 8.206 8.43 8.844 9.247 9.845 10.23 10.6 11.158 11.693 12.207 12.721 13.226 13.879 14.52 15.139 15.879 16.605 17.304 18.1 19.014 19.899 20.87 21.926 23.067 24.342 25.822 27.534 29.22 31.209 33.495 36.213 39.381 43.088 47.518 52.977 57.458 60.06 61.695 62.79 63.528 63.934 64.167 64.311 64.391 64.407 64.373 64.279 64.153 64.025 63.857 63.622 63.39 63.2 63.007 62.801 62.61 62.388 62.145 61.942 61.733 61.502 61.252 61.008 60.825 60.606 60.257 60.035 59.797 59.661 59.363 59.037 58.709 58.529 57.947 57.913 57.678 57.424 56.866 56.554 56.189 55.756 55.254 54.649 53.854 51.468 -3 ,17579 ,TETRA ,17529600,Thu Nov 25 03:44:14 CET,Thu Nov 25 05:57:21 CET,0.0 1.743 2.484 3.047 3.478 3.864 4.228 4.581 5.231 5.531 5.827 5.956 6.658 6.907 7.405 7.879 8.31 8.526 8.951 9.355 9.958 10.341 10.703 11.236 11.764 12.26 12.756 13.256 13.879 14.47 15.051 15.774 16.476 17.152 17.926 18.819 19.71 20.691 21.755 22.898 24.115 25.48 27.107 28.783 30.762 33.009 35.61 38.683 42.44 46.884 52.413 57.066 59.695 61.304 62.339 62.99 63.388 63.626 63.737 63.759 63.711 63.648 63.558 63.408 63.21 63.012 62.802 62.584 62.386 62.172 61.928 61.725 61.502 61.257 61.046 60.812 60.575 60.306 60.011 59.812 59.605 59.257 58.997 58.706 58.557 58.256 57.935 57.591 57.41 56.841 56.782 56.546 56.303 55.752 55.439 55.062 54.579 54.038 53.45 52.565 49.709 -4 ,21807 ,TETRA ,17529610,Thu Nov 25 03:44:43 CET,Thu Nov 25 05:55:30 CET,0.0 1.48 2.122 2.67 3.152 3.577 3.947 4.278 4.918 5.226 5.507 5.603 6.308 6.562 7.069 7.547 7.969 8.174 8.615 9.055 9.69 10.1 10.494 11.063 11.596 12.096 12.583 13.077 13.73 14.369 14.997 15.735 16.427 17.098 17.897 18.801 19.694 20.679 21.773 22.985 24.23 25.597 27.199 28.861 30.903 33.193 35.749 38.725 42.35 46.68 52.128 56.716 59.303 60.919 61.983 62.74 63.213 63.408 63.456 63.459 63.429 63.371 63.257 63.115 62.931 62.76 62.578 62.381 62.191 61.971 61.748 61.557 61.315 61.041 60.822 60.58 60.319 60.024 59.721 59.524 59.312 58.956 58.682 58.378 58.226 57.93 57.617 57.294 57.111 56.514 56.446 56.187 55.916 55.326 54.956 54.535 54.099 53.583 52.94 52.055 49.106 -7 ,12669 ,TETRA ,17529643,Thu Nov 25 03:44:43 CET,Thu Nov 25 05:57:06 CET,0.0 1.469 2.188 2.716 3.167 3.61 3.999 4.333 4.933 5.217 5.494 5.586 6.266 6.508 6.963 7.396 7.815 8.027 8.447 8.842 9.428 9.817 10.193 10.751 11.297 11.812 12.301 12.788 13.422 14.037 14.643 15.359 16.066 16.755 17.544 18.437 19.306 20.285 21.368 22.529 23.756 25.162 26.843 28.577 30.596 32.859 35.535 38.628 42.343 46.739 52.039 56.566 59.258 60.878 61.929 62.648 63.083 63.322 63.454 63.539 63.525 63.439 63.318 63.196 63.061 62.905 62.724 62.534 62.352 62.151 61.931 61.755 61.538 61.281 61.092 60.879 60.637 60.37 60.09 59.895 59.691 59.357 59.095 58.811 58.666 58.356 58.025 57.665 57.471 56.906 56.879 56.655 56.431 55.904 55.545 55.126 54.713 54.267 53.707 52.899 49.888 -8 ,37 ,TETRA ,17529650,Thu Nov 25 03:44:43 CET,Thu Nov 25 05:55:41 CET,0.0 1.997 2.748 3.287 3.723 4.096 4.442 4.792 5.461 5.761 6.051 6.178 6.891 7.154 7.657 8.115 8.565 8.793 9.228 9.641 10.224 10.599 10.971 11.499 12.017 12.529 13.007 13.49 14.139 14.755 15.345 16.061 16.79 17.501 18.287 19.186 20.054 20.998 22.033 23.125 24.317 25.71 27.363 29.051 31.004 33.211 35.827 38.888 42.586 46.978 52.283 56.734 59.38 61.012 62.068 62.741 63.115 63.407 63.566 63.615 63.573 63.501 63.406 63.249 63.094 62.934 62.731 62.528 62.329 62.113 61.867 61.645 61.421 61.157 60.95 60.736 60.468 60.189 59.922 59.719 59.487 59.126 58.879 58.634 58.498 58.2 57.89 57.559 57.383 56.807 56.758 56.525 56.287 55.731 55.415 55.092 54.688 54.151 53.529 52.699 50.418 -9 ,10433 ,TETRA ,17529659,Thu Nov 25 03:44:43 CET,Thu Nov 25 05:57:32 CET,0.0 1.811 2.549 3.085 3.542 3.982 4.343 4.661 5.3 5.61 5.915 6.039 6.753 7.021 7.542 8.031 8.489 8.708 9.13 9.54 10.115 10.487 10.854 11.387 11.916 12.439 12.962 13.451 14.061 14.677 15.292 16.057 16.795 17.489 18.281 19.188 20.058 21.034 22.135 23.307 24.528 25.916 27.561 29.198 31.18 33.495 36.173 39.245 42.945 47.4 52.858 57.358 59.93 61.489 62.498 63.232 63.734 63.999 64.088 64.1 64.062 63.965 63.839 63.729 63.599 63.435 63.216 63.003 62.8 62.564 62.304 62.078 61.838 61.561 61.325 61.091 60.86 60.61 60.33 60.124 59.899 59.546 59.3 59.051 58.912 58.583 58.256 57.884 57.668 57.079 57.036 56.791 56.53 55.932 55.59 55.237 54.864 54.424 53.819 52.982 50.044 -10 ,26752 ,TETRA ,17529674,Thu Nov 25 03:44:46 CET,Thu Nov 25 05:57:56 CET,0.0 1.798 2.518 3.054 3.544 3.952 4.302 4.646 5.29 5.593 5.889 5.994 6.692 6.942 7.405 7.86 8.323 8.543 8.961 9.369 9.948 10.326 10.702 11.262 11.802 12.307 12.813 13.327 13.967 14.586 15.212 15.949 16.652 17.362 18.215 19.165 20.042 21.006 22.075 23.231 24.456 25.865 27.561 29.324 31.361 33.577 36.209 39.215 42.817 47.306 53.004 57.767 60.57 62.306 63.391 64.132 64.58 64.818 64.919 64.954 64.919 64.845 64.736 64.592 64.441 64.288 64.084 63.85 63.643 63.426 63.166 62.928 62.688 62.444 62.244 62.022 61.797 61.557 61.298 61.117 60.895 60.509 60.259 60.002 59.851 59.531 59.2 58.833 58.633 58.044 57.974 57.736 57.473 56.875 56.548 56.148 55.677 55.139 54.49 53.617 51.207 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index 307f3732..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,11861 ,TETRA ,17529709,Thu Nov 25 03:44:45 CET,Thu Nov 25 05:53:30 CET,0.0 1.16 1.756 2.228 2.647 3.056 3.421 3.765 4.443 4.752 5.04 5.117 5.861 6.11 6.596 7.074 7.544 7.775 8.227 8.661 9.29 9.698 10.094 10.673 11.233 11.799 12.362 12.911 13.641 14.35 15.027 15.84 16.655 17.468 18.417 19.497 20.578 21.813 23.177 24.672 26.255 28.049 30.199 32.45 35.202 38.407 42.226 46.685 52.133 58.968 67.986 76.287 81.708 85.482 88.154 90.166 91.701 92.854 93.704 94.459 95.012 95.414 95.734 96.026 96.272 96.469 96.65 96.77 96.829 96.861 96.874 96.893 96.89 96.853 96.823 96.793 96.731 96.638 96.545 96.472 96.395 96.233 96.098 95.957 95.874 95.679 95.48 95.296 95.185 94.68 94.786 94.632 94.471 94.129 93.929 93.658 93.315 92.93 92.447 91.665 88.637 -3 ,17525 ,TETRA ,17529711,Thu Nov 25 03:44:43 CET,Thu Nov 25 05:55:44 CET,0.0 1.371 1.953 2.445 2.878 3.293 3.705 4.063 4.706 5.005 5.291 5.362 6.088 6.352 6.892 7.368 7.826 8.052 8.499 8.958 9.641 10.074 10.491 11.103 11.709 12.311 12.893 13.45 14.191 14.905 15.597 16.473 17.317 18.122 19.085 20.191 21.244 22.436 23.753 25.173 26.711 28.506 30.662 32.88 35.575 38.693 42.427 46.844 52.32 59.263 68.496 76.845 82.24 85.982 88.639 90.673 92.221 93.467 94.421 95.275 95.899 96.345 96.726 97.069 97.352 97.563 97.727 97.854 97.958 98.031 98.081 98.094 98.063 98.035 98.013 97.978 97.924 97.844 97.756 97.7 97.625 97.452 97.32 97.178 97.11 96.946 96.733 96.522 96.393 95.866 95.939 95.809 95.647 95.23 94.98 94.726 94.434 94.06 93.607 92.916 90.807 -4 ,12073 ,TETRA ,17529720,Thu Nov 25 03:44:45 CET,Thu Nov 25 05:55:57 CET,0.0 1.142 1.723 2.183 2.56 2.922 3.264 3.589 4.194 4.485 4.778 4.842 5.581 5.828 6.301 6.754 7.195 7.419 7.861 8.29 8.895 9.292 9.691 10.276 10.841 11.405 11.98 12.527 13.242 13.95 14.644 15.505 16.341 17.153 18.105 19.189 20.254 21.445 22.768 24.208 25.778 27.614 29.782 32.009 34.679 37.773 41.467 45.821 51.286 58.229 67.221 75.329 80.547 84.211 86.887 88.913 90.483 91.726 92.677 93.491 94.063 94.484 94.816 95.094 95.319 95.491 95.675 95.818 95.899 95.966 95.992 95.984 95.985 95.965 95.925 95.874 95.808 95.707 95.601 95.538 95.448 95.271 95.122 94.98 94.915 94.758 94.595 94.412 94.299 93.804 93.902 93.742 93.575 93.192 92.977 92.725 92.436 92.097 91.661 91.002 89.063 -10 ,27135 ,TETRA ,17529739,Thu Nov 25 03:44:45 CET,Thu Nov 25 05:54:20 CET,0.0 1.083 1.638 2.128 2.564 2.958 3.334 3.67 4.288 4.587 4.858 4.906 5.649 5.909 6.413 6.896 7.359 7.583 8.026 8.459 9.101 9.521 9.925 10.5 11.066 11.628 12.18 12.72 13.427 14.142 14.84 15.682 16.495 17.286 18.225 19.316 20.372 21.559 22.904 24.362 25.916 27.726 29.923 32.17 34.831 37.919 41.654 46.072 51.593 58.553 67.65 75.937 81.361 85.14 87.869 90.022 91.658 92.902 93.82 94.65 95.251 95.686 96.042 96.324 96.553 96.75 96.9 96.989 97.07 97.137 97.185 97.202 97.16 97.098 97.069 97.031 96.977 96.902 96.798 96.718 96.628 96.449 96.312 96.177 96.098 95.926 95.771 95.586 95.469 94.98 95.122 94.993 94.831 94.404 94.176 93.924 93.61 93.267 92.842 92.259 90.341 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_18639-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_18639-1.txt deleted file mode 100644 index 153e4d94..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18638-1_18639-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9103 ,KEBNE ,17024581,Wed Dec 22 10:27:15 CET,Wed Dec 22 12:16:40 CET,0.0 1.425 2.06 2.535 2.965 3.346 3.698 4.036 4.679 4.987 5.301 5.437 6.191 6.466 6.992 7.479 7.945 8.185 8.656 9.111 9.786 10.222 10.644 11.274 11.885 12.472 13.043 13.604 14.336 15.059 15.775 16.642 17.482 18.306 19.286 20.403 21.492 22.719 24.059 25.505 27.051 28.815 30.941 33.179 35.834 38.847 42.475 46.733 51.988 58.552 67.085 74.793 79.803 83.345 85.778 87.537 88.829 89.881 90.731 91.445 91.971 92.404 92.74 92.992 93.176 93.302 93.421 93.512 93.547 93.563 93.564 93.522 93.453 93.359 93.293 93.232 93.149 93.023 92.867 92.755 92.635 92.462 92.349 92.216 92.139 91.977 91.804 91.603 91.491 90.996 91.102 90.936 90.755 90.315 90.065 89.765 89.411 89.015 88.514 87.744 85.474 -2 ,30507 ,KEBNE ,17024582,Wed Dec 22 10:27:15 CET,Wed Dec 22 12:16:41 CET,0.0 1.554 2.217 2.746 3.203 3.618 4.015 4.396 5.065 5.366 5.653 5.711 6.453 6.72 7.262 7.789 8.283 8.52 8.984 9.441 10.111 10.539 10.967 11.597 12.19 12.777 13.352 13.914 14.66 15.387 16.081 16.919 17.762 18.591 19.575 20.724 21.831 23.042 24.344 25.766 27.275 29.067 31.295 33.567 36.24 39.278 42.896 47.177 52.469 59.111 67.73 75.449 80.471 83.94 86.386 88.28 89.702 90.784 91.576 92.196 92.605 92.936 93.248 93.5 93.705 93.851 93.953 94.02 94.044 94.038 93.992 93.935 93.867 93.777 93.715 93.651 93.563 93.451 93.303 93.193 93.093 92.92 92.769 92.606 92.52 92.328 92.115 91.868 91.729 91.204 91.263 91.089 90.911 90.498 90.242 89.941 89.593 89.208 88.71 87.932 85.376 -3 ,7389 ,KEBNE ,17024583,Wed Dec 22 10:27:15 CET,Wed Dec 22 12:16:22 CET,0.0 1.715 2.413 2.939 3.376 3.783 4.143 4.469 5.104 5.409 5.709 5.802 6.552 6.826 7.336 7.838 8.34 8.58 9.033 9.483 10.15 10.574 10.977 11.57 12.161 12.746 13.32 13.883 14.62 15.34 16.031 16.857 17.694 18.533 19.488 20.59 21.691 22.91 24.256 25.721 27.26 29.01 31.138 33.33 35.944 38.987 42.645 46.921 52.147 58.657 67.145 74.709 79.577 83.026 85.452 87.228 88.468 89.402 90.106 90.735 91.22 91.573 91.868 92.111 92.29 92.417 92.545 92.654 92.681 92.661 92.635 92.589 92.534 92.439 92.357 92.286 92.188 92.091 91.98 91.879 91.76 91.557 91.418 91.265 91.173 90.987 90.803 90.573 90.439 89.917 89.98 89.816 89.63 89.185 88.958 88.724 88.449 88.058 87.522 86.755 83.941 -4 ,29037 ,KEBNE ,17024584,Wed Dec 22 10:28:17 CET,Wed Dec 22 12:17:34 CET,0.0 1.424 2.108 2.682 3.184 3.605 3.985 4.372 5.098 5.427 5.75 5.894 6.674 6.966 7.533 8.073 8.582 8.827 9.297 9.743 10.383 10.815 11.241 11.884 12.486 13.055 13.625 14.197 14.947 15.676 16.399 17.313 18.205 19.043 20.02 21.121 22.206 23.425 24.761 26.219 27.789 29.591 31.744 33.962 36.618 39.696 43.368 47.693 52.974 59.571 68.007 75.527 80.488 83.903 86.289 88.16 89.548 90.569 91.348 92.019 92.466 92.802 93.11 93.348 93.492 93.587 93.688 93.759 93.782 93.772 93.751 93.744 93.718 93.642 93.571 93.483 93.371 93.246 93.095 92.991 92.884 92.683 92.536 92.384 92.3 92.13 91.941 91.721 91.609 91.109 91.218 91.061 90.884 90.458 90.214 89.94 89.595 89.231 88.801 88.133 86.122 -5 ,5957 ,KEBNE ,17024585,Wed Dec 22 10:28:17 CET,Wed Dec 22 12:18:41 CET,0.0 1.39 2.015 2.504 2.902 3.28 3.667 4.03 4.665 4.958 5.244 5.338 6.092 6.36 6.901 7.447 7.951 8.189 8.648 9.093 9.749 10.178 10.594 11.208 11.808 12.385 12.949 13.506 14.232 14.93 15.609 16.45 17.29 18.124 19.092 20.177 21.26 22.493 23.841 25.306 26.872 28.662 30.775 32.953 35.578 38.645 42.363 46.627 51.837 58.418 67.024 74.771 79.709 83.105 85.512 87.322 88.696 89.78 90.583 91.297 91.809 92.184 92.472 92.684 92.868 93.004 93.099 93.168 93.226 93.264 93.261 93.219 93.186 93.136 93.07 93.002 92.938 92.864 92.741 92.651 92.569 92.399 92.229 92.043 91.954 91.767 91.54 91.267 91.131 90.608 90.669 90.493 90.307 89.825 89.567 89.277 88.917 88.501 87.961 87.145 84.78 -6 ,20822 ,KEBNE ,17024586,Wed Dec 22 10:28:17 CET,Wed Dec 22 12:19:31 CET,0.0 1.434 2.137 2.733 3.229 3.651 4.033 4.377 5.054 5.365 5.653 5.739 6.494 6.769 7.281 7.767 8.246 8.488 8.97 9.434 10.094 10.517 10.93 11.549 12.172 12.781 13.376 13.968 14.729 15.452 16.165 17.018 17.831 18.651 19.624 20.72 21.802 22.997 24.299 25.727 27.252 29.015 31.138 33.339 36.022 39.137 42.771 46.981 52.244 58.877 67.592 75.461 80.52 83.944 86.359 88.213 89.58 90.652 91.463 92.134 92.624 92.997 93.268 93.465 93.611 93.725 93.804 93.84 93.873 93.886 93.841 93.785 93.713 93.61 93.529 93.45 93.375 93.289 93.174 93.078 92.985 92.806 92.664 92.513 92.422 92.231 92.016 91.796 91.675 91.162 91.257 91.097 90.911 90.485 90.245 89.964 89.622 89.21 88.735 88.063 85.35 -7 ,5307 ,KEBNE ,17024587,Wed Dec 22 10:29:20 CET,Wed Dec 22 12:19:39 CET,0.0 1.495 2.206 2.726 3.141 3.509 3.876 4.247 4.95 5.27 5.571 5.666 6.422 6.687 7.202 7.692 8.156 8.391 8.846 9.287 9.954 10.386 10.805 11.427 12.017 12.58 13.149 13.709 14.457 15.192 15.899 16.771 17.633 18.484 19.485 20.632 21.746 22.954 24.263 25.717 27.298 29.105 31.304 33.57 36.241 39.305 42.917 47.158 52.405 58.922 67.315 74.886 79.843 83.33 85.785 87.558 88.883 89.961 90.774 91.478 91.98 92.341 92.621 92.827 93.0 93.136 93.247 93.317 93.332 93.319 93.29 93.254 93.199 93.122 93.052 92.961 92.862 92.764 92.639 92.523 92.397 92.222 92.093 91.934 91.848 91.651 91.43 91.203 91.081 90.574 90.669 90.514 90.346 89.932 89.665 89.367 89.01 88.582 88.131 87.609 85.685 -8 ,32119 ,KEBNE ,17024588,Wed Dec 22 10:29:20 CET,Wed Dec 22 12:20:08 CET,0.0 1.628 2.322 2.879 3.319 3.739 4.113 4.456 5.124 5.445 5.756 5.876 6.646 6.925 7.462 7.973 8.45 8.689 9.158 9.604 10.259 10.691 11.11 11.716 12.321 12.906 13.466 14.004 14.729 15.441 16.125 16.977 17.79 18.582 19.556 20.684 21.797 23.044 24.375 25.807 27.374 29.177 31.296 33.497 36.147 39.228 42.903 47.146 52.363 58.955 67.532 75.111 79.94 83.312 85.723 87.542 88.898 89.93 90.696 91.369 91.851 92.198 92.487 92.726 92.894 93.045 93.179 93.26 93.304 93.317 93.294 93.245 93.171 93.099 93.042 92.973 92.886 92.774 92.672 92.603 92.506 92.317 92.181 92.019 91.926 91.722 91.514 91.297 91.175 90.661 90.745 90.584 90.407 89.91 89.604 89.306 88.964 88.548 88.061 87.334 85.057 -9 ,32210 ,KEBNE ,17024589,Wed Dec 22 10:29:23 CET,Wed Dec 22 12:16:58 CET,0.0 1.707 2.288 2.747 3.173 3.561 3.919 4.264 4.906 5.202 5.49 5.55 6.276 6.531 7.052 7.555 8.042 8.285 8.758 9.205 9.847 10.27 10.687 11.294 11.895 12.482 13.055 13.617 14.349 15.071 15.774 16.645 17.506 18.338 19.305 20.381 21.438 22.632 23.943 25.381 26.917 28.692 30.838 33.084 35.772 38.857 42.54 46.822 52.103 58.663 67.179 74.907 79.951 83.4 85.826 87.67 89.034 90.071 90.819 91.471 91.961 92.342 92.687 92.923 93.077 93.219 93.344 93.438 93.473 93.458 93.434 93.376 93.305 93.224 93.143 93.05 92.939 92.804 92.658 92.57 92.473 92.279 92.132 91.991 91.915 91.74 91.549 91.322 91.188 90.672 90.751 90.586 90.407 89.961 89.725 89.473 89.145 88.749 88.271 87.672 85.767 -10 ,15431 ,KEBNE ,17024590,Wed Dec 22 10:29:22 CET,Wed Dec 22 12:16:06 CET,0.0 1.762 2.496 3.036 3.485 3.878 4.266 4.658 5.349 5.66 5.968 6.087 6.848 7.119 7.646 8.153 8.642 8.884 9.381 9.857 10.522 10.951 11.381 12.013 12.625 13.223 13.814 14.398 15.17 15.906 16.598 17.438 18.266 19.077 20.034 21.149 22.253 23.491 24.833 26.275 27.836 29.643 31.811 34.064 36.756 39.816 43.437 47.722 53.028 59.559 67.939 75.593 80.522 83.929 86.372 88.19 89.504 90.472 91.152 91.777 92.3 92.706 93.047 93.301 93.464 93.593 93.694 93.745 93.761 93.743 93.683 93.632 93.585 93.511 93.427 93.323 93.225 93.113 92.984 92.904 92.803 92.622 92.492 92.342 92.256 92.063 91.866 91.638 91.495 90.972 91.059 90.89 90.705 90.231 89.978 89.702 89.383 89.005 88.5 87.849 85.997 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index a7eb158f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17242 ,TETRA ,17529756,Thu Nov 25 03:44:46 CET,Thu Nov 25 05:56:47 CET,0.0 2.052 2.68 3.136 3.489 3.823 4.143 4.429 4.917 5.123 5.342 5.395 5.964 6.133 6.458 6.764 7.053 7.199 7.493 7.775 8.191 8.453 8.696 9.03 9.353 9.679 9.983 10.267 10.628 10.996 11.344 11.735 12.102 12.435 12.816 13.269 13.703 14.162 14.653 15.189 15.77 16.422 17.145 17.861 18.671 19.494 20.371 21.313 22.386 23.505 24.44 24.678 24.385 23.873 23.335 22.76 22.194 21.617 21.086 20.55 20.057 19.561 19.077 18.63 18.199 17.798 17.401 17.031 16.689 16.346 15.995 15.68 15.346 15.021 14.762 14.493 14.231 13.951 13.639 13.418 13.177 12.796 12.533 12.253 12.108 11.803 11.495 11.149 10.957 10.414 10.436 10.222 9.984 9.447 9.155 8.849 8.491 8.057 7.579 6.964 5.452 -4 ,10972 ,TETRA ,17529764,Thu Nov 25 03:44:52 CET,Thu Nov 25 05:55:20 CET,0.0 1.968 2.608 3.059 3.419 3.72 4.004 4.264 4.7 4.913 5.125 5.107 5.654 5.816 6.116 6.423 6.733 6.875 7.135 7.384 7.741 7.977 8.214 8.55 8.872 9.197 9.517 9.807 10.164 10.515 10.84 11.219 11.602 11.985 12.416 12.902 13.377 13.887 14.453 15.054 15.657 16.315 17.015 17.677 18.477 19.384 20.375 21.397 22.476 23.527 24.482 24.784 24.524 24.028 23.466 22.893 22.324 21.747 21.204 20.66 20.18 19.726 19.286 18.866 18.481 18.089 17.647 17.267 16.949 16.622 16.265 15.948 15.609 15.263 14.99 14.698 14.405 14.12 13.827 13.6 13.354 12.969 12.699 12.416 12.267 11.963 11.646 11.304 11.126 10.561 10.51 10.275 10.023 9.527 9.253 8.932 8.572 8.174 7.717 7.138 5.516 -5 ,22353 ,TETRA ,17529765,Thu Nov 25 03:44:45 CET,Thu Nov 25 05:57:23 CET,0.0 1.411 1.984 2.418 2.791 3.114 3.393 3.636 4.06 4.257 4.45 4.437 4.989 5.164 5.503 5.82 6.122 6.262 6.527 6.786 7.171 7.4 7.607 7.938 8.262 8.56 8.851 9.143 9.522 9.867 10.186 10.552 10.889 11.234 11.665 12.154 12.596 13.06 13.563 14.118 14.699 15.306 15.991 16.662 17.399 18.2 19.131 20.125 21.177 22.247 23.213 23.516 23.296 22.816 22.269 21.684 21.105 20.557 20.04 19.505 19.025 18.594 18.175 17.776 17.39 16.994 16.553 16.153 15.808 15.459 15.102 14.801 14.488 14.164 13.913 13.659 13.395 13.103 12.794 12.573 12.334 11.96 11.708 11.448 11.31 11.029 10.749 10.428 10.244 9.686 9.662 9.453 9.216 8.684 8.403 8.115 7.8 7.394 6.931 6.336 4.539 -6 ,9534 ,TETRA ,17529767,Thu Nov 25 03:44:45 CET,Thu Nov 25 05:52:42 CET,0.0 1.819 2.44 2.912 3.282 3.576 3.849 4.12 4.609 4.827 5.032 5.041 5.614 5.794 6.129 6.436 6.745 6.893 7.167 7.431 7.797 8.03 8.259 8.585 8.879 9.163 9.435 9.696 10.049 10.403 10.729 11.111 11.488 11.851 12.28 12.741 13.171 13.654 14.158 14.671 15.209 15.795 16.469 17.177 17.968 18.808 19.755 20.72 21.774 22.891 23.812 24.067 23.86 23.324 22.664 22.05 21.505 20.971 20.467 19.924 19.412 18.936 18.473 18.018 17.585 17.206 16.799 16.398 16.056 15.721 15.351 15.042 14.726 14.388 14.117 13.829 13.522 13.196 12.853 12.613 12.364 11.98 11.704 11.415 11.271 10.98 10.657 10.292 10.106 9.535 9.482 9.257 9.03 8.569 8.301 7.993 7.643 7.254 6.772 6.149 4.325 -8 ,2512 ,TETRA ,17529770,Thu Nov 25 03:44:46 CET,Thu Nov 25 05:58:17 CET,0.0 1.386 1.977 2.415 2.762 3.089 3.39 3.661 4.159 4.374 4.575 4.567 5.125 5.295 5.627 5.938 6.232 6.371 6.631 6.888 7.253 7.483 7.707 8.027 8.335 8.634 8.927 9.2 9.546 9.885 10.209 10.602 10.977 11.347 11.799 12.278 12.715 13.197 13.7 14.228 14.785 15.416 16.136 16.857 17.668 18.503 19.457 20.48 21.557 22.625 23.601 23.943 23.737 23.284 22.628 21.997 21.454 20.89 20.355 19.817 19.344 18.912 18.49 18.063 17.644 17.273 16.883 16.498 16.171 15.845 15.511 15.227 14.919 14.595 14.337 14.058 13.77 13.474 13.166 12.956 12.736 12.369 12.107 11.834 11.698 11.422 11.112 10.786 10.61 10.065 10.107 9.919 9.703 9.237 8.982 8.694 8.376 7.99 7.544 7.007 5.593 -10 ,2993 ,TETRA ,17529780,Thu Nov 25 03:44:48 CET,Thu Nov 25 05:56:47 CET,0.0 1.526 2.038 2.503 2.906 3.222 3.497 3.737 4.173 4.376 4.565 4.586 5.148 5.306 5.627 5.962 6.262 6.4 6.668 6.923 7.292 7.523 7.746 8.089 8.413 8.715 9.025 9.317 9.676 10.028 10.383 10.815 11.205 11.572 12.002 12.496 12.967 13.478 14.031 14.612 15.215 15.9 16.657 17.356 18.129 18.95 19.901 20.974 22.08 23.158 24.05 24.251 24.015 23.547 22.924 22.244 21.621 21.034 20.513 19.931 19.395 18.926 18.455 17.994 17.565 17.189 16.77 16.378 16.049 15.688 15.319 15.019 14.699 14.367 14.094 13.793 13.479 13.177 12.877 12.657 12.422 12.049 11.777 11.485 11.335 11.01 10.667 10.322 10.145 9.591 9.569 9.358 9.13 8.637 8.369 8.056 7.695 7.293 6.87 6.33 4.188 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index f65c20c7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11482 ,TETRA ,17529806,Thu Nov 25 03:44:47 CET,Thu Nov 25 05:58:26 CET,0.0 1.305 1.895 2.42 2.852 3.226 3.572 3.894 4.535 4.842 5.127 5.193 5.932 6.195 6.717 7.214 7.693 7.931 8.398 8.863 9.547 9.98 10.395 10.999 11.599 12.196 12.776 13.335 14.065 14.801 15.533 16.422 17.306 18.163 19.162 20.317 21.45 22.732 24.147 25.675 27.316 29.221 31.548 33.97 36.868 40.199 44.202 48.907 54.701 62.035 71.659 80.415 86.069 90.039 92.898 95.07 96.703 97.964 98.893 99.713 100.314 100.741 101.105 101.403 101.619 101.767 101.858 101.894 101.906 101.902 101.871 101.829 101.763 101.683 101.603 101.505 101.39 101.245 101.09 100.973 100.834 100.611 100.452 100.259 100.146 99.909 99.651 99.365 99.211 98.684 98.685 98.485 98.261 97.703 97.392 97.03 96.606 96.163 95.618 94.759 91.65 -3 ,855 ,TETRA ,17529809,Thu Nov 25 03:44:50 CET,Thu Nov 25 05:55:47 CET,0.0 1.544 2.184 2.66 3.055 3.419 3.762 4.095 4.724 5.017 5.303 5.375 6.125 6.385 6.886 7.381 7.857 8.083 8.526 8.969 9.616 10.036 10.45 11.072 11.688 12.281 12.868 13.451 14.201 14.943 15.674 16.565 17.446 18.312 19.325 20.482 21.617 22.897 24.33 25.897 27.569 29.486 31.798 34.193 37.059 40.38 44.416 49.229 55.147 62.607 72.491 81.48 87.208 91.189 94.047 96.196 97.79 98.999 99.896 100.71 101.317 101.715 102.023 102.266 102.444 102.587 102.704 102.765 102.788 102.801 102.755 102.667 102.548 102.411 102.305 102.175 102.04 101.924 101.788 101.661 101.518 101.303 101.144 100.965 100.869 100.645 100.378 100.094 99.944 99.403 99.393 99.19 98.958 98.422 98.12 97.769 97.36 96.872 96.266 95.486 93.057 -4 ,29599 ,TETRA ,17529810,Thu Nov 25 03:44:47 CET,Thu Nov 25 05:57:33 CET,0.0 1.511 2.16 2.643 3.091 3.509 3.902 4.276 4.938 5.242 5.537 5.64 6.416 6.691 7.209 7.714 8.207 8.444 8.905 9.365 10.053 10.498 10.918 11.527 12.108 12.685 13.263 13.824 14.561 15.299 16.029 16.912 17.777 18.63 19.626 20.77 21.897 23.175 24.59 26.127 27.802 29.733 32.043 34.451 37.348 40.631 44.6 49.328 55.128 62.447 72.114 80.925 86.571 90.47 93.263 95.354 96.885 98.074 98.938 99.636 100.115 100.459 100.73 100.956 101.157 101.306 101.419 101.463 101.47 101.477 101.463 101.416 101.337 101.235 101.155 101.076 100.95 100.784 100.612 100.47 100.297 100.026 99.837 99.65 99.562 99.362 99.147 98.904 98.756 98.23 98.222 98.029 97.843 97.364 97.079 96.792 96.438 96.034 95.507 94.662 92.243 -5 ,21962 ,TETRA ,17529812,Thu Nov 25 03:44:50 CET,Thu Nov 25 05:53:08 CET,0.0 1.815 2.457 2.914 3.336 3.728 4.097 4.441 5.032 5.306 5.591 5.679 6.436 6.703 7.224 7.721 8.2 8.442 8.925 9.388 10.06 10.502 10.935 11.577 12.188 12.805 13.425 14.016 14.788 15.549 16.269 17.145 18.023 18.877 19.876 21.025 22.168 23.459 24.864 26.389 28.026 29.921 32.224 34.62 37.503 40.814 44.758 49.46 55.213 62.394 71.895 80.63 86.27 90.137 92.938 95.097 96.702 97.944 98.864 99.623 100.159 100.576 100.904 101.146 101.354 101.509 101.618 101.681 101.701 101.693 101.676 101.643 101.575 101.482 101.394 101.3 101.193 101.04 100.847 100.695 100.534 100.303 100.133 99.946 99.843 99.63 99.416 99.152 98.991 98.454 98.482 98.284 98.037 97.501 97.19 96.856 96.503 96.038 95.48 94.718 92.425 -6 ,15194 ,TETRA ,17529813,Thu Nov 25 03:45:17 CET,Thu Nov 25 05:59:12 CET,0.0 1.841 2.539 3.085 3.558 3.963 4.329 4.676 5.344 5.659 5.959 6.068 6.85 7.127 7.642 8.147 8.638 8.877 9.332 9.776 10.435 10.855 11.265 11.872 12.47 13.06 13.654 14.239 14.986 15.721 16.444 17.332 18.203 19.051 20.045 21.173 22.306 23.597 25.016 26.561 28.223 30.148 32.46 34.852 37.696 40.973 44.982 49.789 55.678 63.073 72.792 81.742 87.617 91.612 94.463 96.636 98.26 99.552 100.505 101.285 101.808 102.19 102.522 102.78 102.971 103.116 103.22 103.264 103.281 103.286 103.258 103.218 103.167 103.082 103.005 102.932 102.827 102.684 102.537 102.439 102.314 102.065 101.872 101.654 101.536 101.261 100.948 100.624 100.467 99.96 100.008 99.827 99.657 99.241 98.93 98.569 98.15 97.668 97.041 96.232 94.29 -7 ,22047 ,TETRA ,17529824,Thu Nov 25 03:45:17 CET,Thu Nov 25 06:02:32 CET,0.0 1.528 2.185 2.69 3.127 3.516 3.864 4.193 4.831 5.143 5.44 5.527 6.28 6.54 7.046 7.547 8.019 8.25 8.717 9.161 9.803 10.227 10.655 11.281 11.884 12.47 13.036 13.596 14.33 15.048 15.764 16.647 17.514 18.374 19.395 20.552 21.692 22.977 24.388 25.95 27.631 29.552 31.871 34.278 37.191 40.563 44.56 49.281 55.162 62.547 72.333 81.313 86.983 90.802 93.602 95.75 97.367 98.667 99.641 100.483 101.116 101.593 101.948 102.239 102.48 102.645 102.798 102.887 102.927 102.947 102.929 102.893 102.844 102.765 102.68 102.605 102.522 102.373 102.179 102.048 101.924 101.718 101.534 101.311 101.192 100.935 100.637 100.288 100.1 99.545 99.592 99.426 99.221 98.715 98.449 98.186 97.833 97.319 96.611 95.665 93.178 -8 ,2967 ,TETRA ,17529826,Thu Nov 25 03:45:20 CET,Thu Nov 25 06:02:26 CET,0.0 1.649 2.294 2.834 3.313 3.756 4.156 4.522 5.198 5.496 5.784 5.868 6.634 6.909 7.443 7.955 8.442 8.686 9.164 9.622 10.292 10.737 11.177 11.815 12.447 13.06 13.649 14.227 14.99 15.744 16.482 17.384 18.262 19.123 20.158 21.336 22.482 23.767 25.174 26.709 28.346 30.238 32.547 34.981 37.921 41.299 45.319 50.095 55.953 63.26 72.855 81.624 87.332 91.319 94.209 96.399 98.027 99.277 100.185 100.934 101.465 101.871 102.178 102.442 102.684 102.851 102.982 103.072 103.101 103.1 103.101 103.082 103.031 102.94 102.848 102.74 102.627 102.514 102.361 102.231 102.075 101.812 101.629 101.435 101.326 101.064 100.777 100.436 100.26 99.718 99.678 99.449 99.203 98.627 98.268 97.867 97.436 96.959 96.377 95.532 92.369 -9 ,24099 ,TETRA ,17529827,Thu Nov 25 03:45:21 CET,Thu Nov 25 06:00:10 CET,0.0 1.381 2.038 2.557 3.0 3.413 3.791 4.126 4.773 5.079 5.38 5.489 6.256 6.52 7.031 7.53 8.021 8.266 8.728 9.169 9.809 10.233 10.662 11.278 11.862 12.437 13.007 13.575 14.331 15.068 15.797 16.691 17.558 18.427 19.46 20.613 21.728 22.979 24.352 25.882 27.546 29.486 31.834 34.226 37.066 40.411 44.463 49.217 55.153 62.646 72.394 81.284 87.134 91.266 94.282 96.592 98.307 99.606 100.608 101.509 102.162 102.656 103.074 103.433 103.706 103.904 104.084 104.215 104.305 104.375 104.431 104.459 104.463 104.449 104.423 104.382 104.321 104.233 104.108 103.995 103.874 103.685 103.536 103.365 103.278 103.09 102.877 102.617 102.479 101.968 102.014 101.833 101.644 101.204 100.932 100.618 100.266 99.842 99.252 98.375 95.554 -10 ,8005 ,TETRA ,17529829,Thu Nov 25 03:45:18 CET,Thu Nov 25 05:59:20 CET,0.0 1.674 2.324 2.805 3.185 3.548 3.894 4.243 4.893 5.184 5.467 5.518 6.25 6.49 6.975 7.474 7.966 8.203 8.653 9.101 9.777 10.208 10.628 11.259 11.872 12.46 13.039 13.618 14.37 15.12 15.85 16.73 17.612 18.478 19.496 20.654 21.773 23.036 24.442 25.976 27.643 29.596 31.944 34.343 37.236 40.602 44.606 49.303 55.132 62.465 72.015 80.686 86.322 90.299 93.117 95.206 96.77 98.002 98.905 99.685 100.258 100.701 101.101 101.398 101.589 101.747 101.88 101.945 101.986 102.017 101.999 101.949 101.886 101.802 101.723 101.621 101.495 101.345 101.185 101.081 100.954 100.724 100.565 100.385 100.283 100.06 99.797 99.456 99.282 98.739 98.693 98.454 98.206 97.697 97.379 97.035 96.664 96.207 95.628 94.78 91.894 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt deleted file mode 100644 index 1c0941be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,18912 ,TETRA ,17529843,Thu Nov 25 03:45:18 CET,Thu Nov 25 06:00:29 CET,0.0 1.751 2.222 2.6 2.945 3.257 3.527 3.781 4.241 4.472 4.7 4.591 5.249 5.412 5.739 6.054 6.345 6.482 6.744 7.003 7.368 7.596 7.812 8.132 8.451 8.757 9.059 9.354 9.723 10.073 10.415 10.817 11.198 11.573 12.024 12.533 13.008 13.504 14.004 14.538 15.104 15.737 16.456 17.123 17.889 18.718 19.634 20.663 21.759 22.857 23.666 23.812 23.636 23.294 22.844 22.346 21.856 21.378 20.905 20.35 19.854 19.423 18.994 18.56 18.144 17.784 17.432 17.097 16.786 16.46 16.106 15.786 15.457 15.139 14.89 14.624 14.342 14.042 13.716 13.48 13.235 12.864 12.603 12.314 12.164 11.851 11.532 11.176 10.998 10.351 10.426 10.21 9.999 9.512 9.23 8.926 8.542 8.076 7.604 7.09 5.443 -4 ,2062 ,TETRA ,17529844,Thu Nov 25 03:45:19 CET,Thu Nov 25 05:59:02 CET,0.0 1.612 2.222 2.642 3.029 3.38 3.67 3.919 4.396 4.624 4.834 4.75 5.424 5.609 5.981 6.312 6.605 6.751 7.04 7.318 7.724 7.978 8.217 8.569 8.909 9.229 9.546 9.847 10.216 10.578 10.942 11.368 11.759 12.149 12.593 13.077 13.556 14.08 14.624 15.186 15.785 16.452 17.199 17.906 18.697 19.584 20.586 21.635 22.782 23.969 25.03 25.362 25.112 24.711 24.278 23.824 23.34 22.835 22.352 21.847 21.388 20.951 20.539 20.125 19.723 19.353 18.968 18.613 18.291 17.951 17.58 17.258 16.916 16.562 16.289 16.004 15.703 15.365 14.999 14.755 14.523 14.172 13.911 13.64 13.51 13.219 12.897 12.567 12.391 11.72 11.796 11.591 11.364 10.881 10.598 10.281 9.895 9.412 8.863 8.145 6.023 -7 ,21687 ,TETRA ,17529849,Thu Nov 25 03:45:19 CET,Thu Nov 25 05:58:01 CET,0.0 1.588 2.142 2.533 2.853 3.165 3.458 3.722 4.192 4.42 4.637 4.519 5.171 5.334 5.647 5.957 6.271 6.423 6.699 6.969 7.376 7.626 7.851 8.17 8.49 8.796 9.073 9.338 9.689 10.012 10.327 10.721 11.115 11.502 11.921 12.374 12.807 13.29 13.808 14.349 14.926 15.549 16.225 16.888 17.637 18.458 19.383 20.34 21.381 22.402 23.127 23.201 22.874 22.39 21.934 21.502 21.056 20.599 20.183 19.732 19.307 18.903 18.514 18.143 17.778 17.441 17.072 16.731 16.443 16.134 15.808 15.536 15.256 14.974 14.739 14.485 14.221 13.944 13.646 13.428 13.192 12.846 12.598 12.328 12.197 11.909 11.609 11.27 11.061 10.368 10.389 10.152 9.914 9.364 9.028 8.665 8.274 7.843 7.3 6.55 4.349 -8 ,30638 ,TETRA ,17529851,Thu Nov 25 03:45:20 CET,Thu Nov 25 05:58:37 CET,0.0 1.373 1.919 2.32 2.631 2.915 3.188 3.43 3.857 4.06 4.255 4.148 4.806 4.973 5.302 5.631 5.953 6.103 6.38 6.649 7.039 7.27 7.484 7.803 8.112 8.405 8.687 8.963 9.304 9.626 9.947 10.337 10.714 11.085 11.499 11.935 12.355 12.828 13.366 13.934 14.502 15.126 15.837 16.546 17.331 18.189 19.145 20.165 21.255 22.313 23.145 23.253 22.981 22.54 21.973 21.318 20.663 20.041 19.544 19.064 18.617 18.199 17.783 17.372 16.955 16.55 16.138 15.769 15.416 15.036 14.646 14.325 13.985 13.618 13.326 13.029 12.725 12.4 12.056 11.815 11.567 11.18 10.924 10.664 10.52 10.211 9.888 9.548 9.365 8.702 8.789 8.569 8.326 7.746 7.409 7.026 6.619 6.174 5.603 4.848 2.956 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index b97bc083..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,31209 ,TETRA ,17529887,Thu Nov 25 03:45:20 CET,Thu Nov 25 05:59:21 CET,0.0 1.473 2.05 2.442 2.81 3.103 3.342 3.572 3.954 4.129 4.307 4.262 4.774 4.918 5.215 5.492 5.746 5.857 6.06 6.257 6.551 6.743 6.937 7.2 7.418 7.629 7.831 8.031 8.294 8.544 8.78 9.055 9.321 9.581 9.875 10.19 10.476 10.774 11.04 11.277 11.552 11.919 12.361 12.726 13.076 13.462 13.876 14.184 14.284 14.077 13.343 11.909 10.443 9.059 7.798 6.621 5.576 4.602 3.715 2.884 2.204 1.604 1.042 0.51 0.004 -0.477 -0.972 -1.421 -1.816 -2.24 -2.681 -3.028 -3.407 -3.805 -4.095 -4.391 -4.716 -5.068 -5.414 -5.654 -5.898 -6.283 -6.556 -6.824 -6.966 -7.269 -7.59 -7.913 -8.095 -8.672 -8.689 -8.911 -9.156 -9.712 -10.035 -10.386 -10.755 -11.185 -11.709 -12.298 -14.067 -5 ,24019 ,TETRA ,17529889,Thu Nov 25 03:45:21 CET,Thu Nov 25 05:59:11 CET,0.0 1.617 2.201 2.648 3.009 3.318 3.585 3.841 4.316 4.524 4.703 4.667 5.214 5.372 5.65 5.916 6.172 6.292 6.524 6.743 7.046 7.242 7.433 7.697 7.941 8.186 8.431 8.674 8.984 9.263 9.52 9.853 10.167 10.442 10.735 11.041 11.349 11.675 11.989 12.321 12.689 13.106 13.552 13.954 14.397 14.819 15.23 15.597 15.846 15.766 14.8 13.097 11.479 10.091 8.852 7.709 6.736 5.835 5.051 4.24 3.547 2.924 2.311 1.742 1.219 0.74 0.231 -0.232 -0.639 -1.066 -1.499 -1.853 -2.203 -2.567 -2.875 -3.195 -3.519 -3.854 -4.215 -4.471 -4.72 -5.091 -5.365 -5.658 -5.806 -6.124 -6.481 -6.871 -7.064 -7.627 -7.665 -7.895 -8.124 -8.642 -8.937 -9.214 -9.53 -9.903 -10.302 -10.807 -12.779 -6 ,32311 ,TETRA ,17529891,Thu Nov 25 03:45:23 CET,Thu Nov 25 05:59:13 CET,0.0 1.653 2.258 2.713 3.03 3.307 3.576 3.802 4.225 4.422 4.592 4.545 5.062 5.201 5.479 5.755 6.02 6.148 6.394 6.638 6.995 7.217 7.421 7.694 7.965 8.237 8.486 8.73 9.047 9.33 9.609 9.951 10.27 10.565 10.873 11.228 11.585 11.964 12.366 12.781 13.192 13.631 14.111 14.53 14.974 15.378 15.703 15.946 16.056 15.855 14.861 13.253 11.87 10.626 9.491 8.456 7.49 6.592 5.798 4.976 4.257 3.598 2.964 2.387 1.852 1.343 0.812 0.348 -0.043 -0.452 -0.879 -1.22 -1.57 -1.951 -2.25 -2.571 -2.925 -3.29 -3.646 -3.886 -4.148 -4.559 -4.828 -5.104 -5.256 -5.567 -5.877 -6.213 -6.401 -6.973 -7.006 -7.216 -7.432 -7.911 -8.178 -8.478 -8.78 -9.134 -9.552 -10.062 -11.662 -7 ,29454 ,TETRA ,17529892,Thu Nov 25 03:45:26 CET,Thu Nov 25 05:59:17 CET,0.0 1.744 2.32 2.776 3.156 3.45 3.706 3.939 4.374 4.57 4.747 4.712 5.234 5.389 5.706 5.981 6.217 6.331 6.558 6.778 7.107 7.302 7.47 7.722 7.959 8.19 8.421 8.651 8.929 9.186 9.431 9.732 10.022 10.294 10.595 10.907 11.196 11.531 11.902 12.28 12.658 13.063 13.494 13.905 14.368 14.823 15.242 15.544 15.791 15.859 15.24 14.005 12.745 11.496 10.355 9.268 8.268 7.377 6.613 5.819 5.132 4.524 3.944 3.412 2.921 2.485 2.016 1.568 1.159 0.729 0.303 -0.037 -0.404 -0.812 -1.122 -1.43 -1.733 -2.056 -2.426 -2.682 -2.943 -3.354 -3.634 -3.915 -4.056 -4.37 -4.712 -5.061 -5.237 -5.809 -5.835 -6.036 -6.256 -6.724 -6.994 -7.315 -7.675 -8.121 -8.654 -9.255 -11.425 -8 ,15686 ,TETRA ,17529894,Thu Nov 25 03:45:20 CET,Thu Nov 25 05:53:21 CET,0.0 1.49 2.192 2.725 3.136 3.488 3.793 4.058 4.522 4.719 4.896 4.876 5.429 5.589 5.889 6.195 6.48 6.61 6.848 7.08 7.413 7.622 7.817 8.086 8.342 8.582 8.816 9.064 9.393 9.683 9.941 10.268 10.59 10.883 11.215 11.581 11.914 12.27 12.646 13.029 13.434 13.904 14.395 14.791 15.126 15.451 15.755 15.96 16.101 15.976 15.177 13.745 12.327 10.974 9.781 8.727 7.758 6.872 6.123 5.354 4.661 4.026 3.407 2.821 2.279 1.78 1.255 0.801 0.416 0.003 -0.439 -0.798 -1.161 -1.543 -1.834 -2.146 -2.478 -2.818 -3.185 -3.459 -3.741 -4.154 -4.428 -4.712 -4.862 -5.171 -5.502 -5.858 -6.044 -6.601 -6.593 -6.816 -7.057 -7.55 -7.824 -8.129 -8.439 -8.783 -9.205 -9.784 -11.729 -9 ,11833 ,TETRA ,17529895,Thu Nov 25 03:45:20 CET,Thu Nov 25 05:59:47 CET,0.0 1.879 2.435 2.793 3.102 3.42 3.703 3.96 4.44 4.634 4.82 4.815 5.373 5.554 5.867 6.147 6.426 6.557 6.799 7.025 7.336 7.526 7.725 8.018 8.271 8.518 8.757 8.976 9.265 9.534 9.794 10.113 10.386 10.637 10.922 11.247 11.559 11.878 12.214 12.575 12.941 13.299 13.643 13.937 14.245 14.55 14.844 15.03 15.075 14.826 13.849 12.293 10.826 9.505 8.303 7.123 6.019 5.042 4.194 3.365 2.651 1.96 1.315 0.738 0.201 -0.297 -0.808 -1.274 -1.703 -2.139 -2.592 -2.966 -3.337 -3.735 -4.067 -4.428 -4.791 -5.151 -5.523 -5.79 -6.053 -6.427 -6.709 -7.044 -7.208 -7.536 -7.884 -8.225 -8.415 -9.021 -9.117 -9.364 -9.611 -10.143 -10.451 -10.795 -11.156 -11.516 -11.94 -12.544 -15.04 -10 ,30483 ,TETRA ,17529896,Thu Nov 25 03:45:21 CET,Thu Nov 25 05:59:44 CET,0.0 1.77 2.255 2.651 2.978 3.248 3.493 3.722 4.131 4.34 4.531 4.497 5.035 5.19 5.488 5.77 6.023 6.142 6.385 6.618 6.938 7.13 7.302 7.56 7.829 8.089 8.338 8.573 8.86 9.125 9.397 9.743 10.061 10.356 10.678 11.022 11.338 11.663 12.001 12.33 12.637 12.991 13.407 13.79 14.231 14.708 15.127 15.399 15.469 15.206 14.252 12.643 11.215 9.846 8.565 7.405 6.384 5.472 4.672 3.878 3.198 2.601 2.036 1.488 0.973 0.467 -0.069 -0.526 -0.923 -1.336 -1.778 -2.148 -2.532 -2.921 -3.222 -3.528 -3.837 -4.178 -4.544 -4.797 -5.05 -5.445 -5.74 -6.043 -6.196 -6.52 -6.86 -7.2 -7.383 -7.957 -7.966 -8.185 -8.416 -8.916 -9.214 -9.55 -9.891 -10.256 -10.707 -11.323 -13.274 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index 5c3d7471..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16243 ,KEBNE ,17024591,Wed Dec 22 10:30:22 CET,Wed Dec 22 12:24:04 CET,0.0 1.114 1.576 1.931 2.233 2.526 2.779 3.021 3.505 3.741 3.953 3.977 4.535 4.695 4.976 5.228 5.475 5.592 5.827 6.06 6.37 6.573 6.776 7.051 7.311 7.562 7.788 8.002 8.289 8.551 8.8 9.089 9.369 9.651 9.975 10.337 10.684 11.059 11.425 11.81 12.204 12.613 13.049 13.436 13.856 14.304 14.767 15.206 15.573 15.693 15.243 14.18 12.956 11.809 10.757 9.747 8.857 8.003 7.217 6.456 5.797 5.191 4.624 4.07 3.517 2.993 2.461 1.998 1.577 1.125 0.661 0.274 -0.132 -0.526 -0.825 -1.139 -1.459 -1.801 -2.161 -2.413 -2.675 -3.086 -3.375 -3.689 -3.844 -4.154 -4.526 -4.929 -5.135 -5.729 -5.805 -6.04 -6.292 -6.883 -7.229 -7.614 -8.019 -8.475 -8.976 -9.582 -12.1 -2 ,24919 ,KEBNE ,17024592,Wed Dec 22 10:30:22 CET,Wed Dec 22 12:23:11 CET,0.0 1.592 2.209 2.609 2.932 3.203 3.453 3.693 4.132 4.321 4.491 4.434 4.946 5.087 5.381 5.652 5.916 6.039 6.259 6.464 6.749 6.946 7.133 7.377 7.608 7.843 8.07 8.28 8.546 8.802 9.044 9.334 9.612 9.875 10.177 10.496 10.803 11.122 11.432 11.757 12.121 12.532 12.997 13.462 13.948 14.441 14.973 15.475 15.852 15.907 15.458 14.56 13.582 12.567 11.593 10.648 9.776 9.004 8.337 7.655 7.053 6.456 5.863 5.306 4.788 4.323 3.812 3.349 2.947 2.531 2.101 1.728 1.33 0.924 0.6 0.24 -0.144 -0.54 -0.949 -1.227 -1.507 -1.954 -2.259 -2.567 -2.735 -3.096 -3.467 -3.869 -4.083 -4.667 -4.743 -4.986 -5.238 -5.823 -6.153 -6.505 -6.912 -7.435 -8.007 -8.68 -10.749 -3 ,28196 ,KEBNE ,17024593,Wed Dec 22 10:30:22 CET,Wed Dec 22 12:23:10 CET,0.0 1.373 1.943 2.397 2.751 3.05 3.325 3.554 3.942 4.129 4.307 4.256 4.775 4.912 5.172 5.422 5.649 5.761 5.991 6.219 6.551 6.756 6.939 7.2 7.469 7.717 7.945 8.174 8.471 8.751 9.032 9.377 9.69 9.984 10.312 10.66 10.986 11.327 11.697 12.084 12.47 12.908 13.413 13.902 14.369 14.814 15.298 15.817 16.386 16.718 16.561 15.75 14.736 13.666 12.622 11.627 10.733 9.955 9.281 8.579 7.94 7.327 6.764 6.248 5.746 5.306 4.853 4.426 4.05 3.667 3.272 2.928 2.549 2.116 1.781 1.457 1.131 0.795 0.445 0.183 -0.084 -0.501 -0.818 -1.162 -1.335 -1.687 -2.088 -2.501 -2.699 -3.289 -3.433 -3.705 -3.959 -4.482 -4.775 -5.137 -5.526 -5.961 -6.472 -7.123 -10.484 -4 ,13065 ,KEBNE ,17024594,Wed Dec 22 10:30:22 CET,Wed Dec 22 12:23:10 CET,0.0 1.068 1.496 1.815 2.119 2.357 2.568 2.787 3.215 3.414 3.59 3.536 4.058 4.207 4.524 4.826 5.107 5.241 5.502 5.758 6.105 6.301 6.479 6.74 7.005 7.261 7.5 7.716 8.004 8.285 8.556 8.883 9.175 9.454 9.788 10.13 10.449 10.781 11.131 11.508 11.88 12.287 12.748 13.194 13.655 14.103 14.551 14.983 15.379 15.605 15.435 14.561 13.446 12.376 11.411 10.495 9.659 8.839 8.062 7.252 6.568 5.988 5.448 4.924 4.416 3.931 3.419 2.959 2.539 2.11 1.67 1.313 0.945 0.545 0.234 -0.079 -0.412 -0.758 -1.115 -1.368 -1.633 -2.06 -2.362 -2.685 -2.852 -3.176 -3.533 -3.941 -4.148 -4.754 -4.872 -5.107 -5.348 -5.91 -6.239 -6.587 -6.95 -7.356 -7.925 -8.736 -11.253 -5 ,27779 ,KEBNE ,17024595,Wed Dec 22 10:30:22 CET,Wed Dec 22 12:23:05 CET,0.0 1.138 1.599 1.981 2.281 2.532 2.762 2.978 3.377 3.578 3.763 3.693 4.216 4.376 4.675 4.949 5.213 5.346 5.601 5.828 6.148 6.35 6.545 6.836 7.097 7.333 7.556 7.758 8.037 8.322 8.587 8.9 9.193 9.473 9.81 10.188 10.523 10.864 11.236 11.634 12.045 12.495 13.016 13.515 14.028 14.558 15.085 15.52 15.924 16.143 15.809 14.707 13.479 12.369 11.39 10.471 9.64 8.868 8.163 7.424 6.771 6.196 5.656 5.153 4.652 4.178 3.693 3.255 2.877 2.477 2.039 1.673 1.302 0.897 0.56 0.217 -0.129 -0.489 -0.879 -1.143 -1.413 -1.856 -2.154 -2.458 -2.621 -2.958 -3.307 -3.688 -3.878 -4.452 -4.531 -4.775 -5.033 -5.615 -5.931 -6.283 -6.664 -7.102 -7.674 -8.318 -10.365 -6 ,27635 ,KEBNE ,17024596,Wed Dec 22 10:30:22 CET,Wed Dec 22 12:22:47 CET,0.0 1.583 2.103 2.479 2.819 3.14 3.408 3.639 4.043 4.216 4.385 4.331 4.87 5.029 5.306 5.565 5.809 5.929 6.174 6.399 6.719 6.922 7.114 7.404 7.694 7.96 8.211 8.46 8.767 9.064 9.352 9.667 9.965 10.268 10.62 11.01 11.38 11.773 12.18 12.601 13.026 13.471 13.961 14.422 14.925 15.442 16.007 16.553 17.033 17.344 17.031 15.885 14.686 13.559 12.503 11.561 10.705 9.868 9.129 8.405 7.774 7.208 6.67 6.139 5.639 5.188 4.707 4.27 3.895 3.51 3.119 2.759 2.357 1.954 1.652 1.339 1.005 0.667 0.314 0.06 -0.202 -0.613 -0.908 -1.227 -1.392 -1.728 -2.083 -2.447 -2.626 -3.184 -3.2 -3.423 -3.671 -4.233 -4.533 -4.848 -5.17 -5.557 -6.017 -6.657 -9.064 -7 ,17189 ,KEBNE ,17024597,Wed Dec 22 10:30:22 CET,Wed Dec 22 12:22:34 CET,0.0 1.116 1.629 2.043 2.335 2.593 2.843 3.082 3.515 3.695 3.864 3.81 4.336 4.484 4.762 5.036 5.295 5.413 5.651 5.887 6.197 6.393 6.59 6.883 7.153 7.395 7.627 7.854 8.144 8.419 8.679 8.965 9.235 9.501 9.808 10.17 10.534 10.943 11.374 11.789 12.196 12.638 13.147 13.603 14.042 14.465 14.921 15.351 15.681 15.861 15.55 14.544 13.476 12.498 11.534 10.672 9.867 9.052 8.34 7.611 6.969 6.376 5.786 5.232 4.726 4.286 3.82 3.39 3.019 2.633 2.216 1.843 1.447 1.042 0.727 0.399 0.068 -0.272 -0.646 -0.907 -1.17 -1.583 -1.864 -2.168 -2.333 -2.681 -3.045 -3.427 -3.638 -4.227 -4.287 -4.553 -4.842 -5.397 -5.702 -6.066 -6.484 -6.957 -7.518 -8.302 -10.702 -8 ,19464 ,KEBNE ,17024598,Wed Dec 22 10:31:24 CET,Wed Dec 22 12:24:16 CET,0.0 1.145 1.666 2.04 2.339 2.629 2.891 3.147 3.604 3.791 3.97 3.948 4.503 4.672 4.993 5.271 5.526 5.649 5.88 6.11 6.432 6.617 6.795 7.064 7.305 7.535 7.767 7.995 8.282 8.563 8.837 9.176 9.5 9.784 10.105 10.453 10.773 11.129 11.509 11.903 12.296 12.723 13.213 13.652 14.132 14.668 15.215 15.703 16.065 16.181 15.794 14.738 13.677 12.716 11.799 10.918 10.072 9.278 8.555 7.794 7.152 6.574 6.019 5.502 4.996 4.52 4.039 3.609 3.237 2.84 2.401 2.024 1.636 1.247 0.955 0.635 0.282 -0.095 -0.483 -0.741 -1.021 -1.477 -1.778 -2.081 -2.239 -2.566 -2.93 -3.315 -3.516 -4.099 -4.124 -4.353 -4.611 -5.166 -5.475 -5.799 -6.154 -6.561 -7.067 -7.771 -10.886 -9 ,23297 ,KEBNE ,17024599,Wed Dec 22 10:31:24 CET,Wed Dec 22 12:25:46 CET,0.0 1.151 1.577 1.892 2.183 2.462 2.709 2.945 3.407 3.635 3.846 3.814 4.339 4.488 4.759 5.005 5.245 5.358 5.576 5.793 6.083 6.283 6.496 6.8 7.076 7.316 7.528 7.737 8.038 8.322 8.568 8.886 9.202 9.488 9.815 10.194 10.534 10.884 11.242 11.6 11.988 12.435 12.95 13.477 14.075 14.681 15.241 15.708 16.124 16.354 16.224 15.463 14.508 13.559 12.65 11.783 11.007 10.257 9.601 8.921 8.302 7.726 7.141 6.595 6.111 5.684 5.234 4.825 4.459 4.069 3.653 3.3 2.951 2.591 2.302 1.994 1.659 1.309 0.949 0.715 0.48 0.063 -0.237 -0.541 -0.699 -1.03 -1.393 -1.761 -1.962 -2.55 -2.617 -2.857 -3.104 -3.628 -3.918 -4.236 -4.578 -4.993 -5.563 -6.31 -9.012 -10 ,6481 ,KEBNE ,17024600,Wed Dec 22 10:31:24 CET,Wed Dec 22 12:24:36 CET,0.0 1.972 2.621 3.092 3.467 3.803 4.092 4.352 4.825 5.033 5.22 5.189 5.724 5.877 6.159 6.425 6.679 6.798 7.03 7.249 7.556 7.767 7.972 8.246 8.493 8.737 8.984 9.23 9.527 9.802 10.069 10.363 10.636 10.905 11.207 11.551 11.889 12.242 12.609 12.98 13.345 13.754 14.219 14.669 15.166 15.663 16.125 16.528 16.899 17.089 16.867 16.001 14.949 13.927 13.002 12.125 11.312 10.54 9.856 9.175 8.568 8.012 7.454 6.925 6.426 5.926 5.398 4.956 4.577 4.16 3.727 3.37 2.99 2.6 2.29 1.962 1.625 1.286 0.946 0.707 0.459 0.055 -0.241 -0.569 -0.749 -1.126 -1.527 -1.951 -2.154 -2.724 -2.76 -2.984 -3.216 -3.728 -4.033 -4.388 -4.797 -5.303 -5.923 -6.691 -8.779 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt deleted file mode 100644 index 769b640d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9279 ,TETRA ,17529927,Thu Nov 25 03:45:24 CET,Thu Nov 25 06:01:32 CET,0.0 1.749 2.332 2.761 3.093 3.395 3.695 3.969 4.474 4.698 4.896 4.892 5.448 5.621 5.944 6.264 6.573 6.718 7.002 7.285 7.686 7.925 8.15 8.493 8.829 9.147 9.449 9.722 10.061 10.383 10.696 11.089 11.474 11.845 12.282 12.753 13.191 13.677 14.203 14.76 15.344 15.974 16.678 17.426 18.277 19.136 20.083 21.129 22.273 23.496 24.64 24.966 24.585 23.845 23.112 22.415 21.797 21.271 20.748 20.143 19.605 19.139 18.692 18.241 17.836 17.482 17.104 16.764 16.463 16.131 15.77 15.456 15.114 14.759 14.482 14.2 13.91 13.592 13.249 13.006 12.759 12.38 12.112 11.831 11.675 11.34 10.989 10.596 10.381 9.786 9.649 9.366 9.091 8.445 8.099 7.76 7.367 6.919 6.368 5.646 2.867 -2 ,9037 ,TETRA ,17529929,Thu Nov 25 03:45:25 CET,Thu Nov 25 06:00:27 CET,0.0 1.917 2.5 2.906 3.315 3.695 4.011 4.278 4.758 4.963 5.157 5.18 5.754 5.935 6.253 6.569 6.871 7.015 7.301 7.578 7.957 8.19 8.419 8.749 9.065 9.362 9.646 9.926 10.298 10.654 10.998 11.425 11.834 12.224 12.675 13.178 13.66 14.168 14.673 15.194 15.737 16.355 17.064 17.745 18.551 19.389 20.28 21.253 22.305 23.389 24.276 24.455 24.163 23.675 23.114 22.413 21.698 21.013 20.354 19.656 19.04 18.475 17.924 17.391 16.859 16.377 15.876 15.411 15.024 14.627 14.211 13.861 13.484 13.097 12.802 12.482 12.142 11.787 11.394 11.123 10.843 10.392 10.082 9.767 9.598 9.229 8.853 8.455 8.251 7.677 7.568 7.295 7.02 6.371 5.981 5.6 5.212 4.696 4.083 3.336 1.007 -5 ,3800 ,TETRA ,17529956,Thu Nov 25 03:45:20 CET,Thu Nov 25 06:00:18 CET,0.0 2.316 3.032 3.513 3.925 4.295 4.63 4.918 5.378 5.584 5.795 5.82 6.382 6.56 6.896 7.215 7.51 7.647 7.916 8.173 8.529 8.749 8.962 9.288 9.61 9.917 10.224 10.534 10.929 11.283 11.598 11.986 12.397 12.801 13.244 13.704 14.143 14.652 15.213 15.788 16.357 16.998 17.7 18.373 19.195 20.089 21.045 22.06 23.184 24.352 25.343 25.603 25.187 24.444 23.761 23.095 22.365 21.636 21.007 20.353 19.753 19.188 18.649 18.159 17.676 17.214 16.728 16.295 15.919 15.508 15.063 14.708 14.335 13.932 13.623 13.31 12.972 12.609 12.235 11.961 11.66 11.215 10.913 10.592 10.428 10.09 9.745 9.359 9.155 8.561 8.48 8.234 7.981 7.45 7.131 6.765 6.362 5.889 5.322 4.619 1.852 -7 ,31632 ,TETRA ,17529960,Thu Nov 25 03:45:24 CET,Thu Nov 25 06:00:17 CET,0.0 1.855 2.382 2.793 3.184 3.553 3.87 4.113 4.533 4.733 4.931 4.968 5.539 5.711 6.035 6.369 6.712 6.878 7.166 7.423 7.784 8.022 8.243 8.554 8.875 9.18 9.485 9.776 10.116 10.445 10.784 11.211 11.596 11.942 12.357 12.818 13.255 13.719 14.223 14.754 15.283 15.896 16.625 17.325 18.106 18.977 19.987 21.052 22.159 23.3 24.422 24.848 24.627 24.134 23.599 23.128 22.67 22.175 21.707 21.173 20.608 20.046 19.527 19.079 18.677 18.25 17.772 17.361 17.001 16.633 16.227 15.871 15.506 15.124 14.818 14.494 14.159 13.794 13.394 13.126 12.873 12.46 12.156 11.85 11.691 11.35 10.993 10.612 10.408 9.826 9.765 9.515 9.237 8.689 8.394 8.065 7.687 7.268 6.748 5.966 2.567 -9 ,30507 ,TETRA ,17529978,Thu Nov 25 03:45:50 CET,Thu Nov 25 06:00:10 CET,0.0 2.009 2.542 2.948 3.284 3.579 3.851 4.104 4.57 4.783 5.003 5.059 5.628 5.826 6.211 6.55 6.862 7.01 7.291 7.552 7.926 8.173 8.412 8.763 9.106 9.426 9.734 10.024 10.368 10.695 11.013 11.398 11.77 12.129 12.549 13.029 13.49 13.965 14.464 15.0 15.573 16.215 16.945 17.67 18.46 19.277 20.171 21.124 22.177 23.266 24.232 24.556 24.354 23.952 23.469 22.879 22.219 21.543 20.935 20.312 19.742 19.232 18.773 18.317 17.883 17.495 17.065 16.645 16.247 15.835 15.401 15.033 14.666 14.291 13.99 13.685 13.415 13.147 12.832 12.582 12.317 11.919 11.628 11.32 11.161 10.826 10.448 10.038 9.824 9.231 9.135 8.895 8.65 8.072 7.731 7.378 6.999 6.575 6.078 5.411 3.221 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index 66af59e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,17035 ,TETRA ,17529999,Thu Nov 25 03:46:23 CET,Thu Nov 25 06:03:22 CET,0.0 1.693 2.322 2.853 3.36 3.806 4.209 4.595 5.31 5.633 5.941 6.045 6.853 7.137 7.687 8.23 8.763 9.022 9.535 10.039 10.774 11.237 11.687 12.377 13.059 13.717 14.36 14.994 15.84 16.681 17.505 18.503 19.484 20.449 21.577 22.873 24.136 25.559 27.149 28.872 30.739 32.92 35.545 38.235 41.501 45.343 49.973 55.509 62.354 70.918 82.338 93.035 100.138 105.209 108.943 111.826 113.994 115.713 117.017 118.171 119.047 119.74 120.35 120.844 121.222 121.518 121.798 122.023 122.193 122.331 122.434 122.466 122.48 122.533 122.56 122.563 122.563 122.54 122.48 122.422 122.351 122.215 122.099 121.952 121.877 121.719 121.527 121.293 121.148 120.615 120.655 120.477 120.281 119.802 119.505 119.133 118.73 118.267 117.607 116.746 112.455 -4 ,30562 ,TETRA ,17530003,Thu Nov 25 03:45:50 CET,Thu Nov 25 06:03:47 CET,0.0 1.835 2.489 2.96 3.383 3.779 4.175 4.555 5.257 5.598 5.92 6.017 6.813 7.078 7.61 8.152 8.67 8.919 9.413 9.911 10.639 11.11 11.574 12.253 12.921 13.575 14.202 14.821 15.648 16.455 17.254 18.243 19.227 20.189 21.304 22.591 23.882 25.335 26.905 28.638 30.55 32.733 35.319 38.038 41.359 45.216 49.852 55.351 62.215 71.031 82.701 93.527 100.68 105.713 109.331 112.176 114.434 116.217 117.578 118.772 119.676 120.425 121.106 121.694 122.182 122.579 122.902 123.124 123.288 123.427 123.541 123.558 123.509 123.463 123.408 123.333 123.25 123.135 123.015 122.937 122.867 122.743 122.632 122.522 122.466 122.345 122.188 122.023 121.955 121.492 121.634 121.501 121.335 120.963 120.782 120.579 120.338 120.037 119.675 119.149 116.161 -5 ,27083 ,TETRA ,17530009,Thu Nov 25 03:45:51 CET,Thu Nov 25 06:04:06 CET,0.0 1.731 2.397 3.008 3.499 3.902 4.275 4.615 5.278 5.611 5.943 6.096 6.93 7.236 7.799 8.343 8.869 9.132 9.661 10.159 10.878 11.362 11.833 12.534 13.229 13.912 14.578 15.218 16.037 16.845 17.649 18.621 19.581 20.537 21.673 22.966 24.22 25.639 27.224 28.951 30.822 32.986 35.549 38.227 41.52 45.315 49.839 55.183 61.901 70.692 82.495 93.401 100.55 105.501 109.16 111.995 114.132 115.839 117.17 118.343 119.189 119.852 120.409 120.861 121.249 121.546 121.783 121.962 122.056 122.106 122.14 122.164 122.194 122.19 122.166 122.155 122.141 122.103 122.036 121.978 121.901 121.735 121.628 121.517 121.442 121.278 121.108 120.909 120.798 120.292 120.357 120.19 120.032 119.625 119.37 119.104 118.785 118.38 117.849 116.977 106.261 -6 ,27859 ,TETRA ,17530011,Thu Nov 25 03:45:50 CET,Thu Nov 25 05:58:34 CET,0.0 1.751 2.411 2.918 3.382 3.816 4.2 4.557 5.232 5.561 5.877 5.945 6.747 7.031 7.605 8.167 8.699 8.96 9.473 9.986 10.741 11.229 11.706 12.396 13.068 13.735 14.399 15.07 15.949 16.812 17.658 18.675 19.681 20.676 21.841 23.164 24.479 25.962 27.592 29.372 31.279 33.483 36.168 38.933 42.288 46.24 50.969 56.586 63.594 72.479 84.338 95.357 102.667 107.875 111.705 114.657 116.938 118.781 120.184 121.453 122.44 123.253 123.987 124.585 125.046 125.399 125.743 126.029 126.235 126.431 126.624 126.728 126.761 126.771 126.773 126.762 126.764 126.748 126.684 126.635 126.582 126.506 126.431 126.288 126.212 126.067 125.875 125.627 125.499 125.002 125.118 124.969 124.789 124.36 124.099 123.844 123.592 123.26 122.739 121.809 117.447 -8 ,22284 ,TETRA ,17530014,Thu Nov 25 03:45:52 CET,Thu Nov 25 06:01:13 CET,0.0 1.758 2.462 3.034 3.55 3.996 4.4 4.803 5.559 5.907 6.237 6.357 7.181 7.481 8.05 8.603 9.121 9.366 9.87 10.379 11.113 11.585 12.044 12.728 13.409 14.079 14.751 15.406 16.253 17.083 17.888 18.882 19.862 20.833 21.995 23.316 24.584 26.026 27.675 29.472 31.358 33.518 36.127 38.854 42.164 46.019 50.716 56.285 63.062 71.681 83.368 94.306 101.42 106.406 110.094 112.914 115.076 116.782 118.045 119.196 120.089 120.763 121.306 121.784 122.187 122.496 122.793 123.039 123.227 123.389 123.534 123.626 123.663 123.683 123.702 123.71 123.691 123.646 123.56 123.48 123.409 123.293 123.193 123.095 123.033 122.869 122.694 122.482 122.356 121.846 121.965 121.825 121.682 121.283 120.981 120.591 120.169 119.722 119.112 118.242 106.598 -10 ,22080 ,TETRA ,17530023,Thu Nov 25 03:45:50 CET,Thu Nov 25 06:04:39 CET,0.0 2.181 2.906 3.55 4.109 4.594 5.028 5.425 6.167 6.508 6.825 6.922 7.742 8.042 8.595 9.145 9.683 9.947 10.482 11.023 11.822 12.323 12.807 13.527 14.216 14.877 15.531 16.172 17.015 17.857 18.69 19.697 20.671 21.627 22.763 24.06 25.331 26.765 28.352 30.073 31.918 34.075 36.691 39.417 42.707 46.516 51.073 56.441 63.257 72.056 83.728 94.633 101.852 106.964 110.7 113.587 115.787 117.507 118.828 120.037 120.95 121.661 122.279 122.811 123.246 123.595 123.886 124.094 124.259 124.414 124.567 124.688 124.769 124.803 124.816 124.828 124.832 124.811 124.779 124.736 124.671 124.561 124.461 124.307 124.222 124.067 123.902 123.724 123.634 123.162 123.321 123.185 123.021 122.615 122.346 122.041 121.703 121.339 120.896 120.164 117.108 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt deleted file mode 100644 index f0082ec8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,19423 ,TETRA ,17530044,Thu Nov 25 03:45:51 CET,Thu Nov 25 06:04:15 CET,0.0 2.313 3.041 3.59 4.097 4.564 5.005 5.408 6.138 6.483 6.823 6.977 7.814 8.138 8.775 9.38 9.946 10.219 10.766 11.312 12.126 12.636 13.117 13.839 14.554 15.261 15.956 16.648 17.562 18.445 19.3 20.381 21.452 22.502 23.737 25.133 26.522 28.093 29.8 31.657 33.695 36.066 38.944 41.933 45.499 49.65 54.65 60.534 67.945 77.476 90.168 102.061 110.052 115.834 120.032 123.192 125.627 127.555 129.031 130.38 131.402 132.168 132.849 133.487 134.02 134.468 134.89 135.206 135.411 135.562 135.717 135.861 135.998 136.1 136.163 136.222 136.262 136.27 136.255 136.228 136.187 136.143 136.116 136.067 136.032 135.933 135.788 135.598 135.484 134.976 135.015 134.83 134.636 134.16 133.904 133.639 133.301 132.882 132.273 131.415 119.684 -6 ,20 ,TETRA ,17530051,Thu Nov 25 03:45:51 CET,Thu Nov 25 06:01:24 CET,0.0 2.519 3.411 3.957 4.395 4.808 5.224 5.648 6.455 6.827 7.187 7.391 8.267 8.612 9.272 9.912 10.526 10.821 11.39 11.937 12.728 13.243 13.746 14.499 15.267 16.009 16.719 17.42 18.342 19.256 20.145 21.222 22.286 23.336 24.595 26.062 27.521 29.177 30.994 32.93 34.981 37.358 40.204 43.177 46.749 50.811 55.763 61.782 69.33 78.933 91.922 104.207 112.29 118.034 122.191 125.325 127.754 129.639 131.077 132.423 133.394 134.119 134.78 135.363 135.803 136.147 136.512 136.82 137.061 137.26 137.44 137.589 137.701 137.768 137.782 137.779 137.759 137.719 137.631 137.538 137.44 137.261 137.12 136.98 136.905 136.72 136.52 136.304 136.181 135.681 135.805 135.665 135.491 135.054 134.794 134.491 134.126 133.7 133.157 132.375 123.529 -8 ,17822 ,TETRA ,17530055,Thu Nov 25 03:45:51 CET,Thu Nov 25 05:58:43 CET,0.0 1.965 2.761 3.344 3.829 4.285 4.737 5.146 5.861 6.204 6.55 6.719 7.569 7.888 8.484 9.063 9.62 9.88 10.387 10.901 11.708 12.234 12.731 13.494 14.231 14.915 15.593 16.264 17.139 17.999 18.844 19.873 20.887 21.922 23.154 24.522 25.861 27.362 29.003 30.837 32.813 35.092 37.87 40.739 44.236 48.339 53.327 59.302 66.782 76.301 89.048 101.184 109.245 114.983 119.283 122.635 125.213 127.244 128.825 130.268 131.38 132.293 133.086 133.747 134.286 134.721 135.076 135.326 135.536 135.749 135.968 136.108 136.227 136.329 136.37 136.401 136.433 136.452 136.444 136.421 136.374 136.249 136.152 136.047 135.98 135.799 135.548 135.232 135.086 134.57 134.601 134.419 134.243 133.829 133.574 133.297 132.965 132.541 131.964 130.943 127.187 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt deleted file mode 100644 index 094e7904..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/protein/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3334 ,TETRA ,17530070,Thu Nov 25 03:45:57 CET,Thu Nov 25 05:58:20 CET,0.0 2.388 3.089 3.668 4.18 4.666 5.111 5.502 6.232 6.584 6.921 7.061 7.894 8.206 8.833 9.444 10.03 10.311 10.84 11.352 12.096 12.57 13.043 13.756 14.46 15.142 15.8 16.455 17.33 18.186 19.019 20.053 21.082 22.083 23.27 24.618 25.926 27.396 29.015 30.796 32.746 35.036 37.784 40.621 44.051 48.074 52.965 58.765 65.935 74.921 86.888 98.151 105.527 110.789 114.759 117.897 120.343 122.317 123.821 125.163 126.231 127.069 127.778 128.412 128.965 129.4 129.789 130.115 130.374 130.608 130.818 130.978 131.128 131.248 131.299 131.325 131.342 131.338 131.309 131.289 131.261 131.179 131.094 131.013 130.973 130.863 130.717 130.549 130.466 130.004 130.193 130.075 129.934 129.572 129.354 129.114 128.798 128.435 128.016 127.341 122.788 -2 ,8450 ,TETRA ,17530071,Thu Nov 25 03:45:52 CET,Thu Nov 25 06:04:08 CET,0.0 2.536 3.263 3.831 4.304 4.73 5.151 5.561 6.326 6.685 7.035 7.191 8.008 8.304 8.886 9.469 10.04 10.322 10.874 11.393 12.142 12.65 13.143 13.853 14.551 15.222 15.884 16.551 17.444 18.313 19.144 20.151 21.14 22.128 23.308 24.669 26.0 27.482 29.149 30.957 32.908 35.203 37.978 40.861 44.29 48.242 53.055 58.839 66.05 75.113 87.229 98.544 106.037 111.404 115.376 118.519 120.899 122.691 124.102 125.436 126.471 127.314 128.019 128.615 129.121 129.531 129.917 130.217 130.449 130.662 130.829 130.941 131.049 131.143 131.196 131.225 131.227 131.201 131.173 131.154 131.12 131.051 130.988 130.892 130.84 130.722 130.589 130.454 130.37 129.899 130.051 129.937 129.815 129.504 129.322 129.13 128.882 128.565 128.185 127.47 124.576 -5 ,30630 ,TETRA ,17530076,Thu Nov 25 03:45:53 CET,Thu Nov 25 05:59:32 CET,0.0 2.569 3.362 4.026 4.599 5.06 5.494 5.892 6.619 6.988 7.355 7.506 8.346 8.658 9.285 9.881 10.443 10.726 11.277 11.81 12.584 13.087 13.58 14.291 15.006 15.71 16.391 17.07 17.971 18.867 19.742 20.813 21.867 22.877 24.051 25.408 26.743 28.235 29.896 31.713 33.679 35.954 38.654 41.45 44.854 48.823 53.64 59.445 66.696 75.958 88.442 100.263 108.054 113.482 117.541 120.689 123.056 124.973 126.478 127.833 128.874 129.691 130.399 131.006 131.497 131.906 132.303 132.616 132.864 133.097 133.302 133.447 133.578 133.692 133.765 133.821 133.87 133.913 133.929 133.913 133.889 133.846 133.792 133.727 133.692 133.59 133.443 133.297 133.236 132.788 132.97 132.863 132.756 132.46 132.284 132.095 131.861 131.584 131.259 130.788 127.581 -9 ,17714 ,TETRA ,17530089,Thu Nov 25 03:45:58 CET,Thu Nov 25 06:06:17 CET,0.0 3.039 3.728 4.327 4.855 5.376 5.881 6.32 7.095 7.453 7.796 7.929 8.749 9.055 9.654 10.234 10.786 11.06 11.604 12.12 12.891 13.406 13.898 14.616 15.322 16.014 16.682 17.346 18.236 19.103 19.958 21.005 22.037 23.051 24.227 25.573 26.922 28.456 30.142 32.004 34.039 36.35 39.128 42.019 45.445 49.425 54.324 60.252 67.597 76.787 89.021 100.552 108.188 113.605 117.633 120.785 123.216 125.134 126.536 127.794 128.782 129.558 130.194 130.736 131.219 131.637 132.035 132.331 132.561 132.769 132.933 133.051 133.152 133.213 133.225 133.235 133.25 133.239 133.198 133.174 133.139 133.064 133.008 132.929 132.881 132.754 132.596 132.425 132.332 131.847 131.943 131.797 131.653 131.292 131.088 130.85 130.578 130.225 129.773 129.181 125.495 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18631-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18631-1.txt deleted file mode 100644 index 8cb830bd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18631-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26046 ,KEBNE ,17024601,Wed Dec 22 10:31:24 CET,Wed Dec 22 12:05:13 CET,0.0 0.969 1.438 1.806 2.119 2.396 2.643 2.867 3.259 3.437 3.615 3.586 4.1 4.254 4.536 4.805 5.059 5.179 5.415 5.64 5.957 6.157 6.347 6.616 6.868 7.113 7.354 7.568 7.855 8.142 8.405 8.743 9.068 9.374 9.729 10.136 10.53 10.92 11.315 11.733 12.184 12.685 13.276 13.863 14.513 15.233 15.998 16.751 17.516 18.286 18.844 18.761 18.308 17.728 17.11 16.422 15.759 15.131 14.567 13.989 13.447 12.955 12.489 12.02 11.55 11.103 10.649 10.265 9.919 9.539 9.151 8.826 8.459 8.066 7.761 7.457 7.132 6.758 6.372 6.124 5.86 5.415 5.121 4.816 4.657 4.335 3.978 3.594 3.396 2.833 2.738 2.476 2.181 1.531 1.186 0.805 0.376 -0.125 -0.723 -1.487 -3.894 -2 ,32667 ,KEBNE ,17024602,Wed Dec 22 10:32:27 CET,Wed Dec 22 12:08:35 CET,0.0 1.038 1.59 1.984 2.283 2.537 2.75 2.95 3.331 3.506 3.676 3.648 4.176 4.338 4.628 4.908 5.17 5.295 5.543 5.781 6.107 6.298 6.487 6.778 7.049 7.303 7.545 7.783 8.103 8.408 8.699 9.048 9.366 9.666 10.015 10.401 10.767 11.166 11.593 12.049 12.541 13.085 13.694 14.269 14.889 15.551 16.27 17.018 17.798 18.562 19.166 19.069 18.543 17.9 17.211 16.503 15.824 15.168 14.569 13.966 13.442 12.966 12.479 11.978 11.5 11.054 10.592 10.159 9.78 9.404 9.026 8.712 8.364 7.986 7.683 7.356 7.011 6.663 6.304 6.055 5.788 5.36 5.05 4.734 4.574 4.236 3.878 3.505 3.315 2.756 2.629 2.356 2.082 1.503 1.151 0.794 0.39 -0.113 -0.663 -1.421 -3.587 -3 ,29180 ,KEBNE ,17024603,Wed Dec 22 10:32:26 CET,Wed Dec 22 12:06:43 CET,0.0 1.012 1.435 1.812 2.119 2.376 2.609 2.832 3.25 3.44 3.622 3.605 4.113 4.262 4.552 4.815 5.063 5.185 5.424 5.648 5.972 6.173 6.356 6.627 6.912 7.184 7.431 7.674 7.981 8.26 8.531 8.878 9.202 9.504 9.854 10.229 10.592 10.99 11.429 11.905 12.393 12.929 13.527 14.097 14.726 15.408 16.164 16.967 17.829 18.604 19.096 19.047 18.575 17.906 17.224 16.553 15.912 15.283 14.702 14.131 13.636 13.169 12.7 12.222 11.752 11.316 10.859 10.451 10.086 9.706 9.313 8.967 8.592 8.195 7.886 7.568 7.25 6.921 6.554 6.3 6.044 5.604 5.284 4.972 4.811 4.477 4.115 3.721 3.52 2.959 2.847 2.604 2.346 1.772 1.446 1.069 0.652 0.188 -0.367 -1.145 -3.509 -4 ,22055 ,KEBNE ,17024604,Wed Dec 22 10:32:26 CET,Wed Dec 22 12:07:20 CET,0.0 1.294 1.817 2.202 2.517 2.789 3.035 3.258 3.663 3.852 4.028 3.995 4.506 4.652 4.913 5.164 5.414 5.538 5.774 6.001 6.328 6.528 6.722 7.004 7.264 7.512 7.76 8.006 8.309 8.595 8.886 9.23 9.557 9.873 10.231 10.63 11.004 11.406 11.837 12.282 12.749 13.261 13.829 14.376 14.99 15.695 16.481 17.251 18.079 18.882 19.4 19.317 18.88 18.298 17.628 16.942 16.316 15.734 15.195 14.609 14.08 13.572 13.065 12.593 12.161 11.769 11.336 10.928 10.573 10.197 9.815 9.508 9.167 8.78 8.473 8.15 7.799 7.44 7.062 6.798 6.539 6.118 5.808 5.497 5.335 4.992 4.638 4.231 4.004 3.427 3.305 3.044 2.754 2.117 1.76 1.365 0.911 0.375 -0.26 -0.985 -3.333 -5 ,26511 ,KEBNE ,17024605,Wed Dec 22 10:32:26 CET,Wed Dec 22 12:07:15 CET,0.0 1.065 1.512 1.906 2.25 2.541 2.808 3.05 3.445 3.611 3.784 3.778 4.299 4.455 4.754 5.018 5.266 5.384 5.607 5.833 6.15 6.349 6.548 6.843 7.111 7.365 7.622 7.864 8.179 8.474 8.755 9.103 9.429 9.738 10.1 10.507 10.878 11.273 11.695 12.154 12.617 13.099 13.662 14.215 14.828 15.494 16.213 16.967 17.786 18.558 19.078 19.026 18.608 18.059 17.438 16.763 16.127 15.519 14.935 14.276 13.706 13.225 12.741 12.266 11.814 11.377 10.924 10.536 10.182 9.797 9.392 9.047 8.698 8.328 8.029 7.723 7.408 7.07 6.726 6.483 6.207 5.79 5.506 5.191 5.026 4.677 4.31 3.926 3.714 3.144 3.029 2.766 2.495 1.892 1.548 1.155 0.722 0.252 -0.349 -1.181 -3.627 -6 ,10559 ,KEBNE ,17024606,Wed Dec 22 10:32:26 CET,Wed Dec 22 12:07:00 CET,0.0 0.942 1.407 1.78 2.073 2.345 2.588 2.814 3.226 3.395 3.558 3.537 4.059 4.216 4.511 4.783 5.033 5.152 5.379 5.594 5.899 6.099 6.289 6.563 6.825 7.077 7.326 7.563 7.865 8.142 8.406 8.737 9.054 9.362 9.716 10.122 10.517 10.917 11.337 11.785 12.24 12.747 13.333 13.892 14.53 15.218 15.924 16.699 17.551 18.352 18.939 18.908 18.482 17.89 17.25 16.613 15.97 15.316 14.726 14.11 13.572 13.1 12.619 12.136 11.691 11.266 10.793 10.37 10.005 9.634 9.248 8.912 8.544 8.156 7.859 7.547 7.204 6.808 6.392 6.128 5.863 5.447 5.148 4.827 4.667 4.334 3.968 3.578 3.374 2.818 2.7 2.433 2.166 1.576 1.239 0.865 0.421 -0.1 -0.722 -1.525 -4.232 -7 ,23456 ,KEBNE ,17024607,Wed Dec 22 10:32:31 CET,Wed Dec 22 12:04:54 CET,0.0 1.173 1.649 2.005 2.316 2.598 2.848 3.074 3.487 3.681 3.864 3.835 4.352 4.511 4.807 5.082 5.341 5.458 5.688 5.91 6.213 6.4 6.58 6.85 7.112 7.364 7.614 7.86 8.178 8.478 8.751 9.082 9.397 9.695 10.052 10.451 10.83 11.246 11.667 12.094 12.549 13.06 13.641 14.206 14.855 15.558 16.32 17.107 17.939 18.754 19.312 19.194 18.696 18.061 17.383 16.674 16.012 15.396 14.823 14.249 13.725 13.217 12.733 12.27 11.807 11.358 10.894 10.483 10.122 9.736 9.308 8.949 8.589 8.2 7.904 7.602 7.287 6.963 6.597 6.333 6.076 5.667 5.351 5.028 4.87 4.535 4.187 3.81 3.602 3.025 2.897 2.639 2.364 1.789 1.457 1.105 0.709 0.182 -0.446 -1.272 -4.612 -8 ,14738 ,KEBNE ,17024608,Wed Dec 22 10:32:27 CET,Wed Dec 22 12:07:04 CET,0.0 1.162 1.65 2.104 2.573 2.955 3.262 3.493 3.846 4.025 4.208 4.196 4.708 4.855 5.136 5.389 5.634 5.755 5.985 6.205 6.526 6.727 6.924 7.21 7.474 7.729 7.968 8.191 8.505 8.825 9.114 9.451 9.758 10.048 10.408 10.807 11.168 11.559 11.977 12.416 12.875 13.397 13.998 14.578 15.233 15.902 16.604 17.331 18.097 18.797 19.198 19.049 18.609 18.008 17.364 16.721 16.057 15.399 14.832 14.239 13.691 13.185 12.698 12.217 11.743 11.296 10.846 10.456 10.095 9.7 9.299 8.964 8.591 8.207 7.92 7.625 7.305 6.963 6.605 6.344 6.079 5.669 5.366 5.045 4.882 4.534 4.163 3.797 3.603 3.038 2.909 2.662 2.403 1.803 1.457 1.089 0.67 0.173 -0.392 -1.143 -3.764 -9 ,10246 ,KEBNE ,17024609,Wed Dec 22 10:32:26 CET,Wed Dec 22 12:08:42 CET,0.0 1.277 1.823 2.225 2.557 2.837 3.092 3.334 3.763 3.957 4.136 4.104 4.625 4.783 5.07 5.342 5.598 5.718 5.937 6.147 6.461 6.666 6.871 7.161 7.422 7.684 7.942 8.181 8.481 8.759 9.036 9.379 9.712 10.041 10.398 10.768 11.135 11.543 11.969 12.415 12.873 13.384 13.983 14.574 15.23 15.937 16.675 17.442 18.245 19.022 19.632 19.554 19.091 18.493 17.838 17.158 16.476 15.836 15.295 14.736 14.238 13.748 13.273 12.838 12.393 11.975 11.532 11.131 10.8 10.438 10.039 9.699 9.341 8.942 8.621 8.307 7.974 7.621 7.257 6.996 6.727 6.306 6.02 5.711 5.539 5.191 4.85 4.482 4.273 3.695 3.591 3.351 3.077 2.473 2.154 1.787 1.38 0.925 0.353 -0.501 -3.209 -10 ,22822 ,KEBNE ,17024610,Wed Dec 22 10:34:31 CET,Wed Dec 22 12:09:17 CET,0.0 1.145 1.654 2.028 2.348 2.637 2.888 3.113 3.513 3.696 3.866 3.833 4.348 4.498 4.798 5.062 5.311 5.433 5.672 5.899 6.216 6.419 6.618 6.915 7.199 7.462 7.704 7.938 8.238 8.527 8.814 9.16 9.495 9.814 10.169 10.576 10.959 11.367 11.8 12.234 12.672 13.152 13.708 14.269 14.911 15.587 16.33 17.11 17.909 18.689 19.265 19.221 18.802 18.187 17.528 16.87 16.231 15.618 15.066 14.459 13.894 13.369 12.869 12.404 11.975 11.57 11.112 10.7 10.34 9.959 9.555 9.214 8.849 8.476 8.199 7.893 7.563 7.216 6.852 6.603 6.341 5.917 5.592 5.253 5.08 4.726 4.359 3.951 3.73 3.146 3.027 2.781 2.51 1.885 1.484 1.018 0.506 -0.04 -0.669 -1.523 -3.646 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index 928e251e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21153 ,TETRA ,17530101,Thu Nov 25 03:45:53 CET,Thu Nov 25 05:37:34 CET,0.0 1.444 1.988 2.373 2.712 3.037 3.313 3.533 3.956 4.153 4.344 4.352 4.872 5.032 5.356 5.652 5.91 6.031 6.275 6.514 6.854 7.065 7.255 7.53 7.797 8.052 8.296 8.52 8.814 9.096 9.377 9.703 9.98 10.274 10.619 10.984 11.327 11.674 12.034 12.436 12.831 13.232 13.697 14.129 14.576 15.035 15.517 15.937 16.269 16.399 15.996 14.972 13.89 12.837 11.81 10.866 10.05 9.286 8.603 7.891 7.245 6.664 6.12 5.604 5.101 4.622 4.12 3.676 3.289 2.88 2.45 2.085 1.716 1.357 1.056 0.731 0.398 0.051 -0.31 -0.56 -0.817 -1.243 -1.549 -1.862 -2.023 -2.364 -2.73 -3.111 -3.316 -3.895 -3.971 -4.222 -4.491 -5.062 -5.363 -5.687 -6.088 -6.558 -7.096 -7.816 -9.492 -2 ,28296 ,TETRA ,17530103,Thu Nov 25 03:45:55 CET,Thu Nov 25 05:36:18 CET,0.0 1.385 1.937 2.364 2.715 3.034 3.325 3.573 4.012 4.219 4.404 4.385 4.903 5.055 5.352 5.638 5.917 6.05 6.297 6.528 6.851 7.054 7.25 7.525 7.787 8.044 8.302 8.551 8.869 9.157 9.42 9.721 10.02 10.317 10.629 10.99 11.343 11.702 12.081 12.462 12.846 13.274 13.747 14.195 14.675 15.127 15.554 15.956 16.27 16.372 16.018 15.029 13.96 12.939 11.938 10.952 10.053 9.269 8.593 7.881 7.225 6.625 6.051 5.507 4.991 4.519 4.01 3.557 3.178 2.766 2.336 1.975 1.581 1.167 0.853 0.533 0.193 -0.175 -0.564 -0.829 -1.093 -1.49 -1.768 -2.091 -2.264 -2.615 -2.995 -3.4 -3.601 -4.176 -4.265 -4.499 -4.756 -5.345 -5.662 -5.999 -6.383 -6.835 -7.36 -8.087 -10.113 -4 ,909 ,TETRA ,17530115,Thu Nov 25 03:46:23 CET,Thu Nov 25 05:36:57 CET,0.0 1.097 1.672 2.098 2.437 2.742 3.03 3.291 3.728 3.914 4.102 4.11 4.63 4.782 5.085 5.388 5.663 5.802 6.078 6.314 6.635 6.849 7.055 7.332 7.589 7.84 8.078 8.303 8.594 8.869 9.125 9.459 9.795 10.104 10.441 10.786 11.09 11.442 11.829 12.203 12.567 12.989 13.483 13.931 14.379 14.846 15.344 15.783 16.098 16.196 15.803 14.835 13.796 12.764 11.807 10.883 10.04 9.263 8.535 7.797 7.155 6.55 5.983 5.446 4.94 4.475 3.962 3.51 3.127 2.731 2.305 1.937 1.563 1.155 0.823 0.499 0.176 -0.182 -0.552 -0.796 -1.055 -1.471 -1.773 -2.096 -2.26 -2.593 -2.937 -3.316 -3.524 -4.096 -4.17 -4.406 -4.664 -5.262 -5.568 -5.904 -6.288 -6.711 -7.31 -8.184 -10.266 -5 ,21078 ,TETRA ,17530117,Thu Nov 25 03:46:25 CET,Thu Nov 25 05:36:42 CET,0.0 1.62 2.169 2.552 2.878 3.177 3.441 3.687 4.15 4.354 4.552 4.567 5.097 5.267 5.569 5.855 6.123 6.246 6.486 6.729 7.073 7.289 7.5 7.796 8.071 8.331 8.569 8.791 9.096 9.391 9.67 9.99 10.288 10.581 10.924 11.29 11.617 11.969 12.355 12.745 13.118 13.511 13.96 14.405 14.882 15.366 15.846 16.3 16.717 16.896 16.594 15.608 14.413 13.289 12.252 11.27 10.393 9.57 8.856 8.128 7.497 6.926 6.361 5.813 5.29 4.819 4.334 3.886 3.492 3.086 2.666 2.318 1.954 1.571 1.264 0.927 0.572 0.217 -0.154 -0.426 -0.713 -1.149 -1.442 -1.743 -1.906 -2.234 -2.569 -2.933 -3.134 -3.707 -3.765 -3.994 -4.267 -4.896 -5.225 -5.573 -6.017 -6.493 -6.996 -7.716 -9.788 -6 ,7852 ,TETRA ,17530119,Thu Nov 25 03:46:24 CET,Thu Nov 25 05:37:00 CET,0.0 1.602 2.18 2.594 2.96 3.274 3.545 3.806 4.276 4.479 4.671 4.682 5.201 5.353 5.635 5.909 6.177 6.303 6.543 6.771 7.097 7.296 7.483 7.759 8.027 8.281 8.527 8.762 9.08 9.382 9.65 9.962 10.262 10.552 10.872 11.213 11.538 11.885 12.25 12.643 13.043 13.463 13.916 14.345 14.797 15.256 15.747 16.158 16.459 16.538 16.173 15.216 14.107 13.025 12.017 11.099 10.293 9.542 8.838 8.1 7.483 6.943 6.42 5.895 5.387 4.916 4.427 3.979 3.582 3.181 2.742 2.36 1.98 1.596 1.292 0.984 0.652 0.28 -0.101 -0.352 -0.601 -0.992 -1.274 -1.59 -1.757 -2.079 -2.421 -2.812 -3.021 -3.603 -3.694 -3.927 -4.173 -4.745 -5.076 -5.44 -5.825 -6.236 -6.746 -7.4 -9.265 -9 ,8608 ,TETRA ,17530131,Thu Nov 25 03:46:24 CET,Thu Nov 25 05:29:07 CET,0.0 1.819 2.395 2.847 3.235 3.567 3.859 4.125 4.598 4.811 5.009 4.995 5.505 5.658 5.946 6.208 6.462 6.591 6.833 7.079 7.429 7.631 7.823 8.101 8.367 8.636 8.909 9.16 9.463 9.761 10.038 10.355 10.653 10.932 11.258 11.605 11.946 12.338 12.734 13.129 13.548 13.972 14.412 14.838 15.283 15.737 16.208 16.632 16.982 17.126 16.779 15.809 14.701 13.616 12.612 11.678 10.821 10.001 9.273 8.545 7.917 7.356 6.813 6.273 5.759 5.3 4.82 4.381 3.99 3.581 3.158 2.798 2.412 2.02 1.727 1.42 1.091 0.747 0.375 0.113 -0.169 -0.648 -0.976 -1.291 -1.449 -1.793 -2.176 -2.577 -2.793 -3.39 -3.481 -3.719 -3.973 -4.535 -4.862 -5.216 -5.595 -6.021 -6.562 -7.333 -9.636 -10 ,18094 ,TETRA ,17530133,Thu Nov 25 03:46:24 CET,Thu Nov 25 05:36:44 CET,0.0 1.084 1.63 2.045 2.376 2.681 2.971 3.232 3.671 3.853 4.039 4.045 4.563 4.717 5.017 5.299 5.561 5.683 5.916 6.148 6.472 6.672 6.866 7.143 7.414 7.669 7.911 8.147 8.455 8.755 9.049 9.373 9.668 9.962 10.281 10.633 10.966 11.318 11.675 12.026 12.394 12.791 13.209 13.616 14.088 14.556 15.015 15.424 15.77 15.925 15.585 14.653 13.595 12.546 11.557 10.629 9.791 9.008 8.307 7.581 6.927 6.328 5.762 5.202 4.66 4.184 3.699 3.264 2.88 2.467 2.042 1.686 1.305 0.923 0.632 0.312 -0.049 -0.417 -0.823 -1.134 -1.452 -1.94 -2.283 -2.647 -2.832 -3.186 -3.569 -3.947 -4.13 -4.692 -4.759 -5.002 -5.249 -5.8 -6.124 -6.477 -6.862 -7.295 -7.788 -8.439 -10.225 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt deleted file mode 100644 index 57ec37b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_17124-1_18636-1.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2524 ,TETRA ,17530139,Thu Nov 25 03:46:28 CET,Thu Nov 25 05:35:09 CET,0.0 1.284 1.812 2.183 2.474 2.748 2.993 3.233 3.673 3.867 4.061 4.061 4.583 4.748 5.057 5.343 5.613 5.739 5.996 6.238 6.568 6.783 6.99 7.293 7.591 7.882 8.16 8.417 8.74 9.04 9.322 9.669 10.008 10.327 10.697 11.114 11.509 11.938 12.396 12.879 13.379 13.947 14.581 15.176 15.84 16.568 17.382 18.241 19.183 20.07 20.706 20.67 20.193 19.582 18.9 18.208 17.585 16.982 16.407 15.824 15.263 14.728 14.219 13.698 13.219 12.791 12.349 11.949 11.593 11.199 10.772 10.425 10.068 9.677 9.362 9.028 8.677 8.329 7.962 7.712 7.449 7.031 6.74 6.422 6.251 5.89 5.528 5.143 4.93 4.358 4.231 3.977 3.696 3.043 2.67 2.294 1.89 1.386 0.759 0.004 -2.49 -2 ,1537 ,TETRA ,17530141,Thu Nov 25 03:46:25 CET,Thu Nov 25 05:34:45 CET,0.0 1.726 2.212 2.603 2.941 3.253 3.55 3.816 4.282 4.488 4.676 4.665 5.199 5.395 5.787 6.102 6.362 6.493 6.739 6.974 7.325 7.544 7.753 8.067 8.37 8.642 8.906 9.164 9.49 9.793 10.079 10.424 10.765 11.1 11.484 11.907 12.298 12.731 13.213 13.714 14.229 14.806 15.461 16.109 16.825 17.597 18.432 19.301 20.264 21.211 21.921 21.94 21.566 20.942 20.246 19.602 18.968 18.346 17.779 17.161 16.584 16.056 15.55 15.074 14.639 14.246 13.824 13.428 13.071 12.689 12.272 11.924 11.57 11.188 10.9 10.598 10.245 9.88 9.501 9.228 8.956 8.545 8.239 7.909 7.741 7.394 7.018 6.618 6.411 5.845 5.718 5.458 5.173 4.556 4.205 3.839 3.454 2.954 2.286 1.491 -1.058 -3 ,17392 ,TETRA ,17530143,Thu Nov 25 03:46:27 CET,Thu Nov 25 05:34:56 CET,0.0 1.582 2.194 2.638 2.966 3.267 3.524 3.769 4.225 4.428 4.62 4.611 5.128 5.293 5.611 5.877 6.13 6.264 6.518 6.752 7.071 7.279 7.496 7.807 8.097 8.376 8.645 8.896 9.209 9.514 9.823 10.205 10.559 10.877 11.232 11.631 12.034 12.492 12.957 13.424 13.93 14.521 15.177 15.81 16.515 17.225 18.018 18.921 19.855 20.759 21.499 21.581 21.325 20.861 20.293 19.652 18.987 18.356 17.783 17.166 16.622 16.135 15.638 15.148 14.696 14.273 13.81 13.387 13.001 12.588 12.19 11.872 11.518 11.115 10.798 10.477 10.137 9.782 9.423 9.167 8.897 8.49 8.203 7.877 7.702 7.35 6.971 6.549 6.332 5.768 5.622 5.366 5.097 4.477 4.125 3.756 3.352 2.87 2.262 1.344 -1.962 -6 ,2166 ,TETRA ,17530147,Thu Nov 25 03:46:27 CET,Thu Nov 25 05:33:23 CET,0.0 1.414 1.93 2.319 2.668 2.964 3.218 3.461 3.909 4.094 4.273 4.281 4.804 4.962 5.277 5.567 5.836 5.967 6.216 6.474 6.836 7.052 7.259 7.547 7.83 8.107 8.37 8.626 8.96 9.278 9.589 9.951 10.271 10.591 10.961 11.376 11.785 12.213 12.66 13.117 13.596 14.164 14.793 15.357 15.969 16.683 17.501 18.324 19.215 20.072 20.721 20.777 20.31 19.639 18.943 18.279 17.642 17.058 16.536 15.919 15.373 14.908 14.436 13.963 13.507 13.08 12.611 12.178 11.796 11.399 11.003 10.666 10.293 9.901 9.6 9.287 8.951 8.589 8.22 7.967 7.705 7.285 6.991 6.687 6.529 6.195 5.819 5.405 5.191 4.624 4.48 4.215 3.948 3.374 3.034 2.66 2.279 1.809 1.182 0.326 -2.413 -7 ,16413 ,TETRA ,17530149,Thu Nov 25 03:46:29 CET,Thu Nov 25 05:32:00 CET,0.0 1.691 2.255 2.653 2.998 3.32 3.612 3.847 4.251 4.435 4.612 4.589 5.105 5.267 5.574 5.863 6.146 6.285 6.546 6.782 7.12 7.339 7.542 7.846 8.135 8.406 8.677 8.93 9.235 9.532 9.823 10.175 10.506 10.828 11.212 11.624 12.01 12.438 12.909 13.406 13.914 14.468 15.114 15.741 16.412 17.161 18.033 18.895 19.801 20.686 21.232 21.11 20.56 19.907 19.23 18.54 17.905 17.274 16.696 16.061 15.502 15.033 14.557 14.066 13.618 13.2 12.746 12.338 11.985 11.622 11.217 10.856 10.484 10.109 9.814 9.502 9.179 8.839 8.461 8.192 7.92 7.486 7.163 6.836 6.679 6.35 5.994 5.617 5.418 4.861 4.749 4.49 4.224 3.627 3.282 2.916 2.497 1.996 1.367 0.537 -2.188 -9 ,31041 ,TETRA ,17530154,Thu Nov 25 03:46:25 CET,Thu Nov 25 05:34:11 CET,0.0 1.768 2.386 2.83 3.183 3.469 3.694 3.912 4.318 4.517 4.709 4.687 5.207 5.359 5.63 5.899 6.167 6.293 6.537 6.777 7.104 7.297 7.493 7.797 8.095 8.372 8.629 8.877 9.191 9.499 9.8 10.158 10.494 10.814 11.207 11.639 12.028 12.446 12.877 13.316 13.797 14.35 14.988 15.595 16.289 17.043 17.837 18.685 19.567 20.48 21.236 21.316 20.964 20.407 19.788 19.144 18.558 17.989 17.46 16.888 16.348 15.827 15.313 14.832 14.38 13.977 13.542 13.145 12.778 12.37 11.957 11.604 11.237 10.862 10.554 10.228 9.892 9.537 9.172 8.917 8.649 8.233 7.935 7.608 7.432 7.085 6.72 6.322 6.114 5.555 5.441 5.192 4.927 4.295 3.945 3.564 3.124 2.606 2.037 1.196 -2.162 -10 ,7148 ,TETRA ,17530155,Thu Nov 25 03:46:26 CET,Thu Nov 25 05:34:16 CET,0.0 2.005 2.589 3.019 3.36 3.697 3.978 4.201 4.618 4.816 4.996 4.981 5.498 5.654 5.952 6.219 6.46 6.577 6.806 7.025 7.355 7.569 7.783 8.088 8.356 8.627 8.908 9.181 9.523 9.828 10.131 10.529 10.883 11.208 11.587 12.006 12.397 12.813 13.25 13.707 14.227 14.834 15.525 16.179 16.882 17.675 18.578 19.514 20.47 21.409 22.155 22.108 21.694 21.088 20.44 19.793 19.146 18.499 17.933 17.345 16.792 16.3 15.824 15.344 14.877 14.442 13.993 13.608 13.264 12.88 12.468 12.139 11.804 11.452 11.159 10.841 10.527 10.202 9.848 9.606 9.348 8.91 8.613 8.301 8.126 7.769 7.414 7.032 6.826 6.262 6.128 5.852 5.544 4.816 4.39 3.935 3.436 2.807 2.071 1.021 -2.216 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18626-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18626-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 8e839527..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18626-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11821 ,KEBNE ,17024611,Wed Dec 22 10:34:30 CET,Wed Dec 22 12:06:44 CET,0.0 1.139 1.576 1.904 2.191 2.445 2.685 2.89 3.242 3.405 3.561 3.498 3.969 4.097 4.345 4.574 4.793 4.907 5.122 5.321 5.607 5.776 5.942 6.182 6.396 6.604 6.816 7.024 7.286 7.543 7.785 8.07 8.342 8.601 8.91 9.243 9.54 9.877 10.229 10.614 11.03 11.466 11.991 12.517 13.082 13.672 14.318 15.005 15.757 16.502 17.142 17.367 17.235 16.953 16.621 16.281 15.929 15.56 15.209 14.818 14.482 14.173 13.851 13.554 13.283 13.026 12.756 12.506 12.274 12.035 11.797 11.598 11.376 11.136 10.941 10.738 10.532 10.304 10.067 9.904 9.728 9.461 9.278 9.075 8.97 8.768 8.548 8.299 8.168 7.694 7.713 7.541 7.369 7.014 6.815 6.556 6.242 5.899 5.492 4.876 3.003 -2 ,13985 ,KEBNE ,17024612,Wed Dec 22 10:34:31 CET,Wed Dec 22 12:07:58 CET,0.0 1.101 1.593 1.932 2.195 2.432 2.646 2.841 3.198 3.351 3.494 3.432 3.903 4.032 4.283 4.511 4.727 4.833 5.039 5.222 5.479 5.652 5.819 6.057 6.278 6.486 6.693 6.899 7.166 7.42 7.653 7.93 8.191 8.441 8.731 9.055 9.365 9.683 10.027 10.404 10.794 11.233 11.744 12.23 12.785 13.38 14.009 14.669 15.372 16.089 16.75 16.978 16.841 16.576 16.281 15.935 15.585 15.231 14.89 14.526 14.211 13.919 13.608 13.316 13.057 12.801 12.525 12.264 12.018 11.773 11.525 11.309 11.077 10.842 10.654 10.456 10.258 10.054 9.828 9.667 9.515 9.28 9.11 8.914 8.807 8.6 8.383 8.134 8.002 7.531 7.587 7.44 7.277 6.89 6.645 6.372 6.102 5.772 5.369 4.884 2.915 -3 ,24850 ,KEBNE ,17024613,Wed Dec 22 10:34:30 CET,Wed Dec 22 12:06:31 CET,0.0 1.056 1.53 1.893 2.189 2.433 2.643 2.854 3.242 3.41 3.565 3.529 4.019 4.152 4.4 4.634 4.85 4.955 5.151 5.338 5.596 5.766 5.94 6.187 6.416 6.64 6.85 7.046 7.301 7.547 7.774 8.03 8.284 8.534 8.831 9.161 9.459 9.777 10.119 10.483 10.869 11.291 11.767 12.243 12.779 13.356 14.003 14.698 15.458 16.188 16.8 17.033 16.945 16.697 16.388 16.062 15.704 15.347 15.042 14.736 14.453 14.161 13.853 13.55 13.266 13.008 12.718 12.447 12.224 11.998 11.751 11.537 11.314 11.077 10.883 10.676 10.459 10.238 10.011 9.853 9.688 9.417 9.237 9.051 8.95 8.729 8.489 8.237 8.105 7.629 7.678 7.515 7.348 6.964 6.741 6.485 6.182 5.834 5.375 4.779 3.003 -4 ,23155 ,KEBNE ,17024614,Wed Dec 22 10:36:36 CET,Wed Dec 22 12:10:30 CET,0.0 1.044 1.468 1.804 2.094 2.356 2.601 2.81 3.174 3.348 3.504 3.441 3.913 4.038 4.294 4.544 4.762 4.862 5.055 5.242 5.523 5.692 5.849 6.083 6.306 6.511 6.714 6.924 7.182 7.422 7.659 7.946 8.222 8.477 8.761 9.074 9.38 9.716 10.075 10.43 10.787 11.189 11.673 12.153 12.706 13.344 14.002 14.67 15.387 16.114 16.768 17.01 16.915 16.665 16.348 15.992 15.62 15.271 14.961 14.627 14.305 14.009 13.737 13.46 13.179 12.913 12.631 12.385 12.174 11.945 11.696 11.481 11.262 11.036 10.849 10.653 10.458 10.232 9.994 9.836 9.665 9.396 9.212 9.026 8.923 8.703 8.46 8.189 8.053 7.575 7.596 7.43 7.252 6.855 6.641 6.399 6.115 5.777 5.343 4.787 3.11 -5 ,21221 ,KEBNE ,17024615,Wed Dec 22 10:36:34 CET,Wed Dec 22 12:08:38 CET,0.0 1.022 1.494 1.875 2.199 2.451 2.665 2.881 3.278 3.446 3.591 3.519 3.999 4.141 4.413 4.643 4.843 4.948 5.162 5.345 5.605 5.774 5.938 6.181 6.405 6.615 6.822 7.029 7.284 7.515 7.743 8.02 8.282 8.527 8.809 9.118 9.408 9.743 10.104 10.478 10.861 11.284 11.758 12.198 12.727 13.303 13.935 14.626 15.354 16.12 16.817 17.07 16.99 16.73 16.406 16.073 15.738 15.394 15.07 14.729 14.414 14.127 13.821 13.529 13.252 12.984 12.715 12.469 12.253 12.028 11.776 11.554 11.317 11.066 10.877 10.691 10.488 10.258 10.014 9.844 9.676 9.415 9.216 9.01 8.905 8.677 8.435 8.164 8.029 7.554 7.589 7.425 7.256 6.897 6.676 6.422 6.139 5.822 5.448 4.885 3.363 -6 ,6106 ,KEBNE ,17024616,Wed Dec 22 10:36:34 CET,Wed Dec 22 12:09:53 CET,0.0 0.944 1.399 1.792 2.083 2.311 2.497 2.667 3.005 3.167 3.321 3.29 3.775 3.908 4.15 4.371 4.59 4.696 4.895 5.096 5.399 5.585 5.758 5.995 6.217 6.426 6.636 6.836 7.065 7.292 7.529 7.809 8.073 8.328 8.623 8.942 9.239 9.572 9.929 10.297 10.67 11.074 11.555 12.042 12.595 13.193 13.85 14.57 15.302 15.992 16.586 16.719 16.577 16.297 15.958 15.605 15.254 14.905 14.564 14.217 13.925 13.653 13.364 13.083 12.819 12.554 12.281 12.038 11.822 11.591 11.331 11.11 10.886 10.648 10.461 10.264 10.051 9.843 9.628 9.47 9.299 9.02 8.834 8.636 8.52 8.272 8.026 7.78 7.64 7.153 7.165 6.994 6.835 6.49 6.27 6.019 5.749 5.39 4.947 4.431 2.592 -7 ,12367 ,KEBNE ,17024617,Wed Dec 22 10:36:34 CET,Wed Dec 22 12:08:35 CET,0.0 0.97 1.391 1.698 1.982 2.223 2.437 2.638 2.968 3.111 3.255 3.193 3.669 3.804 4.071 4.313 4.541 4.652 4.866 5.059 5.321 5.491 5.656 5.899 6.129 6.34 6.536 6.736 6.994 7.253 7.499 7.786 8.069 8.321 8.597 8.902 9.192 9.515 9.863 10.242 10.635 11.04 11.506 11.983 12.511 13.08 13.71 14.357 15.056 15.802 16.503 16.814 16.778 16.538 16.214 15.872 15.53 15.169 14.807 14.44 14.122 13.828 13.548 13.269 12.985 12.713 12.418 12.144 11.911 11.664 11.406 11.191 10.956 10.705 10.522 10.338 10.135 9.919 9.7 9.542 9.356 9.055 8.864 8.679 8.575 8.342 8.105 7.846 7.704 7.225 7.268 7.095 6.89 6.377 6.075 5.725 5.337 4.892 4.416 3.84 2.381 -8 ,3401 ,KEBNE ,17024618,Wed Dec 22 10:38:45 CET,Wed Dec 22 12:08:11 CET,0.0 0.983 1.427 1.777 2.081 2.343 2.565 2.755 3.109 3.271 3.433 3.392 3.861 3.999 4.269 4.503 4.722 4.823 5.027 5.223 5.496 5.67 5.842 6.081 6.299 6.515 6.724 6.92 7.193 7.466 7.71 8.004 8.292 8.553 8.844 9.182 9.498 9.833 10.202 10.597 10.996 11.412 11.89 12.361 12.913 13.549 14.213 14.892 15.609 16.364 17.079 17.377 17.322 17.061 16.665 16.28 15.961 15.625 15.309 14.986 14.673 14.356 14.059 13.783 13.525 13.288 13.026 12.784 12.575 12.354 12.1 11.877 11.654 11.419 11.229 11.03 10.809 10.576 10.355 10.197 10.018 9.748 9.561 9.361 9.252 9.025 8.791 8.54 8.413 7.936 7.973 7.818 7.651 7.275 7.06 6.814 6.536 6.217 5.777 5.151 3.504 -9 ,10435 ,KEBNE ,17024619,Wed Dec 22 10:39:49 CET,Wed Dec 22 12:07:48 CET,0.0 1.235 1.703 2.077 2.362 2.605 2.821 3.007 3.325 3.468 3.621 3.585 4.071 4.197 4.441 4.674 4.882 4.978 5.172 5.365 5.648 5.833 6.003 6.248 6.486 6.704 6.899 7.087 7.341 7.588 7.823 8.11 8.388 8.651 8.959 9.296 9.611 9.947 10.299 10.671 11.074 11.518 12.014 12.492 13.023 13.613 14.265 14.974 15.735 16.479 17.092 17.276 17.14 16.863 16.498 16.125 15.793 15.469 15.171 14.86 14.545 14.246 13.969 13.683 13.406 13.155 12.885 12.638 12.418 12.178 11.924 11.714 11.486 11.243 11.056 10.862 10.659 10.441 10.209 10.051 9.877 9.583 9.391 9.211 9.122 8.911 8.667 8.403 8.259 7.773 7.792 7.621 7.45 7.04 6.791 6.533 6.223 5.851 5.467 4.965 3.26 -10 ,12331 ,KEBNE ,17024620,Wed Dec 22 10:39:49 CET,Wed Dec 22 12:07:59 CET,0.0 1.14 1.607 2.0 2.276 2.509 2.724 2.919 3.267 3.419 3.555 3.493 3.979 4.111 4.361 4.601 4.828 4.93 5.134 5.332 5.615 5.798 5.962 6.197 6.423 6.639 6.851 7.056 7.32 7.578 7.822 8.103 8.377 8.639 8.948 9.29 9.608 9.939 10.287 10.652 11.03 11.46 11.93 12.381 12.904 13.495 14.196 14.941 15.678 16.409 17.085 17.334 17.189 16.887 16.541 16.198 15.854 15.475 15.132 14.802 14.488 14.199 13.912 13.618 13.346 13.096 12.824 12.567 12.349 12.126 11.881 11.664 11.426 11.175 10.984 10.787 10.591 10.375 10.138 9.983 9.815 9.536 9.342 9.136 9.031 8.812 8.577 8.335 8.202 7.726 7.768 7.598 7.42 7.043 6.843 6.641 6.398 6.078 5.686 5.116 3.64 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index e50e22c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18327 ,TETRA ,17530171,Thu Nov 25 03:46:25 CET,Thu Nov 25 05:33:53 CET,0.0 1.375 1.801 2.104 2.368 2.594 2.797 2.99 3.345 3.509 3.655 3.579 4.053 4.19 4.449 4.672 4.867 4.965 5.161 5.34 5.599 5.773 5.945 6.189 6.407 6.611 6.806 6.992 7.233 7.46 7.685 7.977 8.254 8.502 8.795 9.131 9.454 9.797 10.152 10.525 10.902 11.31 11.753 12.17 12.678 13.256 13.894 14.534 15.181 15.857 16.459 16.631 16.449 16.128 15.772 15.368 14.976 14.605 14.258 13.882 13.548 13.261 12.966 12.662 12.375 12.116 11.831 11.557 11.323 11.08 10.819 10.592 10.359 10.116 9.921 9.735 9.537 9.311 9.086 8.928 8.753 8.482 8.287 8.09 7.986 7.748 7.496 7.243 7.116 6.641 6.685 6.517 6.347 5.984 5.769 5.526 5.236 4.905 4.508 4.003 2.72 -2 ,16324 ,TETRA ,17530173,Thu Nov 25 03:46:25 CET,Thu Nov 25 05:34:00 CET,0.0 1.1 1.58 1.922 2.209 2.466 2.7 2.896 3.225 3.382 3.535 3.491 3.97 4.096 4.325 4.529 4.721 4.818 5.009 5.184 5.437 5.602 5.755 5.978 6.2 6.416 6.62 6.809 7.042 7.266 7.487 7.751 8.013 8.269 8.573 8.885 9.161 9.481 9.817 10.175 10.558 10.962 11.411 11.858 12.352 12.886 13.486 14.121 14.803 15.464 16.043 16.255 16.057 15.73 15.359 14.953 14.569 14.202 13.868 13.494 13.149 12.837 12.53 12.244 11.977 11.709 11.425 11.175 10.957 10.735 10.498 10.285 10.054 9.807 9.601 9.386 9.168 8.956 8.727 8.555 8.377 8.108 7.915 7.702 7.598 7.382 7.147 6.912 6.786 6.31 6.359 6.196 6.028 5.635 5.408 5.16 4.879 4.527 4.139 3.664 2.443 -3 ,3722 ,TETRA ,17530174,Thu Nov 25 03:46:26 CET,Thu Nov 25 05:33:03 CET,0.0 1.168 1.631 1.969 2.264 2.519 2.743 2.945 3.289 3.441 3.588 3.525 3.996 4.115 4.353 4.568 4.774 4.876 5.061 5.247 5.505 5.663 5.823 6.061 6.286 6.491 6.684 6.872 7.113 7.337 7.55 7.823 8.09 8.334 8.617 8.933 9.229 9.563 9.931 10.308 10.688 11.114 11.596 12.047 12.561 13.122 13.749 14.428 15.1 15.723 16.252 16.386 16.228 15.941 15.581 15.149 14.738 14.361 14.013 13.627 13.294 12.992 12.673 12.372 12.088 11.819 11.546 11.312 11.098 10.873 10.638 10.434 10.217 9.982 9.801 9.617 9.417 9.203 8.958 8.787 8.623 8.363 8.177 7.981 7.879 7.657 7.416 7.175 7.052 6.584 6.666 6.513 6.324 5.912 5.695 5.438 5.167 4.902 4.556 4.031 2.589 -4 ,15119 ,TETRA ,17530176,Thu Nov 25 03:46:26 CET,Thu Nov 25 05:33:25 CET,0.0 1.032 1.496 1.797 2.059 2.287 2.48 2.657 2.985 3.132 3.274 3.22 3.696 3.82 4.068 4.286 4.473 4.57 4.771 4.96 5.222 5.392 5.557 5.785 6.008 6.224 6.429 6.636 6.889 7.124 7.356 7.617 7.869 8.126 8.414 8.716 9.005 9.325 9.665 10.025 10.391 10.782 11.234 11.697 12.226 12.792 13.42 14.069 14.719 15.403 16.021 16.166 16.004 15.717 15.347 14.968 14.605 14.255 13.94 13.571 13.243 12.96 12.671 12.391 12.126 11.856 11.563 11.31 11.085 10.851 10.621 10.409 10.185 9.959 9.77 9.564 9.357 9.154 8.929 8.752 8.573 8.316 8.138 7.944 7.838 7.625 7.4 7.152 7.02 6.53 6.539 6.381 6.215 5.82 5.613 5.381 5.099 4.776 4.39 3.906 2.939 -9 ,21907 ,TETRA ,17530201,Thu Nov 25 03:46:31 CET,Thu Nov 25 05:31:55 CET,0.0 1.394 1.822 2.166 2.456 2.677 2.88 3.076 3.408 3.556 3.702 3.649 4.114 4.226 4.464 4.695 4.886 4.975 5.165 5.355 5.629 5.795 5.957 6.191 6.405 6.609 6.805 6.993 7.234 7.473 7.7 7.979 8.248 8.487 8.75 9.045 9.343 9.683 10.054 10.438 10.805 11.193 11.621 12.047 12.549 13.094 13.706 14.358 15.048 15.728 16.329 16.444 16.293 16.061 15.753 15.403 15.032 14.656 14.3 13.924 13.589 13.283 12.989 12.692 12.404 12.133 11.847 11.591 11.375 11.148 10.893 10.671 10.437 10.198 10.001 9.794 9.586 9.359 9.129 8.975 8.81 8.544 8.364 8.176 8.083 7.875 7.619 7.355 7.214 6.719 6.735 6.567 6.401 6.033 5.813 5.571 5.315 5.037 4.692 4.2 2.941 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index 259190aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18627-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28814 ,TETRA ,17530213,Thu Nov 25 03:46:28 CET,Thu Nov 25 05:33:28 CET,0.0 1.429 1.977 2.399 2.708 2.961 3.173 3.378 3.775 3.943 4.096 4.048 4.531 4.669 4.911 5.132 5.358 5.47 5.685 5.886 6.168 6.338 6.507 6.768 7.016 7.24 7.45 7.659 7.931 8.184 8.423 8.69 8.937 9.179 9.46 9.777 10.045 10.329 10.651 10.988 11.351 11.746 12.16 12.561 13.009 13.458 13.952 14.445 14.894 15.249 15.317 14.977 14.492 13.95 13.434 12.903 12.36 11.844 11.414 10.985 10.596 10.226 9.866 9.52 9.193 8.882 8.536 8.221 7.96 7.701 7.436 7.218 6.978 6.702 6.479 6.252 6.014 5.778 5.537 5.364 5.189 4.92 4.717 4.501 4.4 4.187 3.946 3.694 3.545 3.034 3.033 2.839 2.632 2.217 1.997 1.79 1.575 1.306 0.977 0.484 -0.871 -3 ,19795 ,TETRA ,17530225,Thu Nov 25 03:47:35 CET,Thu Nov 25 05:33:13 CET,0.0 1.703 2.263 2.669 3.015 3.285 3.513 3.723 4.135 4.312 4.486 4.473 4.956 5.093 5.347 5.609 5.856 5.965 6.158 6.35 6.644 6.817 6.974 7.203 7.428 7.642 7.841 8.031 8.285 8.528 8.762 9.038 9.291 9.542 9.833 10.148 10.429 10.736 11.068 11.403 11.717 12.054 12.466 12.86 13.292 13.757 14.253 14.75 15.226 15.597 15.718 15.359 14.803 14.224 13.65 13.12 12.627 12.119 11.677 11.2 10.769 10.386 10.017 9.649 9.307 9.016 8.693 8.398 8.153 7.887 7.6 7.366 7.143 6.906 6.709 6.5 6.262 6.023 5.783 5.613 5.442 5.149 4.942 4.737 4.63 4.396 4.137 3.882 3.752 3.261 3.283 3.121 2.947 2.529 2.316 2.076 1.801 1.496 1.119 0.627 -0.865 -6 ,9957 ,TETRA ,17530233,Thu Nov 25 03:47:00 CET,Thu Nov 25 05:33:23 CET,0.0 1.484 2.039 2.5 2.841 3.108 3.336 3.553 3.946 4.118 4.283 4.263 4.758 4.895 5.144 5.387 5.62 5.723 5.916 6.113 6.389 6.558 6.717 6.954 7.193 7.409 7.61 7.807 8.062 8.308 8.542 8.815 9.069 9.306 9.577 9.883 10.179 10.482 10.794 11.129 11.456 11.813 12.208 12.583 13.006 13.432 13.898 14.37 14.832 15.241 15.408 15.114 14.613 14.061 13.508 12.966 12.484 12.025 11.606 11.169 10.771 10.412 10.038 9.686 9.36 9.043 8.692 8.38 8.12 7.849 7.568 7.325 7.068 6.797 6.589 6.386 6.181 5.957 5.701 5.525 5.354 5.073 4.869 4.661 4.547 4.318 4.072 3.795 3.654 3.167 3.206 3.048 2.869 2.473 2.26 2.021 1.738 1.403 1.02 0.536 -0.816 -9 ,29315 ,TETRA ,17530239,Thu Nov 25 03:46:59 CET,Thu Nov 25 05:34:44 CET,0.0 1.842 2.401 2.802 3.138 3.432 3.677 3.909 4.318 4.483 4.639 4.587 5.068 5.199 5.439 5.679 5.906 6.008 6.205 6.401 6.689 6.862 7.028 7.275 7.509 7.735 7.952 8.155 8.403 8.64 8.863 9.133 9.386 9.615 9.882 10.191 10.478 10.781 11.101 11.443 11.802 12.189 12.608 12.997 13.468 13.99 14.515 15.011 15.479 15.892 16.051 15.725 15.239 14.661 14.059 13.458 12.941 12.466 12.01 11.579 11.188 10.794 10.425 10.084 9.752 9.446 9.15 8.879 8.632 8.363 8.059 7.798 7.544 7.298 7.088 6.868 6.645 6.408 6.174 6.009 5.831 5.556 5.36 5.152 5.039 4.791 4.52 4.259 4.129 3.64 3.668 3.497 3.315 2.926 2.709 2.453 2.164 1.861 1.486 0.949 -0.534 -10 ,9988 ,TETRA ,17530240,Thu Nov 25 03:46:59 CET,Thu Nov 25 05:33:46 CET,0.0 1.721 2.26 2.627 2.946 3.238 3.489 3.705 4.077 4.254 4.421 4.363 4.838 4.968 5.209 5.444 5.666 5.769 5.975 6.17 6.446 6.62 6.788 7.035 7.263 7.473 7.67 7.86 8.093 8.312 8.529 8.792 9.049 9.293 9.586 9.907 10.189 10.487 10.812 11.143 11.483 11.866 12.262 12.633 13.092 13.58 14.07 14.56 15.028 15.39 15.464 15.136 14.634 14.081 13.527 12.984 12.483 12.004 11.59 11.144 10.749 10.402 10.052 9.708 9.375 9.06 8.727 8.441 8.181 7.913 7.657 7.414 7.148 6.884 6.684 6.463 6.231 5.997 5.747 5.574 5.38 5.085 4.882 4.665 4.562 4.339 4.084 3.821 3.684 3.195 3.203 3.024 2.84 2.435 2.203 1.945 1.652 1.32 0.947 0.451 -0.744 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index f536a5b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3168 ,KEBNE ,17024621,Wed Dec 22 10:40:46 CET,Wed Dec 22 12:13:21 CET,0.0 1.322 1.802 2.147 2.406 2.619 2.823 3.022 3.363 3.508 3.645 3.565 4.014 4.13 4.346 4.547 4.736 4.826 4.999 5.167 5.411 5.557 5.685 5.886 6.1 6.29 6.463 6.629 6.841 7.039 7.238 7.479 7.708 7.929 8.186 8.456 8.693 8.974 9.284 9.586 9.886 10.221 10.595 10.951 11.36 11.79 12.222 12.658 13.108 13.497 13.58 13.206 12.679 12.098 11.537 10.98 10.453 9.965 9.521 9.06 8.646 8.272 7.923 7.571 7.212 6.876 6.544 6.251 5.991 5.716 5.436 5.201 4.948 4.694 4.492 4.257 4.014 3.772 3.508 3.328 3.144 2.849 2.64 2.416 2.295 2.052 1.798 1.518 1.363 0.871 0.919 0.763 0.581 0.17 -0.056 -0.314 -0.602 -0.933 -1.34 -1.961 -3.674 -2 ,19975 ,KEBNE ,17024622,Wed Dec 22 10:40:46 CET,Wed Dec 22 12:14:40 CET,0.0 1.192 1.633 1.977 2.255 2.476 2.648 2.808 3.105 3.258 3.409 3.34 3.804 3.919 4.127 4.327 4.514 4.606 4.793 4.961 5.19 5.339 5.484 5.695 5.885 6.06 6.226 6.394 6.624 6.832 7.022 7.255 7.468 7.68 7.935 8.206 8.471 8.753 9.05 9.366 9.683 10.018 10.372 10.724 11.137 11.58 12.012 12.402 12.786 13.081 13.166 12.802 12.263 11.682 11.139 10.587 10.064 9.583 9.129 8.654 8.249 7.879 7.504 7.144 6.804 6.496 6.172 5.887 5.641 5.364 5.084 4.852 4.604 4.339 4.124 3.907 3.666 3.398 3.132 2.952 2.764 2.47 2.261 2.046 1.935 1.697 1.444 1.167 1.023 0.539 0.53 0.343 0.164 -0.216 -0.429 -0.692 -0.988 -1.296 -1.667 -2.176 -3.516 -3 ,17889 ,KEBNE ,17024623,Wed Dec 22 10:40:46 CET,Wed Dec 22 12:13:11 CET,0.0 1.275 1.71 1.982 2.234 2.468 2.668 2.843 3.156 3.301 3.445 3.394 3.862 3.992 4.225 4.428 4.623 4.717 4.886 5.058 5.315 5.464 5.606 5.812 6.008 6.198 6.372 6.549 6.781 6.986 7.174 7.41 7.641 7.848 8.093 8.377 8.624 8.893 9.174 9.449 9.712 10.005 10.35 10.706 11.093 11.478 11.88 12.293 12.739 13.049 13.047 12.638 12.134 11.619 11.04 10.451 9.904 9.382 8.932 8.478 8.076 7.717 7.363 7.011 6.662 6.337 5.999 5.705 5.445 5.155 4.848 4.598 4.335 4.052 3.834 3.608 3.385 3.166 2.914 2.722 2.524 2.222 2.016 1.797 1.686 1.463 1.211 0.956 0.822 0.339 0.354 0.167 -0.026 -0.433 -0.658 -0.909 -1.234 -1.604 -1.984 -2.453 -3.659 -4 ,28900 ,KEBNE ,17024624,Wed Dec 22 10:41:47 CET,Wed Dec 22 12:14:21 CET,0.0 0.991 1.337 1.604 1.852 2.086 2.317 2.506 2.839 2.996 3.132 3.048 3.501 3.615 3.843 4.055 4.257 4.347 4.515 4.685 4.922 5.067 5.21 5.404 5.58 5.761 5.945 6.128 6.364 6.581 6.769 6.994 7.217 7.42 7.648 7.905 8.159 8.439 8.729 9.017 9.31 9.644 10.002 10.332 10.696 11.083 11.514 11.954 12.371 12.656 12.723 12.376 11.828 11.249 10.693 10.132 9.627 9.117 8.634 8.153 7.742 7.36 6.972 6.611 6.268 5.955 5.637 5.347 5.088 4.815 4.53 4.299 4.049 3.759 3.531 3.306 3.074 2.821 2.576 2.416 2.24 1.953 1.74 1.516 1.405 1.177 0.929 0.656 0.509 0.013 0.012 -0.156 -0.331 -0.732 -0.957 -1.209 -1.502 -1.832 -2.245 -2.795 -4.392 -5 ,18974 ,KEBNE ,17024625,Wed Dec 22 10:41:47 CET,Wed Dec 22 12:15:42 CET,0.0 1.212 1.637 1.974 2.26 2.504 2.711 2.894 3.237 3.397 3.543 3.471 3.935 4.055 4.271 4.476 4.666 4.752 4.919 5.08 5.31 5.468 5.615 5.818 6.025 6.212 6.393 6.56 6.769 6.972 7.164 7.406 7.635 7.856 8.095 8.357 8.622 8.903 9.193 9.492 9.807 10.149 10.517 10.89 11.29 11.678 12.098 12.535 12.936 13.264 13.36 13.032 12.532 11.926 11.313 10.714 10.163 9.626 9.15 8.668 8.248 7.863 7.463 7.085 6.732 6.406 6.075 5.781 5.504 5.213 4.926 4.68 4.432 4.164 3.948 3.724 3.487 3.244 2.987 2.801 2.612 2.317 2.103 1.889 1.776 1.53 1.27 0.999 0.857 0.369 0.395 0.213 0.022 -0.368 -0.606 -0.869 -1.147 -1.463 -1.887 -2.492 -4.541 -6 ,1213 ,KEBNE ,17024626,Wed Dec 22 10:41:47 CET,Wed Dec 22 12:14:39 CET,0.0 1.005 1.468 1.802 2.059 2.283 2.499 2.696 3.042 3.203 3.349 3.255 3.708 3.836 4.081 4.288 4.486 4.579 4.75 4.915 5.165 5.318 5.457 5.671 5.881 6.078 6.264 6.441 6.672 6.884 7.087 7.326 7.545 7.765 8.023 8.293 8.539 8.798 9.059 9.36 9.692 10.05 10.427 10.764 11.15 11.545 11.957 12.385 12.831 13.201 13.35 13.09 12.588 11.985 11.4 10.856 10.337 9.818 9.344 8.878 8.465 8.089 7.72 7.35 7.005 6.684 6.34 6.044 5.782 5.492 5.186 4.929 4.656 4.357 4.124 3.907 3.69 3.441 3.181 3.009 2.829 2.544 2.334 2.115 2.005 1.771 1.521 1.254 1.11 0.617 0.617 0.421 0.219 -0.208 -0.445 -0.695 -0.987 -1.319 -1.715 -2.21 -3.448 -7 ,27027 ,KEBNE ,17024627,Wed Dec 22 10:41:47 CET,Wed Dec 22 12:14:27 CET,0.0 1.021 1.462 1.791 2.047 2.264 2.45 2.622 2.955 3.115 3.267 3.201 3.662 3.781 4.015 4.223 4.409 4.501 4.68 4.856 5.116 5.276 5.424 5.638 5.829 6.009 6.192 6.366 6.582 6.795 7.002 7.24 7.468 7.683 7.917 8.181 8.45 8.734 9.019 9.324 9.637 9.976 10.358 10.721 11.096 11.479 11.898 12.308 12.699 13.06 13.261 13.011 12.479 11.877 11.302 10.719 10.156 9.631 9.19 8.733 8.301 7.9 7.516 7.162 6.827 6.525 6.208 5.897 5.634 5.369 5.078 4.83 4.559 4.276 4.06 3.844 3.615 3.372 3.106 2.92 2.748 2.477 2.28 2.065 1.949 1.705 1.457 1.211 1.07 0.578 0.616 0.449 0.27 -0.108 -0.311 -0.548 -0.833 -1.168 -1.534 -2.052 -3.327 -8 ,28380 ,KEBNE ,17024628,Wed Dec 22 10:41:47 CET,Wed Dec 22 12:15:41 CET,0.0 1.098 1.506 1.832 2.095 2.331 2.53 2.706 3.041 3.191 3.329 3.267 3.734 3.85 4.068 4.267 4.478 4.582 4.75 4.897 5.117 5.254 5.391 5.603 5.799 5.992 6.183 6.36 6.578 6.791 6.989 7.222 7.439 7.642 7.876 8.142 8.398 8.678 8.977 9.271 9.57 9.899 10.293 10.667 11.079 11.516 11.977 12.47 12.922 13.283 13.363 12.952 12.411 11.852 11.276 10.718 10.207 9.723 9.293 8.845 8.434 8.076 7.74 7.391 7.046 6.724 6.399 6.11 5.841 5.559 5.264 5.016 4.767 4.497 4.288 4.085 3.867 3.624 3.355 3.175 2.988 2.692 2.484 2.26 2.151 1.935 1.697 1.413 1.262 0.769 0.798 0.626 0.433 0.049 -0.164 -0.411 -0.688 -0.982 -1.336 -1.856 -3.307 -9 ,26284 ,KEBNE ,17024629,Wed Dec 22 10:41:47 CET,Wed Dec 22 12:14:26 CET,0.0 1.151 1.628 1.985 2.259 2.486 2.677 2.855 3.179 3.329 3.467 3.384 3.843 3.962 4.183 4.387 4.582 4.677 4.854 5.026 5.274 5.424 5.57 5.782 5.981 6.161 6.323 6.494 6.711 6.898 7.086 7.337 7.58 7.801 8.05 8.332 8.598 8.858 9.133 9.428 9.718 10.038 10.428 10.836 11.293 11.715 12.133 12.581 12.989 13.267 13.295 12.921 12.402 11.822 11.244 10.673 10.118 9.596 9.148 8.71 8.325 7.968 7.597 7.238 6.921 6.62 6.278 5.958 5.689 5.418 5.135 4.895 4.644 4.376 4.157 3.921 3.68 3.425 3.162 2.98 2.786 2.486 2.274 2.053 1.937 1.69 1.438 1.17 1.03 0.543 0.547 0.369 0.175 -0.256 -0.49 -0.729 -0.999 -1.336 -1.76 -2.336 -4.221 -10 ,16314 ,KEBNE ,17024630,Wed Dec 22 10:41:48 CET,Wed Dec 22 12:14:36 CET,0.0 1.045 1.454 1.744 1.989 2.234 2.453 2.637 2.951 3.077 3.196 3.09 3.533 3.643 3.844 4.033 4.215 4.303 4.468 4.618 4.835 4.981 5.129 5.33 5.513 5.694 5.871 6.038 6.255 6.457 6.643 6.878 7.1 7.301 7.537 7.797 8.058 8.338 8.622 8.928 9.233 9.563 9.916 10.24 10.61 10.99 11.396 11.81 12.213 12.529 12.542 12.123 11.563 10.944 10.365 9.809 9.303 8.821 8.388 7.941 7.524 7.13 6.753 6.41 6.097 5.799 5.471 5.173 4.921 4.656 4.364 4.118 3.868 3.597 3.376 3.143 2.912 2.687 2.431 2.25 2.055 1.74 1.533 1.318 1.212 0.997 0.749 0.475 0.335 -0.148 -0.129 -0.309 -0.501 -0.91 -1.147 -1.404 -1.664 -1.991 -2.393 -2.93 -4.985 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt deleted file mode 100644 index dafbbadc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18628-1_18625-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16434 ,TETRA ,17530250,Thu Nov 25 03:47:00 CET,Thu Nov 25 05:34:09 CET,0.0 1.526 2.003 2.344 2.677 2.983 3.237 3.454 3.843 4.0 4.141 4.09 4.562 4.699 4.972 5.221 5.447 5.546 5.74 5.936 6.215 6.382 6.528 6.742 6.961 7.17 7.366 7.558 7.8 8.015 8.218 8.464 8.698 8.921 9.157 9.4 9.629 9.883 10.123 10.379 10.692 11.025 11.352 11.666 11.99 12.313 12.638 12.885 13.049 13.036 12.545 11.562 10.577 9.653 8.813 8.049 7.339 6.649 6.075 5.502 4.974 4.491 4.041 3.61 3.198 2.818 2.415 2.045 1.733 1.417 1.079 0.81 0.517 0.213 -0.017 -0.268 -0.528 -0.775 -1.023 -1.218 -1.434 -1.773 -2.0 -2.237 -2.358 -2.613 -2.881 -3.165 -3.324 -3.83 -3.848 -4.042 -4.235 -4.652 -4.899 -5.173 -5.467 -5.794 -6.199 -6.74 -8.432 -2 ,406 ,TETRA ,17530251,Thu Nov 25 03:46:59 CET,Thu Nov 25 05:34:43 CET,0.0 1.617 2.181 2.557 2.841 3.105 3.355 3.595 3.984 4.141 4.309 4.289 4.753 4.872 5.097 5.312 5.542 5.648 5.824 5.996 6.249 6.409 6.556 6.779 7.003 7.218 7.425 7.612 7.833 8.039 8.232 8.449 8.657 8.861 9.091 9.355 9.602 9.843 10.118 10.417 10.709 11.029 11.358 11.65 11.951 12.247 12.557 12.822 12.989 12.946 12.505 11.613 10.634 9.679 8.82 8.066 7.381 6.716 6.104 5.493 4.969 4.477 4.029 3.634 3.252 2.883 2.497 2.159 1.857 1.529 1.185 0.9 0.614 0.32 0.077 -0.181 -0.451 -0.731 -0.997 -1.181 -1.391 -1.715 -1.932 -2.16 -2.284 -2.552 -2.819 -3.09 -3.242 -3.749 -3.748 -3.934 -4.124 -4.54 -4.781 -5.044 -5.331 -5.654 -6.076 -6.614 -7.666 -3 ,26997 ,TETRA ,17530253,Thu Nov 25 03:46:59 CET,Thu Nov 25 05:34:02 CET,0.0 1.758 2.281 2.655 2.974 3.253 3.492 3.703 4.084 4.27 4.435 4.386 4.855 4.993 5.26 5.502 5.726 5.835 6.033 6.215 6.487 6.645 6.794 7.021 7.246 7.451 7.622 7.783 8.011 8.223 8.427 8.678 8.91 9.121 9.348 9.602 9.85 10.104 10.366 10.645 10.921 11.238 11.595 11.891 12.175 12.452 12.727 12.971 13.144 13.113 12.613 11.626 10.645 9.721 8.867 8.068 7.334 6.651 6.062 5.452 4.938 4.476 4.007 3.553 3.144 2.798 2.43 2.083 1.784 1.473 1.152 0.887 0.592 0.275 0.028 -0.239 -0.509 -0.777 -1.063 -1.261 -1.464 -1.779 -2.002 -2.232 -2.351 -2.616 -2.895 -3.191 -3.348 -3.853 -3.837 -4.025 -4.228 -4.625 -4.849 -5.114 -5.415 -5.76 -6.147 -6.626 -8.377 -5 ,20714 ,TETRA ,17530266,Thu Nov 25 03:46:59 CET,Thu Nov 25 05:34:24 CET,0.0 1.263 1.76 2.128 2.441 2.724 2.954 3.146 3.507 3.686 3.858 3.829 4.308 4.452 4.709 4.94 5.167 5.278 5.482 5.669 5.931 6.097 6.249 6.46 6.664 6.855 7.045 7.225 7.454 7.671 7.869 8.099 8.315 8.533 8.785 9.048 9.292 9.558 9.852 10.142 10.42 10.724 11.033 11.324 11.625 11.904 12.18 12.427 12.596 12.564 12.092 11.107 10.138 9.264 8.474 7.69 6.962 6.33 5.77 5.161 4.63 4.174 3.714 3.263 2.858 2.498 2.112 1.75 1.433 1.1 0.762 0.483 0.19 -0.126 -0.375 -0.632 -0.902 -1.174 -1.458 -1.652 -1.857 -2.176 -2.393 -2.622 -2.741 -2.993 -3.251 -3.532 -3.687 -4.201 -4.227 -4.409 -4.593 -5.003 -5.23 -5.495 -5.814 -6.163 -6.594 -7.147 -8.986 -7 ,7174 ,TETRA ,17530274,Thu Nov 25 03:47:00 CET,Thu Nov 25 05:35:11 CET,0.0 2.016 2.597 3.007 3.307 3.585 3.846 4.069 4.456 4.626 4.786 4.743 5.219 5.355 5.597 5.819 6.043 6.15 6.354 6.554 6.837 7.016 7.191 7.419 7.631 7.847 8.047 8.228 8.449 8.664 8.865 9.104 9.334 9.559 9.826 10.092 10.323 10.588 10.85 11.091 11.347 11.629 11.918 12.211 12.554 12.892 13.22 13.49 13.641 13.544 13.019 12.129 11.172 10.202 9.336 8.543 7.817 7.153 6.518 5.878 5.358 4.879 4.43 4.027 3.66 3.319 2.943 2.592 2.292 1.973 1.631 1.359 1.088 0.797 0.562 0.31 0.042 -0.226 -0.514 -0.72 -0.929 -1.257 -1.494 -1.748 -1.871 -2.127 -2.413 -2.703 -2.856 -3.366 -3.362 -3.539 -3.732 -4.153 -4.392 -4.647 -4.925 -5.266 -5.685 -6.303 -8.412 -8 ,24298 ,TETRA ,17530276,Thu Nov 25 03:47:02 CET,Thu Nov 25 05:35:02 CET,0.0 1.681 2.185 2.54 2.835 3.1 3.334 3.545 3.928 4.107 4.264 4.239 4.725 4.859 5.12 5.345 5.555 5.66 5.866 6.059 6.329 6.499 6.658 6.881 7.082 7.279 7.47 7.666 7.91 8.121 8.331 8.587 8.818 9.024 9.265 9.531 9.775 10.022 10.265 10.512 10.766 11.05 11.393 11.73 12.073 12.4 12.695 12.948 13.109 13.038 12.528 11.566 10.587 9.682 8.869 8.068 7.336 6.703 6.148 5.564 5.04 4.576 4.143 3.717 3.324 2.956 2.538 2.165 1.868 1.56 1.24 0.966 0.68 0.382 0.137 -0.11 -0.361 -0.622 -0.902 -1.104 -1.305 -1.606 -1.834 -2.075 -2.195 -2.452 -2.729 -3.019 -3.175 -3.683 -3.681 -3.859 -4.058 -4.508 -4.75 -5.047 -5.375 -5.698 -6.099 -6.682 -8.363 -9 ,4675 ,TETRA ,17530277,Thu Nov 25 03:47:05 CET,Thu Nov 25 05:34:55 CET,0.0 1.387 1.906 2.272 2.571 2.826 3.048 3.263 3.646 3.81 3.978 3.951 4.433 4.565 4.818 5.067 5.286 5.391 5.598 5.788 6.036 6.197 6.359 6.591 6.818 7.046 7.244 7.42 7.656 7.873 8.066 8.284 8.504 8.734 8.98 9.227 9.461 9.694 9.956 10.252 10.527 10.834 11.18 11.49 11.813 12.111 12.396 12.587 12.67 12.646 12.231 11.264 10.2 9.26 8.429 7.609 6.876 6.206 5.608 5.012 4.514 4.07 3.637 3.243 2.858 2.476 2.078 1.724 1.43 1.125 0.805 0.525 0.225 -0.073 -0.311 -0.567 -0.823 -1.09 -1.365 -1.547 -1.742 -2.066 -2.291 -2.532 -2.654 -2.9 -3.171 -3.471 -3.63 -4.129 -4.099 -4.264 -4.442 -4.855 -5.088 -5.356 -5.656 -6.0 -6.409 -6.928 -8.45 -10 ,32711 ,TETRA ,17530279,Thu Nov 25 03:47:07 CET,Thu Nov 25 05:34:27 CET,0.0 1.302 1.865 2.3 2.641 2.899 3.122 3.34 3.738 3.913 4.075 4.025 4.48 4.595 4.832 5.071 5.286 5.379 5.557 5.733 5.995 6.166 6.325 6.552 6.758 6.943 7.133 7.314 7.541 7.756 7.959 8.192 8.411 8.618 8.854 9.106 9.336 9.596 9.867 10.123 10.392 10.691 11.005 11.294 11.602 11.935 12.238 12.419 12.543 12.511 11.987 10.966 9.999 9.077 8.185 7.398 6.685 5.999 5.404 4.817 4.311 3.849 3.393 2.949 2.558 2.212 1.821 1.455 1.137 0.805 0.464 0.174 -0.133 -0.446 -0.695 -0.945 -1.2 -1.474 -1.757 -1.959 -2.165 -2.487 -2.722 -2.964 -3.091 -3.357 -3.635 -3.934 -4.086 -4.587 -4.58 -4.765 -4.969 -5.4 -5.628 -5.871 -6.152 -6.495 -6.918 -7.436 -8.894 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index cdd0a8eb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21541 ,TETRA ,17530296,Thu Nov 25 03:47:00 CET,Thu Nov 25 05:34:48 CET,0.0 0.934 1.361 1.75 2.064 2.309 2.532 2.739 3.091 3.235 3.385 3.329 3.802 3.927 4.179 4.412 4.621 4.717 4.911 5.109 5.37 5.529 5.687 5.928 6.169 6.386 6.585 6.781 7.034 7.279 7.518 7.799 8.057 8.298 8.596 8.931 9.245 9.579 9.935 10.319 10.711 11.135 11.629 12.112 12.671 13.282 13.936 14.637 15.386 16.152 16.856 17.189 17.167 17.008 16.825 16.551 16.233 15.921 15.613 15.275 14.97 14.674 14.367 14.079 13.836 13.607 13.344 13.112 12.908 12.689 12.449 12.245 12.035 11.819 11.648 11.458 11.244 11.022 10.805 10.65 10.485 10.217 10.017 9.813 9.714 9.512 9.298 9.052 8.911 8.424 8.435 8.26 8.095 7.735 7.509 7.259 7.007 6.712 6.34 5.876 4.629 -2 ,28556 ,TETRA ,17530297,Thu Nov 25 03:47:01 CET,Thu Nov 25 05:35:08 CET,0.0 1.455 1.991 2.351 2.612 2.856 3.083 3.28 3.661 3.831 3.981 3.941 4.423 4.552 4.805 5.028 5.249 5.358 5.553 5.737 6.005 6.176 6.335 6.566 6.78 6.991 7.191 7.37 7.616 7.87 8.104 8.384 8.657 8.914 9.217 9.551 9.853 10.183 10.532 10.894 11.283 11.705 12.177 12.674 13.229 13.797 14.47 15.199 15.946 16.742 17.518 17.854 17.8 17.582 17.286 16.936 16.602 16.309 16.006 15.658 15.353 15.087 14.831 14.565 14.313 14.086 13.839 13.604 13.393 13.162 12.897 12.674 12.463 12.24 12.059 11.871 11.673 11.472 11.247 11.085 10.932 10.681 10.493 10.31 10.212 9.99 9.766 9.534 9.407 8.929 8.964 8.816 8.674 8.307 8.109 7.897 7.615 7.303 6.908 6.364 5.162 -5 ,10122 ,TETRA ,17530303,Thu Nov 25 03:47:05 CET,Thu Nov 25 05:34:58 CET,0.0 1.397 1.996 2.353 2.637 2.864 3.08 3.296 3.651 3.808 3.967 3.905 4.378 4.499 4.711 4.919 5.128 5.227 5.412 5.597 5.885 6.071 6.239 6.475 6.694 6.901 7.117 7.321 7.563 7.799 8.036 8.297 8.541 8.799 9.102 9.445 9.768 10.105 10.463 10.84 11.244 11.702 12.221 12.716 13.271 13.893 14.552 15.229 16.016 16.823 17.585 17.979 17.976 17.813 17.592 17.317 17.013 16.714 16.419 16.112 15.82 15.528 15.265 14.997 14.737 14.501 14.218 13.967 13.752 13.523 13.287 13.073 12.842 12.598 12.416 12.238 12.038 11.817 11.592 11.434 11.267 11.003 10.812 10.611 10.507 10.286 10.058 9.813 9.684 9.217 9.283 9.136 8.973 8.595 8.368 8.133 7.884 7.587 7.194 6.647 4.943 -6 ,26325 ,TETRA ,17530310,Thu Nov 25 03:47:07 CET,Thu Nov 25 05:34:42 CET,0.0 1.373 1.873 2.248 2.517 2.752 2.976 3.176 3.546 3.705 3.85 3.768 4.226 4.34 4.56 4.773 4.985 5.087 5.286 5.467 5.716 5.88 6.041 6.257 6.462 6.666 6.863 7.051 7.299 7.542 7.781 8.051 8.312 8.579 8.875 9.197 9.501 9.833 10.171 10.544 10.947 11.359 11.826 12.314 12.88 13.499 14.183 14.884 15.636 16.469 17.257 17.58 17.558 17.384 17.122 16.863 16.605 16.302 16.01 15.701 15.424 15.163 14.899 14.65 14.404 14.155 13.877 13.617 13.397 13.179 12.947 12.737 12.514 12.28 12.097 11.916 11.725 11.527 11.322 11.171 11.011 10.754 10.559 10.359 10.256 10.035 9.802 9.548 9.424 8.969 9.025 8.865 8.696 8.317 8.111 7.89 7.641 7.352 6.993 6.526 5.013 -7 ,22217 ,TETRA ,17530313,Thu Nov 25 03:47:01 CET,Thu Nov 25 05:34:58 CET,0.0 1.155 1.595 1.914 2.185 2.425 2.615 2.802 3.182 3.36 3.519 3.456 3.937 4.065 4.313 4.534 4.737 4.837 5.025 5.202 5.465 5.629 5.788 6.019 6.24 6.459 6.666 6.858 7.11 7.349 7.563 7.827 8.086 8.344 8.652 8.984 9.285 9.607 9.946 10.316 10.717 11.17 11.688 12.177 12.723 13.294 13.956 14.694 15.484 16.29 17.028 17.334 17.308 17.109 16.824 16.538 16.251 15.95 15.675 15.367 15.083 14.835 14.575 14.296 14.041 13.821 13.589 13.377 13.181 12.96 12.734 12.549 12.345 12.141 11.974 11.782 11.576 11.364 11.149 10.983 10.804 10.546 10.362 10.157 10.05 9.84 9.63 9.404 9.284 8.829 8.901 8.751 8.582 8.239 8.041 7.799 7.531 7.174 6.764 6.261 4.606 -8 ,28666 ,TETRA ,17530314,Thu Nov 25 03:47:01 CET,Thu Nov 25 05:34:58 CET,0.0 1.266 1.759 2.115 2.392 2.627 2.841 3.021 3.331 3.483 3.638 3.581 4.066 4.197 4.441 4.66 4.869 4.973 5.172 5.358 5.616 5.777 5.928 6.152 6.37 6.586 6.802 6.997 7.245 7.503 7.749 8.029 8.3 8.561 8.849 9.163 9.483 9.84 10.208 10.586 10.978 11.4 11.888 12.4 12.969 13.593 14.307 15.03 15.786 16.556 17.301 17.662 17.673 17.495 17.247 16.973 16.659 16.307 15.99 15.679 15.391 15.107 14.817 14.544 14.281 14.028 13.764 13.525 13.315 13.095 12.867 12.68 12.472 12.249 12.067 11.875 11.68 11.473 11.247 11.079 10.914 10.667 10.491 10.298 10.196 9.987 9.752 9.518 9.401 8.927 8.968 8.819 8.65 8.275 8.065 7.826 7.571 7.285 6.888 6.338 4.745 -9 ,23431 ,TETRA ,17530316,Thu Nov 25 03:47:01 CET,Thu Nov 25 05:34:44 CET,0.0 1.032 1.512 1.89 2.182 2.436 2.664 2.864 3.192 3.342 3.481 3.396 3.876 4.013 4.254 4.483 4.7 4.804 5.004 5.184 5.452 5.623 5.783 6.01 6.215 6.413 6.607 6.808 7.059 7.298 7.54 7.803 8.045 8.283 8.576 8.91 9.225 9.56 9.909 10.279 10.659 11.089 11.598 12.087 12.632 13.207 13.841 14.541 15.345 16.185 17.001 17.407 17.381 17.216 16.963 16.657 16.33 15.979 15.686 15.398 15.12 14.845 14.57 14.333 14.108 13.871 13.608 13.385 13.196 12.987 12.755 12.548 12.33 12.098 11.91 11.721 11.527 11.325 11.103 10.948 10.788 10.523 10.344 10.157 10.061 9.857 9.622 9.364 9.227 8.753 8.81 8.658 8.495 8.129 7.916 7.685 7.436 7.156 6.801 6.334 5.099 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index 189a4ef9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18629-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31459 ,TETRA ,17530328,Thu Nov 25 03:47:05 CET,Thu Nov 25 05:32:57 CET,0.0 1.6 2.125 2.514 2.86 3.154 3.419 3.67 4.084 4.27 4.463 4.458 4.953 5.101 5.393 5.664 5.904 6.012 6.214 6.418 6.716 6.896 7.068 7.314 7.542 7.761 7.973 8.181 8.443 8.689 8.918 9.197 9.467 9.724 10.014 10.339 10.643 10.959 11.31 11.684 12.049 12.425 12.867 13.325 13.827 14.358 14.938 15.54 16.147 16.731 17.09 17.012 16.723 16.315 15.861 15.39 14.946 14.533 14.167 13.763 13.402 13.085 12.775 12.468 12.164 11.884 11.598 11.33 11.09 10.834 10.578 10.372 10.137 9.886 9.691 9.479 9.257 9.027 8.786 8.611 8.443 8.184 7.987 7.775 7.66 7.429 7.186 6.913 6.782 6.303 6.342 6.185 6.011 5.612 5.378 5.131 4.864 4.573 4.243 3.728 2.108 -4 ,9294 ,TETRA ,17530333,Thu Nov 25 03:47:35 CET,Thu Nov 25 05:34:42 CET,0.0 1.497 1.973 2.371 2.665 2.918 3.17 3.406 3.814 3.983 4.14 4.091 4.576 4.719 4.997 5.255 5.48 5.588 5.798 6.006 6.304 6.475 6.636 6.89 7.131 7.364 7.59 7.789 8.045 8.305 8.549 8.835 9.105 9.363 9.663 9.987 10.296 10.608 10.933 11.283 11.654 12.062 12.523 12.961 13.434 13.942 14.463 14.998 15.539 16.073 16.453 16.35 15.978 15.509 15.027 14.543 14.102 13.702 13.339 12.97 12.629 12.276 11.937 11.613 11.302 11.014 10.699 10.42 10.179 9.93 9.665 9.441 9.199 8.937 8.746 8.54 8.304 8.061 7.811 7.637 7.462 7.178 6.978 6.777 6.683 6.464 6.204 5.954 5.82 5.324 5.358 5.17 4.97 4.585 4.37 4.11 3.804 3.467 3.069 2.5 0.652 -5 ,15413 ,TETRA ,17530335,Thu Nov 25 03:47:35 CET,Thu Nov 25 05:35:22 CET,0.0 1.65 2.197 2.58 2.918 3.215 3.475 3.683 4.017 4.183 4.351 4.318 4.806 4.941 5.186 5.407 5.631 5.739 5.96 6.174 6.449 6.621 6.791 7.041 7.272 7.483 7.686 7.89 8.164 8.422 8.659 8.955 9.228 9.493 9.805 10.12 10.407 10.722 11.07 11.443 11.811 12.186 12.616 13.051 13.534 14.036 14.588 15.179 15.749 16.272 16.639 16.514 16.137 15.723 15.284 14.815 14.355 13.902 13.486 13.066 12.709 12.392 12.071 11.717 11.381 11.103 10.821 10.568 10.334 10.081 9.803 9.565 9.319 9.066 8.876 8.666 8.446 8.219 7.975 7.812 7.643 7.364 7.165 6.961 6.86 6.646 6.414 6.166 6.037 5.563 5.64 5.487 5.314 4.928 4.706 4.468 4.195 3.849 3.441 2.878 1.362 -6 ,5225 ,TETRA ,17530348,Thu Nov 25 03:48:35 CET,Thu Nov 25 05:35:43 CET,0.0 1.726 2.206 2.613 2.95 3.231 3.49 3.737 4.12 4.29 4.458 4.427 4.91 5.052 5.316 5.564 5.817 5.927 6.123 6.316 6.604 6.783 6.952 7.199 7.432 7.654 7.87 8.085 8.356 8.611 8.86 9.159 9.428 9.669 9.966 10.31 10.624 10.951 11.284 11.64 12.005 12.408 12.874 13.323 13.813 14.316 14.849 15.392 15.97 16.51 16.861 16.748 16.411 15.989 15.543 15.083 14.657 14.232 13.838 13.429 13.059 12.743 12.429 12.126 11.838 11.546 11.228 10.962 10.743 10.497 10.218 9.979 9.74 9.49 9.297 9.093 8.878 8.65 8.397 8.225 8.052 7.777 7.577 7.37 7.263 7.041 6.816 6.576 6.45 5.979 6.017 5.85 5.675 5.291 5.062 4.813 4.529 4.204 3.833 3.294 1.657 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 8703cce9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30595 ,TETRA ,17530369,Thu Nov 25 03:47:38 CET,Thu Nov 25 05:33:51 CET,0.0 1.108 1.493 1.767 2.012 2.241 2.47 2.665 2.998 3.15 3.304 3.25 3.729 3.853 4.093 4.33 4.556 4.661 4.851 5.03 5.281 5.441 5.601 5.836 6.056 6.271 6.474 6.67 6.914 7.15 7.382 7.662 7.931 8.19 8.481 8.796 9.094 9.412 9.75 10.103 10.5 10.947 11.433 11.931 12.475 13.037 13.711 14.455 15.198 15.94 16.653 16.918 16.846 16.634 16.342 16.019 15.706 15.409 15.147 14.83 14.524 14.255 13.991 13.745 13.51 13.284 13.047 12.805 12.588 12.377 12.154 11.954 11.73 11.492 11.308 11.115 10.912 10.693 10.458 10.295 10.131 9.872 9.675 9.477 9.376 9.157 8.942 8.73 8.606 8.122 8.142 7.977 7.811 7.446 7.24 7.017 6.771 6.477 6.081 5.585 4.283 -2 ,26244 ,TETRA ,17530371,Thu Nov 25 03:47:35 CET,Thu Nov 25 05:34:54 CET,0.0 1.042 1.547 1.901 2.196 2.458 2.681 2.883 3.232 3.395 3.544 3.464 3.944 4.083 4.338 4.565 4.778 4.875 5.06 5.248 5.515 5.683 5.848 6.085 6.313 6.528 6.736 6.942 7.201 7.444 7.692 8.004 8.292 8.545 8.842 9.172 9.478 9.813 10.157 10.51 10.879 11.287 11.768 12.25 12.792 13.373 14.006 14.685 15.426 16.203 16.91 17.205 17.142 16.889 16.557 16.24 15.938 15.616 15.312 14.986 14.68 14.394 14.117 13.841 13.569 13.313 13.05 12.836 12.642 12.411 12.16 11.94 11.701 11.456 11.274 11.089 10.892 10.68 10.459 10.304 10.14 9.89 9.707 9.514 9.415 9.206 8.985 8.723 8.581 8.097 8.148 7.991 7.819 7.443 7.222 6.994 6.742 6.416 6.03 5.514 4.132 -3 ,27817 ,TETRA ,17530373,Thu Nov 25 03:47:35 CET,Thu Nov 25 05:35:19 CET,0.0 1.055 1.483 1.799 2.054 2.305 2.529 2.71 3.044 3.198 3.334 3.258 3.743 3.866 4.094 4.309 4.518 4.625 4.825 5.004 5.265 5.435 5.597 5.848 6.092 6.306 6.511 6.71 6.956 7.197 7.421 7.674 7.926 8.175 8.469 8.788 9.095 9.444 9.807 10.185 10.581 11.026 11.541 12.02 12.554 13.127 13.755 14.436 15.143 15.868 16.633 16.965 16.851 16.599 16.35 16.075 15.744 15.404 15.074 14.726 14.422 14.146 13.87 13.593 13.324 13.06 12.776 12.533 12.322 12.086 11.836 11.636 11.427 11.207 11.039 10.862 10.658 10.432 10.195 10.032 9.857 9.579 9.385 9.192 9.097 8.885 8.644 8.376 8.241 7.77 7.821 7.665 7.488 7.074 6.847 6.597 6.341 6.05 5.634 5.071 3.795 -5 ,2020 ,TETRA ,17530376,Thu Nov 25 03:47:36 CET,Thu Nov 25 05:37:55 CET,0.0 1.067 1.463 1.782 2.028 2.253 2.472 2.673 3.027 3.183 3.331 3.258 3.733 3.868 4.118 4.35 4.564 4.666 4.868 5.049 5.305 5.471 5.641 5.874 6.088 6.3 6.499 6.702 6.96 7.187 7.399 7.659 7.906 8.151 8.443 8.769 9.083 9.42 9.791 10.169 10.563 10.99 11.447 11.912 12.445 13.028 13.68 14.379 15.148 15.933 16.627 16.85 16.744 16.512 16.238 15.951 15.642 15.336 15.062 14.754 14.45 14.176 13.901 13.615 13.345 13.106 12.854 12.618 12.407 12.18 11.935 11.721 11.488 11.25 11.079 10.897 10.709 10.495 10.254 10.088 9.913 9.666 9.488 9.279 9.173 8.958 8.729 8.476 8.334 7.851 7.901 7.75 7.595 7.219 7.002 6.775 6.515 6.185 5.787 5.267 3.956 -6 ,3451 ,TETRA ,17530377,Thu Nov 25 03:47:36 CET,Thu Nov 25 05:34:43 CET,0.0 1.148 1.578 1.985 2.379 2.733 3.048 3.279 3.611 3.769 3.922 3.848 4.308 4.429 4.671 4.897 5.112 5.216 5.418 5.611 5.867 6.03 6.196 6.428 6.645 6.857 7.053 7.238 7.48 7.713 7.943 8.215 8.48 8.732 9.019 9.354 9.659 9.979 10.326 10.687 11.055 11.457 11.956 12.464 13.026 13.628 14.282 14.984 15.722 16.469 17.144 17.416 17.367 17.164 16.902 16.584 16.243 15.913 15.601 15.278 14.991 14.711 14.419 14.136 13.873 13.623 13.357 13.113 12.888 12.649 12.415 12.21 11.983 11.735 11.533 11.328 11.119 10.898 10.664 10.501 10.338 10.077 9.894 9.703 9.604 9.399 9.163 8.905 8.759 8.27 8.291 8.118 7.951 7.597 7.405 7.178 6.892 6.579 6.21 5.658 4.507 -7 ,31438 ,TETRA ,17530388,Thu Nov 25 03:47:38 CET,Thu Nov 25 05:35:31 CET,0.0 1.114 1.55 1.893 2.182 2.433 2.644 2.849 3.23 3.392 3.546 3.484 3.969 4.098 4.332 4.555 4.766 4.862 5.048 5.228 5.496 5.658 5.805 6.035 6.268 6.49 6.694 6.89 7.151 7.408 7.641 7.894 8.142 8.379 8.656 8.965 9.255 9.591 9.959 10.353 10.753 11.187 11.664 12.127 12.681 13.271 13.917 14.577 15.28 16.041 16.754 17.036 16.978 16.761 16.486 16.191 15.856 15.528 15.212 14.867 14.577 14.303 14.007 13.726 13.463 13.207 12.953 12.701 12.474 12.256 12.003 11.781 11.562 11.337 11.15 10.946 10.741 10.53 10.317 10.166 10.002 9.768 9.611 9.442 9.357 9.19 8.995 8.767 8.647 8.182 8.268 8.128 7.983 7.655 7.46 7.266 7.047 6.763 6.433 6.055 5.216 -9 ,17765 ,TETRA ,17530391,Thu Nov 25 03:47:38 CET,Thu Nov 25 05:31:55 CET,0.0 1.308 1.801 2.2 2.493 2.723 2.93 3.118 3.467 3.637 3.782 3.709 4.198 4.333 4.56 4.79 5.011 5.109 5.309 5.499 5.755 5.919 6.084 6.31 6.523 6.744 6.956 7.149 7.402 7.661 7.912 8.201 8.466 8.715 9.007 9.332 9.634 9.965 10.318 10.691 11.083 11.519 12.03 12.507 13.041 13.606 14.23 14.92 15.634 16.39 17.097 17.313 17.202 16.967 16.659 16.33 16.003 15.676 15.381 15.064 14.747 14.44 14.14 13.848 13.562 13.301 13.042 12.806 12.601 12.367 12.12 11.92 11.71 11.482 11.298 11.12 10.918 10.703 10.482 10.315 10.144 9.885 9.699 9.506 9.406 9.194 8.963 8.724 8.591 8.106 8.138 7.972 7.803 7.45 7.259 7.034 6.762 6.462 6.098 5.576 4.461 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt deleted file mode 100644 index c7946b4e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18630-1_18627-1.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18631 ,TETRA ,17530396,Thu Nov 25 03:47:37 CET,Thu Nov 25 05:35:35 CET,0.0 1.268 1.751 2.061 2.332 2.581 2.789 2.983 3.331 3.494 3.649 3.576 4.052 4.18 4.411 4.627 4.829 4.926 5.109 5.29 5.556 5.725 5.892 6.109 6.31 6.525 6.723 6.908 7.145 7.363 7.577 7.84 8.085 8.316 8.581 8.872 9.146 9.448 9.776 10.102 10.417 10.784 11.209 11.608 12.086 12.634 13.192 13.702 14.216 14.73 15.06 15.012 14.744 14.339 13.919 13.501 13.1 12.698 12.332 11.957 11.619 11.314 10.997 10.685 10.389 10.118 9.835 9.567 9.333 9.093 8.845 8.644 8.434 8.221 8.053 7.852 7.646 7.434 7.203 7.053 6.898 6.658 6.485 6.291 6.19 5.983 5.764 5.542 5.422 4.953 5.038 4.897 4.749 4.416 4.223 4.025 3.815 3.589 3.347 3.078 2.343 -2 ,30311 ,TETRA ,17530397,Thu Nov 25 03:47:37 CET,Thu Nov 25 05:32:52 CET,0.0 1.489 1.914 2.276 2.584 2.827 3.026 3.222 3.573 3.719 3.865 3.819 4.303 4.435 4.691 4.927 5.138 5.236 5.429 5.62 5.882 6.046 6.205 6.431 6.654 6.873 7.07 7.255 7.502 7.742 7.973 8.232 8.475 8.714 8.974 9.258 9.54 9.848 10.148 10.46 10.794 11.163 11.591 11.991 12.459 12.965 13.488 14.025 14.581 15.124 15.523 15.459 15.076 14.581 14.109 13.671 13.264 12.878 12.526 12.157 11.831 11.52 11.204 10.909 10.624 10.357 10.082 9.83 9.597 9.341 9.086 8.874 8.647 8.411 8.224 8.023 7.817 7.601 7.371 7.222 7.082 6.85 6.671 6.486 6.388 6.182 5.959 5.721 5.595 5.126 5.18 5.032 4.888 4.575 4.411 4.244 4.06 3.851 3.616 3.293 2.553 -4 ,22263 ,TETRA ,17530400,Thu Nov 25 03:47:38 CET,Thu Nov 25 05:32:42 CET,0.0 1.069 1.485 1.814 2.065 2.313 2.55 2.761 3.129 3.287 3.435 3.373 3.848 3.98 4.239 4.474 4.689 4.787 4.979 5.175 5.445 5.604 5.758 5.987 6.205 6.41 6.603 6.789 7.027 7.245 7.461 7.716 7.939 8.151 8.415 8.733 9.033 9.339 9.658 10.0 10.35 10.748 11.186 11.593 12.037 12.519 13.05 13.579 14.147 14.714 15.1 15.044 14.742 14.355 13.927 13.473 13.039 12.614 12.236 11.857 11.525 11.199 10.884 10.601 10.321 10.074 9.803 9.533 9.304 9.067 8.821 8.624 8.405 8.161 7.975 7.787 7.591 7.393 7.199 7.056 6.903 6.658 6.481 6.285 6.174 5.961 5.754 5.507 5.374 4.914 5.03 4.904 4.774 4.478 4.309 4.131 3.941 3.739 3.509 3.175 2.236 -10 ,17108 ,TETRA ,17530423,Thu Nov 25 03:47:38 CET,Thu Nov 25 05:33:27 CET,0.0 0.933 1.346 1.69 1.974 2.226 2.459 2.667 3.008 3.174 3.34 3.282 3.749 3.861 4.091 4.312 4.523 4.626 4.825 5.019 5.299 5.47 5.636 5.875 6.094 6.293 6.481 6.666 6.905 7.133 7.342 7.602 7.88 8.134 8.4 8.707 9.007 9.32 9.627 9.962 10.302 10.651 11.054 11.483 11.975 12.471 13.005 13.542 14.119 14.646 15.003 14.965 14.661 14.286 13.878 13.439 13.01 12.587 12.205 11.827 11.484 11.144 10.822 10.536 10.27 10.022 9.742 9.503 9.298 9.076 8.858 8.679 8.491 8.294 8.15 7.997 7.834 7.663 7.475 7.342 7.195 6.973 6.824 6.659 6.574 6.402 6.224 6.025 5.914 5.465 5.597 5.481 5.358 5.092 4.924 4.739 4.529 4.296 4.041 3.685 2.855 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18624-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18624-1.txt deleted file mode 100644 index 2ac92760..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18624-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8291 ,KEBNE ,17024631,Wed Dec 22 10:41:47 CET,Wed Dec 22 12:14:31 CET,0.0 1.192 1.694 2.085 2.382 2.624 2.838 3.043 3.43 3.602 3.766 3.714 4.208 4.345 4.594 4.841 5.083 5.198 5.418 5.632 5.939 6.142 6.336 6.597 6.843 7.09 7.326 7.54 7.82 8.104 8.374 8.699 9.023 9.326 9.654 10.016 10.363 10.746 11.163 11.603 12.079 12.602 13.178 13.765 14.457 15.229 16.108 17.062 18.087 19.197 20.332 20.944 21.056 20.962 20.75 20.417 20.056 19.7 19.366 18.999 18.677 18.362 18.026 17.718 17.426 17.159 16.874 16.602 16.37 16.112 15.83 15.594 15.363 15.118 14.909 14.685 14.45 14.202 13.917 13.725 13.522 13.181 12.943 12.708 12.588 12.331 12.059 11.761 11.6 11.09 11.075 10.877 10.664 10.193 9.92 9.618 9.292 8.915 8.384 7.636 5.463 -2 ,8108 ,KEBNE ,17024632,Wed Dec 22 10:41:47 CET,Wed Dec 22 12:15:04 CET,0.0 1.635 2.05 2.439 2.767 3.033 3.248 3.456 3.842 4.021 4.191 4.142 4.633 4.768 5.01 5.247 5.479 5.583 5.795 6.004 6.303 6.494 6.679 6.953 7.214 7.463 7.707 7.937 8.217 8.49 8.756 9.07 9.376 9.674 10.039 10.452 10.827 11.224 11.66 12.138 12.615 13.16 13.823 14.428 15.09 15.858 16.715 17.658 18.719 19.855 21.025 21.646 21.752 21.637 21.411 21.115 20.783 20.424 20.078 19.724 19.37 19.032 18.717 18.39 18.06 17.768 17.469 17.193 16.949 16.688 16.397 16.15 15.899 15.636 15.416 15.183 14.947 14.698 14.425 14.224 14.024 13.709 13.478 13.238 13.111 12.835 12.553 12.269 12.114 11.615 11.598 11.408 11.21 10.737 10.46 10.165 9.861 9.49 9.02 8.32 6.086 -3 ,9232 ,KEBNE ,17024633,Wed Dec 22 10:41:52 CET,Wed Dec 22 12:11:50 CET,0.0 1.213 1.64 1.985 2.272 2.538 2.788 3.01 3.421 3.6 3.763 3.726 4.214 4.356 4.628 4.872 5.103 5.21 5.424 5.64 5.944 6.135 6.318 6.58 6.832 7.073 7.3 7.51 7.779 8.054 8.335 8.671 8.988 9.284 9.612 9.973 10.321 10.71 11.129 11.582 12.073 12.62 13.229 13.829 14.53 15.308 16.169 17.072 18.091 19.231 20.372 20.989 21.065 20.934 20.703 20.393 20.09 19.781 19.467 19.109 18.75 18.415 18.076 17.743 17.429 17.124 16.814 16.54 16.276 16.003 15.72 15.472 15.199 14.907 14.695 14.473 14.238 13.984 13.71 13.528 13.335 13.007 12.777 12.537 12.406 12.128 11.842 11.541 11.392 10.898 10.89 10.701 10.49 10.0 9.726 9.435 9.106 8.703 8.223 7.604 5.169 -4 ,6111 ,KEBNE ,17024634,Wed Dec 22 10:41:48 CET,Wed Dec 22 12:10:59 CET,0.0 1.393 1.929 2.314 2.612 2.843 3.068 3.283 3.657 3.827 3.99 3.978 4.504 4.658 4.928 5.186 5.428 5.545 5.77 5.986 6.304 6.497 6.687 6.955 7.212 7.469 7.708 7.938 8.23 8.508 8.783 9.115 9.436 9.753 10.105 10.495 10.87 11.26 11.689 12.149 12.643 13.211 13.821 14.411 15.101 15.852 16.729 17.693 18.728 19.899 21.15 21.964 22.218 22.177 22.009 21.733 21.372 21.003 20.666 20.324 20.001 19.677 19.367 19.051 18.736 18.442 18.139 17.866 17.61 17.339 17.054 16.813 16.563 16.291 16.07 15.835 15.593 15.33 15.039 14.846 14.656 14.354 14.147 13.926 13.805 13.548 13.269 12.971 12.803 12.285 12.257 12.072 11.87 11.395 11.142 10.86 10.531 10.157 9.674 8.971 6.879 -5 ,27534 ,KEBNE ,17024635,Wed Dec 22 10:41:48 CET,Wed Dec 22 12:14:45 CET,0.0 1.284 1.769 2.132 2.417 2.67 2.886 3.094 3.49 3.662 3.82 3.796 4.298 4.431 4.674 4.91 5.136 5.25 5.487 5.716 6.018 6.201 6.384 6.665 6.931 7.177 7.419 7.653 7.947 8.229 8.498 8.804 9.1 9.394 9.732 10.129 10.499 10.878 11.298 11.754 12.246 12.822 13.459 14.087 14.825 15.583 16.449 17.448 18.52 19.654 20.828 21.498 21.581 21.419 21.193 20.893 20.543 20.193 19.871 19.498 19.143 18.823 18.505 18.197 17.918 17.664 17.351 17.044 16.789 16.524 16.239 16.005 15.76 15.483 15.249 15.009 14.762 14.503 14.227 14.033 13.83 13.503 13.268 13.026 12.899 12.64 12.363 12.055 11.898 11.392 11.371 11.183 10.98 10.549 10.288 10.0 9.69 9.296 8.8 8.184 5.547 -6 ,32576 ,KEBNE ,17024636,Wed Dec 22 10:41:47 CET,Wed Dec 22 12:14:22 CET,0.0 1.11 1.547 1.893 2.2 2.458 2.688 2.891 3.25 3.412 3.563 3.507 4.005 4.151 4.417 4.66 4.891 5.003 5.226 5.443 5.761 5.958 6.146 6.412 6.655 6.888 7.125 7.36 7.661 7.945 8.211 8.538 8.845 9.13 9.455 9.822 10.197 10.607 11.028 11.475 11.947 12.448 13.037 13.657 14.382 15.182 16.032 16.978 18.112 19.303 20.513 21.265 21.459 21.369 21.153 20.848 20.532 20.22 19.918 19.562 19.22 18.92 18.625 18.327 18.022 17.723 17.414 17.133 16.881 16.607 16.308 16.064 15.805 15.532 15.318 15.089 14.838 14.58 14.317 14.135 13.94 13.634 13.422 13.192 13.064 12.788 12.495 12.181 12.021 11.513 11.49 11.3 11.087 10.602 10.33 10.033 9.715 9.329 8.867 8.282 5.748 -7 ,16326 ,KEBNE ,17024637,Wed Dec 22 10:41:48 CET,Wed Dec 22 12:14:46 CET,0.0 1.678 2.111 2.471 2.755 2.996 3.236 3.46 3.838 4.012 4.173 4.102 4.593 4.741 5.013 5.27 5.517 5.63 5.858 6.074 6.372 6.574 6.774 7.05 7.295 7.515 7.727 7.942 8.241 8.523 8.781 9.093 9.403 9.708 10.053 10.438 10.809 11.211 11.641 12.091 12.561 13.097 13.723 14.355 15.055 15.826 16.725 17.685 18.74 19.96 21.218 21.848 21.996 21.938 21.718 21.424 21.106 20.762 20.451 20.12 19.791 19.449 19.103 18.772 18.459 18.169 17.862 17.592 17.343 17.085 16.829 16.596 16.341 16.052 15.826 15.61 15.375 15.113 14.816 14.62 14.434 14.108 13.869 13.618 13.49 13.221 12.937 12.638 12.476 11.975 11.97 11.784 11.573 11.1 10.829 10.532 10.192 9.768 9.221 8.555 6.21 -8 ,24899 ,KEBNE ,17024638,Wed Dec 22 10:41:48 CET,Wed Dec 22 12:14:18 CET,0.0 1.399 1.853 2.214 2.497 2.757 3.008 3.242 3.621 3.783 3.93 3.89 4.406 4.547 4.81 5.069 5.304 5.413 5.635 5.859 6.168 6.353 6.524 6.78 7.016 7.243 7.482 7.712 8.011 8.293 8.561 8.879 9.184 9.486 9.835 10.23 10.616 11.026 11.471 11.943 12.413 12.92 13.511 14.112 14.795 15.54 16.364 17.289 18.384 19.593 20.89 21.705 21.882 21.8 21.547 21.209 20.877 20.508 20.155 19.806 19.481 19.158 18.822 18.513 18.244 17.982 17.692 17.402 17.132 16.862 16.569 16.318 16.056 15.78 15.553 15.31 15.065 14.81 14.532 14.338 14.144 13.828 13.587 13.327 13.199 12.926 12.634 12.348 12.196 11.697 11.716 11.532 11.327 10.878 10.618 10.327 9.967 9.532 9.046 8.422 6.035 -9 ,7949 ,KEBNE ,17024639,Wed Dec 22 10:41:48 CET,Wed Dec 22 12:14:37 CET,0.0 1.144 1.613 1.949 2.226 2.479 2.703 2.906 3.266 3.431 3.584 3.532 4.022 4.16 4.43 4.7 4.954 5.068 5.283 5.495 5.801 5.995 6.199 6.491 6.765 7.024 7.255 7.474 7.765 8.05 8.323 8.665 8.998 9.307 9.665 10.08 10.457 10.853 11.292 11.771 12.252 12.785 13.42 14.047 14.779 15.573 16.481 17.509 18.65 19.851 21.165 21.902 22.056 21.944 21.629 21.265 20.964 20.65 20.308 19.96 19.663 19.363 19.055 18.747 18.436 18.143 17.82 17.522 17.266 17.0 16.721 16.49 16.245 15.982 15.766 15.539 15.305 15.049 14.788 14.615 14.43 14.1 13.865 13.638 13.518 13.254 12.963 12.663 12.502 11.987 11.945 11.741 11.525 11.039 10.765 10.472 10.153 9.782 9.306 8.659 6.851 -10 ,9494 ,KEBNE ,17024640,Wed Dec 22 10:41:48 CET,Wed Dec 22 12:14:27 CET,0.0 1.411 1.892 2.268 2.574 2.81 3.03 3.255 3.669 3.846 4.012 3.986 4.488 4.625 4.88 5.12 5.357 5.467 5.671 5.882 6.199 6.399 6.591 6.852 7.099 7.344 7.582 7.81 8.102 8.375 8.635 8.955 9.268 9.572 9.913 10.296 10.666 11.065 11.49 11.94 12.417 12.946 13.539 14.125 14.812 15.579 16.455 17.432 18.559 19.733 20.964 21.781 21.988 21.914 21.71 21.402 21.054 20.717 20.425 20.084 19.752 19.431 19.098 18.783 18.465 18.166 17.847 17.542 17.286 17.022 16.734 16.481 16.218 15.936 15.707 15.477 15.238 14.994 14.731 14.535 14.341 14.026 13.786 13.542 13.413 13.134 12.842 12.534 12.377 11.871 11.848 11.654 11.449 11.009 10.744 10.472 10.173 9.763 9.275 8.657 6.744 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt deleted file mode 100644 index e705fcee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18625-1.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17232 ,TETRA ,17530437,Thu Nov 25 03:48:33 CET,Thu Nov 25 05:36:02 CET,0.0 1.143 1.594 1.925 2.232 2.509 2.753 2.981 3.394 3.574 3.736 3.689 4.194 4.341 4.625 4.895 5.14 5.264 5.508 5.714 5.99 6.171 6.345 6.619 6.886 7.124 7.348 7.574 7.866 8.13 8.39 8.702 8.991 9.275 9.611 9.982 10.312 10.674 11.084 11.496 11.906 12.375 12.927 13.472 14.09 14.753 15.457 16.167 16.914 17.675 18.368 18.535 18.267 17.872 17.47 17.044 16.607 16.149 15.725 15.299 14.902 14.528 14.161 13.792 13.435 13.116 12.785 12.47 12.183 11.89 11.582 11.319 11.04 10.747 10.527 10.295 10.046 9.788 9.525 9.338 9.12 8.766 8.534 8.297 8.171 7.901 7.613 7.309 7.148 6.623 6.607 6.434 6.237 5.756 5.501 5.222 4.881 4.489 4.053 3.425 1.201 -3 ,3183 ,TETRA ,17530440,Thu Nov 25 03:48:31 CET,Thu Nov 25 05:36:38 CET,0.0 1.191 1.651 2.042 2.38 2.662 2.906 3.126 3.504 3.676 3.84 3.795 4.296 4.439 4.697 4.95 5.199 5.322 5.555 5.773 6.077 6.268 6.463 6.746 7.013 7.259 7.487 7.712 7.998 8.263 8.518 8.825 9.123 9.412 9.733 10.088 10.433 10.787 11.172 11.597 12.023 12.499 13.08 13.635 14.226 14.889 15.603 16.373 17.27 18.125 18.759 18.834 18.546 18.179 17.746 17.267 16.791 16.334 15.924 15.499 15.079 14.669 14.291 13.936 13.588 13.258 12.929 12.609 12.313 12.029 11.722 11.459 11.197 10.911 10.681 10.448 10.208 9.951 9.672 9.474 9.281 8.991 8.785 8.557 8.427 8.153 7.892 7.615 7.456 6.951 6.941 6.745 6.545 6.087 5.827 5.556 5.25 4.871 4.371 3.675 1.777 -5 ,30486 ,TETRA ,17530442,Thu Nov 25 03:48:32 CET,Thu Nov 25 05:36:02 CET,0.0 1.149 1.604 1.941 2.229 2.481 2.705 2.9 3.26 3.426 3.603 3.59 4.082 4.215 4.478 4.732 4.96 5.07 5.287 5.496 5.801 6.001 6.189 6.455 6.714 6.951 7.184 7.412 7.693 7.966 8.238 8.559 8.853 9.144 9.486 9.861 10.227 10.626 11.033 11.457 11.916 12.418 12.968 13.497 14.117 14.809 15.525 16.278 17.109 17.93 18.595 18.693 18.434 18.031 17.593 17.107 16.616 16.143 15.689 15.221 14.823 14.455 14.092 13.734 13.376 13.062 12.729 12.409 12.139 11.841 11.52 11.256 10.976 10.679 10.45 10.212 9.952 9.677 9.379 9.179 8.983 8.67 8.456 8.222 8.094 7.826 7.536 7.231 7.075 6.562 6.555 6.363 6.161 5.735 5.489 5.206 4.859 4.464 4.014 3.419 1.429 -6 ,24169 ,TETRA ,17530444,Thu Nov 25 03:48:32 CET,Thu Nov 25 05:36:02 CET,0.0 1.632 2.199 2.596 2.897 3.166 3.416 3.638 4.027 4.204 4.371 4.323 4.812 4.947 5.202 5.452 5.691 5.807 6.021 6.222 6.515 6.697 6.874 7.132 7.383 7.636 7.865 8.072 8.341 8.605 8.863 9.178 9.478 9.755 10.075 10.44 10.789 11.174 11.584 12.029 12.501 12.986 13.511 14.04 14.677 15.4 16.176 16.947 17.797 18.666 19.342 19.555 19.445 19.145 18.738 18.239 17.736 17.286 16.889 16.432 16.011 15.623 15.218 14.838 14.488 14.151 13.801 13.503 13.236 12.941 12.642 12.404 12.157 11.865 11.629 11.403 11.157 10.886 10.596 10.399 10.202 9.883 9.646 9.401 9.28 9.032 8.753 8.441 8.278 7.772 7.779 7.6 7.404 6.956 6.715 6.467 6.164 5.779 5.322 4.715 2.544 -7 ,21389 ,TETRA ,17530455,Thu Nov 25 03:48:33 CET,Thu Nov 25 05:36:03 CET,0.0 1.135 1.612 1.98 2.287 2.575 2.839 3.056 3.408 3.571 3.731 3.689 4.181 4.311 4.579 4.833 5.062 5.171 5.377 5.573 5.858 6.043 6.233 6.509 6.76 6.995 7.223 7.433 7.708 7.997 8.27 8.581 8.889 9.2 9.546 9.936 10.3 10.667 11.065 11.499 11.948 12.424 12.953 13.474 14.081 14.734 15.456 16.209 16.958 17.694 18.288 18.355 18.041 17.638 17.21 16.752 16.297 15.857 15.427 14.953 14.509 14.086 13.699 13.335 12.986 12.679 12.354 12.036 11.757 11.466 11.152 10.881 10.592 10.295 10.072 9.849 9.612 9.338 9.047 8.848 8.639 8.325 8.11 7.876 7.751 7.495 7.217 6.915 6.758 6.245 6.231 6.042 5.848 5.428 5.2 4.932 4.609 4.259 3.816 3.171 1.331 -8 ,21235 ,TETRA ,17530457,Thu Nov 25 03:48:33 CET,Thu Nov 25 05:36:08 CET,0.0 1.385 1.935 2.344 2.677 2.959 3.195 3.409 3.758 3.932 4.104 4.074 4.575 4.713 4.983 5.245 5.498 5.62 5.864 6.09 6.409 6.604 6.784 7.057 7.315 7.559 7.8 8.034 8.334 8.613 8.863 9.161 9.446 9.719 10.055 10.437 10.781 11.149 11.542 11.958 12.385 12.853 13.384 13.9 14.525 15.217 15.955 16.662 17.388 18.142 18.698 18.69 18.387 17.969 17.456 16.9 16.365 15.888 15.457 14.973 14.546 14.176 13.791 13.412 13.066 12.731 12.372 12.07 11.812 11.517 11.193 10.925 10.64 10.341 10.105 9.867 9.623 9.365 9.104 8.921 8.724 8.396 8.169 7.936 7.809 7.544 7.27 6.976 6.813 6.296 6.289 6.091 5.886 5.454 5.205 4.923 4.598 4.235 3.781 3.174 1.401 -10 ,9408 ,TETRA ,17530460,Thu Nov 25 03:48:37 CET,Thu Nov 25 05:36:36 CET,0.0 1.242 1.711 2.099 2.407 2.663 2.89 3.104 3.498 3.676 3.841 3.794 4.295 4.441 4.724 4.979 5.212 5.322 5.539 5.746 6.039 6.232 6.416 6.678 6.934 7.184 7.417 7.638 7.935 8.218 8.481 8.809 9.124 9.423 9.767 10.153 10.512 10.895 11.272 11.661 12.115 12.584 13.092 13.62 14.212 14.856 15.591 16.337 17.082 17.84 18.432 18.501 18.247 17.864 17.417 16.944 16.481 16.01 15.561 15.106 14.706 14.305 13.925 13.57 13.205 12.87 12.512 12.186 11.909 11.611 11.287 11.022 10.748 10.467 10.255 10.021 9.76 9.49 9.208 9.01 8.806 8.499 8.287 8.049 7.92 7.648 7.355 7.049 6.898 6.413 6.424 6.233 6.04 5.604 5.351 5.081 4.771 4.407 3.959 3.311 1.163 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index ba352798..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18631-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -5 ,19118 ,TETRA ,17530487,Thu Nov 25 03:48:34 CET,Thu Nov 25 05:37:01 CET,0.0 1.021 1.48 1.83 2.147 2.433 2.697 2.922 3.32 3.51 3.696 3.682 4.192 4.347 4.641 4.912 5.17 5.293 5.553 5.809 6.147 6.352 6.545 6.819 7.096 7.372 7.628 7.881 8.206 8.508 8.801 9.172 9.543 9.882 10.271 10.718 11.141 11.594 12.067 12.57 13.12 13.714 14.377 15.061 15.841 16.68 17.637 18.677 19.823 21.06 22.306 23.123 23.371 23.258 23.091 22.874 22.602 22.317 22.045 21.743 21.434 21.123 20.831 20.534 20.239 19.982 19.692 19.415 19.182 18.939 18.676 18.444 18.193 17.941 17.738 17.519 17.3 17.069 16.836 16.665 16.476 16.175 15.96 15.75 15.636 15.388 15.136 14.866 14.719 14.229 14.225 14.033 13.83 13.374 13.136 12.892 12.62 12.289 11.832 11.224 9.544 -6 ,11012 ,TETRA ,17530492,Thu Nov 25 03:48:33 CET,Thu Nov 25 05:36:15 CET,0.0 1.506 1.966 2.363 2.706 2.996 3.275 3.537 4.009 4.227 4.433 4.449 4.968 5.123 5.419 5.68 5.913 6.038 6.282 6.506 6.836 7.049 7.254 7.548 7.836 8.116 8.382 8.636 8.96 9.265 9.554 9.913 10.266 10.602 10.984 11.41 11.821 12.257 12.706 13.191 13.715 14.318 15.029 15.713 16.452 17.275 18.223 19.24 20.346 21.593 22.909 23.569 23.761 23.755 23.569 23.287 23.01 22.731 22.45 22.113 21.791 21.484 21.188 20.894 20.601 20.341 20.051 19.765 19.516 19.265 18.999 18.786 18.563 18.314 18.119 17.908 17.681 17.439 17.171 16.987 16.793 16.494 16.286 16.053 15.93 15.695 15.458 15.177 15.022 14.537 14.541 14.35 14.158 13.711 13.376 13.039 12.745 12.391 11.98 11.487 9.542 -7 ,30443 ,TETRA ,17530499,Thu Nov 25 03:48:34 CET,Thu Nov 25 05:36:17 CET,0.0 1.465 1.982 2.398 2.745 3.031 3.282 3.515 3.946 4.142 4.328 4.306 4.807 4.962 5.265 5.546 5.795 5.914 6.151 6.382 6.726 6.942 7.147 7.449 7.752 8.038 8.29 8.519 8.816 9.114 9.417 9.783 10.122 10.464 10.861 11.297 11.713 12.149 12.623 13.128 13.637 14.2 14.85 15.511 16.289 17.135 18.064 19.087 20.281 21.605 23.008 23.939 24.282 24.301 24.151 23.931 23.662 23.35 23.064 22.746 22.434 22.135 21.851 21.561 21.263 20.995 20.713 20.461 20.227 19.959 19.686 19.474 19.248 18.992 18.783 18.572 18.348 18.111 17.859 17.667 17.467 17.165 16.961 16.739 16.619 16.372 16.116 15.852 15.71 15.228 15.232 15.051 14.857 14.415 14.178 13.929 13.633 13.297 12.917 12.361 10.781 -8 ,31088 ,TETRA ,17530512,Thu Nov 25 03:48:34 CET,Thu Nov 25 05:36:40 CET,0.0 1.529 2.086 2.457 2.775 3.049 3.299 3.546 3.982 4.17 4.354 4.337 4.841 4.994 5.278 5.545 5.795 5.915 6.148 6.371 6.698 6.903 7.106 7.408 7.686 7.962 8.244 8.509 8.853 9.177 9.477 9.849 10.214 10.555 10.933 11.368 11.791 12.258 12.758 13.272 13.815 14.421 15.116 15.798 16.539 17.353 18.304 19.36 20.517 21.724 22.934 23.622 23.788 23.674 23.439 23.153 22.85 22.538 22.245 21.903 21.572 21.28 20.989 20.703 20.423 20.15 19.85 19.568 19.331 19.077 18.795 18.553 18.308 18.069 17.874 17.661 17.434 17.181 16.908 16.718 16.538 16.253 16.033 15.812 15.696 15.45 15.193 14.915 14.764 14.269 14.259 14.082 13.905 13.5 13.27 13.021 12.735 12.374 11.93 11.35 9.586 -10 ,8990 ,TETRA ,17530529,Thu Nov 25 03:49:30 CET,Thu Nov 25 05:37:32 CET,0.0 1.482 1.988 2.37 2.675 2.959 3.222 3.444 3.863 4.06 4.243 4.239 4.759 4.921 5.232 5.533 5.807 5.93 6.165 6.39 6.706 6.918 7.125 7.418 7.705 7.981 8.248 8.51 8.843 9.148 9.437 9.795 10.151 10.483 10.874 11.31 11.708 12.153 12.631 13.139 13.68 14.272 14.946 15.604 16.377 17.227 18.139 19.165 20.332 21.552 22.736 23.409 23.603 23.544 23.341 23.062 22.755 22.467 22.17 21.795 21.478 21.204 20.912 20.595 20.293 20.03 19.751 19.49 19.259 19.018 18.743 18.502 18.253 17.989 17.773 17.548 17.331 17.113 16.87 16.701 16.519 16.217 16.011 15.805 15.69 15.436 15.179 14.893 14.737 14.237 14.227 14.035 13.828 13.377 13.12 12.828 12.534 12.2 11.781 11.174 8.89 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18626-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18626-1.txt deleted file mode 100644 index 043e6472..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18626-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5005 ,KEBNE ,17024641,Wed Dec 22 10:41:48 CET,Wed Dec 22 12:14:27 CET,0.0 2.273 2.79 3.206 3.578 3.86 4.102 4.362 4.816 4.999 5.172 5.123 5.62 5.762 6.023 6.272 6.519 6.631 6.856 7.084 7.385 7.576 7.767 8.042 8.296 8.537 8.77 8.993 9.284 9.555 9.801 10.102 10.394 10.688 11.026 11.373 11.706 12.086 12.494 12.932 13.397 13.919 14.508 15.068 15.723 16.437 17.196 18.018 18.929 19.915 20.9 21.413 21.407 21.166 20.835 20.427 20.052 19.695 19.332 18.948 18.593 18.261 17.95 17.638 17.332 17.038 16.713 16.416 16.157 15.895 15.61 15.362 15.099 14.826 14.611 14.368 14.103 13.834 13.558 13.363 13.171 12.872 12.648 12.416 12.295 12.026 11.749 11.459 11.294 10.771 10.755 10.579 10.387 9.961 9.716 9.429 9.11 8.71 8.232 7.658 5.431 -2 ,27433 ,KEBNE ,17024642,Wed Dec 22 10:41:48 CET,Wed Dec 22 12:14:30 CET,0.0 1.954 2.465 2.887 3.227 3.493 3.739 3.949 4.324 4.508 4.674 4.608 5.097 5.23 5.489 5.734 5.971 6.097 6.37 6.631 6.986 7.19 7.382 7.66 7.908 8.144 8.374 8.601 8.895 9.158 9.406 9.725 10.04 10.346 10.687 11.059 11.418 11.793 12.199 12.612 13.046 13.511 14.031 14.57 15.213 15.936 16.742 17.619 18.574 19.566 20.499 20.884 20.812 20.604 20.294 19.929 19.552 19.148 18.769 18.382 18.031 17.689 17.351 17.027 16.7 16.381 16.044 15.745 15.486 15.224 14.938 14.688 14.436 14.17 13.956 13.732 13.499 13.238 12.948 12.754 12.562 12.256 12.033 11.779 11.65 11.406 11.127 10.817 10.658 10.145 10.133 9.945 9.736 9.261 9.003 8.704 8.374 7.983 7.505 6.872 4.886 -3 ,18986 ,KEBNE ,17024643,Wed Dec 22 10:41:48 CET,Wed Dec 22 12:14:38 CET,0.0 1.89 2.444 2.887 3.233 3.506 3.762 4.004 4.414 4.598 4.762 4.727 5.228 5.368 5.634 5.881 6.119 6.232 6.451 6.675 6.999 7.198 7.39 7.657 7.9 8.14 8.371 8.589 8.879 9.163 9.438 9.767 10.08 10.368 10.695 11.068 11.434 11.823 12.214 12.632 13.068 13.566 14.132 14.677 15.338 16.078 16.919 17.842 18.791 19.726 20.642 21.073 21.011 20.751 20.417 20.045 19.675 19.305 18.942 18.568 18.214 17.852 17.494 17.168 16.866 16.587 16.288 15.988 15.72 15.435 15.141 14.901 14.635 14.378 14.178 13.955 13.702 13.431 13.154 12.966 12.789 12.492 12.271 12.041 11.92 11.675 11.416 11.135 10.988 10.487 10.479 10.289 10.084 9.643 9.398 9.105 8.753 8.381 7.951 7.299 4.813 -4 ,26116 ,KEBNE ,17024644,Wed Dec 22 10:41:48 CET,Wed Dec 22 12:14:19 CET,0.0 1.696 2.207 2.617 2.932 3.213 3.466 3.679 4.056 4.224 4.392 4.353 4.844 4.991 5.274 5.539 5.791 5.906 6.128 6.343 6.653 6.849 7.027 7.292 7.551 7.796 8.04 8.272 8.567 8.854 9.122 9.433 9.731 10.006 10.311 10.672 11.021 11.398 11.814 12.251 12.698 13.2 13.785 14.365 15.001 15.671 16.432 17.218 18.072 19.015 19.94 20.318 20.219 19.977 19.687 19.331 18.957 18.596 18.239 17.856 17.53 17.2 16.848 16.521 16.225 15.95 15.656 15.389 15.137 14.863 14.553 14.301 14.044 13.759 13.55 13.326 13.089 12.842 12.571 12.377 12.186 11.909 11.712 11.482 11.355 11.105 10.842 10.549 10.388 9.869 9.85 9.663 9.461 9.031 8.773 8.46 8.122 7.727 7.232 6.608 4.512 -5 ,16848 ,KEBNE ,17024645,Wed Dec 22 10:42:50 CET,Wed Dec 22 12:15:46 CET,0.0 1.499 2.064 2.507 2.826 3.109 3.383 3.623 4.04 4.227 4.384 4.326 4.822 4.959 5.238 5.517 5.773 5.893 6.118 6.33 6.636 6.838 7.028 7.29 7.542 7.785 8.021 8.247 8.53 8.809 9.068 9.364 9.65 9.93 10.255 10.626 11.008 11.433 11.864 12.294 12.733 13.215 13.786 14.352 14.94 15.594 16.394 17.263 18.195 19.159 20.108 20.549 20.474 20.215 19.891 19.532 19.149 18.747 18.38 17.963 17.577 17.242 16.916 16.59 16.285 16.014 15.709 15.407 15.143 14.861 14.556 14.316 14.09 13.844 13.637 13.422 13.191 12.928 12.646 12.447 12.242 11.934 11.718 11.49 11.365 11.106 10.83 10.53 10.371 9.873 9.88 9.691 9.474 8.972 8.701 8.424 8.107 7.728 7.283 6.757 4.635 -6 ,29787 ,KEBNE ,17024646,Wed Dec 22 10:42:50 CET,Wed Dec 22 12:16:04 CET,0.0 1.687 2.257 2.661 2.997 3.279 3.526 3.744 4.128 4.313 4.5 4.472 4.967 5.098 5.363 5.633 5.888 6.005 6.227 6.448 6.759 6.953 7.138 7.407 7.667 7.91 8.128 8.339 8.623 8.905 9.174 9.481 9.78 10.064 10.392 10.744 11.09 11.488 11.907 12.353 12.817 13.317 13.878 14.438 15.102 15.827 16.618 17.46 18.375 19.406 20.409 20.742 20.63 20.389 20.101 19.745 19.343 18.934 18.553 18.157 17.813 17.499 17.169 16.834 16.527 16.234 15.92 15.632 15.364 15.094 14.82 14.583 14.32 14.055 13.848 13.617 13.377 13.117 12.847 12.656 12.456 12.152 11.924 11.683 11.568 11.326 11.048 10.753 10.602 10.092 10.071 9.879 9.683 9.239 8.989 8.716 8.415 8.038 7.574 6.956 4.399 -7 ,21124 ,KEBNE ,17024647,Wed Dec 22 10:42:50 CET,Wed Dec 22 12:15:23 CET,0.0 1.653 2.166 2.571 2.891 3.146 3.403 3.643 4.047 4.228 4.4 4.372 4.864 5.004 5.285 5.534 5.771 5.885 6.11 6.334 6.645 6.833 7.008 7.278 7.527 7.754 7.985 8.216 8.517 8.805 9.078 9.39 9.707 10.018 10.358 10.738 11.1 11.487 11.904 12.329 12.768 13.272 13.841 14.384 15.01 15.713 16.503 17.36 18.309 19.318 20.22 20.592 20.562 20.375 20.077 19.704 19.326 18.991 18.674 18.279 17.915 17.577 17.238 16.927 16.625 16.32 15.987 15.693 15.437 15.155 14.866 14.626 14.359 14.092 13.892 13.674 13.439 13.183 12.916 12.718 12.508 12.19 11.966 11.734 11.614 11.362 11.098 10.813 10.652 10.146 10.154 9.972 9.77 9.307 9.046 8.758 8.437 8.062 7.644 7.032 4.588 -8 ,20249 ,KEBNE ,17024648,Wed Dec 22 10:42:50 CET,Wed Dec 22 12:15:48 CET,0.0 1.721 2.233 2.612 2.94 3.225 3.499 3.743 4.138 4.31 4.471 4.439 4.947 5.092 5.357 5.609 5.854 5.97 6.178 6.373 6.669 6.864 7.059 7.327 7.586 7.831 8.052 8.273 8.559 8.828 9.089 9.404 9.698 9.987 10.33 10.7 11.048 11.438 11.846 12.261 12.693 13.167 13.72 14.282 14.957 15.706 16.503 17.372 18.33 19.348 20.234 20.57 20.553 20.331 19.966 19.561 19.176 18.802 18.457 18.073 17.719 17.399 17.093 16.801 16.513 16.22 15.905 15.624 15.372 15.103 14.819 14.587 14.344 14.082 13.868 13.637 13.404 13.161 12.89 12.703 12.508 12.205 11.992 11.757 11.636 11.38 11.1 10.804 10.657 10.161 10.161 9.979 9.781 9.306 9.051 8.781 8.465 8.122 7.705 7.096 5.056 -9 ,13722 ,KEBNE ,17024649,Wed Dec 22 10:42:50 CET,Wed Dec 22 12:16:14 CET,0.0 1.783 2.396 2.789 3.075 3.361 3.629 3.872 4.37 4.601 4.798 4.767 5.259 5.394 5.648 5.885 6.121 6.234 6.451 6.647 6.925 7.122 7.315 7.575 7.827 8.081 8.314 8.534 8.817 9.092 9.36 9.673 9.972 10.272 10.622 10.996 11.356 11.743 12.135 12.546 12.977 13.483 14.096 14.691 15.342 16.073 16.884 17.716 18.619 19.573 20.537 20.977 20.933 20.686 20.315 19.915 19.544 19.189 18.844 18.43 18.073 17.761 17.437 17.119 16.808 16.519 16.222 15.932 15.664 15.377 15.073 14.826 14.556 14.276 14.064 13.836 13.596 13.356 13.084 12.886 12.689 12.383 12.168 11.936 11.815 11.568 11.309 11.028 10.88 10.375 10.355 10.163 9.953 9.49 9.229 8.943 8.62 8.242 7.769 7.054 4.58 -10 ,29406 ,KEBNE ,17024650,Wed Dec 22 10:42:50 CET,Wed Dec 22 12:16:00 CET,0.0 1.983 2.438 2.82 3.148 3.41 3.64 3.886 4.321 4.507 4.674 4.647 5.152 5.296 5.57 5.826 6.056 6.164 6.385 6.601 6.905 7.096 7.282 7.546 7.799 8.034 8.271 8.498 8.78 9.052 9.31 9.623 9.937 10.225 10.545 10.921 11.284 11.674 12.096 12.553 13.025 13.523 14.092 14.653 15.29 15.991 16.769 17.627 18.554 19.538 20.466 20.845 20.799 20.562 20.201 19.786 19.384 18.998 18.635 18.213 17.828 17.506 17.188 16.878 16.579 16.276 15.935 15.639 15.389 15.112 14.813 14.57 14.314 14.028 13.811 13.594 13.362 13.118 12.846 12.652 12.452 12.125 11.899 11.682 11.562 11.291 10.999 10.706 10.556 10.048 10.063 9.881 9.677 9.199 8.941 8.678 8.367 7.999 7.567 6.946 5.114 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt deleted file mode 100644 index 6318746c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18632-1_18629-1.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,26158 ,TETRA ,17530567,Thu Nov 25 03:48:37 CET,Thu Nov 25 05:36:01 CET,0.0 1.701 2.319 2.739 3.054 3.358 3.628 3.855 4.291 4.504 4.698 4.678 5.173 5.314 5.587 5.843 6.081 6.197 6.427 6.655 6.972 7.166 7.36 7.631 7.872 8.106 8.35 8.582 8.866 9.14 9.404 9.713 10.002 10.286 10.625 11.01 11.365 11.733 12.14 12.571 13.007 13.503 14.08 14.647 15.304 16.019 16.792 17.644 18.593 19.566 20.371 20.615 20.514 20.262 19.881 19.476 19.07 18.624 18.217 17.815 17.446 17.095 16.75 16.403 16.072 15.765 15.434 15.134 14.852 14.547 14.23 13.972 13.713 13.452 13.242 12.991 12.721 12.443 12.163 11.981 11.792 11.469 11.227 10.967 10.842 10.586 10.301 9.997 9.833 9.323 9.338 9.144 8.92 8.432 8.169 7.875 7.538 7.152 6.641 5.924 3.447 -5 ,14753 ,TETRA ,17530571,Thu Nov 25 03:49:31 CET,Thu Nov 25 05:37:35 CET,0.0 1.515 2.034 2.437 2.757 3.027 3.279 3.51 3.936 4.131 4.297 4.236 4.742 4.892 5.173 5.436 5.695 5.819 6.053 6.277 6.591 6.788 6.976 7.26 7.532 7.791 8.037 8.268 8.57 8.853 9.112 9.425 9.728 10.02 10.372 10.755 11.107 11.498 11.928 12.369 12.821 13.314 13.856 14.39 15.003 15.709 16.519 17.345 18.173 19.025 19.828 20.115 19.973 19.669 19.316 18.919 18.493 18.059 17.673 17.262 16.876 16.52 16.167 15.834 15.517 15.224 14.899 14.583 14.306 14.007 13.687 13.416 13.134 12.855 12.64 12.4 12.149 11.88 11.601 11.415 11.217 10.905 10.671 10.414 10.288 10.037 9.76 9.437 9.269 8.753 8.734 8.543 8.334 7.843 7.57 7.277 6.943 6.549 6.068 5.416 3.401 -7 ,17894 ,TETRA ,17530580,Thu Nov 25 03:49:31 CET,Thu Nov 25 05:37:31 CET,0.0 1.683 2.186 2.573 2.918 3.213 3.48 3.737 4.189 4.386 4.57 4.553 5.061 5.21 5.485 5.745 6.015 6.137 6.366 6.595 6.931 7.127 7.306 7.586 7.866 8.128 8.366 8.6 8.895 9.166 9.423 9.748 10.072 10.369 10.693 11.06 11.423 11.808 12.201 12.609 13.044 13.549 14.149 14.707 15.315 15.972 16.735 17.592 18.505 19.491 20.387 20.754 20.65 20.361 20.012 19.619 19.206 18.775 18.378 17.958 17.593 17.24 16.875 16.527 16.192 15.883 15.537 15.217 14.959 14.687 14.381 14.112 13.829 13.533 13.306 13.077 12.83 12.565 12.285 12.082 11.879 11.563 11.331 11.091 10.965 10.687 10.404 10.117 9.95 9.423 9.39 9.181 8.97 8.488 8.227 7.939 7.585 7.21 6.745 6.039 3.865 -8 ,11463 ,TETRA ,17530592,Thu Nov 25 03:49:31 CET,Thu Nov 25 05:38:11 CET,0.0 2.288 2.969 3.473 3.822 4.104 4.359 4.592 5.011 5.198 5.376 5.347 5.852 5.994 6.271 6.539 6.803 6.927 7.156 7.369 7.674 7.874 8.055 8.311 8.567 8.817 9.057 9.298 9.607 9.882 10.147 10.467 10.774 11.06 11.408 11.804 12.141 12.518 12.951 13.418 13.895 14.392 14.937 15.489 16.135 16.834 17.598 18.385 19.202 20.034 20.87 21.238 21.213 20.989 20.628 20.21 19.79 19.37 18.99 18.579 18.212 17.87 17.518 17.18 16.859 16.573 16.242 15.908 15.633 15.351 15.044 14.795 14.524 14.227 13.997 13.762 13.517 13.243 12.944 12.739 12.525 12.204 11.983 11.745 11.616 11.331 11.034 10.735 10.577 10.071 10.073 9.868 9.641 9.164 8.916 8.637 8.326 7.957 7.483 6.83 4.573 -9 ,21980 ,TETRA ,17530598,Thu Nov 25 03:49:33 CET,Thu Nov 25 05:37:56 CET,0.0 1.546 2.121 2.529 2.862 3.139 3.383 3.612 4.004 4.182 4.353 4.311 4.811 4.968 5.267 5.529 5.772 5.891 6.129 6.366 6.693 6.893 7.089 7.363 7.612 7.854 8.093 8.321 8.63 8.92 9.179 9.509 9.835 10.129 10.455 10.826 11.185 11.586 12.002 12.43 12.877 13.382 13.944 14.483 15.139 15.838 16.618 17.45 18.355 19.37 20.306 20.69 20.604 20.312 19.955 19.54 19.12 18.709 18.32 17.886 17.494 17.151 16.818 16.487 16.159 15.857 15.54 15.243 14.957 14.645 14.329 14.07 13.798 13.515 13.298 13.08 12.836 12.573 12.294 12.09 11.877 11.551 11.329 11.089 10.959 10.683 10.403 10.105 9.935 9.412 9.409 9.204 8.99 8.541 8.271 7.961 7.63 7.231 6.74 6.135 3.63 -10 ,21520 ,TETRA ,17530600,Thu Nov 25 03:49:35 CET,Thu Nov 25 05:37:32 CET,0.0 1.837 2.4 2.792 3.099 3.379 3.647 3.881 4.315 4.515 4.692 4.648 5.15 5.304 5.581 5.832 6.083 6.203 6.438 6.668 6.988 7.195 7.392 7.67 7.933 8.185 8.418 8.636 8.918 9.201 9.473 9.798 10.121 10.428 10.766 11.124 11.481 11.88 12.307 12.753 13.194 13.691 14.282 14.871 15.545 16.267 17.043 17.841 18.694 19.54 20.311 20.65 20.578 20.284 19.904 19.491 19.078 18.664 18.259 17.838 17.467 17.104 16.75 16.42 16.094 15.786 15.461 15.143 14.846 14.541 14.238 13.982 13.711 13.433 13.216 12.978 12.737 12.495 12.23 12.044 11.844 11.52 11.298 11.052 10.923 10.669 10.387 10.064 9.898 9.369 9.326 9.139 8.937 8.465 8.191 7.899 7.589 7.203 6.695 6.008 3.25 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18627-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18627-1.txt deleted file mode 100644 index 98f1b1a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18627-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30192 ,KEBNE ,17024651,Wed Dec 22 10:42:49 CET,Wed Dec 22 12:15:46 CET,0.0 1.2 1.637 1.975 2.259 2.504 2.726 2.925 3.265 3.418 3.565 3.482 3.955 4.08 4.337 4.576 4.795 4.907 5.133 5.336 5.622 5.81 5.989 6.238 6.467 6.69 6.909 7.118 7.385 7.659 7.91 8.193 8.465 8.732 9.043 9.374 9.688 10.044 10.424 10.828 11.258 11.721 12.227 12.729 13.292 13.888 14.537 15.265 16.056 16.847 17.58 17.809 17.637 17.282 16.887 16.477 16.054 15.633 15.237 14.829 14.485 14.158 13.816 13.482 13.153 12.847 12.539 12.253 12.007 11.749 11.457 11.206 10.948 10.663 10.439 10.22 9.984 9.726 9.459 9.27 9.078 8.756 8.528 8.297 8.178 7.929 7.658 7.388 7.247 6.749 6.754 6.573 6.377 5.935 5.688 5.423 5.133 4.816 4.441 3.867 2.327 -2 ,19757 ,KEBNE ,17024652,Wed Dec 22 10:42:50 CET,Wed Dec 22 12:16:23 CET,0.0 1.13 1.599 1.983 2.305 2.559 2.784 2.986 3.339 3.501 3.656 3.598 4.083 4.211 4.455 4.679 4.898 5.006 5.221 5.432 5.723 5.902 6.07 6.311 6.549 6.779 6.997 7.204 7.472 7.742 7.99 8.281 8.562 8.828 9.125 9.448 9.761 10.115 10.485 10.863 11.273 11.735 12.26 12.771 13.341 13.978 14.703 15.436 16.206 16.979 17.675 17.913 17.758 17.394 16.99 16.572 16.152 15.745 15.362 14.944 14.575 14.241 13.911 13.581 13.259 12.971 12.656 12.379 12.132 11.846 11.545 11.294 11.036 10.766 10.539 10.298 10.047 9.79 9.532 9.357 9.177 8.889 8.667 8.429 8.309 8.065 7.801 7.512 7.361 6.867 6.883 6.709 6.516 6.112 5.892 5.639 5.366 5.045 4.623 4.013 2.274 -3 ,12849 ,KEBNE ,17024653,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:16:37 CET,0.0 1.244 1.742 2.096 2.394 2.656 2.919 3.141 3.498 3.65 3.794 3.73 4.213 4.344 4.591 4.834 5.07 5.179 5.392 5.594 5.872 6.056 6.23 6.476 6.719 6.946 7.156 7.359 7.62 7.872 8.109 8.399 8.673 8.941 9.257 9.602 9.93 10.275 10.638 11.024 11.435 11.912 12.449 12.983 13.588 14.214 14.931 15.67 16.465 17.266 17.981 18.225 18.092 17.786 17.387 16.996 16.58 16.145 15.776 15.411 15.057 14.696 14.339 13.99 13.651 13.353 13.045 12.752 12.492 12.202 11.901 11.664 11.412 11.143 10.93 10.712 10.479 10.215 9.942 9.764 9.587 9.293 9.079 8.844 8.723 8.481 8.226 7.942 7.799 7.307 7.303 7.131 6.95 6.544 6.303 6.049 5.746 5.367 4.918 4.246 2.947 -4 ,24462 ,KEBNE ,17024654,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:17:00 CET,0.0 2.325 2.957 3.352 3.673 3.943 4.17 4.362 4.718 4.88 5.039 4.982 5.463 5.585 5.825 6.054 6.273 6.374 6.562 6.759 7.043 7.221 7.398 7.649 7.876 8.094 8.319 8.534 8.805 9.059 9.302 9.588 9.858 10.116 10.425 10.768 11.074 11.427 11.808 12.182 12.56 13.004 13.52 14.041 14.67 15.327 16.011 16.707 17.478 18.319 19.052 19.285 19.114 18.783 18.395 17.965 17.531 17.087 16.671 16.277 15.928 15.577 15.236 14.895 14.569 14.268 13.942 13.655 13.395 13.115 12.821 12.575 12.316 12.042 11.83 11.605 11.365 11.126 10.877 10.704 10.524 10.217 10.002 9.787 9.668 9.413 9.158 8.879 8.731 8.243 8.271 8.108 7.938 7.549 7.313 7.058 6.776 6.457 6.063 5.472 4.038 -5 ,7597 ,KEBNE ,17024655,Wed Dec 22 10:43:55 CET,Wed Dec 22 12:14:48 CET,0.0 1.137 1.581 1.935 2.231 2.487 2.706 2.893 3.228 3.389 3.543 3.471 3.954 4.086 4.327 4.558 4.783 4.886 5.075 5.273 5.573 5.764 5.949 6.203 6.442 6.665 6.88 7.089 7.356 7.618 7.87 8.17 8.465 8.736 9.028 9.366 9.705 10.072 10.448 10.827 11.228 11.684 12.202 12.7 13.26 13.871 14.581 15.342 16.129 16.888 17.592 17.876 17.728 17.364 16.981 16.593 16.192 15.776 15.351 14.926 14.578 14.248 13.905 13.57 13.246 12.93 12.595 12.308 12.063 11.81 11.536 11.3 11.051 10.778 10.56 10.33 10.107 9.865 9.588 9.398 9.196 8.871 8.656 8.439 8.325 8.091 7.837 7.562 7.414 6.903 6.906 6.748 6.573 6.156 5.92 5.65 5.346 5.008 4.597 4.052 2.866 -6 ,3563 ,KEBNE ,17024656,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:16:29 CET,0.0 1.117 1.617 1.955 2.226 2.459 2.686 2.922 3.349 3.526 3.682 3.627 4.119 4.248 4.486 4.704 4.918 5.025 5.233 5.435 5.696 5.854 6.032 6.313 6.565 6.782 6.992 7.199 7.471 7.747 8.003 8.294 8.563 8.829 9.132 9.452 9.771 10.125 10.5 10.89 11.303 11.755 12.263 12.764 13.31 13.929 14.628 15.342 16.089 16.889 17.629 17.883 17.773 17.515 17.152 16.753 16.358 15.952 15.556 15.136 14.763 14.424 14.09 13.744 13.428 13.14 12.817 12.524 12.268 11.996 11.698 11.448 11.194 10.922 10.71 10.491 10.265 10.025 9.759 9.572 9.384 9.082 8.859 8.616 8.491 8.25 8.008 7.733 7.584 7.074 7.065 6.882 6.689 6.286 6.061 5.809 5.489 5.126 4.723 4.209 2.76 -7 ,28946 ,KEBNE ,17024657,Wed Dec 22 10:43:52 CET,Wed Dec 22 12:16:39 CET,0.0 1.043 1.543 1.925 2.242 2.503 2.724 2.921 3.293 3.458 3.613 3.554 4.045 4.178 4.416 4.64 4.863 4.97 5.175 5.37 5.647 5.833 6.004 6.237 6.466 6.691 6.918 7.138 7.413 7.655 7.872 8.149 8.439 8.715 9.001 9.319 9.642 10.0 10.382 10.787 11.193 11.643 12.164 12.673 13.272 13.912 14.594 15.309 16.108 16.989 17.744 17.915 17.739 17.436 17.046 16.602 16.189 15.768 15.349 14.91 14.498 14.145 13.822 13.51 13.203 12.908 12.597 12.297 12.041 11.791 11.523 11.29 11.031 10.749 10.519 10.281 10.039 9.788 9.524 9.341 9.147 8.836 8.623 8.401 8.28 8.032 7.765 7.477 7.325 6.822 6.813 6.632 6.448 6.046 5.816 5.55 5.232 4.863 4.455 3.878 2.516 -8 ,19727 ,KEBNE ,17024658,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:16:43 CET,0.0 1.022 1.513 1.919 2.254 2.537 2.768 2.963 3.318 3.477 3.639 3.601 4.09 4.221 4.477 4.716 4.935 5.039 5.236 5.418 5.693 5.873 6.036 6.267 6.49 6.718 6.936 7.141 7.415 7.675 7.912 8.194 8.46 8.722 9.025 9.353 9.683 10.056 10.445 10.83 11.235 11.703 12.216 12.744 13.346 13.989 14.706 15.463 16.287 17.086 17.815 18.073 17.925 17.618 17.256 16.855 16.447 16.017 15.613 15.226 14.845 14.48 14.156 13.839 13.521 13.22 12.887 12.588 12.336 12.07 11.786 11.546 11.282 11.007 10.793 10.565 10.316 10.058 9.799 9.621 9.44 9.142 8.925 8.7 8.579 8.325 8.056 7.765 7.611 7.104 7.113 6.937 6.745 6.32 6.085 5.808 5.502 5.136 4.711 4.171 2.636 -9 ,10412 ,KEBNE ,17024659,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:17:02 CET,0.0 0.897 1.282 1.6 1.859 2.116 2.35 2.551 2.902 3.053 3.194 3.124 3.609 3.744 3.996 4.218 4.436 4.547 4.759 4.966 5.26 5.441 5.62 5.882 6.123 6.343 6.549 6.744 7.0 7.264 7.529 7.844 8.135 8.414 8.728 9.09 9.434 9.775 10.14 10.545 10.96 11.42 11.95 12.47 13.055 13.68 14.366 15.076 15.842 16.666 17.431 17.664 17.45 17.131 16.741 16.285 15.821 15.377 14.973 14.53 14.127 13.768 13.429 13.098 12.774 12.465 12.131 11.839 11.588 11.314 11.033 10.792 10.529 10.261 10.061 9.852 9.62 9.378 9.127 8.942 8.753 8.465 8.249 8.016 7.899 7.652 7.393 7.114 6.973 6.49 6.487 6.301 6.104 5.633 5.387 5.137 4.844 4.486 4.081 3.492 1.291 -10 ,15901 ,KEBNE ,17024660,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:16:32 CET,0.0 1.468 1.897 2.229 2.511 2.769 2.993 3.182 3.518 3.676 3.827 3.79 4.29 4.422 4.683 4.918 5.14 5.255 5.458 5.649 5.938 6.119 6.297 6.551 6.785 7.018 7.239 7.446 7.709 7.959 8.201 8.503 8.788 9.054 9.365 9.711 10.04 10.404 10.78 11.16 11.549 11.995 12.521 13.043 13.624 14.234 14.89 15.59 16.36 17.108 17.784 17.97 17.788 17.468 17.074 16.642 16.228 15.822 15.436 15.014 14.612 14.254 13.911 13.576 13.271 12.985 12.658 12.359 12.094 11.821 11.548 11.301 11.037 10.769 10.544 10.313 10.077 9.829 9.576 9.391 9.188 8.882 8.676 8.456 8.343 8.103 7.831 7.527 7.369 6.875 6.889 6.713 6.534 6.103 5.854 5.598 5.306 4.97 4.581 4.047 2.759 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt deleted file mode 100644 index 7da84ba2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18630-1.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17601 ,TETRA ,17530617,Thu Nov 25 03:49:37 CET,Thu Nov 25 05:37:52 CET,0.0 0.794 1.14 1.425 1.656 1.85 2.02 2.186 2.504 2.657 2.801 2.712 3.183 3.294 3.516 3.727 3.934 4.035 4.243 4.446 4.713 4.879 5.051 5.302 5.537 5.772 5.996 6.206 6.467 6.709 6.95 7.242 7.527 7.792 8.091 8.428 8.749 9.077 9.421 9.804 10.197 10.628 11.115 11.607 12.16 12.74 13.385 14.039 14.739 15.467 16.096 16.208 15.942 15.584 15.17 14.705 14.231 13.768 13.368 12.95 12.559 12.195 11.841 11.516 11.212 10.907 10.579 10.287 10.023 9.749 9.473 9.23 8.975 8.716 8.505 8.276 8.036 7.805 7.557 7.368 7.174 6.876 6.661 6.427 6.309 6.061 5.812 5.548 5.398 4.899 4.93 4.748 4.555 4.114 3.872 3.615 3.305 2.958 2.551 2.001 0.586 -2 ,15849 ,TETRA ,17530619,Thu Nov 25 03:49:31 CET,Thu Nov 25 05:38:53 CET,0.0 0.839 1.213 1.523 1.764 1.964 2.147 2.329 2.65 2.79 2.925 2.829 3.306 3.429 3.661 3.863 4.059 4.154 4.337 4.513 4.758 4.92 5.073 5.299 5.526 5.755 5.973 6.173 6.443 6.697 6.945 7.25 7.53 7.798 8.095 8.42 8.721 9.034 9.372 9.736 10.127 10.571 11.062 11.528 12.067 12.625 13.26 13.989 14.739 15.455 16.044 16.131 15.862 15.485 15.091 14.663 14.2 13.741 13.34 12.935 12.541 12.162 11.808 11.47 11.156 10.853 10.514 10.199 9.941 9.682 9.389 9.136 8.876 8.6 8.395 8.189 7.951 7.697 7.444 7.269 7.08 6.782 6.576 6.339 6.207 5.952 5.683 5.386 5.231 4.718 4.702 4.525 4.335 3.914 3.683 3.429 3.132 2.788 2.361 1.773 0.291 -4 ,31722 ,TETRA ,17530629,Thu Nov 25 03:49:32 CET,Thu Nov 25 05:36:36 CET,0.0 0.839 1.202 1.502 1.757 1.967 2.136 2.294 2.595 2.731 2.858 2.757 3.228 3.338 3.558 3.781 4.0 4.1 4.268 4.428 4.695 4.865 5.019 5.238 5.449 5.658 5.851 6.037 6.284 6.513 6.728 6.994 7.257 7.51 7.799 8.131 8.437 8.758 9.105 9.482 9.877 10.306 10.799 11.277 11.829 12.428 13.078 13.761 14.46 15.146 15.708 15.779 15.487 15.073 14.62 14.141 13.677 13.22 12.81 12.424 12.065 11.701 11.347 11.032 10.743 10.45 10.128 9.837 9.583 9.311 9.015 8.759 8.496 8.226 8.005 7.77 7.545 7.307 7.039 6.857 6.658 6.346 6.133 5.908 5.795 5.565 5.302 4.996 4.843 4.349 4.379 4.205 4.025 3.621 3.365 3.078 2.792 2.454 2.037 1.447 -0.174 -6 ,4754 ,TETRA ,17530641,Thu Nov 25 03:49:36 CET,Thu Nov 25 05:38:34 CET,0.0 0.625 0.955 1.197 1.423 1.616 1.78 1.939 2.247 2.383 2.51 2.4 2.868 2.98 3.208 3.404 3.577 3.667 3.843 4.015 4.271 4.43 4.593 4.843 5.068 5.27 5.46 5.64 5.867 6.089 6.31 6.571 6.827 7.081 7.388 7.744 8.072 8.405 8.76 9.138 9.509 9.916 10.405 10.897 11.453 12.039 12.713 13.43 14.148 14.839 15.362 15.373 15.066 14.675 14.239 13.77 13.318 12.882 12.483 12.039 11.646 11.28 10.898 10.532 10.195 9.883 9.525 9.197 8.926 8.645 8.359 8.124 7.87 7.589 7.369 7.144 6.9 6.641 6.373 6.187 5.994 5.677 5.458 5.242 5.132 4.895 4.624 4.35 4.202 3.691 3.695 3.525 3.332 2.873 2.631 2.384 2.12 1.792 1.367 0.754 -0.835 -7 ,21373 ,TETRA ,17530650,Thu Nov 25 03:49:38 CET,Thu Nov 25 05:38:34 CET,0.0 0.72 1.028 1.27 1.493 1.687 1.877 2.054 2.349 2.495 2.636 2.521 2.982 3.08 3.265 3.459 3.656 3.745 3.916 4.09 4.349 4.499 4.638 4.857 5.069 5.278 5.487 5.691 5.948 6.195 6.425 6.698 6.949 7.201 7.525 7.869 8.181 8.543 8.935 9.309 9.689 10.113 10.592 11.062 11.592 12.162 12.774 13.44 14.135 14.81 15.269 15.255 14.987 14.601 14.112 13.627 13.22 12.771 12.347 11.919 11.546 11.203 10.838 10.484 10.149 9.829 9.477 9.173 8.919 8.635 8.338 8.1 7.842 7.562 7.335 7.092 6.844 6.59 6.335 6.153 5.963 5.653 5.428 5.208 5.095 4.843 4.577 4.306 4.159 3.655 3.658 3.484 3.311 2.884 2.65 2.413 2.13 1.801 1.408 0.882 -0.683 -8 ,7014 ,TETRA ,17530651,Thu Nov 25 03:49:32 CET,Thu Nov 25 05:37:11 CET,0.0 0.714 1.088 1.388 1.621 1.809 1.988 2.164 2.487 2.629 2.763 2.679 3.164 3.283 3.504 3.712 3.907 4.009 4.196 4.352 4.576 4.727 4.875 5.091 5.309 5.528 5.734 5.934 6.193 6.438 6.666 6.944 7.212 7.46 7.762 8.114 8.444 8.797 9.166 9.552 9.964 10.392 10.845 11.282 11.793 12.376 13.026 13.709 14.369 14.96 15.439 15.505 15.235 14.784 14.301 13.816 13.355 12.917 12.522 12.105 11.727 11.37 11.007 10.663 10.324 10.025 9.719 9.425 9.168 8.891 8.58 8.311 8.042 7.759 7.539 7.312 7.069 6.823 6.566 6.373 6.179 5.864 5.64 5.414 5.293 5.045 4.787 4.522 4.377 3.877 3.901 3.736 3.553 3.131 2.89 2.605 2.302 2.0 1.615 1.055 -0.482 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt deleted file mode 100644 index 09819e9d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18633-1_18632-1.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4072 ,TETRA ,17530697,Thu Nov 25 03:49:34 CET,Thu Nov 25 05:38:35 CET,0.0 3.124 3.821 4.276 4.641 4.942 5.227 5.503 5.975 6.198 6.41 6.426 6.938 7.1 7.424 7.72 7.991 8.119 8.368 8.608 8.931 9.131 9.322 9.595 9.871 10.137 10.383 10.619 10.917 11.207 11.489 11.81 12.116 12.413 12.75 13.122 13.47 13.85 14.245 14.652 15.064 15.485 15.946 16.416 16.949 17.46 18.001 18.552 19.021 19.345 19.294 18.651 17.877 17.099 16.34 15.561 14.815 14.154 13.591 12.974 12.421 11.899 11.405 10.959 10.532 10.131 9.711 9.349 9.045 8.73 8.394 8.1 7.791 7.462 7.215 6.962 6.695 6.417 6.127 5.938 5.728 5.385 5.141 4.881 4.751 4.463 4.159 3.84 3.66 3.115 3.08 2.875 2.658 2.177 1.914 1.624 1.3 0.914 0.5 -0.113 -2.566 -8 ,24540 ,TETRA ,17530769,Thu Nov 25 03:50:31 CET,Thu Nov 25 05:39:32 CET,0.0 2.834 3.477 3.923 4.31 4.656 4.958 5.21 5.675 5.895 6.101 6.154 6.691 6.854 7.171 7.466 7.743 7.866 8.104 8.346 8.683 8.891 9.091 9.396 9.683 9.941 10.202 10.445 10.745 11.037 11.312 11.637 11.955 12.259 12.582 12.923 13.256 13.624 14.011 14.4 14.806 15.249 15.738 16.222 16.738 17.256 17.826 18.395 18.926 19.303 19.251 18.661 17.86 17.075 16.362 15.634 14.951 14.34 13.801 13.209 12.684 12.224 11.754 11.29 10.862 10.47 10.066 9.695 9.367 9.022 8.669 8.371 8.056 7.708 7.441 7.164 6.863 6.573 6.274 6.068 5.844 5.469 5.227 4.974 4.833 4.528 4.209 3.882 3.71 3.172 3.138 2.949 2.73 2.203 1.909 1.588 1.231 0.835 0.362 -0.257 -2.308 -9 ,27410 ,TETRA ,17530778,Thu Nov 25 03:50:31 CET,Thu Nov 25 05:40:29 CET,0.0 2.067 2.661 3.133 3.539 3.896 4.195 4.457 4.889 5.082 5.27 5.268 5.795 5.965 6.265 6.543 6.785 6.908 7.172 7.413 7.754 7.968 8.171 8.467 8.745 9.015 9.273 9.51 9.819 10.104 10.369 10.694 10.993 11.256 11.553 11.906 12.234 12.595 12.977 13.368 13.799 14.273 14.788 15.25 15.749 16.253 16.75 17.249 17.685 17.999 17.963 17.288 16.449 15.67 14.94 14.18 13.474 12.817 12.226 11.626 11.096 10.605 10.147 9.714 9.304 8.941 8.529 8.139 7.823 7.516 7.182 6.895 6.595 6.267 5.999 5.722 5.442 5.154 4.855 4.647 4.436 4.115 3.885 3.634 3.497 3.216 2.924 2.604 2.434 1.894 1.865 1.653 1.431 0.968 0.704 0.411 0.087 -0.257 -0.701 -1.39 -3.118 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt deleted file mode 100644 index 6a9fc432..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18631-1.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24713 ,TETRA ,17530782,Thu Nov 25 03:50:36 CET,Thu Nov 25 05:40:30 CET,0.0 1.182 1.655 2.023 2.378 2.671 2.939 3.186 3.611 3.804 3.983 3.935 4.437 4.585 4.875 5.147 5.403 5.533 5.784 6.015 6.352 6.568 6.772 7.073 7.366 7.64 7.909 8.169 8.492 8.798 9.095 9.466 9.812 10.138 10.519 10.952 11.37 11.806 12.29 12.805 13.325 13.916 14.6 15.26 16.029 16.874 17.773 18.773 19.909 21.137 22.349 22.884 22.908 22.691 22.33 21.917 21.496 21.052 20.616 20.171 19.776 19.406 19.046 18.672 18.304 17.966 17.611 17.287 16.995 16.674 16.333 16.052 15.764 15.465 15.226 14.969 14.684 14.378 14.069 13.853 13.628 13.283 13.042 12.769 12.623 12.319 11.998 11.657 11.475 10.937 10.878 10.662 10.429 9.884 9.593 9.3 8.98 8.579 8.059 7.274 4.916 -2 ,21498 ,TETRA ,17530785,Thu Nov 25 03:50:32 CET,Thu Nov 25 05:40:28 CET,0.0 1.196 1.732 2.134 2.452 2.752 3.032 3.262 3.666 3.857 4.044 4.021 4.55 4.716 5.012 5.285 5.55 5.669 5.906 6.147 6.486 6.695 6.913 7.24 7.526 7.805 8.079 8.342 8.667 8.969 9.269 9.64 10.018 10.38 10.773 11.207 11.628 12.102 12.606 13.127 13.655 14.224 14.922 15.649 16.467 17.316 18.246 19.281 20.431 21.659 22.908 23.543 23.567 23.301 22.928 22.504 22.06 21.601 21.176 20.732 20.339 19.967 19.568 19.156 18.774 18.447 18.089 17.752 17.464 17.154 16.83 16.549 16.24 15.918 15.666 15.409 15.138 14.852 14.548 14.337 14.13 13.782 13.521 13.252 13.11 12.825 12.517 12.181 12.006 11.458 11.408 11.198 10.965 10.435 10.143 9.813 9.428 9.01 8.529 7.89 5.977 -3 ,31733 ,TETRA ,17530787,Thu Nov 25 03:50:31 CET,Thu Nov 25 05:40:52 CET,0.0 1.559 2.109 2.475 2.815 3.13 3.392 3.625 4.042 4.237 4.417 4.381 4.905 5.058 5.34 5.615 5.88 6.004 6.242 6.471 6.806 7.029 7.245 7.555 7.836 8.101 8.361 8.621 8.969 9.303 9.616 9.983 10.333 10.673 11.078 11.519 11.929 12.37 12.836 13.335 13.878 14.49 15.181 15.878 16.661 17.486 18.437 19.464 20.554 21.752 22.934 23.464 23.49 23.314 23.045 22.665 22.225 21.778 21.348 20.889 20.486 20.111 19.742 19.363 19.001 18.673 18.311 17.977 17.683 17.376 17.045 16.76 16.445 16.112 15.864 15.604 15.334 15.051 14.755 14.551 14.325 13.937 13.657 13.363 13.216 12.939 12.642 12.272 12.077 11.543 11.498 11.284 11.065 10.584 10.285 9.912 9.433 8.851 8.266 7.573 5.501 -6 ,28858 ,TETRA ,17530799,Thu Nov 25 03:50:31 CET,Thu Nov 25 05:39:15 CET,0.0 0.914 1.374 1.732 2.069 2.354 2.587 2.787 3.182 3.375 3.559 3.544 4.072 4.224 4.522 4.799 5.05 5.173 5.43 5.666 6.004 6.224 6.439 6.737 7.01 7.278 7.531 7.787 8.123 8.454 8.779 9.164 9.522 9.858 10.249 10.686 11.113 11.574 12.059 12.573 13.104 13.689 14.378 15.081 15.856 16.7 17.697 18.735 19.842 21.073 22.325 22.916 22.98 22.831 22.518 22.134 21.72 21.308 20.933 20.498 20.098 19.736 19.375 19.007 18.645 18.307 17.92 17.561 17.255 16.928 16.588 16.3 15.996 15.68 15.414 15.136 14.86 14.581 14.275 14.059 13.841 13.486 13.228 12.95 12.806 12.5 12.177 11.843 11.664 11.115 11.068 10.849 10.61 10.101 9.808 9.484 9.14 8.753 8.25 7.463 5.47 -10 ,30355 ,TETRA ,17530842,Thu Nov 25 03:50:38 CET,Thu Nov 25 05:40:26 CET,0.0 0.989 1.505 1.896 2.227 2.527 2.763 2.979 3.39 3.577 3.764 3.743 4.26 4.415 4.726 5.007 5.273 5.406 5.661 5.909 6.247 6.457 6.657 6.949 7.241 7.516 7.778 8.037 8.373 8.683 8.981 9.346 9.698 10.027 10.403 10.838 11.246 11.692 12.197 12.72 13.249 13.854 14.557 15.245 16.014 16.869 17.839 18.862 19.998 21.249 22.442 23.024 23.067 22.846 22.512 22.111 21.696 21.286 20.908 20.487 20.093 19.696 19.295 18.92 18.566 18.236 17.87 17.522 17.229 16.925 16.593 16.314 16.021 15.709 15.468 15.209 14.932 14.643 14.326 14.099 13.862 13.505 13.259 13.01 12.881 12.584 12.274 11.957 11.774 11.221 11.155 10.921 10.682 10.173 9.89 9.586 9.229 8.835 8.343 7.61 5.826 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt deleted file mode 100644 index 1ac40e05..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18634-1_18633-1.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,29647 ,TETRA ,17530859,Thu Nov 25 03:50:32 CET,Thu Nov 25 05:38:51 CET,0.0 1.881 2.505 2.998 3.414 3.765 4.083 4.364 4.895 5.137 5.361 5.388 5.938 6.115 6.455 6.787 7.093 7.242 7.538 7.829 8.238 8.498 8.732 9.071 9.409 9.73 10.041 10.33 10.699 11.06 11.423 11.864 12.271 12.651 13.101 13.602 14.065 14.6 15.182 15.774 16.388 17.072 17.859 18.653 19.55 20.465 21.518 22.741 24.081 25.521 26.975 27.807 27.981 27.755 27.327 26.836 26.348 25.853 25.368 24.876 24.451 24.008 23.569 23.158 22.764 22.381 21.974 21.612 21.29 20.954 20.587 20.28 19.972 19.641 19.391 19.12 18.819 18.503 18.154 17.899 17.632 17.224 16.929 16.626 16.472 16.136 15.779 15.391 15.168 14.578 14.434 14.183 13.914 13.298 12.951 12.561 12.135 11.649 11.053 10.106 6.906 -5 ,26921 ,TETRA ,17530871,Thu Nov 25 03:50:33 CET,Thu Nov 25 05:40:35 CET,0.0 1.881 2.583 3.043 3.43 3.737 4.016 4.297 4.806 5.028 5.244 5.322 5.899 6.089 6.434 6.768 7.092 7.243 7.529 7.8 8.206 8.459 8.692 9.032 9.369 9.697 10.005 10.303 10.669 11.017 11.356 11.77 12.185 12.569 12.991 13.487 13.973 14.482 15.02 15.603 16.222 16.915 17.697 18.463 19.326 20.263 21.319 22.455 23.735 25.045 26.374 27.098 27.145 26.909 26.511 26.059 25.645 25.177 24.696 24.191 23.747 23.328 22.899 22.495 22.111 21.744 21.367 21.005 20.646 20.265 19.88 19.56 19.23 18.883 18.603 18.309 18.004 17.691 17.359 17.113 16.847 16.434 16.136 15.828 15.669 15.333 14.975 14.581 14.371 13.798 13.672 13.443 13.185 12.579 12.255 11.87 11.43 10.927 10.285 9.4 6.214 -9 ,9072 ,TETRA ,17530899,Thu Nov 25 03:50:40 CET,Thu Nov 25 05:38:35 CET,0.0 2.151 2.788 3.314 3.733 4.083 4.399 4.697 5.212 5.436 5.652 5.697 6.245 6.433 6.802 7.14 7.465 7.629 7.931 8.209 8.613 8.862 9.099 9.452 9.806 10.144 10.447 10.741 11.129 11.498 11.851 12.281 12.708 13.115 13.563 14.061 14.556 15.107 15.654 16.227 16.864 17.57 18.354 19.155 20.101 21.081 22.178 23.392 24.758 26.201 27.607 28.194 28.109 27.882 27.533 27.114 26.725 26.307 25.878 25.427 24.978 24.532 24.114 23.712 23.338 23.0 22.615 22.245 21.913 21.571 21.199 20.869 20.538 20.204 19.927 19.63 19.329 19.005 18.654 18.413 18.168 17.766 17.468 17.162 17.012 16.707 16.37 15.991 15.777 15.206 15.103 14.858 14.61 14.05 13.729 13.361 12.906 12.352 11.729 11.034 7.666 -10 ,426 ,TETRA ,17530901,Thu Nov 25 03:50:33 CET,Thu Nov 25 05:36:28 CET,0.0 2.248 2.919 3.415 3.815 4.137 4.442 4.736 5.242 5.482 5.72 5.773 6.329 6.515 6.853 7.179 7.495 7.638 7.919 8.194 8.588 8.835 9.074 9.439 9.784 10.117 10.429 10.722 11.09 11.441 11.793 12.221 12.634 13.026 13.481 13.995 14.464 14.983 15.538 16.128 16.757 17.457 18.245 18.996 19.878 20.833 21.883 23.027 24.318 25.679 26.956 27.664 27.743 27.513 27.166 26.704 26.22 25.715 25.251 24.783 24.341 23.91 23.468 23.042 22.633 22.252 21.867 21.49 21.137 20.795 20.436 20.124 19.807 19.458 19.175 18.891 18.6 18.281 17.93 17.687 17.445 17.07 16.802 16.503 16.34 15.99 15.631 15.26 15.06 14.506 14.421 14.183 13.923 13.323 12.993 12.616 12.187 11.674 11.02 10.151 6.448 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index 638a29f4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,24380 ,TETRA ,17530951,Thu Nov 25 03:50:34 CET,Thu Nov 25 05:39:47 CET,0.0 1.343 1.87 2.222 2.528 2.825 3.086 3.325 3.732 3.903 4.074 4.07 4.557 4.685 4.947 5.21 5.449 5.554 5.753 5.948 6.233 6.418 6.593 6.848 7.096 7.326 7.549 7.764 8.033 8.282 8.53 8.836 9.114 9.398 9.718 10.058 10.393 10.764 11.154 11.54 11.949 12.432 12.94 13.428 14.005 14.606 15.277 16.007 16.772 17.558 18.253 18.416 18.208 17.842 17.411 16.989 16.56 16.121 15.72 15.298 14.939 14.612 14.291 13.989 13.683 13.392 13.081 12.793 12.551 12.3 12.028 11.793 11.542 11.275 11.059 10.844 10.626 10.387 10.136 9.97 9.794 9.493 9.28 9.071 8.965 8.737 8.475 8.189 8.049 7.561 7.555 7.372 7.17 6.737 6.493 6.235 5.951 5.607 5.186 4.647 3.104 -3 ,13733 ,TETRA ,17530959,Thu Nov 25 03:50:35 CET,Thu Nov 25 05:35:59 CET,0.0 1.169 1.643 1.995 2.313 2.6 2.846 3.065 3.444 3.621 3.8 3.77 4.255 4.394 4.642 4.889 5.129 5.236 5.456 5.662 5.946 6.13 6.31 6.566 6.813 7.056 7.282 7.499 7.776 8.041 8.298 8.596 8.878 9.157 9.475 9.831 10.183 10.577 10.987 11.382 11.792 12.264 12.79 13.287 13.854 14.473 15.181 15.936 16.686 17.449 18.109 18.281 18.105 17.787 17.419 16.99 16.555 16.15 15.787 15.407 15.041 14.701 14.401 14.105 13.815 13.552 13.259 12.985 12.74 12.486 12.223 11.995 11.752 11.499 11.3 11.084 10.86 10.636 10.397 10.224 10.047 9.776 9.565 9.32 9.206 8.978 8.716 8.452 8.323 7.854 7.901 7.74 7.58 7.241 7.042 6.801 6.545 6.276 5.984 5.606 4.655 -4 ,2989 ,TETRA ,17530966,Thu Nov 25 03:50:35 CET,Thu Nov 25 05:41:45 CET,0.0 1.31 1.779 2.129 2.463 2.759 3.014 3.236 3.595 3.764 3.923 3.883 4.381 4.532 4.822 5.084 5.298 5.407 5.629 5.828 6.104 6.283 6.454 6.717 6.976 7.215 7.44 7.654 7.934 8.195 8.441 8.742 9.035 9.32 9.651 10.022 10.371 10.745 11.123 11.514 11.909 12.351 12.871 13.352 13.906 14.503 15.201 15.96 16.67 17.369 18.013 18.173 17.954 17.567 17.152 16.77 16.351 15.92 15.53 15.107 14.728 14.371 14.036 13.732 13.427 13.125 12.81 12.54 12.293 12.038 11.771 11.532 11.281 11.037 10.85 10.655 10.447 10.207 9.944 9.762 9.581 9.287 9.083 8.87 8.751 8.508 8.243 7.968 7.814 7.304 7.31 7.145 6.983 6.627 6.428 6.232 6.02 5.759 5.441 5.028 3.561 -8 ,4372 ,TETRA ,17530996,Thu Nov 25 03:52:04 CET,Thu Nov 25 05:41:02 CET,0.0 1.382 1.808 2.157 2.45 2.711 2.956 3.174 3.558 3.732 3.893 3.863 4.343 4.477 4.742 4.985 5.221 5.337 5.547 5.749 6.038 6.218 6.402 6.67 6.922 7.164 7.391 7.611 7.898 8.166 8.414 8.723 9.017 9.296 9.617 9.97 10.314 10.675 11.035 11.417 11.825 12.279 12.786 13.312 13.917 14.565 15.272 16.015 16.801 17.572 18.224 18.441 18.264 17.928 17.558 17.146 16.727 16.315 15.923 15.498 15.124 14.785 14.459 14.148 13.849 13.572 13.281 13.001 12.747 12.488 12.208 11.968 11.718 11.459 11.257 11.038 10.812 10.572 10.3 10.11 9.919 9.62 9.396 9.155 9.04 8.802 8.54 8.267 8.123 7.634 7.639 7.459 7.284 6.891 6.648 6.381 6.087 5.801 5.478 5.031 4.003 -9 ,7614 ,TETRA ,17531008,Thu Nov 25 03:52:06 CET,Thu Nov 25 05:41:02 CET,0.0 1.061 1.476 1.823 2.125 2.365 2.589 2.791 3.168 3.359 3.541 3.511 3.989 4.134 4.402 4.645 4.884 4.998 5.216 5.425 5.717 5.897 6.068 6.324 6.566 6.79 7.009 7.218 7.493 7.764 8.016 8.319 8.611 8.894 9.198 9.512 9.831 10.193 10.56 10.95 11.358 11.789 12.285 12.803 13.406 14.034 14.714 15.44 16.213 16.958 17.618 17.834 17.631 17.307 16.944 16.506 16.048 15.613 15.226 14.816 14.454 14.128 13.811 13.486 13.162 12.868 12.571 12.299 12.058 11.81 11.548 11.325 11.084 10.828 10.634 10.443 10.24 10.025 9.818 9.672 9.514 9.258 9.086 8.895 8.789 8.571 8.356 8.137 8.017 7.557 7.621 7.467 7.31 6.988 6.81 6.599 6.337 6.027 5.683 5.247 3.917 -10 ,21296 ,TETRA ,17531014,Thu Nov 25 03:52:02 CET,Thu Nov 25 05:39:10 CET,0.0 1.119 1.571 1.96 2.298 2.581 2.85 3.084 3.458 3.621 3.776 3.714 4.187 4.32 4.599 4.865 5.089 5.2 5.427 5.635 5.927 6.117 6.303 6.565 6.818 7.053 7.273 7.486 7.757 8.021 8.272 8.557 8.83 9.103 9.415 9.757 10.089 10.456 10.825 11.235 11.668 12.102 12.612 13.143 13.732 14.344 15.063 15.856 16.664 17.438 18.052 18.177 18.0 17.683 17.302 16.886 16.458 16.05 15.665 15.233 14.879 14.566 14.234 13.905 13.606 13.315 12.996 12.718 12.478 12.215 11.932 11.699 11.458 11.205 10.992 10.777 10.557 10.306 10.042 9.861 9.67 9.376 9.174 8.948 8.833 8.594 8.321 8.051 7.919 7.446 7.489 7.324 7.157 6.819 6.617 6.374 6.133 5.857 5.521 5.119 3.555 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt deleted file mode 100644 index bf1763ad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18630-1.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,17899 ,TETRA ,17531068,Thu Nov 25 03:52:03 CET,Thu Nov 25 05:41:44 CET,0.0 1.179 1.521 1.772 2.004 2.203 2.37 2.528 2.843 2.989 3.127 3.077 3.555 3.683 3.939 4.196 4.431 4.534 4.724 4.91 5.182 5.356 5.511 5.725 5.93 6.124 6.307 6.483 6.699 6.908 7.125 7.39 7.638 7.874 8.162 8.491 8.786 9.086 9.376 9.677 9.993 10.342 10.729 11.103 11.51 11.922 12.369 12.794 13.209 13.532 13.575 13.19 12.672 12.113 11.491 10.875 10.332 9.817 9.376 8.955 8.552 8.157 7.793 7.436 7.086 6.757 6.413 6.098 5.825 5.557 5.246 4.97 4.686 4.393 4.163 3.941 3.73 3.502 3.245 3.058 2.869 2.584 2.381 2.148 2.033 1.814 1.563 1.284 1.151 0.672 0.71 0.554 0.388 -0.035 -0.249 -0.457 -0.699 -1.009 -1.408 -1.953 -4.648 -5 ,23774 ,TETRA ,17531073,Thu Nov 25 03:52:05 CET,Thu Nov 25 05:41:40 CET,0.0 0.834 1.206 1.484 1.702 1.883 2.067 2.24 2.555 2.697 2.82 2.704 3.164 3.276 3.484 3.665 3.842 3.937 4.119 4.297 4.557 4.721 4.874 5.088 5.291 5.487 5.681 5.869 6.11 6.34 6.558 6.818 7.065 7.302 7.566 7.862 8.151 8.448 8.754 9.09 9.438 9.79 10.188 10.595 11.043 11.487 11.979 12.487 12.943 13.241 13.272 12.904 12.355 11.775 11.197 10.625 10.119 9.661 9.227 8.736 8.297 7.899 7.535 7.21 6.87 6.535 6.186 5.893 5.635 5.361 5.092 4.866 4.622 4.361 4.155 3.913 3.657 3.409 3.154 2.977 2.796 2.519 2.309 2.081 1.968 1.732 1.483 1.22 1.087 0.606 0.641 0.459 0.267 -0.115 -0.336 -0.609 -0.896 -1.192 -1.558 -2.071 -4.419 -6 ,6320 ,TETRA ,17531086,Thu Nov 25 03:52:06 CET,Thu Nov 25 05:41:25 CET,0.0 1.577 2.11 2.448 2.742 3.007 3.242 3.441 3.798 3.96 4.115 4.094 4.592 4.729 4.969 5.194 5.407 5.507 5.71 5.897 6.144 6.299 6.454 6.678 6.887 7.083 7.263 7.435 7.668 7.902 8.123 8.39 8.641 8.876 9.127 9.406 9.686 9.991 10.315 10.655 11.007 11.368 11.769 12.166 12.592 13.023 13.463 13.906 14.338 14.694 14.823 14.476 13.909 13.268 12.65 12.067 11.513 10.987 10.558 10.139 9.768 9.424 9.071 8.733 8.4 8.087 7.741 7.437 7.193 6.934 6.649 6.399 6.13 5.847 5.631 5.409 5.169 4.916 4.662 4.476 4.273 3.968 3.763 3.543 3.427 3.194 2.957 2.698 2.562 2.081 2.117 1.952 1.788 1.428 1.217 0.978 0.726 0.401 0.03 -0.421 -2.207 -7 ,28170 ,TETRA ,17531097,Thu Nov 25 03:52:08 CET,Thu Nov 25 05:41:41 CET,0.0 0.92 1.26 1.534 1.758 1.968 2.159 2.322 2.607 2.743 2.879 2.775 3.225 3.326 3.517 3.703 3.888 3.979 4.154 4.314 4.55 4.708 4.86 5.077 5.287 5.495 5.69 5.87 6.101 6.321 6.538 6.797 7.046 7.286 7.557 7.86 8.143 8.44 8.744 9.082 9.433 9.8 10.221 10.636 11.086 11.535 12.018 12.506 12.946 13.311 13.441 13.084 12.541 11.911 11.291 10.703 10.144 9.624 9.195 8.767 8.365 7.984 7.613 7.257 6.924 6.625 6.312 6.033 5.791 5.522 5.227 4.964 4.696 4.426 4.199 3.964 3.74 3.513 3.251 3.06 2.881 2.6 2.4 2.194 2.076 1.837 1.589 1.314 1.176 0.678 0.674 0.483 0.298 -0.08 -0.307 -0.556 -0.834 -1.142 -1.495 -1.938 -3.63 -8 ,16714 ,TETRA ,17531106,Thu Nov 25 03:52:03 CET,Thu Nov 25 05:40:57 CET,0.0 1.03 1.392 1.697 1.922 2.118 2.292 2.454 2.746 2.874 3.0 2.897 3.349 3.462 3.686 3.917 4.137 4.233 4.404 4.564 4.794 4.945 5.099 5.32 5.524 5.722 5.915 6.091 6.309 6.531 6.745 6.998 7.229 7.441 7.681 7.954 8.221 8.498 8.793 9.115 9.461 9.838 10.257 10.664 11.112 11.561 12.017 12.424 12.813 13.129 13.139 12.73 12.142 11.474 10.847 10.29 9.778 9.267 8.793 8.323 7.897 7.495 7.115 6.77 6.454 6.149 5.823 5.542 5.304 5.048 4.762 4.517 4.263 3.996 3.786 3.583 3.376 3.142 2.873 2.691 2.501 2.178 1.967 1.76 1.65 1.415 1.167 0.91 0.774 0.285 0.309 0.142 -0.042 -0.464 -0.689 -0.913 -1.145 -1.424 -1.776 -2.311 -4.095 -9 ,26075 ,TETRA ,17531107,Thu Nov 25 03:52:07 CET,Thu Nov 25 05:40:30 CET,0.0 1.27 1.708 1.982 2.246 2.485 2.688 2.855 3.143 3.282 3.423 3.328 3.796 3.914 4.121 4.325 4.519 4.61 4.783 4.953 5.19 5.338 5.48 5.689 5.905 6.119 6.321 6.52 6.776 7.028 7.263 7.519 7.777 8.039 8.325 8.615 8.878 9.173 9.476 9.784 10.11 10.481 10.924 11.326 11.738 12.18 12.68 13.148 13.523 13.834 13.904 13.473 12.832 12.177 11.569 10.952 10.341 9.8 9.355 8.903 8.515 8.142 7.763 7.412 7.08 6.757 6.411 6.107 5.853 5.595 5.313 5.06 4.803 4.539 4.33 4.115 3.894 3.659 3.4 3.218 3.05 2.776 2.568 2.351 2.234 2.0 1.759 1.498 1.36 0.873 0.898 0.717 0.537 0.147 -0.085 -0.348 -0.663 -0.997 -1.36 -1.811 -3.496 -10 ,22473 ,TETRA ,17531109,Thu Nov 25 03:52:05 CET,Thu Nov 25 05:41:03 CET,0.0 0.998 1.32 1.57 1.813 2.015 2.192 2.363 2.657 2.792 2.918 2.818 3.275 3.38 3.578 3.757 3.935 4.024 4.193 4.358 4.595 4.762 4.932 5.174 5.392 5.581 5.754 5.92 6.14 6.341 6.542 6.787 7.009 7.225 7.479 7.753 7.993 8.246 8.525 8.835 9.149 9.484 9.873 10.277 10.718 11.138 11.623 12.111 12.533 12.889 12.961 12.471 11.845 11.257 10.683 10.104 9.579 9.081 8.655 8.231 7.874 7.546 7.196 6.858 6.538 6.222 5.894 5.619 5.371 5.108 4.809 4.541 4.282 4.018 3.808 3.591 3.363 3.125 2.876 2.707 2.524 2.22 2.013 1.81 1.706 1.472 1.234 0.976 0.844 0.369 0.407 0.234 0.049 -0.365 -0.602 -0.845 -1.109 -1.403 -1.757 -2.171 -3.865 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18636-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18636-1.txt deleted file mode 100644 index a6134802..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18635-1_18636-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10717 ,KEBNE ,17024661,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:17:31 CET,0.0 1.257 1.793 2.18 2.457 2.711 2.938 3.159 3.559 3.727 3.886 3.83 4.311 4.444 4.692 4.921 5.126 5.221 5.414 5.613 5.88 6.046 6.216 6.442 6.648 6.853 7.035 7.208 7.437 7.652 7.856 8.089 8.316 8.545 8.816 9.096 9.343 9.618 9.907 10.207 10.487 10.754 11.077 11.422 11.757 12.118 12.513 12.834 13.079 13.187 12.97 12.281 11.519 10.763 10.027 9.306 8.696 8.128 7.618 7.104 6.645 6.241 5.87 5.537 5.198 4.881 4.572 4.292 4.049 3.792 3.526 3.302 3.081 2.858 2.667 2.457 2.23 2.004 1.783 1.624 1.456 1.175 0.972 0.769 0.666 0.46 0.247 0.021 -0.101 -0.57 -0.469 -0.614 -0.76 -1.075 -1.255 -1.435 -1.634 -1.894 -2.202 -2.515 -3.286 -2 ,9138 ,KEBNE ,17024662,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:17:00 CET,0.0 1.058 1.488 1.819 2.114 2.375 2.612 2.843 3.219 3.387 3.552 3.509 3.974 4.087 4.315 4.547 4.762 4.864 5.07 5.254 5.52 5.687 5.844 6.078 6.293 6.487 6.67 6.847 7.071 7.293 7.516 7.777 8.021 8.253 8.525 8.818 9.07 9.329 9.625 9.942 10.253 10.573 10.93 11.282 11.672 12.073 12.455 12.784 13.015 13.087 12.856 12.157 11.365 10.558 9.788 9.111 8.516 7.928 7.402 6.878 6.412 5.987 5.585 5.2 4.831 4.476 4.113 3.8 3.511 3.213 2.902 2.634 2.377 2.113 1.905 1.682 1.441 1.193 0.931 0.761 0.603 0.341 0.149 -0.047 -0.142 -0.322 -0.507 -0.727 -0.858 -1.331 -1.233 -1.366 -1.509 -1.817 -1.984 -2.164 -2.356 -2.559 -2.791 -3.072 -3.81 -3 ,19762 ,KEBNE ,17024663,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:17:21 CET,0.0 1.228 1.668 2.037 2.342 2.643 2.903 3.108 3.448 3.605 3.761 3.711 4.196 4.336 4.584 4.799 5.003 5.1 5.28 5.464 5.724 5.88 6.024 6.239 6.452 6.64 6.828 7.019 7.255 7.483 7.709 7.961 8.188 8.415 8.659 8.916 9.166 9.427 9.713 10.013 10.31 10.636 10.978 11.291 11.659 12.036 12.422 12.795 13.072 13.147 12.882 12.143 11.305 10.513 9.758 9.066 8.434 7.844 7.331 6.79 6.311 5.895 5.496 5.089 4.719 4.394 4.038 3.709 3.441 3.162 2.856 2.603 2.347 2.078 1.862 1.64 1.402 1.154 0.884 0.691 0.501 0.208 0.006 -0.211 -0.324 -0.545 -0.769 -1.033 -1.18 -1.674 -1.661 -1.84 -2.01 -2.398 -2.616 -2.825 -3.074 -3.375 -3.69 -4.052 -4.976 -4 ,24989 ,KEBNE ,17024664,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:17:29 CET,0.0 1.082 1.52 1.831 2.107 2.351 2.583 2.787 3.141 3.293 3.438 3.386 3.861 4.003 4.275 4.51 4.723 4.821 5.01 5.187 5.459 5.634 5.802 6.047 6.271 6.475 6.66 6.835 7.056 7.277 7.489 7.737 7.971 8.193 8.453 8.739 9.008 9.281 9.578 9.903 10.233 10.588 10.981 11.328 11.703 12.107 12.474 12.788 13.087 13.216 12.91 12.131 11.272 10.423 9.654 8.952 8.276 7.674 7.162 6.627 6.176 5.768 5.365 4.955 4.559 4.213 3.867 3.548 3.259 2.97 2.676 2.421 2.149 1.856 1.638 1.412 1.163 0.906 0.635 0.441 0.243 -0.053 -0.264 -0.488 -0.601 -0.825 -1.064 -1.311 -1.438 -1.923 -1.869 -2.035 -2.202 -2.563 -2.791 -3.025 -3.296 -3.584 -3.898 -4.361 -5.465 -5 ,22653 ,KEBNE ,17024666,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:17:15 CET,0.0 2.411 2.875 3.254 3.563 3.839 4.082 4.284 4.628 4.787 4.943 4.879 5.347 5.482 5.749 5.984 6.197 6.304 6.512 6.702 6.968 7.132 7.284 7.513 7.733 7.927 8.113 8.296 8.529 8.765 8.987 9.237 9.471 9.7 9.962 10.23 10.475 10.747 11.048 11.354 11.654 12.0 12.379 12.731 13.129 13.509 13.848 14.176 14.479 14.591 14.284 13.554 12.719 11.91 11.17 10.469 9.844 9.25 8.716 8.195 7.753 7.348 6.946 6.564 6.191 5.834 5.48 5.181 4.919 4.627 4.32 4.08 3.833 3.561 3.343 3.117 2.882 2.638 2.381 2.209 2.027 1.727 1.515 1.298 1.19 0.97 0.726 0.466 0.338 -0.14 -0.072 -0.222 -0.38 -0.705 -0.889 -1.082 -1.276 -1.522 -1.798 -2.109 -2.977 -6 ,27271 ,KEBNE ,17024667,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:18:11 CET,0.0 0.993 1.463 1.824 2.126 2.395 2.639 2.864 3.267 3.441 3.597 3.551 4.028 4.154 4.394 4.619 4.826 4.923 5.111 5.288 5.536 5.707 5.873 6.1 6.305 6.497 6.687 6.872 7.111 7.324 7.534 7.804 8.052 8.262 8.5 8.777 9.041 9.318 9.61 9.924 10.237 10.576 10.945 11.276 11.637 11.998 12.347 12.667 12.925 13.032 12.764 12.014 11.215 10.392 9.617 8.935 8.316 7.688 7.116 6.553 6.083 5.676 5.262 4.854 4.479 4.135 3.766 3.426 3.146 2.882 2.601 2.338 2.071 1.802 1.588 1.364 1.126 0.884 0.63 0.453 0.276 -0.02 -0.228 -0.44 -0.552 -0.782 -1.018 -1.29 -1.434 -1.921 -1.879 -2.047 -2.223 -2.624 -2.84 -3.06 -3.325 -3.633 -3.99 -4.452 -5.778 -7 ,19955 ,KEBNE ,17024668,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:17:08 CET,0.0 1.446 1.895 2.246 2.555 2.792 2.999 3.221 3.616 3.788 3.947 3.876 4.34 4.464 4.725 4.982 5.222 5.331 5.522 5.696 5.946 6.095 6.235 6.459 6.678 6.888 7.088 7.278 7.512 7.746 7.98 8.24 8.479 8.713 8.989 9.291 9.571 9.871 10.179 10.478 10.774 11.103 11.462 11.799 12.173 12.56 12.954 13.301 13.575 13.677 13.408 12.682 11.816 10.991 10.286 9.617 8.975 8.38 7.871 7.336 6.863 6.437 6.017 5.616 5.249 4.912 4.554 4.225 3.948 3.679 3.392 3.159 2.913 2.644 2.44 2.229 2.022 1.812 1.582 1.425 1.257 1.0 0.828 0.645 0.543 0.327 0.118 -0.087 -0.19 -0.648 -0.545 -0.692 -0.854 -1.19 -1.362 -1.524 -1.698 -1.902 -2.141 -2.474 -3.352 -8 ,17365 ,KEBNE ,17024669,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:17:14 CET,0.0 1.567 2.106 2.469 2.797 3.099 3.359 3.589 3.968 4.134 4.283 4.258 4.749 4.879 5.132 5.356 5.56 5.659 5.857 6.049 6.311 6.474 6.624 6.839 7.058 7.267 7.456 7.64 7.873 8.092 8.306 8.56 8.802 9.04 9.305 9.586 9.847 10.127 10.408 10.687 10.974 11.291 11.659 12.01 12.378 12.719 13.045 13.352 13.579 13.664 13.472 12.775 11.985 11.26 10.556 9.842 9.204 8.62 8.089 7.562 7.093 6.666 6.27 5.893 5.515 5.158 4.815 4.507 4.223 3.928 3.622 3.381 3.143 2.886 2.683 2.467 2.256 2.044 1.813 1.662 1.501 1.23 1.047 0.864 0.771 0.577 0.372 0.155 0.031 -0.446 -0.37 -0.504 -0.643 -0.961 -1.143 -1.354 -1.558 -1.767 -2.025 -2.357 -3.124 -9 ,15597 ,KEBNE ,17024670,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:17:04 CET,0.0 1.768 2.282 2.666 2.977 3.262 3.502 3.695 4.042 4.217 4.384 4.338 4.813 4.95 5.198 5.414 5.615 5.719 5.921 6.105 6.372 6.545 6.704 6.929 7.154 7.364 7.549 7.726 7.97 8.204 8.43 8.698 8.938 9.155 9.404 9.695 9.962 10.221 10.494 10.792 11.082 11.371 11.688 12.002 12.351 12.695 13.024 13.335 13.552 13.597 13.304 12.614 11.826 11.043 10.316 9.622 8.988 8.395 7.867 7.338 6.883 6.451 6.027 5.635 5.275 4.941 4.591 4.27 3.994 3.697 3.385 3.12 2.842 2.563 2.351 2.132 1.893 1.646 1.402 1.221 1.025 0.717 0.505 0.303 0.197 -0.006 -0.213 -0.43 -0.542 -1.009 -0.923 -1.076 -1.233 -1.532 -1.683 -1.84 -2.038 -2.298 -2.585 -2.915 -3.666 -10 ,4580 ,KEBNE ,17024671,Wed Dec 22 10:43:52 CET,Wed Dec 22 12:17:05 CET,0.0 1.381 1.876 2.297 2.648 2.909 3.127 3.321 3.685 3.86 4.029 3.973 4.446 4.577 4.821 5.033 5.22 5.318 5.515 5.693 5.942 6.102 6.263 6.496 6.72 6.924 7.114 7.295 7.529 7.741 7.942 8.195 8.437 8.659 8.891 9.162 9.414 9.679 9.96 10.254 10.56 10.88 11.244 11.613 12.011 12.375 12.718 13.013 13.237 13.359 13.117 12.396 11.585 10.77 9.984 9.221 8.561 8.004 7.507 6.981 6.506 6.077 5.673 5.292 4.945 4.628 4.283 3.972 3.683 3.384 3.084 2.827 2.557 2.262 2.045 1.83 1.593 1.345 1.095 0.925 0.756 0.498 0.317 0.138 0.044 -0.146 -0.342 -0.591 -0.72 -1.192 -1.13 -1.282 -1.433 -1.747 -1.91 -2.093 -2.291 -2.486 -2.754 -3.121 -4.029 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt deleted file mode 100644 index 52643f14..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18636-1_18628-1.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9045 ,TETRA ,17531133,Thu Nov 25 03:51:02 CET,Thu Nov 25 05:38:52 CET,0.0 1.677 2.17 2.52 2.82 3.087 3.325 3.558 3.971 4.153 4.323 4.315 4.822 4.979 5.282 5.56 5.817 5.939 6.171 6.387 6.692 6.885 7.075 7.364 7.642 7.896 8.132 8.371 8.685 8.985 9.289 9.645 9.957 10.253 10.603 11.005 11.393 11.806 12.251 12.734 13.229 13.798 14.463 15.083 15.795 16.596 17.491 18.428 19.468 20.635 21.799 22.533 22.785 22.739 22.556 22.311 22.019 21.717 21.438 21.123 20.812 20.531 20.23 19.939 19.703 19.459 19.174 18.92 18.692 18.432 18.162 17.949 17.719 17.474 17.265 17.051 16.833 16.591 16.33 16.145 15.96 15.674 15.458 15.227 15.11 14.87 14.605 14.318 14.18 13.698 13.714 13.529 13.318 12.877 12.652 12.415 12.118 11.725 11.194 10.522 8.633 -2 ,18708 ,TETRA ,17531144,Thu Nov 25 03:51:07 CET,Thu Nov 25 05:38:50 CET,0.0 1.682 2.188 2.566 2.865 3.128 3.365 3.596 4.009 4.191 4.366 4.352 4.862 5.016 5.32 5.604 5.864 5.986 6.216 6.438 6.746 6.942 7.139 7.41 7.667 7.917 8.168 8.413 8.709 9.004 9.3 9.645 9.96 10.273 10.662 11.075 11.439 11.834 12.262 12.705 13.17 13.724 14.354 14.955 15.645 16.417 17.288 18.201 19.222 20.333 21.481 22.177 22.345 22.261 22.01 21.691 21.426 21.131 20.823 20.488 20.182 19.885 19.602 19.344 19.068 18.795 18.515 18.266 18.045 17.807 17.548 17.322 17.084 16.834 16.625 16.412 16.213 15.996 15.754 15.583 15.421 15.138 14.925 14.721 14.609 14.371 14.106 13.806 13.649 13.157 13.181 12.995 12.78 12.289 11.971 11.647 11.329 10.986 10.587 10.0 8.26 -3 ,29449 ,TETRA ,17531153,Thu Nov 25 03:51:03 CET,Thu Nov 25 05:38:20 CET,0.0 2.091 2.594 2.989 3.299 3.561 3.824 4.054 4.447 4.632 4.818 4.832 5.333 5.472 5.752 6.024 6.271 6.391 6.629 6.853 7.151 7.342 7.536 7.823 8.103 8.361 8.615 8.866 9.176 9.465 9.752 10.091 10.404 10.713 11.086 11.501 11.881 12.278 12.711 13.175 13.654 14.191 14.815 15.453 16.201 17.004 17.89 18.842 19.851 20.961 22.133 22.769 22.866 22.766 22.615 22.394 22.105 21.772 21.449 21.118 20.811 20.51 20.205 19.907 19.621 19.358 19.079 18.815 18.581 18.336 18.075 17.846 17.596 17.332 17.125 16.909 16.672 16.419 16.154 15.959 15.759 15.467 15.255 15.027 14.909 14.671 14.424 14.147 13.999 13.513 13.517 13.333 13.134 12.694 12.458 12.188 11.851 11.469 11.019 10.452 8.168 -6 ,15993 ,TETRA ,17531176,Thu Nov 25 03:51:03 CET,Thu Nov 25 05:39:47 CET,0.0 1.577 2.06 2.435 2.762 3.04 3.278 3.518 3.96 4.151 4.339 4.335 4.833 4.981 5.257 5.519 5.779 5.913 6.162 6.397 6.726 6.923 7.125 7.418 7.691 7.954 8.203 8.448 8.763 9.061 9.351 9.692 10.014 10.321 10.666 11.047 11.427 11.855 12.3 12.736 13.206 13.751 14.364 14.97 15.673 16.452 17.339 18.333 19.421 20.572 21.735 22.385 22.484 22.345 22.108 21.847 21.562 21.239 20.942 20.643 20.34 20.037 19.758 19.478 19.204 18.958 18.68 18.433 18.226 17.987 17.723 17.504 17.265 17.017 16.828 16.627 16.418 16.198 15.959 15.787 15.606 15.336 15.153 14.946 14.833 14.609 14.356 14.074 13.93 13.443 13.442 13.262 13.056 12.522 12.238 11.962 11.63 11.258 10.854 10.251 8.019 -7 ,19448 ,TETRA ,17531181,Thu Nov 25 03:51:03 CET,Thu Nov 25 05:37:41 CET,0.0 1.589 2.116 2.528 2.82 3.089 3.348 3.592 4.023 4.212 4.391 4.395 4.894 5.04 5.32 5.58 5.83 5.948 6.173 6.39 6.707 6.904 7.088 7.376 7.653 7.905 8.165 8.418 8.733 9.026 9.307 9.654 9.983 10.318 10.693 11.091 11.489 11.906 12.353 12.852 13.377 13.949 14.605 15.231 15.935 16.728 17.561 18.438 19.473 20.56 21.659 22.27 22.386 22.256 22.032 21.797 21.552 21.258 20.95 20.623 20.333 20.072 19.799 19.513 19.251 18.999 18.726 18.45 18.189 17.915 17.618 17.385 17.154 16.896 16.699 16.505 16.285 16.049 15.785 15.602 15.429 15.14 14.924 14.697 14.581 14.324 14.042 13.764 13.608 13.111 13.13 12.953 12.756 12.338 12.101 11.842 11.561 11.202 10.733 10.086 8.074 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index c4f22727..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -5 ,32286 ,TETRA ,17531290,Thu Nov 25 03:51:04 CET,Thu Nov 25 05:42:07 CET,0.0 1.513 2.163 2.693 3.183 3.608 3.956 4.306 4.983 5.289 5.573 5.682 6.361 6.603 7.1 7.602 8.08 8.305 8.716 9.114 9.688 10.054 10.425 10.97 11.479 11.971 12.46 12.943 13.556 14.142 14.723 15.454 16.162 16.844 17.651 18.56 19.443 20.428 21.504 22.65 23.868 25.269 26.927 28.641 30.696 33.025 35.781 38.937 42.7 47.295 53.088 58.066 61.108 63.026 64.295 65.241 65.876 66.287 66.527 66.685 66.742 66.757 66.725 66.656 66.565 66.469 66.347 66.195 66.041 65.874 65.695 65.521 65.317 65.104 64.925 64.726 64.526 64.316 64.076 63.894 63.695 63.356 63.116 62.878 62.759 62.506 62.204 61.876 61.706 61.153 61.082 60.865 60.63 60.082 59.775 59.451 59.057 58.594 58.029 57.183 54.707 -8 ,25322 ,TETRA ,17531305,Thu Nov 25 03:51:04 CET,Thu Nov 25 05:42:04 CET,0.0 1.38 2.045 2.577 3.03 3.44 3.828 4.196 4.8 5.083 5.363 5.462 6.16 6.44 6.986 7.484 7.918 8.131 8.542 8.935 9.533 9.92 10.277 10.798 11.297 11.777 12.267 12.737 13.334 13.941 14.546 15.263 15.964 16.66 17.463 18.371 19.25 20.218 21.279 22.439 23.684 25.094 26.77 28.488 30.493 32.765 35.466 38.591 42.389 47.088 52.975 57.926 60.866 62.732 63.958 64.836 65.44 65.837 66.083 66.238 66.275 66.261 66.221 66.141 66.049 65.949 65.785 65.603 65.461 65.312 65.122 64.951 64.769 64.56 64.376 64.167 63.948 63.712 63.452 63.276 63.086 62.76 62.543 62.302 62.167 61.894 61.586 61.229 61.046 60.501 60.442 60.218 59.972 59.421 59.116 58.768 58.394 57.931 57.28 56.394 53.44 -9 ,15678 ,TETRA ,17531310,Thu Nov 25 03:51:04 CET,Thu Nov 25 05:40:14 CET,0.0 1.421 2.083 2.626 3.078 3.464 3.808 4.14 4.761 5.047 5.322 5.422 6.098 6.34 6.832 7.296 7.73 7.943 8.353 8.752 9.341 9.722 10.088 10.606 11.134 11.647 12.127 12.596 13.211 13.816 14.392 15.106 15.809 16.479 17.281 18.202 19.071 20.028 21.086 22.237 23.501 24.944 26.632 28.353 30.384 32.694 35.389 38.489 42.227 46.768 52.536 57.596 60.603 62.52 63.773 64.62 65.182 65.552 65.797 65.983 66.074 66.091 66.049 65.977 65.897 65.786 65.626 65.456 65.299 65.138 64.952 64.78 64.6 64.403 64.234 64.049 63.856 63.641 63.406 63.244 63.062 62.74 62.51 62.275 62.156 61.911 61.629 61.302 61.128 60.593 60.556 60.346 60.107 59.533 59.21 58.851 58.451 57.977 57.397 56.68 54.395 -10 ,17733 ,TETRA ,17531321,Thu Nov 25 03:52:05 CET,Thu Nov 25 05:44:57 CET,0.0 1.665 2.301 2.81 3.243 3.644 4.002 4.331 4.965 5.25 5.524 5.626 6.299 6.534 6.988 7.438 7.885 8.099 8.51 8.91 9.494 9.872 10.237 10.759 11.275 11.774 12.252 12.73 13.362 13.96 14.539 15.25 15.928 16.602 17.413 18.341 19.235 20.211 21.288 22.449 23.68 25.082 26.752 28.494 30.544 32.826 35.509 38.67 42.487 47.134 53.074 58.253 61.38 63.372 64.686 65.607 66.216 66.588 66.807 66.953 67.027 67.056 67.045 66.998 66.902 66.763 66.618 66.469 66.316 66.155 65.951 65.763 65.56 65.309 65.105 64.906 64.698 64.464 64.211 64.035 63.838 63.517 63.287 63.036 62.91 62.641 62.326 61.97 61.794 61.255 61.184 60.957 60.715 60.188 59.896 59.562 59.153 58.698 58.163 57.428 54.824 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt deleted file mode 100644 index d5b4c4e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18638-1.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,13052 ,TETRA ,17531331,Thu Nov 25 03:52:09 CET,Thu Nov 25 05:44:54 CET,0.0 2.049 2.727 3.322 3.83 4.244 4.591 4.897 5.46 5.706 5.934 5.971 6.604 6.788 7.125 7.435 7.74 7.891 8.196 8.48 8.842 9.092 9.335 9.642 9.92 10.172 10.411 10.633 10.924 11.216 11.483 11.802 12.098 12.359 12.655 12.993 13.306 13.638 13.98 14.314 14.614 14.897 15.164 15.362 15.572 15.701 15.747 15.598 15.002 13.691 10.954 7.293 4.212 1.502 -0.862 -2.984 -4.85 -6.514 -7.954 -9.402 -10.646 -11.726 -12.751 -13.708 -14.602 -15.433 -16.285 -17.036 -17.687 -18.373 -19.078 -19.648 -20.237 -20.863 -21.349 -21.84 -22.354 -22.886 -23.424 -23.797 -24.181 -24.796 -25.231 -25.667 -25.886 -26.355 -26.856 -27.365 -27.637 -28.39 -28.533 -28.844 -29.171 -29.906 -30.297 -30.699 -31.153 -31.681 -32.292 -33.108 -35.187 -3 ,29043 ,TETRA ,17531337,Thu Nov 25 03:52:10 CET,Thu Nov 25 05:44:51 CET,0.0 2.285 2.998 3.547 3.995 4.385 4.743 5.055 5.618 5.864 6.095 6.097 6.712 6.887 7.221 7.541 7.851 8.006 8.318 8.612 9.012 9.27 9.509 9.829 10.127 10.407 10.679 10.929 11.214 11.49 11.762 12.083 12.389 12.67 12.979 13.32 13.618 13.918 14.228 14.53 14.8 15.054 15.278 15.443 15.586 15.666 15.616 15.325 14.652 13.244 10.516 6.857 3.627 0.85 -1.505 -3.624 -5.503 -7.206 -8.658 -10.072 -11.289 -12.393 -13.445 -14.412 -15.306 -16.126 -16.968 -17.706 -18.35 -19.029 -19.72 -20.293 -20.894 -21.514 -21.986 -22.48 -23.001 -23.534 -24.083 -24.464 -24.86 -25.479 -25.91 -26.351 -26.571 -27.031 -27.504 -27.999 -28.274 -29.024 -29.14 -29.457 -29.795 -30.513 -30.93 -31.394 -31.886 -32.442 -33.116 -34.006 -36.425 -4 ,26745 ,TETRA ,17531338,Thu Nov 25 03:52:05 CET,Thu Nov 25 05:43:52 CET,0.0 2.653 3.394 3.927 4.365 4.745 5.1 5.427 5.994 6.252 6.495 6.518 7.151 7.356 7.745 8.077 8.381 8.527 8.818 9.089 9.456 9.706 9.951 10.281 10.57 10.82 11.059 11.32 11.643 11.923 12.223 12.574 12.883 13.167 13.465 13.795 14.088 14.38 14.683 14.985 15.281 15.567 15.851 16.086 16.218 16.252 16.18 15.87 15.156 13.677 10.91 7.388 4.348 1.667 -0.702 -2.789 -4.62 -6.279 -7.653 -9.002 -10.174 -11.222 -12.239 -13.212 -14.111 -14.926 -15.776 -16.524 -17.152 -17.799 -18.498 -19.099 -19.715 -20.346 -20.843 -21.351 -21.866 -22.395 -22.944 -23.326 -23.705 -24.283 -24.704 -25.153 -25.388 -25.891 -26.418 -26.953 -27.233 -27.989 -28.136 -28.452 -28.797 -29.549 -29.958 -30.413 -30.898 -31.438 -32.072 -32.864 -35.153 -7 ,8693 ,TETRA ,17531344,Thu Nov 25 03:52:09 CET,Thu Nov 25 05:42:48 CET,0.0 1.688 2.461 2.996 3.435 3.818 4.14 4.427 4.948 5.191 5.42 5.442 6.081 6.283 6.658 7.006 7.327 7.475 7.749 8.012 8.394 8.635 8.856 9.151 9.434 9.69 9.938 10.197 10.522 10.829 11.121 11.446 11.741 12.007 12.291 12.599 12.9 13.221 13.524 13.815 14.088 14.351 14.62 14.839 14.977 15.038 14.947 14.637 14.024 12.669 9.915 6.252 3.103 0.396 -1.975 -4.058 -5.861 -7.509 -8.905 -10.301 -11.533 -12.631 -13.654 -14.609 -15.519 -16.359 -17.209 -17.936 -18.574 -19.241 -19.911 -20.464 -21.049 -21.679 -22.167 -22.661 -23.164 -23.681 -24.243 -24.632 -25.011 -25.603 -26.022 -26.462 -26.696 -27.176 -27.666 -28.181 -28.451 -29.193 -29.328 -29.654 -29.986 -30.72 -31.117 -31.545 -32.03 -32.547 -33.143 -33.934 -36.019 -9 ,26309 ,TETRA ,17531350,Thu Nov 25 03:52:05 CET,Thu Nov 25 05:41:37 CET,0.0 2.361 3.08 3.645 4.101 4.511 4.886 5.202 5.759 6.016 6.249 6.249 6.872 7.068 7.431 7.758 8.066 8.21 8.502 8.781 9.143 9.369 9.593 9.913 10.205 10.496 10.771 11.018 11.323 11.611 11.878 12.183 12.493 12.777 13.085 13.419 13.695 13.979 14.267 14.555 14.832 15.104 15.364 15.513 15.603 15.644 15.525 15.198 14.478 13.074 10.297 6.607 3.461 0.752 -1.626 -3.764 -5.607 -7.243 -8.616 -10.04 -11.295 -12.391 -13.421 -14.363 -15.262 -16.1 -16.937 -17.679 -18.316 -18.964 -19.656 -20.232 -20.814 -21.424 -21.902 -22.389 -22.904 -23.45 -24.014 -24.39 -24.775 -25.397 -25.846 -26.296 -26.524 -27.024 -27.566 -28.151 -28.474 -29.264 -29.479 -29.853 -30.255 -31.104 -31.566 -32.087 -32.673 -33.344 -34.081 -35.02 -37.661 -10 ,17876 ,TETRA ,17531352,Thu Nov 25 03:52:08 CET,Thu Nov 25 05:46:08 CET,0.0 1.622 2.311 2.845 3.254 3.608 3.953 4.279 4.87 5.124 5.352 5.353 5.981 6.185 6.548 6.887 7.215 7.36 7.64 7.929 8.311 8.531 8.744 9.049 9.354 9.635 9.902 10.16 10.478 10.79 11.098 11.439 11.736 12.022 12.354 12.713 13.009 13.297 13.59 13.911 14.229 14.503 14.753 14.951 15.116 15.21 15.152 14.842 14.186 12.912 10.366 6.768 3.551 0.807 -1.579 -3.724 -5.555 -7.16 -8.563 -9.96 -11.18 -12.287 -13.324 -14.28 -15.165 -15.988 -16.824 -17.544 -18.165 -18.831 -19.539 -20.114 -20.708 -21.321 -21.792 -22.264 -22.75 -23.268 -23.814 -24.192 -24.585 -25.208 -25.633 -26.067 -26.296 -26.782 -27.282 -27.805 -28.075 -28.816 -28.954 -29.269 -29.601 -30.318 -30.711 -31.149 -31.651 -32.227 -32.869 -33.693 -35.683 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt deleted file mode 100644 index fb42246f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18637-1_18639-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25820 ,TETRA ,17531393,Thu Nov 25 03:52:10 CET,Thu Nov 25 05:45:14 CET,0.0 1.684 2.399 2.97 3.44 3.87 4.289 4.648 5.296 5.599 5.883 6.001 6.676 6.933 7.446 7.938 8.413 8.638 9.078 9.504 10.11 10.505 10.892 11.455 11.999 12.523 13.033 13.537 14.198 14.836 15.426 16.158 16.905 17.615 18.426 19.348 20.265 21.297 22.403 23.569 24.821 26.233 27.889 29.579 31.586 33.89 36.606 39.759 43.487 47.871 53.196 57.64 60.138 61.689 62.659 63.252 63.555 63.694 63.743 63.707 63.619 63.5 63.372 63.228 63.02 62.78 62.522 62.279 62.041 61.788 61.537 61.317 61.066 60.785 60.558 60.303 60.039 59.773 59.476 59.256 59.022 58.665 58.398 58.111 57.971 57.671 57.344 56.965 56.754 56.176 56.111 55.862 55.594 54.99 54.621 54.21 53.787 53.305 52.693 51.784 48.955 -3 ,22018 ,TETRA ,17531417,Thu Nov 25 03:52:07 CET,Thu Nov 25 05:41:50 CET,0.0 1.511 2.231 2.799 3.308 3.77 4.174 4.525 5.196 5.517 5.817 5.949 6.642 6.905 7.405 7.887 8.343 8.563 8.99 9.407 10.036 10.438 10.816 11.371 11.904 12.415 12.927 13.426 14.075 14.728 15.361 16.121 16.852 17.542 18.33 19.228 20.12 21.113 22.201 23.388 24.662 26.108 27.797 29.529 31.547 33.801 36.444 39.456 43.077 47.555 53.084 57.559 60.103 61.627 62.599 63.223 63.537 63.64 63.665 63.647 63.552 63.427 63.276 63.102 62.892 62.686 62.464 62.228 62.011 61.772 61.504 61.273 61.0 60.701 60.487 60.246 59.973 59.677 59.346 59.12 58.886 58.503 58.223 57.924 57.779 57.487 57.154 56.773 56.564 55.969 55.876 55.618 55.33 54.719 54.38 53.979 53.519 52.982 52.327 51.487 48.505 -4 ,10434 ,TETRA ,17531431,Thu Nov 25 03:52:09 CET,Thu Nov 25 05:43:46 CET,0.0 1.478 2.2 2.78 3.262 3.701 4.108 4.48 5.147 5.458 5.759 5.926 6.63 6.892 7.393 7.865 8.311 8.529 8.966 9.395 9.999 10.395 10.787 11.335 11.868 12.401 12.911 13.418 14.088 14.722 15.336 16.082 16.798 17.498 18.342 19.306 20.227 21.24 22.344 23.515 24.745 26.177 27.906 29.648 31.674 33.963 36.639 39.726 43.403 47.761 53.177 57.674 60.159 61.648 62.59 63.183 63.536 63.722 63.793 63.788 63.701 63.587 63.461 63.304 63.119 62.934 62.729 62.533 62.335 62.105 61.849 61.611 61.358 61.081 60.851 60.616 60.372 60.127 59.858 59.651 59.412 59.023 58.756 58.477 58.328 58.012 57.677 57.34 57.162 56.576 56.475 56.231 55.953 55.307 54.93 54.525 54.06 53.485 52.789 51.868 48.863 -6 ,24256 ,TETRA ,17531465,Thu Nov 25 03:53:07 CET,Thu Nov 25 05:46:13 CET,0.0 1.569 2.307 2.886 3.378 3.802 4.181 4.54 5.182 5.481 5.77 5.92 6.625 6.885 7.393 7.889 8.359 8.583 9.024 9.452 10.065 10.468 10.878 11.461 12.013 12.548 13.05 13.536 14.191 14.837 15.46 16.236 16.988 17.69 18.515 19.44 20.351 21.364 22.419 23.546 24.768 26.202 27.917 29.656 31.677 33.923 36.561 39.633 43.375 47.776 52.992 57.452 60.01 61.487 62.373 62.958 63.353 63.584 63.694 63.699 63.606 63.464 63.315 63.134 62.931 62.753 62.545 62.343 62.137 61.892 61.631 61.41 61.175 60.924 60.713 60.468 60.208 59.938 59.645 59.447 59.241 58.891 58.618 58.315 58.162 57.859 57.501 57.092 56.887 56.307 56.23 55.972 55.687 55.068 54.714 54.308 53.865 53.358 52.723 51.784 48.629 -7 ,14507 ,TETRA ,17531476,Thu Nov 25 03:52:34 CET,Thu Nov 25 05:46:34 CET,0.0 1.792 2.574 3.137 3.624 4.057 4.449 4.817 5.502 5.823 6.12 6.27 6.964 7.213 7.692 8.166 8.617 8.85 9.309 9.742 10.368 10.773 11.166 11.718 12.262 12.805 13.319 13.809 14.452 15.08 15.692 16.433 17.157 17.869 18.698 19.654 20.575 21.563 22.648 23.826 25.069 26.515 28.227 29.935 31.98 34.308 36.989 40.063 43.795 48.24 53.62 58.063 60.588 62.134 63.08 63.687 64.052 64.252 64.354 64.36 64.309 64.228 64.099 63.932 63.748 63.543 63.318 63.087 62.866 62.643 62.368 62.125 61.881 61.584 61.341 61.084 60.794 60.508 60.228 60.03 59.809 59.434 59.166 58.887 58.743 58.426 58.071 57.68 57.473 56.891 56.817 56.567 56.289 55.723 55.394 54.995 54.545 54.003 53.353 52.471 49.459 -8 ,30782 ,TETRA ,17531477,Thu Nov 25 03:53:07 CET,Thu Nov 25 05:41:55 CET,0.0 2.0 2.849 3.491 4.007 4.428 4.809 5.156 5.826 6.141 6.432 6.561 7.265 7.544 8.072 8.548 9.009 9.238 9.671 10.084 10.696 11.087 11.472 12.034 12.593 13.133 13.65 14.167 14.834 15.475 16.1 16.853 17.561 18.251 19.072 20.007 20.918 21.914 22.976 24.129 25.38 26.827 28.534 30.253 32.296 34.575 37.228 40.265 43.84 48.189 53.564 58.081 60.674 62.234 63.196 63.727 64.043 64.258 64.312 64.282 64.224 64.123 63.989 63.828 63.637 63.447 63.25 63.044 62.83 62.604 62.353 62.132 61.899 61.64 61.426 61.202 60.957 60.675 60.37 60.154 59.931 59.559 59.281 58.994 58.846 58.533 58.205 57.847 57.651 57.09 57.006 56.757 56.506 55.901 55.54 55.155 54.742 54.244 53.6 52.7 50.008 -9 ,1310 ,TETRA ,17531479,Thu Nov 25 03:53:06 CET,Thu Nov 25 05:45:52 CET,0.0 1.583 2.293 2.853 3.352 3.792 4.184 4.542 5.192 5.505 5.795 5.927 6.626 6.897 7.423 7.91 8.369 8.596 9.033 9.463 10.092 10.495 10.892 11.437 11.97 12.509 13.025 13.532 14.203 14.867 15.513 16.268 16.993 17.685 18.473 19.374 20.257 21.253 22.329 23.511 24.797 26.242 27.932 29.626 31.619 33.899 36.555 39.559 43.171 47.518 52.806 57.199 59.839 61.465 62.441 63.02 63.316 63.436 63.457 63.404 63.299 63.2 63.081 62.919 62.727 62.516 62.279 62.05 61.813 61.544 61.273 61.048 60.799 60.509 60.286 60.056 59.789 59.506 59.196 58.976 58.75 58.376 58.112 57.841 57.693 57.368 57.025 56.645 56.434 55.836 55.713 55.48 55.234 54.61 54.246 53.857 53.388 52.807 52.06 50.986 47.862 -10 ,2037 ,TETRA ,17531489,Thu Nov 25 03:52:34 CET,Thu Nov 25 05:45:09 CET,0.0 2.047 2.837 3.412 3.894 4.319 4.709 5.083 5.763 6.068 6.366 6.511 7.196 7.449 7.936 8.404 8.859 9.075 9.515 9.948 10.54 10.93 11.32 11.876 12.409 12.944 13.469 13.959 14.594 15.219 15.834 16.578 17.295 17.993 18.822 19.755 20.634 21.639 22.752 23.924 25.182 26.62 28.327 30.077 32.112 34.431 37.178 40.311 43.99 48.345 53.745 58.222 60.757 62.323 63.3 63.911 64.275 64.442 64.501 64.501 64.44 64.346 64.196 64.017 63.819 63.615 63.404 63.187 62.98 62.748 62.477 62.242 61.981 61.705 61.479 61.228 60.963 60.674 60.362 60.136 59.912 59.57 59.314 59.042 58.892 58.565 58.227 57.858 57.666 57.095 56.997 56.73 56.429 55.784 55.425 55.034 54.595 54.083 53.477 52.6 49.382 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index 70b5e268..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2304 ,TETRA ,17531514,Thu Nov 25 03:52:35 CET,Thu Nov 25 05:45:03 CET,0.0 1.595 2.23 2.762 3.238 3.655 4.027 4.387 5.137 5.501 5.816 5.929 6.668 6.931 7.453 7.961 8.443 8.684 9.16 9.611 10.285 10.719 11.135 11.752 12.359 12.954 13.54 14.13 14.907 15.656 16.385 17.268 18.124 18.96 19.934 21.044 22.139 23.372 24.741 26.224 27.825 29.675 31.87 34.144 36.871 40.028 43.838 48.36 53.941 60.878 69.979 78.301 83.598 87.206 89.777 91.715 93.195 94.35 95.207 95.963 96.502 96.897 97.227 97.512 97.747 97.913 98.032 98.106 98.156 98.199 98.23 98.244 98.231 98.167 98.108 98.05 97.972 97.877 97.776 97.703 97.61 97.429 97.294 97.142 97.05 96.856 96.651 96.426 96.302 95.812 95.875 95.722 95.568 95.211 94.962 94.649 94.31 93.919 93.454 92.788 90.638 -3 ,9107 ,TETRA ,17531527,Thu Nov 25 03:53:09 CET,Thu Nov 25 05:45:05 CET,0.0 1.68 2.418 2.988 3.465 3.874 4.261 4.636 5.326 5.632 5.921 6.014 6.747 7.024 7.571 8.104 8.609 8.842 9.293 9.757 10.446 10.88 11.31 11.945 12.555 13.163 13.758 14.335 15.102 15.848 16.556 17.422 18.27 19.103 20.092 21.221 22.337 23.585 24.944 26.425 28.011 29.84 32.041 34.318 37.036 40.15 43.948 48.475 54.024 60.904 69.833 77.949 83.19 86.875 89.51 91.493 92.952 94.064 94.901 95.633 96.182 96.6 96.914 97.139 97.309 97.442 97.555 97.636 97.685 97.718 97.736 97.725 97.706 97.663 97.606 97.537 97.452 97.339 97.212 97.123 97.025 96.868 96.737 96.576 96.491 96.315 96.122 95.918 95.804 95.323 95.39 95.229 95.05 94.632 94.39 94.113 93.789 93.395 92.925 92.304 89.967 -4 ,9223 ,TETRA ,17531535,Thu Nov 25 03:52:35 CET,Thu Nov 25 05:44:19 CET,0.0 1.408 2.149 2.71 3.173 3.595 3.992 4.375 5.058 5.383 5.701 5.83 6.57 6.839 7.363 7.865 8.354 8.589 9.051 9.506 10.168 10.597 11.025 11.653 12.259 12.844 13.415 13.99 14.756 15.497 16.216 17.083 17.93 18.784 19.786 20.913 22.015 23.252 24.626 26.109 27.692 29.536 31.772 34.073 36.817 40.001 43.828 48.317 53.819 60.694 69.735 77.969 83.25 86.93 89.574 91.565 93.039 94.148 94.988 95.727 96.277 96.688 97.003 97.277 97.505 97.658 97.759 97.832 97.881 97.898 97.898 97.885 97.86 97.822 97.772 97.72 97.658 97.557 97.433 97.353 97.257 97.096 96.973 96.82 96.738 96.543 96.337 96.137 96.017 95.524 95.558 95.381 95.201 94.773 94.524 94.249 93.94 93.55 93.057 92.372 90.229 -5 ,252 ,TETRA ,17531542,Thu Nov 25 03:52:36 CET,Thu Nov 25 05:44:05 CET,0.0 2.117 2.959 3.526 3.959 4.38 4.768 5.142 5.812 6.135 6.45 6.586 7.337 7.615 8.142 8.651 9.146 9.383 9.845 10.284 10.924 11.35 11.768 12.37 12.961 13.559 14.15 14.724 15.469 16.201 16.927 17.816 18.681 19.525 20.521 21.657 22.773 24.018 25.375 26.846 28.446 30.325 32.555 34.846 37.579 40.737 44.54 49.026 54.504 61.376 70.565 78.904 84.177 87.885 90.539 92.484 93.968 95.143 95.99 96.698 97.223 97.617 97.93 98.168 98.342 98.463 98.58 98.669 98.714 98.748 98.771 98.755 98.715 98.655 98.596 98.524 98.43 98.318 98.2 98.122 98.026 97.853 97.722 97.575 97.493 97.324 97.137 96.934 96.825 96.332 96.392 96.227 96.041 95.605 95.348 95.059 94.734 94.352 93.836 93.164 91.499 -6 ,31175 ,TETRA ,17531544,Thu Nov 25 03:52:38 CET,Thu Nov 25 05:45:03 CET,0.0 1.472 2.153 2.717 3.195 3.608 3.986 4.341 5.01 5.339 5.659 5.818 6.576 6.856 7.39 7.912 8.42 8.665 9.153 9.625 10.301 10.728 11.146 11.766 12.38 12.977 13.54 14.101 14.846 15.582 16.307 17.167 18.018 18.876 19.877 21.011 22.113 23.371 24.768 26.273 27.877 29.726 31.929 34.178 36.917 40.068 43.834 48.299 53.797 60.668 69.681 77.942 83.18 86.774 89.33 91.289 92.777 93.934 94.797 95.522 96.068 96.478 96.804 97.071 97.275 97.437 97.564 97.644 97.702 97.738 97.727 97.705 97.69 97.649 97.596 97.521 97.433 97.341 97.234 97.149 97.062 96.918 96.785 96.632 96.556 96.392 96.215 96.017 95.893 95.394 95.455 95.29 95.113 94.692 94.431 94.169 93.876 93.464 92.947 92.255 90.465 -7 ,1087 ,TETRA ,17531554,Thu Nov 25 03:52:34 CET,Thu Nov 25 05:45:54 CET,0.0 1.542 2.223 2.762 3.238 3.674 4.099 4.467 5.113 5.421 5.725 5.857 6.6 6.869 7.396 7.9 8.392 8.634 9.104 9.566 10.259 10.703 11.128 11.751 12.368 12.975 13.566 14.144 14.914 15.674 16.416 17.317 18.182 19.024 20.005 21.132 22.255 23.514 24.884 26.34 27.913 29.758 31.975 34.272 36.98 40.1 43.897 48.37 53.907 60.879 69.908 78.103 83.423 87.089 89.723 91.71 93.14 94.255 95.143 95.906 96.433 96.852 97.185 97.447 97.662 97.81 97.921 97.996 98.042 98.081 98.111 98.099 98.056 98.008 97.96 97.889 97.804 97.701 97.557 97.456 97.361 97.186 97.055 96.906 96.827 96.649 96.443 96.217 96.098 95.615 95.682 95.517 95.341 94.93 94.666 94.375 94.053 93.696 93.26 92.594 90.533 -9 ,18754 ,TETRA ,17531557,Thu Nov 25 03:52:36 CET,Thu Nov 25 05:45:03 CET,0.0 1.517 2.155 2.664 3.135 3.569 3.974 4.342 5.08 5.427 5.725 5.841 6.581 6.846 7.382 7.895 8.374 8.61 9.089 9.562 10.231 10.658 11.092 11.727 12.332 12.923 13.51 14.092 14.852 15.594 16.308 17.179 18.031 18.865 19.852 20.979 22.092 23.347 24.707 26.185 27.777 29.612 31.779 34.034 36.772 39.894 43.656 48.106 53.559 60.377 69.369 77.577 82.849 86.522 89.169 91.14 92.593 93.77 94.651 95.388 95.935 96.353 96.679 96.937 97.157 97.333 97.471 97.549 97.607 97.649 97.641 97.613 97.596 97.561 97.512 97.45 97.366 97.263 97.144 97.065 96.973 96.797 96.673 96.551 96.477 96.304 96.124 95.924 95.813 95.322 95.352 95.182 95.002 94.561 94.305 94.038 93.716 93.321 92.837 92.125 90.324 -10 ,13786 ,TETRA ,17531559,Thu Nov 25 03:52:37 CET,Thu Nov 25 05:45:20 CET,0.0 1.143 1.809 2.376 2.868 3.296 3.675 4.026 4.708 5.036 5.337 5.442 6.186 6.461 6.994 7.518 8.018 8.259 8.736 9.2 9.869 10.294 10.705 11.315 11.921 12.522 13.114 13.698 14.471 15.202 15.921 16.817 17.69 18.543 19.541 20.676 21.798 23.066 24.442 25.915 27.495 29.29 31.448 33.716 36.443 39.609 43.411 47.854 53.31 60.16 69.301 77.654 83.013 86.722 89.348 91.33 92.82 93.985 94.836 95.548 96.106 96.538 96.876 97.126 97.303 97.445 97.577 97.663 97.704 97.73 97.73 97.706 97.662 97.601 97.548 97.496 97.412 97.296 97.176 97.098 97.008 96.824 96.693 96.56 96.488 96.315 96.107 95.858 95.721 95.239 95.333 95.18 94.988 94.531 94.289 94.024 93.707 93.331 92.864 92.204 90.215 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_18639-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_18639-1.txt deleted file mode 100644 index 80f80555..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18638-1_18639-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30701 ,KEBNE ,17024672,Wed Dec 22 10:43:51 CET,Wed Dec 22 12:20:01 CET,0.0 1.631 2.346 2.923 3.426 3.884 4.321 4.739 5.484 5.819 6.133 6.257 7.016 7.307 7.859 8.377 8.896 9.149 9.629 10.083 10.749 11.215 11.675 12.335 12.97 13.567 14.151 14.724 15.48 16.23 16.971 17.881 18.751 19.616 20.607 21.705 22.797 24.041 25.421 26.906 28.509 30.354 32.502 34.711 37.42 40.53 44.219 48.55 53.863 60.459 68.992 76.702 81.564 84.837 87.129 88.811 90.048 91.024 91.752 92.324 92.752 93.102 93.359 93.533 93.672 93.771 93.824 93.834 93.833 93.821 93.778 93.728 93.64 93.533 93.456 93.36 93.234 93.097 92.946 92.833 92.722 92.541 92.383 92.209 92.114 91.915 91.696 91.429 91.279 90.758 90.8 90.624 90.434 89.983 89.72 89.421 89.101 88.745 88.308 87.683 85.58 -2 ,17008 ,KEBNE ,17024673,Wed Dec 22 10:44:53 CET,Wed Dec 22 12:21:11 CET,0.0 1.396 2.11 2.672 3.164 3.613 4.041 4.435 5.165 5.495 5.81 5.952 6.699 6.977 7.514 8.033 8.553 8.814 9.308 9.772 10.449 10.897 11.344 12.005 12.645 13.266 13.869 14.457 15.206 15.931 16.655 17.543 18.422 19.284 20.276 21.382 22.474 23.719 25.08 26.552 28.138 29.97 32.152 34.396 37.087 40.178 43.888 48.244 53.618 60.269 68.762 76.38 81.208 84.521 86.868 88.601 89.873 90.841 91.544 92.145 92.584 92.881 93.112 93.286 93.422 93.517 93.562 93.585 93.575 93.551 93.53 93.489 93.41 93.321 93.263 93.188 93.087 92.971 92.836 92.722 92.609 92.45 92.331 92.178 92.086 91.879 91.653 91.4 91.265 90.761 90.802 90.621 90.429 90.02 89.781 89.49 89.15 88.768 88.273 87.531 85.481 -3 ,20430 ,KEBNE ,17024674,Wed Dec 22 10:44:53 CET,Wed Dec 22 12:21:51 CET,0.0 1.638 2.385 2.975 3.463 3.87 4.261 4.639 5.322 5.646 5.962 6.1 6.866 7.15 7.691 8.21 8.713 8.962 9.451 9.924 10.61 11.053 11.489 12.142 12.77 13.379 13.97 14.551 15.318 16.068 16.803 17.684 18.527 19.353 20.34 21.478 22.588 23.848 25.244 26.733 28.305 30.125 32.311 34.58 37.274 40.333 43.962 48.211 53.475 60.063 68.616 76.265 81.098 84.43 86.809 88.567 89.897 90.893 91.59 92.226 92.691 92.999 93.244 93.459 93.601 93.69 93.775 93.837 93.86 93.86 93.833 93.774 93.697 93.624 93.551 93.456 93.346 93.205 93.045 92.933 92.815 92.604 92.438 92.249 92.151 91.954 91.731 91.466 91.329 90.823 90.898 90.719 90.511 90.069 89.818 89.547 89.266 88.916 88.392 87.676 85.684 -4 ,12661 ,KEBNE ,17024675,Wed Dec 22 10:45:55 CET,Wed Dec 22 12:22:11 CET,0.0 1.867 2.606 3.191 3.724 4.2 4.614 4.987 5.703 6.035 6.35 6.497 7.249 7.527 8.083 8.612 9.125 9.382 9.874 10.338 11.005 11.441 11.883 12.536 13.152 13.764 14.36 14.947 15.71 16.441 17.173 18.075 18.948 19.802 20.801 21.917 23.021 24.273 25.636 27.116 28.699 30.518 32.687 34.948 37.669 40.766 44.433 48.727 54.011 60.6 69.118 76.695 81.563 84.9 87.216 88.914 90.168 91.175 91.924 92.554 92.987 93.311 93.584 93.788 93.93 94.029 94.11 94.141 94.124 94.077 94.014 93.953 93.89 93.811 93.722 93.618 93.507 93.375 93.218 93.107 92.983 92.775 92.61 92.415 92.323 92.121 91.882 91.607 91.455 90.935 90.983 90.812 90.626 90.194 89.943 89.636 89.301 88.884 88.328 87.579 85.649 -5 ,15801 ,KEBNE ,17024676,Wed Dec 22 10:44:53 CET,Wed Dec 22 12:22:28 CET,0.0 1.979 2.736 3.28 3.756 4.2 4.623 4.991 5.634 5.948 6.263 6.413 7.184 7.479 8.022 8.545 9.056 9.302 9.773 10.242 10.94 11.374 11.797 12.433 13.046 13.654 14.253 14.845 15.618 16.365 17.097 17.996 18.86 19.706 20.71 21.842 22.955 24.192 25.558 27.059 28.643 30.475 32.66 34.901 37.612 40.711 44.375 48.66 53.938 60.471 68.861 76.451 81.358 84.723 87.085 88.845 90.122 91.099 91.813 92.419 92.848 93.167 93.423 93.609 93.724 93.777 93.825 93.857 93.86 93.827 93.739 93.655 93.565 93.438 93.333 93.226 93.115 92.992 92.839 92.717 92.583 92.358 92.19 92.01 91.916 91.713 91.48 91.234 91.093 90.57 90.641 90.476 90.284 89.817 89.545 89.239 88.894 88.493 87.998 87.304 84.746 -6 ,19280 ,KEBNE ,17024677,Wed Dec 22 10:44:53 CET,Wed Dec 22 12:21:49 CET,0.0 1.476 2.196 2.815 3.337 3.786 4.192 4.557 5.226 5.537 5.838 5.975 6.737 7.018 7.55 8.08 8.606 8.858 9.371 9.866 10.557 11.013 11.458 12.102 12.733 13.355 13.957 14.551 15.337 16.092 16.823 17.715 18.595 19.472 20.518 21.691 22.822 24.079 25.442 26.911 28.495 30.331 32.5 34.724 37.386 40.445 44.113 48.451 53.723 60.23 68.742 76.312 81.14 84.409 86.66 88.372 89.648 90.61 91.301 91.858 92.256 92.563 92.814 93.004 93.132 93.209 93.255 93.29 93.299 93.287 93.264 93.221 93.162 93.073 92.997 92.905 92.788 92.662 92.505 92.383 92.271 92.081 91.917 91.752 91.659 91.442 91.209 90.965 90.832 90.322 90.376 90.192 89.997 89.546 89.281 88.996 88.679 88.302 87.803 87.048 84.613 -7 ,6184 ,KEBNE ,17024678,Wed Dec 22 10:44:53 CET,Wed Dec 22 12:21:55 CET,0.0 1.465 2.207 2.78 3.322 3.869 4.346 4.742 5.458 5.787 6.104 6.218 6.966 7.245 7.773 8.292 8.799 9.05 9.541 10.016 10.716 11.168 11.597 12.23 12.853 13.456 14.04 14.618 15.373 16.108 16.818 17.7 18.597 19.477 20.504 21.653 22.772 24.006 25.355 26.835 28.439 30.277 32.442 34.694 37.377 40.433 44.114 48.466 53.804 60.297 68.729 76.308 81.072 84.349 86.693 88.43 89.679 90.638 91.351 91.986 92.451 92.796 93.095 93.285 93.374 93.441 93.495 93.532 93.55 93.543 93.502 93.45 93.378 93.265 93.174 93.067 92.937 92.809 92.664 92.546 92.417 92.183 92.013 91.856 91.763 91.568 91.383 91.139 91.009 90.512 90.551 90.382 90.198 89.752 89.496 89.216 88.887 88.496 88.005 87.28 85.181 -8 ,28977 ,KEBNE ,17024679,Wed Dec 22 10:44:53 CET,Wed Dec 22 12:21:51 CET,0.0 1.751 2.44 3.034 3.531 3.947 4.361 4.766 5.509 5.841 6.166 6.322 7.067 7.342 7.885 8.414 8.919 9.164 9.649 10.114 10.787 11.228 11.661 12.291 12.907 13.494 14.062 14.64 15.406 16.159 16.895 17.796 18.668 19.498 20.491 21.639 22.731 23.953 25.317 26.796 28.384 30.231 32.421 34.702 37.444 40.522 44.177 48.528 53.895 60.545 69.163 76.882 81.788 85.112 87.459 89.177 90.413 91.355 92.046 92.637 93.065 93.403 93.679 93.886 94.027 94.108 94.169 94.195 94.212 94.202 94.144 94.093 94.021 93.947 93.885 93.783 93.652 93.511 93.353 93.237 93.123 92.932 92.781 92.611 92.523 92.343 92.124 91.866 91.73 91.222 91.247 91.058 90.874 90.432 90.141 89.831 89.51 89.146 88.656 88.015 86.168 -9 ,27322 ,KEBNE ,17024680,Wed Dec 22 10:44:53 CET,Wed Dec 22 12:21:24 CET,0.0 2.133 2.889 3.44 3.927 4.375 4.763 5.123 5.843 6.19 6.508 6.626 7.375 7.659 8.224 8.76 9.258 9.5 9.976 10.439 11.137 11.594 12.037 12.689 13.317 13.928 14.534 15.131 15.882 16.613 17.332 18.211 19.079 19.919 20.915 22.051 23.148 24.389 25.766 27.264 28.871 30.693 32.847 35.085 37.799 40.892 44.572 48.93 54.256 60.808 69.221 76.883 81.788 85.074 87.376 89.112 90.4 91.388 92.135 92.758 93.191 93.517 93.776 93.965 94.107 94.201 94.235 94.238 94.244 94.227 94.182 94.13 94.066 93.996 93.923 93.819 93.716 93.618 93.49 93.383 93.263 93.047 92.881 92.706 92.616 92.417 92.196 91.954 91.829 91.324 91.382 91.217 91.024 90.556 90.283 89.967 89.62 89.228 88.69 87.903 85.659 -10 ,13419 ,KEBNE ,17024681,Wed Dec 22 10:44:53 CET,Wed Dec 22 12:21:10 CET,0.0 1.727 2.465 3.045 3.547 3.999 4.416 4.811 5.543 5.882 6.207 6.356 7.119 7.418 7.971 8.47 8.961 9.202 9.675 10.128 10.788 11.237 11.689 12.341 12.967 13.582 14.186 14.777 15.535 16.275 16.995 17.875 18.737 19.57 20.564 21.709 22.819 24.06 25.425 26.897 28.476 30.319 32.543 34.766 37.413 40.485 44.166 48.518 53.845 60.476 69.063 76.667 81.494 84.861 87.261 89.04 90.342 91.283 91.948 92.545 92.956 93.241 93.467 93.648 93.767 93.845 93.912 93.932 93.924 93.887 93.837 93.792 93.713 93.586 93.478 93.373 93.248 93.098 92.943 92.837 92.714 92.491 92.322 92.142 92.047 91.825 91.589 91.326 91.192 90.684 90.713 90.54 90.35 89.901 89.647 89.351 89.029 88.669 88.209 87.517 85.335 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index 8178b95e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18639-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2649 ,TETRA ,17531572,Thu Nov 25 03:52:39 CET,Thu Nov 25 05:40:14 CET,0.0 1.527 2.217 2.705 3.097 3.421 3.729 3.994 4.498 4.742 4.964 5.015 5.582 5.774 6.141 6.479 6.814 6.979 7.311 7.623 8.032 8.281 8.533 8.906 9.251 9.582 9.916 10.232 10.622 10.996 11.355 11.788 12.203 12.595 13.03 13.522 13.989 14.485 15.012 15.562 16.157 16.852 17.624 18.344 19.19 20.114 21.089 22.092 23.163 24.259 25.169 25.456 25.174 24.596 23.952 23.276 22.635 22.0 21.407 20.802 20.256 19.769 19.287 18.81 18.36 17.934 17.491 17.126 16.8 16.44 16.066 15.747 15.4 15.037 14.759 14.476 14.182 13.874 13.54 13.3 13.05 12.666 12.409 12.139 11.999 11.7 11.358 10.978 10.783 10.23 10.146 9.909 9.673 9.152 8.851 8.535 8.186 7.785 7.339 6.676 4.753 -4 ,15371 ,TETRA ,17531581,Thu Nov 25 03:52:37 CET,Thu Nov 25 05:43:30 CET,0.0 1.784 2.505 3.021 3.456 3.807 4.108 4.413 4.946 5.176 5.403 5.464 6.03 6.227 6.592 6.918 7.22 7.367 7.671 7.957 8.348 8.598 8.841 9.196 9.534 9.856 10.165 10.471 10.867 11.229 11.574 12.011 12.439 12.832 13.279 13.788 14.261 14.745 15.279 15.857 16.437 17.08 17.825 18.542 19.35 20.232 21.195 22.234 23.347 24.465 25.388 25.64 25.406 24.935 24.329 23.635 22.994 22.38 21.809 21.215 20.674 20.157 19.654 19.197 18.763 18.339 17.896 17.508 17.157 16.773 16.376 16.042 15.675 15.291 14.992 14.678 14.347 14.005 13.654 13.406 13.155 12.774 12.494 12.2 12.047 11.736 11.419 11.066 10.88 10.326 10.263 10.028 9.786 9.281 8.988 8.673 8.33 7.925 7.44 6.827 5.464 -5 ,25720 ,TETRA ,17531583,Thu Nov 25 03:52:37 CET,Thu Nov 25 05:44:19 CET,0.0 1.614 2.379 2.872 3.256 3.612 3.916 4.183 4.687 4.919 5.148 5.197 5.757 5.947 6.311 6.646 6.955 7.107 7.401 7.691 8.093 8.339 8.578 8.922 9.266 9.592 9.89 10.188 10.587 10.966 11.33 11.777 12.183 12.564 13.005 13.483 13.939 14.435 14.959 15.526 16.132 16.805 17.583 18.331 19.148 20.046 21.043 22.076 23.238 24.449 25.446 25.639 25.316 24.801 24.155 23.468 22.816 22.18 21.599 20.988 20.45 19.962 19.468 18.988 18.535 18.13 17.698 17.288 16.944 16.591 16.201 15.872 15.528 15.175 14.898 14.615 14.318 13.997 13.659 13.416 13.159 12.759 12.491 12.232 12.094 11.785 11.458 11.11 10.927 10.368 10.284 10.034 9.78 9.248 8.949 8.624 8.281 7.872 7.362 6.722 5.01 -6 ,6357 ,TETRA ,17531585,Thu Nov 25 03:52:37 CET,Thu Nov 25 05:37:15 CET,0.0 1.576 2.117 2.602 3.029 3.391 3.716 3.995 4.507 4.744 4.958 4.991 5.545 5.73 6.094 6.46 6.831 6.998 7.294 7.579 7.986 8.245 8.492 8.831 9.168 9.51 9.833 10.135 10.523 10.901 11.269 11.701 12.116 12.514 12.962 13.477 13.971 14.495 15.045 15.644 16.265 16.936 17.711 18.499 19.392 20.306 21.268 22.276 23.362 24.467 25.372 25.533 25.173 24.609 24.045 23.409 22.755 22.129 21.563 20.988 20.464 19.979 19.478 18.985 18.567 18.181 17.742 17.323 16.947 16.57 16.187 15.847 15.486 15.12 14.83 14.521 14.21 13.88 13.533 13.3 13.045 12.639 12.36 12.067 11.911 11.591 11.262 10.894 10.705 10.158 10.124 9.915 9.68 9.134 8.855 8.559 8.196 7.778 7.339 6.76 5.055 -7 ,684 ,TETRA ,17531586,Thu Nov 25 03:52:37 CET,Thu Nov 25 05:42:41 CET,0.0 1.812 2.523 3.022 3.416 3.765 4.076 4.348 4.826 5.045 5.268 5.323 5.892 6.087 6.451 6.812 7.159 7.313 7.606 7.884 8.268 8.521 8.78 9.143 9.491 9.842 10.163 10.457 10.828 11.183 11.532 11.951 12.344 12.754 13.243 13.741 14.199 14.718 15.282 15.876 16.485 17.158 17.899 18.607 19.466 20.428 21.463 22.528 23.63 24.721 25.7 25.978 25.67 25.088 24.454 23.783 23.136 22.525 21.946 21.331 20.76 20.246 19.767 19.286 18.837 18.432 17.983 17.583 17.239 16.872 16.485 16.157 15.819 15.463 15.179 14.884 14.572 14.245 13.899 13.667 13.438 13.059 12.784 12.503 12.356 12.021 11.687 11.348 11.157 10.607 10.562 10.34 10.091 9.548 9.259 8.953 8.623 8.228 7.748 7.135 5.289 -8 ,20993 ,TETRA ,17531596,Thu Nov 25 03:52:37 CET,Thu Nov 25 05:43:44 CET,0.0 1.468 2.103 2.607 3.028 3.388 3.701 3.984 4.481 4.71 4.942 4.993 5.555 5.745 6.099 6.407 6.699 6.853 7.148 7.422 7.821 8.09 8.343 8.691 9.018 9.33 9.645 9.951 10.341 10.714 11.07 11.489 11.893 12.277 12.693 13.168 13.638 14.153 14.693 15.247 15.857 16.552 17.317 18.04 18.852 19.76 20.799 21.885 23.049 24.253 25.26 25.481 25.171 24.613 23.986 23.323 22.671 22.066 21.501 20.893 20.34 19.832 19.366 18.936 18.515 18.113 17.692 17.317 16.981 16.629 16.247 15.918 15.581 15.222 14.923 14.607 14.29 13.971 13.636 13.397 13.15 12.755 12.456 12.145 11.997 11.686 11.362 11.02 10.831 10.283 10.238 10.021 9.79 9.24 8.927 8.595 8.218 7.782 7.289 6.601 4.826 -9 ,25046 ,TETRA ,17531597,Thu Nov 25 03:52:37 CET,Thu Nov 25 05:43:19 CET,0.0 1.351 2.039 2.568 3.006 3.385 3.722 4.039 4.607 4.848 5.079 5.154 5.725 5.909 6.258 6.577 6.87 7.019 7.32 7.61 8.023 8.287 8.544 8.929 9.285 9.599 9.905 10.206 10.586 10.956 11.326 11.756 12.15 12.523 12.96 13.461 13.931 14.455 15.035 15.622 16.216 16.875 17.6 18.296 19.158 20.089 21.055 22.094 23.201 24.355 25.302 25.439 25.105 24.589 23.98 23.363 22.768 22.176 21.61 20.988 20.447 19.968 19.486 19.02 18.602 18.202 17.76 17.363 17.006 16.634 16.259 15.941 15.591 15.209 14.912 14.617 14.317 13.978 13.611 13.362 13.11 12.742 12.476 12.185 12.041 11.751 11.434 11.079 10.892 10.341 10.285 10.067 9.838 9.358 9.088 8.783 8.434 8.015 7.507 6.915 5.249 -10 ,26483 ,TETRA ,17531603,Thu Nov 25 03:52:38 CET,Thu Nov 25 05:40:28 CET,0.0 1.894 2.449 2.879 3.304 3.657 3.96 4.253 4.778 5.022 5.258 5.301 5.867 6.061 6.431 6.779 7.092 7.241 7.538 7.83 8.235 8.485 8.738 9.107 9.434 9.752 10.072 10.378 10.764 11.134 11.487 11.912 12.316 12.695 13.137 13.625 14.091 14.617 15.171 15.735 16.313 16.949 17.672 18.39 19.205 20.107 21.064 22.098 23.252 24.365 25.279 25.418 25.047 24.535 23.948 23.299 22.631 21.992 21.442 20.844 20.292 19.799 19.316 18.829 18.373 17.96 17.529 17.132 16.779 16.422 16.03 15.7 15.366 14.994 14.699 14.39 14.078 13.744 13.385 13.146 12.908 12.537 12.265 11.981 11.828 11.501 11.168 10.801 10.594 10.032 9.992 9.77 9.521 8.972 8.665 8.339 7.973 7.525 6.985 6.324 4.647 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt deleted file mode 100644 index 57156023..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_17124-1.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,18493 ,TETRA ,17531615,Thu Nov 25 03:52:41 CET,Thu Nov 25 05:42:49 CET,0.0 1.585 2.336 2.886 3.364 3.801 4.204 4.597 5.335 5.685 6.006 6.115 6.882 7.171 7.718 8.254 8.769 9.018 9.512 9.982 10.664 11.124 11.579 12.226 12.838 13.46 14.071 14.656 15.442 16.224 16.987 17.909 18.824 19.733 20.8 22.021 23.208 24.533 25.994 27.583 29.286 31.234 33.598 36.052 38.996 42.398 46.486 51.313 57.272 64.816 74.748 83.664 89.41 93.436 96.329 98.516 100.158 101.417 102.344 103.132 103.739 104.199 104.56 104.841 105.036 105.199 105.345 105.438 105.496 105.536 105.556 105.543 105.501 105.456 105.405 105.339 105.264 105.161 105.036 104.945 104.853 104.685 104.55 104.39 104.299 104.111 103.888 103.642 103.508 102.981 102.931 102.702 102.46 101.955 101.674 101.344 100.971 100.528 99.947 99.103 96.275 -6 ,27869 ,TETRA ,17531663,Thu Nov 25 03:53:08 CET,Thu Nov 25 05:40:57 CET,0.0 2.026 2.799 3.396 3.904 4.328 4.714 5.107 5.845 6.167 6.471 6.61 7.379 7.657 8.205 8.748 9.261 9.511 10.02 10.512 11.22 11.677 12.111 12.751 13.389 14.024 14.657 15.274 16.064 16.823 17.579 18.518 19.412 20.306 21.381 22.59 23.778 25.106 26.544 28.101 29.773 31.702 34.04 36.521 39.494 42.84 46.843 51.607 57.471 64.845 74.449 83.196 88.79 92.669 95.424 97.494 99.068 100.242 101.096 101.814 102.319 102.694 103.012 103.245 103.392 103.505 103.576 103.618 103.633 103.615 103.594 103.584 103.575 103.534 103.481 103.404 103.298 103.194 103.084 102.996 102.887 102.691 102.543 102.395 102.309 102.113 101.89 101.611 101.467 100.971 101.004 100.791 100.546 99.971 99.662 99.347 98.928 98.368 97.69 96.773 94.165 -7 ,23467 ,TETRA ,17531664,Thu Nov 25 03:53:09 CET,Thu Nov 25 05:44:37 CET,0.0 1.86 2.571 3.141 3.625 4.03 4.398 4.764 5.484 5.825 6.151 6.288 7.053 7.33 7.867 8.386 8.886 9.131 9.62 10.103 10.825 11.295 11.742 12.391 13.01 13.626 14.253 14.866 15.663 16.428 17.169 18.087 18.991 19.885 20.935 22.12 23.294 24.627 26.1 27.687 29.38 31.359 33.719 36.121 39.017 42.425 46.519 51.293 57.224 64.62 74.279 83.211 89.057 93.12 96.008 98.185 99.837 101.126 102.064 102.908 103.56 104.034 104.43 104.745 104.962 105.12 105.248 105.353 105.435 105.478 105.483 105.474 105.453 105.403 105.348 105.281 105.199 105.094 104.959 104.863 104.768 104.591 104.453 104.301 104.222 104.045 103.849 103.611 103.472 102.976 103.039 102.864 102.65 102.073 101.723 101.329 100.903 100.408 99.752 98.84 96.081 -10 ,25882 ,TETRA ,17531705,Thu Nov 25 03:52:37 CET,Thu Nov 25 05:40:21 CET,0.0 1.48 2.195 2.809 3.327 3.778 4.184 4.568 5.293 5.622 5.938 6.085 6.857 7.141 7.69 8.226 8.746 9.002 9.5 9.984 10.696 11.157 11.604 12.264 12.907 13.533 14.144 14.746 15.531 16.295 17.037 17.944 18.832 19.706 20.747 21.952 23.128 24.436 25.884 27.455 29.132 31.094 33.482 35.946 38.88 42.272 46.29 51.016 56.929 64.378 74.137 83.006 88.691 92.564 95.343 97.446 98.969 100.126 101.003 101.785 102.339 102.729 103.029 103.291 103.492 103.614 103.718 103.772 103.78 103.769 103.723 103.657 103.553 103.423 103.303 103.159 103.007 102.839 102.656 102.526 102.386 102.139 101.939 101.706 101.588 101.342 101.052 100.711 100.524 99.989 99.977 99.771 99.532 98.939 98.6 98.207 97.742 97.212 96.523 95.601 92.66 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt deleted file mode 100644 index 5dd243f9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18652-1_18638-1.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,30031 ,TETRA ,17531718,Thu Nov 25 03:52:40 CET,Thu Nov 25 05:46:27 CET,0.0 1.677 2.293 2.776 3.179 3.521 3.826 4.12 4.675 4.92 5.151 5.106 5.779 5.965 6.315 6.634 6.943 7.1 7.397 7.671 8.067 8.322 8.575 8.97 9.343 9.681 10.003 10.313 10.71 11.087 11.438 11.863 12.291 12.709 13.186 13.705 14.173 14.689 15.258 15.818 16.38 17.03 17.804 18.58 19.44 20.352 21.361 22.415 23.516 24.58 25.498 25.861 25.654 25.2 24.655 24.073 23.496 22.889 22.316 21.708 21.15 20.629 20.12 19.608 19.122 18.695 18.252 17.849 17.486 17.087 16.651 16.29 15.918 15.522 15.204 14.872 14.547 14.217 13.866 13.619 13.376 13.004 12.726 12.429 12.276 11.967 11.634 11.257 11.055 10.392 10.446 10.214 9.941 9.286 8.925 8.541 8.118 7.608 7.003 6.356 4.789 -3 ,17476 ,TETRA ,17531720,Thu Nov 25 03:52:42 CET,Thu Nov 25 05:46:27 CET,0.0 1.484 2.107 2.558 2.926 3.242 3.54 3.819 4.31 4.536 4.748 4.657 5.317 5.506 5.858 6.199 6.518 6.667 6.973 7.275 7.698 7.974 8.219 8.555 8.885 9.214 9.534 9.831 10.216 10.596 10.954 11.375 11.784 12.18 12.655 13.162 13.638 14.171 14.736 15.338 15.956 16.624 17.398 18.176 19.053 19.96 20.939 21.993 23.117 24.315 25.395 25.75 25.591 25.212 24.734 24.202 23.662 23.123 22.633 22.098 21.588 21.143 20.71 20.237 19.782 19.398 18.984 18.591 18.245 17.874 17.487 17.163 16.827 16.484 16.214 15.927 15.632 15.313 14.956 14.713 14.461 14.055 13.735 13.374 13.196 12.844 12.505 12.149 11.953 11.283 11.318 11.088 10.835 10.266 9.958 9.614 9.203 8.713 8.096 7.299 5.53 -6 ,17594 ,TETRA ,17531744,Thu Nov 25 03:53:08 CET,Thu Nov 25 05:47:40 CET,0.0 1.838 2.52 3.032 3.449 3.794 4.111 4.396 4.907 5.15 5.375 5.317 5.973 6.153 6.515 6.847 7.163 7.323 7.621 7.896 8.294 8.55 8.803 9.167 9.507 9.832 10.151 10.455 10.851 11.246 11.615 12.053 12.459 12.844 13.299 13.822 14.329 14.865 15.426 15.998 16.588 17.242 17.998 18.744 19.597 20.519 21.496 22.517 23.657 24.878 25.968 26.388 26.252 25.907 25.428 24.845 24.28 23.771 23.297 22.756 22.292 21.868 21.434 20.995 20.575 20.2 19.791 19.402 19.074 18.718 18.337 18.033 17.708 17.363 17.1 16.815 16.494 16.153 15.797 15.55 15.29 14.872 14.593 14.291 14.132 13.826 13.493 13.112 12.91 12.223 12.17 11.898 11.617 10.993 10.622 10.222 9.755 9.239 8.72 8.02 5.903 -7 ,25038 ,TETRA ,17531746,Thu Nov 25 03:53:08 CET,Thu Nov 25 05:46:04 CET,0.0 1.51 2.228 2.721 3.113 3.462 3.765 4.05 4.565 4.807 5.034 4.982 5.652 5.837 6.184 6.513 6.833 6.985 7.266 7.556 7.974 8.233 8.486 8.841 9.186 9.52 9.813 10.099 10.492 10.869 11.227 11.635 12.026 12.428 12.896 13.411 13.896 14.402 14.941 15.514 16.129 16.805 17.56 18.327 19.175 20.057 21.054 22.117 23.262 24.492 25.656 26.125 25.995 25.622 25.087 24.533 24.028 23.51 23.008 22.478 21.991 21.523 21.079 20.667 20.265 19.882 19.482 19.12 18.79 18.426 18.044 17.712 17.37 17.031 16.766 16.492 16.198 15.882 15.547 15.315 15.083 14.712 14.427 14.126 13.976 13.654 13.322 12.961 12.767 12.104 12.143 11.898 11.63 11.074 10.763 10.408 10.015 9.578 9.068 8.36 6.094 -8 ,26804 ,TETRA ,17531748,Thu Nov 25 03:53:10 CET,Thu Nov 25 05:46:06 CET,0.0 1.454 2.0 2.489 2.913 3.271 3.559 3.819 4.31 4.542 4.771 4.726 5.399 5.596 5.962 6.291 6.589 6.736 7.034 7.313 7.716 7.964 8.203 8.565 8.909 9.234 9.543 9.849 10.251 10.637 11.001 11.426 11.847 12.254 12.701 13.193 13.668 14.207 14.783 15.387 16.0 16.652 17.397 18.122 18.951 19.82 20.8 21.897 23.031 24.186 25.27 25.604 25.309 24.83 24.335 23.843 23.355 22.826 22.295 21.766 21.3 20.851 20.415 19.973 19.561 19.2 18.796 18.407 18.076 17.738 17.377 17.056 16.706 16.355 16.082 15.789 15.487 15.169 14.834 14.59 14.331 13.925 13.648 13.366 13.212 12.886 12.543 12.192 12.003 11.35 11.416 11.191 10.955 10.437 10.15 9.813 9.402 8.916 8.345 7.638 6.101 -9 ,27252 ,TETRA ,17531757,Thu Nov 25 03:54:06 CET,Thu Nov 25 05:47:25 CET,0.0 1.369 2.033 2.591 3.051 3.427 3.742 4.039 4.564 4.8 5.035 4.968 5.633 5.823 6.178 6.522 6.857 7.017 7.335 7.638 8.055 8.314 8.558 8.899 9.24 9.573 9.889 10.181 10.554 10.928 11.288 11.72 12.136 12.531 12.98 13.492 13.984 14.508 15.064 15.659 16.272 16.961 17.742 18.506 19.367 20.305 21.34 22.393 23.5 24.626 25.575 25.781 25.499 24.978 24.391 23.788 23.186 22.592 22.024 21.385 20.795 20.268 19.756 19.262 18.786 18.347 17.888 17.454 17.058 16.641 16.208 15.862 15.503 15.094 14.757 14.423 14.078 13.702 13.311 13.037 12.75 12.293 11.98 11.648 11.471 11.113 10.744 10.342 10.114 9.408 9.353 9.069 8.777 8.146 7.784 7.399 6.955 6.408 5.821 4.976 2.274 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index 6624f4b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18658-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8091 ,TETRA ,17531763,Thu Nov 25 03:54:10 CET,Thu Nov 25 05:46:04 CET,0.0 2.317 3.034 3.583 3.983 4.297 4.615 4.907 5.385 5.604 5.818 5.849 6.391 6.571 6.904 7.22 7.514 7.654 7.942 8.198 8.542 8.768 8.982 9.291 9.586 9.857 10.112 10.352 10.667 10.959 11.229 11.559 11.858 12.139 12.455 12.784 13.089 13.441 13.836 14.249 14.677 15.148 15.67 16.154 16.699 17.265 17.813 18.272 18.57 18.561 17.931 16.646 15.292 13.941 12.7 11.556 10.528 9.624 8.824 7.994 7.252 6.579 5.957 5.378 4.833 4.311 3.763 3.286 2.86 2.393 1.909 1.518 1.123 0.72 0.41 0.072 -0.282 -0.627 -0.992 -1.258 -1.514 -1.909 -2.201 -2.509 -2.673 -3.014 -3.369 -3.771 -3.976 -4.542 -4.634 -4.878 -5.131 -5.68 -5.983 -6.314 -6.681 -7.143 -7.733 -8.462 -10.57 -6 ,31748 ,TETRA ,17531797,Thu Nov 25 03:54:07 CET,Thu Nov 25 05:44:19 CET,0.0 3.023 3.697 4.23 4.639 4.989 5.304 5.568 6.071 6.326 6.569 6.637 7.176 7.362 7.721 8.034 8.327 8.465 8.724 8.977 9.341 9.574 9.798 10.105 10.386 10.661 10.931 11.188 11.515 11.809 12.086 12.431 12.766 13.071 13.403 13.779 14.138 14.517 14.923 15.337 15.734 16.152 16.647 17.156 17.69 18.179 18.589 18.881 19.045 18.997 18.365 16.97 15.419 14.005 12.789 11.654 10.614 9.646 8.802 7.971 7.263 6.616 5.967 5.357 4.83 4.34 3.808 3.316 2.884 2.432 1.967 1.589 1.19 0.767 0.436 0.104 -0.219 -0.566 -0.966 -1.24 -1.519 -1.942 -2.23 -2.532 -2.683 -3.015 -3.369 -3.758 -3.974 -4.551 -4.62 -4.853 -5.101 -5.654 -5.973 -6.307 -6.669 -7.097 -7.645 -8.434 -10.449 -9 ,27410 ,TETRA ,17531804,Thu Nov 25 03:54:08 CET,Thu Nov 25 05:44:17 CET,0.0 1.904 2.561 3.122 3.554 3.877 4.167 4.423 4.881 5.092 5.296 5.32 5.841 5.997 6.321 6.625 6.895 7.032 7.304 7.548 7.888 8.099 8.301 8.596 8.872 9.145 9.416 9.671 9.977 10.274 10.566 10.901 11.213 11.514 11.86 12.238 12.59 12.968 13.355 13.766 14.173 14.577 15.046 15.473 15.929 16.388 16.778 17.108 17.338 17.268 16.537 15.097 13.626 12.242 10.995 9.83 8.787 7.839 7.031 6.219 5.491 4.825 4.176 3.564 2.992 2.482 1.941 1.444 1.018 0.578 0.126 -0.261 -0.688 -1.149 -1.494 -1.831 -2.183 -2.558 -2.947 -3.204 -3.462 -3.876 -4.17 -4.474 -4.625 -4.939 -5.302 -5.699 -5.912 -6.503 -6.601 -6.839 -7.081 -7.627 -7.939 -8.283 -8.681 -9.143 -9.668 -10.39 -12.823 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index 64522621..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12848 ,KEBNE ,17024682,Wed Dec 22 10:44:53 CET,Wed Dec 22 12:20:39 CET,0.0 1.507 2.09 2.573 2.962 3.281 3.592 3.89 4.403 4.614 4.805 4.814 5.352 5.516 5.836 6.145 6.433 6.572 6.83 7.071 7.426 7.647 7.854 8.164 8.455 8.723 8.976 9.228 9.559 9.88 10.186 10.534 10.868 11.185 11.554 11.954 12.287 12.652 13.057 13.484 13.916 14.366 14.859 15.335 15.866 16.424 17.0 17.497 17.855 18.053 17.692 16.621 15.482 14.329 13.251 12.276 11.369 10.549 9.82 9.03 8.344 7.731 7.139 6.56 5.983 5.463 4.924 4.452 4.062 3.622 3.139 2.75 2.358 1.965 1.65 1.318 0.983 0.621 0.221 -0.066 -0.352 -0.795 -1.117 -1.456 -1.63 -2.02 -2.405 -2.785 -2.995 -3.582 -3.69 -3.936 -4.203 -4.805 -5.136 -5.506 -5.92 -6.393 -6.992 -7.813 -9.982 -2 ,31403 ,KEBNE ,17024683,Wed Dec 22 10:44:53 CET,Wed Dec 22 12:20:49 CET,0.0 1.69 2.303 2.705 3.05 3.349 3.635 3.926 4.44 4.666 4.883 4.908 5.448 5.612 5.926 6.248 6.546 6.68 6.943 7.195 7.55 7.78 7.996 8.289 8.568 8.867 9.15 9.392 9.694 9.992 10.288 10.618 10.922 11.219 11.565 11.945 12.301 12.68 13.08 13.512 13.977 14.437 14.907 15.378 15.894 16.405 16.927 17.434 17.888 18.13 17.854 16.943 15.837 14.704 13.652 12.667 11.755 10.883 10.109 9.327 8.634 8.009 7.418 6.857 6.319 5.819 5.305 4.85 4.447 4.021 3.556 3.166 2.778 2.363 2.027 1.683 1.329 0.966 0.582 0.314 0.039 -0.413 -0.743 -1.067 -1.224 -1.566 -1.917 -2.306 -2.527 -3.119 -3.224 -3.47 -3.726 -4.299 -4.623 -4.975 -5.359 -5.809 -6.379 -7.338 -11.302 -3 ,10963 ,KEBNE ,17024684,Wed Dec 22 10:44:53 CET,Wed Dec 22 12:20:18 CET,0.0 1.925 2.544 2.97 3.304 3.624 3.909 4.156 4.615 4.833 5.039 5.057 5.599 5.77 6.067 6.357 6.648 6.786 7.045 7.289 7.655 7.887 8.099 8.399 8.678 8.95 9.218 9.449 9.729 10.004 10.278 10.613 10.933 11.245 11.596 11.977 12.331 12.708 13.102 13.498 13.907 14.384 14.904 15.387 15.92 16.493 17.074 17.588 18.055 18.305 17.959 16.879 15.679 14.51 13.456 12.434 11.495 10.653 9.913 9.133 8.442 7.806 7.177 6.589 6.043 5.533 5.011 4.56 4.16 3.737 3.293 2.922 2.533 2.122 1.794 1.42 1.036 0.665 0.283 0.017 -0.271 -0.72 -1.029 -1.355 -1.525 -1.872 -2.228 -2.608 -2.812 -3.399 -3.519 -3.758 -4.016 -4.601 -4.944 -5.319 -5.718 -6.195 -6.757 -7.525 -10.106 -4 ,22584 ,KEBNE ,17024685,Wed Dec 22 10:44:53 CET,Wed Dec 22 12:20:04 CET,0.0 1.677 2.381 2.857 3.231 3.599 3.972 4.281 4.746 4.964 5.189 5.237 5.778 5.932 6.232 6.545 6.834 6.969 7.23 7.475 7.82 8.034 8.24 8.555 8.853 9.122 9.369 9.622 9.96 10.277 10.573 10.918 11.252 11.57 11.918 12.314 12.688 13.086 13.523 13.962 14.405 14.88 15.412 15.921 16.464 16.999 17.536 17.995 18.368 18.556 18.188 17.131 15.956 14.796 13.705 12.669 11.712 10.831 10.06 9.277 8.586 7.963 7.384 6.831 6.3 5.798 5.247 4.762 4.351 3.917 3.472 3.108 2.725 2.325 2.002 1.663 1.306 0.921 0.53 0.269 0.009 -0.418 -0.734 -1.068 -1.231 -1.552 -1.897 -2.269 -2.478 -3.068 -3.174 -3.422 -3.691 -4.258 -4.575 -4.943 -5.348 -5.803 -6.399 -7.201 -9.716 -5 ,6218 ,KEBNE ,17024686,Wed Dec 22 10:45:55 CET,Wed Dec 22 12:21:54 CET,0.0 1.564 2.162 2.587 2.941 3.263 3.554 3.803 4.248 4.464 4.67 4.689 5.228 5.421 5.794 6.098 6.378 6.518 6.788 7.038 7.381 7.597 7.808 8.125 8.424 8.699 8.97 9.233 9.553 9.864 10.162 10.518 10.857 11.158 11.496 11.87 12.224 12.602 13.008 13.445 13.878 14.366 14.929 15.425 15.94 16.483 17.022 17.483 17.822 17.945 17.588 16.617 15.51 14.376 13.343 12.386 11.492 10.648 9.917 9.118 8.415 7.795 7.19 6.608 6.049 5.558 5.048 4.564 4.144 3.702 3.242 2.86 2.458 2.035 1.701 1.359 0.984 0.582 0.179 -0.092 -0.371 -0.801 -1.106 -1.435 -1.607 -1.972 -2.34 -2.716 -2.914 -3.486 -3.589 -3.858 -4.129 -4.709 -5.046 -5.406 -5.805 -6.257 -6.805 -7.548 -10.201 -6 ,19804 ,KEBNE ,17024687,Wed Dec 22 10:45:55 CET,Wed Dec 22 12:22:07 CET,0.0 1.213 1.75 2.152 2.486 2.808 3.096 3.357 3.832 4.042 4.241 4.264 4.805 4.964 5.28 5.593 5.871 6.0 6.261 6.51 6.855 7.08 7.306 7.622 7.915 8.21 8.491 8.754 9.082 9.387 9.679 10.022 10.339 10.64 10.988 11.376 11.746 12.129 12.545 12.987 13.425 13.879 14.365 14.812 15.303 15.812 16.339 16.817 17.186 17.356 17.045 16.072 14.974 13.854 12.807 11.824 10.872 9.995 9.211 8.397 7.707 7.102 6.52 5.961 5.423 4.915 4.363 3.887 3.491 3.069 2.625 2.253 1.864 1.448 1.132 0.812 0.466 0.101 -0.267 -0.539 -0.841 -1.28 -1.58 -1.91 -2.081 -2.427 -2.791 -3.192 -3.404 -3.973 -4.053 -4.318 -4.599 -5.188 -5.511 -5.875 -6.298 -6.783 -7.327 -8.038 -10.435 -7 ,17334 ,KEBNE ,17024688,Wed Dec 22 10:45:55 CET,Wed Dec 22 12:23:31 CET,0.0 1.746 2.305 2.742 3.152 3.48 3.745 3.994 4.467 4.674 4.865 4.88 5.42 5.59 5.895 6.191 6.487 6.631 6.897 7.144 7.501 7.728 7.947 8.25 8.542 8.815 9.066 9.308 9.637 9.949 10.222 10.542 10.861 11.191 11.569 11.954 12.319 12.72 13.134 13.557 13.973 14.448 14.969 15.425 15.961 16.504 16.99 17.44 17.805 17.975 17.662 16.709 15.584 14.448 13.409 12.453 11.576 10.741 9.998 9.253 8.615 8.035 7.463 6.912 6.38 5.869 5.339 4.87 4.473 4.051 3.583 3.189 2.766 2.318 1.977 1.61 1.236 0.853 0.443 0.172 -0.1 -0.538 -0.853 -1.182 -1.356 -1.72 -2.108 -2.509 -2.709 -3.291 -3.392 -3.641 -3.908 -4.474 -4.792 -5.156 -5.56 -5.998 -6.5 -7.25 -10.165 -8 ,21515 ,KEBNE ,17024689,Wed Dec 22 10:45:55 CET,Wed Dec 22 12:22:15 CET,0.0 1.324 1.927 2.354 2.714 3.034 3.318 3.579 4.042 4.259 4.467 4.499 5.042 5.196 5.501 5.824 6.135 6.272 6.528 6.769 7.13 7.367 7.573 7.869 8.162 8.446 8.718 8.971 9.285 9.59 9.887 10.249 10.58 10.871 11.207 11.578 11.929 12.311 12.707 13.123 13.55 14.0 14.497 14.969 15.457 15.971 16.53 17.058 17.497 17.726 17.405 16.352 15.18 14.079 13.038 11.998 11.042 10.175 9.43 8.669 8.001 7.379 6.774 6.211 5.672 5.175 4.639 4.155 3.749 3.325 2.878 2.486 2.086 1.689 1.377 1.057 0.716 0.348 -0.057 -0.347 -0.634 -1.07 -1.376 -1.709 -1.889 -2.255 -2.607 -2.995 -3.215 -3.804 -3.919 -4.182 -4.467 -5.095 -5.443 -5.812 -6.221 -6.678 -7.184 -7.867 -10.569 -9 ,2767 ,KEBNE ,17024690,Wed Dec 22 10:46:57 CET,Wed Dec 22 12:24:06 CET,0.0 1.227 1.798 2.239 2.643 2.989 3.265 3.546 4.069 4.289 4.5 4.514 5.056 5.224 5.54 5.865 6.178 6.316 6.559 6.799 7.182 7.422 7.642 7.95 8.234 8.508 8.784 9.056 9.403 9.72 9.994 10.318 10.641 10.967 11.335 11.742 12.124 12.527 12.935 13.333 13.742 14.178 14.654 15.131 15.669 16.203 16.721 17.16 17.494 17.611 17.217 16.212 15.057 13.879 12.812 11.738 10.756 9.902 9.156 8.373 7.676 7.036 6.398 5.806 5.278 4.775 4.231 3.744 3.337 2.932 2.497 2.129 1.728 1.297 0.968 0.619 0.235 -0.153 -0.547 -0.821 -1.101 -1.552 -1.874 -2.202 -2.364 -2.712 -3.1 -3.531 -3.75 -4.346 -4.482 -4.746 -5.016 -5.587 -5.933 -6.318 -6.728 -7.179 -7.771 -8.609 -11.437 -10 ,22767 ,KEBNE ,17024691,Wed Dec 22 10:46:57 CET,Wed Dec 22 12:22:04 CET,0.0 4.041 5.108 5.711 6.086 6.416 6.719 6.988 7.452 7.653 7.855 7.875 8.42 8.604 8.946 9.257 9.533 9.662 9.924 10.178 10.537 10.757 10.964 11.263 11.541 11.798 12.043 12.287 12.601 12.885 13.161 13.508 13.826 14.124 14.481 14.876 15.237 15.623 16.04 16.455 16.86 17.304 17.785 18.258 18.806 19.365 19.907 20.425 20.868 21.025 20.541 19.473 18.327 17.157 16.11 15.097 14.177 13.319 12.559 11.8 11.127 10.497 9.889 9.333 8.813 8.33 7.813 7.349 6.951 6.517 6.059 5.69 5.277 4.83 4.491 4.157 3.82 3.46 3.081 2.81 2.521 2.092 1.801 1.487 1.319 0.969 0.569 0.158 -0.063 -0.664 -0.757 -0.999 -1.249 -1.849 -2.2 -2.551 -2.941 -3.417 -4.029 -4.896 -8.965 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt deleted file mode 100644 index 1505d534..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18659-1_18658-1.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15340 ,TETRA ,17531817,Thu Nov 25 03:54:09 CET,Thu Nov 25 05:44:39 CET,0.0 1.795 2.504 2.962 3.374 3.752 4.078 4.368 4.898 5.148 5.386 5.468 6.023 6.21 6.582 6.921 7.253 7.414 7.706 7.979 8.383 8.646 8.904 9.271 9.613 9.939 10.256 10.555 10.932 11.303 11.655 12.074 12.483 12.875 13.331 13.859 14.352 14.853 15.38 15.949 16.533 17.16 17.859 18.549 19.376 20.285 21.231 22.182 23.204 24.231 25.096 25.289 24.956 24.359 23.636 22.871 22.194 21.589 20.971 20.308 19.782 19.289 18.73 18.172 17.656 17.206 16.751 16.321 15.94 15.554 15.148 14.786 14.387 13.962 13.634 13.299 12.955 12.605 12.232 11.95 11.667 11.267 10.987 10.683 10.521 10.173 9.808 9.438 9.236 8.666 8.564 8.302 8.044 7.464 7.129 6.766 6.338 5.835 5.272 4.533 2.337 -2 ,19509 ,TETRA ,17531830,Thu Nov 25 03:54:12 CET,Thu Nov 25 05:44:56 CET,0.0 2.001 2.768 3.321 3.742 4.122 4.466 4.775 5.302 5.541 5.766 5.805 6.357 6.549 6.917 7.263 7.588 7.736 8.013 8.282 8.669 8.93 9.195 9.564 9.911 10.241 10.567 10.88 11.256 11.61 11.972 12.401 12.817 13.213 13.648 14.146 14.61 15.086 15.602 16.175 16.755 17.395 18.117 18.831 19.692 20.591 21.496 22.472 23.526 24.519 25.423 25.705 25.353 24.748 24.072 23.313 22.621 22.012 21.437 20.823 20.287 19.762 19.233 18.722 18.256 17.828 17.345 16.913 16.527 16.104 15.66 15.292 14.911 14.497 14.179 13.874 13.554 13.199 12.827 12.579 12.31 11.863 11.556 11.23 11.051 10.694 10.318 9.911 9.695 9.115 9.021 8.773 8.494 7.864 7.526 7.166 6.751 6.279 5.758 4.966 2.108 -3 ,13665 ,TETRA ,17531832,Thu Nov 25 03:54:14 CET,Thu Nov 25 05:44:39 CET,0.0 1.659 2.289 2.758 3.161 3.513 3.816 4.103 4.617 4.848 5.077 5.168 5.736 5.919 6.261 6.584 6.897 7.052 7.348 7.632 8.021 8.259 8.498 8.844 9.181 9.508 9.815 10.126 10.523 10.886 11.223 11.626 12.021 12.404 12.854 13.341 13.803 14.316 14.857 15.429 16.008 16.636 17.355 18.079 18.915 19.791 20.764 21.792 22.838 23.852 24.677 24.84 24.505 23.905 23.248 22.581 21.888 21.157 20.493 19.798 19.205 18.73 18.268 17.784 17.31 16.877 16.419 16.007 15.635 15.216 14.786 14.418 14.037 13.642 13.326 13.022 12.709 12.349 11.946 11.663 11.372 10.928 10.622 10.287 10.113 9.77 9.398 8.983 8.764 8.181 8.044 7.778 7.507 6.885 6.545 6.194 5.79 5.31 4.726 3.94 1.496 -4 ,1160 ,TETRA ,17531834,Thu Nov 25 03:54:08 CET,Thu Nov 25 05:45:50 CET,0.0 1.79 2.532 3.04 3.409 3.759 4.082 4.367 4.886 5.12 5.354 5.438 6.002 6.197 6.555 6.886 7.201 7.353 7.652 7.921 8.293 8.555 8.807 9.166 9.531 9.871 10.193 10.508 10.9 11.272 11.629 12.044 12.438 12.813 13.243 13.733 14.203 14.693 15.189 15.738 16.334 16.993 17.737 18.443 19.279 20.169 21.096 22.141 23.294 24.41 25.319 25.412 25.041 24.537 23.925 23.215 22.486 21.804 21.21 20.569 20.002 19.474 18.925 18.372 17.854 17.405 16.957 16.549 16.195 15.837 15.419 15.041 14.663 14.263 13.942 13.622 13.281 12.915 12.533 12.259 11.982 11.554 11.246 10.925 10.769 10.441 10.083 9.71 9.495 8.909 8.795 8.544 8.29 7.709 7.376 6.985 6.505 5.993 5.429 4.626 1.316 -5 ,167 ,TETRA ,17531851,Thu Nov 25 03:54:09 CET,Thu Nov 25 05:45:38 CET,0.0 1.824 2.573 3.07 3.436 3.778 4.09 4.373 4.897 5.128 5.361 5.448 6.005 6.187 6.505 6.822 7.152 7.309 7.613 7.901 8.311 8.573 8.824 9.18 9.524 9.844 10.149 10.465 10.86 11.224 11.582 12.007 12.402 12.785 13.24 13.754 14.237 14.733 15.247 15.797 16.38 17.041 17.786 18.505 19.321 20.183 21.115 22.101 23.168 24.182 24.977 25.108 24.708 24.051 23.291 22.538 21.801 21.094 20.481 19.803 19.207 18.704 18.224 17.756 17.321 16.89 16.42 16.01 15.636 15.232 14.808 14.446 14.065 13.674 13.374 13.06 12.73 12.388 12.029 11.763 11.486 11.038 10.712 10.376 10.202 9.846 9.478 9.075 8.861 8.289 8.185 7.926 7.638 7.024 6.687 6.312 5.909 5.441 4.867 4.044 1.346 -6 ,19023 ,TETRA ,17531852,Thu Nov 25 03:54:11 CET,Thu Nov 25 05:45:36 CET,0.0 2.029 2.746 3.239 3.613 3.953 4.272 4.573 5.145 5.399 5.63 5.689 6.235 6.408 6.75 7.082 7.403 7.558 7.863 8.137 8.521 8.783 9.032 9.398 9.753 10.082 10.391 10.691 11.08 11.443 11.784 12.181 12.57 12.964 13.406 13.873 14.309 14.791 15.329 15.905 16.493 17.147 17.897 18.652 19.494 20.395 21.4 22.397 23.424 24.511 25.453 25.541 25.117 24.556 23.954 23.36 22.728 22.074 21.484 20.862 20.295 19.76 19.249 18.746 18.265 17.778 17.247 16.799 16.416 16.011 15.568 15.186 14.8 14.428 14.129 13.791 13.421 13.054 12.687 12.419 12.128 11.686 11.381 11.058 10.889 10.535 10.153 9.736 9.519 8.934 8.839 8.606 8.342 7.718 7.374 7.011 6.598 6.096 5.54 4.824 2.363 -10 ,25767 ,TETRA ,17531871,Thu Nov 25 03:54:09 CET,Thu Nov 25 05:44:37 CET,0.0 1.955 2.575 3.117 3.588 3.956 4.284 4.581 5.108 5.352 5.583 5.616 6.166 6.352 6.701 7.031 7.356 7.511 7.802 8.087 8.492 8.75 9.013 9.38 9.71 10.023 10.323 10.617 10.997 11.355 11.685 12.098 12.512 12.899 13.346 13.836 14.284 14.784 15.292 15.828 16.43 17.102 17.839 18.566 19.425 20.311 21.262 22.296 23.354 24.446 25.397 25.573 25.18 24.599 24.007 23.35 22.706 22.082 21.487 20.844 20.247 19.701 19.166 18.661 18.192 17.732 17.236 16.782 16.405 16.015 15.599 15.252 14.862 14.447 14.119 13.779 13.453 13.108 12.723 12.462 12.191 11.766 11.467 11.144 10.973 10.613 10.24 9.834 9.613 9.034 8.922 8.658 8.382 7.764 7.391 7.001 6.587 6.104 5.479 4.702 1.587 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt deleted file mode 100644 index 36f739ed..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18634-1.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,28426 ,TETRA ,17531885,Thu Nov 25 03:54:10 CET,Thu Nov 25 05:45:38 CET,0.0 2.137 2.95 3.621 4.18 4.654 5.089 5.486 6.248 6.603 6.933 7.127 7.958 8.27 8.86 9.432 9.988 10.256 10.787 11.315 12.087 12.581 13.07 13.798 14.516 15.216 15.906 16.583 17.451 18.311 19.165 20.186 21.176 22.158 23.321 24.668 26.0 27.483 29.111 30.869 32.75 34.957 37.658 40.463 43.835 47.732 52.389 57.919 64.767 73.417 84.965 95.613 102.62 107.621 111.247 113.984 116.094 117.819 119.132 120.3 121.216 121.935 122.536 123.038 123.407 123.693 123.976 124.193 124.35 124.489 124.608 124.677 124.712 124.737 124.762 124.767 124.748 124.698 124.621 124.577 124.505 124.361 124.278 124.177 124.113 123.97 123.779 123.516 123.376 122.881 122.951 122.784 122.584 122.071 121.787 121.458 121.053 120.6 120.07 119.252 113.893 -6 ,25582 ,TETRA ,17531905,Thu Nov 25 03:54:09 CET,Thu Nov 25 05:45:35 CET,0.0 1.958 2.733 3.302 3.785 4.226 4.66 5.099 5.897 6.266 6.624 6.802 7.632 7.95 8.562 9.168 9.74 10.008 10.545 11.07 11.835 12.338 12.833 13.548 14.237 14.919 15.596 16.259 17.123 17.971 18.798 19.805 20.798 21.787 22.956 24.306 25.642 27.135 28.774 30.531 32.413 34.606 37.231 39.962 43.259 47.097 51.769 57.314 64.143 72.813 84.44 95.141 102.126 107.048 110.688 113.505 115.615 117.267 118.528 119.632 120.484 121.154 121.707 122.177 122.565 122.856 123.108 123.317 123.494 123.664 123.805 123.881 123.928 123.954 123.955 123.945 123.922 123.887 123.84 123.789 123.725 123.597 123.466 123.35 123.29 123.119 122.93 122.727 122.623 122.127 122.191 122.025 121.835 121.399 121.123 120.81 120.441 119.934 119.287 118.4 114.227 -9 ,14177 ,TETRA ,17531929,Thu Nov 25 03:54:43 CET,Thu Nov 25 05:46:17 CET,0.0 1.78 2.549 3.115 3.615 4.111 4.563 4.972 5.722 6.085 6.43 6.557 7.368 7.678 8.269 8.821 9.36 9.631 10.154 10.673 11.445 11.946 12.444 13.173 13.881 14.568 15.245 15.919 16.809 17.679 18.517 19.538 20.569 21.585 22.763 24.104 25.425 26.903 28.536 30.326 32.237 34.435 37.102 39.873 43.175 46.981 51.609 57.133 63.964 72.624 84.116 94.757 101.77 106.716 110.283 112.992 115.049 116.725 118.04 119.191 120.03 120.701 121.27 121.739 122.148 122.488 122.787 123.009 123.178 123.331 123.477 123.58 123.662 123.723 123.763 123.764 123.737 123.69 123.618 123.564 123.497 123.373 123.261 123.116 123.031 122.864 122.683 122.44 122.303 121.799 121.856 121.691 121.513 121.049 120.772 120.463 120.06 119.577 118.939 118.041 114.655 -10 ,2367 ,TETRA ,17531943,Thu Nov 25 03:54:47 CET,Thu Nov 25 05:45:37 CET,0.0 2.158 2.918 3.447 3.941 4.42 4.874 5.296 6.055 6.401 6.739 6.924 7.732 8.029 8.624 9.206 9.754 10.023 10.569 11.101 11.87 12.366 12.841 13.555 14.268 14.964 15.66 16.339 17.222 18.103 18.975 20.016 21.024 22.012 23.167 24.483 25.769 27.238 28.871 30.63 32.531 34.718 37.361 40.141 43.527 47.461 52.143 57.705 64.62 73.342 84.973 95.728 102.738 107.71 111.332 114.066 116.196 117.88 119.112 120.2 121.032 121.693 122.249 122.708 123.08 123.395 123.698 123.937 124.099 124.222 124.314 124.369 124.416 124.456 124.481 124.475 124.456 124.42 124.357 124.299 124.219 124.078 123.967 123.838 123.764 123.601 123.433 123.195 123.053 122.542 122.579 122.416 122.232 121.768 121.504 121.216 120.855 120.398 119.802 118.935 112.813 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt deleted file mode 100644 index 9ae10da0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18658-1.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15483 ,TETRA ,17531953,Thu Nov 25 03:54:44 CET,Thu Nov 25 05:46:05 CET,0.0 1.334 2.05 2.63 3.173 3.684 4.147 4.552 5.294 5.672 6.034 6.224 7.066 7.404 8.064 8.685 9.271 9.56 10.129 10.678 11.488 12.02 12.541 13.319 14.083 14.819 15.523 16.223 17.144 18.055 18.952 20.052 21.155 22.248 23.526 24.979 26.421 28.034 29.795 31.696 33.744 36.121 39.011 42.038 45.636 49.776 54.844 60.942 68.427 77.835 90.526 102.548 110.515 116.18 120.264 123.476 125.957 127.817 129.225 130.529 131.502 132.268 132.943 133.513 134.021 134.449 134.822 135.108 135.313 135.511 135.718 135.859 135.972 136.037 136.059 136.071 136.071 136.047 135.986 135.942 135.906 135.816 135.72 135.607 135.532 135.34 135.152 134.941 134.811 134.307 134.326 134.13 133.929 133.452 133.165 132.875 132.544 132.08 131.486 130.613 126.648 -3 ,24444 ,TETRA ,17531960,Thu Nov 25 03:54:44 CET,Thu Nov 25 05:46:22 CET,0.0 2.128 2.93 3.564 4.096 4.577 5.02 5.451 6.253 6.622 6.979 7.153 7.97 8.283 8.915 9.532 10.131 10.422 10.984 11.547 12.361 12.89 13.418 14.196 14.961 15.69 16.416 17.138 18.066 18.996 19.908 21.026 22.125 23.188 24.438 25.866 27.256 28.829 30.583 32.473 34.474 36.821 39.708 42.692 46.306 50.512 55.558 61.582 69.109 78.639 91.35 103.23 111.118 116.681 120.644 123.682 126.05 127.938 129.37 130.65 131.646 132.462 133.166 133.736 134.192 134.578 134.933 135.217 135.424 135.599 135.764 135.859 135.951 136.046 136.068 136.077 136.103 136.095 136.035 135.979 135.925 135.81 135.713 135.609 135.558 135.429 135.24 134.992 134.866 134.406 134.49 134.307 134.128 133.711 133.443 133.096 132.668 132.183 131.634 130.792 127.14 -6 ,29507 ,TETRA ,17531985,Thu Nov 25 03:54:46 CET,Thu Nov 25 05:46:21 CET,0.0 1.759 2.481 3.071 3.602 4.06 4.513 4.948 5.756 6.145 6.499 6.689 7.521 7.847 8.477 9.064 9.65 9.941 10.513 11.064 11.861 12.391 12.915 13.677 14.438 15.184 15.915 16.636 17.583 18.535 19.469 20.583 21.653 22.701 23.939 25.353 26.751 28.333 30.087 32.003 34.06 36.438 39.3 42.269 45.848 50.036 55.084 61.052 68.534 78.031 90.788 102.816 110.716 116.274 120.252 123.332 125.711 127.583 129.01 130.269 131.227 131.963 132.617 133.198 133.703 134.135 134.505 134.775 134.999 135.207 135.366 135.466 135.548 135.603 135.624 135.619 135.578 135.535 135.454 135.359 135.276 135.167 135.071 134.949 134.886 134.753 134.602 134.429 134.323 133.859 133.983 133.847 133.668 133.242 132.977 132.677 132.36 131.917 131.33 130.453 126.176 -8 ,13226 ,TETRA ,17531994,Thu Nov 25 03:54:49 CET,Thu Nov 25 05:45:37 CET,0.0 1.455 2.169 2.729 3.249 3.717 4.152 4.565 5.353 5.732 6.096 6.294 7.124 7.443 8.047 8.639 9.234 9.524 10.087 10.645 11.453 11.969 12.478 13.231 13.979 14.725 15.448 16.154 17.081 17.998 18.907 20.02 21.087 22.117 23.349 24.782 26.204 27.816 29.628 31.571 33.617 36.006 38.916 41.955 45.577 49.735 54.751 60.772 68.275 77.806 90.61 102.644 110.644 116.167 120.127 123.113 125.354 127.157 128.55 129.791 130.71 131.442 132.071 132.622 133.082 133.407 133.695 133.921 134.095 134.259 134.388 134.475 134.555 134.603 134.621 134.631 134.625 134.592 134.539 134.496 134.443 134.309 134.193 134.085 134.03 133.897 133.706 133.488 133.367 132.865 132.945 132.782 132.601 132.185 131.894 131.547 131.195 130.741 130.116 129.22 118.949 -10 ,10670 ,TETRA ,17532002,Thu Nov 25 03:54:46 CET,Thu Nov 25 05:45:57 CET,0.0 2.273 3.079 3.708 4.265 4.748 5.195 5.633 6.433 6.796 7.151 7.346 8.175 8.497 9.113 9.707 10.294 10.582 11.157 11.722 12.547 13.089 13.617 14.39 15.151 15.898 16.618 17.325 18.267 19.209 20.113 21.218 22.307 23.373 24.619 26.047 27.449 29.006 30.768 32.668 34.723 37.157 40.029 42.993 46.567 50.696 55.704 61.616 68.942 78.33 90.958 102.734 110.366 115.739 119.701 122.77 125.084 126.882 128.334 129.703 130.748 131.574 132.298 132.917 133.382 133.741 134.06 134.303 134.498 134.659 134.79 134.878 134.957 135.002 134.996 134.992 134.979 134.946 134.906 134.863 134.802 134.656 134.531 134.4 134.328 134.186 134.025 133.82 133.714 133.255 133.341 133.177 132.976 132.468 132.181 131.856 131.5 131.062 130.481 129.661 126.351 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt deleted file mode 100644 index 9e432392..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/JNK1/water/Summary_FEP_18660-1_18659-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12356 ,TETRA ,17532003,Thu Nov 25 03:54:47 CET,Thu Nov 25 05:47:32 CET,0.0 2.57 3.382 4.035 4.583 5.076 5.532 5.96 6.768 7.162 7.54 7.746 8.572 8.898 9.508 10.074 10.662 10.957 11.52 12.066 12.876 13.421 13.951 14.699 15.428 16.148 16.869 17.583 18.488 19.362 20.22 21.252 22.269 23.291 24.504 25.878 27.228 28.731 30.384 32.209 34.187 36.472 39.224 42.073 45.521 49.558 54.409 60.112 67.215 76.329 88.425 99.54 106.901 112.156 116.102 119.18 121.566 123.465 124.882 126.11 127.03 127.805 128.47 128.998 129.438 129.804 130.175 130.473 130.678 130.854 130.999 131.104 131.195 131.271 131.322 131.347 131.361 131.365 131.328 131.284 131.234 131.155 131.095 131.017 130.973 130.877 130.763 130.597 130.486 130.009 130.129 129.985 129.827 129.478 129.238 128.923 128.579 128.181 127.734 127.062 123.782 -2 ,2750 ,TETRA ,17532010,Thu Nov 25 03:54:50 CET,Thu Nov 25 05:46:58 CET,0.0 2.671 3.504 4.117 4.633 5.124 5.605 6.058 6.884 7.262 7.644 7.867 8.7 9.031 9.685 10.315 10.928 11.225 11.817 12.395 13.202 13.727 14.254 15.033 15.791 16.531 17.258 17.965 18.887 19.814 20.727 21.839 22.94 24.017 25.267 26.665 28.051 29.627 31.355 33.237 35.232 37.508 40.212 43.074 46.585 50.675 55.617 61.408 68.589 77.679 89.738 101.014 108.543 113.917 117.882 120.944 123.282 125.162 126.574 127.82 128.817 129.625 130.31 130.897 131.398 131.803 132.164 132.446 132.675 132.891 133.076 133.186 133.282 133.373 133.425 133.468 133.502 133.503 133.479 133.456 133.425 133.327 133.232 133.123 133.053 132.921 132.786 132.622 132.532 132.064 132.172 132.024 131.855 131.448 131.203 130.938 130.629 130.252 129.785 129.015 126.475 -4 ,15043 ,TETRA ,17532023,Thu Nov 25 03:54:50 CET,Thu Nov 25 05:47:01 CET,0.0 2.949 3.781 4.442 5.004 5.502 5.971 6.425 7.239 7.637 8.024 8.237 9.066 9.388 10.018 10.635 11.211 11.49 12.056 12.607 13.394 13.916 14.442 15.198 15.922 16.652 17.39 18.111 19.033 19.94 20.839 21.925 22.978 24.002 25.197 26.572 27.928 29.461 31.151 32.971 34.939 37.227 39.965 42.811 46.244 50.261 55.165 61.016 68.286 77.387 89.577 101.073 108.666 114.056 117.974 121.045 123.456 125.367 126.791 128.073 129.098 129.952 130.659 131.204 131.664 132.041 132.373 132.641 132.853 133.037 133.21 133.342 133.474 133.584 133.629 133.671 133.706 133.702 133.67 133.635 133.586 133.484 133.384 133.268 133.207 133.058 132.888 132.705 132.604 132.142 132.262 132.123 131.964 131.574 131.344 131.071 130.759 130.413 129.94 129.146 126.402 -5 ,30971 ,TETRA ,17532025,Thu Nov 25 03:54:45 CET,Thu Nov 25 05:47:01 CET,0.0 1.875 2.674 3.361 3.944 4.451 4.886 5.323 6.152 6.521 6.868 7.044 7.884 8.218 8.854 9.463 10.061 10.359 10.947 11.5 12.266 12.776 13.299 14.072 14.818 15.527 16.197 16.861 17.742 18.623 19.495 20.554 21.605 22.655 23.886 25.287 26.656 28.181 29.848 31.66 33.612 35.857 38.597 41.479 44.966 49.033 53.91 59.624 66.764 75.834 87.97 99.365 106.869 112.239 116.176 119.163 121.444 123.267 124.651 125.917 126.906 127.674 128.332 128.886 129.358 129.774 130.185 130.506 130.731 130.931 131.095 131.205 131.279 131.323 131.362 131.39 131.407 131.41 131.384 131.35 131.311 131.233 131.153 131.048 131.0 130.907 130.794 130.659 130.558 130.083 130.197 130.054 129.889 129.523 129.31 129.01 128.676 128.35 127.914 127.266 124.023 -6 ,31530 ,TETRA ,17532026,Thu Nov 25 03:54:48 CET,Thu Nov 25 05:46:58 CET,0.0 2.572 3.436 4.041 4.6 5.156 5.675 6.122 6.919 7.302 7.685 7.911 8.766 9.119 9.8 10.466 11.09 11.394 11.996 12.556 13.338 13.854 14.364 15.118 15.87 16.601 17.305 18.002 18.915 19.802 20.689 21.78 22.85 23.903 25.144 26.553 27.923 29.501 31.256 33.124 35.104 37.412 40.242 43.172 46.668 50.697 55.557 61.289 68.424 77.523 89.596 100.946 108.477 113.852 117.818 120.888 123.246 125.138 126.585 127.852 128.835 129.635 130.322 130.925 131.444 131.862 132.245 132.543 132.761 132.961 133.133 133.241 133.341 133.422 133.464 133.467 133.432 133.389 133.325 133.27 133.196 133.091 133.021 132.939 132.896 132.786 132.648 132.493 132.417 131.97 132.111 131.967 131.803 131.391 131.139 130.863 130.539 130.139 129.611 128.984 126.686 -7 ,1521 ,TETRA ,17532034,Thu Nov 25 03:54:46 CET,Thu Nov 25 05:49:20 CET,0.0 2.184 2.976 3.596 4.129 4.614 5.039 5.469 6.297 6.653 6.997 7.173 7.996 8.321 8.951 9.562 10.15 10.435 11.003 11.567 12.379 12.908 13.431 14.176 14.898 15.606 16.309 17.008 17.924 18.832 19.731 20.796 21.807 22.823 24.023 25.39 26.777 28.357 30.085 31.983 34.024 36.344 39.133 42.046 45.523 49.532 54.371 60.193 67.451 76.608 88.923 100.415 107.965 113.356 117.337 120.342 122.613 124.433 125.855 127.116 128.065 128.845 129.524 130.107 130.576 130.943 131.268 131.519 131.723 131.916 132.116 132.24 132.326 132.402 132.425 132.432 132.438 132.418 132.386 132.345 132.274 132.179 132.115 132.027 131.975 131.845 131.689 131.51 131.406 130.929 131.05 130.9 130.741 130.382 130.157 129.898 129.599 129.201 128.665 127.947 121.811 -8 ,26551 ,TETRA ,17532043,Thu Nov 25 03:54:47 CET,Thu Nov 25 05:49:14 CET,0.0 3.172 3.977 4.587 5.123 5.633 6.117 6.566 7.39 7.794 8.178 8.412 9.269 9.617 10.241 10.843 11.441 11.731 12.308 12.873 13.709 14.24 14.764 15.569 16.342 17.087 17.821 18.541 19.481 20.418 21.347 22.465 23.543 24.571 25.781 27.195 28.582 30.139 31.853 33.699 35.688 37.99 40.76 43.625 47.085 51.135 56.02 61.752 68.891 78.055 90.337 101.801 109.398 114.82 118.762 121.803 124.158 126.045 127.478 128.72 129.678 130.441 131.092 131.663 132.14 132.512 132.854 133.122 133.318 133.509 133.675 133.782 133.878 133.949 133.983 134.008 134.03 134.026 134.013 134.004 133.96 133.859 133.766 133.652 133.595 133.474 133.323 133.137 133.02 132.547 132.689 132.558 132.408 132.016 131.771 131.493 131.173 130.79 130.323 129.628 125.737 -9 ,11885 ,TETRA ,17532055,Thu Nov 25 03:54:50 CET,Thu Nov 25 05:46:18 CET,0.0 2.207 3.001 3.62 4.104 4.55 4.997 5.43 6.202 6.565 6.916 7.127 7.971 8.309 8.987 9.638 10.254 10.55 11.126 11.692 12.516 13.052 13.578 14.353 15.107 15.825 16.527 17.231 18.162 19.07 19.936 20.986 22.044 23.102 24.333 25.743 27.121 28.626 30.305 32.173 34.175 36.513 39.291 42.13 45.582 49.572 54.388 60.119 67.21 76.219 88.238 99.436 106.742 111.949 115.854 118.846 121.089 122.915 124.347 125.634 126.66 127.498 128.21 128.776 129.241 129.644 130.018 130.33 130.568 130.754 130.908 131.007 131.071 131.115 131.138 131.16 131.165 131.145 131.103 131.058 131.012 130.921 130.838 130.733 130.675 130.542 130.398 130.244 130.141 129.66 129.8 129.662 129.491 129.1 128.88 128.646 128.322 127.919 127.466 126.801 123.683 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_23_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_23_62.txt deleted file mode 100644 index 7b107d36..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_23_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29127 ,TETRA ,17558675,Sat Nov 27 01:56:43 CET,Sat Nov 27 03:52:28 CET,0.0 1.237 1.713 2.093 2.385 2.63 2.876 3.117 3.512 3.685 3.863 4.001 4.324 4.473 4.744 4.996 5.244 5.364 5.583 5.78 6.068 6.256 6.432 6.668 6.907 7.138 7.361 7.566 7.808 8.048 8.282 8.579 8.858 9.111 9.411 9.74 10.033 10.338 10.687 11.062 11.412 11.788 12.219 12.638 13.098 13.565 14.065 14.562 15.027 15.391 15.52 15.248 14.803 14.294 13.802 13.315 12.852 12.435 12.053 11.61 11.234 10.888 10.505 10.154 9.87 9.605 9.325 9.068 8.828 8.58 8.312 8.089 7.872 7.652 7.477 7.295 7.094 6.87 6.648 6.511 6.366 6.125 5.962 5.793 5.706 5.52 5.325 5.1 4.962 4.66 4.588 4.462 4.328 4.001 3.813 3.609 3.383 3.137 2.872 2.519 1.815 -2 ,31424 ,TETRA ,17558676,Sat Nov 27 01:56:45 CET,Sat Nov 27 03:53:00 CET,0.0 1.393 1.929 2.282 2.576 2.834 3.051 3.248 3.618 3.795 3.974 4.155 4.477 4.612 4.88 5.145 5.38 5.492 5.7 5.897 6.193 6.381 6.565 6.83 7.09 7.34 7.568 7.777 8.051 8.317 8.567 8.869 9.146 9.408 9.72 10.067 10.381 10.714 11.055 11.402 11.782 12.193 12.657 13.096 13.568 14.069 14.618 15.166 15.669 16.068 16.234 15.988 15.476 14.874 14.342 13.885 13.441 12.995 12.607 12.207 11.842 11.523 11.195 10.858 10.565 10.314 10.054 9.82 9.605 9.363 9.094 8.867 8.633 8.385 8.199 8.009 7.811 7.615 7.415 7.275 7.119 6.854 6.674 6.497 6.405 6.209 5.997 5.778 5.668 5.382 5.31 5.18 5.046 4.738 4.558 4.376 4.201 3.98 3.683 3.223 1.345 -3 ,2109 ,TETRA ,17558677,Sat Nov 27 01:56:43 CET,Sat Nov 27 03:52:14 CET,0.0 1.337 1.843 2.155 2.403 2.631 2.852 3.071 3.462 3.628 3.781 3.907 4.231 4.379 4.661 4.925 5.177 5.307 5.542 5.764 6.108 6.322 6.524 6.81 7.069 7.317 7.559 7.791 8.078 8.335 8.585 8.896 9.178 9.442 9.74 10.052 10.354 10.694 11.064 11.444 11.831 12.231 12.662 13.082 13.599 14.196 14.763 15.32 15.866 16.265 16.399 16.094 15.59 15.067 14.591 14.086 13.593 13.169 12.792 12.386 12.019 11.688 11.374 11.048 10.693 10.369 10.061 9.78 9.542 9.299 9.031 8.781 8.514 8.27 8.094 7.898 7.695 7.487 7.279 7.13 6.959 6.677 6.484 6.291 6.193 6.005 5.792 5.561 5.442 5.145 5.071 4.94 4.811 4.514 4.33 4.122 3.91 3.662 3.336 2.929 2.039 -4 ,30360 ,TETRA ,17558678,Sat Nov 27 01:56:45 CET,Sat Nov 27 03:52:32 CET,0.0 1.242 1.671 1.955 2.201 2.449 2.683 2.871 3.185 3.345 3.507 3.636 3.946 4.085 4.356 4.608 4.833 4.942 5.164 5.366 5.648 5.837 6.024 6.272 6.512 6.748 6.959 7.169 7.445 7.706 7.959 8.281 8.616 8.942 9.292 9.66 9.997 10.35 10.73 11.109 11.475 11.889 12.362 12.828 13.347 13.884 14.425 14.944 15.46 15.88 16.02 15.706 15.229 14.692 14.088 13.511 13.031 12.603 12.204 11.789 11.422 11.107 10.827 10.544 10.245 9.97 9.688 9.421 9.2 8.974 8.742 8.545 8.332 8.113 7.933 7.744 7.566 7.387 7.196 7.051 6.895 6.661 6.498 6.333 6.244 6.059 5.863 5.641 5.518 5.22 5.141 5.014 4.88 4.579 4.42 4.24 4.036 3.809 3.531 3.159 2.353 -5 ,30437 ,TETRA ,17558679,Sat Nov 27 01:56:43 CET,Sat Nov 27 03:53:27 CET,0.0 1.142 1.605 1.908 2.139 2.354 2.574 2.78 3.127 3.29 3.456 3.624 3.943 4.078 4.347 4.596 4.839 4.954 5.159 5.373 5.67 5.837 5.994 6.217 6.446 6.683 6.9 7.099 7.35 7.598 7.837 8.106 8.358 8.622 8.917 9.214 9.51 9.854 10.208 10.536 10.862 11.244 11.692 12.144 12.607 13.058 13.583 14.084 14.516 14.821 14.946 14.691 14.216 13.657 13.09 12.508 11.987 11.542 11.158 10.751 10.386 10.064 9.762 9.47 9.192 8.925 8.637 8.371 8.133 7.909 7.687 7.477 7.242 7.011 6.839 6.66 6.466 6.24 6.004 5.85 5.684 5.416 5.228 5.032 4.937 4.766 4.587 4.39 4.278 3.978 3.894 3.754 3.61 3.285 3.083 2.874 2.635 2.348 2.008 1.534 -0.158 -6 ,25087 ,TETRA ,17558680,Sat Nov 27 01:56:45 CET,Sat Nov 27 03:53:35 CET,0.0 0.867 1.251 1.545 1.816 2.057 2.264 2.458 2.804 2.954 3.094 3.177 3.476 3.601 3.842 4.087 4.314 4.421 4.633 4.852 5.155 5.333 5.511 5.768 6.003 6.235 6.471 6.708 7.016 7.304 7.578 7.914 8.231 8.524 8.844 9.174 9.469 9.802 10.186 10.567 10.926 11.331 11.789 12.226 12.765 13.321 13.863 14.391 14.894 15.299 15.435 15.086 14.599 14.094 13.59 13.083 12.586 12.115 11.704 11.294 10.902 10.546 10.221 9.918 9.621 9.329 9.036 8.783 8.56 8.311 8.059 7.866 7.667 7.452 7.277 7.096 6.898 6.69 6.475 6.321 6.168 5.923 5.753 5.598 5.516 5.339 5.151 4.922 4.805 4.529 4.461 4.334 4.197 3.876 3.7 3.528 3.35 3.143 2.874 2.54 1.673 -7 ,9199 ,TETRA ,17558681,Sat Nov 27 01:57:42 CET,Sat Nov 27 03:56:27 CET,0.0 1.286 1.886 2.294 2.59 2.855 3.083 3.29 3.698 3.886 4.066 4.208 4.548 4.701 4.976 5.232 5.491 5.618 5.85 6.079 6.41 6.612 6.809 7.095 7.376 7.642 7.892 8.14 8.453 8.729 8.99 9.33 9.645 9.937 10.287 10.667 11.01 11.365 11.732 12.095 12.45 12.827 13.265 13.738 14.257 14.759 15.234 15.684 16.105 16.465 16.743 16.608 16.169 15.618 15.044 14.498 13.997 13.526 13.116 12.71 12.338 11.976 11.636 11.329 11.027 10.734 10.422 10.133 9.885 9.635 9.373 9.153 8.937 8.721 8.553 8.373 8.188 7.974 7.746 7.603 7.444 7.196 7.026 6.844 6.742 6.495 6.26 6.058 5.951 5.656 5.575 5.44 5.292 4.982 4.811 4.627 4.425 4.178 3.895 3.572 2.429 -8 ,8726 ,TETRA ,17558682,Sat Nov 27 01:58:41 CET,Sat Nov 27 03:54:47 CET,0.0 1.617 2.16 2.523 2.811 3.048 3.262 3.465 3.861 4.031 4.193 4.33 4.656 4.808 5.081 5.327 5.56 5.684 5.931 6.145 6.442 6.638 6.837 7.109 7.367 7.629 7.874 8.095 8.363 8.628 8.889 9.181 9.462 9.746 10.068 10.433 10.77 11.122 11.521 11.95 12.394 12.856 13.346 13.824 14.375 14.999 15.665 16.231 16.748 17.201 17.299 16.96 16.499 15.973 15.407 14.879 14.385 13.905 13.499 13.083 12.724 12.382 12.005 11.648 11.325 11.044 10.772 10.545 10.342 10.11 9.872 9.668 9.458 9.248 9.076 8.89 8.697 8.478 8.228 8.066 7.909 7.667 7.499 7.319 7.225 7.023 6.822 6.637 6.535 6.254 6.172 6.031 5.887 5.562 5.399 5.225 5.001 4.758 4.47 4.018 2.902 -9 ,26392 ,TETRA ,17558683,Sat Nov 27 01:58:40 CET,Sat Nov 27 03:54:47 CET,0.0 1.513 1.981 2.305 2.574 2.836 3.053 3.241 3.601 3.762 3.912 4.038 4.358 4.489 4.742 4.983 5.193 5.301 5.517 5.727 6.03 6.212 6.382 6.618 6.854 7.083 7.3 7.522 7.798 8.048 8.299 8.616 8.909 9.17 9.466 9.785 10.088 10.428 10.79 11.179 11.559 11.953 12.427 12.895 13.388 13.896 14.403 14.883 15.357 15.778 16.08 15.825 15.283 14.717 14.178 13.657 13.187 12.742 12.357 11.967 11.568 11.212 10.891 10.551 10.246 10.002 9.728 9.473 9.246 8.996 8.736 8.523 8.318 8.114 7.95 7.788 7.617 7.419 7.212 7.069 6.917 6.681 6.506 6.321 6.223 6.024 5.833 5.637 5.537 5.257 5.173 5.045 4.925 4.606 4.422 4.235 4.029 3.789 3.508 3.101 2.384 -10 ,18547 ,TETRA ,17558684,Sat Nov 27 01:58:41 CET,Sat Nov 27 03:57:12 CET,0.0 2.133 2.718 3.114 3.429 3.722 3.982 4.221 4.647 4.842 5.036 5.218 5.556 5.706 6.026 6.315 6.587 6.721 6.958 7.191 7.529 7.732 7.925 8.211 8.493 8.762 9.005 9.226 9.506 9.778 10.021 10.304 10.592 10.868 11.185 11.518 11.811 12.133 12.471 12.829 13.201 13.614 14.098 14.587 15.129 15.662 16.172 16.677 17.185 17.667 17.887 17.635 17.179 16.664 16.156 15.608 15.092 14.622 14.241 13.863 13.481 13.104 12.74 12.415 12.126 11.863 11.565 11.282 11.047 10.802 10.535 10.303 10.061 9.84 9.675 9.496 9.314 9.131 8.936 8.797 8.648 8.411 8.254 8.087 7.993 7.789 7.591 7.4 7.295 7.006 6.916 6.778 6.642 6.32 6.138 5.946 5.717 5.437 5.07 4.587 2.824 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_23_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_23_64.txt deleted file mode 100644 index 87197b50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_23_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3620 ,TETRA ,17558685,Sat Nov 27 01:58:41 CET,Sat Nov 27 03:57:35 CET,0.0 1.023 1.379 1.62 1.797 1.974 2.163 2.338 2.615 2.734 2.842 2.872 3.143 3.221 3.375 3.536 3.692 3.769 3.911 4.036 4.223 4.343 4.461 4.639 4.805 4.946 5.067 5.2 5.396 5.57 5.731 5.921 6.099 6.26 6.436 6.619 6.772 6.949 7.138 7.335 7.52 7.68 7.861 8.014 8.117 8.147 8.126 8.049 7.827 7.303 6.162 4.579 3.24 2.137 1.188 0.301 -0.474 -1.157 -1.744 -2.307 -2.8 -3.245 -3.667 -4.071 -4.435 -4.767 -5.116 -5.434 -5.725 -6.021 -6.322 -6.574 -6.837 -7.11 -7.301 -7.498 -7.714 -7.935 -8.163 -8.318 -8.478 -8.729 -8.896 -9.074 -9.169 -9.348 -9.542 -9.767 -9.887 -10.202 -10.265 -10.397 -10.552 -10.899 -11.092 -11.293 -11.503 -11.745 -12.045 -12.44 -13.612 -2 ,28041 ,TETRA ,17558686,Sat Nov 27 01:59:39 CET,Sat Nov 27 03:55:46 CET,0.0 1.571 2.059 2.409 2.698 2.933 3.144 3.309 3.559 3.681 3.797 3.847 4.117 4.215 4.391 4.57 4.726 4.802 4.95 5.095 5.299 5.422 5.542 5.722 5.903 6.072 6.232 6.38 6.548 6.701 6.867 7.068 7.227 7.353 7.506 7.689 7.864 8.058 8.247 8.437 8.631 8.832 9.023 9.136 9.238 9.323 9.36 9.332 9.143 8.693 7.715 6.332 5.172 4.144 3.215 2.37 1.647 0.992 0.413 -0.192 -0.716 -1.155 -1.579 -1.979 -2.361 -2.726 -3.097 -3.419 -3.696 -3.992 -4.298 -4.541 -4.789 -5.052 -5.258 -5.469 -5.703 -5.93 -6.15 -6.309 -6.47 -6.717 -6.887 -7.069 -7.166 -7.373 -7.603 -7.858 -7.98 -8.285 -8.338 -8.463 -8.591 -8.838 -8.988 -9.185 -9.388 -9.618 -9.873 -10.207 -11.396 -3 ,30249 ,TETRA ,17558687,Sat Nov 27 01:59:40 CET,Sat Nov 27 03:55:47 CET,0.0 0.971 1.259 1.479 1.669 1.813 1.942 2.099 2.413 2.547 2.66 2.712 2.983 3.085 3.276 3.449 3.614 3.695 3.854 3.998 4.194 4.309 4.421 4.576 4.718 4.847 4.969 5.101 5.267 5.43 5.59 5.751 5.893 6.035 6.21 6.407 6.579 6.76 6.924 7.075 7.239 7.419 7.596 7.731 7.842 7.925 7.989 7.949 7.756 7.282 6.187 4.726 3.413 2.251 1.25 0.359 -0.42 -1.109 -1.689 -2.285 -2.795 -3.252 -3.686 -4.085 -4.451 -4.776 -5.125 -5.442 -5.711 -6.009 -6.319 -6.56 -6.808 -7.068 -7.271 -7.486 -7.707 -7.938 -8.177 -8.329 -8.49 -8.768 -8.958 -9.151 -9.254 -9.463 -9.679 -9.901 -10.025 -10.353 -10.447 -10.583 -10.724 -11.012 -11.175 -11.348 -11.512 -11.693 -11.925 -12.197 -13.344 -4 ,22955 ,TETRA ,17558688,Sat Nov 27 01:59:39 CET,Sat Nov 27 03:55:26 CET,0.0 2.12 2.524 2.899 3.19 3.404 3.622 3.811 4.146 4.293 4.408 4.455 4.742 4.848 5.048 5.239 5.423 5.507 5.676 5.824 6.009 6.141 6.258 6.401 6.554 6.706 6.828 6.947 7.115 7.26 7.387 7.545 7.716 7.884 8.058 8.247 8.43 8.628 8.823 8.986 9.152 9.359 9.54 9.657 9.765 9.847 9.899 9.86 9.61 8.993 7.823 6.34 5.031 3.883 2.933 2.054 1.273 0.586 -0.014 -0.604 -1.095 -1.528 -1.933 -2.303 -2.654 -2.983 -3.336 -3.648 -3.916 -4.192 -4.474 -4.714 -4.967 -5.218 -5.409 -5.616 -5.832 -6.052 -6.281 -6.445 -6.621 -6.877 -7.053 -7.263 -7.371 -7.58 -7.78 -7.983 -8.091 -8.389 -8.456 -8.593 -8.743 -9.055 -9.208 -9.4 -9.628 -9.87 -10.162 -10.526 -11.658 -5 ,15926 ,TETRA ,17558689,Sat Nov 27 01:59:41 CET,Sat Nov 27 03:55:51 CET,0.0 1.238 1.601 1.882 2.135 2.333 2.51 2.671 2.946 3.071 3.199 3.256 3.529 3.633 3.827 4.032 4.237 4.327 4.498 4.656 4.866 4.992 5.105 5.275 5.448 5.603 5.74 5.871 6.033 6.188 6.346 6.539 6.703 6.841 7.011 7.191 7.336 7.496 7.691 7.885 8.055 8.237 8.434 8.59 8.759 8.875 8.901 8.877 8.669 8.14 7.079 5.676 4.447 3.392 2.448 1.57 0.809 0.126 -0.439 -0.991 -1.463 -1.872 -2.268 -2.641 -2.985 -3.31 -3.663 -3.978 -4.234 -4.501 -4.775 -4.99 -5.216 -5.453 -5.647 -5.839 -6.035 -6.249 -6.466 -6.611 -6.759 -6.986 -7.144 -7.303 -7.381 -7.564 -7.769 -7.974 -8.08 -8.362 -8.408 -8.547 -8.68 -8.942 -9.116 -9.315 -9.534 -9.745 -9.967 -10.345 -11.402 -6 ,3689 ,TETRA ,17558690,Sat Nov 27 01:59:40 CET,Sat Nov 27 03:57:32 CET,0.0 1.411 1.832 2.136 2.394 2.632 2.822 2.98 3.259 3.368 3.476 3.529 3.806 3.897 4.072 4.226 4.367 4.441 4.584 4.72 4.911 5.027 5.125 5.259 5.394 5.538 5.683 5.813 5.975 6.14 6.29 6.456 6.605 6.751 6.922 7.101 7.275 7.456 7.616 7.764 7.917 8.059 8.191 8.312 8.407 8.466 8.499 8.501 8.4 7.98 6.884 5.362 4.085 2.972 1.997 1.119 0.35 -0.332 -0.911 -1.486 -1.976 -2.434 -2.87 -3.263 -3.619 -3.942 -4.299 -4.608 -4.855 -5.12 -5.408 -5.651 -5.903 -6.154 -6.338 -6.53 -6.738 -6.953 -7.175 -7.329 -7.483 -7.724 -7.899 -8.083 -8.176 -8.38 -8.611 -8.836 -8.938 -9.221 -9.267 -9.39 -9.534 -9.867 -10.028 -10.194 -10.395 -10.63 -10.896 -11.248 -12.461 -7 ,24687 ,TETRA ,17558691,Sat Nov 27 02:00:41 CET,Sat Nov 27 03:58:11 CET,0.0 0.934 1.316 1.627 1.948 2.207 2.417 2.59 2.874 3.017 3.156 3.229 3.519 3.631 3.847 4.037 4.208 4.293 4.435 4.581 4.81 4.949 5.079 5.264 5.438 5.605 5.767 5.918 6.088 6.241 6.38 6.545 6.699 6.833 6.982 7.124 7.255 7.413 7.565 7.709 7.839 7.981 8.172 8.338 8.503 8.637 8.682 8.61 8.406 7.933 6.832 5.337 4.021 2.876 1.901 1.051 0.283 -0.408 -1.001 -1.599 -2.103 -2.545 -2.963 -3.361 -3.726 -4.051 -4.384 -4.676 -4.946 -5.238 -5.537 -5.789 -6.054 -6.325 -6.534 -6.74 -6.956 -7.179 -7.404 -7.558 -7.722 -7.981 -8.152 -8.335 -8.433 -8.643 -8.839 -9.049 -9.172 -9.485 -9.565 -9.71 -9.858 -10.164 -10.336 -10.528 -10.736 -10.967 -11.272 -11.688 -12.829 -8 ,10924 ,TETRA ,17558692,Sat Nov 27 02:00:41 CET,Sat Nov 27 03:56:29 CET,0.0 0.974 1.313 1.569 1.756 1.935 2.126 2.315 2.662 2.8 2.909 2.928 3.194 3.289 3.474 3.665 3.834 3.918 4.078 4.218 4.419 4.548 4.666 4.821 4.962 5.112 5.267 5.405 5.571 5.723 5.872 6.044 6.21 6.361 6.506 6.67 6.84 7.016 7.19 7.382 7.579 7.761 7.932 8.082 8.224 8.31 8.3 8.202 8.008 7.509 6.365 4.826 3.533 2.429 1.431 0.535 -0.238 -0.937 -1.536 -2.126 -2.633 -3.062 -3.457 -3.844 -4.213 -4.55 -4.893 -5.203 -5.475 -5.741 -5.999 -6.22 -6.46 -6.709 -6.907 -7.103 -7.3 -7.513 -7.731 -7.878 -8.038 -8.293 -8.461 -8.625 -8.708 -8.891 -9.075 -9.265 -9.371 -9.673 -9.75 -9.883 -10.01 -10.261 -10.398 -10.561 -10.788 -11.032 -11.317 -11.743 -12.741 -9 ,25748 ,TETRA ,17558693,Sat Nov 27 02:01:44 CET,Sat Nov 27 03:48:45 CET,0.0 1.451 1.864 2.206 2.508 2.747 2.951 3.121 3.424 3.554 3.666 3.705 3.992 4.098 4.288 4.479 4.651 4.738 4.903 5.055 5.265 5.393 5.522 5.685 5.83 5.992 6.142 6.269 6.432 6.593 6.735 6.903 7.066 7.22 7.408 7.597 7.752 7.908 8.077 8.264 8.442 8.623 8.799 8.963 9.136 9.243 9.31 9.289 9.072 8.57 7.472 6.018 4.74 3.65 2.734 1.895 1.137 0.452 -0.145 -0.741 -1.241 -1.692 -2.113 -2.506 -2.883 -3.229 -3.583 -3.895 -4.156 -4.43 -4.712 -4.931 -5.161 -5.422 -5.629 -5.839 -6.064 -6.3 -6.547 -6.718 -6.894 -7.157 -7.343 -7.525 -7.611 -7.801 -8.011 -8.229 -8.342 -8.645 -8.672 -8.785 -8.92 -9.242 -9.428 -9.622 -9.808 -10.025 -10.29 -10.684 -11.993 -10 ,14897 ,TETRA ,17558694,Sat Nov 27 02:01:43 CET,Sat Nov 27 03:59:00 CET,0.0 1.415 1.799 2.109 2.353 2.524 2.678 2.839 3.117 3.242 3.369 3.435 3.716 3.815 4.002 4.192 4.369 4.446 4.591 4.728 4.925 5.053 5.178 5.351 5.511 5.66 5.797 5.922 6.087 6.241 6.381 6.56 6.742 6.902 7.063 7.227 7.396 7.595 7.789 7.955 8.096 8.262 8.454 8.64 8.814 8.954 9.055 9.057 8.908 8.455 7.404 5.883 4.544 3.41 2.414 1.524 0.751 0.033 -0.59 -1.201 -1.717 -2.164 -2.585 -2.975 -3.339 -3.669 -3.998 -4.292 -4.543 -4.812 -5.112 -5.354 -5.591 -5.832 -6.032 -6.237 -6.441 -6.655 -6.901 -7.076 -7.236 -7.483 -7.662 -7.855 -7.954 -8.151 -8.351 -8.564 -8.682 -8.995 -9.056 -9.182 -9.308 -9.58 -9.729 -9.892 -10.065 -10.269 -10.546 -10.95 -12.02 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_23_66.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_23_66.txt deleted file mode 100644 index 459af384..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_23_66.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20929 ,KEBNE ,17024705,Wed Dec 22 10:48:00 CET,Wed Dec 22 12:27:57 CET,0.0 1.01 1.36 1.705 1.979 2.167 2.332 2.477 2.715 2.826 2.933 2.957 3.213 3.296 3.447 3.592 3.75 3.828 3.968 4.098 4.307 4.453 4.585 4.757 4.926 5.089 5.24 5.385 5.567 5.75 5.925 6.114 6.286 6.463 6.68 6.913 7.122 7.349 7.594 7.843 8.074 8.296 8.541 8.779 9.042 9.296 9.533 9.73 9.87 9.906 9.588 8.846 8.027 7.23 6.523 5.891 5.349 4.83 4.334 3.828 3.414 3.04 2.655 2.264 1.925 1.639 1.329 1.059 0.831 0.59 0.336 0.134 -0.085 -0.312 -0.482 -0.659 -0.845 -1.035 -1.229 -1.38 -1.552 -1.802 -1.975 -2.183 -2.285 -2.477 -2.689 -2.908 -3.014 -3.319 -3.427 -3.577 -3.725 -4.042 -4.206 -4.406 -4.633 -4.857 -5.158 -5.583 -6.955 -2 ,31922 ,KEBNE ,17024706,Wed Dec 22 10:48:00 CET,Wed Dec 22 12:27:55 CET,0.0 0.957 1.254 1.492 1.719 1.916 2.084 2.234 2.505 2.629 2.732 2.765 3.025 3.113 3.289 3.448 3.579 3.642 3.775 3.904 4.124 4.267 4.396 4.582 4.748 4.911 5.066 5.219 5.418 5.6 5.766 5.951 6.121 6.288 6.483 6.686 6.889 7.106 7.331 7.588 7.842 8.088 8.36 8.61 8.868 9.129 9.412 9.687 9.875 9.891 9.528 8.839 8.082 7.319 6.604 5.957 5.4 4.873 4.408 3.925 3.501 3.132 2.773 2.425 2.121 1.865 1.595 1.331 1.098 0.877 0.632 0.432 0.237 0.038 -0.128 -0.317 -0.504 -0.696 -0.903 -1.05 -1.206 -1.429 -1.565 -1.721 -1.809 -1.987 -2.167 -2.361 -2.467 -2.75 -2.781 -2.896 -3.03 -3.314 -3.458 -3.6 -3.762 -3.952 -4.162 -4.442 -5.03 -3 ,20356 ,KEBNE ,17024707,Wed Dec 22 10:49:04 CET,Wed Dec 22 12:29:03 CET,0.0 0.941 1.197 1.415 1.627 1.82 2.003 2.159 2.421 2.541 2.653 2.695 2.967 3.057 3.233 3.408 3.574 3.655 3.808 3.955 4.146 4.266 4.385 4.544 4.691 4.83 4.968 5.121 5.325 5.517 5.685 5.865 6.043 6.226 6.43 6.65 6.862 7.087 7.318 7.556 7.786 8.026 8.292 8.545 8.826 9.092 9.325 9.532 9.687 9.669 9.291 8.497 7.641 6.843 6.138 5.496 4.924 4.414 3.948 3.442 3.003 2.641 2.311 1.988 1.671 1.37 1.057 0.791 0.572 0.344 0.1 -0.095 -0.295 -0.503 -0.67 -0.846 -1.028 -1.23 -1.439 -1.586 -1.747 -1.998 -2.171 -2.352 -2.443 -2.619 -2.8 -2.989 -3.081 -3.352 -3.384 -3.497 -3.623 -3.897 -4.048 -4.213 -4.415 -4.672 -4.981 -5.384 -6.771 -4 ,6621 ,KEBNE ,17024709,Wed Dec 22 10:49:04 CET,Wed Dec 22 12:29:02 CET,0.0 0.78 1.089 1.293 1.468 1.644 1.807 1.946 2.258 2.411 2.529 2.599 2.907 3.025 3.236 3.429 3.59 3.663 3.813 3.972 4.194 4.325 4.451 4.644 4.841 5.027 5.216 5.394 5.607 5.816 6.021 6.254 6.456 6.644 6.869 7.108 7.314 7.531 7.776 8.036 8.277 8.525 8.806 9.072 9.353 9.616 9.862 10.085 10.238 10.228 9.878 9.145 8.353 7.588 6.912 6.266 5.675 5.149 4.699 4.244 3.846 3.498 3.156 2.814 2.481 2.182 1.896 1.645 1.427 1.192 0.927 0.708 0.489 0.275 0.109 -0.065 -0.249 -0.436 -0.626 -0.752 -0.887 -1.113 -1.276 -1.44 -1.522 -1.701 -1.889 -2.076 -2.176 -2.465 -2.555 -2.695 -2.827 -3.125 -3.29 -3.459 -3.627 -3.816 -4.067 -4.444 -5.467 -5 ,13132 ,KEBNE ,17024710,Wed Dec 22 10:49:03 CET,Wed Dec 22 12:28:06 CET,0.0 1.059 1.345 1.598 1.832 2.021 2.183 2.333 2.607 2.727 2.835 2.866 3.147 3.254 3.463 3.668 3.855 3.938 4.086 4.225 4.418 4.541 4.668 4.85 5.022 5.188 5.339 5.479 5.664 5.838 6.002 6.197 6.381 6.556 6.745 6.95 7.165 7.405 7.646 7.903 8.164 8.416 8.656 8.89 9.158 9.444 9.744 9.984 10.145 10.143 9.716 8.908 8.122 7.333 6.641 6.021 5.423 4.897 4.453 3.968 3.551 3.184 2.843 2.518 2.208 1.927 1.621 1.349 1.127 0.889 0.606 0.364 0.118 -0.12 -0.3 -0.497 -0.692 -0.889 -1.112 -1.262 -1.411 -1.642 -1.807 -1.984 -2.075 -2.263 -2.45 -2.649 -2.756 -3.042 -3.096 -3.223 -3.367 -3.703 -3.894 -4.099 -4.306 -4.524 -4.803 -5.2 -6.512 -6 ,25211 ,KEBNE ,17024711,Wed Dec 22 10:49:04 CET,Wed Dec 22 12:29:15 CET,0.0 0.646 0.965 1.213 1.429 1.612 1.746 1.885 2.141 2.254 2.368 2.395 2.667 2.766 2.929 3.087 3.252 3.333 3.482 3.609 3.799 3.921 4.041 4.229 4.398 4.552 4.702 4.85 5.027 5.19 5.351 5.548 5.736 5.907 6.106 6.324 6.529 6.745 6.97 7.222 7.476 7.719 7.984 8.246 8.505 8.785 9.069 9.296 9.471 9.524 9.277 8.624 7.854 7.147 6.508 5.871 5.316 4.827 4.4 3.951 3.545 3.194 2.822 2.468 2.159 1.851 1.544 1.289 1.063 0.827 0.57 0.352 0.132 -0.092 -0.277 -0.471 -0.663 -0.868 -1.088 -1.235 -1.386 -1.632 -1.806 -1.989 -2.076 -2.243 -2.425 -2.632 -2.743 -3.032 -3.073 -3.198 -3.33 -3.607 -3.768 -3.936 -4.119 -4.333 -4.588 -4.916 -6.048 -7 ,12638 ,KEBNE ,17024712,Wed Dec 22 10:50:05 CET,Wed Dec 22 12:29:30 CET,0.0 1.853 2.189 2.505 2.756 2.947 3.103 3.241 3.499 3.615 3.733 3.785 4.057 4.153 4.347 4.519 4.665 4.731 4.86 4.989 5.174 5.303 5.431 5.612 5.792 5.956 6.107 6.253 6.439 6.625 6.803 7.009 7.192 7.353 7.546 7.774 7.998 8.237 8.482 8.707 8.927 9.163 9.434 9.703 9.972 10.246 10.51 10.766 10.94 10.894 10.485 9.687 8.903 8.179 7.505 6.882 6.333 5.808 5.347 4.869 4.455 4.083 3.722 3.384 3.065 2.782 2.493 2.24 2.013 1.781 1.559 1.363 1.152 0.93 0.755 0.578 0.389 0.192 -0.008 -0.146 -0.291 -0.518 -0.674 -0.833 -0.917 -1.102 -1.292 -1.493 -1.598 -1.881 -1.939 -2.062 -2.195 -2.519 -2.686 -2.844 -3.037 -3.269 -3.571 -4.025 -5.148 -8 ,15077 ,KEBNE ,17024713,Wed Dec 22 10:50:09 CET,Wed Dec 22 12:25:29 CET,0.0 0.922 1.248 1.542 1.773 1.941 2.106 2.262 2.546 2.683 2.797 2.838 3.103 3.196 3.375 3.547 3.715 3.795 3.955 4.101 4.305 4.437 4.551 4.702 4.841 4.995 5.158 5.301 5.476 5.657 5.836 6.042 6.238 6.409 6.602 6.826 7.033 7.254 7.497 7.751 7.993 8.231 8.49 8.747 9.026 9.306 9.567 9.813 10.01 10.1 9.861 9.132 8.336 7.583 6.934 6.324 5.784 5.295 4.857 4.408 4.019 3.664 3.32 2.997 2.691 2.417 2.134 1.872 1.642 1.4 1.154 0.952 0.743 0.532 0.35 0.157 -0.025 -0.219 -0.432 -0.578 -0.727 -0.957 -1.128 -1.304 -1.39 -1.578 -1.771 -1.95 -2.05 -2.349 -2.433 -2.572 -2.716 -2.991 -3.147 -3.321 -3.54 -3.804 -4.07 -4.447 -5.499 -9 ,2327 ,KEBNE ,17024714,Wed Dec 22 10:50:09 CET,Wed Dec 22 12:25:01 CET,0.0 0.708 1.055 1.332 1.573 1.768 1.925 2.056 2.271 2.382 2.488 2.51 2.774 2.874 3.085 3.279 3.439 3.519 3.673 3.812 4.021 4.151 4.28 4.481 4.662 4.821 4.972 5.116 5.295 5.463 5.623 5.823 6.016 6.192 6.397 6.634 6.856 7.084 7.322 7.588 7.868 8.145 8.42 8.676 8.947 9.209 9.481 9.72 9.904 9.979 9.691 9.026 8.305 7.617 6.951 6.297 5.719 5.175 4.692 4.192 3.745 3.353 2.987 2.639 2.327 2.054 1.765 1.501 1.267 1.019 0.758 0.546 0.335 0.107 -0.092 -0.31 -0.532 -0.74 -0.934 -1.074 -1.232 -1.477 -1.639 -1.816 -1.907 -2.09 -2.287 -2.5 -2.605 -2.883 -2.916 -3.026 -3.143 -3.427 -3.577 -3.745 -3.967 -4.2 -4.438 -4.76 -5.765 -10 ,21367 ,KEBNE ,17024715,Wed Dec 22 10:51:07 CET,Wed Dec 22 12:30:24 CET,0.0 1.041 1.427 1.757 2.046 2.291 2.516 2.725 3.085 3.247 3.39 3.489 3.792 3.919 4.177 4.417 4.638 4.741 4.924 5.092 5.317 5.443 5.569 5.755 5.919 6.078 6.232 6.382 6.566 6.736 6.893 7.075 7.249 7.425 7.625 7.832 8.032 8.248 8.468 8.704 8.948 9.199 9.475 9.746 10.036 10.332 10.648 10.917 11.091 11.068 10.703 9.903 9.088 8.381 7.701 7.036 6.458 5.946 5.482 4.993 4.581 4.194 3.769 3.398 3.102 2.832 2.546 2.286 2.06 1.825 1.581 1.37 1.149 0.935 0.775 0.6 0.407 0.216 0.019 -0.129 -0.285 -0.51 -0.674 -0.844 -0.922 -1.095 -1.278 -1.46 -1.557 -1.833 -1.888 -2.01 -2.133 -2.439 -2.596 -2.734 -2.895 -3.116 -3.415 -3.764 -4.924 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_26_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_26_23.txt deleted file mode 100644 index ec5824c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_26_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29093 ,KEBNE ,17024716,Wed Dec 22 10:51:07 CET,Wed Dec 22 12:32:11 CET,0.0 0.705 1.029 1.261 1.485 1.683 1.839 1.973 2.237 2.366 2.481 2.54 2.773 2.862 3.014 3.155 3.29 3.348 3.458 3.571 3.734 3.821 3.9 4.013 4.104 4.187 4.286 4.382 4.484 4.569 4.65 4.74 4.82 4.878 4.935 5.006 5.056 5.087 5.094 5.096 5.084 5.054 4.989 4.846 4.606 4.257 3.73 2.996 1.925 0.282 -2.35 -5.422 -7.898 -9.964 -11.687 -13.18 -14.432 -15.545 -16.505 -17.435 -18.205 -18.883 -19.537 -20.141 -20.683 -21.179 -21.706 -22.165 -22.545 -22.936 -23.329 -23.666 -24.026 -24.41 -24.736 -25.069 -25.406 -25.759 -26.112 -26.352 -26.594 -26.987 -27.276 -27.57 -27.719 -28.034 -28.37 -28.724 -28.91 -29.274 -29.505 -29.714 -29.924 -30.363 -30.592 -30.841 -31.13 -31.481 -31.9 -32.427 -34.429 -2 ,21916 ,KEBNE ,17024717,Wed Dec 22 10:51:07 CET,Wed Dec 22 12:32:39 CET,0.0 1.023 1.395 1.685 1.93 2.136 2.335 2.529 2.844 2.97 3.089 3.166 3.405 3.504 3.683 3.847 3.991 4.054 4.17 4.267 4.399 4.484 4.569 4.706 4.831 4.952 5.066 5.15 5.253 5.346 5.429 5.526 5.602 5.67 5.728 5.779 5.827 5.868 5.908 5.936 5.928 5.873 5.757 5.578 5.32 4.978 4.5 3.848 2.827 1.245 -1.353 -4.501 -7.021 -9.083 -10.847 -12.373 -13.652 -14.781 -15.721 -16.639 -17.431 -18.137 -18.811 -19.449 -20.039 -20.541 -21.039 -21.502 -21.905 -22.321 -22.746 -23.09 -23.447 -23.808 -24.087 -24.376 -24.675 -24.982 -25.318 -25.55 -25.771 -26.115 -26.357 -26.611 -26.742 -27.007 -27.288 -27.588 -27.742 -28.07 -28.244 -28.43 -28.629 -29.065 -29.293 -29.511 -29.744 -30.052 -30.466 -31.007 -32.934 -3 ,31224 ,KEBNE ,17024718,Wed Dec 22 10:51:07 CET,Wed Dec 22 12:33:21 CET,0.0 0.965 1.332 1.585 1.779 1.955 2.124 2.268 2.537 2.664 2.791 2.872 3.097 3.177 3.336 3.491 3.622 3.677 3.784 3.9 4.069 4.157 4.23 4.339 4.438 4.527 4.632 4.744 4.861 4.956 5.042 5.121 5.2 5.277 5.353 5.438 5.497 5.545 5.582 5.59 5.558 5.495 5.392 5.223 4.968 4.64 4.19 3.537 2.577 1.042 -1.664 -4.798 -7.249 -9.306 -11.04 -12.512 -13.744 -14.815 -15.708 -16.579 -17.312 -17.959 -18.584 -19.165 -19.692 -20.175 -20.691 -21.142 -21.523 -21.921 -22.33 -22.674 -23.045 -23.429 -23.723 -24.024 -24.339 -24.666 -24.996 -25.227 -25.455 -25.806 -26.068 -26.347 -26.479 -26.729 -26.989 -27.267 -27.42 -27.751 -27.898 -28.079 -28.278 -28.736 -29.006 -29.271 -29.542 -29.842 -30.202 -30.649 -31.852 -4 ,14698 ,KEBNE ,17024719,Wed Dec 22 10:51:11 CET,Wed Dec 22 12:27:56 CET,0.0 0.844 1.203 1.471 1.723 1.955 2.152 2.327 2.623 2.751 2.863 2.925 3.164 3.261 3.445 3.614 3.752 3.813 3.934 4.059 4.233 4.33 4.422 4.537 4.626 4.716 4.813 4.904 5.015 5.103 5.18 5.291 5.379 5.44 5.502 5.553 5.598 5.631 5.659 5.694 5.702 5.674 5.581 5.434 5.197 4.827 4.318 3.648 2.599 0.945 -1.749 -4.88 -7.356 -9.389 -11.077 -12.567 -13.846 -14.938 -15.864 -16.786 -17.575 -18.279 -18.921 -19.511 -20.059 -20.538 -21.025 -21.473 -21.873 -22.286 -22.706 -23.047 -23.398 -23.76 -24.042 -24.337 -24.633 -24.938 -25.26 -25.473 -25.707 -26.108 -26.382 -26.664 -26.807 -27.071 -27.32 -27.575 -27.699 -28.006 -28.136 -28.279 -28.425 -28.757 -28.936 -29.131 -29.369 -29.622 -29.923 -30.335 -32.637 -5 ,21210 ,KEBNE ,17024720,Wed Dec 22 10:51:07 CET,Wed Dec 22 12:32:28 CET,0.0 1.149 1.596 1.967 2.257 2.479 2.664 2.815 3.066 3.175 3.276 3.347 3.587 3.687 3.877 4.039 4.2 4.276 4.401 4.519 4.676 4.77 4.854 4.965 5.068 5.17 5.275 5.361 5.452 5.545 5.63 5.715 5.802 5.877 5.942 6.009 6.054 6.075 6.083 6.074 6.036 5.963 5.851 5.713 5.509 5.201 4.697 3.987 2.962 1.361 -1.312 -4.45 -6.962 -9.004 -10.682 -12.105 -13.31 -14.406 -15.345 -16.286 -17.064 -17.735 -18.381 -18.982 -19.539 -20.022 -20.51 -20.952 -21.351 -21.764 -22.177 -22.531 -22.896 -23.251 -23.524 -23.813 -24.113 -24.428 -24.777 -25.031 -25.285 -25.665 -25.916 -26.176 -26.306 -26.571 -26.853 -27.136 -27.283 -27.598 -27.733 -27.912 -28.112 -28.559 -28.813 -29.095 -29.418 -29.777 -30.148 -30.631 -32.86 -6 ,22622 ,KEBNE ,17024721,Wed Dec 22 10:51:07 CET,Wed Dec 22 12:32:15 CET,0.0 0.442 0.802 1.142 1.405 1.614 1.789 1.949 2.241 2.366 2.478 2.53 2.75 2.832 2.991 3.139 3.286 3.353 3.482 3.59 3.726 3.824 3.917 4.043 4.151 4.247 4.342 4.427 4.53 4.632 4.707 4.773 4.856 4.934 4.995 5.068 5.122 5.153 5.188 5.189 5.168 5.121 5.013 4.881 4.661 4.331 3.836 3.074 1.969 0.328 -2.382 -5.561 -8.088 -10.149 -11.887 -13.365 -14.612 -15.728 -16.664 -17.575 -18.367 -19.069 -19.705 -20.294 -20.841 -21.337 -21.853 -22.311 -22.715 -23.139 -23.564 -23.91 -24.265 -24.628 -24.91 -25.201 -25.494 -25.797 -26.125 -26.353 -26.585 -26.941 -27.19 -27.46 -27.596 -27.872 -28.159 -28.452 -28.607 -28.954 -29.128 -29.31 -29.507 -29.916 -30.138 -30.381 -30.637 -30.895 -31.229 -31.683 -33.108 -7 ,17612 ,KEBNE ,17024722,Wed Dec 22 10:51:08 CET,Wed Dec 22 12:27:35 CET,0.0 1.095 1.48 1.757 1.965 2.162 2.345 2.508 2.801 2.931 3.052 3.143 3.393 3.487 3.655 3.819 3.971 4.045 4.191 4.322 4.497 4.609 4.713 4.847 4.964 5.065 5.152 5.222 5.304 5.391 5.466 5.54 5.607 5.671 5.73 5.778 5.821 5.855 5.88 5.896 5.868 5.814 5.715 5.561 5.325 4.973 4.454 3.699 2.603 0.93 -1.725 -4.796 -7.312 -9.41 -11.145 -12.638 -13.939 -15.088 -16.035 -16.946 -17.705 -18.382 -19.058 -19.697 -20.284 -20.801 -21.332 -21.804 -22.198 -22.597 -23.016 -23.38 -23.773 -24.166 -24.447 -24.722 -25.007 -25.307 -25.622 -25.855 -26.098 -26.456 -26.697 -26.953 -27.087 -27.372 -27.678 -27.99 -28.151 -28.483 -28.651 -28.836 -29.039 -29.454 -29.679 -29.933 -30.219 -30.541 -30.902 -31.362 -32.307 -8 ,29293 ,KEBNE ,17024723,Wed Dec 22 10:51:11 CET,Wed Dec 22 12:28:08 CET,0.0 0.844 1.22 1.516 1.762 1.964 2.132 2.298 2.623 2.755 2.863 2.931 3.169 3.267 3.443 3.601 3.742 3.806 3.931 4.048 4.212 4.315 4.417 4.558 4.68 4.792 4.882 4.967 5.078 5.174 5.257 5.354 5.439 5.503 5.566 5.622 5.66 5.698 5.734 5.743 5.722 5.655 5.566 5.442 5.227 4.927 4.43 3.733 2.703 1.033 -1.787 -4.979 -7.413 -9.376 -11.038 -12.503 -13.76 -14.874 -15.857 -16.812 -17.597 -18.312 -18.996 -19.652 -20.283 -20.831 -21.358 -21.811 -22.185 -22.573 -22.99 -23.347 -23.703 -24.057 -24.334 -24.618 -24.917 -25.227 -25.544 -25.766 -26.002 -26.377 -26.628 -26.884 -27.01 -27.282 -27.575 -27.87 -28.025 -28.369 -28.549 -28.734 -28.932 -29.38 -29.62 -29.87 -30.14 -30.431 -30.785 -31.315 -32.702 -9 ,7577 ,KEBNE ,17024724,Wed Dec 22 10:52:09 CET,Wed Dec 22 12:33:09 CET,0.0 0.763 1.178 1.502 1.768 1.983 2.177 2.349 2.655 2.784 2.888 2.928 3.155 3.24 3.402 3.534 3.642 3.699 3.798 3.895 4.049 4.151 4.246 4.368 4.473 4.574 4.672 4.75 4.846 4.938 5.02 5.12 5.229 5.323 5.379 5.431 5.489 5.523 5.53 5.523 5.484 5.39 5.263 5.119 4.915 4.574 4.04 3.308 2.206 0.583 -2.059 -5.173 -7.665 -9.66 -11.312 -12.737 -13.925 -14.998 -15.898 -16.78 -17.545 -18.217 -18.856 -19.424 -19.95 -20.454 -20.964 -21.398 -21.773 -22.175 -22.577 -22.896 -23.246 -23.635 -23.929 -24.212 -24.525 -24.866 -25.196 -25.417 -25.64 -25.986 -26.233 -26.486 -26.61 -26.871 -27.171 -27.5 -27.669 -28.024 -28.232 -28.434 -28.651 -29.104 -29.323 -29.542 -29.789 -30.071 -30.395 -30.765 -32.039 -10 ,24265 ,KEBNE ,17024725,Wed Dec 22 10:52:09 CET,Wed Dec 22 12:33:31 CET,0.0 1.121 1.525 1.821 2.06 2.244 2.415 2.571 2.834 2.956 3.063 3.127 3.369 3.462 3.632 3.794 3.936 4.007 4.137 4.238 4.37 4.461 4.55 4.661 4.761 4.856 4.939 5.019 5.12 5.207 5.288 5.368 5.432 5.504 5.578 5.648 5.706 5.737 5.731 5.704 5.677 5.619 5.507 5.337 5.093 4.774 4.254 3.5 2.422 0.762 -1.991 -5.142 -7.655 -9.744 -11.457 -12.93 -14.172 -15.247 -16.163 -17.074 -17.851 -18.523 -19.15 -19.735 -20.282 -20.781 -21.294 -21.754 -22.131 -22.508 -22.909 -23.251 -23.608 -23.977 -24.262 -24.553 -24.846 -25.146 -25.46 -25.67 -25.882 -26.228 -26.477 -26.731 -26.856 -27.103 -27.374 -27.657 -27.802 -28.124 -28.283 -28.469 -28.678 -29.138 -29.391 -29.675 -30.01 -30.399 -30.847 -31.392 -33.136 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_26_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_26_57.txt deleted file mode 100644 index cc0264d6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_26_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31372 ,TETRA ,17558695,Sat Nov 27 02:02:47 CET,Sat Nov 27 03:49:47 CET,0.0 1.468 1.914 2.242 2.535 2.779 2.971 3.153 3.48 3.623 3.749 3.85 4.103 4.199 4.372 4.554 4.725 4.803 4.95 5.078 5.257 5.384 5.505 5.659 5.804 5.939 6.062 6.188 6.328 6.453 6.566 6.689 6.813 6.925 7.037 7.127 7.217 7.338 7.443 7.531 7.596 7.628 7.619 7.529 7.373 7.17 6.824 6.29 5.463 4.06 1.643 -1.133 -3.357 -5.249 -6.865 -8.274 -9.473 -10.556 -11.487 -12.38 -13.133 -13.814 -14.467 -15.066 -15.61 -16.083 -16.578 -17.034 -17.415 -17.8 -18.197 -18.528 -18.878 -19.246 -19.538 -19.849 -20.161 -20.468 -20.781 -21.006 -21.235 -21.567 -21.798 -22.036 -22.155 -22.418 -22.699 -22.967 -23.1 -23.425 -23.582 -23.746 -23.918 -24.301 -24.514 -24.73 -24.947 -25.21 -25.567 -25.984 -26.908 -2 ,442 ,TETRA ,17558696,Sat Nov 27 02:03:47 CET,Sat Nov 27 03:51:59 CET,0.0 1.385 1.818 2.129 2.38 2.603 2.826 3.029 3.374 3.538 3.704 3.851 4.109 4.216 4.422 4.617 4.787 4.862 5.015 5.175 5.389 5.507 5.627 5.808 5.948 6.095 6.234 6.35 6.487 6.607 6.728 6.878 7.01 7.114 7.239 7.372 7.473 7.572 7.681 7.798 7.897 7.957 7.958 7.935 7.858 7.688 7.373 6.864 6.033 4.664 2.382 -0.266 -2.441 -4.324 -5.946 -7.396 -8.629 -9.703 -10.63 -11.558 -12.33 -12.981 -13.59 -14.174 -14.72 -15.216 -15.734 -16.182 -16.57 -16.976 -17.375 -17.694 -18.028 -18.371 -18.639 -18.934 -19.267 -19.618 -19.958 -20.184 -20.421 -20.8 -21.061 -21.307 -21.43 -21.685 -21.946 -22.222 -22.368 -22.694 -22.854 -23.035 -23.216 -23.588 -23.792 -24.022 -24.293 -24.585 -24.91 -25.314 -26.614 -3 ,10338 ,TETRA ,17558697,Sat Nov 27 02:03:47 CET,Sat Nov 27 04:07:58 CET,0.0 1.055 1.491 1.821 2.063 2.286 2.49 2.665 2.992 3.14 3.276 3.418 3.691 3.809 4.031 4.228 4.388 4.464 4.615 4.736 4.927 5.057 5.173 5.333 5.478 5.612 5.741 5.868 6.016 6.156 6.299 6.464 6.603 6.727 6.875 7.023 7.133 7.22 7.287 7.35 7.395 7.436 7.463 7.426 7.284 7.062 6.742 6.286 5.488 4.102 1.884 -0.79 -3.025 -4.889 -6.452 -7.797 -8.958 -10.061 -11.051 -11.982 -12.757 -13.452 -14.123 -14.758 -15.348 -15.885 -16.433 -16.92 -17.345 -17.763 -18.161 -18.493 -18.841 -19.206 -19.496 -19.789 -20.087 -20.401 -20.715 -20.933 -21.167 -21.532 -21.776 -22.036 -22.172 -22.432 -22.704 -23.018 -23.189 -23.542 -23.69 -23.856 -24.031 -24.393 -24.598 -24.819 -25.036 -25.267 -25.571 -25.986 -27.31 -4 ,19588 ,TETRA ,17558698,Sat Nov 27 02:04:49 CET,Sat Nov 27 04:03:57 CET,0.0 1.525 1.962 2.295 2.565 2.787 2.992 3.174 3.478 3.614 3.748 3.855 4.119 4.235 4.434 4.615 4.798 4.889 5.044 5.175 5.359 5.474 5.59 5.743 5.881 6.025 6.162 6.302 6.463 6.611 6.763 6.919 7.061 7.191 7.315 7.454 7.586 7.71 7.83 7.915 7.956 7.987 8.021 8.026 7.917 7.712 7.424 6.971 6.211 4.94 2.758 -0.01 -2.348 -4.279 -5.854 -7.237 -8.437 -9.466 -10.359 -11.269 -12.025 -12.668 -13.28 -13.857 -14.409 -14.934 -15.481 -15.985 -16.4 -16.808 -17.217 -17.555 -17.912 -18.264 -18.539 -18.846 -19.155 -19.442 -19.75 -19.965 -20.191 -20.539 -20.769 -21.004 -21.125 -21.383 -21.644 -21.911 -22.062 -22.408 -22.594 -22.788 -22.997 -23.426 -23.647 -23.892 -24.152 -24.43 -24.771 -25.186 -26.565 -5 ,15153 ,TETRA ,17558699,Sat Nov 27 02:04:48 CET,Sat Nov 27 04:04:18 CET,0.0 1.194 1.554 1.788 2.0 2.207 2.397 2.582 2.916 3.074 3.213 3.306 3.55 3.648 3.825 3.998 4.159 4.23 4.366 4.5 4.707 4.832 4.953 5.149 5.318 5.456 5.594 5.731 5.879 6.0 6.103 6.218 6.338 6.454 6.57 6.675 6.756 6.842 6.921 6.985 7.049 7.073 7.033 6.945 6.796 6.608 6.322 5.789 4.874 3.449 1.054 -1.694 -3.843 -5.647 -7.185 -8.528 -9.67 -10.689 -11.594 -12.503 -13.239 -13.897 -14.573 -15.221 -15.796 -16.314 -16.86 -17.335 -17.75 -18.199 -18.651 -19.013 -19.378 -19.747 -20.029 -20.334 -20.644 -20.951 -21.271 -21.48 -21.691 -22.04 -22.285 -22.554 -22.696 -22.984 -23.288 -23.59 -23.735 -24.057 -24.184 -24.339 -24.51 -24.897 -25.118 -25.343 -25.568 -25.813 -26.082 -26.448 -27.691 -6 ,15421 ,TETRA ,17558700,Sat Nov 27 02:04:51 CET,Sat Nov 27 04:03:47 CET,0.0 1.112 1.523 1.863 2.155 2.393 2.621 2.811 3.128 3.289 3.437 3.548 3.821 3.937 4.144 4.337 4.51 4.586 4.75 4.906 5.104 5.237 5.365 5.535 5.671 5.794 5.922 6.04 6.17 6.305 6.439 6.6 6.737 6.84 6.924 7.017 7.127 7.217 7.308 7.395 7.458 7.523 7.541 7.523 7.489 7.369 7.061 6.497 5.627 4.308 2.084 -0.642 -2.842 -4.691 -6.251 -7.614 -8.819 -9.884 -10.813 -11.749 -12.533 -13.212 -13.841 -14.42 -14.945 -15.41 -15.889 -16.328 -16.741 -17.188 -17.636 -18.002 -18.386 -18.77 -19.046 -19.336 -19.642 -19.963 -20.288 -20.501 -20.717 -21.045 -21.275 -21.508 -21.63 -21.88 -22.133 -22.4 -22.54 -22.857 -23.044 -23.228 -23.39 -23.726 -23.911 -24.115 -24.341 -24.571 -24.849 -25.236 -26.358 -7 ,27875 ,TETRA ,17558701,Sat Nov 27 02:04:48 CET,Sat Nov 27 04:07:53 CET,0.0 1.853 2.373 2.724 3.0 3.262 3.502 3.688 4.014 4.156 4.289 4.404 4.662 4.766 4.964 5.155 5.318 5.383 5.495 5.621 5.822 5.937 6.034 6.178 6.326 6.473 6.607 6.717 6.847 6.967 7.089 7.235 7.361 7.484 7.646 7.809 7.927 8.034 8.15 8.264 8.332 8.371 8.382 8.346 8.269 8.095 7.763 7.248 6.418 5.076 2.693 -0.098 -2.299 -4.142 -5.692 -7.044 -8.191 -9.23 -10.123 -11.013 -11.787 -12.456 -13.093 -13.677 -14.205 -14.706 -15.223 -15.694 -16.113 -16.517 -16.935 -17.302 -17.674 -18.051 -18.345 -18.64 -18.949 -19.275 -19.628 -19.865 -20.096 -20.453 -20.698 -20.95 -21.075 -21.333 -21.596 -21.872 -22.021 -22.33 -22.441 -22.61 -22.776 -23.116 -23.3 -23.514 -23.784 -24.039 -24.331 -24.772 -26.907 -8 ,700 ,TETRA ,17558702,Sat Nov 27 02:05:46 CET,Sat Nov 27 04:04:36 CET,0.0 1.822 2.254 2.562 2.776 2.947 3.123 3.293 3.572 3.686 3.794 3.851 4.094 4.197 4.372 4.542 4.707 4.776 4.922 5.066 5.246 5.357 5.467 5.641 5.804 5.943 6.077 6.208 6.361 6.486 6.599 6.74 6.862 6.961 7.082 7.221 7.339 7.461 7.569 7.651 7.712 7.761 7.78 7.719 7.587 7.349 6.977 6.395 5.463 3.977 1.371 -1.721 -4.055 -5.895 -7.493 -8.902 -10.126 -11.236 -12.17 -13.078 -13.831 -14.493 -15.094 -15.627 -16.143 -16.619 -17.108 -17.55 -17.944 -18.337 -18.715 -19.041 -19.385 -19.732 -20.001 -20.275 -20.561 -20.858 -21.154 -21.355 -21.564 -21.879 -22.094 -22.324 -22.445 -22.71 -22.985 -23.237 -23.362 -23.662 -23.776 -23.923 -24.069 -24.382 -24.553 -24.737 -24.953 -25.189 -25.446 -25.741 -26.261 -9 ,739 ,TETRA ,17558703,Sat Nov 27 02:05:46 CET,Sat Nov 27 04:06:12 CET,0.0 1.467 1.932 2.292 2.575 2.851 3.098 3.301 3.684 3.862 4.007 4.103 4.367 4.494 4.724 4.924 5.11 5.197 5.364 5.52 5.713 5.832 5.959 6.143 6.317 6.485 6.652 6.803 6.981 7.142 7.287 7.448 7.582 7.699 7.857 8.027 8.149 8.276 8.385 8.482 8.578 8.646 8.707 8.71 8.582 8.391 8.123 7.661 6.887 5.62 3.412 0.72 -1.506 -3.401 -4.977 -6.37 -7.552 -8.578 -9.452 -10.347 -11.099 -11.74 -12.339 -12.908 -13.46 -13.944 -14.419 -14.849 -15.248 -15.685 -16.143 -16.517 -16.89 -17.295 -17.613 -17.928 -18.251 -18.575 -18.906 -19.133 -19.366 -19.736 -19.993 -20.246 -20.369 -20.629 -20.899 -21.201 -21.375 -21.732 -21.925 -22.101 -22.272 -22.636 -22.831 -23.043 -23.283 -23.532 -23.805 -24.16 -25.301 -10 ,12314 ,TETRA ,17558704,Sat Nov 27 02:06:47 CET,Sat Nov 27 03:48:25 CET,0.0 1.609 2.079 2.45 2.779 3.072 3.306 3.479 3.798 3.947 4.073 4.164 4.417 4.521 4.732 4.928 5.105 5.191 5.364 5.52 5.721 5.85 5.977 6.161 6.311 6.43 6.553 6.668 6.801 6.939 7.075 7.248 7.404 7.521 7.631 7.762 7.87 7.956 8.051 8.122 8.157 8.172 8.183 8.153 8.041 7.832 7.506 7.014 6.114 4.654 2.151 -0.788 -3.069 -4.948 -6.599 -8.176 -9.509 -10.67 -11.633 -12.542 -13.302 -13.986 -14.648 -15.251 -15.799 -16.313 -16.861 -17.332 -17.724 -18.121 -18.529 -18.872 -19.222 -19.567 -19.83 -20.103 -20.383 -20.674 -20.975 -21.188 -21.398 -21.731 -21.973 -22.217 -22.346 -22.614 -22.894 -23.198 -23.359 -23.691 -23.837 -24.005 -24.169 -24.536 -24.753 -24.97 -25.204 -25.498 -25.886 -26.368 -27.901 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_26_68.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_26_68.txt deleted file mode 100644 index 77cb84f4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_26_68.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28974 ,TETRA ,17558705,Sat Nov 27 02:06:48 CET,Sat Nov 27 04:10:22 CET,0.0 1.332 1.783 2.131 2.443 2.725 2.941 3.107 3.438 3.598 3.748 3.911 4.189 4.316 4.572 4.818 5.053 5.16 5.369 5.56 5.83 6.005 6.17 6.41 6.644 6.866 7.078 7.29 7.563 7.811 8.033 8.309 8.564 8.784 9.028 9.293 9.523 9.783 10.077 10.376 10.682 11.002 11.324 11.66 12.072 12.464 12.84 13.197 13.518 13.687 13.536 13.006 12.285 11.532 10.847 10.212 9.643 9.117 8.681 8.275 7.924 7.579 7.227 6.905 6.601 6.322 6.037 5.77 5.537 5.29 5.03 4.825 4.63 4.436 4.286 4.125 3.933 3.714 3.476 3.307 3.139 2.872 2.694 2.523 2.427 2.223 2.013 1.799 1.686 1.421 1.319 1.193 1.049 0.738 0.557 0.37 0.17 -0.085 -0.399 -0.798 -3.404 -2 ,5160 ,TETRA ,17558706,Sat Nov 27 02:06:47 CET,Sat Nov 27 04:04:01 CET,0.0 1.187 1.648 1.964 2.25 2.505 2.695 2.881 3.241 3.397 3.543 3.665 3.94 4.069 4.305 4.504 4.692 4.791 4.998 5.199 5.457 5.62 5.776 6.005 6.226 6.443 6.648 6.842 7.098 7.33 7.544 7.792 8.019 8.24 8.499 8.796 9.063 9.324 9.595 9.88 10.221 10.584 10.951 11.326 11.722 12.086 12.485 12.911 13.266 13.393 13.252 12.758 12.124 11.49 10.896 10.345 9.851 9.372 8.941 8.516 8.154 7.81 7.465 7.145 6.859 6.576 6.247 5.959 5.728 5.484 5.218 4.992 4.749 4.5 4.317 4.128 3.928 3.72 3.502 3.348 3.174 2.887 2.702 2.531 2.439 2.226 1.982 1.714 1.574 1.286 1.121 0.946 0.764 0.369 0.144 -0.109 -0.349 -0.565 -0.772 -1.099 -2.665 -3 ,22527 ,TETRA ,17558707,Sat Nov 27 02:06:48 CET,Sat Nov 27 04:02:25 CET,0.0 2.569 3.035 3.381 3.657 3.861 4.045 4.242 4.625 4.794 4.947 5.097 5.365 5.485 5.722 5.958 6.176 6.281 6.497 6.701 6.95 7.101 7.257 7.484 7.686 7.866 8.041 8.207 8.409 8.603 8.792 9.024 9.25 9.452 9.686 9.943 10.156 10.388 10.657 10.95 11.25 11.602 11.984 12.312 12.655 12.988 13.355 13.765 14.137 14.311 14.124 13.574 12.892 12.164 11.499 10.916 10.366 9.842 9.408 8.976 8.58 8.226 7.882 7.536 7.211 6.908 6.603 6.326 6.09 5.86 5.602 5.378 5.155 4.921 4.733 4.525 4.287 4.027 3.752 3.564 3.366 3.052 2.831 2.602 2.486 2.257 2.028 1.783 1.646 1.36 1.191 1.0 0.796 0.43 0.224 -0.037 -0.301 -0.588 -0.959 -1.373 -2.563 -4 ,31659 ,TETRA ,17558708,Sat Nov 27 02:06:49 CET,Sat Nov 27 04:05:11 CET,0.0 1.229 1.572 1.868 2.174 2.44 2.652 2.849 3.217 3.38 3.532 3.669 3.931 4.056 4.299 4.507 4.699 4.796 4.991 5.18 5.431 5.579 5.727 5.948 6.161 6.355 6.547 6.732 6.953 7.155 7.337 7.548 7.777 8.0 8.233 8.509 8.785 9.065 9.342 9.617 9.904 10.221 10.552 10.871 11.232 11.586 11.93 12.284 12.649 12.846 12.617 12.004 11.329 10.642 9.993 9.401 8.885 8.388 7.939 7.492 7.108 6.769 6.448 6.132 5.843 5.582 5.292 4.996 4.752 4.513 4.229 3.978 3.72 3.476 3.29 3.072 2.853 2.65 2.424 2.266 2.108 1.853 1.655 1.444 1.34 1.117 0.876 0.624 0.491 0.201 0.028 -0.132 -0.275 -0.536 -0.672 -0.813 -0.961 -1.203 -1.596 -2.096 -3.798 -5 ,24843 ,TETRA ,17558709,Sat Nov 27 02:06:51 CET,Sat Nov 27 04:04:41 CET,0.0 1.266 1.752 2.069 2.334 2.571 2.764 2.931 3.241 3.401 3.553 3.699 3.974 4.103 4.359 4.584 4.794 4.888 5.077 5.286 5.566 5.729 5.878 6.078 6.268 6.473 6.679 6.865 7.083 7.295 7.509 7.776 8.041 8.286 8.531 8.781 9.058 9.364 9.651 9.959 10.28 10.601 10.953 11.284 11.637 12.041 12.45 12.763 13.04 13.265 13.194 12.587 11.883 11.214 10.568 9.951 9.383 8.9 8.484 8.01 7.596 7.225 6.855 6.523 6.221 5.951 5.669 5.393 5.148 4.896 4.627 4.406 4.183 3.936 3.736 3.537 3.34 3.131 2.907 2.743 2.568 2.316 2.151 1.97 1.869 1.641 1.4 1.138 0.995 0.709 0.556 0.401 0.235 -0.122 -0.324 -0.55 -0.789 -1.075 -1.458 -1.998 -4.1 -6 ,21580 ,TETRA ,17558711,Sat Nov 27 02:08:44 CET,Sat Nov 27 04:06:05 CET,0.0 1.212 1.695 2.06 2.368 2.632 2.853 3.061 3.441 3.609 3.762 3.897 4.166 4.294 4.551 4.778 4.978 5.081 5.298 5.508 5.808 5.995 6.166 6.426 6.679 6.914 7.137 7.33 7.552 7.767 7.983 8.226 8.443 8.66 8.919 9.207 9.502 9.804 10.083 10.364 10.651 10.974 11.333 11.63 11.945 12.321 12.707 13.053 13.301 13.411 13.229 12.687 12.093 11.515 10.908 10.253 9.658 9.127 8.696 8.269 7.884 7.531 7.185 6.86 6.539 6.226 5.901 5.614 5.366 5.121 4.873 4.655 4.426 4.188 3.991 3.784 3.563 3.344 3.107 2.942 2.772 2.501 2.319 2.11 1.995 1.748 1.487 1.245 1.134 0.867 0.695 0.524 0.35 -0.022 -0.211 -0.406 -0.684 -0.993 -1.325 -1.81 -3.91 -7 ,3924 ,TETRA ,17558712,Sat Nov 27 02:08:44 CET,Sat Nov 27 04:07:46 CET,0.0 2.043 2.648 3.061 3.389 3.679 3.941 4.168 4.537 4.706 4.863 4.996 5.256 5.381 5.622 5.828 6.025 6.122 6.303 6.477 6.73 6.891 7.05 7.286 7.492 7.694 7.896 8.074 8.297 8.496 8.68 8.896 9.099 9.312 9.572 9.861 10.125 10.389 10.656 10.933 11.202 11.475 11.787 12.095 12.43 12.786 13.155 13.486 13.792 14.011 13.911 13.309 12.654 12.036 11.412 10.821 10.305 9.81 9.359 8.877 8.445 8.067 7.707 7.357 7.02 6.71 6.393 6.117 5.875 5.617 5.326 5.085 4.854 4.617 4.438 4.249 4.05 3.859 3.65 3.482 3.315 3.079 2.903 2.693 2.581 2.361 2.139 1.9 1.775 1.506 1.383 1.238 1.082 0.755 0.572 0.38 0.164 -0.127 -0.464 -0.832 -1.605 -8 ,28360 ,TETRA ,17558713,Sat Nov 27 02:08:44 CET,Sat Nov 27 04:05:43 CET,0.0 1.39 1.811 2.127 2.399 2.643 2.865 3.064 3.407 3.566 3.714 3.869 4.159 4.296 4.534 4.75 4.96 5.056 5.22 5.366 5.583 5.721 5.853 6.04 6.226 6.429 6.613 6.761 6.947 7.133 7.313 7.54 7.787 8.02 8.261 8.514 8.733 8.969 9.232 9.507 9.796 10.099 10.412 10.718 11.064 11.399 11.717 12.001 12.265 12.411 12.24 11.683 11.038 10.344 9.664 9.026 8.463 7.976 7.55 7.121 6.748 6.405 6.086 5.796 5.518 5.249 4.963 4.706 4.487 4.269 4.044 3.847 3.631 3.4 3.229 3.055 2.86 2.665 2.473 2.322 2.167 1.951 1.806 1.649 1.559 1.382 1.206 0.997 0.876 0.608 0.472 0.325 0.188 -0.091 -0.262 -0.473 -0.712 -0.949 -1.229 -1.638 -3.174 -9 ,13716 ,TETRA ,17558714,Sat Nov 27 02:09:41 CET,Sat Nov 27 03:50:37 CET,0.0 0.83 1.247 1.545 1.8 2.042 2.266 2.467 2.84 3.015 3.176 3.322 3.603 3.724 3.967 4.222 4.446 4.541 4.716 4.879 5.112 5.262 5.421 5.656 5.866 6.062 6.25 6.434 6.666 6.879 7.098 7.362 7.594 7.799 8.029 8.293 8.534 8.79 9.055 9.33 9.62 9.933 10.271 10.599 10.957 11.315 11.711 12.08 12.389 12.538 12.4 11.834 11.105 10.335 9.639 9.019 8.458 7.939 7.461 6.968 6.536 6.159 5.816 5.522 5.239 4.961 4.65 4.342 4.086 3.829 3.538 3.28 3.028 2.776 2.57 2.362 2.16 1.954 1.725 1.555 1.377 1.11 0.943 0.778 0.686 0.489 0.267 0.039 -0.066 -0.329 -0.486 -0.652 -0.801 -1.128 -1.314 -1.539 -1.821 -2.09 -2.412 -2.971 -5.552 -10 ,21425 ,TETRA ,17558715,Sat Nov 27 02:09:42 CET,Sat Nov 27 04:07:29 CET,0.0 1.788 2.386 2.774 3.09 3.36 3.595 3.828 4.247 4.419 4.579 4.737 5.012 5.133 5.348 5.548 5.741 5.838 6.031 6.213 6.472 6.639 6.793 6.998 7.211 7.421 7.608 7.789 8.016 8.224 8.406 8.646 8.9 9.143 9.423 9.696 9.927 10.198 10.491 10.799 11.132 11.491 11.847 12.15 12.484 12.845 13.255 13.661 13.979 14.088 13.877 13.306 12.659 11.972 11.337 10.743 10.21 9.698 9.233 8.776 8.393 8.062 7.729 7.405 7.116 6.834 6.525 6.253 5.998 5.72 5.449 5.217 4.967 4.71 4.509 4.3 4.089 3.874 3.634 3.463 3.286 3.011 2.809 2.6 2.494 2.275 2.023 1.757 1.631 1.35 1.195 1.042 0.869 0.461 0.27 0.079 -0.154 -0.405 -0.718 -1.167 -3.094 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_28.txt deleted file mode 100644 index 199d506b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12221 ,TETRA ,17558716,Sat Nov 27 02:09:41 CET,Sat Nov 27 04:05:59 CET,0.0 1.655 2.169 2.564 2.886 3.179 3.44 3.664 4.094 4.287 4.469 4.633 4.974 5.121 5.404 5.684 5.952 6.083 6.323 6.549 6.881 7.098 7.298 7.583 7.871 8.138 8.375 8.594 8.885 9.175 9.448 9.757 10.065 10.357 10.663 10.991 11.324 11.69 12.043 12.413 12.82 13.295 13.804 14.298 14.878 15.449 16.06 16.7 17.295 17.818 18.217 18.147 17.784 17.324 16.882 16.484 16.117 15.753 15.422 15.048 14.702 14.422 14.156 13.887 13.638 13.418 13.176 12.953 12.75 12.527 12.297 12.113 11.925 11.721 11.555 11.379 11.195 11.007 10.816 10.687 10.547 10.327 10.181 10.018 9.929 9.759 9.578 9.376 9.274 8.995 8.91 8.767 8.618 8.306 8.14 7.975 7.782 7.587 7.355 7.062 5.802 -2 ,2893 ,TETRA ,17558717,Sat Nov 27 02:10:42 CET,Sat Nov 27 04:06:40 CET,0.0 3.62 4.074 4.451 4.726 4.944 5.177 5.399 5.784 5.957 6.121 6.259 6.562 6.682 6.92 7.157 7.381 7.488 7.689 7.888 8.168 8.348 8.52 8.766 9.008 9.235 9.456 9.666 9.934 10.189 10.419 10.687 10.955 11.214 11.494 11.797 12.076 12.396 12.728 13.057 13.426 13.82 14.242 14.655 15.128 15.636 16.153 16.623 17.069 17.448 17.738 17.704 17.365 16.948 16.544 16.137 15.746 15.388 15.066 14.734 14.455 14.2 13.949 13.692 13.439 13.2 12.95 12.721 12.511 12.295 12.062 11.864 11.66 11.463 11.323 11.166 10.992 10.799 10.596 10.464 10.332 10.135 9.991 9.841 9.766 9.608 9.442 9.266 9.173 8.903 8.857 8.746 8.635 8.387 8.245 8.086 7.876 7.628 7.364 7.041 6.213 -3 ,207 ,TETRA ,17558718,Sat Nov 27 02:10:43 CET,Sat Nov 27 04:09:15 CET,0.0 2.668 3.191 3.55 3.835 4.079 4.319 4.545 4.946 5.144 5.323 5.478 5.801 5.941 6.207 6.46 6.71 6.832 7.049 7.246 7.512 7.681 7.849 8.105 8.365 8.609 8.842 9.073 9.344 9.604 9.878 10.196 10.477 10.731 11.028 11.345 11.658 12.046 12.439 12.843 13.275 13.712 14.21 14.692 15.206 15.737 16.299 16.82 17.344 17.855 18.133 17.984 17.642 17.242 16.814 16.405 16.036 15.672 15.331 14.987 14.703 14.451 14.204 13.954 13.701 13.484 13.263 13.051 12.861 12.665 12.454 12.272 12.078 11.866 11.697 11.512 11.32 11.137 10.952 10.821 10.697 10.512 10.37 10.196 10.102 9.94 9.773 9.6 9.51 9.223 9.176 9.061 8.939 8.661 8.498 8.318 8.122 7.917 7.702 7.3 5.827 -4 ,631 ,TETRA ,17558719,Sat Nov 27 02:11:40 CET,Sat Nov 27 04:08:11 CET,0.0 2.193 2.613 2.942 3.246 3.498 3.701 3.881 4.234 4.41 4.585 4.749 5.08 5.219 5.498 5.77 6.008 6.114 6.32 6.522 6.802 6.969 7.135 7.392 7.624 7.841 8.067 8.308 8.624 8.906 9.146 9.429 9.696 9.942 10.225 10.536 10.826 11.127 11.443 11.775 12.118 12.506 12.951 13.392 13.885 14.422 14.975 15.502 16.056 16.639 17.145 17.207 16.962 16.573 16.105 15.68 15.325 14.962 14.576 14.183 13.873 13.586 13.291 13.008 12.752 12.528 12.281 12.06 11.865 11.65 11.437 11.253 11.044 10.819 10.647 10.47 10.286 10.087 9.88 9.741 9.594 9.374 9.241 9.099 9.018 8.84 8.658 8.489 8.394 8.119 8.081 7.971 7.846 7.505 7.329 7.154 6.946 6.745 6.533 6.257 5.413 -5 ,32392 ,TETRA ,17558720,Sat Nov 27 02:13:43 CET,Sat Nov 27 04:10:11 CET,0.0 1.865 2.282 2.625 2.948 3.207 3.43 3.641 4.001 4.174 4.342 4.462 4.787 4.93 5.219 5.484 5.713 5.816 6.02 6.208 6.459 6.621 6.785 7.027 7.26 7.484 7.688 7.886 8.139 8.38 8.618 8.906 9.177 9.425 9.711 10.027 10.306 10.595 10.91 11.249 11.607 12.005 12.456 12.85 13.283 13.779 14.309 14.854 15.341 15.66 15.856 15.734 15.404 14.991 14.585 14.195 13.816 13.464 13.155 12.847 12.569 12.292 12.017 11.762 11.534 11.309 11.062 10.832 10.633 10.444 10.253 10.095 9.93 9.743 9.592 9.433 9.265 9.102 8.939 8.82 8.677 8.433 8.271 8.096 8.011 7.85 7.672 7.488 7.389 7.09 6.948 6.806 6.696 6.468 6.347 6.211 6.02 5.792 5.553 5.299 4.503 -6 ,15055 ,TETRA ,17558721,Sat Nov 27 02:14:43 CET,Sat Nov 27 04:15:01 CET,0.0 3.184 3.797 4.21 4.506 4.728 4.94 5.151 5.543 5.714 5.869 5.983 6.317 6.478 6.761 7.018 7.26 7.378 7.602 7.793 8.053 8.213 8.366 8.589 8.812 9.043 9.274 9.488 9.74 9.969 10.177 10.44 10.719 10.982 11.273 11.602 11.918 12.251 12.597 12.973 13.358 13.771 14.254 14.726 15.24 15.756 16.283 16.812 17.356 17.84 18.117 17.983 17.628 17.179 16.707 16.26 15.842 15.425 15.057 14.674 14.327 14.028 13.746 13.468 13.212 12.98 12.723 12.481 12.273 12.066 11.849 11.661 11.464 11.254 11.086 10.919 10.756 10.574 10.375 10.254 10.133 9.912 9.751 9.578 9.485 9.308 9.115 8.899 8.792 8.507 8.454 8.323 8.197 7.922 7.754 7.587 7.426 7.229 6.965 6.549 5.195 -7 ,10799 ,TETRA ,17558722,Sat Nov 27 02:14:43 CET,Sat Nov 27 04:13:06 CET,0.0 1.862 2.389 2.711 2.94 3.156 3.35 3.535 3.902 4.055 4.181 4.261 4.555 4.665 4.89 5.12 5.342 5.449 5.666 5.88 6.191 6.38 6.545 6.775 7.009 7.247 7.475 7.686 7.935 8.171 8.407 8.684 8.947 9.191 9.461 9.757 10.035 10.343 10.695 11.068 11.429 11.826 12.264 12.662 13.053 13.459 13.939 14.434 14.934 15.349 15.588 15.492 15.175 14.772 14.358 13.94 13.546 13.173 12.85 12.524 12.239 11.983 11.734 11.501 11.265 11.038 10.787 10.568 10.387 10.186 9.965 9.787 9.615 9.426 9.268 9.098 8.925 8.745 8.553 8.418 8.267 8.037 7.876 7.7 7.609 7.413 7.199 6.959 6.826 6.509 6.403 6.262 6.11 5.729 5.525 5.326 5.103 4.866 4.622 4.338 3.87 -8 ,31103 ,TETRA ,17558723,Sat Nov 27 02:14:43 CET,Sat Nov 27 04:10:57 CET,0.0 1.798 2.235 2.573 2.871 3.17 3.435 3.655 4.056 4.231 4.41 4.572 4.905 5.054 5.337 5.589 5.82 5.931 6.167 6.408 6.724 6.92 7.116 7.384 7.641 7.9 8.148 8.374 8.658 8.938 9.198 9.49 9.786 10.082 10.416 10.774 11.092 11.436 11.824 12.232 12.626 13.062 13.576 14.02 14.424 14.801 15.228 15.643 16.007 16.363 16.514 16.214 15.817 15.404 14.987 14.59 14.227 13.873 13.534 13.193 12.901 12.627 12.355 12.088 11.821 11.586 11.351 11.139 10.947 10.729 10.52 10.352 10.169 9.978 9.828 9.663 9.475 9.27 9.076 8.937 8.793 8.571 8.411 8.233 8.14 7.953 7.748 7.537 7.434 7.149 7.064 6.924 6.792 6.503 6.34 6.16 5.973 5.767 5.52 5.186 3.933 -9 ,8395 ,TETRA ,17558724,Sat Nov 27 02:14:45 CET,Sat Nov 27 04:12:20 CET,0.0 1.969 2.451 2.741 2.969 3.174 3.393 3.622 4.011 4.19 4.361 4.487 4.794 4.933 5.22 5.497 5.752 5.865 6.07 6.278 6.587 6.796 6.999 7.254 7.485 7.699 7.911 8.122 8.378 8.63 8.875 9.201 9.533 9.849 10.214 10.624 11.004 11.348 11.698 12.066 12.418 12.838 13.342 13.796 14.286 14.794 15.3 15.814 16.355 16.85 17.208 17.21 16.916 16.454 16.032 15.634 15.234 14.88 14.576 14.232 13.922 13.643 13.362 13.108 12.892 12.691 12.45 12.253 12.099 11.912 11.712 11.542 11.345 11.138 10.987 10.824 10.652 10.477 10.271 10.117 9.969 9.747 9.589 9.425 9.341 9.166 8.972 8.761 8.657 8.382 8.315 8.18 8.048 7.747 7.578 7.398 7.19 6.972 6.72 6.335 5.315 -10 ,13216 ,TETRA ,17558725,Sat Nov 27 02:14:43 CET,Sat Nov 27 04:11:17 CET,0.0 1.951 2.426 2.792 3.119 3.419 3.664 3.873 4.261 4.428 4.585 4.729 5.05 5.19 5.47 5.736 5.973 6.088 6.303 6.495 6.775 6.942 7.103 7.345 7.561 7.771 7.978 8.177 8.442 8.695 8.923 9.203 9.477 9.731 10.024 10.374 10.742 11.144 11.543 11.928 12.293 12.705 13.201 13.666 14.127 14.6 15.134 15.665 16.172 16.623 16.845 16.652 16.267 15.823 15.392 14.986 14.619 14.276 13.935 13.589 13.279 12.984 12.728 12.488 12.232 12.003 11.767 11.539 11.341 11.144 10.939 10.751 10.544 10.333 10.178 10.019 9.84 9.651 9.46 9.331 9.197 8.957 8.8 8.659 8.58 8.401 8.207 8.022 7.93 7.652 7.627 7.505 7.38 7.128 6.991 6.847 6.681 6.457 6.154 5.774 4.757 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_30.txt deleted file mode 100644 index e5853c60..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3994 ,TETRA ,17558726,Sat Nov 27 02:15:42 CET,Sat Nov 27 04:13:18 CET,0.0 1.49 1.91 2.233 2.475 2.682 2.87 3.035 3.311 3.431 3.554 3.611 3.9 4.013 4.219 4.383 4.528 4.596 4.726 4.854 5.043 5.158 5.271 5.448 5.609 5.761 5.911 6.055 6.243 6.419 6.586 6.796 6.991 7.15 7.319 7.505 7.671 7.844 8.022 8.214 8.401 8.613 8.887 9.104 9.287 9.456 9.599 9.667 9.576 9.222 8.426 7.3 6.275 5.379 4.598 3.918 3.348 2.81 2.321 1.858 1.468 1.105 0.756 0.436 0.141 -0.128 -0.409 -0.662 -0.874 -1.09 -1.317 -1.515 -1.714 -1.92 -2.082 -2.242 -2.42 -2.61 -2.802 -2.926 -3.049 -3.251 -3.385 -3.52 -3.598 -3.766 -3.935 -4.106 -4.198 -4.473 -4.47 -4.569 -4.674 -4.896 -5.014 -5.135 -5.262 -5.396 -5.562 -5.793 -6.399 -2 ,27895 ,TETRA ,17558727,Sat Nov 27 02:15:45 CET,Sat Nov 27 04:14:27 CET,0.0 1.057 1.325 1.534 1.72 1.873 2.002 2.137 2.394 2.502 2.598 2.592 2.854 2.94 3.093 3.226 3.361 3.431 3.561 3.686 3.853 3.953 4.047 4.198 4.365 4.527 4.669 4.793 4.94 5.083 5.215 5.363 5.513 5.659 5.836 6.027 6.206 6.389 6.564 6.725 6.892 7.087 7.268 7.436 7.61 7.746 7.823 7.84 7.749 7.409 6.68 5.638 4.654 3.787 3.044 2.367 1.784 1.268 0.818 0.371 -0.008 -0.348 -0.674 -0.977 -1.261 -1.525 -1.804 -2.046 -2.252 -2.47 -2.716 -2.927 -3.121 -3.321 -3.483 -3.658 -3.839 -4.027 -4.247 -4.391 -4.519 -4.723 -4.868 -5.013 -5.095 -5.268 -5.445 -5.636 -5.722 -5.994 -5.997 -6.105 -6.226 -6.467 -6.594 -6.743 -6.901 -7.069 -7.277 -7.56 -8.123 -3 ,19329 ,TETRA ,17558728,Sat Nov 27 02:15:42 CET,Sat Nov 27 04:13:37 CET,0.0 0.996 1.342 1.622 1.863 2.083 2.283 2.458 2.784 2.931 3.05 3.086 3.376 3.471 3.664 3.855 4.033 4.121 4.286 4.42 4.595 4.732 4.878 5.07 5.257 5.441 5.611 5.776 5.992 6.205 6.41 6.656 6.888 7.095 7.317 7.54 7.72 7.918 8.117 8.299 8.493 8.711 8.982 9.227 9.448 9.646 9.812 9.902 9.894 9.698 9.041 7.997 7.003 6.11 5.412 4.802 4.23 3.692 3.232 2.781 2.394 2.047 1.709 1.392 1.095 0.82 0.536 0.279 0.058 -0.168 -0.414 -0.619 -0.829 -1.042 -1.205 -1.374 -1.563 -1.768 -1.969 -2.114 -2.258 -2.468 -2.619 -2.776 -2.861 -3.046 -3.241 -3.443 -3.537 -3.814 -3.82 -3.927 -4.052 -4.305 -4.43 -4.558 -4.703 -4.893 -5.106 -5.392 -5.857 -4 ,8964 ,TETRA ,17558729,Sat Nov 27 02:15:45 CET,Sat Nov 27 04:14:14 CET,0.0 1.09 1.499 1.775 2.021 2.247 2.448 2.625 2.89 2.998 3.105 3.131 3.411 3.514 3.701 3.867 4.041 4.122 4.264 4.397 4.591 4.723 4.851 5.016 5.164 5.312 5.456 5.59 5.758 5.918 6.083 6.279 6.458 6.617 6.785 6.981 7.164 7.357 7.573 7.765 7.939 8.112 8.28 8.436 8.586 8.714 8.831 8.881 8.779 8.5 7.855 6.881 5.969 5.134 4.424 3.762 3.177 2.644 2.178 1.733 1.347 0.992 0.653 0.342 0.054 -0.202 -0.482 -0.736 -0.95 -1.18 -1.416 -1.606 -1.81 -2.03 -2.199 -2.373 -2.547 -2.724 -2.919 -3.059 -3.193 -3.391 -3.542 -3.699 -3.773 -3.932 -4.098 -4.264 -4.358 -4.646 -4.65 -4.76 -4.874 -5.099 -5.214 -5.353 -5.521 -5.704 -5.883 -6.135 -6.86 -5 ,27810 ,TETRA ,17558730,Sat Nov 27 02:16:42 CET,Sat Nov 27 04:12:24 CET,0.0 1.304 1.754 2.088 2.35 2.581 2.816 3.011 3.307 3.444 3.564 3.603 3.886 3.985 4.168 4.34 4.495 4.561 4.67 4.773 4.937 5.056 5.174 5.346 5.507 5.651 5.787 5.918 6.08 6.241 6.399 6.588 6.766 6.918 7.078 7.263 7.435 7.62 7.818 8.017 8.225 8.441 8.651 8.806 8.947 9.116 9.268 9.365 9.366 9.123 8.431 7.339 6.322 5.436 4.657 3.971 3.399 2.891 2.437 1.96 1.56 1.206 0.868 0.565 0.29 0.026 -0.26 -0.506 -0.719 -0.943 -1.17 -1.356 -1.561 -1.784 -1.948 -2.11 -2.274 -2.458 -2.651 -2.778 -2.914 -3.126 -3.263 -3.411 -3.495 -3.66 -3.836 -4.012 -4.096 -4.384 -4.416 -4.528 -4.632 -4.84 -4.966 -5.114 -5.295 -5.509 -5.774 -6.084 -6.934 -6 ,8662 ,TETRA ,17558731,Sat Nov 27 02:16:44 CET,Sat Nov 27 04:12:15 CET,0.0 1.122 1.509 1.787 1.984 2.176 2.356 2.522 2.783 2.894 3.017 3.079 3.37 3.484 3.711 3.89 4.035 4.11 4.264 4.409 4.606 4.728 4.84 4.981 5.128 5.271 5.401 5.54 5.707 5.846 5.974 6.142 6.309 6.439 6.592 6.783 6.961 7.144 7.328 7.513 7.669 7.839 8.072 8.268 8.421 8.558 8.673 8.727 8.679 8.453 7.818 6.802 5.868 5.059 4.318 3.65 3.096 2.571 2.116 1.665 1.269 0.915 0.567 0.242 -0.037 -0.283 -0.552 -0.806 -1.033 -1.26 -1.495 -1.703 -1.918 -2.131 -2.3 -2.481 -2.666 -2.865 -3.066 -3.197 -3.337 -3.561 -3.733 -3.909 -3.996 -4.187 -4.369 -4.561 -4.663 -4.951 -4.982 -5.091 -5.204 -5.458 -5.6 -5.738 -5.905 -6.106 -6.3 -6.534 -6.965 -7 ,17442 ,TETRA ,17558732,Sat Nov 27 02:16:42 CET,Sat Nov 27 04:15:04 CET,0.0 1.076 1.442 1.736 1.962 2.16 2.334 2.495 2.76 2.869 2.983 3.046 3.326 3.423 3.613 3.78 3.94 4.022 4.165 4.289 4.479 4.606 4.725 4.883 5.022 5.161 5.301 5.435 5.6 5.753 5.905 6.097 6.272 6.429 6.616 6.819 6.994 7.195 7.422 7.618 7.802 8.025 8.292 8.521 8.713 8.86 8.956 8.992 8.972 8.774 8.08 7.063 6.145 5.284 4.562 3.928 3.37 2.864 2.42 1.979 1.589 1.232 0.886 0.553 0.256 -0.017 -0.306 -0.559 -0.776 -0.998 -1.232 -1.417 -1.611 -1.823 -1.983 -2.138 -2.295 -2.468 -2.66 -2.787 -2.915 -3.112 -3.251 -3.407 -3.49 -3.66 -3.829 -3.991 -4.073 -4.348 -4.375 -4.494 -4.605 -4.807 -4.913 -5.043 -5.193 -5.38 -5.611 -5.843 -6.562 -8 ,19973 ,TETRA ,17558733,Sat Nov 27 02:16:44 CET,Sat Nov 27 04:15:42 CET,0.0 1.741 2.181 2.438 2.675 2.918 3.121 3.317 3.663 3.806 3.949 4.084 4.416 4.56 4.815 5.024 5.194 5.275 5.444 5.609 5.822 5.959 6.094 6.288 6.479 6.651 6.803 6.948 7.129 7.297 7.477 7.706 7.895 8.068 8.265 8.461 8.663 8.881 9.097 9.321 9.549 9.773 9.969 10.121 10.251 10.362 10.47 10.472 10.312 9.992 9.279 8.181 7.187 6.339 5.636 5.0 4.395 3.841 3.369 2.888 2.476 2.11 1.776 1.477 1.192 0.921 0.637 0.384 0.168 -0.06 -0.307 -0.512 -0.701 -0.894 -1.06 -1.218 -1.373 -1.543 -1.724 -1.857 -1.991 -2.175 -2.298 -2.433 -2.511 -2.669 -2.831 -3.003 -3.09 -3.37 -3.384 -3.501 -3.618 -3.852 -3.977 -4.111 -4.259 -4.44 -4.642 -4.898 -5.523 -9 ,21102 ,TETRA ,17558734,Sat Nov 27 02:17:41 CET,Sat Nov 27 04:02:03 CET,0.0 1.153 1.538 1.796 2.007 2.203 2.391 2.546 2.79 2.916 3.052 3.157 3.483 3.605 3.83 4.051 4.251 4.35 4.559 4.752 5.012 5.169 5.315 5.523 5.707 5.883 6.065 6.224 6.407 6.604 6.811 7.034 7.211 7.386 7.585 7.779 7.959 8.162 8.384 8.612 8.833 9.034 9.252 9.476 9.667 9.828 9.961 9.996 9.854 9.495 8.729 7.602 6.6 5.722 4.973 4.304 3.719 3.181 2.717 2.242 1.815 1.452 1.123 0.787 0.464 0.19 -0.102 -0.355 -0.559 -0.782 -1.02 -1.207 -1.396 -1.595 -1.75 -1.915 -2.082 -2.254 -2.45 -2.589 -2.731 -2.953 -3.098 -3.25 -3.331 -3.494 -3.657 -3.832 -3.93 -4.218 -4.221 -4.326 -4.437 -4.729 -4.88 -5.01 -5.154 -5.336 -5.579 -5.832 -6.335 -10 ,12583 ,TETRA ,17558735,Sat Nov 27 02:17:41 CET,Sat Nov 27 04:14:04 CET,0.0 1.207 1.584 1.874 2.132 2.358 2.557 2.742 3.095 3.254 3.397 3.496 3.809 3.935 4.169 4.383 4.574 4.66 4.836 5.001 5.215 5.358 5.489 5.662 5.809 5.944 6.1 6.262 6.442 6.593 6.727 6.894 7.067 7.234 7.401 7.564 7.731 7.933 8.157 8.359 8.534 8.743 9.008 9.259 9.518 9.73 9.869 9.933 9.897 9.631 8.931 7.909 7.008 6.231 5.525 4.868 4.279 3.737 3.262 2.792 2.406 2.045 1.663 1.315 1.025 0.771 0.489 0.239 0.037 -0.181 -0.424 -0.626 -0.855 -1.092 -1.258 -1.421 -1.596 -1.789 -1.982 -2.114 -2.257 -2.467 -2.611 -2.76 -2.834 -2.99 -3.159 -3.355 -3.454 -3.739 -3.776 -3.894 -4.017 -4.285 -4.422 -4.567 -4.748 -4.941 -5.148 -5.453 -6.29 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_32.txt deleted file mode 100644 index e0d6ecec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31203 ,TETRA ,17558736,Sat Nov 27 02:17:44 CET,Sat Nov 27 04:14:09 CET,0.0 0.663 0.924 1.135 1.323 1.484 1.621 1.766 2.036 2.157 2.269 2.308 2.571 2.644 2.793 2.949 3.087 3.151 3.273 3.394 3.572 3.689 3.8 3.947 4.089 4.237 4.377 4.498 4.649 4.803 4.951 5.124 5.274 5.417 5.593 5.77 5.927 6.103 6.291 6.488 6.685 6.876 7.056 7.23 7.446 7.662 7.864 8.07 8.191 8.132 7.765 7.043 6.281 5.571 4.961 4.434 3.928 3.416 2.959 2.458 2.023 1.641 1.285 0.979 0.688 0.413 0.124 -0.139 -0.359 -0.576 -0.813 -1.024 -1.239 -1.468 -1.651 -1.831 -2.014 -2.222 -2.441 -2.583 -2.731 -2.972 -3.136 -3.313 -3.408 -3.612 -3.826 -4.039 -4.154 -4.463 -4.514 -4.622 -4.733 -4.963 -5.091 -5.233 -5.395 -5.574 -5.792 -6.042 -6.492 -2 ,28375 ,TETRA ,17558737,Sat Nov 27 02:17:41 CET,Sat Nov 27 04:14:21 CET,0.0 0.869 1.247 1.533 1.776 1.969 2.121 2.27 2.534 2.646 2.747 2.767 3.042 3.141 3.325 3.512 3.685 3.764 3.91 4.042 4.224 4.331 4.43 4.579 4.733 4.876 5.003 5.137 5.311 5.472 5.623 5.809 5.978 6.131 6.31 6.491 6.651 6.825 7.012 7.217 7.43 7.647 7.87 8.069 8.289 8.548 8.772 8.913 8.951 8.828 8.426 7.692 6.999 6.326 5.721 5.177 4.673 4.207 3.814 3.417 3.069 2.761 2.464 2.181 1.912 1.664 1.404 1.16 0.95 0.738 0.52 0.342 0.148 -0.063 -0.231 -0.398 -0.559 -0.733 -0.918 -1.044 -1.172 -1.379 -1.529 -1.668 -1.737 -1.886 -2.043 -2.216 -2.305 -2.582 -2.61 -2.714 -2.813 -3.011 -3.121 -3.253 -3.415 -3.616 -3.821 -4.056 -4.896 -3 ,25212 ,TETRA ,17558738,Sat Nov 27 02:18:41 CET,Sat Nov 27 04:15:01 CET,0.0 1.212 1.553 1.835 2.078 2.285 2.441 2.556 2.785 2.9 3.016 3.087 3.392 3.497 3.696 3.869 4.024 4.103 4.249 4.392 4.597 4.724 4.855 5.048 5.239 5.428 5.595 5.746 5.922 6.074 6.223 6.421 6.618 6.797 6.992 7.192 7.367 7.544 7.715 7.89 8.075 8.256 8.448 8.634 8.811 8.976 9.143 9.275 9.315 9.192 8.711 7.933 7.184 6.483 5.872 5.301 4.798 4.349 3.964 3.573 3.223 2.915 2.628 2.345 2.066 1.827 1.581 1.355 1.161 0.962 0.743 0.56 0.39 0.19 0.036 -0.107 -0.269 -0.439 -0.622 -0.767 -0.921 -1.132 -1.266 -1.42 -1.503 -1.667 -1.835 -2.016 -2.115 -2.39 -2.424 -2.539 -2.657 -2.896 -3.024 -3.184 -3.366 -3.552 -3.782 -4.155 -5.258 -4 ,20779 ,TETRA ,17558739,Sat Nov 27 02:18:41 CET,Sat Nov 27 04:17:44 CET,0.0 1.517 1.854 2.095 2.276 2.454 2.616 2.763 3.04 3.157 3.268 3.3 3.569 3.658 3.829 3.982 4.127 4.198 4.333 4.464 4.635 4.747 4.86 5.027 5.189 5.343 5.487 5.615 5.776 5.934 6.089 6.274 6.443 6.599 6.778 6.965 7.125 7.286 7.473 7.678 7.889 8.112 8.343 8.54 8.726 8.923 9.115 9.263 9.366 9.336 8.971 8.229 7.496 6.801 6.152 5.526 4.967 4.473 4.046 3.627 3.266 2.945 2.638 2.354 2.095 1.847 1.592 1.363 1.158 0.961 0.756 0.588 0.416 0.224 0.077 -0.077 -0.239 -0.415 -0.601 -0.72 -0.844 -1.033 -1.163 -1.31 -1.388 -1.544 -1.714 -1.895 -1.993 -2.275 -2.291 -2.393 -2.503 -2.73 -2.855 -2.992 -3.142 -3.326 -3.583 -3.933 -4.813 -5 ,22808 ,TETRA ,17558740,Sat Nov 27 02:18:41 CET,Sat Nov 27 04:14:51 CET,0.0 0.875 1.227 1.447 1.624 1.806 1.978 2.124 2.393 2.527 2.649 2.69 2.955 3.039 3.221 3.393 3.545 3.615 3.755 3.9 4.108 4.228 4.331 4.468 4.615 4.759 4.895 5.023 5.184 5.349 5.502 5.68 5.853 6.019 6.209 6.415 6.597 6.782 6.979 7.173 7.339 7.543 7.79 7.99 8.181 8.35 8.519 8.679 8.724 8.601 8.198 7.457 6.687 5.969 5.346 4.791 4.287 3.81 3.407 2.998 2.614 2.266 1.945 1.655 1.372 1.113 0.861 0.645 0.457 0.248 0.033 -0.142 -0.336 -0.555 -0.721 -0.877 -1.03 -1.196 -1.365 -1.476 -1.594 -1.783 -1.923 -2.067 -2.137 -2.299 -2.467 -2.631 -2.719 -2.999 -3.009 -3.125 -3.239 -3.527 -3.7 -3.884 -4.088 -4.274 -4.486 -4.799 -5.711 -6 ,5707 ,TETRA ,17558741,Sat Nov 27 02:18:43 CET,Sat Nov 27 04:15:08 CET,0.0 1.233 1.559 1.832 2.085 2.283 2.464 2.632 2.9 3.01 3.119 3.155 3.432 3.531 3.722 3.89 4.041 4.12 4.278 4.434 4.66 4.797 4.917 5.102 5.275 5.427 5.58 5.729 5.932 6.136 6.327 6.551 6.758 6.951 7.15 7.366 7.567 7.764 7.962 8.161 8.349 8.543 8.813 9.057 9.283 9.491 9.675 9.822 9.905 9.838 9.398 8.616 7.866 7.205 6.605 6.034 5.528 5.071 4.68 4.289 3.94 3.624 3.311 3.007 2.739 2.497 2.243 2.027 1.844 1.639 1.405 1.214 1.01 0.797 0.649 0.502 0.347 0.174 -0.007 -0.122 -0.24 -0.428 -0.555 -0.69 -0.766 -0.926 -1.079 -1.244 -1.335 -1.607 -1.634 -1.74 -1.849 -2.098 -2.239 -2.383 -2.54 -2.734 -2.967 -3.274 -4.361 -7 ,21629 ,TETRA ,17558742,Sat Nov 27 02:18:43 CET,Sat Nov 27 04:17:35 CET,0.0 1.048 1.39 1.666 1.899 2.114 2.311 2.488 2.789 2.919 3.031 3.063 3.336 3.436 3.625 3.795 3.946 4.017 4.159 4.298 4.497 4.621 4.736 4.911 5.08 5.226 5.363 5.491 5.658 5.83 5.988 6.166 6.341 6.535 6.762 6.979 7.181 7.389 7.598 7.813 8.033 8.283 8.537 8.76 8.996 9.215 9.394 9.525 9.57 9.417 8.937 8.209 7.493 6.805 6.193 5.655 5.154 4.669 4.243 3.832 3.487 3.174 2.871 2.583 2.326 2.086 1.823 1.588 1.381 1.163 0.931 0.742 0.545 0.342 0.195 0.048 -0.103 -0.279 -0.486 -0.622 -0.745 -0.931 -1.055 -1.183 -1.259 -1.426 -1.591 -1.751 -1.848 -2.145 -2.182 -2.275 -2.381 -2.65 -2.789 -2.946 -3.129 -3.335 -3.581 -3.934 -4.83 -8 ,516 ,TETRA ,17558743,Sat Nov 27 02:19:42 CET,Sat Nov 27 04:17:15 CET,0.0 1.397 1.703 1.921 2.126 2.293 2.441 2.583 2.864 2.989 3.089 3.106 3.385 3.48 3.671 3.847 4.01 4.09 4.227 4.355 4.57 4.704 4.821 4.982 5.125 5.258 5.386 5.5 5.639 5.787 5.937 6.117 6.291 6.456 6.641 6.849 7.033 7.22 7.42 7.615 7.803 7.99 8.185 8.374 8.573 8.754 8.905 9.027 9.076 8.99 8.626 7.921 7.187 6.543 5.984 5.437 4.959 4.517 4.111 3.695 3.331 3.021 2.714 2.404 2.119 1.869 1.6 1.358 1.161 0.954 0.729 0.539 0.341 0.124 -0.041 -0.194 -0.357 -0.543 -0.743 -0.876 -1.005 -1.201 -1.331 -1.467 -1.542 -1.686 -1.853 -2.044 -2.139 -2.413 -2.424 -2.535 -2.661 -2.906 -3.043 -3.199 -3.373 -3.594 -3.87 -4.236 -5.08 -9 ,25502 ,TETRA ,17558744,Sat Nov 27 02:19:44 CET,Sat Nov 27 04:17:09 CET,0.0 1.242 1.641 1.946 2.183 2.38 2.547 2.702 2.986 3.104 3.211 3.241 3.521 3.61 3.76 3.92 4.081 4.154 4.289 4.419 4.603 4.714 4.82 4.978 5.13 5.266 5.392 5.512 5.676 5.83 5.976 6.153 6.311 6.462 6.639 6.825 6.994 7.175 7.375 7.59 7.792 7.996 8.211 8.404 8.615 8.835 9.009 9.138 9.243 9.207 8.842 8.122 7.358 6.598 5.947 5.4 4.916 4.468 4.069 3.658 3.303 2.988 2.675 2.369 2.078 1.821 1.564 1.339 1.149 0.952 0.746 0.572 0.382 0.162 -0.012 -0.184 -0.358 -0.547 -0.751 -0.888 -1.024 -1.228 -1.365 -1.505 -1.59 -1.767 -1.928 -2.09 -2.17 -2.442 -2.472 -2.568 -2.683 -2.98 -3.155 -3.355 -3.574 -3.802 -4.087 -4.471 -5.752 -10 ,28535 ,TETRA ,17558745,Sat Nov 27 02:19:42 CET,Sat Nov 27 04:20:29 CET,0.0 0.995 1.358 1.617 1.846 2.065 2.272 2.445 2.732 2.861 2.979 3.019 3.295 3.39 3.561 3.717 3.872 3.951 4.119 4.277 4.494 4.634 4.766 4.961 5.161 5.351 5.523 5.681 5.892 6.093 6.269 6.47 6.647 6.839 7.065 7.29 7.509 7.72 7.939 8.195 8.439 8.685 8.977 9.251 9.506 9.724 9.936 10.126 10.228 10.133 9.687 8.913 8.172 7.501 6.888 6.302 5.783 5.297 4.874 4.482 4.138 3.819 3.51 3.219 2.954 2.703 2.424 2.18 1.98 1.764 1.539 1.357 1.171 0.972 0.822 0.67 0.499 0.317 0.133 0.011 -0.121 -0.333 -0.472 -0.628 -0.713 -0.883 -1.07 -1.281 -1.395 -1.697 -1.754 -1.865 -1.984 -2.247 -2.404 -2.59 -2.79 -3.029 -3.306 -3.638 -4.637 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_33.txt deleted file mode 100644 index e5c142fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5624 ,TETRA ,17558746,Sat Nov 27 02:19:41 CET,Sat Nov 27 04:16:36 CET,0.0 0.824 1.156 1.401 1.59 1.766 1.929 2.067 2.301 2.413 2.52 2.548 2.818 2.911 3.093 3.253 3.406 3.487 3.637 3.761 3.932 4.037 4.14 4.299 4.439 4.577 4.724 4.867 5.046 5.214 5.374 5.566 5.732 5.894 6.104 6.316 6.503 6.722 6.976 7.24 7.49 7.768 8.105 8.425 8.765 9.079 9.418 9.762 10.031 10.252 10.241 9.851 9.387 8.876 8.381 7.917 7.497 7.092 6.721 6.35 6.024 5.731 5.446 5.172 4.926 4.704 4.464 4.245 4.049 3.85 3.64 3.462 3.282 3.092 2.933 2.758 2.578 2.397 2.22 2.107 1.995 1.813 1.678 1.532 1.456 1.288 1.12 0.95 0.855 0.584 0.553 0.449 0.339 0.097 -0.056 -0.227 -0.414 -0.633 -0.857 -1.139 -2.275 -2 ,13153 ,TETRA ,17558747,Sat Nov 27 02:20:42 CET,Sat Nov 27 04:16:33 CET,0.0 0.801 1.144 1.399 1.589 1.753 1.91 2.04 2.269 2.389 2.518 2.56 2.827 2.92 3.094 3.258 3.409 3.483 3.624 3.753 3.951 4.079 4.19 4.335 4.477 4.623 4.766 4.905 5.09 5.262 5.427 5.625 5.796 5.958 6.15 6.367 6.558 6.742 6.946 7.172 7.405 7.631 7.883 8.143 8.403 8.665 8.916 9.149 9.332 9.428 9.328 8.865 8.324 7.783 7.246 6.751 6.329 5.942 5.599 5.256 4.961 4.679 4.395 4.134 3.88 3.644 3.4 3.186 2.994 2.799 2.593 2.406 2.217 2.03 1.886 1.741 1.594 1.443 1.292 1.189 1.073 0.871 0.724 0.569 0.495 0.357 0.195 0.024 -0.06 -0.317 -0.357 -0.465 -0.575 -0.81 -0.936 -1.068 -1.218 -1.39 -1.613 -1.938 -2.888 -3 ,19956 ,TETRA ,17558748,Sat Nov 27 02:23:43 CET,Sat Nov 27 04:18:53 CET,0.0 0.872 1.228 1.453 1.657 1.824 1.968 2.122 2.404 2.516 2.634 2.688 2.982 3.092 3.29 3.483 3.655 3.729 3.872 4.011 4.194 4.301 4.398 4.547 4.701 4.847 4.994 5.135 5.299 5.468 5.639 5.829 5.999 6.164 6.349 6.539 6.728 6.936 7.15 7.379 7.611 7.88 8.161 8.389 8.648 8.932 9.201 9.43 9.608 9.694 9.56 9.108 8.55 7.956 7.408 6.919 6.479 6.088 5.745 5.379 5.058 4.772 4.501 4.231 3.981 3.752 3.5 3.277 3.087 2.908 2.727 2.564 2.397 2.227 2.095 1.95 1.803 1.659 1.513 1.407 1.291 1.12 0.997 0.867 0.802 0.667 0.515 0.357 0.276 0.016 0.016 -0.086 -0.195 -0.435 -0.563 -0.697 -0.848 -1.012 -1.208 -1.492 -2.414 -4 ,1859 ,TETRA ,17558749,Sat Nov 27 02:24:44 CET,Sat Nov 27 04:20:55 CET,0.0 0.683 0.944 1.158 1.361 1.538 1.685 1.811 2.062 2.182 2.293 2.317 2.595 2.692 2.896 3.079 3.221 3.29 3.429 3.556 3.731 3.85 3.959 4.11 4.258 4.399 4.523 4.645 4.809 4.965 5.108 5.269 5.431 5.584 5.752 5.959 6.163 6.365 6.577 6.805 7.022 7.261 7.535 7.787 8.045 8.305 8.605 8.875 9.08 9.193 9.102 8.676 8.12 7.574 7.061 6.558 6.108 5.698 5.333 4.967 4.647 4.359 4.096 3.838 3.591 3.372 3.148 2.946 2.764 2.562 2.36 2.197 2.027 1.847 1.713 1.579 1.428 1.274 1.109 0.984 0.854 0.657 0.513 0.368 0.302 0.166 0.005 -0.187 -0.297 -0.576 -0.594 -0.695 -0.795 -1.019 -1.144 -1.272 -1.423 -1.618 -1.868 -2.208 -3.065 -5 ,5333 ,TETRA ,17558750,Sat Nov 27 02:24:46 CET,Sat Nov 27 04:20:33 CET,0.0 1.126 1.495 1.73 1.93 2.102 2.252 2.391 2.64 2.763 2.895 2.979 3.278 3.396 3.62 3.823 4.017 4.108 4.271 4.422 4.651 4.794 4.936 5.14 5.332 5.524 5.699 5.863 6.076 6.283 6.481 6.692 6.869 7.039 7.244 7.464 7.68 7.916 8.16 8.392 8.603 8.845 9.111 9.347 9.597 9.853 10.156 10.454 10.691 10.807 10.654 10.224 9.689 9.147 8.648 8.178 7.735 7.309 6.95 6.597 6.292 6.02 5.753 5.493 5.265 5.07 4.856 4.645 4.449 4.241 4.036 3.874 3.699 3.508 3.357 3.194 3.019 2.845 2.667 2.542 2.417 2.213 2.07 1.924 1.853 1.697 1.53 1.384 1.31 1.045 1.028 0.928 0.817 0.566 0.417 0.272 0.143 0.001 -0.193 -0.464 -1.503 -6 ,15528 ,TETRA ,17558751,Sat Nov 27 02:27:41 CET,Sat Nov 27 04:15:25 CET,0.0 0.797 1.193 1.464 1.703 1.917 2.104 2.311 2.709 2.855 2.971 3.007 3.294 3.406 3.605 3.783 3.952 4.038 4.208 4.347 4.528 4.656 4.779 4.96 5.139 5.306 5.449 5.584 5.763 5.925 6.09 6.289 6.47 6.649 6.855 7.065 7.242 7.439 7.678 7.917 8.142 8.373 8.606 8.826 9.08 9.351 9.625 9.892 10.11 10.182 9.991 9.493 8.942 8.422 7.948 7.492 7.092 6.724 6.381 6.017 5.705 5.422 5.151 4.895 4.639 4.415 4.204 4.003 3.821 3.643 3.453 3.281 3.093 2.906 2.767 2.617 2.461 2.304 2.139 2.019 1.896 1.708 1.576 1.441 1.374 1.234 1.076 0.915 0.822 0.53 0.473 0.354 0.248 0.005 -0.138 -0.293 -0.471 -0.651 -0.841 -1.107 -1.996 -7 ,19251 ,TETRA ,17558752,Sat Nov 27 02:28:47 CET,Sat Nov 27 04:27:42 CET,0.0 0.885 1.279 1.608 1.852 2.054 2.221 2.375 2.638 2.754 2.858 2.874 3.137 3.221 3.391 3.562 3.724 3.798 3.935 4.078 4.278 4.398 4.515 4.675 4.826 4.961 5.108 5.258 5.436 5.604 5.758 5.937 6.117 6.286 6.472 6.689 6.892 7.083 7.274 7.47 7.67 7.909 8.187 8.43 8.682 8.935 9.166 9.387 9.61 9.747 9.629 9.134 8.6 8.102 7.587 7.103 6.686 6.282 5.936 5.577 5.255 4.961 4.666 4.387 4.124 3.888 3.649 3.439 3.25 3.036 2.823 2.658 2.482 2.302 2.164 2.021 1.878 1.726 1.563 1.455 1.337 1.153 1.026 0.88 0.804 0.66 0.508 0.33 0.233 -0.053 -0.105 -0.222 -0.352 -0.595 -0.705 -0.831 -0.979 -1.136 -1.31 -1.588 -2.362 -8 ,1961 ,TETRA ,17558753,Sat Nov 27 02:28:47 CET,Sat Nov 27 04:24:48 CET,0.0 0.906 1.255 1.499 1.674 1.843 2.0 2.147 2.434 2.563 2.673 2.705 2.989 3.083 3.273 3.448 3.611 3.686 3.823 3.962 4.16 4.275 4.387 4.564 4.756 4.954 5.134 5.286 5.466 5.659 5.838 6.016 6.179 6.338 6.525 6.741 6.954 7.178 7.408 7.619 7.829 8.074 8.329 8.568 8.811 9.05 9.317 9.574 9.783 9.877 9.749 9.296 8.753 8.233 7.748 7.291 6.887 6.494 6.133 5.777 5.465 5.186 4.914 4.65 4.416 4.194 3.954 3.753 3.58 3.394 3.203 3.034 2.862 2.682 2.532 2.373 2.213 2.055 1.893 1.772 1.642 1.447 1.306 1.163 1.09 0.941 0.799 0.649 0.563 0.295 0.3 0.203 0.101 -0.103 -0.225 -0.368 -0.512 -0.668 -0.853 -1.086 -1.774 -9 ,7185 ,TETRA ,17558754,Sat Nov 27 02:29:45 CET,Sat Nov 27 04:31:42 CET,0.0 0.891 1.223 1.493 1.712 1.88 2.03 2.179 2.432 2.537 2.637 2.619 2.877 2.959 3.104 3.252 3.41 3.491 3.638 3.762 3.933 4.04 4.151 4.327 4.497 4.664 4.841 5.006 5.209 5.412 5.618 5.87 6.096 6.319 6.565 6.804 7.002 7.225 7.477 7.752 8.021 8.305 8.625 8.919 9.258 9.6 9.986 10.334 10.599 10.785 10.747 10.298 9.706 9.132 8.631 8.154 7.708 7.266 6.889 6.526 6.198 5.884 5.58 5.303 5.035 4.788 4.538 4.298 4.087 3.892 3.694 3.526 3.365 3.188 3.038 2.881 2.723 2.555 2.389 2.279 2.16 1.977 1.84 1.693 1.621 1.457 1.287 1.137 1.057 0.799 0.808 0.708 0.597 0.354 0.214 0.044 -0.146 -0.317 -0.507 -0.77 -1.504 -10 ,18584 ,TETRA ,17558755,Sat Nov 27 02:29:47 CET,Sat Nov 27 04:31:31 CET,0.0 1.079 1.369 1.578 1.758 1.935 2.091 2.227 2.482 2.6 2.711 2.757 3.037 3.134 3.312 3.48 3.643 3.717 3.852 3.983 4.212 4.368 4.513 4.744 4.953 5.118 5.259 5.391 5.572 5.773 5.976 6.216 6.432 6.62 6.826 7.031 7.214 7.421 7.643 7.868 8.089 8.325 8.614 8.879 9.122 9.355 9.624 9.882 10.079 10.181 10.097 9.639 9.046 8.485 8.003 7.561 7.157 6.77 6.411 6.047 5.739 5.456 5.191 4.935 4.689 4.465 4.22 4.003 3.815 3.618 3.422 3.258 3.084 2.903 2.77 2.631 2.476 2.321 2.165 2.052 1.934 1.753 1.621 1.482 1.41 1.252 1.102 0.955 0.874 0.625 0.619 0.513 0.399 0.173 0.042 -0.105 -0.268 -0.468 -0.685 -0.991 -1.91 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_34.txt deleted file mode 100644 index bb37bc9b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25 ,TETRA ,17558756,Sat Nov 27 02:30:48 CET,Sat Nov 27 04:27:59 CET,0.0 1.213 1.712 2.078 2.386 2.654 2.889 3.103 3.428 3.582 3.723 3.78 4.066 4.173 4.393 4.596 4.774 4.859 5.015 5.179 5.411 5.549 5.693 5.909 6.113 6.292 6.46 6.62 6.825 7.032 7.229 7.456 7.688 7.909 8.135 8.377 8.59 8.833 9.097 9.355 9.617 9.878 10.173 10.486 10.81 11.132 11.561 12.058 12.453 12.771 12.887 12.534 12.008 11.474 10.966 10.471 10.023 9.596 9.214 8.834 8.499 8.203 7.931 7.675 7.437 7.219 6.985 6.78 6.604 6.421 6.218 6.043 5.864 5.674 5.532 5.377 5.208 5.036 4.856 4.727 4.591 4.393 4.257 4.111 4.034 3.878 3.713 3.525 3.419 3.126 3.091 2.986 2.872 2.596 2.435 2.254 2.054 1.834 1.584 1.278 0.696 -2 ,22377 ,TETRA ,17558757,Sat Nov 27 02:31:46 CET,Sat Nov 27 04:28:37 CET,0.0 2.002 2.501 2.822 3.097 3.3 3.483 3.677 4.031 4.179 4.324 4.439 4.751 4.874 5.099 5.3 5.493 5.584 5.765 5.95 6.259 6.448 6.591 6.795 6.993 7.18 7.365 7.55 7.777 7.979 8.18 8.437 8.673 8.895 9.147 9.418 9.675 9.938 10.218 10.516 10.808 11.121 11.481 11.857 12.295 12.747 13.239 13.713 14.132 14.503 14.73 14.573 14.211 13.797 13.387 12.95 12.517 12.099 11.716 11.353 11.057 10.785 10.511 10.241 9.999 9.776 9.529 9.306 9.109 8.924 8.737 8.563 8.372 8.158 7.991 7.832 7.673 7.497 7.306 7.173 7.04 6.828 6.671 6.507 6.42 6.251 6.081 5.873 5.758 5.467 5.401 5.267 5.12 4.785 4.607 4.412 4.185 3.937 3.631 3.24 2.106 -3 ,26737 ,TETRA ,17558758,Sat Nov 27 02:35:53 CET,Sat Nov 27 04:31:11 CET,0.0 1.595 2.084 2.427 2.742 3.028 3.287 3.514 3.886 4.055 4.221 4.348 4.658 4.796 5.049 5.292 5.532 5.642 5.858 6.049 6.288 6.449 6.608 6.843 7.06 7.245 7.423 7.609 7.859 8.105 8.343 8.623 8.88 9.115 9.365 9.621 9.876 10.152 10.418 10.696 11.009 11.36 11.759 12.147 12.558 12.964 13.384 13.835 14.294 14.699 14.911 14.687 14.253 13.827 13.405 12.995 12.637 12.281 11.969 11.641 11.342 11.079 10.829 10.587 10.35 10.13 9.894 9.686 9.503 9.299 9.085 8.91 8.729 8.537 8.383 8.23 8.08 7.931 7.774 7.653 7.524 7.325 7.188 7.051 6.979 6.821 6.657 6.489 6.4 6.128 6.102 5.997 5.885 5.641 5.505 5.352 5.189 5.03 4.835 4.516 2.706 -4 ,2191 ,TETRA ,17558759,Sat Nov 27 02:36:51 CET,Sat Nov 27 04:33:39 CET,0.0 1.273 1.712 2.044 2.288 2.504 2.702 2.872 3.205 3.353 3.492 3.565 3.853 3.965 4.186 4.395 4.59 4.691 4.869 5.028 5.263 5.409 5.554 5.755 5.943 6.124 6.292 6.455 6.66 6.858 7.049 7.26 7.464 7.651 7.873 8.13 8.369 8.613 8.867 9.146 9.426 9.76 10.188 10.607 11.07 11.576 12.087 12.557 13.002 13.448 13.761 13.531 13.09 12.603 12.158 11.789 11.428 11.046 10.702 10.349 10.033 9.723 9.409 9.133 8.884 8.653 8.41 8.188 7.998 7.81 7.623 7.468 7.304 7.132 6.983 6.825 6.678 6.531 6.369 6.254 6.14 5.949 5.808 5.662 5.59 5.455 5.307 5.126 5.029 4.766 4.753 4.648 4.541 4.291 4.159 4.04 3.889 3.691 3.466 3.158 2.071 -5 ,12796 ,TETRA ,17558760,Sat Nov 27 02:36:50 CET,Sat Nov 27 04:28:22 CET,0.0 1.553 1.948 2.303 2.61 2.872 3.103 3.298 3.666 3.839 3.992 4.079 4.363 4.474 4.699 4.908 5.109 5.196 5.359 5.522 5.769 5.918 6.054 6.244 6.421 6.6 6.771 6.944 7.16 7.359 7.533 7.716 7.903 8.101 8.323 8.584 8.826 9.067 9.317 9.576 9.866 10.183 10.531 10.86 11.203 11.572 11.931 12.262 12.622 12.882 12.849 12.552 12.129 11.682 11.265 10.86 10.516 10.192 9.879 9.538 9.237 8.965 8.692 8.428 8.192 7.985 7.756 7.537 7.352 7.154 6.949 6.781 6.6 6.399 6.243 6.092 5.933 5.773 5.608 5.484 5.353 5.157 5.025 4.89 4.814 4.663 4.526 4.365 4.27 4.005 4.012 3.908 3.788 3.523 3.358 3.193 3.021 2.825 2.596 2.297 1.25 -6 ,3439 ,TETRA ,17558761,Sat Nov 27 02:36:52 CET,Sat Nov 27 04:33:28 CET,0.0 2.374 2.964 3.39 3.721 4.018 4.285 4.537 4.969 5.145 5.325 5.494 5.814 5.955 6.248 6.533 6.799 6.935 7.216 7.446 7.754 7.974 8.182 8.462 8.729 8.969 9.185 9.391 9.634 9.855 10.054 10.278 10.498 10.699 10.914 11.167 11.414 11.676 11.95 12.236 12.522 12.821 13.14 13.439 13.812 14.221 14.643 15.037 15.397 15.67 15.635 15.315 14.881 14.402 13.951 13.493 13.08 12.721 12.395 12.054 11.769 11.51 11.256 11.017 10.781 10.57 10.354 10.147 9.965 9.773 9.577 9.425 9.251 9.055 8.902 8.755 8.609 8.455 8.277 8.157 8.035 7.828 7.694 7.557 7.486 7.34 7.189 7.026 6.941 6.686 6.691 6.591 6.49 6.291 6.161 6.0 5.832 5.657 5.421 5.121 3.963 -7 ,18022 ,TETRA ,17558762,Sat Nov 27 02:37:49 CET,Sat Nov 27 04:34:12 CET,0.0 1.163 1.555 1.87 2.099 2.283 2.455 2.627 2.935 3.058 3.197 3.341 3.67 3.791 4.025 4.263 4.477 4.572 4.759 4.938 5.177 5.326 5.474 5.69 5.902 6.101 6.304 6.491 6.712 6.928 7.124 7.369 7.607 7.834 8.112 8.416 8.693 8.98 9.273 9.579 9.888 10.224 10.557 10.855 11.215 11.617 12.05 12.456 12.869 13.224 13.231 12.812 12.237 11.613 11.016 10.447 9.953 9.524 9.145 8.745 8.398 8.09 7.797 7.505 7.233 7.001 6.756 6.535 6.349 6.142 5.91 5.714 5.517 5.318 5.167 5.004 4.825 4.642 4.444 4.299 4.158 3.963 3.833 3.692 3.617 3.471 3.314 3.134 3.043 2.786 2.786 2.684 2.579 2.369 2.26 2.14 1.99 1.802 1.609 1.354 0.849 -8 ,21987 ,TETRA ,17558763,Sat Nov 27 02:36:52 CET,Sat Nov 27 04:33:11 CET,0.0 1.138 1.604 1.895 2.132 2.36 2.571 2.789 3.23 3.434 3.607 3.719 4.049 4.192 4.448 4.687 4.929 5.044 5.243 5.437 5.731 5.925 6.121 6.399 6.65 6.893 7.168 7.427 7.688 7.917 8.152 8.457 8.741 9.001 9.305 9.649 9.946 10.248 10.602 10.982 11.359 11.748 12.17 12.593 13.044 13.521 14.034 14.552 15.081 15.474 15.615 15.392 15.014 14.522 13.992 13.515 13.104 12.723 12.364 11.993 11.678 11.382 11.07 10.764 10.481 10.208 9.904 9.645 9.418 9.195 8.973 8.774 8.585 8.405 8.255 8.093 7.926 7.745 7.549 7.413 7.273 7.049 6.883 6.697 6.604 6.405 6.2 5.992 5.882 5.601 5.511 5.376 5.241 4.924 4.762 4.578 4.361 4.117 3.841 3.52 2.937 -9 ,28543 ,TETRA ,17558765,Sat Nov 27 02:37:50 CET,Sat Nov 27 04:35:23 CET,0.0 1.714 2.187 2.557 2.836 3.051 3.254 3.44 3.74 3.882 4.032 4.148 4.467 4.595 4.807 5.031 5.252 5.354 5.555 5.748 6.049 6.234 6.396 6.618 6.835 7.043 7.235 7.411 7.624 7.823 7.999 8.211 8.412 8.609 8.838 9.087 9.337 9.609 9.878 10.135 10.422 10.765 11.131 11.467 11.822 12.192 12.573 12.957 13.28 13.498 13.489 13.032 12.566 12.154 11.743 11.326 10.931 10.567 10.251 9.915 9.618 9.359 9.1 8.853 8.626 8.413 8.192 7.993 7.826 7.656 7.463 7.301 7.133 6.958 6.814 6.67 6.524 6.377 6.228 6.118 6.0 5.818 5.694 5.566 5.498 5.354 5.202 5.045 4.96 4.69 4.671 4.572 4.471 4.265 4.149 4.002 3.818 3.605 3.352 3.033 1.811 -10 ,29845 ,TETRA ,17558766,Sat Nov 27 02:39:51 CET,Sat Nov 27 04:36:14 CET,0.0 0.984 1.305 1.558 1.775 1.975 2.154 2.32 2.605 2.738 2.865 2.936 3.254 3.384 3.615 3.836 4.037 4.127 4.298 4.46 4.7 4.85 4.991 5.172 5.355 5.542 5.706 5.875 6.097 6.296 6.484 6.723 6.963 7.188 7.448 7.745 8.017 8.28 8.536 8.81 9.104 9.411 9.759 10.12 10.492 10.822 11.165 11.531 11.88 12.124 12.061 11.646 11.149 10.624 10.108 9.626 9.206 8.813 8.461 8.089 7.749 7.44 7.163 6.898 6.642 6.4 6.146 5.919 5.719 5.51 5.289 5.096 4.899 4.704 4.555 4.403 4.241 4.064 3.881 3.752 3.616 3.403 3.257 3.106 3.025 2.833 2.639 2.461 2.37 2.114 2.072 1.953 1.837 1.593 1.463 1.302 1.114 0.925 0.727 0.387 -0.423 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_37.txt deleted file mode 100644 index 4f9aa42e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15738 ,TETRA ,17558767,Sat Nov 27 02:40:51 CET,Sat Nov 27 04:37:17 CET,0.0 1.754 2.257 2.642 2.944 3.208 3.472 3.716 4.136 4.32 4.491 4.637 4.962 5.11 5.391 5.663 5.905 6.005 6.183 6.362 6.637 6.815 6.974 7.193 7.396 7.595 7.811 8.017 8.247 8.469 8.696 8.979 9.262 9.504 9.745 10.042 10.318 10.553 10.782 11.007 11.246 11.51 11.78 12.029 12.301 12.546 12.689 12.695 12.575 12.27 11.5 10.321 9.225 8.27 7.422 6.627 5.931 5.327 4.807 4.282 3.822 3.408 3.041 2.685 2.345 2.046 1.717 1.429 1.195 0.953 0.704 0.494 0.281 0.04 -0.157 -0.341 -0.528 -0.72 -0.925 -1.071 -1.219 -1.454 -1.631 -1.813 -1.902 -2.093 -2.291 -2.499 -2.606 -2.9 -2.941 -3.08 -3.226 -3.508 -3.67 -3.836 -4.021 -4.221 -4.446 -4.734 -5.177 -2 ,5308 ,TETRA ,17558768,Sat Nov 27 02:40:51 CET,Sat Nov 27 04:38:41 CET,0.0 1.846 2.404 2.771 3.072 3.341 3.604 3.843 4.242 4.413 4.574 4.703 5.02 5.165 5.446 5.704 5.922 6.03 6.249 6.45 6.717 6.883 7.04 7.268 7.481 7.68 7.885 8.078 8.328 8.566 8.777 9.038 9.284 9.501 9.73 9.958 10.174 10.414 10.662 10.925 11.189 11.463 11.738 11.947 12.147 12.347 12.487 12.548 12.514 12.194 11.295 10.033 8.921 7.935 7.052 6.257 5.575 4.948 4.392 3.84 3.367 2.943 2.533 2.163 1.829 1.511 1.167 0.868 0.622 0.359 0.079 -0.145 -0.369 -0.604 -0.787 -0.975 -1.166 -1.369 -1.586 -1.727 -1.866 -2.103 -2.262 -2.415 -2.502 -2.7 -2.914 -3.128 -3.235 -3.531 -3.575 -3.703 -3.839 -4.13 -4.306 -4.49 -4.666 -4.876 -5.14 -5.448 -6.028 -3 ,3945 ,TETRA ,17558769,Sat Nov 27 02:41:48 CET,Sat Nov 27 04:41:43 CET,0.0 1.929 2.479 2.856 3.158 3.435 3.674 3.887 4.268 4.443 4.61 4.755 5.081 5.226 5.497 5.734 5.959 6.069 6.286 6.495 6.785 6.956 7.12 7.361 7.583 7.796 7.999 8.173 8.397 8.613 8.81 9.045 9.274 9.493 9.722 9.972 10.214 10.471 10.725 10.972 11.225 11.491 11.768 12.021 12.267 12.452 12.608 12.708 12.657 12.351 11.528 10.283 9.159 8.15 7.263 6.485 5.828 5.257 4.767 4.255 3.806 3.42 3.042 2.675 2.352 2.051 1.735 1.465 1.236 0.987 0.73 0.523 0.292 0.057 -0.117 -0.312 -0.509 -0.72 -0.947 -1.092 -1.239 -1.481 -1.655 -1.84 -1.928 -2.095 -2.281 -2.481 -2.578 -2.86 -2.89 -3.004 -3.134 -3.421 -3.559 -3.705 -3.868 -4.051 -4.279 -4.554 -5.312 -4 ,19531 ,TETRA ,17558770,Sat Nov 27 02:41:48 CET,Sat Nov 27 04:38:59 CET,0.0 2.384 3.012 3.424 3.761 4.036 4.279 4.512 4.918 5.099 5.267 5.424 5.775 5.926 6.209 6.454 6.682 6.789 6.981 7.156 7.404 7.552 7.694 7.9 8.097 8.285 8.466 8.658 8.894 9.103 9.302 9.556 9.818 10.053 10.294 10.546 10.774 11.035 11.313 11.577 11.836 12.083 12.318 12.531 12.736 12.917 13.064 13.145 13.108 12.781 11.893 10.655 9.608 8.657 7.817 7.064 6.376 5.743 5.204 4.68 4.234 3.838 3.47 3.119 2.791 2.493 2.173 1.884 1.638 1.392 1.144 0.943 0.721 0.492 0.316 0.142 -0.046 -0.244 -0.443 -0.583 -0.719 -0.927 -1.078 -1.231 -1.308 -1.474 -1.651 -1.843 -1.944 -2.236 -2.253 -2.372 -2.494 -2.765 -2.916 -3.063 -3.224 -3.398 -3.609 -3.887 -4.609 -5 ,27594 ,TETRA ,17558771,Sat Nov 27 02:41:50 CET,Sat Nov 27 04:41:40 CET,0.0 2.235 2.652 2.971 3.23 3.467 3.691 3.902 4.257 4.392 4.536 4.673 4.985 5.1 5.316 5.542 5.765 5.871 6.091 6.306 6.6 6.762 6.901 7.117 7.338 7.566 7.793 7.992 8.234 8.462 8.669 8.906 9.122 9.327 9.576 9.842 10.078 10.336 10.605 10.864 11.108 11.373 11.652 11.881 12.107 12.304 12.493 12.623 12.607 12.337 11.554 10.348 9.275 8.345 7.508 6.701 5.995 5.383 4.854 4.321 3.871 3.478 3.069 2.675 2.334 2.033 1.71 1.425 1.178 0.907 0.618 0.385 0.157 -0.071 -0.246 -0.431 -0.621 -0.83 -1.051 -1.207 -1.386 -1.662 -1.841 -2.011 -2.097 -2.288 -2.475 -2.659 -2.763 -3.066 -3.155 -3.307 -3.461 -3.767 -3.942 -4.12 -4.304 -4.518 -4.715 -4.898 -5.206 -6 ,6382 ,TETRA ,17558772,Sat Nov 27 02:42:39 CET,Sat Nov 27 04:41:39 CET,0.0 2.594 3.187 3.603 3.889 4.125 4.335 4.497 4.806 4.963 5.101 5.212 5.538 5.684 5.931 6.154 6.371 6.479 6.703 6.909 7.207 7.403 7.594 7.865 8.093 8.296 8.486 8.667 8.896 9.114 9.318 9.562 9.814 10.054 10.304 10.555 10.791 11.03 11.271 11.516 11.745 11.996 12.276 12.508 12.739 12.954 13.1 13.18 13.187 12.981 12.377 11.301 10.226 9.282 8.438 7.665 6.984 6.371 5.869 5.376 4.945 4.555 4.18 3.832 3.512 3.217 2.895 2.61 2.379 2.147 1.891 1.659 1.41 1.157 0.969 0.77 0.572 0.371 0.158 0.015 -0.134 -0.368 -0.538 -0.714 -0.801 -0.986 -1.179 -1.388 -1.512 -1.826 -1.873 -1.982 -2.094 -2.355 -2.497 -2.633 -2.78 -2.965 -3.207 -3.486 -4.015 -7 ,14989 ,TETRA ,17558773,Sat Nov 27 02:42:39 CET,Sat Nov 27 04:40:09 CET,0.0 1.612 2.06 2.363 2.626 2.856 3.086 3.303 3.632 3.78 3.936 4.039 4.348 4.483 4.715 4.922 5.126 5.219 5.401 5.582 5.846 6.013 6.171 6.391 6.593 6.779 6.951 7.118 7.341 7.557 7.784 8.061 8.307 8.524 8.732 8.944 9.154 9.379 9.61 9.83 10.047 10.271 10.484 10.688 10.903 11.069 11.229 11.323 11.24 10.854 9.798 8.293 7.027 5.972 5.089 4.285 3.608 3.029 2.517 1.989 1.521 1.091 0.644 0.211 -0.175 -0.523 -0.887 -1.213 -1.49 -1.764 -2.022 -2.236 -2.457 -2.68 -2.868 -3.064 -3.259 -3.469 -3.69 -3.845 -4.019 -4.28 -4.448 -4.624 -4.717 -4.909 -5.1 -5.3 -5.405 -5.705 -5.764 -5.884 -6.009 -6.299 -6.448 -6.601 -6.789 -6.997 -7.21 -7.491 -8.144 -8 ,29886 ,TETRA ,17558774,Sat Nov 27 02:42:41 CET,Sat Nov 27 04:38:53 CET,0.0 1.117 1.574 1.962 2.277 2.552 2.776 2.99 3.384 3.565 3.73 3.866 4.196 4.339 4.613 4.844 5.05 5.153 5.348 5.533 5.793 5.949 6.107 6.334 6.541 6.745 6.942 7.126 7.344 7.551 7.76 8.006 8.239 8.462 8.715 8.981 9.209 9.445 9.709 9.96 10.181 10.433 10.725 10.973 11.22 11.434 11.558 11.605 11.553 11.232 10.44 9.298 8.232 7.289 6.435 5.656 4.983 4.366 3.829 3.283 2.789 2.346 1.951 1.576 1.212 0.883 0.541 0.224 -0.057 -0.341 -0.646 -0.905 -1.178 -1.471 -1.691 -1.908 -2.142 -2.393 -2.646 -2.83 -3.02 -3.307 -3.496 -3.692 -3.801 -4.039 -4.288 -4.536 -4.66 -4.971 -5.047 -5.195 -5.353 -5.679 -5.866 -6.068 -6.277 -6.506 -6.781 -7.117 -7.791 -9 ,25095 ,TETRA ,17558775,Sat Nov 27 02:43:39 CET,Sat Nov 27 04:41:12 CET,0.0 1.404 1.85 2.153 2.393 2.621 2.821 2.998 3.381 3.585 3.765 3.897 4.206 4.327 4.555 4.763 4.955 5.045 5.228 5.403 5.663 5.818 5.967 6.192 6.385 6.566 6.745 6.91 7.112 7.302 7.489 7.703 7.884 8.068 8.291 8.531 8.738 8.932 9.129 9.321 9.498 9.687 9.902 10.092 10.276 10.49 10.687 10.733 10.634 10.286 9.387 8.188 7.115 6.131 5.254 4.46 3.77 3.158 2.646 2.136 1.684 1.283 0.907 0.541 0.201 -0.101 -0.425 -0.716 -0.959 -1.203 -1.459 -1.675 -1.904 -2.135 -2.312 -2.5 -2.708 -2.927 -3.172 -3.342 -3.496 -3.729 -3.906 -4.097 -4.188 -4.359 -4.533 -4.731 -4.839 -5.129 -5.158 -5.282 -5.418 -5.715 -5.873 -6.027 -6.19 -6.38 -6.578 -6.806 -7.541 -10 ,3479 ,TETRA ,17558776,Sat Nov 27 02:43:39 CET,Sat Nov 27 04:43:36 CET,0.0 1.353 1.74 2.042 2.287 2.5 2.696 2.855 3.151 3.291 3.425 3.517 3.824 3.93 4.145 4.353 4.539 4.629 4.797 4.972 5.228 5.38 5.527 5.736 5.92 6.094 6.283 6.459 6.678 6.878 7.036 7.219 7.394 7.563 7.763 7.981 8.163 8.358 8.549 8.725 8.906 9.093 9.265 9.394 9.508 9.548 9.546 9.496 9.27 8.765 7.738 6.392 5.248 4.195 3.294 2.528 1.854 1.238 0.729 0.225 -0.221 -0.604 -0.956 -1.301 -1.641 -1.949 -2.254 -2.529 -2.771 -3.009 -3.246 -3.446 -3.652 -3.858 -4.026 -4.205 -4.393 -4.581 -4.772 -4.905 -5.034 -5.24 -5.396 -5.558 -5.64 -5.82 -6.012 -6.211 -6.31 -6.599 -6.618 -6.727 -6.855 -7.141 -7.282 -7.421 -7.592 -7.81 -8.056 -8.345 -9.215 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_38.txt deleted file mode 100644 index 20987c83..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_38.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24551 ,KEBNE ,17024726,Wed Dec 22 10:52:09 CET,Wed Dec 22 12:32:36 CET,0.0 2.021 2.473 2.837 3.137 3.41 3.649 3.869 4.253 4.409 4.552 4.656 4.998 5.147 5.41 5.642 5.868 5.977 6.177 6.365 6.647 6.834 7.014 7.271 7.516 7.738 7.947 8.15 8.401 8.643 8.875 9.136 9.397 9.647 9.911 10.219 10.497 10.778 11.091 11.418 11.742 12.1 12.475 12.811 13.184 13.524 13.831 14.14 14.446 14.567 14.21 13.364 12.496 11.741 11.137 10.617 10.091 9.554 9.066 8.573 8.162 7.797 7.447 7.109 6.797 6.513 6.223 5.965 5.745 5.528 5.29 5.083 4.877 4.66 4.473 4.283 4.088 3.886 3.672 3.527 3.382 3.148 2.993 2.836 2.758 2.599 2.419 2.22 2.116 1.825 1.762 1.614 1.445 1.084 0.879 0.647 0.386 0.084 -0.284 -0.839 -3.085 -2 ,22015 ,KEBNE ,17024727,Wed Dec 22 10:55:18 CET,Wed Dec 22 12:37:17 CET,0.0 2.278 2.905 3.34 3.616 3.846 4.074 4.283 4.665 4.841 4.994 5.095 5.396 5.519 5.778 6.018 6.256 6.379 6.601 6.803 7.085 7.268 7.439 7.691 7.942 8.189 8.42 8.621 8.88 9.123 9.349 9.614 9.862 10.1 10.356 10.636 10.9 11.185 11.498 11.852 12.22 12.567 12.948 13.308 13.676 14.051 14.389 14.674 14.948 15.098 14.888 14.206 13.384 12.567 11.837 11.194 10.627 10.102 9.656 9.221 8.838 8.499 8.183 7.88 7.59 7.313 7.03 6.78 6.553 6.323 6.086 5.884 5.672 5.461 5.304 5.131 4.94 4.752 4.56 4.419 4.277 4.057 3.903 3.742 3.658 3.492 3.307 3.091 2.98 2.678 2.567 2.389 2.23 1.939 1.793 1.633 1.446 1.231 0.976 0.64 -1.502 -3 ,7232 ,KEBNE ,17024728,Wed Dec 22 10:55:18 CET,Wed Dec 22 12:37:07 CET,0.0 1.7 2.198 2.561 2.9 3.272 3.589 3.874 4.401 4.62 4.812 4.973 5.325 5.509 5.825 6.092 6.358 6.486 6.729 6.95 7.271 7.476 7.673 7.95 8.183 8.415 8.635 8.835 9.091 9.333 9.576 9.884 10.189 10.461 10.768 11.121 11.448 11.787 12.125 12.485 12.866 13.259 13.684 14.084 14.555 15.023 15.429 15.781 16.004 16.085 15.881 15.187 14.426 13.696 13.008 12.386 11.825 11.349 10.933 10.471 10.048 9.668 9.311 8.968 8.632 8.319 7.991 7.697 7.463 7.239 7.0 6.783 6.549 6.31 6.128 5.942 5.75 5.548 5.337 5.196 5.058 4.831 4.662 4.485 4.399 4.224 4.039 3.833 3.724 3.429 3.345 3.201 3.054 2.752 2.589 2.392 2.155 1.893 1.587 1.202 0.088 -4 ,15506 ,KEBNE ,17024729,Wed Dec 22 10:57:22 CET,Wed Dec 22 12:39:03 CET,0.0 2.819 3.378 3.796 4.14 4.428 4.679 4.87 5.189 5.35 5.524 5.657 5.978 6.128 6.39 6.639 6.884 6.998 7.208 7.416 7.728 7.924 8.105 8.358 8.6 8.834 9.055 9.26 9.516 9.744 9.954 10.217 10.475 10.723 10.997 11.29 11.565 11.879 12.204 12.524 12.851 13.197 13.579 13.923 14.291 14.691 15.124 15.498 15.724 15.714 15.323 14.536 13.734 12.95 12.238 11.59 11.03 10.526 10.063 9.596 9.202 8.845 8.489 8.167 7.878 7.612 7.321 7.053 6.835 6.609 6.367 6.175 5.971 5.754 5.57 5.363 5.144 4.928 4.721 4.576 4.427 4.187 4.011 3.841 3.758 3.57 3.371 3.178 3.076 2.776 2.704 2.566 2.421 2.125 1.959 1.782 1.579 1.318 0.948 0.441 -1.147 -5 ,10174 ,KEBNE ,17024730,Wed Dec 22 10:57:22 CET,Wed Dec 22 12:39:10 CET,0.0 2.708 3.365 3.771 4.086 4.356 4.622 4.857 5.275 5.469 5.632 5.772 6.107 6.251 6.51 6.748 6.982 7.1 7.335 7.549 7.842 8.022 8.196 8.457 8.691 8.908 9.13 9.346 9.615 9.879 10.143 10.452 10.724 10.979 11.281 11.618 11.911 12.215 12.557 12.902 13.253 13.65 14.077 14.49 14.926 15.359 15.842 16.296 16.709 17.011 16.877 16.319 15.643 14.975 14.387 13.81 13.263 12.745 12.303 11.864 11.454 11.074 10.688 10.291 9.932 9.615 9.306 9.032 8.767 8.495 8.228 8.014 7.792 7.559 7.366 7.163 6.939 6.713 6.491 6.33 6.174 5.935 5.762 5.569 5.465 5.271 5.076 4.85 4.719 4.4 4.286 4.105 3.92 3.562 3.382 3.202 3.004 2.743 2.38 1.945 0.372 -6 ,17681 ,KEBNE ,17024731,Wed Dec 22 10:58:23 CET,Wed Dec 22 12:40:04 CET,0.0 1.93 2.431 2.832 3.206 3.542 3.82 4.068 4.525 4.737 4.924 5.071 5.401 5.562 5.891 6.18 6.431 6.545 6.758 6.968 7.277 7.472 7.644 7.901 8.175 8.438 8.677 8.892 9.154 9.398 9.638 9.919 10.209 10.504 10.828 11.18 11.504 11.885 12.296 12.693 13.124 13.621 14.159 14.675 15.261 15.814 16.352 16.888 17.392 17.748 17.764 17.226 16.449 15.687 14.977 14.325 13.772 13.253 12.78 12.299 11.868 11.497 11.156 10.813 10.485 10.205 9.92 9.668 9.457 9.227 8.985 8.778 8.567 8.35 8.178 8.002 7.823 7.642 7.448 7.311 7.172 6.944 6.768 6.582 6.495 6.319 6.118 5.915 5.808 5.505 5.464 5.345 5.198 4.871 4.703 4.514 4.281 4.021 3.779 3.452 1.743 -7 ,24761 ,KEBNE ,17024732,Wed Dec 22 10:58:23 CET,Wed Dec 22 12:39:29 CET,0.0 3.193 3.772 4.2 4.575 4.863 5.11 5.337 5.713 5.89 6.069 6.242 6.579 6.721 6.964 7.203 7.432 7.553 7.788 8.002 8.305 8.505 8.704 8.972 9.215 9.438 9.653 9.866 10.137 10.394 10.634 10.916 11.174 11.419 11.706 12.01 12.286 12.593 12.918 13.257 13.591 13.949 14.362 14.75 15.166 15.622 16.08 16.464 16.775 16.96 16.827 16.176 15.461 14.772 14.148 13.566 13.024 12.498 12.045 11.575 11.15 10.794 10.453 10.107 9.779 9.482 9.178 8.911 8.667 8.41 8.152 7.944 7.724 7.495 7.311 7.124 6.934 6.727 6.503 6.32 6.139 5.9 5.722 5.532 5.436 5.249 5.057 4.851 4.728 4.417 4.338 4.202 4.071 3.781 3.634 3.479 3.288 2.995 2.624 2.108 -0.17 -8 ,3611 ,KEBNE ,17024733,Wed Dec 22 10:58:23 CET,Wed Dec 22 12:39:51 CET,0.0 2.292 2.857 3.267 3.589 3.847 4.087 4.29 4.635 4.806 4.958 5.081 5.406 5.543 5.823 6.073 6.287 6.388 6.588 6.794 7.085 7.266 7.434 7.678 7.913 8.133 8.353 8.561 8.819 9.068 9.304 9.595 9.879 10.148 10.467 10.823 11.129 11.439 11.774 12.116 12.461 12.877 13.324 13.683 14.06 14.466 14.89 15.227 15.425 15.532 15.355 14.717 13.967 13.224 12.575 11.963 11.397 10.881 10.427 9.983 9.611 9.281 8.959 8.643 8.352 8.098 7.839 7.609 7.403 7.179 6.949 6.748 6.521 6.291 6.119 5.945 5.775 5.596 5.399 5.268 5.135 4.919 4.767 4.607 4.52 4.319 4.111 3.88 3.749 3.443 3.328 3.175 3.027 2.74 2.578 2.388 2.162 1.901 1.626 1.269 0.451 -9 ,27525 ,KEBNE ,17024734,Wed Dec 22 10:58:23 CET,Wed Dec 22 12:38:53 CET,0.0 4.641 5.277 5.739 6.125 6.452 6.727 6.957 7.368 7.564 7.757 7.957 8.307 8.464 8.739 9.008 9.265 9.383 9.608 9.813 10.121 10.331 10.53 10.819 11.1 11.359 11.597 11.815 12.084 12.343 12.612 12.931 13.245 13.543 13.861 14.208 14.555 14.924 15.305 15.685 16.041 16.437 16.9 17.343 17.798 18.296 18.793 19.222 19.601 19.746 19.455 18.666 17.818 17.067 16.378 15.728 15.161 14.659 14.22 13.78 13.414 13.074 12.725 12.392 12.078 11.794 11.51 11.256 11.033 10.795 10.538 10.325 10.108 9.891 9.721 9.541 9.355 9.167 8.963 8.817 8.681 8.449 8.28 8.102 8.007 7.827 7.646 7.454 7.357 7.062 7.003 6.877 6.756 6.477 6.319 6.167 5.988 5.743 5.464 5.018 2.929 -10 ,26001 ,KEBNE ,17024735,Wed Dec 22 10:58:23 CET,Wed Dec 22 12:39:28 CET,0.0 2.795 3.344 3.815 4.187 4.469 4.72 4.976 5.416 5.594 5.754 5.844 6.152 6.302 6.575 6.803 7.024 7.14 7.387 7.63 7.935 8.109 8.29 8.55 8.776 8.989 9.202 9.419 9.684 9.916 10.146 10.428 10.683 10.927 11.205 11.503 11.772 12.039 12.318 12.612 12.927 13.304 13.727 14.122 14.564 15.02 15.489 15.898 16.183 16.344 16.177 15.484 14.698 13.928 13.21 12.58 12.025 11.514 11.055 10.565 10.151 9.791 9.441 9.106 8.779 8.462 8.137 7.858 7.624 7.376 7.092 6.857 6.616 6.354 6.152 5.941 5.723 5.504 5.269 5.101 4.938 4.673 4.477 4.286 4.186 3.969 3.737 3.476 3.344 3.023 2.91 2.758 2.588 2.232 2.047 1.848 1.613 1.327 0.967 0.518 -1.935 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_39.txt deleted file mode 100644 index 5a976c77..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13520 ,TETRA ,17558777,Sat Nov 27 02:44:43 CET,Sat Nov 27 04:44:38 CET,0.0 3.203 3.693 4.076 4.424 4.718 4.978 5.226 5.697 5.911 6.115 6.329 6.676 6.847 7.187 7.476 7.742 7.871 8.106 8.337 8.692 8.915 9.122 9.394 9.667 9.936 10.18 10.411 10.704 10.989 11.264 11.586 11.888 12.176 12.504 12.855 13.205 13.594 13.975 14.369 14.764 15.172 15.641 16.09 16.542 16.943 17.288 17.577 17.785 17.809 17.341 16.374 15.417 14.544 13.794 13.111 12.461 11.866 11.367 10.851 10.394 10.003 9.608 9.21 8.842 8.497 8.141 7.823 7.537 7.231 6.926 6.678 6.405 6.129 5.919 5.708 5.491 5.253 5.003 4.837 4.678 4.42 4.23 4.037 3.938 3.735 3.518 3.278 3.153 2.833 2.736 2.603 2.461 2.116 1.918 1.726 1.513 1.25 0.962 0.563 -0.308 -2 ,16277 ,TETRA ,17558778,Sat Nov 27 02:45:44 CET,Sat Nov 27 04:48:18 CET,0.0 5.146 5.772 6.229 6.607 6.943 7.233 7.498 7.98 8.188 8.388 8.584 8.925 9.091 9.425 9.735 10.027 10.161 10.401 10.628 10.954 11.162 11.355 11.641 11.897 12.133 12.371 12.591 12.884 13.182 13.472 13.811 14.137 14.466 14.839 15.21 15.541 15.898 16.293 16.709 17.069 17.429 17.841 18.228 18.653 19.061 19.443 19.77 19.972 19.975 19.492 18.507 17.547 16.699 15.945 15.236 14.588 13.982 13.478 12.99 12.575 12.196 11.817 11.463 11.106 10.767 10.452 10.168 9.918 9.676 9.406 9.149 8.892 8.641 8.444 8.249 8.057 7.86 7.638 7.483 7.335 7.097 6.937 6.772 6.678 6.466 6.245 6.021 5.898 5.595 5.531 5.39 5.232 4.857 4.657 4.44 4.191 3.959 3.692 3.315 2.496 -3 ,15940 ,TETRA ,17558779,Sat Nov 27 02:48:43 CET,Sat Nov 27 04:46:37 CET,0.0 2.834 3.435 3.883 4.278 4.61 4.884 5.147 5.625 5.863 6.087 6.292 6.642 6.8 7.094 7.381 7.665 7.802 8.048 8.29 8.622 8.827 9.035 9.335 9.62 9.885 10.136 10.387 10.726 11.041 11.316 11.63 11.926 12.224 12.557 12.919 13.264 13.622 13.985 14.358 14.745 15.166 15.662 16.154 16.687 17.216 17.684 18.024 18.259 18.301 17.915 17.012 16.087 15.237 14.472 13.803 13.209 12.659 12.175 11.684 11.257 10.881 10.52 10.158 9.803 9.473 9.136 8.846 8.597 8.339 8.083 7.873 7.654 7.407 7.203 6.999 6.772 6.54 6.297 6.125 5.953 5.693 5.522 5.333 5.228 5.011 4.802 4.584 4.456 4.145 4.071 3.919 3.763 3.439 3.267 3.072 2.864 2.627 2.305 1.875 0.374 -4 ,7158 ,TETRA ,17558780,Sat Nov 27 02:49:41 CET,Sat Nov 27 04:46:45 CET,0.0 3.257 3.907 4.402 4.787 5.141 5.449 5.703 6.122 6.314 6.502 6.674 6.998 7.154 7.469 7.753 8.029 8.163 8.415 8.654 8.964 9.159 9.348 9.629 9.906 10.173 10.43 10.664 10.947 11.222 11.493 11.779 12.045 12.332 12.641 12.951 13.241 13.559 13.896 14.225 14.557 14.915 15.316 15.718 16.139 16.511 16.869 17.177 17.299 17.168 16.65 15.668 14.661 13.745 12.914 12.169 11.525 10.927 10.399 9.867 9.435 9.064 8.699 8.357 8.033 7.717 7.374 7.077 6.827 6.571 6.289 6.036 5.802 5.583 5.385 5.182 4.974 4.748 4.539 4.389 4.214 3.928 3.724 3.513 3.409 3.206 2.996 2.763 2.635 2.326 2.247 2.108 1.965 1.626 1.441 1.242 1.008 0.763 0.484 0.108 -1.007 -5 ,7130 ,TETRA ,17558781,Sat Nov 27 02:50:41 CET,Sat Nov 27 04:48:29 CET,0.0 4.582 5.428 5.98 6.447 6.855 7.199 7.471 7.973 8.215 8.452 8.7 9.06 9.236 9.538 9.833 10.121 10.255 10.504 10.757 11.109 11.311 11.509 11.794 12.058 12.317 12.575 12.813 13.1 13.364 13.605 13.919 14.234 14.524 14.85 15.227 15.585 15.948 16.312 16.68 17.029 17.372 17.751 18.144 18.55 18.931 19.305 19.557 19.697 19.659 19.171 18.22 17.296 16.43 15.635 14.884 14.206 13.588 13.06 12.559 12.136 11.744 11.382 11.028 10.672 10.356 10.022 9.73 9.493 9.234 8.947 8.705 8.462 8.221 8.03 7.821 7.607 7.39 7.181 7.045 6.891 6.652 6.5 6.305 6.197 5.991 5.778 5.542 5.416 5.099 4.985 4.828 4.668 4.321 4.12 3.908 3.669 3.38 3.034 2.648 0.98 -6 ,31775 ,TETRA ,17558782,Sat Nov 27 02:51:40 CET,Sat Nov 27 04:49:08 CET,0.0 2.328 3.005 3.55 3.987 4.352 4.639 4.892 5.359 5.581 5.784 5.985 6.332 6.5 6.814 7.078 7.331 7.458 7.701 7.925 8.249 8.473 8.708 9.066 9.367 9.611 9.846 10.081 10.382 10.668 10.939 11.249 11.534 11.807 12.121 12.492 12.84 13.182 13.528 13.886 14.26 14.658 15.092 15.517 16.001 16.463 16.905 17.321 17.637 17.73 17.27 16.261 15.313 14.44 13.657 12.947 12.312 11.722 11.201 10.683 10.229 9.841 9.468 9.092 8.745 8.425 8.086 7.786 7.536 7.282 7.032 6.828 6.59 6.34 6.154 5.952 5.738 5.51 5.287 5.137 4.98 4.761 4.61 4.436 4.344 4.149 3.933 3.698 3.571 3.244 3.129 2.979 2.828 2.486 2.303 2.101 1.866 1.587 1.217 0.72 -0.494 -7 ,17230 ,TETRA ,17558783,Sat Nov 27 02:51:39 CET,Sat Nov 27 04:49:03 CET,0.0 3.148 3.794 4.298 4.73 5.085 5.386 5.67 6.23 6.465 6.657 6.849 7.199 7.372 7.733 8.043 8.331 8.476 8.743 9.0 9.357 9.579 9.791 10.095 10.404 10.69 10.949 11.197 11.503 11.796 12.074 12.39 12.716 13.036 13.365 13.746 14.104 14.447 14.801 15.194 15.609 16.015 16.427 16.828 17.271 17.716 18.176 18.618 18.959 19.077 18.741 17.862 16.988 16.207 15.494 14.839 14.251 13.664 13.134 12.623 12.168 11.766 11.382 11.006 10.666 10.358 10.018 9.719 9.462 9.173 8.869 8.619 8.362 8.105 7.898 7.68 7.451 7.217 6.977 6.806 6.625 6.344 6.154 5.939 5.827 5.627 5.427 5.19 5.052 4.721 4.612 4.465 4.304 3.96 3.781 3.607 3.418 3.193 2.942 2.658 2.022 -8 ,29481 ,TETRA ,17558784,Sat Nov 27 02:51:42 CET,Sat Nov 27 04:49:12 CET,0.0 2.435 3.268 3.919 4.382 4.696 4.983 5.249 5.691 5.886 6.068 6.226 6.576 6.738 7.048 7.352 7.631 7.758 8.011 8.249 8.566 8.777 8.992 9.302 9.581 9.85 10.109 10.344 10.664 10.973 11.239 11.534 11.818 12.094 12.411 12.766 13.092 13.442 13.809 14.154 14.481 14.857 15.28 15.683 16.105 16.48 16.888 17.257 17.519 17.641 17.304 16.513 15.646 14.823 14.106 13.421 12.788 12.193 11.652 11.097 10.628 10.221 9.848 9.489 9.149 8.84 8.508 8.205 7.936 7.659 7.378 7.139 6.891 6.631 6.434 6.226 5.983 5.71 5.426 5.254 5.093 4.834 4.655 4.471 4.375 4.171 3.948 3.718 3.603 3.315 3.273 3.141 2.981 2.65 2.479 2.279 2.05 1.785 1.495 1.108 0.228 -9 ,446 ,TETRA ,17558785,Sat Nov 27 02:51:40 CET,Sat Nov 27 04:49:30 CET,0.0 5.364 6.195 6.841 7.344 7.779 8.17 8.492 9.089 9.37 9.643 9.974 10.414 10.651 11.061 11.422 11.743 11.91 12.242 12.543 12.975 13.252 13.516 13.893 14.259 14.618 14.965 15.284 15.674 16.024 16.367 16.807 17.232 17.633 18.067 18.562 19.026 19.47 19.944 20.44 20.951 21.505 22.06 22.569 23.161 23.843 24.492 24.974 25.368 25.644 25.669 25.113 24.291 23.461 22.723 22.067 21.478 20.901 20.383 19.858 19.397 18.984 18.583 18.204 17.85 17.525 17.188 16.883 16.617 16.353 16.092 15.864 15.627 15.384 15.19 14.98 14.766 14.536 14.281 14.107 13.929 13.65 13.451 13.247 13.143 12.917 12.668 12.419 12.289 11.974 11.912 11.775 11.63 11.338 11.173 10.972 10.752 10.505 10.215 9.833 8.896 -10 ,163 ,TETRA ,17558786,Sat Nov 27 02:54:45 CET,Sat Nov 27 04:52:21 CET,0.0 2.4 3.003 3.425 3.805 4.131 4.419 4.706 5.233 5.464 5.678 5.892 6.241 6.381 6.642 6.918 7.183 7.307 7.55 7.778 8.097 8.312 8.515 8.803 9.064 9.29 9.512 9.726 10.002 10.278 10.544 10.84 11.099 11.352 11.64 11.957 12.261 12.58 12.912 13.244 13.592 13.952 14.318 14.697 15.091 15.441 15.744 15.964 16.107 16.045 15.532 14.561 13.644 12.745 11.848 11.055 10.396 9.807 9.315 8.825 8.389 7.995 7.616 7.271 6.953 6.651 6.337 6.055 5.795 5.52 5.257 5.041 4.806 4.565 4.378 4.188 3.999 3.805 3.585 3.423 3.257 2.992 2.825 2.646 2.544 2.325 2.102 1.884 1.764 1.452 1.401 1.267 1.115 0.779 0.584 0.382 0.17 -0.11 -0.446 -0.834 -2.497 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_40.txt deleted file mode 100644 index fd4f8481..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_40.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,12523 ,KEBNE ,17024737,Wed Dec 22 10:58:23 CET,Wed Dec 22 12:39:05 CET,0.0 6.016 7.005 7.739 8.326 8.833 9.244 9.602 10.222 10.474 10.703 10.949 11.318 11.523 11.905 12.266 12.604 12.735 12.957 13.188 13.502 13.698 13.88 14.132 14.372 14.575 14.752 14.93 15.158 15.37 15.584 15.844 16.065 16.256 16.479 16.718 16.936 17.172 17.406 17.604 17.769 17.929 18.08 18.195 18.247 18.195 18.009 17.63 16.904 15.607 13.307 10.555 8.302 6.452 4.893 3.493 2.303 1.252 0.37 -0.49 -1.239 -1.907 -2.551 -3.118 -3.621 -4.083 -4.554 -4.979 -5.353 -5.735 -6.122 -6.447 -6.785 -7.138 -7.413 -7.706 -8.009 -8.306 -8.622 -8.85 -9.084 -9.44 -9.689 -9.965 -10.102 -10.376 -10.661 -10.961 -11.128 -11.506 -11.608 -11.773 -11.951 -12.37 -12.603 -12.815 -13.068 -13.391 -13.726 -14.24 -16.53 -8 ,11395 ,KEBNE ,17024743,Wed Dec 22 11:02:32 CET,Wed Dec 22 12:44:15 CET,0.0 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan -9 ,26299 ,KEBNE ,17024744,Wed Dec 22 11:03:34 CET,Wed Dec 22 12:44:10 CET,0.0 12.27 13.402 14.237 14.925 15.502 15.96 16.358 17.088 17.397 17.659 17.952 18.319 18.508 18.872 19.217 19.536 19.687 19.967 20.205 20.537 20.776 21.014 21.328 21.583 21.807 22.019 22.206 22.428 22.64 22.843 23.069 23.272 23.482 23.72 23.954 24.132 24.308 24.471 24.623 24.772 24.918 25.045 25.095 25.071 24.963 24.728 24.252 23.449 22.195 20.018 17.346 15.176 13.383 11.858 10.542 9.416 8.429 7.589 6.758 6.052 5.431 4.848 4.295 3.789 3.342 2.878 2.475 2.13 1.763 1.381 1.06 0.738 0.414 0.159 -0.119 -0.424 -0.739 -1.05 -1.262 -1.498 -1.872 -2.12 -2.368 -2.501 -2.778 -3.061 -3.403 -3.583 -3.965 -4.117 -4.292 -4.478 -4.923 -5.16 -5.399 -5.656 -5.962 -6.307 -6.694 -7.934 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_41.txt deleted file mode 100644 index feb33270..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_41.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,11586 ,TETRA ,17558788,Sat Nov 27 02:54:45 CET,Sat Nov 27 04:35:02 CET,0.0 3.875 4.81 5.44 5.988 6.444 6.81 7.128 7.696 7.967 8.225 8.535 8.929 9.132 9.503 9.864 10.207 10.351 10.601 10.851 11.206 11.421 11.631 11.934 12.219 12.497 12.769 13.015 13.318 13.61 13.903 14.276 14.613 14.918 15.232 15.557 15.866 16.18 16.534 16.905 17.28 17.69 18.111 18.454 18.798 19.139 19.399 19.619 19.691 19.332 18.469 17.1 15.725 14.539 13.563 12.674 11.851 11.11 10.49 9.893 9.387 8.937 8.502 8.093 7.729 7.392 7.033 6.727 6.451 6.16 5.865 5.618 5.363 5.092 4.884 4.674 4.461 4.241 4.007 3.833 3.663 3.414 3.233 3.048 2.955 2.768 2.565 2.343 2.229 1.921 1.863 1.736 1.595 1.289 1.132 0.954 0.747 0.482 0.105 -0.393 -2.038 -4 ,5081 ,TETRA ,17558790,Sat Nov 27 02:54:45 CET,Sat Nov 27 04:35:13 CET,0.0 9.156 9.948 10.518 11.01 11.452 11.836 12.173 12.744 13.012 13.253 13.512 13.907 14.112 14.499 14.853 15.176 15.328 15.621 15.901 16.304 16.56 16.796 17.13 17.451 17.735 18.007 18.279 18.625 18.965 19.28 19.634 19.958 20.258 20.616 20.999 21.318 21.629 21.938 22.266 22.553 22.812 23.1 23.398 23.759 24.07 24.317 24.51 24.561 24.33 23.544 22.284 21.083 20.013 19.106 18.289 17.553 16.889 16.304 15.719 15.215 14.77 14.336 13.889 13.485 13.151 12.803 12.478 12.21 11.941 11.658 11.432 11.186 10.914 10.713 10.501 10.279 10.058 9.816 9.642 9.452 9.177 9.01 8.816 8.713 8.494 8.272 8.059 7.955 7.659 7.551 7.378 7.236 6.966 6.806 6.634 6.441 6.215 5.93 5.585 4.907 -5 ,7739 ,TETRA ,17558791,Sat Nov 27 02:54:45 CET,Sat Nov 27 04:34:55 CET,0.0 11.817 12.926 13.699 14.369 14.973 15.472 15.917 16.726 17.036 17.275 17.554 17.944 18.149 18.546 18.902 19.222 19.363 19.64 19.915 20.308 20.568 20.814 21.133 21.429 21.735 22.033 22.305 22.648 22.977 23.281 23.678 24.063 24.384 24.748 25.149 25.512 25.876 26.234 26.579 26.873 27.202 27.614 27.957 28.28 28.566 28.805 28.961 28.947 28.657 27.798 26.508 25.307 24.198 23.231 22.364 21.62 20.909 20.308 19.729 19.213 18.775 18.359 17.954 17.58 17.225 16.863 16.545 16.267 15.98 15.665 15.393 15.133 14.881 14.679 14.474 14.268 14.032 13.787 13.624 13.448 13.178 13.003 12.81 12.698 12.457 12.216 11.951 11.799 11.469 11.379 11.219 11.055 10.699 10.503 10.293 10.053 9.804 9.493 9.047 7.56 -6 ,7989 ,TETRA ,17558792,Sat Nov 27 02:54:45 CET,Sat Nov 27 04:34:55 CET,0.0 8.219 9.155 9.826 10.339 10.771 11.149 11.484 12.062 12.3 12.523 12.781 13.165 13.367 13.75 14.112 14.443 14.602 14.918 15.212 15.61 15.864 16.112 16.452 16.778 17.073 17.335 17.587 17.878 18.154 18.445 18.807 19.141 19.434 19.745 20.067 20.401 20.788 21.177 21.56 21.912 22.272 22.664 23.033 23.413 23.742 24.023 24.179 24.145 23.819 22.953 21.616 20.338 19.129 18.083 17.187 16.402 15.698 15.099 14.494 13.968 13.513 13.082 12.629 12.207 11.85 11.475 11.133 10.834 10.517 10.2 9.954 9.707 9.449 9.244 9.038 8.823 8.592 8.337 8.155 7.957 7.626 7.39 7.149 7.031 6.794 6.542 6.276 6.135 5.783 5.651 5.491 5.329 4.95 4.738 4.54 4.351 4.153 3.93 3.542 1.996 -7 ,18220 ,TETRA ,17558793,Sat Nov 27 02:55:42 CET,Sat Nov 27 04:36:23 CET,0.0 4.321 5.28 6.01 6.564 7.012 7.4 7.756 8.43 8.722 9.015 9.416 9.824 10.027 10.425 10.783 11.08 11.216 11.48 11.732 12.081 12.319 12.543 12.829 13.097 13.363 13.609 13.838 14.139 14.41 14.677 15.01 15.317 15.592 15.913 16.275 16.594 16.926 17.28 17.623 17.933 18.287 18.677 18.993 19.333 19.616 19.809 19.951 19.932 19.576 18.542 17.013 15.697 14.591 13.662 12.803 12.049 11.365 10.76 10.161 9.636 9.149 8.683 8.25 7.861 7.514 7.148 6.815 6.532 6.242 5.938 5.692 5.436 5.167 4.952 4.729 4.503 4.276 4.047 3.885 3.717 3.45 3.263 3.065 2.96 2.73 2.482 2.203 2.053 1.729 1.646 1.506 1.355 1.032 0.841 0.606 0.349 0.076 -0.212 -0.639 -1.816 -8 ,17909 ,TETRA ,17558794,Sat Nov 27 02:55:42 CET,Sat Nov 27 04:55:50 CET,0.0 5.458 6.606 7.328 7.836 8.277 8.703 9.072 9.664 9.924 10.171 10.465 10.867 11.068 11.401 11.7 11.965 12.096 12.34 12.563 12.9 13.118 13.325 13.609 13.873 14.138 14.399 14.627 14.911 15.179 15.432 15.746 16.056 16.337 16.65 16.988 17.265 17.546 17.85 18.165 18.478 18.804 19.153 19.453 19.735 20.009 20.27 20.389 20.334 20.008 19.02 17.505 16.13 14.927 13.906 13.01 12.245 11.576 11.005 10.426 9.912 9.467 9.064 8.683 8.312 7.976 7.645 7.351 7.079 6.786 6.478 6.226 5.95 5.627 5.386 5.162 4.939 4.664 4.342 4.14 3.956 3.688 3.474 3.262 3.161 2.926 2.685 2.44 2.306 1.989 1.909 1.772 1.618 1.263 1.038 0.767 0.454 0.114 -0.243 -0.692 -2.282 -10 ,18752 ,TETRA ,17558796,Sat Nov 27 02:55:42 CET,Sat Nov 27 04:35:50 CET,0.0 11.702 12.608 13.22 13.716 14.114 14.461 14.79 15.429 15.747 16.048 16.418 16.834 17.038 17.384 17.688 17.97 18.094 18.363 18.629 18.972 19.18 19.388 19.683 19.95 20.211 20.454 20.675 20.947 21.216 21.475 21.773 22.064 22.338 22.644 22.975 23.276 23.595 23.913 24.235 24.568 24.927 25.305 25.621 25.946 26.27 26.522 26.652 26.631 26.361 25.659 24.403 23.22 22.224 21.369 20.556 19.816 19.15 18.567 17.987 17.507 17.084 16.651 16.239 15.88 15.566 15.205 14.846 14.519 14.191 13.883 13.625 13.353 13.086 12.877 12.637 12.385 12.13 11.851 11.655 11.454 11.143 10.946 10.754 10.654 10.468 10.278 10.085 9.965 9.633 9.505 9.344 9.191 8.893 8.736 8.553 8.345 8.103 7.776 7.324 5.711 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_42.txt deleted file mode 100644 index 1c8280c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_42.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18188 ,TETRA ,17558797,Sat Nov 27 02:55:42 CET,Sat Nov 27 04:35:11 CET,0.0 7.076 7.606 7.977 8.299 8.539 8.753 8.961 9.302 9.448 9.583 9.681 9.983 10.098 10.331 10.555 10.771 10.874 11.07 11.262 11.514 11.673 11.824 12.026 12.241 12.462 12.673 12.872 13.105 13.315 13.525 13.778 14.02 14.252 14.52 14.809 15.09 15.416 15.755 16.106 16.474 16.874 17.339 17.789 18.265 18.75 19.253 19.826 20.492 21.219 21.849 21.956 21.761 21.503 21.228 20.942 20.676 20.397 20.132 19.848 19.597 19.364 19.126 18.914 18.727 18.547 18.346 18.153 17.983 17.814 17.628 17.47 17.306 17.123 16.984 16.856 16.713 16.559 16.395 16.277 16.168 16.004 15.883 15.744 15.664 15.498 15.345 15.189 15.089 14.801 14.73 14.605 14.457 14.067 13.871 13.68 13.461 13.213 12.903 12.485 9.559 -3 ,13561 ,TETRA ,17558799,Sat Nov 27 02:55:42 CET,Sat Nov 27 04:35:12 CET,0.0 3.738 4.31 4.767 5.152 5.466 5.716 5.936 6.4 6.608 6.774 6.863 7.176 7.309 7.544 7.761 7.966 8.067 8.275 8.467 8.708 8.867 9.031 9.251 9.453 9.649 9.842 10.036 10.294 10.545 10.763 11.014 11.26 11.492 11.76 12.052 12.323 12.615 12.92 13.248 13.583 13.964 14.412 14.847 15.314 15.79 16.346 16.934 17.582 18.282 18.911 19.046 18.883 18.631 18.366 18.107 17.841 17.554 17.283 17.0 16.767 16.568 16.362 16.166 15.973 15.787 15.593 15.415 15.253 15.073 14.888 14.748 14.599 14.422 14.268 14.115 13.956 13.767 13.569 13.437 13.296 13.07 12.894 12.703 12.605 12.388 12.157 11.903 11.765 11.454 11.344 11.205 11.078 10.84 10.702 10.558 10.405 10.175 9.877 9.456 7.604 -4 ,20495 ,TETRA ,17558800,Sat Nov 27 02:55:42 CET,Sat Nov 27 04:35:12 CET,0.0 4.149 4.692 5.063 5.363 5.576 5.778 6.009 6.465 6.646 6.804 6.948 7.285 7.426 7.676 7.889 8.092 8.204 8.411 8.597 8.858 9.032 9.205 9.464 9.714 9.942 10.181 10.414 10.7 10.972 11.229 11.549 11.856 12.123 12.406 12.717 13.031 13.364 13.722 14.105 14.468 14.869 15.353 15.825 16.333 16.84 17.353 17.894 18.469 19.041 19.517 19.635 19.464 19.18 18.887 18.604 18.312 18.027 17.761 17.467 17.206 16.956 16.719 16.492 16.269 16.066 15.867 15.686 15.517 15.338 15.138 14.976 14.829 14.669 14.537 14.406 14.268 14.098 13.905 13.779 13.652 13.462 13.327 13.167 13.086 12.931 12.772 12.598 12.501 12.229 12.186 12.067 11.957 11.695 11.512 11.299 11.113 10.945 10.652 10.194 7.985 -5 ,3861 ,TETRA ,17558801,Sat Nov 27 02:55:42 CET,Sat Nov 27 04:35:35 CET,0.0 2.21 2.723 3.097 3.454 3.769 4.042 4.293 4.716 4.903 5.082 5.251 5.606 5.755 6.027 6.3 6.565 6.688 6.923 7.13 7.419 7.612 7.804 8.075 8.321 8.56 8.792 9.008 9.284 9.557 9.808 10.09 10.354 10.601 10.868 11.174 11.47 11.771 12.097 12.43 12.749 13.122 13.553 13.971 14.474 15.005 15.611 16.257 16.95 17.673 18.245 18.356 18.24 18.033 17.781 17.512 17.201 16.877 16.599 16.299 16.011 15.735 15.46 15.198 14.947 14.726 14.513 14.319 14.148 13.967 13.759 13.591 13.429 13.253 13.115 12.968 12.817 12.663 12.502 12.388 12.273 12.091 11.951 11.789 11.708 11.554 11.393 11.224 11.13 10.859 10.823 10.714 10.585 10.279 10.114 9.962 9.807 9.569 9.276 8.867 6.107 -6 ,25222 ,TETRA ,17558802,Sat Nov 27 02:57:43 CET,Sat Nov 27 04:54:07 CET,0.0 2.405 2.997 3.399 3.794 4.141 4.427 4.724 5.206 5.412 5.613 5.806 6.137 6.265 6.506 6.745 6.972 7.078 7.283 7.477 7.785 7.99 8.175 8.439 8.678 8.883 9.062 9.231 9.462 9.679 9.894 10.155 10.403 10.636 10.89 11.209 11.537 11.898 12.269 12.65 13.036 13.433 13.853 14.232 14.644 15.11 15.611 16.137 16.764 17.387 17.812 17.881 17.737 17.452 17.125 16.772 16.478 16.217 15.977 15.735 15.505 15.281 15.055 14.827 14.615 14.432 14.235 14.049 13.886 13.724 13.55 13.405 13.254 13.076 12.938 12.801 12.642 12.468 12.281 12.139 11.971 11.718 11.565 11.416 11.338 11.164 10.972 10.773 10.673 10.386 10.309 10.201 10.081 9.773 9.574 9.332 9.066 8.781 8.477 8.027 4.952 -7 ,12773 ,TETRA ,17558803,Sat Nov 27 02:57:44 CET,Sat Nov 27 04:55:28 CET,0.0 2.409 2.908 3.295 3.633 3.89 4.133 4.363 4.767 4.942 5.102 5.195 5.5 5.611 5.84 6.081 6.304 6.412 6.612 6.793 7.056 7.219 7.36 7.568 7.778 7.98 8.181 8.365 8.605 8.861 9.101 9.362 9.598 9.827 10.088 10.381 10.684 11.011 11.349 11.705 12.069 12.478 12.942 13.401 13.901 14.382 14.933 15.547 16.157 16.75 17.231 17.33 17.195 16.961 16.689 16.399 16.099 15.81 15.557 15.289 15.056 14.824 14.59 14.371 14.171 13.98 13.778 13.601 13.433 13.251 13.051 12.877 12.71 12.545 12.419 12.287 12.145 11.981 11.803 11.682 11.559 11.378 11.247 11.107 11.029 10.864 10.708 10.554 10.475 10.207 10.162 10.058 9.944 9.704 9.574 9.399 9.183 8.946 8.597 8.114 5.701 -8 ,17454 ,TETRA ,17558804,Sat Nov 27 02:57:45 CET,Sat Nov 27 04:54:25 CET,0.0 3.414 3.964 4.298 4.566 4.816 5.044 5.25 5.617 5.8 5.984 6.138 6.457 6.592 6.873 7.136 7.356 7.461 7.652 7.824 8.059 8.205 8.347 8.556 8.753 8.928 9.109 9.29 9.511 9.721 9.934 10.189 10.439 10.671 10.929 11.256 11.568 11.869 12.187 12.528 12.866 13.242 13.692 14.124 14.592 15.077 15.603 16.196 16.862 17.552 18.152 18.397 18.338 18.133 17.889 17.639 17.393 17.143 16.906 16.644 16.38 16.133 15.916 15.705 15.488 15.289 15.084 14.891 14.73 14.569 14.39 14.24 14.083 13.919 13.792 13.649 13.502 13.355 13.198 13.085 12.96 12.762 12.63 12.501 12.43 12.277 12.132 11.977 11.874 11.587 11.542 11.428 11.309 11.038 10.889 10.743 10.551 10.253 9.849 9.386 6.034 -9 ,26491 ,TETRA ,17558805,Sat Nov 27 02:57:45 CET,Sat Nov 27 04:55:15 CET,0.0 4.169 4.751 5.109 5.399 5.639 5.838 6.039 6.433 6.614 6.786 6.929 7.258 7.412 7.694 7.958 8.18 8.27 8.44 8.603 8.832 8.986 9.134 9.346 9.555 9.744 9.924 10.089 10.292 10.498 10.708 10.959 11.201 11.436 11.694 12.007 12.317 12.627 12.941 13.264 13.593 13.96 14.385 14.776 15.24 15.776 16.332 16.895 17.519 18.136 18.59 18.683 18.52 18.241 17.961 17.696 17.441 17.187 16.934 16.644 16.386 16.163 15.95 15.733 15.522 15.333 15.139 14.962 14.803 14.627 14.435 14.28 14.124 13.969 13.844 13.704 13.562 13.405 13.238 13.132 13.019 12.831 12.706 12.588 12.515 12.346 12.189 12.016 11.922 11.648 11.622 11.517 11.395 11.136 10.988 10.814 10.61 10.411 10.175 9.708 6.756 -10 ,6643 ,TETRA ,17558806,Sat Nov 27 02:58:44 CET,Sat Nov 27 04:48:28 CET,0.0 2.937 3.553 3.987 4.29 4.537 4.78 5.007 5.414 5.614 5.796 5.942 6.28 6.424 6.688 6.928 7.14 7.233 7.401 7.567 7.815 7.969 8.122 8.353 8.591 8.821 9.018 9.191 9.41 9.626 9.853 10.13 10.398 10.66 10.963 11.277 11.543 11.821 12.11 12.42 12.757 13.13 13.552 13.984 14.494 15.017 15.549 16.081 16.635 17.18 17.639 17.796 17.734 17.524 17.231 16.928 16.633 16.348 16.095 15.818 15.571 15.343 15.104 14.886 14.695 14.513 14.31 14.114 13.952 13.787 13.604 13.462 13.298 13.121 12.98 12.834 12.678 12.521 12.376 12.272 12.168 11.987 11.847 11.699 11.627 11.468 11.287 11.107 11.018 10.758 10.711 10.598 10.488 10.199 10.049 9.876 9.649 9.384 9.051 8.59 6.365 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_43.txt deleted file mode 100644 index fbafa581..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25901 ,TETRA ,17558807,Sat Nov 27 03:00:44 CET,Sat Nov 27 05:00:26 CET,0.0 2.092 2.562 2.868 3.147 3.371 3.553 3.756 4.142 4.288 4.434 4.554 4.852 4.951 5.161 5.404 5.641 5.755 5.977 6.162 6.395 6.549 6.696 6.906 7.122 7.317 7.497 7.681 7.901 8.121 8.339 8.582 8.805 9.011 9.252 9.503 9.738 10.025 10.351 10.675 10.99 11.291 11.585 11.836 12.06 12.271 12.471 12.604 12.627 12.489 12.022 11.209 10.461 9.779 9.147 8.552 8.001 7.488 7.053 6.611 6.227 5.893 5.578 5.259 4.952 4.677 4.387 4.127 3.904 3.684 3.464 3.279 3.077 2.863 2.7 2.548 2.385 2.208 2.025 1.898 1.773 1.56 1.407 1.262 1.184 1.005 0.815 0.628 0.54 0.266 0.25 0.147 0.036 -0.2 -0.315 -0.441 -0.588 -0.767 -0.993 -1.318 -2.27 -2 ,1474 ,TETRA ,17558808,Sat Nov 27 03:00:43 CET,Sat Nov 27 05:05:48 CET,0.0 1.441 1.81 2.095 2.385 2.623 2.812 2.998 3.318 3.466 3.594 3.641 3.929 4.026 4.231 4.43 4.599 4.686 4.871 5.037 5.258 5.389 5.509 5.692 5.868 6.046 6.223 6.393 6.609 6.793 6.953 7.16 7.366 7.537 7.702 7.897 8.109 8.316 8.514 8.714 8.88 9.044 9.232 9.423 9.631 9.848 10.057 10.173 10.195 10.03 9.462 8.57 7.742 7.012 6.382 5.802 5.281 4.81 4.393 3.966 3.597 3.262 2.925 2.604 2.32 2.067 1.806 1.566 1.352 1.135 0.907 0.709 0.512 0.322 0.173 0.014 -0.151 -0.309 -0.468 -0.584 -0.705 -0.898 -1.042 -1.189 -1.263 -1.432 -1.617 -1.788 -1.883 -2.174 -2.198 -2.3 -2.41 -2.695 -2.861 -3.036 -3.216 -3.401 -3.642 -3.955 -4.847 -3 ,21903 ,TETRA ,17558809,Sat Nov 27 03:00:46 CET,Sat Nov 27 04:58:16 CET,0.0 1.684 2.179 2.484 2.761 3.059 3.324 3.528 3.876 4.029 4.166 4.245 4.534 4.656 4.905 5.144 5.357 5.449 5.627 5.801 6.049 6.196 6.322 6.491 6.649 6.82 7.017 7.203 7.408 7.604 7.802 8.032 8.262 8.476 8.707 8.977 9.207 9.42 9.634 9.837 10.042 10.269 10.533 10.768 10.991 11.206 11.41 11.574 11.609 11.46 10.996 10.178 9.373 8.678 8.06 7.492 6.98 6.488 6.042 5.586 5.207 4.883 4.544 4.22 3.95 3.701 3.433 3.192 2.985 2.764 2.55 2.381 2.202 2.008 1.853 1.7 1.539 1.365 1.18 1.047 0.911 0.708 0.568 0.416 0.335 0.154 -0.039 -0.235 -0.332 -0.624 -0.659 -0.776 -0.9 -1.194 -1.362 -1.53 -1.712 -1.927 -2.224 -2.577 -3.566 -4 ,2451 ,TETRA ,17558810,Sat Nov 27 03:03:40 CET,Sat Nov 27 05:01:14 CET,0.0 2.113 2.558 2.87 3.122 3.329 3.519 3.688 4.001 4.153 4.293 4.366 4.656 4.763 4.947 5.114 5.292 5.377 5.544 5.725 5.972 6.112 6.241 6.428 6.619 6.803 6.969 7.129 7.337 7.525 7.691 7.909 8.11 8.27 8.447 8.642 8.822 9.012 9.212 9.414 9.613 9.821 10.031 10.21 10.38 10.54 10.721 10.837 10.858 10.757 10.241 9.377 8.577 7.859 7.22 6.626 6.064 5.54 5.104 4.667 4.27 3.922 3.605 3.316 3.026 2.744 2.441 2.164 1.94 1.723 1.506 1.335 1.164 0.98 0.829 0.673 0.514 0.344 0.162 0.032 -0.103 -0.31 -0.45 -0.585 -0.656 -0.808 -0.966 -1.138 -1.229 -1.512 -1.527 -1.641 -1.753 -2.03 -2.187 -2.335 -2.491 -2.67 -2.89 -3.225 -4.083 -5 ,3338 ,TETRA ,17558811,Sat Nov 27 03:05:44 CET,Sat Nov 27 05:03:50 CET,0.0 1.554 2.0 2.316 2.56 2.801 3.022 3.201 3.545 3.709 3.867 3.972 4.284 4.401 4.643 4.888 5.1 5.208 5.412 5.592 5.836 5.976 6.11 6.318 6.53 6.729 6.906 7.067 7.267 7.456 7.617 7.801 8.002 8.197 8.409 8.641 8.854 9.07 9.281 9.505 9.734 9.948 10.178 10.414 10.641 10.827 11.005 11.141 11.207 11.14 10.687 9.83 9.021 8.295 7.644 7.065 6.563 6.123 5.702 5.256 4.891 4.552 4.201 3.88 3.594 3.329 3.06 2.815 2.595 2.374 2.15 1.971 1.78 1.581 1.437 1.282 1.106 0.92 0.726 0.599 0.47 0.265 0.12 -0.028 -0.105 -0.269 -0.437 -0.607 -0.695 -0.989 -1.026 -1.148 -1.265 -1.501 -1.628 -1.771 -1.932 -2.11 -2.312 -2.598 -3.524 -6 ,28994 ,TETRA ,17558812,Sat Nov 27 03:05:44 CET,Sat Nov 27 05:04:04 CET,0.0 1.753 2.174 2.44 2.704 2.977 3.197 3.383 3.757 3.916 4.062 4.164 4.497 4.626 4.872 5.109 5.302 5.386 5.586 5.787 6.037 6.202 6.362 6.567 6.753 6.923 7.082 7.237 7.433 7.619 7.785 7.977 8.154 8.326 8.524 8.725 8.91 9.11 9.365 9.657 9.919 10.181 10.446 10.675 10.925 11.168 11.373 11.534 11.642 11.583 11.183 10.431 9.665 8.957 8.335 7.779 7.265 6.765 6.309 5.858 5.486 5.158 4.832 4.53 4.256 4.002 3.746 3.506 3.293 3.084 2.872 2.688 2.487 2.284 2.136 1.984 1.819 1.649 1.474 1.348 1.222 1.037 0.899 0.749 0.672 0.514 0.349 0.185 0.1 -0.183 -0.199 -0.306 -0.418 -0.672 -0.8 -0.93 -1.1 -1.294 -1.509 -1.811 -2.826 -7 ,2600 ,TETRA ,17558813,Sat Nov 27 03:07:44 CET,Sat Nov 27 05:04:42 CET,0.0 2.385 2.838 3.222 3.529 3.748 3.949 4.168 4.551 4.719 4.878 4.983 5.286 5.405 5.624 5.824 6.009 6.099 6.296 6.491 6.743 6.896 7.04 7.256 7.473 7.672 7.858 8.035 8.261 8.472 8.665 8.897 9.124 9.346 9.589 9.849 10.095 10.346 10.579 10.781 10.986 11.225 11.477 11.694 11.926 12.128 12.295 12.439 12.507 12.396 11.93 11.149 10.377 9.656 9.02 8.452 7.924 7.419 6.979 6.534 6.152 5.831 5.509 5.201 4.924 4.657 4.378 4.146 3.952 3.747 3.518 3.327 3.132 2.937 2.788 2.623 2.449 2.266 2.069 1.934 1.797 1.57 1.4 1.233 1.153 0.995 0.822 0.631 0.541 0.261 0.245 0.146 0.038 -0.209 -0.347 -0.488 -0.626 -0.764 -0.978 -1.312 -1.902 -8 ,21723 ,TETRA ,17558814,Sat Nov 27 03:08:38 CET,Sat Nov 27 04:55:53 CET,0.0 2.75 3.351 3.734 4.007 4.235 4.431 4.607 4.946 5.103 5.241 5.31 5.603 5.714 5.953 6.196 6.414 6.519 6.718 6.893 7.118 7.266 7.414 7.639 7.852 8.041 8.219 8.385 8.598 8.799 8.99 9.196 9.391 9.584 9.775 9.976 10.162 10.368 10.585 10.805 11.059 11.354 11.656 11.914 12.173 12.404 12.584 12.726 12.799 12.707 12.31 11.579 10.838 10.166 9.545 8.962 8.424 7.94 7.516 7.068 6.661 6.285 5.944 5.621 5.316 5.041 4.757 4.5 4.279 4.066 3.863 3.7 3.521 3.315 3.157 3.004 2.831 2.652 2.473 2.343 2.211 2.01 1.861 1.714 1.642 1.475 1.297 1.117 1.023 0.749 0.74 0.632 0.514 0.239 0.094 -0.06 -0.236 -0.412 -0.617 -0.88 -1.587 -9 ,14349 ,TETRA ,17558815,Sat Nov 27 03:08:38 CET,Sat Nov 27 05:00:42 CET,0.0 1.931 2.426 2.755 3.035 3.27 3.471 3.677 4.045 4.2 4.336 4.423 4.726 4.851 5.061 5.257 5.456 5.552 5.74 5.913 6.148 6.294 6.426 6.628 6.836 7.006 7.164 7.318 7.525 7.738 7.912 8.105 8.301 8.476 8.691 8.955 9.182 9.411 9.628 9.818 10.006 10.212 10.467 10.719 10.96 11.196 11.433 11.613 11.679 11.558 11.118 10.348 9.644 8.956 8.323 7.765 7.264 6.783 6.342 5.917 5.545 5.2 4.891 4.594 4.304 4.05 3.779 3.531 3.312 3.098 2.873 2.679 2.488 2.289 2.129 1.959 1.791 1.627 1.452 1.326 1.203 1.021 0.887 0.741 0.663 0.514 0.363 0.188 0.092 -0.185 -0.186 -0.286 -0.387 -0.61 -0.732 -0.87 -1.028 -1.203 -1.413 -1.696 -2.562 -10 ,29898 ,TETRA ,17558816,Sat Nov 27 03:09:37 CET,Sat Nov 27 05:08:24 CET,0.0 2.258 2.757 3.153 3.466 3.724 3.948 4.16 4.546 4.72 4.871 4.968 5.281 5.41 5.646 5.871 6.061 6.153 6.335 6.486 6.706 6.842 6.98 7.178 7.357 7.532 7.698 7.852 8.042 8.22 8.38 8.568 8.761 8.932 9.111 9.317 9.501 9.691 9.873 10.043 10.253 10.495 10.748 10.956 11.167 11.399 11.578 11.702 11.775 11.663 11.164 10.374 9.628 8.878 8.185 7.577 7.06 6.57 6.126 5.672 5.29 4.976 4.669 4.353 4.06 3.808 3.536 3.282 3.067 2.836 2.593 2.39 2.181 1.978 1.825 1.667 1.505 1.325 1.118 0.979 0.843 0.643 0.503 0.355 0.278 0.108 -0.071 -0.254 -0.352 -0.642 -0.642 -0.76 -0.89 -1.146 -1.263 -1.381 -1.533 -1.696 -1.855 -2.079 -2.963 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_46.txt deleted file mode 100644 index a1514ed6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25709 ,TETRA ,17558817,Sat Nov 27 03:09:38 CET,Sat Nov 27 05:08:49 CET,0.0 1.263 1.769 2.127 2.407 2.64 2.857 3.047 3.394 3.554 3.704 3.798 4.092 4.212 4.461 4.682 4.881 4.974 5.171 5.352 5.581 5.718 5.846 6.04 6.216 6.382 6.548 6.703 6.888 7.035 7.162 7.305 7.436 7.559 7.694 7.846 7.986 8.151 8.338 8.512 8.674 8.84 8.979 9.092 9.186 9.247 9.314 9.326 9.144 8.614 7.48 5.998 4.779 3.75 2.862 2.053 1.359 0.739 0.201 -0.336 -0.786 -1.179 -1.555 -1.914 -2.256 -2.567 -2.89 -3.176 -3.417 -3.661 -3.918 -4.136 -4.352 -4.561 -4.73 -4.908 -5.087 -5.278 -5.47 -5.602 -5.742 -5.962 -6.116 -6.274 -6.354 -6.51 -6.683 -6.869 -6.964 -7.259 -7.286 -7.409 -7.534 -7.787 -7.923 -8.086 -8.257 -8.469 -8.73 -9.054 -9.768 -2 ,12763 ,TETRA ,17558818,Sat Nov 27 03:10:40 CET,Sat Nov 27 05:09:34 CET,0.0 2.316 2.901 3.274 3.571 3.824 4.072 4.29 4.632 4.804 4.972 5.07 5.37 5.479 5.685 5.904 6.089 6.162 6.317 6.472 6.676 6.809 6.938 7.111 7.268 7.423 7.575 7.719 7.905 8.084 8.236 8.404 8.549 8.668 8.812 9.0 9.166 9.315 9.473 9.632 9.769 9.885 10.027 10.143 10.205 10.238 10.182 9.981 9.606 8.914 7.664 6.125 4.864 3.831 2.959 2.141 1.416 0.794 0.253 -0.288 -0.751 -1.169 -1.551 -1.904 -2.242 -2.539 -2.835 -3.11 -3.359 -3.611 -3.865 -4.073 -4.297 -4.529 -4.709 -4.909 -5.105 -5.3 -5.499 -5.635 -5.78 -5.995 -6.14 -6.303 -6.387 -6.555 -6.739 -6.939 -7.043 -7.352 -7.372 -7.482 -7.599 -7.852 -7.995 -8.144 -8.285 -8.454 -8.658 -8.9 -9.374 -3 ,119 ,TETRA ,17558819,Sat Nov 27 03:10:40 CET,Sat Nov 27 04:57:33 CET,0.0 3.42 4.357 4.814 5.099 5.334 5.549 5.757 6.137 6.287 6.416 6.486 6.772 6.87 7.058 7.247 7.432 7.516 7.672 7.8 7.968 8.089 8.21 8.38 8.528 8.672 8.807 8.929 9.096 9.248 9.393 9.584 9.755 9.894 10.052 10.276 10.497 10.699 10.894 11.071 11.258 11.48 11.701 11.871 11.974 12.024 12.014 11.897 11.665 11.154 10.019 8.492 7.15 6.006 5.048 4.21 3.509 2.879 2.31 1.728 1.24 0.826 0.441 0.091 -0.25 -0.568 -0.879 -1.15 -1.388 -1.641 -1.909 -2.128 -2.339 -2.555 -2.726 -2.906 -3.088 -3.268 -3.454 -3.588 -3.732 -3.949 -4.103 -4.265 -4.348 -4.528 -4.706 -4.902 -5.003 -5.291 -5.291 -5.397 -5.514 -5.772 -5.926 -6.095 -6.253 -6.422 -6.62 -6.888 -7.682 -4 ,18981 ,TETRA ,17558820,Sat Nov 27 03:12:41 CET,Sat Nov 27 04:58:25 CET,0.0 2.188 2.737 3.134 3.443 3.711 3.963 4.185 4.583 4.786 4.981 5.123 5.452 5.604 5.871 6.107 6.325 6.427 6.613 6.797 7.064 7.213 7.349 7.551 7.745 7.927 8.08 8.219 8.396 8.572 8.749 8.951 9.128 9.284 9.453 9.64 9.815 10.002 10.189 10.374 10.542 10.679 10.816 10.909 10.939 10.954 10.939 10.808 10.501 9.881 8.719 7.187 5.869 4.781 3.879 3.059 2.335 1.691 1.133 0.575 0.115 -0.288 -0.69 -1.07 -1.395 -1.677 -1.979 -2.262 -2.509 -2.758 -3.024 -3.246 -3.471 -3.697 -3.871 -4.072 -4.293 -4.512 -4.74 -4.903 -5.077 -5.349 -5.541 -5.725 -5.815 -6.004 -6.185 -6.377 -6.484 -6.795 -6.851 -6.979 -7.106 -7.372 -7.523 -7.704 -7.896 -8.084 -8.286 -8.545 -9.203 -5 ,7820 ,TETRA ,17558821,Sat Nov 27 03:12:41 CET,Sat Nov 27 04:58:10 CET,0.0 1.717 2.157 2.456 2.692 2.912 3.128 3.316 3.639 3.778 3.912 3.999 4.3 4.421 4.642 4.85 5.036 5.127 5.306 5.463 5.686 5.827 5.955 6.149 6.339 6.52 6.71 6.895 7.117 7.31 7.478 7.666 7.835 8.008 8.212 8.426 8.635 8.848 9.041 9.256 9.473 9.696 9.934 10.126 10.295 10.426 10.501 10.487 10.275 9.675 8.588 7.11 5.799 4.679 3.698 2.843 2.112 1.468 0.943 0.426 -0.037 -0.454 -0.849 -1.22 -1.568 -1.896 -2.217 -2.501 -2.763 -3.014 -3.251 -3.463 -3.693 -3.933 -4.121 -4.306 -4.502 -4.714 -4.934 -5.077 -5.214 -5.429 -5.584 -5.755 -5.838 -5.993 -6.157 -6.338 -6.431 -6.72 -6.749 -6.861 -6.981 -7.229 -7.348 -7.487 -7.635 -7.798 -8.011 -8.278 -8.728 -6 ,24606 ,TETRA ,17558822,Sat Nov 27 03:14:42 CET,Sat Nov 27 05:14:16 CET,0.0 2.106 2.699 3.086 3.417 3.724 3.998 4.255 4.666 4.819 4.954 5.025 5.328 5.457 5.703 5.933 6.142 6.246 6.461 6.662 6.951 7.118 7.271 7.502 7.72 7.912 8.063 8.206 8.412 8.582 8.722 8.898 9.065 9.216 9.377 9.567 9.755 9.947 10.117 10.256 10.4 10.554 10.683 10.796 10.894 10.904 10.855 10.731 10.485 9.989 8.888 7.447 6.253 5.168 4.176 3.289 2.543 1.846 1.248 0.642 0.097 -0.379 -0.824 -1.23 -1.609 -1.962 -2.326 -2.638 -2.898 -3.158 -3.429 -3.681 -3.946 -4.189 -4.379 -4.594 -4.803 -5.003 -5.221 -5.38 -5.537 -5.775 -5.942 -6.116 -6.207 -6.401 -6.603 -6.814 -6.921 -7.226 -7.242 -7.349 -7.463 -7.72 -7.867 -8.021 -8.19 -8.374 -8.55 -8.759 -9.421 -7 ,4763 ,TETRA ,17558823,Sat Nov 27 03:16:39 CET,Sat Nov 27 05:03:27 CET,0.0 2.06 2.614 3.062 3.443 3.776 4.046 4.262 4.617 4.764 4.925 5.039 5.36 5.488 5.731 5.951 6.149 6.235 6.396 6.563 6.785 6.923 7.073 7.271 7.449 7.613 7.762 7.904 8.081 8.265 8.442 8.631 8.796 8.957 9.14 9.318 9.469 9.634 9.813 9.991 10.148 10.304 10.48 10.623 10.707 10.744 10.758 10.677 10.385 9.769 8.583 7.043 5.781 4.683 3.737 2.924 2.22 1.59 1.042 0.49 0.013 -0.399 -0.777 -1.13 -1.46 -1.776 -2.101 -2.381 -2.619 -2.862 -3.117 -3.321 -3.54 -3.779 -3.963 -4.162 -4.363 -4.561 -4.775 -4.928 -5.091 -5.34 -5.503 -5.669 -5.749 -5.908 -6.094 -6.296 -6.392 -6.678 -6.689 -6.799 -6.917 -7.191 -7.339 -7.487 -7.667 -7.881 -8.116 -8.392 -9.075 -8 ,4741 ,TETRA ,17558824,Sat Nov 27 03:18:41 CET,Sat Nov 27 05:10:31 CET,0.0 1.789 2.325 2.674 2.968 3.239 3.48 3.676 4.001 4.162 4.324 4.442 4.758 4.885 5.108 5.315 5.493 5.577 5.755 5.931 6.16 6.306 6.447 6.653 6.834 6.99 7.146 7.297 7.485 7.658 7.819 8.019 8.195 8.353 8.539 8.744 8.921 9.098 9.277 9.44 9.595 9.772 9.967 10.095 10.186 10.255 10.258 10.176 9.949 9.377 8.12 6.535 5.211 4.091 3.175 2.355 1.613 0.974 0.43 -0.137 -0.594 -1.0 -1.384 -1.74 -2.079 -2.386 -2.714 -2.997 -3.227 -3.459 -3.7 -3.905 -4.128 -4.369 -4.557 -4.74 -4.919 -5.103 -5.304 -5.446 -5.592 -5.824 -5.984 -6.143 -6.225 -6.395 -6.586 -6.797 -6.906 -7.204 -7.229 -7.348 -7.477 -7.732 -7.866 -8.01 -8.183 -8.389 -8.61 -8.903 -9.731 -9 ,2250 ,TETRA ,17558825,Sat Nov 27 03:22:39 CET,Sat Nov 27 05:15:18 CET,0.0 1.944 2.519 2.914 3.189 3.429 3.66 3.881 4.297 4.48 4.633 4.72 5.015 5.14 5.392 5.618 5.803 5.898 6.092 6.272 6.529 6.688 6.827 7.011 7.183 7.355 7.518 7.675 7.862 8.022 8.175 8.354 8.534 8.718 8.926 9.157 9.377 9.603 9.813 10.036 10.289 10.481 10.652 10.819 10.973 11.166 11.265 11.155 10.885 10.351 9.224 7.75 6.487 5.413 4.476 3.655 2.95 2.29 1.709 1.14 0.657 0.215 -0.202 -0.601 -0.971 -1.305 -1.651 -1.952 -2.217 -2.501 -2.807 -3.047 -3.291 -3.551 -3.749 -3.946 -4.141 -4.353 -4.576 -4.731 -4.88 -5.098 -5.257 -5.426 -5.516 -5.689 -5.862 -6.048 -6.148 -6.46 -6.51 -6.627 -6.744 -7.008 -7.13 -7.266 -7.42 -7.567 -7.769 -8.058 -8.752 -10 ,13039 ,TETRA ,17558826,Sat Nov 27 03:23:41 CET,Sat Nov 27 05:22:16 CET,0.0 2.293 2.928 3.313 3.59 3.846 4.09 4.304 4.677 4.844 4.998 5.107 5.418 5.535 5.738 5.91 6.087 6.173 6.344 6.519 6.765 6.915 7.053 7.24 7.399 7.552 7.695 7.827 8.005 8.166 8.298 8.449 8.589 8.717 8.877 9.071 9.253 9.434 9.617 9.808 10.003 10.162 10.298 10.407 10.489 10.513 10.441 10.279 9.955 9.298 8.076 6.531 5.23 4.14 3.212 2.375 1.63 0.977 0.426 -0.134 -0.611 -1.015 -1.398 -1.759 -2.101 -2.423 -2.754 -3.054 -3.312 -3.579 -3.867 -4.098 -4.335 -4.594 -4.797 -4.994 -5.19 -5.394 -5.619 -5.773 -5.925 -6.166 -6.324 -6.481 -6.56 -6.734 -6.937 -7.133 -7.231 -7.538 -7.569 -7.693 -7.82 -8.09 -8.235 -8.385 -8.548 -8.721 -8.909 -9.182 -9.992 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_47.txt deleted file mode 100644 index 32455cc8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_27_47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3559 ,TETRA ,17558827,Sat Nov 27 03:23:42 CET,Sat Nov 27 05:13:02 CET,0.0 1.302 1.773 2.114 2.39 2.635 2.874 3.113 3.544 3.737 3.914 4.022 4.315 4.428 4.663 4.905 5.129 5.235 5.438 5.62 5.848 5.989 6.13 6.353 6.595 6.812 7.005 7.182 7.393 7.593 7.776 7.975 8.152 8.325 8.541 8.766 8.986 9.236 9.471 9.701 9.929 10.171 10.412 10.599 10.782 10.957 11.128 11.244 11.143 10.707 9.671 8.107 6.74 5.598 4.597 3.708 2.963 2.317 1.77 1.208 0.724 0.294 -0.118 -0.498 -0.844 -1.173 -1.517 -1.807 -2.061 -2.329 -2.607 -2.835 -3.057 -3.287 -3.479 -3.683 -3.89 -4.108 -4.33 -4.488 -4.651 -4.886 -5.057 -5.243 -5.337 -5.528 -5.734 -5.959 -6.076 -6.389 -6.429 -6.551 -6.681 -6.967 -7.126 -7.289 -7.463 -7.665 -7.958 -8.312 -8.884 -2 ,16601 ,TETRA ,17558828,Sat Nov 27 03:23:41 CET,Sat Nov 27 05:10:55 CET,0.0 2.706 3.408 3.909 4.348 4.716 5.016 5.294 5.8 6.046 6.277 6.51 6.875 7.031 7.336 7.633 7.892 8.01 8.246 8.467 8.775 8.977 9.173 9.434 9.67 9.896 10.109 10.307 10.574 10.827 11.066 11.347 11.595 11.825 12.066 12.288 12.494 12.725 12.985 13.232 13.464 13.688 13.891 14.081 14.273 14.434 14.488 14.42 14.216 13.727 12.663 11.166 9.874 8.754 7.761 6.875 6.123 5.443 4.848 4.253 3.747 3.296 2.862 2.465 2.09 1.742 1.394 1.08 0.795 0.503 0.212 -0.044 -0.312 -0.56 -0.749 -0.946 -1.158 -1.393 -1.621 -1.766 -1.922 -2.173 -2.337 -2.492 -2.579 -2.769 -2.959 -3.154 -3.254 -3.557 -3.591 -3.714 -3.847 -4.147 -4.288 -4.458 -4.649 -4.824 -5.04 -5.299 -5.86 -3 ,18566 ,TETRA ,17558829,Sat Nov 27 03:24:40 CET,Sat Nov 27 05:15:20 CET,0.0 2.03 2.576 3.038 3.431 3.686 3.897 4.105 4.456 4.584 4.712 4.812 5.11 5.233 5.447 5.67 5.888 5.972 6.117 6.256 6.445 6.563 6.671 6.813 6.932 7.04 7.161 7.277 7.41 7.571 7.772 8.007 8.215 8.407 8.623 8.849 9.05 9.274 9.506 9.717 9.905 10.094 10.281 10.443 10.559 10.592 10.611 10.521 10.21 9.6 8.405 6.86 5.552 4.471 3.551 2.709 1.956 1.296 0.73 0.173 -0.291 -0.724 -1.149 -1.535 -1.888 -2.217 -2.571 -2.88 -3.133 -3.4 -3.682 -3.918 -4.171 -4.442 -4.647 -4.849 -5.057 -5.271 -5.493 -5.648 -5.81 -6.056 -6.218 -6.394 -6.49 -6.683 -6.884 -7.096 -7.204 -7.509 -7.565 -7.696 -7.823 -8.128 -8.308 -8.472 -8.631 -8.809 -9.051 -9.345 -9.734 -4 ,7997 ,TETRA ,17558830,Sat Nov 27 03:25:40 CET,Sat Nov 27 05:21:53 CET,0.0 1.519 1.964 2.35 2.683 2.921 3.126 3.319 3.662 3.811 3.96 4.078 4.38 4.496 4.724 4.928 5.117 5.206 5.381 5.548 5.774 5.921 6.067 6.281 6.485 6.673 6.836 6.993 7.198 7.384 7.569 7.79 7.994 8.191 8.407 8.622 8.803 8.979 9.146 9.311 9.468 9.629 9.802 9.943 10.088 10.186 10.211 10.159 9.957 9.448 8.196 6.533 5.19 3.997 2.979 2.104 1.319 0.641 0.083 -0.495 -0.997 -1.438 -1.855 -2.239 -2.596 -2.929 -3.264 -3.557 -3.816 -4.089 -4.375 -4.597 -4.814 -5.042 -5.215 -5.399 -5.606 -5.823 -6.051 -6.21 -6.366 -6.609 -6.784 -6.954 -7.039 -7.226 -7.444 -7.69 -7.808 -8.113 -8.117 -8.23 -8.355 -8.604 -8.747 -8.917 -9.1 -9.291 -9.543 -9.869 -10.915 -5 ,6299 ,TETRA ,17558831,Sat Nov 27 03:25:41 CET,Sat Nov 27 05:21:28 CET,0.0 2.113 2.714 3.21 3.541 3.81 4.044 4.273 4.725 4.916 5.083 5.221 5.537 5.666 5.905 6.126 6.336 6.425 6.593 6.791 7.084 7.246 7.396 7.62 7.833 8.034 8.212 8.379 8.609 8.809 8.989 9.216 9.418 9.604 9.824 10.039 10.213 10.384 10.583 10.796 10.96 11.116 11.307 11.468 11.6 11.693 11.765 11.745 11.523 11.002 9.91 8.424 7.048 5.842 4.817 3.892 3.092 2.373 1.771 1.164 0.658 0.233 -0.164 -0.534 -0.893 -1.222 -1.592 -1.94 -2.251 -2.579 -2.904 -3.168 -3.442 -3.722 -3.94 -4.163 -4.386 -4.616 -4.856 -5.029 -5.209 -5.479 -5.663 -5.847 -5.942 -6.139 -6.337 -6.552 -6.672 -6.985 -7.073 -7.221 -7.379 -7.705 -7.883 -8.072 -8.268 -8.487 -8.732 -9.038 -9.902 -6 ,15402 ,TETRA ,17558832,Sat Nov 27 03:25:41 CET,Sat Nov 27 05:22:30 CET,0.0 1.799 2.202 2.493 2.745 2.966 3.184 3.399 3.764 3.92 4.065 4.154 4.454 4.562 4.775 4.974 5.143 5.226 5.393 5.536 5.743 5.876 6.003 6.188 6.354 6.512 6.655 6.787 6.963 7.128 7.282 7.466 7.622 7.763 7.936 8.167 8.38 8.58 8.766 8.929 9.065 9.208 9.348 9.424 9.483 9.489 9.438 9.306 9.015 8.382 7.099 5.451 4.093 2.924 1.909 0.99 0.171 -0.577 -1.224 -1.84 -2.35 -2.823 -3.278 -3.687 -4.049 -4.376 -4.713 -5.01 -5.27 -5.522 -5.787 -6.025 -6.274 -6.535 -6.743 -6.959 -7.186 -7.426 -7.669 -7.828 -7.991 -8.25 -8.429 -8.61 -8.706 -8.917 -9.133 -9.359 -9.472 -9.774 -9.843 -9.978 -10.121 -10.431 -10.604 -10.767 -10.933 -11.127 -11.365 -11.712 -12.468 -7 ,27822 ,TETRA ,17558833,Sat Nov 27 03:26:39 CET,Sat Nov 27 05:23:15 CET,0.0 2.784 3.411 3.851 4.184 4.451 4.676 4.878 5.25 5.395 5.536 5.652 5.982 6.102 6.302 6.48 6.651 6.732 6.874 7.026 7.261 7.397 7.524 7.701 7.846 7.966 8.086 8.21 8.352 8.477 8.598 8.761 8.926 9.097 9.289 9.45 9.562 9.672 9.809 9.939 10.039 10.13 10.246 10.354 10.408 10.448 10.499 10.45 10.18 9.567 8.327 6.696 5.284 4.086 3.089 2.21 1.449 0.771 0.191 -0.397 -0.897 -1.331 -1.736 -2.114 -2.483 -2.82 -3.158 -3.477 -3.781 -4.089 -4.395 -4.654 -4.911 -5.152 -5.339 -5.541 -5.753 -5.985 -6.223 -6.38 -6.54 -6.792 -6.971 -7.16 -7.267 -7.483 -7.692 -7.918 -8.03 -8.338 -8.364 -8.478 -8.61 -8.905 -9.072 -9.238 -9.4 -9.569 -9.757 -9.984 -10.401 -8 ,20910 ,TETRA ,17558834,Sat Nov 27 03:26:40 CET,Sat Nov 27 05:25:07 CET,0.0 2.176 2.689 3.095 3.46 3.797 4.106 4.365 4.811 5.016 5.213 5.372 5.719 5.878 6.178 6.433 6.669 6.798 7.042 7.263 7.575 7.753 7.904 8.13 8.363 8.576 8.77 8.959 9.193 9.411 9.631 9.893 10.116 10.323 10.564 10.802 11.008 11.224 11.433 11.65 11.908 12.175 12.404 12.561 12.717 12.842 12.875 12.813 12.602 12.099 10.938 9.438 8.197 7.104 6.147 5.287 4.545 3.882 3.314 2.749 2.27 1.844 1.425 1.036 0.673 0.344 0.02 -0.272 -0.526 -0.79 -1.067 -1.295 -1.528 -1.779 -1.977 -2.177 -2.378 -2.576 -2.792 -2.947 -3.099 -3.339 -3.504 -3.677 -3.773 -3.975 -4.182 -4.397 -4.508 -4.815 -4.842 -4.968 -5.096 -5.348 -5.478 -5.609 -5.763 -5.973 -6.255 -6.573 -7.163 -9 ,14689 ,TETRA ,17558835,Sat Nov 27 03:26:40 CET,Sat Nov 27 05:23:14 CET,0.0 2.35 2.859 3.228 3.523 3.761 3.986 4.19 4.54 4.698 4.853 4.972 5.274 5.396 5.639 5.863 6.071 6.175 6.371 6.554 6.799 6.943 7.082 7.279 7.457 7.623 7.783 7.925 8.099 8.279 8.456 8.67 8.846 9.006 9.193 9.395 9.586 9.76 9.954 10.151 10.322 10.503 10.699 10.873 11.025 11.129 11.192 11.106 10.799 10.224 9.093 7.557 6.264 5.145 4.159 3.268 2.507 1.833 1.222 0.595 0.077 -0.358 -0.767 -1.169 -1.56 -1.909 -2.256 -2.576 -2.854 -3.134 -3.425 -3.666 -3.901 -4.134 -4.323 -4.52 -4.724 -4.943 -5.171 -5.325 -5.479 -5.725 -5.908 -6.089 -6.178 -6.37 -6.589 -6.828 -6.946 -7.25 -7.308 -7.452 -7.604 -7.971 -8.162 -8.341 -8.52 -8.699 -8.937 -9.238 -9.723 -10 ,12304 ,TETRA ,17558836,Sat Nov 27 03:26:42 CET,Sat Nov 27 05:22:32 CET,0.0 2.095 2.638 3.02 3.343 3.637 3.891 4.125 4.534 4.715 4.892 5.065 5.391 5.545 5.84 6.084 6.299 6.406 6.614 6.807 7.066 7.215 7.356 7.567 7.776 7.986 8.186 8.365 8.582 8.793 8.987 9.208 9.408 9.6 9.826 10.071 10.302 10.532 10.764 10.977 11.169 11.387 11.587 11.733 11.855 11.951 12.01 11.943 11.674 11.146 10.115 8.634 7.286 6.109 5.088 4.148 3.297 2.564 1.952 1.343 0.826 0.369 -0.044 -0.423 -0.8 -1.165 -1.544 -1.889 -2.171 -2.445 -2.734 -2.986 -3.251 -3.515 -3.71 -3.908 -4.112 -4.319 -4.537 -4.686 -4.834 -5.075 -5.249 -5.436 -5.535 -5.733 -5.954 -6.187 -6.294 -6.598 -6.665 -6.801 -6.936 -7.222 -7.388 -7.569 -7.756 -7.965 -8.217 -8.533 -9.014 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_29.txt deleted file mode 100644 index 69476c45..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32218 ,TETRA ,17558837,Sat Nov 27 03:26:41 CET,Sat Nov 27 05:23:34 CET,0.0 5.901 6.351 6.665 6.939 7.166 7.368 7.572 7.929 8.078 8.225 8.345 8.656 8.784 9.019 9.251 9.463 9.574 9.805 10.014 10.274 10.428 10.594 10.826 11.033 11.25 11.463 11.665 11.913 12.143 12.372 12.654 12.92 13.173 13.449 13.726 13.964 14.219 14.502 14.784 15.061 15.39 15.77 16.102 16.478 16.881 17.213 17.482 17.704 17.791 17.317 16.206 15.127 14.159 13.312 12.553 11.866 11.204 10.625 10.038 9.538 9.098 8.666 8.264 7.904 7.578 7.228 6.882 6.575 6.281 5.979 5.719 5.453 5.186 4.96 4.717 4.473 4.217 3.96 3.785 3.603 3.331 3.135 2.926 2.822 2.599 2.357 2.119 1.995 1.672 1.576 1.426 1.279 0.934 0.735 0.547 0.346 0.095 -0.19 -0.561 -3.153 -2 ,12041 ,TETRA ,17558838,Sat Nov 27 03:26:43 CET,Sat Nov 27 05:23:50 CET,0.0 3.11 3.598 3.963 4.292 4.579 4.843 5.086 5.517 5.703 5.864 5.989 6.302 6.431 6.679 6.92 7.126 7.228 7.432 7.623 7.924 8.117 8.283 8.516 8.725 8.93 9.136 9.336 9.602 9.848 10.078 10.355 10.626 10.875 11.132 11.406 11.669 11.939 12.227 12.527 12.821 13.147 13.502 13.812 14.1 14.374 14.625 14.802 14.932 14.853 14.333 13.284 12.154 11.075 10.146 9.36 8.637 7.899 7.264 6.655 6.106 5.637 5.206 4.778 4.376 4.038 3.696 3.395 3.14 2.864 2.575 2.346 2.108 1.855 1.672 1.482 1.282 1.085 0.857 0.683 0.508 0.23 0.025 -0.174 -0.26 -0.432 -0.629 -0.86 -0.979 -1.28 -1.315 -1.456 -1.605 -1.904 -2.098 -2.303 -2.523 -2.809 -3.164 -3.897 -8.014 -3 ,28875 ,TETRA ,17558839,Sat Nov 27 03:26:41 CET,Sat Nov 27 05:23:34 CET,0.0 1.216 1.622 1.951 2.222 2.461 2.682 2.907 3.305 3.476 3.628 3.713 4.009 4.123 4.356 4.55 4.739 4.838 5.018 5.208 5.487 5.638 5.788 6.03 6.263 6.486 6.706 6.921 7.186 7.438 7.678 7.962 8.236 8.505 8.798 9.091 9.358 9.638 9.919 10.222 10.547 10.891 11.228 11.54 11.863 12.156 12.431 12.686 12.886 12.856 12.19 10.929 9.806 8.855 8.024 7.246 6.505 5.782 5.169 4.553 3.98 3.482 3.034 2.588 2.162 1.775 1.382 1.037 0.732 0.413 0.067 -0.214 -0.494 -0.794 -1.027 -1.273 -1.52 -1.785 -2.074 -2.252 -2.429 -2.718 -2.926 -3.132 -3.235 -3.452 -3.684 -3.958 -4.103 -4.415 -4.493 -4.659 -4.828 -5.201 -5.405 -5.617 -5.871 -6.19 -6.551 -6.999 -10.58 -4 ,17853 ,TETRA ,17558840,Sat Nov 27 03:26:42 CET,Sat Nov 27 05:24:03 CET,0.0 2.311 2.761 3.09 3.358 3.595 3.825 4.034 4.426 4.625 4.808 4.964 5.301 5.445 5.674 5.881 6.078 6.175 6.369 6.544 6.813 6.982 7.131 7.356 7.566 7.77 7.959 8.13 8.35 8.566 8.773 9.022 9.257 9.473 9.746 10.05 10.307 10.595 10.889 11.156 11.419 11.703 12.001 12.259 12.54 12.806 13.028 13.16 13.21 13.048 12.354 11.216 10.063 9.035 8.126 7.264 6.48 5.779 5.193 4.577 4.047 3.606 3.16 2.717 2.325 1.97 1.609 1.265 0.963 0.668 0.341 0.062 -0.233 -0.534 -0.76 -0.992 -1.222 -1.446 -1.675 -1.846 -2.031 -2.335 -2.539 -2.725 -2.826 -3.05 -3.286 -3.523 -3.645 -3.969 -4.111 -4.289 -4.476 -4.875 -5.089 -5.322 -5.579 -5.899 -6.25 -6.662 -8.956 -5 ,2161 ,TETRA ,17558841,Sat Nov 27 03:26:41 CET,Sat Nov 27 05:24:33 CET,0.0 2.656 3.102 3.459 3.787 4.041 4.28 4.494 4.803 4.954 5.124 5.283 5.6 5.742 6.008 6.264 6.508 6.628 6.849 7.033 7.29 7.457 7.613 7.831 8.044 8.237 8.431 8.637 8.88 9.095 9.303 9.548 9.787 10.005 10.232 10.496 10.767 11.04 11.289 11.525 11.791 12.098 12.399 12.66 12.944 13.255 13.54 13.73 13.831 13.705 13.025 11.913 10.85 9.844 8.96 8.115 7.374 6.708 6.115 5.536 5.042 4.605 4.193 3.805 3.448 3.122 2.773 2.429 2.126 1.809 1.481 1.225 0.949 0.644 0.417 0.2 -0.019 -0.248 -0.502 -0.682 -0.875 -1.185 -1.403 -1.618 -1.73 -1.97 -2.227 -2.493 -2.629 -2.972 -3.085 -3.243 -3.419 -3.852 -4.103 -4.351 -4.589 -4.895 -5.316 -5.808 -9.635 -6 ,5069 ,TETRA ,17558842,Sat Nov 27 03:26:41 CET,Sat Nov 27 05:24:08 CET,0.0 2.035 2.67 3.067 3.363 3.606 3.848 4.068 4.433 4.594 4.734 4.83 5.137 5.255 5.49 5.719 5.938 6.04 6.246 6.448 6.707 6.866 7.026 7.26 7.472 7.653 7.812 7.982 8.21 8.422 8.624 8.853 9.059 9.262 9.507 9.774 10.025 10.299 10.567 10.827 11.107 11.419 11.763 12.112 12.516 12.861 13.128 13.337 13.403 13.236 12.572 11.509 10.514 9.54 8.638 7.833 7.133 6.42 5.764 5.123 4.579 4.118 3.682 3.234 2.802 2.416 2.004 1.607 1.27 0.933 0.584 0.289 -0.032 -0.346 -0.583 -0.829 -1.083 -1.351 -1.641 -1.842 -2.043 -2.356 -2.579 -2.811 -2.927 -3.156 -3.415 -3.693 -3.826 -4.167 -4.317 -4.474 -4.623 -5.017 -5.276 -5.57 -5.892 -6.291 -6.801 -7.328 -10.09 -7 ,694 ,TETRA ,17558843,Sat Nov 27 03:26:42 CET,Sat Nov 27 05:24:12 CET,0.0 3.495 3.895 4.168 4.393 4.624 4.834 5.054 5.481 5.658 5.805 5.877 6.177 6.305 6.544 6.769 6.998 7.109 7.315 7.515 7.79 7.964 8.135 8.386 8.623 8.843 9.046 9.252 9.531 9.79 10.027 10.282 10.508 10.748 11.027 11.297 11.552 11.83 12.124 12.455 12.807 13.189 13.629 14.051 14.463 14.823 15.175 15.44 15.489 15.256 14.442 13.178 12.055 11.019 10.08 9.217 8.466 7.785 7.175 6.545 5.994 5.484 5.017 4.597 4.204 3.843 3.465 3.11 2.782 2.467 2.157 1.89 1.606 1.307 1.069 0.832 0.594 0.327 0.035 -0.162 -0.364 -0.697 -0.948 -1.184 -1.282 -1.484 -1.716 -1.985 -2.12 -2.433 -2.52 -2.681 -2.852 -3.202 -3.395 -3.616 -3.899 -4.252 -4.638 -5.193 -8.813 -8 ,27026 ,TETRA ,17558844,Sat Nov 27 03:26:42 CET,Sat Nov 27 05:24:41 CET,0.0 2.478 3.017 3.357 3.67 3.957 4.224 4.465 4.88 5.068 5.217 5.324 5.655 5.801 6.06 6.286 6.487 6.584 6.777 6.96 7.215 7.385 7.546 7.748 7.936 8.144 8.336 8.503 8.735 8.975 9.201 9.465 9.73 9.981 10.245 10.534 10.799 11.064 11.324 11.592 11.881 12.203 12.575 12.901 13.22 13.529 13.859 14.11 14.227 14.152 13.593 12.64 11.616 10.679 9.892 9.163 8.516 7.933 7.405 6.828 6.322 5.897 5.499 5.115 4.756 4.43 4.099 3.796 3.511 3.212 2.908 2.657 2.401 2.124 1.916 1.703 1.487 1.267 1.031 0.866 0.694 0.418 0.226 0.018 -0.095 -0.315 -0.546 -0.789 -0.926 -1.269 -1.408 -1.574 -1.735 -2.048 -2.221 -2.424 -2.681 -2.981 -3.353 -3.822 -6.424 -9 ,21766 ,TETRA ,17558845,Sat Nov 27 03:26:43 CET,Sat Nov 27 05:24:23 CET,0.0 1.963 2.403 2.747 3.025 3.252 3.463 3.682 4.062 4.223 4.396 4.523 4.835 4.969 5.204 5.426 5.636 5.73 5.899 6.076 6.338 6.5 6.654 6.889 7.098 7.302 7.513 7.713 7.96 8.185 8.409 8.674 8.891 9.071 9.314 9.573 9.787 10.033 10.306 10.572 10.833 11.15 11.506 11.82 12.154 12.499 12.809 13.03 13.181 13.13 12.571 11.584 10.641 9.695 8.76 7.931 7.23 6.559 5.982 5.435 4.954 4.521 4.094 3.674 3.287 2.923 2.532 2.184 1.871 1.551 1.234 0.974 0.699 0.402 0.16 -0.09 -0.344 -0.601 -0.861 -1.039 -1.208 -1.47 -1.673 -1.897 -2.012 -2.24 -2.473 -2.728 -2.859 -3.181 -3.304 -3.46 -3.624 -3.966 -4.141 -4.345 -4.589 -4.863 -5.203 -5.663 -9.826 -10 ,6148 ,TETRA ,17558846,Sat Nov 27 03:27:40 CET,Sat Nov 27 05:28:56 CET,0.0 3.885 4.455 4.803 5.079 5.317 5.517 5.692 6.042 6.227 6.392 6.51 6.84 6.974 7.238 7.51 7.772 7.881 8.059 8.225 8.482 8.648 8.81 9.052 9.273 9.464 9.647 9.824 10.047 10.279 10.519 10.785 11.036 11.288 11.574 11.907 12.23 12.541 12.808 13.058 13.299 13.595 13.925 14.188 14.441 14.669 14.827 14.945 14.972 14.682 13.777 12.46 11.348 10.343 9.432 8.614 7.903 7.232 6.63 6.037 5.54 5.08 4.635 4.213 3.796 3.411 3.024 2.696 2.406 2.101 1.791 1.53 1.256 0.975 0.755 0.523 0.276 0.024 -0.231 -0.413 -0.601 -0.899 -1.118 -1.348 -1.46 -1.692 -1.942 -2.208 -2.351 -2.691 -2.806 -2.947 -3.109 -3.544 -3.779 -4.006 -4.258 -4.569 -4.913 -5.324 -7.262 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_42.txt deleted file mode 100644 index b77cb474..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31558 ,TETRA ,17558847,Sat Nov 27 03:27:43 CET,Sat Nov 27 05:29:30 CET,0.0 0.422 0.68 0.922 1.118 1.282 1.435 1.58 1.839 1.963 2.086 2.143 2.424 2.53 2.724 2.898 3.061 3.142 3.301 3.446 3.655 3.796 3.934 4.124 4.312 4.497 4.677 4.871 5.104 5.304 5.505 5.738 5.953 6.164 6.406 6.677 6.954 7.276 7.623 8.0 8.361 8.713 9.109 9.485 9.899 10.358 10.88 11.401 11.949 12.506 12.927 12.877 12.561 12.17 11.756 11.338 10.866 10.425 10.098 9.764 9.448 9.152 8.874 8.614 8.378 8.154 7.899 7.671 7.488 7.309 7.123 6.962 6.79 6.612 6.468 6.314 6.152 5.979 5.793 5.66 5.527 5.313 5.175 5.036 4.966 4.829 4.669 4.51 4.428 4.159 4.086 3.943 3.789 3.465 3.292 3.093 2.887 2.671 2.431 2.096 1.016 -2 ,16574 ,TETRA ,17558848,Sat Nov 27 03:27:41 CET,Sat Nov 27 05:27:15 CET,0.0 1.476 1.847 2.107 2.366 2.586 2.784 2.962 3.282 3.421 3.553 3.643 3.929 4.048 4.267 4.456 4.634 4.719 4.889 5.049 5.253 5.384 5.517 5.695 5.868 6.046 6.207 6.364 6.573 6.783 6.986 7.216 7.426 7.628 7.863 8.127 8.385 8.653 8.93 9.229 9.584 9.981 10.378 10.763 11.216 11.714 12.26 12.814 13.389 13.938 14.421 14.492 14.248 13.92 13.566 13.184 12.797 12.43 12.075 11.706 11.394 11.117 10.855 10.593 10.343 10.118 9.88 9.645 9.438 9.237 9.025 8.837 8.64 8.439 8.282 8.117 7.944 7.768 7.582 7.455 7.331 7.134 6.999 6.851 6.775 6.614 6.443 6.277 6.194 5.942 5.892 5.779 5.671 5.413 5.265 5.1 4.944 4.799 4.642 4.463 3.943 -3 ,9317 ,TETRA ,17558849,Sat Nov 27 03:27:40 CET,Sat Nov 27 05:27:07 CET,0.0 1.454 1.877 2.217 2.484 2.721 2.938 3.121 3.415 3.554 3.703 3.807 4.097 4.208 4.422 4.613 4.795 4.883 5.041 5.181 5.389 5.532 5.671 5.86 6.041 6.221 6.391 6.557 6.776 6.984 7.187 7.423 7.641 7.844 8.094 8.383 8.638 8.9 9.185 9.492 9.828 10.225 10.673 11.103 11.562 12.044 12.568 13.118 13.722 14.257 14.638 14.686 14.484 14.237 13.924 13.543 13.16 12.796 12.449 12.11 11.862 11.634 11.405 11.171 10.925 10.712 10.506 10.315 10.146 9.959 9.756 9.596 9.432 9.254 9.119 8.974 8.81 8.649 8.485 8.361 8.239 8.061 7.93 7.794 7.721 7.56 7.401 7.239 7.156 6.908 6.87 6.754 6.637 6.406 6.286 6.162 6.015 5.836 5.642 5.385 4.878 -4 ,6929 ,TETRA ,17558850,Sat Nov 27 03:28:41 CET,Sat Nov 27 05:33:54 CET,0.0 1.193 1.588 1.86 2.136 2.392 2.611 2.807 3.171 3.337 3.486 3.568 3.86 3.971 4.184 4.39 4.589 4.681 4.851 4.998 5.201 5.335 5.472 5.674 5.871 6.051 6.215 6.369 6.555 6.741 6.918 7.131 7.344 7.535 7.747 8.003 8.246 8.508 8.792 9.078 9.382 9.733 10.115 10.485 10.911 11.357 11.876 12.443 12.998 13.496 13.898 13.944 13.714 13.34 12.939 12.553 12.189 11.805 11.45 11.119 10.826 10.56 10.305 10.057 9.803 9.565 9.329 9.117 8.919 8.712 8.516 8.35 8.15 7.935 7.781 7.628 7.476 7.314 7.117 6.969 6.812 6.562 6.391 6.211 6.122 5.951 5.771 5.584 5.477 5.193 5.138 5.015 4.887 4.597 4.438 4.27 4.074 3.863 3.626 3.282 2.259 -5 ,8839 ,TETRA ,17558851,Sat Nov 27 03:28:43 CET,Sat Nov 27 05:28:33 CET,0.0 0.904 1.288 1.567 1.802 2.019 2.197 2.352 2.616 2.747 2.88 2.934 3.209 3.32 3.542 3.741 3.916 3.996 4.156 4.317 4.542 4.682 4.823 5.032 5.219 5.399 5.571 5.734 5.959 6.185 6.403 6.651 6.874 7.088 7.326 7.597 7.873 8.187 8.498 8.825 9.164 9.517 9.943 10.368 10.814 11.276 11.796 12.382 12.994 13.574 14.039 14.081 13.883 13.602 13.27 12.879 12.481 12.136 11.851 11.529 11.234 10.945 10.633 10.331 10.055 9.804 9.527 9.287 9.084 8.87 8.652 8.465 8.261 8.047 7.875 7.695 7.503 7.305 7.11 6.975 6.84 6.634 6.485 6.323 6.238 6.065 5.878 5.667 5.554 5.267 5.174 5.031 4.895 4.614 4.446 4.275 4.098 3.9 3.684 3.365 2.802 -6 ,719 ,TETRA ,17558852,Sat Nov 27 03:28:41 CET,Sat Nov 27 05:23:23 CET,0.0 0.74 1.031 1.29 1.528 1.735 1.91 2.065 2.34 2.468 2.596 2.655 2.932 3.036 3.243 3.441 3.616 3.7 3.859 3.999 4.206 4.341 4.469 4.671 4.856 5.027 5.197 5.36 5.572 5.779 5.984 6.242 6.485 6.699 6.953 7.236 7.492 7.765 8.043 8.345 8.672 9.023 9.405 9.787 10.238 10.706 11.209 11.738 12.311 12.907 13.414 13.518 13.336 13.072 12.745 12.389 12.039 11.661 11.308 10.981 10.704 10.432 10.153 9.894 9.677 9.468 9.22 8.991 8.8 8.61 8.401 8.225 8.049 7.845 7.673 7.492 7.308 7.116 6.926 6.795 6.647 6.415 6.251 6.083 5.999 5.802 5.597 5.403 5.3 5.022 4.952 4.829 4.698 4.427 4.28 4.112 3.907 3.677 3.369 2.973 1.671 -7 ,30441 ,TETRA ,17558853,Sat Nov 27 03:28:41 CET,Sat Nov 27 05:27:03 CET,0.0 0.643 0.951 1.249 1.509 1.72 1.912 2.1 2.414 2.557 2.697 2.783 3.067 3.166 3.37 3.549 3.7 3.78 3.947 4.105 4.331 4.472 4.6 4.785 4.97 5.152 5.323 5.478 5.668 5.859 6.044 6.27 6.488 6.692 6.927 7.192 7.444 7.715 8.022 8.331 8.616 8.941 9.348 9.749 10.189 10.663 11.196 11.764 12.381 13.003 13.427 13.389 13.135 12.852 12.572 12.265 11.96 11.658 11.357 11.029 10.733 10.461 10.202 9.932 9.65 9.415 9.175 8.941 8.751 8.546 8.312 8.118 7.915 7.712 7.547 7.359 7.162 6.962 6.758 6.619 6.478 6.241 6.084 5.928 5.844 5.672 5.479 5.26 5.148 4.867 4.814 4.693 4.569 4.303 4.153 3.991 3.823 3.625 3.387 3.114 2.674 -8 ,32012 ,TETRA ,17558854,Sat Nov 27 03:28:41 CET,Sat Nov 27 05:27:15 CET,0.0 0.735 1.07 1.334 1.569 1.758 1.915 2.056 2.34 2.48 2.608 2.668 2.961 3.073 3.267 3.458 3.64 3.722 3.883 4.037 4.265 4.411 4.56 4.783 4.97 5.139 5.304 5.463 5.667 5.867 6.082 6.334 6.55 6.752 6.994 7.266 7.504 7.772 8.092 8.425 8.767 9.153 9.578 9.985 10.439 10.928 11.466 12.047 12.672 13.272 13.713 13.718 13.493 13.182 12.832 12.485 12.131 11.778 11.44 11.089 10.781 10.503 10.233 9.972 9.729 9.504 9.259 9.026 8.826 8.604 8.355 8.161 7.974 7.773 7.622 7.474 7.314 7.147 6.969 6.834 6.692 6.483 6.339 6.193 6.115 5.954 5.785 5.607 5.519 5.253 5.219 5.11 4.982 4.706 4.571 4.41 4.245 4.086 3.882 3.635 2.891 -9 ,29047 ,TETRA ,17558855,Sat Nov 27 03:28:42 CET,Sat Nov 27 05:26:30 CET,0.0 0.766 1.125 1.404 1.635 1.811 1.959 2.103 2.362 2.483 2.608 2.674 2.956 3.056 3.248 3.432 3.61 3.697 3.867 4.024 4.237 4.371 4.501 4.686 4.86 5.027 5.184 5.348 5.569 5.773 5.961 6.188 6.414 6.63 6.872 7.137 7.389 7.668 7.951 8.234 8.552 8.916 9.327 9.732 10.168 10.616 11.091 11.583 12.088 12.612 13.084 13.204 13.04 12.738 12.338 11.927 11.573 11.244 10.932 10.578 10.275 10.005 9.736 9.485 9.256 9.032 8.777 8.547 8.365 8.179 7.967 7.783 7.603 7.417 7.269 7.121 6.963 6.786 6.601 6.477 6.34 6.129 5.989 5.852 5.782 5.619 5.446 5.272 5.182 4.924 4.887 4.776 4.664 4.408 4.266 4.122 3.961 3.766 3.544 3.237 2.473 -10 ,201 ,TETRA ,17558856,Sat Nov 27 03:28:44 CET,Sat Nov 27 05:27:35 CET,0.0 1.021 1.424 1.728 1.997 2.227 2.421 2.589 2.91 3.063 3.2 3.272 3.564 3.681 3.873 4.058 4.241 4.328 4.486 4.638 4.858 4.995 5.134 5.352 5.551 5.725 5.89 6.048 6.273 6.491 6.688 6.925 7.139 7.335 7.561 7.824 8.076 8.355 8.658 8.957 9.269 9.616 10.003 10.382 10.794 11.231 11.719 12.235 12.784 13.342 13.728 13.677 13.415 13.096 12.755 12.363 11.942 11.559 11.238 10.908 10.628 10.356 10.068 9.797 9.54 9.29 9.031 8.813 8.617 8.401 8.173 7.984 7.788 7.58 7.425 7.266 7.087 6.897 6.708 6.572 6.424 6.191 6.036 5.87 5.78 5.593 5.405 5.219 5.116 4.848 4.795 4.669 4.532 4.246 4.098 3.945 3.763 3.553 3.333 3.042 2.183 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_44.txt deleted file mode 100644 index e36d2efa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_44.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17943 ,TETRA ,17558857,Sat Nov 27 03:29:42 CET,Sat Nov 27 05:27:32 CET,0.0 1.84 2.422 2.813 3.113 3.389 3.612 3.826 4.252 4.444 4.627 4.784 5.104 5.236 5.502 5.75 5.978 6.086 6.306 6.513 6.767 6.925 7.088 7.325 7.544 7.751 7.955 8.15 8.402 8.656 8.896 9.19 9.493 9.776 10.085 10.413 10.728 11.073 11.439 11.818 12.199 12.621 13.102 13.578 14.124 14.673 15.223 15.788 16.409 17.005 17.4 17.414 17.205 16.853 16.463 16.09 15.738 15.377 15.023 14.64 14.292 13.984 13.687 13.402 13.131 12.882 12.62 12.377 12.16 11.928 11.679 11.46 11.223 10.986 10.81 10.627 10.451 10.266 10.061 9.918 9.771 9.543 9.381 9.206 9.116 8.917 8.694 8.46 8.343 8.056 8.008 7.891 7.752 7.43 7.244 7.042 6.837 6.599 6.289 5.87 4.469 -2 ,540 ,TETRA ,17558858,Sat Nov 27 03:29:44 CET,Sat Nov 27 05:25:24 CET,0.0 3.506 4.056 4.443 4.743 4.992 5.198 5.371 5.681 5.833 5.981 6.065 6.356 6.473 6.717 6.946 7.135 7.231 7.412 7.582 7.839 8.003 8.163 8.384 8.592 8.8 8.995 9.184 9.43 9.673 9.914 10.2 10.48 10.744 11.03 11.336 11.631 11.963 12.315 12.687 13.054 13.436 13.891 14.344 14.822 15.318 15.888 16.475 17.08 17.736 18.258 18.299 18.079 17.729 17.282 16.816 16.39 15.958 15.58 15.184 14.827 14.536 14.24 13.891 13.546 13.26 12.977 12.727 12.517 12.281 12.032 11.845 11.637 11.406 11.223 11.03 10.829 10.623 10.41 10.257 10.099 9.851 9.672 9.489 9.394 9.186 8.96 8.731 8.62 8.328 8.234 8.1 7.967 7.661 7.471 7.264 7.043 6.752 6.393 6.015 5.074 -4 ,9926 ,TETRA ,17558860,Sat Nov 27 03:29:43 CET,Sat Nov 27 05:27:42 CET,0.0 1.158 1.571 1.928 2.229 2.465 2.649 2.832 3.162 3.313 3.455 3.562 3.875 4.012 4.277 4.496 4.679 4.769 4.941 5.108 5.362 5.523 5.678 5.902 6.108 6.303 6.49 6.672 6.925 7.174 7.406 7.682 7.934 8.16 8.428 8.742 9.04 9.34 9.655 9.999 10.358 10.75 11.171 11.543 11.974 12.493 13.035 13.575 14.172 14.78 15.261 15.361 15.169 14.8 14.419 14.045 13.68 13.334 13.021 12.69 12.373 12.079 11.79 11.516 11.269 11.025 10.747 10.506 10.301 10.087 9.866 9.673 9.471 9.265 9.089 8.904 8.723 8.533 8.321 8.178 8.041 7.817 7.664 7.508 7.429 7.267 7.076 6.873 6.776 6.508 6.429 6.292 6.158 5.897 5.749 5.573 5.381 5.186 4.974 4.688 4.093 -5 ,23158 ,TETRA ,17558861,Sat Nov 27 03:30:41 CET,Sat Nov 27 05:28:54 CET,0.0 1.351 1.795 2.113 2.357 2.595 2.826 3.017 3.358 3.515 3.658 3.744 4.035 4.152 4.4 4.64 4.855 4.957 5.147 5.324 5.568 5.733 5.884 6.078 6.273 6.473 6.678 6.878 7.146 7.408 7.643 7.933 8.217 8.487 8.796 9.135 9.457 9.767 10.091 10.438 10.784 11.187 11.689 12.218 12.825 13.438 14.094 14.718 15.313 15.868 16.277 16.256 15.94 15.489 14.965 14.474 14.027 13.588 13.214 12.821 12.487 12.221 11.957 11.71 11.469 11.227 10.964 10.734 10.548 10.358 10.147 9.967 9.784 9.593 9.439 9.274 9.117 8.956 8.772 8.651 8.527 8.322 8.17 8.011 7.928 7.75 7.556 7.347 7.247 6.974 6.946 6.828 6.701 6.38 6.201 6.014 5.795 5.555 5.28 4.87 3.719 -6 ,5598 ,TETRA ,17558863,Sat Nov 27 03:30:43 CET,Sat Nov 27 05:29:07 CET,0.0 0.942 1.352 1.657 1.909 2.126 2.34 2.545 2.893 3.047 3.196 3.305 3.617 3.748 3.975 4.175 4.369 4.467 4.672 4.86 5.118 5.287 5.455 5.706 5.95 6.181 6.393 6.593 6.846 7.091 7.325 7.596 7.846 8.097 8.399 8.738 9.051 9.375 9.691 10.017 10.372 10.757 11.178 11.607 12.121 12.689 13.28 13.869 14.448 14.977 15.427 15.468 15.253 14.939 14.593 14.148 13.617 13.12 12.76 12.421 12.118 11.841 11.565 11.328 11.104 10.888 10.638 10.378 10.145 9.91 9.656 9.432 9.213 8.982 8.785 8.573 8.354 8.159 7.988 7.873 7.741 7.52 7.362 7.172 7.07 6.879 6.694 6.519 6.436 6.189 6.12 5.988 5.843 5.515 5.341 5.156 4.959 4.688 4.4 4.108 3.438 -7 ,17861 ,TETRA ,17558864,Sat Nov 27 03:30:41 CET,Sat Nov 27 05:28:11 CET,0.0 1.362 1.873 2.354 2.697 2.959 3.191 3.392 3.736 3.921 4.106 4.275 4.599 4.723 4.961 5.182 5.391 5.493 5.686 5.873 6.135 6.309 6.477 6.712 6.929 7.135 7.339 7.523 7.745 7.959 8.169 8.426 8.689 8.935 9.192 9.467 9.735 10.03 10.352 10.674 10.997 11.391 11.854 12.301 12.78 13.294 13.891 14.477 14.998 15.494 15.975 16.077 15.853 15.532 15.167 14.786 14.406 14.03 13.704 13.354 13.044 12.761 12.438 12.117 11.842 11.586 11.299 11.029 10.801 10.582 10.362 10.192 9.997 9.769 9.591 9.391 9.181 8.979 8.758 8.598 8.432 8.174 7.995 7.815 7.731 7.566 7.392 7.216 7.129 6.869 6.847 6.741 6.62 6.356 6.221 6.084 5.92 5.741 5.531 5.231 3.898 -8 ,2793 ,TETRA ,17558865,Sat Nov 27 03:30:41 CET,Sat Nov 27 05:28:21 CET,0.0 1.071 1.598 1.95 2.278 2.659 3.028 3.295 3.673 3.858 4.041 4.16 4.483 4.625 4.895 5.156 5.397 5.503 5.719 5.935 6.221 6.391 6.554 6.799 7.053 7.297 7.532 7.773 8.085 8.38 8.661 8.995 9.292 9.549 9.848 10.179 10.492 10.831 11.19 11.593 12.01 12.467 13.036 13.577 14.143 14.712 15.298 15.894 16.513 17.193 17.802 17.96 17.72 17.363 17.014 16.631 16.247 15.898 15.559 15.192 14.861 14.551 14.249 13.936 13.664 13.442 13.189 12.941 12.733 12.516 12.268 12.054 11.836 11.617 11.446 11.261 11.066 10.856 10.633 10.472 10.303 10.059 9.885 9.703 9.615 9.419 9.209 9.016 8.923 8.658 8.602 8.487 8.359 8.037 7.852 7.673 7.481 7.239 6.958 6.633 5.518 -9 ,20032 ,TETRA ,17558866,Sat Nov 27 03:30:41 CET,Sat Nov 27 05:29:02 CET,0.0 2.196 2.696 3.051 3.309 3.556 3.776 3.97 4.314 4.471 4.61 4.69 4.983 5.099 5.334 5.561 5.766 5.867 6.078 6.268 6.523 6.683 6.841 7.072 7.291 7.491 7.677 7.861 8.107 8.346 8.56 8.83 9.107 9.356 9.635 9.939 10.225 10.538 10.877 11.239 11.62 12.019 12.459 12.904 13.412 13.955 14.519 15.132 15.793 16.381 16.886 17.075 16.944 16.639 16.336 16.038 15.739 15.414 15.103 14.794 14.516 14.257 14.003 13.76 13.524 13.307 13.072 12.85 12.664 12.47 12.268 12.101 11.925 11.742 11.586 11.42 11.253 11.076 10.888 10.748 10.602 10.383 10.231 10.079 10.004 9.851 9.68 9.5 9.417 9.162 9.124 9.014 8.904 8.651 8.505 8.362 8.225 8.072 7.887 7.624 7.092 -10 ,6408 ,TETRA ,17558867,Sat Nov 27 03:30:42 CET,Sat Nov 27 05:28:49 CET,0.0 1.095 1.464 1.773 2.053 2.317 2.539 2.725 3.035 3.188 3.338 3.438 3.743 3.877 4.142 4.375 4.581 4.684 4.885 5.068 5.332 5.506 5.677 5.92 6.136 6.333 6.522 6.703 6.932 7.154 7.372 7.616 7.826 8.038 8.3 8.572 8.827 9.139 9.479 9.843 10.22 10.622 11.068 11.494 11.98 12.502 13.085 13.683 14.31 14.934 15.338 15.267 14.955 14.563 14.14 13.706 13.273 12.833 12.445 12.07 11.742 11.449 11.165 10.872 10.573 10.3 10.005 9.725 9.504 9.289 9.05 8.84 8.622 8.404 8.228 8.043 7.864 7.675 7.477 7.344 7.208 6.98 6.815 6.646 6.562 6.384 6.166 5.932 5.818 5.519 5.44 5.322 5.198 4.905 4.715 4.514 4.324 4.097 3.809 3.446 2.266 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_45.txt deleted file mode 100644 index d96373ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_45.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3704 ,TETRA ,17558868,Sat Nov 27 03:30:44 CET,Sat Nov 27 05:28:56 CET,0.0 1.216 1.565 1.832 2.072 2.311 2.529 2.726 3.07 3.213 3.363 3.46 3.751 3.865 4.1 4.322 4.525 4.621 4.8 4.966 5.214 5.378 5.534 5.763 5.984 6.206 6.409 6.585 6.824 7.06 7.268 7.495 7.708 7.913 8.134 8.378 8.622 8.887 9.173 9.451 9.723 10.037 10.415 10.774 11.155 11.543 11.908 12.276 12.657 12.957 12.954 12.499 11.96 11.395 10.846 10.341 9.88 9.444 9.061 8.693 8.374 8.057 7.71 7.398 7.135 6.905 6.66 6.429 6.234 6.037 5.825 5.636 5.425 5.196 5.012 4.816 4.611 4.392 4.175 4.026 3.869 3.636 3.474 3.315 3.234 3.058 2.864 2.658 2.556 2.285 2.219 2.087 1.944 1.598 1.425 1.238 1.01 0.768 0.495 0.116 -0.937 -2 ,3074 ,TETRA ,17558869,Sat Nov 27 03:30:42 CET,Sat Nov 27 05:30:12 CET,0.0 1.859 2.328 2.719 3.013 3.262 3.487 3.689 4.036 4.192 4.349 4.479 4.8 4.932 5.189 5.421 5.621 5.716 5.914 6.11 6.381 6.54 6.684 6.904 7.118 7.314 7.51 7.702 7.947 8.181 8.395 8.645 8.878 9.096 9.355 9.644 9.906 10.193 10.509 10.842 11.159 11.502 11.894 12.246 12.654 13.109 13.566 14.002 14.438 14.792 14.921 14.633 14.164 13.641 13.116 12.578 12.083 11.661 11.313 10.926 10.554 10.2 9.859 9.534 9.229 8.965 8.681 8.419 8.191 7.942 7.67 7.431 7.189 6.958 6.785 6.612 6.439 6.26 6.051 5.899 5.742 5.492 5.324 5.152 5.062 4.869 4.671 4.441 4.321 4.02 3.942 3.798 3.631 3.247 3.07 2.915 2.74 2.519 2.223 1.783 0.239 -3 ,27603 ,TETRA ,17558870,Sat Nov 27 03:30:41 CET,Sat Nov 27 05:29:05 CET,0.0 1.464 1.987 2.348 2.62 2.858 3.068 3.26 3.599 3.743 3.879 3.974 4.27 4.391 4.6 4.802 4.986 5.072 5.241 5.395 5.613 5.756 5.905 6.113 6.32 6.522 6.709 6.902 7.157 7.382 7.585 7.841 8.096 8.33 8.586 8.87 9.149 9.436 9.723 10.031 10.363 10.728 11.122 11.496 11.905 12.328 12.751 13.148 13.51 13.798 13.916 13.639 13.162 12.654 12.144 11.65 11.204 10.811 10.459 10.098 9.779 9.49 9.207 8.925 8.671 8.444 8.196 7.962 7.745 7.516 7.294 7.119 6.937 6.745 6.591 6.412 6.195 5.983 5.784 5.649 5.518 5.317 5.179 5.008 4.914 4.741 4.568 4.379 4.275 3.99 3.967 3.86 3.739 3.481 3.341 3.194 3.025 2.849 2.623 2.341 1.758 -4 ,23116 ,TETRA ,17558871,Sat Nov 27 03:31:42 CET,Sat Nov 27 05:31:03 CET,0.0 1.003 1.516 1.899 2.137 2.39 2.609 2.773 3.054 3.19 3.332 3.419 3.694 3.801 4.013 4.229 4.44 4.536 4.712 4.872 5.104 5.249 5.392 5.602 5.791 5.973 6.154 6.32 6.544 6.781 6.993 7.222 7.442 7.651 7.878 8.115 8.342 8.599 8.876 9.184 9.505 9.861 10.262 10.617 10.976 11.354 11.765 12.119 12.395 12.574 12.659 12.371 11.813 11.241 10.736 10.257 9.788 9.343 8.954 8.538 8.154 7.813 7.479 7.152 6.838 6.54 6.232 5.968 5.748 5.521 5.288 5.095 4.886 4.672 4.499 4.308 4.114 3.915 3.717 3.578 3.425 3.159 2.957 2.756 2.657 2.452 2.253 2.046 1.944 1.677 1.641 1.538 1.45 1.248 1.119 0.983 0.844 0.702 0.518 0.293 -0.044 -5 ,7861 ,TETRA ,17558872,Sat Nov 27 03:32:40 CET,Sat Nov 27 05:32:46 CET,0.0 1.478 1.934 2.285 2.596 2.844 3.053 3.244 3.546 3.689 3.821 3.881 4.172 4.285 4.501 4.715 4.914 5.015 5.223 5.412 5.676 5.838 5.985 6.202 6.403 6.587 6.78 6.967 7.184 7.398 7.605 7.844 8.063 8.265 8.498 8.765 9.021 9.296 9.577 9.868 10.187 10.532 10.907 11.254 11.638 12.045 12.464 12.889 13.307 13.594 13.617 13.296 12.763 12.223 11.732 11.235 10.758 10.29 9.886 9.486 9.121 8.777 8.448 8.13 7.82 7.552 7.261 6.993 6.771 6.552 6.319 6.108 5.893 5.678 5.513 5.344 5.171 5.006 4.838 4.715 4.582 4.378 4.231 4.074 3.995 3.828 3.653 3.476 3.382 3.105 3.064 2.955 2.836 2.566 2.423 2.272 2.099 1.913 1.703 1.444 1.006 -6 ,2534 ,TETRA ,17558873,Sat Nov 27 03:31:42 CET,Sat Nov 27 05:30:21 CET,0.0 2.048 2.708 3.126 3.498 3.79 3.995 4.192 4.528 4.685 4.834 4.915 5.201 5.308 5.51 5.711 5.895 5.991 6.168 6.319 6.559 6.725 6.887 7.143 7.382 7.584 7.781 7.962 8.181 8.404 8.624 8.875 9.097 9.306 9.563 9.852 10.124 10.432 10.747 11.042 11.313 11.621 11.985 12.338 12.733 13.125 13.561 14.009 14.452 14.828 14.947 14.633 14.136 13.604 13.077 12.57 12.095 11.649 11.27 10.868 10.502 10.163 9.852 9.559 9.281 9.032 8.762 8.513 8.297 8.07 7.825 7.626 7.421 7.195 7.021 6.835 6.641 6.449 6.252 6.119 5.986 5.782 5.636 5.477 5.395 5.21 5.012 4.823 4.72 4.43 4.375 4.243 4.091 3.785 3.631 3.47 3.303 3.128 2.903 2.595 1.528 -7 ,20665 ,TETRA ,17558875,Sat Nov 27 03:31:42 CET,Sat Nov 27 05:30:22 CET,0.0 0.788 1.196 1.502 1.747 1.954 2.131 2.318 2.662 2.804 2.935 3.037 3.332 3.44 3.639 3.82 4.014 4.106 4.254 4.402 4.619 4.753 4.885 5.067 5.25 5.434 5.604 5.771 5.99 6.201 6.407 6.652 6.897 7.132 7.387 7.667 7.935 8.218 8.502 8.796 9.117 9.475 9.864 10.237 10.645 11.065 11.524 11.936 12.283 12.588 12.702 12.347 11.845 11.374 10.929 10.512 10.101 9.664 9.244 8.79 8.394 8.052 7.727 7.399 7.09 6.82 6.548 6.28 6.042 5.81 5.573 5.393 5.216 5.024 4.862 4.682 4.469 4.233 3.989 3.822 3.643 3.365 3.176 3.01 2.941 2.766 2.565 2.36 2.252 1.955 1.851 1.709 1.574 1.325 1.21 1.084 0.937 0.795 0.599 0.273 -0.827 -8 ,23048 ,TETRA ,17558876,Sat Nov 27 03:31:43 CET,Sat Nov 27 05:29:33 CET,0.0 1.922 2.38 2.748 3.067 3.336 3.579 3.78 4.129 4.295 4.439 4.547 4.846 4.961 5.192 5.414 5.612 5.702 5.87 6.049 6.31 6.475 6.643 6.887 7.114 7.341 7.548 7.73 7.955 8.169 8.375 8.616 8.844 9.061 9.295 9.555 9.816 10.08 10.373 10.702 11.029 11.392 11.809 12.198 12.61 13.002 13.414 13.827 14.174 14.415 14.38 13.989 13.47 12.873 12.323 11.787 11.285 10.817 10.396 9.96 9.551 9.178 8.828 8.51 8.236 7.986 7.735 7.515 7.3 7.057 6.816 6.62 6.41 6.19 6.015 5.834 5.638 5.429 5.219 5.074 4.916 4.658 4.479 4.307 4.218 4.01 3.79 3.561 3.444 3.154 3.123 3.005 2.876 2.579 2.427 2.261 2.073 1.902 1.731 1.512 0.576 -9 ,15478 ,TETRA ,17558877,Sat Nov 27 03:31:42 CET,Sat Nov 27 05:21:17 CET,0.0 1.666 2.131 2.442 2.71 2.918 3.1 3.268 3.573 3.717 3.859 3.953 4.243 4.36 4.581 4.787 4.982 5.078 5.256 5.422 5.659 5.805 5.956 6.179 6.37 6.556 6.737 6.903 7.112 7.32 7.524 7.766 7.993 8.201 8.433 8.693 8.944 9.215 9.492 9.778 10.067 10.386 10.748 11.102 11.493 11.908 12.369 12.814 13.293 13.709 13.842 13.612 13.17 12.664 12.146 11.625 11.148 10.687 10.264 9.831 9.459 9.133 8.815 8.519 8.261 8.011 7.736 7.494 7.272 7.045 6.823 6.632 6.431 6.216 6.054 5.887 5.699 5.492 5.281 5.148 5.009 4.777 4.613 4.438 4.345 4.151 3.959 3.738 3.617 3.328 3.248 3.106 2.962 2.644 2.465 2.262 2.011 1.73 1.436 1.106 0.306 -10 ,12094 ,TETRA ,17558878,Sat Nov 27 03:31:42 CET,Sat Nov 27 05:23:05 CET,0.0 0.898 1.216 1.47 1.704 1.917 2.101 2.268 2.573 2.704 2.819 2.889 3.185 3.294 3.493 3.678 3.856 3.949 4.141 4.326 4.56 4.709 4.853 5.04 5.228 5.419 5.605 5.79 6.018 6.221 6.423 6.665 6.881 7.085 7.321 7.578 7.834 8.113 8.407 8.704 8.997 9.308 9.686 10.092 10.535 10.954 11.366 11.784 12.197 12.588 12.748 12.44 11.975 11.46 10.956 10.459 9.968 9.508 9.142 8.766 8.409 8.069 7.736 7.445 7.196 6.962 6.703 6.481 6.284 6.076 5.859 5.679 5.493 5.301 5.157 5.007 4.853 4.683 4.51 4.391 4.261 4.049 3.898 3.747 3.671 3.515 3.35 3.178 3.084 2.805 2.769 2.656 2.548 2.309 2.141 1.93 1.696 1.433 1.126 0.749 -1.044 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_48.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_48.txt deleted file mode 100644 index f916665d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_28_48.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12226 ,TETRA ,17558879,Sat Nov 27 03:31:42 CET,Sat Nov 27 05:31:37 CET,0.0 1.152 1.509 1.776 2.007 2.209 2.398 2.567 2.864 2.999 3.115 3.159 3.434 3.533 3.736 3.921 4.089 4.172 4.329 4.489 4.724 4.872 5.019 5.23 5.403 5.55 5.703 5.853 6.044 6.223 6.398 6.619 6.802 6.958 7.141 7.386 7.605 7.777 7.978 8.19 8.391 8.612 8.858 9.062 9.243 9.433 9.628 9.749 9.768 9.582 8.924 7.769 6.606 5.615 4.763 3.972 3.237 2.589 2.052 1.497 0.993 0.542 0.117 -0.282 -0.648 -1.006 -1.399 -1.73 -2.003 -2.298 -2.606 -2.862 -3.127 -3.402 -3.614 -3.835 -4.06 -4.288 -4.528 -4.698 -4.873 -5.147 -5.334 -5.522 -5.623 -5.848 -6.083 -6.31 -6.43 -6.737 -6.834 -6.976 -7.109 -7.408 -7.577 -7.759 -7.976 -8.246 -8.58 -9.017 -10.539 -2 ,13090 ,TETRA ,17558880,Sat Nov 27 03:31:42 CET,Sat Nov 27 05:29:59 CET,0.0 1.546 2.045 2.422 2.751 3.06 3.324 3.538 3.916 4.103 4.271 4.384 4.681 4.806 5.038 5.265 5.5 5.612 5.806 5.977 6.224 6.399 6.564 6.787 6.994 7.191 7.378 7.55 7.768 7.964 8.147 8.377 8.592 8.782 8.982 9.189 9.39 9.621 9.871 10.122 10.368 10.607 10.865 11.114 11.346 11.532 11.672 11.79 11.859 11.684 11.021 10.017 9.13 8.336 7.58 6.848 6.209 5.641 5.14 4.64 4.214 3.824 3.441 3.066 2.717 2.419 2.1 1.807 1.564 1.308 1.028 0.794 0.552 0.284 0.065 -0.17 -0.413 -0.635 -0.846 -0.99 -1.143 -1.395 -1.583 -1.769 -1.86 -2.056 -2.263 -2.483 -2.604 -2.929 -3.032 -3.178 -3.326 -3.681 -3.892 -4.118 -4.37 -4.674 -5.057 -5.484 -6.25 -3 ,5324 ,TETRA ,17558881,Sat Nov 27 03:31:43 CET,Sat Nov 27 05:29:52 CET,0.0 1.707 2.08 2.373 2.595 2.779 2.952 3.122 3.43 3.569 3.705 3.789 4.073 4.178 4.354 4.523 4.699 4.786 4.947 5.095 5.305 5.444 5.581 5.775 5.956 6.113 6.262 6.402 6.583 6.751 6.892 7.079 7.268 7.447 7.65 7.869 8.07 8.266 8.464 8.684 8.901 9.122 9.368 9.587 9.804 9.971 10.067 10.133 10.084 9.776 9.034 7.913 6.891 5.986 5.184 4.47 3.866 3.319 2.823 2.289 1.803 1.367 0.947 0.542 0.166 -0.179 -0.549 -0.878 -1.162 -1.467 -1.779 -2.037 -2.321 -2.612 -2.816 -3.024 -3.245 -3.473 -3.715 -3.886 -4.06 -4.334 -4.522 -4.713 -4.811 -5.012 -5.223 -5.431 -5.539 -5.839 -5.921 -6.063 -6.207 -6.516 -6.693 -6.894 -7.122 -7.38 -7.693 -8.081 -9.009 -4 ,25316 ,TETRA ,17558882,Sat Nov 27 03:31:42 CET,Sat Nov 27 05:29:02 CET,0.0 1.888 2.411 2.799 3.121 3.392 3.642 3.858 4.216 4.378 4.528 4.64 4.941 5.065 5.308 5.533 5.755 5.859 6.041 6.218 6.458 6.611 6.77 6.994 7.191 7.365 7.535 7.689 7.871 8.041 8.206 8.405 8.583 8.751 8.942 9.146 9.345 9.562 9.789 10.011 10.214 10.424 10.644 10.849 11.073 11.259 11.396 11.496 11.505 11.242 10.506 9.327 8.226 7.255 6.403 5.665 5.027 4.442 3.931 3.395 2.926 2.511 2.119 1.743 1.372 1.036 0.705 0.423 0.175 -0.091 -0.369 -0.603 -0.857 -1.126 -1.336 -1.54 -1.744 -1.954 -2.174 -2.329 -2.488 -2.744 -2.92 -3.106 -3.205 -3.412 -3.628 -3.857 -3.984 -4.305 -4.373 -4.504 -4.648 -4.953 -5.14 -5.383 -5.647 -5.917 -6.255 -6.707 -8.772 -5 ,20322 ,TETRA ,17558883,Sat Nov 27 03:31:42 CET,Sat Nov 27 05:28:37 CET,0.0 2.927 3.388 3.736 4.017 4.259 4.494 4.706 5.065 5.23 5.386 5.489 5.783 5.899 6.11 6.314 6.509 6.601 6.776 6.95 7.205 7.349 7.473 7.66 7.84 8.014 8.179 8.331 8.521 8.7 8.88 9.09 9.28 9.459 9.653 9.86 10.054 10.266 10.491 10.736 10.99 11.258 11.536 11.774 12.01 12.214 12.392 12.509 12.577 12.563 12.018 10.929 9.869 8.86 7.924 7.036 6.229 5.479 4.86 4.291 3.829 3.414 3.013 2.612 2.233 1.887 1.529 1.226 0.968 0.689 0.393 0.156 -0.098 -0.376 -0.603 -0.848 -1.083 -1.316 -1.569 -1.741 -1.915 -2.184 -2.372 -2.568 -2.664 -2.887 -3.147 -3.401 -3.53 -3.845 -3.926 -4.075 -4.235 -4.55 -4.724 -4.928 -5.153 -5.395 -5.672 -6.087 -7.889 -6 ,17656 ,TETRA ,17558884,Sat Nov 27 03:31:45 CET,Sat Nov 27 05:29:36 CET,0.0 1.812 2.209 2.489 2.731 2.968 3.17 3.335 3.635 3.779 3.919 4.011 4.297 4.403 4.618 4.817 4.984 5.061 5.217 5.374 5.596 5.732 5.86 6.045 6.218 6.383 6.55 6.716 6.929 7.121 7.299 7.518 7.715 7.876 8.054 8.265 8.464 8.658 8.858 9.077 9.293 9.509 9.768 10.027 10.286 10.543 10.773 10.9 10.935 10.854 10.37 9.44 8.489 7.616 6.856 6.126 5.486 4.895 4.37 3.826 3.335 2.925 2.526 2.135 1.77 1.423 1.077 0.771 0.496 0.225 -0.051 -0.291 -0.532 -0.789 -1.001 -1.207 -1.406 -1.618 -1.853 -2.009 -2.161 -2.414 -2.602 -2.811 -2.917 -3.124 -3.346 -3.581 -3.708 -4.034 -4.141 -4.285 -4.44 -4.782 -4.964 -5.177 -5.415 -5.673 -5.949 -6.31 -7.528 -7 ,15510 ,TETRA ,17558885,Sat Nov 27 03:31:47 CET,Sat Nov 27 05:29:08 CET,0.0 1.798 2.198 2.497 2.71 2.908 3.094 3.262 3.568 3.719 3.87 3.959 4.254 4.367 4.602 4.819 5.024 5.121 5.296 5.452 5.66 5.796 5.935 6.131 6.315 6.482 6.632 6.771 6.947 7.125 7.299 7.497 7.677 7.852 8.054 8.275 8.491 8.719 8.95 9.185 9.407 9.621 9.86 10.133 10.436 10.697 10.909 11.035 11.108 10.985 10.474 9.639 8.79 8.012 7.273 6.571 5.947 5.375 4.831 4.248 3.772 3.371 2.965 2.542 2.139 1.784 1.431 1.117 0.849 0.576 0.295 0.069 -0.169 -0.43 -0.638 -0.847 -1.056 -1.285 -1.529 -1.698 -1.88 -2.157 -2.348 -2.548 -2.649 -2.882 -3.129 -3.357 -3.473 -3.777 -3.831 -3.952 -4.083 -4.407 -4.597 -4.804 -5.034 -5.309 -5.631 -6.013 -8.479 -8 ,11909 ,TETRA ,17558886,Sat Nov 27 03:32:40 CET,Sat Nov 27 05:29:18 CET,0.0 2.076 2.623 2.957 3.267 3.531 3.749 3.926 4.239 4.388 4.542 4.654 4.954 5.066 5.269 5.462 5.638 5.721 5.902 6.088 6.347 6.505 6.655 6.878 7.086 7.279 7.454 7.604 7.812 8.021 8.197 8.389 8.575 8.757 8.964 9.196 9.407 9.627 9.864 10.082 10.294 10.529 10.809 11.068 11.296 11.515 11.731 11.884 11.9 11.65 10.901 9.733 8.658 7.705 6.905 6.22 5.56 4.926 4.379 3.821 3.35 2.938 2.548 2.167 1.804 1.476 1.118 0.789 0.504 0.207 -0.08 -0.312 -0.564 -0.826 -1.028 -1.246 -1.471 -1.689 -1.926 -2.09 -2.252 -2.513 -2.707 -2.92 -3.034 -3.251 -3.475 -3.724 -3.855 -4.167 -4.255 -4.405 -4.565 -4.92 -5.126 -5.351 -5.595 -5.864 -6.126 -6.501 -8.004 -9 ,15544 ,TETRA ,17558887,Sat Nov 27 03:32:40 CET,Sat Nov 27 05:29:28 CET,0.0 1.727 2.115 2.411 2.644 2.868 3.07 3.244 3.526 3.668 3.807 3.873 4.165 4.282 4.501 4.704 4.885 4.979 5.156 5.316 5.553 5.705 5.844 6.03 6.204 6.361 6.513 6.655 6.824 6.982 7.14 7.336 7.508 7.666 7.841 8.038 8.236 8.441 8.651 8.878 9.118 9.366 9.608 9.811 10.04 10.263 10.439 10.563 10.58 10.384 9.712 8.589 7.571 6.634 5.739 4.934 4.252 3.633 3.102 2.591 2.153 1.747 1.353 0.975 0.628 0.302 -0.064 -0.396 -0.681 -0.991 -1.313 -1.574 -1.839 -2.102 -2.299 -2.494 -2.698 -2.907 -3.112 -3.25 -3.405 -3.667 -3.864 -4.077 -4.184 -4.403 -4.639 -4.881 -5.002 -5.315 -5.41 -5.573 -5.741 -6.111 -6.31 -6.509 -6.732 -6.982 -7.276 -7.664 -8.891 -10 ,3069 ,TETRA ,17558888,Sat Nov 27 03:32:40 CET,Sat Nov 27 05:32:22 CET,0.0 1.658 2.06 2.377 2.632 2.851 3.063 3.232 3.548 3.709 3.855 3.944 4.242 4.358 4.577 4.783 4.959 5.042 5.213 5.377 5.598 5.746 5.9 6.121 6.307 6.466 6.624 6.776 6.96 7.127 7.289 7.478 7.661 7.84 8.043 8.282 8.504 8.707 8.928 9.164 9.374 9.598 9.85 10.096 10.342 10.565 10.775 10.881 10.851 10.67 10.115 9.11 8.103 7.191 6.391 5.66 5.003 4.39 3.867 3.336 2.858 2.406 1.982 1.567 1.171 0.847 0.519 0.221 -0.031 -0.284 -0.558 -0.809 -1.074 -1.357 -1.583 -1.801 -2.012 -2.239 -2.48 -2.65 -2.829 -3.102 -3.303 -3.522 -3.628 -3.835 -4.068 -4.322 -4.449 -4.762 -4.874 -5.033 -5.204 -5.588 -5.781 -5.963 -6.15 -6.378 -6.677 -7.207 -8.891 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_29_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_29_42.txt deleted file mode 100644 index 580508d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_29_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9950 ,TETRA ,17558889,Sat Nov 27 03:32:40 CET,Sat Nov 27 05:30:20 CET,0.0 2.089 2.551 2.878 3.16 3.402 3.624 3.819 4.177 4.35 4.522 4.629 4.936 5.059 5.308 5.54 5.758 5.865 6.075 6.274 6.531 6.703 6.885 7.155 7.421 7.672 7.91 8.131 8.413 8.684 8.94 9.256 9.553 9.831 10.163 10.531 10.867 11.248 11.673 12.107 12.533 13.008 13.58 14.165 14.833 15.576 16.433 17.355 18.393 19.605 20.972 21.878 22.274 22.361 22.294 22.146 21.929 21.704 21.496 21.254 21.029 20.802 20.562 20.328 20.094 19.885 19.676 19.479 19.297 19.082 18.838 18.645 18.442 18.225 18.056 17.888 17.701 17.496 17.303 17.155 16.983 16.728 16.568 16.385 16.283 16.072 15.837 15.583 15.443 15.129 14.971 14.802 14.635 14.273 14.08 13.867 13.584 13.276 12.952 12.523 11.046 -2 ,12689 ,TETRA ,17558890,Sat Nov 27 03:32:43 CET,Sat Nov 27 05:30:15 CET,0.0 2.103 2.664 3.063 3.373 3.674 3.965 4.203 4.633 4.832 5.016 5.189 5.534 5.674 5.949 6.202 6.413 6.514 6.695 6.865 7.124 7.281 7.433 7.675 7.903 8.112 8.315 8.511 8.762 9.007 9.242 9.52 9.792 10.061 10.391 10.759 11.093 11.462 11.862 12.271 12.677 13.138 13.687 14.24 14.909 15.671 16.553 17.502 18.523 19.641 20.835 21.647 21.908 21.924 21.82 21.621 21.367 21.09 20.827 20.547 20.29 20.043 19.785 19.513 19.26 19.023 18.735 18.472 18.254 18.01 17.731 17.495 17.259 17.004 16.804 16.608 16.419 16.226 16.032 15.89 15.719 15.462 15.291 15.093 14.985 14.754 14.503 14.255 14.123 13.802 13.667 13.507 13.342 12.945 12.74 12.543 12.314 12.006 11.596 11.043 8.931 -3 ,4158 ,TETRA ,17558891,Sat Nov 27 03:32:45 CET,Sat Nov 27 05:30:01 CET,0.0 2.328 2.79 3.127 3.392 3.628 3.85 4.054 4.46 4.663 4.848 4.979 5.317 5.461 5.718 5.974 6.221 6.336 6.544 6.737 7.023 7.206 7.376 7.615 7.843 8.068 8.285 8.485 8.729 8.966 9.217 9.526 9.803 10.061 10.353 10.684 11.031 11.436 11.864 12.307 12.745 13.241 13.831 14.424 15.122 15.86 16.692 17.64 18.752 19.939 21.105 21.747 21.85 21.775 21.631 21.384 21.063 20.756 20.458 20.16 19.884 19.597 19.31 19.014 18.736 18.474 18.195 17.949 17.728 17.48 17.219 17.012 16.791 16.556 16.375 16.186 15.984 15.763 15.521 15.359 15.191 14.911 14.724 14.53 14.426 14.205 13.971 13.739 13.609 13.292 13.173 13.018 12.852 12.492 12.283 12.016 11.72 11.451 11.114 10.594 8.649 -4 ,31640 ,TETRA ,17558892,Sat Nov 27 03:32:40 CET,Sat Nov 27 05:23:08 CET,0.0 1.316 1.85 2.225 2.459 2.659 2.855 3.044 3.393 3.548 3.689 3.792 4.122 4.252 4.502 4.751 4.988 5.096 5.298 5.486 5.746 5.908 6.055 6.268 6.497 6.705 6.889 7.078 7.311 7.543 7.791 8.074 8.33 8.585 8.881 9.2 9.512 9.851 10.22 10.626 11.077 11.596 12.173 12.743 13.423 14.199 15.041 15.963 17.012 18.201 19.551 20.405 20.657 20.716 20.672 20.53 20.343 20.126 19.901 19.663 19.459 19.259 19.042 18.84 18.625 18.385 18.136 17.926 17.746 17.535 17.29 17.102 16.913 16.71 16.553 16.375 16.181 15.978 15.746 15.587 15.442 15.227 15.065 14.891 14.803 14.609 14.381 14.134 13.997 13.684 13.584 13.445 13.291 12.961 12.763 12.546 12.333 12.076 11.773 11.296 8.88 -5 ,29813 ,TETRA ,17558893,Sat Nov 27 03:32:40 CET,Sat Nov 27 05:23:43 CET,0.0 2.177 2.718 3.115 3.445 3.724 3.961 4.169 4.51 4.672 4.828 4.937 5.279 5.428 5.724 5.983 6.199 6.298 6.499 6.697 6.984 7.17 7.357 7.627 7.899 8.18 8.442 8.69 8.998 9.287 9.563 9.878 10.178 10.458 10.794 11.183 11.545 11.936 12.337 12.746 13.171 13.665 14.234 14.798 15.47 16.218 17.053 17.952 19.005 20.216 21.53 22.424 22.774 22.905 22.931 22.869 22.724 22.515 22.326 22.123 21.92 21.728 21.524 21.292 21.059 20.839 20.607 20.405 20.23 20.023 19.793 19.625 19.449 19.238 19.07 18.895 18.71 18.51 18.299 18.15 18.0 17.774 17.613 17.434 17.335 17.124 16.893 16.645 16.502 16.174 16.057 15.919 15.772 15.422 15.225 14.993 14.725 14.453 14.125 13.629 10.148 -6 ,24590 ,TETRA ,17558894,Sat Nov 27 03:32:41 CET,Sat Nov 27 05:31:17 CET,0.0 1.973 2.451 2.843 3.134 3.342 3.534 3.706 3.989 4.126 4.255 4.327 4.634 4.745 4.945 5.153 5.349 5.445 5.624 5.786 6.023 6.174 6.335 6.566 6.766 6.956 7.147 7.335 7.585 7.832 8.069 8.352 8.621 8.891 9.216 9.578 9.922 10.294 10.696 11.145 11.611 12.108 12.68 13.275 14.018 14.866 15.779 16.714 17.73 18.85 20.074 20.884 21.154 21.241 21.227 21.112 20.984 20.831 20.635 20.417 20.225 20.023 19.807 19.597 19.375 19.143 18.891 18.677 18.488 18.297 18.1 17.907 17.701 17.5 17.344 17.179 17.002 16.815 16.606 16.452 16.295 16.053 15.886 15.708 15.617 15.424 15.194 14.934 14.813 14.517 14.428 14.287 14.135 13.766 13.551 13.294 13.009 12.74 12.392 11.848 8.619 -7 ,16542 ,TETRA ,17558895,Sat Nov 27 03:32:42 CET,Sat Nov 27 05:32:26 CET,0.0 1.795 2.291 2.654 2.944 3.161 3.328 3.481 3.772 3.928 4.089 4.195 4.532 4.667 4.907 5.15 5.384 5.497 5.735 5.979 6.323 6.53 6.712 6.948 7.179 7.406 7.62 7.823 8.082 8.333 8.567 8.842 9.133 9.437 9.785 10.159 10.503 10.866 11.249 11.672 12.109 12.588 13.19 13.814 14.528 15.314 16.171 17.09 18.159 19.383 20.746 21.599 21.901 21.904 21.781 21.601 21.362 21.089 20.827 20.555 20.265 19.965 19.698 19.448 19.177 18.926 18.678 18.445 18.239 18.004 17.736 17.5 17.241 16.978 16.789 16.606 16.407 16.198 15.99 15.844 15.676 15.4 15.204 14.993 14.879 14.641 14.385 14.11 13.975 13.65 13.49 13.319 13.147 12.803 12.594 12.358 12.112 11.837 11.471 10.954 7.621 -8 ,24122 ,TETRA ,17558896,Sat Nov 27 03:32:42 CET,Sat Nov 27 05:31:21 CET,0.0 2.045 2.433 2.753 3.029 3.271 3.502 3.72 4.105 4.271 4.436 4.551 4.852 4.974 5.201 5.419 5.641 5.753 5.987 6.231 6.579 6.768 6.927 7.164 7.392 7.601 7.808 8.013 8.285 8.548 8.779 9.043 9.31 9.582 9.902 10.251 10.581 10.93 11.29 11.716 12.2 12.749 13.38 13.965 14.663 15.439 16.229 17.06 18.001 18.995 20.183 21.019 21.297 21.349 21.247 21.039 20.766 20.461 20.181 19.907 19.68 19.451 19.191 18.918 18.659 18.416 18.164 17.921 17.695 17.483 17.266 17.071 16.852 16.619 16.435 16.232 16.015 15.787 15.536 15.371 15.205 14.917 14.699 14.453 14.328 14.079 13.806 13.473 13.297 12.966 12.825 12.656 12.494 12.131 11.914 11.683 11.388 11.049 10.698 10.266 7.977 -9 ,3668 ,TETRA ,17558897,Sat Nov 27 03:32:44 CET,Sat Nov 27 05:31:55 CET,0.0 2.375 2.873 3.264 3.559 3.791 3.982 4.117 4.381 4.507 4.629 4.691 5.001 5.117 5.308 5.49 5.664 5.752 5.924 6.087 6.327 6.483 6.641 6.873 7.098 7.306 7.502 7.718 7.999 8.252 8.491 8.774 9.058 9.328 9.63 9.97 10.303 10.669 11.069 11.49 11.915 12.387 12.957 13.537 14.21 14.953 15.757 16.615 17.672 18.949 20.4 21.342 21.688 21.803 21.795 21.74 21.606 21.392 21.153 20.881 20.656 20.441 20.216 19.989 19.768 19.564 19.332 19.112 18.909 18.688 18.466 18.29 18.099 17.85 17.646 17.466 17.267 17.045 16.821 16.659 16.488 16.225 16.038 15.839 15.738 15.523 15.292 15.06 14.936 14.637 14.51 14.358 14.192 13.824 13.616 13.378 13.116 12.843 12.501 12.02 10.261 -10 ,12870 ,TETRA ,17558898,Sat Nov 27 03:32:46 CET,Sat Nov 27 05:31:04 CET,0.0 1.669 2.183 2.571 2.948 3.278 3.528 3.762 4.198 4.395 4.582 4.697 5.002 5.115 5.321 5.516 5.717 5.816 6.021 6.227 6.517 6.715 6.913 7.183 7.437 7.687 7.903 8.102 8.381 8.636 8.88 9.185 9.471 9.752 10.079 10.425 10.749 11.135 11.57 12.019 12.5 13.025 13.633 14.251 14.936 15.642 16.427 17.308 18.284 19.353 20.584 21.517 21.907 22.023 22.041 21.949 21.797 21.63 21.43 21.2 20.968 20.764 20.513 20.224 19.976 19.736 19.474 19.229 19.013 18.795 18.57 18.36 18.135 17.923 17.743 17.548 17.352 17.16 16.959 16.808 16.655 16.421 16.261 16.089 15.994 15.787 15.583 15.358 15.223 14.893 14.676 14.481 14.303 13.939 13.717 13.469 13.209 12.902 12.45 11.789 7.393 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_30_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_30_31.txt deleted file mode 100644 index d46747c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_30_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31141 ,TETRA ,17558899,Sat Nov 27 03:32:42 CET,Sat Nov 27 05:21:45 CET,0.0 0.772 1.098 1.388 1.62 1.818 1.997 2.168 2.5 2.649 2.783 2.874 3.193 3.322 3.572 3.81 4.037 4.151 4.384 4.602 4.903 5.099 5.281 5.556 5.826 6.085 6.336 6.578 6.932 7.295 7.62 8.014 8.4 8.776 9.215 9.698 10.166 10.659 11.188 11.755 12.346 13.033 13.834 14.617 15.498 16.473 17.602 18.904 20.524 22.564 25.07 27.188 28.445 29.252 29.798 30.168 30.39 30.539 30.645 30.694 30.687 30.682 30.687 30.672 30.643 30.608 30.551 30.485 30.432 30.376 30.304 30.23 30.148 30.075 30.013 29.946 29.881 29.799 29.714 29.655 29.592 29.495 29.429 29.358 29.314 29.21 29.117 29.03 28.977 28.753 28.801 28.719 28.616 28.39 28.275 28.157 28.024 27.833 27.62 27.372 26.803 -2 ,30515 ,TETRA ,17558900,Sat Nov 27 03:32:42 CET,Sat Nov 27 05:29:43 CET,0.0 0.918 1.32 1.606 1.83 2.026 2.226 2.414 2.74 2.897 3.048 3.138 3.467 3.6 3.852 4.088 4.307 4.411 4.609 4.804 5.082 5.279 5.477 5.741 5.996 6.249 6.51 6.755 7.057 7.355 7.659 8.029 8.383 8.732 9.137 9.59 10.044 10.543 11.061 11.608 12.187 12.838 13.603 14.37 15.269 16.289 17.484 18.831 20.394 22.329 24.756 26.814 28.073 28.853 29.399 29.808 30.069 30.244 30.343 30.4 30.417 30.407 30.388 30.36 30.334 30.298 30.224 30.147 30.096 30.038 29.979 29.93 29.872 29.815 29.759 29.689 29.609 29.506 29.376 29.284 29.197 29.073 28.98 28.873 28.822 28.727 28.627 28.513 28.448 28.226 28.259 28.188 28.11 27.912 27.802 27.701 27.584 27.453 27.305 27.105 26.607 -3 ,14329 ,TETRA ,17558901,Sat Nov 27 03:32:43 CET,Sat Nov 27 05:29:25 CET,0.0 0.659 1.008 1.3 1.554 1.772 1.969 2.14 2.477 2.641 2.794 2.894 3.212 3.341 3.596 3.837 4.044 4.146 4.359 4.565 4.845 5.02 5.203 5.47 5.715 5.955 6.188 6.416 6.716 6.999 7.276 7.618 7.953 8.285 8.674 9.114 9.544 10.014 10.508 11.028 11.573 12.216 12.998 13.755 14.661 15.688 16.803 18.087 19.645 21.561 23.923 25.883 27.08 27.869 28.354 28.656 28.881 29.048 29.146 29.214 29.253 29.263 29.261 29.251 29.231 29.197 29.148 29.1 29.035 28.954 28.866 28.78 28.674 28.567 28.488 28.393 28.296 28.207 28.114 28.044 27.968 27.838 27.747 27.66 27.609 27.492 27.361 27.227 27.162 26.93 26.923 26.832 26.746 26.555 26.441 26.301 26.161 26.0 25.814 25.576 24.9 -4 ,1077 ,TETRA ,17558902,Sat Nov 27 03:33:41 CET,Sat Nov 27 05:30:57 CET,0.0 0.817 1.174 1.433 1.635 1.835 2.023 2.191 2.519 2.678 2.825 2.921 3.235 3.354 3.583 3.793 3.996 4.096 4.287 4.483 4.776 4.951 5.133 5.406 5.652 5.898 6.142 6.366 6.65 6.931 7.205 7.572 7.924 8.237 8.624 9.065 9.479 9.932 10.421 10.959 11.53 12.173 12.932 13.683 14.574 15.585 16.757 18.11 19.699 21.593 23.961 25.992 27.26 28.046 28.549 28.892 29.137 29.308 29.402 29.476 29.514 29.526 29.533 29.52 29.482 29.433 29.373 29.313 29.263 29.217 29.165 29.115 29.056 28.992 28.942 28.888 28.83 28.762 28.675 28.613 28.548 28.435 28.361 28.286 28.244 28.143 28.051 27.961 27.908 27.686 27.726 27.666 27.606 27.471 27.393 27.303 27.189 27.059 26.881 26.609 25.861 -5 ,32414 ,TETRA ,17558903,Sat Nov 27 03:33:41 CET,Sat Nov 27 05:33:15 CET,0.0 0.726 1.109 1.403 1.633 1.825 1.999 2.182 2.527 2.675 2.823 2.901 3.22 3.35 3.591 3.818 4.042 4.151 4.347 4.545 4.84 5.024 5.191 5.443 5.706 5.956 6.19 6.43 6.746 7.037 7.315 7.676 8.041 8.386 8.777 9.206 9.622 10.084 10.579 11.115 11.695 12.35 13.118 13.897 14.779 15.768 16.967 18.369 20.012 21.964 24.414 26.57 27.874 28.618 29.079 29.413 29.611 29.688 29.717 29.754 29.757 29.714 29.652 29.566 29.458 29.36 29.258 29.169 29.095 29.021 28.928 28.852 28.775 28.67 28.59 28.512 28.431 28.344 28.238 28.174 28.119 28.013 27.937 27.862 27.821 27.711 27.587 27.474 27.416 27.189 27.2 27.107 27.006 26.793 26.657 26.511 26.353 26.142 25.885 25.562 24.767 -6 ,3630 ,TETRA ,17558904,Sat Nov 27 03:33:41 CET,Sat Nov 27 05:30:26 CET,0.0 0.668 1.08 1.383 1.617 1.828 2.016 2.198 2.528 2.677 2.82 2.896 3.2 3.324 3.56 3.774 3.977 4.07 4.249 4.438 4.722 4.907 5.082 5.332 5.58 5.833 6.09 6.328 6.621 6.905 7.171 7.494 7.799 8.106 8.477 8.888 9.275 9.715 10.197 10.712 11.255 11.853 12.576 13.354 14.293 15.35 16.587 17.965 19.569 21.484 23.961 26.137 27.441 28.275 28.826 29.192 29.423 29.562 29.651 29.732 29.747 29.746 29.764 29.746 29.714 29.683 29.628 29.571 29.521 29.458 29.384 29.322 29.245 29.156 29.086 29.016 28.957 28.884 28.794 28.736 28.672 28.57 28.495 28.412 28.368 28.281 28.188 28.087 28.031 27.816 27.863 27.804 27.734 27.546 27.437 27.317 27.177 27.029 26.88 26.678 26.23 -7 ,25275 ,TETRA ,17558905,Sat Nov 27 03:33:41 CET,Sat Nov 27 05:35:03 CET,0.0 0.732 1.091 1.385 1.608 1.806 1.99 2.173 2.509 2.66 2.813 2.892 3.208 3.333 3.562 3.786 4.024 4.147 4.371 4.583 4.897 5.09 5.284 5.562 5.811 6.064 6.317 6.571 6.906 7.221 7.524 7.91 8.283 8.654 9.091 9.535 9.951 10.411 10.924 11.5 12.102 12.757 13.517 14.292 15.162 16.139 17.283 18.561 20.123 22.044 24.45 26.481 27.723 28.553 29.115 29.521 29.782 29.966 30.079 30.148 30.194 30.213 30.221 30.207 30.15 30.09 30.037 29.962 29.883 29.814 29.742 29.683 29.621 29.55 29.486 29.423 29.37 29.301 29.222 29.155 29.074 28.963 28.882 28.792 28.748 28.659 28.55 28.429 28.362 28.132 28.18 28.106 28.021 27.847 27.742 27.631 27.523 27.412 27.284 27.074 26.662 -8 ,28842 ,TETRA ,17558906,Sat Nov 27 03:33:41 CET,Sat Nov 27 05:31:15 CET,0.0 0.976 1.379 1.697 1.937 2.133 2.324 2.504 2.816 2.946 3.07 3.12 3.433 3.556 3.789 4.015 4.224 4.325 4.525 4.719 4.995 5.167 5.34 5.585 5.811 6.044 6.274 6.495 6.789 7.085 7.386 7.741 8.071 8.39 8.749 9.151 9.555 9.995 10.455 10.933 11.444 12.049 12.749 13.454 14.316 15.303 16.467 17.812 19.409 21.306 23.715 25.816 27.101 27.92 28.419 28.737 28.939 29.078 29.191 29.274 29.296 29.278 29.257 29.228 29.175 29.126 29.05 28.976 28.911 28.824 28.745 28.668 28.583 28.508 28.451 28.392 28.316 28.235 28.151 28.087 28.019 27.899 27.807 27.713 27.662 27.567 27.487 27.388 27.334 27.112 27.149 27.085 27.014 26.86 26.77 26.666 26.548 26.409 26.245 26.05 25.683 -9 ,27478 ,TETRA ,17558907,Sat Nov 27 03:35:41 CET,Sat Nov 27 05:39:19 CET,0.0 0.829 1.169 1.4 1.597 1.761 1.922 2.073 2.345 2.478 2.615 2.693 2.995 3.115 3.344 3.55 3.746 3.845 4.044 4.23 4.486 4.651 4.818 5.064 5.302 5.532 5.76 5.991 6.293 6.583 6.863 7.197 7.524 7.829 8.177 8.585 8.981 9.42 9.917 10.462 11.019 11.64 12.392 13.141 14.013 15.011 16.183 17.54 19.242 21.33 23.879 26.035 27.339 28.175 28.754 29.156 29.41 29.577 29.687 29.78 29.829 29.858 29.847 29.824 29.81 29.787 29.739 29.68 29.635 29.593 29.532 29.467 29.381 29.269 29.185 29.094 28.992 28.888 28.787 28.723 28.656 28.529 28.432 28.347 28.305 28.211 28.112 28.013 27.959 27.74 27.757 27.68 27.6 27.393 27.28 27.168 27.04 26.898 26.721 26.513 26.031 -10 ,15330 ,TETRA ,17558908,Sat Nov 27 03:34:40 CET,Sat Nov 27 05:33:27 CET,0.0 0.734 1.097 1.337 1.537 1.733 1.945 2.146 2.494 2.66 2.822 2.957 3.273 3.401 3.644 3.875 4.108 4.224 4.446 4.658 4.978 5.179 5.363 5.634 5.898 6.145 6.382 6.612 6.919 7.223 7.507 7.857 8.212 8.553 8.95 9.391 9.814 10.274 10.763 11.295 11.851 12.483 13.242 14.002 14.916 15.984 17.208 18.587 20.216 22.138 24.538 26.627 27.868 28.664 29.181 29.554 29.822 30.0 30.101 30.171 30.209 30.206 30.2 30.187 30.153 30.119 30.08 30.033 29.985 29.925 29.855 29.786 29.695 29.588 29.51 29.443 29.378 29.306 29.229 29.17 29.093 28.969 28.892 28.813 28.764 28.648 28.532 28.411 28.349 28.13 28.152 28.075 28.001 27.836 27.732 27.636 27.522 27.371 27.204 26.961 26.216 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_30_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_30_32.txt deleted file mode 100644 index 2d7db9af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_30_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18585 ,KEBNE ,17024746,Wed Dec 22 11:03:38 CET,Wed Dec 22 12:39:21 CET,0.0 1.244 1.621 1.868 2.069 2.236 2.38 2.52 2.759 2.866 2.975 2.974 3.238 3.318 3.472 3.61 3.742 3.81 3.946 4.078 4.265 4.386 4.512 4.677 4.827 4.993 5.149 5.283 5.462 5.629 5.779 5.972 6.169 6.355 6.558 6.788 7.013 7.246 7.499 7.777 8.051 8.348 8.696 9.044 9.437 9.849 10.306 10.806 11.359 11.908 12.348 12.497 12.452 12.313 12.135 11.928 11.674 11.404 11.168 10.905 10.688 10.513 10.315 10.104 9.901 9.695 9.477 9.284 9.107 8.921 8.723 8.552 8.375 8.185 8.03 7.869 7.707 7.528 7.339 7.216 7.083 6.894 6.766 6.621 6.549 6.398 6.222 6.044 5.963 5.686 5.677 5.582 5.467 5.172 5.004 4.818 4.597 4.371 4.127 3.791 2.418 -2 ,18701 ,KEBNE ,17024747,Wed Dec 22 11:04:36 CET,Wed Dec 22 12:45:48 CET,0.0 1.115 1.507 1.768 1.945 2.133 2.324 2.507 2.821 2.955 3.09 3.164 3.469 3.587 3.815 4.023 4.215 4.315 4.516 4.703 4.954 5.12 5.284 5.515 5.744 5.959 6.151 6.313 6.522 6.74 6.956 7.21 7.436 7.648 7.901 8.193 8.474 8.778 9.088 9.398 9.724 10.108 10.543 10.949 11.401 11.898 12.457 13.039 13.665 14.312 14.931 15.176 15.084 14.849 14.56 14.248 13.959 13.696 13.455 13.185 12.929 12.694 12.469 12.252 12.045 11.82 11.561 11.315 11.084 10.864 10.647 10.461 10.266 10.071 9.938 9.811 9.664 9.492 9.307 9.18 9.052 8.842 8.694 8.535 8.448 8.275 8.1 7.923 7.839 7.577 7.542 7.428 7.311 7.052 6.904 6.745 6.547 6.324 6.085 5.773 4.724 -3 ,23806 ,KEBNE ,17024748,Wed Dec 22 11:04:39 CET,Wed Dec 22 12:41:16 CET,0.0 1.056 1.321 1.524 1.715 1.881 2.024 2.157 2.388 2.503 2.619 2.64 2.928 3.017 3.19 3.362 3.52 3.596 3.753 3.911 4.129 4.264 4.397 4.579 4.755 4.928 5.089 5.25 5.455 5.641 5.829 6.065 6.284 6.495 6.727 6.96 7.187 7.439 7.723 8.018 8.307 8.636 9.007 9.36 9.764 10.206 10.717 11.29 11.868 12.439 13.007 13.227 13.12 12.925 12.704 12.42 12.098 11.777 11.476 11.146 10.851 10.572 10.274 9.976 9.718 9.473 9.185 8.949 8.759 8.538 8.305 8.126 7.941 7.744 7.596 7.439 7.274 7.107 6.938 6.819 6.695 6.493 6.335 6.163 6.079 5.91 5.736 5.544 5.438 5.131 5.048 4.899 4.739 4.4 4.213 4.011 3.774 3.497 3.208 2.827 1.631 -4 ,32102 ,KEBNE ,17024749,Wed Dec 22 11:05:42 CET,Wed Dec 22 12:41:25 CET,0.0 0.817 1.119 1.386 1.615 1.807 1.965 2.108 2.384 2.516 2.643 2.689 2.976 3.072 3.269 3.455 3.633 3.713 3.87 4.035 4.292 4.456 4.598 4.793 4.981 5.146 5.299 5.457 5.656 5.839 6.021 6.245 6.469 6.679 6.908 7.16 7.403 7.682 7.966 8.257 8.571 8.92 9.316 9.706 10.138 10.588 11.095 11.626 12.176 12.735 13.205 13.276 13.121 12.922 12.663 12.346 12.027 11.713 11.427 11.146 10.89 10.67 10.465 10.258 10.05 9.854 9.652 9.46 9.3 9.134 8.935 8.763 8.58 8.39 8.235 8.067 7.889 7.696 7.507 7.379 7.258 7.085 6.965 6.834 6.753 6.569 6.386 6.187 6.082 5.797 5.762 5.649 5.528 5.227 5.04 4.853 4.644 4.373 4.074 3.677 2.136 -5 ,31713 ,KEBNE ,17024750,Wed Dec 22 11:07:42 CET,Wed Dec 22 12:48:28 CET,0.0 1.016 1.375 1.65 1.862 2.041 2.179 2.313 2.549 2.654 2.754 2.757 3.028 3.129 3.323 3.493 3.656 3.735 3.883 4.022 4.217 4.34 4.462 4.638 4.808 4.966 5.121 5.272 5.46 5.644 5.814 6.011 6.199 6.381 6.594 6.839 7.076 7.329 7.593 7.869 8.169 8.509 8.897 9.279 9.681 10.115 10.614 11.145 11.697 12.218 12.596 12.631 12.502 12.256 11.965 11.685 11.436 11.17 10.932 10.678 10.435 10.21 9.966 9.741 9.534 9.332 9.107 8.889 8.691 8.494 8.296 8.134 7.957 7.754 7.596 7.43 7.254 7.083 6.91 6.782 6.635 6.405 6.255 6.095 6.009 5.841 5.665 5.466 5.361 5.08 5.016 4.889 4.748 4.405 4.217 4.019 3.801 3.558 3.298 2.985 1.858 -6 ,19334 ,KEBNE ,17024751,Wed Dec 22 11:08:44 CET,Wed Dec 22 12:48:27 CET,0.0 0.505 0.784 1.017 1.2 1.362 1.503 1.639 1.904 2.027 2.149 2.19 2.475 2.575 2.769 2.965 3.151 3.239 3.418 3.587 3.82 3.969 4.105 4.285 4.458 4.626 4.784 4.948 5.166 5.369 5.567 5.813 6.062 6.297 6.552 6.834 7.112 7.403 7.7 8.006 8.303 8.638 9.037 9.41 9.794 10.206 10.678 11.2 11.792 12.375 12.823 12.952 12.85 12.653 12.397 12.094 11.781 11.489 11.225 10.954 10.721 10.484 10.224 9.976 9.748 9.548 9.337 9.132 8.95 8.738 8.498 8.295 8.095 7.896 7.734 7.579 7.439 7.287 7.124 7.013 6.891 6.712 6.586 6.435 6.356 6.197 6.037 5.869 5.78 5.505 5.475 5.364 5.252 5.004 4.866 4.726 4.577 4.395 4.137 3.82 3.154 -7 ,14541 ,KEBNE ,17024752,Wed Dec 22 11:08:45 CET,Wed Dec 22 12:49:42 CET,0.0 1.006 1.409 1.694 1.919 2.075 2.216 2.356 2.635 2.76 2.878 2.919 3.215 3.323 3.513 3.686 3.87 3.965 4.137 4.297 4.514 4.645 4.773 4.967 5.16 5.351 5.535 5.706 5.926 6.136 6.338 6.574 6.782 6.982 7.209 7.484 7.763 8.064 8.382 8.706 9.055 9.433 9.856 10.276 10.739 11.226 11.747 12.344 12.961 13.507 13.998 14.152 14.073 13.864 13.604 13.28 12.93 12.614 12.33 12.031 11.775 11.534 11.302 11.085 10.893 10.709 10.498 10.322 10.173 10.019 9.851 9.713 9.569 9.416 9.294 9.164 9.038 8.899 8.75 8.639 8.515 8.314 8.183 8.059 7.991 7.835 7.675 7.518 7.433 7.174 7.177 7.069 6.953 6.699 6.558 6.388 6.191 5.949 5.628 5.204 3.885 -8 ,6969 ,KEBNE ,17024753,Wed Dec 22 11:08:48 CET,Wed Dec 22 12:46:04 CET,0.0 1.466 1.835 2.08 2.318 2.517 2.679 2.826 3.088 3.229 3.36 3.376 3.656 3.75 3.927 4.095 4.256 4.332 4.479 4.62 4.825 4.956 5.072 5.226 5.378 5.529 5.684 5.838 6.022 6.198 6.361 6.553 6.746 6.938 7.16 7.399 7.63 7.882 8.14 8.405 8.686 9.0 9.35 9.706 10.114 10.548 11.047 11.565 12.103 12.648 13.16 13.331 13.217 12.993 12.735 12.456 12.196 11.948 11.711 11.465 11.234 11.023 10.822 10.632 10.453 10.269 10.062 9.872 9.712 9.543 9.359 9.206 9.052 8.905 8.791 8.668 8.534 8.384 8.22 8.105 7.987 7.804 7.667 7.513 7.435 7.262 7.087 6.885 6.752 6.43 6.326 6.168 5.993 5.599 5.387 5.174 4.942 4.668 4.303 3.817 2.688 -9 ,7581 ,KEBNE ,17024754,Wed Dec 22 11:08:44 CET,Wed Dec 22 12:48:30 CET,0.0 0.841 1.195 1.471 1.696 1.9 2.059 2.207 2.5 2.638 2.767 2.804 3.087 3.186 3.363 3.536 3.704 3.784 3.932 4.075 4.278 4.404 4.54 4.732 4.907 5.085 5.254 5.42 5.634 5.833 6.024 6.269 6.503 6.716 6.967 7.242 7.513 7.825 8.146 8.457 8.758 9.095 9.481 9.84 10.262 10.725 11.241 11.781 12.321 12.868 13.336 13.484 13.366 13.131 12.866 12.579 12.336 12.084 11.828 11.582 11.335 11.102 10.878 10.665 10.457 10.241 10.008 9.792 9.599 9.385 9.182 9.027 8.848 8.651 8.492 8.337 8.187 8.023 7.86 7.737 7.596 7.392 7.26 7.113 7.029 6.864 6.701 6.539 6.449 6.166 6.115 5.991 5.861 5.574 5.425 5.242 5.012 4.767 4.474 4.023 2.313 -10 ,25910 ,KEBNE ,17024755,Wed Dec 22 11:08:45 CET,Wed Dec 22 12:49:08 CET,0.0 1.156 1.521 1.758 1.957 2.131 2.297 2.467 2.784 2.932 3.067 3.119 3.407 3.503 3.693 3.868 4.054 4.141 4.293 4.428 4.61 4.725 4.84 5.015 5.197 5.379 5.545 5.7 5.884 6.047 6.2 6.401 6.602 6.793 7.007 7.233 7.448 7.686 7.953 8.246 8.553 8.871 9.217 9.572 9.995 10.44 10.941 11.491 12.065 12.635 13.13 13.338 13.281 13.074 12.837 12.595 12.357 12.126 11.898 11.672 11.477 11.268 11.038 10.775 10.523 10.282 10.022 9.803 9.615 9.436 9.235 9.052 8.868 8.658 8.486 8.313 8.15 7.97 7.76 7.618 7.459 7.188 6.998 6.813 6.73 6.571 6.391 6.194 6.096 5.808 5.754 5.624 5.487 5.199 5.041 4.865 4.684 4.49 4.269 3.976 3.291 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_30_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_30_38.txt deleted file mode 100644 index 5724c699..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_30_38.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29077 ,TETRA ,17558909,Sat Nov 27 03:34:40 CET,Sat Nov 27 05:37:28 CET,0.0 2.329 2.906 3.345 3.715 4.044 4.354 4.648 5.162 5.382 5.591 5.79 6.146 6.317 6.629 6.916 7.193 7.327 7.58 7.81 8.118 8.314 8.512 8.805 9.085 9.348 9.6 9.835 10.133 10.427 10.708 11.035 11.35 11.67 12.039 12.453 12.853 13.282 13.737 14.19 14.647 15.168 15.765 16.359 17.019 17.694 18.461 19.187 19.837 20.552 21.281 21.685 21.714 21.554 21.303 21.013 20.747 20.466 20.167 19.839 19.535 19.212 18.869 18.557 18.26 17.965 17.661 17.388 17.154 16.921 16.664 16.452 16.239 16.019 15.835 15.63 15.419 15.207 14.977 14.81 14.636 14.364 14.168 13.958 13.847 13.633 13.434 13.231 13.117 12.811 12.745 12.613 12.456 12.097 11.896 11.676 11.415 11.126 10.795 10.37 8.97 -2 ,8431 ,TETRA ,17558910,Sat Nov 27 03:35:43 CET,Sat Nov 27 05:40:27 CET,0.0 2.636 3.132 3.53 3.886 4.19 4.464 4.702 5.104 5.295 5.474 5.633 5.989 6.159 6.478 6.768 7.064 7.215 7.516 7.795 8.137 8.335 8.527 8.802 9.073 9.334 9.591 9.84 10.144 10.434 10.715 11.039 11.342 11.631 11.971 12.358 12.727 13.117 13.491 13.893 14.345 14.823 15.359 15.928 16.596 17.29 18.057 18.84 19.638 20.505 21.246 21.44 21.311 20.964 20.545 20.198 19.84 19.427 19.084 18.756 18.477 18.223 17.961 17.684 17.405 17.163 16.915 16.687 16.493 16.269 16.008 15.791 15.564 15.334 15.17 14.989 14.786 14.588 14.374 14.225 14.082 13.845 13.683 13.526 13.439 13.245 13.025 12.79 12.665 12.35 12.239 12.085 11.933 11.586 11.37 11.124 10.871 10.604 10.249 9.737 8.119 -3 ,11699 ,TETRA ,17558911,Sat Nov 27 03:35:41 CET,Sat Nov 27 05:35:44 CET,0.0 2.226 2.84 3.294 3.653 3.947 4.19 4.415 4.84 5.043 5.225 5.373 5.703 5.832 6.079 6.308 6.539 6.657 6.884 7.102 7.389 7.56 7.733 7.988 8.227 8.454 8.689 8.932 9.229 9.493 9.756 10.067 10.356 10.633 10.955 11.315 11.654 12.022 12.403 12.817 13.227 13.656 14.173 14.708 15.326 15.986 16.701 17.49 18.38 19.321 20.194 20.606 20.551 20.278 19.973 19.667 19.321 18.93 18.605 18.293 18.006 17.761 17.532 17.295 17.063 16.858 16.648 16.443 16.253 16.059 15.863 15.689 15.511 15.325 15.17 15.019 14.865 14.698 14.524 14.401 14.286 14.095 13.938 13.774 13.689 13.508 13.327 13.133 13.029 12.744 12.696 12.574 12.454 12.163 11.974 11.783 11.59 11.336 11.003 10.566 8.467 -4 ,13337 ,TETRA ,17558912,Sat Nov 27 03:35:41 CET,Sat Nov 27 05:35:27 CET,0.0 4.489 5.187 5.606 5.974 6.33 6.625 6.872 7.308 7.503 7.697 7.869 8.206 8.348 8.63 8.9 9.175 9.304 9.526 9.733 10.043 10.25 10.439 10.689 10.945 11.237 11.52 11.76 12.04 12.292 12.543 12.862 13.164 13.445 13.762 14.118 14.466 14.848 15.246 15.688 16.172 16.695 17.281 17.826 18.418 19.071 19.832 20.59 21.352 22.09 22.701 22.978 22.906 22.554 22.086 21.62 21.22 20.854 20.514 20.166 19.858 19.545 19.246 18.972 18.699 18.45 18.191 17.959 17.752 17.522 17.281 17.092 16.906 16.71 16.552 16.376 16.178 15.979 15.783 15.633 15.478 15.268 15.112 14.935 14.84 14.638 14.414 14.191 14.085 13.795 13.714 13.562 13.41 13.074 12.885 12.682 12.457 12.192 11.836 11.287 8.9 -5 ,3189 ,TETRA ,17558913,Sat Nov 27 03:35:41 CET,Sat Nov 27 05:36:31 CET,0.0 3.079 3.609 3.979 4.316 4.658 4.968 5.248 5.731 5.929 6.128 6.322 6.677 6.83 7.131 7.419 7.712 7.851 8.086 8.31 8.629 8.838 9.046 9.34 9.619 9.88 10.124 10.365 10.677 10.963 11.23 11.549 11.871 12.196 12.553 12.926 13.27 13.641 14.062 14.532 15.01 15.536 16.137 16.705 17.344 18.044 18.804 19.616 20.484 21.328 21.902 21.868 21.498 21.031 20.587 20.164 19.747 19.328 18.96 18.592 18.271 17.966 17.671 17.407 17.147 16.897 16.624 16.382 16.171 15.94 15.706 15.52 15.33 15.129 14.97 14.8 14.63 14.465 14.286 14.15 14.0 13.771 13.61 13.441 13.352 13.158 12.96 12.746 12.633 12.337 12.284 12.132 11.972 11.667 11.508 11.297 11.025 10.718 10.383 9.935 7.421 -7 ,22270 ,TETRA ,17558915,Sat Nov 27 03:37:44 CET,Sat Nov 27 05:40:35 CET,0.0 3.965 4.871 5.297 5.636 5.921 6.159 6.393 6.824 7.011 7.2 7.388 7.72 7.858 8.13 8.385 8.62 8.733 8.965 9.176 9.464 9.659 9.847 10.111 10.366 10.621 10.87 11.111 11.407 11.683 11.935 12.242 12.546 12.841 13.185 13.572 13.958 14.376 14.776 15.169 15.601 16.084 16.586 17.091 17.678 18.335 19.071 19.744 20.411 21.107 21.645 21.726 21.538 21.202 20.796 20.352 19.956 19.611 19.28 18.9 18.54 18.222 17.92 17.651 17.392 17.14 16.895 16.661 16.452 16.228 15.99 15.798 15.6 15.407 15.251 15.068 14.873 14.691 14.515 14.388 14.231 13.982 13.816 13.634 13.545 13.383 13.21 13.016 12.916 12.616 12.571 12.448 12.297 11.961 11.792 11.614 11.403 11.134 10.815 10.431 8.74 -8 ,11022 ,TETRA ,17558916,Sat Nov 27 03:37:47 CET,Sat Nov 27 05:40:57 CET,0.0 2.207 2.76 3.151 3.477 3.745 4.011 4.305 4.807 4.999 5.183 5.342 5.699 5.857 6.16 6.444 6.707 6.827 7.055 7.284 7.615 7.822 8.008 8.277 8.537 8.785 9.037 9.29 9.611 9.911 10.206 10.55 10.865 11.168 11.505 11.87 12.218 12.618 13.069 13.545 14.004 14.492 15.067 15.628 16.265 16.931 17.625 18.371 19.208 20.073 20.833 21.132 21.055 20.755 20.414 20.085 19.736 19.348 18.993 18.649 18.328 18.056 17.797 17.53 17.271 17.019 16.761 16.54 16.341 16.129 15.899 15.694 15.478 15.26 15.087 14.901 14.691 14.447 14.196 14.038 13.891 13.658 13.483 13.294 13.198 13.011 12.811 12.59 12.485 12.197 12.122 11.975 11.823 11.511 11.337 11.138 10.907 10.656 10.385 10.026 8.514 -9 ,9671 ,TETRA ,17558917,Sat Nov 27 03:43:44 CET,Sat Nov 27 05:44:35 CET,0.0 1.862 2.275 2.563 2.844 3.144 3.381 3.594 3.96 4.115 4.282 4.407 4.739 4.885 5.173 5.425 5.665 5.786 6.021 6.258 6.581 6.769 6.967 7.242 7.5 7.766 8.015 8.252 8.564 8.851 9.126 9.467 9.778 10.066 10.39 10.744 11.081 11.455 11.849 12.263 12.689 13.159 13.712 14.216 14.77 15.362 16.006 16.679 17.345 17.976 18.384 18.355 18.076 17.671 17.24 16.801 16.401 15.989 15.573 15.148 14.803 14.496 14.213 13.935 13.651 13.391 13.128 12.888 12.671 12.468 12.257 12.062 11.863 11.659 11.487 11.305 11.127 10.949 10.75 10.614 10.482 10.264 10.111 9.943 9.852 9.669 9.472 9.247 9.13 8.828 8.765 8.631 8.497 8.181 8.015 7.815 7.587 7.319 6.978 6.558 4.83 -10 ,31993 ,TETRA ,17558918,Sat Nov 27 03:43:44 CET,Sat Nov 27 05:43:19 CET,0.0 2.63 3.261 3.709 4.07 4.377 4.629 4.857 5.277 5.458 5.634 5.788 6.14 6.308 6.582 6.824 7.077 7.198 7.424 7.639 7.932 8.114 8.294 8.561 8.816 9.05 9.282 9.498 9.763 10.035 10.289 10.581 10.869 11.152 11.482 11.845 12.182 12.551 12.946 13.35 13.767 14.232 14.766 15.309 15.928 16.603 17.351 18.132 18.971 19.829 20.602 20.84 20.644 20.317 19.905 19.482 19.094 18.699 18.326 17.963 17.66 17.379 17.108 16.848 16.597 16.354 16.088 15.842 15.641 15.451 15.229 15.039 14.85 14.633 14.457 14.289 14.128 13.958 13.777 13.654 13.526 13.306 13.162 13.026 12.951 12.797 12.624 12.415 12.301 11.99 11.903 11.742 11.583 11.263 11.08 10.856 10.604 10.345 10.016 9.503 7.569 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_31_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_31_34.txt deleted file mode 100644 index 9ffef759..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_31_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29171 ,TETRA ,17558919,Sat Nov 27 03:45:45 CET,Sat Nov 27 05:43:12 CET,0.0 0.845 1.214 1.471 1.671 1.834 1.988 2.141 2.428 2.549 2.663 2.716 2.976 3.067 3.244 3.425 3.587 3.666 3.834 3.996 4.208 4.336 4.464 4.655 4.833 5.004 5.157 5.288 5.433 5.578 5.729 5.893 6.037 6.187 6.372 6.573 6.748 6.928 7.112 7.308 7.508 7.685 7.863 8.028 8.173 8.267 8.353 8.384 8.259 7.826 6.82 5.422 4.09 2.951 2.003 1.097 0.302 -0.391 -0.987 -1.598 -2.135 -2.62 -3.092 -3.56 -4.013 -4.4 -4.779 -5.122 -5.419 -5.719 -6.024 -6.279 -6.55 -6.834 -7.054 -7.284 -7.517 -7.767 -8.047 -8.241 -8.431 -8.728 -8.941 -9.167 -9.283 -9.536 -9.803 -10.051 -10.169 -10.477 -10.593 -10.74 -10.886 -11.214 -11.393 -11.587 -11.801 -12.033 -12.331 -12.708 -13.698 -2 ,14066 ,TETRA ,17558920,Sat Nov 27 03:45:47 CET,Sat Nov 27 05:42:50 CET,0.0 1.235 1.624 1.892 2.147 2.385 2.593 2.791 3.123 3.26 3.422 3.572 3.867 3.995 4.22 4.435 4.621 4.716 4.915 5.079 5.29 5.416 5.549 5.74 5.922 6.11 6.269 6.412 6.582 6.739 6.897 7.072 7.235 7.39 7.561 7.735 7.882 8.047 8.217 8.411 8.658 8.941 9.231 9.491 9.771 9.983 10.084 10.051 9.851 9.353 8.247 6.708 5.362 4.206 3.184 2.276 1.487 0.749 0.147 -0.404 -0.875 -1.306 -1.727 -2.135 -2.519 -2.874 -3.252 -3.584 -3.861 -4.156 -4.466 -4.723 -4.987 -5.255 -5.458 -5.667 -5.889 -6.123 -6.365 -6.532 -6.709 -6.985 -7.183 -7.374 -7.48 -7.703 -7.919 -8.176 -8.315 -8.624 -8.745 -8.898 -9.06 -9.429 -9.629 -9.823 -10.053 -10.322 -10.623 -11.029 -11.951 -3 ,28298 ,TETRA ,17558921,Sat Nov 27 03:46:43 CET,Sat Nov 27 05:45:13 CET,0.0 1.059 1.401 1.654 1.87 2.063 2.23 2.398 2.721 2.868 3.0 3.067 3.339 3.455 3.684 3.887 4.075 4.171 4.358 4.513 4.707 4.829 4.961 5.165 5.336 5.483 5.636 5.791 5.971 6.129 6.287 6.472 6.635 6.792 6.98 7.166 7.334 7.525 7.705 7.879 8.058 8.251 8.454 8.602 8.75 8.904 8.984 8.93 8.739 8.234 7.158 5.769 4.526 3.392 2.392 1.523 0.777 0.102 -0.499 -1.089 -1.597 -2.081 -2.562 -3.024 -3.459 -3.855 -4.295 -4.699 -5.029 -5.347 -5.663 -5.935 -6.236 -6.546 -6.772 -6.995 -7.228 -7.472 -7.747 -7.936 -8.127 -8.459 -8.69 -8.909 -9.025 -9.271 -9.504 -9.739 -9.87 -10.183 -10.297 -10.46 -10.633 -11.043 -11.299 -11.583 -11.898 -12.229 -12.578 -13.067 -14.824 -4 ,26940 ,TETRA ,17558922,Sat Nov 27 03:46:43 CET,Sat Nov 27 05:43:38 CET,0.0 0.711 1.091 1.386 1.61 1.809 2.019 2.23 2.566 2.714 2.847 2.904 3.16 3.246 3.423 3.605 3.773 3.85 3.999 4.135 4.331 4.461 4.577 4.746 4.913 5.059 5.181 5.291 5.436 5.574 5.706 5.883 6.062 6.232 6.4 6.587 6.778 6.984 7.2 7.384 7.546 7.701 7.881 8.033 8.156 8.27 8.349 8.322 8.091 7.543 6.495 5.057 3.764 2.621 1.626 0.738 -0.003 -0.647 -1.25 -1.852 -2.347 -2.783 -3.196 -3.592 -3.962 -4.303 -4.65 -4.961 -5.233 -5.512 -5.806 -6.053 -6.329 -6.612 -6.813 -7.027 -7.249 -7.481 -7.756 -7.964 -8.172 -8.482 -8.69 -8.899 -8.999 -9.216 -9.463 -9.722 -9.861 -10.171 -10.313 -10.486 -10.682 -11.104 -11.316 -11.526 -11.753 -12.064 -12.408 -12.765 -13.783 -5 ,2898 ,TETRA ,17558923,Sat Nov 27 03:46:44 CET,Sat Nov 27 05:43:14 CET,0.0 1.09 1.466 1.712 1.962 2.2 2.404 2.584 2.936 3.09 3.235 3.349 3.638 3.752 3.968 4.187 4.399 4.498 4.681 4.838 5.042 5.174 5.304 5.492 5.669 5.835 5.991 6.14 6.347 6.535 6.685 6.868 7.06 7.228 7.399 7.612 7.829 8.033 8.218 8.403 8.594 8.807 9.018 9.172 9.311 9.408 9.462 9.425 9.207 8.683 7.619 6.215 4.937 3.801 2.835 1.934 1.109 0.397 -0.226 -0.853 -1.353 -1.825 -2.32 -2.786 -3.223 -3.632 -4.058 -4.432 -4.752 -5.092 -5.447 -5.741 -6.047 -6.361 -6.602 -6.849 -7.103 -7.361 -7.633 -7.823 -8.012 -8.301 -8.512 -8.745 -8.867 -9.116 -9.389 -9.676 -9.825 -10.161 -10.322 -10.498 -10.673 -11.042 -11.237 -11.451 -11.689 -11.922 -12.213 -12.598 -13.77 -6 ,22917 ,TETRA ,17558924,Sat Nov 27 03:46:46 CET,Sat Nov 27 05:43:28 CET,0.0 1.057 1.375 1.632 1.863 2.085 2.28 2.445 2.721 2.847 2.969 3.019 3.271 3.378 3.582 3.763 3.928 4.008 4.167 4.308 4.501 4.616 4.719 4.864 5.014 5.165 5.305 5.439 5.619 5.8 5.974 6.185 6.372 6.52 6.69 6.882 7.047 7.237 7.438 7.614 7.775 7.944 8.145 8.326 8.474 8.6 8.675 8.66 8.517 8.078 6.988 5.475 4.207 3.111 2.157 1.311 0.553 -0.14 -0.759 -1.383 -1.936 -2.431 -2.887 -3.321 -3.716 -4.069 -4.425 -4.765 -5.073 -5.384 -5.705 -5.986 -6.307 -6.639 -6.882 -7.132 -7.394 -7.652 -7.908 -8.084 -8.28 -8.591 -8.808 -9.038 -9.158 -9.403 -9.659 -9.933 -10.073 -10.378 -10.503 -10.666 -10.837 -11.226 -11.436 -11.652 -11.899 -12.169 -12.527 -12.971 -14.075 -7 ,29149 ,TETRA ,17558925,Sat Nov 27 03:47:42 CET,Sat Nov 27 05:45:29 CET,0.0 1.301 1.723 2.006 2.268 2.498 2.694 2.869 3.162 3.303 3.431 3.52 3.804 3.92 4.143 4.336 4.504 4.583 4.732 4.891 5.129 5.265 5.394 5.594 5.78 5.953 6.129 6.283 6.462 6.632 6.789 6.957 7.123 7.306 7.503 7.695 7.848 8.003 8.192 8.404 8.599 8.765 8.943 9.101 9.23 9.337 9.409 9.4 9.258 8.789 7.743 6.294 4.977 3.854 2.871 2.011 1.248 0.519 -0.119 -0.738 -1.246 -1.699 -2.123 -2.544 -2.951 -3.322 -3.712 -4.051 -4.353 -4.695 -5.051 -5.338 -5.642 -5.957 -6.204 -6.467 -6.74 -7.018 -7.302 -7.499 -7.702 -8.019 -8.237 -8.453 -8.561 -8.795 -9.068 -9.363 -9.52 -9.839 -9.979 -10.16 -10.373 -10.787 -10.991 -11.221 -11.48 -11.757 -12.141 -12.584 -13.513 -8 ,2415 ,TETRA ,17558926,Sat Nov 27 03:48:40 CET,Sat Nov 27 05:46:07 CET,0.0 0.778 1.163 1.496 1.727 1.904 2.079 2.259 2.584 2.714 2.829 2.892 3.16 3.263 3.453 3.621 3.769 3.842 3.998 4.152 4.366 4.502 4.633 4.804 4.953 5.101 5.253 5.386 5.529 5.65 5.779 5.966 6.125 6.26 6.425 6.601 6.76 6.938 7.102 7.253 7.39 7.526 7.688 7.833 7.945 7.978 7.94 7.786 7.454 6.811 5.484 3.691 2.184 0.853 -0.372 -1.465 -2.383 -3.197 -3.912 -4.647 -5.283 -5.834 -6.359 -6.868 -7.329 -7.755 -8.208 -8.596 -8.922 -9.26 -9.612 -9.903 -10.203 -10.513 -10.759 -11.022 -11.304 -11.596 -11.888 -12.086 -12.3 -12.632 -12.871 -13.128 -13.252 -13.498 -13.764 -14.061 -14.218 -14.557 -14.748 -14.931 -15.118 -15.501 -15.711 -15.972 -16.272 -16.598 -16.975 -17.444 -19.064 -9 ,19993 ,TETRA ,17558927,Sat Nov 27 03:48:41 CET,Sat Nov 27 05:45:58 CET,0.0 1.159 1.569 1.89 2.148 2.364 2.55 2.724 3.06 3.219 3.352 3.417 3.693 3.823 4.062 4.275 4.471 4.561 4.74 4.915 5.158 5.305 5.444 5.641 5.817 5.985 6.142 6.303 6.515 6.685 6.832 7.007 7.16 7.303 7.481 7.705 7.89 8.053 8.232 8.419 8.613 8.81 9.013 9.177 9.324 9.431 9.505 9.493 9.284 8.867 7.974 6.623 5.356 4.207 3.201 2.296 1.515 0.82 0.212 -0.438 -1.029 -1.525 -1.985 -2.407 -2.785 -3.159 -3.577 -3.938 -4.226 -4.532 -4.87 -5.151 -5.451 -5.772 -6.037 -6.316 -6.594 -6.88 -7.168 -7.357 -7.552 -7.878 -8.118 -8.374 -8.501 -8.742 -8.997 -9.28 -9.435 -9.767 -9.883 -10.039 -10.207 -10.61 -10.835 -11.073 -11.331 -11.63 -11.962 -12.373 -13.42 -10 ,10800 ,TETRA ,17558928,Sat Nov 27 03:48:39 CET,Sat Nov 27 05:45:55 CET,0.0 1.51 1.874 2.145 2.377 2.566 2.725 2.876 3.144 3.262 3.381 3.447 3.709 3.815 4.011 4.187 4.363 4.451 4.614 4.766 5.0 5.153 5.29 5.493 5.697 5.892 6.077 6.241 6.446 6.638 6.829 7.056 7.248 7.419 7.605 7.802 7.984 8.166 8.341 8.51 8.673 8.84 9.004 9.138 9.271 9.384 9.391 9.268 9.032 8.549 7.519 5.981 4.623 3.51 2.536 1.645 0.889 0.201 -0.419 -1.027 -1.553 -2.015 -2.442 -2.852 -3.224 -3.545 -3.871 -4.186 -4.498 -4.833 -5.173 -5.454 -5.732 -6.013 -6.235 -6.476 -6.755 -7.05 -7.326 -7.519 -7.748 -8.114 -8.374 -8.661 -8.803 -9.079 -9.357 -9.663 -9.824 -10.16 -10.372 -10.565 -10.777 -11.284 -11.574 -11.862 -12.15 -12.485 -12.916 -13.421 -14.814 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_32_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_32_43.txt deleted file mode 100644 index fb5bfc7f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_32_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27708 ,KEBNE ,17024756,Wed Dec 22 11:09:47 CET,Wed Dec 22 12:50:46 CET,0.0 0.914 1.308 1.636 1.871 2.066 2.246 2.394 2.67 2.796 2.91 2.946 3.231 3.333 3.522 3.705 3.874 3.953 4.117 4.284 4.512 4.654 4.802 5.019 5.21 5.383 5.57 5.759 5.977 6.169 6.363 6.602 6.824 7.031 7.253 7.485 7.708 7.964 8.226 8.469 8.708 8.968 9.284 9.601 9.945 10.303 10.703 11.121 11.537 11.933 12.12 11.953 11.637 11.243 10.852 10.478 10.116 9.749 9.428 9.088 8.779 8.509 8.245 7.996 7.757 7.523 7.283 7.077 6.898 6.702 6.499 6.332 6.164 5.999 5.86 5.716 5.575 5.423 5.245 5.12 5.002 4.809 4.671 4.533 4.463 4.321 4.169 3.994 3.906 3.644 3.643 3.54 3.434 3.214 3.085 2.943 2.799 2.634 2.438 2.116 1.102 -2 ,1356 ,KEBNE ,17024757,Wed Dec 22 11:09:47 CET,Wed Dec 22 12:51:11 CET,0.0 1.894 2.29 2.551 2.811 3.03 3.22 3.41 3.728 3.871 4.006 4.059 4.344 4.442 4.649 4.865 5.068 5.158 5.324 5.492 5.733 5.879 6.008 6.191 6.379 6.563 6.736 6.9 7.101 7.279 7.453 7.668 7.881 8.091 8.338 8.612 8.856 9.114 9.388 9.694 9.99 10.297 10.646 10.958 11.31 11.693 12.064 12.407 12.745 13.02 13.105 12.865 12.485 12.088 11.715 11.315 10.907 10.526 10.186 9.843 9.525 9.226 8.952 8.695 8.454 8.225 7.978 7.757 7.558 7.331 7.086 6.901 6.727 6.546 6.41 6.27 6.125 5.978 5.814 5.686 5.533 5.282 5.129 4.991 4.915 4.746 4.574 4.388 4.294 4.018 4.011 3.915 3.809 3.567 3.44 3.306 3.145 2.968 2.779 2.568 1.827 -3 ,7325 ,KEBNE ,17024758,Wed Dec 22 11:09:47 CET,Wed Dec 22 12:51:27 CET,0.0 1.695 2.068 2.404 2.698 2.932 3.13 3.336 3.706 3.864 3.999 4.055 4.353 4.473 4.704 4.907 5.094 5.186 5.367 5.537 5.791 5.946 6.087 6.287 6.464 6.653 6.843 7.009 7.228 7.439 7.64 7.88 8.095 8.285 8.498 8.74 8.974 9.21 9.469 9.733 9.986 10.246 10.523 10.809 11.143 11.505 11.873 12.201 12.535 12.85 12.969 12.748 12.358 11.906 11.488 11.095 10.728 10.358 10.032 9.705 9.413 9.157 8.923 8.693 8.448 8.233 8.021 7.822 7.648 7.477 7.306 7.158 6.997 6.828 6.697 6.553 6.397 6.233 6.054 5.93 5.81 5.633 5.515 5.389 5.323 5.181 5.016 4.846 4.756 4.473 4.462 4.352 4.241 3.999 3.873 3.75 3.605 3.446 3.265 3.013 2.39 -4 ,30991 ,KEBNE ,17024759,Wed Dec 22 11:09:48 CET,Wed Dec 22 12:50:45 CET,0.0 1.82 2.328 2.686 2.995 3.264 3.479 3.68 4.029 4.177 4.307 4.388 4.683 4.786 4.979 5.168 5.349 5.448 5.633 5.799 6.058 6.219 6.355 6.562 6.769 6.956 7.119 7.268 7.459 7.657 7.84 8.034 8.231 8.43 8.659 8.917 9.154 9.41 9.686 9.97 10.268 10.609 10.979 11.327 11.696 12.095 12.523 12.912 13.303 13.629 13.783 13.571 13.195 12.81 12.426 12.028 11.66 11.307 11.002 10.676 10.374 10.105 9.846 9.613 9.375 9.151 8.924 8.707 8.517 8.325 8.145 7.999 7.836 7.666 7.525 7.372 7.222 7.061 6.888 6.759 6.629 6.434 6.291 6.153 6.084 5.934 5.776 5.605 5.512 5.232 5.231 5.123 4.998 4.698 4.547 4.4 4.215 4.02 3.784 3.455 2.745 -5 ,13023 ,KEBNE ,17024760,Wed Dec 22 11:09:49 CET,Wed Dec 22 12:46:43 CET,0.0 1.902 2.351 2.681 2.94 3.154 3.326 3.486 3.798 3.946 4.083 4.156 4.469 4.581 4.778 4.953 5.109 5.183 5.334 5.48 5.687 5.827 5.966 6.156 6.328 6.495 6.664 6.832 7.058 7.274 7.481 7.726 7.948 8.163 8.397 8.666 8.935 9.211 9.491 9.793 10.106 10.429 10.793 11.166 11.597 12.051 12.491 12.89 13.27 13.567 13.675 13.464 13.04 12.572 12.16 11.741 11.323 10.958 10.642 10.301 10.001 9.727 9.463 9.231 9.008 8.789 8.577 8.402 8.239 8.06 7.874 7.712 7.536 7.359 7.217 7.057 6.884 6.714 6.541 6.421 6.31 6.14 6.004 5.863 5.798 5.655 5.5 5.337 5.255 4.994 5.01 4.92 4.82 4.604 4.468 4.314 4.151 3.984 3.793 3.476 2.562 -6 ,30345 ,KEBNE ,17024761,Wed Dec 22 11:09:48 CET,Wed Dec 22 12:50:48 CET,0.0 1.528 2.039 2.4 2.704 2.965 3.2 3.399 3.707 3.859 4.01 4.105 4.413 4.534 4.747 4.942 5.131 5.231 5.416 5.574 5.816 5.964 6.105 6.331 6.557 6.766 6.973 7.182 7.461 7.71 7.912 8.151 8.389 8.61 8.852 9.097 9.33 9.598 9.878 10.15 10.411 10.691 11.001 11.316 11.679 12.028 12.399 12.767 13.109 13.421 13.5 13.224 12.795 12.331 11.929 11.547 11.177 10.827 10.517 10.192 9.905 9.632 9.37 9.148 8.928 8.717 8.499 8.299 8.119 7.924 7.738 7.589 7.427 7.252 7.114 6.97 6.823 6.684 6.543 6.44 6.322 6.134 6.004 5.859 5.79 5.66 5.512 5.358 5.276 5.006 4.998 4.898 4.796 4.562 4.426 4.271 4.087 3.871 3.645 3.387 2.578 -7 ,24947 ,KEBNE ,17024762,Wed Dec 22 11:09:47 CET,Wed Dec 22 12:50:42 CET,0.0 1.909 2.371 2.681 2.946 3.166 3.362 3.54 3.852 4.0 4.132 4.173 4.465 4.571 4.772 4.96 5.145 5.234 5.407 5.586 5.827 5.966 6.102 6.309 6.509 6.695 6.873 7.044 7.267 7.471 7.655 7.871 8.098 8.336 8.599 8.861 9.108 9.386 9.669 9.94 10.206 10.514 10.875 11.233 11.614 11.985 12.432 12.885 13.292 13.704 14.013 13.853 13.424 12.96 12.543 12.158 11.788 11.444 11.142 10.83 10.548 10.285 10.036 9.806 9.593 9.397 9.181 8.991 8.816 8.621 8.424 8.257 8.088 7.912 7.772 7.619 7.462 7.31 7.152 7.033 6.91 6.717 6.583 6.449 6.382 6.244 6.096 5.929 5.833 5.544 5.519 5.408 5.304 5.069 4.944 4.815 4.647 4.456 4.245 3.955 3.144 -8 ,19738 ,KEBNE ,17024763,Wed Dec 22 11:09:51 CET,Wed Dec 22 12:46:59 CET,0.0 1.497 2.025 2.412 2.717 2.956 3.175 3.385 3.723 3.871 4.018 4.09 4.383 4.507 4.747 4.96 5.165 5.266 5.452 5.628 5.861 5.996 6.132 6.329 6.488 6.645 6.809 6.966 7.177 7.392 7.591 7.851 8.096 8.316 8.568 8.818 9.026 9.241 9.488 9.772 10.061 10.402 10.806 11.133 11.486 11.873 12.259 12.619 12.939 13.195 13.275 13.042 12.669 12.253 11.878 11.51 11.146 10.798 10.501 10.186 9.888 9.612 9.344 9.103 8.887 8.681 8.465 8.268 8.09 7.895 7.694 7.526 7.346 7.154 7.006 6.862 6.711 6.553 6.386 6.267 6.147 5.971 5.843 5.707 5.635 5.465 5.293 5.131 5.048 4.77 4.777 4.681 4.567 4.306 4.156 3.986 3.797 3.583 3.302 2.953 2.339 -9 ,30201 ,KEBNE ,17024764,Wed Dec 22 11:09:48 CET,Wed Dec 22 12:47:00 CET,0.0 1.196 1.543 1.792 1.988 2.175 2.344 2.517 2.835 2.976 3.116 3.189 3.486 3.584 3.798 4.009 4.189 4.274 4.446 4.619 4.876 5.047 5.209 5.424 5.623 5.812 5.997 6.187 6.434 6.671 6.883 7.13 7.368 7.589 7.847 8.118 8.386 8.677 8.962 9.265 9.577 9.903 10.287 10.682 11.108 11.539 12.033 12.549 13.036 13.476 13.87 13.937 13.718 13.403 13.049 12.7 12.375 12.058 11.789 11.498 11.171 10.848 10.57 10.326 10.1 9.891 9.676 9.492 9.339 9.179 8.997 8.841 8.686 8.521 8.386 8.242 8.105 7.966 7.817 7.707 7.589 7.414 7.296 7.169 7.103 6.962 6.823 6.678 6.59 6.318 6.325 6.233 6.131 5.865 5.72 5.572 5.408 5.201 4.969 4.676 3.972 -10 ,9936 ,KEBNE ,17024765,Wed Dec 22 11:09:48 CET,Wed Dec 22 12:50:42 CET,0.0 1.081 1.593 1.984 2.244 2.445 2.622 2.775 3.044 3.171 3.29 3.319 3.613 3.719 3.916 4.109 4.296 4.379 4.549 4.718 4.948 5.091 5.235 5.448 5.646 5.834 6.006 6.172 6.379 6.554 6.725 6.937 7.128 7.304 7.494 7.714 7.952 8.205 8.456 8.711 8.971 9.263 9.587 9.909 10.265 10.617 11.018 11.413 11.738 12.004 12.117 11.883 11.513 11.146 10.797 10.423 10.056 9.719 9.43 9.124 8.819 8.538 8.283 8.036 7.801 7.585 7.375 7.192 7.017 6.823 6.627 6.459 6.283 6.105 5.962 5.811 5.661 5.502 5.341 5.227 5.102 4.895 4.751 4.601 4.518 4.36 4.204 4.038 3.948 3.661 3.647 3.533 3.41 3.18 3.063 2.937 2.782 2.596 2.39 2.137 1.636 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_32_46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_32_46.txt deleted file mode 100644 index 5295b9cf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_32_46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29722 ,KEBNE ,17024766,Wed Dec 22 11:09:47 CET,Wed Dec 22 12:50:51 CET,0.0 1.186 1.58 1.798 1.973 2.141 2.282 2.428 2.691 2.802 2.909 2.96 3.253 3.367 3.581 3.778 3.962 4.041 4.196 4.353 4.559 4.683 4.802 4.977 5.163 5.326 5.464 5.607 5.797 5.988 6.16 6.34 6.52 6.69 6.869 7.058 7.23 7.422 7.64 7.839 7.999 8.158 8.33 8.472 8.617 8.775 8.912 8.995 8.949 8.682 8.083 7.137 6.255 5.488 4.812 4.186 3.624 3.091 2.643 2.219 1.857 1.528 1.205 0.905 0.636 0.392 0.137 -0.102 -0.321 -0.54 -0.753 -0.939 -1.138 -1.327 -1.475 -1.638 -1.802 -1.973 -2.156 -2.277 -2.396 -2.586 -2.723 -2.858 -2.93 -3.08 -3.253 -3.44 -3.525 -3.803 -3.795 -3.892 -4.003 -4.244 -4.365 -4.492 -4.643 -4.811 -5.003 -5.265 -5.872 -2 ,31033 ,KEBNE ,17024767,Wed Dec 22 11:09:47 CET,Wed Dec 22 12:50:49 CET,0.0 0.918 1.228 1.476 1.702 1.903 2.094 2.264 2.535 2.657 2.785 2.841 3.142 3.25 3.472 3.689 3.878 3.96 4.113 4.254 4.442 4.561 4.672 4.827 4.988 5.154 5.318 5.483 5.692 5.872 6.035 6.219 6.393 6.585 6.812 7.028 7.203 7.392 7.59 7.784 7.986 8.234 8.519 8.74 8.924 9.078 9.212 9.305 9.298 9.118 8.522 7.546 6.64 5.847 5.151 4.517 3.954 3.446 3.028 2.593 2.198 1.859 1.546 1.248 0.981 0.745 0.489 0.251 0.037 -0.193 -0.432 -0.622 -0.81 -1.005 -1.157 -1.312 -1.473 -1.652 -1.845 -2.001 -2.177 -2.427 -2.587 -2.757 -2.846 -3.026 -3.208 -3.396 -3.497 -3.797 -3.821 -3.931 -4.048 -4.3 -4.442 -4.611 -4.808 -5.03 -5.285 -5.6 -6.353 -3 ,27414 ,KEBNE ,17024768,Wed Dec 22 11:09:48 CET,Wed Dec 22 12:50:48 CET,0.0 1.017 1.379 1.604 1.821 2.026 2.2 2.367 2.662 2.79 2.907 2.939 3.225 3.332 3.536 3.717 3.89 3.966 4.103 4.247 4.483 4.641 4.789 4.984 5.147 5.304 5.462 5.616 5.816 6.001 6.165 6.349 6.534 6.721 6.943 7.174 7.389 7.615 7.834 8.057 8.259 8.474 8.7 8.894 9.115 9.322 9.474 9.542 9.516 9.301 8.689 7.757 6.895 6.12 5.444 4.826 4.26 3.74 3.293 2.847 2.457 2.122 1.816 1.53 1.262 1.017 0.765 0.53 0.328 0.114 -0.105 -0.276 -0.459 -0.654 -0.8 -0.953 -1.118 -1.284 -1.464 -1.59 -1.718 -1.919 -2.06 -2.214 -2.288 -2.44 -2.611 -2.799 -2.898 -3.177 -3.175 -3.27 -3.363 -3.591 -3.722 -3.854 -3.994 -4.167 -4.368 -4.639 -5.349 -4 ,9578 ,KEBNE ,17024769,Wed Dec 22 11:09:47 CET,Wed Dec 22 12:51:32 CET,0.0 1.804 2.22 2.542 2.789 2.97 3.143 3.309 3.645 3.793 3.934 4.019 4.322 4.425 4.617 4.799 4.95 5.032 5.215 5.374 5.602 5.74 5.857 6.026 6.209 6.384 6.545 6.701 6.884 7.038 7.187 7.364 7.51 7.648 7.842 8.056 8.228 8.408 8.594 8.804 9.023 9.232 9.451 9.653 9.835 9.978 10.117 10.231 10.187 9.946 9.386 8.515 7.652 6.841 6.149 5.527 4.977 4.474 4.013 3.555 3.17 2.827 2.495 2.173 1.869 1.591 1.31 1.066 0.861 0.653 0.428 0.234 0.019 -0.205 -0.362 -0.519 -0.692 -0.888 -1.093 -1.222 -1.344 -1.534 -1.663 -1.796 -1.872 -2.04 -2.2 -2.373 -2.471 -2.772 -2.79 -2.9 -3.003 -3.261 -3.408 -3.562 -3.73 -3.9 -4.108 -4.429 -5.321 -5 ,6079 ,KEBNE ,17024770,Wed Dec 22 11:09:47 CET,Wed Dec 22 12:51:16 CET,0.0 1.155 1.542 1.816 2.028 2.232 2.433 2.618 2.922 3.054 3.181 3.223 3.515 3.62 3.823 4.015 4.177 4.251 4.398 4.539 4.735 4.861 4.983 5.141 5.278 5.412 5.541 5.657 5.804 5.951 6.086 6.241 6.399 6.557 6.734 6.91 7.094 7.312 7.517 7.717 7.894 8.075 8.276 8.466 8.666 8.84 8.975 9.093 9.115 8.929 8.372 7.443 6.617 5.889 5.251 4.638 4.058 3.534 3.08 2.63 2.247 1.905 1.575 1.259 0.97 0.708 0.429 0.175 -0.034 -0.244 -0.473 -0.654 -0.838 -1.046 -1.201 -1.36 -1.531 -1.703 -1.875 -1.999 -2.131 -2.333 -2.481 -2.622 -2.694 -2.85 -3.011 -3.194 -3.297 -3.585 -3.606 -3.713 -3.818 -4.04 -4.17 -4.304 -4.453 -4.624 -4.818 -5.074 -5.814 -6 ,4390 ,KEBNE ,17024771,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:52:24 CET,0.0 1.377 1.835 2.155 2.407 2.62 2.805 2.965 3.236 3.37 3.502 3.56 3.842 3.945 4.123 4.284 4.427 4.5 4.665 4.837 5.065 5.2 5.333 5.51 5.676 5.854 6.019 6.152 6.311 6.465 6.632 6.838 7.018 7.184 7.37 7.558 7.736 7.943 8.158 8.379 8.582 8.768 8.982 9.211 9.451 9.65 9.825 9.938 9.989 9.877 9.312 8.425 7.604 6.861 6.172 5.553 5.039 4.543 4.092 3.642 3.225 2.866 2.564 2.28 1.998 1.742 1.477 1.241 1.043 0.833 0.62 0.446 0.255 0.041 -0.129 -0.301 -0.469 -0.654 -0.861 -0.995 -1.136 -1.361 -1.512 -1.655 -1.725 -1.894 -2.079 -2.261 -2.353 -2.644 -2.647 -2.751 -2.863 -3.132 -3.278 -3.424 -3.592 -3.803 -4.074 -4.393 -5.283 -7 ,27398 ,KEBNE ,17024772,Wed Dec 22 11:11:50 CET,Wed Dec 22 12:53:44 CET,0.0 1.237 1.605 1.878 2.086 2.262 2.443 2.614 2.896 3.03 3.152 3.183 3.477 3.588 3.784 3.965 4.146 4.23 4.375 4.518 4.73 4.859 4.984 5.165 5.341 5.511 5.655 5.789 5.978 6.183 6.377 6.571 6.731 6.89 7.075 7.281 7.477 7.677 7.888 8.105 8.313 8.521 8.752 8.985 9.223 9.451 9.644 9.763 9.818 9.677 9.107 8.232 7.417 6.624 5.917 5.305 4.77 4.278 3.846 3.415 3.037 2.69 2.361 2.056 1.76 1.482 1.195 0.941 0.734 0.525 0.299 0.11 -0.097 -0.304 -0.448 -0.604 -0.786 -0.958 -1.118 -1.24 -1.374 -1.577 -1.719 -1.878 -1.965 -2.132 -2.305 -2.491 -2.585 -2.872 -2.878 -2.992 -3.113 -3.378 -3.526 -3.674 -3.818 -3.97 -4.137 -4.356 -5.116 -8 ,12354 ,KEBNE ,17024773,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:51:32 CET,0.0 1.877 2.369 2.728 3.03 3.303 3.534 3.735 4.048 4.194 4.335 4.41 4.711 4.827 5.039 5.227 5.394 5.474 5.62 5.748 5.938 6.069 6.197 6.386 6.558 6.716 6.872 7.011 7.193 7.377 7.538 7.737 7.906 8.049 8.227 8.458 8.683 8.878 9.057 9.252 9.443 9.636 9.839 10.034 10.246 10.424 10.556 10.619 10.599 10.445 9.931 9.076 8.285 7.527 6.839 6.217 5.666 5.165 4.729 4.302 3.912 3.556 3.229 2.916 2.638 2.391 2.114 1.856 1.647 1.437 1.212 1.011 0.802 0.606 0.453 0.296 0.129 -0.047 -0.235 -0.377 -0.526 -0.754 -0.907 -1.062 -1.138 -1.299 -1.476 -1.659 -1.751 -2.044 -2.05 -2.152 -2.253 -2.46 -2.577 -2.726 -2.899 -3.085 -3.311 -3.604 -4.335 -9 ,579 ,KEBNE ,17024774,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:52:37 CET,0.0 0.957 1.274 1.534 1.76 1.932 2.09 2.239 2.495 2.607 2.709 2.734 3.028 3.143 3.365 3.597 3.813 3.908 4.093 4.264 4.513 4.672 4.825 5.041 5.239 5.444 5.65 5.84 6.065 6.267 6.454 6.683 6.897 7.068 7.264 7.481 7.652 7.824 8.002 8.192 8.396 8.608 8.844 9.062 9.248 9.387 9.496 9.565 9.556 9.348 8.731 7.803 6.933 6.146 5.445 4.831 4.292 3.787 3.366 2.947 2.574 2.233 1.906 1.606 1.332 1.062 0.786 0.559 0.355 0.143 -0.068 -0.244 -0.431 -0.615 -0.758 -0.921 -1.089 -1.262 -1.453 -1.595 -1.738 -1.945 -2.094 -2.245 -2.317 -2.467 -2.644 -2.83 -2.92 -3.21 -3.236 -3.353 -3.47 -3.736 -3.875 -4.02 -4.195 -4.386 -4.581 -4.824 -5.39 -10 ,12976 ,KEBNE ,17024775,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:52:22 CET,0.0 1.344 1.767 2.09 2.369 2.602 2.791 2.967 3.291 3.428 3.57 3.681 3.995 4.107 4.317 4.507 4.668 4.753 4.919 5.07 5.289 5.414 5.527 5.697 5.83 5.946 6.076 6.202 6.359 6.518 6.678 6.863 7.038 7.192 7.365 7.553 7.731 7.921 8.085 8.247 8.456 8.687 8.917 9.114 9.295 9.475 9.644 9.78 9.814 9.649 9.055 8.097 7.196 6.375 5.672 5.031 4.466 3.942 3.49 3.051 2.674 2.34 2.012 1.692 1.404 1.142 0.875 0.654 0.452 0.232 0.008 -0.177 -0.369 -0.565 -0.718 -0.878 -1.042 -1.212 -1.393 -1.518 -1.648 -1.858 -2.005 -2.143 -2.213 -2.371 -2.54 -2.726 -2.824 -3.113 -3.124 -3.235 -3.35 -3.585 -3.716 -3.87 -4.048 -4.236 -4.439 -4.678 -5.247 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_32_47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_32_47.txt deleted file mode 100644 index d5699bec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_32_47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15166 ,KEBNE ,17024776,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:51:40 CET,0.0 1.334 1.789 2.127 2.407 2.659 2.906 3.126 3.474 3.626 3.764 3.838 4.146 4.287 4.562 4.811 5.05 5.162 5.38 5.58 5.839 6.004 6.159 6.388 6.589 6.76 6.935 7.126 7.369 7.581 7.784 8.039 8.297 8.544 8.784 9.011 9.231 9.472 9.726 9.97 10.188 10.415 10.685 10.939 11.193 11.465 11.761 11.973 12.044 11.92 11.419 10.496 9.569 8.791 8.112 7.402 6.757 6.19 5.701 5.208 4.764 4.362 3.989 3.64 3.308 3.014 2.712 2.446 2.217 1.969 1.716 1.512 1.304 1.076 0.876 0.673 0.475 0.262 0.044 -0.105 -0.254 -0.48 -0.646 -0.823 -0.911 -1.094 -1.291 -1.492 -1.597 -1.904 -1.95 -2.062 -2.208 -2.538 -2.706 -2.901 -3.1 -3.334 -3.652 -4.007 -5.104 -2 ,11601 ,KEBNE ,17024777,Wed Dec 22 11:10:53 CET,Wed Dec 22 12:47:19 CET,0.0 1.771 2.224 2.504 2.719 2.896 3.046 3.216 3.544 3.67 3.782 3.84 4.136 4.242 4.436 4.638 4.837 4.931 5.093 5.234 5.435 5.569 5.705 5.89 6.067 6.234 6.378 6.524 6.712 6.879 7.043 7.249 7.455 7.642 7.824 8.01 8.174 8.343 8.552 8.821 9.094 9.38 9.713 9.983 10.207 10.41 10.643 10.851 10.951 10.836 10.281 9.292 8.355 7.527 6.768 6.068 5.442 4.857 4.344 3.842 3.404 3.011 2.643 2.297 1.97 1.662 1.336 1.052 0.791 0.514 0.23 -0.01 -0.24 -0.459 -0.638 -0.825 -1.03 -1.261 -1.495 -1.654 -1.821 -2.079 -2.251 -2.42 -2.509 -2.716 -2.941 -3.172 -3.296 -3.622 -3.692 -3.841 -3.985 -4.345 -4.543 -4.716 -4.897 -5.072 -5.296 -5.647 -7.359 -3 ,371 ,KEBNE ,17024778,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:52:13 CET,0.0 1.572 1.956 2.257 2.511 2.703 2.871 3.038 3.344 3.474 3.589 3.618 3.91 4.004 4.166 4.327 4.495 4.588 4.767 4.932 5.188 5.35 5.494 5.712 5.94 6.146 6.326 6.497 6.724 6.932 7.143 7.396 7.63 7.852 8.088 8.333 8.558 8.805 9.06 9.329 9.597 9.853 10.139 10.432 10.748 11.007 11.203 11.33 11.355 11.246 10.828 9.972 9.015 8.134 7.338 6.633 6.06 5.531 5.074 4.593 4.15 3.748 3.366 3.019 2.683 2.371 2.054 1.779 1.548 1.296 1.03 0.819 0.604 0.366 0.177 -0.011 -0.196 -0.393 -0.596 -0.728 -0.873 -1.11 -1.273 -1.439 -1.524 -1.693 -1.866 -2.045 -2.135 -2.425 -2.45 -2.561 -2.683 -2.958 -3.11 -3.282 -3.488 -3.71 -3.993 -4.342 -5.768 -4 ,20396 ,KEBNE ,17024779,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:52:01 CET,0.0 1.293 1.798 2.132 2.436 2.7 2.912 3.103 3.491 3.663 3.824 3.948 4.284 4.413 4.652 4.898 5.118 5.216 5.421 5.628 5.912 6.079 6.232 6.449 6.672 6.9 7.117 7.306 7.533 7.757 7.964 8.197 8.415 8.616 8.848 9.117 9.361 9.625 9.878 10.117 10.357 10.597 10.855 11.092 11.357 11.629 11.866 12.016 12.036 11.844 11.182 10.148 9.226 8.376 7.579 6.864 6.255 5.694 5.203 4.697 4.24 3.816 3.395 3.028 2.685 2.366 2.044 1.75 1.48 1.206 0.944 0.733 0.5 0.225 0.022 -0.178 -0.404 -0.648 -0.892 -1.051 -1.216 -1.471 -1.651 -1.842 -1.936 -2.12 -2.328 -2.547 -2.657 -2.967 -3.02 -3.145 -3.285 -3.589 -3.755 -3.936 -4.126 -4.351 -4.614 -4.942 -5.796 -5 ,6249 ,KEBNE ,17024780,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:51:39 CET,0.0 1.183 1.59 1.908 2.19 2.453 2.696 2.892 3.226 3.391 3.553 3.661 4.004 4.148 4.398 4.634 4.856 4.964 5.172 5.367 5.635 5.811 5.982 6.216 6.43 6.639 6.835 7.024 7.26 7.473 7.676 7.901 8.106 8.3 8.511 8.739 8.965 9.223 9.492 9.751 10.008 10.288 10.57 10.827 11.108 11.374 11.636 11.874 11.987 11.842 11.199 10.126 9.187 8.391 7.693 7.049 6.471 5.925 5.436 4.935 4.508 4.127 3.757 3.427 3.142 2.876 2.579 2.31 2.086 1.847 1.597 1.387 1.159 0.943 0.778 0.583 0.369 0.152 -0.07 -0.218 -0.364 -0.595 -0.766 -0.936 -1.024 -1.204 -1.388 -1.581 -1.685 -1.982 -2.011 -2.125 -2.257 -2.578 -2.742 -2.901 -3.089 -3.318 -3.601 -3.953 -4.674 -6 ,14395 ,KEBNE ,17024781,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:51:24 CET,0.0 1.901 2.378 2.712 2.984 3.211 3.431 3.655 4.038 4.21 4.368 4.476 4.779 4.898 5.148 5.391 5.629 5.738 5.942 6.142 6.413 6.587 6.755 6.977 7.176 7.353 7.53 7.718 7.946 8.157 8.358 8.598 8.837 9.061 9.297 9.538 9.761 9.999 10.26 10.545 10.828 11.091 11.374 11.655 11.923 12.156 12.372 12.573 12.681 12.561 11.994 11.001 10.022 9.09 8.279 7.602 6.972 6.36 5.842 5.35 4.934 4.546 4.179 3.828 3.504 3.22 2.921 2.651 2.411 2.163 1.891 1.667 1.452 1.225 1.044 0.845 0.641 0.424 0.194 0.045 -0.105 -0.336 -0.484 -0.636 -0.72 -0.913 -1.12 -1.331 -1.442 -1.749 -1.802 -1.94 -2.088 -2.399 -2.573 -2.772 -2.974 -3.181 -3.424 -3.746 -4.574 -7 ,19620 ,KEBNE ,17024782,Wed Dec 22 11:10:50 CET,Wed Dec 22 12:51:31 CET,0.0 1.18 1.646 1.994 2.267 2.501 2.72 2.921 3.307 3.495 3.658 3.765 4.111 4.249 4.483 4.714 4.947 5.059 5.263 5.45 5.735 5.919 6.085 6.334 6.568 6.787 7.003 7.198 7.435 7.659 7.866 8.107 8.324 8.552 8.829 9.106 9.344 9.613 9.913 10.194 10.481 10.788 11.12 11.437 11.763 12.097 12.385 12.549 12.607 12.459 11.874 10.91 10.037 9.24 8.487 7.792 7.198 6.657 6.195 5.74 5.334 4.947 4.571 4.226 3.914 3.632 3.324 3.062 2.85 2.627 2.387 2.19 1.996 1.785 1.606 1.412 1.206 0.989 0.774 0.627 0.471 0.229 0.059 -0.131 -0.228 -0.412 -0.593 -0.779 -0.875 -1.172 -1.2 -1.312 -1.436 -1.712 -1.869 -2.057 -2.248 -2.439 -2.662 -2.905 -3.471 -8 ,27214 ,KEBNE ,17024783,Wed Dec 22 11:10:50 CET,Wed Dec 22 12:52:01 CET,0.0 1.818 2.307 2.71 3.047 3.321 3.58 3.825 4.246 4.417 4.57 4.698 5.02 5.145 5.387 5.617 5.828 5.939 6.145 6.311 6.557 6.723 6.878 7.094 7.291 7.483 7.688 7.884 8.122 8.335 8.53 8.767 8.99 9.202 9.428 9.654 9.873 10.122 10.394 10.677 10.944 11.22 11.523 11.819 12.146 12.446 12.71 12.874 12.908 12.744 12.185 11.171 10.209 9.4 8.661 7.954 7.324 6.775 6.31 5.831 5.436 5.094 4.748 4.4 4.07 3.779 3.482 3.211 2.97 2.733 2.503 2.313 2.096 1.864 1.7 1.533 1.35 1.148 0.944 0.803 0.657 0.411 0.24 0.07 -0.014 -0.184 -0.371 -0.569 -0.68 -0.993 -1.051 -1.191 -1.353 -1.721 -1.906 -2.105 -2.305 -2.523 -2.75 -3.03 -3.835 -9 ,1278 ,KEBNE ,17024784,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:51:39 CET,0.0 2.587 3.142 3.506 3.807 4.067 4.279 4.467 4.798 4.947 5.08 5.121 5.398 5.508 5.72 5.896 6.07 6.164 6.348 6.515 6.734 6.875 7.013 7.215 7.4 7.59 7.8 7.991 8.23 8.456 8.666 8.914 9.165 9.403 9.646 9.932 10.204 10.455 10.722 11.006 11.287 11.584 11.904 12.192 12.485 12.791 13.064 13.249 13.302 13.178 12.613 11.625 10.724 9.919 9.173 8.463 7.847 7.302 6.826 6.328 5.905 5.54 5.168 4.807 4.483 4.191 3.884 3.608 3.366 3.115 2.843 2.611 2.381 2.142 1.954 1.763 1.559 1.349 1.144 0.996 0.844 0.608 0.442 0.279 0.191 -0.009 -0.219 -0.423 -0.533 -0.85 -0.9 -1.023 -1.151 -1.444 -1.603 -1.772 -1.964 -2.167 -2.382 -2.653 -3.207 -10 ,16731 ,KEBNE ,17024785,Wed Dec 22 11:10:50 CET,Wed Dec 22 12:51:45 CET,0.0 1.319 1.753 2.035 2.257 2.456 2.641 2.83 3.134 3.261 3.385 3.433 3.724 3.813 3.976 4.154 4.323 4.401 4.548 4.681 4.873 5.0 5.121 5.292 5.451 5.618 5.786 5.941 6.125 6.283 6.437 6.643 6.822 6.963 7.119 7.293 7.448 7.607 7.771 7.939 8.088 8.262 8.504 8.725 8.909 9.059 9.174 9.22 9.169 8.872 8.116 7.053 6.098 5.256 4.52 3.832 3.208 2.656 2.188 1.731 1.338 0.975 0.634 0.312 0.007 -0.27 -0.558 -0.817 -1.038 -1.275 -1.524 -1.717 -1.923 -2.149 -2.324 -2.513 -2.708 -2.898 -3.114 -3.261 -3.398 -3.609 -3.756 -3.899 -3.975 -4.138 -4.305 -4.489 -4.594 -4.897 -4.929 -5.045 -5.165 -5.455 -5.623 -5.812 -6.006 -6.224 -6.475 -6.796 -7.413 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_32.txt deleted file mode 100644 index 98199377..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31092 ,TETRA ,17558929,Sat Nov 27 03:48:41 CET,Sat Nov 27 05:45:42 CET,0.0 1.479 1.91 2.191 2.417 2.613 2.793 2.947 3.187 3.301 3.406 3.431 3.686 3.774 3.956 4.139 4.32 4.39 4.522 4.659 4.85 4.971 5.094 5.26 5.413 5.567 5.716 5.86 6.042 6.208 6.364 6.542 6.702 6.859 7.048 7.269 7.484 7.696 7.91 8.149 8.398 8.662 8.955 9.211 9.465 9.727 9.997 10.256 10.468 10.547 10.404 9.961 9.442 8.993 8.518 8.05 7.659 7.25 6.878 6.511 6.155 5.841 5.561 5.276 5.01 4.774 4.526 4.316 4.147 3.967 3.78 3.619 3.443 3.256 3.11 2.962 2.809 2.634 2.446 2.314 2.171 1.957 1.814 1.659 1.573 1.405 1.244 1.055 0.95 0.662 0.645 0.527 0.408 0.159 0.017 -0.141 -0.332 -0.558 -0.842 -1.202 -2.023 -2 ,8163 ,TETRA ,17558930,Sat Nov 27 03:48:41 CET,Sat Nov 27 05:45:12 CET,0.0 1.17 1.507 1.811 2.029 2.172 2.332 2.51 2.795 2.9 2.998 3.039 3.318 3.406 3.586 3.751 3.905 3.984 4.135 4.265 4.437 4.553 4.676 4.839 4.974 5.108 5.243 5.368 5.531 5.685 5.823 5.994 6.165 6.316 6.489 6.69 6.873 7.08 7.324 7.558 7.765 8.0 8.276 8.546 8.826 9.102 9.394 9.653 9.857 9.97 9.845 9.392 8.874 8.35 7.871 7.416 7.008 6.638 6.263 5.873 5.546 5.245 4.966 4.71 4.459 4.208 3.939 3.705 3.518 3.332 3.132 2.959 2.764 2.573 2.436 2.282 2.117 1.947 1.771 1.657 1.543 1.363 1.231 1.09 1.022 0.884 0.716 0.517 0.413 0.126 0.086 -0.043 -0.183 -0.452 -0.596 -0.77 -0.962 -1.174 -1.428 -1.731 -2.544 -3 ,18118 ,TETRA ,17558931,Sat Nov 27 03:48:41 CET,Sat Nov 27 05:49:54 CET,0.0 1.058 1.364 1.601 1.788 1.973 2.14 2.282 2.517 2.618 2.726 2.766 3.043 3.13 3.29 3.443 3.595 3.666 3.806 3.942 4.134 4.249 4.368 4.538 4.679 4.82 4.963 5.105 5.289 5.467 5.633 5.822 6.008 6.186 6.389 6.599 6.799 7.026 7.243 7.457 7.68 7.937 8.216 8.467 8.752 9.038 9.321 9.556 9.748 9.856 9.746 9.374 8.893 8.376 7.872 7.436 7.034 6.643 6.297 5.936 5.636 5.366 5.086 4.818 4.566 4.328 4.092 3.888 3.699 3.502 3.298 3.128 2.949 2.759 2.614 2.452 2.275 2.089 1.898 1.776 1.649 1.437 1.282 1.122 1.04 0.872 0.697 0.523 0.428 0.137 0.077 -0.044 -0.17 -0.45 -0.609 -0.796 -1.0 -1.219 -1.513 -1.871 -3.273 -4 ,9845 ,TETRA ,17558932,Sat Nov 27 03:48:41 CET,Sat Nov 27 05:46:41 CET,0.0 1.019 1.327 1.557 1.726 1.869 2.007 2.147 2.425 2.544 2.65 2.658 2.925 3.005 3.156 3.302 3.458 3.534 3.681 3.824 4.025 4.144 4.248 4.388 4.523 4.66 4.795 4.925 5.085 5.247 5.41 5.615 5.809 5.975 6.162 6.385 6.594 6.809 7.048 7.307 7.552 7.793 8.073 8.365 8.69 9.027 9.346 9.605 9.841 10.018 9.937 9.555 9.09 8.593 8.091 7.606 7.16 6.746 6.374 6.004 5.705 5.436 5.176 4.934 4.693 4.454 4.21 3.987 3.793 3.595 3.387 3.216 3.026 2.819 2.665 2.513 2.361 2.2 2.035 1.919 1.798 1.606 1.476 1.347 1.28 1.134 0.968 0.808 0.73 0.451 0.44 0.339 0.231 -0.006 -0.122 -0.253 -0.397 -0.571 -0.751 -0.956 -1.529 -5 ,15621 ,TETRA ,17558933,Sat Nov 27 03:48:43 CET,Sat Nov 27 05:46:51 CET,0.0 0.965 1.266 1.491 1.662 1.826 1.979 2.116 2.353 2.46 2.561 2.554 2.807 2.892 3.067 3.234 3.374 3.438 3.571 3.698 3.872 3.989 4.115 4.294 4.46 4.629 4.795 4.951 5.146 5.338 5.509 5.695 5.875 6.048 6.245 6.462 6.652 6.843 7.04 7.25 7.48 7.733 8.01 8.257 8.519 8.8 9.076 9.343 9.577 9.708 9.609 9.172 8.675 8.202 7.74 7.281 6.862 6.475 6.129 5.783 5.477 5.187 4.882 4.595 4.338 4.105 3.86 3.634 3.419 3.194 2.976 2.789 2.596 2.389 2.216 2.051 1.892 1.728 1.557 1.433 1.304 1.11 0.968 0.816 0.742 0.595 0.442 0.285 0.198 -0.079 -0.123 -0.232 -0.355 -0.634 -0.79 -0.95 -1.107 -1.272 -1.47 -1.824 -2.782 -6 ,8121 ,TETRA ,17558934,Sat Nov 27 03:48:41 CET,Sat Nov 27 05:45:19 CET,0.0 1.169 1.581 1.86 2.068 2.235 2.384 2.536 2.777 2.882 2.993 3.029 3.297 3.393 3.596 3.791 3.967 4.042 4.191 4.339 4.541 4.66 4.772 4.936 5.09 5.226 5.359 5.494 5.673 5.838 5.997 6.185 6.353 6.508 6.689 6.891 7.07 7.271 7.485 7.722 7.978 8.249 8.561 8.838 9.109 9.378 9.644 9.905 10.153 10.318 10.265 9.863 9.383 8.876 8.39 7.933 7.521 7.14 6.809 6.47 6.153 5.857 5.565 5.288 5.035 4.811 4.578 4.368 4.19 3.996 3.781 3.589 3.399 3.207 3.052 2.892 2.718 2.546 2.39 2.284 2.167 1.984 1.855 1.709 1.633 1.469 1.291 1.105 1.01 0.718 0.667 0.557 0.434 0.156 -0.004 -0.183 -0.37 -0.589 -0.859 -1.218 -2.467 -7 ,27663 ,TETRA ,17558935,Sat Nov 27 03:49:41 CET,Sat Nov 27 05:29:16 CET,0.0 1.544 1.882 2.156 2.433 2.669 2.858 3.041 3.382 3.527 3.659 3.733 4.035 4.164 4.399 4.615 4.802 4.874 4.998 5.121 5.297 5.405 5.522 5.704 5.868 6.012 6.133 6.245 6.405 6.57 6.727 6.912 7.087 7.255 7.449 7.657 7.849 8.046 8.243 8.454 8.666 8.893 9.168 9.435 9.714 10.005 10.283 10.528 10.774 10.955 10.889 10.509 10.022 9.519 9.067 8.615 8.179 7.771 7.415 7.066 6.762 6.485 6.218 5.963 5.723 5.504 5.266 5.069 4.903 4.71 4.501 4.325 4.144 3.97 3.84 3.696 3.539 3.373 3.211 3.089 2.955 2.761 2.63 2.485 2.411 2.264 2.094 1.922 1.835 1.551 1.493 1.361 1.229 0.981 0.847 0.698 0.541 0.373 0.149 -0.222 -1.453 -8 ,17484 ,TETRA ,17558936,Sat Nov 27 03:49:43 CET,Sat Nov 27 05:46:13 CET,0.0 1.047 1.375 1.622 1.81 1.982 2.159 2.306 2.575 2.701 2.808 2.837 3.115 3.201 3.369 3.528 3.687 3.769 3.909 4.031 4.217 4.333 4.436 4.582 4.725 4.867 4.995 5.119 5.286 5.438 5.586 5.775 5.949 6.103 6.287 6.485 6.671 6.875 7.088 7.294 7.501 7.767 8.061 8.327 8.637 8.948 9.258 9.555 9.843 10.019 9.89 9.477 8.973 8.447 7.982 7.541 7.132 6.755 6.441 6.133 5.847 5.58 5.322 5.077 4.842 4.629 4.392 4.171 3.982 3.778 3.571 3.4 3.211 3.012 2.866 2.715 2.553 2.363 2.149 2.006 1.872 1.686 1.549 1.394 1.318 1.17 1.021 0.856 0.75 0.458 0.462 0.354 0.225 -0.039 -0.174 -0.315 -0.465 -0.631 -0.853 -1.181 -2.338 -9 ,32267 ,TETRA ,17558937,Sat Nov 27 03:49:44 CET,Sat Nov 27 05:46:35 CET,0.0 1.617 1.989 2.288 2.547 2.736 2.891 3.036 3.288 3.386 3.469 3.462 3.718 3.8 3.956 4.09 4.218 4.282 4.412 4.543 4.726 4.845 4.964 5.123 5.257 5.378 5.494 5.62 5.79 5.943 6.089 6.271 6.445 6.612 6.799 7.011 7.207 7.401 7.615 7.843 8.06 8.3 8.569 8.82 9.109 9.403 9.673 9.932 10.236 10.471 10.424 10.047 9.567 9.088 8.657 8.226 7.828 7.467 7.141 6.796 6.499 6.23 5.97 5.724 5.481 5.251 5.009 4.81 4.642 4.45 4.248 4.081 3.912 3.742 3.596 3.442 3.279 3.099 2.912 2.788 2.669 2.47 2.32 2.165 2.089 1.945 1.793 1.628 1.532 1.245 1.202 1.088 0.969 0.699 0.545 0.407 0.271 0.07 -0.185 -0.496 -1.45 -10 ,20953 ,TETRA ,17558938,Sat Nov 27 03:49:43 CET,Sat Nov 27 05:46:07 CET,0.0 1.401 1.913 2.273 2.534 2.726 2.879 2.996 3.225 3.344 3.451 3.461 3.72 3.802 3.976 4.129 4.278 4.35 4.473 4.586 4.744 4.846 4.949 5.096 5.236 5.371 5.495 5.621 5.795 5.951 6.099 6.276 6.458 6.635 6.812 7.008 7.202 7.416 7.639 7.857 8.087 8.327 8.586 8.85 9.124 9.403 9.723 10.052 10.317 10.454 10.338 9.881 9.384 8.87 8.373 7.916 7.504 7.095 6.706 6.325 6.0 5.69 5.375 5.074 4.795 4.545 4.296 4.076 3.867 3.643 3.399 3.188 2.987 2.779 2.616 2.452 2.285 2.12 1.944 1.819 1.694 1.498 1.352 1.199 1.121 0.96 0.806 0.648 0.558 0.28 0.303 0.205 0.092 -0.154 -0.29 -0.473 -0.69 -0.883 -1.108 -1.416 -2.346 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_35.txt deleted file mode 100644 index 915f98fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11377 ,TETRA ,17558939,Sat Nov 27 03:49:45 CET,Sat Nov 27 05:45:48 CET,0.0 1.21 1.545 1.787 2.013 2.233 2.423 2.578 2.832 2.951 3.076 3.124 3.401 3.501 3.698 3.883 4.053 4.127 4.265 4.4 4.597 4.718 4.842 5.035 5.212 5.364 5.501 5.63 5.8 5.967 6.109 6.278 6.457 6.615 6.782 6.966 7.135 7.311 7.5 7.694 7.887 8.088 8.295 8.513 8.741 8.958 9.164 9.285 9.302 9.168 8.704 7.913 7.144 6.422 5.826 5.257 4.703 4.233 3.813 3.364 2.994 2.665 2.336 2.034 1.768 1.514 1.238 1.001 0.807 0.61 0.39 0.19 -0.017 -0.225 -0.383 -0.561 -0.748 -0.925 -1.112 -1.247 -1.38 -1.584 -1.725 -1.874 -1.95 -2.104 -2.26 -2.442 -2.551 -2.853 -2.924 -3.065 -3.208 -3.468 -3.601 -3.745 -3.896 -4.098 -4.372 -4.724 -5.418 -2 ,4162 ,TETRA ,17558940,Sat Nov 27 03:49:43 CET,Sat Nov 27 05:46:09 CET,0.0 1.116 1.462 1.715 1.936 2.115 2.283 2.428 2.679 2.794 2.898 2.897 3.163 3.246 3.409 3.568 3.723 3.799 3.947 4.097 4.317 4.449 4.581 4.761 4.918 5.074 5.228 5.376 5.577 5.774 5.94 6.128 6.299 6.458 6.625 6.792 6.955 7.139 7.323 7.497 7.691 7.897 8.099 8.295 8.512 8.767 8.995 9.143 9.198 8.99 8.371 7.508 6.706 5.962 5.26 4.635 4.114 3.637 3.223 2.822 2.475 2.148 1.815 1.477 1.167 0.88 0.567 0.292 0.054 -0.177 -0.419 -0.642 -0.857 -1.061 -1.238 -1.427 -1.614 -1.81 -2.012 -2.14 -2.27 -2.465 -2.598 -2.744 -2.817 -2.959 -3.109 -3.28 -3.373 -3.645 -3.645 -3.747 -3.857 -4.069 -4.189 -4.352 -4.531 -4.688 -4.895 -5.167 -6.029 -3 ,30373 ,TETRA ,17558941,Sat Nov 27 03:49:45 CET,Sat Nov 27 05:46:40 CET,0.0 0.832 1.126 1.353 1.547 1.747 1.914 2.045 2.295 2.408 2.516 2.537 2.796 2.882 3.051 3.206 3.347 3.419 3.562 3.706 3.911 4.032 4.166 4.372 4.566 4.74 4.89 5.02 5.166 5.312 5.452 5.608 5.756 5.905 6.072 6.248 6.416 6.59 6.768 6.943 7.135 7.361 7.596 7.788 7.997 8.198 8.364 8.506 8.565 8.429 7.987 7.235 6.474 5.782 5.109 4.466 3.926 3.422 3.004 2.603 2.244 1.913 1.591 1.289 1.001 0.732 0.466 0.225 0.011 -0.203 -0.423 -0.609 -0.8 -0.992 -1.135 -1.293 -1.482 -1.685 -1.898 -2.041 -2.182 -2.415 -2.578 -2.748 -2.838 -3.021 -3.207 -3.403 -3.507 -3.801 -3.841 -3.962 -4.088 -4.365 -4.517 -4.693 -4.872 -5.041 -5.201 -5.398 -5.951 -4 ,16991 ,TETRA ,17558942,Sat Nov 27 03:49:43 CET,Sat Nov 27 05:37:33 CET,0.0 3.126 3.471 3.73 3.954 4.143 4.308 4.443 4.682 4.806 4.927 4.97 5.256 5.35 5.527 5.696 5.861 5.947 6.112 6.262 6.463 6.595 6.727 6.919 7.101 7.254 7.4 7.544 7.725 7.896 8.069 8.287 8.478 8.65 8.848 9.055 9.246 9.447 9.659 9.874 10.091 10.335 10.607 10.867 11.119 11.337 11.513 11.652 11.751 11.67 11.21 10.444 9.641 8.9 8.229 7.609 7.045 6.507 6.062 5.643 5.292 4.949 4.607 4.28 3.987 3.728 3.441 3.175 2.955 2.734 2.486 2.276 2.069 1.866 1.705 1.537 1.371 1.201 1.013 0.876 0.736 0.512 0.362 0.218 0.145 -0.002 -0.159 -0.327 -0.418 -0.7 -0.704 -0.806 -0.911 -1.139 -1.26 -1.401 -1.561 -1.734 -1.94 -2.226 -3.026 -5 ,28531 ,TETRA ,17558943,Sat Nov 27 03:49:43 CET,Sat Nov 27 05:48:05 CET,0.0 1.28 1.61 1.863 2.067 2.243 2.407 2.566 2.835 2.953 3.058 3.086 3.378 3.466 3.655 3.849 4.01 4.084 4.236 4.373 4.554 4.669 4.779 4.936 5.084 5.229 5.349 5.454 5.604 5.758 5.9 6.064 6.219 6.367 6.528 6.684 6.834 7.011 7.22 7.427 7.623 7.83 8.048 8.235 8.408 8.565 8.697 8.796 8.798 8.641 8.162 7.347 6.55 5.818 5.18 4.613 4.083 3.573 3.148 2.751 2.404 2.062 1.742 1.451 1.134 0.824 0.519 0.26 0.027 -0.225 -0.474 -0.676 -0.891 -1.117 -1.304 -1.506 -1.703 -1.902 -2.109 -2.249 -2.402 -2.641 -2.804 -2.972 -3.054 -3.212 -3.389 -3.568 -3.656 -3.937 -3.964 -4.084 -4.217 -4.484 -4.628 -4.792 -4.979 -5.195 -5.445 -5.777 -7.166 -6 ,29640 ,TETRA ,17558944,Sat Nov 27 03:49:45 CET,Sat Nov 27 05:48:17 CET,0.0 1.724 2.089 2.361 2.568 2.739 2.892 3.047 3.318 3.436 3.544 3.562 3.832 3.926 4.11 4.275 4.424 4.496 4.653 4.804 4.993 5.105 5.203 5.348 5.484 5.616 5.757 5.901 6.085 6.246 6.394 6.565 6.722 6.879 7.061 7.249 7.409 7.585 7.788 7.992 8.175 8.362 8.576 8.776 8.98 9.181 9.378 9.531 9.604 9.507 9.03 8.305 7.565 6.86 6.25 5.68 5.143 4.659 4.245 3.821 3.456 3.142 2.847 2.555 2.274 2.019 1.751 1.511 1.31 1.106 0.898 0.72 0.525 0.316 0.152 -0.019 -0.196 -0.362 -0.542 -0.673 -0.803 -1.006 -1.141 -1.284 -1.361 -1.509 -1.664 -1.843 -1.936 -2.216 -2.249 -2.353 -2.466 -2.714 -2.843 -2.984 -3.128 -3.287 -3.516 -3.862 -4.745 -7 ,10451 ,TETRA ,17558945,Sat Nov 27 03:49:44 CET,Sat Nov 27 05:46:42 CET,0.0 1.176 1.582 1.896 2.125 2.307 2.474 2.632 2.912 3.032 3.14 3.179 3.442 3.539 3.733 3.913 4.075 4.149 4.296 4.43 4.618 4.744 4.873 5.039 5.18 5.322 5.458 5.595 5.773 5.934 6.082 6.266 6.421 6.555 6.728 6.921 7.085 7.251 7.434 7.625 7.81 8.012 8.236 8.44 8.642 8.83 8.999 9.116 9.183 9.085 8.634 7.861 7.073 6.346 5.668 5.062 4.559 4.076 3.652 3.228 2.854 2.526 2.203 1.885 1.593 1.348 1.095 0.852 0.633 0.394 0.165 -0.012 -0.205 -0.411 -0.568 -0.723 -0.886 -1.044 -1.215 -1.341 -1.463 -1.651 -1.785 -1.925 -1.999 -2.158 -2.336 -2.517 -2.609 -2.896 -2.904 -3.013 -3.128 -3.379 -3.505 -3.638 -3.806 -3.998 -4.205 -4.448 -4.924 -8 ,7860 ,TETRA ,17558946,Sat Nov 27 03:49:44 CET,Sat Nov 27 05:47:23 CET,0.0 0.799 1.143 1.417 1.646 1.871 2.076 2.257 2.558 2.68 2.794 2.839 3.13 3.227 3.405 3.56 3.705 3.78 3.922 4.04 4.199 4.31 4.419 4.572 4.726 4.876 5.025 5.177 5.375 5.56 5.731 5.928 6.116 6.287 6.457 6.64 6.815 7.004 7.182 7.355 7.557 7.789 8.03 8.267 8.516 8.748 8.965 9.105 9.208 9.21 8.859 8.179 7.473 6.768 6.101 5.465 4.911 4.424 3.993 3.567 3.221 2.898 2.58 2.269 1.985 1.735 1.48 1.237 1.007 0.787 0.574 0.395 0.218 0.045 -0.096 -0.249 -0.422 -0.62 -0.815 -0.935 -1.063 -1.277 -1.421 -1.569 -1.652 -1.816 -1.974 -2.157 -2.253 -2.536 -2.558 -2.67 -2.79 -3.065 -3.212 -3.362 -3.516 -3.669 -3.859 -4.188 -4.902 -9 ,15557 ,TETRA ,17558947,Sat Nov 27 03:50:40 CET,Sat Nov 27 05:47:28 CET,0.0 1.228 1.671 2.032 2.324 2.537 2.72 2.892 3.169 3.292 3.408 3.455 3.74 3.84 3.999 4.148 4.304 4.387 4.544 4.691 4.883 4.992 5.112 5.286 5.444 5.599 5.748 5.886 6.07 6.243 6.385 6.551 6.713 6.875 7.061 7.266 7.449 7.642 7.863 8.091 8.305 8.526 8.762 8.983 9.193 9.347 9.48 9.622 9.704 9.546 9.019 8.19 7.37 6.62 5.931 5.309 4.778 4.265 3.796 3.347 2.985 2.659 2.331 2.009 1.709 1.455 1.18 0.91 0.692 0.457 0.198 -0.011 -0.228 -0.456 -0.632 -0.8 -0.978 -1.169 -1.363 -1.5 -1.636 -1.828 -1.963 -2.123 -2.218 -2.403 -2.578 -2.758 -2.84 -3.107 -3.082 -3.175 -3.272 -3.478 -3.589 -3.718 -3.868 -4.024 -4.205 -4.422 -5.021 -10 ,2724 ,TETRA ,17558948,Sat Nov 27 03:50:42 CET,Sat Nov 27 05:49:28 CET,0.0 1.131 1.466 1.704 1.909 2.085 2.263 2.426 2.691 2.818 2.944 3.006 3.305 3.415 3.624 3.809 3.965 4.04 4.189 4.326 4.514 4.632 4.742 4.906 5.056 5.196 5.343 5.479 5.634 5.783 5.942 6.141 6.318 6.486 6.685 6.891 7.075 7.265 7.448 7.624 7.805 8.016 8.239 8.449 8.672 8.873 9.046 9.158 9.18 9.096 8.657 7.81 7.011 6.299 5.669 5.089 4.562 4.071 3.657 3.24 2.873 2.562 2.268 1.986 1.726 1.483 1.23 0.992 0.785 0.595 0.402 0.242 0.067 -0.124 -0.274 -0.434 -0.595 -0.759 -0.936 -1.05 -1.164 -1.367 -1.508 -1.647 -1.724 -1.884 -2.041 -2.22 -2.31 -2.594 -2.612 -2.719 -2.842 -3.092 -3.218 -3.342 -3.482 -3.647 -3.834 -4.084 -4.735 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_36.txt deleted file mode 100644 index 982715bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_36.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2623 ,TETRA ,17558949,Sat Nov 27 03:50:43 CET,Sat Nov 27 05:48:27 CET,0.0 1.791 2.361 2.787 3.126 3.434 3.685 3.91 4.349 4.534 4.688 4.786 5.09 5.208 5.44 5.664 5.878 5.98 6.183 6.376 6.649 6.832 6.996 7.22 7.434 7.636 7.819 7.995 8.208 8.376 8.55 8.784 9.006 9.214 9.441 9.672 9.867 10.087 10.332 10.572 10.803 11.05 11.348 11.605 11.87 12.142 12.371 12.57 12.746 12.88 12.771 12.149 11.42 10.815 10.249 9.657 9.15 8.681 8.291 7.916 7.58 7.276 6.981 6.706 6.44 6.188 5.925 5.704 5.519 5.32 5.119 4.941 4.746 4.546 4.391 4.241 4.08 3.903 3.725 3.603 3.469 3.269 3.129 2.982 2.909 2.755 2.586 2.419 2.334 2.064 2.087 1.989 1.864 1.605 1.459 1.3 1.146 0.975 0.76 0.462 -0.473 -2 ,18496 ,TETRA ,17558950,Sat Nov 27 03:50:43 CET,Sat Nov 27 05:47:31 CET,0.0 2.273 2.802 3.162 3.485 3.78 4.059 4.299 4.655 4.816 4.984 5.139 5.456 5.587 5.832 6.072 6.289 6.392 6.6 6.806 7.09 7.273 7.439 7.656 7.865 8.068 8.283 8.489 8.736 8.987 9.216 9.461 9.708 9.94 10.198 10.502 10.756 11.014 11.301 11.593 11.882 12.192 12.557 12.897 13.237 13.543 13.807 13.996 14.117 14.16 13.875 13.221 12.544 11.935 11.369 10.818 10.331 9.91 9.539 9.131 8.765 8.446 8.147 7.862 7.601 7.363 7.118 6.895 6.687 6.47 6.254 6.078 5.912 5.74 5.601 5.46 5.306 5.15 4.984 4.858 4.736 4.532 4.395 4.275 4.211 4.074 3.917 3.733 3.64 3.368 3.364 3.257 3.155 2.93 2.81 2.679 2.532 2.372 2.172 1.911 1.294 -3 ,19395 ,TETRA ,17558951,Sat Nov 27 03:51:41 CET,Sat Nov 27 05:32:27 CET,0.0 1.789 2.238 2.523 2.789 3.04 3.283 3.497 3.892 4.086 4.247 4.32 4.617 4.746 4.976 5.174 5.365 5.46 5.651 5.832 6.085 6.236 6.372 6.565 6.744 6.917 7.08 7.227 7.415 7.602 7.789 8.01 8.2 8.374 8.574 8.788 8.995 9.236 9.5 9.76 10.018 10.3 10.607 10.917 11.267 11.58 11.874 12.19 12.502 12.685 12.586 12.06 11.437 10.859 10.307 9.789 9.321 8.887 8.522 8.145 7.809 7.499 7.197 6.915 6.649 6.408 6.145 5.901 5.691 5.473 5.254 5.087 4.914 4.714 4.56 4.406 4.255 4.103 3.923 3.797 3.677 3.494 3.365 3.224 3.152 3.013 2.866 2.707 2.625 2.334 2.322 2.222 2.117 1.884 1.755 1.625 1.475 1.302 1.089 0.827 0.164 -4 ,23744 ,TETRA ,17558952,Sat Nov 27 03:51:41 CET,Sat Nov 27 05:46:38 CET,0.0 1.866 2.424 2.728 2.983 3.239 3.46 3.653 4.051 4.224 4.379 4.507 4.832 4.957 5.181 5.389 5.6 5.703 5.895 6.082 6.342 6.507 6.67 6.9 7.106 7.327 7.536 7.706 7.934 8.152 8.339 8.561 8.764 8.96 9.191 9.434 9.655 9.888 10.139 10.377 10.621 10.909 11.195 11.455 11.752 12.056 12.341 12.61 12.858 12.921 12.556 11.865 11.209 10.599 10.043 9.489 8.982 8.51 8.113 7.727 7.377 7.064 6.774 6.492 6.223 5.978 5.722 5.5 5.306 5.098 4.873 4.686 4.5 4.313 4.16 4.003 3.849 3.68 3.496 3.378 3.26 3.069 2.939 2.807 2.741 2.592 2.424 2.264 2.182 1.908 1.908 1.81 1.709 1.488 1.365 1.24 1.093 0.917 0.695 0.455 -0.117 -5 ,21052 ,TETRA ,17558953,Sat Nov 27 03:51:40 CET,Sat Nov 27 05:52:38 CET,0.0 2.299 2.777 3.167 3.444 3.643 3.879 4.109 4.46 4.596 4.723 4.794 5.098 5.206 5.404 5.601 5.791 5.89 6.094 6.282 6.54 6.707 6.866 7.087 7.28 7.467 7.65 7.82 8.034 8.225 8.426 8.672 8.894 9.112 9.35 9.607 9.833 10.061 10.31 10.575 10.831 11.134 11.482 11.77 12.079 12.408 12.773 13.12 13.373 13.441 13.212 12.598 11.912 11.302 10.76 10.238 9.738 9.27 8.878 8.476 8.105 7.782 7.493 7.225 6.962 6.714 6.45 6.221 6.026 5.824 5.61 5.437 5.264 5.079 4.929 4.759 4.594 4.439 4.27 4.151 4.033 3.832 3.694 3.557 3.484 3.324 3.152 2.986 2.902 2.631 2.609 2.498 2.396 2.195 2.08 1.948 1.807 1.656 1.453 1.209 0.709 -6 ,11102 ,TETRA ,17558954,Sat Nov 27 03:51:43 CET,Sat Nov 27 05:51:58 CET,0.0 1.387 1.872 2.278 2.606 2.862 3.072 3.244 3.562 3.694 3.819 3.929 4.237 4.36 4.578 4.806 5.037 5.14 5.32 5.498 5.758 5.92 6.073 6.265 6.447 6.631 6.824 7.003 7.214 7.42 7.615 7.852 8.085 8.295 8.527 8.774 8.994 9.257 9.552 9.83 10.066 10.343 10.701 11.003 11.275 11.492 11.697 11.916 12.089 12.09 11.749 11.069 10.416 9.793 9.228 8.71 8.241 7.811 7.426 7.038 6.708 6.409 6.113 5.823 5.553 5.308 5.046 4.819 4.625 4.419 4.205 4.022 3.833 3.639 3.494 3.344 3.184 3.023 2.83 2.693 2.577 2.403 2.273 2.132 2.059 1.908 1.758 1.609 1.532 1.262 1.252 1.143 1.027 0.807 0.692 0.565 0.403 0.221 0.021 -0.263 -0.828 -7 ,26627 ,TETRA ,17558955,Sat Nov 27 03:52:41 CET,Sat Nov 27 05:39:19 CET,0.0 2.588 3.113 3.52 3.867 4.134 4.368 4.584 4.983 5.166 5.337 5.479 5.791 5.916 6.175 6.417 6.628 6.733 6.941 7.135 7.387 7.548 7.715 7.934 8.136 8.343 8.547 8.742 9.005 9.247 9.475 9.741 9.989 10.234 10.481 10.74 10.981 11.235 11.496 11.751 11.994 12.234 12.536 12.859 13.179 13.52 13.832 14.101 14.432 14.717 14.717 14.226 13.568 12.972 12.479 11.998 11.527 11.082 10.688 10.287 9.952 9.668 9.392 9.12 8.863 8.614 8.356 8.145 7.955 7.743 7.518 7.337 7.151 6.947 6.797 6.648 6.49 6.335 6.175 6.056 5.929 5.735 5.607 5.467 5.397 5.25 5.097 4.934 4.847 4.577 4.558 4.452 4.343 4.106 3.98 3.84 3.688 3.514 3.33 3.131 2.582 -8 ,12885 ,TETRA ,17558956,Sat Nov 27 03:53:40 CET,Sat Nov 27 05:51:00 CET,0.0 1.791 2.321 2.66 2.908 3.15 3.369 3.581 3.966 4.149 4.316 4.406 4.711 4.832 5.067 5.288 5.489 5.579 5.74 5.898 6.124 6.267 6.4 6.6 6.795 6.974 7.145 7.313 7.543 7.762 7.952 8.182 8.4 8.596 8.815 9.066 9.326 9.603 9.882 10.186 10.474 10.733 11.042 11.358 11.696 12.01 12.245 12.421 12.536 12.529 12.192 11.538 10.938 10.33 9.737 9.204 8.719 8.293 7.932 7.545 7.21 6.899 6.595 6.312 6.056 5.811 5.568 5.356 5.156 4.952 4.743 4.564 4.372 4.176 4.029 3.875 3.715 3.539 3.35 3.221 3.09 2.885 2.741 2.592 2.517 2.369 2.211 2.053 1.965 1.69 1.689 1.586 1.478 1.26 1.139 0.995 0.839 0.667 0.435 0.13 -0.514 -9 ,27424 ,TETRA ,17558957,Sat Nov 27 03:53:43 CET,Sat Nov 27 05:51:19 CET,0.0 1.691 2.085 2.467 2.798 3.112 3.395 3.602 3.924 4.076 4.223 4.306 4.605 4.707 4.889 5.07 5.259 5.357 5.532 5.689 5.91 6.042 6.169 6.34 6.5 6.668 6.846 7.015 7.224 7.428 7.623 7.872 8.107 8.3 8.521 8.767 8.976 9.203 9.456 9.706 9.958 10.246 10.585 10.941 11.373 11.79 12.159 12.491 12.744 12.842 12.657 12.075 11.397 10.788 10.213 9.674 9.222 8.801 8.426 8.039 7.703 7.411 7.135 6.86 6.594 6.362 6.12 5.895 5.712 5.524 5.301 5.119 4.949 4.749 4.578 4.417 4.267 4.102 3.9 3.76 3.627 3.41 3.252 3.095 3.029 2.903 2.761 2.61 2.521 2.238 2.232 2.127 2.025 1.793 1.667 1.541 1.411 1.277 1.122 0.856 0.059 -10 ,8431 ,TETRA ,17558958,Sat Nov 27 03:53:40 CET,Sat Nov 27 05:50:31 CET,0.0 2.265 2.757 3.11 3.433 3.692 3.904 4.087 4.411 4.566 4.722 4.845 5.144 5.268 5.536 5.782 5.999 6.101 6.307 6.491 6.729 6.879 7.031 7.257 7.475 7.684 7.882 8.062 8.278 8.484 8.684 8.925 9.143 9.351 9.579 9.837 10.068 10.308 10.559 10.798 11.041 11.282 11.578 11.882 12.159 12.424 12.674 12.871 13.02 13.053 12.789 12.167 11.487 10.855 10.293 9.797 9.314 8.856 8.473 8.076 7.734 7.434 7.143 6.864 6.608 6.368 6.12 5.901 5.693 5.486 5.282 5.112 4.93 4.73 4.58 4.427 4.262 4.096 3.916 3.784 3.65 3.453 3.322 3.184 3.109 2.952 2.79 2.621 2.543 2.272 2.252 2.14 2.024 1.785 1.657 1.519 1.379 1.213 1.009 0.742 0.019 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_37.txt deleted file mode 100644 index 359c0ace..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4650 ,TETRA ,17558959,Sat Nov 27 03:53:43 CET,Sat Nov 27 05:50:51 CET,0.0 3.308 3.867 4.286 4.646 4.918 5.158 5.378 5.77 5.942 6.091 6.175 6.485 6.625 6.869 7.093 7.316 7.415 7.593 7.777 8.026 8.175 8.335 8.584 8.816 9.029 9.215 9.395 9.631 9.841 10.038 10.267 10.464 10.645 10.868 11.109 11.324 11.544 11.758 11.972 12.219 12.5 12.787 13.059 13.337 13.624 13.881 14.044 14.079 13.937 13.434 12.521 11.708 10.932 10.221 9.593 8.999 8.452 8.02 7.568 7.154 6.801 6.478 6.175 5.886 5.613 5.339 5.076 4.819 4.556 4.295 4.094 3.896 3.679 3.507 3.327 3.135 2.944 2.738 2.589 2.431 2.193 2.035 1.861 1.777 1.604 1.419 1.229 1.127 0.831 0.787 0.666 0.534 0.262 0.107 -0.064 -0.233 -0.4 -0.606 -0.876 -1.551 -2 ,9136 ,TETRA ,17558960,Sat Nov 27 03:54:41 CET,Sat Nov 27 05:59:36 CET,0.0 1.998 2.487 2.844 3.131 3.376 3.597 3.785 4.146 4.335 4.512 4.633 4.948 5.069 5.296 5.507 5.712 5.822 6.037 6.214 6.449 6.612 6.761 6.963 7.178 7.387 7.578 7.759 7.977 8.17 8.353 8.573 8.779 8.977 9.201 9.447 9.683 9.959 10.249 10.528 10.806 11.094 11.398 11.673 11.952 12.251 12.558 12.775 12.902 12.826 12.301 11.362 10.434 9.598 8.852 8.161 7.558 7.019 6.554 6.077 5.671 5.328 4.995 4.66 4.342 4.069 3.802 3.559 3.335 3.102 2.869 2.667 2.448 2.213 2.041 1.866 1.685 1.506 1.314 1.178 1.045 0.852 0.705 0.535 0.445 0.244 0.037 -0.156 -0.252 -0.548 -0.597 -0.723 -0.861 -1.194 -1.367 -1.544 -1.738 -1.937 -2.168 -2.427 -3.022 -3 ,25010 ,TETRA ,17558961,Sat Nov 27 03:54:41 CET,Sat Nov 27 05:54:27 CET,0.0 1.975 2.551 2.894 3.163 3.447 3.705 3.92 4.284 4.447 4.616 4.753 5.065 5.198 5.435 5.646 5.837 5.923 6.098 6.265 6.507 6.665 6.812 7.036 7.267 7.483 7.678 7.858 8.093 8.314 8.502 8.715 8.916 9.107 9.334 9.596 9.861 10.128 10.381 10.657 10.938 11.228 11.549 11.846 12.154 12.454 12.75 13.022 13.182 13.115 12.648 11.797 10.954 10.154 9.431 8.758 8.179 7.667 7.216 6.732 6.3 5.912 5.549 5.205 4.876 4.575 4.264 3.999 3.772 3.534 3.292 3.088 2.872 2.655 2.487 2.303 2.114 1.919 1.716 1.578 1.432 1.201 1.033 0.866 0.771 0.564 0.363 0.158 0.056 -0.242 -0.285 -0.403 -0.527 -0.798 -0.935 -1.083 -1.256 -1.438 -1.669 -1.934 -2.674 -4 ,3067 ,TETRA ,17558962,Sat Nov 27 03:54:40 CET,Sat Nov 27 05:52:43 CET,0.0 1.415 1.816 2.139 2.403 2.638 2.858 3.07 3.439 3.598 3.751 3.867 4.168 4.283 4.54 4.788 5.014 5.122 5.322 5.522 5.794 5.963 6.132 6.369 6.582 6.79 6.996 7.177 7.396 7.602 7.794 8.03 8.266 8.482 8.734 9.016 9.265 9.517 9.771 10.045 10.321 10.593 10.867 11.11 11.392 11.635 11.857 12.044 12.041 11.85 11.427 10.565 9.541 8.607 7.86 7.139 6.488 5.903 5.421 4.933 4.511 4.149 3.782 3.431 3.099 2.784 2.465 2.183 1.929 1.66 1.37 1.131 0.896 0.648 0.44 0.215 -0.024 -0.263 -0.507 -0.681 -0.856 -1.127 -1.327 -1.539 -1.64 -1.846 -2.077 -2.334 -2.467 -2.787 -2.872 -3.01 -3.148 -3.486 -3.678 -3.874 -4.098 -4.365 -4.662 -5.045 -6.412 -5 ,19172 ,TETRA ,17558963,Sat Nov 27 03:54:43 CET,Sat Nov 27 05:52:14 CET,0.0 2.256 2.691 2.995 3.221 3.453 3.642 3.807 4.145 4.3 4.441 4.523 4.813 4.917 5.131 5.344 5.527 5.607 5.769 5.935 6.164 6.302 6.456 6.665 6.829 6.981 7.132 7.273 7.453 7.631 7.803 8.017 8.204 8.382 8.602 8.832 9.045 9.273 9.496 9.719 9.942 10.19 10.472 10.726 11.015 11.29 11.51 11.654 11.707 11.539 10.945 10.022 9.141 8.318 7.599 6.956 6.351 5.81 5.336 4.868 4.493 4.15 3.819 3.502 3.194 2.915 2.635 2.376 2.139 1.898 1.633 1.413 1.192 0.958 0.781 0.596 0.406 0.21 -0.011 -0.166 -0.328 -0.579 -0.74 -0.894 -0.977 -1.152 -1.344 -1.558 -1.667 -1.971 -2.03 -2.158 -2.274 -2.523 -2.654 -2.805 -2.985 -3.181 -3.414 -3.727 -4.529 -6 ,4517 ,TETRA ,17558964,Sat Nov 27 03:55:42 CET,Sat Nov 27 05:52:29 CET,0.0 2.272 2.642 2.941 3.205 3.414 3.607 3.778 4.078 4.213 4.359 4.457 4.731 4.842 5.058 5.243 5.419 5.514 5.701 5.871 6.139 6.303 6.434 6.63 6.817 6.989 7.157 7.327 7.545 7.743 7.92 8.11 8.294 8.478 8.654 8.834 9.025 9.233 9.438 9.639 9.829 10.029 10.248 10.444 10.644 10.822 10.966 11.031 10.97 10.708 9.998 8.889 7.885 7.002 6.223 5.524 4.915 4.374 3.909 3.412 2.987 2.638 2.314 2.0 1.71 1.456 1.186 0.923 0.689 0.456 0.227 0.033 -0.182 -0.401 -0.565 -0.742 -0.924 -1.105 -1.301 -1.437 -1.583 -1.809 -1.944 -2.084 -2.171 -2.354 -2.55 -2.804 -2.948 -3.29 -3.408 -3.573 -3.742 -4.074 -4.248 -4.458 -4.712 -4.975 -5.288 -5.752 -7.254 -7 ,22577 ,TETRA ,17558965,Sat Nov 27 03:55:41 CET,Sat Nov 27 05:53:28 CET,0.0 1.548 2.006 2.32 2.602 2.829 3.037 3.238 3.582 3.738 3.903 4.072 4.403 4.535 4.797 5.045 5.261 5.363 5.56 5.744 5.993 6.134 6.27 6.485 6.693 6.893 7.097 7.295 7.554 7.8 8.016 8.267 8.495 8.702 8.944 9.219 9.465 9.689 9.907 10.13 10.328 10.541 10.802 11.047 11.307 11.563 11.849 12.105 12.16 11.922 11.286 10.328 9.388 8.526 7.758 7.049 6.436 5.9 5.419 4.92 4.493 4.111 3.756 3.419 3.1 2.813 2.523 2.268 2.039 1.789 1.532 1.336 1.128 0.908 0.746 0.583 0.41 0.214 0.004 -0.135 -0.276 -0.492 -0.639 -0.793 -0.87 -1.029 -1.185 -1.342 -1.434 -1.727 -1.745 -1.858 -1.975 -2.234 -2.375 -2.516 -2.677 -2.883 -3.181 -3.548 -4.533 -8 ,22591 ,TETRA ,17558966,Sat Nov 27 03:55:42 CET,Sat Nov 27 05:53:17 CET,0.0 1.59 1.939 2.197 2.42 2.64 2.849 3.04 3.354 3.49 3.611 3.679 3.973 4.094 4.326 4.544 4.737 4.824 4.994 5.157 5.382 5.532 5.671 5.863 6.051 6.234 6.395 6.548 6.754 6.941 7.106 7.306 7.501 7.683 7.875 8.086 8.294 8.511 8.724 8.939 9.163 9.402 9.666 9.889 10.119 10.362 10.587 10.741 10.833 10.786 10.345 9.464 8.579 7.74 6.998 6.322 5.719 5.178 4.686 4.186 3.766 3.392 3.038 2.698 2.388 2.114 1.821 1.566 1.332 1.083 0.827 0.611 0.383 0.137 -0.058 -0.259 -0.45 -0.645 -0.85 -0.996 -1.149 -1.348 -1.492 -1.662 -1.747 -1.933 -2.12 -2.32 -2.432 -2.73 -2.787 -2.903 -3.02 -3.309 -3.473 -3.656 -3.859 -4.098 -4.423 -4.814 -5.575 -9 ,7172 ,TETRA ,17558967,Sat Nov 27 03:56:39 CET,Sat Nov 27 05:54:18 CET,0.0 2.516 3.005 3.354 3.615 3.825 4.022 4.198 4.512 4.677 4.844 4.989 5.326 5.482 5.778 6.044 6.277 6.382 6.578 6.766 7.037 7.208 7.365 7.581 7.796 8.013 8.217 8.412 8.646 8.869 9.085 9.349 9.618 9.843 10.069 10.326 10.569 10.814 11.069 11.321 11.56 11.823 12.131 12.412 12.71 12.977 13.186 13.359 13.45 13.375 12.972 12.189 11.37 10.574 9.81 9.089 8.482 7.971 7.526 7.066 6.679 6.347 6.019 5.684 5.364 5.054 4.726 4.449 4.223 3.999 3.772 3.576 3.362 3.123 2.924 2.735 2.556 2.368 2.154 2.005 1.86 1.635 1.481 1.319 1.232 1.048 0.855 0.631 0.521 0.225 0.168 0.043 -0.079 -0.343 -0.494 -0.667 -0.858 -1.055 -1.293 -1.59 -2.415 -10 ,30441 ,TETRA ,17558968,Sat Nov 27 03:56:42 CET,Sat Nov 27 05:53:43 CET,0.0 2.171 2.654 2.992 3.264 3.485 3.683 3.867 4.185 4.324 4.459 4.571 4.885 5.009 5.233 5.453 5.655 5.742 5.923 6.099 6.357 6.516 6.674 6.91 7.108 7.3 7.482 7.633 7.826 8.024 8.205 8.408 8.608 8.801 9.024 9.275 9.491 9.726 9.991 10.257 10.514 10.76 10.976 11.179 11.391 11.587 11.794 11.941 11.978 11.852 11.354 10.447 9.501 8.619 7.841 7.155 6.569 6.028 5.553 5.1 4.713 4.344 3.992 3.663 3.343 3.061 2.791 2.552 2.335 2.098 1.845 1.639 1.432 1.213 1.031 0.841 0.656 0.471 0.279 0.14 -0.011 -0.237 -0.404 -0.589 -0.679 -0.852 -1.054 -1.27 -1.376 -1.682 -1.714 -1.832 -1.962 -2.244 -2.398 -2.548 -2.697 -2.902 -3.173 -3.49 -4.633 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_64.txt deleted file mode 100644 index 1cb9b5ea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_33_64.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14521 ,KEBNE ,17024786,Wed Dec 22 11:10:50 CET,Wed Dec 22 12:50:30 CET,0.0 3.033 3.673 4.1 4.44 4.722 4.978 5.217 5.628 5.812 5.973 6.089 6.416 6.568 6.826 7.066 7.294 7.401 7.602 7.787 8.06 8.238 8.408 8.639 8.851 9.05 9.228 9.411 9.656 9.905 10.162 10.456 10.699 10.942 11.244 11.533 11.778 12.036 12.331 12.616 12.854 13.096 13.372 13.646 13.892 14.108 14.335 14.51 14.546 14.353 13.763 12.738 11.684 10.701 9.83 9.109 8.462 7.851 7.313 6.746 6.259 5.826 5.417 5.026 4.66 4.346 4.035 3.747 3.49 3.238 2.972 2.738 2.49 2.229 2.031 1.835 1.643 1.435 1.213 1.063 0.905 0.664 0.493 0.307 0.213 0.021 -0.182 -0.395 -0.517 -0.836 -0.903 -1.038 -1.179 -1.49 -1.679 -1.895 -2.103 -2.359 -2.715 -3.15 -5.179 -2 ,28226 ,KEBNE ,17024787,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:51:25 CET,0.0 6.119 6.783 7.165 7.491 7.795 8.056 8.297 8.713 8.9 9.065 9.201 9.533 9.688 9.973 10.24 10.475 10.575 10.758 10.941 11.209 11.367 11.517 11.739 11.968 12.188 12.382 12.574 12.825 13.069 13.285 13.517 13.73 13.932 14.182 14.469 14.721 14.973 15.236 15.5 15.767 16.061 16.356 16.587 16.877 17.175 17.355 17.449 17.495 17.381 16.794 15.777 14.771 13.871 13.06 12.314 11.655 11.063 10.569 10.059 9.612 9.224 8.861 8.518 8.193 7.864 7.48 7.157 6.895 6.628 6.352 6.116 5.874 5.615 5.41 5.209 5.001 4.775 4.53 4.375 4.226 3.992 3.819 3.632 3.532 3.329 3.134 2.914 2.794 2.494 2.432 2.296 2.158 1.867 1.713 1.536 1.334 1.094 0.76 0.287 -2.183 -3 ,9333 ,KEBNE ,17024788,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:50:43 CET,0.0 3.644 4.247 4.649 4.969 5.283 5.55 5.806 6.255 6.432 6.605 6.778 7.106 7.244 7.512 7.754 8.0 8.125 8.361 8.574 8.854 9.035 9.207 9.452 9.68 9.894 10.101 10.275 10.476 10.683 10.896 11.151 11.406 11.656 11.903 12.151 12.389 12.654 12.923 13.176 13.429 13.702 13.975 14.221 14.457 14.639 14.815 14.932 14.962 14.848 14.293 13.314 12.349 11.435 10.621 9.872 9.19 8.573 8.02 7.461 6.993 6.573 6.159 5.785 5.436 5.115 4.788 4.481 4.216 3.953 3.682 3.456 3.222 2.975 2.783 2.587 2.377 2.159 1.939 1.787 1.642 1.412 1.238 1.063 0.973 0.782 0.578 0.356 0.245 -0.056 -0.112 -0.246 -0.393 -0.7 -0.851 -1.023 -1.253 -1.494 -1.794 -2.185 -3.946 -4 ,18164 ,KEBNE ,17024789,Wed Dec 22 11:10:50 CET,Wed Dec 22 12:51:30 CET,0.0 5.058 5.805 6.341 6.782 7.079 7.282 7.498 7.909 8.096 8.266 8.389 8.721 8.885 9.193 9.475 9.71 9.808 9.996 10.17 10.411 10.582 10.748 10.992 11.214 11.402 11.575 11.748 11.968 12.173 12.386 12.663 12.911 13.134 13.401 13.675 13.929 14.199 14.461 14.73 14.995 15.273 15.587 15.883 16.185 16.451 16.657 16.772 16.778 16.585 15.817 14.521 13.269 12.177 11.27 10.493 9.774 9.101 8.542 8.007 7.536 7.117 6.721 6.333 5.965 5.634 5.301 5.021 4.783 4.526 4.253 4.026 3.797 3.564 3.377 3.18 2.98 2.775 2.557 2.41 2.263 2.025 1.854 1.673 1.578 1.383 1.177 0.961 0.85 0.545 0.49 0.369 0.238 -0.081 -0.256 -0.45 -0.69 -0.945 -1.243 -1.643 -2.879 -5 ,21448 ,KEBNE ,17024790,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:51:46 CET,0.0 6.158 6.898 7.384 7.755 8.102 8.417 8.672 9.075 9.253 9.423 9.543 9.844 9.974 10.222 10.436 10.656 10.771 11.002 11.201 11.465 11.623 11.766 11.999 12.214 12.396 12.569 12.74 12.944 13.133 13.316 13.52 13.723 13.908 14.103 14.327 14.541 14.78 15.02 15.281 15.556 15.821 16.099 16.321 16.542 16.791 16.999 17.12 17.147 16.982 16.383 15.367 14.419 13.495 12.666 11.943 11.285 10.656 10.098 9.549 9.101 8.704 8.307 7.948 7.624 7.305 6.979 6.701 6.459 6.201 5.92 5.688 5.447 5.189 4.987 4.782 4.575 4.351 4.114 3.957 3.792 3.53 3.357 3.181 3.087 2.891 2.689 2.471 2.357 2.044 1.951 1.803 1.653 1.34 1.168 0.961 0.714 0.422 0.077 -0.343 -1.612 -7 ,26927 ,KEBNE ,17024792,Wed Dec 22 11:10:49 CET,Wed Dec 22 12:51:14 CET,0.0 4.913 5.637 6.079 6.439 6.745 6.997 7.235 7.74 8.006 8.228 8.409 8.753 8.907 9.183 9.465 9.742 9.872 10.132 10.364 10.651 10.827 11.009 11.273 11.513 11.734 11.927 12.109 12.36 12.597 12.822 13.102 13.356 13.608 13.899 14.191 14.452 14.724 15.001 15.27 15.52 15.776 16.062 16.301 16.544 16.799 16.996 17.133 17.164 16.938 16.19 15.003 13.926 12.972 12.156 11.413 10.74 10.124 9.581 9.045 8.589 8.162 7.747 7.366 7.002 6.654 6.301 6.008 5.748 5.472 5.194 4.968 4.739 4.51 4.332 4.145 3.943 3.731 3.509 3.355 3.201 2.945 2.761 2.585 2.497 2.302 2.098 1.887 1.775 1.47 1.415 1.271 1.13 0.862 0.697 0.491 0.251 -0.019 -0.334 -0.718 -1.745 -8 ,22175 ,KEBNE ,17024793,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:53:15 CET,0.0 3.408 4.075 4.445 4.748 5.025 5.274 5.517 5.96 6.157 6.347 6.538 6.887 7.052 7.35 7.605 7.848 7.96 8.168 8.371 8.661 8.86 9.047 9.29 9.525 9.746 9.94 10.124 10.359 10.577 10.783 11.029 11.265 11.478 11.718 11.991 12.242 12.517 12.819 13.131 13.43 13.727 14.069 14.37 14.656 14.925 15.205 15.481 15.577 15.415 14.818 13.765 12.769 11.867 11.027 10.27 9.635 9.034 8.508 7.992 7.515 7.093 6.718 6.372 6.042 5.723 5.403 5.127 4.889 4.646 4.392 4.179 3.961 3.735 3.553 3.361 3.17 2.973 2.779 2.641 2.496 2.277 2.117 1.959 1.878 1.699 1.513 1.313 1.197 0.897 0.848 0.717 0.579 0.287 0.105 -0.077 -0.264 -0.519 -0.849 -1.275 -2.849 -9 ,30106 ,KEBNE ,17024794,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:53:02 CET,0.0 7.545 8.026 8.39 8.72 9.015 9.313 9.606 10.091 10.303 10.48 10.598 10.906 11.036 11.296 11.535 11.744 11.846 12.064 12.261 12.503 12.652 12.81 13.049 13.276 13.488 13.7 13.915 14.189 14.446 14.669 14.923 15.183 15.423 15.693 15.993 16.284 16.578 16.837 17.087 17.358 17.663 17.958 18.216 18.509 18.799 19.067 19.225 19.245 19.016 18.242 17.085 16.013 15.106 14.275 13.504 12.855 12.261 11.734 11.194 10.741 10.325 9.905 9.516 9.156 8.839 8.521 8.23 7.953 7.657 7.359 7.121 6.878 6.626 6.429 6.221 6.006 5.782 5.556 5.408 5.246 4.976 4.784 4.596 4.504 4.298 4.094 3.876 3.759 3.455 3.416 3.281 3.134 2.785 2.595 2.404 2.17 1.907 1.617 1.181 -1.154 -10 ,17400 ,KEBNE ,17024795,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:52:13 CET,0.0 3.756 4.398 4.861 5.252 5.633 5.977 6.227 6.659 6.873 7.071 7.275 7.621 7.775 8.063 8.365 8.657 8.797 9.054 9.288 9.647 9.876 10.085 10.382 10.67 10.94 11.191 11.41 11.641 11.844 12.032 12.284 12.554 12.804 13.075 13.36 13.614 13.864 14.111 14.382 14.66 14.966 15.332 15.627 15.924 16.251 16.572 16.787 16.863 16.724 16.094 15.01 14.013 13.157 12.4 11.66 10.98 10.383 9.874 9.359 8.921 8.52 8.132 7.776 7.438 7.13 6.814 6.528 6.282 6.028 5.766 5.549 5.322 5.095 4.922 4.74 4.556 4.36 4.161 4.029 3.88 3.618 3.422 3.226 3.126 2.927 2.738 2.529 2.408 2.1 2.048 1.919 1.784 1.492 1.306 1.105 0.885 0.654 0.407 0.034 -1.894 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_35_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_35_36.txt deleted file mode 100644 index 94a0fa82..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_35_36.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31384 ,TETRA ,17558969,Sat Nov 27 03:56:40 CET,Sat Nov 27 05:54:15 CET,0.0 1.675 2.167 2.516 2.744 2.947 3.12 3.271 3.556 3.701 3.84 3.904 4.2 4.31 4.523 4.717 4.903 4.999 5.177 5.344 5.572 5.711 5.849 6.06 6.26 6.44 6.61 6.777 6.999 7.211 7.411 7.648 7.881 8.103 8.348 8.625 8.895 9.19 9.498 9.796 10.124 10.493 10.891 11.298 11.762 12.221 12.714 13.267 13.807 14.268 14.661 14.733 14.548 14.282 13.994 13.702 13.394 13.063 12.76 12.47 12.212 11.976 11.761 11.553 11.351 11.165 10.968 10.781 10.616 10.437 10.254 10.1 9.93 9.757 9.614 9.462 9.315 9.163 9.01 8.903 8.786 8.609 8.48 8.352 8.29 8.153 8.002 7.825 7.74 7.472 7.489 7.398 7.297 7.077 6.95 6.812 6.666 6.49 6.287 6.024 5.361 -2 ,8097 ,TETRA ,17558970,Sat Nov 27 03:57:41 CET,Sat Nov 27 05:57:25 CET,0.0 1.81 2.241 2.555 2.857 3.109 3.33 3.532 3.842 3.971 4.089 4.141 4.448 4.567 4.787 5.002 5.2 5.29 5.465 5.635 5.873 6.013 6.148 6.36 6.565 6.766 6.956 7.141 7.371 7.575 7.771 8.017 8.248 8.478 8.758 9.068 9.35 9.636 9.942 10.259 10.585 10.926 11.279 11.606 12.002 12.423 12.846 13.327 13.846 14.321 14.813 14.956 14.763 14.526 14.285 14.028 13.731 13.411 13.141 12.846 12.554 12.293 12.038 11.772 11.518 11.296 11.062 10.865 10.704 10.525 10.303 10.112 9.926 9.737 9.604 9.469 9.313 9.154 8.997 8.888 8.775 8.578 8.429 8.276 8.193 8.024 7.858 7.68 7.594 7.316 7.335 7.242 7.14 6.909 6.791 6.671 6.533 6.366 6.17 5.905 5.309 -3 ,25387 ,TETRA ,17558971,Sat Nov 27 03:57:41 CET,Sat Nov 27 05:55:34 CET,0.0 1.378 1.714 1.972 2.186 2.402 2.618 2.814 3.114 3.24 3.379 3.475 3.803 3.92 4.137 4.366 4.57 4.668 4.865 5.043 5.285 5.436 5.583 5.799 6.015 6.214 6.395 6.569 6.786 6.975 7.173 7.419 7.648 7.874 8.134 8.419 8.681 8.981 9.297 9.609 9.953 10.328 10.739 11.112 11.551 12.067 12.621 13.232 13.864 14.451 14.907 14.932 14.621 14.259 13.952 13.661 13.362 13.08 12.84 12.574 12.315 12.073 11.849 11.635 11.422 11.221 11.012 10.817 10.653 10.486 10.304 10.161 10.015 9.86 9.739 9.617 9.49 9.355 9.205 9.094 8.989 8.821 8.698 8.572 8.508 8.369 8.217 8.049 7.958 7.681 7.715 7.63 7.538 7.318 7.192 7.072 6.956 6.832 6.657 6.388 5.61 -4 ,16561 ,TETRA ,17558972,Sat Nov 27 03:57:42 CET,Sat Nov 27 05:56:51 CET,0.0 1.576 2.064 2.451 2.747 2.992 3.219 3.432 3.811 3.985 4.149 4.258 4.592 4.738 5.007 5.271 5.51 5.624 5.839 6.044 6.353 6.557 6.751 6.989 7.194 7.393 7.577 7.756 7.99 8.21 8.425 8.679 8.914 9.141 9.411 9.699 9.958 10.233 10.512 10.811 11.14 11.492 11.886 12.293 12.735 13.198 13.698 14.244 14.869 15.448 15.882 15.979 15.857 15.616 15.313 15.004 14.712 14.428 14.169 13.888 13.628 13.382 13.136 12.895 12.695 12.499 12.272 12.083 11.926 11.765 11.593 11.449 11.296 11.13 11.0 10.872 10.733 10.596 10.445 10.331 10.225 10.073 9.967 9.84 9.771 9.627 9.476 9.324 9.234 8.959 8.982 8.892 8.778 8.532 8.407 8.277 8.126 7.965 7.767 7.535 6.789 -5 ,21003 ,TETRA ,17558973,Sat Nov 27 03:57:41 CET,Sat Nov 27 05:50:18 CET,0.0 1.5 1.983 2.284 2.53 2.772 2.978 3.151 3.517 3.676 3.819 3.918 4.246 4.373 4.615 4.85 5.066 5.167 5.363 5.55 5.803 5.956 6.102 6.314 6.52 6.732 6.926 7.102 7.321 7.515 7.702 7.941 8.156 8.357 8.595 8.857 9.112 9.38 9.658 9.965 10.304 10.703 11.142 11.55 12.046 12.581 13.137 13.663 14.193 14.787 15.257 15.292 15.091 14.853 14.598 14.27 13.971 13.697 13.433 13.178 12.947 12.716 12.49 12.278 12.078 11.888 11.691 11.515 11.355 11.183 11.003 10.846 10.684 10.519 10.396 10.273 10.136 9.982 9.817 9.716 9.616 9.448 9.335 9.219 9.151 9.009 8.871 8.704 8.619 8.356 8.37 8.27 8.161 7.94 7.823 7.694 7.551 7.364 7.128 6.821 5.906 -6 ,25301 ,TETRA ,17558974,Sat Nov 27 03:58:37 CET,Sat Nov 27 05:58:35 CET,0.0 1.499 1.987 2.3 2.558 2.785 2.971 3.136 3.452 3.604 3.737 3.772 4.065 4.176 4.394 4.581 4.751 4.841 5.017 5.185 5.426 5.573 5.711 5.915 6.112 6.305 6.491 6.669 6.91 7.139 7.353 7.603 7.852 8.094 8.357 8.659 8.961 9.248 9.528 9.847 10.187 10.564 10.988 11.387 11.835 12.327 12.857 13.399 13.977 14.56 15.076 15.225 15.104 14.902 14.63 14.295 13.997 13.734 13.468 13.19 12.95 12.717 12.493 12.286 12.087 11.909 11.718 11.52 11.348 11.169 10.977 10.823 10.669 10.507 10.388 10.266 10.123 9.974 9.818 9.702 9.585 9.411 9.293 9.174 9.117 9.002 8.868 8.717 8.638 8.361 8.359 8.252 8.141 7.923 7.804 7.68 7.55 7.403 7.206 6.951 6.37 -7 ,12666 ,TETRA ,17558975,Sat Nov 27 03:58:37 CET,Sat Nov 27 05:56:16 CET,0.0 1.376 1.885 2.241 2.561 2.848 3.123 3.364 3.765 3.948 4.097 4.154 4.455 4.565 4.773 4.967 5.144 5.233 5.411 5.584 5.828 5.986 6.129 6.322 6.518 6.71 6.89 7.067 7.311 7.537 7.757 8.028 8.277 8.526 8.805 9.098 9.381 9.676 9.99 10.342 10.69 11.019 11.375 11.725 12.136 12.584 13.071 13.662 14.294 14.816 15.216 15.205 14.956 14.634 14.312 13.976 13.632 13.319 13.047 12.748 12.493 12.251 11.996 11.764 11.553 11.369 11.183 11.002 10.827 10.646 10.467 10.323 10.177 10.023 9.89 9.756 9.621 9.482 9.342 9.231 9.111 8.94 8.823 8.703 8.64 8.484 8.312 8.142 8.064 7.794 7.806 7.707 7.602 7.365 7.223 7.072 6.921 6.748 6.575 6.357 5.498 -8 ,20326 ,TETRA ,17558976,Sat Nov 27 03:58:39 CET,Sat Nov 27 05:56:34 CET,0.0 1.336 1.757 2.06 2.294 2.492 2.662 2.823 3.114 3.252 3.382 3.435 3.734 3.849 4.074 4.28 4.466 4.551 4.721 4.889 5.132 5.285 5.44 5.676 5.892 6.098 6.293 6.472 6.697 6.911 7.125 7.374 7.61 7.834 8.075 8.35 8.618 8.905 9.21 9.534 9.873 10.252 10.661 11.063 11.52 12.0 12.517 13.024 13.539 14.045 14.541 14.653 14.49 14.236 13.942 13.651 13.369 13.1 12.857 12.586 12.337 12.125 11.909 11.684 11.468 11.268 11.055 10.87 10.71 10.532 10.353 10.215 10.066 9.9 9.774 9.64 9.497 9.351 9.194 9.093 8.978 8.795 8.674 8.542 8.478 8.352 8.205 8.046 7.972 7.704 7.706 7.61 7.501 7.245 7.111 6.99 6.859 6.681 6.472 6.213 5.534 -9 ,25192 ,TETRA ,17558977,Sat Nov 27 03:58:39 CET,Sat Nov 27 05:59:01 CET,0.0 1.533 1.974 2.319 2.624 2.854 3.05 3.248 3.596 3.733 3.855 3.906 4.206 4.328 4.55 4.751 4.956 5.053 5.238 5.414 5.661 5.817 5.97 6.185 6.384 6.585 6.783 6.969 7.207 7.44 7.662 7.927 8.161 8.389 8.653 8.934 9.203 9.5 9.845 10.186 10.519 10.9 11.343 11.788 12.258 12.763 13.342 13.931 14.505 15.101 15.677 15.778 15.567 15.291 14.959 14.619 14.346 14.086 13.818 13.514 13.253 13.033 12.823 12.617 12.424 12.245 12.053 11.886 11.746 11.579 11.381 11.23 11.089 10.93 10.793 10.66 10.534 10.402 10.239 10.121 10.007 9.825 9.707 9.586 9.517 9.364 9.189 9.018 8.935 8.659 8.656 8.55 8.441 8.203 8.086 7.969 7.839 7.698 7.534 7.276 6.644 -10 ,114 ,TETRA ,17558978,Sat Nov 27 03:58:41 CET,Sat Nov 27 05:58:59 CET,0.0 1.212 1.565 1.869 2.102 2.32 2.527 2.721 3.075 3.239 3.4 3.509 3.828 3.951 4.177 4.392 4.6 4.694 4.867 5.03 5.294 5.481 5.654 5.892 6.107 6.32 6.523 6.704 6.937 7.167 7.396 7.683 7.97 8.221 8.495 8.811 9.091 9.417 9.789 10.149 10.497 10.856 11.243 11.643 12.089 12.555 13.098 13.722 14.38 14.945 15.42 15.571 15.39 15.081 14.748 14.393 14.077 13.808 13.529 13.205 12.933 12.695 12.463 12.246 12.046 11.856 11.667 11.489 11.32 11.136 10.94 10.777 10.598 10.409 10.268 10.126 9.98 9.827 9.671 9.564 9.445 9.258 9.136 9.002 8.929 8.79 8.635 8.464 8.376 8.095 8.083 7.982 7.878 7.643 7.513 7.376 7.22 7.025 6.771 6.432 5.531 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_35_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_35_37.txt deleted file mode 100644 index 1e5cdcd2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_35_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31643 ,TETRA ,17558979,Sat Nov 27 03:59:39 CET,Sat Nov 27 05:59:02 CET,0.0 1.336 1.81 2.149 2.416 2.626 2.834 3.038 3.365 3.527 3.696 3.811 4.134 4.263 4.507 4.724 4.939 5.045 5.245 5.438 5.7 5.864 6.025 6.259 6.487 6.706 6.909 7.101 7.359 7.605 7.836 8.107 8.353 8.597 8.867 9.144 9.411 9.714 10.026 10.338 10.66 11.006 11.396 11.77 12.187 12.622 13.084 13.52 13.889 14.228 14.363 14.064 13.638 13.153 12.665 12.201 11.795 11.422 11.093 10.739 10.397 10.087 9.798 9.527 9.275 9.045 8.8 8.579 8.398 8.208 7.999 7.823 7.615 7.393 7.233 7.062 6.88 6.68 6.471 6.329 6.183 5.974 5.827 5.667 5.591 5.439 5.26 5.07 4.966 4.661 4.582 4.449 4.313 4.006 3.84 3.673 3.507 3.304 3.055 2.768 2.283 -2 ,18353 ,TETRA ,17558980,Sat Nov 27 04:02:41 CET,Sat Nov 27 05:48:35 CET,0.0 1.383 1.76 2.077 2.344 2.586 2.821 3.026 3.363 3.518 3.67 3.781 4.108 4.246 4.51 4.738 4.949 5.061 5.279 5.468 5.733 5.899 6.052 6.274 6.499 6.712 6.907 7.111 7.391 7.635 7.869 8.149 8.401 8.64 8.905 9.188 9.471 9.776 10.093 10.448 10.805 11.183 11.616 12.027 12.443 12.844 13.283 13.745 14.167 14.442 14.47 14.154 13.745 13.313 12.849 12.416 12.046 11.697 11.371 11.027 10.724 10.465 10.206 9.945 9.708 9.472 9.217 9.001 8.823 8.644 8.446 8.269 8.069 7.861 7.71 7.555 7.393 7.207 7.002 6.874 6.749 6.539 6.393 6.249 6.174 6.007 5.814 5.626 5.53 5.224 5.182 5.076 4.944 4.62 4.45 4.293 4.141 3.975 3.775 3.535 3.087 -3 ,21746 ,TETRA ,17558981,Sat Nov 27 04:02:41 CET,Sat Nov 27 06:00:31 CET,0.0 1.446 1.774 2.047 2.301 2.527 2.718 2.891 3.193 3.335 3.479 3.566 3.879 3.997 4.234 4.477 4.709 4.813 5.006 5.188 5.442 5.603 5.757 5.985 6.205 6.405 6.59 6.777 7.029 7.267 7.484 7.749 8.002 8.229 8.494 8.783 9.054 9.347 9.654 9.989 10.333 10.706 11.137 11.545 11.989 12.46 12.93 13.353 13.741 14.079 14.24 13.939 13.487 13.032 12.6 12.187 11.772 11.359 10.993 10.634 10.3 9.99 9.705 9.443 9.2 8.967 8.711 8.48 8.282 8.084 7.89 7.721 7.534 7.353 7.216 7.073 6.918 6.757 6.588 6.462 6.338 6.156 6.026 5.885 5.815 5.668 5.508 5.335 5.229 4.918 4.908 4.807 4.707 4.472 4.333 4.202 4.065 3.902 3.68 3.41 1.946 -4 ,16390 ,TETRA ,17558982,Sat Nov 27 04:04:40 CET,Sat Nov 27 06:02:33 CET,0.0 1.11 1.518 1.844 2.124 2.37 2.577 2.777 3.13 3.289 3.441 3.523 3.835 3.963 4.206 4.418 4.614 4.709 4.896 5.085 5.366 5.539 5.712 5.963 6.196 6.414 6.623 6.819 7.07 7.318 7.546 7.808 8.063 8.309 8.589 8.893 9.167 9.452 9.737 10.031 10.341 10.675 11.071 11.441 11.825 12.238 12.678 13.087 13.475 13.779 13.796 13.416 12.907 12.436 12.004 11.544 11.09 10.664 10.298 9.931 9.61 9.317 9.031 8.741 8.478 8.259 8.012 7.776 7.583 7.386 7.175 6.989 6.78 6.55 6.37 6.201 6.044 5.878 5.688 5.562 5.432 5.203 5.051 4.913 4.839 4.674 4.51 4.352 4.262 3.971 3.929 3.815 3.689 3.398 3.238 3.077 2.91 2.721 2.521 2.263 1.414 -5 ,29236 ,TETRA ,17558983,Sat Nov 27 04:04:39 CET,Sat Nov 27 06:02:38 CET,0.0 1.564 2.011 2.337 2.587 2.801 3.023 3.227 3.578 3.731 3.872 3.947 4.274 4.397 4.649 4.902 5.13 5.24 5.456 5.656 5.931 6.098 6.256 6.476 6.688 6.894 7.084 7.266 7.518 7.77 8.007 8.284 8.546 8.781 9.008 9.249 9.483 9.742 10.031 10.343 10.653 10.986 11.372 11.754 12.199 12.64 13.036 13.441 13.858 14.199 14.324 14.082 13.702 13.238 12.762 12.277 11.791 11.37 11.027 10.663 10.339 10.035 9.735 9.442 9.166 8.908 8.61 8.342 8.116 7.873 7.612 7.397 7.176 6.941 6.748 6.559 6.384 6.198 5.996 5.86 5.727 5.512 5.364 5.219 5.133 4.936 4.734 4.51 4.398 4.111 4.074 3.951 3.825 3.562 3.418 3.26 3.095 2.911 2.667 2.374 1.603 -6 ,27093 ,TETRA ,17558984,Sat Nov 27 04:04:42 CET,Sat Nov 27 06:02:05 CET,0.0 1.262 1.739 2.109 2.393 2.623 2.826 3.042 3.432 3.606 3.772 3.858 4.178 4.31 4.555 4.787 5.011 5.109 5.306 5.503 5.755 5.904 6.054 6.283 6.5 6.717 6.925 7.118 7.367 7.616 7.851 8.12 8.381 8.637 8.931 9.254 9.544 9.852 10.191 10.535 10.879 11.235 11.644 12.063 12.49 12.906 13.342 13.773 14.198 14.55 14.599 14.3 13.9 13.422 12.96 12.55 12.174 11.804 11.458 11.082 10.742 10.418 10.085 9.778 9.514 9.277 9.021 8.793 8.597 8.384 8.146 7.942 7.724 7.487 7.298 7.103 6.913 6.723 6.532 6.403 6.265 6.061 5.917 5.743 5.655 5.473 5.282 5.1 5.008 4.724 4.678 4.55 4.413 4.106 3.937 3.765 3.566 3.33 3.049 2.757 2.218 -7 ,17052 ,TETRA ,17558985,Sat Nov 27 04:04:40 CET,Sat Nov 27 06:02:42 CET,0.0 1.165 1.571 1.869 2.127 2.369 2.586 2.793 3.174 3.332 3.478 3.585 3.9 4.021 4.261 4.485 4.694 4.793 4.99 5.184 5.468 5.646 5.807 6.035 6.244 6.44 6.623 6.798 7.034 7.256 7.454 7.68 7.909 8.157 8.451 8.763 9.056 9.36 9.675 10.009 10.333 10.67 11.045 11.417 11.869 12.339 12.809 13.264 13.703 14.126 14.347 14.177 13.815 13.374 12.939 12.488 12.056 11.665 11.305 10.933 10.601 10.297 10.004 9.715 9.455 9.225 8.966 8.735 8.551 8.361 8.139 7.944 7.756 7.572 7.437 7.284 7.099 6.902 6.709 6.588 6.463 6.242 6.095 5.958 5.885 5.729 5.569 5.396 5.3 5.017 4.999 4.89 4.775 4.497 4.349 4.208 4.053 3.874 3.689 3.387 2.354 -8 ,7961 ,TETRA ,17558986,Sat Nov 27 04:05:45 CET,Sat Nov 27 06:03:08 CET,0.0 1.087 1.473 1.784 2.033 2.244 2.439 2.652 3.054 3.21 3.347 3.446 3.763 3.901 4.165 4.404 4.628 4.725 4.907 5.085 5.361 5.538 5.708 5.944 6.161 6.376 6.574 6.764 7.003 7.235 7.459 7.715 7.959 8.204 8.481 8.777 9.07 9.394 9.717 10.041 10.378 10.754 11.145 11.507 11.918 12.332 12.756 13.159 13.545 13.824 13.862 13.562 13.099 12.614 12.177 11.739 11.288 10.868 10.502 10.13 9.815 9.514 9.215 8.936 8.678 8.44 8.178 7.935 7.729 7.524 7.32 7.134 6.92 6.709 6.549 6.384 6.219 6.044 5.855 5.71 5.56 5.339 5.186 5.013 4.921 4.753 4.555 4.33 4.219 3.915 3.842 3.703 3.576 3.324 3.175 3.001 2.823 2.602 2.322 2.007 1.279 -9 ,28817 ,TETRA ,17558987,Sat Nov 27 04:05:48 CET,Sat Nov 27 06:03:59 CET,0.0 1.151 1.533 1.841 2.104 2.34 2.545 2.737 3.092 3.252 3.4 3.494 3.806 3.931 4.175 4.406 4.618 4.725 4.93 5.111 5.367 5.534 5.693 5.909 6.125 6.34 6.544 6.744 6.995 7.232 7.457 7.711 7.942 8.161 8.409 8.684 8.955 9.25 9.552 9.855 10.189 10.575 10.988 11.379 11.819 12.261 12.719 13.173 13.637 14.034 14.213 14.042 13.702 13.27 12.79 12.339 11.939 11.56 11.238 10.88 10.546 10.257 9.974 9.707 9.462 9.219 8.96 8.713 8.488 8.257 8.021 7.833 7.634 7.425 7.263 7.081 6.888 6.703 6.509 6.376 6.234 6.009 5.856 5.693 5.607 5.431 5.242 5.036 4.933 4.639 4.622 4.515 4.397 4.117 3.953 3.796 3.623 3.38 3.123 2.863 2.014 -10 ,2550 ,TETRA ,17558988,Sat Nov 27 04:05:45 CET,Sat Nov 27 06:03:26 CET,0.0 1.098 1.536 1.824 2.062 2.295 2.511 2.717 3.118 3.296 3.452 3.533 3.834 3.941 4.159 4.371 4.591 4.699 4.895 5.089 5.371 5.54 5.706 5.953 6.182 6.394 6.592 6.792 7.029 7.248 7.468 7.731 7.975 8.208 8.476 8.756 9.007 9.286 9.599 9.912 10.227 10.591 10.993 11.331 11.711 12.131 12.588 13.012 13.386 13.732 13.878 13.621 13.196 12.701 12.235 11.81 11.396 11.004 10.668 10.327 10.016 9.739 9.478 9.216 8.975 8.768 8.545 8.341 8.147 7.913 7.675 7.492 7.296 7.09 6.939 6.772 6.59 6.409 6.224 6.096 5.954 5.728 5.566 5.389 5.292 5.095 4.905 4.707 4.596 4.292 4.235 4.105 3.976 3.719 3.585 3.435 3.268 3.085 2.85 2.572 2.012 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_35_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_35_49.txt deleted file mode 100644 index 9d4fafee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_35_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28193 ,TETRA ,17558989,Sat Nov 27 04:06:45 CET,Sat Nov 27 06:05:09 CET,0.0 1.104 1.511 1.867 2.151 2.383 2.605 2.816 3.152 3.311 3.475 3.589 3.918 4.054 4.329 4.555 4.764 4.873 5.098 5.31 5.601 5.793 5.973 6.23 6.496 6.744 6.973 7.197 7.473 7.745 8.005 8.313 8.614 8.895 9.214 9.592 9.963 10.351 10.779 11.24 11.7 12.2 12.766 13.338 13.981 14.621 15.334 16.071 16.787 17.481 18.113 18.426 18.387 18.214 18.011 17.75 17.495 17.242 16.986 16.703 16.452 16.209 15.962 15.738 15.525 15.314 15.098 14.909 14.729 14.533 14.33 14.158 13.98 13.785 13.621 13.446 13.27 13.087 12.888 12.75 12.614 12.399 12.239 12.074 11.994 11.829 11.648 11.435 11.32 11.017 10.996 10.887 10.78 10.543 10.405 10.251 10.076 9.879 9.679 9.428 8.502 -2 ,22439 ,TETRA ,17558990,Sat Nov 27 04:06:45 CET,Sat Nov 27 06:04:29 CET,0.0 1.289 1.696 2.005 2.273 2.514 2.745 2.965 3.329 3.495 3.653 3.758 4.091 4.231 4.487 4.725 4.952 5.057 5.265 5.457 5.735 5.929 6.119 6.395 6.647 6.877 7.097 7.319 7.616 7.894 8.154 8.478 8.791 9.075 9.399 9.763 10.123 10.519 10.914 11.313 11.722 12.183 12.707 13.226 13.85 14.52 15.233 16.022 16.895 17.739 18.481 18.83 18.814 18.619 18.392 18.146 17.876 17.604 17.337 17.044 16.79 16.566 16.349 16.13 15.896 15.677 15.463 15.258 15.08 14.9 14.711 14.557 14.378 14.187 14.049 13.901 13.746 13.596 13.454 13.356 13.242 13.052 12.923 12.794 12.726 12.565 12.398 12.24 12.154 11.888 11.878 11.756 11.634 11.423 11.296 11.166 11.032 10.875 10.687 10.414 8.239 -3 ,6200 ,TETRA ,17558991,Sat Nov 27 04:06:45 CET,Sat Nov 27 06:03:27 CET,0.0 0.894 1.323 1.633 1.909 2.198 2.442 2.637 3.018 3.185 3.329 3.42 3.746 3.88 4.141 4.379 4.599 4.707 4.911 5.106 5.41 5.601 5.786 6.054 6.31 6.561 6.789 7.002 7.277 7.54 7.803 8.123 8.42 8.699 9.023 9.391 9.763 10.17 10.565 10.974 11.404 11.883 12.423 12.953 13.566 14.221 14.916 15.587 16.351 17.244 18.043 18.4 18.42 18.192 17.882 17.591 17.304 17.045 16.829 16.558 16.302 16.077 15.847 15.631 15.431 15.232 15.007 14.803 14.618 14.427 14.242 14.086 13.914 13.728 13.581 13.431 13.274 13.115 12.927 12.779 12.64 12.456 12.328 12.173 12.093 11.932 11.757 11.559 11.457 11.176 11.139 11.01 10.871 10.591 10.446 10.29 10.117 9.923 9.7 9.439 8.705 -4 ,15815 ,TETRA ,17558992,Sat Nov 27 04:06:48 CET,Sat Nov 27 06:03:37 CET,0.0 1.095 1.47 1.786 2.052 2.286 2.499 2.684 3.001 3.166 3.327 3.455 3.789 3.923 4.175 4.418 4.648 4.755 4.966 5.177 5.487 5.697 5.901 6.162 6.408 6.656 6.893 7.121 7.413 7.699 7.977 8.3 8.611 8.904 9.232 9.589 9.935 10.323 10.738 11.166 11.598 12.067 12.574 13.075 13.66 14.296 15.026 15.772 16.518 17.305 18.028 18.354 18.319 18.112 17.903 17.652 17.389 17.15 16.924 16.691 16.469 16.239 15.99 15.756 15.552 15.373 15.188 15.01 14.851 14.686 14.507 14.365 14.218 14.058 13.933 13.787 13.634 13.472 13.291 13.153 13.008 12.798 12.654 12.503 12.422 12.257 12.099 11.933 11.843 11.565 11.506 11.382 11.261 10.99 10.845 10.697 10.529 10.344 10.112 9.782 9.203 -5 ,29487 ,TETRA ,17558993,Sat Nov 27 04:07:48 CET,Sat Nov 27 06:04:55 CET,0.0 1.406 1.853 2.154 2.421 2.64 2.846 3.034 3.359 3.514 3.66 3.756 4.074 4.203 4.461 4.698 4.916 5.024 5.225 5.41 5.689 5.871 6.051 6.308 6.549 6.78 7.005 7.228 7.518 7.792 8.047 8.345 8.635 8.911 9.213 9.547 9.879 10.29 10.729 11.157 11.588 12.065 12.625 13.172 13.759 14.35 15.009 15.759 16.572 17.358 18.187 18.589 18.575 18.465 18.252 17.998 17.717 17.439 17.189 16.926 16.693 16.454 16.212 15.996 15.795 15.592 15.358 15.15 14.984 14.822 14.641 14.473 14.293 14.105 13.956 13.799 13.636 13.476 13.309 13.188 13.065 12.863 12.713 12.567 12.498 12.342 12.167 11.982 11.883 11.602 11.546 11.431 11.3 11.003 10.871 10.747 10.598 10.431 10.221 9.976 9.227 -6 ,18157 ,TETRA ,17558994,Sat Nov 27 04:08:48 CET,Sat Nov 27 06:06:40 CET,0.0 1.002 1.45 1.818 2.103 2.333 2.556 2.771 3.184 3.383 3.569 3.721 4.041 4.163 4.411 4.657 4.894 5.009 5.229 5.436 5.724 5.902 6.078 6.335 6.574 6.802 7.026 7.251 7.53 7.781 8.036 8.338 8.627 8.924 9.276 9.67 10.024 10.391 10.768 11.147 11.567 12.045 12.609 13.168 13.771 14.411 15.122 15.859 16.586 17.336 18.055 18.369 18.33 18.165 17.969 17.686 17.368 17.061 16.79 16.482 16.203 15.954 15.716 15.484 15.255 15.065 14.855 14.653 14.486 14.317 14.135 13.969 13.791 13.608 13.443 13.258 13.075 12.899 12.721 12.597 12.48 12.305 12.175 12.038 11.962 11.794 11.616 11.428 11.331 11.059 11.023 10.91 10.808 10.579 10.449 10.303 10.129 9.939 9.695 9.364 8.645 -7 ,16122 ,TETRA ,17558995,Sat Nov 27 04:08:50 CET,Sat Nov 27 06:06:36 CET,0.0 0.91 1.355 1.72 2.026 2.277 2.503 2.722 3.11 3.278 3.444 3.582 3.918 4.064 4.338 4.595 4.835 4.954 5.19 5.412 5.725 5.929 6.129 6.404 6.654 6.893 7.127 7.347 7.624 7.892 8.139 8.428 8.706 8.982 9.322 9.693 10.025 10.4 10.807 11.227 11.65 12.117 12.645 13.152 13.77 14.437 15.146 15.865 16.637 17.439 18.11 18.313 18.231 18.068 17.888 17.63 17.343 17.072 16.823 16.558 16.332 16.139 15.937 15.744 15.56 15.373 15.165 14.961 14.791 14.617 14.423 14.261 14.089 13.921 13.784 13.617 13.45 13.29 13.126 13.012 12.884 12.682 12.548 12.407 12.335 12.192 12.029 11.854 11.772 11.507 11.484 11.375 11.26 11.015 10.882 10.739 10.597 10.447 10.256 9.988 9.317 -8 ,5843 ,TETRA ,17558996,Sat Nov 27 04:08:49 CET,Sat Nov 27 06:07:21 CET,0.0 1.264 1.667 1.941 2.182 2.415 2.64 2.84 3.185 3.344 3.495 3.595 3.898 4.022 4.266 4.503 4.742 4.86 5.076 5.268 5.544 5.729 5.918 6.18 6.445 6.707 6.949 7.197 7.509 7.794 8.073 8.411 8.732 9.037 9.392 9.796 10.166 10.552 10.96 11.397 11.856 12.353 12.902 13.457 14.085 14.761 15.508 16.297 17.179 18.128 19.026 19.481 19.568 19.473 19.277 19.034 18.791 18.557 18.36 18.153 17.947 17.749 17.542 17.34 17.151 16.962 16.744 16.536 16.36 16.175 15.987 15.83 15.658 15.485 15.342 15.182 15.022 14.854 14.677 14.561 14.455 14.305 14.201 14.091 14.027 13.889 13.749 13.591 13.503 13.232 13.24 13.141 13.039 12.81 12.681 12.568 12.44 12.251 11.991 11.624 10.487 -9 ,7054 ,TETRA ,17558997,Sat Nov 27 04:08:49 CET,Sat Nov 27 06:05:59 CET,0.0 1.06 1.458 1.787 2.071 2.329 2.567 2.794 3.209 3.394 3.579 3.734 4.079 4.226 4.497 4.751 4.997 5.118 5.355 5.576 5.886 6.098 6.299 6.581 6.851 7.102 7.341 7.568 7.86 8.125 8.38 8.69 8.974 9.243 9.575 9.946 10.296 10.686 11.087 11.492 11.907 12.384 12.986 13.56 14.11 14.693 15.376 16.116 16.931 17.878 18.839 19.263 19.257 19.083 18.834 18.518 18.18 17.874 17.605 17.325 17.087 16.882 16.669 16.444 16.235 16.041 15.838 15.649 15.471 15.29 15.094 14.917 14.729 14.544 14.41 14.264 14.109 13.943 13.762 13.637 13.514 13.335 13.207 13.069 12.996 12.835 12.664 12.479 12.38 12.098 12.037 11.905 11.776 11.47 11.309 11.154 10.969 10.759 10.529 10.243 9.694 -10 ,21342 ,TETRA ,17558998,Sat Nov 27 04:08:49 CET,Sat Nov 27 06:09:07 CET,0.0 0.84 1.191 1.496 1.748 1.959 2.159 2.355 2.717 2.882 3.044 3.147 3.449 3.572 3.835 4.067 4.285 4.392 4.597 4.808 5.11 5.292 5.473 5.747 6.008 6.249 6.481 6.707 7.004 7.284 7.54 7.843 8.129 8.417 8.754 9.115 9.45 9.813 10.204 10.62 11.062 11.573 12.165 12.74 13.387 14.062 14.789 15.51 16.279 17.124 17.872 18.179 18.17 18.031 17.784 17.5 17.227 16.958 16.724 16.471 16.242 16.025 15.789 15.568 15.363 15.163 14.962 14.785 14.617 14.425 14.226 14.069 13.905 13.731 13.6 13.456 13.306 13.155 12.984 12.863 12.734 12.518 12.36 12.207 12.139 11.985 11.808 11.636 11.545 11.267 11.249 11.144 11.025 10.797 10.67 10.503 10.31 10.116 9.908 9.672 9.255 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_35_52.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_35_52.txt deleted file mode 100644 index e7ac043d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_35_52.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13955 ,TETRA ,17558999,Sat Nov 27 04:08:49 CET,Sat Nov 27 06:10:04 CET,0.0 1.224 1.735 2.083 2.374 2.642 2.897 3.125 3.508 3.684 3.869 4.034 4.379 4.54 4.82 5.071 5.301 5.412 5.618 5.82 6.134 6.326 6.496 6.756 6.995 7.201 7.414 7.63 7.892 8.101 8.298 8.541 8.775 9.0 9.255 9.539 9.782 10.038 10.308 10.574 10.85 11.173 11.554 11.885 12.213 12.525 12.825 13.089 13.269 13.333 13.065 12.401 11.681 10.949 10.272 9.623 9.033 8.483 8.012 7.556 7.127 6.739 6.375 6.029 5.698 5.386 5.058 4.769 4.53 4.276 4.022 3.805 3.56 3.311 3.122 2.921 2.707 2.492 2.275 2.118 1.949 1.688 1.505 1.309 1.208 0.997 0.768 0.534 0.421 0.117 0.014 -0.135 -0.288 -0.632 -0.818 -1.009 -1.229 -1.479 -1.792 -2.215 -3.123 -2 ,26627 ,TETRA ,17559000,Sat Nov 27 04:09:45 CET,Sat Nov 27 06:09:49 CET,0.0 1.446 1.876 2.149 2.393 2.637 2.908 3.161 3.554 3.727 3.895 4.055 4.391 4.525 4.8 5.079 5.326 5.444 5.668 5.866 6.134 6.319 6.497 6.733 6.959 7.183 7.401 7.603 7.848 8.085 8.315 8.592 8.848 9.061 9.293 9.559 9.828 10.121 10.394 10.664 10.971 11.309 11.672 12.035 12.456 12.889 13.297 13.649 13.931 14.014 13.659 12.885 12.128 11.394 10.704 10.073 9.507 8.997 8.576 8.148 7.767 7.447 7.118 6.762 6.409 6.086 5.752 5.452 5.198 4.934 4.645 4.414 4.188 3.934 3.731 3.535 3.345 3.132 2.903 2.744 2.58 2.327 2.15 1.972 1.884 1.694 1.493 1.285 1.174 0.872 0.852 0.724 0.578 0.292 0.128 -0.058 -0.232 -0.416 -0.669 -1.016 -1.855 -3 ,1000 ,TETRA ,17559001,Sat Nov 27 04:11:46 CET,Sat Nov 27 06:09:15 CET,0.0 1.026 1.444 1.735 1.986 2.252 2.477 2.68 3.059 3.223 3.385 3.504 3.831 3.963 4.204 4.423 4.629 4.724 4.906 5.082 5.336 5.494 5.64 5.885 6.127 6.32 6.508 6.698 6.926 7.145 7.36 7.606 7.823 8.034 8.281 8.56 8.818 9.102 9.419 9.719 10.026 10.367 10.729 11.075 11.447 11.814 12.241 12.658 12.92 13.001 12.819 12.245 11.551 10.807 10.11 9.512 8.982 8.497 8.086 7.666 7.276 6.929 6.591 6.246 5.935 5.666 5.377 5.12 4.903 4.665 4.409 4.202 4.0 3.781 3.598 3.418 3.228 3.023 2.807 2.658 2.514 2.293 2.129 1.958 1.87 1.676 1.481 1.295 1.19 0.876 0.801 0.662 0.528 0.263 0.107 -0.074 -0.274 -0.508 -0.81 -1.184 -3.017 -4 ,7623 ,TETRA ,17559002,Sat Nov 27 04:11:46 CET,Sat Nov 27 06:14:39 CET,0.0 1.292 1.71 2.107 2.436 2.691 2.93 3.17 3.62 3.823 4.008 4.128 4.449 4.593 4.857 5.111 5.362 5.48 5.707 5.912 6.198 6.378 6.546 6.788 7.023 7.238 7.432 7.628 7.879 8.1 8.296 8.523 8.748 8.982 9.256 9.551 9.835 10.135 10.462 10.784 11.092 11.42 11.759 12.078 12.412 12.735 13.065 13.364 13.581 13.609 13.301 12.582 11.826 11.109 10.414 9.742 9.138 8.612 8.161 7.697 7.31 6.978 6.655 6.332 6.016 5.732 5.422 5.145 4.896 4.624 4.34 4.099 3.838 3.573 3.382 3.176 2.952 2.734 2.518 2.363 2.194 1.903 1.7 1.493 1.381 1.142 0.906 0.673 0.546 0.223 0.112 -0.029 -0.177 -0.527 -0.705 -0.902 -1.143 -1.411 -1.743 -2.253 -3.448 -5 ,19364 ,TETRA ,17559003,Sat Nov 27 04:11:46 CET,Sat Nov 27 06:09:11 CET,0.0 1.37 1.822 2.157 2.435 2.674 2.87 3.065 3.447 3.621 3.787 3.912 4.249 4.397 4.666 4.911 5.137 5.24 5.44 5.629 5.873 6.021 6.164 6.37 6.569 6.762 6.94 7.125 7.375 7.596 7.797 8.041 8.263 8.477 8.726 8.992 9.24 9.508 9.794 10.083 10.376 10.688 11.044 11.373 11.746 12.127 12.453 12.729 12.957 13.058 12.808 12.14 11.441 10.747 10.082 9.486 8.965 8.471 8.034 7.61 7.256 6.925 6.606 6.296 5.969 5.664 5.346 5.044 4.765 4.486 4.215 3.992 3.77 3.539 3.346 3.138 2.925 2.711 2.49 2.333 2.16 1.882 1.673 1.452 1.343 1.107 0.859 0.611 0.478 0.156 0.024 -0.138 -0.297 -0.652 -0.846 -1.052 -1.292 -1.571 -1.865 -2.288 -3.937 -6 ,10796 ,TETRA ,17559004,Sat Nov 27 04:11:45 CET,Sat Nov 27 06:08:55 CET,0.0 0.996 1.334 1.653 1.892 2.091 2.265 2.409 2.657 2.774 2.883 2.915 3.203 3.303 3.51 3.695 3.847 3.916 4.057 4.208 4.426 4.55 4.667 4.852 5.022 5.177 5.325 5.453 5.618 5.81 6.007 6.213 6.388 6.556 6.742 6.917 7.083 7.284 7.499 7.729 7.965 8.244 8.577 8.862 9.177 9.5 9.799 10.062 10.271 10.376 10.173 9.523 8.756 7.928 7.202 6.584 6.078 5.622 5.172 4.706 4.325 3.998 3.663 3.324 3.001 2.696 2.362 2.059 1.805 1.545 1.284 1.069 0.834 0.6 0.418 0.221 0.012 -0.206 -0.43 -0.59 -0.751 -1.018 -1.219 -1.415 -1.511 -1.713 -1.928 -2.153 -2.263 -2.568 -2.642 -2.776 -2.918 -3.246 -3.428 -3.621 -3.817 -4.027 -4.271 -4.652 -5.783 -7 ,10717 ,TETRA ,17559005,Sat Nov 27 04:11:48 CET,Sat Nov 27 06:09:26 CET,0.0 1.431 1.901 2.265 2.561 2.807 3.05 3.288 3.676 3.836 3.987 4.115 4.431 4.549 4.803 5.055 5.282 5.392 5.597 5.784 6.06 6.235 6.41 6.665 6.888 7.103 7.329 7.527 7.733 7.926 8.125 8.387 8.638 8.877 9.13 9.394 9.627 9.871 10.149 10.439 10.747 11.067 11.393 11.707 12.064 12.46 12.836 13.163 13.396 13.45 13.156 12.448 11.748 11.003 10.281 9.65 9.067 8.525 8.055 7.57 7.152 6.803 6.46 6.088 5.73 5.41 5.086 4.803 4.556 4.292 4.019 3.798 3.572 3.337 3.15 2.967 2.774 2.57 2.362 2.214 2.07 1.84 1.685 1.532 1.451 1.278 1.086 0.888 0.779 0.474 0.43 0.313 0.2 -0.077 -0.227 -0.374 -0.571 -0.816 -1.107 -1.523 -2.826 -8 ,15052 ,TETRA ,17559006,Sat Nov 27 04:12:47 CET,Sat Nov 27 06:09:45 CET,0.0 1.625 2.161 2.558 2.836 3.05 3.243 3.437 3.77 3.909 4.043 4.11 4.424 4.553 4.802 5.033 5.269 5.381 5.581 5.765 6.037 6.221 6.42 6.683 6.917 7.168 7.392 7.592 7.851 8.084 8.273 8.517 8.795 9.046 9.321 9.637 9.923 10.19 10.443 10.731 11.018 11.326 11.682 12.008 12.354 12.698 13.04 13.321 13.521 13.609 13.357 12.614 11.807 11.076 10.387 9.748 9.183 8.652 8.164 7.683 7.291 6.944 6.616 6.316 6.036 5.763 5.473 5.217 4.986 4.741 4.49 4.273 4.035 3.783 3.587 3.381 3.164 2.94 2.721 2.573 2.414 2.161 1.987 1.799 1.699 1.475 1.229 0.986 0.857 0.544 0.456 0.3 0.148 -0.19 -0.374 -0.555 -0.757 -1.019 -1.29 -1.637 -3.04 -9 ,11844 ,TETRA ,17559007,Sat Nov 27 04:12:49 CET,Sat Nov 27 06:09:30 CET,0.0 1.543 1.988 2.318 2.544 2.74 2.916 3.064 3.316 3.43 3.547 3.586 3.869 3.974 4.188 4.393 4.574 4.65 4.792 4.922 5.104 5.23 5.355 5.531 5.7 5.854 6.016 6.166 6.333 6.495 6.657 6.851 7.022 7.186 7.381 7.585 7.78 7.98 8.193 8.41 8.614 8.86 9.144 9.437 9.81 10.14 10.382 10.599 10.763 10.805 10.383 9.325 8.317 7.5 6.821 6.178 5.587 5.057 4.609 4.154 3.754 3.405 3.06 2.712 2.395 2.104 1.801 1.517 1.251 0.971 0.679 0.455 0.223 -0.031 -0.233 -0.443 -0.666 -0.89 -1.116 -1.281 -1.449 -1.726 -1.914 -2.091 -2.186 -2.39 -2.607 -2.835 -2.951 -3.257 -3.322 -3.46 -3.606 -3.928 -4.09 -4.256 -4.449 -4.672 -4.947 -5.316 -6.276 -10 ,27897 ,TETRA ,17559008,Sat Nov 27 04:12:47 CET,Sat Nov 27 06:11:31 CET,0.0 1.355 1.886 2.215 2.486 2.763 2.999 3.213 3.63 3.826 4.001 4.128 4.478 4.64 4.909 5.137 5.369 5.481 5.689 5.895 6.178 6.349 6.508 6.735 6.973 7.213 7.43 7.629 7.865 8.081 8.302 8.557 8.798 9.032 9.275 9.538 9.793 10.081 10.383 10.681 10.991 11.361 11.734 12.046 12.402 12.753 13.073 13.359 13.636 13.796 13.611 12.994 12.275 11.586 10.929 10.284 9.702 9.169 8.685 8.168 7.727 7.355 6.984 6.622 6.296 6.009 5.701 5.419 5.183 4.942 4.69 4.478 4.255 4.02 3.834 3.643 3.441 3.222 2.992 2.83 2.658 2.386 2.206 2.014 1.916 1.725 1.518 1.304 1.186 0.886 0.834 0.708 0.577 0.269 0.103 -0.074 -0.272 -0.483 -0.742 -1.123 -2.256 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_37_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_37_50.txt deleted file mode 100644 index b32e0047..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_37_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16329 ,TETRA ,17559009,Sat Nov 27 04:13:48 CET,Sat Nov 27 06:11:30 CET,0.0 0.663 0.997 1.265 1.519 1.743 1.934 2.102 2.396 2.525 2.647 2.717 3.024 3.134 3.353 3.565 3.765 3.866 4.052 4.225 4.478 4.629 4.767 4.977 5.19 5.395 5.581 5.756 5.994 6.218 6.435 6.709 6.962 7.186 7.446 7.75 8.036 8.356 8.69 9.025 9.39 9.822 10.317 10.746 11.211 11.725 12.281 12.901 13.56 14.158 14.604 14.669 14.474 14.187 13.874 13.551 13.225 12.898 12.598 12.312 12.075 11.83 11.565 11.307 11.065 10.849 10.627 10.421 10.252 10.071 9.877 9.719 9.545 9.358 9.218 9.071 8.914 8.758 8.595 8.478 8.353 8.155 8.02 7.874 7.798 7.651 7.497 7.321 7.238 6.977 6.966 6.855 6.736 6.476 6.345 6.213 6.07 5.916 5.758 5.557 4.928 -2 ,4065 ,TETRA ,17559010,Sat Nov 27 04:13:49 CET,Sat Nov 27 06:13:25 CET,0.0 0.97 1.337 1.582 1.805 2.013 2.201 2.374 2.691 2.831 2.969 3.042 3.333 3.441 3.671 3.889 4.08 4.168 4.34 4.506 4.75 4.909 5.061 5.278 5.484 5.684 5.878 6.067 6.304 6.534 6.765 7.041 7.301 7.54 7.801 8.103 8.403 8.715 9.044 9.402 9.774 10.197 10.69 11.158 11.668 12.17 12.691 13.273 13.91 14.543 15.02 15.15 15.014 14.718 14.418 14.127 13.834 13.555 13.292 12.967 12.665 12.401 12.149 11.917 11.698 11.498 11.288 11.095 10.922 10.727 10.524 10.357 10.177 9.993 9.855 9.719 9.576 9.41 9.228 9.098 8.967 8.761 8.616 8.481 8.406 8.235 8.059 7.885 7.792 7.508 7.464 7.348 7.224 6.962 6.83 6.68 6.502 6.324 6.107 5.82 5.175 -3 ,20647 ,TETRA ,17559011,Sat Nov 27 04:13:49 CET,Sat Nov 27 06:13:10 CET,0.0 0.839 1.233 1.564 1.852 2.101 2.332 2.549 2.933 3.099 3.247 3.334 3.65 3.764 3.97 4.177 4.39 4.493 4.683 4.86 5.114 5.277 5.435 5.671 5.893 6.092 6.282 6.467 6.708 6.934 7.149 7.404 7.65 7.898 8.185 8.492 8.765 9.054 9.362 9.699 10.041 10.424 10.893 11.351 11.853 12.367 12.958 13.602 14.235 14.865 15.398 15.51 15.313 15.014 14.711 14.396 14.073 13.744 13.445 13.143 12.867 12.622 12.371 12.116 11.88 11.66 11.43 11.233 11.055 10.87 10.678 10.506 10.331 10.155 10.017 9.862 9.701 9.537 9.358 9.235 9.11 8.911 8.771 8.612 8.535 8.387 8.217 8.024 7.921 7.638 7.619 7.511 7.389 7.143 7.006 6.85 6.691 6.507 6.301 6.098 5.523 -4 ,18457 ,TETRA ,17559012,Sat Nov 27 04:14:49 CET,Sat Nov 27 06:14:33 CET,0.0 0.701 1.077 1.364 1.595 1.789 1.955 2.116 2.444 2.59 2.72 2.792 3.102 3.213 3.438 3.66 3.864 3.954 4.131 4.308 4.561 4.727 4.893 5.124 5.345 5.552 5.729 5.905 6.15 6.395 6.625 6.886 7.126 7.372 7.649 7.942 8.224 8.54 8.879 9.212 9.545 9.923 10.369 10.803 11.264 11.745 12.31 12.892 13.474 14.079 14.558 14.641 14.488 14.195 13.894 13.596 13.297 13.008 12.738 12.454 12.201 11.965 11.71 11.453 11.229 11.034 10.834 10.656 10.5 10.324 10.132 9.974 9.812 9.646 9.507 9.355 9.202 9.056 8.892 8.77 8.641 8.434 8.289 8.14 8.058 7.881 7.701 7.524 7.444 7.177 7.157 7.066 6.977 6.755 6.63 6.495 6.349 6.208 6.057 5.867 5.468 -5 ,31059 ,TETRA ,17559013,Sat Nov 27 04:14:52 CET,Sat Nov 27 06:15:18 CET,0.0 0.73 1.103 1.339 1.565 1.764 1.948 2.145 2.516 2.661 2.791 2.867 3.177 3.287 3.489 3.701 3.911 4.009 4.184 4.348 4.596 4.754 4.906 5.131 5.347 5.538 5.724 5.911 6.14 6.367 6.592 6.863 7.12 7.357 7.627 7.935 8.215 8.506 8.859 9.236 9.609 10.035 10.527 10.983 11.467 12.023 12.663 13.313 13.949 14.559 15.102 15.221 14.992 14.594 14.201 13.872 13.565 13.254 12.949 12.608 12.325 12.059 11.77 11.5 11.262 11.046 10.806 10.591 10.418 10.235 10.041 9.874 9.704 9.515 9.363 9.217 9.061 8.908 8.755 8.642 8.522 8.339 8.214 8.083 8.007 7.834 7.659 7.48 7.384 7.11 7.073 6.965 6.849 6.574 6.43 6.257 6.06 5.84 5.577 5.227 4.603 -6 ,16423 ,TETRA ,17559014,Sat Nov 27 04:14:49 CET,Sat Nov 27 06:12:03 CET,0.0 1.233 1.592 1.83 2.07 2.296 2.499 2.692 3.051 3.205 3.343 3.432 3.748 3.86 4.064 4.262 4.457 4.552 4.737 4.912 5.163 5.328 5.484 5.706 5.921 6.132 6.341 6.535 6.78 7.007 7.235 7.516 7.771 8.0 8.249 8.512 8.766 9.05 9.357 9.689 10.018 10.369 10.767 11.16 11.625 12.135 12.68 13.225 13.836 14.461 14.953 15.052 14.865 14.589 14.286 13.956 13.637 13.317 13.009 12.711 12.437 12.18 11.936 11.695 11.456 11.236 11.005 10.796 10.608 10.41 10.206 10.025 9.836 9.661 9.526 9.376 9.219 9.054 8.887 8.766 8.638 8.441 8.292 8.139 8.063 7.904 7.73 7.54 7.444 7.168 7.145 7.034 6.917 6.65 6.506 6.369 6.229 6.075 5.889 5.664 5.198 -7 ,6582 ,TETRA ,17559015,Sat Nov 27 04:14:52 CET,Sat Nov 27 06:12:45 CET,0.0 0.526 0.823 1.063 1.275 1.483 1.677 1.859 2.168 2.31 2.446 2.512 2.819 2.929 3.135 3.336 3.526 3.62 3.822 4.013 4.264 4.431 4.591 4.816 5.05 5.281 5.483 5.668 5.906 6.131 6.346 6.612 6.883 7.132 7.403 7.714 8.02 8.363 8.719 9.082 9.469 9.883 10.339 10.793 11.307 11.862 12.483 13.106 13.736 14.393 14.919 15.021 14.908 14.665 14.346 14.01 13.697 13.377 13.073 12.757 12.459 12.18 11.902 11.645 11.413 11.194 10.968 10.771 10.594 10.395 10.162 9.966 9.773 9.576 9.428 9.274 9.121 8.961 8.789 8.671 8.557 8.377 8.242 8.109 8.038 7.885 7.725 7.554 7.471 7.204 7.174 7.06 6.935 6.671 6.545 6.403 6.242 6.065 5.877 5.634 5.084 -8 ,4574 ,TETRA ,17559016,Sat Nov 27 04:14:50 CET,Sat Nov 27 06:15:11 CET,0.0 0.658 0.984 1.238 1.453 1.652 1.831 1.998 2.308 2.447 2.575 2.629 2.93 3.044 3.255 3.46 3.65 3.74 3.919 4.081 4.308 4.462 4.608 4.811 5.007 5.199 5.388 5.566 5.797 6.025 6.241 6.485 6.72 6.942 7.199 7.502 7.781 8.078 8.396 8.741 9.119 9.535 10.004 10.461 10.992 11.586 12.258 12.944 13.601 14.216 14.639 14.663 14.461 14.154 13.826 13.519 13.218 12.918 12.652 12.357 12.081 11.829 11.592 11.368 11.144 10.926 10.676 10.459 10.281 10.084 9.87 9.683 9.499 9.316 9.172 9.031 8.871 8.696 8.522 8.393 8.251 8.043 7.911 7.777 7.701 7.538 7.378 7.211 7.111 6.836 6.81 6.688 6.567 6.319 6.182 6.03 5.873 5.697 5.443 5.113 4.591 -9 ,6306 ,TETRA ,17559017,Sat Nov 27 04:14:49 CET,Sat Nov 27 06:12:15 CET,0.0 0.72 1.015 1.259 1.483 1.682 1.85 2.002 2.294 2.443 2.587 2.656 2.957 3.068 3.278 3.488 3.682 3.775 3.961 4.133 4.369 4.52 4.669 4.882 5.083 5.275 5.451 5.61 5.827 6.055 6.276 6.546 6.806 7.039 7.29 7.587 7.882 8.189 8.509 8.858 9.229 9.623 10.092 10.571 11.084 11.639 12.238 12.816 13.419 14.043 14.595 14.691 14.533 14.276 13.911 13.512 13.184 12.882 12.602 12.301 12.013 11.754 11.503 11.256 11.017 10.81 10.605 10.398 10.211 10.016 9.8 9.633 9.462 9.278 9.139 8.986 8.826 8.669 8.506 8.391 8.264 8.055 7.917 7.768 7.693 7.543 7.384 7.213 7.124 6.858 6.839 6.735 6.626 6.413 6.296 6.161 6.005 5.819 5.603 5.315 4.799 -10 ,27264 ,TETRA ,17559018,Sat Nov 27 04:15:50 CET,Sat Nov 27 06:13:12 CET,0.0 0.699 1.005 1.248 1.471 1.678 1.847 2.008 2.321 2.461 2.582 2.632 2.938 3.056 3.284 3.495 3.696 3.794 3.974 4.145 4.404 4.569 4.72 4.934 5.147 5.353 5.535 5.715 5.946 6.163 6.385 6.654 6.895 7.124 7.391 7.7 7.994 8.306 8.646 8.989 9.329 9.719 10.189 10.653 11.212 11.817 12.432 13.028 13.624 14.231 14.764 14.932 14.745 14.445 14.146 13.816 13.474 13.155 12.871 12.554 12.277 12.021 11.776 11.539 11.298 11.089 10.885 10.695 10.523 10.338 10.137 9.964 9.785 9.593 9.436 9.292 9.152 8.989 8.828 8.719 8.593 8.397 8.264 8.116 8.038 7.871 7.696 7.525 7.431 7.147 7.132 7.027 6.908 6.644 6.512 6.371 6.203 6.029 5.844 5.61 5.057 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_37_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_37_53.txt deleted file mode 100644 index 570246b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_37_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18108 ,TETRA ,17559019,Sat Nov 27 04:15:50 CET,Sat Nov 27 06:05:26 CET,0.0 1.197 1.648 1.99 2.303 2.554 2.752 2.948 3.314 3.468 3.604 3.677 3.987 4.113 4.323 4.509 4.7 4.791 4.966 5.115 5.303 5.438 5.575 5.753 5.927 6.1 6.289 6.485 6.72 6.943 7.145 7.376 7.587 7.763 7.964 8.208 8.425 8.634 8.867 9.121 9.35 9.537 9.721 9.924 10.149 10.364 10.551 10.637 10.628 10.456 9.814 8.732 7.703 6.764 5.904 5.079 4.332 3.657 3.101 2.543 2.045 1.593 1.149 0.738 0.36 0.008 -0.369 -0.71 -0.99 -1.271 -1.578 -1.83 -2.085 -2.352 -2.565 -2.788 -3.024 -3.268 -3.522 -3.692 -3.872 -4.16 -4.353 -4.551 -4.655 -4.884 -5.119 -5.357 -5.483 -5.815 -5.913 -6.071 -6.232 -6.609 -6.817 -7.046 -7.277 -7.495 -7.782 -8.155 -8.982 -2 ,848 ,TETRA ,17559020,Sat Nov 27 04:15:50 CET,Sat Nov 27 06:15:18 CET,0.0 1.21 1.571 1.85 2.085 2.276 2.436 2.583 2.855 2.97 3.072 3.08 3.371 3.462 3.638 3.815 3.995 4.082 4.241 4.378 4.552 4.669 4.786 4.953 5.121 5.281 5.423 5.563 5.746 5.901 6.036 6.213 6.375 6.52 6.701 6.917 7.121 7.35 7.611 7.867 8.131 8.383 8.601 8.828 9.094 9.319 9.492 9.573 9.584 9.467 8.924 7.921 6.93 6.009 5.153 4.412 3.776 3.156 2.613 2.065 1.573 1.136 0.726 0.36 0.055 -0.197 -0.453 -0.7 -0.93 -1.173 -1.412 -1.609 -1.824 -2.055 -2.23 -2.407 -2.59 -2.782 -2.977 -3.113 -3.26 -3.483 -3.638 -3.791 -3.869 -4.026 -4.188 -4.367 -4.468 -4.762 -4.792 -4.915 -5.052 -5.387 -5.552 -5.717 -5.928 -6.168 -6.471 -6.971 -9.239 -3 ,3429 ,TETRA ,17559021,Sat Nov 27 04:15:50 CET,Sat Nov 27 06:13:54 CET,0.0 0.838 1.24 1.587 1.882 2.094 2.282 2.447 2.727 2.85 2.959 3.003 3.317 3.43 3.634 3.818 3.98 4.055 4.205 4.354 4.563 4.7 4.825 4.993 5.167 5.336 5.49 5.634 5.806 5.971 6.128 6.302 6.478 6.654 6.847 7.063 7.261 7.471 7.683 7.9 8.142 8.377 8.614 8.829 9.044 9.227 9.336 9.408 9.434 9.257 8.627 7.612 6.66 5.782 4.979 4.228 3.528 2.888 2.384 1.916 1.512 1.151 0.818 0.521 0.247 -0.034 -0.352 -0.623 -0.847 -1.087 -1.34 -1.546 -1.753 -1.966 -2.148 -2.346 -2.538 -2.716 -2.898 -3.035 -3.178 -3.399 -3.556 -3.723 -3.806 -3.976 -4.18 -4.402 -4.507 -4.796 -4.806 -4.908 -5.03 -5.323 -5.473 -5.638 -5.802 -5.967 -6.179 -6.458 -7.537 -4 ,6684 ,TETRA ,17559022,Sat Nov 27 04:15:52 CET,Sat Nov 27 06:13:39 CET,0.0 0.756 1.182 1.472 1.723 1.933 2.103 2.263 2.56 2.693 2.833 2.935 3.239 3.35 3.56 3.764 3.961 4.056 4.229 4.385 4.613 4.775 4.942 5.178 5.396 5.581 5.743 5.893 6.069 6.226 6.384 6.582 6.774 6.96 7.186 7.437 7.662 7.904 8.133 8.347 8.562 8.78 9.032 9.354 9.707 9.97 10.154 10.28 10.346 10.194 9.622 8.667 7.698 6.769 5.929 5.209 4.641 4.094 3.589 3.119 2.73 2.391 2.07 1.757 1.47 1.207 0.923 0.663 0.449 0.229 -0.007 -0.208 -0.417 -0.619 -0.782 -0.961 -1.141 -1.333 -1.549 -1.703 -1.87 -2.129 -2.296 -2.46 -2.543 -2.717 -2.891 -3.072 -3.173 -3.472 -3.485 -3.608 -3.729 -3.954 -4.077 -4.219 -4.371 -4.561 -4.79 -5.134 -6.212 -5 ,32542 ,TETRA ,17559023,Sat Nov 27 04:16:48 CET,Sat Nov 27 06:16:31 CET,0.0 0.936 1.295 1.585 1.819 2.014 2.195 2.363 2.689 2.85 2.991 3.061 3.376 3.492 3.687 3.877 4.082 4.179 4.353 4.512 4.738 4.884 5.017 5.209 5.387 5.57 5.739 5.892 6.106 6.312 6.504 6.72 6.944 7.161 7.392 7.649 7.876 8.116 8.378 8.615 8.836 9.099 9.396 9.658 9.913 10.107 10.243 10.357 10.401 10.169 9.496 8.398 7.313 6.37 5.559 4.769 4.042 3.4 2.841 2.27 1.751 1.286 0.849 0.437 0.06 -0.285 -0.644 -0.973 -1.267 -1.559 -1.865 -2.129 -2.398 -2.686 -2.915 -3.152 -3.398 -3.649 -3.897 -4.064 -4.241 -4.527 -4.727 -4.934 -5.043 -5.269 -5.497 -5.73 -5.857 -6.174 -6.279 -6.435 -6.6 -6.958 -7.177 -7.408 -7.641 -7.899 -8.193 -8.57 -9.503 -6 ,520 ,TETRA ,17559024,Sat Nov 27 04:16:50 CET,Sat Nov 27 06:17:05 CET,0.0 0.839 1.28 1.664 1.942 2.158 2.383 2.598 2.977 3.146 3.297 3.384 3.686 3.809 4.05 4.251 4.409 4.492 4.654 4.793 4.998 5.124 5.243 5.44 5.641 5.825 6.0 6.165 6.373 6.563 6.725 6.916 7.097 7.251 7.424 7.625 7.805 7.992 8.199 8.439 8.674 8.895 9.14 9.37 9.636 9.914 10.152 10.312 10.395 10.286 9.674 8.625 7.586 6.679 5.872 5.124 4.474 3.868 3.338 2.79 2.288 1.829 1.408 1.029 0.665 0.308 -0.076 -0.402 -0.687 -0.979 -1.277 -1.518 -1.753 -2.012 -2.223 -2.435 -2.652 -2.878 -3.113 -3.289 -3.467 -3.733 -3.94 -4.153 -4.256 -4.459 -4.671 -4.909 -5.036 -5.35 -5.403 -5.531 -5.67 -5.983 -6.16 -6.353 -6.58 -6.875 -7.193 -7.531 -8.584 -7 ,14125 ,TETRA ,17559025,Sat Nov 27 04:17:47 CET,Sat Nov 27 06:16:21 CET,0.0 0.913 1.209 1.493 1.728 1.93 2.105 2.264 2.594 2.735 2.855 2.903 3.202 3.325 3.574 3.789 3.988 4.083 4.246 4.41 4.663 4.817 4.96 5.141 5.303 5.482 5.661 5.83 6.023 6.214 6.415 6.662 6.896 7.094 7.293 7.497 7.681 7.887 8.119 8.362 8.608 8.891 9.171 9.366 9.559 9.734 9.873 9.956 9.963 9.767 9.081 7.917 6.861 5.943 5.105 4.317 3.612 2.96 2.393 1.819 1.34 0.927 0.51 0.105 -0.256 -0.597 -0.957 -1.267 -1.547 -1.849 -2.165 -2.425 -2.702 -2.99 -3.205 -3.429 -3.655 -3.897 -4.156 -4.333 -4.526 -4.826 -5.032 -5.256 -5.38 -5.623 -5.873 -6.132 -6.259 -6.588 -6.675 -6.812 -6.956 -7.29 -7.484 -7.679 -7.906 -8.168 -8.44 -8.777 -9.669 -8 ,25297 ,TETRA ,17559026,Sat Nov 27 04:17:48 CET,Sat Nov 27 06:16:31 CET,0.0 1.088 1.44 1.718 1.96 2.215 2.441 2.611 2.92 3.081 3.228 3.312 3.612 3.719 3.926 4.133 4.35 4.452 4.633 4.797 5.002 5.121 5.245 5.436 5.62 5.78 5.916 6.059 6.261 6.439 6.613 6.849 7.065 7.258 7.458 7.661 7.857 8.094 8.364 8.617 8.852 9.096 9.358 9.581 9.783 9.971 10.167 10.276 10.223 9.993 9.355 8.34 7.364 6.423 5.566 4.781 4.123 3.501 2.949 2.428 1.97 1.542 1.12 0.717 0.341 -0.007 -0.364 -0.671 -0.94 -1.216 -1.506 -1.75 -1.995 -2.251 -2.459 -2.678 -2.921 -3.178 -3.418 -3.579 -3.754 -4.029 -4.224 -4.428 -4.532 -4.748 -4.972 -5.208 -5.345 -5.678 -5.771 -5.92 -6.087 -6.44 -6.615 -6.797 -7.009 -7.247 -7.53 -7.868 -8.712 -9 ,21345 ,TETRA ,17559027,Sat Nov 27 04:17:48 CET,Sat Nov 27 06:15:53 CET,0.0 1.15 1.495 1.781 2.043 2.259 2.484 2.693 3.002 3.132 3.25 3.282 3.58 3.693 3.916 4.096 4.263 4.347 4.49 4.642 4.864 4.982 5.092 5.261 5.445 5.618 5.754 5.872 6.031 6.188 6.344 6.525 6.681 6.828 7.0 7.176 7.353 7.549 7.751 7.949 8.132 8.324 8.541 8.765 9.014 9.246 9.407 9.503 9.517 9.306 8.605 7.507 6.492 5.586 4.739 3.945 3.247 2.582 2.022 1.472 0.977 0.541 0.15 -0.223 -0.587 -0.914 -1.266 -1.593 -1.899 -2.226 -2.559 -2.827 -3.09 -3.366 -3.593 -3.831 -4.065 -4.31 -4.573 -4.752 -4.936 -5.227 -5.425 -5.632 -5.739 -5.944 -6.15 -6.358 -6.474 -6.814 -6.917 -7.064 -7.222 -7.575 -7.771 -7.981 -8.23 -8.525 -8.844 -9.211 -9.949 -10 ,14343 ,TETRA ,17559028,Sat Nov 27 04:17:48 CET,Sat Nov 27 06:16:29 CET,0.0 1.312 1.762 2.018 2.232 2.437 2.592 2.718 2.982 3.095 3.195 3.193 3.469 3.548 3.709 3.881 4.034 4.097 4.224 4.35 4.519 4.626 4.738 4.9 5.04 5.174 5.32 5.449 5.604 5.766 5.935 6.134 6.305 6.459 6.631 6.837 7.028 7.232 7.449 7.651 7.816 7.999 8.248 8.475 8.685 8.873 9.046 9.134 9.127 8.975 8.491 7.624 6.752 5.966 5.276 4.67 4.126 3.633 3.223 2.791 2.386 2.009 1.643 1.31 1.026 0.751 0.438 0.161 -0.069 -0.311 -0.566 -0.769 -0.982 -1.195 -1.351 -1.515 -1.682 -1.849 -2.033 -2.171 -2.314 -2.517 -2.653 -2.807 -2.888 -3.05 -3.209 -3.39 -3.493 -3.785 -3.81 -3.93 -4.068 -4.372 -4.517 -4.661 -4.829 -5.032 -5.272 -5.636 -6.869 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_37_56.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_37_56.txt deleted file mode 100644 index 670e01e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_37_56.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20047 ,KEBNE ,17024796,Wed Dec 22 11:11:50 CET,Wed Dec 22 12:53:19 CET,0.0 1.345 1.885 2.245 2.565 2.859 3.092 3.313 3.702 3.865 4.03 4.157 4.476 4.611 4.851 5.067 5.268 5.374 5.585 5.767 6.035 6.222 6.411 6.672 6.907 7.114 7.305 7.491 7.727 7.959 8.181 8.452 8.713 8.948 9.201 9.473 9.72 10.019 10.366 10.707 11.063 11.441 11.844 12.234 12.691 13.198 13.707 14.172 14.581 14.958 15.151 14.87 14.421 13.87 13.287 12.734 12.225 11.798 11.434 11.037 10.697 10.4 10.107 9.822 9.548 9.291 9.016 8.784 8.615 8.445 8.247 8.061 7.868 7.683 7.524 7.35 7.18 6.994 6.782 6.633 6.49 6.277 6.134 5.981 5.903 5.749 5.593 5.418 5.323 5.032 4.989 4.871 4.757 4.51 4.352 4.154 3.92 3.65 3.339 2.915 1.987 -2 ,24268 ,KEBNE ,17024797,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:53:37 CET,0.0 2.264 2.804 3.185 3.481 3.755 3.983 4.188 4.593 4.789 4.963 5.088 5.405 5.532 5.787 6.054 6.293 6.398 6.623 6.81 7.034 7.185 7.351 7.599 7.83 8.051 8.268 8.47 8.709 8.943 9.182 9.472 9.74 10.007 10.29 10.568 10.841 11.141 11.452 11.787 12.136 12.505 12.924 13.305 13.706 14.131 14.558 14.967 15.358 15.607 15.573 15.183 14.701 14.172 13.578 12.999 12.457 11.938 11.508 11.07 10.65 10.244 9.831 9.446 9.113 8.802 8.48 8.197 7.947 7.684 7.395 7.147 6.89 6.633 6.436 6.233 6.021 5.794 5.549 5.385 5.218 4.961 4.796 4.623 4.522 4.299 4.07 3.829 3.702 3.376 3.283 3.143 2.998 2.674 2.502 2.332 2.135 1.901 1.618 1.245 0.245 -3 ,4722 ,KEBNE ,17024798,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:54:11 CET,0.0 1.668 2.187 2.555 2.812 3.026 3.248 3.462 3.818 3.985 4.155 4.297 4.634 4.77 5.023 5.257 5.452 5.553 5.763 5.956 6.241 6.428 6.603 6.84 7.067 7.31 7.541 7.745 8.0 8.241 8.467 8.733 8.994 9.256 9.572 9.903 10.19 10.501 10.838 11.182 11.523 11.904 12.346 12.769 13.223 13.682 14.157 14.622 15.074 15.49 15.658 15.331 14.837 14.292 13.747 13.198 12.636 12.125 11.692 11.25 10.867 10.502 10.144 9.791 9.43 9.086 8.731 8.412 8.141 7.862 7.569 7.327 7.079 6.818 6.609 6.399 6.18 5.947 5.701 5.53 5.355 5.079 4.886 4.688 4.59 4.384 4.153 3.893 3.758 3.443 3.362 3.212 3.056 2.703 2.523 2.338 2.123 1.881 1.599 1.218 0.173 -4 ,19478 ,KEBNE ,17024799,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:53:39 CET,0.0 1.532 1.993 2.345 2.657 2.926 3.162 3.391 3.8 3.972 4.136 4.264 4.583 4.713 5.001 5.259 5.478 5.587 5.781 5.969 6.257 6.438 6.599 6.825 7.05 7.262 7.453 7.643 7.882 8.101 8.315 8.588 8.855 9.102 9.378 9.69 9.988 10.291 10.593 10.904 11.26 11.645 12.02 12.403 12.843 13.299 13.817 14.289 14.756 15.149 15.187 14.814 14.321 13.747 13.083 12.471 11.935 11.417 10.944 10.461 10.051 9.695 9.377 9.064 8.736 8.42 8.084 7.759 7.478 7.205 6.925 6.69 6.441 6.193 6.0 5.804 5.601 5.377 5.143 4.985 4.817 4.528 4.329 4.132 4.032 3.825 3.593 3.354 3.227 2.902 2.851 2.713 2.555 2.214 2.017 1.814 1.62 1.383 1.116 0.834 0.261 -5 ,15117 ,KEBNE ,17024800,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:53:06 CET,0.0 1.286 1.757 2.13 2.458 2.759 3.035 3.257 3.619 3.799 3.979 4.131 4.465 4.608 4.886 5.161 5.406 5.517 5.729 5.932 6.222 6.402 6.568 6.797 7.021 7.242 7.47 7.686 7.937 8.175 8.406 8.676 8.923 9.149 9.414 9.714 9.998 10.302 10.609 10.92 11.239 11.599 12.012 12.418 12.868 13.33 13.831 14.302 14.723 15.075 15.203 14.949 14.428 13.762 13.088 12.441 11.853 11.319 10.863 10.401 9.984 9.6 9.235 8.894 8.583 8.299 7.982 7.68 7.417 7.142 6.869 6.643 6.391 6.13 5.934 5.743 5.546 5.334 5.111 4.945 4.761 4.479 4.281 4.061 3.944 3.719 3.493 3.234 3.097 2.777 2.691 2.534 2.373 2.026 1.834 1.63 1.424 1.201 0.92 0.56 -0.351 -6 ,19392 ,KEBNE ,17024801,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:53:00 CET,0.0 1.723 2.296 2.88 3.365 3.703 3.978 4.224 4.609 4.767 4.905 4.964 5.267 5.393 5.655 5.918 6.138 6.245 6.455 6.668 6.98 7.166 7.336 7.597 7.859 8.101 8.323 8.528 8.786 9.02 9.239 9.515 9.768 9.995 10.261 10.551 10.818 11.071 11.334 11.63 11.943 12.279 12.654 13.023 13.458 13.897 14.357 14.828 15.236 15.567 15.662 15.375 14.923 14.371 13.836 13.319 12.834 12.437 12.095 11.725 11.376 11.025 10.672 10.364 10.111 9.86 9.567 9.316 9.11 8.894 8.678 8.488 8.291 8.092 7.922 7.747 7.562 7.364 7.158 7.011 6.865 6.63 6.46 6.282 6.188 6.013 5.832 5.615 5.501 5.192 5.122 4.984 4.831 4.524 4.366 4.198 4.003 3.801 3.607 3.341 2.501 -7 ,19599 ,KEBNE ,17024802,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:52:35 CET,0.0 2.596 3.354 3.797 4.138 4.412 4.667 4.896 5.249 5.414 5.591 5.733 6.065 6.217 6.5 6.716 6.924 7.039 7.244 7.429 7.721 7.912 8.08 8.308 8.52 8.736 8.958 9.17 9.444 9.705 9.937 10.193 10.427 10.659 10.928 11.221 11.51 11.822 12.137 12.458 12.783 13.144 13.566 13.975 14.414 14.903 15.452 15.97 16.415 16.738 16.804 16.478 15.906 15.246 14.682 14.137 13.617 13.141 12.715 12.226 11.748 11.342 10.987 10.669 10.367 10.074 9.767 9.476 9.227 8.992 8.733 8.491 8.238 7.973 7.775 7.587 7.399 7.194 6.961 6.786 6.592 6.292 6.101 5.92 5.826 5.623 5.407 5.167 5.039 4.728 4.638 4.492 4.347 4.04 3.88 3.71 3.508 3.273 2.992 2.658 1.521 -8 ,14068 ,KEBNE ,17024803,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:52:35 CET,0.0 1.936 2.51 2.897 3.205 3.476 3.721 3.931 4.289 4.454 4.637 4.807 5.143 5.293 5.566 5.811 6.037 6.144 6.361 6.593 6.916 7.1 7.274 7.532 7.774 7.995 8.203 8.405 8.646 8.867 9.099 9.393 9.663 9.92 10.229 10.574 10.896 11.246 11.604 11.948 12.283 12.667 13.123 13.558 14.046 14.574 15.103 15.579 16.017 16.373 16.511 16.272 15.745 15.148 14.577 14.05 13.586 13.122 12.703 12.297 11.924 11.562 11.232 10.915 10.625 10.379 10.102 9.842 9.625 9.397 9.16 8.962 8.745 8.519 8.34 8.148 7.948 7.742 7.521 7.376 7.23 6.995 6.838 6.655 6.555 6.347 6.134 5.924 5.816 5.518 5.453 5.3 5.147 4.845 4.685 4.524 4.344 4.129 3.887 3.602 2.881 -9 ,24056 ,KEBNE ,17024805,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:53:49 CET,0.0 2.516 3.15 3.556 3.845 4.116 4.348 4.55 4.92 5.108 5.287 5.43 5.766 5.906 6.164 6.392 6.636 6.755 6.964 7.155 7.398 7.553 7.701 7.911 8.127 8.327 8.525 8.728 8.969 9.194 9.421 9.684 9.926 10.157 10.407 10.679 10.965 11.283 11.604 11.945 12.29 12.658 13.038 13.375 13.776 14.172 14.581 14.996 15.393 15.776 15.758 15.261 14.712 14.151 13.629 13.086 12.513 11.982 11.573 11.182 10.755 10.348 9.996 9.639 9.28 8.968 8.659 8.373 8.112 7.846 7.586 7.377 7.148 6.891 6.69 6.493 6.276 6.04 5.794 5.621 5.444 5.157 4.959 4.758 4.657 4.437 4.18 3.917 3.792 3.471 3.389 3.252 3.11 2.789 2.628 2.451 2.238 1.994 1.724 1.348 0.25 -10 ,31568 ,KEBNE ,17024806,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:53:35 CET,0.0 1.178 1.665 2.006 2.276 2.518 2.762 2.996 3.393 3.569 3.73 3.848 4.197 4.353 4.612 4.856 5.074 5.173 5.367 5.56 5.85 6.023 6.188 6.438 6.655 6.867 7.081 7.284 7.543 7.784 8.015 8.298 8.554 8.793 9.092 9.438 9.743 10.07 10.43 10.804 11.179 11.573 12.042 12.471 12.928 13.444 14.008 14.591 15.13 15.585 15.768 15.459 14.889 14.27 13.718 13.133 12.578 12.072 11.612 11.134 10.73 10.363 9.98 9.615 9.299 9.006 8.663 8.351 8.09 7.832 7.544 7.276 6.997 6.73 6.538 6.342 6.131 5.897 5.653 5.483 5.307 5.051 4.879 4.693 4.595 4.4 4.185 3.941 3.815 3.496 3.377 3.209 3.043 2.704 2.507 2.287 2.063 1.829 1.568 1.242 0.364 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_38_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_38_39.txt deleted file mode 100644 index 66d7ff29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_38_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1166 ,TETRA ,17559029,Sat Nov 27 04:18:45 CET,Sat Nov 27 06:16:34 CET,0.0 1.973 2.278 2.556 2.824 3.088 3.344 3.554 3.911 4.082 4.24 4.329 4.647 4.785 5.061 5.323 5.559 5.673 5.899 6.107 6.413 6.619 6.817 7.089 7.335 7.587 7.838 8.077 8.395 8.687 8.962 9.284 9.57 9.839 10.154 10.516 10.863 11.25 11.678 12.112 12.541 13.025 13.563 14.07 14.655 15.263 15.902 16.547 17.232 17.901 18.39 18.362 17.953 17.418 16.861 16.296 15.777 15.274 14.807 14.292 13.802 13.354 12.953 12.583 12.219 11.897 11.571 11.281 11.024 10.749 10.474 10.238 9.988 9.734 9.531 9.31 9.067 8.82 8.587 8.425 8.248 7.978 7.789 7.584 7.476 7.251 7.006 6.768 6.652 6.336 6.24 6.086 5.925 5.567 5.366 5.154 4.927 4.659 4.353 3.981 3.132 -2 ,18607 ,TETRA ,17559030,Sat Nov 27 04:19:44 CET,Sat Nov 27 06:16:19 CET,0.0 3.168 3.901 4.44 4.906 5.318 5.666 5.983 6.54 6.762 6.958 7.135 7.489 7.661 7.993 8.29 8.576 8.715 8.984 9.246 9.599 9.817 10.034 10.36 10.663 10.929 11.178 11.413 11.723 12.024 12.308 12.646 12.959 13.249 13.576 13.928 14.267 14.632 14.999 15.396 15.836 16.318 16.85 17.375 17.949 18.555 19.246 19.92 20.602 21.298 21.823 21.822 21.551 21.186 20.709 20.2 19.775 19.363 18.929 18.437 17.993 17.57 17.157 16.788 16.445 16.137 15.8 15.487 15.232 14.977 14.703 14.474 14.236 13.979 13.779 13.577 13.368 13.139 12.884 12.708 12.537 12.253 12.047 11.843 11.742 11.547 11.349 11.135 11.024 10.713 10.608 10.453 10.275 9.875 9.671 9.444 9.184 8.901 8.606 8.223 6.296 -3 ,22869 ,TETRA ,17559031,Sat Nov 27 04:19:44 CET,Sat Nov 27 06:17:36 CET,0.0 0.99 1.4 1.734 2.027 2.272 2.495 2.712 3.127 3.323 3.49 3.613 3.944 4.078 4.342 4.61 4.876 5.012 5.263 5.493 5.823 6.032 6.242 6.559 6.854 7.126 7.4 7.662 7.987 8.302 8.599 8.951 9.288 9.61 9.972 10.369 10.762 11.178 11.595 12.05 12.534 13.047 13.643 14.257 14.943 15.667 16.477 17.377 18.311 19.172 19.839 19.835 19.418 18.885 18.364 17.856 17.373 16.87 16.358 15.842 15.433 15.092 14.754 14.407 14.056 13.72 13.371 13.058 12.777 12.476 12.165 11.923 11.665 11.367 11.142 10.93 10.68 10.375 10.054 9.833 9.6 9.256 9.03 8.783 8.652 8.373 8.071 7.742 7.551 7.161 6.963 6.748 6.536 6.078 5.801 5.511 5.225 4.885 4.468 3.853 1.54 -4 ,13257 ,TETRA ,17559032,Sat Nov 27 04:21:48 CET,Sat Nov 27 06:19:15 CET,0.0 1.712 2.202 2.56 2.845 3.085 3.293 3.501 3.943 4.138 4.302 4.45 4.789 4.937 5.217 5.458 5.7 5.819 6.045 6.265 6.583 6.794 6.99 7.264 7.551 7.836 8.121 8.418 8.795 9.122 9.411 9.74 10.046 10.341 10.687 11.084 11.449 11.822 12.196 12.603 13.028 13.463 13.947 14.413 14.963 15.532 16.067 16.579 17.065 17.409 17.356 16.82 16.221 15.629 15.042 14.472 13.951 13.405 12.863 12.291 11.76 11.308 10.926 10.567 10.194 9.83 9.456 9.142 8.871 8.555 8.216 7.932 7.643 7.35 7.125 6.887 6.639 6.381 6.104 5.914 5.715 5.379 5.14 4.896 4.777 4.533 4.279 4.008 3.864 3.535 3.406 3.239 3.056 2.623 2.388 2.163 1.921 1.627 1.266 0.811 -0.46 -5 ,12337 ,TETRA ,17559033,Sat Nov 27 04:21:49 CET,Sat Nov 27 06:18:43 CET,0.0 1.242 1.685 2.017 2.321 2.602 2.856 3.066 3.437 3.606 3.76 3.879 4.208 4.35 4.629 4.875 5.089 5.191 5.389 5.583 5.877 6.07 6.259 6.532 6.787 7.025 7.266 7.505 7.792 8.056 8.324 8.656 8.961 9.252 9.586 9.942 10.268 10.623 11.01 11.412 11.821 12.28 12.838 13.382 13.961 14.528 15.094 15.673 16.204 16.646 16.878 16.603 16.012 15.366 14.747 14.168 13.613 13.059 12.569 12.072 11.593 11.138 10.713 10.307 9.941 9.611 9.249 8.932 8.645 8.328 8.007 7.747 7.483 7.216 7.019 6.801 6.555 6.302 6.033 5.842 5.658 5.369 5.152 4.927 4.815 4.573 4.324 4.08 3.957 3.646 3.558 3.417 3.268 2.931 2.727 2.509 2.292 2.057 1.749 1.311 0.048 -6 ,712 ,TETRA ,17559034,Sat Nov 27 04:21:49 CET,Sat Nov 27 06:22:10 CET,0.0 1.049 1.486 1.838 2.153 2.434 2.68 2.88 3.222 3.393 3.553 3.658 3.965 4.099 4.368 4.616 4.863 4.979 5.191 5.416 5.741 5.935 6.125 6.402 6.653 6.88 7.099 7.316 7.595 7.867 8.134 8.446 8.737 9.022 9.351 9.711 10.041 10.389 10.752 11.138 11.524 11.933 12.397 12.869 13.424 14.011 14.582 15.108 15.653 16.126 16.32 15.989 15.455 14.852 14.235 13.615 13.042 12.518 12.051 11.57 11.148 10.738 10.33 9.96 9.625 9.325 9.004 8.702 8.43 8.155 7.877 7.628 7.351 7.053 6.827 6.6 6.363 6.132 5.901 5.728 5.54 5.246 5.05 4.847 4.737 4.504 4.265 4.007 3.867 3.532 3.352 3.144 2.952 2.545 2.314 2.068 1.81 1.512 1.153 0.685 -1.586 -7 ,11473 ,TETRA ,17559035,Sat Nov 27 04:23:46 CET,Sat Nov 27 06:24:23 CET,0.0 1.537 1.996 2.324 2.614 2.859 3.069 3.261 3.63 3.809 3.959 4.03 4.34 4.477 4.755 5.014 5.25 5.355 5.559 5.76 6.051 6.246 6.429 6.683 6.932 7.171 7.391 7.599 7.885 8.174 8.444 8.764 9.064 9.354 9.677 10.014 10.342 10.713 11.108 11.503 11.912 12.367 12.857 13.307 13.81 14.363 14.947 15.504 16.072 16.581 16.764 16.338 15.728 15.071 14.399 13.762 13.181 12.625 12.127 11.602 11.155 10.765 10.38 10.022 9.638 9.275 8.932 8.617 8.343 8.061 7.782 7.553 7.293 7.017 6.804 6.57 6.34 6.108 5.844 5.664 5.493 5.222 5.022 4.804 4.688 4.455 4.219 3.953 3.81 3.489 3.395 3.239 3.07 2.651 2.422 2.214 1.998 1.751 1.409 0.979 -0.79 -8 ,22619 ,TETRA ,17559036,Sat Nov 27 04:25:44 CET,Sat Nov 27 06:22:20 CET,0.0 1.159 1.568 1.918 2.225 2.483 2.717 2.934 3.358 3.558 3.748 3.916 4.271 4.448 4.773 5.078 5.378 5.511 5.761 6.01 6.394 6.651 6.897 7.232 7.529 7.814 8.092 8.356 8.703 9.045 9.376 9.771 10.148 10.504 10.902 11.331 11.736 12.181 12.657 13.147 13.654 14.212 14.802 15.393 16.114 16.89 17.745 18.546 19.165 19.588 19.635 19.02 18.166 17.437 16.827 16.184 15.584 14.994 14.468 13.963 13.507 13.086 12.655 12.248 11.894 11.557 11.189 10.865 10.566 10.242 9.923 9.641 9.354 9.077 8.844 8.591 8.348 8.086 7.789 7.582 7.375 7.088 6.884 6.648 6.529 6.293 6.027 5.735 5.588 5.256 5.106 4.93 4.752 4.344 4.121 3.885 3.617 3.33 3.024 2.612 1.197 -9 ,32634 ,TETRA ,17559037,Sat Nov 27 04:28:47 CET,Sat Nov 27 06:27:07 CET,0.0 1.342 1.796 2.129 2.404 2.668 2.93 3.166 3.59 3.787 3.986 4.172 4.514 4.656 4.904 5.138 5.361 5.471 5.689 5.898 6.19 6.365 6.533 6.788 7.038 7.272 7.493 7.701 7.957 8.242 8.533 8.861 9.168 9.448 9.773 10.141 10.479 10.857 11.288 11.737 12.211 12.733 13.292 13.835 14.465 15.129 15.828 16.554 17.287 17.967 18.347 18.195 17.815 17.302 16.766 16.225 15.719 15.223 14.818 14.398 13.974 13.573 13.187 12.833 12.483 12.134 11.762 11.435 11.154 10.87 10.559 10.29 10.016 9.742 9.53 9.295 9.05 8.813 8.566 8.38 8.177 7.865 7.669 7.464 7.35 7.112 6.858 6.593 6.443 6.099 5.998 5.824 5.632 5.256 5.064 4.846 4.589 4.302 3.972 3.456 2.008 -10 ,20204 ,TETRA ,17559038,Sat Nov 27 04:28:47 CET,Sat Nov 27 06:20:40 CET,0.0 1.53 2.029 2.403 2.671 2.9 3.116 3.313 3.682 3.857 4.024 4.139 4.454 4.584 4.851 5.103 5.349 5.482 5.728 5.947 6.266 6.465 6.663 6.952 7.208 7.441 7.663 7.883 8.159 8.428 8.693 9.023 9.337 9.613 9.911 10.252 10.604 10.988 11.363 11.763 12.175 12.592 13.059 13.516 14.037 14.589 15.207 15.847 16.451 16.994 17.249 16.978 16.494 15.921 15.31 14.723 14.194 13.671 13.197 12.668 12.17 11.75 11.361 10.969 10.59 10.25 9.893 9.555 9.246 8.928 8.602 8.33 8.068 7.808 7.595 7.368 7.131 6.879 6.613 6.421 6.218 5.914 5.703 5.481 5.364 5.123 4.887 4.643 4.509 4.183 4.069 3.908 3.735 3.346 3.114 2.845 2.574 2.311 2.015 1.62 0.584 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_38_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_38_40.txt deleted file mode 100644 index 67c1b30d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_38_40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16179 ,TETRA ,17559039,Sat Nov 27 04:28:46 CET,Sat Nov 27 06:29:01 CET,0.0 3.134 3.92 4.407 4.866 5.264 5.553 5.821 6.321 6.533 6.731 6.942 7.296 7.46 7.763 8.071 8.358 8.488 8.729 8.951 9.276 9.49 9.682 9.965 10.24 10.476 10.703 10.934 11.222 11.487 11.732 12.002 12.241 12.469 12.718 12.971 13.197 13.414 13.62 13.818 14.01 14.188 14.378 14.528 14.618 14.65 14.583 14.351 13.856 12.898 10.976 8.453 6.334 4.564 3.074 1.732 0.539 -0.523 -1.439 -2.327 -3.051 -3.687 -4.274 -4.843 -5.38 -5.87 -6.382 -6.805 -7.166 -7.546 -7.946 -8.277 -8.614 -8.977 -9.259 -9.557 -9.869 -10.187 -10.522 -10.744 -10.969 -11.343 -11.591 -11.847 -11.98 -12.257 -12.566 -12.868 -13.014 -13.376 -13.54 -13.735 -13.927 -14.319 -14.547 -14.836 -15.13 -15.418 -15.821 -16.468 -18.25 -2 ,9895 ,TETRA ,17559040,Sat Nov 27 04:29:45 CET,Sat Nov 27 06:27:13 CET,0.0 7.979 8.612 9.074 9.432 9.737 10.04 10.337 10.83 11.036 11.215 11.373 11.726 11.883 12.183 12.473 12.746 12.872 13.093 13.311 13.639 13.829 14.006 14.261 14.486 14.677 14.854 15.023 15.236 15.454 15.66 15.885 16.107 16.321 16.554 16.816 17.059 17.304 17.551 17.788 18.011 18.206 18.383 18.541 18.653 18.712 18.705 18.558 18.226 17.615 16.093 13.78 11.768 10.075 8.545 7.133 5.922 4.839 3.935 3.066 2.345 1.714 1.121 0.551 0.002 -0.488 -0.984 -1.428 -1.816 -2.228 -2.654 -2.996 -3.346 -3.711 -3.996 -4.288 -4.583 -4.879 -5.195 -5.415 -5.645 -6.006 -6.248 -6.503 -6.633 -6.909 -7.194 -7.49 -7.658 -8.033 -8.168 -8.347 -8.558 -9.061 -9.338 -9.607 -9.901 -10.242 -10.635 -11.159 -12.729 -3 ,5803 ,TETRA ,17559041,Sat Nov 27 04:31:49 CET,Sat Nov 27 06:28:10 CET,0.0 3.798 4.431 4.914 5.329 5.704 6.032 6.301 6.759 6.971 7.154 7.332 7.674 7.836 8.155 8.453 8.736 8.865 9.094 9.317 9.64 9.834 10.018 10.285 10.545 10.796 11.045 11.296 11.583 11.827 12.077 12.364 12.606 12.862 13.163 13.482 13.808 14.148 14.43 14.647 14.856 15.042 15.198 15.334 15.445 15.487 15.429 15.248 14.857 14.065 12.428 10.218 8.272 6.594 5.141 3.82 2.627 1.529 0.602 -0.316 -1.096 -1.77 -2.422 -3.051 -3.618 -4.112 -4.627 -5.094 -5.505 -5.924 -6.346 -6.7 -7.064 -7.436 -7.719 -8.0 -8.298 -8.629 -8.965 -9.19 -9.425 -9.785 -10.031 -10.279 -10.409 -10.697 -10.989 -11.29 -11.455 -11.824 -11.98 -12.17 -12.354 -12.745 -12.971 -13.218 -13.5 -13.844 -14.254 -14.801 -16.122 -4 ,25308 ,TETRA ,17559042,Sat Nov 27 04:32:52 CET,Sat Nov 27 06:37:22 CET,0.0 2.819 3.616 4.174 4.603 4.996 5.302 5.547 6.004 6.206 6.396 6.565 6.918 7.1 7.416 7.699 7.996 8.131 8.363 8.58 8.898 9.098 9.278 9.533 9.782 10.006 10.209 10.405 10.645 10.862 11.058 11.288 11.509 11.707 11.919 12.139 12.347 12.598 12.871 13.144 13.402 13.639 13.86 14.025 14.171 14.258 14.217 14.066 13.675 12.833 11.155 8.907 6.957 5.239 3.746 2.453 1.318 0.294 -0.557 -1.417 -2.161 -2.823 -3.459 -4.042 -4.601 -5.122 -5.636 -6.073 -6.455 -6.857 -7.253 -7.576 -7.921 -8.275 -8.546 -8.831 -9.128 -9.435 -9.756 -9.982 -10.223 -10.605 -10.857 -11.12 -11.258 -11.526 -11.789 -12.072 -12.225 -12.574 -12.681 -12.842 -13.021 -13.448 -13.669 -13.901 -14.18 -14.449 -14.732 -15.143 -16.373 -5 ,10372 ,TETRA ,17559043,Sat Nov 27 04:32:54 CET,Sat Nov 27 06:36:58 CET,0.0 3.124 3.867 4.356 4.789 5.197 5.524 5.79 6.3 6.535 6.739 6.927 7.288 7.451 7.721 7.965 8.19 8.299 8.516 8.743 9.08 9.278 9.468 9.747 10.014 10.268 10.479 10.663 10.909 11.128 11.329 11.565 11.785 11.999 12.222 12.443 12.655 12.882 13.076 13.241 13.42 13.592 13.748 13.901 14.017 14.077 14.032 13.819 13.336 12.404 10.706 8.51 6.557 4.838 3.325 1.936 0.741 -0.316 -1.221 -2.127 -2.891 -3.553 -4.169 -4.74 -5.273 -5.772 -6.291 -6.749 -7.143 -7.542 -7.958 -8.303 -8.664 -9.036 -9.323 -9.622 -9.921 -10.236 -10.564 -10.792 -11.017 -11.36 -11.601 -11.852 -11.984 -12.262 -12.556 -12.86 -13.025 -13.408 -13.561 -13.735 -13.908 -14.313 -14.543 -14.8 -15.082 -15.385 -15.715 -16.117 -17.117 -6 ,12252 ,TETRA ,17559044,Sat Nov 27 04:33:53 CET,Sat Nov 27 06:30:51 CET,0.0 2.754 3.486 4.055 4.517 4.872 5.171 5.442 5.926 6.149 6.331 6.447 6.763 6.9 7.159 7.411 7.643 7.752 7.965 8.162 8.439 8.614 8.782 9.015 9.217 9.4 9.578 9.753 9.98 10.187 10.383 10.622 10.84 11.022 11.218 11.436 11.633 11.828 12.028 12.241 12.438 12.6 12.753 12.926 13.099 13.151 13.043 12.784 12.306 11.344 9.483 7.135 5.161 3.487 2.048 0.788 -0.318 -1.34 -2.209 -3.051 -3.772 -4.425 -5.048 -5.614 -6.129 -6.606 -7.104 -7.546 -7.922 -8.302 -8.694 -9.024 -9.363 -9.729 -10.024 -10.307 -10.591 -10.888 -11.209 -11.424 -11.641 -12.004 -12.258 -12.504 -12.629 -12.922 -13.248 -13.582 -13.752 -14.118 -14.27 -14.468 -14.666 -15.078 -15.308 -15.56 -15.825 -16.119 -16.477 -16.96 -18.348 -7 ,26152 ,TETRA ,17559045,Sat Nov 27 04:34:52 CET,Sat Nov 27 06:31:10 CET,0.0 2.679 3.324 3.892 4.349 4.695 4.982 5.249 5.716 5.944 6.163 6.331 6.677 6.834 7.135 7.424 7.68 7.803 8.042 8.264 8.578 8.767 8.957 9.243 9.502 9.746 9.973 10.191 10.454 10.699 10.928 11.176 11.412 11.627 11.861 12.118 12.355 12.604 12.839 13.089 13.331 13.543 13.77 13.949 14.095 14.172 14.18 14.078 13.723 12.88 11.111 8.81 6.785 5.019 3.513 2.209 1.089 0.08 -0.768 -1.607 -2.329 -2.991 -3.635 -4.232 -4.787 -5.282 -5.794 -6.263 -6.664 -7.068 -7.483 -7.817 -8.174 -8.567 -8.874 -9.176 -9.481 -9.798 -10.112 -10.332 -10.556 -10.905 -11.167 -11.44 -11.579 -11.86 -12.144 -12.452 -12.626 -12.999 -13.116 -13.291 -13.486 -13.927 -14.16 -14.405 -14.674 -15.001 -15.399 -15.909 -16.958 -8 ,8114 ,TETRA ,17559046,Sat Nov 27 04:34:51 CET,Sat Nov 27 06:32:29 CET,0.0 2.952 3.63 4.073 4.497 4.867 5.189 5.487 5.989 6.2 6.407 6.643 7.006 7.174 7.487 7.781 8.048 8.169 8.408 8.645 8.967 9.147 9.308 9.539 9.752 9.965 10.18 10.376 10.616 10.844 11.057 11.309 11.553 11.775 11.997 12.208 12.404 12.6 12.76 12.906 13.055 13.194 13.307 13.399 13.456 13.436 13.329 13.121 12.698 11.784 10.034 7.742 5.769 4.092 2.658 1.318 0.095 -0.995 -1.916 -2.809 -3.542 -4.185 -4.799 -5.377 -5.909 -6.385 -6.888 -7.346 -7.735 -8.143 -8.566 -8.923 -9.294 -9.659 -9.937 -10.224 -10.517 -10.824 -11.145 -11.372 -11.606 -11.955 -12.207 -12.473 -12.602 -12.877 -13.179 -13.496 -13.649 -14.002 -14.148 -14.362 -14.602 -15.108 -15.395 -15.703 -16.023 -16.4 -16.819 -17.315 -18.639 -9 ,21756 ,TETRA ,17559047,Sat Nov 27 04:34:52 CET,Sat Nov 27 06:32:27 CET,0.0 4.456 5.023 5.428 5.792 6.1 6.349 6.61 7.088 7.274 7.443 7.573 7.898 8.033 8.289 8.537 8.773 8.879 9.08 9.285 9.567 9.732 9.888 10.119 10.351 10.581 10.797 10.993 11.23 11.451 11.658 11.898 12.125 12.353 12.608 12.863 13.066 13.256 13.444 13.615 13.797 13.99 14.182 14.356 14.477 14.517 14.469 14.277 13.91 13.15 11.568 9.516 7.718 6.135 4.767 3.528 2.436 1.491 0.663 -0.18 -0.88 -1.505 -2.094 -2.65 -3.178 -3.647 -4.133 -4.572 -4.963 -5.392 -5.845 -6.209 -6.588 -6.993 -7.303 -7.623 -7.942 -8.25 -8.57 -8.814 -9.063 -9.425 -9.678 -9.946 -10.09 -10.391 -10.686 -10.994 -11.165 -11.537 -11.686 -11.874 -12.078 -12.553 -12.808 -13.084 -13.397 -13.725 -14.172 -14.822 -16.524 -10 ,27043 ,TETRA ,17559048,Sat Nov 27 04:35:51 CET,Sat Nov 27 06:15:47 CET,0.0 3.248 3.873 4.272 4.599 4.91 5.192 5.444 5.893 6.097 6.283 6.445 6.769 6.913 7.204 7.492 7.777 7.912 8.134 8.339 8.645 8.83 9.003 9.245 9.443 9.665 9.903 10.127 10.403 10.634 10.843 11.095 11.32 11.526 11.772 12.034 12.252 12.466 12.69 12.901 13.091 13.285 13.491 13.64 13.741 13.823 13.817 13.636 13.201 12.33 10.539 8.09 5.944 4.105 2.531 1.154 0.026 -0.96 -1.822 -2.703 -3.445 -4.076 -4.691 -5.278 -5.802 -6.271 -6.772 -7.22 -7.601 -7.99 -8.382 -8.707 -9.049 -9.396 -9.668 -9.958 -10.26 -10.571 -10.895 -11.124 -11.359 -11.723 -11.988 -12.261 -12.399 -12.676 -12.959 -13.253 -13.407 -13.775 -13.915 -14.109 -14.309 -14.746 -14.98 -15.224 -15.511 -15.835 -16.223 -16.687 -17.964 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_39_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_39_41.txt deleted file mode 100644 index 59b9784e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_39_41.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31944 ,KEBNE ,17024807,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:53:55 CET,0.0 4.139 4.929 5.508 5.997 6.445 6.86 7.242 7.917 8.214 8.483 8.808 9.245 9.496 9.97 10.399 10.762 10.911 11.198 11.449 11.805 12.053 12.277 12.58 12.874 13.157 13.427 13.68 14.002 14.317 14.627 15.006 15.373 15.708 16.076 16.458 16.81 17.2 17.607 18.017 18.429 18.866 19.357 19.859 20.412 20.963 21.557 22.166 22.67 23.0 22.958 22.34 21.543 20.713 19.915 19.172 18.498 17.881 17.328 16.761 16.287 15.841 15.396 14.973 14.577 14.214 13.845 13.512 13.208 12.881 12.555 12.283 11.984 11.685 11.452 11.201 10.946 10.687 10.406 10.208 9.999 9.65 9.414 9.185 9.066 8.807 8.535 8.243 8.085 7.722 7.576 7.401 7.206 6.773 6.534 6.285 6.001 5.642 5.262 4.815 3.194 -2 ,8599 ,KEBNE ,17024808,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:53:48 CET,0.0 4.144 5.015 5.636 6.174 6.652 7.08 7.433 8.005 8.256 8.472 8.703 9.087 9.265 9.588 9.9 10.175 10.31 10.583 10.818 11.127 11.336 11.551 11.849 12.13 12.406 12.671 12.927 13.239 13.515 13.797 14.133 14.442 14.734 15.052 15.416 15.77 16.149 16.548 16.949 17.372 17.814 18.27 18.718 19.213 19.711 20.222 20.738 21.206 21.452 21.318 20.64 19.733 18.877 18.103 17.348 16.661 16.007 15.44 14.835 14.298 13.822 13.341 12.892 12.475 12.081 11.654 11.255 10.905 10.537 10.156 9.861 9.565 9.255 9.008 8.738 8.458 8.179 7.899 7.7 7.487 7.163 6.94 6.701 6.58 6.333 6.075 5.811 5.67 5.323 5.217 5.078 4.925 4.579 4.38 4.156 3.877 3.556 3.18 2.744 0.843 -3 ,27692 ,KEBNE ,17024809,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:54:25 CET,0.0 3.788 4.667 5.24 5.634 5.989 6.305 6.581 7.084 7.322 7.541 7.76 8.114 8.282 8.616 8.936 9.237 9.379 9.645 9.911 10.306 10.549 10.774 11.088 11.388 11.676 11.969 12.253 12.599 12.92 13.212 13.547 13.879 14.205 14.571 14.98 15.356 15.757 16.173 16.589 16.987 17.413 17.901 18.365 18.872 19.39 19.904 20.394 20.827 21.09 20.928 20.302 19.477 18.601 17.821 17.064 16.355 15.745 15.186 14.58 14.065 13.592 13.135 12.698 12.277 11.906 11.528 11.166 10.852 10.516 10.163 9.884 9.584 9.266 9.007 8.744 8.488 8.218 7.923 7.719 7.526 7.225 6.999 6.775 6.657 6.407 6.162 5.898 5.759 5.423 5.273 5.104 4.936 4.543 4.314 4.078 3.823 3.506 3.107 2.469 0.434 -4 ,20453 ,KEBNE ,17024810,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:54:40 CET,0.0 2.731 3.486 4.041 4.476 4.843 5.179 5.495 6.063 6.316 6.561 6.87 7.275 7.475 7.858 8.218 8.558 8.716 9.031 9.339 9.755 10.011 10.264 10.618 10.954 11.268 11.552 11.819 12.144 12.478 12.828 13.229 13.585 13.904 14.255 14.637 15.005 15.419 15.868 16.296 16.732 17.227 17.735 18.166 18.634 19.141 19.605 20.076 20.551 20.724 20.355 19.401 18.287 17.228 16.291 15.432 14.624 13.877 13.263 12.639 12.077 11.573 11.072 10.6 10.161 9.758 9.341 8.945 8.61 8.278 7.932 7.634 7.332 7.02 6.773 6.52 6.258 5.994 5.72 5.521 5.307 4.947 4.7 4.447 4.313 4.034 3.748 3.434 3.261 2.91 2.765 2.582 2.417 2.1 1.876 1.636 1.43 1.159 0.786 0.298 -1.041 -5 ,12296 ,KEBNE ,17024811,Wed Dec 22 11:11:55 CET,Wed Dec 22 12:54:07 CET,0.0 9.276 10.003 10.503 10.909 11.251 11.553 11.847 12.398 12.647 12.883 13.155 13.548 13.757 14.156 14.515 14.837 14.993 15.305 15.599 16.008 16.265 16.504 16.81 17.104 17.406 17.696 17.979 18.348 18.697 19.017 19.347 19.673 20.043 20.467 20.907 21.313 21.768 22.228 22.626 22.979 23.419 24.02 24.591 25.11 25.544 25.978 26.399 26.629 26.516 25.918 24.736 23.503 22.387 21.482 20.657 19.875 19.163 18.565 17.941 17.378 16.892 16.422 15.972 15.551 15.162 14.749 14.361 14.034 13.693 13.331 13.036 12.724 12.394 12.146 11.89 11.614 11.319 11.015 10.803 10.583 10.251 10.023 9.788 9.664 9.417 9.151 8.849 8.702 8.358 8.2 8.035 7.856 7.453 7.241 6.993 6.704 6.366 5.957 5.424 3.14 -6 ,9047 ,KEBNE ,17024812,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:53:57 CET,0.0 3.242 4.018 4.533 4.895 5.213 5.539 5.873 6.471 6.723 6.938 7.151 7.511 7.687 8.052 8.394 8.718 8.876 9.193 9.484 9.85 10.077 10.295 10.61 10.899 11.152 11.393 11.637 11.958 12.254 12.531 12.874 13.193 13.478 13.797 14.15 14.475 14.824 15.203 15.6 16.017 16.466 16.961 17.442 17.957 18.462 18.982 19.472 19.95 20.31 20.265 19.702 18.939 18.199 17.518 16.822 16.147 15.515 14.951 14.368 13.817 13.317 12.865 12.438 12.021 11.626 11.221 10.877 10.575 10.251 9.909 9.623 9.335 9.04 8.814 8.58 8.335 8.051 7.748 7.551 7.348 7.035 6.803 6.546 6.417 6.161 5.9 5.619 5.469 5.124 4.974 4.799 4.63 4.258 4.03 3.767 3.488 3.207 2.898 2.443 0.759 -7 ,257 ,KEBNE ,17024813,Wed Dec 22 11:11:51 CET,Wed Dec 22 12:53:38 CET,0.0 4.077 4.98 5.581 6.046 6.423 6.764 7.054 7.563 7.791 7.998 8.24 8.622 8.811 9.153 9.464 9.777 9.937 10.239 10.514 10.885 11.109 11.328 11.65 11.951 12.226 12.489 12.736 13.057 13.369 13.659 14.001 14.328 14.644 15.014 15.425 15.809 16.211 16.609 17.018 17.446 17.923 18.44 18.925 19.477 20.011 20.561 21.096 21.532 21.804 21.665 20.972 20.095 19.208 18.39 17.59 16.835 16.131 15.488 14.828 14.241 13.691 13.186 12.727 12.299 11.907 11.497 11.14 10.828 10.485 10.14 9.866 9.573 9.262 9.024 8.77 8.518 8.261 7.979 7.785 7.59 7.284 7.054 6.821 6.71 6.483 6.246 5.998 5.859 5.525 5.413 5.253 5.088 4.732 4.547 4.327 4.068 3.791 3.487 3.027 0.174 -9 ,10524 ,KEBNE ,17024815,Wed Dec 22 11:12:53 CET,Wed Dec 22 12:55:44 CET,0.0 2.25 2.895 3.392 3.777 4.082 4.377 4.651 5.144 5.373 5.569 5.731 6.101 6.276 6.598 6.878 7.145 7.281 7.538 7.773 8.107 8.323 8.526 8.802 9.067 9.304 9.545 9.786 10.073 10.343 10.607 10.918 11.204 11.487 11.801 12.144 12.486 12.847 13.211 13.585 13.972 14.388 14.832 15.25 15.699 16.182 16.675 17.14 17.548 17.764 17.515 16.606 15.659 14.707 13.782 12.946 12.218 11.51 10.875 10.255 9.719 9.233 8.765 8.316 7.882 7.475 7.061 6.696 6.388 6.078 5.752 5.471 5.157 4.814 4.537 4.246 3.957 3.656 3.339 3.133 2.921 2.591 2.363 2.116 1.996 1.747 1.484 1.214 1.072 0.746 0.635 0.463 0.284 -0.101 -0.326 -0.559 -0.813 -1.097 -1.431 -1.958 -3.429 -10 ,642 ,KEBNE ,17024816,Wed Dec 22 11:12:53 CET,Wed Dec 22 12:55:34 CET,0.0 3.747 4.524 5.144 5.647 6.086 6.455 6.787 7.359 7.602 7.834 8.07 8.452 8.64 8.971 9.274 9.574 9.727 9.996 10.246 10.604 10.822 11.044 11.372 11.667 11.952 12.234 12.488 12.807 13.113 13.394 13.728 14.042 14.332 14.674 15.046 15.388 15.748 16.134 16.554 16.969 17.396 17.885 18.337 18.807 19.296 19.759 20.159 20.488 20.66 20.281 19.264 18.217 17.196 16.306 15.508 14.75 14.036 13.44 12.835 12.31 11.845 11.379 10.945 10.557 10.196 9.794 9.44 9.14 8.828 8.504 8.235 7.955 7.66 7.429 7.202 6.948 6.67 6.391 6.192 5.991 5.677 5.46 5.238 5.116 4.849 4.579 4.305 4.161 3.832 3.684 3.495 3.313 2.943 2.728 2.486 2.22 1.89 1.474 0.954 -1.723 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_40_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_40_41.txt deleted file mode 100644 index 71dc968f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_40_41.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12343 ,TETRA ,17559049,Sat Nov 27 04:35:51 CET,Sat Nov 27 06:15:57 CET,0.0 5.503 6.467 7.156 7.683 8.124 8.493 8.811 9.398 9.653 9.886 10.121 10.527 10.718 11.08 11.434 11.764 11.915 12.223 12.526 12.949 13.216 13.477 13.858 14.226 14.572 14.889 15.204 15.607 15.999 16.38 16.835 17.274 17.671 18.114 18.618 19.123 19.665 20.24 20.838 21.456 22.167 22.993 23.806 24.735 25.769 26.938 28.17 29.475 30.988 32.638 33.639 33.953 33.969 33.835 33.59 33.284 32.93 32.626 32.293 31.965 31.678 31.368 31.041 30.75 30.462 30.155 29.881 29.621 29.358 29.067 28.814 28.546 28.254 28.016 27.754 27.481 27.206 26.923 26.734 26.548 26.254 26.032 25.764 25.627 25.38 25.116 24.819 24.651 24.272 24.048 23.797 23.542 23.019 22.736 22.438 22.082 21.629 21.063 20.359 16.361 -2 ,16411 ,TETRA ,17559050,Sat Nov 27 04:35:53 CET,Sat Nov 27 06:34:02 CET,0.0 4.197 5.139 5.814 6.363 6.822 7.241 7.612 8.201 8.455 8.692 8.972 9.419 9.635 10.026 10.386 10.723 10.898 11.252 11.581 12.045 12.333 12.593 12.952 13.295 13.634 13.978 14.301 14.671 15.026 15.391 15.844 16.272 16.682 17.16 17.703 18.219 18.749 19.315 19.904 20.502 21.2 22.013 22.839 23.802 24.885 26.097 27.341 28.762 30.346 32.102 33.221 33.401 33.235 33.025 32.776 32.437 32.099 31.759 31.334 30.98 30.665 30.327 29.968 29.628 29.313 28.95 28.605 28.296 27.98 27.668 27.413 27.112 26.75 26.459 26.159 25.869 25.588 25.324 25.154 24.948 24.584 24.342 24.119 24.009 23.763 23.478 23.176 23.016 22.645 22.501 22.301 22.092 21.653 21.393 21.098 20.721 20.288 19.782 19.034 15.429 -3 ,27152 ,TETRA ,17559051,Sat Nov 27 04:35:53 CET,Sat Nov 27 06:15:45 CET,0.0 3.906 4.697 5.274 5.754 6.168 6.525 6.849 7.45 7.722 7.96 8.18 8.585 8.772 9.13 9.475 9.798 9.953 10.249 10.526 10.93 11.202 11.456 11.801 12.124 12.434 12.713 12.986 13.363 13.725 14.08 14.496 14.887 15.25 15.68 16.172 16.642 17.194 17.757 18.358 19.017 19.739 20.532 21.281 22.12 23.019 24.038 25.144 26.384 27.799 29.304 30.134 30.442 30.453 30.191 29.797 29.454 29.144 28.819 28.47 28.173 27.91 27.632 27.329 27.041 26.771 26.462 26.163 25.904 25.633 25.351 25.114 24.856 24.581 24.373 24.161 23.92 23.65 23.348 23.128 22.901 22.544 22.288 22.015 21.87 21.576 21.263 20.929 20.751 20.364 20.115 19.88 19.639 19.097 18.791 18.45 18.045 17.54 16.921 16.18 13.025 -4 ,8625 ,TETRA ,17559052,Sat Nov 27 04:35:53 CET,Sat Nov 27 06:15:29 CET,0.0 4.424 5.417 6.125 6.694 7.161 7.569 7.94 8.615 8.916 9.197 9.548 9.996 10.231 10.692 11.105 11.498 11.69 12.072 12.423 12.904 13.211 13.517 13.974 14.391 14.771 15.133 15.481 15.914 16.344 16.774 17.299 17.788 18.233 18.717 19.221 19.707 20.226 20.779 21.367 21.983 22.658 23.435 24.205 25.07 26.01 27.097 28.285 29.619 31.105 32.707 33.786 34.229 34.363 34.315 34.101 33.769 33.396 33.056 32.687 32.319 31.941 31.519 31.1 30.734 30.394 30.007 29.642 29.317 28.956 28.582 28.284 27.974 27.662 27.419 27.147 26.855 26.557 26.228 25.993 25.755 25.383 25.125 24.844 24.692 24.373 24.044 23.715 23.539 23.159 22.927 22.685 22.434 21.843 21.506 21.169 20.802 20.349 19.796 19.023 16.345 -5 ,12024 ,TETRA ,17559053,Sat Nov 27 04:35:53 CET,Sat Nov 27 06:15:59 CET,0.0 3.711 4.707 5.412 5.934 6.37 6.746 7.09 7.735 8.039 8.319 8.595 9.022 9.237 9.656 10.067 10.441 10.608 10.924 11.233 11.687 11.972 12.238 12.617 12.979 13.325 13.652 13.989 14.428 14.838 15.226 15.655 16.06 16.473 16.949 17.471 17.979 18.535 19.12 19.713 20.318 21.032 21.868 22.687 23.624 24.646 25.806 27.159 28.681 30.247 32.04 33.319 33.819 33.88 33.734 33.555 33.308 33.0 32.688 32.309 31.953 31.643 31.337 31.057 30.803 30.512 30.136 29.793 29.507 29.204 28.91 28.682 28.413 28.1 27.846 27.596 27.334 27.042 26.745 26.534 26.301 25.945 25.691 25.398 25.246 24.948 24.625 24.277 24.103 23.732 23.51 23.281 23.038 22.489 22.194 21.87 21.439 20.932 20.31 19.226 13.41 -7 ,16757 ,TETRA ,17559055,Sat Nov 27 04:36:52 CET,Sat Nov 27 06:16:53 CET,0.0 7.732 8.615 9.242 9.736 10.183 10.571 10.898 11.476 11.726 11.95 12.161 12.575 12.771 13.126 13.469 13.796 13.948 14.231 14.5 14.909 15.175 15.424 15.776 16.115 16.432 16.722 17.003 17.369 17.695 18.015 18.431 18.835 19.224 19.692 20.213 20.684 21.179 21.701 22.273 22.911 23.641 24.48 25.309 26.217 27.22 28.312 29.494 30.892 32.491 34.169 35.268 35.668 35.673 35.533 35.321 35.048 34.741 34.42 34.067 33.769 33.475 33.151 32.835 32.529 32.229 31.908 31.609 31.338 31.063 30.787 30.538 30.264 29.974 29.738 29.486 29.22 28.948 28.673 28.466 28.238 27.876 27.612 27.334 27.177 26.822 26.445 26.026 25.817 25.428 25.175 24.925 24.667 24.113 23.788 23.441 23.072 22.607 22.005 21.175 13.537 -9 ,32489 ,TETRA ,17559057,Sat Nov 27 04:36:52 CET,Sat Nov 27 06:34:06 CET,0.0 6.539 7.431 8.044 8.484 8.922 9.354 9.744 10.444 10.737 10.988 11.246 11.674 11.875 12.297 12.694 13.052 13.226 13.554 13.873 14.32 14.594 14.863 15.24 15.605 15.971 16.329 16.686 17.128 17.536 17.942 18.422 18.855 19.262 19.737 20.26 20.755 21.306 21.893 22.503 23.149 23.859 24.659 25.489 26.488 27.557 28.713 30.003 31.421 32.956 34.655 35.788 36.204 36.325 36.243 36.009 35.696 35.325 34.975 34.607 34.279 33.947 33.599 33.246 32.908 32.602 32.281 31.992 31.735 31.466 31.178 30.929 30.649 30.341 30.09 29.818 29.546 29.267 28.951 28.723 28.488 28.13 27.876 27.586 27.44 27.14 26.815 26.462 26.278 25.897 25.647 25.393 25.108 24.51 24.195 23.786 23.325 22.844 22.245 21.404 15.968 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_42_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_42_44.txt deleted file mode 100644 index 6449502d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_42_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22922 ,TETRA ,17559059,Sat Nov 27 04:36:52 CET,Sat Nov 27 06:17:10 CET,0.0 1.815 2.351 2.75 3.027 3.202 3.355 3.496 3.776 3.908 4.029 4.11 4.4 4.515 4.768 4.998 5.185 5.27 5.437 5.6 5.839 5.998 6.15 6.402 6.651 6.852 7.039 7.218 7.44 7.64 7.82 8.038 8.265 8.5 8.776 9.083 9.371 9.684 9.995 10.314 10.613 10.902 11.255 11.595 11.988 12.399 12.804 13.226 13.662 14.055 14.303 14.077 13.684 13.287 12.867 12.467 12.114 11.8 11.525 11.213 10.933 10.69 10.437 10.191 9.966 9.748 9.511 9.302 9.132 8.955 8.763 8.61 8.443 8.264 8.13 7.99 7.841 7.684 7.525 7.406 7.278 7.09 6.956 6.81 6.733 6.578 6.435 6.291 6.208 5.942 5.914 5.82 5.72 5.471 5.331 5.182 4.996 4.767 4.479 4.092 2.463 -2 ,17860 ,TETRA ,17559060,Sat Nov 27 04:36:52 CET,Sat Nov 27 06:16:36 CET,0.0 1.441 1.881 2.189 2.436 2.648 2.852 3.027 3.315 3.442 3.563 3.605 3.892 4.0 4.185 4.37 4.541 4.63 4.816 4.981 5.191 5.331 5.482 5.701 5.903 6.101 6.29 6.456 6.655 6.851 7.044 7.283 7.493 7.696 7.951 8.22 8.45 8.689 8.954 9.249 9.562 9.898 10.282 10.638 10.999 11.367 11.765 12.197 12.61 12.92 13.089 12.897 12.548 12.171 11.775 11.361 10.989 10.65 10.345 10.031 9.734 9.456 9.208 8.973 8.747 8.535 8.297 8.094 7.925 7.74 7.549 7.392 7.219 7.017 6.85 6.696 6.54 6.364 6.19 6.076 5.956 5.751 5.604 5.456 5.386 5.235 5.074 4.918 4.832 4.578 4.556 4.457 4.343 4.063 3.899 3.695 3.441 3.194 2.938 2.554 1.151 -3 ,18791 ,TETRA ,17559061,Sat Nov 27 04:36:52 CET,Sat Nov 27 06:16:42 CET,0.0 1.553 1.889 2.101 2.331 2.533 2.672 2.818 3.121 3.251 3.381 3.46 3.744 3.856 4.042 4.196 4.353 4.43 4.594 4.759 4.967 5.1 5.239 5.436 5.617 5.781 5.945 6.105 6.311 6.523 6.721 6.952 7.168 7.35 7.566 7.822 8.05 8.294 8.567 8.855 9.15 9.47 9.821 10.15 10.521 10.928 11.359 11.811 12.238 12.567 12.731 12.585 12.261 11.883 11.487 11.092 10.747 10.439 10.159 9.842 9.55 9.29 9.026 8.768 8.541 8.331 8.107 7.917 7.742 7.547 7.343 7.165 6.978 6.785 6.639 6.491 6.334 6.178 6.018 5.909 5.798 5.605 5.461 5.329 5.261 5.101 4.938 4.764 4.668 4.392 4.35 4.238 4.118 3.856 3.705 3.541 3.375 3.176 2.918 2.52 1.098 -4 ,4505 ,TETRA ,17559062,Sat Nov 27 04:36:52 CET,Sat Nov 27 06:17:21 CET,0.0 1.702 2.153 2.434 2.652 2.84 3.031 3.195 3.464 3.594 3.725 3.78 4.056 4.159 4.371 4.578 4.738 4.807 4.955 5.098 5.299 5.439 5.58 5.781 5.968 6.151 6.344 6.522 6.732 6.94 7.138 7.356 7.554 7.755 8.003 8.28 8.54 8.818 9.098 9.394 9.706 10.059 10.465 10.836 11.234 11.683 12.219 12.797 13.313 13.708 13.908 13.722 13.384 12.991 12.608 12.246 11.901 11.575 11.269 10.928 10.627 10.344 10.069 9.825 9.602 9.392 9.17 8.979 8.813 8.624 8.416 8.251 8.093 7.919 7.783 7.642 7.493 7.323 7.13 6.996 6.856 6.648 6.507 6.343 6.257 6.094 5.92 5.743 5.65 5.385 5.367 5.253 5.142 4.912 4.753 4.582 4.418 4.228 3.984 3.658 2.284 -5 ,20153 ,TETRA ,17559063,Sat Nov 27 04:36:52 CET,Sat Nov 27 06:26:54 CET,0.0 1.749 2.212 2.567 2.839 3.093 3.337 3.547 3.913 4.069 4.217 4.333 4.636 4.757 4.997 5.219 5.419 5.515 5.704 5.892 6.151 6.305 6.444 6.648 6.852 7.048 7.246 7.435 7.662 7.877 8.096 8.364 8.616 8.847 9.086 9.341 9.59 9.859 10.124 10.429 10.754 11.074 11.422 11.749 12.102 12.467 12.865 13.26 13.635 13.949 14.066 13.845 13.437 13.025 12.641 12.262 11.908 11.57 11.267 10.939 10.637 10.352 10.089 9.837 9.601 9.384 9.156 8.952 8.753 8.537 8.322 8.16 8.006 7.824 7.674 7.53 7.38 7.204 7.006 6.875 6.739 6.534 6.378 6.21 6.126 5.953 5.779 5.568 5.459 5.187 5.126 5.012 4.901 4.62 4.468 4.313 4.099 3.842 3.528 3.118 1.877 -6 ,28367 ,TETRA ,17559064,Sat Nov 27 04:36:52 CET,Sat Nov 27 06:35:17 CET,0.0 1.773 2.237 2.499 2.727 2.932 3.109 3.272 3.572 3.722 3.85 3.92 4.208 4.314 4.529 4.712 4.872 4.949 5.112 5.281 5.506 5.645 5.787 5.985 6.16 6.338 6.521 6.678 6.858 7.035 7.214 7.441 7.652 7.852 8.1 8.367 8.6 8.863 9.168 9.491 9.822 10.163 10.512 10.84 11.24 11.693 12.161 12.591 13.028 13.42 13.593 13.399 13.028 12.668 12.312 11.951 11.613 11.286 10.972 10.634 10.34 10.074 9.819 9.566 9.333 9.132 8.905 8.708 8.552 8.369 8.147 7.962 7.784 7.612 7.479 7.335 7.18 7.018 6.849 6.731 6.611 6.419 6.283 6.139 6.062 5.895 5.72 5.553 5.459 5.184 5.109 4.988 4.88 4.657 4.533 4.394 4.204 3.983 3.749 3.445 2.092 -7 ,16566 ,TETRA ,17559065,Sat Nov 27 04:37:51 CET,Sat Nov 27 06:35:22 CET,0.0 1.549 1.939 2.231 2.473 2.666 2.839 3.001 3.281 3.413 3.539 3.592 3.869 3.979 4.16 4.316 4.474 4.556 4.713 4.847 5.023 5.146 5.272 5.453 5.626 5.797 5.95 6.097 6.296 6.481 6.666 6.91 7.153 7.358 7.579 7.819 8.023 8.253 8.506 8.784 9.073 9.361 9.712 10.086 10.48 10.891 11.32 11.735 12.196 12.603 12.813 12.61 12.243 11.807 11.349 10.922 10.507 10.141 9.831 9.504 9.209 8.936 8.687 8.446 8.209 7.975 7.722 7.496 7.313 7.136 6.935 6.752 6.563 6.384 6.249 6.107 5.966 5.826 5.671 5.552 5.429 5.234 5.091 4.94 4.861 4.705 4.541 4.351 4.25 3.97 3.903 3.78 3.657 3.406 3.28 3.138 2.96 2.747 2.481 2.094 0.293 -8 ,1749 ,TETRA ,17559066,Sat Nov 27 04:37:51 CET,Sat Nov 27 06:17:38 CET,0.0 1.895 2.306 2.604 2.831 2.995 3.121 3.248 3.523 3.65 3.774 3.847 4.133 4.232 4.438 4.635 4.8 4.879 5.049 5.203 5.407 5.543 5.672 5.864 6.06 6.236 6.403 6.57 6.77 6.954 7.133 7.338 7.533 7.727 7.948 8.201 8.45 8.727 9.01 9.279 9.552 9.862 10.218 10.568 10.941 11.341 11.774 12.186 12.656 13.053 13.194 12.987 12.574 12.073 11.617 11.186 10.79 10.42 10.061 9.659 9.308 9.001 8.697 8.424 8.178 7.944 7.684 7.451 7.262 7.053 6.833 6.655 6.475 6.276 6.126 5.97 5.807 5.652 5.482 5.363 5.239 5.04 4.901 4.759 4.683 4.518 4.335 4.147 4.058 3.797 3.776 3.675 3.558 3.316 3.164 2.964 2.747 2.515 2.234 1.896 0.622 -9 ,32570 ,TETRA ,17559067,Sat Nov 27 04:39:52 CET,Sat Nov 27 06:36:53 CET,0.0 1.646 2.05 2.317 2.576 2.803 2.978 3.154 3.476 3.613 3.725 3.753 4.029 4.127 4.302 4.47 4.639 4.725 4.888 5.039 5.261 5.404 5.525 5.703 5.886 6.055 6.206 6.356 6.565 6.771 6.953 7.161 7.356 7.531 7.736 7.975 8.203 8.443 8.684 8.921 9.184 9.499 9.851 10.172 10.51 10.865 11.262 11.687 12.072 12.344 12.439 12.225 11.91 11.523 11.113 10.72 10.344 9.984 9.676 9.379 9.098 8.814 8.532 8.283 8.057 7.844 7.633 7.416 7.22 7.024 6.807 6.635 6.466 6.285 6.134 5.984 5.837 5.669 5.507 5.396 5.264 5.063 4.932 4.799 4.726 4.57 4.408 4.223 4.122 3.849 3.804 3.697 3.585 3.338 3.195 3.042 2.878 2.683 2.443 2.044 0.656 -10 ,13355 ,TETRA ,17559068,Sat Nov 27 04:39:53 CET,Sat Nov 27 06:37:36 CET,0.0 0.672 0.978 1.234 1.448 1.649 1.853 2.034 2.353 2.509 2.664 2.799 3.1 3.222 3.448 3.654 3.848 3.945 4.128 4.289 4.517 4.674 4.823 5.032 5.254 5.473 5.68 5.875 6.111 6.321 6.509 6.744 6.984 7.192 7.431 7.717 7.963 8.229 8.528 8.812 9.097 9.428 9.799 10.139 10.516 10.91 11.314 11.728 12.243 12.752 12.957 12.797 12.456 12.05 11.642 11.226 10.852 10.52 10.217 9.903 9.615 9.346 9.092 8.848 8.614 8.407 8.185 7.991 7.823 7.616 7.386 7.211 7.038 6.849 6.705 6.558 6.386 6.205 6.024 5.899 5.771 5.578 5.448 5.301 5.225 5.053 4.867 4.677 4.57 4.289 4.235 4.124 4.003 3.722 3.569 3.397 3.212 3.011 2.767 2.408 0.625 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_42_51.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_42_51.txt deleted file mode 100644 index ed0c1ab8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_42_51.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,208 ,TETRA ,17559069,Sat Nov 27 04:39:52 CET,Sat Nov 27 06:37:15 CET,0.0 2.044 2.448 2.772 3.049 3.288 3.515 3.706 4.025 4.173 4.322 4.416 4.705 4.838 5.077 5.294 5.494 5.591 5.784 5.969 6.25 6.421 6.59 6.844 7.097 7.336 7.557 7.782 8.053 8.295 8.527 8.799 9.057 9.312 9.606 9.921 10.221 10.558 10.902 11.267 11.646 12.041 12.496 12.943 13.451 13.997 14.596 15.186 15.789 16.433 16.955 17.041 16.867 16.609 16.285 15.911 15.56 15.228 14.926 14.593 14.289 14.031 13.784 13.548 13.327 13.115 12.894 12.694 12.508 12.31 12.103 11.925 11.728 11.516 11.361 11.201 11.025 10.846 10.653 10.521 10.39 10.173 10.017 9.846 9.751 9.553 9.35 9.13 9.019 8.743 8.689 8.569 8.426 8.059 7.861 7.667 7.453 7.197 6.849 6.374 4.895 -2 ,4201 ,TETRA ,17559070,Sat Nov 27 04:40:50 CET,Sat Nov 27 06:38:47 CET,0.0 0.814 1.226 1.55 1.809 2.025 2.221 2.411 2.772 2.928 3.062 3.139 3.439 3.567 3.807 4.03 4.249 4.35 4.543 4.743 5.011 5.175 5.33 5.56 5.792 5.996 6.194 6.399 6.664 6.927 7.184 7.484 7.77 8.053 8.371 8.698 9.004 9.35 9.707 10.06 10.433 10.849 11.305 11.736 12.238 12.829 13.468 14.059 14.678 15.327 15.872 16.026 15.869 15.553 15.219 14.891 14.539 14.183 13.886 13.578 13.288 13.017 12.763 12.523 12.299 12.109 11.904 11.698 11.511 11.303 11.069 10.882 10.7 10.513 10.359 10.191 10.007 9.804 9.597 9.456 9.315 9.081 8.906 8.734 8.644 8.453 8.25 8.033 7.921 7.65 7.593 7.468 7.335 7.04 6.879 6.698 6.5 6.291 6.025 5.682 4.789 -3 ,15945 ,TETRA ,17559071,Sat Nov 27 04:40:49 CET,Sat Nov 27 06:38:27 CET,0.0 1.111 1.437 1.682 1.937 2.192 2.401 2.588 2.91 3.054 3.198 3.304 3.597 3.718 3.946 4.166 4.379 4.477 4.661 4.857 5.146 5.32 5.49 5.741 5.978 6.194 6.396 6.594 6.848 7.09 7.307 7.559 7.827 8.086 8.358 8.669 8.976 9.322 9.717 10.118 10.479 10.853 11.282 11.712 12.196 12.704 13.262 13.871 14.567 15.286 15.843 15.931 15.738 15.451 15.151 14.834 14.507 14.179 13.885 13.584 13.301 13.01 12.738 12.489 12.254 12.042 11.815 11.602 11.428 11.244 11.04 10.875 10.711 10.526 10.367 10.209 10.046 9.881 9.705 9.575 9.447 9.236 9.082 8.926 8.844 8.665 8.477 8.284 8.188 7.919 7.854 7.725 7.568 7.23 7.042 6.847 6.619 6.357 6.049 5.543 3.47 -4 ,28017 ,TETRA ,17559072,Sat Nov 27 04:40:50 CET,Sat Nov 27 06:39:36 CET,0.0 1.54 2.025 2.41 2.746 3.027 3.288 3.523 3.911 4.088 4.263 4.41 4.721 4.857 5.117 5.356 5.609 5.739 5.981 6.198 6.498 6.687 6.861 7.121 7.355 7.568 7.787 8.015 8.329 8.613 8.873 9.172 9.448 9.727 10.043 10.36 10.654 10.973 11.311 11.667 12.046 12.465 12.93 13.392 13.893 14.446 15.085 15.739 16.417 17.079 17.662 17.811 17.679 17.438 17.108 16.769 16.443 16.131 15.847 15.522 15.238 14.976 14.714 14.457 14.21 13.979 13.724 13.5 13.302 13.079 12.84 12.653 12.461 12.271 12.11 11.919 11.732 11.556 11.374 11.245 11.112 10.901 10.75 10.591 10.513 10.356 10.188 10.0 9.893 9.613 9.563 9.456 9.324 9.004 8.854 8.706 8.512 8.272 8.001 7.618 6.663 -5 ,21264 ,TETRA ,17559073,Sat Nov 27 04:42:48 CET,Sat Nov 27 06:42:08 CET,0.0 1.6 2.034 2.365 2.612 2.824 3.038 3.236 3.563 3.723 3.868 3.958 4.248 4.364 4.584 4.797 4.998 5.096 5.301 5.501 5.775 5.948 6.111 6.336 6.544 6.747 6.947 7.131 7.371 7.61 7.833 8.094 8.348 8.602 8.894 9.22 9.537 9.872 10.223 10.593 10.97 11.369 11.815 12.256 12.738 13.265 13.846 14.405 15.0 15.599 16.057 16.184 16.025 15.719 15.387 15.031 14.682 14.357 14.064 13.753 13.487 13.245 13.011 12.805 12.612 12.417 12.201 11.999 11.817 11.63 11.445 11.285 11.117 10.951 10.815 10.666 10.523 10.376 10.218 10.104 9.981 9.77 9.601 9.431 9.347 9.169 8.993 8.825 8.737 8.474 8.445 8.339 8.221 7.965 7.821 7.652 7.437 7.167 6.888 6.549 5.434 -6 ,30170 ,TETRA ,17559074,Sat Nov 27 04:41:50 CET,Sat Nov 27 06:40:34 CET,0.0 0.927 1.39 1.757 2.038 2.283 2.497 2.689 3.074 3.256 3.422 3.532 3.839 3.975 4.242 4.505 4.745 4.847 5.045 5.244 5.535 5.724 5.896 6.138 6.373 6.601 6.822 7.03 7.315 7.596 7.849 8.135 8.419 8.682 8.961 9.269 9.561 9.895 10.264 10.648 11.049 11.494 11.982 12.448 12.921 13.446 14.075 14.753 15.482 16.124 16.593 16.652 16.432 16.062 15.703 15.346 14.985 14.649 14.362 14.073 13.822 13.595 13.368 13.144 12.93 12.724 12.494 12.289 12.109 11.917 11.735 11.597 11.453 11.274 11.12 10.956 10.788 10.633 10.472 10.358 10.242 10.06 9.923 9.775 9.702 9.561 9.415 9.248 9.151 8.889 8.842 8.718 8.587 8.296 8.138 7.985 7.814 7.61 7.384 7.054 6.095 -7 ,12060 ,TETRA ,17559075,Sat Nov 27 04:42:49 CET,Sat Nov 27 06:42:18 CET,0.0 1.896 2.271 2.596 2.878 3.119 3.328 3.523 3.86 4.005 4.141 4.223 4.494 4.597 4.817 5.026 5.23 5.343 5.557 5.738 5.972 6.135 6.305 6.535 6.743 6.959 7.185 7.398 7.653 7.896 8.124 8.38 8.61 8.84 9.124 9.44 9.735 10.062 10.382 10.695 11.051 11.468 11.962 12.42 12.909 13.423 14.005 14.616 15.222 15.879 16.488 16.636 16.449 16.146 15.798 15.476 15.169 14.851 14.557 14.239 13.967 13.725 13.489 13.264 13.054 12.838 12.6 12.392 12.214 12.027 11.838 11.687 11.523 11.339 11.192 11.046 10.881 10.692 10.492 10.355 10.223 10.027 9.899 9.762 9.69 9.547 9.391 9.193 9.083 8.821 8.796 8.681 8.548 8.206 8.0 7.793 7.574 7.323 6.993 6.551 5.236 -8 ,14015 ,TETRA ,17559076,Sat Nov 27 04:42:49 CET,Sat Nov 27 06:43:33 CET,0.0 1.249 1.593 1.882 2.115 2.299 2.491 2.661 2.949 3.085 3.217 3.307 3.595 3.713 3.962 4.207 4.428 4.525 4.719 4.92 5.206 5.392 5.581 5.839 6.056 6.266 6.464 6.639 6.875 7.109 7.323 7.592 7.848 8.097 8.383 8.699 9.016 9.374 9.742 10.12 10.519 10.969 11.467 11.907 12.4 12.948 13.537 14.168 14.805 15.313 15.677 15.697 15.456 15.098 14.71 14.346 13.994 13.638 13.309 12.97 12.658 12.377 12.118 11.863 11.618 11.401 11.177 10.97 10.769 10.555 10.329 10.131 9.918 9.695 9.527 9.354 9.169 8.977 8.788 8.648 8.503 8.278 8.107 7.94 7.859 7.688 7.502 7.322 7.229 6.971 6.933 6.81 6.68 6.405 6.24 6.061 5.872 5.673 5.467 5.157 3.859 -9 ,32665 ,TETRA ,17559077,Sat Nov 27 04:44:51 CET,Sat Nov 27 06:44:49 CET,0.0 1.632 2.063 2.425 2.784 3.075 3.322 3.543 3.925 4.099 4.273 4.432 4.748 4.886 5.145 5.38 5.607 5.716 5.935 6.136 6.398 6.559 6.708 6.929 7.153 7.367 7.581 7.787 8.041 8.277 8.508 8.794 9.074 9.343 9.637 9.96 10.278 10.627 10.975 11.351 11.775 12.249 12.78 13.285 13.826 14.376 14.992 15.685 16.424 17.105 17.666 17.74 17.498 17.159 16.794 16.459 16.152 15.817 15.505 15.207 14.925 14.649 14.403 14.17 13.948 13.725 13.477 13.265 13.097 12.922 12.719 12.55 12.376 12.184 12.031 11.865 11.681 11.5 11.315 11.181 11.046 10.841 10.699 10.534 10.448 10.263 10.047 9.825 9.704 9.417 9.337 9.201 9.048 8.699 8.503 8.264 8.02 7.796 7.538 7.221 6.215 -10 ,15987 ,TETRA ,17559078,Sat Nov 27 04:45:52 CET,Sat Nov 27 06:45:55 CET,0.0 2.279 2.758 3.128 3.426 3.7 3.976 4.225 4.652 4.833 4.99 5.093 5.394 5.526 5.799 6.06 6.306 6.422 6.639 6.829 7.087 7.262 7.439 7.683 7.892 8.084 8.276 8.464 8.716 8.971 9.205 9.469 9.724 9.976 10.291 10.655 10.984 11.336 11.737 12.162 12.591 13.059 13.575 14.064 14.618 15.22 15.864 16.557 17.316 18.057 18.781 19.006 18.791 18.45 18.072 17.703 17.325 16.973 16.658 16.317 16.025 15.761 15.497 15.242 15.008 14.786 14.553 14.339 14.144 13.954 13.763 13.595 13.417 13.227 13.084 12.935 12.775 12.617 12.458 12.344 12.216 12.009 11.872 11.726 11.648 11.484 11.31 11.117 11.015 10.736 10.657 10.533 10.403 10.124 9.976 9.827 9.627 9.371 9.101 8.678 6.636 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_42_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_42_54.txt deleted file mode 100644 index c82bbe4c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_42_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25168 ,TETRA ,17559079,Sat Nov 27 04:47:49 CET,Sat Nov 27 06:45:20 CET,0.0 0.573 0.842 1.041 1.211 1.372 1.521 1.652 1.884 1.99 2.092 2.113 2.379 2.47 2.641 2.793 2.937 3.006 3.127 3.253 3.44 3.545 3.636 3.753 3.88 4.027 4.178 4.307 4.439 4.562 4.708 4.875 5.024 5.181 5.362 5.532 5.67 5.829 5.996 6.194 6.405 6.591 6.776 6.957 7.145 7.355 7.558 7.666 7.65 7.476 6.877 5.897 5.001 4.151 3.42 2.737 2.13 1.574 1.088 0.624 0.237 -0.105 -0.433 -0.746 -1.037 -1.293 -1.57 -1.838 -2.074 -2.303 -2.544 -2.749 -2.957 -3.173 -3.344 -3.527 -3.719 -3.914 -4.113 -4.244 -4.367 -4.567 -4.71 -4.855 -4.934 -5.105 -5.273 -5.446 -5.539 -5.818 -5.846 -5.952 -6.075 -6.353 -6.495 -6.623 -6.754 -6.924 -7.109 -7.314 -8.035 -2 ,5181 ,TETRA ,17559080,Sat Nov 27 04:47:49 CET,Sat Nov 27 06:44:25 CET,0.0 0.724 1.058 1.314 1.536 1.71 1.855 1.986 2.232 2.337 2.436 2.464 2.742 2.836 3.006 3.174 3.326 3.392 3.517 3.655 3.882 4.013 4.126 4.288 4.435 4.583 4.732 4.884 5.061 5.214 5.347 5.502 5.667 5.805 5.962 6.135 6.28 6.432 6.607 6.802 6.995 7.198 7.399 7.566 7.711 7.867 8.031 8.091 8.037 7.796 7.12 6.09 5.177 4.349 3.621 2.945 2.321 1.776 1.322 0.842 0.416 0.039 -0.31 -0.643 -0.956 -1.237 -1.528 -1.773 -1.981 -2.196 -2.43 -2.636 -2.837 -3.033 -3.196 -3.371 -3.541 -3.716 -3.909 -4.048 -4.184 -4.39 -4.55 -4.719 -4.805 -4.977 -5.138 -5.301 -5.392 -5.664 -5.672 -5.774 -5.869 -6.068 -6.188 -6.327 -6.499 -6.677 -6.866 -7.126 -7.591 -3 ,26532 ,TETRA ,17559081,Sat Nov 27 04:48:50 CET,Sat Nov 27 06:50:42 CET,0.0 0.735 1.051 1.274 1.469 1.647 1.797 1.946 2.207 2.318 2.429 2.474 2.752 2.844 3.002 3.134 3.261 3.327 3.455 3.585 3.774 3.892 3.998 4.157 4.321 4.46 4.588 4.707 4.849 4.996 5.135 5.315 5.49 5.64 5.804 5.977 6.157 6.362 6.551 6.704 6.851 7.035 7.252 7.444 7.656 7.878 8.065 8.186 8.184 7.965 7.341 6.389 5.446 4.607 3.867 3.152 2.541 2.009 1.539 1.07 0.681 0.338 0.005 -0.306 -0.593 -0.868 -1.16 -1.429 -1.662 -1.89 -2.122 -2.319 -2.519 -2.721 -2.885 -3.049 -3.214 -3.394 -3.585 -3.711 -3.839 -4.049 -4.191 -4.328 -4.397 -4.544 -4.714 -4.888 -4.972 -5.232 -5.224 -5.323 -5.438 -5.682 -5.813 -5.955 -6.115 -6.299 -6.473 -6.701 -7.346 -4 ,19145 ,TETRA ,17559082,Sat Nov 27 04:48:50 CET,Sat Nov 27 06:37:14 CET,0.0 0.768 1.04 1.225 1.4 1.546 1.684 1.818 2.012 2.1 2.198 2.205 2.456 2.527 2.676 2.814 2.944 3.009 3.125 3.231 3.389 3.49 3.59 3.736 3.882 4.012 4.128 4.241 4.404 4.58 4.743 4.93 5.094 5.229 5.388 5.559 5.718 5.894 6.079 6.258 6.423 6.605 6.811 7.004 7.199 7.425 7.677 7.84 7.857 7.608 6.92 5.858 4.87 4.054 3.314 2.626 2.009 1.442 0.966 0.504 0.093 -0.275 -0.609 -0.927 -1.222 -1.481 -1.749 -2.006 -2.23 -2.453 -2.669 -2.838 -3.018 -3.219 -3.379 -3.539 -3.711 -3.894 -4.079 -4.201 -4.327 -4.535 -4.679 -4.82 -4.89 -5.044 -5.212 -5.383 -5.467 -5.734 -5.754 -5.854 -5.961 -6.198 -6.33 -6.47 -6.617 -6.771 -6.947 -7.216 -7.792 -5 ,6925 ,TETRA ,17559083,Sat Nov 27 04:48:50 CET,Sat Nov 27 06:36:37 CET,0.0 0.966 1.353 1.596 1.791 1.975 2.163 2.334 2.611 2.743 2.87 2.912 3.172 3.259 3.447 3.625 3.779 3.855 3.983 4.102 4.276 4.386 4.492 4.637 4.789 4.941 5.075 5.198 5.354 5.506 5.64 5.78 5.925 6.081 6.253 6.431 6.595 6.774 6.969 7.175 7.367 7.534 7.724 7.916 8.119 8.288 8.42 8.511 8.482 8.298 7.715 6.744 5.825 5.016 4.344 3.718 3.114 2.541 2.04 1.521 1.077 0.719 0.381 0.045 -0.27 -0.543 -0.81 -1.054 -1.268 -1.492 -1.723 -1.927 -2.14 -2.344 -2.485 -2.646 -2.82 -2.984 -3.156 -3.276 -3.408 -3.622 -3.772 -3.935 -4.015 -4.179 -4.34 -4.5 -4.591 -4.864 -4.879 -4.982 -5.09 -5.32 -5.439 -5.566 -5.716 -5.893 -6.11 -6.435 -7.05 -6 ,13275 ,TETRA ,17559084,Sat Nov 27 04:48:50 CET,Sat Nov 27 06:46:40 CET,0.0 0.708 0.963 1.18 1.374 1.527 1.651 1.751 1.962 2.071 2.168 2.168 2.426 2.519 2.717 2.895 3.056 3.132 3.267 3.378 3.525 3.624 3.722 3.853 3.977 4.12 4.258 4.382 4.551 4.712 4.873 5.062 5.217 5.378 5.581 5.777 5.945 6.138 6.33 6.502 6.665 6.859 7.089 7.283 7.476 7.643 7.782 7.896 7.907 7.634 6.982 6.055 5.133 4.308 3.604 2.966 2.397 1.883 1.436 0.989 0.605 0.261 -0.083 -0.415 -0.706 -0.976 -1.28 -1.559 -1.801 -2.049 -2.312 -2.526 -2.719 -2.912 -3.075 -3.252 -3.435 -3.613 -3.797 -3.929 -4.055 -4.251 -4.397 -4.557 -4.642 -4.802 -4.948 -5.104 -5.187 -5.453 -5.49 -5.614 -5.732 -5.951 -6.082 -6.228 -6.367 -6.53 -6.739 -6.968 -7.567 -7 ,19269 ,TETRA ,17559085,Sat Nov 27 04:48:50 CET,Sat Nov 27 06:47:36 CET,0.0 0.786 1.13 1.385 1.589 1.761 1.928 2.085 2.318 2.427 2.525 2.537 2.796 2.887 3.051 3.202 3.347 3.42 3.565 3.697 3.892 4.024 4.146 4.309 4.475 4.638 4.801 4.953 5.13 5.294 5.449 5.632 5.798 5.944 6.099 6.273 6.43 6.597 6.779 6.973 7.184 7.409 7.63 7.827 8.04 8.233 8.414 8.531 8.534 8.374 7.773 6.689 5.684 4.831 4.065 3.364 2.748 2.185 1.709 1.24 0.837 0.481 0.151 -0.167 -0.475 -0.746 -1.026 -1.285 -1.501 -1.718 -1.945 -2.14 -2.345 -2.552 -2.713 -2.88 -3.048 -3.222 -3.399 -3.52 -3.65 -3.86 -4.01 -4.167 -4.254 -4.442 -4.624 -4.799 -4.884 -5.156 -5.201 -5.304 -5.42 -5.705 -5.852 -5.998 -6.168 -6.368 -6.608 -6.953 -7.769 -8 ,29958 ,TETRA ,17559086,Sat Nov 27 04:49:51 CET,Sat Nov 27 06:46:36 CET,0.0 0.855 1.179 1.406 1.564 1.711 1.864 2.005 2.278 2.395 2.487 2.496 2.756 2.84 3.001 3.147 3.279 3.341 3.453 3.579 3.771 3.885 3.989 4.135 4.276 4.412 4.545 4.678 4.844 5.001 5.163 5.349 5.502 5.632 5.784 5.982 6.184 6.376 6.552 6.726 6.921 7.129 7.331 7.508 7.683 7.831 7.954 8.015 7.945 7.684 7.079 6.032 5.094 4.323 3.616 2.963 2.374 1.829 1.363 0.908 0.512 0.158 -0.173 -0.489 -0.785 -1.049 -1.325 -1.561 -1.759 -1.984 -2.22 -2.417 -2.624 -2.83 -2.99 -3.162 -3.336 -3.519 -3.715 -3.846 -3.98 -4.216 -4.38 -4.523 -4.594 -4.75 -4.914 -5.075 -5.156 -5.428 -5.437 -5.533 -5.642 -5.897 -6.02 -6.149 -6.288 -6.433 -6.622 -6.892 -7.534 -9 ,16577 ,TETRA ,17559087,Sat Nov 27 04:49:51 CET,Sat Nov 27 06:46:23 CET,0.0 0.886 1.177 1.392 1.591 1.769 1.932 2.079 2.389 2.528 2.652 2.722 3.01 3.123 3.325 3.502 3.671 3.754 3.906 4.039 4.228 4.363 4.48 4.63 4.794 4.948 5.077 5.189 5.329 5.471 5.609 5.784 5.948 6.096 6.266 6.451 6.626 6.801 6.983 7.164 7.332 7.513 7.72 7.914 8.109 8.294 8.456 8.581 8.629 8.482 7.96 6.975 6.017 5.174 4.414 3.732 3.128 2.575 2.087 1.593 1.189 0.827 0.471 0.153 -0.131 -0.391 -0.662 -0.907 -1.12 -1.33 -1.54 -1.718 -1.912 -2.125 -2.289 -2.451 -2.605 -2.767 -2.95 -3.08 -3.205 -3.39 -3.521 -3.662 -3.738 -3.899 -4.08 -4.263 -4.349 -4.607 -4.601 -4.691 -4.801 -5.053 -5.183 -5.331 -5.499 -5.658 -5.815 -6.087 -6.794 -10 ,12904 ,TETRA ,17559088,Sat Nov 27 04:49:54 CET,Sat Nov 27 06:47:12 CET,0.0 0.57 0.787 0.951 1.067 1.176 1.294 1.415 1.646 1.754 1.853 1.862 2.128 2.221 2.404 2.563 2.7 2.763 2.878 2.983 3.139 3.242 3.355 3.505 3.635 3.757 3.882 4.008 4.161 4.294 4.42 4.577 4.717 4.851 5.011 5.181 5.334 5.508 5.702 5.917 6.119 6.309 6.503 6.646 6.808 6.974 7.097 7.154 7.103 6.869 6.268 5.251 4.3 3.459 2.709 2.033 1.412 0.836 0.34 -0.141 -0.562 -0.935 -1.278 -1.594 -1.881 -2.148 -2.417 -2.658 -2.88 -3.107 -3.337 -3.531 -3.732 -3.933 -4.097 -4.277 -4.451 -4.623 -4.808 -4.933 -5.062 -5.266 -5.402 -5.559 -5.633 -5.778 -5.948 -6.134 -6.231 -6.499 -6.515 -6.622 -6.736 -6.967 -7.1 -7.252 -7.388 -7.549 -7.746 -8.014 -8.735 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_43_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_43_42.txt deleted file mode 100644 index b0ac4035..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_43_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5790 ,KEBNE ,17024817,Wed Dec 22 11:12:53 CET,Wed Dec 22 12:54:28 CET,0.0 1.557 1.977 2.313 2.613 2.864 3.072 3.264 3.645 3.816 3.97 4.075 4.403 4.536 4.788 5.024 5.242 5.344 5.521 5.684 5.941 6.114 6.282 6.523 6.769 7.004 7.207 7.41 7.677 7.925 8.171 8.472 8.752 9.02 9.325 9.669 9.996 10.337 10.689 11.055 11.447 11.888 12.396 12.919 13.521 14.139 14.807 15.527 16.319 17.219 18.25 18.961 19.192 19.136 18.993 18.818 18.636 18.447 18.244 18.011 17.776 17.551 17.345 17.145 16.93 16.705 16.469 16.271 16.091 15.898 15.701 15.537 15.365 15.198 15.073 14.93 14.754 14.546 14.344 14.228 14.105 13.871 13.72 13.588 13.509 13.318 13.118 12.916 12.808 12.526 12.493 12.376 12.245 11.957 11.793 11.591 11.342 11.035 10.677 10.214 6.73 -2 ,20555 ,KEBNE ,17024818,Wed Dec 22 11:12:53 CET,Wed Dec 22 12:55:00 CET,0.0 1.581 2.041 2.312 2.537 2.734 2.907 3.08 3.402 3.553 3.713 3.792 4.104 4.222 4.442 4.659 4.86 4.951 5.133 5.309 5.556 5.717 5.871 6.083 6.296 6.494 6.682 6.881 7.118 7.341 7.56 7.827 8.094 8.334 8.606 8.925 9.227 9.556 9.91 10.271 10.657 11.115 11.626 12.129 12.705 13.341 14.097 14.923 15.755 16.64 17.647 18.321 18.599 18.627 18.516 18.368 18.213 18.039 17.873 17.674 17.486 17.308 17.092 16.855 16.657 16.49 16.289 16.073 15.903 15.756 15.565 15.397 15.231 15.061 14.931 14.803 14.658 14.478 14.295 14.176 14.055 13.868 13.717 13.522 13.408 13.163 12.913 12.643 12.489 12.138 11.938 11.778 11.644 11.379 11.201 10.999 10.782 10.479 10.148 9.662 7.234 -3 ,13510 ,KEBNE ,17024819,Wed Dec 22 11:12:53 CET,Wed Dec 22 12:54:24 CET,0.0 3.132 3.693 4.006 4.24 4.466 4.675 4.862 5.171 5.302 5.43 5.479 5.786 5.909 6.136 6.336 6.539 6.637 6.825 7.013 7.274 7.433 7.596 7.847 8.082 8.297 8.504 8.707 8.973 9.219 9.459 9.751 10.019 10.28 10.585 10.919 11.217 11.535 11.882 12.254 12.653 13.093 13.611 14.168 14.787 15.424 16.122 16.891 17.752 18.678 19.731 20.401 20.627 20.584 20.423 20.269 20.084 19.848 19.616 19.381 19.16 18.974 18.811 18.638 18.465 18.295 18.092 17.903 17.746 17.575 17.392 17.239 17.068 16.878 16.718 16.544 16.386 16.228 16.058 15.937 15.799 15.552 15.372 15.19 15.094 14.9 14.724 14.534 14.424 14.135 14.037 13.9 13.734 13.323 13.119 12.925 12.712 12.454 12.165 11.705 8.753 -4 ,31824 ,KEBNE ,17024820,Wed Dec 22 11:12:53 CET,Wed Dec 22 12:54:25 CET,0.0 1.677 2.003 2.263 2.496 2.719 2.91 3.071 3.355 3.488 3.616 3.689 4.005 4.128 4.343 4.54 4.732 4.827 5.008 5.168 5.399 5.548 5.704 5.936 6.152 6.369 6.575 6.768 7.016 7.264 7.501 7.786 8.059 8.306 8.559 8.853 9.166 9.513 9.874 10.243 10.629 11.074 11.592 12.139 12.775 13.402 14.105 14.916 15.846 16.87 17.909 18.563 18.812 18.839 18.716 18.54 18.377 18.212 18.057 17.861 17.657 17.469 17.279 17.084 16.893 16.695 16.468 16.257 16.074 15.904 15.725 15.556 15.386 15.189 15.028 14.889 14.752 14.59 14.42 14.294 14.16 13.96 13.804 13.639 13.551 13.362 13.165 12.957 12.851 12.568 12.505 12.382 12.245 11.903 11.735 11.54 11.311 11.057 10.765 10.325 7.831 -5 ,17738 ,KEBNE ,17024821,Wed Dec 22 11:12:53 CET,Wed Dec 22 12:53:24 CET,0.0 2.27 2.68 2.995 3.215 3.387 3.56 3.718 4.005 4.14 4.267 4.344 4.651 4.765 4.977 5.186 5.389 5.481 5.657 5.831 6.08 6.232 6.379 6.599 6.819 7.038 7.242 7.43 7.667 7.89 8.106 8.375 8.622 8.86 9.172 9.553 9.921 10.311 10.718 11.119 11.517 11.987 12.531 13.05 13.667 14.342 15.071 15.874 16.785 17.769 18.873 19.629 19.838 19.802 19.683 19.528 19.362 19.164 18.953 18.718 18.517 18.347 18.162 17.96 17.761 17.569 17.367 17.197 17.046 16.89 16.727 16.582 16.428 16.265 16.135 15.998 15.852 15.704 15.55 15.432 15.296 15.09 14.953 14.816 14.743 14.583 14.395 14.186 14.078 13.798 13.709 13.574 13.449 13.153 12.98 12.811 12.586 12.257 11.899 11.427 9.152 -6 ,22862 ,KEBNE ,17024822,Wed Dec 22 11:13:54 CET,Wed Dec 22 12:54:01 CET,0.0 1.963 2.449 2.797 3.042 3.276 3.475 3.661 4.038 4.206 4.348 4.425 4.748 4.882 5.119 5.342 5.564 5.678 5.903 6.108 6.389 6.564 6.732 6.983 7.208 7.408 7.611 7.815 8.083 8.321 8.527 8.773 9.036 9.294 9.565 9.867 10.162 10.493 10.851 11.227 11.619 12.068 12.601 13.128 13.733 14.381 15.09 15.886 16.78 17.725 18.781 19.458 19.644 19.665 19.584 19.434 19.281 19.096 18.917 18.717 18.495 18.299 18.101 17.899 17.715 17.538 17.345 17.166 17.014 16.83 16.604 16.426 16.239 16.048 15.901 15.735 15.558 15.373 15.173 15.035 14.894 14.673 14.521 14.354 14.264 14.072 13.879 13.683 13.573 13.272 13.192 13.051 12.896 12.53 12.314 12.071 11.808 11.508 11.14 10.657 8.301 -7 ,14998 ,KEBNE ,17024823,Wed Dec 22 11:13:55 CET,Wed Dec 22 12:54:54 CET,0.0 1.558 2.13 2.531 2.828 3.097 3.337 3.549 3.945 4.135 4.297 4.419 4.743 4.873 5.124 5.347 5.558 5.664 5.864 6.043 6.288 6.443 6.598 6.813 7.02 7.229 7.427 7.614 7.868 8.116 8.345 8.607 8.865 9.124 9.419 9.765 10.096 10.464 10.895 11.341 11.752 12.184 12.699 13.225 13.846 14.528 15.261 16.067 16.992 18.005 19.145 19.836 20.063 20.106 20.03 19.91 19.756 19.563 19.391 19.196 18.997 18.82 18.646 18.459 18.264 18.062 17.847 17.653 17.48 17.285 17.088 16.948 16.795 16.617 16.458 16.286 16.106 15.92 15.723 15.577 15.428 15.202 15.04 14.871 14.784 14.6 14.412 14.222 14.118 13.831 13.772 13.659 13.527 13.188 12.996 12.794 12.574 12.296 11.954 11.466 9.631 -8 ,19830 ,KEBNE ,17024824,Wed Dec 22 11:13:54 CET,Wed Dec 22 12:54:08 CET,0.0 2.385 2.939 3.275 3.524 3.749 3.951 4.138 4.48 4.638 4.785 4.868 5.189 5.311 5.547 5.795 6.024 6.138 6.358 6.567 6.864 7.043 7.225 7.495 7.732 7.963 8.192 8.409 8.703 8.993 9.277 9.623 9.96 10.277 10.622 10.991 11.335 11.691 12.042 12.423 12.831 13.287 13.816 14.319 14.887 15.532 16.29 17.112 18.024 19.047 20.213 20.941 21.171 21.199 21.111 20.932 20.725 20.548 20.366 20.173 20.014 19.846 19.659 19.468 19.275 19.1 18.914 18.739 18.563 18.376 18.18 17.99 17.807 17.644 17.505 17.357 17.208 17.021 16.816 16.679 16.543 16.342 16.188 16.022 15.944 15.776 15.592 15.412 15.312 15.027 14.994 14.868 14.729 14.423 14.243 14.039 13.803 13.552 13.235 12.776 9.951 -9 ,25458 ,KEBNE ,17024825,Wed Dec 22 11:13:55 CET,Wed Dec 22 12:54:46 CET,0.0 2.131 2.5 2.785 3.051 3.303 3.528 3.728 4.097 4.259 4.405 4.524 4.852 4.988 5.231 5.444 5.656 5.759 5.952 6.145 6.423 6.605 6.786 7.029 7.256 7.478 7.692 7.91 8.178 8.432 8.687 8.995 9.295 9.59 9.95 10.337 10.669 11.033 11.402 11.762 12.148 12.575 13.07 13.575 14.126 14.728 15.469 16.282 17.127 18.118 19.295 19.981 20.147 20.122 20.025 19.882 19.722 19.552 19.343 19.112 18.884 18.635 18.386 18.148 17.926 17.713 17.487 17.264 17.07 16.879 16.67 16.5 16.307 16.099 15.938 15.776 15.609 15.426 15.225 15.09 14.968 14.765 14.602 14.42 14.326 14.139 13.946 13.726 13.608 13.322 13.268 13.145 13.0 12.579 12.299 11.992 11.668 11.256 10.736 10.067 7.826 -10 ,21721 ,KEBNE ,17024826,Wed Dec 22 11:14:56 CET,Wed Dec 22 12:56:08 CET,0.0 2.243 2.7 3.103 3.465 3.763 3.993 4.178 4.497 4.647 4.797 4.896 5.211 5.326 5.554 5.778 6.001 6.109 6.289 6.437 6.66 6.821 6.987 7.22 7.424 7.617 7.815 8.01 8.244 8.468 8.689 8.938 9.19 9.443 9.738 10.075 10.402 10.746 11.086 11.469 11.87 12.31 12.837 13.369 13.978 14.655 15.419 16.271 17.239 18.268 19.308 19.904 20.104 20.084 19.976 19.799 19.549 19.247 18.975 18.73 18.503 18.228 17.903 17.599 17.334 17.115 16.899 16.677 16.466 16.245 16.007 15.794 15.573 15.377 15.227 15.054 14.875 14.685 14.471 14.327 14.186 13.934 13.751 13.562 13.454 13.255 13.093 12.916 12.807 12.514 12.445 12.305 12.167 11.877 11.705 11.509 11.259 10.959 10.61 10.122 8.619 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_45_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_45_42.txt deleted file mode 100644 index c39fe638..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_45_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,802 ,TETRA ,17559089,Sat Nov 27 04:49:52 CET,Sat Nov 27 06:39:54 CET,0.0 2.338 2.617 2.818 2.989 3.142 3.283 3.414 3.665 3.796 3.918 3.954 4.237 4.336 4.526 4.704 4.873 4.952 5.109 5.258 5.461 5.593 5.725 5.914 6.089 6.261 6.429 6.592 6.802 6.986 7.15 7.362 7.571 7.776 8.01 8.269 8.531 8.816 9.121 9.438 9.762 10.126 10.539 10.945 11.42 11.901 12.416 13.015 13.677 14.34 14.927 15.151 15.134 14.999 14.773 14.498 14.223 13.949 13.687 13.426 13.192 12.957 12.72 12.481 12.224 11.998 11.783 11.57 11.383 11.198 11.003 10.827 10.644 10.443 10.261 10.068 9.887 9.712 9.518 9.374 9.221 8.994 8.828 8.639 8.543 8.36 8.151 7.933 7.824 7.531 7.433 7.288 7.128 6.782 6.577 6.346 6.099 5.823 5.481 4.995 3.111 -2 ,19991 ,TETRA ,17559090,Sat Nov 27 04:49:51 CET,Sat Nov 27 06:46:52 CET,0.0 1.293 1.6 1.821 1.995 2.154 2.299 2.426 2.643 2.751 2.863 2.896 3.17 3.25 3.395 3.541 3.702 3.782 3.928 4.065 4.274 4.411 4.542 4.73 4.914 5.085 5.246 5.393 5.584 5.791 5.985 6.191 6.401 6.616 6.859 7.125 7.381 7.67 7.978 8.299 8.641 9.003 9.408 9.806 10.233 10.708 11.257 11.856 12.501 13.161 13.76 13.948 13.879 13.712 13.461 13.173 12.897 12.599 12.305 11.999 11.707 11.426 11.156 10.902 10.666 10.447 10.224 10.024 9.848 9.674 9.49 9.308 9.113 8.91 8.745 8.591 8.425 8.237 8.041 7.898 7.743 7.522 7.378 7.223 7.142 6.961 6.769 6.573 6.461 6.156 6.076 5.94 5.792 5.497 5.342 5.187 5.016 4.788 4.489 4.131 3.143 -3 ,5653 ,TETRA ,17559091,Sat Nov 27 04:50:51 CET,Sat Nov 27 06:47:57 CET,0.0 1.06 1.329 1.557 1.781 1.946 2.082 2.208 2.443 2.561 2.673 2.698 2.984 3.079 3.259 3.414 3.569 3.648 3.799 3.944 4.133 4.255 4.387 4.583 4.765 4.938 5.108 5.271 5.487 5.7 5.876 6.071 6.258 6.447 6.671 6.93 7.188 7.471 7.772 8.086 8.417 8.787 9.228 9.651 10.119 10.633 11.189 11.78 12.438 13.132 13.795 14.096 14.039 13.879 13.64 13.347 13.069 12.811 12.591 12.356 12.129 11.886 11.625 11.371 11.12 10.892 10.662 10.455 10.269 10.066 9.845 9.659 9.479 9.288 9.13 8.979 8.818 8.642 8.449 8.306 8.16 7.93 7.768 7.61 7.535 7.374 7.2 7.017 6.917 6.619 6.557 6.444 6.323 6.058 5.925 5.776 5.606 5.421 5.213 4.912 3.854 -4 ,20570 ,TETRA ,17559092,Sat Nov 27 04:52:51 CET,Sat Nov 27 06:49:40 CET,0.0 0.847 1.085 1.282 1.46 1.62 1.761 1.882 2.107 2.208 2.312 2.335 2.608 2.705 2.884 3.055 3.203 3.276 3.424 3.566 3.775 3.907 4.037 4.243 4.429 4.586 4.738 4.896 5.096 5.291 5.476 5.703 5.921 6.125 6.36 6.62 6.881 7.18 7.485 7.801 8.116 8.472 8.898 9.299 9.756 10.244 10.804 11.393 12.029 12.749 13.476 13.804 13.818 13.706 13.515 13.293 13.059 12.804 12.551 12.264 12.006 11.771 11.539 11.308 11.08 10.867 10.632 10.431 10.255 10.067 9.884 9.722 9.535 9.339 9.191 9.047 8.9 8.733 8.545 8.414 8.289 8.091 7.943 7.787 7.71 7.543 7.365 7.172 7.067 6.796 6.755 6.641 6.515 6.23 6.089 5.899 5.654 5.406 5.15 4.756 3.77 -5 ,13579 ,TETRA ,17559093,Sat Nov 27 04:54:52 CET,Sat Nov 27 06:51:40 CET,0.0 0.682 0.954 1.143 1.291 1.441 1.594 1.715 1.937 2.047 2.149 2.132 2.395 2.481 2.641 2.787 2.928 3.004 3.15 3.287 3.487 3.608 3.728 3.916 4.101 4.275 4.431 4.576 4.768 4.955 5.145 5.382 5.586 5.776 6.001 6.261 6.512 6.795 7.107 7.432 7.759 8.097 8.477 8.876 9.345 9.844 10.385 10.99 11.652 12.332 12.954 13.189 13.127 12.924 12.632 12.335 12.04 11.703 11.386 11.057 10.758 10.486 10.233 10.009 9.791 9.577 9.354 9.151 8.968 8.765 8.554 8.381 8.2 8.014 7.868 7.702 7.52 7.321 7.103 6.962 6.826 6.602 6.44 6.274 6.187 6.019 5.851 5.665 5.558 5.272 5.225 5.106 4.952 4.605 4.437 4.237 4.036 3.853 3.629 3.321 2.687 -6 ,23368 ,TETRA ,17559094,Sat Nov 27 04:54:52 CET,Sat Nov 27 06:52:34 CET,0.0 0.885 1.214 1.523 1.771 1.926 2.062 2.211 2.486 2.609 2.715 2.741 3.022 3.121 3.298 3.464 3.625 3.706 3.858 4.001 4.211 4.345 4.47 4.649 4.83 4.992 5.137 5.283 5.474 5.658 5.848 6.081 6.286 6.485 6.722 6.982 7.232 7.5 7.8 8.126 8.449 8.811 9.245 9.678 10.161 10.691 11.282 11.893 12.559 13.306 14.053 14.319 14.277 14.126 13.875 13.597 13.313 12.982 12.661 12.359 12.088 11.826 11.575 11.329 11.089 10.861 10.629 10.425 10.252 10.085 9.9 9.736 9.572 9.399 9.251 9.1 8.949 8.785 8.605 8.474 8.333 8.092 7.925 7.767 7.692 7.542 7.37 7.178 7.067 6.774 6.692 6.546 6.392 6.071 5.892 5.689 5.471 5.245 4.968 4.553 3.033 -7 ,20105 ,TETRA ,17559095,Sat Nov 27 04:54:56 CET,Sat Nov 27 06:53:20 CET,0.0 0.751 1.024 1.18 1.319 1.456 1.573 1.69 1.927 2.044 2.162 2.186 2.463 2.562 2.745 2.906 3.05 3.126 3.276 3.422 3.623 3.759 3.907 4.108 4.28 4.436 4.583 4.729 4.917 5.094 5.258 5.462 5.665 5.856 6.083 6.35 6.616 6.911 7.212 7.513 7.821 8.168 8.565 8.943 9.403 9.931 10.488 11.064 11.697 12.337 12.894 13.096 13.056 12.887 12.653 12.41 12.16 11.907 11.679 11.423 11.183 10.949 10.714 10.48 10.25 10.039 9.82 9.624 9.451 9.257 9.054 8.891 8.716 8.528 8.377 8.225 8.079 7.927 7.755 7.636 7.511 7.315 7.172 7.02 6.94 6.745 6.538 6.335 6.231 5.959 5.916 5.799 5.675 5.406 5.262 5.09 4.882 4.677 4.408 3.94 2.455 -8 ,25366 ,TETRA ,17559096,Sat Nov 27 04:54:58 CET,Sat Nov 27 06:54:50 CET,0.0 0.62 0.944 1.173 1.349 1.499 1.631 1.768 2.027 2.153 2.258 2.253 2.529 2.626 2.809 2.981 3.143 3.218 3.382 3.545 3.756 3.883 4.007 4.196 4.378 4.556 4.732 4.903 5.118 5.321 5.512 5.735 5.952 6.16 6.399 6.668 6.925 7.202 7.494 7.795 8.103 8.459 8.874 9.264 9.701 10.187 10.7 11.235 11.835 12.505 13.154 13.446 13.423 13.253 12.995 12.681 12.342 12.003 11.697 11.396 11.141 10.889 10.629 10.369 10.134 9.927 9.694 9.484 9.299 9.089 8.885 8.714 8.527 8.33 8.174 8.025 7.863 7.693 7.517 7.385 7.241 6.985 6.797 6.617 6.527 6.326 6.129 5.938 5.84 5.572 5.531 5.405 5.274 4.957 4.773 4.592 4.404 4.188 3.938 3.593 2.259 -9 ,17853 ,TETRA ,17559097,Sat Nov 27 04:54:52 CET,Sat Nov 27 06:51:53 CET,0.0 1.325 1.748 2.112 2.42 2.663 2.877 3.066 3.391 3.546 3.691 3.779 4.078 4.196 4.423 4.642 4.838 4.93 5.117 5.289 5.529 5.684 5.826 6.034 6.244 6.452 6.65 6.832 7.076 7.314 7.534 7.801 8.051 8.282 8.535 8.8 9.039 9.299 9.589 9.904 10.24 10.598 10.993 11.401 11.902 12.415 12.965 13.583 14.218 14.902 15.545 15.862 15.857 15.699 15.468 15.193 14.899 14.565 14.26 13.949 13.664 13.405 13.153 12.898 12.651 12.436 12.19 11.953 11.757 11.556 11.341 11.162 10.971 10.762 10.595 10.429 10.263 10.088 9.899 9.759 9.621 9.406 9.25 9.09 9.003 8.814 8.622 8.418 8.306 8.026 7.995 7.866 7.734 7.442 7.278 7.096 6.88 6.653 6.399 6.05 4.844 -10 ,8365 ,TETRA ,17559098,Sat Nov 27 04:55:51 CET,Sat Nov 27 06:53:09 CET,0.0 0.713 0.975 1.173 1.343 1.526 1.695 1.833 2.084 2.208 2.324 2.355 2.629 2.727 2.913 3.086 3.246 3.32 3.472 3.629 3.839 3.97 4.098 4.272 4.429 4.579 4.729 4.882 5.088 5.282 5.463 5.677 5.894 6.103 6.331 6.598 6.851 7.119 7.421 7.744 8.085 8.473 8.909 9.344 9.845 10.367 10.937 11.531 12.196 12.923 13.587 13.897 13.888 13.738 13.504 13.228 12.952 12.655 12.355 12.055 11.778 11.507 11.268 11.044 10.817 10.607 10.382 10.189 10.027 9.837 9.623 9.448 9.271 9.083 8.939 8.792 8.639 8.473 8.296 8.173 8.052 7.852 7.695 7.52 7.432 7.264 7.073 6.878 6.776 6.486 6.406 6.278 6.14 5.832 5.679 5.521 5.315 5.035 4.718 4.363 2.207 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_46_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_46_43.txt deleted file mode 100644 index 37d53b09..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_46_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22917 ,TETRA ,17559099,Sat Nov 27 04:56:49 CET,Sat Nov 27 06:57:45 CET,0.0 0.473 0.808 1.068 1.274 1.447 1.617 1.793 2.104 2.246 2.378 2.4 2.711 2.825 3.048 3.268 3.479 3.569 3.734 3.891 4.109 4.26 4.424 4.659 4.872 5.087 5.292 5.476 5.715 5.955 6.187 6.454 6.714 6.965 7.239 7.532 7.818 8.14 8.479 8.831 9.207 9.647 10.141 10.602 11.134 11.726 12.422 13.18 14.014 14.901 15.877 16.473 16.671 16.722 16.631 16.461 16.261 16.06 15.858 15.622 15.405 15.21 15.01 14.807 14.627 14.442 14.21 14.012 13.858 13.701 13.523 13.358 13.186 13.021 12.894 12.75 12.592 12.418 12.251 12.153 12.04 11.828 11.671 11.511 11.426 11.255 11.067 10.854 10.742 10.446 10.425 10.307 10.196 9.969 9.844 9.7 9.538 9.352 9.105 8.794 7.958 -2 ,20184 ,TETRA ,17559100,Sat Nov 27 04:56:49 CET,Sat Nov 27 06:55:07 CET,0.0 0.799 1.146 1.407 1.627 1.816 1.993 2.163 2.464 2.616 2.75 2.768 3.07 3.17 3.359 3.564 3.78 3.879 4.079 4.271 4.546 4.719 4.863 5.053 5.237 5.416 5.594 5.774 6.004 6.228 6.448 6.707 6.962 7.211 7.503 7.833 8.123 8.425 8.767 9.112 9.455 9.827 10.237 10.652 11.127 11.657 12.301 13.014 13.776 14.59 15.441 16.001 16.196 16.178 16.067 15.947 15.813 15.641 15.468 15.285 15.11 14.923 14.755 14.615 14.45 14.281 14.121 13.986 13.863 13.719 13.567 13.438 13.295 13.155 13.039 12.91 12.769 12.618 12.462 12.359 12.254 12.076 11.949 11.826 11.767 11.653 11.54 11.417 11.345 11.075 11.089 10.98 10.847 10.575 10.437 10.284 10.118 9.931 9.705 9.371 8.505 -3 ,12013 ,TETRA ,17559101,Sat Nov 27 04:56:49 CET,Sat Nov 27 06:43:55 CET,0.0 0.494 0.774 1.005 1.182 1.349 1.522 1.676 1.938 2.047 2.143 2.133 2.423 2.512 2.701 2.881 3.05 3.135 3.293 3.446 3.657 3.79 3.928 4.122 4.303 4.465 4.617 4.777 4.982 5.17 5.358 5.582 5.804 6.019 6.249 6.5 6.753 7.037 7.333 7.647 7.986 8.367 8.806 9.242 9.737 10.25 10.851 11.535 12.281 13.096 13.942 14.49 14.624 14.574 14.452 14.292 14.12 13.943 13.761 13.564 13.39 13.208 13.039 12.884 12.729 12.575 12.392 12.223 12.076 11.924 11.769 11.631 11.486 11.341 11.227 11.102 10.96 10.809 10.653 10.554 10.455 10.291 10.168 10.029 9.962 9.823 9.683 9.544 9.466 9.185 9.202 9.102 8.986 8.742 8.62 8.492 8.345 8.177 7.993 7.768 7.217 -4 ,11867 ,TETRA ,17559102,Sat Nov 27 04:58:52 CET,Sat Nov 27 06:58:52 CET,0.0 0.637 0.885 1.11 1.32 1.487 1.628 1.759 1.981 2.087 2.207 2.271 2.559 2.643 2.816 2.973 3.123 3.2 3.353 3.503 3.712 3.841 3.966 4.148 4.323 4.501 4.676 4.83 5.034 5.241 5.435 5.665 5.886 6.095 6.344 6.63 6.897 7.185 7.498 7.825 8.17 8.543 8.966 9.385 9.884 10.433 11.015 11.636 12.383 13.209 13.986 14.463 14.652 14.643 14.532 14.399 14.24 14.064 13.889 13.666 13.452 13.276 13.098 12.904 12.734 12.577 12.405 12.26 12.123 11.964 11.801 11.68 11.548 11.395 11.284 11.169 11.035 10.89 10.748 10.641 10.511 10.318 10.198 10.073 10.005 9.87 9.72 9.532 9.433 9.147 9.115 9.006 8.9 8.677 8.572 8.46 8.326 8.163 7.941 7.65 7.007 -5 ,21121 ,TETRA ,17559103,Sat Nov 27 04:58:55 CET,Sat Nov 27 06:57:50 CET,0.0 0.844 1.108 1.304 1.484 1.635 1.773 1.913 2.209 2.352 2.465 2.477 2.761 2.855 3.036 3.203 3.349 3.419 3.572 3.717 3.912 4.038 4.162 4.347 4.522 4.69 4.844 4.997 5.224 5.45 5.646 5.868 6.098 6.329 6.575 6.856 7.145 7.446 7.752 8.077 8.427 8.803 9.23 9.671 10.157 10.691 11.316 11.985 12.728 13.544 14.39 14.916 15.056 15.033 14.952 14.803 14.623 14.457 14.289 14.087 13.892 13.708 13.525 13.349 13.19 13.027 12.824 12.642 12.486 12.323 12.168 12.042 11.89 11.716 11.574 11.432 11.3 11.162 11.005 10.893 10.777 10.588 10.451 10.312 10.243 10.092 9.936 9.783 9.695 9.41 9.397 9.279 9.169 8.928 8.782 8.625 8.452 8.269 8.064 7.782 6.952 -6 ,30427 ,TETRA ,17559104,Sat Nov 27 04:58:52 CET,Sat Nov 27 06:58:14 CET,0.0 0.808 1.102 1.319 1.511 1.663 1.804 1.928 2.161 2.275 2.382 2.398 2.685 2.778 2.956 3.127 3.294 3.377 3.523 3.655 3.849 3.982 4.103 4.262 4.417 4.573 4.733 4.889 5.095 5.305 5.503 5.732 5.942 6.15 6.403 6.683 6.946 7.244 7.565 7.896 8.229 8.594 9.034 9.459 9.942 10.468 11.042 11.679 12.408 13.209 14.034 14.512 14.639 14.602 14.479 14.303 14.121 13.947 13.788 13.613 13.433 13.243 13.053 12.885 12.72 12.551 12.369 12.203 12.058 11.896 11.717 11.573 11.425 11.262 11.132 10.988 10.828 10.67 10.511 10.399 10.282 10.1 9.984 9.866 9.798 9.648 9.484 9.318 9.224 8.931 8.916 8.808 8.691 8.467 8.353 8.209 8.041 7.877 7.679 7.411 6.423 -7 ,28121 ,TETRA ,17559105,Sat Nov 27 04:58:55 CET,Sat Nov 27 06:56:39 CET,0.0 0.87 1.229 1.497 1.703 1.899 2.075 2.223 2.498 2.643 2.782 2.846 3.163 3.276 3.491 3.683 3.862 3.948 4.106 4.25 4.459 4.592 4.717 4.907 5.084 5.249 5.409 5.564 5.765 5.957 6.147 6.378 6.596 6.803 7.029 7.294 7.558 7.845 8.17 8.521 8.879 9.276 9.743 10.19 10.685 11.225 11.84 12.501 13.256 14.101 14.935 15.432 15.61 15.602 15.484 15.333 15.188 15.006 14.812 14.602 14.401 14.215 14.024 13.847 13.69 13.536 13.379 13.24 13.101 12.943 12.781 12.641 12.484 12.33 12.203 12.057 11.91 11.752 11.583 11.464 11.346 11.161 11.033 10.891 10.82 10.685 10.531 10.364 10.285 10.022 10.041 9.956 9.843 9.597 9.455 9.31 9.174 9.004 8.795 8.559 7.808 -8 ,24908 ,TETRA ,17559106,Sat Nov 27 04:58:52 CET,Sat Nov 27 06:56:24 CET,0.0 0.609 0.846 1.073 1.259 1.422 1.56 1.687 1.947 2.066 2.184 2.208 2.492 2.584 2.764 2.922 3.072 3.152 3.319 3.471 3.676 3.804 3.936 4.13 4.311 4.493 4.666 4.831 5.043 5.239 5.422 5.654 5.877 6.086 6.322 6.586 6.835 7.114 7.422 7.719 8.043 8.424 8.86 9.304 9.795 10.317 10.932 11.604 12.335 13.109 13.897 14.445 14.644 14.623 14.516 14.384 14.252 14.096 13.93 13.753 13.593 13.429 13.269 13.109 12.946 12.803 12.662 12.533 12.406 12.265 12.109 11.984 11.854 11.707 11.595 11.466 11.324 11.186 11.037 10.934 10.836 10.672 10.552 10.419 10.347 10.209 10.06 9.907 9.833 9.558 9.55 9.454 9.35 9.109 8.968 8.811 8.649 8.47 8.277 8.023 7.364 -9 ,25754 ,TETRA ,17559107,Sat Nov 27 04:58:52 CET,Sat Nov 27 06:44:57 CET,0.0 0.68 1.016 1.265 1.462 1.621 1.751 1.881 2.119 2.23 2.346 2.375 2.666 2.759 2.93 3.09 3.241 3.315 3.462 3.603 3.814 3.956 4.082 4.252 4.419 4.581 4.755 4.935 5.162 5.371 5.57 5.808 6.048 6.275 6.516 6.786 7.053 7.351 7.667 7.984 8.323 8.734 9.207 9.674 10.191 10.746 11.384 12.04 12.805 13.679 14.523 14.994 15.168 15.192 15.125 14.993 14.827 14.651 14.474 14.269 14.064 13.887 13.712 13.533 13.364 13.193 13.015 12.865 12.741 12.603 12.44 12.306 12.174 12.026 11.913 11.8 11.666 11.536 11.407 11.312 11.206 11.024 10.904 10.782 10.717 10.58 10.429 10.274 10.202 9.942 9.969 9.874 9.773 9.545 9.421 9.294 9.148 8.98 8.789 8.516 7.805 -10 ,18491 ,TETRA ,17559108,Sat Nov 27 04:58:52 CET,Sat Nov 27 06:44:38 CET,0.0 0.811 1.119 1.335 1.536 1.694 1.83 1.975 2.222 2.333 2.443 2.472 2.775 2.881 3.079 3.261 3.445 3.54 3.716 3.872 4.097 4.243 4.386 4.605 4.816 5.007 5.182 5.345 5.556 5.771 5.978 6.209 6.428 6.638 6.888 7.171 7.431 7.717 8.014 8.326 8.676 9.084 9.554 10.002 10.493 11.033 11.612 12.26 13.032 13.905 14.861 15.464 15.646 15.645 15.548 15.373 15.159 14.928 14.731 14.54 14.343 14.152 13.979 13.823 13.666 13.495 13.33 13.193 13.067 12.92 12.745 12.607 12.469 12.324 12.202 12.074 11.933 11.784 11.63 11.532 11.447 11.296 11.184 11.069 11.007 10.865 10.708 10.554 10.475 10.203 10.201 10.098 10.0 9.784 9.658 9.517 9.365 9.18 8.971 8.72 8.054 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_47_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_47_43.txt deleted file mode 100644 index 035a7a5e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_47_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23620 ,TETRA ,17559109,Sat Nov 27 05:00:49 CET,Sat Nov 27 07:00:01 CET,0.0 0.338 0.596 0.83 1.019 1.191 1.358 1.497 1.737 1.848 1.965 2.013 2.316 2.414 2.612 2.804 2.992 3.082 3.236 3.391 3.641 3.8 3.954 4.184 4.394 4.581 4.756 4.935 5.176 5.4 5.608 5.869 6.134 6.385 6.676 7.002 7.296 7.607 7.951 8.307 8.684 9.135 9.635 10.103 10.622 11.182 11.841 12.539 13.344 14.241 15.132 15.666 15.786 15.743 15.577 15.297 14.987 14.695 14.423 14.136 13.865 13.6 13.342 13.068 12.812 12.585 12.339 12.116 11.913 11.704 11.485 11.289 11.085 10.867 10.69 10.511 10.33 10.147 9.944 9.796 9.638 9.394 9.232 9.072 8.99 8.817 8.623 8.4 8.282 7.981 7.946 7.82 7.691 7.392 7.215 7.025 6.801 6.569 6.324 5.995 5.133 -2 ,24965 ,TETRA ,17559110,Sat Nov 27 05:01:50 CET,Sat Nov 27 07:00:24 CET,0.0 0.637 0.972 1.256 1.49 1.676 1.844 1.987 2.245 2.378 2.494 2.502 2.787 2.883 3.083 3.28 3.462 3.548 3.713 3.873 4.112 4.266 4.411 4.627 4.832 5.03 5.222 5.391 5.611 5.836 6.043 6.29 6.539 6.778 7.056 7.376 7.683 8.042 8.434 8.837 9.254 9.712 10.248 10.763 11.318 11.917 12.568 13.299 14.177 15.146 16.157 16.766 16.892 16.855 16.73 16.524 16.266 15.973 15.707 15.427 15.164 14.912 14.669 14.432 14.189 13.948 13.705 13.497 13.318 13.141 12.953 12.779 12.587 12.373 12.212 12.06 11.902 11.725 11.544 11.429 11.311 11.112 10.97 10.818 10.732 10.544 10.355 10.16 10.056 9.767 9.701 9.562 9.423 9.134 8.971 8.777 8.563 8.331 8.075 7.738 7.286 -3 ,25268 ,TETRA ,17559111,Sat Nov 27 05:01:52 CET,Sat Nov 27 06:58:59 CET,0.0 0.552 0.828 1.058 1.263 1.431 1.585 1.73 1.99 2.116 2.236 2.277 2.579 2.672 2.84 2.999 3.16 3.243 3.414 3.588 3.806 3.933 4.06 4.25 4.447 4.638 4.814 4.982 5.195 5.404 5.632 5.911 6.173 6.427 6.7 6.981 7.235 7.519 7.835 8.171 8.534 8.971 9.452 9.914 10.475 11.078 11.701 12.35 13.159 14.052 14.979 15.555 15.629 15.513 15.368 15.147 14.863 14.586 14.333 14.071 13.857 13.639 13.383 13.15 12.934 12.701 12.438 12.206 12.009 11.786 11.529 11.319 11.112 10.892 10.722 10.551 10.366 10.174 9.966 9.819 9.673 9.44 9.286 9.133 9.052 8.875 8.695 8.505 8.399 8.096 8.044 7.92 7.786 7.497 7.33 7.149 6.964 6.751 6.461 6.099 5.434 -4 ,21419 ,TETRA ,17559112,Sat Nov 27 05:01:50 CET,Sat Nov 27 06:58:56 CET,0.0 0.792 1.097 1.346 1.562 1.73 1.89 2.041 2.299 2.419 2.544 2.602 2.901 3.011 3.207 3.403 3.59 3.672 3.847 4.017 4.24 4.39 4.534 4.747 4.957 5.159 5.354 5.536 5.757 5.976 6.18 6.417 6.657 6.892 7.165 7.476 7.789 8.149 8.527 8.902 9.281 9.69 10.155 10.625 11.18 11.79 12.475 13.196 14.035 14.961 15.937 16.623 16.842 16.799 16.614 16.373 16.142 15.919 15.692 15.452 15.225 14.999 14.775 14.526 14.288 14.083 13.864 13.647 13.442 13.218 12.978 12.784 12.589 12.39 12.235 12.074 11.895 11.708 11.515 11.382 11.249 11.02 10.855 10.684 10.592 10.401 10.208 10.016 9.924 9.645 9.621 9.5 9.358 9.002 8.81 8.634 8.45 8.248 8.015 7.713 6.919 -5 ,18383 ,TETRA ,17559113,Sat Nov 27 05:03:50 CET,Sat Nov 27 06:50:38 CET,0.0 0.639 0.97 1.238 1.433 1.603 1.769 1.924 2.216 2.357 2.489 2.54 2.84 2.945 3.16 3.371 3.569 3.66 3.829 3.996 4.251 4.405 4.544 4.758 4.947 5.111 5.286 5.468 5.701 5.926 6.149 6.411 6.647 6.882 7.156 7.461 7.744 8.064 8.426 8.8 9.169 9.56 10.038 10.56 11.151 11.742 12.393 13.112 13.919 14.768 15.609 16.162 16.313 16.279 16.13 15.892 15.651 15.408 15.195 14.947 14.681 14.427 14.186 13.94 13.689 13.469 13.246 13.031 12.842 12.629 12.393 12.211 12.028 11.823 11.634 11.434 11.243 11.04 10.816 10.667 10.532 10.324 10.174 9.999 9.905 9.713 9.52 9.319 9.205 8.898 8.846 8.722 8.593 8.292 8.114 7.923 7.728 7.512 7.227 6.864 6.084 -6 ,737 ,TETRA ,17559114,Sat Nov 27 05:04:52 CET,Sat Nov 27 07:04:31 CET,0.0 0.406 0.684 0.902 1.102 1.291 1.443 1.597 1.938 2.088 2.198 2.225 2.521 2.623 2.83 3.029 3.227 3.314 3.474 3.632 3.859 4.019 4.184 4.416 4.629 4.826 5.012 5.198 5.433 5.65 5.862 6.126 6.384 6.637 6.948 7.292 7.603 7.94 8.295 8.659 9.043 9.464 9.943 10.416 10.939 11.523 12.2 12.946 13.761 14.658 15.611 16.163 16.286 16.217 16.077 15.875 15.645 15.338 15.019 14.724 14.451 14.19 13.952 13.735 13.522 13.314 13.085 12.872 12.688 12.49 12.261 12.066 11.85 11.618 11.44 11.261 11.084 10.889 10.692 10.562 10.412 10.187 10.035 9.88 9.798 9.617 9.427 9.222 9.12 8.832 8.784 8.656 8.523 8.236 8.067 7.871 7.672 7.445 7.174 6.822 5.952 -7 ,27222 ,TETRA ,17559115,Sat Nov 27 05:05:49 CET,Sat Nov 27 07:02:57 CET,0.0 1.269 1.631 1.832 2.015 2.195 2.366 2.525 2.811 2.954 3.108 3.181 3.499 3.627 3.857 4.072 4.268 4.366 4.562 4.744 5.012 5.184 5.346 5.586 5.818 6.037 6.239 6.43 6.667 6.9 7.13 7.432 7.741 8.027 8.352 8.705 9.02 9.349 9.689 10.048 10.456 10.93 11.449 11.947 12.501 13.093 13.776 14.543 15.384 16.259 17.193 17.68 17.752 17.654 17.441 17.215 16.962 16.672 16.39 16.08 15.796 15.564 15.352 15.103 14.847 14.595 14.333 14.099 13.885 13.652 13.383 13.146 12.913 12.691 12.519 12.343 12.162 11.968 11.769 11.628 11.476 11.24 11.081 10.916 10.83 10.649 10.468 10.284 10.177 9.869 9.793 9.653 9.517 9.234 9.073 8.895 8.708 8.51 8.264 7.937 7.131 -8 ,6213 ,TETRA ,17559116,Sat Nov 27 05:06:50 CET,Sat Nov 27 07:10:28 CET,0.0 0.928 1.318 1.611 1.846 2.038 2.223 2.391 2.67 2.796 2.922 2.958 3.262 3.368 3.562 3.753 3.935 4.018 4.173 4.318 4.525 4.664 4.804 5.02 5.228 5.414 5.602 5.791 6.018 6.233 6.454 6.717 6.961 7.199 7.476 7.781 8.063 8.379 8.721 9.099 9.507 9.965 10.498 10.988 11.552 12.188 12.911 13.652 14.458 15.414 16.393 16.944 17.064 17.0 16.856 16.659 16.431 16.181 15.942 15.68 15.44 15.204 14.946 14.695 14.477 14.267 14.019 13.8 13.605 13.39 13.188 13.033 12.856 12.655 12.499 12.342 12.176 12.0 11.813 11.681 11.543 11.322 11.167 11.015 10.93 10.753 10.583 10.398 10.292 9.991 9.964 9.845 9.712 9.433 9.283 9.125 8.947 8.75 8.529 8.254 7.734 -9 ,26558 ,TETRA ,17559117,Sat Nov 27 05:06:50 CET,Sat Nov 27 07:03:50 CET,0.0 0.461 0.736 0.956 1.159 1.341 1.5 1.635 1.891 2.023 2.148 2.173 2.479 2.587 2.799 2.998 3.186 3.28 3.453 3.619 3.871 4.039 4.204 4.422 4.627 4.823 5.004 5.179 5.406 5.632 5.85 6.107 6.361 6.615 6.906 7.241 7.582 7.94 8.317 8.72 9.124 9.563 10.074 10.579 11.149 11.797 12.546 13.369 14.328 15.316 16.294 16.962 17.193 17.158 16.994 16.794 16.576 16.333 16.105 15.851 15.582 15.307 15.046 14.801 14.553 14.323 14.104 13.899 13.701 13.496 13.271 13.078 12.884 12.671 12.504 12.337 12.147 11.953 11.75 11.609 11.471 11.246 11.09 10.914 10.818 10.625 10.431 10.216 10.094 9.792 9.742 9.609 9.47 9.153 8.994 8.841 8.656 8.43 8.152 7.837 7.383 -10 ,7152 ,TETRA ,17559118,Sat Nov 27 05:08:53 CET,Sat Nov 27 07:08:30 CET,0.0 0.927 1.203 1.402 1.585 1.764 1.935 2.098 2.42 2.579 2.727 2.818 3.158 3.288 3.526 3.745 3.949 4.052 4.244 4.424 4.681 4.849 5.013 5.259 5.496 5.706 5.911 6.119 6.388 6.621 6.832 7.09 7.335 7.579 7.86 8.154 8.442 8.764 9.106 9.472 9.844 10.238 10.684 11.141 11.66 12.244 12.925 13.65 14.426 15.278 16.188 16.692 16.835 16.817 16.682 16.485 16.255 15.982 15.715 15.455 15.191 14.935 14.687 14.433 14.185 13.951 13.694 13.465 13.261 13.037 12.809 12.626 12.407 12.174 12.009 11.847 11.674 11.483 11.295 11.156 11.007 10.771 10.598 10.42 10.324 10.123 9.913 9.684 9.57 9.265 9.186 9.047 8.905 8.601 8.429 8.244 8.045 7.819 7.548 7.202 6.481 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_48_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_48_42.txt deleted file mode 100644 index 48f537d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_48_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17697 ,TETRA ,17559119,Sat Nov 27 05:09:50 CET,Sat Nov 27 07:09:14 CET,0.0 0.701 0.989 1.248 1.486 1.672 1.817 1.952 2.222 2.357 2.481 2.515 2.808 2.914 3.111 3.298 3.477 3.559 3.725 3.89 4.134 4.289 4.448 4.688 4.908 5.123 5.322 5.506 5.746 5.98 6.214 6.509 6.792 7.055 7.345 7.667 7.972 8.307 8.691 9.11 9.553 10.064 10.659 11.207 11.805 12.483 13.334 14.299 15.394 16.641 17.949 18.927 19.415 19.641 19.748 19.76 19.709 19.637 19.545 19.404 19.246 19.084 18.927 18.774 18.611 18.436 18.253 18.103 17.97 17.821 17.663 17.527 17.368 17.189 17.052 16.908 16.756 16.595 16.416 16.286 16.157 15.953 15.813 15.672 15.598 15.441 15.276 15.091 14.991 14.702 14.628 14.505 14.369 14.061 13.909 13.755 13.561 13.323 13.025 12.64 10.913 -2 ,20278 ,TETRA ,17559120,Sat Nov 27 05:10:46 CET,Sat Nov 27 07:11:42 CET,0.0 0.984 1.351 1.655 1.913 2.149 2.362 2.571 2.949 3.116 3.274 3.38 3.705 3.832 4.091 4.36 4.619 4.733 4.926 5.115 5.386 5.551 5.704 5.925 6.137 6.331 6.538 6.738 6.976 7.237 7.493 7.774 8.049 8.309 8.621 8.997 9.353 9.739 10.152 10.586 11.025 11.498 12.054 12.607 13.253 13.977 14.781 15.698 16.792 18.079 19.55 20.629 21.131 21.355 21.468 21.442 21.33 21.214 21.107 20.974 20.802 20.634 20.466 20.296 20.141 19.993 19.83 19.674 19.531 19.379 19.227 19.101 18.96 18.804 18.676 18.544 18.414 18.266 18.109 18.002 17.886 17.704 17.577 17.436 17.357 17.192 17.014 16.828 16.729 16.459 16.42 16.295 16.165 15.89 15.722 15.535 15.325 15.058 14.733 14.34 12.599 -3 ,20808 ,TETRA ,17559121,Sat Nov 27 05:11:48 CET,Sat Nov 27 07:02:14 CET,0.0 1.047 1.403 1.704 1.939 2.121 2.282 2.431 2.69 2.81 2.926 2.982 3.28 3.386 3.593 3.789 3.977 4.071 4.249 4.422 4.681 4.841 4.991 5.197 5.396 5.592 5.774 5.95 6.189 6.421 6.649 6.931 7.196 7.442 7.724 8.041 8.357 8.713 9.096 9.501 9.913 10.375 10.909 11.458 12.101 12.805 13.647 14.605 15.702 16.942 18.328 19.332 19.82 20.048 20.087 20.052 19.995 19.88 19.732 19.555 19.393 19.244 19.09 18.932 18.777 18.622 18.452 18.305 18.172 18.041 17.893 17.743 17.59 17.448 17.335 17.197 17.045 16.884 16.718 16.599 16.473 16.281 16.142 16.009 15.938 15.782 15.606 15.407 15.306 15.04 15.008 14.885 14.747 14.411 14.225 14.058 13.865 13.613 13.272 12.855 11.249 -4 ,10454 ,TETRA ,17559122,Sat Nov 27 05:14:47 CET,Sat Nov 27 07:14:25 CET,0.0 1.354 1.688 1.936 2.167 2.364 2.547 2.72 3.012 3.151 3.271 3.314 3.623 3.744 3.96 4.16 4.35 4.438 4.606 4.783 5.053 5.219 5.371 5.588 5.788 5.974 6.167 6.359 6.595 6.813 7.027 7.304 7.576 7.828 8.115 8.442 8.758 9.098 9.461 9.845 10.242 10.689 11.226 11.773 12.411 13.116 13.926 14.835 15.819 16.98 18.431 19.495 19.98 20.214 20.289 20.264 20.207 20.13 20.029 19.904 19.756 19.609 19.453 19.274 19.109 18.954 18.789 18.648 18.513 18.364 18.195 18.053 17.904 17.746 17.63 17.493 17.333 17.168 16.998 16.885 16.768 16.565 16.431 16.288 16.21 16.052 15.886 15.703 15.598 15.309 15.256 15.136 15.007 14.717 14.543 14.358 14.152 13.892 13.588 13.2 11.842 -5 ,25085 ,TETRA ,17559123,Sat Nov 27 05:15:48 CET,Sat Nov 27 07:08:44 CET,0.0 1.888 2.282 2.554 2.791 3.009 3.187 3.337 3.588 3.72 3.845 3.874 4.172 4.281 4.473 4.634 4.798 4.884 5.052 5.204 5.413 5.55 5.691 5.906 6.107 6.294 6.49 6.69 6.94 7.18 7.414 7.679 7.92 8.165 8.454 8.77 9.093 9.446 9.8 10.174 10.572 11.015 11.542 12.109 12.772 13.493 14.295 15.169 16.212 17.42 18.794 19.803 20.336 20.589 20.626 20.581 20.499 20.358 20.223 20.066 19.882 19.713 19.558 19.402 19.238 19.076 18.888 18.715 18.574 18.418 18.242 18.099 17.941 17.767 17.631 17.483 17.333 17.184 17.012 16.886 16.77 16.601 16.467 16.316 16.243 16.093 15.927 15.753 15.658 15.375 15.35 15.244 15.121 14.841 14.685 14.505 14.316 14.11 13.856 13.522 12.217 -6 ,25823 ,TETRA ,17559124,Sat Nov 27 05:15:49 CET,Sat Nov 27 07:05:45 CET,0.0 1.15 1.512 1.789 2.05 2.305 2.534 2.733 3.101 3.278 3.435 3.536 3.863 3.996 4.232 4.456 4.68 4.787 4.983 5.162 5.408 5.571 5.735 5.969 6.202 6.432 6.649 6.869 7.153 7.415 7.663 7.951 8.235 8.51 8.831 9.204 9.549 9.902 10.269 10.66 11.087 11.556 12.107 12.685 13.332 13.998 14.788 15.738 16.852 18.12 19.55 20.564 21.039 21.249 21.316 21.303 21.226 21.087 20.938 20.783 20.63 20.471 20.309 20.137 19.957 19.797 19.613 19.443 19.308 19.154 18.988 18.845 18.691 18.537 18.41 18.275 18.142 17.995 17.828 17.714 17.602 17.429 17.299 17.164 17.085 16.916 16.755 16.57 16.469 16.191 16.136 16.015 15.885 15.601 15.439 15.262 15.065 14.816 14.497 14.037 12.562 -7 ,9599 ,TETRA ,17559125,Sat Nov 27 05:21:50 CET,Sat Nov 27 07:18:51 CET,0.0 0.856 1.255 1.537 1.773 1.984 2.161 2.303 2.583 2.725 2.869 2.954 3.263 3.387 3.602 3.796 3.993 4.081 4.265 4.45 4.691 4.84 4.985 5.214 5.435 5.634 5.817 5.99 6.231 6.471 6.714 7.019 7.297 7.576 7.914 8.265 8.574 8.932 9.33 9.723 10.129 10.589 11.128 11.689 12.359 13.086 13.899 14.845 15.934 17.136 18.55 19.625 20.117 20.306 20.354 20.31 20.206 20.076 19.932 19.754 19.604 19.48 19.327 19.155 18.998 18.845 18.679 18.532 18.399 18.255 18.099 17.956 17.797 17.636 17.51 17.371 17.226 17.073 16.911 16.795 16.667 16.47 16.339 16.202 16.134 16.002 15.849 15.672 15.582 15.311 15.252 15.125 14.989 14.671 14.491 14.307 14.112 13.867 13.556 13.067 11.051 -8 ,31304 ,TETRA ,17559126,Sat Nov 27 05:22:48 CET,Sat Nov 27 07:20:53 CET,0.0 1.446 1.903 2.242 2.529 2.767 2.967 3.155 3.491 3.636 3.764 3.801 4.086 4.192 4.409 4.619 4.816 4.907 5.083 5.257 5.52 5.682 5.833 6.058 6.27 6.476 6.676 6.862 7.098 7.332 7.583 7.882 8.144 8.396 8.695 9.037 9.359 9.694 10.051 10.445 10.863 11.34 11.894 12.437 13.08 13.794 14.582 15.453 16.482 17.661 18.986 19.99 20.488 20.691 20.765 20.767 20.691 20.589 20.479 20.322 20.163 20.033 19.883 19.716 19.569 19.423 19.256 19.107 18.949 18.762 18.572 18.412 18.237 18.043 17.879 17.699 17.511 17.318 17.118 16.973 16.808 16.544 16.365 16.176 16.073 15.837 15.576 15.313 15.187 14.883 14.746 14.571 14.382 13.975 13.746 13.489 13.213 12.9 12.552 12.044 10.134 -9 ,25674 ,TETRA ,17559127,Sat Nov 27 05:22:48 CET,Sat Nov 27 07:19:48 CET,0.0 0.635 0.906 1.148 1.367 1.558 1.753 1.94 2.251 2.387 2.522 2.592 2.891 3.0 3.213 3.41 3.592 3.676 3.85 4.025 4.271 4.423 4.575 4.798 4.997 5.181 5.37 5.571 5.82 6.052 6.276 6.54 6.794 7.038 7.325 7.642 7.949 8.298 8.689 9.109 9.538 10.014 10.553 11.082 11.718 12.456 13.278 14.149 15.15 16.348 17.752 18.701 19.121 19.276 19.292 19.286 19.201 19.054 18.911 18.741 18.569 18.402 18.236 18.079 17.932 17.79 17.639 17.502 17.363 17.206 17.044 16.903 16.755 16.611 16.495 16.364 16.228 16.074 15.911 15.791 15.665 15.471 15.332 15.19 15.117 14.964 14.798 14.631 14.547 14.277 14.23 14.116 13.994 13.698 13.538 13.365 13.146 12.918 12.69 12.325 10.972 -10 ,24234 ,TETRA ,17559128,Sat Nov 27 05:22:49 CET,Sat Nov 27 07:20:00 CET,0.0 1.648 2.034 2.303 2.5 2.658 2.809 2.953 3.209 3.318 3.425 3.466 3.77 3.887 4.105 4.285 4.457 4.544 4.711 4.869 5.091 5.235 5.379 5.594 5.805 6.012 6.206 6.389 6.635 6.878 7.097 7.366 7.634 7.889 8.194 8.526 8.831 9.169 9.547 9.945 10.362 10.826 11.376 11.953 12.586 13.273 14.084 14.976 16.002 17.154 18.386 19.329 19.799 19.986 20.041 20.037 19.97 19.864 19.727 19.577 19.442 19.301 19.153 19.001 18.853 18.715 18.564 18.414 18.278 18.134 17.983 17.861 17.727 17.577 17.455 17.315 17.166 17.016 16.859 16.753 16.64 16.446 16.296 16.147 16.074 15.909 15.732 15.533 15.418 15.122 15.037 14.909 14.777 14.467 14.291 14.113 13.93 13.701 13.415 13.042 11.68 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_49_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_49_50.txt deleted file mode 100644 index 18821966..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_49_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21037 ,TETRA ,17559129,Sat Nov 27 05:22:49 CET,Sat Nov 27 07:19:59 CET,0.0 0.812 1.105 1.309 1.509 1.672 1.805 1.941 2.204 2.322 2.425 2.439 2.707 2.801 2.989 3.164 3.328 3.411 3.577 3.726 3.929 4.05 4.178 4.369 4.543 4.706 4.864 5.014 5.195 5.363 5.529 5.741 5.948 6.141 6.358 6.598 6.837 7.117 7.421 7.717 7.985 8.302 8.664 8.997 9.38 9.732 10.068 10.401 10.669 10.814 10.714 10.232 9.64 9.047 8.507 7.974 7.456 6.982 6.565 6.13 5.713 5.334 4.999 4.683 4.383 4.089 3.779 3.516 3.272 3.017 2.767 2.564 2.347 2.121 1.951 1.77 1.564 1.345 1.124 0.98 0.838 0.604 0.445 0.271 0.177 0.001 -0.172 -0.359 -0.458 -0.744 -0.785 -0.903 -1.028 -1.312 -1.467 -1.622 -1.782 -1.974 -2.203 -2.452 -3.173 -2 ,21349 ,TETRA ,17559130,Sat Nov 27 05:23:48 CET,Sat Nov 27 07:20:48 CET,0.0 0.619 0.971 1.22 1.434 1.614 1.777 1.927 2.171 2.284 2.393 2.432 2.721 2.824 3.011 3.177 3.335 3.415 3.573 3.73 3.958 4.109 4.252 4.448 4.623 4.797 4.973 5.133 5.331 5.522 5.704 5.924 6.132 6.323 6.549 6.813 7.048 7.291 7.549 7.816 8.094 8.403 8.732 9.01 9.323 9.686 10.082 10.456 10.79 11.003 10.841 10.259 9.637 9.01 8.423 7.872 7.355 6.851 6.409 5.977 5.603 5.239 4.884 4.563 4.269 4.001 3.721 3.475 3.249 3.011 2.78 2.591 2.381 2.155 1.975 1.778 1.574 1.364 1.147 1.002 0.858 0.649 0.499 0.332 0.247 0.087 -0.074 -0.259 -0.35 -0.618 -0.635 -0.742 -0.855 -1.106 -1.261 -1.435 -1.621 -1.828 -2.048 -2.293 -2.916 -3 ,5501 ,TETRA ,17559131,Sat Nov 27 05:23:48 CET,Sat Nov 27 07:00:39 CET,0.0 0.861 1.203 1.483 1.696 1.872 2.022 2.157 2.412 2.534 2.656 2.717 2.998 3.096 3.288 3.458 3.617 3.694 3.834 3.99 4.23 4.376 4.523 4.741 4.939 5.12 5.286 5.446 5.643 5.843 6.037 6.243 6.424 6.593 6.796 7.022 7.234 7.476 7.744 8.014 8.291 8.586 8.9 9.228 9.586 9.941 10.32 10.677 10.972 11.08 10.877 10.312 9.712 9.136 8.586 8.078 7.612 7.188 6.803 6.396 6.036 5.702 5.379 5.063 4.761 4.492 4.215 3.965 3.758 3.54 3.305 3.102 2.891 2.67 2.485 2.294 2.103 1.901 1.687 1.547 1.41 1.196 1.052 0.907 0.83 0.683 0.525 0.346 0.248 -0.041 -0.071 -0.187 -0.307 -0.57 -0.716 -0.868 -1.056 -1.286 -1.552 -1.911 -2.585 -4 ,24700 ,TETRA ,17559132,Sat Nov 27 05:23:49 CET,Sat Nov 27 07:20:32 CET,0.0 0.707 1.043 1.332 1.566 1.774 1.956 2.128 2.459 2.604 2.734 2.797 3.088 3.186 3.381 3.581 3.78 3.876 4.061 4.237 4.487 4.645 4.793 5.019 5.246 5.46 5.659 5.845 6.077 6.29 6.483 6.714 6.945 7.172 7.428 7.701 7.948 8.211 8.493 8.774 9.049 9.352 9.705 10.023 10.334 10.634 10.955 11.284 11.547 11.672 11.492 10.988 10.381 9.736 9.133 8.595 8.105 7.64 7.247 6.844 6.475 6.139 5.823 5.502 5.209 4.946 4.666 4.414 4.183 3.936 3.691 3.493 3.28 3.063 2.9 2.737 2.561 2.361 2.154 2.022 1.889 1.681 1.53 1.366 1.285 1.115 0.934 0.735 0.628 0.343 0.329 0.217 0.101 -0.137 -0.279 -0.435 -0.618 -0.819 -1.045 -1.324 -1.96 -5 ,24240 ,TETRA ,17559133,Sat Nov 27 05:23:51 CET,Sat Nov 27 07:20:36 CET,0.0 0.507 0.771 0.999 1.182 1.365 1.539 1.684 1.945 2.067 2.183 2.22 2.511 2.613 2.804 2.974 3.129 3.207 3.36 3.514 3.738 3.876 4.01 4.193 4.362 4.533 4.708 4.874 5.082 5.282 5.471 5.704 5.921 6.115 6.34 6.577 6.809 7.046 7.278 7.527 7.79 8.086 8.433 8.768 9.12 9.476 9.827 10.165 10.454 10.644 10.552 10.038 9.471 8.895 8.279 7.7 7.191 6.717 6.296 5.876 5.511 5.183 4.864 4.552 4.271 4.017 3.738 3.481 3.266 3.056 2.831 2.626 2.417 2.202 2.033 1.86 1.681 1.484 1.264 1.109 0.96 0.726 0.565 0.404 0.32 0.155 -0.015 -0.2 -0.298 -0.58 -0.621 -0.745 -0.87 -1.15 -1.308 -1.468 -1.657 -1.874 -2.081 -2.307 -2.737 -6 ,3268 ,TETRA ,17559134,Sat Nov 27 05:23:49 CET,Sat Nov 27 07:17:28 CET,0.0 0.644 0.967 1.219 1.402 1.565 1.736 1.892 2.173 2.308 2.449 2.524 2.818 2.925 3.13 3.331 3.525 3.62 3.809 3.981 4.239 4.41 4.56 4.756 4.931 5.096 5.264 5.431 5.636 5.828 6.016 6.258 6.48 6.678 6.914 7.18 7.417 7.658 7.946 8.241 8.539 8.893 9.258 9.58 9.934 10.297 10.665 10.996 11.276 11.413 11.303 10.87 10.303 9.695 9.11 8.565 8.071 7.599 7.171 6.726 6.352 6.039 5.744 5.473 5.223 4.971 4.703 4.475 4.262 4.035 3.808 3.622 3.424 3.212 3.051 2.881 2.698 2.506 2.32 2.194 2.064 1.854 1.702 1.554 1.481 1.326 1.152 0.967 0.87 0.588 0.55 0.432 0.308 0.019 -0.131 -0.276 -0.435 -0.62 -0.847 -1.133 -1.737 -7 ,32171 ,TETRA ,17559135,Sat Nov 27 05:23:49 CET,Sat Nov 27 07:20:17 CET,0.0 0.457 0.756 0.979 1.173 1.348 1.503 1.639 1.88 1.989 2.088 2.092 2.372 2.466 2.64 2.822 2.996 3.076 3.228 3.38 3.589 3.725 3.866 4.051 4.221 4.39 4.559 4.711 4.891 5.07 5.245 5.443 5.628 5.809 6.033 6.304 6.547 6.781 7.02 7.254 7.497 7.776 8.079 8.37 8.695 8.993 9.28 9.569 9.813 9.936 9.725 9.19 8.613 7.944 7.301 6.721 6.233 5.803 5.407 5.004 4.642 4.289 3.949 3.632 3.331 3.058 2.77 2.511 2.294 2.074 1.852 1.665 1.45 1.224 1.061 0.892 0.718 0.54 0.34 0.199 0.052 -0.177 -0.342 -0.509 -0.589 -0.76 -0.928 -1.103 -1.206 -1.5 -1.542 -1.65 -1.759 -1.999 -2.144 -2.297 -2.472 -2.663 -2.881 -3.189 -5.04 -8 ,9843 ,TETRA ,17559136,Sat Nov 27 05:23:49 CET,Sat Nov 27 07:20:35 CET,0.0 0.636 0.928 1.191 1.422 1.63 1.816 1.964 2.197 2.304 2.405 2.426 2.701 2.798 2.98 3.151 3.315 3.398 3.559 3.719 3.963 4.111 4.243 4.434 4.605 4.762 4.911 5.057 5.245 5.428 5.611 5.833 6.036 6.238 6.477 6.725 6.954 7.182 7.429 7.689 7.963 8.262 8.585 8.896 9.22 9.552 9.889 10.172 10.449 10.649 10.585 10.085 9.486 8.876 8.312 7.801 7.324 6.88 6.473 6.067 5.716 5.367 5.044 4.744 4.459 4.215 3.959 3.718 3.501 3.281 3.049 2.858 2.652 2.426 2.255 2.082 1.898 1.708 1.509 1.37 1.226 0.996 0.834 0.67 0.584 0.402 0.204 -0.007 -0.113 -0.403 -0.447 -0.569 -0.688 -0.949 -1.102 -1.244 -1.397 -1.592 -1.795 -2.087 -2.654 -9 ,12801 ,TETRA ,17559137,Sat Nov 27 05:23:49 CET,Sat Nov 27 07:20:47 CET,0.0 0.613 0.957 1.215 1.42 1.616 1.799 1.947 2.204 2.334 2.459 2.501 2.785 2.887 3.082 3.264 3.416 3.483 3.623 3.756 3.942 4.069 4.192 4.369 4.543 4.701 4.849 5.003 5.193 5.376 5.56 5.778 5.978 6.167 6.398 6.653 6.889 7.134 7.392 7.645 7.886 8.172 8.495 8.796 9.109 9.448 9.809 10.111 10.38 10.569 10.452 9.944 9.331 8.711 8.147 7.616 7.134 6.671 6.26 5.849 5.483 5.139 4.799 4.477 4.188 3.928 3.661 3.437 3.234 3.01 2.769 2.564 2.347 2.129 1.96 1.779 1.6 1.415 1.219 1.084 0.949 0.73 0.57 0.407 0.327 0.152 -0.037 -0.229 -0.328 -0.602 -0.631 -0.743 -0.857 -1.113 -1.248 -1.4 -1.572 -1.753 -1.943 -2.181 -2.607 -10 ,19427 ,TETRA ,17559138,Sat Nov 27 05:24:50 CET,Sat Nov 27 07:21:39 CET,0.0 0.924 1.229 1.455 1.645 1.819 1.979 2.121 2.396 2.525 2.65 2.706 2.993 3.095 3.283 3.456 3.62 3.702 3.859 4.008 4.227 4.353 4.47 4.646 4.819 4.99 5.157 5.318 5.519 5.708 5.887 6.099 6.301 6.487 6.701 6.97 7.218 7.469 7.738 8.005 8.269 8.558 8.874 9.171 9.49 9.806 10.12 10.434 10.685 10.787 10.679 10.206 9.609 9.047 8.5 7.987 7.535 7.068 6.627 6.181 5.807 5.472 5.137 4.818 4.527 4.264 3.997 3.748 3.521 3.301 3.07 2.864 2.657 2.446 2.281 2.106 1.922 1.741 1.555 1.419 1.264 1.026 0.884 0.737 0.655 0.481 0.297 0.111 0.015 -0.269 -0.299 -0.407 -0.527 -0.769 -0.894 -1.033 -1.2 -1.398 -1.627 -1.922 -2.606 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_51_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_51_54.txt deleted file mode 100644 index 5f28e309..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_51_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32739 ,TETRA ,17559139,Sat Nov 27 05:24:52 CET,Sat Nov 27 07:23:35 CET,0.0 1.518 1.977 2.248 2.47 2.698 2.918 3.112 3.429 3.537 3.65 3.745 4.037 4.144 4.339 4.542 4.726 4.812 4.968 5.109 5.301 5.438 5.571 5.733 5.886 6.05 6.207 6.341 6.513 6.684 6.86 7.064 7.243 7.41 7.625 7.882 8.109 8.313 8.501 8.726 8.978 9.243 9.48 9.651 9.815 9.953 10.082 10.154 10.066 9.712 8.812 7.341 5.94 4.747 3.739 2.819 1.996 1.217 0.542 -0.119 -0.7 -1.223 -1.713 -2.177 -2.628 -3.015 -3.412 -3.79 -4.108 -4.438 -4.791 -5.073 -5.359 -5.668 -5.905 -6.157 -6.413 -6.664 -6.923 -7.102 -7.303 -7.632 -7.849 -8.057 -8.166 -8.414 -8.682 -8.964 -9.11 -9.443 -9.567 -9.736 -9.899 -10.249 -10.454 -10.667 -10.919 -11.213 -11.527 -11.923 -13.213 -2 ,15563 ,TETRA ,17559140,Sat Nov 27 05:24:52 CET,Sat Nov 27 07:23:40 CET,0.0 1.545 2.057 2.378 2.664 2.916 3.122 3.284 3.586 3.729 3.868 3.965 4.234 4.348 4.563 4.75 4.934 5.02 5.183 5.331 5.543 5.664 5.779 5.955 6.129 6.3 6.458 6.611 6.789 6.943 7.105 7.3 7.477 7.654 7.863 8.105 8.312 8.51 8.699 8.891 9.088 9.309 9.543 9.719 9.874 10.003 10.131 10.202 10.144 9.82 8.927 7.588 6.319 5.157 4.163 3.266 2.479 1.764 1.144 0.526 -0.016 -0.501 -0.958 -1.375 -1.775 -2.174 -2.593 -2.947 -3.232 -3.521 -3.84 -4.118 -4.42 -4.729 -4.967 -5.216 -5.476 -5.745 -6.013 -6.203 -6.403 -6.71 -6.935 -7.169 -7.286 -7.539 -7.812 -8.081 -8.211 -8.543 -8.71 -8.881 -9.06 -9.462 -9.676 -9.891 -10.139 -10.435 -10.772 -11.194 -12.782 -3 ,3579 ,TETRA ,17559141,Sat Nov 27 05:24:53 CET,Sat Nov 27 07:23:32 CET,0.0 2.557 3.018 3.319 3.598 3.855 4.086 4.308 4.7 4.859 5.002 5.116 5.401 5.502 5.704 5.883 6.037 6.121 6.295 6.459 6.678 6.82 6.958 7.172 7.373 7.542 7.699 7.849 8.038 8.211 8.367 8.563 8.746 8.907 9.097 9.295 9.476 9.678 9.889 10.092 10.284 10.5 10.762 10.963 11.148 11.356 11.559 11.691 11.613 11.236 10.346 9.007 7.795 6.704 5.699 4.783 3.949 3.179 2.534 1.896 1.348 0.857 0.375 -0.086 -0.511 -0.895 -1.277 -1.628 -1.926 -2.255 -2.625 -2.923 -3.227 -3.536 -3.767 -4.004 -4.257 -4.523 -4.806 -5.011 -5.222 -5.544 -5.77 -6.001 -6.118 -6.361 -6.62 -6.901 -7.056 -7.394 -7.553 -7.739 -7.912 -8.292 -8.504 -8.737 -9.037 -9.398 -9.779 -10.22 -11.643 -4 ,30818 ,TETRA ,17559142,Sat Nov 27 05:24:52 CET,Sat Nov 27 07:24:03 CET,0.0 1.761 2.282 2.635 2.923 3.151 3.356 3.56 3.906 4.043 4.171 4.256 4.539 4.655 4.861 5.072 5.281 5.382 5.577 5.747 5.957 6.093 6.238 6.437 6.613 6.766 6.912 7.068 7.261 7.427 7.59 7.783 7.96 8.123 8.307 8.498 8.68 8.88 9.079 9.295 9.501 9.697 9.936 10.168 10.355 10.521 10.686 10.777 10.689 10.273 9.33 7.98 6.701 5.601 4.653 3.766 2.996 2.314 1.702 1.066 0.51 0.004 -0.471 -0.91 -1.323 -1.712 -2.111 -2.458 -2.769 -3.087 -3.405 -3.665 -3.941 -4.236 -4.462 -4.701 -4.966 -5.246 -5.531 -5.732 -5.926 -6.225 -6.447 -6.679 -6.798 -7.051 -7.325 -7.611 -7.758 -8.084 -8.232 -8.407 -8.587 -8.987 -9.19 -9.412 -9.679 -9.94 -10.193 -10.608 -14.861 -5 ,1784 ,TETRA ,17559143,Sat Nov 27 05:24:54 CET,Sat Nov 27 07:24:57 CET,0.0 3.932 4.445 4.741 4.966 5.165 5.328 5.476 5.771 5.899 6.017 6.047 6.294 6.385 6.593 6.796 6.968 7.047 7.18 7.312 7.514 7.636 7.753 7.907 8.072 8.249 8.398 8.537 8.702 8.85 8.995 9.179 9.377 9.574 9.778 9.979 10.175 10.385 10.594 10.823 11.063 11.295 11.508 11.684 11.874 12.052 12.192 12.24 12.155 11.784 10.8 9.378 8.084 6.924 5.922 5.015 4.211 3.481 2.839 2.19 1.619 1.108 0.636 0.18 -0.238 -0.614 -1.029 -1.391 -1.692 -2.016 -2.36 -2.65 -2.977 -3.301 -3.546 -3.816 -4.082 -4.341 -4.624 -4.831 -5.04 -5.355 -5.561 -5.77 -5.887 -6.14 -6.399 -6.67 -6.813 -7.137 -7.255 -7.415 -7.603 -8.042 -8.255 -8.475 -8.718 -8.982 -9.304 -9.723 -11.61 -6 ,19789 ,TETRA ,17559144,Sat Nov 27 05:24:52 CET,Sat Nov 27 07:25:03 CET,0.0 2.374 2.815 3.174 3.478 3.742 3.971 4.143 4.472 4.623 4.767 4.908 5.215 5.336 5.574 5.781 5.949 6.036 6.216 6.382 6.585 6.706 6.839 7.037 7.217 7.382 7.542 7.705 7.9 8.073 8.251 8.456 8.637 8.821 9.018 9.212 9.405 9.608 9.827 10.048 10.267 10.509 10.732 10.921 11.142 11.353 11.496 11.568 11.519 11.143 10.175 8.617 7.237 6.05 4.965 4.016 3.192 2.449 1.838 1.206 0.635 0.109 -0.391 -0.828 -1.237 -1.617 -2.014 -2.369 -2.665 -2.97 -3.3 -3.581 -3.869 -4.174 -4.407 -4.644 -4.912 -5.193 -5.477 -5.676 -5.877 -6.179 -6.39 -6.616 -6.735 -6.981 -7.233 -7.507 -7.646 -7.964 -8.107 -8.273 -8.44 -8.793 -8.977 -9.167 -9.418 -9.734 -10.073 -10.499 -12.278 -7 ,13232 ,TETRA ,17559145,Sat Nov 27 05:25:51 CET,Sat Nov 27 07:26:15 CET,0.0 2.15 2.718 3.101 3.401 3.642 3.831 4.003 4.299 4.449 4.597 4.675 4.943 5.036 5.234 5.442 5.616 5.7 5.877 6.049 6.313 6.465 6.595 6.776 6.956 7.128 7.277 7.429 7.604 7.759 7.912 8.099 8.303 8.484 8.662 8.854 9.049 9.26 9.452 9.634 9.807 9.997 10.253 10.461 10.637 10.823 10.939 10.985 10.972 10.653 9.673 8.272 6.938 5.713 4.667 3.726 2.856 2.092 1.447 0.777 0.199 -0.297 -0.744 -1.178 -1.593 -1.997 -2.452 -2.834 -3.158 -3.509 -3.871 -4.163 -4.451 -4.734 -4.954 -5.192 -5.457 -5.731 -6.012 -6.209 -6.411 -6.731 -6.954 -7.171 -7.285 -7.531 -7.793 -8.068 -8.209 -8.552 -8.756 -8.93 -9.096 -9.5 -9.707 -9.921 -10.197 -10.494 -10.802 -11.187 -12.692 -8 ,5356 ,TETRA ,17559146,Sat Nov 27 05:25:53 CET,Sat Nov 27 07:25:32 CET,0.0 2.482 3.01 3.407 3.712 3.984 4.201 4.369 4.647 4.787 4.941 5.054 5.328 5.438 5.663 5.848 6.004 6.086 6.256 6.405 6.609 6.742 6.858 7.029 7.211 7.381 7.536 7.677 7.853 8.022 8.181 8.364 8.543 8.732 8.945 9.174 9.378 9.572 9.765 9.957 10.142 10.347 10.573 10.772 10.945 11.141 11.318 11.358 11.293 11.073 10.291 8.92 7.583 6.366 5.283 4.276 3.387 2.628 1.993 1.346 0.806 0.329 -0.143 -0.587 -1.0 -1.379 -1.776 -2.125 -2.426 -2.768 -3.129 -3.413 -3.708 -4.025 -4.277 -4.535 -4.789 -5.039 -5.312 -5.499 -5.683 -5.978 -6.19 -6.423 -6.544 -6.789 -7.045 -7.317 -7.465 -7.792 -7.933 -8.09 -8.245 -8.576 -8.773 -8.997 -9.239 -9.566 -9.966 -10.467 -11.669 -9 ,9198 ,TETRA ,17559147,Sat Nov 27 05:25:53 CET,Sat Nov 27 07:25:47 CET,0.0 2.126 2.713 3.083 3.356 3.624 3.864 4.067 4.4 4.531 4.657 4.75 5.039 5.151 5.359 5.564 5.75 5.837 5.989 6.131 6.344 6.477 6.593 6.755 6.92 7.085 7.239 7.379 7.56 7.723 7.866 8.04 8.227 8.398 8.586 8.795 8.979 9.183 9.399 9.596 9.781 9.979 10.186 10.379 10.613 10.816 10.929 10.992 10.941 10.593 9.734 8.507 7.333 6.194 5.207 4.284 3.435 2.668 2.023 1.398 0.835 0.315 -0.177 -0.634 -1.063 -1.442 -1.818 -2.174 -2.491 -2.828 -3.165 -3.431 -3.713 -4.01 -4.244 -4.49 -4.746 -5.0 -5.267 -5.453 -5.641 -5.946 -6.166 -6.393 -6.512 -6.75 -6.995 -7.258 -7.4 -7.723 -7.864 -8.035 -8.221 -8.621 -8.846 -9.1 -9.363 -9.618 -9.919 -10.329 -12.194 -10 ,28512 ,TETRA ,17559148,Sat Nov 27 05:25:53 CET,Sat Nov 27 07:25:27 CET,0.0 1.406 1.775 2.063 2.297 2.505 2.686 2.851 3.133 3.248 3.35 3.372 3.621 3.7 3.857 4.018 4.187 4.27 4.429 4.58 4.791 4.93 5.068 5.249 5.399 5.561 5.725 5.88 6.072 6.241 6.406 6.603 6.786 6.959 7.147 7.333 7.51 7.706 7.901 8.085 8.255 8.451 8.649 8.829 9.042 9.22 9.335 9.377 9.347 9.148 8.293 6.897 5.792 4.844 4.031 3.273 2.571 1.919 1.331 0.713 0.175 -0.309 -0.788 -1.242 -1.663 -2.026 -2.393 -2.753 -3.077 -3.4 -3.737 -4.02 -4.312 -4.63 -4.876 -5.127 -5.384 -5.638 -5.889 -6.06 -6.239 -6.529 -6.736 -6.965 -7.084 -7.314 -7.561 -7.836 -7.966 -8.267 -8.382 -8.544 -8.716 -9.086 -9.284 -9.489 -9.718 -9.993 -10.326 -10.782 -11.996 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_52_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_52_53.txt deleted file mode 100644 index 2934f948..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_52_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8030 ,TETRA ,17559149,Sat Nov 27 05:25:54 CET,Sat Nov 27 07:24:35 CET,0.0 1.659 2.065 2.382 2.644 2.881 3.121 3.34 3.734 3.906 4.058 4.157 4.465 4.58 4.811 5.023 5.219 5.313 5.472 5.641 5.912 6.072 6.22 6.442 6.648 6.828 6.994 7.162 7.376 7.549 7.706 7.931 8.139 8.314 8.527 8.763 8.991 9.258 9.537 9.798 10.048 10.331 10.652 10.96 11.28 11.638 12.023 12.325 12.574 12.705 12.507 11.854 11.105 10.352 9.633 9.002 8.447 7.928 7.456 6.96 6.522 6.12 5.735 5.358 5.012 4.707 4.368 4.057 3.799 3.528 3.241 3.002 2.743 2.474 2.264 2.043 1.815 1.583 1.333 1.15 0.959 0.675 0.484 0.293 0.191 -0.018 -0.221 -0.451 -0.577 -0.895 -0.964 -1.125 -1.307 -1.666 -1.863 -2.082 -2.328 -2.612 -2.987 -3.485 -4.446 -2 ,16740 ,TETRA ,17559150,Sat Nov 27 05:26:48 CET,Sat Nov 27 07:29:17 CET,0.0 0.82 1.177 1.471 1.707 1.916 2.116 2.315 2.625 2.763 2.896 2.94 3.245 3.352 3.545 3.725 3.909 3.998 4.163 4.319 4.546 4.702 4.85 5.048 5.233 5.419 5.604 5.775 5.98 6.169 6.342 6.557 6.771 6.964 7.176 7.406 7.619 7.87 8.146 8.403 8.659 8.958 9.291 9.608 9.947 10.275 10.564 10.823 11.062 11.174 10.945 10.339 9.678 8.968 8.334 7.788 7.3 6.829 6.395 5.94 5.527 5.15 4.8 4.465 4.125 3.817 3.497 3.211 2.97 2.718 2.445 2.212 1.962 1.694 1.482 1.267 1.047 0.806 0.563 0.394 0.214 -0.04 -0.217 -0.409 -0.502 -0.705 -0.946 -1.218 -1.373 -1.721 -1.835 -1.981 -2.116 -2.386 -2.546 -2.736 -2.946 -3.196 -3.508 -3.949 -5.185 -3 ,29186 ,TETRA ,17559151,Sat Nov 27 05:26:49 CET,Sat Nov 27 07:28:46 CET,0.0 1.276 1.597 1.857 2.101 2.316 2.516 2.689 3.024 3.185 3.322 3.4 3.712 3.825 4.036 4.235 4.438 4.535 4.708 4.87 5.107 5.258 5.408 5.622 5.823 6.019 6.203 6.375 6.585 6.787 6.971 7.195 7.411 7.613 7.841 8.102 8.353 8.611 8.894 9.186 9.473 9.803 10.168 10.485 10.797 11.085 11.379 11.659 11.834 11.854 11.526 10.796 10.057 9.335 8.636 7.98 7.406 6.891 6.424 5.921 5.466 5.065 4.688 4.32 3.971 3.649 3.327 3.047 2.805 2.543 2.261 2.023 1.773 1.515 1.312 1.107 0.895 0.662 0.412 0.233 0.047 -0.244 -0.432 -0.63 -0.741 -0.961 -1.203 -1.474 -1.616 -1.95 -2.051 -2.218 -2.387 -2.712 -2.896 -3.101 -3.317 -3.576 -3.875 -4.26 -5.945 -4 ,30715 ,TETRA ,17559152,Sat Nov 27 05:26:47 CET,Sat Nov 27 07:24:50 CET,0.0 1.177 1.641 1.939 2.142 2.316 2.484 2.641 2.967 3.113 3.232 3.275 3.569 3.681 3.887 4.075 4.254 4.342 4.514 4.685 4.93 5.076 5.215 5.41 5.587 5.758 5.933 6.104 6.325 6.531 6.709 6.91 7.09 7.261 7.46 7.687 7.9 8.121 8.349 8.599 8.855 9.109 9.372 9.628 9.907 10.181 10.474 10.752 10.958 10.942 10.614 9.92 9.108 8.334 7.627 6.991 6.423 5.89 5.418 4.929 4.511 4.124 3.73 3.363 3.028 2.711 2.37 2.065 1.801 1.539 1.266 1.039 0.822 0.583 0.379 0.181 -0.011 -0.215 -0.442 -0.602 -0.775 -1.048 -1.24 -1.434 -1.527 -1.731 -1.957 -2.18 -2.3 -2.624 -2.708 -2.853 -3.017 -3.356 -3.54 -3.744 -3.978 -4.247 -4.539 -4.909 -5.82 -5 ,24156 ,TETRA ,17559153,Sat Nov 27 05:27:50 CET,Sat Nov 27 07:27:24 CET,0.0 1.224 1.633 1.962 2.244 2.477 2.692 2.896 3.254 3.412 3.56 3.643 3.962 4.087 4.307 4.53 4.767 4.889 5.12 5.324 5.588 5.737 5.869 6.071 6.287 6.494 6.691 6.876 7.09 7.29 7.481 7.698 7.902 8.101 8.328 8.571 8.791 9.032 9.288 9.565 9.831 10.11 10.442 10.748 11.055 11.355 11.655 11.894 12.018 12.039 11.797 11.115 10.446 9.858 9.265 8.646 8.069 7.526 7.045 6.564 6.141 5.74 5.358 4.996 4.65 4.341 4.02 3.723 3.454 3.17 2.871 2.632 2.373 2.097 1.877 1.638 1.401 1.17 0.924 0.747 0.564 0.267 0.054 -0.164 -0.275 -0.506 -0.755 -1.018 -1.155 -1.491 -1.621 -1.794 -1.976 -2.366 -2.564 -2.793 -3.059 -3.324 -3.632 -4.007 -5.06 -6 ,30618 ,TETRA ,17559154,Sat Nov 27 05:27:50 CET,Sat Nov 27 07:27:02 CET,0.0 1.653 2.147 2.521 2.863 3.128 3.34 3.53 3.878 4.024 4.16 4.249 4.559 4.682 4.925 5.153 5.37 5.47 5.668 5.857 6.128 6.303 6.473 6.729 6.953 7.148 7.344 7.526 7.729 7.916 8.09 8.316 8.565 8.801 9.063 9.329 9.557 9.817 10.092 10.354 10.613 10.912 11.259 11.597 11.957 12.288 12.654 13.046 13.433 13.621 13.317 12.618 11.915 11.267 10.627 9.994 9.418 8.868 8.38 7.904 7.501 7.125 6.751 6.385 6.049 5.735 5.386 5.083 4.833 4.58 4.312 4.092 3.862 3.606 3.395 3.191 2.991 2.785 2.567 2.402 2.229 1.97 1.784 1.586 1.484 1.267 1.04 0.799 0.666 0.331 0.221 0.075 -0.089 -0.484 -0.67 -0.85 -1.099 -1.407 -1.73 -2.13 -3.4 -7 ,784 ,TETRA ,17559155,Sat Nov 27 05:27:51 CET,Sat Nov 27 07:26:56 CET,0.0 1.257 1.632 1.902 2.137 2.346 2.548 2.73 3.024 3.151 3.287 3.373 3.677 3.788 4.001 4.205 4.386 4.473 4.647 4.813 5.052 5.203 5.343 5.541 5.724 5.887 6.051 6.217 6.431 6.64 6.851 7.104 7.333 7.548 7.776 8.036 8.298 8.562 8.816 9.073 9.331 9.593 9.865 10.124 10.393 10.647 10.935 11.208 11.434 11.585 11.371 10.789 10.145 9.477 8.823 8.208 7.662 7.131 6.617 6.097 5.675 5.308 4.961 4.638 4.332 4.045 3.721 3.41 3.148 2.88 2.594 2.354 2.1 1.831 1.62 1.403 1.176 0.945 0.715 0.552 0.376 0.112 -0.061 -0.241 -0.339 -0.547 -0.78 -1.046 -1.178 -1.513 -1.642 -1.809 -1.957 -2.253 -2.412 -2.598 -2.804 -3.052 -3.363 -3.792 -4.877 -8 ,20785 ,TETRA ,17559156,Sat Nov 27 05:27:51 CET,Sat Nov 27 07:26:53 CET,0.0 2.319 2.764 3.076 3.35 3.573 3.763 3.944 4.253 4.392 4.519 4.57 4.879 4.994 5.222 5.435 5.622 5.718 5.902 6.055 6.265 6.407 6.545 6.742 6.922 7.091 7.264 7.448 7.684 7.889 8.095 8.357 8.606 8.84 9.107 9.386 9.629 9.885 10.163 10.467 10.791 11.132 11.508 11.864 12.213 12.55 12.879 13.241 13.545 13.586 13.309 12.686 12.0 11.308 10.643 10.008 9.42 8.829 8.337 7.893 7.498 7.115 6.725 6.365 6.04 5.742 5.413 5.109 4.832 4.531 4.229 3.994 3.757 3.502 3.297 3.074 2.821 2.565 2.31 2.143 1.973 1.692 1.482 1.264 1.158 0.94 0.684 0.406 0.266 -0.067 -0.195 -0.356 -0.523 -0.903 -1.116 -1.332 -1.577 -1.874 -2.228 -2.7 -4.61 -9 ,21783 ,TETRA ,17559157,Sat Nov 27 05:27:51 CET,Sat Nov 27 07:25:41 CET,0.0 1.342 1.757 2.052 2.277 2.478 2.651 2.832 3.171 3.32 3.461 3.488 3.774 3.885 4.105 4.292 4.45 4.537 4.7 4.844 5.038 5.161 5.282 5.451 5.636 5.818 5.974 6.121 6.304 6.467 6.63 6.842 7.052 7.251 7.48 7.721 7.929 8.158 8.402 8.65 8.889 9.146 9.448 9.762 10.112 10.448 10.767 11.063 11.312 11.438 11.295 10.769 10.163 9.555 9.02 8.507 8.019 7.592 7.239 6.872 6.541 6.235 5.948 5.695 5.455 5.211 4.949 4.72 4.504 4.26 4.005 3.805 3.614 3.409 3.244 3.08 2.911 2.731 2.548 2.426 2.296 2.073 1.917 1.751 1.665 1.504 1.347 1.161 1.056 0.754 0.731 0.62 0.504 0.217 0.075 -0.065 -0.245 -0.474 -0.861 -1.446 -4.376 -10 ,5699 ,TETRA ,17559158,Sat Nov 27 05:28:48 CET,Sat Nov 27 07:26:17 CET,0.0 1.422 1.878 2.248 2.549 2.795 3.014 3.219 3.599 3.776 3.944 4.063 4.379 4.499 4.736 4.956 5.167 5.273 5.471 5.656 5.922 6.085 6.244 6.485 6.703 6.892 7.088 7.26 7.451 7.643 7.839 8.064 8.267 8.449 8.661 8.906 9.133 9.36 9.603 9.883 10.151 10.432 10.741 11.056 11.427 11.77 12.096 12.402 12.619 12.636 12.294 11.558 10.765 10.011 9.332 8.708 8.126 7.561 7.053 6.538 6.097 5.707 5.309 4.93 4.611 4.322 3.993 3.68 3.411 3.125 2.816 2.555 2.295 2.038 1.83 1.623 1.424 1.213 0.984 0.819 0.637 0.34 0.135 -0.082 -0.197 -0.43 -0.67 -0.937 -1.069 -1.395 -1.505 -1.663 -1.835 -2.219 -2.44 -2.669 -2.942 -3.297 -3.715 -4.329 -6.367 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_53_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_53_54.txt deleted file mode 100644 index c2c78d06..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_53_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12120 ,TETRA ,17559159,Sat Nov 27 05:28:48 CET,Sat Nov 27 07:28:10 CET,0.0 1.198 1.534 1.818 2.063 2.269 2.448 2.604 2.865 2.991 3.111 3.156 3.456 3.569 3.795 3.995 4.183 4.27 4.436 4.594 4.826 4.975 5.122 5.345 5.556 5.747 5.93 6.11 6.355 6.602 6.848 7.151 7.433 7.698 8.01 8.361 8.691 9.055 9.453 9.893 10.367 10.885 11.483 12.088 12.799 13.568 14.46 15.47 16.599 17.867 19.283 20.37 20.906 21.16 21.276 21.285 21.244 21.16 21.061 20.912 20.755 20.631 20.497 20.345 20.197 20.054 19.896 19.747 19.618 19.481 19.339 19.227 19.113 18.972 18.842 18.708 18.582 18.457 18.33 18.237 18.143 17.99 17.879 17.76 17.699 17.57 17.428 17.28 17.19 16.914 16.885 16.778 16.656 16.367 16.221 16.052 15.864 15.666 15.395 14.99 13.043 -2 ,23363 ,TETRA ,17559160,Sat Nov 27 05:28:49 CET,Sat Nov 27 07:27:18 CET,0.0 1.063 1.402 1.645 1.861 2.06 2.248 2.431 2.725 2.86 2.988 3.017 3.319 3.429 3.65 3.865 4.062 4.15 4.325 4.491 4.722 4.872 5.02 5.231 5.433 5.635 5.831 6.013 6.254 6.488 6.733 7.039 7.318 7.59 7.891 8.23 8.557 8.922 9.325 9.723 10.141 10.642 11.225 11.798 12.476 13.23 14.087 15.012 16.044 17.277 18.759 19.85 20.432 20.78 20.928 20.975 20.945 20.843 20.731 20.592 20.446 20.29 20.12 19.961 19.817 19.689 19.555 19.404 19.276 19.16 19.028 18.913 18.792 18.649 18.534 18.422 18.294 18.154 18.016 17.917 17.814 17.641 17.501 17.364 17.301 17.17 17.025 16.876 16.792 16.528 16.507 16.399 16.285 15.998 15.836 15.683 15.495 15.272 15.037 14.622 12.872 -3 ,28628 ,TETRA ,17559161,Sat Nov 27 05:28:49 CET,Sat Nov 27 07:27:30 CET,0.0 0.977 1.286 1.555 1.773 1.966 2.145 2.29 2.579 2.727 2.849 2.894 3.207 3.325 3.551 3.759 3.956 4.049 4.22 4.391 4.641 4.803 4.95 5.17 5.39 5.596 5.797 5.984 6.223 6.465 6.7 6.987 7.275 7.558 7.883 8.238 8.571 8.933 9.32 9.731 10.194 10.743 11.356 11.955 12.67 13.447 14.322 15.303 16.408 17.683 19.148 20.31 20.965 21.304 21.432 21.416 21.314 21.173 21.041 20.884 20.729 20.596 20.459 20.311 20.168 20.024 19.858 19.702 19.553 19.382 19.209 19.075 18.94 18.796 18.678 18.556 18.422 18.268 18.114 17.999 17.88 17.718 17.587 17.444 17.375 17.231 17.068 16.89 16.795 16.514 16.474 16.348 16.216 15.956 15.811 15.652 15.482 15.254 14.968 14.564 13.164 -4 ,5471 ,TETRA ,17559162,Sat Nov 27 05:28:49 CET,Sat Nov 27 07:27:21 CET,0.0 1.66 2.057 2.319 2.516 2.691 2.84 2.99 3.284 3.421 3.555 3.608 3.928 4.037 4.241 4.455 4.652 4.74 4.913 5.075 5.289 5.436 5.581 5.804 6.033 6.25 6.461 6.659 6.909 7.149 7.379 7.659 7.915 8.169 8.471 8.801 9.14 9.51 9.898 10.312 10.73 11.196 11.762 12.35 13.038 13.818 14.713 15.693 16.827 18.145 19.625 20.693 21.222 21.53 21.648 21.617 21.542 21.482 21.419 21.32 21.228 21.124 20.984 20.845 20.725 20.606 20.453 20.298 20.169 20.038 19.882 19.743 19.599 19.447 19.32 19.167 19.006 18.853 18.696 18.586 18.471 18.304 18.188 18.059 17.99 17.818 17.638 17.475 17.389 17.125 17.092 16.965 16.82 16.453 16.252 16.049 15.823 15.558 15.212 14.679 12.907 -5 ,21896 ,TETRA ,17559163,Sat Nov 27 05:28:49 CET,Sat Nov 27 07:28:18 CET,0.0 1.704 2.127 2.399 2.59 2.779 2.951 3.103 3.392 3.521 3.654 3.723 4.037 4.149 4.388 4.634 4.835 4.924 5.128 5.328 5.588 5.744 5.894 6.117 6.328 6.538 6.747 6.934 7.183 7.417 7.63 7.886 8.136 8.385 8.685 9.034 9.359 9.707 10.09 10.512 10.953 11.46 12.052 12.619 13.286 14.059 14.943 15.915 17.046 18.348 19.822 20.912 21.464 21.776 21.907 21.915 21.855 21.763 21.662 21.507 21.33 21.168 21.01 20.857 20.706 20.571 20.432 20.309 20.191 20.041 19.895 19.775 19.624 19.482 19.376 19.258 19.151 19.032 18.88 18.763 18.649 18.481 18.364 18.232 18.164 18.034 17.883 17.7 17.607 17.324 17.265 17.143 17.016 16.741 16.589 16.411 16.2 15.896 15.534 15.155 14.136 -6 ,3331 ,TETRA ,17559164,Sat Nov 27 05:29:47 CET,Sat Nov 27 07:27:01 CET,0.0 1.897 2.236 2.452 2.65 2.823 2.999 3.158 3.41 3.534 3.654 3.674 3.97 4.079 4.276 4.469 4.656 4.738 4.903 5.065 5.301 5.464 5.617 5.85 6.078 6.286 6.498 6.697 6.942 7.184 7.423 7.717 8.005 8.279 8.579 8.89 9.2 9.559 9.947 10.359 10.794 11.28 11.862 12.462 13.142 13.881 14.71 15.618 16.622 17.765 19.065 20.097 20.601 20.821 20.913 20.907 20.827 20.702 20.55 20.392 20.256 20.11 19.964 19.827 19.697 19.561 19.42 19.289 19.16 19.023 18.873 18.742 18.603 18.464 18.354 18.238 18.124 18.002 17.859 17.754 17.639 17.428 17.286 17.162 17.098 16.966 16.82 16.647 16.554 16.283 16.249 16.143 16.04 15.808 15.659 15.477 15.293 15.083 14.835 14.551 13.209 -7 ,4844 ,TETRA ,17559165,Sat Nov 27 05:29:47 CET,Sat Nov 27 07:28:13 CET,0.0 1.22 1.626 1.94 2.158 2.357 2.542 2.728 3.09 3.24 3.384 3.463 3.775 3.881 4.077 4.268 4.456 4.551 4.733 4.911 5.166 5.324 5.47 5.689 5.895 6.091 6.297 6.502 6.767 7.005 7.231 7.517 7.798 8.066 8.363 8.681 8.992 9.353 9.747 10.17 10.625 11.149 11.739 12.315 12.999 13.772 14.661 15.622 16.719 18.018 19.437 20.395 20.883 21.158 21.29 21.332 21.315 21.249 21.151 21.039 20.927 20.801 20.66 20.512 20.358 20.21 20.045 19.893 19.762 19.631 19.482 19.341 19.205 19.056 18.932 18.807 18.68 18.537 18.379 18.273 18.164 18.006 17.895 17.771 17.704 17.56 17.402 17.228 17.142 16.889 16.916 16.806 16.682 16.385 16.228 16.064 15.864 15.647 15.399 15.066 13.557 -8 ,1352 ,TETRA ,17559166,Sat Nov 27 05:29:49 CET,Sat Nov 27 07:28:05 CET,0.0 1.413 1.886 2.174 2.418 2.619 2.796 2.96 3.242 3.366 3.489 3.529 3.833 3.949 4.171 4.369 4.564 4.652 4.82 4.983 5.209 5.356 5.497 5.701 5.907 6.096 6.28 6.468 6.707 6.935 7.153 7.416 7.676 7.933 8.239 8.577 8.906 9.275 9.667 10.11 10.573 11.069 11.654 12.243 12.939 13.687 14.522 15.472 16.538 17.78 19.304 20.432 20.998 21.317 21.479 21.509 21.493 21.448 21.353 21.237 21.135 21.027 20.891 20.765 20.635 20.486 20.333 20.196 20.055 19.916 19.783 19.651 19.496 19.338 19.224 19.105 18.972 18.817 18.652 18.549 18.443 18.279 18.154 18.02 17.951 17.812 17.668 17.506 17.425 17.163 17.171 17.09 16.996 16.771 16.639 16.494 16.352 16.171 15.9 15.491 13.892 -9 ,32035 ,TETRA ,17559167,Sat Nov 27 05:29:49 CET,Sat Nov 27 07:27:38 CET,0.0 1.29 1.666 1.947 2.188 2.36 2.535 2.693 2.982 3.118 3.235 3.267 3.57 3.682 3.889 4.086 4.27 4.363 4.553 4.726 4.977 5.135 5.284 5.508 5.723 5.931 6.135 6.331 6.571 6.805 7.039 7.325 7.597 7.849 8.158 8.515 8.837 9.182 9.558 9.966 10.403 10.877 11.431 11.985 12.624 13.351 14.212 15.198 16.316 17.615 19.219 20.447 21.022 21.294 21.386 21.417 21.405 21.34 21.257 21.127 20.978 20.826 20.676 20.532 20.38 20.244 20.098 19.954 19.817 19.671 19.507 19.353 19.183 19.002 18.873 18.741 18.594 18.449 18.304 18.196 18.079 17.868 17.719 17.578 17.509 17.359 17.18 16.991 16.901 16.626 16.628 16.522 16.401 16.151 16.01 15.868 15.687 15.452 15.169 14.814 12.997 -10 ,24323 ,TETRA ,17559168,Sat Nov 27 05:29:49 CET,Sat Nov 27 07:30:25 CET,0.0 0.926 1.228 1.502 1.72 1.926 2.108 2.269 2.568 2.692 2.823 2.888 3.198 3.304 3.504 3.708 3.908 4.004 4.181 4.36 4.625 4.793 4.949 5.173 5.393 5.602 5.806 6.004 6.254 6.493 6.73 7.02 7.29 7.549 7.859 8.208 8.542 8.916 9.317 9.749 10.209 10.709 11.275 11.846 12.532 13.301 14.182 15.165 16.313 17.645 19.262 20.503 21.048 21.291 21.427 21.488 21.458 21.359 21.255 21.143 21.02 20.886 20.746 20.6 20.458 20.338 20.212 20.094 19.979 19.839 19.682 19.535 19.382 19.239 19.128 19.001 18.869 18.735 18.582 18.481 18.373 18.185 18.049 17.918 17.856 17.721 17.566 17.395 17.304 17.034 17.023 16.916 16.805 16.569 16.432 16.281 16.129 15.94 15.658 15.243 12.744 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_53_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_53_58.txt deleted file mode 100644 index 750ee759..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_53_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27039 ,TETRA ,17559169,Sat Nov 27 05:29:49 CET,Sat Nov 27 07:31:26 CET,0.0 1.974 2.519 2.887 3.208 3.497 3.766 4.042 4.493 4.669 4.816 4.926 5.262 5.405 5.655 5.88 6.106 6.214 6.418 6.625 6.924 7.096 7.255 7.482 7.716 7.951 8.163 8.372 8.638 8.871 9.087 9.365 9.641 9.89 10.163 10.476 10.797 11.13 11.445 11.775 12.103 12.454 12.849 13.253 13.734 14.265 14.815 15.332 15.849 16.375 16.717 16.567 16.301 15.946 15.546 15.152 14.775 14.407 14.075 13.747 13.462 13.206 12.967 12.699 12.431 12.192 11.931 11.697 11.5 11.296 11.087 10.913 10.71 10.489 10.312 10.132 9.955 9.775 9.579 9.419 9.248 9.005 8.844 8.68 8.596 8.415 8.227 8.015 7.906 7.605 7.567 7.448 7.335 7.062 6.908 6.746 6.559 6.357 6.106 5.743 4.776 -2 ,29015 ,TETRA ,17559170,Sat Nov 27 05:29:48 CET,Sat Nov 27 07:29:17 CET,0.0 1.705 2.231 2.651 2.976 3.258 3.534 3.766 4.147 4.316 4.477 4.606 4.945 5.089 5.336 5.552 5.751 5.855 6.061 6.254 6.512 6.67 6.825 7.042 7.267 7.486 7.687 7.873 8.095 8.315 8.526 8.782 9.023 9.244 9.51 9.805 10.077 10.38 10.716 11.071 11.434 11.832 12.28 12.732 13.247 13.728 14.222 14.804 15.414 15.938 16.318 16.229 15.907 15.495 15.088 14.757 14.436 14.074 13.756 13.454 13.175 12.908 12.644 12.389 12.132 11.895 11.642 11.417 11.229 11.04 10.862 10.715 10.543 10.362 10.224 10.081 9.926 9.742 9.539 9.413 9.295 9.097 8.958 8.811 8.734 8.57 8.39 8.2 8.101 7.802 7.763 7.649 7.525 7.258 7.115 6.968 6.803 6.584 6.331 6.01 4.623 -3 ,14824 ,TETRA ,17559171,Sat Nov 27 05:29:51 CET,Sat Nov 27 07:29:50 CET,0.0 1.613 2.117 2.518 2.864 3.157 3.428 3.663 4.06 4.242 4.393 4.497 4.829 4.963 5.223 5.449 5.663 5.773 5.992 6.185 6.46 6.633 6.777 7.007 7.268 7.5 7.689 7.876 8.132 8.373 8.596 8.875 9.142 9.386 9.69 10.028 10.321 10.629 10.978 11.355 11.721 12.091 12.487 12.869 13.289 13.738 14.237 14.773 15.286 15.716 16.015 15.968 15.666 15.284 14.879 14.478 14.145 13.829 13.493 13.137 12.829 12.545 12.286 12.031 11.789 11.557 11.333 11.153 10.968 10.761 10.548 10.368 10.191 10.012 9.859 9.698 9.533 9.353 9.149 8.995 8.836 8.604 8.439 8.256 8.155 7.958 7.794 7.611 7.512 7.218 7.186 7.071 6.95 6.677 6.526 6.354 6.158 5.958 5.715 5.371 4.155 -4 ,21729 ,TETRA ,17559172,Sat Nov 27 05:29:53 CET,Sat Nov 27 07:29:38 CET,0.0 1.873 2.452 2.839 3.134 3.397 3.615 3.81 4.179 4.347 4.496 4.577 4.897 5.029 5.278 5.519 5.735 5.831 6.033 6.211 6.465 6.645 6.82 7.067 7.276 7.474 7.683 7.888 8.147 8.379 8.579 8.825 9.078 9.313 9.578 9.86 10.136 10.444 10.76 11.091 11.439 11.833 12.266 12.667 13.11 13.58 14.068 14.571 15.078 15.513 15.771 15.705 15.422 15.052 14.664 14.294 13.95 13.558 13.173 12.785 12.473 12.215 11.951 11.693 11.457 11.247 11.018 10.793 10.603 10.425 10.232 10.056 9.877 9.694 9.548 9.397 9.238 9.079 8.913 8.793 8.674 8.482 8.335 8.18 8.099 7.928 7.747 7.541 7.426 7.118 7.095 6.972 6.851 6.579 6.432 6.282 6.112 5.913 5.651 5.326 4.593 -5 ,27775 ,TETRA ,17559173,Sat Nov 27 05:29:49 CET,Sat Nov 27 07:29:00 CET,0.0 1.868 2.436 2.831 3.168 3.464 3.712 3.929 4.295 4.473 4.659 4.789 5.127 5.273 5.529 5.767 5.999 6.102 6.286 6.464 6.732 6.911 7.071 7.3 7.528 7.727 7.906 8.092 8.325 8.564 8.79 9.053 9.305 9.547 9.82 10.105 10.392 10.713 11.051 11.406 11.764 12.136 12.557 12.992 13.474 13.945 14.445 14.962 15.439 15.833 16.086 15.989 15.702 15.362 14.978 14.576 14.204 13.848 13.514 13.166 12.865 12.584 12.314 12.035 11.774 11.554 11.326 11.123 10.916 10.685 10.468 10.289 10.091 9.893 9.745 9.59 9.424 9.234 9.011 8.854 8.715 8.521 8.39 8.255 8.179 8.022 7.861 7.676 7.564 7.262 7.256 7.158 7.046 6.79 6.639 6.445 6.223 6.01 5.781 5.464 4.256 -6 ,31109 ,TETRA ,17559174,Sat Nov 27 05:29:49 CET,Sat Nov 27 07:29:34 CET,0.0 1.808 2.29 2.638 2.947 3.23 3.483 3.729 4.186 4.364 4.521 4.638 4.979 5.104 5.356 5.618 5.841 5.944 6.14 6.33 6.634 6.823 6.985 7.215 7.443 7.66 7.856 8.045 8.298 8.547 8.773 9.04 9.314 9.581 9.889 10.212 10.517 10.841 11.17 11.515 11.862 12.242 12.672 13.076 13.527 13.978 14.467 15.012 15.532 15.999 16.351 16.318 16.049 15.725 15.32 14.899 14.518 14.112 13.759 13.426 13.129 12.86 12.617 12.369 12.099 11.843 11.583 11.358 11.146 10.923 10.709 10.535 10.336 10.109 9.943 9.787 9.616 9.436 9.259 9.119 8.97 8.746 8.599 8.449 8.37 8.198 8.013 7.831 7.733 7.423 7.375 7.258 7.128 6.833 6.693 6.548 6.389 6.198 5.932 5.597 4.083 -7 ,31699 ,TETRA ,17559175,Sat Nov 27 05:29:49 CET,Sat Nov 27 07:29:06 CET,0.0 2.156 2.709 3.115 3.45 3.752 4.026 4.27 4.666 4.838 5.01 5.129 5.447 5.579 5.836 6.07 6.291 6.407 6.636 6.844 7.133 7.32 7.496 7.722 7.93 8.14 8.339 8.519 8.759 9.0 9.229 9.499 9.75 9.975 10.227 10.518 10.795 11.08 11.392 11.733 12.12 12.552 13.033 13.501 13.97 14.461 14.999 15.533 16.048 16.543 16.768 16.526 16.177 15.794 15.367 14.977 14.642 14.296 13.977 13.627 13.317 13.035 12.767 12.507 12.247 12.005 11.756 11.537 11.345 11.138 10.906 10.726 10.546 10.344 10.177 10.012 9.839 9.652 9.464 9.335 9.205 9.01 8.865 8.706 8.625 8.457 8.274 8.085 7.99 7.701 7.682 7.569 7.451 7.148 6.986 6.83 6.629 6.418 6.178 5.864 4.539 -8 ,1999 ,TETRA ,17559176,Sat Nov 27 05:30:48 CET,Sat Nov 27 07:30:19 CET,0.0 2.385 2.921 3.312 3.645 3.923 4.208 4.468 4.863 5.035 5.2 5.286 5.607 5.753 6.03 6.272 6.505 6.619 6.841 7.059 7.363 7.547 7.724 7.975 8.205 8.417 8.628 8.832 9.098 9.357 9.584 9.848 10.107 10.367 10.66 10.968 11.247 11.565 11.899 12.209 12.528 12.905 13.35 13.753 14.21 14.737 15.273 15.813 16.346 16.805 17.077 17.025 16.785 16.417 16.022 15.643 15.269 14.915 14.6 14.267 13.97 13.698 13.428 13.178 12.953 12.73 12.479 12.258 12.074 11.879 11.661 11.48 11.289 11.08 10.919 10.764 10.611 10.442 10.268 10.147 10.013 9.808 9.673 9.538 9.467 9.312 9.136 8.947 8.848 8.544 8.499 8.385 8.271 8.013 7.868 7.716 7.55 7.366 7.152 6.839 5.785 -9 ,28940 ,TETRA ,17559177,Sat Nov 27 05:30:47 CET,Sat Nov 27 07:34:10 CET,0.0 2.282 2.765 3.121 3.412 3.658 3.887 4.128 4.577 4.756 4.919 5.021 5.34 5.466 5.727 5.969 6.197 6.305 6.516 6.723 7.0 7.177 7.345 7.57 7.78 7.99 8.209 8.428 8.689 8.913 9.133 9.408 9.676 9.939 10.22 10.516 10.805 11.121 11.452 11.789 12.128 12.524 12.959 13.366 13.835 14.324 14.847 15.354 15.896 16.389 16.699 16.556 16.203 15.776 15.358 14.97 14.56 14.136 13.77 13.395 13.041 12.729 12.436 12.152 11.878 11.618 11.333 11.068 10.847 10.621 10.385 10.173 9.955 9.754 9.583 9.387 9.186 8.978 8.774 8.642 8.509 8.302 8.149 7.985 7.902 7.738 7.57 7.395 7.308 7.022 6.999 6.883 6.757 6.498 6.352 6.171 5.973 5.772 5.514 5.14 4.004 -10 ,11642 ,TETRA ,17559178,Sat Nov 27 05:30:50 CET,Sat Nov 27 07:33:46 CET,0.0 2.038 2.593 2.996 3.354 3.658 3.895 4.092 4.482 4.672 4.841 4.959 5.285 5.41 5.664 5.909 6.132 6.241 6.45 6.646 6.913 7.066 7.212 7.421 7.62 7.822 8.016 8.197 8.42 8.622 8.834 9.097 9.343 9.589 9.875 10.178 10.458 10.747 11.067 11.426 11.795 12.166 12.568 12.971 13.415 13.932 14.484 14.994 15.485 15.944 16.294 16.209 15.914 15.594 15.236 14.865 14.498 14.092 13.723 13.353 13.001 12.675 12.375 12.087 11.818 11.594 11.36 11.152 10.958 10.744 10.507 10.293 10.095 9.906 9.755 9.605 9.437 9.244 9.053 8.924 8.798 8.592 8.436 8.272 8.187 8.008 7.818 7.613 7.513 7.235 7.211 7.098 6.975 6.709 6.558 6.384 6.189 5.968 5.697 5.274 3.913 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_54_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_54_37.txt deleted file mode 100644 index 8ab880af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_54_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6243 ,KEBNE ,17069846,Fri Dec 24 10:49:07 CET,Fri Dec 24 12:25:07 CET,0.0 1.374 1.796 2.105 2.326 2.54 2.756 2.932 3.245 3.403 3.545 3.631 3.934 4.051 4.286 4.507 4.708 4.806 4.979 5.143 5.396 5.557 5.707 5.923 6.152 6.363 6.548 6.733 6.976 7.199 7.404 7.658 7.898 8.127 8.384 8.649 8.884 9.144 9.437 9.748 10.072 10.424 10.781 11.098 11.439 11.771 12.127 12.441 12.619 12.591 12.225 11.483 10.692 9.912 9.131 8.359 7.639 6.96 6.374 5.81 5.338 4.903 4.495 4.117 3.748 3.407 3.059 2.741 2.468 2.175 1.866 1.61 1.339 1.068 0.857 0.638 0.408 0.17 -0.064 -0.238 -0.436 -0.731 -0.914 -1.112 -1.22 -1.436 -1.67 -1.924 -2.058 -2.381 -2.485 -2.629 -2.769 -3.078 -3.263 -3.475 -3.712 -4.016 -4.398 -4.907 -6.784 -2 ,5327 ,KEBNE ,17069847,Fri Dec 24 10:51:10 CET,Fri Dec 24 12:31:06 CET,0.0 1.148 1.567 1.895 2.162 2.402 2.615 2.802 3.136 3.285 3.425 3.505 3.803 3.927 4.164 4.378 4.578 4.675 4.853 5.023 5.276 5.434 5.574 5.78 5.994 6.199 6.399 6.598 6.838 7.051 7.261 7.513 7.744 7.963 8.202 8.465 8.718 8.978 9.251 9.534 9.829 10.143 10.467 10.786 11.17 11.563 11.934 12.192 12.344 12.413 12.087 11.285 10.486 9.674 8.931 8.255 7.596 7.024 6.56 6.07 5.631 5.244 4.878 4.52 4.189 3.88 3.557 3.276 3.042 2.798 2.532 2.304 2.055 1.769 1.546 1.346 1.136 0.9 0.644 0.474 0.317 0.069 -0.116 -0.311 -0.403 -0.596 -0.793 -1.028 -1.169 -1.482 -1.536 -1.683 -1.858 -2.222 -2.434 -2.68 -2.948 -3.271 -3.737 -4.388 -5.918 -3 ,27140 ,KEBNE ,17069848,Fri Dec 24 10:53:15 CET,Fri Dec 24 12:34:36 CET,0.0 1.024 1.337 1.587 1.812 2.03 2.214 2.392 2.732 2.871 2.986 3.028 3.314 3.427 3.633 3.827 4.006 4.091 4.262 4.434 4.682 4.824 4.959 5.163 5.358 5.544 5.735 5.92 6.154 6.375 6.562 6.775 6.991 7.202 7.426 7.661 7.891 8.146 8.416 8.709 9.015 9.297 9.585 9.88 10.197 10.504 10.844 11.151 11.419 11.571 11.215 10.328 9.529 8.783 8.106 7.468 6.864 6.3 5.774 5.167 4.646 4.209 3.82 3.481 3.146 2.839 2.545 2.291 2.058 1.818 1.569 1.353 1.104 0.826 0.608 0.377 0.154 -0.053 -0.277 -0.451 -0.628 -0.908 -1.109 -1.3 -1.396 -1.609 -1.861 -2.143 -2.278 -2.6 -2.704 -2.855 -2.994 -3.353 -3.562 -3.78 -4.035 -4.344 -4.704 -5.146 -6.284 -4 ,26420 ,KEBNE ,17069849,Fri Dec 24 10:54:19 CET,Fri Dec 24 12:34:20 CET,0.0 1.085 1.554 1.909 2.18 2.408 2.604 2.776 3.099 3.262 3.406 3.475 3.778 3.908 4.149 4.363 4.555 4.656 4.848 5.023 5.283 5.449 5.608 5.835 6.051 6.252 6.435 6.618 6.872 7.119 7.331 7.578 7.811 8.027 8.272 8.547 8.809 9.079 9.354 9.627 9.91 10.232 10.575 10.854 11.151 11.454 11.761 12.063 12.284 12.398 12.218 11.608 10.885 10.146 9.467 8.777 8.113 7.517 6.994 6.465 5.992 5.592 5.236 4.9 4.603 4.323 4.021 3.739 3.495 3.234 2.951 2.732 2.489 2.207 1.995 1.791 1.572 1.344 1.11 0.94 0.763 0.491 0.294 0.094 -0.002 -0.214 -0.439 -0.662 -0.783 -1.105 -1.225 -1.383 -1.563 -1.965 -2.166 -2.39 -2.672 -2.997 -3.337 -3.781 -5.744 -5 ,4874 ,KEBNE ,17069850,Fri Dec 24 10:56:26 CET,Fri Dec 24 12:37:29 CET,0.0 1.241 1.654 1.968 2.208 2.418 2.611 2.804 3.148 3.311 3.466 3.564 3.881 4.02 4.27 4.498 4.716 4.817 5.003 5.188 5.45 5.605 5.756 5.97 6.167 6.345 6.518 6.694 6.908 7.105 7.293 7.519 7.73 7.927 8.159 8.425 8.687 8.967 9.263 9.553 9.831 10.136 10.476 10.799 11.156 11.516 11.866 12.172 12.43 12.526 12.228 11.564 10.855 10.115 9.391 8.66 7.979 7.379 6.873 6.352 5.879 5.459 5.061 4.671 4.297 3.967 3.643 3.346 3.076 2.79 2.483 2.215 1.935 1.66 1.444 1.209 0.958 0.711 0.475 0.304 0.125 -0.171 -0.386 -0.598 -0.707 -0.926 -1.165 -1.434 -1.567 -1.881 -1.983 -2.152 -2.346 -2.759 -2.98 -3.21 -3.453 -3.729 -4.055 -4.48 -5.686 -6 ,15479 ,KEBNE ,17069851,Fri Dec 24 10:57:31 CET,Fri Dec 24 12:37:50 CET,0.0 1.042 1.443 1.8 2.1 2.333 2.534 2.721 3.048 3.183 3.329 3.434 3.737 3.859 4.091 4.307 4.509 4.604 4.784 4.97 5.233 5.392 5.541 5.774 6.001 6.2 6.392 6.579 6.811 7.038 7.252 7.482 7.71 7.946 8.207 8.478 8.727 8.997 9.28 9.589 9.91 10.235 10.579 10.876 11.197 11.552 11.888 12.176 12.398 12.468 12.12 11.325 10.536 9.765 9.067 8.418 7.815 7.204 6.671 6.142 5.656 5.217 4.792 4.381 4.016 3.71 3.374 3.057 2.795 2.543 2.3 2.096 1.872 1.624 1.436 1.258 1.082 0.909 0.72 0.575 0.42 0.155 -0.034 -0.209 -0.298 -0.49 -0.684 -0.903 -1.028 -1.351 -1.48 -1.634 -1.794 -2.179 -2.386 -2.599 -2.85 -3.157 -3.55 -4.154 -6.74 -7 ,11652 ,KEBNE ,17069852,Fri Dec 24 10:59:36 CET,Fri Dec 24 12:39:54 CET,0.0 0.922 1.299 1.572 1.82 2.041 2.212 2.374 2.683 2.838 2.99 3.089 3.418 3.565 3.803 4.012 4.216 4.31 4.49 4.669 4.922 5.075 5.228 5.441 5.643 5.849 6.037 6.214 6.437 6.655 6.868 7.114 7.35 7.569 7.826 8.108 8.358 8.624 8.914 9.203 9.492 9.807 10.142 10.467 10.855 11.249 11.641 12.005 12.176 12.134 11.793 10.924 10.042 9.24 8.451 7.733 7.134 6.608 6.137 5.66 5.238 4.845 4.472 4.122 3.809 3.524 3.196 2.881 2.61 2.336 2.039 1.785 1.534 1.269 1.05 0.816 0.568 0.314 0.056 -0.127 -0.308 -0.565 -0.755 -0.956 -1.053 -1.256 -1.471 -1.705 -1.835 -2.163 -2.281 -2.433 -2.603 -3.054 -3.277 -3.508 -3.8 -4.09 -4.423 -4.91 -6.604 -8 ,3444 ,KEBNE ,17069853,Fri Dec 24 11:00:40 CET,Fri Dec 24 12:42:58 CET,0.0 0.779 1.108 1.363 1.604 1.87 2.138 2.335 2.659 2.809 2.95 3.044 3.347 3.475 3.723 3.939 4.147 4.242 4.417 4.592 4.833 4.981 5.129 5.351 5.559 5.755 5.946 6.128 6.358 6.579 6.796 7.059 7.301 7.522 7.757 8.001 8.23 8.481 8.748 9.034 9.336 9.639 9.956 10.25 10.542 10.839 11.147 11.446 11.729 11.813 11.553 10.94 10.226 9.504 8.808 8.139 7.54 6.992 6.51 6.025 5.593 5.194 4.797 4.421 4.062 3.736 3.424 3.136 2.881 2.627 2.369 2.147 1.894 1.631 1.432 1.221 1.014 0.802 0.585 0.423 0.248 -0.014 -0.202 -0.395 -0.495 -0.7 -0.917 -1.15 -1.269 -1.576 -1.658 -1.797 -1.939 -2.277 -2.457 -2.657 -2.93 -3.246 -3.612 -4.114 -5.787 -9 ,24258 ,KEBNE ,17069854,Fri Dec 24 11:01:45 CET,Fri Dec 24 12:41:50 CET,0.0 0.876 1.21 1.523 1.788 1.993 2.199 2.377 2.693 2.844 2.989 3.088 3.399 3.519 3.745 3.956 4.14 4.232 4.416 4.589 4.836 4.993 5.142 5.343 5.535 5.728 5.925 6.108 6.322 6.522 6.72 6.951 7.166 7.376 7.609 7.865 8.111 8.382 8.667 8.96 9.241 9.529 9.875 10.201 10.567 10.971 11.38 11.78 12.157 12.432 12.257 11.463 10.639 9.817 9.073 8.429 7.851 7.304 6.844 6.394 5.977 5.594 5.239 4.888 4.56 4.253 3.922 3.645 3.41 3.161 2.895 2.633 2.347 2.086 1.876 1.648 1.419 1.169 0.917 0.74 0.559 0.305 0.138 -0.038 -0.131 -0.31 -0.501 -0.723 -0.853 -1.166 -1.273 -1.441 -1.599 -2.002 -2.221 -2.416 -2.625 -2.902 -3.303 -3.869 -5.516 -10 ,7769 ,KEBNE ,17069855,Fri Dec 24 11:02:49 CET,Fri Dec 24 12:44:04 CET,0.0 1.281 1.675 2.019 2.339 2.601 2.823 3.024 3.407 3.589 3.749 3.862 4.172 4.295 4.526 4.755 4.981 5.087 5.287 5.471 5.723 5.882 6.036 6.261 6.482 6.689 6.883 7.072 7.308 7.515 7.711 7.965 8.2 8.411 8.653 8.909 9.151 9.428 9.718 10.024 10.341 10.671 11.03 11.372 11.726 12.055 12.379 12.661 12.895 12.995 12.775 12.154 11.386 10.617 9.945 9.325 8.729 8.165 7.68 7.184 6.73 6.343 5.991 5.655 5.343 5.046 4.741 4.47 4.239 4.01 3.771 3.561 3.327 3.063 2.847 2.626 2.403 2.188 1.945 1.753 1.561 1.26 1.053 0.832 0.717 0.484 0.235 -0.018 -0.152 -0.469 -0.55 -0.687 -0.841 -1.16 -1.334 -1.557 -1.798 -2.051 -2.391 -2.834 -3.875 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_56_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_56_43.txt deleted file mode 100644 index 0bc11be2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_56_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13232 ,KEBNE ,17024827,Wed Dec 22 11:14:56 CET,Wed Dec 22 12:56:46 CET,0.0 1.067 1.464 1.808 2.094 2.338 2.558 2.757 3.085 3.23 3.359 3.405 3.729 3.857 4.104 4.354 4.595 4.702 4.9 5.094 5.377 5.553 5.729 5.974 6.2 6.432 6.654 6.872 7.139 7.391 7.643 7.939 8.217 8.462 8.733 9.045 9.354 9.687 10.035 10.426 10.821 11.204 11.635 12.094 12.598 13.149 13.816 14.559 15.342 16.185 17.103 17.562 17.629 17.466 17.204 17.003 16.778 16.487 16.173 15.847 15.575 15.288 15.003 14.749 14.508 14.264 13.998 13.747 13.52 13.318 13.094 12.877 12.658 12.432 12.25 12.061 11.851 11.636 11.411 11.251 11.099 10.866 10.689 10.504 10.402 10.177 9.957 9.731 9.608 9.296 9.194 9.032 8.857 8.446 8.219 7.968 7.681 7.343 6.941 6.397 4.549 -2 ,28778 ,KEBNE ,17024828,Wed Dec 22 11:14:56 CET,Wed Dec 22 12:57:15 CET,0.0 0.967 1.27 1.529 1.754 1.926 2.081 2.207 2.429 2.545 2.665 2.701 2.999 3.101 3.298 3.48 3.652 3.738 3.916 4.086 4.302 4.435 4.574 4.787 4.992 5.172 5.345 5.528 5.762 5.983 6.2 6.466 6.723 6.962 7.255 7.584 7.876 8.2 8.544 8.875 9.217 9.626 10.11 10.583 11.15 11.794 12.479 13.224 14.123 15.141 16.085 16.433 16.349 16.141 15.83 15.459 15.111 14.774 14.448 14.102 13.808 13.536 13.236 12.954 12.684 12.402 12.095 11.833 11.605 11.368 11.096 10.841 10.59 10.344 10.151 9.934 9.711 9.497 9.262 9.091 8.908 8.636 8.467 8.29 8.191 7.957 7.713 7.472 7.339 7.012 6.928 6.773 6.619 6.3 6.101 5.86 5.589 5.257 4.862 4.306 2.244 -3 ,26316 ,KEBNE ,17024829,Wed Dec 22 11:15:00 CET,Wed Dec 22 12:53:18 CET,0.0 1.422 1.784 2.043 2.267 2.459 2.643 2.817 3.078 3.193 3.318 3.375 3.677 3.776 3.978 4.16 4.328 4.415 4.58 4.745 4.984 5.134 5.289 5.502 5.685 5.878 6.081 6.261 6.495 6.744 6.979 7.249 7.506 7.75 8.003 8.265 8.538 8.85 9.172 9.499 9.838 10.213 10.652 11.151 11.766 12.425 13.155 13.914 14.734 15.586 16.396 16.822 16.881 16.76 16.554 16.31 16.013 15.704 15.432 15.119 14.793 14.484 14.222 13.976 13.705 13.454 13.218 12.977 12.748 12.526 12.291 12.078 11.85 11.616 11.418 11.207 11.007 10.79 10.543 10.385 10.233 9.984 9.809 9.629 9.541 9.376 9.179 8.94 8.812 8.497 8.414 8.256 8.079 7.703 7.505 7.277 7.007 6.715 6.339 5.764 3.617 -4 ,30783 ,KEBNE ,17024830,Wed Dec 22 11:15:00 CET,Wed Dec 22 12:52:08 CET,0.0 1.098 1.466 1.721 1.933 2.128 2.297 2.451 2.734 2.884 3.021 3.069 3.387 3.512 3.757 3.977 4.195 4.298 4.489 4.682 4.962 5.134 5.294 5.526 5.764 5.992 6.199 6.397 6.664 6.925 7.169 7.48 7.796 8.082 8.37 8.663 8.937 9.255 9.597 9.958 10.347 10.773 11.269 11.778 12.321 12.89 13.529 14.194 14.953 15.821 16.623 16.934 16.896 16.692 16.457 16.176 15.847 15.535 15.244 14.931 14.661 14.41 14.148 13.893 13.643 13.398 13.129 12.883 12.674 12.447 12.199 11.984 11.747 11.515 11.33 11.132 10.917 10.676 10.43 10.251 10.067 9.802 9.606 9.398 9.298 9.084 8.851 8.608 8.469 8.137 8.025 7.871 7.706 7.32 7.109 6.882 6.621 6.304 5.885 5.34 3.782 -5 ,23013 ,KEBNE ,17024831,Wed Dec 22 11:17:04 CET,Wed Dec 22 12:59:26 CET,0.0 1.077 1.426 1.638 1.811 1.982 2.166 2.327 2.621 2.746 2.876 2.95 3.264 3.377 3.587 3.78 3.967 4.059 4.23 4.397 4.639 4.797 4.955 5.174 5.376 5.576 5.767 5.943 6.169 6.393 6.616 6.882 7.122 7.359 7.63 7.932 8.233 8.53 8.845 9.194 9.558 9.955 10.392 10.842 11.377 11.946 12.56 13.218 13.986 14.838 15.643 16.028 16.047 15.855 15.605 15.288 14.959 14.645 14.36 14.048 13.766 13.514 13.248 12.988 12.742 12.48 12.21 11.983 11.772 11.544 11.316 11.114 10.887 10.663 10.493 10.308 10.09 9.866 9.632 9.467 9.288 8.986 8.78 8.579 8.481 8.28 8.052 7.783 7.643 7.318 7.214 7.063 6.9 6.517 6.324 6.143 5.937 5.673 5.323 4.848 3.161 -6 ,20101 ,KEBNE ,17024832,Wed Dec 22 11:15:58 CET,Wed Dec 22 12:58:23 CET,0.0 1.094 1.535 1.846 2.08 2.271 2.439 2.602 2.917 3.064 3.202 3.256 3.568 3.684 3.907 4.118 4.31 4.4 4.563 4.735 5.024 5.192 5.341 5.577 5.827 6.061 6.258 6.456 6.743 7.015 7.26 7.547 7.828 8.087 8.379 8.704 9.005 9.316 9.641 9.983 10.347 10.776 11.281 11.787 12.325 12.872 13.502 14.227 15.021 15.774 16.478 16.849 16.812 16.607 16.347 16.065 15.785 15.481 15.19 14.901 14.635 14.363 14.087 13.808 13.544 13.295 13.028 12.784 12.553 12.298 12.036 11.833 11.621 11.377 11.171 10.967 10.763 10.549 10.305 10.125 9.964 9.714 9.532 9.341 9.238 9.021 8.787 8.543 8.411 8.078 7.946 7.769 7.591 7.236 7.041 6.813 6.558 6.262 5.855 5.255 3.556 -7 ,7610 ,KEBNE ,17024833,Wed Dec 22 11:15:58 CET,Wed Dec 22 12:58:22 CET,0.0 1.345 1.756 2.057 2.313 2.506 2.655 2.819 3.111 3.244 3.381 3.456 3.768 3.868 4.056 4.257 4.458 4.554 4.738 4.895 5.13 5.303 5.458 5.667 5.881 6.097 6.311 6.517 6.777 7.031 7.263 7.514 7.775 8.034 8.343 8.705 9.044 9.398 9.788 10.233 10.696 11.199 11.746 12.29 12.881 13.497 14.172 14.897 15.739 16.556 17.28 17.579 17.566 17.435 17.227 16.958 16.671 16.368 16.086 15.818 15.54 15.242 14.954 14.662 14.361 14.102 13.848 13.608 13.403 13.181 12.939 12.736 12.506 12.253 12.059 11.849 11.629 11.428 11.196 11.027 10.853 10.59 10.42 10.225 10.124 9.894 9.638 9.403 9.288 8.972 8.869 8.716 8.56 8.224 8.04 7.824 7.516 7.155 6.734 6.112 3.856 -8 ,30526 ,KEBNE ,17024834,Wed Dec 22 11:15:58 CET,Wed Dec 22 12:58:26 CET,0.0 0.548 0.849 1.097 1.299 1.509 1.706 1.883 2.189 2.335 2.474 2.514 2.814 2.92 3.126 3.316 3.485 3.569 3.735 3.906 4.171 4.332 4.487 4.699 4.887 5.07 5.248 5.422 5.637 5.848 6.062 6.33 6.596 6.841 7.121 7.429 7.718 8.033 8.356 8.712 9.106 9.527 10.008 10.457 10.942 11.502 12.137 12.833 13.65 14.513 15.332 15.723 15.731 15.53 15.27 15.041 14.748 14.43 14.163 13.883 13.604 13.327 13.069 12.812 12.536 12.282 12.031 11.807 11.603 11.374 11.139 10.946 10.729 10.495 10.314 10.126 9.933 9.722 9.483 9.314 9.131 8.853 8.664 8.465 8.361 8.119 7.852 7.576 7.431 7.095 6.979 6.822 6.657 6.28 6.055 5.803 5.526 5.227 4.847 4.318 2.679 -9 ,6330 ,KEBNE ,17024835,Wed Dec 22 11:16:00 CET,Wed Dec 22 12:55:00 CET,0.0 1.178 1.558 1.847 2.08 2.291 2.459 2.619 2.932 3.065 3.181 3.194 3.498 3.599 3.797 3.988 4.17 4.26 4.423 4.566 4.778 4.916 5.053 5.26 5.458 5.648 5.817 5.979 6.198 6.414 6.632 6.9 7.162 7.428 7.732 8.071 8.386 8.706 9.051 9.417 9.783 10.197 10.685 11.152 11.691 12.273 12.869 13.543 14.36 15.213 16.045 16.466 16.488 16.36 16.162 15.899 15.584 15.252 14.917 14.567 14.26 13.975 13.692 13.418 13.136 12.891 12.657 12.402 12.162 11.923 11.682 11.487 11.265 11.011 10.816 10.624 10.429 10.218 9.997 9.841 9.661 9.366 9.165 8.96 8.851 8.608 8.353 8.092 7.958 7.635 7.528 7.375 7.203 6.788 6.561 6.315 6.036 5.742 5.417 5.007 3.459 -10 ,31196 ,KEBNE ,17024836,Wed Dec 22 11:16:02 CET,Wed Dec 22 12:54:21 CET,0.0 1.056 1.451 1.744 2.001 2.237 2.422 2.585 2.885 3.018 3.154 3.236 3.556 3.674 3.903 4.125 4.338 4.441 4.63 4.81 5.086 5.262 5.432 5.679 5.921 6.166 6.401 6.629 6.929 7.221 7.497 7.796 8.065 8.349 8.68 9.021 9.378 9.772 10.182 10.572 10.928 11.336 11.811 12.267 12.779 13.344 14.011 14.733 15.504 16.341 17.16 17.591 17.655 17.521 17.313 17.065 16.789 16.498 16.222 15.924 15.652 15.405 15.137 14.873 14.607 14.379 14.161 13.933 13.72 13.492 13.26 13.058 12.825 12.561 12.357 12.174 11.989 11.773 11.566 11.413 11.234 10.942 10.724 10.512 10.401 10.176 9.922 9.645 9.518 9.193 9.08 8.915 8.728 8.289 8.022 7.742 7.441 7.097 6.682 6.032 3.79 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_56_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_56_57.txt deleted file mode 100644 index a9e3237c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_56_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18576 ,TETRA ,17559179,Sat Nov 27 05:30:49 CET,Sat Nov 27 07:29:12 CET,0.0 0.898 1.211 1.49 1.737 1.937 2.105 2.265 2.547 2.68 2.811 2.878 3.183 3.307 3.555 3.785 3.991 4.091 4.285 4.477 4.757 4.934 5.1 5.34 5.582 5.814 6.047 6.277 6.566 6.836 7.087 7.389 7.674 7.965 8.321 8.712 9.081 9.491 9.941 10.431 10.954 11.551 12.269 12.963 13.754 14.664 15.714 16.891 18.26 19.813 21.625 23.076 23.793 24.084 24.184 24.25 24.268 24.244 24.183 24.014 23.834 23.673 23.484 23.3 23.118 22.94 22.759 22.576 22.412 22.24 22.06 21.917 21.77 21.609 21.463 21.295 21.112 20.933 20.764 20.648 20.529 20.349 20.225 20.081 20.005 19.844 19.665 19.483 19.395 19.134 19.125 19.026 18.917 18.657 18.523 18.398 18.258 18.09 17.881 17.593 16.714 -2 ,21197 ,TETRA ,17559180,Sat Nov 27 05:30:49 CET,Sat Nov 27 07:30:17 CET,0.0 0.679 0.936 1.176 1.397 1.606 1.777 1.931 2.21 2.339 2.458 2.501 2.826 2.956 3.208 3.453 3.667 3.758 3.944 4.147 4.45 4.648 4.838 5.123 5.41 5.688 5.965 6.219 6.533 6.838 7.122 7.463 7.796 8.105 8.471 8.883 9.267 9.69 10.131 10.602 11.112 11.699 12.369 13.022 13.809 14.703 15.714 16.842 18.171 19.703 21.471 22.914 23.695 24.123 24.32 24.338 24.252 24.159 24.053 23.899 23.745 23.606 23.454 23.282 23.113 22.944 22.749 22.574 22.421 22.254 22.069 21.902 21.729 21.556 21.417 21.272 21.118 20.952 20.79 20.674 20.554 20.392 20.276 20.141 20.065 19.906 19.753 19.585 19.491 19.219 19.214 19.115 19.011 18.785 18.66 18.521 18.349 18.145 17.886 17.538 16.89 -3 ,27461 ,TETRA ,17559181,Sat Nov 27 05:30:49 CET,Sat Nov 27 07:30:29 CET,0.0 0.75 1.062 1.337 1.569 1.785 2.001 2.198 2.529 2.673 2.825 2.921 3.264 3.399 3.644 3.874 4.104 4.217 4.435 4.651 4.955 5.151 5.357 5.65 5.925 6.195 6.451 6.694 6.996 7.271 7.526 7.834 8.153 8.468 8.829 9.241 9.623 10.045 10.497 10.984 11.528 12.144 12.816 13.451 14.209 15.081 16.156 17.397 18.838 20.53 22.542 24.137 24.874 25.238 25.467 25.581 25.586 25.508 25.389 25.259 25.137 25.002 24.854 24.686 24.522 24.361 24.185 24.019 23.867 23.704 23.526 23.379 23.22 23.048 22.901 22.741 22.591 22.445 22.289 22.183 22.075 21.884 21.739 21.594 21.522 21.372 21.205 21.024 20.937 20.676 20.645 20.538 20.427 20.168 20.027 19.867 19.679 19.449 19.181 18.832 17.996 -4 ,5386 ,TETRA ,17559182,Sat Nov 27 05:30:51 CET,Sat Nov 27 07:30:10 CET,0.0 1.01 1.358 1.597 1.802 2.007 2.188 2.344 2.648 2.793 2.927 2.99 3.314 3.434 3.66 3.881 4.085 4.18 4.363 4.534 4.785 4.955 5.122 5.373 5.609 5.832 6.05 6.256 6.518 6.78 7.046 7.366 7.672 7.976 8.335 8.732 9.105 9.519 9.968 10.444 10.941 11.519 12.201 12.861 13.608 14.445 15.459 16.589 17.886 19.442 21.234 22.633 23.364 23.744 23.933 24.029 24.021 23.909 23.78 23.592 23.387 23.198 23.011 22.825 22.635 22.441 22.23 22.026 21.82 21.575 21.318 21.141 20.981 20.812 20.671 20.53 20.384 20.215 20.028 19.899 19.76 19.536 19.386 19.225 19.142 18.967 18.783 18.587 18.481 18.212 18.161 18.036 17.911 17.657 17.512 17.352 17.164 16.95 16.723 16.492 15.968 -5 ,19117 ,TETRA ,17559183,Sat Nov 27 05:30:49 CET,Sat Nov 27 07:30:49 CET,0.0 1.034 1.271 1.47 1.688 1.888 2.065 2.23 2.557 2.708 2.832 2.883 3.204 3.332 3.575 3.792 3.99 4.086 4.287 4.484 4.767 4.947 5.109 5.334 5.566 5.804 6.042 6.287 6.615 6.922 7.193 7.509 7.819 8.112 8.431 8.794 9.168 9.582 10.028 10.523 11.039 11.621 12.297 12.956 13.752 14.635 15.636 16.823 18.201 19.738 21.525 22.942 23.689 24.064 24.221 24.266 24.248 24.19 24.089 23.932 23.759 23.584 23.396 23.221 23.063 22.902 22.731 22.569 22.419 22.251 22.074 21.925 21.759 21.588 21.461 21.328 21.178 21.014 20.834 20.696 20.548 20.315 20.169 20.03 19.954 19.806 19.656 19.465 19.362 19.088 19.016 18.898 18.78 18.483 18.307 18.131 17.933 17.688 17.402 17.082 16.302 -6 ,8217 ,TETRA ,17559184,Sat Nov 27 05:30:51 CET,Sat Nov 27 07:31:05 CET,0.0 0.878 1.236 1.501 1.724 1.903 2.076 2.261 2.603 2.755 2.897 2.976 3.289 3.399 3.61 3.83 4.048 4.161 4.387 4.598 4.897 5.085 5.262 5.517 5.76 5.996 6.237 6.481 6.813 7.138 7.445 7.819 8.2 8.568 8.963 9.404 9.835 10.288 10.778 11.319 11.905 12.608 13.4 14.132 14.984 15.932 17.023 18.261 19.725 21.427 23.377 24.886 25.684 26.125 26.372 26.473 26.482 26.468 26.391 26.263 26.152 26.037 25.91 25.775 25.636 25.51 25.377 25.245 25.135 25.022 24.89 24.768 24.627 24.479 24.36 24.233 24.086 23.924 23.771 23.666 23.559 23.383 23.253 23.113 23.04 22.9 22.739 22.556 22.461 22.188 22.16 22.059 21.939 21.631 21.458 21.285 21.101 20.908 20.681 20.377 19.622 -7 ,30116 ,TETRA ,17559185,Sat Nov 27 05:30:49 CET,Sat Nov 27 07:30:40 CET,0.0 1.204 1.52 1.73 1.917 2.081 2.236 2.396 2.682 2.806 2.929 2.988 3.301 3.418 3.642 3.852 4.061 4.166 4.372 4.566 4.843 5.032 5.224 5.512 5.782 6.043 6.298 6.541 6.845 7.126 7.397 7.727 8.048 8.359 8.716 9.112 9.517 9.977 10.444 10.926 11.428 11.993 12.667 13.355 14.139 15.01 16.034 17.174 18.538 20.166 22.026 23.496 24.275 24.624 24.791 24.867 24.832 24.732 24.624 24.466 24.29 24.116 23.927 23.75 23.595 23.441 23.246 23.068 22.917 22.745 22.561 22.4 22.229 22.052 21.914 21.778 21.643 21.494 21.326 21.202 21.064 20.849 20.709 20.565 20.492 20.33 20.146 19.963 19.87 19.606 19.575 19.459 19.355 19.114 18.968 18.834 18.686 18.523 18.329 17.97 17.12 -8 ,17858 ,TETRA ,17559186,Sat Nov 27 05:30:51 CET,Sat Nov 27 07:30:13 CET,0.0 0.84 1.157 1.436 1.664 1.862 2.044 2.223 2.525 2.661 2.802 2.873 3.192 3.311 3.542 3.768 3.978 4.088 4.312 4.516 4.818 5.018 5.204 5.479 5.742 5.98 6.217 6.464 6.778 7.058 7.33 7.669 7.999 8.312 8.683 9.116 9.533 9.981 10.427 10.886 11.381 11.968 12.65 13.314 14.083 14.961 15.981 17.119 18.463 20.039 21.889 23.3 24.03 24.465 24.664 24.722 24.741 24.697 24.641 24.561 24.446 24.324 24.195 24.072 23.94 23.797 23.655 23.532 23.4 23.252 23.113 23.0 22.859 22.698 22.57 22.409 22.228 22.04 21.857 21.732 21.59 21.375 21.226 21.081 21.01 20.859 20.687 20.493 20.396 20.13 20.113 20.004 19.873 19.58 19.42 19.221 18.978 18.721 18.392 17.965 16.43 -9 ,12158 ,TETRA ,17559188,Sat Nov 27 05:30:53 CET,Sat Nov 27 07:30:23 CET,0.0 0.294 0.549 0.783 0.997 1.164 1.301 1.449 1.745 1.878 2.002 2.059 2.366 2.477 2.691 2.901 3.097 3.197 3.406 3.608 3.887 4.071 4.254 4.499 4.73 4.954 5.187 5.412 5.676 5.933 6.191 6.498 6.796 7.091 7.451 7.855 8.233 8.665 9.136 9.607 10.11 10.711 11.417 12.131 12.932 13.818 14.849 16.002 17.346 18.94 20.91 22.52 23.364 23.8 23.983 24.024 23.992 23.901 23.775 23.614 23.417 23.222 23.035 22.842 22.663 22.487 22.274 22.092 21.927 21.733 21.504 21.291 21.091 20.901 20.746 20.599 20.454 20.293 20.098 19.955 19.805 19.586 19.439 19.277 19.189 19.0 18.808 18.593 18.476 18.188 18.124 17.996 17.87 17.575 17.403 17.21 17.0 16.771 16.481 16.052 14.81 -10 ,3674 ,TETRA ,17559189,Sat Nov 27 05:30:50 CET,Sat Nov 27 07:30:03 CET,0.0 0.649 0.9 1.127 1.336 1.538 1.709 1.861 2.155 2.282 2.403 2.454 2.764 2.868 3.069 3.271 3.46 3.557 3.758 3.962 4.263 4.46 4.646 4.898 5.143 5.394 5.641 5.869 6.161 6.449 6.715 7.025 7.326 7.621 7.946 8.313 8.687 9.098 9.536 10.006 10.512 11.071 11.736 12.422 13.214 14.107 15.181 16.403 17.818 19.514 21.439 22.861 23.616 24.007 24.18 24.255 24.248 24.165 24.032 23.862 23.723 23.561 23.393 23.225 23.026 22.833 22.63 22.44 22.271 22.105 21.921 21.751 21.571 21.392 21.254 21.097 20.928 20.757 20.585 20.468 20.343 20.144 19.998 19.825 19.741 19.577 19.401 19.211 19.107 18.818 18.751 18.635 18.521 18.292 18.169 18.028 17.864 17.673 17.45 17.189 16.348 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_56_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_56_58.txt deleted file mode 100644 index 7f33e427..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_56_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26586 ,TETRA ,17559190,Sat Nov 27 05:30:50 CET,Sat Nov 27 07:30:15 CET,0.0 1.156 1.618 1.967 2.216 2.455 2.663 2.843 3.184 3.34 3.479 3.522 3.824 3.94 4.175 4.387 4.591 4.696 4.878 5.053 5.305 5.465 5.622 5.83 6.031 6.226 6.412 6.597 6.824 7.034 7.236 7.472 7.691 7.88 8.088 8.332 8.561 8.801 9.074 9.391 9.713 10.051 10.419 10.761 11.118 11.438 11.738 12.045 12.299 12.319 11.95 11.224 10.471 9.778 9.137 8.476 7.861 7.302 6.83 6.367 5.95 5.564 5.172 4.806 4.473 4.154 3.827 3.546 3.303 3.046 2.771 2.551 2.327 2.084 1.888 1.691 1.496 1.303 1.095 0.948 0.806 0.578 0.417 0.247 0.159 -0.026 -0.219 -0.41 -0.521 -0.833 -0.894 -1.027 -1.19 -1.51 -1.671 -1.862 -2.073 -2.309 -2.602 -3.041 -4.695 -2 ,6520 ,TETRA ,17559191,Sat Nov 27 05:30:52 CET,Sat Nov 27 07:31:37 CET,0.0 1.229 1.601 1.877 2.156 2.412 2.619 2.794 3.114 3.271 3.417 3.488 3.805 3.932 4.165 4.384 4.594 4.696 4.891 5.077 5.37 5.576 5.764 6.0 6.215 6.415 6.599 6.777 6.991 7.188 7.387 7.632 7.855 8.073 8.344 8.651 8.941 9.263 9.567 9.85 10.117 10.386 10.681 10.953 11.29 11.636 11.905 12.099 12.234 12.289 12.023 11.322 10.559 9.801 9.082 8.381 7.748 7.185 6.695 6.204 5.786 5.404 5.009 4.647 4.331 4.024 3.696 3.417 3.167 2.894 2.607 2.372 2.145 1.923 1.732 1.513 1.278 1.034 0.8 0.645 0.479 0.233 0.061 -0.139 -0.24 -0.418 -0.593 -0.781 -0.886 -1.193 -1.285 -1.444 -1.596 -1.917 -2.092 -2.27 -2.473 -2.726 -3.041 -3.466 -5.107 -3 ,9263 ,TETRA ,17559192,Sat Nov 27 05:30:54 CET,Sat Nov 27 07:30:49 CET,0.0 3.557 4.046 4.428 4.751 5.035 5.29 5.52 5.898 6.064 6.219 6.348 6.696 6.839 7.098 7.357 7.604 7.717 7.928 8.126 8.42 8.606 8.769 9.008 9.242 9.481 9.723 9.945 10.217 10.48 10.743 11.056 11.345 11.614 11.914 12.253 12.564 12.87 13.17 13.479 13.822 14.199 14.58 14.925 15.282 15.609 15.959 16.282 16.478 16.563 16.269 15.431 14.567 13.754 12.975 12.307 11.747 11.189 10.683 10.174 9.726 9.311 8.918 8.549 8.207 7.889 7.553 7.246 6.967 6.676 6.385 6.144 5.884 5.621 5.427 5.23 5.019 4.798 4.546 4.361 4.175 3.886 3.703 3.52 3.421 3.212 2.986 2.747 2.623 2.308 2.237 2.097 1.949 1.622 1.455 1.275 1.069 0.807 0.472 0.044 -1.322 -4 ,16692 ,TETRA ,17559193,Sat Nov 27 05:30:50 CET,Sat Nov 27 07:30:57 CET,0.0 2.206 2.817 3.194 3.445 3.665 3.875 4.092 4.5 4.666 4.816 4.921 5.254 5.396 5.688 5.962 6.185 6.282 6.464 6.645 6.9 7.046 7.206 7.448 7.654 7.862 8.067 8.247 8.471 8.694 8.903 9.164 9.406 9.628 9.881 10.128 10.378 10.677 10.956 11.218 11.478 11.766 12.106 12.409 12.722 13.036 13.398 13.73 13.968 14.086 13.865 13.15 12.367 11.572 10.795 10.126 9.568 9.015 8.532 8.048 7.594 7.175 6.787 6.42 6.089 5.804 5.516 5.241 4.989 4.74 4.484 4.27 4.043 3.797 3.605 3.402 3.184 2.954 2.72 2.57 2.409 2.137 1.942 1.744 1.649 1.447 1.244 1.048 0.94 0.632 0.564 0.42 0.256 -0.115 -0.301 -0.489 -0.717 -0.959 -1.225 -1.657 -3.492 -5 ,22034 ,TETRA ,17559194,Sat Nov 27 05:31:49 CET,Sat Nov 27 07:34:12 CET,0.0 2.499 3.049 3.492 3.806 4.063 4.29 4.496 4.896 5.086 5.265 5.37 5.686 5.793 6.02 6.268 6.514 6.621 6.807 6.993 7.266 7.432 7.599 7.847 8.079 8.297 8.5 8.693 8.935 9.163 9.396 9.683 9.927 10.151 10.447 10.804 11.114 11.429 11.755 12.057 12.345 12.682 13.053 13.354 13.67 13.984 14.263 14.499 14.646 14.672 14.396 13.64 12.894 12.187 11.501 10.856 10.257 9.683 9.175 8.638 8.188 7.803 7.425 7.079 6.759 6.448 6.102 5.795 5.538 5.269 4.995 4.775 4.549 4.314 4.127 3.925 3.7 3.454 3.207 3.036 2.862 2.618 2.454 2.268 2.168 1.971 1.774 1.565 1.442 1.121 1.059 0.922 0.772 0.426 0.231 0.03 -0.194 -0.457 -0.746 -1.128 -2.535 -6 ,5452 ,TETRA ,17559195,Sat Nov 27 05:31:49 CET,Sat Nov 27 07:32:09 CET,0.0 1.846 2.284 2.594 2.859 3.139 3.396 3.631 4.047 4.235 4.392 4.466 4.789 4.919 5.185 5.44 5.69 5.808 6.017 6.225 6.506 6.673 6.837 7.077 7.299 7.497 7.69 7.873 8.106 8.326 8.524 8.77 9.012 9.249 9.521 9.811 10.078 10.331 10.593 10.917 11.252 11.578 11.916 12.204 12.492 12.759 13.029 13.283 13.424 13.441 13.144 12.398 11.596 10.799 10.103 9.454 8.861 8.326 7.871 7.43 7.0 6.576 6.166 5.761 5.372 5.021 4.673 4.365 4.111 3.86 3.591 3.358 3.106 2.83 2.615 2.407 2.197 1.968 1.716 1.544 1.37 1.09 0.895 0.695 0.589 0.368 0.139 -0.085 -0.199 -0.517 -0.606 -0.753 -0.907 -1.26 -1.451 -1.649 -1.874 -2.115 -2.404 -2.796 -4.972 -7 ,10480 ,TETRA ,17559196,Sat Nov 27 05:31:49 CET,Sat Nov 27 07:33:25 CET,0.0 2.419 2.89 3.233 3.521 3.749 3.961 4.166 4.519 4.667 4.813 4.894 5.214 5.331 5.56 5.801 6.047 6.161 6.359 6.534 6.788 6.952 7.093 7.315 7.547 7.746 7.931 8.122 8.356 8.56 8.756 8.984 9.202 9.419 9.668 9.933 10.176 10.444 10.724 11.003 11.272 11.533 11.804 12.093 12.403 12.679 12.974 13.258 13.436 13.474 13.239 12.607 11.885 11.176 10.495 9.861 9.304 8.752 8.275 7.806 7.403 7.041 6.67 6.32 6.006 5.709 5.388 5.08 4.826 4.587 4.331 4.113 3.882 3.634 3.438 3.231 3.016 2.789 2.555 2.402 2.246 1.994 1.814 1.638 1.542 1.332 1.121 0.906 0.798 0.497 0.458 0.336 0.2 -0.105 -0.294 -0.499 -0.703 -0.962 -1.273 -1.63 -3.022 -8 ,2214 ,TETRA ,17559197,Sat Nov 27 05:31:49 CET,Sat Nov 27 07:31:39 CET,0.0 1.382 1.823 2.119 2.362 2.57 2.787 2.992 3.354 3.519 3.672 3.771 4.098 4.228 4.447 4.658 4.869 4.971 5.152 5.321 5.58 5.754 5.916 6.135 6.352 6.563 6.747 6.916 7.13 7.34 7.546 7.791 8.02 8.244 8.494 8.777 9.05 9.327 9.626 9.904 10.16 10.466 10.836 11.167 11.49 11.802 12.101 12.363 12.497 12.476 12.198 11.471 10.699 9.926 9.186 8.516 7.913 7.33 6.764 6.139 5.618 5.158 4.714 4.351 4.043 3.754 3.411 3.101 2.852 2.588 2.328 2.116 1.874 1.613 1.424 1.222 0.998 0.785 0.564 0.41 0.257 0.017 -0.16 -0.348 -0.434 -0.613 -0.827 -1.071 -1.201 -1.53 -1.624 -1.77 -1.913 -2.223 -2.397 -2.604 -2.827 -3.053 -3.324 -3.72 -5.122 -9 ,28807 ,TETRA ,17559198,Sat Nov 27 05:31:51 CET,Sat Nov 27 07:31:50 CET,0.0 1.176 1.701 2.2 2.569 2.828 3.027 3.214 3.541 3.676 3.809 3.892 4.211 4.345 4.596 4.821 5.043 5.158 5.359 5.528 5.807 5.998 6.178 6.431 6.659 6.876 7.07 7.236 7.45 7.64 7.813 8.021 8.221 8.438 8.697 8.978 9.251 9.545 9.807 10.048 10.292 10.573 10.889 11.157 11.454 11.75 12.023 12.284 12.533 12.643 12.442 11.802 11.115 10.475 9.828 9.204 8.639 8.109 7.627 7.122 6.686 6.275 5.892 5.543 5.204 4.897 4.578 4.289 4.046 3.798 3.524 3.302 3.074 2.817 2.611 2.395 2.176 1.976 1.79 1.656 1.503 1.246 1.065 0.866 0.767 0.57 0.359 0.131 0.018 -0.284 -0.355 -0.504 -0.656 -0.974 -1.144 -1.322 -1.522 -1.767 -2.067 -2.467 -4.239 -10 ,29581 ,TETRA ,17559199,Sat Nov 27 05:31:49 CET,Sat Nov 27 07:32:13 CET,0.0 1.546 1.967 2.334 2.63 2.883 3.102 3.279 3.592 3.742 3.892 3.986 4.318 4.46 4.732 5.008 5.253 5.356 5.569 5.778 6.04 6.202 6.36 6.593 6.814 7.03 7.239 7.424 7.655 7.901 8.139 8.379 8.591 8.791 9.018 9.268 9.502 9.785 10.093 10.378 10.656 10.952 11.28 11.608 11.972 12.313 12.629 12.946 13.186 13.234 12.988 12.273 11.464 10.686 9.948 9.269 8.659 8.089 7.618 7.159 6.751 6.362 5.976 5.614 5.281 4.979 4.658 4.379 4.124 3.851 3.573 3.336 3.091 2.832 2.635 2.454 2.266 2.058 1.842 1.695 1.539 1.289 1.119 0.94 0.847 0.652 0.451 0.231 0.115 -0.199 -0.31 -0.466 -0.62 -0.983 -1.175 -1.38 -1.628 -1.899 -2.23 -2.722 -4.274 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_60_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_60_37.txt deleted file mode 100644 index 0e7d670b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_60_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19738 ,KEBNE ,17024837,Wed Dec 22 11:15:58 CET,Wed Dec 22 12:56:56 CET,0.0 0.998 1.433 1.72 1.952 2.174 2.378 2.555 2.877 3.027 3.175 3.265 3.572 3.687 3.915 4.141 4.36 4.465 4.663 4.843 5.092 5.243 5.379 5.586 5.795 5.992 6.182 6.356 6.574 6.792 7.012 7.286 7.539 7.778 8.074 8.41 8.719 9.038 9.367 9.704 10.063 10.476 10.924 11.354 11.842 12.337 12.882 13.443 13.958 14.425 14.744 14.643 14.355 13.966 13.525 13.082 12.608 12.174 11.786 11.37 10.996 10.637 10.291 9.95 9.626 9.344 9.056 8.808 8.583 8.343 8.103 7.879 7.628 7.383 7.189 6.983 6.767 6.524 6.274 6.107 5.938 5.669 5.476 5.281 5.184 4.985 4.758 4.503 4.378 4.065 3.961 3.819 3.68 3.364 3.18 2.994 2.795 2.574 2.313 2.022 1.538 -2 ,29363 ,KEBNE ,17024838,Wed Dec 22 11:15:58 CET,Wed Dec 22 12:55:38 CET,0.0 1.102 1.505 1.771 2.022 2.258 2.464 2.641 2.947 3.099 3.245 3.303 3.605 3.734 3.957 4.17 4.377 4.477 4.682 4.862 5.107 5.264 5.419 5.642 5.85 6.057 6.258 6.449 6.678 6.888 7.101 7.36 7.614 7.876 8.171 8.48 8.771 9.081 9.413 9.757 10.106 10.495 10.951 11.386 11.848 12.332 12.851 13.4 13.938 14.422 14.757 14.637 14.171 13.651 13.206 12.729 12.246 11.784 11.389 10.992 10.618 10.272 9.921 9.581 9.27 8.991 8.703 8.434 8.189 7.932 7.67 7.457 7.243 7.014 6.828 6.635 6.428 6.2 5.975 5.824 5.662 5.406 5.226 5.041 4.948 4.742 4.527 4.301 4.181 3.87 3.777 3.634 3.48 3.17 3.01 2.832 2.609 2.369 2.146 1.81 1.142 -3 ,15817 ,KEBNE ,17024839,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:58:13 CET,0.0 1.1 1.536 1.895 2.145 2.358 2.555 2.729 3.036 3.177 3.314 3.387 3.699 3.826 4.072 4.301 4.495 4.589 4.767 4.941 5.194 5.358 5.515 5.735 5.946 6.146 6.341 6.529 6.773 7.006 7.243 7.526 7.779 8.03 8.326 8.654 8.963 9.294 9.635 9.988 10.376 10.789 11.214 11.615 12.077 12.594 13.135 13.68 14.191 14.637 14.906 14.706 14.284 13.744 13.225 12.735 12.266 11.839 11.444 11.049 10.699 10.37 10.048 9.719 9.404 9.11 8.811 8.56 8.34 8.116 7.888 7.682 7.452 7.229 7.062 6.877 6.685 6.488 6.27 6.121 5.974 5.737 5.571 5.397 5.299 5.09 4.883 4.66 4.538 4.23 4.142 3.998 3.854 3.523 3.337 3.153 2.948 2.71 2.426 2.046 0.951 -4 ,21885 ,KEBNE ,17024840,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:56:28 CET,0.0 0.852 1.147 1.384 1.614 1.821 2.011 2.177 2.471 2.621 2.768 2.846 3.143 3.253 3.469 3.671 3.858 3.948 4.125 4.286 4.513 4.661 4.802 5.004 5.208 5.409 5.603 5.79 6.018 6.222 6.416 6.674 6.934 7.17 7.432 7.729 8.01 8.315 8.639 8.983 9.323 9.674 10.075 10.483 10.963 11.438 11.904 12.413 12.955 13.443 13.787 13.634 13.146 12.624 12.123 11.632 11.208 10.796 10.381 9.949 9.578 9.235 8.901 8.582 8.268 7.97 7.685 7.442 7.213 6.96 6.692 6.476 6.269 6.046 5.863 5.681 5.492 5.274 5.032 4.855 4.679 4.427 4.261 4.081 3.98 3.77 3.559 3.343 3.221 2.91 2.831 2.69 2.538 2.192 2.008 1.817 1.6 1.327 0.967 0.535 -0.416 -5 ,12594 ,KEBNE ,17024841,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:57:02 CET,0.0 0.712 1.052 1.371 1.613 1.84 2.067 2.268 2.638 2.799 2.941 3.02 3.332 3.452 3.679 3.897 4.112 4.217 4.412 4.588 4.866 5.049 5.208 5.441 5.668 5.894 6.109 6.314 6.577 6.818 7.056 7.35 7.614 7.869 8.163 8.489 8.808 9.147 9.502 9.91 10.336 10.779 11.279 11.748 12.238 12.751 13.324 13.896 14.463 14.958 15.26 15.097 14.688 14.205 13.725 13.253 12.813 12.366 11.951 11.544 11.183 10.823 10.456 10.118 9.818 9.526 9.209 8.952 8.73 8.487 8.22 7.991 7.758 7.523 7.34 7.149 6.95 6.737 6.5 6.333 6.16 5.877 5.686 5.491 5.396 5.213 5.009 4.786 4.656 4.327 4.234 4.104 3.963 3.593 3.4 3.217 3.015 2.806 2.569 2.245 1.683 -6 ,6547 ,KEBNE ,17024842,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:56:39 CET,0.0 0.692 1.067 1.445 1.757 1.985 2.19 2.385 2.734 2.893 3.033 3.116 3.426 3.545 3.773 3.979 4.16 4.252 4.434 4.6 4.848 5.011 5.159 5.37 5.578 5.774 5.951 6.115 6.325 6.527 6.731 6.971 7.188 7.412 7.684 7.986 8.271 8.587 8.948 9.338 9.715 10.094 10.539 10.977 11.46 11.977 12.503 13.042 13.623 14.146 14.42 14.279 13.908 13.459 12.973 12.462 11.991 11.565 11.175 10.747 10.363 10.023 9.699 9.374 9.072 8.818 8.54 8.28 8.052 7.815 7.572 7.35 7.119 6.891 6.722 6.542 6.345 6.143 5.918 5.765 5.614 5.363 5.18 4.993 4.895 4.685 4.466 4.238 4.118 3.805 3.742 3.602 3.457 3.138 2.954 2.759 2.55 2.317 2.025 1.667 0.842 -7 ,2775 ,KEBNE ,17024843,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:56:56 CET,0.0 0.667 1.06 1.346 1.584 1.806 2.012 2.192 2.505 2.654 2.801 2.898 3.218 3.345 3.586 3.803 4.014 4.123 4.327 4.507 4.756 4.917 5.071 5.295 5.516 5.724 5.912 6.104 6.357 6.597 6.832 7.112 7.383 7.634 7.92 8.229 8.508 8.813 9.145 9.472 9.787 10.168 10.647 11.084 11.536 12.018 12.533 13.071 13.675 14.253 14.596 14.5 14.177 13.85 13.427 12.979 12.571 12.195 11.87 11.501 11.175 10.877 10.565 10.257 9.977 9.72 9.441 9.18 8.952 8.719 8.464 8.244 8.021 7.781 7.584 7.385 7.186 6.973 6.743 6.587 6.429 6.183 6.01 5.827 5.732 5.536 5.32 5.076 4.946 4.624 4.544 4.416 4.279 3.973 3.796 3.59 3.372 3.161 2.903 2.543 1.896 -8 ,17988 ,KEBNE ,17024844,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:57:28 CET,0.0 1.041 1.397 1.727 2.021 2.25 2.462 2.664 3.005 3.147 3.282 3.368 3.691 3.815 4.043 4.258 4.451 4.545 4.733 4.902 5.15 5.306 5.462 5.705 5.931 6.141 6.34 6.539 6.797 7.031 7.247 7.495 7.739 7.982 8.259 8.561 8.833 9.135 9.449 9.746 10.06 10.428 10.864 11.303 11.796 12.3 12.82 13.351 13.956 14.542 14.932 14.798 14.384 13.983 13.554 13.114 12.712 12.282 11.884 11.482 11.134 10.825 10.515 10.243 9.997 9.739 9.42 9.118 8.875 8.628 8.368 8.152 7.934 7.709 7.524 7.325 7.119 6.903 6.663 6.494 6.324 6.072 5.894 5.693 5.594 5.402 5.195 4.973 4.856 4.555 4.473 4.331 4.177 3.824 3.627 3.427 3.171 2.865 2.525 2.077 1.331 -9 ,26847 ,KEBNE ,17024845,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:57:07 CET,0.0 1.449 1.759 1.967 2.148 2.31 2.455 2.593 2.855 2.97 3.076 3.068 3.346 3.435 3.603 3.759 3.898 3.971 4.123 4.267 4.468 4.594 4.715 4.881 5.048 5.212 5.371 5.524 5.714 5.892 6.054 6.249 6.445 6.632 6.845 7.07 7.274 7.497 7.743 8.005 8.267 8.568 8.897 9.214 9.573 9.927 10.334 10.752 11.146 11.467 11.657 11.44 10.976 10.478 9.993 9.484 8.997 8.572 8.189 7.779 7.41 7.077 6.754 6.449 6.174 5.922 5.658 5.419 5.196 4.957 4.714 4.509 4.303 4.091 3.92 3.74 3.546 3.343 3.134 2.981 2.823 2.581 2.407 2.237 2.151 1.964 1.785 1.591 1.479 1.175 1.152 1.027 0.884 0.572 0.422 0.261 0.074 -0.153 -0.45 -0.856 -2.132 -10 ,8225 ,KEBNE ,17024846,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:56:48 CET,0.0 0.626 0.952 1.259 1.487 1.68 1.87 2.062 2.398 2.551 2.692 2.756 3.066 3.193 3.435 3.654 3.854 3.952 4.142 4.314 4.554 4.712 4.866 5.1 5.336 5.553 5.754 5.944 6.177 6.4 6.619 6.874 7.121 7.365 7.644 7.949 8.238 8.534 8.844 9.183 9.531 9.91 10.353 10.808 11.318 11.858 12.428 12.988 13.532 13.961 14.202 14.099 13.781 13.31 12.81 12.302 11.853 11.433 11.018 10.569 10.202 9.9 9.624 9.344 9.075 8.838 8.552 8.291 8.079 7.847 7.601 7.399 7.191 6.977 6.807 6.626 6.432 6.238 6.037 5.895 5.75 5.521 5.357 5.179 5.091 4.911 4.712 4.506 4.389 4.07 3.965 3.806 3.642 3.317 3.143 2.968 2.764 2.488 2.166 1.748 0.346 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_60_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_60_61.txt deleted file mode 100644 index 6753a691..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_60_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31745 ,TETRA ,17559200,Sat Nov 27 05:32:49 CET,Sat Nov 27 07:29:41 CET,0.0 1.32 1.836 2.277 2.677 2.99 3.252 3.507 3.958 4.146 4.339 4.515 4.86 5.015 5.312 5.601 5.87 5.995 6.226 6.44 6.737 6.936 7.139 7.429 7.719 7.998 8.248 8.479 8.787 9.076 9.345 9.665 9.975 10.263 10.58 10.934 11.287 11.679 12.083 12.506 12.963 13.494 14.091 14.642 15.248 15.92 16.627 17.331 18.108 18.816 19.368 19.466 19.182 18.825 18.44 18.001 17.551 17.114 16.73 16.351 16.031 15.731 15.429 15.132 14.837 14.565 14.287 14.022 13.78 13.535 13.277 13.075 12.863 12.62 12.429 12.234 12.036 11.83 11.616 11.469 11.311 11.066 10.903 10.733 10.643 10.44 10.191 9.904 9.755 9.43 9.347 9.216 9.075 8.752 8.57 8.376 8.155 7.906 7.56 7.147 6.322 -2 ,20867 ,TETRA ,17559201,Sat Nov 27 05:32:49 CET,Sat Nov 27 07:31:04 CET,0.0 1.715 2.206 2.566 2.891 3.167 3.41 3.637 4.056 4.24 4.41 4.537 4.863 5.004 5.272 5.529 5.794 5.921 6.164 6.402 6.725 6.927 7.13 7.428 7.716 7.983 8.236 8.481 8.787 9.079 9.375 9.73 10.061 10.378 10.733 11.122 11.496 11.903 12.345 12.815 13.284 13.779 14.375 14.935 15.55 16.252 17.019 17.811 18.616 19.399 20.044 20.289 20.208 19.901 19.52 19.1 18.625 18.155 17.744 17.309 16.915 16.556 16.211 15.91 15.622 15.336 15.03 14.728 14.469 14.227 13.984 13.77 13.531 13.279 13.082 12.88 12.691 12.496 12.277 12.12 11.951 11.684 11.5 11.323 11.238 11.042 10.824 10.597 10.476 10.17 10.083 9.936 9.793 9.49 9.314 9.097 8.872 8.573 8.171 7.665 6.194 -3 ,14099 ,TETRA ,17559202,Sat Nov 27 05:32:49 CET,Sat Nov 27 07:29:21 CET,0.0 1.159 1.601 1.958 2.273 2.544 2.801 3.034 3.43 3.619 3.797 3.945 4.287 4.443 4.756 5.049 5.324 5.456 5.708 5.965 6.342 6.568 6.786 7.072 7.326 7.593 7.855 8.11 8.447 8.752 9.03 9.382 9.721 10.027 10.378 10.77 11.136 11.537 11.983 12.445 12.911 13.442 14.043 14.66 15.351 16.009 16.688 17.359 18.084 18.808 19.391 19.491 19.175 18.705 18.263 17.821 17.399 17.023 16.662 16.256 15.88 15.538 15.205 14.889 14.624 14.38 14.108 13.845 13.606 13.369 13.132 12.921 12.694 12.458 12.278 12.1 11.901 11.682 11.448 11.291 11.138 10.894 10.73 10.559 10.47 10.287 10.084 9.867 9.751 9.442 9.297 9.121 8.959 8.659 8.479 8.247 8.0 7.702 7.343 6.896 5.426 -4 ,10547 ,TETRA ,17559203,Sat Nov 27 05:32:51 CET,Sat Nov 27 07:33:10 CET,0.0 1.654 2.274 2.716 3.079 3.393 3.669 3.911 4.338 4.551 4.764 4.955 5.305 5.466 5.783 6.082 6.357 6.486 6.729 6.957 7.294 7.525 7.744 8.044 8.337 8.629 8.905 9.157 9.488 9.814 10.113 10.457 10.783 11.096 11.458 11.851 12.221 12.611 13.025 13.475 13.924 14.444 15.065 15.649 16.32 17.049 17.79 18.536 19.342 20.177 20.941 21.141 20.924 20.541 20.144 19.772 19.428 19.075 18.733 18.363 18.022 17.708 17.406 17.135 16.886 16.63 16.344 16.1 15.885 15.659 15.421 15.203 14.96 14.728 14.556 14.369 14.172 13.964 13.749 13.596 13.426 13.149 12.961 12.771 12.672 12.481 12.301 12.107 11.993 11.698 11.64 11.508 11.354 11.017 10.835 10.625 10.415 10.18 9.899 9.511 8.02 -5 ,2766 ,TETRA ,17559204,Sat Nov 27 05:32:52 CET,Sat Nov 27 07:32:11 CET,0.0 1.151 1.595 1.931 2.216 2.488 2.75 2.982 3.395 3.585 3.765 3.944 4.299 4.444 4.722 4.995 5.251 5.372 5.607 5.841 6.182 6.408 6.618 6.923 7.209 7.467 7.732 7.988 8.305 8.6 8.878 9.217 9.554 9.87 10.222 10.628 10.992 11.351 11.759 12.201 12.656 13.14 13.67 14.178 14.733 15.347 16.017 16.719 17.417 18.095 18.683 18.748 18.463 18.154 17.827 17.409 16.965 16.522 16.144 15.784 15.478 15.196 14.91 14.617 14.328 14.063 13.789 13.541 13.309 13.067 12.815 12.594 12.37 12.141 11.96 11.776 11.586 11.385 11.161 11.012 10.861 10.605 10.437 10.276 10.189 10.003 9.784 9.543 9.417 9.111 9.029 8.884 8.744 8.429 8.255 8.065 7.861 7.635 7.3 6.814 4.281 -6 ,16348 ,TETRA ,17559205,Sat Nov 27 05:33:49 CET,Sat Nov 27 07:29:58 CET,0.0 4.149 4.703 5.063 5.394 5.67 5.884 6.07 6.42 6.584 6.754 6.882 7.199 7.333 7.623 7.895 8.164 8.298 8.543 8.772 9.091 9.298 9.503 9.805 10.098 10.371 10.633 10.875 11.182 11.491 11.783 12.131 12.477 12.811 13.18 13.594 13.985 14.393 14.815 15.263 15.736 16.233 16.769 17.308 17.947 18.611 19.285 19.993 20.732 21.466 22.074 22.09 21.802 21.496 21.178 20.795 20.387 19.975 19.601 19.205 18.866 18.563 18.274 17.995 17.708 17.438 17.134 16.833 16.587 16.354 16.111 15.898 15.678 15.472 15.309 15.124 14.941 14.76 14.563 14.429 14.292 14.056 13.887 13.718 13.632 13.452 13.252 13.034 12.924 12.63 12.575 12.453 12.325 12.062 11.904 11.723 11.526 11.324 11.053 10.634 8.001 -7 ,11949 ,TETRA ,17559206,Sat Nov 27 05:33:49 CET,Sat Nov 27 07:31:47 CET,0.0 1.908 2.376 2.781 3.129 3.422 3.689 3.936 4.378 4.589 4.794 4.977 5.327 5.486 5.796 6.087 6.359 6.49 6.735 6.967 7.31 7.526 7.725 8.011 8.288 8.565 8.835 9.092 9.407 9.697 9.99 10.374 10.721 11.017 11.361 11.741 12.085 12.466 12.892 13.325 13.769 14.256 14.798 15.359 15.985 16.652 17.394 18.136 18.94 19.763 20.429 20.634 20.425 19.992 19.533 19.086 18.639 18.195 17.76 17.326 16.995 16.681 16.356 16.052 15.769 15.505 15.233 14.992 14.781 14.541 14.276 14.065 13.85 13.625 13.453 13.267 13.069 12.865 12.65 12.503 12.35 12.105 11.929 11.737 11.644 11.46 11.258 11.048 10.923 10.592 10.483 10.341 10.197 9.876 9.662 9.398 9.149 8.905 8.601 8.201 7.187 -8 ,11184 ,TETRA ,17559207,Sat Nov 27 05:34:50 CET,Sat Nov 27 07:38:30 CET,0.0 1.294 1.784 2.161 2.469 2.752 3.027 3.269 3.716 3.939 4.143 4.327 4.679 4.837 5.148 5.439 5.701 5.822 6.063 6.298 6.615 6.823 7.024 7.302 7.573 7.842 8.096 8.331 8.641 8.952 9.251 9.608 9.972 10.317 10.675 11.059 11.43 11.848 12.306 12.792 13.271 13.762 14.315 14.855 15.457 16.093 16.774 17.493 18.251 18.968 19.556 19.687 19.506 19.225 18.858 18.433 18.022 17.603 17.203 16.786 16.434 16.129 15.828 15.531 15.238 14.954 14.656 14.395 14.171 13.938 13.679 13.455 13.23 13.017 12.843 12.641 12.417 12.189 11.951 11.784 11.623 11.38 11.209 11.018 10.921 10.733 10.528 10.296 10.175 9.867 9.787 9.64 9.487 9.178 8.97 8.732 8.471 8.207 7.888 7.416 5.679 -9 ,27767 ,TETRA ,17559208,Sat Nov 27 05:34:50 CET,Sat Nov 27 07:32:39 CET,0.0 1.398 1.995 2.43 2.789 3.085 3.349 3.596 4.044 4.245 4.436 4.617 4.956 5.107 5.412 5.689 5.95 6.082 6.334 6.565 6.893 7.117 7.33 7.628 7.913 8.186 8.453 8.704 9.018 9.328 9.641 10.003 10.335 10.651 11.006 11.398 11.777 12.171 12.578 13.0 13.436 13.916 14.471 15.049 15.705 16.368 17.073 17.828 18.687 19.542 20.15 20.214 19.898 19.438 18.967 18.526 18.095 17.647 17.234 16.811 16.452 16.118 15.803 15.511 15.239 14.974 14.667 14.399 14.188 13.976 13.75 13.557 13.341 13.116 12.944 12.767 12.584 12.381 12.161 12.007 11.848 11.602 11.424 11.241 11.151 10.969 10.773 10.55 10.433 10.122 10.039 9.893 9.739 9.411 9.241 9.043 8.811 8.554 8.258 7.803 5.488 -10 ,12103 ,TETRA ,17559209,Sat Nov 27 05:35:47 CET,Sat Nov 27 07:36:56 CET,0.0 1.487 2.012 2.426 2.745 3.006 3.239 3.469 3.892 4.091 4.284 4.437 4.778 4.932 5.227 5.5 5.756 5.886 6.139 6.378 6.724 6.939 7.14 7.418 7.691 7.964 8.211 8.447 8.777 9.097 9.391 9.744 10.082 10.4 10.79 11.24 11.644 12.058 12.488 12.935 13.394 13.911 14.519 15.103 15.725 16.347 17.019 17.719 18.426 19.198 19.838 19.874 19.558 19.166 18.768 18.307 17.835 17.382 16.983 16.579 16.239 15.94 15.669 15.401 15.132 14.886 14.624 14.387 14.174 13.926 13.674 13.48 13.262 13.025 12.842 12.651 12.449 12.241 12.045 11.914 11.766 11.526 11.361 11.178 11.085 10.894 10.684 10.453 10.336 10.045 9.978 9.841 9.694 9.375 9.202 9.015 8.818 8.577 8.269 7.947 6.224 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_60_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_60_63.txt deleted file mode 100644 index c9f495fc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_60_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32431 ,TETRA ,17559210,Sat Nov 27 05:36:49 CET,Sat Nov 27 07:34:52 CET,0.0 1.128 1.464 1.705 1.899 2.053 2.185 2.303 2.524 2.631 2.74 2.755 3.049 3.154 3.332 3.503 3.661 3.735 3.867 3.995 4.2 4.34 4.463 4.626 4.782 4.946 5.112 5.248 5.422 5.601 5.77 5.957 6.125 6.295 6.503 6.725 6.906 7.088 7.288 7.518 7.758 8.005 8.271 8.493 8.695 8.913 9.208 9.462 9.6 9.634 9.298 8.53 7.739 6.968 6.295 5.731 5.193 4.664 4.198 3.747 3.34 2.961 2.61 2.278 1.977 1.706 1.425 1.165 0.942 0.718 0.489 0.298 0.093 -0.122 -0.298 -0.485 -0.675 -0.862 -1.052 -1.19 -1.331 -1.543 -1.697 -1.851 -1.93 -2.116 -2.327 -2.527 -2.625 -2.915 -2.919 -3.031 -3.147 -3.403 -3.552 -3.696 -3.837 -4.029 -4.276 -4.607 -5.382 -2 ,26868 ,TETRA ,17559211,Sat Nov 27 05:36:49 CET,Sat Nov 27 07:34:39 CET,0.0 0.998 1.435 1.714 1.961 2.207 2.461 2.65 2.921 3.053 3.176 3.212 3.499 3.596 3.784 3.957 4.12 4.204 4.363 4.508 4.726 4.861 4.99 5.18 5.359 5.532 5.688 5.836 6.022 6.191 6.349 6.53 6.705 6.876 7.075 7.298 7.501 7.715 7.929 8.152 8.386 8.609 8.858 9.08 9.295 9.489 9.68 9.889 10.065 10.084 9.713 8.957 8.171 7.422 6.745 6.134 5.577 5.04 4.564 4.084 3.686 3.334 3.006 2.704 2.418 2.149 1.863 1.599 1.358 1.11 0.869 0.678 0.48 0.273 0.117 -0.052 -0.239 -0.436 -0.647 -0.793 -0.926 -1.118 -1.254 -1.398 -1.474 -1.638 -1.816 -2.009 -2.114 -2.416 -2.476 -2.587 -2.697 -2.969 -3.109 -3.257 -3.415 -3.574 -3.786 -4.147 -4.937 -3 ,26757 ,TETRA ,17559212,Sat Nov 27 05:37:49 CET,Sat Nov 27 07:36:45 CET,0.0 0.863 1.22 1.476 1.648 1.796 1.963 2.12 2.39 2.524 2.655 2.707 2.989 3.074 3.265 3.451 3.632 3.715 3.862 4.021 4.255 4.388 4.527 4.742 4.925 5.083 5.231 5.39 5.615 5.817 5.996 6.215 6.417 6.601 6.816 7.053 7.254 7.449 7.659 7.876 8.105 8.375 8.702 9.008 9.273 9.496 9.713 9.907 10.006 9.97 9.559 8.706 7.865 7.096 6.415 5.779 5.204 4.675 4.223 3.76 3.344 2.969 2.594 2.227 1.886 1.594 1.305 1.033 0.793 0.538 0.261 0.036 -0.197 -0.44 -0.614 -0.792 -0.989 -1.186 -1.377 -1.511 -1.671 -1.946 -2.126 -2.303 -2.392 -2.575 -2.767 -2.973 -3.073 -3.369 -3.412 -3.536 -3.664 -3.973 -4.131 -4.305 -4.485 -4.657 -4.851 -5.14 -5.936 -4 ,4225 ,TETRA ,17559213,Sat Nov 27 05:37:46 CET,Sat Nov 27 07:36:18 CET,0.0 0.966 1.368 1.667 1.922 2.146 2.341 2.519 2.862 3.009 3.145 3.221 3.534 3.647 3.874 4.067 4.241 4.328 4.5 4.669 4.905 5.05 5.189 5.403 5.601 5.774 5.935 6.095 6.289 6.468 6.636 6.823 7.007 7.185 7.368 7.57 7.772 7.989 8.227 8.487 8.758 9.055 9.367 9.641 9.944 10.235 10.473 10.656 10.739 10.623 10.18 9.404 8.554 7.767 7.057 6.394 5.833 5.332 4.894 4.473 4.092 3.743 3.394 3.051 2.74 2.467 2.186 1.929 1.717 1.498 1.251 1.027 0.802 0.585 0.412 0.236 0.062 -0.119 -0.303 -0.426 -0.559 -0.779 -0.927 -1.073 -1.152 -1.317 -1.49 -1.687 -1.785 -2.067 -2.085 -2.202 -2.325 -2.604 -2.747 -2.885 -3.043 -3.217 -3.431 -3.756 -4.795 -5 ,22761 ,TETRA ,17559214,Sat Nov 27 05:38:46 CET,Sat Nov 27 07:25:57 CET,0.0 0.851 1.258 1.587 1.811 1.997 2.167 2.336 2.629 2.752 2.866 2.9 3.197 3.313 3.51 3.693 3.866 3.947 4.109 4.259 4.468 4.595 4.716 4.883 5.049 5.205 5.363 5.523 5.74 5.95 6.122 6.322 6.508 6.674 6.854 7.051 7.233 7.416 7.634 7.846 8.049 8.296 8.567 8.806 9.041 9.268 9.482 9.638 9.736 9.661 9.102 8.176 7.325 6.555 5.846 5.188 4.602 4.062 3.593 3.096 2.673 2.318 1.98 1.646 1.338 1.075 0.808 0.574 0.371 0.155 -0.095 -0.306 -0.502 -0.708 -0.865 -1.027 -1.206 -1.396 -1.591 -1.723 -1.861 -2.083 -2.235 -2.392 -2.478 -2.654 -2.826 -2.996 -3.092 -3.391 -3.418 -3.521 -3.634 -3.864 -3.988 -4.142 -4.328 -4.531 -4.753 -5.067 -5.882 -6 ,30926 ,TETRA ,17559215,Sat Nov 27 05:38:46 CET,Sat Nov 27 07:40:14 CET,0.0 0.981 1.265 1.511 1.722 1.897 2.065 2.212 2.498 2.627 2.724 2.734 3.005 3.103 3.305 3.487 3.656 3.74 3.895 4.021 4.181 4.284 4.405 4.588 4.747 4.904 5.048 5.179 5.36 5.54 5.714 5.908 6.08 6.243 6.435 6.645 6.848 7.079 7.332 7.582 7.828 8.067 8.306 8.519 8.747 8.983 9.18 9.351 9.478 9.396 8.88 8.029 7.199 6.427 5.726 5.048 4.441 3.902 3.435 2.945 2.534 2.19 1.856 1.529 1.226 0.944 0.645 0.389 0.165 -0.062 -0.305 -0.515 -0.719 -0.926 -1.084 -1.252 -1.429 -1.599 -1.776 -1.902 -2.028 -2.239 -2.399 -2.554 -2.63 -2.796 -2.975 -3.167 -3.271 -3.573 -3.595 -3.715 -3.833 -4.073 -4.202 -4.339 -4.506 -4.702 -4.922 -5.182 -5.8 -7 ,4155 ,TETRA ,17559216,Sat Nov 27 05:39:48 CET,Sat Nov 27 07:42:37 CET,0.0 0.684 0.918 1.12 1.289 1.428 1.562 1.696 1.931 2.041 2.155 2.167 2.436 2.527 2.701 2.875 3.046 3.125 3.262 3.395 3.588 3.698 3.801 3.953 4.088 4.23 4.378 4.52 4.71 4.882 5.042 5.226 5.403 5.569 5.769 5.993 6.2 6.427 6.647 6.862 7.077 7.299 7.534 7.773 8.043 8.292 8.52 8.684 8.783 8.742 8.279 7.416 6.555 5.81 5.116 4.447 3.865 3.34 2.889 2.449 2.055 1.693 1.349 1.031 0.733 0.449 0.166 -0.079 -0.306 -0.548 -0.803 -1.015 -1.227 -1.441 -1.601 -1.773 -1.964 -2.155 -2.348 -2.484 -2.612 -2.806 -2.951 -3.106 -3.186 -3.348 -3.512 -3.688 -3.78 -4.063 -4.082 -4.196 -4.319 -4.593 -4.742 -4.895 -5.065 -5.234 -5.449 -5.787 -6.568 -8 ,29970 ,TETRA ,17559217,Sat Nov 27 05:39:48 CET,Sat Nov 27 07:25:00 CET,0.0 0.804 1.11 1.382 1.585 1.76 1.918 2.038 2.261 2.377 2.488 2.514 2.793 2.877 3.042 3.212 3.37 3.441 3.573 3.713 3.919 4.038 4.16 4.338 4.508 4.675 4.838 4.998 5.201 5.399 5.591 5.816 6.025 6.207 6.409 6.645 6.859 7.066 7.278 7.483 7.679 7.898 8.172 8.433 8.681 8.917 9.144 9.31 9.431 9.401 8.924 8.054 7.18 6.342 5.602 4.975 4.437 3.916 3.457 3.02 2.65 2.312 1.971 1.633 1.323 1.041 0.746 0.494 0.278 0.043 -0.192 -0.4 -0.626 -0.849 -1.02 -1.19 -1.376 -1.564 -1.747 -1.876 -2.011 -2.232 -2.38 -2.531 -2.616 -2.794 -2.985 -3.168 -3.252 -3.539 -3.575 -3.693 -3.812 -4.073 -4.227 -4.397 -4.58 -4.79 -5.029 -5.344 -6.081 -9 ,7757 ,TETRA ,17559218,Sat Nov 27 05:41:46 CET,Sat Nov 27 07:43:02 CET,0.0 1.122 1.45 1.691 1.874 2.037 2.199 2.363 2.627 2.746 2.879 2.939 3.218 3.298 3.459 3.626 3.787 3.865 4.005 4.136 4.327 4.456 4.574 4.741 4.91 5.077 5.231 5.373 5.548 5.703 5.852 6.022 6.183 6.348 6.538 6.761 6.971 7.19 7.401 7.616 7.847 8.066 8.301 8.534 8.776 9.039 9.324 9.531 9.625 9.555 9.058 8.158 7.317 6.512 5.78 5.136 4.585 4.093 3.658 3.21 2.806 2.446 2.11 1.803 1.518 1.243 0.957 0.719 0.504 0.269 0.042 -0.143 -0.344 -0.559 -0.725 -0.889 -1.061 -1.245 -1.435 -1.561 -1.696 -1.909 -2.052 -2.203 -2.283 -2.449 -2.644 -2.861 -2.968 -3.256 -3.272 -3.386 -3.506 -3.751 -3.883 -4.042 -4.212 -4.399 -4.629 -4.941 -5.693 -10 ,31291 ,TETRA ,17559219,Sat Nov 27 05:41:46 CET,Sat Nov 27 07:42:09 CET,0.0 1.012 1.341 1.603 1.875 2.121 2.324 2.495 2.817 2.959 3.084 3.129 3.425 3.538 3.731 3.891 4.042 4.116 4.262 4.403 4.618 4.758 4.885 5.059 5.225 5.376 5.531 5.685 5.886 6.084 6.269 6.471 6.65 6.823 7.025 7.251 7.453 7.654 7.867 8.086 8.301 8.549 8.802 9.012 9.259 9.509 9.705 9.843 9.932 9.888 9.517 8.701 7.787 6.943 6.204 5.533 4.946 4.438 3.993 3.543 3.141 2.783 2.455 2.136 1.831 1.547 1.249 0.983 0.747 0.507 0.261 0.051 -0.159 -0.366 -0.528 -0.698 -0.875 -1.066 -1.272 -1.407 -1.546 -1.769 -1.924 -2.087 -2.169 -2.331 -2.496 -2.674 -2.777 -3.073 -3.13 -3.254 -3.379 -3.657 -3.794 -3.944 -4.136 -4.355 -4.618 -4.963 -5.839 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_60_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_60_65.txt deleted file mode 100644 index c694cb83..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_60_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19108 ,TETRA ,17559220,Sat Nov 27 05:41:49 CET,Sat Nov 27 07:41:32 CET,0.0 0.98 1.36 1.641 1.848 2.024 2.192 2.344 2.616 2.746 2.86 2.894 3.174 3.268 3.465 3.634 3.793 3.875 4.034 4.18 4.388 4.526 4.648 4.818 4.988 5.145 5.317 5.488 5.695 5.894 6.077 6.282 6.472 6.657 6.87 7.107 7.324 7.577 7.86 8.112 8.329 8.573 8.863 9.155 9.452 9.712 9.954 10.153 10.267 10.208 9.867 9.224 8.471 7.718 7.05 6.46 5.958 5.479 5.036 4.577 4.17 3.8 3.45 3.126 2.819 2.531 2.24 1.982 1.764 1.549 1.311 1.109 0.898 0.674 0.503 0.33 0.154 -0.037 -0.226 -0.356 -0.494 -0.708 -0.871 -1.048 -1.138 -1.32 -1.501 -1.691 -1.794 -2.088 -2.111 -2.217 -2.34 -2.646 -2.811 -2.963 -3.124 -3.337 -3.627 -4.025 -4.906 -2 ,2740 ,TETRA ,17559221,Sat Nov 27 05:43:47 CET,Sat Nov 27 07:40:04 CET,0.0 0.999 1.352 1.611 1.814 1.998 2.181 2.345 2.618 2.757 2.891 2.92 3.211 3.307 3.485 3.67 3.836 3.91 4.058 4.2 4.406 4.537 4.674 4.858 5.01 5.159 5.304 5.451 5.642 5.823 5.991 6.19 6.383 6.574 6.784 6.989 7.182 7.395 7.619 7.866 8.123 8.409 8.708 8.976 9.268 9.547 9.795 10.003 10.162 10.196 9.86 9.156 8.46 7.791 7.166 6.569 6.022 5.519 5.07 4.617 4.214 3.841 3.478 3.167 2.901 2.631 2.328 2.058 1.837 1.612 1.356 1.151 0.95 0.724 0.553 0.38 0.195 0.002 -0.206 -0.344 -0.483 -0.702 -0.863 -1.039 -1.121 -1.289 -1.48 -1.687 -1.795 -2.091 -2.113 -2.225 -2.366 -2.702 -2.874 -3.053 -3.24 -3.453 -3.682 -3.942 -4.668 -3 ,27186 ,TETRA ,17559222,Sat Nov 27 05:43:50 CET,Sat Nov 27 07:39:47 CET,0.0 0.869 1.186 1.436 1.671 1.885 2.054 2.201 2.487 2.613 2.731 2.765 3.072 3.184 3.399 3.591 3.774 3.867 4.052 4.214 4.422 4.557 4.689 4.868 5.02 5.17 5.335 5.492 5.685 5.873 6.061 6.279 6.48 6.674 6.896 7.13 7.348 7.583 7.831 8.089 8.347 8.623 8.911 9.172 9.455 9.749 10.01 10.235 10.465 10.562 10.258 9.543 8.798 8.089 7.451 6.856 6.306 5.794 5.335 4.883 4.483 4.112 3.76 3.446 3.156 2.886 2.616 2.371 2.145 1.905 1.659 1.461 1.255 1.035 0.867 0.701 0.534 0.359 0.172 0.039 -0.097 -0.301 -0.448 -0.609 -0.695 -0.866 -1.054 -1.251 -1.347 -1.633 -1.666 -1.785 -1.916 -2.211 -2.353 -2.504 -2.688 -2.893 -3.13 -3.427 -4.31 -4 ,22727 ,TETRA ,17559223,Sat Nov 27 05:43:47 CET,Sat Nov 27 07:41:30 CET,0.0 1.38 1.782 2.028 2.232 2.42 2.597 2.76 3.04 3.174 3.31 3.369 3.669 3.783 3.979 4.151 4.294 4.365 4.511 4.643 4.832 4.957 5.08 5.262 5.433 5.601 5.759 5.908 6.097 6.278 6.452 6.662 6.869 7.063 7.267 7.472 7.666 7.871 8.096 8.335 8.566 8.824 9.103 9.352 9.635 9.912 10.143 10.332 10.481 10.507 10.214 9.509 8.695 7.91 7.218 6.583 6.019 5.501 5.047 4.58 4.189 3.847 3.515 3.202 2.908 2.637 2.351 2.105 1.897 1.671 1.431 1.234 1.025 0.799 0.635 0.469 0.289 0.104 -0.103 -0.247 -0.384 -0.608 -0.759 -0.922 -1.01 -1.194 -1.383 -1.572 -1.672 -1.966 -1.998 -2.113 -2.234 -2.47 -2.592 -2.74 -2.93 -3.139 -3.367 -3.702 -5.048 -5 ,11354 ,TETRA ,17559224,Sat Nov 27 05:44:47 CET,Sat Nov 27 07:41:03 CET,0.0 0.779 1.069 1.277 1.46 1.651 1.824 1.984 2.265 2.389 2.515 2.558 2.846 2.952 3.147 3.327 3.496 3.576 3.728 3.87 4.061 4.18 4.309 4.495 4.661 4.825 4.979 5.118 5.299 5.479 5.66 5.894 6.106 6.289 6.525 6.824 7.062 7.258 7.468 7.679 7.887 8.126 8.394 8.655 8.962 9.29 9.6 9.847 10.027 10.077 9.787 9.048 8.269 7.561 6.933 6.344 5.764 5.229 4.764 4.293 3.895 3.53 3.182 2.866 2.57 2.304 2.026 1.776 1.561 1.335 1.106 0.922 0.724 0.508 0.336 0.16 -0.026 -0.223 -0.42 -0.558 -0.711 -0.954 -1.104 -1.261 -1.349 -1.528 -1.71 -1.911 -2.02 -2.331 -2.386 -2.515 -2.65 -2.949 -3.109 -3.271 -3.441 -3.626 -3.846 -4.164 -5.152 -6 ,6240 ,TETRA ,17559225,Sat Nov 27 05:44:49 CET,Sat Nov 27 07:41:47 CET,0.0 0.696 1.01 1.267 1.474 1.645 1.811 1.976 2.247 2.368 2.488 2.539 2.834 2.945 3.14 3.32 3.5 3.585 3.751 3.898 4.101 4.223 4.34 4.517 4.697 4.876 5.042 5.189 5.372 5.562 5.753 5.969 6.162 6.344 6.549 6.779 7.006 7.239 7.465 7.698 7.939 8.203 8.5 8.754 9.021 9.292 9.562 9.821 9.992 9.977 9.645 8.88 8.076 7.331 6.657 6.043 5.485 4.989 4.563 4.123 3.746 3.394 3.042 2.722 2.415 2.121 1.826 1.577 1.357 1.116 0.857 0.65 0.433 0.209 0.048 -0.119 -0.294 -0.468 -0.647 -0.779 -0.922 -1.149 -1.306 -1.469 -1.561 -1.756 -1.951 -2.158 -2.263 -2.561 -2.639 -2.771 -2.907 -3.183 -3.33 -3.508 -3.713 -3.929 -4.181 -4.497 -5.799 -7 ,19036 ,TETRA ,17559226,Sat Nov 27 05:44:51 CET,Sat Nov 27 07:42:06 CET,0.0 1.009 1.349 1.626 1.861 2.074 2.259 2.427 2.714 2.838 2.97 3.047 3.348 3.451 3.652 3.848 4.03 4.106 4.253 4.407 4.632 4.766 4.901 5.104 5.278 5.429 5.575 5.716 5.891 6.063 6.238 6.444 6.629 6.806 7.009 7.222 7.425 7.636 7.859 8.103 8.34 8.599 8.874 9.122 9.404 9.688 9.963 10.185 10.325 10.343 10.005 9.301 8.523 7.786 7.143 6.544 5.967 5.416 4.948 4.486 4.102 3.759 3.433 3.115 2.817 2.543 2.255 2.001 1.782 1.551 1.311 1.106 0.88 0.65 0.477 0.303 0.117 -0.074 -0.274 -0.419 -0.566 -0.784 -0.933 -1.098 -1.182 -1.344 -1.521 -1.716 -1.815 -2.102 -2.166 -2.295 -2.427 -2.711 -2.86 -3.013 -3.169 -3.364 -3.592 -3.952 -5.11 -8 ,7019 ,TETRA ,17559227,Sat Nov 27 05:44:47 CET,Sat Nov 27 07:41:05 CET,0.0 0.633 0.955 1.223 1.442 1.601 1.727 1.858 2.118 2.232 2.344 2.386 2.676 2.773 2.947 3.122 3.296 3.383 3.559 3.728 3.95 4.079 4.205 4.394 4.568 4.717 4.868 5.02 5.206 5.388 5.571 5.771 5.951 6.132 6.342 6.574 6.78 6.993 7.231 7.463 7.697 7.956 8.237 8.495 8.769 9.056 9.338 9.574 9.725 9.696 9.363 8.636 7.85 7.123 6.472 5.876 5.349 4.866 4.43 3.98 3.585 3.233 2.907 2.592 2.292 2.027 1.752 1.482 1.25 1.018 0.763 0.549 0.341 0.143 -0.018 -0.202 -0.382 -0.555 -0.738 -0.868 -1.004 -1.213 -1.361 -1.52 -1.598 -1.764 -1.951 -2.136 -2.239 -2.552 -2.595 -2.7 -2.822 -3.084 -3.218 -3.39 -3.585 -3.813 -4.101 -4.463 -5.265 -9 ,15196 ,TETRA ,17559228,Sat Nov 27 05:44:50 CET,Sat Nov 27 07:40:48 CET,0.0 0.851 1.228 1.518 1.726 1.892 2.044 2.194 2.47 2.616 2.753 2.794 3.082 3.176 3.363 3.531 3.702 3.79 3.949 4.094 4.286 4.406 4.532 4.734 4.921 5.102 5.272 5.436 5.646 5.84 6.024 6.243 6.439 6.616 6.839 7.086 7.297 7.524 7.771 8.033 8.303 8.59 8.9 9.206 9.537 9.866 10.184 10.48 10.722 10.783 10.448 9.669 8.861 8.14 7.47 6.812 6.22 5.683 5.229 4.765 4.358 4.0 3.665 3.337 3.029 2.76 2.467 2.191 1.961 1.734 1.483 1.262 1.046 0.833 0.648 0.451 0.271 0.088 -0.121 -0.268 -0.41 -0.634 -0.796 -0.971 -1.063 -1.248 -1.444 -1.639 -1.736 -2.032 -2.059 -2.17 -2.294 -2.557 -2.709 -2.88 -3.045 -3.219 -3.437 -3.708 -4.54 -10 ,21017 ,TETRA ,17559229,Sat Nov 27 05:44:47 CET,Sat Nov 27 07:41:21 CET,0.0 0.991 1.492 1.879 2.206 2.501 2.73 2.928 3.303 3.485 3.651 3.735 4.037 4.154 4.361 4.548 4.724 4.811 4.989 5.142 5.34 5.47 5.593 5.778 5.946 6.092 6.245 6.396 6.584 6.75 6.919 7.138 7.34 7.528 7.743 7.979 8.217 8.465 8.688 8.936 9.201 9.454 9.71 9.964 10.234 10.503 10.788 11.04 11.211 11.241 10.915 10.186 9.393 8.636 7.956 7.315 6.744 6.221 5.774 5.343 4.95 4.583 4.239 3.925 3.625 3.353 3.075 2.828 2.603 2.369 2.13 1.926 1.713 1.495 1.325 1.142 0.955 0.773 0.594 0.469 0.331 0.109 -0.053 -0.23 -0.317 -0.493 -0.69 -0.894 -0.992 -1.273 -1.294 -1.402 -1.519 -1.778 -1.916 -2.082 -2.309 -2.54 -2.789 -3.079 -3.908 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_61_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_61_50.txt deleted file mode 100644 index a38cd021..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_61_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30293 ,KEBNE ,17024847,Wed Dec 22 11:16:59 CET,Wed Dec 22 12:57:25 CET,0.0 1.456 1.792 2.042 2.258 2.443 2.615 2.77 3.054 3.188 3.324 3.394 3.686 3.799 4.019 4.226 4.414 4.506 4.698 4.876 5.113 5.261 5.404 5.614 5.811 5.987 6.158 6.338 6.585 6.822 7.048 7.318 7.57 7.807 8.088 8.397 8.682 8.994 9.313 9.643 9.991 10.401 10.862 11.281 11.739 12.213 12.742 13.367 14.018 14.635 15.121 15.069 14.729 14.243 13.731 13.274 12.821 12.371 11.958 11.521 11.123 10.751 10.365 9.985 9.629 9.298 8.968 8.687 8.45 8.187 7.891 7.66 7.427 7.174 6.966 6.75 6.535 6.301 6.036 5.858 5.681 5.394 5.187 4.969 4.86 4.643 4.42 4.193 4.067 3.748 3.641 3.494 3.344 3.001 2.805 2.601 2.366 2.1 1.803 1.405 0.447 -2 ,28736 ,KEBNE ,17024848,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:56:33 CET,0.0 0.937 1.288 1.562 1.789 1.985 2.17 2.339 2.617 2.754 2.892 2.965 3.275 3.398 3.621 3.822 3.998 4.083 4.254 4.419 4.67 4.831 4.978 5.178 5.386 5.589 5.779 5.968 6.214 6.458 6.684 6.953 7.211 7.454 7.718 8.01 8.299 8.616 8.954 9.285 9.637 10.026 10.475 10.945 11.451 11.954 12.532 13.111 13.671 14.24 14.624 14.567 14.225 13.754 13.179 12.605 12.095 11.564 11.115 10.664 10.203 9.819 9.495 9.168 8.848 8.538 8.2 7.903 7.64 7.346 7.038 6.774 6.5 6.235 6.029 5.8 5.559 5.32 5.065 4.892 4.708 4.41 4.209 3.991 3.877 3.658 3.432 3.181 3.04 2.714 2.571 2.411 2.253 1.886 1.679 1.473 1.255 1.004 0.698 0.299 -0.619 -3 ,18311 ,KEBNE ,17024849,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:56:53 CET,0.0 0.882 1.224 1.47 1.668 1.846 1.998 2.134 2.385 2.504 2.616 2.661 2.957 3.067 3.282 3.471 3.66 3.754 3.926 4.091 4.334 4.487 4.631 4.838 5.048 5.253 5.455 5.643 5.879 6.121 6.343 6.606 6.853 7.074 7.342 7.665 7.964 8.266 8.566 8.882 9.226 9.61 10.052 10.48 10.984 11.571 12.193 12.795 13.394 13.939 14.304 14.193 13.818 13.378 12.856 12.282 11.754 11.271 10.831 10.369 9.976 9.614 9.259 8.941 8.633 8.344 8.03 7.712 7.446 7.172 6.866 6.621 6.357 6.082 5.878 5.66 5.428 5.184 4.939 4.768 4.595 4.344 4.169 3.974 3.871 3.658 3.42 3.176 3.046 2.727 2.627 2.471 2.312 1.988 1.797 1.562 1.303 1.046 0.77 0.404 -0.659 -4 ,2184 ,KEBNE ,17024850,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:56:59 CET,0.0 0.784 1.175 1.486 1.727 1.937 2.117 2.288 2.631 2.78 2.919 2.987 3.294 3.41 3.623 3.822 4.009 4.099 4.278 4.451 4.7 4.858 5.006 5.211 5.424 5.629 5.802 5.972 6.2 6.417 6.629 6.891 7.133 7.368 7.644 7.947 8.231 8.544 8.895 9.253 9.604 9.991 10.417 10.831 11.331 11.865 12.381 12.913 13.495 14.056 14.433 14.349 14.005 13.569 13.119 12.638 12.184 11.731 11.293 10.813 10.387 9.999 9.624 9.27 8.94 8.647 8.315 7.987 7.703 7.425 7.137 6.88 6.618 6.363 6.167 5.97 5.759 5.54 5.311 5.139 4.97 4.715 4.525 4.323 4.218 3.994 3.764 3.537 3.418 3.112 3.022 2.867 2.693 2.354 2.165 1.943 1.701 1.439 1.162 0.82 -0.551 -5 ,12791 ,KEBNE ,17024851,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:57:37 CET,0.0 0.931 1.271 1.566 1.841 2.067 2.241 2.404 2.729 2.883 3.025 3.088 3.386 3.499 3.703 3.886 4.052 4.135 4.322 4.5 4.722 4.873 5.021 5.218 5.413 5.604 5.782 5.965 6.2 6.412 6.622 6.877 7.12 7.358 7.621 7.921 8.212 8.513 8.831 9.17 9.518 9.895 10.334 10.769 11.26 11.763 12.308 12.888 13.454 13.976 14.364 14.3 13.972 13.547 13.093 12.597 12.109 11.665 11.24 10.779 10.361 9.952 9.561 9.204 8.861 8.546 8.207 7.906 7.644 7.373 7.091 6.853 6.619 6.372 6.17 5.959 5.733 5.503 5.247 5.063 4.866 4.565 4.369 4.161 4.05 3.834 3.616 3.353 3.213 2.903 2.793 2.634 2.469 2.102 1.905 1.701 1.467 1.205 0.902 0.482 -0.813 -6 ,12702 ,KEBNE ,17024852,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:56:50 CET,0.0 0.866 1.163 1.434 1.671 1.857 2.04 2.202 2.494 2.633 2.754 2.801 3.087 3.196 3.403 3.589 3.771 3.868 4.061 4.227 4.459 4.608 4.748 4.956 5.173 5.391 5.588 5.764 5.992 6.219 6.444 6.71 6.967 7.23 7.548 7.877 8.167 8.477 8.815 9.185 9.552 9.972 10.474 10.941 11.463 12.031 12.629 13.216 13.792 14.356 14.694 14.564 14.227 13.788 13.272 12.759 12.31 11.852 11.407 10.911 10.464 10.079 9.713 9.343 8.981 8.669 8.348 8.051 7.789 7.518 7.24 6.999 6.741 6.467 6.24 5.997 5.759 5.505 5.219 5.024 4.83 4.527 4.321 4.116 4.007 3.78 3.547 3.282 3.148 2.843 2.756 2.609 2.467 2.108 1.887 1.656 1.394 1.098 0.753 0.325 -1.401 -7 ,22331 ,KEBNE ,17024853,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:57:34 CET,0.0 0.699 1.033 1.28 1.522 1.716 1.886 2.051 2.331 2.47 2.61 2.682 2.996 3.119 3.335 3.535 3.736 3.838 4.034 4.234 4.521 4.691 4.857 5.088 5.291 5.477 5.658 5.838 6.067 6.284 6.491 6.75 7.003 7.227 7.489 7.806 8.11 8.436 8.759 9.085 9.432 9.822 10.263 10.661 11.09 11.575 12.119 12.681 13.269 13.843 14.276 14.266 13.929 13.463 12.983 12.522 12.081 11.616 11.211 10.799 10.421 10.058 9.672 9.295 8.954 8.652 8.327 8.021 7.757 7.492 7.203 6.945 6.677 6.418 6.209 5.986 5.766 5.527 5.28 5.117 4.943 4.658 4.459 4.25 4.141 3.922 3.694 3.445 3.314 2.99 2.863 2.708 2.541 2.167 1.957 1.712 1.444 1.165 0.857 0.528 -0.428 -8 ,25059 ,KEBNE ,17024854,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:56:37 CET,0.0 0.728 1.087 1.359 1.569 1.746 1.908 2.055 2.321 2.444 2.559 2.608 2.912 3.021 3.229 3.435 3.629 3.719 3.903 4.078 4.316 4.473 4.625 4.846 5.052 5.244 5.435 5.615 5.827 6.042 6.261 6.519 6.748 6.961 7.213 7.498 7.77 8.059 8.354 8.677 9.02 9.381 9.82 10.281 10.769 11.267 11.807 12.365 12.961 13.517 13.933 13.967 13.67 13.234 12.75 12.22 11.697 11.224 10.788 10.315 9.897 9.526 9.162 8.797 8.452 8.123 7.777 7.472 7.201 6.93 6.666 6.43 6.161 5.879 5.672 5.46 5.224 4.979 4.734 4.559 4.375 4.107 3.911 3.701 3.596 3.369 3.137 2.903 2.78 2.469 2.369 2.223 2.071 1.711 1.523 1.33 1.112 0.878 0.553 0.129 -0.955 -9 ,12304 ,KEBNE ,17024855,Wed Dec 22 11:16:59 CET,Wed Dec 22 12:57:05 CET,0.0 1.224 1.59 1.902 2.156 2.341 2.504 2.665 2.974 3.103 3.224 3.297 3.599 3.708 3.9 4.083 4.259 4.343 4.511 4.671 4.904 5.049 5.183 5.385 5.583 5.78 5.975 6.161 6.409 6.637 6.839 7.078 7.305 7.529 7.807 8.121 8.409 8.716 9.058 9.427 9.777 10.154 10.6 11.014 11.484 12.003 12.562 13.121 13.675 14.234 14.688 14.637 14.279 13.792 13.248 12.71 12.212 11.742 11.332 10.898 10.497 10.127 9.78 9.433 9.079 8.75 8.392 8.071 7.803 7.515 7.2 6.937 6.681 6.424 6.212 5.981 5.752 5.524 5.277 5.106 4.923 4.612 4.395 4.185 4.08 3.867 3.634 3.368 3.229 2.912 2.813 2.659 2.496 2.133 1.927 1.723 1.496 1.235 0.913 0.467 -0.675 -10 ,1167 ,KEBNE ,17024856,Wed Dec 22 11:17:00 CET,Wed Dec 22 12:56:32 CET,0.0 0.903 1.249 1.498 1.718 1.926 2.139 2.335 2.661 2.798 2.925 3.001 3.313 3.443 3.681 3.879 4.055 4.141 4.318 4.52 4.824 5.01 5.188 5.424 5.639 5.842 6.022 6.194 6.421 6.652 6.904 7.209 7.475 7.703 7.966 8.267 8.566 8.886 9.196 9.535 9.909 10.346 10.828 11.26 11.755 12.251 12.783 13.331 13.859 14.322 14.614 14.474 14.099 13.646 13.169 12.648 12.107 11.603 11.16 10.693 10.282 9.911 9.518 9.14 8.787 8.45 8.117 7.813 7.538 7.246 6.951 6.714 6.453 6.168 5.942 5.706 5.464 5.211 4.938 4.749 4.556 4.258 4.063 3.826 3.702 3.455 3.196 2.926 2.784 2.472 2.352 2.192 2.034 1.689 1.489 1.273 1.03 0.743 0.383 -0.039 -1.047 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_61_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_61_65.txt deleted file mode 100644 index 8f040bad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_61_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5019 ,TETRA ,17559230,Sat Nov 27 05:45:47 CET,Sat Nov 27 07:44:03 CET,0.0 1.861 2.327 2.721 3.074 3.315 3.556 3.775 4.129 4.304 4.49 4.644 4.966 5.095 5.348 5.576 5.781 5.876 6.062 6.25 6.498 6.65 6.8 7.014 7.219 7.412 7.595 7.77 7.988 8.188 8.374 8.608 8.826 9.018 9.247 9.515 9.777 10.062 10.367 10.661 10.934 11.21 11.474 11.736 12.015 12.262 12.473 12.599 12.595 12.322 11.548 10.275 9.003 7.826 6.836 5.917 5.064 4.301 3.644 2.977 2.418 1.902 1.405 0.95 0.508 0.116 -0.276 -0.656 -1.007 -1.37 -1.744 -2.055 -2.38 -2.727 -2.995 -3.259 -3.526 -3.81 -4.121 -4.34 -4.553 -4.895 -5.157 -5.431 -5.564 -5.835 -6.124 -6.447 -6.618 -6.981 -7.147 -7.341 -7.567 -8.045 -8.305 -8.601 -8.901 -9.201 -9.626 -10.253 -12.782 -2 ,328 ,TETRA ,17559231,Sat Nov 27 05:45:47 CET,Sat Nov 27 07:42:36 CET,0.0 2.18 2.709 3.083 3.389 3.679 3.928 4.143 4.518 4.685 4.841 4.959 5.284 5.425 5.681 5.909 6.14 6.249 6.447 6.624 6.872 7.043 7.216 7.453 7.681 7.908 8.115 8.301 8.55 8.798 9.035 9.309 9.55 9.774 10.018 10.293 10.564 10.877 11.237 11.586 11.895 12.19 12.514 12.846 13.23 13.591 13.879 14.162 14.467 14.571 14.193 13.202 12.106 11.073 10.084 9.143 8.302 7.54 6.875 6.205 5.596 5.029 4.493 3.984 3.523 3.106 2.663 2.269 1.922 1.55 1.158 0.819 0.478 0.134 -0.137 -0.416 -0.724 -1.059 -1.409 -1.656 -1.916 -2.307 -2.57 -2.848 -2.99 -3.276 -3.579 -3.906 -4.083 -4.467 -4.68 -4.897 -5.131 -5.652 -5.937 -6.236 -6.562 -6.996 -7.5 -8.068 -9.85 -3 ,15067 ,TETRA ,17559232,Sat Nov 27 05:45:47 CET,Sat Nov 27 07:42:27 CET,0.0 1.493 1.92 2.228 2.515 2.737 2.929 3.118 3.492 3.665 3.806 3.888 4.194 4.315 4.555 4.769 4.989 5.098 5.293 5.474 5.744 5.924 6.091 6.335 6.575 6.814 7.035 7.228 7.469 7.696 7.894 8.135 8.386 8.621 8.867 9.13 9.366 9.613 9.871 10.136 10.441 10.821 11.219 11.538 11.86 12.183 12.449 12.621 12.674 12.416 11.555 10.23 8.993 7.856 6.837 5.892 5.028 4.219 3.495 2.751 2.097 1.51 0.956 0.426 -0.061 -0.501 -0.976 -1.41 -1.795 -2.199 -2.624 -2.964 -3.306 -3.669 -3.959 -4.276 -4.603 -4.932 -5.284 -5.527 -5.774 -6.161 -6.437 -6.728 -6.877 -7.168 -7.483 -7.816 -7.985 -8.367 -8.562 -8.773 -8.992 -9.475 -9.759 -10.057 -10.405 -10.766 -11.226 -11.885 -14.519 -4 ,6480 ,TETRA ,17559233,Sat Nov 27 05:45:47 CET,Sat Nov 27 07:42:45 CET,0.0 3.133 3.607 3.961 4.321 4.62 4.85 5.041 5.419 5.6 5.775 5.894 6.204 6.334 6.591 6.838 7.073 7.184 7.386 7.572 7.835 7.997 8.169 8.427 8.651 8.87 9.089 9.29 9.548 9.801 10.021 10.298 10.57 10.816 11.099 11.399 11.667 11.949 12.239 12.535 12.827 13.129 13.479 13.808 14.147 14.463 14.763 15.032 15.191 15.116 14.563 13.462 12.317 11.252 10.301 9.419 8.632 7.892 7.216 6.531 5.942 5.423 4.906 4.409 3.967 3.567 3.128 2.724 2.377 2.023 1.653 1.33 0.987 0.64 0.373 0.09 -0.202 -0.499 -0.821 -1.054 -1.3 -1.688 -1.954 -2.224 -2.361 -2.654 -2.968 -3.308 -3.486 -3.858 -4.067 -4.273 -4.492 -5.005 -5.283 -5.574 -5.921 -6.296 -6.734 -7.373 -9.18 -5 ,14420 ,TETRA ,17559234,Sat Nov 27 05:46:49 CET,Sat Nov 27 07:43:19 CET,0.0 2.003 2.498 2.855 3.104 3.329 3.541 3.745 4.108 4.275 4.437 4.54 4.847 4.972 5.193 5.392 5.58 5.674 5.866 6.048 6.286 6.432 6.576 6.783 6.984 7.178 7.37 7.565 7.825 8.075 8.298 8.55 8.789 9.008 9.236 9.473 9.68 9.888 10.12 10.386 10.671 10.975 11.305 11.616 11.927 12.228 12.557 12.805 12.914 12.96 12.647 11.753 10.755 9.768 8.749 7.771 6.954 6.221 5.563 4.888 4.289 3.721 3.19 2.711 2.274 1.872 1.441 1.05 0.715 0.371 0.003 -0.308 -0.625 -0.955 -1.231 -1.51 -1.79 -2.085 -2.4 -2.615 -2.834 -3.186 -3.438 -3.709 -3.848 -4.148 -4.477 -4.8 -4.969 -5.346 -5.559 -5.764 -5.974 -6.436 -6.701 -7.0 -7.313 -7.669 -8.098 -8.681 -10.311 -6 ,1488 ,TETRA ,17559235,Sat Nov 27 05:46:51 CET,Sat Nov 27 07:43:02 CET,0.0 1.457 1.949 2.308 2.588 2.812 3.035 3.247 3.58 3.714 3.86 3.97 4.283 4.404 4.636 4.861 5.074 5.172 5.352 5.533 5.807 5.989 6.15 6.382 6.61 6.801 6.982 7.152 7.375 7.6 7.812 8.07 8.313 8.547 8.82 9.101 9.361 9.643 9.93 10.215 10.502 10.829 11.189 11.532 11.903 12.244 12.535 12.746 12.858 12.769 12.2 11.176 10.081 9.0 8.021 7.137 6.356 5.608 4.937 4.283 3.729 3.227 2.724 2.218 1.738 1.295 0.825 0.414 0.058 -0.311 -0.682 -1.0 -1.338 -1.68 -1.95 -2.233 -2.535 -2.849 -3.18 -3.411 -3.635 -3.977 -4.229 -4.488 -4.616 -4.906 -5.22 -5.539 -5.714 -6.087 -6.259 -6.443 -6.648 -7.097 -7.348 -7.615 -7.934 -8.307 -8.716 -9.23 -10.826 -7 ,31805 ,TETRA ,17559236,Sat Nov 27 05:46:49 CET,Sat Nov 27 07:43:33 CET,0.0 2.466 3.089 3.528 3.853 4.11 4.33 4.545 4.907 5.058 5.21 5.301 5.605 5.723 5.934 6.138 6.344 6.438 6.609 6.771 6.998 7.145 7.287 7.49 7.688 7.89 8.079 8.243 8.462 8.687 8.889 9.119 9.323 9.51 9.754 10.019 10.252 10.515 10.801 11.091 11.359 11.653 11.996 12.322 12.674 13.018 13.355 13.655 13.829 13.706 13.069 11.905 10.733 9.602 8.608 7.674 6.815 6.063 5.415 4.74 4.154 3.63 3.124 2.657 2.205 1.769 1.304 0.894 0.547 0.186 -0.197 -0.517 -0.852 -1.192 -1.462 -1.748 -2.034 -2.335 -2.662 -2.896 -3.14 -3.509 -3.752 -4.006 -4.137 -4.407 -4.688 -4.973 -5.116 -5.46 -5.616 -5.805 -6.0 -6.406 -6.616 -6.852 -7.112 -7.397 -7.805 -8.442 -11.511 -8 ,14814 ,TETRA ,17559237,Sat Nov 27 05:46:49 CET,Sat Nov 27 07:44:08 CET,0.0 1.403 1.839 2.187 2.482 2.722 2.943 3.203 3.714 3.919 4.094 4.207 4.517 4.642 4.889 5.123 5.343 5.447 5.643 5.832 6.1 6.257 6.407 6.609 6.799 6.994 7.18 7.348 7.563 7.78 7.993 8.254 8.507 8.734 8.984 9.259 9.505 9.76 10.028 10.306 10.6 10.915 11.253 11.59 11.932 12.239 12.526 12.742 12.866 12.768 12.189 11.112 10.008 9.042 8.183 7.365 6.635 5.96 5.379 4.781 4.232 3.741 3.254 2.787 2.371 1.998 1.627 1.299 0.998 0.667 0.323 0.047 -0.239 -0.541 -0.769 -1.002 -1.247 -1.503 -1.783 -1.988 -2.194 -2.511 -2.741 -2.972 -3.09 -3.341 -3.591 -3.862 -4.005 -4.332 -4.456 -4.615 -4.769 -5.117 -5.312 -5.521 -5.769 -6.076 -6.419 -6.876 -8.606 -9 ,10278 ,TETRA ,17559238,Sat Nov 27 05:46:51 CET,Sat Nov 27 07:43:45 CET,0.0 1.569 2.008 2.327 2.598 2.835 3.044 3.242 3.612 3.776 3.931 4.055 4.385 4.525 4.783 5.026 5.243 5.346 5.54 5.725 6.004 6.168 6.322 6.558 6.779 6.974 7.148 7.32 7.551 7.776 7.991 8.25 8.509 8.747 9.003 9.278 9.533 9.806 10.087 10.397 10.709 11.015 11.369 11.697 12.064 12.457 12.835 13.119 13.302 13.331 12.822 11.733 10.6 9.548 8.639 7.77 6.92 6.104 5.42 4.741 4.131 3.604 3.102 2.605 2.13 1.684 1.226 0.823 0.469 0.1 -0.283 -0.593 -0.914 -1.253 -1.519 -1.813 -2.135 -2.461 -2.787 -3.01 -3.25 -3.62 -3.874 -4.139 -4.273 -4.558 -4.859 -5.16 -5.323 -5.689 -5.87 -6.069 -6.277 -6.761 -7.042 -7.345 -7.676 -8.05 -8.477 -9.087 -10.752 -10 ,27459 ,TETRA ,17559239,Sat Nov 27 05:46:49 CET,Sat Nov 27 07:42:43 CET,0.0 1.561 2.097 2.566 2.889 3.134 3.358 3.555 3.91 4.077 4.234 4.332 4.649 4.776 5.025 5.251 5.465 5.576 5.796 6.006 6.294 6.467 6.628 6.859 7.071 7.274 7.466 7.642 7.862 8.082 8.298 8.556 8.806 9.045 9.322 9.615 9.878 10.149 10.434 10.711 10.974 11.273 11.649 11.997 12.296 12.574 12.823 12.992 13.063 12.906 12.218 11.094 9.965 8.832 7.776 6.818 5.95 5.143 4.465 3.781 3.173 2.623 2.083 1.584 1.113 0.652 0.174 -0.233 -0.578 -0.928 -1.317 -1.652 -1.989 -2.36 -2.647 -2.935 -3.239 -3.552 -3.868 -4.083 -4.31 -4.672 -4.912 -5.158 -5.293 -5.575 -5.866 -6.194 -6.365 -6.719 -6.868 -7.056 -7.261 -7.739 -7.996 -8.268 -8.592 -8.956 -9.374 -9.987 -12.088 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_63_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_63_53.txt deleted file mode 100644 index 80a06d89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_63_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32212 ,TETRA ,17559240,Sat Nov 27 05:46:49 CET,Sat Nov 27 07:44:48 CET,0.0 0.729 1.05 1.298 1.499 1.65 1.774 1.906 2.169 2.276 2.387 2.429 2.731 2.832 3.022 3.191 3.348 3.422 3.567 3.704 3.903 4.039 4.171 4.35 4.52 4.686 4.843 4.999 5.206 5.401 5.58 5.789 5.991 6.176 6.383 6.619 6.853 7.111 7.374 7.628 7.885 8.175 8.514 8.856 9.216 9.608 10.081 10.53 10.936 11.273 11.448 11.232 10.771 10.264 9.751 9.194 8.699 8.255 7.858 7.447 7.052 6.684 6.344 6.011 5.709 5.443 5.149 4.881 4.656 4.425 4.184 3.989 3.789 3.561 3.37 3.168 2.956 2.748 2.544 2.4 2.243 2.005 1.84 1.671 1.585 1.408 1.202 0.956 0.83 0.529 0.507 0.38 0.239 -0.058 -0.219 -0.395 -0.578 -0.804 -1.082 -1.463 -2.62 -2 ,5723 ,TETRA ,17559241,Sat Nov 27 05:47:48 CET,Sat Nov 27 07:45:29 CET,0.0 1.04 1.365 1.597 1.819 2.015 2.197 2.36 2.635 2.767 2.89 2.925 3.206 3.292 3.456 3.613 3.767 3.844 3.991 4.133 4.348 4.477 4.6 4.79 4.958 5.122 5.279 5.421 5.607 5.777 5.932 6.136 6.337 6.514 6.717 6.944 7.151 7.397 7.662 7.915 8.181 8.477 8.819 9.147 9.508 9.885 10.257 10.632 11.017 11.366 11.492 11.141 10.65 10.145 9.637 9.108 8.582 8.088 7.669 7.26 6.92 6.618 6.299 5.993 5.715 5.447 5.166 4.905 4.664 4.401 4.139 3.919 3.685 3.471 3.309 3.128 2.929 2.716 2.502 2.358 2.204 1.959 1.792 1.622 1.53 1.34 1.144 0.921 0.801 0.488 0.413 0.276 0.141 -0.163 -0.334 -0.513 -0.726 -0.984 -1.278 -1.621 -2.542 -3 ,30105 ,TETRA ,17559242,Sat Nov 27 05:47:49 CET,Sat Nov 27 07:45:46 CET,0.0 0.673 0.981 1.203 1.398 1.57 1.718 1.842 2.082 2.193 2.295 2.298 2.581 2.666 2.831 2.99 3.134 3.204 3.341 3.477 3.687 3.811 3.926 4.111 4.282 4.426 4.58 4.736 4.922 5.088 5.248 5.449 5.653 5.857 6.076 6.301 6.509 6.737 6.976 7.239 7.521 7.817 8.163 8.52 8.908 9.274 9.611 9.971 10.352 10.647 10.784 10.504 10.016 9.5 8.945 8.37 7.858 7.369 6.932 6.488 6.106 5.788 5.477 5.178 4.883 4.596 4.294 4.024 3.791 3.538 3.269 3.056 2.83 2.578 2.391 2.198 1.994 1.788 1.57 1.413 1.248 1.0 0.83 0.653 0.56 0.354 0.129 -0.107 -0.226 -0.536 -0.602 -0.743 -0.888 -1.2 -1.379 -1.571 -1.777 -2.007 -2.278 -2.636 -3.648 -4 ,7526 ,TETRA ,17559243,Sat Nov 27 05:47:48 CET,Sat Nov 27 07:46:31 CET,0.0 0.933 1.251 1.494 1.659 1.823 2.01 2.179 2.465 2.583 2.692 2.71 2.997 3.093 3.275 3.44 3.606 3.685 3.834 3.979 4.184 4.307 4.425 4.59 4.744 4.903 5.052 5.179 5.339 5.503 5.667 5.864 6.055 6.242 6.464 6.711 6.929 7.16 7.412 7.661 7.925 8.213 8.536 8.872 9.234 9.596 9.956 10.327 10.71 11.013 11.108 10.795 10.352 9.903 9.394 8.873 8.393 7.913 7.492 7.084 6.729 6.401 6.067 5.737 5.434 5.16 4.889 4.632 4.385 4.132 3.877 3.668 3.44 3.197 3.005 2.798 2.596 2.405 2.185 2.031 1.883 1.64 1.46 1.265 1.175 0.995 0.797 0.58 0.458 0.153 0.122 0.006 -0.119 -0.401 -0.562 -0.762 -0.98 -1.198 -1.474 -1.841 -3.009 -5 ,22312 ,TETRA ,17559244,Sat Nov 27 05:47:49 CET,Sat Nov 27 07:46:28 CET,0.0 1.417 1.7 1.927 2.12 2.268 2.404 2.527 2.751 2.875 2.994 3.012 3.312 3.412 3.605 3.776 3.948 4.032 4.175 4.309 4.518 4.649 4.762 4.925 5.089 5.241 5.383 5.525 5.711 5.879 6.053 6.277 6.484 6.687 6.924 7.167 7.385 7.621 7.881 8.132 8.389 8.686 8.988 9.287 9.651 10.019 10.399 10.789 11.199 11.56 11.807 11.617 11.132 10.626 10.146 9.68 9.223 8.748 8.309 7.883 7.523 7.172 6.816 6.497 6.204 5.935 5.665 5.403 5.16 4.915 4.656 4.426 4.193 3.966 3.78 3.578 3.368 3.153 2.931 2.778 2.612 2.338 2.168 2.004 1.914 1.726 1.517 1.281 1.16 0.847 0.785 0.642 0.486 0.161 -0.01 -0.196 -0.43 -0.691 -0.972 -1.321 -2.111 -6 ,30804 ,TETRA ,17559245,Sat Nov 27 05:47:49 CET,Sat Nov 27 07:42:38 CET,0.0 0.727 0.986 1.168 1.339 1.509 1.67 1.813 2.061 2.168 2.266 2.269 2.546 2.63 2.797 2.958 3.12 3.203 3.348 3.49 3.7 3.84 3.976 4.166 4.329 4.476 4.647 4.807 4.985 5.161 5.331 5.535 5.73 5.906 6.096 6.322 6.557 6.807 7.058 7.302 7.554 7.842 8.197 8.541 8.895 9.269 9.638 10.011 10.401 10.703 10.765 10.444 9.952 9.441 8.931 8.41 7.932 7.478 7.072 6.652 6.291 5.962 5.624 5.293 4.991 4.706 4.375 4.062 3.8 3.55 3.294 3.076 2.85 2.624 2.45 2.264 2.08 1.897 1.692 1.549 1.402 1.164 0.995 0.822 0.724 0.508 0.308 0.119 0.012 -0.298 -0.357 -0.477 -0.601 -0.888 -1.038 -1.2 -1.395 -1.619 -1.872 -2.21 -3.126 -7 ,8783 ,TETRA ,17559246,Sat Nov 27 05:47:49 CET,Sat Nov 27 07:49:00 CET,0.0 1.728 2.064 2.294 2.462 2.63 2.799 2.953 3.246 3.381 3.488 3.497 3.774 3.858 4.018 4.179 4.334 4.408 4.541 4.664 4.855 4.983 5.109 5.284 5.456 5.608 5.753 5.905 6.096 6.271 6.423 6.604 6.796 6.978 7.191 7.423 7.637 7.87 8.107 8.363 8.626 8.924 9.249 9.54 9.872 10.244 10.669 11.094 11.459 11.735 11.803 11.517 11.066 10.506 9.929 9.385 8.881 8.416 7.999 7.565 7.178 6.827 6.491 6.157 5.846 5.557 5.249 4.995 4.769 4.516 4.264 4.071 3.856 3.619 3.443 3.252 3.058 2.862 2.644 2.485 2.32 2.071 1.895 1.704 1.604 1.402 1.206 0.984 0.868 0.564 0.53 0.405 0.269 -0.037 -0.183 -0.339 -0.53 -0.77 -1.065 -1.421 -2.349 -8 ,60 ,TETRA ,17559247,Sat Nov 27 05:47:51 CET,Sat Nov 27 07:49:13 CET,0.0 0.784 1.097 1.316 1.514 1.694 1.838 1.958 2.184 2.306 2.434 2.472 2.751 2.837 2.998 3.153 3.311 3.394 3.553 3.7 3.901 4.021 4.128 4.278 4.431 4.581 4.728 4.87 5.054 5.234 5.401 5.598 5.778 5.941 6.144 6.381 6.611 6.856 7.103 7.361 7.624 7.916 8.248 8.58 8.94 9.313 9.733 10.165 10.574 10.917 11.026 10.79 10.342 9.806 9.298 8.779 8.307 7.864 7.455 7.056 6.675 6.302 5.957 5.645 5.375 5.119 4.84 4.596 4.382 4.15 3.912 3.712 3.496 3.271 3.09 2.89 2.683 2.479 2.276 2.136 1.989 1.738 1.561 1.386 1.288 1.082 0.863 0.633 0.511 0.185 0.099 -0.046 -0.212 -0.539 -0.713 -0.918 -1.146 -1.39 -1.669 -2.056 -2.947 -9 ,28352 ,TETRA ,17559248,Sat Nov 27 05:47:49 CET,Sat Nov 27 07:46:14 CET,0.0 0.805 1.052 1.252 1.439 1.621 1.784 1.932 2.185 2.31 2.429 2.444 2.732 2.821 3.013 3.197 3.353 3.431 3.578 3.714 3.913 4.045 4.172 4.349 4.522 4.687 4.836 4.969 5.138 5.307 5.467 5.648 5.831 6.025 6.241 6.481 6.72 6.969 7.216 7.478 7.747 8.032 8.367 8.688 9.007 9.382 9.827 10.229 10.6 10.923 11.02 10.722 10.249 9.742 9.213 8.704 8.242 7.777 7.396 6.998 6.622 6.287 5.951 5.611 5.294 4.994 4.665 4.374 4.135 3.897 3.655 3.464 3.254 3.018 2.845 2.669 2.473 2.259 2.033 1.881 1.717 1.464 1.298 1.109 1.01 0.82 0.612 0.388 0.271 -0.037 -0.099 -0.231 -0.372 -0.692 -0.876 -1.08 -1.296 -1.538 -1.823 -2.163 -3.68 -10 ,12699 ,TETRA ,17559249,Sat Nov 27 05:47:49 CET,Sat Nov 27 07:46:52 CET,0.0 0.972 1.283 1.543 1.736 1.893 2.042 2.168 2.385 2.496 2.606 2.6 2.885 2.975 3.136 3.287 3.432 3.502 3.64 3.784 3.98 4.101 4.226 4.402 4.564 4.713 4.868 5.016 5.198 5.374 5.543 5.737 5.926 6.114 6.32 6.541 6.747 6.966 7.202 7.456 7.729 8.027 8.341 8.651 9.016 9.391 9.78 10.155 10.526 10.878 11.039 10.805 10.292 9.73 9.194 8.644 8.16 7.702 7.276 6.848 6.475 6.122 5.775 5.447 5.137 4.864 4.569 4.305 4.095 3.871 3.622 3.405 3.179 2.948 2.776 2.593 2.399 2.199 1.988 1.847 1.701 1.451 1.266 1.083 0.988 0.786 0.588 0.387 0.278 -0.029 -0.085 -0.218 -0.355 -0.676 -0.838 -1.004 -1.205 -1.445 -1.744 -2.137 -3.098 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_63_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_63_58.txt deleted file mode 100644 index 6d7aa075..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_63_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21812 ,TETRA ,17559251,Sat Nov 27 05:48:47 CET,Sat Nov 27 07:47:50 CET,0.0 0.906 1.253 1.566 1.785 1.965 2.128 2.282 2.571 2.706 2.843 2.881 3.173 3.273 3.473 3.673 3.854 3.936 4.101 4.261 4.507 4.666 4.809 5.002 5.18 5.366 5.559 5.745 5.986 6.216 6.437 6.706 6.952 7.185 7.459 7.745 8.006 8.288 8.588 8.903 9.224 9.59 10.029 10.426 10.839 11.298 11.814 12.36 12.963 13.5 13.796 13.727 13.424 13.05 12.633 12.198 11.808 11.449 11.135 10.798 10.469 10.142 9.808 9.512 9.24 8.987 8.715 8.456 8.235 8.017 7.791 7.596 7.393 7.169 6.986 6.808 6.624 6.431 6.233 6.098 5.967 5.762 5.607 5.434 5.346 5.171 4.994 4.799 4.701 4.407 4.394 4.289 4.17 3.895 3.747 3.592 3.417 3.224 2.989 2.627 1.693 -2 ,11631 ,TETRA ,17559252,Sat Nov 27 05:48:47 CET,Sat Nov 27 07:48:42 CET,0.0 0.847 1.19 1.447 1.676 1.87 2.049 2.209 2.488 2.615 2.741 2.78 3.072 3.175 3.367 3.54 3.698 3.782 3.947 4.102 4.356 4.517 4.662 4.867 5.055 5.243 5.418 5.577 5.786 5.995 6.199 6.45 6.691 6.919 7.183 7.478 7.76 8.055 8.349 8.657 8.985 9.349 9.757 10.159 10.624 11.139 11.684 12.253 12.812 13.292 13.665 13.617 13.289 12.866 12.421 11.978 11.545 11.124 10.755 10.349 9.963 9.626 9.305 9.006 8.759 8.542 8.306 8.089 7.904 7.719 7.505 7.324 7.151 6.971 6.821 6.647 6.466 6.287 6.103 5.974 5.837 5.621 5.463 5.295 5.21 5.039 4.861 4.673 4.569 4.283 4.271 4.163 4.043 3.785 3.653 3.506 3.325 3.131 2.917 2.62 1.73 -3 ,21057 ,TETRA ,17559253,Sat Nov 27 05:48:48 CET,Sat Nov 27 07:49:49 CET,0.0 0.915 1.175 1.395 1.578 1.743 1.895 2.051 2.328 2.438 2.546 2.565 2.853 2.953 3.146 3.338 3.52 3.608 3.771 3.935 4.179 4.324 4.462 4.659 4.854 5.042 5.217 5.388 5.608 5.807 6.008 6.262 6.502 6.728 7.007 7.331 7.624 7.938 8.264 8.595 8.928 9.294 9.711 10.127 10.597 11.071 11.583 12.127 12.655 13.094 13.3 13.202 12.923 12.532 12.145 11.787 11.421 11.045 10.704 10.303 9.937 9.629 9.336 9.05 8.775 8.523 8.261 8.027 7.822 7.618 7.406 7.226 7.028 6.82 6.664 6.503 6.338 6.16 5.958 5.82 5.68 5.462 5.314 5.158 5.076 4.9 4.715 4.528 4.426 4.133 4.111 4.004 3.891 3.653 3.521 3.369 3.171 2.958 2.734 2.436 1.639 -4 ,11524 ,TETRA ,17559254,Sat Nov 27 05:48:50 CET,Sat Nov 27 07:48:47 CET,0.0 0.845 1.244 1.565 1.846 2.091 2.312 2.515 2.874 3.031 3.159 3.217 3.542 3.654 3.852 4.038 4.206 4.284 4.449 4.614 4.853 5.009 5.163 5.392 5.602 5.783 5.966 6.165 6.42 6.662 6.897 7.177 7.438 7.683 7.963 8.274 8.563 8.876 9.212 9.574 9.946 10.336 10.764 11.185 11.66 12.153 12.687 13.295 13.934 14.483 14.861 14.806 14.518 14.092 13.627 13.208 12.858 12.482 12.109 11.717 11.357 11.0 10.644 10.323 10.031 9.786 9.543 9.291 9.072 8.857 8.624 8.423 8.216 8.01 7.85 7.686 7.504 7.312 7.112 6.981 6.858 6.662 6.512 6.342 6.257 6.088 5.934 5.777 5.689 5.402 5.381 5.264 5.152 4.922 4.786 4.639 4.469 4.266 4.019 3.651 2.608 -5 ,3941 ,TETRA ,17559255,Sat Nov 27 05:48:48 CET,Sat Nov 27 07:46:58 CET,0.0 0.861 1.198 1.467 1.69 1.893 2.064 2.229 2.547 2.681 2.81 2.85 3.144 3.253 3.457 3.642 3.833 3.927 4.11 4.276 4.504 4.651 4.795 5.002 5.208 5.412 5.598 5.772 6.007 6.227 6.432 6.685 6.908 7.115 7.361 7.657 7.954 8.258 8.563 8.885 9.221 9.598 10.032 10.43 10.878 11.364 11.867 12.354 12.883 13.383 13.711 13.611 13.282 12.903 12.45 11.983 11.562 11.175 10.832 10.475 10.167 9.884 9.609 9.335 9.056 8.796 8.522 8.283 8.077 7.866 7.663 7.486 7.298 7.106 6.939 6.762 6.577 6.363 6.134 5.987 5.835 5.586 5.419 5.258 5.175 5.002 4.825 4.629 4.519 4.214 4.182 4.07 3.954 3.684 3.538 3.383 3.214 3.041 2.852 2.59 1.962 -6 ,10759 ,TETRA ,17559256,Sat Nov 27 05:49:50 CET,Sat Nov 27 07:37:06 CET,0.0 0.813 1.131 1.383 1.615 1.81 1.975 2.158 2.466 2.588 2.71 2.768 3.077 3.189 3.405 3.613 3.818 3.916 4.095 4.263 4.51 4.666 4.811 5.027 5.227 5.404 5.59 5.762 5.975 6.191 6.39 6.62 6.839 7.047 7.287 7.572 7.849 8.15 8.468 8.788 9.139 9.538 9.988 10.412 10.867 11.323 11.803 12.354 12.934 13.414 13.718 13.654 13.32 12.939 12.525 12.084 11.68 11.295 10.948 10.594 10.295 10.018 9.742 9.469 9.206 8.953 8.693 8.461 8.252 8.048 7.823 7.631 7.438 7.24 7.079 6.92 6.767 6.591 6.41 6.293 6.167 5.958 5.804 5.631 5.536 5.34 5.129 4.919 4.814 4.5 4.455 4.344 4.218 3.943 3.799 3.633 3.443 3.239 2.98 2.644 1.73 -7 ,29631 ,TETRA ,17559257,Sat Nov 27 05:50:48 CET,Sat Nov 27 07:51:20 CET,0.0 0.896 1.191 1.421 1.633 1.821 1.993 2.168 2.467 2.597 2.719 2.763 3.065 3.163 3.373 3.568 3.741 3.834 4.017 4.185 4.414 4.557 4.699 4.911 5.106 5.31 5.514 5.695 5.927 6.162 6.375 6.623 6.867 7.089 7.345 7.626 7.904 8.201 8.497 8.826 9.175 9.578 10.035 10.45 10.909 11.381 11.868 12.377 12.948 13.492 13.875 13.857 13.556 13.168 12.806 12.424 12.027 11.669 11.359 11.035 10.738 10.44 10.159 9.903 9.657 9.424 9.182 8.962 8.744 8.512 8.285 8.09 7.893 7.708 7.567 7.423 7.263 7.086 6.889 6.744 6.593 6.352 6.191 6.034 5.961 5.806 5.654 5.497 5.405 5.117 5.088 4.967 4.848 4.609 4.479 4.332 4.158 3.961 3.743 3.413 2.478 -8 ,7422 ,TETRA ,17559258,Sat Nov 27 05:50:48 CET,Sat Nov 27 07:54:49 CET,0.0 0.873 1.263 1.572 1.784 1.968 2.153 2.314 2.605 2.75 2.884 2.936 3.235 3.346 3.548 3.734 3.911 3.997 4.167 4.327 4.552 4.69 4.83 5.035 5.23 5.424 5.604 5.775 5.999 6.211 6.42 6.679 6.918 7.138 7.378 7.64 7.895 8.166 8.45 8.75 9.099 9.492 9.898 10.278 10.688 11.112 11.6 12.133 12.657 13.092 13.368 13.242 12.892 12.534 12.093 11.633 11.234 10.852 10.519 10.16 9.814 9.519 9.245 8.968 8.727 8.479 8.182 7.937 7.747 7.544 7.336 7.16 6.96 6.761 6.606 6.433 6.251 6.073 5.898 5.78 5.642 5.403 5.243 5.088 5.009 4.84 4.651 4.44 4.336 4.045 4.036 3.925 3.799 3.529 3.377 3.208 3.03 2.829 2.592 2.358 1.777 -9 ,30985 ,TETRA ,17559259,Sat Nov 27 05:50:47 CET,Sat Nov 27 07:38:27 CET,0.0 0.858 1.262 1.532 1.759 1.954 2.118 2.283 2.588 2.732 2.87 2.927 3.22 3.317 3.52 3.715 3.899 3.989 4.156 4.307 4.519 4.658 4.802 5.018 5.214 5.4 5.585 5.758 5.961 6.157 6.36 6.606 6.842 7.072 7.332 7.605 7.873 8.17 8.476 8.805 9.133 9.51 9.945 10.344 10.816 11.326 11.861 12.385 12.876 13.389 13.77 13.683 13.319 12.913 12.55 12.186 11.803 11.424 11.092 10.756 10.451 10.168 9.879 9.585 9.318 9.081 8.809 8.549 8.335 8.118 7.894 7.716 7.514 7.289 7.126 6.957 6.768 6.563 6.353 6.228 6.108 5.923 5.795 5.644 5.561 5.399 5.229 5.037 4.93 4.622 4.576 4.452 4.33 4.054 3.91 3.749 3.57 3.377 3.159 2.863 2.031 -10 ,15968 ,TETRA ,17559260,Sat Nov 27 05:51:47 CET,Sat Nov 27 07:50:41 CET,0.0 0.696 1.021 1.27 1.495 1.692 1.872 2.039 2.334 2.478 2.608 2.651 2.945 3.052 3.252 3.438 3.615 3.703 3.865 4.016 4.245 4.393 4.524 4.714 4.917 5.106 5.293 5.483 5.72 5.954 6.17 6.422 6.656 6.874 7.126 7.399 7.669 7.973 8.298 8.64 8.972 9.312 9.741 10.187 10.636 11.117 11.647 12.19 12.737 13.207 13.433 13.292 12.977 12.581 12.188 11.807 11.417 11.012 10.663 10.285 9.965 9.696 9.424 9.167 8.928 8.704 8.461 8.251 8.066 7.856 7.628 7.46 7.299 7.1 6.938 6.778 6.602 6.419 6.221 6.085 5.945 5.701 5.538 5.377 5.297 5.147 4.989 4.816 4.723 4.422 4.41 4.297 4.181 3.931 3.779 3.616 3.447 3.247 3.01 2.668 1.469 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_63_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_63_64.txt deleted file mode 100644 index f25de761..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_63_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19096 ,TETRA ,17559261,Sat Nov 27 05:51:50 CET,Sat Nov 27 07:49:37 CET,0.0 0.828 1.095 1.321 1.495 1.655 1.82 1.963 2.211 2.344 2.473 2.498 2.796 2.906 3.111 3.291 3.459 3.542 3.711 3.883 4.127 4.277 4.419 4.625 4.838 5.047 5.235 5.411 5.642 5.871 6.092 6.348 6.591 6.829 7.103 7.403 7.668 7.956 8.284 8.624 8.99 9.429 9.951 10.448 11.043 11.693 12.35 13.085 13.898 14.739 15.549 15.916 15.933 15.814 15.632 15.427 15.174 14.875 14.591 14.291 14.018 13.754 13.49 13.244 13.01 12.794 12.56 12.354 12.167 11.951 11.715 11.519 11.312 11.096 10.932 10.773 10.596 10.411 10.242 10.127 9.993 9.771 9.619 9.471 9.392 9.221 9.059 8.886 8.784 8.493 8.459 8.341 8.209 7.929 7.789 7.639 7.467 7.266 7.034 6.724 5.518 -2 ,24823 ,TETRA ,17559262,Sat Nov 27 05:51:47 CET,Sat Nov 27 07:49:16 CET,0.0 1.602 1.968 2.172 2.352 2.526 2.71 2.864 3.112 3.231 3.355 3.414 3.71 3.818 4.014 4.186 4.359 4.447 4.622 4.788 5.021 5.173 5.313 5.528 5.74 5.931 6.117 6.294 6.518 6.737 6.944 7.194 7.443 7.666 7.929 8.243 8.547 8.868 9.191 9.529 9.894 10.321 10.817 11.314 11.878 12.491 13.166 13.876 14.681 15.596 16.603 17.155 17.23 17.114 16.902 16.649 16.426 16.147 15.833 15.497 15.184 14.895 14.64 14.41 14.196 14.005 13.799 13.621 13.454 13.258 13.058 12.899 12.722 12.529 12.38 12.226 12.046 11.846 11.649 11.508 11.363 11.145 10.99 10.827 10.744 10.57 10.378 10.184 10.088 9.813 9.788 9.659 9.523 9.229 9.06 8.866 8.653 8.384 8.052 7.717 6.849 -3 ,20099 ,TETRA ,17559263,Sat Nov 27 05:51:50 CET,Sat Nov 27 07:48:54 CET,0.0 1.695 2.137 2.469 2.699 2.9 3.088 3.257 3.583 3.734 3.873 3.935 4.228 4.323 4.519 4.707 4.881 4.966 5.136 5.318 5.586 5.733 5.871 6.07 6.249 6.427 6.612 6.798 7.022 7.232 7.441 7.691 7.925 8.154 8.415 8.695 8.966 9.272 9.599 9.95 10.322 10.722 11.196 11.685 12.231 12.804 13.438 14.105 14.805 15.561 16.357 16.781 16.823 16.671 16.464 16.25 15.983 15.709 15.477 15.207 14.945 14.687 14.421 14.159 13.907 13.67 13.393 13.137 12.909 12.678 12.433 12.221 12.01 11.786 11.617 11.447 11.273 11.094 10.903 10.781 10.666 10.484 10.35 10.193 10.11 9.934 9.748 9.559 9.455 9.15 9.102 8.962 8.824 8.532 8.341 8.13 7.906 7.652 7.334 6.941 5.785 -4 ,5950 ,TETRA ,17559264,Sat Nov 27 05:54:51 CET,Sat Nov 27 07:51:48 CET,0.0 0.833 1.204 1.418 1.642 1.866 2.077 2.264 2.547 2.674 2.799 2.851 3.155 3.265 3.485 3.678 3.835 3.913 4.074 4.231 4.442 4.576 4.728 4.94 5.132 5.322 5.513 5.696 5.918 6.144 6.361 6.623 6.88 7.129 7.422 7.74 8.053 8.395 8.743 9.103 9.487 9.94 10.454 10.936 11.516 12.117 12.731 13.433 14.214 15.053 15.84 16.207 16.179 15.949 15.695 15.427 15.137 14.83 14.535 14.242 13.995 13.742 13.483 13.237 13.003 12.784 12.538 12.307 12.112 11.921 11.72 11.542 11.352 11.154 11.001 10.84 10.666 10.476 10.264 10.125 9.98 9.74 9.558 9.381 9.302 9.135 8.961 8.784 8.693 8.404 8.347 8.224 8.101 7.843 7.695 7.532 7.341 7.111 6.803 6.463 5.677 -5 ,20407 ,TETRA ,17559265,Sat Nov 27 05:53:50 CET,Sat Nov 27 07:50:49 CET,0.0 1.214 1.564 1.784 1.962 2.13 2.304 2.465 2.735 2.855 2.968 3.008 3.311 3.416 3.617 3.796 3.958 4.038 4.19 4.336 4.551 4.695 4.843 5.074 5.286 5.477 5.67 5.852 6.077 6.294 6.5 6.752 7.0 7.238 7.498 7.804 8.098 8.411 8.744 9.09 9.462 9.874 10.344 10.819 11.391 11.969 12.58 13.286 14.039 14.848 15.677 16.125 16.186 16.092 15.896 15.607 15.321 15.057 14.804 14.526 14.27 14.034 13.807 13.585 13.347 13.098 12.833 12.602 12.394 12.188 12.0 11.845 11.662 11.464 11.312 11.15 10.993 10.834 10.643 10.508 10.365 10.123 9.957 9.775 9.682 9.498 9.297 9.082 8.975 8.679 8.624 8.491 8.344 8.017 7.833 7.656 7.492 7.271 7.012 6.654 5.616 -6 ,29521 ,TETRA ,17559266,Sat Nov 27 05:53:50 CET,Sat Nov 27 07:55:07 CET,0.0 1.163 1.592 1.916 2.196 2.403 2.581 2.746 3.046 3.187 3.319 3.345 3.634 3.729 3.922 4.107 4.271 4.355 4.516 4.669 4.888 5.02 5.154 5.372 5.58 5.752 5.935 6.121 6.358 6.587 6.792 7.027 7.261 7.488 7.752 8.049 8.336 8.653 8.976 9.315 9.675 10.09 10.569 11.013 11.512 12.078 12.727 13.416 14.175 14.983 15.725 16.085 16.1 16.03 15.9 15.642 15.356 15.115 14.868 14.56 14.275 14.006 13.761 13.53 13.299 13.083 12.849 12.643 12.464 12.259 12.032 11.841 11.636 11.415 11.246 11.074 10.897 10.716 10.509 10.367 10.242 10.041 9.887 9.716 9.629 9.465 9.281 9.047 8.925 8.634 8.604 8.486 8.351 8.051 7.896 7.74 7.552 7.309 7.002 6.604 5.327 -7 ,11998 ,TETRA ,17559267,Sat Nov 27 05:53:52 CET,Sat Nov 27 07:55:25 CET,0.0 1.62 2.041 2.345 2.598 2.797 2.965 3.123 3.417 3.551 3.676 3.741 4.041 4.148 4.358 4.558 4.76 4.86 5.04 5.203 5.452 5.619 5.776 5.986 6.186 6.382 6.571 6.749 6.982 7.218 7.443 7.707 7.939 8.156 8.417 8.71 8.994 9.31 9.661 10.029 10.401 10.813 11.291 11.777 12.313 12.892 13.533 14.217 14.998 15.804 16.588 17.02 17.095 16.994 16.821 16.621 16.41 16.168 15.928 15.668 15.431 15.209 14.975 14.746 14.537 14.338 14.12 13.894 13.691 13.498 13.293 13.121 12.938 12.753 12.611 12.46 12.285 12.087 11.881 11.736 11.592 11.361 11.195 11.012 10.92 10.758 10.571 10.357 10.258 9.978 9.91 9.771 9.633 9.326 9.142 8.942 8.741 8.494 8.17 7.736 6.362 -8 ,24911 ,TETRA ,17559268,Sat Nov 27 05:53:50 CET,Sat Nov 27 07:52:18 CET,0.0 1.117 1.493 1.729 1.929 2.101 2.25 2.4 2.715 2.848 2.967 3.003 3.303 3.412 3.609 3.793 3.967 4.05 4.205 4.351 4.591 4.762 4.919 5.122 5.317 5.51 5.685 5.857 6.069 6.261 6.446 6.688 6.939 7.177 7.465 7.786 8.072 8.406 8.76 9.111 9.471 9.86 10.324 10.801 11.353 11.931 12.553 13.236 14.011 14.813 15.54 15.865 15.882 15.694 15.435 15.19 14.927 14.667 14.44 14.197 13.96 13.734 13.511 13.3 13.089 12.869 12.621 12.399 12.221 12.035 11.838 11.668 11.491 11.284 11.114 10.947 10.769 10.58 10.38 10.245 10.101 9.87 9.704 9.548 9.476 9.301 9.098 8.9 8.795 8.493 8.415 8.291 8.164 7.87 7.7 7.505 7.289 7.071 6.816 6.475 5.259 -9 ,17386 ,TETRA ,17559269,Sat Nov 27 05:53:49 CET,Sat Nov 27 07:51:51 CET,0.0 1.136 1.472 1.739 1.954 2.116 2.277 2.427 2.677 2.803 2.922 2.947 3.249 3.368 3.579 3.766 3.941 4.025 4.184 4.337 4.572 4.729 4.871 5.081 5.291 5.483 5.668 5.842 6.072 6.294 6.497 6.753 6.996 7.228 7.504 7.814 8.12 8.451 8.797 9.154 9.505 9.894 10.358 10.818 11.372 12.015 12.688 13.359 14.07 14.775 15.417 15.639 15.517 15.316 15.069 14.77 14.467 14.182 13.896 13.57 13.269 12.972 12.684 12.41 12.137 11.882 11.617 11.378 11.187 11.007 10.826 10.66 10.476 10.286 10.13 9.964 9.803 9.641 9.472 9.35 9.227 9.047 8.896 8.729 8.65 8.49 8.317 8.135 8.04 7.744 7.703 7.595 7.469 7.164 6.967 6.72 6.4 6.049 5.664 5.21 4.472 -10 ,30783 ,TETRA ,17559270,Sat Nov 27 05:53:52 CET,Sat Nov 27 07:51:29 CET,0.0 1.043 1.486 1.816 2.052 2.236 2.405 2.56 2.828 2.953 3.079 3.139 3.44 3.54 3.725 3.904 4.067 4.152 4.318 4.468 4.698 4.854 5.001 5.215 5.416 5.604 5.781 5.952 6.177 6.401 6.609 6.858 7.109 7.342 7.602 7.89 8.181 8.515 8.859 9.21 9.577 9.993 10.482 10.975 11.536 12.134 12.807 13.531 14.321 15.161 15.989 16.38 16.41 16.256 16.011 15.744 15.471 15.215 14.981 14.714 14.46 14.212 13.977 13.77 13.569 13.351 13.113 12.908 12.727 12.524 12.31 12.134 11.934 11.716 11.566 11.418 11.258 11.084 10.891 10.75 10.601 10.379 10.223 10.046 9.95 9.76 9.562 9.349 9.243 8.95 8.895 8.754 8.612 8.304 8.129 7.939 7.723 7.512 7.252 6.875 5.982 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_63_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_63_65.txt deleted file mode 100644 index 8f7f0788..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_63_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13017 ,TETRA ,17559271,Sat Nov 27 05:54:48 CET,Sat Nov 27 07:51:22 CET,0.0 0.898 1.193 1.437 1.644 1.837 2.027 2.177 2.458 2.602 2.729 2.768 3.059 3.153 3.344 3.549 3.759 3.849 4.022 4.184 4.408 4.561 4.704 4.907 5.095 5.271 5.45 5.616 5.817 6.007 6.191 6.427 6.647 6.843 7.081 7.357 7.599 7.859 8.136 8.43 8.742 9.093 9.516 9.915 10.356 10.817 11.279 11.781 12.312 12.755 13.062 12.95 12.598 12.159 11.691 11.213 10.77 10.402 10.097 9.762 9.456 9.189 8.927 8.649 8.372 8.111 7.843 7.617 7.413 7.19 6.953 6.752 6.536 6.313 6.139 5.954 5.768 5.57 5.36 5.212 5.059 4.838 4.677 4.515 4.433 4.244 4.049 3.845 3.737 3.436 3.364 3.214 3.062 2.766 2.589 2.377 2.14 1.894 1.603 1.152 0.209 -2 ,16146 ,TETRA ,17559272,Sat Nov 27 05:54:49 CET,Sat Nov 27 07:51:53 CET,0.0 1.374 1.781 2.065 2.287 2.465 2.636 2.81 3.135 3.269 3.396 3.438 3.732 3.836 4.043 4.24 4.422 4.505 4.676 4.855 5.096 5.243 5.383 5.586 5.793 5.995 6.173 6.34 6.559 6.76 6.959 7.199 7.422 7.639 7.903 8.196 8.455 8.744 9.051 9.349 9.642 9.963 10.363 10.779 11.244 11.694 12.133 12.595 13.076 13.451 13.687 13.537 13.191 12.753 12.202 11.576 11.039 10.606 10.201 9.795 9.449 9.127 8.807 8.494 8.195 7.909 7.595 7.321 7.083 6.832 6.554 6.31 6.059 5.809 5.63 5.449 5.256 5.039 4.805 4.639 4.47 4.205 4.023 3.835 3.733 3.529 3.317 3.083 2.957 2.637 2.559 2.428 2.289 1.947 1.751 1.549 1.333 1.078 0.755 0.319 -0.833 -3 ,7738 ,TETRA ,17559273,Sat Nov 27 05:54:49 CET,Sat Nov 27 07:51:25 CET,0.0 0.928 1.298 1.6 1.807 1.974 2.137 2.306 2.61 2.737 2.854 2.884 3.179 3.277 3.465 3.642 3.811 3.9 4.078 4.246 4.473 4.609 4.748 4.953 5.136 5.31 5.481 5.643 5.85 6.053 6.233 6.458 6.69 6.915 7.167 7.441 7.692 7.941 8.213 8.516 8.835 9.187 9.567 9.929 10.359 10.816 11.293 11.794 12.333 12.848 13.209 13.15 12.819 12.402 11.976 11.532 11.088 10.681 10.351 9.998 9.677 9.377 9.081 8.774 8.484 8.252 8.017 7.79 7.584 7.379 7.174 6.999 6.8 6.58 6.41 6.237 6.068 5.883 5.678 5.55 5.414 5.181 5.026 4.868 4.781 4.603 4.428 4.232 4.122 3.83 3.799 3.675 3.539 3.214 3.031 2.857 2.653 2.388 2.095 1.796 1.034 -4 ,12440 ,TETRA ,17559274,Sat Nov 27 05:55:49 CET,Sat Nov 27 07:55:38 CET,0.0 1.056 1.433 1.705 1.924 2.132 2.309 2.456 2.743 2.877 3.001 3.037 3.329 3.429 3.623 3.83 4.031 4.117 4.275 4.435 4.669 4.818 4.959 5.167 5.372 5.554 5.718 5.882 6.098 6.303 6.503 6.738 6.967 7.184 7.429 7.72 7.982 8.242 8.539 8.85 9.164 9.511 9.9 10.267 10.67 11.125 11.61 12.09 12.602 13.062 13.334 13.219 12.862 12.416 11.997 11.637 11.305 10.976 10.677 10.353 10.044 9.75 9.465 9.208 8.959 8.727 8.478 8.247 8.057 7.858 7.65 7.477 7.278 7.049 6.876 6.704 6.53 6.357 6.178 6.042 5.878 5.604 5.406 5.207 5.111 4.907 4.679 4.441 4.313 3.98 3.875 3.716 3.566 3.261 3.073 2.853 2.617 2.365 2.087 1.637 0.175 -5 ,25367 ,TETRA ,17559275,Sat Nov 27 05:56:49 CET,Sat Nov 27 07:54:21 CET,0.0 0.941 1.339 1.662 1.948 2.192 2.39 2.563 2.876 3.014 3.148 3.219 3.528 3.624 3.803 3.969 4.129 4.211 4.369 4.512 4.722 4.861 4.995 5.189 5.375 5.563 5.743 5.913 6.14 6.346 6.535 6.759 6.961 7.168 7.412 7.683 7.948 8.241 8.552 8.866 9.177 9.523 9.905 10.272 10.712 11.193 11.727 12.274 12.782 13.232 13.515 13.433 13.188 12.786 12.295 11.822 11.38 10.967 10.612 10.238 9.923 9.623 9.33 9.061 8.807 8.55 8.254 7.999 7.777 7.547 7.313 7.123 6.917 6.692 6.527 6.365 6.189 6.001 5.814 5.683 5.539 5.307 5.153 5.008 4.933 4.771 4.598 4.403 4.293 3.993 3.918 3.771 3.618 3.295 3.102 2.882 2.645 2.396 2.111 1.737 0.18 -6 ,29808 ,TETRA ,17559276,Sat Nov 27 05:56:50 CET,Sat Nov 27 07:54:25 CET,0.0 0.696 1.032 1.297 1.504 1.677 1.845 1.992 2.255 2.393 2.527 2.56 2.857 2.96 3.145 3.314 3.485 3.575 3.743 3.899 4.12 4.259 4.402 4.601 4.791 4.971 5.144 5.318 5.522 5.726 5.926 6.151 6.366 6.581 6.836 7.105 7.34 7.598 7.885 8.202 8.533 8.883 9.284 9.651 10.068 10.532 11.009 11.531 12.05 12.508 12.876 12.822 12.511 12.134 11.724 11.319 10.952 10.595 10.26 9.898 9.586 9.302 9.005 8.73 8.498 8.283 8.054 7.854 7.682 7.472 7.224 7.008 6.765 6.506 6.318 6.131 5.952 5.789 5.612 5.479 5.333 5.103 4.957 4.795 4.706 4.528 4.343 4.147 4.04 3.729 3.667 3.544 3.406 3.096 2.95 2.783 2.567 2.322 2.063 1.703 0.54 -7 ,14319 ,TETRA ,17559277,Sat Nov 27 05:57:51 CET,Sat Nov 27 07:57:04 CET,0.0 1.105 1.423 1.651 1.867 2.065 2.252 2.43 2.723 2.86 2.989 3.023 3.33 3.454 3.676 3.874 4.07 4.157 4.322 4.485 4.727 4.886 5.026 5.229 5.442 5.639 5.808 5.965 6.171 6.375 6.58 6.822 7.063 7.301 7.556 7.831 8.1 8.379 8.661 8.942 9.227 9.564 9.938 10.307 10.737 11.17 11.642 12.162 12.683 13.152 13.45 13.383 13.097 12.677 12.224 11.799 11.407 11.015 10.659 10.282 9.932 9.613 9.326 9.049 8.791 8.567 8.32 8.084 7.878 7.67 7.464 7.304 7.131 6.927 6.759 6.578 6.378 6.181 5.989 5.857 5.723 5.515 5.372 5.227 5.149 4.978 4.796 4.581 4.461 4.148 4.091 3.971 3.844 3.585 3.44 3.259 3.049 2.808 2.548 2.244 1.268 -8 ,18266 ,TETRA ,17559278,Sat Nov 27 05:57:51 CET,Sat Nov 27 07:57:03 CET,0.0 0.911 1.183 1.39 1.562 1.73 1.911 2.063 2.317 2.435 2.542 2.562 2.852 2.956 3.164 3.361 3.534 3.608 3.764 3.929 4.159 4.301 4.439 4.635 4.822 5.01 5.19 5.355 5.569 5.767 5.959 6.195 6.398 6.593 6.83 7.093 7.332 7.596 7.899 8.204 8.526 8.897 9.286 9.663 10.099 10.528 11.008 11.533 12.049 12.505 12.738 12.59 12.211 11.756 11.309 10.877 10.457 10.062 9.709 9.338 9.025 8.745 8.476 8.206 7.942 7.714 7.455 7.201 6.986 6.767 6.53 6.335 6.144 5.918 5.733 5.553 5.367 5.154 4.922 4.777 4.633 4.399 4.242 4.068 3.972 3.784 3.582 3.371 3.268 2.968 2.924 2.793 2.674 2.441 2.293 2.114 1.92 1.712 1.465 1.1 0.081 -9 ,2521 ,TETRA ,17559279,Sat Nov 27 05:57:52 CET,Sat Nov 27 07:54:49 CET,0.0 0.689 1.002 1.261 1.489 1.683 1.855 2.018 2.316 2.45 2.575 2.599 2.892 2.993 3.196 3.387 3.575 3.668 3.847 4.012 4.238 4.385 4.529 4.742 4.948 5.14 5.31 5.487 5.714 5.925 6.139 6.391 6.629 6.855 7.104 7.381 7.643 7.928 8.252 8.606 8.946 9.307 9.723 10.104 10.536 11.033 11.576 12.113 12.653 13.182 13.539 13.47 13.161 12.733 12.278 11.869 11.516 11.159 10.799 10.397 10.057 9.761 9.469 9.2 8.951 8.728 8.488 8.246 8.019 7.772 7.514 7.304 7.11 6.925 6.775 6.615 6.444 6.27 6.085 5.95 5.817 5.622 5.476 5.309 5.224 5.054 4.858 4.63 4.521 4.224 4.184 4.071 3.947 3.648 3.486 3.283 3.041 2.791 2.531 2.222 1.218 -10 ,3414 ,TETRA ,17559280,Sat Nov 27 05:59:45 CET,Sat Nov 27 08:00:27 CET,0.0 1.066 1.477 1.775 2.0 2.2 2.375 2.52 2.767 2.894 3.023 3.07 3.375 3.476 3.668 3.845 4.021 4.101 4.251 4.405 4.622 4.755 4.894 5.103 5.304 5.489 5.658 5.818 6.022 6.212 6.388 6.599 6.813 7.031 7.269 7.539 7.796 8.061 8.341 8.67 9.017 9.353 9.734 10.102 10.521 10.996 11.493 11.997 12.542 13.054 13.38 13.265 12.962 12.603 12.207 11.789 11.389 11.008 10.641 10.254 9.951 9.694 9.426 9.156 8.883 8.597 8.306 8.085 7.89 7.656 7.411 7.214 7.02 6.831 6.676 6.506 6.334 6.168 5.987 5.847 5.694 5.456 5.297 5.123 5.025 4.819 4.614 4.404 4.291 3.996 3.949 3.818 3.68 3.346 3.155 2.952 2.718 2.412 2.09 1.694 0.576 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_64_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_64_54.txt deleted file mode 100644 index b1146c9f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_64_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13190 ,TETRA ,17559281,Sat Nov 27 05:59:45 CET,Sat Nov 27 07:57:41 CET,0.0 0.933 1.266 1.531 1.754 1.931 2.093 2.228 2.445 2.558 2.679 2.722 3.011 3.116 3.294 3.457 3.62 3.702 3.864 4.014 4.205 4.33 4.468 4.673 4.873 5.065 5.245 5.423 5.652 5.868 6.08 6.338 6.584 6.806 7.06 7.366 7.656 7.947 8.265 8.6 8.96 9.376 9.836 10.302 10.835 11.413 12.086 12.819 13.592 14.384 15.267 15.772 15.871 15.83 15.659 15.423 15.154 14.885 14.638 14.342 14.085 13.833 13.553 13.288 13.035 12.805 12.572 12.355 12.173 11.979 11.769 11.592 11.403 11.217 11.064 10.899 10.733 10.539 10.337 10.214 10.09 9.88 9.726 9.561 9.471 9.287 9.103 8.915 8.816 8.523 8.475 8.345 8.204 7.912 7.758 7.592 7.403 7.154 6.856 6.496 5.404 -2 ,28604 ,TETRA ,17559282,Sat Nov 27 05:59:45 CET,Sat Nov 27 07:58:49 CET,0.0 1.259 1.554 1.815 2.027 2.202 2.344 2.464 2.696 2.812 2.927 2.95 3.243 3.348 3.535 3.695 3.841 3.907 4.046 4.201 4.426 4.574 4.714 4.896 5.06 5.222 5.386 5.544 5.741 5.928 6.123 6.351 6.571 6.787 7.035 7.328 7.613 7.923 8.245 8.576 8.918 9.308 9.758 10.204 10.727 11.297 11.916 12.595 13.391 14.235 15.076 15.59 15.644 15.534 15.383 15.101 14.798 14.514 14.269 14.023 13.767 13.535 13.312 13.076 12.852 12.646 12.411 12.193 12.008 11.805 11.584 11.403 11.2 10.988 10.833 10.672 10.483 10.292 10.103 9.961 9.809 9.585 9.444 9.289 9.2 9.004 8.802 8.571 8.439 8.133 8.04 7.89 7.733 7.38 7.177 6.953 6.716 6.433 6.073 5.563 4.235 -3 ,27719 ,TETRA ,17559283,Sat Nov 27 05:59:48 CET,Sat Nov 27 07:57:59 CET,0.0 0.524 0.786 0.99 1.149 1.302 1.44 1.571 1.834 1.954 2.066 2.082 2.372 2.47 2.656 2.838 3.015 3.093 3.228 3.354 3.547 3.672 3.792 3.987 4.175 4.341 4.499 4.661 4.881 5.098 5.29 5.51 5.734 5.957 6.211 6.494 6.764 7.059 7.387 7.745 8.111 8.522 9.009 9.474 10.023 10.656 11.378 12.132 12.891 13.705 14.531 14.939 14.973 14.851 14.632 14.363 14.075 13.76 13.492 13.217 12.978 12.752 12.521 12.29 12.063 11.838 11.593 11.386 11.21 11.016 10.801 10.628 10.461 10.278 10.132 9.98 9.805 9.629 9.458 9.338 9.211 9.008 8.861 8.695 8.613 8.449 8.267 8.079 7.981 7.71 7.671 7.548 7.416 7.14 6.999 6.844 6.665 6.464 6.192 5.862 4.931 -4 ,9721 ,TETRA ,17559284,Sat Nov 27 06:00:49 CET,Sat Nov 27 08:05:22 CET,0.0 0.787 1.007 1.166 1.323 1.497 1.654 1.806 2.077 2.187 2.298 2.322 2.601 2.69 2.865 3.028 3.19 3.271 3.424 3.561 3.755 3.883 4.005 4.196 4.38 4.546 4.704 4.86 5.07 5.278 5.474 5.703 5.931 6.155 6.408 6.68 6.95 7.257 7.573 7.902 8.27 8.697 9.196 9.678 10.203 10.778 11.433 12.136 12.904 13.75 14.614 15.16 15.354 15.267 15.024 14.752 14.478 14.196 13.945 13.675 13.414 13.164 12.903 12.646 12.405 12.194 11.968 11.753 11.563 11.364 11.161 10.983 10.789 10.574 10.403 10.235 10.074 9.907 9.73 9.61 9.482 9.271 9.122 8.962 8.878 8.712 8.517 8.302 8.193 7.905 7.853 7.731 7.599 7.331 7.182 7.011 6.827 6.613 6.374 6.076 4.901 -5 ,6083 ,TETRA ,17559285,Sat Nov 27 06:01:48 CET,Sat Nov 27 07:58:55 CET,0.0 0.658 1.008 1.266 1.439 1.589 1.732 1.875 2.141 2.251 2.353 2.368 2.661 2.765 2.945 3.107 3.261 3.337 3.486 3.628 3.836 3.98 4.122 4.331 4.534 4.721 4.899 5.067 5.282 5.482 5.68 5.926 6.15 6.359 6.602 6.907 7.223 7.546 7.884 8.253 8.636 9.059 9.54 10.033 10.62 11.236 11.931 12.655 13.417 14.295 15.221 15.713 15.785 15.665 15.433 15.179 14.926 14.636 14.356 14.036 13.733 13.476 13.243 12.99 12.731 12.507 12.288 12.095 11.906 11.687 11.476 11.313 11.142 10.956 10.812 10.661 10.495 10.318 10.136 10.008 9.874 9.668 9.514 9.352 9.266 9.083 8.896 8.713 8.621 8.337 8.269 8.136 8.001 7.727 7.569 7.39 7.191 6.961 6.709 6.385 5.489 -6 ,13026 ,TETRA ,17559286,Sat Nov 27 06:03:49 CET,Sat Nov 27 08:02:15 CET,0.0 1.009 1.344 1.572 1.741 1.913 2.085 2.252 2.543 2.67 2.778 2.792 3.062 3.153 3.338 3.518 3.692 3.777 3.948 4.118 4.348 4.49 4.631 4.83 5.021 5.217 5.41 5.586 5.788 5.988 6.198 6.444 6.685 6.907 7.157 7.452 7.737 8.056 8.409 8.778 9.16 9.605 10.119 10.594 11.151 11.758 12.388 13.077 13.828 14.611 15.38 15.765 15.818 15.677 15.435 15.128 14.818 14.539 14.269 13.975 13.699 13.451 13.212 12.959 12.709 12.482 12.246 12.033 11.851 11.655 11.454 11.285 11.1 10.906 10.731 10.531 10.342 10.156 9.948 9.803 9.653 9.412 9.262 9.108 9.022 8.841 8.655 8.454 8.352 8.071 8.024 7.902 7.78 7.52 7.386 7.242 7.057 6.819 6.524 6.124 4.448 -7 ,10245 ,TETRA ,17559287,Sat Nov 27 06:03:47 CET,Sat Nov 27 08:02:10 CET,0.0 0.974 1.271 1.492 1.715 1.914 2.066 2.195 2.432 2.547 2.662 2.694 2.988 3.08 3.256 3.442 3.623 3.707 3.874 4.033 4.238 4.371 4.496 4.686 4.879 5.057 5.236 5.416 5.636 5.834 6.026 6.263 6.489 6.695 6.945 7.239 7.509 7.797 8.119 8.459 8.813 9.219 9.675 10.114 10.616 11.183 11.857 12.56 13.29 14.109 15.039 15.563 15.595 15.469 15.252 14.975 14.697 14.437 14.197 13.916 13.664 13.423 13.172 12.934 12.713 12.511 12.288 12.078 11.907 11.728 11.534 11.366 11.17 10.977 10.837 10.689 10.531 10.355 10.176 10.044 9.902 9.682 9.528 9.376 9.301 9.14 8.967 8.781 8.674 8.379 8.334 8.217 8.086 7.817 7.678 7.519 7.35 7.149 6.87 6.491 5.45 -8 ,9361 ,TETRA ,17559288,Sat Nov 27 06:03:47 CET,Sat Nov 27 08:00:11 CET,0.0 1.156 1.498 1.695 1.88 2.066 2.22 2.367 2.659 2.767 2.86 2.869 3.15 3.25 3.432 3.601 3.755 3.829 3.979 4.124 4.321 4.449 4.59 4.793 4.975 5.149 5.318 5.488 5.709 5.911 6.1 6.33 6.541 6.741 6.991 7.273 7.558 7.861 8.163 8.503 8.879 9.3 9.806 10.329 10.907 11.503 12.165 12.879 13.676 14.549 15.363 15.808 15.895 15.714 15.461 15.213 14.932 14.626 14.338 14.047 13.794 13.554 13.279 13.006 12.772 12.566 12.347 12.14 11.949 11.741 11.526 11.359 11.193 11.013 10.871 10.713 10.534 10.345 10.148 10.014 9.868 9.65 9.51 9.351 9.265 9.099 8.936 8.766 8.675 8.38 8.286 8.16 8.039 7.776 7.631 7.473 7.272 7.031 6.693 6.261 5.252 -9 ,2935 ,TETRA ,17559289,Sat Nov 27 06:03:50 CET,Sat Nov 27 08:00:23 CET,0.0 0.758 1.119 1.375 1.585 1.765 1.91 2.052 2.326 2.442 2.555 2.578 2.859 2.952 3.128 3.304 3.465 3.546 3.711 3.868 4.08 4.214 4.35 4.552 4.742 4.903 5.059 5.222 5.426 5.631 5.836 6.073 6.299 6.523 6.781 7.065 7.327 7.631 7.968 8.301 8.652 9.055 9.522 10.002 10.557 11.137 11.764 12.443 13.218 14.077 14.937 15.39 15.513 15.466 15.289 15.037 14.779 14.517 14.236 13.951 13.699 13.46 13.213 12.969 12.732 12.5 12.284 12.108 11.924 11.726 11.531 11.355 11.151 10.925 10.763 10.605 10.421 10.211 10.006 9.87 9.733 9.522 9.371 9.22 9.14 8.953 8.757 8.561 8.454 8.175 8.11 7.974 7.843 7.571 7.431 7.269 7.061 6.828 6.573 6.226 4.917 -10 ,4351 ,TETRA ,17559290,Sat Nov 27 06:03:48 CET,Sat Nov 27 08:01:02 CET,0.0 2.115 2.574 2.882 3.12 3.309 3.476 3.634 3.917 4.062 4.209 4.275 4.58 4.695 4.923 5.14 5.346 5.451 5.662 5.845 6.075 6.212 6.345 6.535 6.722 6.91 7.078 7.239 7.45 7.667 7.883 8.143 8.398 8.638 8.911 9.219 9.532 9.875 10.225 10.584 10.977 11.418 11.891 12.366 12.904 13.48 14.11 14.762 15.537 16.429 17.363 17.891 17.996 17.953 17.83 17.648 17.422 17.164 16.913 16.63 16.38 16.157 15.932 15.71 15.501 15.314 15.114 14.905 14.714 14.528 14.323 14.143 13.952 13.755 13.602 13.433 13.254 13.059 12.849 12.708 12.563 12.332 12.162 11.985 11.904 11.746 11.574 11.388 11.275 10.97 10.93 10.813 10.68 10.386 10.237 10.068 9.885 9.709 9.483 9.208 8.441 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_65_66.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_65_66.txt deleted file mode 100644 index afd996b5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_65_66.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21758 ,TETRA ,17559291,Sat Nov 27 06:04:51 CET,Sat Nov 27 08:02:11 CET,0.0 1.004 1.312 1.567 1.798 1.99 2.168 2.331 2.633 2.773 2.913 2.99 3.294 3.416 3.637 3.847 4.07 4.174 4.358 4.543 4.812 4.979 5.148 5.394 5.626 5.847 6.049 6.245 6.51 6.764 7.005 7.298 7.591 7.872 8.191 8.559 8.907 9.281 9.696 10.156 10.644 11.186 11.804 12.421 13.13 13.933 14.861 15.844 16.961 18.26 19.722 20.758 21.217 21.428 21.464 21.409 21.287 21.129 20.985 20.829 20.681 20.518 20.331 20.139 19.951 19.772 19.565 19.365 19.202 19.03 18.848 18.719 18.589 18.41 18.265 18.127 17.979 17.807 17.62 17.489 17.351 17.131 16.957 16.777 16.691 16.516 16.333 16.142 16.035 15.744 15.667 15.526 15.383 15.078 14.914 14.735 14.523 14.267 13.954 13.594 12.453 -2 ,22950 ,TETRA ,17559292,Sat Nov 27 06:04:52 CET,Sat Nov 27 08:02:11 CET,0.0 0.874 1.211 1.505 1.758 1.958 2.152 2.331 2.646 2.805 2.943 2.975 3.268 3.382 3.611 3.83 4.038 4.132 4.308 4.481 4.745 4.916 5.079 5.318 5.548 5.758 5.96 6.166 6.445 6.71 6.961 7.263 7.551 7.838 8.176 8.552 8.908 9.3 9.741 10.198 10.648 11.162 11.79 12.422 13.15 13.943 14.833 15.848 17.037 18.419 20.055 21.313 21.925 22.238 22.371 22.382 22.322 22.213 22.093 21.945 21.78 21.608 21.452 21.291 21.123 20.971 20.792 20.621 20.478 20.329 20.176 20.04 19.881 19.72 19.593 19.462 19.332 19.152 18.941 18.816 18.701 18.518 18.383 18.236 18.158 17.999 17.823 17.637 17.544 17.274 17.232 17.115 16.995 16.764 16.613 16.414 16.197 15.945 15.64 15.252 13.915 -3 ,11924 ,TETRA ,17559293,Sat Nov 27 06:04:52 CET,Sat Nov 27 08:02:18 CET,0.0 1.394 1.786 2.08 2.293 2.479 2.651 2.822 3.129 3.269 3.416 3.491 3.802 3.914 4.139 4.366 4.577 4.678 4.872 5.056 5.318 5.506 5.688 5.923 6.146 6.358 6.565 6.773 7.054 7.32 7.567 7.874 8.174 8.459 8.785 9.147 9.495 9.87 10.276 10.711 11.163 11.669 12.276 12.916 13.63 14.378 15.241 16.234 17.376 18.644 20.077 21.113 21.578 21.763 21.829 21.818 21.77 21.677 21.535 21.351 21.174 20.991 20.774 20.566 20.381 20.189 19.965 19.736 19.53 19.324 19.112 18.929 18.728 18.533 18.399 18.275 18.132 17.953 17.76 17.622 17.47 17.23 17.068 16.91 16.824 16.65 16.493 16.324 16.235 15.96 15.864 15.723 15.565 15.22 15.046 14.85 14.641 14.394 14.091 13.679 12.023 -4 ,16912 ,TETRA ,17559294,Sat Nov 27 06:04:54 CET,Sat Nov 27 08:02:13 CET,0.0 0.959 1.271 1.512 1.753 1.971 2.146 2.308 2.613 2.744 2.866 2.913 3.217 3.338 3.59 3.83 4.053 4.159 4.357 4.54 4.786 4.945 5.103 5.325 5.547 5.768 5.983 6.2 6.473 6.716 6.957 7.269 7.575 7.87 8.203 8.574 8.939 9.333 9.743 10.176 10.649 11.179 11.814 12.468 13.187 13.954 14.821 15.781 16.967 18.383 19.971 21.2 21.784 22.013 22.097 22.127 22.02 21.798 21.605 21.445 21.297 21.136 20.967 20.796 20.628 20.467 20.262 20.068 19.91 19.734 19.52 19.314 19.11 18.903 18.73 18.565 18.404 18.232 18.064 17.946 17.816 17.605 17.452 17.28 17.185 16.979 16.755 16.525 16.41 16.117 16.031 15.892 15.752 15.437 15.248 15.03 14.813 14.577 14.269 13.88 13.243 -5 ,6815 ,TETRA ,17559295,Sat Nov 27 06:05:47 CET,Sat Nov 27 08:03:28 CET,0.0 0.782 1.156 1.456 1.673 1.872 2.057 2.223 2.545 2.689 2.827 2.911 3.229 3.36 3.617 3.851 4.055 4.152 4.357 4.566 4.851 5.028 5.207 5.465 5.706 5.926 6.138 6.351 6.614 6.873 7.125 7.425 7.71 7.979 8.298 8.657 9.008 9.402 9.825 10.282 10.745 11.266 11.893 12.521 13.255 14.059 14.999 16.053 17.212 18.548 20.166 21.45 22.043 22.286 22.368 22.329 22.233 22.137 22.007 21.817 21.653 21.491 21.289 21.085 20.893 20.701 20.491 20.284 20.087 19.885 19.687 19.516 19.327 19.133 18.984 18.834 18.69 18.536 18.357 18.242 18.116 17.894 17.738 17.571 17.482 17.296 17.098 16.897 16.785 16.481 16.413 16.287 16.162 15.875 15.684 15.482 15.28 15.027 14.713 14.269 13.203 -6 ,4200 ,TETRA ,17559296,Sat Nov 27 06:05:46 CET,Sat Nov 27 08:05:24 CET,0.0 1.022 1.34 1.591 1.791 1.979 2.158 2.337 2.665 2.803 2.932 3.002 3.313 3.431 3.652 3.854 4.05 4.144 4.328 4.506 4.755 4.92 5.074 5.302 5.529 5.747 5.959 6.167 6.444 6.707 6.949 7.247 7.535 7.81 8.137 8.51 8.876 9.282 9.713 10.169 10.656 11.194 11.803 12.41 13.116 13.926 14.879 15.93 17.117 18.424 19.874 20.96 21.447 21.703 21.78 21.752 21.688 21.564 21.424 21.28 21.128 20.969 20.798 20.606 20.414 20.227 20.016 19.828 19.659 19.473 19.258 19.08 18.914 18.739 18.591 18.435 18.273 18.104 17.926 17.8 17.668 17.449 17.28 17.094 17.004 16.826 16.626 16.415 16.302 16.0 15.933 15.802 15.669 15.404 15.245 15.07 14.877 14.636 14.357 13.987 12.811 -7 ,5880 ,TETRA ,17559297,Sat Nov 27 06:05:47 CET,Sat Nov 27 08:02:28 CET,0.0 1.05 1.4 1.629 1.841 2.041 2.218 2.363 2.625 2.753 2.879 2.934 3.237 3.361 3.612 3.824 4.01 4.103 4.288 4.465 4.726 4.893 5.054 5.283 5.512 5.735 5.952 6.171 6.452 6.72 6.98 7.289 7.58 7.871 8.222 8.621 9.007 9.426 9.864 10.302 10.765 11.292 11.964 12.638 13.352 14.134 15.015 16.033 17.18 18.456 19.93 20.853 21.215 21.341 21.308 21.179 20.975 20.757 20.537 20.284 20.079 19.861 19.626 19.414 19.211 19.017 18.795 18.582 18.399 18.211 18.001 17.812 17.626 17.432 17.271 17.094 16.9 16.704 16.509 16.364 16.212 15.972 15.798 15.624 15.527 15.33 15.135 14.916 14.799 14.498 14.431 14.303 14.173 13.876 13.704 13.524 13.322 13.093 12.759 12.287 11.274 -8 ,12219 ,TETRA ,17559298,Sat Nov 27 06:06:50 CET,Sat Nov 27 07:54:11 CET,0.0 0.764 1.146 1.435 1.676 1.893 2.082 2.26 2.583 2.734 2.877 2.948 3.276 3.411 3.658 3.868 4.064 4.159 4.366 4.571 4.842 5.012 5.18 5.426 5.667 5.906 6.135 6.348 6.612 6.864 7.119 7.429 7.725 8.015 8.363 8.765 9.135 9.528 9.962 10.408 10.861 11.371 11.98 12.612 13.359 14.195 15.12 16.133 17.324 18.667 20.07 20.988 21.447 21.68 21.706 21.601 21.446 21.261 21.069 20.832 20.598 20.381 20.16 19.958 19.76 19.565 19.348 19.152 18.981 18.79 18.58 18.408 18.238 18.067 17.934 17.792 17.646 17.482 17.302 17.184 17.048 16.829 16.676 16.525 16.449 16.286 16.104 15.902 15.8 15.512 15.479 15.359 15.219 14.912 14.742 14.545 14.305 14.025 13.703 13.287 12.073 -9 ,29864 ,TETRA ,17559299,Sat Nov 27 06:06:50 CET,Sat Nov 27 08:03:50 CET,0.0 0.734 1.042 1.295 1.526 1.723 1.919 2.104 2.444 2.59 2.731 2.803 3.117 3.24 3.463 3.678 3.874 3.972 4.166 4.351 4.637 4.813 4.976 5.215 5.437 5.641 5.843 6.047 6.325 6.596 6.85 7.143 7.411 7.674 8.001 8.379 8.727 9.101 9.519 9.977 10.459 10.983 11.573 12.179 12.89 13.661 14.565 15.592 16.739 18.033 19.503 20.614 21.147 21.429 21.502 21.403 21.209 20.981 20.795 20.622 20.433 20.228 20.001 19.767 19.572 19.376 19.133 18.921 18.75 18.583 18.4 18.225 18.041 17.846 17.684 17.523 17.356 17.18 16.996 16.869 16.736 16.517 16.356 16.183 16.091 15.907 15.701 15.479 15.374 15.087 15.03 14.904 14.784 14.525 14.374 14.19 13.978 13.753 13.446 12.965 11.486 -10 ,19445 ,TETRA ,17559300,Sat Nov 27 06:07:50 CET,Sat Nov 27 08:03:59 CET,0.0 1.116 1.492 1.81 2.06 2.301 2.511 2.693 3.029 3.175 3.305 3.378 3.694 3.812 4.026 4.243 4.46 4.567 4.776 4.975 5.272 5.455 5.621 5.865 6.103 6.335 6.565 6.794 7.086 7.358 7.623 7.931 8.225 8.513 8.843 9.211 9.57 9.955 10.36 10.788 11.231 11.743 12.35 12.961 13.661 14.428 15.336 16.371 17.487 18.716 20.134 21.112 21.516 21.65 21.653 21.542 21.36 21.12 20.886 20.643 20.382 20.131 19.893 19.646 19.393 19.149 18.897 18.7 18.519 18.305 18.088 17.907 17.721 17.506 17.329 17.154 16.971 16.783 16.581 16.449 16.306 16.045 15.867 15.677 15.583 15.386 15.183 14.99 14.881 14.578 14.515 14.382 14.251 13.958 13.794 13.636 13.458 13.231 12.953 12.565 11.436 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_66_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_66_62.txt deleted file mode 100644 index 407db2a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_66_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18325 ,TETRA ,17559301,Sat Nov 27 06:07:52 CET,Sat Nov 27 08:04:56 CET,0.0 1.367 1.838 2.126 2.369 2.608 2.84 3.061 3.444 3.616 3.778 3.898 4.221 4.35 4.617 4.879 5.13 5.25 5.47 5.674 5.953 6.138 6.316 6.576 6.839 7.083 7.328 7.57 7.864 8.136 8.404 8.743 9.054 9.338 9.684 10.087 10.453 10.837 11.253 11.691 12.15 12.641 13.184 13.711 14.281 14.9 15.641 16.441 17.279 18.158 18.969 19.3 19.252 19.015 18.664 18.293 17.963 17.641 17.328 16.987 16.676 16.381 16.105 15.849 15.579 15.315 15.027 14.769 14.558 14.335 14.097 13.893 13.688 13.486 13.328 13.159 12.975 12.778 12.564 12.419 12.281 12.047 11.876 11.707 11.621 11.45 11.28 11.102 10.99 10.692 10.622 10.485 10.334 10.038 9.877 9.694 9.484 9.247 8.969 8.583 6.536 -2 ,16071 ,TETRA ,17559302,Sat Nov 27 06:07:49 CET,Sat Nov 27 08:07:06 CET,0.0 1.464 1.868 2.158 2.432 2.683 2.92 3.144 3.558 3.749 3.924 4.063 4.399 4.552 4.851 5.157 5.44 5.575 5.836 6.068 6.379 6.578 6.777 7.057 7.325 7.583 7.832 8.07 8.367 8.641 8.904 9.222 9.532 9.827 10.17 10.543 10.887 11.277 11.693 12.111 12.534 13.009 13.559 14.097 14.672 15.279 15.952 16.696 17.541 18.343 19.052 19.38 19.35 19.152 18.853 18.516 18.176 17.831 17.503 17.161 16.846 16.563 16.289 15.998 15.734 15.514 15.261 15.014 14.797 14.551 14.301 14.108 13.908 13.7 13.53 13.346 13.17 13.003 12.825 12.694 12.555 12.337 12.177 11.991 11.895 11.693 11.466 11.242 11.115 10.804 10.727 10.586 10.437 10.141 9.986 9.819 9.635 9.384 9.062 8.627 7.314 -3 ,7942 ,TETRA ,17559303,Sat Nov 27 06:09:48 CET,Sat Nov 27 08:07:02 CET,0.0 1.252 1.693 1.983 2.244 2.504 2.731 2.936 3.303 3.479 3.657 3.811 4.143 4.291 4.567 4.833 5.094 5.215 5.446 5.665 5.982 6.183 6.375 6.664 6.943 7.201 7.451 7.683 7.986 8.282 8.553 8.893 9.215 9.519 9.882 10.287 10.651 11.047 11.482 11.922 12.374 12.9 13.491 14.028 14.605 15.255 16.005 16.754 17.565 18.376 19.118 19.418 19.362 19.145 18.847 18.535 18.197 17.871 17.593 17.284 16.987 16.704 16.431 16.163 15.896 15.639 15.387 15.177 14.984 14.777 14.552 14.364 14.172 13.967 13.814 13.648 13.46 13.264 13.056 12.911 12.766 12.542 12.384 12.207 12.116 11.941 11.765 11.575 11.473 11.198 11.145 11.015 10.859 10.514 10.326 10.128 9.932 9.685 9.375 8.966 8.252 -4 ,26221 ,TETRA ,17559304,Sat Nov 27 06:09:48 CET,Sat Nov 27 08:07:16 CET,0.0 1.067 1.458 1.768 2.026 2.241 2.465 2.681 3.058 3.221 3.367 3.463 3.781 3.919 4.17 4.412 4.648 4.76 4.98 5.205 5.516 5.715 5.918 6.19 6.447 6.71 6.956 7.184 7.475 7.762 8.033 8.358 8.67 8.961 9.302 9.679 10.031 10.428 10.836 11.26 11.728 12.249 12.849 13.409 14.04 14.733 15.44 16.184 16.998 17.843 18.57 18.829 18.697 18.463 18.188 17.842 17.458 17.071 16.74 16.379 16.035 15.722 15.399 15.106 14.865 14.647 14.407 14.177 13.98 13.759 13.514 13.328 13.127 12.905 12.74 12.565 12.38 12.193 11.986 11.833 11.668 11.409 11.232 11.054 10.963 10.774 10.583 10.375 10.267 9.989 9.932 9.803 9.66 9.36 9.192 9.01 8.789 8.534 8.232 7.815 5.98 -5 ,1074 ,TETRA ,17559305,Sat Nov 27 06:09:47 CET,Sat Nov 27 08:08:19 CET,0.0 0.971 1.348 1.678 1.947 2.17 2.375 2.574 2.952 3.132 3.305 3.444 3.767 3.91 4.184 4.446 4.701 4.817 5.021 5.231 5.556 5.76 5.951 6.228 6.493 6.735 6.966 7.184 7.46 7.727 7.978 8.282 8.588 8.887 9.231 9.625 9.99 10.372 10.782 11.245 11.738 12.261 12.864 13.448 14.094 14.785 15.548 16.355 17.199 18.061 18.811 19.111 19.074 18.861 18.596 18.29 17.92 17.539 17.179 16.788 16.474 16.186 15.896 15.653 15.42 15.194 14.963 14.745 14.54 14.313 14.079 13.879 13.671 13.448 13.271 13.094 12.916 12.73 12.524 12.38 12.229 11.99 11.824 11.658 11.575 11.404 11.22 11.022 10.909 10.603 10.494 10.348 10.185 9.827 9.637 9.432 9.214 8.957 8.649 8.228 6.548 -6 ,13348 ,TETRA ,17559306,Sat Nov 27 06:09:50 CET,Sat Nov 27 08:08:20 CET,0.0 1.276 1.702 2.075 2.38 2.64 2.869 3.082 3.495 3.686 3.858 3.998 4.324 4.455 4.729 4.999 5.253 5.371 5.591 5.801 6.084 6.261 6.431 6.671 6.902 7.131 7.355 7.567 7.842 8.105 8.36 8.661 8.948 9.239 9.577 9.947 10.292 10.652 11.022 11.401 11.81 12.284 12.835 13.39 14.023 14.686 15.443 16.251 17.046 17.85 18.565 18.839 18.749 18.423 18.014 17.609 17.242 16.877 16.521 16.17 15.855 15.538 15.254 14.981 14.717 14.475 14.183 13.917 13.69 13.469 13.242 13.036 12.826 12.61 12.434 12.246 12.062 11.88 11.681 11.537 11.389 11.155 10.991 10.825 10.744 10.572 10.388 10.182 10.065 9.772 9.695 9.57 9.444 9.141 8.968 8.77 8.535 8.284 7.962 7.518 6.372 -7 ,23548 ,TETRA ,17559307,Sat Nov 27 06:09:48 CET,Sat Nov 27 08:09:15 CET,0.0 1.075 1.505 1.889 2.197 2.457 2.686 2.905 3.322 3.507 3.682 3.852 4.179 4.33 4.625 4.902 5.158 5.28 5.518 5.753 6.098 6.322 6.532 6.82 7.078 7.315 7.553 7.784 8.06 8.339 8.633 8.987 9.314 9.614 9.95 10.322 10.673 11.058 11.479 11.932 12.403 12.914 13.476 14.027 14.668 15.342 16.061 16.824 17.673 18.553 19.338 19.647 19.566 19.353 19.07 18.696 18.33 17.952 17.6 17.247 16.935 16.648 16.365 16.072 15.791 15.546 15.28 15.041 14.835 14.618 14.379 14.179 13.963 13.732 13.555 13.379 13.21 13.018 12.8 12.662 12.512 12.269 12.108 11.933 11.849 11.683 11.496 11.282 11.166 10.876 10.802 10.663 10.522 10.255 10.121 9.966 9.783 9.558 9.258 8.829 6.14 -8 ,6466 ,TETRA ,17559308,Sat Nov 27 06:10:46 CET,Sat Nov 27 08:07:40 CET,0.0 1.415 1.83 2.138 2.41 2.681 2.916 3.12 3.496 3.657 3.81 3.92 4.235 4.366 4.615 4.85 5.079 5.198 5.429 5.64 5.949 6.138 6.309 6.546 6.786 7.033 7.267 7.486 7.777 8.063 8.334 8.648 8.947 9.245 9.58 9.948 10.301 10.689 11.093 11.518 11.961 12.455 13.004 13.533 14.133 14.745 15.45 16.269 17.099 17.908 18.589 18.807 18.722 18.447 18.108 17.738 17.338 16.921 16.519 16.136 15.832 15.545 15.259 14.981 14.713 14.458 14.164 13.9 13.69 13.462 13.214 13.003 12.784 12.557 12.383 12.203 12.001 11.786 11.551 11.384 11.22 10.95 10.763 10.587 10.497 10.309 10.101 9.867 9.744 9.458 9.409 9.282 9.142 8.82 8.627 8.416 8.199 7.965 7.667 7.276 6.313 -9 ,24696 ,TETRA ,17559309,Sat Nov 27 06:10:48 CET,Sat Nov 27 08:07:08 CET,0.0 0.922 1.319 1.62 1.858 2.072 2.273 2.46 2.811 2.971 3.122 3.248 3.575 3.726 4.025 4.317 4.594 4.724 4.983 5.226 5.543 5.742 5.928 6.212 6.506 6.778 7.035 7.28 7.582 7.868 8.137 8.455 8.755 9.05 9.401 9.773 10.13 10.545 10.974 11.403 11.859 12.355 12.919 13.503 14.159 14.862 15.645 16.395 17.148 18.025 18.898 19.257 19.172 18.919 18.589 18.267 17.978 17.641 17.265 16.909 16.636 16.36 16.065 15.775 15.503 15.263 15.019 14.802 14.618 14.404 14.168 13.968 13.741 13.506 13.333 13.151 12.967 12.775 12.556 12.41 12.281 12.065 11.903 11.74 11.656 11.48 11.275 11.031 10.906 10.605 10.539 10.41 10.255 9.916 9.742 9.552 9.342 9.101 8.812 8.385 7.288 -10 ,3416 ,TETRA ,17559310,Sat Nov 27 06:10:47 CET,Sat Nov 27 08:11:30 CET,0.0 1.327 1.77 2.135 2.441 2.712 2.958 3.205 3.685 3.878 4.047 4.19 4.525 4.671 4.945 5.203 5.448 5.569 5.794 6.01 6.325 6.519 6.716 7.013 7.291 7.55 7.791 8.006 8.281 8.549 8.801 9.114 9.404 9.689 10.033 10.41 10.766 11.154 11.55 11.964 12.415 12.905 13.465 14.022 14.672 15.389 16.13 16.871 17.665 18.431 19.154 19.428 19.268 18.984 18.654 18.262 17.901 17.579 17.283 16.979 16.695 16.418 16.155 15.902 15.648 15.418 15.176 14.963 14.752 14.528 14.294 14.088 13.894 13.68 13.495 13.3 13.098 12.894 12.693 12.557 12.417 12.204 12.051 11.887 11.803 11.623 11.427 11.226 11.119 10.826 10.748 10.613 10.466 10.175 10.01 9.807 9.577 9.329 9.043 8.657 7.705 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_66_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_66_64.txt deleted file mode 100644 index 72880153..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_66_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11086 ,TETRA ,17559311,Sat Nov 27 06:10:48 CET,Sat Nov 27 08:12:44 CET,0.0 2.667 3.218 3.61 3.911 4.208 4.453 4.65 5.007 5.187 5.362 5.487 5.784 5.904 6.148 6.377 6.611 6.713 6.903 7.08 7.315 7.478 7.641 7.878 8.087 8.272 8.463 8.645 8.854 9.06 9.264 9.496 9.704 9.897 10.121 10.366 10.619 10.898 11.149 11.411 11.702 11.998 12.345 12.684 13.028 13.398 13.729 13.944 14.051 13.982 13.49 12.498 11.53 10.635 9.832 9.082 8.405 7.795 7.253 6.72 6.252 5.813 5.395 5.001 4.634 4.279 3.904 3.575 3.291 3.004 2.687 2.423 2.141 1.847 1.635 1.418 1.192 0.96 0.71 0.527 0.349 0.065 -0.149 -0.352 -0.448 -0.655 -0.871 -1.116 -1.237 -1.534 -1.644 -1.805 -1.959 -2.311 -2.529 -2.772 -3.028 -3.302 -3.611 -4.026 -6.305 -2 ,3059 ,TETRA ,17559312,Sat Nov 27 06:12:44 CET,Sat Nov 27 08:09:08 CET,0.0 2.51 3.019 3.352 3.639 3.929 4.219 4.453 4.839 5.014 5.169 5.286 5.611 5.736 5.976 6.201 6.399 6.488 6.654 6.814 7.056 7.22 7.388 7.602 7.796 7.983 8.16 8.319 8.512 8.701 8.897 9.15 9.381 9.598 9.845 10.12 10.374 10.654 10.956 11.244 11.516 11.764 12.069 12.433 12.761 13.041 13.297 13.457 13.503 13.297 12.657 11.602 10.63 9.72 8.896 8.164 7.493 6.845 6.299 5.79 5.342 4.915 4.516 4.159 3.797 3.446 3.103 2.809 2.544 2.269 1.979 1.731 1.468 1.19 0.976 0.76 0.522 0.273 0.03 -0.135 -0.312 -0.614 -0.831 -1.04 -1.139 -1.351 -1.578 -1.804 -1.93 -2.251 -2.342 -2.48 -2.654 -3.052 -3.238 -3.444 -3.68 -3.935 -4.287 -4.797 -6.79 -3 ,17988 ,TETRA ,17559313,Sat Nov 27 06:12:44 CET,Sat Nov 27 08:12:36 CET,0.0 2.332 2.944 3.41 3.783 4.104 4.385 4.598 4.958 5.112 5.248 5.307 5.602 5.734 5.977 6.2 6.411 6.502 6.675 6.849 7.095 7.259 7.412 7.628 7.847 8.031 8.193 8.37 8.598 8.798 8.987 9.199 9.417 9.633 9.884 10.147 10.37 10.619 10.893 11.161 11.407 11.686 11.965 12.204 12.509 12.84 13.156 13.444 13.613 13.516 12.949 11.896 10.854 9.938 9.144 8.429 7.8 7.219 6.717 6.202 5.735 5.319 4.916 4.53 4.177 3.845 3.478 3.152 2.88 2.597 2.3 2.052 1.807 1.558 1.361 1.149 0.93 0.692 0.442 0.285 0.122 -0.136 -0.313 -0.518 -0.632 -0.86 -1.097 -1.357 -1.496 -1.822 -1.928 -2.078 -2.238 -2.609 -2.816 -3.043 -3.306 -3.578 -3.888 -4.304 -6.276 -4 ,5444 ,TETRA ,17559314,Sat Nov 27 06:13:49 CET,Sat Nov 27 08:12:01 CET,0.0 1.831 2.29 2.643 3.016 3.307 3.502 3.68 4.005 4.142 4.269 4.348 4.654 4.784 5.025 5.261 5.494 5.601 5.793 5.99 6.285 6.463 6.627 6.85 7.046 7.226 7.387 7.552 7.768 7.956 8.134 8.348 8.551 8.74 8.957 9.212 9.463 9.708 9.952 10.226 10.496 10.786 11.118 11.422 11.707 11.982 12.281 12.544 12.665 12.526 11.986 11.101 10.203 9.332 8.512 7.755 7.099 6.526 6.055 5.536 5.062 4.648 4.255 3.897 3.55 3.215 2.867 2.55 2.269 1.973 1.658 1.401 1.145 0.885 0.681 0.465 0.246 0.021 -0.216 -0.382 -0.562 -0.835 -1.016 -1.213 -1.316 -1.521 -1.754 -2.022 -2.153 -2.463 -2.552 -2.697 -2.862 -3.245 -3.469 -3.7 -3.962 -4.271 -4.706 -5.399 -8.878 -5 ,24343 ,TETRA ,17559315,Sat Nov 27 06:13:49 CET,Sat Nov 27 08:09:41 CET,0.0 2.415 2.972 3.358 3.682 3.918 4.118 4.293 4.627 4.789 4.935 5.015 5.305 5.411 5.616 5.795 5.968 6.058 6.235 6.414 6.652 6.783 6.911 7.113 7.31 7.497 7.681 7.847 8.04 8.224 8.427 8.679 8.892 9.097 9.34 9.606 9.833 10.054 10.308 10.579 10.845 11.14 11.453 11.714 11.968 12.216 12.509 12.818 13.023 12.976 12.521 11.587 10.628 9.755 8.968 8.215 7.546 6.969 6.449 5.908 5.448 5.015 4.583 4.183 3.83 3.524 3.205 2.903 2.638 2.371 2.098 1.862 1.603 1.347 1.152 0.94 0.714 0.482 0.253 0.094 -0.072 -0.353 -0.551 -0.746 -0.846 -1.052 -1.269 -1.496 -1.615 -1.926 -2.013 -2.149 -2.302 -2.671 -2.861 -3.056 -3.278 -3.593 -3.99 -4.454 -6.637 -6 ,26810 ,TETRA ,17559316,Sat Nov 27 06:13:49 CET,Sat Nov 27 08:11:04 CET,0.0 3.375 4.101 4.499 4.797 5.054 5.281 5.486 5.881 6.066 6.231 6.379 6.697 6.828 7.093 7.357 7.575 7.677 7.897 8.095 8.346 8.505 8.666 8.889 9.082 9.263 9.446 9.613 9.821 10.028 10.253 10.526 10.736 10.934 11.179 11.42 11.658 11.966 12.276 12.547 12.798 13.075 13.415 13.696 13.99 14.303 14.522 14.692 14.787 14.688 14.212 13.252 12.278 11.375 10.533 9.762 9.077 8.428 7.871 7.331 6.878 6.47 6.079 5.707 5.36 5.037 4.69 4.394 4.133 3.843 3.542 3.293 3.038 2.766 2.553 2.346 2.13 1.901 1.651 1.481 1.302 1.02 0.827 0.625 0.518 0.287 0.045 -0.196 -0.315 -0.632 -0.777 -0.984 -1.205 -1.718 -1.998 -2.29 -2.643 -3.069 -3.538 -4.151 -6.943 -7 ,15 ,TETRA ,17559317,Sat Nov 27 06:13:51 CET,Sat Nov 27 08:11:03 CET,0.0 2.167 2.707 3.08 3.424 3.701 3.956 4.154 4.468 4.629 4.784 4.887 5.199 5.34 5.596 5.819 6.023 6.116 6.303 6.484 6.723 6.874 7.022 7.223 7.406 7.587 7.765 7.921 8.123 8.343 8.543 8.756 8.938 9.116 9.357 9.651 9.912 10.157 10.399 10.647 10.895 11.164 11.459 11.718 11.987 12.231 12.494 12.734 12.801 12.685 12.132 11.161 10.252 9.393 8.562 7.779 7.102 6.474 5.911 5.352 4.868 4.415 3.985 3.589 3.222 2.878 2.513 2.186 1.895 1.596 1.295 1.046 0.784 0.52 0.316 0.102 -0.133 -0.382 -0.62 -0.777 -0.944 -1.216 -1.406 -1.591 -1.686 -1.904 -2.133 -2.359 -2.476 -2.792 -2.9 -3.049 -3.203 -3.594 -3.8 -3.998 -4.206 -4.424 -4.767 -5.292 -8.752 -8 ,30806 ,TETRA ,17559318,Sat Nov 27 06:13:52 CET,Sat Nov 27 08:13:13 CET,0.0 2.444 3.038 3.404 3.781 4.142 4.429 4.643 5.006 5.157 5.307 5.387 5.688 5.812 6.063 6.273 6.463 6.552 6.721 6.893 7.115 7.243 7.377 7.593 7.793 7.956 8.113 8.283 8.5 8.697 8.879 9.097 9.303 9.485 9.692 9.93 10.162 10.405 10.659 10.928 11.202 11.5 11.8 12.058 12.363 12.683 12.961 13.216 13.398 13.422 13.032 12.066 11.117 10.279 9.502 8.757 8.072 7.461 6.938 6.409 5.912 5.453 5.027 4.62 4.241 3.895 3.544 3.231 2.937 2.639 2.351 2.101 1.849 1.591 1.373 1.139 0.904 0.673 0.437 0.278 0.104 -0.169 -0.351 -0.534 -0.627 -0.837 -1.068 -1.316 -1.45 -1.774 -1.873 -2.041 -2.22 -2.633 -2.846 -3.078 -3.347 -3.659 -3.985 -4.54 -6.938 -9 ,17750 ,TETRA ,17559319,Sat Nov 27 06:13:49 CET,Sat Nov 27 08:12:43 CET,0.0 3.693 4.179 4.521 4.826 5.088 5.313 5.506 5.856 6.008 6.128 6.204 6.5 6.609 6.817 7.01 7.183 7.267 7.439 7.607 7.832 7.96 8.09 8.312 8.545 8.754 8.94 9.116 9.348 9.563 9.767 10.024 10.267 10.468 10.676 10.913 11.142 11.385 11.643 11.917 12.169 12.402 12.67 12.923 13.181 13.432 13.66 13.853 13.95 13.816 13.231 12.244 11.261 10.371 9.576 8.819 8.127 7.518 7.003 6.502 6.071 5.649 5.243 4.872 4.505 4.157 3.784 3.451 3.177 2.901 2.604 2.334 2.05 1.771 1.561 1.342 1.117 0.882 0.622 0.449 0.26 -0.055 -0.26 -0.485 -0.609 -0.862 -1.101 -1.341 -1.483 -1.828 -1.93 -2.079 -2.239 -2.614 -2.821 -3.103 -3.463 -3.843 -4.209 -4.706 -6.133 -10 ,20663 ,TETRA ,17559320,Sat Nov 27 06:14:46 CET,Sat Nov 27 08:12:04 CET,0.0 2.002 2.478 2.768 3.017 3.237 3.416 3.575 3.884 4.032 4.179 4.257 4.55 4.677 4.914 5.115 5.319 5.423 5.609 5.781 6.011 6.159 6.315 6.542 6.743 6.923 7.092 7.242 7.44 7.633 7.802 8.016 8.239 8.437 8.667 8.94 9.173 9.414 9.665 9.911 10.182 10.499 10.856 11.169 11.465 11.751 12.016 12.218 12.354 12.308 11.861 10.994 10.027 9.149 8.425 7.755 7.137 6.539 6.015 5.488 5.032 4.618 4.211 3.833 3.489 3.169 2.82 2.491 2.205 1.916 1.621 1.384 1.135 0.859 0.629 0.392 0.157 -0.087 -0.349 -0.527 -0.71 -0.994 -1.196 -1.407 -1.512 -1.729 -1.939 -2.169 -2.297 -2.616 -2.696 -2.852 -3.018 -3.387 -3.601 -3.829 -4.102 -4.436 -4.837 -5.428 -7.859 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_67_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_67_26.txt deleted file mode 100644 index 0777de28..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_67_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8326 ,TETRA ,17559321,Sat Nov 27 06:14:49 CET,Sat Nov 27 08:12:58 CET,0.0 3.408 3.927 4.298 4.589 4.811 5.013 5.207 5.566 5.743 5.913 6.06 6.354 6.494 6.778 7.051 7.322 7.454 7.699 7.935 8.262 8.467 8.679 8.978 9.247 9.517 9.775 10.007 10.303 10.586 10.861 11.206 11.539 11.859 12.228 12.635 13.035 13.474 13.952 14.445 14.936 15.515 16.21 16.911 17.702 18.577 19.575 20.687 22.062 23.644 25.481 26.944 27.698 28.109 28.302 28.345 28.322 28.27 28.2 28.11 28.02 27.909 27.78 27.665 27.552 27.423 27.269 27.131 26.995 26.833 26.668 26.532 26.389 26.245 26.129 26.007 25.882 25.745 25.601 25.504 25.394 25.216 25.1 24.963 24.891 24.754 24.608 24.429 24.32 24.067 23.986 23.867 23.742 23.46 23.285 23.1 22.903 22.695 22.442 22.083 20.892 -2 ,24397 ,TETRA ,17559322,Sat Nov 27 06:15:47 CET,Sat Nov 27 08:16:49 CET,0.0 1.861 2.283 2.64 2.958 3.234 3.467 3.648 3.966 4.124 4.282 4.423 4.74 4.881 5.118 5.333 5.557 5.673 5.885 6.086 6.384 6.581 6.769 7.019 7.265 7.518 7.767 8.001 8.293 8.578 8.859 9.183 9.491 9.812 10.177 10.563 10.93 11.339 11.792 12.292 12.824 13.421 14.113 14.804 15.597 16.467 17.494 18.66 20.005 21.521 23.257 24.66 25.476 25.928 26.125 26.17 26.165 26.152 26.114 26.026 25.913 25.798 25.662 25.515 25.371 25.223 25.061 24.909 24.77 24.621 24.473 24.35 24.201 24.028 23.888 23.737 23.589 23.44 23.265 23.149 23.037 22.839 22.685 22.526 22.447 22.287 22.115 21.95 21.867 21.628 21.54 21.414 21.283 21.002 20.832 20.655 20.463 20.204 19.938 19.638 18.909 -3 ,4130 ,TETRA ,17559323,Sat Nov 27 06:15:47 CET,Sat Nov 27 08:16:39 CET,0.0 1.441 1.859 2.131 2.396 2.642 2.84 3.012 3.364 3.521 3.674 3.813 4.118 4.261 4.511 4.748 4.992 5.111 5.337 5.549 5.867 6.079 6.275 6.564 6.845 7.114 7.371 7.609 7.894 8.18 8.461 8.785 9.104 9.414 9.772 10.177 10.57 11.002 11.473 11.988 12.532 13.147 13.865 14.567 15.404 16.345 17.4 18.568 19.853 21.299 22.998 24.327 25.002 25.346 25.508 25.564 25.534 25.448 25.349 25.236 25.117 24.993 24.866 24.728 24.59 24.442 24.287 24.142 24.003 23.867 23.726 23.6 23.461 23.296 23.159 23.02 22.864 22.682 22.494 22.375 22.251 22.06 21.92 21.761 21.68 21.505 21.323 21.144 21.048 20.803 20.714 20.596 20.458 20.16 19.996 19.812 19.601 19.363 19.076 18.643 17.541 -4 ,14575 ,TETRA ,17559324,Sat Nov 27 06:15:47 CET,Sat Nov 27 08:15:24 CET,0.0 1.649 2.221 2.673 3.017 3.312 3.554 3.736 4.045 4.177 4.305 4.404 4.691 4.808 5.021 5.218 5.397 5.489 5.682 5.853 6.09 6.251 6.41 6.652 6.884 7.097 7.299 7.493 7.767 8.047 8.301 8.595 8.882 9.167 9.498 9.856 10.19 10.568 10.986 11.443 11.925 12.473 13.128 13.77 14.5 15.321 16.286 17.351 18.585 20.063 21.776 23.113 23.814 24.209 24.436 24.523 24.545 24.537 24.476 24.375 24.262 24.158 24.056 23.942 23.843 23.741 23.614 23.473 23.346 23.219 23.069 22.951 22.824 22.676 22.556 22.43 22.294 22.151 22.006 21.896 21.787 21.631 21.527 21.414 21.349 21.206 21.048 20.877 20.789 20.554 20.498 20.387 20.255 19.975 19.818 19.645 19.472 19.253 18.993 18.627 17.25 -5 ,22999 ,TETRA ,17559325,Sat Nov 27 06:15:49 CET,Sat Nov 27 08:16:19 CET,0.0 0.806 1.181 1.512 1.773 1.993 2.196 2.399 2.788 2.968 3.132 3.286 3.612 3.759 3.99 4.196 4.413 4.522 4.718 4.904 5.186 5.37 5.545 5.797 6.033 6.261 6.495 6.726 7.019 7.303 7.564 7.879 8.189 8.489 8.868 9.284 9.65 10.066 10.535 11.027 11.529 12.073 12.705 13.373 14.2 15.105 16.115 17.263 18.608 20.201 22.037 23.451 24.174 24.584 24.818 24.913 24.942 24.903 24.818 24.69 24.551 24.427 24.283 24.117 23.945 23.785 23.612 23.454 23.317 23.168 23.008 22.873 22.726 22.558 22.43 22.29 22.139 21.99 21.832 21.719 21.605 21.427 21.297 21.155 21.084 20.939 20.769 20.58 20.486 20.258 20.189 20.064 19.938 19.648 19.478 19.325 19.163 18.943 18.673 18.331 17.431 -6 ,30304 ,TETRA ,17559326,Sat Nov 27 06:16:50 CET,Sat Nov 27 08:14:28 CET,0.0 2.526 3.069 3.446 3.752 4.026 4.278 4.497 4.83 4.984 5.146 5.315 5.627 5.771 6.033 6.273 6.508 6.62 6.843 7.053 7.347 7.539 7.733 8.011 8.258 8.51 8.764 9.0 9.289 9.576 9.852 10.178 10.516 10.847 11.221 11.65 12.051 12.487 12.957 13.445 13.945 14.525 15.207 15.879 16.669 17.524 18.512 19.633 20.916 22.433 24.256 25.638 26.313 26.667 26.841 26.875 26.857 26.798 26.698 26.596 26.5 26.379 26.243 26.119 25.987 25.842 25.687 25.521 25.358 25.186 25.009 24.865 24.689 24.493 24.349 24.188 24.033 23.885 23.73 23.618 23.499 23.315 23.18 23.037 22.962 22.821 22.659 22.459 22.359 22.112 22.032 21.909 21.77 21.448 21.281 21.116 20.929 20.712 20.446 20.082 19.39 -7 ,31305 ,TETRA ,17559327,Sat Nov 27 06:16:50 CET,Sat Nov 27 07:56:36 CET,0.0 1.249 1.676 2.058 2.328 2.586 2.831 3.04 3.418 3.582 3.738 3.896 4.216 4.364 4.656 4.925 5.179 5.295 5.515 5.729 6.052 6.258 6.448 6.731 7.014 7.296 7.555 7.8 8.126 8.443 8.754 9.137 9.515 9.866 10.258 10.696 11.121 11.585 12.08 12.592 13.104 13.693 14.387 15.099 15.916 16.788 17.796 18.948 20.237 21.67 23.345 24.701 25.464 25.827 26.004 26.102 26.128 26.112 26.056 25.984 25.903 25.786 25.651 25.532 25.41 25.276 25.153 25.047 24.935 24.798 24.638 24.497 24.344 24.185 24.06 23.92 23.78 23.636 23.46 23.326 23.191 22.982 22.827 22.669 22.59 22.43 22.261 22.073 21.962 21.709 21.621 21.494 21.367 21.071 20.902 20.727 20.533 20.28 19.943 19.498 18.451 -8 ,22541 ,TETRA ,17559328,Sat Nov 27 06:16:49 CET,Sat Nov 27 07:56:57 CET,0.0 0.879 1.256 1.536 1.761 1.969 2.163 2.348 2.699 2.848 2.987 3.1 3.394 3.52 3.758 4.012 4.283 4.406 4.634 4.853 5.153 5.346 5.534 5.803 6.058 6.313 6.578 6.839 7.175 7.492 7.775 8.099 8.402 8.687 9.025 9.4 9.76 10.171 10.607 11.075 11.577 12.145 12.807 13.488 14.284 15.137 16.124 17.256 18.574 20.101 21.903 23.319 24.065 24.49 24.705 24.823 24.867 24.814 24.749 24.665 24.574 24.467 24.332 24.19 24.065 23.965 23.843 23.726 23.624 23.508 23.365 23.225 23.07 22.913 22.786 22.65 22.51 22.349 22.174 22.062 21.948 21.762 21.636 21.504 21.43 21.27 21.092 20.899 20.797 20.558 20.499 20.394 20.287 20.063 19.93 19.76 19.523 19.269 19.033 18.658 17.572 -9 ,25168 ,TETRA ,17559329,Sat Nov 27 06:16:50 CET,Sat Nov 27 08:20:21 CET,0.0 1.468 1.891 2.199 2.468 2.726 2.967 3.166 3.458 3.592 3.735 3.857 4.166 4.315 4.597 4.873 5.138 5.261 5.494 5.707 6.017 6.224 6.435 6.734 7.007 7.286 7.554 7.808 8.132 8.437 8.736 9.09 9.434 9.766 10.138 10.553 10.96 11.416 11.933 12.471 12.994 13.581 14.252 14.919 15.686 16.548 17.545 18.691 20.066 21.662 23.538 24.939 25.641 25.979 26.136 26.235 26.233 26.156 26.072 25.972 25.842 25.7 25.565 25.434 25.315 25.188 25.041 24.896 24.765 24.617 24.444 24.289 24.13 23.977 23.867 23.763 23.64 23.489 23.332 23.231 23.127 22.942 22.795 22.649 22.577 22.408 22.223 22.031 21.925 21.672 21.563 21.439 21.293 20.968 20.81 20.641 20.461 20.246 19.979 19.524 17.915 -10 ,8700 ,TETRA ,17559330,Sat Nov 27 06:16:50 CET,Sat Nov 27 08:15:11 CET,0.0 1.657 2.092 2.413 2.678 2.941 3.181 3.386 3.736 3.902 4.08 4.266 4.57 4.714 4.987 5.233 5.476 5.585 5.794 5.996 6.291 6.486 6.682 6.982 7.248 7.483 7.72 7.948 8.23 8.501 8.779 9.129 9.455 9.76 10.117 10.517 10.903 11.348 11.84 12.35 12.89 13.488 14.123 14.762 15.544 16.409 17.408 18.52 19.789 21.327 23.237 24.769 25.511 25.864 26.048 26.12 26.127 26.098 26.036 25.939 25.856 25.758 25.612 25.441 25.294 25.153 24.974 24.813 24.659 24.496 24.334 24.19 24.028 23.845 23.697 23.557 23.421 23.281 23.125 23.002 22.878 22.703 22.575 22.429 22.347 22.184 22.016 21.835 21.739 21.486 21.374 21.245 21.116 20.802 20.623 20.441 20.248 20.021 19.745 19.385 18.114 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_67_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_67_37.txt deleted file mode 100644 index 84c2b451..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_67_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32670 ,TETRA ,17559331,Sat Nov 27 06:16:50 CET,Sat Nov 27 07:57:19 CET,0.0 0.765 1.096 1.341 1.557 1.749 1.908 2.061 2.329 2.442 2.548 2.584 2.842 2.937 3.128 3.307 3.454 3.522 3.656 3.787 3.963 4.068 4.176 4.338 4.481 4.618 4.73 4.828 4.949 5.053 5.161 5.292 5.419 5.537 5.659 5.79 5.891 6.003 6.141 6.255 6.32 6.36 6.38 6.352 6.245 6.044 5.737 5.218 4.359 3.044 0.699 -2.122 -4.362 -6.201 -7.739 -9.133 -10.352 -11.429 -12.327 -13.2 -13.926 -14.552 -15.154 -15.729 -16.245 -16.701 -17.181 -17.6 -17.961 -18.348 -18.752 -19.072 -19.394 -19.731 -19.994 -20.272 -20.557 -20.833 -21.109 -21.303 -21.5 -21.794 -22.003 -22.221 -22.331 -22.56 -22.793 -23.037 -23.163 -23.469 -23.548 -23.696 -23.844 -24.158 -24.342 -24.523 -24.693 -24.891 -25.128 -25.446 -26.141 -2 ,31377 ,TETRA ,17559332,Sat Nov 27 06:17:52 CET,Sat Nov 27 08:11:06 CET,0.0 0.659 0.966 1.238 1.472 1.677 1.847 1.991 2.24 2.364 2.48 2.523 2.781 2.888 3.076 3.246 3.411 3.491 3.658 3.813 4.03 4.166 4.288 4.448 4.592 4.729 4.859 4.986 5.135 5.265 5.377 5.52 5.666 5.799 5.932 6.046 6.144 6.265 6.408 6.535 6.623 6.691 6.715 6.68 6.609 6.46 6.159 5.675 4.896 3.592 1.318 -1.484 -3.758 -5.582 -7.084 -8.432 -9.618 -10.632 -11.459 -12.3 -13.052 -13.714 -14.313 -14.859 -15.362 -15.825 -16.292 -16.71 -17.084 -17.472 -17.871 -18.19 -18.507 -18.811 -19.038 -19.274 -19.532 -19.796 -20.057 -20.239 -20.43 -20.707 -20.904 -21.119 -21.227 -21.446 -21.675 -21.916 -22.039 -22.349 -22.437 -22.591 -22.746 -23.066 -23.252 -23.46 -23.694 -23.958 -24.217 -24.568 -25.276 -3 ,23623 ,TETRA ,17559333,Sat Nov 27 06:16:50 CET,Sat Nov 27 07:57:36 CET,0.0 0.769 1.216 1.568 1.862 2.105 2.31 2.483 2.768 2.892 3.022 3.107 3.389 3.543 3.823 4.028 4.195 4.268 4.403 4.532 4.724 4.837 4.941 5.092 5.249 5.4 5.534 5.666 5.826 5.964 6.101 6.252 6.376 6.489 6.612 6.745 6.878 7.023 7.139 7.235 7.312 7.372 7.404 7.389 7.302 7.091 6.734 6.182 5.362 4.055 1.705 -1.102 -3.331 -5.147 -6.686 -8.027 -9.147 -10.146 -10.987 -11.806 -12.507 -13.108 -13.661 -14.195 -14.692 -15.126 -15.577 -15.985 -16.345 -16.727 -17.109 -17.408 -17.72 -18.051 -18.291 -18.536 -18.811 -19.094 -19.384 -19.58 -19.786 -20.12 -20.344 -20.585 -20.709 -20.951 -21.203 -21.447 -21.569 -21.88 -21.98 -22.123 -22.278 -22.637 -22.832 -23.035 -23.248 -23.501 -23.786 -24.096 -24.607 -4 ,27375 ,TETRA ,17559334,Sat Nov 27 06:16:50 CET,Sat Nov 27 07:57:34 CET,0.0 0.931 1.322 1.596 1.804 1.97 2.135 2.287 2.551 2.681 2.807 2.882 3.148 3.247 3.431 3.612 3.773 3.844 3.992 4.138 4.332 4.451 4.565 4.714 4.856 5.01 5.153 5.288 5.456 5.608 5.747 5.902 6.035 6.166 6.302 6.433 6.55 6.677 6.829 6.961 7.047 7.093 7.133 7.134 7.066 6.939 6.653 6.17 5.429 4.246 2.102 -0.549 -2.712 -4.528 -6.083 -7.446 -8.591 -9.579 -10.396 -11.187 -11.879 -12.526 -13.122 -13.678 -14.194 -14.645 -15.106 -15.521 -15.872 -16.221 -16.589 -16.89 -17.204 -17.538 -17.795 -18.054 -18.315 -18.595 -18.892 -19.106 -19.325 -19.641 -19.861 -20.072 -20.177 -20.416 -20.666 -20.914 -21.042 -21.362 -21.447 -21.584 -21.723 -22.046 -22.223 -22.399 -22.594 -22.823 -23.096 -23.481 -24.617 -5 ,1156 ,TETRA ,17559335,Sat Nov 27 06:16:50 CET,Sat Nov 27 07:57:33 CET,0.0 0.809 1.104 1.368 1.597 1.782 1.955 2.127 2.432 2.56 2.688 2.781 3.055 3.157 3.348 3.511 3.652 3.717 3.857 4.001 4.185 4.299 4.418 4.584 4.744 4.911 5.061 5.198 5.371 5.521 5.661 5.799 5.919 6.054 6.194 6.314 6.424 6.537 6.645 6.724 6.784 6.845 6.849 6.824 6.725 6.543 6.258 5.753 4.971 3.696 1.473 -1.215 -3.397 -5.192 -6.697 -7.996 -9.118 -10.112 -10.961 -11.804 -12.538 -13.193 -13.795 -14.348 -14.841 -15.28 -15.752 -16.16 -16.51 -16.88 -17.256 -17.579 -17.9 -18.216 -18.485 -18.757 -19.025 -19.303 -19.584 -19.771 -19.962 -20.27 -20.479 -20.696 -20.814 -21.042 -21.275 -21.523 -21.65 -21.966 -22.065 -22.207 -22.355 -22.673 -22.847 -23.026 -23.211 -23.423 -23.661 -23.977 -24.574 -6 ,4859 ,TETRA ,17559336,Sat Nov 27 06:17:51 CET,Sat Nov 27 07:58:29 CET,0.0 0.535 0.845 1.129 1.339 1.506 1.657 1.816 2.122 2.251 2.365 2.421 2.682 2.774 2.955 3.133 3.302 3.385 3.53 3.642 3.808 3.919 4.028 4.186 4.317 4.44 4.562 4.677 4.819 4.948 5.077 5.217 5.336 5.445 5.558 5.69 5.821 5.94 6.029 6.103 6.173 6.227 6.248 6.2 6.092 5.929 5.638 5.156 4.401 3.151 0.855 -1.891 -4.046 -5.867 -7.441 -8.817 -9.945 -10.907 -11.738 -12.611 -13.346 -13.968 -14.551 -15.082 -15.56 -16.004 -16.49 -16.91 -17.26 -17.625 -17.991 -18.285 -18.594 -18.942 -19.208 -19.464 -19.734 -20.011 -20.298 -20.501 -20.703 -21.011 -21.221 -21.438 -21.551 -21.784 -22.026 -22.27 -22.397 -22.712 -22.816 -22.978 -23.136 -23.45 -23.623 -23.821 -24.043 -24.257 -24.492 -24.774 -25.421 -7 ,7307 ,TETRA ,17559337,Sat Nov 27 06:17:52 CET,Sat Nov 27 08:07:12 CET,0.0 0.54 0.82 1.045 1.234 1.412 1.569 1.699 1.943 2.061 2.169 2.209 2.456 2.553 2.741 2.92 3.081 3.158 3.301 3.435 3.63 3.749 3.868 4.05 4.209 4.345 4.472 4.579 4.715 4.862 5.007 5.178 5.318 5.442 5.577 5.715 5.832 5.95 6.07 6.142 6.198 6.273 6.328 6.313 6.195 5.983 5.666 5.193 4.439 3.2 1.035 -1.611 -3.777 -5.516 -6.95 -8.237 -9.337 -10.296 -11.117 -11.915 -12.584 -13.179 -13.743 -14.28 -14.77 -15.192 -15.642 -16.073 -16.447 -16.828 -17.214 -17.526 -17.842 -18.172 -18.436 -18.695 -18.948 -19.209 -19.495 -19.697 -19.904 -20.225 -20.447 -20.683 -20.8 -21.044 -21.294 -21.552 -21.688 -22.005 -22.091 -22.238 -22.411 -22.772 -22.949 -23.154 -23.369 -23.584 -23.832 -24.119 -24.565 -8 ,8971 ,TETRA ,17559338,Sat Nov 27 06:17:52 CET,Sat Nov 27 07:58:15 CET,0.0 0.902 1.244 1.481 1.706 1.915 2.107 2.289 2.6 2.735 2.852 2.899 3.15 3.235 3.431 3.625 3.788 3.864 4.006 4.131 4.293 4.403 4.525 4.704 4.856 4.995 5.133 5.269 5.437 5.576 5.684 5.825 5.968 6.074 6.192 6.317 6.411 6.518 6.626 6.7 6.751 6.793 6.828 6.829 6.742 6.548 6.217 5.721 4.972 3.71 1.463 -1.268 -3.541 -5.434 -6.986 -8.304 -9.431 -10.47 -11.352 -12.202 -12.915 -13.534 -14.112 -14.649 -15.161 -15.633 -16.101 -16.518 -16.885 -17.251 -17.616 -17.911 -18.216 -18.539 -18.779 -19.016 -19.265 -19.522 -19.787 -19.983 -20.197 -20.521 -20.738 -20.961 -21.072 -21.305 -21.542 -21.797 -21.924 -22.224 -22.297 -22.452 -22.628 -22.993 -23.182 -23.387 -23.608 -23.858 -24.109 -24.39 -25.181 -9 ,13698 ,TETRA ,17559339,Sat Nov 27 06:17:52 CET,Sat Nov 27 08:19:46 CET,0.0 0.847 1.157 1.416 1.625 1.807 2.0 2.174 2.457 2.58 2.695 2.724 2.974 3.063 3.245 3.411 3.562 3.635 3.78 3.922 4.114 4.223 4.332 4.493 4.635 4.763 4.873 4.976 5.11 5.234 5.361 5.504 5.614 5.705 5.816 5.945 6.056 6.159 6.25 6.317 6.364 6.416 6.441 6.409 6.319 6.139 5.81 5.281 4.466 3.144 0.87 -1.864 -4.129 -6.019 -7.641 -9.048 -10.223 -11.267 -12.164 -13.052 -13.787 -14.427 -15.03 -15.596 -16.109 -16.554 -17.019 -17.44 -17.798 -18.157 -18.526 -18.829 -19.122 -19.422 -19.667 -19.911 -20.163 -20.44 -20.713 -20.89 -21.079 -21.363 -21.569 -21.794 -21.908 -22.16 -22.437 -22.73 -22.87 -23.188 -23.283 -23.424 -23.572 -23.891 -24.058 -24.258 -24.474 -24.709 -24.984 -25.286 -25.798 -10 ,25605 ,TETRA ,17559340,Sat Nov 27 06:17:54 CET,Sat Nov 27 08:20:52 CET,0.0 0.559 0.865 1.09 1.284 1.45 1.583 1.697 1.889 1.989 2.099 2.147 2.401 2.486 2.656 2.806 2.944 3.012 3.142 3.274 3.452 3.567 3.682 3.832 3.961 4.082 4.195 4.316 4.471 4.596 4.715 4.851 4.977 5.103 5.231 5.35 5.443 5.53 5.615 5.708 5.786 5.842 5.868 5.863 5.797 5.621 5.272 4.763 3.991 2.699 0.387 -2.379 -4.571 -6.418 -7.971 -9.315 -10.463 -11.472 -12.303 -13.118 -13.816 -14.441 -15.035 -15.59 -16.109 -16.572 -17.042 -17.443 -17.785 -18.149 -18.535 -18.856 -19.177 -19.509 -19.773 -20.035 -20.301 -20.575 -20.852 -21.039 -21.242 -21.566 -21.793 -22.024 -22.14 -22.37 -22.595 -22.85 -22.986 -23.297 -23.374 -23.514 -23.672 -24.021 -24.198 -24.368 -24.554 -24.788 -25.06 -25.388 -25.98 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_67_60.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_67_60.txt deleted file mode 100644 index 0ec06c23..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_67_60.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1260 ,KEBNE ,17024857,Wed Dec 22 11:16:59 CET,Wed Dec 22 12:57:41 CET,0.0 0.968 1.286 1.506 1.693 1.849 1.986 2.131 2.413 2.535 2.64 2.647 2.887 2.964 3.11 3.246 3.388 3.454 3.562 3.657 3.788 3.867 3.946 4.08 4.21 4.317 4.408 4.506 4.626 4.725 4.809 4.902 4.978 5.048 5.145 5.225 5.281 5.343 5.373 5.389 5.413 5.393 5.301 5.189 5.035 4.787 4.379 3.773 2.896 1.587 -0.708 -3.479 -5.64 -7.41 -8.872 -10.154 -11.281 -12.292 -13.11 -13.876 -14.546 -15.145 -15.694 -16.189 -16.645 -17.058 -17.484 -17.871 -18.203 -18.543 -18.886 -19.165 -19.452 -19.745 -19.971 -20.208 -20.451 -20.699 -20.951 -21.118 -21.292 -21.569 -21.761 -21.952 -22.047 -22.247 -22.467 -22.72 -22.847 -23.142 -23.202 -23.331 -23.47 -23.76 -23.926 -24.096 -24.263 -24.458 -24.723 -25.136 -26.264 -2 ,27035 ,KEBNE ,17024858,Wed Dec 22 11:17:03 CET,Wed Dec 22 12:53:37 CET,0.0 0.629 0.987 1.228 1.416 1.599 1.754 1.893 2.146 2.252 2.357 2.398 2.639 2.712 2.853 2.992 3.118 3.169 3.265 3.368 3.522 3.608 3.686 3.797 3.888 3.98 4.082 4.176 4.286 4.385 4.462 4.55 4.641 4.722 4.805 4.875 4.928 5.003 5.06 5.106 5.153 5.183 5.188 5.124 4.945 4.668 4.241 3.627 2.736 1.322 -0.941 -3.501 -5.564 -7.276 -8.722 -9.955 -11.001 -11.947 -12.738 -13.518 -14.178 -14.753 -15.288 -15.781 -16.229 -16.638 -17.066 -17.428 -17.745 -18.091 -18.455 -18.746 -19.03 -19.324 -19.556 -19.788 -20.012 -20.254 -20.508 -20.684 -20.869 -21.14 -21.32 -21.498 -21.588 -21.784 -22.004 -22.235 -22.347 -22.653 -22.707 -22.831 -22.962 -23.229 -23.366 -23.536 -23.762 -24.003 -24.253 -24.588 -25.615 -3 ,531 ,KEBNE ,17024859,Wed Dec 22 11:17:04 CET,Wed Dec 22 12:53:16 CET,0.0 1.089 1.392 1.622 1.812 1.977 2.13 2.266 2.49 2.586 2.678 2.687 2.934 3.009 3.142 3.279 3.419 3.484 3.611 3.726 3.875 3.966 4.056 4.19 4.303 4.406 4.511 4.612 4.732 4.842 4.936 5.019 5.104 5.188 5.277 5.364 5.425 5.468 5.507 5.534 5.511 5.457 5.399 5.32 5.179 4.95 4.578 4.006 3.095 1.722 -0.636 -3.441 -5.615 -7.413 -8.902 -10.185 -11.279 -12.232 -13.018 -13.793 -14.455 -15.032 -15.582 -16.092 -16.549 -16.953 -17.37 -17.753 -18.093 -18.446 -18.801 -19.085 -19.37 -19.668 -19.899 -20.134 -20.375 -20.619 -20.876 -21.049 -21.223 -21.507 -21.705 -21.911 -22.02 -22.247 -22.484 -22.734 -22.852 -23.156 -23.233 -23.377 -23.519 -23.808 -23.954 -24.105 -24.276 -24.468 -24.698 -25.039 -26.046 -4 ,1661 ,KEBNE ,17024860,Wed Dec 22 11:17:04 CET,Wed Dec 22 12:53:31 CET,0.0 0.802 1.059 1.249 1.415 1.556 1.693 1.826 2.057 2.166 2.272 2.279 2.518 2.591 2.735 2.878 3.008 3.067 3.171 3.273 3.416 3.509 3.61 3.732 3.85 3.965 4.041 4.117 4.219 4.307 4.391 4.479 4.563 4.644 4.727 4.808 4.895 4.997 5.111 5.222 5.296 5.345 5.379 5.344 5.183 4.946 4.592 4.042 3.134 1.701 -0.599 -3.312 -5.478 -7.289 -8.783 -10.033 -11.103 -12.071 -12.883 -13.659 -14.322 -14.896 -15.438 -15.954 -16.412 -16.836 -17.263 -17.635 -17.956 -18.273 -18.616 -18.903 -19.185 -19.485 -19.729 -19.967 -20.196 -20.442 -20.705 -20.888 -21.091 -21.43 -21.663 -21.897 -22.017 -22.264 -22.522 -22.788 -22.927 -23.265 -23.383 -23.542 -23.712 -24.059 -24.241 -24.444 -24.677 -24.939 -25.211 -25.536 -26.267 -5 ,19782 ,KEBNE ,17024861,Wed Dec 22 11:17:02 CET,Wed Dec 22 12:55:06 CET,0.0 1.024 1.376 1.631 1.818 1.962 2.101 2.233 2.465 2.568 2.668 2.69 2.931 3.0 3.149 3.289 3.404 3.456 3.561 3.665 3.8 3.886 3.967 4.064 4.153 4.256 4.356 4.442 4.543 4.634 4.719 4.82 4.909 4.988 5.077 5.189 5.282 5.347 5.403 5.453 5.463 5.424 5.351 5.248 5.093 4.868 4.486 3.912 3.098 1.787 -0.575 -3.336 -5.494 -7.278 -8.753 -9.998 -11.057 -12.017 -12.818 -13.577 -14.228 -14.791 -15.307 -15.795 -16.255 -16.675 -17.085 -17.443 -17.756 -18.078 -18.426 -18.711 -18.993 -19.287 -19.514 -19.747 -19.996 -20.26 -20.522 -20.691 -20.869 -21.156 -21.353 -21.548 -21.644 -21.841 -22.051 -22.281 -22.393 -22.7 -22.749 -22.882 -23.021 -23.299 -23.464 -23.644 -23.849 -24.108 -24.392 -24.686 -25.496 -6 ,16586 ,KEBNE ,17024862,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:58:57 CET,0.0 1.172 1.458 1.688 1.888 2.053 2.186 2.31 2.55 2.651 2.737 2.748 2.987 3.071 3.217 3.344 3.464 3.52 3.631 3.741 3.886 3.976 4.061 4.165 4.254 4.348 4.438 4.512 4.61 4.718 4.821 4.931 5.015 5.088 5.185 5.286 5.36 5.429 5.498 5.564 5.614 5.621 5.561 5.472 5.328 5.075 4.652 4.018 3.073 1.698 -0.535 -3.182 -5.303 -7.044 -8.533 -9.814 -10.876 -11.826 -12.629 -13.412 -14.063 -14.623 -15.173 -15.696 -16.151 -16.544 -16.956 -17.337 -17.654 -17.969 -18.299 -18.561 -18.83 -19.13 -19.362 -19.583 -19.818 -20.066 -20.325 -20.514 -20.701 -20.975 -21.155 -21.331 -21.428 -21.633 -21.836 -22.059 -22.186 -22.506 -22.625 -22.8 -22.98 -23.35 -23.551 -23.765 -23.987 -24.264 -24.592 -25.003 -26.142 -7 ,21155 ,KEBNE ,17024863,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:58:34 CET,0.0 0.952 1.343 1.624 1.825 1.981 2.116 2.251 2.487 2.587 2.676 2.678 2.919 2.999 3.149 3.284 3.408 3.471 3.586 3.685 3.827 3.912 3.986 4.092 4.188 4.284 4.381 4.462 4.557 4.641 4.726 4.825 4.901 4.959 5.04 5.134 5.186 5.237 5.285 5.316 5.318 5.289 5.276 5.236 5.059 4.808 4.429 3.799 2.82 1.343 -0.99 -3.753 -5.983 -7.789 -9.255 -10.52 -11.598 -12.536 -13.34 -14.128 -14.772 -15.324 -15.852 -16.358 -16.826 -17.231 -17.64 -18.013 -18.337 -18.67 -19.014 -19.283 -19.556 -19.846 -20.071 -20.315 -20.555 -20.794 -21.045 -21.212 -21.388 -21.666 -21.855 -22.058 -22.164 -22.374 -22.589 -22.812 -22.928 -23.237 -23.299 -23.435 -23.574 -23.865 -24.018 -24.181 -24.36 -24.599 -24.907 -25.241 -25.875 -8 ,15129 ,KEBNE ,17024864,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:59:07 CET,0.0 0.989 1.284 1.507 1.684 1.821 1.949 2.084 2.323 2.43 2.541 2.579 2.828 2.917 3.079 3.215 3.332 3.393 3.526 3.644 3.809 3.902 3.982 4.108 4.23 4.34 4.447 4.543 4.644 4.753 4.861 4.978 5.088 5.178 5.243 5.287 5.327 5.373 5.414 5.439 5.459 5.452 5.398 5.307 5.154 4.928 4.569 3.968 3.041 1.649 -0.675 -3.348 -5.493 -7.236 -8.651 -9.884 -10.943 -11.879 -12.662 -13.447 -14.127 -14.709 -15.25 -15.766 -16.239 -16.662 -17.103 -17.484 -17.808 -18.146 -18.504 -18.807 -19.106 -19.4 -19.634 -19.879 -20.122 -20.376 -20.64 -20.818 -21.006 -21.29 -21.48 -21.67 -21.768 -21.979 -22.194 -22.417 -22.53 -22.841 -22.917 -23.051 -23.191 -23.51 -23.683 -23.86 -24.043 -24.27 -24.551 -24.881 -25.747 -9 ,12054 ,KEBNE ,17024865,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:58:35 CET,0.0 0.974 1.285 1.517 1.711 1.893 2.062 2.204 2.435 2.55 2.653 2.677 2.926 3.011 3.178 3.32 3.434 3.495 3.622 3.734 3.891 3.985 4.059 4.157 4.255 4.358 4.454 4.544 4.671 4.784 4.893 5.032 5.17 5.281 5.374 5.475 5.557 5.633 5.706 5.749 5.772 5.773 5.723 5.646 5.505 5.258 4.896 4.336 3.467 2.09 -0.205 -2.881 -5.048 -6.832 -8.303 -9.572 -10.666 -11.618 -12.409 -13.178 -13.817 -14.367 -14.891 -15.381 -15.843 -16.271 -16.698 -17.078 -17.416 -17.754 -18.088 -18.368 -18.659 -18.967 -19.203 -19.44 -19.674 -19.919 -20.166 -20.333 -20.511 -20.792 -20.99 -21.192 -21.297 -21.521 -21.752 -21.973 -22.087 -22.398 -22.471 -22.609 -22.744 -23.026 -23.181 -23.339 -23.511 -23.728 -23.992 -24.351 -25.369 -10 ,27144 ,KEBNE ,17024866,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:59:14 CET,0.0 1.032 1.265 1.439 1.596 1.743 1.886 2.025 2.259 2.369 2.472 2.509 2.76 2.843 2.985 3.107 3.235 3.301 3.436 3.551 3.684 3.776 3.874 4.0 4.096 4.185 4.268 4.345 4.461 4.57 4.654 4.736 4.801 4.873 4.959 5.028 5.068 5.108 5.157 5.183 5.156 5.109 5.038 4.895 4.673 4.389 3.962 3.379 2.513 1.163 -1.056 -3.659 -5.716 -7.435 -8.883 -10.168 -11.27 -12.231 -13.032 -13.822 -14.481 -15.042 -15.575 -16.085 -16.543 -16.937 -17.356 -17.734 -18.058 -18.394 -18.741 -19.037 -19.333 -19.621 -19.843 -20.071 -20.303 -20.542 -20.794 -20.969 -21.157 -21.457 -21.665 -21.883 -21.993 -22.213 -22.442 -22.68 -22.802 -23.113 -23.202 -23.345 -23.483 -23.79 -23.965 -24.148 -24.343 -24.544 -24.851 -25.28 -26.081 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_68_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_68_54.txt deleted file mode 100644 index b965eb49..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_68_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16935 ,TETRA ,17559341,Sat Nov 27 06:17:53 CET,Sat Nov 27 08:17:12 CET,0.0 1.613 2.031 2.314 2.517 2.709 2.862 2.968 3.15 3.227 3.291 3.284 3.505 3.58 3.728 3.855 3.959 4.002 4.089 4.183 4.305 4.369 4.42 4.496 4.578 4.65 4.712 4.76 4.816 4.87 4.919 4.978 5.03 5.063 5.076 5.078 5.074 5.065 5.035 4.991 4.907 4.773 4.608 4.419 4.116 3.71 3.158 2.33 1.081 -0.754 -3.645 -7.021 -9.703 -11.906 -13.742 -15.313 -16.648 -17.813 -18.804 -19.767 -20.576 -21.29 -21.938 -22.538 -23.08 -23.563 -24.082 -24.549 -24.936 -25.325 -25.738 -26.092 -26.446 -26.797 -27.07 -27.349 -27.632 -27.926 -28.238 -28.448 -28.653 -28.987 -29.224 -29.467 -29.592 -29.843 -30.108 -30.393 -30.536 -30.855 -30.988 -31.154 -31.318 -31.647 -31.828 -32.052 -32.298 -32.562 -32.917 -33.439 -35.376 -2 ,13399 ,TETRA ,17559342,Sat Nov 27 06:17:55 CET,Sat Nov 27 08:16:38 CET,0.0 1.148 1.519 1.788 2.006 2.177 2.322 2.441 2.659 2.762 2.84 2.85 3.059 3.117 3.237 3.355 3.463 3.514 3.618 3.705 3.805 3.879 3.945 4.024 4.097 4.168 4.239 4.302 4.368 4.434 4.494 4.549 4.591 4.634 4.678 4.695 4.687 4.655 4.612 4.573 4.518 4.42 4.246 4.029 3.751 3.359 2.753 1.92 0.729 -1.037 -3.985 -7.366 -10.071 -12.307 -14.12 -15.676 -16.985 -18.133 -19.095 -20.031 -20.856 -21.583 -22.248 -22.864 -23.423 -23.922 -24.436 -24.883 -25.264 -25.672 -26.097 -26.446 -26.811 -27.186 -27.473 -27.76 -28.048 -28.347 -28.655 -28.871 -29.085 -29.432 -29.682 -29.931 -30.055 -30.302 -30.551 -30.794 -30.937 -31.261 -31.396 -31.564 -31.731 -32.095 -32.299 -32.55 -32.855 -33.18 -33.542 -34.043 -36.244 -3 ,9492 ,TETRA ,17559343,Sat Nov 27 06:17:53 CET,Sat Nov 27 07:57:18 CET,0.0 2.259 2.524 2.701 2.859 3.008 3.149 3.271 3.46 3.555 3.661 3.683 3.881 3.942 4.057 4.172 4.292 4.35 4.451 4.545 4.688 4.768 4.822 4.9 4.983 5.044 5.108 5.174 5.257 5.323 5.372 5.418 5.446 5.473 5.503 5.54 5.562 5.552 5.522 5.466 5.383 5.274 5.095 4.875 4.563 4.124 3.507 2.644 1.388 -0.491 -3.471 -6.875 -9.627 -11.883 -13.76 -15.397 -16.784 -17.955 -18.932 -19.911 -20.733 -21.44 -22.107 -22.747 -23.344 -23.88 -24.432 -24.914 -25.323 -25.748 -26.179 -26.52 -26.866 -27.223 -27.498 -27.776 -28.068 -28.378 -28.691 -28.899 -29.117 -29.474 -29.708 -29.935 -30.059 -30.324 -30.608 -30.92 -31.075 -31.4 -31.549 -31.725 -31.893 -32.262 -32.518 -32.828 -33.145 -33.509 -33.899 -34.419 -36.201 -4 ,26069 ,TETRA ,17559344,Sat Nov 27 06:17:53 CET,Sat Nov 27 08:16:27 CET,0.0 1.825 2.273 2.543 2.748 2.961 3.132 3.28 3.522 3.613 3.691 3.687 3.901 3.956 4.058 4.151 4.236 4.281 4.366 4.444 4.551 4.606 4.666 4.759 4.838 4.906 4.956 4.998 5.054 5.099 5.139 5.196 5.236 5.265 5.302 5.329 5.354 5.37 5.352 5.304 5.241 5.147 4.986 4.768 4.453 4.006 3.386 2.608 1.473 -0.309 -3.233 -6.653 -9.369 -11.527 -13.303 -14.824 -16.118 -17.287 -18.266 -19.218 -20.028 -20.741 -21.413 -22.018 -22.554 -23.046 -23.558 -24.022 -24.408 -24.8 -25.231 -25.576 -25.924 -26.274 -26.543 -26.824 -27.091 -27.362 -27.668 -27.888 -28.104 -28.431 -28.661 -28.901 -29.025 -29.274 -29.531 -29.807 -29.956 -30.292 -30.433 -30.603 -30.792 -31.175 -31.422 -31.728 -32.052 -32.429 -32.797 -33.229 -34.805 -5 ,17193 ,TETRA ,17559345,Sat Nov 27 06:17:53 CET,Sat Nov 27 07:56:52 CET,0.0 1.176 1.492 1.772 1.946 2.11 2.267 2.389 2.606 2.688 2.759 2.754 2.971 3.039 3.163 3.27 3.37 3.416 3.498 3.57 3.661 3.718 3.773 3.866 3.959 4.03 4.102 4.181 4.268 4.348 4.428 4.51 4.585 4.642 4.673 4.698 4.717 4.715 4.703 4.691 4.637 4.555 4.433 4.237 3.961 3.587 3.033 2.266 1.137 -0.598 -3.556 -6.986 -9.644 -11.775 -13.555 -15.132 -16.47 -17.641 -18.643 -19.627 -20.448 -21.15 -21.819 -22.441 -22.996 -23.499 -23.993 -24.427 -24.809 -25.195 -25.606 -25.956 -26.316 -26.688 -26.958 -27.224 -27.511 -27.811 -28.11 -28.311 -28.523 -28.864 -29.105 -29.352 -29.479 -29.745 -30.011 -30.29 -30.433 -30.743 -30.875 -31.044 -31.214 -31.556 -31.756 -31.975 -32.217 -32.533 -32.914 -33.417 -35.866 -6 ,4047 ,TETRA ,17559346,Sat Nov 27 06:17:53 CET,Sat Nov 27 08:16:16 CET,0.0 1.249 1.519 1.756 1.96 2.113 2.236 2.35 2.578 2.681 2.752 2.786 3.017 3.091 3.219 3.317 3.412 3.459 3.542 3.606 3.706 3.771 3.827 3.909 3.984 4.052 4.113 4.177 4.261 4.337 4.397 4.432 4.463 4.5 4.529 4.55 4.557 4.558 4.547 4.518 4.466 4.376 4.223 3.999 3.692 3.302 2.696 1.836 0.592 -1.319 -4.395 -7.873 -10.585 -12.816 -14.647 -16.189 -17.468 -18.587 -19.585 -20.59 -21.425 -22.135 -22.783 -23.393 -23.964 -24.478 -25.021 -25.498 -25.88 -26.276 -26.711 -27.08 -27.443 -27.792 -28.069 -28.356 -28.634 -28.915 -29.209 -29.419 -29.646 -29.991 -30.221 -30.462 -30.587 -30.836 -31.101 -31.38 -31.524 -31.856 -32.0 -32.177 -32.354 -32.734 -32.975 -33.231 -33.51 -33.825 -34.178 -34.697 -36.656 -7 ,1786 ,TETRA ,17559347,Sat Nov 27 06:18:53 CET,Sat Nov 27 08:18:27 CET,0.0 1.035 1.399 1.646 1.827 1.983 2.125 2.25 2.459 2.551 2.64 2.66 2.872 2.928 3.035 3.151 3.264 3.309 3.392 3.467 3.561 3.623 3.678 3.747 3.833 3.915 3.975 4.033 4.1 4.153 4.198 4.245 4.282 4.318 4.35 4.381 4.411 4.412 4.388 4.33 4.238 4.116 3.931 3.727 3.422 2.973 2.371 1.56 0.358 -1.592 -4.744 -8.219 -10.881 -13.063 -14.877 -16.478 -17.858 -19.026 -20.012 -21.015 -21.856 -22.587 -23.284 -23.924 -24.516 -25.032 -25.554 -26.024 -26.416 -26.827 -27.258 -27.603 -27.958 -28.325 -28.606 -28.895 -29.191 -29.492 -29.795 -30.008 -30.23 -30.594 -30.845 -31.094 -31.22 -31.48 -31.754 -32.041 -32.191 -32.533 -32.729 -32.918 -33.095 -33.488 -33.711 -33.943 -34.205 -34.509 -34.917 -35.499 -37.784 -8 ,29222 ,TETRA ,17559348,Sat Nov 27 06:18:52 CET,Sat Nov 27 07:57:57 CET,0.0 0.604 0.833 1.043 1.25 1.417 1.543 1.655 1.849 1.95 2.05 2.07 2.293 2.359 2.482 2.598 2.696 2.743 2.845 2.927 3.006 3.064 3.124 3.219 3.313 3.387 3.455 3.513 3.584 3.654 3.705 3.755 3.802 3.83 3.851 3.867 3.873 3.863 3.836 3.774 3.675 3.529 3.318 3.076 2.741 2.297 1.684 0.869 -0.326 -2.176 -5.194 -8.632 -11.314 -13.531 -15.341 -16.881 -18.21 -19.374 -20.335 -21.281 -22.092 -22.793 -23.454 -24.081 -24.644 -25.124 -25.639 -26.118 -26.524 -26.926 -27.326 -27.662 -28.021 -28.379 -28.648 -28.934 -29.229 -29.518 -29.813 -30.025 -30.258 -30.602 -30.826 -31.063 -31.187 -31.469 -31.743 -32.004 -32.147 -32.485 -32.626 -32.795 -32.983 -33.389 -33.612 -33.846 -34.114 -34.419 -34.762 -35.23 -36.846 -9 ,6583 ,TETRA ,17559349,Sat Nov 27 06:19:49 CET,Sat Nov 27 08:17:06 CET,0.0 2.09 2.397 2.638 2.837 3.022 3.162 3.258 3.436 3.546 3.647 3.644 3.851 3.917 4.029 4.129 4.226 4.273 4.386 4.488 4.602 4.672 4.732 4.815 4.898 4.98 5.051 5.11 5.17 5.224 5.278 5.331 5.365 5.384 5.403 5.422 5.436 5.43 5.404 5.365 5.307 5.203 5.047 4.844 4.5 4.034 3.411 2.58 1.362 -0.571 -3.634 -7.029 -9.761 -11.988 -13.817 -15.407 -16.731 -17.887 -18.887 -19.878 -20.695 -21.396 -22.08 -22.721 -23.289 -23.8 -24.312 -24.754 -25.132 -25.52 -25.928 -26.27 -26.612 -26.963 -27.242 -27.531 -27.835 -28.161 -28.484 -28.694 -28.916 -29.265 -29.498 -29.731 -29.857 -30.122 -30.387 -30.676 -30.82 -31.157 -31.341 -31.518 -31.7 -32.099 -32.319 -32.568 -32.835 -33.105 -33.422 -33.807 -34.95 -10 ,25331 ,TETRA ,17559350,Sat Nov 27 06:19:52 CET,Sat Nov 27 08:17:00 CET,0.0 1.358 1.654 1.838 2.026 2.21 2.366 2.494 2.702 2.799 2.901 2.928 3.144 3.211 3.34 3.468 3.57 3.61 3.701 3.801 3.932 4.009 4.076 4.176 4.258 4.331 4.417 4.493 4.585 4.67 4.743 4.821 4.883 4.919 4.937 4.961 4.979 4.973 4.936 4.888 4.84 4.753 4.629 4.462 4.191 3.839 3.35 2.609 1.42 -0.393 -3.403 -6.865 -9.605 -11.88 -13.752 -15.38 -16.77 -17.959 -18.909 -19.846 -20.652 -21.334 -21.971 -22.578 -23.143 -23.659 -24.199 -24.665 -25.059 -25.468 -25.875 -26.211 -26.568 -26.937 -27.218 -27.504 -27.787 -28.085 -28.398 -28.618 -28.853 -29.2 -29.434 -29.677 -29.799 -30.053 -30.323 -30.616 -30.77 -31.101 -31.236 -31.412 -31.594 -31.947 -32.156 -32.415 -32.699 -33.005 -33.338 -33.748 -35.892 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_68_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_68_64.txt deleted file mode 100644 index c61a12c2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/protein/Summary_FEP_68_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23195 ,TETRA ,17559351,Sat Nov 27 06:21:50 CET,Sat Nov 27 08:13:23 CET,0.0 0.908 1.169 1.403 1.586 1.786 1.955 2.079 2.301 2.399 2.485 2.479 2.687 2.742 2.866 2.987 3.077 3.115 3.193 3.255 3.326 3.382 3.435 3.498 3.564 3.645 3.713 3.768 3.826 3.853 3.879 3.914 3.931 3.935 3.918 3.898 3.885 3.832 3.741 3.621 3.468 3.258 2.966 2.625 2.166 1.547 0.695 -0.386 -1.922 -4.184 -7.685 -11.711 -14.848 -17.316 -19.328 -21.062 -22.505 -23.768 -24.849 -25.885 -26.737 -27.477 -28.158 -28.791 -29.371 -29.895 -30.439 -30.909 -31.318 -31.736 -32.156 -32.504 -32.849 -33.22 -33.509 -33.789 -34.088 -34.396 -34.717 -34.934 -35.155 -35.513 -35.755 -36.0 -36.126 -36.385 -36.65 -36.932 -37.082 -37.407 -37.505 -37.67 -37.855 -38.224 -38.417 -38.624 -38.859 -39.146 -39.469 -39.897 -41.808 -2 ,2214 ,TETRA ,17559352,Sat Nov 27 06:22:49 CET,Sat Nov 27 08:20:03 CET,0.0 0.666 0.945 1.191 1.365 1.52 1.653 1.77 1.99 2.093 2.177 2.197 2.412 2.484 2.621 2.747 2.862 2.907 2.981 3.05 3.145 3.209 3.278 3.379 3.471 3.55 3.601 3.649 3.718 3.774 3.818 3.85 3.858 3.864 3.861 3.832 3.808 3.76 3.671 3.558 3.399 3.205 2.933 2.607 2.19 1.634 0.849 -0.238 -1.795 -4.045 -7.62 -11.642 -14.726 -17.163 -19.16 -20.915 -22.392 -23.671 -24.752 -25.773 -26.605 -27.338 -28.019 -28.644 -29.22 -29.735 -30.278 -30.78 -31.212 -31.626 -32.037 -32.381 -32.735 -33.108 -33.399 -33.687 -33.972 -34.261 -34.568 -34.778 -34.989 -35.318 -35.545 -35.78 -35.903 -36.148 -36.391 -36.642 -36.775 -37.1 -37.183 -37.328 -37.509 -37.936 -38.157 -38.383 -38.631 -38.904 -39.219 -39.674 -41.36 -3 ,27672 ,TETRA ,17559353,Sat Nov 27 06:22:49 CET,Sat Nov 27 08:22:08 CET,0.0 1.755 2.081 2.316 2.48 2.608 2.727 2.829 3.023 3.109 3.188 3.197 3.405 3.469 3.587 3.696 3.803 3.851 3.935 4.008 4.116 4.186 4.24 4.309 4.373 4.428 4.474 4.508 4.544 4.589 4.63 4.656 4.672 4.676 4.666 4.634 4.587 4.524 4.46 4.364 4.227 4.043 3.749 3.415 2.991 2.418 1.614 0.52 -1.05 -3.325 -6.882 -10.818 -13.858 -16.311 -18.28 -19.99 -21.469 -22.747 -23.801 -24.829 -25.695 -26.436 -27.128 -27.77 -28.354 -28.883 -29.419 -29.895 -30.313 -30.742 -31.169 -31.512 -31.866 -32.23 -32.512 -32.802 -33.098 -33.413 -33.738 -33.952 -34.165 -34.504 -34.75 -34.999 -35.124 -35.381 -35.637 -35.909 -36.053 -36.387 -36.508 -36.664 -36.817 -37.161 -37.358 -37.555 -37.788 -38.085 -38.424 -38.898 -41.511 -4 ,30766 ,TETRA ,17559354,Sat Nov 27 06:24:48 CET,Sat Nov 27 08:25:08 CET,0.0 1.332 1.718 1.955 2.133 2.305 2.462 2.581 2.802 2.936 3.047 3.055 3.27 3.346 3.478 3.593 3.692 3.733 3.801 3.871 3.993 4.067 4.123 4.195 4.262 4.334 4.405 4.463 4.524 4.567 4.6 4.618 4.614 4.613 4.612 4.571 4.512 4.442 4.345 4.211 4.043 3.847 3.59 3.26 2.797 2.207 1.434 0.364 -1.19 -3.421 -6.948 -10.912 -13.956 -16.427 -18.477 -20.221 -21.675 -22.945 -24.006 -25.019 -25.868 -26.616 -27.292 -27.929 -28.523 -29.051 -29.592 -30.066 -30.479 -30.899 -31.33 -31.683 -32.032 -32.388 -32.672 -32.979 -33.285 -33.584 -33.89 -34.097 -34.31 -34.634 -34.864 -35.11 -35.242 -35.512 -35.783 -36.075 -36.232 -36.579 -36.693 -36.86 -37.038 -37.392 -37.58 -37.786 -38.033 -38.33 -38.666 -39.137 -43.118 -5 ,12523 ,TETRA ,17559355,Sat Nov 27 06:27:47 CET,Sat Nov 27 08:26:24 CET,0.0 2.753 3.146 3.371 3.56 3.736 3.879 3.997 4.215 4.309 4.4 4.411 4.617 4.692 4.831 4.93 5.029 5.081 5.17 5.238 5.333 5.392 5.446 5.54 5.631 5.705 5.772 5.828 5.887 5.948 6.003 6.058 6.098 6.119 6.119 6.109 6.093 6.038 5.957 5.852 5.712 5.526 5.255 4.912 4.437 3.827 3.052 1.997 0.433 -1.855 -5.433 -9.427 -12.544 -15.055 -17.071 -18.768 -20.218 -21.496 -22.557 -23.603 -24.468 -25.214 -25.924 -26.588 -27.182 -27.702 -28.257 -28.741 -29.149 -29.571 -30.003 -30.362 -30.727 -31.105 -31.395 -31.685 -31.991 -32.3 -32.611 -32.825 -33.042 -33.384 -33.629 -33.874 -33.998 -34.275 -34.559 -34.84 -34.98 -35.312 -35.442 -35.614 -35.791 -36.159 -36.357 -36.578 -36.828 -37.103 -37.409 -37.87 -39.686 -6 ,2804 ,TETRA ,17559356,Sat Nov 27 06:27:47 CET,Sat Nov 27 08:25:06 CET,0.0 1.685 2.088 2.33 2.53 2.709 2.893 3.044 3.274 3.368 3.456 3.468 3.684 3.749 3.864 3.973 4.083 4.133 4.22 4.303 4.415 4.483 4.541 4.626 4.712 4.785 4.847 4.901 4.967 5.005 5.018 5.037 5.061 5.077 5.073 5.074 5.065 5.025 4.963 4.859 4.726 4.545 4.265 3.917 3.429 2.819 2.018 0.917 -0.663 -2.971 -6.493 -10.381 -13.426 -15.854 -17.851 -19.56 -20.982 -22.218 -23.24 -24.226 -25.068 -25.802 -26.485 -27.12 -27.707 -28.229 -28.776 -29.267 -29.685 -30.116 -30.548 -30.897 -31.26 -31.629 -31.92 -32.224 -32.524 -32.827 -33.125 -33.322 -33.529 -33.848 -34.074 -34.306 -34.424 -34.674 -34.928 -35.192 -35.335 -35.666 -35.783 -35.948 -36.127 -36.498 -36.701 -36.919 -37.147 -37.438 -37.77 -38.092 -40.129 -7 ,16381 ,TETRA ,17559357,Sat Nov 27 06:27:47 CET,Sat Nov 27 08:13:45 CET,0.0 1.794 2.272 2.69 3.05 3.283 3.422 3.554 3.794 3.897 3.991 4.03 4.257 4.324 4.458 4.571 4.658 4.697 4.773 4.86 4.987 5.06 5.121 5.191 5.257 5.324 5.38 5.428 5.47 5.501 5.52 5.532 5.549 5.566 5.564 5.552 5.53 5.472 5.39 5.278 5.143 4.958 4.656 4.296 3.812 3.224 2.446 1.324 -0.256 -2.465 -5.986 -9.936 -13.016 -15.518 -17.524 -19.246 -20.735 -22.026 -23.068 -24.079 -24.947 -25.699 -26.412 -27.077 -27.696 -28.252 -28.795 -29.283 -29.713 -30.155 -30.597 -30.94 -31.297 -31.658 -31.929 -32.218 -32.514 -32.813 -33.118 -33.328 -33.563 -33.919 -34.148 -34.383 -34.503 -34.748 -35.005 -35.3 -35.455 -35.791 -35.94 -36.111 -36.286 -36.672 -36.877 -37.082 -37.304 -37.595 -37.942 -38.373 -39.86 -8 ,19616 ,TETRA ,17559358,Sat Nov 27 06:28:46 CET,Sat Nov 27 08:24:29 CET,0.0 2.187 2.569 2.82 3.024 3.209 3.351 3.47 3.683 3.777 3.866 3.897 4.114 4.185 4.312 4.443 4.552 4.597 4.682 4.747 4.854 4.942 5.03 5.157 5.25 5.315 5.381 5.44 5.507 5.556 5.595 5.625 5.646 5.661 5.663 5.646 5.601 5.538 5.468 5.371 5.222 5.018 4.739 4.395 3.946 3.352 2.516 1.44 -0.09 -2.364 -5.902 -9.872 -12.919 -15.358 -17.394 -19.155 -20.59 -21.819 -22.861 -23.898 -24.78 -25.547 -26.27 -26.938 -27.547 -28.102 -28.67 -29.175 -29.604 -30.038 -30.483 -30.839 -31.205 -31.583 -31.876 -32.168 -32.465 -32.789 -33.127 -33.347 -33.567 -33.92 -34.149 -34.377 -34.503 -34.767 -35.028 -35.288 -35.419 -35.736 -35.855 -36.02 -36.204 -36.568 -36.768 -37.02 -37.273 -37.537 -37.883 -38.391 -40.594 -9 ,26694 ,TETRA ,17559359,Sat Nov 27 06:29:46 CET,Sat Nov 27 08:28:29 CET,0.0 8.324 8.797 9.048 9.234 9.393 9.538 9.663 9.907 10.013 10.113 10.131 10.339 10.408 10.518 10.614 10.713 10.764 10.852 10.932 11.027 11.076 11.13 11.205 11.283 11.348 11.388 11.435 11.501 11.543 11.566 11.584 11.615 11.637 11.642 11.629 11.598 11.53 11.442 11.317 11.165 11.001 10.755 10.456 10.022 9.436 8.628 7.503 5.922 3.61 0.002 -3.991 -7.123 -9.631 -11.643 -13.359 -14.821 -16.104 -17.161 -18.195 -19.088 -19.872 -20.583 -21.236 -21.837 -22.373 -22.919 -23.389 -23.786 -24.191 -24.609 -24.955 -25.316 -25.696 -25.987 -26.276 -26.578 -26.903 -27.235 -27.453 -27.678 -28.038 -28.269 -28.497 -28.621 -28.877 -29.128 -29.399 -29.551 -29.882 -30.003 -30.177 -30.364 -30.76 -30.966 -31.218 -31.504 -31.806 -32.164 -32.637 -34.911 -10 ,14646 ,TETRA ,17559360,Sat Nov 27 06:31:45 CET,Sat Nov 27 08:26:52 CET,0.0 1.337 1.661 1.884 2.084 2.27 2.411 2.521 2.722 2.822 2.916 2.943 3.156 3.217 3.346 3.474 3.578 3.63 3.737 3.836 3.982 4.074 4.142 4.224 4.307 4.392 4.464 4.51 4.563 4.615 4.658 4.694 4.721 4.722 4.696 4.68 4.66 4.621 4.548 4.423 4.25 4.019 3.733 3.42 3.0 2.408 1.574 0.478 -1.051 -3.347 -6.974 -10.995 -14.116 -16.54 -18.512 -20.234 -21.695 -22.967 -24.021 -25.031 -25.874 -26.607 -27.303 -27.96 -28.554 -29.087 -29.635 -30.111 -30.518 -30.936 -31.358 -31.714 -32.086 -32.458 -32.741 -33.023 -33.311 -33.619 -33.953 -34.18 -34.401 -34.746 -34.982 -35.221 -35.349 -35.63 -35.908 -36.188 -36.335 -36.665 -36.79 -36.95 -37.118 -37.52 -37.755 -37.988 -38.223 -38.494 -38.833 -39.31 -42.21 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_23_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_23_62.txt deleted file mode 100644 index d1b2732b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_23_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22519 ,TETRA ,17559361,Sat Nov 27 06:32:48 CET,Sat Nov 27 08:21:53 CET,0.0 1.6 2.172 2.616 2.929 3.226 3.519 3.779 4.214 4.41 4.595 4.788 5.099 5.27 5.583 5.85 6.11 6.246 6.524 6.781 7.127 7.331 7.507 7.772 8.043 8.301 8.544 8.781 9.107 9.428 9.736 10.117 10.451 10.761 11.131 11.508 11.849 12.214 12.597 13.014 13.426 13.866 14.353 14.836 15.394 15.976 16.564 17.117 17.7 18.176 18.386 18.189 17.722 17.191 16.658 16.114 15.636 15.201 14.803 14.379 14.005 13.662 13.308 12.971 12.671 12.395 12.104 11.848 11.629 11.396 11.149 10.956 10.769 10.566 10.399 10.215 10.001 9.76 9.528 9.38 9.222 8.973 8.795 8.6 8.498 8.305 8.105 7.874 7.762 7.518 7.414 7.271 7.111 6.796 6.618 6.416 6.212 5.986 5.662 5.203 3.434 -2 ,16534 ,TETRA ,17559362,Sat Nov 27 06:32:48 CET,Sat Nov 27 08:22:57 CET,0.0 2.775 3.351 3.712 4.028 4.314 4.567 4.807 5.232 5.417 5.608 5.823 6.126 6.282 6.561 6.84 7.115 7.245 7.496 7.754 8.149 8.383 8.601 8.912 9.212 9.515 9.814 10.091 10.431 10.744 11.019 11.338 11.659 11.981 12.337 12.725 13.093 13.476 13.874 14.305 14.73 15.166 15.679 16.183 16.72 17.267 17.896 18.554 19.157 19.699 20.029 19.812 19.314 18.811 18.338 17.835 17.362 16.933 16.536 16.123 15.75 15.408 15.091 14.792 14.501 14.226 13.939 13.672 13.417 13.147 12.894 12.682 12.443 12.186 11.989 11.799 11.599 11.372 11.125 10.947 10.764 10.515 10.349 10.169 10.067 9.853 9.61 9.328 9.197 8.918 8.745 8.576 8.408 8.026 7.812 7.59 7.362 7.115 6.796 6.334 4.39 -3 ,3621 ,TETRA ,17559363,Sat Nov 27 06:33:25 CET,Sat Nov 27 08:23:42 CET,0.0 3.125 3.8 4.35 4.757 5.037 5.278 5.501 5.921 6.102 6.285 6.496 6.788 6.924 7.206 7.48 7.719 7.833 8.074 8.317 8.669 8.879 9.084 9.4 9.678 9.925 10.159 10.382 10.664 10.949 11.216 11.5 11.785 12.067 12.382 12.732 13.039 13.365 13.712 14.076 14.458 14.839 15.288 15.747 16.221 16.7 17.213 17.731 18.23 18.64 18.82 18.557 18.089 17.569 16.999 16.415 15.907 15.403 14.938 14.527 14.16 13.807 13.46 13.126 12.808 12.502 12.182 11.875 11.611 11.355 11.079 10.836 10.588 10.339 10.141 9.924 9.701 9.476 9.234 9.063 8.891 8.622 8.438 8.25 8.149 7.93 7.678 7.417 7.293 7.022 6.895 6.758 6.611 6.221 6.0 5.788 5.554 5.275 4.897 4.388 3.283 -4 ,12390 ,TETRA ,17559364,Sat Nov 27 06:34:23 CET,Sat Nov 27 08:24:55 CET,0.0 2.933 3.593 4.019 4.371 4.682 4.951 5.222 5.733 5.951 6.152 6.365 6.671 6.843 7.171 7.441 7.685 7.808 8.045 8.257 8.544 8.735 8.925 9.204 9.479 9.741 9.985 10.217 10.498 10.746 11.008 11.343 11.645 11.923 12.24 12.601 12.933 13.257 13.591 13.932 14.304 14.762 15.283 15.775 16.271 16.764 17.275 17.732 18.2 18.637 18.801 18.536 18.137 17.634 17.077 16.559 16.072 15.599 15.175 14.712 14.303 13.949 13.629 13.337 13.046 12.78 12.508 12.254 12.005 11.726 11.423 11.168 10.89 10.587 10.354 10.104 9.837 9.579 9.318 9.128 8.924 8.577 8.337 8.109 7.996 7.752 7.504 7.245 7.105 6.831 6.705 6.55 6.378 5.971 5.744 5.475 5.189 4.901 4.56 4.058 2.667 -5 ,12352 ,TETRA ,17559365,Sat Nov 27 06:34:23 CET,Sat Nov 27 08:24:31 CET,0.0 3.135 3.814 4.346 4.722 5.042 5.326 5.579 6.034 6.241 6.424 6.638 6.952 7.113 7.432 7.731 8.004 8.131 8.362 8.579 8.885 9.087 9.291 9.559 9.814 10.073 10.324 10.561 10.85 11.132 11.398 11.703 11.98 12.257 12.61 13.003 13.371 13.764 14.155 14.547 14.942 15.385 15.885 16.374 16.944 17.495 18.057 18.644 19.222 19.736 20.016 19.766 19.306 18.813 18.325 17.838 17.375 16.937 16.544 16.098 15.684 15.297 14.905 14.551 14.249 13.966 13.653 13.386 13.157 12.895 12.627 12.403 12.162 11.922 11.736 11.54 11.342 11.139 10.926 10.769 10.606 10.356 10.168 9.963 9.857 9.649 9.437 9.213 9.099 8.842 8.722 8.568 8.392 8.024 7.823 7.605 7.367 7.063 6.685 6.179 3.729 -6 ,521 ,TETRA ,17559366,Sat Nov 27 06:35:23 CET,Sat Nov 27 08:24:38 CET,0.0 1.846 2.409 2.824 3.14 3.445 3.756 4.032 4.501 4.713 4.91 5.129 5.453 5.627 5.929 6.199 6.463 6.592 6.841 7.078 7.401 7.61 7.819 8.117 8.406 8.696 8.967 9.219 9.549 9.867 10.177 10.53 10.849 11.148 11.485 11.854 12.195 12.567 12.977 13.404 13.839 14.324 14.855 15.334 15.872 16.434 17.014 17.609 18.221 18.75 19.058 18.92 18.501 17.939 17.395 16.88 16.399 15.977 15.599 15.185 14.803 14.44 14.088 13.765 13.487 13.242 12.962 12.684 12.437 12.187 11.92 11.701 11.477 11.23 11.043 10.849 10.642 10.411 10.169 10.004 9.817 9.504 9.294 9.095 8.997 8.793 8.587 8.358 8.231 7.95 7.803 7.652 7.478 7.12 6.927 6.678 6.385 6.077 5.732 5.32 4.005 -7 ,31913 ,TETRA ,17559367,Sat Nov 27 06:36:26 CET,Sat Nov 27 08:26:28 CET,0.0 2.002 2.653 3.075 3.391 3.658 3.894 4.135 4.584 4.781 4.961 5.145 5.441 5.586 5.86 6.113 6.348 6.466 6.695 6.905 7.215 7.424 7.634 7.938 8.226 8.498 8.757 8.994 9.297 9.596 9.884 10.221 10.533 10.84 11.168 11.501 11.833 12.216 12.617 13.029 13.45 13.904 14.396 14.878 15.436 16.03 16.66 17.269 17.871 18.411 18.791 18.671 18.226 17.644 17.075 16.538 16.025 15.542 15.079 14.611 14.236 13.88 13.525 13.177 12.828 12.521 12.202 11.907 11.648 11.372 11.096 10.873 10.631 10.365 10.174 9.981 9.773 9.542 9.28 9.112 8.956 8.697 8.505 8.311 8.21 8.007 7.813 7.59 7.47 7.209 7.091 6.951 6.804 6.461 6.245 6.0 5.73 5.381 4.975 4.517 3.46 -8 ,1413 ,TETRA ,17559368,Sat Nov 27 06:36:26 CET,Sat Nov 27 08:26:27 CET,0.0 2.483 3.005 3.408 3.748 4.095 4.402 4.647 5.043 5.24 5.431 5.599 5.888 6.04 6.333 6.604 6.863 6.987 7.214 7.422 7.706 7.896 8.081 8.347 8.612 8.871 9.123 9.362 9.639 9.884 10.147 10.478 10.776 11.071 11.407 11.769 12.115 12.477 12.84 13.212 13.598 14.008 14.473 14.9 15.356 15.851 16.383 16.898 17.397 17.815 17.998 17.754 17.342 16.863 16.35 15.82 15.29 14.808 14.381 13.94 13.545 13.188 12.842 12.501 12.198 11.919 11.591 11.29 11.039 10.782 10.507 10.273 10.036 9.778 9.581 9.384 9.186 8.978 8.746 8.58 8.393 8.098 7.907 7.715 7.622 7.419 7.189 6.911 6.764 6.499 6.345 6.187 6.035 5.683 5.495 5.282 5.023 4.762 4.456 3.977 2.559 -9 ,15822 ,TETRA ,17559369,Sat Nov 27 06:37:26 CET,Sat Nov 27 08:32:23 CET,0.0 2.084 2.633 3.138 3.492 3.751 3.989 4.213 4.599 4.787 4.975 5.174 5.478 5.627 5.903 6.177 6.422 6.532 6.749 6.964 7.277 7.486 7.686 7.957 8.2 8.421 8.635 8.838 9.119 9.403 9.683 10.013 10.296 10.559 10.873 11.203 11.506 11.858 12.239 12.621 13.013 13.423 13.871 14.306 14.78 15.306 15.86 16.409 16.912 17.32 17.543 17.326 16.899 16.442 15.981 15.499 15.051 14.634 14.25 13.845 13.489 13.18 12.882 12.606 12.298 11.987 11.687 11.419 11.164 10.886 10.599 10.368 10.147 9.914 9.719 9.503 9.27 9.051 8.833 8.662 8.475 8.207 8.028 7.832 7.736 7.539 7.302 7.036 6.898 6.613 6.481 6.332 6.161 5.788 5.545 5.272 4.999 4.701 4.392 3.89 2.036 -10 ,11243 ,TETRA ,17559370,Sat Nov 27 06:37:26 CET,Sat Nov 27 08:25:51 CET,0.0 1.678 2.124 2.474 2.785 3.053 3.281 3.489 3.872 4.053 4.229 4.423 4.729 4.881 5.175 5.453 5.714 5.845 6.113 6.363 6.67 6.861 7.038 7.289 7.535 7.759 7.973 8.175 8.43 8.689 8.934 9.209 9.463 9.72 10.06 10.428 10.747 11.099 11.455 11.815 12.188 12.596 13.075 13.521 13.999 14.51 15.024 15.505 15.989 16.433 16.68 16.505 16.055 15.514 15.008 14.515 14.027 13.545 13.135 12.717 12.333 11.998 11.638 11.262 10.933 10.644 10.334 10.02 9.746 9.482 9.204 8.994 8.781 8.528 8.326 8.13 7.922 7.688 7.425 7.243 7.062 6.783 6.59 6.381 6.272 6.05 5.83 5.605 5.485 5.219 5.091 4.951 4.78 4.397 4.214 4.018 3.801 3.516 3.142 2.678 1.465 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_23_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_23_64.txt deleted file mode 100644 index 61cd3495..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_23_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12554 ,TETRA ,17559371,Sat Nov 27 06:37:25 CET,Sat Nov 27 08:17:12 CET,0.0 2.049 2.478 2.805 3.08 3.323 3.553 3.775 4.131 4.285 4.44 4.606 4.888 5.013 5.223 5.427 5.63 5.73 5.933 6.111 6.348 6.502 6.646 6.843 7.043 7.235 7.408 7.565 7.766 7.953 8.127 8.333 8.522 8.694 8.886 9.115 9.327 9.534 9.736 9.95 10.174 10.391 10.608 10.795 10.994 11.171 11.293 11.34 11.246 10.852 9.906 8.582 7.309 6.135 5.103 4.223 3.453 2.73 2.118 1.502 0.948 0.449 -0.039 -0.485 -0.898 -1.283 -1.681 -2.037 -2.344 -2.664 -2.989 -3.258 -3.539 -3.834 -4.065 -4.307 -4.572 -4.849 -5.135 -5.333 -5.537 -5.85 -6.053 -6.265 -6.379 -6.627 -6.885 -7.151 -7.297 -7.591 -7.773 -7.967 -8.172 -8.635 -8.882 -9.167 -9.507 -9.895 -10.352 -10.919 -12.78 -2 ,24826 ,TETRA ,17559372,Sat Nov 27 06:38:25 CET,Sat Nov 27 08:33:01 CET,0.0 1.525 2.022 2.388 2.67 2.908 3.122 3.33 3.704 3.872 4.031 4.193 4.467 4.578 4.803 5.022 5.238 5.333 5.508 5.687 5.949 6.111 6.254 6.472 6.681 6.862 7.025 7.181 7.394 7.616 7.817 8.032 8.222 8.399 8.593 8.788 8.975 9.199 9.424 9.635 9.853 10.07 10.282 10.475 10.637 10.786 10.941 10.986 10.878 10.482 9.504 8.175 6.956 5.828 4.858 3.98 3.191 2.485 1.892 1.301 0.778 0.266 -0.216 -0.631 -1.022 -1.377 -1.731 -2.045 -2.33 -2.648 -2.995 -3.284 -3.566 -3.865 -4.101 -4.358 -4.625 -4.86 -5.08 -5.253 -5.444 -5.751 -5.971 -6.191 -6.303 -6.519 -6.747 -7.007 -7.151 -7.436 -7.563 -7.717 -7.867 -8.205 -8.398 -8.634 -8.9 -9.196 -9.557 -10.016 -11.082 -3 ,7883 ,TETRA ,17559373,Sat Nov 27 06:38:25 CET,Sat Nov 27 08:28:20 CET,0.0 1.166 1.594 1.927 2.191 2.455 2.718 2.932 3.298 3.457 3.607 3.735 4.015 4.148 4.376 4.586 4.791 4.897 5.101 5.284 5.526 5.679 5.826 6.013 6.184 6.359 6.521 6.672 6.861 7.045 7.221 7.433 7.654 7.86 8.065 8.278 8.469 8.692 8.936 9.157 9.361 9.584 9.847 10.058 10.262 10.477 10.612 10.643 10.546 10.187 9.227 7.792 6.543 5.471 4.506 3.635 2.856 2.124 1.507 0.918 0.404 -0.07 -0.557 -1.016 -1.399 -1.733 -2.098 -2.442 -2.735 -3.033 -3.369 -3.653 -3.928 -4.201 -4.411 -4.64 -4.886 -5.134 -5.391 -5.576 -5.766 -6.061 -6.265 -6.484 -6.6 -6.821 -7.064 -7.318 -7.443 -7.73 -7.844 -7.985 -8.147 -8.523 -8.715 -8.907 -9.119 -9.373 -9.688 -10.119 -11.439 -4 ,16845 ,TETRA ,17559374,Sat Nov 27 06:38:25 CET,Sat Nov 27 08:28:37 CET,0.0 0.848 1.309 1.662 1.957 2.214 2.459 2.677 3.058 3.241 3.419 3.624 3.914 4.037 4.27 4.512 4.732 4.828 5.03 5.213 5.425 5.562 5.7 5.892 6.076 6.259 6.451 6.635 6.84 7.02 7.188 7.378 7.556 7.741 7.957 8.164 8.358 8.572 8.788 9.009 9.221 9.444 9.664 9.862 10.072 10.241 10.364 10.394 10.281 9.934 9.052 7.7 6.415 5.301 4.327 3.434 2.671 1.956 1.322 0.718 0.207 -0.278 -0.755 -1.204 -1.604 -1.955 -2.319 -2.652 -2.946 -3.254 -3.586 -3.847 -4.123 -4.415 -4.638 -4.868 -5.098 -5.345 -5.625 -5.818 -6.01 -6.31 -6.52 -6.737 -6.845 -7.086 -7.332 -7.576 -7.716 -8.012 -8.148 -8.311 -8.475 -8.852 -9.08 -9.313 -9.553 -9.842 -10.203 -10.678 -12.058 -5 ,1084 ,TETRA ,17559375,Sat Nov 27 06:38:24 CET,Sat Nov 27 08:17:13 CET,0.0 1.738 2.226 2.56 2.822 3.037 3.247 3.461 3.839 3.99 4.134 4.264 4.517 4.623 4.84 5.052 5.262 5.367 5.547 5.717 5.966 6.113 6.258 6.497 6.746 6.951 7.117 7.28 7.496 7.695 7.872 8.056 8.216 8.38 8.576 8.785 8.982 9.187 9.415 9.651 9.864 10.057 10.278 10.522 10.729 10.868 10.989 11.007 10.855 10.431 9.447 8.04 6.788 5.702 4.759 3.898 3.121 2.416 1.816 1.217 0.704 0.232 -0.238 -0.671 -1.05 -1.375 -1.714 -2.05 -2.343 -2.644 -2.97 -3.233 -3.504 -3.801 -4.043 -4.297 -4.547 -4.8 -5.069 -5.246 -5.422 -5.699 -5.889 -6.089 -6.2 -6.42 -6.645 -6.895 -7.039 -7.342 -7.509 -7.688 -7.878 -8.303 -8.533 -8.774 -9.041 -9.349 -9.749 -10.247 -11.805 -6 ,16659 ,TETRA ,17559376,Sat Nov 27 06:39:24 CET,Sat Nov 27 08:28:49 CET,0.0 0.942 1.448 1.852 2.141 2.377 2.59 2.795 3.199 3.378 3.544 3.713 3.988 4.11 4.348 4.575 4.792 4.895 5.078 5.257 5.534 5.7 5.853 6.08 6.314 6.523 6.705 6.88 7.085 7.283 7.472 7.679 7.861 8.033 8.242 8.463 8.666 8.884 9.092 9.308 9.517 9.724 9.957 10.151 10.31 10.419 10.492 10.49 10.348 9.961 9.015 7.608 6.327 5.166 4.169 3.3 2.531 1.853 1.286 0.692 0.144 -0.327 -0.776 -1.211 -1.587 -1.93 -2.299 -2.639 -2.936 -3.229 -3.543 -3.802 -4.073 -4.353 -4.566 -4.791 -5.017 -5.253 -5.516 -5.696 -5.886 -6.179 -6.368 -6.566 -6.671 -6.882 -7.118 -7.373 -7.501 -7.782 -7.906 -8.054 -8.212 -8.553 -8.755 -8.977 -9.215 -9.495 -9.833 -10.293 -11.89 -7 ,8888 ,TETRA ,17559377,Sat Nov 27 06:39:24 CET,Sat Nov 27 08:29:50 CET,0.0 2.105 2.658 3.031 3.327 3.621 3.894 4.133 4.531 4.716 4.868 4.968 5.226 5.338 5.548 5.739 5.909 5.984 6.137 6.294 6.519 6.661 6.801 7.01 7.201 7.385 7.561 7.727 7.926 8.121 8.322 8.562 8.789 9.024 9.277 9.499 9.693 9.894 10.096 10.291 10.487 10.704 10.923 11.108 11.294 11.438 11.539 11.558 11.415 11.02 10.104 8.723 7.456 6.365 5.417 4.537 3.749 3.058 2.452 1.838 1.31 0.845 0.408 -0.015 -0.425 -0.8 -1.166 -1.493 -1.775 -2.074 -2.393 -2.676 -2.999 -3.324 -3.548 -3.774 -4.016 -4.265 -4.524 -4.704 -4.874 -5.147 -5.349 -5.559 -5.674 -5.92 -6.166 -6.42 -6.561 -6.854 -6.992 -7.144 -7.3 -7.661 -7.883 -8.124 -8.391 -8.685 -9.021 -9.494 -10.654 -8 ,4806 ,TETRA ,17559378,Sat Nov 27 06:40:25 CET,Sat Nov 27 08:23:54 CET,0.0 1.985 2.501 2.861 3.163 3.449 3.689 3.906 4.299 4.483 4.639 4.789 5.069 5.187 5.429 5.664 5.855 5.938 6.11 6.274 6.494 6.634 6.77 6.976 7.183 7.365 7.515 7.663 7.877 8.089 8.277 8.477 8.665 8.846 9.05 9.264 9.473 9.701 9.913 10.138 10.363 10.59 10.819 11.009 11.184 11.334 11.458 11.495 11.4 11.03 10.081 8.701 7.469 6.382 5.413 4.556 3.816 3.124 2.521 1.926 1.422 0.967 0.515 0.096 -0.296 -0.66 -1.031 -1.361 -1.645 -1.933 -2.242 -2.498 -2.763 -3.063 -3.295 -3.523 -3.779 -4.05 -4.304 -4.48 -4.665 -4.979 -5.205 -5.44 -5.558 -5.802 -6.076 -6.363 -6.513 -6.822 -7.022 -7.192 -7.366 -7.789 -8.024 -8.277 -8.551 -8.856 -9.245 -9.723 -11.342 -9 ,14919 ,TETRA ,17559379,Sat Nov 27 06:40:26 CET,Sat Nov 27 08:30:06 CET,0.0 1.96 2.482 2.875 3.166 3.421 3.664 3.89 4.273 4.447 4.61 4.754 5.036 5.176 5.442 5.688 5.915 6.022 6.224 6.409 6.685 6.84 6.979 7.192 7.374 7.546 7.715 7.88 8.082 8.25 8.417 8.626 8.821 9.007 9.217 9.432 9.614 9.819 10.027 10.236 10.468 10.72 10.948 11.13 11.311 11.468 11.61 11.667 11.525 11.099 10.115 8.717 7.483 6.405 5.448 4.59 3.862 3.182 2.575 1.963 1.432 0.961 0.515 0.107 -0.267 -0.616 -0.97 -1.275 -1.549 -1.849 -2.158 -2.405 -2.673 -2.964 -3.185 -3.405 -3.649 -3.917 -4.185 -4.365 -4.55 -4.837 -5.028 -5.236 -5.355 -5.598 -5.849 -6.101 -6.228 -6.521 -6.669 -6.873 -7.078 -7.466 -7.701 -7.966 -8.254 -8.57 -8.928 -9.357 -10.484 -10 ,19679 ,TETRA ,17559380,Sat Nov 27 06:41:23 CET,Sat Nov 27 08:31:03 CET,0.0 1.477 1.995 2.38 2.695 2.935 3.112 3.288 3.65 3.832 3.997 4.129 4.391 4.508 4.723 4.931 5.123 5.216 5.41 5.597 5.858 6.017 6.16 6.362 6.559 6.745 6.915 7.075 7.274 7.465 7.645 7.845 8.031 8.209 8.412 8.627 8.818 9.023 9.24 9.446 9.655 9.872 10.098 10.303 10.489 10.638 10.754 10.81 10.733 10.349 9.417 8.04 6.753 5.682 4.783 3.95 3.198 2.512 1.91 1.3 0.794 0.338 -0.117 -0.559 -0.955 -1.307 -1.692 -2.049 -2.349 -2.646 -2.946 -3.192 -3.465 -3.752 -3.968 -4.192 -4.418 -4.646 -4.903 -5.083 -5.259 -5.569 -5.815 -6.081 -6.205 -6.442 -6.69 -6.936 -7.068 -7.369 -7.54 -7.697 -7.854 -8.207 -8.41 -8.625 -8.884 -9.208 -9.609 -10.131 -11.446 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_23_66.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_23_66.txt deleted file mode 100644 index ae111b30..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_23_66.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8695 ,KEBNE ,17024867,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:52:05 CET,0.0 1.156 1.618 1.974 2.265 2.513 2.763 2.977 3.367 3.549 3.707 3.834 4.101 4.22 4.439 4.676 4.908 5.006 5.184 5.357 5.613 5.77 5.918 6.131 6.333 6.524 6.698 6.872 7.103 7.298 7.484 7.733 7.97 8.194 8.431 8.686 8.93 9.185 9.447 9.71 9.984 10.285 10.612 10.898 11.223 11.542 11.83 12.092 12.319 12.442 12.182 11.442 10.633 9.854 9.158 8.496 7.91 7.374 6.9 6.437 6.033 5.661 5.304 4.967 4.655 4.355 4.028 3.733 3.479 3.226 2.956 2.736 2.515 2.261 2.068 1.871 1.658 1.444 1.229 1.079 0.92 0.677 0.513 0.337 0.238 0.016 -0.219 -0.455 -0.575 -0.849 -0.978 -1.119 -1.263 -1.573 -1.745 -1.942 -2.179 -2.449 -2.79 -3.232 -4.943 -2 ,28388 ,KEBNE ,17024868,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:52:20 CET,0.0 1.229 1.654 1.974 2.277 2.531 2.744 2.936 3.262 3.416 3.575 3.713 3.978 4.1 4.341 4.565 4.767 4.872 5.089 5.292 5.579 5.748 5.903 6.115 6.317 6.51 6.695 6.87 7.086 7.284 7.47 7.71 7.93 8.115 8.337 8.612 8.875 9.129 9.397 9.68 9.953 10.253 10.594 10.917 11.26 11.581 11.872 12.142 12.372 12.489 12.228 11.55 10.804 10.04 9.342 8.693 8.131 7.62 7.142 6.659 6.227 5.839 5.485 5.119 4.736 4.378 4.021 3.696 3.411 3.108 2.811 2.599 2.357 2.068 1.854 1.651 1.446 1.214 0.971 0.816 0.65 0.372 0.189 0.009 -0.088 -0.291 -0.505 -0.732 -0.851 -1.133 -1.296 -1.45 -1.614 -1.998 -2.203 -2.435 -2.709 -3.004 -3.321 -3.685 -4.557 -3 ,7262 ,KEBNE ,17024869,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:52:09 CET,0.0 0.999 1.46 1.826 2.101 2.32 2.541 2.736 3.057 3.209 3.358 3.486 3.754 3.885 4.121 4.344 4.554 4.643 4.821 4.991 5.23 5.387 5.543 5.771 5.973 6.157 6.344 6.533 6.764 6.971 7.173 7.404 7.605 7.808 8.044 8.309 8.564 8.833 9.105 9.371 9.654 9.956 10.263 10.558 10.883 11.19 11.483 11.738 11.93 11.984 11.702 11.003 10.198 9.434 8.735 8.087 7.517 6.966 6.471 5.99 5.554 5.136 4.73 4.339 3.984 3.651 3.3 2.995 2.721 2.434 2.127 1.87 1.615 1.364 1.168 0.954 0.733 0.515 0.301 0.151 -0.011 -0.273 -0.462 -0.651 -0.756 -0.988 -1.231 -1.487 -1.613 -1.883 -1.985 -2.125 -2.278 -2.602 -2.791 -3.009 -3.259 -3.548 -3.896 -4.332 -5.554 -4 ,20510 ,KEBNE ,17024870,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:51:51 CET,0.0 1.086 1.493 1.748 1.998 2.247 2.465 2.667 3.053 3.216 3.355 3.473 3.729 3.846 4.071 4.274 4.46 4.554 4.725 4.889 5.124 5.271 5.421 5.641 5.848 6.044 6.223 6.383 6.589 6.773 6.956 7.195 7.417 7.633 7.871 8.119 8.354 8.603 8.868 9.142 9.42 9.72 10.054 10.379 10.735 11.09 11.422 11.693 11.91 11.999 11.738 11.059 10.315 9.559 8.856 8.222 7.645 7.127 6.659 6.15 5.715 5.308 4.895 4.519 4.157 3.815 3.415 3.048 2.777 2.517 2.228 1.966 1.69 1.399 1.172 0.939 0.708 0.463 0.198 0.017 -0.168 -0.458 -0.654 -0.861 -0.979 -1.219 -1.452 -1.682 -1.793 -2.064 -2.212 -2.373 -2.552 -2.943 -3.121 -3.305 -3.531 -3.755 -4.029 -4.378 -5.29 -5 ,16222 ,KEBNE ,17024871,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:51:56 CET,0.0 1.43 1.856 2.249 2.588 2.892 3.133 3.324 3.693 3.846 3.991 4.161 4.443 4.579 4.825 5.03 5.22 5.317 5.515 5.71 5.971 6.125 6.277 6.489 6.695 6.898 7.085 7.26 7.48 7.679 7.864 8.103 8.333 8.528 8.741 8.99 9.234 9.487 9.753 10.04 10.348 10.674 10.998 11.293 11.631 11.953 12.262 12.523 12.709 12.794 12.564 11.85 11.038 10.269 9.537 8.782 8.102 7.495 6.979 6.453 6.003 5.636 5.273 4.913 4.582 4.267 3.919 3.61 3.355 3.111 2.837 2.599 2.354 2.088 1.881 1.669 1.458 1.236 1.012 0.863 0.7 0.432 0.241 0.038 -0.065 -0.279 -0.495 -0.724 -0.844 -1.123 -1.281 -1.435 -1.604 -1.975 -2.202 -2.456 -2.712 -2.993 -3.33 -3.764 -4.62 -6 ,8906 ,KEBNE ,17024872,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:51:51 CET,0.0 1.267 1.751 2.097 2.381 2.639 2.864 3.052 3.383 3.534 3.688 3.849 4.12 4.237 4.458 4.663 4.851 4.946 5.128 5.299 5.533 5.672 5.814 6.031 6.234 6.424 6.601 6.772 6.993 7.198 7.391 7.616 7.833 8.041 8.273 8.529 8.772 9.026 9.29 9.564 9.844 10.145 10.471 10.77 11.094 11.392 11.676 11.931 12.144 12.27 12.008 11.312 10.547 9.759 9.029 8.377 7.791 7.234 6.742 6.263 5.862 5.469 5.079 4.718 4.37 4.029 3.673 3.355 3.078 2.792 2.486 2.241 1.98 1.716 1.529 1.334 1.129 0.896 0.624 0.432 0.25 -0.01 -0.193 -0.389 -0.489 -0.704 -0.933 -1.178 -1.306 -1.58 -1.714 -1.868 -2.036 -2.393 -2.572 -2.76 -2.972 -3.209 -3.533 -4.002 -5.365 -7 ,9822 ,KEBNE ,17024873,Wed Dec 22 11:18:02 CET,Wed Dec 22 12:51:39 CET,0.0 1.111 1.662 2.034 2.3 2.54 2.793 3.026 3.384 3.527 3.674 3.816 4.092 4.22 4.444 4.652 4.863 4.97 5.172 5.358 5.614 5.768 5.918 6.152 6.381 6.592 6.784 6.971 7.205 7.423 7.638 7.888 8.126 8.341 8.592 8.876 9.151 9.455 9.761 10.081 10.393 10.692 11.021 11.35 11.677 11.993 12.345 12.664 12.869 12.901 12.567 11.897 11.188 10.479 9.793 9.134 8.545 8.0 7.525 7.038 6.613 6.241 5.876 5.526 5.2 4.892 4.572 4.281 4.008 3.707 3.415 3.189 2.935 2.655 2.437 2.217 1.989 1.761 1.526 1.358 1.174 0.881 0.68 0.471 0.359 0.132 -0.093 -0.355 -0.491 -0.775 -0.946 -1.104 -1.259 -1.623 -1.825 -2.055 -2.312 -2.571 -2.886 -3.288 -4.153 -8 ,32076 ,KEBNE ,17024874,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:51:46 CET,0.0 1.867 2.401 2.793 3.105 3.367 3.584 3.784 4.136 4.285 4.441 4.599 4.872 4.998 5.238 5.456 5.652 5.741 5.918 6.093 6.332 6.481 6.625 6.823 7.026 7.215 7.381 7.552 7.779 7.997 8.203 8.439 8.667 8.888 9.114 9.348 9.58 9.835 10.122 10.413 10.687 10.978 11.309 11.608 11.905 12.206 12.497 12.736 12.932 13.045 12.832 12.152 11.367 10.631 9.922 9.211 8.597 8.071 7.607 7.107 6.668 6.264 5.864 5.505 5.184 4.89 4.58 4.274 4.0 3.723 3.436 3.21 2.984 2.74 2.526 2.305 2.082 1.838 1.602 1.454 1.292 1.025 0.837 0.641 0.537 0.322 0.104 -0.154 -0.302 -0.602 -0.727 -0.862 -1.003 -1.307 -1.502 -1.726 -1.948 -2.19 -2.523 -2.996 -3.783 -9 ,19834 ,KEBNE ,17024875,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:52:20 CET,0.0 2.097 2.55 2.959 3.337 3.637 3.866 4.073 4.464 4.648 4.823 5.012 5.297 5.431 5.7 5.942 6.15 6.251 6.453 6.643 6.915 7.099 7.278 7.516 7.752 7.976 8.167 8.348 8.597 8.84 9.068 9.334 9.591 9.825 10.077 10.378 10.644 10.906 11.19 11.466 11.748 12.041 12.367 12.676 12.986 13.281 13.544 13.764 13.978 14.096 13.776 13.066 12.318 11.572 10.884 10.228 9.622 9.046 8.537 8.016 7.547 7.13 6.747 6.364 5.993 5.658 5.315 5.005 4.723 4.425 4.127 3.898 3.653 3.393 3.184 2.971 2.759 2.527 2.292 2.134 1.963 1.674 1.476 1.275 1.171 0.956 0.721 0.468 0.339 0.061 -0.061 -0.213 -0.397 -0.779 -0.976 -1.163 -1.357 -1.635 -1.97 -2.317 -3.61 -10 ,28490 ,KEBNE ,17024876,Wed Dec 22 11:18:02 CET,Wed Dec 22 12:51:47 CET,0.0 1.777 2.255 2.599 2.917 3.202 3.413 3.602 3.971 4.137 4.298 4.44 4.714 4.843 5.058 5.258 5.472 5.577 5.759 5.926 6.17 6.32 6.456 6.674 6.917 7.137 7.346 7.561 7.8 8.005 8.206 8.442 8.665 8.874 9.144 9.445 9.692 9.955 10.221 10.488 10.77 11.072 11.373 11.679 12.025 12.338 12.641 12.929 13.137 13.19 12.885 12.154 11.385 10.582 9.867 9.207 8.596 8.048 7.585 7.114 6.663 6.269 5.91 5.552 5.212 4.908 4.598 4.311 4.055 3.789 3.511 3.276 3.036 2.784 2.573 2.342 2.116 1.899 1.664 1.499 1.334 1.065 0.873 0.691 0.589 0.369 0.134 -0.12 -0.252 -0.536 -0.661 -0.797 -0.949 -1.356 -1.601 -1.852 -2.107 -2.374 -2.687 -3.086 -4.117 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_26_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_26_23.txt deleted file mode 100644 index fe8bdad5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_26_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28572 ,KEBNE ,17024877,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:52:12 CET,0.0 1.732 2.245 2.63 2.922 3.158 3.363 3.551 3.878 4.018 4.148 4.285 4.513 4.621 4.837 5.017 5.161 5.233 5.362 5.466 5.625 5.744 5.856 6.017 6.171 6.292 6.393 6.479 6.573 6.673 6.788 6.92 7.036 7.15 7.271 7.379 7.453 7.52 7.568 7.601 7.603 7.574 7.522 7.433 7.247 6.961 6.552 5.935 4.984 3.438 0.805 -2.312 -4.755 -6.749 -8.456 -9.956 -11.24 -12.377 -13.363 -14.328 -15.122 -15.82 -16.487 -17.12 -17.696 -18.202 -18.736 -19.224 -19.643 -20.057 -20.489 -20.86 -21.251 -21.651 -21.96 -22.279 -22.593 -22.918 -23.274 -23.513 -23.742 -24.092 -24.335 -24.605 -24.744 -25.006 -25.281 -25.61 -25.779 -26.085 -26.29 -26.475 -26.675 -27.143 -27.401 -27.676 -27.971 -28.275 -28.611 -29.066 -30.547 -2 ,10186 ,KEBNE ,17024878,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:51:47 CET,0.0 1.371 1.908 2.321 2.607 2.841 3.046 3.237 3.579 3.721 3.852 3.981 4.204 4.317 4.526 4.697 4.86 4.941 5.098 5.244 5.448 5.572 5.685 5.841 5.991 6.126 6.251 6.373 6.515 6.642 6.752 6.86 6.95 7.034 7.122 7.218 7.298 7.352 7.41 7.453 7.433 7.37 7.286 7.176 6.989 6.718 6.265 5.598 4.588 3.049 0.489 -2.572 -4.96 -6.974 -8.672 -10.136 -11.404 -12.514 -13.432 -14.331 -15.114 -15.822 -16.48 -17.076 -17.64 -18.157 -18.679 -19.139 -19.541 -19.96 -20.387 -20.743 -21.113 -21.481 -21.781 -22.085 -22.369 -22.655 -22.989 -23.231 -23.462 -23.809 -24.061 -24.341 -24.478 -24.727 -24.981 -25.246 -25.393 -25.692 -25.862 -26.025 -26.211 -26.657 -26.899 -27.149 -27.437 -27.832 -28.314 -28.837 -31.764 -3 ,28833 ,KEBNE ,17024879,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:53:33 CET,0.0 3.004 3.493 3.862 4.162 4.419 4.649 4.836 5.148 5.29 5.427 5.564 5.785 5.889 6.079 6.264 6.455 6.541 6.695 6.847 7.063 7.188 7.293 7.442 7.584 7.725 7.854 7.963 8.093 8.208 8.311 8.426 8.528 8.623 8.727 8.831 8.915 8.981 9.025 9.068 9.114 9.142 9.127 9.036 8.859 8.597 8.159 7.489 6.503 4.956 2.382 -0.633 -3.061 -5.086 -6.811 -8.283 -9.509 -10.613 -11.599 -12.597 -13.405 -14.085 -14.732 -15.344 -15.914 -16.418 -16.934 -17.395 -17.804 -18.23 -18.657 -19.004 -19.364 -19.747 -20.036 -20.339 -20.669 -21.013 -21.357 -21.58 -21.8 -22.164 -22.415 -22.671 -22.801 -23.04 -23.296 -23.584 -23.743 -24.047 -24.23 -24.401 -24.579 -24.951 -25.157 -25.379 -25.627 -25.937 -26.314 -27.035 -28.901 -4 ,11971 ,KEBNE ,17024880,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:51:54 CET,0.0 1.33 1.748 2.062 2.35 2.584 2.78 2.967 3.316 3.474 3.61 3.74 3.949 4.043 4.223 4.396 4.557 4.635 4.793 4.953 5.161 5.285 5.406 5.573 5.719 5.843 5.991 6.155 6.335 6.475 6.587 6.704 6.814 6.916 7.024 7.125 7.204 7.292 7.354 7.376 7.399 7.395 7.322 7.209 7.009 6.688 6.231 5.554 4.502 2.897 0.316 -2.703 -5.146 -7.151 -8.809 -10.249 -11.517 -12.658 -13.607 -14.539 -15.334 -16.023 -16.677 -17.299 -17.858 -18.377 -18.927 -19.394 -19.795 -20.207 -20.633 -21.002 -21.387 -21.749 -22.008 -22.27 -22.554 -22.852 -23.145 -23.391 -23.637 -23.964 -24.231 -24.514 -24.644 -24.913 -25.207 -25.524 -25.689 -26.002 -26.207 -26.394 -26.601 -27.034 -27.267 -27.528 -27.82 -28.153 -28.587 -29.089 -30.21 -5 ,4235 ,KEBNE ,17024881,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:53:46 CET,0.0 1.321 1.822 2.182 2.497 2.743 2.967 3.193 3.569 3.716 3.855 3.981 4.204 4.326 4.559 4.758 4.932 5.013 5.164 5.305 5.486 5.603 5.728 5.896 6.043 6.171 6.288 6.392 6.523 6.654 6.77 6.893 6.995 7.084 7.192 7.295 7.375 7.451 7.513 7.559 7.59 7.61 7.584 7.501 7.335 7.041 6.612 5.964 4.96 3.432 0.883 -2.144 -4.565 -6.545 -8.222 -9.678 -10.921 -12.036 -12.961 -13.875 -14.664 -15.361 -16.017 -16.619 -17.195 -17.719 -18.246 -18.698 -19.089 -19.509 -19.938 -20.29 -20.667 -21.056 -21.346 -21.655 -21.974 -22.301 -22.663 -22.915 -23.171 -23.582 -23.856 -24.137 -24.291 -24.614 -24.946 -25.284 -25.469 -25.812 -26.062 -26.247 -26.433 -26.863 -27.088 -27.334 -27.615 -27.938 -28.36 -28.853 -30.119 -6 ,21059 ,KEBNE ,17024882,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:51:58 CET,0.0 1.344 1.765 2.081 2.355 2.598 2.808 3.001 3.35 3.494 3.628 3.767 3.994 4.109 4.316 4.502 4.681 4.77 4.935 5.083 5.292 5.425 5.551 5.713 5.848 5.974 6.097 6.223 6.39 6.539 6.66 6.793 6.928 7.028 7.12 7.226 7.307 7.372 7.42 7.451 7.459 7.469 7.446 7.35 7.157 6.894 6.483 5.831 4.873 3.321 0.65 -2.41 -4.88 -6.945 -8.664 -10.148 -11.415 -12.546 -13.527 -14.47 -15.257 -15.952 -16.602 -17.207 -17.752 -18.23 -18.728 -19.176 -19.569 -19.98 -20.384 -20.708 -21.052 -21.431 -21.749 -22.07 -22.375 -22.687 -23.012 -23.24 -23.474 -23.813 -24.036 -24.263 -24.392 -24.682 -24.984 -25.308 -25.481 -25.811 -26.055 -26.264 -26.483 -26.947 -27.21 -27.453 -27.706 -28.034 -28.418 -28.932 -30.75 -7 ,12454 ,KEBNE ,17024883,Wed Dec 22 11:18:01 CET,Wed Dec 22 12:52:16 CET,0.0 2.219 2.704 3.052 3.3 3.511 3.713 3.914 4.281 4.431 4.571 4.716 4.95 5.058 5.253 5.423 5.577 5.657 5.822 5.978 6.17 6.279 6.395 6.558 6.696 6.833 6.965 7.086 7.242 7.375 7.489 7.601 7.691 7.784 7.886 7.968 8.038 8.135 8.223 8.277 8.304 8.298 8.245 8.141 7.947 7.677 7.265 6.598 5.586 4.063 1.499 -1.489 -3.877 -5.902 -7.585 -9.033 -10.289 -11.405 -12.318 -13.204 -13.993 -14.701 -15.364 -15.97 -16.524 -17.019 -17.518 -17.978 -18.374 -18.803 -19.27 -19.651 -20.034 -20.433 -20.749 -21.066 -21.383 -21.714 -22.066 -22.315 -22.563 -22.943 -23.213 -23.513 -23.667 -23.962 -24.263 -24.581 -24.749 -25.062 -25.28 -25.465 -25.661 -26.102 -26.369 -26.666 -26.973 -27.297 -27.693 -28.262 -32.601 -8 ,28534 ,KEBNE ,17024884,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:50 CET,0.0 1.682 2.103 2.428 2.715 2.971 3.183 3.368 3.705 3.866 4.03 4.203 4.427 4.536 4.735 4.912 5.072 5.147 5.284 5.416 5.587 5.704 5.819 5.964 6.105 6.239 6.372 6.494 6.649 6.782 6.9 7.039 7.157 7.243 7.32 7.426 7.541 7.633 7.696 7.736 7.752 7.723 7.653 7.544 7.351 7.054 6.601 5.956 4.915 3.313 0.677 -2.378 -4.789 -6.82 -8.528 -10.009 -11.249 -12.321 -13.252 -14.19 -14.972 -15.666 -16.316 -16.917 -17.501 -18.031 -18.557 -19.011 -19.406 -19.832 -20.26 -20.61 -20.98 -21.36 -21.661 -21.978 -22.314 -22.655 -22.995 -23.225 -23.441 -23.794 -24.058 -24.332 -24.477 -24.761 -25.039 -25.342 -25.506 -25.835 -26.066 -26.241 -26.441 -26.869 -27.091 -27.322 -27.572 -27.837 -28.15 -28.659 -30.617 -9 ,9535 ,KEBNE ,17024885,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:52:52 CET,0.0 1.251 1.66 1.943 2.185 2.411 2.628 2.842 3.206 3.345 3.476 3.639 3.877 3.994 4.199 4.381 4.555 4.633 4.774 4.908 5.102 5.231 5.349 5.509 5.658 5.789 5.908 6.021 6.16 6.296 6.412 6.528 6.637 6.728 6.81 6.896 6.969 7.03 7.095 7.147 7.192 7.216 7.163 7.047 6.871 6.599 6.158 5.471 4.459 2.926 0.302 -2.77 -5.239 -7.241 -8.907 -10.355 -11.571 -12.655 -13.597 -14.567 -15.425 -16.17 -16.831 -17.445 -18.006 -18.51 -19.038 -19.504 -19.897 -20.297 -20.717 -21.071 -21.432 -21.806 -22.107 -22.417 -22.736 -23.072 -23.419 -23.646 -23.878 -24.277 -24.563 -24.858 -25.01 -25.314 -25.611 -25.915 -26.082 -26.403 -26.638 -26.825 -27.028 -27.491 -27.728 -27.967 -28.245 -28.586 -28.975 -29.483 -31.734 -10 ,22270 ,KEBNE ,17024886,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:59 CET,0.0 1.413 1.906 2.311 2.611 2.843 3.061 3.275 3.649 3.803 3.935 4.063 4.289 4.398 4.592 4.774 4.95 5.035 5.207 5.358 5.558 5.687 5.807 5.972 6.12 6.252 6.372 6.49 6.62 6.729 6.835 6.957 7.066 7.162 7.272 7.376 7.438 7.494 7.553 7.581 7.588 7.566 7.494 7.38 7.201 6.927 6.499 5.866 4.881 3.274 0.587 -2.525 -4.98 -6.994 -8.677 -10.124 -11.368 -12.501 -13.462 -14.384 -15.158 -15.84 -16.5 -17.152 -17.782 -18.338 -18.883 -19.357 -19.758 -20.161 -20.586 -20.947 -21.317 -21.702 -22.004 -22.311 -22.63 -22.956 -23.285 -23.514 -23.747 -24.108 -24.361 -24.637 -24.783 -25.065 -25.347 -25.661 -25.825 -26.128 -26.319 -26.489 -26.677 -27.117 -27.357 -27.622 -27.923 -28.245 -28.661 -29.315 -31.274 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_26_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_26_57.txt deleted file mode 100644 index f1e19165..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_26_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3710 ,TETRA ,17559381,Sat Nov 27 06:42:23 CET,Sat Nov 27 08:36:08 CET,0.0 1.465 1.939 2.304 2.624 2.894 3.13 3.34 3.691 3.849 3.994 4.134 4.364 4.469 4.679 4.908 5.122 5.222 5.4 5.556 5.784 5.925 6.061 6.248 6.403 6.539 6.665 6.786 6.943 7.089 7.233 7.4 7.553 7.689 7.86 8.069 8.228 8.36 8.492 8.601 8.675 8.716 8.727 8.695 8.612 8.462 8.139 7.633 6.809 5.405 3.066 0.265 -2.069 -4.014 -5.667 -7.126 -8.38 -9.508 -10.458 -11.399 -12.217 -12.943 -13.63 -14.297 -14.903 -15.451 -16.025 -16.524 -16.962 -17.409 -17.865 -18.243 -18.635 -19.04 -19.355 -19.678 -20.009 -20.357 -20.71 -20.943 -21.184 -21.562 -21.811 -22.056 -22.189 -22.462 -22.747 -23.078 -23.241 -23.551 -23.755 -23.929 -24.109 -24.475 -24.675 -24.918 -25.19 -25.517 -25.864 -26.238 -27.254 -2 ,29804 ,TETRA ,17559382,Sat Nov 27 06:43:24 CET,Sat Nov 27 08:35:36 CET,0.0 1.577 2.079 2.466 2.768 3.008 3.213 3.408 3.752 3.911 4.083 4.253 4.48 4.585 4.788 4.991 5.179 5.262 5.402 5.544 5.767 5.909 6.04 6.233 6.424 6.601 6.768 6.919 7.101 7.272 7.438 7.639 7.806 7.936 8.082 8.24 8.402 8.552 8.688 8.832 8.939 9.04 9.112 9.106 9.02 8.841 8.546 8.079 7.311 5.963 3.655 0.944 -1.322 -3.234 -4.861 -6.263 -7.477 -8.54 -9.455 -10.425 -11.282 -12.024 -12.719 -13.392 -14.007 -14.557 -15.128 -15.619 -16.044 -16.494 -16.958 -17.329 -17.702 -18.092 -18.393 -18.699 -19.017 -19.347 -19.685 -19.916 -20.143 -20.492 -20.738 -20.995 -21.127 -21.399 -21.689 -21.987 -22.141 -22.451 -22.646 -22.821 -23.01 -23.456 -23.705 -23.966 -24.251 -24.574 -24.912 -25.249 -25.922 -3 ,25650 ,TETRA ,17559383,Sat Nov 27 06:44:24 CET,Sat Nov 27 08:37:34 CET,0.0 4.701 5.775 6.349 6.67 6.942 7.176 7.406 7.817 7.993 8.148 8.32 8.569 8.701 8.948 9.168 9.367 9.465 9.647 9.821 10.076 10.222 10.349 10.528 10.687 10.865 11.065 11.251 11.455 11.641 11.811 11.994 12.159 12.301 12.458 12.624 12.757 12.881 13.007 13.131 13.254 13.388 13.485 13.515 13.473 13.331 13.081 12.675 11.933 10.657 8.475 5.735 3.485 1.581 -0.034 -1.407 -2.594 -3.653 -4.564 -5.489 -6.26 -6.895 -7.494 -8.089 -8.656 -9.187 -9.761 -10.274 -10.699 -11.129 -11.583 -11.964 -12.354 -12.759 -13.067 -13.359 -13.66 -13.974 -14.289 -14.51 -14.734 -15.072 -15.311 -15.561 -15.685 -15.943 -16.233 -16.544 -16.702 -17.0 -17.219 -17.419 -17.61 -18.031 -18.284 -18.569 -18.875 -19.209 -19.555 -19.955 -21.047 -4 ,28344 ,TETRA ,17559384,Sat Nov 27 06:44:25 CET,Sat Nov 27 08:25:12 CET,0.0 2.026 2.6 2.971 3.288 3.536 3.77 4.007 4.424 4.606 4.766 4.915 5.151 5.278 5.526 5.769 5.959 6.033 6.19 6.342 6.541 6.665 6.78 6.937 7.081 7.199 7.314 7.429 7.569 7.704 7.839 8.002 8.143 8.264 8.386 8.523 8.639 8.739 8.846 8.928 8.996 9.046 9.06 9.034 8.928 8.761 8.567 8.258 7.58 6.303 3.959 1.189 -1.137 -3.099 -4.782 -6.32 -7.623 -8.754 -9.725 -10.657 -11.434 -12.131 -12.83 -13.522 -14.142 -14.697 -15.27 -15.784 -16.246 -16.706 -17.146 -17.502 -17.904 -18.321 -18.611 -18.897 -19.2 -19.515 -19.847 -20.079 -20.311 -20.663 -20.903 -21.162 -21.298 -21.565 -21.838 -22.125 -22.27 -22.58 -22.786 -22.963 -23.162 -23.595 -23.84 -24.108 -24.384 -24.68 -25.045 -25.479 -26.475 -5 ,225 ,TETRA ,17559385,Sat Nov 27 06:45:20 CET,Sat Nov 27 08:34:43 CET,0.0 2.256 2.935 3.418 3.806 4.063 4.27 4.455 4.761 4.91 5.063 5.235 5.478 5.595 5.802 6.001 6.195 6.274 6.421 6.58 6.808 6.95 7.087 7.274 7.454 7.63 7.801 7.964 8.162 8.357 8.535 8.73 8.893 9.039 9.204 9.376 9.514 9.667 9.836 9.96 10.031 10.076 10.1 10.095 10.033 9.891 9.57 9.044 8.223 6.907 4.698 2.078 -0.037 -1.808 -3.345 -4.718 -5.912 -7.018 -8.022 -9.02 -9.843 -10.545 -11.225 -11.861 -12.429 -12.935 -13.441 -13.923 -14.353 -14.782 -15.225 -15.591 -15.972 -16.366 -16.673 -16.988 -17.313 -17.643 -17.975 -18.208 -18.438 -18.785 -19.039 -19.304 -19.438 -19.726 -20.024 -20.329 -20.489 -20.8 -20.995 -21.169 -21.36 -21.765 -21.977 -22.215 -22.489 -22.844 -23.261 -23.725 -24.802 -6 ,4918 ,TETRA ,17559386,Sat Nov 27 06:45:21 CET,Sat Nov 27 08:37:36 CET,0.0 2.112 2.663 3.063 3.422 3.751 4.001 4.222 4.606 4.767 4.911 5.087 5.333 5.462 5.713 5.933 6.139 6.244 6.454 6.647 6.891 7.036 7.168 7.346 7.515 7.681 7.835 7.963 8.126 8.269 8.404 8.575 8.731 8.878 9.022 9.156 9.285 9.421 9.553 9.667 9.774 9.846 9.888 9.934 9.915 9.776 9.477 8.964 8.141 6.815 4.564 1.869 -0.375 -2.296 -3.85 -5.201 -6.395 -7.444 -8.323 -9.211 -10.003 -10.696 -11.388 -12.072 -12.684 -13.233 -13.805 -14.304 -14.709 -15.124 -15.552 -15.897 -16.249 -16.614 -16.908 -17.216 -17.526 -17.854 -18.207 -18.457 -18.709 -19.071 -19.306 -19.543 -19.675 -19.956 -20.251 -20.578 -20.742 -21.04 -21.235 -21.428 -21.638 -22.086 -22.317 -22.564 -22.84 -23.177 -23.582 -24.13 -25.709 -7 ,22189 ,TETRA ,17559387,Sat Nov 27 06:45:20 CET,Sat Nov 27 08:24:57 CET,0.0 1.879 2.384 2.786 3.133 3.437 3.684 3.91 4.286 4.441 4.587 4.734 4.971 5.092 5.317 5.531 5.724 5.81 5.984 6.158 6.39 6.544 6.694 6.888 7.063 7.226 7.381 7.525 7.7 7.86 8.017 8.186 8.331 8.464 8.61 8.779 8.923 9.061 9.203 9.322 9.417 9.505 9.533 9.529 9.516 9.384 9.057 8.517 7.683 6.413 4.205 1.337 -1.073 -3.006 -4.617 -6.057 -7.295 -8.388 -9.32 -10.266 -11.072 -11.794 -12.516 -13.199 -13.789 -14.305 -14.869 -15.387 -15.823 -16.248 -16.669 -17.031 -17.401 -17.779 -18.079 -18.382 -18.692 -19.01 -19.334 -19.545 -19.76 -20.118 -20.366 -20.622 -20.759 -21.034 -21.319 -21.616 -21.775 -22.084 -22.274 -22.455 -22.639 -23.032 -23.256 -23.506 -23.804 -24.102 -24.42 -24.883 -26.594 -8 ,30485 ,TETRA ,17559388,Sat Nov 27 06:45:20 CET,Sat Nov 27 08:24:04 CET,0.0 1.793 2.341 2.78 3.096 3.361 3.595 3.788 4.134 4.283 4.428 4.583 4.806 4.917 5.137 5.338 5.519 5.601 5.751 5.898 6.09 6.196 6.305 6.473 6.642 6.809 6.943 7.051 7.201 7.347 7.497 7.678 7.848 8.001 8.142 8.28 8.419 8.575 8.701 8.8 8.859 8.897 8.932 8.915 8.846 8.672 8.335 7.855 7.039 5.657 3.278 0.448 -1.796 -3.688 -5.296 -6.66 -7.924 -9.11 -10.084 -11.027 -11.844 -12.579 -13.26 -13.913 -14.52 -15.047 -15.607 -16.115 -16.548 -16.993 -17.435 -17.801 -18.179 -18.573 -18.878 -19.187 -19.51 -19.853 -20.206 -20.439 -20.681 -21.066 -21.333 -21.6 -21.746 -22.052 -22.35 -22.649 -22.811 -23.135 -23.354 -23.546 -23.74 -24.153 -24.371 -24.594 -24.854 -25.161 -25.529 -25.96 -27.091 -9 ,23062 ,TETRA ,17559389,Sat Nov 27 06:46:20 CET,Sat Nov 27 08:36:13 CET,0.0 1.645 2.205 2.621 2.936 3.202 3.442 3.642 4.019 4.2 4.368 4.528 4.77 4.891 5.087 5.287 5.483 5.57 5.726 5.871 6.086 6.23 6.373 6.559 6.725 6.886 7.022 7.144 7.304 7.452 7.588 7.751 7.897 8.026 8.158 8.285 8.412 8.535 8.649 8.759 8.842 8.876 8.88 8.874 8.816 8.681 8.401 7.938 7.213 5.958 3.682 0.9 -1.407 -3.324 -4.913 -6.314 -7.525 -8.616 -9.548 -10.476 -11.292 -12.023 -12.702 -13.34 -13.967 -14.539 -15.12 -15.634 -16.087 -16.565 -17.053 -17.434 -17.822 -18.256 -18.582 -18.91 -19.257 -19.605 -19.947 -20.186 -20.437 -20.827 -21.099 -21.368 -21.506 -21.796 -22.101 -22.425 -22.602 -22.93 -23.174 -23.387 -23.607 -24.082 -24.353 -24.634 -24.917 -25.266 -25.679 -26.097 -27.007 -10 ,6720 ,TETRA ,17559390,Sat Nov 27 06:46:20 CET,Sat Nov 27 08:39:38 CET,0.0 1.66 2.199 2.649 3.0 3.257 3.479 3.69 4.064 4.236 4.403 4.579 4.821 4.947 5.202 5.414 5.613 5.712 5.889 6.053 6.277 6.425 6.562 6.768 6.956 7.119 7.284 7.434 7.615 7.79 7.955 8.154 8.344 8.499 8.654 8.814 8.962 9.109 9.231 9.339 9.42 9.478 9.525 9.521 9.45 9.288 9.016 8.568 7.728 6.339 4.024 1.2 -1.157 -3.105 -4.749 -6.211 -7.478 -8.63 -9.631 -10.618 -11.423 -12.122 -12.805 -13.436 -14.025 -14.572 -15.145 -15.675 -16.139 -16.594 -17.066 -17.461 -17.866 -18.282 -18.589 -18.913 -19.255 -19.595 -19.953 -20.203 -20.452 -20.844 -21.114 -21.392 -21.537 -21.839 -22.149 -22.478 -22.655 -22.974 -23.202 -23.394 -23.595 -24.028 -24.257 -24.481 -24.713 -24.996 -25.332 -25.733 -26.773 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_26_68.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_26_68.txt deleted file mode 100644 index a75702a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_26_68.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31426 ,TETRA ,17559391,Sat Nov 27 06:47:20 CET,Sat Nov 27 08:36:31 CET,0.0 1.319 1.802 2.186 2.516 2.764 2.981 3.206 3.635 3.81 3.951 4.114 4.368 4.511 4.781 5.012 5.25 5.378 5.617 5.827 6.084 6.244 6.401 6.638 6.866 7.07 7.279 7.489 7.737 7.964 8.177 8.437 8.682 8.902 9.162 9.443 9.696 9.968 10.253 10.55 10.85 11.177 11.55 11.911 12.286 12.659 13.023 13.353 13.661 13.832 13.641 12.976 12.258 11.562 10.861 10.206 9.617 9.051 8.553 8.046 7.605 7.209 6.831 6.474 6.133 5.811 5.47 5.173 4.916 4.641 4.348 4.097 3.841 3.584 3.372 3.149 2.927 2.683 2.43 2.257 2.069 1.767 1.552 1.351 1.255 1.015 0.748 0.489 0.355 0.104 -0.088 -0.267 -0.462 -0.86 -1.081 -1.333 -1.619 -1.966 -2.342 -2.761 -4.086 -2 ,7012 ,TETRA ,17559392,Sat Nov 27 06:47:20 CET,Sat Nov 27 08:36:35 CET,0.0 1.828 2.338 2.644 2.908 3.146 3.347 3.553 3.943 4.122 4.283 4.441 4.679 4.805 5.058 5.289 5.507 5.61 5.792 5.964 6.196 6.341 6.492 6.717 6.916 7.095 7.268 7.443 7.676 7.922 8.148 8.379 8.598 8.808 9.051 9.336 9.594 9.845 10.098 10.354 10.626 10.936 11.259 11.561 11.887 12.208 12.537 12.82 13.068 13.207 13.039 12.464 11.848 11.253 10.664 10.11 9.618 9.169 8.755 8.319 7.923 7.562 7.205 6.855 6.546 6.278 5.994 5.738 5.508 5.263 5.023 4.827 4.606 4.37 4.18 3.987 3.807 3.587 3.315 3.102 2.874 2.531 2.294 2.052 1.935 1.71 1.457 1.183 1.041 0.773 0.578 0.418 0.23 -0.197 -0.411 -0.65 -0.933 -1.273 -1.713 -2.205 -4.191 -3 ,18404 ,TETRA ,17559393,Sat Nov 27 06:48:21 CET,Sat Nov 27 08:38:27 CET,0.0 1.783 2.263 2.621 2.904 3.146 3.365 3.568 3.928 4.095 4.255 4.438 4.673 4.786 5.03 5.265 5.483 5.592 5.81 6.016 6.309 6.498 6.687 6.925 7.13 7.342 7.539 7.724 7.964 8.195 8.427 8.688 8.911 9.147 9.424 9.695 9.937 10.195 10.482 10.777 11.079 11.436 11.825 12.189 12.572 12.932 13.339 13.746 14.096 14.298 14.121 13.418 12.592 11.866 11.185 10.524 9.94 9.398 8.918 8.413 7.962 7.568 7.188 6.821 6.487 6.174 5.829 5.519 5.265 4.998 4.69 4.423 4.149 3.845 3.605 3.373 3.135 2.878 2.607 2.412 2.202 1.877 1.655 1.435 1.326 1.101 0.863 0.618 0.488 0.234 0.033 -0.133 -0.303 -0.695 -0.905 -1.108 -1.313 -1.568 -1.876 -2.332 -4.441 -4 ,22998 ,TETRA ,17559394,Sat Nov 27 06:48:20 CET,Sat Nov 27 08:37:07 CET,0.0 1.422 1.925 2.258 2.525 2.756 2.986 3.202 3.573 3.748 3.916 4.141 4.423 4.569 4.816 5.053 5.287 5.395 5.61 5.806 6.084 6.269 6.449 6.718 6.957 7.177 7.401 7.627 7.894 8.123 8.341 8.61 8.859 9.088 9.352 9.63 9.894 10.179 10.479 10.776 11.061 11.371 11.726 12.09 12.492 12.86 13.207 13.574 13.896 14.082 13.983 13.384 12.655 11.922 11.242 10.624 10.044 9.487 9.005 8.502 8.053 7.644 7.244 6.879 6.548 6.226 5.871 5.564 5.302 5.025 4.717 4.463 4.181 3.866 3.64 3.417 3.183 2.93 2.658 2.477 2.279 1.941 1.714 1.491 1.381 1.152 0.913 0.655 0.518 0.277 0.089 -0.077 -0.248 -0.622 -0.821 -1.065 -1.369 -1.7 -2.042 -2.563 -6.703 -5 ,7049 ,TETRA ,17559395,Sat Nov 27 06:48:21 CET,Sat Nov 27 08:37:22 CET,0.0 1.419 1.931 2.359 2.751 3.047 3.252 3.44 3.788 3.962 4.121 4.287 4.543 4.678 4.919 5.135 5.323 5.417 5.608 5.775 6.012 6.167 6.32 6.547 6.761 6.963 7.153 7.328 7.543 7.754 7.995 8.271 8.495 8.721 8.989 9.298 9.571 9.853 10.153 10.458 10.786 11.148 11.538 11.885 12.257 12.633 13.032 13.429 13.757 13.915 13.788 13.214 12.525 11.847 11.168 10.523 9.924 9.373 8.886 8.39 7.955 7.561 7.175 6.8 6.458 6.141 5.802 5.485 5.21 4.937 4.636 4.384 4.124 3.846 3.62 3.374 3.135 2.895 2.653 2.488 2.304 2.02 1.819 1.606 1.499 1.271 1.031 0.779 0.646 0.394 0.212 0.055 -0.132 -0.547 -0.765 -1.001 -1.268 -1.576 -1.909 -2.335 -4.631 -6 ,12358 ,TETRA ,17559396,Sat Nov 27 06:48:21 CET,Sat Nov 27 08:38:22 CET,0.0 1.461 1.932 2.302 2.625 2.895 3.141 3.357 3.765 3.952 4.112 4.287 4.542 4.69 4.968 5.221 5.462 5.572 5.762 5.936 6.188 6.36 6.528 6.777 7.024 7.248 7.456 7.645 7.899 8.146 8.361 8.614 8.869 9.124 9.387 9.655 9.923 10.215 10.525 10.846 11.166 11.498 11.863 12.221 12.612 13.028 13.445 13.802 14.127 14.359 14.326 13.8 13.063 12.356 11.73 11.125 10.556 10.043 9.59 9.111 8.691 8.3 7.909 7.554 7.22 6.912 6.595 6.29 6.027 5.76 5.49 5.257 4.998 4.727 4.521 4.281 4.013 3.75 3.484 3.305 3.122 2.835 2.633 2.41 2.289 2.036 1.774 1.485 1.323 1.06 0.882 0.723 0.555 0.165 -0.053 -0.274 -0.523 -0.865 -1.324 -1.769 -3.45 -7 ,6703 ,TETRA ,17559397,Sat Nov 27 06:48:21 CET,Sat Nov 27 08:38:00 CET,0.0 2.564 3.11 3.455 3.774 4.057 4.309 4.533 4.926 5.122 5.302 5.479 5.712 5.829 6.07 6.295 6.503 6.603 6.799 6.995 7.288 7.47 7.636 7.861 8.077 8.294 8.482 8.669 8.912 9.108 9.299 9.548 9.786 10.007 10.269 10.564 10.83 11.11 11.408 11.714 12.028 12.379 12.767 13.131 13.553 13.994 14.407 14.798 15.112 15.312 15.202 14.612 13.925 13.206 12.533 11.868 11.234 10.653 10.163 9.672 9.215 8.795 8.41 8.047 7.718 7.408 7.084 6.806 6.55 6.279 6.006 5.774 5.51 5.232 5.03 4.837 4.622 4.377 4.117 3.924 3.728 3.454 3.267 3.063 2.96 2.76 2.545 2.317 2.195 1.949 1.755 1.566 1.378 0.981 0.765 0.528 0.237 -0.081 -0.432 -0.928 -2.14 -8 ,5537 ,TETRA ,17559398,Sat Nov 27 06:49:22 CET,Sat Nov 27 08:38:19 CET,0.0 1.027 1.426 1.739 2.021 2.296 2.545 2.758 3.149 3.32 3.48 3.672 3.925 4.065 4.331 4.591 4.863 4.988 5.197 5.398 5.697 5.895 6.101 6.382 6.634 6.876 7.1 7.307 7.55 7.784 8.021 8.297 8.552 8.795 9.077 9.357 9.618 9.92 10.235 10.539 10.841 11.18 11.551 11.904 12.299 12.693 13.088 13.456 13.796 13.968 13.741 13.1 12.34 11.585 10.902 10.243 9.599 8.981 8.433 7.889 7.416 6.98 6.553 6.15 5.785 5.472 5.142 4.836 4.58 4.315 4.036 3.803 3.552 3.282 3.087 2.897 2.693 2.47 2.233 2.06 1.871 1.592 1.405 1.199 1.093 0.878 0.641 0.362 0.213 -0.041 -0.24 -0.392 -0.551 -0.883 -1.083 -1.309 -1.572 -1.912 -2.301 -2.776 -5.386 -9 ,3137 ,TETRA ,17559399,Sat Nov 27 06:49:25 CET,Sat Nov 27 08:38:27 CET,0.0 2.439 2.991 3.312 3.587 3.835 4.042 4.24 4.635 4.82 4.989 5.182 5.427 5.559 5.798 6.004 6.208 6.31 6.504 6.689 6.978 7.15 7.3 7.544 7.799 8.035 8.246 8.448 8.698 8.924 9.14 9.401 9.655 9.901 10.164 10.445 10.709 10.988 11.29 11.608 11.934 12.257 12.611 12.965 13.334 13.696 14.039 14.375 14.688 14.861 14.705 14.069 13.33 12.591 11.891 11.236 10.638 10.082 9.592 9.091 8.629 8.209 7.825 7.465 7.124 6.792 6.437 6.117 5.841 5.563 5.255 5.001 4.742 4.456 4.226 4.0 3.778 3.542 3.293 3.119 2.934 2.649 2.447 2.241 2.138 1.916 1.666 1.382 1.234 0.963 0.749 0.59 0.412 0.009 -0.202 -0.438 -0.728 -1.023 -1.334 -1.767 -3.892 -10 ,23899 ,TETRA ,17559400,Sat Nov 27 06:49:27 CET,Sat Nov 27 08:38:45 CET,0.0 1.412 1.895 2.219 2.519 2.79 3.001 3.199 3.608 3.808 3.998 4.23 4.493 4.643 4.935 5.218 5.482 5.601 5.83 6.055 6.357 6.544 6.727 6.967 7.175 7.38 7.567 7.735 7.968 8.213 8.45 8.751 9.046 9.306 9.569 9.849 10.102 10.392 10.702 10.993 11.303 11.665 12.051 12.384 12.768 13.158 13.518 13.867 14.193 14.388 14.207 13.562 12.833 12.111 11.459 10.873 10.357 9.868 9.442 9.027 8.664 8.322 7.989 7.668 7.343 7.03 6.668 6.346 6.072 5.784 5.523 5.313 5.087 4.852 4.66 4.452 4.237 4.02 3.785 3.614 3.436 3.167 2.978 2.785 2.687 2.483 2.275 2.048 1.93 1.69 1.49 1.329 1.164 0.799 0.611 0.391 0.129 -0.155 -0.466 -0.858 -2.421 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_28.txt deleted file mode 100644 index a4ed03fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30327 ,TETRA ,17559401,Sat Nov 27 06:50:23 CET,Sat Nov 27 08:37:44 CET,0.0 1.632 1.984 2.252 2.498 2.725 2.921 3.11 3.469 3.622 3.759 3.85 4.113 4.243 4.498 4.727 4.933 5.029 5.226 5.426 5.702 5.875 6.041 6.256 6.465 6.686 6.896 7.085 7.32 7.552 7.77 8.038 8.294 8.522 8.769 9.046 9.33 9.634 9.944 10.267 10.59 10.918 11.292 11.655 12.054 12.491 12.967 13.415 13.842 14.19 14.315 14.114 13.757 13.342 12.914 12.505 12.108 11.723 11.373 11.007 10.692 10.394 10.11 9.848 9.597 9.347 9.078 8.833 8.61 8.389 8.184 8.008 7.791 7.566 7.398 7.211 7.017 6.825 6.598 6.432 6.269 6.008 5.809 5.585 5.471 5.262 5.041 4.78 4.648 4.364 4.209 4.036 3.848 3.47 3.252 3.015 2.758 2.446 2.066 1.461 -0.678 -2 ,587 ,TETRA ,17559402,Sat Nov 27 06:51:24 CET,Sat Nov 27 08:42:54 CET,0.0 2.835 3.385 3.805 4.111 4.372 4.621 4.846 5.232 5.397 5.561 5.737 6.023 6.158 6.437 6.706 6.956 7.071 7.276 7.453 7.713 7.9 8.073 8.311 8.539 8.75 8.948 9.126 9.359 9.575 9.762 9.995 10.24 10.474 10.738 11.038 11.306 11.583 11.918 12.269 12.596 12.963 13.367 13.727 14.102 14.474 14.901 15.38 15.843 16.238 16.449 16.329 16.01 15.589 15.194 14.816 14.432 14.045 13.648 13.246 12.91 12.585 12.259 11.93 11.648 11.422 11.188 10.976 10.763 10.516 10.264 10.066 9.872 9.682 9.534 9.364 9.179 8.968 8.704 8.505 8.313 8.021 7.796 7.564 7.447 7.176 6.892 6.625 6.49 6.201 6.041 5.884 5.717 5.351 5.141 4.92 4.691 4.387 3.994 3.464 1.674 -3 ,31843 ,TETRA ,17559403,Sat Nov 27 06:51:24 CET,Sat Nov 27 08:29:51 CET,0.0 2.97 3.586 4.036 4.351 4.595 4.814 5.012 5.361 5.533 5.698 5.859 6.146 6.268 6.491 6.716 6.942 7.05 7.263 7.472 7.77 7.95 8.122 8.363 8.588 8.807 9.022 9.204 9.428 9.68 9.913 10.158 10.383 10.607 10.852 11.114 11.372 11.658 11.952 12.233 12.529 12.871 13.268 13.644 14.046 14.482 14.955 15.449 15.96 16.434 16.615 16.3 15.858 15.342 14.828 14.338 13.946 13.622 13.297 12.938 12.633 12.35 12.03 11.713 11.433 11.181 10.918 10.68 10.46 10.23 10.014 9.829 9.618 9.402 9.223 9.029 8.842 8.647 8.44 8.293 8.13 7.888 7.741 7.572 7.48 7.29 7.039 6.766 6.644 6.372 6.248 6.107 5.97 5.657 5.476 5.284 5.032 4.656 4.222 3.645 1.132 -4 ,21302 ,TETRA ,17559404,Sat Nov 27 06:52:21 CET,Sat Nov 27 08:39:44 CET,0.0 2.794 3.389 3.761 4.084 4.385 4.634 4.865 5.266 5.442 5.605 5.76 6.059 6.215 6.487 6.747 6.988 7.109 7.335 7.535 7.826 8.002 8.165 8.394 8.593 8.808 9.041 9.255 9.507 9.741 9.973 10.246 10.495 10.739 11.026 11.326 11.596 11.898 12.23 12.559 12.876 13.227 13.604 13.933 14.322 14.732 15.151 15.589 15.996 16.308 16.432 16.218 15.85 15.442 15.029 14.625 14.245 13.886 13.544 13.19 12.886 12.603 12.332 12.071 11.831 11.581 11.269 11.013 10.818 10.608 10.377 10.19 9.994 9.777 9.608 9.422 9.222 9.006 8.762 8.6 8.443 8.203 8.022 7.811 7.704 7.472 7.223 6.966 6.84 6.569 6.427 6.264 6.091 5.736 5.531 5.292 5.015 4.686 4.33 3.873 1.998 -5 ,26903 ,TETRA ,17559405,Sat Nov 27 06:52:21 CET,Sat Nov 27 08:39:40 CET,0.0 1.423 1.842 2.161 2.417 2.663 2.891 3.095 3.432 3.561 3.69 3.804 4.087 4.209 4.423 4.633 4.845 4.953 5.181 5.416 5.731 5.912 6.08 6.314 6.54 6.761 6.974 7.183 7.454 7.714 7.952 8.216 8.472 8.728 9.02 9.327 9.603 9.896 10.211 10.541 10.88 11.268 11.681 12.044 12.465 12.939 13.441 13.925 14.402 14.768 14.974 14.836 14.498 14.102 13.704 13.282 12.866 12.481 12.146 11.82 11.555 11.315 11.059 10.802 10.564 10.326 10.069 9.847 9.649 9.433 9.206 9.021 8.838 8.639 8.471 8.287 8.099 7.926 7.743 7.588 7.417 7.171 7.0 6.803 6.691 6.461 6.236 5.987 5.853 5.587 5.469 5.325 5.152 4.699 4.477 4.279 4.052 3.783 3.449 2.948 0.459 -6 ,6738 ,TETRA ,17559406,Sat Nov 27 06:53:22 CET,Sat Nov 27 08:41:16 CET,0.0 2.27 2.819 3.23 3.543 3.802 4.022 4.207 4.591 4.773 4.928 5.078 5.381 5.526 5.789 6.059 6.304 6.408 6.596 6.771 7.044 7.225 7.395 7.628 7.845 8.067 8.28 8.488 8.75 9.0 9.262 9.563 9.832 10.086 10.393 10.731 11.038 11.379 11.735 12.09 12.469 12.897 13.383 13.855 14.347 14.843 15.352 15.813 16.271 16.731 16.995 16.807 16.399 15.939 15.509 15.132 14.765 14.374 14.026 13.683 13.388 13.126 12.861 12.603 12.337 12.088 11.838 11.612 11.405 11.18 10.951 10.777 10.588 10.369 10.212 10.052 9.867 9.678 9.485 9.333 9.162 8.872 8.66 8.453 8.353 8.145 7.913 7.675 7.555 7.282 7.169 7.035 6.889 6.582 6.415 6.196 5.933 5.665 5.37 4.988 3.131 -7 ,3132 ,TETRA ,17559407,Sat Nov 27 06:53:22 CET,Sat Nov 27 08:41:23 CET,0.0 2.62 3.306 3.885 4.31 4.627 4.893 5.171 5.643 5.808 5.966 6.134 6.437 6.582 6.847 7.102 7.32 7.418 7.618 7.812 8.056 8.216 8.388 8.626 8.84 9.054 9.265 9.474 9.75 9.988 10.188 10.448 10.705 10.933 11.192 11.464 11.722 12.022 12.346 12.691 13.053 13.406 13.759 14.098 14.47 14.871 15.323 15.778 16.198 16.576 16.802 16.624 16.24 15.808 15.373 14.965 14.587 14.204 13.866 13.506 13.185 12.883 12.585 12.313 12.065 11.838 11.59 11.361 11.167 10.964 10.73 10.532 10.33 10.119 9.944 9.752 9.562 9.355 9.13 8.978 8.827 8.597 8.431 8.245 8.147 7.96 7.738 7.489 7.368 7.093 6.968 6.817 6.662 6.333 6.135 5.911 5.662 5.392 5.072 4.685 3.091 -8 ,8377 ,TETRA ,17559408,Sat Nov 27 06:54:21 CET,Sat Nov 27 08:42:52 CET,0.0 2.514 3.123 3.461 3.758 4.031 4.264 4.476 4.857 5.029 5.199 5.36 5.665 5.811 6.076 6.339 6.576 6.68 6.886 7.095 7.389 7.577 7.781 8.06 8.291 8.5 8.696 8.886 9.123 9.339 9.54 9.787 10.028 10.267 10.52 10.772 11.04 11.345 11.646 11.938 12.249 12.584 12.942 13.331 13.781 14.203 14.622 15.048 15.488 15.854 15.992 15.791 15.434 15.028 14.63 14.253 13.871 13.49 13.174 12.856 12.562 12.28 12.003 11.753 11.515 11.284 11.031 10.814 10.619 10.391 10.157 9.967 9.776 9.583 9.423 9.252 9.066 8.863 8.628 8.449 8.265 7.987 7.79 7.59 7.494 7.297 7.106 6.894 6.761 6.48 6.352 6.207 6.053 5.72 5.526 5.301 5.06 4.801 4.459 3.942 2.123 -9 ,550 ,TETRA ,17559409,Sat Nov 27 06:55:24 CET,Sat Nov 27 08:44:01 CET,0.0 2.485 3.033 3.38 3.622 3.848 4.058 4.276 4.684 4.872 5.054 5.239 5.544 5.701 6.006 6.277 6.534 6.662 6.899 7.11 7.382 7.548 7.71 7.95 8.164 8.359 8.545 8.732 8.994 9.252 9.494 9.766 10.012 10.249 10.525 10.826 11.138 11.471 11.814 12.173 12.496 12.848 13.237 13.603 14.024 14.471 14.945 15.435 15.866 16.218 16.429 16.238 15.875 15.457 15.023 14.616 14.21 13.799 13.468 13.133 12.823 12.529 12.231 11.964 11.721 11.5 11.239 10.965 10.729 10.498 10.252 10.032 9.816 9.6 9.418 9.222 9.003 8.766 8.511 8.34 8.184 7.961 7.8 7.622 7.537 7.34 7.116 6.893 6.775 6.504 6.382 6.231 6.076 5.741 5.523 5.27 5.031 4.735 4.376 3.853 1.562 -10 ,10938 ,TETRA ,17559410,Sat Nov 27 06:55:25 CET,Sat Nov 27 08:43:19 CET,0.0 1.504 1.914 2.214 2.503 2.746 2.964 3.184 3.583 3.745 3.9 4.022 4.283 4.398 4.628 4.851 5.062 5.155 5.335 5.521 5.784 5.952 6.11 6.336 6.577 6.809 7.014 7.199 7.437 7.67 7.895 8.175 8.435 8.676 8.957 9.252 9.535 9.858 10.183 10.522 10.87 11.223 11.621 12.018 12.465 12.957 13.485 13.943 14.406 14.903 15.163 14.937 14.529 14.09 13.676 13.273 12.892 12.517 12.161 11.78 11.454 11.151 10.842 10.55 10.273 10.03 9.766 9.517 9.311 9.068 8.794 8.577 8.347 8.116 7.936 7.75 7.548 7.324 7.11 6.963 6.816 6.586 6.412 6.223 6.129 5.944 5.746 5.543 5.43 5.17 5.096 4.96 4.785 4.411 4.208 3.99 3.768 3.506 3.156 2.703 0.856 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_30.txt deleted file mode 100644 index a825f7f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4606 ,TETRA ,17559411,Sat Nov 27 06:57:21 CET,Sat Nov 27 08:45:43 CET,0.0 1.48 1.939 2.253 2.51 2.737 2.943 3.111 3.4 3.532 3.651 3.733 3.987 4.092 4.298 4.496 4.677 4.767 4.939 5.104 5.328 5.462 5.595 5.769 5.931 6.101 6.268 6.421 6.601 6.777 6.954 7.146 7.316 7.481 7.664 7.85 8.031 8.223 8.419 8.626 8.808 9.008 9.227 9.404 9.587 9.763 9.929 10.057 10.063 9.863 9.244 8.261 7.349 6.503 5.762 5.094 4.499 3.96 3.505 3.036 2.625 2.268 1.914 1.576 1.263 0.975 0.669 0.398 0.159 -0.081 -0.329 -0.546 -0.774 -1.016 -1.192 -1.376 -1.576 -1.786 -2.003 -2.145 -2.295 -2.544 -2.71 -2.875 -2.966 -3.158 -3.365 -3.589 -3.709 -3.984 -4.088 -4.234 -4.377 -4.677 -4.865 -5.087 -5.319 -5.554 -5.868 -6.375 -7.817 -2 ,27947 ,TETRA ,17559412,Sat Nov 27 06:57:21 CET,Sat Nov 27 08:45:36 CET,0.0 1.516 2.021 2.328 2.644 2.917 3.11 3.289 3.601 3.754 3.893 4.011 4.285 4.394 4.594 4.798 4.984 5.06 5.198 5.34 5.544 5.672 5.797 5.979 6.138 6.285 6.437 6.595 6.8 6.979 7.148 7.331 7.493 7.665 7.867 8.076 8.261 8.452 8.675 8.896 9.075 9.276 9.495 9.683 9.883 10.042 10.18 10.305 10.299 10.102 9.505 8.526 7.624 6.794 6.049 5.372 4.762 4.202 3.716 3.232 2.822 2.452 2.084 1.742 1.428 1.138 0.846 0.589 0.358 0.109 -0.148 -0.364 -0.59 -0.817 -0.996 -1.179 -1.374 -1.58 -1.793 -1.948 -2.101 -2.33 -2.499 -2.673 -2.763 -2.94 -3.128 -3.331 -3.43 -3.68 -3.77 -3.904 -4.04 -4.323 -4.457 -4.618 -4.831 -5.08 -5.386 -5.811 -7.129 -3 ,5634 ,TETRA ,17559413,Sat Nov 27 06:58:23 CET,Sat Nov 27 08:47:32 CET,0.0 1.822 2.312 2.648 2.942 3.205 3.445 3.653 4.031 4.197 4.346 4.51 4.799 4.918 5.144 5.375 5.575 5.665 5.845 6.005 6.225 6.373 6.521 6.737 6.938 7.134 7.319 7.492 7.719 7.914 8.083 8.278 8.461 8.654 8.881 9.107 9.3 9.507 9.73 9.958 10.176 10.408 10.668 10.899 11.177 11.414 11.536 11.601 11.584 11.401 10.778 9.755 8.798 7.946 7.225 6.577 5.993 5.448 4.97 4.482 4.058 3.701 3.363 3.04 2.734 2.453 2.163 1.895 1.659 1.42 1.165 0.95 0.731 0.508 0.34 0.151 -0.06 -0.262 -0.468 -0.614 -0.762 -1.005 -1.177 -1.37 -1.47 -1.67 -1.904 -2.161 -2.295 -2.58 -2.659 -2.77 -2.896 -3.185 -3.345 -3.528 -3.736 -3.965 -4.223 -4.597 -6.309 -4 ,18791 ,TETRA ,17559414,Sat Nov 27 06:59:21 CET,Sat Nov 27 08:47:32 CET,0.0 1.967 2.391 2.686 2.978 3.218 3.414 3.597 3.904 4.045 4.186 4.279 4.53 4.632 4.816 5.006 5.195 5.278 5.432 5.581 5.789 5.929 6.067 6.254 6.422 6.575 6.728 6.882 7.072 7.252 7.407 7.586 7.779 7.966 8.155 8.352 8.552 8.767 8.975 9.163 9.356 9.557 9.779 9.977 10.172 10.373 10.541 10.603 10.573 10.359 9.759 8.805 7.877 7.045 6.309 5.635 5.05 4.505 4.028 3.562 3.156 2.783 2.425 2.085 1.763 1.471 1.169 0.897 0.66 0.411 0.147 -0.072 -0.295 -0.525 -0.707 -0.898 -1.097 -1.297 -1.506 -1.653 -1.805 -2.058 -2.251 -2.459 -2.564 -2.784 -3.023 -3.291 -3.431 -3.723 -3.875 -4.03 -4.187 -4.545 -4.739 -4.95 -5.19 -5.45 -5.764 -6.154 -6.973 -5 ,15913 ,TETRA ,17559415,Sat Nov 27 06:59:21 CET,Sat Nov 27 08:52:14 CET,0.0 1.749 2.244 2.615 2.9 3.124 3.321 3.496 3.813 3.95 4.08 4.195 4.47 4.584 4.795 5.003 5.193 5.277 5.431 5.579 5.796 5.932 6.054 6.234 6.416 6.592 6.748 6.888 7.069 7.246 7.419 7.616 7.798 7.963 8.14 8.333 8.499 8.668 8.875 9.098 9.299 9.503 9.696 9.885 10.098 10.273 10.424 10.507 10.462 10.211 9.536 8.526 7.575 6.712 5.959 5.258 4.632 4.059 3.557 3.066 2.638 2.245 1.879 1.54 1.209 0.899 0.576 0.291 0.048 -0.209 -0.481 -0.709 -0.93 -1.163 -1.347 -1.512 -1.692 -1.887 -2.081 -2.219 -2.366 -2.6 -2.776 -2.967 -3.06 -3.258 -3.483 -3.719 -3.845 -4.136 -4.243 -4.378 -4.517 -4.815 -4.986 -5.199 -5.457 -5.73 -6.036 -6.46 -7.754 -6 ,7097 ,TETRA ,17559416,Sat Nov 27 06:59:21 CET,Sat Nov 27 08:49:48 CET,0.0 1.62 2.08 2.379 2.639 2.871 3.063 3.222 3.531 3.676 3.81 3.926 4.193 4.309 4.53 4.735 4.919 5.007 5.17 5.33 5.559 5.693 5.819 6.018 6.208 6.39 6.57 6.718 6.896 7.07 7.239 7.429 7.612 7.799 7.995 8.204 8.4 8.6 8.793 8.981 9.163 9.358 9.591 9.805 10.014 10.214 10.383 10.465 10.415 10.183 9.612 8.662 7.728 6.892 6.14 5.46 4.865 4.329 3.863 3.385 2.984 2.637 2.298 1.971 1.669 1.392 1.094 0.819 0.583 0.342 0.076 -0.142 -0.358 -0.589 -0.767 -0.952 -1.162 -1.388 -1.624 -1.79 -1.951 -2.211 -2.411 -2.612 -2.708 -2.898 -3.106 -3.343 -3.467 -3.746 -3.883 -4.04 -4.21 -4.57 -4.757 -4.961 -5.199 -5.494 -5.837 -6.285 -7.483 -7 ,11323 ,TETRA ,17559417,Sat Nov 27 06:59:21 CET,Sat Nov 27 08:49:40 CET,0.0 1.608 1.999 2.322 2.612 2.865 3.069 3.238 3.573 3.734 3.883 4.006 4.27 4.379 4.581 4.771 4.939 5.019 5.173 5.329 5.554 5.7 5.842 6.025 6.19 6.357 6.517 6.661 6.823 6.992 7.164 7.357 7.542 7.717 7.917 8.126 8.322 8.549 8.761 8.949 9.139 9.355 9.596 9.795 9.98 10.142 10.28 10.361 10.364 10.191 9.595 8.607 7.692 6.832 6.078 5.446 4.877 4.332 3.854 3.371 2.939 2.565 2.216 1.869 1.549 1.273 0.98 0.708 0.476 0.23 -0.035 -0.249 -0.48 -0.725 -0.914 -1.096 -1.287 -1.49 -1.698 -1.854 -2.017 -2.278 -2.468 -2.66 -2.755 -2.958 -3.177 -3.411 -3.532 -3.81 -3.927 -4.075 -4.225 -4.57 -4.778 -4.993 -5.235 -5.537 -5.913 -6.282 -6.929 -8 ,18108 ,TETRA ,17559418,Sat Nov 27 06:59:20 CET,Sat Nov 27 08:47:45 CET,0.0 2.158 2.729 3.038 3.271 3.508 3.731 3.93 4.3 4.468 4.634 4.804 5.092 5.229 5.474 5.725 5.938 6.022 6.19 6.35 6.561 6.693 6.824 7.009 7.178 7.338 7.481 7.622 7.805 7.995 8.19 8.402 8.58 8.732 8.902 9.097 9.287 9.495 9.702 9.918 10.128 10.344 10.558 10.768 10.99 11.154 11.296 11.402 11.4 11.171 10.539 9.498 8.534 7.63 6.842 6.141 5.537 4.99 4.512 4.041 3.618 3.254 2.924 2.604 2.296 2.018 1.723 1.459 1.226 0.969 0.711 0.511 0.298 0.061 -0.119 -0.308 -0.509 -0.712 -0.905 -1.038 -1.184 -1.409 -1.577 -1.757 -1.847 -2.035 -2.226 -2.438 -2.56 -2.843 -2.954 -3.097 -3.239 -3.537 -3.712 -3.908 -4.124 -4.351 -4.601 -4.928 -5.794 -9 ,9091 ,TETRA ,17559419,Sat Nov 27 07:00:24 CET,Sat Nov 27 08:49:02 CET,0.0 2.262 2.78 3.114 3.378 3.621 3.857 4.076 4.438 4.622 4.794 4.947 5.225 5.359 5.593 5.793 5.972 6.055 6.215 6.36 6.572 6.71 6.833 7.008 7.188 7.374 7.556 7.736 7.974 8.193 8.385 8.596 8.797 8.984 9.167 9.353 9.54 9.738 9.949 10.156 10.346 10.57 10.806 10.974 11.163 11.357 11.51 11.563 11.485 11.253 10.645 9.691 8.803 7.998 7.247 6.564 5.948 5.391 4.929 4.449 4.023 3.654 3.312 2.998 2.694 2.413 2.123 1.85 1.618 1.373 1.089 0.841 0.61 0.375 0.17 -0.044 -0.267 -0.489 -0.699 -0.84 -0.988 -1.228 -1.39 -1.56 -1.651 -1.839 -2.039 -2.257 -2.375 -2.655 -2.756 -2.901 -3.049 -3.371 -3.549 -3.734 -3.952 -4.204 -4.521 -4.891 -5.659 -10 ,17466 ,TETRA ,17559420,Sat Nov 27 07:01:21 CET,Sat Nov 27 08:51:57 CET,0.0 1.376 1.836 2.175 2.453 2.703 2.913 3.106 3.436 3.591 3.741 3.857 4.123 4.236 4.437 4.628 4.814 4.904 5.076 5.226 5.446 5.578 5.693 5.866 6.025 6.183 6.342 6.49 6.677 6.863 7.038 7.237 7.423 7.59 7.791 8.006 8.192 8.393 8.601 8.813 9.016 9.227 9.472 9.69 9.908 10.101 10.236 10.293 10.277 10.099 9.485 8.494 7.591 6.765 6.02 5.37 4.796 4.257 3.785 3.302 2.881 2.52 2.167 1.832 1.518 1.223 0.914 0.635 0.406 0.157 -0.107 -0.319 -0.551 -0.798 -0.982 -1.165 -1.359 -1.56 -1.766 -1.911 -2.059 -2.296 -2.467 -2.637 -2.724 -2.911 -3.106 -3.33 -3.453 -3.719 -3.796 -3.917 -4.058 -4.378 -4.557 -4.755 -4.984 -5.278 -5.632 -6.026 -7.289 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_32.txt deleted file mode 100644 index 286720a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12068 ,TETRA ,17559422,Sat Nov 27 07:01:22 CET,Sat Nov 27 08:31:56 CET,0.0 1.792 2.373 2.789 3.098 3.341 3.538 3.712 4.02 4.15 4.262 4.356 4.62 4.732 4.956 5.168 5.353 5.435 5.588 5.734 5.958 6.122 6.279 6.482 6.677 6.862 7.035 7.205 7.425 7.613 7.775 7.977 8.168 8.348 8.565 8.807 9.042 9.285 9.517 9.751 9.976 10.211 10.47 10.702 10.964 11.246 11.532 11.761 11.909 11.966 11.718 11.133 10.515 9.89 9.285 8.717 8.221 7.759 7.337 6.929 6.579 6.261 5.956 5.654 5.362 5.079 4.802 4.57 4.363 4.135 3.885 3.68 3.475 3.263 3.103 2.944 2.774 2.587 2.385 2.24 2.09 1.868 1.71 1.543 1.461 1.286 1.087 0.876 0.766 0.495 0.395 0.258 0.11 -0.202 -0.362 -0.544 -0.764 -1.033 -1.317 -1.648 -2.649 -2 ,6536 ,TETRA ,17559423,Sat Nov 27 07:03:23 CET,Sat Nov 27 08:46:43 CET,0.0 1.013 1.412 1.703 1.986 2.238 2.453 2.652 3.048 3.222 3.373 3.51 3.77 3.881 4.112 4.329 4.515 4.602 4.773 4.933 5.154 5.286 5.42 5.624 5.808 5.978 6.142 6.3 6.482 6.646 6.817 7.042 7.26 7.459 7.684 7.932 8.156 8.373 8.589 8.818 9.05 9.3 9.571 9.82 10.1 10.374 10.656 10.894 11.075 11.132 10.886 10.283 9.614 8.947 8.323 7.771 7.272 6.794 6.382 5.973 5.623 5.293 4.938 4.597 4.296 4.024 3.736 3.464 3.224 2.983 2.723 2.502 2.264 2.016 1.834 1.638 1.437 1.223 0.996 0.844 0.684 0.425 0.245 0.055 -0.05 -0.271 -0.494 -0.727 -0.853 -1.128 -1.264 -1.424 -1.578 -1.942 -2.129 -2.312 -2.526 -2.801 -3.145 -3.588 -5.014 -3 ,23561 ,TETRA ,17559424,Sat Nov 27 07:04:20 CET,Sat Nov 27 08:52:59 CET,0.0 1.833 2.377 2.756 3.023 3.246 3.446 3.628 3.953 4.092 4.229 4.353 4.631 4.76 5.002 5.237 5.467 5.576 5.778 5.957 6.223 6.38 6.515 6.712 6.894 7.071 7.251 7.431 7.641 7.818 7.999 8.211 8.41 8.603 8.808 9.046 9.289 9.533 9.777 10.016 10.254 10.5 10.774 11.042 11.321 11.59 11.863 12.11 12.267 12.32 12.056 11.377 10.677 10.039 9.445 8.895 8.396 7.925 7.515 7.104 6.765 6.439 6.107 5.785 5.467 5.178 4.88 4.614 4.379 4.128 3.871 3.66 3.439 3.213 3.029 2.833 2.629 2.403 2.157 1.991 1.829 1.573 1.372 1.155 1.054 0.853 0.642 0.439 0.316 0.038 -0.057 -0.209 -0.376 -0.704 -0.865 -1.058 -1.276 -1.522 -1.82 -2.251 -3.28 -4 ,15089 ,TETRA ,17559425,Sat Nov 27 07:04:21 CET,Sat Nov 27 08:53:00 CET,0.0 2.031 2.505 2.862 3.147 3.37 3.572 3.775 4.178 4.35 4.496 4.636 4.919 5.053 5.299 5.517 5.701 5.784 5.951 6.117 6.349 6.49 6.632 6.851 7.041 7.217 7.396 7.561 7.758 7.946 8.122 8.331 8.535 8.717 8.909 9.127 9.333 9.545 9.768 9.994 10.223 10.467 10.744 11.021 11.29 11.549 11.808 12.047 12.229 12.255 12.004 11.38 10.724 10.09 9.472 8.886 8.395 7.969 7.573 7.164 6.808 6.467 6.137 5.808 5.486 5.203 4.914 4.657 4.428 4.173 3.904 3.697 3.49 3.26 3.08 2.893 2.692 2.497 2.298 2.156 1.995 1.739 1.572 1.392 1.296 1.101 0.881 0.639 0.521 0.258 0.184 0.056 -0.075 -0.375 -0.561 -0.758 -1.006 -1.312 -1.663 -2.11 -2.891 -5 ,32707 ,TETRA ,17559426,Sat Nov 27 07:05:22 CET,Sat Nov 27 08:54:42 CET,0.0 2.151 2.683 3.068 3.384 3.605 3.793 3.974 4.296 4.443 4.576 4.676 4.95 5.076 5.305 5.522 5.72 5.807 5.974 6.137 6.361 6.499 6.636 6.857 7.046 7.216 7.385 7.541 7.748 7.937 8.103 8.302 8.489 8.675 8.886 9.118 9.348 9.586 9.852 10.125 10.361 10.612 10.903 11.183 11.479 11.747 11.998 12.236 12.46 12.539 12.271 11.699 11.061 10.415 9.812 9.253 8.734 8.235 7.794 7.359 6.984 6.646 6.322 6.005 5.714 5.436 5.139 4.869 4.626 4.369 4.104 3.892 3.671 3.443 3.264 3.069 2.87 2.657 2.415 2.251 2.084 1.84 1.679 1.502 1.402 1.187 0.969 0.754 0.643 0.373 0.264 0.129 -0.013 -0.327 -0.487 -0.666 -0.906 -1.18 -1.454 -1.887 -3.373 -6 ,10634 ,TETRA ,17559427,Sat Nov 27 07:06:22 CET,Sat Nov 27 08:48:32 CET,0.0 1.735 2.268 2.576 2.829 3.056 3.233 3.417 3.764 3.903 4.035 4.15 4.429 4.56 4.788 5.001 5.216 5.323 5.509 5.683 5.931 6.094 6.263 6.506 6.727 6.928 7.11 7.277 7.48 7.663 7.846 8.065 8.267 8.449 8.649 8.879 9.091 9.317 9.553 9.796 10.069 10.346 10.643 10.944 11.241 11.535 11.818 12.046 12.218 12.263 11.978 11.344 10.689 10.058 9.475 8.951 8.46 7.99 7.584 7.166 6.815 6.5 6.187 5.891 5.591 5.317 5.042 4.792 4.589 4.38 4.156 3.959 3.74 3.52 3.353 3.182 3.004 2.812 2.617 2.479 2.332 2.107 1.954 1.795 1.708 1.514 1.301 1.066 0.952 0.686 0.6 0.477 0.333 -0.003 -0.199 -0.428 -0.658 -0.868 -1.137 -1.538 -2.65 -7 ,12670 ,TETRA ,17559428,Sat Nov 27 07:07:21 CET,Sat Nov 27 08:55:49 CET,0.0 1.402 1.891 2.306 2.627 2.907 3.165 3.368 3.717 3.877 4.022 4.154 4.431 4.557 4.781 4.966 5.143 5.227 5.392 5.555 5.773 5.91 6.051 6.253 6.434 6.591 6.743 6.902 7.094 7.281 7.481 7.715 7.927 8.114 8.323 8.548 8.751 8.964 9.177 9.394 9.629 9.907 10.216 10.5 10.77 11.041 11.319 11.525 11.662 11.687 11.429 10.785 10.081 9.46 8.869 8.31 7.833 7.387 6.975 6.554 6.196 5.873 5.558 5.25 4.952 4.671 4.382 4.13 3.917 3.697 3.465 3.273 3.078 2.872 2.703 2.533 2.364 2.185 1.997 1.865 1.722 1.508 1.362 1.196 1.104 0.915 0.723 0.507 0.397 0.127 0.019 -0.107 -0.242 -0.554 -0.72 -0.899 -1.109 -1.359 -1.64 -2.063 -3.479 -8 ,11514 ,TETRA ,17559429,Sat Nov 27 07:07:22 CET,Sat Nov 27 08:55:45 CET,0.0 1.962 2.458 2.84 3.155 3.397 3.609 3.797 4.12 4.271 4.413 4.518 4.778 4.882 5.085 5.273 5.45 5.534 5.685 5.819 5.994 6.115 6.248 6.449 6.637 6.804 6.966 7.119 7.313 7.489 7.646 7.829 8.002 8.173 8.374 8.597 8.803 9.017 9.228 9.441 9.663 9.904 10.178 10.444 10.709 10.966 11.249 11.474 11.614 11.657 11.365 10.67 9.959 9.324 8.734 8.146 7.596 7.094 6.656 6.215 5.833 5.477 5.149 4.842 4.535 4.241 3.937 3.669 3.423 3.166 2.889 2.658 2.435 2.199 2.019 1.842 1.641 1.433 1.239 1.103 0.949 0.687 0.504 0.32 0.225 0.037 -0.152 -0.356 -0.462 -0.737 -0.847 -0.969 -1.097 -1.427 -1.624 -1.82 -2.025 -2.271 -2.577 -2.991 -3.958 -9 ,15858 ,TETRA ,17559430,Sat Nov 27 07:07:24 CET,Sat Nov 27 08:55:27 CET,0.0 1.185 1.609 1.976 2.269 2.517 2.724 2.898 3.216 3.36 3.5 3.608 3.87 3.984 4.222 4.438 4.635 4.732 4.924 5.092 5.314 5.459 5.599 5.789 5.963 6.137 6.308 6.467 6.67 6.859 7.03 7.239 7.446 7.639 7.859 8.109 8.33 8.558 8.796 9.023 9.241 9.488 9.774 10.052 10.343 10.584 10.827 11.062 11.224 11.23 10.908 10.261 9.621 9.013 8.442 7.896 7.377 6.897 6.489 6.088 5.741 5.416 5.096 4.793 4.517 4.25 3.965 3.723 3.508 3.279 3.029 2.825 2.624 2.413 2.245 2.06 1.878 1.681 1.459 1.3 1.136 0.896 0.73 0.563 0.475 0.296 0.12 -0.064 -0.173 -0.441 -0.536 -0.671 -0.804 -1.095 -1.297 -1.503 -1.704 -1.955 -2.247 -2.658 -3.707 -10 ,703 ,TETRA ,17559431,Sat Nov 27 07:09:23 CET,Sat Nov 27 08:58:08 CET,0.0 1.603 2.112 2.408 2.659 2.916 3.123 3.298 3.601 3.74 3.879 3.972 4.236 4.347 4.555 4.753 4.943 5.034 5.206 5.368 5.604 5.762 5.905 6.095 6.281 6.449 6.602 6.755 6.947 7.12 7.289 7.496 7.698 7.882 8.097 8.32 8.531 8.77 9.0 9.238 9.488 9.749 10.028 10.268 10.495 10.736 11.007 11.244 11.412 11.448 11.15 10.498 9.832 9.16 8.538 7.992 7.501 7.052 6.67 6.271 5.913 5.586 5.279 4.974 4.685 4.424 4.145 3.876 3.632 3.382 3.142 2.962 2.769 2.562 2.392 2.22 2.023 1.803 1.585 1.434 1.28 1.027 0.847 0.663 0.558 0.34 0.131 -0.1 -0.217 -0.489 -0.603 -0.743 -0.89 -1.222 -1.415 -1.615 -1.82 -2.114 -2.472 -2.904 -4.095 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_33.txt deleted file mode 100644 index 420fb192..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26353 ,TETRA ,17559432,Sat Nov 27 07:09:23 CET,Sat Nov 27 08:53:36 CET,0.0 1.35 1.872 2.249 2.553 2.789 2.979 3.175 3.578 3.752 3.901 4.059 4.335 4.453 4.688 4.918 5.133 5.241 5.467 5.672 5.945 6.126 6.31 6.557 6.788 7.029 7.257 7.469 7.725 7.97 8.193 8.425 8.639 8.836 9.063 9.324 9.561 9.811 10.085 10.353 10.613 10.9 11.227 11.545 11.888 12.245 12.658 13.088 13.438 13.69 13.694 13.355 12.873 12.371 11.917 11.448 10.992 10.57 10.211 9.85 9.508 9.205 8.916 8.629 8.352 8.101 7.85 7.625 7.419 7.197 6.971 6.786 6.601 6.404 6.233 6.063 5.895 5.717 5.537 5.402 5.259 5.048 4.893 4.733 4.649 4.451 4.229 3.995 3.874 3.606 3.486 3.347 3.199 2.88 2.704 2.504 2.284 2.054 1.775 1.346 0.195 -2 ,7137 ,TETRA ,17559433,Sat Nov 27 07:10:22 CET,Sat Nov 27 08:58:36 CET,0.0 1.324 1.826 2.188 2.473 2.751 2.986 3.167 3.472 3.61 3.764 3.934 4.226 4.357 4.59 4.82 5.034 5.124 5.299 5.474 5.728 5.886 6.026 6.232 6.433 6.628 6.807 6.972 7.169 7.349 7.532 7.758 7.97 8.163 8.395 8.651 8.868 9.11 9.38 9.665 9.97 10.291 10.621 10.95 11.301 11.643 12.0 12.336 12.659 12.9 12.934 12.616 12.146 11.657 11.178 10.697 10.261 9.868 9.506 9.136 8.812 8.511 8.215 7.934 7.679 7.435 7.168 6.932 6.736 6.528 6.301 6.111 5.911 5.699 5.534 5.367 5.182 4.974 4.77 4.632 4.484 4.257 4.099 3.936 3.854 3.679 3.483 3.284 3.192 2.94 2.85 2.73 2.596 2.282 2.114 1.927 1.695 1.449 1.143 0.701 -0.325 -3 ,21187 ,TETRA ,17559434,Sat Nov 27 07:11:23 CET,Sat Nov 27 09:05:39 CET,0.0 1.708 2.203 2.53 2.785 3.013 3.223 3.418 3.737 3.888 4.054 4.19 4.453 4.558 4.75 4.924 5.101 5.193 5.39 5.598 5.858 5.997 6.123 6.323 6.518 6.708 6.88 7.036 7.246 7.443 7.626 7.844 8.043 8.227 8.439 8.666 8.89 9.143 9.432 9.724 9.997 10.299 10.63 10.959 11.336 11.727 12.109 12.472 12.808 13.076 13.083 12.741 12.315 11.835 11.36 10.867 10.421 10.017 9.653 9.251 8.872 8.542 8.217 7.908 7.63 7.364 7.08 6.83 6.622 6.403 6.172 5.981 5.783 5.576 5.408 5.229 5.042 4.847 4.642 4.495 4.337 4.085 3.907 3.73 3.637 3.434 3.228 3.004 2.881 2.607 2.482 2.346 2.189 1.833 1.637 1.443 1.219 0.902 0.549 0.158 -1.043 -4 ,18280 ,TETRA ,17559435,Sat Nov 27 07:12:21 CET,Sat Nov 27 09:02:59 CET,0.0 0.986 1.411 1.766 2.07 2.309 2.501 2.677 3.009 3.161 3.311 3.444 3.729 3.865 4.137 4.375 4.585 4.692 4.89 5.067 5.312 5.472 5.625 5.845 6.052 6.25 6.445 6.63 6.862 7.06 7.233 7.473 7.709 7.91 8.149 8.423 8.667 8.93 9.209 9.497 9.781 10.087 10.431 10.761 11.154 11.555 11.961 12.375 12.728 12.961 12.995 12.606 12.109 11.609 11.134 10.669 10.248 9.855 9.483 9.117 8.789 8.461 8.151 7.874 7.613 7.367 7.106 6.872 6.668 6.461 6.251 6.066 5.867 5.664 5.507 5.348 5.178 4.998 4.817 4.685 4.535 4.308 4.15 3.979 3.894 3.721 3.533 3.295 3.153 2.872 2.741 2.597 2.442 2.103 1.914 1.684 1.407 1.139 0.883 0.531 -0.545 -5 ,10002 ,TETRA ,17559436,Sat Nov 27 07:13:22 CET,Sat Nov 27 08:46:10 CET,0.0 1.379 1.904 2.284 2.547 2.779 2.992 3.185 3.541 3.707 3.852 4.002 4.288 4.424 4.661 4.872 5.073 5.168 5.362 5.555 5.815 5.964 6.09 6.27 6.457 6.644 6.822 6.982 7.181 7.371 7.56 7.795 8.019 8.223 8.448 8.705 8.946 9.22 9.522 9.807 10.078 10.366 10.698 11.005 11.328 11.695 12.085 12.431 12.764 13.025 13.042 12.668 12.209 11.707 11.223 10.749 10.289 9.885 9.543 9.196 8.878 8.578 8.27 7.986 7.72 7.443 7.142 6.888 6.668 6.429 6.186 5.986 5.774 5.55 5.368 5.173 4.974 4.769 4.546 4.384 4.22 3.971 3.793 3.606 3.507 3.306 3.101 2.861 2.74 2.479 2.353 2.208 2.062 1.751 1.57 1.343 1.094 0.855 0.565 0.123 -0.973 -6 ,9817 ,TETRA ,17559437,Sat Nov 27 07:15:21 CET,Sat Nov 27 09:03:55 CET,0.0 1.46 1.883 2.188 2.448 2.661 2.856 3.047 3.381 3.541 3.71 3.872 4.14 4.251 4.472 4.673 4.861 4.959 5.15 5.307 5.521 5.665 5.801 6.002 6.212 6.435 6.656 6.864 7.126 7.364 7.588 7.86 8.125 8.362 8.595 8.85 9.119 9.428 9.738 10.044 10.333 10.64 10.989 11.341 11.722 12.069 12.429 12.779 13.096 13.339 13.324 12.943 12.428 11.896 11.379 10.894 10.472 10.068 9.684 9.298 8.963 8.662 8.38 8.101 7.837 7.604 7.351 7.113 6.918 6.716 6.477 6.26 6.038 5.816 5.648 5.484 5.311 5.122 4.937 4.812 4.675 4.461 4.311 4.154 4.074 3.896 3.7 3.48 3.353 3.074 2.917 2.779 2.652 2.369 2.207 2.02 1.811 1.554 1.225 0.725 -0.23 -7 ,31518 ,TETRA ,17559438,Sat Nov 27 07:17:22 CET,Sat Nov 27 09:05:52 CET,0.0 1.734 2.27 2.684 2.991 3.247 3.489 3.731 4.135 4.324 4.517 4.724 5.029 5.176 5.438 5.676 5.896 5.989 6.165 6.335 6.562 6.713 6.859 7.072 7.266 7.444 7.615 7.78 7.995 8.195 8.38 8.594 8.801 8.992 9.202 9.443 9.672 9.926 10.173 10.427 10.708 11.007 11.349 11.672 11.996 12.346 12.722 13.068 13.425 13.718 13.764 13.41 12.958 12.478 11.991 11.518 11.102 10.698 10.335 9.965 9.627 9.314 9.001 8.706 8.447 8.217 7.969 7.732 7.518 7.313 7.097 6.906 6.706 6.498 6.341 6.168 5.98 5.796 5.611 5.476 5.328 5.099 4.945 4.779 4.689 4.495 4.279 4.052 3.931 3.665 3.545 3.403 3.255 2.903 2.71 2.504 2.266 1.991 1.652 1.037 -0.57 -8 ,2321 ,TETRA ,17559439,Sat Nov 27 07:17:24 CET,Sat Nov 27 09:06:12 CET,0.0 1.341 1.83 2.192 2.485 2.723 2.93 3.111 3.447 3.605 3.75 3.857 4.117 4.232 4.449 4.649 4.833 4.924 5.1 5.263 5.504 5.651 5.792 6.007 6.208 6.405 6.6 6.774 6.993 7.202 7.39 7.606 7.807 8.002 8.232 8.477 8.707 8.963 9.228 9.504 9.789 10.106 10.473 10.812 11.173 11.532 11.909 12.326 12.717 12.978 12.966 12.564 12.056 11.551 11.067 10.589 10.143 9.76 9.413 9.026 8.692 8.39 8.099 7.824 7.559 7.301 7.038 6.815 6.619 6.417 6.207 6.021 5.822 5.623 5.462 5.289 5.121 4.954 4.773 4.633 4.483 4.252 4.091 3.919 3.824 3.619 3.412 3.189 3.065 2.797 2.657 2.503 2.348 2.014 1.807 1.583 1.356 1.092 0.745 0.238 -1.203 -9 ,29173 ,TETRA ,17559440,Sat Nov 27 07:18:21 CET,Sat Nov 27 09:04:43 CET,0.0 1.492 2.066 2.409 2.699 2.972 3.197 3.384 3.703 3.852 4.002 4.141 4.42 4.56 4.82 5.025 5.208 5.301 5.483 5.654 5.899 6.058 6.218 6.457 6.694 6.926 7.128 7.306 7.538 7.767 7.968 8.183 8.401 8.629 8.911 9.199 9.419 9.636 9.875 10.141 10.419 10.714 11.039 11.348 11.679 12.028 12.412 12.794 13.154 13.428 13.422 13.053 12.571 12.059 11.569 11.097 10.661 10.26 9.889 9.493 9.157 8.858 8.559 8.267 7.991 7.74 7.479 7.247 7.056 6.851 6.625 6.436 6.241 6.041 5.881 5.715 5.534 5.339 5.156 5.027 4.885 4.661 4.509 4.35 4.268 4.108 3.936 3.754 3.659 3.403 3.303 3.18 3.045 2.746 2.582 2.401 2.206 1.964 1.639 1.135 -0.303 -10 ,8756 ,TETRA ,17559441,Sat Nov 27 07:20:21 CET,Sat Nov 27 09:08:50 CET,0.0 1.022 1.432 1.747 2.019 2.253 2.456 2.633 2.958 3.11 3.26 3.379 3.647 3.749 3.944 4.157 4.357 4.456 4.633 4.812 5.086 5.239 5.38 5.603 5.812 5.986 6.166 6.346 6.571 6.781 6.989 7.231 7.451 7.671 7.931 8.219 8.483 8.753 9.041 9.343 9.63 9.954 10.36 10.747 11.144 11.533 11.909 12.264 12.594 12.808 12.843 12.571 12.133 11.659 11.167 10.714 10.335 9.95 9.586 9.198 8.857 8.556 8.241 7.936 7.661 7.407 7.142 6.912 6.709 6.494 6.266 6.085 5.902 5.697 5.536 5.369 5.189 4.998 4.798 4.66 4.517 4.292 4.136 3.975 3.885 3.677 3.471 3.263 3.149 2.897 2.81 2.677 2.536 2.227 2.053 1.853 1.616 1.325 0.932 0.382 -1.113 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_34.txt deleted file mode 100644 index c8a318c3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3642 ,TETRA ,17559442,Sat Nov 27 07:21:23 CET,Sat Nov 27 09:10:46 CET,0.0 2.135 2.617 3.008 3.316 3.611 3.893 4.106 4.468 4.651 4.83 5.007 5.304 5.44 5.695 5.939 6.162 6.272 6.491 6.696 6.988 7.163 7.325 7.567 7.791 8.002 8.205 8.4 8.637 8.866 9.111 9.401 9.666 9.929 10.22 10.533 10.831 11.158 11.497 11.832 12.179 12.572 13.007 13.437 13.929 14.425 14.931 15.427 15.898 16.316 16.612 16.537 16.152 15.715 15.301 14.829 14.382 13.981 13.613 13.223 12.889 12.593 12.3 12.018 11.747 11.488 11.222 10.981 10.774 10.567 10.351 10.166 9.968 9.751 9.566 9.374 9.171 8.968 8.773 8.637 8.488 8.238 8.072 7.907 7.815 7.627 7.442 7.226 7.108 6.848 6.74 6.61 6.473 6.178 6.013 5.835 5.622 5.381 5.051 4.584 3.354 -2 ,30027 ,TETRA ,17559443,Sat Nov 27 07:21:23 CET,Sat Nov 27 09:09:26 CET,0.0 1.953 2.59 3.029 3.381 3.663 3.917 4.145 4.577 4.774 4.961 5.152 5.442 5.59 5.857 6.111 6.362 6.471 6.672 6.859 7.147 7.339 7.529 7.806 8.064 8.302 8.523 8.72 8.973 9.223 9.454 9.727 9.987 10.235 10.513 10.813 11.094 11.417 11.778 12.171 12.572 12.989 13.45 13.915 14.447 14.997 15.568 16.126 16.667 17.143 17.462 17.37 17.049 16.652 16.24 15.821 15.42 15.044 14.725 14.39 14.079 13.786 13.517 13.244 12.94 12.668 12.415 12.203 11.985 11.763 11.571 11.403 11.216 11.012 10.85 10.687 10.528 10.372 10.2 10.053 9.88 9.627 9.467 9.303 9.221 9.054 8.878 8.702 8.599 8.346 8.274 8.159 8.042 7.762 7.6 7.413 7.191 6.939 6.638 6.285 5.328 -3 ,5218 ,TETRA ,17559444,Sat Nov 27 07:21:23 CET,Sat Nov 27 09:09:46 CET,0.0 1.9 2.514 2.939 3.279 3.588 3.844 4.061 4.461 4.644 4.82 5.028 5.332 5.472 5.756 6.022 6.253 6.362 6.568 6.773 7.072 7.256 7.442 7.714 7.978 8.231 8.471 8.713 9.023 9.289 9.514 9.792 10.067 10.315 10.604 10.917 11.206 11.512 11.816 12.137 12.483 12.877 13.34 13.796 14.276 14.779 15.308 15.843 16.422 16.879 17.141 17.055 16.73 16.32 15.879 15.452 15.061 14.68 14.355 14.023 13.712 13.437 13.171 12.911 12.675 12.467 12.247 12.04 11.856 11.657 11.44 11.253 11.054 10.842 10.681 10.531 10.376 10.181 9.965 9.824 9.677 9.444 9.266 9.071 8.972 8.765 8.542 8.306 8.187 7.925 7.803 7.66 7.509 7.166 6.97 6.755 6.54 6.301 6.009 5.652 3.717 -4 ,26693 ,TETRA ,17559445,Sat Nov 27 07:21:23 CET,Sat Nov 27 09:09:02 CET,0.0 1.722 2.43 2.81 3.075 3.33 3.584 3.816 4.229 4.414 4.585 4.779 5.084 5.219 5.466 5.713 5.959 6.074 6.287 6.495 6.804 6.991 7.15 7.37 7.594 7.829 8.044 8.236 8.495 8.753 8.998 9.273 9.534 9.791 10.085 10.435 10.774 11.13 11.481 11.84 12.234 12.667 13.156 13.632 14.167 14.726 15.299 15.9 16.528 17.085 17.371 17.163 16.785 16.327 15.83 15.373 14.969 14.583 14.226 13.849 13.517 13.219 12.931 12.648 12.371 12.121 11.864 11.649 11.457 11.233 11.002 10.819 10.624 10.415 10.247 10.06 9.872 9.68 9.473 9.313 9.142 8.914 8.752 8.57 8.473 8.287 8.087 7.873 7.768 7.512 7.397 7.262 7.115 6.801 6.644 6.456 6.26 6.06 5.823 5.511 4.469 -5 ,4692 ,TETRA ,17559446,Sat Nov 27 07:21:23 CET,Sat Nov 27 09:11:30 CET,0.0 1.842 2.417 2.828 3.166 3.455 3.707 3.944 4.373 4.578 4.763 4.954 5.249 5.405 5.713 5.998 6.269 6.404 6.664 6.889 7.205 7.407 7.603 7.881 8.137 8.4 8.644 8.861 9.145 9.42 9.684 9.991 10.274 10.549 10.873 11.223 11.564 11.938 12.317 12.706 13.116 13.554 14.027 14.491 15.015 15.605 16.195 16.732 17.294 17.831 18.13 17.93 17.55 17.103 16.647 16.22 15.815 15.432 15.092 14.704 14.359 14.047 13.738 13.43 13.124 12.867 12.608 12.354 12.13 11.898 11.654 11.454 11.247 11.036 10.871 10.696 10.511 10.322 10.121 9.972 9.814 9.579 9.425 9.249 9.157 8.981 8.801 8.595 8.483 8.231 8.133 7.997 7.846 7.541 7.382 7.196 6.973 6.737 6.469 6.111 5.006 -6 ,31548 ,TETRA ,17559447,Sat Nov 27 07:21:23 CET,Sat Nov 27 09:09:09 CET,0.0 1.936 2.501 2.953 3.332 3.646 3.933 4.197 4.608 4.779 4.953 5.108 5.395 5.537 5.809 6.057 6.281 6.389 6.588 6.773 7.056 7.233 7.394 7.638 7.869 8.085 8.296 8.489 8.739 8.977 9.196 9.47 9.727 9.959 10.227 10.534 10.839 11.154 11.478 11.823 12.168 12.543 12.97 13.389 13.872 14.414 14.967 15.528 16.095 16.556 16.825 16.699 16.373 15.972 15.565 15.155 14.734 14.364 14.057 13.711 13.397 13.115 12.839 12.556 12.303 12.093 11.851 11.625 11.436 11.236 11.017 10.827 10.628 10.417 10.246 10.077 9.905 9.704 9.478 9.329 9.185 8.974 8.817 8.632 8.54 8.356 8.17 7.961 7.841 7.586 7.511 7.382 7.247 6.99 6.859 6.681 6.474 6.259 5.991 5.555 4.546 -7 ,13839 ,TETRA ,17559448,Sat Nov 27 07:22:24 CET,Sat Nov 27 09:10:21 CET,0.0 2.273 2.889 3.376 3.771 4.069 4.335 4.574 5.002 5.188 5.363 5.532 5.815 5.942 6.219 6.476 6.686 6.788 6.982 7.169 7.444 7.624 7.805 8.04 8.256 8.485 8.701 8.894 9.143 9.393 9.636 9.927 10.2 10.443 10.711 11.015 11.309 11.61 11.929 12.299 12.689 13.125 13.587 14.03 14.546 15.073 15.656 16.253 16.866 17.424 17.72 17.576 17.227 16.847 16.457 16.045 15.652 15.286 14.973 14.645 14.331 14.045 13.765 13.482 13.228 13.016 12.794 12.59 12.415 12.212 11.987 11.804 11.597 11.376 11.214 11.031 10.819 10.619 10.438 10.296 10.14 9.928 9.769 9.585 9.493 9.307 9.114 8.903 8.787 8.527 8.438 8.304 8.158 7.872 7.72 7.538 7.319 7.068 6.806 6.47 5.016 -8 ,32456 ,TETRA ,17559449,Sat Nov 27 07:24:22 CET,Sat Nov 27 09:12:11 CET,0.0 1.48 2.005 2.412 2.738 3.018 3.249 3.472 3.898 4.077 4.24 4.408 4.697 4.83 5.076 5.308 5.54 5.649 5.844 6.027 6.295 6.477 6.65 6.876 7.095 7.322 7.548 7.765 8.021 8.257 8.483 8.763 9.042 9.334 9.667 10.005 10.326 10.694 11.105 11.504 11.877 12.275 12.746 13.199 13.69 14.201 14.754 15.321 15.846 16.311 16.564 16.333 15.837 15.271 14.686 14.123 13.633 13.196 12.804 12.402 12.055 11.719 11.367 11.021 10.707 10.431 10.129 9.85 9.6 9.337 9.069 8.848 8.611 8.363 8.177 7.979 7.772 7.568 7.359 7.213 7.059 6.806 6.626 6.434 6.336 6.14 5.917 5.692 5.584 5.321 5.203 5.058 4.893 4.561 4.389 4.193 3.977 3.74 3.448 3.065 1.784 -9 ,27453 ,TETRA ,17559450,Sat Nov 27 07:24:22 CET,Sat Nov 27 09:12:07 CET,0.0 2.26 3.1 3.624 3.997 4.282 4.576 4.85 5.271 5.465 5.648 5.851 6.152 6.296 6.566 6.814 7.054 7.174 7.411 7.619 7.912 8.1 8.285 8.556 8.827 9.074 9.294 9.509 9.776 10.023 10.265 10.574 10.901 11.188 11.484 11.826 12.126 12.436 12.789 13.175 13.551 13.927 14.354 14.769 15.24 15.732 16.225 16.748 17.336 17.841 18.031 17.858 17.569 17.226 16.799 16.324 15.888 15.487 15.134 14.753 14.411 14.103 13.801 13.509 13.244 13.005 12.747 12.509 12.295 12.066 11.836 11.632 11.417 11.21 11.048 10.882 10.697 10.489 10.278 10.14 9.994 9.761 9.604 9.433 9.338 9.127 8.911 8.708 8.6 8.344 8.258 8.139 8.009 7.709 7.539 7.366 7.184 6.967 6.718 6.376 5.435 -10 ,317 ,TETRA ,17559451,Sat Nov 27 07:24:24 CET,Sat Nov 27 09:11:53 CET,0.0 1.822 2.477 2.908 3.27 3.57 3.828 4.062 4.456 4.633 4.805 4.999 5.295 5.427 5.704 5.964 6.207 6.327 6.543 6.743 7.042 7.242 7.426 7.676 7.921 8.165 8.39 8.595 8.858 9.105 9.347 9.652 9.933 10.193 10.471 10.76 11.063 11.404 11.762 12.12 12.484 12.901 13.343 13.765 14.269 14.782 15.304 15.842 16.399 16.866 17.085 16.884 16.422 15.926 15.431 14.945 14.509 14.094 13.718 13.348 13.01 12.718 12.458 12.192 11.936 11.707 11.466 11.25 11.053 10.84 10.617 10.431 10.25 10.081 9.941 9.774 9.594 9.403 9.208 9.079 8.93 8.679 8.508 8.342 8.26 8.087 7.914 7.743 7.652 7.403 7.316 7.203 7.086 6.832 6.659 6.456 6.231 5.986 5.743 5.429 4.134 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_37.txt deleted file mode 100644 index 5bf3eb23..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15227 ,TETRA ,17559452,Sat Nov 27 07:24:22 CET,Sat Nov 27 09:13:00 CET,0.0 2.803 3.532 4.05 4.433 4.717 4.993 5.262 5.739 5.954 6.147 6.369 6.687 6.853 7.162 7.453 7.711 7.826 8.043 8.252 8.553 8.742 8.93 9.203 9.445 9.672 9.902 10.115 10.399 10.662 10.903 11.196 11.456 11.702 11.995 12.298 12.567 12.853 13.153 13.448 13.745 14.066 14.402 14.724 15.07 15.382 15.621 15.787 15.874 15.743 15.175 14.186 13.209 12.271 11.43 10.684 10.037 9.452 8.944 8.425 7.954 7.533 7.159 6.814 6.487 6.195 5.886 5.605 5.361 5.102 4.806 4.553 4.286 3.994 3.773 3.554 3.332 3.1 2.879 2.73 2.566 2.315 2.143 1.961 1.872 1.684 1.465 1.243 1.138 0.878 0.804 0.672 0.526 0.241 0.095 -0.071 -0.263 -0.5 -0.794 -1.204 -2.034 -2 ,604 ,TETRA ,17559453,Sat Nov 27 07:25:22 CET,Sat Nov 27 09:14:32 CET,0.0 2.271 2.849 3.33 3.747 4.041 4.306 4.569 5.026 5.223 5.408 5.607 5.905 6.041 6.306 6.567 6.812 6.926 7.156 7.357 7.647 7.849 8.044 8.323 8.573 8.821 9.062 9.271 9.538 9.799 10.037 10.297 10.574 10.845 11.118 11.427 11.715 12.017 12.33 12.636 12.935 13.241 13.573 13.871 14.184 14.478 14.746 14.992 15.138 15.024 14.436 13.401 12.391 11.487 10.686 9.979 9.364 8.795 8.258 7.689 7.214 6.793 6.395 6.036 5.714 5.406 5.075 4.774 4.507 4.237 3.967 3.748 3.524 3.296 3.122 2.933 2.732 2.516 2.271 2.1 1.939 1.713 1.56 1.394 1.309 1.137 0.949 0.725 0.606 0.336 0.252 0.11 -0.036 -0.334 -0.502 -0.67 -0.856 -1.04 -1.273 -1.678 -3.043 -3 ,3243 ,TETRA ,17559454,Sat Nov 27 07:25:21 CET,Sat Nov 27 09:08:30 CET,0.0 2.342 2.943 3.387 3.741 4.05 4.364 4.654 5.11 5.314 5.519 5.73 6.036 6.189 6.45 6.679 6.912 7.031 7.256 7.472 7.785 7.977 8.163 8.42 8.655 8.894 9.121 9.322 9.571 9.815 10.047 10.322 10.582 10.821 11.094 11.393 11.677 11.961 12.233 12.531 12.842 13.167 13.51 13.81 14.124 14.435 14.731 14.964 15.065 14.927 14.32 13.23 12.212 11.314 10.554 9.849 9.218 8.618 8.076 7.544 7.092 6.698 6.326 5.955 5.6 5.285 4.966 4.672 4.407 4.133 3.852 3.613 3.356 3.092 2.893 2.696 2.497 2.29 2.062 1.898 1.732 1.483 1.306 1.126 1.032 0.836 0.634 0.404 0.276 0.001 -0.101 -0.239 -0.389 -0.728 -0.906 -1.084 -1.275 -1.5 -1.767 -2.117 -2.93 -4 ,17610 ,TETRA ,17559455,Sat Nov 27 07:25:21 CET,Sat Nov 27 09:14:33 CET,0.0 1.786 2.346 2.73 3.09 3.413 3.679 3.901 4.322 4.526 4.703 4.872 5.167 5.318 5.619 5.91 6.15 6.253 6.46 6.663 6.985 7.215 7.431 7.724 7.998 8.244 8.475 8.704 8.974 9.209 9.437 9.714 9.983 10.223 10.469 10.745 11.015 11.291 11.572 11.855 12.153 12.481 12.827 13.129 13.439 13.768 14.099 14.32 14.402 14.324 13.805 12.765 11.728 10.836 10.063 9.317 8.622 8.018 7.534 7.042 6.597 6.196 5.811 5.451 5.113 4.801 4.476 4.184 3.925 3.654 3.378 3.147 2.906 2.66 2.467 2.259 2.048 1.84 1.622 1.455 1.261 0.959 0.763 0.567 0.468 0.272 0.073 -0.135 -0.258 -0.548 -0.674 -0.818 -0.97 -1.301 -1.488 -1.675 -1.862 -2.088 -2.358 -2.675 -3.577 -5 ,28615 ,TETRA ,17559456,Sat Nov 27 07:26:22 CET,Sat Nov 27 09:07:47 CET,0.0 2.516 3.145 3.626 3.994 4.303 4.595 4.867 5.314 5.492 5.655 5.821 6.106 6.239 6.512 6.768 7.005 7.126 7.361 7.584 7.884 8.06 8.228 8.471 8.709 8.928 9.132 9.336 9.601 9.841 10.05 10.29 10.509 10.725 10.986 11.252 11.505 11.77 12.032 12.314 12.597 12.87 13.167 13.431 13.714 13.969 14.16 14.32 14.339 14.146 13.517 12.477 11.458 10.546 9.743 9.019 8.372 7.767 7.255 6.736 6.259 5.837 5.453 5.076 4.735 4.42 4.08 3.779 3.52 3.259 2.989 2.752 2.502 2.25 2.053 1.838 1.624 1.413 1.183 1.023 0.85 0.592 0.428 0.246 0.145 -0.06 -0.277 -0.499 -0.614 -0.902 -1.042 -1.201 -1.376 -1.746 -1.934 -2.121 -2.323 -2.55 -2.851 -3.302 -4.324 -6 ,6867 ,TETRA ,17559457,Sat Nov 27 07:27:21 CET,Sat Nov 27 09:15:36 CET,0.0 2.592 3.168 3.616 4.015 4.323 4.609 4.871 5.294 5.473 5.648 5.805 6.089 6.245 6.532 6.781 7.034 7.154 7.373 7.594 7.893 8.059 8.204 8.411 8.618 8.821 9.011 9.19 9.432 9.645 9.831 10.073 10.302 10.514 10.76 11.021 11.253 11.496 11.76 12.019 12.272 12.526 12.825 13.152 13.478 13.755 14.026 14.247 14.297 14.102 13.496 12.512 11.562 10.724 9.988 9.303 8.674 8.094 7.581 7.046 6.574 6.162 5.763 5.377 5.048 4.77 4.464 4.174 3.916 3.648 3.371 3.144 2.909 2.664 2.469 2.268 2.061 1.846 1.614 1.454 1.294 1.042 0.857 0.65 0.544 0.327 0.091 -0.154 -0.279 -0.564 -0.706 -0.86 -1.017 -1.363 -1.557 -1.768 -1.989 -2.241 -2.63 -3.156 -4.107 -7 ,11699 ,TETRA ,17559458,Sat Nov 27 07:26:22 CET,Sat Nov 27 09:15:10 CET,0.0 2.162 2.802 3.241 3.601 3.924 4.213 4.471 4.899 5.09 5.269 5.42 5.699 5.835 6.1 6.349 6.594 6.717 6.938 7.134 7.416 7.576 7.743 7.993 8.209 8.417 8.616 8.806 9.052 9.291 9.499 9.736 9.964 10.19 10.433 10.665 10.911 11.195 11.453 11.696 11.936 12.203 12.504 12.764 13.027 13.252 13.417 13.538 13.554 13.4 12.786 11.783 10.84 9.984 9.237 8.541 7.926 7.364 6.878 6.397 5.964 5.588 5.229 4.865 4.525 4.229 3.92 3.649 3.419 3.188 2.952 2.744 2.522 2.283 2.094 1.893 1.69 1.487 1.279 1.13 0.973 0.744 0.59 0.425 0.337 0.163 -0.034 -0.27 -0.395 -0.669 -0.751 -0.864 -1.008 -1.347 -1.543 -1.76 -1.977 -2.233 -2.496 -2.799 -3.769 -8 ,10232 ,TETRA ,17559459,Sat Nov 27 07:26:22 CET,Sat Nov 27 09:15:04 CET,0.0 1.567 2.154 2.554 2.87 3.126 3.364 3.589 3.956 4.131 4.296 4.437 4.729 4.871 5.128 5.366 5.592 5.701 5.928 6.152 6.457 6.647 6.816 7.052 7.285 7.516 7.744 7.96 8.219 8.449 8.665 8.921 9.162 9.401 9.666 9.915 10.171 10.499 10.821 11.104 11.386 11.705 12.098 12.451 12.8 13.096 13.308 13.524 13.625 13.464 12.789 11.634 10.591 9.691 8.889 8.146 7.489 6.915 6.402 5.879 5.458 5.084 4.711 4.342 3.991 3.68 3.356 3.048 2.779 2.522 2.255 2.025 1.781 1.518 1.311 1.098 0.873 0.645 0.414 0.249 0.077 -0.19 -0.377 -0.585 -0.696 -0.92 -1.142 -1.379 -1.513 -1.802 -1.917 -2.066 -2.227 -2.563 -2.733 -2.928 -3.16 -3.411 -3.715 -4.124 -5.487 -9 ,24757 ,TETRA ,17559460,Sat Nov 27 07:26:22 CET,Sat Nov 27 09:16:47 CET,0.0 1.588 2.264 2.854 3.306 3.673 3.976 4.255 4.746 4.951 5.15 5.342 5.638 5.798 6.095 6.383 6.664 6.803 7.073 7.309 7.618 7.808 7.994 8.268 8.531 8.772 8.99 9.187 9.437 9.692 9.931 10.194 10.462 10.731 11.017 11.31 11.579 11.854 12.149 12.475 12.803 13.13 13.464 13.766 14.045 14.313 14.57 14.739 14.797 14.643 14.019 12.961 11.984 11.073 10.251 9.514 8.866 8.263 7.734 7.206 6.73 6.318 5.94 5.555 5.192 4.891 4.589 4.304 4.053 3.795 3.538 3.335 3.126 2.893 2.71 2.529 2.335 2.14 1.917 1.739 1.556 1.271 1.096 0.905 0.799 0.609 0.412 0.185 0.059 -0.221 -0.31 -0.431 -0.563 -0.874 -1.059 -1.262 -1.467 -1.68 -1.971 -2.354 -3.43 -10 ,1571 ,TETRA ,17559461,Sat Nov 27 07:26:22 CET,Sat Nov 27 09:15:45 CET,0.0 2.068 2.766 3.222 3.578 3.875 4.137 4.378 4.782 4.961 5.15 5.363 5.668 5.815 6.085 6.342 6.59 6.707 6.917 7.127 7.446 7.65 7.831 8.08 8.324 8.544 8.744 8.935 9.182 9.411 9.637 9.907 10.153 10.381 10.638 10.935 11.201 11.446 11.705 11.974 12.231 12.523 12.851 13.151 13.422 13.642 13.849 14.008 14.087 13.929 13.332 12.358 11.401 10.524 9.722 8.982 8.332 7.739 7.216 6.702 6.258 5.843 5.447 5.091 4.755 4.442 4.117 3.809 3.54 3.273 2.988 2.746 2.493 2.243 2.046 1.839 1.631 1.402 1.162 1.003 0.842 0.589 0.418 0.226 0.12 -0.09 -0.308 -0.545 -0.684 -0.988 -1.113 -1.251 -1.396 -1.71 -1.898 -2.097 -2.302 -2.535 -2.79 -3.147 -4.193 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_38.txt deleted file mode 100644 index a95547f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_38.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27242 ,KEBNE ,17024887,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:52:53 CET,0.0 8.633 9.417 9.977 10.445 10.903 11.299 11.569 12.048 12.285 12.532 12.825 13.141 13.313 13.639 13.939 14.214 14.347 14.65 14.93 15.309 15.563 15.792 16.117 16.445 16.758 17.05 17.342 17.705 18.022 18.316 18.662 18.975 19.263 19.587 19.94 20.273 20.657 21.069 21.472 21.881 22.338 22.835 23.306 23.814 24.374 25.01 25.632 26.236 26.685 26.732 26.284 25.701 25.106 24.521 23.959 23.445 22.954 22.545 22.131 21.741 21.379 21.013 20.674 20.384 20.104 19.792 19.487 19.22 18.979 18.726 18.508 18.277 18.022 17.814 17.613 17.416 17.215 16.988 16.814 16.637 16.35 16.137 15.923 15.821 15.613 15.385 15.128 14.999 14.714 14.585 14.435 14.272 13.912 13.721 13.522 13.304 13.047 12.741 12.308 11.116 -2 ,24886 ,KEBNE ,17024888,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:53:35 CET,0.0 7.395 8.324 8.938 9.397 9.803 10.16 10.463 10.956 11.19 11.418 11.672 12.006 12.196 12.548 12.878 13.183 13.316 13.589 13.866 14.248 14.474 14.694 15.032 15.34 15.617 15.886 16.144 16.459 16.753 17.045 17.38 17.688 17.995 18.341 18.712 19.047 19.394 19.779 20.204 20.622 21.064 21.525 21.969 22.473 22.985 23.589 24.185 24.717 25.152 25.288 24.965 24.396 23.799 23.24 22.68 22.176 21.703 21.27 20.822 20.437 20.082 19.715 19.359 19.023 18.724 18.42 18.14 17.886 17.593 17.294 17.074 16.845 16.612 16.424 16.219 16.014 15.803 15.577 15.411 15.245 14.983 14.775 14.547 14.435 14.198 13.931 13.641 13.49 13.186 12.99 12.812 12.637 12.26 12.051 11.816 11.538 11.206 10.841 10.376 8.592 -3 ,2915 ,KEBNE ,17024889,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:53:35 CET,0.0 4.618 5.478 6.006 6.487 6.896 7.221 7.515 8.087 8.35 8.575 8.826 9.16 9.349 9.721 10.074 10.384 10.543 10.847 11.123 11.494 11.712 11.923 12.225 12.502 12.762 13.034 13.301 13.617 13.924 14.214 14.56 14.885 15.189 15.533 15.895 16.225 16.582 16.952 17.325 17.69 18.094 18.556 18.999 19.513 20.046 20.558 21.039 21.48 21.833 21.927 21.485 20.847 20.207 19.606 19.054 18.53 18.001 17.544 17.1 16.715 16.331 15.957 15.611 15.273 14.948 14.593 14.258 13.972 13.683 13.355 13.077 12.789 12.495 12.273 12.039 11.796 11.542 11.273 11.091 10.912 10.624 10.433 10.246 10.144 9.918 9.662 9.386 9.255 8.967 8.794 8.603 8.41 8.072 7.901 7.704 7.453 7.129 6.783 6.311 4.344 -4 ,23304 ,KEBNE ,17024890,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:54:28 CET,0.0 4.375 5.283 5.92 6.443 6.882 7.251 7.537 8.06 8.305 8.517 8.803 9.169 9.361 9.723 10.063 10.375 10.528 10.823 11.087 11.454 11.696 11.918 12.224 12.521 12.805 13.065 13.311 13.638 13.951 14.257 14.632 14.966 15.25 15.564 15.913 16.263 16.663 17.069 17.443 17.837 18.28 18.758 19.208 19.67 20.163 20.706 21.271 21.802 22.223 22.364 21.965 21.358 20.764 20.211 19.653 19.135 18.654 18.231 17.803 17.402 17.017 16.654 16.309 15.974 15.669 15.373 15.105 14.864 14.613 14.315 14.036 13.755 13.476 13.258 13.039 12.814 12.567 12.304 12.125 11.945 11.655 11.429 11.189 11.076 10.847 10.613 10.38 10.26 9.978 9.847 9.715 9.57 9.214 9.005 8.773 8.481 8.15 7.787 7.302 5.785 -5 ,21305 ,KEBNE ,17024891,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:55:30 CET,0.0 5.415 6.34 6.954 7.395 7.786 8.154 8.484 9.082 9.331 9.558 9.827 10.172 10.365 10.729 11.083 11.423 11.575 11.866 12.134 12.488 12.704 12.897 13.202 13.491 13.754 14.022 14.279 14.579 14.866 15.147 15.488 15.793 16.069 16.396 16.764 17.119 17.527 17.947 18.345 18.74 19.198 19.69 20.166 20.7 21.191 21.711 22.286 22.852 23.235 23.324 22.996 22.484 21.835 21.225 20.674 20.158 19.652 19.2 18.763 18.373 18.007 17.682 17.374 17.074 16.806 16.505 16.221 15.982 15.74 15.488 15.276 15.048 14.805 14.611 14.39 14.167 13.943 13.7 13.538 13.369 13.093 12.905 12.707 12.6 12.366 12.105 11.819 11.673 11.372 11.203 11.04 10.876 10.464 10.223 9.966 9.696 9.392 9.012 8.473 6.612 -6 ,25199 ,KEBNE ,17024892,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:53:44 CET,0.0 3.542 4.475 5.111 5.637 6.124 6.511 6.823 7.373 7.628 7.877 8.149 8.473 8.641 8.967 9.266 9.545 9.678 9.94 10.195 10.539 10.754 10.966 11.272 11.554 11.812 12.062 12.313 12.627 12.934 13.223 13.566 13.886 14.169 14.499 14.87 15.217 15.588 15.985 16.371 16.772 17.245 17.763 18.222 18.704 19.227 19.799 20.349 20.881 21.237 21.279 20.975 20.455 19.865 19.32 18.745 18.194 17.717 17.296 16.879 16.502 16.144 15.81 15.485 15.174 14.888 14.59 14.309 14.06 13.798 13.531 13.319 13.085 12.837 12.649 12.447 12.243 12.044 11.829 11.68 11.526 11.262 11.063 10.838 10.726 10.505 10.254 9.974 9.837 9.548 9.368 9.205 9.043 8.66 8.453 8.21 7.911 7.557 7.136 6.606 3.734 -7 ,6498 ,KEBNE ,17024893,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:54:17 CET,0.0 5.022 5.841 6.441 6.913 7.336 7.681 7.959 8.488 8.712 8.914 9.163 9.487 9.661 9.978 10.269 10.557 10.711 11.008 11.269 11.619 11.82 12.016 12.307 12.591 12.882 13.153 13.391 13.683 13.972 14.252 14.583 14.902 15.193 15.521 15.892 16.237 16.599 16.974 17.378 17.785 18.222 18.719 19.17 19.687 20.256 20.821 21.346 21.825 22.231 22.345 21.884 21.234 20.579 19.933 19.345 18.839 18.355 17.927 17.472 17.086 16.743 16.397 16.066 15.74 15.452 15.173 14.923 14.709 14.475 14.207 13.987 13.769 13.534 13.351 13.159 12.947 12.737 12.533 12.39 12.232 11.989 11.825 11.635 11.537 11.319 11.066 10.813 10.681 10.388 10.24 10.083 9.913 9.522 9.277 9.004 8.716 8.36 7.932 7.454 5.441 -8 ,6079 ,KEBNE ,17024894,Wed Dec 22 11:20:06 CET,Wed Dec 22 12:54:20 CET,0.0 3.537 4.369 4.979 5.438 5.802 6.143 6.463 6.975 7.189 7.4 7.658 7.998 8.181 8.535 8.882 9.199 9.352 9.641 9.901 10.246 10.459 10.676 10.976 11.256 11.53 11.776 12.007 12.305 12.592 12.882 13.211 13.511 13.812 14.142 14.496 14.825 15.174 15.533 15.921 16.338 16.777 17.25 17.726 18.262 18.803 19.403 19.997 20.499 20.883 21.032 20.762 20.206 19.566 18.999 18.433 17.904 17.405 16.938 16.467 16.068 15.703 15.357 15.009 14.675 14.372 14.04 13.758 13.523 13.266 13.009 12.794 12.564 12.319 12.121 11.924 11.719 11.508 11.288 11.134 10.983 10.734 10.548 10.353 10.255 10.073 9.876 9.629 9.496 9.201 9.058 8.896 8.725 8.364 8.164 7.931 7.655 7.352 6.991 6.502 5.136 -9 ,1907 ,KEBNE ,17024895,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:53:41 CET,0.0 5.53 6.465 7.122 7.66 8.103 8.477 8.808 9.441 9.717 9.964 10.292 10.637 10.836 11.231 11.588 11.9 12.049 12.324 12.57 12.942 13.174 13.378 13.665 13.954 14.252 14.535 14.794 15.109 15.388 15.663 16.003 16.319 16.632 16.983 17.353 17.696 18.066 18.472 18.906 19.339 19.797 20.313 20.829 21.382 21.92 22.487 23.021 23.539 23.997 24.205 23.896 23.313 22.664 22.071 21.505 20.943 20.458 20.074 19.64 19.224 18.797 18.351 17.92 17.524 17.184 16.819 16.474 16.172 15.862 15.526 15.239 14.949 14.655 14.426 14.191 13.943 13.685 13.429 13.249 13.052 12.735 12.529 12.323 12.216 11.987 11.732 11.472 11.324 11.003 10.802 10.633 10.469 10.111 9.903 9.691 9.456 9.133 8.776 8.312 6.108 -10 ,12474 ,KEBNE ,17024896,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:52:57 CET,0.0 7.546 8.388 8.937 9.423 9.816 10.159 10.456 11.003 11.265 11.523 11.852 12.198 12.391 12.759 13.109 13.415 13.553 13.841 14.101 14.429 14.659 14.878 15.175 15.461 15.725 15.987 16.229 16.531 16.828 17.117 17.45 17.765 18.068 18.387 18.758 19.134 19.515 19.895 20.289 20.684 21.138 21.646 22.115 22.646 23.187 23.733 24.29 24.817 25.236 25.39 24.941 24.35 23.752 23.125 22.54 22.037 21.548 21.074 20.587 20.186 19.831 19.448 19.064 18.71 18.383 18.047 17.728 17.446 17.152 16.823 16.556 16.296 16.028 15.817 15.594 15.355 15.113 14.865 14.692 14.511 14.205 13.983 13.766 13.66 13.437 13.206 12.954 12.817 12.527 12.346 12.174 11.99 11.517 11.272 11.035 10.804 10.51 10.103 9.647 7.534 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_39.txt deleted file mode 100644 index 334ab4b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30450 ,TETRA ,17559462,Sat Nov 27 07:26:22 CET,Sat Nov 27 09:15:42 CET,0.0 8.261 9.181 9.782 10.258 10.663 11.035 11.363 11.892 12.144 12.396 12.662 13.005 13.211 13.6 13.967 14.319 14.487 14.771 15.017 15.386 15.63 15.876 16.233 16.546 16.834 17.122 17.38 17.681 17.967 18.219 18.513 18.803 19.083 19.389 19.704 20.036 20.412 20.786 21.161 21.548 21.958 22.389 22.798 23.242 23.687 24.111 24.478 24.794 24.974 24.778 24.022 23.137 22.306 21.529 20.788 20.143 19.569 19.043 18.492 18.05 17.667 17.276 16.888 16.525 16.19 15.844 15.541 15.278 15.0 14.711 14.459 14.188 13.91 13.698 13.485 13.267 13.034 12.788 12.613 12.427 12.161 11.963 11.737 11.626 11.393 11.14 10.864 10.712 10.404 10.246 10.056 9.868 9.557 9.374 9.124 8.812 8.48 8.1 7.637 6.597 -2 ,2222 ,TETRA ,17559463,Sat Nov 27 07:26:22 CET,Sat Nov 27 09:17:52 CET,0.0 5.041 5.783 6.384 6.86 7.25 7.622 7.962 8.584 8.863 9.117 9.452 9.808 10.004 10.407 10.76 11.07 11.223 11.508 11.756 12.093 12.304 12.515 12.822 13.129 13.42 13.672 13.912 14.248 14.572 14.856 15.197 15.515 15.803 16.146 16.533 16.892 17.292 17.717 18.132 18.547 19.042 19.613 20.112 20.632 21.159 21.682 22.193 22.62 22.942 22.942 22.289 21.509 20.75 20.015 19.358 18.779 18.198 17.684 17.197 16.79 16.413 16.04 15.681 15.342 15.025 14.689 14.383 14.133 13.863 13.573 13.349 13.104 12.814 12.596 12.393 12.173 11.945 11.714 11.536 11.342 11.077 10.902 10.699 10.589 10.341 10.067 9.782 9.627 9.318 9.155 8.978 8.791 8.389 8.161 7.914 7.673 7.386 6.974 6.381 5.311 -3 ,29514 ,TETRA ,17559464,Sat Nov 27 07:27:22 CET,Sat Nov 27 09:17:02 CET,0.0 6.0 7.079 7.756 8.249 8.671 9.05 9.417 10.093 10.358 10.573 10.817 11.15 11.321 11.65 11.98 12.288 12.425 12.681 12.929 13.285 13.512 13.742 14.094 14.413 14.699 14.976 15.26 15.599 15.907 16.234 16.628 17.0 17.338 17.726 18.171 18.612 19.126 19.629 20.099 20.571 21.102 21.693 22.211 22.762 23.318 23.886 24.433 24.918 25.173 25.009 24.332 23.554 22.796 22.095 21.469 20.885 20.333 19.84 19.289 18.832 18.457 18.085 17.719 17.374 17.069 16.746 16.455 16.194 15.908 15.597 15.331 15.067 14.794 14.58 14.359 14.144 13.931 13.701 13.543 13.374 13.108 12.917 12.706 12.597 12.371 12.127 11.882 11.751 11.46 11.355 11.204 11.053 10.713 10.493 10.212 9.945 9.664 9.338 8.966 7.121 -4 ,14102 ,TETRA ,17559465,Sat Nov 27 07:27:22 CET,Sat Nov 27 09:17:05 CET,0.0 3.656 4.47 5.03 5.56 6.013 6.348 6.657 7.238 7.496 7.723 7.963 8.286 8.481 8.846 9.166 9.452 9.587 9.851 10.115 10.497 10.756 10.992 11.301 11.586 11.854 12.128 12.397 12.732 13.041 13.354 13.719 14.037 14.348 14.695 15.065 15.407 15.759 16.127 16.51 16.929 17.401 17.893 18.347 18.838 19.35 19.854 20.321 20.78 21.043 20.907 20.262 19.542 18.786 18.01 17.316 16.69 16.062 15.528 15.045 14.612 14.193 13.791 13.417 13.073 12.744 12.385 12.067 11.798 11.541 11.283 11.058 10.803 10.517 10.304 10.087 9.841 9.563 9.251 9.053 8.881 8.616 8.432 8.231 8.127 7.912 7.681 7.434 7.306 7.028 6.918 6.781 6.631 6.316 6.15 5.926 5.659 5.351 4.946 4.426 2.433 -5 ,14639 ,TETRA ,17559466,Sat Nov 27 07:27:22 CET,Sat Nov 27 09:17:00 CET,0.0 3.511 4.314 4.952 5.475 5.882 6.234 6.562 7.153 7.394 7.616 7.905 8.259 8.461 8.835 9.185 9.497 9.645 9.896 10.127 10.472 10.687 10.905 11.216 11.506 11.792 12.062 12.307 12.628 12.909 13.16 13.482 13.78 14.046 14.346 14.676 14.981 15.308 15.665 16.03 16.411 16.827 17.252 17.661 18.131 18.579 19.02 19.457 19.852 20.121 20.001 19.319 18.524 17.776 17.099 16.446 15.844 15.297 14.813 14.331 13.921 13.55 13.2 12.881 12.571 12.269 11.95 11.65 11.385 11.093 10.768 10.497 10.205 9.895 9.645 9.386 9.134 8.883 8.605 8.413 8.229 7.93 7.71 7.49 7.382 7.165 6.932 6.681 6.549 6.25 6.089 5.913 5.739 5.342 5.098 4.86 4.608 4.316 3.986 3.554 2.467 -6 ,14776 ,TETRA ,17559467,Sat Nov 27 07:27:22 CET,Sat Nov 27 09:19:25 CET,0.0 5.476 6.345 6.923 7.383 7.763 8.099 8.408 8.982 9.252 9.502 9.79 10.131 10.314 10.694 11.053 11.371 11.517 11.793 12.059 12.446 12.685 12.903 13.203 13.519 13.825 14.095 14.341 14.663 14.965 15.225 15.537 15.846 16.142 16.476 16.814 17.134 17.502 17.873 18.258 18.647 19.041 19.485 19.92 20.392 20.869 21.304 21.708 22.084 22.275 22.112 21.509 20.738 19.944 19.179 18.456 17.846 17.277 16.756 16.238 15.762 15.319 14.91 14.537 14.195 13.87 13.52 13.188 12.894 12.598 12.312 12.087 11.851 11.589 11.379 11.166 10.947 10.727 10.505 10.344 10.18 9.921 9.731 9.537 9.436 9.213 8.985 8.759 8.635 8.351 8.212 8.051 7.896 7.557 7.361 7.138 6.876 6.564 6.165 5.659 4.333 -7 ,23756 ,TETRA ,17559468,Sat Nov 27 07:27:22 CET,Sat Nov 27 09:16:53 CET,0.0 5.44 6.369 7.018 7.496 7.891 8.233 8.527 9.024 9.253 9.484 9.78 10.125 10.309 10.644 10.96 11.258 11.42 11.753 12.052 12.46 12.717 12.974 13.341 13.689 14.012 14.303 14.59 14.963 15.299 15.608 16.0 16.369 16.7 17.111 17.586 18.01 18.464 18.973 19.506 20.018 20.525 21.046 21.566 22.121 22.674 23.245 23.724 24.106 24.385 24.214 23.479 22.713 21.988 21.295 20.64 20.002 19.401 18.888 18.363 17.917 17.512 17.112 16.721 16.37 16.037 15.685 15.367 15.079 14.763 14.421 14.14 13.842 13.54 13.308 13.056 12.791 12.548 12.323 12.167 12.008 11.747 11.569 11.378 11.272 11.063 10.837 10.566 10.42 10.129 10.018 9.873 9.698 9.319 9.109 8.849 8.543 8.261 7.959 7.347 5.305 -8 ,31702 ,TETRA ,17559469,Sat Nov 27 07:28:24 CET,Sat Nov 27 09:18:10 CET,0.0 2.886 3.706 4.343 4.866 5.305 5.658 5.977 6.552 6.803 7.041 7.339 7.696 7.895 8.266 8.633 8.981 9.14 9.441 9.729 10.111 10.332 10.544 10.846 11.121 11.389 11.66 11.918 12.245 12.548 12.816 13.13 13.45 13.762 14.089 14.431 14.76 15.127 15.485 15.848 16.268 16.729 17.216 17.689 18.209 18.745 19.286 19.81 20.326 20.722 20.633 19.908 19.163 18.432 17.738 17.095 16.509 15.925 15.421 14.929 14.487 14.09 13.707 13.341 12.986 12.651 12.3 11.98 11.691 11.406 11.097 10.828 10.548 10.27 10.069 9.836 9.591 9.356 9.112 8.943 8.757 8.454 8.245 8.023 7.914 7.697 7.464 7.209 7.067 6.772 6.598 6.426 6.264 5.931 5.755 5.553 5.315 4.976 4.599 4.189 2.782 -9 ,7530 ,TETRA ,17559470,Sat Nov 27 07:28:24 CET,Sat Nov 27 09:18:39 CET,0.0 6.883 7.883 8.518 8.98 9.403 9.766 10.044 10.51 10.752 10.99 11.277 11.611 11.781 12.115 12.451 12.765 12.9 13.153 13.413 13.796 14.026 14.264 14.61 14.904 15.183 15.464 15.756 16.117 16.463 16.774 17.111 17.461 17.78 18.127 18.517 18.884 19.289 19.69 20.104 20.564 21.085 21.647 22.117 22.642 23.213 23.768 24.283 24.714 24.981 24.922 24.222 23.397 22.597 21.842 21.134 20.515 19.941 19.425 18.877 18.386 17.975 17.582 17.209 16.858 16.516 16.158 15.828 15.544 15.262 14.953 14.685 14.424 14.163 13.958 13.735 13.503 13.272 13.014 12.829 12.643 12.355 12.157 11.942 11.828 11.609 11.377 11.121 10.99 10.702 10.585 10.444 10.295 9.968 9.763 9.505 9.211 8.877 8.508 7.997 6.515 -10 ,19591 ,TETRA ,17559471,Sat Nov 27 07:28:24 CET,Sat Nov 27 09:18:43 CET,0.0 4.532 5.432 6.069 6.542 6.929 7.278 7.623 8.283 8.559 8.794 9.079 9.433 9.632 9.98 10.303 10.598 10.733 11.001 11.258 11.622 11.84 12.064 12.395 12.683 12.97 13.265 13.549 13.903 14.235 14.529 14.891 15.219 15.499 15.817 16.147 16.46 16.802 17.166 17.547 17.919 18.317 18.794 19.314 19.929 20.523 21.035 21.489 21.957 22.25 22.115 21.475 20.664 19.883 19.152 18.44 17.804 17.239 16.773 16.296 15.846 15.432 15.038 14.675 14.318 13.966 13.592 13.252 12.961 12.657 12.339 12.053 11.765 11.498 11.292 11.075 10.842 10.597 10.33 10.131 9.929 9.609 9.371 9.127 9.004 8.747 8.496 8.252 8.108 7.798 7.648 7.505 7.367 7.022 6.82 6.601 6.374 6.104 5.766 5.337 4.001 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_40.txt deleted file mode 100644 index b6d9c4d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_40.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29475 ,KEBNE ,17024897,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:53:05 CET,0.0 4.819 6.051 6.855 7.465 8.009 8.522 8.965 9.66 9.976 10.256 10.62 11.01 11.24 11.658 12.053 12.403 12.558 12.842 13.122 13.543 13.812 14.06 14.395 14.718 15.026 15.311 15.587 15.933 16.23 16.497 16.804 17.087 17.37 17.67 17.946 18.178 18.412 18.667 18.914 19.121 19.317 19.491 19.62 19.708 19.723 19.666 19.46 18.933 18.095 16.475 14.052 12.02 10.39 8.996 7.789 6.738 5.808 4.962 4.089 3.409 2.828 2.242 1.631 1.074 0.616 0.156 -0.249 -0.585 -0.936 -1.293 -1.585 -1.892 -2.224 -2.5 -2.785 -3.081 -3.392 -3.717 -3.947 -4.177 -4.534 -4.794 -5.053 -5.182 -5.458 -5.747 -6.046 -6.203 -6.535 -6.725 -6.92 -7.114 -7.545 -7.816 -8.164 -8.556 -8.983 -9.459 -10.086 -12.911 -2 ,29710 ,KEBNE ,17024898,Wed Dec 22 11:19:07 CET,Wed Dec 22 12:53:44 CET,0.0 7.261 8.39 9.231 9.83 10.336 10.82 11.22 11.87 12.173 12.481 12.927 13.328 13.555 13.962 14.331 14.648 14.805 15.113 15.389 15.771 16.019 16.249 16.563 16.845 17.109 17.385 17.637 17.932 18.211 18.479 18.792 19.055 19.278 19.555 19.836 20.063 20.301 20.527 20.749 20.954 21.158 21.36 21.516 21.679 21.757 21.735 21.566 21.034 20.065 18.26 15.853 13.857 12.16 10.709 9.499 8.451 7.442 6.559 5.702 4.989 4.362 3.738 3.132 2.597 2.119 1.604 1.149 0.782 0.403 -0.017 -0.369 -0.707 -1.054 -1.327 -1.615 -1.941 -2.268 -2.606 -2.838 -3.066 -3.427 -3.67 -3.914 -4.04 -4.315 -4.611 -4.946 -5.125 -5.477 -5.709 -5.934 -6.17 -6.684 -6.956 -7.264 -7.638 -8.076 -8.571 -9.216 -11.662 -4 ,2673 ,KEBNE ,17024900,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:53:01 CET,0.0 8.682 9.776 10.501 11.104 11.65 12.111 12.512 13.285 13.627 13.91 14.274 14.658 14.883 15.267 15.622 15.965 16.113 16.403 16.688 17.076 17.315 17.538 17.869 18.19 18.473 18.746 19.007 19.328 19.616 19.863 20.149 20.427 20.686 20.951 21.211 21.439 21.687 21.945 22.191 22.438 22.657 22.847 23.036 23.265 23.444 23.533 23.496 23.171 22.297 20.444 18.14 16.002 14.116 12.542 11.133 9.951 8.939 8.045 7.132 6.35 5.66 5.008 4.389 3.817 3.306 2.788 2.346 1.953 1.541 1.117 0.745 0.376 0.028 -0.252 -0.558 -0.866 -1.165 -1.485 -1.73 -1.997 -2.401 -2.691 -2.998 -3.139 -3.42 -3.716 -4.024 -4.196 -4.545 -4.774 -4.983 -5.187 -5.634 -5.892 -6.177 -6.488 -6.892 -7.418 -7.991 -9.988 -6 ,12764 ,KEBNE ,17024902,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:53:16 CET,0.0 13.642 14.722 15.52 16.205 16.745 17.187 17.574 18.193 18.5 18.82 19.266 19.681 19.952 20.432 20.86 21.251 21.437 21.785 22.066 22.451 22.714 22.983 23.347 23.662 23.958 24.242 24.511 24.846 25.147 25.448 25.812 26.116 26.387 26.696 27.019 27.303 27.583 27.851 28.119 28.4 28.674 28.918 29.138 29.284 29.34 29.331 29.194 28.807 27.986 26.287 23.885 21.797 19.995 18.422 17.045 15.849 14.818 13.935 13.04 12.273 11.595 10.959 10.361 9.802 9.298 8.784 8.326 7.927 7.518 7.087 6.719 6.337 5.953 5.665 5.365 5.062 4.753 4.424 4.196 3.967 3.576 3.292 3.023 2.887 2.618 2.341 2.029 1.867 1.535 1.358 1.176 0.982 0.551 0.308 0.033 -0.284 -0.65 -1.046 -1.577 -3.693 -8 ,6524 ,KEBNE ,17024904,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:53:13 CET,0.0 10.235 11.521 12.412 13.124 13.718 14.217 14.653 15.363 15.648 15.916 16.28 16.663 16.881 17.278 17.679 18.052 18.22 18.556 18.869 19.262 19.492 19.718 20.04 20.326 20.603 20.86 21.093 21.382 21.632 21.868 22.145 22.383 22.584 22.819 23.113 23.374 23.597 23.819 24.035 24.237 24.473 24.725 24.962 25.162 25.288 25.351 25.22 24.757 23.813 22.024 19.607 17.521 15.788 14.254 12.939 11.874 10.898 10.059 9.242 8.54 7.916 7.331 6.802 6.29 5.796 5.299 4.883 4.523 4.156 3.787 3.485 3.154 2.786 2.508 2.217 1.915 1.616 1.333 1.129 0.894 0.551 0.329 0.083 -0.058 -0.385 -0.714 -1.03 -1.194 -1.538 -1.736 -1.928 -2.128 -2.586 -2.833 -3.104 -3.425 -3.835 -4.347 -5.083 -8.823 -10 ,26871 ,KEBNE ,17024906,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:53:35 CET,0.0 11.198 12.445 13.34 14.047 14.612 15.092 15.53 16.301 16.639 16.941 17.294 17.662 17.902 18.377 18.793 19.155 19.325 19.649 19.927 20.325 20.598 20.847 21.179 21.485 21.781 22.07 22.345 22.67 22.946 23.209 23.526 23.804 24.073 24.388 24.735 25.064 25.364 25.635 25.931 26.214 26.481 26.761 26.982 27.147 27.266 27.276 27.056 26.552 25.619 23.713 21.259 19.157 17.381 15.936 14.639 13.474 12.416 11.514 10.604 9.838 9.174 8.574 8.044 7.543 7.079 6.586 6.145 5.77 5.398 5.032 4.726 4.378 3.995 3.713 3.441 3.146 2.812 2.455 2.199 1.936 1.545 1.274 0.988 0.844 0.544 0.23 -0.099 -0.285 -0.64 -0.825 -1.011 -1.207 -1.62 -1.842 -2.069 -2.35 -2.711 -3.115 -3.652 -5.766 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_41.txt deleted file mode 100644 index 0bfbbd2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_41.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,4782 ,TETRA ,17559474,Sat Nov 27 07:28:25 CET,Sat Nov 27 09:18:07 CET,0.0 11.012 12.191 12.997 13.636 14.207 14.691 15.129 15.863 16.167 16.43 16.773 17.15 17.369 17.785 18.174 18.517 18.673 18.981 19.296 19.754 20.03 20.296 20.675 21.016 21.338 21.657 21.947 22.286 22.595 22.868 23.178 23.46 23.706 23.99 24.335 24.643 24.959 25.303 25.635 25.973 26.321 26.687 27.017 27.387 27.725 27.975 28.188 28.24 28.02 27.289 26.061 24.887 23.829 22.875 21.988 21.218 20.531 19.935 19.319 18.764 18.266 17.809 17.354 16.912 16.521 16.106 15.741 15.433 15.131 14.782 14.453 14.134 13.833 13.596 13.333 13.076 12.826 12.565 12.384 12.198 11.9 11.682 11.457 11.341 11.091 10.836 10.58 10.436 10.127 9.958 9.797 9.628 9.228 9.0 8.776 8.555 8.275 7.953 7.553 6.077 -4 ,5150 ,TETRA ,17559475,Sat Nov 27 07:29:21 CET,Sat Nov 27 09:18:19 CET,0.0 5.06 6.174 6.932 7.543 8.056 8.509 8.86 9.475 9.758 10.032 10.453 10.843 11.06 11.477 11.841 12.182 12.345 12.645 12.936 13.367 13.635 13.881 14.253 14.591 14.899 15.205 15.5 15.862 16.166 16.449 16.77 17.068 17.371 17.704 18.035 18.334 18.66 19.01 19.356 19.661 19.98 20.348 20.665 20.959 21.261 21.537 21.687 21.698 21.581 20.916 19.634 18.524 17.563 16.634 15.757 15.005 14.332 13.752 13.155 12.645 12.19 11.757 11.346 10.946 10.593 10.229 9.893 9.619 9.346 9.028 8.769 8.522 8.268 8.061 7.836 7.597 7.306 6.989 6.788 6.573 6.216 5.985 5.757 5.638 5.396 5.146 4.868 4.717 4.403 4.232 4.057 3.869 3.475 3.249 2.984 2.698 2.366 1.978 1.447 -0.616 -5 ,25763 ,TETRA ,17559476,Sat Nov 27 07:29:24 CET,Sat Nov 27 09:18:08 CET,0.0 7.293 8.459 9.238 9.853 10.353 10.779 11.179 11.849 12.131 12.395 12.729 13.106 13.326 13.706 14.056 14.387 14.545 14.858 15.144 15.505 15.739 15.951 16.24 16.518 16.786 17.043 17.285 17.611 17.913 18.181 18.492 18.772 19.04 19.337 19.656 19.96 20.299 20.648 20.974 21.313 21.685 22.065 22.395 22.741 23.061 23.324 23.519 23.568 23.325 22.571 21.363 20.216 19.124 18.158 17.329 16.568 15.856 15.234 14.567 14.008 13.553 13.11 12.699 12.325 11.962 11.581 11.251 10.967 10.67 10.357 10.102 9.842 9.561 9.347 9.138 8.916 8.677 8.426 8.256 8.076 7.796 7.612 7.418 7.32 7.107 6.867 6.622 6.503 6.221 6.112 5.968 5.813 5.5 5.301 5.034 4.738 4.391 4.019 3.542 2.42 -6 ,17694 ,TETRA ,17559477,Sat Nov 27 07:29:21 CET,Sat Nov 27 09:21:35 CET,0.0 4.183 5.285 6.039 6.611 7.117 7.567 7.958 8.658 8.995 9.296 9.662 10.044 10.278 10.709 11.098 11.459 11.636 11.989 12.33 12.789 13.053 13.3 13.644 13.977 14.286 14.59 14.886 15.245 15.587 15.891 16.23 16.548 16.834 17.152 17.523 17.874 18.226 18.593 18.968 19.343 19.723 20.122 20.501 20.87 21.177 21.473 21.711 21.83 21.664 20.885 19.545 18.354 17.333 16.385 15.503 14.739 14.069 13.476 12.88 12.37 11.901 11.459 11.051 10.666 10.319 9.958 9.637 9.369 9.092 8.806 8.558 8.287 7.99 7.756 7.526 7.301 7.07 6.81 6.62 6.426 6.128 5.917 5.698 5.578 5.304 5.026 4.75 4.592 4.262 4.066 3.879 3.674 3.276 3.065 2.814 2.538 2.239 1.894 1.374 -0.293 -7 ,22146 ,TETRA ,17559478,Sat Nov 27 07:29:21 CET,Sat Nov 27 09:19:00 CET,0.0 10.996 12.14 12.852 13.375 13.854 14.291 14.69 15.402 15.707 15.971 16.28 16.659 16.889 17.335 17.723 18.045 18.199 18.508 18.794 19.181 19.426 19.648 19.95 20.241 20.533 20.838 21.126 21.449 21.764 22.064 22.423 22.753 23.047 23.384 23.744 24.084 24.452 24.818 25.191 25.584 26.015 26.465 26.812 27.18 27.64 28.091 28.386 28.493 28.353 27.697 26.498 25.373 24.272 23.298 22.461 21.71 21.047 20.476 19.893 19.424 19.012 18.589 18.18 17.796 17.452 17.078 16.717 16.402 16.077 15.746 15.471 15.183 14.903 14.699 14.487 14.261 14.021 13.765 13.58 13.388 13.092 12.887 12.688 12.595 12.398 12.158 11.893 11.759 11.458 11.289 11.108 10.927 10.562 10.355 10.129 9.885 9.618 9.323 8.958 7.89 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_42.txt deleted file mode 100644 index 87b04df9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2340 ,TETRA ,17559482,Sat Nov 27 07:30:25 CET,Sat Nov 27 09:18:42 CET,0.0 6.216 6.861 7.298 7.64 7.982 8.313 8.576 8.989 9.194 9.408 9.664 9.991 10.159 10.474 10.768 11.061 11.199 11.449 11.661 11.946 12.123 12.293 12.563 12.848 13.12 13.357 13.597 13.914 14.186 14.433 14.725 15.006 15.284 15.604 15.934 16.246 16.615 17.005 17.399 17.805 18.264 18.816 19.329 19.87 20.449 21.106 21.814 22.592 23.386 24.115 24.482 24.46 24.263 24.014 23.73 23.398 23.077 22.816 22.548 22.296 22.055 21.823 21.598 21.376 21.157 20.933 20.727 20.533 20.329 20.126 19.948 19.758 19.567 19.414 19.256 19.087 18.908 18.724 18.581 18.427 18.192 18.038 17.873 17.784 17.6 17.397 17.183 17.066 16.811 16.675 16.511 16.346 16.037 15.867 15.68 15.488 15.177 14.762 14.209 11.885 -2 ,30070 ,TETRA ,17559483,Sat Nov 27 07:30:24 CET,Sat Nov 27 09:24:26 CET,0.0 4.054 4.932 5.542 6.006 6.371 6.674 6.944 7.426 7.664 7.89 8.178 8.512 8.674 8.987 9.29 9.569 9.7 9.961 10.221 10.576 10.802 11.024 11.32 11.597 11.864 12.112 12.351 12.663 12.945 13.213 13.53 13.815 14.087 14.388 14.718 15.041 15.394 15.781 16.178 16.583 16.999 17.487 18.009 18.59 19.198 19.847 20.553 21.331 22.127 22.825 23.1 23.049 22.876 22.628 22.314 22.007 21.704 21.421 21.108 20.823 20.578 20.355 20.145 19.926 19.702 19.469 19.269 19.089 18.876 18.635 18.448 18.254 18.048 17.891 17.735 17.579 17.405 17.215 17.083 16.936 16.695 16.544 16.393 16.305 16.121 15.922 15.712 15.595 15.333 15.244 15.12 14.954 14.514 14.265 14.014 13.756 13.441 13.031 12.501 9.417 -3 ,12 ,TETRA ,17559484,Sat Nov 27 07:31:21 CET,Sat Nov 27 09:21:21 CET,0.0 4.849 5.541 5.989 6.428 6.813 7.126 7.409 7.847 8.04 8.255 8.524 8.835 8.99 9.293 9.568 9.815 9.935 10.173 10.395 10.7 10.881 11.061 11.334 11.61 11.864 12.093 12.322 12.611 12.882 13.149 13.459 13.76 14.04 14.344 14.69 15.034 15.424 15.826 16.224 16.611 17.051 17.565 18.063 18.635 19.237 19.915 20.631 21.364 22.138 22.858 23.118 23.023 22.794 22.51 22.214 21.934 21.615 21.318 21.05 20.79 20.548 20.317 20.066 19.805 19.561 19.302 19.08 18.89 18.7 18.521 18.367 18.184 17.968 17.789 17.596 17.4 17.216 17.012 16.855 16.699 16.458 16.281 16.1 16.011 15.815 15.607 15.369 15.244 14.991 14.902 14.774 14.645 14.36 14.191 13.982 13.771 13.484 13.06 12.54 10.14 -4 ,26502 ,TETRA ,17559485,Sat Nov 27 07:30:24 CET,Sat Nov 27 09:19:11 CET,0.0 6.585 7.337 7.86 8.298 8.673 8.998 9.302 9.859 10.114 10.343 10.604 10.93 11.097 11.421 11.707 12.002 12.153 12.408 12.651 12.999 13.219 13.431 13.718 13.993 14.273 14.539 14.774 15.067 15.355 15.626 15.927 16.22 16.499 16.802 17.149 17.487 17.836 18.205 18.606 19.002 19.441 19.96 20.471 21.027 21.629 22.322 23.038 23.763 24.482 25.2 25.551 25.529 25.332 25.068 24.777 24.476 24.161 23.884 23.61 23.353 23.112 22.854 22.587 22.347 22.134 21.912 21.699 21.487 21.25 21.007 20.812 20.612 20.39 20.209 20.019 19.814 19.599 19.392 19.255 19.11 18.879 18.722 18.563 18.482 18.312 18.113 17.887 17.766 17.49 17.347 17.193 17.018 16.662 16.459 16.217 15.937 15.656 15.332 14.858 13.108 -5 ,5373 ,TETRA ,17559486,Sat Nov 27 07:30:24 CET,Sat Nov 27 09:19:45 CET,0.0 4.035 4.712 5.208 5.591 5.91 6.183 6.43 6.867 7.077 7.277 7.49 7.803 7.963 8.267 8.56 8.836 8.969 9.216 9.442 9.767 9.965 10.166 10.48 10.772 11.027 11.263 11.494 11.797 12.096 12.386 12.73 13.06 13.374 13.721 14.101 14.453 14.829 15.231 15.643 16.076 16.566 17.091 17.588 18.174 18.8 19.451 20.119 20.847 21.604 22.297 22.576 22.521 22.367 22.12 21.838 21.569 21.276 20.985 20.682 20.421 20.184 19.937 19.697 19.466 19.25 19.019 18.814 18.619 18.407 18.19 18.01 17.832 17.632 17.464 17.272 17.066 16.857 16.627 16.466 16.288 15.987 15.783 15.579 15.478 15.282 15.088 14.869 14.748 14.49 14.416 14.291 14.128 13.733 13.519 13.292 13.047 12.762 12.366 11.787 9.631 -6 ,21113 ,TETRA ,17559487,Sat Nov 27 07:30:24 CET,Sat Nov 27 09:19:17 CET,0.0 5.017 5.717 6.15 6.48 6.783 7.072 7.344 7.827 8.072 8.301 8.54 8.866 9.04 9.375 9.667 9.943 10.08 10.345 10.6 10.978 11.204 11.408 11.694 11.964 12.241 12.495 12.721 13.017 13.306 13.582 13.893 14.194 14.5 14.849 15.221 15.59 15.996 16.42 16.861 17.293 17.79 18.351 18.864 19.433 20.058 20.764 21.506 22.275 23.054 23.763 24.047 23.954 23.745 23.501 23.212 22.928 22.65 22.388 22.094 21.84 21.592 21.33 21.092 20.862 20.652 20.42 20.191 19.977 19.74 19.506 19.319 19.118 18.9 18.734 18.563 18.376 18.183 17.969 17.814 17.657 17.398 17.206 17.02 16.929 16.728 16.506 16.261 16.129 15.847 15.669 15.501 15.328 14.931 14.703 14.46 14.213 13.957 13.629 13.14 11.348 -7 ,28536 ,TETRA ,17559488,Sat Nov 27 07:30:24 CET,Sat Nov 27 09:20:44 CET,0.0 3.1 3.747 4.158 4.49 4.802 5.048 5.287 5.768 6.006 6.249 6.534 6.854 7.023 7.369 7.698 7.996 8.134 8.398 8.643 8.983 9.215 9.439 9.745 10.031 10.271 10.496 10.723 11.012 11.285 11.541 11.854 12.157 12.459 12.814 13.18 13.503 13.85 14.283 14.743 15.171 15.647 16.173 16.692 17.259 17.832 18.498 19.236 20.04 20.863 21.584 21.892 21.845 21.699 21.481 21.208 20.936 20.647 20.374 20.093 19.842 19.601 19.352 19.12 18.918 18.714 18.486 18.275 18.074 17.876 17.667 17.488 17.312 17.124 16.97 16.804 16.626 16.433 16.224 16.085 15.938 15.693 15.524 15.358 15.259 15.041 14.828 14.605 14.488 14.23 14.089 13.935 13.769 13.405 13.234 13.041 12.785 12.497 12.184 11.726 9.998 -8 ,3445 ,TETRA ,17559489,Sat Nov 27 07:31:21 CET,Sat Nov 27 09:19:55 CET,0.0 4.111 5.063 5.752 6.282 6.706 7.094 7.433 8.037 8.302 8.543 8.807 9.135 9.307 9.598 9.859 10.128 10.257 10.481 10.694 11.031 11.238 11.436 11.724 11.989 12.216 12.428 12.644 12.928 13.22 13.499 13.814 14.115 14.397 14.717 15.083 15.413 15.76 16.134 16.52 16.919 17.358 17.855 18.34 18.89 19.485 20.114 20.786 21.531 22.295 23.045 23.399 23.37 23.177 22.932 22.67 22.387 22.099 21.837 21.56 21.296 21.035 20.778 20.521 20.247 19.963 19.644 19.364 19.133 18.884 18.628 18.405 18.167 17.927 17.735 17.531 17.321 17.098 16.852 16.688 16.528 16.266 16.055 15.832 15.721 15.493 15.267 15.053 14.933 14.67 14.563 14.404 14.223 13.872 13.701 13.493 13.223 12.91 12.596 12.249 10.595 -9 ,25124 ,TETRA ,17559490,Sat Nov 27 07:31:21 CET,Sat Nov 27 09:19:47 CET,0.0 5.793 6.675 7.261 7.761 8.186 8.49 8.718 9.102 9.288 9.469 9.644 9.941 10.091 10.375 10.662 10.931 11.049 11.266 11.478 11.795 11.999 12.2 12.47 12.712 12.95 13.178 13.402 13.686 13.957 14.213 14.504 14.79 15.064 15.37 15.727 16.067 16.416 16.786 17.19 17.611 18.069 18.62 19.14 19.692 20.316 20.976 21.659 22.448 23.303 24.136 24.487 24.429 24.229 23.975 23.674 23.388 23.109 22.852 22.554 22.27 22.028 21.78 21.525 21.276 21.043 20.8 20.576 20.372 20.159 19.941 19.765 19.578 19.374 19.219 19.062 18.899 18.728 18.545 18.419 18.292 18.078 17.919 17.758 17.68 17.523 17.34 17.137 17.008 16.715 16.559 16.398 16.246 15.94 15.766 15.571 15.34 15.08 14.763 14.251 12.099 -10 ,12611 ,TETRA ,17559491,Sat Nov 27 07:31:21 CET,Sat Nov 27 09:20:10 CET,0.0 4.592 5.397 5.985 6.473 6.918 7.302 7.62 8.111 8.33 8.547 8.781 9.096 9.252 9.55 9.832 10.105 10.234 10.475 10.709 11.027 11.226 11.432 11.715 11.969 12.226 12.47 12.698 12.99 13.269 13.53 13.82 14.105 14.396 14.718 15.057 15.369 15.735 16.144 16.554 16.954 17.376 17.882 18.407 19.001 19.642 20.336 21.018 21.722 22.479 23.254 23.562 23.449 23.266 23.058 22.817 22.569 22.275 21.985 21.697 21.442 21.192 20.936 20.684 20.447 20.229 19.982 19.758 19.555 19.337 19.137 18.964 18.765 18.567 18.424 18.252 18.04 17.831 17.629 17.472 17.293 17.006 16.81 16.61 16.508 16.316 16.113 15.906 15.799 15.516 15.369 15.225 15.057 14.725 14.535 14.289 13.993 13.683 13.352 12.85 10.49 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_43.txt deleted file mode 100644 index 36b526e3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25428 ,TETRA ,17559492,Sat Nov 27 07:31:21 CET,Sat Nov 27 09:20:26 CET,0.0 2.381 2.9 3.319 3.659 3.968 4.226 4.437 4.83 4.999 5.162 5.363 5.662 5.788 6.05 6.297 6.53 6.64 6.835 7.029 7.31 7.484 7.63 7.825 8.036 8.239 8.42 8.599 8.838 9.071 9.296 9.573 9.813 10.011 10.241 10.504 10.746 10.997 11.274 11.549 11.811 12.108 12.452 12.757 13.056 13.357 13.668 13.974 14.227 14.295 14.028 13.393 12.703 12.013 11.38 10.804 10.269 9.777 9.337 8.878 8.494 8.132 7.778 7.464 7.179 6.924 6.648 6.386 6.153 5.921 5.685 5.482 5.269 5.044 4.863 4.673 4.472 4.256 4.036 3.89 3.733 3.491 3.321 3.126 3.028 2.848 2.667 2.484 2.38 2.11 2.022 1.9 1.769 1.492 1.327 1.126 0.912 0.654 0.392 0.103 -1.046 -2 ,30868 ,TETRA ,17559493,Sat Nov 27 07:31:22 CET,Sat Nov 27 09:21:15 CET,0.0 2.186 2.778 3.225 3.612 3.995 4.343 4.632 5.124 5.345 5.537 5.709 5.988 6.118 6.38 6.616 6.841 6.949 7.163 7.37 7.637 7.791 7.942 8.159 8.352 8.541 8.724 8.9 9.125 9.345 9.553 9.778 9.991 10.197 10.419 10.666 10.907 11.162 11.423 11.706 12.008 12.32 12.649 12.973 13.318 13.612 13.909 14.162 14.382 14.449 14.15 13.488 12.755 12.121 11.548 10.957 10.381 9.844 9.36 8.844 8.426 8.069 7.704 7.344 6.999 6.669 6.324 6.038 5.805 5.569 5.332 5.134 4.922 4.701 4.532 4.359 4.174 3.975 3.767 3.617 3.462 3.229 3.073 2.904 2.813 2.629 2.434 2.223 2.111 1.841 1.754 1.634 1.492 1.137 0.94 0.74 0.532 0.292 0.004 -0.398 -1.724 -3 ,18782 ,TETRA ,17559494,Sat Nov 27 07:31:22 CET,Sat Nov 27 09:23:33 CET,0.0 1.582 2.183 2.627 2.967 3.228 3.457 3.671 4.051 4.234 4.423 4.599 4.888 5.035 5.302 5.531 5.737 5.837 6.039 6.223 6.472 6.63 6.774 6.993 7.212 7.418 7.605 7.782 8.004 8.21 8.411 8.644 8.859 9.061 9.301 9.56 9.792 10.045 10.299 10.561 10.825 11.103 11.424 11.723 12.038 12.353 12.657 12.948 13.17 13.216 12.964 12.356 11.626 10.893 10.26 9.682 9.142 8.637 8.21 7.748 7.34 6.989 6.646 6.323 6.023 5.745 5.45 5.201 4.984 4.747 4.504 4.302 4.075 3.837 3.664 3.491 3.307 3.115 2.916 2.76 2.588 2.31 2.113 1.934 1.84 1.614 1.352 1.081 0.948 0.663 0.533 0.377 0.218 -0.144 -0.34 -0.545 -0.792 -1.094 -1.44 -1.801 -2.669 -4 ,11581 ,TETRA ,17559495,Sat Nov 27 07:31:22 CET,Sat Nov 27 09:20:31 CET,0.0 2.279 2.916 3.348 3.698 3.996 4.275 4.537 4.944 5.12 5.292 5.452 5.747 5.896 6.161 6.392 6.635 6.751 6.964 7.167 7.443 7.624 7.793 8.025 8.257 8.493 8.71 8.905 9.158 9.399 9.628 9.883 10.119 10.343 10.599 10.876 11.117 11.359 11.625 11.904 12.192 12.506 12.825 13.127 13.441 13.735 14.054 14.39 14.659 14.767 14.548 13.937 13.218 12.56 11.963 11.345 10.783 10.291 9.855 9.417 9.034 8.688 8.344 8.016 7.716 7.437 7.16 6.91 6.681 6.437 6.171 5.947 5.73 5.504 5.319 5.134 4.944 4.744 4.532 4.38 4.224 3.975 3.805 3.633 3.542 3.348 3.131 2.904 2.781 2.503 2.396 2.232 2.062 1.706 1.507 1.292 1.053 0.815 0.521 0.155 -0.716 -5 ,24801 ,TETRA ,17559496,Sat Nov 27 07:31:25 CET,Sat Nov 27 09:20:33 CET,0.0 2.273 2.846 3.258 3.64 3.998 4.28 4.52 4.915 5.081 5.255 5.434 5.733 5.885 6.153 6.389 6.612 6.721 6.92 7.101 7.369 7.538 7.707 7.956 8.175 8.38 8.584 8.767 8.988 9.202 9.398 9.642 9.867 10.06 10.299 10.577 10.82 11.071 11.345 11.619 11.892 12.22 12.597 12.936 13.255 13.553 13.858 14.142 14.365 14.436 14.143 13.451 12.715 11.998 11.356 10.744 10.185 9.706 9.292 8.853 8.452 8.088 7.744 7.418 7.121 6.846 6.55 6.289 6.072 5.837 5.582 5.367 5.145 4.913 4.737 4.558 4.365 4.154 3.927 3.774 3.635 3.408 3.224 3.045 2.949 2.758 2.568 2.35 2.242 1.976 1.874 1.736 1.594 1.304 1.157 0.99 0.785 0.554 0.298 -0.084 -1.044 -6 ,13067 ,TETRA ,17559497,Sat Nov 27 07:31:22 CET,Sat Nov 27 09:19:53 CET,0.0 2.35 2.89 3.237 3.548 3.819 4.07 4.316 4.704 4.86 5.004 5.141 5.429 5.561 5.811 6.042 6.256 6.352 6.548 6.742 7.002 7.168 7.328 7.554 7.772 7.977 8.169 8.353 8.581 8.786 8.982 9.215 9.448 9.682 9.944 10.218 10.45 10.701 10.968 11.221 11.494 11.816 12.162 12.46 12.742 13.022 13.335 13.625 13.85 13.952 13.732 13.104 12.413 11.723 11.072 10.49 9.98 9.48 9.019 8.565 8.197 7.865 7.542 7.236 6.938 6.652 6.35 6.08 5.851 5.615 5.355 5.132 4.908 4.683 4.495 4.304 4.126 3.937 3.749 3.624 3.49 3.276 3.122 2.956 2.867 2.678 2.501 2.31 2.201 1.931 1.847 1.719 1.574 1.216 1.022 0.834 0.632 0.403 0.088 -0.338 -1.716 -7 ,22234 ,TETRA ,17559498,Sat Nov 27 07:32:21 CET,Sat Nov 27 09:21:14 CET,0.0 2.346 2.985 3.468 3.794 4.026 4.253 4.483 4.882 5.051 5.222 5.398 5.681 5.809 6.041 6.254 6.462 6.566 6.761 6.943 7.211 7.375 7.528 7.754 7.974 8.175 8.366 8.556 8.793 9.013 9.217 9.449 9.666 9.869 10.101 10.353 10.61 10.898 11.181 11.466 11.745 12.049 12.373 12.638 12.927 13.232 13.543 13.813 14.035 14.148 13.852 13.184 12.513 11.848 11.201 10.581 10.043 9.557 9.133 8.696 8.32 7.971 7.631 7.32 7.015 6.745 6.47 6.195 5.955 5.715 5.47 5.261 5.038 4.806 4.622 4.433 4.226 4.003 3.782 3.638 3.484 3.215 3.033 2.847 2.745 2.524 2.285 2.047 1.931 1.662 1.546 1.403 1.264 0.966 0.803 0.628 0.443 0.207 -0.107 -0.482 -1.267 -8 ,21458 ,TETRA ,17559499,Sat Nov 27 07:32:21 CET,Sat Nov 27 09:21:27 CET,0.0 2.25 2.726 3.137 3.486 3.748 3.991 4.227 4.653 4.837 4.999 5.157 5.469 5.615 5.867 6.121 6.367 6.482 6.695 6.893 7.16 7.315 7.465 7.693 7.923 8.136 8.33 8.504 8.732 8.955 9.157 9.421 9.676 9.902 10.134 10.414 10.717 11.013 11.27 11.516 11.766 12.04 12.371 12.689 13.01 13.322 13.626 13.915 14.188 14.33 14.167 13.616 12.912 12.274 11.736 11.209 10.734 10.276 9.871 9.459 9.085 8.758 8.44 8.137 7.847 7.572 7.301 7.054 6.818 6.568 6.285 6.058 5.843 5.62 5.451 5.272 5.081 4.884 4.677 4.524 4.359 4.11 3.944 3.771 3.682 3.501 3.314 3.114 3.005 2.751 2.676 2.546 2.397 2.09 1.939 1.78 1.597 1.358 1.051 0.635 -0.168 -9 ,9837 ,TETRA ,17559500,Sat Nov 27 07:32:21 CET,Sat Nov 27 09:21:09 CET,0.0 2.051 2.654 3.102 3.461 3.732 3.967 4.169 4.519 4.675 4.834 4.976 5.25 5.379 5.632 5.871 6.087 6.188 6.372 6.552 6.83 6.993 7.139 7.35 7.555 7.762 7.963 8.144 8.367 8.571 8.775 9.027 9.258 9.474 9.711 9.968 10.198 10.443 10.713 11.001 11.295 11.587 11.894 12.191 12.52 12.838 13.125 13.394 13.601 13.676 13.416 12.776 12.125 11.467 10.865 10.283 9.737 9.236 8.807 8.383 8.015 7.686 7.359 7.041 6.749 6.476 6.183 5.927 5.709 5.469 5.224 5.017 4.788 4.54 4.345 4.151 3.944 3.718 3.493 3.344 3.18 2.902 2.702 2.499 2.399 2.203 2.014 1.807 1.695 1.425 1.367 1.247 1.097 0.765 0.587 0.372 0.136 -0.086 -0.386 -0.835 -1.865 -10 ,9671 ,TETRA ,17559501,Sat Nov 27 07:32:21 CET,Sat Nov 27 09:21:28 CET,0.0 1.989 2.563 2.959 3.304 3.595 3.882 4.146 4.572 4.759 4.931 5.11 5.403 5.54 5.812 6.068 6.291 6.397 6.6 6.796 7.082 7.258 7.43 7.665 7.882 8.091 8.286 8.471 8.689 8.906 9.126 9.385 9.63 9.845 10.073 10.323 10.554 10.808 11.068 11.344 11.623 11.898 12.218 12.551 12.898 13.21 13.502 13.769 14.018 14.148 13.88 13.177 12.45 11.777 11.146 10.511 9.959 9.463 8.988 8.53 8.151 7.792 7.448 7.125 6.819 6.531 6.234 5.962 5.731 5.508 5.265 5.056 4.839 4.624 4.459 4.272 4.071 3.874 3.673 3.53 3.39 3.166 3.0 2.831 2.746 2.571 2.381 2.181 2.077 1.812 1.712 1.578 1.431 1.14 0.989 0.797 0.572 0.316 -0.052 -0.602 -1.902 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_46.txt deleted file mode 100644 index 4f85fc59..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12580 ,TETRA ,17559502,Sat Nov 27 07:32:25 CET,Sat Nov 27 09:21:28 CET,0.0 2.343 2.935 3.394 3.755 4.058 4.329 4.566 4.962 5.124 5.269 5.403 5.676 5.798 6.033 6.246 6.436 6.525 6.707 6.883 7.128 7.27 7.395 7.588 7.784 7.966 8.126 8.287 8.493 8.672 8.841 9.044 9.225 9.4 9.601 9.8 9.995 10.203 10.397 10.597 10.8 10.997 11.181 11.337 11.499 11.619 11.675 11.651 11.498 11.116 10.209 8.934 7.821 6.836 5.938 5.153 4.489 3.892 3.358 2.813 2.354 1.934 1.521 1.12 0.744 0.408 0.053 -0.27 -0.547 -0.851 -1.177 -1.437 -1.702 -1.975 -2.197 -2.43 -2.651 -2.875 -3.128 -3.305 -3.482 -3.762 -3.949 -4.135 -4.23 -4.427 -4.648 -4.871 -4.99 -5.276 -5.382 -5.524 -5.674 -6.001 -6.179 -6.373 -6.614 -6.864 -7.124 -7.542 -8.522 -2 ,28700 ,TETRA ,17559503,Sat Nov 27 07:32:23 CET,Sat Nov 27 09:21:28 CET,0.0 2.396 2.975 3.367 3.705 3.989 4.249 4.482 4.861 5.029 5.199 5.342 5.623 5.749 5.993 6.215 6.432 6.539 6.711 6.885 7.134 7.273 7.403 7.6 7.798 7.99 8.184 8.357 8.562 8.746 8.917 9.126 9.324 9.511 9.705 9.895 10.08 10.279 10.48 10.696 10.912 11.131 11.333 11.478 11.612 11.707 11.759 11.779 11.645 11.223 10.285 9.001 7.885 6.911 6.046 5.256 4.569 3.966 3.448 2.933 2.485 2.078 1.687 1.313 0.963 0.63 0.29 -0.005 -0.258 -0.522 -0.8 -1.024 -1.263 -1.501 -1.675 -1.861 -2.065 -2.289 -2.531 -2.697 -2.861 -3.104 -3.267 -3.43 -3.516 -3.696 -3.886 -4.093 -4.2 -4.47 -4.58 -4.718 -4.853 -5.16 -5.323 -5.498 -5.714 -5.97 -6.299 -6.694 -7.751 -3 ,6592 ,TETRA ,17559504,Sat Nov 27 07:32:21 CET,Sat Nov 27 09:22:42 CET,0.0 2.233 2.789 3.146 3.455 3.707 3.946 4.165 4.535 4.701 4.867 5.057 5.361 5.508 5.769 6.026 6.261 6.369 6.563 6.732 6.987 7.145 7.277 7.464 7.657 7.839 8.009 8.158 8.337 8.504 8.667 8.871 9.066 9.247 9.441 9.633 9.801 9.991 10.183 10.368 10.537 10.71 10.908 11.062 11.215 11.336 11.371 11.315 11.146 10.746 9.783 8.475 7.355 6.336 5.471 4.701 4.028 3.439 2.908 2.38 1.942 1.532 1.138 0.76 0.389 0.065 -0.256 -0.542 -0.786 -1.043 -1.314 -1.546 -1.778 -2.024 -2.214 -2.404 -2.602 -2.809 -3.029 -3.178 -3.334 -3.575 -3.747 -3.933 -4.033 -4.236 -4.439 -4.658 -4.778 -5.061 -5.189 -5.347 -5.522 -5.91 -6.108 -6.341 -6.613 -6.886 -7.185 -7.593 -8.846 -4 ,28702 ,TETRA ,17559505,Sat Nov 27 07:32:24 CET,Sat Nov 27 09:22:43 CET,0.0 2.152 2.713 3.162 3.505 3.759 3.973 4.179 4.555 4.72 4.878 5.051 5.342 5.473 5.722 5.936 6.127 6.223 6.419 6.607 6.851 7.003 7.155 7.355 7.523 7.682 7.85 8.01 8.197 8.384 8.574 8.775 8.947 9.103 9.29 9.513 9.71 9.919 10.109 10.29 10.484 10.677 10.857 11.01 11.154 11.27 11.346 11.358 11.246 10.877 9.974 8.734 7.605 6.593 5.73 4.972 4.304 3.686 3.164 2.641 2.165 1.74 1.352 0.98 0.63 0.307 -0.026 -0.321 -0.58 -0.844 -1.12 -1.355 -1.584 -1.821 -2.01 -2.201 -2.408 -2.629 -2.866 -3.024 -3.178 -3.42 -3.587 -3.765 -3.864 -4.079 -4.314 -4.566 -4.697 -4.987 -5.11 -5.257 -5.41 -5.754 -5.943 -6.133 -6.346 -6.621 -6.946 -7.337 -8.169 -5 ,351 ,TETRA ,17559506,Sat Nov 27 07:32:26 CET,Sat Nov 27 09:22:45 CET,0.0 2.191 2.771 3.191 3.534 3.811 4.029 4.222 4.589 4.765 4.928 5.063 5.343 5.473 5.712 5.942 6.151 6.248 6.426 6.605 6.875 7.027 7.159 7.361 7.549 7.722 7.877 8.03 8.232 8.417 8.593 8.78 8.952 9.129 9.321 9.524 9.706 9.892 10.088 10.272 10.441 10.624 10.818 10.967 11.108 11.225 11.27 11.256 11.089 10.644 9.712 8.42 7.296 6.253 5.354 4.582 3.908 3.287 2.734 2.201 1.756 1.351 0.958 0.575 0.21 -0.117 -0.464 -0.764 -1.013 -1.289 -1.569 -1.786 -2.025 -2.281 -2.477 -2.676 -2.878 -3.1 -3.342 -3.502 -3.661 -3.906 -4.082 -4.272 -4.37 -4.56 -4.767 -4.995 -5.117 -5.416 -5.548 -5.689 -5.84 -6.163 -6.336 -6.552 -6.828 -7.118 -7.421 -7.776 -8.992 -6 ,17321 ,TETRA ,17559507,Sat Nov 27 07:32:23 CET,Sat Nov 27 09:23:27 CET,0.0 1.891 2.419 2.829 3.184 3.485 3.763 4.005 4.413 4.592 4.749 4.889 5.166 5.286 5.51 5.73 5.934 6.02 6.182 6.346 6.584 6.722 6.85 7.042 7.23 7.412 7.58 7.721 7.902 8.088 8.259 8.459 8.641 8.802 8.976 9.172 9.343 9.502 9.668 9.855 10.046 10.244 10.451 10.634 10.793 10.924 11.025 10.99 10.811 10.419 9.483 8.208 7.088 6.089 5.223 4.473 3.808 3.207 2.69 2.165 1.702 1.285 0.894 0.525 0.187 -0.113 -0.431 -0.715 -0.964 -1.232 -1.509 -1.741 -1.981 -2.225 -2.428 -2.653 -2.891 -3.14 -3.388 -3.565 -3.758 -4.051 -4.247 -4.442 -4.549 -4.784 -5.03 -5.285 -5.414 -5.704 -5.832 -5.983 -6.142 -6.493 -6.69 -6.911 -7.162 -7.448 -7.769 -8.179 -9.226 -7 ,17721 ,TETRA ,17559508,Sat Nov 27 07:33:21 CET,Sat Nov 27 09:23:04 CET,0.0 1.945 2.532 2.947 3.302 3.591 3.828 4.042 4.432 4.603 4.764 4.929 5.213 5.333 5.56 5.772 5.979 6.085 6.289 6.479 6.737 6.889 7.031 7.215 7.387 7.568 7.739 7.882 8.058 8.246 8.439 8.654 8.839 8.997 9.185 9.385 9.559 9.741 9.941 10.15 10.341 10.537 10.728 10.895 11.056 11.175 11.255 11.239 11.069 10.637 9.706 8.382 7.194 6.188 5.304 4.531 3.871 3.243 2.709 2.203 1.75 1.344 0.972 0.619 0.266 -0.084 -0.465 -0.781 -1.032 -1.294 -1.559 -1.787 -2.025 -2.267 -2.459 -2.655 -2.859 -3.08 -3.308 -3.466 -3.622 -3.873 -4.069 -4.276 -4.378 -4.577 -4.772 -4.978 -5.085 -5.35 -5.441 -5.572 -5.703 -6.065 -6.303 -6.543 -6.781 -7.071 -7.42 -7.873 -9.31 -8 ,28090 ,TETRA ,17559509,Sat Nov 27 07:33:21 CET,Sat Nov 27 09:10:32 CET,0.0 2.334 2.977 3.422 3.73 4.022 4.28 4.504 4.924 5.115 5.29 5.461 5.749 5.882 6.137 6.366 6.583 6.686 6.884 7.069 7.329 7.482 7.616 7.82 8.035 8.242 8.434 8.605 8.821 9.028 9.215 9.427 9.619 9.805 10.011 10.239 10.453 10.666 10.877 11.075 11.279 11.501 11.72 11.913 12.081 12.227 12.336 12.337 12.191 11.806 10.958 9.701 8.542 7.523 6.661 5.892 5.202 4.581 4.023 3.428 2.927 2.494 2.097 1.72 1.35 1.025 0.689 0.379 0.111 -0.176 -0.473 -0.715 -0.969 -1.229 -1.429 -1.644 -1.862 -2.082 -2.317 -2.481 -2.647 -2.917 -3.108 -3.309 -3.416 -3.644 -3.89 -4.158 -4.289 -4.576 -4.684 -4.833 -4.997 -5.333 -5.515 -5.74 -5.997 -6.267 -6.592 -7.026 -8.219 -9 ,14280 ,TETRA ,17559510,Sat Nov 27 07:33:21 CET,Sat Nov 27 09:23:01 CET,0.0 1.703 2.284 2.7 3.0 3.228 3.458 3.673 4.053 4.213 4.359 4.514 4.803 4.938 5.167 5.369 5.54 5.624 5.817 6.009 6.271 6.423 6.561 6.753 6.935 7.112 7.287 7.445 7.646 7.842 8.018 8.235 8.439 8.628 8.828 9.042 9.227 9.414 9.608 9.78 9.948 10.146 10.372 10.555 10.709 10.831 10.884 10.856 10.727 10.354 9.463 8.206 7.116 6.143 5.277 4.53 3.867 3.244 2.737 2.229 1.767 1.355 0.965 0.593 0.237 -0.087 -0.425 -0.724 -0.977 -1.25 -1.535 -1.773 -2.02 -2.272 -2.462 -2.652 -2.856 -3.066 -3.286 -3.44 -3.601 -3.848 -4.01 -4.189 -4.286 -4.483 -4.711 -4.954 -5.083 -5.373 -5.49 -5.635 -5.787 -6.144 -6.349 -6.557 -6.822 -7.124 -7.441 -7.875 -9.043 -10 ,31023 ,TETRA ,17559511,Sat Nov 27 07:33:24 CET,Sat Nov 27 09:23:05 CET,0.0 2.325 2.858 3.269 3.627 3.944 4.201 4.434 4.852 5.046 5.218 5.366 5.646 5.773 5.988 6.189 6.377 6.468 6.641 6.809 7.067 7.221 7.361 7.56 7.731 7.887 8.047 8.201 8.398 8.582 8.747 8.942 9.129 9.302 9.486 9.686 9.887 10.077 10.279 10.494 10.685 10.874 11.043 11.203 11.384 11.504 11.548 11.511 11.35 10.929 9.937 8.651 7.517 6.525 5.65 4.829 4.126 3.494 2.943 2.395 1.926 1.517 1.126 0.758 0.412 0.108 -0.201 -0.482 -0.73 -0.997 -1.264 -1.481 -1.702 -1.953 -2.145 -2.335 -2.536 -2.755 -2.984 -3.139 -3.305 -3.555 -3.725 -3.915 -4.023 -4.254 -4.511 -4.776 -4.893 -5.173 -5.312 -5.473 -5.639 -5.99 -6.183 -6.399 -6.645 -6.933 -7.272 -7.827 -10.069 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_47.txt deleted file mode 100644 index 1b77ae13..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_27_47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27655 ,TETRA ,17559512,Sat Nov 27 07:33:21 CET,Sat Nov 27 09:21:50 CET,0.0 3.189 3.797 4.174 4.501 4.782 5.025 5.25 5.665 5.859 6.043 6.209 6.494 6.645 6.935 7.201 7.455 7.579 7.802 8.0 8.291 8.473 8.642 8.875 9.093 9.287 9.476 9.667 9.898 10.111 10.318 10.579 10.809 11.029 11.269 11.514 11.743 11.977 12.221 12.462 12.689 12.929 13.185 13.402 13.609 13.789 13.94 13.967 13.806 13.39 12.324 10.637 9.151 7.856 6.722 5.722 4.854 4.069 3.393 2.716 2.104 1.571 1.082 0.619 0.175 -0.227 -0.628 -0.981 -1.279 -1.584 -1.891 -2.15 -2.439 -2.725 -2.949 -3.187 -3.43 -3.691 -3.954 -4.132 -4.32 -4.619 -4.825 -5.037 -5.149 -5.379 -5.623 -5.877 -5.999 -6.295 -6.418 -6.574 -6.746 -7.122 -7.327 -7.555 -7.794 -8.049 -8.332 -8.722 -9.629 -2 ,28510 ,TETRA ,17559513,Sat Nov 27 07:33:24 CET,Sat Nov 27 09:21:49 CET,0.0 2.399 2.965 3.362 3.71 4.037 4.314 4.55 4.988 5.193 5.384 5.557 5.838 5.968 6.214 6.449 6.669 6.781 7.005 7.213 7.506 7.679 7.833 8.069 8.293 8.511 8.72 8.909 9.155 9.38 9.583 9.822 10.062 10.282 10.517 10.771 10.999 11.235 11.489 11.728 11.941 12.183 12.447 12.657 12.842 12.988 13.075 13.075 12.943 12.525 11.469 9.818 8.336 7.1 5.993 4.996 4.145 3.374 2.719 2.058 1.494 0.989 0.489 0.051 -0.349 -0.739 -1.134 -1.481 -1.786 -2.1 -2.44 -2.723 -3.008 -3.298 -3.526 -3.762 -4.009 -4.273 -4.539 -4.716 -4.896 -5.185 -5.383 -5.588 -5.697 -5.919 -6.154 -6.417 -6.556 -6.852 -6.947 -7.102 -7.284 -7.709 -7.941 -8.167 -8.406 -8.675 -8.979 -9.345 -10.273 -3 ,24383 ,TETRA ,17559514,Sat Nov 27 07:33:25 CET,Sat Nov 27 09:21:56 CET,0.0 1.775 2.318 2.733 3.052 3.356 3.638 3.878 4.279 4.438 4.589 4.754 5.069 5.235 5.526 5.755 5.966 6.072 6.278 6.477 6.733 6.898 7.066 7.284 7.475 7.657 7.836 8.006 8.23 8.451 8.659 8.88 9.068 9.258 9.47 9.678 9.867 10.069 10.297 10.535 10.765 10.999 11.248 11.485 11.697 11.882 12.033 12.048 11.837 11.322 10.279 8.809 7.474 6.247 5.134 4.108 3.241 2.488 1.817 1.144 0.551 0.038 -0.412 -0.85 -1.253 -1.607 -1.988 -2.336 -2.639 -2.948 -3.264 -3.534 -3.815 -4.105 -4.335 -4.582 -4.828 -5.072 -5.328 -5.504 -5.687 -6.012 -6.25 -6.48 -6.599 -6.852 -7.106 -7.369 -7.507 -7.822 -7.987 -8.153 -8.312 -8.656 -8.847 -9.065 -9.311 -9.594 -9.917 -10.384 -11.809 -4 ,14518 ,TETRA ,17559515,Sat Nov 27 07:33:22 CET,Sat Nov 27 09:22:08 CET,0.0 2.26 2.822 3.273 3.655 3.991 4.267 4.504 4.936 5.131 5.309 5.495 5.785 5.926 6.2 6.446 6.684 6.804 7.033 7.24 7.521 7.693 7.864 8.118 8.357 8.58 8.789 8.979 9.207 9.418 9.619 9.865 10.097 10.303 10.541 10.817 11.07 11.314 11.544 11.785 12.016 12.24 12.48 12.694 12.893 13.042 13.156 13.173 12.997 12.545 11.426 9.859 8.482 7.264 6.177 5.186 4.336 3.56 2.887 2.204 1.597 1.071 0.563 0.077 -0.35 -0.728 -1.138 -1.513 -1.823 -2.156 -2.528 -2.811 -3.09 -3.384 -3.612 -3.849 -4.101 -4.355 -4.62 -4.811 -5.008 -5.303 -5.501 -5.709 -5.81 -6.008 -6.216 -6.442 -6.573 -6.899 -7.07 -7.235 -7.406 -7.737 -7.922 -8.141 -8.38 -8.636 -8.932 -9.34 -10.567 -5 ,18605 ,TETRA ,17559516,Sat Nov 27 07:34:22 CET,Sat Nov 27 09:26:47 CET,0.0 2.69 3.298 3.74 4.102 4.399 4.645 4.879 5.307 5.5 5.69 5.903 6.208 6.358 6.634 6.883 7.123 7.237 7.44 7.625 7.891 8.06 8.227 8.479 8.724 8.952 9.174 9.388 9.635 9.87 10.087 10.333 10.561 10.765 10.99 11.238 11.458 11.682 11.903 12.106 12.322 12.566 12.834 13.089 13.322 13.483 13.606 13.637 13.478 13.012 11.851 10.258 8.854 7.594 6.468 5.465 4.614 3.817 3.106 2.418 1.849 1.351 0.875 0.429 0.015 -0.358 -0.732 -1.075 -1.368 -1.672 -2.002 -2.273 -2.558 -2.865 -3.098 -3.333 -3.583 -3.84 -4.112 -4.306 -4.504 -4.795 -4.985 -5.179 -5.285 -5.51 -5.755 -6.051 -6.207 -6.51 -6.646 -6.806 -6.961 -7.296 -7.49 -7.699 -7.921 -8.176 -8.477 -8.836 -10.192 -6 ,15905 ,TETRA ,17559517,Sat Nov 27 07:34:25 CET,Sat Nov 27 09:26:46 CET,0.0 2.597 3.276 3.668 3.984 4.29 4.554 4.802 5.248 5.449 5.628 5.814 6.12 6.236 6.454 6.668 6.891 7.002 7.195 7.382 7.631 7.773 7.913 8.129 8.347 8.537 8.69 8.854 9.064 9.25 9.426 9.632 9.84 10.044 10.265 10.482 10.693 10.907 11.112 11.337 11.554 11.775 12.008 12.229 12.439 12.586 12.691 12.748 12.675 12.283 11.147 9.543 8.157 6.91 5.812 4.819 3.933 3.139 2.456 1.749 1.15 0.646 0.142 -0.359 -0.821 -1.23 -1.641 -2.012 -2.337 -2.67 -3.015 -3.309 -3.62 -3.928 -4.167 -4.433 -4.721 -5.0 -5.297 -5.514 -5.724 -6.034 -6.237 -6.44 -6.554 -6.808 -7.082 -7.37 -7.511 -7.817 -7.956 -8.13 -8.31 -8.664 -8.881 -9.133 -9.376 -9.613 -9.855 -10.237 -11.451 -7 ,12377 ,TETRA ,17559518,Sat Nov 27 07:34:23 CET,Sat Nov 27 09:25:55 CET,0.0 2.148 2.783 3.215 3.571 3.868 4.137 4.362 4.744 4.927 5.094 5.244 5.513 5.625 5.842 6.056 6.257 6.354 6.545 6.716 6.945 7.093 7.235 7.462 7.691 7.906 8.112 8.302 8.511 8.71 8.925 9.174 9.396 9.599 9.823 10.076 10.313 10.567 10.819 11.031 11.233 11.45 11.683 11.901 12.115 12.293 12.409 12.441 12.301 11.819 10.66 9.037 7.594 6.301 5.159 4.188 3.323 2.498 1.808 1.125 0.552 0.05 -0.437 -0.896 -1.317 -1.704 -2.115 -2.483 -2.801 -3.132 -3.477 -3.756 -4.04 -4.331 -4.559 -4.798 -5.044 -5.303 -5.578 -5.771 -5.972 -6.282 -6.507 -6.745 -6.867 -7.109 -7.342 -7.597 -7.732 -8.038 -8.159 -8.32 -8.489 -8.824 -9.026 -9.268 -9.524 -9.788 -10.076 -10.475 -11.64 -8 ,32710 ,TETRA ,17559519,Sat Nov 27 07:35:21 CET,Sat Nov 27 09:24:14 CET,0.0 1.855 2.395 2.811 3.17 3.457 3.688 3.913 4.34 4.529 4.694 4.87 5.163 5.292 5.525 5.759 6.006 6.118 6.309 6.485 6.747 6.918 7.078 7.322 7.536 7.702 7.879 8.062 8.276 8.478 8.681 8.904 9.092 9.271 9.493 9.73 9.945 10.184 10.415 10.617 10.82 11.054 11.293 11.491 11.698 11.891 12.023 12.027 11.826 11.29 10.143 8.538 7.159 5.967 4.907 3.946 3.088 2.286 1.618 0.94 0.35 -0.151 -0.624 -1.083 -1.516 -1.904 -2.305 -2.669 -2.984 -3.297 -3.617 -3.898 -4.209 -4.531 -4.769 -5.012 -5.265 -5.524 -5.791 -5.98 -6.179 -6.467 -6.662 -6.88 -6.991 -7.217 -7.469 -7.741 -7.875 -8.174 -8.29 -8.438 -8.594 -8.944 -9.131 -9.331 -9.546 -9.802 -10.107 -10.49 -11.663 -9 ,13019 ,TETRA ,17559520,Sat Nov 27 07:35:21 CET,Sat Nov 27 09:26:08 CET,0.0 2.032 2.565 2.989 3.306 3.596 3.843 4.055 4.454 4.638 4.812 4.993 5.291 5.422 5.663 5.897 6.11 6.212 6.422 6.619 6.867 7.038 7.21 7.414 7.603 7.795 7.977 8.156 8.383 8.582 8.758 8.991 9.215 9.412 9.624 9.852 10.07 10.284 10.482 10.683 10.874 11.083 11.31 11.478 11.627 11.77 11.899 11.909 11.745 11.234 10.111 8.463 7.031 5.767 4.644 3.642 2.747 1.972 1.299 0.626 0.049 -0.469 -0.946 -1.421 -1.886 -2.267 -2.648 -3.008 -3.309 -3.62 -3.958 -4.234 -4.523 -4.827 -5.05 -5.269 -5.507 -5.758 -6.016 -6.194 -6.39 -6.712 -6.927 -7.14 -7.246 -7.457 -7.699 -7.976 -8.113 -8.421 -8.567 -8.725 -8.9 -9.287 -9.478 -9.691 -9.936 -10.19 -10.488 -10.909 -11.932 -10 ,24429 ,TETRA ,17559521,Sat Nov 27 07:35:21 CET,Sat Nov 27 09:24:03 CET,0.0 1.927 2.431 2.813 3.175 3.493 3.758 3.981 4.383 4.568 4.724 4.864 5.145 5.272 5.513 5.755 5.991 6.106 6.323 6.517 6.771 6.933 7.095 7.327 7.543 7.734 7.918 8.115 8.359 8.574 8.786 9.049 9.296 9.524 9.774 10.039 10.285 10.532 10.777 11.016 11.251 11.505 11.76 11.998 12.226 12.404 12.5 12.462 12.268 11.793 10.744 9.135 7.736 6.505 5.406 4.424 3.55 2.75 2.053 1.362 0.786 0.295 -0.157 -0.589 -0.985 -1.353 -1.748 -2.079 -2.373 -2.684 -2.999 -3.271 -3.545 -3.818 -4.021 -4.226 -4.452 -4.696 -4.962 -5.152 -5.355 -5.66 -5.864 -6.077 -6.191 -6.432 -6.674 -6.922 -7.043 -7.336 -7.476 -7.628 -7.782 -8.127 -8.326 -8.585 -8.896 -9.22 -9.623 -10.255 -11.516 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_29.txt deleted file mode 100644 index 9431b8da..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23033 ,TETRA ,17559522,Sat Nov 27 07:37:21 CET,Sat Nov 27 09:18:14 CET,0.0 3.291 4.193 4.691 5.071 5.414 5.74 6.026 6.504 6.692 6.85 7.008 7.303 7.457 7.768 8.042 8.299 8.422 8.658 8.876 9.19 9.384 9.572 9.851 10.107 10.351 10.594 10.809 11.058 11.306 11.549 11.818 12.062 12.312 12.597 12.924 13.232 13.532 13.85 14.185 14.522 14.89 15.314 15.748 16.19 16.599 17.001 17.318 17.585 17.714 17.475 16.791 15.863 14.853 13.955 13.147 12.42 11.753 11.152 10.541 10.008 9.532 9.066 8.605 8.191 7.834 7.46 7.105 6.79 6.48 6.175 5.922 5.645 5.348 5.132 4.902 4.647 4.391 4.095 3.879 3.673 3.376 3.16 2.91 2.781 2.527 2.246 1.935 1.775 1.456 1.258 1.071 0.877 0.432 0.165 -0.11 -0.412 -0.775 -1.219 -1.734 -5.356 -2 ,12578 ,TETRA ,17559523,Sat Nov 27 07:37:21 CET,Sat Nov 27 09:28:07 CET,0.0 5.987 6.64 7.146 7.512 7.809 8.058 8.297 8.8 9.024 9.209 9.396 9.698 9.86 10.174 10.443 10.698 10.825 11.063 11.284 11.586 11.792 12.001 12.269 12.511 12.781 13.043 13.264 13.543 13.802 14.051 14.376 14.675 14.93 15.22 15.516 15.793 16.107 16.45 16.799 17.134 17.5 17.875 18.222 18.581 18.935 19.29 19.6 19.836 19.902 19.675 18.885 17.922 16.972 16.092 15.255 14.528 13.884 13.288 12.669 12.112 11.627 11.186 10.746 10.338 9.978 9.585 9.233 8.938 8.626 8.289 8.001 7.687 7.345 7.079 6.822 6.561 6.287 6.003 5.794 5.574 5.234 4.992 4.747 4.629 4.372 4.086 3.788 3.641 3.345 3.207 3.062 2.905 2.539 2.334 2.135 1.925 1.672 1.331 0.719 -3.019 -3 ,27481 ,TETRA ,17559524,Sat Nov 27 07:37:21 CET,Sat Nov 27 09:28:13 CET,0.0 3.188 3.844 4.399 4.846 5.191 5.497 5.768 6.214 6.413 6.608 6.806 7.102 7.251 7.528 7.788 8.044 8.175 8.418 8.636 8.949 9.147 9.344 9.632 9.883 10.101 10.315 10.524 10.815 11.097 11.35 11.654 11.936 12.195 12.51 12.869 13.183 13.503 13.827 14.154 14.489 14.834 15.182 15.499 15.849 16.218 16.629 17.021 17.363 17.532 17.2 16.327 15.489 14.666 13.798 12.942 12.197 11.522 10.926 10.324 9.792 9.32 8.883 8.476 8.105 7.746 7.344 6.985 6.677 6.372 6.083 5.839 5.578 5.308 5.104 4.897 4.661 4.412 4.156 3.963 3.765 3.466 3.258 3.036 2.927 2.723 2.506 2.271 2.141 1.842 1.711 1.562 1.397 1.036 0.829 0.596 0.34 0.043 -0.285 -0.665 -2.898 -4 ,23768 ,TETRA ,17559525,Sat Nov 27 07:37:24 CET,Sat Nov 27 09:28:15 CET,0.0 2.127 2.754 3.174 3.549 3.895 4.178 4.449 4.956 5.172 5.374 5.614 5.939 6.102 6.394 6.679 6.946 7.067 7.303 7.522 7.825 8.027 8.234 8.518 8.773 9.029 9.265 9.475 9.755 10.026 10.278 10.581 10.865 11.118 11.394 11.718 12.01 12.299 12.629 12.984 13.348 13.735 14.136 14.531 14.973 15.398 15.806 16.191 16.491 16.568 16.23 15.334 14.461 13.611 12.714 11.881 11.179 10.545 9.976 9.425 8.912 8.422 7.956 7.518 7.11 6.732 6.335 5.972 5.659 5.328 4.99 4.707 4.419 4.127 3.9 3.672 3.439 3.176 2.895 2.708 2.499 2.179 1.95 1.704 1.593 1.374 1.144 0.889 0.75 0.453 0.329 0.179 -0.003 -0.435 -0.676 -0.923 -1.186 -1.479 -1.819 -2.248 -4.359 -5 ,17822 ,TETRA ,17559526,Sat Nov 27 07:39:23 CET,Sat Nov 27 09:34:25 CET,0.0 2.682 3.304 3.837 4.222 4.527 4.808 5.057 5.513 5.73 5.935 6.119 6.414 6.566 6.854 7.134 7.397 7.531 7.789 8.01 8.326 8.525 8.716 8.992 9.248 9.491 9.716 9.937 10.221 10.482 10.715 10.998 11.282 11.535 11.81 12.129 12.463 12.826 13.183 13.555 13.924 14.293 14.689 15.067 15.44 15.78 16.125 16.41 16.625 16.704 16.201 15.103 14.033 13.087 12.227 11.432 10.742 10.117 9.57 8.982 8.454 7.98 7.54 7.116 6.702 6.328 5.945 5.6 5.297 4.972 4.629 4.359 4.063 3.747 3.508 3.264 3.011 2.741 2.46 2.266 2.076 1.753 1.529 1.322 1.214 0.989 0.762 0.525 0.389 0.088 -0.085 -0.277 -0.448 -0.746 -0.93 -1.14 -1.373 -1.651 -1.974 -2.395 -4.542 -6 ,17034 ,TETRA ,17559527,Sat Nov 27 07:39:23 CET,Sat Nov 27 09:26:11 CET,0.0 2.886 3.502 3.97 4.336 4.641 4.916 5.162 5.625 5.83 6.019 6.199 6.509 6.671 6.958 7.236 7.501 7.62 7.854 8.078 8.4 8.595 8.774 9.054 9.325 9.573 9.826 10.071 10.364 10.632 10.891 11.188 11.456 11.723 12.036 12.35 12.633 12.938 13.233 13.525 13.852 14.202 14.536 14.846 15.184 15.506 15.809 16.123 16.326 16.225 15.708 14.73 13.655 12.633 11.734 10.906 10.234 9.647 9.105 8.56 8.111 7.716 7.328 6.922 6.527 6.163 5.767 5.427 5.133 4.819 4.494 4.239 3.966 3.665 3.42 3.162 2.893 2.617 2.334 2.129 1.919 1.559 1.308 1.083 0.974 0.743 0.493 0.216 0.057 -0.257 -0.419 -0.589 -0.771 -1.17 -1.415 -1.666 -1.914 -2.172 -2.449 -2.859 -4.548 -7 ,11327 ,TETRA ,17559528,Sat Nov 27 07:39:22 CET,Sat Nov 27 09:24:13 CET,0.0 8.541 9.458 9.93 10.312 10.647 10.96 11.246 11.717 11.911 12.094 12.317 12.635 12.796 13.093 13.379 13.64 13.765 14.027 14.289 14.61 14.786 14.959 15.231 15.492 15.72 15.953 16.188 16.484 16.762 17.02 17.318 17.596 17.856 18.15 18.472 18.769 19.078 19.411 19.767 20.106 20.493 20.933 21.282 21.647 22.05 22.422 22.787 23.145 23.308 22.985 22.063 21.088 20.139 19.26 18.407 17.634 16.987 16.403 15.785 15.256 14.778 14.313 13.878 13.465 13.086 12.716 12.384 12.088 11.785 11.462 11.192 10.927 10.642 10.423 10.194 9.939 9.648 9.349 9.17 8.996 8.721 8.525 8.327 8.226 8.007 7.767 7.505 7.368 7.079 6.944 6.766 6.576 6.152 5.93 5.706 5.465 5.206 4.893 4.446 2.363 -8 ,12259 ,TETRA ,17559529,Sat Nov 27 07:41:19 CET,Sat Nov 27 09:30:19 CET,0.0 2.387 2.883 3.323 3.72 4.025 4.295 4.549 4.998 5.195 5.38 5.575 5.875 6.038 6.35 6.625 6.884 6.998 7.225 7.446 7.745 7.932 8.112 8.375 8.617 8.853 9.081 9.292 9.575 9.851 10.116 10.426 10.715 10.977 11.27 11.619 11.941 12.255 12.603 12.989 13.398 13.86 14.373 14.825 15.252 15.669 16.106 16.494 16.834 17.08 16.871 16.087 15.299 14.529 13.799 13.127 12.541 11.967 11.429 10.865 10.344 9.872 9.421 8.985 8.579 8.202 7.807 7.46 7.151 6.814 6.467 6.195 5.922 5.621 5.365 5.102 4.851 4.596 4.329 4.152 3.959 3.642 3.419 3.183 3.065 2.827 2.584 2.313 2.161 1.843 1.647 1.467 1.279 0.815 0.509 0.199 -0.114 -0.51 -1.007 -1.64 -4.131 -9 ,4533 ,TETRA ,17559530,Sat Nov 27 07:40:24 CET,Sat Nov 27 09:29:24 CET,0.0 3.021 3.808 4.385 4.765 5.064 5.335 5.576 5.98 6.18 6.382 6.605 6.936 7.114 7.419 7.695 7.969 8.097 8.321 8.533 8.847 9.037 9.212 9.49 9.768 10.025 10.264 10.488 10.778 11.049 11.301 11.623 11.935 12.211 12.509 12.836 13.112 13.389 13.702 14.052 14.402 14.735 15.078 15.407 15.77 16.153 16.532 16.867 17.163 17.299 16.968 16.049 15.134 14.296 13.488 12.705 11.977 11.272 10.67 10.047 9.517 9.079 8.624 8.171 7.771 7.394 6.98 6.605 6.291 5.963 5.604 5.319 5.022 4.7 4.449 4.193 3.918 3.633 3.344 3.143 2.938 2.581 2.329 2.098 1.986 1.737 1.468 1.19 1.037 0.732 0.592 0.435 0.274 -0.057 -0.236 -0.443 -0.661 -0.903 -1.231 -1.655 -3.012 -10 ,25857 ,TETRA ,17559531,Sat Nov 27 07:40:21 CET,Sat Nov 27 09:29:14 CET,0.0 2.318 2.836 3.234 3.57 3.891 4.178 4.404 4.809 4.998 5.188 5.407 5.713 5.857 6.125 6.376 6.619 6.742 6.984 7.205 7.517 7.71 7.888 8.152 8.407 8.648 8.857 9.066 9.355 9.64 9.914 10.223 10.52 10.795 11.105 11.449 11.777 12.137 12.506 12.868 13.218 13.601 14.013 14.395 14.834 15.276 15.686 16.055 16.379 16.48 15.999 15.106 14.336 13.469 12.586 11.752 10.938 10.165 9.478 8.786 8.209 7.728 7.283 6.854 6.451 6.068 5.652 5.284 4.97 4.631 4.279 3.997 3.722 3.447 3.211 2.964 2.722 2.471 2.206 2.016 1.83 1.547 1.344 1.128 1.015 0.783 0.528 0.27 0.152 -0.15 -0.34 -0.519 -0.726 -1.145 -1.338 -1.558 -1.811 -2.083 -2.447 -2.927 -4.838 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_42.txt deleted file mode 100644 index c36bec4d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23351 ,TETRA ,17559532,Sat Nov 27 07:40:21 CET,Sat Nov 27 09:20:47 CET,0.0 1.549 2.032 2.358 2.645 2.905 3.121 3.308 3.647 3.81 3.981 4.162 4.451 4.58 4.817 5.061 5.289 5.396 5.601 5.791 6.091 6.273 6.442 6.696 6.932 7.152 7.364 7.578 7.837 8.062 8.28 8.562 8.835 9.083 9.366 9.676 9.979 10.304 10.656 11.041 11.422 11.843 12.338 12.821 13.357 13.946 14.603 15.257 15.957 16.68 17.32 17.601 17.511 17.238 16.923 16.588 16.24 15.895 15.567 15.224 14.914 14.634 14.353 14.086 13.831 13.582 13.313 13.066 12.865 12.666 12.44 12.249 12.051 11.832 11.656 11.474 11.29 11.097 10.912 10.786 10.654 10.458 10.318 10.169 10.091 9.918 9.739 9.558 9.463 9.224 9.156 9.045 8.918 8.641 8.509 8.381 8.223 8.048 7.868 7.654 7.138 -2 ,23458 ,TETRA ,17559533,Sat Nov 27 07:41:19 CET,Sat Nov 27 09:33:56 CET,0.0 1.617 2.061 2.392 2.683 2.934 3.135 3.295 3.621 3.781 3.933 4.081 4.372 4.515 4.775 5.024 5.255 5.365 5.572 5.761 6.037 6.217 6.387 6.628 6.856 7.089 7.318 7.525 7.781 8.03 8.275 8.555 8.82 9.086 9.391 9.729 10.033 10.355 10.71 11.092 11.497 11.934 12.408 12.864 13.375 13.953 14.594 15.266 15.979 16.761 17.505 17.79 17.722 17.436 17.085 16.715 16.353 16.047 15.802 15.541 15.301 15.069 14.816 14.561 14.301 14.057 13.827 13.634 13.471 13.289 13.086 12.923 12.766 12.602 12.466 12.317 12.168 12.027 11.863 11.74 11.62 11.436 11.31 11.18 11.114 10.971 10.813 10.652 10.572 10.351 10.306 10.212 10.119 9.899 9.772 9.64 9.494 9.331 9.162 8.961 8.395 -3 ,19328 ,TETRA ,17559534,Sat Nov 27 07:41:19 CET,Sat Nov 27 09:30:43 CET,0.0 1.226 1.755 2.133 2.438 2.703 2.938 3.157 3.549 3.712 3.867 4.014 4.29 4.42 4.68 4.931 5.154 5.259 5.474 5.67 5.938 6.118 6.299 6.561 6.793 7.015 7.232 7.437 7.693 7.927 8.155 8.429 8.691 8.942 9.228 9.55 9.861 10.199 10.553 10.925 11.313 11.746 12.223 12.683 13.211 13.809 14.49 15.181 15.928 16.681 17.317 17.526 17.413 17.178 16.875 16.51 16.154 15.804 15.463 15.109 14.815 14.546 14.27 13.981 13.704 13.462 13.208 12.982 12.774 12.553 12.333 12.147 11.948 11.724 11.539 11.364 11.196 11.024 10.849 10.725 10.595 10.391 10.258 10.121 10.042 9.867 9.677 9.488 9.4 9.168 9.11 9.006 8.901 8.677 8.541 8.393 8.22 8.027 7.829 7.632 7.251 -4 ,20859 ,TETRA ,17559535,Sat Nov 27 07:41:23 CET,Sat Nov 27 09:30:43 CET,0.0 1.24 1.744 2.067 2.363 2.609 2.838 3.041 3.382 3.554 3.722 3.865 4.131 4.255 4.478 4.675 4.88 4.973 5.158 5.342 5.597 5.764 5.923 6.141 6.357 6.568 6.777 6.983 7.232 7.461 7.678 7.951 8.207 8.45 8.734 9.058 9.36 9.678 10.024 10.381 10.744 11.126 11.58 12.037 12.528 13.093 13.708 14.359 15.048 15.74 16.392 16.659 16.61 16.416 16.158 15.883 15.61 15.332 15.074 14.78 14.523 14.289 14.035 13.793 13.561 13.317 13.045 12.815 12.626 12.425 12.221 12.071 11.883 11.661 11.516 11.369 11.216 11.063 10.89 10.765 10.635 10.431 10.295 10.154 10.082 9.943 9.781 9.615 9.54 9.311 9.251 9.148 9.042 8.824 8.711 8.582 8.448 8.293 8.093 7.858 7.381 -5 ,26298 ,TETRA ,17559536,Sat Nov 27 07:42:22 CET,Sat Nov 27 09:22:27 CET,0.0 1.907 2.454 2.877 3.237 3.521 3.735 3.922 4.288 4.458 4.608 4.73 4.998 5.122 5.36 5.583 5.79 5.89 6.08 6.261 6.532 6.701 6.855 7.083 7.296 7.493 7.669 7.847 8.081 8.303 8.523 8.783 9.042 9.293 9.567 9.857 10.133 10.421 10.738 11.094 11.451 11.855 12.345 12.845 13.39 13.953 14.569 15.212 15.922 16.672 17.354 17.578 17.38 17.069 16.777 16.412 16.057 15.734 15.434 15.111 14.807 14.523 14.255 13.968 13.687 13.449 13.197 12.972 12.77 12.554 12.328 12.142 11.95 11.741 11.571 11.403 11.239 11.062 10.881 10.76 10.632 10.435 10.3 10.151 10.073 9.921 9.758 9.578 9.485 9.253 9.205 9.107 9.002 8.755 8.62 8.485 8.339 8.17 7.963 7.747 7.33 -6 ,31015 ,TETRA ,17559537,Sat Nov 27 07:42:22 CET,Sat Nov 27 09:31:42 CET,0.0 1.492 1.992 2.353 2.658 2.925 3.157 3.372 3.727 3.88 4.034 4.171 4.448 4.584 4.86 5.107 5.314 5.411 5.611 5.799 6.061 6.225 6.379 6.608 6.828 7.026 7.218 7.418 7.684 7.964 8.242 8.546 8.836 9.114 9.414 9.745 10.058 10.384 10.724 11.081 11.444 11.838 12.288 12.749 13.297 13.894 14.528 15.201 15.94 16.665 17.246 17.418 17.334 17.176 16.952 16.632 16.299 15.958 15.65 15.354 15.079 14.795 14.491 14.21 13.945 13.698 13.449 13.229 13.024 12.793 12.542 12.326 12.115 11.9 11.74 11.571 11.385 11.188 10.97 10.828 10.691 10.484 10.348 10.206 10.133 9.985 9.821 9.644 9.548 9.307 9.239 9.128 9.014 8.769 8.637 8.5 8.344 8.159 7.939 7.691 7.306 -7 ,26497 ,TETRA ,17559538,Sat Nov 27 07:42:24 CET,Sat Nov 27 09:31:53 CET,0.0 1.379 1.893 2.282 2.581 2.829 3.062 3.277 3.639 3.817 3.986 4.145 4.43 4.564 4.819 5.061 5.295 5.402 5.608 5.804 6.084 6.26 6.429 6.682 6.915 7.134 7.349 7.551 7.817 8.086 8.345 8.634 8.893 9.155 9.452 9.763 10.063 10.402 10.761 11.128 11.489 11.898 12.387 12.868 13.393 13.98 14.651 15.357 16.106 16.806 17.432 17.633 17.525 17.256 16.938 16.601 16.242 15.88 15.573 15.267 14.998 14.743 14.463 14.185 13.934 13.69 13.387 13.119 12.897 12.657 12.416 12.231 12.038 11.818 11.645 11.473 11.302 11.13 10.94 10.813 10.688 10.484 10.347 10.215 10.141 9.971 9.787 9.6 9.501 9.259 9.181 9.062 8.936 8.686 8.555 8.412 8.256 8.087 7.899 7.669 7.196 -8 ,17457 ,TETRA ,17559539,Sat Nov 27 07:42:22 CET,Sat Nov 27 09:31:40 CET,0.0 1.152 1.612 1.949 2.262 2.553 2.8 3.053 3.472 3.628 3.768 3.896 4.163 4.286 4.521 4.719 4.914 5.004 5.172 5.342 5.583 5.743 5.901 6.131 6.357 6.567 6.767 6.971 7.246 7.498 7.732 8.012 8.29 8.571 8.87 9.182 9.484 9.824 10.191 10.57 10.974 11.422 11.915 12.388 12.926 13.506 14.132 14.794 15.552 16.388 17.138 17.406 17.274 16.925 16.568 16.24 15.947 15.665 15.392 15.117 14.874 14.624 14.388 14.152 13.912 13.715 13.493 13.249 13.043 12.859 12.679 12.527 12.363 12.176 12.034 11.9 11.767 11.629 11.484 11.385 11.281 11.123 11.014 10.894 10.821 10.655 10.497 10.344 10.261 10.036 10.011 9.926 9.833 9.621 9.513 9.399 9.269 9.121 8.947 8.752 8.334 -9 ,2239 ,TETRA ,17559540,Sat Nov 27 07:42:22 CET,Sat Nov 27 09:33:21 CET,0.0 1.412 1.886 2.242 2.546 2.808 3.031 3.23 3.62 3.8 3.963 4.142 4.438 4.568 4.793 5.011 5.24 5.352 5.568 5.769 6.045 6.223 6.395 6.633 6.86 7.077 7.289 7.498 7.762 8.015 8.265 8.563 8.839 9.105 9.399 9.721 10.029 10.358 10.706 11.074 11.464 11.905 12.415 12.903 13.477 14.109 14.75 15.389 16.094 16.83 17.456 17.651 17.55 17.293 16.957 16.598 16.278 15.985 15.693 15.361 15.055 14.761 14.461 14.19 13.945 13.713 13.463 13.24 13.043 12.83 12.609 12.43 12.238 12.035 11.875 11.706 11.531 11.338 11.147 11.027 10.896 10.691 10.551 10.399 10.324 10.18 10.021 9.837 9.739 9.501 9.451 9.346 9.231 8.977 8.844 8.72 8.585 8.426 8.238 8.028 7.595 -10 ,7014 ,TETRA ,17559541,Sat Nov 27 07:42:22 CET,Sat Nov 27 09:33:44 CET,0.0 1.44 1.858 2.172 2.491 2.768 2.993 3.208 3.592 3.748 3.883 3.998 4.272 4.396 4.644 4.893 5.125 5.23 5.427 5.629 5.912 6.089 6.265 6.506 6.735 6.963 7.177 7.386 7.654 7.903 8.147 8.447 8.748 9.033 9.32 9.639 9.953 10.282 10.631 11.0 11.391 11.813 12.292 12.767 13.314 13.905 14.537 15.233 15.992 16.833 17.637 17.858 17.684 17.365 16.995 16.638 16.302 15.958 15.646 15.322 15.028 14.747 14.468 14.207 13.957 13.71 13.439 13.195 12.993 12.775 12.53 12.321 12.122 11.912 11.728 11.54 11.349 11.157 10.967 10.845 10.728 10.537 10.4 10.254 10.176 10.003 9.826 9.65 9.56 9.325 9.28 9.168 9.048 8.837 8.742 8.642 8.521 8.379 8.212 7.988 7.453 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_44.txt deleted file mode 100644 index 5c1fa3c7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24051 ,TETRA ,17559542,Sat Nov 27 07:43:23 CET,Sat Nov 27 09:31:48 CET,0.0 2.171 2.762 3.207 3.57 3.878 4.144 4.366 4.732 4.909 5.091 5.286 5.591 5.749 6.057 6.33 6.582 6.714 6.969 7.183 7.48 7.663 7.844 8.107 8.352 8.603 8.844 9.062 9.343 9.613 9.862 10.151 10.451 10.76 11.104 11.476 11.841 12.239 12.646 13.075 13.531 14.005 14.546 15.083 15.681 16.347 17.062 17.797 18.584 19.404 20.156 20.423 20.3 20.05 19.743 19.389 19.037 18.693 18.37 18.006 17.661 17.352 17.063 16.778 16.506 16.27 16.022 15.789 15.576 15.349 15.127 14.944 14.744 14.539 14.383 14.226 14.065 13.887 13.693 13.565 13.429 13.188 13.03 12.883 12.801 12.636 12.449 12.249 12.155 11.906 11.811 11.691 11.57 11.307 11.165 11.002 10.826 10.665 10.473 10.232 9.077 -2 ,7799 ,TETRA ,17559543,Sat Nov 27 07:43:23 CET,Sat Nov 27 09:31:59 CET,0.0 2.158 2.882 3.312 3.668 4.01 4.31 4.575 5.006 5.191 5.366 5.555 5.849 5.998 6.267 6.493 6.728 6.848 7.085 7.313 7.629 7.843 8.052 8.343 8.618 8.869 9.104 9.329 9.613 9.899 10.164 10.463 10.759 11.049 11.387 11.763 12.109 12.475 12.894 13.342 13.782 14.264 14.822 15.37 15.988 16.643 17.356 18.131 18.98 19.796 20.503 20.806 20.675 20.363 20.021 19.651 19.281 18.944 18.604 18.232 17.91 17.589 17.278 16.997 16.734 16.475 16.192 15.952 15.738 15.505 15.264 15.059 14.844 14.626 14.461 14.289 14.107 13.926 13.743 13.616 13.481 13.25 13.093 12.924 12.833 12.657 12.466 12.274 12.176 11.93 11.857 11.749 11.625 11.327 11.161 10.985 10.794 10.584 10.329 10.052 9.469 -3 ,18670 ,TETRA ,17559544,Sat Nov 27 07:43:23 CET,Sat Nov 27 09:32:04 CET,0.0 2.141 2.781 3.188 3.531 3.841 4.12 4.378 4.829 5.028 5.218 5.416 5.728 5.892 6.178 6.415 6.644 6.759 6.987 7.213 7.517 7.701 7.869 8.121 8.384 8.651 8.899 9.13 9.427 9.711 9.973 10.275 10.575 10.872 11.21 11.58 11.932 12.322 12.729 13.144 13.571 14.037 14.56 15.081 15.685 16.374 17.14 17.876 18.675 19.522 20.29 20.609 20.521 20.261 19.943 19.571 19.227 18.888 18.538 18.153 17.818 17.5 17.175 16.876 16.599 16.355 16.088 15.805 15.569 15.354 15.13 14.935 14.739 14.542 14.386 14.223 14.046 13.859 13.659 13.514 13.369 13.168 13.032 12.875 12.796 12.634 12.446 12.242 12.134 11.881 11.798 11.685 11.568 11.289 11.145 11.012 10.854 10.639 10.417 10.172 9.313 -4 ,23315 ,TETRA ,17559545,Sat Nov 27 07:43:23 CET,Sat Nov 27 09:37:05 CET,0.0 2.337 2.947 3.376 3.724 4.02 4.285 4.549 5.012 5.2 5.374 5.562 5.866 6.019 6.312 6.6 6.858 6.972 7.205 7.426 7.724 7.916 8.11 8.368 8.618 8.877 9.129 9.367 9.667 9.948 10.212 10.538 10.85 11.154 11.498 11.884 12.248 12.624 13.018 13.444 13.907 14.41 14.946 15.471 16.088 16.788 17.534 18.295 19.118 19.954 20.774 21.014 20.867 20.62 20.324 19.976 19.613 19.254 18.925 18.569 18.239 17.945 17.654 17.355 17.068 16.803 16.535 16.301 16.1 15.881 15.646 15.458 15.257 15.014 14.816 14.619 14.414 14.213 14.016 13.872 13.728 13.504 13.35 13.201 13.122 12.95 12.768 12.576 12.473 12.222 12.098 11.952 11.814 11.532 11.38 11.217 11.037 10.846 10.631 10.357 9.683 -5 ,31790 ,TETRA ,17559546,Sat Nov 27 07:43:23 CET,Sat Nov 27 09:32:40 CET,0.0 1.662 2.169 2.575 2.924 3.249 3.536 3.788 4.242 4.448 4.646 4.858 5.163 5.321 5.619 5.9 6.149 6.267 6.512 6.746 7.046 7.255 7.468 7.76 8.039 8.293 8.522 8.753 9.056 9.338 9.624 9.968 10.269 10.556 10.897 11.256 11.587 11.973 12.391 12.816 13.246 13.72 14.291 14.835 15.435 16.087 16.819 17.608 18.432 19.242 19.901 20.128 20.0 19.769 19.462 19.126 18.83 18.555 18.286 17.991 17.723 17.471 17.218 16.96 16.699 16.455 16.21 15.994 15.778 15.535 15.307 15.13 14.949 14.758 14.612 14.461 14.295 14.124 13.951 13.828 13.704 13.501 13.36 13.208 13.122 12.95 12.769 12.581 12.489 12.24 12.162 12.06 11.958 11.746 11.639 11.518 11.365 11.193 11.007 10.755 9.908 -6 ,21431 ,TETRA ,17559547,Sat Nov 27 07:43:23 CET,Sat Nov 27 09:32:58 CET,0.0 1.792 2.288 2.636 2.941 3.264 3.53 3.737 4.143 4.328 4.494 4.652 4.947 5.106 5.404 5.65 5.88 5.987 6.189 6.392 6.698 6.895 7.085 7.366 7.615 7.846 8.055 8.26 8.555 8.836 9.101 9.403 9.675 9.946 10.27 10.633 10.971 11.318 11.691 12.091 12.506 12.961 13.486 14.026 14.626 15.262 16.002 16.783 17.644 18.521 19.259 19.546 19.446 19.174 18.832 18.465 18.12 17.774 17.441 17.072 16.733 16.427 16.127 15.839 15.578 15.32 15.012 14.736 14.504 14.254 13.994 13.787 13.562 13.323 13.144 12.964 12.771 12.556 12.342 12.194 12.026 11.761 11.574 11.384 11.296 11.123 10.934 10.733 10.631 10.382 10.284 10.169 10.048 9.797 9.668 9.519 9.351 9.16 8.925 8.641 7.925 -7 ,27314 ,TETRA ,17559548,Sat Nov 27 07:43:23 CET,Sat Nov 27 09:32:34 CET,0.0 2.217 2.825 3.241 3.549 3.81 4.073 4.336 4.784 4.991 5.179 5.376 5.688 5.857 6.152 6.409 6.658 6.787 7.042 7.278 7.607 7.809 7.993 8.265 8.537 8.781 9.012 9.249 9.562 9.884 10.198 10.571 10.921 11.226 11.547 11.907 12.263 12.644 13.031 13.439 13.874 14.354 14.924 15.503 16.149 16.812 17.569 18.405 19.245 20.095 20.929 21.223 21.059 20.789 20.483 20.106 19.727 19.356 19.007 18.628 18.29 18.001 17.715 17.414 17.122 16.88 16.628 16.371 16.14 15.919 15.682 15.466 15.248 15.02 14.838 14.646 14.451 14.261 14.063 13.93 13.801 13.594 13.438 13.276 13.194 13.033 12.861 12.663 12.56 12.323 12.26 12.139 12.015 11.756 11.608 11.451 11.268 11.074 10.853 10.516 9.818 -8 ,1554 ,TETRA ,17559549,Sat Nov 27 07:44:22 CET,Sat Nov 27 09:33:41 CET,0.0 1.363 1.828 2.297 2.704 3.024 3.288 3.512 3.929 4.117 4.293 4.491 4.793 4.946 5.249 5.527 5.774 5.886 6.107 6.333 6.657 6.854 7.047 7.336 7.614 7.87 8.11 8.344 8.64 8.919 9.19 9.497 9.794 10.099 10.441 10.796 11.117 11.47 11.845 12.221 12.627 13.084 13.622 14.189 14.831 15.479 16.155 16.923 17.782 18.63 19.367 19.565 19.458 19.218 18.896 18.554 18.184 17.805 17.472 17.112 16.769 16.447 16.152 15.87 15.593 15.332 15.028 14.751 14.53 14.299 14.055 13.853 13.642 13.416 13.235 13.046 12.854 12.656 12.441 12.296 12.139 11.885 11.706 11.522 11.428 11.235 11.037 10.815 10.69 10.426 10.323 10.197 10.067 9.797 9.639 9.467 9.293 9.094 8.864 8.597 7.842 -9 ,22414 ,TETRA ,17559550,Sat Nov 27 07:44:22 CET,Sat Nov 27 09:29:35 CET,0.0 2.022 2.592 3.026 3.352 3.636 3.897 4.166 4.66 4.865 5.065 5.293 5.61 5.769 6.048 6.301 6.538 6.65 6.847 7.043 7.37 7.566 7.733 7.99 8.275 8.576 8.878 9.132 9.406 9.691 9.968 10.282 10.58 10.861 11.184 11.548 11.877 12.233 12.645 13.066 13.471 13.91 14.425 14.956 15.613 16.33 17.023 17.728 18.54 19.421 20.263 20.578 20.524 20.312 20.046 19.72 19.357 19.023 18.711 18.374 18.059 17.74 17.432 17.146 16.872 16.618 16.353 16.102 15.867 15.61 15.368 15.186 14.993 14.788 14.627 14.457 14.277 14.099 13.896 13.759 13.629 13.422 13.271 13.086 12.992 12.82 12.636 12.438 12.339 12.096 12.0 11.868 11.737 11.449 11.285 11.124 10.947 10.759 10.562 10.299 9.75 -10 ,25032 ,TETRA ,17559551,Sat Nov 27 07:44:22 CET,Sat Nov 27 09:34:17 CET,0.0 3.072 3.768 4.205 4.56 4.884 5.174 5.443 5.913 6.103 6.275 6.469 6.775 6.931 7.236 7.52 7.782 7.91 8.157 8.379 8.713 8.931 9.131 9.429 9.698 9.941 10.189 10.443 10.765 11.066 11.344 11.676 11.992 12.279 12.619 12.997 13.34 13.737 14.171 14.598 15.025 15.497 16.047 16.591 17.188 17.828 18.534 19.258 20.015 20.804 21.512 21.762 21.683 21.44 21.124 20.774 20.403 20.037 19.714 19.353 19.015 18.714 18.422 18.135 17.874 17.636 17.378 17.139 16.926 16.704 16.47 16.273 16.078 15.899 15.762 15.616 15.467 15.31 15.132 14.998 14.849 14.616 14.462 14.297 14.213 14.029 13.818 13.606 13.5 13.252 13.175 13.059 12.938 12.66 12.502 12.34 12.172 11.99 11.782 11.522 10.751 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_45.txt deleted file mode 100644 index ff48266d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_45.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20605 ,TETRA ,17559552,Sat Nov 27 07:44:22 CET,Sat Nov 27 09:34:48 CET,0.0 1.765 2.322 2.733 3.032 3.302 3.546 3.761 4.131 4.286 4.436 4.578 4.852 4.966 5.192 5.432 5.648 5.746 5.947 6.147 6.421 6.586 6.749 6.983 7.191 7.387 7.577 7.768 8.039 8.291 8.517 8.787 9.018 9.239 9.515 9.813 10.09 10.384 10.685 10.992 11.316 11.704 12.142 12.554 12.992 13.517 14.116 14.672 15.28 15.86 16.242 16.227 15.96 15.558 15.138 14.714 14.308 13.913 13.548 13.157 12.826 12.544 12.245 11.939 11.639 11.358 11.067 10.813 10.613 10.412 10.198 10.023 9.834 9.629 9.462 9.281 9.101 8.916 8.723 8.592 8.456 8.238 8.077 7.919 7.841 7.669 7.483 7.289 7.183 6.923 6.849 6.737 6.623 6.361 6.215 6.068 5.895 5.688 5.428 5.124 4.37 -2 ,20882 ,TETRA ,17559553,Sat Nov 27 07:44:25 CET,Sat Nov 27 09:34:37 CET,0.0 1.706 2.359 2.832 3.183 3.491 3.763 3.996 4.426 4.616 4.809 5.029 5.329 5.464 5.717 5.958 6.163 6.259 6.453 6.658 6.969 7.146 7.295 7.523 7.748 7.959 8.164 8.369 8.649 8.918 9.156 9.419 9.661 9.897 10.164 10.457 10.746 11.078 11.417 11.758 12.098 12.45 12.862 13.277 13.739 14.201 14.672 15.181 15.726 16.259 16.722 16.749 16.479 16.117 15.735 15.387 15.056 14.707 14.398 14.076 13.788 13.52 13.251 13.002 12.762 12.55 12.317 12.096 11.92 11.737 11.526 11.35 11.174 10.991 10.851 10.703 10.544 10.38 10.217 10.092 9.961 9.769 9.636 9.498 9.427 9.283 9.12 8.946 8.864 8.64 8.607 8.499 8.376 8.145 8.018 7.867 7.71 7.545 7.373 7.136 6.542 -3 ,20776 ,TETRA ,17559554,Sat Nov 27 07:45:24 CET,Sat Nov 27 09:35:13 CET,0.0 2.185 2.765 3.188 3.533 3.806 4.049 4.274 4.696 4.887 5.074 5.273 5.556 5.69 5.968 6.222 6.439 6.547 6.77 6.987 7.309 7.498 7.673 7.941 8.178 8.389 8.602 8.811 9.078 9.332 9.561 9.822 10.069 10.317 10.622 10.964 11.271 11.601 11.965 12.348 12.728 13.125 13.558 13.984 14.498 15.042 15.602 16.18 16.747 17.209 17.571 17.593 17.279 16.85 16.388 15.94 15.51 15.094 14.732 14.341 13.984 13.654 13.352 13.06 12.769 12.517 12.27 12.042 11.84 11.616 11.387 11.221 11.047 10.834 10.662 10.49 10.315 10.139 9.945 9.808 9.676 9.469 9.317 9.165 9.09 8.932 8.762 8.57 8.463 8.21 8.141 8.037 7.927 7.671 7.524 7.376 7.224 7.052 6.84 6.563 6.087 -4 ,10736 ,TETRA ,17559555,Sat Nov 27 07:45:24 CET,Sat Nov 27 09:36:22 CET,0.0 2.18 2.736 3.138 3.484 3.785 4.02 4.238 4.671 4.866 5.037 5.192 5.487 5.628 5.891 6.141 6.379 6.489 6.712 6.925 7.222 7.413 7.593 7.845 8.077 8.3 8.5 8.694 8.942 9.171 9.4 9.674 9.923 10.153 10.428 10.734 11.019 11.338 11.708 12.108 12.487 12.878 13.313 13.744 14.228 14.734 15.281 15.864 16.487 17.057 17.461 17.444 17.106 16.697 16.272 15.832 15.429 15.035 14.682 14.304 13.961 13.641 13.316 13.012 12.732 12.468 12.183 11.92 11.69 11.453 11.209 11.006 10.792 10.578 10.408 10.238 10.061 9.872 9.699 9.575 9.436 9.214 9.064 8.914 8.833 8.651 8.444 8.232 8.124 7.87 7.803 7.684 7.558 7.308 7.176 7.024 6.857 6.68 6.47 6.159 5.553 -5 ,286 ,TETRA ,17559556,Sat Nov 27 07:46:21 CET,Sat Nov 27 09:36:33 CET,0.0 1.826 2.342 2.721 3.038 3.32 3.551 3.735 4.079 4.256 4.422 4.556 4.818 4.946 5.202 5.436 5.659 5.766 5.979 6.181 6.457 6.637 6.801 7.04 7.267 7.476 7.676 7.861 8.114 8.345 8.563 8.832 9.068 9.296 9.56 9.85 10.109 10.366 10.663 10.996 11.372 11.795 12.244 12.668 13.148 13.64 14.174 14.767 15.355 15.872 16.209 16.137 15.812 15.402 14.991 14.568 14.15 13.741 13.394 13.033 12.67 12.344 12.046 11.756 11.473 11.199 10.914 10.667 10.441 10.21 9.978 9.786 9.587 9.378 9.219 9.054 8.876 8.688 8.503 8.376 8.236 8.006 7.842 7.673 7.588 7.419 7.239 7.054 6.961 6.712 6.63 6.514 6.393 6.127 5.989 5.837 5.661 5.485 5.298 5.022 4.32 -6 ,19862 ,TETRA ,17559557,Sat Nov 27 07:46:24 CET,Sat Nov 27 09:36:34 CET,0.0 2.865 3.511 3.924 4.249 4.565 4.84 5.077 5.529 5.717 5.892 6.115 6.44 6.594 6.885 7.166 7.41 7.51 7.685 7.871 8.155 8.325 8.471 8.693 8.914 9.114 9.298 9.49 9.754 10.001 10.23 10.527 10.81 11.054 11.337 11.662 11.956 12.266 12.596 12.94 13.29 13.67 14.103 14.547 15.045 15.548 16.085 16.615 17.188 17.735 18.07 17.953 17.615 17.208 16.775 16.318 15.886 15.476 15.088 14.688 14.341 14.02 13.702 13.418 13.151 12.893 12.627 12.385 12.168 11.941 11.706 11.508 11.307 11.11 10.961 10.794 10.614 10.427 10.232 10.098 9.962 9.738 9.575 9.416 9.337 9.168 8.988 8.799 8.702 8.459 8.389 8.267 8.148 7.901 7.757 7.597 7.429 7.246 7.017 6.722 5.913 -7 ,10302 ,TETRA ,17559558,Sat Nov 27 07:46:21 CET,Sat Nov 27 09:42:06 CET,0.0 1.795 2.317 2.732 3.079 3.391 3.652 3.872 4.27 4.457 4.642 4.837 5.149 5.291 5.571 5.845 6.096 6.213 6.431 6.636 6.933 7.119 7.302 7.574 7.809 8.018 8.226 8.424 8.676 8.927 9.147 9.412 9.665 9.9 10.194 10.531 10.838 11.16 11.507 11.863 12.226 12.63 13.096 13.531 14.013 14.533 15.084 15.652 16.263 16.794 17.071 16.948 16.617 16.228 15.81 15.37 14.964 14.579 14.215 13.841 13.5 13.16 12.819 12.505 12.212 11.935 11.65 11.393 11.166 10.928 10.67 10.453 10.234 10.021 9.862 9.697 9.528 9.352 9.154 9.009 8.867 8.654 8.509 8.346 8.259 8.093 7.916 7.708 7.596 7.348 7.283 7.17 7.052 6.791 6.654 6.493 6.309 6.128 5.935 5.688 5.194 -8 ,143 ,TETRA ,17559559,Sat Nov 27 07:47:20 CET,Sat Nov 27 09:37:05 CET,0.0 2.269 2.9 3.332 3.676 3.975 4.249 4.518 4.967 5.148 5.333 5.533 5.833 5.976 6.231 6.485 6.734 6.85 7.07 7.276 7.568 7.752 7.928 8.171 8.394 8.618 8.847 9.064 9.318 9.555 9.778 10.042 10.303 10.557 10.868 11.206 11.522 11.862 12.189 12.521 12.881 13.263 13.686 14.105 14.582 15.114 15.697 16.278 16.819 17.321 17.696 17.628 17.286 16.906 16.524 16.069 15.631 15.24 14.869 14.475 14.121 13.784 13.456 13.137 12.867 12.638 12.379 12.135 11.94 11.765 11.572 11.411 11.25 11.075 10.943 10.806 10.658 10.509 10.358 10.251 10.136 9.948 9.81 9.669 9.593 9.431 9.271 9.094 8.997 8.745 8.66 8.543 8.421 8.16 8.009 7.847 7.664 7.468 7.282 7.061 6.507 -9 ,7333 ,TETRA ,17559560,Sat Nov 27 07:47:23 CET,Sat Nov 27 09:37:11 CET,0.0 2.299 2.902 3.336 3.688 3.958 4.214 4.452 4.867 5.053 5.22 5.384 5.688 5.835 6.108 6.368 6.61 6.72 6.921 7.114 7.406 7.594 7.774 8.037 8.272 8.493 8.716 8.93 9.209 9.478 9.731 10.025 10.285 10.526 10.811 11.126 11.418 11.737 12.079 12.42 12.78 13.181 13.649 14.104 14.583 15.075 15.604 16.168 16.75 17.308 17.711 17.648 17.314 16.856 16.413 15.988 15.553 15.129 14.751 14.338 13.971 13.646 13.336 13.035 12.748 12.494 12.236 12.009 11.822 11.635 11.446 11.291 11.131 10.963 10.826 10.686 10.539 10.383 10.234 10.133 10.028 9.854 9.728 9.601 9.539 9.407 9.265 9.11 9.026 8.799 8.757 8.651 8.549 8.338 8.226 8.116 7.997 7.847 7.654 7.423 6.992 -10 ,19457 ,TETRA ,17559561,Sat Nov 27 07:47:21 CET,Sat Nov 27 09:38:46 CET,0.0 2.694 3.425 3.881 4.227 4.516 4.747 4.944 5.327 5.529 5.711 5.875 6.169 6.301 6.551 6.78 6.988 7.094 7.295 7.478 7.75 7.93 8.105 8.354 8.579 8.796 9.005 9.211 9.475 9.704 9.916 10.185 10.432 10.656 10.919 11.212 11.486 11.809 12.17 12.538 12.907 13.296 13.731 14.161 14.637 15.127 15.649 16.193 16.79 17.337 17.694 17.58 17.267 16.88 16.442 15.983 15.55 15.16 14.808 14.439 14.104 13.784 13.472 13.162 12.871 12.6 12.306 12.04 11.806 11.569 11.315 11.092 10.883 10.675 10.512 10.344 10.175 10.003 9.812 9.682 9.546 9.323 9.171 9.014 8.936 8.769 8.583 8.388 8.283 8.035 7.959 7.837 7.71 7.432 7.267 7.073 6.87 6.665 6.447 6.145 5.356 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_48.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_48.txt deleted file mode 100644 index 76a4a06c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_28_48.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22233 ,TETRA ,17559562,Sat Nov 27 07:47:21 CET,Sat Nov 27 09:37:17 CET,0.0 1.98 2.513 2.851 3.071 3.28 3.518 3.736 4.121 4.299 4.456 4.587 4.864 4.997 5.25 5.477 5.688 5.789 5.967 6.147 6.452 6.627 6.768 6.969 7.155 7.336 7.511 7.668 7.862 8.056 8.258 8.504 8.735 8.955 9.192 9.428 9.646 9.874 10.152 10.474 10.78 11.064 11.353 11.618 11.859 12.129 12.355 12.505 12.608 12.456 11.846 10.865 9.824 8.85 7.992 7.162 6.411 5.754 5.202 4.615 4.082 3.607 3.152 2.734 2.352 2.012 1.646 1.288 0.983 0.669 0.339 0.066 -0.213 -0.501 -0.728 -0.948 -1.182 -1.431 -1.679 -1.863 -2.061 -2.347 -2.539 -2.745 -2.858 -3.084 -3.338 -3.617 -3.75 -4.061 -4.223 -4.39 -4.579 -4.982 -5.204 -5.442 -5.713 -6.054 -6.427 -6.86 -8.57 -2 ,16391 ,TETRA ,17559563,Sat Nov 27 07:48:21 CET,Sat Nov 27 09:37:03 CET,0.0 1.669 2.124 2.471 2.722 2.976 3.197 3.374 3.729 3.891 4.03 4.163 4.458 4.617 4.907 5.166 5.415 5.524 5.704 5.86 6.071 6.22 6.365 6.596 6.81 6.961 7.113 7.27 7.487 7.706 7.919 8.177 8.422 8.635 8.872 9.122 9.327 9.534 9.745 9.949 10.152 10.387 10.642 10.872 11.121 11.328 11.467 11.539 11.519 11.287 10.489 9.191 7.99 6.884 5.846 4.9 4.093 3.386 2.749 2.086 1.537 1.079 0.624 0.169 -0.248 -0.634 -1.03 -1.398 -1.717 -2.035 -2.365 -2.632 -2.925 -3.233 -3.464 -3.716 -3.977 -4.238 -4.52 -4.726 -4.943 -5.285 -5.508 -5.732 -5.86 -6.119 -6.378 -6.658 -6.801 -7.107 -7.254 -7.42 -7.594 -8.003 -8.262 -8.569 -8.888 -9.201 -9.595 -10.243 -12.577 -3 ,27152 ,TETRA ,17559564,Sat Nov 27 07:48:22 CET,Sat Nov 27 09:29:55 CET,0.0 1.92 2.506 2.938 3.258 3.552 3.804 4.034 4.436 4.611 4.757 4.863 5.136 5.265 5.52 5.764 5.982 6.081 6.264 6.448 6.706 6.854 7.001 7.222 7.425 7.612 7.789 7.962 8.173 8.369 8.585 8.838 9.045 9.229 9.447 9.688 9.926 10.182 10.412 10.636 10.854 11.073 11.31 11.504 11.686 11.87 11.988 11.994 11.89 11.572 10.855 9.661 8.462 7.409 6.493 5.642 4.876 4.21 3.641 3.047 2.521 2.048 1.612 1.214 0.841 0.502 0.14 -0.194 -0.488 -0.801 -1.137 -1.425 -1.703 -1.974 -2.187 -2.413 -2.647 -2.92 -3.21 -3.39 -3.57 -3.848 -4.04 -4.243 -4.356 -4.579 -4.789 -5.016 -5.145 -5.438 -5.538 -5.667 -5.794 -6.091 -6.261 -6.432 -6.6 -6.765 -6.956 -7.258 -9.358 -4 ,245 ,TETRA ,17559565,Sat Nov 27 07:48:23 CET,Sat Nov 27 09:38:00 CET,0.0 2.586 3.17 3.57 3.869 4.136 4.405 4.67 5.145 5.347 5.542 5.743 6.038 6.171 6.394 6.604 6.801 6.888 7.062 7.247 7.484 7.612 7.744 7.943 8.129 8.296 8.44 8.58 8.773 8.952 9.119 9.311 9.483 9.654 9.867 10.093 10.314 10.557 10.804 11.03 11.248 11.495 11.756 11.986 12.182 12.384 12.599 12.771 12.832 12.67 12.006 10.902 9.83 8.754 7.826 7.018 6.316 5.686 5.098 4.498 3.987 3.516 3.07 2.658 2.288 1.95 1.597 1.267 0.969 0.659 0.356 0.121 -0.145 -0.436 -0.659 -0.881 -1.12 -1.384 -1.646 -1.828 -2.023 -2.318 -2.519 -2.726 -2.831 -3.054 -3.312 -3.588 -3.728 -4.031 -4.165 -4.328 -4.496 -4.897 -5.136 -5.399 -5.678 -6.025 -6.438 -7.01 -9.053 -5 ,10943 ,TETRA ,17559566,Sat Nov 27 07:49:21 CET,Sat Nov 27 09:37:59 CET,0.0 1.9 2.4 2.804 3.121 3.384 3.584 3.79 4.196 4.36 4.505 4.621 4.898 5.02 5.264 5.5 5.714 5.816 6.016 6.198 6.447 6.606 6.767 7.002 7.217 7.422 7.609 7.786 8.013 8.222 8.425 8.677 8.919 9.143 9.379 9.619 9.846 10.072 10.295 10.535 10.797 11.06 11.321 11.549 11.781 11.987 12.141 12.25 12.278 12.092 11.417 10.235 9.114 8.075 7.17 6.405 5.686 5.002 4.432 3.875 3.403 2.963 2.54 2.141 1.762 1.405 1.017 0.669 0.381 0.102 -0.192 -0.459 -0.746 -1.035 -1.253 -1.477 -1.718 -1.963 -2.228 -2.417 -2.611 -2.909 -3.111 -3.34 -3.45 -3.666 -3.905 -4.16 -4.306 -4.632 -4.833 -5.019 -5.233 -5.769 -6.031 -6.324 -6.677 -7.075 -7.524 -8.033 -9.417 -6 ,11938 ,TETRA ,17559567,Sat Nov 27 07:49:21 CET,Sat Nov 27 09:37:58 CET,0.0 1.867 2.438 2.837 3.107 3.355 3.59 3.784 4.125 4.285 4.429 4.56 4.838 4.96 5.191 5.392 5.566 5.651 5.826 6.009 6.266 6.42 6.57 6.781 6.983 7.174 7.345 7.497 7.682 7.85 8.033 8.272 8.486 8.68 8.892 9.113 9.332 9.585 9.829 10.055 10.281 10.501 10.718 10.929 11.123 11.293 11.446 11.5 11.403 11.093 10.364 9.152 7.977 6.973 6.029 5.109 4.29 3.573 2.981 2.371 1.844 1.399 0.938 0.487 0.065 -0.338 -0.743 -1.091 -1.377 -1.656 -1.941 -2.191 -2.465 -2.75 -2.979 -3.213 -3.45 -3.713 -3.977 -4.147 -4.325 -4.613 -4.809 -5.006 -5.111 -5.332 -5.56 -5.802 -5.932 -6.233 -6.353 -6.496 -6.654 -7.002 -7.193 -7.385 -7.601 -7.86 -8.141 -8.474 -9.333 -7 ,15195 ,TETRA ,17559568,Sat Nov 27 07:49:21 CET,Sat Nov 27 09:39:12 CET,0.0 2.113 2.709 3.143 3.475 3.741 3.956 4.16 4.556 4.722 4.881 5.026 5.307 5.428 5.649 5.863 6.066 6.162 6.342 6.509 6.746 6.906 7.061 7.259 7.447 7.639 7.83 8.014 8.235 8.434 8.63 8.867 9.09 9.295 9.515 9.757 9.988 10.219 10.468 10.761 11.043 11.303 11.582 11.834 12.071 12.293 12.49 12.599 12.508 12.174 11.439 10.238 9.12 8.13 7.215 6.341 5.562 4.89 4.328 3.774 3.309 2.872 2.428 2.009 1.606 1.221 0.842 0.504 0.177 -0.173 -0.529 -0.835 -1.166 -1.503 -1.76 -2.028 -2.311 -2.601 -2.885 -3.066 -3.25 -3.529 -3.746 -3.989 -4.101 -4.325 -4.571 -4.858 -5.014 -5.324 -5.473 -5.64 -5.821 -6.197 -6.398 -6.629 -6.9 -7.22 -7.559 -7.954 -10.384 -8 ,11919 ,TETRA ,17559569,Sat Nov 27 07:50:22 CET,Sat Nov 27 09:40:12 CET,0.0 2.245 2.777 3.208 3.535 3.779 4.005 4.216 4.593 4.749 4.898 5.039 5.318 5.446 5.685 5.911 6.116 6.215 6.412 6.601 6.865 7.025 7.173 7.371 7.554 7.727 7.901 8.076 8.301 8.515 8.739 8.99 9.191 9.391 9.621 9.88 10.133 10.388 10.644 10.917 11.169 11.412 11.687 11.928 12.174 12.399 12.558 12.64 12.594 12.277 11.398 10.127 8.976 7.958 7.063 6.21 5.446 4.744 4.148 3.567 3.047 2.583 2.149 1.721 1.327 0.976 0.628 0.324 0.045 -0.243 -0.539 -0.785 -1.042 -1.343 -1.589 -1.838 -2.104 -2.38 -2.654 -2.835 -3.012 -3.303 -3.508 -3.703 -3.807 -4.034 -4.29 -4.538 -4.671 -4.984 -5.119 -5.298 -5.488 -5.879 -6.093 -6.317 -6.579 -6.893 -7.243 -7.747 -9.953 -9 ,6774 ,TETRA ,17559570,Sat Nov 27 07:50:24 CET,Sat Nov 27 09:39:25 CET,0.0 2.396 2.908 3.3 3.628 3.905 4.173 4.389 4.698 4.837 4.984 5.144 5.427 5.554 5.788 6.01 6.225 6.331 6.541 6.741 7.002 7.154 7.291 7.506 7.722 7.901 8.075 8.254 8.496 8.715 8.898 9.123 9.335 9.537 9.764 9.997 10.209 10.457 10.745 11.031 11.298 11.592 11.878 12.12 12.407 12.635 12.789 12.846 12.776 12.498 11.707 10.474 9.311 8.228 7.293 6.427 5.697 5.075 4.523 3.957 3.456 3.003 2.555 2.133 1.762 1.389 0.977 0.647 0.381 0.092 -0.236 -0.518 -0.795 -1.076 -1.296 -1.526 -1.782 -2.057 -2.351 -2.559 -2.773 -3.091 -3.307 -3.53 -3.646 -3.908 -4.194 -4.499 -4.649 -4.94 -5.058 -5.223 -5.422 -5.871 -6.115 -6.351 -6.58 -6.809 -7.076 -7.437 -8.628 -10 ,1744 ,TETRA ,17559571,Sat Nov 27 07:50:22 CET,Sat Nov 27 09:40:10 CET,0.0 1.589 2.193 2.641 2.964 3.235 3.48 3.7 4.071 4.245 4.399 4.528 4.809 4.931 5.155 5.376 5.581 5.683 5.875 6.047 6.301 6.464 6.613 6.82 7.013 7.2 7.382 7.549 7.772 7.982 8.164 8.391 8.602 8.797 9.028 9.272 9.508 9.767 10.014 10.261 10.492 10.734 10.996 11.208 11.436 11.688 11.905 11.983 11.898 11.597 10.787 9.46 8.242 7.18 6.218 5.329 4.505 3.761 3.153 2.524 1.97 1.505 1.09 0.689 0.314 -0.025 -0.376 -0.686 -0.96 -1.249 -1.548 -1.796 -2.054 -2.323 -2.518 -2.706 -2.92 -3.174 -3.454 -3.648 -3.863 -4.206 -4.429 -4.664 -4.792 -5.068 -5.355 -5.653 -5.803 -6.111 -6.258 -6.421 -6.582 -6.93 -7.12 -7.318 -7.538 -7.794 -8.093 -8.456 -9.289 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_29_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_29_42.txt deleted file mode 100644 index c2a79ed4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_29_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18544 ,TETRA ,17559572,Sat Nov 27 07:50:22 CET,Sat Nov 27 09:39:25 CET,0.0 2.286 2.855 3.3 3.639 3.92 4.188 4.442 4.836 5.018 5.196 5.357 5.657 5.812 6.121 6.411 6.676 6.808 7.075 7.306 7.642 7.864 8.062 8.349 8.619 8.882 9.138 9.38 9.705 10.03 10.333 10.693 11.039 11.383 11.784 12.232 12.655 13.101 13.603 14.144 14.715 15.372 16.109 16.762 17.513 18.357 19.298 20.327 21.489 22.844 24.201 24.967 25.28 25.362 25.304 25.195 25.015 24.733 24.444 24.15 23.872 23.591 23.297 23.014 22.76 22.532 22.273 22.015 21.788 21.573 21.362 21.169 20.964 20.742 20.565 20.372 20.18 19.967 19.704 19.519 19.338 19.084 18.904 18.705 18.597 18.378 18.137 17.88 17.747 17.469 17.305 17.134 16.955 16.558 16.332 16.102 15.829 15.523 15.179 14.647 13.122 -2 ,21749 ,TETRA ,17559573,Sat Nov 27 07:51:23 CET,Sat Nov 27 09:40:14 CET,0.0 2.982 3.6 4.015 4.368 4.665 4.931 5.153 5.562 5.768 5.974 6.222 6.542 6.695 6.998 7.267 7.524 7.652 7.895 8.125 8.45 8.656 8.863 9.172 9.475 9.755 10.004 10.241 10.563 10.882 11.186 11.553 11.91 12.259 12.649 13.079 13.504 13.961 14.441 14.923 15.395 15.979 16.642 17.241 17.942 18.717 19.673 20.747 21.862 23.089 24.353 25.106 25.304 25.307 25.234 25.042 24.82 24.58 24.309 24.005 23.727 23.475 23.228 23.011 22.792 22.541 22.276 22.038 21.82 21.578 21.31 21.086 20.855 20.608 20.418 20.212 19.986 19.747 19.508 19.349 19.189 18.935 18.743 18.538 18.43 18.206 17.951 17.658 17.514 17.23 17.071 16.923 16.762 16.379 16.169 15.922 15.599 15.248 14.861 14.281 12.278 -3 ,12484 ,TETRA ,17559574,Sat Nov 27 07:51:22 CET,Sat Nov 27 09:41:02 CET,0.0 3.758 4.375 4.887 5.281 5.576 5.851 6.104 6.546 6.754 6.951 7.177 7.492 7.655 7.963 8.254 8.538 8.679 8.936 9.177 9.518 9.73 9.942 10.247 10.535 10.818 11.1 11.39 11.768 12.112 12.429 12.824 13.191 13.533 13.949 14.394 14.813 15.29 15.772 16.265 16.798 17.435 18.138 18.795 19.563 20.4 21.32 22.242 23.251 24.558 26.106 27.0 27.278 27.265 27.143 26.924 26.655 26.41 26.175 25.872 25.578 25.299 25.029 24.76 24.486 24.243 23.993 23.763 23.559 23.333 23.072 22.845 22.604 22.341 22.14 21.94 21.734 21.508 21.274 21.118 20.946 20.657 20.446 20.241 20.138 19.919 19.686 19.432 19.291 18.995 18.802 18.638 18.475 18.095 17.897 17.663 17.386 17.078 16.686 16.184 14.426 -4 ,16359 ,TETRA ,17559575,Sat Nov 27 07:51:25 CET,Sat Nov 27 09:40:40 CET,0.0 1.897 2.476 2.884 3.258 3.545 3.817 4.083 4.538 4.744 4.938 5.144 5.462 5.621 5.921 6.208 6.479 6.61 6.892 7.147 7.457 7.675 7.88 8.164 8.464 8.758 9.026 9.276 9.612 9.941 10.256 10.636 10.981 11.296 11.687 12.13 12.539 12.996 13.483 13.988 14.527 15.121 15.793 16.499 17.319 18.209 19.22 20.306 21.443 22.598 23.801 24.549 24.753 24.669 24.491 24.275 24.008 23.722 23.465 23.203 22.924 22.648 22.379 22.091 21.805 21.549 21.286 21.04 20.821 20.588 20.327 20.108 19.875 19.623 19.428 19.222 18.993 18.746 18.5 18.328 18.142 17.859 17.677 17.477 17.364 17.141 16.896 16.637 16.501 16.204 16.024 15.85 15.642 15.213 14.968 14.667 14.371 14.035 13.601 13.129 11.693 -5 ,29868 ,TETRA ,17559576,Sat Nov 27 07:51:23 CET,Sat Nov 27 09:41:15 CET,0.0 2.245 2.777 3.176 3.48 3.753 4.013 4.259 4.737 4.952 5.138 5.344 5.662 5.813 6.093 6.356 6.619 6.75 6.994 7.241 7.604 7.829 8.037 8.337 8.644 8.946 9.228 9.497 9.832 10.145 10.434 10.767 11.092 11.423 11.816 12.243 12.681 13.166 13.65 14.134 14.636 15.215 15.922 16.63 17.405 18.228 19.122 20.004 20.983 22.098 23.263 23.99 24.176 24.091 23.923 23.72 23.459 23.166 22.894 22.555 22.236 21.954 21.664 21.379 21.114 20.866 20.598 20.342 20.108 19.865 19.615 19.402 19.172 18.924 18.729 18.53 18.321 18.095 17.838 17.659 17.49 17.237 17.055 16.839 16.721 16.487 16.257 16.032 15.91 15.628 15.445 15.275 15.085 14.658 14.438 14.201 13.954 13.705 13.338 12.807 10.738 -6 ,14724 ,TETRA ,17559577,Sat Nov 27 07:52:23 CET,Sat Nov 27 09:41:09 CET,0.0 1.789 2.287 2.672 2.984 3.239 3.507 3.762 4.222 4.433 4.621 4.807 5.124 5.292 5.613 5.889 6.151 6.283 6.542 6.793 7.148 7.376 7.591 7.896 8.193 8.488 8.777 9.054 9.391 9.707 10.024 10.404 10.782 11.127 11.499 11.928 12.342 12.792 13.285 13.801 14.318 14.895 15.58 16.246 17.0 17.855 18.778 19.771 20.906 22.07 23.257 24.032 24.368 24.44 24.335 24.149 23.873 23.577 23.304 23.0 22.719 22.439 22.154 21.862 21.568 21.308 21.056 20.826 20.62 20.385 20.128 19.913 19.689 19.447 19.247 19.042 18.829 18.615 18.398 18.234 18.062 17.779 17.56 17.335 17.228 17.014 16.788 16.534 16.389 16.103 15.939 15.768 15.582 15.188 14.945 14.657 14.334 13.98 13.555 12.811 9.9 -7 ,16959 ,TETRA ,17559578,Sat Nov 27 07:52:25 CET,Sat Nov 27 09:41:01 CET,0.0 2.695 3.339 3.757 4.084 4.39 4.66 4.903 5.332 5.536 5.731 5.912 6.231 6.402 6.711 6.997 7.275 7.407 7.655 7.901 8.27 8.502 8.712 9.024 9.336 9.627 9.91 10.188 10.555 10.902 11.224 11.606 11.983 12.339 12.75 13.208 13.634 14.119 14.639 15.161 15.668 16.21 16.861 17.515 18.257 19.064 19.998 21.031 22.153 23.391 24.775 25.783 26.184 26.272 26.25 26.111 25.875 25.61 25.35 25.067 24.815 24.58 24.316 24.035 23.775 23.541 23.286 23.051 22.836 22.592 22.323 22.085 21.827 21.574 21.374 21.165 20.941 20.695 20.453 20.306 20.164 19.913 19.736 19.55 19.456 19.258 19.048 18.83 18.706 18.439 18.322 18.178 18.0 17.539 17.278 17.017 16.75 16.453 16.087 15.564 13.255 -8 ,19649 ,TETRA ,17559579,Sat Nov 27 07:52:23 CET,Sat Nov 27 09:41:07 CET,0.0 2.587 3.207 3.725 4.111 4.408 4.67 4.915 5.351 5.553 5.747 5.948 6.276 6.445 6.753 7.042 7.307 7.434 7.688 7.936 8.285 8.49 8.694 9.0 9.294 9.572 9.823 10.069 10.391 10.701 11.011 11.364 11.685 12.02 12.425 12.878 13.3 13.76 14.268 14.8 15.336 15.921 16.565 17.167 17.873 18.671 19.568 20.601 21.765 22.997 24.257 25.135 25.539 25.665 25.572 25.367 25.11 24.832 24.579 24.301 24.04 23.77 23.471 23.164 22.879 22.64 22.395 22.168 21.967 21.758 21.509 21.29 21.068 20.83 20.638 20.438 20.232 20.022 19.813 19.661 19.501 19.253 19.08 18.903 18.81 18.617 18.405 18.17 18.04 17.752 17.574 17.413 17.257 16.885 16.675 16.462 16.226 15.913 15.519 15.089 13.785 -9 ,18852 ,TETRA ,17559580,Sat Nov 27 07:52:23 CET,Sat Nov 27 09:41:35 CET,0.0 2.585 3.258 3.701 4.023 4.284 4.558 4.832 5.269 5.457 5.644 5.847 6.184 6.351 6.627 6.896 7.174 7.311 7.558 7.794 8.135 8.354 8.581 8.912 9.219 9.507 9.769 10.019 10.335 10.638 10.934 11.289 11.648 11.98 12.342 12.746 13.156 13.631 14.122 14.616 15.146 15.747 16.42 17.07 17.822 18.641 19.537 20.519 21.62 22.82 24.125 25.03 25.377 25.464 25.383 25.175 24.92 24.644 24.384 24.106 23.861 23.622 23.377 23.119 22.861 22.623 22.377 22.145 21.921 21.693 21.437 21.212 20.987 20.749 20.56 20.352 20.125 19.891 19.652 19.487 19.318 19.033 18.829 18.621 18.509 18.27 18.03 17.779 17.639 17.354 17.183 17.019 16.845 16.451 16.235 15.985 15.714 15.402 15.007 14.479 12.412 -10 ,7309 ,TETRA ,17559581,Sat Nov 27 07:52:23 CET,Sat Nov 27 09:42:07 CET,0.0 2.417 2.939 3.305 3.624 3.936 4.229 4.491 4.934 5.138 5.336 5.534 5.857 6.029 6.359 6.671 6.971 7.116 7.381 7.615 7.953 8.169 8.372 8.654 8.932 9.203 9.463 9.731 10.072 10.385 10.676 11.012 11.35 11.684 12.068 12.509 12.938 13.393 13.877 14.404 14.916 15.438 16.069 16.735 17.5 18.333 19.308 20.407 21.575 22.861 24.337 25.427 25.863 25.893 25.739 25.489 25.148 24.782 24.486 24.193 23.903 23.636 23.381 23.113 22.836 22.569 22.289 22.035 21.825 21.607 21.365 21.162 20.941 20.694 20.494 20.288 20.081 19.86 19.635 19.488 19.332 19.059 18.858 18.647 18.544 18.347 18.132 17.891 17.767 17.496 17.32 17.134 16.939 16.559 16.338 16.068 15.777 15.473 15.114 14.651 13.128 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_30_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_30_31.txt deleted file mode 100644 index d613eceb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_30_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18967 ,TETRA ,17559582,Sat Nov 27 07:52:23 CET,Sat Nov 27 09:41:05 CET,0.0 0.973 1.465 1.824 2.104 2.351 2.562 2.754 3.115 3.299 3.487 3.665 3.963 4.102 4.377 4.641 4.882 4.995 5.21 5.431 5.757 5.96 6.155 6.433 6.708 6.978 7.231 7.482 7.814 8.127 8.427 8.78 9.12 9.462 9.86 10.288 10.703 11.171 11.669 12.186 12.732 13.368 14.132 14.902 15.781 16.769 17.962 19.347 20.98 22.945 25.429 27.495 28.758 29.588 30.127 30.523 30.778 30.944 31.057 31.122 31.137 31.145 31.151 31.126 31.086 31.05 31.003 30.958 30.915 30.869 30.804 30.726 30.652 30.585 30.527 30.457 30.38 30.303 30.224 30.169 30.104 30.002 29.93 29.848 29.802 29.706 29.603 29.487 29.429 29.245 29.247 29.171 29.088 28.906 28.807 28.7 28.58 28.454 28.307 28.096 27.369 -2 ,10451 ,TETRA ,17559583,Sat Nov 27 07:52:23 CET,Sat Nov 27 09:40:29 CET,0.0 0.895 1.27 1.638 1.975 2.256 2.492 2.721 3.135 3.31 3.483 3.657 3.958 4.1 4.378 4.643 4.884 5.006 5.252 5.471 5.783 5.985 6.175 6.459 6.735 7.0 7.257 7.504 7.824 8.135 8.433 8.791 9.138 9.493 9.892 10.331 10.76 11.21 11.702 12.243 12.81 13.443 14.171 14.927 15.844 16.886 18.099 19.459 21.095 23.079 25.502 27.564 28.848 29.69 30.208 30.585 30.86 31.039 31.152 31.211 31.242 31.254 31.232 31.202 31.167 31.135 31.102 31.054 31.0 30.95 30.894 30.84 30.771 30.687 30.623 30.555 30.474 30.383 30.258 30.161 30.075 29.958 29.873 29.768 29.71 29.589 29.46 29.31 29.229 29.022 28.982 28.886 28.781 28.558 28.439 28.316 28.174 28.014 27.834 27.567 27.074 -3 ,8503 ,TETRA ,17559584,Sat Nov 27 07:52:23 CET,Sat Nov 27 09:40:15 CET,0.0 0.929 1.393 1.738 2.028 2.294 2.538 2.757 3.121 3.288 3.447 3.597 3.89 4.027 4.301 4.561 4.803 4.921 5.154 5.375 5.683 5.884 6.067 6.335 6.621 6.89 7.139 7.386 7.705 8.009 8.306 8.666 9.016 9.352 9.732 10.178 10.621 11.101 11.626 12.186 12.773 13.451 14.26 15.068 15.987 17.009 18.219 19.599 21.197 23.143 25.628 27.692 28.91 29.715 30.277 30.669 30.929 31.091 31.169 31.208 31.221 31.231 31.232 31.218 31.178 31.142 31.092 31.036 30.993 30.927 30.834 30.761 30.691 30.626 30.571 30.497 30.423 30.349 30.256 30.19 30.129 30.029 29.962 29.89 29.848 29.741 29.624 29.51 29.449 29.262 29.27 29.201 29.123 28.952 28.863 28.768 28.66 28.539 28.407 28.26 27.637 -4 ,30434 ,TETRA ,17559585,Sat Nov 27 07:53:21 CET,Sat Nov 27 09:41:10 CET,0.0 0.771 1.137 1.442 1.731 1.997 2.24 2.476 2.88 3.047 3.21 3.366 3.681 3.845 4.142 4.43 4.704 4.831 5.073 5.313 5.658 5.878 6.091 6.373 6.641 6.914 7.186 7.438 7.76 8.088 8.414 8.784 9.129 9.472 9.863 10.296 10.724 11.191 11.712 12.283 12.853 13.495 14.266 15.043 15.954 16.971 18.151 19.518 21.164 23.157 25.627 27.75 29.0 29.775 30.301 30.681 30.941 31.13 31.277 31.364 31.376 31.368 31.364 31.347 31.294 31.239 31.189 31.131 31.075 31.009 30.935 30.875 30.817 30.747 30.687 30.631 30.566 30.481 30.394 30.327 30.256 30.156 30.085 30.001 29.956 29.862 29.759 29.643 29.585 29.401 29.404 29.339 29.272 29.112 29.008 28.892 28.778 28.652 28.525 28.355 27.871 -5 ,4987 ,TETRA ,17559586,Sat Nov 27 07:54:22 CET,Sat Nov 27 09:37:20 CET,0.0 0.701 1.055 1.34 1.605 1.823 2.02 2.227 2.594 2.767 2.953 3.134 3.448 3.589 3.826 4.071 4.316 4.432 4.66 4.877 5.192 5.393 5.587 5.875 6.159 6.433 6.691 6.937 7.254 7.566 7.868 8.223 8.572 8.92 9.331 9.787 10.21 10.652 11.124 11.634 12.17 12.786 13.529 14.291 15.177 16.169 17.344 18.714 20.379 22.38 24.914 27.096 28.358 29.173 29.713 30.084 30.332 30.514 30.613 30.68 30.736 30.745 30.73 30.719 30.689 30.64 30.596 30.549 30.494 30.435 30.355 30.284 30.229 30.172 30.116 30.043 29.966 29.895 29.819 29.765 29.709 29.616 29.542 29.459 29.42 29.33 29.219 29.105 29.05 28.865 28.87 28.801 28.727 28.575 28.499 28.407 28.285 28.162 28.033 27.886 27.503 -6 ,8605 ,TETRA ,17559587,Sat Nov 27 07:55:21 CET,Sat Nov 27 09:46:32 CET,0.0 0.587 0.944 1.304 1.595 1.839 2.054 2.256 2.646 2.816 2.975 3.138 3.448 3.588 3.852 4.109 4.36 4.483 4.715 4.93 5.231 5.423 5.617 5.908 6.181 6.455 6.744 7.012 7.334 7.666 7.989 8.36 8.723 9.07 9.471 9.921 10.333 10.784 11.277 11.79 12.337 12.975 13.742 14.496 15.369 16.365 17.55 18.941 20.579 22.546 24.985 27.033 28.291 29.124 29.669 30.047 30.284 30.436 30.52 30.594 30.638 30.625 30.607 30.585 30.538 30.491 30.442 30.379 30.325 30.277 30.225 30.171 30.098 30.028 29.978 29.922 29.863 29.803 29.732 29.67 29.604 29.492 29.41 29.322 29.278 29.189 29.091 28.986 28.919 28.724 28.732 28.668 28.611 28.476 28.393 28.3 28.198 28.068 27.918 27.722 27.146 -7 ,1841 ,TETRA ,17559588,Sat Nov 27 07:55:21 CET,Sat Nov 27 09:43:49 CET,0.0 0.82 1.236 1.555 1.821 2.076 2.331 2.564 2.963 3.147 3.321 3.498 3.808 3.957 4.221 4.466 4.705 4.824 5.053 5.271 5.595 5.798 5.991 6.282 6.562 6.837 7.105 7.35 7.661 7.958 8.263 8.646 9.012 9.376 9.793 10.244 10.676 11.14 11.644 12.171 12.72 13.341 14.071 14.819 15.699 16.703 17.878 19.226 20.839 22.819 25.289 27.331 28.555 29.365 29.906 30.27 30.518 30.69 30.795 30.85 30.864 30.86 30.859 30.845 30.807 30.761 30.703 30.645 30.581 30.507 30.439 30.374 30.31 30.251 30.192 30.127 30.06 29.991 29.899 29.822 29.753 29.648 29.567 29.478 29.439 29.364 29.265 29.168 29.124 28.943 28.948 28.888 28.814 28.653 28.571 28.463 28.345 28.23 28.101 27.924 27.464 -8 ,23550 ,TETRA ,17559589,Sat Nov 27 07:55:21 CET,Sat Nov 27 09:44:37 CET,0.0 0.721 1.149 1.562 1.91 2.153 2.365 2.565 2.965 3.151 3.311 3.459 3.756 3.903 4.183 4.44 4.681 4.802 5.044 5.25 5.549 5.744 5.934 6.231 6.51 6.775 7.043 7.289 7.603 7.906 8.197 8.566 8.916 9.255 9.65 10.101 10.555 11.055 11.587 12.146 12.72 13.344 14.084 14.847 15.734 16.753 17.973 19.357 20.978 22.953 25.466 27.577 28.855 29.721 30.283 30.652 30.911 31.091 31.197 31.259 31.308 31.338 31.338 31.324 31.299 31.263 31.208 31.146 31.088 31.033 30.982 30.93 30.864 30.788 30.722 30.648 30.568 30.491 30.404 30.335 30.264 30.156 30.077 29.994 29.954 29.878 29.793 29.692 29.643 29.463 29.483 29.419 29.352 29.196 29.103 29.007 28.898 28.775 28.629 28.448 28.055 -9 ,10046 ,TETRA ,17559590,Sat Nov 27 07:55:21 CET,Sat Nov 27 09:44:17 CET,0.0 1.745 2.35 2.723 2.989 3.232 3.477 3.702 4.102 4.292 4.478 4.657 4.964 5.117 5.426 5.733 6.018 6.149 6.407 6.671 7.016 7.205 7.385 7.657 7.929 8.193 8.443 8.684 9.003 9.302 9.597 9.975 10.343 10.691 11.091 11.547 11.98 12.457 12.974 13.517 14.099 14.754 15.512 16.284 17.202 18.203 19.373 20.731 22.363 24.359 26.831 28.961 30.257 31.064 31.581 31.955 32.193 32.359 32.491 32.586 32.636 32.646 32.624 32.604 32.576 32.527 32.471 32.422 32.36 32.296 32.232 32.168 32.101 32.028 31.957 31.879 31.811 31.732 31.637 31.573 31.514 31.418 31.341 31.251 31.208 31.121 31.022 30.926 30.878 30.693 30.713 30.652 30.57 30.383 30.283 30.172 30.049 29.914 29.759 29.534 28.877 -10 ,14510 ,TETRA ,17559591,Sat Nov 27 07:55:21 CET,Sat Nov 27 09:44:53 CET,0.0 1.055 1.543 1.906 2.215 2.467 2.706 2.945 3.338 3.502 3.675 3.845 4.146 4.302 4.605 4.887 5.156 5.277 5.513 5.752 6.074 6.273 6.473 6.776 7.062 7.331 7.594 7.846 8.177 8.502 8.811 9.179 9.535 9.868 10.248 10.668 11.058 11.508 12.023 12.556 13.103 13.728 14.48 15.236 16.136 17.16 18.355 19.725 21.383 23.401 25.892 28.017 29.309 30.14 30.684 31.075 31.349 31.538 31.657 31.751 31.807 31.82 31.796 31.747 31.698 31.659 31.612 31.562 31.515 31.45 31.376 31.316 31.242 31.168 31.118 31.047 30.961 30.873 30.79 30.731 30.669 30.576 30.504 30.426 30.386 30.301 30.214 30.118 30.064 29.883 29.888 29.81 29.725 29.547 29.462 29.374 29.276 29.154 28.997 28.803 28.408 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_30_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_30_32.txt deleted file mode 100644 index eb767522..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_30_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26949 ,KEBNE ,17024907,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:52:00 CET,0.0 0.657 0.969 1.199 1.389 1.565 1.749 1.946 2.274 2.411 2.539 2.658 2.949 3.083 3.331 3.55 3.754 3.856 4.059 4.248 4.507 4.669 4.829 5.055 5.27 5.484 5.691 5.884 6.126 6.356 6.576 6.837 7.085 7.326 7.612 7.93 8.22 8.533 8.874 9.228 9.593 10.019 10.496 10.93 11.407 11.897 12.412 12.98 13.582 14.136 14.623 14.785 14.674 14.439 14.156 13.849 13.536 13.226 12.95 12.645 12.367 12.128 11.896 11.65 11.395 11.158 10.914 10.699 10.502 10.288 10.077 9.913 9.728 9.531 9.38 9.211 9.025 8.823 8.617 8.48 8.342 8.119 7.956 7.791 7.702 7.507 7.307 7.087 6.974 6.698 6.568 6.423 6.246 5.848 5.641 5.443 5.235 4.974 4.639 4.122 2.049 -2 ,29491 ,KEBNE ,17024908,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:52:24 CET,0.0 1.482 1.954 2.337 2.613 2.843 3.068 3.27 3.633 3.809 3.98 4.119 4.385 4.495 4.712 4.898 5.076 5.173 5.35 5.511 5.75 5.892 6.028 6.228 6.421 6.609 6.787 6.96 7.164 7.362 7.551 7.778 8.0 8.22 8.473 8.731 8.995 9.279 9.584 9.964 10.355 10.723 11.125 11.534 11.993 12.459 12.976 13.549 14.158 14.771 15.349 15.561 15.454 15.25 14.998 14.69 14.371 14.059 13.774 13.465 13.172 12.918 12.667 12.402 12.157 11.943 11.709 11.498 11.309 11.092 10.875 10.702 10.517 10.324 10.165 9.996 9.824 9.642 9.441 9.3 9.166 8.948 8.778 8.609 8.525 8.343 8.147 7.94 7.822 7.548 7.443 7.3 7.143 6.791 6.58 6.357 6.122 5.851 5.543 5.082 3.322 -3 ,4712 ,KEBNE ,17024909,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:54:40 CET,0.0 2.37 3.001 3.403 3.713 3.982 4.197 4.38 4.721 4.877 5.03 5.18 5.479 5.608 5.843 6.082 6.314 6.432 6.643 6.806 7.031 7.192 7.35 7.56 7.768 7.982 8.183 8.372 8.612 8.84 9.077 9.354 9.596 9.821 10.076 10.368 10.646 10.929 11.231 11.547 11.865 12.239 12.663 13.058 13.486 13.955 14.496 15.052 15.632 16.247 16.784 17.012 16.98 16.762 16.47 16.165 15.856 15.559 15.304 15.041 14.789 14.543 14.292 14.037 13.811 13.603 13.382 13.18 12.99 12.784 12.563 12.388 12.214 12.022 11.859 11.69 11.513 11.327 11.131 10.995 10.861 10.641 10.478 10.31 10.23 10.071 9.88 9.665 9.552 9.282 9.188 9.064 8.933 8.643 8.488 8.326 8.123 7.882 7.628 7.291 6.235 -4 ,9996 ,KEBNE ,17024910,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:56 CET,0.0 1.172 1.63 1.968 2.23 2.494 2.733 2.94 3.311 3.465 3.605 3.727 4.016 4.141 4.363 4.581 4.79 4.897 5.119 5.315 5.567 5.733 5.89 6.107 6.317 6.513 6.718 6.909 7.151 7.416 7.672 7.939 8.179 8.41 8.676 8.972 9.243 9.567 9.906 10.237 10.576 10.935 11.341 11.759 12.254 12.78 13.356 13.988 14.61 15.207 15.759 15.942 15.857 15.62 15.313 14.987 14.658 14.372 14.12 13.823 13.537 13.278 13.044 12.811 12.586 12.374 12.137 11.922 11.729 11.514 11.283 11.093 10.898 10.687 10.519 10.355 10.191 10.0 9.798 9.666 9.517 9.275 9.106 8.939 8.86 8.69 8.501 8.3 8.194 7.935 7.835 7.695 7.529 7.13 6.909 6.664 6.408 6.133 5.838 5.542 4.609 -5 ,7276 ,KEBNE ,17024911,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:50 CET,0.0 0.738 1.007 1.237 1.463 1.675 1.867 2.042 2.341 2.478 2.607 2.705 2.978 3.087 3.295 3.493 3.672 3.76 3.928 4.086 4.32 4.476 4.623 4.827 5.026 5.212 5.391 5.575 5.826 6.07 6.305 6.588 6.856 7.109 7.415 7.756 8.055 8.355 8.657 8.981 9.319 9.673 10.071 10.467 10.929 11.455 12.023 12.589 13.193 13.831 14.389 14.582 14.476 14.225 13.919 13.603 13.283 12.974 12.709 12.412 12.125 11.848 11.588 11.352 11.124 10.906 10.666 10.444 10.252 10.058 9.849 9.675 9.506 9.319 9.153 8.975 8.793 8.597 8.401 8.269 8.133 7.897 7.714 7.541 7.453 7.262 7.058 6.84 6.72 6.437 6.334 6.2 6.04 5.681 5.481 5.24 4.992 4.722 4.428 3.972 2.35 -6 ,25228 ,KEBNE ,17024912,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:54:04 CET,0.0 1.532 2.103 2.434 2.683 2.909 3.134 3.336 3.675 3.838 4.0 4.147 4.431 4.564 4.821 5.054 5.265 5.366 5.583 5.797 6.06 6.209 6.36 6.579 6.775 6.954 7.127 7.303 7.544 7.775 7.991 8.269 8.531 8.783 9.07 9.382 9.678 9.969 10.282 10.615 10.944 11.308 11.717 12.099 12.525 13.001 13.549 14.115 14.715 15.327 15.913 16.133 15.986 15.741 15.454 15.16 14.861 14.555 14.26 13.941 13.673 13.434 13.198 12.952 12.727 12.521 12.294 12.092 11.907 11.699 11.488 11.31 11.12 10.923 10.77 10.604 10.426 10.25 10.07 9.935 9.798 9.569 9.394 9.208 9.112 8.927 8.726 8.489 8.37 8.077 7.905 7.745 7.583 7.226 7.039 6.827 6.565 6.249 5.831 5.355 3.586 -7 ,15892 ,KEBNE ,17024913,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:53:30 CET,0.0 1.114 1.618 2.055 2.356 2.601 2.82 3.026 3.386 3.541 3.694 3.835 4.128 4.255 4.465 4.653 4.838 4.929 5.109 5.279 5.512 5.651 5.796 6.012 6.216 6.42 6.607 6.787 7.031 7.255 7.453 7.692 7.922 8.146 8.416 8.71 8.98 9.251 9.546 9.873 10.202 10.557 10.987 11.416 11.858 12.336 12.885 13.46 14.089 14.708 15.211 15.405 15.338 15.114 14.857 14.597 14.318 14.018 13.74 13.457 13.208 12.952 12.69 12.434 12.192 11.976 11.737 11.509 11.315 11.117 10.909 10.721 10.527 10.322 10.154 9.991 9.811 9.621 9.445 9.318 9.176 8.946 8.783 8.612 8.519 8.318 8.12 7.912 7.797 7.531 7.42 7.282 7.133 6.772 6.569 6.34 6.056 5.705 5.293 4.828 3.064 -8 ,1987 ,KEBNE ,17024914,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:42 CET,0.0 0.753 1.028 1.242 1.444 1.619 1.774 1.929 2.231 2.369 2.496 2.555 2.805 2.904 3.106 3.301 3.488 3.572 3.744 3.913 4.147 4.304 4.454 4.661 4.869 5.078 5.285 5.474 5.696 5.918 6.129 6.372 6.628 6.87 7.124 7.415 7.688 7.97 8.266 8.563 8.874 9.235 9.654 10.052 10.489 10.988 11.575 12.22 12.911 13.611 14.244 14.444 14.364 14.15 13.843 13.531 13.246 12.959 12.67 12.361 12.085 11.793 11.482 11.204 10.944 10.701 10.453 10.217 10.001 9.788 9.571 9.392 9.201 8.99 8.826 8.638 8.429 8.209 7.973 7.819 7.666 7.421 7.256 7.085 6.993 6.808 6.612 6.389 6.264 5.976 5.831 5.681 5.528 5.173 4.992 4.796 4.553 4.278 3.962 3.464 1.438 -9 ,3371 ,KEBNE ,17024915,Wed Dec 22 11:19:03 CET,Wed Dec 22 12:53:54 CET,0.0 0.946 1.367 1.65 1.896 2.142 2.333 2.522 2.868 3.013 3.166 3.305 3.589 3.704 3.922 4.137 4.351 4.47 4.708 4.918 5.206 5.382 5.526 5.718 5.9 6.085 6.283 6.473 6.712 6.928 7.135 7.388 7.636 7.877 8.143 8.419 8.677 8.964 9.272 9.593 9.93 10.306 10.737 11.171 11.641 12.127 12.642 13.176 13.743 14.351 14.889 15.046 14.917 14.667 14.39 14.088 13.758 13.436 13.145 12.833 12.574 12.337 12.102 11.875 11.641 11.421 11.194 10.987 10.802 10.611 10.404 10.218 10.029 9.83 9.682 9.531 9.362 9.175 8.974 8.83 8.682 8.456 8.294 8.12 8.038 7.862 7.658 7.443 7.336 7.073 6.964 6.818 6.664 6.319 6.131 5.926 5.7 5.449 5.094 4.589 3.01 -10 ,26001 ,KEBNE ,17024916,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:01 CET,0.0 0.691 1.017 1.239 1.434 1.635 1.824 1.999 2.321 2.468 2.605 2.689 2.953 3.052 3.238 3.443 3.632 3.719 3.903 4.081 4.325 4.469 4.608 4.813 5.001 5.177 5.354 5.533 5.756 5.98 6.203 6.444 6.67 6.891 7.163 7.477 7.763 8.075 8.414 8.738 9.061 9.43 9.854 10.266 10.734 11.228 11.788 12.393 13.02 13.643 14.156 14.347 14.252 14.035 13.796 13.531 13.248 12.979 12.717 12.401 12.105 11.838 11.585 11.346 11.122 10.919 10.706 10.485 10.292 10.096 9.884 9.702 9.495 9.268 9.095 8.896 8.669 8.456 8.234 8.062 7.876 7.58 7.388 7.191 7.086 6.878 6.658 6.396 6.262 5.993 5.862 5.714 5.55 5.183 4.966 4.732 4.499 4.194 3.83 3.364 2.109 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_30_38.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_30_38.txt deleted file mode 100644 index 0e457f16..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_30_38.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24837 ,TETRA ,17559592,Sat Nov 27 07:56:23 CET,Sat Nov 27 09:45:54 CET,0.0 5.122 6.149 6.87 7.354 7.764 8.13 8.442 9.002 9.256 9.491 9.797 10.164 10.357 10.728 11.074 11.397 11.544 11.836 12.129 12.538 12.8 13.043 13.386 13.707 13.999 14.292 14.585 14.947 15.292 15.623 16.016 16.377 16.726 17.131 17.592 18.041 18.503 18.982 19.491 20.022 20.626 21.334 22.004 22.755 23.584 24.472 25.379 26.324 27.315 28.258 28.591 28.495 28.186 27.825 27.469 27.106 26.778 26.483 26.131 25.818 25.529 25.236 24.964 24.692 24.41 24.128 23.876 23.646 23.387 23.098 22.87 22.621 22.367 22.183 21.993 21.802 21.605 21.393 21.244 21.08 20.802 20.619 20.446 20.356 20.152 19.935 19.733 19.635 19.376 19.3 19.162 19.011 18.711 18.536 18.32 18.082 17.847 17.573 17.191 16.277 -2 ,625 ,TETRA ,17559593,Sat Nov 27 07:56:25 CET,Sat Nov 27 09:45:13 CET,0.0 6.342 7.181 7.777 8.195 8.572 8.94 9.283 9.891 10.159 10.402 10.673 11.026 11.232 11.61 11.958 12.296 12.456 12.75 13.03 13.438 13.704 13.954 14.303 14.636 14.966 15.273 15.552 15.911 16.248 16.59 16.985 17.346 17.701 18.108 18.563 18.988 19.452 19.956 20.472 20.992 21.583 22.264 22.922 23.675 24.49 25.37 26.286 27.254 28.255 29.148 29.538 29.477 29.167 28.753 28.343 27.946 27.478 27.048 26.624 26.248 25.902 25.558 25.233 24.923 24.648 24.393 24.171 23.977 23.775 23.559 23.361 23.143 22.895 22.703 22.536 22.345 22.119 21.89 21.736 21.566 21.29 21.111 20.923 20.826 20.635 20.418 20.182 20.075 19.815 19.736 19.617 19.473 19.116 18.941 18.766 18.569 18.344 18.056 17.718 16.059 -3 ,28038 ,TETRA ,17559594,Sat Nov 27 07:56:23 CET,Sat Nov 27 09:46:23 CET,0.0 3.565 4.382 4.951 5.392 5.781 6.158 6.523 7.167 7.436 7.681 7.98 8.337 8.518 8.852 9.185 9.503 9.65 9.93 10.21 10.605 10.851 11.082 11.405 11.724 12.061 12.384 12.682 13.05 13.402 13.767 14.175 14.527 14.876 15.273 15.694 16.076 16.526 17.038 17.524 18.006 18.555 19.176 19.789 20.497 21.255 22.052 22.887 23.786 24.706 25.534 25.887 25.832 25.57 25.247 24.898 24.578 24.262 23.913 23.54 23.239 22.959 22.697 22.44 22.174 21.921 21.644 21.386 21.147 20.898 20.651 20.427 20.18 19.938 19.746 19.551 19.332 19.092 18.851 18.682 18.508 18.224 18.029 17.826 17.728 17.535 17.31 17.084 16.98 16.714 16.633 16.504 16.369 16.101 15.961 15.795 15.618 15.42 15.167 14.834 13.414 -4 ,24665 ,TETRA ,17559595,Sat Nov 27 07:56:25 CET,Sat Nov 27 09:46:22 CET,0.0 3.356 4.046 4.555 4.999 5.41 5.774 6.102 6.631 6.87 7.115 7.435 7.81 8.012 8.388 8.721 9.035 9.182 9.446 9.706 10.097 10.369 10.631 10.966 11.258 11.545 11.831 12.125 12.504 12.838 13.14 13.488 13.807 14.122 14.49 14.921 15.354 15.812 16.305 16.835 17.38 17.965 18.598 19.225 19.963 20.778 21.682 22.603 23.568 24.529 25.396 25.848 25.887 25.668 25.328 24.999 24.693 24.355 24.002 23.62 23.284 22.985 22.694 22.416 22.168 21.935 21.671 21.415 21.2 20.987 20.736 20.512 20.275 20.039 19.862 19.663 19.457 19.237 19.011 18.855 18.697 18.466 18.295 18.119 18.032 17.852 17.664 17.46 17.342 17.06 16.961 16.825 16.686 16.384 16.219 16.029 15.828 15.638 15.402 15.094 13.996 -5 ,6923 ,TETRA ,17559596,Sat Nov 27 07:56:23 CET,Sat Nov 27 09:49:07 CET,0.0 2.763 3.556 4.026 4.469 4.881 5.217 5.508 6.047 6.293 6.514 6.797 7.163 7.363 7.732 8.083 8.393 8.526 8.809 9.088 9.489 9.745 9.98 10.325 10.663 10.976 11.262 11.53 11.882 12.207 12.511 12.877 13.23 13.59 14.018 14.485 14.921 15.399 15.907 16.434 16.97 17.587 18.297 18.958 19.708 20.522 21.443 22.436 23.46 24.491 25.414 25.759 25.716 25.513 25.22 24.847 24.46 24.11 23.77 23.36 22.981 22.671 22.371 22.058 21.782 21.531 21.262 21.012 20.783 20.562 20.323 20.128 19.946 19.763 19.624 19.477 19.32 19.159 18.979 18.856 18.743 18.546 18.396 18.23 18.142 17.971 17.783 17.583 17.479 17.218 17.169 17.067 16.955 16.687 16.528 16.351 16.162 15.939 15.66 15.274 14.17 -6 ,16759 ,TETRA ,17559597,Sat Nov 27 07:56:22 CET,Sat Nov 27 09:48:05 CET,0.0 3.999 4.705 5.187 5.606 5.963 6.27 6.573 7.116 7.363 7.602 7.884 8.243 8.429 8.782 9.145 9.504 9.676 9.994 10.289 10.708 10.98 11.251 11.639 11.983 12.31 12.632 12.933 13.3 13.651 13.99 14.381 14.759 15.108 15.467 15.847 16.242 16.682 17.15 17.685 18.242 18.809 19.429 20.037 20.735 21.519 22.4 23.327 24.35 25.405 26.332 26.755 26.691 26.383 26.059 25.7 25.321 24.951 24.603 24.256 23.96 23.67 23.385 23.13 22.876 22.613 22.336 22.094 21.878 21.655 21.408 21.191 20.965 20.735 20.562 20.369 20.162 19.973 19.791 19.653 19.482 19.22 19.056 18.888 18.796 18.596 18.38 18.164 18.052 17.77 17.667 17.543 17.393 17.046 16.863 16.687 16.494 16.251 15.95 15.552 13.846 -7 ,14374 ,TETRA ,17559598,Sat Nov 27 07:57:21 CET,Sat Nov 27 09:34:19 CET,0.0 8.327 9.368 9.953 10.372 10.735 11.055 11.368 11.925 12.152 12.374 12.654 13.011 13.194 13.531 13.874 14.211 14.37 14.677 14.982 15.408 15.677 15.939 16.287 16.616 16.929 17.25 17.545 17.89 18.235 18.567 18.979 19.38 19.744 20.137 20.572 20.983 21.431 21.902 22.393 22.889 23.423 24.089 24.772 25.555 26.415 27.273 28.105 28.994 29.944 30.793 31.045 30.932 30.697 30.348 29.904 29.508 29.116 28.749 28.368 28.002 27.677 27.341 27.027 26.708 26.385 26.069 25.797 25.549 25.283 25.008 24.775 24.534 24.279 24.079 23.863 23.636 23.399 23.143 22.966 22.786 22.495 22.293 22.108 22.016 21.826 21.648 21.463 21.342 21.047 20.935 20.819 20.683 20.334 20.139 19.942 19.756 19.569 19.366 19.048 17.951 -8 ,2742 ,TETRA ,17559599,Sat Nov 27 07:57:21 CET,Sat Nov 27 09:31:27 CET,0.0 3.858 4.763 5.299 5.779 6.201 6.553 6.873 7.495 7.766 8.016 8.338 8.701 8.901 9.274 9.616 9.946 10.099 10.397 10.696 11.091 11.35 11.605 11.96 12.298 12.602 12.897 13.204 13.597 13.956 14.289 14.691 15.071 15.437 15.865 16.337 16.791 17.287 17.801 18.328 18.867 19.452 20.133 20.81 21.565 22.367 23.255 24.208 25.217 26.246 27.334 27.995 28.089 27.882 27.608 27.298 26.896 26.468 26.116 25.784 25.456 25.149 24.883 24.643 24.401 24.155 23.897 23.655 23.428 23.193 22.961 22.765 22.553 22.326 22.153 21.98 21.795 21.603 21.385 21.22 21.044 20.77 20.563 20.339 20.224 19.976 19.726 19.478 19.351 19.049 18.913 18.78 18.641 18.359 18.208 18.034 17.836 17.622 17.379 16.973 15.187 -9 ,17699 ,TETRA ,17559600,Sat Nov 27 07:57:23 CET,Sat Nov 27 09:48:31 CET,0.0 4.854 5.791 6.346 6.773 7.168 7.559 7.904 8.445 8.708 8.97 9.287 9.656 9.856 10.22 10.574 10.904 11.052 11.331 11.607 12.016 12.278 12.52 12.843 13.152 13.45 13.752 14.059 14.433 14.782 15.102 15.474 15.828 16.159 16.554 16.996 17.389 17.809 18.264 18.754 19.254 19.793 20.422 21.044 21.754 22.505 23.304 24.156 25.098 26.105 27.072 27.452 27.468 27.307 27.041 26.758 26.445 26.096 25.761 25.437 25.153 24.889 24.625 24.366 24.116 23.873 23.616 23.37 23.151 22.924 22.681 22.488 22.294 22.088 21.919 21.743 21.552 21.34 21.1 20.929 20.772 20.539 20.373 20.19 20.098 19.921 19.728 19.493 19.367 19.101 19.004 18.865 18.719 18.36 18.127 17.886 17.643 17.352 16.989 16.542 15.109 -10 ,8369 ,TETRA ,17559601,Sat Nov 27 07:57:23 CET,Sat Nov 27 09:31:45 CET,0.0 4.053 4.93 5.595 6.156 6.619 6.96 7.24 7.744 7.984 8.227 8.574 8.965 9.164 9.524 9.869 10.175 10.317 10.602 10.888 11.285 11.515 11.746 12.107 12.439 12.746 13.052 13.342 13.729 14.101 14.423 14.812 15.191 15.543 15.937 16.384 16.845 17.351 17.892 18.475 19.051 19.66 20.392 21.123 21.919 22.751 23.626 24.581 25.67 26.74 27.687 28.101 28.058 27.809 27.452 27.122 26.854 26.578 26.285 25.974 25.69 25.42 25.142 24.869 24.616 24.337 24.027 23.769 23.546 23.336 23.13 22.941 22.726 22.522 22.383 22.243 22.096 21.947 21.794 21.671 21.539 21.34 21.197 21.051 20.978 20.815 20.647 20.488 20.401 20.134 20.026 19.881 19.738 19.449 19.292 19.111 18.931 18.765 18.543 18.274 17.693 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_31_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_31_34.txt deleted file mode 100644 index 65a5ff1d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_31_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26304 ,TETRA ,17559602,Sat Nov 27 07:57:23 CET,Sat Nov 27 09:48:55 CET,0.0 1.325 1.764 2.076 2.328 2.565 2.785 2.996 3.346 3.49 3.617 3.731 3.972 4.08 4.285 4.477 4.673 4.767 4.946 5.128 5.38 5.517 5.65 5.86 6.056 6.234 6.406 6.553 6.72 6.9 7.088 7.297 7.485 7.659 7.84 8.031 8.215 8.414 8.609 8.797 8.971 9.173 9.457 9.691 9.847 9.961 10.002 9.947 9.762 9.253 8.167 6.652 5.303 4.098 3.053 2.082 1.193 0.394 -0.272 -0.923 -1.514 -2.061 -2.563 -3.025 -3.458 -3.856 -4.28 -4.662 -4.992 -5.344 -5.697 -5.985 -6.288 -6.599 -6.846 -7.099 -7.357 -7.638 -7.935 -8.13 -8.333 -8.661 -8.895 -9.142 -9.266 -9.516 -9.796 -10.097 -10.247 -10.546 -10.739 -10.915 -11.093 -11.484 -11.728 -11.979 -12.267 -12.634 -13.027 -13.478 -14.786 -2 ,2143 ,TETRA ,17559603,Sat Nov 27 07:58:20 CET,Sat Nov 27 09:31:54 CET,0.0 1.157 1.595 1.961 2.241 2.515 2.764 2.973 3.36 3.523 3.672 3.833 4.084 4.201 4.44 4.677 4.911 5.019 5.209 5.384 5.627 5.781 5.926 6.131 6.328 6.522 6.695 6.868 7.095 7.28 7.451 7.666 7.861 8.042 8.24 8.466 8.667 8.865 9.085 9.302 9.508 9.722 9.915 10.066 10.24 10.382 10.472 10.483 10.326 9.868 8.764 7.201 5.844 4.625 3.556 2.59 1.741 0.982 0.331 -0.317 -0.859 -1.342 -1.802 -2.244 -2.674 -3.077 -3.49 -3.864 -4.197 -4.541 -4.902 -5.206 -5.515 -5.834 -6.083 -6.337 -6.614 -6.908 -7.201 -7.407 -7.63 -7.972 -8.203 -8.448 -8.579 -8.831 -9.088 -9.376 -9.531 -9.827 -9.998 -10.16 -10.318 -10.7 -10.921 -11.161 -11.447 -11.76 -12.121 -12.633 -14.372 -3 ,5878 ,TETRA ,17559604,Sat Nov 27 07:58:20 CET,Sat Nov 27 09:33:04 CET,0.0 1.154 1.658 2.014 2.346 2.606 2.802 2.968 3.298 3.456 3.597 3.746 4.007 4.137 4.373 4.58 4.767 4.865 5.075 5.261 5.526 5.695 5.846 6.053 6.244 6.43 6.603 6.772 6.988 7.176 7.348 7.563 7.759 7.931 8.143 8.38 8.581 8.791 9.011 9.217 9.406 9.604 9.811 10.008 10.193 10.327 10.394 10.364 10.172 9.693 8.568 6.963 5.572 4.376 3.356 2.419 1.567 0.803 0.164 -0.475 -1.031 -1.54 -2.021 -2.471 -2.918 -3.325 -3.738 -4.11 -4.429 -4.773 -5.124 -5.415 -5.725 -6.049 -6.295 -6.558 -6.837 -7.105 -7.388 -7.584 -7.776 -8.082 -8.311 -8.559 -8.677 -8.919 -9.187 -9.461 -9.612 -9.905 -10.07 -10.235 -10.43 -10.894 -11.131 -11.396 -11.671 -11.96 -12.346 -12.827 -14.082 -4 ,6350 ,TETRA ,17559605,Sat Nov 27 07:58:20 CET,Sat Nov 27 09:30:56 CET,0.0 0.969 1.339 1.651 1.915 2.143 2.363 2.562 2.907 3.07 3.227 3.386 3.646 3.768 3.99 4.189 4.37 4.46 4.637 4.806 5.029 5.16 5.287 5.468 5.647 5.829 6.001 6.153 6.347 6.525 6.697 6.898 7.078 7.257 7.464 7.687 7.877 8.061 8.254 8.464 8.656 8.854 9.048 9.222 9.402 9.509 9.572 9.556 9.395 8.934 7.793 6.19 4.844 3.658 2.62 1.704 0.898 0.157 -0.473 -1.106 -1.655 -2.16 -2.667 -3.127 -3.545 -3.929 -4.325 -4.691 -5.011 -5.335 -5.681 -5.967 -6.263 -6.579 -6.822 -7.083 -7.363 -7.646 -7.938 -8.134 -8.336 -8.666 -8.891 -9.119 -9.238 -9.486 -9.751 -10.037 -10.179 -10.471 -10.679 -10.866 -11.056 -11.429 -11.633 -11.875 -12.13 -12.425 -12.777 -13.227 -14.63 -5 ,2302 ,TETRA ,17559606,Sat Nov 27 07:58:20 CET,Sat Nov 27 09:30:58 CET,0.0 1.661 2.179 2.517 2.799 3.074 3.3 3.496 3.84 3.997 4.152 4.325 4.593 4.72 4.937 5.14 5.342 5.436 5.621 5.803 6.037 6.186 6.336 6.553 6.763 6.949 7.13 7.318 7.554 7.772 7.981 8.222 8.437 8.609 8.788 9.015 9.234 9.46 9.671 9.87 10.069 10.276 10.505 10.688 10.827 10.92 10.992 11.02 10.866 10.365 9.223 7.664 6.296 5.065 3.978 3.004 2.126 1.315 0.628 -0.06 -0.655 -1.185 -1.702 -2.169 -2.599 -2.991 -3.39 -3.758 -4.084 -4.414 -4.745 -5.011 -5.276 -5.571 -5.828 -6.085 -6.344 -6.607 -6.892 -7.097 -7.284 -7.597 -7.845 -8.078 -8.185 -8.428 -8.705 -9.008 -9.161 -9.459 -9.672 -9.865 -10.052 -10.456 -10.68 -10.928 -11.187 -11.446 -11.816 -12.308 -13.425 -6 ,19204 ,TETRA ,17559607,Sat Nov 27 07:58:20 CET,Sat Nov 27 09:48:24 CET,0.0 1.705 2.144 2.477 2.756 3.0 3.207 3.415 3.78 3.938 4.087 4.206 4.443 4.561 4.793 5.01 5.205 5.3 5.492 5.669 5.913 6.056 6.194 6.38 6.551 6.722 6.877 7.027 7.218 7.403 7.578 7.775 7.959 8.143 8.379 8.65 8.873 9.073 9.264 9.454 9.63 9.816 10.011 10.144 10.249 10.335 10.32 10.193 9.922 9.344 8.097 6.506 5.164 3.923 2.78 1.755 0.88 0.113 -0.514 -1.134 -1.697 -2.212 -2.678 -3.123 -3.538 -3.917 -4.32 -4.68 -4.999 -5.316 -5.644 -5.944 -6.261 -6.589 -6.841 -7.098 -7.371 -7.648 -7.922 -8.111 -8.304 -8.583 -8.78 -9.002 -9.116 -9.346 -9.604 -9.901 -10.046 -10.33 -10.497 -10.653 -10.813 -11.204 -11.433 -11.671 -11.921 -12.223 -12.605 -13.102 -14.188 -7 ,6125 ,TETRA ,17559608,Sat Nov 27 07:58:20 CET,Sat Nov 27 09:30:45 CET,0.0 1.352 1.836 2.194 2.474 2.715 2.928 3.129 3.48 3.642 3.793 3.924 4.164 4.272 4.479 4.661 4.82 4.908 5.089 5.252 5.489 5.645 5.797 6.009 6.196 6.371 6.548 6.705 6.908 7.107 7.286 7.494 7.694 7.892 8.122 8.36 8.571 8.805 9.03 9.237 9.461 9.692 9.902 10.083 10.264 10.411 10.512 10.495 10.301 9.818 8.696 7.125 5.733 4.502 3.426 2.448 1.604 0.835 0.157 -0.504 -1.065 -1.575 -2.079 -2.547 -2.966 -3.35 -3.762 -4.132 -4.449 -4.777 -5.108 -5.373 -5.636 -5.919 -6.161 -6.406 -6.652 -6.912 -7.177 -7.352 -7.541 -7.841 -8.046 -8.276 -8.405 -8.689 -8.98 -9.266 -9.408 -9.696 -9.906 -10.095 -10.296 -10.726 -10.95 -11.213 -11.515 -11.856 -12.296 -12.865 -14.138 -8 ,21418 ,TETRA ,17559609,Sat Nov 27 07:58:20 CET,Sat Nov 27 09:30:31 CET,0.0 1.25 1.707 2.056 2.324 2.547 2.753 2.95 3.331 3.502 3.666 3.848 4.11 4.232 4.456 4.661 4.85 4.946 5.135 5.312 5.571 5.717 5.846 6.049 6.253 6.44 6.618 6.8 7.009 7.183 7.343 7.536 7.718 7.89 8.087 8.284 8.457 8.655 8.875 9.101 9.311 9.531 9.749 9.896 10.029 10.155 10.234 10.22 10.031 9.528 8.471 7.002 5.693 4.538 3.493 2.555 1.746 1.009 0.353 -0.303 -0.856 -1.342 -1.806 -2.252 -2.674 -3.062 -3.472 -3.835 -4.151 -4.486 -4.815 -5.087 -5.384 -5.682 -5.91 -6.152 -6.414 -6.696 -6.999 -7.217 -7.438 -7.743 -7.95 -8.179 -8.298 -8.543 -8.781 -9.039 -9.175 -9.462 -9.638 -9.817 -10.014 -10.419 -10.614 -10.809 -11.06 -11.399 -11.812 -12.383 -14.395 -9 ,27829 ,TETRA ,17559610,Sat Nov 27 07:58:20 CET,Sat Nov 27 09:47:16 CET,0.0 2.157 2.607 2.906 3.199 3.46 3.677 3.867 4.189 4.331 4.474 4.634 4.899 5.023 5.235 5.419 5.593 5.678 5.841 6.007 6.264 6.42 6.56 6.766 6.97 7.162 7.335 7.497 7.686 7.842 8.005 8.204 8.393 8.579 8.765 8.972 9.168 9.353 9.521 9.722 9.944 10.153 10.377 10.561 10.725 10.872 10.982 10.982 10.75 10.189 9.039 7.493 6.12 4.916 3.876 2.964 2.155 1.398 0.735 0.078 -0.505 -1.027 -1.504 -1.95 -2.367 -2.768 -3.195 -3.559 -3.862 -4.18 -4.529 -4.817 -5.107 -5.402 -5.632 -5.887 -6.164 -6.456 -6.755 -6.959 -7.171 -7.49 -7.714 -7.956 -8.079 -8.327 -8.597 -8.889 -9.041 -9.337 -9.526 -9.711 -9.901 -10.312 -10.538 -10.781 -11.05 -11.376 -11.781 -12.254 -13.925 -10 ,7455 ,TETRA ,17559611,Sat Nov 27 07:59:22 CET,Sat Nov 27 09:32:37 CET,0.0 1.213 1.681 2.007 2.281 2.514 2.704 2.885 3.248 3.432 3.597 3.744 4.015 4.146 4.372 4.583 4.784 4.879 5.047 5.224 5.5 5.663 5.815 6.016 6.196 6.368 6.54 6.702 6.902 7.088 7.259 7.457 7.648 7.834 8.039 8.242 8.419 8.619 8.833 9.056 9.266 9.461 9.656 9.82 9.973 10.086 10.152 10.144 9.945 9.455 8.425 6.905 5.526 4.323 3.251 2.26 1.418 0.68 0.027 -0.635 -1.189 -1.687 -2.189 -2.665 -3.098 -3.493 -3.911 -4.287 -4.615 -4.961 -5.318 -5.62 -5.924 -6.226 -6.462 -6.715 -6.98 -7.248 -7.544 -7.75 -7.964 -8.309 -8.553 -8.815 -8.949 -9.205 -9.468 -9.769 -9.931 -10.237 -10.429 -10.607 -10.798 -11.219 -11.455 -11.699 -11.96 -12.283 -12.664 -13.126 -14.797 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_32_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_32_43.txt deleted file mode 100644 index 9f1bceb8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_32_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24048 ,KEBNE ,17024917,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:51 CET,0.0 2.339 2.844 3.193 3.49 3.757 4.016 4.245 4.67 4.872 5.048 5.261 5.59 5.743 6.006 6.22 6.411 6.509 6.709 6.881 7.121 7.276 7.423 7.645 7.859 8.059 8.246 8.425 8.663 8.887 9.092 9.335 9.564 9.77 10.015 10.296 10.565 10.846 11.147 11.475 11.8 12.153 12.544 12.899 13.314 13.761 14.209 14.678 15.144 15.578 15.843 15.637 15.234 14.789 14.344 13.912 13.508 13.11 12.733 12.362 12.055 11.775 11.502 11.23 10.964 10.703 10.429 10.197 9.998 9.793 9.578 9.408 9.231 9.038 8.894 8.742 8.58 8.414 8.258 8.155 8.045 7.872 7.733 7.574 7.49 7.311 7.132 6.938 6.839 6.589 6.519 6.405 6.295 6.052 5.92 5.775 5.622 5.428 5.175 4.867 3.774 -2 ,28643 ,KEBNE ,17024918,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:54:12 CET,0.0 1.203 1.699 2.056 2.37 2.642 2.887 3.113 3.502 3.679 3.841 3.981 4.272 4.403 4.647 4.873 5.076 5.168 5.344 5.518 5.774 5.94 6.101 6.325 6.526 6.731 6.932 7.113 7.364 7.61 7.83 8.085 8.32 8.544 8.806 9.095 9.358 9.64 9.938 10.239 10.549 10.901 11.294 11.657 12.071 12.523 12.991 13.453 13.943 14.351 14.51 14.263 13.859 13.421 12.967 12.531 12.136 11.747 11.384 10.99 10.659 10.374 10.082 9.805 9.546 9.294 9.026 8.788 8.586 8.384 8.16 7.972 7.777 7.57 7.405 7.237 7.065 6.893 6.722 6.612 6.498 6.306 6.177 6.047 5.971 5.818 5.67 5.495 5.397 5.145 5.123 5.037 4.945 4.735 4.621 4.492 4.356 4.206 4.02 3.744 3.278 -3 ,183 ,KEBNE ,17024919,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:57 CET,0.0 1.733 2.33 2.746 3.05 3.317 3.574 3.805 4.212 4.385 4.548 4.703 4.987 5.119 5.376 5.623 5.856 5.957 6.153 6.344 6.61 6.788 6.965 7.217 7.447 7.67 7.875 8.062 8.314 8.547 8.755 8.995 9.22 9.445 9.702 9.983 10.249 10.527 10.827 11.142 11.449 11.787 12.198 12.575 12.959 13.39 13.881 14.36 14.806 15.195 15.373 15.173 14.766 14.318 13.892 13.46 13.057 12.664 12.275 11.866 11.52 11.228 10.954 10.68 10.418 10.176 9.919 9.657 9.427 9.215 8.978 8.783 8.593 8.382 8.215 8.05 7.887 7.726 7.572 7.462 7.338 7.14 7.006 6.87 6.794 6.633 6.47 6.302 6.214 5.973 5.955 5.854 5.753 5.529 5.4 5.268 5.123 4.971 4.813 4.603 4.025 -4 ,25554 ,KEBNE ,17024920,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:44 CET,0.0 1.559 2.111 2.501 2.782 3.034 3.264 3.452 3.773 3.926 4.065 4.176 4.448 4.574 4.803 5.008 5.212 5.313 5.497 5.665 5.897 6.043 6.188 6.413 6.634 6.84 7.032 7.21 7.442 7.673 7.886 8.14 8.382 8.621 8.878 9.139 9.405 9.696 10.0 10.312 10.621 10.959 11.34 11.701 12.103 12.526 12.975 13.453 13.936 14.333 14.568 14.412 14.033 13.594 13.159 12.714 12.291 11.896 11.528 11.153 10.838 10.555 10.276 10.009 9.742 9.499 9.258 9.014 8.8 8.598 8.373 8.175 7.975 7.779 7.618 7.438 7.257 7.069 6.884 6.76 6.634 6.435 6.299 6.169 6.1 5.938 5.781 5.631 5.548 5.302 5.265 5.164 5.061 4.848 4.725 4.593 4.458 4.3 4.11 3.884 3.373 -5 ,28767 ,KEBNE ,17024921,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:53 CET,0.0 1.632 2.182 2.529 2.826 3.092 3.322 3.498 3.827 3.988 4.128 4.238 4.52 4.648 4.879 5.094 5.29 5.385 5.577 5.754 5.989 6.138 6.294 6.531 6.772 6.995 7.194 7.383 7.631 7.875 8.098 8.35 8.601 8.847 9.121 9.437 9.731 10.053 10.397 10.73 11.052 11.401 11.798 12.19 12.66 13.154 13.644 14.12 14.628 15.076 15.291 15.125 14.719 14.246 13.789 13.316 12.889 12.489 12.111 11.729 11.388 11.068 10.753 10.466 10.212 9.969 9.716 9.496 9.302 9.091 8.865 8.669 8.477 8.298 8.155 7.994 7.811 7.626 7.46 7.344 7.221 7.032 6.902 6.763 6.69 6.543 6.404 6.254 6.164 5.918 5.901 5.797 5.692 5.482 5.366 5.231 5.087 4.933 4.75 4.561 4.11 -6 ,18716 ,KEBNE ,17024922,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:54:22 CET,0.0 1.319 1.725 2.027 2.292 2.541 2.783 3.005 3.431 3.636 3.826 4.007 4.288 4.416 4.64 4.84 5.049 5.155 5.352 5.538 5.794 5.953 6.11 6.333 6.531 6.716 6.903 7.085 7.308 7.527 7.738 7.989 8.23 8.45 8.691 8.956 9.199 9.475 9.779 10.095 10.39 10.717 11.117 11.486 11.885 12.315 12.791 13.251 13.708 14.125 14.319 14.149 13.742 13.285 12.846 12.383 11.968 11.587 11.22 10.86 10.542 10.245 9.959 9.682 9.42 9.173 8.911 8.673 8.469 8.254 8.027 7.846 7.656 7.446 7.281 7.123 6.974 6.821 6.666 6.562 6.446 6.254 6.125 5.999 5.93 5.778 5.625 5.474 5.394 5.146 5.106 5.012 4.911 4.709 4.604 4.487 4.353 4.207 4.039 3.853 3.394 -7 ,18679 ,KEBNE ,17024923,Wed Dec 22 11:20:06 CET,Wed Dec 22 12:54:23 CET,0.0 1.357 1.872 2.301 2.578 2.788 2.985 3.173 3.538 3.716 3.877 4.001 4.281 4.409 4.635 4.86 5.069 5.162 5.331 5.506 5.756 5.918 6.075 6.287 6.497 6.698 6.892 7.089 7.327 7.543 7.766 8.042 8.287 8.522 8.803 9.113 9.392 9.668 9.955 10.253 10.555 10.874 11.226 11.558 11.961 12.422 12.902 13.381 13.881 14.312 14.514 14.312 13.943 13.552 13.149 12.7 12.253 11.854 11.491 11.079 10.739 10.465 10.192 9.933 9.697 9.477 9.237 9.017 8.832 8.642 8.432 8.247 8.056 7.868 7.715 7.561 7.424 7.279 7.113 6.998 6.887 6.725 6.608 6.486 6.411 6.222 6.013 5.803 5.693 5.416 5.318 5.19 5.06 4.766 4.588 4.397 4.206 3.964 3.683 3.359 2.234 -8 ,2796 ,KEBNE ,17024924,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:55 CET,0.0 1.216 1.738 2.137 2.452 2.697 2.917 3.113 3.468 3.646 3.805 3.929 4.207 4.328 4.565 4.785 4.996 5.096 5.282 5.456 5.713 5.884 6.05 6.276 6.484 6.675 6.86 7.045 7.266 7.475 7.682 7.932 8.162 8.396 8.664 8.943 9.217 9.515 9.817 10.12 10.43 10.782 11.182 11.557 11.979 12.43 12.871 13.317 13.801 14.251 14.482 14.257 13.855 13.401 12.958 12.53 12.111 11.685 11.282 10.889 10.562 10.251 9.952 9.677 9.399 9.132 8.861 8.616 8.402 8.173 7.926 7.738 7.542 7.336 7.183 7.005 6.807 6.608 6.405 6.268 6.135 5.928 5.785 5.643 5.575 5.433 5.287 5.124 5.039 4.796 4.795 4.703 4.589 4.335 4.196 4.06 3.922 3.755 3.509 3.196 2.78 -9 ,5687 ,KEBNE ,17024925,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:54:29 CET,0.0 1.642 2.142 2.505 2.826 3.117 3.34 3.537 3.896 4.055 4.207 4.344 4.622 4.742 4.973 5.183 5.379 5.479 5.666 5.848 6.107 6.254 6.399 6.612 6.825 7.028 7.218 7.413 7.653 7.875 8.089 8.341 8.589 8.813 9.069 9.364 9.633 9.934 10.262 10.59 10.905 11.254 11.672 12.051 12.447 12.874 13.303 13.738 14.23 14.629 14.801 14.636 14.265 13.843 13.39 12.942 12.532 12.141 11.81 11.463 11.135 10.833 10.538 10.25 9.981 9.756 9.538 9.336 9.15 8.953 8.733 8.552 8.374 8.197 8.059 7.909 7.756 7.588 7.415 7.297 7.175 6.99 6.852 6.701 6.629 6.476 6.324 6.168 6.081 5.837 5.797 5.699 5.599 5.36 5.219 5.072 4.924 4.773 4.585 4.327 3.604 -10 ,28268 ,KEBNE ,17024926,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:41 CET,0.0 1.806 2.27 2.621 2.943 3.224 3.465 3.682 4.063 4.232 4.394 4.555 4.842 4.97 5.22 5.456 5.662 5.758 5.953 6.14 6.39 6.549 6.706 6.934 7.158 7.363 7.548 7.737 7.984 8.204 8.406 8.645 8.878 9.113 9.367 9.642 9.922 10.214 10.509 10.803 11.106 11.46 11.852 12.226 12.649 13.089 13.528 13.981 14.442 14.796 14.957 14.798 14.42 13.969 13.551 13.146 12.753 12.379 12.029 11.659 11.328 11.048 10.781 10.515 10.261 10.028 9.768 9.527 9.318 9.097 8.864 8.668 8.468 8.255 8.088 7.916 7.745 7.573 7.376 7.232 7.091 6.867 6.696 6.517 6.431 6.243 6.043 5.83 5.718 5.459 5.415 5.306 5.191 4.946 4.805 4.644 4.484 4.315 4.074 3.728 3.239 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_32_46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_32_46.txt deleted file mode 100644 index 156f1524..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_32_46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,536 ,KEBNE ,17024927,Wed Dec 22 11:19:04 CET,Wed Dec 22 12:52:52 CET,0.0 1.6 2.132 2.526 2.842 3.097 3.313 3.509 3.866 4.031 4.19 4.302 4.562 4.672 4.879 5.07 5.246 5.33 5.498 5.648 5.846 5.985 6.123 6.308 6.469 6.626 6.792 6.958 7.152 7.328 7.502 7.689 7.864 8.042 8.235 8.437 8.632 8.868 9.114 9.335 9.557 9.794 10.031 10.242 10.456 10.661 10.862 10.999 11.044 10.918 10.397 9.562 8.793 8.073 7.397 6.757 6.192 5.666 5.234 4.802 4.418 4.067 3.724 3.412 3.148 2.906 2.641 2.412 2.205 1.974 1.747 1.585 1.412 1.219 1.068 0.911 0.75 0.58 0.398 0.27 0.145 -0.051 -0.185 -0.32 -0.398 -0.562 -0.719 -0.896 -0.988 -1.226 -1.228 -1.321 -1.419 -1.645 -1.769 -1.908 -2.058 -2.21 -2.399 -2.648 -3.237 -2 ,30513 ,KEBNE ,17024928,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:54:21 CET,0.0 1.887 2.323 2.637 2.915 3.176 3.411 3.606 3.966 4.137 4.304 4.479 4.775 4.902 5.146 5.388 5.609 5.717 5.922 6.108 6.361 6.513 6.667 6.892 7.101 7.292 7.467 7.627 7.811 7.981 8.153 8.354 8.548 8.742 8.932 9.11 9.279 9.45 9.642 9.843 10.043 10.266 10.488 10.675 10.887 11.089 11.279 11.42 11.431 11.302 10.821 9.993 9.23 8.563 7.962 7.395 6.873 6.398 6.003 5.594 5.24 4.917 4.581 4.266 3.98 3.725 3.456 3.213 3.012 2.796 2.579 2.407 2.219 2.028 1.876 1.712 1.536 1.361 1.183 1.056 0.92 0.698 0.552 0.406 0.331 0.179 0.008 -0.181 -0.271 -0.519 -0.549 -0.658 -0.767 -0.985 -1.101 -1.238 -1.382 -1.518 -1.673 -1.861 -2.271 -3 ,9713 ,KEBNE ,17024929,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:54:09 CET,0.0 1.69 2.19 2.54 2.857 3.122 3.356 3.571 3.957 4.13 4.291 4.459 4.742 4.865 5.099 5.314 5.531 5.643 5.841 6.026 6.282 6.427 6.573 6.794 6.999 7.199 7.395 7.568 7.786 7.994 8.184 8.406 8.606 8.793 8.998 9.204 9.412 9.674 9.951 10.204 10.436 10.663 10.909 11.151 11.396 11.646 11.87 12.044 12.152 12.072 11.61 10.798 10.022 9.31 8.649 8.014 7.453 6.958 6.526 6.061 5.656 5.311 4.994 4.712 4.445 4.195 3.942 3.71 3.508 3.306 3.088 2.901 2.699 2.474 2.278 2.069 1.848 1.627 1.41 1.262 1.112 0.864 0.687 0.509 0.416 0.217 0.001 -0.224 -0.34 -0.617 -0.711 -0.847 -0.983 -1.247 -1.388 -1.543 -1.725 -1.939 -2.175 -2.476 -3.122 -4 ,14764 ,KEBNE ,17024930,Wed Dec 22 11:20:08 CET,Wed Dec 22 12:56:22 CET,0.0 2.049 2.529 2.858 3.147 3.378 3.581 3.769 4.102 4.253 4.398 4.517 4.792 4.913 5.13 5.337 5.537 5.63 5.815 5.987 6.227 6.371 6.504 6.709 6.903 7.083 7.252 7.415 7.604 7.775 7.95 8.168 8.367 8.538 8.736 8.953 9.151 9.37 9.6 9.821 10.015 10.215 10.449 10.69 10.953 11.174 11.363 11.537 11.607 11.483 11.02 10.201 9.393 8.662 8.019 7.429 6.917 6.459 6.072 5.675 5.309 4.98 4.668 4.37 4.081 3.819 3.556 3.334 3.148 2.954 2.748 2.571 2.383 2.191 2.035 1.869 1.705 1.528 1.337 1.209 1.087 0.898 0.762 0.623 0.55 0.397 0.224 0.045 -0.039 -0.29 -0.33 -0.435 -0.538 -0.742 -0.857 -0.989 -1.137 -1.304 -1.491 -1.706 -2.146 -5 ,27571 ,KEBNE ,17024931,Wed Dec 22 11:20:06 CET,Wed Dec 22 12:54:27 CET,0.0 1.654 2.134 2.498 2.808 3.08 3.284 3.486 3.863 4.007 4.143 4.256 4.525 4.629 4.844 5.049 5.219 5.306 5.477 5.634 5.855 5.988 6.123 6.309 6.471 6.633 6.793 6.943 7.139 7.332 7.512 7.718 7.925 8.123 8.327 8.544 8.755 8.974 9.178 9.379 9.585 9.813 10.077 10.321 10.582 10.824 11.015 11.171 11.265 11.211 10.768 9.925 9.123 8.39 7.744 7.135 6.561 6.056 5.642 5.21 4.822 4.484 4.169 3.852 3.553 3.294 3.021 2.786 2.591 2.385 2.176 2.009 1.835 1.65 1.5 1.342 1.18 1.01 0.844 0.73 0.603 0.4 0.256 0.108 0.032 -0.12 -0.28 -0.454 -0.546 -0.794 -0.826 -0.933 -1.046 -1.295 -1.429 -1.558 -1.699 -1.892 -2.12 -2.409 -3.133 -6 ,22663 ,KEBNE ,17024932,Wed Dec 22 11:20:06 CET,Wed Dec 22 12:55:34 CET,0.0 1.38 1.926 2.312 2.606 2.838 3.034 3.211 3.523 3.672 3.81 3.919 4.199 4.31 4.502 4.686 4.882 4.979 5.162 5.335 5.564 5.712 5.855 6.055 6.244 6.418 6.584 6.741 6.941 7.138 7.344 7.582 7.779 7.955 8.161 8.388 8.591 8.814 9.052 9.286 9.513 9.741 9.991 10.236 10.461 10.637 10.827 10.971 11.055 10.981 10.499 9.706 8.915 8.181 7.539 6.945 6.385 5.867 5.439 4.994 4.592 4.217 3.861 3.524 3.203 2.927 2.645 2.387 2.165 1.936 1.713 1.542 1.36 1.164 1.015 0.86 0.693 0.514 0.332 0.205 0.074 -0.108 -0.227 -0.354 -0.42 -0.558 -0.71 -0.886 -0.98 -1.231 -1.264 -1.363 -1.459 -1.674 -1.792 -1.92 -2.05 -2.188 -2.364 -2.631 -3.437 -7 ,26524 ,KEBNE ,17024933,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:54:54 CET,0.0 2.361 2.904 3.269 3.568 3.839 4.069 4.279 4.623 4.773 4.924 5.053 5.34 5.472 5.702 5.916 6.117 6.22 6.407 6.579 6.855 7.024 7.18 7.404 7.609 7.795 7.958 8.111 8.294 8.465 8.637 8.839 9.02 9.186 9.373 9.593 9.807 10.029 10.255 10.481 10.702 10.93 11.173 11.417 11.658 11.847 12.038 12.182 12.236 12.134 11.685 10.861 10.071 9.336 8.663 8.036 7.483 6.983 6.555 6.145 5.787 5.461 5.156 4.866 4.593 4.35 4.096 3.866 3.669 3.468 3.255 3.081 2.911 2.72 2.558 2.387 2.217 2.055 1.889 1.762 1.631 1.438 1.299 1.149 1.074 0.93 0.779 0.615 0.529 0.281 0.271 0.174 0.06 -0.185 -0.309 -0.432 -0.576 -0.737 -0.92 -1.154 -1.732 -8 ,24146 ,KEBNE ,17024934,Wed Dec 22 11:20:06 CET,Wed Dec 22 12:54:00 CET,0.0 1.333 1.774 2.112 2.383 2.608 2.836 3.063 3.448 3.643 3.831 4.01 4.315 4.454 4.701 4.935 5.149 5.252 5.435 5.602 5.848 5.988 6.123 6.325 6.504 6.674 6.839 6.99 7.181 7.366 7.543 7.747 7.915 8.072 8.269 8.495 8.707 8.928 9.161 9.393 9.605 9.819 10.055 10.268 10.497 10.712 10.911 11.054 11.097 10.982 10.466 9.641 8.83 8.052 7.33 6.661 6.119 5.636 5.198 4.772 4.43 4.134 3.84 3.563 3.295 3.039 2.772 2.536 2.33 2.103 1.872 1.681 1.484 1.295 1.145 0.981 0.817 0.657 0.481 0.352 0.231 0.047 -0.09 -0.223 -0.29 -0.444 -0.602 -0.766 -0.859 -1.115 -1.146 -1.247 -1.35 -1.599 -1.732 -1.855 -2.003 -2.172 -2.372 -2.62 -3.018 -9 ,20774 ,KEBNE ,17024935,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:54:16 CET,0.0 1.4 1.882 2.261 2.548 2.773 2.966 3.151 3.518 3.691 3.855 3.992 4.258 4.379 4.609 4.801 4.978 5.063 5.23 5.396 5.617 5.751 5.886 6.085 6.279 6.45 6.62 6.791 6.986 7.171 7.347 7.541 7.723 7.901 8.099 8.304 8.499 8.716 8.946 9.175 9.39 9.611 9.862 10.118 10.382 10.624 10.843 11.003 11.051 10.944 10.495 9.668 8.905 8.188 7.515 6.882 6.302 5.794 5.366 4.939 4.576 4.252 3.932 3.628 3.367 3.141 2.894 2.662 2.461 2.237 1.999 1.807 1.599 1.381 1.215 1.04 0.857 0.671 0.471 0.327 0.187 -0.016 -0.166 -0.327 -0.409 -0.595 -0.781 -0.968 -1.074 -1.345 -1.405 -1.519 -1.642 -1.915 -2.059 -2.201 -2.348 -2.534 -2.738 -2.994 -3.79 -10 ,20867 ,KEBNE ,17024936,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:55:57 CET,0.0 1.291 1.789 2.128 2.407 2.656 2.868 3.061 3.399 3.553 3.684 3.78 4.054 4.169 4.388 4.584 4.762 4.846 5.009 5.163 5.378 5.518 5.649 5.838 6.022 6.206 6.372 6.518 6.712 6.898 7.074 7.27 7.457 7.621 7.809 8.042 8.255 8.479 8.702 8.922 9.144 9.39 9.663 9.903 10.153 10.395 10.602 10.73 10.76 10.632 10.15 9.353 8.581 7.86 7.207 6.559 5.976 5.467 5.016 4.555 4.144 3.798 3.504 3.218 2.934 2.685 2.429 2.19 1.989 1.782 1.562 1.384 1.207 1.028 0.887 0.726 0.558 0.393 0.216 0.083 -0.055 -0.257 -0.391 -0.527 -0.599 -0.758 -0.916 -1.073 -1.154 -1.397 -1.414 -1.509 -1.607 -1.824 -1.959 -2.101 -2.254 -2.439 -2.681 -2.961 -3.656 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_32_47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_32_47.txt deleted file mode 100644 index 27724d7e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_32_47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30714 ,KEBNE ,17024937,Wed Dec 22 11:20:06 CET,Wed Dec 22 12:53:29 CET,0.0 1.371 1.8 2.118 2.407 2.68 2.925 3.14 3.496 3.669 3.838 3.983 4.272 4.397 4.643 4.876 5.092 5.203 5.403 5.581 5.838 6.0 6.154 6.374 6.588 6.803 7.001 7.184 7.425 7.654 7.873 8.13 8.366 8.582 8.791 8.999 9.218 9.441 9.652 9.876 10.114 10.356 10.615 10.871 11.131 11.386 11.586 11.709 11.736 11.555 10.958 9.875 8.705 7.598 6.674 5.849 5.113 4.459 3.877 3.273 2.738 2.254 1.788 1.358 0.973 0.628 0.266 -0.055 -0.319 -0.604 -0.911 -1.168 -1.431 -1.7 -1.913 -2.129 -2.353 -2.604 -2.86 -3.033 -3.22 -3.514 -3.708 -3.911 -4.02 -4.235 -4.464 -4.712 -4.846 -5.157 -5.278 -5.428 -5.592 -5.995 -6.215 -6.434 -6.688 -6.956 -7.236 -7.568 -8.499 -2 ,19596 ,KEBNE ,17024938,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:55:25 CET,0.0 1.446 1.876 2.22 2.522 2.754 2.962 3.157 3.484 3.649 3.818 3.967 4.249 4.391 4.659 4.874 5.071 5.171 5.355 5.519 5.744 5.908 6.067 6.274 6.458 6.632 6.802 6.967 7.18 7.388 7.576 7.804 8.025 8.203 8.412 8.672 8.93 9.191 9.444 9.74 10.051 10.312 10.561 10.807 11.064 11.296 11.506 11.665 11.7 11.56 10.994 9.927 8.929 8.019 7.189 6.344 5.519 4.82 4.272 3.736 3.265 2.831 2.429 2.052 1.679 1.34 0.995 0.672 0.371 0.076 -0.219 -0.487 -0.772 -1.065 -1.292 -1.523 -1.757 -1.996 -2.241 -2.394 -2.54 -2.77 -2.937 -3.12 -3.209 -3.394 -3.584 -3.78 -3.881 -4.147 -4.198 -4.319 -4.455 -4.726 -4.858 -5.005 -5.159 -5.332 -5.559 -5.822 -6.219 -3 ,6443 ,KEBNE ,17024939,Wed Dec 22 11:20:06 CET,Wed Dec 22 12:54:53 CET,0.0 2.053 2.496 2.796 3.064 3.282 3.48 3.68 4.064 4.23 4.384 4.541 4.828 4.951 5.205 5.455 5.674 5.77 5.958 6.134 6.384 6.53 6.654 6.836 7.022 7.223 7.415 7.579 7.789 7.991 8.188 8.429 8.665 8.887 9.133 9.391 9.614 9.852 10.099 10.361 10.617 10.896 11.238 11.548 11.829 12.085 12.31 12.451 12.494 12.377 11.887 10.939 9.941 9.041 8.221 7.419 6.722 6.061 5.447 4.875 4.387 3.948 3.538 3.13 2.748 2.398 2.047 1.745 1.474 1.195 0.914 0.68 0.433 0.173 -0.056 -0.298 -0.536 -0.79 -1.052 -1.248 -1.45 -1.737 -1.941 -2.165 -2.285 -2.527 -2.759 -2.999 -3.131 -3.434 -3.567 -3.736 -3.912 -4.258 -4.454 -4.684 -4.918 -5.193 -5.537 -5.957 -6.92 -4 ,12847 ,KEBNE ,17024940,Wed Dec 22 11:20:15 CET,Wed Dec 22 12:54:08 CET,0.0 2.247 2.799 3.153 3.459 3.712 3.917 4.131 4.528 4.697 4.844 4.929 5.201 5.33 5.573 5.813 6.032 6.132 6.315 6.469 6.686 6.832 6.978 7.177 7.362 7.546 7.723 7.901 8.14 8.365 8.546 8.743 8.941 9.119 9.339 9.611 9.855 10.114 10.387 10.673 10.97 11.245 11.538 11.841 12.173 12.456 12.67 12.816 12.863 12.728 12.185 11.176 10.131 9.167 8.279 7.459 6.742 6.113 5.539 4.95 4.464 4.017 3.586 3.166 2.774 2.4 2.019 1.712 1.45 1.174 0.888 0.644 0.379 0.103 -0.104 -0.326 -0.569 -0.82 -1.079 -1.259 -1.442 -1.714 -1.899 -2.103 -2.214 -2.429 -2.656 -2.906 -3.039 -3.347 -3.486 -3.637 -3.789 -4.142 -4.342 -4.547 -4.774 -5.052 -5.375 -5.765 -7.17 -5 ,21868 ,KEBNE ,17024941,Wed Dec 22 11:20:10 CET,Wed Dec 22 12:53:35 CET,0.0 2.552 3.126 3.508 3.814 4.086 4.312 4.524 4.896 5.059 5.214 5.351 5.653 5.797 6.067 6.312 6.531 6.63 6.813 6.979 7.201 7.356 7.512 7.714 7.901 8.089 8.272 8.478 8.756 8.997 9.191 9.391 9.585 9.766 9.994 10.261 10.494 10.751 11.029 11.327 11.636 11.952 12.296 12.597 12.893 13.175 13.441 13.653 13.753 13.64 13.032 11.915 10.833 9.836 8.934 8.092 7.371 6.713 6.122 5.549 5.04 4.579 4.137 3.691 3.274 2.905 2.531 2.201 1.9 1.592 1.297 1.04 0.755 0.465 0.24 0.007 -0.234 -0.489 -0.742 -0.914 -1.103 -1.41 -1.615 -1.826 -1.941 -2.18 -2.42 -2.674 -2.808 -3.107 -3.225 -3.376 -3.53 -3.819 -3.977 -4.15 -4.354 -4.596 -4.861 -5.241 -6.084 -6 ,14313 ,KEBNE ,17024942,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:56:05 CET,0.0 2.725 3.398 3.768 4.054 4.321 4.56 4.779 5.164 5.335 5.499 5.666 5.959 6.097 6.35 6.567 6.768 6.867 7.065 7.26 7.534 7.705 7.87 8.101 8.321 8.53 8.734 8.932 9.181 9.419 9.651 9.936 10.206 10.449 10.723 11.016 11.266 11.526 11.809 12.111 12.42 12.736 13.056 13.373 13.704 13.981 14.232 14.451 14.564 14.402 13.736 12.609 11.549 10.594 9.694 8.822 8.074 7.43 6.853 6.288 5.793 5.336 4.908 4.498 4.119 3.764 3.389 3.058 2.768 2.462 2.155 1.909 1.642 1.369 1.162 0.94 0.689 0.432 0.182 0.01 -0.171 -0.47 -0.682 -0.902 -1.021 -1.266 -1.517 -1.793 -1.935 -2.243 -2.404 -2.57 -2.736 -3.118 -3.332 -3.574 -3.833 -4.102 -4.438 -4.885 -6.212 -7 ,5584 ,KEBNE ,17024943,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:55:04 CET,0.0 1.675 2.217 2.54 2.811 3.048 3.258 3.453 3.786 3.94 4.092 4.235 4.526 4.656 4.886 5.102 5.299 5.389 5.562 5.736 5.985 6.115 6.228 6.426 6.626 6.808 6.974 7.146 7.402 7.626 7.818 8.053 8.269 8.462 8.662 8.881 9.112 9.353 9.594 9.866 10.158 10.461 10.793 11.108 11.444 11.753 12.057 12.348 12.48 12.284 11.57 10.444 9.304 8.23 7.242 6.339 5.57 4.878 4.26 3.615 3.058 2.548 2.074 1.628 1.2 0.816 0.41 0.047 -0.273 -0.595 -0.907 -1.166 -1.426 -1.695 -1.904 -2.11 -2.328 -2.559 -2.788 -2.951 -3.124 -3.399 -3.6 -3.794 -3.895 -4.105 -4.303 -4.509 -4.626 -4.91 -4.989 -5.124 -5.269 -5.593 -5.78 -5.973 -6.192 -6.453 -6.731 -7.06 -8.006 -8 ,9799 ,KEBNE ,17024944,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:53:59 CET,0.0 2.031 2.565 2.919 3.23 3.517 3.766 3.988 4.361 4.535 4.696 4.841 5.139 5.267 5.522 5.762 5.98 6.075 6.255 6.45 6.715 6.879 7.042 7.273 7.493 7.685 7.863 8.039 8.254 8.455 8.64 8.85 9.064 9.277 9.507 9.731 9.933 10.166 10.404 10.652 10.922 11.233 11.555 11.794 12.01 12.221 12.426 12.603 12.653 12.497 11.851 10.725 9.691 8.697 7.823 7.04 6.325 5.675 5.111 4.558 4.075 3.629 3.189 2.769 2.392 2.054 1.7 1.394 1.134 0.83 0.507 0.252 -0.017 -0.3 -0.511 -0.734 -0.974 -1.227 -1.474 -1.64 -1.833 -2.148 -2.361 -2.565 -2.662 -2.86 -3.082 -3.323 -3.441 -3.73 -3.833 -3.979 -4.131 -4.46 -4.645 -4.85 -5.068 -5.297 -5.513 -5.792 -6.411 -9 ,25840 ,KEBNE ,17024945,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:53:48 CET,0.0 1.695 2.188 2.601 2.94 3.192 3.417 3.624 4.008 4.179 4.328 4.435 4.716 4.842 5.074 5.302 5.51 5.613 5.816 6.008 6.264 6.417 6.576 6.811 7.028 7.232 7.422 7.584 7.802 8.03 8.246 8.48 8.684 8.879 9.113 9.366 9.58 9.827 10.088 10.333 10.569 10.819 11.094 11.356 11.639 11.914 12.17 12.332 12.34 12.124 11.46 10.287 9.136 8.054 7.087 6.263 5.551 4.916 4.374 3.799 3.296 2.83 2.374 1.96 1.561 1.194 0.833 0.519 0.241 -0.05 -0.372 -0.654 -0.934 -1.225 -1.458 -1.692 -1.935 -2.183 -2.43 -2.596 -2.764 -3.03 -3.213 -3.407 -3.507 -3.713 -3.925 -4.135 -4.252 -4.544 -4.625 -4.752 -4.878 -5.152 -5.313 -5.493 -5.677 -5.885 -6.128 -6.423 -7.1 -10 ,4043 ,KEBNE ,17024946,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:55:01 CET,0.0 1.664 2.14 2.523 2.859 3.119 3.349 3.566 3.939 4.11 4.264 4.377 4.649 4.759 4.978 5.215 5.457 5.578 5.812 6.03 6.327 6.503 6.66 6.876 7.098 7.308 7.493 7.669 7.902 8.14 8.371 8.632 8.874 9.101 9.35 9.616 9.869 10.145 10.434 10.728 11.023 11.342 11.697 12.019 12.336 12.628 12.929 13.198 13.362 13.281 12.689 11.592 10.552 9.573 8.67 7.81 7.016 6.324 5.737 5.153 4.674 4.236 3.814 3.432 3.072 2.742 2.392 2.074 1.806 1.53 1.223 0.954 0.67 0.357 0.108 -0.151 -0.439 -0.748 -1.062 -1.271 -1.477 -1.794 -2.015 -2.242 -2.36 -2.61 -2.89 -3.199 -3.353 -3.663 -3.815 -4.001 -4.194 -4.593 -4.822 -5.061 -5.308 -5.565 -5.857 -6.322 -7.94 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_32.txt deleted file mode 100644 index 6f50328e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29666 ,TETRA ,17559612,Sat Nov 27 07:59:22 CET,Sat Nov 27 09:48:32 CET,0.0 0.813 1.104 1.363 1.594 1.788 1.929 2.043 2.257 2.343 2.421 2.425 2.648 2.725 2.887 3.055 3.223 3.294 3.416 3.528 3.669 3.772 3.88 4.028 4.174 4.324 4.477 4.63 4.825 5.007 5.176 5.382 5.581 5.765 5.971 6.2 6.424 6.658 6.888 7.141 7.406 7.669 7.944 8.222 8.534 8.839 9.136 9.42 9.695 9.87 9.818 9.391 8.817 8.257 7.747 7.267 6.829 6.397 5.995 5.582 5.228 4.908 4.591 4.285 3.981 3.713 3.435 3.179 2.956 2.706 2.445 2.248 2.048 1.829 1.658 1.475 1.28 1.078 0.866 0.711 0.549 0.29 0.103 -0.095 -0.196 -0.397 -0.61 -0.849 -0.987 -1.266 -1.394 -1.539 -1.688 -2.028 -2.209 -2.405 -2.68 -2.994 -3.298 -3.694 -5.144 -2 ,13178 ,TETRA ,17559613,Sat Nov 27 07:59:22 CET,Sat Nov 27 09:31:33 CET,0.0 0.651 0.82 0.965 1.121 1.307 1.52 1.705 2.014 2.167 2.316 2.446 2.713 2.827 3.034 3.204 3.384 3.481 3.651 3.803 4.015 4.156 4.294 4.485 4.669 4.83 4.983 5.144 5.356 5.553 5.737 5.961 6.182 6.383 6.6 6.842 7.065 7.301 7.547 7.788 8.044 8.309 8.582 8.855 9.147 9.441 9.755 10.076 10.381 10.554 10.453 9.984 9.391 8.791 8.226 7.671 7.163 6.689 6.257 5.825 5.471 5.169 4.868 4.569 4.285 4.022 3.75 3.494 3.254 2.995 2.73 2.52 2.311 2.079 1.892 1.702 1.492 1.281 1.061 0.905 0.759 0.518 0.338 0.148 0.052 -0.143 -0.348 -0.557 -0.671 -0.936 -1.017 -1.15 -1.303 -1.653 -1.847 -2.051 -2.294 -2.59 -2.903 -3.308 -4.363 -3 ,4251 ,TETRA ,17559614,Sat Nov 27 07:59:22 CET,Sat Nov 27 09:48:35 CET,0.0 0.98 1.369 1.609 1.836 2.058 2.257 2.454 2.844 3.024 3.179 3.312 3.58 3.699 3.904 4.096 4.276 4.361 4.529 4.686 4.89 5.018 5.15 5.337 5.517 5.693 5.859 6.012 6.2 6.373 6.547 6.758 6.955 7.142 7.342 7.558 7.769 8.001 8.262 8.528 8.796 9.074 9.353 9.618 9.928 10.248 10.541 10.827 11.108 11.265 11.149 10.706 10.18 9.582 9.001 8.49 8.035 7.602 7.2 6.788 6.444 6.132 5.834 5.538 5.257 5.0 4.73 4.499 4.293 4.077 3.862 3.656 3.435 3.217 3.047 2.876 2.692 2.49 2.274 2.124 1.966 1.722 1.54 1.342 1.241 1.025 0.794 0.546 0.429 0.156 0.027 -0.122 -0.291 -0.644 -0.85 -1.07 -1.279 -1.531 -1.897 -2.383 -3.532 -4 ,16471 ,TETRA ,17559615,Sat Nov 27 08:01:59 CET,Sat Nov 27 09:49:50 CET,0.0 1.051 1.372 1.596 1.807 1.982 2.132 2.272 2.514 2.627 2.738 2.789 3.038 3.141 3.333 3.509 3.709 3.811 3.989 4.157 4.415 4.585 4.736 4.955 5.17 5.37 5.553 5.719 5.938 6.145 6.333 6.554 6.768 6.964 7.193 7.466 7.698 7.934 8.179 8.419 8.671 8.943 9.253 9.565 9.869 10.161 10.486 10.817 11.117 11.286 11.201 10.765 10.208 9.633 9.084 8.568 8.113 7.66 7.228 6.817 6.478 6.153 5.843 5.552 5.274 5.017 4.748 4.505 4.282 4.033 3.783 3.58 3.358 3.125 2.949 2.767 2.563 2.349 2.127 1.977 1.825 1.603 1.448 1.27 1.179 0.991 0.78 0.566 0.467 0.214 0.117 -0.023 -0.193 -0.587 -0.786 -0.977 -1.194 -1.428 -1.679 -2.164 -3.407 -5 ,16303 ,TETRA ,17559616,Sat Nov 27 08:01:59 CET,Sat Nov 27 09:49:36 CET,0.0 0.8 1.081 1.272 1.445 1.606 1.744 1.866 2.095 2.197 2.291 2.321 2.545 2.616 2.77 2.923 3.056 3.123 3.252 3.373 3.541 3.653 3.763 3.916 4.061 4.206 4.35 4.491 4.666 4.841 5.011 5.202 5.391 5.568 5.778 6.019 6.234 6.461 6.702 6.948 7.2 7.494 7.825 8.108 8.396 8.721 9.055 9.342 9.588 9.71 9.594 9.106 8.514 7.925 7.364 6.861 6.398 5.94 5.531 5.129 4.779 4.441 4.119 3.819 3.536 3.285 3.016 2.766 2.552 2.323 2.074 1.873 1.674 1.462 1.285 1.104 0.922 0.731 0.536 0.403 0.261 0.007 -0.177 -0.358 -0.446 -0.632 -0.843 -1.058 -1.164 -1.449 -1.614 -1.769 -1.931 -2.279 -2.498 -2.747 -2.994 -3.231 -3.522 -3.948 -5.259 -6 ,5523 ,TETRA ,17559617,Sat Nov 27 08:01:59 CET,Sat Nov 27 09:49:06 CET,0.0 0.738 0.99 1.223 1.428 1.597 1.751 1.898 2.151 2.262 2.367 2.406 2.65 2.747 2.921 3.078 3.247 3.332 3.491 3.659 3.902 4.05 4.197 4.409 4.589 4.761 4.939 5.094 5.3 5.503 5.692 5.928 6.131 6.311 6.515 6.732 6.931 7.15 7.366 7.583 7.822 8.084 8.363 8.63 8.889 9.142 9.402 9.666 9.944 10.104 9.952 9.445 8.902 8.34 7.812 7.303 6.838 6.404 6.021 5.65 5.325 5.003 4.674 4.366 4.075 3.827 3.578 3.328 3.109 2.893 2.667 2.471 2.26 2.051 1.895 1.722 1.55 1.37 1.179 1.05 0.913 0.7 0.533 0.34 0.229 -0.015 -0.272 -0.539 -0.674 -0.965 -1.148 -1.337 -1.524 -1.909 -2.102 -2.283 -2.487 -2.784 -3.161 -3.569 -4.318 -7 ,8765 ,TETRA ,17559618,Sat Nov 27 08:01:59 CET,Sat Nov 27 09:51:04 CET,0.0 1.303 1.693 1.961 2.171 2.352 2.524 2.676 2.946 3.088 3.219 3.305 3.558 3.673 3.905 4.094 4.262 4.341 4.494 4.646 4.882 5.032 5.179 5.398 5.608 5.802 5.984 6.166 6.383 6.567 6.734 6.935 7.121 7.301 7.514 7.733 7.948 8.188 8.43 8.662 8.893 9.165 9.471 9.758 10.074 10.383 10.686 10.981 11.246 11.416 11.308 10.808 10.247 9.705 9.212 8.73 8.243 7.797 7.429 7.034 6.661 6.331 6.04 5.737 5.441 5.179 4.893 4.612 4.371 4.133 3.876 3.665 3.463 3.249 3.071 2.884 2.684 2.485 2.273 2.111 1.939 1.688 1.518 1.329 1.223 1.017 0.82 0.597 0.485 0.215 0.086 -0.077 -0.275 -0.666 -0.856 -1.063 -1.316 -1.62 -1.951 -2.419 -4.673 -8 ,12534 ,TETRA ,17559619,Sat Nov 27 08:03:22 CET,Sat Nov 27 09:51:17 CET,0.0 0.986 1.316 1.579 1.804 2.061 2.299 2.476 2.796 2.948 3.081 3.157 3.409 3.51 3.691 3.858 4.012 4.076 4.198 4.309 4.479 4.591 4.699 4.858 4.998 5.134 5.266 5.386 5.544 5.705 5.856 6.036 6.226 6.415 6.633 6.87 7.091 7.32 7.563 7.819 8.061 8.33 8.645 8.936 9.241 9.551 9.859 10.152 10.418 10.577 10.447 9.962 9.414 8.846 8.334 7.841 7.378 6.945 6.544 6.135 5.786 5.468 5.155 4.857 4.578 4.315 4.035 3.784 3.555 3.3 3.049 2.847 2.644 2.439 2.256 2.039 1.811 1.587 1.351 1.178 0.993 0.717 0.536 0.341 0.235 0.029 -0.177 -0.412 -0.551 -0.856 -1.03 -1.189 -1.349 -1.683 -1.888 -2.141 -2.432 -2.792 -3.184 -3.608 -4.736 -9 ,22224 ,TETRA ,17559620,Sat Nov 27 08:03:23 CET,Sat Nov 27 09:51:07 CET,0.0 1.536 1.966 2.283 2.539 2.763 2.965 3.159 3.481 3.625 3.775 3.925 4.202 4.319 4.526 4.735 4.938 5.028 5.186 5.323 5.522 5.671 5.813 6.001 6.178 6.356 6.521 6.68 6.882 7.066 7.24 7.457 7.674 7.89 8.153 8.418 8.638 8.869 9.111 9.358 9.605 9.885 10.199 10.479 10.781 11.081 11.354 11.623 11.911 12.069 11.925 11.458 10.836 10.208 9.654 9.141 8.662 8.22 7.801 7.355 6.956 6.593 6.263 5.969 5.675 5.352 5.029 4.78 4.579 4.349 4.089 3.886 3.679 3.465 3.296 3.119 2.918 2.713 2.512 2.356 2.182 1.896 1.691 1.491 1.389 1.156 0.892 0.608 0.46 0.147 -0.002 -0.133 -0.281 -0.604 -0.788 -1.013 -1.268 -1.581 -1.908 -2.311 -3.378 -10 ,14170 ,TETRA ,17559621,Sat Nov 27 08:03:23 CET,Sat Nov 27 09:50:35 CET,0.0 1.097 1.437 1.709 1.926 2.11 2.27 2.406 2.673 2.803 2.918 2.975 3.219 3.313 3.481 3.65 3.821 3.901 4.052 4.208 4.415 4.532 4.651 4.831 5.008 5.183 5.348 5.501 5.688 5.87 6.038 6.226 6.414 6.596 6.803 7.051 7.297 7.563 7.843 8.123 8.407 8.696 9.006 9.292 9.57 9.861 10.177 10.479 10.732 10.885 10.784 10.294 9.701 9.112 8.57 8.048 7.582 7.153 6.748 6.342 6.0 5.681 5.366 5.066 4.792 4.533 4.236 3.966 3.737 3.5 3.249 3.033 2.804 2.576 2.406 2.22 2.026 1.828 1.637 1.505 1.36 1.132 0.97 0.809 0.722 0.525 0.315 0.085 -0.033 -0.294 -0.394 -0.525 -0.669 -1.013 -1.197 -1.398 -1.652 -1.943 -2.257 -2.642 -3.884 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_35.txt deleted file mode 100644 index 5f160835..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7265 ,TETRA ,17559622,Sat Nov 27 08:03:23 CET,Sat Nov 27 09:50:59 CET,0.0 2.222 2.881 3.369 3.694 3.937 4.167 4.382 4.772 4.951 5.127 5.301 5.594 5.732 5.956 6.17 6.382 6.476 6.644 6.794 7.006 7.153 7.292 7.481 7.671 7.851 8.018 8.173 8.361 8.534 8.709 8.933 9.141 9.324 9.519 9.729 9.943 10.176 10.412 10.646 10.88 11.13 11.429 11.699 11.933 12.161 12.377 12.543 12.663 12.603 12.199 11.469 10.693 9.985 9.373 8.78 8.217 7.709 7.274 6.818 6.426 6.089 5.78 5.483 5.181 4.895 4.593 4.323 4.097 3.87 3.629 3.424 3.221 2.992 2.795 2.601 2.416 2.223 2.01 1.871 1.726 1.488 1.327 1.16 1.071 0.88 0.679 0.475 0.361 0.081 -0.042 -0.18 -0.324 -0.643 -0.815 -1.009 -1.239 -1.497 -1.802 -2.205 -3.238 -2 ,11095 ,TETRA ,17559623,Sat Nov 27 08:03:25 CET,Sat Nov 27 09:50:57 CET,0.0 1.689 2.169 2.561 2.86 3.091 3.317 3.525 3.857 4.0 4.141 4.246 4.511 4.633 4.877 5.099 5.316 5.421 5.601 5.766 5.997 6.138 6.272 6.454 6.624 6.793 6.949 7.097 7.273 7.441 7.604 7.789 7.975 8.151 8.351 8.561 8.753 8.984 9.218 9.446 9.682 9.953 10.245 10.491 10.739 10.977 11.201 11.375 11.486 11.482 11.138 10.354 9.574 8.851 8.217 7.624 7.068 6.56 6.132 5.697 5.304 4.953 4.622 4.303 4.001 3.726 3.428 3.166 2.945 2.712 2.475 2.27 2.06 1.844 1.67 1.499 1.316 1.111 0.897 0.751 0.607 0.379 0.207 0.031 -0.056 -0.252 -0.481 -0.727 -0.85 -1.128 -1.242 -1.383 -1.534 -1.887 -2.088 -2.294 -2.52 -2.774 -3.068 -3.46 -4.499 -3 ,3568 ,TETRA ,17559624,Sat Nov 27 08:03:23 CET,Sat Nov 27 09:51:05 CET,0.0 1.638 2.132 2.47 2.733 2.972 3.177 3.362 3.708 3.868 4.006 4.113 4.375 4.489 4.711 4.907 5.086 5.185 5.398 5.598 5.873 6.045 6.19 6.374 6.563 6.755 6.939 7.119 7.349 7.575 7.787 8.022 8.232 8.428 8.662 8.901 9.12 9.358 9.577 9.788 10.0 10.218 10.463 10.694 10.943 11.169 11.353 11.615 11.892 11.921 11.521 10.765 10.037 9.33 8.647 8.037 7.501 6.987 6.544 6.108 5.719 5.381 5.053 4.73 4.429 4.145 3.844 3.581 3.321 3.012 2.692 2.423 2.148 1.906 1.746 1.583 1.391 1.145 0.885 0.711 0.536 0.262 0.066 -0.12 -0.204 -0.37 -0.55 -0.731 -0.839 -1.12 -1.291 -1.456 -1.609 -1.974 -2.163 -2.363 -2.593 -2.817 -3.085 -3.463 -4.705 -4 ,18771 ,TETRA ,17559625,Sat Nov 27 08:03:25 CET,Sat Nov 27 09:50:48 CET,0.0 2.201 2.747 3.138 3.45 3.692 3.9 4.083 4.382 4.521 4.667 4.779 5.039 5.15 5.357 5.555 5.732 5.821 5.991 6.148 6.36 6.495 6.628 6.81 6.969 7.138 7.307 7.456 7.661 7.856 8.03 8.237 8.435 8.634 8.849 9.075 9.291 9.506 9.728 9.964 10.214 10.482 10.791 11.08 11.331 11.566 11.819 12.009 12.124 12.128 11.767 11.02 10.212 9.448 8.803 8.217 7.683 7.192 6.767 6.311 5.891 5.514 5.157 4.82 4.514 4.237 3.942 3.677 3.442 3.199 2.951 2.749 2.54 2.32 2.146 1.963 1.765 1.554 1.34 1.176 1.004 0.763 0.595 0.413 0.326 0.161 -0.027 -0.249 -0.367 -0.631 -0.721 -0.856 -1.005 -1.312 -1.484 -1.681 -1.902 -2.125 -2.371 -2.69 -3.582 -5 ,17660 ,TETRA ,17559626,Sat Nov 27 08:04:20 CET,Sat Nov 27 09:52:01 CET,0.0 1.659 2.105 2.435 2.707 2.943 3.148 3.331 3.669 3.839 3.997 4.128 4.402 4.526 4.773 4.994 5.176 5.261 5.422 5.581 5.802 5.941 6.078 6.26 6.431 6.598 6.765 6.934 7.137 7.332 7.519 7.729 7.931 8.117 8.318 8.529 8.723 8.948 9.179 9.405 9.633 9.894 10.216 10.496 10.756 10.995 11.23 11.447 11.568 11.52 11.138 10.337 9.554 8.838 8.144 7.485 6.918 6.395 5.911 5.438 5.039 4.688 4.364 4.042 3.731 3.449 3.169 2.913 2.681 2.446 2.191 1.976 1.753 1.522 1.334 1.114 0.898 0.662 0.411 0.244 0.064 -0.217 -0.395 -0.588 -0.701 -0.91 -1.108 -1.306 -1.411 -1.688 -1.826 -1.978 -2.131 -2.483 -2.691 -2.924 -3.164 -3.414 -3.693 -4.064 -6.114 -6 ,16322 ,TETRA ,17559627,Sat Nov 27 08:04:20 CET,Sat Nov 27 09:51:52 CET,0.0 1.972 2.52 2.921 3.23 3.479 3.732 3.973 4.351 4.499 4.638 4.771 5.036 5.155 5.389 5.608 5.795 5.88 6.045 6.189 6.403 6.545 6.673 6.854 7.032 7.208 7.371 7.526 7.72 7.914 8.107 8.335 8.544 8.731 8.949 9.191 9.404 9.622 9.853 10.102 10.351 10.605 10.876 11.134 11.406 11.697 11.976 12.201 12.352 12.33 11.958 11.219 10.485 9.792 9.139 8.503 7.953 7.463 7.012 6.554 6.152 5.785 5.43 5.095 4.785 4.499 4.199 3.935 3.719 3.484 3.23 3.027 2.813 2.573 2.383 2.185 1.994 1.788 1.561 1.407 1.24 0.983 0.806 0.632 0.55 0.382 0.172 -0.066 -0.187 -0.455 -0.542 -0.669 -0.81 -1.127 -1.308 -1.507 -1.75 -2.03 -2.352 -2.819 -3.815 -7 ,14015 ,TETRA ,17559628,Sat Nov 27 08:04:20 CET,Sat Nov 27 09:53:02 CET,0.0 1.399 1.942 2.376 2.686 2.956 3.178 3.362 3.681 3.83 3.965 4.051 4.307 4.42 4.644 4.839 5.01 5.099 5.282 5.453 5.704 5.856 5.996 6.207 6.412 6.591 6.759 6.924 7.112 7.295 7.478 7.688 7.896 8.086 8.298 8.532 8.754 9.0 9.249 9.485 9.718 9.97 10.232 10.469 10.721 10.962 11.204 11.411 11.54 11.511 11.13 10.399 9.648 8.9 8.251 7.684 7.145 6.645 6.201 5.728 5.335 5.006 4.668 4.32 4.008 3.727 3.429 3.15 2.903 2.662 2.42 2.224 2.017 1.789 1.612 1.422 1.228 1.037 0.826 0.676 0.518 0.281 0.108 -0.088 -0.191 -0.408 -0.636 -0.884 -1.008 -1.288 -1.444 -1.599 -1.775 -2.167 -2.376 -2.613 -2.897 -3.239 -3.608 -4.048 -5.375 -8 ,7384 ,TETRA ,17559629,Sat Nov 27 08:05:20 CET,Sat Nov 27 09:53:17 CET,0.0 1.698 2.135 2.506 2.811 3.062 3.293 3.486 3.818 3.964 4.107 4.236 4.506 4.635 4.879 5.101 5.314 5.414 5.61 5.811 6.099 6.256 6.396 6.597 6.772 6.939 7.098 7.256 7.459 7.638 7.8 8.004 8.199 8.389 8.601 8.802 8.988 9.193 9.406 9.64 9.87 10.109 10.372 10.603 10.857 11.127 11.393 11.636 11.821 11.823 11.437 10.687 9.928 9.21 8.58 7.989 7.443 6.924 6.454 6.022 5.666 5.328 4.986 4.668 4.374 4.105 3.827 3.555 3.306 3.061 2.812 2.597 2.375 2.143 1.956 1.781 1.599 1.396 1.178 1.016 0.851 0.588 0.392 0.194 0.101 -0.087 -0.288 -0.5 -0.606 -0.863 -0.963 -1.093 -1.238 -1.596 -1.791 -1.998 -2.226 -2.501 -2.855 -3.333 -4.532 -9 ,28670 ,TETRA ,17559630,Sat Nov 27 08:06:22 CET,Sat Nov 27 09:55:59 CET,0.0 1.248 1.773 2.171 2.503 2.78 3.003 3.184 3.502 3.644 3.772 3.855 4.108 4.218 4.425 4.604 4.784 4.88 5.045 5.19 5.413 5.548 5.674 5.865 6.044 6.205 6.358 6.505 6.681 6.854 7.03 7.241 7.428 7.585 7.782 8.006 8.213 8.439 8.682 8.935 9.187 9.452 9.719 9.974 10.26 10.519 10.756 10.949 11.068 11.018 10.648 9.949 9.192 8.46 7.794 7.188 6.663 6.166 5.723 5.291 4.915 4.565 4.224 3.9 3.589 3.3 3.005 2.737 2.506 2.272 2.011 1.789 1.566 1.334 1.155 0.966 0.774 0.581 0.377 0.241 0.089 -0.178 -0.36 -0.554 -0.658 -0.878 -1.113 -1.36 -1.491 -1.78 -1.918 -2.075 -2.247 -2.646 -2.862 -3.088 -3.34 -3.633 -3.998 -4.457 -5.614 -10 ,30751 ,TETRA ,17559631,Sat Nov 27 08:06:21 CET,Sat Nov 27 09:59:26 CET,0.0 1.387 1.951 2.36 2.666 2.916 3.135 3.323 3.626 3.75 3.872 3.999 4.28 4.406 4.636 4.87 5.085 5.179 5.359 5.534 5.764 5.901 6.028 6.208 6.375 6.526 6.671 6.807 6.986 7.165 7.33 7.521 7.709 7.875 8.054 8.266 8.469 8.675 8.889 9.119 9.367 9.615 9.855 10.084 10.327 10.567 10.772 10.94 11.021 10.919 10.527 9.763 8.999 8.334 7.699 7.115 6.61 6.135 5.69 5.222 4.859 4.539 4.24 3.96 3.659 3.363 3.07 2.813 2.568 2.317 2.062 1.824 1.579 1.357 1.184 0.995 0.794 0.584 0.37 0.214 0.054 -0.186 -0.362 -0.565 -0.665 -0.846 -1.034 -1.235 -1.346 -1.616 -1.7 -1.838 -1.991 -2.311 -2.482 -2.666 -2.862 -3.113 -3.408 -3.714 -4.465 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_36.txt deleted file mode 100644 index 4e526d66..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_36.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9780 ,TETRA ,17559632,Sat Nov 27 08:07:23 CET,Sat Nov 27 09:55:26 CET,0.0 2.59 3.24 3.729 4.138 4.437 4.682 4.91 5.328 5.53 5.715 5.891 6.178 6.331 6.614 6.836 7.05 7.158 7.363 7.554 7.837 8.018 8.18 8.413 8.634 8.837 9.044 9.237 9.472 9.691 9.89 10.121 10.351 10.588 10.845 11.127 11.402 11.672 11.936 12.23 12.542 12.877 13.231 13.559 13.933 14.309 14.692 15.068 15.396 15.563 15.417 14.965 14.423 13.827 13.257 12.738 12.259 11.807 11.409 10.985 10.614 10.3 10.014 9.728 9.431 9.165 8.898 8.654 8.436 8.194 7.936 7.728 7.517 7.285 7.095 6.912 6.729 6.525 6.311 6.172 6.027 5.799 5.637 5.462 5.38 5.204 5.009 4.809 4.694 4.422 4.321 4.186 4.04 3.732 3.561 3.359 3.124 2.835 2.549 2.158 1.119 -2 ,18016 ,TETRA ,17559633,Sat Nov 27 08:07:22 CET,Sat Nov 27 09:55:46 CET,0.0 2.121 2.811 3.299 3.665 3.981 4.255 4.514 4.986 5.2 5.388 5.555 5.843 6.002 6.304 6.568 6.824 6.948 7.196 7.446 7.775 7.966 8.134 8.362 8.592 8.814 9.025 9.222 9.453 9.676 9.887 10.133 10.36 10.571 10.82 11.093 11.334 11.588 11.869 12.159 12.461 12.775 13.118 13.461 13.819 14.153 14.516 14.866 15.14 15.331 15.301 14.877 14.325 13.739 13.171 12.655 12.194 11.727 11.323 10.935 10.583 10.259 9.961 9.679 9.412 9.164 8.906 8.687 8.484 8.259 8.043 7.859 7.653 7.443 7.278 7.117 6.951 6.769 6.564 6.396 6.214 5.978 5.83 5.672 5.588 5.409 5.227 5.024 4.91 4.651 4.588 4.475 4.348 4.059 3.882 3.685 3.493 3.277 2.98 2.581 1.524 -3 ,6189 ,TETRA ,17559634,Sat Nov 27 08:07:22 CET,Sat Nov 27 09:57:53 CET,0.0 2.223 2.769 3.209 3.575 3.874 4.125 4.352 4.748 4.943 5.122 5.29 5.581 5.726 5.982 6.219 6.471 6.598 6.84 7.058 7.359 7.542 7.719 7.962 8.175 8.377 8.566 8.751 8.987 9.218 9.443 9.707 9.953 10.176 10.424 10.694 10.939 11.199 11.468 11.764 12.073 12.386 12.73 13.065 13.419 13.769 14.145 14.506 14.78 14.955 14.856 14.377 13.805 13.218 12.677 12.161 11.693 11.253 10.851 10.458 10.123 9.803 9.482 9.182 8.916 8.675 8.404 8.152 7.928 7.687 7.42 7.201 6.956 6.675 6.469 6.266 6.06 5.842 5.631 5.493 5.339 5.099 4.917 4.732 4.64 4.423 4.212 4.012 3.906 3.644 3.545 3.408 3.273 2.964 2.799 2.643 2.454 2.234 2.012 1.728 1.147 -4 ,19478 ,TETRA ,17559635,Sat Nov 27 08:08:21 CET,Sat Nov 27 09:56:41 CET,0.0 2.172 2.842 3.329 3.696 3.984 4.237 4.46 4.871 5.067 5.243 5.427 5.73 5.877 6.146 6.41 6.651 6.758 6.958 7.156 7.436 7.601 7.748 7.972 8.192 8.399 8.593 8.774 9.015 9.241 9.457 9.716 9.965 10.2 10.444 10.721 10.982 11.241 11.511 11.811 12.112 12.439 12.809 13.167 13.561 13.937 14.291 14.627 14.922 15.075 14.989 14.561 14.043 13.496 12.941 12.433 11.965 11.501 11.101 10.71 10.357 10.036 9.734 9.448 9.181 8.936 8.677 8.427 8.2 7.981 7.768 7.58 7.371 7.165 7.006 6.832 6.657 6.476 6.282 6.141 5.99 5.773 5.62 5.45 5.363 5.166 4.949 4.719 4.598 4.333 4.242 4.113 3.986 3.693 3.523 3.346 3.141 2.888 2.533 2.028 0.688 -5 ,17075 ,TETRA ,17559636,Sat Nov 27 08:08:21 CET,Sat Nov 27 09:56:38 CET,0.0 1.832 2.437 2.791 3.108 3.393 3.655 3.913 4.37 4.567 4.728 4.844 5.133 5.268 5.535 5.798 6.026 6.14 6.359 6.561 6.845 7.011 7.168 7.416 7.659 7.87 8.072 8.272 8.545 8.78 8.983 9.23 9.457 9.681 9.94 10.239 10.516 10.797 11.088 11.386 11.693 12.037 12.391 12.693 13.044 13.402 13.773 14.15 14.467 14.664 14.598 14.159 13.609 13.04 12.5 11.999 11.52 11.062 10.672 10.276 9.923 9.607 9.312 9.031 8.75 8.491 8.237 7.994 7.771 7.554 7.334 7.142 6.947 6.747 6.589 6.416 6.227 6.047 5.873 5.747 5.608 5.391 5.248 5.096 5.011 4.829 4.644 4.456 4.357 4.088 3.957 3.815 3.642 3.268 3.098 2.918 2.684 2.431 2.157 1.806 0.814 -6 ,10005 ,TETRA ,17559637,Sat Nov 27 08:08:21 CET,Sat Nov 27 09:56:30 CET,0.0 2.474 3.119 3.536 3.865 4.169 4.411 4.612 4.97 5.142 5.301 5.457 5.743 5.88 6.159 6.417 6.639 6.742 6.953 7.164 7.451 7.624 7.8 8.043 8.273 8.488 8.672 8.847 9.075 9.292 9.498 9.734 9.958 10.18 10.426 10.692 10.953 11.249 11.55 11.853 12.163 12.478 12.819 13.152 13.511 13.882 14.255 14.604 14.931 15.118 15.014 14.506 13.927 13.372 12.836 12.329 11.893 11.484 11.111 10.717 10.371 10.067 9.769 9.471 9.183 8.928 8.666 8.429 8.231 8.021 7.791 7.592 7.377 7.161 7.008 6.856 6.678 6.485 6.288 6.146 6.002 5.776 5.622 5.477 5.396 5.22 5.048 4.849 4.731 4.468 4.354 4.215 4.091 3.837 3.686 3.489 3.234 2.967 2.674 2.279 1.607 -7 ,17813 ,TETRA ,17559638,Sat Nov 27 08:09:20 CET,Sat Nov 27 09:57:34 CET,0.0 2.505 3.258 3.686 4.012 4.291 4.518 4.734 5.16 5.354 5.535 5.729 6.028 6.173 6.445 6.708 6.958 7.077 7.305 7.513 7.793 7.974 8.147 8.392 8.625 8.851 9.063 9.257 9.519 9.766 9.987 10.252 10.514 10.766 11.051 11.362 11.654 11.99 12.314 12.608 12.937 13.285 13.646 13.967 14.329 14.726 15.134 15.521 15.816 16.001 15.955 15.46 14.867 14.285 13.74 13.235 12.771 12.333 11.943 11.547 11.206 10.9 10.596 10.294 10.006 9.734 9.466 9.246 9.024 8.767 8.499 8.265 8.026 7.777 7.584 7.395 7.193 6.975 6.754 6.599 6.429 6.171 5.989 5.802 5.704 5.494 5.278 5.056 4.946 4.677 4.551 4.401 4.25 3.924 3.747 3.54 3.309 3.083 2.775 2.376 1.626 -8 ,31044 ,TETRA ,17559639,Sat Nov 27 08:09:22 CET,Sat Nov 27 09:58:58 CET,0.0 2.013 2.644 3.089 3.432 3.746 4.037 4.274 4.674 4.851 5.023 5.19 5.475 5.609 5.862 6.103 6.333 6.449 6.67 6.862 7.123 7.297 7.468 7.696 7.911 8.121 8.327 8.518 8.748 8.964 9.172 9.422 9.651 9.864 10.11 10.387 10.645 10.913 11.216 11.534 11.834 12.146 12.49 12.827 13.204 13.59 13.988 14.392 14.764 14.995 14.918 14.422 13.831 13.286 12.763 12.258 11.792 11.355 10.967 10.548 10.194 9.889 9.592 9.304 9.027 8.767 8.503 8.271 8.055 7.827 7.594 7.41 7.221 7.008 6.838 6.669 6.503 6.332 6.152 6.024 5.883 5.647 5.48 5.319 5.236 5.055 4.862 4.672 4.562 4.292 4.187 4.038 3.87 3.518 3.354 3.192 3.001 2.786 2.511 2.078 1.026 -9 ,6496 ,TETRA ,17559640,Sat Nov 27 08:09:23 CET,Sat Nov 27 09:58:54 CET,0.0 2.549 3.228 3.676 4.014 4.323 4.592 4.831 5.291 5.485 5.658 5.844 6.134 6.282 6.572 6.84 7.078 7.187 7.411 7.628 7.931 8.125 8.304 8.569 8.828 9.071 9.303 9.513 9.768 10.016 10.255 10.529 10.78 11.014 11.296 11.61 11.903 12.216 12.532 12.851 13.184 13.554 13.96 14.31 14.684 15.084 15.447 15.826 16.209 16.461 16.423 15.951 15.363 14.743 14.203 13.723 13.28 12.852 12.462 12.063 11.705 11.373 11.067 10.767 10.489 10.244 9.969 9.729 9.527 9.303 9.068 8.879 8.681 8.474 8.309 8.129 7.947 7.754 7.546 7.406 7.254 7.028 6.891 6.751 6.668 6.491 6.316 6.123 6.017 5.758 5.672 5.542 5.41 5.141 4.99 4.826 4.627 4.359 4.034 3.622 2.597 -10 ,13147 ,TETRA ,17559641,Sat Nov 27 08:10:21 CET,Sat Nov 27 09:59:56 CET,0.0 1.861 2.463 2.905 3.263 3.565 3.838 4.066 4.461 4.645 4.819 4.99 5.282 5.426 5.701 5.959 6.189 6.292 6.488 6.676 6.935 7.098 7.262 7.486 7.682 7.88 8.077 8.267 8.497 8.72 8.935 9.182 9.407 9.616 9.87 10.167 10.446 10.712 10.983 11.276 11.587 11.924 12.278 12.625 13.005 13.372 13.757 14.121 14.427 14.637 14.583 14.165 13.628 13.075 12.547 12.042 11.588 11.152 10.763 10.372 10.031 9.725 9.406 9.081 8.801 8.555 8.296 8.058 7.838 7.628 7.401 7.188 6.98 6.779 6.609 6.419 6.227 6.031 5.829 5.688 5.539 5.314 5.141 4.945 4.844 4.624 4.374 4.12 3.998 3.718 3.575 3.416 3.253 2.924 2.738 2.525 2.287 2.023 1.706 1.332 0.331 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_37.txt deleted file mode 100644 index c33ff167..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10909 ,TETRA ,17559642,Sat Nov 27 08:10:21 CET,Sat Nov 27 09:58:28 CET,0.0 2.429 3.06 3.498 3.816 4.097 4.382 4.628 5.031 5.226 5.412 5.598 5.892 6.034 6.31 6.579 6.837 6.959 7.182 7.396 7.698 7.889 8.06 8.298 8.52 8.746 8.971 9.191 9.465 9.694 9.932 10.216 10.444 10.657 10.92 11.212 11.465 11.735 12.031 12.329 12.616 12.901 13.203 13.496 13.83 14.153 14.453 14.7 14.85 14.83 14.433 13.615 12.704 11.863 11.11 10.377 9.737 9.176 8.687 8.195 7.77 7.378 6.994 6.642 6.304 5.99 5.665 5.379 5.144 4.898 4.629 4.392 4.152 3.91 3.72 3.522 3.305 3.082 2.856 2.692 2.531 2.273 2.093 1.918 1.821 1.601 1.378 1.146 1.025 0.746 0.624 0.487 0.333 -0.013 -0.218 -0.454 -0.697 -0.976 -1.332 -1.767 -2.967 -2 ,4812 ,TETRA ,17559643,Sat Nov 27 08:10:21 CET,Sat Nov 27 10:02:42 CET,0.0 1.808 2.398 2.846 3.198 3.473 3.718 3.948 4.33 4.489 4.653 4.813 5.082 5.2 5.426 5.661 5.876 5.971 6.158 6.337 6.579 6.734 6.881 7.099 7.318 7.505 7.673 7.842 8.048 8.225 8.398 8.616 8.826 9.029 9.266 9.516 9.727 9.961 10.221 10.47 10.727 11.015 11.296 11.551 11.843 12.115 12.359 12.55 12.625 12.484 11.958 11.097 10.233 9.466 8.775 8.118 7.527 6.991 6.507 6.02 5.623 5.249 4.89 4.584 4.3 4.028 3.718 3.424 3.178 2.933 2.689 2.474 2.248 2.023 1.829 1.619 1.41 1.201 0.981 0.829 0.672 0.401 0.219 0.038 -0.057 -0.258 -0.488 -0.738 -0.858 -1.128 -1.239 -1.385 -1.549 -1.929 -2.116 -2.291 -2.499 -2.759 -3.072 -3.5 -5.114 -3 ,25917 ,TETRA ,17559644,Sat Nov 27 08:11:20 CET,Sat Nov 27 09:59:31 CET,0.0 3.062 3.666 4.051 4.374 4.664 4.918 5.14 5.505 5.667 5.829 5.987 6.277 6.417 6.679 6.922 7.143 7.251 7.468 7.685 7.986 8.172 8.336 8.557 8.768 8.975 9.182 9.378 9.625 9.848 10.061 10.321 10.554 10.761 11.007 11.298 11.558 11.826 12.103 12.387 12.684 13.0 13.337 13.624 13.929 14.218 14.485 14.695 14.775 14.709 14.264 13.414 12.562 11.748 10.984 10.279 9.685 9.153 8.687 8.213 7.803 7.426 7.055 6.714 6.377 6.061 5.746 5.471 5.223 4.948 4.661 4.43 4.18 3.91 3.711 3.512 3.307 3.085 2.853 2.687 2.506 2.239 2.059 1.872 1.774 1.569 1.358 1.122 1.0 0.724 0.613 0.471 0.315 -0.02 -0.194 -0.399 -0.617 -0.834 -1.138 -1.587 -2.805 -4 ,8789 ,TETRA ,17559645,Sat Nov 27 08:11:20 CET,Sat Nov 27 09:59:18 CET,0.0 2.01 2.43 2.722 2.982 3.212 3.412 3.587 3.909 4.065 4.193 4.288 4.557 4.676 4.9 5.108 5.301 5.391 5.564 5.728 5.96 6.097 6.225 6.414 6.591 6.763 6.917 7.074 7.284 7.488 7.697 7.939 8.172 8.393 8.639 8.904 9.137 9.391 9.65 9.894 10.131 10.391 10.671 10.918 11.187 11.476 11.763 12.023 12.193 12.217 11.852 10.972 10.071 9.233 8.498 7.83 7.229 6.679 6.185 5.675 5.244 4.862 4.495 4.146 3.817 3.507 3.19 2.91 2.659 2.394 2.114 1.894 1.672 1.43 1.233 1.02 0.807 0.59 0.363 0.203 0.028 -0.251 -0.452 -0.667 -0.775 -0.984 -1.191 -1.412 -1.534 -1.813 -1.943 -2.092 -2.236 -2.582 -2.797 -3.004 -3.213 -3.465 -3.77 -4.193 -5.791 -5 ,12511 ,TETRA ,17559646,Sat Nov 27 08:11:22 CET,Sat Nov 27 09:59:24 CET,0.0 2.05 2.574 2.96 3.321 3.628 3.857 4.045 4.417 4.618 4.826 5.066 5.372 5.513 5.775 6.026 6.264 6.385 6.619 6.824 7.095 7.264 7.425 7.65 7.873 8.077 8.264 8.451 8.708 8.949 9.165 9.419 9.659 9.882 10.14 10.423 10.68 10.952 11.233 11.52 11.801 12.118 12.482 12.792 13.087 13.356 13.651 13.916 14.063 14.015 13.58 12.753 11.827 10.982 10.278 9.615 9.008 8.447 7.965 7.473 7.04 6.654 6.281 5.929 5.594 5.289 4.978 4.695 4.448 4.194 3.926 3.698 3.464 3.22 3.021 2.811 2.605 2.401 2.169 2.002 1.836 1.564 1.376 1.184 1.086 0.889 0.682 0.465 0.343 0.056 -0.074 -0.213 -0.354 -0.664 -0.843 -1.034 -1.262 -1.548 -1.963 -2.51 -4.173 -6 ,29939 ,TETRA ,17559647,Sat Nov 27 08:12:22 CET,Sat Nov 27 10:00:23 CET,0.0 2.396 2.957 3.336 3.629 3.879 4.12 4.326 4.691 4.854 5.002 5.143 5.418 5.554 5.819 6.058 6.274 6.371 6.553 6.735 6.978 7.132 7.28 7.484 7.692 7.888 8.07 8.248 8.465 8.653 8.836 9.051 9.252 9.457 9.697 9.962 10.225 10.515 10.8 11.069 11.332 11.638 11.976 12.284 12.608 12.891 13.151 13.367 13.499 13.464 13.001 12.051 11.145 10.315 9.586 8.915 8.295 7.751 7.282 6.777 6.318 5.927 5.561 5.204 4.871 4.566 4.254 3.979 3.738 3.484 3.2 2.963 2.727 2.481 2.29 2.093 1.885 1.655 1.41 1.247 1.073 0.81 0.634 0.447 0.351 0.153 -0.05 -0.257 -0.374 -0.656 -0.762 -0.899 -1.045 -1.385 -1.571 -1.784 -2.03 -2.29 -2.59 -2.967 -4.451 -7 ,16748 ,TETRA ,17559648,Sat Nov 27 08:12:22 CET,Sat Nov 27 10:00:35 CET,0.0 1.384 1.84 2.242 2.608 2.915 3.192 3.449 3.873 4.061 4.243 4.446 4.757 4.906 5.164 5.403 5.627 5.741 5.958 6.17 6.459 6.631 6.793 7.01 7.222 7.437 7.647 7.837 8.076 8.315 8.539 8.787 9.032 9.266 9.53 9.822 10.068 10.326 10.612 10.897 11.172 11.464 11.781 12.073 12.414 12.752 13.027 13.231 13.36 13.307 12.82 11.888 10.98 10.174 9.433 8.767 8.19 7.64 7.158 6.665 6.233 5.845 5.478 5.128 4.79 4.486 4.169 3.886 3.639 3.373 3.101 2.875 2.641 2.394 2.199 1.998 1.788 1.559 1.323 1.169 1.014 0.77 0.606 0.431 0.339 0.141 -0.078 -0.308 -0.425 -0.701 -0.826 -0.965 -1.115 -1.438 -1.604 -1.793 -2.016 -2.293 -2.614 -2.983 -4.299 -8 ,24192 ,TETRA ,17559649,Sat Nov 27 08:12:21 CET,Sat Nov 27 10:05:05 CET,0.0 3.454 4.166 4.539 4.864 5.138 5.347 5.55 5.927 6.093 6.257 6.418 6.691 6.823 7.069 7.271 7.476 7.573 7.742 7.921 8.182 8.335 8.495 8.721 8.927 9.131 9.319 9.488 9.7 9.914 10.132 10.371 10.58 10.777 10.992 11.241 11.479 11.715 11.972 12.234 12.498 12.8 13.121 13.416 13.696 13.946 14.172 14.367 14.533 14.529 14.043 13.153 12.279 11.449 10.716 10.048 9.431 8.852 8.36 7.878 7.436 7.047 6.68 6.314 5.968 5.661 5.355 5.073 4.825 4.567 4.293 4.047 3.797 3.56 3.372 3.168 2.947 2.718 2.496 2.343 2.178 1.915 1.735 1.549 1.447 1.233 1.004 0.752 0.636 0.368 0.252 0.103 -0.058 -0.383 -0.557 -0.766 -1.003 -1.3 -1.646 -2.038 -4.211 -9 ,22625 ,TETRA ,17559650,Sat Nov 27 08:14:20 CET,Sat Nov 27 09:56:50 CET,0.0 1.966 2.545 3.012 3.357 3.642 3.894 4.117 4.494 4.663 4.83 4.98 5.271 5.423 5.695 5.938 6.162 6.263 6.46 6.643 6.892 7.055 7.224 7.477 7.696 7.885 8.082 8.269 8.494 8.704 8.908 9.141 9.337 9.519 9.727 9.958 10.169 10.404 10.665 10.929 11.173 11.418 11.689 11.929 12.169 12.409 12.604 12.767 12.902 12.884 12.448 11.51 10.623 9.824 9.059 8.359 7.718 7.103 6.575 6.043 5.574 5.154 4.758 4.41 4.104 3.823 3.508 3.211 2.954 2.683 2.381 2.138 1.907 1.649 1.439 1.223 0.995 0.765 0.543 0.401 0.254 0.003 -0.181 -0.374 -0.475 -0.68 -0.914 -1.16 -1.274 -1.552 -1.669 -1.802 -1.953 -2.266 -2.428 -2.6 -2.806 -3.049 -3.358 -3.805 -5.429 -10 ,3070 ,TETRA ,17559651,Sat Nov 27 08:13:21 CET,Sat Nov 27 10:02:42 CET,0.0 2.286 2.805 3.147 3.445 3.717 3.96 4.188 4.605 4.775 4.933 5.086 5.378 5.517 5.757 5.99 6.222 6.325 6.51 6.696 6.984 7.156 7.295 7.485 7.672 7.848 8.02 8.183 8.378 8.558 8.748 8.981 9.197 9.408 9.64 9.888 10.132 10.413 10.704 10.979 11.246 11.523 11.837 12.168 12.513 12.808 13.08 13.279 13.353 13.266 12.831 11.969 11.063 10.268 9.576 8.913 8.31 7.754 7.261 6.769 6.343 5.951 5.582 5.237 4.907 4.602 4.29 4.011 3.761 3.503 3.23 2.996 2.741 2.49 2.315 2.125 1.923 1.727 1.519 1.369 1.211 0.962 0.792 0.602 0.504 0.317 0.116 -0.102 -0.219 -0.492 -0.583 -0.73 -0.891 -1.215 -1.393 -1.584 -1.787 -2.017 -2.29 -2.648 -3.832 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_64.txt deleted file mode 100644 index d520122e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_33_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28740 ,KEBNE ,17024947,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:52:57 CET,0.0 3.386 4.118 4.633 5.085 5.475 5.778 6.037 6.499 6.706 6.914 7.149 7.475 7.653 7.979 8.306 8.59 8.727 8.98 9.205 9.53 9.729 9.93 10.244 10.518 10.771 11.02 11.251 11.549 11.83 12.083 12.379 12.664 12.929 13.241 13.583 13.896 14.239 14.58 14.942 15.306 15.683 16.119 16.529 16.971 17.39 17.769 18.083 18.332 18.436 17.994 17.043 16.05 15.096 14.246 13.466 12.747 12.088 11.548 11.004 10.515 10.061 9.61 9.169 8.753 8.361 7.935 7.554 7.233 6.907 6.559 6.279 5.992 5.679 5.439 5.184 4.911 4.641 4.372 4.178 3.963 3.613 3.37 3.133 3.008 2.743 2.484 2.213 2.06 1.744 1.585 1.411 1.223 0.812 0.579 0.307 0.008 -0.277 -0.597 -1.118 -2.874 -2 ,1763 ,KEBNE ,17024948,Wed Dec 22 11:20:08 CET,Wed Dec 22 12:53:03 CET,0.0 3.424 4.209 4.813 5.308 5.709 6.043 6.33 6.878 7.105 7.294 7.532 7.855 8.017 8.322 8.609 8.872 8.999 9.251 9.492 9.833 10.051 10.268 10.573 10.846 11.099 11.334 11.561 11.846 12.114 12.384 12.703 13.002 13.286 13.594 13.939 14.258 14.572 14.897 15.246 15.601 15.996 16.457 16.892 17.337 17.751 18.156 18.504 18.782 18.939 18.66 17.813 16.861 15.963 15.137 14.33 13.613 12.977 12.427 11.866 11.385 10.957 10.532 10.132 9.758 9.423 9.078 8.767 8.497 8.201 7.868 7.556 7.207 6.852 6.592 6.337 6.073 5.787 5.494 5.296 5.096 4.787 4.57 4.345 4.234 3.983 3.702 3.43 3.291 2.98 2.813 2.642 2.456 2.053 1.85 1.642 1.381 1.067 0.704 0.206 -2.047 -3 ,22741 ,KEBNE ,17024949,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:54:35 CET,0.0 3.924 4.697 5.194 5.662 6.112 6.47 6.767 7.293 7.522 7.746 8.049 8.39 8.573 8.937 9.276 9.564 9.698 9.952 10.181 10.523 10.744 10.942 11.203 11.464 11.726 11.965 12.193 12.491 12.777 13.061 13.386 13.664 13.942 14.253 14.585 14.908 15.248 15.589 15.943 16.307 16.677 17.086 17.484 17.925 18.368 18.758 19.073 19.286 19.362 19.004 18.055 17.059 16.145 15.327 14.564 13.854 13.196 12.623 12.037 11.518 11.047 10.586 10.131 9.706 9.323 8.941 8.578 8.248 7.898 7.497 7.176 6.851 6.502 6.251 6.01 5.762 5.504 5.228 5.028 4.818 4.483 4.243 4.0 3.884 3.654 3.406 3.141 2.989 2.666 2.491 2.309 2.109 1.683 1.468 1.233 0.984 0.713 0.363 -0.137 -2.959 -4 ,27609 ,KEBNE ,17024950,Wed Dec 22 11:20:06 CET,Wed Dec 22 12:54:47 CET,0.0 3.815 4.72 5.274 5.684 6.074 6.434 6.758 7.371 7.658 7.927 8.268 8.617 8.804 9.167 9.502 9.823 9.968 10.229 10.486 10.858 11.089 11.302 11.61 11.909 12.182 12.438 12.686 12.986 13.258 13.51 13.801 14.086 14.354 14.64 14.967 15.282 15.61 15.962 16.317 16.677 17.078 17.498 17.898 18.357 18.806 19.194 19.523 19.793 19.886 19.483 18.601 17.657 16.729 15.906 15.146 14.458 13.805 13.212 12.619 12.104 11.643 11.189 10.762 10.386 10.045 9.654 9.297 9.015 8.742 8.435 8.166 7.908 7.629 7.397 7.17 6.941 6.699 6.444 6.269 6.096 5.816 5.597 5.358 5.238 4.997 4.747 4.457 4.294 3.98 3.828 3.658 3.478 3.101 2.889 2.654 2.408 2.09 1.706 1.24 -0.277 -5 ,10556 ,KEBNE ,17024951,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:54:59 CET,0.0 3.605 4.407 4.986 5.456 5.863 6.186 6.463 6.951 7.166 7.383 7.65 7.978 8.156 8.49 8.817 9.114 9.254 9.527 9.787 10.151 10.376 10.587 10.894 11.185 11.44 11.682 11.929 12.261 12.57 12.845 13.158 13.45 13.723 14.017 14.344 14.659 14.983 15.317 15.674 16.044 16.402 16.793 17.209 17.655 18.089 18.511 18.866 19.126 19.205 18.853 17.973 17.023 16.054 15.173 14.377 13.674 12.99 12.381 11.8 11.297 10.833 10.379 9.94 9.543 9.201 8.82 8.452 8.125 7.768 7.408 7.143 6.872 6.602 6.388 6.149 5.915 5.667 5.398 5.212 5.015 4.696 4.464 4.22 4.091 3.836 3.587 3.316 3.165 2.852 2.668 2.485 2.292 1.862 1.633 1.376 1.064 0.727 0.376 -0.08 -2.893 -6 ,8016 ,KEBNE ,17024952,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:54:29 CET,0.0 3.445 4.224 4.843 5.372 5.797 6.144 6.45 6.961 7.19 7.404 7.686 8.041 8.241 8.649 9.005 9.314 9.461 9.726 9.973 10.34 10.564 10.767 11.05 11.317 11.578 11.826 12.073 12.399 12.7 12.966 13.268 13.556 13.856 14.207 14.548 14.848 15.167 15.499 15.84 16.197 16.595 17.012 17.383 17.765 18.155 18.537 18.868 19.148 19.256 18.937 18.042 17.104 16.205 15.357 14.588 13.92 13.292 12.734 12.165 11.655 11.173 10.68 10.228 9.832 9.465 9.065 8.676 8.362 8.052 7.699 7.404 7.105 6.81 6.553 6.296 6.052 5.766 5.469 5.267 5.055 4.749 4.538 4.309 4.191 3.943 3.679 3.401 3.254 2.949 2.775 2.6 2.423 2.045 1.826 1.584 1.328 1.049 0.647 0.101 -1.718 -7 ,25471 ,KEBNE ,17024953,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:53:19 CET,0.0 3.049 3.872 4.477 4.935 5.321 5.684 5.991 6.521 6.75 6.955 7.182 7.505 7.696 8.086 8.438 8.757 8.911 9.212 9.489 9.871 10.111 10.316 10.606 10.889 11.147 11.387 11.61 11.906 12.194 12.465 12.778 13.077 13.366 13.69 14.036 14.358 14.704 15.045 15.384 15.724 16.12 16.566 16.952 17.371 17.791 18.2 18.591 18.917 19.012 18.691 17.84 16.858 15.936 15.099 14.332 13.642 12.984 12.396 11.817 11.33 10.893 10.477 10.086 9.711 9.359 8.992 8.659 8.367 8.051 7.714 7.448 7.168 6.875 6.648 6.403 6.164 5.937 5.681 5.497 5.311 5.015 4.817 4.607 4.492 4.268 4.037 3.774 3.633 3.335 3.176 2.994 2.821 2.476 2.277 2.049 1.752 1.428 1.134 0.638 -0.985 -8 ,12250 ,KEBNE ,17024954,Wed Dec 22 11:20:06 CET,Wed Dec 22 12:53:34 CET,0.0 3.647 4.402 4.912 5.362 5.747 6.076 6.372 6.892 7.133 7.37 7.637 7.963 8.146 8.489 8.805 9.1 9.252 9.543 9.806 10.177 10.403 10.619 10.909 11.175 11.446 11.713 11.95 12.241 12.513 12.774 13.093 13.406 13.701 14.011 14.354 14.67 14.99 15.344 15.733 16.119 16.541 16.993 17.394 17.816 18.212 18.605 18.981 19.244 19.334 19.017 18.035 17.022 16.081 15.222 14.446 13.75 13.094 12.525 11.967 11.486 11.032 10.58 10.16 9.776 9.432 9.069 8.746 8.458 8.158 7.851 7.592 7.315 7.041 6.837 6.605 6.35 6.078 5.781 5.575 5.372 5.039 4.783 4.513 4.378 4.124 3.882 3.621 3.476 3.156 2.961 2.773 2.575 2.108 1.835 1.578 1.318 1.019 0.649 0.127 -1.949 -9 ,32492 ,KEBNE ,17024955,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:52:55 CET,0.0 3.883 4.697 5.217 5.643 5.964 6.234 6.524 7.072 7.307 7.523 7.777 8.095 8.251 8.56 8.841 9.119 9.255 9.494 9.731 10.074 10.28 10.47 10.735 11.002 11.262 11.511 11.754 12.049 12.324 12.582 12.89 13.188 13.479 13.805 14.137 14.449 14.8 15.171 15.534 15.909 16.318 16.74 17.139 17.554 17.957 18.341 18.672 18.909 18.886 18.45 17.519 16.497 15.59 14.784 14.01 13.305 12.66 12.092 11.537 11.08 10.667 10.247 9.837 9.456 9.097 8.708 8.354 8.046 7.724 7.385 7.102 6.803 6.508 6.267 6.006 5.75 5.477 5.197 5.01 4.819 4.523 4.308 4.095 3.989 3.76 3.523 3.229 3.069 2.771 2.635 2.466 2.284 1.925 1.73 1.5 1.257 0.986 0.647 0.15 -1.899 -10 ,27916 ,KEBNE ,17024956,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:54:31 CET,0.0 3.682 4.432 4.929 5.369 5.735 6.037 6.319 6.862 7.11 7.322 7.562 7.882 8.058 8.385 8.657 8.931 9.069 9.334 9.576 9.911 10.129 10.346 10.654 10.931 11.198 11.448 11.672 11.948 12.222 12.493 12.812 13.108 13.384 13.693 14.02 14.342 14.691 15.042 15.413 15.786 16.181 16.588 16.971 17.364 17.735 18.148 18.52 18.825 18.902 18.498 17.517 16.489 15.575 14.718 13.925 13.214 12.556 12.003 11.468 10.987 10.547 10.14 9.738 9.353 9.012 8.671 8.323 8.002 7.681 7.315 7.015 6.718 6.401 6.159 5.912 5.655 5.391 5.11 4.913 4.715 4.391 4.154 3.913 3.787 3.515 3.237 2.952 2.79 2.463 2.274 2.082 1.884 1.474 1.241 0.994 0.73 0.432 0.06 -0.409 -1.431 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_35_36.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_35_36.txt deleted file mode 100644 index f2548d15..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_35_36.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12270 ,TETRA ,17559652,Sat Nov 27 08:13:21 CET,Sat Nov 27 10:03:06 CET,0.0 1.318 1.884 2.237 2.51 2.762 2.996 3.196 3.561 3.728 3.876 4.019 4.315 4.449 4.701 4.942 5.162 5.265 5.463 5.671 5.973 6.153 6.321 6.547 6.765 6.985 7.194 7.4 7.654 7.889 8.112 8.393 8.666 8.915 9.211 9.536 9.837 10.153 10.481 10.82 11.179 11.586 12.021 12.46 12.98 13.509 14.081 14.693 15.312 15.926 16.468 16.584 16.39 16.081 15.765 15.455 15.157 14.837 14.536 14.234 13.951 13.672 13.387 13.122 12.884 12.662 12.423 12.22 12.05 11.865 11.672 11.51 11.326 11.124 10.98 10.834 10.683 10.528 10.37 10.261 10.14 9.947 9.822 9.691 9.618 9.459 9.294 9.131 9.047 8.805 8.749 8.637 8.532 8.311 8.188 8.045 7.872 7.681 7.493 7.22 6.215 -2 ,11957 ,TETRA ,17559653,Sat Nov 27 08:13:21 CET,Sat Nov 27 10:03:58 CET,0.0 1.401 1.922 2.31 2.641 2.948 3.186 3.393 3.782 3.958 4.124 4.279 4.565 4.696 4.947 5.175 5.404 5.519 5.722 5.908 6.209 6.41 6.596 6.87 7.151 7.407 7.629 7.844 8.128 8.401 8.663 8.972 9.243 9.492 9.786 10.106 10.395 10.717 11.047 11.379 11.734 12.123 12.55 12.985 13.48 14.003 14.589 15.193 15.795 16.389 16.897 17.034 16.891 16.615 16.299 15.989 15.697 15.404 15.134 14.813 14.518 14.265 14.004 13.743 13.5 13.277 13.054 12.86 12.673 12.445 12.206 12.029 11.863 11.692 11.557 11.407 11.256 11.105 10.945 10.84 10.732 10.549 10.424 10.306 10.244 10.115 9.985 9.833 9.749 9.513 9.469 9.369 9.27 9.018 8.876 8.73 8.56 8.357 8.038 7.557 6.276 -3 ,10741 ,TETRA ,17559654,Sat Nov 27 08:13:21 CET,Sat Nov 27 10:04:03 CET,0.0 1.475 2.028 2.401 2.704 2.975 3.218 3.433 3.818 3.994 4.161 4.321 4.607 4.737 4.994 5.235 5.462 5.566 5.775 5.984 6.293 6.489 6.662 6.924 7.193 7.443 7.656 7.85 8.089 8.315 8.534 8.799 9.065 9.317 9.61 9.936 10.23 10.54 10.874 11.243 11.622 12.035 12.512 12.972 13.479 14.028 14.614 15.233 15.875 16.506 17.075 17.186 17.013 16.767 16.482 16.168 15.848 15.514 15.21 14.905 14.625 14.365 14.117 13.888 13.673 13.463 13.231 13.015 12.817 12.619 12.435 12.28 12.114 11.946 11.821 11.696 11.561 11.419 11.27 11.166 11.05 10.87 10.747 10.615 10.547 10.417 10.28 10.117 10.038 9.808 9.76 9.65 9.531 9.286 9.16 9.008 8.839 8.662 8.454 8.156 7.522 -4 ,973 ,TETRA ,17559655,Sat Nov 27 08:14:20 CET,Sat Nov 27 10:04:28 CET,0.0 1.315 1.897 2.287 2.585 2.837 3.053 3.247 3.621 3.797 3.953 4.08 4.366 4.502 4.743 4.967 5.2 5.317 5.534 5.724 5.986 6.155 6.329 6.583 6.816 7.042 7.261 7.462 7.715 7.951 8.186 8.464 8.726 8.981 9.262 9.588 9.903 10.236 10.574 10.937 11.323 11.733 12.205 12.662 13.17 13.71 14.306 14.919 15.516 16.091 16.586 16.724 16.606 16.345 16.048 15.73 15.396 15.067 14.787 14.513 14.26 14.008 13.749 13.504 13.269 13.028 12.781 12.579 12.412 12.241 12.067 11.932 11.782 11.619 11.492 11.352 11.212 11.073 10.92 10.812 10.706 10.539 10.428 10.316 10.256 10.125 9.984 9.839 9.756 9.518 9.495 9.404 9.308 9.079 8.956 8.829 8.675 8.518 8.344 8.102 7.586 -5 ,28618 ,TETRA ,17559656,Sat Nov 27 08:14:20 CET,Sat Nov 27 09:55:45 CET,0.0 1.572 2.118 2.472 2.779 3.061 3.302 3.486 3.808 3.979 4.147 4.297 4.586 4.721 4.979 5.209 5.414 5.516 5.715 5.903 6.183 6.363 6.535 6.783 7.032 7.26 7.458 7.646 7.89 8.132 8.366 8.655 8.946 9.211 9.484 9.8 10.098 10.397 10.733 11.093 11.447 11.834 12.272 12.682 13.141 13.659 14.217 14.758 15.312 15.867 16.338 16.465 16.321 16.047 15.736 15.433 15.143 14.845 14.56 14.254 13.972 13.71 13.462 13.213 12.977 12.764 12.552 12.368 12.204 12.036 11.86 11.707 11.549 11.383 11.261 11.13 10.988 10.849 10.696 10.593 10.487 10.308 10.178 10.046 9.981 9.844 9.701 9.561 9.479 9.241 9.219 9.133 9.041 8.836 8.73 8.615 8.483 8.323 8.134 7.893 7.138 -6 ,6368 ,TETRA ,17559657,Sat Nov 27 08:15:20 CET,Sat Nov 27 10:07:11 CET,0.0 1.241 1.817 2.139 2.406 2.681 2.937 3.184 3.59 3.761 3.937 4.102 4.382 4.51 4.756 4.99 5.212 5.312 5.507 5.706 5.998 6.175 6.333 6.564 6.794 7.01 7.227 7.437 7.685 7.914 8.137 8.398 8.635 8.86 9.128 9.442 9.745 10.073 10.408 10.765 11.146 11.55 11.998 12.438 12.924 13.425 13.963 14.579 15.268 15.965 16.542 16.648 16.488 16.214 15.909 15.59 15.247 14.891 14.569 14.248 13.965 13.701 13.44 13.201 12.991 12.801 12.581 12.382 12.225 12.056 11.87 11.711 11.539 11.352 11.21 11.073 10.932 10.778 10.616 10.501 10.382 10.195 10.066 9.941 9.876 9.739 9.59 9.43 9.34 9.092 9.059 8.963 8.862 8.617 8.507 8.417 8.282 8.107 7.929 7.686 7.106 -7 ,11861 ,TETRA ,17559658,Sat Nov 27 08:16:21 CET,Sat Nov 27 10:06:32 CET,0.0 1.5 1.986 2.356 2.665 2.941 3.188 3.406 3.761 3.927 4.092 4.226 4.504 4.623 4.866 5.109 5.353 5.464 5.65 5.829 6.095 6.264 6.436 6.683 6.895 7.098 7.294 7.478 7.718 7.944 8.162 8.424 8.682 8.951 9.259 9.593 9.902 10.215 10.555 10.915 11.304 11.79 12.335 12.784 13.242 13.755 14.33 14.947 15.583 16.192 16.705 16.876 16.764 16.516 16.232 15.932 15.642 15.349 15.064 14.767 14.495 14.234 13.98 13.722 13.479 13.271 13.049 12.846 12.671 12.479 12.286 12.122 11.953 11.792 11.674 11.551 11.408 11.249 11.08 10.97 10.853 10.657 10.529 10.406 10.344 10.216 10.074 9.91 9.831 9.606 9.588 9.493 9.398 9.193 9.08 8.955 8.822 8.68 8.475 8.139 7.331 -8 ,3392 ,TETRA ,17559659,Sat Nov 27 08:16:20 CET,Sat Nov 27 10:05:45 CET,0.0 1.617 2.191 2.559 2.89 3.211 3.47 3.714 4.163 4.351 4.515 4.667 4.961 5.092 5.332 5.575 5.808 5.916 6.118 6.309 6.588 6.755 6.915 7.152 7.37 7.583 7.786 7.983 8.25 8.519 8.764 9.037 9.306 9.552 9.82 10.134 10.455 10.804 11.145 11.476 11.824 12.247 12.733 13.163 13.655 14.205 14.8 15.429 16.07 16.667 17.179 17.297 17.128 16.842 16.524 16.193 15.862 15.552 15.263 14.955 14.692 14.435 14.196 13.974 13.742 13.528 13.296 13.08 12.891 12.7 12.514 12.362 12.207 12.04 11.909 11.783 11.647 11.501 11.354 11.248 11.142 11.003 10.9 10.785 10.726 10.596 10.458 10.311 10.234 9.999 9.963 9.878 9.8 9.609 9.495 9.376 9.245 9.095 8.915 8.711 7.976 -9 ,9407 ,TETRA ,17559660,Sat Nov 27 08:17:20 CET,Sat Nov 27 10:08:37 CET,0.0 1.511 2.034 2.413 2.709 2.954 3.177 3.38 3.755 3.932 4.082 4.221 4.506 4.631 4.877 5.099 5.32 5.429 5.625 5.813 6.079 6.249 6.416 6.658 6.887 7.116 7.342 7.543 7.799 8.056 8.297 8.572 8.824 9.074 9.375 9.694 9.989 10.328 10.683 11.051 11.433 11.847 12.306 12.752 13.253 13.763 14.314 14.896 15.495 16.067 16.597 16.766 16.634 16.381 16.071 15.742 15.415 15.094 14.798 14.466 14.157 13.876 13.632 13.408 13.186 12.976 12.76 12.569 12.386 12.206 12.025 11.874 11.719 11.556 11.433 11.3 11.162 11.021 10.873 10.775 10.669 10.494 10.368 10.24 10.173 10.027 9.874 9.715 9.637 9.405 9.383 9.286 9.186 8.971 8.848 8.732 8.601 8.448 8.262 7.97 7.437 -10 ,10869 ,TETRA ,17559661,Sat Nov 27 08:17:20 CET,Sat Nov 27 10:07:41 CET,0.0 1.295 1.778 2.184 2.539 2.838 3.079 3.279 3.643 3.83 4.022 4.223 4.526 4.671 4.944 5.21 5.456 5.555 5.744 5.934 6.198 6.36 6.514 6.737 6.958 7.183 7.394 7.596 7.858 8.099 8.336 8.618 8.887 9.14 9.41 9.726 10.037 10.352 10.681 11.028 11.396 11.795 12.217 12.629 13.122 13.644 14.198 14.821 15.469 16.082 16.56 16.595 16.406 16.129 15.841 15.521 15.198 14.91 14.655 14.378 14.1 13.837 13.599 13.365 13.148 12.955 12.736 12.534 12.342 12.131 11.91 11.729 11.547 11.355 11.214 11.071 10.928 10.786 10.634 10.529 10.425 10.254 10.125 9.989 9.921 9.776 9.627 9.483 9.4 9.157 9.121 9.032 8.944 8.743 8.618 8.484 8.342 8.186 8.025 7.805 7.316 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_35_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_35_37.txt deleted file mode 100644 index 8cf7cba5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_35_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29045 ,TETRA ,17559662,Sat Nov 27 08:17:20 CET,Sat Nov 27 10:08:19 CET,0.0 1.254 1.662 1.985 2.263 2.491 2.687 2.872 3.201 3.352 3.497 3.63 3.92 4.043 4.272 4.492 4.716 4.836 5.093 5.336 5.664 5.861 6.032 6.265 6.487 6.703 6.909 7.126 7.41 7.669 7.917 8.202 8.466 8.726 9.016 9.334 9.625 9.934 10.28 10.627 10.989 11.392 11.823 12.243 12.707 13.167 13.63 14.098 14.531 14.873 14.992 14.726 14.279 13.747 13.222 12.72 12.261 11.84 11.483 11.098 10.743 10.423 10.112 9.811 9.517 9.241 8.958 8.707 8.477 8.24 8.007 7.815 7.609 7.379 7.193 7.009 6.816 6.614 6.392 6.232 6.085 5.868 5.703 5.512 5.411 5.205 4.97 4.722 4.608 4.347 4.284 4.177 4.07 3.823 3.69 3.544 3.382 3.19 2.975 2.729 2.29 -2 ,22998 ,TETRA ,17559663,Sat Nov 27 08:17:22 CET,Sat Nov 27 10:06:59 CET,0.0 1.166 1.551 1.837 2.053 2.227 2.396 2.568 2.883 3.026 3.175 3.314 3.603 3.736 3.991 4.213 4.417 4.523 4.721 4.903 5.152 5.316 5.491 5.748 6.005 6.258 6.498 6.727 7.002 7.263 7.518 7.805 8.076 8.333 8.617 8.936 9.242 9.585 9.934 10.27 10.625 11.016 11.456 11.869 12.317 12.8 13.289 13.73 14.144 14.526 14.676 14.346 13.874 13.381 12.908 12.453 12.005 11.56 11.149 10.72 10.344 10.033 9.747 9.477 9.227 8.993 8.753 8.53 8.328 8.126 7.914 7.749 7.573 7.368 7.206 7.042 6.884 6.717 6.545 6.432 6.316 6.13 6.003 5.86 5.782 5.617 5.436 5.263 5.18 4.928 4.831 4.685 4.544 4.25 4.092 3.923 3.713 3.452 3.17 2.821 0.773 -3 ,14081 ,TETRA ,17559664,Sat Nov 27 08:17:24 CET,Sat Nov 27 10:06:47 CET,0.0 1.153 1.444 1.67 1.866 2.06 2.23 2.373 2.627 2.754 2.883 2.96 3.225 3.349 3.582 3.783 3.977 4.079 4.265 4.43 4.667 4.818 4.983 5.239 5.476 5.673 5.857 6.042 6.268 6.469 6.668 6.911 7.136 7.348 7.6 7.88 8.138 8.416 8.691 8.974 9.268 9.565 9.902 10.248 10.654 11.084 11.472 11.848 12.214 12.489 12.58 12.33 11.908 11.454 11.05 10.659 10.248 9.846 9.493 9.142 8.839 8.558 8.301 8.044 7.78 7.534 7.287 7.068 6.877 6.688 6.497 6.344 6.186 6.01 5.862 5.714 5.566 5.408 5.249 5.146 5.031 4.832 4.7 4.565 4.495 4.361 4.211 4.04 3.952 3.706 3.681 3.587 3.486 3.246 3.108 2.974 2.811 2.627 2.425 2.165 1.7 -4 ,8879 ,TETRA ,17559665,Sat Nov 27 08:17:22 CET,Sat Nov 27 10:07:25 CET,0.0 0.878 1.21 1.493 1.742 1.95 2.14 2.33 2.652 2.785 2.899 2.958 3.228 3.336 3.52 3.679 3.851 3.938 4.097 4.25 4.485 4.643 4.801 5.046 5.278 5.484 5.681 5.863 6.087 6.298 6.509 6.766 7.0 7.224 7.482 7.769 8.032 8.318 8.628 8.942 9.25 9.571 9.92 10.279 10.675 11.106 11.604 12.071 12.527 12.902 13.054 12.835 12.395 11.877 11.358 10.844 10.4 9.984 9.607 9.238 8.905 8.593 8.295 8.026 7.786 7.549 7.279 7.032 6.812 6.584 6.339 6.13 5.92 5.704 5.534 5.355 5.169 4.963 4.743 4.589 4.43 4.175 3.996 3.811 3.711 3.515 3.307 3.071 2.951 2.675 2.621 2.524 2.419 2.191 2.069 1.939 1.794 1.601 1.346 1.049 0.265 -5 ,32318 ,TETRA ,17559666,Sat Nov 27 08:18:20 CET,Sat Nov 27 10:08:27 CET,0.0 1.325 1.749 2.061 2.313 2.524 2.737 2.934 3.275 3.432 3.581 3.751 4.067 4.21 4.446 4.652 4.848 4.94 5.114 5.296 5.558 5.716 5.863 6.093 6.327 6.55 6.756 6.932 7.157 7.379 7.59 7.849 8.09 8.349 8.667 9.004 9.311 9.616 9.946 10.3 10.657 11.042 11.456 11.871 12.321 12.776 13.256 13.703 14.135 14.49 14.607 14.27 13.761 13.251 12.76 12.268 11.801 11.354 10.978 10.59 10.232 9.922 9.616 9.315 9.035 8.77 8.491 8.249 8.038 7.823 7.58 7.373 7.171 6.969 6.818 6.649 6.466 6.285 6.109 5.984 5.848 5.636 5.479 5.314 5.234 5.064 4.872 4.66 4.548 4.285 4.228 4.109 3.983 3.72 3.584 3.439 3.284 3.115 2.921 2.685 2.211 -6 ,29855 ,TETRA ,17559667,Sat Nov 27 08:17:22 CET,Sat Nov 27 10:07:58 CET,0.0 2.393 3.04 3.476 3.757 3.958 4.148 4.329 4.678 4.828 4.954 5.029 5.286 5.379 5.572 5.767 5.944 6.024 6.176 6.328 6.531 6.654 6.788 6.994 7.197 7.385 7.577 7.776 8.003 8.212 8.457 8.765 9.029 9.26 9.508 9.782 10.044 10.339 10.655 10.978 11.321 11.682 12.09 12.5 12.955 13.408 13.891 14.394 14.876 15.219 15.303 15.023 14.57 14.068 13.584 13.116 12.662 12.242 11.885 11.508 11.17 10.843 10.527 10.243 9.977 9.724 9.444 9.194 8.969 8.727 8.473 8.254 8.013 7.761 7.557 7.342 7.138 6.926 6.687 6.529 6.353 6.047 5.872 5.724 5.64 5.464 5.288 5.1 5.0 4.747 4.715 4.61 4.504 4.257 4.123 3.988 3.841 3.676 3.472 3.192 2.769 -7 ,8031 ,TETRA ,17559668,Sat Nov 27 08:18:23 CET,Sat Nov 27 10:08:26 CET,0.0 1.059 1.387 1.671 1.923 2.148 2.358 2.552 2.886 3.033 3.18 3.302 3.593 3.727 3.961 4.185 4.405 4.504 4.712 4.93 5.2 5.362 5.539 5.81 6.073 6.323 6.568 6.801 7.078 7.337 7.583 7.877 8.165 8.44 8.742 9.075 9.386 9.732 10.087 10.416 10.763 11.143 11.538 11.928 12.368 12.817 13.291 13.785 14.242 14.596 14.706 14.395 13.945 13.443 12.941 12.436 11.96 11.517 11.115 10.696 10.331 9.994 9.67 9.353 9.054 8.78 8.491 8.23 8.0 7.752 7.476 7.267 7.066 6.837 6.653 6.47 6.278 6.075 5.861 5.715 5.568 5.323 5.147 4.979 4.899 4.733 4.553 4.364 4.264 3.999 3.927 3.825 3.718 3.493 3.355 3.2 3.051 2.872 2.641 2.37 1.739 -8 ,7617 ,TETRA ,17559669,Sat Nov 27 08:18:20 CET,Sat Nov 27 09:59:39 CET,0.0 1.138 1.556 1.879 2.167 2.409 2.621 2.815 3.15 3.293 3.424 3.526 3.802 3.931 4.199 4.455 4.669 4.769 4.962 5.15 5.43 5.611 5.773 5.991 6.208 6.425 6.624 6.814 7.069 7.305 7.524 7.792 8.052 8.304 8.591 8.909 9.214 9.532 9.865 10.196 10.538 10.94 11.402 11.823 12.282 12.764 13.236 13.667 14.074 14.413 14.553 14.279 13.832 13.347 12.843 12.371 11.942 11.501 11.105 10.707 10.35 10.021 9.71 9.413 9.135 8.884 8.605 8.342 8.116 7.88 7.63 7.417 7.197 6.977 6.822 6.671 6.506 6.323 6.124 5.99 5.853 5.628 5.478 5.329 5.252 5.087 4.898 4.7 4.6 4.342 4.305 4.209 4.087 3.824 3.698 3.546 3.363 3.177 2.996 2.761 2.105 -9 ,15761 ,TETRA ,17559670,Sat Nov 27 08:18:20 CET,Sat Nov 27 09:59:31 CET,0.0 1.156 1.473 1.72 1.916 2.114 2.306 2.471 2.744 2.87 2.998 3.068 3.328 3.436 3.636 3.811 3.975 4.059 4.226 4.379 4.592 4.732 4.867 5.08 5.291 5.493 5.701 5.895 6.123 6.342 6.543 6.787 7.023 7.247 7.504 7.777 8.041 8.325 8.588 8.859 9.155 9.474 9.839 10.185 10.571 10.995 11.412 11.776 12.133 12.448 12.566 12.297 11.894 11.449 10.982 10.535 10.133 9.749 9.396 9.006 8.656 8.362 8.075 7.795 7.537 7.308 7.077 6.867 6.69 6.493 6.276 6.1 5.922 5.735 5.583 5.434 5.291 5.141 4.972 4.854 4.735 4.546 4.419 4.294 4.23 4.095 3.943 3.776 3.694 3.452 3.425 3.328 3.21 2.96 2.831 2.684 2.521 2.349 2.19 2.014 1.638 -10 ,26003 ,TETRA ,17559671,Sat Nov 27 08:19:20 CET,Sat Nov 27 10:11:13 CET,0.0 1.052 1.465 1.709 1.905 2.082 2.235 2.378 2.633 2.746 2.858 2.912 3.172 3.275 3.463 3.626 3.775 3.858 4.038 4.208 4.425 4.557 4.684 4.876 5.071 5.255 5.445 5.634 5.856 6.062 6.253 6.48 6.703 6.935 7.204 7.502 7.784 8.059 8.338 8.625 8.921 9.249 9.674 10.101 10.527 10.976 11.455 11.888 12.317 12.727 12.936 12.654 12.162 11.639 11.133 10.615 10.124 9.679 9.302 8.919 8.575 8.252 7.917 7.602 7.313 7.038 6.743 6.466 6.225 5.992 5.751 5.545 5.306 5.06 4.884 4.69 4.48 4.269 4.055 3.916 3.78 3.547 3.384 3.219 3.132 2.965 2.789 2.602 2.507 2.261 2.208 2.097 1.985 1.706 1.553 1.407 1.231 1.033 0.842 0.558 -0.203 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_35_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_35_49.txt deleted file mode 100644 index fc05d5aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_35_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3321 ,TETRA ,17559672,Sat Nov 27 08:20:20 CET,Sat Nov 27 10:09:22 CET,0.0 0.718 1.055 1.323 1.551 1.752 1.946 2.148 2.525 2.681 2.832 2.982 3.275 3.411 3.689 3.951 4.177 4.289 4.503 4.699 4.989 5.172 5.342 5.592 5.838 6.072 6.287 6.507 6.804 7.079 7.339 7.667 7.986 8.295 8.641 9.01 9.368 9.759 10.186 10.638 11.075 11.531 12.052 12.549 13.11 13.739 14.48 15.271 16.06 16.894 17.654 17.917 17.759 17.473 17.16 16.814 16.494 16.172 15.879 15.574 15.294 15.022 14.757 14.501 14.248 14.008 13.747 13.523 13.334 13.119 12.892 12.715 12.519 12.315 12.161 11.985 11.808 11.644 11.481 11.356 11.218 11.013 10.873 10.734 10.663 10.504 10.348 10.189 10.1 9.863 9.826 9.719 9.606 9.378 9.258 9.12 8.96 8.792 8.611 8.4 7.675 -2 ,11720 ,TETRA ,17559673,Sat Nov 27 08:20:20 CET,Sat Nov 27 10:08:44 CET,0.0 0.896 1.337 1.633 1.893 2.122 2.334 2.523 2.869 3.037 3.191 3.328 3.62 3.747 3.989 4.226 4.458 4.573 4.812 5.044 5.358 5.561 5.759 6.036 6.299 6.566 6.821 7.053 7.352 7.632 7.887 8.198 8.504 8.798 9.16 9.56 9.922 10.306 10.7 11.118 11.562 12.03 12.557 13.075 13.657 14.282 14.955 15.672 16.382 17.044 17.66 17.758 17.546 17.295 16.964 16.62 16.304 15.975 15.681 15.376 15.091 14.823 14.567 14.306 14.042 13.814 13.567 13.319 13.111 12.923 12.722 12.538 12.339 12.134 11.982 11.83 11.683 11.532 11.358 11.235 11.112 10.916 10.777 10.632 10.562 10.413 10.249 10.075 9.983 9.744 9.686 9.578 9.469 9.223 9.087 8.936 8.765 8.596 8.404 8.122 7.639 -3 ,771 ,TETRA ,17559674,Sat Nov 27 08:21:21 CET,Sat Nov 27 10:16:02 CET,0.0 0.963 1.314 1.601 1.858 2.075 2.266 2.437 2.777 2.939 3.088 3.202 3.486 3.622 3.881 4.108 4.32 4.429 4.637 4.831 5.108 5.288 5.464 5.717 5.958 6.189 6.396 6.595 6.875 7.164 7.45 7.776 8.077 8.365 8.702 9.071 9.426 9.818 10.21 10.611 11.055 11.542 12.078 12.637 13.282 13.945 14.661 15.388 16.111 16.839 17.513 17.716 17.588 17.328 16.998 16.663 16.351 16.022 15.707 15.385 15.101 14.827 14.55 14.303 14.084 13.889 13.679 13.473 13.285 13.084 12.882 12.712 12.528 12.356 12.235 12.115 11.985 11.852 11.72 11.618 11.506 11.327 11.205 11.074 11.006 10.87 10.732 10.587 10.51 10.288 10.271 10.175 10.068 9.833 9.701 9.565 9.419 9.264 9.102 8.905 8.257 -4 ,14193 ,TETRA ,17559675,Sat Nov 27 08:21:21 CET,Sat Nov 27 10:11:28 CET,0.0 1.315 1.715 1.98 2.225 2.461 2.662 2.849 3.209 3.374 3.528 3.657 3.943 4.072 4.314 4.542 4.766 4.875 5.085 5.279 5.571 5.773 5.976 6.277 6.551 6.799 7.035 7.277 7.594 7.88 8.151 8.472 8.769 9.059 9.383 9.738 10.093 10.477 10.869 11.284 11.726 12.209 12.763 13.309 13.926 14.569 15.247 15.967 16.729 17.525 18.263 18.474 18.296 18.004 17.656 17.304 16.99 16.661 16.325 15.973 15.683 15.41 15.111 14.816 14.544 14.276 13.985 13.738 13.537 13.336 13.134 12.965 12.793 12.616 12.461 12.296 12.137 11.969 11.786 11.659 11.529 11.345 11.222 11.1 11.035 10.887 10.735 10.587 10.512 10.277 10.24 10.147 10.042 9.817 9.697 9.562 9.398 9.231 9.049 8.738 8.103 -5 ,28380 ,TETRA ,17559676,Sat Nov 27 08:22:18 CET,Sat Nov 27 10:10:27 CET,0.0 1.025 1.445 1.692 1.886 2.08 2.249 2.408 2.705 2.849 2.986 3.067 3.336 3.458 3.674 3.865 4.049 4.142 4.346 4.556 4.858 5.048 5.221 5.47 5.715 5.962 6.194 6.397 6.662 6.944 7.218 7.536 7.86 8.183 8.537 8.895 9.232 9.609 10.011 10.44 10.878 11.35 11.913 12.458 13.042 13.678 14.365 15.079 15.85 16.606 17.214 17.41 17.301 17.051 16.718 16.379 16.057 15.705 15.38 15.054 14.756 14.469 14.182 13.912 13.661 13.421 13.159 12.931 12.745 12.556 12.363 12.196 12.02 11.828 11.669 11.511 11.345 11.167 10.984 10.859 10.727 10.518 10.382 10.252 10.184 10.045 9.908 9.764 9.683 9.452 9.434 9.333 9.223 8.987 8.869 8.76 8.638 8.467 8.298 8.12 7.651 -6 ,30172 ,TETRA ,17559677,Sat Nov 27 08:23:16 CET,Sat Nov 27 10:12:04 CET,0.0 0.916 1.274 1.53 1.757 1.97 2.154 2.329 2.693 2.844 2.981 3.108 3.383 3.493 3.709 3.921 4.116 4.209 4.391 4.579 4.853 5.015 5.179 5.42 5.643 5.861 6.053 6.224 6.452 6.692 6.925 7.2 7.466 7.72 8.003 8.321 8.645 8.99 9.345 9.725 10.118 10.559 11.071 11.55 12.086 12.673 13.305 13.94 14.602 15.255 15.843 16.082 15.947 15.689 15.388 15.041 14.739 14.444 14.144 13.82 13.533 13.263 12.988 12.724 12.481 12.25 11.981 11.743 11.536 11.302 11.043 10.82 10.604 10.378 10.193 9.986 9.767 9.546 9.311 9.149 8.994 8.761 8.594 8.414 8.318 8.117 7.898 7.663 7.549 7.279 7.172 7.038 6.892 6.59 6.421 6.249 6.088 5.922 5.729 5.464 4.943 -7 ,17453 ,TETRA ,17559678,Sat Nov 27 08:23:16 CET,Sat Nov 27 10:14:49 CET,0.0 0.867 1.235 1.506 1.734 1.91 2.064 2.214 2.507 2.646 2.785 2.878 3.139 3.239 3.438 3.658 3.874 3.973 4.153 4.316 4.543 4.697 4.848 5.051 5.253 5.448 5.637 5.831 6.078 6.321 6.561 6.855 7.138 7.397 7.672 7.982 8.277 8.599 8.953 9.32 9.689 10.09 10.551 10.991 11.512 12.085 12.708 13.363 14.038 14.745 15.346 15.585 15.548 15.361 15.089 14.762 14.454 14.142 13.849 13.554 13.293 13.049 12.808 12.577 12.362 12.16 11.928 11.707 11.515 11.324 11.126 10.956 10.782 10.604 10.468 10.326 10.174 10.03 9.885 9.782 9.681 9.524 9.409 9.284 9.22 9.085 8.938 8.786 8.716 8.492 8.439 8.335 8.245 7.996 7.853 7.719 7.572 7.39 7.184 6.969 6.564 -8 ,19 ,TETRA ,17559679,Sat Nov 27 08:24:18 CET,Sat Nov 27 10:15:48 CET,0.0 0.906 1.266 1.543 1.79 2.007 2.204 2.394 2.733 2.885 3.026 3.126 3.412 3.55 3.789 4.028 4.278 4.397 4.617 4.817 5.089 5.257 5.429 5.689 5.934 6.166 6.381 6.593 6.879 7.153 7.406 7.708 7.99 8.259 8.578 8.939 9.286 9.648 10.024 10.435 10.851 11.29 11.79 12.306 12.905 13.529 14.202 14.9 15.654 16.431 17.097 17.262 17.128 16.893 16.567 16.194 15.846 15.513 15.191 14.859 14.572 14.306 14.042 13.79 13.572 13.367 13.13 12.922 12.757 12.587 12.399 12.236 12.063 11.885 11.748 11.606 11.448 11.275 11.109 11.012 10.903 10.719 10.6 10.47 10.406 10.285 10.149 9.99 9.909 9.685 9.669 9.583 9.495 9.288 9.181 9.06 8.908 8.741 8.544 8.336 7.995 -9 ,13185 ,TETRA ,17559680,Sat Nov 27 08:24:18 CET,Sat Nov 27 10:07:54 CET,0.0 1.157 1.552 1.839 2.079 2.288 2.483 2.683 3.036 3.187 3.338 3.469 3.753 3.887 4.145 4.394 4.634 4.733 4.912 5.098 5.395 5.587 5.77 6.033 6.281 6.516 6.753 6.991 7.27 7.526 7.787 8.094 8.383 8.672 8.994 9.335 9.67 10.048 10.446 10.867 11.319 11.816 12.33 12.849 13.473 14.109 14.821 15.577 16.301 17.001 17.588 17.783 17.666 17.368 17.021 16.694 16.385 16.069 15.766 15.456 15.181 14.919 14.648 14.392 14.151 13.918 13.678 13.469 13.263 13.041 12.817 12.628 12.44 12.242 12.073 11.888 11.695 11.491 11.277 11.123 10.965 10.724 10.563 10.408 10.323 10.143 9.97 9.792 9.702 9.463 9.425 9.319 9.207 8.949 8.802 8.652 8.481 8.302 8.123 7.926 7.514 -10 ,4709 ,TETRA ,17559681,Sat Nov 27 08:24:17 CET,Sat Nov 27 10:04:46 CET,0.0 1.167 1.473 1.71 1.921 2.147 2.36 2.552 2.898 3.05 3.2 3.328 3.615 3.746 3.998 4.236 4.452 4.557 4.766 4.972 5.262 5.444 5.622 5.873 6.122 6.366 6.59 6.811 7.088 7.332 7.568 7.862 8.161 8.454 8.759 9.092 9.449 9.86 10.262 10.669 11.095 11.57 12.123 12.674 13.284 13.933 14.622 15.301 16.085 16.898 17.571 17.796 17.69 17.473 17.198 16.845 16.498 16.185 15.897 15.572 15.272 15.013 14.771 14.537 14.313 14.106 13.881 13.666 13.486 13.301 13.096 12.925 12.741 12.54 12.372 12.19 12.013 11.816 11.583 11.432 11.284 11.044 10.885 10.728 10.646 10.49 10.344 10.197 10.12 9.889 9.884 9.8 9.689 9.407 9.266 9.126 8.97 8.784 8.578 8.364 7.984 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_35_52.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_35_52.txt deleted file mode 100644 index 2a022e5a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_35_52.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15967 ,TETRA ,17559682,Sat Nov 27 08:25:17 CET,Sat Nov 27 10:15:04 CET,0.0 1.239 1.706 2.074 2.334 2.542 2.726 2.888 3.237 3.404 3.561 3.688 3.971 4.1 4.331 4.541 4.731 4.815 4.983 5.152 5.403 5.561 5.712 5.922 6.121 6.318 6.513 6.707 6.981 7.254 7.499 7.788 8.052 8.293 8.573 8.896 9.202 9.517 9.836 10.17 10.498 10.841 11.221 11.573 11.966 12.361 12.74 13.078 13.411 13.669 13.534 12.879 12.13 11.417 10.766 10.129 9.558 9.022 8.542 8.046 7.608 7.207 6.814 6.455 6.118 5.791 5.453 5.175 4.932 4.68 4.412 4.177 3.923 3.659 3.451 3.231 3.005 2.772 2.538 2.377 2.219 1.986 1.821 1.647 1.557 1.373 1.166 0.951 0.845 0.579 0.5 0.381 0.252 -0.045 -0.212 -0.39 -0.583 -0.787 -1.01 -1.326 -2.944 -2 ,20536 ,TETRA ,17559683,Sat Nov 27 08:25:17 CET,Sat Nov 27 10:13:23 CET,0.0 2.023 2.528 2.911 3.207 3.471 3.744 3.993 4.412 4.605 4.798 4.967 5.265 5.414 5.683 5.934 6.164 6.278 6.506 6.711 6.987 7.165 7.346 7.606 7.86 8.091 8.297 8.495 8.747 8.994 9.235 9.509 9.764 10.007 10.31 10.658 10.963 11.287 11.62 11.972 12.33 12.699 13.102 13.489 13.933 14.372 14.81 15.243 15.584 15.765 15.672 15.121 14.502 13.81 13.132 12.53 11.977 11.447 10.974 10.468 10.004 9.609 9.237 8.891 8.553 8.24 7.925 7.618 7.342 7.063 6.765 6.514 6.264 6.005 5.807 5.599 5.366 5.129 4.882 4.72 4.574 4.325 4.142 3.949 3.85 3.634 3.391 3.159 3.05 2.791 2.726 2.585 2.436 2.183 2.026 1.854 1.683 1.485 1.248 0.937 -0.111 -3 ,22234 ,TETRA ,17559684,Sat Nov 27 08:25:18 CET,Sat Nov 27 10:13:19 CET,0.0 2.808 3.433 3.865 4.194 4.467 4.72 4.948 5.376 5.573 5.746 5.92 6.225 6.36 6.608 6.845 7.065 7.162 7.36 7.584 7.911 8.103 8.286 8.558 8.813 9.039 9.244 9.443 9.701 9.959 10.205 10.487 10.759 11.01 11.291 11.604 11.878 12.153 12.463 12.795 13.113 13.456 13.851 14.192 14.547 14.923 15.287 15.654 15.969 16.176 16.073 15.512 14.892 14.233 13.624 13.069 12.556 12.059 11.612 11.158 10.762 10.414 10.075 9.724 9.373 9.048 8.696 8.398 8.159 7.889 7.603 7.363 7.092 6.792 6.566 6.33 6.077 5.831 5.583 5.401 5.21 4.914 4.716 4.507 4.388 4.141 3.892 3.612 3.47 3.192 3.061 2.9 2.736 2.359 2.145 1.915 1.682 1.45 1.139 0.679 -0.911 -4 ,19123 ,TETRA ,17559685,Sat Nov 27 08:25:18 CET,Sat Nov 27 10:14:27 CET,0.0 1.354 1.802 2.177 2.469 2.72 2.943 3.124 3.442 3.593 3.745 3.909 4.199 4.319 4.529 4.745 4.974 5.078 5.28 5.474 5.752 5.918 6.079 6.321 6.554 6.773 6.971 7.183 7.469 7.71 7.926 8.193 8.437 8.66 8.93 9.213 9.47 9.767 10.072 10.38 10.724 11.105 11.505 11.869 12.233 12.619 13.031 13.449 13.835 13.972 13.763 13.206 12.515 11.789 11.102 10.475 9.928 9.406 8.931 8.437 7.998 7.613 7.241 6.883 6.55 6.242 5.9 5.58 5.306 5.027 4.753 4.522 4.274 4.025 3.829 3.623 3.405 3.172 2.937 2.778 2.602 2.325 2.143 1.955 1.861 1.666 1.455 1.24 1.127 0.858 0.784 0.656 0.516 0.218 0.057 -0.115 -0.313 -0.543 -0.793 -1.094 -1.708 -5 ,684 ,TETRA ,17559686,Sat Nov 27 08:25:18 CET,Sat Nov 27 10:14:00 CET,0.0 1.818 2.253 2.556 2.871 3.172 3.43 3.666 4.091 4.28 4.45 4.594 4.896 5.047 5.31 5.537 5.748 5.854 6.066 6.269 6.551 6.719 6.887 7.14 7.382 7.606 7.81 7.995 8.237 8.482 8.728 8.998 9.226 9.458 9.715 9.977 10.245 10.537 10.827 11.137 11.465 11.819 12.219 12.591 12.978 13.367 13.787 14.201 14.523 14.701 14.596 14.092 13.443 12.755 12.133 11.544 10.982 10.445 9.953 9.485 9.094 8.716 8.359 8.026 7.705 7.402 7.066 6.749 6.476 6.206 5.928 5.689 5.44 5.173 4.963 4.739 4.514 4.301 4.069 3.912 3.745 3.45 3.26 3.078 2.972 2.722 2.455 2.199 2.066 1.765 1.601 1.444 1.286 0.935 0.733 0.489 0.214 -0.088 -0.445 -0.855 -2.258 -6 ,24792 ,TETRA ,17559687,Sat Nov 27 08:25:18 CET,Sat Nov 27 10:10:15 CET,0.0 2.362 2.865 3.248 3.559 3.82 4.054 4.295 4.72 4.91 5.083 5.212 5.492 5.626 5.912 6.173 6.395 6.502 6.706 6.905 7.205 7.383 7.547 7.792 8.037 8.261 8.483 8.703 8.98 9.24 9.477 9.748 10.01 10.261 10.531 10.829 11.133 11.446 11.742 12.067 12.411 12.778 13.189 13.575 14.009 14.43 14.82 15.159 15.422 15.597 15.472 14.882 14.13 13.378 12.659 12.014 11.469 10.945 10.474 9.993 9.567 9.191 8.835 8.487 8.154 7.846 7.528 7.239 6.99 6.733 6.452 6.206 5.945 5.686 5.492 5.276 5.054 4.815 4.571 4.415 4.242 3.967 3.771 3.555 3.448 3.226 2.984 2.726 2.583 2.279 2.129 1.978 1.821 1.498 1.308 1.092 0.875 0.645 0.378 -0.019 -1.442 -7 ,5369 ,TETRA ,17559688,Sat Nov 27 08:26:16 CET,Sat Nov 27 10:14:22 CET,0.0 1.02 1.45 1.775 2.064 2.318 2.544 2.762 3.128 3.277 3.431 3.578 3.869 3.997 4.248 4.485 4.725 4.841 5.054 5.258 5.528 5.695 5.866 6.132 6.389 6.624 6.842 7.045 7.306 7.559 7.792 8.059 8.32 8.574 8.871 9.173 9.449 9.761 10.076 10.4 10.74 11.122 11.52 11.886 12.28 12.678 13.092 13.441 13.712 13.817 13.658 13.116 12.471 11.8 11.136 10.552 10.007 9.484 9.013 8.499 8.041 7.602 7.156 6.741 6.363 6.025 5.679 5.381 5.133 4.871 4.594 4.346 4.095 3.834 3.633 3.456 3.272 3.071 2.868 2.734 2.588 2.364 2.211 2.05 1.968 1.793 1.598 1.386 1.275 1.01 0.948 0.837 0.723 0.469 0.314 0.151 -0.03 -0.28 -0.583 -0.969 -3.045 -8 ,3304 ,TETRA ,17559689,Sat Nov 27 08:26:16 CET,Sat Nov 27 10:17:20 CET,0.0 1.019 1.389 1.701 1.982 2.233 2.456 2.675 3.095 3.284 3.446 3.566 3.837 3.957 4.2 4.415 4.623 4.722 4.919 5.118 5.403 5.579 5.735 5.948 6.154 6.373 6.586 6.782 7.03 7.275 7.521 7.809 8.071 8.318 8.608 8.918 9.196 9.49 9.792 10.104 10.449 10.842 11.245 11.612 12.034 12.48 12.892 13.251 13.551 13.666 13.509 12.922 12.23 11.509 10.811 10.149 9.588 9.079 8.62 8.172 7.787 7.432 7.066 6.711 6.397 6.117 5.814 5.53 5.287 5.038 4.779 4.563 4.329 4.063 3.838 3.622 3.415 3.204 2.985 2.829 2.66 2.4 2.209 1.987 1.866 1.619 1.374 1.122 0.985 0.687 0.518 0.351 0.171 -0.225 -0.432 -0.682 -0.988 -1.292 -1.614 -2.095 -3.981 -9 ,15166 ,TETRA ,17559690,Sat Nov 27 08:26:16 CET,Sat Nov 27 10:06:50 CET,0.0 2.082 2.614 3.031 3.361 3.649 3.883 4.086 4.441 4.585 4.713 4.811 5.091 5.228 5.479 5.691 5.879 5.971 6.153 6.335 6.592 6.748 6.906 7.15 7.385 7.612 7.84 8.049 8.306 8.553 8.787 9.058 9.311 9.566 9.854 10.155 10.441 10.757 11.094 11.419 11.761 12.153 12.56 12.946 13.341 13.734 14.13 14.475 14.745 14.874 14.699 14.077 13.338 12.662 12.043 11.396 10.801 10.269 9.795 9.302 8.877 8.493 8.119 7.761 7.421 7.11 6.773 6.467 6.21 5.956 5.691 5.474 5.254 5.022 4.85 4.674 4.487 4.272 4.029 3.865 3.703 3.465 3.304 3.119 3.011 2.772 2.524 2.282 2.151 1.844 1.658 1.484 1.304 0.914 0.689 0.448 0.186 -0.13 -0.512 -0.999 -2.934 -10 ,2248 ,TETRA ,17559691,Sat Nov 27 08:27:18 CET,Sat Nov 27 10:16:57 CET,0.0 0.967 1.334 1.66 1.917 2.137 2.34 2.536 2.908 3.066 3.205 3.328 3.624 3.763 4.033 4.285 4.494 4.592 4.79 4.979 5.283 5.478 5.642 5.886 6.125 6.356 6.569 6.758 7.003 7.229 7.446 7.731 8.001 8.237 8.488 8.781 9.069 9.374 9.696 10.016 10.324 10.666 11.069 11.439 11.841 12.275 12.73 13.16 13.515 13.686 13.568 13.007 12.32 11.643 11.019 10.402 9.834 9.299 8.807 8.32 7.892 7.506 7.144 6.798 6.463 6.136 5.802 5.526 5.284 5.022 4.743 4.505 4.258 4.007 3.808 3.599 3.378 3.141 2.906 2.742 2.564 2.286 2.096 1.899 1.796 1.572 1.333 1.079 0.945 0.654 0.5 0.346 0.186 -0.173 -0.359 -0.546 -0.748 -0.951 -1.172 -1.47 -2.313 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_37_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_37_50.txt deleted file mode 100644 index 9572bb06..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_37_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25408 ,TETRA ,17559692,Sat Nov 27 08:27:18 CET,Sat Nov 27 10:16:39 CET,0.0 0.842 1.201 1.465 1.685 1.895 2.075 2.223 2.496 2.63 2.771 2.867 3.134 3.245 3.451 3.653 3.847 3.94 4.125 4.299 4.534 4.671 4.803 5.014 5.233 5.467 5.692 5.896 6.172 6.433 6.678 6.969 7.234 7.499 7.801 8.125 8.45 8.792 9.136 9.505 9.913 10.36 10.834 11.294 11.82 12.372 12.966 13.587 14.233 14.902 15.474 15.585 15.398 15.063 14.718 14.381 14.033 13.683 13.352 13.008 12.705 12.424 12.151 11.894 11.647 11.417 11.165 10.925 10.728 10.527 10.299 10.104 9.92 9.735 9.588 9.434 9.268 9.112 8.963 8.856 8.748 8.583 8.477 8.358 8.294 8.164 8.01 7.838 7.748 7.504 7.467 7.377 7.274 7.045 6.93 6.81 6.675 6.522 6.357 6.134 5.631 -2 ,10082 ,TETRA ,17559693,Sat Nov 27 08:27:18 CET,Sat Nov 27 10:17:59 CET,0.0 0.68 0.993 1.218 1.436 1.62 1.768 1.917 2.193 2.332 2.465 2.535 2.801 2.919 3.149 3.368 3.57 3.662 3.844 4.028 4.285 4.448 4.6 4.805 5.001 5.185 5.366 5.562 5.805 6.015 6.226 6.477 6.698 6.914 7.18 7.472 7.753 8.066 8.387 8.72 9.083 9.522 10.033 10.496 10.995 11.544 12.162 12.833 13.526 14.142 14.643 14.759 14.57 14.262 13.911 13.536 13.192 12.854 12.538 12.232 11.947 11.665 11.38 11.117 10.87 10.648 10.418 10.204 10.017 9.823 9.626 9.468 9.299 9.115 8.977 8.847 8.707 8.548 8.375 8.26 8.148 7.965 7.835 7.699 7.626 7.481 7.337 7.179 7.094 6.856 6.826 6.74 6.646 6.429 6.313 6.198 6.071 5.912 5.718 5.512 5.162 -3 ,9135 ,TETRA ,17559694,Sat Nov 27 08:27:18 CET,Sat Nov 27 10:17:20 CET,0.0 0.464 0.73 0.944 1.137 1.32 1.48 1.632 1.881 1.99 2.104 2.155 2.404 2.5 2.679 2.835 2.986 3.063 3.234 3.408 3.625 3.759 3.9 4.103 4.297 4.471 4.63 4.799 5.026 5.246 5.463 5.731 5.985 6.229 6.508 6.81 7.099 7.427 7.786 8.159 8.546 8.956 9.41 9.84 10.313 10.847 11.452 12.094 12.773 13.412 13.952 14.145 13.997 13.725 13.392 13.023 12.692 12.384 12.105 11.81 11.54 11.304 11.066 10.825 10.597 10.386 10.164 9.956 9.782 9.607 9.43 9.281 9.13 8.983 8.863 8.741 8.62 8.489 8.338 8.226 8.12 7.968 7.854 7.715 7.646 7.518 7.383 7.247 7.18 6.961 6.95 6.867 6.777 6.591 6.495 6.38 6.24 6.091 5.922 5.727 5.452 -4 ,22077 ,TETRA ,17559695,Sat Nov 27 08:29:17 CET,Sat Nov 27 10:18:37 CET,0.0 0.837 1.202 1.469 1.667 1.856 2.028 2.196 2.537 2.678 2.804 2.89 3.154 3.258 3.471 3.676 3.875 3.971 4.144 4.325 4.582 4.734 4.879 5.08 5.277 5.474 5.656 5.828 6.06 6.294 6.517 6.768 7.006 7.248 7.529 7.836 8.14 8.494 8.862 9.231 9.625 10.065 10.563 11.04 11.567 12.113 12.694 13.296 13.91 14.534 15.118 15.269 15.115 14.848 14.507 14.164 13.853 13.537 13.221 12.876 12.57 12.275 11.998 11.724 11.466 11.251 11.019 10.788 10.579 10.357 10.124 9.935 9.744 9.549 9.399 9.234 9.052 8.873 8.685 8.553 8.43 8.243 8.113 7.967 7.892 7.748 7.6 7.448 7.37 7.132 7.099 7.01 6.909 6.668 6.546 6.416 6.276 6.122 5.929 5.715 5.327 -5 ,29231 ,TETRA ,17559696,Sat Nov 27 08:29:17 CET,Sat Nov 27 10:18:36 CET,0.0 0.802 1.15 1.407 1.63 1.836 2.01 2.172 2.481 2.615 2.739 2.817 3.084 3.193 3.398 3.581 3.755 3.848 4.031 4.205 4.45 4.602 4.747 4.965 5.167 5.352 5.527 5.701 5.931 6.154 6.358 6.608 6.855 7.08 7.341 7.621 7.902 8.236 8.604 8.993 9.408 9.863 10.365 10.84 11.341 11.87 12.454 13.079 13.786 14.512 15.053 15.142 14.922 14.587 14.26 13.897 13.508 13.151 12.837 12.505 12.209 11.935 11.669 11.415 11.171 10.937 10.702 10.51 10.342 10.157 9.957 9.785 9.613 9.442 9.308 9.17 9.029 8.882 8.716 8.599 8.486 8.303 8.172 8.04 7.964 7.81 7.656 7.492 7.41 7.181 7.163 7.062 6.957 6.741 6.61 6.466 6.327 6.187 6.032 5.816 5.369 -6 ,16811 ,TETRA ,17559697,Sat Nov 27 08:29:19 CET,Sat Nov 27 10:20:44 CET,0.0 0.957 1.235 1.477 1.715 1.936 2.138 2.317 2.612 2.755 2.883 2.963 3.236 3.349 3.561 3.767 3.95 4.037 4.214 4.395 4.665 4.826 4.979 5.21 5.412 5.6 5.803 5.998 6.251 6.499 6.746 7.045 7.316 7.578 7.871 8.191 8.498 8.822 9.163 9.521 9.896 10.317 10.79 11.244 11.768 12.325 12.944 13.621 14.261 14.846 15.381 15.489 15.272 14.991 14.69 14.351 13.994 13.63 13.299 12.95 12.647 12.375 12.092 11.818 11.564 11.344 11.109 10.889 10.705 10.502 10.275 10.088 9.899 9.681 9.512 9.351 9.182 9.014 8.845 8.726 8.601 8.413 8.286 8.142 8.071 7.933 7.783 7.636 7.557 7.324 7.303 7.214 7.113 6.899 6.789 6.656 6.505 6.343 6.149 5.906 5.423 -7 ,22091 ,TETRA ,17559698,Sat Nov 27 08:29:17 CET,Sat Nov 27 10:18:47 CET,0.0 1.029 1.399 1.663 1.885 2.076 2.273 2.457 2.762 2.906 3.049 3.174 3.46 3.572 3.776 3.978 4.171 4.264 4.441 4.622 4.883 5.033 5.176 5.385 5.589 5.794 5.985 6.151 6.37 6.601 6.831 7.127 7.412 7.685 8.002 8.33 8.632 8.955 9.3 9.662 10.045 10.487 10.992 11.469 11.994 12.548 13.181 13.871 14.584 15.303 15.893 16.02 15.841 15.534 15.203 14.842 14.449 14.07 13.734 13.397 13.108 12.828 12.556 12.28 12.026 11.795 11.536 11.303 11.099 10.891 10.676 10.494 10.302 10.11 9.974 9.839 9.691 9.535 9.373 9.259 9.135 8.929 8.778 8.62 8.537 8.365 8.173 7.968 7.867 7.617 7.561 7.454 7.341 7.098 6.958 6.813 6.67 6.515 6.339 6.058 5.507 -8 ,24305 ,TETRA ,17559699,Sat Nov 27 08:30:18 CET,Sat Nov 27 10:21:17 CET,0.0 0.532 0.838 1.074 1.249 1.398 1.533 1.659 1.903 2.017 2.134 2.231 2.506 2.614 2.818 3.018 3.219 3.327 3.525 3.702 3.96 4.117 4.265 4.499 4.722 4.947 5.175 5.364 5.612 5.854 6.072 6.347 6.632 6.908 7.215 7.539 7.855 8.209 8.593 9.003 9.423 9.855 10.33 10.812 11.349 11.927 12.557 13.197 13.84 14.465 15.041 15.23 15.07 14.771 14.428 14.06 13.697 13.355 13.046 12.717 12.411 12.142 11.895 11.652 11.417 11.2 10.981 10.784 10.611 10.437 10.263 10.118 9.958 9.786 9.656 9.518 9.362 9.207 9.047 8.93 8.811 8.635 8.506 8.368 8.299 8.161 8.01 7.854 7.771 7.537 7.504 7.406 7.306 7.082 6.966 6.851 6.704 6.537 6.36 6.161 5.841 -9 ,4085 ,TETRA ,17559700,Sat Nov 27 08:30:18 CET,Sat Nov 27 10:20:03 CET,0.0 0.337 0.551 0.762 0.983 1.191 1.371 1.532 1.81 1.94 2.076 2.174 2.448 2.565 2.781 2.976 3.165 3.263 3.457 3.629 3.858 4.014 4.179 4.413 4.61 4.797 4.996 5.19 5.429 5.677 5.921 6.194 6.445 6.676 6.929 7.216 7.492 7.791 8.126 8.47 8.843 9.254 9.73 10.202 10.718 11.274 11.882 12.526 13.169 13.824 14.406 14.532 14.321 14.015 13.687 13.339 13.016 12.718 12.448 12.162 11.897 11.662 11.418 11.182 10.969 10.76 10.539 10.338 10.165 9.982 9.798 9.647 9.483 9.321 9.195 9.069 8.94 8.807 8.669 8.569 8.462 8.295 8.178 8.05 7.985 7.865 7.745 7.61 7.54 7.325 7.311 7.225 7.136 6.951 6.859 6.74 6.597 6.46 6.331 6.188 5.945 -10 ,2520 ,TETRA ,17559701,Sat Nov 27 08:30:18 CET,Sat Nov 27 10:10:21 CET,0.0 1.574 2.079 2.333 2.553 2.77 2.95 3.088 3.32 3.443 3.557 3.593 3.847 3.941 4.128 4.314 4.489 4.569 4.713 4.855 5.058 5.182 5.305 5.488 5.667 5.839 6.001 6.158 6.379 6.609 6.84 7.123 7.377 7.615 7.895 8.206 8.508 8.835 9.172 9.518 9.879 10.272 10.72 11.165 11.684 12.276 12.921 13.571 14.227 14.867 15.387 15.517 15.359 15.062 14.724 14.369 14.023 13.691 13.379 13.038 12.732 12.453 12.173 11.903 11.653 11.441 11.235 11.046 10.884 10.707 10.52 10.381 10.226 10.059 9.927 9.782 9.64 9.497 9.336 9.227 9.114 8.914 8.779 8.648 8.58 8.438 8.282 8.117 8.03 7.797 7.778 7.691 7.594 7.368 7.25 7.113 6.961 6.809 6.63 6.419 6.019 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_37_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_37_53.txt deleted file mode 100644 index 264c06d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_37_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9938 ,TETRA ,17559702,Sat Nov 27 08:31:16 CET,Sat Nov 27 10:21:10 CET,0.0 0.742 1.092 1.377 1.643 1.837 1.995 2.148 2.418 2.542 2.662 2.742 3.015 3.13 3.329 3.511 3.687 3.771 3.946 4.122 4.36 4.498 4.63 4.828 5.017 5.188 5.354 5.521 5.735 5.947 6.164 6.41 6.638 6.868 7.115 7.374 7.635 7.922 8.229 8.552 8.859 9.181 9.54 9.862 10.211 10.565 10.89 11.172 11.457 11.64 11.4 10.648 9.848 9.088 8.381 7.714 7.111 6.512 5.968 5.431 4.983 4.561 4.12 3.699 3.327 2.987 2.628 2.3 2.008 1.712 1.405 1.171 0.955 0.736 0.561 0.372 0.168 -0.043 -0.248 -0.387 -0.541 -0.786 -0.948 -1.121 -1.209 -1.389 -1.592 -1.813 -1.925 -2.196 -2.276 -2.417 -2.571 -2.867 -3.025 -3.19 -3.377 -3.6 -3.82 -4.093 -4.604 -2 ,7394 ,TETRA ,17559703,Sat Nov 27 08:32:15 CET,Sat Nov 27 10:04:25 CET,0.0 0.842 1.119 1.32 1.5 1.655 1.795 1.923 2.158 2.281 2.398 2.452 2.713 2.818 3.029 3.223 3.407 3.49 3.635 3.8 4.037 4.171 4.302 4.481 4.677 4.901 5.112 5.31 5.565 5.811 6.042 6.308 6.559 6.782 7.042 7.318 7.562 7.835 8.143 8.449 8.746 9.065 9.424 9.748 10.096 10.456 10.808 11.137 11.406 11.539 11.272 10.523 9.704 8.934 8.198 7.496 6.854 6.204 5.66 5.135 4.645 4.203 3.809 3.43 3.078 2.738 2.344 2.008 1.745 1.488 1.216 0.975 0.726 0.464 0.262 0.066 -0.141 -0.356 -0.577 -0.725 -0.883 -1.147 -1.322 -1.492 -1.578 -1.75 -1.937 -2.132 -2.229 -2.487 -2.548 -2.666 -2.796 -3.065 -3.213 -3.373 -3.533 -3.712 -3.932 -4.203 -4.727 -3 ,4215 ,TETRA ,17559704,Sat Nov 27 08:33:18 CET,Sat Nov 27 10:27:19 CET,0.0 0.658 0.985 1.265 1.468 1.656 1.826 1.981 2.275 2.414 2.542 2.618 2.885 2.994 3.199 3.391 3.569 3.646 3.797 3.952 4.177 4.321 4.452 4.642 4.828 5.012 5.188 5.362 5.592 5.811 6.027 6.279 6.511 6.723 6.956 7.228 7.505 7.778 8.058 8.361 8.668 8.994 9.329 9.653 10.018 10.361 10.687 10.982 11.242 11.378 11.155 10.454 9.674 8.914 8.196 7.464 6.801 6.201 5.647 5.094 4.611 4.178 3.75 3.335 2.971 2.632 2.27 1.947 1.676 1.395 1.094 0.861 0.634 0.4 0.212 0.015 -0.194 -0.412 -0.633 -0.781 -0.928 -1.169 -1.359 -1.556 -1.651 -1.849 -2.061 -2.283 -2.398 -2.675 -2.781 -2.921 -3.064 -3.364 -3.516 -3.678 -3.858 -4.062 -4.293 -4.593 -5.347 -4 ,3821 ,TETRA ,17559705,Sat Nov 27 08:33:20 CET,Sat Nov 27 10:29:05 CET,0.0 0.792 1.107 1.355 1.579 1.799 1.984 2.13 2.428 2.565 2.681 2.754 3.02 3.127 3.347 3.545 3.726 3.814 3.984 4.158 4.401 4.553 4.694 4.894 5.087 5.256 5.421 5.58 5.765 5.964 6.158 6.37 6.583 6.784 7.026 7.31 7.57 7.85 8.15 8.453 8.772 9.091 9.424 9.771 10.137 10.488 10.861 11.206 11.465 11.568 11.333 10.644 9.881 9.161 8.468 7.781 7.131 6.538 6.039 5.532 5.079 4.662 4.25 3.88 3.543 3.207 2.853 2.529 2.242 1.945 1.653 1.418 1.164 0.904 0.71 0.496 0.276 0.073 -0.145 -0.306 -0.478 -0.748 -0.933 -1.122 -1.216 -1.422 -1.637 -1.857 -1.972 -2.247 -2.346 -2.475 -2.609 -2.9 -3.06 -3.226 -3.416 -3.627 -3.858 -4.208 -4.975 -5 ,30650 ,TETRA ,17559706,Sat Nov 27 08:35:16 CET,Sat Nov 27 10:24:11 CET,0.0 0.656 0.98 1.239 1.43 1.604 1.78 1.943 2.226 2.354 2.478 2.553 2.82 2.935 3.151 3.337 3.515 3.607 3.784 3.938 4.14 4.272 4.412 4.609 4.789 4.957 5.12 5.276 5.475 5.674 5.852 6.067 6.289 6.498 6.72 6.95 7.169 7.411 7.675 7.944 8.22 8.545 8.912 9.225 9.555 9.875 10.189 10.53 10.852 11.043 10.841 10.093 9.247 8.468 7.752 7.057 6.43 5.841 5.292 4.73 4.267 3.856 3.459 3.07 2.68 2.328 1.967 1.639 1.364 1.078 0.783 0.543 0.315 0.091 -0.1 -0.308 -0.515 -0.73 -0.962 -1.13 -1.304 -1.57 -1.745 -1.929 -2.026 -2.217 -2.414 -2.637 -2.756 -3.033 -3.152 -3.289 -3.423 -3.712 -3.863 -4.02 -4.2 -4.402 -4.642 -5.086 -5.944 -6 ,32052 ,TETRA ,17559707,Sat Nov 27 08:36:16 CET,Sat Nov 27 10:27:28 CET,0.0 0.696 0.926 1.112 1.298 1.465 1.611 1.748 2.011 2.126 2.23 2.262 2.515 2.623 2.826 3.006 3.156 3.225 3.366 3.516 3.752 3.914 4.066 4.26 4.431 4.617 4.801 4.966 5.172 5.363 5.55 5.768 5.966 6.167 6.394 6.623 6.843 7.11 7.406 7.702 8.001 8.304 8.615 8.931 9.297 9.651 9.996 10.28 10.539 10.693 10.428 9.747 8.98 8.205 7.504 6.831 6.197 5.594 5.068 4.526 4.058 3.631 3.227 2.849 2.48 2.157 1.812 1.491 1.22 0.928 0.624 0.362 0.103 -0.137 -0.311 -0.491 -0.676 -0.854 -1.041 -1.179 -1.33 -1.549 -1.685 -1.821 -1.893 -2.056 -2.241 -2.426 -2.516 -2.768 -2.812 -2.917 -3.031 -3.279 -3.401 -3.532 -3.688 -3.87 -4.104 -4.426 -5.253 -7 ,15142 ,TETRA ,17559708,Sat Nov 27 08:36:16 CET,Sat Nov 27 10:25:48 CET,0.0 0.746 1.092 1.355 1.567 1.74 1.893 2.052 2.364 2.509 2.64 2.721 2.988 3.102 3.326 3.546 3.746 3.832 3.999 4.159 4.392 4.536 4.668 4.862 5.032 5.191 5.351 5.505 5.716 5.907 6.079 6.291 6.494 6.685 6.907 7.169 7.418 7.686 7.958 8.242 8.524 8.823 9.17 9.49 9.832 10.184 10.54 10.83 11.051 11.143 10.911 10.224 9.498 8.793 8.115 7.494 6.932 6.395 5.927 5.449 5.025 4.645 4.286 3.947 3.626 3.333 3.023 2.743 2.496 2.238 1.983 1.783 1.575 1.35 1.18 0.999 0.808 0.616 0.415 0.279 0.134 -0.108 -0.279 -0.46 -0.555 -0.742 -0.925 -1.121 -1.224 -1.491 -1.561 -1.673 -1.786 -2.072 -2.226 -2.364 -2.511 -2.688 -2.902 -3.132 -3.696 -8 ,1983 ,TETRA ,17559709,Sat Nov 27 08:37:17 CET,Sat Nov 27 10:30:20 CET,0.0 1.336 1.721 2.025 2.281 2.506 2.708 2.889 3.209 3.351 3.481 3.592 3.872 3.975 4.18 4.377 4.559 4.653 4.831 4.992 5.206 5.342 5.474 5.675 5.889 6.092 6.285 6.474 6.717 6.951 7.175 7.432 7.652 7.866 8.118 8.406 8.671 8.925 9.186 9.454 9.718 10.023 10.374 10.688 11.026 11.38 11.748 12.076 12.367 12.541 12.284 11.531 10.72 9.989 9.337 8.733 8.184 7.654 7.194 6.699 6.268 5.896 5.527 5.156 4.805 4.504 4.188 3.892 3.64 3.389 3.123 2.895 2.663 2.435 2.259 2.078 1.893 1.704 1.51 1.374 1.237 1.026 0.88 0.724 0.64 0.472 0.307 0.136 0.035 -0.231 -0.295 -0.417 -0.539 -0.804 -0.948 -1.097 -1.271 -1.474 -1.662 -1.916 -2.722 -9 ,14176 ,TETRA ,17559710,Sat Nov 27 08:37:16 CET,Sat Nov 27 10:26:20 CET,0.0 0.818 1.146 1.394 1.604 1.788 1.954 2.116 2.41 2.543 2.673 2.761 3.033 3.143 3.345 3.527 3.701 3.786 3.955 4.113 4.338 4.483 4.623 4.816 5.005 5.181 5.336 5.488 5.693 5.89 6.073 6.284 6.499 6.722 6.963 7.208 7.45 7.706 7.965 8.238 8.508 8.797 9.127 9.43 9.766 10.117 10.466 10.782 10.991 11.06 10.834 10.112 9.358 8.655 7.992 7.373 6.786 6.23 5.756 5.267 4.831 4.446 4.061 3.705 3.403 3.128 2.835 2.578 2.358 2.112 1.846 1.627 1.405 1.159 0.961 0.771 0.576 0.371 0.165 0.026 -0.109 -0.306 -0.436 -0.576 -0.655 -0.809 -0.962 -1.133 -1.217 -1.466 -1.522 -1.624 -1.732 -1.967 -2.084 -2.211 -2.347 -2.513 -2.71 -2.91 -3.214 -10 ,1174 ,TETRA ,17559711,Sat Nov 27 08:37:16 CET,Sat Nov 27 10:26:50 CET,0.0 0.849 1.155 1.408 1.626 1.831 2.023 2.204 2.518 2.652 2.778 2.861 3.127 3.231 3.441 3.647 3.834 3.926 4.094 4.243 4.463 4.603 4.743 4.947 5.138 5.319 5.483 5.641 5.867 6.096 6.309 6.555 6.787 7.002 7.254 7.533 7.793 8.078 8.373 8.676 8.969 9.279 9.633 9.962 10.338 10.701 11.027 11.347 11.647 11.83 11.612 10.968 10.247 9.545 8.906 8.275 7.657 7.084 6.611 6.14 5.742 5.388 5.012 4.639 4.308 4.009 3.691 3.401 3.168 2.94 2.678 2.451 2.221 1.979 1.793 1.612 1.432 1.229 1.013 0.869 0.715 0.477 0.318 0.153 0.064 -0.117 -0.306 -0.5 -0.601 -0.856 -0.904 -1.018 -1.15 -1.444 -1.584 -1.727 -1.907 -2.098 -2.311 -2.564 -3.043 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_37_56.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_37_56.txt deleted file mode 100644 index 3a7de0d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_37_56.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22147 ,KEBNE ,17024957,Wed Dec 22 11:20:06 CET,Wed Dec 22 12:55:54 CET,0.0 2.763 3.348 3.704 3.949 4.195 4.43 4.621 4.955 5.118 5.275 5.418 5.713 5.837 6.068 6.298 6.528 6.644 6.868 7.071 7.356 7.523 7.685 7.923 8.157 8.387 8.597 8.797 9.054 9.312 9.558 9.838 10.111 10.373 10.675 11.022 11.379 11.744 12.109 12.503 12.92 13.38 13.887 14.379 14.921 15.477 16.055 16.621 17.214 17.767 18.04 17.824 17.326 16.747 16.243 15.674 15.1 14.604 14.176 13.755 13.352 12.92 12.494 12.114 11.756 11.421 11.025 10.655 10.368 10.054 9.724 9.477 9.235 8.967 8.737 8.503 8.258 7.999 7.73 7.556 7.394 7.142 6.97 6.804 6.723 6.559 6.381 6.198 6.107 5.854 5.8 5.693 5.581 5.315 5.165 5.034 4.883 4.65 4.364 4.035 3.199 -2 ,10183 ,KEBNE ,17024958,Wed Dec 22 11:20:06 CET,Wed Dec 22 12:55:54 CET,0.0 1.716 2.22 2.562 2.845 3.091 3.297 3.504 3.9 4.084 4.264 4.437 4.742 4.884 5.131 5.344 5.55 5.648 5.842 6.034 6.295 6.459 6.618 6.824 7.012 7.211 7.398 7.573 7.796 8.012 8.221 8.48 8.744 8.982 9.256 9.594 9.915 10.249 10.579 10.934 11.323 11.753 12.231 12.682 13.157 13.627 14.147 14.708 15.283 15.75 16.038 15.799 15.332 14.844 14.319 13.798 13.338 12.888 12.429 11.967 11.545 11.154 10.763 10.337 9.95 9.608 9.223 8.862 8.551 8.242 7.928 7.656 7.384 7.123 6.916 6.698 6.483 6.256 6.001 5.828 5.662 5.41 5.236 5.059 4.964 4.75 4.526 4.3 4.177 3.886 3.775 3.645 3.509 3.199 3.03 2.857 2.661 2.446 2.195 1.828 1.027 -3 ,15869 ,KEBNE ,17024959,Wed Dec 22 11:20:08 CET,Wed Dec 22 12:54:50 CET,0.0 1.931 2.519 2.925 3.229 3.511 3.783 4.03 4.449 4.618 4.786 4.982 5.299 5.446 5.703 5.93 6.147 6.26 6.48 6.68 6.952 7.133 7.313 7.576 7.813 8.023 8.24 8.45 8.714 8.963 9.195 9.479 9.741 9.993 10.291 10.626 10.96 11.312 11.672 12.049 12.446 12.887 13.366 13.81 14.301 14.855 15.435 15.961 16.52 17.046 17.339 17.205 16.755 16.193 15.635 15.089 14.53 14.001 13.535 13.068 12.62 12.199 11.823 11.442 11.082 10.777 10.49 10.211 9.955 9.714 9.465 9.263 9.059 8.834 8.659 8.489 8.305 8.121 7.926 7.783 7.647 7.444 7.297 7.134 7.043 6.846 6.644 6.448 6.354 6.092 6.038 5.931 5.822 5.579 5.443 5.294 5.118 4.926 4.734 4.551 4.082 -4 ,18846 ,KEBNE ,17024960,Wed Dec 22 11:20:08 CET,Wed Dec 22 12:56:33 CET,0.0 1.706 2.192 2.537 2.863 3.158 3.408 3.643 4.063 4.236 4.402 4.568 4.871 5.008 5.272 5.528 5.765 5.875 6.076 6.266 6.553 6.729 6.899 7.173 7.436 7.667 7.884 8.098 8.371 8.637 8.891 9.184 9.481 9.764 10.065 10.392 10.695 11.025 11.389 11.787 12.189 12.62 13.092 13.553 14.073 14.606 15.176 15.728 16.264 16.719 16.968 16.791 16.386 15.904 15.394 14.875 14.379 13.918 13.471 12.926 12.462 12.055 11.626 11.189 10.811 10.493 10.128 9.759 9.434 9.11 8.794 8.547 8.266 7.988 7.779 7.535 7.291 7.043 6.77 6.582 6.389 6.096 5.889 5.676 5.572 5.373 5.159 4.906 4.779 4.504 4.402 4.255 4.095 3.767 3.605 3.423 3.223 3.016 2.778 2.504 1.31 -5 ,3320 ,KEBNE ,17024961,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:56:31 CET,0.0 1.532 2.104 2.542 2.847 3.093 3.329 3.559 3.947 4.123 4.295 4.459 4.758 4.894 5.153 5.41 5.635 5.743 5.959 6.16 6.442 6.62 6.8 7.059 7.306 7.552 7.791 8.022 8.3 8.562 8.828 9.14 9.434 9.72 10.051 10.402 10.72 11.061 11.425 11.807 12.181 12.581 13.026 13.472 13.974 14.504 15.08 15.656 16.234 16.73 16.966 16.809 16.409 15.907 15.4 14.862 14.366 13.926 13.513 13.026 12.585 12.221 11.883 11.549 11.248 10.974 10.677 10.414 10.204 9.973 9.712 9.5 9.282 9.07 8.899 8.718 8.532 8.349 8.161 8.015 7.86 7.628 7.475 7.318 7.237 7.064 6.885 6.711 6.622 6.362 6.288 6.164 6.035 5.782 5.64 5.486 5.316 5.119 4.892 4.598 3.755 -6 ,7759 ,KEBNE ,17024962,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:54:40 CET,0.0 1.478 1.964 2.325 2.635 2.883 3.1 3.31 3.722 3.912 4.086 4.25 4.551 4.688 4.935 5.159 5.38 5.481 5.661 5.852 6.151 6.341 6.513 6.751 6.998 7.234 7.448 7.665 7.954 8.235 8.521 8.86 9.167 9.46 9.783 10.127 10.436 10.77 11.148 11.538 11.945 12.385 12.868 13.328 13.823 14.33 14.862 15.414 15.94 16.427 16.704 16.434 15.989 15.474 14.955 14.431 13.931 13.47 13.033 12.578 12.205 11.865 11.502 11.134 10.798 10.513 10.202 9.915 9.681 9.429 9.16 8.939 8.722 8.497 8.314 8.121 7.924 7.734 7.532 7.383 7.227 6.959 6.773 6.6 6.508 6.312 6.096 5.848 5.726 5.458 5.388 5.259 5.129 4.858 4.708 4.546 4.365 4.143 3.906 3.633 3.028 -7 ,2679 ,KEBNE ,17024963,Wed Dec 22 11:20:06 CET,Wed Dec 22 12:55:13 CET,0.0 1.291 1.777 2.161 2.45 2.716 2.94 3.148 3.542 3.72 3.893 4.064 4.365 4.506 4.786 5.049 5.265 5.361 5.567 5.769 6.047 6.218 6.382 6.629 6.871 7.104 7.308 7.494 7.743 7.998 8.25 8.545 8.831 9.113 9.439 9.803 10.134 10.471 10.824 11.193 11.601 12.025 12.473 12.924 13.434 14.013 14.626 15.205 15.79 16.28 16.594 16.471 16.023 15.431 14.82 14.288 13.792 13.312 12.878 12.426 12.031 11.675 11.356 11.048 10.753 10.484 10.17 9.876 9.627 9.369 9.083 8.823 8.554 8.274 8.058 7.868 7.692 7.512 7.323 7.187 7.047 6.822 6.655 6.48 6.397 6.22 5.983 5.718 5.606 5.344 5.269 5.146 5.03 4.796 4.66 4.517 4.366 4.205 4.003 3.737 2.52 -8 ,11120 ,KEBNE ,17024964,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:56:02 CET,0.0 1.461 1.938 2.294 2.571 2.791 3.001 3.197 3.557 3.714 3.862 4.025 4.321 4.46 4.722 4.953 5.189 5.301 5.484 5.655 5.894 6.044 6.208 6.454 6.703 6.956 7.187 7.408 7.68 7.928 8.169 8.46 8.737 8.996 9.309 9.645 9.941 10.28 10.648 11.018 11.403 11.802 12.235 12.654 13.144 13.684 14.249 14.826 15.4 15.871 16.178 16.0 15.555 15.083 14.588 14.12 13.629 13.127 12.689 12.235 11.848 11.484 11.108 10.742 10.413 10.128 9.812 9.526 9.249 8.942 8.65 8.402 8.13 7.848 7.629 7.397 7.157 6.904 6.638 6.455 6.272 5.996 5.804 5.6 5.494 5.301 5.12 4.923 4.824 4.569 4.489 4.362 4.232 3.952 3.791 3.62 3.427 3.225 3.03 2.765 1.983 -9 ,1363 ,KEBNE ,17024965,Wed Dec 22 11:20:08 CET,Wed Dec 22 12:54:55 CET,0.0 1.256 1.712 2.067 2.333 2.598 2.857 3.087 3.516 3.7 3.87 4.037 4.338 4.488 4.751 5.012 5.277 5.397 5.627 5.853 6.176 6.386 6.59 6.881 7.145 7.38 7.608 7.828 8.111 8.404 8.69 9.014 9.324 9.617 9.934 10.288 10.621 10.966 11.329 11.711 12.104 12.546 13.058 13.535 14.044 14.562 15.135 15.756 16.365 16.827 17.063 16.832 16.324 15.842 15.387 14.845 14.32 13.844 13.464 13.089 12.724 12.406 12.08 11.752 11.451 11.173 10.896 10.646 10.425 10.193 9.95 9.76 9.569 9.373 9.214 9.032 8.848 8.681 8.501 8.364 8.221 7.996 7.825 7.648 7.561 7.369 7.178 6.968 6.851 6.577 6.495 6.37 6.228 5.928 5.782 5.627 5.441 5.227 4.979 4.689 3.965 -10 ,8055 ,KEBNE ,17024966,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:54:50 CET,0.0 1.733 2.306 2.689 3.042 3.353 3.634 3.88 4.307 4.491 4.664 4.844 5.155 5.312 5.597 5.857 6.12 6.25 6.507 6.742 7.056 7.263 7.471 7.771 8.063 8.344 8.611 8.874 9.21 9.528 9.816 10.145 10.455 10.751 11.106 11.494 11.836 12.205 12.601 12.999 13.413 13.861 14.373 14.894 15.425 15.955 16.54 17.123 17.721 18.246 18.59 18.531 18.148 17.625 17.119 16.557 15.973 15.434 15.018 14.641 14.313 14.021 13.726 13.442 13.179 12.899 12.561 12.28 12.073 11.844 11.573 11.333 11.083 10.837 10.647 10.464 10.279 10.09 9.906 9.774 9.619 9.363 9.185 9.01 8.922 8.733 8.542 8.343 8.241 7.969 7.869 7.742 7.613 7.319 7.164 7.014 6.851 6.664 6.446 6.173 4.614 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_38_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_38_39.txt deleted file mode 100644 index cc3e94cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_38_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23444 ,TETRA ,17559712,Sat Nov 27 08:37:18 CET,Sat Nov 27 10:28:38 CET,0.0 2.477 3.065 3.471 3.812 4.125 4.385 4.604 5.044 5.254 5.452 5.682 6.008 6.156 6.42 6.665 6.906 7.023 7.267 7.513 7.837 8.042 8.234 8.558 8.883 9.151 9.406 9.648 9.935 10.212 10.502 10.855 11.184 11.492 11.843 12.241 12.637 13.062 13.5 13.933 14.393 14.912 15.494 16.081 16.652 17.13 17.661 18.209 18.694 18.961 18.833 18.237 17.432 16.518 15.688 14.871 14.067 13.378 12.807 12.225 11.706 11.222 10.754 10.315 9.922 9.549 9.136 8.767 8.447 8.129 7.78 7.475 7.148 6.818 6.574 6.32 6.064 5.807 5.518 5.308 5.094 4.764 4.542 4.297 4.167 3.897 3.586 3.268 3.115 2.79 2.573 2.371 2.162 1.745 1.531 1.283 1.01 0.713 0.356 -0.116 -1.763 -2 ,29682 ,TETRA ,17559713,Sat Nov 27 08:38:17 CET,Sat Nov 27 10:29:22 CET,0.0 1.351 1.868 2.236 2.546 2.847 3.105 3.345 3.796 3.989 4.158 4.341 4.656 4.811 5.125 5.459 5.774 5.906 6.15 6.405 6.81 7.064 7.299 7.612 7.897 8.162 8.407 8.667 9.012 9.327 9.634 9.988 10.315 10.632 10.975 11.333 11.685 12.076 12.467 12.886 13.307 13.753 14.279 14.779 15.348 15.942 16.537 17.074 17.513 17.803 17.758 17.144 16.379 15.619 14.828 14.014 13.273 12.606 12.016 11.372 10.801 10.309 9.856 9.423 8.99 8.57 8.125 7.73 7.397 7.059 6.689 6.378 6.068 5.742 5.472 5.194 4.912 4.623 4.329 4.121 3.903 3.548 3.296 3.053 2.927 2.657 2.396 2.113 1.957 1.639 1.449 1.271 1.083 0.676 0.438 0.181 -0.109 -0.439 -0.784 -1.28 -3.015 -3 ,17220 ,TETRA ,17559714,Sat Nov 27 08:38:17 CET,Sat Nov 27 10:29:48 CET,0.0 2.293 2.828 3.284 3.633 3.906 4.151 4.38 4.798 5.0 5.184 5.365 5.672 5.828 6.134 6.43 6.723 6.851 7.073 7.283 7.61 7.829 8.038 8.333 8.598 8.839 9.075 9.303 9.582 9.854 10.112 10.415 10.717 11.018 11.371 11.761 12.134 12.534 12.952 13.397 13.85 14.311 14.807 15.315 15.881 16.472 17.094 17.695 18.288 18.76 18.905 18.392 17.627 16.785 15.968 15.22 14.516 13.848 13.263 12.662 12.145 11.682 11.228 10.792 10.391 10.017 9.638 9.311 9.014 8.7 8.349 8.051 7.736 7.402 7.152 6.895 6.63 6.343 6.028 5.806 5.584 5.24 4.996 4.741 4.611 4.36 4.101 3.828 3.679 3.354 3.16 2.967 2.767 2.335 2.084 1.813 1.525 1.209 0.777 0.129 -2.115 -4 ,24789 ,TETRA ,17559715,Sat Nov 27 08:38:18 CET,Sat Nov 27 10:29:43 CET,0.0 1.622 2.163 2.601 2.945 3.219 3.496 3.764 4.242 4.441 4.602 4.761 5.079 5.244 5.559 5.854 6.113 6.236 6.483 6.711 7.033 7.234 7.427 7.715 7.994 8.273 8.537 8.782 9.085 9.364 9.642 9.987 10.318 10.633 10.978 11.353 11.713 12.111 12.544 12.976 13.396 13.882 14.431 14.896 15.425 15.997 16.579 17.107 17.522 17.906 18.195 17.963 17.324 16.543 15.826 15.095 14.385 13.726 13.148 12.562 12.017 11.502 11.009 10.536 10.097 9.711 9.301 8.901 8.534 8.178 7.845 7.567 7.267 6.948 6.703 6.449 6.184 5.905 5.602 5.394 5.183 4.847 4.607 4.345 4.203 3.92 3.64 3.348 3.191 2.856 2.644 2.468 2.277 1.826 1.577 1.318 1.049 0.754 0.364 -0.111 -1.625 -5 ,25866 ,TETRA ,17559716,Sat Nov 27 08:38:17 CET,Sat Nov 27 10:31:06 CET,0.0 1.608 2.277 2.82 3.229 3.554 3.843 4.087 4.525 4.731 4.921 5.109 5.412 5.568 5.855 6.124 6.39 6.517 6.759 7.008 7.366 7.579 7.783 8.063 8.331 8.614 8.883 9.133 9.45 9.737 10.004 10.318 10.619 10.925 11.279 11.663 12.035 12.432 12.839 13.248 13.649 14.097 14.579 15.014 15.534 16.12 16.758 17.354 17.88 18.3 18.36 17.912 17.275 16.563 15.851 15.133 14.458 13.801 13.177 12.565 12.079 11.633 11.197 10.773 10.353 9.963 9.547 9.168 8.819 8.449 8.059 7.722 7.379 7.025 6.749 6.478 6.195 5.891 5.569 5.342 5.12 4.775 4.525 4.255 4.116 3.837 3.542 3.239 3.068 2.731 2.503 2.29 2.073 1.573 1.309 1.058 0.784 0.487 0.136 -0.387 -2.726 -6 ,29969 ,TETRA ,17559717,Sat Nov 27 08:38:17 CET,Sat Nov 27 10:31:22 CET,0.0 1.683 2.274 2.703 3.04 3.344 3.625 3.88 4.303 4.499 4.704 4.909 5.219 5.395 5.725 6.009 6.279 6.411 6.64 6.857 7.207 7.43 7.636 7.934 8.22 8.488 8.738 8.981 9.292 9.586 9.865 10.189 10.488 10.781 11.133 11.505 11.838 12.211 12.609 13.008 13.42 13.88 14.403 14.918 15.495 16.037 16.584 17.195 17.806 18.26 18.305 17.84 17.155 16.353 15.57 14.774 14.006 13.3 12.676 12.014 11.432 10.925 10.447 10.005 9.569 9.141 8.702 8.322 7.997 7.653 7.297 7.004 6.692 6.365 6.105 5.838 5.558 5.253 4.939 4.721 4.491 4.129 3.875 3.611 3.47 3.184 2.906 2.613 2.453 2.131 1.952 1.771 1.566 1.127 0.89 0.641 0.353 0.022 -0.358 -0.875 -2.311 -7 ,23063 ,TETRA ,17559718,Sat Nov 27 08:38:17 CET,Sat Nov 27 10:29:46 CET,0.0 1.892 2.461 2.924 3.288 3.594 3.866 4.114 4.589 4.804 4.998 5.221 5.548 5.703 5.99 6.283 6.563 6.703 6.963 7.197 7.537 7.739 7.945 8.264 8.55 8.82 9.083 9.331 9.655 9.967 10.25 10.592 10.934 11.255 11.611 11.97 12.31 12.712 13.151 13.597 14.033 14.482 14.975 15.463 15.986 16.553 17.199 17.767 18.218 18.505 18.323 17.602 16.745 15.927 15.175 14.406 13.694 13.017 12.405 11.807 11.299 10.831 10.367 9.913 9.477 9.079 8.672 8.302 7.965 7.621 7.26 6.959 6.645 6.309 6.063 5.819 5.562 5.287 5.003 4.799 4.58 4.252 4.037 3.811 3.688 3.424 3.126 2.817 2.662 2.343 2.145 1.937 1.726 1.291 1.044 0.778 0.462 0.125 -0.187 -0.705 -2.589 -8 ,10960 ,TETRA ,17559719,Sat Nov 27 08:39:17 CET,Sat Nov 27 10:30:33 CET,0.0 1.36 1.899 2.242 2.532 2.842 3.151 3.385 3.768 3.961 4.143 4.332 4.638 4.79 5.087 5.362 5.609 5.73 5.952 6.15 6.461 6.672 6.869 7.139 7.391 7.639 7.887 8.132 8.447 8.749 9.032 9.376 9.697 9.992 10.342 10.728 11.081 11.461 11.851 12.267 12.69 13.131 13.63 14.119 14.676 15.254 15.915 16.602 17.16 17.516 17.53 16.92 15.992 15.053 14.18 13.366 12.632 11.923 11.283 10.656 10.15 9.66 9.176 8.719 8.289 7.902 7.488 7.121 6.809 6.475 6.123 5.832 5.509 5.178 4.927 4.649 4.357 4.064 3.752 3.524 3.293 2.937 2.675 2.405 2.267 1.973 1.659 1.336 1.168 0.835 0.613 0.413 0.195 -0.297 -0.547 -0.807 -1.106 -1.446 -1.844 -2.393 -4.497 -9 ,22545 ,TETRA ,17559720,Sat Nov 27 08:39:18 CET,Sat Nov 27 10:30:39 CET,0.0 2.4 2.963 3.379 3.732 4.043 4.302 4.537 4.968 5.171 5.384 5.663 6.009 6.192 6.532 6.849 7.14 7.286 7.561 7.817 8.195 8.432 8.652 8.97 9.291 9.589 9.87 10.126 10.424 10.715 10.992 11.315 11.613 11.899 12.256 12.681 13.094 13.534 13.983 14.461 14.968 15.506 16.11 16.72 17.381 17.999 18.595 19.212 19.797 20.238 20.387 19.94 19.247 18.511 17.743 16.964 16.286 15.682 15.135 14.577 14.083 13.599 13.13 12.701 12.28 11.885 11.464 11.087 10.763 10.417 10.045 9.74 9.407 9.052 8.788 8.525 8.245 7.931 7.603 7.364 7.124 6.77 6.519 6.249 6.108 5.829 5.546 5.254 5.098 4.771 4.569 4.388 4.199 3.786 3.567 3.31 3.018 2.668 2.246 1.733 0.123 -10 ,12243 ,TETRA ,17559721,Sat Nov 27 08:39:19 CET,Sat Nov 27 10:30:31 CET,0.0 2.603 3.167 3.568 3.926 4.244 4.511 4.717 5.074 5.245 5.41 5.56 5.856 6.002 6.294 6.553 6.782 6.899 7.134 7.358 7.663 7.858 8.056 8.331 8.591 8.843 9.087 9.318 9.592 9.841 10.093 10.408 10.693 10.979 11.322 11.699 12.041 12.399 12.798 13.206 13.588 14.0 14.487 14.959 15.504 16.096 16.731 17.405 18.083 18.672 18.876 18.502 17.878 17.19 16.485 15.857 15.258 14.62 14.044 13.415 12.872 12.393 11.896 11.39 10.922 10.499 10.054 9.67 9.351 9.048 8.735 8.455 8.15 7.825 7.569 7.299 7.019 6.725 6.432 6.228 6.01 5.665 5.415 5.174 5.05 4.789 4.521 4.226 4.071 3.76 3.604 3.421 3.21 2.739 2.474 2.184 1.874 1.528 1.149 0.651 -0.666 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_38_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_38_40.txt deleted file mode 100644 index 3cd765f2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_38_40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8839 ,TETRA ,17559722,Sat Nov 27 08:39:18 CET,Sat Nov 27 10:30:28 CET,0.0 3.825 4.704 5.366 5.856 6.231 6.544 6.829 7.335 7.585 7.833 8.126 8.494 8.693 9.048 9.361 9.659 9.801 10.045 10.279 10.621 10.826 11.017 11.282 11.527 11.764 11.991 12.2 12.444 12.683 12.929 13.217 13.467 13.678 13.901 14.153 14.405 14.677 14.947 15.19 15.408 15.64 15.881 16.079 16.255 16.342 16.37 16.274 15.919 15.188 13.688 11.716 9.974 8.343 6.928 5.713 4.634 3.632 2.744 1.888 1.189 0.547 -0.074 -0.635 -1.163 -1.668 -2.196 -2.672 -3.078 -3.493 -3.93 -4.309 -4.694 -5.065 -5.356 -5.681 -6.023 -6.356 -6.703 -6.951 -7.205 -7.587 -7.864 -8.154 -8.306 -8.618 -8.915 -9.257 -9.448 -9.811 -10.047 -10.257 -10.48 -10.977 -11.229 -11.521 -11.887 -12.282 -12.778 -13.476 -15.59 -2 ,25954 ,TETRA ,17559723,Sat Nov 27 08:39:18 CET,Sat Nov 27 10:30:50 CET,0.0 3.361 4.012 4.471 4.854 5.209 5.548 5.828 6.284 6.506 6.719 6.958 7.298 7.46 7.802 8.121 8.381 8.502 8.745 8.977 9.289 9.487 9.676 9.943 10.206 10.455 10.674 10.88 11.133 11.386 11.639 11.926 12.192 12.415 12.66 12.918 13.138 13.353 13.552 13.748 13.926 14.08 14.265 14.476 14.665 14.789 14.876 14.862 14.63 13.909 12.225 10.049 8.189 6.567 5.112 3.83 2.745 1.775 0.948 0.134 -0.557 -1.174 -1.767 -2.353 -2.918 -3.42 -3.93 -4.363 -4.741 -5.147 -5.553 -5.888 -6.241 -6.619 -6.914 -7.212 -7.546 -7.902 -8.237 -8.475 -8.731 -9.129 -9.41 -9.716 -9.881 -10.244 -10.591 -10.908 -11.084 -11.448 -11.688 -11.884 -12.089 -12.526 -12.755 -13.034 -13.355 -13.699 -14.128 -14.656 -16.093 -3 ,13494 ,TETRA ,17559724,Sat Nov 27 08:40:17 CET,Sat Nov 27 10:31:09 CET,0.0 2.225 2.868 3.363 3.743 4.064 4.357 4.642 5.148 5.376 5.606 5.878 6.225 6.421 6.738 6.999 7.258 7.392 7.663 7.91 8.254 8.474 8.671 8.949 9.223 9.478 9.713 9.934 10.224 10.506 10.758 11.041 11.287 11.519 11.782 12.066 12.321 12.573 12.813 13.032 13.245 13.462 13.674 13.832 13.944 14.04 14.076 13.961 13.635 12.906 11.445 9.441 7.691 6.133 4.736 3.475 2.344 1.319 0.399 -0.531 -1.303 -1.991 -2.668 -3.314 -3.908 -4.441 -4.968 -5.448 -5.893 -6.359 -6.832 -7.22 -7.613 -8.004 -8.3 -8.606 -8.923 -9.245 -9.598 -9.848 -10.115 -10.57 -10.889 -11.203 -11.367 -11.71 -12.057 -12.413 -12.601 -12.958 -13.212 -13.443 -13.688 -14.205 -14.468 -14.757 -15.087 -15.452 -15.899 -16.546 -19.159 -4 ,25463 ,TETRA ,17559725,Sat Nov 27 08:40:17 CET,Sat Nov 27 10:32:47 CET,0.0 3.207 3.95 4.434 4.871 5.279 5.589 5.856 6.328 6.544 6.766 7.001 7.329 7.511 7.85 8.146 8.406 8.54 8.804 9.031 9.339 9.534 9.738 10.037 10.29 10.542 10.796 11.017 11.278 11.532 11.779 12.067 12.325 12.556 12.822 13.104 13.361 13.635 13.902 14.177 14.432 14.68 14.921 15.111 15.268 15.307 15.236 15.008 14.63 13.956 12.385 10.182 8.309 6.707 5.321 4.087 2.988 1.993 1.153 0.323 -0.396 -1.03 -1.628 -2.2 -2.725 -3.206 -3.7 -4.153 -4.573 -5.0 -5.431 -5.78 -6.134 -6.499 -6.795 -7.122 -7.457 -7.818 -8.201 -8.444 -8.684 -9.056 -9.327 -9.614 -9.754 -10.041 -10.364 -10.702 -10.872 -11.222 -11.444 -11.656 -11.886 -12.391 -12.654 -12.945 -13.283 -13.641 -14.032 -14.625 -16.322 -5 ,13984 ,TETRA ,17559726,Sat Nov 27 08:40:17 CET,Sat Nov 27 10:34:37 CET,0.0 2.812 3.547 4.06 4.484 4.852 5.16 5.453 5.97 6.19 6.389 6.605 6.935 7.113 7.434 7.719 7.984 8.118 8.373 8.605 8.938 9.132 9.321 9.595 9.839 10.07 10.283 10.491 10.76 11.01 11.237 11.488 11.727 11.954 12.197 12.458 12.696 12.947 13.196 13.427 13.632 13.839 14.054 14.228 14.371 14.469 14.529 14.47 14.186 13.532 12.099 10.065 8.279 6.654 5.239 4.003 2.903 1.919 1.092 0.287 -0.402 -1.034 -1.623 -2.169 -2.705 -3.212 -3.721 -4.169 -4.57 -5.0 -5.455 -5.829 -6.208 -6.591 -6.891 -7.204 -7.531 -7.877 -8.228 -8.469 -8.739 -9.17 -9.462 -9.759 -9.908 -10.226 -10.556 -10.899 -11.09 -11.45 -11.668 -11.869 -12.084 -12.591 -12.872 -13.171 -13.513 -13.912 -14.412 -15.074 -17.243 -6 ,2040 ,TETRA ,17559727,Sat Nov 27 08:42:18 CET,Sat Nov 27 10:33:20 CET,0.0 3.573 4.39 4.97 5.413 5.781 6.095 6.39 6.924 7.173 7.411 7.695 8.04 8.22 8.556 8.874 9.183 9.327 9.591 9.844 10.21 10.444 10.663 10.958 11.224 11.464 11.701 11.926 12.211 12.495 12.755 13.046 13.321 13.577 13.862 14.169 14.467 14.785 15.088 15.383 15.671 15.953 16.211 16.422 16.629 16.763 16.824 16.677 16.204 15.288 13.55 11.359 9.423 7.695 6.166 4.847 3.688 2.635 1.747 0.874 0.107 -0.591 -1.257 -1.876 -2.444 -2.975 -3.555 -4.082 -4.533 -5.009 -5.486 -5.853 -6.235 -6.62 -6.918 -7.238 -7.56 -7.889 -8.259 -8.515 -8.779 -9.193 -9.461 -9.747 -9.902 -10.197 -10.493 -10.807 -10.979 -11.344 -11.574 -11.776 -11.97 -12.369 -12.616 -12.894 -13.216 -13.59 -14.01 -14.619 -17.157 -7 ,14461 ,TETRA ,17559728,Sat Nov 27 08:42:16 CET,Sat Nov 27 10:33:46 CET,0.0 3.493 4.332 4.975 5.468 5.89 6.274 6.607 7.182 7.433 7.65 7.909 8.257 8.423 8.703 8.976 9.221 9.329 9.534 9.739 10.049 10.253 10.443 10.695 10.937 11.182 11.411 11.617 11.86 12.081 12.315 12.616 12.87 13.089 13.312 13.541 13.768 14.01 14.26 14.479 14.665 14.861 15.077 15.245 15.376 15.499 15.56 15.445 15.061 14.212 12.45 10.35 8.705 7.135 5.711 4.471 3.396 2.421 1.555 0.688 -0.049 -0.702 -1.308 -1.88 -2.426 -2.924 -3.431 -3.885 -4.276 -4.671 -5.097 -5.451 -5.809 -6.192 -6.486 -6.797 -7.122 -7.45 -7.792 -8.029 -8.277 -8.666 -8.935 -9.215 -9.36 -9.672 -10.004 -10.36 -10.559 -10.932 -11.181 -11.426 -11.675 -12.19 -12.469 -12.764 -13.091 -13.485 -13.997 -14.778 -17.019 -8 ,7142 ,TETRA ,17559729,Sat Nov 27 08:42:18 CET,Sat Nov 27 10:34:29 CET,0.0 3.207 4.051 4.64 5.091 5.451 5.788 6.108 6.575 6.766 6.952 7.147 7.466 7.625 7.919 8.219 8.511 8.633 8.872 9.115 9.436 9.627 9.818 10.109 10.368 10.604 10.821 11.019 11.28 11.53 11.773 12.068 12.339 12.578 12.847 13.127 13.366 13.611 13.857 14.095 14.332 14.564 14.774 14.935 15.049 15.106 15.063 14.899 14.51 13.657 12.027 9.862 7.928 6.273 4.909 3.68 2.575 1.582 0.742 -0.097 -0.818 -1.452 -2.054 -2.636 -3.172 -3.685 -4.232 -4.697 -5.091 -5.514 -5.948 -6.303 -6.686 -7.097 -7.406 -7.711 -8.031 -8.378 -8.753 -9.029 -9.304 -9.705 -9.975 -10.246 -10.399 -10.725 -11.063 -11.456 -11.659 -12.012 -12.241 -12.452 -12.656 -13.141 -13.417 -13.707 -14.029 -14.384 -14.815 -15.335 -16.604 -9 ,27021 ,TETRA ,17559730,Sat Nov 27 08:43:15 CET,Sat Nov 27 10:35:11 CET,0.0 4.646 5.515 6.064 6.525 6.879 7.181 7.466 7.956 8.19 8.42 8.697 9.057 9.253 9.597 9.908 10.186 10.317 10.554 10.763 11.084 11.296 11.498 11.796 12.044 12.258 12.463 12.668 12.955 13.22 13.468 13.776 14.048 14.295 14.581 14.879 15.171 15.485 15.738 15.956 16.192 16.435 16.662 16.868 17.091 17.264 17.315 17.228 16.978 16.334 14.855 12.733 10.776 9.118 7.717 6.434 5.307 4.283 3.442 2.628 1.905 1.251 0.59 -0.046 -0.62 -1.144 -1.666 -2.145 -2.57 -3.02 -3.483 -3.838 -4.189 -4.585 -4.906 -5.223 -5.551 -5.877 -6.216 -6.464 -6.718 -7.113 -7.41 -7.694 -7.839 -8.185 -8.549 -8.912 -9.087 -9.441 -9.691 -9.924 -10.204 -10.751 -11.001 -11.266 -11.564 -11.906 -12.365 -13.026 -14.632 -10 ,19672 ,TETRA ,17559731,Sat Nov 27 08:43:15 CET,Sat Nov 27 10:39:00 CET,0.0 2.794 3.536 4.075 4.508 4.861 5.157 5.427 5.914 6.132 6.351 6.604 6.921 7.07 7.357 7.631 7.892 8.021 8.254 8.475 8.771 8.945 9.123 9.386 9.638 9.893 10.129 10.341 10.629 10.888 11.109 11.378 11.63 11.862 12.112 12.381 12.643 12.916 13.192 13.452 13.693 13.925 14.147 14.334 14.495 14.61 14.629 14.481 14.128 13.374 11.741 9.6 7.794 6.225 4.872 3.579 2.411 1.4 0.53 -0.346 -1.094 -1.769 -2.419 -3.017 -3.597 -4.146 -4.717 -5.214 -5.621 -6.052 -6.51 -6.88 -7.265 -7.673 -7.985 -8.303 -8.644 -8.998 -9.353 -9.598 -9.842 -10.228 -10.506 -10.801 -10.954 -11.246 -11.569 -11.942 -12.141 -12.512 -12.759 -12.982 -13.219 -13.688 -13.963 -14.299 -14.658 -15.054 -15.513 -16.091 -17.861 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_39_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_39_41.txt deleted file mode 100644 index a000af05..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_39_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9365 ,KEBNE ,17024967,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:56:36 CET,0.0 3.975 4.676 5.244 5.738 6.113 6.409 6.664 7.174 7.444 7.722 8.065 8.423 8.612 8.979 9.33 9.662 9.819 10.123 10.414 10.801 11.044 11.278 11.618 11.936 12.236 12.529 12.804 13.156 13.485 13.786 14.141 14.475 14.794 15.16 15.558 15.933 16.339 16.76 17.22 17.703 18.197 18.706 19.212 19.785 20.367 21.014 21.635 22.165 22.437 22.156 21.44 20.653 19.79 18.931 18.096 17.367 16.69 16.089 15.461 14.869 14.308 13.766 13.258 12.79 12.368 11.929 11.53 11.183 10.812 10.428 10.113 9.778 9.453 9.216 8.962 8.698 8.433 8.14 7.932 7.724 7.39 7.156 6.918 6.791 6.509 6.219 5.93 5.777 5.455 5.242 5.053 4.86 4.409 4.162 3.899 3.599 3.25 2.838 2.33 1.026 -2 ,15480 ,KEBNE ,17024968,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:57:32 CET,0.0 4.349 5.238 5.806 6.257 6.657 7.002 7.308 7.837 8.07 8.285 8.523 8.864 9.034 9.347 9.657 9.935 10.071 10.336 10.577 10.913 11.143 11.388 11.748 12.068 12.352 12.613 12.857 13.174 13.479 13.777 14.144 14.483 14.786 15.129 15.498 15.817 16.172 16.589 17.016 17.423 17.869 18.387 18.883 19.38 19.868 20.415 20.904 21.285 21.529 21.408 20.699 19.791 18.893 18.023 17.163 16.403 15.724 15.098 14.453 13.884 13.357 12.88 12.453 12.043 11.663 11.262 10.886 10.558 10.23 9.891 9.598 9.276 8.948 8.709 8.452 8.173 7.892 7.59 7.37 7.143 6.806 6.573 6.304 6.168 5.891 5.59 5.277 5.111 4.776 4.541 4.326 4.111 3.669 3.423 3.156 2.824 2.423 1.979 1.396 -0.325 -3 ,14542 ,KEBNE ,17024969,Wed Dec 22 11:20:07 CET,Wed Dec 22 12:57:34 CET,0.0 3.476 4.288 4.834 5.25 5.615 5.947 6.222 6.72 6.96 7.185 7.415 7.754 7.932 8.286 8.624 8.935 9.084 9.37 9.644 10.054 10.317 10.545 10.838 11.12 11.387 11.637 11.88 12.193 12.483 12.761 13.096 13.405 13.689 14.015 14.365 14.702 15.071 15.438 15.824 16.211 16.606 17.034 17.434 17.879 18.347 18.823 19.253 19.588 19.822 19.664 18.831 17.901 17.042 16.217 15.382 14.667 14.03 13.432 12.841 12.34 11.899 11.466 11.035 10.638 10.26 9.829 9.443 9.119 8.788 8.438 8.133 7.834 7.536 7.295 7.046 6.796 6.536 6.246 6.039 5.818 5.478 5.23 4.955 4.824 4.562 4.281 3.986 3.838 3.52 3.319 3.143 2.958 2.544 2.312 2.062 1.798 1.463 1.047 0.487 -1.772 -4 ,13245 ,KEBNE ,17024970,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:06 CET,0.0 6.326 7.25 7.944 8.483 8.885 9.241 9.573 10.127 10.371 10.607 10.903 11.257 11.447 11.818 12.156 12.474 12.621 12.9 13.174 13.569 13.814 14.033 14.361 14.686 14.978 15.261 15.535 15.899 16.264 16.582 16.932 17.259 17.576 17.925 18.308 18.665 19.032 19.415 19.805 20.197 20.607 21.085 21.543 22.032 22.523 22.997 23.439 23.847 24.08 23.883 23.109 22.2 21.352 20.497 19.657 18.92 18.249 17.658 17.047 16.484 15.975 15.467 14.986 14.572 14.193 13.762 13.379 13.065 12.71 12.334 12.037 11.72 11.378 11.116 10.844 10.554 10.267 9.977 9.769 9.564 9.248 9.022 8.782 8.655 8.385 8.108 7.808 7.647 7.33 7.117 6.911 6.695 6.201 5.923 5.658 5.388 5.07 4.681 4.177 2.041 -5 ,19815 ,KEBNE ,17024971,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:56:38 CET,0.0 3.288 4.177 4.795 5.229 5.604 5.935 6.242 6.777 6.997 7.193 7.428 7.76 7.94 8.276 8.585 8.878 9.015 9.278 9.541 9.925 10.159 10.389 10.75 11.101 11.398 11.66 11.923 12.273 12.592 12.866 13.199 13.531 13.837 14.168 14.544 14.907 15.274 15.643 16.028 16.432 16.86 17.332 17.799 18.301 18.809 19.329 19.832 20.276 20.442 20.16 19.427 18.582 17.748 16.945 16.137 15.384 14.73 14.16 13.523 12.953 12.483 12.048 11.613 11.19 10.801 10.392 10.014 9.686 9.346 9.006 8.749 8.487 8.194 7.955 7.71 7.46 7.194 6.926 6.742 6.545 6.204 5.953 5.693 5.561 5.303 5.02 4.697 4.53 4.21 4.046 3.852 3.643 3.271 3.06 2.785 2.461 2.121 1.702 1.128 -1.137 -6 ,2233 ,KEBNE ,17024972,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:58:14 CET,0.0 2.619 3.375 3.898 4.317 4.68 4.996 5.289 5.824 6.053 6.258 6.499 6.854 7.06 7.426 7.739 8.024 8.16 8.458 8.76 9.155 9.397 9.63 9.967 10.298 10.618 10.915 11.178 11.508 11.817 12.109 12.465 12.789 13.09 13.444 13.848 14.238 14.658 15.088 15.531 15.947 16.382 16.907 17.393 17.901 18.417 18.964 19.496 19.972 20.333 20.35 19.833 19.049 18.185 17.406 16.685 15.986 15.323 14.731 14.116 13.585 13.109 12.658 12.234 11.82 11.444 11.052 10.688 10.367 10.038 9.691 9.389 9.076 8.758 8.524 8.268 7.997 7.719 7.426 7.206 6.968 6.627 6.387 6.129 6.001 5.752 5.463 5.134 4.97 4.649 4.444 4.233 4.009 3.501 3.204 2.882 2.553 2.195 1.763 1.134 -1.436 -7 ,7739 ,KEBNE ,17024973,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:41 CET,0.0 4.729 5.548 6.16 6.624 7.003 7.342 7.681 8.281 8.508 8.723 8.969 9.296 9.465 9.786 10.105 10.423 10.566 10.824 11.065 11.393 11.602 11.799 12.089 12.361 12.614 12.866 13.104 13.416 13.727 14.0 14.303 14.591 14.871 15.189 15.536 15.867 16.226 16.6 16.994 17.398 17.815 18.273 18.73 19.218 19.697 20.191 20.629 20.967 21.156 20.914 20.155 19.303 18.386 17.47 16.625 15.872 15.198 14.622 14.002 13.461 12.966 12.493 12.047 11.617 11.235 10.829 10.459 10.142 9.815 9.478 9.192 8.878 8.542 8.297 8.043 7.773 7.5 7.193 6.972 6.755 6.425 6.186 5.935 5.803 5.525 5.237 4.95 4.8 4.481 4.269 4.069 3.873 3.459 3.22 2.964 2.681 2.366 1.993 1.419 -0.281 -8 ,23064 ,KEBNE ,17024974,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:48 CET,0.0 4.368 5.074 5.612 6.066 6.44 6.755 7.05 7.644 7.908 8.138 8.447 8.825 9.008 9.339 9.65 9.93 10.064 10.322 10.566 10.941 11.185 11.416 11.742 12.055 12.349 12.617 12.888 13.2 13.453 13.712 14.05 14.371 14.684 15.065 15.47 15.829 16.217 16.631 17.085 17.561 18.008 18.482 18.95 19.451 19.979 20.523 21.039 21.48 21.677 21.469 20.784 19.984 19.162 18.363 17.557 16.822 16.166 15.565 14.942 14.417 13.952 13.497 13.053 12.633 12.246 11.831 11.465 11.157 10.828 10.481 10.183 9.866 9.543 9.289 9.008 8.702 8.382 8.056 7.833 7.599 7.241 6.991 6.726 6.585 6.284 5.963 5.616 5.449 5.128 4.911 4.704 4.481 3.998 3.747 3.475 3.149 2.802 2.384 1.87 0.326 -9 ,10083 ,KEBNE ,17024975,Wed Dec 22 11:21:09 CET,Wed Dec 22 12:58:45 CET,0.0 3.622 4.483 5.038 5.496 5.918 6.288 6.586 7.109 7.378 7.617 7.876 8.213 8.393 8.723 9.029 9.347 9.504 9.802 10.081 10.467 10.704 10.914 11.206 11.516 11.821 12.076 12.302 12.589 12.86 13.124 13.435 13.72 14.003 14.324 14.656 14.971 15.315 15.692 16.09 16.486 16.943 17.407 17.78 18.163 18.536 18.921 19.278 19.566 19.681 19.461 18.769 17.979 17.145 16.317 15.553 14.858 14.205 13.624 13.028 12.509 12.046 11.587 11.124 10.699 10.309 9.889 9.53 9.211 8.873 8.521 8.223 7.909 7.567 7.313 7.068 6.802 6.505 6.205 5.996 5.774 5.454 5.233 4.999 4.88 4.612 4.321 3.992 3.823 3.513 3.339 3.163 2.966 2.573 2.369 2.123 1.835 1.476 1.047 0.392 -1.752 -10 ,1359 ,KEBNE ,17024976,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:32 CET,0.0 4.141 4.989 5.629 6.126 6.512 6.859 7.175 7.689 7.916 8.133 8.401 8.748 8.946 9.309 9.623 9.912 10.062 10.36 10.645 11.037 11.261 11.467 11.773 12.063 12.338 12.611 12.867 13.177 13.491 13.792 14.145 14.484 14.784 15.13 15.505 15.828 16.183 16.559 16.933 17.325 17.766 18.28 18.742 19.208 19.689 20.173 20.617 21.041 21.339 21.194 20.445 19.541 18.617 17.719 16.894 16.152 15.476 14.846 14.196 13.647 13.143 12.668 12.229 11.823 11.451 11.058 10.697 10.342 9.958 9.577 9.25 8.905 8.546 8.27 8.0 7.713 7.389 7.083 6.891 6.678 6.344 6.105 5.855 5.725 5.462 5.196 4.92 4.778 4.457 4.241 4.051 3.849 3.4 3.152 2.883 2.591 2.252 1.803 1.139 -1.626 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_40_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_40_41.txt deleted file mode 100644 index 0a485670..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_40_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22585 ,TETRA ,17559732,Sat Nov 27 08:44:18 CET,Sat Nov 27 10:37:36 CET,0.0 4.82 5.86 6.539 7.105 7.568 7.99 8.398 9.066 9.342 9.611 9.97 10.382 10.613 11.038 11.419 11.78 11.953 12.296 12.631 13.096 13.385 13.664 14.05 14.41 14.775 15.133 15.461 15.89 16.314 16.7 17.145 17.57 17.983 18.455 18.984 19.496 20.044 20.625 21.243 21.899 22.602 23.408 24.224 25.153 26.163 27.245 28.446 29.804 31.188 32.515 33.325 33.506 33.404 33.154 32.831 32.5 32.095 31.692 31.279 30.895 30.524 30.142 29.763 29.393 29.061 28.704 28.343 28.03 27.712 27.367 27.087 26.794 26.474 26.218 25.956 25.671 25.364 25.047 24.826 24.588 24.188 23.923 23.639 23.483 23.136 22.757 22.35 22.12 21.716 21.405 21.171 20.878 20.191 19.82 19.42 18.979 18.435 17.742 16.728 11.314 -2 ,23317 ,TETRA ,17559733,Sat Nov 27 08:44:18 CET,Sat Nov 27 10:36:25 CET,0.0 3.301 4.093 4.775 5.377 5.836 6.24 6.615 7.253 7.532 7.783 8.077 8.476 8.702 9.149 9.576 9.97 10.151 10.493 10.811 11.22 11.496 11.774 12.172 12.573 12.944 13.312 13.68 14.116 14.518 14.903 15.334 15.743 16.143 16.591 17.098 17.583 18.104 18.669 19.256 19.87 20.567 21.344 22.081 22.875 23.74 24.777 25.957 27.332 28.845 30.269 31.09 31.367 31.372 31.177 30.888 30.584 30.265 29.932 29.519 29.082 28.67 28.326 27.992 27.637 27.3 26.949 26.615 26.323 26.035 25.715 25.445 25.163 24.867 24.637 24.384 24.127 23.88 23.612 23.413 23.2 22.869 22.628 22.339 22.18 21.868 21.561 21.226 21.049 20.707 20.446 20.228 19.991 19.432 19.109 18.765 18.38 17.865 17.213 16.356 11.979 -3 ,19185 ,TETRA ,17559734,Sat Nov 27 08:44:18 CET,Sat Nov 27 10:35:55 CET,0.0 5.767 6.817 7.553 8.086 8.533 8.985 9.409 10.066 10.326 10.571 10.875 11.247 11.442 11.85 12.245 12.597 12.767 13.129 13.47 13.91 14.185 14.454 14.834 15.186 15.51 15.813 16.106 16.468 16.811 17.143 17.536 17.926 18.324 18.813 19.335 19.826 20.367 20.934 21.552 22.21 22.907 23.672 24.456 25.371 26.377 27.505 28.707 30.067 31.547 33.065 33.875 34.003 33.906 33.672 33.368 33.04 32.728 32.44 32.101 31.776 31.467 31.178 30.892 30.61 30.342 30.041 29.755 29.51 29.24 28.905 28.586 28.25 27.903 27.618 27.345 27.082 26.808 26.519 26.317 26.117 25.79 25.563 25.337 25.211 24.92 24.599 24.261 24.087 23.752 23.512 23.262 22.962 22.327 21.978 21.588 21.136 20.619 19.968 18.988 14.214 -4 ,29325 ,TETRA ,17559735,Sat Nov 27 08:44:18 CET,Sat Nov 27 10:35:39 CET,0.0 3.739 4.763 5.481 6.035 6.493 6.89 7.24 7.815 8.084 8.337 8.62 9.02 9.236 9.633 10.021 10.397 10.592 10.958 11.298 11.786 12.066 12.329 12.711 13.078 13.407 13.71 14.011 14.393 14.761 15.116 15.519 15.921 16.311 16.74 17.226 17.678 18.164 18.715 19.287 19.85 20.488 21.25 22.062 22.993 23.963 25.062 26.301 27.688 29.165 30.567 31.31 31.53 31.503 31.288 30.95 30.574 30.19 29.827 29.404 29.0 28.595 28.203 27.86 27.499 27.143 26.784 26.453 26.157 25.843 25.509 25.205 24.881 24.569 24.316 24.015 23.689 23.345 22.993 22.765 22.522 22.133 21.852 21.565 21.417 21.09 20.73 20.317 20.08 19.687 19.353 19.086 18.797 18.183 17.85 17.462 17.052 16.562 15.966 14.928 7.198 -5 ,24538 ,TETRA ,17559736,Sat Nov 27 08:46:18 CET,Sat Nov 27 10:39:50 CET,0.0 3.662 4.596 5.249 5.755 6.196 6.577 6.917 7.535 7.8 8.075 8.429 8.809 9.005 9.399 9.792 10.153 10.319 10.625 10.911 11.33 11.599 11.858 12.233 12.608 12.97 13.317 13.666 14.118 14.541 14.933 15.414 15.869 16.282 16.756 17.283 17.788 18.335 18.926 19.546 20.205 20.958 21.782 22.59 23.53 24.521 25.634 26.851 28.128 29.49 31.009 31.868 32.086 32.048 31.874 31.624 31.306 30.932 30.542 30.15 29.785 29.396 29.003 28.629 28.287 27.968 27.635 27.35 27.083 26.761 26.415 26.154 25.894 25.609 25.385 25.151 24.878 24.566 24.262 24.054 23.825 23.442 23.184 22.929 22.788 22.488 22.135 21.71 21.489 21.119 20.857 20.626 20.372 19.807 19.475 19.117 18.715 18.24 17.637 16.759 12.339 -6 ,6884 ,TETRA ,17559737,Sat Nov 27 08:46:17 CET,Sat Nov 27 10:38:18 CET,0.0 4.231 5.211 5.944 6.531 7.03 7.457 7.831 8.506 8.8 9.058 9.342 9.71 9.905 10.299 10.703 11.081 11.24 11.538 11.843 12.274 12.533 12.777 13.135 13.493 13.825 14.149 14.462 14.858 15.257 15.642 16.089 16.521 16.954 17.451 17.982 18.483 19.069 19.675 20.282 20.924 21.649 22.49 23.349 24.327 25.328 26.428 27.59 28.845 30.274 31.855 32.866 33.244 33.33 33.227 33.026 32.785 32.505 32.215 31.9 31.582 31.259 30.935 30.614 30.297 30.0 29.696 29.421 29.157 28.876 28.601 28.372 28.128 27.857 27.637 27.405 27.138 26.846 26.539 26.322 26.096 25.722 25.436 25.14 24.987 24.647 24.294 23.933 23.729 23.341 23.012 22.761 22.466 21.734 21.327 20.886 20.423 19.913 19.292 18.429 13.98 -7 ,25363 ,TETRA ,17559738,Sat Nov 27 08:46:17 CET,Sat Nov 27 10:37:29 CET,0.0 6.25 7.42 8.146 8.675 9.101 9.462 9.8 10.419 10.705 10.989 11.335 11.735 11.96 12.403 12.834 13.238 13.413 13.754 14.1 14.569 14.852 15.11 15.482 15.834 16.165 16.494 16.804 17.175 17.529 17.886 18.335 18.77 19.191 19.678 20.188 20.645 21.122 21.632 22.186 22.759 23.403 24.168 24.91 25.724 26.628 27.689 28.837 30.1 31.525 33.05 33.971 34.244 34.211 34.008 33.717 33.385 33.058 32.733 32.378 32.068 31.754 31.443 31.141 30.843 30.561 30.234 29.9 29.593 29.287 28.963 28.688 28.394 28.075 27.823 27.534 27.219 26.9 26.559 26.308 26.05 25.645 25.334 25.0 24.831 24.471 24.091 23.712 23.517 23.149 22.824 22.557 22.279 21.662 21.314 20.925 20.497 19.976 19.322 18.34 12.596 -8 ,24721 ,TETRA ,17559739,Sat Nov 27 08:47:17 CET,Sat Nov 27 10:38:00 CET,0.0 3.965 5.038 5.844 6.492 7.032 7.491 7.852 8.498 8.8 9.089 9.499 9.93 10.157 10.543 10.891 11.215 11.373 11.693 12.007 12.432 12.692 12.961 13.342 13.688 14.035 14.372 14.672 15.038 15.398 15.756 16.184 16.606 17.025 17.504 18.013 18.489 19.009 19.545 20.089 20.679 21.342 22.093 22.84 23.698 24.619 25.643 26.755 28.048 29.524 31.084 32.016 32.256 32.197 32.012 31.726 31.404 31.133 30.876 30.578 30.303 30.032 29.721 29.391 29.075 28.772 28.436 28.124 27.848 27.577 27.291 27.036 26.766 26.466 26.226 25.995 25.733 25.44 25.133 24.914 24.694 24.335 24.075 23.815 23.687 23.403 23.068 22.699 22.482 22.067 21.673 21.407 21.144 20.571 20.244 19.86 19.425 18.877 18.189 17.252 12.967 -9 ,14468 ,TETRA ,17559740,Sat Nov 27 08:47:17 CET,Sat Nov 27 10:38:12 CET,0.0 4.582 5.586 6.325 6.894 7.345 7.754 8.133 8.865 9.188 9.456 9.789 10.207 10.441 10.87 11.292 11.693 11.877 12.247 12.586 13.05 13.336 13.608 13.991 14.343 14.671 14.994 15.323 15.737 16.113 16.476 16.922 17.345 17.72 18.139 18.612 19.094 19.621 20.14 20.732 21.403 22.135 22.933 23.71 24.601 25.536 26.56 27.715 28.996 30.369 31.82 32.736 33.081 33.097 32.946 32.726 32.459 32.153 31.851 31.535 31.258 30.974 30.661 30.357 30.048 29.75 29.438 29.176 28.948 28.672 28.365 28.114 27.844 27.558 27.321 27.063 26.797 26.513 26.189 25.945 25.699 25.284 24.969 24.648 24.482 24.149 23.822 23.481 23.293 22.932 22.655 22.426 22.179 21.606 21.232 20.824 20.427 19.931 19.281 18.409 9.117 -10 ,12953 ,TETRA ,17559741,Sat Nov 27 08:47:18 CET,Sat Nov 27 10:24:07 CET,0.0 3.548 4.583 5.366 5.942 6.383 6.781 7.137 7.793 8.105 8.37 8.701 9.111 9.325 9.721 10.096 10.435 10.604 10.946 11.263 11.707 11.976 12.242 12.638 12.997 13.35 13.7 14.024 14.419 14.79 15.149 15.582 16.008 16.409 16.872 17.376 17.857 18.392 18.937 19.503 20.078 20.753 21.579 22.394 23.307 24.271 25.324 26.477 27.794 29.257 30.686 31.465 31.609 31.466 31.16 30.74 30.328 29.967 29.624 29.243 28.918 28.599 28.29 28.006 27.713 27.423 27.113 26.825 26.565 26.27 25.959 25.708 25.444 25.149 24.916 24.667 24.4 24.117 23.815 23.606 23.382 23.028 22.784 22.519 22.378 22.063 21.706 21.304 21.089 20.706 20.372 20.137 19.888 19.354 19.045 18.667 18.243 17.742 17.048 16.083 10.753 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_42_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_42_44.txt deleted file mode 100644 index eecea28a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_42_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22069 ,TETRA ,17559742,Sat Nov 27 08:47:17 CET,Sat Nov 27 10:32:27 CET,0.0 1.336 1.922 2.361 2.682 2.938 3.16 3.361 3.731 3.897 4.038 4.158 4.441 4.582 4.811 5.027 5.234 5.335 5.532 5.711 5.942 6.087 6.241 6.467 6.681 6.888 7.082 7.259 7.481 7.718 7.946 8.192 8.428 8.658 8.921 9.212 9.478 9.764 10.086 10.411 10.719 11.061 11.462 11.854 12.294 12.769 13.284 13.789 14.279 14.756 15.117 15.052 14.736 14.374 13.96 13.524 13.138 12.758 12.413 12.058 11.747 11.477 11.214 10.963 10.715 10.465 10.217 10.005 9.814 9.605 9.387 9.21 9.017 8.796 8.618 8.443 8.269 8.083 7.891 7.752 7.598 7.376 7.211 7.028 6.934 6.748 6.538 6.292 6.161 5.895 5.753 5.592 5.437 5.084 4.88 4.672 4.439 4.168 3.879 3.524 2.513 -2 ,19256 ,TETRA ,17559743,Sat Nov 27 08:48:17 CET,Sat Nov 27 10:38:13 CET,0.0 1.274 1.793 2.196 2.522 2.807 3.049 3.234 3.557 3.715 3.862 3.978 4.232 4.352 4.582 4.797 4.998 5.099 5.316 5.529 5.81 5.973 6.126 6.349 6.559 6.756 6.943 7.115 7.34 7.576 7.799 8.047 8.283 8.507 8.769 9.052 9.326 9.632 9.944 10.26 10.586 10.956 11.379 11.786 12.222 12.699 13.214 13.719 14.239 14.688 14.951 14.835 14.525 14.126 13.706 13.292 12.911 12.558 12.236 11.88 11.552 11.246 10.937 10.632 10.362 10.117 9.832 9.587 9.39 9.199 8.993 8.804 8.595 8.378 8.199 7.997 7.773 7.545 7.306 7.127 6.954 6.701 6.523 6.344 6.253 6.056 5.853 5.646 5.533 5.274 5.177 5.055 4.913 4.634 4.488 4.305 4.06 3.808 3.545 3.184 1.241 -3 ,3143 ,TETRA ,17559744,Sat Nov 27 08:48:17 CET,Sat Nov 27 10:37:27 CET,0.0 1.904 2.371 2.739 3.022 3.256 3.475 3.661 3.989 4.137 4.283 4.438 4.704 4.814 5.02 5.226 5.424 5.525 5.709 5.865 6.105 6.273 6.441 6.679 6.897 7.097 7.281 7.452 7.682 7.915 8.128 8.366 8.605 8.837 9.097 9.378 9.634 9.915 10.224 10.551 10.86 11.207 11.626 12.031 12.481 12.943 13.426 13.914 14.437 14.95 15.298 15.221 14.902 14.525 14.155 13.781 13.409 13.012 12.645 12.294 11.987 11.706 11.419 11.136 10.873 10.605 10.325 10.09 9.879 9.655 9.424 9.23 9.023 8.815 8.661 8.488 8.299 8.112 7.905 7.768 7.63 7.396 7.232 7.072 6.992 6.823 6.652 6.47 6.365 6.113 6.027 5.903 5.744 5.376 5.173 4.939 4.685 4.402 4.085 3.653 2.552 -4 ,31806 ,TETRA ,17559745,Sat Nov 27 08:48:18 CET,Sat Nov 27 10:37:27 CET,0.0 1.589 2.053 2.377 2.624 2.858 3.065 3.246 3.575 3.736 3.89 4.015 4.285 4.415 4.638 4.838 5.033 5.13 5.32 5.486 5.71 5.858 6.005 6.216 6.421 6.621 6.812 7.008 7.263 7.492 7.716 7.965 8.196 8.426 8.686 8.965 9.229 9.519 9.828 10.142 10.466 10.832 11.233 11.625 12.073 12.529 12.989 13.465 13.981 14.451 14.792 14.741 14.42 14.036 13.695 13.329 12.959 12.631 12.324 11.981 11.671 11.38 11.107 10.852 10.593 10.338 10.059 9.817 9.612 9.406 9.186 8.97 8.753 8.555 8.385 8.2 8.025 7.851 7.665 7.526 7.376 7.158 7.011 6.846 6.756 6.577 6.398 6.204 6.103 5.855 5.755 5.636 5.502 5.189 5.018 4.841 4.645 4.382 4.033 3.602 1.812 -5 ,12338 ,TETRA ,17559746,Sat Nov 27 08:48:18 CET,Sat Nov 27 10:39:09 CET,0.0 1.529 2.009 2.41 2.751 3.044 3.27 3.454 3.809 3.97 4.11 4.245 4.516 4.636 4.845 5.052 5.272 5.373 5.552 5.726 5.97 6.118 6.259 6.461 6.662 6.85 7.027 7.203 7.435 7.664 7.874 8.118 8.36 8.586 8.854 9.157 9.421 9.712 10.024 10.345 10.701 11.068 11.461 11.874 12.335 12.792 13.291 13.804 14.308 14.809 15.158 15.055 14.725 14.346 13.97 13.6 13.238 12.875 12.53 12.165 11.817 11.516 11.245 10.969 10.696 10.45 10.203 9.969 9.762 9.549 9.318 9.123 8.934 8.733 8.564 8.391 8.223 8.047 7.829 7.678 7.533 7.299 7.147 6.993 6.905 6.723 6.556 6.37 6.249 5.969 5.824 5.679 5.521 5.197 4.998 4.77 4.52 4.226 3.895 3.543 1.919 -6 ,26051 ,TETRA ,17559747,Sat Nov 27 08:48:18 CET,Sat Nov 27 10:39:11 CET,0.0 1.559 2.079 2.452 2.729 2.98 3.213 3.42 3.793 3.981 4.155 4.33 4.614 4.765 5.049 5.285 5.488 5.582 5.773 5.959 6.227 6.392 6.539 6.75 6.959 7.163 7.359 7.539 7.766 7.989 8.197 8.435 8.663 8.895 9.169 9.467 9.727 10.006 10.322 10.654 10.983 11.318 11.704 12.083 12.514 12.968 13.456 13.967 14.493 15.015 15.377 15.253 14.944 14.636 14.292 13.883 13.492 13.124 12.758 12.374 12.06 11.789 11.508 11.24 10.994 10.746 10.481 10.25 10.037 9.817 9.603 9.411 9.205 8.996 8.841 8.683 8.501 8.296 8.061 7.902 7.748 7.49 7.312 7.126 7.029 6.836 6.636 6.427 6.312 6.053 5.93 5.794 5.657 5.334 5.129 4.919 4.71 4.427 4.059 3.624 1.868 -7 ,1157 ,TETRA ,17559748,Sat Nov 27 08:48:18 CET,Sat Nov 27 10:38:32 CET,0.0 2.265 2.75 3.062 3.279 3.477 3.693 3.898 4.264 4.439 4.614 4.802 5.09 5.219 5.455 5.687 5.901 5.998 6.182 6.353 6.591 6.753 6.904 7.121 7.329 7.527 7.717 7.899 8.133 8.346 8.565 8.835 9.082 9.314 9.567 9.842 10.12 10.419 10.702 11.026 11.378 11.733 12.142 12.552 12.985 13.413 13.875 14.38 14.919 15.364 15.66 15.619 15.322 14.942 14.551 14.175 13.835 13.493 13.161 12.832 12.547 12.26 11.975 11.716 11.476 11.241 10.986 10.76 10.55 10.328 10.092 9.891 9.692 9.488 9.321 9.15 8.976 8.781 8.569 8.426 8.279 8.035 7.88 7.716 7.629 7.465 7.282 7.076 6.961 6.699 6.583 6.443 6.29 5.98 5.798 5.591 5.357 5.122 4.82 4.395 3.497 -8 ,10991 ,TETRA ,17559749,Sat Nov 27 08:49:18 CET,Sat Nov 27 10:44:13 CET,0.0 1.632 2.145 2.564 2.929 3.182 3.388 3.572 3.905 4.054 4.198 4.34 4.611 4.732 4.963 5.182 5.377 5.469 5.648 5.83 6.093 6.257 6.414 6.648 6.861 7.048 7.235 7.415 7.649 7.872 8.078 8.329 8.553 8.773 9.034 9.308 9.591 9.897 10.202 10.527 10.846 11.211 11.641 12.034 12.505 13.023 13.517 14.028 14.561 15.06 15.377 15.307 15.04 14.69 14.326 13.948 13.562 13.182 12.824 12.461 12.139 11.848 11.584 11.317 11.067 10.834 10.578 10.351 10.151 9.934 9.704 9.514 9.319 9.096 8.921 8.756 8.587 8.424 8.244 8.108 7.963 7.741 7.584 7.406 7.312 7.128 6.929 6.724 6.618 6.367 6.27 6.133 5.981 5.64 5.464 5.281 5.051 4.793 4.486 4.082 2.536 -9 ,14624 ,TETRA ,17559750,Sat Nov 27 08:49:17 CET,Sat Nov 27 10:39:24 CET,0.0 1.233 1.668 1.972 2.222 2.462 2.687 2.873 3.216 3.375 3.529 3.672 3.939 4.059 4.288 4.493 4.687 4.785 4.986 5.172 5.441 5.617 5.776 5.991 6.191 6.389 6.576 6.759 7.003 7.229 7.44 7.686 7.905 8.117 8.361 8.632 8.906 9.198 9.488 9.793 10.114 10.458 10.851 11.24 11.686 12.182 12.701 13.229 13.76 14.221 14.549 14.508 14.248 13.86 13.421 13.009 12.629 12.259 11.938 11.598 11.283 11.0 10.722 10.462 10.205 9.965 9.731 9.517 9.324 9.119 8.903 8.715 8.508 8.291 8.117 7.94 7.761 7.576 7.39 7.265 7.129 6.901 6.745 6.576 6.488 6.316 6.129 5.922 5.813 5.558 5.447 5.31 5.139 4.756 4.57 4.367 4.116 3.825 3.48 3.017 2.069 -10 ,18459 ,TETRA ,17559751,Sat Nov 27 08:50:17 CET,Sat Nov 27 10:42:32 CET,0.0 1.372 1.757 2.092 2.375 2.628 2.846 3.033 3.387 3.554 3.705 3.818 4.074 4.194 4.424 4.651 4.87 4.964 5.145 5.311 5.553 5.727 5.903 6.14 6.355 6.565 6.762 6.945 7.183 7.415 7.632 7.881 8.118 8.353 8.616 8.895 9.155 9.442 9.753 10.068 10.401 10.759 11.145 11.548 12.001 12.445 12.923 13.431 13.928 14.407 14.747 14.707 14.398 13.979 13.596 13.204 12.831 12.487 12.16 11.811 11.504 11.225 10.955 10.688 10.429 10.198 9.943 9.7 9.492 9.269 9.037 8.85 8.659 8.459 8.294 8.124 7.949 7.766 7.573 7.434 7.292 7.038 6.848 6.675 6.593 6.414 6.207 5.983 5.861 5.594 5.479 5.347 5.202 4.863 4.664 4.436 4.209 3.966 3.663 3.288 1.695 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_42_51.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_42_51.txt deleted file mode 100644 index 1f58298e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_42_51.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,240 ,TETRA ,17559752,Sat Nov 27 08:49:18 CET,Sat Nov 27 10:33:13 CET,0.0 1.661 2.13 2.51 2.832 3.084 3.291 3.493 3.864 4.026 4.178 4.342 4.627 4.754 4.983 5.206 5.428 5.538 5.746 5.942 6.21 6.385 6.551 6.781 7.009 7.22 7.413 7.596 7.835 8.068 8.281 8.54 8.819 9.074 9.329 9.623 9.905 10.202 10.525 10.863 11.215 11.611 12.073 12.505 12.974 13.483 14.07 14.709 15.325 15.93 16.49 16.661 16.508 16.23 15.902 15.573 15.243 14.931 14.631 14.289 13.983 13.698 13.444 13.223 12.998 12.778 12.561 12.376 12.195 11.984 11.762 11.578 11.385 11.188 11.052 10.902 10.737 10.562 10.373 10.245 10.111 9.887 9.703 9.514 9.423 9.259 9.093 8.878 8.762 8.527 8.44 8.309 8.173 7.919 7.779 7.619 7.39 7.094 6.813 6.465 4.954 -2 ,27332 ,TETRA ,17559753,Sat Nov 27 08:50:18 CET,Sat Nov 27 10:42:31 CET,0.0 3.763 4.336 4.719 4.994 5.198 5.39 5.587 5.968 6.143 6.288 6.397 6.666 6.797 7.042 7.259 7.467 7.575 7.783 7.951 8.188 8.36 8.53 8.771 8.993 9.199 9.404 9.607 9.844 10.057 10.261 10.519 10.781 11.015 11.273 11.561 11.849 12.177 12.52 12.875 13.251 13.654 14.082 14.496 14.956 15.45 16.002 16.586 17.213 17.863 18.441 18.567 18.423 18.165 17.851 17.56 17.277 16.95 16.644 16.349 16.07 15.797 15.544 15.299 15.046 14.801 14.547 14.334 14.145 13.934 13.713 13.516 13.308 13.091 12.924 12.748 12.559 12.375 12.186 12.052 11.903 11.668 11.504 11.327 11.236 11.034 10.82 10.597 10.488 10.251 10.154 10.024 9.887 9.571 9.401 9.232 9.04 8.811 8.565 8.235 7.265 -3 ,20332 ,TETRA ,17559754,Sat Nov 27 08:50:17 CET,Sat Nov 27 10:41:36 CET,0.0 1.861 2.465 2.881 3.222 3.49 3.719 3.93 4.323 4.492 4.633 4.742 5.019 5.149 5.393 5.62 5.831 5.931 6.108 6.288 6.571 6.741 6.9 7.135 7.357 7.576 7.784 7.984 8.243 8.484 8.713 8.984 9.243 9.493 9.788 10.137 10.46 10.776 11.106 11.474 11.847 12.244 12.709 13.162 13.691 14.317 15.001 15.648 16.334 17.035 17.576 17.702 17.508 17.191 16.876 16.568 16.257 15.95 15.671 15.378 15.132 14.886 14.587 14.29 14.041 13.827 13.613 13.425 13.252 13.06 12.855 12.685 12.5 12.299 12.151 12.0 11.834 11.668 11.504 11.386 11.255 11.047 10.894 10.729 10.642 10.471 10.313 10.138 10.032 9.778 9.653 9.506 9.371 9.107 8.959 8.794 8.603 8.356 8.057 7.737 6.615 -4 ,17944 ,TETRA ,17559755,Sat Nov 27 08:50:17 CET,Sat Nov 27 10:44:03 CET,0.0 1.242 1.734 2.127 2.427 2.692 2.923 3.125 3.502 3.697 3.886 4.063 4.356 4.509 4.795 5.054 5.312 5.434 5.652 5.862 6.157 6.343 6.534 6.814 7.068 7.309 7.546 7.775 8.071 8.347 8.61 8.924 9.217 9.503 9.822 10.167 10.511 10.873 11.241 11.658 12.097 12.569 13.102 13.611 14.165 14.744 15.413 16.124 16.805 17.46 18.018 18.149 17.964 17.683 17.318 16.923 16.569 16.201 15.87 15.54 15.237 14.957 14.677 14.419 14.165 13.921 13.673 13.447 13.253 13.044 12.833 12.651 12.436 12.215 12.052 11.883 11.699 11.508 11.307 11.169 11.034 10.803 10.642 10.478 10.386 10.194 9.999 9.792 9.684 9.451 9.384 9.264 9.138 8.827 8.645 8.468 8.261 8.02 7.799 7.384 5.92 -5 ,15662 ,TETRA ,17559756,Sat Nov 27 08:52:17 CET,Sat Nov 27 10:44:26 CET,0.0 1.831 2.294 2.666 3.002 3.312 3.59 3.812 4.208 4.38 4.533 4.679 4.968 5.127 5.421 5.684 5.936 6.059 6.291 6.51 6.819 7.008 7.191 7.46 7.722 7.98 8.217 8.437 8.729 9.014 9.282 9.592 9.891 10.179 10.518 10.888 11.207 11.547 11.944 12.356 12.762 13.211 13.744 14.266 14.803 15.363 15.992 16.636 17.298 18.006 18.687 18.896 18.741 18.428 18.034 17.625 17.276 16.953 16.657 16.361 16.099 15.865 15.626 15.373 15.132 14.901 14.642 14.415 14.238 14.061 13.876 13.715 13.532 13.32 13.153 12.989 12.821 12.644 12.44 12.292 12.15 11.944 11.787 11.608 11.527 11.376 11.22 11.037 10.932 10.685 10.562 10.424 10.293 10.003 9.833 9.636 9.426 9.188 8.893 8.505 7.21 -6 ,21806 ,TETRA ,17559757,Sat Nov 27 08:52:18 CET,Sat Nov 27 10:42:09 CET,0.0 1.946 2.457 2.812 3.13 3.407 3.639 3.848 4.24 4.416 4.594 4.796 5.086 5.228 5.498 5.741 5.964 6.078 6.309 6.526 6.823 7.012 7.197 7.458 7.702 7.941 8.173 8.402 8.687 8.952 9.213 9.538 9.841 10.108 10.421 10.768 11.094 11.44 11.798 12.187 12.601 13.048 13.545 14.05 14.634 15.237 15.893 16.616 17.366 18.13 18.799 18.945 18.773 18.474 18.146 17.795 17.441 17.113 16.823 16.507 16.206 15.929 15.655 15.387 15.142 14.912 14.678 14.469 14.265 14.055 13.857 13.69 13.5 13.309 13.157 12.974 12.784 12.596 12.402 12.267 12.127 11.912 11.76 11.592 11.498 11.304 11.112 10.897 10.778 10.516 10.378 10.239 10.086 9.725 9.523 9.274 9.007 8.793 8.566 8.249 5.108 -7 ,25565 ,TETRA ,17559758,Sat Nov 27 08:53:20 CET,Sat Nov 27 10:42:45 CET,0.0 1.899 2.446 2.84 3.129 3.35 3.549 3.762 4.17 4.344 4.496 4.638 4.924 5.058 5.301 5.53 5.734 5.83 6.018 6.192 6.457 6.636 6.804 7.034 7.245 7.464 7.697 7.929 8.201 8.46 8.708 8.974 9.233 9.476 9.737 10.036 10.336 10.66 11.014 11.383 11.746 12.138 12.601 13.063 13.589 14.165 14.752 15.369 16.026 16.705 17.319 17.423 17.21 16.92 16.565 16.201 15.881 15.53 15.173 14.805 14.511 14.253 13.99 13.745 13.511 13.29 13.071 12.872 12.706 12.52 12.298 12.12 11.944 11.749 11.578 11.412 11.264 11.106 10.931 10.797 10.646 10.431 10.293 10.133 10.053 9.904 9.715 9.489 9.371 9.108 8.987 8.849 8.702 8.39 8.226 8.06 7.865 7.598 7.268 6.91 5.749 -8 ,2407 ,TETRA ,17559759,Sat Nov 27 08:53:20 CET,Sat Nov 27 10:43:16 CET,0.0 1.572 2.069 2.501 2.855 3.138 3.395 3.619 4.013 4.201 4.372 4.534 4.815 4.95 5.206 5.45 5.676 5.784 5.971 6.135 6.387 6.55 6.703 6.905 7.091 7.286 7.485 7.669 7.909 8.169 8.41 8.687 8.954 9.205 9.487 9.8 10.099 10.427 10.786 11.162 11.532 11.916 12.345 12.764 13.232 13.739 14.316 14.92 15.559 16.172 16.681 16.818 16.644 16.363 16.042 15.698 15.378 15.068 14.793 14.505 14.23 13.97 13.711 13.477 13.238 12.997 12.746 12.516 12.313 12.11 11.918 11.752 11.567 11.358 11.186 11.025 10.864 10.677 10.467 10.324 10.179 9.961 9.812 9.653 9.575 9.405 9.203 8.978 8.865 8.624 8.517 8.367 8.222 7.915 7.709 7.497 7.302 7.077 6.784 6.339 4.559 -9 ,6308 ,TETRA ,17559760,Sat Nov 27 08:53:20 CET,Sat Nov 27 10:44:37 CET,0.0 2.388 3.151 3.612 3.952 4.226 4.471 4.684 5.146 5.378 5.566 5.722 6.002 6.143 6.388 6.61 6.851 6.973 7.185 7.371 7.633 7.81 7.983 8.229 8.465 8.69 8.896 9.091 9.35 9.612 9.859 10.141 10.396 10.644 10.936 11.265 11.573 11.877 12.217 12.592 12.998 13.458 13.977 14.488 15.042 15.65 16.303 16.938 17.633 18.354 18.925 19.105 18.956 18.695 18.419 18.007 17.59 17.25 16.952 16.639 16.339 16.06 15.806 15.561 15.309 15.075 14.845 14.649 14.485 14.304 14.099 13.923 13.74 13.55 13.404 13.256 13.094 12.914 12.729 12.6 12.452 12.217 12.065 11.894 11.804 11.639 11.471 11.288 11.187 10.944 10.848 10.712 10.554 10.237 10.083 9.895 9.679 9.438 9.189 8.898 6.618 -10 ,9861 ,TETRA ,17559761,Sat Nov 27 08:53:20 CET,Sat Nov 27 10:43:37 CET,0.0 2.402 2.97 3.418 3.739 3.986 4.206 4.408 4.793 4.974 5.138 5.299 5.573 5.707 5.975 6.209 6.445 6.568 6.793 7.0 7.295 7.481 7.678 7.958 8.22 8.478 8.712 8.935 9.231 9.495 9.737 10.042 10.342 10.638 10.954 11.297 11.644 12.017 12.398 12.798 13.215 13.668 14.172 14.696 15.311 15.905 16.529 17.195 17.92 18.621 19.191 19.303 19.096 18.835 18.527 18.174 17.814 17.468 17.173 16.852 16.572 16.287 16.015 15.782 15.547 15.327 15.094 14.887 14.708 14.517 14.31 14.13 13.939 13.749 13.605 13.45 13.281 13.103 12.914 12.79 12.663 12.418 12.256 12.121 12.048 11.883 11.71 11.526 11.416 11.162 11.083 10.958 10.804 10.478 10.302 10.117 9.927 9.687 9.398 9.052 5.974 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_42_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_42_54.txt deleted file mode 100644 index a0aa7ffa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_42_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21412 ,TETRA ,17559762,Sat Nov 27 08:54:19 CET,Sat Nov 27 10:41:11 CET,0.0 1.378 1.796 2.124 2.419 2.685 2.936 3.139 3.447 3.592 3.727 3.826 4.078 4.188 4.385 4.562 4.734 4.82 4.98 5.133 5.365 5.507 5.64 5.829 6.013 6.188 6.34 6.483 6.666 6.827 6.988 7.183 7.36 7.541 7.745 7.95 8.146 8.37 8.601 8.835 9.067 9.321 9.594 9.823 10.082 10.343 10.58 10.785 10.898 10.813 10.32 9.426 8.566 7.796 7.115 6.485 5.877 5.311 4.845 4.37 3.957 3.585 3.23 2.901 2.591 2.311 2.022 1.754 1.513 1.273 1.033 0.819 0.584 0.334 0.138 -0.06 -0.264 -0.471 -0.678 -0.818 -0.972 -1.221 -1.394 -1.578 -1.67 -1.858 -2.066 -2.29 -2.421 -2.706 -2.813 -2.938 -3.078 -3.395 -3.569 -3.759 -3.971 -4.218 -4.513 -4.944 -5.96 -2 ,16982 ,TETRA ,17559763,Sat Nov 27 08:55:18 CET,Sat Nov 27 10:45:14 CET,0.0 1.019 1.512 1.808 2.024 2.218 2.399 2.562 2.88 3.03 3.169 3.28 3.538 3.653 3.869 4.061 4.245 4.329 4.49 4.652 4.874 5.01 5.144 5.343 5.527 5.7 5.866 6.022 6.207 6.369 6.534 6.736 6.926 7.111 7.316 7.545 7.748 7.954 8.172 8.4 8.633 8.869 9.121 9.373 9.64 9.88 10.087 10.244 10.325 10.23 9.745 8.838 7.926 7.109 6.389 5.715 5.096 4.53 4.055 3.566 3.147 2.771 2.4 2.051 1.733 1.444 1.124 0.843 0.61 0.359 0.095 -0.117 -0.337 -0.573 -0.754 -0.942 -1.131 -1.321 -1.534 -1.678 -1.822 -2.061 -2.234 -2.413 -2.505 -2.706 -2.923 -3.154 -3.274 -3.537 -3.65 -3.789 -3.931 -4.244 -4.417 -4.626 -4.853 -5.09 -5.396 -5.804 -6.9 -3 ,2604 ,TETRA ,17559764,Sat Nov 27 08:56:19 CET,Sat Nov 27 10:47:22 CET,0.0 1.503 1.913 2.228 2.496 2.714 2.899 3.071 3.391 3.528 3.672 3.808 4.073 4.189 4.407 4.595 4.775 4.865 5.027 5.178 5.377 5.504 5.631 5.82 6.004 6.175 6.336 6.489 6.669 6.829 6.993 7.19 7.375 7.558 7.76 7.988 8.198 8.396 8.611 8.839 9.064 9.305 9.555 9.805 10.067 10.297 10.503 10.641 10.709 10.614 10.105 9.19 8.292 7.502 6.779 6.081 5.459 4.899 4.407 3.915 3.507 3.147 2.799 2.465 2.154 1.866 1.562 1.298 1.069 0.826 0.575 0.359 0.133 -0.086 -0.253 -0.429 -0.62 -0.836 -1.074 -1.247 -1.429 -1.71 -1.912 -2.127 -2.237 -2.461 -2.703 -2.976 -3.113 -3.394 -3.543 -3.703 -3.869 -4.255 -4.48 -4.712 -4.937 -5.17 -5.477 -5.974 -7.029 -4 ,18452 ,TETRA ,17559765,Sat Nov 27 08:56:22 CET,Sat Nov 27 10:46:30 CET,0.0 1.36 1.809 2.135 2.384 2.592 2.788 2.967 3.288 3.438 3.57 3.674 3.938 4.054 4.248 4.428 4.616 4.718 4.908 5.049 5.246 5.393 5.543 5.752 5.942 6.115 6.275 6.421 6.608 6.797 6.971 7.17 7.366 7.554 7.768 8.012 8.229 8.478 8.744 8.968 9.189 9.439 9.71 9.969 10.229 10.483 10.73 10.892 11.007 10.97 10.466 9.549 8.668 7.876 7.172 6.523 5.939 5.375 4.875 4.375 3.94 3.551 3.181 2.836 2.52 2.239 1.925 1.642 1.409 1.171 0.923 0.705 0.47 0.238 0.063 -0.12 -0.312 -0.511 -0.716 -0.855 -0.997 -1.239 -1.406 -1.569 -1.661 -1.869 -2.077 -2.277 -2.386 -2.646 -2.729 -2.868 -3.025 -3.334 -3.518 -3.73 -3.935 -4.167 -4.46 -4.928 -6.566 -5 ,16471 ,TETRA ,17559766,Sat Nov 27 08:56:23 CET,Sat Nov 27 10:46:03 CET,0.0 1.789 2.375 2.736 3.03 3.293 3.498 3.654 3.928 4.062 4.195 4.291 4.541 4.652 4.861 5.049 5.234 5.32 5.484 5.64 5.851 5.991 6.131 6.318 6.486 6.648 6.806 6.964 7.16 7.355 7.54 7.74 7.922 8.095 8.303 8.521 8.729 8.954 9.182 9.412 9.638 9.886 10.163 10.397 10.631 10.873 11.116 11.305 11.399 11.365 10.898 9.974 9.078 8.243 7.5 6.841 6.254 5.724 5.241 4.728 4.294 3.897 3.533 3.199 2.898 2.626 2.326 2.059 1.833 1.595 1.337 1.12 0.904 0.683 0.507 0.321 0.121 -0.076 -0.289 -0.438 -0.582 -0.814 -0.996 -1.19 -1.279 -1.466 -1.672 -1.883 -1.997 -2.27 -2.381 -2.523 -2.677 -2.993 -3.179 -3.379 -3.568 -3.767 -3.999 -4.375 -5.704 -6 ,10029 ,TETRA ,17559767,Sat Nov 27 08:56:20 CET,Sat Nov 27 10:47:37 CET,0.0 0.972 1.434 1.791 2.088 2.321 2.501 2.674 3.005 3.157 3.3 3.415 3.674 3.787 3.993 4.18 4.359 4.448 4.631 4.804 5.025 5.161 5.296 5.491 5.681 5.86 6.025 6.186 6.386 6.58 6.767 6.977 7.164 7.337 7.531 7.747 7.951 8.175 8.41 8.638 8.868 9.114 9.375 9.62 9.893 10.145 10.363 10.518 10.548 10.42 9.943 9.033 8.161 7.377 6.64 5.963 5.355 4.801 4.322 3.85 3.428 3.061 2.728 2.406 2.105 1.814 1.509 1.237 1.009 0.777 0.537 0.334 0.117 -0.104 -0.29 -0.475 -0.679 -0.898 -1.105 -1.255 -1.418 -1.669 -1.837 -2.004 -2.089 -2.262 -2.448 -2.661 -2.774 -3.028 -3.107 -3.237 -3.379 -3.699 -3.887 -4.076 -4.292 -4.554 -4.865 -5.26 -5.969 -7 ,32436 ,TETRA ,17559768,Sat Nov 27 08:56:21 CET,Sat Nov 27 10:47:37 CET,0.0 1.827 2.307 2.598 2.825 3.06 3.288 3.472 3.788 3.912 4.03 4.139 4.397 4.506 4.713 4.916 5.086 5.162 5.316 5.472 5.702 5.847 5.98 6.165 6.345 6.515 6.683 6.844 7.029 7.191 7.354 7.555 7.734 7.903 8.108 8.355 8.578 8.785 9.0 9.241 9.472 9.69 9.936 10.178 10.421 10.667 10.921 11.111 11.203 11.112 10.629 9.764 8.891 8.085 7.364 6.689 6.087 5.54 5.059 4.573 4.153 3.777 3.414 3.073 2.744 2.442 2.132 1.855 1.623 1.378 1.11 0.887 0.665 0.442 0.265 0.083 -0.106 -0.319 -0.537 -0.678 -0.826 -1.061 -1.229 -1.401 -1.49 -1.678 -1.879 -2.096 -2.209 -2.469 -2.558 -2.693 -2.837 -3.135 -3.32 -3.522 -3.724 -3.97 -4.246 -4.611 -5.471 -8 ,18997 ,TETRA ,17559769,Sat Nov 27 08:57:18 CET,Sat Nov 27 10:47:43 CET,0.0 0.956 1.392 1.684 1.923 2.141 2.326 2.496 2.802 2.94 3.071 3.176 3.429 3.541 3.787 4.009 4.212 4.305 4.477 4.645 4.874 5.01 5.15 5.362 5.561 5.748 5.93 6.106 6.317 6.521 6.72 6.948 7.174 7.392 7.632 7.887 8.111 8.329 8.56 8.814 9.072 9.353 9.676 9.967 10.239 10.518 10.804 11.038 11.154 11.096 10.652 9.716 8.816 7.987 7.24 6.569 5.96 5.381 4.878 4.388 3.942 3.527 3.149 2.787 2.438 2.114 1.778 1.486 1.228 0.952 0.668 0.438 0.201 -0.038 -0.221 -0.418 -0.638 -0.867 -1.093 -1.247 -1.416 -1.676 -1.853 -2.044 -2.137 -2.328 -2.539 -2.766 -2.887 -3.176 -3.325 -3.47 -3.627 -3.952 -4.117 -4.274 -4.441 -4.646 -4.895 -5.195 -6.075 -9 ,5482 ,TETRA ,17559771,Sat Nov 27 08:58:19 CET,Sat Nov 27 10:47:55 CET,0.0 0.967 1.336 1.651 1.91 2.125 2.321 2.491 2.792 2.951 3.103 3.234 3.513 3.635 3.836 4.018 4.195 4.284 4.47 4.647 4.882 5.022 5.151 5.355 5.554 5.745 5.932 6.095 6.291 6.475 6.654 6.867 7.057 7.239 7.454 7.688 7.888 8.111 8.356 8.596 8.848 9.098 9.341 9.583 9.828 10.046 10.245 10.381 10.436 10.358 9.865 8.93 8.042 7.247 6.536 5.865 5.266 4.719 4.225 3.704 3.26 2.884 2.523 2.19 1.886 1.592 1.269 0.993 0.76 0.509 0.252 0.032 -0.198 -0.431 -0.604 -0.791 -1.001 -1.208 -1.421 -1.564 -1.714 -1.961 -2.148 -2.339 -2.432 -2.63 -2.829 -3.028 -3.137 -3.396 -3.466 -3.59 -3.735 -4.063 -4.245 -4.443 -4.66 -4.909 -5.192 -5.557 -6.464 -10 ,25790 ,TETRA ,17559772,Sat Nov 27 08:59:17 CET,Sat Nov 27 10:50:03 CET,0.0 1.458 1.978 2.338 2.632 2.904 3.125 3.324 3.671 3.829 3.99 4.134 4.395 4.517 4.723 4.903 5.099 5.196 5.373 5.532 5.746 5.878 6.006 6.192 6.37 6.538 6.706 6.855 7.031 7.206 7.367 7.581 7.79 7.963 8.159 8.388 8.598 8.812 9.038 9.282 9.526 9.756 10.0 10.231 10.471 10.723 10.957 11.134 11.222 11.148 10.683 9.86 9.013 8.219 7.511 6.848 6.242 5.693 5.213 4.733 4.312 3.927 3.57 3.252 2.964 2.692 2.382 2.106 1.872 1.629 1.374 1.16 0.951 0.722 0.533 0.343 0.151 -0.058 -0.28 -0.425 -0.575 -0.806 -0.979 -1.177 -1.269 -1.449 -1.666 -1.898 -2.018 -2.299 -2.417 -2.557 -2.715 -3.042 -3.219 -3.422 -3.68 -3.983 -4.351 -4.904 -6.229 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_43_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_43_42.txt deleted file mode 100644 index 861c7526..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_43_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13458 ,KEBNE ,17024977,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:56:03 CET,0.0 3.743 4.788 5.392 5.721 5.987 6.242 6.462 6.825 6.989 7.148 7.311 7.622 7.774 8.061 8.324 8.555 8.674 8.917 9.146 9.475 9.681 9.873 10.149 10.422 10.689 10.937 11.157 11.447 11.737 12.011 12.335 12.636 12.926 13.274 13.669 14.036 14.423 14.844 15.314 15.801 16.317 16.912 17.496 18.153 18.879 19.69 20.599 21.63 22.697 23.874 24.591 24.795 24.763 24.599 24.39 24.138 23.882 23.659 23.382 23.113 22.877 22.633 22.391 22.16 21.936 21.688 21.463 21.261 21.058 20.845 20.666 20.476 20.273 20.118 19.947 19.766 19.574 19.375 19.234 19.079 18.835 18.651 18.458 18.364 18.158 17.924 17.681 17.553 17.285 17.159 17.006 16.839 16.451 16.233 15.981 15.673 15.382 15.058 14.597 11.922 -2 ,29025 ,KEBNE ,17024978,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:44 CET,0.0 2.024 2.667 3.068 3.428 3.747 4.017 4.252 4.739 4.987 5.201 5.382 5.685 5.842 6.144 6.408 6.661 6.789 7.037 7.29 7.652 7.859 8.047 8.31 8.557 8.796 9.023 9.24 9.527 9.819 10.094 10.406 10.719 11.032 11.385 11.772 12.143 12.54 12.961 13.409 13.888 14.41 14.987 15.567 16.237 16.957 17.768 18.633 19.557 20.538 21.583 22.305 22.538 22.5 22.354 22.154 21.906 21.615 21.343 21.058 20.811 20.596 20.354 20.11 19.899 19.701 19.486 19.294 19.117 18.907 18.673 18.485 18.291 18.071 17.89 17.712 17.522 17.329 17.12 16.965 16.796 16.5 16.307 16.118 16.011 15.753 15.444 15.113 14.959 14.674 14.482 14.294 14.093 13.681 13.446 13.181 12.902 12.578 12.171 11.589 9.651 -3 ,16938 ,KEBNE ,17024979,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:56:31 CET,0.0 1.64 2.064 2.429 2.744 3.013 3.27 3.495 3.886 4.08 4.258 4.412 4.72 4.877 5.17 5.439 5.691 5.801 6.013 6.231 6.544 6.753 6.958 7.231 7.485 7.736 7.974 8.198 8.492 8.766 9.019 9.35 9.681 9.989 10.327 10.702 11.049 11.429 11.834 12.256 12.716 13.235 13.838 14.415 15.099 15.852 16.651 17.509 18.464 19.528 20.685 21.396 21.622 21.61 21.49 21.34 21.147 20.9 20.661 20.395 20.143 19.895 19.655 19.419 19.18 18.964 18.737 18.516 18.321 18.114 17.875 17.666 17.438 17.206 17.028 16.843 16.657 16.458 16.244 16.092 15.93 15.664 15.48 15.289 15.182 14.946 14.715 14.472 14.335 14.041 13.844 13.671 13.498 13.125 12.912 12.697 12.44 12.099 11.644 11.084 9.154 -4 ,23041 ,KEBNE ,17024980,Wed Dec 22 11:21:09 CET,Wed Dec 22 12:56:02 CET,0.0 2.501 3.002 3.4 3.742 4.047 4.314 4.556 4.954 5.127 5.295 5.461 5.766 5.908 6.181 6.435 6.661 6.771 6.994 7.209 7.501 7.683 7.869 8.139 8.379 8.62 8.863 9.085 9.364 9.645 9.918 10.232 10.538 10.855 11.212 11.581 11.923 12.304 12.713 13.146 13.6 14.086 14.69 15.308 15.962 16.672 17.475 18.317 19.299 20.423 21.591 22.272 22.441 22.444 22.351 22.154 21.899 21.626 21.363 21.081 20.823 20.583 20.348 20.108 19.827 19.53 19.221 18.931 18.655 18.381 18.091 17.837 17.574 17.297 17.076 16.837 16.602 16.364 16.117 15.95 15.76 15.447 15.24 15.033 14.921 14.675 14.403 14.115 13.97 13.685 13.535 13.374 13.202 12.862 12.663 12.419 12.154 11.842 11.438 10.88 8.618 -5 ,18628 ,KEBNE ,17024981,Wed Dec 22 11:21:07 CET,Wed Dec 22 12:56:03 CET,0.0 4.294 5.01 5.401 5.678 5.931 6.199 6.444 6.844 7.019 7.19 7.37 7.689 7.841 8.123 8.386 8.625 8.74 8.959 9.169 9.478 9.673 9.857 10.126 10.397 10.653 10.886 11.128 11.445 11.724 11.987 12.301 12.6 12.886 13.224 13.619 14.005 14.409 14.836 15.286 15.743 16.273 16.874 17.455 18.14 18.888 19.688 20.534 21.51 22.615 23.838 24.561 24.707 24.647 24.507 24.295 24.051 23.804 23.561 23.28 23.014 22.78 22.557 22.33 22.088 21.868 21.65 21.431 21.234 21.041 20.836 20.665 20.474 20.258 20.099 19.935 19.751 19.566 19.373 19.227 19.074 18.838 18.662 18.464 18.364 18.151 17.922 17.66 17.527 17.261 17.128 16.985 16.806 16.362 16.134 15.897 15.607 15.283 14.874 14.31 12.372 -6 ,4939 ,KEBNE ,17024982,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:56:58 CET,0.0 2.548 3.174 3.616 3.984 4.277 4.518 4.743 5.184 5.385 5.568 5.738 6.035 6.174 6.449 6.728 6.977 7.089 7.31 7.519 7.81 8.005 8.206 8.476 8.73 8.978 9.209 9.439 9.748 10.039 10.301 10.628 10.94 11.226 11.562 11.94 12.308 12.699 13.106 13.535 14.001 14.527 15.127 15.712 16.409 17.208 18.075 19.017 20.037 21.109 22.25 22.927 23.115 23.083 22.921 22.698 22.418 22.129 21.865 21.571 21.309 21.046 20.773 20.519 20.268 20.025 19.764 19.527 19.315 19.092 18.85 18.651 18.442 18.202 17.994 17.766 17.531 17.296 17.061 16.896 16.718 16.426 16.23 16.052 15.955 15.735 15.484 15.198 15.042 14.726 14.487 14.295 14.099 13.676 13.439 13.192 12.902 12.562 12.17 11.632 9.309 -7 ,18880 ,KEBNE ,17024983,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:12 CET,0.0 1.269 1.833 2.351 2.674 2.926 3.176 3.406 3.828 4.023 4.205 4.366 4.661 4.804 5.092 5.358 5.586 5.695 5.918 6.127 6.416 6.599 6.778 7.05 7.306 7.544 7.775 7.997 8.291 8.584 8.861 9.187 9.485 9.767 10.123 10.556 10.953 11.356 11.77 12.209 12.695 13.218 13.807 14.408 15.106 15.842 16.643 17.554 18.545 19.626 20.8 21.586 21.829 21.841 21.743 21.557 21.337 21.099 20.861 20.605 20.346 20.104 19.863 19.588 19.314 19.067 18.821 18.607 18.416 18.202 17.969 17.777 17.583 17.369 17.193 17.011 16.828 16.635 16.419 16.263 16.094 15.825 15.624 15.42 15.317 15.084 14.84 14.592 14.459 14.165 13.916 13.714 13.526 13.132 12.909 12.643 12.351 12.02 11.671 11.161 8.861 -8 ,16227 ,KEBNE ,17024984,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:09 CET,0.0 2.46 3.028 3.411 3.711 3.957 4.184 4.406 4.799 4.975 5.151 5.317 5.607 5.744 6.015 6.266 6.519 6.645 6.883 7.11 7.426 7.618 7.799 8.069 8.32 8.555 8.781 9.002 9.293 9.557 9.819 10.148 10.455 10.737 11.074 11.47 11.829 12.202 12.614 13.051 13.479 13.961 14.543 15.136 15.817 16.565 17.421 18.295 19.229 20.302 21.455 22.117 22.318 22.298 22.199 22.043 21.826 21.603 21.381 21.101 20.848 20.595 20.344 20.117 19.858 19.615 19.372 19.14 18.945 18.733 18.508 18.323 18.127 17.921 17.754 17.58 17.391 17.205 17.028 16.886 16.728 16.48 16.311 16.136 16.043 15.86 15.659 15.416 15.284 15.015 14.876 14.718 14.557 14.199 13.998 13.741 13.439 13.137 12.777 12.223 9.751 -9 ,16156 ,KEBNE ,17024985,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:55:17 CET,0.0 2.558 3.153 3.607 3.943 4.216 4.453 4.663 5.056 5.226 5.389 5.564 5.862 5.986 6.251 6.515 6.749 6.866 7.097 7.311 7.601 7.786 7.971 8.239 8.498 8.751 8.988 9.205 9.48 9.735 9.983 10.3 10.602 10.899 11.243 11.629 12.003 12.399 12.816 13.26 13.719 14.222 14.785 15.343 16.01 16.73 17.542 18.432 19.404 20.452 21.524 22.128 22.268 22.27 22.185 22.028 21.826 21.59 21.353 21.076 20.796 20.542 20.303 20.066 19.837 19.619 19.402 19.201 18.996 18.771 18.544 18.354 18.159 17.942 17.763 17.581 17.39 17.194 16.979 16.833 16.694 16.455 16.283 16.106 16.008 15.777 15.523 15.269 15.139 14.859 14.693 14.533 14.366 13.968 13.713 13.422 13.088 12.732 12.311 11.687 8.932 -10 ,13597 ,KEBNE ,17024986,Wed Dec 22 11:21:07 CET,Wed Dec 22 12:56:57 CET,0.0 2.115 2.682 3.092 3.374 3.654 3.921 4.144 4.564 4.767 4.96 5.164 5.48 5.636 5.938 6.216 6.449 6.564 6.798 7.0 7.284 7.47 7.657 7.944 8.212 8.48 8.741 8.971 9.278 9.575 9.835 10.151 10.439 10.711 11.046 11.424 11.757 12.12 12.54 12.984 13.451 13.974 14.581 15.174 15.841 16.589 17.432 18.358 19.398 20.52 21.717 22.421 22.599 22.552 22.394 22.183 21.989 21.778 21.547 21.274 21.007 20.766 20.531 20.301 20.059 19.822 19.571 19.331 19.124 18.902 18.669 18.485 18.286 18.078 17.902 17.707 17.507 17.298 17.081 16.922 16.761 16.498 16.296 16.08 15.968 15.744 15.515 15.281 15.153 14.874 14.719 14.565 14.403 14.052 13.837 13.573 13.291 13.003 12.65 12.157 10.753 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_45_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_45_42.txt deleted file mode 100644 index 55b9db14..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_45_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10027 ,TETRA ,17559773,Sat Nov 27 08:59:18 CET,Sat Nov 27 10:50:01 CET,0.0 1.416 1.829 2.104 2.328 2.539 2.732 2.911 3.222 3.356 3.482 3.591 3.851 3.957 4.176 4.383 4.57 4.657 4.82 4.982 5.226 5.373 5.512 5.713 5.909 6.111 6.303 6.481 6.716 6.952 7.179 7.449 7.693 7.921 8.184 8.479 8.774 9.091 9.394 9.701 10.03 10.4 10.816 11.228 11.696 12.182 12.689 13.253 13.87 14.46 14.975 15.084 14.926 14.666 14.333 13.976 13.629 13.286 12.967 12.617 12.288 12.004 11.736 11.474 11.203 10.941 10.672 10.443 10.226 9.997 9.771 9.573 9.375 9.185 9.029 8.86 8.681 8.474 8.259 8.098 7.926 7.666 7.472 7.27 7.177 6.981 6.752 6.504 6.382 6.12 5.978 5.827 5.649 5.199 4.974 4.766 4.547 4.327 4.068 3.685 2.182 -2 ,28707 ,TETRA ,17559774,Sat Nov 27 08:59:17 CET,Sat Nov 27 10:51:34 CET,0.0 1.017 1.456 1.724 1.972 2.206 2.421 2.603 2.917 3.062 3.188 3.278 3.545 3.662 3.879 4.088 4.266 4.357 4.538 4.702 4.928 5.075 5.236 5.477 5.696 5.901 6.084 6.248 6.475 6.692 6.896 7.152 7.393 7.616 7.861 8.137 8.405 8.694 9.001 9.308 9.619 9.991 10.405 10.793 11.242 11.717 12.22 12.751 13.331 13.931 14.429 14.535 14.405 14.151 13.799 13.423 13.061 12.675 12.337 12.014 11.716 11.423 11.132 10.876 10.637 10.405 10.148 9.902 9.7 9.487 9.248 9.043 8.816 8.572 8.393 8.21 8.017 7.808 7.577 7.426 7.264 6.984 6.802 6.617 6.521 6.331 6.113 5.857 5.723 5.446 5.319 5.182 5.032 4.701 4.525 4.324 4.066 3.785 3.434 2.933 1.066 -3 ,25009 ,TETRA ,17559775,Sat Nov 27 09:03:18 CET,Sat Nov 27 10:56:34 CET,0.0 1.166 1.567 1.854 2.137 2.376 2.591 2.811 3.223 3.396 3.547 3.675 3.947 4.07 4.286 4.496 4.721 4.833 5.051 5.253 5.497 5.634 5.777 6.006 6.223 6.421 6.608 6.782 6.992 7.186 7.378 7.626 7.864 8.075 8.316 8.589 8.86 9.157 9.472 9.793 10.119 10.468 10.866 11.276 11.742 12.242 12.805 13.419 14.054 14.651 15.186 15.309 15.136 14.842 14.484 14.126 13.779 13.437 13.133 12.8 12.475 12.181 11.889 11.603 11.337 11.102 10.852 10.602 10.383 10.153 9.908 9.71 9.507 9.286 9.118 8.941 8.753 8.563 8.357 8.208 8.047 7.797 7.623 7.441 7.346 7.144 6.925 6.706 6.592 6.321 6.165 6.013 5.861 5.528 5.326 5.097 4.858 4.596 4.266 3.817 2.359 -4 ,19422 ,TETRA ,17559776,Sat Nov 27 09:04:17 CET,Sat Nov 27 10:56:36 CET,0.0 1.52 2.036 2.384 2.665 2.899 3.103 3.284 3.638 3.797 3.941 4.078 4.354 4.478 4.711 4.929 5.136 5.239 5.43 5.61 5.868 6.037 6.201 6.426 6.639 6.833 7.025 7.23 7.492 7.726 7.949 8.23 8.495 8.733 9.005 9.309 9.597 9.915 10.251 10.601 10.96 11.358 11.815 12.257 12.765 13.293 13.854 14.459 15.105 15.761 16.322 16.466 16.263 15.921 15.546 15.139 14.726 14.346 14.018 13.683 13.374 13.062 12.761 12.466 12.188 11.932 11.652 11.409 11.186 10.951 10.724 10.548 10.359 10.141 9.969 9.797 9.621 9.432 9.244 9.102 8.938 8.687 8.515 8.328 8.231 8.029 7.825 7.604 7.469 7.184 7.019 6.869 6.709 6.342 6.133 5.91 5.68 5.435 5.134 4.701 3.048 -5 ,24734 ,TETRA ,17559777,Sat Nov 27 09:05:18 CET,Sat Nov 27 10:53:22 CET,0.0 1.158 1.544 1.911 2.232 2.479 2.667 2.827 3.106 3.252 3.392 3.491 3.768 3.898 4.133 4.338 4.528 4.629 4.832 5.02 5.28 5.438 5.586 5.809 6.018 6.22 6.423 6.598 6.813 7.023 7.238 7.516 7.775 8.01 8.264 8.543 8.801 9.077 9.384 9.703 10.015 10.376 10.803 11.207 11.676 12.168 12.714 13.289 13.874 14.463 14.915 14.98 14.818 14.577 14.278 13.92 13.577 13.244 12.936 12.592 12.259 11.97 11.694 11.41 11.127 10.863 10.581 10.326 10.104 9.87 9.622 9.407 9.194 8.981 8.801 8.604 8.402 8.197 7.978 7.822 7.672 7.458 7.277 7.079 6.98 6.759 6.53 6.29 6.162 5.892 5.736 5.571 5.408 5.009 4.785 4.547 4.284 3.988 3.597 3.111 1.013 -6 ,6316 ,TETRA ,17559778,Sat Nov 27 09:06:18 CET,Sat Nov 27 11:03:04 CET,0.0 1.026 1.424 1.727 1.967 2.174 2.378 2.565 2.87 3.019 3.153 3.251 3.511 3.616 3.822 4.014 4.195 4.284 4.453 4.617 4.87 5.027 5.164 5.371 5.564 5.742 5.916 6.087 6.313 6.521 6.718 6.956 7.185 7.408 7.67 7.956 8.208 8.484 8.771 9.059 9.382 9.75 10.167 10.576 11.038 11.536 12.079 12.636 13.266 13.922 14.424 14.555 14.394 14.063 13.716 13.364 12.993 12.639 12.32 11.982 11.659 11.358 11.099 10.85 10.604 10.361 10.098 9.878 9.678 9.453 9.22 9.019 8.81 8.591 8.421 8.241 8.045 7.838 7.631 7.496 7.355 7.13 6.971 6.812 6.724 6.524 6.31 6.083 5.963 5.709 5.6 5.457 5.309 4.984 4.807 4.617 4.387 4.104 3.744 3.268 2.109 -7 ,23311 ,TETRA ,17559779,Sat Nov 27 09:07:20 CET,Sat Nov 27 10:58:47 CET,0.0 1.758 2.17 2.547 2.85 3.085 3.293 3.487 3.819 3.972 4.114 4.251 4.534 4.665 4.889 5.092 5.293 5.387 5.566 5.748 5.993 6.135 6.265 6.451 6.636 6.805 6.968 7.132 7.352 7.569 7.763 8.001 8.242 8.462 8.717 9.001 9.26 9.529 9.816 10.13 10.447 10.783 11.171 11.564 11.999 12.478 13.019 13.569 14.187 14.811 15.344 15.463 15.311 15.034 14.682 14.321 13.974 13.62 13.272 12.937 12.65 12.376 12.111 11.846 11.59 11.347 11.077 10.833 10.628 10.41 10.175 9.974 9.76 9.531 9.35 9.163 8.968 8.772 8.577 8.441 8.295 8.044 7.865 7.68 7.582 7.397 7.193 6.947 6.811 6.526 6.373 6.222 6.062 5.703 5.5 5.289 5.058 4.785 4.419 3.916 2.221 -8 ,29357 ,TETRA ,17559780,Sat Nov 27 09:07:20 CET,Sat Nov 27 10:59:06 CET,0.0 1.233 1.684 2.018 2.311 2.582 2.823 3.0 3.3 3.455 3.596 3.709 3.971 4.087 4.283 4.464 4.633 4.714 4.884 5.051 5.291 5.439 5.577 5.778 5.973 6.166 6.339 6.518 6.763 6.98 7.192 7.436 7.665 7.888 8.137 8.414 8.684 8.982 9.289 9.629 9.984 10.347 10.763 11.175 11.626 12.109 12.654 13.227 13.846 14.473 15.018 15.123 14.932 14.625 14.28 13.912 13.552 13.209 12.903 12.576 12.262 11.972 11.705 11.45 11.203 10.986 10.751 10.517 10.302 10.083 9.847 9.647 9.439 9.218 9.047 8.871 8.693 8.506 8.301 8.154 8.001 7.75 7.569 7.383 7.29 7.099 6.899 6.681 6.557 6.285 6.165 6.028 5.859 5.463 5.247 5.019 4.783 4.516 4.207 3.739 2.346 -9 ,14446 ,TETRA ,17559781,Sat Nov 27 09:07:21 CET,Sat Nov 27 10:59:27 CET,0.0 1.039 1.452 1.777 2.057 2.301 2.525 2.738 3.119 3.279 3.419 3.535 3.799 3.923 4.152 4.36 4.547 4.635 4.807 4.962 5.202 5.363 5.505 5.715 5.921 6.101 6.279 6.455 6.68 6.9 7.112 7.354 7.581 7.808 8.063 8.333 8.595 8.903 9.223 9.527 9.843 10.182 10.584 11.004 11.471 11.964 12.478 13.033 13.641 14.229 14.672 14.707 14.52 14.25 13.917 13.554 13.206 12.866 12.557 12.226 11.919 11.614 11.314 11.042 10.791 10.563 10.305 10.073 9.875 9.647 9.401 9.201 8.997 8.773 8.604 8.432 8.243 8.039 7.835 7.692 7.534 7.29 7.116 6.915 6.801 6.573 6.345 6.102 5.972 5.697 5.522 5.357 5.198 4.868 4.675 4.436 4.16 3.861 3.489 2.929 0.967 -10 ,18721 ,TETRA ,17559782,Sat Nov 27 09:08:17 CET,Sat Nov 27 10:51:33 CET,0.0 1.35 1.814 2.17 2.429 2.632 2.801 2.955 3.287 3.447 3.582 3.694 3.951 4.06 4.273 4.472 4.66 4.744 4.907 5.074 5.309 5.455 5.603 5.82 6.021 6.218 6.403 6.592 6.855 7.088 7.287 7.543 7.808 8.042 8.287 8.553 8.806 9.088 9.383 9.687 10.026 10.413 10.845 11.272 11.743 12.203 12.703 13.264 13.856 14.428 14.86 14.926 14.742 14.435 14.074 13.74 13.434 13.101 12.785 12.45 12.144 11.866 11.605 11.337 11.077 10.85 10.613 10.403 10.209 9.999 9.786 9.599 9.402 9.187 9.021 8.849 8.65 8.435 8.214 8.056 7.884 7.618 7.424 7.222 7.121 6.903 6.678 6.444 6.306 6.02 5.873 5.724 5.551 5.164 4.96 4.741 4.494 4.204 3.874 3.449 1.893 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_46_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_46_43.txt deleted file mode 100644 index c4e3c413..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_46_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24166 ,TETRA ,17559783,Sat Nov 27 09:09:19 CET,Sat Nov 27 11:00:13 CET,0.0 0.92 1.345 1.613 1.833 2.035 2.218 2.397 2.706 2.845 2.982 3.088 3.363 3.476 3.686 3.879 4.061 4.15 4.325 4.492 4.736 4.898 5.056 5.277 5.487 5.696 5.895 6.076 6.318 6.553 6.776 7.072 7.344 7.581 7.852 8.144 8.428 8.752 9.099 9.455 9.824 10.246 10.728 11.201 11.732 12.305 12.972 13.686 14.487 15.382 16.317 16.835 16.957 16.88 16.699 16.473 16.241 15.999 15.757 15.498 15.283 15.083 14.863 14.648 14.44 14.243 14.023 13.823 13.655 13.474 13.264 13.098 12.93 12.743 12.607 12.464 12.317 12.157 11.974 11.853 11.731 11.532 11.388 11.241 11.163 11.006 10.849 10.659 10.558 10.302 10.195 10.058 9.921 9.612 9.429 9.22 8.995 8.752 8.426 7.975 6.935 -2 ,10777 ,TETRA ,17559784,Sat Nov 27 09:09:19 CET,Sat Nov 27 10:59:47 CET,0.0 1.216 1.619 1.896 2.153 2.378 2.572 2.745 3.049 3.184 3.314 3.413 3.696 3.809 4.028 4.228 4.415 4.509 4.688 4.859 5.103 5.256 5.408 5.634 5.85 6.054 6.244 6.423 6.663 6.892 7.109 7.368 7.61 7.84 8.111 8.422 8.71 9.021 9.361 9.725 10.107 10.525 11.011 11.483 12.019 12.623 13.288 13.981 14.728 15.574 16.505 17.038 17.174 17.107 16.945 16.76 16.564 16.334 16.124 15.9 15.666 15.457 15.252 15.046 14.849 14.663 14.444 14.219 14.026 13.831 13.637 13.488 13.327 13.139 12.987 12.839 12.682 12.512 12.341 12.228 12.103 11.882 11.73 11.591 11.513 11.345 11.173 10.97 10.863 10.609 10.524 10.393 10.254 9.944 9.773 9.595 9.412 9.202 8.923 8.467 7.401 -3 ,12454 ,TETRA ,17559785,Sat Nov 27 09:09:19 CET,Sat Nov 27 10:55:39 CET,0.0 1.065 1.562 1.928 2.236 2.461 2.642 2.828 3.169 3.314 3.454 3.545 3.813 3.923 4.126 4.317 4.514 4.612 4.799 4.983 5.255 5.414 5.557 5.765 5.964 6.168 6.362 6.543 6.785 7.011 7.229 7.493 7.736 7.983 8.28 8.59 8.88 9.209 9.556 9.91 10.282 10.686 11.141 11.604 12.149 12.729 13.4 14.141 14.963 15.841 16.732 17.215 17.302 17.255 17.116 16.907 16.673 16.421 16.206 15.972 15.73 15.504 15.273 15.039 14.817 14.615 14.414 14.235 14.072 13.892 13.702 13.535 13.349 13.144 12.977 12.82 12.669 12.506 12.322 12.195 12.073 11.88 11.752 11.619 11.537 11.357 11.169 10.976 10.875 10.621 10.557 10.433 10.295 9.994 9.832 9.672 9.509 9.302 8.995 8.557 7.355 -4 ,12174 ,TETRA ,17559786,Sat Nov 27 09:09:19 CET,Sat Nov 27 10:55:52 CET,0.0 1.291 1.75 2.102 2.397 2.639 2.839 2.999 3.284 3.439 3.615 3.794 4.101 4.245 4.514 4.773 4.984 5.076 5.263 5.447 5.699 5.862 6.024 6.253 6.475 6.692 6.91 7.112 7.355 7.579 7.814 8.117 8.397 8.647 8.923 9.248 9.553 9.883 10.242 10.603 10.976 11.393 11.874 12.349 12.893 13.488 14.163 14.924 15.778 16.632 17.426 17.932 18.147 18.179 18.081 17.882 17.669 17.456 17.265 17.068 16.875 16.679 16.456 16.238 16.058 15.886 15.695 15.532 15.39 15.233 15.073 14.928 14.777 14.611 14.466 14.318 14.151 13.934 13.694 13.541 13.385 13.164 13.028 12.879 12.794 12.618 12.435 12.242 12.142 11.885 11.804 11.674 11.534 11.224 11.074 10.912 10.723 10.532 10.302 9.938 8.795 -5 ,1361 ,TETRA ,17559787,Sat Nov 27 09:10:17 CET,Sat Nov 27 11:00:18 CET,0.0 1.059 1.385 1.627 1.853 2.07 2.253 2.416 2.743 2.907 3.042 3.097 3.361 3.478 3.699 3.886 4.059 4.149 4.325 4.505 4.768 4.916 5.058 5.264 5.463 5.649 5.839 6.027 6.263 6.489 6.714 6.988 7.244 7.494 7.79 8.123 8.434 8.778 9.127 9.491 9.887 10.321 10.833 11.326 11.851 12.424 13.09 13.787 14.543 15.45 16.373 16.851 16.989 16.949 16.819 16.614 16.366 16.126 15.898 15.604 15.341 15.136 14.925 14.718 14.51 14.299 14.08 13.875 13.702 13.526 13.322 13.148 12.977 12.802 12.665 12.514 12.352 12.184 11.998 11.861 11.727 11.521 11.362 11.2 11.122 10.954 10.769 10.581 10.479 10.215 10.115 9.989 9.857 9.573 9.424 9.261 9.092 8.877 8.606 8.218 7.209 -6 ,740 ,TETRA ,17559788,Sat Nov 27 09:10:17 CET,Sat Nov 27 11:01:47 CET,0.0 0.897 1.299 1.576 1.825 2.044 2.237 2.426 2.76 2.911 3.058 3.163 3.445 3.563 3.788 4.002 4.205 4.296 4.474 4.651 4.897 5.059 5.215 5.442 5.645 5.831 6.023 6.209 6.446 6.68 6.908 7.18 7.439 7.682 7.97 8.288 8.593 8.924 9.248 9.6 9.972 10.373 10.818 11.266 11.796 12.368 13.013 13.728 14.507 15.363 16.285 16.819 16.93 16.863 16.686 16.471 16.244 16.006 15.764 15.51 15.292 15.072 14.83 14.586 14.375 14.19 13.994 13.807 13.63 13.45 13.264 13.102 12.922 12.734 12.593 12.445 12.285 12.125 11.953 11.825 11.698 11.503 11.363 11.204 11.125 10.971 10.808 10.621 10.512 10.246 10.172 10.062 9.95 9.648 9.473 9.295 9.091 8.875 8.618 8.242 7.413 -7 ,16082 ,TETRA ,17559789,Sat Nov 27 09:10:17 CET,Sat Nov 27 11:00:10 CET,0.0 0.765 1.119 1.423 1.691 1.906 2.124 2.32 2.633 2.781 2.916 2.999 3.278 3.404 3.632 3.831 4.019 4.116 4.304 4.48 4.747 4.91 5.062 5.293 5.514 5.718 5.903 6.08 6.315 6.537 6.745 6.998 7.24 7.479 7.761 8.066 8.365 8.704 9.054 9.416 9.775 10.187 10.674 11.145 11.709 12.311 12.973 13.715 14.527 15.375 16.248 16.747 16.869 16.805 16.648 16.477 16.259 16.013 15.788 15.548 15.338 15.129 14.923 14.726 14.54 14.348 14.139 13.962 13.798 13.613 13.42 13.251 13.075 12.902 12.769 12.622 12.456 12.282 12.096 11.962 11.827 11.624 11.484 11.332 11.249 11.095 10.931 10.729 10.62 10.362 10.296 10.186 10.056 9.75 9.59 9.395 9.166 8.892 8.548 8.112 7.05 -8 ,11813 ,TETRA ,17559790,Sat Nov 27 09:11:18 CET,Sat Nov 27 11:03:02 CET,0.0 1.142 1.621 2.012 2.346 2.653 2.92 3.122 3.479 3.65 3.821 3.972 4.275 4.399 4.629 4.852 5.062 5.155 5.325 5.491 5.732 5.88 6.021 6.234 6.444 6.636 6.819 7.003 7.24 7.464 7.687 7.947 8.178 8.402 8.665 8.966 9.263 9.578 9.914 10.277 10.655 11.075 11.563 12.013 12.526 13.114 13.799 14.549 15.339 16.168 17.029 17.52 17.614 17.541 17.425 17.264 17.032 16.801 16.59 16.354 16.143 15.938 15.733 15.536 15.345 15.162 14.958 14.765 14.596 14.418 14.231 14.082 13.914 13.724 13.575 13.424 13.259 13.087 12.914 12.791 12.657 12.436 12.278 12.121 12.043 11.872 11.699 11.514 11.409 11.144 11.076 10.958 10.834 10.549 10.388 10.227 10.041 9.813 9.512 9.116 8.184 -9 ,30817 ,TETRA ,17559791,Sat Nov 27 09:11:19 CET,Sat Nov 27 11:02:43 CET,0.0 0.85 1.28 1.618 1.86 2.071 2.276 2.45 2.754 2.897 3.043 3.156 3.438 3.554 3.774 3.984 4.179 4.276 4.462 4.624 4.855 5.007 5.163 5.382 5.588 5.785 5.98 6.18 6.44 6.662 6.864 7.119 7.366 7.599 7.874 8.191 8.474 8.771 9.114 9.489 9.856 10.263 10.73 11.187 11.722 12.32 13.017 13.768 14.574 15.457 16.362 16.865 16.99 16.94 16.789 16.596 16.387 16.161 15.905 15.642 15.432 15.218 15.024 14.84 14.648 14.469 14.287 14.113 13.958 13.802 13.646 13.518 13.371 13.206 13.075 12.941 12.795 12.645 12.492 12.373 12.24 11.983 11.784 11.592 11.491 11.293 11.118 10.951 10.859 10.608 10.554 10.436 10.303 10.003 9.825 9.633 9.437 9.196 8.899 8.467 7.233 -10 ,22132 ,TETRA ,17559792,Sat Nov 27 09:11:19 CET,Sat Nov 27 10:50:03 CET,0.0 1.381 1.783 2.08 2.343 2.562 2.772 2.974 3.283 3.408 3.531 3.61 3.882 4.007 4.262 4.497 4.712 4.827 5.055 5.271 5.603 5.814 6.011 6.299 6.572 6.846 7.118 7.364 7.668 7.96 8.252 8.608 8.904 9.149 9.411 9.713 10.028 10.368 10.715 11.086 11.467 11.875 12.361 12.835 13.375 13.959 14.594 15.266 16.048 16.954 17.866 18.404 18.516 18.444 18.302 18.102 17.893 17.672 17.465 17.254 17.03 16.803 16.577 16.368 16.185 15.994 15.769 15.555 15.381 15.201 15.009 14.853 14.689 14.513 14.372 14.226 14.071 13.911 13.745 13.627 13.49 13.238 13.055 12.864 12.76 12.536 12.305 12.077 11.964 11.694 11.603 11.481 11.368 11.107 10.953 10.78 10.573 10.327 10.048 9.694 8.783 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_47_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_47_43.txt deleted file mode 100644 index 3ff6042e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_47_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29914 ,TETRA ,17559793,Sat Nov 27 09:13:18 CET,Sat Nov 27 11:02:51 CET,0.0 0.904 1.297 1.638 1.925 2.184 2.416 2.606 2.953 3.117 3.262 3.359 3.65 3.775 4.012 4.243 4.488 4.61 4.836 5.047 5.365 5.575 5.767 6.033 6.286 6.535 6.773 7.007 7.313 7.599 7.859 8.165 8.48 8.769 9.095 9.467 9.804 10.177 10.597 11.025 11.462 11.974 12.565 13.149 13.817 14.494 15.294 16.196 17.175 18.238 19.39 20.154 20.384 20.376 20.262 20.117 19.913 19.684 19.458 19.204 18.999 18.789 18.569 18.365 18.161 17.957 17.748 17.568 17.401 17.219 17.027 16.87 16.708 16.522 16.36 16.194 16.019 15.835 15.658 15.536 15.399 15.169 15.013 14.859 14.777 14.592 14.402 14.208 14.106 13.844 13.753 13.634 13.498 13.199 13.033 12.838 12.636 12.411 12.151 11.776 10.908 -2 ,11569 ,TETRA ,17559794,Sat Nov 27 09:12:17 CET,Sat Nov 27 11:01:45 CET,0.0 1.328 1.759 2.068 2.345 2.582 2.785 2.969 3.29 3.443 3.596 3.723 4.026 4.159 4.41 4.648 4.878 4.991 5.19 5.381 5.667 5.847 6.027 6.294 6.538 6.769 6.991 7.21 7.499 7.777 8.055 8.385 8.684 8.971 9.305 9.683 10.033 10.433 10.889 11.351 11.808 12.324 12.924 13.514 14.19 14.935 15.766 16.664 17.651 18.742 19.867 20.519 20.704 20.64 20.476 20.266 20.067 19.859 19.621 19.351 19.112 18.893 18.673 18.44 18.209 17.988 17.753 17.543 17.365 17.186 16.988 16.82 16.663 16.487 16.339 16.192 16.037 15.874 15.703 15.572 15.432 15.206 15.059 14.919 14.844 14.694 14.53 14.353 14.25 13.987 13.913 13.782 13.626 13.299 13.134 12.937 12.727 12.509 12.226 11.724 10.42 -3 ,8197 ,TETRA ,17559795,Sat Nov 27 09:12:20 CET,Sat Nov 27 11:01:45 CET,0.0 0.779 1.17 1.483 1.752 1.991 2.22 2.443 2.838 3.003 3.142 3.261 3.576 3.713 3.951 4.176 4.396 4.506 4.73 4.939 5.224 5.42 5.624 5.894 6.13 6.358 6.578 6.775 7.031 7.279 7.51 7.799 8.074 8.338 8.649 8.992 9.312 9.672 10.072 10.503 10.927 11.399 11.962 12.539 13.232 13.978 14.831 15.768 16.756 17.767 18.758 19.285 19.337 19.201 19.027 18.852 18.668 18.472 18.271 18.034 17.813 17.618 17.422 17.201 16.968 16.756 16.53 16.303 16.106 15.918 15.734 15.58 15.406 15.233 15.095 14.928 14.759 14.578 14.373 14.234 14.101 13.879 13.719 13.554 13.467 13.297 13.117 12.925 12.817 12.534 12.466 12.346 12.212 11.911 11.753 11.583 11.375 11.135 10.852 10.358 9.178 -4 ,6148 ,TETRA ,17559796,Sat Nov 27 09:12:17 CET,Sat Nov 27 11:03:08 CET,0.0 0.748 1.181 1.504 1.752 1.97 2.171 2.367 2.741 2.921 3.088 3.209 3.501 3.634 3.91 4.175 4.424 4.543 4.787 5.01 5.307 5.51 5.72 5.997 6.219 6.446 6.684 6.906 7.196 7.481 7.754 8.069 8.38 8.683 9.02 9.391 9.746 10.16 10.605 11.055 11.529 12.035 12.604 13.193 13.877 14.634 15.451 16.305 17.292 18.34 19.463 20.243 20.446 20.379 20.201 19.967 19.716 19.465 19.187 18.866 18.588 18.326 18.067 17.81 17.554 17.318 17.075 16.844 16.644 16.431 16.183 15.974 15.766 15.561 15.402 15.221 15.02 14.808 14.58 14.429 14.276 14.024 13.843 13.653 13.556 13.36 13.155 12.954 12.846 12.571 12.448 12.298 12.144 11.818 11.645 11.454 11.22 10.922 10.588 10.21 9.427 -5 ,27671 ,TETRA ,17559797,Sat Nov 27 09:13:19 CET,Sat Nov 27 11:03:26 CET,0.0 0.987 1.357 1.665 1.926 2.163 2.377 2.578 2.918 3.068 3.213 3.321 3.628 3.772 4.041 4.286 4.507 4.613 4.821 5.03 5.352 5.555 5.737 6.005 6.264 6.516 6.768 7.008 7.308 7.59 7.857 8.184 8.496 8.796 9.134 9.498 9.85 10.256 10.677 11.109 11.573 12.067 12.645 13.251 13.949 14.726 15.574 16.454 17.407 18.436 19.559 20.263 20.372 20.263 20.106 19.871 19.615 19.346 19.085 18.802 18.528 18.25 17.975 17.724 17.484 17.257 16.997 16.76 16.542 16.306 16.071 15.874 15.676 15.472 15.31 15.137 14.93 14.715 14.502 14.352 14.19 13.944 13.774 13.59 13.499 13.311 13.094 12.862 12.752 12.483 12.37 12.222 12.068 11.712 11.519 11.313 11.09 10.855 10.553 10.13 8.735 -6 ,17 ,TETRA ,17559798,Sat Nov 27 09:13:21 CET,Sat Nov 27 11:02:51 CET,0.0 1.161 1.567 1.865 2.159 2.429 2.646 2.832 3.149 3.315 3.479 3.624 3.934 4.067 4.34 4.594 4.838 4.951 5.162 5.376 5.673 5.859 6.047 6.309 6.552 6.793 7.024 7.251 7.551 7.826 8.086 8.404 8.7 8.979 9.319 9.719 10.089 10.484 10.905 11.339 11.789 12.296 12.881 13.472 14.15 14.889 15.72 16.611 17.627 18.695 19.783 20.393 20.521 20.46 20.263 20.005 19.748 19.462 19.186 18.898 18.615 18.338 18.056 17.782 17.553 17.357 17.135 16.922 16.725 16.522 16.318 16.143 15.958 15.756 15.595 15.436 15.282 15.114 14.921 14.782 14.635 14.387 14.224 14.079 14.004 13.835 13.655 13.465 13.361 13.101 13.018 12.878 12.731 12.424 12.241 12.042 11.849 11.627 11.378 11.024 10.286 -7 ,28602 ,TETRA ,17559799,Sat Nov 27 09:13:18 CET,Sat Nov 27 11:03:55 CET,0.0 0.917 1.287 1.643 1.951 2.145 2.33 2.516 2.845 2.996 3.15 3.274 3.563 3.694 3.954 4.202 4.434 4.543 4.746 4.955 5.268 5.44 5.594 5.823 6.041 6.249 6.457 6.655 6.915 7.176 7.425 7.725 8.011 8.304 8.643 9.017 9.374 9.737 10.116 10.518 10.943 11.434 11.992 12.549 13.187 13.872 14.669 15.522 16.488 17.612 18.803 19.462 19.61 19.529 19.321 19.043 18.773 18.511 18.257 17.984 17.724 17.473 17.215 16.958 16.718 16.48 16.234 16.002 15.789 15.582 15.356 15.155 14.933 14.704 14.54 14.367 14.182 13.992 13.776 13.625 13.471 13.241 13.077 12.892 12.794 12.6 12.403 12.186 12.073 11.795 11.662 11.512 11.367 11.068 10.887 10.669 10.411 10.135 9.83 9.433 8.604 -8 ,28616 ,TETRA ,17559800,Sat Nov 27 09:13:18 CET,Sat Nov 27 11:03:37 CET,0.0 1.0 1.361 1.676 1.948 2.188 2.42 2.62 2.973 3.144 3.313 3.472 3.773 3.902 4.169 4.418 4.641 4.744 4.949 5.158 5.441 5.633 5.815 6.069 6.334 6.579 6.797 7.024 7.319 7.591 7.875 8.213 8.514 8.816 9.172 9.552 9.917 10.31 10.722 11.18 11.663 12.18 12.781 13.373 14.027 14.773 15.626 16.546 17.587 18.698 19.807 20.451 20.66 20.648 20.487 20.249 19.97 19.669 19.385 19.099 18.819 18.558 18.323 18.091 17.853 17.62 17.362 17.122 16.915 16.691 16.444 16.233 16.011 15.792 15.627 15.45 15.261 15.065 14.852 14.695 14.531 14.274 14.101 13.921 13.824 13.614 13.4 13.174 13.05 12.777 12.686 12.544 12.389 12.049 11.869 11.668 11.439 11.199 10.921 10.512 9.717 -9 ,9202 ,TETRA ,17559801,Sat Nov 27 09:13:18 CET,Sat Nov 27 11:03:06 CET,0.0 0.729 1.08 1.39 1.667 1.894 2.091 2.276 2.616 2.778 2.924 3.047 3.357 3.495 3.759 4.004 4.234 4.339 4.536 4.739 5.037 5.223 5.398 5.666 5.933 6.182 6.417 6.651 6.951 7.226 7.495 7.822 8.123 8.412 8.759 9.145 9.509 9.92 10.364 10.827 11.293 11.798 12.406 12.995 13.643 14.383 15.26 16.206 17.174 18.221 19.32 19.95 20.131 20.08 19.909 19.682 19.401 19.101 18.837 18.548 18.275 18.011 17.753 17.517 17.295 17.086 16.838 16.607 16.402 16.175 15.937 15.75 15.558 15.336 15.154 14.963 14.763 14.573 14.376 14.231 14.073 13.851 13.713 13.569 13.496 13.335 13.168 12.998 12.906 12.654 12.572 12.448 12.319 12.035 11.887 11.729 11.54 11.305 11.038 10.667 9.732 -10 ,7424 ,TETRA ,17559802,Sat Nov 27 09:14:17 CET,Sat Nov 27 11:04:30 CET,0.0 1.204 1.601 1.919 2.191 2.416 2.623 2.819 3.19 3.357 3.52 3.657 3.958 4.082 4.314 4.548 4.792 4.915 5.143 5.354 5.64 5.818 6.003 6.278 6.532 6.769 7.006 7.233 7.524 7.809 8.089 8.408 8.7 8.997 9.334 9.71 10.064 10.435 10.846 11.304 11.782 12.315 12.948 13.549 14.208 14.923 15.718 16.607 17.62 18.678 19.752 20.419 20.575 20.538 20.393 20.159 19.909 19.661 19.392 19.1 18.836 18.588 18.34 18.071 17.814 17.576 17.328 17.109 16.91 16.705 16.482 16.271 16.056 15.84 15.659 15.481 15.31 15.109 14.877 14.717 14.558 14.316 14.149 13.974 13.881 13.677 13.467 13.244 13.126 12.849 12.719 12.558 12.381 12.004 11.797 11.601 11.391 11.127 10.818 10.428 9.461 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_48_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_48_42.txt deleted file mode 100644 index a195b048..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_48_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7812 ,TETRA ,17559803,Sat Nov 27 09:15:18 CET,Sat Nov 27 11:04:35 CET,0.0 1.522 2.066 2.467 2.806 3.114 3.397 3.656 4.114 4.324 4.516 4.718 5.044 5.21 5.517 5.795 6.07 6.206 6.468 6.719 7.083 7.31 7.532 7.846 8.128 8.392 8.629 8.86 9.174 9.46 9.73 10.075 10.402 10.704 11.061 11.46 11.825 12.227 12.675 13.16 13.682 14.268 14.922 15.574 16.384 17.296 18.276 19.384 20.672 22.108 23.777 25.04 25.653 25.988 26.148 26.169 26.098 26.011 25.898 25.75 25.614 25.461 25.283 25.088 24.89 24.715 24.539 24.38 24.233 24.084 23.94 23.816 23.69 23.558 23.452 23.343 23.217 23.073 22.922 22.802 22.657 22.431 22.281 22.098 21.998 21.807 21.611 21.396 21.281 21.024 20.892 20.729 20.56 20.233 20.066 19.899 19.725 19.482 19.157 18.721 16.894 -2 ,21890 ,TETRA ,17559804,Sat Nov 27 09:15:18 CET,Sat Nov 27 11:05:11 CET,0.0 1.326 1.83 2.219 2.565 2.865 3.127 3.356 3.793 4.005 4.195 4.341 4.639 4.774 5.022 5.252 5.478 5.598 5.83 6.043 6.361 6.562 6.742 7.002 7.267 7.522 7.764 7.998 8.291 8.57 8.846 9.189 9.514 9.831 10.211 10.621 11.015 11.433 11.87 12.347 12.854 13.419 14.07 14.726 15.495 16.355 17.328 18.411 19.649 21.072 22.699 23.882 24.495 24.821 24.963 24.977 24.941 24.855 24.74 24.585 24.414 24.268 24.107 23.935 23.766 23.599 23.421 23.242 23.092 22.94 22.77 22.622 22.469 22.292 22.15 21.994 21.827 21.657 21.454 21.298 21.15 20.931 20.754 20.557 20.455 20.244 20.015 19.781 19.653 19.369 19.206 19.045 18.872 18.483 18.249 17.99 17.699 17.352 16.948 16.483 14.886 -3 ,18876 ,TETRA ,17559805,Sat Nov 27 09:15:17 CET,Sat Nov 27 11:05:55 CET,0.0 1.857 2.358 2.694 2.965 3.198 3.418 3.632 4.022 4.195 4.363 4.529 4.843 4.988 5.253 5.513 5.748 5.861 6.091 6.302 6.6 6.798 6.982 7.272 7.563 7.803 8.024 8.259 8.573 8.858 9.114 9.421 9.728 10.026 10.38 10.768 11.142 11.549 11.987 12.494 13.009 13.545 14.192 14.856 15.618 16.495 17.524 18.622 19.853 21.307 23.044 24.366 24.993 25.294 25.437 25.49 25.446 25.348 25.241 25.109 24.982 24.852 24.699 24.527 24.358 24.197 23.997 23.813 23.655 23.484 23.312 23.161 22.998 22.824 22.679 22.522 22.356 22.171 21.978 21.847 21.712 21.511 21.361 21.198 21.109 20.913 20.708 20.497 20.382 20.119 20.004 19.866 19.705 19.33 19.135 18.927 18.672 18.339 17.914 17.337 15.956 -4 ,8739 ,TETRA ,17559806,Sat Nov 27 09:16:16 CET,Sat Nov 27 11:05:42 CET,0.0 1.527 1.987 2.353 2.674 2.965 3.193 3.39 3.778 3.977 4.16 4.33 4.647 4.8 5.076 5.334 5.595 5.721 5.951 6.163 6.48 6.678 6.861 7.117 7.361 7.59 7.823 8.062 8.357 8.644 8.929 9.256 9.564 9.861 10.219 10.634 11.031 11.469 11.923 12.393 12.899 13.453 14.095 14.75 15.516 16.397 17.375 18.437 19.708 21.207 22.843 24.094 24.798 25.126 25.244 25.251 25.192 25.087 24.959 24.805 24.67 24.522 24.36 24.199 24.031 23.869 23.688 23.507 23.345 23.181 23.007 22.861 22.702 22.527 22.373 22.208 22.046 21.871 21.687 21.554 21.41 21.194 21.049 20.894 20.815 20.644 20.445 20.231 20.117 19.86 19.743 19.603 19.442 19.085 18.888 18.647 18.381 18.099 17.759 17.311 15.671 -5 ,19098 ,TETRA ,17559807,Sat Nov 27 09:16:16 CET,Sat Nov 27 11:06:20 CET,0.0 1.324 1.794 2.15 2.454 2.742 3.005 3.232 3.637 3.83 4.006 4.146 4.461 4.615 4.888 5.129 5.371 5.494 5.741 5.976 6.299 6.503 6.711 7.008 7.284 7.551 7.811 8.059 8.385 8.697 8.974 9.31 9.646 9.985 10.395 10.84 11.272 11.756 12.256 12.754 13.268 13.852 14.518 15.154 15.9 16.747 17.702 18.766 20.002 21.493 23.285 24.621 25.282 25.579 25.681 25.723 25.687 25.591 25.473 25.305 25.142 24.99 24.811 24.64 24.478 24.317 24.146 23.981 23.825 23.647 23.459 23.312 23.149 22.972 22.836 22.682 22.518 22.349 22.162 22.027 21.888 21.652 21.484 21.314 21.226 21.04 20.843 20.627 20.507 20.228 20.052 19.876 19.684 19.274 19.034 18.765 18.462 18.081 17.614 17.052 15.688 -6 ,6607 ,TETRA ,17559808,Sat Nov 27 09:16:16 CET,Sat Nov 27 11:06:37 CET,0.0 2.259 2.813 3.228 3.572 3.853 4.089 4.302 4.688 4.852 5.002 5.13 5.435 5.578 5.858 6.121 6.371 6.486 6.697 6.899 7.205 7.401 7.593 7.866 8.116 8.364 8.606 8.836 9.132 9.416 9.687 10.021 10.344 10.663 11.038 11.451 11.839 12.268 12.733 13.228 13.759 14.359 15.056 15.762 16.559 17.416 18.411 19.525 20.807 22.302 24.019 25.316 25.938 26.244 26.347 26.356 26.322 26.241 26.134 25.993 25.85 25.709 25.541 25.366 25.202 25.051 24.888 24.733 24.594 24.432 24.241 24.088 23.917 23.717 23.57 23.424 23.269 23.112 22.941 22.815 22.688 22.481 22.32 22.16 22.077 21.89 21.685 21.474 21.359 21.099 20.979 20.833 20.672 20.311 20.11 19.888 19.639 19.324 18.901 18.328 16.814 -7 ,3405 ,TETRA ,17559809,Sat Nov 27 09:16:16 CET,Sat Nov 27 11:04:54 CET,0.0 1.787 2.292 2.66 2.966 3.243 3.496 3.712 4.104 4.282 4.447 4.586 4.901 5.062 5.353 5.62 5.881 6.005 6.243 6.456 6.756 6.954 7.152 7.461 7.758 8.039 8.31 8.587 8.925 9.215 9.496 9.846 10.183 10.496 10.849 11.243 11.625 12.044 12.488 12.959 13.469 14.051 14.746 15.437 16.229 17.106 18.065 19.135 20.417 21.886 23.584 24.812 25.425 25.793 25.95 25.968 25.899 25.797 25.696 25.567 25.417 25.254 25.095 24.94 24.767 24.575 24.344 24.146 23.982 23.812 23.631 23.47 23.31 23.139 22.988 22.833 22.671 22.501 22.337 22.216 22.079 21.886 21.747 21.584 21.498 21.311 21.097 20.866 20.751 20.492 20.389 20.256 20.117 19.82 19.656 19.466 19.242 18.962 18.573 18.075 16.623 -8 ,21446 ,TETRA ,17559810,Sat Nov 27 09:31:01 CET,Sat Nov 27 11:21:28 CET,0.0 1.387 1.88 2.23 2.56 2.855 3.12 3.361 3.753 3.93 4.089 4.244 4.56 4.701 4.963 5.225 5.475 5.588 5.816 6.048 6.363 6.558 6.74 7.001 7.249 7.492 7.724 7.94 8.216 8.487 8.763 9.099 9.429 9.75 10.127 10.524 10.904 11.331 11.775 12.251 12.75 13.301 13.948 14.597 15.356 16.23 17.228 18.309 19.55 20.969 22.611 23.89 24.513 24.771 24.864 24.907 24.878 24.792 24.686 24.543 24.406 24.268 24.121 23.96 23.809 23.642 23.436 23.257 23.091 22.928 22.774 22.631 22.462 22.265 22.118 21.974 21.807 21.631 21.444 21.307 21.16 20.897 20.71 20.534 20.446 20.248 20.044 19.829 19.707 19.443 19.308 19.151 18.988 18.637 18.436 18.212 17.974 17.73 17.455 17.081 16.182 -9 ,14451 ,TETRA ,17559811,Sat Nov 27 09:31:03 CET,Sat Nov 27 11:22:36 CET,0.0 2.041 2.635 3.076 3.442 3.762 4.031 4.285 4.75 4.938 5.113 5.297 5.639 5.811 6.141 6.439 6.708 6.844 7.089 7.321 7.661 7.866 8.052 8.325 8.6 8.852 9.091 9.341 9.672 9.974 10.262 10.614 10.94 11.239 11.576 11.952 12.315 12.728 13.182 13.665 14.201 14.787 15.448 16.126 16.907 17.767 18.787 19.916 21.18 22.629 24.239 25.428 26.056 26.391 26.516 26.525 26.456 26.33 26.196 26.028 25.871 25.715 25.547 25.383 25.21 25.038 24.855 24.68 24.521 24.366 24.188 24.026 23.861 23.678 23.531 23.374 23.2 23.02 22.835 22.699 22.543 22.299 22.142 21.974 21.883 21.692 21.486 21.26 21.127 20.853 20.733 20.584 20.419 20.015 19.771 19.506 19.202 18.843 18.402 17.843 16.303 -10 ,12836 ,TETRA ,17559812,Sat Nov 27 09:31:02 CET,Sat Nov 27 11:21:26 CET,0.0 2.663 3.314 3.703 4.004 4.273 4.512 4.729 5.172 5.385 5.579 5.796 6.137 6.305 6.615 6.914 7.2 7.33 7.576 7.817 8.16 8.392 8.621 8.922 9.204 9.482 9.746 9.994 10.306 10.596 10.874 11.21 11.53 11.828 12.162 12.561 12.961 13.386 13.837 14.324 14.844 15.414 16.068 16.729 17.522 18.428 19.407 20.476 21.76 23.206 24.915 26.27 26.924 27.227 27.319 27.304 27.266 27.185 27.064 26.923 26.781 26.622 26.454 26.289 26.119 25.968 25.798 25.622 25.454 25.283 25.107 24.953 24.793 24.62 24.477 24.319 24.154 23.971 23.77 23.64 23.502 23.267 23.094 22.904 22.801 22.589 22.369 22.125 21.991 21.711 21.535 21.364 21.187 20.794 20.569 20.307 20.023 19.699 19.261 18.613 16.538 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_49_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_49_50.txt deleted file mode 100644 index a8253d8e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_49_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4365 ,TETRA ,17559813,Sat Nov 27 09:31:02 CET,Sat Nov 27 11:19:46 CET,0.0 0.748 1.086 1.341 1.549 1.705 1.839 1.966 2.224 2.346 2.455 2.516 2.769 2.862 3.023 3.189 3.344 3.412 3.556 3.698 3.89 4.012 4.134 4.321 4.508 4.679 4.847 5.009 5.208 5.405 5.607 5.864 6.116 6.361 6.636 6.918 7.186 7.486 7.805 8.123 8.453 8.822 9.213 9.578 9.977 10.363 10.774 11.215 11.619 11.91 11.968 11.575 10.998 10.432 9.909 9.389 8.891 8.413 7.976 7.536 7.17 6.865 6.586 6.288 5.997 5.736 5.45 5.181 4.946 4.699 4.437 4.232 4.022 3.798 3.623 3.448 3.275 3.099 2.912 2.783 2.642 2.405 2.249 2.093 2.012 1.849 1.682 1.501 1.405 1.157 1.104 1.003 0.897 0.669 0.548 0.415 0.261 0.072 -0.13 -0.359 -0.96 -2 ,12288 ,TETRA ,17559814,Sat Nov 27 09:31:02 CET,Sat Nov 27 11:19:18 CET,0.0 0.733 1.035 1.282 1.525 1.729 1.901 2.05 2.327 2.46 2.591 2.706 2.964 3.063 3.264 3.452 3.626 3.706 3.867 4.032 4.275 4.433 4.574 4.764 4.952 5.139 5.314 5.481 5.697 5.902 6.098 6.326 6.54 6.756 7.009 7.307 7.591 7.876 8.187 8.513 8.834 9.18 9.572 9.949 10.373 10.804 11.236 11.679 12.116 12.422 12.451 12.075 11.547 11.003 10.463 9.947 9.507 9.056 8.638 8.225 7.855 7.506 7.169 6.86 6.573 6.298 5.998 5.736 5.508 5.266 5.017 4.812 4.594 4.367 4.184 3.976 3.772 3.586 3.394 3.259 3.126 2.922 2.773 2.621 2.543 2.377 2.205 2.016 1.918 1.672 1.614 1.508 1.395 1.133 1.003 0.871 0.718 0.545 0.34 0.093 -0.378 -3 ,24485 ,TETRA ,17559815,Sat Nov 27 09:31:02 CET,Sat Nov 27 11:19:50 CET,0.0 0.815 1.151 1.418 1.64 1.839 2.035 2.217 2.523 2.664 2.805 2.931 3.199 3.302 3.495 3.687 3.867 3.952 4.122 4.291 4.535 4.689 4.837 5.039 5.221 5.404 5.583 5.738 5.953 6.172 6.379 6.627 6.868 7.103 7.368 7.652 7.907 8.173 8.464 8.784 9.106 9.447 9.838 10.226 10.632 11.033 11.468 11.914 12.329 12.676 12.779 12.385 11.827 11.234 10.675 10.133 9.64 9.188 8.78 8.341 7.945 7.589 7.245 6.921 6.624 6.355 6.075 5.821 5.59 5.346 5.091 4.892 4.704 4.5 4.336 4.175 4.009 3.837 3.669 3.557 3.435 3.229 3.083 2.934 2.854 2.69 2.522 2.35 2.254 2.006 1.967 1.863 1.745 1.5 1.376 1.237 1.078 0.904 0.729 0.537 0.111 -4 ,8756 ,TETRA ,17559816,Sat Nov 27 09:31:04 CET,Sat Nov 27 11:20:10 CET,0.0 0.865 1.196 1.454 1.672 1.876 2.073 2.247 2.532 2.66 2.797 2.915 3.18 3.29 3.49 3.669 3.852 3.948 4.127 4.288 4.52 4.668 4.813 5.028 5.23 5.412 5.583 5.762 6.003 6.232 6.451 6.715 6.951 7.178 7.451 7.741 8.018 8.307 8.61 8.93 9.255 9.591 9.95 10.322 10.732 11.153 11.605 12.04 12.427 12.677 12.67 12.332 11.829 11.264 10.665 10.078 9.571 9.118 8.721 8.289 7.898 7.545 7.199 6.886 6.602 6.333 6.046 5.772 5.537 5.305 5.053 4.832 4.608 4.385 4.203 4.01 3.816 3.624 3.431 3.297 3.167 2.972 2.833 2.687 2.609 2.448 2.281 2.104 2.011 1.763 1.704 1.598 1.488 1.241 1.109 0.977 0.843 0.692 0.503 0.252 -0.268 -5 ,3837 ,TETRA ,17559817,Sat Nov 27 09:31:02 CET,Sat Nov 27 11:20:05 CET,0.0 0.773 1.127 1.397 1.635 1.833 1.994 2.146 2.429 2.569 2.697 2.771 3.028 3.137 3.343 3.537 3.718 3.803 3.972 4.143 4.379 4.526 4.664 4.853 5.038 5.223 5.405 5.59 5.836 6.062 6.268 6.521 6.781 7.022 7.292 7.597 7.874 8.153 8.454 8.784 9.109 9.467 9.884 10.256 10.661 11.105 11.565 11.986 12.403 12.715 12.755 12.418 11.9 11.341 10.798 10.272 9.78 9.293 8.853 8.41 8.02 7.666 7.329 7.022 6.728 6.459 6.185 5.935 5.719 5.494 5.256 5.06 4.858 4.654 4.505 4.342 4.17 3.994 3.81 3.683 3.553 3.347 3.203 3.058 2.983 2.838 2.682 2.505 2.415 2.172 2.141 2.049 1.939 1.696 1.572 1.448 1.306 1.149 0.98 0.746 0.325 -6 ,29561 ,TETRA ,17559818,Sat Nov 27 09:31:02 CET,Sat Nov 27 11:20:32 CET,0.0 0.828 1.131 1.354 1.573 1.776 1.955 2.132 2.453 2.591 2.716 2.787 3.051 3.164 3.369 3.565 3.748 3.841 4.029 4.206 4.47 4.64 4.81 5.055 5.276 5.49 5.694 5.888 6.136 6.377 6.601 6.866 7.118 7.357 7.638 7.93 8.193 8.483 8.792 9.116 9.437 9.776 10.159 10.536 10.969 11.419 11.86 12.272 12.654 12.967 12.986 12.543 11.973 11.386 10.836 10.285 9.78 9.311 8.895 8.48 8.123 7.793 7.463 7.148 6.858 6.597 6.309 6.035 5.81 5.592 5.362 5.171 4.97 4.764 4.605 4.434 4.261 4.095 3.915 3.783 3.652 3.453 3.318 3.169 3.086 2.916 2.746 2.577 2.485 2.242 2.186 2.084 1.977 1.738 1.604 1.454 1.279 1.092 0.917 0.705 0.374 -7 ,13048 ,TETRA ,17559819,Sat Nov 27 09:32:00 CET,Sat Nov 27 11:21:26 CET,0.0 0.709 1.003 1.199 1.387 1.564 1.726 1.872 2.12 2.225 2.319 2.368 2.615 2.713 2.91 3.094 3.275 3.367 3.558 3.738 3.967 4.124 4.3 4.539 4.755 4.965 5.172 5.376 5.629 5.859 6.083 6.344 6.594 6.839 7.107 7.396 7.659 7.948 8.265 8.583 8.891 9.231 9.623 10.001 10.427 10.858 11.281 11.7 12.067 12.309 12.3 11.878 11.299 10.67 10.083 9.532 9.034 8.568 8.177 7.76 7.356 7.008 6.691 6.401 6.136 5.892 5.619 5.373 5.169 4.956 4.734 4.532 4.329 4.127 3.971 3.81 3.645 3.468 3.274 3.137 2.987 2.745 2.576 2.416 2.34 2.161 1.966 1.78 1.693 1.458 1.412 1.311 1.21 0.969 0.852 0.732 0.603 0.451 0.267 0.001 -1.081 -8 ,24885 ,TETRA ,17559820,Sat Nov 27 09:33:01 CET,Sat Nov 27 11:21:32 CET,0.0 0.76 1.075 1.347 1.573 1.771 1.952 2.122 2.411 2.529 2.653 2.764 3.023 3.123 3.318 3.501 3.665 3.748 3.927 4.106 4.351 4.498 4.638 4.834 5.029 5.216 5.394 5.574 5.795 5.992 6.185 6.431 6.674 6.91 7.184 7.488 7.776 8.072 8.378 8.712 9.059 9.408 9.786 10.155 10.546 10.94 11.325 11.719 12.166 12.535 12.616 12.25 11.723 11.138 10.575 10.065 9.589 9.131 8.71 8.273 7.899 7.566 7.222 6.878 6.552 6.258 5.974 5.711 5.475 5.237 4.982 4.768 4.555 4.327 4.146 3.959 3.753 3.528 3.303 3.16 3.019 2.789 2.637 2.494 2.419 2.262 2.104 1.937 1.846 1.599 1.548 1.44 1.333 1.12 0.989 0.841 0.672 0.479 0.265 0.024 -0.408 -9 ,15152 ,TETRA ,17559821,Sat Nov 27 09:32:00 CET,Sat Nov 27 11:20:38 CET,0.0 0.702 1.026 1.258 1.457 1.633 1.784 1.927 2.192 2.311 2.427 2.516 2.79 2.918 3.152 3.375 3.605 3.719 3.924 4.105 4.365 4.549 4.723 4.958 5.185 5.398 5.605 5.806 6.06 6.303 6.533 6.8 7.058 7.299 7.562 7.847 8.114 8.405 8.717 9.052 9.384 9.717 10.107 10.489 10.897 11.322 11.77 12.212 12.595 12.863 12.909 12.577 12.009 11.397 10.813 10.273 9.795 9.335 8.916 8.461 8.08 7.751 7.429 7.123 6.842 6.588 6.333 6.101 5.901 5.692 5.466 5.274 5.076 4.876 4.71 4.545 4.386 4.209 4.017 3.888 3.759 3.55 3.401 3.253 3.177 3.013 2.835 2.651 2.555 2.307 2.258 2.156 2.046 1.792 1.656 1.51 1.346 1.169 0.974 0.748 0.347 -10 ,16943 ,TETRA ,17559822,Sat Nov 27 09:32:00 CET,Sat Nov 27 11:21:21 CET,0.0 1.468 1.847 2.136 2.39 2.618 2.817 2.982 3.248 3.369 3.486 3.54 3.781 3.871 4.038 4.208 4.371 4.447 4.603 4.768 5.012 5.166 5.317 5.535 5.725 5.891 6.054 6.201 6.384 6.567 6.743 6.953 7.154 7.345 7.56 7.797 8.015 8.255 8.517 8.787 9.056 9.354 9.726 10.112 10.563 11.047 11.526 12.001 12.493 12.865 12.946 12.601 12.071 11.5 10.93 10.397 9.907 9.475 9.106 8.709 8.364 8.049 7.729 7.419 7.141 6.908 6.68 6.467 6.28 6.085 5.884 5.724 5.555 5.358 5.2 5.05 4.9 4.733 4.554 4.438 4.327 4.144 4.013 3.883 3.813 3.669 3.515 3.351 3.268 3.026 2.992 2.895 2.778 2.554 2.442 2.293 2.133 1.984 1.824 1.629 0.827 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_51_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_51_54.txt deleted file mode 100644 index ce3cf605..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_51_54.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,26321 ,TETRA ,17559824,Sat Nov 27 09:32:02 CET,Sat Nov 27 11:20:55 CET,0.0 2.316 2.826 3.142 3.366 3.59 3.809 4.011 4.395 4.549 4.678 4.811 5.079 5.202 5.408 5.577 5.742 5.826 5.987 6.137 6.352 6.496 6.632 6.819 7.003 7.181 7.362 7.546 7.764 7.976 8.18 8.403 8.606 8.793 9.015 9.266 9.484 9.712 9.974 10.234 10.463 10.675 10.908 11.154 11.403 11.625 11.82 11.908 11.873 11.643 10.901 9.586 8.284 7.146 6.161 5.208 4.326 3.533 2.836 2.162 1.602 1.062 0.535 0.044 -0.419 -0.839 -1.267 -1.639 -1.97 -2.307 -2.658 -2.948 -3.235 -3.524 -3.746 -3.986 -4.248 -4.522 -4.804 -5.005 -5.212 -5.561 -5.816 -6.056 -6.172 -6.403 -6.644 -6.896 -7.032 -7.326 -7.493 -7.664 -7.834 -8.21 -8.433 -8.69 -9.003 -9.345 -9.685 -10.133 -14.78 -3 ,16542 ,TETRA ,17559825,Sat Nov 27 09:32:02 CET,Sat Nov 27 11:21:33 CET,0.0 1.653 2.122 2.498 2.791 3.04 3.245 3.469 3.869 4.017 4.148 4.247 4.504 4.624 4.833 5.029 5.228 5.324 5.502 5.672 5.942 6.12 6.282 6.513 6.751 6.963 7.131 7.296 7.518 7.747 7.967 8.218 8.449 8.648 8.867 9.102 9.346 9.611 9.848 10.079 10.29 10.531 10.832 11.1 11.362 11.592 11.785 11.912 11.888 11.611 10.822 9.579 8.422 7.36 6.361 5.405 4.575 3.806 3.102 2.371 1.776 1.25 0.727 0.237 -0.215 -0.62 -1.051 -1.448 -1.791 -2.153 -2.528 -2.832 -3.159 -3.498 -3.751 -4.018 -4.304 -4.601 -4.906 -5.119 -5.332 -5.644 -5.85 -6.065 -6.178 -6.404 -6.684 -6.99 -7.145 -7.46 -7.647 -7.831 -8.015 -8.417 -8.663 -8.905 -9.148 -9.524 -9.989 -10.487 -12.925 -4 ,5259 ,TETRA ,17559826,Sat Nov 27 09:32:02 CET,Sat Nov 27 11:20:44 CET,0.0 1.511 1.977 2.338 2.65 2.899 3.103 3.316 3.712 3.878 4.032 4.194 4.473 4.608 4.853 5.085 5.304 5.406 5.584 5.737 5.946 6.076 6.206 6.416 6.636 6.838 7.028 7.21 7.422 7.612 7.799 8.034 8.249 8.448 8.671 8.899 9.111 9.341 9.578 9.818 10.047 10.278 10.532 10.765 10.984 11.19 11.386 11.504 11.462 11.171 10.373 9.064 7.812 6.739 5.752 4.792 3.945 3.177 2.504 1.822 1.235 0.7 0.192 -0.284 -0.733 -1.131 -1.555 -1.941 -2.276 -2.625 -2.981 -3.281 -3.594 -3.92 -4.17 -4.43 -4.704 -4.992 -5.279 -5.48 -5.709 -6.054 -6.296 -6.546 -6.667 -6.929 -7.199 -7.492 -7.658 -7.972 -8.177 -8.364 -8.562 -9.009 -9.253 -9.503 -9.783 -10.143 -10.562 -11.049 -13.748 -5 ,31692 ,TETRA ,17559827,Sat Nov 27 09:33:01 CET,Sat Nov 27 11:22:31 CET,0.0 2.24 2.795 3.219 3.532 3.747 3.938 4.122 4.464 4.62 4.755 4.872 5.136 5.261 5.509 5.745 5.972 6.086 6.291 6.476 6.737 6.913 7.082 7.295 7.466 7.621 7.773 7.925 8.112 8.277 8.455 8.675 8.879 9.072 9.264 9.476 9.703 9.954 10.203 10.436 10.667 10.904 11.153 11.4 11.652 11.879 12.03 12.104 12.079 11.765 10.909 9.634 8.441 7.293 6.248 5.274 4.395 3.651 3.023 2.354 1.784 1.293 0.817 0.359 -0.088 -0.506 -0.938 -1.326 -1.665 -2.016 -2.376 -2.67 -2.977 -3.288 -3.535 -3.791 -4.049 -4.324 -4.592 -4.774 -4.967 -5.276 -5.488 -5.704 -5.824 -6.09 -6.384 -6.713 -6.891 -7.217 -7.449 -7.654 -7.858 -8.307 -8.555 -8.836 -9.153 -9.502 -9.977 -10.604 -13.608 -6 ,6678 ,TETRA ,17559828,Sat Nov 27 09:33:01 CET,Sat Nov 27 11:22:42 CET,0.0 1.778 2.245 2.601 2.92 3.193 3.438 3.665 4.034 4.192 4.336 4.476 4.745 4.881 5.12 5.336 5.535 5.625 5.804 5.974 6.232 6.398 6.547 6.748 6.933 7.106 7.283 7.47 7.713 7.943 8.162 8.413 8.655 8.887 9.144 9.418 9.648 9.884 10.147 10.414 10.67 10.961 11.297 11.582 11.849 12.065 12.235 12.391 12.432 12.169 11.349 9.991 8.711 7.535 6.491 5.546 4.766 4.09 3.522 2.971 2.458 1.98 1.523 1.095 0.707 0.354 -0.022 -0.36 -0.657 -0.963 -1.277 -1.553 -1.833 -2.118 -2.343 -2.577 -2.825 -3.077 -3.336 -3.514 -3.701 -3.981 -4.167 -4.374 -4.49 -4.719 -4.959 -5.242 -5.393 -5.694 -5.869 -6.048 -6.233 -6.6 -6.815 -7.078 -7.371 -7.675 -8.027 -8.543 -10.22 -7 ,22758 ,TETRA ,17559829,Sat Nov 27 09:33:03 CET,Sat Nov 27 11:22:27 CET,0.0 3.161 3.762 4.188 4.494 4.736 4.959 5.165 5.5 5.678 5.848 6.009 6.287 6.423 6.661 6.885 7.089 7.176 7.339 7.492 7.717 7.861 8.011 8.231 8.449 8.661 8.832 8.997 9.216 9.413 9.602 9.822 10.031 10.22 10.439 10.683 10.903 11.136 11.378 11.617 11.848 12.085 12.336 12.575 12.844 13.112 13.327 13.498 13.607 13.467 12.719 11.419 10.18 9.028 7.999 7.082 6.28 5.528 4.847 4.158 3.572 3.046 2.528 2.053 1.624 1.235 0.829 0.452 0.124 -0.224 -0.599 -0.9 -1.199 -1.526 -1.79 -2.048 -2.317 -2.603 -2.887 -3.093 -3.31 -3.646 -3.887 -4.133 -4.257 -4.518 -4.802 -5.1 -5.261 -5.576 -5.78 -5.967 -6.178 -6.662 -6.929 -7.201 -7.499 -7.869 -8.283 -8.831 -11.221 -8 ,5294 ,TETRA ,17559830,Sat Nov 27 09:33:01 CET,Sat Nov 27 11:22:32 CET,0.0 1.52 2.005 2.35 2.629 2.87 3.083 3.28 3.594 3.73 3.884 4.11 4.412 4.549 4.782 4.999 5.216 5.312 5.499 5.681 5.937 6.106 6.26 6.473 6.696 6.904 7.091 7.282 7.522 7.726 7.919 8.172 8.404 8.61 8.85 9.104 9.328 9.563 9.806 10.051 10.298 10.571 10.874 11.13 11.408 11.68 11.873 11.999 12.005 11.763 11.048 9.836 8.582 7.419 6.399 5.47 4.651 3.893 3.22 2.56 1.983 1.461 0.985 0.536 0.108 -0.294 -0.721 -1.096 -1.432 -1.79 -2.157 -2.461 -2.788 -3.138 -3.4 -3.669 -3.957 -4.247 -4.537 -4.74 -4.95 -5.302 -5.562 -5.829 -5.958 -6.214 -6.498 -6.808 -6.968 -7.284 -7.506 -7.695 -7.904 -8.413 -8.688 -8.957 -9.243 -9.608 -10.089 -10.734 -14.274 -9 ,30985 ,TETRA ,17559831,Sat Nov 27 09:33:01 CET,Sat Nov 27 11:22:42 CET,0.0 1.414 1.896 2.293 2.631 2.908 3.129 3.33 3.691 3.871 4.045 4.23 4.502 4.622 4.856 5.077 5.277 5.367 5.534 5.696 5.934 6.089 6.239 6.449 6.658 6.84 7.0 7.156 7.365 7.576 7.762 7.97 8.159 8.344 8.581 8.831 9.044 9.288 9.542 9.776 10.001 10.25 10.557 10.828 11.053 11.254 11.448 11.581 11.585 11.306 10.497 9.21 7.967 6.77 5.732 4.827 3.99 3.235 2.575 1.922 1.371 0.853 0.355 -0.103 -0.553 -0.973 -1.419 -1.816 -2.156 -2.512 -2.865 -3.153 -3.466 -3.796 -4.043 -4.288 -4.54 -4.8 -5.066 -5.239 -5.419 -5.72 -5.937 -6.179 -6.3 -6.543 -6.789 -7.028 -7.152 -7.437 -7.577 -7.73 -7.89 -8.291 -8.523 -8.791 -9.135 -9.524 -10.01 -10.675 -13.259 -10 ,28624 ,TETRA ,17559832,Sat Nov 27 09:33:01 CET,Sat Nov 27 11:23:01 CET,0.0 2.697 3.23 3.599 3.885 4.142 4.378 4.604 5.023 5.203 5.369 5.534 5.815 5.952 6.203 6.429 6.635 6.734 6.909 7.076 7.335 7.501 7.652 7.882 8.099 8.298 8.476 8.62 8.811 9.003 9.197 9.42 9.609 9.79 10.009 10.256 10.478 10.708 10.949 11.169 11.384 11.62 11.847 12.065 12.34 12.597 12.768 12.853 12.816 12.583 11.912 10.717 9.486 8.357 7.374 6.495 5.676 4.874 4.192 3.538 2.949 2.411 1.896 1.419 0.986 0.589 0.16 -0.235 -0.57 -0.923 -1.295 -1.597 -1.909 -2.236 -2.495 -2.758 -3.022 -3.302 -3.597 -3.804 -4.021 -4.354 -4.582 -4.83 -4.968 -5.231 -5.492 -5.793 -5.952 -6.246 -6.421 -6.605 -6.782 -7.169 -7.398 -7.677 -8.02 -8.366 -8.751 -9.258 -11.536 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_52_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_52_53.txt deleted file mode 100644 index 6f26aee9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_52_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29406 ,TETRA ,17559833,Sat Nov 27 09:34:00 CET,Sat Nov 27 11:23:31 CET,0.0 1.18 1.519 1.76 1.952 2.118 2.26 2.384 2.641 2.772 2.896 2.955 3.207 3.304 3.498 3.678 3.843 3.926 4.09 4.236 4.45 4.588 4.714 4.912 5.113 5.293 5.456 5.614 5.824 6.035 6.242 6.476 6.691 6.902 7.139 7.386 7.622 7.875 8.147 8.421 8.688 8.989 9.346 9.675 9.985 10.32 10.71 11.095 11.425 11.694 11.771 11.4 10.863 10.314 9.788 9.255 8.774 8.307 7.865 7.446 7.096 6.753 6.415 6.091 5.785 5.512 5.229 4.993 4.787 4.551 4.3 4.098 3.879 3.647 3.478 3.302 3.121 2.947 2.751 2.591 2.405 2.108 1.915 1.723 1.626 1.404 1.147 0.886 0.766 0.491 0.417 0.308 0.192 -0.06 -0.188 -0.337 -0.513 -0.705 -1.009 -1.323 -1.854 -2 ,28777 ,TETRA ,17559834,Sat Nov 27 09:33:59 CET,Sat Nov 27 11:22:02 CET,0.0 0.929 1.316 1.605 1.823 2.025 2.203 2.366 2.662 2.802 2.937 3.051 3.325 3.43 3.641 3.852 4.051 4.151 4.354 4.535 4.787 4.95 5.101 5.311 5.506 5.694 5.877 6.051 6.27 6.477 6.674 6.913 7.149 7.383 7.653 7.947 8.213 8.496 8.793 9.101 9.423 9.773 10.166 10.554 10.969 11.386 11.808 12.217 12.591 12.844 12.848 12.519 12.019 11.425 10.869 10.321 9.803 9.349 8.957 8.541 8.164 7.816 7.458 7.106 6.778 6.489 6.201 5.945 5.722 5.492 5.26 5.059 4.838 4.608 4.422 4.217 4.004 3.781 3.556 3.407 3.255 3.036 2.868 2.684 2.589 2.391 2.19 1.982 1.879 1.619 1.537 1.407 1.273 0.938 0.762 0.6 0.421 0.208 -0.061 -0.444 -1.377 -3 ,20112 ,TETRA ,17559835,Sat Nov 27 09:33:59 CET,Sat Nov 27 11:24:20 CET,0.0 0.777 1.17 1.497 1.704 1.891 2.064 2.217 2.496 2.628 2.751 2.827 3.091 3.198 3.406 3.604 3.796 3.888 4.067 4.246 4.489 4.643 4.792 5.007 5.218 5.409 5.597 5.789 6.028 6.252 6.473 6.741 6.999 7.229 7.481 7.778 8.05 8.342 8.675 9.014 9.342 9.691 10.081 10.443 10.813 11.222 11.638 12.041 12.415 12.663 12.639 12.226 11.716 11.179 10.649 10.086 9.555 9.08 8.659 8.226 7.829 7.463 7.104 6.762 6.431 6.119 5.808 5.534 5.298 5.057 4.813 4.6 4.379 4.159 3.986 3.793 3.582 3.376 3.165 3.02 2.87 2.628 2.465 2.286 2.193 2.014 1.825 1.617 1.504 1.232 1.147 1.019 0.886 0.596 0.436 0.249 0.032 -0.207 -0.48 -0.805 -1.647 -4 ,12382 ,TETRA ,17559836,Sat Nov 27 09:33:59 CET,Sat Nov 27 11:23:11 CET,0.0 1.686 2.103 2.434 2.745 3.009 3.234 3.437 3.79 3.954 4.111 4.258 4.548 4.672 4.896 5.12 5.333 5.434 5.63 5.831 6.1 6.257 6.416 6.656 6.879 7.098 7.311 7.501 7.732 7.957 8.195 8.466 8.712 8.955 9.213 9.506 9.794 10.088 10.389 10.699 11.024 11.375 11.742 12.085 12.49 12.905 13.344 13.773 14.145 14.402 14.365 13.922 13.37 12.787 12.195 11.637 11.136 10.674 10.245 9.782 9.391 9.053 8.729 8.416 8.121 7.85 7.551 7.266 7.031 6.789 6.529 6.307 6.084 5.85 5.664 5.471 5.271 5.077 4.872 4.724 4.576 4.328 4.149 3.965 3.871 3.691 3.501 3.296 3.186 2.907 2.789 2.645 2.49 2.172 2.008 1.84 1.686 1.511 1.31 1.057 0.385 -5 ,25093 ,TETRA ,17559837,Sat Nov 27 09:33:59 CET,Sat Nov 27 11:25:28 CET,0.0 0.854 1.135 1.383 1.593 1.771 1.938 2.1 2.381 2.506 2.636 2.709 2.971 3.065 3.28 3.495 3.677 3.77 3.957 4.116 4.349 4.501 4.644 4.859 5.065 5.26 5.458 5.672 5.953 6.201 6.429 6.693 6.935 7.166 7.435 7.73 7.998 8.301 8.626 8.957 9.285 9.654 10.058 10.447 10.873 11.263 11.649 12.058 12.475 12.791 12.809 12.402 11.847 11.263 10.707 10.179 9.679 9.2 8.75 8.28 7.882 7.526 7.165 6.804 6.476 6.174 5.852 5.562 5.299 5.021 4.744 4.528 4.294 4.042 3.842 3.633 3.435 3.229 3.014 2.871 2.73 2.49 2.308 2.108 2.0 1.786 1.556 1.303 1.178 0.91 0.843 0.728 0.607 0.339 0.191 0.027 -0.144 -0.322 -0.546 -0.812 -1.548 -6 ,11565 ,TETRA ,17559838,Sat Nov 27 09:34:02 CET,Sat Nov 27 11:26:35 CET,0.0 1.04 1.395 1.674 1.914 2.116 2.3 2.476 2.806 2.967 3.119 3.264 3.563 3.707 3.951 4.17 4.395 4.499 4.689 4.871 5.136 5.304 5.468 5.718 5.958 6.174 6.382 6.592 6.844 7.064 7.281 7.554 7.813 8.059 8.327 8.613 8.882 9.171 9.484 9.816 10.147 10.503 10.898 11.311 11.752 12.154 12.603 13.026 13.38 13.686 13.755 13.379 12.882 12.291 11.714 11.191 10.699 10.212 9.753 9.304 8.927 8.571 8.229 7.892 7.557 7.238 6.918 6.639 6.391 6.121 5.828 5.598 5.354 5.089 4.894 4.692 4.468 4.238 3.996 3.837 3.689 3.451 3.265 3.068 2.974 2.784 2.586 2.378 2.259 1.974 1.868 1.73 1.582 1.259 1.093 0.913 0.711 0.503 0.251 -0.09 -0.955 -7 ,24247 ,TETRA ,17559839,Sat Nov 27 09:35:00 CET,Sat Nov 27 11:24:59 CET,0.0 0.98 1.291 1.551 1.779 1.984 2.176 2.355 2.693 2.855 3.016 3.184 3.468 3.595 3.85 4.076 4.289 4.394 4.593 4.789 5.072 5.244 5.41 5.658 5.892 6.104 6.31 6.517 6.775 7.002 7.211 7.464 7.709 7.945 8.213 8.5 8.781 9.102 9.451 9.784 10.11 10.484 10.889 11.304 11.772 12.191 12.623 13.037 13.391 13.655 13.669 13.235 12.708 12.137 11.538 10.981 10.474 10.014 9.602 9.156 8.768 8.418 8.068 7.727 7.409 7.12 6.813 6.536 6.315 6.089 5.843 5.639 5.414 5.175 4.987 4.795 4.593 4.395 4.201 4.065 3.919 3.676 3.507 3.338 3.251 3.064 2.87 2.671 2.564 2.287 2.19 2.062 1.935 1.655 1.492 1.304 1.09 0.871 0.627 0.328 -0.602 -8 ,17217 ,TETRA ,17559840,Sat Nov 27 09:35:00 CET,Sat Nov 27 11:24:38 CET,0.0 0.777 1.085 1.313 1.512 1.692 1.866 2.035 2.362 2.521 2.683 2.841 3.129 3.252 3.485 3.709 3.937 4.052 4.263 4.461 4.757 4.936 5.093 5.317 5.544 5.776 6.001 6.211 6.464 6.702 6.936 7.201 7.447 7.679 7.951 8.264 8.547 8.839 9.144 9.461 9.802 10.175 10.596 10.992 11.403 11.822 12.267 12.701 13.094 13.389 13.396 13.047 12.523 11.944 11.391 10.848 10.335 9.842 9.389 8.932 8.524 8.136 7.757 7.409 7.097 6.801 6.472 6.178 5.922 5.656 5.362 5.114 4.869 4.611 4.411 4.212 4.018 3.834 3.653 3.527 3.4 3.206 3.064 2.916 2.845 2.689 2.512 2.318 2.221 1.975 1.901 1.743 1.556 1.154 0.967 0.781 0.545 0.279 -0.011 -0.336 -0.98 -9 ,18837 ,TETRA ,17559841,Sat Nov 27 09:35:00 CET,Sat Nov 27 11:29:44 CET,0.0 1.247 1.73 2.142 2.486 2.786 3.021 3.209 3.554 3.713 3.864 3.993 4.287 4.424 4.679 4.935 5.17 5.278 5.492 5.688 5.96 6.138 6.301 6.534 6.764 6.972 7.18 7.389 7.648 7.89 8.11 8.37 8.618 8.858 9.144 9.438 9.708 10.007 10.31 10.625 10.961 11.334 11.728 12.086 12.478 12.907 13.373 13.809 14.191 14.448 14.465 14.053 13.439 12.829 12.26 11.714 11.211 10.708 10.244 9.797 9.428 9.107 8.796 8.488 8.211 7.968 7.707 7.467 7.259 7.046 6.821 6.624 6.411 6.189 6.012 5.825 5.631 5.439 5.251 5.12 4.98 4.757 4.595 4.418 4.324 4.133 3.951 3.765 3.669 3.399 3.315 3.192 3.068 2.795 2.651 2.493 2.317 2.124 1.888 1.572 0.477 -10 ,31438 ,TETRA ,17559842,Sat Nov 27 09:35:00 CET,Sat Nov 27 11:24:24 CET,0.0 1.015 1.344 1.627 1.861 2.069 2.243 2.405 2.683 2.806 2.941 3.063 3.352 3.476 3.699 3.906 4.095 4.175 4.318 4.464 4.68 4.829 4.971 5.167 5.357 5.526 5.685 5.854 6.065 6.256 6.456 6.702 6.937 7.169 7.429 7.722 8.008 8.309 8.613 8.908 9.201 9.523 9.884 10.222 10.573 10.95 11.377 11.777 12.232 12.645 12.729 12.376 11.856 11.31 10.76 10.198 9.687 9.208 8.775 8.373 8.035 7.697 7.371 7.069 6.783 6.515 6.231 5.982 5.784 5.589 5.383 5.208 5.021 4.829 4.675 4.513 4.354 4.191 4.008 3.876 3.744 3.546 3.415 3.263 3.178 3.008 2.83 2.643 2.551 2.297 2.248 2.149 2.041 1.771 1.624 1.475 1.323 1.133 0.916 0.64 -0.43 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_53_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_53_54.txt deleted file mode 100644 index 5c9197aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_53_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1755 ,TETRA ,17559843,Sat Nov 27 09:35:03 CET,Sat Nov 27 11:24:33 CET,0.0 1.173 1.528 1.839 2.124 2.372 2.591 2.788 3.154 3.319 3.47 3.605 3.896 4.028 4.26 4.475 4.7 4.812 5.014 5.201 5.458 5.632 5.806 6.052 6.304 6.538 6.751 6.959 7.24 7.503 7.757 8.056 8.364 8.663 8.989 9.363 9.716 10.095 10.516 10.975 11.428 11.945 12.574 13.196 13.898 14.648 15.506 16.447 17.486 18.653 19.955 20.737 20.986 21.051 20.984 20.831 20.638 20.441 20.231 19.987 19.776 19.569 19.355 19.158 18.953 18.749 18.52 18.318 18.146 17.96 17.77 17.605 17.429 17.243 17.095 16.947 16.808 16.664 16.507 16.401 16.277 16.074 15.935 15.795 15.727 15.579 15.392 15.174 15.068 14.813 14.752 14.645 14.528 14.27 14.134 13.983 13.801 13.583 13.319 12.985 12.088 -2 ,25656 ,TETRA ,17559844,Sat Nov 27 09:35:00 CET,Sat Nov 27 11:28:15 CET,0.0 1.075 1.464 1.774 2.035 2.242 2.44 2.641 3.008 3.172 3.334 3.46 3.739 3.863 4.102 4.323 4.526 4.63 4.833 5.024 5.316 5.509 5.691 5.936 6.173 6.403 6.613 6.824 7.116 7.386 7.641 7.972 8.291 8.587 8.925 9.31 9.683 10.085 10.484 10.899 11.36 11.89 12.495 13.07 13.723 14.461 15.326 16.277 17.374 18.639 20.005 20.877 21.192 21.266 21.207 21.058 20.854 20.634 20.431 20.201 19.97 19.736 19.503 19.271 19.052 18.844 18.605 18.386 18.191 17.977 17.75 17.555 17.354 17.148 16.984 16.816 16.638 16.459 16.267 16.124 15.973 15.727 15.564 15.398 15.313 15.146 14.959 14.758 14.654 14.393 14.303 14.178 14.049 13.753 13.568 13.34 13.094 12.859 12.603 12.285 11.248 -3 ,17356 ,TETRA ,17559845,Sat Nov 27 09:36:00 CET,Sat Nov 27 11:25:50 CET,0.0 1.634 2.113 2.491 2.79 3.036 3.249 3.461 3.866 4.048 4.229 4.418 4.727 4.871 5.137 5.389 5.616 5.721 5.92 6.099 6.359 6.526 6.701 6.95 7.183 7.415 7.637 7.859 8.149 8.419 8.672 8.971 9.266 9.561 9.906 10.285 10.639 11.024 11.436 11.872 12.321 12.835 13.431 14.011 14.686 15.443 16.302 17.258 18.311 19.43 20.663 21.493 21.762 21.791 21.715 21.573 21.392 21.164 20.936 20.703 20.498 20.295 20.085 19.88 19.65 19.42 19.193 18.991 18.807 18.609 18.397 18.209 18.003 17.781 17.604 17.421 17.239 17.053 16.854 16.718 16.586 16.363 16.191 16.016 15.932 15.752 15.549 15.308 15.168 14.876 14.748 14.624 14.502 14.189 13.992 13.756 13.494 13.224 12.927 12.527 11.649 -4 ,4460 ,TETRA ,17559846,Sat Nov 27 09:37:02 CET,Sat Nov 27 11:26:26 CET,0.0 1.308 1.728 2.024 2.258 2.485 2.709 2.907 3.252 3.419 3.584 3.728 4.009 4.138 4.395 4.631 4.861 4.981 5.191 5.377 5.652 5.829 6.009 6.265 6.501 6.748 6.975 7.186 7.463 7.725 7.99 8.307 8.608 8.9 9.24 9.615 9.967 10.358 10.789 11.236 11.683 12.18 12.77 13.382 14.125 14.924 15.761 16.686 17.752 18.928 20.174 20.998 21.332 21.418 21.343 21.163 20.902 20.582 20.276 19.971 19.737 19.522 19.302 19.08 18.876 18.688 18.46 18.248 18.044 17.818 17.618 17.457 17.272 17.063 16.884 16.711 16.54 16.342 16.139 16.003 15.858 15.641 15.487 15.33 15.256 15.111 14.967 14.79 14.699 14.453 14.377 14.251 14.11 13.776 13.598 13.361 13.065 12.728 12.331 11.744 9.519 -5 ,22334 ,TETRA ,17559847,Sat Nov 27 09:37:04 CET,Sat Nov 27 11:27:31 CET,0.0 1.493 1.889 2.212 2.478 2.69 2.891 3.079 3.393 3.544 3.689 3.8 4.085 4.207 4.434 4.661 4.882 4.99 5.199 5.395 5.683 5.864 6.032 6.29 6.536 6.761 6.987 7.214 7.499 7.76 8.012 8.317 8.605 8.882 9.205 9.568 9.914 10.289 10.701 11.16 11.644 12.156 12.736 13.307 13.96 14.7 15.568 16.547 17.66 18.873 20.201 21.126 21.455 21.546 21.511 21.383 21.188 20.953 20.71 20.429 20.168 19.926 19.676 19.422 19.18 18.941 18.679 18.442 18.234 18.029 17.803 17.616 17.419 17.212 17.067 16.919 16.767 16.608 16.426 16.294 16.168 15.99 15.871 15.733 15.655 15.499 15.338 15.158 15.064 14.823 14.776 14.669 14.538 14.208 14.031 13.848 13.655 13.45 13.199 12.865 11.067 -6 ,8679 ,TETRA ,17559849,Sat Nov 27 09:37:00 CET,Sat Nov 27 11:27:54 CET,0.0 3.725 4.502 4.886 5.166 5.404 5.614 5.793 6.12 6.281 6.432 6.546 6.824 6.955 7.19 7.406 7.619 7.727 7.951 8.161 8.446 8.628 8.814 9.083 9.322 9.553 9.788 10.008 10.276 10.526 10.77 11.069 11.368 11.649 11.957 12.313 12.661 13.048 13.476 13.942 14.422 14.94 15.569 16.176 16.844 17.596 18.48 19.48 20.598 21.813 23.079 23.85 24.165 24.235 24.155 23.995 23.789 23.557 23.319 23.062 22.827 22.592 22.363 22.137 21.911 21.705 21.484 21.276 21.086 20.892 20.672 20.474 20.274 20.072 19.914 19.726 19.544 19.378 19.198 19.072 18.939 18.756 18.631 18.483 18.41 18.268 18.111 17.919 17.811 17.558 17.496 17.378 17.248 16.954 16.804 16.656 16.482 16.27 16.03 15.757 14.7 -7 ,14570 ,TETRA ,17559850,Sat Nov 27 09:37:01 CET,Sat Nov 27 11:26:42 CET,0.0 1.37 1.837 2.152 2.395 2.636 2.86 3.064 3.456 3.622 3.773 3.886 4.169 4.294 4.534 4.757 4.965 5.071 5.287 5.489 5.782 5.976 6.157 6.405 6.629 6.849 7.063 7.272 7.539 7.797 8.05 8.354 8.65 8.924 9.245 9.624 9.971 10.356 10.794 11.243 11.7 12.216 12.823 13.425 14.106 14.879 15.777 16.739 17.827 19.07 20.405 21.338 21.704 21.786 21.727 21.617 21.446 21.233 21.03 20.804 20.586 20.383 20.172 19.945 19.728 19.522 19.283 19.068 18.885 18.686 18.474 18.292 18.087 17.875 17.723 17.552 17.363 17.172 16.977 16.837 16.699 16.479 16.305 16.099 15.995 15.813 15.631 15.441 15.326 15.066 15.011 14.892 14.76 14.458 14.284 14.08 13.861 13.635 13.345 12.917 11.939 -8 ,20912 ,TETRA ,17559851,Sat Nov 27 09:36:59 CET,Sat Nov 27 11:26:00 CET,0.0 1.56 2.016 2.342 2.602 2.809 3.013 3.198 3.521 3.685 3.844 3.977 4.264 4.396 4.655 4.891 5.109 5.213 5.411 5.618 5.95 6.18 6.391 6.66 6.907 7.131 7.34 7.548 7.824 8.096 8.356 8.659 8.955 9.244 9.581 9.953 10.312 10.717 11.143 11.593 12.069 12.601 13.201 13.796 14.492 15.235 16.059 16.968 18.061 19.291 20.558 21.462 21.851 21.94 21.892 21.78 21.602 21.382 21.168 20.931 20.707 20.488 20.262 20.036 19.817 19.615 19.402 19.208 19.023 18.815 18.594 18.383 18.167 17.975 17.816 17.648 17.48 17.295 17.075 16.912 16.74 16.451 16.259 16.066 15.965 15.757 15.553 15.361 15.263 15.015 14.93 14.788 14.657 14.376 14.21 14.021 13.808 13.573 13.302 12.966 12.052 -9 ,2664 ,TETRA ,17559852,Sat Nov 27 09:37:02 CET,Sat Nov 27 11:26:47 CET,0.0 1.279 1.7 2.004 2.253 2.516 2.76 2.954 3.33 3.498 3.641 3.782 4.084 4.214 4.447 4.664 4.875 4.978 5.187 5.393 5.692 5.882 6.069 6.343 6.606 6.849 7.069 7.283 7.565 7.835 8.079 8.386 8.692 8.98 9.316 9.692 10.053 10.436 10.855 11.302 11.77 12.289 12.887 13.496 14.174 14.912 15.742 16.724 17.85 19.017 20.276 21.132 21.475 21.57 21.494 21.319 21.117 20.892 20.671 20.415 20.177 19.952 19.725 19.515 19.301 19.088 18.86 18.667 18.5 18.322 18.14 17.978 17.8 17.619 17.487 17.339 17.171 16.996 16.824 16.713 16.596 16.404 16.266 16.111 16.023 15.826 15.629 15.422 15.295 14.995 14.814 14.635 14.467 14.105 13.905 13.688 13.448 13.198 12.916 12.504 11.051 -10 ,27385 ,TETRA ,17559853,Sat Nov 27 09:38:01 CET,Sat Nov 27 11:22:59 CET,0.0 0.968 1.391 1.701 1.959 2.171 2.361 2.553 2.929 3.096 3.244 3.373 3.677 3.815 4.035 4.256 4.471 4.581 4.788 4.974 5.252 5.432 5.608 5.866 6.127 6.377 6.598 6.806 7.077 7.326 7.569 7.87 8.165 8.455 8.789 9.145 9.497 9.88 10.291 10.754 11.237 11.757 12.334 12.912 13.573 14.322 15.19 16.119 17.198 18.362 19.601 20.455 20.769 20.808 20.705 20.524 20.292 20.076 19.882 19.657 19.428 19.222 19.028 18.819 18.603 18.405 18.203 18.01 17.827 17.643 17.45 17.291 17.138 16.969 16.835 16.692 16.55 16.405 16.24 16.12 15.978 15.744 15.584 15.406 15.312 15.116 14.917 14.7 14.588 14.325 14.223 14.099 13.968 13.677 13.518 13.339 13.148 12.942 12.713 12.35 11.31 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_53_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_53_58.txt deleted file mode 100644 index 7e3fceec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_53_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24344 ,TETRA ,17559854,Sat Nov 27 09:38:01 CET,Sat Nov 27 11:28:39 CET,0.0 1.781 2.312 2.667 2.944 3.186 3.407 3.625 4.024 4.201 4.378 4.529 4.821 4.966 5.228 5.455 5.675 5.783 5.984 6.191 6.48 6.655 6.82 7.051 7.269 7.468 7.667 7.872 8.135 8.391 8.639 8.933 9.219 9.487 9.792 10.118 10.421 10.772 11.164 11.55 11.923 12.338 12.824 13.282 13.773 14.321 14.921 15.524 16.126 16.674 16.98 16.845 16.469 16.025 15.592 15.165 14.739 14.31 13.922 13.497 13.136 12.808 12.459 12.133 11.834 11.552 11.261 10.998 10.765 10.513 10.216 9.965 9.731 9.507 9.338 9.156 8.946 8.735 8.536 8.393 8.241 8.023 7.882 7.731 7.649 7.486 7.317 7.126 7.034 6.787 6.729 6.613 6.49 6.211 6.073 5.943 5.782 5.595 5.386 5.11 4.439 -2 ,28768 ,TETRA ,17559855,Sat Nov 27 09:38:01 CET,Sat Nov 27 11:29:11 CET,0.0 1.785 2.324 2.713 3.036 3.317 3.568 3.793 4.178 4.335 4.473 4.589 4.878 5.008 5.268 5.52 5.756 5.875 6.098 6.302 6.593 6.772 6.946 7.201 7.433 7.648 7.854 8.045 8.291 8.532 8.773 9.059 9.322 9.575 9.858 10.17 10.459 10.766 11.096 11.441 11.808 12.237 12.763 13.253 13.77 14.343 14.942 15.505 16.018 16.465 16.78 16.687 16.328 15.917 15.503 15.083 14.703 14.306 13.945 13.557 13.203 12.883 12.542 12.207 11.897 11.617 11.33 11.091 10.894 10.691 10.472 10.287 10.095 9.877 9.706 9.522 9.315 9.099 8.888 8.757 8.616 8.388 8.241 8.088 8.008 7.847 7.666 7.481 7.388 7.135 7.082 6.964 6.837 6.587 6.46 6.317 6.169 6.004 5.804 5.573 4.962 -3 ,32289 ,TETRA ,17559856,Sat Nov 27 09:38:01 CET,Sat Nov 27 11:32:05 CET,0.0 1.69 2.222 2.585 2.913 3.192 3.448 3.706 4.131 4.3 4.447 4.573 4.851 4.97 5.206 5.459 5.706 5.811 6.024 6.225 6.505 6.683 6.839 7.067 7.306 7.538 7.741 7.928 8.181 8.416 8.645 8.918 9.162 9.395 9.663 9.956 10.244 10.572 10.915 11.298 11.72 12.156 12.643 13.111 13.629 14.189 14.814 15.463 16.093 16.624 16.919 16.756 16.353 15.904 15.441 14.971 14.537 14.143 13.785 13.409 13.048 12.707 12.39 12.069 11.734 11.427 11.137 10.873 10.621 10.361 10.098 9.869 9.616 9.36 9.176 8.974 8.748 8.514 8.26 8.088 7.935 7.706 7.553 7.402 7.324 7.166 6.992 6.806 6.716 6.465 6.419 6.303 6.178 5.948 5.802 5.619 5.414 5.187 4.952 4.619 3.185 -4 ,11831 ,TETRA ,17559857,Sat Nov 27 09:38:01 CET,Sat Nov 27 11:29:22 CET,0.0 2.623 3.312 3.774 4.141 4.48 4.779 5.049 5.483 5.682 5.882 6.09 6.419 6.589 6.872 7.104 7.329 7.443 7.64 7.832 8.106 8.286 8.471 8.723 8.971 9.207 9.432 9.64 9.914 10.183 10.44 10.75 11.024 11.297 11.612 11.944 12.242 12.567 12.935 13.32 13.708 14.13 14.611 15.093 15.644 16.195 16.736 17.316 17.876 18.359 18.751 18.665 18.295 17.804 17.302 16.835 16.409 16.03 15.701 15.34 15.016 14.739 14.455 14.155 13.868 13.607 13.353 13.129 12.938 12.728 12.486 12.29 12.09 11.885 11.713 11.526 11.348 11.16 10.948 10.801 10.669 10.469 10.316 10.146 10.055 9.863 9.681 9.505 9.408 9.146 9.075 8.96 8.838 8.573 8.432 8.259 8.041 7.791 7.513 7.175 5.843 -5 ,23840 ,TETRA ,17559858,Sat Nov 27 09:39:00 CET,Sat Nov 27 11:28:58 CET,0.0 1.574 2.057 2.379 2.674 2.962 3.211 3.418 3.779 3.957 4.128 4.267 4.57 4.712 4.976 5.251 5.495 5.607 5.843 6.077 6.385 6.577 6.768 7.039 7.312 7.567 7.809 8.058 8.361 8.642 8.917 9.226 9.526 9.809 10.128 10.493 10.83 11.188 11.577 11.971 12.369 12.804 13.27 13.732 14.292 14.879 15.462 16.064 16.685 17.216 17.601 17.561 17.272 16.825 16.351 15.868 15.391 14.947 14.535 14.094 13.73 13.399 13.064 12.742 12.437 12.163 11.864 11.597 11.371 11.108 10.81 10.571 10.32 10.059 9.867 9.681 9.492 9.292 9.081 8.935 8.793 8.581 8.432 8.275 8.193 8.028 7.855 7.659 7.561 7.302 7.245 7.136 7.009 6.72 6.573 6.417 6.241 6.054 5.853 5.593 4.784 -6 ,6100 ,TETRA ,17559859,Sat Nov 27 09:39:00 CET,Sat Nov 27 11:30:53 CET,0.0 2.229 2.727 3.074 3.399 3.667 3.897 4.094 4.436 4.597 4.752 4.896 5.194 5.34 5.609 5.861 6.081 6.181 6.378 6.572 6.868 7.063 7.253 7.51 7.762 8.0 8.217 8.436 8.726 9.001 9.27 9.599 9.89 10.168 10.49 10.821 11.139 11.498 11.875 12.241 12.603 13.027 13.523 13.998 14.521 15.04 15.604 16.174 16.733 17.266 17.542 17.372 17.001 16.57 16.137 15.689 15.249 14.843 14.475 14.041 13.614 13.202 12.788 12.424 12.14 11.863 11.573 11.328 11.092 10.839 10.587 10.365 10.127 9.855 9.638 9.432 9.206 8.959 8.697 8.521 8.35 8.096 7.908 7.702 7.603 7.407 7.206 7.007 6.907 6.636 6.569 6.457 6.334 6.011 5.821 5.6 5.371 5.123 4.847 4.495 2.944 -7 ,10584 ,TETRA ,17559860,Sat Nov 27 09:39:00 CET,Sat Nov 27 11:29:42 CET,0.0 2.055 2.538 2.934 3.274 3.543 3.788 3.993 4.35 4.528 4.694 4.839 5.123 5.252 5.523 5.767 5.973 6.079 6.287 6.489 6.788 6.964 7.137 7.392 7.628 7.845 8.033 8.208 8.453 8.692 8.926 9.211 9.471 9.725 10.03 10.372 10.705 11.058 11.436 11.813 12.174 12.59 13.06 13.513 14.027 14.573 15.139 15.728 16.306 16.781 17.048 16.927 16.565 16.091 15.584 15.078 14.622 14.126 13.641 13.172 12.717 12.283 11.891 11.526 11.19 10.882 10.556 10.266 10.026 9.762 9.473 9.238 9.001 8.765 8.585 8.378 8.139 7.907 7.674 7.513 7.349 7.108 6.951 6.784 6.691 6.502 6.313 6.102 5.989 5.721 5.634 5.515 5.395 5.123 4.97 4.798 4.606 4.406 4.172 3.853 2.307 -8 ,29658 ,TETRA ,17559861,Sat Nov 27 09:39:00 CET,Sat Nov 27 11:30:17 CET,0.0 3.34 4.056 4.599 5.027 5.39 5.697 5.973 6.452 6.653 6.825 6.972 7.267 7.407 7.684 7.92 8.125 8.227 8.432 8.627 8.899 9.065 9.217 9.443 9.663 9.873 10.073 10.265 10.505 10.73 10.956 11.222 11.484 11.737 12.024 12.352 12.66 13.005 13.369 13.724 14.081 14.507 14.996 15.45 15.952 16.471 17.002 17.576 18.222 18.841 19.275 19.13 18.689 18.311 17.902 17.426 16.963 16.539 16.185 15.803 15.455 15.141 14.826 14.513 14.187 13.855 13.497 13.184 12.904 12.613 12.345 12.135 11.893 11.611 11.397 11.164 10.924 10.701 10.475 10.329 10.166 9.916 9.753 9.573 9.475 9.26 9.032 8.788 8.665 8.387 8.279 8.141 7.998 7.675 7.5 7.308 7.069 6.803 6.503 6.077 4.864 -9 ,20337 ,TETRA ,17559862,Sat Nov 27 09:40:01 CET,Sat Nov 27 11:30:54 CET,0.0 1.481 2.015 2.416 2.737 3.026 3.272 3.484 3.878 4.057 4.223 4.366 4.662 4.797 5.027 5.258 5.494 5.608 5.821 6.01 6.286 6.466 6.631 6.856 7.078 7.303 7.519 7.73 8.007 8.283 8.548 8.851 9.147 9.427 9.744 10.079 10.379 10.709 11.063 11.431 11.823 12.254 12.729 13.184 13.698 14.25 14.831 15.423 15.954 16.367 16.657 16.499 16.156 15.732 15.257 14.793 14.346 13.941 13.594 13.2 12.841 12.529 12.217 11.869 11.543 11.277 11.002 10.748 10.514 10.267 10.015 9.81 9.601 9.376 9.202 9.031 8.859 8.671 8.479 8.349 8.207 7.98 7.824 7.658 7.571 7.401 7.224 7.017 6.903 6.643 6.592 6.474 6.344 6.078 5.934 5.773 5.615 5.438 5.235 4.962 4.027 -10 ,24482 ,TETRA ,17559863,Sat Nov 27 09:40:00 CET,Sat Nov 27 11:31:22 CET,0.0 1.753 2.287 2.67 2.986 3.232 3.453 3.674 4.067 4.236 4.386 4.509 4.786 4.911 5.156 5.382 5.602 5.711 5.919 6.119 6.414 6.616 6.807 7.051 7.274 7.493 7.699 7.897 8.151 8.39 8.63 8.916 9.187 9.464 9.786 10.131 10.457 10.801 11.154 11.555 11.966 12.37 12.824 13.301 13.867 14.418 14.987 15.61 16.225 16.732 17.101 17.055 16.69 16.238 15.75 15.23 14.758 14.321 13.93 13.53 13.18 12.855 12.525 12.229 11.955 11.701 11.454 11.23 11.03 10.822 10.602 10.434 10.257 10.064 9.918 9.757 9.575 9.398 9.222 9.088 8.935 8.695 8.533 8.379 8.302 8.145 7.968 7.753 7.641 7.382 7.336 7.223 7.098 6.84 6.717 6.581 6.411 6.209 5.959 5.67 4.56 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_54_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_54_37.txt deleted file mode 100644 index 3bb37641..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_54_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26439 ,KEBNE ,17069856,Fri Dec 24 11:02:49 CET,Fri Dec 24 12:38:16 CET,0.0 1.065 1.403 1.638 1.85 2.062 2.258 2.436 2.735 2.876 3.018 3.123 3.389 3.502 3.705 3.894 4.088 4.186 4.371 4.538 4.767 4.92 5.06 5.257 5.45 5.641 5.82 5.986 6.213 6.449 6.677 6.93 7.17 7.412 7.684 7.969 8.237 8.523 8.826 9.131 9.448 9.808 10.199 10.562 10.939 11.295 11.634 11.933 12.139 12.165 11.797 10.919 9.98 9.073 8.253 7.516 6.84 6.215 5.676 5.105 4.611 4.178 3.753 3.348 2.977 2.633 2.258 1.925 1.64 1.34 1.015 0.748 0.476 0.193 -0.03 -0.261 -0.499 -0.749 -1.01 -1.205 -1.401 -1.679 -1.866 -2.059 -2.167 -2.4 -2.625 -2.866 -2.994 -3.27 -3.39 -3.541 -3.695 -4.015 -4.217 -4.465 -4.744 -5.042 -5.396 -5.952 -7.35 -2 ,3313 ,KEBNE ,17069857,Fri Dec 24 11:04:56 CET,Fri Dec 24 12:40:59 CET,0.0 0.788 1.134 1.41 1.625 1.815 1.988 2.147 2.461 2.601 2.724 2.809 3.068 3.181 3.415 3.622 3.801 3.888 4.053 4.222 4.482 4.652 4.806 5.013 5.232 5.446 5.641 5.832 6.083 6.325 6.56 6.845 7.118 7.377 7.668 7.976 8.238 8.518 8.84 9.168 9.492 9.842 10.209 10.525 10.869 11.251 11.616 11.91 12.175 12.267 11.964 11.17 10.23 9.349 8.565 7.816 7.125 6.482 5.936 5.39 4.905 4.472 4.06 3.646 3.243 2.887 2.521 2.194 1.912 1.616 1.301 1.045 0.782 0.497 0.278 0.039 -0.219 -0.471 -0.735 -0.921 -1.105 -1.394 -1.605 -1.825 -1.943 -2.192 -2.454 -2.737 -2.879 -3.169 -3.328 -3.491 -3.661 -4.031 -4.231 -4.484 -4.776 -5.114 -5.52 -5.994 -7.615 -3 ,15291 ,KEBNE ,17069858,Fri Dec 24 11:05:58 CET,Fri Dec 24 12:41:35 CET,0.0 0.93 1.279 1.555 1.801 2.004 2.182 2.349 2.656 2.806 2.942 3.04 3.311 3.431 3.646 3.844 4.039 4.133 4.307 4.472 4.701 4.847 4.992 5.201 5.404 5.598 5.786 5.964 6.189 6.418 6.642 6.915 7.172 7.403 7.665 7.951 8.218 8.495 8.796 9.113 9.434 9.793 10.185 10.531 10.912 11.299 11.669 11.981 12.223 12.27 11.895 11.021 10.045 9.136 8.318 7.557 6.907 6.296 5.742 5.194 4.706 4.263 3.836 3.439 3.074 2.73 2.356 2.013 1.716 1.41 1.092 0.831 0.567 0.289 0.062 -0.173 -0.413 -0.658 -0.912 -1.096 -1.289 -1.593 -1.813 -2.039 -2.156 -2.396 -2.649 -2.945 -3.106 -3.417 -3.568 -3.731 -3.918 -4.32 -4.541 -4.797 -5.089 -5.418 -5.857 -6.376 -7.422 -4 ,22523 ,KEBNE ,17069859,Fri Dec 24 11:13:26 CET,Fri Dec 24 12:47:27 CET,0.0 0.89 1.248 1.536 1.768 1.975 2.171 2.342 2.633 2.777 2.922 3.029 3.298 3.422 3.668 3.888 4.077 4.169 4.343 4.516 4.784 4.961 5.14 5.376 5.594 5.835 6.081 6.29 6.551 6.799 7.032 7.305 7.556 7.799 8.071 8.373 8.65 8.945 9.259 9.574 9.889 10.226 10.587 10.937 11.305 11.647 12.024 12.379 12.61 12.575 12.092 11.244 10.336 9.475 8.67 7.901 7.218 6.614 6.071 5.495 4.988 4.521 4.092 3.684 3.3 2.95 2.567 2.225 1.933 1.628 1.305 1.047 0.777 0.484 0.258 0.029 -0.207 -0.455 -0.717 -0.907 -1.107 -1.402 -1.602 -1.821 -1.936 -2.183 -2.45 -2.734 -2.885 -3.192 -3.367 -3.548 -3.73 -4.108 -4.333 -4.577 -4.819 -5.097 -5.42 -5.818 -6.744 -5 ,16778 ,KEBNE ,17069860,Fri Dec 24 11:14:28 CET,Fri Dec 24 12:50:17 CET,0.0 0.896 1.205 1.497 1.772 2.012 2.222 2.387 2.678 2.837 2.993 3.078 3.341 3.456 3.696 3.928 4.112 4.196 4.355 4.516 4.762 4.91 5.059 5.278 5.491 5.7 5.887 6.06 6.274 6.484 6.674 6.892 7.12 7.342 7.585 7.848 8.1 8.367 8.643 8.927 9.234 9.576 9.956 10.303 10.656 11.007 11.311 11.593 11.836 11.867 11.456 10.594 9.686 8.782 7.934 7.171 6.505 5.88 5.321 4.737 4.234 3.786 3.355 2.956 2.582 2.237 1.884 1.566 1.292 1.004 0.689 0.433 0.171 -0.111 -0.338 -0.581 -0.826 -1.075 -1.327 -1.513 -1.709 -2.009 -2.215 -2.427 -2.543 -2.803 -3.086 -3.353 -3.493 -3.795 -3.949 -4.105 -4.283 -4.678 -4.878 -5.092 -5.349 -5.658 -6.027 -6.528 -8.014 -6 ,26018 ,KEBNE ,17069861,Fri Dec 24 11:16:39 CET,Fri Dec 24 12:45:44 CET,0.0 0.645 0.917 1.168 1.432 1.719 1.971 2.177 2.524 2.687 2.856 3.042 3.353 3.5 3.745 3.996 4.237 4.35 4.561 4.76 5.063 5.251 5.424 5.674 5.908 6.129 6.334 6.523 6.766 6.997 7.225 7.501 7.753 8.006 8.288 8.574 8.831 9.107 9.411 9.719 10.059 10.427 10.785 11.118 11.486 11.838 12.166 12.471 12.75 12.797 12.362 11.466 10.477 9.538 8.7 7.956 7.325 6.723 6.174 5.603 5.106 4.675 4.257 3.854 3.485 3.156 2.823 2.525 2.252 1.965 1.671 1.417 1.148 0.866 0.641 0.408 0.171 -0.082 -0.368 -0.557 -0.744 -1.059 -1.268 -1.476 -1.588 -1.826 -2.096 -2.379 -2.52 -2.824 -3.012 -3.188 -3.36 -3.719 -3.945 -4.197 -4.444 -4.747 -5.113 -5.573 -7.187 -7 ,2827 ,KEBNE ,17069862,Fri Dec 24 11:20:50 CET,Fri Dec 24 12:54:56 CET,0.0 1.453 1.873 2.206 2.483 2.721 2.917 3.095 3.441 3.591 3.727 3.841 4.117 4.245 4.485 4.706 4.903 5.002 5.211 5.403 5.653 5.819 5.987 6.229 6.459 6.672 6.875 7.063 7.302 7.548 7.771 8.018 8.257 8.495 8.763 9.057 9.335 9.633 9.941 10.255 10.582 10.931 11.304 11.63 11.975 12.34 12.696 12.995 13.249 13.328 13.015 12.169 11.267 10.435 9.625 8.873 8.215 7.583 7.028 6.492 6.034 5.613 5.175 4.753 4.369 4.022 3.654 3.319 3.03 2.721 2.385 2.102 1.804 1.493 1.249 0.988 0.705 0.418 0.134 -0.052 -0.258 -0.602 -0.829 -1.07 -1.198 -1.462 -1.75 -2.058 -2.212 -2.528 -2.748 -2.945 -3.156 -3.615 -3.856 -4.118 -4.433 -4.785 -5.178 -5.799 -7.856 -8 ,17382 ,KEBNE ,17069863,Fri Dec 24 11:22:57 CET,Fri Dec 24 12:59:07 CET,0.0 0.735 0.986 1.213 1.447 1.661 1.846 2.014 2.317 2.459 2.601 2.72 2.988 3.097 3.303 3.516 3.716 3.81 3.992 4.158 4.39 4.533 4.682 4.91 5.123 5.334 5.546 5.741 5.974 6.209 6.453 6.741 6.975 7.193 7.471 7.772 8.041 8.312 8.61 8.934 9.239 9.555 9.902 10.249 10.65 11.063 11.467 11.759 11.913 11.902 11.508 10.562 9.595 8.729 7.91 7.132 6.438 5.802 5.243 4.7 4.236 3.819 3.421 3.038 2.664 2.294 1.895 1.536 1.248 0.945 0.613 0.359 0.095 -0.196 -0.416 -0.644 -0.893 -1.148 -1.413 -1.597 -1.788 -2.095 -2.322 -2.563 -2.684 -2.925 -3.17 -3.428 -3.57 -3.871 -4.041 -4.206 -4.376 -4.8 -5.03 -5.267 -5.539 -5.852 -6.255 -6.832 -8.905 -9 ,5159 ,KEBNE ,17069864,Fri Dec 24 11:25:06 CET,Fri Dec 24 13:01:15 CET,0.0 0.849 1.197 1.485 1.717 1.903 2.082 2.232 2.489 2.618 2.753 2.871 3.132 3.241 3.474 3.694 3.9 3.994 4.171 4.345 4.584 4.733 4.874 5.073 5.269 5.463 5.65 5.829 6.065 6.291 6.49 6.723 6.948 7.16 7.404 7.691 7.965 8.239 8.522 8.823 9.129 9.473 9.854 10.203 10.553 10.887 11.227 11.523 11.775 11.888 11.536 10.657 9.731 8.869 8.08 7.31 6.608 5.963 5.414 4.849 4.349 3.908 3.496 3.091 2.707 2.363 1.994 1.671 1.391 1.095 0.786 0.527 0.248 -0.037 -0.251 -0.484 -0.735 -0.992 -1.257 -1.442 -1.636 -1.937 -2.15 -2.372 -2.484 -2.731 -2.999 -3.275 -3.413 -3.703 -3.86 -4.025 -4.204 -4.599 -4.826 -5.078 -5.377 -5.736 -6.175 -6.752 -8.531 -10 ,15475 ,KEBNE ,17069865,Fri Dec 24 11:28:13 CET,Fri Dec 24 13:02:47 CET,0.0 0.709 1.026 1.245 1.459 1.675 1.862 2.023 2.308 2.441 2.572 2.661 2.919 3.031 3.251 3.461 3.655 3.745 3.92 4.094 4.328 4.477 4.639 4.859 5.056 5.252 5.45 5.651 5.901 6.13 6.348 6.607 6.863 7.112 7.387 7.696 7.99 8.281 8.585 8.909 9.217 9.547 9.898 10.207 10.546 10.909 11.27 11.615 11.882 11.932 11.575 10.713 9.858 9.022 8.22 7.465 6.771 6.151 5.607 5.038 4.564 4.135 3.69 3.269 2.892 2.533 2.147 1.811 1.523 1.211 0.894 0.623 0.344 0.069 -0.146 -0.368 -0.61 -0.865 -1.137 -1.324 -1.51 -1.816 -2.035 -2.261 -2.37 -2.6 -2.867 -3.149 -3.294 -3.592 -3.753 -3.927 -4.111 -4.506 -4.718 -4.957 -5.246 -5.606 -6.013 -6.444 -7.188 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_56_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_56_43.txt deleted file mode 100644 index 76241327..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_56_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4698 ,KEBNE ,17024987,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:55:45 CET,0.0 0.855 1.275 1.589 1.883 2.126 2.327 2.512 2.848 2.996 3.148 3.283 3.564 3.686 3.938 4.173 4.382 4.488 4.7 4.894 5.164 5.338 5.5 5.74 5.999 6.233 6.44 6.641 6.898 7.163 7.416 7.701 7.982 8.251 8.544 8.868 9.173 9.509 9.881 10.278 10.686 11.143 11.641 12.114 12.662 13.229 13.83 14.473 15.189 15.944 16.619 16.895 16.75 16.405 15.956 15.468 15.03 14.589 14.157 13.712 13.324 12.978 12.643 12.311 11.996 11.705 11.394 11.099 10.841 10.557 10.245 9.993 9.733 9.448 9.224 8.998 8.756 8.5 8.241 8.058 7.851 7.522 7.283 7.036 6.909 6.65 6.391 6.097 5.926 5.612 5.423 5.226 5.018 4.569 4.313 4.027 3.722 3.336 2.832 2.158 -0.077 -2 ,18015 ,KEBNE ,17024988,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:55:47 CET,0.0 1.159 1.532 1.834 2.108 2.345 2.568 2.763 3.086 3.249 3.405 3.543 3.845 3.977 4.215 4.439 4.662 4.767 4.967 5.153 5.411 5.587 5.762 6.002 6.219 6.44 6.671 6.906 7.217 7.495 7.75 8.068 8.384 8.685 9.003 9.363 9.715 10.063 10.433 10.827 11.259 11.712 12.204 12.732 13.309 13.892 14.519 15.163 15.853 16.574 17.19 17.316 17.06 16.683 16.275 15.828 15.39 14.968 14.586 14.159 13.767 13.415 13.057 12.711 12.391 12.099 11.784 11.498 11.246 10.953 10.642 10.397 10.139 9.873 9.669 9.432 9.185 8.931 8.64 8.444 8.246 7.911 7.677 7.466 7.36 7.108 6.822 6.503 6.326 5.994 5.744 5.531 5.321 4.834 4.552 4.234 3.835 3.364 2.839 2.255 -0.304 -3 ,28967 ,KEBNE ,17024989,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:03 CET,0.0 1.146 1.565 1.87 2.125 2.355 2.57 2.775 3.16 3.317 3.463 3.617 3.926 4.075 4.348 4.597 4.828 4.939 5.154 5.357 5.638 5.823 6.013 6.283 6.542 6.791 7.029 7.269 7.576 7.864 8.147 8.496 8.79 9.047 9.371 9.74 10.073 10.437 10.836 11.252 11.657 12.059 12.516 12.983 13.533 14.138 14.811 15.556 16.311 17.03 17.632 17.734 17.529 17.143 16.709 16.268 15.823 15.367 14.969 14.571 14.213 13.896 13.567 13.232 12.911 12.625 12.321 12.035 11.784 11.52 11.26 11.025 10.75 10.472 10.247 10.007 9.763 9.516 9.263 9.076 8.865 8.515 8.287 8.065 7.938 7.67 7.4 7.086 6.922 6.611 6.404 6.207 6.006 5.571 5.294 4.988 4.669 4.314 3.903 3.293 1.573 -4 ,22493 ,KEBNE ,17024990,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:09 CET,0.0 1.085 1.517 1.851 2.096 2.335 2.56 2.758 3.1 3.252 3.404 3.544 3.832 3.951 4.207 4.464 4.683 4.791 5.011 5.206 5.471 5.651 5.823 6.057 6.283 6.522 6.759 6.975 7.252 7.52 7.78 8.105 8.411 8.674 8.963 9.303 9.624 9.977 10.361 10.742 11.144 11.591 12.079 12.56 13.092 13.652 14.306 15.027 15.802 16.61 17.269 17.421 17.198 16.836 16.481 16.092 15.674 15.246 14.859 14.457 14.104 13.766 13.424 13.092 12.784 12.49 12.151 11.837 11.569 11.295 11.007 10.756 10.483 10.207 10.001 9.777 9.531 9.288 9.038 8.857 8.691 8.453 8.24 7.995 7.876 7.624 7.357 7.088 6.941 6.627 6.437 6.257 6.051 5.581 5.344 5.08 4.771 4.421 4.001 3.404 1.789 -5 ,18948 ,KEBNE ,17024991,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:18 CET,0.0 0.832 1.254 1.606 1.908 2.156 2.364 2.566 2.96 3.146 3.309 3.442 3.739 3.871 4.125 4.384 4.622 4.73 4.941 5.155 5.441 5.606 5.775 6.029 6.257 6.473 6.689 6.9 7.185 7.447 7.694 7.985 8.249 8.503 8.783 9.09 9.389 9.703 10.058 10.425 10.808 11.255 11.736 12.206 12.754 13.344 13.979 14.654 15.36 16.038 16.606 16.716 16.498 16.165 15.743 15.282 14.837 14.401 14.001 13.569 13.199 12.885 12.574 12.263 11.953 11.661 11.348 11.04 10.772 10.501 10.199 9.957 9.71 9.44 9.228 8.999 8.756 8.488 8.192 8.009 7.831 7.526 7.291 7.052 6.931 6.676 6.409 6.118 5.961 5.636 5.415 5.222 5.015 4.539 4.299 4.032 3.682 3.282 2.819 2.179 -0.024 -6 ,4268 ,KEBNE ,17024992,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:44 CET,0.0 1.686 2.139 2.464 2.738 3.022 3.279 3.488 3.852 4.01 4.169 4.322 4.62 4.769 5.058 5.335 5.584 5.699 5.928 6.142 6.453 6.643 6.812 7.08 7.356 7.607 7.826 8.033 8.328 8.609 8.868 9.19 9.503 9.794 10.128 10.489 10.821 11.19 11.58 12.006 12.457 12.92 13.416 13.911 14.507 15.152 15.843 16.559 17.309 18.051 18.703 18.866 18.625 18.229 17.798 17.319 16.811 16.325 15.904 15.481 15.092 14.715 14.334 13.955 13.595 13.264 12.919 12.602 12.313 12.004 11.685 11.421 11.124 10.803 10.566 10.325 10.066 9.793 9.513 9.319 9.119 8.811 8.596 8.356 8.227 7.957 7.69 7.423 7.275 6.962 6.783 6.605 6.414 5.989 5.732 5.447 5.145 4.796 4.378 3.801 1.603 -7 ,24417 ,KEBNE ,17024993,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:18 CET,0.0 0.918 1.288 1.603 1.857 2.079 2.292 2.497 2.855 3.014 3.184 3.356 3.657 3.797 4.07 4.338 4.59 4.704 4.921 5.134 5.44 5.633 5.827 6.121 6.412 6.695 6.951 7.198 7.511 7.812 8.104 8.437 8.742 9.046 9.402 9.755 10.071 10.434 10.816 11.214 11.609 12.012 12.495 12.989 13.507 14.04 14.672 15.348 16.06 16.79 17.442 17.627 17.444 17.094 16.702 16.294 15.874 15.448 15.037 14.581 14.207 13.869 13.51 13.165 12.828 12.503 12.152 11.839 11.577 11.304 11.021 10.775 10.491 10.188 9.957 9.727 9.509 9.271 9.01 8.826 8.619 8.309 8.108 7.883 7.761 7.468 7.142 6.831 6.672 6.362 6.188 6.004 5.812 5.375 5.109 4.838 4.541 4.178 3.743 3.189 1.116 -8 ,18495 ,KEBNE ,17024994,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:56:01 CET,0.0 1.306 1.817 2.202 2.502 2.748 2.976 3.166 3.493 3.651 3.807 3.944 4.228 4.346 4.59 4.843 5.07 5.176 5.391 5.603 5.913 6.11 6.288 6.554 6.802 7.026 7.251 7.478 7.778 8.064 8.336 8.668 8.982 9.281 9.616 9.991 10.333 10.687 11.098 11.535 11.98 12.433 12.952 13.484 14.117 14.84 15.592 16.355 17.149 17.888 18.508 18.7 18.521 18.175 17.787 17.37 16.929 16.488 16.079 15.656 15.274 14.923 14.587 14.261 13.953 13.671 13.353 13.041 12.779 12.499 12.183 11.922 11.671 11.414 11.191 10.954 10.709 10.45 10.189 10.013 9.822 9.507 9.286 9.047 8.925 8.692 8.444 8.152 8.0 7.682 7.453 7.247 7.026 6.557 6.278 5.96 5.605 5.214 4.742 4.075 1.338 -9 ,30050 ,KEBNE ,17024995,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:04 CET,0.0 1.161 1.589 1.893 2.184 2.46 2.719 2.95 3.33 3.504 3.671 3.821 4.124 4.274 4.532 4.768 5.007 5.123 5.342 5.541 5.823 6.02 6.208 6.458 6.706 6.943 7.169 7.393 7.665 7.934 8.203 8.497 8.774 9.056 9.394 9.75 10.052 10.398 10.778 11.156 11.54 11.966 12.44 12.914 13.435 13.995 14.638 15.294 15.986 16.666 17.231 17.337 17.128 16.772 16.357 15.888 15.448 15.004 14.572 14.131 13.738 13.375 13.028 12.691 12.358 12.046 11.705 11.401 11.122 10.858 10.6 10.364 10.111 9.841 9.639 9.432 9.21 8.986 8.753 8.586 8.408 8.119 7.928 7.716 7.596 7.36 7.092 6.816 6.681 6.386 6.237 6.067 5.901 5.524 5.286 5.028 4.751 4.437 4.071 3.592 1.804 -10 ,20222 ,KEBNE ,17024996,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:15 CET,0.0 0.782 1.191 1.488 1.757 1.981 2.164 2.35 2.7 2.859 3.0 3.09 3.384 3.511 3.741 3.966 4.193 4.304 4.52 4.724 5.005 5.185 5.379 5.67 5.931 6.168 6.39 6.601 6.88 7.168 7.434 7.735 8.015 8.295 8.639 9.039 9.409 9.788 10.21 10.635 11.041 11.492 12.003 12.472 12.98 13.576 14.244 14.932 15.683 16.452 17.134 17.306 17.166 16.887 16.545 16.125 15.658 15.204 14.793 14.385 14.026 13.667 13.282 12.906 12.571 12.266 11.917 11.596 11.323 11.036 10.729 10.475 10.19 9.882 9.653 9.405 9.133 8.859 8.594 8.403 8.203 7.889 7.662 7.41 7.272 7.006 6.73 6.446 6.303 6.002 5.845 5.664 5.493 5.137 4.924 4.69 4.434 4.143 3.755 3.182 1.679 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_56_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_56_57.txt deleted file mode 100644 index 8c59872c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_56_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6342 ,TETRA ,17559864,Sat Nov 27 09:40:01 CET,Sat Nov 27 11:32:48 CET,0.0 0.53 0.835 1.092 1.316 1.512 1.703 1.9 2.278 2.461 2.626 2.767 3.061 3.199 3.477 3.737 3.98 4.102 4.34 4.571 4.904 5.123 5.328 5.618 5.904 6.175 6.445 6.706 7.039 7.354 7.653 8.015 8.362 8.685 9.062 9.504 9.937 10.421 10.925 11.426 11.945 12.526 13.216 13.919 14.735 15.647 16.668 17.825 19.17 20.672 22.412 23.661 24.225 24.477 24.542 24.504 24.39 24.207 23.993 23.724 23.474 23.252 23.006 22.759 22.5 22.24 21.972 21.714 21.492 21.276 21.068 20.902 20.706 20.489 20.327 20.148 19.954 19.764 19.572 19.428 19.278 19.053 18.891 18.729 18.646 18.465 18.275 18.075 17.971 17.717 17.614 17.491 17.362 17.098 16.945 16.781 16.573 16.321 16.059 15.756 14.912 -2 ,21985 ,TETRA ,17559865,Sat Nov 27 09:40:00 CET,Sat Nov 27 11:32:43 CET,0.0 0.941 1.343 1.663 1.973 2.255 2.471 2.673 3.066 3.244 3.408 3.568 3.87 4.01 4.28 4.548 4.804 4.921 5.136 5.348 5.665 5.874 6.089 6.399 6.697 6.981 7.242 7.488 7.799 8.105 8.399 8.769 9.124 9.45 9.866 10.351 10.782 11.24 11.715 12.225 12.785 13.383 14.047 14.728 15.544 16.462 17.482 18.612 19.943 21.503 23.301 24.621 25.243 25.474 25.542 25.479 25.334 25.161 24.968 24.734 24.489 24.227 23.951 23.695 23.434 23.189 22.923 22.68 22.477 22.239 21.985 21.764 21.533 21.306 21.126 20.945 20.743 20.52 20.29 20.129 19.971 19.725 19.565 19.403 19.312 19.122 18.923 18.714 18.611 18.366 18.275 18.148 18.02 17.735 17.582 17.432 17.265 17.06 16.812 16.476 15.345 -3 ,11101 ,TETRA ,17559866,Sat Nov 27 09:40:00 CET,Sat Nov 27 11:31:29 CET,0.0 0.961 1.401 1.794 2.112 2.376 2.61 2.82 3.228 3.41 3.587 3.79 4.107 4.261 4.563 4.851 5.136 5.267 5.513 5.762 6.123 6.351 6.574 6.901 7.204 7.507 7.794 8.05 8.381 8.7 9.0 9.364 9.727 10.074 10.459 10.871 11.287 11.731 12.192 12.723 13.272 13.861 14.579 15.308 16.127 17.033 18.115 19.326 20.666 22.246 24.071 25.481 26.158 26.442 26.526 26.384 26.114 25.849 25.617 25.374 25.127 24.863 24.591 24.319 24.055 23.805 23.531 23.264 23.023 22.761 22.479 22.247 22.014 21.775 21.59 21.389 21.183 20.981 20.766 20.605 20.429 20.18 20.02 19.846 19.755 19.567 19.362 19.13 19.007 18.748 18.658 18.534 18.391 18.076 17.913 17.731 17.534 17.322 17.089 16.813 16.082 -4 ,1910 ,TETRA ,17559867,Sat Nov 27 09:40:00 CET,Sat Nov 27 11:31:28 CET,0.0 1.031 1.502 1.85 2.153 2.421 2.666 2.891 3.329 3.524 3.696 3.852 4.154 4.293 4.55 4.791 5.027 5.146 5.391 5.65 6.009 6.228 6.455 6.772 7.076 7.388 7.682 7.956 8.309 8.662 9.009 9.415 9.813 10.208 10.648 11.121 11.573 12.065 12.56 13.052 13.581 14.203 14.925 15.628 16.428 17.342 18.355 19.453 20.767 22.288 24.048 25.361 25.98 26.19 26.177 26.078 25.948 25.783 25.596 25.392 25.219 25.02 24.804 24.592 24.374 24.163 23.927 23.727 23.572 23.401 23.209 23.061 22.905 22.727 22.58 22.42 22.257 22.106 21.939 21.811 21.686 21.48 21.335 21.192 21.114 20.958 20.793 20.584 20.467 20.213 20.145 20.03 19.904 19.595 19.423 19.251 19.051 18.818 18.523 18.165 17.44 -5 ,26450 ,TETRA ,17559868,Sat Nov 27 09:41:00 CET,Sat Nov 27 11:32:16 CET,0.0 0.676 0.959 1.237 1.501 1.745 2.0 2.216 2.587 2.765 2.932 3.1 3.406 3.546 3.828 4.113 4.378 4.499 4.74 4.972 5.29 5.511 5.729 6.032 6.327 6.616 6.894 7.163 7.522 7.865 8.194 8.58 8.933 9.29 9.71 10.174 10.622 11.123 11.652 12.199 12.793 13.481 14.258 15.008 15.861 16.824 17.93 19.139 20.506 22.068 23.897 25.225 25.882 26.192 26.28 26.274 26.188 26.046 25.903 25.7 25.491 25.277 25.031 24.774 24.509 24.248 23.967 23.689 23.436 23.183 22.92 22.699 22.454 22.184 21.954 21.696 21.455 21.225 20.974 20.792 20.598 20.29 20.076 19.852 19.733 19.476 19.218 18.959 18.823 18.544 18.389 18.233 18.078 17.73 17.54 17.336 17.117 16.874 16.562 16.159 15.068 -6 ,12346 ,TETRA ,17559869,Sat Nov 27 09:41:00 CET,Sat Nov 27 11:32:25 CET,0.0 0.898 1.187 1.442 1.703 1.953 2.184 2.403 2.845 3.048 3.222 3.382 3.689 3.835 4.111 4.389 4.651 4.774 5.023 5.264 5.592 5.796 6.001 6.304 6.602 6.876 7.125 7.375 7.701 8.022 8.34 8.724 9.084 9.428 9.837 10.284 10.713 11.191 11.71 12.262 12.824 13.457 14.206 14.937 15.787 16.738 17.823 19.047 20.428 21.992 23.818 25.14 25.792 26.099 26.178 26.14 26.064 25.933 25.76 25.569 25.391 25.187 24.919 24.639 24.373 24.098 23.8 23.524 23.28 23.053 22.818 22.595 22.378 22.178 21.999 21.793 21.587 21.384 21.164 20.998 20.816 20.524 20.329 20.143 20.042 19.837 19.625 19.405 19.299 19.049 18.98 18.856 18.724 18.454 18.316 18.161 18.005 17.826 17.625 17.402 16.949 -7 ,18776 ,TETRA ,17559870,Sat Nov 27 09:41:00 CET,Sat Nov 27 11:33:25 CET,0.0 1.552 2.067 2.43 2.732 3.0 3.245 3.491 3.946 4.145 4.324 4.507 4.825 4.982 5.282 5.569 5.854 6.004 6.288 6.541 6.898 7.131 7.352 7.685 8.017 8.326 8.621 8.911 9.285 9.626 9.963 10.378 10.769 11.157 11.619 12.126 12.589 13.099 13.666 14.251 14.816 15.435 16.144 16.859 17.686 18.585 19.673 20.884 22.217 23.737 25.508 26.738 27.296 27.57 27.625 27.523 27.346 27.159 26.981 26.747 26.48 26.217 25.956 25.715 25.472 25.22 24.936 24.693 24.488 24.27 24.03 23.814 23.589 23.35 23.168 22.999 22.822 22.626 22.431 22.287 22.131 21.89 21.714 21.53 21.434 21.222 20.988 20.747 20.622 20.362 20.252 20.109 19.956 19.606 19.411 19.183 18.945 18.692 18.396 17.946 16.393 -8 ,5911 ,TETRA ,17559871,Sat Nov 27 09:41:00 CET,Sat Nov 27 11:33:44 CET,0.0 1.312 1.786 2.176 2.469 2.741 3.012 3.25 3.641 3.813 3.985 4.131 4.431 4.58 4.857 5.126 5.378 5.503 5.751 5.994 6.348 6.564 6.764 7.058 7.346 7.628 7.907 8.182 8.531 8.865 9.192 9.574 9.947 10.313 10.733 11.23 11.728 12.231 12.71 13.205 13.743 14.342 15.044 15.757 16.581 17.488 18.499 19.65 20.97 22.411 24.108 25.382 25.931 26.142 26.224 26.192 26.058 25.861 25.632 25.357 25.113 24.87 24.624 24.38 24.132 23.89 23.615 23.354 23.137 22.907 22.648 22.431 22.21 21.964 21.769 21.573 21.383 21.189 20.974 20.835 20.694 20.449 20.275 20.078 19.974 19.775 19.574 19.363 19.24 18.97 18.879 18.754 18.624 18.346 18.192 18.004 17.788 17.545 17.281 16.973 15.916 -9 ,17022 ,TETRA ,17559872,Sat Nov 27 09:41:00 CET,Sat Nov 27 11:32:17 CET,0.0 1.037 1.457 1.797 2.094 2.357 2.599 2.819 3.205 3.386 3.55 3.694 3.983 4.116 4.389 4.662 4.934 5.069 5.344 5.624 6.022 6.275 6.5 6.8 7.102 7.399 7.683 7.953 8.302 8.645 8.984 9.398 9.799 10.165 10.571 11.025 11.473 11.954 12.453 12.985 13.589 14.305 15.069 15.78 16.596 17.493 18.5 19.603 20.876 22.352 24.094 25.344 25.824 25.94 25.976 25.989 25.916 25.782 25.578 25.338 25.158 24.976 24.778 24.581 24.381 24.168 23.924 23.707 23.518 23.323 23.117 22.931 22.73 22.501 22.32 22.139 21.939 21.742 21.557 21.419 21.272 21.068 20.923 20.748 20.655 20.469 20.272 20.063 19.956 19.704 19.627 19.507 19.372 19.096 18.953 18.792 18.608 18.379 18.11 17.758 16.85 -10 ,24395 ,TETRA ,17559873,Sat Nov 27 09:41:01 CET,Sat Nov 27 11:32:14 CET,0.0 0.77 1.255 1.615 1.887 2.134 2.36 2.57 2.99 3.19 3.374 3.555 3.869 4.023 4.298 4.55 4.8 4.924 5.159 5.385 5.714 5.924 6.133 6.433 6.716 6.981 7.236 7.473 7.796 8.141 8.493 8.913 9.284 9.616 9.996 10.423 10.824 11.292 11.816 12.339 12.879 13.49 14.209 14.951 15.813 16.754 17.849 19.096 20.494 22.062 23.842 25.169 25.772 26.027 26.132 26.054 25.894 25.729 25.527 25.254 24.999 24.766 24.504 24.236 24.004 23.779 23.527 23.294 23.068 22.818 22.563 22.342 22.1 21.855 21.661 21.443 21.217 21.003 20.78 20.625 20.473 20.234 20.061 19.88 19.792 19.614 19.415 19.206 19.1 18.85 18.767 18.64 18.504 18.24 18.086 17.917 17.733 17.505 17.247 16.94 16.132 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_56_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_56_58.txt deleted file mode 100644 index 5983a9be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_56_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2199 ,TETRA ,17559874,Sat Nov 27 09:41:58 CET,Sat Nov 27 11:33:03 CET,0.0 1.436 1.818 2.111 2.37 2.607 2.815 3.026 3.416 3.571 3.712 3.822 4.109 4.232 4.475 4.69 4.893 4.994 5.18 5.368 5.664 5.853 6.028 6.269 6.508 6.743 6.974 7.198 7.473 7.737 7.991 8.28 8.545 8.806 9.111 9.431 9.717 10.008 10.31 10.644 10.994 11.375 11.802 12.178 12.577 12.987 13.388 13.752 14.087 14.289 14.188 13.606 12.906 12.227 11.569 10.903 10.284 9.717 9.199 8.65 8.162 7.735 7.352 6.984 6.627 6.275 5.871 5.489 5.163 4.845 4.524 4.247 3.95 3.655 3.437 3.209 2.969 2.718 2.462 2.282 2.102 1.835 1.646 1.46 1.365 1.143 0.907 0.673 0.556 0.287 0.168 0.022 -0.121 -0.435 -0.603 -0.788 -1.002 -1.252 -1.566 -1.933 -2.87 -2 ,27989 ,TETRA ,17559875,Sat Nov 27 09:42:01 CET,Sat Nov 27 11:33:06 CET,0.0 1.259 1.669 1.964 2.184 2.389 2.583 2.769 3.137 3.308 3.473 3.606 3.902 4.029 4.277 4.535 4.77 4.889 5.148 5.392 5.737 5.972 6.191 6.471 6.714 6.952 7.182 7.407 7.712 8.001 8.276 8.624 8.935 9.217 9.554 9.909 10.221 10.573 10.948 11.33 11.719 12.133 12.663 13.149 13.598 14.081 14.565 15.006 15.398 15.696 15.663 15.093 14.432 13.735 13.026 12.33 11.701 11.108 10.588 10.065 9.593 9.157 8.715 8.292 7.922 7.587 7.231 6.897 6.602 6.298 5.991 5.744 5.478 5.197 4.985 4.776 4.571 4.353 4.094 3.92 3.754 3.482 3.307 3.132 3.032 2.834 2.63 2.4 2.279 1.995 1.89 1.761 1.625 1.313 1.143 0.961 0.77 0.534 0.222 -0.205 -3.119 -3 ,9562 ,TETRA ,17559876,Sat Nov 27 09:41:58 CET,Sat Nov 27 11:33:19 CET,0.0 2.727 3.182 3.497 3.728 3.924 4.113 4.285 4.615 4.758 4.889 5.004 5.287 5.417 5.678 5.928 6.164 6.272 6.465 6.65 6.907 7.066 7.218 7.439 7.663 7.896 8.128 8.337 8.595 8.879 9.17 9.52 9.826 10.087 10.404 10.736 11.024 11.334 11.669 12.018 12.358 12.73 13.178 13.602 14.041 14.482 14.924 15.347 15.72 15.936 15.838 15.273 14.573 13.886 13.238 12.592 11.987 11.427 10.937 10.428 9.961 9.548 9.163 8.774 8.384 8.022 7.661 7.332 7.045 6.733 6.402 6.146 5.886 5.617 5.398 5.178 4.961 4.744 4.526 4.37 4.208 3.974 3.807 3.621 3.528 3.335 3.125 2.907 2.793 2.509 2.383 2.239 2.094 1.778 1.598 1.409 1.201 0.962 0.714 0.379 -0.666 -4 ,10029 ,TETRA ,17559877,Sat Nov 27 09:41:59 CET,Sat Nov 27 11:33:13 CET,0.0 1.727 2.245 2.59 2.875 3.147 3.388 3.602 4.018 4.215 4.392 4.555 4.869 5.014 5.27 5.51 5.722 5.836 6.085 6.324 6.647 6.847 7.032 7.295 7.563 7.809 8.043 8.27 8.556 8.849 9.156 9.536 9.883 10.177 10.487 10.843 11.19 11.547 11.911 12.287 12.677 13.124 13.61 14.035 14.526 15.02 15.48 15.914 16.295 16.534 16.423 15.807 15.138 14.494 13.901 13.333 12.76 12.216 11.73 11.177 10.711 10.328 9.936 9.545 9.176 8.839 8.489 8.184 7.924 7.664 7.394 7.163 6.92 6.662 6.458 6.24 6.019 5.803 5.574 5.411 5.254 5.002 4.813 4.623 4.527 4.32 4.108 3.894 3.778 3.492 3.381 3.236 3.091 2.812 2.657 2.478 2.291 2.079 1.824 1.497 0.185 -5 ,7575 ,TETRA ,17559878,Sat Nov 27 09:41:59 CET,Sat Nov 27 11:32:14 CET,0.0 1.501 1.982 2.313 2.556 2.785 3.019 3.231 3.619 3.797 3.978 4.177 4.503 4.658 4.906 5.137 5.372 5.489 5.725 5.95 6.256 6.441 6.615 6.867 7.104 7.344 7.583 7.803 8.072 8.322 8.577 8.879 9.163 9.45 9.748 10.066 10.371 10.68 11.001 11.343 11.718 12.118 12.51 12.883 13.328 13.769 14.193 14.564 14.9 15.143 15.101 14.591 13.911 13.239 12.588 11.949 11.37 10.831 10.338 9.812 9.336 8.901 8.468 8.07 7.695 7.356 7.03 6.702 6.383 6.066 5.781 5.558 5.327 5.086 4.882 4.647 4.413 4.179 3.942 3.781 3.601 3.31 3.11 2.902 2.797 2.588 2.37 2.141 2.021 1.747 1.659 1.525 1.389 1.085 0.911 0.728 0.539 0.328 0.087 -0.216 -1.173 -6 ,27307 ,TETRA ,17559879,Sat Nov 27 09:41:59 CET,Sat Nov 27 11:34:01 CET,0.0 1.101 1.519 1.839 2.148 2.418 2.637 2.828 3.16 3.31 3.459 3.574 3.849 3.965 4.198 4.427 4.634 4.731 4.926 5.115 5.392 5.566 5.728 5.951 6.173 6.392 6.582 6.769 7.007 7.241 7.486 7.755 7.996 8.276 8.646 9.036 9.396 9.772 10.118 10.462 10.823 11.207 11.612 11.985 12.392 12.817 13.246 13.662 14.024 14.258 14.167 13.598 12.937 12.28 11.63 10.998 10.404 9.814 9.275 8.732 8.255 7.792 7.342 6.93 6.534 6.175 5.809 5.471 5.191 4.897 4.572 4.29 3.99 3.691 3.455 3.225 2.997 2.748 2.469 2.268 2.058 1.719 1.503 1.285 1.163 0.904 0.631 0.344 0.201 -0.096 -0.23 -0.368 -0.504 -0.791 -0.946 -1.131 -1.335 -1.532 -1.803 -2.171 -2.953 -7 ,7186 ,TETRA ,17559880,Sat Nov 27 09:41:59 CET,Sat Nov 27 11:34:08 CET,0.0 1.948 2.437 2.764 3.05 3.301 3.53 3.74 4.121 4.312 4.482 4.611 4.909 5.041 5.267 5.487 5.713 5.831 6.052 6.275 6.613 6.815 7.016 7.295 7.552 7.807 8.045 8.275 8.574 8.843 9.089 9.393 9.675 9.926 10.22 10.561 10.878 11.234 11.62 12.005 12.389 12.799 13.237 13.639 14.077 14.537 14.997 15.394 15.714 15.956 15.885 15.259 14.533 13.844 13.172 12.562 12.025 11.51 11.025 10.529 10.1 9.69 9.29 8.916 8.555 8.213 7.868 7.553 7.285 7.012 6.726 6.496 6.235 5.945 5.72 5.501 5.288 5.079 4.857 4.683 4.501 4.232 4.045 3.846 3.737 3.522 3.308 3.088 2.972 2.691 2.579 2.441 2.304 2.015 1.84 1.659 1.477 1.257 0.993 0.614 -1.095 -8 ,9793 ,TETRA ,17559881,Sat Nov 27 09:41:59 CET,Sat Nov 27 11:31:52 CET,0.0 1.393 1.834 2.173 2.452 2.67 2.867 3.066 3.408 3.557 3.709 3.826 4.105 4.227 4.446 4.642 4.86 4.973 5.169 5.349 5.605 5.781 5.947 6.168 6.369 6.553 6.747 6.96 7.238 7.49 7.723 8.006 8.322 8.628 8.933 9.271 9.582 9.889 10.221 10.595 10.969 11.346 11.756 12.146 12.588 13.029 13.468 13.889 14.242 14.442 14.343 13.807 13.11 12.395 11.695 11.031 10.447 9.883 9.388 8.864 8.391 7.935 7.505 7.141 6.768 6.405 6.029 5.682 5.387 5.093 4.783 4.52 4.25 3.971 3.749 3.526 3.309 3.091 2.875 2.725 2.555 2.298 2.115 1.912 1.813 1.618 1.41 1.197 1.084 0.808 0.72 0.59 0.448 0.15 -0.01 -0.189 -0.389 -0.577 -0.785 -1.169 -2.475 -9 ,3794 ,TETRA ,17559882,Sat Nov 27 09:43:00 CET,Sat Nov 27 11:34:13 CET,0.0 1.128 1.559 1.902 2.162 2.374 2.574 2.764 3.117 3.289 3.442 3.551 3.841 3.965 4.2 4.441 4.656 4.754 4.952 5.155 5.466 5.66 5.832 6.083 6.323 6.55 6.765 6.961 7.235 7.511 7.775 8.093 8.418 8.729 9.074 9.484 9.864 10.245 10.62 10.995 11.365 11.747 12.204 12.626 13.039 13.465 13.903 14.298 14.674 14.953 14.93 14.355 13.598 12.85 12.161 11.484 10.875 10.356 9.874 9.345 8.87 8.444 8.013 7.599 7.215 6.854 6.442 6.067 5.749 5.394 5.03 4.727 4.41 4.093 3.846 3.596 3.338 3.07 2.81 2.629 2.455 2.196 2.007 1.829 1.743 1.547 1.324 1.087 0.963 0.687 0.606 0.462 0.311 0.008 -0.153 -0.322 -0.525 -0.745 -0.992 -1.336 -2.485 -10 ,22188 ,TETRA ,17559883,Sat Nov 27 09:43:00 CET,Sat Nov 27 11:38:41 CET,0.0 1.104 1.457 1.756 1.999 2.211 2.422 2.612 2.933 3.081 3.228 3.343 3.627 3.747 3.999 4.24 4.447 4.55 4.748 4.939 5.229 5.407 5.569 5.802 6.043 6.287 6.523 6.744 7.032 7.303 7.544 7.841 8.128 8.404 8.724 9.069 9.384 9.743 10.121 10.465 10.806 11.203 11.66 12.093 12.55 12.996 13.488 13.954 14.326 14.539 14.473 13.977 13.346 12.712 12.065 11.407 10.806 10.253 9.745 9.227 8.796 8.411 8.025 7.659 7.327 7.016 6.681 6.391 6.134 5.852 5.557 5.315 5.067 4.789 4.561 4.347 4.126 3.889 3.657 3.494 3.318 3.046 2.857 2.652 2.547 2.338 2.122 1.895 1.779 1.505 1.432 1.308 1.167 0.887 0.751 0.586 0.393 0.192 -0.053 -0.356 -1.387 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_60_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_60_37.txt deleted file mode 100644 index 04e754d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_60_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28442 ,KEBNE ,17024997,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:56:56 CET,0.0 0.459 0.679 0.843 1.003 1.165 1.315 1.442 1.686 1.802 1.913 1.98 2.238 2.346 2.548 2.738 2.918 3.012 3.192 3.357 3.583 3.724 3.862 4.058 4.239 4.412 4.577 4.729 4.93 5.123 5.299 5.519 5.755 5.98 6.223 6.488 6.734 7.004 7.295 7.587 7.883 8.219 8.568 8.9 9.306 9.738 10.159 10.545 10.939 11.257 11.305 10.986 10.553 10.042 9.46 8.9 8.397 7.931 7.52 7.064 6.662 6.287 5.919 5.576 5.246 4.93 4.605 4.316 4.068 3.808 3.543 3.329 3.088 2.828 2.637 2.459 2.275 2.081 1.878 1.733 1.58 1.351 1.186 1.011 0.925 0.746 0.56 0.363 0.259 -0.011 -0.089 -0.201 -0.333 -0.619 -0.772 -0.932 -1.115 -1.328 -1.548 -1.825 -2.322 -2 ,25759 ,KEBNE ,17024998,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:57:06 CET,0.0 0.913 1.213 1.473 1.711 1.878 2.018 2.16 2.436 2.562 2.676 2.75 2.998 3.097 3.274 3.43 3.575 3.644 3.787 3.919 4.106 4.229 4.346 4.513 4.679 4.834 4.977 5.127 5.313 5.497 5.691 5.92 6.146 6.367 6.61 6.872 7.125 7.393 7.673 7.978 8.291 8.618 8.988 9.323 9.686 10.097 10.531 10.949 11.328 11.662 11.795 11.49 11.008 10.452 9.899 9.363 8.864 8.382 7.948 7.499 7.094 6.713 6.343 5.998 5.675 5.387 5.085 4.804 4.569 4.328 4.072 3.862 3.656 3.443 3.27 3.083 2.886 2.682 2.473 2.331 2.177 1.934 1.774 1.605 1.52 1.352 1.167 0.963 0.856 0.599 0.523 0.39 0.253 -0.034 -0.184 -0.342 -0.513 -0.732 -1.029 -1.408 -2.089 -3 ,28315 ,KEBNE ,17024999,Wed Dec 22 11:21:08 CET,Wed Dec 22 12:56:56 CET,0.0 0.693 1.07 1.289 1.479 1.661 1.832 1.986 2.257 2.383 2.502 2.584 2.844 2.949 3.149 3.332 3.504 3.589 3.762 3.922 4.137 4.284 4.426 4.63 4.83 5.02 5.205 5.39 5.633 5.852 6.057 6.32 6.568 6.797 7.062 7.352 7.627 7.935 8.253 8.602 8.96 9.327 9.742 10.134 10.554 11.003 11.503 11.99 12.442 12.849 13.012 12.73 12.205 11.607 11.039 10.466 9.935 9.429 8.952 8.476 8.089 7.73 7.363 7.005 6.673 6.378 6.08 5.829 5.601 5.359 5.117 4.907 4.693 4.479 4.302 4.112 3.919 3.723 3.523 3.381 3.229 2.984 2.812 2.647 2.558 2.371 2.178 1.981 1.868 1.579 1.45 1.302 1.131 0.711 0.495 0.286 0.05 -0.226 -0.536 -0.928 -2.01 -4 ,16889 ,KEBNE ,17025000,Wed Dec 22 11:22:09 CET,Wed Dec 22 12:57:16 CET,0.0 0.497 0.75 0.965 1.174 1.353 1.52 1.679 1.953 2.085 2.224 2.354 2.624 2.736 2.945 3.126 3.303 3.389 3.555 3.725 3.977 4.137 4.278 4.476 4.691 4.916 5.13 5.331 5.588 5.824 6.04 6.304 6.547 6.779 7.055 7.36 7.655 7.978 8.336 8.706 9.066 9.465 9.884 10.275 10.727 11.217 11.781 12.312 12.759 13.065 13.14 12.817 12.291 11.713 11.118 10.553 10.049 9.523 9.03 8.559 8.16 7.797 7.428 7.032 6.656 6.329 5.979 5.661 5.384 5.1 4.823 4.613 4.392 4.144 3.96 3.785 3.604 3.421 3.234 3.1 2.961 2.745 2.587 2.418 2.333 2.143 1.94 1.736 1.625 1.353 1.271 1.136 0.982 0.649 0.452 0.242 0.012 -0.257 -0.574 -0.976 -1.872 -5 ,23331 ,KEBNE ,17025001,Wed Dec 22 11:22:09 CET,Wed Dec 22 12:57:14 CET,0.0 0.499 0.781 1.008 1.215 1.399 1.567 1.721 1.994 2.122 2.246 2.322 2.591 2.707 2.913 3.106 3.284 3.373 3.55 3.717 3.953 4.104 4.248 4.453 4.647 4.831 5.011 5.199 5.443 5.658 5.865 6.135 6.4 6.658 6.945 7.25 7.544 7.861 8.185 8.521 8.876 9.282 9.724 10.124 10.597 11.111 11.609 12.09 12.572 12.985 13.164 12.812 12.296 11.741 11.165 10.603 10.07 9.541 9.063 8.577 8.174 7.841 7.512 7.198 6.899 6.605 6.306 6.042 5.81 5.582 5.344 5.141 4.935 4.728 4.564 4.383 4.194 4.003 3.802 3.662 3.515 3.271 3.101 2.929 2.844 2.675 2.494 2.281 2.168 1.895 1.808 1.69 1.56 1.284 1.137 0.955 0.745 0.511 0.249 -0.038 -0.491 -6 ,5722 ,KEBNE ,17025002,Wed Dec 22 11:22:09 CET,Wed Dec 22 12:56:41 CET,0.0 0.784 1.055 1.304 1.529 1.728 1.911 2.082 2.378 2.509 2.635 2.714 2.974 3.085 3.296 3.49 3.661 3.743 3.907 4.066 4.29 4.431 4.58 4.806 5.012 5.199 5.373 5.541 5.766 5.98 6.188 6.444 6.693 6.941 7.224 7.534 7.832 8.151 8.473 8.801 9.129 9.493 9.887 10.267 10.698 11.129 11.595 12.076 12.547 12.942 13.039 12.723 12.168 11.552 10.977 10.397 9.837 9.318 8.875 8.428 8.037 7.676 7.329 7.001 6.688 6.39 6.08 5.812 5.583 5.346 5.112 4.914 4.703 4.493 4.319 4.138 3.954 3.746 3.541 3.407 3.251 3.01 2.859 2.701 2.613 2.432 2.243 2.054 1.961 1.704 1.613 1.478 1.34 1.006 0.822 0.631 0.421 0.196 -0.037 -0.337 -1.072 -7 ,2617 ,KEBNE ,17025003,Wed Dec 22 11:22:10 CET,Wed Dec 22 12:57:07 CET,0.0 0.354 0.597 0.796 0.966 1.113 1.248 1.374 1.616 1.728 1.822 1.834 2.073 2.176 2.384 2.571 2.75 2.847 3.039 3.21 3.443 3.596 3.745 3.955 4.148 4.327 4.502 4.676 4.907 5.13 5.344 5.594 5.821 6.032 6.298 6.626 6.923 7.212 7.488 7.776 8.083 8.436 8.853 9.224 9.608 10.018 10.473 10.899 11.296 11.664 11.827 11.584 11.144 10.612 10.11 9.639 9.176 8.719 8.306 7.849 7.445 7.091 6.728 6.382 6.077 5.795 5.479 5.185 4.93 4.679 4.405 4.173 3.96 3.733 3.558 3.387 3.198 2.997 2.791 2.651 2.51 2.283 2.126 1.951 1.859 1.673 1.473 1.273 1.167 0.903 0.836 0.715 0.584 0.272 0.095 -0.106 -0.337 -0.549 -0.769 -1.087 -2.272 -8 ,6659 ,KEBNE ,17025004,Wed Dec 22 11:22:09 CET,Wed Dec 22 12:57:51 CET,0.0 0.504 0.75 0.956 1.113 1.262 1.39 1.505 1.72 1.83 1.936 1.968 2.21 2.291 2.445 2.594 2.745 2.816 2.954 3.099 3.293 3.403 3.519 3.697 3.862 4.023 4.178 4.324 4.515 4.692 4.854 5.04 5.227 5.434 5.684 5.954 6.202 6.481 6.774 7.066 7.37 7.695 8.065 8.433 8.819 9.216 9.655 10.116 10.564 10.931 11.053 10.726 10.238 9.662 9.084 8.542 8.046 7.57 7.137 6.692 6.307 5.958 5.625 5.301 4.982 4.683 4.37 4.115 3.897 3.658 3.41 3.2 2.985 2.763 2.59 2.413 2.229 2.039 1.843 1.706 1.562 1.322 1.149 0.981 0.888 0.697 0.512 0.313 0.208 -0.061 -0.131 -0.253 -0.39 -0.686 -0.848 -1.035 -1.23 -1.423 -1.658 -1.957 -2.724 -9 ,21617 ,KEBNE ,17025005,Wed Dec 22 11:22:10 CET,Wed Dec 22 12:58:12 CET,0.0 0.453 0.71 0.914 1.099 1.269 1.415 1.545 1.791 1.902 2.004 2.081 2.344 2.45 2.65 2.835 3.028 3.122 3.282 3.434 3.653 3.785 3.918 4.115 4.302 4.474 4.638 4.795 5.004 5.238 5.462 5.708 5.939 6.159 6.416 6.706 6.985 7.268 7.552 7.849 8.156 8.499 8.909 9.323 9.779 10.22 10.631 11.064 11.504 11.893 12.116 11.846 11.33 10.743 10.24 9.746 9.262 8.818 8.383 7.95 7.561 7.189 6.826 6.483 6.177 5.874 5.557 5.284 5.036 4.772 4.496 4.273 4.056 3.822 3.637 3.468 3.283 3.078 2.864 2.715 2.563 2.324 2.173 2.008 1.919 1.753 1.565 1.335 1.212 0.932 0.849 0.725 0.597 0.342 0.189 0.014 -0.171 -0.365 -0.589 -0.936 -1.702 -10 ,1642 ,KEBNE ,17025006,Wed Dec 22 11:22:10 CET,Wed Dec 22 12:58:10 CET,0.0 1.154 1.46 1.657 1.833 1.982 2.115 2.241 2.513 2.648 2.759 2.808 3.063 3.167 3.338 3.503 3.656 3.725 3.86 3.985 4.166 4.288 4.409 4.58 4.749 4.904 5.041 5.178 5.358 5.538 5.73 5.975 6.194 6.398 6.649 6.939 7.209 7.481 7.769 8.07 8.369 8.721 9.117 9.48 9.877 10.305 10.778 11.248 11.707 12.115 12.291 11.972 11.398 10.762 10.161 9.607 9.047 8.51 8.037 7.56 7.189 6.852 6.52 6.208 5.922 5.653 5.365 5.112 4.889 4.643 4.389 4.19 3.977 3.75 3.582 3.41 3.227 3.039 2.847 2.704 2.551 2.311 2.113 1.888 1.774 1.546 1.299 1.023 0.888 0.6 0.493 0.368 0.239 -0.032 -0.206 -0.423 -0.663 -0.892 -1.12 -1.428 -2.118 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_60_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_60_61.txt deleted file mode 100644 index d1596b99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_60_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17064 ,TETRA ,17559884,Sat Nov 27 09:45:00 CET,Sat Nov 27 11:35:48 CET,0.0 1.777 2.215 2.59 2.946 3.23 3.477 3.708 4.107 4.291 4.475 4.656 4.959 5.107 5.41 5.705 5.968 6.089 6.326 6.556 6.91 7.143 7.351 7.637 7.906 8.175 8.45 8.722 9.058 9.386 9.699 10.063 10.404 10.738 11.168 11.638 12.031 12.427 12.832 13.253 13.687 14.176 14.744 15.288 15.883 16.519 17.213 17.884 18.567 19.27 19.832 19.865 19.503 19.023 18.561 18.078 17.598 17.15 16.756 16.328 15.93 15.574 15.213 14.867 14.528 14.214 13.905 13.604 13.343 13.099 12.809 12.542 12.28 12.033 11.835 11.625 11.446 11.279 11.099 10.969 10.817 10.565 10.394 10.198 10.084 9.853 9.607 9.293 9.131 8.84 8.685 8.51 8.326 7.956 7.731 7.47 7.195 6.892 6.506 6.001 4.395 -2 ,8974 ,TETRA ,17559885,Sat Nov 27 09:45:00 CET,Sat Nov 27 11:34:42 CET,0.0 1.317 1.751 2.078 2.323 2.55 2.754 2.942 3.276 3.433 3.589 3.712 3.99 4.107 4.352 4.578 4.777 4.878 5.075 5.266 5.532 5.691 5.857 6.11 6.343 6.554 6.747 6.94 7.193 7.443 7.681 7.98 8.276 8.558 8.89 9.246 9.569 9.936 10.324 10.722 11.132 11.573 12.087 12.562 13.084 13.649 14.242 14.896 15.553 16.201 16.742 16.77 16.444 16.027 15.606 15.181 14.765 14.354 13.984 13.603 13.255 12.945 12.657 12.352 12.052 11.748 11.412 11.151 10.951 10.738 10.513 10.321 10.128 9.933 9.757 9.575 9.402 9.224 9.026 8.876 8.719 8.465 8.282 8.085 7.983 7.792 7.607 7.403 7.294 7.032 6.954 6.822 6.674 6.33 6.138 5.962 5.77 5.54 5.289 4.924 3.507 -3 ,31791 ,TETRA ,17559886,Sat Nov 27 09:45:00 CET,Sat Nov 27 11:33:30 CET,0.0 1.137 1.52 1.854 2.163 2.395 2.602 2.813 3.202 3.38 3.548 3.67 3.949 4.093 4.378 4.627 4.861 4.97 5.173 5.374 5.671 5.875 6.066 6.308 6.535 6.777 7.024 7.255 7.542 7.819 8.073 8.396 8.73 9.033 9.372 9.749 10.111 10.501 10.911 11.331 11.756 12.246 12.825 13.37 13.972 14.601 15.265 15.969 16.728 17.443 17.951 17.993 17.725 17.311 16.829 16.38 15.974 15.582 15.205 14.786 14.414 14.079 13.741 13.403 13.087 12.795 12.487 12.199 11.957 11.717 11.451 11.217 10.96 10.695 10.496 10.29 10.084 9.869 9.64 9.478 9.307 9.047 8.88 8.711 8.616 8.41 8.195 7.98 7.874 7.616 7.526 7.386 7.238 6.941 6.777 6.584 6.363 6.156 5.894 5.522 4.627 -4 ,10776 ,TETRA ,17559887,Sat Nov 27 09:46:01 CET,Sat Nov 27 11:36:55 CET,0.0 1.675 2.195 2.578 2.903 3.19 3.456 3.706 4.128 4.319 4.513 4.733 5.046 5.196 5.495 5.8 6.089 6.225 6.472 6.7 7.039 7.242 7.436 7.723 7.995 8.242 8.478 8.715 9.018 9.326 9.629 9.996 10.352 10.683 11.05 11.465 11.871 12.29 12.721 13.185 13.672 14.184 14.753 15.341 16.03 16.726 17.446 18.168 18.849 19.44 19.818 19.752 19.436 19.06 18.64 18.189 17.768 17.361 17.006 16.627 16.251 15.896 15.548 15.22 14.927 14.651 14.361 14.101 13.868 13.622 13.35 13.12 12.856 12.546 12.314 12.101 11.891 11.665 11.431 11.288 11.153 10.9 10.696 10.485 10.38 10.173 9.969 9.751 9.623 9.337 9.204 9.065 8.933 8.642 8.482 8.298 8.08 7.83 7.506 7.096 6.138 -5 ,3983 ,TETRA ,17559888,Sat Nov 27 09:47:01 CET,Sat Nov 27 11:38:32 CET,0.0 2.812 3.283 3.627 3.92 4.209 4.472 4.716 5.14 5.323 5.5 5.676 5.973 6.102 6.333 6.559 6.788 6.894 7.086 7.272 7.55 7.731 7.912 8.175 8.421 8.646 8.863 9.074 9.325 9.554 9.784 10.087 10.378 10.634 10.932 11.298 11.65 12.028 12.435 12.854 13.295 13.762 14.275 14.782 15.327 15.902 16.541 17.166 17.811 18.474 18.882 18.836 18.593 18.256 17.863 17.446 17.042 16.636 16.289 15.929 15.578 15.275 14.965 14.628 14.295 13.994 13.732 13.538 13.365 13.172 12.973 12.816 12.643 12.448 12.307 12.17 12.028 11.872 11.712 11.597 11.467 11.255 11.102 10.944 10.86 10.68 10.485 10.273 10.165 9.912 9.85 9.736 9.601 9.308 9.144 8.957 8.751 8.509 8.218 7.87 6.994 -6 ,666 ,TETRA ,17559889,Sat Nov 27 09:48:02 CET,Sat Nov 27 11:37:55 CET,0.0 1.184 1.54 1.832 2.077 2.276 2.458 2.659 3.03 3.184 3.328 3.447 3.72 3.845 4.086 4.299 4.494 4.59 4.815 5.037 5.349 5.554 5.736 5.985 6.24 6.49 6.721 6.939 7.244 7.549 7.832 8.171 8.499 8.806 9.152 9.524 9.896 10.311 10.715 11.121 11.528 11.991 12.548 13.126 13.796 14.492 15.257 16.056 16.831 17.547 18.091 18.118 17.802 17.363 16.925 16.473 16.044 15.614 15.214 14.821 14.471 14.13 13.795 13.499 13.218 12.931 12.637 12.365 12.1 11.837 11.594 11.38 11.152 10.93 10.756 10.574 10.39 10.192 9.978 9.832 9.684 9.455 9.311 9.165 9.087 8.913 8.726 8.542 8.439 8.168 8.022 7.871 7.72 7.364 7.154 6.924 6.687 6.407 6.079 5.677 4.822 -7 ,20332 ,TETRA ,17559890,Sat Nov 27 09:49:01 CET,Sat Nov 27 11:38:33 CET,0.0 1.956 2.466 2.745 2.965 3.183 3.395 3.575 3.903 4.053 4.19 4.298 4.575 4.696 4.936 5.164 5.375 5.478 5.689 5.903 6.191 6.357 6.523 6.77 6.992 7.195 7.405 7.617 7.879 8.131 8.38 8.698 8.999 9.279 9.608 9.97 10.308 10.67 11.047 11.445 11.837 12.254 12.755 13.259 13.81 14.368 15.003 15.69 16.357 16.973 17.457 17.505 17.167 16.76 16.384 15.988 15.582 15.185 14.814 14.413 14.055 13.737 13.44 13.138 12.862 12.595 12.292 12.039 11.832 11.607 11.385 11.216 11.03 10.835 10.679 10.514 10.328 10.127 9.93 9.801 9.658 9.436 9.288 9.123 9.042 8.881 8.695 8.479 8.361 8.078 7.96 7.831 7.702 7.418 7.249 7.044 6.823 6.599 6.342 5.961 5.049 -8 ,30914 ,TETRA ,17559891,Sat Nov 27 09:49:01 CET,Sat Nov 27 11:38:28 CET,0.0 1.016 1.444 1.779 2.057 2.297 2.52 2.725 3.068 3.214 3.36 3.489 3.776 3.903 4.14 4.362 4.572 4.675 4.881 5.087 5.374 5.545 5.714 5.953 6.188 6.428 6.657 6.899 7.2 7.473 7.741 8.089 8.423 8.714 9.061 9.444 9.799 10.171 10.561 10.973 11.404 11.871 12.377 12.858 13.396 13.993 14.67 15.337 16.029 16.739 17.231 17.193 16.902 16.537 16.15 15.729 15.298 14.904 14.54 14.154 13.843 13.556 13.26 12.979 12.723 12.472 12.191 11.934 11.698 11.443 11.179 10.959 10.732 10.492 10.309 10.143 9.969 9.752 9.517 9.362 9.203 8.948 8.765 8.593 8.508 8.302 8.07 7.819 7.703 7.455 7.332 7.183 7.037 6.704 6.516 6.303 6.038 5.756 5.448 4.964 3.489 -9 ,21085 ,TETRA ,17559892,Sat Nov 27 09:49:01 CET,Sat Nov 27 11:38:36 CET,0.0 1.453 1.963 2.34 2.645 2.929 3.182 3.394 3.787 3.984 4.162 4.33 4.641 4.796 5.083 5.357 5.616 5.742 5.985 6.208 6.527 6.729 6.924 7.209 7.478 7.728 7.967 8.211 8.524 8.812 9.107 9.472 9.802 10.105 10.46 10.861 11.228 11.625 12.067 12.538 13.018 13.529 14.089 14.67 15.358 16.07 16.776 17.501 18.258 19.019 19.594 19.546 19.26 18.871 18.38 17.863 17.419 17.024 16.648 16.247 15.875 15.528 15.211 14.887 14.557 14.257 13.943 13.638 13.375 13.115 12.817 12.563 12.31 12.029 11.804 11.578 11.338 11.079 10.812 10.633 10.446 10.15 9.935 9.705 9.597 9.398 9.19 8.976 8.869 8.603 8.477 8.328 8.174 7.855 7.659 7.439 7.18 6.833 6.438 6.012 3.823 -10 ,11445 ,TETRA ,17559893,Sat Nov 27 09:49:01 CET,Sat Nov 27 11:40:00 CET,0.0 1.291 1.804 2.206 2.534 2.814 3.07 3.293 3.703 3.883 4.052 4.236 4.538 4.687 4.998 5.284 5.554 5.688 5.949 6.19 6.536 6.761 6.978 7.291 7.589 7.865 8.133 8.397 8.74 9.061 9.35 9.699 10.035 10.376 10.787 11.239 11.652 12.075 12.512 12.962 13.427 13.948 14.506 15.063 15.727 16.44 17.213 17.951 18.696 19.423 19.915 19.878 19.549 19.158 18.729 18.247 17.767 17.275 16.807 16.377 16.011 15.668 15.381 15.112 14.839 14.575 14.276 14.01 13.802 13.588 13.353 13.15 12.92 12.681 12.511 12.346 12.175 12.005 11.817 11.662 11.512 11.302 11.137 10.964 10.881 10.685 10.461 10.219 10.098 9.835 9.745 9.622 9.501 9.233 9.076 8.905 8.714 8.499 8.26 7.961 7.178 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_60_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_60_63.txt deleted file mode 100644 index 5752eedb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_60_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18652 ,TETRA ,17559894,Sat Nov 27 09:50:01 CET,Sat Nov 27 11:39:08 CET,0.0 0.641 0.976 1.192 1.401 1.591 1.752 1.899 2.183 2.315 2.442 2.545 2.822 2.932 3.124 3.31 3.479 3.559 3.726 3.875 4.08 4.214 4.344 4.522 4.689 4.854 5.007 5.148 5.34 5.525 5.689 5.891 6.102 6.314 6.543 6.788 7.04 7.303 7.571 7.857 8.148 8.459 8.799 9.127 9.465 9.79 10.108 10.389 10.635 10.709 10.433 9.759 8.998 8.24 7.526 6.857 6.267 5.734 5.257 4.789 4.373 3.981 3.614 3.264 2.942 2.655 2.342 2.058 1.808 1.543 1.284 1.085 0.882 0.663 0.504 0.344 0.172 -0.015 -0.216 -0.35 -0.495 -0.724 -0.875 -1.028 -1.108 -1.286 -1.463 -1.636 -1.725 -1.973 -2.02 -2.138 -2.25 -2.477 -2.605 -2.754 -2.914 -3.09 -3.31 -3.617 -4.563 -2 ,23084 ,TETRA ,17559895,Sat Nov 27 09:49:01 CET,Sat Nov 27 11:39:03 CET,0.0 0.695 0.962 1.184 1.393 1.581 1.74 1.872 2.15 2.29 2.422 2.518 2.774 2.874 3.067 3.228 3.379 3.455 3.596 3.728 3.934 4.081 4.231 4.462 4.679 4.866 5.042 5.237 5.495 5.732 5.955 6.199 6.433 6.654 6.906 7.194 7.43 7.703 8.012 8.329 8.68 9.051 9.402 9.69 9.996 10.32 10.64 10.907 11.141 11.223 10.911 10.159 9.366 8.633 7.927 7.248 6.633 6.063 5.571 5.061 4.638 4.271 3.898 3.533 3.196 2.881 2.524 2.209 1.966 1.725 1.48 1.266 1.04 0.825 0.658 0.467 0.261 0.055 -0.144 -0.266 -0.402 -0.645 -0.814 -0.996 -1.083 -1.243 -1.417 -1.605 -1.705 -1.963 -2.024 -2.138 -2.257 -2.505 -2.64 -2.785 -2.933 -3.102 -3.284 -3.516 -3.982 -3 ,21332 ,TETRA ,17559896,Sat Nov 27 09:50:04 CET,Sat Nov 27 11:39:11 CET,0.0 0.894 1.313 1.57 1.783 1.972 2.136 2.301 2.598 2.728 2.855 2.932 3.183 3.28 3.46 3.628 3.813 3.9 4.061 4.22 4.439 4.575 4.706 4.894 5.074 5.248 5.41 5.561 5.758 5.937 6.112 6.333 6.546 6.757 6.995 7.257 7.499 7.758 8.015 8.273 8.552 8.856 9.178 9.482 9.814 10.119 10.432 10.715 10.934 11.007 10.747 10.006 9.191 8.43 7.724 7.057 6.467 5.899 5.383 4.902 4.498 4.124 3.742 3.376 3.038 2.737 2.439 2.18 1.964 1.745 1.507 1.294 1.077 0.86 0.691 0.522 0.348 0.163 -0.037 -0.183 -0.347 -0.586 -0.731 -0.887 -0.969 -1.129 -1.292 -1.466 -1.556 -1.813 -1.868 -1.967 -2.076 -2.321 -2.463 -2.607 -2.746 -2.909 -3.105 -3.331 -3.82 -4 ,24282 ,TETRA ,17559897,Sat Nov 27 09:50:01 CET,Sat Nov 27 11:38:20 CET,0.0 0.666 0.983 1.208 1.392 1.568 1.755 1.925 2.185 2.291 2.401 2.455 2.706 2.812 3.008 3.178 3.345 3.427 3.582 3.736 3.944 4.068 4.188 4.359 4.52 4.676 4.832 4.981 5.175 5.369 5.556 5.766 5.963 6.145 6.348 6.595 6.817 7.055 7.312 7.572 7.847 8.138 8.472 8.807 9.157 9.498 9.837 10.145 10.393 10.528 10.318 9.589 8.784 8.037 7.351 6.682 6.063 5.502 5.012 4.529 4.099 3.691 3.288 2.916 2.591 2.297 1.996 1.744 1.529 1.297 1.049 0.851 0.656 0.454 0.301 0.139 -0.033 -0.208 -0.395 -0.523 -0.652 -0.873 -1.036 -1.189 -1.263 -1.415 -1.585 -1.766 -1.853 -2.106 -2.158 -2.268 -2.382 -2.613 -2.737 -2.875 -3.021 -3.181 -3.391 -3.648 -4.028 -5 ,32429 ,TETRA ,17559898,Sat Nov 27 09:50:01 CET,Sat Nov 27 11:41:50 CET,0.0 0.713 1.042 1.291 1.505 1.698 1.868 2.017 2.275 2.398 2.517 2.576 2.829 2.927 3.114 3.304 3.476 3.545 3.693 3.844 4.046 4.187 4.334 4.531 4.709 4.876 5.024 5.17 5.359 5.531 5.698 5.899 6.095 6.291 6.514 6.764 7.005 7.255 7.509 7.784 8.071 8.373 8.721 9.057 9.38 9.679 10.032 10.354 10.528 10.551 10.293 9.59 8.783 7.975 7.231 6.59 6.013 5.471 5.001 4.518 4.08 3.672 3.311 2.979 2.662 2.385 2.1 1.833 1.603 1.382 1.147 0.942 0.729 0.512 0.343 0.151 -0.048 -0.255 -0.479 -0.621 -0.759 -0.969 -1.112 -1.265 -1.338 -1.484 -1.645 -1.821 -1.918 -2.181 -2.232 -2.341 -2.462 -2.698 -2.814 -2.939 -3.088 -3.264 -3.464 -3.691 -4.29 -6 ,1426 ,TETRA ,17559899,Sat Nov 27 09:50:03 CET,Sat Nov 27 11:43:17 CET,0.0 0.463 0.708 0.932 1.124 1.291 1.449 1.606 1.888 2.006 2.12 2.177 2.43 2.528 2.735 2.933 3.108 3.189 3.336 3.475 3.681 3.818 3.952 4.152 4.356 4.553 4.734 4.901 5.125 5.35 5.549 5.782 6.032 6.272 6.521 6.782 7.035 7.297 7.552 7.83 8.103 8.392 8.748 9.076 9.403 9.743 10.076 10.388 10.629 10.67 10.378 9.698 8.906 8.106 7.401 6.751 6.147 5.57 5.079 4.619 4.204 3.793 3.377 3.001 2.679 2.381 2.06 1.78 1.531 1.275 1.016 0.811 0.613 0.401 0.229 0.048 -0.141 -0.327 -0.518 -0.655 -0.794 -1.003 -1.15 -1.303 -1.38 -1.533 -1.701 -1.887 -1.987 -2.244 -2.288 -2.399 -2.519 -2.777 -2.911 -3.053 -3.213 -3.375 -3.559 -3.835 -4.476 -7 ,26713 ,TETRA ,17559900,Sat Nov 27 09:50:59 CET,Sat Nov 27 11:39:05 CET,0.0 1.032 1.368 1.618 1.831 2.013 2.172 2.317 2.594 2.721 2.838 2.92 3.184 3.284 3.479 3.669 3.844 3.924 4.082 4.234 4.434 4.562 4.694 4.881 5.05 5.217 5.381 5.54 5.729 5.911 6.093 6.304 6.522 6.743 6.997 7.265 7.516 7.784 8.05 8.332 8.623 8.935 9.267 9.579 9.918 10.235 10.537 10.777 10.951 10.988 10.69 9.989 9.194 8.394 7.648 6.972 6.388 5.843 5.37 4.906 4.492 4.104 3.735 3.387 3.05 2.747 2.434 2.142 1.905 1.664 1.421 1.235 1.029 0.807 0.646 0.478 0.303 0.127 -0.052 -0.17 -0.298 -0.508 -0.658 -0.813 -0.89 -1.051 -1.214 -1.386 -1.487 -1.761 -1.845 -1.969 -2.098 -2.36 -2.499 -2.643 -2.783 -2.949 -3.16 -3.418 -4.053 -8 ,32560 ,TETRA ,17559901,Sat Nov 27 09:51:56 CET,Sat Nov 27 11:41:20 CET,0.0 0.516 0.786 1.091 1.372 1.577 1.75 1.907 2.191 2.315 2.43 2.496 2.759 2.874 3.11 3.327 3.525 3.618 3.795 3.957 4.195 4.352 4.499 4.698 4.882 5.055 5.222 5.399 5.617 5.802 6.0 6.243 6.467 6.683 6.907 7.152 7.39 7.639 7.915 8.218 8.528 8.852 9.212 9.554 9.907 10.226 10.546 10.845 11.112 11.266 10.986 10.26 9.517 8.773 8.052 7.372 6.775 6.224 5.729 5.238 4.817 4.436 4.07 3.721 3.392 3.102 2.819 2.573 2.351 2.131 1.907 1.711 1.514 1.31 1.139 0.959 0.769 0.57 0.371 0.235 0.1 -0.106 -0.25 -0.41 -0.49 -0.651 -0.825 -0.996 -1.084 -1.332 -1.377 -1.483 -1.585 -1.806 -1.938 -2.103 -2.267 -2.421 -2.639 -2.939 -3.722 -9 ,5045 ,TETRA ,17559902,Sat Nov 27 09:51:59 CET,Sat Nov 27 11:41:09 CET,0.0 0.531 0.794 1.023 1.209 1.367 1.513 1.643 1.843 1.937 2.038 2.088 2.331 2.432 2.608 2.764 2.916 2.99 3.142 3.3 3.532 3.664 3.787 3.99 4.217 4.45 4.656 4.834 5.055 5.257 5.447 5.677 5.887 6.092 6.332 6.594 6.837 7.095 7.37 7.659 7.936 8.226 8.541 8.848 9.158 9.482 9.872 10.204 10.393 10.429 10.172 9.506 8.747 8.01 7.338 6.699 6.104 5.545 5.051 4.559 4.142 3.78 3.416 3.05 2.713 2.393 2.031 1.714 1.456 1.184 0.903 0.65 0.395 0.16 -0.026 -0.224 -0.438 -0.646 -0.837 -0.965 -1.096 -1.312 -1.481 -1.662 -1.749 -1.921 -2.112 -2.304 -2.403 -2.668 -2.718 -2.819 -2.93 -3.175 -3.314 -3.469 -3.637 -3.82 -4.075 -4.441 -5.124 -10 ,29962 ,TETRA ,17559903,Sat Nov 27 09:51:56 CET,Sat Nov 27 11:41:42 CET,0.0 0.712 1.021 1.264 1.469 1.644 1.801 1.949 2.213 2.338 2.457 2.528 2.785 2.887 3.085 3.266 3.442 3.539 3.708 3.854 4.071 4.205 4.337 4.528 4.704 4.868 5.027 5.182 5.392 5.594 5.775 5.985 6.185 6.375 6.584 6.813 7.031 7.268 7.499 7.741 8.002 8.271 8.584 8.894 9.251 9.592 9.877 10.14 10.356 10.423 10.15 9.486 8.721 7.968 7.246 6.554 5.976 5.472 5.014 4.504 4.07 3.704 3.332 2.975 2.651 2.359 2.065 1.802 1.581 1.361 1.146 0.961 0.757 0.552 0.39 0.225 0.036 -0.172 -0.362 -0.493 -0.634 -0.848 -1.005 -1.165 -1.243 -1.418 -1.608 -1.802 -1.895 -2.141 -2.183 -2.291 -2.404 -2.663 -2.799 -2.932 -3.078 -3.262 -3.488 -3.764 -4.275 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_60_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_60_65.txt deleted file mode 100644 index 8423c1c3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_60_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31649 ,TETRA ,17559904,Sat Nov 27 09:17:16 CET,Sat Nov 27 11:06:36 CET,0.0 0.662 0.952 1.189 1.38 1.546 1.709 1.864 2.142 2.27 2.378 2.416 2.668 2.77 2.966 3.152 3.308 3.382 3.544 3.706 3.926 4.062 4.191 4.372 4.54 4.692 4.852 5.015 5.21 5.404 5.582 5.789 5.999 6.209 6.448 6.714 6.968 7.238 7.51 7.789 8.08 8.392 8.731 9.061 9.425 9.767 10.122 10.435 10.646 10.712 10.468 9.816 9.045 8.298 7.599 6.968 6.415 5.899 5.454 4.984 4.581 4.235 3.872 3.522 3.214 2.919 2.61 2.348 2.095 1.832 1.572 1.352 1.136 0.901 0.72 0.553 0.387 0.21 0.012 -0.13 -0.264 -0.46 -0.603 -0.759 -0.844 -1.014 -1.185 -1.364 -1.459 -1.712 -1.762 -1.872 -1.993 -2.261 -2.402 -2.569 -2.771 -2.979 -3.194 -3.473 -4.215 -2 ,11721 ,TETRA ,17559905,Sat Nov 27 09:17:16 CET,Sat Nov 27 11:07:28 CET,0.0 0.799 1.103 1.337 1.524 1.687 1.827 1.968 2.234 2.353 2.472 2.551 2.815 2.925 3.11 3.278 3.438 3.516 3.675 3.829 4.04 4.168 4.296 4.474 4.649 4.81 4.954 5.093 5.285 5.476 5.649 5.866 6.075 6.256 6.458 6.711 6.967 7.242 7.523 7.796 8.06 8.355 8.689 9.021 9.37 9.689 10.049 10.393 10.652 10.763 10.542 9.904 9.157 8.4 7.678 7.044 6.492 5.937 5.467 4.991 4.576 4.216 3.838 3.489 3.181 2.885 2.581 2.329 2.118 1.898 1.672 1.485 1.291 1.089 0.925 0.754 0.578 0.397 0.201 0.066 -0.07 -0.284 -0.427 -0.58 -0.66 -0.829 -1.004 -1.176 -1.266 -1.52 -1.588 -1.706 -1.835 -2.1 -2.244 -2.401 -2.583 -2.785 -3.019 -3.339 -3.792 -3 ,22573 ,TETRA ,17559906,Sat Nov 27 09:17:16 CET,Sat Nov 27 11:06:44 CET,0.0 0.948 1.282 1.555 1.762 1.955 2.13 2.283 2.58 2.719 2.845 2.937 3.195 3.292 3.489 3.675 3.847 3.933 4.088 4.235 4.454 4.607 4.758 4.946 5.126 5.297 5.442 5.579 5.772 5.948 6.12 6.342 6.545 6.732 6.942 7.167 7.379 7.614 7.87 8.139 8.41 8.691 8.987 9.284 9.647 10.022 10.389 10.709 10.923 11.015 10.817 10.193 9.483 8.74 8.063 7.457 6.905 6.396 5.942 5.459 5.035 4.659 4.304 3.965 3.641 3.344 3.035 2.774 2.54 2.278 2.017 1.815 1.587 1.343 1.182 1.029 0.855 0.665 0.487 0.367 0.229 0.005 -0.144 -0.3 -0.38 -0.537 -0.703 -0.886 -0.983 -1.233 -1.28 -1.385 -1.491 -1.726 -1.858 -1.993 -2.14 -2.318 -2.539 -2.799 -3.443 -4 ,30403 ,TETRA ,17559907,Sat Nov 27 09:17:16 CET,Sat Nov 27 11:07:29 CET,0.0 0.9 1.186 1.428 1.641 1.821 1.988 2.147 2.455 2.589 2.708 2.804 3.053 3.144 3.33 3.502 3.665 3.742 3.892 4.033 4.242 4.375 4.506 4.692 4.876 5.057 5.221 5.38 5.573 5.748 5.924 6.14 6.343 6.532 6.745 6.966 7.189 7.437 7.726 8.027 8.302 8.611 8.973 9.327 9.669 9.974 10.303 10.642 10.874 10.924 10.686 10.02 9.24 8.52 7.877 7.28 6.738 6.23 5.761 5.292 4.894 4.505 4.132 3.772 3.437 3.158 2.851 2.562 2.32 2.087 1.853 1.655 1.452 1.244 1.087 0.923 0.748 0.57 0.379 0.249 0.115 -0.09 -0.226 -0.378 -0.463 -0.627 -0.779 -0.939 -1.026 -1.272 -1.328 -1.439 -1.544 -1.773 -1.904 -2.046 -2.204 -2.364 -2.544 -2.795 -3.65 -5 ,19776 ,TETRA ,17559908,Sat Nov 27 09:17:17 CET,Sat Nov 27 11:08:27 CET,0.0 0.745 1.06 1.309 1.503 1.669 1.808 1.946 2.221 2.344 2.465 2.552 2.808 2.899 3.08 3.264 3.429 3.506 3.655 3.793 3.999 4.127 4.251 4.425 4.581 4.744 4.897 5.038 5.231 5.412 5.588 5.824 6.05 6.236 6.438 6.684 6.939 7.204 7.466 7.761 8.076 8.401 8.752 9.055 9.381 9.701 10.034 10.344 10.589 10.767 10.591 9.911 9.174 8.433 7.772 7.171 6.598 6.059 5.595 5.12 4.713 4.341 3.966 3.628 3.33 3.051 2.728 2.433 2.184 1.925 1.655 1.434 1.196 0.94 0.748 0.537 0.31 0.106 -0.087 -0.227 -0.37 -0.593 -0.753 -0.907 -0.985 -1.155 -1.333 -1.507 -1.599 -1.855 -1.899 -2.009 -2.125 -2.37 -2.517 -2.682 -2.855 -3.036 -3.222 -3.487 -4.449 -6 ,4852 ,TETRA ,17559909,Sat Nov 27 09:19:16 CET,Sat Nov 27 11:08:32 CET,0.0 0.549 0.861 1.113 1.355 1.577 1.759 1.922 2.237 2.372 2.504 2.587 2.848 2.959 3.179 3.4 3.594 3.68 3.853 4.019 4.242 4.382 4.516 4.703 4.886 5.058 5.218 5.377 5.59 5.786 5.969 6.193 6.399 6.589 6.801 7.049 7.302 7.568 7.838 8.117 8.389 8.661 9.001 9.351 9.691 10.022 10.384 10.749 11.027 11.115 10.899 10.293 9.553 8.837 8.201 7.592 7.04 6.507 6.043 5.59 5.186 4.807 4.454 4.128 3.828 3.559 3.259 3.002 2.801 2.576 2.333 2.133 1.931 1.733 1.572 1.396 1.214 1.031 0.822 0.668 0.505 0.257 0.085 -0.097 -0.183 -0.354 -0.534 -0.723 -0.817 -1.067 -1.121 -1.226 -1.335 -1.59 -1.732 -1.892 -2.078 -2.278 -2.502 -2.761 -3.465 -7 ,23098 ,TETRA ,17559910,Sat Nov 27 09:18:16 CET,Sat Nov 27 11:07:50 CET,0.0 0.983 1.296 1.519 1.71 1.898 2.078 2.241 2.535 2.673 2.801 2.866 3.111 3.201 3.392 3.575 3.745 3.829 3.992 4.153 4.389 4.541 4.69 4.896 5.076 5.249 5.41 5.568 5.769 5.945 6.122 6.331 6.525 6.715 6.936 7.192 7.437 7.694 7.958 8.225 8.505 8.813 9.144 9.467 9.799 10.14 10.493 10.777 11.0 11.078 10.805 10.111 9.355 8.625 7.955 7.319 6.744 6.216 5.742 5.252 4.82 4.422 4.041 3.696 3.374 3.08 2.765 2.491 2.266 2.041 1.804 1.607 1.411 1.193 1.012 0.834 0.66 0.473 0.275 0.143 0.014 -0.196 -0.345 -0.503 -0.587 -0.761 -0.932 -1.103 -1.201 -1.455 -1.501 -1.612 -1.741 -2.025 -2.172 -2.32 -2.469 -2.636 -2.835 -3.091 -3.984 -8 ,4905 ,TETRA ,17559911,Sat Nov 27 09:19:19 CET,Sat Nov 27 11:08:32 CET,0.0 0.968 1.348 1.603 1.811 2.002 2.167 2.32 2.615 2.764 2.898 2.99 3.26 3.369 3.585 3.796 3.995 4.091 4.269 4.43 4.642 4.774 4.908 5.131 5.367 5.596 5.811 6.012 6.259 6.506 6.737 6.986 7.223 7.452 7.712 7.987 8.254 8.563 8.866 9.162 9.471 9.792 10.147 10.474 10.823 11.186 11.531 11.845 12.145 12.293 12.086 11.465 10.717 9.968 9.311 8.694 8.139 7.6 7.121 6.654 6.237 5.866 5.509 5.164 4.833 4.533 4.224 3.961 3.749 3.534 3.309 3.122 2.927 2.72 2.557 2.388 2.217 2.037 1.844 1.715 1.588 1.399 1.257 1.1 1.021 0.862 0.706 0.536 0.446 0.195 0.124 0.008 -0.098 -0.35 -0.501 -0.643 -0.786 -0.955 -1.151 -1.401 -2.043 -9 ,4880 ,TETRA ,17559912,Sat Nov 27 09:19:17 CET,Sat Nov 27 11:08:22 CET,0.0 0.449 0.731 0.958 1.141 1.317 1.484 1.645 1.922 2.047 2.166 2.212 2.453 2.553 2.76 2.935 3.096 3.178 3.341 3.489 3.692 3.819 3.943 4.134 4.318 4.51 4.692 4.856 5.088 5.323 5.546 5.823 6.09 6.323 6.564 6.835 7.089 7.351 7.625 7.904 8.179 8.462 8.787 9.115 9.461 9.822 10.183 10.481 10.702 10.795 10.558 9.859 9.129 8.409 7.735 7.086 6.481 5.929 5.456 4.975 4.551 4.182 3.841 3.514 3.195 2.912 2.611 2.33 2.093 1.838 1.568 1.338 1.098 0.86 0.682 0.518 0.351 0.172 -0.011 -0.142 -0.281 -0.497 -0.643 -0.793 -0.873 -1.039 -1.21 -1.392 -1.489 -1.736 -1.775 -1.885 -2.004 -2.243 -2.37 -2.513 -2.669 -2.859 -3.079 -3.316 -4.08 -10 ,15751 ,TETRA ,17559913,Sat Nov 27 09:19:17 CET,Sat Nov 27 11:08:33 CET,0.0 0.881 1.247 1.519 1.739 1.93 2.092 2.248 2.539 2.667 2.786 2.85 3.102 3.191 3.373 3.551 3.721 3.8 3.944 4.082 4.278 4.408 4.544 4.741 4.93 5.11 5.278 5.444 5.683 5.906 6.102 6.34 6.555 6.762 6.993 7.257 7.524 7.804 8.07 8.327 8.599 8.912 9.262 9.589 9.946 10.296 10.651 10.961 11.215 11.343 11.09 10.427 9.706 8.984 8.316 7.696 7.126 6.596 6.135 5.649 5.22 4.837 4.469 4.13 3.812 3.52 3.218 2.955 2.731 2.508 2.277 2.076 1.875 1.655 1.48 1.32 1.166 0.99 0.803 0.682 0.549 0.329 0.18 0.03 -0.05 -0.216 -0.381 -0.561 -0.649 -0.889 -0.924 -1.031 -1.144 -1.393 -1.53 -1.668 -1.822 -1.996 -2.206 -2.458 -2.951 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_61_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_61_50.txt deleted file mode 100644 index 0c74b7af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_61_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18175 ,KEBNE ,17025007,Wed Dec 22 11:22:09 CET,Wed Dec 22 12:56:07 CET,0.0 0.791 1.097 1.353 1.585 1.793 1.957 2.101 2.38 2.505 2.625 2.704 2.961 3.068 3.259 3.43 3.601 3.692 3.87 4.035 4.272 4.42 4.565 4.781 4.981 5.17 5.358 5.546 5.784 6.022 6.268 6.562 6.838 7.097 7.394 7.72 8.024 8.341 8.676 9.028 9.394 9.807 10.267 10.705 11.196 11.745 12.338 12.916 13.473 13.962 14.176 13.899 13.426 12.844 12.225 11.628 11.065 10.534 10.062 9.534 9.052 8.652 8.264 7.878 7.512 7.165 6.819 6.502 6.218 5.939 5.661 5.438 5.193 4.922 4.712 4.503 4.294 4.079 3.843 3.675 3.508 3.259 3.083 2.884 2.782 2.582 2.364 2.139 2.021 1.749 1.651 1.528 1.389 1.089 0.928 0.744 0.554 0.359 0.109 -0.288 -1.365 -2 ,16370 ,KEBNE ,17025008,Wed Dec 22 11:22:09 CET,Wed Dec 22 12:57:37 CET,0.0 0.837 1.165 1.385 1.581 1.772 1.942 2.102 2.398 2.525 2.643 2.716 2.969 3.065 3.251 3.437 3.609 3.694 3.869 4.034 4.253 4.394 4.54 4.74 4.929 5.114 5.303 5.497 5.736 5.987 6.242 6.522 6.784 7.033 7.309 7.604 7.891 8.213 8.562 8.928 9.287 9.674 10.115 10.526 11.014 11.541 12.088 12.627 13.174 13.702 13.941 13.639 13.137 12.607 12.065 11.502 10.958 10.427 9.965 9.483 9.048 8.65 8.242 7.854 7.474 7.112 6.739 6.41 6.133 5.834 5.524 5.279 5.018 4.744 4.519 4.285 4.053 3.804 3.563 3.396 3.217 2.959 2.775 2.568 2.457 2.241 2.022 1.774 1.641 1.355 1.214 1.053 0.887 0.53 0.332 0.137 -0.069 -0.305 -0.578 -0.958 -2.203 -3 ,11156 ,KEBNE ,17025009,Wed Dec 22 11:22:09 CET,Wed Dec 22 12:58:01 CET,0.0 1.355 1.65 1.864 2.047 2.218 2.377 2.515 2.751 2.877 3.011 3.117 3.386 3.503 3.73 3.954 4.153 4.24 4.391 4.532 4.741 4.882 5.031 5.252 5.49 5.718 5.913 6.094 6.353 6.611 6.837 7.103 7.365 7.612 7.878 8.179 8.458 8.744 9.062 9.395 9.726 10.094 10.533 10.944 11.394 11.847 12.33 12.827 13.335 13.8 14.015 13.791 13.31 12.737 12.149 11.589 11.093 10.604 10.152 9.681 9.252 8.878 8.526 8.174 7.836 7.513 7.177 6.874 6.597 6.306 6.009 5.746 5.471 5.188 4.975 4.77 4.558 4.332 4.096 3.931 3.745 3.437 3.22 3.001 2.888 2.645 2.401 2.152 2.018 1.728 1.568 1.413 1.264 0.955 0.78 0.584 0.386 0.149 -0.116 -0.441 -1.637 -4 ,30421 ,KEBNE ,17025010,Wed Dec 22 11:22:10 CET,Wed Dec 22 12:59:08 CET,0.0 0.866 1.112 1.336 1.545 1.727 1.889 2.045 2.361 2.494 2.606 2.677 2.937 3.045 3.25 3.445 3.624 3.71 3.884 4.055 4.313 4.484 4.65 4.891 5.131 5.359 5.566 5.767 6.028 6.269 6.499 6.775 7.026 7.26 7.534 7.846 8.151 8.474 8.818 9.178 9.549 9.951 10.408 10.858 11.346 11.853 12.407 12.979 13.525 13.971 14.207 14.007 13.549 12.98 12.398 11.803 11.227 10.659 10.163 9.676 9.216 8.784 8.357 7.941 7.538 7.166 6.79 6.447 6.148 5.837 5.518 5.27 5.016 4.734 4.519 4.305 4.071 3.845 3.621 3.447 3.265 2.983 2.788 2.583 2.475 2.262 2.033 1.796 1.675 1.397 1.273 1.117 0.947 0.585 0.375 0.125 -0.129 -0.379 -0.685 -1.052 -2.006 -5 ,2289 ,KEBNE ,17025011,Wed Dec 22 11:23:12 CET,Wed Dec 22 12:59:26 CET,0.0 0.897 1.172 1.412 1.642 1.82 1.961 2.114 2.393 2.501 2.606 2.648 2.893 2.985 3.144 3.302 3.458 3.536 3.685 3.814 4.015 4.14 4.256 4.443 4.626 4.795 4.954 5.11 5.313 5.513 5.714 6.006 6.297 6.565 6.851 7.126 7.402 7.719 8.041 8.362 8.716 9.109 9.525 9.925 10.398 10.89 11.428 11.998 12.529 13.02 13.337 13.157 12.732 12.163 11.57 11.014 10.482 9.949 9.425 8.858 8.365 7.932 7.523 7.118 6.746 6.416 6.061 5.739 5.46 5.16 4.843 4.578 4.302 4.047 3.834 3.595 3.352 3.1 2.842 2.667 2.483 2.191 2.002 1.801 1.693 1.466 1.238 1.003 0.861 0.562 0.432 0.287 0.139 -0.191 -0.381 -0.569 -0.785 -1.061 -1.391 -1.789 -3.036 -6 ,24553 ,KEBNE ,17025012,Wed Dec 22 11:23:11 CET,Wed Dec 22 12:59:02 CET,0.0 0.872 1.211 1.453 1.647 1.799 1.929 2.064 2.323 2.433 2.538 2.599 2.849 2.945 3.13 3.301 3.468 3.556 3.726 3.895 4.121 4.251 4.38 4.56 4.741 4.923 5.104 5.293 5.529 5.744 5.96 6.226 6.464 6.69 6.957 7.256 7.542 7.833 8.141 8.474 8.816 9.197 9.628 10.041 10.486 10.983 11.495 12.001 12.536 12.961 13.149 12.894 12.41 11.901 11.429 10.917 10.39 9.888 9.443 8.961 8.527 8.143 7.775 7.405 7.043 6.733 6.413 6.09 5.796 5.509 5.209 4.964 4.722 4.465 4.272 4.079 3.875 3.668 3.45 3.29 3.119 2.852 2.66 2.474 2.381 2.194 2.004 1.771 1.643 1.366 1.246 1.104 0.956 0.638 0.46 0.264 0.066 -0.158 -0.429 -0.763 -1.603 -7 ,11434 ,KEBNE ,17025013,Wed Dec 22 11:30:29 CET,Wed Dec 22 13:04:31 CET,0.0 0.811 1.149 1.383 1.567 1.749 1.933 2.103 2.368 2.49 2.61 2.7 2.959 3.068 3.272 3.459 3.654 3.755 3.949 4.114 4.34 4.48 4.622 4.839 5.033 5.213 5.4 5.579 5.82 6.058 6.271 6.543 6.818 7.101 7.433 7.756 8.053 8.371 8.704 9.054 9.407 9.799 10.23 10.659 11.137 11.631 12.178 12.747 13.305 13.794 14.091 13.888 13.387 12.8 12.203 11.583 11.004 10.479 10.007 9.499 9.051 8.629 8.187 7.779 7.393 7.039 6.669 6.317 6.005 5.692 5.382 5.121 4.847 4.566 4.354 4.14 3.917 3.692 3.459 3.292 3.108 2.813 2.619 2.425 2.323 2.098 1.861 1.619 1.496 1.223 1.073 0.902 0.723 0.362 0.179 -0.019 -0.225 -0.459 -0.737 -1.079 -1.855 -8 ,31665 ,KEBNE ,17025014,Wed Dec 22 11:30:29 CET,Wed Dec 22 13:04:22 CET,0.0 0.848 1.177 1.424 1.613 1.777 1.951 2.125 2.423 2.547 2.669 2.743 2.99 3.1 3.317 3.503 3.685 3.769 3.924 4.076 4.315 4.467 4.62 4.841 5.039 5.227 5.401 5.588 5.848 6.096 6.325 6.588 6.853 7.108 7.389 7.695 7.988 8.301 8.63 8.979 9.341 9.726 10.161 10.604 11.094 11.611 12.153 12.717 13.282 13.753 14.013 13.753 13.239 12.694 12.115 11.535 10.98 10.423 9.952 9.469 9.035 8.633 8.221 7.805 7.416 7.081 6.726 6.404 6.113 5.808 5.497 5.229 4.941 4.639 4.404 4.176 3.945 3.703 3.448 3.269 3.089 2.807 2.605 2.398 2.296 2.078 1.84 1.586 1.457 1.176 1.042 0.889 0.735 0.382 0.181 -0.014 -0.233 -0.478 -0.746 -1.066 -1.821 -9 ,1799 ,KEBNE ,17025015,Wed Dec 22 11:30:29 CET,Wed Dec 22 13:04:31 CET,0.0 0.62 0.938 1.155 1.347 1.541 1.717 1.879 2.168 2.292 2.414 2.521 2.785 2.89 3.109 3.318 3.497 3.579 3.728 3.888 4.116 4.249 4.379 4.576 4.79 4.993 5.175 5.358 5.591 5.832 6.079 6.37 6.632 6.87 7.146 7.463 7.768 8.073 8.396 8.786 9.178 9.585 10.087 10.555 11.045 11.564 12.106 12.631 13.168 13.636 13.939 13.806 13.367 12.826 12.275 11.669 11.075 10.53 10.019 9.481 9.022 8.606 8.208 7.817 7.424 7.047 6.67 6.355 6.065 5.755 5.422 5.134 4.84 4.536 4.289 4.031 3.763 3.489 3.216 3.022 2.833 2.557 2.374 2.184 2.078 1.846 1.607 1.364 1.241 0.963 0.822 0.678 0.522 0.176 -0.003 -0.199 -0.413 -0.643 -0.942 -1.347 -2.433 -10 ,15127 ,KEBNE ,17025016,Wed Dec 22 11:31:32 CET,Wed Dec 22 13:05:55 CET,0.0 0.803 1.095 1.306 1.49 1.67 1.861 2.036 2.316 2.439 2.555 2.625 2.87 2.972 3.17 3.357 3.544 3.631 3.803 3.973 4.201 4.34 4.476 4.689 4.902 5.095 5.295 5.486 5.707 5.921 6.139 6.409 6.674 6.947 7.261 7.602 7.913 8.239 8.591 8.977 9.364 9.75 10.209 10.654 11.106 11.584 12.109 12.676 13.236 13.712 14.006 13.809 13.368 12.821 12.26 11.684 11.108 10.573 10.087 9.57 9.118 8.7 8.277 7.891 7.52 7.152 6.778 6.446 6.153 5.84 5.511 5.264 5.017 4.757 4.564 4.359 4.139 3.908 3.658 3.47 3.287 3.017 2.821 2.614 2.504 2.286 2.055 1.802 1.676 1.4 1.249 1.096 0.952 0.62 0.422 0.205 -0.016 -0.258 -0.54 -0.92 -2.12 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_61_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_61_65.txt deleted file mode 100644 index 82584206..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_61_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27037 ,TETRA ,17559914,Sat Nov 27 09:19:17 CET,Sat Nov 27 11:10:37 CET,0.0 2.289 2.811 3.199 3.493 3.774 4.037 4.27 4.671 4.843 5.003 5.178 5.481 5.625 5.886 6.138 6.371 6.477 6.704 6.918 7.211 7.386 7.546 7.783 8.008 8.237 8.451 8.646 8.912 9.203 9.472 9.777 10.065 10.317 10.606 10.931 11.255 11.626 11.994 12.319 12.649 13.016 13.398 13.733 14.105 14.48 14.821 15.108 15.333 15.364 14.904 13.834 12.744 11.749 10.764 9.792 8.93 8.128 7.425 6.722 6.121 5.577 5.02 4.485 4.025 3.609 3.144 2.723 2.362 1.983 1.56 1.21 0.861 0.492 0.224 -0.029 -0.296 -0.592 -0.906 -1.122 -1.342 -1.686 -1.945 -2.215 -2.348 -2.615 -2.894 -3.193 -3.347 -3.66 -3.845 -4.024 -4.225 -4.69 -4.938 -5.191 -5.469 -5.786 -6.159 -6.661 -8.14 -2 ,20871 ,TETRA ,17559915,Sat Nov 27 09:19:19 CET,Sat Nov 27 11:01:54 CET,0.0 1.211 1.705 2.071 2.342 2.584 2.818 3.046 3.477 3.679 3.861 4.045 4.346 4.499 4.763 4.987 5.198 5.289 5.454 5.616 5.847 6.008 6.17 6.402 6.625 6.836 7.039 7.234 7.475 7.691 7.914 8.192 8.442 8.695 8.982 9.283 9.567 9.888 10.224 10.582 10.955 11.302 11.679 12.058 12.438 12.776 13.078 13.362 13.582 13.628 13.273 12.386 11.389 10.377 9.451 8.632 7.841 7.076 6.425 5.751 5.168 4.656 4.151 3.665 3.208 2.796 2.358 1.953 1.606 1.242 0.869 0.57 0.262 -0.05 -0.299 -0.556 -0.812 -1.083 -1.38 -1.578 -1.777 -2.099 -2.326 -2.567 -2.693 -2.974 -3.271 -3.583 -3.752 -4.084 -4.304 -4.503 -4.699 -5.145 -5.397 -5.672 -5.971 -6.297 -6.798 -7.563 -10.371 -3 ,4755 ,TETRA ,17559916,Sat Nov 27 09:20:18 CET,Sat Nov 27 11:09:53 CET,0.0 2.439 3.039 3.473 3.838 4.136 4.368 4.583 5.001 5.178 5.348 5.537 5.831 5.965 6.234 6.489 6.723 6.835 7.058 7.265 7.561 7.76 7.947 8.21 8.466 8.713 8.953 9.182 9.468 9.734 9.994 10.308 10.602 10.878 11.183 11.513 11.813 12.133 12.472 12.83 13.187 13.564 13.99 14.377 14.752 15.104 15.484 15.816 16.033 16.086 15.744 14.858 13.874 12.898 11.98 11.146 10.429 9.746 9.092 8.384 7.775 7.266 6.791 6.335 5.865 5.411 4.953 4.536 4.173 3.798 3.419 3.104 2.766 2.426 2.163 1.893 1.622 1.341 1.056 0.862 0.653 0.337 0.131 -0.095 -0.216 -0.462 -0.708 -0.98 -1.129 -1.438 -1.621 -1.791 -1.959 -2.321 -2.526 -2.762 -3.066 -3.407 -3.788 -4.28 -6.15 -4 ,20053 ,TETRA ,17559917,Sat Nov 27 09:19:19 CET,Sat Nov 27 11:09:13 CET,0.0 2.995 3.577 3.986 4.311 4.596 4.871 5.099 5.47 5.653 5.826 6.001 6.287 6.423 6.685 6.936 7.185 7.302 7.519 7.715 7.982 8.154 8.327 8.572 8.801 9.035 9.257 9.46 9.713 9.959 10.213 10.513 10.778 11.034 11.322 11.642 11.94 12.246 12.584 12.921 13.279 13.678 14.082 14.458 14.873 15.276 15.649 15.944 16.099 16.116 15.825 14.955 13.949 12.974 12.019 11.111 10.319 9.585 8.915 8.243 7.679 7.173 6.688 6.226 5.803 5.422 4.999 4.615 4.277 3.925 3.583 3.291 2.972 2.64 2.382 2.125 1.866 1.603 1.324 1.124 0.919 0.596 0.354 0.098 -0.029 -0.298 -0.611 -0.947 -1.113 -1.429 -1.604 -1.781 -1.981 -2.484 -2.776 -3.054 -3.347 -3.733 -4.241 -4.954 -7.757 -5 ,18512 ,TETRA ,17559918,Sat Nov 27 09:19:19 CET,Sat Nov 27 11:08:32 CET,0.0 2.38 2.956 3.365 3.7 3.987 4.241 4.472 4.893 5.088 5.266 5.419 5.712 5.857 6.121 6.355 6.563 6.663 6.87 7.077 7.376 7.56 7.724 7.949 8.176 8.404 8.631 8.855 9.117 9.348 9.566 9.826 10.074 10.319 10.608 10.94 11.277 11.623 11.947 12.283 12.634 13.005 13.393 13.767 14.182 14.557 14.884 15.178 15.389 15.406 14.964 13.992 13.029 12.047 11.063 10.119 9.274 8.537 7.889 7.201 6.606 6.07 5.54 5.061 4.606 4.186 3.767 3.395 3.089 2.767 2.406 2.107 1.809 1.486 1.218 0.937 0.656 0.37 0.061 -0.159 -0.392 -0.754 -1.001 -1.264 -1.399 -1.674 -1.967 -2.27 -2.437 -2.764 -2.976 -3.164 -3.37 -3.841 -4.086 -4.342 -4.631 -4.962 -5.38 -5.911 -8.62 -6 ,2338 ,TETRA ,17559919,Sat Nov 27 09:19:19 CET,Sat Nov 27 11:09:25 CET,0.0 3.544 4.032 4.337 4.596 4.862 5.115 5.33 5.695 5.861 6.027 6.198 6.492 6.64 6.929 7.175 7.386 7.486 7.686 7.883 8.167 8.351 8.524 8.756 8.969 9.184 9.386 9.574 9.821 10.052 10.261 10.511 10.797 11.087 11.37 11.659 11.936 12.231 12.518 12.814 13.14 13.489 13.869 14.237 14.651 15.038 15.402 15.746 15.993 16.004 15.458 14.417 13.376 12.336 11.339 10.431 9.594 8.802 8.108 7.389 6.755 6.196 5.666 5.144 4.662 4.217 3.747 3.306 2.905 2.511 2.106 1.763 1.391 1.009 0.723 0.428 0.12 -0.193 -0.498 -0.705 -0.932 -1.299 -1.543 -1.774 -1.896 -2.182 -2.476 -2.77 -2.933 -3.241 -3.435 -3.643 -3.859 -4.303 -4.537 -4.805 -5.091 -5.415 -5.824 -6.333 -8.097 -7 ,12962 ,TETRA ,17559920,Sat Nov 27 09:19:20 CET,Sat Nov 27 11:09:25 CET,0.0 2.232 2.734 3.102 3.383 3.606 3.81 3.999 4.332 4.489 4.639 4.758 5.029 5.145 5.365 5.563 5.76 5.863 6.05 6.226 6.467 6.612 6.765 6.98 7.167 7.37 7.582 7.776 8.007 8.211 8.426 8.72 8.983 9.201 9.461 9.763 10.047 10.382 10.747 11.103 11.448 11.82 12.224 12.584 12.999 13.424 13.814 14.147 14.355 14.393 13.975 12.988 11.898 10.887 9.902 8.94 8.123 7.371 6.714 6.061 5.477 4.924 4.398 3.91 3.463 3.044 2.57 2.141 1.755 1.35 0.93 0.574 0.22 -0.138 -0.407 -0.685 -0.994 -1.328 -1.65 -1.869 -2.1 -2.466 -2.73 -2.99 -3.129 -3.426 -3.717 -4.026 -4.192 -4.525 -4.773 -4.978 -5.186 -5.603 -5.82 -6.057 -6.308 -6.604 -6.973 -7.496 -9.63 -8 ,11359 ,TETRA ,17559921,Sat Nov 27 09:19:19 CET,Sat Nov 27 11:09:32 CET,0.0 3.0 3.598 3.994 4.319 4.582 4.828 5.057 5.423 5.6 5.767 5.935 6.234 6.383 6.651 6.886 7.119 7.231 7.445 7.659 7.968 8.154 8.33 8.571 8.796 9.031 9.256 9.461 9.728 9.983 10.219 10.486 10.744 11.0 11.29 11.63 11.946 12.27 12.61 12.957 13.307 13.685 14.104 14.495 14.904 15.293 15.667 15.995 16.252 16.3 15.891 14.941 13.933 12.978 12.063 11.219 10.429 9.682 9.044 8.382 7.807 7.297 6.815 6.342 5.87 5.454 5.003 4.588 4.218 3.835 3.451 3.116 2.767 2.409 2.136 1.859 1.575 1.275 0.961 0.739 0.506 0.147 -0.103 -0.359 -0.497 -0.795 -1.104 -1.421 -1.581 -1.91 -2.139 -2.322 -2.498 -2.895 -3.124 -3.378 -3.658 -3.979 -4.351 -4.804 -6.697 -9 ,23122 ,TETRA ,17559922,Sat Nov 27 09:19:19 CET,Sat Nov 27 11:08:34 CET,0.0 1.376 1.828 2.193 2.512 2.794 3.023 3.225 3.596 3.768 3.931 4.084 4.366 4.49 4.757 5.023 5.247 5.346 5.543 5.73 5.991 6.154 6.312 6.536 6.749 6.977 7.213 7.443 7.734 8.01 8.279 8.584 8.844 9.096 9.4 9.718 9.993 10.275 10.584 10.912 11.226 11.565 11.971 12.369 12.765 13.15 13.549 13.852 13.999 13.967 13.477 12.489 11.457 10.423 9.467 8.583 7.794 7.037 6.393 5.72 5.101 4.558 4.019 3.478 2.985 2.545 2.076 1.655 1.285 0.914 0.532 0.208 -0.113 -0.471 -0.756 -1.038 -1.341 -1.654 -1.983 -2.221 -2.468 -2.862 -3.127 -3.392 -3.53 -3.814 -4.114 -4.437 -4.612 -4.945 -5.144 -5.31 -5.493 -5.934 -6.173 -6.419 -6.679 -6.97 -7.288 -7.716 -9.142 -10 ,20674 ,TETRA ,17559923,Sat Nov 27 09:20:18 CET,Sat Nov 27 11:12:04 CET,0.0 12.224 12.902 13.281 13.556 13.805 14.049 14.269 14.658 14.836 15.007 15.173 15.471 15.609 15.882 16.14 16.377 16.498 16.74 16.966 17.264 17.437 17.602 17.855 18.102 18.33 18.543 18.739 18.993 19.249 19.488 19.764 20.037 20.3 20.596 20.925 21.223 21.532 21.884 22.284 22.645 23.012 23.442 23.855 24.327 24.795 25.185 25.515 25.826 25.914 25.451 24.443 23.394 22.385 21.455 20.627 19.877 19.15 18.47 17.787 17.221 16.697 16.179 15.693 15.224 14.791 14.358 13.961 13.619 13.259 12.886 12.579 12.246 11.904 11.622 11.322 11.022 10.716 10.385 10.144 9.892 9.507 9.242 8.959 8.81 8.498 8.173 7.83 7.649 7.311 7.074 6.867 6.647 6.134 5.875 5.616 5.333 5.007 4.623 4.18 2.293 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_63_53.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_63_53.txt deleted file mode 100644 index 4db08b78..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_63_53.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3539 ,TETRA ,17559924,Sat Nov 27 09:20:17 CET,Sat Nov 27 11:08:18 CET,0.0 0.452 0.707 0.898 1.075 1.23 1.377 1.51 1.747 1.853 1.95 1.992 2.248 2.334 2.491 2.643 2.789 2.86 3.008 3.148 3.349 3.49 3.627 3.825 4.008 4.166 4.323 4.476 4.662 4.842 5.015 5.228 5.449 5.666 5.908 6.176 6.431 6.712 7.016 7.329 7.671 8.045 8.442 8.82 9.212 9.622 10.083 10.533 10.971 11.378 11.539 11.288 10.813 10.259 9.705 9.163 8.612 8.086 7.642 7.196 6.818 6.45 6.08 5.727 5.396 5.094 4.775 4.484 4.239 3.986 3.713 3.488 3.252 3.015 2.839 2.653 2.446 2.208 1.963 1.801 1.637 1.397 1.219 1.031 0.945 0.756 0.539 0.314 0.199 -0.075 -0.166 -0.295 -0.424 -0.718 -0.89 -1.06 -1.247 -1.474 -1.753 -2.125 -3.031 -2 ,14585 ,TETRA ,17559925,Sat Nov 27 09:20:19 CET,Sat Nov 27 11:10:53 CET,0.0 0.694 0.964 1.191 1.397 1.561 1.709 1.837 2.05 2.166 2.28 2.32 2.574 2.664 2.825 2.981 3.121 3.187 3.321 3.453 3.651 3.775 3.908 4.121 4.311 4.48 4.634 4.786 4.989 5.175 5.339 5.555 5.775 5.961 6.182 6.455 6.706 6.975 7.272 7.577 7.904 8.284 8.703 9.087 9.527 9.999 10.464 10.929 11.401 11.849 12.097 11.857 11.4 10.898 10.383 9.874 9.385 8.917 8.487 8.028 7.622 7.249 6.892 6.558 6.243 5.951 5.615 5.305 5.041 4.759 4.469 4.219 3.948 3.666 3.452 3.232 3.016 2.78 2.512 2.326 2.129 1.832 1.625 1.413 1.308 1.077 0.84 0.606 0.466 0.148 -0.047 -0.23 -0.428 -0.848 -1.055 -1.257 -1.474 -1.712 -2.002 -2.419 -3.342 -3 ,24013 ,TETRA ,17559926,Sat Nov 27 09:20:20 CET,Sat Nov 27 11:11:29 CET,0.0 0.488 0.806 1.036 1.232 1.425 1.587 1.728 1.982 2.105 2.233 2.333 2.601 2.696 2.878 3.039 3.177 3.247 3.391 3.518 3.693 3.835 3.978 4.159 4.331 4.492 4.643 4.788 4.981 5.188 5.4 5.651 5.896 6.118 6.346 6.597 6.837 7.107 7.401 7.701 8.018 8.376 8.751 9.111 9.533 9.99 10.499 10.987 11.46 11.902 12.148 11.939 11.473 10.942 10.407 9.869 9.349 8.822 8.35 7.881 7.457 7.077 6.716 6.373 6.068 5.804 5.525 5.26 5.018 4.765 4.507 4.305 4.102 3.865 3.672 3.473 3.266 3.06 2.844 2.692 2.538 2.297 2.129 1.951 1.858 1.668 1.473 1.273 1.164 0.887 0.775 0.641 0.492 0.18 0.022 -0.161 -0.369 -0.613 -0.906 -1.315 -2.189 -4 ,1498 ,TETRA ,17559927,Sat Nov 27 09:20:23 CET,Sat Nov 27 11:09:31 CET,0.0 0.874 1.157 1.356 1.51 1.669 1.812 1.931 2.146 2.245 2.354 2.409 2.66 2.75 2.923 3.086 3.23 3.3 3.449 3.592 3.782 3.905 4.029 4.207 4.373 4.528 4.673 4.826 5.025 5.2 5.372 5.592 5.812 6.028 6.272 6.55 6.808 7.091 7.385 7.691 8.026 8.385 8.777 9.141 9.533 9.983 10.48 10.95 11.422 11.836 12.014 11.747 11.227 10.624 10.069 9.498 8.935 8.435 8.0 7.553 7.172 6.817 6.46 6.112 5.783 5.488 5.156 4.858 4.612 4.341 4.049 3.805 3.57 3.345 3.171 2.99 2.794 2.604 2.412 2.27 2.114 1.858 1.69 1.52 1.424 1.234 1.05 0.857 0.755 0.49 0.401 0.262 0.108 -0.214 -0.384 -0.553 -0.723 -0.921 -1.2 -1.574 -2.472 -5 ,17779 ,TETRA ,17559928,Sat Nov 27 09:20:19 CET,Sat Nov 27 11:09:36 CET,0.0 0.363 0.596 0.797 0.98 1.13 1.256 1.408 1.733 1.86 1.955 1.962 2.206 2.299 2.481 2.635 2.772 2.843 2.984 3.119 3.309 3.431 3.553 3.732 3.905 4.065 4.212 4.367 4.566 4.753 4.95 5.2 5.438 5.66 5.915 6.182 6.426 6.702 7.017 7.357 7.695 8.047 8.439 8.825 9.246 9.685 10.169 10.684 11.202 11.596 11.729 11.408 10.894 10.332 9.766 9.224 8.7 8.229 7.82 7.358 6.953 6.578 6.21 5.888 5.583 5.291 4.977 4.683 4.43 4.175 3.908 3.695 3.466 3.225 3.042 2.842 2.621 2.405 2.207 2.07 1.918 1.675 1.507 1.339 1.251 1.059 0.86 0.647 0.529 0.245 0.13 -0.005 -0.14 -0.442 -0.622 -0.828 -1.05 -1.273 -1.505 -1.802 -2.528 -6 ,24580 ,TETRA ,17559929,Sat Nov 27 09:20:19 CET,Sat Nov 27 11:10:34 CET,0.0 0.559 0.869 1.146 1.379 1.589 1.783 1.949 2.272 2.422 2.565 2.684 2.952 3.064 3.288 3.486 3.666 3.755 3.924 4.073 4.296 4.443 4.591 4.816 5.032 5.233 5.414 5.587 5.823 6.041 6.241 6.499 6.767 7.007 7.25 7.532 7.808 8.104 8.409 8.726 9.064 9.412 9.784 10.163 10.589 11.041 11.543 12.045 12.518 12.905 13.093 12.791 12.253 11.676 11.126 10.613 10.124 9.638 9.216 8.762 8.348 7.97 7.609 7.263 6.918 6.597 6.284 6.02 5.777 5.512 5.245 5.029 4.802 4.57 4.399 4.222 4.03 3.822 3.605 3.46 3.306 3.061 2.88 2.692 2.6 2.41 2.2 1.975 1.86 1.588 1.479 1.341 1.205 0.908 0.745 0.56 0.365 0.141 -0.162 -0.511 -1.495 -7 ,13876 ,TETRA ,17559930,Sat Nov 27 09:20:19 CET,Sat Nov 27 11:09:16 CET,0.0 0.827 1.097 1.32 1.522 1.681 1.836 1.98 2.244 2.367 2.477 2.526 2.779 2.863 3.028 3.202 3.369 3.446 3.592 3.73 3.924 4.042 4.155 4.328 4.49 4.642 4.799 4.973 5.188 5.406 5.612 5.823 6.009 6.192 6.412 6.655 6.911 7.195 7.502 7.833 8.145 8.46 8.842 9.221 9.636 10.088 10.566 11.015 11.444 11.823 12.025 11.8 11.347 10.835 10.289 9.74 9.229 8.729 8.262 7.773 7.355 6.996 6.65 6.321 6.0 5.695 5.349 5.031 4.77 4.516 4.234 3.985 3.74 3.473 3.258 3.04 2.811 2.575 2.336 2.179 2.026 1.782 1.596 1.401 1.301 1.096 0.896 0.693 0.584 0.313 0.229 0.096 -0.031 -0.322 -0.478 -0.63 -0.803 -1.04 -1.341 -1.735 -2.453 -8 ,15222 ,TETRA ,17559931,Sat Nov 27 09:21:18 CET,Sat Nov 27 11:12:13 CET,0.0 0.675 0.891 1.094 1.285 1.436 1.562 1.687 1.904 2.005 2.113 2.156 2.408 2.502 2.674 2.825 2.965 3.038 3.185 3.337 3.578 3.745 3.898 4.115 4.316 4.501 4.69 4.864 5.088 5.298 5.486 5.701 5.915 6.132 6.379 6.644 6.892 7.173 7.492 7.819 8.146 8.512 8.898 9.273 9.726 10.201 10.68 11.149 11.631 12.052 12.221 11.975 11.535 11.05 10.552 10.018 9.498 9.009 8.566 8.125 7.723 7.354 7.0 6.638 6.287 5.971 5.639 5.331 5.06 4.795 4.529 4.33 4.127 3.885 3.695 3.509 3.318 3.112 2.898 2.753 2.599 2.362 2.201 2.031 1.935 1.734 1.536 1.328 1.223 0.959 0.88 0.747 0.6 0.287 0.128 -0.062 -0.251 -0.445 -0.729 -1.092 -1.822 -9 ,25681 ,TETRA ,17559932,Sat Nov 27 09:21:18 CET,Sat Nov 27 11:10:49 CET,0.0 0.686 0.947 1.123 1.297 1.457 1.602 1.743 1.981 2.089 2.194 2.236 2.476 2.56 2.731 2.895 3.043 3.118 3.275 3.419 3.617 3.743 3.867 4.053 4.245 4.436 4.615 4.793 5.015 5.214 5.406 5.643 5.882 6.115 6.365 6.618 6.873 7.171 7.47 7.776 8.1 8.453 8.874 9.264 9.667 10.107 10.563 11.052 11.587 12.025 12.23 12.041 11.621 11.095 10.514 9.972 9.484 8.974 8.514 8.072 7.651 7.245 6.855 6.497 6.176 5.886 5.588 5.317 5.084 4.844 4.592 4.374 4.14 3.896 3.697 3.483 3.268 3.055 2.836 2.681 2.524 2.282 2.111 1.933 1.841 1.65 1.443 1.228 1.116 0.853 0.787 0.652 0.501 0.168 -0.003 -0.169 -0.359 -0.587 -0.845 -1.191 -1.801 -10 ,24914 ,TETRA ,17559933,Sat Nov 27 09:21:18 CET,Sat Nov 27 11:11:12 CET,0.0 0.743 1.003 1.222 1.41 1.571 1.717 1.849 2.099 2.21 2.306 2.351 2.612 2.71 2.913 3.096 3.25 3.325 3.475 3.614 3.801 3.925 4.058 4.253 4.422 4.583 4.744 4.897 5.085 5.272 5.457 5.67 5.866 6.048 6.262 6.521 6.768 7.03 7.32 7.639 7.979 8.348 8.742 9.114 9.512 9.92 10.385 10.877 11.398 11.878 12.031 11.729 11.238 10.696 10.189 9.664 9.154 8.672 8.215 7.738 7.329 6.979 6.653 6.332 6.039 5.783 5.491 5.215 4.975 4.72 4.461 4.243 4.006 3.76 3.571 3.383 3.187 2.987 2.78 2.63 2.48 2.244 2.085 1.915 1.823 1.634 1.434 1.225 1.106 0.825 0.733 0.588 0.44 0.155 -0.011 -0.185 -0.382 -0.613 -0.846 -1.108 -2.31 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_63_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_63_58.txt deleted file mode 100644 index 616481d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_63_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6243 ,TETRA ,17559934,Sat Nov 27 09:21:20 CET,Sat Nov 27 11:11:54 CET,0.0 0.524 0.796 1.017 1.2 1.373 1.532 1.69 1.973 2.101 2.222 2.285 2.557 2.669 2.909 3.117 3.283 3.368 3.537 3.698 3.949 4.113 4.26 4.468 4.662 4.843 5.028 5.224 5.491 5.752 6.008 6.327 6.614 6.899 7.244 7.591 7.919 8.29 8.659 9.029 9.417 9.82 10.27 10.732 11.27 11.861 12.483 13.118 13.79 14.408 14.801 14.682 14.284 13.799 13.304 12.835 12.393 11.973 11.621 11.241 10.862 10.526 10.226 9.924 9.621 9.345 9.05 8.759 8.499 8.252 7.998 7.773 7.548 7.335 7.176 7.011 6.835 6.658 6.47 6.328 6.192 5.988 5.84 5.696 5.625 5.481 5.32 5.136 5.047 4.806 4.715 4.579 4.438 4.14 3.986 3.824 3.639 3.43 3.201 2.933 2.419 -2 ,9187 ,TETRA ,17559935,Sat Nov 27 09:21:18 CET,Sat Nov 27 11:12:11 CET,0.0 0.504 0.802 1.036 1.242 1.422 1.596 1.761 2.061 2.209 2.332 2.391 2.647 2.75 2.96 3.148 3.319 3.409 3.586 3.743 3.959 4.104 4.249 4.454 4.665 4.884 5.091 5.293 5.572 5.835 6.067 6.318 6.539 6.747 7.007 7.318 7.618 7.965 8.364 8.772 9.162 9.591 10.102 10.585 11.101 11.643 12.247 12.856 13.467 14.09 14.533 14.527 14.245 13.838 13.35 12.857 12.415 11.992 11.613 11.215 10.863 10.545 10.25 9.97 9.694 9.446 9.18 8.937 8.739 8.527 8.285 8.079 7.871 7.662 7.492 7.303 7.102 6.9 6.706 6.575 6.43 6.208 6.053 5.892 5.81 5.633 5.452 5.281 5.179 4.904 4.841 4.727 4.605 4.348 4.201 4.034 3.848 3.666 3.495 3.238 2.299 -3 ,21002 ,TETRA ,17559936,Sat Nov 27 09:21:18 CET,Sat Nov 27 11:11:07 CET,0.0 0.631 0.934 1.185 1.381 1.545 1.691 1.841 2.139 2.279 2.407 2.485 2.759 2.869 3.073 3.267 3.452 3.533 3.687 3.852 4.09 4.236 4.38 4.59 4.795 4.985 5.182 5.379 5.64 5.888 6.111 6.398 6.682 6.95 7.262 7.599 7.919 8.275 8.657 9.041 9.446 9.903 10.379 10.833 11.356 11.898 12.495 13.132 13.792 14.459 14.981 14.928 14.606 14.203 13.745 13.272 12.859 12.455 12.058 11.664 11.307 10.968 10.626 10.285 9.956 9.641 9.301 8.981 8.732 8.483 8.207 7.965 7.705 7.472 7.301 7.1 6.891 6.682 6.458 6.298 6.128 5.857 5.674 5.485 5.383 5.174 4.978 4.797 4.692 4.417 4.329 4.207 4.087 3.835 3.705 3.561 3.384 3.17 2.941 2.706 2.228 -4 ,6583 ,TETRA ,17559937,Sat Nov 27 09:21:18 CET,Sat Nov 27 11:12:33 CET,0.0 0.508 0.764 0.983 1.18 1.355 1.52 1.675 1.941 2.06 2.181 2.262 2.527 2.628 2.842 3.038 3.21 3.294 3.458 3.624 3.855 4.007 4.156 4.361 4.557 4.749 4.931 5.108 5.337 5.568 5.798 6.061 6.306 6.545 6.805 7.083 7.352 7.654 8.005 8.386 8.803 9.269 9.759 10.227 10.78 11.364 11.967 12.567 13.161 13.806 14.363 14.34 14.022 13.641 13.234 12.75 12.26 11.804 11.403 10.969 10.585 10.256 9.913 9.567 9.263 8.996 8.708 8.428 8.171 7.912 7.651 7.437 7.216 6.972 6.765 6.554 6.356 6.158 5.959 5.831 5.692 5.457 5.287 5.108 5.027 4.87 4.694 4.496 4.387 4.128 4.066 3.946 3.829 3.579 3.428 3.252 3.066 2.881 2.676 2.421 1.798 -5 ,17592 ,TETRA ,17559938,Sat Nov 27 09:22:16 CET,Sat Nov 27 11:13:13 CET,0.0 0.63 0.921 1.136 1.342 1.55 1.73 1.88 2.143 2.269 2.387 2.457 2.723 2.831 3.055 3.281 3.501 3.603 3.791 3.986 4.26 4.434 4.613 4.86 5.08 5.289 5.495 5.694 5.949 6.219 6.482 6.777 7.053 7.308 7.603 7.935 8.257 8.609 8.967 9.333 9.708 10.13 10.6 11.046 11.574 12.143 12.7 13.284 13.936 14.514 14.891 14.78 14.461 14.072 13.598 13.078 12.607 12.128 11.698 11.266 10.884 10.538 10.143 9.729 9.372 9.061 8.76 8.502 8.289 8.064 7.793 7.536 7.263 7.012 6.838 6.654 6.466 6.269 6.044 5.886 5.72 5.468 5.305 5.146 5.056 4.872 4.687 4.487 4.384 4.119 4.049 3.931 3.812 3.543 3.389 3.232 3.053 2.855 2.621 2.253 1.576 -6 ,4881 ,TETRA ,17559939,Sat Nov 27 09:22:16 CET,Sat Nov 27 11:13:57 CET,0.0 0.583 0.879 1.12 1.313 1.473 1.634 1.786 2.053 2.188 2.319 2.404 2.671 2.78 3.007 3.219 3.417 3.509 3.677 3.826 4.052 4.201 4.347 4.563 4.764 4.965 5.167 5.351 5.586 5.81 6.033 6.314 6.583 6.829 7.101 7.399 7.688 7.989 8.302 8.638 8.971 9.333 9.744 10.165 10.654 11.172 11.751 12.328 12.93 13.451 13.764 13.684 13.317 12.872 12.426 11.943 11.417 10.886 10.443 10.02 9.666 9.341 9.02 8.704 8.393 8.092 7.773 7.497 7.26 6.991 6.695 6.47 6.255 6.032 5.856 5.688 5.521 5.336 5.127 4.989 4.854 4.641 4.487 4.322 4.236 4.053 3.862 3.672 3.567 3.301 3.237 3.11 2.979 2.712 2.563 2.378 2.179 1.97 1.71 1.317 0.148 -7 ,6250 ,TETRA ,17559940,Sat Nov 27 09:22:16 CET,Sat Nov 27 11:14:09 CET,0.0 0.587 0.881 1.093 1.295 1.484 1.664 1.838 2.156 2.297 2.42 2.5 2.777 2.895 3.125 3.343 3.541 3.628 3.796 3.967 4.198 4.337 4.481 4.704 4.924 5.124 5.297 5.462 5.694 5.937 6.178 6.441 6.691 6.947 7.235 7.544 7.849 8.193 8.564 8.947 9.336 9.776 10.291 10.774 11.29 11.864 12.509 13.18 13.853 14.491 14.921 14.908 14.626 14.243 13.817 13.332 12.908 12.519 12.096 11.667 11.328 10.984 10.634 10.322 10.029 9.758 9.483 9.226 8.993 8.741 8.466 8.252 8.042 7.811 7.635 7.467 7.289 7.093 6.887 6.75 6.602 6.379 6.224 6.067 5.99 5.83 5.661 5.468 5.364 5.086 4.986 4.861 4.729 4.467 4.325 4.157 3.971 3.784 3.596 3.369 2.744 -8 ,26996 ,TETRA ,17559941,Sat Nov 27 09:22:18 CET,Sat Nov 27 11:13:13 CET,0.0 0.497 0.779 1.004 1.192 1.365 1.533 1.678 1.951 2.085 2.201 2.262 2.541 2.657 2.864 3.069 3.259 3.352 3.535 3.695 3.925 4.071 4.218 4.424 4.618 4.815 5.006 5.197 5.441 5.67 5.884 6.142 6.395 6.639 6.94 7.288 7.605 7.955 8.324 8.696 9.086 9.519 10.002 10.471 11.008 11.581 12.162 12.759 13.401 14.01 14.552 14.6 14.284 13.861 13.4 12.964 12.57 12.169 11.781 11.358 10.969 10.625 10.287 9.945 9.62 9.314 9.01 8.745 8.514 8.262 7.988 7.771 7.547 7.304 7.095 6.862 6.631 6.392 6.141 5.98 5.825 5.59 5.437 5.282 5.195 5.003 4.814 4.645 4.551 4.29 4.22 4.094 3.96 3.653 3.481 3.308 3.13 2.941 2.703 2.381 1.695 -9 ,10813 ,TETRA ,17559942,Sat Nov 27 09:22:18 CET,Sat Nov 27 11:13:09 CET,0.0 0.625 0.938 1.16 1.348 1.529 1.736 1.945 2.292 2.457 2.622 2.735 3.002 3.105 3.283 3.462 3.656 3.754 3.936 4.109 4.352 4.503 4.652 4.867 5.063 5.247 5.43 5.611 5.861 6.093 6.308 6.601 6.908 7.177 7.47 7.83 8.186 8.57 8.98 9.398 9.798 10.223 10.713 11.169 11.671 12.172 12.696 13.265 13.853 14.375 14.696 14.555 14.175 13.73 13.28 12.817 12.368 11.942 11.568 11.183 10.836 10.494 10.158 9.836 9.507 9.206 8.901 8.628 8.392 8.15 7.895 7.676 7.447 7.233 7.071 6.897 6.719 6.536 6.332 6.189 6.044 5.812 5.653 5.483 5.395 5.232 5.059 4.872 4.772 4.503 4.437 4.324 4.208 3.95 3.813 3.66 3.5 3.319 3.092 2.8 2.072 -10 ,21260 ,TETRA ,17559943,Sat Nov 27 09:22:18 CET,Sat Nov 27 11:12:59 CET,0.0 0.622 0.961 1.206 1.405 1.577 1.75 1.931 2.278 2.432 2.586 2.718 3.015 3.132 3.335 3.524 3.707 3.802 3.981 4.149 4.381 4.527 4.678 4.905 5.112 5.313 5.516 5.704 5.929 6.143 6.36 6.63 6.882 7.116 7.389 7.704 7.999 8.329 8.687 9.064 9.462 9.9 10.384 10.857 11.386 11.928 12.523 13.162 13.803 14.379 14.792 14.771 14.453 13.991 13.487 12.989 12.507 12.041 11.643 11.241 10.876 10.541 10.217 9.907 9.599 9.312 9.015 8.727 8.457 8.177 7.881 7.642 7.411 7.175 7.008 6.847 6.665 6.459 6.243 6.093 5.926 5.67 5.517 5.362 5.273 5.085 4.909 4.717 4.607 4.342 4.283 4.169 4.049 3.814 3.687 3.53 3.355 3.172 2.955 2.695 2.123 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_63_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_63_64.txt deleted file mode 100644 index 5bcfddb0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_63_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18783 ,TETRA ,17559944,Sat Nov 27 09:22:20 CET,Sat Nov 27 11:11:58 CET,0.0 0.916 1.38 1.697 1.97 2.205 2.433 2.649 3.006 3.16 3.305 3.438 3.728 3.858 4.107 4.343 4.559 4.659 4.853 5.043 5.333 5.518 5.699 5.956 6.189 6.417 6.642 6.85 7.105 7.361 7.607 7.899 8.179 8.444 8.753 9.092 9.409 9.752 10.121 10.522 10.943 11.39 11.901 12.403 12.928 13.505 14.157 14.838 15.607 16.417 17.091 17.275 17.066 16.736 16.36 15.968 15.557 15.086 14.694 14.314 13.969 13.636 13.307 13.018 12.75 12.481 12.172 11.887 11.632 11.372 11.131 10.94 10.734 10.521 10.357 10.177 9.995 9.816 9.625 9.497 9.362 9.131 8.961 8.788 8.704 8.531 8.342 8.14 8.034 7.767 7.678 7.547 7.411 7.147 7.006 6.862 6.697 6.473 6.188 5.836 5.139 -2 ,23646 ,TETRA ,17559945,Sat Nov 27 09:22:22 CET,Sat Nov 27 11:12:07 CET,0.0 1.375 1.828 2.186 2.457 2.677 2.887 3.08 3.416 3.581 3.738 3.88 4.183 4.327 4.592 4.855 5.105 5.222 5.451 5.644 5.894 6.067 6.246 6.488 6.711 6.934 7.152 7.366 7.634 7.897 8.146 8.431 8.702 8.965 9.273 9.621 9.953 10.306 10.676 11.079 11.502 11.961 12.479 12.976 13.535 14.138 14.808 15.552 16.332 17.099 17.722 17.829 17.672 17.361 16.949 16.487 16.044 15.637 15.274 14.879 14.5 14.15 13.807 13.448 13.1 12.781 12.451 12.162 11.901 11.607 11.3 11.053 10.785 10.497 10.277 10.055 9.827 9.576 9.322 9.153 8.974 8.704 8.525 8.34 8.239 8.029 7.8 7.547 7.415 7.126 6.999 6.85 6.692 6.366 6.197 6.0 5.759 5.482 5.168 4.757 4.068 -3 ,32600 ,TETRA ,17559946,Sat Nov 27 09:22:18 CET,Sat Nov 27 11:12:07 CET,0.0 2.504 2.943 3.296 3.621 3.875 4.08 4.265 4.607 4.771 4.931 5.072 5.362 5.491 5.738 5.962 6.171 6.273 6.479 6.681 6.962 7.132 7.301 7.543 7.775 7.999 8.223 8.44 8.711 8.99 9.243 9.536 9.821 10.117 10.48 10.885 11.274 11.645 12.002 12.394 12.793 13.233 13.75 14.236 14.807 15.417 16.032 16.736 17.491 18.231 18.879 18.994 18.761 18.423 18.057 17.678 17.301 16.93 16.554 16.139 15.771 15.442 15.131 14.838 14.545 14.288 14.027 13.787 13.572 13.329 13.087 12.885 12.657 12.425 12.256 12.084 11.906 11.714 11.509 11.362 11.206 10.969 10.807 10.642 10.561 10.385 10.198 10.002 9.892 9.616 9.494 9.342 9.172 8.801 8.601 8.388 8.156 7.864 7.557 7.205 6.139 -4 ,720 ,TETRA ,17559947,Sat Nov 27 09:22:18 CET,Sat Nov 27 11:12:04 CET,0.0 1.403 1.877 2.187 2.457 2.705 2.92 3.137 3.526 3.688 3.854 4.032 4.345 4.489 4.753 4.993 5.238 5.362 5.593 5.801 6.073 6.252 6.428 6.676 6.911 7.138 7.35 7.552 7.809 8.058 8.305 8.604 8.891 9.153 9.451 9.789 10.121 10.47 10.827 11.224 11.649 12.108 12.621 13.127 13.699 14.299 14.984 15.721 16.474 17.245 17.908 17.979 17.774 17.467 17.084 16.692 16.305 15.904 15.516 15.103 14.715 14.35 14.031 13.74 13.466 13.186 12.861 12.575 12.333 12.082 11.818 11.583 11.317 11.046 10.846 10.632 10.422 10.212 9.99 9.826 9.657 9.394 9.203 9.009 8.909 8.71 8.492 8.213 8.065 7.766 7.625 7.478 7.331 7.002 6.822 6.635 6.433 6.196 5.899 5.509 4.307 -5 ,32323 ,TETRA ,17559948,Sat Nov 27 09:22:19 CET,Sat Nov 27 11:12:05 CET,0.0 0.856 1.312 1.637 1.887 2.118 2.34 2.558 2.949 3.115 3.277 3.397 3.672 3.803 4.069 4.318 4.554 4.665 4.898 5.119 5.409 5.596 5.767 6.006 6.229 6.435 6.636 6.839 7.099 7.343 7.569 7.821 8.075 8.333 8.64 8.98 9.294 9.641 10.008 10.376 10.774 11.224 11.723 12.216 12.764 13.347 14.025 14.705 15.371 16.065 16.678 16.835 16.577 16.149 15.714 15.305 14.903 14.5 14.126 13.749 13.407 13.069 12.715 12.365 12.045 11.76 11.468 11.218 11.014 10.799 10.578 10.397 10.199 9.978 9.804 9.62 9.425 9.226 9.013 8.872 8.736 8.515 8.354 8.194 8.109 7.912 7.701 7.47 7.355 7.092 7.015 6.889 6.762 6.503 6.354 6.187 6.036 5.868 5.615 5.241 4.427 -6 ,23378 ,TETRA ,17559949,Sat Nov 27 09:22:21 CET,Sat Nov 27 11:12:04 CET,0.0 1.5 1.92 2.324 2.68 2.997 3.277 3.516 3.921 4.105 4.274 4.418 4.721 4.869 5.141 5.4 5.638 5.755 5.983 6.199 6.503 6.68 6.84 7.087 7.326 7.54 7.755 7.963 8.23 8.492 8.747 9.045 9.326 9.606 9.912 10.262 10.606 10.968 11.347 11.75 12.17 12.618 13.127 13.655 14.284 14.948 15.645 16.367 17.078 17.756 18.321 18.437 18.212 17.828 17.4 16.96 16.542 16.122 15.748 15.361 15.003 14.665 14.321 13.984 13.669 13.382 13.088 12.821 12.561 12.294 12.034 11.806 11.56 11.301 11.09 10.863 10.621 10.375 10.117 9.948 9.791 9.552 9.383 9.188 9.082 8.873 8.668 8.456 8.339 8.054 7.946 7.796 7.645 7.319 7.15 6.995 6.816 6.571 6.278 5.905 4.928 -7 ,12443 ,TETRA ,17559950,Sat Nov 27 09:23:15 CET,Sat Nov 27 11:13:20 CET,0.0 1.479 1.894 2.226 2.507 2.73 2.929 3.122 3.51 3.691 3.852 3.995 4.283 4.411 4.656 4.895 5.126 5.236 5.459 5.668 5.95 6.136 6.316 6.572 6.806 7.02 7.239 7.453 7.719 7.979 8.232 8.532 8.808 9.078 9.379 9.698 10.013 10.365 10.741 11.109 11.483 11.912 12.422 12.918 13.471 14.071 14.741 15.478 16.254 16.992 17.681 17.891 17.671 17.341 16.937 16.487 16.072 15.658 15.297 14.927 14.542 14.19 13.89 13.589 13.291 13.005 12.707 12.423 12.159 11.887 11.614 11.383 11.146 10.907 10.71 10.502 10.292 10.07 9.826 9.655 9.486 9.235 9.063 8.886 8.792 8.599 8.407 8.196 8.078 7.8 7.732 7.614 7.485 7.174 7.005 6.832 6.634 6.418 6.133 5.748 4.774 -8 ,28523 ,TETRA ,17559951,Sat Nov 27 09:23:18 CET,Sat Nov 27 11:14:53 CET,0.0 1.037 1.483 1.826 2.146 2.454 2.682 2.879 3.256 3.409 3.548 3.676 3.968 4.096 4.327 4.551 4.765 4.868 5.077 5.282 5.564 5.739 5.915 6.164 6.397 6.615 6.83 7.037 7.299 7.562 7.816 8.114 8.413 8.702 9.018 9.354 9.676 10.022 10.38 10.792 11.232 11.67 12.168 12.666 13.227 13.856 14.538 15.233 15.97 16.703 17.341 17.534 17.323 16.917 16.437 15.971 15.558 15.149 14.757 14.322 13.91 13.524 13.147 12.779 12.441 12.137 11.793 11.474 11.214 10.934 10.643 10.426 10.193 9.935 9.738 9.535 9.307 9.04 8.75 8.546 8.345 8.087 7.905 7.7 7.599 7.387 7.168 6.958 6.846 6.574 6.479 6.339 6.179 5.826 5.632 5.415 5.177 4.924 4.647 4.33 3.667 -9 ,7676 ,TETRA ,17559952,Sat Nov 27 09:23:18 CET,Sat Nov 27 11:14:00 CET,0.0 1.552 1.958 2.301 2.592 2.847 3.101 3.326 3.689 3.854 4.014 4.159 4.456 4.591 4.845 5.085 5.31 5.415 5.605 5.792 6.081 6.261 6.438 6.693 6.924 7.136 7.34 7.542 7.796 8.036 8.283 8.595 8.883 9.156 9.463 9.8 10.147 10.512 10.881 11.27 11.663 12.107 12.624 13.146 13.743 14.395 15.107 15.813 16.529 17.275 17.9 18.138 17.927 17.547 17.129 16.685 16.264 15.864 15.523 15.136 14.779 14.466 14.128 13.792 13.466 13.158 12.855 12.592 12.37 12.13 11.86 11.638 11.404 11.158 10.982 10.8 10.587 10.373 10.151 9.981 9.802 9.524 9.334 9.14 9.041 8.839 8.606 8.351 8.231 7.961 7.847 7.702 7.551 7.218 7.026 6.813 6.555 6.257 5.956 5.635 4.792 -10 ,26235 ,TETRA ,17559953,Sat Nov 27 09:23:18 CET,Sat Nov 27 11:14:13 CET,0.0 1.09 1.53 1.895 2.189 2.437 2.661 2.86 3.192 3.359 3.515 3.645 3.934 4.069 4.32 4.563 4.801 4.91 5.112 5.304 5.57 5.743 5.918 6.164 6.401 6.633 6.85 7.048 7.308 7.558 7.798 8.094 8.396 8.677 8.979 9.317 9.641 9.993 10.375 10.785 11.202 11.647 12.152 12.656 13.234 13.876 14.564 15.286 16.078 16.883 17.47 17.563 17.377 17.048 16.653 16.244 15.838 15.423 15.046 14.657 14.305 13.992 13.673 13.367 13.081 12.803 12.497 12.205 11.961 11.724 11.476 11.265 11.043 10.814 10.643 10.473 10.296 10.107 9.905 9.761 9.61 9.379 9.222 9.063 8.977 8.797 8.617 8.404 8.295 8.034 7.935 7.798 7.648 7.338 7.187 7.017 6.812 6.573 6.333 6.005 5.184 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_63_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_63_65.txt deleted file mode 100644 index 44027a6f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_63_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6330 ,TETRA ,17559954,Sat Nov 27 09:23:19 CET,Sat Nov 27 11:14:14 CET,0.0 0.895 1.329 1.647 1.882 2.095 2.289 2.475 2.826 2.981 3.128 3.25 3.551 3.689 3.955 4.196 4.41 4.51 4.707 4.897 5.158 5.332 5.504 5.745 5.978 6.206 6.42 6.621 6.889 7.158 7.417 7.708 7.977 8.246 8.553 8.887 9.201 9.533 9.878 10.223 10.572 10.983 11.451 11.893 12.376 12.841 13.352 13.892 14.413 14.881 15.129 14.943 14.505 13.983 13.47 12.988 12.545 12.113 11.707 11.293 10.931 10.575 10.23 9.908 9.603 9.329 9.042 8.787 8.56 8.296 8.022 7.813 7.61 7.399 7.221 7.041 6.856 6.67 6.471 6.327 6.181 5.956 5.81 5.658 5.578 5.408 5.229 5.039 4.934 4.669 4.574 4.453 4.333 4.063 3.916 3.736 3.506 3.259 2.996 2.627 1.744 -2 ,3653 ,TETRA ,17559955,Sat Nov 27 09:23:18 CET,Sat Nov 27 11:14:21 CET,0.0 0.723 1.091 1.408 1.633 1.834 2.014 2.18 2.478 2.611 2.74 2.822 3.087 3.194 3.392 3.582 3.783 3.887 4.086 4.268 4.519 4.675 4.824 5.041 5.24 5.432 5.632 5.832 6.086 6.328 6.564 6.847 7.126 7.386 7.666 7.968 8.251 8.56 8.889 9.251 9.617 10.003 10.433 10.873 11.35 11.863 12.452 13.015 13.586 14.106 14.356 14.143 13.711 13.238 12.76 12.267 11.805 11.377 10.986 10.586 10.232 9.883 9.539 9.223 8.932 8.651 8.351 8.083 7.851 7.617 7.373 7.164 6.929 6.691 6.527 6.357 6.177 5.987 5.795 5.661 5.524 5.31 5.148 4.989 4.91 4.738 4.556 4.361 4.266 4.013 3.943 3.818 3.685 3.395 3.232 3.067 2.89 2.692 2.47 2.2 1.514 -3 ,4811 ,TETRA ,17559956,Sat Nov 27 09:23:18 CET,Sat Nov 27 11:14:18 CET,0.0 0.666 1.014 1.259 1.48 1.666 1.813 1.963 2.243 2.374 2.495 2.542 2.806 2.91 3.104 3.294 3.467 3.549 3.714 3.868 4.08 4.224 4.363 4.56 4.751 4.939 5.114 5.273 5.472 5.67 5.866 6.121 6.394 6.661 6.956 7.26 7.543 7.861 8.188 8.534 8.902 9.296 9.733 10.156 10.64 11.152 11.674 12.2 12.733 13.194 13.43 13.255 12.811 12.311 11.831 11.347 10.901 10.454 10.034 9.609 9.23 8.871 8.516 8.186 7.869 7.586 7.281 6.998 6.766 6.507 6.229 6.016 5.793 5.539 5.349 5.163 4.98 4.799 4.606 4.464 4.317 4.084 3.928 3.759 3.666 3.49 3.304 3.118 3.015 2.744 2.674 2.556 2.42 2.147 2.007 1.839 1.646 1.433 1.179 0.854 -0.178 -4 ,22525 ,TETRA ,17559957,Sat Nov 27 09:23:18 CET,Sat Nov 27 11:14:15 CET,0.0 0.697 1.001 1.238 1.437 1.615 1.775 1.916 2.183 2.315 2.438 2.51 2.782 2.886 3.07 3.245 3.414 3.493 3.647 3.809 4.052 4.19 4.334 4.554 4.747 4.95 5.162 5.37 5.631 5.869 6.087 6.358 6.609 6.839 7.127 7.445 7.735 8.055 8.403 8.786 9.159 9.536 9.97 10.402 10.896 11.391 11.898 12.421 12.938 13.408 13.696 13.547 13.136 12.642 12.165 11.664 11.171 10.713 10.312 9.901 9.544 9.212 8.875 8.541 8.228 7.932 7.609 7.312 7.075 6.855 6.627 6.428 6.213 5.99 5.817 5.641 5.465 5.29 5.089 4.942 4.799 4.581 4.427 4.268 4.184 4.008 3.818 3.608 3.504 3.248 3.192 3.056 2.917 2.655 2.515 2.361 2.171 1.943 1.702 1.345 0.669 -5 ,16370 ,TETRA ,17559958,Sat Nov 27 09:23:18 CET,Sat Nov 27 11:13:21 CET,0.0 0.8 1.105 1.345 1.588 1.821 2.014 2.177 2.474 2.619 2.758 2.841 3.106 3.22 3.432 3.614 3.794 3.885 4.065 4.23 4.456 4.604 4.755 4.978 5.196 5.401 5.594 5.792 6.061 6.328 6.585 6.876 7.136 7.399 7.712 8.058 8.385 8.724 9.079 9.439 9.802 10.189 10.613 11.055 11.559 12.04 12.557 13.088 13.587 14.092 14.469 14.376 13.935 13.41 12.883 12.337 11.845 11.379 10.973 10.56 10.182 9.845 9.508 9.182 8.88 8.589 8.278 7.975 7.681 7.361 7.05 6.82 6.588 6.318 6.109 5.92 5.728 5.527 5.319 5.169 5.012 4.764 4.573 4.375 4.28 4.092 3.892 3.668 3.551 3.279 3.199 3.063 2.921 2.614 2.441 2.255 2.054 1.834 1.603 1.261 0.625 -6 ,23820 ,TETRA ,17559959,Sat Nov 27 09:24:14 CET,Sat Nov 27 11:13:55 CET,0.0 0.615 0.941 1.192 1.402 1.611 1.804 1.961 2.21 2.334 2.463 2.557 2.827 2.932 3.119 3.29 3.461 3.548 3.705 3.848 4.076 4.222 4.368 4.592 4.809 5.027 5.236 5.431 5.673 5.894 6.112 6.383 6.638 6.882 7.164 7.476 7.758 8.072 8.431 8.792 9.146 9.534 9.97 10.408 10.875 11.374 11.943 12.491 13.051 13.543 13.836 13.668 13.241 12.763 12.265 11.764 11.305 10.871 10.48 10.086 9.718 9.376 9.036 8.697 8.405 8.137 7.832 7.571 7.358 7.151 6.928 6.74 6.552 6.345 6.175 6.0 5.817 5.623 5.417 5.277 5.137 4.925 4.766 4.588 4.502 4.324 4.131 3.924 3.809 3.526 3.435 3.313 3.183 2.889 2.719 2.535 2.335 2.125 1.902 1.613 1.061 -7 ,31849 ,TETRA ,17559960,Sat Nov 27 09:24:15 CET,Sat Nov 27 11:17:38 CET,0.0 0.688 0.947 1.182 1.397 1.594 1.759 1.901 2.173 2.304 2.44 2.524 2.784 2.879 3.066 3.251 3.441 3.541 3.725 3.876 4.077 4.212 4.348 4.533 4.724 4.919 5.095 5.269 5.492 5.709 5.933 6.191 6.449 6.716 7.001 7.312 7.606 7.915 8.253 8.615 8.979 9.369 9.799 10.21 10.683 11.205 11.747 12.274 12.794 13.297 13.586 13.48 13.122 12.67 12.196 11.702 11.238 10.807 10.375 9.878 9.44 9.044 8.668 8.307 7.957 7.641 7.317 7.016 6.746 6.472 6.187 5.954 5.7 5.426 5.217 4.999 4.775 4.543 4.315 4.161 3.994 3.722 3.541 3.357 3.252 3.032 2.807 2.575 2.449 2.166 2.053 1.918 1.777 1.441 1.257 1.065 0.848 0.596 0.316 -0.032 -0.923 -8 ,693 ,TETRA ,17559961,Sat Nov 27 09:24:14 CET,Sat Nov 27 11:14:45 CET,0.0 0.893 1.262 1.53 1.744 1.933 2.118 2.296 2.63 2.777 2.913 3.031 3.314 3.434 3.651 3.857 4.036 4.114 4.269 4.419 4.637 4.786 4.933 5.129 5.318 5.498 5.663 5.834 6.066 6.301 6.533 6.818 7.072 7.301 7.575 7.877 8.164 8.493 8.825 9.147 9.503 9.893 10.307 10.715 11.203 11.701 12.209 12.741 13.257 13.68 13.905 13.731 13.286 12.735 12.207 11.685 11.198 10.744 10.32 9.902 9.555 9.223 8.892 8.578 8.274 7.982 7.679 7.407 7.167 6.933 6.678 6.465 6.262 6.045 5.878 5.706 5.524 5.339 5.136 4.991 4.846 4.622 4.464 4.298 4.21 4.03 3.848 3.65 3.548 3.29 3.209 3.081 2.939 2.608 2.435 2.259 2.077 1.876 1.605 1.251 0.278 -9 ,1830 ,TETRA ,17559962,Sat Nov 27 09:25:12 CET,Sat Nov 27 11:15:12 CET,0.0 0.807 1.087 1.32 1.516 1.687 1.849 2.014 2.34 2.49 2.627 2.716 2.979 3.08 3.268 3.44 3.603 3.684 3.845 4.007 4.231 4.365 4.496 4.683 4.873 5.067 5.261 5.439 5.655 5.89 6.104 6.333 6.567 6.791 7.058 7.365 7.65 7.96 8.287 8.605 8.93 9.302 9.723 10.167 10.688 11.217 11.793 12.359 12.899 13.38 13.657 13.472 13.065 12.573 12.07 11.593 11.13 10.685 10.304 9.895 9.503 9.153 8.803 8.461 8.159 7.874 7.557 7.272 7.035 6.784 6.533 6.345 6.14 5.907 5.736 5.569 5.39 5.197 4.99 4.847 4.7 4.47 4.317 4.152 4.068 3.909 3.738 3.554 3.46 3.206 3.124 3.009 2.881 2.587 2.437 2.281 2.106 1.912 1.679 1.401 0.84 -10 ,10222 ,TETRA ,17559963,Sat Nov 27 09:25:12 CET,Sat Nov 27 11:19:24 CET,0.0 0.842 1.161 1.418 1.64 1.829 2.002 2.14 2.404 2.536 2.659 2.737 2.993 3.087 3.282 3.472 3.633 3.712 3.875 4.026 4.236 4.374 4.509 4.713 4.906 5.081 5.263 5.431 5.64 5.855 6.055 6.295 6.53 6.766 7.055 7.385 7.688 8.004 8.353 8.713 9.053 9.456 9.925 10.362 10.825 11.311 11.818 12.309 12.827 13.259 13.485 13.279 12.854 12.37 11.864 11.343 10.877 10.432 10.016 9.606 9.255 8.916 8.575 8.237 7.905 7.599 7.304 7.057 6.839 6.626 6.408 6.216 6.008 5.792 5.625 5.451 5.273 5.089 4.9 4.769 4.628 4.414 4.255 4.097 4.02 3.847 3.667 3.467 3.363 3.11 3.045 2.928 2.792 2.494 2.354 2.193 1.999 1.784 1.56 1.272 0.145 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_64_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_64_54.txt deleted file mode 100644 index b02762d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_64_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25649 ,TETRA ,17559964,Sat Nov 27 09:25:12 CET,Sat Nov 27 11:14:53 CET,0.0 1.324 1.789 2.181 2.472 2.74 2.983 3.183 3.505 3.649 3.789 3.895 4.179 4.307 4.516 4.726 4.943 5.051 5.257 5.438 5.677 5.83 5.985 6.212 6.442 6.667 6.868 7.065 7.322 7.547 7.777 8.066 8.331 8.598 8.897 9.222 9.531 9.87 10.231 10.604 10.997 11.43 11.943 12.472 13.049 13.657 14.358 15.093 15.9 16.794 17.741 18.232 18.238 18.093 17.908 17.632 17.327 17.034 16.735 16.404 16.12 15.862 15.604 15.339 15.074 14.829 14.566 14.33 14.119 13.89 13.656 13.463 13.267 13.048 12.872 12.7 12.506 12.292 12.064 11.912 11.755 11.488 11.302 11.107 11.007 10.763 10.488 10.211 10.07 9.785 9.585 9.391 9.19 8.767 8.55 8.321 8.069 7.776 7.403 6.898 5.775 -2 ,11459 ,TETRA ,17559965,Sat Nov 27 09:26:09 CET,Sat Nov 27 11:19:00 CET,0.0 1.365 1.701 1.97 2.242 2.485 2.687 2.889 3.274 3.44 3.583 3.687 3.959 4.08 4.304 4.511 4.708 4.803 4.994 5.176 5.432 5.597 5.759 6.004 6.24 6.458 6.676 6.882 7.127 7.368 7.597 7.855 8.107 8.376 8.679 8.999 9.314 9.661 10.02 10.383 10.759 11.202 11.726 12.245 12.833 13.422 14.054 14.77 15.604 16.468 17.314 17.707 17.689 17.541 17.283 16.998 16.714 16.405 16.118 15.818 15.541 15.28 15.014 14.751 14.511 14.283 14.045 13.811 13.607 13.389 13.138 12.936 12.735 12.519 12.344 12.15 11.942 11.729 11.511 11.355 11.185 10.937 10.76 10.566 10.467 10.255 10.034 9.812 9.695 9.422 9.27 9.095 8.902 8.47 8.248 8.021 7.774 7.49 7.144 6.68 5.115 -3 ,13698 ,TETRA ,17559966,Sat Nov 27 09:27:07 CET,Sat Nov 27 11:19:42 CET,0.0 1.196 1.599 1.877 2.138 2.367 2.56 2.757 3.118 3.264 3.396 3.501 3.778 3.89 4.113 4.335 4.539 4.635 4.823 5.008 5.275 5.433 5.586 5.82 6.051 6.269 6.481 6.677 6.917 7.151 7.368 7.629 7.887 8.148 8.457 8.81 9.14 9.46 9.798 10.159 10.537 10.989 11.504 11.975 12.53 13.143 13.842 14.609 15.463 16.368 17.222 17.636 17.628 17.482 17.289 17.031 16.743 16.411 16.103 15.797 15.503 15.212 14.93 14.669 14.409 14.164 13.925 13.703 13.501 13.287 13.047 12.851 12.645 12.417 12.235 12.042 11.851 11.666 11.442 11.267 11.088 10.805 10.612 10.416 10.314 10.099 9.855 9.586 9.438 9.139 8.973 8.808 8.631 8.221 7.993 7.751 7.471 7.128 6.739 6.217 5.094 -4 ,1126 ,TETRA ,17559967,Sat Nov 27 09:27:09 CET,Sat Nov 27 11:20:03 CET,0.0 1.398 1.898 2.22 2.504 2.761 2.967 3.131 3.44 3.59 3.738 3.837 4.106 4.226 4.456 4.69 4.904 4.999 5.185 5.366 5.623 5.793 5.958 6.181 6.399 6.612 6.827 7.026 7.264 7.497 7.737 8.023 8.271 8.511 8.802 9.137 9.452 9.792 10.179 10.591 11.0 11.445 11.952 12.451 13.028 13.648 14.339 15.083 15.896 16.776 17.626 18.091 18.151 17.96 17.692 17.431 17.147 16.83 16.548 16.264 15.969 15.684 15.419 15.151 14.882 14.625 14.364 14.138 13.938 13.73 13.501 13.298 13.093 12.858 12.662 12.476 12.276 12.053 11.831 11.677 11.496 11.188 10.973 10.734 10.61 10.374 10.123 9.839 9.688 9.387 9.214 9.053 8.877 8.492 8.282 8.064 7.829 7.575 7.222 6.745 5.424 -5 ,1994 ,TETRA ,17559968,Sat Nov 27 09:27:07 CET,Sat Nov 27 11:17:47 CET,0.0 0.872 1.262 1.582 1.858 2.083 2.283 2.461 2.768 2.93 3.084 3.185 3.46 3.573 3.793 4.004 4.204 4.301 4.491 4.672 4.937 5.097 5.242 5.485 5.752 5.979 6.174 6.369 6.607 6.842 7.083 7.363 7.608 7.838 8.132 8.452 8.755 9.104 9.473 9.848 10.223 10.654 11.175 11.681 12.236 12.869 13.587 14.354 15.174 16.008 16.819 17.153 17.114 16.994 16.823 16.563 16.258 15.964 15.668 15.345 15.058 14.784 14.534 14.284 14.045 13.832 13.589 13.364 13.153 12.924 12.681 12.472 12.269 12.066 11.899 11.724 11.543 11.338 11.11 10.958 10.801 10.56 10.384 10.195 10.1 9.884 9.643 9.4 9.281 9.009 8.877 8.723 8.572 8.255 8.067 7.862 7.608 7.291 6.958 6.565 5.006 -6 ,17172 ,TETRA ,17559969,Sat Nov 27 09:27:07 CET,Sat Nov 27 11:18:20 CET,0.0 1.206 1.661 2.0 2.277 2.503 2.692 2.872 3.213 3.358 3.485 3.584 3.856 3.981 4.224 4.436 4.619 4.703 4.875 5.07 5.361 5.546 5.734 6.006 6.274 6.528 6.762 6.969 7.225 7.479 7.724 8.003 8.261 8.52 8.815 9.135 9.441 9.777 10.129 10.498 10.869 11.267 11.754 12.243 12.781 13.374 14.043 14.754 15.574 16.467 17.33 17.773 17.833 17.688 17.436 17.171 16.886 16.561 16.238 15.905 15.613 15.338 15.079 14.816 14.565 14.341 14.101 13.88 13.687 13.483 13.252 13.029 12.787 12.552 12.372 12.177 11.961 11.732 11.509 11.362 11.192 10.913 10.736 10.546 10.444 10.226 9.989 9.738 9.606 9.319 9.166 9.008 8.84 8.459 8.259 8.048 7.813 7.547 7.222 6.855 5.358 -7 ,7317 ,TETRA ,17559970,Sat Nov 27 09:29:05 CET,Sat Nov 27 11:20:37 CET,0.0 0.965 1.396 1.777 2.091 2.356 2.592 2.805 3.185 3.358 3.528 3.692 3.983 4.098 4.332 4.558 4.773 4.878 5.076 5.26 5.508 5.665 5.821 6.041 6.25 6.451 6.654 6.855 7.096 7.311 7.52 7.792 8.047 8.285 8.57 8.894 9.207 9.535 9.868 10.236 10.621 11.034 11.533 12.029 12.581 13.204 13.903 14.661 15.493 16.378 17.253 17.645 17.636 17.473 17.217 16.944 16.677 16.408 16.146 15.833 15.554 15.307 15.041 14.755 14.477 14.212 13.943 13.704 13.471 13.227 12.982 12.777 12.557 12.332 12.163 11.977 11.776 11.559 11.331 11.178 11.016 10.753 10.565 10.376 10.279 10.049 9.805 9.559 9.414 9.112 8.926 8.74 8.564 8.207 8.001 7.779 7.518 7.208 6.855 6.396 4.987 -8 ,26935 ,TETRA ,17559971,Sat Nov 27 09:29:06 CET,Sat Nov 27 11:20:03 CET,0.0 1.037 1.464 1.75 1.994 2.199 2.393 2.598 2.937 3.072 3.204 3.306 3.577 3.703 3.934 4.136 4.332 4.427 4.607 4.787 5.046 5.208 5.373 5.614 5.84 6.052 6.258 6.463 6.741 7.01 7.257 7.561 7.853 8.124 8.432 8.762 9.087 9.462 9.867 10.281 10.681 11.125 11.652 12.165 12.782 13.477 14.219 15.018 15.88 16.785 17.629 18.047 18.052 17.887 17.663 17.373 17.063 16.727 16.399 16.044 15.706 15.402 15.102 14.813 14.542 14.277 13.984 13.709 13.47 13.23 12.972 12.759 12.535 12.295 12.12 11.946 11.748 11.524 11.289 11.138 10.984 10.714 10.51 10.29 10.17 9.92 9.64 9.337 9.19 8.897 8.712 8.53 8.341 7.946 7.724 7.49 7.235 6.922 6.561 6.111 4.769 -9 ,25897 ,TETRA ,17559972,Sat Nov 27 09:29:08 CET,Sat Nov 27 11:19:56 CET,0.0 1.354 1.809 2.143 2.366 2.558 2.752 2.918 3.205 3.344 3.487 3.598 3.872 3.988 4.196 4.393 4.593 4.691 4.875 5.051 5.306 5.47 5.623 5.839 6.046 6.247 6.44 6.627 6.868 7.098 7.323 7.589 7.857 8.116 8.412 8.742 9.055 9.4 9.766 10.154 10.543 10.979 11.491 11.979 12.53 13.124 13.805 14.552 15.35 16.201 17.056 17.519 17.541 17.385 17.141 16.859 16.583 16.269 15.954 15.611 15.288 14.994 14.721 14.466 14.221 13.986 13.726 13.47 13.251 13.038 12.808 12.606 12.393 12.165 11.976 11.783 11.604 11.405 11.182 11.031 10.871 10.609 10.423 10.222 10.117 9.913 9.692 9.455 9.326 9.046 8.933 8.792 8.638 8.302 8.098 7.872 7.637 7.374 7.056 6.621 5.118 -10 ,1396 ,TETRA ,17559973,Sat Nov 27 09:30:02 CET,Sat Nov 27 11:20:48 CET,0.0 1.207 1.641 1.986 2.274 2.521 2.75 2.947 3.293 3.469 3.635 3.793 4.091 4.23 4.485 4.712 4.934 5.038 5.246 5.459 5.746 5.906 6.052 6.274 6.492 6.698 6.892 7.077 7.321 7.55 7.769 8.032 8.288 8.538 8.827 9.152 9.463 9.795 10.149 10.516 10.897 11.353 11.87 12.368 12.949 13.606 14.321 15.055 15.889 16.804 17.661 18.007 18.017 17.896 17.685 17.408 17.131 16.838 16.54 16.241 15.954 15.663 15.384 15.116 14.845 14.605 14.363 14.136 13.942 13.727 13.485 13.277 13.051 12.822 12.645 12.455 12.263 12.073 11.875 11.736 11.577 11.317 11.141 10.958 10.859 10.659 10.451 10.203 10.075 9.805 9.669 9.511 9.34 8.98 8.794 8.583 8.351 8.079 7.716 7.274 5.581 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_65_66.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_65_66.txt deleted file mode 100644 index fd6fdcd3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_65_66.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13329 ,TETRA ,17559974,Sat Nov 27 09:51:59 CET,Sat Nov 27 11:41:55 CET,0.0 0.966 1.436 1.826 2.143 2.415 2.657 2.878 3.253 3.431 3.611 3.794 4.112 4.267 4.541 4.804 5.063 5.187 5.42 5.639 5.947 6.153 6.358 6.636 6.895 7.153 7.408 7.656 7.984 8.285 8.568 8.915 9.234 9.538 9.906 10.306 10.678 11.076 11.486 11.943 12.438 12.981 13.589 14.189 14.88 15.64 16.515 17.485 18.585 19.805 21.125 22.026 22.36 22.372 22.226 22.031 21.82 21.562 21.302 20.996 20.699 20.44 20.164 19.883 19.635 19.392 19.101 18.83 18.591 18.36 18.141 17.953 17.757 17.559 17.393 17.206 17.02 16.837 16.623 16.438 16.24 15.962 15.777 15.587 15.487 15.277 15.066 14.849 14.735 14.462 14.352 14.202 14.032 13.658 13.46 13.236 12.974 12.676 12.312 11.861 10.991 -2 ,4293 ,TETRA ,17559975,Sat Nov 27 09:30:05 CET,Sat Nov 27 11:20:51 CET,0.0 1.806 2.326 2.696 2.989 3.257 3.494 3.701 4.052 4.217 4.374 4.504 4.787 4.92 5.16 5.392 5.622 5.73 5.967 6.202 6.491 6.671 6.863 7.146 7.414 7.66 7.878 8.093 8.379 8.66 8.919 9.216 9.504 9.797 10.141 10.526 10.896 11.288 11.717 12.19 12.678 13.217 13.836 14.425 15.084 15.801 16.634 17.598 18.701 19.886 21.116 21.919 22.199 22.216 22.097 21.907 21.683 21.41 21.167 20.895 20.598 20.333 20.082 19.801 19.533 19.31 19.051 18.791 18.58 18.368 18.114 17.893 17.665 17.42 17.234 17.05 16.852 16.629 16.397 16.249 16.114 15.912 15.764 15.604 15.515 15.328 15.146 14.945 14.84 14.584 14.5 14.377 14.239 13.918 13.735 13.54 13.347 13.145 12.896 12.519 11.73 -3 ,18420 ,TETRA ,17559976,Sat Nov 27 09:30:06 CET,Sat Nov 27 11:21:34 CET,0.0 1.133 1.627 2.025 2.346 2.601 2.829 3.041 3.401 3.573 3.734 3.865 4.162 4.298 4.544 4.805 5.074 5.198 5.442 5.675 5.992 6.19 6.381 6.663 6.944 7.219 7.476 7.711 8.018 8.311 8.585 8.92 9.221 9.512 9.879 10.285 10.656 11.05 11.483 11.942 12.405 12.925 13.548 14.172 14.864 15.638 16.542 17.508 18.588 19.802 21.066 21.77 21.963 21.903 21.744 21.536 21.304 21.073 20.848 20.556 20.241 19.919 19.615 19.356 19.091 18.842 18.583 18.345 18.146 17.936 17.715 17.543 17.368 17.163 16.988 16.817 16.656 16.482 16.29 16.169 16.046 15.836 15.678 15.51 15.423 15.234 15.042 14.827 14.721 14.46 14.34 14.217 14.097 13.83 13.659 13.461 13.26 13.025 12.715 12.343 11.428 -4 ,12647 ,TETRA ,17559977,Sat Nov 27 09:30:03 CET,Sat Nov 27 11:19:34 CET,0.0 1.584 2.227 2.675 2.966 3.226 3.469 3.674 4.026 4.183 4.338 4.474 4.756 4.89 5.139 5.384 5.622 5.731 5.939 6.138 6.433 6.629 6.819 7.083 7.325 7.56 7.784 8.006 8.296 8.57 8.836 9.151 9.447 9.733 10.075 10.461 10.826 11.228 11.673 12.136 12.615 13.157 13.758 14.362 15.074 15.856 16.741 17.706 18.782 19.929 21.199 22.025 22.261 22.272 22.156 21.945 21.711 21.453 21.196 20.902 20.61 20.316 20.059 19.834 19.595 19.382 19.164 18.949 18.755 18.556 18.361 18.205 18.042 17.859 17.717 17.577 17.424 17.26 17.085 16.961 16.827 16.629 16.495 16.345 16.265 16.096 15.927 15.759 15.666 15.417 15.359 15.247 15.128 14.882 14.739 14.577 14.394 14.202 13.948 13.583 12.739 -5 ,10744 ,TETRA ,17559978,Sat Nov 27 09:30:03 CET,Sat Nov 27 11:18:34 CET,0.0 2.235 2.78 3.155 3.451 3.722 3.952 4.156 4.575 4.775 4.936 5.074 5.373 5.516 5.807 6.072 6.307 6.422 6.649 6.86 7.139 7.317 7.491 7.734 7.985 8.242 8.482 8.718 9.025 9.306 9.575 9.904 10.212 10.504 10.846 11.226 11.597 11.996 12.415 12.864 13.327 13.842 14.437 15.038 15.768 16.564 17.41 18.325 19.403 20.627 21.86 22.64 22.869 22.874 22.795 22.596 22.368 22.101 21.836 21.535 21.266 21.031 20.774 20.511 20.261 20.025 19.75 19.494 19.265 19.038 18.792 18.57 18.358 18.137 17.961 17.793 17.627 17.452 17.258 17.117 16.979 16.749 16.581 16.407 16.315 16.115 15.909 15.704 15.594 15.321 15.211 15.094 14.973 14.689 14.533 14.382 14.209 13.982 13.703 13.34 12.354 -6 ,25138 ,TETRA ,17559979,Sat Nov 27 09:30:05 CET,Sat Nov 27 11:19:13 CET,0.0 1.537 2.076 2.435 2.746 3.02 3.285 3.539 3.999 4.202 4.38 4.553 4.862 5.02 5.329 5.624 5.879 6.0 6.233 6.458 6.782 6.981 7.162 7.423 7.679 7.944 8.197 8.425 8.724 9.02 9.308 9.664 9.997 10.312 10.707 11.114 11.463 11.852 12.272 12.71 13.176 13.702 14.294 14.901 15.611 16.391 17.276 18.244 19.305 20.532 21.882 22.693 22.971 22.991 22.881 22.708 22.458 22.184 21.936 21.645 21.36 21.098 20.844 20.595 20.357 20.13 19.878 19.637 19.421 19.195 18.948 18.743 18.526 18.283 18.092 17.91 17.722 17.517 17.3 17.138 16.961 16.698 16.516 16.326 16.231 16.015 15.782 15.546 15.421 15.148 15.018 14.856 14.672 14.277 14.069 13.83 13.551 13.257 12.98 12.651 11.922 -7 ,10515 ,TETRA ,17559980,Sat Nov 27 09:51:57 CET,Sat Nov 27 11:41:07 CET,0.0 1.473 1.983 2.346 2.657 2.932 3.186 3.405 3.801 3.978 4.131 4.267 4.55 4.672 4.89 5.111 5.349 5.461 5.668 5.874 6.171 6.362 6.542 6.803 7.054 7.293 7.529 7.755 8.038 8.304 8.565 8.893 9.2 9.479 9.802 10.173 10.541 10.955 11.37 11.798 12.266 12.795 13.405 14.016 14.711 15.497 16.409 17.382 18.46 19.675 20.968 21.801 22.071 22.065 21.94 21.748 21.525 21.258 21.001 20.733 20.465 20.196 19.909 19.629 19.382 19.156 18.904 18.655 18.449 18.248 18.032 17.857 17.666 17.448 17.271 17.106 16.945 16.76 16.561 16.429 16.298 16.087 15.93 15.759 15.669 15.475 15.262 15.044 14.939 14.676 14.588 14.468 14.332 14.017 13.845 13.679 13.488 13.221 12.895 12.482 11.482 -8 ,6726 ,TETRA ,17559981,Sat Nov 27 09:51:59 CET,Sat Nov 27 11:40:58 CET,0.0 1.637 2.21 2.653 3.002 3.308 3.564 3.782 4.176 4.352 4.518 4.686 4.984 5.124 5.415 5.705 5.967 6.088 6.319 6.531 6.821 7.014 7.206 7.471 7.71 7.953 8.2 8.417 8.69 8.968 9.246 9.58 9.885 10.17 10.506 10.891 11.26 11.646 12.046 12.488 12.977 13.53 14.162 14.799 15.522 16.286 17.121 18.087 19.194 20.38 21.671 22.409 22.604 22.587 22.432 22.242 22.035 21.769 21.52 21.275 21.049 20.823 20.566 20.316 20.076 19.823 19.556 19.314 19.084 18.821 18.55 18.349 18.133 17.888 17.705 17.526 17.327 17.117 16.91 16.773 16.632 16.37 16.174 15.994 15.902 15.71 15.514 15.31 15.209 14.955 14.832 14.688 14.548 14.26 14.088 13.872 13.664 13.455 13.182 12.861 12.082 -9 ,12321 ,TETRA ,17559982,Sat Nov 27 09:51:57 CET,Sat Nov 27 11:42:03 CET,0.0 1.815 2.338 2.689 2.969 3.227 3.472 3.673 4.008 4.164 4.322 4.501 4.805 4.95 5.22 5.468 5.716 5.838 6.07 6.288 6.591 6.773 6.942 7.179 7.421 7.685 7.948 8.182 8.47 8.743 9.004 9.328 9.63 9.926 10.301 10.739 11.133 11.527 11.942 12.377 12.836 13.372 14.0 14.609 15.291 16.054 16.944 17.898 18.952 20.144 21.42 22.15 22.354 22.341 22.248 22.073 21.833 21.587 21.344 21.086 20.836 20.603 20.373 20.128 19.874 19.613 19.343 19.108 18.901 18.687 18.419 18.167 17.924 17.685 17.509 17.332 17.152 16.943 16.72 16.559 16.378 16.105 15.919 15.732 15.636 15.422 15.193 14.974 14.87 14.611 14.508 14.371 14.237 13.944 13.778 13.61 13.431 13.24 12.992 12.642 11.475 -10 ,20865 ,TETRA ,17559983,Sat Nov 27 09:52:56 CET,Sat Nov 27 11:42:19 CET,0.0 1.066 1.467 1.789 2.06 2.309 2.535 2.762 3.164 3.341 3.517 3.681 3.973 4.12 4.401 4.654 4.891 5.006 5.235 5.466 5.788 5.986 6.187 6.478 6.758 7.02 7.256 7.497 7.811 8.121 8.449 8.817 9.137 9.438 9.789 10.196 10.583 11.007 11.446 11.88 12.338 12.857 13.461 14.086 14.82 15.611 16.498 17.499 18.656 19.898 21.141 21.89 22.102 22.096 21.995 21.783 21.541 21.291 21.032 20.757 20.518 20.268 20.017 19.766 19.516 19.3 19.064 18.84 18.64 18.44 18.232 18.034 17.83 17.625 17.454 17.279 17.091 16.881 16.669 16.535 16.396 16.161 15.997 15.831 15.747 15.584 15.41 15.208 15.092 14.82 14.709 14.582 14.454 14.096 13.893 13.708 13.496 13.23 12.937 12.629 11.841 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_66_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_66_62.txt deleted file mode 100644 index 2199415c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_66_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7031 ,TETRA ,17559984,Sat Nov 27 09:52:56 CET,Sat Nov 27 11:41:36 CET,0.0 1.543 2.089 2.443 2.727 2.984 3.236 3.489 3.939 4.122 4.296 4.504 4.84 5.012 5.286 5.525 5.751 5.863 6.093 6.31 6.602 6.786 6.971 7.239 7.491 7.738 7.974 8.204 8.505 8.801 9.079 9.404 9.703 9.987 10.327 10.698 11.042 11.403 11.779 12.165 12.57 13.047 13.617 14.187 14.844 15.54 16.289 17.069 17.876 18.694 19.373 19.528 19.351 19.031 18.631 18.225 17.839 17.443 17.07 16.692 16.338 15.999 15.672 15.35 15.05 14.784 14.482 14.193 13.965 13.729 13.47 13.249 13.005 12.736 12.516 12.287 12.059 11.842 11.601 11.421 11.248 10.98 10.792 10.583 10.471 10.243 10.004 9.757 9.623 9.338 9.161 8.995 8.82 8.429 8.218 7.99 7.729 7.438 7.102 6.621 5.647 -2 ,17696 ,TETRA ,17559985,Sat Nov 27 09:53:56 CET,Sat Nov 27 11:43:41 CET,0.0 2.447 2.947 3.365 3.728 4.047 4.339 4.6 5.107 5.326 5.518 5.753 6.074 6.243 6.567 6.866 7.153 7.295 7.569 7.809 8.161 8.393 8.604 8.895 9.17 9.43 9.673 9.923 10.244 10.544 10.835 11.192 11.52 11.806 12.145 12.526 12.876 13.254 13.657 14.073 14.503 15.014 15.585 16.124 16.747 17.436 18.237 19.08 20.008 20.944 21.757 21.994 21.838 21.564 21.235 20.864 20.476 20.09 19.749 19.401 19.078 18.772 18.46 18.159 17.851 17.562 17.255 16.965 16.72 16.474 16.213 15.997 15.787 15.546 15.347 15.144 14.929 14.704 14.461 14.296 14.123 13.837 13.641 13.458 13.365 13.161 12.942 12.677 12.517 12.219 12.059 11.894 11.714 11.344 11.15 10.926 10.651 10.33 9.966 9.533 7.905 -3 ,30479 ,TETRA ,17559986,Sat Nov 27 09:53:58 CET,Sat Nov 27 11:44:38 CET,0.0 1.805 2.351 2.779 3.157 3.482 3.75 3.982 4.387 4.593 4.802 5.007 5.313 5.467 5.749 6.008 6.259 6.38 6.6 6.824 7.164 7.379 7.584 7.859 8.107 8.362 8.613 8.858 9.186 9.482 9.771 10.109 10.418 10.714 11.054 11.438 11.813 12.245 12.726 13.229 13.719 14.251 14.872 15.454 16.121 16.858 17.67 18.474 19.343 20.253 20.99 21.195 21.009 20.721 20.371 19.967 19.603 19.239 18.885 18.515 18.191 17.894 17.601 17.289 16.969 16.674 16.364 16.094 15.867 15.61 15.307 15.056 14.819 14.582 14.397 14.212 14.024 13.823 13.61 13.457 13.29 13.017 12.824 12.627 12.514 12.267 12.007 11.721 11.573 11.28 11.148 11.008 10.85 10.488 10.292 10.086 9.855 9.572 9.12 8.304 4.1 -4 ,31082 ,TETRA ,17559987,Sat Nov 27 09:55:58 CET,Sat Nov 27 11:44:47 CET,0.0 1.646 2.154 2.539 2.864 3.149 3.391 3.596 4.001 4.193 4.368 4.581 4.903 5.065 5.362 5.639 5.896 6.014 6.229 6.434 6.716 6.894 7.077 7.353 7.604 7.849 8.085 8.309 8.59 8.862 9.128 9.432 9.733 10.037 10.366 10.716 11.05 11.416 11.802 12.206 12.642 13.106 13.622 14.13 14.681 15.273 15.928 16.598 17.308 18.012 18.618 18.842 18.674 18.39 18.083 17.715 17.346 16.988 16.687 16.378 16.065 15.754 15.446 15.141 14.848 14.583 14.305 14.037 13.796 13.546 13.282 13.058 12.811 12.558 12.361 12.15 11.935 11.709 11.448 11.259 11.077 10.799 10.599 10.389 10.284 10.06 9.809 9.54 9.4 9.12 8.959 8.798 8.617 8.197 7.969 7.703 7.412 7.098 6.691 6.168 4.059 -5 ,12302 ,TETRA ,17559988,Sat Nov 27 09:55:58 CET,Sat Nov 27 11:45:48 CET,0.0 1.875 2.446 2.878 3.237 3.514 3.767 4.015 4.45 4.664 4.886 5.125 5.429 5.581 5.881 6.18 6.471 6.609 6.874 7.118 7.453 7.677 7.892 8.191 8.481 8.774 9.067 9.35 9.691 10.011 10.318 10.683 11.019 11.342 11.716 12.121 12.502 12.919 13.365 13.821 14.275 14.773 15.368 15.946 16.589 17.3 18.069 18.835 19.622 20.468 21.261 21.59 21.536 21.291 20.951 20.568 20.208 19.834 19.482 19.124 18.802 18.522 18.247 17.966 17.686 17.414 17.116 16.846 16.61 16.371 16.139 15.931 15.692 15.426 15.206 14.98 14.748 14.496 14.2 13.98 13.767 13.431 13.169 12.913 12.795 12.556 12.306 12.032 11.899 11.628 11.511 11.361 11.202 10.856 10.647 10.413 10.168 9.885 9.525 9.055 7.731 -6 ,26946 ,TETRA ,17559989,Sat Nov 27 09:55:58 CET,Sat Nov 27 11:42:00 CET,0.0 2.079 2.556 2.965 3.321 3.628 3.92 4.186 4.629 4.824 5.022 5.26 5.592 5.762 6.081 6.393 6.711 6.863 7.147 7.416 7.773 7.997 8.215 8.525 8.83 9.135 9.423 9.696 10.034 10.331 10.612 10.967 11.313 11.642 12.019 12.421 12.806 13.241 13.707 14.179 14.675 15.219 15.832 16.417 17.071 17.824 18.627 19.449 20.307 21.163 21.969 22.261 22.123 21.822 21.447 21.057 20.664 20.267 19.919 19.556 19.223 18.896 18.565 18.246 17.936 17.644 17.357 17.123 16.901 16.651 16.384 16.162 15.944 15.707 15.505 15.296 15.073 14.838 14.6 14.44 14.276 14.015 13.808 13.573 13.452 13.213 12.982 12.729 12.591 12.309 12.166 12.012 11.853 11.536 11.352 11.12 10.848 10.532 10.1 9.492 8.347 -7 ,23410 ,TETRA ,17559990,Sat Nov 27 09:57:58 CET,Sat Nov 27 11:41:22 CET,0.0 3.885 4.459 4.888 5.228 5.534 5.815 6.057 6.529 6.756 6.963 7.199 7.522 7.689 7.998 8.294 8.586 8.727 8.983 9.228 9.595 9.831 10.066 10.406 10.729 11.032 11.322 11.6 11.953 12.296 12.612 12.971 13.302 13.614 14.001 14.427 14.817 15.254 15.705 16.17 16.673 17.233 17.846 18.454 19.131 19.858 20.658 21.467 22.283 23.034 23.736 23.985 23.861 23.574 23.246 22.893 22.507 22.091 21.716 21.306 20.939 20.627 20.318 20.022 19.739 19.464 19.172 18.908 18.68 18.441 18.163 17.935 17.714 17.471 17.276 17.065 16.84 16.617 16.385 16.215 16.039 15.78 15.599 15.413 15.318 15.107 14.886 14.657 14.539 14.264 14.108 13.953 13.78 13.335 13.101 12.857 12.568 12.25 11.888 11.331 8.658 -8 ,18452 ,TETRA ,17559991,Sat Nov 27 09:56:57 CET,Sat Nov 27 11:46:46 CET,0.0 2.891 3.522 3.963 4.347 4.675 4.96 5.206 5.633 5.847 6.059 6.275 6.592 6.761 7.083 7.389 7.671 7.8 8.059 8.327 8.68 8.901 9.12 9.434 9.733 10.017 10.288 10.533 10.855 11.171 11.484 11.856 12.204 12.539 12.923 13.353 13.741 14.154 14.6 15.073 15.573 16.126 16.755 17.341 17.976 18.67 19.419 20.224 21.116 22.012 22.724 22.952 22.825 22.505 22.13 21.755 21.401 21.028 20.669 20.301 19.951 19.621 19.311 19.015 18.713 18.419 18.113 17.844 17.608 17.362 17.121 16.913 16.679 16.427 16.237 16.04 15.818 15.596 15.37 15.217 15.048 14.757 14.564 14.36 14.246 14.011 13.774 13.509 13.37 13.089 12.939 12.775 12.586 12.176 11.965 11.74 11.478 11.151 10.71 9.962 7.715 -9 ,24092 ,TETRA ,17559992,Sat Nov 27 09:56:58 CET,Sat Nov 27 11:47:59 CET,0.0 1.674 2.217 2.625 2.949 3.261 3.532 3.781 4.226 4.432 4.625 4.813 5.125 5.283 5.569 5.825 6.071 6.192 6.432 6.661 6.994 7.206 7.405 7.688 7.956 8.212 8.452 8.677 8.99 9.296 9.576 9.905 10.209 10.5 10.839 11.223 11.577 11.945 12.33 12.725 13.146 13.627 14.171 14.707 15.323 15.975 16.675 17.419 18.227 19.032 19.669 19.838 19.665 19.375 19.045 18.633 18.211 17.835 17.486 17.095 16.744 16.431 16.101 15.791 15.517 15.257 14.982 14.717 14.485 14.242 13.976 13.757 13.529 13.266 13.055 12.838 12.61 12.379 12.14 11.967 11.779 11.475 11.259 11.036 10.925 10.694 10.448 10.2 10.07 9.792 9.656 9.502 9.332 8.937 8.704 8.462 8.238 7.957 7.549 7.012 5.408 -10 ,1686 ,TETRA ,17559993,Sat Nov 27 09:56:57 CET,Sat Nov 27 11:46:29 CET,0.0 2.316 2.803 3.116 3.411 3.672 3.894 4.114 4.509 4.68 4.863 5.062 5.368 5.531 5.82 6.078 6.329 6.457 6.715 6.953 7.269 7.475 7.673 7.967 8.26 8.52 8.79 9.059 9.367 9.665 9.953 10.282 10.593 10.881 11.207 11.589 11.956 12.35 12.773 13.189 13.625 14.113 14.636 15.166 15.793 16.446 17.126 17.861 18.638 19.398 20.088 20.265 20.108 19.854 19.515 19.144 18.773 18.373 17.991 17.578 17.219 16.875 16.537 16.234 15.946 15.67 15.363 15.1 14.863 14.605 14.353 14.138 13.908 13.645 13.444 13.258 13.067 12.864 12.652 12.499 12.328 12.052 11.852 11.651 11.546 11.317 11.101 10.881 10.757 10.486 10.358 10.214 10.059 9.68 9.453 9.194 8.91 8.571 8.148 7.723 6.63 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_66_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_66_64.txt deleted file mode 100644 index 22985a3d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_66_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7929 ,TETRA ,17559994,Sat Nov 27 09:57:58 CET,Sat Nov 27 11:47:53 CET,0.0 2.531 3.078 3.491 3.85 4.172 4.494 4.765 5.18 5.37 5.557 5.754 6.062 6.207 6.478 6.743 7.004 7.121 7.346 7.582 7.91 8.107 8.298 8.577 8.824 9.054 9.294 9.522 9.799 10.06 10.313 10.607 10.862 11.099 11.375 11.684 11.973 12.265 12.567 12.879 13.185 13.517 13.896 14.25 14.658 15.005 15.266 15.502 15.681 15.682 15.31 14.481 13.592 12.722 11.897 11.12 10.435 9.794 9.225 8.646 8.126 7.627 7.143 6.711 6.295 5.895 5.461 5.063 4.714 4.344 3.959 3.636 3.281 2.888 2.6 2.307 2.007 1.708 1.386 1.157 0.913 0.53 0.223 -0.135 -0.318 -0.634 -0.934 -1.281 -1.472 -1.818 -2.043 -2.247 -2.48 -3.076 -3.386 -3.67 -4.004 -4.447 -4.984 -5.667 -7.747 -2 ,4087 ,TETRA ,17559995,Sat Nov 27 09:57:57 CET,Sat Nov 27 11:47:35 CET,0.0 4.369 4.997 5.413 5.78 6.081 6.332 6.575 6.977 7.142 7.305 7.475 7.772 7.929 8.245 8.518 8.762 8.881 9.103 9.297 9.573 9.738 9.902 10.146 10.377 10.588 10.774 10.957 11.199 11.42 11.623 11.848 12.056 12.27 12.541 12.818 13.052 13.314 13.583 13.861 14.166 14.482 14.784 15.071 15.394 15.678 15.931 16.144 16.24 16.131 15.588 14.598 13.587 12.63 11.803 11.047 10.338 9.678 9.12 8.556 8.041 7.571 7.098 6.627 6.205 5.827 5.428 5.069 4.753 4.421 4.066 3.784 3.493 3.162 2.901 2.64 2.377 2.096 1.795 1.58 1.355 0.997 0.75 0.506 0.374 0.103 -0.169 -0.465 -0.63 -0.967 -1.197 -1.386 -1.594 -2.044 -2.271 -2.535 -2.856 -3.232 -3.735 -4.4 -7.014 -3 ,8047 ,TETRA ,17559996,Sat Nov 27 09:58:57 CET,Sat Nov 27 11:48:42 CET,0.0 2.865 3.608 4.129 4.49 4.801 5.089 5.355 5.817 6.03 6.239 6.452 6.752 6.905 7.205 7.475 7.715 7.829 8.038 8.238 8.533 8.732 8.927 9.193 9.434 9.671 9.899 10.114 10.4 10.662 10.897 11.185 11.458 11.71 11.986 12.295 12.615 12.953 13.267 13.577 13.92 14.307 14.688 15.01 15.346 15.651 15.944 16.201 16.411 16.454 16.06 15.162 14.232 13.4 12.583 11.81 11.143 10.533 10.003 9.442 8.939 8.488 8.038 7.612 7.228 6.854 6.447 6.075 5.742 5.405 5.056 4.768 4.459 4.136 3.901 3.664 3.407 3.151 2.879 2.674 2.461 2.126 1.895 1.662 1.545 1.28 0.986 0.68 0.52 0.208 0.016 -0.172 -0.383 -0.891 -1.149 -1.41 -1.737 -2.146 -2.682 -3.428 -6.432 -4 ,28110 ,TETRA ,17559997,Sat Nov 27 09:58:58 CET,Sat Nov 27 11:49:41 CET,0.0 2.576 3.179 3.632 4.01 4.315 4.588 4.841 5.29 5.484 5.656 5.837 6.147 6.295 6.57 6.817 7.039 7.144 7.355 7.559 7.839 8.014 8.196 8.462 8.697 8.917 9.137 9.352 9.636 9.909 10.172 10.468 10.733 10.993 11.276 11.554 11.824 12.126 12.416 12.7 12.991 13.321 13.696 14.045 14.434 14.786 15.104 15.387 15.554 15.541 15.134 14.244 13.277 12.384 11.575 10.859 10.228 9.607 9.04 8.453 7.961 7.537 7.113 6.692 6.281 5.889 5.477 5.094 4.743 4.351 3.932 3.604 3.271 2.912 2.643 2.361 2.044 1.714 1.358 1.124 0.902 0.562 0.336 0.113 -0.007 -0.28 -0.567 -0.868 -1.036 -1.369 -1.551 -1.734 -1.911 -2.287 -2.546 -2.857 -3.232 -3.631 -4.023 -4.557 -7.604 -5 ,18782 ,TETRA ,17559998,Sat Nov 27 09:59:56 CET,Sat Nov 27 11:49:35 CET,0.0 2.716 3.454 3.905 4.263 4.578 4.849 5.084 5.508 5.716 5.924 6.127 6.419 6.563 6.86 7.15 7.403 7.536 7.794 8.029 8.37 8.583 8.784 9.056 9.294 9.522 9.735 9.927 10.183 10.43 10.663 10.92 11.167 11.417 11.702 12.003 12.282 12.563 12.856 13.162 13.483 13.833 14.184 14.552 14.947 15.286 15.61 15.939 16.181 16.161 15.671 14.778 13.879 13.018 12.213 11.467 10.778 10.147 9.6 9.051 8.594 8.153 7.697 7.253 6.84 6.469 6.082 5.75 5.466 5.141 4.808 4.55 4.267 3.942 3.684 3.435 3.181 2.908 2.605 2.392 2.166 1.806 1.563 1.306 1.173 0.921 0.65 0.342 0.185 -0.149 -0.4 -0.618 -0.852 -1.351 -1.646 -1.987 -2.37 -2.812 -3.294 -3.847 -6.026 -6 ,8960 ,TETRA ,17559999,Sat Nov 27 09:59:57 CET,Sat Nov 27 11:49:11 CET,0.0 3.284 3.871 4.248 4.553 4.858 5.131 5.326 5.683 5.874 6.067 6.317 6.659 6.841 7.163 7.45 7.718 7.848 8.113 8.366 8.704 8.91 9.104 9.389 9.676 9.921 10.132 10.344 10.601 10.836 11.083 11.373 11.627 11.848 12.095 12.397 12.679 12.971 13.269 13.55 13.83 14.138 14.479 14.817 15.158 15.476 15.803 16.046 16.186 16.192 15.797 14.914 13.983 13.124 12.269 11.466 10.778 10.135 9.573 8.995 8.477 8.031 7.629 7.215 6.825 6.481 6.112 5.771 5.42 5.008 4.61 4.308 4.0 3.684 3.448 3.196 2.929 2.635 2.314 2.093 1.863 1.491 1.234 0.995 0.878 0.623 0.322 -0.011 -0.189 -0.544 -0.774 -0.952 -1.132 -1.56 -1.838 -2.171 -2.533 -2.94 -3.455 -4.246 -7.955 -7 ,2972 ,TETRA ,17560000,Sat Nov 27 10:00:00 CET,Sat Nov 27 11:50:46 CET,0.0 3.197 3.842 4.281 4.629 4.946 5.23 5.486 5.961 6.181 6.389 6.607 6.916 7.079 7.367 7.622 7.865 7.977 8.189 8.387 8.66 8.839 9.001 9.225 9.45 9.662 9.865 10.061 10.297 10.521 10.753 11.038 11.281 11.49 11.74 12.042 12.314 12.582 12.867 13.162 13.437 13.773 14.145 14.433 14.745 15.055 15.377 15.657 15.875 15.9 15.44 14.476 13.531 12.661 11.823 11.084 10.436 9.811 9.266 8.685 8.161 7.724 7.299 6.859 6.448 6.084 5.721 5.393 5.103 4.785 4.426 4.118 3.787 3.44 3.169 2.903 2.645 2.374 2.074 1.858 1.637 1.294 1.06 0.814 0.683 0.419 0.14 -0.192 -0.385 -0.745 -1.015 -1.238 -1.47 -1.899 -2.129 -2.397 -2.744 -3.16 -3.644 -4.292 -6.301 -8 ,9224 ,TETRA ,17560001,Sat Nov 27 09:59:57 CET,Sat Nov 27 11:51:52 CET,0.0 4.447 5.226 5.693 6.111 6.451 6.724 6.971 7.409 7.632 7.856 8.098 8.417 8.585 8.9 9.182 9.454 9.587 9.823 10.034 10.348 10.553 10.743 11.003 11.244 11.473 11.692 11.912 12.219 12.501 12.74 13.005 13.237 13.459 13.712 13.966 14.206 14.489 14.788 15.1 15.43 15.784 16.14 16.468 16.83 17.169 17.5 17.795 18.009 18.017 17.586 16.709 15.788 14.922 14.141 13.397 12.694 12.053 11.51 10.898 10.356 9.869 9.381 8.948 8.55 8.181 7.805 7.449 7.131 6.81 6.45 6.144 5.838 5.521 5.274 5.003 4.709 4.406 4.094 3.883 3.66 3.331 3.112 2.877 2.763 2.52 2.247 1.933 1.765 1.44 1.235 1.043 0.835 0.415 0.186 -0.093 -0.426 -0.856 -1.386 -1.988 -3.701 -9 ,18542 ,TETRA ,17560002,Sat Nov 27 09:59:56 CET,Sat Nov 27 11:49:25 CET,0.0 2.803 3.524 3.994 4.338 4.615 4.895 5.15 5.614 5.819 6.011 6.215 6.508 6.639 6.916 7.199 7.451 7.575 7.83 8.078 8.449 8.694 8.893 9.136 9.39 9.637 9.864 10.067 10.321 10.575 10.805 11.058 11.298 11.549 11.851 12.162 12.454 12.802 13.17 13.517 13.841 14.171 14.528 14.862 15.192 15.517 15.822 16.053 16.199 16.153 15.677 14.775 13.872 13.014 12.182 11.401 10.696 10.043 9.482 8.902 8.415 7.98 7.539 7.118 6.721 6.311 5.864 5.478 5.136 4.775 4.401 4.08 3.767 3.454 3.207 2.955 2.683 2.403 2.112 1.917 1.72 1.41 1.179 0.931 0.808 0.545 0.267 -0.018 -0.17 -0.489 -0.684 -0.897 -1.141 -1.631 -1.889 -2.159 -2.469 -2.802 -3.235 -3.914 -7.052 -10 ,19396 ,TETRA ,17560003,Sat Nov 27 09:59:59 CET,Sat Nov 27 11:49:25 CET,0.0 3.33 3.931 4.341 4.68 4.977 5.253 5.505 5.961 6.17 6.376 6.593 6.894 7.046 7.326 7.583 7.838 7.963 8.198 8.416 8.722 8.906 9.074 9.335 9.583 9.8 10.002 10.208 10.463 10.694 10.94 11.244 11.532 11.787 12.066 12.385 12.663 12.955 13.248 13.544 13.876 14.24 14.59 14.874 15.215 15.568 15.879 16.155 16.352 16.371 15.965 15.034 14.125 13.257 12.369 11.545 10.868 10.223 9.645 9.062 8.53 8.038 7.559 7.091 6.657 6.259 5.818 5.418 5.072 4.717 4.341 4.039 3.715 3.352 3.075 2.799 2.495 2.165 1.847 1.63 1.393 1.022 0.771 0.529 0.404 0.141 -0.157 -0.496 -0.668 -0.998 -1.208 -1.411 -1.635 -2.13 -2.415 -2.718 -3.035 -3.397 -3.837 -4.458 -6.785 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_67_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_67_26.txt deleted file mode 100644 index 2b1b4c71..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_67_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22414 ,TETRA ,17560004,Sat Nov 27 09:59:57 CET,Sat Nov 27 11:55:45 CET,0.0 1.311 1.846 2.283 2.617 2.893 3.123 3.362 3.8 3.989 4.174 4.408 4.702 4.851 5.123 5.386 5.633 5.75 5.983 6.216 6.534 6.752 6.968 7.274 7.577 7.858 8.123 8.388 8.728 9.048 9.354 9.711 10.044 10.372 10.762 11.209 11.643 12.102 12.581 13.08 13.629 14.259 14.964 15.658 16.481 17.393 18.395 19.5 20.767 22.266 23.963 25.178 25.74 25.934 26.014 25.991 25.89 25.725 25.537 25.355 25.171 24.972 24.769 24.583 24.4 24.214 24.018 23.831 23.656 23.465 23.271 23.1 22.916 22.733 22.59 22.437 22.272 22.097 21.908 21.775 21.645 21.44 21.299 21.157 21.082 20.908 20.723 20.551 20.472 20.269 20.163 20.051 19.946 19.703 19.559 19.402 19.248 19.073 18.83 18.498 17.309 -2 ,25493 ,TETRA ,17560005,Sat Nov 27 09:59:57 CET,Sat Nov 27 11:45:49 CET,0.0 1.593 2.026 2.338 2.602 2.838 3.055 3.253 3.634 3.822 3.989 4.165 4.421 4.557 4.836 5.107 5.364 5.486 5.716 5.942 6.273 6.485 6.692 6.981 7.236 7.463 7.701 7.935 8.217 8.481 8.741 9.068 9.382 9.684 10.031 10.423 10.789 11.178 11.616 12.082 12.56 13.097 13.714 14.343 15.099 15.93 16.863 17.914 19.137 20.55 22.144 23.297 23.848 24.062 24.116 24.092 23.995 23.838 23.661 23.481 23.291 23.068 22.845 22.611 22.374 22.16 21.945 21.759 21.584 21.393 21.191 21.027 20.847 20.666 20.53 20.382 20.226 20.052 19.869 19.737 19.604 19.403 19.25 19.093 19.015 18.858 18.7 18.534 18.44 18.222 18.118 18.004 17.885 17.636 17.494 17.32 17.146 16.974 16.716 16.328 14.726 -3 ,17787 ,TETRA ,17560006,Sat Nov 27 09:59:57 CET,Sat Nov 27 11:50:51 CET,0.0 2.622 3.181 3.561 3.874 4.139 4.388 4.641 5.08 5.25 5.407 5.567 5.824 5.956 6.205 6.448 6.699 6.813 7.022 7.243 7.551 7.738 7.918 8.19 8.46 8.699 8.931 9.168 9.48 9.783 10.083 10.445 10.805 11.147 11.525 11.959 12.368 12.806 13.28 13.807 14.347 14.938 15.626 16.346 17.171 18.026 18.999 20.06 21.265 22.659 24.216 25.356 25.903 26.151 26.191 26.076 25.95 25.81 25.644 25.451 25.257 25.065 24.852 24.632 24.423 24.225 24.012 23.809 23.631 23.449 23.25 23.077 22.887 22.686 22.552 22.414 22.256 22.095 21.917 21.787 21.656 21.463 21.323 21.174 21.101 20.95 20.776 20.576 20.478 20.257 20.134 20.017 19.883 19.591 19.427 19.245 19.062 18.847 18.564 18.212 16.837 -4 ,27566 ,TETRA ,17560007,Sat Nov 27 10:00:00 CET,Sat Nov 27 11:50:52 CET,0.0 1.11 1.547 1.883 2.172 2.43 2.661 2.875 3.26 3.435 3.606 3.804 4.071 4.207 4.473 4.717 4.939 5.046 5.273 5.493 5.786 5.978 6.162 6.412 6.662 6.918 7.155 7.383 7.69 8.006 8.322 8.686 9.02 9.323 9.665 10.083 10.486 10.915 11.374 11.864 12.381 12.939 13.578 14.218 14.967 15.799 16.772 17.865 19.07 20.456 22.016 23.1 23.563 23.761 23.853 23.791 23.646 23.491 23.318 23.084 22.872 22.692 22.481 22.283 22.108 21.93 21.752 21.608 21.473 21.317 21.159 21.02 20.874 20.738 20.622 20.487 20.35 20.201 20.044 19.932 19.803 19.588 19.444 19.301 19.218 19.039 18.865 18.647 18.525 18.303 18.199 18.074 17.938 17.635 17.467 17.299 17.102 16.885 16.65 16.297 15.074 -5 ,26362 ,TETRA ,17560008,Sat Nov 27 09:59:57 CET,Sat Nov 27 11:47:01 CET,0.0 1.872 2.341 2.659 2.933 3.2 3.425 3.628 4.025 4.205 4.381 4.638 4.929 5.067 5.324 5.575 5.807 5.925 6.153 6.364 6.68 6.879 7.075 7.363 7.621 7.86 8.094 8.315 8.605 8.899 9.185 9.515 9.821 10.13 10.492 10.881 11.251 11.669 12.133 12.636 13.16 13.741 14.41 15.062 15.798 16.605 17.549 18.622 19.842 21.212 22.804 23.988 24.571 24.822 24.859 24.805 24.708 24.572 24.424 24.244 24.045 23.823 23.587 23.358 23.135 22.935 22.721 22.513 22.34 22.159 21.97 21.81 21.634 21.455 21.306 21.138 20.974 20.809 20.636 20.518 20.392 20.17 20.02 19.873 19.798 19.644 19.459 19.274 19.185 18.972 18.875 18.758 18.633 18.327 18.156 17.964 17.741 17.49 17.184 16.728 13.759 -6 ,7227 ,TETRA ,17560009,Sat Nov 27 10:00:57 CET,Sat Nov 27 11:52:42 CET,0.0 2.203 2.752 3.089 3.36 3.578 3.792 4.032 4.488 4.682 4.869 5.107 5.396 5.541 5.809 6.067 6.309 6.424 6.643 6.859 7.175 7.365 7.543 7.804 8.067 8.33 8.572 8.799 9.1 9.394 9.681 10.014 10.319 10.619 10.983 11.385 11.759 12.186 12.654 13.153 13.662 14.213 14.849 15.483 16.229 17.072 18.043 19.089 20.272 21.631 23.24 24.406 24.926 25.167 25.217 25.14 24.984 24.797 24.624 24.444 24.291 24.141 23.971 23.79 23.598 23.423 23.251 23.077 22.903 22.718 22.527 22.374 22.226 22.079 21.959 21.825 21.681 21.523 21.357 21.253 21.146 20.942 20.797 20.648 20.56 20.378 20.201 20.012 19.913 19.696 19.615 19.516 19.406 19.158 19.02 18.87 18.695 18.501 18.256 17.963 16.805 -7 ,28888 ,TETRA ,17560010,Sat Nov 27 10:00:56 CET,Sat Nov 27 11:50:13 CET,0.0 1.84 2.38 2.776 3.062 3.317 3.565 3.806 4.203 4.382 4.557 4.742 5.012 5.147 5.404 5.655 5.899 6.017 6.239 6.465 6.817 7.038 7.231 7.502 7.763 8.007 8.245 8.485 8.789 9.069 9.353 9.703 10.028 10.335 10.689 11.085 11.461 11.875 12.306 12.778 13.3 13.867 14.507 15.144 15.866 16.687 17.642 18.678 19.859 21.228 22.844 24.018 24.5 24.661 24.672 24.618 24.496 24.336 24.157 23.938 23.739 23.548 23.356 23.183 23.001 22.808 22.596 22.399 22.221 22.011 21.789 21.611 21.433 21.266 21.125 20.961 20.782 20.599 20.41 20.279 20.147 19.924 19.757 19.591 19.51 19.332 19.141 18.945 18.844 18.63 18.532 18.416 18.291 18.02 17.877 17.708 17.537 17.368 17.142 16.733 15.054 -8 ,4006 ,TETRA ,17560011,Sat Nov 27 10:00:56 CET,Sat Nov 27 11:50:12 CET,0.0 1.982 2.462 2.789 3.108 3.401 3.654 3.868 4.287 4.478 4.651 4.852 5.127 5.263 5.508 5.749 6.002 6.121 6.333 6.538 6.831 7.016 7.201 7.473 7.729 7.967 8.193 8.427 8.74 9.033 9.317 9.647 9.944 10.233 10.582 10.987 11.377 11.796 12.233 12.687 13.172 13.733 14.397 15.069 15.84 16.683 17.633 18.689 19.926 21.311 22.782 23.913 24.371 24.498 24.56 24.542 24.458 24.314 24.115 23.896 23.676 23.445 23.207 22.956 22.727 22.52 22.287 22.067 21.868 21.66 21.436 21.256 21.081 20.9 20.762 20.611 20.445 20.283 20.132 20.027 19.912 19.731 19.607 19.481 19.413 19.261 19.093 18.899 18.797 18.575 18.48 18.378 18.261 17.979 17.822 17.643 17.457 17.26 16.988 16.617 15.473 -9 ,29147 ,TETRA ,17560012,Sat Nov 27 10:03:05 CET,Sat Nov 27 11:52:40 CET,0.0 1.293 1.79 2.154 2.43 2.691 2.925 3.129 3.502 3.683 3.859 4.078 4.378 4.541 4.848 5.144 5.42 5.547 5.798 6.032 6.349 6.545 6.728 6.999 7.26 7.51 7.757 7.996 8.299 8.59 8.868 9.198 9.515 9.825 10.189 10.596 10.974 11.383 11.825 12.295 12.799 13.362 14.004 14.645 15.377 16.18 17.096 18.137 19.349 20.708 22.264 23.528 24.114 24.383 24.495 24.453 24.369 24.253 24.106 23.934 23.756 23.581 23.397 23.212 23.05 22.879 22.657 22.442 22.254 22.052 21.839 21.675 21.513 21.337 21.204 21.074 20.935 20.795 20.638 20.523 20.41 20.234 20.108 19.972 19.901 19.746 19.568 19.369 19.266 19.037 18.925 18.809 18.689 18.43 18.285 18.137 17.988 17.791 17.465 17.007 15.428 -10 ,15087 ,TETRA ,17560013,Sat Nov 27 10:03:05 CET,Sat Nov 27 11:54:38 CET,0.0 1.115 1.52 1.818 2.084 2.328 2.563 2.797 3.21 3.384 3.543 3.707 3.992 4.168 4.49 4.761 5.015 5.14 5.386 5.612 5.941 6.154 6.349 6.612 6.862 7.105 7.34 7.569 7.887 8.204 8.506 8.864 9.209 9.558 9.948 10.368 10.782 11.231 11.696 12.185 12.7 13.269 13.919 14.557 15.289 16.094 17.01 18.043 19.22 20.6 22.085 22.927 23.259 23.311 23.25 23.153 22.984 22.81 22.63 22.381 22.137 21.932 21.75 21.568 21.387 21.193 20.971 20.784 20.622 20.447 20.247 20.066 19.871 19.649 19.473 19.296 19.114 18.928 18.732 18.589 18.44 18.204 18.029 17.842 17.757 17.597 17.409 17.21 17.112 16.892 16.767 16.639 16.502 16.195 16.025 15.835 15.631 15.418 15.165 14.814 13.968 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_67_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_67_37.txt deleted file mode 100644 index 7129ce98..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_67_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11208 ,TETRA ,17560014,Sat Nov 27 10:03:57 CET,Sat Nov 27 11:53:22 CET,0.0 0.437 0.767 1.005 1.193 1.376 1.53 1.662 1.898 2.019 2.138 2.222 2.447 2.534 2.688 2.839 2.984 3.053 3.191 3.315 3.489 3.597 3.701 3.86 4.007 4.143 4.27 4.392 4.551 4.696 4.82 4.966 5.1 5.232 5.384 5.535 5.654 5.755 5.865 5.982 6.053 6.077 6.091 6.076 6.013 5.889 5.591 5.068 4.241 2.947 0.71 -2.059 -4.37 -6.315 -7.953 -9.355 -10.524 -11.578 -12.484 -13.384 -14.147 -14.812 -15.436 -16.014 -16.565 -17.07 -17.586 -18.043 -18.444 -18.861 -19.282 -19.597 -19.914 -20.259 -20.515 -20.768 -21.033 -21.304 -21.584 -21.781 -21.975 -22.257 -22.458 -22.677 -22.787 -23.005 -23.224 -23.448 -23.569 -23.858 -23.95 -24.084 -24.227 -24.543 -24.715 -24.884 -25.05 -25.238 -25.453 -25.728 -26.345 -2 ,16865 ,TETRA ,17560015,Sat Nov 27 10:04:58 CET,Sat Nov 27 11:37:42 CET,0.0 0.401 0.605 0.783 0.93 1.059 1.177 1.3 1.537 1.644 1.74 1.795 2.013 2.102 2.262 2.405 2.54 2.594 2.68 2.768 2.896 2.968 3.04 3.145 3.229 3.305 3.377 3.448 3.528 3.611 3.716 3.841 3.949 4.047 4.144 4.237 4.306 4.374 4.469 4.584 4.678 4.723 4.731 4.706 4.579 4.319 3.921 3.301 2.344 0.88 -1.531 -4.341 -6.656 -8.607 -10.196 -11.564 -12.721 -13.733 -14.611 -15.48 -16.225 -16.871 -17.46 -18.035 -18.576 -19.051 -19.538 -19.96 -20.34 -20.72 -21.076 -21.384 -21.704 -22.019 -22.266 -22.533 -22.8 -23.051 -23.309 -23.492 -23.676 -23.965 -24.155 -24.346 -24.451 -24.683 -24.93 -25.174 -25.301 -25.589 -25.719 -25.871 -26.036 -26.356 -26.499 -26.646 -26.815 -27.008 -27.2 -27.419 -28.031 -3 ,8996 ,TETRA ,17560016,Sat Nov 27 10:04:57 CET,Sat Nov 27 11:56:08 CET,0.0 0.764 1.07 1.307 1.491 1.636 1.749 1.857 2.076 2.174 2.265 2.305 2.511 2.586 2.725 2.864 3.0 3.059 3.163 3.258 3.405 3.498 3.587 3.721 3.829 3.928 4.027 4.124 4.243 4.344 4.437 4.545 4.637 4.71 4.806 4.935 5.053 5.152 5.222 5.288 5.339 5.366 5.357 5.296 5.2 4.991 4.626 4.037 3.1 1.66 -0.782 -3.636 -5.906 -7.781 -9.378 -10.813 -12.029 -13.085 -13.985 -14.875 -15.642 -16.316 -16.934 -17.518 -18.07 -18.552 -19.046 -19.501 -19.878 -20.261 -20.653 -20.964 -21.281 -21.617 -21.88 -22.145 -22.41 -22.684 -22.972 -23.161 -23.351 -23.66 -23.87 -24.08 -24.187 -24.407 -24.637 -24.882 -25.011 -25.304 -25.437 -25.588 -25.745 -26.072 -26.24 -26.411 -26.602 -26.824 -27.038 -27.3 -27.794 -4 ,15660 ,TETRA ,17560017,Sat Nov 27 10:04:57 CET,Sat Nov 27 11:55:51 CET,0.0 0.673 0.897 1.115 1.281 1.401 1.512 1.613 1.79 1.874 1.952 1.959 2.153 2.225 2.373 2.511 2.633 2.688 2.79 2.878 2.993 3.061 3.126 3.229 3.325 3.426 3.528 3.623 3.744 3.842 3.928 4.031 4.125 4.219 4.327 4.417 4.49 4.579 4.641 4.678 4.715 4.719 4.668 4.584 4.448 4.198 3.779 3.164 2.283 0.936 -1.466 -4.319 -6.637 -8.584 -10.191 -11.602 -12.799 -13.826 -14.709 -15.613 -16.375 -17.042 -17.67 -18.238 -18.766 -19.255 -19.747 -20.173 -20.533 -20.903 -21.292 -21.622 -21.95 -22.283 -22.545 -22.805 -23.075 -23.344 -23.612 -23.798 -23.998 -24.323 -24.547 -24.774 -24.892 -25.141 -25.387 -25.635 -25.769 -26.056 -26.192 -26.339 -26.485 -26.803 -26.97 -27.155 -27.367 -27.597 -27.848 -28.175 -29.06 -5 ,5603 ,TETRA ,17560018,Sat Nov 27 10:04:57 CET,Sat Nov 27 11:55:31 CET,0.0 0.513 0.784 0.993 1.178 1.353 1.494 1.627 1.884 1.996 2.106 2.181 2.383 2.46 2.621 2.775 2.916 2.984 3.113 3.225 3.39 3.495 3.598 3.739 3.859 3.982 4.097 4.195 4.329 4.455 4.563 4.688 4.798 4.895 5.019 5.167 5.301 5.419 5.533 5.66 5.75 5.8 5.836 5.823 5.729 5.558 5.274 4.787 3.968 2.683 0.389 -2.482 -4.801 -6.735 -8.323 -9.68 -10.873 -11.947 -12.865 -13.767 -14.522 -15.193 -15.826 -16.41 -16.938 -17.411 -17.916 -18.365 -18.745 -19.137 -19.541 -19.883 -20.241 -20.607 -20.878 -21.149 -21.438 -21.738 -22.049 -22.272 -22.519 -22.887 -23.116 -23.33 -23.431 -23.63 -23.827 -24.033 -24.136 -24.404 -24.511 -24.656 -24.796 -25.085 -25.249 -25.409 -25.583 -25.814 -26.083 -26.372 -26.889 -6 ,31295 ,TETRA ,17560019,Sat Nov 27 10:05:56 CET,Sat Nov 27 11:55:26 CET,0.0 0.42 0.623 0.78 0.936 1.067 1.183 1.29 1.465 1.563 1.662 1.694 1.903 1.976 2.121 2.262 2.395 2.454 2.555 2.641 2.768 2.843 2.904 2.989 3.068 3.144 3.215 3.29 3.423 3.551 3.646 3.753 3.85 3.938 4.038 4.128 4.212 4.294 4.366 4.412 4.443 4.464 4.43 4.378 4.277 4.057 3.681 3.122 2.195 0.716 -1.739 -4.613 -6.88 -8.768 -10.363 -11.779 -12.986 -14.064 -14.978 -15.853 -16.601 -17.244 -17.883 -18.504 -19.044 -19.529 -20.037 -20.478 -20.864 -21.26 -21.641 -21.935 -22.24 -22.547 -22.781 -23.029 -23.303 -23.59 -23.877 -24.074 -24.283 -24.615 -24.845 -25.072 -25.191 -25.464 -25.733 -25.993 -26.133 -26.438 -26.562 -26.693 -26.829 -27.111 -27.248 -27.392 -27.545 -27.711 -27.933 -28.206 -28.584 -7 ,18731 ,TETRA ,17560020,Sat Nov 27 10:05:56 CET,Sat Nov 27 12:00:01 CET,0.0 0.411 0.61 0.766 0.911 1.052 1.188 1.297 1.48 1.577 1.667 1.704 1.888 1.954 2.084 2.198 2.3 2.354 2.456 2.53 2.637 2.71 2.785 2.897 2.991 3.065 3.132 3.198 3.284 3.366 3.44 3.527 3.607 3.662 3.718 3.806 3.913 4.008 4.087 4.15 4.166 4.147 4.076 3.975 3.811 3.556 3.158 2.575 1.745 0.376 -1.945 -4.672 -6.904 -8.815 -10.46 -11.894 -13.142 -14.225 -15.122 -15.992 -16.723 -17.387 -18.009 -18.579 -19.107 -19.584 -20.088 -20.536 -20.911 -21.306 -21.718 -22.062 -22.421 -22.768 -23.025 -23.28 -23.545 -23.824 -24.109 -24.304 -24.496 -24.801 -25.017 -25.229 -25.338 -25.571 -25.832 -26.1 -26.237 -26.545 -26.697 -26.862 -27.042 -27.384 -27.563 -27.745 -27.913 -28.076 -28.29 -28.551 -29.056 -8 ,13391 ,TETRA ,17560021,Sat Nov 27 10:05:56 CET,Sat Nov 27 11:53:34 CET,0.0 0.66 0.875 1.055 1.195 1.316 1.435 1.564 1.803 1.895 1.979 2.022 2.239 2.318 2.467 2.614 2.744 2.796 2.885 2.967 3.09 3.17 3.239 3.329 3.423 3.537 3.652 3.751 3.858 3.995 4.156 4.329 4.494 4.591 4.651 4.735 4.804 4.84 4.879 4.95 5.007 5.045 5.071 5.089 5.036 4.852 4.527 3.974 3.118 1.778 -0.575 -3.4 -5.705 -7.658 -9.332 -10.803 -12.044 -13.102 -13.99 -14.867 -15.608 -16.248 -16.843 -17.409 -17.939 -18.436 -18.923 -19.327 -19.68 -20.029 -20.371 -20.657 -20.962 -21.274 -21.512 -21.749 -21.995 -22.257 -22.511 -22.685 -22.87 -23.151 -23.34 -23.54 -23.643 -23.87 -24.107 -24.333 -24.446 -24.719 -24.793 -24.92 -25.054 -25.334 -25.49 -25.702 -25.907 -26.082 -26.324 -26.618 -27.042 -9 ,24153 ,TETRA ,17560022,Sat Nov 27 10:06:58 CET,Sat Nov 27 11:57:13 CET,0.0 0.782 1.093 1.328 1.535 1.73 1.897 2.041 2.318 2.442 2.558 2.652 2.887 3.0 3.187 3.355 3.524 3.595 3.727 3.86 4.04 4.151 4.26 4.422 4.567 4.685 4.79 4.892 5.032 5.163 5.268 5.387 5.509 5.618 5.739 5.878 6.002 6.114 6.21 6.31 6.39 6.435 6.451 6.415 6.321 6.151 5.815 5.281 4.475 3.101 0.758 -2.015 -4.337 -6.278 -7.923 -9.414 -10.74 -11.901 -12.889 -13.9 -14.733 -15.451 -16.138 -16.78 -17.376 -17.899 -18.427 -18.89 -19.283 -19.694 -20.118 -20.458 -20.806 -21.177 -21.462 -21.757 -22.059 -22.362 -22.681 -22.889 -23.102 -23.462 -23.716 -23.967 -24.098 -24.386 -24.677 -24.961 -25.109 -25.416 -25.564 -25.732 -25.911 -26.277 -26.457 -26.653 -26.864 -27.088 -27.352 -27.68 -28.586 -10 ,6108 ,TETRA ,17560023,Sat Nov 27 10:07:57 CET,Sat Nov 27 11:58:06 CET,0.0 0.34 0.512 0.666 0.801 0.919 1.009 1.108 1.296 1.383 1.456 1.454 1.642 1.699 1.825 1.947 2.058 2.104 2.182 2.265 2.386 2.454 2.515 2.608 2.695 2.787 2.868 2.938 3.024 3.112 3.209 3.312 3.403 3.489 3.579 3.666 3.737 3.804 3.862 3.9 3.912 3.913 3.868 3.766 3.617 3.384 2.984 2.393 1.471 0.016 -2.392 -5.229 -7.558 -9.472 -11.051 -12.437 -13.631 -14.69 -15.564 -16.449 -17.233 -17.918 -18.546 -19.106 -19.607 -20.075 -20.564 -20.991 -21.36 -21.737 -22.127 -22.456 -22.795 -23.133 -23.402 -23.698 -24.007 -24.307 -24.586 -24.768 -24.957 -25.249 -25.448 -25.643 -25.747 -25.964 -26.195 -26.454 -26.581 -26.858 -26.958 -27.085 -27.209 -27.468 -27.606 -27.744 -27.898 -28.09 -28.29 -28.558 -29.009 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_67_60.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_67_60.txt deleted file mode 100644 index 2bc89ffd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_67_60.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23306 ,KEBNE ,17025017,Wed Dec 22 11:31:32 CET,Wed Dec 22 13:06:26 CET,0.0 0.637 0.868 1.051 1.22 1.371 1.508 1.651 1.909 2.01 2.097 2.145 2.35 2.426 2.565 2.678 2.789 2.846 2.949 3.042 3.185 3.281 3.375 3.496 3.59 3.675 3.761 3.865 4.007 4.132 4.253 4.381 4.492 4.589 4.689 4.786 4.864 4.939 5.008 5.063 5.114 5.135 5.116 5.063 4.937 4.721 4.37 3.841 2.988 1.62 -0.647 -3.33 -5.526 -7.329 -8.816 -10.137 -11.265 -12.261 -13.096 -13.914 -14.614 -15.224 -15.827 -16.387 -16.884 -17.35 -17.824 -18.231 -18.571 -18.918 -19.294 -19.617 -19.947 -20.28 -20.532 -20.799 -21.068 -21.338 -21.62 -21.804 -21.976 -22.232 -22.432 -22.649 -22.76 -23.0 -23.217 -23.42 -23.537 -23.818 -23.909 -24.047 -24.195 -24.508 -24.675 -24.85 -25.025 -25.217 -25.457 -25.74 -26.154 -2 ,22650 ,KEBNE ,17025018,Wed Dec 22 11:32:33 CET,Wed Dec 22 13:07:48 CET,0.0 1.246 1.606 1.841 2.045 2.212 2.344 2.459 2.67 2.772 2.861 2.876 3.078 3.158 3.297 3.433 3.572 3.633 3.739 3.841 3.976 4.056 4.139 4.256 4.355 4.45 4.541 4.649 4.793 4.921 5.045 5.179 5.29 5.373 5.46 5.567 5.67 5.78 5.875 5.934 5.975 5.987 5.964 5.898 5.771 5.566 5.226 4.722 3.892 2.519 0.184 -2.525 -4.686 -6.466 -7.933 -9.238 -10.368 -11.39 -12.258 -13.101 -13.805 -14.401 -14.973 -15.517 -16.017 -16.458 -16.928 -17.362 -17.729 -18.1 -18.475 -18.799 -19.14 -19.448 -19.669 -19.895 -20.131 -20.383 -20.632 -20.803 -20.981 -21.249 -21.436 -21.621 -21.71 -21.906 -22.127 -22.36 -22.471 -22.741 -22.842 -22.962 -23.09 -23.366 -23.529 -23.715 -23.9 -24.076 -24.278 -24.55 -25.073 -3 ,4631 ,KEBNE ,17025019,Wed Dec 22 11:32:33 CET,Wed Dec 22 13:07:53 CET,0.0 0.568 0.818 1.039 1.227 1.398 1.54 1.668 1.89 1.974 2.051 2.077 2.276 2.347 2.489 2.623 2.743 2.795 2.888 2.984 3.123 3.208 3.285 3.396 3.511 3.621 3.717 3.793 3.891 3.993 4.083 4.18 4.252 4.316 4.402 4.495 4.579 4.672 4.76 4.814 4.849 4.884 4.88 4.819 4.692 4.46 4.09 3.556 2.716 1.366 -0.909 -3.575 -5.715 -7.466 -8.93 -10.233 -11.348 -12.334 -13.166 -13.982 -14.672 -15.279 -15.864 -16.415 -16.92 -17.369 -17.84 -18.246 -18.591 -18.947 -19.317 -19.634 -19.965 -20.294 -20.544 -20.812 -21.09 -21.378 -21.657 -21.853 -22.07 -22.377 -22.589 -22.829 -22.948 -23.183 -23.43 -23.697 -23.844 -24.139 -24.268 -24.411 -24.55 -24.846 -25.01 -25.169 -25.348 -25.547 -25.772 -26.024 -26.481 -4 ,6852 ,KEBNE ,17025020,Wed Dec 22 11:34:37 CET,Wed Dec 22 13:08:15 CET,0.0 0.742 1.011 1.202 1.35 1.483 1.605 1.726 1.942 2.032 2.113 2.143 2.348 2.422 2.561 2.682 2.794 2.848 2.957 3.06 3.202 3.295 3.379 3.501 3.614 3.721 3.829 3.93 4.075 4.238 4.398 4.55 4.655 4.746 4.85 4.96 5.035 5.107 5.181 5.247 5.321 5.37 5.349 5.282 5.142 4.925 4.578 4.044 3.21 1.876 -0.396 -3.09 -5.256 -7.069 -8.582 -9.85 -10.929 -11.898 -12.75 -13.617 -14.331 -14.933 -15.505 -16.068 -16.605 -17.1 -17.612 -18.056 -18.445 -18.842 -19.239 -19.575 -19.945 -20.316 -20.573 -20.828 -21.091 -21.364 -21.647 -21.837 -22.034 -22.346 -22.553 -22.771 -22.888 -23.121 -23.359 -23.611 -23.738 -24.019 -24.147 -24.299 -24.458 -24.786 -24.971 -25.159 -25.338 -25.513 -25.682 -25.91 -26.474 -5 ,17716 ,KEBNE ,17025021,Wed Dec 22 11:34:37 CET,Wed Dec 22 13:08:21 CET,0.0 0.667 1.01 1.322 1.557 1.729 1.88 2.018 2.254 2.357 2.438 2.462 2.668 2.74 2.877 2.995 3.11 3.173 3.289 3.389 3.549 3.651 3.726 3.833 3.944 4.047 4.137 4.223 4.346 4.465 4.574 4.696 4.808 4.923 5.049 5.165 5.265 5.362 5.436 5.508 5.563 5.585 5.56 5.523 5.44 5.228 4.888 4.363 3.5 2.163 -0.072 -2.767 -4.932 -6.711 -8.223 -9.517 -10.608 -11.598 -12.454 -13.297 -13.992 -14.614 -15.208 -15.735 -16.214 -16.647 -17.11 -17.518 -17.852 -18.181 -18.515 -18.794 -19.077 -19.363 -19.582 -19.815 -20.057 -20.313 -20.576 -20.749 -20.926 -21.205 -21.391 -21.581 -21.676 -21.877 -22.098 -22.317 -22.421 -22.676 -22.748 -22.886 -23.045 -23.362 -23.517 -23.668 -23.841 -24.046 -24.266 -24.51 -25.172 -6 ,25562 ,KEBNE ,17025022,Wed Dec 22 11:35:40 CET,Wed Dec 22 13:09:49 CET,0.0 0.818 1.096 1.287 1.472 1.632 1.753 1.871 2.093 2.2 2.295 2.34 2.551 2.634 2.778 2.894 3.007 3.068 3.181 3.274 3.39 3.463 3.544 3.656 3.755 3.854 3.945 4.033 4.146 4.251 4.336 4.43 4.526 4.61 4.69 4.768 4.842 4.906 4.947 4.992 5.024 5.043 5.042 4.974 4.838 4.613 4.261 3.765 2.924 1.534 -0.776 -3.466 -5.623 -7.42 -8.935 -10.26 -11.374 -12.345 -13.168 -13.983 -14.67 -15.272 -15.859 -16.411 -16.907 -17.342 -17.766 -18.145 -18.471 -18.801 -19.148 -19.436 -19.729 -20.033 -20.265 -20.498 -20.745 -20.989 -21.236 -21.412 -21.591 -21.861 -22.048 -22.24 -22.335 -22.54 -22.759 -22.984 -23.096 -23.359 -23.439 -23.568 -23.703 -23.989 -24.141 -24.319 -24.5 -24.669 -24.869 -25.151 -25.744 -7 ,13224 ,KEBNE ,17025023,Wed Dec 22 11:36:41 CET,Wed Dec 22 13:10:42 CET,0.0 0.839 1.105 1.291 1.462 1.615 1.754 1.883 2.142 2.264 2.376 2.438 2.641 2.722 2.898 3.071 3.233 3.309 3.441 3.565 3.75 3.862 3.96 4.093 4.227 4.357 4.476 4.593 4.742 4.88 5.001 5.132 5.256 5.354 5.466 5.588 5.681 5.76 5.839 5.91 5.978 6.038 6.04 5.989 5.861 5.635 5.307 4.785 3.917 2.583 0.302 -2.391 -4.555 -6.321 -7.786 -9.095 -10.224 -11.192 -11.993 -12.792 -13.493 -14.12 -14.698 -15.225 -15.709 -16.156 -16.633 -17.049 -17.41 -17.791 -18.169 -18.468 -18.768 -19.07 -19.306 -19.552 -19.807 -20.068 -20.328 -20.503 -20.678 -20.945 -21.135 -21.326 -21.417 -21.603 -21.81 -22.046 -22.169 -22.439 -22.528 -22.652 -22.787 -23.07 -23.208 -23.361 -23.538 -23.729 -23.948 -24.203 -24.754 -8 ,10628 ,KEBNE ,17025024,Wed Dec 22 11:36:41 CET,Wed Dec 22 13:10:34 CET,0.0 0.767 1.07 1.274 1.454 1.602 1.745 1.886 2.107 2.199 2.291 2.331 2.53 2.598 2.74 2.877 3.004 3.067 3.18 3.277 3.403 3.48 3.566 3.696 3.812 3.92 4.022 4.115 4.215 4.321 4.436 4.582 4.717 4.825 4.929 5.037 5.123 5.203 5.289 5.357 5.392 5.403 5.373 5.292 5.17 4.973 4.623 4.082 3.234 1.942 -0.322 -3.095 -5.337 -7.135 -8.597 -9.87 -11.0 -12.021 -12.879 -13.704 -14.388 -14.996 -15.578 -16.12 -16.602 -17.059 -17.529 -17.924 -18.269 -18.629 -19.006 -19.311 -19.605 -19.908 -20.145 -20.371 -20.607 -20.864 -21.124 -21.297 -21.471 -21.739 -21.924 -22.118 -22.225 -22.454 -22.67 -22.888 -23.003 -23.262 -23.334 -23.459 -23.592 -23.886 -24.057 -24.228 -24.396 -24.574 -24.787 -25.048 -25.582 -9 ,7034 ,KEBNE ,17025025,Wed Dec 22 11:36:40 CET,Wed Dec 22 13:10:30 CET,0.0 0.747 0.988 1.185 1.337 1.476 1.612 1.733 1.939 2.04 2.136 2.166 2.376 2.454 2.594 2.722 2.836 2.892 3.005 3.111 3.284 3.393 3.487 3.63 3.773 3.901 4.027 4.155 4.31 4.441 4.555 4.688 4.798 4.9 5.022 5.139 5.228 5.302 5.398 5.49 5.532 5.57 5.596 5.556 5.429 5.212 4.86 4.317 3.485 2.128 -0.207 -2.848 -4.988 -6.79 -8.295 -9.602 -10.696 -11.65 -12.461 -13.271 -13.952 -14.55 -15.123 -15.652 -16.142 -16.577 -17.028 -17.452 -17.82 -18.181 -18.549 -18.859 -19.182 -19.528 -19.79 -20.052 -20.321 -20.586 -20.859 -21.037 -21.216 -21.479 -21.656 -21.844 -21.937 -22.131 -22.336 -22.553 -22.667 -22.936 -23.039 -23.168 -23.299 -23.58 -23.738 -23.916 -24.106 -24.306 -24.537 -24.836 -25.429 -10 ,3445 ,KEBNE ,17025026,Wed Dec 22 11:36:41 CET,Wed Dec 22 13:10:58 CET,0.0 0.587 0.887 1.135 1.32 1.472 1.614 1.74 1.966 2.073 2.182 2.244 2.445 2.522 2.683 2.85 2.982 3.035 3.131 3.218 3.343 3.415 3.485 3.581 3.665 3.741 3.821 3.903 4.02 4.15 4.266 4.381 4.49 4.599 4.697 4.804 4.915 5.022 5.106 5.16 5.199 5.234 5.222 5.132 4.998 4.777 4.404 3.856 3.02 1.698 -0.554 -3.223 -5.421 -7.225 -8.701 -10.026 -11.147 -12.139 -13.003 -13.825 -14.506 -15.116 -15.705 -16.294 -16.861 -17.396 -17.958 -18.425 -18.81 -19.209 -19.633 -19.982 -20.352 -20.757 -21.062 -21.352 -21.652 -21.966 -22.277 -22.486 -22.7 -23.042 -23.278 -23.517 -23.634 -23.881 -24.138 -24.401 -24.539 -24.837 -24.992 -25.148 -25.304 -25.642 -25.831 -26.023 -26.241 -26.509 -26.802 -27.154 -28.081 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_68_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_68_54.txt deleted file mode 100644 index bf54a997..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_68_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17590 ,TETRA ,17560024,Sat Nov 27 10:07:57 CET,Sat Nov 27 11:58:07 CET,0.0 2.486 3.002 3.3 3.536 3.77 3.947 4.098 4.392 4.519 4.627 4.715 4.931 5.033 5.217 5.375 5.516 5.588 5.725 5.842 6.009 6.115 6.211 6.354 6.484 6.588 6.697 6.806 6.927 7.024 7.106 7.212 7.312 7.397 7.493 7.581 7.631 7.685 7.748 7.775 7.77 7.729 7.64 7.507 7.284 6.945 6.439 5.714 4.601 2.909 0.092 -3.167 -5.694 -7.8 -9.578 -11.132 -12.461 -13.629 -14.629 -15.64 -16.484 -17.205 -17.868 -18.476 -19.028 -19.519 -20.039 -20.509 -20.918 -21.343 -21.778 -22.128 -22.491 -22.861 -23.147 -23.455 -23.77 -24.097 -24.427 -24.656 -24.895 -25.242 -25.499 -25.775 -25.9 -26.159 -26.448 -26.762 -26.931 -27.251 -27.465 -27.652 -27.84 -28.273 -28.534 -28.799 -29.084 -29.418 -29.782 -30.242 -32.289 -2 ,12179 ,TETRA ,17560025,Sat Nov 27 10:07:57 CET,Sat Nov 27 11:57:11 CET,0.0 1.745 2.203 2.572 2.908 3.152 3.326 3.481 3.768 3.92 4.067 4.193 4.412 4.51 4.689 4.87 5.062 5.149 5.293 5.436 5.644 5.767 5.885 6.052 6.199 6.327 6.437 6.544 6.696 6.816 6.919 7.04 7.139 7.228 7.305 7.377 7.452 7.507 7.541 7.551 7.53 7.502 7.416 7.268 7.05 6.728 6.26 5.55 4.479 2.874 0.163 -3.009 -5.546 -7.672 -9.463 -10.998 -12.289 -13.438 -14.448 -15.427 -16.228 -16.947 -17.627 -18.262 -18.847 -19.374 -19.898 -20.362 -20.775 -21.198 -21.633 -21.99 -22.364 -22.752 -23.054 -23.364 -23.697 -24.039 -24.379 -24.611 -24.86 -25.264 -25.541 -25.817 -25.947 -26.226 -26.532 -26.831 -26.988 -27.298 -27.495 -27.684 -27.885 -28.29 -28.506 -28.778 -29.105 -29.436 -29.759 -30.243 -31.831 -3 ,18335 ,TETRA ,17560026,Sat Nov 27 10:07:59 CET,Sat Nov 27 11:57:04 CET,0.0 2.003 2.531 2.92 3.21 3.495 3.725 3.909 4.253 4.394 4.527 4.697 4.925 5.021 5.208 5.391 5.562 5.64 5.782 5.923 6.121 6.24 6.346 6.496 6.629 6.742 6.867 6.996 7.144 7.267 7.385 7.523 7.633 7.732 7.827 7.917 8.006 8.078 8.128 8.167 8.187 8.176 8.106 7.97 7.768 7.477 7.03 6.367 5.31 3.687 0.971 -2.311 -4.92 -7.073 -8.887 -10.455 -11.78 -12.973 -13.988 -14.98 -15.819 -16.556 -17.268 -17.934 -18.524 -19.054 -19.631 -20.14 -20.567 -21.003 -21.456 -21.838 -22.234 -22.646 -22.963 -23.276 -23.6 -23.934 -24.27 -24.501 -24.75 -25.142 -25.412 -25.702 -25.845 -26.15 -26.481 -26.825 -27.003 -27.324 -27.56 -27.758 -27.962 -28.443 -28.695 -28.942 -29.241 -29.585 -30.016 -30.612 -32.219 -4 ,15099 ,TETRA ,17560027,Sat Nov 27 10:07:57 CET,Sat Nov 27 11:58:18 CET,0.0 2.136 2.601 2.958 3.245 3.5 3.72 3.91 4.273 4.441 4.583 4.716 4.941 5.046 5.23 5.393 5.542 5.608 5.74 5.867 6.048 6.15 6.238 6.379 6.5 6.606 6.713 6.806 6.915 7.014 7.098 7.191 7.28 7.363 7.459 7.555 7.623 7.664 7.683 7.699 7.711 7.703 7.641 7.513 7.287 6.948 6.455 5.766 4.725 3.096 0.252 -3.026 -5.587 -7.69 -9.43 -10.978 -12.318 -13.463 -14.422 -15.355 -16.142 -16.882 -17.568 -18.172 -18.728 -19.229 -19.75 -20.223 -20.622 -21.013 -21.434 -21.793 -22.164 -22.554 -22.852 -23.16 -23.484 -23.807 -24.137 -24.376 -24.616 -24.976 -25.23 -25.498 -25.634 -25.912 -26.217 -26.529 -26.686 -26.999 -27.211 -27.417 -27.627 -28.056 -28.298 -28.565 -28.88 -29.245 -29.679 -30.239 -33.284 -5 ,30168 ,TETRA ,17560028,Sat Nov 27 10:07:57 CET,Sat Nov 27 11:48:13 CET,0.0 1.53 2.071 2.44 2.723 2.943 3.115 3.284 3.588 3.723 3.859 3.995 4.203 4.303 4.496 4.668 4.82 4.889 5.009 5.116 5.272 5.361 5.445 5.579 5.707 5.827 5.931 6.035 6.171 6.284 6.376 6.484 6.588 6.678 6.756 6.826 6.891 6.933 6.948 6.964 6.984 6.97 6.892 6.777 6.591 6.29 5.809 5.088 4.008 2.388 -0.27 -3.408 -5.988 -8.184 -9.967 -11.497 -12.793 -13.938 -14.918 -15.872 -16.681 -17.401 -18.082 -18.724 -19.316 -19.838 -20.378 -20.849 -21.259 -21.7 -22.148 -22.504 -22.869 -23.252 -23.547 -23.854 -24.172 -24.49 -24.816 -25.049 -25.285 -25.638 -25.891 -26.157 -26.292 -26.564 -26.85 -27.182 -27.364 -27.682 -27.888 -28.09 -28.307 -28.748 -28.991 -29.266 -29.578 -29.901 -30.274 -30.778 -33.252 -6 ,17555 ,TETRA ,17560029,Sat Nov 27 10:08:58 CET,Sat Nov 27 11:59:22 CET,0.0 1.813 2.222 2.499 2.768 3.006 3.2 3.392 3.732 3.865 3.99 4.11 4.32 4.41 4.586 4.75 4.895 4.972 5.132 5.281 5.504 5.629 5.741 5.894 6.026 6.159 6.291 6.415 6.56 6.69 6.81 6.937 7.053 7.147 7.238 7.34 7.41 7.462 7.498 7.501 7.474 7.424 7.343 7.21 6.981 6.627 6.12 5.383 4.271 2.599 -0.16 -3.317 -5.829 -7.974 -9.824 -11.394 -12.69 -13.842 -14.829 -15.801 -16.614 -17.332 -18.014 -18.639 -19.223 -19.756 -20.286 -20.749 -21.16 -21.571 -21.986 -22.342 -22.708 -23.076 -23.354 -23.649 -23.974 -24.297 -24.623 -24.849 -25.077 -25.433 -25.685 -25.95 -26.091 -26.393 -26.719 -27.061 -27.244 -27.577 -27.829 -28.047 -28.271 -28.746 -28.993 -29.241 -29.497 -29.8 -30.164 -30.653 -33.099 -7 ,27009 ,TETRA ,17560030,Sat Nov 27 10:08:58 CET,Sat Nov 27 11:58:53 CET,0.0 1.313 1.774 2.122 2.389 2.626 2.832 3.007 3.345 3.503 3.636 3.776 4.002 4.108 4.317 4.495 4.646 4.715 4.84 4.956 5.136 5.251 5.355 5.492 5.621 5.743 5.847 5.946 6.07 6.175 6.285 6.405 6.485 6.548 6.632 6.734 6.805 6.849 6.874 6.886 6.899 6.876 6.773 6.617 6.426 6.14 5.661 4.997 3.956 2.274 -0.511 -3.682 -6.234 -8.348 -10.073 -11.598 -12.918 -14.107 -15.123 -16.08 -16.857 -17.549 -18.208 -18.826 -19.409 -19.947 -20.487 -20.965 -21.398 -21.831 -22.268 -22.627 -22.999 -23.383 -23.674 -23.979 -24.305 -24.635 -24.964 -25.198 -25.433 -25.792 -26.051 -26.319 -26.454 -26.738 -27.038 -27.343 -27.501 -27.807 -28.011 -28.2 -28.396 -28.831 -29.092 -29.377 -29.686 -30.021 -30.439 -31.016 -32.433 -8 ,26146 ,TETRA ,17560031,Sat Nov 27 10:08:58 CET,Sat Nov 27 11:52:10 CET,0.0 1.569 1.954 2.23 2.484 2.709 2.898 3.073 3.435 3.613 3.769 3.929 4.176 4.294 4.486 4.658 4.816 4.898 5.055 5.197 5.402 5.523 5.631 5.797 5.946 6.083 6.212 6.321 6.44 6.557 6.674 6.828 6.982 7.132 7.279 7.365 7.397 7.418 7.451 7.459 7.437 7.379 7.275 7.11 6.862 6.532 6.044 5.34 4.238 2.535 -0.269 -3.533 -6.106 -8.221 -9.998 -11.548 -12.866 -14.037 -15.021 -15.983 -16.799 -17.508 -18.168 -18.792 -19.387 -19.922 -20.485 -20.987 -21.393 -21.803 -22.259 -22.658 -23.059 -23.46 -23.791 -24.135 -24.468 -24.81 -25.157 -25.4 -25.654 -26.027 -26.27 -26.521 -26.653 -26.924 -27.211 -27.536 -27.706 -28.02 -28.22 -28.412 -28.613 -29.041 -29.266 -29.51 -29.773 -30.076 -30.46 -30.983 -33.216 -9 ,6772 ,TETRA ,17560032,Sat Nov 27 10:08:58 CET,Sat Nov 27 11:58:58 CET,0.0 1.84 2.327 2.621 2.846 3.039 3.218 3.388 3.684 3.807 3.92 3.999 4.196 4.293 4.479 4.637 4.779 4.85 4.989 5.116 5.295 5.403 5.501 5.646 5.767 5.868 5.962 6.061 6.186 6.287 6.376 6.491 6.599 6.688 6.78 6.861 6.919 6.956 6.976 6.971 6.961 6.931 6.859 6.721 6.471 6.166 5.734 5.055 4.018 2.419 -0.353 -3.624 -6.185 -8.296 -10.058 -11.588 -12.912 -14.081 -15.048 -15.993 -16.809 -17.528 -18.202 -18.825 -19.4 -19.919 -20.445 -20.911 -21.302 -21.712 -22.145 -22.496 -22.851 -23.221 -23.521 -23.821 -24.126 -24.45 -24.795 -25.032 -25.273 -25.63 -25.881 -26.154 -26.294 -26.58 -26.85 -27.136 -27.297 -27.619 -27.843 -28.033 -28.237 -28.708 -28.96 -29.233 -29.543 -29.887 -30.289 -30.826 -32.835 -10 ,32355 ,TETRA ,17560033,Sat Nov 27 10:09:01 CET,Sat Nov 27 11:58:53 CET,0.0 1.639 2.13 2.507 2.818 3.074 3.29 3.486 3.818 3.966 4.119 4.273 4.495 4.601 4.788 4.96 5.112 5.179 5.3 5.419 5.605 5.715 5.813 5.951 6.073 6.179 6.277 6.368 6.474 6.572 6.678 6.79 6.872 6.944 7.035 7.127 7.197 7.252 7.279 7.288 7.28 7.251 7.166 7.032 6.838 6.542 6.092 5.459 4.463 2.873 0.189 -3.037 -5.669 -7.865 -9.655 -11.187 -12.498 -13.644 -14.631 -15.588 -16.385 -17.092 -17.778 -18.429 -19.004 -19.513 -20.049 -20.543 -20.963 -21.376 -21.808 -22.174 -22.558 -22.955 -23.282 -23.63 -23.979 -24.351 -24.744 -24.993 -25.241 -25.664 -25.955 -26.239 -26.385 -26.693 -27.012 -27.355 -27.527 -27.846 -28.056 -28.259 -28.496 -28.988 -29.242 -29.504 -29.787 -30.117 -30.523 -31.05 -32.796 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_68_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_68_64.txt deleted file mode 100644 index 5953d7da..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/MCL1/water/Summary_FEP_68_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24725 ,TETRA ,17560034,Sat Nov 27 10:09:02 CET,Sat Nov 27 11:58:08 CET,0.0 1.999 2.517 2.884 3.191 3.466 3.708 3.925 4.291 4.447 4.593 4.735 4.955 5.068 5.263 5.429 5.588 5.669 5.823 5.965 6.149 6.246 6.341 6.487 6.616 6.723 6.818 6.908 7.013 7.103 7.171 7.235 7.293 7.34 7.391 7.436 7.457 7.456 7.439 7.397 7.328 7.206 7.04 6.85 6.501 6.003 5.336 4.411 3.029 0.956 -2.385 -6.215 -9.185 -11.581 -13.582 -15.303 -16.753 -18.024 -19.083 -20.13 -21.003 -21.768 -22.482 -23.132 -23.729 -24.27 -24.834 -25.321 -25.73 -26.154 -26.604 -26.969 -27.351 -27.752 -28.053 -28.366 -28.683 -29.009 -29.342 -29.565 -29.794 -30.14 -30.382 -30.638 -30.771 -31.046 -31.326 -31.618 -31.779 -32.102 -32.297 -32.478 -32.671 -33.118 -33.389 -33.708 -34.048 -34.424 -34.843 -35.343 -37.349 -2 ,30130 ,TETRA ,17560035,Sat Nov 27 10:08:58 CET,Sat Nov 27 11:57:49 CET,0.0 2.07 2.632 3.009 3.277 3.489 3.704 3.9 4.194 4.339 4.48 4.639 4.883 5.001 5.204 5.397 5.589 5.681 5.843 5.976 6.15 6.258 6.362 6.509 6.642 6.758 6.842 6.918 7.019 7.098 7.162 7.25 7.323 7.366 7.407 7.453 7.506 7.539 7.515 7.455 7.375 7.253 7.046 6.798 6.457 5.985 5.27 4.295 2.886 0.786 -2.544 -6.431 -9.435 -11.849 -13.832 -15.556 -17.014 -18.271 -19.338 -20.402 -21.303 -22.061 -22.75 -23.388 -23.992 -24.536 -25.082 -25.571 -25.994 -26.433 -26.883 -27.275 -27.692 -28.086 -28.381 -28.692 -29.02 -29.359 -29.723 -29.99 -30.244 -30.585 -30.826 -31.084 -31.219 -31.512 -31.818 -32.123 -32.282 -32.61 -32.855 -33.052 -33.247 -33.704 -33.963 -34.253 -34.573 -34.951 -35.372 -35.899 -38.118 -3 ,5680 ,TETRA ,17560036,Sat Nov 27 10:09:58 CET,Sat Nov 27 12:02:00 CET,0.0 2.023 2.523 2.983 3.367 3.701 3.965 4.168 4.536 4.695 4.838 4.984 5.224 5.352 5.579 5.755 5.922 5.999 6.163 6.309 6.474 6.577 6.683 6.853 7.001 7.117 7.222 7.313 7.409 7.492 7.573 7.677 7.769 7.84 7.912 7.973 8.021 8.053 8.05 8.02 7.957 7.858 7.712 7.523 7.205 6.737 6.103 5.201 3.825 1.756 -1.539 -5.314 -8.287 -10.732 -12.751 -14.485 -15.962 -17.25 -18.336 -19.416 -20.326 -21.117 -21.856 -22.551 -23.187 -23.746 -24.31 -24.813 -25.263 -25.73 -26.187 -26.57 -26.98 -27.385 -27.692 -28.011 -28.342 -28.671 -29.014 -29.25 -29.473 -29.825 -30.083 -30.345 -30.485 -30.808 -31.15 -31.491 -31.668 -32.0 -32.245 -32.451 -32.664 -33.116 -33.379 -33.676 -33.99 -34.362 -34.811 -35.365 -37.578 -4 ,24926 ,TETRA ,17560037,Sat Nov 27 10:11:00 CET,Sat Nov 27 12:01:55 CET,0.0 1.928 2.449 2.833 3.109 3.328 3.525 3.72 4.054 4.196 4.318 4.392 4.587 4.677 4.855 5.036 5.195 5.27 5.423 5.551 5.729 5.836 5.932 6.057 6.187 6.323 6.434 6.528 6.648 6.744 6.833 6.941 7.011 7.064 7.12 7.158 7.18 7.19 7.184 7.156 7.086 6.958 6.742 6.506 6.186 5.713 5.023 4.076 2.683 0.581 -2.781 -6.556 -9.474 -11.849 -13.781 -15.455 -16.88 -18.121 -19.152 -20.188 -21.073 -21.819 -22.524 -23.2 -23.81 -24.355 -24.925 -25.416 -25.822 -26.236 -26.677 -27.053 -27.437 -27.847 -28.171 -28.489 -28.829 -29.179 -29.519 -29.763 -30.013 -30.403 -30.676 -30.939 -31.077 -31.374 -31.672 -31.978 -32.134 -32.454 -32.702 -32.925 -33.154 -33.587 -33.808 -34.063 -34.375 -34.745 -35.205 -35.826 -37.87 -5 ,14234 ,TETRA ,17560038,Sat Nov 27 10:11:00 CET,Sat Nov 27 12:01:55 CET,0.0 1.835 2.321 2.686 3.001 3.261 3.501 3.722 4.069 4.209 4.345 4.5 4.72 4.822 5.011 5.187 5.352 5.43 5.571 5.691 5.87 5.977 6.073 6.203 6.316 6.43 6.541 6.637 6.732 6.809 6.877 6.959 7.031 7.095 7.159 7.196 7.207 7.214 7.202 7.155 7.076 6.956 6.778 6.556 6.216 5.757 5.086 4.111 2.731 0.675 -2.693 -6.505 -9.476 -11.893 -13.894 -15.617 -17.04 -18.267 -19.305 -20.321 -21.164 -21.904 -22.622 -23.284 -23.888 -24.443 -25.022 -25.526 -25.968 -26.428 -26.883 -27.257 -27.644 -28.043 -28.339 -28.635 -28.952 -29.28 -29.61 -29.836 -30.066 -30.418 -30.672 -30.944 -31.082 -31.367 -31.655 -31.965 -32.137 -32.46 -32.658 -32.847 -33.048 -33.502 -33.741 -34.005 -34.305 -34.644 -35.037 -35.548 -37.581 -6 ,20413 ,TETRA ,17560039,Sat Nov 27 10:11:00 CET,Sat Nov 27 11:51:19 CET,0.0 1.987 2.436 2.768 3.129 3.417 3.643 3.829 4.12 4.253 4.365 4.469 4.681 4.772 4.944 5.109 5.264 5.336 5.459 5.574 5.736 5.833 5.932 6.073 6.199 6.314 6.418 6.527 6.656 6.748 6.822 6.91 6.994 7.061 7.114 7.161 7.179 7.161 7.148 7.13 7.059 6.937 6.757 6.511 6.167 5.708 5.042 4.114 2.746 0.677 -2.691 -6.53 -9.447 -11.813 -13.776 -15.48 -16.913 -18.149 -19.194 -20.212 -21.084 -21.871 -22.593 -23.242 -23.84 -24.395 -24.964 -25.456 -25.881 -26.323 -26.78 -27.154 -27.539 -27.945 -28.265 -28.574 -28.883 -29.217 -29.559 -29.788 -30.028 -30.409 -30.677 -30.95 -31.089 -31.378 -31.679 -32.018 -32.192 -32.518 -32.752 -32.959 -33.18 -33.609 -33.811 -34.037 -34.339 -34.698 -35.117 -35.643 -38.255 -7 ,22527 ,TETRA ,17560040,Sat Nov 27 10:12:00 CET,Sat Nov 27 12:03:18 CET,0.0 3.806 4.461 4.926 5.25 5.51 5.739 5.942 6.265 6.402 6.539 6.682 6.901 6.988 7.169 7.335 7.481 7.554 7.675 7.787 7.943 8.034 8.122 8.237 8.346 8.448 8.528 8.606 8.717 8.816 8.899 8.972 9.037 9.1 9.156 9.208 9.236 9.248 9.233 9.197 9.145 9.045 8.873 8.63 8.288 7.807 7.074 6.08 4.683 2.598 -0.757 -4.541 -7.525 -9.929 -11.876 -13.542 -14.979 -16.268 -17.362 -18.439 -19.334 -20.092 -20.803 -21.479 -22.091 -22.644 -23.221 -23.713 -24.131 -24.558 -25.003 -25.382 -25.781 -26.187 -26.49 -26.804 -27.142 -27.493 -27.841 -28.07 -28.312 -28.681 -28.937 -29.218 -29.354 -29.624 -29.934 -30.268 -30.427 -30.736 -30.922 -31.113 -31.317 -31.744 -31.979 -32.249 -32.529 -32.838 -33.26 -33.794 -36.364 -8 ,10264 ,TETRA ,17560041,Sat Nov 27 10:12:00 CET,Sat Nov 27 12:03:55 CET,0.0 2.39 2.833 3.166 3.432 3.674 3.901 4.088 4.418 4.58 4.734 4.88 5.103 5.2 5.364 5.522 5.685 5.763 5.906 6.032 6.201 6.306 6.405 6.546 6.666 6.758 6.844 6.931 7.021 7.098 7.183 7.278 7.354 7.427 7.503 7.56 7.592 7.6 7.592 7.569 7.496 7.373 7.187 6.933 6.57 6.105 5.439 4.47 3.023 0.911 -2.423 -6.295 -9.303 -11.71 -13.682 -15.379 -16.839 -18.107 -19.162 -20.183 -21.035 -21.791 -22.505 -23.167 -23.764 -24.305 -24.881 -25.395 -25.835 -26.287 -26.757 -27.141 -27.523 -27.91 -28.207 -28.505 -28.805 -29.131 -29.488 -29.723 -29.95 -30.334 -30.602 -30.872 -31.01 -31.285 -31.563 -31.859 -32.021 -32.341 -32.555 -32.754 -32.946 -33.38 -33.625 -33.89 -34.186 -34.499 -34.898 -35.389 -38.775 -9 ,8081 ,TETRA ,17560042,Sat Nov 27 10:12:59 CET,Sat Nov 27 12:03:30 CET,0.0 3.055 3.561 3.946 4.246 4.486 4.683 4.875 5.173 5.297 5.433 5.558 5.759 5.857 6.038 6.207 6.37 6.451 6.594 6.705 6.853 6.937 7.021 7.145 7.259 7.373 7.473 7.553 7.654 7.754 7.828 7.898 7.979 8.044 8.096 8.157 8.184 8.176 8.159 8.115 8.052 7.938 7.731 7.487 7.149 6.667 5.959 4.977 3.604 1.541 -1.806 -5.602 -8.568 -10.971 -12.951 -14.665 -16.104 -17.351 -18.419 -19.453 -20.323 -21.092 -21.791 -22.441 -23.052 -23.607 -24.18 -24.69 -25.134 -25.587 -26.045 -26.435 -26.833 -27.215 -27.521 -27.844 -28.165 -28.504 -28.849 -29.082 -29.329 -29.71 -29.965 -30.242 -30.392 -30.696 -31.019 -31.366 -31.543 -31.888 -32.166 -32.389 -32.613 -33.075 -33.328 -33.596 -33.876 -34.198 -34.572 -35.101 -37.089 -10 ,12843 ,TETRA ,17560043,Sat Nov 27 10:14:00 CET,Sat Nov 27 12:04:21 CET,0.0 1.964 2.467 2.793 3.029 3.247 3.463 3.667 4.038 4.208 4.37 4.567 4.802 4.903 5.073 5.23 5.393 5.476 5.625 5.75 5.933 6.044 6.141 6.279 6.399 6.502 6.589 6.673 6.793 6.902 6.985 7.055 7.102 7.151 7.213 7.267 7.302 7.312 7.314 7.277 7.186 7.085 6.914 6.678 6.357 5.875 5.146 4.149 2.747 0.706 -2.588 -6.372 -9.329 -11.734 -13.715 -15.416 -16.854 -18.089 -19.14 -20.181 -21.054 -21.819 -22.543 -23.226 -23.853 -24.407 -24.98 -25.486 -25.904 -26.328 -26.775 -27.143 -27.521 -27.905 -28.198 -28.498 -28.801 -29.124 -29.475 -29.707 -29.933 -30.289 -30.537 -30.794 -30.926 -31.205 -31.512 -31.827 -31.994 -32.315 -32.524 -32.737 -32.968 -33.472 -33.733 -33.992 -34.26 -34.586 -35.008 -35.549 -37.717 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt deleted file mode 100644 index d543f09c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10217 ,KEBNE ,16689937,Thu Nov 25 07:52:39 CET,Thu Nov 25 07:53:54 CET,0.0 1.181 1.779 2.222 2.562 2.854 3.127 3.403 3.927 4.15 4.361 4.147 4.962 5.147 5.513 5.865 6.2 6.363 6.683 7.002 7.454 7.738 8.01 8.406 8.788 9.146 9.5 9.864 10.34 10.784 11.197 11.694 12.171 12.633 13.162 13.756 14.31 14.895 15.551 16.25 16.957 17.733 18.555 19.275 20.094 20.999 21.871 22.72 23.553 24.177 24.393 23.934 23.226 22.405 21.586 20.788 19.988 19.2 18.542 17.858 17.219 16.665 16.099 15.507 14.904 14.335 13.723 13.147 12.655 12.156 11.64 11.183 10.691 10.184 9.787 9.365 8.925 8.475 7.993 7.65 7.276 6.686 6.27 5.803 5.558 5.042 4.498 3.907 3.589 2.646 2.639 2.283 1.902 1.06 0.581 0.03 -0.559 -1.188 -1.95 -3.056 -10.499 -2 ,31778 ,KEBNE ,16690663,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:26:46 CET,0.0 1.696 2.363 2.833 3.248 3.619 3.929 4.227 4.781 5.04 5.281 5.079 5.938 6.152 6.561 6.941 7.305 7.481 7.806 8.112 8.553 8.844 9.121 9.509 9.902 10.276 10.631 10.982 11.425 11.868 12.297 12.808 13.313 13.779 14.281 14.839 15.395 16.002 16.61 17.241 17.91 18.671 19.551 20.38 21.253 22.155 23.122 23.938 24.648 25.375 25.763 25.301 24.534 23.713 22.895 22.089 21.342 20.606 19.954 19.225 18.503 17.833 17.171 16.51 15.829 15.194 14.544 13.935 13.408 12.852 12.244 11.716 11.188 10.668 10.251 9.817 9.376 8.895 8.381 8.028 7.653 7.058 6.633 6.183 5.956 5.447 4.9 4.363 4.071 3.117 3.055 2.691 2.319 1.482 1.0 0.492 -0.065 -0.716 -1.547 -2.882 -15.243 -3 ,11925 ,KEBNE ,16690664,Thu Nov 25 08:24:16 CET,Thu Nov 25 10:26:55 CET,0.0 1.375 1.949 2.408 2.827 3.175 3.502 3.815 4.355 4.599 4.843 4.649 5.508 5.716 6.086 6.448 6.801 6.963 7.271 7.567 7.986 8.254 8.521 8.901 9.256 9.607 9.941 10.262 10.668 11.047 11.398 11.836 12.28 12.697 13.171 13.694 14.189 14.721 15.269 15.827 16.432 17.097 17.796 18.481 19.228 19.976 20.762 21.564 22.421 23.211 23.551 23.1 22.37 21.615 20.864 20.043 19.216 18.423 17.716 16.936 16.223 15.564 14.893 14.252 13.648 13.074 12.458 11.88 11.357 10.826 10.256 9.779 9.31 8.804 8.417 8.014 7.577 7.105 6.548 6.138 5.746 5.161 4.744 4.312 4.092 3.632 3.117 2.523 2.205 1.257 1.241 0.873 0.468 -0.41 -0.903 -1.47 -2.133 -2.899 -3.914 -5.347 -11.637 -4 ,4291 ,KEBNE ,16690665,Thu Nov 25 08:24:18 CET,Thu Nov 25 10:28:33 CET,0.0 1.251 1.76 2.207 2.596 2.942 3.253 3.544 4.064 4.304 4.545 4.329 5.186 5.389 5.749 6.086 6.436 6.609 6.938 7.253 7.71 8.004 8.284 8.675 9.049 9.407 9.755 10.103 10.549 10.968 11.368 11.845 12.3 12.737 13.23 13.797 14.352 14.929 15.543 16.164 16.763 17.438 18.253 19.041 19.888 20.707 21.527 22.359 23.107 23.773 24.219 23.953 23.357 22.638 21.826 20.988 20.265 19.519 18.826 18.08 17.372 16.692 16.02 15.405 14.82 14.247 13.633 13.069 12.558 12.011 11.422 10.921 10.364 9.76 9.29 8.791 8.288 7.782 7.266 6.922 6.55 5.921 5.473 5.008 4.759 4.23 3.643 3.038 2.734 1.782 1.722 1.31 0.885 0.029 -0.411 -0.894 -1.527 -2.273 -3.132 -4.253 -16.31 -5 ,12872 ,KEBNE ,16690666,Thu Nov 25 08:24:15 CET,Thu Nov 25 10:27:13 CET,0.0 2.939 3.793 4.44 4.946 5.319 5.61 5.872 6.368 6.598 6.814 6.584 7.413 7.585 7.922 8.254 8.591 8.755 9.059 9.349 9.752 10.013 10.277 10.659 11.036 11.413 11.777 12.122 12.568 12.993 13.398 13.881 14.344 14.792 15.308 15.881 16.415 16.985 17.586 18.222 18.853 19.511 20.279 21.035 21.876 22.736 23.636 24.582 25.475 26.138 26.458 26.074 25.254 24.282 23.309 22.389 21.554 20.788 20.089 19.257 18.556 17.973 17.347 16.711 16.087 15.486 14.839 14.274 13.761 13.196 12.639 12.18 11.681 11.149 10.729 10.274 9.802 9.323 8.828 8.49 8.134 7.563 7.147 6.688 6.449 5.962 5.405 4.798 4.49 3.532 3.511 3.145 2.732 1.79 1.241 0.632 0.013 -0.663 -1.468 -2.418 -8.6 -6 ,18221 ,KEBNE ,16690667,Thu Nov 25 08:24:19 CET,Thu Nov 25 10:27:29 CET,0.0 3.592 4.494 5.121 5.637 6.095 6.496 6.854 7.496 7.79 8.076 7.976 8.843 9.048 9.389 9.703 10.005 10.141 10.394 10.633 10.967 11.175 11.379 11.689 11.996 12.283 12.576 12.86 13.193 13.499 13.778 14.121 14.46 14.78 15.134 15.494 15.829 16.216 16.643 17.093 17.54 18.005 18.514 18.987 19.538 20.127 20.718 21.258 21.67 21.876 21.554 20.567 19.478 18.342 17.278 16.311 15.358 14.425 13.582 12.66 11.813 11.065 10.344 9.628 8.992 8.411 7.78 7.204 6.704 6.199 5.663 5.188 4.662 4.107 3.654 3.167 2.67 2.168 1.646 1.28 0.914 0.33 -0.082 -0.52 -0.745 -1.185 -1.661 -2.216 -2.549 -3.549 -3.723 -4.128 -4.567 -5.478 -6.009 -6.62 -7.259 -8.005 -9.063 -10.475 -21.351 -8 ,14180 ,KEBNE ,16689944,Thu Nov 25 07:53:39 CET,Thu Nov 25 07:54:51 CET,0.0 1.567 2.259 2.82 3.284 3.694 4.08 4.464 5.169 5.481 5.776 5.669 6.567 6.806 7.259 7.688 8.091 8.286 8.647 8.992 9.504 9.826 10.124 10.579 11.018 11.414 11.81 12.195 12.674 13.101 13.507 14.001 14.491 14.97 15.472 16.056 16.637 17.196 17.719 18.242 18.8 19.408 20.115 20.811 21.503 22.179 22.912 23.682 24.362 24.898 25.263 24.976 24.249 23.477 22.688 21.849 21.007 20.173 19.458 18.644 17.853 17.132 16.421 15.705 15.035 14.423 13.776 13.228 12.733 12.184 11.636 11.216 10.728 10.177 9.755 9.325 8.877 8.402 7.918 7.574 7.213 6.632 6.197 5.743 5.515 5.032 4.479 3.921 3.662 2.743 2.731 2.394 2.02 1.216 0.761 0.185 -0.454 -1.15 -1.994 -3.242 -9.21 -9 ,13676 ,KEBNE ,16689945,Thu Nov 25 07:53:40 CET,Thu Nov 25 07:54:56 CET,0.0 1.604 2.296 2.853 3.317 3.702 4.043 4.367 4.935 5.189 5.445 5.254 6.119 6.347 6.753 7.126 7.491 7.677 8.045 8.393 8.878 9.179 9.474 9.913 10.341 10.746 11.143 11.537 12.022 12.469 12.916 13.499 14.058 14.565 15.116 15.682 16.211 16.768 17.351 17.972 18.613 19.361 20.257 21.156 22.103 23.014 24.011 25.034 25.978 26.858 27.479 27.353 26.727 25.977 25.239 24.401 23.586 22.839 22.151 21.452 20.827 20.212 19.537 18.885 18.321 17.796 17.228 16.68 16.16 15.621 15.044 14.57 14.089 13.557 13.146 12.734 12.3 11.834 11.339 10.979 10.589 9.977 9.562 9.13 8.895 8.393 7.867 7.316 7.016 6.047 5.941 5.549 5.168 4.361 3.866 3.268 2.646 1.987 1.16 -0.116 -9.616 -10 ,21758 ,KEBNE ,16689946,Thu Nov 25 07:53:39 CET,Thu Nov 25 07:54:46 CET,0.0 1.686 2.353 2.852 3.257 3.617 3.97 4.304 4.892 5.162 5.417 5.291 6.195 6.441 6.897 7.329 7.742 7.938 8.314 8.67 9.162 9.474 9.774 10.212 10.647 11.074 11.483 11.873 12.367 12.813 13.23 13.736 14.228 14.701 15.235 15.852 16.419 17.018 17.676 18.409 19.169 19.916 20.695 21.418 22.199 23.012 23.861 24.772 25.743 26.451 26.488 25.809 24.947 23.993 23.078 22.237 21.485 20.786 20.158 19.354 18.509 17.718 16.925 16.168 15.454 14.786 14.099 13.475 12.921 12.358 11.766 11.265 10.739 10.217 9.82 9.379 8.92 8.421 7.896 7.529 7.155 6.591 6.187 5.757 5.523 5.033 4.509 3.924 3.621 2.674 2.664 2.312 1.912 1.051 0.575 0.015 -0.668 -1.464 -2.458 -3.792 -15.227 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt deleted file mode 100644 index b0fda3c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25136 ,KEBNE ,16690672,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:32:00 CET,0.0 1.826 2.669 3.29 3.84 4.33 4.738 5.079 5.684 5.979 6.277 6.203 7.117 7.386 7.897 8.364 8.795 9.007 9.4 9.769 10.337 10.699 11.036 11.538 12.035 12.506 12.961 13.407 13.985 14.505 14.98 15.563 16.13 16.639 17.218 17.885 18.509 19.225 19.984 20.754 21.583 22.5 23.546 24.596 25.767 26.995 28.34 29.803 31.451 33.354 35.543 36.978 37.621 37.917 37.886 37.693 37.481 37.191 36.861 36.507 36.165 35.77 35.337 34.925 34.511 34.136 33.774 33.459 33.153 32.772 32.359 31.992 31.564 31.1 30.722 30.327 29.96 29.578 29.139 28.83 28.517 28.015 27.637 27.238 27.031 26.59 26.153 25.7 25.464 24.586 24.693 24.385 24.03 23.243 22.867 22.44 21.898 21.322 20.678 19.842 17.363 -2 ,12138 ,KEBNE ,16689948,Thu Nov 25 07:53:43 CET,Thu Nov 25 07:54:46 CET,0.0 2.111 2.946 3.531 4.037 4.509 4.941 5.341 6.057 6.374 6.672 6.59 7.495 7.747 8.239 8.733 9.205 9.427 9.841 10.242 10.811 11.181 11.538 12.051 12.547 13.024 13.487 13.928 14.479 14.985 15.503 16.152 16.717 17.208 17.833 18.529 19.148 19.88 20.649 21.418 22.221 23.147 24.274 25.394 26.658 27.99 29.489 31.21 33.145 35.25 37.421 38.822 39.367 39.433 39.357 39.207 38.95 38.582 38.192 37.792 37.451 37.063 36.636 36.234 35.813 35.37 34.898 34.482 34.119 33.732 33.323 32.994 32.609 32.168 31.833 31.488 31.11 30.704 30.289 29.985 29.666 29.171 28.787 28.35 28.131 27.708 27.28 26.801 26.538 25.654 25.692 25.381 25.065 24.311 23.887 23.413 22.877 22.348 21.741 20.922 18.18 -3 ,7058 ,KEBNE ,16690674,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:29:19 CET,0.0 2.114 2.954 3.536 4.064 4.559 5.013 5.426 6.177 6.523 6.841 6.782 7.691 7.963 8.491 8.955 9.38 9.598 10.023 10.426 11.013 11.392 11.764 12.306 12.812 13.3 13.772 14.222 14.808 15.356 15.88 16.52 17.127 17.724 18.419 19.168 19.868 20.622 21.392 22.182 23.023 23.957 24.999 26.008 27.143 28.402 29.851 31.406 33.202 35.218 37.38 38.98 39.599 39.703 39.609 39.408 39.069 38.624 38.226 37.83 37.422 36.983 36.551 36.14 35.7 35.27 34.862 34.45 34.052 33.663 33.262 32.901 32.483 32.039 31.707 31.35 30.983 30.591 30.164 29.869 29.551 29.038 28.688 28.334 28.136 27.733 27.35 26.926 26.703 25.857 25.988 25.727 25.434 24.733 24.355 23.953 23.484 22.93 22.141 21.043 18.241 -4 ,25331 ,KEBNE ,16689950,Thu Nov 25 07:53:39 CET,Thu Nov 25 07:54:37 CET,0.0 3.147 4.013 4.67 5.267 5.771 6.227 6.658 7.407 7.74 8.052 8.01 8.944 9.198 9.716 10.208 10.659 10.874 11.291 11.702 12.293 12.69 13.094 13.64 14.136 14.606 15.073 15.523 16.087 16.631 17.173 17.819 18.423 19.002 19.675 20.416 21.141 21.948 22.754 23.561 24.405 25.392 26.58 27.763 29.146 30.593 32.174 34.021 36.105 38.348 40.611 42.111 42.887 43.179 43.223 43.122 42.919 42.596 42.151 41.681 41.234 40.737 40.253 39.827 39.411 39.028 38.632 38.248 37.907 37.569 37.199 36.836 36.42 35.991 35.649 35.278 34.899 34.549 34.182 33.901 33.623 33.18 32.829 32.416 32.221 31.873 31.46 30.971 30.718 29.833 29.867 29.547 29.21 28.485 28.044 27.587 27.102 26.511 25.844 24.919 22.009 -5 ,14079 ,KEBNE ,16690676,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:31:10 CET,0.0 1.394 2.006 2.528 3.003 3.464 3.87 4.281 5.045 5.347 5.629 5.549 6.475 6.738 7.234 7.736 8.197 8.413 8.838 9.245 9.802 10.149 10.498 11.031 11.553 12.033 12.466 12.889 13.442 13.966 14.465 15.069 15.632 16.138 16.745 17.433 18.082 18.83 19.631 20.414 21.195 22.067 23.082 24.12 25.391 26.771 28.248 29.861 31.698 33.751 36.057 37.713 38.422 38.672 38.692 38.513 38.262 37.91 37.498 37.008 36.508 36.037 35.579 35.159 34.716 34.238 33.716 33.252 32.826 32.354 31.881 31.483 31.046 30.578 30.206 29.827 29.453 29.072 28.664 28.362 28.048 27.533 27.175 26.794 26.592 26.173 25.739 25.299 25.061 24.174 24.262 23.982 23.682 22.961 22.559 22.101 21.595 21.054 20.435 19.566 17.355 -6 ,31253 ,KEBNE ,16689952,Thu Nov 25 07:53:39 CET,Thu Nov 25 07:54:29 CET,0.0 3.089 3.981 4.699 5.281 5.778 6.238 6.656 7.372 7.699 8.04 8.086 9.007 9.282 9.806 10.305 10.768 10.994 11.457 11.902 12.537 12.927 13.308 13.874 14.386 14.872 15.33 15.769 16.366 16.916 17.433 18.082 18.711 19.321 19.994 20.715 21.418 22.162 22.926 23.739 24.609 25.62 26.794 27.965 29.247 30.619 32.163 33.787 35.652 37.761 39.999 41.479 41.981 42.076 42.006 41.818 41.528 41.153 40.841 40.508 40.086 39.657 39.274 38.879 38.445 38.042 37.631 37.307 37.027 36.656 36.24 35.882 35.515 35.104 34.739 34.354 33.955 33.556 33.133 32.83 32.539 32.068 31.721 31.368 31.167 30.74 30.307 29.822 29.566 28.704 28.755 28.411 28.056 27.287 26.855 26.394 25.878 25.29 24.566 23.577 20.908 -7 ,22396 ,KEBNE ,16690678,Thu Nov 25 08:24:12 CET,Thu Nov 25 10:30:05 CET,0.0 1.663 2.288 2.797 3.249 3.648 4.013 4.365 4.995 5.283 5.55 5.407 6.284 6.537 7.02 7.481 7.922 8.132 8.55 8.952 9.494 9.842 10.199 10.704 11.178 11.65 12.109 12.553 13.125 13.643 14.146 14.762 15.334 15.892 16.551 17.302 18.049 18.881 19.744 20.641 21.589 22.575 23.67 24.819 26.154 27.581 29.206 31.075 33.121 35.341 37.776 39.485 40.292 40.532 40.494 40.368 40.13 39.752 39.322 38.9 38.51 38.152 37.743 37.305 36.882 36.431 35.917 35.461 35.068 34.628 34.166 33.786 33.378 32.931 32.587 32.216 31.805 31.393 30.969 30.671 30.369 29.884 29.523 29.147 28.958 28.555 28.093 27.618 27.392 26.52 26.605 26.311 26.02 25.322 24.938 24.555 24.088 23.57 22.989 22.085 19.195 -8 ,27968 ,KEBNE ,16689954,Thu Nov 25 07:54:41 CET,Thu Nov 25 07:55:54 CET,0.0 1.795 2.46 3.019 3.52 3.941 4.322 4.698 5.425 5.752 6.054 5.988 6.897 7.162 7.663 8.138 8.587 8.801 9.207 9.596 10.162 10.528 10.881 11.394 11.879 12.348 12.81 13.254 13.811 14.351 14.889 15.523 16.118 16.709 17.391 18.153 18.834 19.531 20.284 21.09 22.024 23.07 24.171 25.226 26.476 27.893 29.471 31.209 33.217 35.38 37.72 39.407 40.043 40.175 40.114 39.944 39.712 39.422 39.074 38.574 38.092 37.697 37.296 36.853 36.422 36.016 35.541 35.082 34.662 34.213 33.727 33.311 32.877 32.441 32.103 31.741 31.344 30.942 30.545 30.26 29.963 29.492 29.168 28.829 28.646 28.25 27.827 27.366 27.116 26.201 26.231 25.933 25.616 24.903 24.514 24.068 23.54 22.959 22.266 21.356 18.661 -9 ,30088 ,KEBNE ,16690680,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:29:50 CET,0.0 1.375 2.062 2.633 3.114 3.554 3.97 4.35 5.003 5.306 5.617 5.548 6.465 6.714 7.205 7.68 8.099 8.297 8.697 9.088 9.636 9.993 10.348 10.851 11.319 11.778 12.244 12.693 13.243 13.781 14.304 14.934 15.564 16.156 16.85 17.649 18.399 19.212 20.069 20.954 21.856 22.825 23.822 24.758 25.854 27.103 28.553 30.135 31.956 34.012 36.296 37.944 38.67 38.906 38.842 38.61 38.232 37.754 37.329 36.904 36.538 36.163 35.742 35.334 34.914 34.479 33.98 33.513 33.119 32.735 32.335 32.003 31.64 31.218 30.883 30.537 30.173 29.8 29.417 29.134 28.824 28.314 27.943 27.547 27.349 26.964 26.53 26.052 25.801 24.907 24.976 24.678 24.362 23.694 23.301 22.866 22.381 21.804 21.172 20.334 18.304 -10 ,12634 ,KEBNE ,16690681,Thu Nov 25 08:24:12 CET,Thu Nov 25 10:30:15 CET,0.0 1.728 2.449 2.989 3.435 3.815 4.164 4.518 5.2 5.524 5.835 5.737 6.644 6.906 7.414 7.893 8.338 8.553 8.968 9.362 9.919 10.278 10.629 11.123 11.594 12.06 12.499 12.917 13.478 14.023 14.542 15.158 15.742 16.329 17.027 17.764 18.443 19.155 19.864 20.618 21.508 22.544 23.642 24.714 25.934 27.273 28.816 30.535 32.49 34.561 36.606 38.141 38.872 39.137 38.997 38.68 38.346 37.953 37.539 37.109 36.729 36.331 35.871 35.347 34.845 34.444 34.031 33.6 33.182 32.741 32.265 31.875 31.459 31.005 30.664 30.319 29.962 29.56 29.136 28.847 28.549 28.083 27.74 27.377 27.192 26.789 26.353 25.888 25.635 24.758 24.874 24.593 24.28 23.556 23.143 22.711 22.229 21.693 21.13 20.331 17.599 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt deleted file mode 100644 index 81222244..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31090 ,KEBNE ,16689957,Thu Nov 25 07:54:41 CET,Thu Nov 25 07:55:50 CET,0.0 0.689 1.024 1.308 1.576 1.839 2.094 2.331 2.748 2.93 3.118 2.832 3.664 3.825 4.133 4.448 4.758 4.906 5.21 5.507 5.929 6.199 6.458 6.848 7.226 7.585 7.936 8.271 8.687 9.099 9.52 10.044 10.543 11.014 11.537 12.131 12.727 13.36 14.032 14.787 15.592 16.509 17.601 18.687 19.927 21.303 22.949 24.802 26.936 29.424 32.287 34.523 35.644 36.186 36.427 36.447 36.339 36.155 35.95 35.762 35.506 35.193 34.887 34.567 34.243 33.935 33.602 33.281 32.97 32.637 32.273 31.969 31.659 31.315 31.038 30.746 30.446 30.137 29.809 29.584 29.344 28.948 28.659 28.343 28.181 27.828 27.429 27.034 26.837 26.002 26.165 25.918 25.662 25.113 24.783 24.415 24.048 23.638 23.162 22.521 21.247 -2 ,28328 ,KEBNE ,16689958,Thu Nov 25 07:54:41 CET,Thu Nov 25 07:55:40 CET,0.0 0.52 0.846 1.093 1.338 1.553 1.739 1.925 2.271 2.425 2.586 2.266 3.082 3.258 3.573 3.872 4.15 4.288 4.576 4.864 5.252 5.497 5.758 6.135 6.476 6.803 7.129 7.448 7.846 8.218 8.584 9.041 9.493 9.938 10.461 11.042 11.6 12.246 12.963 13.708 14.49 15.381 16.426 17.506 18.797 20.272 22.005 23.996 26.412 29.295 32.76 35.595 37.215 38.166 38.757 39.077 39.149 39.102 39.011 38.876 38.704 38.499 38.237 37.905 37.566 37.226 36.842 36.518 36.252 35.956 35.61 35.33 35.051 34.734 34.463 34.194 33.921 33.632 33.341 33.122 32.881 32.511 32.235 31.936 31.774 31.438 31.098 30.733 30.534 29.679 29.847 29.583 29.289 28.658 28.33 27.991 27.589 27.11 26.532 25.777 24.29 -3 ,23625 ,KEBNE ,16689959,Thu Nov 25 07:54:42 CET,Thu Nov 25 07:55:56 CET,0.0 0.517 0.828 1.109 1.353 1.569 1.776 1.979 2.347 2.521 2.7 2.423 3.224 3.38 3.689 3.979 4.247 4.382 4.656 4.913 5.273 5.515 5.758 6.115 6.447 6.764 7.074 7.38 7.767 8.139 8.518 8.964 9.384 9.804 10.286 10.817 11.36 11.962 12.594 13.277 14.007 14.88 15.929 16.975 18.201 19.58 21.206 23.031 25.148 27.757 31.031 33.606 35.069 35.94 36.379 36.578 36.544 36.43 36.33 36.154 35.938 35.641 35.328 35.033 34.762 34.505 34.178 33.84 33.542 33.229 32.883 32.577 32.227 31.869 31.586 31.271 30.946 30.594 30.219 29.947 29.661 29.249 28.971 28.672 28.506 28.156 27.788 27.39 27.182 26.344 26.459 26.196 25.933 25.352 25.042 24.689 24.283 23.848 23.335 22.669 21.245 -4 ,2956 ,KEBNE ,16689960,Thu Nov 25 07:54:40 CET,Thu Nov 25 07:55:34 CET,0.0 0.824 1.254 1.586 1.884 2.155 2.417 2.662 3.079 3.28 3.472 3.185 4.008 4.177 4.495 4.797 5.09 5.231 5.504 5.773 6.164 6.403 6.629 6.985 7.341 7.673 8.001 8.317 8.716 9.121 9.524 9.994 10.434 10.868 11.373 11.937 12.487 13.104 13.771 14.477 15.232 16.088 17.091 18.11 19.346 20.756 22.405 24.305 26.568 29.314 32.653 35.35 36.791 37.541 37.821 37.916 37.827 37.546 37.248 36.911 36.549 36.185 35.851 35.551 35.225 34.891 34.516 34.164 33.865 33.556 33.241 32.97 32.65 32.305 32.043 31.743 31.405 31.062 30.734 30.5 30.241 29.843 29.582 29.302 29.144 28.813 28.488 28.172 27.998 27.163 27.301 27.065 26.84 26.315 26.007 25.668 25.308 24.903 24.419 23.79 22.735 -5 ,9461 ,KEBNE ,16690686,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:32:09 CET,0.0 0.682 1.121 1.397 1.658 1.925 2.182 2.409 2.83 3.024 3.208 2.926 3.731 3.89 4.207 4.519 4.809 4.942 5.204 5.466 5.872 6.143 6.403 6.79 7.164 7.52 7.882 8.228 8.657 9.069 9.472 9.957 10.417 10.855 11.357 11.927 12.499 13.153 13.857 14.618 15.438 16.38 17.511 18.653 20.03 21.556 23.271 25.263 27.639 30.466 33.948 36.764 38.335 39.279 39.761 40.011 40.146 40.054 39.835 39.563 39.349 39.158 38.899 38.614 38.319 38.05 37.738 37.427 37.137 36.822 36.514 36.255 35.978 35.66 35.405 35.133 34.842 34.547 34.2 33.958 33.715 33.302 33.017 32.71 32.545 32.185 31.787 31.387 31.191 30.365 30.546 30.282 30.009 29.414 29.068 28.708 28.358 27.98 27.531 26.871 25.337 -6 ,12451 ,KEBNE ,16690687,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:32:07 CET,0.0 0.639 0.916 1.167 1.412 1.658 1.903 2.118 2.526 2.711 2.902 2.658 3.476 3.65 3.978 4.293 4.592 4.736 5.018 5.301 5.709 5.966 6.219 6.572 6.917 7.252 7.576 7.927 8.395 8.832 9.25 9.753 10.245 10.704 11.214 11.803 12.393 13.034 13.72 14.467 15.271 16.179 17.232 18.324 19.613 21.071 22.8 24.783 27.152 29.95 33.322 36.096 37.639 38.494 38.927 39.154 39.217 39.066 38.763 38.382 38.002 37.593 37.209 36.913 36.619 36.303 35.953 35.62 35.311 34.968 34.588 34.283 33.981 33.661 33.413 33.139 32.856 32.566 32.247 32.024 31.782 31.371 31.084 30.795 30.645 30.312 29.959 29.578 29.378 28.541 28.751 28.504 28.23 27.615 27.266 26.913 26.526 26.077 25.515 24.801 23.519 -7 ,29974 ,KEBNE ,16690688,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:31:45 CET,0.0 0.425 0.786 1.098 1.394 1.652 1.883 2.111 2.554 2.746 2.914 2.621 3.433 3.607 3.947 4.26 4.552 4.699 4.984 5.257 5.663 5.932 6.187 6.543 6.889 7.251 7.605 7.928 8.361 8.785 9.193 9.707 10.208 10.673 11.204 11.828 12.441 13.135 13.878 14.654 15.501 16.48 17.593 18.686 20.003 21.545 23.321 25.289 27.616 30.417 33.82 36.315 37.679 38.509 38.787 38.851 38.853 38.795 38.714 38.481 38.206 38.013 37.828 37.594 37.306 36.995 36.683 36.402 36.124 35.825 35.499 35.228 34.939 34.625 34.384 34.114 33.834 33.524 33.186 32.962 32.732 32.358 32.096 31.82 31.661 31.344 31.022 30.675 30.495 29.684 29.861 29.64 29.419 28.89 28.584 28.281 27.973 27.604 27.163 26.639 25.39 -8 ,674 ,KEBNE ,16689964,Thu Nov 25 07:55:47 CET,Thu Nov 25 07:56:53 CET,0.0 0.657 1.065 1.417 1.697 1.95 2.175 2.372 2.771 2.986 3.198 2.938 3.741 3.903 4.232 4.547 4.873 5.034 5.327 5.595 5.977 6.221 6.45 6.788 7.107 7.431 7.766 8.091 8.497 8.885 9.265 9.735 10.215 10.663 11.165 11.758 12.33 12.96 13.668 14.415 15.204 16.137 17.247 18.314 19.516 20.929 22.677 24.676 27.022 29.813 33.245 36.111 37.691 38.596 38.959 38.952 38.808 38.544 38.246 37.924 37.587 37.264 36.945 36.585 36.22 35.879 35.511 35.194 34.932 34.63 34.295 33.994 33.673 33.334 33.061 32.773 32.474 32.167 31.839 31.591 31.314 30.91 30.616 30.29 30.135 29.812 29.434 29.023 28.818 27.968 28.14 27.901 27.656 27.166 26.901 26.592 26.203 25.717 25.173 24.487 23.363 -9 ,7778 ,KEBNE ,16690690,Thu Nov 25 08:24:10 CET,Thu Nov 25 10:31:54 CET,0.0 0.762 1.069 1.332 1.593 1.833 2.058 2.275 2.704 2.902 3.097 2.843 3.661 3.839 4.189 4.508 4.798 4.952 5.258 5.54 5.935 6.186 6.442 6.792 7.137 7.485 7.809 8.128 8.539 8.936 9.339 9.827 10.308 10.798 11.358 11.966 12.549 13.198 13.927 14.697 15.515 16.447 17.535 18.648 19.947 21.438 23.148 25.127 27.542 30.452 33.838 36.569 38.142 39.032 39.542 39.742 39.798 39.793 39.691 39.45 39.182 38.926 38.655 38.378 38.073 37.758 37.415 37.101 36.821 36.529 36.21 35.926 35.629 35.31 35.063 34.814 34.551 34.263 33.94 33.711 33.474 33.085 32.808 32.527 32.38 32.087 31.774 31.415 31.226 30.405 30.569 30.338 30.108 29.61 29.331 29.0 28.64 28.261 27.786 27.174 26.112 -10 ,2851 ,KEBNE ,16689966,Thu Nov 25 07:55:43 CET,Thu Nov 25 07:56:54 CET,0.0 0.492 0.849 1.162 1.445 1.711 1.968 2.219 2.675 2.891 3.094 2.808 3.617 3.792 4.122 4.424 4.704 4.85 5.145 5.422 5.832 6.094 6.343 6.715 7.078 7.437 7.784 8.117 8.547 8.966 9.384 9.894 10.39 10.865 11.423 12.04 12.618 13.257 13.934 14.665 15.485 16.423 17.5 18.579 19.875 21.365 23.07 24.976 27.271 30.052 33.493 36.221 37.686 38.453 38.822 39.022 38.992 38.707 38.354 38.024 37.729 37.431 37.135 36.866 36.614 36.351 36.054 35.772 35.474 35.145 34.834 34.559 34.259 33.951 33.713 33.447 33.14 32.841 32.537 32.308 32.069 31.68 31.39 31.07 30.903 30.562 30.207 29.862 29.677 28.846 29.039 28.802 28.559 28.016 27.695 27.339 26.959 26.512 25.955 25.223 23.666 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt deleted file mode 100644 index e6561bef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31382 ,KEBNE ,16690692,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:33:36 CET,0.0 3.191 4.016 4.629 5.138 5.599 6.024 6.39 7.016 7.304 7.58 7.418 8.286 8.522 8.969 9.384 9.792 10.001 10.395 10.721 11.17 11.473 11.78 12.237 12.667 13.075 13.45 13.822 14.318 14.774 15.191 15.713 16.229 16.704 17.238 17.826 18.364 18.948 19.616 20.339 21.053 21.84 22.759 23.706 24.815 26.006 27.388 28.971 30.793 32.946 35.481 37.394 38.443 39.01 39.226 39.313 39.294 39.147 38.936 38.68 38.415 38.158 37.891 37.653 37.39 37.11 36.794 36.47 36.196 35.912 35.607 35.345 35.066 34.769 34.53 34.273 33.995 33.679 33.338 33.103 32.861 32.489 32.244 31.985 31.846 31.542 31.214 30.865 30.684 29.88 30.098 29.863 29.616 29.1 28.82 28.519 28.166 27.74 27.245 26.613 25.468 -2 ,4752 ,KEBNE ,16689968,Thu Nov 25 07:55:51 CET,Thu Nov 25 07:56:51 CET,0.0 2.605 3.37 3.951 4.437 4.883 5.284 5.628 6.263 6.567 6.857 6.758 7.632 7.869 8.312 8.742 9.162 9.357 9.722 10.067 10.556 10.858 11.156 11.588 12.006 12.428 12.809 13.157 13.602 14.043 14.477 14.992 15.491 15.965 16.486 17.048 17.577 18.167 18.813 19.489 20.197 20.993 21.894 22.829 23.948 25.207 26.642 28.195 29.994 32.151 34.673 36.602 37.625 38.203 38.485 38.585 38.571 38.496 38.388 38.234 38.059 37.849 37.587 37.291 37.003 36.74 36.471 36.207 35.949 35.674 35.349 35.088 34.836 34.549 34.323 34.091 33.818 33.545 33.292 33.083 32.836 32.451 32.199 31.94 31.807 31.537 31.231 30.879 30.693 29.892 30.087 29.849 29.592 29.038 28.75 28.453 28.115 27.74 27.302 26.74 25.413 -3 ,4471 ,KEBNE ,16689969,Thu Nov 25 07:55:51 CET,Thu Nov 25 07:56:51 CET,0.0 2.883 3.685 4.244 4.739 5.182 5.567 5.891 6.465 6.736 6.999 6.869 7.76 8.002 8.454 8.875 9.265 9.456 9.817 10.147 10.611 10.917 11.224 11.653 12.053 12.435 12.818 13.201 13.66 14.092 14.511 15.004 15.477 15.931 16.469 17.072 17.628 18.249 18.909 19.569 20.269 21.061 21.972 22.906 24.011 25.204 26.571 28.105 29.884 31.971 34.426 36.291 37.282 37.845 38.099 38.178 38.131 37.911 37.69 37.515 37.31 37.036 36.707 36.413 36.193 35.949 35.62 35.317 35.075 34.803 34.529 34.312 34.034 33.741 33.517 33.293 33.061 32.788 32.492 32.286 32.05 31.67 31.415 31.159 31.028 30.759 30.462 30.139 29.97 29.168 29.375 29.152 28.926 28.439 28.16 27.818 27.439 27.05 26.596 26.028 25.045 -4 ,22159 ,KEBNE ,16689970,Thu Nov 25 07:55:42 CET,Thu Nov 25 07:56:43 CET,0.0 2.902 3.705 4.302 4.793 5.221 5.613 5.968 6.616 6.923 7.209 7.065 7.948 8.185 8.638 9.049 9.452 9.646 10.023 10.393 10.933 11.263 11.56 12.024 12.46 12.858 13.231 13.585 14.035 14.453 14.864 15.354 15.824 16.269 16.787 17.386 17.962 18.584 19.227 19.923 20.649 21.434 22.383 23.371 24.494 25.726 27.126 28.699 30.56 32.729 35.175 37.012 37.925 38.407 38.661 38.805 38.825 38.756 38.663 38.472 38.283 38.048 37.712 37.377 37.11 36.884 36.616 36.373 36.115 35.783 35.461 35.204 34.898 34.566 34.314 34.059 33.774 33.468 33.145 32.906 32.65 32.257 31.989 31.703 31.559 31.248 30.91 30.561 30.378 29.561 29.727 29.503 29.281 28.764 28.468 28.142 27.798 27.413 26.948 26.354 25.127 -5 ,9455 ,KEBNE ,16689971,Thu Nov 25 07:55:42 CET,Thu Nov 25 07:56:43 CET,0.0 2.536 3.376 3.982 4.485 4.922 5.314 5.663 6.29 6.581 6.858 6.755 7.631 7.862 8.318 8.732 9.119 9.312 9.691 10.063 10.587 10.929 11.244 11.686 12.104 12.51 12.921 13.306 13.783 14.229 14.681 15.216 15.72 16.219 16.776 17.39 17.977 18.607 19.275 19.99 20.724 21.554 22.55 23.532 24.654 25.881 27.269 28.803 30.589 32.721 35.1 36.885 37.9 38.351 38.532 38.612 38.477 38.25 38.086 37.906 37.698 37.487 37.217 36.935 36.685 36.466 36.202 35.921 35.658 35.371 35.058 34.819 34.574 34.291 34.073 33.856 33.618 33.333 33.022 32.812 32.592 32.227 31.979 31.731 31.592 31.291 30.972 30.603 30.412 29.599 29.81 29.59 29.365 28.861 28.56 28.23 27.873 27.473 27.017 26.408 25.113 -6 ,24424 ,KEBNE ,16690697,Thu Nov 25 08:24:12 CET,Thu Nov 25 10:34:09 CET,0.0 3.023 3.82 4.398 4.873 5.281 5.678 6.042 6.652 6.938 7.217 7.096 7.971 8.195 8.62 9.044 9.453 9.643 10.013 10.373 10.884 11.191 11.476 11.904 12.32 12.715 13.091 13.462 13.921 14.355 14.777 15.278 15.762 16.237 16.802 17.395 17.958 18.59 19.261 19.964 20.694 21.521 22.449 23.353 24.432 25.667 27.08 28.625 30.481 32.624 35.075 37.133 38.182 38.714 38.993 39.057 39.038 38.978 38.845 38.634 38.393 38.113 37.832 37.568 37.273 36.993 36.682 36.346 36.058 35.771 35.45 35.179 34.899 34.604 34.373 34.129 33.883 33.62 33.323 33.117 32.916 32.587 32.347 32.094 31.966 31.71 31.422 31.092 30.926 30.133 30.422 30.225 30.018 29.575 29.322 29.046 28.756 28.403 27.974 27.442 26.539 -7 ,26085 ,KEBNE ,16689973,Thu Nov 25 07:55:42 CET,Thu Nov 25 07:56:36 CET,0.0 2.739 3.583 4.168 4.646 5.063 5.447 5.808 6.461 6.75 7.014 6.91 7.797 8.018 8.444 8.85 9.236 9.419 9.784 10.138 10.616 10.927 11.237 11.672 12.098 12.513 12.91 13.291 13.739 14.159 14.574 15.069 15.562 16.046 16.604 17.231 17.869 18.554 19.238 19.953 20.694 21.515 22.456 23.38 24.433 25.624 27.022 28.587 30.403 32.524 35.066 37.001 37.974 38.525 38.787 38.893 38.897 38.792 38.598 38.32 38.05 37.8 37.556 37.316 37.093 36.885 36.638 36.38 36.143 35.868 35.542 35.302 35.034 34.689 34.402 34.128 33.86 33.557 33.236 33.026 32.807 32.452 32.197 31.92 31.779 31.494 31.202 30.903 30.733 29.919 30.142 29.92 29.685 29.201 28.954 28.685 28.37 27.998 27.613 27.176 26.411 -8 ,1436 ,KEBNE ,16690699,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:32:21 CET,0.0 2.599 3.464 4.108 4.638 5.073 5.455 5.811 6.455 6.741 7.017 6.89 7.775 7.993 8.405 8.811 9.196 9.383 9.741 10.092 10.602 10.924 11.234 11.677 12.102 12.51 12.908 13.285 13.765 14.234 14.686 15.24 15.76 16.255 16.834 17.481 18.096 18.718 19.357 20.044 20.792 21.662 22.645 23.625 24.774 26.032 27.48 29.115 31.003 33.167 35.688 37.662 38.736 39.329 39.596 39.669 39.64 39.566 39.388 39.107 38.779 38.506 38.295 38.002 37.694 37.443 37.142 36.829 36.539 36.231 35.92 35.658 35.375 35.069 34.837 34.585 34.304 34.003 33.695 33.491 33.276 32.913 32.646 32.346 32.191 31.904 31.586 31.223 31.039 30.233 30.484 30.28 30.055 29.527 29.244 28.947 28.63 28.248 27.789 27.227 26.25 -9 ,1460 ,KEBNE ,16689975,Thu Nov 25 07:55:42 CET,Thu Nov 25 07:56:36 CET,0.0 3.266 4.155 4.742 5.236 5.657 6.053 6.435 7.101 7.407 7.679 7.523 8.416 8.659 9.098 9.505 9.904 10.105 10.489 10.835 11.329 11.646 11.954 12.397 12.81 13.22 13.64 14.047 14.567 15.067 15.553 16.126 16.673 17.218 17.789 18.366 18.926 19.533 20.17 20.856 21.594 22.408 23.347 24.27 25.343 26.57 28.015 29.604 31.435 33.605 36.116 38.039 39.02 39.532 39.735 39.798 39.731 39.55 39.391 39.122 38.843 38.613 38.329 38.035 37.755 37.475 37.151 36.865 36.634 36.396 36.112 35.844 35.562 35.238 34.97 34.71 34.429 34.126 33.802 33.577 33.347 32.975 32.705 32.421 32.283 31.976 31.629 31.292 31.116 30.312 30.556 30.343 30.103 29.609 29.347 29.045 28.69 28.299 27.849 27.21 25.987 -10 ,18162 ,KEBNE ,16690701,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:31:59 CET,0.0 2.579 3.328 3.902 4.388 4.802 5.159 5.479 6.086 6.361 6.631 6.496 7.375 7.609 8.066 8.502 8.896 9.074 9.427 9.765 10.241 10.551 10.863 11.322 11.766 12.192 12.596 12.963 13.419 13.87 14.306 14.816 15.291 15.755 16.296 16.881 17.436 18.04 18.673 19.335 20.066 20.892 21.816 22.749 23.871 25.111 26.489 28.081 29.956 32.13 34.655 36.551 37.485 37.983 38.228 38.305 38.258 38.134 37.969 37.742 37.515 37.294 37.036 36.745 36.501 36.277 35.994 35.721 35.454 35.17 34.86 34.59 34.304 33.979 33.719 33.464 33.201 32.922 32.613 32.403 32.21 31.895 31.66 31.416 31.29 31.035 30.748 30.422 30.264 29.453 29.722 29.541 29.331 28.858 28.618 28.323 27.97 27.614 27.246 26.736 25.495 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt deleted file mode 100644 index be48374f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28682 ,KEBNE ,16690702,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:32:06 CET,0.0 1.17 1.762 2.19 2.568 2.946 3.28 3.564 4.065 4.298 4.513 4.27 5.143 5.338 5.699 6.048 6.371 6.53 6.836 7.118 7.527 7.787 8.053 8.44 8.803 9.156 9.485 9.799 10.213 10.62 10.995 11.439 11.889 12.322 12.815 13.353 13.854 14.425 15.04 15.685 16.369 17.081 17.855 18.598 19.432 20.337 21.312 22.323 23.465 24.67 25.832 26.407 26.501 26.389 26.135 25.799 25.427 25.059 24.712 24.277 23.873 23.515 23.157 22.792 22.455 22.127 21.721 21.344 21.008 20.638 20.268 19.956 19.618 19.27 18.991 18.705 18.409 18.079 17.734 17.495 17.254 16.88 16.607 16.315 16.163 15.865 15.542 15.177 14.985 14.16 14.399 14.185 13.948 13.435 13.161 12.841 12.475 12.091 11.676 11.113 9.767 -2 ,25831 ,KEBNE ,16689978,Thu Nov 25 07:55:44 CET,Thu Nov 25 07:57:00 CET,0.0 0.975 1.454 1.854 2.202 2.514 2.82 3.113 3.638 3.883 4.114 3.926 4.752 4.951 5.345 5.706 6.036 6.197 6.517 6.835 7.294 7.562 7.829 8.232 8.597 8.937 9.281 9.622 10.052 10.47 10.863 11.298 11.723 12.143 12.628 13.182 13.704 14.264 14.844 15.433 16.046 16.71 17.462 18.202 19.03 19.89 20.8 21.813 22.957 24.154 25.314 25.922 25.965 25.77 25.478 25.065 24.666 24.309 23.975 23.559 23.164 22.796 22.432 22.034 21.622 21.219 20.8 20.436 20.091 19.738 19.376 19.069 18.743 18.391 18.109 17.817 17.506 17.18 16.841 16.6 16.348 15.955 15.669 15.358 15.198 14.87 14.534 14.193 14.014 13.19 13.416 13.196 12.951 12.387 12.056 11.705 11.341 10.956 10.487 9.899 8.97 -3 ,5483 ,KEBNE ,16690704,Thu Nov 25 08:24:12 CET,Thu Nov 25 10:32:26 CET,0.0 0.886 1.397 1.827 2.221 2.57 2.872 3.16 3.668 3.908 4.153 3.948 4.789 4.987 5.371 5.749 6.106 6.277 6.6 6.897 7.329 7.624 7.921 8.336 8.717 9.089 9.451 9.807 10.269 10.704 11.104 11.566 12.02 12.456 12.94 13.463 13.963 14.482 15.034 15.646 16.296 17.043 17.873 18.631 19.565 20.556 21.487 22.53 23.706 24.865 25.971 26.572 26.676 26.551 26.275 25.916 25.552 25.139 24.763 24.328 23.894 23.514 23.131 22.779 22.425 22.043 21.659 21.294 20.941 20.572 20.201 19.878 19.531 19.166 18.883 18.608 18.311 17.989 17.652 17.419 17.18 16.811 16.548 16.261 16.112 15.791 15.418 15.031 14.835 14.003 14.194 13.962 13.728 13.243 12.966 12.641 12.236 11.794 11.311 10.737 9.427 -4 ,19380 ,KEBNE ,16690705,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:31:14 CET,0.0 0.965 1.525 1.959 2.345 2.679 2.969 3.245 3.77 4.003 4.227 4.013 4.874 5.07 5.436 5.792 6.134 6.301 6.624 6.94 7.394 7.673 7.939 8.33 8.723 9.093 9.428 9.746 10.17 10.587 10.979 11.449 11.901 12.309 12.771 13.306 13.788 14.291 14.847 15.462 16.101 16.749 17.45 18.149 18.949 19.813 20.752 21.728 22.804 23.959 25.125 25.679 25.703 25.56 25.314 25.011 24.652 24.225 23.828 23.45 23.069 22.685 22.322 21.965 21.574 21.177 20.777 20.387 20.021 19.661 19.278 18.94 18.614 18.264 17.969 17.684 17.391 17.063 16.709 16.458 16.208 15.824 15.543 15.248 15.091 14.74 14.385 14.025 13.833 13.004 13.238 13.018 12.769 12.256 11.982 11.682 11.354 10.988 10.59 10.102 9.053 -5 ,21585 ,KEBNE ,16690706,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:31:49 CET,0.0 0.776 1.306 1.741 2.121 2.472 2.8 3.102 3.631 3.879 4.11 3.935 4.78 4.987 5.398 5.768 6.108 6.278 6.616 6.94 7.407 7.702 7.999 8.423 8.811 9.193 9.548 9.87 10.307 10.735 11.133 11.607 12.052 12.487 13.005 13.559 14.05 14.569 15.14 15.74 16.352 17.018 17.713 18.413 19.217 20.053 20.993 22.022 23.15 24.374 25.6 26.26 26.377 26.223 25.905 25.546 25.175 24.76 24.358 23.931 23.58 23.236 22.88 22.535 22.173 21.8 21.33 20.89 20.518 20.169 19.851 19.575 19.247 18.9 18.636 18.338 18.024 17.698 17.345 17.103 16.86 16.464 16.183 15.888 15.744 15.428 15.052 14.655 14.46 13.647 13.833 13.599 13.343 12.771 12.475 12.164 11.824 11.412 10.906 10.307 9.161 -6 ,27796 ,KEBNE ,16689982,Thu Nov 25 07:55:43 CET,Thu Nov 25 07:56:51 CET,0.0 0.944 1.418 1.805 2.172 2.504 2.816 3.104 3.633 3.875 4.108 3.938 4.794 5.007 5.414 5.802 6.166 6.337 6.664 6.986 7.429 7.709 7.989 8.386 8.769 9.157 9.522 9.872 10.318 10.752 11.154 11.593 12.018 12.449 12.959 13.506 13.997 14.549 15.14 15.763 16.42 17.116 17.877 18.605 19.392 20.225 21.205 22.252 23.392 24.671 25.993 26.69 26.744 26.511 26.145 25.763 25.382 24.956 24.579 24.196 23.835 23.503 23.165 22.825 22.494 22.158 21.733 21.35 21.013 20.634 20.263 19.942 19.596 19.238 18.958 18.659 18.343 18.013 17.681 17.459 17.232 16.869 16.6 16.315 16.169 15.85 15.482 15.091 14.902 14.083 14.297 14.083 13.838 13.298 13.018 12.721 12.402 12.07 11.669 11.12 10.096 -7 ,29132 ,KEBNE ,16690708,Thu Nov 25 08:24:11 CET,Thu Nov 25 10:31:49 CET,0.0 0.909 1.462 1.937 2.351 2.706 3.012 3.29 3.818 4.064 4.292 4.103 4.953 5.162 5.537 5.878 6.209 6.358 6.647 6.938 7.353 7.616 7.873 8.247 8.606 8.959 9.299 9.615 10.036 10.457 10.837 11.293 11.767 12.22 12.695 13.227 13.755 14.301 14.856 15.421 15.977 16.574 17.261 17.935 18.709 19.566 20.494 21.443 22.492 23.665 24.854 25.496 25.59 25.485 25.267 24.942 24.591 24.212 23.842 23.46 23.106 22.721 22.34 22.016 21.678 21.284 20.873 20.541 20.215 19.852 19.502 19.238 18.928 18.576 18.293 17.988 17.67 17.339 16.999 16.775 16.53 16.134 15.862 15.58 15.424 15.06 14.684 14.317 14.125 13.301 13.474 13.248 13.004 12.452 12.17 11.877 11.543 11.147 10.687 10.147 9.386 -8 ,8329 ,KEBNE ,16689984,Thu Nov 25 07:55:45 CET,Thu Nov 25 07:56:58 CET,0.0 0.823 1.395 1.83 2.209 2.55 2.86 3.136 3.626 3.851 4.074 3.869 4.709 4.914 5.305 5.663 6.0 6.16 6.478 6.785 7.219 7.49 7.745 8.131 8.501 8.844 9.182 9.511 9.93 10.331 10.724 11.2 11.643 12.074 12.561 13.071 13.556 14.065 14.597 15.196 15.826 16.483 17.223 17.954 18.769 19.613 20.573 21.621 22.73 23.899 25.126 25.716 25.711 25.477 25.157 24.823 24.445 24.054 23.676 23.196 22.708 22.246 21.808 21.397 20.997 20.619 20.233 19.87 19.55 19.205 18.807 18.477 18.131 17.774 17.5 17.202 16.881 16.541 16.185 15.95 15.712 15.343 15.06 14.751 14.6 14.291 13.966 13.597 13.397 12.567 12.768 12.526 12.263 11.73 11.421 11.07 10.692 10.262 9.755 9.107 7.945 -9 ,4598 ,KEBNE ,16689985,Thu Nov 25 07:55:51 CET,Thu Nov 25 07:56:53 CET,0.0 0.821 1.346 1.78 2.142 2.468 2.774 3.063 3.604 3.856 4.088 3.876 4.72 4.923 5.306 5.666 5.989 6.144 6.457 6.751 7.178 7.447 7.715 8.126 8.517 8.913 9.302 9.663 10.107 10.519 10.907 11.382 11.832 12.271 12.793 13.344 13.868 14.434 15.008 15.583 16.188 16.873 17.588 18.271 19.056 19.891 20.825 21.81 22.901 24.139 25.357 25.983 26.016 25.804 25.559 25.203 24.742 24.303 23.931 23.543 23.122 22.657 22.196 21.738 21.297 20.894 20.461 20.067 19.717 19.345 18.952 18.614 18.27 17.918 17.646 17.352 17.039 16.718 16.372 16.127 15.87 15.482 15.22 14.942 14.8 14.496 14.164 13.808 13.626 12.799 13.017 12.796 12.562 12.07 11.817 11.543 11.24 10.895 10.456 9.902 8.92 -10 ,2311 ,KEBNE ,16690711,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:33:00 CET,0.0 1.258 1.858 2.25 2.56 2.881 3.176 3.428 3.894 4.128 4.367 4.155 4.996 5.181 5.557 5.913 6.244 6.413 6.728 7.028 7.477 7.759 8.031 8.42 8.792 9.156 9.506 9.832 10.26 10.676 11.077 11.553 11.977 12.387 12.873 13.382 13.847 14.361 14.914 15.521 16.189 16.906 17.651 18.354 19.166 20.083 21.123 22.215 23.401 24.595 25.747 26.369 26.339 26.078 25.746 25.196 24.581 24.005 23.421 22.795 22.232 21.676 21.15 20.664 20.198 19.754 19.285 18.863 18.493 18.121 17.73 17.388 17.037 16.68 16.404 16.103 15.777 15.454 15.112 14.873 14.634 14.245 13.972 13.701 13.552 13.217 12.859 12.47 12.277 11.441 11.65 11.417 11.167 10.594 10.27 9.929 9.542 9.088 8.544 7.859 6.508 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt deleted file mode 100644 index d7746a06..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12901 ,KEBNE ,16689987,Thu Nov 25 07:57:45 CET,Thu Nov 25 07:58:50 CET,0.0 1.29 1.901 2.327 2.69 3.013 3.317 3.595 4.115 4.364 4.599 4.581 5.26 5.464 5.835 6.191 6.53 6.696 7.029 7.345 7.8 8.093 8.367 8.745 9.117 9.482 9.835 10.165 10.575 10.975 11.353 11.804 12.244 12.671 13.181 13.779 14.324 14.876 15.497 16.136 16.742 17.404 18.167 18.9 19.733 20.685 21.772 22.876 24.078 25.494 26.965 27.839 28.15 28.218 28.153 27.97 27.756 27.504 27.231 26.921 26.639 26.356 26.058 25.755 25.453 25.182 24.905 24.632 24.385 24.135 23.859 23.631 23.401 23.145 22.935 22.713 22.485 22.243 21.971 21.784 21.606 21.329 21.125 20.907 20.788 20.539 20.275 19.982 19.833 19.213 19.319 19.135 18.941 18.538 18.301 18.013 17.689 17.336 16.953 16.418 15.158 -2 ,269 ,KEBNE ,16690713,Thu Nov 25 08:25:13 CET,Thu Nov 25 10:23:04 CET,0.0 1.454 1.99 2.45 2.838 3.188 3.52 3.803 4.298 4.539 4.761 4.7 5.363 5.557 5.933 6.283 6.629 6.794 7.116 7.441 7.889 8.162 8.432 8.835 9.23 9.602 9.96 10.294 10.715 11.128 11.523 11.991 12.445 12.905 13.412 13.923 14.412 14.955 15.545 16.13 16.74 17.444 18.221 18.989 19.909 20.9 21.978 23.174 24.54 26.038 27.676 28.829 29.217 29.168 28.92 28.642 28.359 28.025 27.65 27.279 26.964 26.641 26.316 25.955 25.598 25.222 24.804 24.443 24.114 23.784 23.45 23.184 22.9 22.58 22.331 22.08 21.821 21.525 21.204 20.981 20.748 20.385 20.131 19.859 19.716 19.41 19.08 18.72 18.531 17.874 17.933 17.712 17.453 16.92 16.616 16.273 15.916 15.525 15.028 14.309 12.292 -3 ,19253 ,KEBNE ,16689989,Thu Nov 25 07:57:45 CET,Thu Nov 25 07:58:50 CET,0.0 1.978 2.635 3.151 3.574 3.965 4.297 4.584 5.097 5.328 5.562 5.558 6.233 6.43 6.79 7.145 7.519 7.692 8.0 8.295 8.73 9.007 9.271 9.649 10.011 10.361 10.691 11.009 11.409 11.786 12.153 12.581 12.998 13.402 13.861 14.383 14.873 15.395 15.954 16.555 17.182 17.874 18.672 19.45 20.299 21.207 22.258 23.418 24.712 26.15 27.775 28.896 29.309 29.337 29.246 29.103 28.895 28.674 28.468 28.206 27.93 27.671 27.405 27.139 26.899 26.653 26.363 26.111 25.897 25.659 25.404 25.191 24.922 24.626 24.406 24.177 23.949 23.709 23.462 23.291 23.099 22.797 22.594 22.37 22.241 21.931 21.588 21.241 21.051 20.387 20.41 20.166 19.906 19.361 19.018 18.654 18.277 17.841 17.315 16.632 14.821 -4 ,10006 ,KEBNE ,16689990,Thu Nov 25 07:57:50 CET,Thu Nov 25 07:59:02 CET,0.0 1.408 2.049 2.539 2.95 3.291 3.589 3.892 4.455 4.695 4.912 4.865 5.534 5.721 6.083 6.449 6.809 6.989 7.325 7.627 8.053 8.329 8.602 8.998 9.376 9.751 10.122 10.479 10.934 11.367 11.788 12.267 12.734 13.188 13.67 14.195 14.703 15.26 15.858 16.471 17.11 17.832 18.594 19.334 20.189 21.095 22.14 23.315 24.6 26.028 27.592 28.535 28.894 29.003 28.937 28.754 28.515 28.237 27.921 27.563 27.237 26.925 26.598 26.258 25.946 25.681 25.354 25.031 24.761 24.471 24.149 23.874 23.597 23.314 23.09 22.86 22.622 22.371 22.1 21.911 21.707 21.378 21.158 20.926 20.812 20.574 20.315 20.055 19.92 19.33 19.443 19.25 19.049 18.602 18.365 18.1 17.793 17.435 16.959 16.325 14.561 -5 ,2208 ,KEBNE ,16690716,Thu Nov 25 08:25:13 CET,Thu Nov 25 10:23:44 CET,0.0 1.516 2.14 2.621 3.021 3.364 3.67 3.95 4.437 4.669 4.905 4.867 5.544 5.743 6.131 6.491 6.813 6.979 7.306 7.6 8.018 8.295 8.571 8.961 9.326 9.68 9.998 10.305 10.718 11.108 11.475 11.936 12.381 12.78 13.24 13.772 14.292 14.857 15.463 16.082 16.706 17.413 18.233 19.032 19.927 20.915 22.023 23.216 24.508 25.925 27.549 28.557 28.943 29.095 29.073 28.883 28.615 28.35 28.019 27.64 27.311 26.986 26.634 26.294 25.982 25.671 25.333 25.031 24.764 24.474 24.17 23.896 23.586 23.271 23.042 22.816 22.578 22.304 22.002 21.794 21.569 21.205 20.944 20.666 20.52 20.222 19.924 19.59 19.411 18.787 18.867 18.658 18.441 17.987 17.742 17.466 17.162 16.828 16.401 15.855 14.455 -6 ,5520 ,KEBNE ,16689992,Thu Nov 25 07:57:46 CET,Thu Nov 25 07:59:03 CET,0.0 1.926 2.616 3.069 3.472 3.822 4.121 4.429 4.997 5.245 5.495 5.494 6.193 6.402 6.777 7.107 7.434 7.608 7.949 8.248 8.658 8.923 9.182 9.557 9.911 10.259 10.59 10.913 11.335 11.729 12.086 12.497 12.909 13.32 13.789 14.285 14.765 15.307 15.885 16.493 17.101 17.795 18.612 19.38 20.238 21.151 22.164 23.283 24.551 25.967 27.49 28.545 28.961 28.989 28.88 28.681 28.408 28.093 27.769 27.409 27.081 26.741 26.398 26.089 25.788 25.493 25.187 24.922 24.673 24.411 24.122 23.876 23.631 23.361 23.155 22.949 22.718 22.468 22.205 22.012 21.803 21.483 21.269 21.044 20.922 20.657 20.379 20.088 19.935 19.314 19.378 19.169 18.95 18.479 18.216 17.926 17.601 17.23 16.831 16.301 14.73 -7 ,673 ,KEBNE ,16689993,Thu Nov 25 07:57:46 CET,Thu Nov 25 07:59:04 CET,0.0 1.323 1.922 2.4 2.798 3.145 3.438 3.723 4.246 4.473 4.71 4.704 5.401 5.612 6.007 6.374 6.732 6.899 7.226 7.556 8.034 8.325 8.589 8.981 9.355 9.719 10.088 10.431 10.854 11.257 11.639 12.105 12.555 12.977 13.455 13.991 14.497 15.048 15.62 16.199 16.802 17.469 18.207 18.946 19.786 20.679 21.645 22.689 23.906 25.242 26.661 27.526 27.909 28.098 28.095 27.941 27.727 27.499 27.268 26.981 26.669 26.365 26.087 25.773 25.43 25.125 24.784 24.458 24.198 23.946 23.668 23.422 23.162 22.906 22.692 22.444 22.19 21.929 21.671 21.487 21.274 20.949 20.723 20.481 20.355 20.085 19.787 19.447 19.27 18.636 18.72 18.504 18.265 17.729 17.422 17.097 16.763 16.391 15.894 15.242 13.771 -8 ,29895 ,KEBNE ,16690719,Thu Nov 25 08:25:13 CET,Thu Nov 25 10:22:34 CET,0.0 1.328 1.922 2.367 2.8 3.208 3.572 3.905 4.512 4.78 5.031 5.02 5.732 5.959 6.369 6.76 7.141 7.322 7.659 7.979 8.427 8.7 8.967 9.363 9.743 10.091 10.416 10.745 11.168 11.563 11.931 12.369 12.812 13.226 13.683 14.191 14.677 15.223 15.81 16.421 17.021 17.67 18.455 19.266 20.191 21.159 22.24 23.437 24.717 26.09 27.552 28.469 28.813 28.896 28.844 28.669 28.434 28.13 27.793 27.402 27.036 26.691 26.329 25.968 25.617 25.295 24.953 24.637 24.358 24.054 23.707 23.421 23.134 22.815 22.568 22.313 22.042 21.76 21.456 21.243 21.009 20.636 20.357 20.06 19.914 19.617 19.302 18.969 18.792 18.135 18.169 17.948 17.705 17.159 16.847 16.528 16.208 15.828 15.382 14.804 13.398 -9 ,20106 ,KEBNE ,16689995,Thu Nov 25 07:57:45 CET,Thu Nov 25 07:59:09 CET,0.0 1.47 2.118 2.591 2.99 3.367 3.719 4.034 4.618 4.896 5.156 5.153 5.854 6.057 6.446 6.823 7.174 7.34 7.669 7.985 8.458 8.753 9.02 9.403 9.766 10.121 10.468 10.803 11.22 11.613 12.007 12.5 12.983 13.431 13.949 14.509 15.055 15.658 16.281 16.919 17.563 18.297 19.136 19.957 20.869 21.859 22.926 24.094 25.458 26.93 28.552 29.691 30.182 30.268 30.146 29.991 29.801 29.532 29.241 28.9 28.582 28.285 27.972 27.651 27.321 27.006 26.668 26.368 26.11 25.808 25.456 25.142 24.813 24.506 24.26 23.992 23.719 23.447 23.158 22.942 22.705 22.294 21.998 21.701 21.556 21.242 20.89 20.501 20.29 19.626 19.6 19.358 19.12 18.582 18.28 17.946 17.531 17.053 16.542 15.883 14.462 -10 ,32283 ,KEBNE ,16690721,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:23:33 CET,0.0 1.264 1.941 2.432 2.798 3.127 3.449 3.757 4.283 4.516 4.748 4.748 5.424 5.621 5.995 6.335 6.661 6.829 7.162 7.491 7.945 8.217 8.476 8.858 9.234 9.579 9.91 10.235 10.662 11.084 11.472 11.938 12.401 12.861 13.37 13.899 14.42 14.996 15.589 16.216 16.875 17.576 18.361 19.148 20.043 20.995 22.044 23.179 24.446 25.872 27.429 28.499 28.911 29.048 29.084 29.009 28.8 28.566 28.32 28.035 27.764 27.442 27.12 26.833 26.547 26.275 25.971 25.655 25.346 25.001 24.636 24.325 24.02 23.718 23.46 23.193 22.932 22.661 22.381 22.18 21.964 21.63 21.399 21.16 21.039 20.79 20.52 20.22 20.057 19.438 19.543 19.346 19.152 18.731 18.455 18.123 17.738 17.293 16.796 16.192 14.995 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt deleted file mode 100644 index 0fd0028b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12722 ,KEBNE ,16690722,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:23:35 CET,0.0 0.912 1.396 1.761 2.059 2.329 2.598 2.843 3.285 3.491 3.684 3.601 4.285 4.474 4.809 5.116 5.408 5.551 5.845 6.119 6.49 6.728 6.961 7.284 7.595 7.904 8.189 8.472 8.824 9.155 9.48 9.854 10.201 10.511 10.893 11.327 11.723 12.129 12.522 12.956 13.36 13.79 14.313 14.778 15.259 15.78 16.345 16.905 17.458 17.987 18.331 18.166 17.765 17.277 16.761 16.255 15.721 15.153 14.635 14.082 13.584 13.136 12.684 12.277 11.879 11.439 10.979 10.59 10.233 9.836 9.406 9.043 8.668 8.295 8.005 7.71 7.401 7.084 6.762 6.527 6.272 5.856 5.562 5.265 5.119 4.806 4.469 4.091 3.885 3.192 3.256 3.044 2.821 2.299 1.997 1.685 1.363 1.012 0.588 0.015 -1.471 -2 ,30995 ,KEBNE ,16690723,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:23:52 CET,0.0 0.847 1.258 1.563 1.869 2.149 2.394 2.634 3.055 3.234 3.416 3.313 3.968 4.134 4.454 4.761 5.055 5.196 5.463 5.728 6.123 6.371 6.616 6.96 7.278 7.572 7.85 8.113 8.453 8.779 9.085 9.453 9.775 10.086 10.482 10.925 11.339 11.753 12.174 12.619 13.058 13.554 14.092 14.565 15.126 15.774 16.439 17.048 17.588 18.081 18.434 18.33 17.965 17.51 16.989 16.395 15.871 15.398 14.938 14.467 14.052 13.647 13.243 12.837 12.372 11.898 11.43 11.056 10.715 10.288 9.853 9.515 9.162 8.775 8.447 8.108 7.768 7.408 7.039 6.803 6.549 6.123 5.825 5.512 5.354 5.027 4.674 4.286 4.083 3.393 3.495 3.296 3.08 2.605 2.335 2.048 1.73 1.367 0.942 0.384 -0.861 -3 ,24777 ,KEBNE ,16690724,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:23:37 CET,0.0 0.751 1.188 1.557 1.891 2.203 2.48 2.725 3.151 3.362 3.582 3.496 4.159 4.326 4.661 4.976 5.263 5.398 5.667 5.926 6.294 6.521 6.748 7.091 7.412 7.708 7.982 8.255 8.591 8.899 9.216 9.585 9.924 10.268 10.654 11.062 11.453 11.876 12.299 12.688 13.076 13.519 14.036 14.509 15.007 15.546 16.137 16.702 17.267 17.838 18.206 17.929 17.359 16.87 16.391 15.865 15.383 14.907 14.472 14.005 13.521 13.054 12.613 12.185 11.796 11.406 10.978 10.616 10.269 9.918 9.576 9.257 8.884 8.496 8.22 7.919 7.598 7.253 6.882 6.636 6.374 5.972 5.686 5.374 5.213 4.888 4.555 4.184 3.982 3.296 3.364 3.12 2.87 2.352 2.051 1.734 1.416 1.057 0.624 0.067 -1.101 -4 ,11862 ,KEBNE ,16690725,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:23:28 CET,0.0 0.733 1.143 1.527 1.885 2.196 2.454 2.686 3.131 3.349 3.548 3.442 4.115 4.295 4.617 4.927 5.241 5.391 5.677 5.939 6.311 6.555 6.792 7.133 7.457 7.766 8.061 8.342 8.675 9.003 9.328 9.706 10.078 10.428 10.795 11.184 11.534 11.898 12.311 12.719 13.116 13.61 14.143 14.628 15.199 15.781 16.454 17.116 17.713 18.232 18.556 18.358 17.877 17.368 16.868 16.366 15.883 15.409 14.949 14.458 14.031 13.655 13.29 12.903 12.54 12.2 11.781 11.355 11.013 10.678 10.309 9.979 9.634 9.286 8.996 8.7 8.398 8.055 7.683 7.435 7.185 6.761 6.467 6.163 6.008 5.703 5.359 4.988 4.8 4.118 4.152 3.912 3.656 3.1 2.814 2.479 2.124 1.748 1.265 0.715 -0.459 -5 ,12489 ,KEBNE ,16690726,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:23:42 CET,0.0 1.036 1.479 1.818 2.109 2.371 2.61 2.863 3.367 3.599 3.803 3.679 4.354 4.544 4.874 5.191 5.492 5.631 5.915 6.186 6.557 6.796 7.033 7.371 7.675 7.955 8.236 8.52 8.867 9.207 9.558 9.956 10.298 10.625 11.025 11.446 11.805 12.167 12.54 12.93 13.332 13.762 14.262 14.725 15.203 15.735 16.332 16.907 17.492 18.025 18.342 18.235 17.878 17.392 16.859 16.342 15.856 15.318 14.824 14.298 13.834 13.397 12.939 12.505 12.125 11.83 11.431 11.036 10.715 10.34 9.917 9.569 9.232 8.872 8.571 8.262 7.938 7.585 7.214 6.956 6.687 6.245 5.941 5.628 5.473 5.149 4.794 4.43 4.238 3.568 3.634 3.406 3.157 2.59 2.304 2.0 1.668 1.317 0.883 0.323 -1.27 -6 ,28964 ,KEBNE ,16690002,Thu Nov 25 07:57:45 CET,Thu Nov 25 07:58:54 CET,0.0 0.852 1.328 1.757 2.089 2.355 2.599 2.85 3.327 3.539 3.736 3.611 4.267 4.446 4.785 5.093 5.381 5.521 5.795 6.053 6.429 6.671 6.899 7.229 7.536 7.823 8.098 8.367 8.698 9.028 9.334 9.711 10.111 10.473 10.88 11.311 11.685 12.071 12.551 13.026 13.412 13.841 14.298 14.77 15.31 15.843 16.425 17.011 17.602 18.2 18.609 18.477 18.131 17.674 17.15 16.593 16.025 15.454 14.95 14.478 14.056 13.613 13.185 12.797 12.437 12.104 11.707 11.338 11.02 10.667 10.298 9.979 9.644 9.297 9.01 8.7 8.366 8.024 7.669 7.413 7.151 6.765 6.488 6.19 6.046 5.741 5.384 5.009 4.822 4.148 4.243 4.024 3.805 3.332 3.062 2.738 2.378 2.011 1.593 1.059 -0.392 -7 ,3640 ,KEBNE ,16690728,Thu Nov 25 08:25:13 CET,Thu Nov 25 10:24:29 CET,0.0 0.926 1.375 1.718 2.053 2.361 2.628 2.881 3.367 3.59 3.783 3.655 4.328 4.505 4.843 5.172 5.49 5.637 5.924 6.205 6.589 6.837 7.082 7.411 7.723 8.045 8.349 8.619 8.966 9.301 9.618 9.98 10.299 10.616 10.995 11.449 11.859 12.251 12.642 13.02 13.425 13.884 14.388 14.856 15.386 15.922 16.504 17.105 17.707 18.264 18.564 18.391 17.952 17.459 16.968 16.466 15.952 15.471 15.084 14.652 14.206 13.783 13.407 13.023 12.612 12.195 11.751 11.357 11.007 10.666 10.291 9.934 9.566 9.172 8.851 8.533 8.206 7.861 7.481 7.215 6.947 6.522 6.247 5.967 5.81 5.48 5.134 4.782 4.601 3.924 3.991 3.775 3.548 3.043 2.762 2.468 2.128 1.726 1.226 0.566 -0.865 -8 ,16718 ,KEBNE ,16690004,Thu Nov 25 07:57:46 CET,Thu Nov 25 07:58:46 CET,0.0 1.037 1.516 1.93 2.289 2.577 2.843 3.102 3.581 3.803 3.995 3.869 4.537 4.707 5.036 5.361 5.658 5.802 6.088 6.36 6.733 6.963 7.192 7.532 7.853 8.17 8.484 8.769 9.107 9.43 9.765 10.187 10.579 10.928 11.313 11.745 12.165 12.61 13.032 13.457 13.864 14.268 14.728 15.197 15.755 16.329 16.879 17.441 18.067 18.598 18.933 18.827 18.346 17.774 17.201 16.584 16.047 15.596 15.149 14.676 14.295 13.9 13.448 12.985 12.535 12.149 11.769 11.389 11.042 10.66 10.242 9.909 9.575 9.232 8.954 8.657 8.33 7.967 7.587 7.327 7.069 6.658 6.378 6.083 5.925 5.585 5.204 4.821 4.629 3.953 4.05 3.831 3.578 3.019 2.726 2.422 2.066 1.618 1.083 0.494 -0.613 -9 ,21276 ,KEBNE ,16690730,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:22:25 CET,0.0 0.899 1.358 1.713 2.045 2.348 2.617 2.868 3.311 3.516 3.713 3.57 4.223 4.394 4.73 5.051 5.341 5.477 5.743 6.007 6.374 6.593 6.817 7.158 7.462 7.743 8.015 8.283 8.623 8.946 9.254 9.615 9.955 10.285 10.659 11.055 11.441 11.865 12.321 12.795 13.229 13.659 14.124 14.591 15.117 15.672 16.283 16.912 17.507 18.034 18.288 17.967 17.499 16.944 16.359 15.824 15.299 14.801 14.349 13.871 13.465 13.027 12.546 12.11 11.715 11.348 10.896 10.489 10.163 9.817 9.437 9.087 8.743 8.398 8.115 7.822 7.503 7.177 6.836 6.583 6.316 5.91 5.618 5.296 5.129 4.79 4.429 4.026 3.829 3.147 3.168 2.918 2.662 2.11 1.82 1.514 1.177 0.778 0.318 -0.288 -1.469 -10 ,27432 ,KEBNE ,16690731,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:23:50 CET,0.0 0.918 1.437 1.826 2.168 2.468 2.745 2.993 3.419 3.623 3.817 3.686 4.347 4.515 4.824 5.129 5.424 5.561 5.835 6.103 6.481 6.724 6.96 7.301 7.623 7.933 8.225 8.499 8.874 9.227 9.542 9.936 10.3 10.642 11.023 11.398 11.761 12.179 12.619 13.035 13.46 13.942 14.433 14.887 15.416 15.985 16.571 17.102 17.63 18.141 18.491 18.365 17.921 17.388 16.842 16.313 15.776 15.248 14.776 14.281 13.821 13.42 12.996 12.544 12.147 11.789 11.399 11.03 10.703 10.353 9.939 9.589 9.256 8.912 8.621 8.314 8.0 7.672 7.322 7.063 6.796 6.395 6.102 5.775 5.605 5.275 4.955 4.597 4.404 3.721 3.765 3.523 3.259 2.717 2.442 2.139 1.8 1.438 1.014 0.512 -0.771 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt deleted file mode 100644 index 7e9717c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3641 ,KEBNE ,16690007,Thu Nov 25 07:57:47 CET,Thu Nov 25 07:59:08 CET,0.0 1.661 2.327 2.815 3.222 3.608 3.951 4.262 4.813 5.057 5.286 5.21 5.91 6.105 6.468 6.808 7.127 7.274 7.563 7.839 8.24 8.505 8.753 9.096 9.41 9.702 9.98 10.254 10.603 10.935 11.264 11.635 11.968 12.296 12.66 13.051 13.441 13.881 14.331 14.78 15.193 15.581 15.99 16.327 16.67 16.99 17.245 17.467 17.668 17.632 16.973 15.702 14.366 13.092 11.826 10.642 9.675 8.815 8.054 7.257 6.517 5.838 5.175 4.519 3.908 3.309 2.704 2.222 1.805 1.364 0.914 0.536 0.148 -0.279 -0.653 -1.044 -1.441 -1.848 -2.273 -2.563 -2.854 -3.327 -3.667 -4.013 -4.188 -4.562 -4.98 -5.417 -5.647 -6.4 -6.397 -6.693 -7.0 -7.625 -7.951 -8.3 -8.693 -9.121 -9.635 -10.355 -12.104 -2 ,19295 ,KEBNE ,16690733,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:24:29 CET,0.0 2.011 2.653 3.146 3.552 3.947 4.311 4.65 5.254 5.506 5.745 5.736 6.448 6.668 7.079 7.439 7.773 7.94 8.261 8.563 9.003 9.286 9.553 9.924 10.267 10.595 10.909 11.225 11.649 12.037 12.388 12.781 13.136 13.476 13.842 14.237 14.612 14.979 15.395 15.828 16.218 16.612 16.994 17.301 17.636 18.024 18.383 18.651 18.815 18.71 17.976 16.662 15.37 14.137 13.099 12.14 11.224 10.386 9.68 8.941 8.305 7.735 7.142 6.572 6.04 5.531 4.968 4.456 4.02 3.584 3.131 2.75 2.347 1.919 1.587 1.254 0.919 0.565 0.192 -0.062 -0.323 -0.74 -1.024 -1.323 -1.49 -1.841 -2.199 -2.566 -2.753 -3.453 -3.332 -3.547 -3.775 -4.272 -4.569 -4.9 -5.284 -5.701 -6.179 -6.809 -8.268 -3 ,29484 ,KEBNE ,16690009,Thu Nov 25 07:57:45 CET,Thu Nov 25 07:59:05 CET,0.0 1.541 2.153 2.662 3.064 3.424 3.775 4.095 4.672 4.914 5.147 5.122 5.832 6.055 6.472 6.805 7.091 7.239 7.545 7.865 8.329 8.61 8.868 9.23 9.556 9.848 10.142 10.433 10.797 11.137 11.46 11.84 12.189 12.549 12.949 13.309 13.651 14.03 14.422 14.792 15.135 15.504 15.913 16.277 16.68 17.087 17.42 17.68 17.859 17.799 17.166 15.891 14.652 13.563 12.539 11.558 10.662 9.846 9.145 8.418 7.771 7.193 6.647 6.117 5.592 5.097 4.562 4.062 3.584 3.099 2.631 2.243 1.825 1.353 0.986 0.621 0.235 -0.186 -0.645 -0.973 -1.303 -1.8 -2.156 -2.537 -2.728 -3.117 -3.518 -3.963 -4.197 -4.925 -4.892 -5.142 -5.39 -5.915 -6.213 -6.567 -6.98 -7.436 -7.964 -8.701 -11.169 -4 ,26915 ,KEBNE ,16690010,Thu Nov 25 07:57:46 CET,Thu Nov 25 07:58:57 CET,0.0 1.85 2.541 3.069 3.479 3.81 4.112 4.388 4.87 5.111 5.332 5.234 5.908 6.095 6.465 6.822 7.155 7.31 7.602 7.888 8.279 8.522 8.759 9.094 9.424 9.738 10.025 10.301 10.649 10.999 11.346 11.726 12.075 12.398 12.73 13.095 13.462 13.834 14.184 14.527 14.896 15.336 15.809 16.197 16.552 16.871 17.151 17.345 17.449 17.327 16.572 15.37 14.169 12.993 11.945 10.949 10.045 9.238 8.527 7.741 7.064 6.466 5.876 5.316 4.813 4.345 3.798 3.312 2.892 2.442 1.98 1.592 1.19 0.766 0.414 0.05 -0.324 -0.703 -1.083 -1.343 -1.609 -2.037 -2.344 -2.666 -2.832 -3.166 -3.504 -3.862 -4.048 -4.743 -4.656 -4.871 -5.1 -5.604 -5.876 -6.158 -6.46 -6.776 -7.16 -7.646 -8.574 -5 ,30879 ,KEBNE ,16690736,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:23:41 CET,0.0 1.869 2.568 3.072 3.515 3.904 4.259 4.598 5.194 5.456 5.693 5.648 6.345 6.538 6.911 7.234 7.535 7.68 7.954 8.213 8.568 8.796 9.014 9.323 9.622 9.907 10.169 10.402 10.703 11.009 11.305 11.644 11.958 12.259 12.588 12.912 13.187 13.468 13.813 14.251 14.646 15.021 15.444 15.77 16.085 16.393 16.643 16.835 16.95 16.812 15.942 14.364 12.936 11.663 10.469 9.3 8.274 7.359 6.605 5.857 5.178 4.562 3.959 3.389 2.807 2.23 1.62 1.089 0.637 0.13 -0.432 -0.891 -1.349 -1.824 -2.196 -2.621 -3.062 -3.496 -3.979 -4.314 -4.652 -5.177 -5.536 -5.91 -6.103 -6.497 -6.927 -7.386 -7.628 -8.38 -8.429 -8.724 -9.041 -9.73 -10.085 -10.454 -10.874 -11.364 -11.936 -12.7 -15.007 -6 ,5087 ,KEBNE ,16690737,Thu Nov 25 08:25:13 CET,Thu Nov 25 10:25:03 CET,0.0 1.659 2.318 2.841 3.273 3.631 3.946 4.245 4.794 5.05 5.3 5.259 5.974 6.211 6.652 7.032 7.364 7.526 7.837 8.1 8.463 8.697 8.911 9.226 9.549 9.839 10.107 10.372 10.72 11.059 11.386 11.791 12.168 12.49 12.826 13.168 13.516 13.891 14.229 14.595 14.998 15.41 15.805 16.168 16.514 16.805 17.096 17.377 17.508 17.322 16.63 15.373 14.101 12.896 11.78 10.716 9.807 8.989 8.223 7.45 6.801 6.198 5.62 5.044 4.432 3.878 3.313 2.793 2.305 1.756 1.213 0.766 0.292 -0.189 -0.558 -0.939 -1.342 -1.782 -2.23 -2.536 -2.855 -3.357 -3.72 -4.085 -4.271 -4.676 -5.101 -5.557 -5.803 -6.547 -6.558 -6.83 -7.124 -7.756 -8.105 -8.505 -8.923 -9.403 -9.909 -10.522 -11.926 -7 ,3829 ,KEBNE ,16690738,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:23:45 CET,0.0 1.709 2.357 2.843 3.246 3.6 3.925 4.239 4.823 5.085 5.317 5.284 5.966 6.168 6.538 6.879 7.22 7.388 7.716 8.025 8.441 8.71 8.96 9.293 9.598 9.879 10.17 10.438 10.75 11.072 11.387 11.773 12.147 12.473 12.801 13.159 13.497 13.859 14.242 14.619 14.986 15.394 15.814 16.187 16.596 16.953 17.28 17.484 17.568 17.492 16.83 15.528 14.253 13.11 12.023 10.973 10.033 9.114 8.287 7.474 6.754 6.066 5.397 4.757 4.142 3.577 3.007 2.478 1.975 1.451 0.912 0.467 0.013 -0.483 -0.866 -1.25 -1.659 -2.083 -2.533 -2.846 -3.163 -3.647 -3.997 -4.37 -4.567 -4.984 -5.422 -5.882 -6.124 -6.878 -6.879 -7.155 -7.448 -8.082 -8.447 -8.844 -9.266 -9.731 -10.274 -10.916 -12.379 -8 ,23235 ,KEBNE ,16690739,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:24:54 CET,0.0 1.849 2.449 2.936 3.309 3.593 3.854 4.126 4.611 4.813 5.009 4.926 5.606 5.784 6.119 6.445 6.744 6.89 7.179 7.464 7.903 8.175 8.432 8.794 9.125 9.45 9.739 10.018 10.398 10.741 11.077 11.474 11.805 12.125 12.542 12.983 13.346 13.725 14.102 14.46 14.778 15.122 15.563 16.031 16.478 16.791 17.08 17.328 17.474 17.422 16.775 15.463 14.285 13.193 12.148 11.233 10.407 9.621 8.894 8.131 7.467 6.84 6.172 5.519 4.962 4.457 3.912 3.424 2.986 2.529 2.041 1.61 1.164 0.692 0.287 -0.14 -0.576 -1.031 -1.515 -1.846 -2.184 -2.707 -3.062 -3.432 -3.634 -4.06 -4.491 -4.943 -5.172 -5.927 -6.001 -6.322 -6.649 -7.346 -7.73 -8.139 -8.613 -9.146 -9.749 -10.536 -12.676 -9 ,13147 ,KEBNE ,16690015,Thu Nov 25 07:57:47 CET,Thu Nov 25 07:59:08 CET,0.0 1.606 2.241 2.794 3.297 3.699 4.05 4.375 4.956 5.226 5.486 5.507 6.207 6.417 6.814 7.185 7.535 7.701 8.018 8.319 8.748 9.023 9.275 9.631 9.989 10.315 10.627 10.955 11.37 11.734 12.088 12.544 12.959 13.308 13.699 14.112 14.471 14.843 15.252 15.69 16.05 16.442 16.911 17.31 17.755 18.158 18.505 18.771 18.891 18.783 18.053 16.802 15.593 14.478 13.482 12.543 11.68 10.889 10.169 9.409 8.764 8.184 7.622 7.052 6.494 5.983 5.426 4.909 4.46 3.99 3.492 3.08 2.638 2.194 1.855 1.492 1.127 0.731 0.302 -0.002 -0.335 -0.873 -1.245 -1.625 -1.814 -2.21 -2.628 -3.065 -3.3 -4.045 -4.018 -4.288 -4.576 -5.194 -5.547 -5.935 -6.344 -6.799 -7.294 -7.883 -8.99 -10 ,15955 ,KEBNE ,16690016,Thu Nov 25 07:57:45 CET,Thu Nov 25 07:59:06 CET,0.0 2.666 3.424 3.984 4.441 4.851 5.235 5.608 6.262 6.539 6.784 6.722 7.405 7.606 7.988 8.343 8.676 8.822 9.102 9.382 9.771 10.014 10.243 10.583 10.898 11.199 11.512 11.824 12.212 12.569 12.905 13.285 13.625 13.94 14.295 14.692 15.082 15.466 15.851 16.255 16.673 17.121 17.552 17.9 18.222 18.565 18.924 19.204 19.343 19.253 18.712 17.54 16.277 15.12 14.045 13.002 12.076 11.173 10.363 9.6 8.926 8.263 7.574 6.924 6.344 5.802 5.228 4.758 4.365 3.935 3.465 3.072 2.684 2.274 1.944 1.594 1.231 0.849 0.441 0.165 -0.119 -0.57 -0.886 -1.217 -1.384 -1.73 -2.1 -2.497 -2.715 -3.444 -3.401 -3.634 -3.873 -4.385 -4.663 -4.969 -5.313 -5.693 -6.125 -6.695 -7.691 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt deleted file mode 100644 index c71184c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8340 ,KEBNE ,16690017,Thu Nov 25 07:57:46 CET,Thu Nov 25 07:59:01 CET,0.0 0.771 1.192 1.585 1.936 2.276 2.615 2.905 3.415 3.646 3.859 3.762 4.452 4.637 4.987 5.321 5.649 5.805 6.106 6.416 6.856 7.118 7.375 7.725 8.071 8.435 8.805 9.154 9.532 9.895 10.26 10.689 11.087 11.474 11.949 12.454 12.937 13.493 14.094 14.741 15.435 16.103 16.736 17.356 18.085 18.883 19.78 20.766 21.862 23.105 24.378 25.103 25.2 25.033 24.688 24.237 23.727 23.167 22.671 22.172 21.646 21.11 20.571 20.085 19.617 19.151 18.619 18.14 17.73 17.254 16.721 16.257 15.784 15.31 14.918 14.502 14.061 13.569 13.041 12.665 12.291 11.69 11.26 10.834 10.615 10.143 9.607 9.048 8.765 7.948 7.702 7.303 6.882 6.035 5.551 5.002 4.419 3.742 2.888 1.671 -2.602 -2 ,18180 ,KEBNE ,16690743,Thu Nov 25 08:25:13 CET,Thu Nov 25 10:21:11 CET,0.0 0.787 1.23 1.604 1.958 2.281 2.551 2.792 3.25 3.465 3.667 3.567 4.241 4.427 4.764 5.077 5.37 5.516 5.81 6.085 6.478 6.738 7.0 7.371 7.73 8.072 8.388 8.702 9.107 9.488 9.861 10.308 10.736 11.138 11.577 12.065 12.544 13.057 13.555 14.061 14.588 15.177 15.866 16.498 17.195 18.012 18.954 19.948 21.05 22.271 23.491 24.041 23.989 23.726 23.388 22.991 22.564 22.096 21.63 21.116 20.607 20.135 19.656 19.193 18.725 18.227 17.733 17.27 16.819 16.339 15.809 15.327 14.751 14.132 13.683 13.239 12.787 12.311 11.8 11.431 11.048 10.465 10.048 9.619 9.397 8.89 8.343 7.751 7.443 6.657 6.47 6.081 5.618 4.671 4.188 3.664 3.079 2.379 1.493 0.14 -4.857 -3 ,1010 ,KEBNE ,16690744,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:20:24 CET,0.0 0.858 1.386 1.81 2.177 2.48 2.723 2.976 3.487 3.728 3.945 3.847 4.516 4.694 5.053 5.389 5.7 5.858 6.174 6.468 6.876 7.139 7.404 7.795 8.161 8.512 8.855 9.184 9.616 10.011 10.383 10.828 11.253 11.674 12.141 12.649 13.116 13.636 14.236 14.81 15.342 15.919 16.564 17.227 17.989 18.798 19.723 20.693 21.738 22.891 24.046 24.68 24.742 24.608 24.335 23.93 23.478 22.993 22.448 21.793 21.203 20.638 20.064 19.531 19.03 18.568 18.045 17.548 17.115 16.663 16.191 15.768 15.304 14.792 14.387 13.955 13.501 13.047 12.562 12.2 11.784 11.118 10.667 10.203 9.969 9.479 8.94 8.344 8.015 7.193 6.98 6.582 6.155 5.223 4.694 4.131 3.56 2.881 1.979 0.715 -4.044 -4 ,3931 ,KEBNE ,16690020,Thu Nov 25 07:57:47 CET,Thu Nov 25 07:59:11 CET,0.0 0.974 1.413 1.774 2.124 2.443 2.738 3.001 3.462 3.673 3.881 3.775 4.454 4.643 5.003 5.34 5.651 5.805 6.116 6.411 6.822 7.079 7.337 7.72 8.073 8.414 8.76 9.093 9.515 9.908 10.289 10.733 11.122 11.536 12.063 12.631 13.098 13.548 14.108 14.705 15.248 15.827 16.477 17.156 17.955 18.798 19.713 20.712 21.804 23.001 24.248 24.789 24.696 24.352 23.966 23.524 23.103 22.712 22.205 21.662 21.215 20.745 20.274 19.822 19.332 18.863 18.374 17.903 17.473 16.978 16.438 16.005 15.56 15.109 14.751 14.34 13.903 13.467 13.035 12.728 12.387 11.81 11.405 11.002 10.79 10.334 9.833 9.26 8.956 8.167 8.004 7.666 7.295 6.418 5.903 5.323 4.683 3.915 2.993 1.756 -2.279 -5 ,10978 ,KEBNE ,16690746,Thu Nov 25 08:25:13 CET,Thu Nov 25 10:20:55 CET,0.0 1.079 1.585 1.973 2.313 2.614 2.9 3.165 3.606 3.821 4.042 3.961 4.648 4.835 5.192 5.525 5.85 6.011 6.325 6.614 7.045 7.337 7.604 7.974 8.337 8.677 9.003 9.332 9.752 10.126 10.485 10.917 11.314 11.69 12.125 12.637 13.12 13.647 14.23 14.775 15.302 15.913 16.598 17.243 17.991 18.817 19.708 20.668 21.771 22.999 24.212 24.77 24.778 24.576 24.22 23.711 23.188 22.625 22.059 21.391 20.785 20.267 19.775 19.292 18.803 18.335 17.795 17.274 16.841 16.399 15.892 15.438 14.963 14.463 14.065 13.648 13.222 12.758 12.238 11.888 11.527 10.928 10.52 10.073 9.831 9.338 8.808 8.206 7.882 7.072 6.842 6.465 6.064 5.183 4.681 4.07 3.406 2.675 1.783 0.63 -6.228 -6 ,32359 ,KEBNE ,16690747,Thu Nov 25 08:25:13 CET,Thu Nov 25 10:21:02 CET,0.0 0.783 1.261 1.669 2.006 2.3 2.567 2.812 3.291 3.524 3.745 3.659 4.346 4.531 4.889 5.211 5.518 5.665 5.95 6.242 6.651 6.9 7.146 7.507 7.87 8.217 8.533 8.839 9.252 9.666 10.058 10.518 10.967 11.385 11.852 12.374 12.904 13.477 14.032 14.581 15.147 15.799 16.614 17.39 18.154 18.955 19.848 20.84 21.976 23.148 24.295 24.964 25.053 24.865 24.491 24.009 23.578 23.092 22.521 21.861 21.266 20.689 20.113 19.599 19.135 18.653 18.135 17.667 17.191 16.68 16.147 15.673 15.19 14.7 14.283 13.845 13.409 12.954 12.468 12.094 11.694 11.078 10.629 10.163 9.92 9.417 8.895 8.322 8.025 7.236 7.04 6.639 6.221 5.328 4.822 4.276 3.65 2.97 2.162 1.086 -4.113 -7 ,17736 ,KEBNE ,16690748,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:22:06 CET,0.0 0.786 1.236 1.582 1.899 2.214 2.499 2.742 3.227 3.46 3.664 3.549 4.232 4.423 4.778 5.105 5.409 5.553 5.852 6.133 6.546 6.817 7.068 7.42 7.762 8.103 8.444 8.759 9.143 9.518 9.88 10.341 10.788 11.197 11.67 12.178 12.651 13.145 13.61 14.152 14.761 15.394 16.077 16.751 17.554 18.408 19.304 20.252 21.345 22.583 23.816 24.409 24.408 24.172 23.819 23.413 22.971 22.445 21.94 21.42 20.899 20.437 20.025 19.565 19.067 18.594 18.084 17.612 17.178 16.711 16.21 15.777 15.306 14.827 14.445 14.023 13.603 13.152 12.658 12.311 11.953 11.399 10.971 10.512 10.283 9.782 9.252 8.703 8.404 7.613 7.449 7.085 6.67 5.739 5.232 4.703 4.105 3.394 2.536 1.421 -1.662 -8 ,7197 ,KEBNE ,16690024,Thu Nov 25 07:57:50 CET,Thu Nov 25 07:59:08 CET,0.0 0.86 1.275 1.648 1.991 2.289 2.547 2.782 3.236 3.456 3.669 3.566 4.245 4.429 4.772 5.095 5.42 5.574 5.867 6.152 6.559 6.821 7.076 7.433 7.772 8.101 8.43 8.755 9.176 9.567 9.95 10.409 10.838 11.272 11.77 12.298 12.788 13.324 13.905 14.525 15.147 15.785 16.534 17.27 18.097 18.954 19.843 20.841 21.892 23.027 24.234 24.858 24.945 24.722 24.319 23.873 23.375 22.834 22.315 21.721 21.156 20.663 20.118 19.53 19.017 18.525 17.974 17.443 16.971 16.462 15.905 15.471 15.02 14.526 14.15 13.763 13.333 12.856 12.352 11.989 11.606 10.972 10.496 10.026 9.795 9.303 8.779 8.215 7.903 7.085 6.9 6.537 6.112 5.198 4.711 4.158 3.599 2.977 2.197 1.069 -4.318 -9 ,8050 ,KEBNE ,16690750,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:22:36 CET,0.0 1.174 1.736 2.131 2.447 2.735 3.022 3.295 3.742 3.948 4.149 4.038 4.723 4.9 5.248 5.59 5.911 6.073 6.394 6.696 7.129 7.393 7.659 8.033 8.36 8.682 9.006 9.314 9.714 10.098 10.488 10.965 11.368 11.766 12.252 12.791 13.292 13.815 14.397 15.008 15.575 16.204 16.939 17.586 18.291 19.105 20.055 21.069 22.206 23.422 24.616 25.299 25.409 25.258 24.947 24.539 24.072 23.583 23.075 22.533 21.985 21.466 20.985 20.489 20.015 19.549 19.014 18.501 18.034 17.522 17.013 16.632 16.215 15.69 15.273 14.868 14.433 13.983 13.529 13.212 12.866 12.272 11.835 11.393 11.176 10.708 10.171 9.578 9.282 8.509 8.327 7.981 7.608 6.736 6.258 5.706 5.049 4.268 3.315 1.947 -2.442 -10 ,8202 ,KEBNE ,16690751,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:23:51 CET,0.0 1.103 1.64 2.037 2.385 2.709 2.995 3.239 3.677 3.887 4.092 3.997 4.68 4.863 5.223 5.561 5.865 6.009 6.29 6.574 6.991 7.256 7.509 7.875 8.223 8.553 8.873 9.172 9.582 9.994 10.375 10.825 11.262 11.692 12.187 12.71 13.217 13.765 14.309 14.852 15.391 15.976 16.655 17.344 18.115 18.933 19.835 20.848 21.96 23.097 24.334 25.0 25.134 25.049 24.802 24.373 23.869 23.361 22.899 22.428 21.925 21.404 20.891 20.335 19.784 19.267 18.688 18.17 17.718 17.252 16.779 16.346 15.866 15.38 14.995 14.589 14.146 13.662 13.177 12.856 12.5 11.915 11.516 11.08 10.854 10.385 9.847 9.262 8.96 8.177 8.001 7.646 7.321 6.608 6.146 5.631 5.073 4.352 3.523 2.349 -1.571 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt deleted file mode 100644 index aaf3aa35..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25299 ,KEBNE ,16690752,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:23:12 CET,0.0 1.183 1.709 2.101 2.474 2.824 3.135 3.424 3.967 4.213 4.441 4.385 5.103 5.312 5.725 6.112 6.464 6.625 6.925 7.235 7.688 7.97 8.242 8.63 9.001 9.371 9.723 10.066 10.509 10.937 11.35 11.82 12.272 12.718 13.238 13.833 14.358 14.863 15.379 15.927 16.515 17.218 18.033 18.779 19.638 20.569 21.572 22.608 23.73 24.958 26.158 26.71 26.771 26.575 26.193 25.615 24.997 24.41 23.793 23.152 22.652 22.184 21.698 21.192 20.653 20.149 19.647 19.201 18.779 18.278 17.741 17.325 16.877 16.4 16.047 15.675 15.281 14.838 14.358 14.023 13.68 13.157 12.781 12.394 12.185 11.735 11.271 10.771 10.492 9.708 9.589 9.253 8.898 8.137 7.689 7.203 6.703 6.14 5.451 4.477 0.065 -2 ,6090 ,KEBNE ,16690028,Thu Nov 25 07:57:46 CET,Thu Nov 25 07:58:55 CET,0.0 1.308 1.789 2.175 2.53 2.871 3.198 3.489 4.003 4.251 4.479 4.394 5.098 5.307 5.707 6.09 6.461 6.641 6.974 7.288 7.722 7.999 8.281 8.684 9.063 9.413 9.755 10.098 10.538 10.956 11.358 11.875 12.351 12.801 13.321 13.872 14.392 14.989 15.604 16.203 16.834 17.49 18.239 19.004 19.864 20.773 21.744 22.816 24.054 25.326 26.51 27.145 27.203 27.001 26.682 26.271 25.815 25.228 24.634 24.027 23.489 23.013 22.54 21.986 21.397 20.911 20.393 19.869 19.391 18.885 18.344 17.898 17.435 16.917 16.502 16.098 15.675 15.222 14.756 14.433 14.093 13.544 13.168 12.781 12.572 12.102 11.596 11.075 10.812 10.056 9.933 9.608 9.269 8.548 8.123 7.632 7.091 6.498 5.778 4.733 0.703 -3 ,26496 ,KEBNE ,16690754,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:24:22 CET,0.0 1.218 1.752 2.194 2.615 2.972 3.29 3.598 4.107 4.353 4.598 4.541 5.238 5.437 5.807 6.176 6.547 6.716 7.035 7.352 7.826 8.13 8.418 8.822 9.205 9.588 9.966 10.316 10.738 11.167 11.589 12.098 12.562 13.006 13.512 14.031 14.574 15.171 15.795 16.461 17.155 17.858 18.625 19.37 20.175 21.038 21.959 22.991 24.161 25.428 26.7 27.376 27.408 27.04 26.607 26.214 25.772 25.184 24.619 24.004 23.485 23.053 22.587 22.077 21.52 21.028 20.507 20.001 19.566 19.078 18.573 18.15 17.689 17.203 16.813 16.435 16.036 15.597 15.132 14.793 14.446 13.926 13.568 13.209 13.015 12.569 12.069 11.56 11.3 10.533 10.394 10.076 9.762 9.093 8.704 8.264 7.735 7.116 6.432 5.493 1.978 -4 ,23852 ,KEBNE ,16690755,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:22:49 CET,0.0 1.328 1.859 2.28 2.627 2.935 3.223 3.53 4.11 4.35 4.596 4.597 5.313 5.529 5.92 6.287 6.659 6.84 7.188 7.519 7.986 8.286 8.571 8.971 9.354 9.735 10.099 10.45 10.917 11.376 11.811 12.334 12.846 13.33 13.82 14.336 14.849 15.389 15.978 16.543 17.134 17.819 18.569 19.294 20.091 20.963 21.943 22.949 24.058 25.257 26.505 27.228 27.273 27.014 26.652 26.212 25.75 25.264 24.762 24.165 23.594 23.056 22.505 21.956 21.46 20.966 20.409 19.948 19.531 19.054 18.578 18.175 17.722 17.242 16.872 16.495 16.09 15.654 15.196 14.884 14.556 14.017 13.646 13.256 13.04 12.582 12.101 11.605 11.331 10.556 10.394 10.034 9.678 8.934 8.511 8.035 7.499 6.897 6.209 5.194 1.203 -5 ,556 ,KEBNE ,16690756,Thu Nov 25 08:25:12 CET,Thu Nov 25 10:24:37 CET,0.0 1.609 2.166 2.613 3.037 3.393 3.718 4.006 4.522 4.77 5.007 4.943 5.654 5.867 6.268 6.641 6.983 7.152 7.486 7.81 8.278 8.57 8.851 9.265 9.666 10.029 10.367 10.715 11.181 11.621 12.05 12.556 13.013 13.453 13.97 14.526 15.031 15.56 16.091 16.675 17.28 17.947 18.743 19.473 20.266 21.135 22.154 23.254 24.438 25.666 26.842 27.405 27.398 27.18 26.836 26.399 25.91 25.296 24.666 24.032 23.471 22.951 22.384 21.85 21.326 20.792 20.231 19.715 19.242 18.807 18.39 17.971 17.488 17.014 16.656 16.277 15.865 15.39 14.885 14.545 14.201 13.648 13.261 12.873 12.659 12.19 11.68 11.126 10.839 10.07 9.97 9.637 9.281 8.514 8.083 7.573 7.013 6.4 5.61 4.543 1.139 -6 ,15947 ,KEBNE ,16690032,Thu Nov 25 07:57:45 CET,Thu Nov 25 07:58:46 CET,0.0 1.405 2.147 2.713 3.225 3.687 4.071 4.411 4.962 5.223 5.478 5.415 6.135 6.36 6.776 7.135 7.487 7.683 8.101 8.454 8.884 9.154 9.432 9.845 10.225 10.583 10.945 11.302 11.74 12.169 12.601 13.101 13.56 14.022 14.559 15.127 15.668 16.263 16.847 17.414 17.977 18.617 19.369 20.041 20.813 21.693 22.678 23.755 24.97 26.258 27.484 28.127 28.211 28.05 27.708 27.238 26.738 26.203 25.704 25.153 24.568 24.079 23.626 23.156 22.736 22.285 21.742 21.267 20.82 20.328 19.811 19.375 18.908 18.398 18.006 17.586 17.141 16.683 16.19 15.861 15.548 15.022 14.635 14.248 14.044 13.578 13.083 12.573 12.302 11.544 11.453 11.141 10.806 10.034 9.592 9.11 8.567 7.948 7.148 6.119 2.285 -7 ,15884 ,KEBNE ,16690033,Thu Nov 25 07:57:47 CET,Thu Nov 25 07:59:15 CET,0.0 1.154 1.715 2.14 2.498 2.836 3.139 3.42 3.993 4.268 4.507 4.449 5.159 5.366 5.753 6.119 6.466 6.636 6.968 7.285 7.77 8.091 8.389 8.804 9.2 9.57 9.921 10.271 10.727 11.162 11.574 12.084 12.574 13.059 13.615 14.204 14.782 15.387 15.983 16.641 17.333 18.019 18.789 19.516 20.305 21.225 22.335 23.511 24.73 26.088 27.416 28.114 28.265 28.042 27.673 27.284 26.802 26.285 25.827 25.289 24.703 24.117 23.628 23.212 22.78 22.337 21.861 21.426 21.03 20.586 20.096 19.679 19.236 18.766 18.386 17.995 17.596 17.173 16.688 16.296 15.892 15.327 14.931 14.515 14.306 13.86 13.387 12.864 12.588 11.824 11.7 11.378 11.044 10.301 9.89 9.429 8.893 8.311 7.612 6.629 3.083 -8 ,24764 ,KEBNE ,16690759,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:23:38 CET,0.0 1.035 1.591 2.034 2.404 2.701 2.993 3.286 3.811 4.063 4.311 4.271 4.962 5.153 5.548 5.925 6.256 6.414 6.735 7.048 7.518 7.826 8.113 8.525 8.923 9.294 9.646 9.99 10.454 10.901 11.327 11.814 12.249 12.67 13.165 13.75 14.271 14.791 15.37 15.944 16.523 17.179 17.948 18.719 19.591 20.544 21.573 22.653 23.856 25.112 26.403 27.091 27.179 26.97 26.58 26.004 25.411 24.904 24.44 23.853 23.291 22.773 22.228 21.691 21.163 20.655 20.173 19.789 19.391 18.929 18.477 18.13 17.739 17.272 16.895 16.483 16.058 15.638 15.201 14.876 14.523 13.937 13.539 13.123 12.893 12.417 11.903 11.35 11.055 10.252 10.152 9.813 9.443 8.611 8.12 7.586 6.983 6.29 5.505 4.465 0.42 -9 ,3458 ,KEBNE ,16690035,Thu Nov 25 07:59:47 CET,Thu Nov 25 08:01:00 CET,0.0 1.877 2.574 3.083 3.512 3.886 4.229 4.551 5.147 5.415 5.667 5.62 6.354 6.578 6.982 7.359 7.706 7.872 8.194 8.504 8.941 9.214 9.477 9.854 10.225 10.59 10.946 11.287 11.723 12.138 12.554 13.084 13.588 14.051 14.571 15.16 15.735 16.349 17.007 17.706 18.393 19.116 19.908 20.668 21.499 22.349 23.286 24.274 25.376 26.589 27.803 28.535 28.64 28.378 27.935 27.414 26.899 26.449 25.99 25.423 24.876 24.338 23.812 23.281 22.763 22.262 21.705 21.184 20.751 20.277 19.733 19.3 18.871 18.402 18.034 17.655 17.259 16.827 16.35 16.016 15.66 15.111 14.749 14.341 14.123 13.693 13.239 12.759 12.489 11.707 11.608 11.272 10.916 10.199 9.786 9.316 8.801 8.256 7.567 6.613 3.596 -10 ,29543 ,KEBNE ,16690036,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:00:59 CET,0.0 1.041 1.617 2.1 2.456 2.777 3.07 3.37 3.933 4.194 4.441 4.38 5.092 5.308 5.733 6.119 6.464 6.635 6.978 7.318 7.774 8.045 8.314 8.722 9.12 9.503 9.88 10.235 10.655 11.062 11.482 11.991 12.457 12.901 13.422 13.982 14.556 15.185 15.83 16.527 17.199 17.883 18.669 19.434 20.289 21.179 22.154 23.244 24.425 25.719 26.954 27.595 27.602 27.289 26.894 26.42 25.857 25.347 24.906 24.352 23.787 23.259 22.757 22.214 21.714 21.298 20.791 20.298 19.889 19.429 18.917 18.503 18.052 17.572 17.209 16.806 16.369 15.924 15.474 15.166 14.829 14.294 13.92 13.534 13.341 12.918 12.448 11.97 11.719 10.954 10.824 10.485 10.118 9.338 8.903 8.443 7.919 7.292 6.561 5.579 1.793 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23467_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23467_23466.txt deleted file mode 100644 index 0ec43bd4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23467_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1800 ,KEBNE ,16690762,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:17:55 CET,0.0 0.976 1.48 1.832 2.106 2.345 2.543 2.723 3.066 3.224 3.372 3.233 3.837 3.981 4.236 4.466 4.686 4.798 5.042 5.267 5.554 5.741 5.927 6.184 6.413 6.632 6.857 7.081 7.342 7.58 7.824 8.109 8.377 8.647 8.93 9.214 9.486 9.752 9.992 10.249 10.533 10.802 11.052 11.251 11.405 11.506 11.579 11.621 11.404 10.713 9.2 6.984 5.045 3.4 2.002 0.784 -0.401 -1.495 -2.392 -3.313 -4.144 -4.943 -5.682 -6.345 -6.976 -7.566 -8.187 -8.741 -9.24 -9.758 -10.272 -10.705 -11.16 -11.612 -11.969 -12.358 -12.762 -13.188 -13.642 -13.962 -14.289 -14.766 -15.097 -15.45 -15.635 -16.027 -16.442 -16.849 -17.057 -17.761 -17.762 -18.002 -18.257 -18.851 -19.198 -19.559 -19.95 -20.409 -20.964 -21.662 -23.147 -2 ,4395 ,KEBNE ,16690763,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:17:19 CET,0.0 1.082 1.568 1.977 2.296 2.547 2.778 2.987 3.343 3.498 3.644 3.484 4.052 4.177 4.428 4.692 4.934 5.038 5.229 5.418 5.686 5.847 6.008 6.264 6.506 6.713 6.889 7.056 7.282 7.503 7.71 7.934 8.149 8.336 8.529 8.764 8.982 9.215 9.448 9.636 9.789 9.959 10.138 10.284 10.399 10.475 10.454 10.213 9.748 8.893 7.243 5.108 3.243 1.625 0.219 -1.05 -2.154 -3.158 -4.036 -4.935 -5.708 -6.407 -7.076 -7.684 -8.257 -8.779 -9.322 -9.829 -10.299 -10.788 -11.266 -11.64 -12.027 -12.44 -12.776 -13.143 -13.523 -13.91 -14.322 -14.616 -14.91 -15.38 -15.736 -16.101 -16.273 -16.627 -17.02 -17.431 -17.645 -18.333 -18.38 -18.65 -18.924 -19.526 -19.869 -20.248 -20.686 -21.204 -21.779 -22.475 -24.846 -3 ,19772 ,KEBNE ,16690039,Thu Nov 25 07:59:47 CET,Thu Nov 25 08:00:53 CET,0.0 1.677 2.312 2.738 3.062 3.326 3.55 3.753 4.114 4.281 4.441 4.268 4.86 5.0 5.248 5.48 5.703 5.812 6.014 6.196 6.459 6.627 6.783 6.992 7.179 7.365 7.545 7.714 7.924 8.121 8.31 8.53 8.732 8.936 9.171 9.385 9.561 9.759 9.951 10.115 10.244 10.369 10.51 10.606 10.664 10.704 10.621 10.395 9.998 9.185 7.61 5.44 3.598 2.103 0.766 -0.472 -1.547 -2.546 -3.456 -4.404 -5.22 -5.925 -6.591 -7.215 -7.824 -8.416 -9.052 -9.637 -10.135 -10.645 -11.156 -11.565 -11.997 -12.438 -12.768 -13.109 -13.475 -13.859 -14.243 -14.508 -14.784 -15.214 -15.529 -15.862 -16.026 -16.38 -16.78 -17.204 -17.419 -18.091 -18.107 -18.37 -18.638 -19.216 -19.53 -19.882 -20.253 -20.649 -21.164 -21.847 -24.125 -4 ,21893 ,KEBNE ,16690040,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:01:09 CET,0.0 1.307 1.832 2.269 2.621 2.891 3.115 3.318 3.691 3.868 4.061 3.985 4.58 4.708 4.965 5.205 5.43 5.54 5.766 5.967 6.223 6.387 6.539 6.753 6.966 7.16 7.343 7.512 7.708 7.892 8.065 8.271 8.463 8.658 8.878 9.079 9.274 9.497 9.706 9.919 10.122 10.312 10.493 10.641 10.766 10.812 10.747 10.552 10.131 9.325 7.844 5.801 3.913 2.296 0.892 -0.369 -1.516 -2.598 -3.545 -4.47 -5.235 -5.902 -6.548 -7.179 -7.761 -8.299 -8.874 -9.393 -9.842 -10.33 -10.831 -11.265 -11.727 -12.209 -12.593 -12.985 -13.389 -13.81 -14.257 -14.564 -14.873 -15.371 -15.728 -16.092 -16.275 -16.646 -17.043 -17.47 -17.692 -18.392 -18.394 -18.636 -18.893 -19.462 -19.78 -20.132 -20.524 -20.973 -21.571 -22.45 -25.766 -5 ,13213 ,KEBNE ,16690041,Thu Nov 25 07:59:49 CET,Thu Nov 25 08:01:08 CET,0.0 0.86 1.283 1.606 1.892 2.146 2.372 2.587 2.928 3.079 3.223 3.055 3.624 3.748 3.982 4.18 4.369 4.458 4.645 4.832 5.079 5.234 5.382 5.589 5.786 5.968 6.14 6.301 6.497 6.684 6.857 7.052 7.243 7.42 7.6 7.799 7.972 8.153 8.331 8.479 8.629 8.781 8.927 9.026 9.083 9.107 9.064 8.817 8.368 7.618 6.123 4.099 2.293 0.754 -0.57 -1.791 -2.872 -3.862 -4.758 -5.646 -6.407 -7.092 -7.722 -8.327 -8.907 -9.44 -9.988 -10.464 -10.897 -11.371 -11.862 -12.266 -12.692 -13.135 -13.467 -13.813 -14.173 -14.537 -14.926 -15.206 -15.509 -15.962 -16.277 -16.625 -16.801 -17.163 -17.549 -17.964 -18.189 -18.885 -18.898 -19.144 -19.402 -19.996 -20.338 -20.705 -21.104 -21.555 -22.125 -22.908 -26.319 -6 ,24667 ,KEBNE ,16690042,Thu Nov 25 07:59:47 CET,Thu Nov 25 08:01:08 CET,0.0 1.199 1.69 2.085 2.424 2.749 3.034 3.268 3.642 3.806 3.964 3.818 4.41 4.557 4.816 5.04 5.251 5.358 5.564 5.775 6.104 6.29 6.45 6.699 6.917 7.11 7.296 7.468 7.694 7.895 8.08 8.295 8.498 8.686 8.889 9.103 9.305 9.505 9.674 9.847 10.014 10.153 10.278 10.364 10.415 10.434 10.37 10.123 9.682 8.892 7.268 5.034 3.091 1.464 0.088 -1.173 -2.293 -3.293 -4.166 -5.05 -5.825 -6.534 -7.223 -7.871 -8.453 -8.981 -9.535 -10.034 -10.474 -10.944 -11.429 -11.811 -12.216 -12.671 -13.025 -13.377 -13.756 -14.154 -14.549 -14.818 -15.098 -15.544 -15.878 -16.222 -16.397 -16.762 -17.14 -17.547 -17.764 -18.465 -18.495 -18.753 -19.003 -19.528 -19.832 -20.19 -20.579 -21.003 -21.504 -22.215 -24.526 -7 ,13621 ,KEBNE ,16690043,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:01:08 CET,0.0 3.079 3.928 4.472 4.905 5.262 5.542 5.766 6.151 6.325 6.487 6.34 6.933 7.071 7.333 7.588 7.826 7.935 8.132 8.317 8.574 8.729 8.876 9.073 9.267 9.472 9.662 9.817 10.02 10.221 10.398 10.586 10.76 10.932 11.124 11.34 11.539 11.725 11.921 12.123 12.288 12.439 12.599 12.739 12.824 12.809 12.751 12.549 12.082 11.266 9.64 7.533 5.672 4.071 2.665 1.315 0.143 -0.878 -1.73 -2.588 -3.347 -4.028 -4.689 -5.329 -5.914 -6.419 -6.95 -7.438 -7.867 -8.33 -8.803 -9.179 -9.572 -9.998 -10.344 -10.698 -11.065 -11.451 -11.862 -12.155 -12.455 -12.92 -13.252 -13.591 -13.757 -14.096 -14.466 -14.879 -15.097 -15.76 -15.752 -15.991 -16.257 -16.843 -17.17 -17.513 -17.875 -18.272 -18.737 -19.372 -21.838 -8 ,27251 ,KEBNE ,16690044,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:01:05 CET,0.0 1.309 1.804 2.185 2.508 2.783 3.014 3.219 3.572 3.747 3.921 3.78 4.366 4.505 4.762 5.011 5.238 5.342 5.531 5.702 5.967 6.141 6.294 6.494 6.681 6.859 7.042 7.207 7.401 7.589 7.753 7.933 8.124 8.326 8.539 8.748 8.946 9.159 9.356 9.541 9.744 9.931 10.085 10.201 10.303 10.342 10.249 10.017 9.585 8.792 7.196 4.994 3.15 1.654 0.3 -0.946 -2.024 -3.026 -3.885 -4.747 -5.505 -6.208 -6.913 -7.556 -8.152 -8.686 -9.209 -9.661 -10.061 -10.505 -10.989 -11.392 -11.821 -12.279 -12.626 -12.997 -13.364 -13.737 -14.139 -14.407 -14.697 -15.175 -15.498 -15.826 -16.003 -16.415 -16.856 -17.288 -17.504 -18.192 -18.188 -18.433 -18.687 -19.274 -19.611 -19.963 -20.356 -20.833 -21.386 -22.135 -24.515 -9 ,23134 ,KEBNE ,16690770,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:15:21 CET,0.0 1.127 1.562 1.908 2.215 2.495 2.749 2.964 3.346 3.524 3.679 3.517 4.116 4.24 4.48 4.703 4.903 4.998 5.194 5.382 5.621 5.769 5.914 6.1 6.272 6.453 6.625 6.773 6.96 7.131 7.295 7.498 7.693 7.869 8.051 8.235 8.41 8.606 8.786 8.943 9.075 9.199 9.332 9.437 9.495 9.487 9.387 9.131 8.656 7.816 6.24 4.143 2.303 0.71 -0.736 -2.069 -3.22 -4.235 -5.113 -6.0 -6.773 -7.485 -8.179 -8.827 -9.439 -10.002 -10.604 -11.168 -11.671 -12.21 -12.773 -13.217 -13.664 -14.15 -14.53 -14.909 -15.286 -15.647 -16.022 -16.288 -16.574 -17.033 -17.351 -17.675 -17.845 -18.195 -18.556 -18.947 -19.159 -19.864 -19.856 -20.121 -20.381 -20.925 -21.223 -21.57 -21.994 -22.455 -22.954 -23.657 -26.273 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23466.txt deleted file mode 100644 index 4902bd6f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18850 ,KEBNE ,17025043,Wed Dec 22 11:37:43 CET,Wed Dec 22 13:31:38 CET,0.0 0.965 1.436 1.795 2.127 2.45 2.767 3.054 3.523 3.739 3.96 3.889 4.596 4.808 5.207 5.574 5.896 6.05 6.361 6.655 7.069 7.339 7.618 8.019 8.395 8.76 9.098 9.422 9.847 10.258 10.671 11.188 11.676 12.12 12.642 13.246 13.804 14.385 14.997 15.618 16.254 17.036 17.981 18.816 19.695 20.703 21.853 23.136 24.569 25.998 27.483 28.429 28.686 28.724 28.625 28.359 28.051 27.705 27.339 26.961 26.604 26.218 25.806 25.361 24.866 24.412 23.954 23.528 23.152 22.745 22.294 21.927 21.547 21.157 20.828 20.468 20.111 19.751 19.372 19.087 18.787 18.336 18.024 17.7 17.528 17.156 16.742 16.303 16.067 15.34 15.29 15.002 14.713 14.09 13.711 13.255 12.729 12.129 11.335 10.269 6.263 -3 ,10423 ,KEBNE ,17025045,Wed Dec 22 11:37:43 CET,Wed Dec 22 13:32:06 CET,0.0 0.841 1.328 1.762 2.114 2.428 2.691 2.921 3.395 3.616 3.821 3.724 4.399 4.583 4.94 5.267 5.579 5.738 6.034 6.316 6.748 7.033 7.31 7.714 8.09 8.448 8.801 9.14 9.588 10.018 10.425 10.922 11.42 11.905 12.445 13.05 13.618 14.207 14.837 15.525 16.223 16.99 17.883 18.732 19.726 20.827 22.024 23.351 24.882 26.523 28.292 29.574 30.051 30.094 29.893 29.567 29.145 28.734 28.36 27.956 27.596 27.202 26.734 26.265 25.785 25.351 24.926 24.514 24.137 23.71 23.259 22.895 22.486 22.061 21.738 21.395 21.026 20.638 20.235 19.954 19.667 19.216 18.881 18.515 18.328 17.945 17.54 17.089 16.832 16.082 16.022 15.736 15.431 14.772 14.367 13.868 13.386 12.816 12.062 11.096 6.02 -4 ,25168 ,KEBNE ,17025046,Wed Dec 22 11:37:42 CET,Wed Dec 22 13:31:20 CET,0.0 0.946 1.455 1.871 2.241 2.564 2.851 3.111 3.591 3.812 4.04 3.953 4.628 4.825 5.213 5.569 5.906 6.062 6.357 6.652 7.096 7.383 7.66 8.058 8.447 8.827 9.19 9.535 9.994 10.427 10.818 11.288 11.74 12.192 12.73 13.344 13.935 14.517 15.089 15.753 16.407 17.084 17.956 18.874 19.911 20.989 22.23 23.59 25.078 26.681 28.316 29.381 29.683 29.681 29.485 29.195 28.853 28.478 28.108 27.67 27.237 26.815 26.409 25.997 25.616 25.262 24.862 24.504 24.167 23.793 23.4 23.037 22.643 22.245 21.939 21.604 21.248 20.888 20.513 20.252 19.977 19.532 19.206 18.813 18.592 18.174 17.752 17.279 17.03 16.294 16.161 15.832 15.484 14.597 14.057 13.498 12.878 12.111 11.111 9.76 4.046 -5 ,7542 ,KEBNE ,17025047,Wed Dec 22 11:37:42 CET,Wed Dec 22 13:31:26 CET,0.0 0.803 1.319 1.731 2.082 2.39 2.67 2.913 3.349 3.571 3.787 3.681 4.375 4.561 4.917 5.272 5.611 5.778 6.11 6.422 6.856 7.116 7.382 7.784 8.166 8.532 8.874 9.201 9.645 10.078 10.489 10.975 11.438 11.902 12.433 13.021 13.578 14.172 14.816 15.485 16.184 16.951 17.76 18.593 19.542 20.521 21.633 22.921 24.407 26.005 27.76 28.785 29.117 29.156 29.01 28.784 28.465 28.126 27.777 27.378 27.017 26.629 26.253 25.855 25.393 24.951 24.522 24.118 23.727 23.301 22.834 22.446 22.046 21.641 21.313 20.962 20.596 20.22 19.833 19.552 19.243 18.748 18.414 18.066 17.88 17.479 17.04 16.588 16.352 15.631 15.553 15.274 14.975 14.275 13.896 13.456 12.904 12.285 11.479 10.207 5.283 -6 ,28445 ,KEBNE ,17025048,Wed Dec 22 11:37:43 CET,Wed Dec 22 13:31:51 CET,0.0 0.754 1.168 1.547 1.918 2.239 2.505 2.759 3.252 3.482 3.688 3.582 4.281 4.483 4.842 5.154 5.471 5.627 5.916 6.192 6.585 6.842 7.099 7.481 7.849 8.187 8.53 8.877 9.328 9.77 10.182 10.647 11.095 11.538 12.039 12.603 13.171 13.818 14.488 15.145 15.864 16.69 17.614 18.514 19.481 20.481 21.655 22.997 24.535 26.297 28.142 29.319 29.738 29.74 29.472 29.113 28.789 28.469 28.112 27.654 27.26 26.922 26.553 26.191 25.828 25.409 24.932 24.518 24.158 23.777 23.394 23.05 22.651 22.26 21.97 21.653 21.3 20.932 20.545 20.269 19.985 19.56 19.241 18.877 18.696 18.335 17.935 17.507 17.28 16.559 16.472 16.184 15.88 15.181 14.785 14.367 13.858 13.254 12.517 11.485 8.545 -7 ,26074 ,KEBNE ,17025049,Wed Dec 22 11:37:42 CET,Wed Dec 22 13:31:12 CET,0.0 1.415 2.086 2.63 3.051 3.384 3.709 4.009 4.542 4.791 5.031 4.983 5.649 5.828 6.184 6.517 6.835 6.996 7.318 7.625 8.06 8.334 8.599 8.996 9.375 9.723 10.087 10.438 10.868 11.295 11.703 12.167 12.6 13.022 13.516 14.071 14.6 15.205 15.861 16.512 17.178 17.933 18.819 19.666 20.645 21.765 22.982 24.27 25.665 27.211 28.968 30.09 30.359 30.23 29.898 29.509 29.109 28.694 28.279 27.814 27.393 26.961 26.516 26.067 25.594 25.162 24.714 24.308 23.97 23.615 23.239 22.912 22.546 22.164 21.851 21.522 21.187 20.835 20.449 20.161 19.861 19.368 19.03 18.704 18.537 18.151 17.726 17.282 17.025 16.265 16.11 15.77 15.439 14.694 14.279 13.845 13.339 12.761 11.973 10.661 5.214 -8 ,18299 ,KEBNE ,17025050,Wed Dec 22 11:37:43 CET,Wed Dec 22 13:31:17 CET,0.0 0.858 1.247 1.601 1.959 2.258 2.548 2.827 3.31 3.527 3.742 3.662 4.363 4.565 4.941 5.293 5.627 5.788 6.102 6.412 6.856 7.13 7.394 7.775 8.159 8.542 8.896 9.227 9.66 10.071 10.436 10.882 11.36 11.821 12.328 12.924 13.5 14.107 14.721 15.34 15.977 16.731 17.634 18.501 19.426 20.466 21.753 23.161 24.746 26.474 28.206 29.291 29.721 29.789 29.619 29.326 29.003 28.648 28.298 27.902 27.467 27.046 26.679 26.327 25.934 25.552 25.111 24.68 24.306 23.887 23.441 23.071 22.68 22.274 21.955 21.6 21.228 20.811 20.315 19.993 19.693 19.229 18.914 18.558 18.359 17.972 17.573 17.115 16.875 16.147 16.091 15.8 15.462 14.656 14.197 13.707 13.139 12.508 11.815 10.809 6.839 -9 ,2418 ,KEBNE ,17025051,Wed Dec 22 11:38:44 CET,Wed Dec 22 13:32:13 CET,0.0 1.355 1.953 2.41 2.817 3.158 3.458 3.739 4.274 4.544 4.791 4.697 5.387 5.574 5.935 6.285 6.619 6.78 7.091 7.384 7.796 8.063 8.321 8.686 9.044 9.393 9.738 10.084 10.508 10.897 11.268 11.718 12.16 12.595 13.097 13.648 14.152 14.716 15.354 16.013 16.683 17.435 18.292 19.153 20.169 21.265 22.489 23.833 25.374 27.183 29.092 30.175 30.597 30.702 30.641 30.453 30.156 29.785 29.409 28.943 28.525 28.155 27.724 27.279 26.843 26.434 26.001 25.585 25.233 24.865 24.462 24.132 23.793 23.41 23.089 22.745 22.389 22.017 21.623 21.358 21.089 20.639 20.317 19.982 19.806 19.436 19.028 18.572 18.33 17.604 17.539 17.25 16.937 16.233 15.818 15.336 14.763 14.087 13.297 12.163 7.914 -10 ,9335 ,KEBNE ,17025052,Wed Dec 22 11:39:45 CET,Wed Dec 22 13:34:37 CET,0.0 0.94 1.439 1.812 2.169 2.469 2.742 3.0 3.47 3.684 3.895 3.805 4.484 4.678 5.047 5.379 5.696 5.853 6.165 6.468 6.886 7.151 7.414 7.792 8.16 8.523 8.887 9.236 9.671 10.08 10.484 10.98 11.478 11.959 12.492 13.089 13.645 14.236 14.858 15.48 16.109 16.849 17.75 18.614 19.618 20.737 21.908 23.172 24.697 26.479 28.175 29.084 29.435 29.546 29.403 29.15 28.875 28.531 28.198 27.783 27.366 26.949 26.493 26.089 25.734 25.35 24.946 24.583 24.223 23.823 23.375 23.011 22.676 22.287 21.94 21.576 21.213 20.884 20.54 20.27 19.962 19.48 19.161 18.812 18.63 18.275 17.885 17.437 17.191 16.463 16.406 16.113 15.795 15.116 14.732 14.298 13.792 13.193 12.418 11.261 6.485 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23467.txt deleted file mode 100644 index 69da4b1c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23468_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22115 ,KEBNE ,17069868,Fri Dec 24 11:28:13 CET,Fri Dec 24 13:23:34 CET,0.0 1.047 1.609 2.014 2.371 2.716 3.038 3.359 3.978 4.263 4.525 4.53 5.278 5.507 5.933 6.346 6.754 6.952 7.337 7.709 8.244 8.588 8.914 9.394 9.861 10.311 10.755 11.202 11.778 12.309 12.826 13.453 14.08 14.684 15.36 16.113 16.828 17.616 18.489 19.395 20.376 21.488 22.704 23.955 25.41 27.036 28.934 31.082 33.571 36.487 40.002 42.816 44.316 45.184 45.667 45.943 46.06 45.974 45.803 45.552 45.294 45.091 44.852 44.593 44.359 44.079 43.718 43.402 43.135 42.84 42.508 42.226 41.914 41.596 41.37 41.128 40.844 40.546 40.202 39.948 39.711 39.335 39.053 38.751 38.6 38.286 37.955 37.61 37.422 36.774 36.797 36.555 36.308 35.764 35.439 35.071 34.618 34.104 33.463 32.442 28.919 -3 ,18104 ,KEBNE ,17069870,Fri Dec 24 11:29:18 CET,Fri Dec 24 13:24:10 CET,0.0 1.315 1.887 2.311 2.679 3.037 3.4 3.725 4.302 4.58 4.841 4.833 5.575 5.812 6.262 6.699 7.111 7.301 7.678 8.047 8.592 8.952 9.293 9.771 10.228 10.668 11.105 11.543 12.124 12.685 13.215 13.852 14.486 15.1 15.777 16.54 17.285 18.096 18.957 19.891 20.871 21.923 23.152 24.41 25.854 27.474 29.381 31.533 34.066 36.952 40.421 43.316 44.822 45.664 46.189 46.491 46.632 46.656 46.616 46.494 46.301 46.077 45.875 45.621 45.321 45.033 44.731 44.478 44.233 43.949 43.657 43.389 43.078 42.764 42.512 42.235 41.948 41.642 41.307 41.071 40.828 40.455 40.182 39.887 39.736 39.426 39.102 38.754 38.566 37.901 37.891 37.626 37.368 36.813 36.502 36.164 35.769 35.297 34.741 33.955 32.012 -4 ,9313 ,KEBNE ,17069871,Fri Dec 24 11:29:18 CET,Fri Dec 24 13:24:05 CET,0.0 1.72 2.356 2.867 3.284 3.649 3.991 4.304 4.866 5.13 5.386 5.379 6.131 6.401 6.892 7.331 7.755 7.953 8.336 8.709 9.25 9.605 9.949 10.436 10.893 11.335 11.772 12.186 12.719 13.251 13.768 14.366 14.954 15.54 16.215 16.967 17.683 18.475 19.352 20.305 21.298 22.399 23.685 24.966 26.438 28.073 29.905 31.958 34.363 37.217 40.664 43.324 44.814 45.716 46.173 46.39 46.427 46.332 46.209 46.02 45.787 45.553 45.3 45.023 44.749 44.481 44.178 43.918 43.682 43.413 43.114 42.85 42.572 42.268 42.033 41.772 41.481 41.195 40.899 40.684 40.454 40.09 39.832 39.538 39.381 39.037 38.644 38.247 38.042 37.373 37.371 37.109 36.838 36.221 35.86 35.483 35.046 34.474 33.697 32.486 27.172 -5 ,19574 ,KEBNE ,17069872,Fri Dec 24 11:31:27 CET,Fri Dec 24 13:25:49 CET,0.0 1.176 1.801 2.328 2.767 3.152 3.492 3.797 4.376 4.662 4.934 4.929 5.659 5.889 6.321 6.724 7.117 7.319 7.722 8.096 8.637 8.996 9.344 9.83 10.318 10.816 11.264 11.701 12.276 12.817 13.347 13.993 14.628 15.194 15.841 16.633 17.403 18.216 19.099 20.052 21.002 22.037 23.273 24.522 26.039 27.727 29.59 31.76 34.394 37.559 41.23 44.027 45.536 46.49 47.045 47.341 47.512 47.553 47.519 47.377 47.165 46.976 46.747 46.467 46.158 45.841 45.524 45.224 44.93 44.596 44.261 43.988 43.693 43.382 43.116 42.852 42.577 42.271 41.949 41.711 41.47 41.108 40.839 40.543 40.394 40.086 39.74 39.351 39.139 38.471 38.469 38.207 37.934 37.344 37.006 36.624 36.179 35.673 35.021 34.095 30.686 -6 ,6017 ,KEBNE ,17069873,Fri Dec 24 11:34:38 CET,Fri Dec 24 13:29:16 CET,0.0 1.214 1.784 2.219 2.6 2.972 3.325 3.629 4.169 4.42 4.662 4.623 5.348 5.571 5.994 6.412 6.834 7.042 7.437 7.815 8.341 8.674 9.005 9.487 9.962 10.428 10.869 11.298 11.867 12.416 12.954 13.591 14.201 14.823 15.542 16.302 17.036 17.853 18.694 19.576 20.527 21.56 22.732 23.968 25.417 26.998 28.921 31.137 33.723 36.781 40.395 43.285 44.822 45.79 46.395 46.684 46.804 46.81 46.716 46.579 46.44 46.272 46.07 45.837 45.565 45.301 45.016 44.754 44.499 44.187 43.863 43.611 43.337 43.038 42.801 42.553 42.283 41.975 41.644 41.411 41.157 40.745 40.453 40.123 39.947 39.592 39.193 38.772 38.553 37.867 37.789 37.515 37.227 36.552 36.18 35.791 35.344 34.831 34.22 33.305 29.941 -7 ,30065 ,KEBNE ,17069874,Fri Dec 24 11:34:38 CET,Fri Dec 24 13:29:49 CET,0.0 1.532 2.192 2.759 3.259 3.694 4.07 4.415 5.022 5.297 5.552 5.554 6.294 6.509 6.926 7.346 7.747 7.941 8.315 8.675 9.189 9.517 9.852 10.346 10.82 11.263 11.686 12.107 12.655 13.196 13.711 14.325 14.929 15.497 16.15 16.933 17.696 18.478 19.301 20.212 21.143 22.144 23.338 24.589 26.004 27.521 29.352 31.49 34.002 36.916 40.502 43.426 45.002 45.923 46.497 46.863 47.057 47.119 47.103 47.009 46.869 46.684 46.462 46.273 46.025 45.729 45.386 45.068 44.812 44.519 44.207 43.937 43.654 43.363 43.128 42.895 42.636 42.327 41.982 41.744 41.488 41.09 40.828 40.529 40.368 40.046 39.682 39.278 39.052 38.353 38.349 38.087 37.81 37.202 36.867 36.512 36.062 35.504 34.889 34.08 31.546 -8 ,31310 ,KEBNE ,17069875,Fri Dec 24 11:36:46 CET,Fri Dec 24 13:30:31 CET,0.0 1.082 1.676 2.131 2.522 2.886 3.226 3.557 4.177 4.453 4.701 4.697 5.427 5.654 6.098 6.521 6.927 7.129 7.525 7.885 8.379 8.703 9.017 9.459 9.901 10.348 10.781 11.189 11.709 12.222 12.72 13.325 13.91 14.462 15.12 15.854 16.548 17.334 18.182 19.079 19.993 21.059 22.316 23.521 24.885 26.439 28.298 30.406 32.848 35.799 39.514 42.41 43.945 44.791 45.287 45.595 45.754 45.799 45.72 45.566 45.415 45.201 44.933 44.695 44.443 44.173 43.888 43.594 43.308 43.004 42.689 42.42 42.122 41.794 41.527 41.247 40.954 40.639 40.298 40.056 39.803 39.39 39.093 38.783 38.622 38.282 37.903 37.502 37.288 36.616 36.574 36.291 35.996 35.338 34.969 34.565 34.127 33.604 32.862 31.811 27.982 -9 ,17616 ,KEBNE ,17069876,Fri Dec 24 11:37:50 CET,Fri Dec 24 13:32:57 CET,0.0 2.585 3.21 3.695 4.135 4.56 4.945 5.284 5.913 6.196 6.458 6.48 7.229 7.455 7.876 8.293 8.69 8.884 9.261 9.624 10.137 10.465 10.806 11.309 11.78 12.223 12.645 13.046 13.569 14.097 14.609 15.22 15.82 16.385 17.027 17.769 18.52 19.331 20.16 21.023 21.932 22.985 24.257 25.561 27.068 28.708 30.594 32.725 35.201 38.142 41.824 44.708 46.234 47.176 47.721 47.987 48.1 48.117 48.012 47.816 47.615 47.441 47.243 47.03 46.78 46.5 46.194 45.909 45.653 45.349 45.0 44.7 44.405 44.097 43.845 43.591 43.319 43.004 42.659 42.419 42.165 41.771 41.481 41.189 41.034 40.705 40.35 39.956 39.749 39.073 39.054 38.801 38.513 37.849 37.475 37.092 36.659 36.138 35.475 34.555 31.849 -10 ,4544 ,KEBNE ,17069877,Fri Dec 24 11:38:55 CET,Fri Dec 24 13:33:41 CET,0.0 0.946 1.461 1.903 2.323 2.712 3.049 3.369 3.99 4.278 4.547 4.536 5.269 5.512 5.956 6.378 6.788 6.987 7.367 7.738 8.265 8.596 8.924 9.428 9.942 10.41 10.85 11.287 11.844 12.365 12.864 13.51 14.119 14.693 15.398 16.223 16.981 17.756 18.563 19.412 20.312 21.397 22.713 23.933 25.36 26.983 28.889 31.081 33.672 36.735 40.273 43.121 44.622 45.485 46.05 46.329 46.414 46.359 46.202 46.019 45.842 45.618 45.37 45.104 44.851 44.634 44.366 44.087 43.828 43.555 43.28 43.042 42.769 42.482 42.252 41.986 41.702 41.393 41.062 40.839 40.611 40.231 39.937 39.62 39.457 39.132 38.771 38.352 38.135 37.481 37.471 37.229 36.955 36.263 35.886 35.503 35.054 34.485 33.798 32.864 29.322 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index aa5949e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6661 ,KEBNE ,16690772,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:25:25 CET,0.0 1.28 1.874 2.352 2.755 3.121 3.451 3.757 4.305 4.551 4.784 4.733 5.412 5.603 5.973 6.312 6.642 6.801 7.109 7.399 7.802 8.065 8.333 8.711 9.06 9.399 9.712 10.003 10.383 10.753 11.116 11.55 11.935 12.299 12.729 13.214 13.69 14.194 14.729 15.301 15.862 16.457 17.111 17.736 18.473 19.26 20.074 20.892 21.715 22.434 22.832 22.607 21.882 21.001 20.115 19.257 18.449 17.69 17.022 16.308 15.683 15.112 14.544 14.019 13.541 13.098 12.633 12.234 11.873 11.487 11.073 10.704 10.325 9.922 9.596 9.27 8.921 8.533 8.13 7.847 7.559 7.119 6.807 6.482 6.308 5.939 5.539 5.097 4.874 4.168 4.186 3.938 3.674 3.129 2.814 2.473 2.107 1.702 1.224 0.645 -1.042 -2 ,3729 ,KEBNE ,16690048,Thu Nov 25 07:59:47 CET,Thu Nov 25 08:01:00 CET,0.0 1.315 1.93 2.37 2.738 3.116 3.476 3.755 4.224 4.466 4.694 4.625 5.288 5.47 5.828 6.167 6.481 6.628 6.913 7.196 7.58 7.822 8.075 8.435 8.765 9.105 9.445 9.764 10.174 10.545 10.888 11.292 11.662 12.04 12.497 12.983 13.443 13.958 14.508 15.095 15.67 16.265 16.94 17.598 18.33 19.073 19.874 20.755 21.617 22.281 22.684 22.444 21.728 20.94 20.05 19.101 18.223 17.399 16.669 15.876 15.185 14.593 14.006 13.41 12.85 12.352 11.823 11.329 10.897 10.474 10.022 9.615 9.201 8.785 8.465 8.121 7.744 7.366 6.993 6.731 6.446 5.996 5.679 5.342 5.172 4.838 4.487 4.097 3.891 3.205 3.259 3.019 2.759 2.224 1.923 1.566 1.167 0.744 0.27 -0.366 -1.522 -3 ,1735 ,KEBNE ,16690049,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:01:00 CET,0.0 0.994 1.527 1.935 2.296 2.616 2.904 3.166 3.653 3.864 4.056 3.939 4.609 4.791 5.127 5.464 5.783 5.931 6.223 6.517 6.93 7.168 7.408 7.775 8.11 8.429 8.752 9.067 9.484 9.867 10.2 10.595 10.973 11.326 11.728 12.162 12.558 12.981 13.438 13.929 14.458 15.076 15.749 16.364 17.068 17.829 18.653 19.502 20.384 21.191 21.746 21.583 20.858 20.028 19.269 18.497 17.808 17.213 16.643 16.009 15.44 14.933 14.435 13.946 13.461 13.005 12.537 12.124 11.756 11.355 10.932 10.579 10.219 9.846 9.548 9.245 8.915 8.547 8.18 7.919 7.644 7.236 6.937 6.615 6.455 6.127 5.762 5.369 5.177 4.492 4.497 4.22 3.924 3.349 3.031 2.681 2.297 1.897 1.443 0.786 -1.152 -4 ,22100 ,KEBNE ,16690050,Thu Nov 25 07:59:47 CET,Thu Nov 25 08:01:12 CET,0.0 1.027 1.608 2.06 2.438 2.807 3.166 3.482 4.006 4.238 4.454 4.385 5.061 5.259 5.634 5.996 6.33 6.482 6.784 7.077 7.479 7.744 8.008 8.376 8.737 9.092 9.44 9.773 10.18 10.569 10.931 11.355 11.778 12.191 12.642 13.137 13.603 14.085 14.612 15.175 15.753 16.404 17.18 17.937 18.747 19.562 20.384 21.257 22.142 22.894 23.423 23.309 22.776 22.049 21.31 20.558 19.758 19.025 18.43 17.813 17.221 16.657 16.094 15.522 14.991 14.508 14.026 13.592 13.2 12.795 12.349 11.969 11.567 11.156 10.843 10.508 10.145 9.757 9.343 9.063 8.778 8.297 7.959 7.618 7.444 7.1 6.736 6.325 6.104 5.403 5.423 5.191 4.926 4.354 4.054 3.712 3.363 2.966 2.466 1.815 0.421 -5 ,4910 ,KEBNE ,16690776,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:26:26 CET,0.0 1.121 1.656 2.098 2.432 2.74 3.046 3.332 3.836 4.066 4.289 4.232 4.922 5.121 5.503 5.87 6.213 6.383 6.701 6.984 7.405 7.681 7.938 8.303 8.666 9.015 9.346 9.656 10.053 10.441 10.803 11.239 11.661 12.056 12.499 13.002 13.495 14.011 14.55 15.137 15.755 16.406 17.156 17.858 18.577 19.392 20.31 21.218 22.099 22.789 23.05 22.697 22.034 21.246 20.382 19.511 18.716 17.934 17.206 16.427 15.733 15.146 14.583 14.011 13.471 12.964 12.427 11.962 11.556 11.121 10.652 10.252 9.855 9.456 9.134 8.788 8.412 8.013 7.609 7.332 7.047 6.602 6.292 5.976 5.806 5.435 5.035 4.584 4.353 3.638 3.643 3.378 3.103 2.529 2.221 1.907 1.554 1.138 0.642 -0.038 -2.054 -6 ,19396 ,KEBNE ,16690777,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:26:18 CET,0.0 1.235 1.746 2.14 2.499 2.82 3.098 3.349 3.786 3.996 4.209 4.093 4.746 4.927 5.255 5.553 5.854 5.997 6.248 6.492 6.877 7.126 7.359 7.687 7.983 8.259 8.546 8.838 9.206 9.553 9.878 10.269 10.64 10.982 11.387 11.879 12.351 12.849 13.388 13.94 14.496 15.096 15.78 16.436 17.155 18.001 18.952 19.846 20.729 21.57 22.188 22.067 21.505 20.831 20.139 19.425 18.711 17.994 17.389 16.767 16.183 15.634 15.093 14.574 14.055 13.547 13.011 12.536 12.11 11.652 11.152 10.754 10.346 9.9 9.569 9.225 8.859 8.492 8.108 7.833 7.557 7.109 6.794 6.477 6.309 5.956 5.579 5.196 4.997 4.305 4.341 4.111 3.853 3.267 2.934 2.575 2.183 1.756 1.281 0.634 -0.964 -7 ,3550 ,KEBNE ,16690778,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:25:09 CET,0.0 0.898 1.372 1.772 2.14 2.448 2.726 2.992 3.46 3.669 3.867 3.768 4.424 4.6 4.946 5.307 5.646 5.802 6.095 6.38 6.795 7.063 7.33 7.7 8.063 8.423 8.747 9.045 9.42 9.801 10.192 10.631 11.035 11.428 11.88 12.365 12.811 13.286 13.809 14.383 14.965 15.633 16.391 17.13 17.938 18.72 19.659 20.565 21.395 22.327 22.88 22.671 22.199 21.599 20.889 20.1 19.352 18.69 18.105 17.456 16.841 16.305 15.836 15.387 14.893 14.446 13.998 13.562 13.174 12.75 12.302 11.906 11.483 11.046 10.703 10.353 10.0 9.637 9.235 8.959 8.681 8.241 7.941 7.615 7.441 7.072 6.669 6.263 6.061 5.378 5.403 5.172 4.912 4.344 4.051 3.734 3.401 3.016 2.565 2.041 0.489 -8 ,22343 ,KEBNE ,16690054,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:01:08 CET,0.0 1.281 1.851 2.316 2.718 3.065 3.365 3.646 4.154 4.401 4.642 4.606 5.308 5.516 5.903 6.273 6.621 6.776 7.063 7.362 7.801 8.079 8.344 8.722 9.1 9.473 9.813 10.123 10.516 10.878 11.228 11.655 12.05 12.42 12.862 13.379 13.874 14.403 14.94 15.474 16.04 16.674 17.385 18.062 18.787 19.575 20.445 21.338 22.287 23.135 23.634 23.484 22.874 22.021 21.196 20.446 19.717 19.022 18.4 17.762 17.155 16.607 16.121 15.665 15.223 14.804 14.354 13.94 13.572 13.188 12.781 12.433 12.062 11.657 11.338 11.029 10.719 10.364 9.983 9.73 9.47 9.031 8.679 8.293 8.096 7.687 7.235 6.751 6.504 5.775 5.742 5.455 5.141 4.426 4.041 3.636 3.209 2.771 2.242 1.545 0.236 -9 ,31698 ,KEBNE ,16690055,Thu Nov 25 07:59:47 CET,Thu Nov 25 08:01:04 CET,0.0 1.284 1.787 2.212 2.556 2.841 3.105 3.346 3.849 4.08 4.274 4.187 4.857 5.036 5.39 5.743 6.069 6.223 6.512 6.793 7.205 7.479 7.755 8.152 8.521 8.872 9.224 9.565 9.981 10.374 10.767 11.258 11.727 12.165 12.673 13.268 13.802 14.33 14.876 15.442 16.035 16.681 17.385 18.07 18.848 19.644 20.515 21.363 22.18 22.881 23.232 23.024 22.372 21.515 20.628 19.758 18.951 18.216 17.561 16.926 16.359 15.798 15.264 14.752 14.257 13.805 13.309 12.86 12.459 12.025 11.568 11.167 10.752 10.347 10.036 9.682 9.31 8.94 8.552 8.288 7.995 7.499 7.173 6.843 6.676 6.326 5.954 5.558 5.35 4.666 4.657 4.399 4.126 3.565 3.272 2.942 2.563 2.161 1.707 1.134 -0.543 -10 ,24054 ,KEBNE ,16690781,Thu Nov 25 08:26:14 CET,Thu Nov 25 10:27:23 CET,0.0 1.112 1.663 2.126 2.502 2.849 3.183 3.474 3.986 4.234 4.473 4.43 5.129 5.332 5.72 6.088 6.432 6.601 6.926 7.232 7.684 7.979 8.261 8.66 9.021 9.364 9.702 10.017 10.393 10.743 11.083 11.5 11.898 12.278 12.706 13.175 13.628 14.114 14.627 15.178 15.758 16.423 17.196 17.921 18.709 19.474 20.177 20.905 21.644 22.162 22.235 21.758 20.954 20.03 19.132 18.267 17.494 16.761 16.124 15.49 14.938 14.418 13.877 13.375 12.89 12.411 11.877 11.395 10.996 10.583 10.141 9.752 9.352 8.949 8.643 8.309 7.957 7.585 7.184 6.904 6.595 6.115 5.793 5.466 5.292 4.914 4.534 4.113 3.881 3.16 3.144 2.895 2.63 2.049 1.731 1.382 1.006 0.554 0.023 -0.632 -2.346 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23468.txt deleted file mode 100644 index fbfa378b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7187 ,KEBNE ,17025053,Wed Dec 22 11:39:46 CET,Wed Dec 22 13:38:10 CET,0.0 1.645 2.218 2.697 3.107 3.457 3.766 4.047 4.6 4.857 5.081 4.997 5.658 5.845 6.184 6.507 6.805 6.952 7.234 7.497 7.882 8.125 8.347 8.638 8.914 9.193 9.455 9.7 10.003 10.278 10.532 10.834 11.157 11.485 11.799 12.096 12.373 12.671 12.97 13.261 13.577 13.919 14.27 14.587 14.898 15.143 15.316 15.453 15.41 14.916 13.646 11.782 10.103 8.616 7.264 5.961 4.811 3.756 2.851 1.955 1.15 0.457 -0.212 -0.885 -1.539 -2.147 -2.757 -3.291 -3.76 -4.252 -4.773 -5.209 -5.663 -6.14 -6.515 -6.912 -7.338 -7.799 -8.303 -8.638 -8.966 -9.498 -9.872 -10.239 -10.43 -10.857 -11.327 -11.849 -12.119 -12.899 -13.027 -13.347 -13.666 -14.37 -14.773 -15.211 -15.728 -16.289 -16.92 -17.777 -20.426 -2 ,1778 ,KEBNE ,17025054,Wed Dec 22 11:39:46 CET,Wed Dec 22 13:37:42 CET,0.0 1.905 2.546 3.005 3.375 3.703 4.001 4.268 4.75 4.979 5.195 5.105 5.781 5.979 6.349 6.694 7.019 7.164 7.44 7.714 8.098 8.334 8.567 8.907 9.215 9.503 9.771 10.031 10.383 10.713 11.008 11.365 11.707 12.012 12.349 12.71 13.042 13.383 13.718 14.084 14.457 14.799 15.115 15.392 15.67 15.872 15.992 16.014 15.816 15.246 13.957 12.035 10.288 8.743 7.359 6.104 5.001 3.977 3.057 2.105 1.3 0.571 -0.179 -0.898 -1.536 -2.146 -2.806 -3.404 -3.91 -4.419 -4.938 -5.372 -5.854 -6.358 -6.731 -7.131 -7.556 -7.986 -8.449 -8.773 -9.1 -9.62 -10.006 -10.417 -10.631 -11.084 -11.574 -12.069 -12.33 -13.09 -13.155 -13.441 -13.744 -14.431 -14.842 -15.317 -15.832 -16.419 -17.13 -18.193 -21.064 -3 ,9305 ,KEBNE ,17025055,Wed Dec 22 11:39:46 CET,Wed Dec 22 13:37:11 CET,0.0 1.316 1.988 2.529 2.971 3.313 3.612 3.88 4.317 4.527 4.739 4.65 5.31 5.485 5.806 6.104 6.401 6.553 6.842 7.102 7.465 7.715 7.988 8.392 8.769 9.122 9.484 9.852 10.301 10.727 11.112 11.485 11.801 12.111 12.493 12.9 13.242 13.589 13.95 14.302 14.641 14.988 15.333 15.61 15.864 16.109 16.26 16.266 16.1 15.548 14.184 12.262 10.478 8.8 7.321 6.04 4.973 4.026 3.083 2.086 1.265 0.546 -0.137 -0.827 -1.487 -2.091 -2.742 -3.325 -3.81 -4.319 -4.872 -5.32 -5.776 -6.278 -6.673 -7.07 -7.519 -8.004 -8.476 -8.796 -9.131 -9.669 -10.043 -10.42 -10.615 -11.045 -11.528 -12.038 -12.303 -13.072 -13.115 -13.429 -13.764 -14.531 -15.024 -15.522 -16.009 -16.569 -17.236 -18.126 -21.215 -4 ,23221 ,KEBNE ,17025056,Wed Dec 22 11:39:45 CET,Wed Dec 22 13:37:37 CET,0.0 1.899 2.53 2.98 3.35 3.696 4.013 4.302 4.847 5.103 5.343 5.305 5.994 6.19 6.559 6.892 7.183 7.319 7.59 7.85 8.225 8.456 8.671 8.989 9.309 9.605 9.866 10.12 10.439 10.74 11.025 11.355 11.661 11.933 12.255 12.629 12.963 13.306 13.65 13.984 14.304 14.655 15.047 15.372 15.668 15.947 16.135 16.134 15.978 15.467 14.132 12.175 10.4 8.788 7.377 6.1 4.918 3.815 2.85 1.89 1.034 0.251 -0.513 -1.225 -1.886 -2.508 -3.166 -3.756 -4.253 -4.756 -5.268 -5.697 -6.174 -6.676 -7.055 -7.454 -7.886 -8.33 -8.783 -9.103 -9.44 -9.977 -10.338 -10.705 -10.902 -11.323 -11.761 -12.239 -12.507 -13.277 -13.39 -13.715 -14.063 -14.781 -15.164 -15.608 -16.102 -16.689 -17.366 -18.184 -20.961 -5 ,32181 ,KEBNE ,17025057,Wed Dec 22 11:39:46 CET,Wed Dec 22 13:36:49 CET,0.0 2.158 2.857 3.37 3.762 4.116 4.434 4.732 5.259 5.488 5.698 5.616 6.283 6.46 6.806 7.138 7.449 7.595 7.87 8.137 8.525 8.768 8.993 9.317 9.624 9.913 10.19 10.451 10.776 11.085 11.385 11.733 12.059 12.347 12.662 13.02 13.35 13.691 14.053 14.437 14.791 15.16 15.553 15.881 16.204 16.448 16.602 16.653 16.522 15.943 14.569 12.602 10.775 9.099 7.645 6.332 5.141 4.054 3.108 2.168 1.346 0.619 -0.096 -0.784 -1.423 -2.031 -2.664 -3.235 -3.737 -4.257 -4.802 -5.283 -5.792 -6.305 -6.689 -7.077 -7.514 -7.975 -8.46 -8.797 -9.148 -9.702 -10.076 -10.494 -10.705 -11.119 -11.579 -12.069 -12.327 -13.091 -13.152 -13.457 -13.794 -14.555 -14.993 -15.436 -15.894 -16.475 -17.165 -18.016 -21.368 -6 ,893 ,KEBNE ,17025058,Wed Dec 22 11:39:46 CET,Wed Dec 22 13:38:07 CET,0.0 1.821 2.464 2.977 3.393 3.757 4.071 4.345 4.837 5.087 5.351 5.335 6.026 6.232 6.581 6.898 7.198 7.334 7.601 7.872 8.238 8.454 8.663 8.978 9.266 9.541 9.805 10.044 10.352 10.639 10.912 11.257 11.574 11.855 12.154 12.481 12.788 13.09 13.398 13.689 13.969 14.271 14.596 14.886 15.149 15.354 15.552 15.662 15.552 15.07 13.87 12.033 10.296 8.763 7.357 6.027 4.851 3.806 2.856 1.88 1.068 0.334 -0.381 -1.039 -1.648 -2.218 -2.812 -3.336 -3.801 -4.302 -4.821 -5.281 -5.784 -6.298 -6.692 -7.088 -7.489 -7.914 -8.368 -8.674 -8.997 -9.528 -9.898 -10.278 -10.485 -10.939 -11.404 -11.881 -12.14 -12.916 -12.967 -13.251 -13.554 -14.228 -14.596 -15.0 -15.476 -15.989 -16.619 -17.506 -19.728 -7 ,31485 ,KEBNE ,17025059,Wed Dec 22 11:39:46 CET,Wed Dec 22 13:37:38 CET,0.0 1.893 2.5 2.993 3.422 3.806 4.152 4.457 4.99 5.24 5.481 5.443 6.113 6.3 6.667 7.007 7.318 7.47 7.772 8.064 8.474 8.736 8.984 9.329 9.642 9.926 10.19 10.444 10.762 11.052 11.318 11.625 11.934 12.241 12.573 12.893 13.195 13.537 13.905 14.286 14.677 15.06 15.362 15.584 15.801 15.945 15.985 15.866 15.51 14.881 13.479 11.291 9.347 7.714 6.212 4.792 3.539 2.414 1.456 0.478 -0.368 -1.125 -1.831 -2.496 -3.134 -3.709 -4.322 -4.879 -5.359 -5.871 -6.412 -6.861 -7.352 -7.862 -8.237 -8.625 -9.028 -9.438 -9.883 -10.199 -10.54 -11.095 -11.466 -11.856 -12.061 -12.489 -12.942 -13.44 -13.712 -14.487 -14.582 -14.908 -15.242 -15.973 -16.387 -16.836 -17.363 -18.023 -18.781 -19.692 -23.258 -8 ,4775 ,KEBNE ,17025060,Wed Dec 22 11:39:45 CET,Wed Dec 22 13:36:37 CET,0.0 1.462 2.02 2.46 2.824 3.125 3.392 3.653 4.125 4.345 4.564 4.475 5.144 5.331 5.674 5.999 6.305 6.45 6.753 7.048 7.462 7.731 7.984 8.314 8.617 8.902 9.17 9.448 9.788 10.097 10.405 10.779 11.131 11.458 11.8 12.14 12.485 12.861 13.21 13.533 13.856 14.214 14.604 14.928 15.184 15.362 15.464 15.447 15.239 14.659 13.249 11.122 9.26 7.639 6.155 4.749 3.45 2.21 1.14 0.049 -0.943 -1.811 -2.623 -3.408 -4.139 -4.853 -5.603 -6.256 -6.833 -7.467 -8.134 -8.648 -9.197 -9.766 -10.189 -10.624 -11.085 -11.59 -12.106 -12.46 -12.822 -13.376 -13.774 -14.184 -14.4 -14.881 -15.382 -15.872 -16.138 -16.898 -16.92 -17.203 -17.486 -18.147 -18.557 -18.998 -19.468 -20.023 -20.645 -21.463 -23.928 -9 ,10494 ,KEBNE ,17025061,Wed Dec 22 11:40:47 CET,Wed Dec 22 13:38:21 CET,0.0 1.814 2.43 2.866 3.263 3.605 3.908 4.191 4.685 4.911 5.123 5.024 5.696 5.876 6.2 6.498 6.805 6.96 7.236 7.482 7.823 8.037 8.244 8.541 8.82 9.102 9.385 9.659 10.009 10.335 10.66 11.054 11.403 11.73 12.097 12.496 12.839 13.168 13.515 13.857 14.169 14.474 14.795 15.076 15.328 15.531 15.676 15.729 15.604 15.147 14.007 12.29 10.69 9.188 7.808 6.521 5.305 4.135 3.157 2.215 1.391 0.64 -0.104 -0.801 -1.449 -2.051 -2.67 -3.24 -3.763 -4.304 -4.848 -5.312 -5.789 -6.263 -6.63 -7.024 -7.439 -7.869 -8.329 -8.645 -8.966 -9.497 -9.902 -10.318 -10.53 -10.974 -11.427 -11.924 -12.183 -12.94 -13.013 -13.326 -13.65 -14.315 -14.694 -15.138 -15.673 -16.354 -17.221 -18.444 -23.293 -10 ,7245 ,KEBNE ,17025062,Wed Dec 22 11:40:47 CET,Wed Dec 22 13:37:37 CET,0.0 1.683 2.333 2.812 3.242 3.602 3.935 4.247 4.794 5.044 5.264 5.198 5.877 6.056 6.421 6.778 7.1 7.247 7.513 7.759 8.145 8.392 8.61 8.924 9.218 9.528 9.843 10.124 10.469 10.783 11.055 11.376 11.699 11.998 12.318 12.687 13.047 13.417 13.769 14.135 14.508 14.882 15.271 15.597 15.942 16.256 16.443 16.524 16.452 16.029 14.775 12.738 10.897 9.305 7.907 6.582 5.355 4.236 3.27 2.266 1.362 0.533 -0.262 -1.049 -1.769 -2.37 -3.0 -3.599 -4.14 -4.689 -5.276 -5.794 -6.361 -6.932 -7.343 -7.758 -8.188 -8.65 -9.134 -9.472 -9.826 -10.39 -10.774 -11.184 -11.4 -11.835 -12.318 -12.878 -13.177 -13.97 -14.055 -14.372 -14.705 -15.438 -15.865 -16.359 -16.944 -17.705 -18.681 -20.027 -25.743 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23471.txt deleted file mode 100644 index 38134424..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23469_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14665 ,KEBNE ,16690057,Thu Nov 25 07:59:47 CET,Thu Nov 25 08:01:03 CET,0.0 3.859 4.839 5.462 5.9 6.291 6.642 6.956 7.506 7.744 7.968 7.906 8.586 8.769 9.125 9.46 9.79 9.952 10.237 10.492 10.862 11.104 11.341 11.681 12.025 12.354 12.645 12.912 13.242 13.551 13.836 14.167 14.468 14.743 15.061 15.389 15.65 15.909 16.179 16.413 16.634 16.872 17.072 17.165 17.212 17.212 16.98 16.452 15.579 14.08 11.38 7.989 5.175 2.834 0.87 -0.887 -2.458 -3.876 -5.069 -6.267 -7.331 -8.329 -9.266 -10.097 -10.869 -11.568 -12.284 -12.92 -13.493 -14.089 -14.713 -15.232 -15.784 -16.369 -16.811 -17.257 -17.729 -18.246 -18.779 -19.154 -19.532 -20.104 -20.499 -20.882 -21.083 -21.533 -22.016 -22.545 -22.825 -23.606 -23.724 -24.065 -24.415 -25.254 -25.721 -26.207 -26.726 -27.305 -28.026 -29.053 -32.52 -2 ,24542 ,KEBNE ,16690783,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:23:16 CET,0.0 1.173 1.717 2.112 2.467 2.791 3.078 3.341 3.804 4.013 4.21 4.103 4.774 4.941 5.27 5.605 5.911 6.054 6.328 6.582 6.951 7.186 7.408 7.725 8.036 8.32 8.582 8.848 9.193 9.497 9.757 10.078 10.403 10.713 11.048 11.403 11.73 12.064 12.401 12.726 13.037 13.34 13.679 13.964 14.177 14.31 14.307 14.119 13.493 12.246 9.914 6.646 3.769 1.399 -0.726 -2.606 -4.173 -5.553 -6.709 -7.922 -9.053 -10.087 -11.077 -12.012 -12.884 -13.68 -14.509 -15.242 -15.875 -16.533 -17.232 -17.817 -18.416 -19.018 -19.478 -19.98 -20.513 -21.057 -21.604 -21.983 -22.388 -23.03 -23.47 -23.905 -24.126 -24.6 -25.119 -25.669 -25.952 -26.771 -26.877 -27.206 -27.549 -28.254 -28.638 -29.083 -29.622 -30.246 -30.951 -31.822 -34.613 -3 ,27610 ,KEBNE ,16690059,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:01:07 CET,0.0 1.65 2.399 2.966 3.419 3.796 4.125 4.436 5.003 5.254 5.483 5.439 6.117 6.314 6.678 7.004 7.317 7.466 7.744 7.995 8.364 8.595 8.8 9.088 9.376 9.661 9.934 10.179 10.479 10.765 11.031 11.322 11.584 11.828 12.092 12.353 12.586 12.832 13.065 13.299 13.498 13.658 13.814 13.91 13.91 13.8 13.556 13.105 12.248 10.724 7.952 4.549 1.735 -0.662 -2.678 -4.395 -5.857 -7.224 -8.426 -9.623 -10.626 -11.517 -12.401 -13.244 -14.016 -14.73 -15.492 -16.158 -16.746 -17.377 -18.039 -18.594 -19.172 -19.793 -20.309 -20.833 -21.338 -21.879 -22.449 -22.832 -23.233 -23.893 -24.349 -24.816 -25.058 -25.554 -26.089 -26.677 -26.995 -27.817 -27.977 -28.326 -28.676 -29.482 -29.933 -30.398 -30.916 -31.534 -32.277 -33.248 -36.723 -4 ,29103 ,KEBNE ,16690060,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:01:05 CET,0.0 1.197 1.846 2.36 2.809 3.212 3.576 3.909 4.454 4.664 4.872 4.785 5.458 5.644 6.033 6.404 6.75 6.919 7.249 7.545 7.927 8.16 8.381 8.697 9.025 9.326 9.572 9.797 10.078 10.34 10.577 10.848 11.081 11.307 11.584 11.864 12.11 12.355 12.58 12.798 13.007 13.167 13.305 13.382 13.407 13.358 13.104 12.72 12.1 10.892 8.612 5.659 3.213 1.104 -0.804 -2.558 -4.11 -5.514 -6.705 -7.902 -8.94 -9.866 -10.747 -11.579 -12.378 -13.098 -13.845 -14.518 -15.115 -15.788 -16.456 -16.964 -17.499 -18.034 -18.44 -18.878 -19.349 -19.84 -20.372 -20.772 -21.179 -21.781 -22.196 -22.639 -22.879 -23.377 -23.872 -24.388 -24.659 -25.445 -25.557 -25.897 -26.225 -26.919 -27.337 -27.793 -28.285 -28.891 -29.671 -30.826 -34.88 -5 ,8834 ,KEBNE ,16690786,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:22:28 CET,0.0 1.503 2.184 2.739 3.17 3.534 3.862 4.167 4.685 4.901 5.102 4.978 5.626 5.792 6.097 6.386 6.648 6.764 6.988 7.201 7.506 7.699 7.875 8.118 8.354 8.604 8.835 9.033 9.301 9.573 9.837 10.125 10.372 10.601 10.851 11.108 11.352 11.6 11.84 12.095 12.322 12.507 12.676 12.799 12.872 12.839 12.631 12.242 11.458 10.001 7.372 4.064 1.251 -1.111 -3.105 -4.927 -6.532 -7.917 -9.096 -10.283 -11.299 -12.234 -13.141 -13.978 -14.785 -15.543 -16.331 -17.035 -17.617 -18.218 -18.869 -19.421 -19.985 -20.57 -21.04 -21.511 -21.983 -22.491 -23.04 -23.415 -23.786 -24.379 -24.8 -25.232 -25.462 -25.933 -26.413 -26.945 -27.237 -28.041 -28.145 -28.487 -28.818 -29.572 -30.024 -30.521 -31.051 -31.681 -32.432 -33.398 -36.328 -6 ,22966 ,KEBNE ,16690787,Thu Nov 25 08:26:14 CET,Thu Nov 25 10:25:31 CET,0.0 1.822 2.54 3.048 3.485 3.871 4.193 4.477 4.987 5.23 5.461 5.403 6.085 6.267 6.618 6.984 7.331 7.484 7.765 8.028 8.399 8.626 8.844 9.143 9.418 9.701 9.974 10.214 10.504 10.779 11.041 11.343 11.593 11.816 12.091 12.378 12.628 12.883 13.143 13.399 13.623 13.845 14.044 14.191 14.321 14.347 14.228 13.916 13.207 11.914 9.608 6.609 4.041 1.853 -0.062 -1.802 -3.329 -4.773 -6.015 -7.219 -8.268 -9.167 -9.999 -10.814 -11.588 -12.276 -12.99 -13.65 -14.229 -14.848 -15.502 -16.063 -16.638 -17.205 -17.676 -18.193 -18.721 -19.24 -19.78 -20.148 -20.529 -21.141 -21.561 -22.02 -22.257 -22.721 -23.193 -23.678 -23.933 -24.71 -24.82 -25.159 -25.524 -26.325 -26.782 -27.286 -27.81 -28.396 -29.105 -30.114 -33.439 -7 ,769 ,KEBNE ,16690788,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:21:57 CET,0.0 1.596 2.253 2.759 3.168 3.494 3.77 4.016 4.455 4.647 4.822 4.691 5.346 5.508 5.804 6.066 6.31 6.441 6.688 6.912 7.224 7.411 7.584 7.827 8.06 8.295 8.516 8.716 8.954 9.178 9.41 9.68 9.929 10.16 10.395 10.634 10.864 11.094 11.29 11.501 11.722 11.937 12.15 12.281 12.373 12.369 12.18 11.813 11.057 9.668 7.111 3.752 0.994 -1.324 -3.314 -5.14 -6.81 -8.318 -9.627 -10.969 -12.118 -13.139 -14.104 -14.996 -15.809 -16.558 -17.351 -18.042 -18.633 -19.239 -19.875 -20.413 -20.956 -21.521 -21.983 -22.462 -22.938 -23.418 -23.923 -24.283 -24.656 -25.236 -25.653 -26.087 -26.304 -26.747 -27.235 -27.741 -27.99 -28.76 -28.853 -29.183 -29.525 -30.276 -30.681 -31.087 -31.483 -31.969 -32.614 -33.447 -37.271 -8 ,21052 ,KEBNE ,16690064,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:00:55 CET,0.0 1.563 2.209 2.686 3.121 3.53 3.896 4.236 4.867 5.147 5.375 5.31 5.993 6.186 6.552 6.88 7.185 7.333 7.625 7.898 8.277 8.52 8.74 9.049 9.361 9.645 9.922 10.192 10.501 10.769 11.026 11.348 11.63 11.9 12.218 12.543 12.814 13.083 13.365 13.636 13.878 14.12 14.364 14.553 14.694 14.754 14.677 14.42 13.829 12.605 10.253 7.22 4.664 2.465 0.543 -1.146 -2.669 -4.073 -5.282 -6.556 -7.648 -8.563 -9.417 -10.228 -11.037 -11.774 -12.518 -13.22 -13.811 -14.423 -15.076 -15.618 -16.162 -16.736 -17.207 -17.693 -18.192 -18.703 -19.245 -19.622 -19.995 -20.565 -20.987 -21.439 -21.671 -22.155 -22.644 -23.164 -23.457 -24.276 -24.448 -24.819 -25.211 -26.103 -26.589 -27.085 -27.682 -28.361 -29.109 -30.088 -32.798 -9 ,21647 ,KEBNE ,16690790,Thu Nov 25 08:26:14 CET,Thu Nov 25 10:24:57 CET,0.0 1.676 2.378 2.923 3.35 3.726 4.081 4.393 4.94 5.182 5.404 5.347 6.004 6.183 6.528 6.83 7.121 7.263 7.54 7.811 8.184 8.406 8.602 8.884 9.179 9.449 9.681 9.891 10.157 10.432 10.703 11.002 11.263 11.515 11.815 12.126 12.396 12.651 12.909 13.196 13.508 13.791 14.039 14.263 14.436 14.506 14.417 14.091 13.466 12.285 9.946 6.947 4.435 2.224 0.291 -1.46 -3.014 -4.414 -5.63 -6.846 -7.883 -8.833 -9.734 -10.579 -11.359 -12.085 -12.84 -13.495 -14.06 -14.653 -15.296 -15.836 -16.386 -16.977 -17.452 -17.951 -18.446 -18.944 -19.529 -19.958 -20.394 -21.059 -21.49 -21.892 -22.109 -22.582 -23.115 -23.687 -23.979 -24.824 -24.999 -25.358 -25.736 -26.56 -27.02 -27.544 -28.133 -28.754 -29.511 -30.539 -33.368 -10 ,16106 ,KEBNE ,16690066,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:00:56 CET,0.0 2.015 2.728 3.233 3.667 4.068 4.424 4.752 5.316 5.55 5.766 5.717 6.385 6.576 6.921 7.231 7.53 7.682 7.973 8.239 8.593 8.813 9.033 9.35 9.655 9.934 10.198 10.453 10.771 11.075 11.351 11.66 11.937 12.191 12.464 12.726 12.958 13.185 13.381 13.558 13.72 13.845 13.956 14.035 14.016 13.888 13.642 13.148 12.273 10.778 8.029 4.654 1.844 -0.558 -2.606 -4.461 -6.035 -7.396 -8.573 -9.77 -10.818 -11.761 -12.684 -13.564 -14.373 -15.077 -15.805 -16.521 -17.163 -17.827 -18.526 -19.072 -19.6 -20.15 -20.592 -21.059 -21.578 -22.156 -22.742 -23.146 -23.57 -24.207 -24.655 -25.144 -25.4 -25.915 -26.46 -27.064 -27.385 -28.212 -28.429 -28.815 -29.21 -30.052 -30.503 -31.015 -31.599 -32.25 -33.009 -34.053 -37.456 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23468.txt deleted file mode 100644 index 16bc8c43..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13506 ,KEBNE ,16690792,Thu Nov 25 08:26:17 CET,Thu Nov 25 10:18:01 CET,0.0 1.628 2.362 2.941 3.445 3.884 4.274 4.657 5.345 5.66 5.96 5.981 6.827 7.098 7.607 8.074 8.524 8.741 9.157 9.562 10.144 10.519 10.887 11.419 11.91 12.368 12.816 13.268 13.861 14.447 15.01 15.656 16.296 16.928 17.695 18.521 19.253 20.07 20.99 21.95 22.913 24.028 25.347 26.671 28.219 29.996 32.118 34.562 37.385 40.735 44.972 48.69 50.923 52.361 53.275 53.899 54.319 54.553 54.665 54.679 54.622 54.556 54.466 54.357 54.244 54.098 53.87 53.62 53.394 53.13 52.856 52.634 52.39 52.104 51.849 51.554 51.225 50.896 50.569 50.311 50.035 49.609 49.291 48.988 48.831 48.476 48.066 47.638 47.428 46.685 46.729 46.501 46.275 45.667 45.299 44.905 44.45 43.964 43.378 42.614 40.572 -2 ,13272 ,KEBNE ,16690068,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:01:01 CET,0.0 1.083 1.687 2.191 2.615 3.001 3.369 3.72 4.37 4.679 4.969 4.967 5.766 6.014 6.498 6.937 7.373 7.59 8.001 8.407 9.012 9.385 9.738 10.27 10.783 11.271 11.749 12.219 12.812 13.392 13.956 14.584 15.169 15.756 16.454 17.249 17.973 18.737 19.608 20.554 21.528 22.625 23.952 25.32 26.9 28.668 30.75 33.177 36.061 39.553 43.975 47.769 49.929 51.323 52.273 52.976 53.441 53.73 53.932 54.062 54.114 54.102 54.013 53.886 53.752 53.588 53.378 53.162 52.973 52.764 52.53 52.314 52.056 51.764 51.52 51.275 51.0 50.673 50.323 50.084 49.828 49.411 49.12 48.809 48.65 48.32 47.977 47.619 47.424 46.7 46.715 46.478 46.212 45.581 45.222 44.833 44.443 44.021 43.443 42.631 40.247 -3 ,9163 ,KEBNE ,16690794,Thu Nov 25 08:26:21 CET,Thu Nov 25 10:18:59 CET,0.0 1.295 1.982 2.49 2.913 3.288 3.628 3.946 4.561 4.866 5.166 5.17 5.952 6.188 6.641 7.066 7.476 7.679 8.062 8.439 9.0 9.353 9.695 10.18 10.649 11.121 11.594 12.034 12.603 13.166 13.688 14.312 14.919 15.505 16.207 17.042 17.824 18.618 19.47 20.404 21.41 22.561 23.89 25.203 26.738 28.486 30.59 33.011 35.84 39.315 43.786 47.543 49.735 51.188 52.144 52.801 53.229 53.477 53.558 53.465 53.32 53.188 53.017 52.84 52.66 52.454 52.266 52.105 51.922 51.707 51.46 51.225 50.967 50.687 50.452 50.193 49.924 49.653 49.362 49.148 48.932 48.632 48.391 48.116 47.968 47.642 47.309 46.925 46.729 46.037 46.046 45.798 45.546 44.936 44.572 44.159 43.697 43.191 42.555 41.657 38.662 -4 ,25859 ,KEBNE ,16690070,Thu Nov 25 07:59:47 CET,Thu Nov 25 08:00:49 CET,0.0 1.555 2.126 2.615 3.098 3.524 3.918 4.277 4.866 5.143 5.42 5.408 6.189 6.432 6.912 7.359 7.773 7.991 8.428 8.822 9.359 9.7 10.039 10.552 11.05 11.537 12.013 12.454 13.04 13.64 14.168 14.769 15.405 16.051 16.743 17.483 18.243 19.143 20.103 21.05 22.034 23.121 24.41 25.698 27.206 28.918 30.884 33.159 35.93 39.29 43.479 47.112 49.311 50.692 51.578 52.163 52.525 52.735 52.799 52.781 52.721 52.61 52.481 52.358 52.202 51.976 51.667 51.438 51.293 51.102 50.825 50.562 50.281 50.001 49.781 49.538 49.268 48.976 48.652 48.429 48.201 47.818 47.559 47.285 47.133 46.793 46.43 46.052 45.851 45.164 45.25 45.013 44.733 44.085 43.706 43.312 42.911 42.476 41.925 41.166 38.895 -5 ,11394 ,KEBNE ,16690796,Thu Nov 25 08:26:18 CET,Thu Nov 25 10:18:52 CET,0.0 1.21 1.923 2.477 2.913 3.3 3.681 4.054 4.737 5.049 5.356 5.392 6.195 6.467 6.975 7.454 7.936 8.169 8.614 9.045 9.678 10.086 10.483 11.062 11.631 12.159 12.617 13.08 13.708 14.292 14.874 15.589 16.253 16.839 17.485 18.276 19.074 19.959 20.931 21.916 22.92 24.081 25.439 26.83 28.444 30.206 32.234 34.568 37.402 40.932 45.307 48.934 51.162 52.627 53.606 54.292 54.721 54.962 55.09 55.162 55.154 55.124 55.036 54.88 54.677 54.47 54.27 54.077 53.913 53.675 53.35 53.081 52.8 52.52 52.302 52.065 51.8 51.505 51.212 50.995 50.748 50.367 50.097 49.81 49.652 49.325 48.985 48.617 48.411 47.695 47.754 47.511 47.248 46.657 46.344 45.996 45.562 45.066 44.503 43.736 41.7 -6 ,27682 ,KEBNE ,16690797,Thu Nov 25 08:26:17 CET,Thu Nov 25 10:18:52 CET,0.0 0.886 1.442 1.947 2.374 2.741 3.085 3.408 4.013 4.307 4.597 4.633 5.444 5.708 6.214 6.717 7.191 7.406 7.817 8.219 8.797 9.177 9.542 10.068 10.586 11.075 11.532 11.976 12.574 13.142 13.694 14.375 15.023 15.662 16.369 17.12 17.831 18.651 19.566 20.488 21.441 22.52 23.802 25.13 26.665 28.424 30.534 32.948 35.812 39.252 43.583 47.332 49.55 50.936 51.8 52.32 52.652 52.878 52.988 53.039 53.031 52.95 52.822 52.691 52.536 52.37 52.172 51.962 51.762 51.538 51.296 51.076 50.827 50.552 50.329 50.094 49.816 49.508 49.216 49.008 48.779 48.419 48.163 47.895 47.75 47.431 47.092 46.745 46.563 45.88 45.909 45.662 45.407 44.841 44.526 44.17 43.746 43.237 42.649 41.853 39.556 -7 ,1730 ,KEBNE ,16690073,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:01:10 CET,0.0 1.223 1.876 2.375 2.822 3.237 3.625 3.98 4.642 4.941 5.211 5.175 5.969 6.21 6.66 7.083 7.5 7.708 8.121 8.508 9.052 9.411 9.774 10.315 10.827 11.31 11.778 12.214 12.77 13.344 13.904 14.586 15.254 15.869 16.579 17.398 18.159 18.996 19.926 20.882 21.858 22.971 24.293 25.633 27.198 28.982 31.079 33.491 36.329 39.692 43.939 47.65 49.912 51.385 52.366 53.048 53.513 53.717 53.716 53.612 53.442 53.224 52.997 52.791 52.564 52.33 52.077 51.827 51.608 51.378 51.088 50.823 50.537 50.209 49.939 49.667 49.383 49.062 48.718 48.478 48.22 47.784 47.484 47.193 47.033 46.671 46.293 45.907 45.698 44.957 45.003 44.751 44.461 43.781 43.418 43.028 42.562 42.035 41.388 40.435 37.554 -8 ,3025 ,KEBNE ,16690799,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:20:56 CET,0.0 1.12 1.807 2.37 2.834 3.267 3.651 4.019 4.709 5.024 5.316 5.311 6.11 6.358 6.837 7.284 7.709 7.923 8.337 8.729 9.292 9.644 9.988 10.494 11.003 11.505 11.991 12.453 13.035 13.597 14.143 14.832 15.473 16.062 16.772 17.566 18.335 19.194 20.095 21.048 22.061 23.176 24.503 25.841 27.41 29.204 31.304 33.714 36.646 40.221 44.646 48.379 50.66 52.138 53.09 53.719 54.067 54.239 54.306 54.26 54.182 54.08 53.926 53.74 53.553 53.36 53.158 52.958 52.726 52.449 52.127 51.86 51.589 51.3 51.046 50.766 50.473 50.147 49.811 49.573 49.32 48.918 48.625 48.315 48.158 47.825 47.49 47.127 46.916 46.201 46.229 45.976 45.71 45.127 44.796 44.42 43.993 43.5 42.903 42.063 39.953 -9 ,32366 ,KEBNE ,16690800,Thu Nov 25 08:26:14 CET,Thu Nov 25 10:22:27 CET,0.0 1.277 1.835 2.304 2.748 3.146 3.509 3.858 4.506 4.796 5.086 5.093 5.902 6.157 6.628 7.091 7.543 7.756 8.164 8.562 9.134 9.497 9.85 10.37 10.884 11.37 11.831 12.297 12.886 13.439 13.989 14.648 15.282 15.898 16.597 17.372 18.145 19.011 19.898 20.8 21.755 22.854 24.119 25.417 27.002 28.759 30.83 33.266 36.142 39.616 44.042 47.843 50.119 51.567 52.535 53.21 53.63 53.895 54.057 54.165 54.199 54.186 54.125 54.02 53.864 53.692 53.484 53.247 53.037 52.845 52.634 52.42 52.18 51.908 51.686 51.449 51.188 50.914 50.592 50.341 50.089 49.71 49.424 49.108 48.961 48.667 48.316 47.91 47.699 46.985 47.017 46.773 46.502 45.93 45.617 45.251 44.836 44.331 43.748 42.864 40.789 -10 ,9724 ,KEBNE ,16690076,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:00:59 CET,0.0 1.412 2.041 2.55 2.972 3.361 3.715 4.036 4.666 4.978 5.27 5.265 6.054 6.301 6.795 7.257 7.689 7.905 8.34 8.759 9.358 9.75 10.123 10.653 11.148 11.625 12.087 12.55 13.166 13.747 14.314 15.003 15.643 16.258 16.982 17.803 18.609 19.461 20.36 21.313 22.338 23.542 24.913 26.219 27.755 29.524 31.594 33.962 36.8 40.265 44.661 48.432 50.717 52.249 53.218 53.919 54.451 54.823 55.009 55.119 55.163 55.116 55.017 54.891 54.75 54.594 54.367 54.101 53.856 53.593 53.302 53.044 52.776 52.504 52.293 52.074 51.824 51.527 51.187 50.951 50.724 50.345 50.059 49.762 49.601 49.258 48.902 48.511 48.314 47.612 47.649 47.41 47.159 46.578 46.246 45.861 45.43 44.971 44.47 43.806 41.889 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23471.txt deleted file mode 100644 index afc6cd5e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23470_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5668 ,KEBNE ,16690077,Thu Nov 25 07:59:49 CET,Thu Nov 25 08:01:10 CET,0.0 2.056 2.961 3.627 4.239 4.762 5.209 5.609 6.325 6.639 6.93 6.989 7.83 8.104 8.609 9.1 9.568 9.787 10.212 10.628 11.239 11.634 12.013 12.568 13.079 13.565 14.034 14.453 14.998 15.53 16.03 16.646 17.255 17.859 18.551 19.294 19.987 20.751 21.585 22.49 23.445 24.507 25.755 26.958 28.374 29.969 31.723 33.667 35.876 38.441 41.297 43.429 44.515 44.959 45.11 45.119 44.983 44.742 44.515 44.183 43.797 43.447 43.086 42.75 42.443 42.12 41.758 41.416 41.116 40.8 40.446 40.147 39.818 39.48 39.213 38.916 38.581 38.236 37.903 37.655 37.368 36.907 36.58 36.221 36.036 35.692 35.352 34.953 34.733 33.967 33.953 33.653 33.322 32.596 32.184 31.731 31.252 30.727 30.105 29.28 27.059 -2 ,22477 ,KEBNE ,16690803,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:20:44 CET,0.0 1.08 1.688 2.195 2.638 3.042 3.392 3.721 4.348 4.626 4.893 4.849 5.628 5.855 6.317 6.741 7.14 7.338 7.724 8.08 8.596 8.933 9.249 9.728 10.193 10.628 11.038 11.44 11.965 12.481 12.991 13.578 14.139 14.698 15.378 16.144 16.843 17.592 18.388 19.187 19.983 20.965 22.157 23.319 24.632 25.987 27.517 29.235 31.258 33.627 36.407 38.627 39.826 40.362 40.595 40.689 40.659 40.512 40.301 40.067 39.826 39.576 39.304 39.036 38.748 38.451 38.105 37.766 37.468 37.144 36.745 36.385 36.023 35.633 35.321 34.991 34.643 34.287 33.914 33.658 33.399 32.951 32.612 32.274 32.108 31.756 31.358 30.923 30.699 29.947 29.878 29.556 29.24 28.581 28.21 27.835 27.39 26.855 26.253 25.467 23.843 -3 ,7330 ,KEBNE ,16690079,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:01:06 CET,0.0 1.035 1.612 2.097 2.532 2.945 3.329 3.678 4.291 4.569 4.846 4.807 5.578 5.825 6.289 6.701 7.096 7.289 7.665 8.017 8.523 8.849 9.184 9.671 10.117 10.571 11.017 11.437 11.954 12.448 12.931 13.511 14.072 14.599 15.211 15.917 16.591 17.323 18.124 18.945 19.81 20.824 21.972 23.167 24.497 25.804 27.307 29.018 31.012 33.452 36.369 38.496 39.544 40.096 40.418 40.502 40.391 40.24 40.07 39.851 39.621 39.361 39.07 38.803 38.501 38.133 37.696 37.329 37.016 36.682 36.334 36.03 35.712 35.378 35.098 34.783 34.444 34.073 33.668 33.385 33.102 32.688 32.391 32.056 31.88 31.488 31.053 30.597 30.367 29.616 29.599 29.314 28.965 28.213 27.837 27.428 26.962 26.398 25.724 24.882 22.712 -4 ,1492 ,KEBNE ,16690805,Thu Nov 25 08:26:14 CET,Thu Nov 25 10:22:47 CET,0.0 0.953 1.588 2.059 2.459 2.828 3.19 3.54 4.155 4.431 4.703 4.682 5.48 5.729 6.195 6.639 7.055 7.254 7.65 8.038 8.598 8.953 9.296 9.801 10.288 10.737 11.172 11.592 12.127 12.654 13.155 13.755 14.326 14.852 15.459 16.138 16.791 17.536 18.375 19.294 20.227 21.218 22.346 23.406 24.576 25.911 27.416 29.052 30.963 33.291 36.089 38.293 39.411 40.009 40.279 40.302 40.22 40.093 39.951 39.733 39.44 39.148 38.826 38.487 38.234 38.016 37.679 37.326 36.992 36.628 36.251 35.914 35.572 35.199 34.887 34.587 34.273 33.907 33.508 33.231 32.943 32.468 32.136 31.794 31.617 31.254 30.85 30.401 30.169 29.411 29.359 29.065 28.749 28.039 27.635 27.198 26.751 26.224 25.623 24.856 22.255 -5 ,11778 ,KEBNE ,16690081,Thu Nov 25 07:59:48 CET,Thu Nov 25 08:01:02 CET,0.0 0.781 1.316 1.772 2.189 2.573 2.923 3.251 3.847 4.122 4.393 4.362 5.142 5.384 5.862 6.315 6.743 6.942 7.316 7.673 8.205 8.553 8.897 9.419 9.903 10.349 10.784 11.187 11.692 12.187 12.654 13.223 13.786 14.333 14.924 15.598 16.286 17.029 17.833 18.72 19.605 20.501 21.512 22.556 23.769 25.08 26.577 28.314 30.382 32.743 35.627 37.847 38.92 39.435 39.659 39.661 39.537 39.38 39.137 38.807 38.485 38.119 37.745 37.428 37.145 36.88 36.592 36.296 36.02 35.735 35.436 35.176 34.888 34.577 34.334 34.08 33.789 33.472 33.141 32.899 32.636 32.234 31.961 31.659 31.499 31.144 30.753 30.361 30.161 29.416 29.392 29.121 28.84 28.211 27.842 27.442 27.033 26.575 25.996 25.27 23.057 -6 ,16828 ,KEBNE ,16690807,Thu Nov 25 08:26:13 CET,Thu Nov 25 10:22:25 CET,0.0 0.99 1.57 2.023 2.455 2.846 3.18 3.498 4.087 4.364 4.633 4.58 5.362 5.596 6.04 6.471 6.884 7.09 7.501 7.887 8.427 8.768 9.107 9.611 10.075 10.494 10.895 11.285 11.836 12.376 12.866 13.47 14.066 14.663 15.346 16.06 16.725 17.464 18.276 19.133 20.041 21.013 22.114 23.208 24.381 25.693 27.234 28.994 31.028 33.356 36.135 38.314 39.498 40.083 40.281 40.319 40.236 40.081 39.901 39.656 39.312 38.939 38.658 38.37 38.025 37.696 37.342 36.996 36.677 36.295 35.886 35.554 35.181 34.788 34.486 34.128 33.748 33.387 32.996 32.719 32.425 31.972 31.673 31.355 31.185 30.827 30.413 29.971 29.748 29.013 28.989 28.7 28.387 27.681 27.286 26.869 26.429 25.911 25.263 24.405 22.484 -7 ,29150 ,KEBNE ,16690083,Thu Nov 25 07:59:47 CET,Thu Nov 25 08:00:51 CET,0.0 1.332 1.897 2.353 2.796 3.189 3.536 3.843 4.404 4.682 4.935 4.852 5.617 5.849 6.286 6.7 7.096 7.287 7.657 8.004 8.489 8.804 9.114 9.573 10.031 10.474 10.9 11.306 11.82 12.329 12.825 13.382 13.932 14.49 15.138 15.875 16.557 17.286 18.045 18.836 19.631 20.568 21.729 22.846 24.133 25.494 27.011 28.788 30.859 33.241 36.035 38.183 39.295 39.903 40.234 40.362 40.312 40.153 39.951 39.732 39.505 39.261 38.994 38.681 38.373 38.075 37.69 37.311 36.988 36.694 36.404 36.134 35.827 35.484 35.207 34.895 34.553 34.201 33.824 33.563 33.287 32.818 32.481 32.13 31.946 31.544 31.12 30.66 30.398 29.609 29.552 29.263 28.976 28.343 27.972 27.576 27.146 26.644 26.08 25.355 22.534 -8 ,4405 ,KEBNE ,16690084,Thu Nov 25 08:01:50 CET,Thu Nov 25 08:02:59 CET,0.0 1.122 1.704 2.163 2.568 2.963 3.34 3.683 4.306 4.586 4.854 4.811 5.588 5.822 6.276 6.713 7.139 7.341 7.712 8.073 8.608 8.951 9.291 9.803 10.281 10.728 11.152 11.556 12.081 12.565 13.059 13.702 14.301 14.861 15.507 16.216 16.878 17.611 18.409 19.294 20.206 21.111 22.115 23.12 24.293 25.646 27.278 29.11 31.208 33.59 36.366 38.548 39.69 40.241 40.507 40.566 40.437 40.25 40.072 39.862 39.618 39.37 39.089 38.771 38.422 38.051 37.705 37.423 37.139 36.829 36.475 36.149 35.802 35.444 35.161 34.838 34.519 34.2 33.824 33.56 33.274 32.806 32.498 32.174 32.006 31.672 31.293 30.843 30.6 29.833 29.786 29.49 29.203 28.571 28.213 27.831 27.368 26.775 26.102 25.196 22.879 -9 ,4246 ,KEBNE ,16690085,Thu Nov 25 08:01:49 CET,Thu Nov 25 08:02:50 CET,0.0 0.912 1.512 2.029 2.454 2.827 3.191 3.512 4.097 4.385 4.667 4.66 5.447 5.674 6.108 6.504 6.902 7.105 7.497 7.875 8.413 8.751 9.078 9.564 10.042 10.506 10.949 11.353 11.879 12.413 12.908 13.486 14.037 14.575 15.219 15.935 16.591 17.264 17.996 18.781 19.58 20.468 21.49 22.527 23.717 25.002 26.531 28.287 30.273 32.599 35.377 37.581 38.713 39.318 39.591 39.62 39.562 39.441 39.287 39.055 38.822 38.573 38.275 37.972 37.67 37.374 37.008 36.654 36.326 35.965 35.571 35.222 34.829 34.41 34.101 33.785 33.467 33.149 32.807 32.539 32.255 31.795 31.452 31.102 30.913 30.519 30.118 29.688 29.459 28.702 28.665 28.361 28.046 27.389 27.021 26.614 26.162 25.7 25.134 24.288 22.049 -10 ,24678 ,KEBNE ,16690086,Thu Nov 25 08:01:49 CET,Thu Nov 25 08:02:50 CET,0.0 1.25 1.936 2.42 2.844 3.224 3.571 3.886 4.476 4.747 5.007 5.0 5.785 6.037 6.525 6.965 7.358 7.545 7.913 8.271 8.799 9.142 9.466 9.917 10.358 10.786 11.197 11.588 12.093 12.59 13.079 13.652 14.214 14.752 15.302 15.896 16.52 17.275 18.049 18.794 19.58 20.484 21.594 22.732 24.046 25.508 27.062 28.747 30.731 33.077 35.848 38.081 39.277 39.935 40.269 40.372 40.316 40.175 39.969 39.721 39.456 39.162 38.903 38.629 38.328 38.019 37.619 37.268 36.966 36.604 36.213 35.876 35.509 35.122 34.815 34.495 34.147 33.758 33.348 33.068 32.777 32.309 32.001 31.674 31.493 31.158 30.807 30.383 30.162 29.415 29.419 29.124 28.817 28.177 27.826 27.406 26.958 26.47 25.833 24.926 22.419 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23466.txt deleted file mode 100644 index ce0f6046..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18528 ,KEBNE ,16690087,Thu Nov 25 08:01:51 CET,Thu Nov 25 08:03:11 CET,0.0 0.677 1.051 1.42 1.764 2.071 2.341 2.596 3.067 3.278 3.491 3.414 4.124 4.32 4.697 5.06 5.406 5.578 5.907 6.223 6.695 6.998 7.302 7.764 8.208 8.635 9.024 9.385 9.879 10.374 10.85 11.414 11.943 12.441 13.046 13.723 14.355 15.062 15.811 16.648 17.529 18.512 19.697 20.83 22.193 23.683 25.318 27.216 29.473 32.133 35.352 38.089 39.637 40.543 41.055 41.364 41.498 41.507 41.477 41.427 41.331 41.165 40.934 40.654 40.325 39.988 39.632 39.351 39.068 38.716 38.348 38.031 37.69 37.348 37.079 36.773 36.46 36.13 35.757 35.494 35.213 34.827 34.561 34.214 34.025 33.65 33.254 32.847 32.623 31.886 31.844 31.561 31.248 30.499 30.051 29.576 29.054 28.475 27.785 26.811 22.326 -2 ,27327 ,KEBNE ,16690813,Thu Nov 25 08:29:17 CET,Thu Nov 25 10:18:23 CET,0.0 1.248 1.788 2.263 2.649 2.955 3.233 3.494 4.022 4.269 4.499 4.434 5.162 5.371 5.767 6.131 6.496 6.676 7.027 7.368 7.854 8.16 8.453 8.874 9.293 9.707 10.113 10.509 11.004 11.484 11.938 12.486 13.025 13.536 14.129 14.828 15.516 16.218 16.994 17.841 18.714 19.721 20.902 22.075 23.409 24.885 26.573 28.47 30.755 33.436 36.574 39.147 40.613 41.373 41.843 42.14 42.26 42.266 42.102 41.905 41.7 41.422 41.182 40.954 40.681 40.387 40.037 39.73 39.452 39.146 38.769 38.421 38.083 37.75 37.496 37.213 36.891 36.569 36.223 35.952 35.673 35.237 34.9 34.555 34.391 34.058 33.687 33.286 33.08 32.375 32.37 32.092 31.758 31.011 30.603 30.179 29.731 29.203 28.467 27.55 24.391 -3 ,1910 ,KEBNE ,16690089,Thu Nov 25 08:01:50 CET,Thu Nov 25 08:03:11 CET,0.0 3.204 3.986 4.441 4.802 5.121 5.41 5.68 6.165 6.391 6.617 6.519 7.223 7.422 7.793 8.141 8.48 8.642 8.95 9.246 9.655 9.913 10.171 10.552 10.905 11.236 11.58 11.935 12.38 12.814 13.248 13.768 14.274 14.748 15.313 15.98 16.604 17.271 18.001 18.798 19.637 20.581 21.642 22.666 23.911 25.346 27.058 29.029 31.309 34.044 37.405 40.119 41.619 42.5 42.978 43.23 43.309 43.289 43.205 43.03 42.844 42.641 42.371 42.063 41.752 41.416 41.037 40.715 40.419 40.077 39.72 39.426 39.09 38.743 38.481 38.2 37.921 37.625 37.295 37.063 36.815 36.379 36.052 35.724 35.549 35.176 34.775 34.347 34.137 33.461 33.478 33.226 32.969 32.321 31.912 31.437 30.921 30.314 29.536 28.454 24.406 -4 ,7641 ,KEBNE ,16690815,Thu Nov 25 08:29:17 CET,Thu Nov 25 10:18:53 CET,0.0 0.754 1.233 1.644 1.995 2.291 2.587 2.876 3.378 3.614 3.84 3.774 4.502 4.702 5.108 5.509 5.87 6.045 6.39 6.711 7.173 7.47 7.759 8.185 8.598 9.006 9.41 9.798 10.314 10.821 11.302 11.883 12.422 12.936 13.528 14.206 14.86 15.55 16.312 17.149 17.991 18.909 20.04 21.176 22.468 23.954 25.697 27.644 29.922 32.673 36.099 38.896 40.328 41.09 41.579 41.898 42.01 42.0 41.865 41.618 41.42 41.245 41.022 40.768 40.483 40.153 39.755 39.391 39.077 38.758 38.417 38.103 37.783 37.449 37.205 36.928 36.572 36.175 35.795 35.544 35.28 34.876 34.582 34.269 34.103 33.756 33.358 32.881 32.648 31.945 31.894 31.59 31.279 30.497 30.046 29.648 29.229 28.672 27.919 26.905 24.137 -5 ,7525 ,KEBNE ,16690091,Thu Nov 25 08:01:54 CET,Thu Nov 25 08:03:05 CET,0.0 0.893 1.439 1.856 2.22 2.56 2.857 3.145 3.667 3.879 4.089 3.975 4.701 4.907 5.305 5.674 6.033 6.207 6.525 6.842 7.313 7.602 7.884 8.31 8.722 9.117 9.497 9.868 10.356 10.816 11.265 11.826 12.362 12.882 13.493 14.159 14.791 15.458 16.191 17.016 17.89 18.874 19.967 21.082 22.441 23.94 25.675 27.637 29.892 32.559 35.857 38.522 40.052 40.936 41.415 41.66 41.783 41.832 41.755 41.589 41.388 41.129 40.827 40.512 40.188 39.877 39.552 39.252 38.975 38.666 38.347 38.077 37.765 37.407 37.122 36.833 36.538 36.235 35.912 35.685 35.444 35.032 34.748 34.451 34.277 33.895 33.53 33.142 32.93 32.239 32.207 31.933 31.628 30.917 30.497 30.034 29.53 28.942 28.194 27.188 22.272 -6 ,29607 ,KEBNE ,16690092,Thu Nov 25 08:01:50 CET,Thu Nov 25 08:03:00 CET,0.0 1.314 1.871 2.372 2.805 3.179 3.513 3.83 4.394 4.647 4.888 4.826 5.532 5.743 6.153 6.53 6.896 7.078 7.42 7.747 8.234 8.564 8.887 9.333 9.757 10.185 10.604 10.984 11.447 11.894 12.337 12.893 13.437 13.943 14.529 15.187 15.814 16.511 17.257 18.06 18.901 19.829 20.957 22.101 23.45 24.908 26.526 28.412 30.678 33.423 36.665 39.242 40.664 41.394 41.72 41.834 41.832 41.75 41.607 41.366 41.137 40.919 40.652 40.402 40.157 39.902 39.637 39.387 39.124 38.835 38.546 38.282 37.998 37.705 37.462 37.199 36.895 36.55 36.207 35.974 35.723 35.329 35.043 34.734 34.567 34.217 33.867 33.481 33.267 32.565 32.497 32.207 31.904 31.221 30.806 30.332 29.836 29.242 28.468 27.439 23.5 -7 ,23010 ,KEBNE ,16690093,Thu Nov 25 08:01:50 CET,Thu Nov 25 08:03:00 CET,0.0 0.832 1.283 1.641 1.97 2.303 2.599 2.873 3.344 3.555 3.775 3.718 4.448 4.649 5.035 5.404 5.768 5.945 6.288 6.61 7.085 7.396 7.687 8.124 8.557 8.974 9.365 9.735 10.215 10.691 11.148 11.675 12.167 12.623 13.168 13.81 14.47 15.196 15.985 16.832 17.648 18.599 19.805 20.987 22.365 23.876 25.556 27.497 29.747 32.434 35.651 38.185 39.655 40.513 40.988 41.222 41.294 41.125 40.857 40.578 40.256 39.944 39.618 39.292 38.994 38.683 38.348 38.037 37.742 37.447 37.135 36.835 36.514 36.185 35.921 35.64 35.33 34.985 34.603 34.33 34.044 33.579 33.272 32.968 32.797 32.436 32.048 31.604 31.366 30.648 30.598 30.284 29.939 29.228 28.805 28.351 27.878 27.315 26.615 25.665 21.13 -8 ,72 ,KEBNE ,16690819,Thu Nov 25 08:30:18 CET,Thu Nov 25 10:19:35 CET,0.0 1.018 1.451 1.818 2.15 2.466 2.762 3.04 3.562 3.804 4.045 3.967 4.701 4.891 5.238 5.569 5.893 6.052 6.369 6.679 7.128 7.422 7.704 8.114 8.555 8.976 9.359 9.756 10.278 10.786 11.257 11.83 12.413 12.957 13.596 14.308 14.967 15.715 16.507 17.308 18.171 19.155 20.315 21.485 22.891 24.424 26.108 28.006 30.238 33.021 36.549 39.476 40.959 41.75 42.239 42.525 42.646 42.662 42.583 42.439 42.297 42.124 41.875 41.58 41.253 40.922 40.623 40.379 40.136 39.826 39.465 39.157 38.842 38.499 38.204 37.893 37.56 37.221 36.852 36.578 36.313 35.895 35.573 35.212 35.031 34.68 34.322 33.932 33.705 32.993 32.938 32.667 32.404 31.811 31.467 31.064 30.593 30.035 29.232 28.141 24.66 -9 ,26152 ,KEBNE ,16690095,Thu Nov 25 08:01:50 CET,Thu Nov 25 08:02:58 CET,0.0 1.149 1.743 2.184 2.537 2.875 3.226 3.551 4.08 4.31 4.534 4.445 5.154 5.347 5.721 6.058 6.372 6.525 6.825 7.12 7.57 7.858 8.129 8.519 8.908 9.283 9.616 9.949 10.391 10.814 11.236 11.743 12.221 12.691 13.252 13.881 14.494 15.158 15.853 16.597 17.41 18.348 19.446 20.572 21.88 23.324 25.019 26.903 29.133 31.881 35.022 37.239 38.215 38.598 38.699 38.636 38.435 38.155 37.877 37.527 37.176 36.828 36.481 36.137 35.789 35.446 35.065 34.693 34.361 34.01 33.617 33.289 32.948 32.571 32.26 31.926 31.591 31.245 30.868 30.61 30.341 29.902 29.585 29.242 29.057 28.67 28.262 27.805 27.57 26.851 26.781 26.483 26.149 25.416 24.983 24.493 23.972 23.364 22.526 21.442 16.645 -10 ,12352 ,KEBNE ,16690821,Thu Nov 25 08:30:18 CET,Thu Nov 25 10:19:30 CET,0.0 1.267 1.887 2.356 2.766 3.11 3.398 3.665 4.152 4.389 4.62 4.522 5.228 5.417 5.781 6.133 6.472 6.634 6.945 7.243 7.689 7.968 8.237 8.635 9.011 9.381 9.734 10.07 10.51 10.946 11.376 11.891 12.381 12.863 13.417 14.03 14.626 15.267 15.969 16.746 17.568 18.477 19.53 20.609 21.904 23.342 25.001 26.847 29.063 31.782 35.046 37.701 39.083 39.821 40.205 40.363 40.374 40.311 40.185 39.999 39.758 39.529 39.3 39.029 38.747 38.489 38.223 37.954 37.693 37.415 37.125 36.863 36.566 36.237 35.973 35.694 35.404 35.097 34.752 34.51 34.27 33.862 33.558 33.224 33.043 32.674 32.281 31.867 31.639 30.916 30.889 30.623 30.336 29.709 29.334 28.881 28.354 27.763 27.054 26.001 22.459 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23467.txt deleted file mode 100644 index af740206..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16204 ,KEBNE ,16690097,Thu Nov 25 08:01:50 CET,Thu Nov 25 08:02:47 CET,0.0 1.112 1.714 2.221 2.653 3.045 3.395 3.728 4.35 4.637 4.911 4.933 5.707 5.955 6.431 6.881 7.287 7.482 7.871 8.248 8.791 9.145 9.494 10.024 10.555 11.068 11.547 12.008 12.58 13.134 13.703 14.395 15.07 15.692 16.413 17.238 18.059 18.978 19.901 20.863 21.915 23.115 24.569 26.108 27.895 29.936 32.379 35.191 38.565 42.69 47.896 52.442 55.174 57.012 58.281 59.093 59.598 59.996 60.244 60.442 60.586 60.645 60.595 60.483 60.371 60.232 60.018 59.8 59.634 59.459 59.238 59.031 58.823 58.6 58.398 58.176 57.931 57.651 57.365 57.161 56.941 56.6 56.338 56.047 55.905 55.616 55.286 54.913 54.725 54.086 54.164 53.952 53.711 53.153 52.812 52.426 51.988 51.516 50.971 50.193 47.683 -2 ,13361 ,KEBNE ,16690823,Thu Nov 25 08:31:19 CET,Thu Nov 25 10:22:45 CET,0.0 1.331 1.994 2.54 3.019 3.441 3.823 4.175 4.791 5.091 5.385 5.412 6.192 6.446 6.941 7.412 7.859 8.081 8.51 8.915 9.48 9.836 10.193 10.727 11.231 11.705 12.173 12.644 13.258 13.849 14.418 15.115 15.806 16.473 17.234 18.087 18.936 19.901 20.951 22.044 23.168 24.458 26.003 27.531 29.341 31.398 33.773 36.574 39.89 43.922 49.063 53.535 56.287 58.147 59.437 60.321 60.907 61.316 61.493 61.513 61.505 61.497 61.455 61.358 61.232 61.065 60.858 60.654 60.455 60.242 60.0 59.775 59.523 59.242 59.01 58.776 58.543 58.291 58.019 57.833 57.631 57.291 57.051 56.808 56.676 56.372 56.044 55.674 55.472 54.832 54.873 54.642 54.371 53.739 53.393 52.973 52.503 51.991 51.358 50.542 46.999 -3 ,8758 ,KEBNE ,16690099,Thu Nov 25 08:01:50 CET,Thu Nov 25 08:03:06 CET,0.0 0.87 1.415 1.886 2.319 2.696 3.048 3.383 3.987 4.258 4.521 4.524 5.278 5.516 5.978 6.433 6.862 7.07 7.469 7.865 8.454 8.826 9.195 9.737 10.245 10.739 11.203 11.657 12.28 12.885 13.476 14.172 14.826 15.485 16.267 17.107 17.931 18.852 19.807 20.828 21.952 23.235 24.676 26.13 27.842 29.826 32.198 34.988 38.378 42.366 47.336 51.625 54.298 56.106 57.299 58.163 58.78 59.205 59.433 59.596 59.684 59.713 59.682 59.56 59.394 59.219 59.029 58.844 58.655 58.43 58.204 58.012 57.777 57.524 57.322 57.085 56.839 56.594 56.323 56.128 55.917 55.574 55.308 55.01 54.863 54.58 54.259 53.889 53.693 53.036 53.029 52.765 52.507 51.992 51.681 51.292 50.839 50.351 49.797 49.086 45.843 -4 ,1514 ,KEBNE ,16690825,Thu Nov 25 08:31:20 CET,Thu Nov 25 10:22:56 CET,0.0 1.1 1.763 2.267 2.701 3.084 3.423 3.755 4.385 4.675 4.954 4.958 5.715 5.943 6.408 6.877 7.342 7.572 8.018 8.427 9.027 9.424 9.796 10.331 10.86 11.37 11.846 12.293 12.878 13.466 14.055 14.761 15.448 16.138 16.88 17.722 18.57 19.507 20.52 21.562 22.699 24.008 25.494 26.982 28.74 30.757 33.145 35.969 39.365 43.476 48.623 52.992 55.638 57.364 58.47 59.143 59.445 59.68 59.815 59.833 59.824 59.717 59.558 59.38 59.196 59.024 58.813 58.606 58.415 58.213 57.989 57.795 57.558 57.284 57.064 56.804 56.548 56.3 56.0 55.782 55.564 55.201 54.925 54.644 54.503 54.221 53.935 53.617 53.451 52.823 52.881 52.659 52.41 51.885 51.59 51.262 50.891 50.47 49.961 49.303 47.133 -5 ,30380 ,KEBNE ,16690101,Thu Nov 25 08:01:49 CET,Thu Nov 25 08:03:03 CET,0.0 1.226 1.866 2.301 2.682 3.042 3.398 3.74 4.362 4.648 4.922 4.939 5.722 5.983 6.491 6.964 7.393 7.604 8.021 8.43 9.048 9.44 9.799 10.315 10.828 11.334 11.821 12.282 12.875 13.459 14.032 14.686 15.321 15.98 16.755 17.611 18.396 19.258 20.252 21.309 22.395 23.646 25.145 26.696 28.515 30.538 32.91 35.675 39.032 43.103 48.136 52.68 55.578 57.466 58.701 59.572 60.205 60.655 60.811 60.883 60.97 60.989 60.891 60.732 60.583 60.431 60.228 60.006 59.814 59.619 59.381 59.168 58.942 58.702 58.507 58.291 58.048 57.782 57.502 57.306 57.116 56.805 56.575 56.318 56.178 55.882 55.575 55.253 55.081 54.465 54.548 54.325 54.058 53.442 53.112 52.771 52.347 51.836 51.253 50.42 47.785 -6 ,6063 ,KEBNE ,16690102,Thu Nov 25 08:01:50 CET,Thu Nov 25 08:03:04 CET,0.0 1.576 2.179 2.684 3.138 3.536 3.881 4.202 4.801 5.102 5.384 5.387 6.134 6.361 6.811 7.241 7.653 7.853 8.247 8.643 9.223 9.587 9.934 10.437 10.944 11.444 11.932 12.418 13.034 13.61 14.17 14.858 15.534 16.177 16.948 17.837 18.645 19.541 20.545 21.6 22.712 23.983 25.47 26.96 28.727 30.811 33.269 36.032 39.396 43.491 48.612 53.159 55.98 57.852 59.079 59.836 60.293 60.62 60.835 60.972 61.035 61.028 60.965 60.873 60.766 60.653 60.478 60.293 60.141 59.971 59.76 59.569 59.359 59.124 58.942 58.75 58.548 58.338 58.104 57.929 57.743 57.448 57.227 56.978 56.846 56.58 56.295 55.971 55.801 55.17 55.192 54.953 54.71 54.155 53.841 53.487 53.08 52.532 51.877 51.076 47.651 -7 ,8772 ,KEBNE ,16690828,Thu Nov 25 08:32:26 CET,Thu Nov 25 10:20:14 CET,0.0 1.349 2.007 2.512 2.977 3.416 3.792 4.14 4.767 5.05 5.317 5.327 6.08 6.32 6.801 7.247 7.675 7.884 8.271 8.65 9.216 9.578 9.928 10.447 10.95 11.425 11.882 12.325 12.882 13.42 13.98 14.666 15.312 15.933 16.653 17.463 18.255 19.131 20.086 21.126 22.217 23.456 24.946 26.454 28.261 30.363 32.831 35.701 39.16 43.225 48.036 51.914 54.15 55.607 56.536 57.061 57.332 57.457 57.48 57.424 57.304 57.161 57.021 56.841 56.65 56.462 56.25 56.061 55.846 55.589 55.32 55.102 54.882 54.633 54.415 54.184 53.955 53.704 53.418 53.209 52.98 52.589 52.313 52.018 51.865 51.538 51.171 50.776 50.56 49.88 49.806 49.51 49.167 48.478 48.119 47.719 47.286 46.801 46.186 45.358 43.269 -8 ,25907 ,KEBNE ,16690829,Thu Nov 25 08:33:23 CET,Thu Nov 25 10:23:13 CET,0.0 1.252 1.828 2.298 2.699 3.072 3.429 3.759 4.38 4.674 4.954 4.973 5.741 5.977 6.444 6.879 7.295 7.503 7.911 8.306 8.867 9.23 9.584 10.108 10.632 11.157 11.655 12.127 12.747 13.348 13.927 14.64 15.333 15.988 16.709 17.497 18.306 19.224 20.205 21.207 22.257 23.471 24.939 26.518 28.361 30.358 32.719 35.435 38.679 42.682 47.743 52.138 54.893 56.725 57.961 58.81 59.435 59.88 60.123 60.244 60.264 60.233 60.15 60.025 59.857 59.677 59.474 59.246 59.048 58.846 58.594 58.362 58.107 57.87 57.681 57.447 57.185 56.884 56.574 56.355 56.115 55.735 55.458 55.145 54.983 54.66 54.312 53.911 53.701 53.039 52.997 52.728 52.437 51.755 51.361 50.964 50.511 50.019 49.461 48.716 46.325 -9 ,21936 ,KEBNE ,16690105,Thu Nov 25 08:01:49 CET,Thu Nov 25 08:03:05 CET,0.0 1.004 1.622 2.057 2.443 2.811 3.151 3.472 4.083 4.363 4.631 4.647 5.413 5.665 6.148 6.612 7.049 7.264 7.68 8.069 8.645 9.019 9.383 9.903 10.402 10.9 11.375 11.832 12.439 13.04 13.609 14.307 15.014 15.681 16.44 17.274 18.063 18.955 19.928 20.98 22.112 23.358 24.755 26.224 27.994 29.972 32.336 35.131 38.522 42.624 47.817 52.237 54.812 56.359 57.357 58.09 58.612 58.936 59.067 59.114 59.114 59.101 59.062 58.975 58.858 58.718 58.535 58.352 58.181 57.983 57.754 57.546 57.32 57.084 56.892 56.659 56.408 56.145 55.865 55.677 55.462 55.115 54.874 54.613 54.47 54.177 53.869 53.51 53.302 52.646 52.627 52.394 52.143 51.6 51.305 50.975 50.576 50.033 49.371 48.537 45.919 -10 ,6482 ,KEBNE ,16690831,Thu Nov 25 08:34:25 CET,Thu Nov 25 10:24:02 CET,0.0 1.396 1.929 2.378 2.762 3.111 3.455 3.761 4.298 4.571 4.839 4.812 5.549 5.768 6.191 6.611 7.002 7.187 7.556 7.916 8.438 8.776 9.108 9.584 10.039 10.492 10.934 11.362 11.916 12.443 12.95 13.576 14.181 14.783 15.517 16.359 17.162 18.035 18.961 19.957 21.026 22.216 23.623 25.087 26.899 28.958 31.301 34.093 37.53 41.707 46.999 51.488 54.203 55.995 57.215 58.025 58.528 58.864 59.076 59.212 59.276 59.293 59.239 59.171 59.077 58.954 58.804 58.656 58.502 58.324 58.144 57.992 57.82 57.594 57.411 57.225 57.001 56.754 56.523 56.359 56.182 55.883 55.66 55.42 55.292 55.038 54.77 54.482 54.324 53.695 53.775 53.581 53.386 52.926 52.629 52.32 51.983 51.557 51.07 50.493 48.639 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23468.txt deleted file mode 100644 index c24a364c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23471_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18008 ,KEBNE ,16690107,Thu Nov 25 08:01:49 CET,Thu Nov 25 08:03:09 CET,0.0 2.914 3.724 4.33 4.856 5.346 5.793 6.202 6.955 7.293 7.599 7.649 8.443 8.711 9.22 9.693 10.137 10.352 10.751 11.092 11.592 11.92 12.223 12.674 13.126 13.563 13.968 14.334 14.804 15.273 15.729 16.24 16.716 17.203 17.739 18.305 18.9 19.53 20.14 20.795 21.487 22.268 23.128 23.973 24.968 26.043 27.257 28.587 30.13 31.903 33.773 35.013 35.519 35.692 35.672 35.538 35.36 35.111 34.776 34.328 33.907 33.494 33.069 32.681 32.316 31.929 31.456 31.002 30.592 30.19 29.818 29.494 29.133 28.746 28.436 28.122 27.804 27.451 27.079 26.828 26.566 26.154 25.872 25.564 25.402 25.09 24.745 24.346 24.139 23.435 23.505 23.269 23.016 22.459 22.121 21.749 21.339 20.827 20.239 19.511 17.15 -2 ,46 ,KEBNE ,16690108,Thu Nov 25 08:01:49 CET,Thu Nov 25 08:03:06 CET,0.0 1.63 2.27 2.757 3.155 3.508 3.831 4.125 4.662 4.92 5.176 5.16 5.886 6.11 6.55 6.958 7.343 7.541 7.921 8.277 8.757 9.058 9.376 9.835 10.279 10.69 11.063 11.426 11.883 12.319 12.76 13.272 13.731 14.176 14.687 15.308 15.89 16.463 17.12 17.84 18.531 19.255 20.115 20.999 22.028 23.156 24.415 25.764 27.262 29.003 30.963 32.395 33.039 33.262 33.265 33.125 32.906 32.625 32.277 31.81 31.385 31.032 30.652 30.229 29.838 29.49 29.092 28.7 28.354 27.973 27.534 27.18 26.837 26.482 26.215 25.937 25.629 25.295 24.938 24.673 24.393 23.974 23.679 23.367 23.203 22.856 22.491 22.111 21.907 21.199 21.225 20.966 20.701 20.122 19.799 19.474 19.097 18.607 18.002 17.242 15.414 -3 ,9110 ,KEBNE ,16690834,Thu Nov 25 08:34:29 CET,Thu Nov 25 10:24:28 CET,0.0 1.755 2.39 2.91 3.392 3.801 4.166 4.494 5.096 5.387 5.657 5.646 6.372 6.594 7.022 7.414 7.78 7.966 8.313 8.642 9.14 9.465 9.78 10.219 10.632 11.034 11.422 11.791 12.256 12.682 13.094 13.598 14.076 14.54 15.062 15.624 16.18 16.789 17.417 18.094 18.801 19.567 20.45 21.335 22.348 23.442 24.664 26.021 27.557 29.275 31.239 32.6 33.181 33.388 33.399 33.249 33.024 32.796 32.546 32.197 31.829 31.467 31.085 30.685 30.302 29.936 29.528 29.16 28.813 28.438 28.054 27.72 27.345 26.943 26.643 26.325 25.998 25.67 25.304 25.035 24.757 24.326 24.031 23.718 23.563 23.264 22.928 22.549 22.35 21.652 21.691 21.455 21.216 20.688 20.384 20.056 19.69 19.281 18.824 18.196 16.268 -4 ,18972 ,KEBNE ,16690835,Thu Nov 25 08:34:29 CET,Thu Nov 25 10:21:57 CET,0.0 2.453 3.084 3.591 4.035 4.429 4.782 5.106 5.719 6.011 6.291 6.304 7.058 7.281 7.728 8.145 8.524 8.711 9.076 9.431 9.94 10.269 10.588 11.047 11.485 11.893 12.289 12.681 13.174 13.622 14.061 14.609 15.114 15.592 16.146 16.768 17.374 18.013 18.67 19.364 20.085 20.885 21.805 22.694 23.674 24.736 25.999 27.382 28.917 30.619 32.447 33.803 34.382 34.56 34.591 34.473 34.238 33.959 33.658 33.295 32.897 32.51 32.159 31.789 31.412 31.106 30.737 30.335 29.988 29.616 29.217 28.861 28.5 28.155 27.881 27.574 27.271 26.97 26.629 26.387 26.141 25.736 25.441 25.144 24.987 24.658 24.309 23.935 23.736 23.026 23.077 22.834 22.572 22.002 21.702 21.378 21.029 20.614 20.114 19.494 18.19 -5 ,223 ,KEBNE ,16690111,Thu Nov 25 08:01:50 CET,Thu Nov 25 08:03:14 CET,0.0 1.759 2.404 2.898 3.332 3.733 4.108 4.448 5.073 5.362 5.631 5.609 6.348 6.566 6.994 7.42 7.828 8.017 8.373 8.716 9.218 9.545 9.854 10.283 10.698 11.096 11.478 11.859 12.368 12.842 13.292 13.842 14.377 14.892 15.472 16.092 16.701 17.352 17.968 18.633 19.336 20.085 20.953 21.806 22.805 23.933 25.15 26.467 27.956 29.597 31.462 32.806 33.399 33.59 33.573 33.411 33.184 32.874 32.563 32.193 31.744 31.283 30.873 30.526 30.177 29.838 29.47 29.125 28.821 28.489 28.119 27.806 27.485 27.142 26.864 26.578 26.292 25.978 25.649 25.421 25.173 24.759 24.476 24.189 24.037 23.723 23.397 23.054 22.868 22.179 22.27 22.05 21.804 21.254 20.943 20.601 20.216 19.796 19.308 18.602 16.937 -6 ,24024 ,KEBNE ,16690837,Thu Nov 25 08:35:27 CET,Thu Nov 25 10:30:07 CET,0.0 1.922 2.671 3.196 3.645 4.048 4.427 4.77 5.363 5.637 5.903 5.906 6.665 6.895 7.334 7.745 8.144 8.341 8.726 9.097 9.619 9.962 10.303 10.774 11.214 11.633 12.023 12.393 12.87 13.341 13.811 14.372 14.879 15.369 15.912 16.472 17.009 17.594 18.222 18.894 19.59 20.352 21.235 22.09 23.042 24.107 25.315 26.614 28.117 29.779 31.629 32.934 33.445 33.649 33.631 33.479 33.271 32.999 32.727 32.366 31.993 31.634 31.258 30.882 30.528 30.171 29.764 29.394 29.07 28.719 28.332 28.023 27.717 27.386 27.091 26.763 26.436 26.086 25.724 25.473 25.201 24.771 24.476 24.164 23.996 23.647 23.255 22.833 22.612 21.863 21.85 21.565 21.258 20.591 20.211 19.784 19.36 18.914 18.306 17.406 15.182 -7 ,30238 ,KEBNE ,16690113,Thu Nov 25 08:01:51 CET,Thu Nov 25 08:03:18 CET,0.0 4.293 5.274 5.937 6.456 6.883 7.273 7.653 8.306 8.593 8.881 8.903 9.659 9.894 10.365 10.81 11.237 11.443 11.803 12.12 12.585 12.899 13.2 13.616 14.031 14.448 14.852 15.242 15.741 16.231 16.708 17.28 17.818 18.333 18.942 19.603 20.206 20.864 21.566 22.3 23.06 23.916 24.922 25.845 26.828 27.92 29.141 30.451 31.926 33.709 35.656 37.003 37.703 37.831 37.749 37.632 37.405 37.111 36.757 36.318 35.912 35.523 35.111 34.709 34.321 33.962 33.604 33.264 32.948 32.606 32.231 31.918 31.59 31.226 30.93 30.622 30.3 29.975 29.611 29.357 29.109 28.689 28.383 28.043 27.866 27.526 27.172 26.797 26.598 25.902 25.989 25.748 25.491 24.986 24.699 24.381 24.035 23.628 23.174 22.52 21.178 -8 ,30541 ,KEBNE ,16690114,Thu Nov 25 08:01:51 CET,Thu Nov 25 08:03:13 CET,0.0 1.974 2.612 3.141 3.619 4.038 4.414 4.761 5.382 5.679 5.975 6.025 6.786 7.018 7.476 7.912 8.319 8.518 8.917 9.289 9.808 10.15 10.48 10.946 11.394 11.829 12.244 12.64 13.12 13.567 14.03 14.574 15.081 15.575 16.16 16.814 17.395 18.022 18.703 19.418 20.126 20.868 21.73 22.593 23.554 24.569 25.757 27.097 28.618 30.339 32.24 33.553 34.062 34.286 34.261 34.056 33.83 33.508 33.169 32.835 32.516 32.161 31.76 31.352 30.977 30.622 30.219 29.841 29.512 29.183 28.82 28.509 28.208 27.906 27.665 27.395 27.095 26.781 26.447 26.205 25.967 25.614 25.364 25.098 24.953 24.641 24.308 23.949 23.763 23.078 23.146 22.922 22.671 22.064 21.682 21.231 20.697 20.053 19.219 18.046 14.35 -9 ,5440 ,KEBNE ,16690840,Thu Nov 25 08:35:27 CET,Thu Nov 25 10:27:58 CET,0.0 2.246 2.929 3.538 4.035 4.44 4.802 5.122 5.673 5.919 6.161 6.153 6.873 7.084 7.489 7.861 8.243 8.428 8.772 9.105 9.577 9.872 10.155 10.572 10.956 11.334 11.711 12.066 12.521 12.96 13.39 13.907 14.38 14.834 15.381 15.985 16.568 17.214 17.882 18.579 19.289 20.062 20.966 21.871 22.929 24.089 25.364 26.706 28.201 29.904 31.755 33.017 33.598 33.795 33.78 33.573 33.229 32.838 32.445 32.044 31.694 31.368 31.046 30.725 30.396 30.09 29.769 29.423 29.101 28.77 28.407 28.107 27.823 27.526 27.267 26.98 26.682 26.378 26.058 25.826 25.577 25.196 24.926 24.623 24.473 24.175 23.844 23.497 23.318 22.625 22.671 22.431 22.187 21.645 21.349 21.031 20.662 20.257 19.811 19.188 17.19 -10 ,19312 ,KEBNE ,16690116,Thu Nov 25 08:01:51 CET,Thu Nov 25 08:03:13 CET,0.0 1.624 2.345 2.871 3.279 3.651 4.012 4.341 4.923 5.191 5.454 5.444 6.197 6.433 6.891 7.325 7.718 7.904 8.255 8.589 9.081 9.406 9.724 10.178 10.615 11.019 11.403 11.771 12.244 12.705 13.146 13.672 14.177 14.659 15.208 15.82 16.392 17.018 17.671 18.329 19.021 19.786 20.711 21.634 22.612 23.682 24.911 26.279 27.844 29.597 31.51 32.865 33.476 33.694 33.704 33.571 33.36 33.068 32.753 32.361 31.994 31.624 31.189 30.761 30.35 29.995 29.619 29.235 28.881 28.498 28.068 27.684 27.3 26.938 26.67 26.37 26.037 25.688 25.319 25.065 24.811 24.421 24.137 23.834 23.67 23.333 22.985 22.606 22.402 21.69 21.776 21.546 21.299 20.792 20.509 20.177 19.81 19.378 18.898 18.319 16.87 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index 529548c2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23541 ,KEBNE ,16690117,Thu Nov 25 08:01:49 CET,Thu Nov 25 08:03:01 CET,0.0 1.49 2.232 2.827 3.346 3.791 4.204 4.611 5.397 5.777 6.126 6.173 7.075 7.37 7.939 8.476 9.002 9.26 9.772 10.291 11.04 11.517 11.983 12.669 13.363 14.042 14.691 15.331 16.168 16.978 17.779 18.791 19.811 20.799 21.934 23.278 24.619 26.055 27.609 29.304 31.082 33.148 35.657 38.248 41.27 44.638 48.801 53.75 59.736 67.296 77.44 86.86 92.948 97.072 99.958 102.107 103.862 105.355 106.468 107.346 107.945 108.433 108.842 109.221 109.518 109.723 109.9 109.995 110.039 110.065 110.067 110.054 110.039 110.011 109.982 109.941 109.875 109.785 109.662 109.553 109.411 109.179 109.012 108.825 108.729 108.512 108.24 107.952 107.82 107.213 107.352 107.156 106.925 106.408 106.127 105.808 105.454 105.018 104.417 103.637 101.351 -2 ,1426 ,KEBNE ,16690118,Thu Nov 25 08:01:51 CET,Thu Nov 25 08:03:11 CET,0.0 1.925 2.72 3.377 3.964 4.483 4.949 5.367 6.138 6.498 6.846 6.948 7.868 8.191 8.819 9.424 9.98 10.246 10.784 11.328 12.105 12.592 13.084 13.825 14.554 15.268 15.959 16.635 17.51 18.362 19.2 20.251 21.291 22.261 23.361 24.631 25.889 27.322 28.92 30.646 32.494 34.596 37.097 39.7 42.842 46.405 50.597 55.517 61.582 69.289 79.383 88.644 94.806 99.175 102.363 104.838 106.705 108.179 109.321 110.303 111.05 111.643 112.075 112.417 112.708 112.913 113.097 113.199 113.263 113.326 113.336 113.297 113.232 113.16 113.105 113.048 112.968 112.874 112.78 112.701 112.599 112.433 112.299 112.144 112.061 111.889 111.701 111.432 111.262 110.613 110.743 110.554 110.351 109.866 109.591 109.294 108.917 108.488 107.995 107.323 105.208 -3 ,6836 ,KEBNE ,16690119,Thu Nov 25 08:01:50 CET,Thu Nov 25 08:03:09 CET,0.0 1.804 2.609 3.269 3.828 4.321 4.776 5.213 6.003 6.376 6.743 6.885 7.798 8.121 8.746 9.37 9.978 10.262 10.817 11.375 12.185 12.703 13.217 13.973 14.706 15.444 16.161 16.844 17.715 18.57 19.414 20.426 21.433 22.425 23.573 24.847 26.062 27.438 28.977 30.654 32.435 34.519 37.065 39.697 42.942 46.729 51.147 56.271 62.515 70.218 80.413 89.961 96.185 100.459 103.537 105.893 107.639 108.975 109.994 110.892 111.52 112.01 112.433 112.749 113.005 113.194 113.342 113.46 113.514 113.569 113.629 113.636 113.6 113.524 113.441 113.358 113.269 113.155 113.028 112.95 112.835 112.612 112.482 112.337 112.252 112.074 111.894 111.715 111.614 111.009 111.215 111.075 110.934 110.58 110.331 110.027 109.7 109.352 108.937 108.293 105.107 -4 ,5343 ,KEBNE ,16690120,Thu Nov 25 08:01:51 CET,Thu Nov 25 08:03:08 CET,0.0 1.28 1.969 2.537 3.038 3.539 3.99 4.372 5.102 5.441 5.764 5.839 6.725 7.011 7.587 8.173 8.718 8.977 9.495 9.997 10.704 11.164 11.632 12.351 13.041 13.684 14.338 15.001 15.854 16.699 17.535 18.54 19.511 20.473 21.604 22.897 24.182 25.586 27.095 28.778 30.552 32.51 34.88 37.36 40.339 43.777 47.909 52.851 58.952 66.529 76.55 85.88 92.023 96.422 99.589 102.002 103.875 105.37 106.521 107.547 108.307 108.916 109.452 109.893 110.21 110.445 110.605 110.657 110.682 110.724 110.767 110.738 110.655 110.562 110.474 110.382 110.283 110.168 110.021 109.904 109.763 109.524 109.371 109.199 109.105 108.903 108.689 108.459 108.337 107.736 107.922 107.76 107.585 107.149 106.884 106.609 106.308 105.927 105.44 104.767 103.154 -5 ,15875 ,KEBNE ,16690846,Thu Nov 25 08:35:31 CET,Thu Nov 25 10:26:59 CET,0.0 1.717 2.438 3.031 3.555 4.013 4.435 4.824 5.563 5.922 6.271 6.358 7.265 7.58 8.209 8.811 9.374 9.646 10.169 10.67 11.402 11.884 12.356 13.048 13.731 14.419 15.1 15.762 16.611 17.417 18.208 19.209 20.182 21.118 22.266 23.589 24.845 26.255 27.817 29.548 31.399 33.483 35.954 38.489 41.494 44.988 49.211 54.145 60.189 67.805 77.984 87.353 93.544 97.882 101.058 103.509 105.38 106.848 107.9 108.808 109.539 110.14 110.624 111.006 111.322 111.541 111.702 111.863 112.009 112.085 112.108 112.094 112.03 111.966 111.926 111.879 111.814 111.723 111.606 111.513 111.405 111.212 111.079 110.942 110.866 110.684 110.496 110.294 110.168 109.542 109.695 109.524 109.348 108.996 108.781 108.541 108.249 107.871 107.437 106.887 105.756 -6 ,16958 ,KEBNE ,16690847,Thu Nov 25 08:36:28 CET,Thu Nov 25 10:34:08 CET,0.0 1.364 1.96 2.445 2.858 3.246 3.626 4.004 4.729 5.065 5.394 5.435 6.346 6.672 7.29 7.88 8.46 8.741 9.267 9.781 10.543 11.045 11.529 12.232 12.925 13.608 14.283 14.962 15.847 16.675 17.483 18.472 19.473 20.447 21.569 22.879 24.162 25.607 27.213 28.917 30.737 32.861 35.381 37.913 40.888 44.335 48.452 53.338 59.37 66.962 77.133 86.57 92.673 97.0 100.151 102.623 104.549 106.047 107.197 108.211 108.978 109.57 109.973 110.303 110.624 110.9 111.093 111.176 111.245 111.296 111.332 111.356 111.329 111.279 111.236 111.184 111.111 110.992 110.832 110.716 110.607 110.437 110.306 110.153 110.06 109.855 109.64 109.419 109.312 108.729 108.904 108.673 108.417 107.903 107.611 107.273 106.91 106.526 106.017 105.281 103.046 -7 ,28644 ,KEBNE ,16690848,Thu Nov 25 08:36:28 CET,Thu Nov 25 10:32:46 CET,0.0 1.588 2.172 2.682 3.129 3.507 3.876 4.228 4.891 5.218 5.551 5.62 6.502 6.805 7.402 7.988 8.55 8.825 9.364 9.9 10.696 11.21 11.72 12.451 13.152 13.829 14.487 15.135 15.99 16.826 17.641 18.64 19.628 20.619 21.773 23.125 24.453 25.871 27.445 29.186 31.051 33.186 35.732 38.347 41.499 45.231 49.699 54.829 61.084 68.957 79.396 89.174 95.617 100.117 103.367 105.838 107.717 109.188 110.278 111.238 111.982 112.597 113.122 113.549 113.886 114.164 114.356 114.432 114.484 114.521 114.533 114.522 114.476 114.404 114.337 114.255 114.161 114.07 113.939 113.814 113.676 113.456 113.297 113.111 113.01 112.79 112.543 112.292 112.154 111.516 111.645 111.461 111.265 110.832 110.546 110.213 109.885 109.475 108.962 108.309 106.571 -8 ,12817 ,KEBNE ,16690849,Thu Nov 25 08:36:28 CET,Thu Nov 25 10:34:36 CET,0.0 1.248 1.916 2.429 2.881 3.317 3.71 4.071 4.763 5.107 5.441 5.5 6.403 6.717 7.307 7.853 8.378 8.634 9.16 9.692 10.45 10.951 11.445 12.14 12.816 13.487 14.152 14.804 15.646 16.452 17.234 18.206 19.185 20.133 21.259 22.564 23.805 25.182 26.695 28.326 30.134 32.208 34.685 37.239 40.189 43.663 47.849 52.76 58.781 66.357 76.565 86.07 92.288 96.634 99.831 102.333 104.25 105.777 106.957 107.989 108.767 109.394 109.906 110.349 110.755 111.065 111.314 111.471 111.543 111.54 111.472 111.39 111.297 111.215 111.152 111.069 110.973 110.874 110.759 110.665 110.566 110.392 110.253 110.096 110.006 109.818 109.617 109.385 109.248 108.62 108.774 108.603 108.396 107.924 107.652 107.298 106.96 106.608 106.138 105.518 103.775 -9 ,24300 ,KEBNE ,16690125,Thu Nov 25 08:01:50 CET,Thu Nov 25 08:02:52 CET,0.0 1.904 2.564 3.072 3.518 3.957 4.389 4.792 5.538 5.867 6.188 6.248 7.146 7.456 8.071 8.647 9.198 9.465 9.975 10.477 11.223 11.704 12.175 12.867 13.545 14.203 14.837 15.459 16.293 17.119 17.91 18.903 19.895 20.84 21.954 23.225 24.46 25.846 27.349 28.957 30.737 32.788 35.137 37.634 40.688 44.141 48.266 53.093 59.122 66.781 76.955 86.42 92.535 96.843 100.013 102.5 104.397 105.907 107.067 108.052 108.787 109.351 109.806 110.165 110.422 110.62 110.772 110.861 110.949 111.044 111.09 111.09 111.089 111.06 111.008 110.949 110.879 110.777 110.648 110.548 110.425 110.231 110.075 109.891 109.795 109.587 109.374 109.144 109.019 108.419 108.613 108.451 108.264 107.833 107.587 107.319 107.03 106.677 106.262 105.703 103.271 -10 ,31199 ,KEBNE ,16690851,Thu Nov 25 08:36:28 CET,Thu Nov 25 10:33:35 CET,0.0 1.256 1.841 2.307 2.781 3.252 3.696 4.098 4.814 5.154 5.489 5.546 6.451 6.748 7.344 7.919 8.455 8.714 9.236 9.754 10.51 11.0 11.477 12.167 12.838 13.519 14.182 14.825 15.659 16.481 17.307 18.323 19.312 20.274 21.413 22.717 23.97 25.36 26.874 28.5 30.225 32.212 34.614 37.095 40.11 43.582 47.745 52.611 58.617 66.248 76.411 85.875 92.049 96.381 99.513 101.964 103.855 105.368 106.534 107.519 108.178 108.667 109.081 109.418 109.673 109.89 110.1 110.226 110.296 110.336 110.36 110.379 110.387 110.367 110.328 110.264 110.174 110.067 109.955 109.867 109.774 109.612 109.461 109.297 109.216 109.027 108.807 108.548 108.406 107.788 107.95 107.794 107.623 107.204 106.935 106.633 106.329 105.954 105.461 104.853 102.248 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23469.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23469.txt deleted file mode 100644 index 6fafd098..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23469.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21167 ,KEBNE ,17025063,Wed Dec 22 11:40:47 CET,Wed Dec 22 13:37:27 CET,0.0 2.22 3.238 4.043 4.74 5.328 5.87 6.393 7.344 7.775 8.199 8.398 9.384 9.741 10.432 11.119 11.775 12.092 12.718 13.299 14.134 14.675 15.201 15.985 16.745 17.486 18.202 18.898 19.816 20.72 21.585 22.607 23.622 24.622 25.801 27.173 28.478 29.89 31.51 33.292 35.115 37.217 39.677 42.143 45.139 48.6 52.775 57.628 63.569 71.097 81.118 90.433 96.657 101.093 104.295 106.711 108.554 110.011 111.106 112.018 112.664 113.18 113.641 114.032 114.355 114.589 114.76 114.884 114.988 115.075 115.122 115.132 115.101 115.076 115.051 114.997 114.945 114.878 114.782 114.718 114.656 114.532 114.452 114.366 114.312 114.185 114.021 113.839 113.733 113.132 113.324 113.163 113.016 112.689 112.46 112.184 111.859 111.453 110.914 110.182 108.033 -2 ,8962 ,KEBNE ,17025064,Wed Dec 22 11:40:47 CET,Wed Dec 22 13:37:37 CET,0.0 1.742 2.522 3.146 3.677 4.176 4.65 5.081 5.858 6.232 6.588 6.676 7.599 7.923 8.536 9.133 9.703 9.982 10.537 11.067 11.858 12.381 12.882 13.599 14.298 14.974 15.621 16.258 17.088 17.892 18.68 19.638 20.582 21.519 22.625 23.852 25.028 26.353 27.802 29.371 31.062 33.006 35.334 37.737 40.653 44.031 48.02 52.752 58.658 66.075 75.93 85.155 91.207 95.448 98.518 100.838 102.549 103.915 104.96 105.87 106.597 107.174 107.644 108.025 108.335 108.559 108.73 108.862 108.968 109.066 109.125 109.146 109.155 109.136 109.112 109.09 109.059 109.027 108.976 108.923 108.856 108.709 108.594 108.464 108.4 108.273 108.136 107.979 107.883 107.319 107.566 107.44 107.292 106.882 106.64 106.401 106.127 105.79 105.379 104.794 102.703 -3 ,24245 ,KEBNE ,17025065,Wed Dec 22 11:40:47 CET,Wed Dec 22 13:37:13 CET,0.0 2.362 3.248 3.97 4.638 5.217 5.688 6.14 6.978 7.364 7.746 7.915 8.835 9.168 9.795 10.387 10.968 11.256 11.824 12.357 13.109 13.599 14.082 14.791 15.478 16.153 16.812 17.462 18.315 19.13 19.924 20.893 21.826 22.738 23.806 25.016 26.201 27.558 29.036 30.592 32.282 34.258 36.606 39.002 41.853 45.14 49.083 53.8 59.641 66.88 76.442 85.314 91.166 95.403 98.481 100.829 102.648 104.099 105.186 106.138 106.852 107.406 107.888 108.305 108.64 108.868 109.054 109.208 109.317 109.401 109.475 109.517 109.536 109.516 109.467 109.427 109.378 109.293 109.202 109.136 109.038 108.858 108.735 108.611 108.543 108.396 108.215 107.993 107.876 107.27 107.472 107.319 107.166 106.826 106.621 106.398 106.155 105.851 105.461 104.924 103.282 -4 ,26972 ,KEBNE ,17025066,Wed Dec 22 11:40:47 CET,Wed Dec 22 13:37:37 CET,0.0 1.676 2.564 3.27 3.907 4.481 5.017 5.512 6.343 6.731 7.123 7.302 8.232 8.558 9.155 9.722 10.312 10.611 11.212 11.817 12.637 13.125 13.59 14.29 14.997 15.693 16.371 17.03 17.871 18.674 19.448 20.397 21.322 22.216 23.273 24.474 25.642 26.942 28.361 29.918 31.619 33.573 35.887 38.277 41.163 44.481 48.498 53.276 59.173 66.635 76.502 85.679 91.747 96.006 99.086 101.461 103.275 104.708 105.751 106.676 107.372 107.871 108.301 108.704 109.045 109.291 109.524 109.7 109.819 109.915 110.002 110.057 110.083 110.092 110.074 110.057 110.021 109.954 109.882 109.821 109.746 109.609 109.498 109.38 109.306 109.148 108.967 108.741 108.628 108.012 108.201 108.05 107.884 107.484 107.25 106.968 106.637 106.234 105.715 104.996 102.78 -5 ,25360 ,KEBNE ,17025067,Wed Dec 22 11:40:47 CET,Wed Dec 22 13:37:24 CET,0.0 1.738 2.565 3.193 3.764 4.291 4.766 5.216 6.078 6.478 6.854 6.982 7.921 8.255 8.893 9.524 10.139 10.428 10.986 11.529 12.312 12.83 13.354 14.114 14.843 15.565 16.27 16.974 17.89 18.773 19.644 20.674 21.672 22.659 23.85 25.248 26.519 27.897 29.487 31.186 32.98 35.05 37.499 40.023 43.043 46.514 50.63 55.433 61.404 68.982 78.982 88.141 94.159 98.437 101.617 104.011 105.782 107.166 108.142 108.951 109.615 110.151 110.585 110.937 111.189 111.379 111.543 111.65 111.694 111.71 111.72 111.723 111.725 111.712 111.682 111.637 111.587 111.527 111.443 111.373 111.295 111.164 111.073 110.957 110.884 110.715 110.532 110.333 110.226 109.639 109.851 109.682 109.52 109.179 108.954 108.698 108.429 108.087 107.639 107.052 105.137 -6 ,30045 ,KEBNE ,17025068,Wed Dec 22 11:41:49 CET,Wed Dec 22 13:37:38 CET,0.0 1.731 2.511 3.113 3.697 4.253 4.746 5.201 6.051 6.463 6.845 6.977 7.914 8.246 8.89 9.515 10.121 10.418 10.978 11.521 12.342 12.882 13.405 14.151 14.876 15.604 16.333 17.019 17.899 18.77 19.609 20.633 21.65 22.634 23.811 25.184 26.5 27.934 29.528 31.293 33.094 35.111 37.594 40.183 43.249 46.681 50.738 55.548 61.573 69.11 79.088 88.324 94.334 98.354 101.129 103.258 104.788 105.947 106.837 107.626 108.234 108.72 109.112 109.454 109.727 109.897 110.018 110.084 110.126 110.149 110.146 110.149 110.149 110.136 110.108 110.059 109.994 109.915 109.819 109.75 109.679 109.54 109.44 109.33 109.255 109.094 108.937 108.77 108.671 108.064 108.282 108.139 107.978 107.636 107.43 107.196 106.949 106.593 106.128 105.54 103.497 -7 ,8136 ,KEBNE ,17025069,Wed Dec 22 11:43:51 CET,Wed Dec 22 13:40:07 CET,0.0 2.305 3.155 3.887 4.474 5.019 5.525 5.98 6.818 7.202 7.569 7.683 8.593 8.914 9.544 10.143 10.696 10.967 11.508 12.034 12.79 13.275 13.755 14.464 15.182 15.867 16.518 17.147 17.938 18.709 19.476 20.422 21.332 22.231 23.344 24.657 25.951 27.393 28.914 30.508 32.199 34.159 36.534 38.99 41.921 45.269 49.297 54.064 59.989 67.495 77.357 86.444 92.392 96.522 99.545 101.92 103.7 105.057 106.089 107.021 107.749 108.344 108.825 109.189 109.476 109.707 109.907 110.037 110.129 110.196 110.254 110.294 110.312 110.303 110.284 110.252 110.218 110.177 110.101 110.033 109.947 109.795 109.678 109.545 109.477 109.321 109.151 108.978 108.884 108.293 108.478 108.329 108.172 107.791 107.574 107.272 106.853 106.38 105.866 105.152 102.954 -8 ,2084 ,KEBNE ,17025070,Wed Dec 22 11:44:54 CET,Wed Dec 22 13:42:02 CET,0.0 1.942 2.73 3.342 3.907 4.417 4.871 5.288 6.072 6.451 6.814 6.9 7.798 8.112 8.719 9.293 9.84 10.108 10.653 11.187 11.956 12.458 12.951 13.662 14.36 15.032 15.69 16.347 17.214 18.068 18.892 19.875 20.828 21.763 22.873 24.128 25.339 26.719 28.24 29.905 31.695 33.741 36.234 38.801 41.869 45.305 49.279 54.008 59.854 67.235 77.112 86.386 92.385 96.533 99.555 101.904 103.693 105.078 106.128 107.086 107.824 108.389 108.835 109.182 109.468 109.695 109.881 110.015 110.104 110.154 110.164 110.173 110.195 110.195 110.167 110.116 110.034 109.93 109.826 109.74 109.649 109.519 109.431 109.327 109.268 109.142 108.946 108.681 108.541 107.923 108.046 107.847 107.66 107.254 107.001 106.706 106.388 106.0 105.436 104.681 102.471 -9 ,27247 ,KEBNE ,17025071,Wed Dec 22 11:44:54 CET,Wed Dec 22 13:42:18 CET,0.0 1.893 2.722 3.402 3.998 4.517 5.001 5.462 6.31 6.706 7.076 7.166 8.052 8.362 8.988 9.576 10.147 10.429 10.96 11.456 12.192 12.658 13.113 13.806 14.484 15.14 15.781 16.406 17.225 18.047 18.841 19.793 20.709 21.606 22.668 23.888 25.077 26.382 27.821 29.399 31.079 33.005 35.308 37.663 40.553 43.971 48.012 52.718 58.471 65.774 75.585 84.648 90.571 94.753 97.823 100.143 101.891 103.25 104.271 105.163 105.817 106.346 106.804 107.195 107.502 107.721 107.909 108.012 108.086 108.171 108.235 108.272 108.278 108.268 108.263 108.251 108.207 108.126 108.054 107.989 107.891 107.737 107.617 107.494 107.426 107.278 107.105 106.904 106.798 106.21 106.443 106.295 106.128 105.727 105.488 105.223 104.933 104.608 104.188 103.536 101.081 -10 ,1898 ,KEBNE ,17025072,Wed Dec 22 11:44:54 CET,Wed Dec 22 13:42:18 CET,0.0 1.909 2.738 3.407 3.978 4.495 4.977 5.449 6.327 6.711 7.075 7.169 8.077 8.395 9.002 9.579 10.151 10.43 10.975 11.51 12.276 12.777 13.277 14.003 14.695 15.369 16.025 16.672 17.52 18.328 19.096 20.047 20.998 21.924 23.011 24.259 25.492 26.885 28.408 30.058 31.84 33.873 36.313 38.855 41.843 45.284 49.406 54.217 60.133 67.519 77.193 86.226 92.226 96.413 99.405 101.724 103.494 104.848 105.906 106.849 107.544 108.109 108.602 109.005 109.319 109.561 109.77 109.928 110.057 110.158 110.236 110.274 110.298 110.328 110.344 110.341 110.312 110.258 110.179 110.117 110.035 109.891 109.781 109.655 109.586 109.442 109.282 109.076 108.958 108.358 108.563 108.406 108.238 107.828 107.576 107.319 107.044 106.614 106.046 105.328 103.246 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23471.txt deleted file mode 100644 index c3f013f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23472_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10498 ,KEBNE ,16690852,Thu Nov 25 08:36:28 CET,Thu Nov 25 10:32:24 CET,0.0 1.599 2.402 3.003 3.498 3.938 4.365 4.782 5.552 5.909 6.255 6.318 7.231 7.537 8.125 8.668 9.194 9.455 9.963 10.46 11.184 11.649 12.099 12.761 13.374 13.958 14.547 15.125 15.879 16.587 17.278 18.111 18.891 19.642 20.542 21.586 22.601 23.711 24.859 26.068 27.362 28.855 30.704 32.664 34.947 37.455 40.417 43.884 48.093 53.316 60.072 66.077 69.887 72.57 74.445 75.822 76.861 77.665 78.268 78.763 79.111 79.376 79.56 79.677 79.731 79.69 79.55 79.394 79.29 79.152 78.972 78.812 78.635 78.451 78.276 78.08 77.878 77.658 77.405 77.202 76.988 76.593 76.295 75.982 75.825 75.475 75.09 74.721 74.514 73.784 73.859 73.613 73.323 72.617 72.209 71.731 71.129 70.393 69.613 68.711 61.64 -2 ,2131 ,KEBNE ,16690853,Thu Nov 25 08:36:28 CET,Thu Nov 25 10:31:10 CET,0.0 1.957 2.723 3.351 3.923 4.455 4.949 5.386 6.187 6.558 6.912 6.997 7.893 8.206 8.82 9.39 9.924 10.188 10.711 11.223 11.947 12.404 12.863 13.52 14.148 14.757 15.326 15.872 16.597 17.305 17.986 18.8 19.598 20.388 21.321 22.385 23.41 24.524 25.722 27.056 28.521 30.141 31.984 33.842 35.993 38.462 41.436 44.85 48.975 54.187 60.96 67.127 71.173 73.942 75.903 77.366 78.401 79.196 79.786 80.229 80.47 80.618 80.751 80.843 80.873 80.854 80.789 80.677 80.571 80.466 80.325 80.178 80.018 79.828 79.678 79.535 79.375 79.198 78.972 78.793 78.612 78.328 78.117 77.898 77.794 77.569 77.284 76.959 76.791 76.11 76.235 76.027 75.8 75.237 74.898 74.517 74.08 73.518 72.82 71.824 68.267 -3 ,31854 ,KEBNE ,16690854,Thu Nov 25 08:36:28 CET,Thu Nov 25 10:31:13 CET,0.0 2.7 3.677 4.349 4.928 5.484 5.979 6.437 7.243 7.6 7.953 8.066 8.995 9.324 9.94 10.528 11.084 11.343 11.864 12.369 13.087 13.546 13.987 14.634 15.251 15.85 16.462 17.069 17.845 18.593 19.335 20.257 21.136 21.972 22.937 24.021 25.067 26.215 27.472 28.854 30.313 31.956 33.931 35.945 38.286 40.893 43.911 47.405 51.686 56.981 63.736 69.735 73.536 76.169 78.068 79.492 80.497 81.262 81.826 82.288 82.636 82.874 82.991 83.065 83.078 83.017 82.933 82.831 82.713 82.575 82.425 82.296 82.121 81.906 81.756 81.598 81.384 81.13 80.862 80.67 80.444 80.081 79.836 79.589 79.458 79.163 78.816 78.434 78.239 77.507 77.579 77.306 77.028 76.444 76.087 75.681 75.271 74.803 74.115 73.126 64.608 -4 ,27958 ,KEBNE ,16690855,Thu Nov 25 08:36:28 CET,Thu Nov 25 10:32:16 CET,0.0 3.863 5.002 5.85 6.53 7.108 7.586 7.987 8.673 8.996 9.319 9.332 10.203 10.49 11.045 11.566 12.062 12.302 12.766 13.233 13.91 14.339 14.769 15.389 15.968 16.532 17.087 17.644 18.392 19.132 19.85 20.713 21.557 22.365 23.304 24.365 25.378 26.513 27.764 29.102 30.497 32.091 34.004 35.962 38.231 40.792 43.915 47.578 52.005 57.524 64.638 70.956 74.935 77.673 79.578 80.909 81.884 82.612 83.133 83.56 83.81 83.943 84.033 84.091 84.107 84.104 84.077 84.01 83.934 83.832 83.709 83.601 83.445 83.268 83.12 82.949 82.772 82.585 82.353 82.197 82.042 81.759 81.559 81.348 81.225 80.934 80.615 80.272 80.087 79.397 79.526 79.325 79.096 78.522 78.154 77.726 77.252 76.683 75.979 74.991 71.065 -5 ,3541 ,KEBNE ,16690856,Thu Nov 25 08:36:28 CET,Thu Nov 25 10:32:18 CET,0.0 1.367 2.132 2.75 3.261 3.753 4.226 4.662 5.399 5.715 6.021 6.022 6.923 7.235 7.811 8.378 8.953 9.222 9.726 10.198 10.871 11.321 11.762 12.401 13.023 13.616 14.188 14.751 15.484 16.223 16.951 17.806 18.642 19.419 20.305 21.362 22.396 23.551 24.822 26.173 27.646 29.322 31.173 33.01 35.228 37.747 40.689 44.15 48.347 53.511 60.241 66.286 70.113 72.748 74.627 76.029 77.031 77.788 78.327 78.77 79.088 79.267 79.35 79.407 79.465 79.509 79.472 79.358 79.27 79.166 79.029 78.918 78.775 78.599 78.461 78.306 78.135 77.952 77.734 77.549 77.336 76.996 76.757 76.482 76.334 76.03 75.696 75.359 75.172 74.462 74.543 74.291 74.028 73.467 73.11 72.669 72.12 71.52 70.89 69.855 59.733 -6 ,7591 ,KEBNE ,16690132,Thu Nov 25 08:01:51 CET,Thu Nov 25 08:03:12 CET,0.0 1.374 2.13 2.696 3.169 3.59 3.986 4.363 5.105 5.474 5.836 5.943 6.864 7.157 7.727 8.275 8.803 9.057 9.563 10.06 10.768 11.217 11.651 12.29 12.898 13.5 14.112 14.684 15.417 16.153 16.853 17.678 18.489 19.285 20.234 21.284 22.293 23.472 24.746 26.085 27.514 29.161 31.094 32.981 35.137 37.667 40.705 44.231 48.524 53.724 60.391 66.43 70.257 72.87 74.713 76.1 77.163 77.982 78.6 79.128 79.483 79.729 79.891 79.935 79.93 79.975 79.985 79.937 79.864 79.75 79.607 79.443 79.269 79.094 78.935 78.741 78.542 78.328 78.079 77.913 77.722 77.399 77.18 76.963 76.842 76.56 76.256 75.942 75.767 75.062 75.149 74.891 74.598 73.978 73.592 73.117 72.624 72.071 71.351 70.375 58.701 -7 ,21885 ,KEBNE ,16690133,Thu Nov 25 08:01:51 CET,Thu Nov 25 08:03:09 CET,0.0 1.641 2.447 3.039 3.569 4.093 4.563 4.961 5.704 6.063 6.417 6.489 7.372 7.666 8.227 8.753 9.267 9.522 10.013 10.462 11.122 11.547 11.953 12.56 13.168 13.766 14.334 14.889 15.612 16.323 17.018 17.864 18.712 19.538 20.497 21.577 22.616 23.776 25.043 26.382 27.8 29.42 31.291 33.182 35.42 37.953 40.932 44.418 48.616 53.774 60.355 66.276 70.118 72.712 74.539 75.931 76.961 77.757 78.29 78.613 78.852 79.098 79.269 79.302 79.303 79.288 79.204 79.101 78.966 78.796 78.637 78.487 78.255 78.007 77.854 77.658 77.44 77.241 77.013 76.813 76.59 76.263 76.027 75.772 75.641 75.344 74.973 74.553 74.347 73.642 73.749 73.528 73.3 72.788 72.443 72.025 71.585 71.11 70.531 69.617 64.888 -8 ,13265 ,KEBNE ,16690859,Thu Nov 25 08:36:28 CET,Thu Nov 25 10:31:40 CET,0.0 1.658 2.391 3.004 3.519 3.966 4.385 4.77 5.477 5.803 6.109 6.129 7.004 7.267 7.79 8.303 8.785 9.027 9.509 9.987 10.722 11.196 11.633 12.267 12.88 13.474 14.068 14.661 15.431 16.163 16.865 17.733 18.582 19.394 20.332 21.38 22.386 23.517 24.784 26.108 27.494 29.133 31.098 33.048 35.302 37.926 40.991 44.474 48.708 54.015 60.956 67.178 71.097 73.795 75.717 77.147 78.101 78.798 79.327 79.728 79.969 80.132 80.254 80.326 80.358 80.342 80.287 80.222 80.149 80.052 79.895 79.731 79.597 79.464 79.336 79.185 79.004 78.809 78.618 78.456 78.267 77.975 77.757 77.533 77.425 77.183 76.909 76.611 76.44 75.756 75.874 75.667 75.455 74.892 74.552 74.171 73.704 73.185 72.594 71.869 66.199 -10 ,25787 ,KEBNE ,16690861,Thu Nov 25 08:37:30 CET,Thu Nov 25 10:34:25 CET,0.0 1.881 2.709 3.423 4.024 4.559 5.043 5.471 6.243 6.602 6.955 7.04 7.945 8.255 8.849 9.431 9.994 10.268 10.793 11.294 12.033 12.515 12.975 13.615 14.228 14.851 15.446 16.015 16.752 17.452 18.142 18.989 19.835 20.648 21.586 22.636 23.614 24.729 25.995 27.33 28.735 30.333 32.186 34.068 36.3 38.846 41.816 45.254 49.407 54.576 61.289 67.34 71.248 73.918 75.815 77.254 78.309 79.064 79.613 80.049 80.364 80.601 80.685 80.718 80.792 80.843 80.769 80.619 80.537 80.473 80.358 80.209 80.035 79.871 79.716 79.521 79.345 79.184 78.95 78.795 78.653 78.378 78.161 77.903 77.764 77.477 77.175 76.845 76.662 75.956 76.022 75.778 75.504 74.87 74.484 74.056 73.548 72.896 72.134 71.015 64.604 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23473_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23473_23467.txt deleted file mode 100644 index 2c155d1e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23473_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15870 ,KEBNE ,16690862,Thu Nov 25 08:37:30 CET,Thu Nov 25 10:32:20 CET,0.0 1.232 1.717 2.078 2.401 2.718 3.022 3.29 3.772 3.995 4.207 4.138 4.788 4.975 5.308 5.607 5.912 6.056 6.317 6.563 6.92 7.159 7.393 7.727 8.032 8.327 8.606 8.87 9.205 9.517 9.821 10.178 10.506 10.841 11.227 11.66 12.071 12.493 12.929 13.399 13.926 14.53 15.224 15.916 16.663 17.403 18.175 18.949 19.757 20.502 21.0 20.948 20.631 20.182 19.661 19.118 18.572 18.045 17.585 17.071 16.623 16.226 15.791 15.33 14.884 14.474 14.049 13.687 13.362 12.977 12.57 12.232 11.869 11.463 11.127 10.755 10.367 9.98 9.549 9.25 8.95 8.462 8.118 7.752 7.569 7.208 6.789 6.282 6.014 5.269 5.09 4.763 4.432 3.662 3.22 2.744 2.24 1.679 0.899 -0.178 -5.217 -3 ,29240 ,KEBNE ,16690139,Thu Nov 25 08:03:56 CET,Thu Nov 25 08:05:08 CET,0.0 1.368 1.91 2.373 2.723 3.019 3.304 3.552 4.019 4.236 4.434 4.357 4.994 5.168 5.519 5.841 6.142 6.288 6.56 6.821 7.201 7.443 7.681 8.032 8.353 8.643 8.927 9.207 9.555 9.876 10.191 10.585 10.97 11.318 11.715 12.188 12.615 13.057 13.558 14.096 14.626 15.211 15.858 16.463 17.172 17.914 18.678 19.441 20.281 21.251 22.036 22.342 22.28 21.978 21.5 20.91 20.301 19.673 19.092 18.494 17.954 17.46 16.999 16.549 16.092 15.652 15.187 14.761 14.387 14.006 13.61 13.276 12.925 12.545 12.232 11.904 11.57 11.213 10.829 10.562 10.289 9.862 9.545 9.195 9.009 8.631 8.241 7.804 7.577 6.919 6.889 6.623 6.356 5.761 5.358 4.872 4.351 3.767 3.065 2.146 -4.691 -4 ,21216 ,KEBNE ,16690140,Thu Nov 25 08:03:52 CET,Thu Nov 25 08:05:03 CET,0.0 1.204 1.716 2.133 2.484 2.792 3.083 3.384 3.926 4.148 4.352 4.26 4.879 5.052 5.399 5.717 6.008 6.151 6.445 6.726 7.122 7.357 7.567 7.86 8.159 8.434 8.676 8.925 9.242 9.518 9.785 10.119 10.442 10.751 11.101 11.481 11.846 12.246 12.667 13.104 13.561 14.051 14.613 15.174 15.78 16.426 17.127 17.911 18.77 19.663 20.376 20.378 20.073 19.635 19.144 18.507 17.858 17.244 16.63 15.955 15.381 14.908 14.43 13.95 13.496 13.06 12.568 12.128 11.758 11.36 10.93 10.559 10.174 9.768 9.445 9.11 8.743 8.363 7.977 7.705 7.431 7.01 6.714 6.362 6.172 5.77 5.352 4.939 4.709 4.045 4.018 3.752 3.457 2.742 2.358 1.98 1.561 1.021 0.226 -0.969 -4.977 -5 ,16498 ,KEBNE ,16690866,Thu Nov 25 08:37:30 CET,Thu Nov 25 10:31:20 CET,0.0 1.268 1.847 2.283 2.653 2.972 3.264 3.529 4.004 4.219 4.425 4.32 4.969 5.144 5.489 5.816 6.122 6.268 6.538 6.798 7.164 7.391 7.605 7.928 8.25 8.548 8.833 9.116 9.468 9.786 10.105 10.502 10.886 11.254 11.68 12.148 12.559 13.008 13.489 13.996 14.522 15.081 15.728 16.371 17.096 17.872 18.705 19.593 20.52 21.363 22.066 22.295 22.085 21.692 21.284 20.815 20.313 19.803 19.29 18.732 18.276 17.835 17.358 16.851 16.386 15.991 15.57 15.168 14.798 14.42 14.023 13.687 13.342 12.975 12.673 12.344 11.988 11.595 11.194 10.928 10.651 10.215 9.907 9.566 9.372 8.957 8.51 8.06 7.834 7.145 7.088 6.805 6.52 5.903 5.538 5.117 4.569 3.91 3.156 2.155 -8.054 -6 ,30344 ,KEBNE ,16690867,Thu Nov 25 08:37:30 CET,Thu Nov 25 10:34:50 CET,0.0 1.484 2.051 2.468 2.812 3.108 3.397 3.664 4.137 4.349 4.551 4.477 5.131 5.316 5.643 5.975 6.299 6.437 6.708 6.983 7.367 7.626 7.871 8.192 8.503 8.793 9.064 9.331 9.682 10.028 10.363 10.745 11.094 11.439 11.853 12.31 12.74 13.211 13.711 14.228 14.726 15.256 15.864 16.432 17.088 17.826 18.616 19.404 20.206 20.922 21.366 21.301 20.873 20.319 19.701 19.037 18.426 17.835 17.265 16.644 16.071 15.549 15.04 14.55 14.077 13.64 13.171 12.709 12.309 11.9 11.473 11.122 10.748 10.319 9.981 9.661 9.326 8.962 8.543 8.237 7.932 7.438 7.089 6.758 6.597 6.242 5.827 5.353 5.087 4.381 4.327 4.045 3.711 3.001 2.607 2.118 1.584 0.924 0.021 -1.179 -5.703 -7 ,1096 ,KEBNE ,16690868,Thu Nov 25 08:37:30 CET,Thu Nov 25 10:35:09 CET,0.0 1.25 1.847 2.292 2.652 2.963 3.277 3.566 4.026 4.238 4.451 4.41 5.049 5.233 5.604 5.954 6.252 6.389 6.67 6.944 7.316 7.553 7.785 8.12 8.452 8.763 9.053 9.341 9.712 10.077 10.424 10.837 11.251 11.63 12.036 12.481 12.93 13.411 13.886 14.359 14.831 15.352 15.915 16.461 17.089 17.719 18.375 19.095 19.838 20.532 21.067 21.034 20.735 20.31 19.764 19.193 18.657 18.129 17.637 17.106 16.604 16.147 15.716 15.29 14.872 14.484 14.066 13.66 13.302 12.948 12.55 12.202 11.866 11.465 11.124 10.805 10.491 10.148 9.784 9.516 9.218 8.733 8.387 8.031 7.856 7.494 7.084 6.648 6.409 5.706 5.632 5.376 5.091 4.418 4.053 3.64 3.138 2.556 1.83 0.756 -3.996 -8 ,23874 ,KEBNE ,16690144,Thu Nov 25 08:03:51 CET,Thu Nov 25 08:04:49 CET,0.0 1.319 1.882 2.301 2.652 2.946 3.214 3.46 3.926 4.142 4.353 4.285 4.935 5.12 5.45 5.758 6.055 6.201 6.499 6.781 7.169 7.417 7.659 7.994 8.313 8.625 8.927 9.212 9.575 9.92 10.261 10.684 11.065 11.42 11.833 12.289 12.735 13.228 13.737 14.256 14.764 15.321 15.979 16.606 17.285 17.981 18.711 19.487 20.34 21.259 22.102 22.267 21.955 21.402 20.766 20.114 19.513 18.946 18.4 17.849 17.355 16.855 16.376 15.907 15.435 15.0 14.565 14.154 13.787 13.393 12.965 12.624 12.266 11.862 11.538 11.196 10.847 10.497 10.116 9.852 9.582 9.116 8.769 8.394 8.196 7.774 7.342 6.878 6.611 5.892 5.78 5.464 5.097 4.295 3.913 3.514 2.993 2.455 1.781 0.658 -6.775 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index 43d66dda..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29698 ,KEBNE ,16690872,Thu Nov 25 08:37:30 CET,Thu Nov 25 10:35:11 CET,0.0 1.406 1.945 2.351 2.696 3.029 3.331 3.595 4.086 4.326 4.544 4.455 5.15 5.34 5.682 6.016 6.321 6.465 6.748 7.031 7.445 7.696 7.939 8.297 8.621 8.942 9.255 9.538 9.91 10.269 10.615 11.054 11.482 11.865 12.291 12.778 13.249 13.707 14.164 14.684 15.219 15.802 16.454 17.067 17.8 18.633 19.492 20.368 21.18 21.884 22.488 22.59 22.239 21.722 21.199 20.665 20.149 19.618 19.095 18.528 18.005 17.518 17.044 16.629 16.237 15.836 15.383 14.903 14.486 14.088 13.672 13.318 12.963 12.598 12.287 11.98 11.661 11.303 10.914 10.649 10.375 9.92 9.62 9.312 9.152 8.834 8.486 8.106 7.904 7.226 7.281 7.06 6.815 6.266 5.967 5.633 5.246 4.765 4.187 3.394 1.308 -2 ,28999 ,KEBNE ,16690148,Thu Nov 25 08:03:51 CET,Thu Nov 25 08:04:59 CET,0.0 1.065 1.577 2.012 2.361 2.649 2.941 3.213 3.673 3.892 4.1 4.015 4.693 4.88 5.224 5.558 5.878 6.023 6.299 6.572 6.965 7.226 7.479 7.849 8.212 8.544 8.873 9.195 9.592 9.977 10.327 10.758 11.181 11.572 11.998 12.481 12.936 13.4 13.897 14.431 14.969 15.497 16.072 16.663 17.351 18.074 18.846 19.613 20.4 21.154 21.673 21.648 21.289 20.76 20.228 19.74 19.211 18.648 18.142 17.608 17.117 16.657 16.185 15.741 15.319 14.913 14.486 14.083 13.725 13.35 12.938 12.589 12.226 11.845 11.545 11.239 10.931 10.615 10.279 10.04 9.788 9.377 9.085 8.77 8.609 8.272 7.907 7.536 7.336 6.632 6.67 6.436 6.168 5.583 5.248 4.884 4.471 4.01 3.511 2.791 0.574 -3 ,27988 ,KEBNE ,16690149,Thu Nov 25 08:03:52 CET,Thu Nov 25 08:05:12 CET,0.0 0.766 1.281 1.768 2.183 2.514 2.791 3.062 3.574 3.807 4.018 3.913 4.575 4.751 5.096 5.43 5.727 5.867 6.154 6.433 6.837 7.109 7.37 7.764 8.135 8.461 8.79 9.11 9.487 9.843 10.196 10.613 11.024 11.414 11.849 12.327 12.795 13.313 13.861 14.445 15.021 15.622 16.279 16.916 17.694 18.542 19.405 20.286 21.204 22.096 22.898 23.199 23.126 22.827 22.407 21.949 21.481 20.992 20.512 19.957 19.463 19.026 18.571 18.113 17.708 17.322 16.852 16.429 16.077 15.7 15.297 14.964 14.622 14.244 13.959 13.675 13.369 13.053 12.701 12.449 12.188 11.798 11.533 11.24 11.09 10.792 10.476 10.129 9.945 9.279 9.258 8.983 8.72 8.183 7.89 7.577 7.225 6.818 6.361 5.78 4.149 -4 ,16905 ,KEBNE ,16690875,Thu Nov 25 08:37:30 CET,Thu Nov 25 10:36:49 CET,0.0 1.669 2.319 2.819 3.251 3.642 3.976 4.242 4.696 4.897 5.085 4.969 5.643 5.83 6.177 6.494 6.804 6.955 7.245 7.536 7.942 8.197 8.447 8.799 9.124 9.421 9.714 10.004 10.373 10.732 11.077 11.49 11.873 12.244 12.688 13.162 13.603 14.088 14.588 15.094 15.612 16.182 16.859 17.55 18.267 19.01 19.815 20.64 21.518 22.215 22.681 22.692 22.307 21.868 21.375 20.858 20.32 19.754 19.267 18.792 18.341 17.9 17.487 17.103 16.701 16.301 15.883 15.493 15.163 14.825 14.481 14.195 13.882 13.549 13.28 12.984 12.662 12.315 11.928 11.662 11.387 10.963 10.685 10.393 10.236 9.92 9.573 9.207 9.026 8.355 8.403 8.168 7.908 7.357 7.018 6.638 6.23 5.749 5.218 4.567 2.862 -5 ,5173 ,KEBNE ,16690876,Thu Nov 25 08:37:30 CET,Thu Nov 25 10:35:53 CET,0.0 1.324 1.825 2.194 2.512 2.808 3.078 3.333 3.808 4.014 4.212 4.119 4.788 4.968 5.297 5.642 5.966 6.114 6.423 6.728 7.141 7.398 7.653 8.031 8.398 8.736 9.051 9.368 9.778 10.158 10.5 10.926 11.347 11.747 12.216 12.734 13.22 13.719 14.231 14.765 15.305 15.938 16.685 17.353 18.042 18.836 19.771 20.767 21.801 22.779 23.733 24.156 24.069 23.812 23.486 23.031 22.543 22.062 21.595 21.1 20.642 20.222 19.81 19.392 18.99 18.62 18.224 17.853 17.515 17.163 16.803 16.497 16.177 15.825 15.529 15.219 14.888 14.549 14.197 13.944 13.696 13.311 13.028 12.725 12.573 12.262 11.925 11.54 11.338 10.662 10.702 10.475 10.233 9.644 9.308 8.952 8.549 8.101 7.61 6.991 4.988 -6 ,22991 ,KEBNE ,16690152,Thu Nov 25 08:03:51 CET,Thu Nov 25 08:05:05 CET,0.0 0.988 1.439 1.823 2.136 2.427 2.73 3.007 3.507 3.726 3.926 3.823 4.49 4.664 5.011 5.343 5.659 5.809 6.093 6.365 6.752 7.006 7.246 7.589 7.937 8.271 8.586 8.881 9.243 9.612 9.98 10.413 10.83 11.241 11.7 12.179 12.632 13.13 13.646 14.15 14.659 15.214 15.849 16.464 17.124 17.821 18.551 19.27 20.113 20.994 21.709 22.002 21.831 21.436 21.076 20.698 20.286 19.905 19.525 19.007 18.504 18.072 17.621 17.168 16.753 16.337 15.89 15.501 15.164 14.8 14.418 14.097 13.75 13.388 13.098 12.778 12.438 12.078 11.698 11.434 11.16 10.746 10.448 10.12 9.947 9.592 9.24 8.863 8.651 7.97 7.993 7.764 7.518 6.971 6.655 6.315 5.953 5.544 5.037 4.414 2.578 -7 ,7927 ,KEBNE ,16690878,Thu Nov 25 08:38:31 CET,Thu Nov 25 10:36:23 CET,0.0 0.899 1.438 1.865 2.235 2.56 2.856 3.121 3.608 3.82 4.023 3.973 4.653 4.842 5.183 5.526 5.847 5.998 6.296 6.579 6.98 7.226 7.459 7.811 8.146 8.453 8.741 9.009 9.351 9.693 10.034 10.44 10.816 11.17 11.583 12.038 12.473 12.958 13.45 13.934 14.445 14.996 15.581 16.134 16.78 17.512 18.322 19.134 19.932 20.699 21.305 21.431 21.216 20.885 20.478 20.011 19.528 19.032 18.521 17.938 17.447 16.975 16.494 16.034 15.591 15.176 14.717 14.289 13.925 13.561 13.168 12.812 12.44 12.048 11.749 11.466 11.173 10.866 10.551 10.32 10.086 9.74 9.484 9.197 9.054 8.756 8.438 8.097 7.898 7.173 7.168 6.907 6.649 6.044 5.688 5.319 4.942 4.512 3.924 3.161 1.515 -8 ,9715 ,KEBNE ,16690154,Thu Nov 25 08:03:52 CET,Thu Nov 25 08:05:05 CET,0.0 1.077 1.61 2.039 2.398 2.723 3.038 3.321 3.829 4.074 4.306 4.243 4.92 5.119 5.479 5.819 6.145 6.3 6.598 6.882 7.281 7.54 7.789 8.127 8.464 8.793 9.117 9.428 9.821 10.209 10.567 10.986 11.392 11.757 12.172 12.63 13.065 13.551 14.03 14.538 15.082 15.671 16.324 16.929 17.61 18.346 19.106 19.889 20.753 21.596 22.28 22.528 22.4 22.08 21.647 21.093 20.54 20.009 19.518 19.02 18.542 18.063 17.632 17.224 16.813 16.434 16.035 15.66 15.319 14.966 14.574 14.228 13.87 13.491 13.201 12.906 12.588 12.244 11.878 11.621 11.357 10.933 10.644 10.358 10.198 9.836 9.457 9.051 8.837 8.15 8.182 7.946 7.693 7.072 6.711 6.348 5.925 5.427 4.911 4.229 2.473 -9 ,32706 ,KEBNE ,16690155,Thu Nov 25 08:03:52 CET,Thu Nov 25 08:05:10 CET,0.0 1.2 1.661 2.069 2.435 2.76 3.078 3.379 3.902 4.135 4.353 4.26 4.91 5.086 5.443 5.791 6.125 6.289 6.577 6.851 7.258 7.529 7.787 8.129 8.456 8.782 9.102 9.406 9.761 10.108 10.471 10.89 11.278 11.661 12.115 12.614 13.063 13.578 14.121 14.673 15.249 15.87 16.586 17.263 17.921 18.615 19.522 20.467 21.372 22.275 23.132 23.485 23.292 22.912 22.524 22.127 21.671 21.169 20.709 20.16 19.655 19.226 18.771 18.313 17.92 17.527 17.066 16.615 16.2 15.812 15.404 15.05 14.699 14.333 14.036 13.723 13.378 13.016 12.672 12.43 12.167 11.748 11.456 11.151 10.988 10.659 10.299 9.894 9.681 8.981 8.996 8.763 8.507 7.943 7.623 7.266 6.881 6.454 5.992 5.344 3.775 -10 ,11293 ,KEBNE ,16690881,Thu Nov 25 08:38:32 CET,Thu Nov 25 10:35:41 CET,0.0 1.419 1.995 2.44 2.853 3.204 3.484 3.746 4.241 4.467 4.683 4.579 5.236 5.413 5.787 6.148 6.485 6.645 6.944 7.242 7.701 7.968 8.209 8.559 8.878 9.198 9.512 9.805 10.173 10.537 10.899 11.33 11.744 12.147 12.618 13.152 13.643 14.148 14.682 15.209 15.749 16.361 17.046 17.712 18.44 19.242 20.18 21.244 22.395 23.443 24.373 24.698 24.54 24.234 23.82 23.301 22.749 22.151 21.611 21.065 20.567 20.13 19.681 19.216 18.769 18.346 17.889 17.496 17.166 16.824 16.459 16.135 15.771 15.393 15.106 14.805 14.501 14.17 13.824 13.593 13.354 12.97 12.688 12.387 12.225 11.88 11.524 11.138 10.926 10.238 10.289 10.035 9.773 9.219 8.89 8.533 8.128 7.689 7.168 6.484 4.762 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_23475.txt deleted file mode 100644 index 8db38581..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23474_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16689 ,KEBNE ,17025073,Wed Dec 22 11:44:53 CET,Wed Dec 22 13:41:49 CET,0.0 1.471 1.965 2.314 2.633 2.922 3.174 3.401 3.832 4.037 4.241 4.166 4.832 5.004 5.32 5.607 5.883 6.023 6.307 6.592 6.986 7.223 7.448 7.77 8.091 8.408 8.714 9.008 9.409 9.778 10.098 10.487 10.865 11.197 11.564 11.973 12.348 12.75 13.149 13.56 13.969 14.369 14.813 15.25 15.735 16.223 16.683 17.096 17.474 17.771 17.767 17.315 16.655 15.919 15.192 14.479 13.792 13.116 12.559 11.914 11.237 10.664 10.124 9.55 8.98 8.457 7.913 7.432 7.025 6.585 6.097 5.665 5.221 4.78 4.441 4.078 3.708 3.341 2.936 2.649 2.351 1.871 1.545 1.209 1.021 0.63 0.239 -0.189 -0.406 -1.106 -1.168 -1.445 -1.75 -2.44 -2.799 -3.199 -3.66 -4.166 -4.71 -5.514 -8.13 -2 ,19136 ,KEBNE ,17025074,Wed Dec 22 11:44:54 CET,Wed Dec 22 13:41:54 CET,0.0 2.583 3.373 3.924 4.378 4.782 5.113 5.41 5.931 6.173 6.406 6.35 7.017 7.208 7.57 7.895 8.204 8.354 8.653 8.939 9.348 9.614 9.86 10.199 10.525 10.838 11.13 11.404 11.77 12.125 12.431 12.787 13.146 13.497 13.883 14.279 14.655 15.064 15.522 16.029 16.558 17.111 17.674 18.146 18.611 19.039 19.448 19.906 20.314 20.54 20.475 19.847 18.982 18.104 17.256 16.33 15.383 14.509 13.787 13.036 12.427 11.915 11.381 10.853 10.352 9.88 9.395 8.949 8.532 8.081 7.607 7.234 6.852 6.444 6.115 5.754 5.391 5.045 4.686 4.413 4.129 3.686 3.373 3.041 2.873 2.537 2.164 1.774 1.567 0.851 0.788 0.501 0.233 -0.368 -0.727 -1.112 -1.522 -1.973 -2.52 -3.286 -5.834 -3 ,24780 ,KEBNE ,17025075,Wed Dec 22 11:44:54 CET,Wed Dec 22 13:40:40 CET,0.0 1.239 1.721 2.122 2.488 2.797 3.059 3.295 3.744 3.966 4.19 4.092 4.75 4.922 5.243 5.558 5.86 6.003 6.279 6.545 6.916 7.147 7.367 7.687 7.999 8.289 8.58 8.851 9.183 9.499 9.787 10.136 10.504 10.862 11.225 11.629 12.053 12.509 12.922 13.341 13.772 14.206 14.68 15.161 15.643 16.107 16.626 17.087 17.485 17.744 17.752 17.224 16.434 15.577 14.71 13.825 12.956 12.187 11.576 10.984 10.409 9.813 9.235 8.683 8.156 7.669 7.15 6.695 6.299 5.879 5.438 5.048 4.627 4.177 3.832 3.496 3.144 2.764 2.361 2.079 1.781 1.277 0.92 0.54 0.339 -0.068 -0.494 -0.954 -1.204 -1.922 -1.937 -2.197 -2.464 -3.076 -3.417 -3.775 -4.181 -4.658 -5.248 -5.993 -8.523 -4 ,5953 ,KEBNE ,17025076,Wed Dec 22 11:45:56 CET,Wed Dec 22 13:42:47 CET,0.0 1.72 2.271 2.695 3.052 3.367 3.635 3.91 4.427 4.66 4.874 4.754 5.415 5.594 5.932 6.239 6.52 6.655 6.924 7.202 7.595 7.824 8.06 8.395 8.691 8.982 9.265 9.534 9.893 10.253 10.577 10.957 11.314 11.659 12.067 12.519 12.949 13.421 13.939 14.47 14.959 15.463 15.983 16.41 16.859 17.34 17.823 18.239 18.62 18.896 18.86 18.236 17.35 16.368 15.529 14.721 13.899 13.149 12.441 11.684 11.025 10.437 9.885 9.341 8.811 8.33 7.817 7.342 6.949 6.563 6.137 5.755 5.374 4.952 4.62 4.291 3.939 3.566 3.151 2.856 2.559 2.116 1.793 1.442 1.257 0.852 0.439 0.003 -0.224 -0.936 -0.934 -1.187 -1.447 -2.036 -2.379 -2.753 -3.171 -3.635 -4.138 -4.808 -7.288 -5 ,12408 ,KEBNE ,17025077,Wed Dec 22 11:46:58 CET,Wed Dec 22 13:44:44 CET,0.0 2.119 2.735 3.176 3.557 3.893 4.197 4.492 5.013 5.248 5.475 5.41 6.102 6.289 6.641 6.976 7.288 7.445 7.741 8.001 8.381 8.621 8.856 9.199 9.518 9.822 10.105 10.365 10.687 11.008 11.334 11.702 12.053 12.374 12.716 13.127 13.497 13.852 14.258 14.684 15.124 15.586 16.019 16.44 16.933 17.486 18.051 18.501 18.924 19.31 19.325 18.763 18.089 17.38 16.623 15.781 15.015 14.25 13.569 12.85 12.177 11.596 11.027 10.443 9.9 9.414 8.881 8.399 7.985 7.537 7.075 6.682 6.247 5.803 5.474 5.136 4.761 4.364 3.96 3.697 3.426 2.984 2.674 2.354 2.186 1.816 1.414 0.987 0.774 0.079 0.1 -0.175 -0.464 -1.051 -1.386 -1.768 -2.181 -2.655 -3.222 -3.931 -6.171 -6 ,412 ,KEBNE ,17025078,Wed Dec 22 11:46:58 CET,Wed Dec 22 13:44:12 CET,0.0 1.374 1.888 2.285 2.623 2.939 3.223 3.488 3.988 4.206 4.408 4.31 4.98 5.166 5.52 5.855 6.162 6.304 6.59 6.874 7.265 7.516 7.758 8.088 8.398 8.689 8.965 9.238 9.59 9.915 10.226 10.583 10.902 11.21 11.575 11.995 12.384 12.794 13.219 13.581 13.975 14.463 14.954 15.397 15.845 16.339 16.888 17.367 17.779 18.028 17.929 17.244 16.389 15.494 14.567 13.672 12.827 12.033 11.311 10.535 9.8 9.129 8.522 7.923 7.351 6.836 6.281 5.764 5.319 4.852 4.37 4.007 3.638 3.211 2.88 2.557 2.202 1.818 1.43 1.15 0.839 0.357 0.031 -0.308 -0.472 -0.828 -1.223 -1.619 -1.838 -2.565 -2.604 -2.891 -3.171 -3.75 -4.084 -4.455 -4.865 -5.348 -5.925 -6.669 -9.236 -7 ,4374 ,KEBNE ,17025079,Wed Dec 22 11:46:58 CET,Wed Dec 22 13:43:05 CET,0.0 1.202 1.713 2.08 2.39 2.706 3.007 3.281 3.753 3.964 4.164 4.048 4.699 4.854 5.161 5.463 5.766 5.918 6.207 6.471 6.841 7.071 7.288 7.606 7.912 8.211 8.499 8.776 9.117 9.449 9.762 10.086 10.415 10.747 11.061 11.363 11.664 12.046 12.498 12.937 13.324 13.789 14.336 14.75 15.174 15.625 16.096 16.579 17.12 17.537 17.557 17.053 16.275 15.382 14.491 13.616 12.782 12.038 11.396 10.706 10.062 9.495 8.929 8.327 7.767 7.289 6.743 6.2 5.755 5.282 4.772 4.38 3.965 3.491 3.131 2.778 2.411 2.019 1.617 1.326 1.013 0.528 0.196 -0.139 -0.317 -0.698 -1.115 -1.542 -1.765 -2.486 -2.491 -2.766 -3.041 -3.61 -3.935 -4.3 -4.709 -5.212 -5.769 -6.433 -9.429 -8 ,16241 ,KEBNE ,17025080,Wed Dec 22 11:46:57 CET,Wed Dec 22 13:44:07 CET,0.0 1.575 2.213 2.732 3.167 3.538 3.857 4.143 4.674 4.922 5.159 5.136 5.802 6.002 6.397 6.777 7.131 7.295 7.601 7.91 8.339 8.6 8.866 9.251 9.597 9.927 10.257 10.552 10.891 11.217 11.537 11.93 12.289 12.593 12.957 13.391 13.782 14.161 14.546 14.974 15.418 15.888 16.421 16.914 17.443 17.967 18.458 18.936 19.376 19.718 19.724 19.212 18.467 17.611 16.749 15.969 15.231 14.504 13.822 13.091 12.475 11.931 11.401 10.886 10.408 9.985 9.534 9.108 8.741 8.357 7.949 7.616 7.273 6.899 6.582 6.244 5.893 5.534 5.165 4.921 4.678 4.273 3.966 3.646 3.481 3.139 2.798 2.412 2.193 1.498 1.486 1.217 0.916 0.269 -0.082 -0.49 -0.919 -1.403 -2.076 -3.014 -5.814 -9 ,22796 ,KEBNE ,17025081,Wed Dec 22 11:47:59 CET,Wed Dec 22 13:43:56 CET,0.0 1.463 1.999 2.408 2.759 3.067 3.324 3.567 4.033 4.242 4.446 4.343 4.967 5.124 5.444 5.747 6.025 6.162 6.442 6.708 7.078 7.317 7.552 7.908 8.229 8.521 8.834 9.144 9.534 9.885 10.206 10.61 11.001 11.36 11.77 12.209 12.601 13.004 13.427 13.853 14.269 14.729 15.221 15.632 16.088 16.565 16.99 17.39 17.746 17.993 17.963 17.428 16.674 15.821 15.033 14.297 13.589 12.875 12.169 11.418 10.749 10.146 9.57 8.988 8.445 7.976 7.482 7.009 6.597 6.139 5.633 5.229 4.823 4.411 4.089 3.728 3.358 2.995 2.609 2.337 2.053 1.622 1.312 0.983 0.816 0.491 0.129 -0.296 -0.517 -1.238 -1.217 -1.478 -1.769 -2.402 -2.729 -3.105 -3.541 -4.028 -4.616 -5.312 -6.69 -10 ,4753 ,KEBNE ,17025082,Wed Dec 22 11:47:59 CET,Wed Dec 22 13:46:20 CET,0.0 3.597 4.27 4.751 5.235 5.668 6.026 6.334 6.825 7.038 7.265 7.226 7.907 8.1 8.479 8.831 9.156 9.306 9.602 9.88 10.258 10.496 10.73 11.068 11.386 11.693 11.98 12.271 12.655 12.996 13.303 13.684 14.081 14.447 14.842 15.299 15.726 16.161 16.612 17.077 17.553 18.031 18.507 18.963 19.453 19.919 20.429 20.936 21.418 21.784 21.886 21.55 20.821 19.945 19.107 18.322 17.487 16.662 15.992 15.306 14.68 14.085 13.499 12.95 12.408 11.881 11.322 10.83 10.422 10.001 9.547 9.166 8.762 8.329 8.009 7.687 7.349 6.986 6.605 6.323 6.014 5.548 5.227 4.881 4.699 4.316 3.903 3.457 3.229 2.512 2.497 2.23 1.956 1.39 1.051 0.675 0.258 -0.232 -0.806 -1.554 -4.41 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23475_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23475_23468.txt deleted file mode 100644 index 4bbec069..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23475_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25545 ,KEBNE ,17025083,Wed Dec 22 11:47:59 CET,Wed Dec 22 13:44:21 CET,0.0 1.046 1.619 2.086 2.469 2.804 3.116 3.391 3.905 4.153 4.387 4.339 5.029 5.224 5.606 5.989 6.329 6.471 6.766 7.056 7.448 7.701 7.943 8.29 8.614 8.938 9.264 9.577 9.989 10.392 10.755 11.16 11.57 11.957 12.364 12.827 13.256 13.681 14.093 14.477 14.913 15.433 15.944 16.397 16.886 17.357 17.88 18.437 18.816 18.884 18.468 17.462 16.29 15.155 14.078 12.991 11.989 11.059 10.283 9.507 8.845 8.271 7.656 7.058 6.475 5.907 5.316 4.791 4.349 3.884 3.376 2.953 2.531 2.085 1.729 1.341 0.953 0.577 0.167 -0.132 -0.451 -0.928 -1.247 -1.582 -1.755 -2.103 -2.465 -2.874 -3.089 -3.797 -3.725 -3.962 -4.236 -4.864 -5.189 -5.501 -5.84 -6.205 -6.652 -7.311 -8.715 -2 ,18823 ,KEBNE ,17025084,Wed Dec 22 11:48:00 CET,Wed Dec 22 13:46:09 CET,0.0 0.862 1.376 1.809 2.182 2.49 2.794 3.097 3.614 3.845 4.076 4.039 4.731 4.914 5.258 5.599 5.928 6.095 6.407 6.689 7.108 7.381 7.638 7.997 8.338 8.663 8.965 9.24 9.601 9.962 10.302 10.701 11.088 11.45 11.842 12.258 12.677 13.145 13.578 13.981 14.375 14.85 15.392 15.844 16.322 16.806 17.244 17.659 18.048 18.237 17.998 17.124 16.059 15.022 14.045 13.036 12.112 11.235 10.426 9.648 8.946 8.303 7.693 7.098 6.52 5.986 5.419 4.861 4.369 3.911 3.442 3.03 2.617 2.193 1.844 1.479 1.105 0.704 0.281 -0.013 -0.319 -0.793 -1.122 -1.463 -1.641 -2.013 -2.395 -2.794 -3.003 -3.721 -3.688 -3.925 -4.175 -4.726 -5.019 -5.349 -5.73 -6.176 -6.671 -7.338 -9.06 -3 ,15285 ,KEBNE ,17025085,Wed Dec 22 11:47:59 CET,Wed Dec 22 13:45:35 CET,0.0 0.923 1.461 1.881 2.259 2.6 2.91 3.184 3.687 3.925 4.141 4.056 4.72 4.907 5.263 5.586 5.89 6.042 6.34 6.612 7.015 7.276 7.529 7.885 8.219 8.553 8.865 9.179 9.602 9.958 10.283 10.683 11.056 11.419 11.802 12.199 12.604 13.052 13.494 13.959 14.44 14.899 15.389 15.864 16.371 16.882 17.423 17.922 18.344 18.611 18.266 17.127 15.982 14.916 13.879 12.852 11.892 11.0 10.21 9.408 8.738 8.147 7.546 6.937 6.358 5.831 5.255 4.738 4.319 3.858 3.363 2.958 2.512 2.015 1.622 1.228 0.837 0.434 0.019 -0.26 -0.555 -1.04 -1.378 -1.712 -1.878 -2.227 -2.588 -2.957 -3.161 -3.889 -3.831 -4.066 -4.331 -4.928 -5.265 -5.619 -5.995 -6.408 -6.88 -7.467 -9.095 -4 ,454 ,KEBNE ,17025086,Wed Dec 22 11:47:59 CET,Wed Dec 22 13:46:21 CET,0.0 0.758 1.22 1.628 1.976 2.287 2.586 2.856 3.339 3.566 3.785 3.712 4.399 4.59 4.933 5.256 5.573 5.726 6.036 6.342 6.77 7.041 7.302 7.67 8.036 8.394 8.718 9.017 9.392 9.752 10.1 10.536 10.944 11.322 11.742 12.171 12.572 13.013 13.494 13.942 14.361 14.82 15.302 15.735 16.232 16.801 17.375 17.994 18.712 19.067 18.576 17.4 16.167 14.995 13.857 12.791 11.78 10.879 10.139 9.293 8.466 7.728 7.109 6.526 5.924 5.386 4.854 4.367 3.909 3.41 2.898 2.468 2.01 1.531 1.176 0.828 0.454 0.085 -0.298 -0.588 -0.892 -1.363 -1.696 -2.059 -2.264 -2.701 -3.135 -3.592 -3.844 -4.625 -4.647 -4.933 -5.236 -5.839 -6.197 -6.619 -7.052 -7.541 -8.131 -8.856 -10.421 -5 ,10380 ,KEBNE ,17025087,Wed Dec 22 11:47:59 CET,Wed Dec 22 13:45:18 CET,0.0 1.009 1.599 2.088 2.486 2.822 3.131 3.409 3.911 4.149 4.372 4.294 4.982 5.177 5.546 5.888 6.219 6.388 6.713 7.005 7.42 7.679 7.929 8.312 8.667 8.998 9.322 9.643 10.039 10.413 10.791 11.212 11.585 11.962 12.372 12.777 13.172 13.582 13.975 14.421 14.883 15.337 15.814 16.265 16.762 17.291 17.857 18.362 18.788 19.018 18.714 17.759 16.693 15.568 14.464 13.415 12.508 11.683 10.929 10.11 9.405 8.792 8.2 7.623 7.049 6.505 5.92 5.388 4.931 4.461 3.957 3.538 3.096 2.619 2.256 1.897 1.535 1.128 0.701 0.421 0.136 -0.321 -0.653 -1.02 -1.209 -1.595 -2.007 -2.435 -2.654 -3.377 -3.352 -3.604 -3.876 -4.457 -4.757 -5.095 -5.492 -5.915 -6.432 -7.07 -8.451 -6 ,6804 ,KEBNE ,17025088,Wed Dec 22 11:48:00 CET,Wed Dec 22 13:46:01 CET,0.0 1.004 1.596 2.076 2.463 2.806 3.124 3.413 3.927 4.168 4.394 4.325 5.016 5.216 5.58 5.929 6.259 6.424 6.74 7.042 7.455 7.706 7.96 8.325 8.684 9.037 9.364 9.67 10.024 10.358 10.72 11.15 11.514 11.861 12.27 12.716 13.111 13.503 13.946 14.401 14.829 15.292 15.796 16.298 16.835 17.352 17.842 18.297 18.661 18.762 18.502 17.482 16.168 14.949 13.857 12.834 11.938 11.12 10.403 9.575 8.846 8.267 7.657 7.038 6.502 6.015 5.436 4.926 4.494 4.012 3.506 3.105 2.669 2.221 1.896 1.531 1.136 0.731 0.316 0.038 -0.253 -0.717 -1.038 -1.384 -1.561 -1.914 -2.292 -2.696 -2.9 -3.624 -3.628 -3.885 -4.146 -4.674 -4.95 -5.285 -5.699 -6.193 -6.779 -7.437 -8.878 -7 ,5674 ,KEBNE ,17025089,Wed Dec 22 11:48:00 CET,Wed Dec 22 13:44:38 CET,0.0 0.989 1.545 1.995 2.388 2.729 3.036 3.325 3.853 4.093 4.312 4.245 4.933 5.118 5.478 5.829 6.136 6.279 6.564 6.846 7.258 7.517 7.771 8.148 8.503 8.827 9.136 9.449 9.841 10.198 10.52 10.878 11.235 11.588 11.98 12.448 12.896 13.295 13.675 14.069 14.455 14.874 15.354 15.805 16.288 16.77 17.22 17.653 18.026 18.174 17.825 16.738 15.588 14.513 13.455 12.443 11.475 10.57 9.849 9.123 8.465 7.874 7.251 6.633 6.058 5.509 4.939 4.426 3.975 3.488 2.967 2.529 2.074 1.607 1.24 0.849 0.441 0.022 -0.412 -0.715 -1.034 -1.51 -1.837 -2.2 -2.391 -2.778 -3.179 -3.588 -3.81 -4.545 -4.529 -4.788 -5.068 -5.66 -6.018 -6.403 -6.798 -7.253 -7.819 -8.569 -10.844 -8 ,22903 ,KEBNE ,17025090,Wed Dec 22 11:49:01 CET,Wed Dec 22 13:47:09 CET,0.0 1.018 1.529 1.931 2.317 2.653 2.933 3.211 3.737 3.97 4.186 4.097 4.758 4.935 5.282 5.607 5.915 6.073 6.371 6.649 7.072 7.341 7.588 7.947 8.298 8.632 8.946 9.25 9.619 9.971 10.332 10.697 11.013 11.354 11.741 12.145 12.555 13.032 13.471 13.9 14.337 14.784 15.373 15.943 16.466 16.973 17.506 18.015 18.487 18.76 18.373 17.299 16.224 15.073 13.933 12.922 11.981 11.065 10.294 9.514 8.724 7.988 7.368 6.796 6.217 5.69 5.126 4.595 4.164 3.736 3.272 2.862 2.42 1.954 1.601 1.242 0.866 0.485 0.079 -0.21 -0.505 -0.972 -1.316 -1.668 -1.843 -2.193 -2.561 -2.969 -3.178 -3.9 -3.891 -4.14 -4.43 -5.088 -5.414 -5.783 -6.204 -6.644 -7.112 -7.673 -9.136 -9 ,22871 ,KEBNE ,17025091,Wed Dec 22 11:49:01 CET,Wed Dec 22 13:46:20 CET,0.0 0.853 1.361 1.777 2.138 2.473 2.771 3.046 3.536 3.763 3.973 3.866 4.526 4.71 5.074 5.424 5.747 5.904 6.207 6.483 6.878 7.135 7.382 7.724 8.057 8.386 8.705 9.007 9.4 9.778 10.122 10.536 10.893 11.246 11.679 12.135 12.538 12.951 13.382 13.8 14.239 14.7 15.177 15.602 16.088 16.553 17.027 17.512 17.863 18.023 17.789 16.836 15.587 14.33 13.288 12.355 11.477 10.647 9.856 9.001 8.263 7.615 7.023 6.427 5.806 5.247 4.692 4.163 3.712 3.24 2.715 2.294 1.875 1.42 1.065 0.721 0.336 -0.076 -0.504 -0.793 -1.076 -1.51 -1.813 -2.138 -2.302 -2.634 -2.989 -3.396 -3.612 -4.333 -4.35 -4.607 -4.868 -5.461 -5.764 -6.1 -6.497 -6.908 -7.373 -7.993 -9.313 -10 ,15582 ,KEBNE ,17025092,Wed Dec 22 11:49:01 CET,Wed Dec 22 13:46:26 CET,0.0 0.831 1.351 1.749 2.123 2.434 2.715 2.996 3.498 3.729 3.958 3.896 4.586 4.786 5.161 5.502 5.804 5.948 6.238 6.519 6.929 7.185 7.428 7.781 8.133 8.475 8.808 9.142 9.536 9.875 10.21 10.64 11.045 11.413 11.829 12.278 12.705 13.164 13.594 14.053 14.519 14.955 15.486 16.002 16.521 17.049 17.584 18.091 18.468 18.636 18.371 17.368 16.235 15.095 13.969 12.937 12.031 11.189 10.471 9.736 9.059 8.409 7.73 7.114 6.561 6.032 5.484 4.984 4.537 4.071 3.579 3.154 2.703 2.231 1.854 1.464 1.071 0.67 0.261 -0.029 -0.348 -0.824 -1.135 -1.478 -1.663 -2.052 -2.463 -2.883 -3.089 -3.8 -3.781 -4.044 -4.319 -4.938 -5.266 -5.597 -5.962 -6.414 -6.927 -7.476 -8.682 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt deleted file mode 100644 index cd6d6716..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1299 ,KEBNE ,16690157,Thu Nov 25 08:03:57 CET,Thu Nov 25 08:05:14 CET,0.0 1.214 1.685 2.071 2.435 2.751 3.011 3.253 3.731 3.956 4.164 4.08 4.755 4.933 5.281 5.616 5.911 6.05 6.325 6.587 6.959 7.187 7.422 7.782 8.108 8.401 8.693 8.99 9.353 9.667 9.943 10.299 10.691 11.064 11.493 11.964 12.362 12.783 13.255 13.725 14.148 14.608 15.131 15.606 16.109 16.603 17.142 17.675 18.15 18.57 18.729 18.378 17.807 17.166 16.485 15.855 15.298 14.729 14.204 13.664 13.192 12.739 12.271 11.832 11.456 11.058 10.567 10.13 9.761 9.402 8.985 8.627 8.235 7.813 7.497 7.166 6.825 6.444 6.03 5.754 5.489 5.086 4.785 4.454 4.289 3.955 3.582 3.168 2.961 2.265 2.289 2.052 1.805 1.248 0.942 0.605 0.212 -0.218 -0.688 -1.298 -2.777 -2 ,12392 ,KEBNE ,16690883,Thu Nov 25 08:38:31 CET,Thu Nov 25 10:34:43 CET,0.0 0.916 1.421 1.84 2.169 2.453 2.73 2.987 3.439 3.643 3.834 3.726 4.405 4.591 4.941 5.272 5.582 5.735 6.036 6.319 6.686 6.93 7.181 7.528 7.856 8.164 8.454 8.733 9.082 9.426 9.751 10.104 10.456 10.807 11.162 11.497 11.833 12.236 12.639 13.035 13.414 13.791 14.225 14.641 15.101 15.599 16.128 16.644 17.161 17.617 17.826 17.458 16.883 16.259 15.572 14.89 14.279 13.711 13.175 12.578 12.042 11.535 11.066 10.636 10.2 9.767 9.299 8.89 8.531 8.123 7.681 7.299 6.891 6.473 6.144 5.809 5.465 5.111 4.725 4.442 4.158 3.722 3.422 3.098 2.927 2.592 2.237 1.849 1.654 0.968 1.029 0.794 0.554 0.046 -0.249 -0.574 -0.892 -1.247 -1.685 -2.31 -4.301 -3 ,2240 ,KEBNE ,16690159,Thu Nov 25 08:03:55 CET,Thu Nov 25 08:05:01 CET,0.0 0.82 1.279 1.647 1.972 2.297 2.58 2.839 3.331 3.548 3.757 3.65 4.295 4.475 4.836 5.17 5.46 5.596 5.861 6.112 6.482 6.715 6.943 7.293 7.619 7.912 8.206 8.489 8.851 9.202 9.531 9.887 10.227 10.57 10.949 11.336 11.687 12.102 12.53 12.93 13.355 13.862 14.394 14.838 15.313 15.814 16.355 16.889 17.38 17.766 17.975 17.768 17.241 16.604 16.001 15.373 14.741 14.166 13.616 12.979 12.432 11.935 11.448 10.952 10.473 10.028 9.539 9.08 8.696 8.292 7.85 7.473 7.077 6.65 6.306 5.969 5.618 5.246 4.857 4.587 4.318 3.908 3.617 3.297 3.121 2.741 2.339 1.93 1.717 1.003 1.003 0.756 0.514 -0.001 -0.304 -0.642 -1.004 -1.396 -1.889 -2.547 -4.234 -4 ,10527 ,KEBNE ,16690885,Thu Nov 25 08:38:31 CET,Thu Nov 25 10:35:49 CET,0.0 0.922 1.364 1.747 2.105 2.427 2.728 3.021 3.526 3.729 3.924 3.829 4.513 4.687 5.008 5.306 5.603 5.753 6.041 6.309 6.68 6.918 7.146 7.464 7.775 8.074 8.359 8.65 9.019 9.368 9.698 10.076 10.399 10.68 11.029 11.417 11.802 12.212 12.587 12.953 13.365 13.809 14.256 14.676 15.143 15.657 16.205 16.743 17.243 17.627 17.713 17.349 16.783 16.174 15.577 14.946 14.326 13.764 13.263 12.682 12.128 11.638 11.191 10.761 10.32 9.913 9.502 9.079 8.699 8.348 7.928 7.567 7.195 6.779 6.45 6.092 5.728 5.359 4.961 4.678 4.414 4.009 3.702 3.381 3.218 2.881 2.503 2.087 1.868 1.164 1.172 0.925 0.665 0.105 -0.184 -0.514 -0.935 -1.408 -1.952 -2.732 -4.643 -5 ,7821 ,KEBNE ,16690161,Thu Nov 25 08:03:52 CET,Thu Nov 25 08:05:08 CET,0.0 1.124 1.593 1.967 2.277 2.559 2.833 3.089 3.582 3.812 4.018 3.922 4.579 4.763 5.122 5.458 5.77 5.913 6.189 6.456 6.83 7.075 7.316 7.634 7.936 8.24 8.538 8.823 9.184 9.527 9.841 10.193 10.515 10.858 11.246 11.616 11.972 12.351 12.722 13.099 13.493 13.927 14.405 14.839 15.284 15.756 16.302 16.882 17.399 17.811 18.051 17.765 17.22 16.571 15.925 15.291 14.662 14.085 13.6 13.061 12.561 12.108 11.673 11.208 10.75 10.36 9.907 9.464 9.082 8.7 8.276 7.878 7.465 7.066 6.744 6.398 6.054 5.721 5.363 5.085 4.798 4.36 4.051 3.721 3.55 3.192 2.795 2.346 2.127 1.435 1.481 1.245 0.98 0.39 0.076 -0.239 -0.609 -1.041 -1.555 -2.209 -3.504 -6 ,9890 ,KEBNE ,16690162,Thu Nov 25 08:03:51 CET,Thu Nov 25 08:05:12 CET,0.0 0.941 1.388 1.795 2.172 2.502 2.792 3.06 3.534 3.75 3.958 3.881 4.554 4.739 5.084 5.403 5.705 5.853 6.132 6.397 6.766 7.006 7.248 7.582 7.889 8.196 8.488 8.763 9.135 9.481 9.795 10.166 10.522 10.868 11.242 11.606 11.94 12.297 12.67 13.052 13.451 13.937 14.502 15.073 15.734 16.322 16.886 17.46 18.088 18.64 18.721 18.223 17.578 16.89 16.218 15.553 14.915 14.319 13.769 13.173 12.67 12.227 11.783 11.369 10.95 10.548 10.131 9.739 9.347 8.904 8.449 8.081 7.696 7.261 6.922 6.584 6.226 5.842 5.456 5.192 4.921 4.508 4.22 3.903 3.728 3.362 2.991 2.603 2.395 1.699 1.72 1.473 1.229 0.681 0.364 0.005 -0.359 -0.777 -1.272 -1.892 -3.414 -7 ,8013 ,KEBNE ,16690163,Thu Nov 25 08:03:52 CET,Thu Nov 25 08:05:09 CET,0.0 1.333 1.854 2.277 2.626 2.929 3.193 3.438 3.899 4.119 4.325 4.227 4.884 5.065 5.395 5.706 6.013 6.153 6.435 6.719 7.093 7.329 7.552 7.867 8.165 8.454 8.732 8.997 9.343 9.672 9.984 10.371 10.756 11.083 11.439 11.85 12.215 12.59 12.973 13.356 13.749 14.189 14.699 15.173 15.685 16.245 16.814 17.344 17.855 18.24 18.348 17.96 17.335 16.624 15.907 15.188 14.495 13.863 13.299 12.716 12.176 11.677 11.209 10.761 10.326 9.889 9.405 8.944 8.543 8.13 7.715 7.38 7.015 6.609 6.267 5.942 5.602 5.21 4.811 4.539 4.255 3.805 3.49 3.158 2.987 2.641 2.27 1.876 1.662 0.961 0.952 0.689 0.416 -0.231 -0.606 -0.979 -1.351 -1.762 -2.256 -2.926 -4.622 -8 ,19052 ,KEBNE ,16690889,Thu Nov 25 08:38:31 CET,Thu Nov 25 10:34:56 CET,0.0 1.52 2.017 2.427 2.773 3.057 3.329 3.591 4.082 4.315 4.526 4.439 5.094 5.26 5.591 5.913 6.224 6.379 6.689 6.979 7.378 7.628 7.871 8.227 8.549 8.861 9.171 9.467 9.821 10.139 10.449 10.784 11.082 11.404 11.813 12.254 12.629 13.018 13.401 13.76 14.126 14.58 15.153 15.649 16.159 16.677 17.21 17.741 18.269 18.719 18.859 18.545 17.937 17.253 16.599 15.877 15.2 14.582 14.002 13.363 12.814 12.331 11.839 11.39 10.962 10.517 10.036 9.613 9.275 8.902 8.427 8.034 7.637 7.204 6.866 6.521 6.178 5.813 5.402 5.12 4.838 4.401 4.099 3.784 3.615 3.261 2.872 2.455 2.238 1.53 1.561 1.328 1.084 0.508 0.181 -0.15 -0.502 -0.908 -1.417 -2.061 -3.679 -9 ,14444 ,KEBNE ,16690890,Thu Nov 25 08:38:31 CET,Thu Nov 25 10:35:42 CET,0.0 0.86 1.343 1.769 2.123 2.443 2.738 2.998 3.451 3.66 3.865 3.744 4.402 4.574 4.926 5.263 5.568 5.712 5.996 6.262 6.631 6.88 7.124 7.462 7.78 8.098 8.397 8.674 9.035 9.379 9.733 10.164 10.565 10.943 11.317 11.69 12.053 12.488 12.977 13.417 13.785 14.189 14.689 15.178 15.71 16.243 16.807 17.363 17.899 18.3 18.413 18.111 17.565 16.936 16.314 15.691 15.085 14.502 13.967 13.432 12.941 12.443 11.917 11.402 10.931 10.532 10.119 9.726 9.374 8.955 8.473 8.106 7.745 7.339 7.019 6.689 6.341 5.96 5.542 5.266 4.992 4.536 4.201 3.868 3.702 3.338 2.962 2.581 2.384 1.692 1.732 1.477 1.2 0.627 0.312 -0.033 -0.364 -0.753 -1.268 -1.897 -3.725 -10 ,18824 ,KEBNE ,16690166,Thu Nov 25 08:03:52 CET,Thu Nov 25 08:05:12 CET,0.0 1.504 2.089 2.518 2.855 3.158 3.437 3.694 4.177 4.411 4.628 4.511 5.189 5.386 5.748 6.086 6.395 6.536 6.808 7.074 7.453 7.695 7.921 8.232 8.553 8.845 9.128 9.421 9.762 10.082 10.413 10.82 11.205 11.555 11.951 12.395 12.761 13.13 13.532 13.943 14.363 14.808 15.314 15.78 16.279 16.78 17.266 17.751 18.317 18.813 18.97 18.532 17.838 17.108 16.397 15.685 15.053 14.478 13.894 13.259 12.744 12.273 11.736 11.211 10.761 10.321 9.823 9.357 8.943 8.523 8.063 7.683 7.283 6.85 6.523 6.171 5.804 5.437 5.036 4.754 4.466 4.028 3.728 3.406 3.238 2.879 2.518 2.147 1.96 1.276 1.296 1.048 0.801 0.274 -0.028 -0.349 -0.688 -1.075 -1.511 -2.097 -3.751 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23474.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23474.txt deleted file mode 100644 index b62f3eac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23474.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2291 ,KEBNE ,16690892,Thu Nov 25 08:38:32 CET,Thu Nov 25 10:35:49 CET,0.0 1.974 2.64 3.116 3.485 3.828 4.147 4.447 4.977 5.222 5.456 5.394 6.084 6.28 6.637 6.986 7.312 7.47 7.797 8.105 8.527 8.795 9.055 9.427 9.771 10.097 10.437 10.77 11.173 11.566 11.954 12.409 12.814 13.198 13.667 14.2 14.705 15.215 15.744 16.303 16.897 17.566 18.385 19.187 19.975 20.756 21.536 22.425 23.423 24.239 24.752 24.734 24.4 23.972 23.43 22.856 22.331 21.778 21.251 20.679 20.148 19.601 19.054 18.595 18.183 17.748 17.262 16.819 16.445 16.055 15.607 15.232 14.839 14.449 14.139 13.801 13.454 13.1 12.719 12.448 12.169 11.743 11.456 11.161 11.011 10.696 10.358 9.994 9.797 9.112 9.172 8.956 8.72 8.212 7.936 7.636 7.308 6.928 6.478 5.952 4.823 -2 ,8139 ,KEBNE ,16690168,Thu Nov 25 08:03:52 CET,Thu Nov 25 08:05:12 CET,0.0 1.485 2.085 2.507 2.883 3.236 3.551 3.845 4.393 4.634 4.848 4.755 5.434 5.628 6.024 6.414 6.77 6.942 7.257 7.535 7.952 8.224 8.483 8.853 9.223 9.588 9.927 10.245 10.652 11.021 11.382 11.874 12.343 12.762 13.236 13.778 14.309 14.853 15.42 16.006 16.599 17.3 18.123 18.829 19.509 20.176 20.912 21.711 22.509 23.247 23.742 23.669 23.354 22.904 22.338 21.695 21.047 20.45 19.894 19.304 18.783 18.318 17.842 17.339 16.84 16.348 15.82 15.313 14.853 14.392 13.892 13.474 13.055 12.599 12.245 11.893 11.529 11.141 10.741 10.463 10.165 9.707 9.383 9.036 8.85 8.474 8.107 7.705 7.484 6.778 6.762 6.488 6.206 5.614 5.3 4.939 4.504 4.013 3.435 2.627 0.507 -3 ,19912 ,KEBNE ,16690169,Thu Nov 25 08:03:51 CET,Thu Nov 25 08:05:19 CET,0.0 1.597 2.144 2.569 2.975 3.326 3.622 3.902 4.44 4.703 4.953 4.907 5.587 5.768 6.133 6.463 6.772 6.928 7.236 7.549 7.999 8.272 8.532 8.909 9.267 9.615 9.966 10.323 10.738 11.109 11.473 11.901 12.32 12.711 13.158 13.645 14.097 14.592 15.145 15.717 16.283 16.906 17.655 18.407 19.189 20.031 20.869 21.675 22.501 23.259 23.8 23.816 23.506 23.064 22.567 21.955 21.349 20.796 20.297 19.776 19.255 18.723 18.206 17.706 17.227 16.754 16.238 15.784 15.379 14.956 14.535 14.175 13.788 13.396 13.096 12.791 12.46 12.073 11.651 11.363 11.076 10.655 10.368 10.06 9.897 9.559 9.206 8.821 8.616 7.919 7.92 7.677 7.429 6.899 6.572 6.194 5.766 5.266 4.706 3.985 1.051 -4 ,31739 ,KEBNE ,16690170,Thu Nov 25 08:03:52 CET,Thu Nov 25 08:05:15 CET,0.0 1.341 1.99 2.444 2.805 3.188 3.555 3.867 4.406 4.657 4.903 4.863 5.549 5.738 6.083 6.409 6.749 6.91 7.201 7.476 7.899 8.18 8.463 8.864 9.221 9.577 9.915 10.24 10.661 11.052 11.441 11.918 12.341 12.722 13.151 13.655 14.164 14.697 15.251 15.815 16.403 17.109 17.844 18.55 19.344 20.103 20.983 21.869 22.647 23.348 24.065 24.274 23.993 23.624 23.177 22.686 22.172 21.592 21.063 20.515 19.972 19.5 19.052 18.596 18.186 17.815 17.357 16.912 16.527 16.099 15.627 15.246 14.851 14.427 14.101 13.747 13.355 12.946 12.523 12.232 11.938 11.455 11.103 10.745 10.556 10.173 9.796 9.377 9.159 8.464 8.484 8.227 7.972 7.437 7.111 6.759 6.392 5.928 5.337 4.699 2.689 -5 ,30412 ,KEBNE ,16690896,Thu Nov 25 08:39:32 CET,Thu Nov 25 10:37:07 CET,0.0 1.25 1.852 2.342 2.771 3.142 3.458 3.749 4.263 4.48 4.695 4.646 5.342 5.557 5.941 6.317 6.657 6.808 7.114 7.408 7.837 8.103 8.347 8.73 9.102 9.463 9.814 10.153 10.606 11.017 11.386 11.809 12.204 12.619 13.106 13.614 14.059 14.532 15.051 15.627 16.229 16.881 17.624 18.317 19.091 19.89 20.722 21.52 22.315 23.101 23.842 24.018 23.711 23.285 22.782 22.216 21.655 21.106 20.586 20.047 19.551 19.098 18.639 18.179 17.708 17.263 16.821 16.407 16.031 15.611 15.169 14.799 14.397 13.965 13.641 13.319 12.969 12.592 12.205 11.93 11.653 11.236 10.942 10.645 10.491 10.158 9.786 9.373 9.167 8.465 8.464 8.214 7.935 7.299 6.967 6.616 6.226 5.828 5.368 4.723 2.338 -6 ,12445 ,KEBNE ,16690897,Thu Nov 25 08:39:32 CET,Thu Nov 25 10:38:21 CET,0.0 3.959 4.529 4.958 5.303 5.617 5.952 6.264 6.792 7.019 7.223 7.146 7.821 8.005 8.371 8.731 9.071 9.232 9.546 9.839 10.245 10.511 10.767 11.132 11.464 11.783 12.119 12.458 12.876 13.284 13.675 14.118 14.548 14.97 15.464 15.996 16.479 17.017 17.557 18.117 18.699 19.317 20.011 20.673 21.355 22.022 22.772 23.558 24.388 25.294 26.141 26.387 26.14 25.677 25.161 24.617 24.101 23.58 23.075 22.439 21.82 21.299 20.764 20.196 19.66 19.195 18.743 18.349 17.966 17.525 17.076 16.711 16.35 15.967 15.633 15.279 14.939 14.588 14.184 13.911 13.644 13.225 12.934 12.622 12.46 12.106 11.723 11.316 11.105 10.426 10.469 10.219 9.954 9.36 9.039 8.678 8.25 7.812 7.31 6.701 4.691 -7 ,26973 ,KEBNE ,16690898,Thu Nov 25 08:39:32 CET,Thu Nov 25 10:35:50 CET,0.0 1.638 2.257 2.738 3.145 3.511 3.833 4.119 4.652 4.892 5.111 5.06 5.761 5.962 6.338 6.697 7.031 7.187 7.481 7.741 8.118 8.384 8.651 9.008 9.357 9.715 10.038 10.333 10.69 11.039 11.394 11.819 12.229 12.636 13.121 13.666 14.195 14.759 15.308 15.85 16.42 17.072 17.838 18.533 19.257 20.044 20.886 21.738 22.598 23.421 24.157 24.32 24.037 23.565 23.048 22.422 21.754 21.118 20.579 19.995 19.448 18.945 18.421 17.887 17.35 16.848 16.33 15.865 15.437 14.955 14.433 13.995 13.546 13.063 12.681 12.282 11.868 11.452 11.027 10.725 10.409 9.924 9.578 9.204 9.013 8.632 8.225 7.799 7.576 6.847 6.767 6.477 6.194 5.558 5.209 4.824 4.4 3.926 3.314 2.556 0.09 -8 ,10923 ,KEBNE ,16690899,Thu Nov 25 08:39:32 CET,Thu Nov 25 10:36:22 CET,0.0 5.585 6.328 6.81 7.218 7.583 7.907 8.213 8.749 8.973 9.183 9.119 9.798 9.985 10.358 10.716 11.052 11.206 11.507 11.802 12.233 12.518 12.798 13.21 13.585 13.915 14.237 14.565 14.977 15.363 15.745 16.202 16.618 16.999 17.468 18.011 18.492 19.028 19.591 20.152 20.715 21.355 22.155 22.874 23.572 24.34 25.209 26.055 26.874 27.651 28.396 28.634 28.342 27.86 27.371 26.83 26.255 25.637 25.049 24.438 23.835 23.272 22.751 22.235 21.731 21.262 20.776 20.331 19.945 19.548 19.115 18.752 18.395 18.037 17.738 17.4 17.051 16.689 16.323 16.07 15.8 15.383 15.078 14.727 14.537 14.147 13.738 13.309 13.079 12.356 12.304 11.995 11.683 11.063 10.718 10.374 9.977 9.526 9.0 8.255 5.837 -9 ,28018 ,KEBNE ,16690175,Thu Nov 25 08:03:52 CET,Thu Nov 25 08:05:10 CET,0.0 1.319 1.904 2.298 2.691 3.06 3.373 3.67 4.196 4.436 4.664 4.616 5.3 5.487 5.818 6.143 6.453 6.605 6.898 7.195 7.624 7.887 8.155 8.536 8.892 9.238 9.572 9.895 10.302 10.688 11.066 11.523 11.955 12.361 12.819 13.349 13.854 14.366 14.907 15.488 16.084 16.696 17.384 18.128 19.017 19.924 20.807 21.733 22.65 23.473 24.098 24.144 23.809 23.276 22.74 22.168 21.585 21.019 20.487 19.891 19.402 18.973 18.511 18.084 17.618 17.115 16.587 16.106 15.716 15.333 14.897 14.531 14.154 13.753 13.441 13.105 12.746 12.356 11.945 11.663 11.364 10.889 10.557 10.229 10.059 9.694 9.313 8.916 8.694 7.989 7.997 7.739 7.451 6.846 6.513 6.158 5.785 5.427 5.024 4.397 2.07 -10 ,5615 ,KEBNE ,16690901,Thu Nov 25 08:39:32 CET,Thu Nov 25 10:39:35 CET,0.0 1.393 2.021 2.521 2.921 3.252 3.547 3.809 4.342 4.592 4.817 4.785 5.468 5.657 6.032 6.382 6.699 6.853 7.169 7.478 7.922 8.215 8.497 8.885 9.249 9.607 9.967 10.291 10.664 11.031 11.378 11.794 12.197 12.581 13.013 13.478 13.921 14.417 14.981 15.597 16.21 16.872 17.664 18.434 19.245 20.079 20.932 21.809 22.787 23.66 24.299 24.28 23.953 23.576 23.035 22.424 21.874 21.364 20.894 20.4 19.941 19.456 18.981 18.555 18.113 17.684 17.211 16.792 16.446 16.076 15.71 15.397 15.029 14.632 14.319 13.969 13.599 13.235 12.856 12.595 12.317 11.88 11.581 11.247 11.075 10.713 10.339 9.952 9.748 9.051 9.099 8.867 8.622 8.114 7.826 7.494 7.127 6.697 6.217 5.669 4.101 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23475.txt deleted file mode 100644 index b78e782d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16802 ,KEBNE ,16690902,Thu Nov 25 08:39:32 CET,Thu Nov 25 10:35:22 CET,0.0 0.971 1.428 1.81 2.163 2.463 2.713 2.947 3.38 3.584 3.779 3.678 4.355 4.521 4.842 5.16 5.45 5.584 5.843 6.103 6.505 6.759 6.994 7.329 7.652 7.961 8.238 8.505 8.838 9.138 9.452 9.833 10.202 10.561 10.963 11.435 11.881 12.302 12.747 13.193 13.587 14.05 14.592 15.117 15.716 16.335 16.963 17.598 18.192 18.59 18.718 18.329 17.701 17.058 16.418 15.745 15.082 14.425 13.851 13.222 12.644 12.161 11.717 11.255 10.752 10.288 9.826 9.406 9.028 8.602 8.144 7.764 7.355 6.906 6.555 6.197 5.833 5.451 5.067 4.796 4.498 4.024 3.678 3.324 3.146 2.772 2.383 1.978 1.777 1.101 1.139 0.882 0.598 -0.004 -0.339 -0.71 -1.111 -1.614 -2.256 -3.053 -6.127 -2 ,27638 ,KEBNE ,16690903,Thu Nov 25 08:39:32 CET,Thu Nov 25 10:34:32 CET,0.0 0.953 1.416 1.775 2.08 2.347 2.582 2.808 3.248 3.451 3.646 3.522 4.193 4.376 4.714 5.028 5.33 5.476 5.753 6.009 6.37 6.613 6.856 7.171 7.474 7.778 8.055 8.308 8.669 9.04 9.338 9.697 10.092 10.455 10.859 11.321 11.749 12.208 12.713 13.223 13.686 14.159 14.688 15.184 15.721 16.291 16.868 17.374 17.836 18.23 18.421 18.049 17.471 16.851 16.192 15.46 14.796 14.211 13.702 13.085 12.495 11.987 11.461 10.915 10.417 9.982 9.485 9.012 8.611 8.208 7.766 7.362 6.919 6.455 6.106 5.737 5.345 4.959 4.56 4.261 3.944 3.481 3.161 2.819 2.644 2.281 1.905 1.525 1.331 0.628 0.672 0.433 0.187 -0.325 -0.618 -0.937 -1.276 -1.668 -2.139 -2.75 -4.557 -3 ,21589 ,KEBNE ,16690179,Thu Nov 25 08:03:52 CET,Thu Nov 25 08:04:57 CET,0.0 0.955 1.457 1.824 2.111 2.394 2.671 2.917 3.339 3.538 3.732 3.608 4.278 4.466 4.827 5.14 5.435 5.574 5.853 6.124 6.505 6.747 6.991 7.354 7.691 7.979 8.238 8.508 8.858 9.189 9.514 9.891 10.243 10.577 10.953 11.382 11.778 12.165 12.586 13.035 13.458 13.906 14.418 14.903 15.388 15.861 16.413 16.972 17.547 18.077 18.347 18.094 17.534 16.812 16.072 15.347 14.702 14.131 13.583 12.961 12.404 11.864 11.349 10.886 10.436 10.027 9.591 9.186 8.794 8.377 7.988 7.651 7.237 6.797 6.469 6.127 5.764 5.374 4.946 4.652 4.358 3.89 3.572 3.251 3.072 2.69 2.292 1.881 1.674 0.981 1.006 0.746 0.475 -0.092 -0.39 -0.733 -1.108 -1.535 -2.079 -2.763 -4.42 -4 ,18566 ,KEBNE ,16690905,Thu Nov 25 08:40:33 CET,Thu Nov 25 10:34:41 CET,0.0 1.068 1.557 1.904 2.199 2.48 2.75 3.013 3.497 3.719 3.925 3.832 4.493 4.658 4.992 5.314 5.597 5.728 5.992 6.256 6.621 6.855 7.091 7.421 7.722 8.0 8.273 8.549 8.896 9.205 9.505 9.905 10.294 10.62 10.958 11.364 11.751 12.143 12.552 12.936 13.325 13.777 14.294 14.819 15.394 15.953 16.547 17.144 17.696 18.147 18.395 18.171 17.695 17.11 16.497 15.846 15.226 14.652 14.074 13.445 12.838 12.281 11.803 11.352 10.899 10.465 9.978 9.517 9.098 8.661 8.219 7.847 7.46 7.044 6.705 6.356 5.976 5.559 5.131 4.839 4.533 4.059 3.737 3.41 3.237 2.876 2.491 2.077 1.872 1.176 1.21 0.97 0.711 0.143 -0.193 -0.575 -0.952 -1.377 -1.948 -2.605 -4.038 -5 ,7797 ,KEBNE ,16690906,Thu Nov 25 08:40:34 CET,Thu Nov 25 10:36:55 CET,0.0 0.992 1.469 1.877 2.198 2.497 2.776 3.045 3.556 3.787 3.999 3.911 4.579 4.759 5.093 5.436 5.768 5.916 6.19 6.457 6.852 7.094 7.325 7.642 7.948 8.279 8.587 8.854 9.185 9.504 9.818 10.201 10.566 10.887 11.233 11.615 11.964 12.349 12.75 13.146 13.548 13.985 14.494 14.977 15.485 16.06 16.717 17.351 17.963 18.477 18.739 18.513 18.054 17.465 16.873 16.286 15.697 15.09 14.557 14.046 13.554 13.067 12.587 12.134 11.652 11.172 10.718 10.351 10.002 9.572 9.119 8.723 8.315 7.931 7.612 7.241 6.86 6.464 6.04 5.777 5.53 5.109 4.783 4.451 4.283 3.933 3.554 3.132 2.919 2.228 2.252 2.013 1.765 1.195 0.861 0.467 0.053 -0.344 -0.794 -1.435 -3.186 -6 ,4436 ,KEBNE ,16690907,Thu Nov 25 08:40:34 CET,Thu Nov 25 10:36:29 CET,0.0 0.813 1.26 1.585 1.878 2.144 2.406 2.661 3.105 3.319 3.537 3.441 4.098 4.274 4.61 4.932 5.227 5.368 5.644 5.919 6.304 6.545 6.785 7.134 7.469 7.774 8.044 8.327 8.694 9.029 9.338 9.679 10.052 10.431 10.828 11.26 11.689 12.105 12.475 12.887 13.3 13.72 14.234 14.703 15.209 15.739 16.279 16.878 17.481 17.959 18.204 18.028 17.597 17.018 16.406 15.787 15.161 14.492 13.871 13.242 12.678 12.136 11.614 11.137 10.66 10.205 9.756 9.377 9.025 8.605 8.124 7.706 7.268 6.808 6.458 6.105 5.743 5.342 4.919 4.63 4.332 3.882 3.572 3.234 3.051 2.679 2.284 1.882 1.675 0.962 0.94 0.676 0.404 -0.181 -0.514 -0.873 -1.297 -1.804 -2.352 -3.119 -4.84 -7 ,20262 ,KEBNE ,16690183,Thu Nov 25 08:03:52 CET,Thu Nov 25 08:05:04 CET,0.0 0.942 1.407 1.801 2.135 2.447 2.726 2.978 3.447 3.661 3.855 3.724 4.388 4.554 4.864 5.162 5.455 5.594 5.866 6.133 6.494 6.722 6.949 7.271 7.596 7.92 8.226 8.508 8.853 9.191 9.517 9.887 10.211 10.528 10.913 11.32 11.697 12.112 12.552 12.988 13.391 13.854 14.38 14.843 15.374 15.941 16.521 17.116 17.714 18.272 18.618 18.391 17.896 17.328 16.749 16.134 15.521 14.91 14.394 13.838 13.325 12.908 12.484 12.022 11.602 11.241 10.772 10.306 9.923 9.522 9.096 8.723 8.314 7.905 7.575 7.215 6.863 6.497 6.098 5.811 5.519 5.061 4.739 4.405 4.232 3.886 3.518 3.098 2.873 2.159 2.174 1.933 1.68 1.116 0.808 0.468 0.088 -0.338 -0.821 -1.514 -4.092 -8 ,12141 ,KEBNE ,16690184,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:07:04 CET,0.0 1.793 2.447 2.978 3.404 3.768 4.122 4.468 5.079 5.345 5.602 5.61 6.291 6.493 6.83 7.119 7.382 7.511 7.767 8.017 8.374 8.592 8.808 9.125 9.426 9.711 9.984 10.238 10.56 10.857 11.14 11.474 11.797 12.104 12.448 12.867 13.285 13.687 14.041 14.443 14.876 15.287 15.787 16.303 16.819 17.371 17.968 18.53 19.08 19.582 19.844 19.537 18.964 18.337 17.727 17.082 16.446 15.819 15.287 14.698 14.142 13.64 13.159 12.71 12.207 11.71 11.22 10.771 10.366 9.951 9.51 9.134 8.731 8.305 7.975 7.622 7.251 6.861 6.46 6.19 5.923 5.492 5.167 4.831 4.661 4.307 3.935 3.539 3.331 2.639 2.679 2.434 2.161 1.549 1.218 0.857 0.433 -0.062 -0.644 -1.412 -3.004 -9 ,29494 ,KEBNE ,16690185,Thu Nov 25 08:05:54 CET,Thu Nov 25 08:07:08 CET,0.0 0.647 1.078 1.495 1.859 2.154 2.436 2.676 3.089 3.294 3.488 3.348 4.009 4.181 4.505 4.804 5.095 5.24 5.519 5.788 6.152 6.37 6.577 6.886 7.201 7.501 7.779 8.052 8.405 8.752 9.078 9.469 9.821 10.149 10.54 10.971 11.355 11.72 12.102 12.536 12.981 13.445 13.937 14.393 14.904 15.421 16.011 16.615 17.188 17.7 18.029 17.822 17.244 16.585 15.944 15.316 14.688 14.082 13.542 12.997 12.506 12.032 11.528 11.026 10.54 10.065 9.609 9.21 8.815 8.391 7.924 7.522 7.151 6.748 6.396 6.039 5.663 5.276 4.897 4.619 4.328 3.878 3.571 3.252 3.083 2.748 2.375 1.961 1.747 1.04 1.048 0.796 0.52 -0.1 -0.45 -0.791 -1.159 -1.59 -2.093 -2.737 -4.43 -10 ,13307 ,KEBNE ,16690186,Thu Nov 25 08:05:54 CET,Thu Nov 25 08:07:14 CET,0.0 0.965 1.364 1.745 2.107 2.415 2.706 2.973 3.435 3.652 3.859 3.759 4.429 4.619 4.961 5.281 5.608 5.759 6.026 6.291 6.671 6.903 7.134 7.478 7.799 8.095 8.384 8.653 8.997 9.326 9.632 10.028 10.399 10.716 11.069 11.441 11.783 12.168 12.58 13.052 13.513 13.93 14.417 14.904 15.43 15.966 16.504 17.046 17.604 18.11 18.386 18.126 17.625 17.062 16.471 15.854 15.295 14.703 14.092 13.404 12.776 12.22 11.687 11.174 10.66 10.166 9.64 9.195 8.831 8.419 7.958 7.567 7.178 6.763 6.419 6.062 5.702 5.322 4.918 4.646 4.364 3.906 3.566 3.215 3.045 2.681 2.279 1.847 1.621 0.919 0.9 0.644 0.374 -0.299 -0.657 -1.011 -1.487 -2.027 -2.608 -3.409 -6.109 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23477.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23477.txt deleted file mode 100644 index 1928ebb1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23476_23477.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10767 ,KEBNE ,17069878,Fri Dec 24 11:38:55 CET,Fri Dec 24 13:34:42 CET,0.0 1.677 2.154 2.558 2.928 3.25 3.532 3.792 4.252 4.465 4.671 4.55 5.197 5.361 5.688 6.018 6.331 6.474 6.74 7.006 7.39 7.624 7.84 8.14 8.433 8.71 8.966 9.227 9.537 9.804 10.081 10.409 10.717 10.999 11.322 11.717 12.05 12.353 12.674 12.964 13.229 13.484 13.774 14.054 14.309 14.546 14.765 14.959 15.032 14.793 13.844 12.325 10.971 9.711 8.353 7.077 6.01 5.036 4.131 3.194 2.422 1.704 0.986 0.304 -0.298 -0.852 -1.493 -2.057 -2.563 -3.081 -3.624 -4.1 -4.58 -5.108 -5.517 -5.926 -6.358 -6.817 -7.309 -7.647 -8.001 -8.578 -8.968 -9.374 -9.589 -10.024 -10.47 -10.942 -11.211 -12.002 -12.076 -12.384 -12.695 -13.372 -13.716 -14.08 -14.498 -15.006 -15.644 -16.463 -19.514 -2 ,20922 ,KEBNE ,17069879,Fri Dec 24 11:38:55 CET,Fri Dec 24 13:35:42 CET,0.0 1.714 2.25 2.681 3.076 3.421 3.709 3.987 4.502 4.728 4.935 4.854 5.526 5.695 6.025 6.343 6.646 6.792 7.079 7.348 7.73 7.981 8.224 8.565 8.905 9.239 9.555 9.85 10.218 10.557 10.873 11.263 11.643 11.99 12.353 12.744 13.089 13.454 13.877 14.276 14.645 15.088 15.542 15.902 16.28 16.676 17.029 17.292 17.469 17.4 16.611 15.109 13.725 12.444 11.321 10.259 9.259 8.328 7.525 6.732 6.022 5.328 4.637 3.954 3.257 2.617 1.988 1.45 0.967 0.447 -0.1 -0.515 -0.955 -1.449 -1.81 -2.191 -2.616 -3.065 -3.529 -3.866 -4.221 -4.772 -5.14 -5.505 -5.695 -6.092 -6.506 -6.935 -7.163 -7.906 -7.898 -8.17 -8.456 -9.06 -9.395 -9.77 -10.176 -10.638 -11.185 -11.841 -13.303 -3 ,430 ,KEBNE ,17069880,Fri Dec 24 11:40:01 CET,Fri Dec 24 13:36:10 CET,0.0 1.398 1.906 2.334 2.686 2.995 3.304 3.578 4.067 4.29 4.486 4.388 5.054 5.235 5.591 5.946 6.281 6.436 6.723 7.009 7.424 7.666 7.892 8.224 8.552 8.873 9.165 9.432 9.776 10.101 10.423 10.802 11.149 11.484 11.823 12.174 12.544 12.951 13.384 13.824 14.199 14.606 15.063 15.433 15.792 16.099 16.392 16.652 16.767 16.658 15.984 14.677 13.359 12.109 11.002 9.945 9.0 8.1 7.266 6.437 5.728 5.058 4.396 3.719 3.117 2.62 2.058 1.509 1.035 0.538 0.008 -0.438 -0.914 -1.419 -1.826 -2.26 -2.704 -3.146 -3.603 -3.922 -4.271 -4.821 -5.2 -5.619 -5.824 -6.223 -6.651 -7.097 -7.329 -8.081 -8.114 -8.397 -8.684 -9.295 -9.635 -10.011 -10.401 -10.825 -11.35 -12.027 -13.354 -4 ,14588 ,KEBNE ,17069881,Fri Dec 24 11:44:17 CET,Fri Dec 24 13:39:51 CET,0.0 1.252 1.765 2.229 2.618 2.953 3.271 3.559 4.075 4.305 4.511 4.438 5.09 5.27 5.592 5.896 6.194 6.328 6.581 6.835 7.184 7.389 7.601 7.916 8.201 8.462 8.704 8.945 9.273 9.588 9.872 10.187 10.484 10.774 11.113 11.473 11.82 12.193 12.569 12.948 13.328 13.726 14.15 14.515 14.842 15.133 15.416 15.684 15.881 15.803 15.09 13.728 12.354 11.165 10.07 8.976 7.971 7.045 6.214 5.381 4.666 3.999 3.288 2.623 2.004 1.418 0.819 0.277 -0.194 -0.698 -1.226 -1.684 -2.198 -2.736 -3.139 -3.548 -3.975 -4.428 -4.891 -5.224 -5.602 -6.168 -6.541 -6.927 -7.124 -7.543 -7.998 -8.448 -8.679 -9.429 -9.487 -9.767 -10.051 -10.677 -11.04 -11.468 -11.917 -12.404 -12.991 -13.736 -16.541 -5 ,8193 ,KEBNE ,17069882,Fri Dec 24 11:46:22 CET,Fri Dec 24 13:42:45 CET,0.0 1.655 2.186 2.597 2.954 3.263 3.543 3.821 4.296 4.486 4.663 4.553 5.225 5.417 5.765 6.082 6.396 6.549 6.837 7.1 7.487 7.736 7.97 8.314 8.645 8.953 9.233 9.513 9.918 10.301 10.637 11.022 11.414 11.772 12.185 12.642 13.063 13.49 13.882 14.29 14.633 14.967 15.329 15.658 16.022 16.405 16.742 16.99 17.17 17.099 16.357 15.021 13.731 12.538 11.397 10.294 9.341 8.477 7.672 6.827 6.108 5.438 4.805 4.214 3.643 3.135 2.57 1.978 1.493 1.007 0.451 -0.002 -0.492 -1.011 -1.403 -1.822 -2.284 -2.773 -3.29 -3.65 -4.011 -4.556 -4.939 -5.342 -5.551 -5.975 -6.404 -6.859 -7.116 -7.887 -7.88 -8.162 -8.467 -9.099 -9.456 -9.875 -10.343 -10.88 -11.522 -12.352 -14.354 -6 ,1913 ,KEBNE ,17069883,Fri Dec 24 11:46:22 CET,Fri Dec 24 13:43:37 CET,0.0 2.082 2.613 3.021 3.373 3.68 3.959 4.216 4.679 4.888 5.085 4.966 5.635 5.815 6.176 6.514 6.826 6.974 7.245 7.494 7.864 8.094 8.309 8.637 8.949 9.244 9.53 9.8 10.151 10.485 10.807 11.201 11.529 11.834 12.178 12.527 12.898 13.286 13.641 14.005 14.407 14.808 15.213 15.601 15.979 16.315 16.605 16.863 16.981 16.82 16.055 14.794 13.528 12.267 11.165 10.133 9.157 8.257 7.447 6.605 5.843 5.125 4.422 3.766 3.197 2.622 2.006 1.482 0.981 0.43 -0.15 -0.625 -1.109 -1.611 -2.016 -2.446 -2.885 -3.366 -3.864 -4.184 -4.521 -5.057 -5.423 -5.816 -6.017 -6.454 -6.936 -7.431 -7.679 -8.424 -8.454 -8.746 -9.061 -9.709 -10.063 -10.474 -10.93 -11.427 -12.03 -12.826 -16.094 -7 ,29579 ,KEBNE ,17069884,Fri Dec 24 11:47:25 CET,Fri Dec 24 13:43:18 CET,0.0 2.722 3.249 3.652 3.982 4.289 4.567 4.824 5.332 5.559 5.778 5.707 6.378 6.553 6.907 7.241 7.529 7.671 7.966 8.257 8.653 8.889 9.12 9.457 9.775 10.066 10.356 10.632 10.948 11.265 11.569 11.906 12.238 12.548 12.902 13.341 13.739 14.129 14.567 14.962 15.276 15.692 16.166 16.504 16.835 17.169 17.47 17.653 17.651 17.339 16.407 14.903 13.527 12.204 10.95 9.872 8.924 7.984 7.166 6.334 5.539 4.785 4.053 3.366 2.721 2.138 1.572 1.028 0.521 -0.021 -0.598 -1.061 -1.533 -2.023 -2.405 -2.8 -3.201 -3.632 -4.085 -4.401 -4.739 -5.276 -5.657 -6.051 -6.251 -6.667 -7.108 -7.57 -7.822 -8.571 -8.63 -8.93 -9.223 -9.827 -10.201 -10.597 -11.027 -11.544 -12.114 -12.835 -15.014 -8 ,25329 ,KEBNE ,17069885,Fri Dec 24 11:48:27 CET,Fri Dec 24 13:43:42 CET,0.0 1.967 2.466 2.873 3.19 3.452 3.707 3.959 4.421 4.645 4.861 4.776 5.463 5.656 6.0 6.308 6.603 6.746 7.01 7.262 7.614 7.832 8.057 8.358 8.63 8.914 9.181 9.423 9.734 10.043 10.332 10.675 10.997 11.283 11.59 11.913 12.2 12.508 12.831 13.131 13.459 13.788 14.123 14.452 14.781 15.108 15.39 15.606 15.663 15.381 14.399 12.862 11.424 10.06 8.861 7.815 6.85 5.932 5.126 4.278 3.563 2.935 2.259 1.614 1.014 0.423 -0.247 -0.826 -1.294 -1.798 -2.369 -2.859 -3.336 -3.838 -4.255 -4.684 -5.126 -5.596 -6.081 -6.414 -6.748 -7.266 -7.654 -8.065 -8.267 -8.693 -9.143 -9.603 -9.847 -10.597 -10.606 -10.881 -11.177 -11.865 -12.239 -12.634 -13.096 -13.579 -14.099 -14.783 -17.357 -9 ,20720 ,KEBNE ,17069886,Fri Dec 24 11:54:42 CET,Fri Dec 24 13:49:51 CET,0.0 1.484 1.947 2.35 2.719 3.072 3.396 3.685 4.215 4.466 4.711 4.675 5.395 5.599 5.974 6.315 6.616 6.748 7.008 7.285 7.677 7.912 8.153 8.514 8.85 9.167 9.464 9.759 10.144 10.5 10.833 11.226 11.591 11.94 12.323 12.674 12.996 13.34 13.643 14.005 14.406 14.773 15.153 15.531 15.927 16.266 16.576 16.83 16.942 16.819 16.077 14.76 13.501 12.292 11.141 10.025 8.998 7.906 6.864 5.852 4.937 4.09 3.31 2.563 1.843 1.175 0.474 -0.141 -0.654 -1.165 -1.731 -2.217 -2.716 -3.249 -3.674 -4.095 -4.506 -4.948 -5.418 -5.747 -6.088 -6.596 -6.954 -7.329 -7.514 -7.893 -8.286 -8.702 -8.924 -9.652 -9.639 -9.901 -10.171 -10.802 -11.153 -11.515 -11.92 -12.389 -12.951 -13.774 -15.936 -10 ,5067 ,KEBNE ,17069887,Fri Dec 24 12:25:29 CET,Fri Dec 24 14:15:12 CET,0.0 1.516 2.051 2.493 2.865 3.179 3.47 3.734 4.198 4.4 4.59 4.467 5.13 5.295 5.608 5.887 6.151 6.274 6.518 6.755 7.085 7.3 7.513 7.807 8.072 8.336 8.584 8.825 9.133 9.426 9.728 10.11 10.467 10.802 11.16 11.514 11.865 12.26 12.649 13.032 13.442 13.894 14.379 14.811 15.229 15.619 15.979 16.267 16.435 16.298 15.392 13.905 12.448 11.053 9.758 8.58 7.497 6.473 5.571 4.623 3.78 3.01 2.24 1.525 0.89 0.295 -0.355 -0.946 -1.451 -1.986 -2.538 -3.006 -3.528 -4.087 -4.519 -4.957 -5.426 -5.913 -6.417 -6.786 -7.158 -7.709 -8.103 -8.503 -8.718 -9.188 -9.66 -10.149 -10.405 -11.175 -11.259 -11.583 -11.921 -12.605 -12.994 -13.417 -13.864 -14.412 -15.088 -15.942 -18.33 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23477_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23477_23475.txt deleted file mode 100644 index dfa78e48..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23477_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8094 ,KEBNE ,16690187,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:07:03 CET,0.0 1.753 2.391 2.867 3.247 3.584 3.907 4.234 4.826 5.083 5.318 5.263 5.966 6.155 6.533 6.915 7.265 7.43 7.761 8.089 8.554 8.842 9.113 9.508 9.886 10.241 10.585 10.902 11.303 11.7 12.093 12.549 12.978 13.409 13.925 14.501 15.034 15.612 16.243 16.881 17.52 18.218 18.976 19.751 20.649 21.642 22.755 23.938 25.233 26.599 27.91 28.576 28.699 28.646 28.516 28.288 27.996 27.647 27.298 26.956 26.635 26.324 25.977 25.602 25.272 24.966 24.573 24.169 23.856 23.537 23.165 22.862 22.544 22.189 21.898 21.606 21.303 20.983 20.646 20.405 20.16 19.759 19.481 19.206 19.058 18.745 18.422 18.091 17.921 17.258 17.328 17.103 16.87 16.37 16.106 15.821 15.497 15.135 14.743 14.267 12.992 -2 ,31564 ,KEBNE ,16690913,Thu Nov 25 08:41:35 CET,Thu Nov 25 10:39:59 CET,0.0 1.596 2.212 2.682 3.098 3.447 3.757 4.06 4.631 4.899 5.143 5.1 5.823 6.033 6.439 6.822 7.189 7.367 7.698 8.003 8.453 8.743 9.038 9.451 9.836 10.218 10.572 10.916 11.367 11.796 12.21 12.693 13.151 13.568 14.026 14.554 15.04 15.572 16.132 16.677 17.252 17.959 18.758 19.464 20.253 21.138 22.142 23.203 24.403 25.691 26.972 27.797 28.062 27.997 27.752 27.425 27.1 26.767 26.389 25.964 25.612 25.246 24.849 24.465 24.107 23.783 23.378 22.987 22.662 22.342 21.986 21.688 21.363 20.98 20.685 20.385 20.074 19.757 19.418 19.177 18.918 18.503 18.213 17.91 17.758 17.429 17.096 16.76 16.575 15.891 15.972 15.751 15.518 15.017 14.746 14.46 14.122 13.761 13.334 12.809 11.912 -3 ,24623 ,KEBNE ,16690914,Thu Nov 25 08:41:35 CET,Thu Nov 25 10:40:27 CET,0.0 1.781 2.343 2.76 3.143 3.495 3.828 4.13 4.68 4.934 5.16 5.077 5.771 5.964 6.347 6.71 7.044 7.204 7.522 7.835 8.289 8.574 8.838 9.212 9.565 9.905 10.24 10.57 11.008 11.419 11.812 12.281 12.729 13.175 13.672 14.197 14.696 15.255 15.82 16.386 16.979 17.608 18.313 19.029 19.83 20.712 21.728 22.811 24.022 25.346 26.762 27.592 27.821 27.801 27.654 27.446 27.178 26.868 26.543 26.166 25.825 25.532 25.226 24.872 24.508 24.163 23.775 23.412 23.097 22.74 22.346 22.045 21.709 21.324 21.042 20.753 20.446 20.112 19.771 19.542 19.302 18.929 18.66 18.373 18.227 17.911 17.574 17.218 17.023 16.334 16.382 16.165 15.926 15.387 15.108 14.819 14.506 14.153 13.721 13.183 11.634 -4 ,15560 ,KEBNE ,16690190,Thu Nov 25 08:05:58 CET,Thu Nov 25 08:07:11 CET,0.0 1.48 2.034 2.501 2.908 3.238 3.546 3.837 4.373 4.618 4.849 4.8 5.512 5.705 6.074 6.416 6.755 6.923 7.242 7.545 7.981 8.261 8.54 8.926 9.261 9.582 9.909 10.255 10.71 11.11 11.48 11.947 12.387 12.796 13.258 13.764 14.26 14.791 15.361 15.986 16.609 17.278 18.068 18.826 19.645 20.55 21.594 22.684 23.911 25.252 26.661 27.43 27.644 27.602 27.381 27.075 26.768 26.46 26.141 25.741 25.324 24.968 24.619 24.239 23.865 23.528 23.193 22.871 22.571 22.216 21.791 21.459 21.127 20.783 20.52 20.227 19.92 19.61 19.267 19.013 18.763 18.382 18.107 17.828 17.681 17.374 17.06 16.731 16.555 15.887 15.967 15.75 15.526 15.048 14.773 14.478 14.159 13.805 13.374 12.817 11.583 -5 ,22378 ,KEBNE ,16690191,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:07:07 CET,0.0 1.517 2.177 2.651 3.073 3.482 3.872 4.218 4.81 5.098 5.367 5.318 6.045 6.271 6.721 7.13 7.525 7.718 8.083 8.426 8.918 9.24 9.551 9.993 10.408 10.811 11.207 11.591 12.081 12.546 12.971 13.448 13.91 14.359 14.877 15.456 16.009 16.637 17.274 17.932 18.648 19.372 20.164 20.97 21.913 22.924 24.048 25.286 26.649 28.104 29.67 30.681 30.91 30.783 30.451 30.054 29.669 29.202 28.735 28.205 27.679 27.236 26.779 26.28 25.841 25.446 24.999 24.602 24.261 23.907 23.529 23.201 22.857 22.491 22.2 21.926 21.654 21.361 21.039 20.811 20.57 20.182 19.918 19.643 19.497 19.184 18.853 18.51 18.332 17.67 17.763 17.557 17.347 16.854 16.584 16.295 15.952 15.561 15.109 14.58 13.148 -6 ,30944 ,KEBNE ,16690192,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:07:07 CET,0.0 1.66 2.284 2.74 3.088 3.41 3.713 3.994 4.524 4.785 5.036 4.967 5.703 5.915 6.309 6.653 6.967 7.131 7.461 7.775 8.239 8.531 8.807 9.21 9.592 9.945 10.289 10.617 11.061 11.523 11.963 12.481 12.986 13.465 13.997 14.573 15.137 15.75 16.393 17.055 17.694 18.37 19.139 19.887 20.696 21.596 22.642 23.739 24.931 26.286 27.725 28.577 28.832 28.834 28.652 28.342 27.968 27.595 27.272 26.924 26.583 26.252 25.903 25.542 25.209 24.862 24.433 24.034 23.693 23.353 22.998 22.689 22.369 22.036 21.748 21.418 21.026 20.641 20.294 20.057 19.808 19.409 19.127 18.831 18.681 18.364 18.019 17.651 17.466 16.801 16.884 16.658 16.429 15.934 15.663 15.362 15.03 14.675 14.273 13.701 12.251 -7 ,7726 ,KEBNE ,16690918,Thu Nov 25 08:44:41 CET,Thu Nov 25 10:44:40 CET,0.0 1.331 1.862 2.324 2.727 3.092 3.421 3.707 4.257 4.519 4.773 4.725 5.424 5.62 5.995 6.346 6.683 6.846 7.172 7.478 7.904 8.198 8.488 8.882 9.262 9.61 9.966 10.325 10.776 11.196 11.567 12.044 12.546 13.002 13.477 13.998 14.518 15.085 15.665 16.284 16.892 17.523 18.217 18.907 19.747 20.678 21.67 22.701 23.86 25.126 26.535 27.412 27.654 27.706 27.597 27.35 27.066 26.717 26.345 25.988 25.656 25.337 24.968 24.581 24.209 23.819 23.43 23.074 22.735 22.418 22.077 21.748 21.402 21.063 20.785 20.476 20.16 19.823 19.452 19.198 18.954 18.583 18.307 18.012 17.866 17.545 17.201 16.867 16.696 16.022 16.079 15.854 15.628 15.12 14.852 14.56 14.253 13.914 13.531 13.044 11.679 -8 ,7233 ,KEBNE ,16690194,Thu Nov 25 08:05:52 CET,Thu Nov 25 08:06:52 CET,0.0 1.527 2.054 2.479 2.851 3.184 3.486 3.785 4.349 4.599 4.843 4.805 5.507 5.698 6.067 6.429 6.764 6.925 7.252 7.569 8.014 8.294 8.568 8.964 9.34 9.711 10.067 10.405 10.826 11.229 11.623 12.098 12.569 13.0 13.444 13.918 14.392 14.929 15.451 15.98 16.563 17.212 17.962 18.73 19.639 20.581 21.602 22.731 23.959 25.242 26.577 27.361 27.568 27.519 27.305 26.979 26.666 26.311 25.977 25.638 25.256 24.886 24.517 24.167 23.866 23.546 23.185 22.846 22.523 22.179 21.813 21.496 21.146 20.782 20.502 20.21 19.915 19.608 19.264 19.009 18.745 18.344 18.074 17.789 17.64 17.333 16.997 16.639 16.47 15.809 15.894 15.676 15.448 14.975 14.7 14.398 14.081 13.746 13.37 12.848 11.257 -9 ,32512 ,KEBNE ,16690920,Thu Nov 25 08:44:45 CET,Thu Nov 25 10:41:22 CET,0.0 1.457 2.021 2.453 2.819 3.155 3.445 3.699 4.174 4.405 4.633 4.55 5.25 5.455 5.845 6.219 6.577 6.74 7.061 7.386 7.872 8.176 8.44 8.822 9.206 9.579 9.924 10.252 10.681 11.093 11.5 11.983 12.435 12.865 13.39 13.985 14.53 15.113 15.715 16.32 16.939 17.579 18.315 19.08 19.928 20.859 21.908 23.035 24.301 25.676 27.094 27.889 28.129 28.16 28.008 27.738 27.424 27.056 26.696 26.285 25.866 25.454 25.043 24.662 24.314 23.97 23.6 23.266 22.953 22.609 22.245 21.921 21.587 21.263 21.01 20.744 20.456 20.15 19.817 19.578 19.329 18.952 18.7 18.43 18.277 17.96 17.636 17.291 17.113 16.432 16.482 16.267 16.045 15.552 15.27 14.975 14.666 14.32 13.931 13.42 11.579 -10 ,26998 ,KEBNE ,16690196,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:06:53 CET,0.0 1.564 2.087 2.528 2.912 3.26 3.559 3.806 4.25 4.463 4.67 4.59 5.304 5.495 5.872 6.23 6.554 6.715 7.034 7.327 7.763 8.041 8.301 8.685 9.058 9.414 9.757 10.095 10.519 10.916 11.311 11.78 12.224 12.653 13.154 13.703 14.2 14.743 15.291 15.827 16.405 17.119 17.892 18.596 19.441 20.347 21.342 22.453 23.643 24.892 26.295 27.137 27.407 27.382 27.187 26.911 26.597 26.245 25.87 25.498 25.18 24.873 24.572 24.251 23.941 23.65 23.32 23.012 22.722 22.381 22.017 21.722 21.397 21.072 20.797 20.458 20.112 19.778 19.429 19.195 18.951 18.556 18.297 18.018 17.866 17.565 17.26 16.929 16.752 16.078 16.147 15.923 15.694 15.247 14.99 14.709 14.411 14.052 13.622 13.141 11.998 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23475.txt deleted file mode 100644 index 35ca3db5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22393 ,KEBNE ,16690197,Thu Nov 25 08:05:54 CET,Thu Nov 25 08:07:16 CET,0.0 1.773 2.367 2.846 3.231 3.576 3.917 4.247 4.853 5.116 5.374 5.354 6.149 6.391 6.848 7.277 7.7 7.902 8.309 8.713 9.285 9.654 10.012 10.53 11.044 11.562 12.06 12.53 13.136 13.756 14.366 15.081 15.76 16.413 17.162 17.981 18.774 19.665 20.653 21.704 22.782 24.018 25.504 26.998 28.748 30.751 33.149 35.943 39.282 43.368 48.482 52.91 55.622 57.349 58.541 59.441 60.04 60.428 60.697 60.898 61.008 61.074 61.106 61.088 61.002 60.887 60.712 60.469 60.229 60.001 59.751 59.534 59.278 58.983 58.766 58.555 58.334 58.066 57.78 57.58 57.351 56.972 56.717 56.454 56.31 56.005 55.69 55.347 55.142 54.443 54.46 54.212 53.956 53.385 53.039 52.662 52.279 51.811 51.183 50.368 46.666 -2 ,14872 ,KEBNE ,16690198,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:07:02 CET,0.0 2.158 2.764 3.294 3.721 4.107 4.461 4.798 5.426 5.705 5.971 5.947 6.749 6.988 7.457 7.896 8.311 8.518 8.925 9.334 9.962 10.356 10.726 11.261 11.78 12.259 12.715 13.196 13.829 14.44 15.019 15.709 16.402 17.07 17.847 18.697 19.492 20.368 21.34 22.415 23.507 24.692 26.131 27.645 29.377 31.344 33.704 36.45 39.76 43.764 48.908 53.38 56.126 57.977 59.229 60.076 60.609 60.922 61.084 61.206 61.253 61.208 61.144 61.027 60.882 60.764 60.6 60.409 60.237 60.011 59.714 59.467 59.212 58.904 58.655 58.407 58.144 57.857 57.561 57.354 57.119 56.739 56.473 56.193 56.049 55.732 55.375 54.988 54.794 54.12 54.182 53.955 53.708 53.11 52.771 52.405 51.993 51.508 50.898 50.069 46.063 -3 ,12950 ,KEBNE ,16690924,Thu Nov 25 08:46:43 CET,Thu Nov 25 10:45:22 CET,0.0 1.524 2.179 2.713 3.152 3.509 3.843 4.174 4.814 5.108 5.376 5.325 6.125 6.365 6.817 7.259 7.677 7.884 8.315 8.726 9.305 9.674 10.03 10.559 11.09 11.614 12.104 12.565 13.154 13.728 14.316 15.023 15.72 16.391 17.152 18.001 18.785 19.678 20.658 21.7 22.784 24.08 25.651 27.139 28.859 30.843 33.205 35.943 39.289 43.455 48.768 53.335 56.013 57.702 58.892 59.685 60.19 60.53 60.757 60.884 60.938 60.947 60.9 60.847 60.771 60.683 60.505 60.286 60.093 59.879 59.632 59.408 59.153 58.885 58.674 58.439 58.186 57.91 57.606 57.384 57.161 56.818 56.574 56.304 56.156 55.834 55.484 55.102 54.896 54.202 54.214 53.956 53.69 53.127 52.826 52.507 52.126 51.685 51.144 50.384 46.272 -4 ,10969 ,KEBNE ,16690925,Thu Nov 25 08:46:44 CET,Thu Nov 25 10:49:57 CET,0.0 1.925 2.612 3.129 3.564 3.973 4.366 4.714 5.369 5.674 5.956 5.952 6.752 7.002 7.499 7.971 8.4 8.606 9.034 9.456 10.062 10.45 10.823 11.374 11.92 12.459 12.982 13.471 14.091 14.728 15.35 16.091 16.785 17.427 18.205 19.091 19.935 20.858 21.843 22.875 23.972 25.231 26.725 28.304 30.152 32.2 34.609 37.439 40.936 45.207 50.629 55.372 58.181 60.041 61.354 62.279 62.883 63.268 63.504 63.715 63.83 63.834 63.775 63.674 63.547 63.377 63.18 63.034 62.9 62.749 62.549 62.336 62.1 61.841 61.637 61.406 61.146 60.869 60.567 60.362 60.141 59.762 59.489 59.192 59.039 58.744 58.424 58.051 57.853 57.192 57.252 56.997 56.704 56.081 55.731 55.323 54.84 54.269 53.606 52.657 48.911 -5 ,14633 ,KEBNE ,16690926,Thu Nov 25 08:46:44 CET,Thu Nov 25 10:45:46 CET,0.0 1.516 2.087 2.544 2.956 3.341 3.702 4.039 4.681 4.994 5.304 5.339 6.15 6.406 6.896 7.364 7.815 8.033 8.451 8.864 9.478 9.878 10.272 10.84 11.368 11.886 12.403 12.895 13.518 14.104 14.669 15.366 16.022 16.635 17.357 18.187 19.005 19.883 20.792 21.763 22.831 24.071 25.601 27.16 28.933 30.979 33.35 36.085 39.398 43.5 48.729 53.146 55.716 57.374 58.508 59.296 59.824 60.19 60.406 60.503 60.483 60.405 60.33 60.209 60.05 59.882 59.674 59.501 59.339 59.122 58.863 58.645 58.415 58.155 57.936 57.682 57.41 57.126 56.826 56.631 56.424 56.067 55.799 55.514 55.363 55.039 54.703 54.379 54.199 53.496 53.511 53.264 53.013 52.423 52.101 51.766 51.349 50.858 50.327 49.566 45.664 -6 ,32428 ,KEBNE ,16690202,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:07:14 CET,0.0 1.465 2.075 2.571 3.034 3.437 3.788 4.105 4.687 4.973 5.253 5.239 6.036 6.272 6.723 7.161 7.593 7.804 8.222 8.625 9.201 9.572 9.936 10.471 10.978 11.47 11.948 12.422 13.054 13.655 14.222 14.912 15.594 16.246 16.994 17.846 18.646 19.538 20.534 21.601 22.731 23.988 25.443 26.969 28.801 30.873 33.322 36.044 39.29 43.282 48.415 52.99 55.767 57.61 58.821 59.644 60.213 60.554 60.732 60.859 60.873 60.903 60.91 60.777 60.644 60.526 60.323 60.084 59.876 59.667 59.451 59.264 59.037 58.767 58.548 58.335 58.105 57.829 57.521 57.31 57.084 56.696 56.419 56.136 55.979 55.66 55.294 54.879 54.681 54.001 54.029 53.771 53.507 52.969 52.641 52.272 51.806 51.222 50.59 49.824 46.181 -7 ,22770 ,KEBNE ,16690203,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:07:08 CET,0.0 1.469 2.108 2.633 3.087 3.493 3.883 4.247 4.925 5.234 5.536 5.568 6.36 6.621 7.128 7.615 8.065 8.277 8.702 9.122 9.725 10.114 10.487 11.019 11.543 12.057 12.553 13.031 13.651 14.252 14.842 15.557 16.235 16.893 17.674 18.588 19.455 20.39 21.42 22.495 23.606 24.901 26.457 28.032 29.899 31.995 34.407 37.195 40.576 44.703 49.912 54.35 56.961 58.589 59.707 60.548 61.045 61.33 61.532 61.669 61.702 61.682 61.63 61.519 61.397 61.289 61.138 60.954 60.778 60.588 60.38 60.204 60.011 59.801 59.614 59.404 59.183 58.935 58.669 58.482 58.295 57.996 57.767 57.52 57.394 57.117 56.812 56.481 56.307 55.647 55.693 55.455 55.213 54.718 54.451 54.14 53.773 53.345 52.811 52.041 49.066 -8 ,22640 ,KEBNE ,16690929,Thu Nov 25 08:48:46 CET,Thu Nov 25 10:47:46 CET,0.0 1.426 1.979 2.456 2.868 3.244 3.588 3.89 4.46 4.745 5.021 5.006 5.801 6.045 6.514 6.978 7.425 7.64 8.059 8.456 9.035 9.415 9.783 10.306 10.815 11.304 11.777 12.244 12.849 13.439 14.022 14.748 15.443 16.111 16.895 17.76 18.573 19.485 20.527 21.654 22.789 24.025 25.519 27.08 28.884 30.85 33.19 35.895 39.095 43.037 48.067 52.417 55.073 56.878 58.121 58.998 59.56 59.928 60.156 60.271 60.327 60.287 60.193 60.088 59.925 59.75 59.569 59.364 59.157 58.945 58.704 58.473 58.207 57.918 57.69 57.439 57.188 56.902 56.595 56.408 56.196 55.815 55.571 55.31 55.16 54.848 54.524 54.186 53.98 53.28 53.314 53.07 52.793 52.172 51.847 51.493 51.097 50.599 49.976 49.088 45.907 -9 ,29800 ,KEBNE ,16690930,Thu Nov 25 08:48:46 CET,Thu Nov 25 10:50:29 CET,0.0 1.712 2.317 2.793 3.195 3.564 3.917 4.247 4.856 5.153 5.447 5.454 6.25 6.503 6.979 7.415 7.852 8.066 8.481 8.875 9.456 9.84 10.21 10.761 11.287 11.79 12.279 12.754 13.376 13.978 14.562 15.217 15.851 16.521 17.315 18.23 19.115 20.068 21.063 22.103 23.211 24.452 25.946 27.512 29.428 31.573 34.04 36.95 40.392 44.566 49.857 54.464 57.379 59.339 60.615 61.458 62.011 62.427 62.707 62.888 62.981 63.053 63.097 63.087 63.055 62.925 62.74 62.568 62.411 62.241 61.978 61.729 61.493 61.249 61.04 60.802 60.559 60.27 59.949 59.745 59.519 59.127 58.861 58.578 58.431 58.125 57.771 57.35 57.131 56.437 56.419 56.159 55.909 55.334 54.998 54.629 54.219 53.713 53.105 52.369 49.268 -10 ,1725 ,KEBNE ,16690206,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:07:12 CET,0.0 1.363 2.042 2.624 3.099 3.508 3.886 4.239 4.889 5.199 5.51 5.533 6.335 6.582 7.058 7.512 7.958 8.178 8.602 9.017 9.608 9.978 10.352 10.904 11.433 11.944 12.427 12.901 13.527 14.138 14.75 15.479 16.175 16.851 17.635 18.532 19.413 20.37 21.367 22.433 23.578 24.883 26.423 27.993 29.843 31.893 34.285 37.013 40.263 44.464 49.914 54.39 57.163 59.105 60.361 61.216 61.736 62.068 62.297 62.461 62.542 62.529 62.46 62.386 62.282 62.144 61.996 61.881 61.773 61.607 61.422 61.268 61.094 60.894 60.707 60.499 60.278 60.042 59.8 59.63 59.447 59.15 58.936 58.706 58.581 58.298 57.976 57.624 57.452 56.778 56.871 56.671 56.445 55.907 55.609 55.309 54.951 54.484 53.942 53.163 49.535 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23476.txt deleted file mode 100644 index 42435d0f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23479_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,963 ,KEBNE ,16690932,Thu Nov 25 08:49:48 CET,Thu Nov 25 10:52:08 CET,0.0 1.454 2.194 2.764 3.253 3.713 4.126 4.469 5.117 5.429 5.724 5.756 6.575 6.846 7.349 7.84 8.31 8.542 9.006 9.453 10.096 10.498 10.9 11.51 12.08 12.621 13.154 13.672 14.342 14.998 15.628 16.35 17.004 17.655 18.466 19.374 20.201 21.131 22.167 23.225 24.38 25.821 27.466 29.024 30.868 32.896 35.258 38.056 41.419 45.465 50.573 55.065 57.798 59.47 60.511 61.227 61.722 62.066 62.248 62.364 62.374 62.253 62.154 62.058 61.932 61.826 61.643 61.465 61.306 61.052 60.755 60.523 60.271 60.004 59.796 59.58 59.341 59.068 58.776 58.563 58.312 57.919 57.681 57.432 57.296 57.028 56.729 56.393 56.213 55.531 55.615 55.402 55.16 54.599 54.287 53.929 53.525 53.085 52.573 51.802 48.183 -2 ,17305 ,KEBNE ,16690208,Thu Nov 25 08:05:58 CET,Thu Nov 25 08:07:15 CET,0.0 1.258 1.844 2.372 2.795 3.182 3.557 3.889 4.499 4.797 5.08 5.088 5.914 6.175 6.666 7.144 7.643 7.875 8.292 8.712 9.316 9.702 10.079 10.636 11.189 11.716 12.24 12.758 13.423 14.083 14.73 15.503 16.259 17.002 17.839 18.742 19.61 20.57 21.627 22.762 23.908 25.248 26.832 28.363 30.217 32.3 34.671 37.446 40.838 45.022 50.268 54.808 57.41 59.017 60.172 61.004 61.552 61.88 62.047 62.182 62.261 62.252 62.153 62.074 62.015 61.895 61.724 61.56 61.418 61.23 60.988 60.793 60.593 60.351 60.146 59.914 59.648 59.357 59.046 58.832 58.615 58.273 58.038 57.768 57.612 57.292 56.938 56.544 56.348 55.676 55.747 55.509 55.245 54.624 54.278 53.908 53.48 52.99 52.453 51.778 49.404 -3 ,28913 ,KEBNE ,16690209,Thu Nov 25 08:06:01 CET,Thu Nov 25 08:07:03 CET,0.0 2.116 2.746 3.318 3.841 4.296 4.706 5.075 5.784 6.136 6.48 6.546 7.385 7.71 8.304 8.84 9.362 9.617 10.106 10.55 11.185 11.597 12.005 12.615 13.213 13.804 14.357 14.874 15.521 16.166 16.811 17.578 18.322 19.052 19.894 20.86 21.759 22.719 23.774 24.866 26.023 27.317 28.833 30.392 32.22 34.293 36.759 39.601 42.974 47.121 52.216 56.629 59.461 61.173 62.21 62.96 63.522 63.884 64.085 64.248 64.309 64.294 64.217 64.082 63.964 63.821 63.586 63.346 63.165 62.982 62.703 62.465 62.21 61.89 61.663 61.435 61.175 60.894 60.601 60.387 60.153 59.787 59.549 59.31 59.177 58.892 58.59 58.267 58.094 57.419 57.469 57.216 56.955 56.43 56.15 55.826 55.461 55.034 54.507 53.845 50.231 -4 ,6517 ,KEBNE ,16690935,Thu Nov 25 09:07:16 CET,Thu Nov 25 11:07:50 CET,0.0 1.959 2.729 3.273 3.754 4.192 4.58 4.951 5.619 5.93 6.237 6.278 7.105 7.373 7.885 8.385 8.885 9.123 9.577 10.005 10.615 11.02 11.411 11.992 12.571 13.14 13.687 14.209 14.881 15.536 16.191 16.982 17.723 18.431 19.268 20.227 21.148 22.173 23.304 24.547 25.843 27.285 28.89 30.435 32.227 34.204 36.568 39.34 42.699 46.834 52.042 56.554 59.281 60.998 62.066 62.766 63.273 63.602 63.786 63.895 63.915 63.83 63.702 63.589 63.464 63.299 63.089 62.875 62.666 62.43 62.133 61.876 61.623 61.325 61.091 60.851 60.576 60.279 59.97 59.765 59.552 59.21 58.969 58.703 58.563 58.25 57.92 57.577 57.391 56.73 56.806 56.596 56.365 55.804 55.482 55.131 54.779 54.38 53.884 53.197 50.619 -5 ,31219 ,KEBNE ,16690936,Thu Nov 25 09:07:17 CET,Thu Nov 25 11:11:54 CET,0.0 1.373 2.139 2.706 3.169 3.592 3.982 4.332 4.996 5.311 5.612 5.64 6.45 6.709 7.223 7.712 8.185 8.417 8.861 9.29 9.909 10.305 10.702 11.274 11.815 12.364 12.871 13.335 13.974 14.606 15.251 16.075 16.828 17.47 18.194 19.021 19.898 20.906 21.935 23.032 24.193 25.531 27.087 28.647 30.48 32.559 35.021 37.809 41.136 45.256 50.379 54.621 57.146 58.819 59.918 60.661 61.118 61.419 61.612 61.716 61.758 61.741 61.586 61.412 61.291 61.153 60.989 60.762 60.553 60.393 60.171 59.931 59.686 59.433 59.229 59.008 58.752 58.484 58.204 57.991 57.754 57.4 57.149 56.885 56.757 56.491 56.201 55.857 55.663 54.98 55.06 54.841 54.605 54.092 53.821 53.514 53.13 52.69 52.154 51.438 48.801 -6 ,29878 ,KEBNE ,16690937,Thu Nov 25 09:12:24 CET,Thu Nov 25 11:13:06 CET,0.0 1.215 1.898 2.382 2.807 3.211 3.599 3.952 4.622 4.949 5.259 5.303 6.133 6.419 6.956 7.447 7.916 8.148 8.614 9.051 9.676 10.092 10.502 11.098 11.678 12.239 12.782 13.325 14.039 14.688 15.29 16.006 16.744 17.485 18.245 19.083 19.915 20.831 21.835 22.908 24.0 25.234 26.72 28.21 30.025 32.161 34.686 37.585 41.004 45.092 50.182 54.528 57.077 58.63 59.62 60.28 60.724 60.992 61.122 61.194 61.168 61.094 60.986 60.834 60.68 60.491 60.222 59.944 59.68 59.425 59.168 58.923 58.636 58.326 58.1 57.86 57.595 57.308 57.01 56.812 56.595 56.247 55.985 55.686 55.527 55.209 54.853 54.479 54.295 53.598 53.611 53.365 53.119 52.572 52.239 51.862 51.48 51.078 50.572 49.859 47.154 -7 ,5820 ,KEBNE ,16690213,Thu Nov 25 08:05:54 CET,Thu Nov 25 08:07:18 CET,0.0 2.203 3.006 3.622 4.145 4.574 4.983 5.345 6.006 6.323 6.63 6.707 7.549 7.832 8.353 8.842 9.327 9.558 9.978 10.384 10.993 11.381 11.745 12.263 12.778 13.286 13.778 14.264 14.886 15.489 16.082 16.794 17.481 18.145 18.921 19.791 20.629 21.575 22.627 23.753 24.927 26.252 27.796 29.358 31.212 33.302 35.743 38.489 41.793 45.997 51.246 55.776 58.58 60.38 61.618 62.501 63.127 63.562 63.837 64.048 64.133 64.152 64.129 64.054 63.943 63.807 63.653 63.487 63.296 63.092 62.881 62.684 62.475 62.256 62.082 61.895 61.671 61.429 61.174 60.985 60.786 60.471 60.246 59.999 59.869 59.589 59.298 58.971 58.799 58.155 58.224 57.992 57.739 57.201 56.876 56.516 56.154 55.734 55.234 54.562 51.455 -8 ,3912 ,KEBNE ,16690214,Thu Nov 25 08:05:54 CET,Thu Nov 25 08:07:16 CET,0.0 2.046 2.903 3.524 4.04 4.509 4.948 5.365 6.135 6.489 6.807 6.872 7.717 8.012 8.58 9.114 9.626 9.874 10.357 10.818 11.464 11.886 12.289 12.887 13.497 14.064 14.607 15.142 15.833 16.531 17.203 18.005 18.775 19.505 20.353 21.3 22.231 23.239 24.261 25.348 26.49 27.811 29.376 30.925 32.755 34.806 37.225 40.006 43.406 47.609 52.932 57.47 60.187 61.873 62.985 63.764 64.243 64.574 64.753 64.824 64.83 64.771 64.73 64.679 64.567 64.458 64.266 64.072 63.891 63.674 63.454 63.259 63.05 62.8 62.583 62.348 62.097 61.834 61.563 61.361 61.142 60.785 60.522 60.268 60.14 59.869 59.571 59.238 59.061 58.379 58.406 58.175 57.917 57.335 57.001 56.615 56.179 55.623 54.958 54.183 52.355 -9 ,19518 ,KEBNE ,16690940,Thu Nov 25 09:21:40 CET,Thu Nov 25 11:21:19 CET,0.0 3.294 4.002 4.543 5.03 5.46 5.835 6.185 6.848 7.176 7.494 7.518 8.317 8.578 9.13 9.658 10.142 10.375 10.81 11.24 11.875 12.272 12.665 13.243 13.802 14.348 14.881 15.418 16.115 16.772 17.408 18.163 18.91 19.643 20.502 21.444 22.285 23.231 24.307 25.453 26.627 27.959 29.518 31.124 32.995 35.021 37.458 40.313 43.666 47.793 52.928 57.236 59.77 61.411 62.631 63.493 64.033 64.328 64.498 64.618 64.674 64.697 64.623 64.501 64.337 64.131 63.9 63.684 63.462 63.197 62.902 62.65 62.386 62.104 61.885 61.636 61.371 61.095 60.81 60.609 60.402 60.091 59.86 59.619 59.495 59.19 58.859 58.512 58.328 57.637 57.727 57.502 57.208 56.495 56.102 55.73 55.364 54.939 54.387 53.674 50.639 -10 ,7087 ,KEBNE ,16690941,Thu Nov 25 09:23:44 CET,Thu Nov 25 11:25:11 CET,0.0 1.84 2.551 3.15 3.649 4.072 4.48 4.881 5.648 5.986 6.291 6.332 7.153 7.421 7.923 8.419 8.892 9.122 9.574 10.02 10.67 11.09 11.499 12.071 12.622 13.171 13.694 14.204 14.858 15.497 16.131 16.913 17.658 18.352 19.168 20.084 20.968 21.989 23.058 24.162 25.345 26.666 28.217 29.791 31.644 33.655 36.017 38.8 42.193 46.251 51.255 55.737 58.396 60.049 61.182 61.908 62.38 62.708 62.918 63.056 63.075 63.048 62.987 62.838 62.631 62.404 62.116 61.905 61.738 61.48 61.187 60.947 60.665 60.394 60.195 59.973 59.743 59.506 59.258 59.078 58.881 58.558 58.332 58.087 57.959 57.7 57.428 57.134 56.965 56.307 56.371 56.15 55.918 55.4 55.104 54.765 54.375 53.954 53.418 52.652 50.496 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23479.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23479.txt deleted file mode 100644 index e85d8b4e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23479.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28298 ,KEBNE ,16690217,Thu Nov 25 08:05:55 CET,Thu Nov 25 08:07:15 CET,0.0 1.537 2.151 2.634 3.084 3.493 3.85 4.168 4.725 4.979 5.232 5.208 5.967 6.185 6.609 7.01 7.377 7.543 7.869 8.187 8.658 8.942 9.212 9.612 9.984 10.343 10.69 11.034 11.449 11.84 12.198 12.608 13.03 13.397 13.793 14.229 14.608 14.995 15.418 15.869 16.288 16.754 17.276 17.743 18.253 18.732 19.148 19.516 19.755 19.706 19.084 17.925 16.689 15.468 14.358 13.199 12.118 11.179 10.381 9.615 8.946 8.33 7.741 7.181 6.655 6.12 5.525 4.986 4.502 3.989 3.47 3.043 2.597 2.135 1.781 1.422 1.03 0.611 0.176 -0.135 -0.451 -0.937 -1.28 -1.633 -1.817 -2.201 -2.612 -3.045 -3.262 -4.02 -4.0 -4.264 -4.538 -5.155 -5.502 -5.867 -6.256 -6.73 -7.266 -7.894 -9.61 -2 ,15850 ,KEBNE ,16690943,Thu Nov 25 09:24:47 CET,Thu Nov 25 11:29:40 CET,0.0 1.694 2.374 2.965 3.412 3.786 4.122 4.436 5.027 5.3 5.564 5.539 6.329 6.568 6.979 7.375 7.774 7.962 8.309 8.637 9.116 9.408 9.676 10.08 10.461 10.812 11.146 11.456 11.842 12.236 12.632 13.047 13.41 13.794 14.247 14.683 15.058 15.437 15.871 16.379 16.883 17.347 17.782 18.183 18.597 19.002 19.385 19.718 19.929 19.866 19.163 17.886 16.663 15.475 14.359 13.281 12.293 11.401 10.615 9.81 9.088 8.446 7.833 7.246 6.703 6.141 5.537 5.035 4.582 4.102 3.569 3.117 2.649 2.148 1.773 1.385 0.992 0.56 0.073 -0.254 -0.583 -1.105 -1.445 -1.795 -1.985 -2.384 -2.817 -3.28 -3.524 -4.31 -4.263 -4.543 -4.836 -5.468 -5.834 -6.229 -6.662 -7.165 -7.732 -8.449 -10.416 -3 ,26028 ,KEBNE ,16690944,Thu Nov 25 09:24:46 CET,Thu Nov 25 11:28:33 CET,0.0 1.779 2.391 2.875 3.282 3.665 4.012 4.297 4.843 5.104 5.35 5.292 6.045 6.26 6.654 7.02 7.373 7.544 7.888 8.221 8.668 8.944 9.211 9.602 9.982 10.34 10.68 11.002 11.409 11.809 12.182 12.62 13.032 13.403 13.812 14.285 14.719 15.159 15.663 16.185 16.732 17.262 17.723 18.187 18.697 19.188 19.702 20.168 20.546 20.659 20.047 18.777 17.537 16.301 15.148 14.002 12.96 12.071 11.285 10.427 9.679 8.975 8.23 7.489 6.814 6.202 5.568 5.007 4.529 4.041 3.51 3.066 2.608 2.121 1.739 1.337 0.917 0.48 0.02 -0.295 -0.622 -1.114 -1.463 -1.856 -2.064 -2.482 -2.926 -3.415 -3.667 -4.451 -4.406 -4.675 -4.974 -5.63 -5.974 -6.327 -6.705 -7.151 -7.652 -8.261 -9.878 -4 ,14464 ,KEBNE ,16690945,Thu Nov 25 09:24:46 CET,Thu Nov 25 11:29:36 CET,0.0 1.271 1.76 2.176 2.526 2.84 3.106 3.342 3.758 3.939 4.112 3.911 4.604 4.753 5.033 5.297 5.559 5.69 5.923 6.133 6.453 6.664 6.878 7.161 7.428 7.701 7.952 8.183 8.479 8.766 9.048 9.385 9.693 9.978 10.306 10.663 11.005 11.39 11.771 12.145 12.544 12.962 13.409 13.832 14.293 14.774 15.228 15.607 15.853 15.782 15.035 13.703 12.443 11.276 10.181 9.159 8.203 7.296 6.531 5.755 5.073 4.461 3.856 3.273 2.725 2.199 1.642 1.151 0.742 0.319 -0.134 -0.519 -0.922 -1.335 -1.655 -1.984 -2.332 -2.701 -3.093 -3.367 -3.642 -4.071 -4.367 -4.673 -4.833 -5.167 -5.533 -5.916 -6.099 -6.848 -6.719 -6.927 -7.147 -7.656 -7.939 -8.248 -8.595 -8.983 -9.401 -9.916 -11.211 -5 ,19531 ,KEBNE ,16690221,Thu Nov 25 08:05:54 CET,Thu Nov 25 08:07:08 CET,0.0 1.094 1.536 1.879 2.238 2.563 2.835 3.089 3.524 3.727 3.936 3.805 4.497 4.658 4.979 5.274 5.547 5.676 5.927 6.174 6.553 6.782 6.975 7.261 7.538 7.787 8.048 8.312 8.624 8.9 9.16 9.465 9.746 10.023 10.345 10.711 11.039 11.383 11.757 12.143 12.534 12.956 13.436 13.873 14.341 14.809 15.263 15.653 15.917 15.918 15.313 14.059 12.823 11.63 10.429 9.314 8.336 7.426 6.632 5.853 5.188 4.569 3.959 3.392 2.859 2.332 1.754 1.256 0.839 0.39 -0.094 -0.507 -0.951 -1.392 -1.718 -2.061 -2.414 -2.795 -3.199 -3.475 -3.755 -4.2 -4.515 -4.856 -5.039 -5.407 -5.789 -6.175 -6.361 -7.115 -7.011 -7.235 -7.462 -7.966 -8.251 -8.555 -8.902 -9.302 -9.75 -10.313 -12.131 -6 ,14286 ,KEBNE ,16690222,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:06:55 CET,0.0 1.266 1.789 2.214 2.541 2.81 3.05 3.282 3.71 3.912 4.109 3.952 4.648 4.816 5.129 5.42 5.701 5.839 6.101 6.355 6.73 6.973 7.206 7.535 7.851 8.154 8.433 8.692 9.015 9.325 9.62 9.958 10.273 10.591 10.961 11.348 11.689 12.052 12.433 12.801 13.193 13.645 14.146 14.606 15.092 15.569 15.968 16.263 16.502 16.521 16.007 14.88 13.673 12.555 11.548 10.616 9.72 8.849 8.074 7.285 6.576 5.941 5.37 4.793 4.216 3.734 3.253 2.811 2.408 1.956 1.499 1.148 0.769 0.355 0.036 -0.305 -0.678 -1.074 -1.486 -1.755 -2.024 -2.449 -2.736 -3.035 -3.191 -3.516 -3.876 -4.248 -4.426 -5.141 -5.038 -5.262 -5.484 -5.938 -6.19 -6.461 -6.737 -7.04 -7.405 -7.897 -8.787 -7 ,12029 ,KEBNE ,16690223,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:06:55 CET,0.0 2.202 2.916 3.486 3.942 4.326 4.678 5.009 5.62 5.908 6.187 6.153 6.914 7.133 7.531 7.921 8.301 8.474 8.799 9.104 9.541 9.822 10.1 10.513 10.909 11.264 11.587 11.904 12.293 12.647 12.973 13.36 13.776 14.151 14.528 14.957 15.384 15.829 16.265 16.683 17.093 17.527 17.979 18.399 18.822 19.228 19.595 19.902 20.095 19.982 19.347 18.174 16.922 15.655 14.511 13.497 12.578 11.73 10.92 10.022 9.312 8.728 8.144 7.58 7.008 6.474 5.903 5.347 4.855 4.361 3.888 3.466 2.996 2.513 2.14 1.754 1.331 0.875 0.408 0.098 -0.22 -0.737 -1.085 -1.442 -1.632 -2.042 -2.49 -2.955 -3.19 -3.984 -3.964 -4.246 -4.547 -5.206 -5.571 -5.962 -6.399 -6.901 -7.476 -8.161 -9.982 -8 ,20094 ,KEBNE ,16690949,Thu Nov 25 09:25:50 CET,Thu Nov 25 11:30:32 CET,0.0 1.854 2.537 3.055 3.511 3.922 4.286 4.614 5.224 5.517 5.785 5.731 6.484 6.688 7.085 7.482 7.856 8.03 8.361 8.668 9.109 9.399 9.678 10.052 10.412 10.771 11.134 11.48 11.908 12.303 12.672 13.094 13.459 13.838 14.241 14.581 14.917 15.312 15.696 16.077 16.481 16.935 17.409 17.829 18.26 18.663 19.089 19.464 19.709 19.682 19.068 17.83 16.581 15.396 14.285 13.269 12.325 11.432 10.645 9.843 9.144 8.513 7.867 7.236 6.654 6.085 5.456 4.927 4.463 3.94 3.396 2.953 2.475 1.952 1.541 1.116 0.685 0.237 -0.22 -0.537 -0.87 -1.395 -1.771 -2.155 -2.352 -2.753 -3.166 -3.592 -3.824 -4.618 -4.541 -4.809 -5.107 -5.755 -6.099 -6.468 -6.867 -7.285 -7.777 -8.407 -10.68 -9 ,17138 ,KEBNE ,16690225,Thu Nov 25 08:05:54 CET,Thu Nov 25 08:07:17 CET,0.0 2.598 3.322 3.859 4.294 4.667 5.041 5.393 5.989 6.26 6.517 6.476 7.222 7.427 7.815 8.185 8.541 8.716 9.073 9.402 9.828 10.092 10.354 10.742 11.127 11.503 11.85 12.149 12.544 12.929 13.271 13.662 14.021 14.359 14.756 15.215 15.633 16.055 16.466 16.885 17.315 17.755 18.196 18.612 19.076 19.521 19.912 20.24 20.473 20.498 19.932 18.72 17.429 16.163 15.001 13.962 13.072 12.239 11.47 10.627 9.876 9.213 8.601 8.057 7.504 6.968 6.406 5.863 5.353 4.825 4.283 3.818 3.314 2.796 2.41 2.019 1.621 1.198 0.745 0.426 0.09 -0.423 -0.781 -1.168 -1.369 -1.78 -2.2 -2.649 -2.89 -3.681 -3.671 -3.963 -4.277 -4.929 -5.276 -5.666 -6.1 -6.593 -7.144 -7.814 -9.937 -10 ,14485 ,KEBNE ,16690951,Thu Nov 25 09:28:56 CET,Thu Nov 25 11:34:34 CET,0.0 1.614 2.258 2.757 3.197 3.561 3.888 4.2 4.748 5.0 5.24 5.195 5.938 6.139 6.534 6.911 7.265 7.432 7.769 8.094 8.555 8.839 9.118 9.526 9.908 10.27 10.606 10.912 11.293 11.647 11.976 12.394 12.823 13.214 13.629 14.074 14.473 14.904 15.399 15.907 16.36 16.811 17.341 17.848 18.345 18.758 19.14 19.506 19.738 19.733 19.232 17.988 16.648 15.393 14.295 13.293 12.395 11.53 10.763 9.983 9.263 8.609 8.002 7.424 6.856 6.309 5.73 5.183 4.66 4.113 3.56 3.117 2.643 2.141 1.763 1.37 0.972 0.545 0.076 -0.246 -0.57 -1.069 -1.438 -1.833 -2.035 -2.434 -2.854 -3.299 -3.53 -4.305 -4.267 -4.556 -4.864 -5.504 -5.857 -6.236 -6.633 -7.07 -7.6 -8.358 -10.191 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23482.txt deleted file mode 100644 index 874252f2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23480_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12968 ,KEBNE ,16690952,Thu Nov 25 10:16:34 CET,Thu Nov 25 12:19:48 CET,0.0 1.51 2.074 2.503 2.838 3.116 3.354 3.586 4.012 4.203 4.376 4.167 4.867 5.009 5.255 5.463 5.655 5.745 5.912 6.077 6.309 6.452 6.578 6.754 6.92 7.071 7.208 7.321 7.462 7.59 7.684 7.779 7.843 7.871 7.897 7.899 7.856 7.764 7.59 7.333 7.013 6.552 5.9 5.116 4.089 2.779 0.899 -1.698 -5.386 -10.603 -18.762 -27.793 -34.589 -39.929 -44.27 -47.982 -51.097 -53.844 -56.151 -58.387 -60.263 -61.901 -63.401 -64.815 -66.164 -67.37 -68.61 -69.721 -70.645 -71.58 -72.54 -73.311 -74.118 -74.958 -75.595 -76.237 -76.885 -77.562 -78.263 -78.745 -79.243 -79.978 -80.478 -80.999 -81.264 -81.816 -82.402 -83.02 -83.323 -84.253 -84.235 -84.564 -84.907 -85.651 -86.051 -86.478 -86.96 -87.518 -88.186 -89.07 -91.136 -2 ,29773 ,KEBNE ,16690228,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:07:04 CET,0.0 2.164 2.857 3.373 3.777 4.113 4.396 4.659 5.149 5.368 5.587 5.469 6.185 6.369 6.679 6.953 7.206 7.326 7.541 7.735 8.039 8.23 8.378 8.552 8.727 8.895 9.052 9.205 9.383 9.533 9.655 9.749 9.805 9.815 9.737 9.638 9.552 9.415 9.223 8.975 8.656 8.191 7.529 6.69 5.51 4.023 2.039 -0.665 -4.458 -9.832 -18.225 -27.568 -34.755 -40.414 -44.957 -48.821 -52.049 -54.811 -57.082 -59.276 -61.159 -62.798 -64.302 -65.704 -67.0 -68.162 -69.404 -70.547 -71.482 -72.471 -73.54 -74.374 -75.216 -76.099 -76.774 -77.446 -78.133 -78.885 -79.662 -80.168 -80.682 -81.478 -82.022 -82.586 -82.877 -83.49 -84.11 -84.75 -85.082 -86.056 -86.164 -86.544 -86.94 -87.855 -88.357 -88.855 -89.387 -89.969 -90.592 -91.35 -93.089 -3 ,20724 ,KEBNE ,16690954,Thu Nov 25 10:15:31 CET,Thu Nov 25 12:19:15 CET,0.0 2.471 3.106 3.57 3.938 4.245 4.541 4.799 5.18 5.335 5.485 5.223 5.878 5.989 6.207 6.396 6.552 6.618 6.741 6.836 6.948 7.008 7.086 7.206 7.277 7.329 7.365 7.38 7.393 7.392 7.367 7.294 7.203 7.13 7.003 6.787 6.536 6.234 5.884 5.45 4.913 4.212 3.27 2.238 0.913 -0.729 -2.872 -5.77 -9.871 -15.588 -24.302 -33.797 -40.847 -46.431 -50.999 -54.913 -58.184 -60.99 -63.332 -65.606 -67.526 -69.193 -70.729 -72.147 -73.418 -74.545 -75.732 -76.778 -77.673 -78.615 -79.567 -80.324 -81.093 -81.875 -82.472 -83.083 -83.699 -84.328 -84.992 -85.451 -85.924 -86.647 -87.135 -87.631 -87.883 -88.399 -88.93 -89.489 -89.771 -90.676 -90.614 -90.918 -91.239 -91.911 -92.258 -92.64 -93.029 -93.479 -94.008 -94.634 -96.393 -4 ,14657 ,KEBNE ,16690955,Thu Nov 25 10:15:31 CET,Thu Nov 25 12:19:26 CET,0.0 2.302 3.115 3.676 4.118 4.497 4.813 5.089 5.537 5.707 5.868 5.618 6.283 6.403 6.629 6.818 7.001 7.079 7.213 7.343 7.518 7.625 7.717 7.838 7.942 8.022 8.074 8.101 8.11 8.095 8.086 8.065 8.015 7.945 7.839 7.686 7.505 7.263 6.953 6.586 6.15 5.558 4.78 3.919 2.779 1.29 -0.796 -3.591 -7.481 -13.028 -21.519 -30.672 -37.553 -42.952 -47.29 -50.963 -54.05 -56.772 -59.063 -61.286 -63.158 -64.772 -66.264 -67.654 -68.943 -70.112 -71.314 -72.369 -73.246 -74.127 -75.043 -75.796 -76.559 -77.351 -77.974 -78.593 -79.209 -79.844 -80.504 -80.962 -81.43 -82.2 -82.753 -83.311 -83.592 -84.163 -84.751 -85.37 -85.69 -86.643 -86.714 -87.077 -87.448 -88.213 -88.617 -89.069 -89.549 -90.065 -90.667 -91.404 -93.034 -5 ,31139 ,KEBNE ,16690956,Thu Nov 25 10:16:33 CET,Thu Nov 25 12:20:30 CET,0.0 2.174 2.899 3.386 3.763 4.111 4.428 4.706 5.19 5.382 5.528 5.256 5.912 6.025 6.268 6.493 6.649 6.726 6.875 7.004 7.201 7.309 7.388 7.489 7.583 7.66 7.708 7.742 7.79 7.818 7.816 7.794 7.743 7.676 7.591 7.463 7.312 7.104 6.794 6.392 5.908 5.261 4.384 3.365 2.06 0.495 -1.631 -4.454 -8.24 -13.607 -22.035 -31.271 -38.178 -43.599 -48.041 -51.803 -54.893 -57.614 -59.951 -62.215 -64.091 -65.713 -67.229 -68.64 -69.95 -71.119 -72.292 -73.348 -74.248 -75.16 -76.094 -76.857 -77.631 -78.425 -79.05 -79.666 -80.277 -80.896 -81.545 -82.004 -82.471 -83.166 -83.642 -84.149 -84.405 -84.916 -85.44 -85.992 -86.295 -87.221 -87.19 -87.501 -87.839 -88.566 -88.972 -89.412 -89.871 -90.345 -90.91 -91.674 -93.496 -6 ,25333 ,KEBNE ,16690232,Thu Nov 25 08:05:53 CET,Thu Nov 25 08:06:57 CET,0.0 1.622 2.227 2.721 3.12 3.426 3.69 3.922 4.353 4.543 4.728 4.533 5.226 5.382 5.641 5.881 6.105 6.204 6.385 6.524 6.691 6.81 6.924 7.093 7.275 7.435 7.566 7.678 7.804 7.903 7.968 8.028 8.07 8.077 8.041 7.959 7.839 7.684 7.498 7.22 6.823 6.292 5.573 4.714 3.509 1.97 -0.074 -2.817 -6.594 -11.97 -20.274 -29.393 -36.285 -41.65 -46.0 -49.728 -52.864 -55.582 -57.888 -60.114 -61.989 -63.679 -65.245 -66.697 -68.066 -69.3 -70.531 -71.61 -72.541 -73.468 -74.393 -75.186 -76.034 -76.872 -77.506 -78.153 -78.804 -79.5 -80.245 -80.741 -81.246 -82.023 -82.557 -83.127 -83.412 -83.973 -84.564 -85.178 -85.483 -86.425 -86.478 -86.841 -87.206 -87.943 -88.352 -88.807 -89.273 -89.758 -90.327 -91.026 -92.495 -7 ,5585 ,KEBNE ,16690958,Thu Nov 25 10:16:34 CET,Thu Nov 25 12:20:49 CET,0.0 2.611 3.322 3.854 4.298 4.684 5.029 5.314 5.814 6.046 6.276 6.143 6.834 6.984 7.266 7.535 7.753 7.856 8.073 8.27 8.549 8.71 8.833 8.988 9.119 9.253 9.373 9.472 9.607 9.729 9.834 9.945 10.017 10.057 10.043 9.954 9.868 9.752 9.608 9.429 9.155 8.764 8.233 7.574 6.634 5.338 3.324 0.513 -3.436 -9.232 -18.101 -27.647 -34.92 -40.713 -45.412 -49.436 -52.842 -55.943 -58.609 -61.151 -63.262 -65.097 -66.792 -68.397 -69.892 -71.225 -72.59 -73.75 -74.709 -75.729 -76.813 -77.701 -78.574 -79.451 -80.14 -80.85 -81.567 -82.294 -83.047 -83.574 -84.13 -84.994 -85.581 -86.176 -86.486 -87.131 -87.798 -88.499 -88.845 -89.805 -89.918 -90.34 -90.783 -91.722 -92.229 -92.741 -93.289 -93.908 -94.626 -95.463 -97.461 -8 ,23584 ,KEBNE ,16690234,Thu Nov 25 08:07:55 CET,Thu Nov 25 08:09:08 CET,0.0 2.56 3.344 3.829 4.165 4.472 4.743 4.996 5.458 5.644 5.8 5.534 6.198 6.314 6.53 6.745 6.928 7.027 7.228 7.383 7.575 7.69 7.789 7.906 8.002 8.067 8.105 8.123 8.137 8.15 8.151 8.125 8.084 8.03 7.921 7.772 7.606 7.349 6.978 6.512 5.962 5.303 4.47 3.484 2.156 0.447 -1.803 -4.655 -8.648 -14.469 -23.333 -32.887 -40.067 -45.684 -50.209 -54.054 -57.328 -60.168 -62.496 -64.761 -66.663 -68.304 -69.832 -71.24 -72.514 -73.665 -74.864 -75.921 -76.803 -77.693 -78.609 -79.374 -80.17 -80.978 -81.596 -82.221 -82.851 -83.49 -84.143 -84.591 -85.048 -85.763 -86.258 -86.77 -87.036 -87.585 -88.16 -88.74 -89.038 -89.973 -89.998 -90.34 -90.697 -91.428 -91.794 -92.192 -92.646 -93.166 -93.758 -94.469 -96.12 -9 ,30530 ,KEBNE ,16690960,Thu Nov 25 10:17:36 CET,Thu Nov 25 12:22:56 CET,0.0 2.56 3.307 3.737 4.153 4.559 4.872 5.126 5.604 5.806 5.981 5.788 6.475 6.627 6.907 7.155 7.408 7.531 7.736 7.939 8.241 8.435 8.607 8.828 9.011 9.18 9.338 9.487 9.643 9.771 9.861 9.906 9.947 9.928 9.878 9.831 9.735 9.594 9.413 9.146 8.733 8.15 7.378 6.523 5.325 3.671 1.518 -1.256 -5.142 -10.63 -19.019 -28.081 -34.91 -40.393 -44.847 -48.617 -51.825 -54.652 -56.953 -59.143 -61.01 -62.621 -64.103 -65.505 -66.843 -68.038 -69.262 -70.384 -71.317 -72.269 -73.275 -74.107 -74.966 -75.846 -76.545 -77.267 -77.982 -78.715 -79.491 -80.026 -80.574 -81.397 -81.955 -82.547 -82.854 -83.456 -84.094 -84.805 -85.17 -86.175 -86.323 -86.739 -87.178 -88.108 -88.593 -89.077 -89.597 -90.18 -90.857 -91.765 -94.094 -10 ,29761 ,KEBNE ,16690961,Thu Nov 25 10:17:36 CET,Thu Nov 25 12:22:37 CET,0.0 2.243 2.869 3.336 3.706 4.022 4.315 4.573 4.95 5.12 5.286 5.068 5.764 5.904 6.169 6.383 6.554 6.641 6.796 6.926 7.096 7.188 7.278 7.391 7.483 7.546 7.585 7.64 7.696 7.729 7.758 7.713 7.631 7.557 7.458 7.289 7.083 6.823 6.477 6.066 5.573 4.903 4.046 3.109 1.882 0.274 -1.994 -4.858 -8.65 -14.08 -22.461 -31.676 -38.837 -44.586 -49.181 -53.006 -56.164 -58.908 -61.22 -63.501 -65.388 -67.015 -68.545 -69.967 -71.261 -72.439 -73.66 -74.71 -75.601 -76.521 -77.473 -78.233 -78.972 -79.732 -80.314 -80.901 -81.506 -82.131 -82.795 -83.245 -83.694 -84.417 -84.916 -85.421 -85.68 -86.199 -86.728 -87.267 -87.553 -88.488 -88.461 -88.771 -89.097 -89.776 -90.137 -90.535 -90.969 -91.471 -92.072 -92.842 -95.031 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23475.txt deleted file mode 100644 index 8825defb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21229 ,KEBNE ,17025093,Wed Dec 22 11:49:01 CET,Wed Dec 22 13:47:51 CET,0.0 1.724 2.49 3.101 3.586 4.044 4.475 4.869 5.588 5.939 6.273 6.289 7.223 7.532 8.125 8.709 9.287 9.58 10.16 10.724 11.539 12.065 12.576 13.339 14.105 14.848 15.569 16.269 17.189 18.082 18.963 20.068 21.148 22.201 23.439 24.87 26.291 27.865 29.592 31.514 33.61 36.004 38.853 41.828 45.473 49.718 54.844 60.945 68.581 78.361 91.646 104.372 112.808 118.739 123.057 126.529 129.239 131.381 133.097 134.602 135.706 136.609 137.433 138.134 138.704 139.176 139.633 139.968 140.202 140.45 140.691 140.848 140.945 140.997 141.025 141.043 141.063 141.083 141.065 141.037 140.985 140.872 140.792 140.691 140.632 140.482 140.29 140.053 139.909 139.264 139.404 139.217 139.032 138.624 138.38 138.081 137.732 137.305 136.752 135.914 132.638 -2 ,15656 ,KEBNE ,17025094,Wed Dec 22 11:49:01 CET,Wed Dec 22 13:49:28 CET,0.0 2.316 3.138 3.752 4.361 4.991 5.537 5.989 6.859 7.28 7.677 7.802 8.797 9.145 9.827 10.493 11.135 11.451 12.071 12.683 13.574 14.162 14.744 15.582 16.395 17.181 17.967 18.751 19.757 20.74 21.731 22.945 24.131 25.29 26.63 28.158 29.652 31.332 33.151 35.128 37.308 39.808 42.776 45.835 49.49 53.752 58.887 64.963 72.561 82.311 95.365 107.516 115.637 121.436 125.729 129.098 131.653 133.686 135.272 136.706 137.834 138.743 139.512 140.137 140.665 141.097 141.481 141.799 142.047 142.276 142.481 142.629 142.766 142.878 142.946 142.998 143.034 143.042 143.016 142.984 142.937 142.869 142.807 142.714 142.666 142.549 142.427 142.291 142.21 141.635 141.843 141.677 141.526 141.155 140.905 140.594 140.224 139.735 139.106 138.185 126.497 -3 ,5120 ,KEBNE ,17025095,Wed Dec 22 11:49:01 CET,Wed Dec 22 13:48:40 CET,0.0 2.13 2.877 3.482 4.037 4.551 5.04 5.487 6.327 6.744 7.145 7.26 8.227 8.558 9.222 9.873 10.501 10.811 11.413 11.994 12.86 13.436 13.999 14.839 15.65 16.444 17.244 18.034 19.066 20.038 20.974 22.146 23.313 24.457 25.774 27.298 28.813 30.506 32.38 34.394 36.566 39.103 42.163 45.326 49.111 53.52 58.77 64.937 72.673 82.575 95.771 108.234 116.538 122.368 126.684 130.045 132.671 134.808 136.413 137.844 138.932 139.798 140.584 141.237 141.765 142.187 142.549 142.846 143.076 143.264 143.443 143.595 143.723 143.801 143.827 143.864 143.889 143.848 143.793 143.751 143.693 143.594 143.514 143.416 143.361 143.235 143.089 142.935 142.846 142.286 142.543 142.413 142.254 141.837 141.565 141.287 140.991 140.529 139.852 138.943 134.548 -5 ,14730 ,KEBNE ,17025097,Wed Dec 22 11:49:01 CET,Wed Dec 22 13:48:54 CET,0.0 1.965 2.783 3.442 4.032 4.584 5.081 5.536 6.408 6.815 7.216 7.357 8.366 8.723 9.403 10.058 10.693 11.008 11.621 12.222 13.094 13.64 14.18 14.974 15.758 16.535 17.291 18.032 19.001 19.954 20.913 22.097 23.235 24.374 25.715 27.214 28.636 30.218 31.969 33.837 35.857 38.271 41.192 44.14 47.698 51.811 56.782 62.728 70.18 79.837 92.917 104.995 113.049 118.888 123.17 126.428 128.986 131.142 132.79 134.225 135.21 136.002 136.737 137.278 137.683 137.992 138.286 138.52 138.665 138.775 138.863 138.921 138.965 138.989 139.01 139.011 138.976 138.896 138.774 138.665 138.533 138.344 138.227 138.102 138.015 137.786 137.495 137.193 137.055 136.439 136.58 136.381 136.146 135.489 135.125 134.773 134.348 133.846 133.118 132.082 123.628 -6 ,3074 ,KEBNE ,17025098,Wed Dec 22 11:49:01 CET,Wed Dec 22 13:47:50 CET,0.0 1.58 2.288 2.861 3.39 3.901 4.373 4.82 5.65 6.04 6.432 6.573 7.576 7.936 8.626 9.292 9.94 10.246 10.843 11.44 12.314 12.885 13.45 14.286 15.106 15.9 16.667 17.431 18.451 19.457 20.446 21.629 22.776 23.929 25.293 26.851 28.374 30.066 31.938 33.993 36.22 38.816 41.995 45.306 49.287 53.82 59.269 65.697 73.701 83.939 97.523 110.559 119.325 125.323 129.527 132.795 135.248 137.133 138.593 139.882 140.864 141.664 142.33 142.903 143.39 143.769 144.099 144.335 144.498 144.654 144.828 144.954 145.052 145.128 145.174 145.195 145.177 145.13 145.054 144.984 144.908 144.814 144.713 144.535 144.447 144.283 144.096 143.879 143.763 143.166 143.37 143.191 143.01 142.465 142.046 141.601 141.172 140.677 139.891 138.761 134.516 -7 ,20222 ,KEBNE ,17025099,Wed Dec 22 11:49:01 CET,Wed Dec 22 13:49:00 CET,0.0 2.108 2.88 3.453 3.955 4.427 4.868 5.282 6.075 6.454 6.815 6.866 7.836 8.174 8.816 9.447 10.082 10.391 10.991 11.583 12.437 12.996 13.553 14.357 15.143 15.892 16.627 17.368 18.353 19.332 20.283 21.447 22.592 23.724 25.057 26.545 27.997 29.65 31.48 33.476 35.641 38.129 41.076 44.112 47.793 52.103 57.355 63.696 71.706 81.816 95.251 107.897 116.347 122.445 126.883 130.174 132.681 134.703 136.274 137.661 138.747 139.636 140.374 140.987 141.522 141.985 142.437 142.803 143.084 143.355 143.567 143.71 143.852 143.986 144.059 144.13 144.213 144.288 144.325 144.297 144.264 144.204 144.135 144.039 143.991 143.871 143.685 143.474 143.349 142.747 142.977 142.809 142.633 142.25 141.99 141.696 141.345 140.898 140.304 139.481 135.073 -8 ,4784 ,KEBNE ,17025100,Wed Dec 22 11:49:01 CET,Wed Dec 22 13:47:56 CET,0.0 1.656 2.388 2.972 3.508 3.995 4.431 4.855 5.673 6.049 6.411 6.477 7.436 7.764 8.427 9.074 9.695 9.998 10.581 11.161 12.048 12.617 13.156 13.949 14.707 15.443 16.181 16.906 17.869 18.819 19.76 20.916 22.023 23.094 24.356 25.818 27.233 28.85 30.668 32.651 34.765 37.136 40.033 43.028 46.646 50.863 55.97 62.057 69.543 79.115 91.939 104.084 112.331 118.219 122.575 126.057 128.74 130.81 132.32 133.666 134.664 135.434 136.069 136.614 137.066 137.411 137.73 137.951 138.107 138.28 138.425 138.499 138.546 138.566 138.57 138.564 138.528 138.45 138.339 138.258 138.159 137.97 137.833 137.654 137.539 137.3 137.049 136.756 136.596 135.945 135.984 135.723 135.471 134.948 134.647 134.28 133.801 133.219 132.511 131.488 127.262 -9 ,30209 ,KEBNE ,17025101,Wed Dec 22 11:49:01 CET,Wed Dec 22 13:49:13 CET,0.0 2.035 2.936 3.638 4.272 4.836 5.348 5.85 6.789 7.212 7.618 7.771 8.78 9.155 9.878 10.549 11.196 11.521 12.154 12.762 13.631 14.204 14.798 15.692 16.536 17.328 18.124 18.922 19.951 20.933 21.901 23.093 24.256 25.395 26.72 28.254 29.768 31.449 33.285 35.253 37.376 39.852 42.859 45.952 49.635 53.945 59.191 65.429 73.179 83.103 96.349 108.507 116.443 122.103 126.236 129.411 131.911 133.98 135.57 136.982 138.086 138.979 139.734 140.348 140.873 141.314 141.723 142.051 142.227 142.392 142.566 142.68 142.799 142.873 142.928 142.978 142.978 142.962 142.947 142.948 142.919 142.804 142.73 142.626 142.56 142.42 142.258 142.051 141.927 141.341 141.535 141.367 141.175 140.684 140.382 140.06 139.696 139.151 138.285 137.058 130.824 -10 ,29620 ,KEBNE ,17025102,Wed Dec 22 11:50:03 CET,Wed Dec 22 13:50:22 CET,0.0 2.174 2.949 3.547 4.088 4.595 5.06 5.507 6.344 6.731 7.115 7.23 8.238 8.589 9.26 9.922 10.57 10.896 11.521 12.117 12.991 13.557 14.121 14.939 15.739 16.539 17.329 18.103 19.099 20.066 21.01 22.166 23.319 24.427 25.726 27.245 28.726 30.371 32.183 34.149 36.241 38.687 41.641 44.689 48.372 52.607 57.718 63.793 71.372 81.207 94.593 107.004 115.164 121.022 125.273 128.516 131.07 133.171 134.824 136.337 137.523 138.397 139.1 139.757 140.313 140.778 141.277 141.671 141.977 142.265 142.514 142.702 142.869 142.973 143.007 143.032 143.06 143.089 143.098 143.079 143.022 142.88 142.753 142.614 142.526 142.333 142.163 141.967 141.844 141.233 141.414 141.259 141.099 140.675 140.402 140.053 139.593 139.031 138.356 137.485 128.853 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23476.txt deleted file mode 100644 index a0c6626d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12959 ,KEBNE ,16690237,Thu Nov 25 08:07:55 CET,Thu Nov 25 08:09:05 CET,0.0 1.585 2.28 2.846 3.366 3.845 4.315 4.781 5.643 6.036 6.424 6.56 7.559 7.915 8.62 9.305 9.947 10.264 10.892 11.491 12.381 12.969 13.551 14.411 15.241 16.057 16.844 17.615 18.624 19.601 20.584 21.799 22.941 24.063 25.45 27.007 28.45 30.057 31.842 33.777 35.85 38.251 41.117 44.114 47.77 51.956 56.955 63.024 70.626 80.274 93.378 105.761 114.076 119.965 124.329 127.759 130.343 132.288 133.81 135.229 136.243 137.033 137.717 138.214 138.633 139.006 139.329 139.598 139.798 139.94 140.062 140.123 140.15 140.157 140.127 140.097 140.069 140.038 139.984 139.927 139.871 139.766 139.667 139.56 139.505 139.357 139.157 138.93 138.798 138.18 138.37 138.204 138.025 137.576 137.294 137.011 136.705 136.245 135.613 134.706 131.197 -3 ,13067 ,KEBNE ,16690964,Thu Nov 25 10:18:41 CET,Thu Nov 25 12:19:15 CET,0.0 3.463 4.543 5.328 5.996 6.589 7.119 7.642 8.596 9.034 9.463 9.664 10.689 11.064 11.798 12.497 13.162 13.498 14.165 14.798 15.709 16.31 16.919 17.819 18.654 19.441 20.203 20.959 21.966 22.943 23.908 25.098 26.268 27.407 28.742 30.259 31.735 33.371 35.182 37.173 39.353 41.929 45.005 48.158 51.938 56.326 61.61 67.793 75.477 85.309 98.646 111.169 119.388 125.187 129.449 132.78 135.331 137.389 138.968 140.4 141.522 142.41 143.162 143.78 144.305 144.769 145.208 145.564 145.858 146.122 146.328 146.46 146.585 146.702 146.774 146.848 146.912 146.911 146.874 146.857 146.83 146.723 146.627 146.541 146.5 146.413 146.295 146.143 146.052 145.466 145.717 145.586 145.444 145.12 144.931 144.683 144.391 144.003 143.373 142.323 138.15 -4 ,16406 ,KEBNE ,16690240,Thu Nov 25 08:08:00 CET,Thu Nov 25 08:09:11 CET,0.0 1.729 2.481 3.084 3.607 4.096 4.543 4.983 5.825 6.225 6.609 6.685 7.653 7.987 8.649 9.3 9.932 10.24 10.848 11.441 12.31 12.892 13.46 14.28 15.086 15.89 16.697 17.484 18.502 19.498 20.478 21.672 22.838 23.986 25.321 26.816 28.273 29.937 31.811 33.874 36.087 38.563 41.521 44.633 48.396 52.737 57.938 64.076 71.692 81.368 94.325 106.362 114.347 119.986 124.186 127.485 129.96 131.953 133.44 134.711 135.642 136.381 136.993 137.488 137.925 138.263 138.542 138.768 138.949 139.077 139.148 139.186 139.214 139.254 139.258 139.212 139.182 139.147 139.072 139.014 138.926 138.749 138.626 138.494 138.414 138.214 138.009 137.788 137.656 137.049 137.254 137.084 136.893 136.468 136.233 135.961 135.613 135.175 134.611 133.89 129.234 -5 ,23998 ,KEBNE ,16690241,Thu Nov 25 08:07:56 CET,Thu Nov 25 08:09:07 CET,0.0 2.299 3.13 3.795 4.361 4.89 5.381 5.864 6.751 7.162 7.568 7.704 8.693 9.036 9.701 10.352 10.977 11.284 11.897 12.518 13.441 14.042 14.625 15.445 16.266 17.101 17.907 18.688 19.724 20.737 21.716 22.894 24.041 25.168 26.49 28.016 29.484 31.117 32.912 34.849 36.95 39.39 42.32 45.325 48.932 53.156 58.266 64.362 72.0 81.775 94.825 107.03 115.074 120.845 125.194 128.567 131.064 133.003 134.564 135.947 136.898 137.653 138.33 138.865 139.309 139.681 139.984 140.232 140.417 140.549 140.639 140.699 140.77 140.802 140.802 140.799 140.786 140.736 140.669 140.605 140.518 140.373 140.23 140.074 139.999 139.838 139.648 139.435 139.317 138.705 138.853 138.651 138.45 137.947 137.652 137.333 136.947 136.454 135.843 135.121 130.999 -6 ,3037 ,KEBNE ,16690967,Thu Nov 25 10:19:39 CET,Thu Nov 25 12:24:04 CET,0.0 3.709 4.52 5.215 5.868 6.459 7.049 7.565 8.428 8.847 9.26 9.427 10.416 10.769 11.472 12.174 12.863 13.206 13.87 14.499 15.429 16.051 16.663 17.543 18.388 19.233 20.067 20.867 21.898 22.91 23.92 25.151 26.363 27.575 29.006 30.62 32.168 33.899 35.808 37.86 40.044 42.536 45.505 48.618 52.4 56.743 61.976 68.215 75.993 85.858 99.032 111.32 119.387 125.159 129.431 132.715 135.248 137.287 138.846 140.21 141.258 142.096 142.84 143.489 144.01 144.424 144.797 145.081 145.33 145.556 145.716 145.822 145.891 145.945 145.966 145.941 145.911 145.873 145.83 145.787 145.719 145.63 145.563 145.449 145.38 145.238 145.057 144.836 144.723 144.118 144.336 144.192 144.012 143.544 143.28 143.018 142.727 142.347 141.852 141.024 137.14 -7 ,21567 ,KEBNE ,16690243,Thu Nov 25 08:07:55 CET,Thu Nov 25 08:08:57 CET,0.0 5.318 6.34 7.136 7.876 8.508 9.072 9.606 10.562 11.007 11.448 11.687 12.723 13.119 13.897 14.649 15.336 15.661 16.3 16.929 17.841 18.421 18.995 19.84 20.672 21.488 22.273 23.052 24.081 25.07 26.04 27.207 28.336 29.462 30.769 32.205 33.628 35.251 37.017 38.937 41.033 43.475 46.409 49.483 53.229 57.576 62.819 69.036 76.75 86.545 99.675 111.998 120.024 125.648 129.843 133.088 135.506 137.38 138.845 140.143 141.097 141.882 142.561 143.103 143.539 143.856 144.145 144.396 144.567 144.714 144.837 144.929 144.995 144.999 144.958 144.913 144.883 144.852 144.766 144.675 144.579 144.436 144.311 144.137 144.054 143.877 143.649 143.414 143.27 142.619 142.738 142.536 142.34 141.904 141.63 141.323 141.005 140.576 140.052 139.386 134.959 -8 ,15989 ,KEBNE ,16690244,Thu Nov 25 08:07:55 CET,Thu Nov 25 08:08:56 CET,0.0 2.503 3.336 4.051 4.66 5.173 5.678 6.169 7.048 7.457 7.853 7.953 8.937 9.293 10.011 10.697 11.338 11.647 12.255 12.861 13.781 14.382 14.962 15.806 16.624 17.407 18.203 19.001 20.028 21.016 21.974 23.142 24.29 25.444 26.795 28.343 29.821 31.422 33.193 35.128 37.202 39.615 42.566 45.671 49.331 53.482 58.668 64.836 72.32 81.883 94.836 107.065 115.203 120.887 124.983 128.213 130.638 132.505 133.951 135.274 136.291 137.072 137.772 138.318 138.736 139.09 139.377 139.632 139.824 139.955 140.074 140.141 140.196 140.224 140.209 140.184 140.153 140.094 140.029 139.979 139.905 139.769 139.644 139.504 139.431 139.242 138.974 138.627 138.449 137.813 137.971 137.794 137.59 137.112 136.86 136.582 136.249 135.832 135.273 134.467 131.137 -9 ,2833 ,KEBNE ,16690970,Thu Nov 25 10:19:43 CET,Thu Nov 25 12:15:33 CET,0.0 1.663 2.372 2.963 3.501 4.001 4.477 4.917 5.717 6.108 6.502 6.615 7.602 7.955 8.642 9.326 9.987 10.295 10.899 11.508 12.395 12.969 13.537 14.338 15.11 15.898 16.667 17.426 18.43 19.403 20.367 21.529 22.651 23.759 25.071 26.612 28.096 29.74 31.543 33.533 35.69 38.118 41.043 44.06 47.692 51.931 57.047 63.173 70.799 80.4 93.348 105.583 113.776 119.644 123.948 127.325 129.982 132.028 133.538 134.83 135.865 136.689 137.315 137.919 138.438 138.813 139.162 139.429 139.609 139.759 139.873 139.944 140.007 140.048 140.041 140.023 139.989 139.927 139.857 139.783 139.696 139.561 139.429 139.27 139.192 139.021 138.829 138.61 138.482 137.863 138.054 137.897 137.704 137.273 137.046 136.746 136.395 136.02 135.542 134.814 129.657 -10 ,16108 ,KEBNE ,16690971,Thu Nov 25 10:19:43 CET,Thu Nov 25 12:19:52 CET,0.0 2.189 3.06 3.774 4.383 4.93 5.477 5.973 6.869 7.293 7.713 7.9 8.905 9.282 10.022 10.745 11.438 11.764 12.422 13.075 14.016 14.644 15.287 16.227 17.139 18.015 18.846 19.655 20.717 21.778 22.792 23.999 25.199 26.361 27.683 29.179 30.664 32.33 34.159 36.162 38.276 40.687 43.639 46.705 50.367 54.604 59.69 65.789 73.415 83.201 96.485 108.809 116.95 122.745 126.915 130.071 132.513 134.523 136.069 137.434 138.524 139.395 140.152 140.789 141.256 141.628 141.991 142.258 142.421 142.569 142.705 142.771 142.824 142.866 142.856 142.82 142.74 142.634 142.53 142.454 142.379 142.251 142.15 142.033 141.959 141.779 141.569 141.316 141.184 140.572 140.718 140.507 140.284 139.791 139.51 139.228 138.871 138.425 137.863 137.026 133.941 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23479.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23479.txt deleted file mode 100644 index 4f43a250..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23482_23479.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20339 ,KEBNE ,16690247,Thu Nov 25 08:07:55 CET,Thu Nov 25 08:08:53 CET,0.0 2.061 2.712 3.242 3.768 4.257 4.64 5.0 5.693 6.011 6.32 6.283 7.201 7.464 7.987 8.505 8.997 9.238 9.709 10.157 10.82 11.238 11.639 12.237 12.831 13.432 14.023 14.612 15.361 16.079 16.805 17.686 18.519 19.333 20.297 21.4 22.488 23.72 25.062 26.49 28.039 29.81 31.921 34.092 36.676 39.668 43.263 47.506 52.745 59.366 68.073 75.971 81.21 84.889 87.458 89.428 90.917 92.089 92.963 93.687 94.258 94.683 95.004 95.257 95.454 95.629 95.756 95.821 95.861 95.864 95.855 95.849 95.825 95.775 95.716 95.645 95.567 95.474 95.364 95.269 95.165 94.993 94.858 94.708 94.605 94.358 94.126 93.884 93.747 93.047 93.274 93.097 92.927 92.514 92.248 91.963 91.638 91.226 90.73 90.053 87.86 -2 ,18944 ,KEBNE ,16690973,Thu Nov 25 10:19:41 CET,Thu Nov 25 12:21:50 CET,0.0 1.915 2.796 3.505 4.118 4.655 5.155 5.614 6.434 6.809 7.169 7.247 8.222 8.555 9.209 9.829 10.397 10.672 11.212 11.747 12.543 13.043 13.527 14.261 14.961 15.623 16.273 16.919 17.753 18.542 19.337 20.308 21.217 22.1 23.136 24.283 25.381 26.608 27.967 29.473 31.079 32.869 35.024 37.247 39.817 42.717 46.157 50.261 55.274 61.418 69.513 77.036 81.992 85.378 87.819 89.734 91.145 92.148 92.791 93.398 93.904 94.263 94.497 94.59 94.616 94.639 94.616 94.563 94.507 94.401 94.258 94.134 93.988 93.791 93.628 93.484 93.326 93.127 92.892 92.73 92.547 92.222 92.0 91.763 91.637 91.378 91.089 90.745 90.571 89.85 89.973 89.748 89.496 88.917 88.617 88.297 87.88 87.38 86.744 85.91 83.795 -3 ,5710 ,KEBNE ,16690974,Thu Nov 25 10:21:43 CET,Thu Nov 25 12:24:30 CET,0.0 1.451 2.189 2.765 3.305 3.804 4.25 4.649 5.417 5.782 6.125 6.134 7.073 7.378 7.98 8.537 9.069 9.335 9.871 10.382 11.104 11.573 12.033 12.702 13.354 14.005 14.642 15.234 16.016 16.802 17.533 18.404 19.263 20.094 21.029 22.104 23.163 24.319 25.57 26.919 28.43 30.176 32.179 34.254 36.766 39.58 42.921 46.888 51.76 57.914 66.003 73.326 78.153 81.527 83.808 85.585 86.996 88.003 88.682 89.236 89.58 89.822 89.992 90.07 90.157 90.236 90.244 90.182 90.104 90.008 89.898 89.787 89.653 89.484 89.331 89.169 88.99 88.81 88.621 88.47 88.313 88.055 87.85 87.633 87.518 87.276 87.015 86.729 86.571 85.845 86.011 85.808 85.597 85.172 84.925 84.627 84.246 83.804 83.332 82.68 80.679 -4 ,32080 ,KEBNE ,16690250,Thu Nov 25 08:07:55 CET,Thu Nov 25 08:09:00 CET,0.0 2.081 2.78 3.294 3.768 4.256 4.687 5.047 5.737 6.062 6.383 6.383 7.291 7.571 8.095 8.598 9.073 9.3 9.754 10.208 10.864 11.285 11.703 12.305 12.878 13.458 14.042 14.604 15.329 16.036 16.726 17.577 18.411 19.215 20.168 21.262 22.322 23.496 24.764 26.123 27.566 29.242 31.308 33.481 36.081 39.068 42.661 46.889 52.059 58.549 67.126 75.056 80.289 83.918 86.546 88.497 89.893 90.981 91.804 92.508 93.029 93.433 93.776 94.071 94.289 94.424 94.523 94.588 94.637 94.654 94.62 94.588 94.548 94.492 94.437 94.382 94.308 94.214 94.108 94.018 93.922 93.754 93.615 93.433 93.338 93.17 92.98 92.765 92.648 91.998 92.249 92.092 91.926 91.54 91.299 91.039 90.748 90.399 89.908 89.24 87.059 -5 ,5572 ,KEBNE ,16690251,Thu Nov 25 08:07:56 CET,Thu Nov 25 08:09:16 CET,0.0 2.765 3.616 4.251 4.81 5.314 5.758 6.164 6.931 7.301 7.675 7.766 8.716 9.043 9.673 10.264 10.839 11.128 11.677 12.202 12.957 13.442 13.925 14.634 15.329 15.991 16.619 17.231 18.018 18.812 19.604 20.531 21.428 22.359 23.42 24.574 25.725 27.019 28.39 29.832 31.382 33.138 35.243 37.409 39.978 42.9 46.355 50.466 55.595 61.789 69.75 77.072 81.766 84.964 87.193 88.906 90.21 91.182 91.878 92.451 92.764 92.948 93.1 93.175 93.213 93.273 93.303 93.284 93.219 93.084 92.951 92.826 92.673 92.519 92.37 92.208 92.058 91.861 91.625 91.467 91.302 91.012 90.795 90.55 90.417 90.143 89.847 89.53 89.356 88.63 88.75 88.517 88.264 87.701 87.364 87.026 86.679 86.265 85.763 85.083 83.149 -6 ,24242 ,KEBNE ,16690252,Thu Nov 25 08:07:55 CET,Thu Nov 25 08:09:17 CET,0.0 3.654 4.745 5.51 6.131 6.678 7.118 7.492 8.165 8.48 8.78 8.713 9.621 9.888 10.409 10.901 11.396 11.669 12.232 12.75 13.436 13.871 14.288 14.903 15.511 16.091 16.663 17.216 17.93 18.63 19.315 20.137 20.932 21.731 22.667 23.72 24.752 25.916 27.21 28.614 30.104 31.819 33.855 35.919 38.375 41.155 44.493 48.446 53.31 59.494 67.672 75.168 80.034 83.367 85.747 87.598 88.956 89.964 90.718 91.38 91.904 92.316 92.626 92.873 93.044 93.157 93.264 93.343 93.372 93.37 93.374 93.362 93.325 93.253 93.178 93.097 93.006 92.914 92.805 92.72 92.624 92.457 92.331 92.18 92.091 91.902 91.706 91.485 91.351 90.666 90.9 90.733 90.559 90.117 89.866 89.611 89.319 88.96 88.494 87.846 85.539 -7 ,26124 ,KEBNE ,16690978,Thu Nov 25 10:21:43 CET,Thu Nov 25 12:24:29 CET,0.0 3.603 4.741 5.577 6.239 6.736 7.128 7.496 8.183 8.509 8.813 8.734 9.648 9.93 10.451 10.95 11.442 11.676 12.141 12.599 13.25 13.673 14.089 14.705 15.321 15.919 16.5 17.063 17.781 18.48 19.166 20.012 20.857 21.702 22.663 23.754 24.843 26.009 27.264 28.627 30.125 31.912 34.023 36.178 38.737 41.631 45.164 49.355 54.386 60.621 68.88 76.368 81.051 84.278 86.654 88.478 89.85 90.903 91.671 92.31 92.801 93.186 93.511 93.762 93.927 94.069 94.192 94.27 94.298 94.291 94.282 94.264 94.218 94.149 94.079 93.995 93.903 93.798 93.695 93.613 93.505 93.315 93.167 93.002 92.921 92.74 92.526 92.318 92.206 91.539 91.816 91.657 91.501 91.164 90.928 90.67 90.402 90.062 89.637 89.002 87.002 -8 ,18421 ,KEBNE ,16690979,Thu Nov 25 10:21:43 CET,Thu Nov 25 12:24:32 CET,0.0 1.87 2.674 3.298 3.847 4.34 4.798 5.225 6.006 6.359 6.668 6.619 7.544 7.819 8.34 8.83 9.309 9.551 10.038 10.521 11.201 11.624 12.052 12.696 13.317 13.92 14.512 15.097 15.863 16.603 17.334 18.237 19.1 19.941 20.915 22.022 23.095 24.273 25.57 26.986 28.495 30.215 32.279 34.424 36.979 39.912 43.425 47.541 52.619 59.072 67.703 75.631 80.749 84.239 86.707 88.603 90.038 91.168 92.013 92.711 93.215 93.617 93.957 94.234 94.436 94.571 94.675 94.724 94.75 94.771 94.762 94.737 94.706 94.667 94.622 94.549 94.448 94.289 94.122 94.018 93.904 93.718 93.576 93.395 93.295 93.106 92.903 92.681 92.575 91.928 92.151 91.986 91.819 91.44 91.197 90.92 90.597 90.202 89.754 89.135 86.605 -9 ,30320 ,KEBNE ,16690255,Thu Nov 25 08:07:55 CET,Thu Nov 25 08:09:08 CET,0.0 2.014 2.796 3.378 3.875 4.341 4.768 5.135 5.785 6.09 6.386 6.332 7.254 7.528 8.06 8.562 9.03 9.269 9.75 10.219 10.897 11.32 11.744 12.383 12.993 13.587 14.176 14.75 15.499 16.242 16.963 17.826 18.667 19.496 20.445 21.508 22.546 23.687 24.954 26.362 27.861 29.583 31.648 33.77 36.292 39.146 42.523 46.487 51.404 57.637 65.84 73.265 78.044 81.368 83.782 85.611 86.941 87.97 88.784 89.483 89.988 90.395 90.727 90.99 91.181 91.303 91.37 91.353 91.345 91.355 91.344 91.321 91.255 91.154 91.067 90.961 90.835 90.684 90.513 90.396 90.278 90.08 89.928 89.759 89.669 89.475 89.253 88.993 88.855 88.169 88.427 88.281 88.127 87.765 87.543 87.269 86.948 86.565 86.127 85.49 83.127 -10 ,15596 ,KEBNE ,16690256,Thu Nov 25 08:07:56 CET,Thu Nov 25 08:09:11 CET,0.0 4.959 6.034 6.691 7.167 7.584 7.983 8.383 9.16 9.534 9.866 9.822 10.73 10.997 11.503 12.048 12.587 12.837 13.312 13.763 14.415 14.843 15.273 15.912 16.535 17.118 17.685 18.251 18.984 19.716 20.429 21.301 22.154 22.977 23.927 25.021 26.079 27.249 28.549 29.902 31.355 33.093 35.171 37.314 39.915 42.877 46.347 50.477 55.592 61.992 70.496 78.283 83.367 86.948 89.535 91.496 92.895 93.989 94.849 95.578 96.139 96.555 96.859 97.076 97.238 97.359 97.452 97.509 97.527 97.516 97.486 97.428 97.343 97.236 97.142 97.057 96.962 96.847 96.707 96.596 96.478 96.277 96.124 95.961 95.87 95.655 95.421 95.172 95.029 94.341 94.541 94.337 94.12 93.612 93.303 92.995 92.629 92.197 91.684 90.839 88.387 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23483_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23483_23482.txt deleted file mode 100644 index 2232ab76..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23483_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12137 ,KEBNE ,16690257,Thu Nov 25 08:07:56 CET,Thu Nov 25 08:09:14 CET,0.0 1.139 1.729 2.197 2.595 2.923 3.203 3.469 3.983 4.217 4.447 4.233 5.057 5.229 5.562 5.892 6.206 6.356 6.644 6.915 7.303 7.556 7.808 8.161 8.486 8.804 9.109 9.407 9.798 10.16 10.506 10.937 11.351 11.774 12.251 12.718 13.134 13.597 14.092 14.505 14.829 15.146 15.493 15.82 16.106 16.323 16.465 16.437 16.114 15.353 13.638 11.144 8.931 6.986 5.262 3.7 2.318 1.082 0.061 -0.976 -1.91 -2.777 -3.64 -4.434 -5.199 -5.995 -6.861 -7.59 -8.217 -8.901 -9.584 -10.164 -10.78 -11.417 -11.911 -12.4 -12.916 -13.458 -13.992 -14.356 -14.756 -15.398 -15.837 -16.303 -16.556 -17.092 -17.653 -18.228 -18.524 -19.445 -19.45 -19.787 -20.135 -20.941 -21.377 -21.855 -22.395 -23.012 -23.751 -24.806 -28.372 -2 ,5103 ,KEBNE ,16690983,Thu Nov 25 10:21:43 CET,Thu Nov 25 12:27:03 CET,0.0 1.357 1.945 2.395 2.785 3.141 3.452 3.747 4.282 4.5 4.713 4.492 5.308 5.493 5.849 6.205 6.538 6.695 7.006 7.289 7.694 7.958 8.213 8.593 8.946 9.258 9.545 9.821 10.186 10.562 10.904 11.288 11.651 11.981 12.384 12.82 13.192 13.587 14.024 14.464 14.895 15.371 15.89 16.398 16.863 17.272 17.645 17.835 17.821 17.357 15.924 13.725 11.597 9.647 7.936 6.365 4.978 3.661 2.491 1.293 0.241 -0.699 -1.607 -2.491 -3.31 -4.021 -4.767 -5.467 -6.081 -6.733 -7.413 -7.966 -8.552 -9.202 -9.693 -10.177 -10.68 -11.188 -11.742 -12.139 -12.541 -13.189 -13.654 -14.117 -14.35 -14.837 -15.354 -15.9 -16.188 -17.12 -17.167 -17.551 -17.941 -18.776 -19.242 -19.745 -20.289 -20.938 -21.798 -23.04 -28.115 -3 ,9926 ,KEBNE ,16690259,Thu Nov 25 08:07:59 CET,Thu Nov 25 08:09:11 CET,0.0 2.999 3.94 4.606 5.105 5.508 5.889 6.227 6.731 6.934 7.111 6.78 7.555 7.711 8.003 8.255 8.478 8.591 8.813 9.022 9.335 9.533 9.717 9.976 10.218 10.441 10.659 10.886 11.16 11.409 11.647 11.913 12.159 12.388 12.639 12.913 13.184 13.46 13.748 14.04 14.291 14.516 14.767 14.957 15.1 15.18 15.139 14.947 14.394 13.175 10.832 7.868 5.278 3.019 1.04 -0.715 -2.25 -3.678 -4.896 -6.089 -7.134 -8.069 -8.925 -9.718 -10.476 -11.21 -12.016 -12.732 -13.324 -13.916 -14.558 -15.121 -15.686 -16.246 -16.67 -17.106 -17.584 -18.069 -18.55 -18.906 -19.283 -19.867 -20.262 -20.673 -20.895 -21.376 -21.884 -22.418 -22.72 -23.657 -23.671 -24.003 -24.363 -25.191 -25.622 -26.095 -26.717 -27.544 -28.399 -29.377 -38.941 -4 ,18608 ,KEBNE ,16690985,Thu Nov 25 10:21:43 CET,Thu Nov 25 12:26:55 CET,0.0 1.307 1.857 2.304 2.697 3.057 3.369 3.655 4.159 4.377 4.599 4.428 5.261 5.459 5.829 6.173 6.49 6.641 6.922 7.186 7.574 7.828 8.075 8.424 8.752 9.062 9.354 9.638 10.003 10.335 10.648 11.031 11.398 11.75 12.13 12.535 12.923 13.338 13.766 14.233 14.732 15.247 15.83 16.39 16.947 17.489 18.002 18.347 18.388 17.896 16.293 13.785 11.493 9.491 7.729 6.104 4.679 3.404 2.316 1.182 0.118 -0.826 -1.728 -2.632 -3.468 -4.231 -5.024 -5.714 -6.297 -6.92 -7.622 -8.227 -8.837 -9.46 -9.961 -10.464 -10.948 -11.436 -11.95 -12.304 -12.67 -13.286 -13.744 -14.215 -14.446 -14.926 -15.417 -15.943 -16.223 -17.153 -17.162 -17.503 -17.857 -18.641 -19.057 -19.518 -20.081 -20.787 -21.617 -22.688 -25.554 -5 ,21942 ,KEBNE ,16690261,Thu Nov 25 08:08:04 CET,Thu Nov 25 08:09:07 CET,0.0 1.678 2.316 2.795 3.169 3.51 3.817 4.108 4.634 4.871 5.091 4.865 5.677 5.854 6.179 6.499 6.804 6.947 7.223 7.484 7.871 8.121 8.352 8.702 9.036 9.349 9.655 9.941 10.287 10.609 10.926 11.305 11.659 12.009 12.414 12.845 13.249 13.704 14.155 14.595 14.991 15.324 15.689 16.09 16.485 16.746 16.859 16.789 16.484 15.685 13.918 11.41 9.08 7.061 5.351 3.783 2.368 1.055 -0.085 -1.276 -2.334 -3.255 -4.139 -4.999 -5.805 -6.553 -7.345 -8.067 -8.692 -9.335 -10.002 -10.548 -11.099 -11.676 -12.126 -12.593 -13.088 -13.622 -14.174 -14.525 -14.887 -15.471 -15.892 -16.359 -16.607 -17.102 -17.623 -18.178 -18.468 -19.407 -19.425 -19.793 -20.165 -20.975 -21.432 -21.915 -22.439 -23.05 -23.819 -24.823 -29.152 -6 ,20924 ,KEBNE ,16690987,Thu Nov 25 10:21:43 CET,Thu Nov 25 12:26:33 CET,0.0 1.33 2.022 2.588 3.069 3.501 3.902 4.255 4.83 5.103 5.376 5.258 6.111 6.32 6.701 7.057 7.409 7.579 7.911 8.226 8.666 8.945 9.218 9.596 9.972 10.336 10.654 10.95 11.344 11.733 12.105 12.518 12.862 13.183 13.534 13.879 14.207 14.582 14.962 15.328 15.76 16.223 16.644 17.127 17.612 17.895 18.066 18.108 17.956 17.291 15.588 13.093 10.79 8.764 7.015 5.39 3.951 2.624 1.464 0.315 -0.662 -1.584 -2.464 -3.284 -4.105 -4.847 -5.649 -6.368 -6.985 -7.665 -8.381 -8.984 -9.589 -10.191 -10.658 -11.12 -11.61 -12.164 -12.75 -13.133 -13.526 -14.16 -14.61 -15.064 -15.304 -15.842 -16.429 -17.015 -17.305 -18.254 -18.272 -18.621 -19.025 -19.971 -20.435 -20.906 -21.441 -22.06 -22.801 -23.851 -28.925 -7 ,8986 ,KEBNE ,16690263,Thu Nov 25 08:07:56 CET,Thu Nov 25 08:09:05 CET,0.0 1.675 2.301 2.767 3.133 3.443 3.721 3.984 4.479 4.717 4.936 4.722 5.534 5.703 6.041 6.368 6.667 6.804 7.072 7.343 7.724 7.962 8.19 8.509 8.819 9.102 9.381 9.657 10.005 10.346 10.67 11.026 11.341 11.652 12.012 12.404 12.764 13.124 13.522 13.926 14.294 14.682 15.085 15.486 15.908 16.209 16.348 16.308 16.003 15.221 13.49 10.978 8.762 6.841 5.158 3.625 2.265 1.042 -0.014 -1.242 -2.37 -3.334 -4.274 -5.155 -5.948 -6.676 -7.434 -8.121 -8.734 -9.365 -10.023 -10.576 -11.133 -11.704 -12.147 -12.609 -13.093 -13.588 -14.094 -14.445 -14.813 -15.396 -15.801 -16.237 -16.466 -16.932 -17.428 -17.949 -18.239 -19.189 -19.121 -19.441 -19.783 -20.542 -20.965 -21.435 -21.966 -22.592 -23.405 -24.504 -27.918 -8 ,20133 ,KEBNE ,16690989,Thu Nov 25 10:21:43 CET,Thu Nov 25 12:28:09 CET,0.0 1.453 2.196 2.765 3.213 3.602 3.963 4.286 4.862 5.146 5.41 5.257 6.127 6.357 6.782 7.171 7.53 7.707 8.057 8.383 8.844 9.131 9.403 9.781 10.138 10.485 10.817 11.14 11.542 11.912 12.259 12.67 13.05 13.376 13.706 14.052 14.36 14.699 15.044 15.417 15.9 16.365 16.724 17.019 17.317 17.559 17.671 17.584 17.156 16.248 14.383 11.864 9.661 7.696 6.021 4.527 3.205 2.008 0.897 -0.189 -1.061 -1.853 -2.634 -3.367 -4.076 -4.791 -5.548 -6.209 -6.771 -7.399 -8.105 -8.693 -9.307 -9.925 -10.387 -10.878 -11.402 -11.948 -12.515 -12.916 -13.329 -13.967 -14.437 -14.943 -15.19 -15.679 -16.197 -16.714 -16.994 -17.929 -17.958 -18.335 -18.724 -19.552 -20.018 -20.546 -21.137 -21.805 -22.643 -23.755 -27.776 -9 ,31631 ,KEBNE ,16690265,Thu Nov 25 08:07:56 CET,Thu Nov 25 08:09:17 CET,0.0 3.863 4.892 5.629 6.247 6.726 7.056 7.318 7.802 8.048 8.281 8.083 8.89 9.075 9.411 9.719 10.021 10.169 10.449 10.717 11.096 11.342 11.585 11.92 12.239 12.537 12.831 13.108 13.417 13.727 14.038 14.394 14.72 15.013 15.366 15.754 16.1 16.466 16.802 17.148 17.486 17.806 18.156 18.44 18.705 18.88 18.905 18.71 18.134 17.023 14.9 12.047 9.549 7.344 5.373 3.599 2.025 0.552 -0.753 -2.073 -3.208 -4.211 -5.178 -6.056 -6.867 -7.636 -8.397 -9.068 -9.642 -10.253 -10.905 -11.429 -11.986 -12.574 -13.031 -13.497 -14.006 -14.516 -15.056 -15.437 -15.802 -16.406 -16.832 -17.278 -17.521 -18.02 -18.569 -19.146 -19.435 -20.362 -20.431 -20.766 -21.103 -21.9 -22.37 -22.891 -23.439 -24.074 -24.812 -25.728 -30.625 -10 ,17548 ,KEBNE ,16690266,Thu Nov 25 08:07:56 CET,Thu Nov 25 08:09:16 CET,0.0 1.553 2.188 2.709 3.131 3.502 3.839 4.159 4.734 4.982 5.221 5.041 5.851 6.045 6.418 6.777 7.104 7.256 7.557 7.854 8.263 8.519 8.758 9.101 9.429 9.723 10.001 10.28 10.634 10.947 11.238 11.594 11.932 12.245 12.591 12.959 13.316 13.671 13.999 14.323 14.621 15.064 15.532 15.797 16.0 16.045 15.98 15.784 15.345 14.48 12.635 10.072 7.778 5.789 4.081 2.538 1.159 -0.079 -1.16 -2.287 -3.302 -4.208 -5.0 -5.77 -6.578 -7.34 -8.115 -8.801 -9.397 -10.008 -10.64 -11.175 -11.758 -12.356 -12.818 -13.314 -13.835 -14.379 -14.946 -15.325 -15.708 -16.293 -16.712 -17.18 -17.423 -17.951 -18.523 -19.111 -19.402 -20.349 -20.489 -20.876 -21.279 -22.217 -22.794 -23.424 -24.03 -24.722 -25.685 -26.978 -31.291 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23484.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23484.txt deleted file mode 100644 index 03ef0e66..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23484.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11807 ,KEBNE ,16690992,Thu Nov 25 10:24:50 CET,Thu Nov 25 12:32:56 CET,0.0 0.51 0.818 1.106 1.384 1.626 1.841 2.036 2.388 2.552 2.718 2.426 3.219 3.371 3.645 3.906 4.185 4.323 4.583 4.844 5.221 5.465 5.697 6.017 6.312 6.578 6.839 7.1 7.456 7.806 8.146 8.581 9.01 9.429 9.909 10.428 10.936 11.497 12.087 12.731 13.414 14.193 15.105 16.04 17.158 18.408 19.839 21.41 23.219 25.383 27.83 29.553 30.389 30.784 30.884 30.699 30.379 30.053 29.743 29.379 29.003 28.624 28.241 27.863 27.505 27.172 26.808 26.467 26.153 25.819 25.478 25.193 24.901 24.591 24.344 24.081 23.786 23.493 23.209 22.995 22.756 22.387 22.136 21.875 21.737 21.449 21.153 20.813 20.639 19.845 20.07 19.881 19.672 19.175 18.9 18.607 18.268 17.87 17.396 16.86 16.052 -2 ,26400 ,KEBNE ,16690268,Thu Nov 25 08:07:55 CET,Thu Nov 25 08:09:16 CET,0.0 0.577 0.942 1.287 1.586 1.822 2.034 2.243 2.649 2.85 3.047 2.764 3.546 3.697 4.004 4.3 4.579 4.714 4.977 5.232 5.621 5.871 6.113 6.471 6.829 7.164 7.474 7.798 8.235 8.64 9.014 9.467 9.926 10.363 10.86 11.432 11.986 12.603 13.268 13.959 14.649 15.409 16.317 17.259 18.387 19.647 21.038 22.563 24.335 26.274 28.354 29.678 30.219 30.385 30.329 30.138 29.86 29.543 29.219 28.848 28.468 28.082 27.702 27.349 26.988 26.616 26.229 25.879 25.559 25.219 24.86 24.565 24.262 23.922 23.644 23.347 23.042 22.733 22.401 22.165 21.922 21.56 21.306 21.019 20.864 20.559 20.234 19.884 19.7 18.87 19.077 18.862 18.616 18.083 17.809 17.503 17.154 16.765 16.269 15.58 14.429 -3 ,6877 ,KEBNE ,16690994,Thu Nov 25 10:24:54 CET,Thu Nov 25 12:33:10 CET,0.0 0.668 1.025 1.341 1.64 1.91 2.145 2.368 2.773 2.951 3.132 2.849 3.634 3.785 4.087 4.373 4.644 4.775 5.028 5.264 5.601 5.812 6.03 6.37 6.704 7.038 7.369 7.68 8.082 8.462 8.833 9.306 9.78 10.232 10.719 11.258 11.805 12.399 13.015 13.666 14.361 15.166 16.083 16.991 18.013 19.1 20.386 21.829 23.432 25.224 27.211 28.603 29.115 29.188 29.06 28.845 28.538 28.165 27.831 27.471 27.097 26.739 26.372 25.973 25.592 25.234 24.83 24.462 24.149 23.819 23.48 23.197 22.889 22.561 22.31 22.054 21.783 21.486 21.138 20.899 20.664 20.301 20.04 19.758 19.62 19.318 18.998 18.662 18.489 17.666 17.875 17.669 17.477 17.024 16.765 16.473 16.132 15.765 15.3 14.651 13.539 -4 ,16050 ,KEBNE ,16690995,Thu Nov 25 10:24:51 CET,Thu Nov 25 12:34:03 CET,0.0 0.332 0.631 0.909 1.178 1.429 1.663 1.893 2.311 2.494 2.671 2.365 3.17 3.327 3.602 3.864 4.135 4.273 4.548 4.813 5.176 5.411 5.64 5.97 6.276 6.566 6.874 7.169 7.52 7.863 8.203 8.618 9.021 9.407 9.865 10.403 10.915 11.49 12.122 12.77 13.427 14.177 15.068 15.974 17.052 18.266 19.687 21.271 23.124 25.334 27.841 29.583 30.461 30.749 30.629 30.335 30.048 29.722 29.335 28.887 28.472 28.104 27.738 27.362 26.991 26.632 26.229 25.857 25.55 25.216 24.826 24.497 24.152 23.8 23.528 23.238 22.939 22.62 22.29 22.072 21.83 21.437 21.181 20.913 20.778 20.494 20.184 19.837 19.653 18.843 19.111 18.896 18.664 18.135 17.827 17.517 17.17 16.77 16.322 15.751 14.444 -5 ,19074 ,KEBNE ,16690996,Thu Nov 25 10:24:51 CET,Thu Nov 25 12:33:40 CET,0.0 0.61 0.927 1.188 1.404 1.602 1.805 2.005 2.374 2.556 2.744 2.414 3.168 3.318 3.628 3.909 4.179 4.317 4.566 4.806 5.156 5.38 5.603 5.916 6.23 6.526 6.812 7.102 7.452 7.791 8.133 8.56 8.969 9.351 9.813 10.34 10.83 11.364 11.943 12.565 13.209 13.92 14.804 15.737 16.827 18.067 19.476 21.003 22.8 24.901 27.281 28.956 29.689 29.946 29.829 29.655 29.476 29.16 28.837 28.469 28.07 27.706 27.373 27.037 26.677 26.346 26.002 25.661 25.342 24.983 24.585 24.27 23.948 23.598 23.328 23.055 22.771 22.454 22.099 21.849 21.596 21.221 20.958 20.671 20.53 20.204 19.853 19.498 19.308 18.481 18.708 18.482 18.244 17.72 17.425 17.125 16.801 16.42 15.949 15.384 14.388 -6 ,7211 ,KEBNE ,16690272,Thu Nov 25 08:07:55 CET,Thu Nov 25 08:08:56 CET,0.0 0.672 1.002 1.265 1.505 1.736 1.95 2.156 2.561 2.742 2.91 2.593 3.368 3.5 3.792 4.097 4.388 4.523 4.766 5.015 5.391 5.644 5.872 6.195 6.508 6.801 7.088 7.366 7.712 8.033 8.35 8.732 9.114 9.506 9.987 10.535 11.024 11.533 12.084 12.7 13.352 14.067 14.893 15.735 16.757 17.922 19.27 20.769 22.482 24.483 26.805 28.422 29.285 29.719 29.813 29.631 29.296 28.944 28.595 28.232 27.868 27.484 27.1 26.723 26.358 26.044 25.71 25.354 25.033 24.701 24.325 23.998 23.673 23.342 23.079 22.802 22.528 22.243 21.928 21.705 21.473 21.108 20.841 20.567 20.425 20.099 19.732 19.369 19.185 18.388 18.609 18.398 18.173 17.717 17.473 17.207 16.893 16.54 16.136 15.61 14.568 -7 ,20856 ,KEBNE ,16690998,Thu Nov 25 10:24:54 CET,Thu Nov 25 12:34:22 CET,0.0 0.433 0.76 1.07 1.337 1.581 1.817 2.021 2.39 2.586 2.781 2.479 3.303 3.462 3.756 4.045 4.336 4.48 4.755 5.015 5.397 5.648 5.889 6.226 6.54 6.853 7.154 7.439 7.803 8.155 8.499 8.914 9.319 9.709 10.165 10.691 11.196 11.767 12.395 13.029 13.681 14.411 15.251 16.121 17.182 18.405 19.794 21.329 23.065 24.932 26.965 28.437 29.026 29.224 29.159 28.839 28.471 28.111 27.786 27.43 27.045 26.648 26.249 25.865 25.504 25.153 24.76 24.407 24.101 23.778 23.441 23.146 22.818 22.471 22.197 21.901 21.607 21.297 20.957 20.722 20.48 20.102 19.823 19.526 19.375 19.059 18.705 18.322 18.127 17.305 17.51 17.266 17.009 16.5 16.194 15.84 15.47 15.017 14.485 13.822 12.654 -8 ,22192 ,KEBNE ,16690999,Thu Nov 25 10:24:51 CET,Thu Nov 25 12:34:41 CET,0.0 0.548 0.865 1.124 1.344 1.556 1.755 1.946 2.267 2.406 2.554 2.24 3.029 3.175 3.442 3.711 3.959 4.077 4.308 4.553 4.909 5.14 5.37 5.7 6.022 6.332 6.633 6.936 7.317 7.664 8.014 8.442 8.844 9.236 9.697 10.205 10.694 11.239 11.838 12.475 13.127 13.875 14.772 15.668 16.746 17.962 19.285 20.775 22.52 24.547 26.965 28.789 29.657 29.949 30.025 29.983 29.822 29.592 29.342 29.041 28.716 28.39 28.054 27.738 27.384 27.043 26.693 26.357 26.089 25.78 25.438 25.144 24.817 24.488 24.226 23.957 23.686 23.397 23.089 22.869 22.637 22.286 22.045 21.772 21.631 21.345 21.049 20.734 20.561 19.774 19.996 19.804 19.595 19.152 18.887 18.582 18.272 17.921 17.522 17.056 16.208 -9 ,8582 ,KEBNE ,16691000,Thu Nov 25 10:24:51 CET,Thu Nov 25 12:34:15 CET,0.0 0.592 0.999 1.339 1.587 1.807 2.033 2.251 2.647 2.823 2.988 2.665 3.457 3.6 3.894 4.174 4.429 4.556 4.811 5.061 5.442 5.688 5.917 6.242 6.555 6.847 7.13 7.424 7.785 8.121 8.458 8.877 9.28 9.669 10.15 10.69 11.213 11.815 12.448 13.107 13.804 14.599 15.548 16.506 17.6 18.817 20.18 21.705 23.445 25.406 27.698 29.239 29.811 30.047 30.065 29.972 29.838 29.59 29.269 28.89 28.523 28.178 27.847 27.538 27.219 26.894 26.551 26.237 25.952 25.654 25.341 25.069 24.774 24.482 24.257 23.992 23.698 23.397 23.104 22.9 22.677 22.334 22.086 21.81 21.661 21.349 21.014 20.678 20.51 19.713 19.97 19.786 19.59 19.167 18.92 18.662 18.381 18.047 17.648 17.158 15.916 -10 ,32099 ,KEBNE ,16691001,Thu Nov 25 10:24:50 CET,Thu Nov 25 12:33:33 CET,0.0 0.56 0.907 1.193 1.45 1.681 1.9 2.11 2.506 2.699 2.875 2.557 3.358 3.512 3.8 4.078 4.35 4.48 4.744 5.003 5.37 5.592 5.802 6.12 6.433 6.741 7.045 7.333 7.689 8.044 8.394 8.803 9.198 9.588 10.049 10.555 11.03 11.568 12.158 12.781 13.434 14.182 15.061 15.934 16.931 18.026 19.246 20.595 22.127 23.931 25.918 27.17 27.688 27.825 27.7 27.473 27.22 26.899 26.559 26.181 25.847 25.542 25.233 24.898 24.558 24.243 23.886 23.547 23.226 22.9 22.567 22.265 21.966 21.673 21.442 21.185 20.924 20.637 20.307 20.086 19.866 19.518 19.27 19.012 18.877 18.57 18.236 17.891 17.711 16.893 17.112 16.883 16.644 16.118 15.824 15.517 15.183 14.78 14.255 13.589 12.317 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23485.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23485.txt deleted file mode 100644 index 0ecc701a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/protein/Summary_FEP_23486_23485.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25566 ,KEBNE ,16690277,Thu Nov 25 08:07:55 CET,Thu Nov 25 08:09:05 CET,0.0 2.51 3.244 3.811 4.3 4.738 5.134 5.502 6.136 6.412 6.67 6.509 7.384 7.602 8.009 8.41 8.777 8.954 9.31 9.649 10.137 10.446 10.735 11.145 11.545 11.935 12.303 12.655 13.089 13.478 13.866 14.311 14.716 15.154 15.693 16.263 16.773 17.302 17.88 18.523 19.15 19.795 20.545 21.318 22.192 23.133 24.215 25.38 26.631 28.0 29.556 30.639 31.051 31.174 31.084 30.854 30.575 30.244 29.91 29.541 29.182 28.838 28.52 28.201 27.856 27.518 27.16 26.847 26.561 26.235 25.893 25.592 25.279 24.965 24.726 24.459 24.163 23.868 23.56 23.334 23.094 22.736 22.486 22.204 22.046 21.713 21.393 21.088 20.924 20.13 20.416 20.243 20.054 19.618 19.36 19.069 18.742 18.391 17.996 17.489 16.329 -2 ,28435 ,KEBNE ,16691003,Thu Nov 25 10:24:50 CET,Thu Nov 25 12:31:27 CET,0.0 2.607 3.397 4.007 4.488 4.895 5.255 5.598 6.192 6.447 6.699 6.531 7.37 7.575 7.979 8.354 8.74 8.93 9.285 9.633 10.127 10.437 10.736 11.157 11.554 11.949 12.325 12.67 13.115 13.556 13.994 14.524 15.054 15.568 16.124 16.713 17.278 17.903 18.572 19.244 19.918 20.702 21.593 22.407 23.343 24.364 25.492 26.746 28.098 29.56 31.093 32.076 32.479 32.508 32.353 32.133 31.901 31.575 31.159 30.681 30.214 29.752 29.337 28.97 28.601 28.248 27.853 27.486 27.172 26.84 26.465 26.165 25.887 25.576 25.311 25.039 24.763 24.471 24.159 23.941 23.72 23.373 23.121 22.856 22.718 22.417 22.108 21.786 21.614 20.813 21.033 20.834 20.629 20.158 19.899 19.599 19.261 18.895 18.494 18.013 17.24 -3 ,28109 ,KEBNE ,16690279,Thu Nov 25 08:07:55 CET,Thu Nov 25 08:09:01 CET,0.0 2.805 3.611 4.187 4.644 5.047 5.415 5.756 6.361 6.637 6.914 6.78 7.656 7.876 8.293 8.676 9.041 9.237 9.608 9.941 10.442 10.765 11.054 11.462 11.863 12.243 12.623 12.988 13.433 13.854 14.242 14.694 15.141 15.591 16.098 16.648 17.147 17.664 18.256 18.888 19.514 20.192 20.962 21.739 22.616 23.542 24.609 25.831 27.224 28.758 30.356 31.341 31.691 31.725 31.579 31.356 31.09 30.786 30.443 30.05 29.712 29.377 29.01 28.627 28.235 27.866 27.458 27.075 26.738 26.373 25.99 25.677 25.373 25.069 24.823 24.566 24.301 24.025 23.725 23.521 23.316 22.96 22.695 22.422 22.288 22.021 21.727 21.427 21.275 20.474 20.709 20.505 20.303 19.834 19.58 19.296 18.966 18.62 18.221 17.775 17.014 -4 ,23868 ,KEBNE ,16691005,Thu Nov 25 10:24:50 CET,Thu Nov 25 12:31:43 CET,0.0 3.204 4.12 4.723 5.186 5.605 5.985 6.332 6.982 7.28 7.545 7.416 8.285 8.502 8.926 9.337 9.743 9.936 10.275 10.597 11.053 11.339 11.613 12.022 12.43 12.808 13.182 13.532 13.959 14.372 14.764 15.277 15.777 16.213 16.678 17.191 17.688 18.209 18.749 19.328 19.934 20.612 21.378 22.158 23.095 24.085 25.168 26.345 27.635 29.086 30.692 31.834 32.263 32.39 32.342 32.165 31.899 31.553 31.247 30.849 30.486 30.157 29.795 29.413 29.009 28.665 28.319 27.982 27.665 27.319 26.952 26.662 26.348 26.016 25.769 25.501 25.214 24.921 24.623 24.42 24.214 23.88 23.637 23.384 23.247 22.963 22.653 22.324 22.161 21.352 21.577 21.362 21.141 20.722 20.5 20.233 19.919 19.562 19.124 18.608 17.691 -5 ,28021 ,KEBNE ,16691006,Thu Nov 25 10:24:51 CET,Thu Nov 25 12:31:01 CET,0.0 2.269 3.019 3.565 3.998 4.392 4.727 5.038 5.621 5.889 6.155 5.997 6.847 7.068 7.519 7.94 8.332 8.517 8.85 9.163 9.632 9.934 10.213 10.626 11.033 11.405 11.763 12.107 12.533 12.943 13.338 13.819 14.265 14.679 15.161 15.679 16.154 16.688 17.265 17.867 18.506 19.21 20.001 20.784 21.671 22.641 23.742 24.932 26.284 27.736 29.253 30.265 30.632 30.64 30.479 30.227 29.948 29.635 29.295 28.864 28.421 27.983 27.545 27.132 26.743 26.383 25.978 25.601 25.275 24.934 24.568 24.251 23.924 23.592 23.322 23.037 22.771 22.494 22.19 21.97 21.733 21.365 21.117 20.864 20.727 20.435 20.135 19.813 19.645 18.856 19.123 18.925 18.703 18.236 17.98 17.708 17.411 17.068 16.662 16.183 15.283 -6 ,31618 ,KEBNE ,16690282,Thu Nov 25 08:07:56 CET,Thu Nov 25 08:09:14 CET,0.0 2.214 2.972 3.574 4.055 4.468 4.839 5.168 5.768 6.054 6.338 6.207 7.088 7.32 7.788 8.217 8.602 8.795 9.158 9.502 10.004 10.311 10.612 11.062 11.472 11.847 12.201 12.539 12.981 13.403 13.797 14.258 14.684 15.087 15.567 16.098 16.594 17.151 17.734 18.351 18.982 19.642 20.413 21.176 22.032 22.971 24.042 25.226 26.588 28.085 29.668 30.714 31.088 31.196 31.083 30.852 30.575 30.231 29.929 29.598 29.231 28.879 28.55 28.205 27.861 27.523 27.166 26.842 26.518 26.158 25.799 25.501 25.175 24.846 24.568 24.276 23.978 23.654 23.326 23.117 22.898 22.512 22.247 21.991 21.856 21.561 21.258 20.934 20.762 19.979 20.196 19.977 19.758 19.303 19.048 18.753 18.434 18.088 17.692 17.21 16.314 -7 ,21666 ,KEBNE ,16690283,Thu Nov 25 08:07:56 CET,Thu Nov 25 08:09:17 CET,0.0 2.547 3.313 3.902 4.387 4.786 5.158 5.517 6.11 6.375 6.656 6.557 7.434 7.672 8.126 8.52 8.876 9.051 9.405 9.728 10.162 10.449 10.733 11.137 11.524 11.915 12.3 12.656 13.103 13.544 13.963 14.435 14.892 15.326 15.798 16.323 16.806 17.313 17.874 18.484 19.106 19.787 20.57 21.343 22.247 23.208 24.315 25.561 26.907 28.391 29.96 30.953 31.306 31.391 31.31 31.073 30.744 30.447 30.182 29.822 29.434 29.053 28.703 28.354 27.996 27.655 27.287 26.979 26.705 26.369 25.997 25.699 25.4 25.083 24.819 24.541 24.263 23.962 23.633 23.411 23.18 22.796 22.525 22.241 22.095 21.792 21.464 21.111 20.929 20.127 20.345 20.125 19.909 19.448 19.171 18.872 18.588 18.265 17.902 17.424 16.192 -8 ,17405 ,KEBNE ,16691009,Thu Nov 25 10:24:50 CET,Thu Nov 25 12:31:15 CET,0.0 3.054 3.922 4.52 5.002 5.447 5.866 6.214 6.811 7.1 7.389 7.297 8.169 8.398 8.826 9.214 9.563 9.75 10.122 10.448 10.902 11.204 11.498 11.925 12.336 12.717 13.082 13.438 13.879 14.271 14.655 15.111 15.565 16.03 16.582 17.213 17.76 18.301 18.877 19.511 20.174 20.873 21.669 22.452 23.34 24.363 25.529 26.819 28.245 29.716 31.269 32.315 32.775 32.891 32.779 32.593 32.352 32.027 31.713 31.347 30.976 30.587 30.157 29.769 29.427 29.09 28.724 28.396 28.102 27.779 27.417 27.112 26.793 26.452 26.185 25.9 25.601 25.284 24.967 24.747 24.515 24.157 23.899 23.626 23.483 23.182 22.859 22.525 22.347 21.53 21.76 21.56 21.337 20.833 20.574 20.28 19.913 19.535 19.162 18.647 17.556 -9 ,8228 ,KEBNE ,16690285,Thu Nov 25 08:09:57 CET,Thu Nov 25 08:11:00 CET,0.0 2.957 3.761 4.338 4.82 5.259 5.646 5.99 6.625 6.919 7.187 7.034 7.878 8.091 8.5 8.894 9.277 9.463 9.811 10.149 10.63 10.945 11.25 11.672 12.073 12.446 12.801 13.155 13.611 14.036 14.435 14.898 15.334 15.769 16.303 16.858 17.342 17.905 18.519 19.118 19.736 20.435 21.222 22.009 22.898 23.88 25.007 26.191 27.499 28.99 30.57 31.606 32.018 32.087 31.992 31.833 31.597 31.258 30.902 30.525 30.145 29.781 29.413 29.039 28.663 28.33 28.022 27.717 27.433 27.135 26.791 26.508 26.226 25.907 25.643 25.368 25.101 24.822 24.508 24.277 24.04 23.663 23.404 23.155 23.018 22.709 22.398 22.077 21.906 21.1 21.323 21.107 20.891 20.406 20.134 19.853 19.544 19.195 18.799 18.258 17.189 -10 ,6491 ,KEBNE ,16691011,Thu Nov 25 10:24:50 CET,Thu Nov 25 12:32:17 CET,0.0 2.986 3.799 4.402 4.941 5.384 5.763 6.11 6.736 7.016 7.275 7.115 7.965 8.178 8.611 9.018 9.396 9.573 9.909 10.238 10.713 11.019 11.313 11.727 12.12 12.495 12.857 13.212 13.676 14.127 14.551 15.044 15.485 15.887 16.354 16.892 17.404 17.941 18.524 19.139 19.778 20.473 21.259 22.038 22.947 23.935 25.049 26.274 27.623 29.138 30.832 31.95 32.335 32.426 32.315 32.071 31.826 31.547 31.237 30.831 30.45 30.126 29.783 29.42 29.071 28.77 28.452 28.108 27.774 27.425 27.046 26.746 26.434 26.105 25.855 25.581 25.303 25.015 24.707 24.491 24.263 23.892 23.636 23.364 23.222 22.942 22.652 22.337 22.166 21.376 21.629 21.435 21.242 20.849 20.632 20.38 20.105 19.795 19.417 18.926 17.967 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt deleted file mode 100644 index 0c276eff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4924 ,KEBNE ,16690287,Thu Nov 25 08:09:58 CET,Thu Nov 25 08:11:08 CET,0.0 1.265 1.821 2.297 2.712 3.085 3.429 3.748 4.312 4.579 4.836 4.849 5.565 5.775 6.156 6.511 6.859 7.025 7.371 7.735 8.245 8.557 8.838 9.212 9.575 9.927 10.278 10.627 11.04 11.425 11.803 12.29 12.782 13.23 13.736 14.309 14.806 15.314 15.869 16.417 16.969 17.597 18.256 18.846 19.465 20.092 20.79 21.473 22.06 22.39 22.155 21.205 19.999 18.698 17.43 16.188 15.012 13.934 13.015 12.085 11.275 10.537 9.81 9.087 8.393 7.783 7.118 6.514 6.01 5.461 4.876 4.352 3.772 3.161 2.679 2.188 1.657 1.116 0.575 0.187 -0.237 -0.891 -1.34 -1.816 -2.063 -2.595 -3.147 -3.755 -4.07 -4.881 -5.138 -5.507 -5.899 -6.744 -7.2 -7.736 -8.39 -9.154 -10.106 -11.47 -16.42 -2 ,20446 ,KEBNE ,16691013,Thu Nov 25 10:24:49 CET,Thu Nov 25 12:03:02 CET,0.0 2.14 2.926 3.525 4.034 4.478 4.884 5.247 5.893 6.199 6.482 6.516 7.242 7.489 7.971 8.411 8.84 9.056 9.458 9.819 10.324 10.649 10.949 11.363 11.773 12.155 12.509 12.85 13.295 13.715 14.102 14.564 15.007 15.429 15.919 16.476 17.022 17.635 18.211 18.754 19.377 20.053 20.738 21.348 21.991 22.63 23.244 23.814 24.286 24.516 24.122 23.082 21.96 20.764 19.607 18.517 17.478 16.393 15.412 14.447 13.561 12.758 11.999 11.26 10.521 9.802 9.063 8.407 7.831 7.214 6.562 6.019 5.416 4.785 4.302 3.803 3.261 2.67 2.087 1.701 1.289 0.616 0.137 -0.358 -0.613 -1.143 -1.704 -2.332 -2.658 -3.46 -3.672 -4.059 -4.474 -5.345 -5.878 -6.551 -7.3 -8.194 -9.25 -10.747 -19.305 -3 ,11107 ,KEBNE ,16691014,Thu Nov 25 10:24:51 CET,Thu Nov 25 12:04:07 CET,0.0 2.197 3.024 3.652 4.171 4.627 5.042 5.411 6.039 6.323 6.607 6.66 7.398 7.644 8.11 8.572 9.005 9.21 9.608 9.973 10.475 10.791 11.103 11.575 12.043 12.483 12.896 13.286 13.777 14.246 14.688 15.189 15.671 16.112 16.593 17.185 17.755 18.292 18.818 19.346 19.897 20.498 21.141 21.787 22.526 23.247 23.925 24.594 25.179 25.511 25.153 24.089 22.96 21.749 20.635 19.606 18.647 17.712 16.812 15.857 15.011 14.219 13.456 12.754 12.071 11.437 10.745 10.082 9.491 8.869 8.231 7.711 7.171 6.576 6.071 5.558 5.073 4.549 3.959 3.56 3.139 2.446 1.981 1.511 1.257 0.716 0.138 -0.489 -0.808 -1.636 -1.922 -2.331 -2.754 -3.711 -4.269 -4.848 -5.463 -6.201 -7.213 -8.744 -15.532 -4 ,13369 ,KEBNE ,16690290,Thu Nov 25 08:09:58 CET,Thu Nov 25 08:11:21 CET,0.0 1.002 1.508 1.899 2.21 2.493 2.769 3.024 3.486 3.71 3.936 3.867 4.537 4.721 5.09 5.429 5.749 5.916 6.238 6.548 7.0 7.268 7.535 7.971 8.362 8.72 9.075 9.409 9.852 10.275 10.687 11.178 11.593 11.962 12.39 12.877 13.348 13.855 14.401 14.975 15.575 16.249 16.976 17.657 18.382 19.02 19.617 20.21 20.77 21.083 20.762 19.647 18.321 17.014 15.851 14.763 13.715 12.713 11.848 10.944 10.132 9.381 8.609 7.8 7.064 6.425 5.738 5.099 4.524 3.938 3.34 2.859 2.334 1.769 1.324 0.835 0.336 -0.154 -0.682 -1.052 -1.438 -2.074 -2.529 -2.979 -3.224 -3.759 -4.314 -4.928 -5.255 -6.086 -6.331 -6.73 -7.166 -8.114 -8.649 -9.254 -9.955 -10.699 -11.6 -12.889 -17.216 -5 ,11248 ,KEBNE ,16690291,Thu Nov 25 08:10:01 CET,Thu Nov 25 08:11:16 CET,0.0 2.084 2.833 3.401 3.887 4.334 4.731 5.09 5.703 5.98 6.252 6.254 6.96 7.19 7.643 8.039 8.406 8.587 8.939 9.276 9.761 10.072 10.367 10.787 11.207 11.592 11.956 12.3 12.708 13.124 13.507 13.954 14.418 14.869 15.336 15.818 16.302 16.817 17.348 17.923 18.538 19.248 20.008 20.603 21.227 21.888 22.493 23.049 23.574 23.958 23.872 23.069 21.934 20.725 19.541 18.365 17.296 16.304 15.452 14.574 13.672 12.825 12.029 11.251 10.562 9.948 9.287 8.659 8.114 7.528 6.852 6.294 5.727 5.142 4.659 4.156 3.671 3.16 2.586 2.183 1.776 1.146 0.699 0.195 -0.061 -0.589 -1.14 -1.734 -2.053 -2.859 -3.078 -3.455 -3.838 -4.744 -5.277 -5.842 -6.526 -7.41 -8.471 -9.724 -13.907 -6 ,3097 ,KEBNE ,16690292,Thu Nov 25 08:09:57 CET,Thu Nov 25 08:11:10 CET,0.0 2.023 2.755 3.272 3.717 4.126 4.494 4.847 5.493 5.791 6.084 6.144 6.879 7.138 7.636 8.089 8.519 8.721 9.087 9.435 9.932 10.247 10.553 10.997 11.419 11.817 12.19 12.535 12.985 13.47 13.946 14.465 14.912 15.325 15.813 16.397 16.948 17.5 18.093 18.7 19.223 19.798 20.488 21.104 21.75 22.402 23.107 23.781 24.279 24.614 24.385 23.366 22.194 21.003 19.878 18.747 17.716 16.773 15.92 15.014 14.199 13.482 12.793 12.118 11.461 10.873 10.246 9.63 9.101 8.568 7.972 7.424 6.849 6.252 5.791 5.341 4.869 4.355 3.809 3.435 3.034 2.369 1.898 1.407 1.155 0.651 0.127 -0.486 -0.83 -1.682 -2.024 -2.442 -2.862 -3.812 -4.359 -4.96 -5.632 -6.373 -7.258 -8.51 -12.841 -7 ,21089 ,KEBNE ,16691018,Thu Nov 25 10:24:50 CET,Thu Nov 25 12:03:08 CET,0.0 1.787 2.498 3.022 3.5 3.925 4.304 4.646 5.267 5.549 5.808 5.826 6.545 6.78 7.23 7.636 7.997 8.183 8.584 8.941 9.377 9.652 9.939 10.371 10.763 11.13 11.481 11.798 12.213 12.629 13.029 13.525 13.996 14.438 14.94 15.486 16.019 16.585 17.147 17.734 18.334 18.999 19.767 20.442 21.166 21.893 22.664 23.419 24.032 24.367 24.134 23.192 21.989 20.731 19.535 18.421 17.431 16.448 15.557 14.67 13.852 13.073 12.276 11.506 10.846 10.262 9.603 9.017 8.516 7.977 7.408 6.95 6.473 5.966 5.567 5.119 4.641 4.114 3.572 3.212 2.843 2.283 1.872 1.425 1.199 0.747 0.286 -0.203 -0.493 -1.289 -1.439 -1.804 -2.196 -3.088 -3.617 -4.161 -4.813 -5.619 -6.657 -8.037 -12.235 -8 ,29240 ,KEBNE ,16690294,Thu Nov 25 08:09:57 CET,Thu Nov 25 08:10:59 CET,0.0 1.869 2.57 3.084 3.537 3.959 4.336 4.675 5.281 5.568 5.826 5.808 6.5 6.702 7.077 7.431 7.776 7.948 8.279 8.57 9.012 9.304 9.57 9.957 10.332 10.681 11.015 11.366 11.841 12.259 12.623 13.065 13.507 13.937 14.431 14.976 15.467 15.976 16.523 17.115 17.655 18.153 18.73 19.304 19.892 20.437 21.018 21.589 22.004 22.142 21.755 20.601 19.2 17.735 16.376 15.057 13.906 12.823 11.861 10.887 9.999 9.161 8.344 7.606 6.891 6.217 5.494 4.821 4.265 3.689 3.07 2.553 1.977 1.369 0.899 0.4 -0.134 -0.699 -1.277 -1.678 -2.103 -2.813 -3.326 -3.825 -4.081 -4.639 -5.229 -5.845 -6.152 -6.943 -7.159 -7.557 -7.961 -8.876 -9.386 -9.944 -10.604 -11.323 -12.162 -13.387 -19.155 -9 ,2183 ,KEBNE ,16690295,Thu Nov 25 08:09:57 CET,Thu Nov 25 08:10:59 CET,0.0 1.096 1.695 2.164 2.557 2.916 3.247 3.548 4.11 4.388 4.648 4.649 5.364 5.586 6.002 6.382 6.759 6.941 7.257 7.555 8.016 8.312 8.576 8.967 9.36 9.73 10.088 10.438 10.852 11.226 11.598 12.039 12.43 12.796 13.263 13.789 14.246 14.749 15.285 15.827 16.372 16.936 17.554 18.117 18.707 19.34 19.993 20.582 21.035 21.291 21.065 19.93 18.554 17.108 15.804 14.682 13.65 12.612 11.664 10.686 9.822 9.04 8.279 7.578 6.906 6.206 5.447 4.815 4.266 3.661 2.989 2.459 1.941 1.383 0.943 0.469 -0.019 -0.538 -1.102 -1.489 -1.902 -2.535 -2.956 -3.394 -3.623 -4.117 -4.65 -5.245 -5.568 -6.387 -6.626 -7.023 -7.45 -8.406 -8.971 -9.595 -10.263 -10.995 -11.907 -13.19 -18.351 -10 ,4565 ,KEBNE ,16691021,Thu Nov 25 10:24:49 CET,Thu Nov 25 12:03:00 CET,0.0 1.439 2.018 2.509 2.976 3.368 3.696 4.003 4.556 4.806 5.047 5.008 5.695 5.893 6.274 6.629 6.975 7.143 7.464 7.772 8.223 8.51 8.787 9.172 9.533 9.864 10.172 10.508 10.945 11.343 11.706 12.127 12.526 12.898 13.318 13.789 14.279 14.852 15.411 15.938 16.518 17.126 17.743 18.288 18.856 19.465 20.045 20.459 20.759 20.906 20.468 19.172 17.76 16.41 15.167 14.028 12.971 11.99 11.13 10.234 9.412 8.659 7.933 7.267 6.632 6.002 5.297 4.645 4.089 3.515 2.879 2.314 1.741 1.172 0.73 0.255 -0.253 -0.772 -1.298 -1.667 -2.053 -2.67 -3.105 -3.566 -3.807 -4.3 -4.813 -5.375 -5.682 -6.481 -6.681 -7.043 -7.452 -8.359 -8.848 -9.409 -10.075 -10.847 -11.826 -13.233 -22.588 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt deleted file mode 100644 index 86a551a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23483.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5301 ,KEBNE ,16691022,Thu Nov 25 10:24:50 CET,Thu Nov 25 12:08:43 CET,0.0 2.361 3.186 3.824 4.314 4.771 5.188 5.554 6.2 6.487 6.786 6.89 7.652 7.931 8.425 8.881 9.344 9.562 9.99 10.411 10.99 11.359 11.715 12.231 12.746 13.235 13.702 14.133 14.665 15.195 15.716 16.345 16.93 17.487 18.14 18.846 19.526 20.28 21.076 21.912 22.742 23.685 24.871 26.053 27.34 28.67 30.149 31.797 33.678 35.75 37.981 39.454 40.023 40.14 40.001 39.693 39.321 38.878 38.417 37.953 37.527 37.072 36.62 36.211 35.782 35.29 34.743 34.288 33.858 33.414 32.977 32.606 32.225 31.805 31.475 31.139 30.782 30.411 29.994 29.692 29.387 28.911 28.571 28.219 28.025 27.59 27.133 26.668 26.428 25.696 25.604 25.314 24.992 24.276 23.887 23.446 22.976 22.457 21.788 20.829 17.931 -2 ,22790 ,KEBNE ,16690298,Thu Nov 25 08:09:57 CET,Thu Nov 25 08:10:58 CET,0.0 2.685 3.57 4.245 4.812 5.303 5.712 6.086 6.759 7.052 7.34 7.428 8.172 8.437 8.939 9.399 9.85 10.064 10.479 10.883 11.445 11.795 12.143 12.663 13.173 13.672 14.148 14.599 15.164 15.703 16.222 16.812 17.387 17.948 18.589 19.307 19.986 20.71 21.487 22.331 23.189 24.132 25.234 26.363 27.661 29.025 30.512 32.142 33.986 36.021 38.3 39.751 40.207 40.301 40.144 39.838 39.487 39.04 38.547 38.014 37.505 36.995 36.522 36.082 35.648 35.223 34.781 34.379 34.003 33.581 33.128 32.761 32.379 31.972 31.629 31.294 30.952 30.568 30.179 29.886 29.564 29.078 28.74 28.388 28.206 27.812 27.361 26.862 26.605 25.883 25.815 25.524 25.226 24.57 24.189 23.751 23.281 22.78 22.136 21.107 18.033 -3 ,30319 ,KEBNE ,16690299,Thu Nov 25 08:09:58 CET,Thu Nov 25 08:11:21 CET,0.0 2.49 3.276 3.933 4.476 4.956 5.374 5.757 6.482 6.819 7.135 7.233 7.988 8.25 8.755 9.239 9.7 9.92 10.346 10.758 11.359 11.729 12.077 12.606 13.109 13.565 14.002 14.44 15.022 15.569 16.084 16.694 17.28 17.846 18.495 19.238 19.965 20.744 21.54 22.347 23.162 24.05 25.095 26.143 27.32 28.591 30.024 31.6 33.369 35.378 37.539 39.037 39.624 39.75 39.649 39.352 38.996 38.604 38.176 37.695 37.229 36.791 36.368 35.932 35.495 35.073 34.584 34.135 33.735 33.293 32.842 32.481 32.087 31.666 31.33 30.95 30.551 30.155 29.747 29.46 29.167 28.68 28.315 27.926 27.723 27.3 26.844 26.36 26.106 25.39 25.336 25.05 24.738 24.029 23.638 23.22 22.787 22.225 21.448 20.56 17.017 -4 ,5913 ,KEBNE ,16691025,Thu Nov 25 10:24:50 CET,Thu Nov 25 12:08:54 CET,0.0 2.264 3.09 3.688 4.227 4.734 5.189 5.586 6.264 6.571 6.885 7.015 7.779 8.044 8.559 9.028 9.467 9.684 10.086 10.484 11.086 11.475 11.846 12.361 12.853 13.334 13.782 14.197 14.73 15.275 15.824 16.479 17.087 17.632 18.266 19.017 19.726 20.494 21.311 22.134 22.987 23.937 24.995 26.077 27.364 28.714 30.169 31.827 33.781 35.832 37.964 39.375 39.815 39.826 39.645 39.294 38.885 38.438 37.963 37.445 36.955 36.493 36.053 35.624 35.217 34.84 34.404 33.978 33.598 33.202 32.791 32.442 32.048 31.613 31.284 30.941 30.561 30.183 29.795 29.515 29.225 28.762 28.411 28.023 27.828 27.425 26.982 26.493 26.251 25.551 25.507 25.224 24.946 24.331 23.974 23.576 23.1 22.527 21.894 21.05 18.689 -5 ,17906 ,KEBNE ,16690301,Thu Nov 25 08:09:57 CET,Thu Nov 25 08:11:06 CET,0.0 2.177 3.056 3.75 4.347 4.888 5.356 5.746 6.453 6.792 7.128 7.264 8.031 8.303 8.824 9.309 9.769 9.993 10.427 10.834 11.411 11.792 12.143 12.647 13.139 13.597 14.038 14.465 15.03 15.582 16.126 16.755 17.315 17.85 18.473 19.153 19.82 20.559 21.35 22.137 22.929 23.869 25.005 26.116 27.368 28.791 30.373 32.039 33.88 35.948 38.198 39.681 40.186 40.214 40.075 39.813 39.444 39.055 38.708 38.262 37.781 37.329 36.845 36.322 35.844 35.395 34.879 34.405 33.995 33.589 33.147 32.762 32.347 31.908 31.57 31.188 30.767 30.351 29.941 29.654 29.348 28.852 28.515 28.173 27.992 27.61 27.191 26.744 26.514 25.776 25.677 25.38 25.08 24.394 23.996 23.562 23.075 22.58 21.97 21.141 18.232 -6 ,11292 ,KEBNE ,16690302,Thu Nov 25 08:09:57 CET,Thu Nov 25 08:11:21 CET,0.0 2.197 3.066 3.765 4.309 4.783 5.202 5.553 6.204 6.512 6.809 6.902 7.657 7.926 8.454 8.957 9.415 9.627 10.042 10.446 11.016 11.377 11.732 12.251 12.762 13.249 13.691 14.117 14.673 15.216 15.738 16.334 16.926 17.522 18.205 18.949 19.644 20.406 21.209 22.053 22.972 23.952 25.046 26.193 27.508 28.897 30.414 32.053 33.907 35.991 38.225 39.676 40.205 40.283 40.161 39.921 39.587 39.187 38.783 38.293 37.848 37.442 37.016 36.603 36.195 35.756 35.266 34.815 34.41 34.012 33.572 33.177 32.741 32.305 31.986 31.637 31.253 30.819 30.358 30.052 29.746 29.258 28.897 28.507 28.308 27.912 27.481 26.986 26.731 26.002 25.92 25.622 25.312 24.587 24.182 23.77 23.296 22.71 22.057 21.257 17.165 -7 ,30939 ,KEBNE ,16690303,Thu Nov 25 08:09:57 CET,Thu Nov 25 08:11:27 CET,0.0 2.42 3.176 3.825 4.358 4.839 5.279 5.675 6.347 6.642 6.951 7.051 7.805 8.067 8.559 9.003 9.456 9.685 10.116 10.528 11.097 11.448 11.782 12.268 12.756 13.232 13.686 14.114 14.638 15.162 15.671 16.253 16.814 17.357 17.988 18.694 19.364 20.099 20.87 21.683 22.529 23.468 24.555 25.64 26.909 28.284 29.793 31.475 33.399 35.489 37.718 39.171 39.662 39.722 39.612 39.326 38.951 38.519 38.101 37.634 37.174 36.742 36.291 35.812 35.313 34.861 34.442 34.055 33.664 33.226 32.76 32.353 31.941 31.521 31.183 30.817 30.419 30.013 29.606 29.316 29.004 28.517 28.168 27.805 27.622 27.222 26.786 26.324 26.075 25.338 25.252 24.945 24.62 23.899 23.505 23.085 22.619 22.07 21.357 20.395 16.934 -8 ,15976 ,KEBNE ,16690304,Thu Nov 25 08:09:58 CET,Thu Nov 25 08:11:21 CET,0.0 2.316 3.137 3.803 4.347 4.827 5.243 5.614 6.309 6.644 6.972 7.071 7.819 8.081 8.571 9.032 9.489 9.703 10.105 10.501 11.047 11.402 11.746 12.249 12.748 13.233 13.702 14.144 14.695 15.244 15.77 16.379 16.976 17.565 18.212 18.918 19.617 20.36 21.136 21.968 22.843 23.798 24.892 25.993 27.226 28.583 30.096 31.711 33.511 35.482 37.726 39.14 39.571 39.685 39.602 39.303 38.835 38.346 37.94 37.443 36.959 36.527 36.084 35.625 35.194 34.793 34.357 33.957 33.587 33.171 32.727 32.348 31.945 31.543 31.237 30.902 30.517 30.097 29.656 29.349 29.019 28.517 28.184 27.83 27.643 27.252 26.827 26.363 26.117 25.369 25.242 24.937 24.615 23.929 23.549 23.101 22.596 22.055 21.434 20.555 16.306 -9 ,26349 ,KEBNE ,16690305,Thu Nov 25 08:09:57 CET,Thu Nov 25 08:11:12 CET,0.0 1.862 2.599 3.157 3.669 4.148 4.579 4.978 5.677 5.997 6.314 6.416 7.166 7.42 7.913 8.382 8.839 9.049 9.449 9.843 10.387 10.754 11.114 11.616 12.119 12.611 13.074 13.517 14.067 14.574 15.075 15.687 16.288 16.854 17.501 18.236 18.91 19.646 20.435 21.289 22.2 23.164 24.206 25.232 26.476 27.865 29.383 31.028 32.862 34.926 37.201 38.672 39.184 39.293 39.15 38.808 38.366 37.904 37.451 36.933 36.471 36.018 35.549 35.102 34.669 34.285 33.866 33.44 33.048 32.636 32.188 31.804 31.421 31.011 30.657 30.267 29.888 29.523 29.137 28.849 28.527 28.016 27.664 27.302 27.115 26.72 26.298 25.847 25.607 24.891 24.814 24.505 24.186 23.535 23.158 22.748 22.31 21.758 21.084 20.246 17.159 -10 ,10888 ,KEBNE ,16691031,Thu Nov 25 10:24:51 CET,Thu Nov 25 12:06:47 CET,0.0 2.476 3.41 4.056 4.561 5.023 5.451 5.839 6.526 6.852 7.173 7.302 8.075 8.345 8.837 9.318 9.793 10.026 10.5 10.941 11.529 11.913 12.282 12.803 13.303 13.779 14.251 14.699 15.272 15.826 16.345 16.975 17.566 18.136 18.794 19.548 20.285 21.07 21.916 22.773 23.648 24.621 25.72 26.788 27.992 29.318 30.861 32.583 34.489 36.555 38.776 40.125 40.598 40.727 40.601 40.338 39.988 39.551 39.09 38.621 38.199 37.77 37.32 36.877 36.433 35.981 35.501 35.083 34.697 34.259 33.812 33.447 33.042 32.616 32.282 31.928 31.575 31.197 30.776 30.477 30.17 29.68 29.321 28.953 28.768 28.386 27.979 27.548 27.314 26.581 26.484 26.187 25.892 25.221 24.812 24.373 23.889 23.321 22.651 21.749 18.773 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt deleted file mode 100644 index 41c4bc7d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23484.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29783 ,KEBNE ,16691032,Thu Nov 25 10:24:50 CET,Thu Nov 25 12:07:39 CET,0.0 0.822 1.318 1.721 2.05 2.339 2.609 2.874 3.366 3.578 3.788 3.729 4.418 4.613 4.978 5.318 5.646 5.812 6.14 6.467 6.933 7.213 7.486 7.891 8.276 8.648 9.009 9.347 9.778 10.203 10.61 11.104 11.585 12.072 12.649 13.284 13.884 14.535 15.235 15.983 16.763 17.683 18.79 19.866 21.124 22.555 24.217 26.103 28.287 30.839 33.77 35.838 36.84 37.343 37.541 37.535 37.433 37.213 36.945 36.661 36.374 36.077 35.764 35.439 35.124 34.817 34.458 34.109 33.799 33.49 33.163 32.868 32.556 32.226 31.97 31.7 31.395 31.068 30.7 30.45 30.198 29.793 29.524 29.214 29.047 28.721 28.369 27.981 27.785 27.131 27.14 26.881 26.613 26.01 25.69 25.358 24.955 24.468 23.911 23.203 21.813 -2 ,10658 ,KEBNE ,16690308,Thu Nov 25 08:09:58 CET,Thu Nov 25 08:11:19 CET,0.0 0.938 1.374 1.76 2.105 2.421 2.748 3.072 3.631 3.871 4.093 3.984 4.652 4.845 5.246 5.636 5.991 6.154 6.477 6.796 7.233 7.516 7.801 8.199 8.574 8.952 9.322 9.675 10.114 10.539 10.954 11.452 11.935 12.404 12.956 13.583 14.196 14.879 15.582 16.339 17.171 18.081 19.143 20.206 21.422 22.754 24.346 26.179 28.202 30.545 33.328 35.412 36.42 36.861 36.971 36.927 36.809 36.596 36.295 35.978 35.69 35.392 35.073 34.736 34.407 34.08 33.707 33.374 33.083 32.75 32.382 32.085 31.767 31.425 31.152 30.864 30.568 30.255 29.935 29.7 29.448 29.043 28.748 28.444 28.288 27.977 27.62 27.227 27.03 26.35 26.344 26.113 25.861 25.302 24.998 24.653 24.258 23.799 23.251 22.524 20.956 -3 ,5289 ,KEBNE ,16690309,Thu Nov 25 08:10:02 CET,Thu Nov 25 08:11:21 CET,0.0 1.098 1.591 1.984 2.323 2.642 2.949 3.224 3.727 3.956 4.177 4.125 4.825 5.018 5.361 5.701 6.022 6.165 6.45 6.727 7.154 7.445 7.711 8.082 8.447 8.828 9.212 9.576 10.044 10.486 10.889 11.387 11.877 12.352 12.914 13.535 14.147 14.817 15.52 16.279 17.098 18.005 19.063 20.126 21.354 22.746 24.343 26.178 28.323 30.711 33.427 35.633 36.693 37.145 37.275 37.202 37.057 36.863 36.631 36.329 36.031 35.76 35.485 35.179 34.86 34.551 34.205 33.882 33.583 33.265 32.933 32.663 32.372 32.038 31.762 31.475 31.187 30.878 30.561 30.342 30.109 29.729 29.441 29.142 28.989 28.65 28.295 27.921 27.712 27.026 27.003 26.756 26.501 25.878 25.539 25.17 24.753 24.347 23.864 23.186 21.996 -4 ,23662 ,KEBNE ,16690310,Thu Nov 25 08:10:01 CET,Thu Nov 25 08:11:11 CET,0.0 1.077 1.532 1.899 2.221 2.521 2.799 3.057 3.506 3.715 3.938 3.879 4.551 4.733 5.104 5.464 5.808 5.979 6.299 6.6 7.028 7.304 7.594 8.014 8.409 8.797 9.175 9.549 10.016 10.46 10.904 11.434 11.927 12.413 12.978 13.603 14.225 14.923 15.656 16.427 17.253 18.177 19.231 20.273 21.512 22.907 24.475 26.216 28.273 30.677 33.598 35.926 37.005 37.505 37.686 37.644 37.499 37.272 37.014 36.709 36.386 36.071 35.742 35.425 35.122 34.822 34.474 34.128 33.823 33.475 33.109 32.825 32.518 32.149 31.858 31.566 31.262 30.948 30.603 30.358 30.104 29.716 29.431 29.128 28.972 28.638 28.266 27.849 27.638 26.97 26.971 26.719 26.455 25.887 25.601 25.282 24.894 24.43 23.857 23.171 21.607 -5 ,21548 ,KEBNE ,16690311,Thu Nov 25 08:10:04 CET,Thu Nov 25 08:11:14 CET,0.0 0.972 1.617 2.088 2.407 2.692 2.982 3.27 3.736 3.946 4.166 4.095 4.769 4.96 5.301 5.631 5.96 6.122 6.435 6.732 7.165 7.454 7.733 8.119 8.491 8.854 9.208 9.55 9.99 10.414 10.824 11.346 11.86 12.344 12.896 13.52 14.142 14.837 15.551 16.301 17.11 18.027 19.118 20.203 21.432 22.805 24.439 26.295 28.505 31.061 33.907 36.151 37.241 37.658 37.752 37.722 37.673 37.532 37.258 36.895 36.578 36.293 35.992 35.67 35.331 35.001 34.651 34.313 34.006 33.691 33.343 33.032 32.728 32.42 32.155 31.848 31.527 31.217 30.864 30.609 30.361 29.979 29.708 29.418 29.268 28.949 28.591 28.189 27.971 27.286 27.255 27.006 26.754 26.139 25.78 25.432 25.049 24.566 24.031 23.279 21.911 -6 ,19599 ,KEBNE ,16690312,Thu Nov 25 08:10:06 CET,Thu Nov 25 08:11:10 CET,0.0 0.935 1.5 1.974 2.314 2.61 2.875 3.119 3.603 3.823 4.039 3.992 4.668 4.848 5.192 5.521 5.839 5.999 6.336 6.661 7.119 7.41 7.696 8.099 8.481 8.861 9.227 9.593 10.078 10.535 10.964 11.485 11.983 12.459 13.01 13.619 14.224 14.897 15.611 16.383 17.157 18.004 19.044 20.105 21.311 22.651 24.208 26.076 28.294 30.872 33.764 35.739 36.74 37.257 37.425 37.387 37.22 36.962 36.701 36.401 36.09 35.779 35.432 35.097 34.757 34.441 34.121 33.792 33.486 33.152 32.79 32.505 32.218 31.873 31.605 31.353 31.068 30.729 30.363 30.123 29.88 29.486 29.215 28.931 28.777 28.439 28.084 27.695 27.486 26.815 26.801 26.548 26.274 25.659 25.33 24.97 24.591 24.112 23.56 22.871 21.224 -7 ,6648 ,KEBNE ,16690313,Thu Nov 25 08:10:01 CET,Thu Nov 25 08:11:09 CET,0.0 1.091 1.587 1.967 2.32 2.658 2.962 3.234 3.736 3.968 4.19 4.129 4.8 4.976 5.323 5.641 5.941 6.091 6.397 6.698 7.136 7.41 7.684 8.089 8.459 8.818 9.163 9.505 9.954 10.392 10.854 11.421 11.94 12.454 13.044 13.679 14.306 14.978 15.68 16.412 17.183 18.09 19.138 20.204 21.474 22.849 24.402 26.202 28.302 30.7 33.486 35.519 36.585 37.081 37.256 37.29 37.153 36.924 36.662 36.315 36.017 35.733 35.433 35.131 34.786 34.448 34.086 33.741 33.441 33.112 32.752 32.452 32.137 31.785 31.51 31.226 30.936 30.635 30.311 30.084 29.837 29.431 29.145 28.837 28.674 28.347 28.008 27.655 27.458 26.786 26.831 26.586 26.319 25.742 25.425 25.076 24.7 24.279 23.714 23.014 21.349 -8 ,15453 ,KEBNE ,16691039,Thu Nov 25 10:24:49 CET,Thu Nov 25 12:04:55 CET,0.0 0.896 1.367 1.743 2.074 2.364 2.637 2.903 3.377 3.591 3.797 3.69 4.345 4.517 4.879 5.23 5.563 5.731 6.037 6.328 6.777 7.081 7.367 7.788 8.203 8.598 8.957 9.284 9.714 10.127 10.536 11.067 11.572 12.066 12.654 13.29 13.904 14.586 15.303 16.052 16.865 17.808 18.912 20.01 21.284 22.705 24.284 26.063 28.202 30.632 33.404 35.477 36.563 37.062 37.211 37.189 37.026 36.767 36.501 36.198 35.885 35.562 35.225 34.891 34.533 34.192 33.847 33.512 33.216 32.921 32.59 32.311 32.025 31.698 31.447 31.177 30.866 30.548 30.226 30.003 29.756 29.345 29.056 28.748 28.571 28.195 27.808 27.392 27.165 26.47 26.437 26.164 25.862 25.249 24.946 24.618 24.262 23.867 23.334 22.59 20.963 -9 ,10082 ,KEBNE ,16690315,Thu Nov 25 08:09:58 CET,Thu Nov 25 08:11:09 CET,0.0 1.195 1.682 2.063 2.405 2.685 2.947 3.234 3.733 3.953 4.189 4.152 4.825 5.019 5.395 5.773 6.128 6.306 6.655 6.971 7.418 7.702 7.978 8.363 8.738 9.108 9.475 9.839 10.3 10.741 11.171 11.699 12.228 12.737 13.309 13.95 14.572 15.25 15.992 16.765 17.571 18.509 19.605 20.684 21.963 23.386 24.977 26.821 28.945 31.364 34.237 36.335 37.249 37.665 37.788 37.749 37.553 37.288 37.004 36.686 36.385 36.054 35.716 35.388 35.059 34.716 34.329 33.984 33.685 33.358 32.996 32.67 32.337 31.999 31.737 31.469 31.183 30.861 30.495 30.241 29.978 29.577 29.289 28.982 28.832 28.498 28.109 27.698 27.483 26.802 26.775 26.512 26.236 25.641 25.331 25.001 24.614 24.137 23.583 22.889 21.393 -10 ,16880 ,KEBNE ,16690316,Thu Nov 25 08:09:58 CET,Thu Nov 25 08:11:21 CET,0.0 0.727 1.184 1.549 1.863 2.146 2.41 2.674 3.156 3.359 3.556 3.48 4.155 4.338 4.688 5.033 5.389 5.548 5.833 6.127 6.544 6.821 7.105 7.504 7.866 8.224 8.583 8.944 9.433 9.901 10.34 10.888 11.437 11.94 12.484 13.107 13.742 14.448 15.205 15.973 16.81 17.797 18.921 20.021 21.284 22.713 24.368 26.232 28.336 30.839 33.76 35.817 36.803 37.239 37.343 37.271 37.139 36.924 36.624 36.294 35.972 35.653 35.326 34.968 34.636 34.338 33.995 33.654 33.329 32.977 32.614 32.321 32.002 31.675 31.423 31.147 30.843 30.506 30.178 29.954 29.711 29.303 29.008 28.726 28.58 28.253 27.913 27.545 27.342 26.665 26.67 26.415 26.153 25.544 25.181 24.792 24.387 23.96 23.481 22.839 21.428 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt deleted file mode 100644 index bc22c992..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23485.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19656 ,KEBNE ,16691042,Thu Nov 25 10:25:51 CET,Thu Nov 25 12:07:57 CET,0.0 2.446 3.309 3.945 4.515 5.016 5.44 5.803 6.422 6.711 7.002 7.062 7.799 8.049 8.529 8.98 9.397 9.595 9.987 10.342 10.84 11.163 11.476 11.923 12.348 12.769 13.174 13.562 14.06 14.534 14.981 15.526 16.047 16.537 17.106 17.752 18.367 19.063 19.788 20.482 21.225 22.08 23.056 24.002 25.077 26.305 27.736 29.32 31.1 33.143 35.466 36.992 37.609 37.789 37.737 37.618 37.425 37.152 36.849 36.502 36.157 35.796 35.418 35.057 34.709 34.375 33.975 33.596 33.285 32.962 32.611 32.306 31.975 31.598 31.295 30.986 30.674 30.354 30.012 29.764 29.502 29.067 28.773 28.485 28.335 28.012 27.645 27.262 27.071 26.392 26.364 26.11 25.85 25.341 25.074 24.749 24.389 24.017 23.492 22.798 21.615 -2 ,30869 ,KEBNE ,16690318,Thu Nov 25 08:09:58 CET,Thu Nov 25 08:11:19 CET,0.0 2.619 3.519 4.249 4.844 5.325 5.726 6.092 6.767 7.071 7.38 7.51 8.272 8.536 9.044 9.488 9.882 10.08 10.462 10.819 11.321 11.657 11.989 12.469 12.963 13.411 13.813 14.212 14.699 15.156 15.631 16.21 16.751 17.245 17.783 18.406 19.002 19.647 20.359 21.126 21.893 22.675 23.614 24.588 25.699 26.901 28.261 29.766 31.487 33.458 35.596 37.091 37.794 38.099 38.141 37.991 37.758 37.463 37.14 36.755 36.378 36.031 35.675 35.312 34.958 34.607 34.218 33.857 33.548 33.242 32.919 32.651 32.342 31.987 31.73 31.469 31.186 30.901 30.568 30.322 30.094 29.726 29.449 29.162 29.016 28.707 28.367 27.994 27.798 27.123 27.146 26.895 26.624 26.051 25.745 25.393 24.996 24.572 24.042 23.374 22.254 -3 ,13602 ,KEBNE ,16691044,Thu Nov 25 10:25:51 CET,Thu Nov 25 12:11:39 CET,0.0 2.455 3.318 3.926 4.432 4.873 5.264 5.644 6.349 6.671 6.974 7.027 7.757 7.992 8.443 8.873 9.28 9.473 9.841 10.194 10.717 11.054 11.395 11.887 12.349 12.779 13.174 13.561 14.038 14.495 14.951 15.499 16.022 16.515 17.089 17.757 18.384 19.039 19.73 20.469 21.247 22.107 23.088 24.052 25.172 26.425 27.823 29.336 31.034 32.965 35.164 36.723 37.344 37.563 37.6 37.467 37.195 36.868 36.546 36.176 35.813 35.447 35.045 34.643 34.266 33.941 33.594 33.244 32.93 32.601 32.259 31.974 31.668 31.343 31.069 30.769 30.454 30.129 29.804 29.567 29.322 28.958 28.686 28.381 28.218 27.871 27.499 27.127 26.939 26.275 26.326 26.09 25.852 25.302 24.973 24.618 24.231 23.792 23.258 22.57 21.161 -4 ,22445 ,KEBNE ,16691045,Thu Nov 25 10:25:51 CET,Thu Nov 25 12:08:37 CET,0.0 2.483 3.33 3.967 4.532 5.03 5.454 5.844 6.562 6.889 7.192 7.288 8.052 8.329 8.828 9.299 9.736 9.933 10.315 10.68 11.203 11.536 11.862 12.339 12.791 13.225 13.641 14.046 14.543 15.007 15.467 16.017 16.52 17.015 17.605 18.255 18.874 19.53 20.225 20.988 21.788 22.632 23.597 24.564 25.704 26.977 28.386 29.94 31.717 33.696 35.866 37.436 38.161 38.376 38.356 38.269 38.081 37.801 37.505 37.163 36.874 36.569 36.199 35.825 35.476 35.139 34.778 34.436 34.112 33.784 33.432 33.121 32.804 32.447 32.151 31.867 31.56 31.212 30.853 30.605 30.336 29.902 29.608 29.299 29.136 28.799 28.435 28.045 27.856 27.207 27.286 27.06 26.806 26.238 25.923 25.569 25.196 24.797 24.314 23.701 22.271 -5 ,30318 ,KEBNE ,16690321,Thu Nov 25 08:09:58 CET,Thu Nov 25 08:11:06 CET,0.0 2.455 3.392 4.026 4.517 4.955 5.385 5.781 6.475 6.792 7.083 7.143 7.877 8.127 8.62 9.089 9.515 9.722 10.129 10.491 10.995 11.334 11.673 12.155 12.606 13.044 13.479 13.869 14.344 14.813 15.261 15.797 16.342 16.865 17.427 18.049 18.65 19.329 20.029 20.731 21.457 22.242 23.221 24.221 25.32 26.507 27.833 29.383 31.192 33.125 35.266 36.9 37.707 38.04 38.052 37.907 37.712 37.463 37.166 36.83 36.496 36.145 35.764 35.369 34.995 34.645 34.266 33.905 33.586 33.253 32.885 32.57 32.236 31.865 31.574 31.285 30.979 30.647 30.276 30.011 29.739 29.313 29.009 28.7 28.541 28.192 27.823 27.427 27.223 26.547 26.574 26.33 26.069 25.524 25.222 24.874 24.494 24.045 23.478 22.713 21.137 -6 ,13541 ,KEBNE ,16691047,Thu Nov 25 10:25:51 CET,Thu Nov 25 12:08:54 CET,0.0 2.52 3.395 4.031 4.535 5.007 5.473 5.875 6.572 6.885 7.2 7.309 8.062 8.306 8.756 9.175 9.598 9.809 10.202 10.598 11.142 11.456 11.776 12.262 12.689 13.097 13.522 13.915 14.436 14.986 15.484 16.068 16.629 17.114 17.686 18.339 18.955 19.601 20.269 21.001 21.763 22.587 23.523 24.478 25.598 26.84 28.249 29.773 31.484 33.456 35.766 37.372 38.074 38.398 38.468 38.414 38.249 37.935 37.615 37.325 37.051 36.728 36.35 35.978 35.641 35.31 34.933 34.581 34.268 33.926 33.552 33.249 32.928 32.583 32.302 32.001 31.7 31.398 31.08 30.841 30.587 30.185 29.915 29.641 29.485 29.171 28.85 28.481 28.293 27.624 27.644 27.424 27.178 26.559 26.214 25.852 25.426 24.965 24.433 23.729 22.305 -7 ,25000 ,KEBNE ,16690323,Thu Nov 25 08:09:58 CET,Thu Nov 25 08:11:06 CET,0.0 2.112 2.99 3.631 4.14 4.593 4.991 5.382 6.077 6.366 6.65 6.725 7.459 7.692 8.142 8.592 9.027 9.222 9.588 9.953 10.457 10.778 11.108 11.573 12.028 12.453 12.86 13.282 13.779 14.243 14.711 15.272 15.801 16.298 16.885 17.543 18.153 18.8 19.472 20.21 20.984 21.826 22.843 23.799 24.899 26.154 27.516 29.048 30.767 32.678 34.946 36.547 37.18 37.368 37.348 37.233 37.008 36.697 36.396 36.062 35.725 35.376 35.027 34.679 34.317 33.963 33.589 33.242 32.937 32.616 32.264 31.967 31.656 31.317 31.048 30.761 30.445 30.1 29.753 29.506 29.238 28.846 28.568 28.27 28.112 27.777 27.413 26.994 26.782 26.121 26.181 25.972 25.746 25.196 24.869 24.553 24.235 23.853 23.379 22.711 21.154 -8 ,8367 ,KEBNE ,16691049,Thu Nov 25 10:25:51 CET,Thu Nov 25 12:11:08 CET,0.0 2.904 3.807 4.443 4.942 5.366 5.794 6.174 6.819 7.118 7.413 7.515 8.262 8.502 8.958 9.407 9.848 10.057 10.442 10.787 11.283 11.604 11.905 12.365 12.793 13.225 13.653 14.045 14.555 15.041 15.496 16.039 16.561 17.043 17.614 18.251 18.821 19.417 20.074 20.793 21.502 22.3 23.261 24.23 25.34 26.534 27.918 29.409 31.079 33.026 35.257 36.876 37.624 37.925 37.904 37.748 37.491 37.15 36.836 36.47 36.124 35.799 35.438 35.073 34.718 34.372 33.995 33.658 33.344 32.999 32.668 32.373 32.033 31.69 31.419 31.117 30.806 30.47 30.099 29.847 29.59 29.186 28.908 28.624 28.474 28.15 27.795 27.425 27.233 26.551 26.552 26.316 26.079 25.508 25.164 24.783 24.368 23.924 23.454 22.84 21.365 -9 ,26607 ,KEBNE ,16691050,Thu Nov 25 10:25:51 CET,Thu Nov 25 12:06:44 CET,0.0 2.604 3.486 4.135 4.703 5.195 5.622 6.018 6.716 7.021 7.316 7.401 8.154 8.404 8.877 9.341 9.771 9.973 10.366 10.735 11.27 11.615 11.946 12.409 12.855 13.278 13.677 14.066 14.573 15.065 15.527 16.063 16.563 17.062 17.62 18.207 18.812 19.487 20.2 20.936 21.738 22.651 23.631 24.591 25.719 26.981 28.37 29.885 31.613 33.526 35.729 37.371 38.144 38.452 38.494 38.369 38.121 37.818 37.518 37.18 36.841 36.475 36.1 35.757 35.433 35.121 34.763 34.419 34.115 33.776 33.397 33.098 32.782 32.418 32.117 31.808 31.498 31.187 30.858 30.613 30.358 29.939 29.651 29.367 29.212 28.872 28.508 28.147 27.956 27.281 27.313 27.08 26.835 26.292 25.963 25.588 25.196 24.767 24.291 23.65 22.334 -10 ,26607 ,KEBNE ,16691051,Thu Nov 25 10:25:51 CET,Thu Nov 25 12:08:20 CET,0.0 2.604 3.486 4.135 4.703 5.195 5.622 6.018 6.716 7.021 7.316 7.401 8.154 8.404 8.877 9.341 9.771 9.973 10.366 10.735 11.27 11.615 11.946 12.409 12.855 13.278 13.677 14.066 14.573 15.065 15.527 16.063 16.563 17.062 17.62 18.207 18.812 19.487 20.2 20.936 21.738 22.651 23.631 24.591 25.719 26.981 28.37 29.885 31.613 33.526 35.729 37.371 38.144 38.452 38.494 38.369 38.121 37.818 37.518 37.18 36.841 36.475 36.1 35.757 35.433 35.121 34.763 34.419 34.115 33.776 33.397 33.098 32.782 32.418 32.117 31.808 31.498 31.187 30.858 30.613 30.358 29.939 29.651 29.367 29.212 28.872 28.508 28.147 27.956 27.281 27.313 27.08 26.835 26.292 25.963 25.588 25.196 24.767 24.291 23.65 22.334 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt deleted file mode 100644 index 171391d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20667-2qbp-_23486.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27331 ,KEBNE ,16691052,Thu Nov 25 10:25:51 CET,Thu Nov 25 12:10:17 CET,0.0 1.366 2.016 2.468 2.908 3.294 3.619 3.916 4.488 4.767 5.027 5.059 5.781 5.995 6.377 6.775 7.154 7.319 7.645 7.97 8.438 8.74 9.022 9.413 9.801 10.181 10.56 10.931 11.375 11.791 12.198 12.7 13.201 13.666 14.182 14.739 15.251 15.812 16.411 17.012 17.605 18.277 19.079 19.892 20.815 21.761 22.755 23.778 24.855 26.031 27.24 27.82 27.863 27.579 27.088 26.591 26.124 25.655 25.21 24.704 24.246 23.835 23.395 22.897 22.425 22.033 21.611 21.206 20.834 20.444 20.042 19.689 19.326 18.956 18.659 18.357 18.03 17.672 17.297 17.046 16.793 16.396 16.12 15.829 15.669 15.319 14.959 14.56 14.341 13.628 13.581 13.329 13.063 12.463 12.157 11.83 11.474 11.079 10.578 9.911 8.529 -2 ,601 ,KEBNE ,16691053,Thu Nov 25 10:25:50 CET,Thu Nov 25 12:05:41 CET,0.0 1.354 2.004 2.542 2.975 3.322 3.661 3.973 4.537 4.794 5.046 5.046 5.748 5.956 6.347 6.72 7.08 7.253 7.589 7.919 8.41 8.711 8.986 9.39 9.778 10.136 10.489 10.832 11.255 11.666 12.079 12.554 13.004 13.429 13.9 14.429 14.92 15.473 16.101 16.742 17.394 18.103 18.898 19.691 20.592 21.57 22.668 23.814 25.014 26.305 27.53 28.133 28.168 27.946 27.588 27.12 26.671 26.201 25.724 25.242 24.813 24.37 23.894 23.431 22.969 22.554 22.131 21.719 21.329 20.932 20.54 20.183 19.796 19.426 19.133 18.799 18.436 18.064 17.677 17.407 17.143 16.742 16.424 16.062 15.899 15.577 15.213 14.84 14.648 13.974 14.021 13.78 13.519 12.944 12.636 12.315 11.958 11.558 11.072 10.433 9.097 -3 ,2293 ,KEBNE ,16691054,Thu Nov 25 10:25:50 CET,Thu Nov 25 12:07:00 CET,0.0 1.412 2.012 2.473 2.83 3.144 3.455 3.767 4.349 4.604 4.843 4.801 5.497 5.703 6.116 6.51 6.873 7.035 7.347 7.669 8.123 8.423 8.726 9.163 9.58 9.977 10.337 10.671 11.097 11.509 11.91 12.407 12.876 13.311 13.865 14.537 15.119 15.697 16.328 17.004 17.697 18.444 19.273 20.048 20.894 21.858 22.928 24.039 25.238 26.463 27.632 28.177 28.124 27.907 27.615 27.198 26.716 26.24 25.787 25.256 24.781 24.347 23.93 23.519 23.102 22.714 22.306 21.92 21.572 21.219 20.835 20.489 20.139 19.767 19.472 19.174 18.855 18.505 18.132 17.876 17.601 17.16 16.852 16.543 16.383 16.046 15.678 15.295 15.104 14.405 14.397 14.141 13.88 13.297 12.961 12.607 12.226 11.807 11.327 10.641 9.323 -4 ,3064 ,KEBNE ,16690330,Thu Nov 25 08:09:58 CET,Thu Nov 25 08:11:06 CET,0.0 1.459 2.106 2.612 3.028 3.404 3.73 4.019 4.578 4.836 5.095 5.084 5.78 5.994 6.387 6.762 7.14 7.32 7.658 7.972 8.409 8.713 9.027 9.452 9.843 10.227 10.608 10.968 11.415 11.837 12.214 12.67 13.141 13.624 14.168 14.76 15.309 15.888 16.508 17.119 17.732 18.402 19.195 20.0 20.963 22.03 23.133 24.246 25.4 26.603 27.713 28.221 28.179 27.873 27.484 27.044 26.565 26.07 25.612 25.116 24.653 24.219 23.776 23.344 22.929 22.526 22.107 21.748 21.414 21.05 20.69 20.38 20.033 19.664 19.37 19.058 18.713 18.346 17.948 17.67 17.391 16.968 16.673 16.366 16.21 15.865 15.488 15.083 14.869 14.183 14.242 14.001 13.731 13.169 12.892 12.578 12.194 11.757 11.227 10.511 9.193 -5 ,25045 ,KEBNE ,16691056,Thu Nov 25 10:25:52 CET,Thu Nov 25 12:09:02 CET,0.0 1.25 1.861 2.375 2.842 3.219 3.562 3.858 4.414 4.682 4.931 4.935 5.638 5.844 6.242 6.612 6.958 7.127 7.45 7.764 8.229 8.53 8.821 9.232 9.616 9.98 10.341 10.686 11.139 11.58 11.973 12.459 12.926 13.354 13.836 14.363 14.882 15.458 16.07 16.722 17.389 18.112 18.935 19.731 20.627 21.563 22.596 23.786 25.078 26.366 27.529 28.038 27.987 27.698 27.34 26.91 26.491 26.027 25.51 24.936 24.436 24.011 23.604 23.215 22.846 22.47 22.06 21.694 21.352 20.981 20.601 20.283 19.925 19.526 19.214 18.901 18.567 18.216 17.839 17.575 17.307 16.865 16.558 16.243 16.068 15.684 15.302 14.893 14.659 13.957 13.962 13.699 13.432 12.883 12.597 12.282 11.876 11.371 10.829 10.209 8.772 -6 ,3611 ,KEBNE ,16691057,Thu Nov 25 10:26:52 CET,Thu Nov 25 12:07:11 CET,0.0 1.541 2.163 2.621 3.029 3.433 3.803 4.122 4.713 5.001 5.27 5.276 5.99 6.204 6.596 6.965 7.311 7.48 7.81 8.107 8.528 8.808 9.08 9.477 9.863 10.225 10.591 10.952 11.397 11.834 12.272 12.785 13.252 13.713 14.23 14.783 15.286 15.872 16.514 17.137 17.818 18.553 19.314 20.05 20.918 21.839 22.865 23.965 25.126 26.337 27.492 28.055 28.066 27.771 27.384 26.966 26.448 25.902 25.436 24.944 24.473 24.017 23.547 23.079 22.659 22.286 21.885 21.512 21.174 20.804 20.386 20.035 19.686 19.315 19.011 18.679 18.344 18.013 17.655 17.403 17.127 16.689 16.396 16.076 15.907 15.573 15.232 14.866 14.668 13.976 13.997 13.744 13.484 12.939 12.617 12.288 11.954 11.545 11.048 10.479 9.228 -7 ,12870 ,KEBNE ,16690333,Thu Nov 25 08:09:58 CET,Thu Nov 25 08:11:19 CET,0.0 1.201 1.809 2.262 2.658 3.013 3.322 3.622 4.181 4.438 4.672 4.612 5.307 5.518 5.937 6.343 6.716 6.894 7.242 7.562 8.028 8.332 8.601 8.973 9.359 9.758 10.121 10.461 10.9 11.325 11.754 12.278 12.753 13.185 13.684 14.24 14.783 15.354 15.935 16.544 17.169 17.876 18.723 19.563 20.458 21.409 22.483 23.594 24.819 26.148 27.375 27.965 27.963 27.655 27.264 26.815 26.315 25.82 25.347 24.811 24.32 23.888 23.475 23.061 22.659 22.283 21.864 21.485 21.149 20.781 20.396 20.075 19.734 19.368 19.067 18.74 18.39 18.019 17.634 17.368 17.09 16.66 16.345 16.018 15.863 15.545 15.199 14.818 14.622 13.943 13.994 13.768 13.531 12.964 12.636 12.289 11.894 11.444 10.888 10.157 8.805 -8 ,7521 ,KEBNE ,16691059,Thu Nov 25 10:26:52 CET,Thu Nov 25 12:06:02 CET,0.0 1.458 2.139 2.594 2.994 3.343 3.674 3.973 4.498 4.738 4.969 4.937 5.649 5.867 6.285 6.675 7.04 7.213 7.54 7.86 8.323 8.625 8.922 9.357 9.773 10.155 10.513 10.855 11.27 11.672 12.05 12.468 12.905 13.348 13.861 14.445 14.97 15.504 16.07 16.691 17.339 18.034 18.853 19.643 20.506 21.433 22.452 23.573 24.812 26.039 27.16 27.695 27.665 27.359 26.96 26.487 26.002 25.536 25.097 24.594 24.122 23.697 23.269 22.82 22.381 21.987 21.56 21.168 20.814 20.447 20.053 19.705 19.341 18.95 18.632 18.314 17.998 17.669 17.307 17.034 16.754 16.319 16.016 15.708 15.549 15.197 14.799 14.395 14.19 13.5 13.496 13.22 12.933 12.372 12.079 11.769 11.411 10.997 10.475 9.767 8.582 -9 ,28654 ,KEBNE ,16691060,Thu Nov 25 10:26:52 CET,Thu Nov 25 12:07:51 CET,0.0 1.196 1.753 2.177 2.556 2.905 3.24 3.553 4.11 4.352 4.583 4.568 5.274 5.481 5.876 6.242 6.609 6.778 7.087 7.415 7.908 8.2 8.481 8.905 9.308 9.688 10.038 10.369 10.804 11.243 11.662 12.147 12.603 13.036 13.565 14.168 14.731 15.333 15.947 16.589 17.275 18.013 18.815 19.607 20.514 21.488 22.52 23.609 24.76 25.946 27.15 27.717 27.756 27.547 27.156 26.654 26.182 25.697 25.214 24.712 24.254 23.826 23.379 22.929 22.517 22.112 21.669 21.247 20.864 20.484 20.064 19.707 19.351 18.965 18.661 18.348 18.026 17.673 17.284 17.011 16.722 16.279 15.975 15.651 15.476 15.107 14.739 14.342 14.131 13.438 13.417 13.152 12.883 12.312 11.973 11.593 11.201 10.722 10.132 9.443 7.95 -10 ,2567 ,KEBNE ,16691061,Thu Nov 25 10:26:53 CET,Thu Nov 25 12:09:50 CET,0.0 1.019 1.59 2.072 2.516 2.922 3.269 3.597 4.166 4.402 4.651 4.651 5.34 5.54 5.946 6.321 6.676 6.858 7.193 7.49 7.917 8.201 8.495 8.944 9.377 9.791 10.178 10.538 11.036 11.502 11.906 12.389 12.858 13.299 13.801 14.416 15.041 15.651 16.228 16.862 17.543 18.279 19.122 19.925 20.805 21.711 22.689 23.79 25.026 26.286 27.428 27.888 27.811 27.482 27.05 26.543 26.027 25.536 25.076 24.586 24.102 23.645 23.243 22.843 22.443 22.055 21.625 21.246 20.873 20.461 20.059 19.722 19.369 18.994 18.7 18.389 18.053 17.682 17.289 17.04 16.788 16.358 16.048 15.729 15.574 15.254 14.897 14.518 14.321 13.634 13.617 13.347 13.074 12.496 12.179 11.838 11.458 11.0 10.503 9.922 8.737 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt deleted file mode 100644 index de611c89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20669-2qbr-_23473.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8135 ,KEBNE ,16691062,Thu Nov 25 10:26:52 CET,Thu Nov 25 12:02:24 CET,0.0 1.277 1.903 2.445 2.958 3.378 3.763 4.112 4.676 4.939 5.215 5.412 5.985 6.212 6.628 7.027 7.417 7.603 7.971 8.337 8.858 9.18 9.492 9.982 10.424 10.832 11.247 11.625 12.106 12.57 13.019 13.555 14.048 14.521 15.064 15.643 16.174 16.771 17.408 18.064 18.782 19.586 20.491 21.399 22.411 23.512 24.761 26.126 27.676 29.276 30.877 31.956 32.421 32.469 32.34 32.145 31.875 31.549 31.187 30.816 30.505 30.201 29.886 29.541 29.167 28.785 28.39 28.073 27.784 27.457 27.104 26.807 26.508 26.185 25.92 25.627 25.307 24.976 24.634 24.396 24.152 23.789 23.531 23.266 23.121 22.803 22.472 22.091 21.883 21.344 21.173 20.938 20.702 20.177 19.883 19.57 19.204 18.765 18.298 17.748 16.501 -2 ,29298 ,KEBNE ,16690338,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:12:57 CET,0.0 1.647 2.338 2.845 3.309 3.742 4.139 4.519 5.146 5.411 5.666 5.814 6.384 6.609 7.048 7.479 7.891 8.084 8.437 8.769 9.255 9.56 9.857 10.29 10.692 11.077 11.455 11.809 12.26 12.683 13.098 13.608 14.092 14.553 15.07 15.653 16.211 16.832 17.475 18.135 18.872 19.696 20.552 21.396 22.416 23.495 24.687 25.97 27.395 28.971 30.573 31.674 32.092 32.158 32.102 31.899 31.598 31.309 31.036 30.706 30.339 29.964 29.594 29.225 28.859 28.52 28.165 27.81 27.485 27.153 26.771 26.435 26.096 25.749 25.476 25.194 24.898 24.596 24.286 24.057 23.827 23.475 23.204 22.906 22.76 22.453 22.107 21.745 21.566 21.064 20.977 20.754 20.513 19.962 19.668 19.354 18.999 18.619 18.129 17.447 16.176 -3 ,23214 ,KEBNE ,16690339,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:12:57 CET,0.0 1.562 2.259 2.821 3.333 3.765 4.109 4.438 5.058 5.333 5.604 5.804 6.378 6.614 7.086 7.55 7.969 8.158 8.519 8.858 9.36 9.684 9.998 10.462 10.893 11.302 11.702 12.076 12.565 13.032 13.45 13.93 14.399 14.861 15.394 16.008 16.6 17.239 17.895 18.555 19.231 19.993 20.871 21.71 22.679 23.719 24.875 26.165 27.58 29.077 30.756 31.789 32.127 32.165 32.008 31.738 31.389 31.028 30.708 30.339 30.003 29.687 29.345 28.993 28.665 28.374 28.051 27.732 27.419 27.054 26.687 26.402 26.092 25.768 25.512 25.232 24.927 24.593 24.254 24.026 23.79 23.42 23.146 22.858 22.704 22.36 21.989 21.609 21.418 20.919 20.865 20.665 20.443 19.919 19.633 19.329 18.999 18.635 18.168 17.486 16.252 -4 ,16368 ,KEBNE ,16690340,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:14 CET,0.0 1.819 2.726 3.362 3.782 4.15 4.506 4.863 5.542 5.881 6.204 6.419 7.003 7.239 7.687 8.095 8.464 8.655 9.038 9.409 9.947 10.28 10.6 11.043 11.448 11.826 12.192 12.559 13.047 13.516 13.963 14.492 14.995 15.474 16.025 16.639 17.197 17.792 18.445 19.161 19.88 20.636 21.504 22.334 23.253 24.321 25.486 26.706 28.166 29.801 31.446 32.456 32.911 33.077 33.034 32.831 32.55 32.254 31.958 31.566 31.16 30.784 30.427 30.072 29.714 29.37 28.984 28.649 28.334 27.976 27.633 27.356 27.049 26.701 26.417 26.125 25.843 25.54 25.219 25.001 24.771 24.408 24.134 23.822 23.664 23.345 23.005 22.646 22.455 21.948 21.865 21.638 21.394 20.836 20.482 20.132 19.739 19.274 18.803 18.169 16.741 -5 ,3144 ,KEBNE ,16690341,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:15 CET,0.0 1.751 2.448 2.993 3.449 3.831 4.176 4.505 5.126 5.42 5.696 5.861 6.425 6.651 7.097 7.505 7.889 8.083 8.446 8.784 9.274 9.59 9.913 10.38 10.799 11.187 11.569 11.942 12.411 12.85 13.272 13.79 14.294 14.761 15.284 15.845 16.383 17.01 17.661 18.323 19.024 19.814 20.724 21.593 22.535 23.577 24.775 26.067 27.501 29.117 30.84 31.925 32.305 32.393 32.29 32.024 31.692 31.366 31.03 30.636 30.297 29.935 29.531 29.172 28.813 28.469 28.127 27.795 27.478 27.13 26.787 26.505 26.202 25.87 25.593 25.298 24.987 24.675 24.339 24.09 23.845 23.472 23.183 22.885 22.737 22.43 22.091 21.721 21.523 20.993 20.876 20.648 20.413 19.941 19.67 19.371 19.042 18.669 18.224 17.661 16.304 -6 ,29891 ,KEBNE ,16691067,Thu Nov 25 10:27:55 CET,Thu Nov 25 12:06:11 CET,0.0 1.481 2.278 2.871 3.377 3.804 4.168 4.517 5.176 5.466 5.726 5.904 6.481 6.713 7.18 7.61 7.988 8.188 8.564 8.894 9.376 9.684 9.981 10.432 10.858 11.253 11.638 12.02 12.521 13.013 13.493 14.033 14.54 15.029 15.564 16.148 16.733 17.391 18.043 18.697 19.398 20.171 21.047 21.904 22.861 23.907 25.084 26.356 27.785 29.324 30.997 32.147 32.587 32.67 32.572 32.294 31.996 31.69 31.342 30.933 30.567 30.231 29.878 29.508 29.16 28.848 28.509 28.183 27.846 27.485 27.131 26.848 26.531 26.177 25.906 25.61 25.307 24.999 24.659 24.419 24.177 23.82 23.562 23.273 23.131 22.85 22.549 22.22 22.033 21.504 21.397 21.184 20.957 20.448 20.17 19.872 19.527 19.082 18.522 17.88 16.478 -7 ,17714 ,KEBNE ,16690343,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:07 CET,0.0 1.395 2.11 2.749 3.291 3.713 4.084 4.433 5.082 5.362 5.615 5.775 6.344 6.551 6.926 7.289 7.665 7.853 8.215 8.557 9.059 9.385 9.704 10.169 10.588 10.981 11.362 11.721 12.167 12.602 13.018 13.498 13.979 14.467 15.013 15.612 16.17 16.776 17.414 18.056 18.75 19.539 20.421 21.255 22.234 23.294 24.474 25.788 27.21 28.786 30.458 31.541 31.969 32.08 31.978 31.707 31.426 31.136 30.84 30.5 30.146 29.784 29.413 29.055 28.711 28.37 28.011 27.665 27.338 26.995 26.641 26.353 26.052 25.725 25.468 25.216 24.939 24.624 24.291 24.059 23.811 23.419 23.137 22.84 22.689 22.364 22.025 21.674 21.478 20.959 20.864 20.648 20.423 19.911 19.625 19.302 18.908 18.448 17.945 17.32 15.861 -8 ,22943 ,KEBNE ,16690344,Thu Nov 25 08:12:00 CET,Thu Nov 25 08:13:20 CET,0.0 1.333 2.01 2.541 3.055 3.477 3.833 4.193 4.853 5.153 5.427 5.57 6.13 6.355 6.794 7.208 7.597 7.78 8.121 8.456 8.941 9.255 9.571 10.015 10.416 10.794 11.183 11.568 12.023 12.436 12.853 13.382 13.883 14.353 14.901 15.481 15.996 16.586 17.229 17.885 18.566 19.311 20.226 21.13 22.081 23.131 24.33 25.625 27.104 28.722 30.407 31.424 31.679 31.701 31.629 31.414 31.125 30.808 30.5 30.121 29.733 29.363 29.002 28.652 28.299 27.961 27.601 27.259 26.954 26.619 26.249 25.946 25.626 25.284 25.013 24.699 24.377 24.078 23.761 23.53 23.283 22.879 22.596 22.312 22.172 21.867 21.528 21.179 20.99 20.463 20.345 20.124 19.889 19.394 19.104 18.779 18.429 18.011 17.531 16.93 15.472 -9 ,17671 ,KEBNE ,16690345,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:20 CET,0.0 1.474 2.144 2.67 3.078 3.462 3.833 4.19 4.8 5.072 5.35 5.523 6.08 6.296 6.712 7.108 7.498 7.691 8.061 8.406 8.901 9.212 9.501 9.916 10.317 10.718 11.114 11.49 11.982 12.457 12.885 13.394 13.9 14.37 14.912 15.532 16.097 16.712 17.37 18.056 18.744 19.45 20.313 21.23 22.294 23.399 24.619 25.955 27.41 29.041 30.735 31.772 32.103 32.125 31.989 31.789 31.534 31.229 30.911 30.544 30.212 29.868 29.51 29.126 28.726 28.394 28.036 27.675 27.351 27.019 26.691 26.418 26.134 25.816 25.531 25.224 24.911 24.591 24.264 24.044 23.816 23.424 23.139 22.836 22.675 22.364 22.013 21.612 21.409 20.88 20.718 20.446 20.181 19.667 19.37 19.033 18.667 18.244 17.751 17.215 15.932 -10 ,11044 ,KEBNE ,16691071,Thu Nov 25 10:27:59 CET,Thu Nov 25 11:58:17 CET,0.0 1.138 1.796 2.374 2.852 3.256 3.639 4.014 4.709 5.032 5.322 5.513 6.078 6.301 6.731 7.133 7.518 7.696 8.039 8.389 8.901 9.205 9.487 9.921 10.338 10.717 11.087 11.459 11.934 12.384 12.802 13.313 13.809 14.269 14.817 15.406 15.936 16.529 17.161 17.829 18.542 19.329 20.198 21.031 21.994 23.03 24.163 25.378 26.75 28.311 30.049 31.241 31.688 31.703 31.587 31.408 31.117 30.784 30.475 30.106 29.747 29.408 29.071 28.725 28.365 28.029 27.672 27.324 27.024 26.72 26.377 26.09 25.768 25.435 25.193 24.937 24.66 24.35 24.013 23.767 23.512 23.129 22.868 22.6 22.462 22.152 21.818 21.474 21.289 20.788 20.682 20.433 20.208 19.734 19.44 19.113 18.762 18.39 17.896 17.18 15.95 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt deleted file mode 100644 index 065ac99d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26853 ,KEBNE ,16691072,Thu Nov 25 10:27:59 CET,Thu Nov 25 12:00:16 CET,0.0 1.372 1.946 2.403 2.782 3.1 3.406 3.704 4.231 4.469 4.688 4.763 5.32 5.52 5.862 6.194 6.494 6.648 6.973 7.276 7.706 7.986 8.245 8.639 9.026 9.374 9.69 10.001 10.408 10.757 11.076 11.484 11.866 12.203 12.591 13.036 13.429 13.836 14.291 14.769 15.266 15.772 16.284 16.779 17.379 18.052 18.776 19.48 20.124 20.669 20.927 20.663 20.133 19.503 18.846 18.174 17.539 16.941 16.406 15.813 15.293 14.824 14.37 13.907 13.464 13.058 12.592 12.181 11.798 11.354 10.896 10.503 10.085 9.668 9.355 9.022 8.672 8.305 7.907 7.644 7.386 6.984 6.69 6.384 6.231 5.898 5.527 5.122 4.908 4.342 4.189 3.932 3.668 3.081 2.749 2.39 2.006 1.597 1.084 0.385 -1.396 -2 ,20495 ,KEBNE ,16690348,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:20 CET,0.0 1.603 2.264 2.699 3.079 3.456 3.782 4.052 4.523 4.743 4.96 5.026 5.556 5.739 6.066 6.388 6.705 6.865 7.182 7.473 7.883 8.149 8.407 8.798 9.154 9.471 9.78 10.065 10.416 10.757 11.1 11.526 11.911 12.276 12.688 13.11 13.508 13.917 14.327 14.751 15.207 15.725 16.308 16.861 17.454 18.025 18.591 19.214 19.814 20.36 20.733 20.472 19.893 19.237 18.581 17.931 17.332 16.735 16.156 15.565 15.058 14.563 14.041 13.556 13.116 12.695 12.225 11.776 11.37 10.96 10.559 10.227 9.873 9.484 9.15 8.799 8.464 8.125 7.752 7.487 7.219 6.789 6.475 6.143 5.981 5.667 5.336 4.942 4.728 4.172 4.017 3.767 3.517 2.97 2.657 2.326 1.939 1.46 0.928 0.303 -1.129 -3 ,28121 ,KEBNE ,16690349,Thu Nov 25 08:11:58 CET,Thu Nov 25 08:13:08 CET,0.0 1.029 1.629 2.081 2.455 2.774 3.075 3.377 3.92 4.166 4.386 4.461 5.007 5.212 5.591 5.943 6.275 6.426 6.707 6.98 7.368 7.613 7.859 8.195 8.507 8.828 9.137 9.426 9.774 10.1 10.418 10.8 11.157 11.51 11.937 12.394 12.843 13.323 13.8 14.29 14.778 15.307 15.866 16.388 16.991 17.602 18.241 18.922 19.619 20.212 20.478 20.207 19.676 19.091 18.495 17.878 17.275 16.683 16.105 15.516 14.969 14.436 13.938 13.433 12.929 12.471 12.024 11.617 11.244 10.879 10.489 10.148 9.794 9.42 9.116 8.782 8.42 8.056 7.706 7.463 7.199 6.761 6.442 6.125 5.972 5.644 5.275 4.871 4.66 4.108 4.028 3.803 3.553 2.952 2.609 2.261 1.876 1.412 0.877 0.235 -1.624 -4 ,4754 ,KEBNE ,16690350,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:07 CET,0.0 1.209 1.809 2.336 2.801 3.212 3.542 3.806 4.332 4.588 4.818 4.883 5.416 5.614 6.016 6.406 6.76 6.912 7.209 7.506 7.914 8.185 8.479 8.888 9.23 9.534 9.83 10.146 10.532 10.874 11.186 11.546 11.889 12.236 12.65 13.096 13.508 13.923 14.363 14.874 15.404 15.927 16.483 17.005 17.595 18.228 18.941 19.647 20.299 20.869 21.153 20.903 20.386 19.749 19.109 18.475 17.832 17.21 16.641 16.034 15.485 15.001 14.543 14.094 13.655 13.228 12.766 12.353 11.981 11.574 11.15 10.783 10.402 10.019 9.71 9.389 9.062 8.706 8.302 8.023 7.749 7.335 7.043 6.721 6.559 6.234 5.884 5.466 5.25 4.717 4.621 4.37 4.099 3.503 3.209 2.88 2.488 2.005 1.441 0.766 -0.565 -5 ,21415 ,KEBNE ,16691076,Thu Nov 25 10:28:56 CET,Thu Nov 25 12:03:38 CET,0.0 1.646 2.242 2.701 3.07 3.411 3.728 4.019 4.566 4.808 5.04 5.132 5.665 5.843 6.197 6.542 6.873 7.03 7.338 7.632 8.047 8.305 8.553 8.891 9.195 9.488 9.791 10.101 10.496 10.853 11.191 11.581 11.926 12.262 12.642 13.071 13.482 13.907 14.38 14.898 15.425 16.0 16.603 17.148 17.762 18.352 18.986 19.598 20.176 20.758 21.077 20.786 20.249 19.606 18.926 18.247 17.605 17.012 16.465 15.882 15.328 14.795 14.295 13.825 13.393 12.994 12.533 12.126 11.79 11.425 11.011 10.65 10.277 9.879 9.572 9.25 8.918 8.566 8.184 7.928 7.672 7.25 6.94 6.62 6.461 6.134 5.786 5.43 5.243 4.696 4.563 4.316 4.066 3.545 3.242 2.898 2.513 2.073 1.531 0.783 -0.949 -6 ,3799 ,KEBNE ,16691077,Thu Nov 25 10:28:57 CET,Thu Nov 25 12:02:49 CET,0.0 1.089 1.711 2.173 2.565 2.92 3.236 3.532 4.057 4.291 4.517 4.61 5.148 5.325 5.676 6.02 6.339 6.501 6.815 7.107 7.533 7.795 8.051 8.417 8.743 9.058 9.374 9.679 10.07 10.438 10.78 11.208 11.606 11.954 12.329 12.744 13.152 13.572 13.996 14.469 14.98 15.509 16.13 16.705 17.309 17.974 18.611 19.254 19.937 20.528 20.794 20.511 20.032 19.507 18.906 18.252 17.633 17.06 16.542 15.973 15.466 14.995 14.5 14.027 13.583 13.162 12.712 12.294 11.911 11.516 11.103 10.744 10.371 9.968 9.646 9.308 8.972 8.634 8.257 7.99 7.716 7.275 6.962 6.613 6.433 6.086 5.711 5.326 5.128 4.57 4.456 4.217 3.97 3.424 3.115 2.776 2.406 1.995 1.451 0.719 -1.041 -7 ,17557 ,KEBNE ,16691078,Thu Nov 25 10:28:57 CET,Thu Nov 25 12:06:31 CET,0.0 1.292 1.909 2.4 2.813 3.157 3.468 3.772 4.318 4.565 4.796 4.879 5.421 5.608 5.961 6.298 6.621 6.774 7.059 7.34 7.752 8.01 8.254 8.599 8.915 9.22 9.537 9.858 10.236 10.586 10.926 11.309 11.655 11.973 12.35 12.804 13.23 13.646 14.076 14.531 14.98 15.461 16.051 16.643 17.291 17.982 18.684 19.318 19.909 20.452 20.757 20.509 20.055 19.475 18.851 18.202 17.506 16.867 16.304 15.699 15.191 14.706 14.218 13.748 13.294 12.87 12.408 11.985 11.608 11.206 10.803 10.467 10.101 9.701 9.392 9.076 8.74 8.376 7.984 7.709 7.417 6.958 6.642 6.324 6.159 5.796 5.404 5.02 4.821 4.259 4.118 3.857 3.596 3.039 2.702 2.348 1.988 1.568 1.054 0.404 -0.916 -8 ,31471 ,KEBNE ,16691079,Thu Nov 25 10:29:01 CET,Thu Nov 25 12:04:31 CET,0.0 1.533 2.084 2.535 2.921 3.249 3.562 3.849 4.317 4.543 4.789 4.909 5.455 5.643 6.021 6.37 6.678 6.837 7.139 7.404 7.774 8.013 8.242 8.583 8.914 9.22 9.512 9.805 10.178 10.506 10.821 11.204 11.573 11.944 12.369 12.805 13.177 13.586 14.051 14.531 15.019 15.559 16.154 16.722 17.315 17.868 18.454 19.074 19.678 20.213 20.539 20.317 19.747 19.14 18.504 17.83 17.19 16.605 16.076 15.491 14.976 14.489 13.983 13.519 13.092 12.655 12.195 11.786 11.409 11.013 10.607 10.264 9.919 9.548 9.24 8.897 8.534 8.192 7.827 7.569 7.301 6.877 6.583 6.269 6.099 5.742 5.383 5.0 4.793 4.251 4.17 3.939 3.685 3.085 2.742 2.377 1.978 1.544 1.045 0.436 -0.925 -9 ,12732 ,KEBNE ,16690355,Thu Nov 25 08:12:03 CET,Thu Nov 25 08:13:07 CET,0.0 1.339 1.978 2.478 2.915 3.302 3.627 3.93 4.487 4.725 4.952 5.036 5.574 5.765 6.143 6.508 6.828 6.975 7.27 7.555 7.948 8.198 8.453 8.796 9.119 9.443 9.74 10.005 10.367 10.725 11.058 11.448 11.83 12.187 12.57 13.002 13.405 13.832 14.301 14.794 15.278 15.818 16.389 16.939 17.57 18.183 18.815 19.435 20.046 20.543 20.739 20.484 19.933 19.26 18.599 17.932 17.284 16.666 16.059 15.402 14.85 14.352 13.838 13.341 12.899 12.481 11.995 11.549 11.171 10.78 10.364 10.013 9.634 9.229 8.91 8.585 8.269 7.938 7.563 7.303 7.048 6.656 6.36 6.038 5.874 5.531 5.174 4.807 4.62 4.077 3.956 3.717 3.467 2.912 2.597 2.255 1.894 1.458 0.91 0.271 -1.156 -10 ,11108 ,KEBNE ,16690356,Thu Nov 25 08:12:00 CET,Thu Nov 25 08:13:20 CET,0.0 1.654 2.288 2.762 3.162 3.516 3.814 4.082 4.582 4.812 5.032 5.093 5.629 5.827 6.201 6.534 6.854 7.003 7.284 7.554 7.938 8.192 8.449 8.825 9.181 9.509 9.847 10.178 10.57 10.937 11.274 11.666 12.045 12.408 12.813 13.247 13.624 14.032 14.502 14.97 15.439 15.965 16.551 17.16 17.811 18.422 19.082 19.715 20.316 20.824 21.104 20.86 20.304 19.61 18.949 18.377 17.823 17.244 16.694 16.112 15.596 15.111 14.65 14.204 13.744 13.296 12.81 12.357 11.976 11.564 11.119 10.779 10.423 10.025 9.717 9.395 9.047 8.681 8.295 8.041 7.784 7.359 7.058 6.751 6.601 6.284 5.907 5.494 5.284 4.729 4.631 4.382 4.111 3.51 3.165 2.818 2.444 1.981 1.428 0.618 -1.57 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt deleted file mode 100644 index 8a1f5fbf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_20670-2qbs-_23477.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5264 ,KEBNE ,16691082,Thu Nov 25 10:29:59 CET,Thu Nov 25 12:04:45 CET,0.0 1.961 2.708 3.34 3.878 4.274 4.627 4.992 5.614 5.879 6.14 6.302 6.877 7.109 7.541 7.937 8.292 8.455 8.761 9.063 9.507 9.774 10.021 10.38 10.714 11.036 11.359 11.673 12.088 12.461 12.793 13.185 13.547 13.896 14.294 14.704 15.069 15.481 15.928 16.397 16.84 17.277 17.773 18.226 18.695 19.132 19.491 19.754 19.861 19.732 19.068 17.743 16.353 14.992 13.721 12.572 11.549 10.548 9.68 8.791 7.995 7.333 6.684 6.031 5.407 4.835 4.221 3.648 3.16 2.672 2.143 1.693 1.237 0.748 0.361 -0.031 -0.417 -0.827 -1.306 -1.63 -1.936 -2.442 -2.808 -3.182 -3.377 -3.771 -4.223 -4.748 -5.017 -5.63 -5.788 -6.096 -6.436 -7.194 -7.63 -8.09 -8.583 -9.119 -9.779 -10.649 -12.986 -2 ,1031 ,KEBNE ,16691083,Thu Nov 25 10:29:59 CET,Thu Nov 25 12:04:51 CET,0.0 3.163 4.022 4.477 4.844 5.18 5.509 5.819 6.348 6.589 6.807 6.865 7.39 7.584 7.986 8.355 8.701 8.879 9.191 9.454 9.828 10.075 10.331 10.677 10.983 11.307 11.637 11.936 12.287 12.625 12.951 13.313 13.651 14.008 14.429 14.861 15.267 15.709 16.147 16.58 17.042 17.502 17.956 18.399 18.928 19.459 19.862 20.191 20.368 20.221 19.465 18.067 16.713 15.402 14.168 13.016 11.938 10.935 10.069 9.139 8.302 7.548 6.828 6.18 5.571 5.011 4.435 3.889 3.404 2.899 2.39 1.982 1.528 1.045 0.672 0.293 -0.093 -0.508 -0.938 -1.229 -1.542 -2.041 -2.368 -2.71 -2.893 -3.256 -3.622 -4.045 -4.285 -4.877 -4.989 -5.237 -5.512 -6.138 -6.471 -6.808 -7.188 -7.596 -8.097 -8.991 -11.859 -3 ,8638 ,KEBNE ,16691084,Thu Nov 25 10:29:59 CET,Thu Nov 25 12:07:08 CET,0.0 1.939 2.612 3.121 3.581 4.002 4.371 4.702 5.288 5.568 5.839 5.985 6.543 6.76 7.178 7.547 7.896 8.064 8.37 8.664 9.088 9.351 9.61 10.024 10.455 10.855 11.186 11.465 11.855 12.223 12.548 12.955 13.372 13.772 14.175 14.581 14.964 15.352 15.735 16.128 16.535 16.998 17.503 17.955 18.398 18.816 19.191 19.528 19.755 19.604 18.812 17.412 16.033 14.655 13.374 12.266 11.298 10.397 9.593 8.765 8.021 7.341 6.693 6.061 5.428 4.849 4.258 3.68 3.153 2.622 2.083 1.648 1.191 0.708 0.344 -0.038 -0.459 -0.882 -1.292 -1.563 -1.865 -2.37 -2.713 -3.08 -3.27 -3.659 -4.062 -4.471 -4.686 -5.266 -5.381 -5.653 -5.964 -6.594 -6.921 -7.305 -7.733 -8.206 -8.779 -9.501 -10.985 -4 ,24539 ,KEBNE ,16690360,Thu Nov 25 08:12:03 CET,Thu Nov 25 08:13:15 CET,0.0 2.02 2.776 3.342 3.773 4.153 4.502 4.816 5.392 5.666 5.918 6.048 6.603 6.8 7.17 7.534 7.882 8.047 8.361 8.679 9.162 9.456 9.73 10.111 10.457 10.788 11.113 11.428 11.847 12.247 12.593 12.997 13.39 13.74 14.126 14.533 14.915 15.337 15.758 16.19 16.636 17.068 17.492 17.885 18.358 18.847 19.286 19.591 19.703 19.576 18.815 17.31 15.836 14.527 13.349 12.257 11.3 10.377 9.505 8.599 7.808 7.134 6.49 5.834 5.205 4.626 4.035 3.519 3.06 2.577 2.072 1.647 1.215 0.758 0.376 -0.023 -0.436 -0.874 -1.32 -1.607 -1.909 -2.414 -2.778 -3.191 -3.407 -3.821 -4.269 -4.758 -5.014 -5.621 -5.841 -6.15 -6.447 -7.101 -7.477 -7.912 -8.39 -8.917 -9.506 -10.296 -12.539 -5 ,12906 ,KEBNE ,16691086,Thu Nov 25 10:29:59 CET,Thu Nov 25 12:03:51 CET,0.0 1.357 2.017 2.575 3.046 3.451 3.836 4.196 4.843 5.108 5.342 5.432 5.97 6.179 6.577 6.936 7.294 7.48 7.839 8.172 8.604 8.872 9.128 9.483 9.827 10.164 10.481 10.761 11.105 11.444 11.786 12.192 12.582 12.945 13.356 13.818 14.224 14.619 15.037 15.509 15.973 16.428 16.913 17.378 17.902 18.392 18.773 19.088 19.252 19.017 18.098 16.587 15.113 13.729 12.512 11.364 10.268 9.295 8.471 7.614 6.886 6.229 5.559 4.898 4.297 3.77 3.179 2.594 2.101 1.579 1.01 0.549 0.071 -0.444 -0.849 -1.267 -1.699 -2.142 -2.6 -2.915 -3.24 -3.767 -4.153 -4.567 -4.765 -5.153 -5.571 -6.012 -6.256 -6.882 -7.104 -7.407 -7.732 -8.476 -8.885 -9.313 -9.811 -10.362 -11.029 -11.965 -13.996 -6 ,20597 ,KEBNE ,16690362,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:08 CET,0.0 1.808 2.485 3.014 3.468 3.851 4.2 4.501 5.04 5.296 5.535 5.634 6.181 6.375 6.748 7.081 7.384 7.539 7.857 8.155 8.542 8.787 9.02 9.35 9.684 9.993 10.272 10.543 10.899 11.226 11.563 11.99 12.341 12.664 13.042 13.433 13.808 14.22 14.633 15.062 15.493 15.927 16.387 16.865 17.401 17.87 18.312 18.683 18.819 18.548 17.569 16.019 14.545 13.089 11.759 10.526 9.367 8.289 7.361 6.416 5.551 4.774 4.064 3.385 2.736 2.153 1.567 1.039 0.577 0.104 -0.426 -0.857 -1.305 -1.8 -2.184 -2.585 -3.01 -3.474 -3.96 -4.285 -4.627 -5.181 -5.566 -5.97 -6.182 -6.621 -7.095 -7.598 -7.843 -8.466 -8.683 -8.985 -9.32 -10.077 -10.474 -10.918 -11.404 -11.94 -12.643 -13.562 -15.61 -7 ,13125 ,KEBNE ,16691088,Thu Nov 25 10:31:01 CET,Thu Nov 25 12:07:00 CET,0.0 1.887 2.698 3.283 3.743 4.155 4.511 4.838 5.445 5.711 5.955 6.055 6.6 6.813 7.24 7.595 7.914 8.073 8.387 8.698 9.139 9.419 9.669 10.038 10.39 10.705 11.01 11.327 11.725 12.061 12.378 12.77 13.162 13.521 13.896 14.338 14.738 15.101 15.454 15.836 16.262 16.693 17.087 17.423 17.77 18.075 18.301 18.47 18.518 18.196 17.158 15.484 13.947 12.508 11.102 9.804 8.641 7.591 6.687 5.765 4.954 4.201 3.453 2.769 2.164 1.592 0.965 0.397 -0.088 -0.586 -1.113 -1.585 -2.091 -2.601 -2.992 -3.408 -3.832 -4.266 -4.724 -5.055 -5.406 -5.956 -6.339 -6.732 -6.939 -7.375 -7.847 -8.355 -8.606 -9.217 -9.408 -9.706 -10.044 -10.796 -11.191 -11.619 -12.082 -12.594 -13.223 -14.122 -16.419 -8 ,21794 ,KEBNE ,16690364,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:12:59 CET,0.0 1.846 2.547 3.074 3.557 3.998 4.369 4.72 5.356 5.609 5.828 5.909 6.449 6.649 7.038 7.389 7.709 7.865 8.189 8.498 8.923 9.187 9.439 9.814 10.184 10.529 10.874 11.203 11.572 11.905 12.229 12.632 13.001 13.345 13.74 14.129 14.5 14.921 15.359 15.814 16.241 16.683 17.192 17.691 18.161 18.573 18.954 19.252 19.373 19.133 18.241 16.697 15.163 13.744 12.49 11.315 10.279 9.334 8.438 7.554 6.838 6.208 5.621 5.041 4.453 3.876 3.259 2.702 2.236 1.743 1.206 0.793 0.369 -0.088 -0.456 -0.872 -1.314 -1.772 -2.241 -2.565 -2.908 -3.41 -3.743 -4.123 -4.331 -4.78 -5.259 -5.761 -6.007 -6.606 -6.784 -7.102 -7.433 -8.136 -8.529 -8.951 -9.436 -10.042 -10.81 -11.715 -13.826 -9 ,22729 ,KEBNE ,16691090,Thu Nov 25 10:31:01 CET,Thu Nov 25 12:04:52 CET,0.0 1.168 1.818 2.253 2.603 2.924 3.205 3.478 4.029 4.267 4.477 4.543 5.071 5.26 5.617 5.96 6.281 6.431 6.722 6.998 7.411 7.68 7.928 8.285 8.618 8.94 9.254 9.586 10.061 10.471 10.825 11.217 11.59 11.976 12.399 12.903 13.382 13.825 14.27 14.754 15.217 15.649 16.106 16.564 17.062 17.517 17.895 18.181 18.392 18.339 17.603 16.067 14.542 13.21 11.98 10.858 9.874 8.888 7.946 7.034 6.244 5.529 4.854 4.211 3.623 3.069 2.464 1.911 1.42 0.928 0.431 0.02 -0.433 -0.928 -1.319 -1.727 -2.141 -2.575 -3.03 -3.336 -3.656 -4.18 -4.563 -4.959 -5.154 -5.58 -6.033 -6.496 -6.746 -7.366 -7.588 -7.899 -8.217 -8.887 -9.269 -9.675 -10.109 -10.598 -11.181 -11.941 -13.518 -10 ,23712 ,KEBNE ,16690366,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:12:59 CET,0.0 1.774 2.521 3.115 3.623 4.078 4.466 4.803 5.387 5.648 5.904 6.072 6.642 6.85 7.236 7.595 7.924 8.094 8.423 8.721 9.149 9.432 9.687 10.044 10.406 10.747 11.068 11.37 11.75 12.133 12.507 12.927 13.318 13.683 14.075 14.491 14.9 15.353 15.799 16.249 16.709 17.234 17.751 18.157 18.607 19.088 19.533 19.856 20.033 19.873 19.023 17.381 15.742 14.326 13.052 11.787 10.59 9.475 8.524 7.612 6.798 6.052 5.352 4.689 4.037 3.39 2.737 2.182 1.687 1.178 0.644 0.192 -0.274 -0.777 -1.178 -1.59 -2.015 -2.478 -2.976 -3.317 -3.673 -4.222 -4.623 -5.046 -5.25 -5.675 -6.118 -6.562 -6.794 -7.4 -7.598 -7.903 -8.228 -8.946 -9.33 -9.761 -10.236 -10.784 -11.516 -12.427 -14.438 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt deleted file mode 100644 index 1e124997..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26270 ,KEBNE ,16690367,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:07 CET,0.0 1.832 2.537 3.044 3.467 3.857 4.185 4.497 5.064 5.314 5.551 5.625 6.178 6.377 6.754 7.126 7.481 7.654 7.989 8.305 8.755 9.03 9.285 9.67 10.029 10.361 10.688 11.028 11.482 11.919 12.332 12.794 13.21 13.582 14.042 14.573 15.034 15.51 16.046 16.627 17.21 17.859 18.613 19.34 20.133 21.01 21.977 22.961 24.028 25.139 26.108 26.386 26.194 25.811 25.216 24.53 23.925 23.336 22.702 21.993 21.371 20.806 20.262 19.701 19.148 18.613 18.036 17.532 17.078 16.562 15.997 15.53 15.033 14.509 14.082 13.628 13.181 12.706 12.195 11.839 11.474 10.915 10.514 10.057 9.812 9.31 8.735 8.128 7.84 7.195 6.837 6.458 6.035 5.117 4.619 4.034 3.346 2.554 1.641 0.382 -7.591 -2 ,2255 ,KEBNE ,16690368,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:06 CET,0.0 1.615 2.328 2.885 3.31 3.709 4.112 4.469 5.041 5.289 5.541 5.645 6.205 6.415 6.835 7.241 7.605 7.784 8.131 8.452 8.897 9.167 9.433 9.816 10.168 10.516 10.859 11.178 11.583 11.994 12.384 12.841 13.275 13.682 14.159 14.674 15.141 15.646 16.18 16.746 17.347 17.981 18.654 19.338 20.157 21.05 22.01 22.995 24.032 25.119 26.125 26.415 26.155 25.746 25.212 24.572 23.947 23.332 22.763 22.153 21.582 21.041 20.509 19.981 19.44 18.925 18.376 17.839 17.365 16.875 16.352 15.881 15.378 14.873 14.492 14.081 13.616 13.143 12.654 12.304 11.937 11.325 10.875 10.395 10.143 9.606 9.038 8.443 8.122 7.447 7.072 6.687 6.269 5.355 4.871 4.311 3.655 2.925 2.048 0.786 -3.725 -3 ,532 ,KEBNE ,16690369,Thu Nov 25 08:12:00 CET,Thu Nov 25 08:13:20 CET,0.0 1.48 2.214 2.742 3.121 3.484 3.829 4.137 4.671 4.925 5.17 5.281 5.852 6.051 6.417 6.77 7.1 7.27 7.602 7.91 8.376 8.679 8.96 9.357 9.726 10.104 10.478 10.811 11.217 11.621 12.002 12.457 12.903 13.325 13.816 14.349 14.842 15.377 15.931 16.48 17.031 17.654 18.385 19.121 19.959 20.842 21.747 22.737 23.859 24.934 25.84 26.168 25.974 25.552 25.026 24.399 23.745 23.112 22.486 21.843 21.272 20.697 20.149 19.638 19.155 18.665 18.078 17.508 17.029 16.549 16.02 15.576 15.125 14.644 14.259 13.842 13.39 12.908 12.377 12.001 11.614 10.982 10.551 10.101 9.867 9.38 8.837 8.258 7.947 7.267 6.904 6.537 6.118 5.142 4.624 4.111 3.495 2.696 1.686 0.363 -4.069 -4 ,11896 ,KEBNE ,16690370,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:19 CET,0.0 1.592 2.284 2.843 3.275 3.643 3.968 4.277 4.825 5.076 5.326 5.408 5.95 6.155 6.538 6.913 7.301 7.479 7.793 8.083 8.496 8.774 9.043 9.416 9.826 10.237 10.601 10.95 11.391 11.787 12.169 12.645 13.082 13.477 13.939 14.449 14.899 15.399 15.941 16.511 17.08 17.702 18.411 19.101 19.926 20.76 21.645 22.633 23.671 24.738 25.711 26.089 26.023 25.624 25.056 24.477 23.877 23.258 22.642 21.952 21.316 20.735 20.176 19.594 19.017 18.479 17.914 17.388 16.91 16.404 15.877 15.442 14.978 14.458 14.012 13.542 13.052 12.547 12.042 11.685 11.305 10.707 10.273 9.808 9.571 9.08 8.536 7.945 7.63 6.974 6.661 6.312 5.924 4.989 4.451 3.869 3.207 2.473 1.576 0.26 -5.78 -5 ,18885 ,KEBNE ,16690371,Thu Nov 25 08:12:00 CET,Thu Nov 25 08:13:17 CET,0.0 1.485 2.172 2.692 3.13 3.502 3.835 4.126 4.624 4.866 5.104 5.205 5.761 5.973 6.377 6.735 7.082 7.256 7.585 7.884 8.33 8.625 8.908 9.298 9.661 10.017 10.366 10.709 11.138 11.549 11.952 12.414 12.862 13.302 13.808 14.37 14.864 15.385 15.925 16.478 17.057 17.684 18.431 19.149 19.939 20.754 21.663 22.626 23.641 24.673 25.597 26.008 25.898 25.417 24.826 24.186 23.548 22.912 22.309 21.683 21.119 20.554 19.941 19.337 18.792 18.312 17.762 17.228 16.748 16.249 15.716 15.254 14.778 14.285 13.919 13.519 13.087 12.635 12.14 11.793 11.426 10.836 10.433 10.011 9.783 9.294 8.786 8.247 7.935 7.271 6.915 6.523 6.116 5.228 4.716 4.146 3.503 2.752 1.847 0.691 -3.657 -6 ,21118 ,KEBNE ,16690372,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:24 CET,0.0 1.317 1.959 2.45 2.885 3.283 3.64 3.975 4.557 4.814 5.047 5.159 5.741 5.955 6.332 6.691 7.044 7.216 7.565 7.886 8.333 8.636 8.906 9.264 9.627 9.989 10.328 10.664 11.1 11.488 11.868 12.344 12.794 13.203 13.643 14.14 14.641 15.195 15.767 16.347 16.957 17.608 18.308 19.043 19.922 20.79 21.71 22.679 23.669 24.72 25.696 26.047 25.926 25.538 25.022 24.455 23.856 23.216 22.622 21.981 21.372 20.812 20.267 19.7 19.14 18.669 18.189 17.701 17.239 16.78 16.286 15.823 15.318 14.781 14.357 13.944 13.511 13.034 12.532 12.165 11.744 11.093 10.65 10.166 9.923 9.416 8.867 8.255 7.931 7.269 6.923 6.537 6.125 5.264 4.786 4.256 3.642 2.913 2.001 0.704 -9.223 -7 ,23847 ,KEBNE ,16690373,Thu Nov 25 08:11:58 CET,Thu Nov 25 08:13:13 CET,0.0 1.576 2.328 2.867 3.332 3.733 4.083 4.392 4.957 5.231 5.483 5.612 6.181 6.388 6.766 7.119 7.458 7.621 7.923 8.199 8.612 8.879 9.138 9.542 9.954 10.309 10.633 10.973 11.4 11.801 12.171 12.587 13.007 13.413 13.875 14.388 14.873 15.432 16.021 16.596 17.222 17.919 18.693 19.467 20.252 21.028 21.932 22.952 24.013 25.074 26.001 26.251 26.012 25.591 25.091 24.527 23.974 23.396 22.818 22.187 21.627 21.081 20.528 19.976 19.407 18.882 18.334 17.846 17.398 16.891 16.33 15.842 15.339 14.827 14.44 14.018 13.567 13.1 12.609 12.258 11.872 11.261 10.834 10.377 10.135 9.628 9.114 8.55 8.23 7.567 7.218 6.831 6.408 5.493 4.966 4.38 3.723 2.987 2.094 0.858 -4.611 -8 ,5643 ,KEBNE ,16691099,Thu Nov 25 10:32:02 CET,Thu Nov 25 12:08:05 CET,0.0 1.233 1.824 2.336 2.774 3.125 3.451 3.765 4.342 4.592 4.827 4.942 5.52 5.735 6.139 6.509 6.842 7.013 7.353 7.667 8.082 8.34 8.601 9.002 9.407 9.769 10.084 10.388 10.808 11.219 11.59 12.047 12.517 12.958 13.425 13.943 14.466 15.019 15.578 16.17 16.781 17.454 18.201 18.889 19.631 20.433 21.31 22.247 23.277 24.342 25.279 25.591 25.473 25.075 24.542 23.92 23.307 22.703 22.118 21.489 20.899 20.355 19.799 19.258 18.726 18.217 17.689 17.183 16.715 16.217 15.683 15.225 14.753 14.252 13.829 13.385 12.927 12.441 11.929 11.577 11.213 10.605 10.158 9.704 9.479 8.995 8.469 7.931 7.654 7.01 6.68 6.331 5.949 5.015 4.459 3.883 3.217 2.453 1.563 0.292 -3.866 -9 ,11000 ,KEBNE ,16690375,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:15 CET,0.0 1.77 2.461 2.928 3.331 3.7 4.053 4.365 4.871 5.116 5.347 5.423 5.976 6.173 6.563 6.943 7.281 7.454 7.823 8.155 8.577 8.844 9.125 9.54 9.915 10.262 10.612 10.962 11.386 11.784 12.18 12.655 13.098 13.521 13.993 14.479 14.929 15.46 16.083 16.689 17.293 18.014 18.847 19.591 20.362 21.16 22.074 23.095 24.114 25.118 26.07 26.463 26.341 25.963 25.461 24.902 24.351 23.681 22.947 22.189 21.545 20.942 20.349 19.721 19.117 18.587 17.985 17.447 16.992 16.514 15.996 15.542 15.065 14.563 14.135 13.7 13.274 12.8 12.273 11.909 11.531 10.942 10.534 10.106 9.877 9.359 8.819 8.259 7.957 7.285 6.898 6.52 6.112 5.263 4.784 4.229 3.626 2.944 2.069 0.761 -4.836 -10 ,7237 ,KEBNE ,16690376,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:18 CET,0.0 2.219 2.865 3.331 3.71 4.025 4.342 4.652 5.242 5.505 5.747 5.852 6.409 6.613 6.996 7.362 7.724 7.903 8.244 8.555 8.994 9.266 9.519 9.88 10.242 10.585 10.911 11.249 11.7 12.13 12.527 12.989 13.413 13.822 14.311 14.868 15.408 15.961 16.503 17.068 17.641 18.265 18.977 19.696 20.517 21.349 22.246 23.226 24.303 25.415 26.477 26.79 26.5 26.05 25.534 24.904 24.235 23.58 22.966 22.305 21.728 21.183 20.606 20.061 19.536 19.029 18.459 17.943 17.5 16.998 16.451 15.983 15.5 14.994 14.587 14.158 13.701 13.226 12.727 12.367 11.982 11.381 10.95 10.49 10.262 9.775 9.239 8.613 8.289 7.626 7.255 6.876 6.455 5.54 5.035 4.455 3.804 3.039 2.107 0.8 -3.381 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt deleted file mode 100644 index 673c0bb8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23330-2qbq-_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4343 ,KEBNE ,16691102,Thu Nov 25 10:32:03 CET,Thu Nov 25 12:10:44 CET,0.0 1.95 2.678 3.205 3.662 4.131 4.579 4.977 5.615 5.885 6.151 6.308 6.892 7.115 7.537 7.917 8.27 8.447 8.811 9.167 9.648 9.935 10.222 10.645 11.033 11.414 11.794 12.177 12.679 13.134 13.548 14.049 14.539 14.984 15.477 16.047 16.603 17.178 17.759 18.387 19.024 19.715 20.501 21.252 22.129 23.034 24.052 25.189 26.373 27.511 28.479 28.807 28.697 28.382 27.854 27.204 26.571 25.963 25.396 24.771 24.181 23.6 23.015 22.459 21.933 21.442 20.881 20.374 19.922 19.456 19.004 18.59 18.13 17.645 17.251 16.836 16.41 15.948 15.443 15.096 14.74 14.167 13.772 13.356 13.132 12.664 12.186 11.669 11.377 10.738 10.461 10.12 9.768 8.973 8.508 7.982 7.359 6.671 5.877 4.743 0.731 -2 ,17851 ,KEBNE ,16690378,Thu Nov 25 08:12:00 CET,Thu Nov 25 08:13:20 CET,0.0 2.351 3.113 3.628 4.069 4.467 4.835 5.162 5.749 6.018 6.268 6.417 7.006 7.235 7.685 8.112 8.505 8.693 9.04 9.379 9.913 10.235 10.537 10.978 11.4 11.8 12.186 12.552 12.991 13.406 13.815 14.324 14.818 15.255 15.743 16.352 16.912 17.478 18.065 18.65 19.319 20.099 20.924 21.672 22.486 23.366 24.352 25.407 26.543 27.691 28.744 29.148 28.971 28.548 28.062 27.547 26.982 26.362 25.803 25.245 24.717 24.174 23.574 22.97 22.417 21.905 21.318 20.79 20.336 19.867 19.387 18.97 18.519 18.033 17.662 17.275 16.867 16.429 15.982 15.676 15.356 14.822 14.426 14.006 13.792 13.353 12.843 12.259 11.962 11.351 11.087 10.755 10.399 9.595 9.153 8.636 8.074 7.434 6.547 5.357 2.103 -3 ,30642 ,KEBNE ,16690379,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:13 CET,0.0 1.721 2.44 2.988 3.461 3.856 4.205 4.538 5.15 5.425 5.681 5.802 6.377 6.593 7.017 7.419 7.809 7.998 8.351 8.683 9.163 9.495 9.811 10.251 10.681 11.086 11.478 11.837 12.27 12.689 13.105 13.595 14.036 14.46 14.969 15.564 16.089 16.625 17.221 17.828 18.428 19.081 19.85 20.623 21.467 22.331 23.323 24.427 25.621 26.869 27.971 28.374 28.279 27.968 27.458 26.816 26.195 25.587 25.029 24.432 23.916 23.448 22.922 22.381 21.885 21.409 20.873 20.354 19.894 19.418 18.924 18.491 18.021 17.528 17.126 16.69 16.229 15.763 15.279 14.936 14.586 14.049 13.661 13.237 13.023 12.576 12.094 11.583 11.287 10.638 10.368 10.054 9.7 8.926 8.504 7.99 7.365 6.667 5.863 4.777 0.78 -4 ,10333 ,KEBNE ,16691105,Thu Nov 25 10:32:07 CET,Thu Nov 25 12:09:01 CET,0.0 1.686 2.484 3.084 3.548 3.957 4.323 4.676 5.347 5.652 5.93 6.103 6.691 6.899 7.306 7.717 8.125 8.326 8.692 9.044 9.523 9.822 10.143 10.599 11.012 11.409 11.784 12.161 12.648 13.1 13.539 14.047 14.524 14.97 15.484 16.034 16.553 17.171 17.796 18.419 19.07 19.83 20.688 21.484 22.39 23.333 24.369 25.434 26.575 27.762 28.823 29.213 29.131 28.731 28.114 27.465 26.834 26.225 25.67 25.029 24.428 23.824 23.218 22.655 22.107 21.594 21.063 20.588 20.167 19.71 19.188 18.744 18.302 17.844 17.461 17.067 16.648 16.184 15.704 15.376 15.038 14.477 14.06 13.627 13.411 12.95 12.437 11.896 11.61 10.974 10.671 10.33 9.965 9.143 8.681 8.168 7.602 6.933 6.152 5.072 0.91 -5 ,26365 ,KEBNE ,16690381,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:02 CET,0.0 2.98 3.981 4.7 5.213 5.631 6.062 6.474 7.095 7.366 7.629 7.778 8.366 8.596 9.031 9.423 9.812 9.999 10.347 10.694 11.158 11.448 11.754 12.223 12.68 13.107 13.504 13.887 14.393 14.853 15.269 15.784 16.275 16.745 17.264 17.836 18.379 18.962 19.559 20.163 20.794 21.515 22.331 23.07 23.906 24.792 25.768 26.844 28.011 29.215 30.251 30.672 30.55 30.153 29.676 29.094 28.49 27.886 27.314 26.687 26.096 25.538 25.009 24.455 23.904 23.392 22.855 22.396 21.981 21.507 20.998 20.575 20.112 19.624 19.244 18.835 18.394 17.961 17.5 17.161 16.82 16.279 15.861 15.416 15.19 14.698 14.163 13.612 13.342 12.719 12.428 12.078 11.706 10.917 10.48 10.015 9.453 8.747 7.94 6.803 3.162 -6 ,27933 ,KEBNE ,16691107,Thu Nov 25 10:32:03 CET,Thu Nov 25 12:08:59 CET,0.0 2.43 3.371 3.958 4.365 4.747 5.117 5.48 6.125 6.396 6.639 6.749 7.316 7.538 7.961 8.341 8.711 8.899 9.264 9.603 10.065 10.362 10.655 11.092 11.491 11.841 12.191 12.55 13.044 13.5 13.903 14.411 14.936 15.442 15.988 16.581 17.12 17.679 18.264 18.912 19.559 20.215 21.039 21.87 22.775 23.74 24.748 25.764 26.869 28.03 29.07 29.445 29.389 29.043 28.562 28.039 27.442 26.793 26.182 25.568 24.996 24.428 23.828 23.237 22.702 22.203 21.651 21.159 20.731 20.254 19.765 19.371 18.939 18.475 18.118 17.727 17.302 16.857 16.369 16.025 15.681 15.151 14.772 14.364 14.152 13.694 13.184 12.632 12.348 11.725 11.468 11.127 10.757 9.931 9.455 8.931 8.328 7.661 6.875 5.729 1.794 -7 ,5008 ,KEBNE ,16690383,Thu Nov 25 08:11:59 CET,Thu Nov 25 08:13:23 CET,0.0 1.796 2.504 3.071 3.56 3.974 4.328 4.664 5.248 5.516 5.79 5.93 6.515 6.754 7.207 7.613 8.003 8.201 8.607 8.991 9.49 9.798 10.093 10.492 10.878 11.272 11.638 11.992 12.464 12.914 13.375 13.923 14.416 14.885 15.387 15.911 16.407 16.958 17.54 18.18 18.871 19.602 20.429 21.225 22.08 23.026 24.075 25.099 26.198 27.404 28.567 29.013 28.875 28.474 27.934 27.319 26.699 26.052 25.431 24.748 24.123 23.543 22.983 22.436 21.896 21.354 20.804 20.327 19.865 19.369 18.874 18.459 18.013 17.532 17.133 16.719 16.277 15.798 15.286 14.92 14.547 13.972 13.578 13.176 12.969 12.492 11.953 11.415 11.129 10.475 10.13 9.768 9.412 8.677 8.229 7.702 7.164 6.543 5.758 4.674 1.475 -8 ,9920 ,KEBNE ,16690384,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:16 CET,0.0 2.175 2.864 3.435 3.917 4.348 4.743 5.098 5.679 5.927 6.171 6.346 6.936 7.161 7.573 7.948 8.316 8.503 8.868 9.21 9.678 9.982 10.281 10.725 11.157 11.552 11.934 12.302 12.769 13.231 13.647 14.139 14.641 15.089 15.594 16.192 16.722 17.298 17.923 18.548 19.197 19.887 20.666 21.464 22.379 23.353 24.439 25.59 26.854 28.092 29.155 29.657 29.565 29.176 28.661 28.08 27.511 26.896 26.324 25.714 25.114 24.567 24.034 23.48 22.933 22.44 21.893 21.386 20.927 20.428 19.909 19.473 19.02 18.538 18.154 17.747 17.321 16.863 16.378 16.059 15.729 15.185 14.797 14.373 14.146 13.675 13.143 12.567 12.279 11.641 11.328 10.964 10.571 9.736 9.263 8.769 8.24 7.584 6.767 5.658 2.359 -9 ,2806 ,KEBNE ,16691110,Thu Nov 25 10:33:06 CET,Thu Nov 25 12:12:39 CET,0.0 1.809 2.542 3.105 3.57 3.962 4.328 4.673 5.258 5.541 5.819 5.973 6.563 6.795 7.225 7.639 7.994 8.17 8.533 8.861 9.31 9.617 9.913 10.327 10.755 11.152 11.531 11.957 12.516 13.024 13.527 14.099 14.595 15.07 15.659 16.282 16.814 17.387 18.021 18.692 19.315 20.007 20.82 21.602 22.495 23.446 24.466 25.519 26.704 27.936 29.002 29.395 29.245 28.901 28.416 27.742 27.089 26.484 25.935 25.361 24.781 24.234 23.699 23.168 22.637 22.095 21.53 21.026 20.566 20.087 19.558 19.086 18.6 18.082 17.68 17.292 16.884 16.438 15.97 15.633 15.255 14.658 14.249 13.838 13.629 13.176 12.663 12.073 11.787 11.176 10.9 10.567 10.212 9.407 8.958 8.46 7.871 7.221 6.487 5.412 1.708 -10 ,14255 ,KEBNE ,16690386,Thu Nov 25 08:14:00 CET,Thu Nov 25 08:15:00 CET,0.0 1.701 2.514 3.169 3.689 4.102 4.453 4.778 5.402 5.691 5.96 6.12 6.708 6.952 7.441 7.883 8.275 8.463 8.818 9.159 9.657 9.969 10.263 10.673 11.088 11.483 11.858 12.22 12.667 13.098 13.52 14.026 14.537 15.038 15.548 16.117 16.66 17.211 17.79 18.372 18.974 19.678 20.479 21.247 22.12 23.045 24.022 25.008 26.022 27.089 28.124 28.559 28.379 27.95 27.418 26.792 26.123 25.491 24.894 24.267 23.691 23.126 22.606 22.101 21.581 21.074 20.513 20.017 19.586 19.122 18.627 18.198 17.746 17.253 16.876 16.491 16.062 15.606 15.129 14.813 14.482 13.916 13.506 13.062 12.834 12.38 11.894 11.357 11.069 10.439 10.155 9.828 9.451 8.582 8.138 7.665 7.125 6.515 5.765 4.596 -1.703 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23467_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23467_23466.txt deleted file mode 100644 index 8042408c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23467_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13523 ,KEBNE ,16691112,Thu Nov 25 10:33:06 CET,Thu Nov 25 12:05:14 CET,0.0 0.926 1.397 1.797 2.135 2.446 2.738 2.992 3.418 3.611 3.803 3.865 4.349 4.52 4.853 5.151 5.419 5.548 5.795 6.021 6.332 6.538 6.746 7.028 7.285 7.534 7.774 8.001 8.289 8.601 8.885 9.157 9.404 9.654 9.969 10.29 10.53 10.767 11.01 11.248 11.486 11.73 11.985 12.197 12.354 12.456 12.471 12.339 11.982 11.2 9.657 7.515 5.614 3.939 2.466 1.122 -0.064 -1.146 -2.099 -3.068 -3.922 -4.689 -5.433 -6.159 -6.836 -7.449 -8.078 -8.66 -9.188 -9.734 -10.291 -10.745 -11.237 -11.788 -12.201 -12.615 -13.068 -13.531 -13.989 -14.305 -14.65 -15.181 -15.542 -15.928 -16.129 -16.516 -16.934 -17.403 -17.649 -18.242 -18.468 -18.763 -19.073 -19.768 -20.144 -20.564 -21.036 -21.567 -22.205 -23.028 -25.039 -2 ,18238 ,KEBNE ,16690388,Thu Nov 25 08:14:00 CET,Thu Nov 25 08:14:58 CET,0.0 1.221 1.779 2.178 2.532 2.86 3.16 3.429 3.913 4.133 4.334 4.385 4.862 5.015 5.318 5.631 5.906 6.034 6.288 6.514 6.826 7.032 7.237 7.534 7.823 8.086 8.317 8.534 8.814 9.072 9.327 9.62 9.864 10.106 10.383 10.663 10.899 11.173 11.484 11.774 12.07 12.373 12.609 12.745 12.904 13.016 12.96 12.819 12.476 11.64 10.068 7.967 6.035 4.379 2.942 1.598 0.406 -0.665 -1.591 -2.511 -3.334 -4.087 -4.817 -5.549 -6.231 -6.837 -7.513 -8.117 -8.6 -9.105 -9.66 -10.125 -10.606 -11.115 -11.502 -11.903 -12.33 -12.787 -13.261 -13.594 -13.945 -14.479 -14.858 -15.252 -15.451 -15.855 -16.295 -16.787 -17.042 -17.638 -17.833 -18.123 -18.443 -19.126 -19.494 -19.906 -20.387 -20.952 -21.647 -22.558 -24.933 -3 ,24824 ,KEBNE ,16691114,Thu Nov 25 10:33:06 CET,Thu Nov 25 12:04:24 CET,0.0 1.276 1.879 2.309 2.659 2.982 3.269 3.527 3.985 4.196 4.395 4.454 4.941 5.117 5.434 5.712 5.985 6.121 6.396 6.673 7.078 7.319 7.513 7.785 8.074 8.372 8.647 8.875 9.164 9.448 9.701 10.008 10.283 10.512 10.746 10.977 11.195 11.45 11.736 11.981 12.189 12.432 12.707 12.929 13.091 13.201 13.258 13.168 12.866 12.071 10.373 8.143 6.197 4.502 3.01 1.663 0.478 -0.576 -1.502 -2.454 -3.303 -4.063 -4.772 -5.467 -6.119 -6.719 -7.366 -7.943 -8.439 -8.978 -9.566 -10.047 -10.534 -11.037 -11.423 -11.839 -12.289 -12.732 -13.172 -13.489 -13.829 -14.359 -14.73 -15.13 -15.336 -15.745 -16.185 -16.661 -16.911 -17.507 -17.713 -17.993 -18.302 -19.008 -19.391 -19.801 -20.243 -20.747 -21.354 -22.166 -24.345 -4 ,12320 ,KEBNE ,16691115,Thu Nov 25 10:33:05 CET,Thu Nov 25 12:02:28 CET,0.0 1.187 1.759 2.189 2.572 2.914 3.224 3.495 3.98 4.199 4.398 4.448 4.926 5.079 5.382 5.682 5.946 6.078 6.341 6.59 6.955 7.167 7.361 7.673 7.962 8.213 8.475 8.724 9.027 9.315 9.583 9.874 10.148 10.401 10.65 10.951 11.235 11.477 11.742 12.013 12.211 12.414 12.67 12.886 13.085 13.222 13.227 13.061 12.664 11.841 10.172 8.032 6.114 4.345 2.823 1.502 0.333 -0.753 -1.705 -2.684 -3.522 -4.274 -4.992 -5.682 -6.36 -6.989 -7.633 -8.193 -8.701 -9.249 -9.835 -10.322 -10.81 -11.338 -11.753 -12.164 -12.574 -13.016 -13.498 -13.834 -14.175 -14.711 -15.098 -15.492 -15.689 -16.09 -16.514 -16.982 -17.23 -17.826 -18.04 -18.338 -18.648 -19.326 -19.686 -20.072 -20.513 -21.007 -21.605 -22.449 -24.743 -5 ,13872 ,KEBNE ,16691116,Thu Nov 25 10:33:05 CET,Thu Nov 25 12:03:46 CET,0.0 1.544 2.134 2.561 2.902 3.199 3.49 3.748 4.224 4.439 4.626 4.684 5.178 5.335 5.618 5.904 6.179 6.3 6.544 6.783 7.089 7.29 7.496 7.789 8.054 8.306 8.535 8.732 8.994 9.249 9.499 9.785 10.037 10.311 10.64 10.966 11.267 11.556 11.812 12.05 12.277 12.492 12.73 12.967 13.172 13.285 13.315 13.189 12.834 12.132 10.601 8.424 6.548 4.915 3.462 2.084 0.862 -0.279 -1.299 -2.299 -3.14 -3.864 -4.571 -5.276 -5.933 -6.537 -7.176 -7.749 -8.245 -8.774 -9.327 -9.793 -10.295 -10.835 -11.237 -11.627 -12.057 -12.513 -12.979 -13.303 -13.643 -14.189 -14.564 -14.962 -15.178 -15.617 -16.059 -16.506 -16.75 -17.357 -17.586 -17.876 -18.166 -18.811 -19.192 -19.605 -20.068 -20.605 -21.174 -21.898 -23.953 -6 ,1894 ,KEBNE ,16690392,Thu Nov 25 08:14:00 CET,Thu Nov 25 08:15:07 CET,0.0 1.469 2.149 2.64 2.99 3.278 3.547 3.787 4.207 4.407 4.622 4.731 5.221 5.392 5.703 6.002 6.306 6.449 6.725 6.969 7.29 7.502 7.698 7.968 8.244 8.525 8.77 8.993 9.295 9.577 9.832 10.106 10.365 10.603 10.853 11.132 11.388 11.648 11.932 12.211 12.464 12.722 12.963 13.136 13.279 13.377 13.426 13.349 12.992 12.258 10.772 8.594 6.666 4.993 3.496 2.117 0.877 -0.261 -1.223 -2.225 -3.11 -3.891 -4.668 -5.389 -6.046 -6.657 -7.338 -7.957 -8.452 -8.984 -9.536 -9.975 -10.461 -10.988 -11.404 -11.826 -12.248 -12.691 -13.15 -13.487 -13.855 -14.398 -14.775 -15.19 -15.398 -15.802 -16.245 -16.731 -16.973 -17.559 -17.781 -18.079 -18.38 -19.039 -19.399 -19.794 -20.248 -20.732 -21.289 -22.103 -24.452 -7 ,23560 ,KEBNE ,16691118,Thu Nov 25 10:33:06 CET,Thu Nov 25 12:04:35 CET,0.0 1.134 1.664 2.092 2.449 2.744 2.999 3.244 3.699 3.903 4.102 4.156 4.638 4.796 5.1 5.371 5.628 5.765 6.027 6.252 6.549 6.752 6.953 7.237 7.507 7.755 7.993 8.217 8.48 8.706 8.93 9.224 9.496 9.735 9.998 10.293 10.554 10.812 11.106 11.388 11.633 11.84 12.036 12.281 12.498 12.613 12.653 12.53 12.221 11.524 9.953 7.821 5.968 4.298 2.776 1.352 0.057 -1.089 -2.088 -3.094 -3.961 -4.756 -5.49 -6.194 -6.854 -7.443 -8.075 -8.665 -9.18 -9.69 -10.213 -10.669 -11.141 -11.627 -12.018 -12.43 -12.871 -13.328 -13.797 -14.154 -14.524 -15.047 -15.423 -15.832 -16.039 -16.493 -16.972 -17.454 -17.725 -18.342 -18.574 -18.881 -19.224 -19.992 -20.38 -20.77 -21.197 -21.695 -22.247 -22.941 -24.859 -8 ,21692 ,KEBNE ,16690394,Thu Nov 25 08:14:00 CET,Thu Nov 25 08:15:22 CET,0.0 1.213 1.77 2.165 2.494 2.813 3.139 3.432 3.916 4.124 4.32 4.383 4.868 5.042 5.361 5.659 5.929 6.057 6.316 6.56 6.878 7.079 7.272 7.526 7.76 8.001 8.247 8.469 8.717 8.957 9.197 9.475 9.738 9.973 10.237 10.523 10.798 11.059 11.314 11.594 11.849 12.105 12.339 12.541 12.691 12.746 12.791 12.727 12.406 11.635 10.058 7.859 5.966 4.311 2.817 1.45 0.194 -0.955 -1.924 -2.865 -3.666 -4.43 -5.173 -5.892 -6.595 -7.223 -7.843 -8.398 -8.882 -9.389 -9.953 -10.428 -10.918 -11.456 -11.884 -12.315 -12.753 -13.201 -13.65 -13.962 -14.301 -14.823 -15.19 -15.581 -15.782 -16.205 -16.64 -17.098 -17.337 -17.919 -18.109 -18.389 -18.69 -19.356 -19.721 -20.107 -20.537 -21.058 -21.717 -22.507 -25.165 -9 ,28191 ,KEBNE ,16690395,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:23 CET,0.0 1.357 1.957 2.374 2.717 3.046 3.33 3.588 4.067 4.285 4.494 4.558 5.035 5.198 5.49 5.768 6.04 6.171 6.429 6.678 7.021 7.233 7.419 7.672 7.954 8.232 8.466 8.67 8.929 9.185 9.449 9.741 10.005 10.243 10.514 10.832 11.099 11.361 11.644 11.915 12.161 12.435 12.699 12.897 13.061 13.124 13.124 13.033 12.681 11.889 10.262 8.196 6.41 4.773 3.297 1.931 0.7 -0.4 -1.358 -2.329 -3.198 -4.023 -4.807 -5.515 -6.172 -6.789 -7.467 -8.071 -8.573 -9.099 -9.646 -10.109 -10.594 -11.11 -11.519 -11.966 -12.435 -12.897 -13.361 -13.687 -14.03 -14.562 -14.942 -15.33 -15.532 -15.956 -16.397 -16.849 -17.094 -17.709 -17.98 -18.283 -18.592 -19.269 -19.645 -20.064 -20.514 -21.016 -21.635 -22.506 -24.737 -10 ,23435 ,KEBNE ,16690396,Thu Nov 25 08:14:00 CET,Thu Nov 25 08:15:21 CET,0.0 0.997 1.492 1.902 2.245 2.546 2.829 3.089 3.537 3.746 3.942 3.974 4.45 4.603 4.896 5.168 5.417 5.547 5.816 6.063 6.386 6.585 6.782 7.066 7.342 7.604 7.853 8.082 8.384 8.677 8.928 9.218 9.482 9.74 10.024 10.32 10.573 10.848 11.161 11.426 11.657 11.928 12.195 12.358 12.509 12.626 12.643 12.496 12.193 11.464 9.79 7.576 5.603 3.91 2.468 1.142 -0.073 -1.218 -2.192 -3.126 -3.946 -4.704 -5.453 -6.17 -6.866 -7.494 -8.125 -8.713 -9.225 -9.749 -10.308 -10.789 -11.299 -11.831 -12.231 -12.64 -13.072 -13.524 -13.978 -14.28 -14.601 -15.103 -15.455 -15.833 -16.03 -16.439 -16.866 -17.316 -17.558 -18.144 -18.342 -18.632 -18.945 -19.641 -20.005 -20.387 -20.82 -21.367 -22.13 -23.213 -27.568 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23466.txt deleted file mode 100644 index a71d2328..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3836 ,KEBNE ,17025103,Wed Dec 22 11:50:03 CET,Wed Dec 22 13:20:24 CET,0.0 1.422 2.052 2.581 2.992 3.334 3.654 3.965 4.521 4.776 5.01 5.096 5.682 5.905 6.33 6.721 7.083 7.257 7.595 7.921 8.406 8.74 9.072 9.539 9.994 10.433 10.825 11.19 11.666 12.125 12.585 13.16 13.7 14.194 14.734 15.319 15.886 16.493 17.173 17.951 18.752 19.587 20.488 21.404 22.475 23.619 24.945 26.395 27.945 29.641 31.322 32.199 32.359 32.226 31.901 31.446 30.931 30.406 29.909 29.394 28.932 28.416 27.856 27.335 26.864 26.408 25.921 25.467 25.055 24.615 24.124 23.709 23.299 22.885 22.547 22.17 21.752 21.308 20.831 20.494 20.166 19.66 19.279 18.877 18.675 18.249 17.816 17.34 17.085 16.494 16.251 15.931 15.588 14.807 14.38 13.932 13.446 12.803 11.955 10.78 5.946 -2 ,19588 ,KEBNE ,17025104,Wed Dec 22 11:50:03 CET,Wed Dec 22 13:22:14 CET,0.0 1.287 1.913 2.376 2.748 3.092 3.427 3.726 4.263 4.531 4.804 4.973 5.557 5.783 6.239 6.654 7.04 7.221 7.573 7.891 8.336 8.63 8.934 9.366 9.765 10.174 10.579 10.964 11.42 11.844 12.267 12.762 13.233 13.706 14.271 14.926 15.526 16.154 16.86 17.569 18.277 19.101 20.107 21.104 22.184 23.36 24.686 26.086 27.59 29.258 31.019 31.995 32.234 32.15 31.884 31.44 30.92 30.363 29.838 29.295 28.769 28.272 27.765 27.213 26.705 26.251 25.75 25.307 24.928 24.519 24.035 23.62 23.22 22.776 22.417 22.046 21.649 21.241 20.796 20.468 20.125 19.585 19.22 18.854 18.659 18.216 17.744 17.262 16.995 16.385 16.177 15.854 15.477 14.582 14.096 13.602 13.069 12.44 11.616 10.504 6.333 -3 ,5482 ,KEBNE ,17025105,Wed Dec 22 11:50:03 CET,Wed Dec 22 13:22:41 CET,0.0 1.368 2.0 2.495 2.943 3.316 3.664 4.002 4.588 4.849 5.089 5.147 5.731 5.941 6.341 6.749 7.132 7.318 7.669 7.992 8.472 8.78 9.069 9.495 9.913 10.328 10.738 11.12 11.599 12.048 12.471 12.966 13.429 13.887 14.428 15.039 15.624 16.247 16.941 17.695 18.491 19.351 20.252 21.095 22.111 23.317 24.655 26.049 27.597 29.297 31.066 32.087 32.295 32.123 31.747 31.197 30.639 30.169 29.713 29.162 28.648 28.182 27.698 27.245 26.813 26.375 25.903 25.442 25.032 24.611 24.146 23.735 23.318 22.874 22.505 22.113 21.702 21.267 20.809 20.495 20.174 19.661 19.306 18.934 18.737 18.326 17.888 17.405 17.139 16.525 16.26 15.925 15.561 14.8 14.361 13.857 13.294 12.664 11.921 10.883 7.218 -4 ,17929 ,KEBNE ,17025106,Wed Dec 22 11:50:04 CET,Wed Dec 22 13:22:54 CET,0.0 1.655 2.32 2.83 3.242 3.62 3.969 4.302 4.896 5.16 5.41 5.519 6.101 6.308 6.7 7.067 7.421 7.591 7.923 8.248 8.737 9.06 9.352 9.772 10.18 10.574 10.958 11.315 11.777 12.231 12.648 13.146 13.644 14.13 14.699 15.317 15.876 16.487 17.16 17.894 18.63 19.417 20.343 21.259 22.302 23.439 24.763 26.187 27.75 29.457 31.213 32.196 32.354 32.145 31.763 31.34 30.951 30.483 29.968 29.431 28.922 28.408 27.913 27.43 26.972 26.566 26.108 25.683 25.304 24.881 24.388 23.958 23.539 23.109 22.771 22.407 22.017 21.624 21.206 20.903 20.576 20.052 19.685 19.314 19.116 18.686 18.238 17.74 17.483 16.88 16.626 16.298 15.936 15.15 14.717 14.229 13.664 12.989 12.127 11.067 7.312 -5 ,44 ,KEBNE ,17025107,Wed Dec 22 11:51:04 CET,Wed Dec 22 13:23:26 CET,0.0 1.199 1.813 2.302 2.7 3.061 3.391 3.695 4.284 4.564 4.82 4.94 5.509 5.718 6.14 6.525 6.901 7.102 7.487 7.843 8.344 8.641 8.934 9.366 9.785 10.187 10.583 10.962 11.435 11.903 12.364 12.918 13.428 13.874 14.383 14.969 15.536 16.169 16.82 17.522 18.247 19.038 19.952 20.857 21.939 23.141 24.451 25.86 27.379 29.095 30.943 32.024 32.294 32.131 31.768 31.306 30.827 30.338 29.864 29.302 28.773 28.301 27.839 27.377 26.886 26.396 25.889 25.435 25.039 24.622 24.156 23.762 23.352 22.884 22.512 22.12 21.697 21.249 20.789 20.472 20.144 19.611 19.23 18.836 18.634 18.227 17.786 17.319 17.062 16.446 16.202 15.876 15.522 14.746 14.305 13.814 13.273 12.632 11.835 10.739 6.614 -6 ,24285 ,KEBNE ,17025108,Wed Dec 22 11:51:05 CET,Wed Dec 22 13:22:53 CET,0.0 1.565 2.217 2.687 3.114 3.497 3.835 4.131 4.679 4.942 5.195 5.273 5.868 6.094 6.476 6.829 7.182 7.365 7.725 8.069 8.562 8.867 9.17 9.597 9.999 10.384 10.766 11.156 11.647 12.093 12.506 13.016 13.508 13.963 14.5 15.125 15.706 16.325 16.967 17.644 18.416 19.287 20.229 21.169 22.276 23.469 24.797 26.238 27.818 29.511 31.252 32.234 32.477 32.33 31.985 31.547 31.09 30.629 30.165 29.661 29.19 28.728 28.24 27.76 27.322 26.882 26.378 25.915 25.471 25.033 24.608 24.221 23.776 23.291 22.92 22.534 22.13 21.706 21.283 20.976 20.63 20.094 19.728 19.361 19.164 18.748 18.302 17.787 17.506 16.879 16.601 16.279 15.93 15.117 14.681 14.205 13.643 12.981 12.135 11.048 7.112 -7 ,6336 ,KEBNE ,17025109,Wed Dec 22 11:52:08 CET,Wed Dec 22 13:23:05 CET,0.0 1.295 1.907 2.369 2.774 3.149 3.506 3.831 4.404 4.662 4.913 5.052 5.653 5.875 6.262 6.624 6.989 7.164 7.5 7.835 8.31 8.624 8.933 9.393 9.835 10.248 10.646 11.009 11.475 11.929 12.358 12.866 13.346 13.801 14.337 14.943 15.514 16.142 16.831 17.542 18.247 19.052 19.969 20.864 21.944 23.117 24.435 25.885 27.512 29.222 30.88 31.815 32.012 31.877 31.502 31.043 30.545 30.015 29.508 28.949 28.491 28.033 27.533 27.057 26.61 26.159 25.646 25.188 24.798 24.387 23.94 23.54 23.114 22.679 22.336 21.967 21.554 21.119 20.621 20.257 19.904 19.358 18.976 18.603 18.417 18.005 17.559 17.067 16.802 16.192 15.925 15.616 15.286 14.519 14.074 13.583 13.037 12.423 11.687 10.639 6.877 -8 ,723 ,KEBNE ,17025110,Wed Dec 22 11:53:10 CET,Wed Dec 22 13:23:27 CET,0.0 1.219 1.877 2.376 2.776 3.123 3.438 3.732 4.304 4.572 4.829 4.924 5.496 5.707 6.141 6.547 6.894 7.067 7.407 7.745 8.269 8.592 8.898 9.361 9.786 10.176 10.555 10.932 11.433 11.908 12.341 12.871 13.361 13.811 14.338 14.936 15.497 16.108 16.776 17.472 18.207 19.034 19.973 20.87 21.883 23.023 24.315 25.724 27.296 28.976 30.617 31.592 31.841 31.699 31.405 30.966 30.46 29.929 29.435 28.93 28.459 27.972 27.478 26.964 26.461 26.019 25.526 25.07 24.685 24.274 23.797 23.405 22.977 22.515 22.162 21.806 21.436 20.978 20.454 20.113 19.79 19.277 18.921 18.538 18.329 17.875 17.392 16.916 16.662 16.057 15.801 15.476 15.116 14.329 13.886 13.4 12.856 12.216 11.45 10.414 6.426 -9 ,25988 ,KEBNE ,17025111,Wed Dec 22 11:53:10 CET,Wed Dec 22 13:23:34 CET,0.0 1.418 2.081 2.61 3.024 3.388 3.719 4.029 4.584 4.834 5.085 5.208 5.786 5.998 6.404 6.795 7.151 7.325 7.674 8.01 8.488 8.806 9.112 9.535 9.932 10.307 10.684 11.058 11.543 12.005 12.431 12.94 13.434 13.898 14.425 15.023 15.594 16.22 16.939 17.698 18.43 19.214 20.112 21.019 22.047 23.162 24.402 25.777 27.373 29.122 30.887 31.928 32.188 32.041 31.784 31.458 31.058 30.605 30.121 29.597 29.106 28.625 28.145 27.635 27.131 26.666 26.144 25.662 25.267 24.857 24.376 23.974 23.552 23.089 22.725 22.339 21.939 21.502 21.048 20.744 20.421 19.877 19.503 19.122 18.923 18.509 18.037 17.528 17.263 16.651 16.405 16.088 15.75 15.009 14.597 14.143 13.589 12.93 12.105 10.971 5.865 -10 ,13080 ,KEBNE ,17025112,Wed Dec 22 11:53:09 CET,Wed Dec 22 13:23:32 CET,0.0 1.755 2.471 2.931 3.288 3.654 4.016 4.361 5.011 5.286 5.53 5.644 6.232 6.445 6.862 7.249 7.606 7.79 8.142 8.481 8.977 9.278 9.567 10.0 10.42 10.819 11.202 11.573 12.055 12.527 12.979 13.507 13.998 14.465 14.972 15.573 16.179 16.817 17.473 18.151 18.898 19.693 20.601 21.54 22.579 23.731 25.072 26.485 27.997 29.698 31.577 32.681 32.945 32.834 32.531 32.14 31.65 31.108 30.646 30.173 29.705 29.208 28.7 28.216 27.759 27.329 26.857 26.396 25.982 25.553 25.11 24.738 24.333 23.89 23.54 23.173 22.789 22.391 21.958 21.642 21.313 20.796 20.429 20.055 19.862 19.462 19.027 18.544 18.283 17.659 17.38 17.063 16.727 15.987 15.557 15.081 14.537 13.924 13.181 12.034 7.601 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23467.txt deleted file mode 100644 index f29f0fe8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23468_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22465 ,KEBNE ,17069888,Fri Dec 24 12:28:35 CET,Fri Dec 24 14:02:33 CET,0.0 1.558 2.28 2.831 3.371 3.885 4.295 4.66 5.286 5.578 5.879 6.089 6.722 6.979 7.478 7.948 8.381 8.602 9.034 9.451 10.064 10.434 10.789 11.316 11.843 12.357 12.829 13.298 13.927 14.509 15.07 15.779 16.472 17.135 17.856 18.636 19.408 20.258 21.158 22.119 23.158 24.348 25.701 27.041 28.61 30.33 32.307 34.535 37.104 40.111 43.702 46.476 47.977 48.812 49.162 49.297 49.313 49.261 49.09 48.841 48.575 48.244 47.904 47.536 47.174 46.86 46.49 46.128 45.793 45.444 45.089 44.755 44.382 44.019 43.73 43.403 43.075 42.722 42.319 42.048 41.774 41.348 41.049 40.726 40.556 40.196 39.813 39.374 39.128 38.562 38.333 38.048 37.752 37.106 36.736 36.335 35.853 35.245 34.571 33.713 31.119 -2 ,2485 ,KEBNE ,17069889,Fri Dec 24 12:31:47 CET,Fri Dec 24 14:02:11 CET,0.0 1.594 2.339 2.935 3.405 3.844 4.24 4.62 5.347 5.689 6.007 6.22 6.862 7.138 7.666 8.168 8.638 8.869 9.314 9.734 10.334 10.715 11.104 11.653 12.138 12.62 13.092 13.535 14.122 14.697 15.248 15.923 16.57 17.194 17.928 18.748 19.521 20.374 21.32 22.319 23.343 24.528 25.894 27.205 28.736 30.482 32.488 34.709 37.401 40.592 44.216 46.995 48.486 49.359 49.766 49.887 49.89 49.756 49.557 49.333 49.095 48.836 48.548 48.208 47.845 47.489 47.122 46.794 46.481 46.134 45.781 45.475 45.103 44.749 44.485 44.182 43.862 43.505 43.113 42.838 42.551 42.102 41.795 41.476 41.292 40.905 40.522 40.102 39.887 39.356 39.201 38.943 38.654 37.999 37.62 37.191 36.686 36.077 35.456 34.694 32.483 -3 ,16105 ,KEBNE ,17069890,Fri Dec 24 12:35:00 CET,Fri Dec 24 14:07:26 CET,0.0 1.571 2.275 2.822 3.304 3.749 4.146 4.51 5.187 5.494 5.789 6.002 6.632 6.876 7.373 7.854 8.288 8.501 8.924 9.308 9.853 10.227 10.587 11.113 11.66 12.184 12.659 13.095 13.646 14.203 14.743 15.369 15.974 16.565 17.239 18.036 18.84 19.69 20.596 21.575 22.641 23.827 25.116 26.427 27.984 29.712 31.766 34.068 36.711 39.84 43.454 46.211 47.659 48.472 48.93 49.162 49.208 49.139 48.988 48.761 48.56 48.334 48.054 47.723 47.386 47.091 46.735 46.379 46.045 45.692 45.336 45.003 44.629 44.258 43.959 43.626 43.293 42.95 42.583 42.327 42.06 41.613 41.288 40.941 40.76 40.361 39.91 39.441 39.207 38.653 38.451 38.16 37.836 37.149 36.787 36.365 35.884 35.355 34.677 33.772 30.778 -4 ,5850 ,KEBNE ,17069891,Fri Dec 24 12:35:00 CET,Fri Dec 24 14:05:24 CET,0.0 1.698 2.442 3.081 3.609 4.037 4.43 4.806 5.532 5.869 6.189 6.438 7.093 7.36 7.85 8.313 8.763 8.976 9.375 9.766 10.343 10.724 11.11 11.661 12.171 12.653 13.134 13.605 14.198 14.773 15.335 16.022 16.681 17.308 18.042 18.908 19.723 20.598 21.513 22.464 23.493 24.601 25.889 27.226 28.822 30.593 32.537 34.751 37.417 40.555 44.185 46.931 48.446 49.239 49.615 49.822 49.828 49.679 49.469 49.273 49.079 48.85 48.585 48.3 47.975 47.631 47.283 46.975 46.655 46.284 45.892 45.561 45.224 44.841 44.535 44.236 43.922 43.596 43.258 43.015 42.744 42.317 42.03 41.696 41.518 41.162 40.782 40.361 40.139 39.593 39.386 39.11 38.807 38.133 37.761 37.354 36.9 36.342 35.652 34.717 31.231 -5 ,10843 ,KEBNE ,17069892,Fri Dec 24 12:38:11 CET,Fri Dec 24 14:10:09 CET,0.0 1.826 2.595 3.18 3.666 4.096 4.501 4.862 5.51 5.806 6.098 6.309 6.945 7.193 7.655 8.103 8.558 8.787 9.227 9.649 10.244 10.624 10.987 11.517 12.042 12.543 13.024 13.475 14.036 14.586 15.152 15.844 16.479 17.098 17.86 18.703 19.484 20.325 21.244 22.229 23.202 24.301 25.588 26.819 28.225 29.846 31.779 33.948 36.53 39.621 43.243 46.057 47.498 48.346 48.837 49.031 49.019 48.932 48.793 48.51 48.215 47.941 47.636 47.313 46.95 46.607 46.255 45.907 45.594 45.253 44.883 44.585 44.264 43.903 43.606 43.303 43.004 42.678 42.307 42.043 41.752 41.272 40.944 40.609 40.44 40.073 39.668 39.245 39.013 38.451 38.248 37.961 37.66 36.979 36.591 36.181 35.707 35.083 34.357 33.391 30.157 -6 ,6864 ,KEBNE ,17069893,Fri Dec 24 12:38:11 CET,Fri Dec 24 14:08:38 CET,0.0 1.473 2.168 2.726 3.19 3.637 4.043 4.411 5.104 5.416 5.709 5.91 6.536 6.793 7.313 7.788 8.22 8.442 8.857 9.249 9.822 10.193 10.556 11.07 11.569 12.059 12.559 13.048 13.647 14.223 14.789 15.471 16.113 16.743 17.47 18.29 19.093 19.936 20.844 21.8 22.793 23.95 25.274 26.54 28.02 29.686 31.632 33.815 36.371 39.534 43.203 45.989 47.491 48.413 48.875 49.021 49.006 48.863 48.651 48.431 48.214 47.932 47.629 47.343 47.03 46.694 46.307 45.951 45.636 45.271 44.893 44.589 44.246 43.888 43.591 43.259 42.922 42.574 42.157 41.847 41.544 41.041 40.673 40.298 40.102 39.721 39.318 38.864 38.643 38.101 37.872 37.586 37.298 36.671 36.309 35.904 35.427 34.86 34.21 33.392 30.809 -7 ,14701 ,KEBNE ,17069894,Fri Dec 24 12:39:15 CET,Fri Dec 24 14:11:02 CET,0.0 1.788 2.57 3.158 3.646 4.089 4.495 4.866 5.515 5.814 6.1 6.306 6.956 7.225 7.735 8.222 8.676 8.906 9.355 9.777 10.403 10.785 11.124 11.643 12.158 12.65 13.142 13.624 14.235 14.82 15.361 16.001 16.625 17.219 17.913 18.714 19.486 20.347 21.303 22.306 23.346 24.5 25.822 27.182 28.776 30.523 32.544 34.751 37.261 40.289 43.962 46.809 48.209 49.006 49.498 49.733 49.755 49.62 49.437 49.228 48.985 48.733 48.501 48.222 47.922 47.634 47.286 46.964 46.667 46.328 45.931 45.597 45.262 44.883 44.592 44.291 43.949 43.587 43.201 42.93 42.644 42.168 41.845 41.504 41.331 40.984 40.583 40.146 39.914 39.367 39.156 38.861 38.557 37.896 37.488 37.045 36.583 36.069 35.42 34.465 32.135 -8 ,14138 ,KEBNE ,17069895,Fri Dec 24 12:40:18 CET,Fri Dec 24 14:11:44 CET,0.0 1.794 2.488 3.048 3.528 3.956 4.33 4.685 5.364 5.665 5.958 6.181 6.802 7.049 7.531 7.998 8.441 8.656 9.058 9.428 9.981 10.353 10.709 11.217 11.704 12.174 12.648 13.116 13.712 14.282 14.85 15.531 16.164 16.784 17.504 18.308 19.074 19.906 20.805 21.773 22.793 23.954 25.373 26.808 28.473 30.292 32.302 34.602 37.325 40.48 44.071 46.897 48.495 49.374 49.83 49.981 49.954 49.828 49.649 49.376 49.046 48.729 48.389 48.045 47.701 47.367 47.024 46.709 46.43 46.11 45.751 45.428 45.079 44.74 44.447 44.114 43.786 43.429 43.039 42.781 42.51 42.055 41.738 41.387 41.2 40.813 40.385 39.949 39.727 39.172 38.953 38.673 38.379 37.737 37.37 36.943 36.447 35.899 35.241 34.334 31.523 -9 ,4196 ,KEBNE ,17069896,Fri Dec 24 12:41:20 CET,Fri Dec 24 14:13:58 CET,0.0 1.808 2.565 3.111 3.599 4.042 4.463 4.842 5.52 5.827 6.126 6.351 6.983 7.258 7.814 8.335 8.811 9.04 9.473 9.89 10.479 10.843 11.185 11.712 12.246 12.745 13.225 13.693 14.264 14.802 15.32 15.94 16.535 17.107 17.801 18.612 19.407 20.285 21.208 22.187 23.229 24.391 25.775 27.19 28.768 30.476 32.45 34.599 37.102 40.144 43.76 46.62 48.176 48.962 49.29 49.473 49.519 49.392 49.177 48.919 48.664 48.412 48.18 47.919 47.608 47.288 46.9 46.528 46.214 45.888 45.531 45.202 44.851 44.497 44.207 43.895 43.56 43.214 42.842 42.57 42.282 41.824 41.495 41.147 40.97 40.594 40.177 39.682 39.43 38.876 38.679 38.407 38.099 37.353 36.962 36.563 36.122 35.603 34.951 34.01 31.125 -10 ,19854 ,KEBNE ,17069897,Fri Dec 24 12:42:23 CET,Fri Dec 24 14:12:58 CET,0.0 1.731 2.508 3.159 3.681 4.121 4.526 4.9 5.576 5.893 6.197 6.407 7.043 7.32 7.84 8.333 8.785 9.001 9.425 9.833 10.418 10.79 11.157 11.688 12.197 12.693 13.165 13.618 14.212 14.792 15.352 16.024 16.66 17.27 17.995 18.842 19.647 20.524 21.484 22.5 23.553 24.721 26.077 27.472 29.101 30.858 32.821 34.941 37.373 40.315 43.843 46.67 48.209 49.033 49.392 49.507 49.483 49.383 49.24 49.029 48.787 48.495 48.176 47.895 47.626 47.338 47.013 46.698 46.406 46.091 45.76 45.444 45.081 44.716 44.426 44.09 43.739 43.408 43.055 42.807 42.546 42.12 41.83 41.497 41.316 40.942 40.536 40.11 39.879 39.31 39.048 38.763 38.456 37.766 37.398 37.015 36.585 36.024 35.29 34.36 31.913 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index 29ef4341..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5037 ,KEBNE ,16690397,Thu Nov 25 08:14:05 CET,Thu Nov 25 08:15:20 CET,0.0 1.438 2.093 2.604 3.038 3.432 3.772 4.069 4.641 4.924 5.186 5.289 5.846 6.061 6.475 6.884 7.261 7.433 7.783 8.132 8.632 8.929 9.206 9.595 9.947 10.308 10.677 11.025 11.47 11.883 12.272 12.735 13.187 13.619 14.114 14.65 15.147 15.69 16.25 16.876 17.525 18.209 19.034 19.793 20.606 21.461 22.326 23.213 24.193 25.119 25.575 25.246 24.545 23.673 22.834 22.003 21.2 20.443 19.766 19.048 18.384 17.784 17.222 16.659 16.084 15.53 14.938 14.42 13.981 13.526 13.037 12.624 12.195 11.731 11.37 11.006 10.622 10.206 9.773 9.478 9.171 8.683 8.339 7.973 7.791 7.415 7.0 6.575 6.357 5.773 5.544 5.268 4.98 4.303 3.924 3.537 3.126 2.666 2.129 1.443 0.163 -2 ,18221 ,KEBNE ,16691123,Thu Nov 25 10:33:05 CET,Thu Nov 25 12:07:37 CET,0.0 1.473 2.24 2.828 3.274 3.639 3.961 4.26 4.855 5.135 5.395 5.515 6.072 6.282 6.68 7.057 7.446 7.631 7.971 8.304 8.82 9.147 9.444 9.869 10.286 10.688 11.069 11.422 11.862 12.303 12.737 13.269 13.77 14.235 14.751 15.328 15.897 16.503 17.162 17.865 18.603 19.417 20.334 21.233 22.26 23.376 24.613 25.978 27.464 28.999 30.405 30.936 30.799 30.416 29.933 29.367 28.784 28.179 27.583 26.947 26.38 25.804 25.198 24.635 24.097 23.609 23.102 22.628 22.218 21.795 21.318 20.913 20.501 20.056 19.688 19.292 18.884 18.44 17.972 17.664 17.35 16.814 16.415 16.02 15.821 15.386 14.932 14.478 14.231 13.633 13.419 13.116 12.785 12.054 11.644 11.204 10.699 10.145 9.475 8.524 3.521 -3 ,17352 ,KEBNE ,16690399,Thu Nov 25 08:14:09 CET,Thu Nov 25 08:15:15 CET,0.0 1.528 2.297 2.922 3.442 3.871 4.225 4.576 5.233 5.536 5.827 6.031 6.634 6.865 7.291 7.687 8.072 8.255 8.601 8.953 9.46 9.758 10.046 10.451 10.825 11.207 11.564 11.901 12.348 12.771 13.183 13.702 14.181 14.612 15.105 15.645 16.168 16.731 17.332 17.991 18.646 19.346 20.141 20.93 21.83 22.737 23.778 24.878 25.908 26.851 27.496 27.331 26.647 25.821 24.995 24.162 23.382 22.625 21.923 21.186 20.51 19.896 19.282 18.677 18.118 17.601 17.019 16.479 16.008 15.551 15.1 14.696 14.262 13.806 13.442 13.061 12.678 12.274 11.828 11.519 11.203 10.716 10.378 10.013 9.824 9.437 9.023 8.565 8.318 7.739 7.559 7.275 6.974 6.342 5.993 5.611 5.193 4.73 4.206 3.547 2.206 -4 ,7083 ,KEBNE ,16691125,Thu Nov 25 10:33:05 CET,Thu Nov 25 12:07:54 CET,0.0 1.171 1.822 2.363 2.785 3.163 3.519 3.83 4.409 4.677 4.921 5.042 5.608 5.828 6.265 6.682 7.062 7.239 7.583 7.905 8.363 8.653 8.931 9.342 9.747 10.123 10.468 10.81 11.264 11.696 12.098 12.566 13.006 13.426 13.909 14.464 14.976 15.507 16.059 16.639 17.256 17.926 18.695 19.451 20.291 21.135 22.036 23.014 24.047 24.994 25.494 25.108 24.357 23.527 22.683 21.867 21.047 20.217 19.494 18.762 18.108 17.51 16.923 16.349 15.807 15.29 14.718 14.194 13.753 13.305 12.827 12.42 11.994 11.544 11.179 10.784 10.372 9.969 9.552 9.235 8.927 8.456 8.114 7.751 7.563 7.173 6.763 6.34 6.101 5.514 5.309 5.016 4.698 4.001 3.617 3.208 2.791 2.329 1.724 0.953 -0.547 -5 ,12680 ,KEBNE ,16690401,Thu Nov 25 08:14:09 CET,Thu Nov 25 08:15:11 CET,0.0 1.499 2.139 2.634 3.054 3.413 3.757 4.088 4.695 4.98 5.229 5.363 5.937 6.168 6.601 7.012 7.414 7.596 7.927 8.249 8.698 8.984 9.275 9.685 10.075 10.451 10.798 11.132 11.561 11.961 12.348 12.824 13.278 13.713 14.194 14.732 15.246 15.779 16.354 16.941 17.525 18.212 18.959 19.648 20.475 21.377 22.426 23.51 24.475 25.275 25.687 25.371 24.685 23.859 23.019 22.166 21.327 20.469 19.711 18.974 18.298 17.671 17.084 16.538 15.986 15.458 14.96 14.509 14.075 13.614 13.137 12.718 12.274 11.825 11.48 11.105 10.694 10.285 9.868 9.554 9.231 8.762 8.419 8.068 7.892 7.511 7.09 6.619 6.378 5.815 5.652 5.38 5.1 4.48 4.144 3.784 3.368 2.885 2.332 1.619 0.095 -6 ,23441 ,KEBNE ,16691127,Thu Nov 25 10:34:07 CET,Thu Nov 25 12:07:02 CET,0.0 1.205 1.831 2.31 2.74 3.109 3.43 3.729 4.306 4.562 4.811 4.956 5.522 5.739 6.142 6.531 6.896 7.071 7.412 7.742 8.202 8.469 8.742 9.155 9.525 9.864 10.189 10.53 10.97 11.391 11.803 12.273 12.728 13.163 13.672 14.217 14.703 15.249 15.833 16.421 17.018 17.687 18.429 19.133 19.901 20.731 21.631 22.587 23.533 24.435 25.069 24.813 24.067 23.184 22.361 21.548 20.735 19.918 19.138 18.336 17.638 17.006 16.411 15.838 15.275 14.766 14.225 13.728 13.313 12.871 12.376 11.939 11.458 10.943 10.553 10.171 9.778 9.378 8.963 8.658 8.34 7.866 7.527 7.153 6.963 6.574 6.164 5.737 5.5 4.904 4.697 4.42 4.121 3.497 3.175 2.799 2.359 1.878 1.304 0.55 -1.058 -7 ,14349 ,KEBNE ,16691128,Thu Nov 25 10:34:08 CET,Thu Nov 25 12:08:15 CET,0.0 1.132 1.728 2.254 2.727 3.124 3.468 3.771 4.318 4.564 4.805 4.958 5.522 5.728 6.129 6.508 6.867 7.04 7.367 7.679 8.141 8.437 8.711 9.092 9.452 9.807 10.162 10.516 10.992 11.434 11.84 12.327 12.776 13.21 13.72 14.266 14.779 15.336 15.931 16.586 17.228 17.852 18.518 19.195 20.02 20.908 21.838 22.806 23.803 24.71 25.238 25.014 24.369 23.486 22.626 21.797 20.993 20.248 19.592 18.946 18.385 17.78 17.141 16.557 16.016 15.509 14.964 14.452 13.991 13.523 13.066 12.696 12.277 11.819 11.455 11.068 10.682 10.293 9.884 9.587 9.275 8.783 8.416 8.031 7.848 7.464 7.045 6.603 6.377 5.811 5.638 5.355 5.044 4.362 3.976 3.564 3.13 2.661 2.109 1.391 -0.018 -8 ,7002 ,KEBNE ,16691129,Thu Nov 25 10:34:09 CET,Thu Nov 25 12:10:49 CET,0.0 1.635 2.346 2.944 3.433 3.87 4.276 4.62 5.231 5.518 5.787 5.953 6.558 6.794 7.238 7.675 8.07 8.261 8.649 9.006 9.48 9.78 10.068 10.49 10.908 11.295 11.656 12.014 12.472 12.897 13.297 13.768 14.227 14.667 15.155 15.68 16.17 16.704 17.304 17.948 18.571 19.266 20.098 20.883 21.727 22.584 23.496 24.4 25.305 26.203 26.734 26.329 25.615 24.86 24.047 23.218 22.448 21.709 21.022 20.29 19.632 19.023 18.416 17.831 17.276 16.755 16.235 15.801 15.425 15.02 14.573 14.191 13.799 13.385 13.041 12.647 12.226 11.801 11.365 11.076 10.776 10.267 9.924 9.568 9.369 8.968 8.548 8.107 7.874 7.295 7.074 6.77 6.454 5.782 5.414 5.009 4.59 4.148 3.613 2.927 1.694 -9 ,31871 ,KEBNE ,16691130,Thu Nov 25 10:34:08 CET,Thu Nov 25 12:10:24 CET,0.0 1.377 2.046 2.581 3.044 3.428 3.764 4.085 4.66 4.908 5.157 5.302 5.884 6.12 6.535 6.892 7.219 7.386 7.745 8.094 8.6 8.919 9.211 9.627 10.027 10.408 10.78 11.146 11.616 12.08 12.517 13.03 13.557 14.061 14.598 15.194 15.755 16.338 16.967 17.652 18.364 19.119 19.951 20.836 21.896 23.018 24.209 25.459 26.844 28.239 29.487 30.011 29.953 29.646 29.158 28.555 27.902 27.125 26.366 25.662 25.041 24.475 23.924 23.334 22.764 22.259 21.729 21.238 20.796 20.297 19.76 19.35 18.924 18.474 18.135 17.759 17.377 16.99 16.592 16.319 16.034 15.592 15.25 14.889 14.697 14.288 13.875 13.441 13.213 12.633 12.42 12.125 11.808 11.162 10.817 10.465 10.091 9.637 9.06 8.292 6.391 -10 ,5847 ,KEBNE ,16690406,Thu Nov 25 08:14:00 CET,Thu Nov 25 08:14:58 CET,0.0 1.206 1.797 2.271 2.679 3.043 3.389 3.722 4.305 4.574 4.828 4.952 5.509 5.712 6.103 6.481 6.854 7.032 7.357 7.681 8.161 8.487 8.81 9.23 9.603 9.968 10.341 10.698 11.125 11.529 11.93 12.396 12.828 13.23 13.706 14.239 14.728 15.269 15.837 16.455 17.105 17.801 18.591 19.351 20.196 21.101 22.104 23.134 24.138 25.019 25.66 25.516 24.845 24.035 23.223 22.429 21.655 20.904 20.235 19.553 18.934 18.333 17.734 17.155 16.61 16.104 15.574 15.086 14.635 14.175 13.688 13.273 12.861 12.424 12.073 11.702 11.303 10.879 10.43 10.128 9.824 9.354 9.025 8.665 8.479 8.098 7.696 7.26 7.03 6.452 6.285 6.03 5.755 5.1 4.7 4.244 3.761 3.279 2.72 2.028 0.594 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23468.txt deleted file mode 100644 index da96887a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20554 ,KEBNE ,17025113,Wed Dec 22 11:54:13 CET,Wed Dec 22 13:26:37 CET,0.0 1.741 2.469 3.03 3.506 3.925 4.313 4.672 5.305 5.576 5.822 5.941 6.507 6.719 7.128 7.52 7.886 8.054 8.389 8.701 9.123 9.388 9.641 10.009 10.36 10.688 11.003 11.306 11.676 12.022 12.355 12.762 13.15 13.523 13.927 14.35 14.76 15.18 15.576 15.955 16.311 16.705 17.162 17.531 17.879 18.217 18.475 18.545 18.433 17.996 16.756 14.843 13.051 11.414 9.91 8.506 7.268 6.114 5.045 3.961 3.027 2.169 1.329 0.556 -0.146 -0.795 -1.471 -2.1 -2.664 -3.245 -3.85 -4.364 -4.909 -5.469 -5.894 -6.354 -6.837 -7.33 -7.844 -8.197 -8.562 -9.168 -9.626 -10.103 -10.336 -10.81 -11.309 -11.839 -12.118 -12.768 -13.062 -13.404 -13.774 -14.579 -15.041 -15.533 -16.044 -16.662 -17.394 -18.382 -21.957 -2 ,20267 ,KEBNE ,17025114,Wed Dec 22 11:54:12 CET,Wed Dec 22 13:28:48 CET,0.0 1.376 2.056 2.597 3.063 3.468 3.827 4.149 4.699 4.96 5.23 5.427 6.003 6.207 6.605 6.981 7.352 7.531 7.855 8.16 8.611 8.901 9.177 9.552 9.908 10.248 10.559 10.85 11.244 11.621 11.965 12.394 12.8 13.181 13.594 14.012 14.385 14.765 15.174 15.588 15.984 16.427 16.88 17.23 17.574 17.856 18.076 18.177 18.052 17.532 16.148 14.125 12.25 10.524 8.939 7.504 6.274 5.138 4.107 3.047 2.154 1.377 0.605 -0.184 -0.945 -1.63 -2.341 -3.016 -3.641 -4.288 -4.948 -5.47 -6.012 -6.571 -6.983 -7.422 -7.908 -8.417 -8.942 -9.327 -9.743 -10.387 -10.817 -11.264 -11.498 -11.978 -12.485 -13.035 -13.317 -13.975 -14.276 -14.612 -14.966 -15.747 -16.186 -16.651 -17.158 -17.726 -18.402 -19.334 -22.341 -3 ,3270 ,KEBNE ,17025115,Wed Dec 22 11:54:12 CET,Wed Dec 22 13:26:49 CET,0.0 2.248 2.934 3.446 3.903 4.335 4.721 5.045 5.616 5.89 6.141 6.24 6.794 6.993 7.372 7.747 8.119 8.29 8.611 8.922 9.358 9.625 9.877 10.244 10.599 10.944 11.259 11.556 11.952 12.314 12.666 13.079 13.442 13.772 14.119 14.498 14.854 15.232 15.647 16.058 16.448 16.864 17.322 17.725 18.071 18.318 18.456 18.47 18.399 17.923 16.528 14.504 12.611 10.893 9.415 8.037 6.749 5.57 4.554 3.514 2.589 1.752 0.953 0.198 -0.514 -1.206 -1.962 -2.645 -3.234 -3.83 -4.437 -4.935 -5.484 -6.068 -6.518 -7.001 -7.476 -7.965 -8.489 -8.845 -9.228 -9.832 -10.254 -10.709 -10.947 -11.435 -11.961 -12.519 -12.81 -13.469 -13.694 -14.017 -14.366 -15.126 -15.545 -16.0 -16.504 -17.109 -17.884 -18.989 -21.758 -4 ,10194 ,KEBNE ,17025116,Wed Dec 22 11:54:12 CET,Wed Dec 22 13:27:36 CET,0.0 1.969 2.668 3.195 3.661 4.073 4.42 4.746 5.355 5.647 5.929 6.082 6.642 6.847 7.25 7.631 7.989 8.163 8.49 8.791 9.227 9.527 9.81 10.204 10.609 10.99 11.33 11.659 12.101 12.491 12.838 13.252 13.629 13.997 14.41 14.825 15.196 15.606 16.006 16.37 16.735 17.106 17.488 17.815 18.133 18.456 18.714 18.829 18.76 18.275 16.94 14.896 13.001 11.339 9.816 8.411 7.128 5.915 4.856 3.803 2.907 2.055 1.203 0.394 -0.372 -1.087 -1.814 -2.44 -3.016 -3.646 -4.276 -4.772 -5.292 -5.854 -6.28 -6.719 -7.21 -7.749 -8.315 -8.703 -9.09 -9.712 -10.146 -10.578 -10.804 -11.266 -11.741 -12.247 -12.524 -13.183 -13.466 -13.797 -14.13 -14.885 -15.279 -15.716 -16.239 -16.783 -17.412 -18.322 -20.594 -5 ,23730 ,KEBNE ,17025117,Wed Dec 22 11:54:13 CET,Wed Dec 22 13:27:40 CET,0.0 1.605 2.36 2.915 3.366 3.763 4.123 4.443 5.021 5.279 5.529 5.677 6.25 6.469 6.904 7.303 7.662 7.847 8.211 8.552 9.02 9.287 9.533 9.898 10.261 10.59 10.897 11.195 11.565 11.941 12.295 12.684 13.051 13.392 13.789 14.234 14.642 15.094 15.558 15.953 16.317 16.714 17.14 17.528 17.884 18.19 18.406 18.481 18.373 17.826 16.439 14.333 12.395 10.697 9.154 7.672 6.391 5.225 4.203 3.165 2.212 1.343 0.513 -0.271 -1.018 -1.698 -2.406 -3.055 -3.639 -4.255 -4.881 -5.399 -5.961 -6.548 -6.999 -7.457 -7.928 -8.443 -8.98 -9.343 -9.717 -10.296 -10.697 -11.121 -11.349 -11.831 -12.332 -12.854 -13.122 -13.766 -14.026 -14.358 -14.72 -15.503 -15.934 -16.412 -16.962 -17.589 -18.308 -19.304 -22.638 -6 ,15156 ,KEBNE ,17025118,Wed Dec 22 11:55:14 CET,Wed Dec 22 13:28:49 CET,0.0 2.18 2.929 3.507 3.982 4.412 4.816 5.185 5.807 6.077 6.338 6.468 7.036 7.261 7.677 8.051 8.413 8.594 8.932 9.246 9.707 9.986 10.238 10.628 11.01 11.354 11.673 11.984 12.407 12.797 13.18 13.63 14.007 14.36 14.733 15.12 15.483 15.859 16.246 16.653 17.076 17.516 17.965 18.349 18.688 18.963 19.194 19.292 19.199 18.748 17.424 15.453 13.637 11.892 10.308 8.877 7.586 6.344 5.249 4.221 3.354 2.552 1.755 0.985 0.27 -0.421 -1.167 -1.825 -2.389 -2.999 -3.626 -4.135 -4.685 -5.265 -5.716 -6.177 -6.671 -7.186 -7.711 -8.107 -8.518 -9.118 -9.546 -9.989 -10.214 -10.673 -11.171 -11.749 -12.047 -12.691 -12.947 -13.281 -13.613 -14.343 -14.759 -15.217 -15.714 -16.29 -17.067 -18.055 -21.186 -7 ,17947 ,KEBNE ,17025119,Wed Dec 22 11:56:15 CET,Wed Dec 22 13:28:32 CET,0.0 1.814 2.596 3.197 3.704 4.158 4.596 4.994 5.668 5.975 6.257 6.453 7.058 7.307 7.787 8.247 8.692 8.895 9.276 9.635 10.145 10.473 10.781 11.204 11.603 11.997 12.376 12.702 13.097 13.474 13.816 14.214 14.589 14.939 15.301 15.674 16.065 16.471 16.867 17.243 17.617 18.046 18.528 18.976 19.351 19.63 19.902 20.031 19.9 19.401 18.084 16.13 14.31 12.603 11.112 9.752 8.502 7.344 6.296 5.197 4.273 3.452 2.645 1.871 1.148 0.485 -0.201 -0.83 -1.419 -2.055 -2.702 -3.243 -3.793 -4.338 -4.782 -5.249 -5.731 -6.221 -6.733 -7.111 -7.511 -8.12 -8.52 -8.944 -9.175 -9.654 -10.171 -10.755 -11.069 -11.741 -12.076 -12.416 -12.757 -13.544 -13.982 -14.437 -14.905 -15.46 -16.153 -17.053 -19.295 -8 ,4376 ,KEBNE ,17025120,Wed Dec 22 11:57:19 CET,Wed Dec 22 13:29:18 CET,0.0 2.003 2.742 3.286 3.746 4.162 4.528 4.85 5.439 5.71 5.987 6.203 6.785 7.009 7.414 7.783 8.142 8.318 8.643 8.943 9.368 9.658 9.948 10.362 10.745 11.095 11.416 11.719 12.091 12.441 12.78 13.158 13.509 13.816 14.138 14.5 14.866 15.263 15.662 16.094 16.565 17.004 17.437 17.812 18.157 18.489 18.753 18.87 18.744 18.189 16.84 14.88 13.047 11.359 9.835 8.505 7.343 6.192 5.178 4.128 3.221 2.402 1.554 0.772 0.08 -0.574 -1.275 -1.933 -2.513 -3.108 -3.731 -4.239 -4.775 -5.355 -5.801 -6.263 -6.769 -7.297 -7.811 -8.158 -8.534 -9.135 -9.56 -10.001 -10.226 -10.701 -11.212 -11.782 -12.073 -12.733 -13.039 -13.379 -13.737 -14.484 -14.934 -15.44 -15.977 -16.584 -17.31 -18.282 -20.771 -9 ,1248 ,KEBNE ,17025121,Wed Dec 22 11:57:19 CET,Wed Dec 22 13:29:29 CET,0.0 2.014 2.807 3.37 3.83 4.252 4.625 4.978 5.597 5.852 6.09 6.191 6.743 6.95 7.377 7.778 8.132 8.307 8.633 8.927 9.365 9.652 9.929 10.337 10.718 11.082 11.427 11.756 12.178 12.557 12.895 13.28 13.636 13.982 14.373 14.825 15.245 15.643 16.034 16.408 16.758 17.117 17.509 17.867 18.213 18.507 18.701 18.727 18.603 18.123 16.776 14.766 12.885 11.222 9.763 8.386 7.13 5.965 4.904 3.83 2.904 2.079 1.308 0.532 -0.229 -0.918 -1.656 -2.32 -2.857 -3.422 -4.044 -4.579 -5.147 -5.758 -6.237 -6.709 -7.199 -7.698 -8.21 -8.573 -8.951 -9.546 -9.963 -10.394 -10.616 -11.076 -11.553 -12.083 -12.368 -13.005 -13.23 -13.564 -13.921 -14.692 -15.138 -15.656 -16.207 -16.809 -17.515 -18.457 -21.319 -10 ,25539 ,KEBNE ,17025122,Wed Dec 22 11:57:20 CET,Wed Dec 22 13:31:29 CET,0.0 1.967 2.914 3.637 4.232 4.672 5.054 5.402 5.978 6.247 6.51 6.635 7.196 7.402 7.808 8.206 8.578 8.75 9.077 9.378 9.816 10.114 10.414 10.832 11.185 11.512 11.817 12.105 12.489 12.842 13.178 13.59 13.969 14.305 14.669 15.091 15.52 15.967 16.406 16.822 17.216 17.637 18.078 18.454 18.844 19.187 19.419 19.561 19.511 19.056 17.734 15.765 13.931 12.212 10.679 9.301 8.073 6.922 5.918 4.922 4.041 3.24 2.451 1.702 1.021 0.384 -0.317 -0.957 -1.507 -2.118 -2.751 -3.259 -3.831 -4.421 -4.858 -5.328 -5.81 -6.29 -6.794 -7.151 -7.532 -8.146 -8.558 -8.979 -9.206 -9.681 -10.189 -10.736 -11.016 -11.666 -11.959 -12.3 -12.668 -13.489 -13.948 -14.437 -14.961 -15.559 -16.3 -17.294 -20.155 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23471.txt deleted file mode 100644 index bf5e0c30..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23469_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4205 ,KEBNE ,16691132,Thu Nov 25 10:34:12 CET,Thu Nov 25 12:03:13 CET,0.0 1.651 2.352 2.899 3.32 3.641 3.939 4.23 4.755 4.986 5.222 5.343 5.898 6.106 6.495 6.858 7.206 7.365 7.647 7.913 8.292 8.527 8.755 9.07 9.377 9.669 9.934 10.184 10.505 10.806 11.078 11.38 11.702 12.007 12.283 12.601 12.89 13.165 13.447 13.705 13.915 14.152 14.405 14.512 14.54 14.512 14.307 13.821 12.959 11.463 8.714 5.25 2.317 -0.151 -2.199 -4.026 -5.698 -7.236 -8.563 -9.838 -10.926 -11.924 -12.883 -13.772 -14.593 -15.379 -16.228 -16.989 -17.624 -18.273 -18.969 -19.566 -20.225 -20.899 -21.399 -21.914 -22.456 -22.986 -23.511 -23.901 -24.312 -24.952 -25.405 -25.88 -26.127 -26.639 -27.172 -27.75 -28.054 -28.728 -29.032 -29.386 -29.758 -30.581 -31.049 -31.558 -32.171 -32.875 -33.588 -34.53 -37.667 -2 ,11648 ,KEBNE ,16691133,Thu Nov 25 10:34:08 CET,Thu Nov 25 12:08:16 CET,0.0 1.818 2.579 3.192 3.705 4.138 4.521 4.86 5.482 5.779 6.05 6.188 6.76 6.986 7.396 7.803 8.192 8.366 8.691 9.004 9.436 9.689 9.939 10.285 10.603 10.906 11.193 11.486 11.86 12.192 12.486 12.83 13.156 13.47 13.831 14.213 14.557 14.889 15.185 15.423 15.658 15.92 16.132 16.281 16.398 16.439 16.369 16.068 15.431 14.182 11.713 8.616 5.949 3.59 1.468 -0.454 -2.104 -3.596 -4.893 -6.185 -7.313 -8.31 -9.264 -10.198 -11.046 -11.823 -12.658 -13.402 -14.029 -14.694 -15.398 -15.982 -16.618 -17.262 -17.726 -18.21 -18.733 -19.261 -19.817 -20.246 -20.697 -21.323 -21.765 -22.264 -22.517 -23.039 -23.594 -24.176 -24.468 -25.131 -25.4 -25.747 -26.117 -26.909 -27.356 -27.856 -28.398 -29.02 -29.727 -30.622 -34.317 -3 ,32490 ,KEBNE ,16690409,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:24 CET,0.0 1.356 2.037 2.575 3.037 3.455 3.811 4.125 4.702 4.963 5.207 5.323 5.873 6.071 6.46 6.85 7.192 7.34 7.632 7.911 8.321 8.588 8.838 9.176 9.467 9.728 9.977 10.225 10.541 10.839 11.111 11.429 11.719 11.994 12.308 12.608 12.884 13.164 13.414 13.649 13.844 14.016 14.167 14.278 14.344 14.284 14.104 13.737 12.882 11.357 8.527 4.984 2.06 -0.505 -2.655 -4.491 -6.11 -7.595 -8.897 -10.213 -11.338 -12.302 -13.222 -14.131 -15.013 -15.812 -16.665 -17.442 -18.106 -18.788 -19.486 -20.08 -20.74 -21.428 -21.935 -22.457 -23.002 -23.572 -24.15 -24.563 -24.996 -25.636 -26.095 -26.587 -26.843 -27.384 -27.94 -28.513 -28.819 -29.49 -29.733 -30.076 -30.438 -31.212 -31.66 -32.144 -32.666 -33.237 -33.954 -34.901 -38.09 -4 ,9350 ,KEBNE ,16691135,Thu Nov 25 10:34:08 CET,Thu Nov 25 12:07:12 CET,0.0 1.521 2.231 2.763 3.197 3.555 3.9 4.217 4.778 5.028 5.268 5.358 5.905 6.108 6.49 6.86 7.205 7.355 7.647 7.935 8.323 8.567 8.804 9.134 9.462 9.787 10.094 10.366 10.68 10.979 11.253 11.569 11.863 12.131 12.43 12.736 12.991 13.242 13.495 13.747 13.976 14.187 14.356 14.409 14.376 14.238 13.919 13.397 12.524 11.015 8.257 4.773 1.902 -0.549 -2.67 -4.562 -6.26 -7.794 -9.057 -10.32 -11.454 -12.462 -13.409 -14.347 -15.255 -16.06 -16.902 -17.652 -18.276 -18.948 -19.66 -20.24 -20.842 -21.465 -21.961 -22.476 -23.014 -23.577 -24.168 -24.575 -24.98 -25.594 -26.034 -26.515 -26.764 -27.284 -27.824 -28.381 -28.672 -29.344 -29.602 -29.966 -30.364 -31.21 -31.701 -32.244 -32.839 -33.516 -34.307 -35.305 -38.087 -5 ,7148 ,KEBNE ,16690411,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:16 CET,0.0 1.013 1.665 2.15 2.593 2.987 3.334 3.668 4.235 4.471 4.698 4.793 5.35 5.556 5.936 6.263 6.578 6.734 7.026 7.29 7.676 7.935 8.179 8.512 8.8 9.065 9.33 9.581 9.889 10.205 10.501 10.823 11.107 11.363 11.64 11.931 12.199 12.498 12.78 13.033 13.277 13.51 13.695 13.794 13.848 13.767 13.512 13.007 12.14 10.653 7.95 4.533 1.626 -0.88 -3.033 -4.974 -6.675 -8.234 -9.545 -10.834 -11.974 -12.98 -13.933 -14.834 -15.663 -16.448 -17.287 -18.002 -18.616 -19.265 -19.956 -20.532 -21.123 -21.749 -22.224 -22.729 -23.284 -23.831 -24.376 -24.762 -25.174 -25.83 -26.293 -26.777 -27.021 -27.526 -28.048 -28.584 -28.87 -29.539 -29.82 -30.165 -30.528 -31.349 -31.797 -32.278 -32.85 -33.456 -34.169 -35.185 -38.951 -6 ,24029 ,KEBNE ,16690412,Thu Nov 25 08:14:00 CET,Thu Nov 25 08:15:15 CET,0.0 1.185 1.752 2.234 2.68 3.052 3.401 3.717 4.286 4.548 4.789 4.904 5.46 5.659 6.057 6.425 6.753 6.915 7.233 7.533 7.973 8.234 8.456 8.776 9.091 9.378 9.659 9.928 10.246 10.54 10.8 11.09 11.36 11.644 11.954 12.241 12.509 12.793 13.073 13.331 13.573 13.797 13.998 14.13 14.184 14.152 13.923 13.442 12.741 11.61 9.309 6.189 3.437 0.992 -1.165 -3.114 -4.824 -6.326 -7.609 -8.92 -10.037 -11.048 -12.008 -12.921 -13.804 -14.607 -15.432 -16.154 -16.802 -17.463 -18.139 -18.712 -19.318 -19.972 -20.475 -20.991 -21.533 -22.095 -22.662 -23.049 -23.458 -24.095 -24.535 -25.01 -25.264 -25.779 -26.319 -26.883 -27.17 -27.849 -28.167 -28.518 -28.882 -29.67 -30.128 -30.631 -31.172 -31.781 -32.464 -33.371 -35.68 -7 ,9968 ,KEBNE ,16690413,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:18 CET,0.0 1.542 2.253 2.742 3.177 3.61 3.999 4.345 4.942 5.212 5.469 5.575 6.127 6.338 6.711 7.044 7.37 7.529 7.824 8.093 8.489 8.742 8.977 9.32 9.649 9.943 10.201 10.439 10.751 11.045 11.317 11.629 11.897 12.157 12.488 12.845 13.111 13.347 13.634 13.92 14.152 14.371 14.576 14.712 14.783 14.751 14.483 13.933 13.023 11.514 8.802 5.288 2.288 -0.216 -2.347 -4.262 -5.913 -7.387 -8.655 -9.929 -11.028 -12.037 -13.026 -13.955 -14.805 -15.546 -16.316 -17.024 -17.65 -18.323 -19.028 -19.592 -20.171 -20.802 -21.295 -21.796 -22.316 -22.852 -23.425 -23.832 -24.252 -24.917 -25.38 -25.846 -26.079 -26.569 -27.126 -27.73 -28.048 -28.732 -29.05 -29.416 -29.801 -30.644 -31.093 -31.602 -32.184 -32.858 -33.682 -34.738 -37.593 -8 ,21255 ,KEBNE ,16691139,Thu Nov 25 10:34:08 CET,Thu Nov 25 12:07:00 CET,0.0 1.49 2.199 2.734 3.183 3.586 3.962 4.306 4.885 5.128 5.356 5.449 6.003 6.214 6.611 6.97 7.314 7.473 7.754 8.025 8.423 8.673 8.894 9.206 9.519 9.823 10.117 10.381 10.701 11.002 11.29 11.625 11.934 12.228 12.527 12.826 13.103 13.372 13.609 13.862 14.098 14.317 14.515 14.641 14.673 14.602 14.385 13.842 12.908 11.384 8.61 5.114 2.151 -0.376 -2.485 -4.37 -6.008 -7.474 -8.744 -10.003 -11.15 -12.208 -13.181 -14.109 -14.991 -15.808 -16.678 -17.446 -18.095 -18.755 -19.456 -20.049 -20.66 -21.3 -21.794 -22.294 -22.801 -23.346 -23.933 -24.345 -24.758 -25.401 -25.868 -26.351 -26.594 -27.09 -27.604 -28.156 -28.451 -29.143 -29.461 -29.818 -30.193 -31.01 -31.473 -31.97 -32.533 -33.164 -33.878 -34.783 -37.296 -9 ,27817 ,KEBNE ,16690415,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:21 CET,0.0 1.546 2.266 2.806 3.264 3.674 4.024 4.337 4.896 5.159 5.412 5.524 6.073 6.272 6.639 6.964 7.274 7.43 7.722 7.998 8.386 8.636 8.872 9.183 9.51 9.841 10.124 10.369 10.68 10.98 11.265 11.607 11.924 12.233 12.551 12.857 13.137 13.411 13.697 13.963 14.187 14.392 14.599 14.727 14.738 14.718 14.553 14.079 13.225 11.718 8.858 5.345 2.503 0.06 -2.123 -4.075 -5.713 -7.213 -8.528 -9.855 -10.995 -12.006 -12.982 -13.926 -14.789 -15.518 -16.295 -17.043 -17.694 -18.355 -19.04 -19.6 -20.206 -20.844 -21.331 -21.851 -22.382 -22.913 -23.47 -23.866 -24.283 -24.989 -25.478 -25.959 -26.21 -26.736 -27.295 -27.86 -28.148 -28.828 -29.138 -29.478 -29.832 -30.665 -31.153 -31.709 -32.291 -32.922 -33.689 -34.663 -37.684 -10 ,17392 ,KEBNE ,16691141,Thu Nov 25 10:34:08 CET,Thu Nov 25 12:09:18 CET,0.0 3.086 4.023 4.693 5.184 5.565 5.913 6.226 6.792 7.049 7.287 7.385 7.943 8.157 8.543 8.875 9.18 9.334 9.63 9.919 10.331 10.573 10.804 11.131 11.425 11.721 12.006 12.27 12.594 12.882 13.155 13.502 13.839 14.11 14.38 14.691 14.963 15.213 15.494 15.77 15.989 16.188 16.361 16.482 16.536 16.434 16.165 15.714 14.907 13.431 10.631 7.228 4.368 1.846 -0.265 -2.117 -3.724 -5.185 -6.476 -7.764 -8.894 -9.897 -10.848 -11.785 -12.667 -13.472 -14.324 -15.083 -15.731 -16.385 -17.055 -17.62 -18.233 -18.89 -19.388 -19.906 -20.458 -21.016 -21.599 -22.0 -22.408 -23.066 -23.532 -24.016 -24.263 -24.784 -25.332 -25.901 -26.197 -26.856 -27.083 -27.41 -27.757 -28.535 -28.991 -29.465 -29.981 -30.612 -31.358 -32.386 -36.316 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23468.txt deleted file mode 100644 index bb0a7d9f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30509 ,KEBNE ,16691142,Thu Nov 25 10:34:08 CET,Thu Nov 25 12:10:41 CET,0.0 1.736 2.578 3.261 3.788 4.25 4.674 5.047 5.71 6.016 6.317 6.505 7.19 7.467 7.99 8.473 8.926 9.15 9.595 10.017 10.622 11.025 11.417 11.946 12.441 12.935 13.425 13.891 14.483 15.039 15.587 16.291 16.987 17.62 18.317 19.109 19.88 20.741 21.689 22.703 23.757 24.924 26.299 27.704 29.333 31.212 33.436 35.926 38.85 42.428 46.906 50.681 52.92 54.32 55.243 55.848 56.211 56.424 56.469 56.379 56.229 56.051 55.844 55.594 55.341 55.128 54.873 54.624 54.399 54.126 53.796 53.505 53.185 52.858 52.63 52.378 52.09 51.771 51.44 51.182 50.898 50.486 50.187 49.858 49.683 49.288 48.838 48.382 48.156 47.558 47.41 47.126 46.834 46.19 45.809 45.405 44.934 44.374 43.686 42.814 40.551 -2 ,14171 ,KEBNE ,16690418,Thu Nov 25 08:14:00 CET,Thu Nov 25 08:15:09 CET,0.0 1.723 2.472 3.066 3.595 4.084 4.505 4.877 5.561 5.879 6.191 6.381 7.057 7.328 7.85 8.341 8.798 9.028 9.486 9.911 10.513 10.9 11.291 11.877 12.426 12.944 13.452 13.938 14.543 15.126 15.719 16.441 17.108 17.735 18.503 19.379 20.152 21.007 21.966 22.98 24.037 25.257 26.717 28.173 29.812 31.612 33.732 36.165 39.021 42.436 46.709 50.259 52.334 53.686 54.528 54.979 55.232 55.392 55.417 55.364 55.247 55.082 54.873 54.613 54.344 54.094 53.81 53.549 53.313 53.023 52.698 52.422 52.152 51.843 51.557 51.267 50.986 50.688 50.357 50.119 49.873 49.48 49.172 48.838 48.666 48.294 47.889 47.459 47.253 46.691 46.587 46.317 46.035 45.416 45.063 44.659 44.151 43.572 42.894 41.977 39.466 -3 ,26402 ,KEBNE ,16691144,Thu Nov 25 10:35:10 CET,Thu Nov 25 12:10:10 CET,0.0 1.717 2.587 3.265 3.782 4.246 4.678 5.083 5.794 6.108 6.408 6.572 7.231 7.482 7.983 8.469 8.946 9.172 9.6 10.02 10.637 11.02 11.386 11.925 12.444 12.958 13.461 13.917 14.5 15.081 15.643 16.333 16.996 17.656 18.4 19.218 20.008 20.847 21.766 22.745 23.779 24.947 26.29 27.691 29.348 31.157 33.273 35.694 38.564 42.036 46.395 50.052 52.129 53.352 54.066 54.525 54.788 54.897 54.967 54.988 54.936 54.846 54.691 54.48 54.273 54.031 53.736 53.464 53.214 52.963 52.694 52.459 52.2 51.9 51.664 51.414 51.113 50.789 50.441 50.188 49.946 49.569 49.273 48.936 48.751 48.385 48.011 47.605 47.395 46.821 46.666 46.376 46.069 45.382 45.009 44.606 44.159 43.647 43.043 42.2 39.507 -4 ,13287 ,KEBNE ,16691145,Thu Nov 25 10:35:11 CET,Thu Nov 25 12:12:14 CET,0.0 1.861 2.704 3.3 3.803 4.278 4.729 5.137 5.854 6.189 6.516 6.741 7.43 7.697 8.201 8.676 9.138 9.366 9.8 10.225 10.807 11.177 11.545 12.056 12.56 13.07 13.551 13.994 14.567 15.178 15.779 16.454 17.103 17.753 18.495 19.319 20.127 20.988 21.86 22.773 23.827 25.096 26.521 27.949 29.602 31.375 33.491 35.952 38.831 42.29 46.618 50.332 52.549 53.88 54.719 55.317 55.69 55.87 55.99 56.059 56.017 55.918 55.777 55.549 55.292 55.062 54.787 54.53 54.285 53.998 53.698 53.452 53.195 52.887 52.62 52.363 52.11 51.806 51.432 51.181 50.949 50.592 50.308 49.975 49.8 49.452 49.082 48.647 48.417 47.829 47.712 47.464 47.191 46.564 46.194 45.773 45.3 44.751 44.066 43.164 40.699 -5 ,15411 ,KEBNE ,16691146,Thu Nov 25 10:35:10 CET,Thu Nov 25 12:07:10 CET,0.0 1.815 2.58 3.189 3.717 4.22 4.674 5.1 5.883 6.232 6.575 6.786 7.457 7.729 8.241 8.744 9.236 9.468 9.912 10.351 10.96 11.34 11.742 12.319 12.834 13.322 13.786 14.248 14.842 15.388 15.939 16.62 17.248 17.857 18.569 19.379 20.168 21.032 21.97 22.965 23.993 25.186 26.607 28.014 29.67 31.532 33.708 36.173 39.078 42.671 47.039 50.604 52.701 53.96 54.709 55.173 55.481 55.72 55.831 55.766 55.65 55.539 55.385 55.202 55.016 54.801 54.503 54.228 53.997 53.729 53.419 53.128 52.843 52.573 52.326 52.045 51.76 51.46 51.109 50.864 50.623 50.226 49.942 49.637 49.468 49.108 48.715 48.28 48.048 47.456 47.329 47.053 46.753 46.09 45.703 45.279 44.806 44.27 43.621 42.723 40.488 -6 ,31676 ,KEBNE ,16690422,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:08 CET,0.0 1.234 1.955 2.568 3.063 3.5 3.903 4.283 5.008 5.335 5.638 5.842 6.537 6.815 7.347 7.833 8.28 8.495 8.929 9.346 9.929 10.315 10.702 11.258 11.787 12.28 12.75 13.224 13.864 14.48 15.047 15.725 16.384 17.014 17.748 18.58 19.359 20.236 21.193 22.227 23.321 24.491 25.871 27.282 28.898 30.684 32.799 35.279 38.232 41.776 46.179 49.961 52.261 53.749 54.651 55.227 55.582 55.8 55.9 55.867 55.745 55.6 55.454 55.304 55.109 54.863 54.579 54.307 54.075 53.835 53.561 53.33 53.065 52.769 52.527 52.258 51.983 51.671 51.339 51.098 50.827 50.373 50.033 49.692 49.525 49.171 48.753 48.303 48.071 47.458 47.317 47.037 46.737 46.098 45.7 45.236 44.762 44.238 43.613 42.86 40.695 -7 ,12603 ,KEBNE ,16691148,Thu Nov 25 10:35:11 CET,Thu Nov 25 12:09:05 CET,0.0 1.775 2.583 3.159 3.67 4.13 4.547 4.933 5.647 5.994 6.318 6.503 7.173 7.429 7.915 8.395 8.86 9.083 9.525 9.953 10.552 10.931 11.307 11.863 12.393 12.91 13.404 13.863 14.465 15.078 15.67 16.357 17.01 17.654 18.416 19.264 20.077 20.942 21.844 22.843 23.929 25.116 26.501 27.952 29.614 31.431 33.549 35.988 38.9 42.424 46.891 50.675 52.884 54.304 55.254 55.863 56.187 56.353 56.428 56.368 56.258 56.152 56.017 55.855 55.635 55.366 55.083 54.851 54.637 54.4 54.135 53.852 53.529 53.217 52.964 52.688 52.391 52.069 51.739 51.506 51.252 50.839 50.537 50.221 50.057 49.729 49.363 48.948 48.726 48.133 48.022 47.754 47.464 46.836 46.46 46.014 45.556 45.027 44.356 43.458 40.639 -8 ,1427 ,KEBNE ,16690424,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:08 CET,0.0 1.448 2.179 2.768 3.258 3.699 4.115 4.494 5.2 5.532 5.844 6.048 6.74 7.007 7.504 7.98 8.463 8.702 9.172 9.606 10.197 10.577 10.945 11.489 12.026 12.539 13.024 13.501 14.122 14.731 15.308 15.995 16.676 17.329 18.075 18.912 19.719 20.584 21.49 22.444 23.471 24.659 26.034 27.412 29.027 30.856 33.009 35.491 38.424 41.878 46.087 49.673 51.805 53.104 53.913 54.398 54.649 54.808 54.843 54.71 54.529 54.369 54.192 53.987 53.74 53.467 53.173 52.879 52.622 52.365 52.049 51.756 51.455 51.155 50.922 50.673 50.417 50.122 49.792 49.566 49.314 48.901 48.607 48.285 48.108 47.744 47.367 46.976 46.761 46.161 46.025 45.732 45.415 44.748 44.383 43.949 43.478 42.958 42.306 41.445 39.118 -9 ,6390 ,KEBNE ,16690425,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:07 CET,0.0 1.505 2.236 2.812 3.318 3.802 4.227 4.594 5.265 5.578 5.878 6.034 6.716 7.002 7.534 8.006 8.46 8.689 9.136 9.572 10.19 10.585 10.98 11.543 12.068 12.574 13.082 13.577 14.183 14.765 15.34 16.037 16.714 17.406 18.233 19.117 19.954 20.87 21.833 22.84 23.883 25.029 26.398 27.78 29.367 31.216 33.398 35.908 38.848 42.365 46.828 50.656 52.973 54.444 55.362 55.944 56.273 56.428 56.501 56.519 56.457 56.327 56.159 55.949 55.73 55.504 55.232 54.941 54.671 54.399 54.087 53.81 53.509 53.211 52.98 52.725 52.432 52.109 51.762 51.506 51.233 50.813 50.535 50.233 50.071 49.741 49.398 49.022 48.807 48.203 48.037 47.771 47.481 46.814 46.447 46.061 45.622 45.075 44.394 43.551 41.144 -10 ,22046 ,KEBNE ,16690426,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:22 CET,0.0 1.599 2.368 3.004 3.545 4.0 4.381 4.739 5.402 5.711 6.004 6.15 6.82 7.083 7.604 8.1 8.566 8.794 9.235 9.664 10.274 10.658 11.032 11.579 12.11 12.635 13.137 13.607 14.216 14.802 15.378 16.064 16.707 17.337 18.078 18.886 19.649 20.49 21.388 22.359 23.388 24.548 25.928 27.281 28.834 30.616 32.71 35.054 37.834 41.202 45.429 49.019 51.114 52.441 53.197 53.586 53.803 53.893 53.915 53.865 53.745 53.593 53.4 53.193 52.957 52.726 52.466 52.214 51.994 51.748 51.478 51.221 50.939 50.624 50.366 50.116 49.853 49.554 49.219 48.983 48.728 48.335 48.05 47.731 47.562 47.186 46.768 46.321 46.098 45.515 45.367 45.09 44.793 44.154 43.785 43.354 42.903 42.368 41.688 40.827 38.327 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23471.txt deleted file mode 100644 index 9ebcf5af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23470_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7124 ,KEBNE ,16690427,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:19 CET,0.0 1.485 2.135 2.675 3.153 3.583 3.976 4.345 5.041 5.357 5.641 5.812 6.49 6.75 7.236 7.704 8.144 8.352 8.752 9.133 9.682 10.036 10.381 10.906 11.41 11.88 12.344 12.781 13.326 13.849 14.351 14.971 15.593 16.2 16.87 17.602 18.315 19.113 19.973 20.887 21.832 22.872 24.057 25.204 26.562 28.068 29.779 31.717 33.928 36.473 39.411 41.564 42.672 43.309 43.57 43.586 43.513 43.363 43.14 42.85 42.554 42.255 41.907 41.548 41.182 40.837 40.507 40.153 39.773 39.388 38.977 38.621 38.296 37.952 37.656 37.342 37.008 36.648 36.257 35.979 35.687 35.241 34.918 34.557 34.362 33.967 33.546 33.044 32.779 32.15 31.971 31.681 31.376 30.657 30.244 29.791 29.284 28.699 28.035 27.156 25.098 -2 ,4250 ,KEBNE ,16691153,Thu Nov 25 10:35:10 CET,Thu Nov 25 12:09:37 CET,0.0 1.111 1.725 2.201 2.597 2.958 3.305 3.654 4.299 4.589 4.879 5.044 5.702 5.96 6.458 6.924 7.376 7.599 8.03 8.451 9.048 9.398 9.736 10.259 10.779 11.263 11.717 12.167 12.737 13.263 13.776 14.406 14.989 15.546 16.19 16.914 17.606 18.361 19.19 20.047 20.914 21.882 23.002 24.152 25.505 26.98 28.665 30.536 32.713 35.221 38.152 40.417 41.638 42.239 42.442 42.504 42.451 42.308 42.127 41.836 41.509 41.181 40.854 40.539 40.186 39.841 39.474 39.106 38.796 38.479 38.112 37.787 37.435 37.063 36.751 36.421 36.087 35.723 35.32 35.031 34.731 34.272 33.937 33.562 33.37 32.974 32.563 32.123 31.888 31.282 31.137 30.852 30.559 29.87 29.483 29.047 28.569 28.047 27.433 26.558 23.926 -3 ,28581 ,KEBNE ,16691154,Thu Nov 25 10:35:11 CET,Thu Nov 25 12:10:28 CET,0.0 1.575 2.435 3.06 3.544 3.976 4.361 4.728 5.404 5.719 6.038 6.209 6.874 7.139 7.653 8.145 8.623 8.842 9.253 9.652 10.231 10.594 10.927 11.426 11.931 12.412 12.863 13.291 13.85 14.401 14.942 15.574 16.169 16.747 17.399 18.122 18.827 19.603 20.426 21.283 22.178 23.167 24.302 25.452 26.762 28.195 29.872 31.83 34.107 36.689 39.699 41.894 43.002 43.579 43.843 43.902 43.838 43.695 43.521 43.297 42.986 42.64 42.321 41.977 41.58 41.189 40.797 40.444 40.116 39.745 39.351 39.027 38.684 38.316 38.022 37.701 37.361 37.011 36.636 36.387 36.13 35.7 35.379 35.033 34.849 34.468 34.069 33.637 33.403 32.788 32.628 32.335 32.023 31.362 30.964 30.519 30.015 29.448 28.817 27.959 24.543 -4 ,25542 ,KEBNE ,16690430,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:14 CET,0.0 1.3 1.929 2.446 2.894 3.288 3.657 4.003 4.678 4.996 5.3 5.474 6.134 6.385 6.862 7.31 7.747 7.961 8.379 8.783 9.36 9.73 10.078 10.592 11.095 11.576 12.03 12.452 13.004 13.55 14.075 14.705 15.271 15.819 16.507 17.258 17.957 18.697 19.493 20.376 21.299 22.326 23.474 24.593 25.919 27.356 28.975 30.806 32.91 35.289 38.083 40.157 41.201 41.805 42.124 42.222 42.177 42.061 41.835 41.505 41.185 40.849 40.508 40.19 39.854 39.521 39.139 38.758 38.413 38.058 37.701 37.376 37.025 36.661 36.356 36.019 35.657 35.279 34.894 34.617 34.314 33.842 33.514 33.168 32.992 32.608 32.189 31.756 31.518 30.877 30.669 30.365 30.046 29.386 29.006 28.576 28.089 27.527 26.867 25.984 23.69 -5 ,23167 ,KEBNE ,16691156,Thu Nov 25 10:36:13 CET,Thu Nov 25 12:10:21 CET,0.0 1.363 2.115 2.715 3.235 3.709 4.097 4.45 5.139 5.471 5.774 5.906 6.569 6.815 7.287 7.737 8.16 8.372 8.788 9.193 9.763 10.116 10.45 10.931 11.426 11.903 12.348 12.783 13.342 13.892 14.411 15.011 15.609 16.192 16.851 17.594 18.3 19.05 19.841 20.688 21.604 22.603 23.771 24.956 26.284 27.738 29.399 31.261 33.418 35.95 38.875 41.137 42.336 42.969 43.262 43.332 43.256 43.097 42.901 42.613 42.313 42.009 41.655 41.298 40.954 40.597 40.235 39.91 39.573 39.2 38.826 38.521 38.197 37.86 37.581 37.269 36.934 36.58 36.186 35.885 35.586 35.129 34.785 34.422 34.235 33.853 33.437 32.96 32.718 32.104 31.919 31.633 31.33 30.636 30.246 29.843 29.405 28.878 28.19 27.17 23.888 -6 ,19023 ,KEBNE ,16690432,Thu Nov 25 08:14:01 CET,Thu Nov 25 08:15:13 CET,0.0 1.54 2.328 2.904 3.39 3.84 4.261 4.64 5.313 5.622 5.944 6.132 6.798 7.055 7.554 8.018 8.453 8.662 9.057 9.437 9.99 10.349 10.691 11.19 11.689 12.175 12.634 13.069 13.643 14.186 14.712 15.374 15.997 16.582 17.248 17.972 18.675 19.433 20.204 21.026 21.897 22.894 24.047 25.163 26.501 28.007 29.668 31.525 33.651 36.02 38.777 40.856 41.829 42.257 42.385 42.305 42.138 41.938 41.665 41.335 41.012 40.669 40.32 39.99 39.669 39.337 38.961 38.585 38.252 37.902 37.479 37.117 36.78 36.42 36.124 35.797 35.417 35.017 34.616 34.338 34.051 33.593 33.262 32.911 32.732 32.364 31.966 31.547 31.307 30.683 30.499 30.182 29.864 29.156 28.734 28.27 27.801 27.296 26.68 25.768 23.65 -7 ,9951 ,KEBNE ,16690433,Thu Nov 25 08:14:00 CET,Thu Nov 25 08:15:00 CET,0.0 1.471 2.058 2.58 3.021 3.42 3.826 4.2 4.861 5.182 5.499 5.689 6.37 6.644 7.15 7.609 8.067 8.288 8.701 9.09 9.628 9.983 10.331 10.819 11.273 11.719 12.163 12.593 13.134 13.647 14.156 14.768 15.36 15.932 16.57 17.284 17.954 18.699 19.53 20.417 21.335 22.36 23.565 24.72 26.032 27.489 29.119 30.934 33.11 35.676 38.672 40.903 42.07 42.701 42.94 42.973 42.881 42.708 42.478 42.128 41.771 41.444 41.103 40.775 40.488 40.2 39.852 39.508 39.186 38.832 38.453 38.127 37.791 37.395 37.058 36.713 36.359 35.975 35.55 35.251 34.946 34.501 34.173 33.802 33.609 33.203 32.771 32.32 32.09 31.477 31.309 31.019 30.719 30.062 29.697 29.287 28.789 28.204 27.531 26.632 23.514 -8 ,2089 ,KEBNE ,16691159,Thu Nov 25 10:36:13 CET,Thu Nov 25 12:08:51 CET,0.0 1.655 2.521 3.16 3.693 4.203 4.639 4.997 5.645 5.926 6.192 6.307 6.949 7.169 7.621 8.071 8.49 8.688 9.089 9.492 10.056 10.419 10.778 11.28 11.789 12.282 12.731 13.166 13.728 14.278 14.821 15.474 16.09 16.702 17.39 18.132 18.834 19.598 20.43 21.342 22.29 23.275 24.438 25.622 26.956 28.435 30.093 31.938 34.116 36.636 39.542 41.779 42.922 43.507 43.705 43.701 43.585 43.396 43.135 42.771 42.455 42.153 41.817 41.481 41.139 40.824 40.508 40.177 39.867 39.536 39.151 38.802 38.458 38.109 37.809 37.484 37.139 36.776 36.409 36.134 35.843 35.388 35.04 34.665 34.478 34.075 33.64 33.176 32.922 32.295 32.075 31.761 31.453 30.77 30.389 29.988 29.495 28.921 28.274 27.414 25.329 -9 ,32073 ,KEBNE ,16691160,Thu Nov 25 10:36:13 CET,Thu Nov 25 12:08:55 CET,0.0 1.191 1.678 2.116 2.515 2.894 3.242 3.57 4.19 4.488 4.777 4.932 5.606 5.882 6.397 6.863 7.295 7.502 7.904 8.293 8.843 9.179 9.519 10.037 10.521 10.991 11.471 11.939 12.51 13.054 13.579 14.2 14.81 15.392 16.051 16.772 17.446 18.18 18.989 19.877 20.837 21.933 23.142 24.321 25.691 27.229 28.973 30.784 32.855 35.238 37.908 39.835 40.817 41.332 41.528 41.504 41.334 41.056 40.764 40.369 39.978 39.611 39.267 38.959 38.606 38.239 37.826 37.448 37.143 36.807 36.41 36.06 35.686 35.296 34.974 34.63 34.284 33.892 33.464 33.181 32.89 32.404 32.088 31.764 31.582 31.186 30.773 30.345 30.108 29.482 29.304 28.997 28.682 28.053 27.671 27.23 26.727 26.156 25.508 24.609 22.312 -10 ,5269 ,KEBNE ,16690436,Thu Nov 25 08:16:02 CET,Thu Nov 25 08:17:03 CET,0.0 1.389 2.162 2.752 3.23 3.672 4.066 4.434 5.094 5.399 5.703 5.855 6.514 6.759 7.25 7.741 8.189 8.398 8.79 9.167 9.719 10.084 10.438 10.938 11.445 11.953 12.415 12.855 13.43 13.981 14.516 15.144 15.737 16.31 16.978 17.728 18.434 19.179 19.977 20.834 21.749 22.767 23.915 25.062 26.382 27.827 29.473 31.315 33.45 35.93 38.883 41.146 42.274 42.838 43.087 43.104 43.023 42.882 42.655 42.325 41.988 41.69 41.381 41.071 40.752 40.406 40.024 39.645 39.298 38.937 38.547 38.191 37.795 37.399 37.105 36.795 36.471 36.125 35.724 35.452 35.176 34.72 34.384 34.022 33.836 33.44 33.007 32.504 32.228 31.576 31.349 31.058 30.754 30.033 29.598 29.154 28.684 28.133 27.45 26.512 24.074 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23466.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23466.txt deleted file mode 100644 index 5181148a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23466.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26179 ,KEBNE ,16690437,Thu Nov 25 08:16:02 CET,Thu Nov 25 08:17:13 CET,0.0 1.273 1.853 2.321 2.706 3.054 3.393 3.695 4.246 4.496 4.741 4.863 5.465 5.681 6.084 6.465 6.838 7.027 7.401 7.765 8.286 8.615 8.935 9.393 9.821 10.235 10.643 11.025 11.533 12.028 12.497 13.073 13.627 14.172 14.78 15.441 16.107 16.874 17.713 18.572 19.448 20.432 21.592 22.775 24.149 25.684 27.461 29.438 31.711 34.439 37.649 40.125 41.437 42.124 42.48 42.629 42.614 42.491 42.313 42.029 41.737 41.457 41.16 40.826 40.46 40.129 39.782 39.439 39.137 38.835 38.483 38.155 37.803 37.412 37.106 36.796 36.439 36.064 35.703 35.438 35.144 34.679 34.352 34.008 33.823 33.42 33.007 32.543 32.302 31.73 31.554 31.267 30.955 30.271 29.875 29.404 28.905 28.349 27.634 26.679 23.513 -2 ,19228 ,KEBNE ,16690438,Thu Nov 25 08:16:02 CET,Thu Nov 25 08:17:11 CET,0.0 1.273 1.841 2.299 2.703 3.037 3.348 3.658 4.244 4.517 4.772 4.885 5.477 5.697 6.139 6.556 6.934 7.116 7.479 7.829 8.324 8.637 8.95 9.411 9.843 10.255 10.661 11.059 11.569 12.076 12.56 13.119 13.652 14.166 14.763 15.427 16.068 16.765 17.518 18.316 19.188 20.175 21.319 22.523 23.91 25.438 27.183 29.165 31.464 34.165 37.436 39.999 41.4 42.155 42.49 42.547 42.442 42.315 42.153 41.85 41.522 41.201 40.867 40.537 40.218 39.911 39.561 39.227 38.885 38.513 38.137 37.796 37.442 37.077 36.786 36.454 36.1 35.754 35.379 35.1 34.792 34.319 33.998 33.637 33.449 33.044 32.622 32.176 31.92 31.313 31.09 30.807 30.477 29.718 29.312 28.854 28.3 27.666 26.917 25.896 21.986 -3 ,22500 ,KEBNE ,16690439,Thu Nov 25 08:16:03 CET,Thu Nov 25 08:17:01 CET,0.0 1.3 1.9 2.354 2.743 3.115 3.478 3.843 4.485 4.759 5.011 5.13 5.738 5.961 6.385 6.795 7.201 7.389 7.736 8.083 8.577 8.887 9.184 9.617 10.05 10.475 10.884 11.281 11.81 12.31 12.763 13.314 13.843 14.354 14.983 15.713 16.393 17.1 17.863 18.678 19.532 20.5 21.622 22.786 24.169 25.702 27.44 29.396 31.721 34.453 37.716 40.238 41.581 42.316 42.669 42.839 42.886 42.765 42.574 42.35 42.083 41.807 41.524 41.193 40.832 40.502 40.16 39.822 39.506 39.142 38.74 38.416 38.058 37.651 37.332 37.006 36.676 36.339 35.987 35.719 35.434 35.008 34.703 34.376 34.205 33.812 33.369 32.906 32.657 32.061 31.84 31.539 31.22 30.503 30.088 29.652 29.149 28.592 27.955 26.977 23.136 -4 ,4464 ,KEBNE ,16691165,Thu Nov 25 10:36:14 CET,Thu Nov 25 12:08:23 CET,0.0 1.268 1.868 2.353 2.755 3.104 3.449 3.757 4.29 4.552 4.818 4.95 5.553 5.774 6.198 6.594 6.963 7.145 7.482 7.801 8.268 8.576 8.885 9.339 9.773 10.184 10.584 10.971 11.495 12.001 12.484 13.057 13.584 14.098 14.73 15.437 16.076 16.792 17.572 18.399 19.283 20.301 21.497 22.662 24.039 25.614 27.373 29.288 31.571 34.332 37.553 40.078 41.448 42.11 42.379 42.433 42.379 42.26 42.088 41.832 41.546 41.255 40.949 40.637 40.326 40.003 39.632 39.302 39.003 38.644 38.269 37.951 37.585 37.217 36.939 36.646 36.338 35.995 35.602 35.322 35.036 34.574 34.242 33.923 33.754 33.377 32.973 32.553 32.333 31.754 31.557 31.279 30.973 30.185 29.734 29.271 28.738 28.14 27.467 26.568 23.187 -5 ,17039 ,KEBNE ,16691166,Thu Nov 25 10:36:14 CET,Thu Nov 25 12:08:22 CET,0.0 1.232 1.81 2.272 2.685 3.037 3.356 3.676 4.255 4.514 4.768 4.88 5.47 5.686 6.102 6.515 6.918 7.105 7.473 7.834 8.335 8.645 8.96 9.436 9.891 10.318 10.733 11.137 11.638 12.107 12.554 13.109 13.665 14.197 14.789 15.464 16.119 16.832 17.606 18.429 19.301 20.274 21.44 22.619 23.978 25.46 27.122 29.089 31.359 34.002 37.183 39.706 41.049 41.737 42.083 42.23 42.204 42.049 41.839 41.559 41.242 40.857 40.465 40.102 39.726 39.368 39.008 38.676 38.375 38.058 37.701 37.386 37.041 36.664 36.369 36.058 35.73 35.392 35.041 34.772 34.473 34.002 33.663 33.303 33.123 32.738 32.302 31.84 31.604 31.029 30.845 30.552 30.244 29.55 29.129 28.648 28.103 27.486 26.714 25.592 21.783 -6 ,11252 ,KEBNE ,16690442,Thu Nov 25 08:16:03 CET,Thu Nov 25 08:17:18 CET,0.0 1.19 1.859 2.356 2.78 3.152 3.493 3.811 4.362 4.619 4.876 4.99 5.587 5.808 6.236 6.627 7.0 7.179 7.519 7.856 8.354 8.669 8.974 9.414 9.826 10.23 10.628 11.012 11.524 12.028 12.523 13.105 13.655 14.228 14.902 15.63 16.31 17.022 17.799 18.643 19.523 20.516 21.651 22.787 24.169 25.768 27.565 29.522 31.86 34.616 37.882 40.378 41.682 42.366 42.627 42.661 42.594 42.47 42.24 41.889 41.569 41.28 40.943 40.58 40.234 39.909 39.543 39.202 38.894 38.555 38.179 37.835 37.471 37.085 36.75 36.393 36.044 35.686 35.304 35.034 34.743 34.282 33.947 33.572 33.384 32.98 32.558 32.104 31.852 31.273 31.127 30.84 30.515 29.806 29.418 29.01 28.544 27.959 27.168 25.977 21.033 -7 ,11839 ,KEBNE ,16690443,Thu Nov 25 08:16:03 CET,Thu Nov 25 08:17:10 CET,0.0 1.83 2.466 2.924 3.3 3.643 3.975 4.279 4.815 5.086 5.35 5.457 6.048 6.264 6.706 7.122 7.486 7.664 8.021 8.361 8.847 9.176 9.501 9.959 10.393 10.806 11.206 11.594 12.107 12.591 13.07 13.664 14.215 14.758 15.401 16.093 16.745 17.473 18.257 19.083 19.974 21.013 22.157 23.299 24.621 26.078 27.821 29.798 32.186 34.999 38.211 40.69 42.014 42.77 43.119 43.206 43.183 43.078 42.925 42.726 42.504 42.227 41.911 41.596 41.275 40.97 40.626 40.304 40.019 39.698 39.326 38.996 38.617 38.195 37.89 37.582 37.232 36.866 36.491 36.205 35.911 35.449 35.117 34.773 34.59 34.208 33.805 33.388 33.164 32.568 32.381 32.093 31.759 31.066 30.692 30.232 29.689 29.094 28.409 27.213 21.674 -8 ,7280 ,KEBNE ,16690444,Thu Nov 25 08:16:03 CET,Thu Nov 25 08:17:09 CET,0.0 1.429 2.08 2.594 3.014 3.407 3.757 4.07 4.636 4.881 5.124 5.199 5.782 5.997 6.403 6.782 7.141 7.316 7.665 8.005 8.492 8.804 9.1 9.524 9.945 10.344 10.725 11.097 11.58 12.07 12.545 13.125 13.678 14.191 14.796 15.491 16.164 16.903 17.691 18.526 19.409 20.383 21.532 22.682 24.015 25.505 27.177 29.119 31.478 34.193 37.291 39.73 41.082 41.794 42.091 42.179 42.165 42.047 41.854 41.606 41.363 41.109 40.821 40.51 40.188 39.865 39.524 39.21 38.91 38.589 38.243 37.921 37.551 37.18 36.9 36.596 36.276 35.928 35.535 35.259 34.974 34.518 34.201 33.866 33.69 33.322 32.911 32.458 32.214 31.622 31.411 31.097 30.765 30.081 29.707 29.259 28.714 28.051 27.198 26.098 21.936 -9 ,16433 ,KEBNE ,16691170,Thu Nov 25 10:36:13 CET,Thu Nov 25 12:06:19 CET,0.0 1.127 1.726 2.198 2.583 2.932 3.289 3.609 4.139 4.413 4.681 4.769 5.358 5.572 5.984 6.404 6.811 7.004 7.369 7.701 8.176 8.491 8.797 9.244 9.68 10.104 10.509 10.914 11.437 11.927 12.41 12.986 13.535 14.05 14.652 15.387 16.084 16.799 17.566 18.399 19.285 20.256 21.395 22.561 23.905 25.405 27.171 29.176 31.444 34.126 37.388 39.872 41.199 41.98 42.415 42.554 42.508 42.401 42.157 41.826 41.539 41.234 40.904 40.59 40.263 39.937 39.611 39.267 38.95 38.626 38.243 37.9 37.532 37.151 36.85 36.54 36.214 35.839 35.394 35.067 34.754 34.288 33.944 33.568 33.386 33.018 32.624 32.202 31.976 31.391 31.171 30.861 30.53 29.799 29.387 28.928 28.42 27.857 27.202 26.17 21.413 -10 ,191 ,KEBNE ,16691171,Thu Nov 25 10:36:13 CET,Thu Nov 25 12:07:14 CET,0.0 1.931 2.576 3.05 3.452 3.835 4.168 4.482 5.071 5.322 5.572 5.716 6.318 6.539 6.97 7.36 7.734 7.92 8.272 8.611 9.111 9.437 9.752 10.207 10.648 11.066 11.468 11.851 12.34 12.807 13.256 13.82 14.361 14.877 15.494 16.191 16.837 17.533 18.302 19.137 20.028 21.031 22.213 23.371 24.7 26.221 27.938 29.853 32.179 34.904 38.01 40.261 41.25 41.684 41.776 41.619 41.372 41.072 40.735 40.318 39.937 39.539 39.1 38.654 38.196 37.754 37.3 36.903 36.528 36.102 35.638 35.249 34.855 34.454 34.132 33.769 33.384 32.993 32.574 32.272 31.958 31.472 31.114 30.711 30.501 30.072 29.623 29.154 28.906 28.3 28.074 27.767 27.409 26.601 26.131 25.617 25.058 24.44 23.69 22.622 18.424 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23467.txt deleted file mode 100644 index 14f9c00f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20186 ,KEBNE ,16690447,Thu Nov 25 08:16:03 CET,Thu Nov 25 08:17:22 CET,0.0 1.543 2.373 2.968 3.429 3.827 4.213 4.59 5.294 5.617 5.919 6.116 6.762 7.026 7.514 7.998 8.476 8.701 9.134 9.559 10.212 10.625 11.012 11.566 12.108 12.636 13.141 13.625 14.247 14.851 15.443 16.158 16.84 17.505 18.288 19.186 20.057 21.02 22.074 23.191 24.372 25.719 27.298 28.849 30.668 32.778 35.228 38.046 41.413 45.449 50.567 54.891 57.481 59.12 60.153 60.887 61.317 61.516 61.616 61.672 61.65 61.581 61.49 61.342 61.139 60.936 60.701 60.456 60.226 59.965 59.69 59.467 59.218 58.931 58.687 58.435 58.163 57.854 57.532 57.293 57.036 56.647 56.378 56.077 55.911 55.566 55.2 54.808 54.601 54.069 53.882 53.616 53.336 52.747 52.407 52.022 51.578 51.075 50.46 49.533 46.698 -2 ,30276 ,KEBNE ,16691173,Thu Nov 25 10:36:13 CET,Thu Nov 25 12:09:23 CET,0.0 1.555 2.314 2.909 3.421 3.859 4.242 4.606 5.273 5.581 5.875 6.088 6.736 7.008 7.506 7.979 8.447 8.675 9.117 9.546 10.177 10.57 10.95 11.514 12.039 12.548 13.056 13.549 14.172 14.795 15.405 16.135 16.846 17.526 18.299 19.16 19.998 20.919 21.917 23.003 24.175 25.498 27.091 28.712 30.554 32.608 34.974 37.744 41.184 45.291 50.201 54.17 56.334 57.543 58.254 58.731 58.997 59.104 59.159 59.114 58.917 58.68 58.454 58.233 57.978 57.716 57.41 57.081 56.771 56.47 56.158 55.861 55.532 55.174 54.892 54.577 54.235 53.912 53.579 53.343 53.083 52.66 52.36 52.02 51.844 51.499 51.122 50.685 50.439 49.876 49.643 49.364 49.075 48.402 48.033 47.623 47.148 46.601 45.959 45.101 42.63 -3 ,1290 ,KEBNE ,16691174,Thu Nov 25 10:36:13 CET,Thu Nov 25 12:07:46 CET,0.0 1.468 2.23 2.781 3.26 3.684 4.068 4.436 5.133 5.456 5.752 5.952 6.588 6.858 7.392 7.878 8.336 8.558 9.003 9.436 10.08 10.489 10.869 11.408 11.927 12.423 12.908 13.393 14.037 14.669 15.281 16.004 16.694 17.356 18.124 19.006 19.869 20.8 21.793 22.866 23.998 25.302 26.852 28.424 30.314 32.479 34.921 37.65 40.982 45.038 50.075 54.453 57.1 58.729 59.745 60.457 60.915 61.177 61.296 61.296 61.259 61.181 61.05 60.881 60.65 60.407 60.178 59.971 59.745 59.49 59.234 59.003 58.735 58.435 58.198 57.949 57.681 57.389 57.083 56.86 56.61 56.213 55.95 55.655 55.495 55.172 54.815 54.402 54.179 53.648 53.505 53.266 52.999 52.361 52.015 51.656 51.239 50.755 50.136 49.152 46.48 -4 ,2930 ,KEBNE ,16690450,Thu Nov 25 08:16:10 CET,Thu Nov 25 08:17:16 CET,0.0 1.33 2.076 2.676 3.166 3.599 3.988 4.357 5.053 5.377 5.678 5.886 6.54 6.806 7.3 7.781 8.247 8.466 8.894 9.314 9.919 10.31 10.693 11.257 11.819 12.344 12.84 13.334 13.983 14.627 15.248 15.967 16.647 17.295 18.042 18.882 19.711 20.657 21.688 22.802 23.968 25.309 26.897 28.479 30.347 32.432 34.866 37.685 41.093 45.248 50.405 54.812 57.37 59.002 60.086 60.788 61.23 61.507 61.652 61.699 61.684 61.64 61.542 61.366 61.148 60.953 60.75 60.519 60.304 60.081 59.835 59.61 59.365 59.109 58.871 58.604 58.332 58.037 57.725 57.511 57.274 56.852 56.578 56.307 56.152 55.841 55.505 55.135 54.944 54.431 54.294 54.045 53.788 53.214 52.883 52.522 52.093 51.593 51.023 50.151 45.731 -5 ,29085 ,KEBNE ,16690451,Thu Nov 25 08:16:11 CET,Thu Nov 25 08:17:14 CET,0.0 1.358 2.067 2.628 3.085 3.51 3.904 4.271 4.913 5.217 5.522 5.724 6.356 6.611 7.122 7.61 8.064 8.279 8.689 9.093 9.718 10.135 10.522 11.077 11.611 12.131 12.645 13.142 13.775 14.408 15.038 15.788 16.485 17.135 17.908 18.799 19.664 20.608 21.617 22.729 23.938 25.277 26.79 28.354 30.269 32.407 34.86 37.735 41.228 45.344 50.437 54.825 57.428 59.003 60.005 60.719 61.128 61.322 61.414 61.454 61.417 61.323 61.192 61.027 60.842 60.623 60.387 60.175 59.956 59.711 59.448 59.219 58.955 58.663 58.441 58.205 57.95 57.653 57.326 57.1 56.85 56.465 56.185 55.895 55.744 55.411 55.037 54.665 54.48 53.939 53.728 53.447 53.159 52.546 52.185 51.822 51.405 50.912 50.345 49.539 46.912 -6 ,20054 ,KEBNE ,16691177,Thu Nov 25 10:37:15 CET,Thu Nov 25 12:10:38 CET,0.0 2.714 3.614 4.171 4.647 5.082 5.469 5.84 6.524 6.832 7.119 7.3 7.929 8.181 8.7 9.206 9.66 9.88 10.314 10.73 11.332 11.726 12.119 12.683 13.225 13.752 14.264 14.758 15.437 16.096 16.7 17.436 18.147 18.806 19.569 20.432 21.258 22.169 23.175 24.254 25.389 26.671 28.185 29.781 31.685 33.778 36.202 39.018 42.453 46.641 51.604 55.799 58.422 60.075 61.11 61.773 62.179 62.425 62.548 62.576 62.482 62.352 62.224 62.052 61.858 61.644 61.406 61.182 60.966 60.724 60.465 60.206 59.92 59.636 59.41 59.168 58.895 58.565 58.213 57.984 57.74 57.367 57.093 56.78 56.616 56.275 55.925 55.566 55.356 54.816 54.665 54.421 54.156 53.566 53.241 52.871 52.445 51.936 51.293 50.536 48.42 -7 ,1364 ,KEBNE ,16690453,Thu Nov 25 08:16:03 CET,Thu Nov 25 08:17:27 CET,0.0 1.632 2.333 2.915 3.406 3.812 4.188 4.558 5.26 5.58 5.886 6.089 6.733 7.006 7.519 7.996 8.445 8.669 9.101 9.514 10.116 10.509 10.898 11.451 11.998 12.531 13.035 13.523 14.116 14.696 15.307 16.061 16.769 17.441 18.205 19.069 19.919 20.859 21.843 22.903 24.093 25.465 27.071 28.675 30.557 32.721 35.267 38.124 41.493 45.582 50.714 55.19 57.868 59.506 60.523 61.193 61.603 61.842 61.964 62.022 61.99 61.854 61.67 61.479 61.279 61.086 60.846 60.585 60.359 60.115 59.826 59.56 59.291 59.02 58.775 58.528 58.304 58.033 57.722 57.514 57.297 56.942 56.668 56.363 56.202 55.854 55.468 55.045 54.839 54.306 54.127 53.868 53.588 52.967 52.634 52.258 51.846 51.376 50.808 49.974 47.401 -8 ,25488 ,KEBNE ,16690454,Thu Nov 25 08:16:03 CET,Thu Nov 25 08:17:18 CET,0.0 1.451 2.218 2.838 3.375 3.825 4.221 4.605 5.299 5.601 5.905 6.129 6.781 7.046 7.558 8.04 8.53 8.774 9.252 9.699 10.294 10.68 11.071 11.624 12.142 12.661 13.171 13.67 14.32 14.934 15.527 16.257 16.942 17.596 18.374 19.279 20.14 21.049 22.044 23.132 24.305 25.637 27.199 28.774 30.637 32.79 35.341 38.249 41.683 45.746 50.779 55.065 57.636 59.255 60.266 60.885 61.255 61.515 61.596 61.585 61.565 61.498 61.357 61.159 60.96 60.748 60.499 60.296 60.109 59.885 59.632 59.39 59.107 58.782 58.552 58.317 58.026 57.721 57.417 57.215 57.007 56.663 56.405 56.124 55.969 55.625 55.27 54.902 54.704 54.172 54.021 53.778 53.507 52.879 52.537 52.147 51.685 51.192 50.55 49.613 46.994 -9 ,6511 ,KEBNE ,16691180,Thu Nov 25 10:37:15 CET,Thu Nov 25 12:12:27 CET,0.0 1.71 2.405 2.943 3.431 3.849 4.226 4.588 5.21 5.514 5.829 6.076 6.738 7.014 7.548 8.043 8.499 8.723 9.172 9.61 10.244 10.638 11.015 11.572 12.106 12.608 13.103 13.608 14.268 14.917 15.535 16.254 16.944 17.588 18.331 19.206 20.043 20.944 21.959 23.072 24.26 25.614 27.228 28.855 30.765 32.947 35.433 38.194 41.533 45.696 50.784 55.034 57.653 59.385 60.446 61.09 61.48 61.741 61.875 61.89 61.851 61.736 61.582 61.405 61.171 60.941 60.707 60.489 60.267 60.007 59.729 59.497 59.219 58.92 58.698 58.435 58.146 57.842 57.529 57.311 57.071 56.698 56.436 56.144 55.991 55.675 55.338 54.965 54.749 54.213 54.066 53.827 53.569 52.977 52.64 52.28 51.873 51.367 50.763 50.012 48.075 -10 ,14924 ,KEBNE ,16690456,Thu Nov 25 08:16:02 CET,Thu Nov 25 08:17:17 CET,0.0 1.696 2.445 3.032 3.532 3.951 4.321 4.674 5.33 5.648 5.951 6.173 6.809 7.065 7.583 8.073 8.527 8.748 9.171 9.592 10.242 10.646 11.021 11.56 12.087 12.627 13.151 13.674 14.394 15.089 15.772 16.613 17.418 18.186 19.079 20.068 21.03 22.127 23.29 24.499 25.723 27.088 28.717 30.326 32.196 34.329 36.838 39.645 42.945 46.996 52.058 56.361 58.934 60.562 61.588 62.303 62.742 62.968 63.099 63.158 63.115 62.997 62.844 62.713 62.556 62.35 62.1 61.864 61.662 61.446 61.159 60.872 60.588 60.326 60.099 59.817 59.539 59.26 58.925 58.681 58.446 58.066 57.78 57.467 57.3 56.964 56.611 56.229 56.033 55.51 55.381 55.134 54.871 54.294 53.954 53.566 53.13 52.631 52.023 51.24 49.244 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23468.txt deleted file mode 100644 index ce41eb7a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23471_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22213 ,KEBNE ,16691182,Thu Nov 25 10:37:15 CET,Thu Nov 25 12:10:11 CET,0.0 2.469 3.318 4.017 4.648 5.175 5.645 6.052 6.738 7.052 7.341 7.525 8.158 8.422 8.914 9.389 9.853 10.073 10.473 10.845 11.393 11.734 12.065 12.551 13.009 13.431 13.859 14.279 14.804 15.326 15.809 16.381 16.938 17.451 18.032 18.711 19.373 20.053 20.759 21.5 22.236 23.063 24.049 24.994 26.065 27.223 28.461 29.817 31.356 33.08 34.92 36.103 36.534 36.582 36.407 36.08 35.684 35.274 34.852 34.363 33.924 33.522 33.108 32.663 32.221 31.792 31.305 30.867 30.484 30.098 29.701 29.352 28.98 28.585 28.257 27.912 27.545 27.173 26.796 26.525 26.243 25.806 25.493 25.154 24.98 24.595 24.185 23.773 23.561 22.979 22.829 22.556 22.275 21.664 21.307 20.896 20.438 19.893 19.2 18.221 14.311 -2 ,9157 ,KEBNE ,16690458,Thu Nov 25 08:16:03 CET,Thu Nov 25 08:17:24 CET,0.0 1.911 2.706 3.301 3.797 4.207 4.582 4.956 5.65 5.958 6.244 6.433 7.064 7.317 7.806 8.282 8.761 8.992 9.425 9.838 10.417 10.785 11.136 11.627 12.094 12.541 12.989 13.401 13.904 14.426 14.946 15.542 16.08 16.571 17.125 17.764 18.397 19.086 19.794 20.52 21.263 22.088 23.038 24.0 25.126 26.326 27.685 29.185 30.746 32.413 34.273 35.424 35.851 35.928 35.813 35.58 35.206 34.739 34.238 33.738 33.303 32.882 32.475 32.067 31.665 31.253 30.808 30.391 30.023 29.651 29.258 28.912 28.54 28.15 27.837 27.502 27.142 26.756 26.348 26.062 25.755 25.271 24.928 24.568 24.384 24.013 23.615 23.194 22.973 22.38 22.237 21.961 21.671 21.083 20.751 20.367 19.933 19.421 18.787 17.978 15.806 -3 ,16830 ,KEBNE ,16691184,Thu Nov 25 10:37:15 CET,Thu Nov 25 12:10:33 CET,0.0 1.907 2.647 3.286 3.789 4.254 4.699 5.093 5.798 6.138 6.462 6.667 7.291 7.547 8.028 8.476 8.908 9.114 9.514 9.901 10.469 10.822 11.152 11.636 12.11 12.563 12.979 13.364 13.852 14.363 14.854 15.423 15.945 16.441 17.028 17.665 18.281 18.944 19.655 20.396 21.172 22.084 23.141 24.168 25.288 26.447 27.731 29.168 30.747 32.446 34.266 35.465 35.885 35.872 35.667 35.373 34.98 34.587 34.216 33.763 33.364 32.956 32.463 31.99 31.575 31.191 30.76 30.346 30.003 29.63 29.196 28.829 28.436 28.03 27.717 27.359 26.982 26.613 26.218 25.944 25.666 25.224 24.908 24.554 24.372 23.994 23.593 23.166 22.941 22.347 22.203 21.934 21.649 21.017 20.665 20.278 19.852 19.354 18.696 17.857 15.746 -4 ,7479 ,KEBNE ,16690460,Thu Nov 25 08:16:04 CET,Thu Nov 25 08:17:22 CET,0.0 2.913 3.809 4.494 5.065 5.606 6.089 6.499 7.188 7.5 7.821 8.074 8.708 8.959 9.453 9.89 10.319 10.523 10.913 11.294 11.834 12.176 12.511 13.006 13.49 13.973 14.432 14.839 15.354 15.848 16.297 16.835 17.372 17.889 18.467 19.093 19.701 20.386 21.104 21.842 22.631 23.53 24.522 25.522 26.658 27.788 29.052 30.487 32.079 33.8 35.646 36.823 37.197 37.218 37.006 36.6 36.18 35.726 35.26 34.735 34.252 33.822 33.396 32.975 32.575 32.185 31.75 31.362 31.008 30.592 30.124 29.745 29.376 28.984 28.653 28.302 27.935 27.548 27.155 26.893 26.612 26.148 25.822 25.488 25.313 24.951 24.564 24.137 23.916 23.329 23.206 22.933 22.632 21.981 21.628 21.248 20.839 20.388 19.815 19.061 17.473 -5 ,17872 ,KEBNE ,16691186,Thu Nov 25 10:38:17 CET,Thu Nov 25 12:12:04 CET,0.0 2.172 2.993 3.588 4.074 4.52 4.916 5.266 5.904 6.212 6.515 6.699 7.34 7.601 8.072 8.53 8.976 9.181 9.552 9.914 10.444 10.785 11.126 11.608 12.05 12.488 12.916 13.313 13.795 14.267 14.742 15.299 15.842 16.384 16.975 17.629 18.246 18.893 19.585 20.298 21.031 21.841 22.806 23.784 24.886 26.053 27.353 28.755 30.304 31.972 33.808 35.013 35.336 35.343 35.163 34.849 34.518 34.132 33.729 33.293 32.866 32.458 32.047 31.599 31.158 30.749 30.293 29.889 29.529 29.124 28.68 28.291 27.893 27.497 27.196 26.891 26.575 26.235 25.86 25.598 25.328 24.873 24.532 24.181 24.005 23.65 23.276 22.857 22.629 22.03 21.891 21.635 21.353 20.763 20.424 20.041 19.621 19.137 18.538 17.801 16.194 -6 ,18754 ,KEBNE ,16691187,Thu Nov 25 10:38:22 CET,Thu Nov 25 12:07:19 CET,0.0 2.252 3.022 3.594 4.071 4.545 4.973 5.352 6.027 6.336 6.635 6.803 7.42 7.667 8.139 8.591 9.025 9.24 9.669 10.088 10.695 11.074 11.426 11.927 12.415 12.883 13.332 13.752 14.271 14.777 15.266 15.86 16.436 16.951 17.525 18.18 18.786 19.427 20.12 20.862 21.643 22.507 23.454 24.35 25.415 26.587 27.849 29.274 30.903 32.62 34.458 35.679 36.111 36.183 36.046 35.783 35.493 35.14 34.745 34.259 33.79 33.352 32.927 32.48 32.046 31.68 31.278 30.876 30.504 30.081 29.63 29.287 28.906 28.469 28.144 27.825 27.501 27.147 26.755 26.493 26.213 25.75 25.416 25.059 24.881 24.517 24.145 23.747 23.524 22.926 22.768 22.512 22.235 21.564 21.188 20.815 20.426 19.99 19.454 18.867 17.577 -7 ,12192 ,KEBNE ,16690463,Thu Nov 25 08:16:02 CET,Thu Nov 25 08:17:25 CET,0.0 2.12 2.877 3.446 3.979 4.484 4.916 5.286 5.954 6.261 6.551 6.728 7.354 7.61 8.083 8.522 8.955 9.167 9.565 9.931 10.458 10.801 11.136 11.622 12.064 12.484 12.901 13.304 13.83 14.323 14.772 15.331 15.868 16.372 16.939 17.556 18.142 18.798 19.528 20.324 21.131 21.986 22.969 23.931 25.023 26.194 27.452 28.868 30.481 32.212 34.052 35.269 35.69 35.691 35.477 35.141 34.773 34.36 33.941 33.496 33.086 32.676 32.243 31.815 31.406 31.02 30.566 30.133 29.754 29.34 28.899 28.496 28.085 27.697 27.377 27.017 26.637 26.252 25.87 25.596 25.303 24.859 24.554 24.243 24.075 23.729 23.367 22.952 22.721 22.13 22.01 21.738 21.448 20.845 20.506 20.125 19.692 19.193 18.615 17.908 16.043 -8 ,21810 ,KEBNE ,16690464,Thu Nov 25 08:16:06 CET,Thu Nov 25 08:17:20 CET,0.0 2.667 3.562 4.21 4.685 5.102 5.498 5.857 6.505 6.805 7.111 7.329 7.948 8.212 8.724 9.18 9.613 9.819 10.21 10.583 11.104 11.445 11.766 12.231 12.695 13.133 13.552 13.951 14.448 14.944 15.446 16.028 16.576 17.096 17.693 18.37 18.983 19.649 20.396 21.158 21.92 22.794 23.769 24.698 25.778 26.947 28.262 29.674 31.264 33.012 34.854 36.003 36.376 36.405 36.257 35.961 35.58 35.137 34.705 34.24 33.82 33.406 32.986 32.584 32.168 31.779 31.375 30.992 30.65 30.286 29.876 29.517 29.162 28.782 28.456 28.094 27.718 27.359 26.964 26.669 26.386 25.954 25.638 25.3 25.127 24.764 24.375 23.962 23.739 23.152 23.005 22.737 22.477 21.928 21.637 21.311 20.943 20.542 20.053 19.422 17.697 -9 ,10658 ,KEBNE ,16690465,Thu Nov 25 08:16:02 CET,Thu Nov 25 08:17:12 CET,0.0 2.552 3.355 3.911 4.375 4.8 5.199 5.575 6.225 6.531 6.843 7.075 7.706 7.946 8.411 8.86 9.265 9.459 9.846 10.213 10.735 11.061 11.388 11.886 12.359 12.793 13.218 13.623 14.131 14.62 15.098 15.646 16.167 16.689 17.286 17.947 18.558 19.21 19.931 20.702 21.472 22.316 23.293 24.252 25.34 26.512 27.834 29.295 30.897 32.637 34.512 35.734 36.16 36.211 36.085 35.816 35.495 35.105 34.674 34.187 33.73 33.297 32.862 32.436 32.018 31.627 31.238 30.884 30.572 30.236 29.849 29.482 29.074 28.655 28.343 28.017 27.667 27.284 26.869 26.59 26.313 25.863 25.528 25.177 24.993 24.615 24.235 23.842 23.622 23.033 22.885 22.641 22.4 21.833 21.5 21.138 20.771 20.39 19.899 19.223 17.24 -10 ,242 ,KEBNE ,16691191,Thu Nov 25 10:39:21 CET,Thu Nov 25 12:16:48 CET,0.0 2.301 3.159 3.769 4.269 4.734 5.119 5.458 6.118 6.444 6.767 6.986 7.627 7.889 8.362 8.799 9.213 9.418 9.821 10.2 10.723 11.055 11.383 11.862 12.323 12.762 13.19 13.598 14.111 14.604 15.075 15.645 16.192 16.721 17.325 18.005 18.666 19.394 20.193 21.002 21.812 22.721 23.717 24.674 25.725 26.892 28.204 29.615 31.157 32.8 34.712 35.944 36.334 36.352 36.168 35.866 35.494 35.067 34.648 34.159 33.683 33.263 32.839 32.383 31.913 31.498 31.072 30.684 30.331 29.929 29.493 29.118 28.726 28.324 28.022 27.689 27.333 26.973 26.583 26.319 26.037 25.568 25.205 24.795 24.587 24.145 23.679 23.2 22.952 22.335 22.186 21.893 21.574 20.875 20.486 20.057 19.57 19.021 18.39 17.49 14.248 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index 76fe6008..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8745 ,KEBNE ,16691192,Thu Nov 25 10:39:21 CET,Thu Nov 25 12:15:02 CET,0.0 1.852 2.702 3.384 3.96 4.458 4.916 5.366 6.164 6.554 6.944 7.219 8.004 8.335 8.988 9.605 10.182 10.477 11.063 11.619 12.413 12.927 13.444 14.181 14.887 15.599 16.315 17.025 17.914 18.781 19.64 20.695 21.729 22.722 23.898 25.227 26.516 27.967 29.563 31.29 33.12 35.208 37.712 40.292 43.388 46.967 51.218 56.153 62.299 70.017 80.106 89.406 95.367 99.506 102.384 104.531 106.173 107.443 108.385 109.178 109.813 110.334 110.759 111.062 111.234 111.357 111.473 111.535 111.541 111.56 111.556 111.515 111.443 111.302 111.187 111.094 110.998 110.893 110.767 110.64 110.482 110.207 109.999 109.772 109.656 109.427 109.168 108.881 108.738 108.247 108.226 108.023 107.805 107.336 107.073 106.773 106.419 106.024 105.514 104.793 102.911 -2 ,7675 ,KEBNE ,16691193,Thu Nov 25 10:39:21 CET,Thu Nov 25 12:17:33 CET,0.0 3.244 4.191 4.908 5.492 6.013 6.515 6.987 7.795 8.171 8.54 8.777 9.549 9.874 10.493 11.101 11.7 11.99 12.548 13.102 13.919 14.43 14.925 15.667 16.395 17.107 17.809 18.5 19.377 20.226 21.076 22.115 23.117 24.079 25.232 26.57 27.856 29.271 30.828 32.538 34.376 36.449 38.928 41.521 44.599 48.094 52.255 57.218 63.373 71.013 80.972 90.126 95.987 100.032 103.018 105.282 106.909 108.217 109.176 109.972 110.568 111.019 111.379 111.636 111.845 111.997 112.117 112.191 112.221 112.233 112.239 112.226 112.179 112.093 111.985 111.864 111.756 111.635 111.476 111.358 111.234 111.021 110.873 110.699 110.598 110.397 110.17 109.892 109.747 109.258 109.214 109.016 108.833 108.378 108.103 107.811 107.436 107.001 106.481 105.775 103.789 -3 ,22997 ,KEBNE ,16690469,Thu Nov 25 08:16:02 CET,Thu Nov 25 08:17:14 CET,0.0 1.681 2.41 3.009 3.56 4.053 4.501 4.939 5.798 6.202 6.59 6.912 7.726 8.076 8.719 9.341 9.952 10.241 10.808 11.367 12.169 12.701 13.219 13.961 14.69 15.396 16.08 16.761 17.629 18.468 19.322 20.393 21.436 22.456 23.65 24.999 26.326 27.818 29.451 31.206 33.066 35.191 37.725 40.328 43.434 46.987 51.215 56.174 62.227 69.746 79.639 88.751 94.696 98.792 101.71 103.967 105.68 106.944 107.831 108.655 109.276 109.75 110.124 110.4 110.63 110.778 110.888 110.932 110.939 110.967 110.98 110.954 110.896 110.804 110.707 110.604 110.496 110.377 110.256 110.163 110.06 109.848 109.681 109.515 109.422 109.206 108.96 108.697 108.553 108.051 108.053 107.865 107.634 107.067 106.75 106.437 106.092 105.697 105.204 104.557 102.709 -4 ,24978 ,KEBNE ,16690470,Thu Nov 25 08:16:02 CET,Thu Nov 25 08:17:03 CET,0.0 1.737 2.558 3.205 3.734 4.249 4.721 5.134 5.935 6.319 6.697 6.974 7.757 8.084 8.726 9.357 9.959 10.243 10.799 11.337 12.126 12.638 13.131 13.874 14.632 15.36 16.059 16.751 17.646 18.511 19.348 20.363 21.363 22.353 23.495 24.773 26.037 27.447 29.021 30.737 32.548 34.625 37.138 39.696 42.743 46.287 50.516 55.491 61.653 69.368 79.428 88.56 94.454 98.488 101.377 103.623 105.294 106.561 107.52 108.347 108.968 109.438 109.79 110.052 110.253 110.424 110.572 110.673 110.707 110.709 110.667 110.603 110.542 110.477 110.415 110.322 110.188 110.017 109.845 109.721 109.591 109.394 109.241 109.049 108.936 108.709 108.464 108.175 108.033 107.553 107.574 107.396 107.19 106.694 106.42 106.132 105.765 105.336 104.782 103.942 101.696 -5 ,25861 ,KEBNE ,16691196,Thu Nov 25 10:41:34 CET,Thu Nov 25 12:15:51 CET,0.0 1.648 2.45 3.089 3.634 4.151 4.62 5.047 5.873 6.254 6.627 6.913 7.69 8.012 8.65 9.275 9.884 10.178 10.751 11.312 12.139 12.665 13.168 13.905 14.621 15.332 16.057 16.759 17.646 18.529 19.386 20.442 21.494 22.518 23.685 24.998 26.293 27.738 29.34 31.063 32.865 34.962 37.517 40.117 43.177 46.702 51.019 56.108 62.299 70.055 80.37 89.808 95.747 99.879 102.847 105.05 106.684 107.947 108.888 109.714 110.301 110.75 111.157 111.489 111.726 111.896 112.029 112.11 112.178 112.22 112.21 112.189 112.149 112.079 112.001 111.911 111.805 111.676 111.526 111.425 111.315 111.088 110.94 110.766 110.664 110.472 110.27 110.031 109.885 109.394 109.396 109.202 108.979 108.508 108.242 107.919 107.554 107.141 106.6 105.825 103.11 -6 ,27844 ,KEBNE ,16691197,Thu Nov 25 10:42:32 CET,Thu Nov 25 12:14:40 CET,0.0 1.61 2.427 3.075 3.625 4.122 4.597 5.045 5.875 6.251 6.616 6.903 7.71 8.053 8.699 9.317 9.919 10.213 10.78 11.341 12.148 12.658 13.161 13.913 14.677 15.43 16.152 16.847 17.728 18.574 19.418 20.454 21.471 22.482 23.642 24.934 26.192 27.607 29.186 30.875 32.638 34.665 37.187 39.828 42.955 46.548 50.804 55.789 61.821 69.369 79.386 88.331 94.099 98.19 101.142 103.363 105.046 106.375 107.355 108.217 108.876 109.373 109.753 110.024 110.231 110.387 110.504 110.577 110.616 110.623 110.601 110.546 110.47 110.396 110.325 110.232 110.109 109.96 109.809 109.678 109.516 109.272 109.115 108.944 108.846 108.647 108.42 108.155 108.012 107.528 107.545 107.37 107.19 106.711 106.413 106.116 105.791 105.4 104.948 104.299 102.513 -7 ,27352 ,KEBNE ,16690473,Thu Nov 25 08:16:03 CET,Thu Nov 25 08:17:12 CET,0.0 1.754 2.59 3.224 3.76 4.245 4.7 5.139 5.95 6.336 6.712 7.004 7.796 8.12 8.754 9.356 9.936 10.224 10.773 11.326 12.165 12.691 13.205 13.968 14.705 15.427 16.142 16.833 17.731 18.602 19.438 20.479 21.534 22.572 23.772 25.116 26.418 27.842 29.425 31.201 33.083 35.239 37.839 40.486 43.584 47.143 51.409 56.456 62.741 70.509 80.539 89.719 95.633 99.701 102.584 104.752 106.363 107.628 108.615 109.455 110.071 110.561 110.958 111.299 111.569 111.732 111.861 111.95 111.989 111.988 111.969 111.96 111.933 111.878 111.811 111.709 111.599 111.48 111.328 111.217 111.088 110.859 110.688 110.497 110.388 110.135 109.861 109.574 109.426 108.931 108.905 108.722 108.522 108.056 107.754 107.389 107.012 106.592 106.063 105.296 102.98 -8 ,13227 ,KEBNE ,16691199,Thu Nov 25 10:44:35 CET,Thu Nov 25 12:19:01 CET,0.0 1.889 2.722 3.368 3.892 4.37 4.815 5.23 6.022 6.401 6.773 7.059 7.845 8.178 8.825 9.445 10.024 10.312 10.886 11.438 12.241 12.768 13.289 14.043 14.757 15.456 16.158 16.852 17.731 18.575 19.414 20.468 21.494 22.482 23.618 24.911 26.195 27.609 29.145 30.828 32.628 34.667 37.144 39.693 42.711 46.194 50.372 55.299 61.403 69.143 79.27 88.561 94.528 98.618 101.573 103.852 105.513 106.822 107.81 108.675 109.3 109.769 110.128 110.397 110.63 110.808 110.971 111.078 111.128 111.147 111.136 111.11 111.059 110.953 110.862 110.769 110.651 110.504 110.349 110.222 110.068 109.842 109.679 109.501 109.403 109.193 108.972 108.716 108.574 108.088 108.074 107.878 107.665 107.17 106.879 106.539 106.182 105.806 105.3 104.587 102.49 -9 ,4397 ,KEBNE ,16690475,Thu Nov 25 08:16:04 CET,Thu Nov 25 08:17:23 CET,0.0 1.925 2.626 3.21 3.714 4.189 4.633 5.053 5.857 6.227 6.598 6.895 7.695 8.029 8.684 9.322 9.922 10.207 10.771 11.337 12.154 12.689 13.21 13.947 14.67 15.398 16.1 16.771 17.652 18.514 19.346 20.334 21.315 22.298 23.466 24.828 26.123 27.53 29.091 30.777 32.602 34.69 37.133 39.695 42.773 46.316 50.567 55.549 61.695 69.285 79.331 88.66 94.572 98.598 101.528 103.795 105.553 106.879 107.795 108.584 109.202 109.687 110.049 110.287 110.453 110.589 110.691 110.775 110.846 110.865 110.848 110.787 110.677 110.556 110.445 110.331 110.215 110.07 109.898 109.776 109.627 109.373 109.208 109.041 108.946 108.721 108.442 108.161 108.019 107.525 107.513 107.311 107.095 106.63 106.353 106.023 105.659 105.247 104.727 104.042 101.957 -10 ,15061 ,KEBNE ,16691201,Thu Nov 25 10:45:38 CET,Thu Nov 25 12:20:27 CET,0.0 1.864 2.691 3.349 3.909 4.414 4.876 5.329 6.167 6.551 6.922 7.196 7.983 8.329 8.969 9.581 10.194 10.488 11.076 11.637 12.46 12.996 13.495 14.218 14.93 15.653 16.367 17.059 17.952 18.843 19.709 20.747 21.784 22.8 23.973 25.305 26.602 28.035 29.61 31.318 33.169 35.307 37.882 40.545 43.673 47.222 51.463 56.509 62.678 70.389 80.541 89.751 95.639 99.707 102.626 104.869 106.552 107.875 108.855 109.683 110.286 110.732 111.061 111.278 111.429 111.554 111.656 111.715 111.77 111.778 111.695 111.611 111.549 111.468 111.388 111.294 111.176 111.028 110.869 110.76 110.645 110.445 110.289 110.091 109.974 109.743 109.504 109.244 109.09 108.577 108.57 108.393 108.211 107.803 107.54 107.227 106.867 106.461 105.974 105.311 103.432 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23469.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23469.txt deleted file mode 100644 index 48421549..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23469.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32694 ,KEBNE ,17025123,Wed Dec 22 11:57:19 CET,Wed Dec 22 13:31:29 CET,0.0 1.881 2.677 3.363 3.943 4.487 4.995 5.455 6.319 6.734 7.14 7.485 8.289 8.62 9.284 9.936 10.542 10.843 11.43 11.981 12.775 13.3 13.819 14.578 15.334 16.072 16.779 17.456 18.34 19.197 20.047 21.12 22.139 23.095 24.238 25.579 26.857 28.262 29.822 31.556 33.429 35.495 37.928 40.415 43.375 46.792 50.855 55.682 61.632 69.076 78.888 87.892 93.767 97.966 101.008 103.308 105.05 106.392 107.412 108.302 108.958 109.468 109.871 110.183 110.414 110.586 110.728 110.845 110.925 110.967 110.995 111.008 110.994 110.951 110.869 110.752 110.65 110.524 110.371 110.266 110.146 109.929 109.757 109.571 109.479 109.29 109.087 108.852 108.712 108.202 108.176 107.985 107.786 107.288 106.983 106.653 106.301 105.954 105.495 104.813 102.679 -2 ,2997 ,KEBNE ,17025124,Wed Dec 22 11:57:19 CET,Wed Dec 22 13:31:48 CET,0.0 1.939 2.875 3.58 4.218 4.801 5.307 5.787 6.689 7.095 7.491 7.825 8.635 8.984 9.653 10.302 10.918 11.211 11.796 12.389 13.247 13.795 14.324 15.083 15.826 16.531 17.216 17.895 18.789 19.658 20.501 21.506 22.483 23.456 24.603 25.904 27.156 28.569 30.131 31.797 33.56 35.591 38.012 40.494 43.488 46.941 51.026 55.82 61.746 69.248 79.145 88.112 93.911 98.002 101.014 103.343 105.059 106.412 107.417 108.266 108.9 109.386 109.8 110.111 110.316 110.497 110.669 110.758 110.789 110.771 110.733 110.705 110.667 110.627 110.584 110.509 110.413 110.302 110.155 110.042 109.925 109.725 109.582 109.441 109.349 109.135 108.91 108.635 108.488 107.987 107.949 107.747 107.538 107.05 106.758 106.448 106.091 105.657 105.098 104.342 102.188 -3 ,24041 ,KEBNE ,17025125,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:33:09 CET,0.0 2.015 2.884 3.548 4.142 4.673 5.162 5.654 6.556 6.963 7.337 7.588 8.381 8.723 9.37 9.995 10.585 10.87 11.434 11.974 12.767 13.28 13.811 14.624 15.385 16.094 16.78 17.448 18.323 19.204 20.041 21.038 22.05 23.052 24.183 25.437 26.683 28.12 29.695 31.367 33.176 35.228 37.636 40.147 43.144 46.557 50.617 55.386 61.28 68.668 78.492 87.656 93.573 97.731 100.785 103.079 104.772 106.099 107.097 107.952 108.592 109.078 109.494 109.86 110.137 110.305 110.374 110.437 110.492 110.513 110.525 110.507 110.44 110.349 110.297 110.22 110.109 109.981 109.832 109.733 109.609 109.39 109.235 109.065 108.975 108.749 108.48 108.215 108.078 107.577 107.559 107.365 107.156 106.7 106.425 106.112 105.77 105.356 104.815 103.987 101.38 -4 ,30203 ,KEBNE ,17025126,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:33:12 CET,0.0 1.742 2.613 3.308 3.917 4.446 4.954 5.448 6.318 6.713 7.103 7.409 8.202 8.544 9.197 9.826 10.434 10.729 11.345 11.983 12.879 13.453 14.025 14.835 15.581 16.285 16.995 17.694 18.577 19.443 20.285 21.324 22.353 23.309 24.405 25.709 26.995 28.429 30.006 31.716 33.51 35.547 38.036 40.569 43.537 46.893 50.866 55.563 61.396 68.768 78.556 87.577 93.453 97.624 100.615 102.83 104.51 105.856 106.884 107.78 108.445 108.934 109.302 109.598 109.811 109.974 110.128 110.248 110.319 110.35 110.361 110.344 110.304 110.201 110.107 110.048 109.991 109.882 109.699 109.568 109.453 109.25 109.083 108.898 108.807 108.595 108.344 108.072 107.92 107.417 107.413 107.22 107.024 106.557 106.275 105.958 105.612 105.183 104.607 103.797 101.25 -5 ,30875 ,KEBNE ,17025127,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:31:33 CET,0.0 2.42 3.279 3.976 4.585 5.122 5.651 6.168 7.078 7.496 7.891 8.203 9.019 9.356 10.013 10.703 11.383 11.709 12.324 12.905 13.717 14.244 14.763 15.512 16.246 16.966 17.666 18.359 19.255 20.094 20.905 21.893 22.864 23.831 24.981 26.267 27.511 28.893 30.411 32.073 33.835 35.831 38.223 40.682 43.64 47.116 51.219 56.023 61.95 69.428 79.299 88.314 94.232 98.424 101.49 103.847 105.621 107.03 108.083 108.974 109.615 110.073 110.424 110.744 110.989 111.145 111.281 111.368 111.44 111.497 111.511 111.505 111.476 111.381 111.284 111.201 111.112 110.984 110.835 110.73 110.616 110.431 110.263 110.067 109.966 109.756 109.56 109.333 109.179 108.654 108.635 108.453 108.262 107.817 107.537 107.207 106.842 106.403 105.849 105.1 103.362 -6 ,17872 ,KEBNE ,17025128,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:32:56 CET,0.0 2.361 3.322 4.083 4.719 5.277 5.786 6.253 7.175 7.604 8.007 8.355 9.173 9.537 10.258 10.947 11.607 11.915 12.503 13.076 13.902 14.443 14.974 15.76 16.523 17.26 17.974 18.651 19.557 20.469 21.342 22.38 23.403 24.403 25.553 26.838 28.084 29.459 30.976 32.608 34.321 36.281 38.664 41.185 44.196 47.584 51.595 56.282 61.998 69.225 78.713 87.361 93.012 96.964 99.814 101.922 103.504 104.757 105.664 106.417 106.936 107.328 107.659 107.926 108.118 108.218 108.293 108.378 108.416 108.381 108.354 108.317 108.258 108.197 108.139 108.068 107.966 107.829 107.675 107.574 107.458 107.249 107.084 106.891 106.779 106.524 106.259 106.01 105.879 105.393 105.4 105.215 105.007 104.477 104.133 103.759 103.36 102.939 102.433 101.729 99.875 -7 ,25858 ,KEBNE ,17025129,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:33:36 CET,0.0 1.572 2.454 3.187 3.823 4.389 4.893 5.365 6.251 6.669 7.058 7.349 8.145 8.478 9.129 9.742 10.336 10.64 11.255 11.844 12.679 13.205 13.717 14.484 15.236 15.965 16.67 17.346 18.2 19.037 19.867 20.883 21.871 22.845 24.003 25.305 26.591 28.035 29.578 31.24 33.019 35.049 37.482 39.961 42.918 46.359 50.463 55.298 61.29 68.733 78.415 87.48 93.493 97.663 100.672 103.03 104.8 106.128 107.083 107.914 108.568 109.088 109.507 109.849 110.093 110.298 110.488 110.606 110.677 110.716 110.728 110.748 110.763 110.74 110.696 110.625 110.525 110.389 110.235 110.119 109.98 109.759 109.6 109.443 109.366 109.178 108.977 108.75 108.613 108.114 108.14 107.968 107.76 107.266 106.976 106.655 106.281 105.814 105.258 104.466 102.278 -8 ,18272 ,KEBNE ,17025130,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:31:26 CET,0.0 2.045 2.956 3.698 4.332 4.888 5.395 5.866 6.754 7.168 7.56 7.869 8.677 9.022 9.676 10.298 10.902 11.197 11.764 12.336 13.176 13.704 14.237 15.016 15.749 16.473 17.181 17.856 18.729 19.578 20.412 21.456 22.463 23.441 24.603 25.905 27.161 28.567 30.103 31.719 33.444 35.443 37.863 40.396 43.383 46.801 50.89 55.7 61.583 68.971 78.751 87.749 93.627 97.727 100.682 102.909 104.6 105.94 106.947 107.81 108.451 108.966 109.397 109.753 110.019 110.192 110.33 110.422 110.477 110.535 110.564 110.544 110.505 110.422 110.353 110.29 110.192 110.089 109.956 109.827 109.688 109.476 109.34 109.181 109.083 108.884 108.679 108.426 108.286 107.794 107.769 107.576 107.362 106.841 106.547 106.216 105.85 105.426 104.918 104.219 102.423 -9 ,10743 ,KEBNE ,17025131,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:31:34 CET,0.0 3.231 4.386 5.184 5.8 6.352 6.872 7.328 8.139 8.529 8.91 9.188 9.991 10.344 11.045 11.702 12.313 12.606 13.171 13.732 14.557 15.102 15.632 16.384 17.101 17.797 18.472 19.123 19.989 20.846 21.681 22.7 23.705 24.695 25.847 27.163 28.44 29.854 31.399 33.049 34.802 36.828 39.24 41.704 44.716 48.222 52.362 57.167 62.953 70.213 79.917 88.858 94.678 98.762 101.757 104.071 105.829 107.205 108.233 109.129 109.754 110.201 110.59 110.904 111.143 111.34 111.512 111.633 111.712 111.767 111.783 111.763 111.726 111.681 111.609 111.516 111.423 111.294 111.148 111.033 110.895 110.668 110.524 110.377 110.286 110.077 109.844 109.579 109.442 108.952 108.964 108.794 108.613 108.143 107.845 107.513 107.147 106.713 106.18 105.433 103.429 -10 ,27562 ,KEBNE ,17025132,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:32:46 CET,0.0 1.572 2.486 3.195 3.763 4.289 4.797 5.272 6.119 6.517 6.898 7.169 7.965 8.308 8.97 9.595 10.216 10.52 11.093 11.658 12.506 13.037 13.543 14.292 15.014 15.722 16.415 17.076 17.941 18.81 19.65 20.687 21.698 22.67 23.829 25.141 26.39 27.793 29.342 31.017 32.803 34.855 37.294 39.787 42.778 46.193 50.302 55.203 61.119 68.47 78.251 87.287 93.143 97.309 100.254 102.427 104.139 105.497 106.499 107.34 107.933 108.409 108.814 109.132 109.404 109.6 109.754 109.862 109.876 109.852 109.842 109.807 109.757 109.689 109.61 109.522 109.424 109.309 109.182 109.087 108.965 108.764 108.628 108.465 108.372 108.143 107.887 107.621 107.471 106.968 106.949 106.741 106.508 106.01 105.76 105.44 105.081 104.679 104.14 103.387 101.193 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23471.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23471.txt deleted file mode 100644 index 809782b7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23472_23471.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8048 ,KEBNE ,16691202,Thu Nov 25 10:45:39 CET,Thu Nov 25 12:23:20 CET,0.0 1.962 2.909 3.613 4.244 4.807 5.297 5.764 6.601 6.977 7.337 7.545 8.299 8.614 9.26 9.883 10.455 10.729 11.252 11.746 12.462 12.925 13.375 14.034 14.668 15.293 15.909 16.492 17.243 17.981 18.727 19.605 20.41 21.227 22.178 23.224 24.259 25.427 26.73 28.12 29.521 31.089 32.939 34.84 37.129 39.803 42.992 46.64 51.094 56.612 63.554 69.647 73.411 75.879 77.595 78.796 79.597 80.183 80.587 80.911 81.146 81.261 81.283 81.269 81.212 81.157 81.09 80.982 80.853 80.679 80.469 80.269 80.053 79.838 79.67 79.462 79.228 78.992 78.702 78.482 78.257 77.908 77.647 77.359 77.215 76.901 76.574 76.213 76.001 75.404 75.318 75.067 74.765 74.086 73.732 73.342 72.886 72.395 71.781 70.848 65.298 -2 ,14053 ,KEBNE ,16691203,Thu Nov 25 10:45:38 CET,Thu Nov 25 12:20:25 CET,0.0 1.747 2.663 3.379 3.958 4.489 4.991 5.44 6.278 6.678 7.045 7.298 8.09 8.417 9.042 9.624 10.157 10.414 10.924 11.438 12.18 12.668 13.137 13.794 14.426 15.049 15.659 16.25 17.016 17.765 18.499 19.396 20.255 21.078 22.061 23.155 24.191 25.351 26.603 27.98 29.434 31.075 33.074 35.091 37.461 40.168 43.355 47.059 51.537 56.978 63.815 69.767 73.45 75.916 77.62 78.856 79.821 80.532 80.996 81.276 81.457 81.615 81.683 81.665 81.595 81.54 81.431 81.287 81.178 81.049 80.856 80.691 80.512 80.286 80.099 79.891 79.672 79.43 79.168 78.977 78.783 78.472 78.236 77.961 77.823 77.543 77.211 76.846 76.643 76.05 75.912 75.633 75.338 74.684 74.339 73.968 73.504 72.889 72.171 71.224 66.597 -3 ,926 ,KEBNE ,16691204,Thu Nov 25 10:47:45 CET,Thu Nov 25 12:22:20 CET,0.0 1.598 2.385 3.045 3.651 4.219 4.74 5.231 6.087 6.461 6.822 7.07 7.841 8.16 8.76 9.315 9.841 10.101 10.62 11.116 11.846 12.317 12.758 13.416 14.07 14.705 15.313 15.886 16.634 17.37 18.083 18.933 19.757 20.581 21.54 22.621 23.685 24.838 26.073 27.404 28.814 30.402 32.285 34.251 36.58 39.202 42.314 45.909 50.223 55.537 62.303 68.351 72.096 74.498 76.191 77.469 78.403 79.072 79.502 79.807 79.96 80.073 80.176 80.215 80.183 80.103 79.968 79.821 79.683 79.509 79.329 79.196 79.031 78.828 78.639 78.445 78.224 77.978 77.734 77.544 77.343 77.031 76.794 76.525 76.387 76.105 75.795 75.421 75.203 74.617 74.531 74.267 73.983 73.366 72.98 72.546 72.088 71.495 70.704 69.678 62.151 -4 ,18783 ,KEBNE ,16691205,Thu Nov 25 10:47:45 CET,Thu Nov 25 12:20:11 CET,0.0 1.8 2.649 3.303 3.862 4.362 4.861 5.329 6.157 6.545 6.921 7.188 7.974 8.295 8.906 9.495 10.057 10.328 10.883 11.445 12.244 12.715 13.156 13.812 14.459 15.1 15.71 16.309 17.094 17.84 18.535 19.38 20.201 20.981 21.902 22.957 23.95 25.053 26.281 27.573 28.904 30.473 32.426 34.458 36.807 39.425 42.483 45.969 50.224 55.534 62.338 68.254 71.971 74.469 76.205 77.501 78.386 79.016 79.419 79.719 79.917 80.033 80.091 80.119 80.129 80.108 80.031 79.924 79.821 79.697 79.542 79.384 79.184 78.944 78.752 78.545 78.307 78.066 77.825 77.627 77.412 77.074 76.805 76.494 76.336 76.008 75.662 75.307 75.106 74.528 74.414 74.143 73.853 73.208 72.837 72.384 71.897 71.337 70.584 69.565 65.8 -5 ,13719 ,KEBNE ,16690481,Thu Nov 25 08:16:03 CET,Thu Nov 25 08:17:25 CET,0.0 3.402 4.277 4.938 5.539 6.091 6.58 7.029 7.884 8.266 8.627 8.907 9.683 10.018 10.702 11.35 11.945 12.229 12.787 13.314 14.086 14.581 15.068 15.736 16.352 16.97 17.579 18.188 18.99 19.772 20.486 21.288 22.103 22.924 23.867 24.937 26.001 27.182 28.455 29.803 31.218 32.828 34.701 36.6 38.873 41.471 44.553 48.159 52.479 57.773 64.548 70.5 74.2 76.697 78.449 79.75 80.646 81.265 81.702 82.075 82.312 82.437 82.499 82.511 82.471 82.414 82.333 82.196 82.048 81.898 81.713 81.542 81.36 81.127 80.913 80.697 80.481 80.229 79.947 79.746 79.526 79.164 78.886 78.589 78.432 78.096 77.731 77.323 77.102 76.516 76.399 76.123 75.835 75.161 74.781 74.352 73.865 73.259 72.422 71.315 66.992 -6 ,32061 ,KEBNE ,16690482,Thu Nov 25 08:16:03 CET,Thu Nov 25 08:17:16 CET,0.0 1.808 2.794 3.577 4.182 4.698 5.156 5.594 6.407 6.787 7.166 7.444 8.23 8.565 9.183 9.776 10.368 10.654 11.226 11.781 12.551 13.052 13.542 14.225 14.879 15.53 16.168 16.795 17.617 18.42 19.188 20.082 20.959 21.818 22.786 23.907 25.02 26.227 27.506 28.863 30.347 32.003 33.929 35.902 38.215 40.859 43.997 47.613 52.017 57.474 64.284 70.175 73.762 76.137 77.917 79.357 80.351 81.006 81.421 81.767 82.004 82.099 82.127 82.127 82.081 82.024 81.948 81.842 81.726 81.607 81.462 81.289 81.09 80.877 80.686 80.471 80.245 80.027 79.769 79.55 79.334 79.018 78.775 78.512 78.381 78.1 77.769 77.381 77.164 76.585 76.504 76.253 75.979 75.379 75.025 74.587 74.087 73.484 72.727 71.666 64.57 -7 ,7991 ,KEBNE ,16690483,Thu Nov 25 08:16:03 CET,Thu Nov 25 08:17:03 CET,0.0 1.971 2.889 3.659 4.295 4.836 5.322 5.794 6.667 7.052 7.416 7.676 8.453 8.772 9.384 9.964 10.537 10.819 11.35 11.869 12.627 13.107 13.581 14.262 14.909 15.561 16.199 16.797 17.58 18.36 19.121 20.044 20.922 21.775 22.758 23.852 24.922 26.102 27.365 28.755 30.274 32.008 34.031 36.023 38.335 41.028 44.196 47.816 52.24 57.674 64.533 70.711 74.544 77.066 78.796 79.972 80.793 81.47 81.929 82.257 82.481 82.575 82.608 82.617 82.583 82.525 82.417 82.277 82.111 81.903 81.681 81.512 81.338 81.118 80.914 80.683 80.431 80.174 79.914 79.703 79.487 79.148 78.876 78.587 78.434 78.098 77.703 77.264 77.041 76.451 76.362 76.096 75.802 75.167 74.794 74.384 73.923 73.392 72.762 71.718 64.108 -8 ,25637 ,KEBNE ,16691209,Thu Nov 25 10:48:48 CET,Thu Nov 25 12:23:04 CET,0.0 2.279 3.204 3.848 4.424 4.983 5.475 5.893 6.685 7.066 7.419 7.642 8.401 8.696 9.257 9.816 10.356 10.615 11.129 11.639 12.381 12.862 13.325 13.973 14.595 15.203 15.808 16.408 17.182 17.895 18.581 19.427 20.227 21.006 21.94 22.98 23.963 25.087 26.315 27.627 29.033 30.64 32.542 34.504 36.847 39.459 42.554 46.146 50.461 55.747 62.485 68.455 72.232 74.787 76.544 77.862 78.782 79.449 79.852 80.103 80.268 80.366 80.418 80.441 80.425 80.361 80.269 80.165 80.058 79.91 79.699 79.502 79.306 79.089 78.892 78.689 78.451 78.181 77.901 77.694 77.474 77.135 76.879 76.593 76.437 76.099 75.737 75.369 75.168 74.569 74.428 74.147 73.836 73.112 72.701 72.278 71.867 71.361 70.624 69.598 65.926 -9 ,1875 ,KEBNE ,16691210,Thu Nov 25 10:48:48 CET,Thu Nov 25 12:25:35 CET,0.0 2.318 3.33 4.092 4.665 5.162 5.648 6.101 6.924 7.328 7.738 8.041 8.818 9.138 9.734 10.318 10.877 11.143 11.662 12.159 12.885 13.353 13.793 14.43 15.073 15.735 16.383 16.995 17.764 18.501 19.224 20.125 21.003 21.867 22.883 23.998 25.074 26.257 27.523 28.858 30.256 31.856 33.748 35.705 38.017 40.599 43.612 47.119 51.388 56.537 63.23 69.265 73.027 75.577 77.37 78.587 79.436 80.101 80.537 80.88 81.055 81.145 81.221 81.254 81.224 81.152 81.033 80.855 80.66 80.454 80.248 80.07 79.88 79.666 79.472 79.266 79.03 78.765 78.474 78.27 78.068 77.709 77.432 77.127 76.983 76.673 76.314 75.952 75.758 75.172 75.015 74.735 74.435 73.766 73.378 72.95 72.451 71.827 71.05 69.97 65.257 -10 ,4901 ,KEBNE ,16690486,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:05 CET,0.0 1.905 2.743 3.416 4.011 4.57 5.06 5.504 6.341 6.727 7.086 7.333 8.107 8.425 9.033 9.607 10.181 10.468 11.023 11.548 12.304 12.794 13.265 13.936 14.581 15.206 15.806 16.404 17.177 17.905 18.63 19.502 20.341 21.176 22.16 23.261 24.307 25.45 26.684 28.018 29.443 31.078 33.036 35.055 37.407 40.121 43.325 46.93 51.277 56.558 63.3 69.283 73.012 75.515 77.188 78.353 79.211 79.849 80.222 80.491 80.656 80.748 80.78 80.745 80.678 80.56 80.407 80.271 80.162 80.055 79.896 79.723 79.518 79.269 79.055 78.842 78.624 78.396 78.166 77.987 77.771 77.407 77.127 76.815 76.665 76.364 76.051 75.696 75.483 74.882 74.788 74.547 74.269 73.642 73.306 72.907 72.432 71.879 71.181 70.172 66.004 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23473_23467.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23473_23467.txt deleted file mode 100644 index c7a2ec06..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23473_23467.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18764 ,KEBNE ,16691212,Thu Nov 25 10:50:53 CET,Thu Nov 25 12:27:02 CET,0.0 1.463 2.12 2.622 3.032 3.465 3.852 4.17 4.732 4.997 5.26 5.428 5.972 6.17 6.543 6.907 7.235 7.394 7.712 8.011 8.434 8.705 8.96 9.32 9.647 9.971 10.294 10.603 11.027 11.443 11.845 12.305 12.698 13.042 13.446 13.902 14.343 14.857 15.363 15.837 16.329 16.869 17.522 18.217 18.953 19.684 20.43 21.118 21.778 22.354 22.671 22.33 21.687 20.942 20.2 19.422 18.683 18.004 17.374 16.68 16.005 15.406 14.848 14.277 13.729 13.253 12.746 12.288 11.886 11.453 10.997 10.587 10.148 9.718 9.376 8.989 8.581 8.155 7.711 7.4 7.09 6.6 6.243 5.848 5.634 5.184 4.708 4.194 3.93 3.363 3.073 2.748 2.404 1.636 1.168 0.653 0.111 -0.515 -1.34 -2.49 -8.408 -2 ,19442 ,KEBNE ,16690488,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:12 CET,0.0 1.277 1.915 2.404 2.793 3.139 3.468 3.774 4.322 4.572 4.801 4.908 5.429 5.628 6.004 6.364 6.714 6.893 7.221 7.528 7.974 8.243 8.501 8.877 9.235 9.598 9.942 10.25 10.634 10.994 11.339 11.749 12.151 12.538 12.975 13.469 13.934 14.421 14.911 15.446 15.979 16.502 17.113 17.725 18.401 19.129 19.923 20.694 21.452 22.201 22.693 22.487 21.901 21.229 20.522 19.779 19.043 18.304 17.678 17.018 16.399 15.833 15.265 14.71 14.177 13.699 13.211 12.759 12.33 11.843 11.313 10.864 10.414 9.944 9.575 9.196 8.799 8.384 7.93 7.613 7.28 6.716 6.318 5.916 5.71 5.257 4.764 4.251 3.982 3.393 3.129 2.819 2.491 1.777 1.365 0.908 0.397 -0.235 -1.087 -2.302 -6.699 -3 ,31778 ,KEBNE ,16691214,Thu Nov 25 11:04:23 CET,Thu Nov 25 12:36:50 CET,0.0 1.583 2.233 2.698 3.088 3.442 3.763 4.054 4.6 4.859 5.108 5.247 5.768 5.964 6.35 6.702 7.024 7.18 7.487 7.793 8.229 8.502 8.759 9.119 9.487 9.828 10.124 10.417 10.799 11.192 11.568 11.996 12.407 12.794 13.24 13.738 14.197 14.678 15.158 15.661 16.206 16.785 17.393 17.957 18.603 19.302 20.075 20.943 21.843 22.583 23.001 22.746 22.126 21.454 20.757 20.004 19.308 18.633 17.99 17.28 16.633 16.068 15.524 14.963 14.429 13.958 13.452 12.973 12.547 12.113 11.663 11.283 10.876 10.435 10.091 9.723 9.33 8.891 8.397 8.074 7.748 7.233 6.873 6.506 6.309 5.849 5.372 4.899 4.633 4.034 3.758 3.46 3.146 2.4 1.922 1.401 0.878 0.297 -0.451 -1.529 -5.642 -4 ,8310 ,KEBNE ,16690490,Thu Nov 25 08:18:12 CET,Thu Nov 25 08:19:16 CET,0.0 2.463 3.319 3.838 4.3 4.734 5.121 5.444 6.002 6.256 6.493 6.622 7.159 7.376 7.797 8.216 8.607 8.781 9.096 9.388 9.791 10.043 10.294 10.656 11.009 11.338 11.656 11.97 12.38 12.789 13.149 13.568 13.975 14.366 14.823 15.352 15.829 16.29 16.821 17.369 17.877 18.432 19.062 19.666 20.357 21.076 21.815 22.546 23.227 23.83 24.195 23.946 23.379 22.76 22.121 21.422 20.722 20.052 19.452 18.785 18.192 17.646 17.065 16.52 16.024 15.549 15.029 14.576 14.173 13.74 13.281 12.864 12.426 11.967 11.601 11.202 10.782 10.376 9.959 9.657 9.319 8.766 8.39 8.001 7.792 7.353 6.897 6.405 6.138 5.555 5.296 4.989 4.642 3.912 3.495 3.006 2.452 1.797 0.976 -0.092 -4.69 -5 ,23038 ,KEBNE ,16691216,Thu Nov 25 11:04:24 CET,Thu Nov 25 12:37:25 CET,0.0 1.276 1.906 2.375 2.791 3.138 3.454 3.776 4.364 4.611 4.838 4.955 5.49 5.698 6.077 6.425 6.76 6.926 7.24 7.539 7.965 8.251 8.541 8.94 9.294 9.634 9.982 10.302 10.707 11.118 11.482 11.889 12.309 12.711 13.147 13.641 14.085 14.538 15.027 15.547 16.098 16.665 17.244 17.805 18.437 19.095 19.797 20.525 21.252 21.905 22.361 22.203 21.612 20.816 20.027 19.286 18.558 17.813 17.077 16.318 15.707 15.165 14.612 14.063 13.54 13.039 12.506 12.035 11.618 11.174 10.666 10.229 9.801 9.343 8.992 8.629 8.233 7.81 7.34 7.016 6.689 6.171 5.824 5.47 5.27 4.852 4.44 3.999 3.761 3.18 2.88 2.558 2.219 1.412 0.951 0.476 -0.065 -0.718 -1.504 -2.637 -7.713 -6 ,30102 ,KEBNE ,16691217,Thu Nov 25 11:17:56 CET,Thu Nov 25 12:49:50 CET,0.0 1.173 1.783 2.25 2.64 2.999 3.35 3.671 4.225 4.478 4.718 4.856 5.385 5.583 5.957 6.326 6.662 6.832 7.178 7.492 7.937 8.215 8.478 8.854 9.221 9.557 9.872 10.19 10.573 10.927 11.289 11.699 12.064 12.446 12.907 13.414 13.911 14.43 14.946 15.468 16.007 16.588 17.22 17.853 18.543 19.231 19.954 20.699 21.493 22.187 22.517 22.21 21.548 20.823 20.115 19.407 18.77 18.137 17.529 16.868 16.252 15.678 15.113 14.58 14.087 13.627 13.135 12.676 12.253 11.795 11.307 10.856 10.374 9.9 9.545 9.149 8.717 8.3 7.857 7.549 7.235 6.713 6.327 5.951 5.763 5.334 4.869 4.377 4.113 3.517 3.246 2.934 2.568 1.748 1.309 0.834 0.285 -0.341 -1.105 -2.074 -6.804 -7 ,16378 ,KEBNE ,16690493,Thu Nov 25 08:18:12 CET,Thu Nov 25 08:19:12 CET,0.0 1.293 2.012 2.535 2.974 3.375 3.726 4.025 4.528 4.755 4.976 5.068 5.586 5.798 6.204 6.588 6.929 7.09 7.406 7.699 8.133 8.409 8.671 9.046 9.407 9.759 10.099 10.426 10.852 11.248 11.607 12.054 12.477 12.851 13.285 13.76 14.191 14.662 15.156 15.663 16.203 16.81 17.49 18.129 18.836 19.557 20.288 21.046 21.798 22.44 22.876 22.662 22.114 21.48 20.82 20.149 19.41 18.714 18.135 17.468 16.844 16.28 15.739 15.213 14.686 14.198 13.677 13.182 12.727 12.245 11.773 11.394 10.975 10.534 10.19 9.807 9.41 9.0 8.555 8.247 7.93 7.412 7.06 6.709 6.518 6.102 5.629 5.111 4.851 4.263 3.951 3.613 3.263 2.559 2.186 1.728 1.203 0.578 -0.261 -1.504 -6.603 -8 ,11662 ,KEBNE ,16690494,Thu Nov 25 08:18:03 CET,Thu Nov 25 08:19:00 CET,0.0 1.175 1.821 2.318 2.732 3.125 3.503 3.835 4.367 4.627 4.877 5.002 5.517 5.706 6.062 6.398 6.728 6.889 7.192 7.498 7.957 8.243 8.512 8.882 9.233 9.603 9.974 10.312 10.71 11.077 11.435 11.866 12.287 12.709 13.175 13.651 14.117 14.651 15.168 15.657 16.192 16.773 17.395 17.982 18.666 19.421 20.194 20.914 21.591 22.268 22.625 22.442 21.927 21.229 20.481 19.747 19.069 18.417 17.76 17.055 16.491 15.942 15.398 14.874 14.33 13.816 13.305 12.847 12.416 11.954 11.464 11.052 10.626 10.169 9.816 9.436 9.03 8.615 8.157 7.829 7.493 6.96 6.599 6.252 6.068 5.628 5.123 4.602 4.333 3.746 3.481 3.186 2.867 2.08 1.644 1.166 0.64 0.032 -0.779 -1.829 -5.36 -9 ,4158 ,KEBNE ,16690495,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:00 CET,0.0 1.309 1.923 2.466 2.924 3.294 3.625 3.932 4.479 4.719 4.956 5.111 5.642 5.831 6.221 6.601 6.953 7.125 7.443 7.734 8.175 8.479 8.769 9.173 9.543 9.909 10.264 10.604 11.023 11.4 11.766 12.177 12.547 12.913 13.373 13.895 14.365 14.862 15.381 15.907 16.422 16.972 17.585 18.167 18.824 19.515 20.238 20.96 21.705 22.347 22.727 22.483 21.924 21.293 20.609 19.896 19.184 18.456 17.811 17.17 16.586 16.03 15.456 14.877 14.355 13.894 13.37 12.873 12.451 12.009 11.533 11.128 10.666 10.166 9.784 9.401 9.023 8.608 8.17 7.876 7.564 7.065 6.702 6.301 6.097 5.679 5.218 4.7 4.426 3.845 3.582 3.272 2.927 2.102 1.631 1.11 0.536 -0.102 -0.88 -1.9 -6.925 -10 ,21791 ,KEBNE ,16691221,Thu Nov 25 11:32:28 CET,Thu Nov 25 13:07:26 CET,0.0 1.152 1.743 2.201 2.587 2.924 3.221 3.503 4.036 4.278 4.515 4.678 5.203 5.399 5.793 6.144 6.461 6.619 6.941 7.246 7.686 7.975 8.245 8.631 9.003 9.346 9.663 9.975 10.39 10.797 11.191 11.633 12.032 12.392 12.801 13.259 13.697 14.17 14.665 15.174 15.674 16.245 16.895 17.497 18.166 18.903 19.719 20.487 21.204 21.777 22.04 21.811 21.204 20.497 19.797 19.098 18.405 17.678 17.009 16.328 15.727 15.185 14.638 14.09 13.575 13.076 12.557 12.092 11.636 11.142 10.64 10.211 9.761 9.281 8.907 8.532 8.131 7.699 7.251 6.94 6.611 6.08 5.685 5.299 5.118 4.708 4.244 3.764 3.501 2.909 2.676 2.392 2.077 1.38 0.998 0.592 0.112 -0.505 -1.219 -2.259 -6.525 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt deleted file mode 100644 index 6a73f6ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_20669-2qbr-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26154 ,KEBNE ,16690497,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:16 CET,0.0 1.591 2.262 2.771 3.191 3.563 3.893 4.186 4.72 4.969 5.208 5.32 5.867 6.078 6.451 6.79 7.134 7.306 7.632 7.931 8.346 8.613 8.871 9.257 9.636 9.993 10.349 10.68 11.062 11.444 11.803 12.231 12.638 13.003 13.422 13.902 14.37 14.847 15.324 15.844 16.363 16.917 17.545 18.15 18.817 19.534 20.336 21.14 21.913 22.662 23.216 23.205 22.817 22.233 21.65 21.086 20.505 19.867 19.216 18.575 18.025 17.523 17.027 16.504 16.001 15.58 15.147 14.734 14.351 13.935 13.523 13.16 12.732 12.292 11.963 11.6 11.214 10.846 10.474 10.199 9.906 9.423 9.086 8.731 8.534 8.138 7.742 7.304 7.066 6.499 6.365 6.102 5.824 5.192 4.835 4.47 4.083 3.622 3.087 2.275 0.169 -2 ,4870 ,KEBNE ,16691223,Thu Nov 25 11:59:35 CET,Thu Nov 25 13:31:36 CET,0.0 1.511 2.107 2.598 3.027 3.39 3.728 4.047 4.615 4.881 5.137 5.27 5.82 6.024 6.394 6.742 7.089 7.257 7.578 7.878 8.32 8.6 8.861 9.241 9.589 9.914 10.229 10.539 10.947 11.353 11.735 12.167 12.554 12.941 13.408 13.899 14.36 14.841 15.317 15.818 16.37 16.96 17.613 18.256 18.967 19.697 20.471 21.284 22.087 22.861 23.441 23.445 23.039 22.458 21.807 21.126 20.477 19.827 19.283 18.697 18.159 17.672 17.149 16.63 16.159 15.743 15.271 14.812 14.412 14.004 13.58 13.207 12.801 12.389 12.077 11.748 11.398 11.027 10.626 10.356 10.07 9.594 9.274 8.933 8.746 8.314 7.823 7.354 7.123 6.555 6.363 6.083 5.816 5.203 4.843 4.441 3.954 3.41 2.771 2.002 -0.139 -3 ,25567 ,KEBNE ,16691224,Thu Nov 25 12:00:33 CET,Thu Nov 25 13:37:36 CET,0.0 1.229 1.791 2.278 2.678 3.04 3.382 3.701 4.28 4.549 4.817 4.983 5.542 5.741 6.133 6.511 6.865 7.029 7.342 7.641 8.055 8.321 8.582 8.969 9.335 9.67 9.993 10.319 10.725 11.118 11.535 12.017 12.429 12.817 13.237 13.688 14.138 14.644 15.139 15.634 16.17 16.748 17.384 18.035 18.77 19.556 20.417 21.248 22.027 22.743 23.245 23.209 22.798 22.173 21.518 20.879 20.29 19.719 19.18 18.577 18.007 17.488 16.963 16.479 16.06 15.631 15.158 14.756 14.4 14.007 13.57 13.203 12.814 12.403 12.081 11.734 11.377 10.99 10.568 10.272 9.968 9.503 9.172 8.83 8.666 8.323 7.933 7.526 7.312 6.754 6.588 6.323 6.033 5.377 5.043 4.719 4.337 3.841 3.23 2.409 0.203 -4 ,970 ,KEBNE ,16690500,Thu Nov 25 08:18:05 CET,Thu Nov 25 08:19:25 CET,0.0 1.489 2.122 2.626 3.066 3.465 3.806 4.112 4.646 4.897 5.151 5.28 5.819 6.016 6.396 6.755 7.095 7.26 7.585 7.912 8.387 8.677 8.97 9.39 9.759 10.111 10.444 10.758 11.158 11.548 11.927 12.391 12.832 13.243 13.699 14.186 14.626 15.095 15.596 16.124 16.677 17.272 17.941 18.591 19.266 19.979 20.806 21.699 22.589 23.392 24.1 24.257 23.964 23.583 23.074 22.538 22.084 21.594 21.082 20.508 19.998 19.499 18.998 18.521 18.044 17.605 17.15 16.691 16.284 15.875 15.432 15.065 14.696 14.306 13.995 13.676 13.33 12.962 12.568 12.294 12.007 11.531 11.2 10.86 10.668 10.262 9.864 9.434 9.198 8.602 8.393 8.113 7.828 7.226 6.885 6.49 6.078 5.613 5.016 4.299 2.212 -5 ,29906 ,KEBNE ,16690501,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:23 CET,0.0 1.249 1.814 2.256 2.683 3.06 3.392 3.714 4.311 4.58 4.823 4.957 5.515 5.741 6.186 6.594 6.957 7.138 7.487 7.803 8.239 8.493 8.746 9.139 9.5 9.837 10.179 10.5 10.898 11.278 11.629 12.037 12.404 12.76 13.183 13.646 14.077 14.553 15.079 15.618 16.149 16.768 17.493 18.119 18.771 19.448 20.195 21.006 21.837 22.638 23.249 23.243 22.802 22.235 21.637 20.988 20.367 19.764 19.166 18.534 17.988 17.473 16.959 16.467 15.985 15.521 15.043 14.608 14.225 13.826 13.393 13.033 12.656 12.246 11.904 11.535 11.146 10.737 10.33 10.044 9.753 9.289 8.963 8.624 8.434 8.039 7.639 7.229 7.017 6.462 6.311 6.055 5.766 5.115 4.774 4.402 3.991 3.532 2.907 2.057 0.219 -6 ,10485 ,KEBNE ,16690502,Thu Nov 25 08:18:03 CET,Thu Nov 25 08:19:22 CET,0.0 2.227 2.899 3.379 3.785 4.156 4.51 4.84 5.428 5.679 5.913 6.037 6.59 6.805 7.219 7.599 7.954 8.125 8.447 8.742 9.16 9.439 9.721 10.115 10.471 10.801 11.125 11.45 11.876 12.28 12.661 13.107 13.53 13.937 14.382 14.829 15.212 15.644 16.133 16.667 17.245 17.872 18.545 19.194 19.928 20.643 21.382 22.146 22.914 23.657 24.175 24.104 23.752 23.259 22.709 22.163 21.616 21.029 20.464 19.873 19.299 18.783 18.264 17.722 17.187 16.678 16.158 15.715 15.357 14.985 14.545 14.156 13.754 13.318 12.981 12.626 12.259 11.896 11.498 11.2 10.866 10.309 9.936 9.569 9.387 9.018 8.626 8.201 7.976 7.407 7.252 7.007 6.766 6.226 5.911 5.546 5.098 4.56 3.897 3.067 1.212 -7 ,6150 ,KEBNE ,16690503,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:20 CET,0.0 1.3 1.94 2.429 2.859 3.253 3.608 3.915 4.478 4.739 4.972 5.083 5.618 5.808 6.19 6.568 6.93 7.101 7.424 7.739 8.206 8.489 8.75 9.12 9.476 9.825 10.157 10.483 10.884 11.283 11.672 12.101 12.514 12.899 13.332 13.809 14.245 14.711 15.198 15.728 16.295 16.896 17.594 18.238 18.916 19.62 20.352 21.145 21.985 22.775 23.33 23.312 22.936 22.286 21.583 20.94 20.276 19.612 19.006 18.343 17.786 17.287 16.774 16.3 15.841 15.387 14.89 14.447 14.05 13.647 13.22 12.842 12.455 12.045 11.717 11.346 10.948 10.541 10.13 9.858 9.569 9.118 8.81 8.492 8.33 7.989 7.637 7.245 7.023 6.464 6.318 6.056 5.775 5.171 4.821 4.415 3.958 3.441 2.816 1.984 -0.074 -8 ,18405 ,KEBNE ,16690504,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:14 CET,0.0 1.274 1.905 2.374 2.757 3.123 3.451 3.746 4.29 4.541 4.783 4.893 5.44 5.649 6.038 6.418 6.775 6.938 7.269 7.594 8.058 8.35 8.631 9.064 9.474 9.834 10.173 10.501 10.904 11.279 11.626 12.055 12.478 12.879 13.359 13.904 14.381 14.842 15.372 15.958 16.521 17.091 17.697 18.275 18.923 19.632 20.407 21.166 21.933 22.661 23.215 23.157 22.806 22.358 21.823 21.321 20.8 20.221 19.671 19.056 18.501 18.018 17.549 17.058 16.568 16.112 15.612 15.186 14.823 14.422 13.988 13.632 13.278 12.904 12.598 12.261 11.881 11.465 11.051 10.778 10.493 10.044 9.731 9.39 9.21 8.844 8.444 8.038 7.838 7.293 7.158 6.899 6.618 5.998 5.648 5.261 4.842 4.395 3.862 3.053 0.87 -9 ,16250 ,KEBNE ,16691230,Thu Nov 25 12:00:37 CET,Thu Nov 25 13:31:23 CET,0.0 1.228 1.892 2.364 2.776 3.13 3.428 3.71 4.257 4.518 4.758 4.876 5.424 5.629 6.04 6.433 6.776 6.933 7.227 7.508 7.933 8.215 8.488 8.903 9.298 9.63 9.943 10.272 10.674 11.025 11.36 11.785 12.187 12.559 13.004 13.483 13.909 14.38 14.891 15.419 15.978 16.588 17.214 17.831 18.571 19.307 20.094 20.981 21.874 22.627 23.066 22.972 22.509 21.91 21.318 20.702 20.106 19.533 18.995 18.392 17.832 17.325 16.841 16.349 15.878 15.442 14.966 14.531 14.16 13.767 13.344 12.987 12.602 12.194 11.868 11.525 11.183 10.814 10.414 10.139 9.856 9.433 9.119 8.789 8.625 8.274 7.892 7.475 7.25 6.675 6.508 6.233 5.933 5.308 4.984 4.612 4.189 3.711 3.134 2.317 -0.3 -10 ,20095 ,KEBNE ,16691231,Thu Nov 25 12:04:43 CET,Thu Nov 25 13:39:50 CET,0.0 1.613 2.333 2.848 3.269 3.624 3.948 4.261 4.814 5.065 5.316 5.447 5.994 6.203 6.618 6.999 7.35 7.517 7.827 8.119 8.555 8.819 9.068 9.444 9.819 10.172 10.494 10.818 11.225 11.594 11.946 12.372 12.783 13.172 13.594 14.049 14.475 14.949 15.471 16.007 16.568 17.169 17.81 18.398 19.073 19.84 20.672 21.496 22.278 22.993 23.57 23.568 23.142 22.548 21.943 21.335 20.691 20.065 19.482 18.853 18.284 17.74 17.24 16.769 16.306 15.855 15.337 14.891 14.521 14.136 13.723 13.354 12.956 12.524 12.19 11.856 11.515 11.159 10.778 10.516 10.204 9.678 9.359 9.038 8.86 8.494 8.132 7.747 7.534 6.974 6.811 6.549 6.282 5.705 5.364 4.987 4.589 4.116 3.562 2.867 0.704 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_23475.txt deleted file mode 100644 index 834fd5a4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23474_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16131 ,KEBNE ,17025133,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:35:05 CET,0.0 1.743 2.394 2.89 3.279 3.627 3.965 4.286 4.83 5.085 5.34 5.476 6.019 6.223 6.594 6.924 7.253 7.417 7.734 8.032 8.461 8.733 8.973 9.342 9.718 10.056 10.367 10.659 11.017 11.374 11.731 12.124 12.49 12.866 13.285 13.702 14.071 14.501 14.969 15.421 15.885 16.398 16.956 17.471 17.995 18.498 19.02 19.5 19.894 20.126 19.902 19.087 18.144 17.179 16.265 15.379 14.6 13.858 13.192 12.509 11.839 11.187 10.577 10.006 9.448 8.92 8.388 7.917 7.523 7.113 6.629 6.215 5.793 5.358 5.009 4.657 4.302 3.929 3.511 3.198 2.868 2.346 1.989 1.643 1.46 1.073 0.683 0.249 0.017 -0.559 -0.749 -1.043 -1.348 -2.009 -2.371 -2.765 -3.215 -3.748 -4.376 -5.23 -8.311 -2 ,14937 ,KEBNE ,17025134,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:34:38 CET,0.0 1.725 2.344 2.83 3.271 3.67 4.036 4.361 4.914 5.164 5.406 5.52 6.071 6.287 6.695 7.076 7.428 7.592 7.902 8.184 8.573 8.822 9.094 9.487 9.803 10.115 10.442 10.741 11.109 11.463 11.794 12.165 12.527 12.874 13.265 13.709 14.124 14.549 14.979 15.429 15.874 16.344 16.848 17.293 17.767 18.248 18.732 19.171 19.565 19.809 19.647 18.943 18.092 17.137 16.22 15.391 14.599 13.861 13.173 12.443 11.801 11.205 10.65 10.117 9.597 9.109 8.565 8.062 7.628 7.179 6.705 6.31 5.914 5.492 5.148 4.783 4.411 4.028 3.611 3.317 3.002 2.492 2.132 1.773 1.592 1.203 0.787 0.329 0.081 -0.507 -0.706 -0.997 -1.313 -1.976 -2.339 -2.723 -3.15 -3.671 -4.299 -5.055 -7.313 -3 ,16737 ,KEBNE ,17025135,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:32:21 CET,0.0 1.589 2.279 2.798 3.226 3.584 3.894 4.182 4.709 4.956 5.187 5.283 5.857 6.099 6.489 6.822 7.139 7.296 7.599 7.889 8.292 8.536 8.783 9.143 9.464 9.766 10.076 10.399 10.795 11.157 11.502 11.885 12.264 12.644 13.044 13.456 13.853 14.273 14.706 15.144 15.588 16.046 16.586 17.143 17.673 18.194 18.756 19.284 19.725 19.988 19.743 18.847 17.928 17.053 16.241 15.419 14.62 13.842 13.106 12.326 11.682 11.117 10.52 9.949 9.419 8.893 8.347 7.883 7.481 7.047 6.586 6.199 5.784 5.344 5.007 4.652 4.276 3.882 3.487 3.207 2.9 2.404 2.054 1.699 1.524 1.164 0.783 0.358 0.128 -0.451 -0.622 -0.906 -1.21 -1.866 -2.224 -2.627 -3.073 -3.577 -4.214 -5.048 -7.72 -4 ,27588 ,KEBNE ,17025136,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:32:24 CET,0.0 1.823 2.57 3.113 3.564 3.972 4.323 4.631 5.223 5.497 5.735 5.838 6.383 6.575 6.936 7.292 7.628 7.787 8.088 8.367 8.776 9.054 9.327 9.704 10.043 10.351 10.658 10.957 11.331 11.676 11.994 12.409 12.815 13.186 13.605 14.044 14.429 14.845 15.308 15.752 16.178 16.689 17.26 17.789 18.348 18.871 19.386 19.966 20.454 20.647 20.427 19.645 18.786 17.861 16.926 16.09 15.347 14.591 13.871 13.115 12.424 11.805 11.242 10.694 10.169 9.704 9.187 8.672 8.219 7.778 7.284 6.852 6.412 5.95 5.598 5.241 4.873 4.465 4.034 3.748 3.437 2.918 2.554 2.177 1.981 1.594 1.187 0.738 0.501 -0.084 -0.257 -0.531 -0.823 -1.468 -1.865 -2.273 -2.682 -3.186 -3.883 -4.827 -7.594 -5 ,5280 ,KEBNE ,17025137,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:32:37 CET,0.0 1.226 1.868 2.372 2.784 3.145 3.502 3.82 4.348 4.594 4.834 4.948 5.496 5.704 6.107 6.482 6.844 7.011 7.311 7.588 7.974 8.222 8.461 8.795 9.124 9.457 9.778 10.07 10.428 10.757 11.061 11.415 11.751 12.075 12.424 12.834 13.254 13.681 14.11 14.557 14.987 15.413 15.922 16.45 17.02 17.583 18.117 18.593 19.01 19.251 19.033 18.269 17.364 16.396 15.474 14.621 13.835 13.079 12.397 11.692 11.091 10.533 9.953 9.39 8.851 8.365 7.849 7.356 6.909 6.447 5.975 5.542 5.091 4.651 4.322 3.982 3.598 3.188 2.754 2.455 2.163 1.709 1.36 0.984 0.795 0.403 -0.006 -0.443 -0.676 -1.259 -1.444 -1.716 -1.994 -2.657 -3.024 -3.412 -3.846 -4.353 -4.999 -5.814 -8.913 -6 ,26694 ,KEBNE ,17025138,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:33:52 CET,0.0 1.922 2.552 2.99 3.376 3.765 4.111 4.457 5.052 5.296 5.53 5.623 6.169 6.379 6.771 7.124 7.456 7.613 7.917 8.201 8.602 8.869 9.135 9.512 9.861 10.2 10.513 10.807 11.203 11.568 11.91 12.303 12.649 13.001 13.417 13.875 14.295 14.725 15.186 15.649 16.114 16.639 17.205 17.694 18.214 18.742 19.276 19.75 20.144 20.434 20.297 19.539 18.651 17.76 16.928 16.115 15.343 14.595 13.931 13.236 12.636 12.106 11.528 10.956 10.43 9.94 9.415 8.936 8.521 8.092 7.62 7.218 6.796 6.361 6.022 5.646 5.248 4.869 4.472 4.173 3.868 3.382 3.035 2.663 2.473 2.09 1.671 1.179 0.917 0.323 0.118 -0.157 -0.429 -1.076 -1.442 -1.838 -2.314 -2.88 -3.568 -4.557 -8.108 -7 ,4057 ,KEBNE ,17025139,Wed Dec 22 11:58:20 CET,Wed Dec 22 13:34:28 CET,0.0 1.996 2.633 3.137 3.586 3.983 4.329 4.654 5.209 5.446 5.69 5.833 6.383 6.593 6.997 7.355 7.699 7.866 8.179 8.471 8.884 9.161 9.428 9.807 10.16 10.487 10.791 11.067 11.446 11.843 12.2 12.593 12.954 13.278 13.651 14.078 14.495 14.93 15.353 15.791 16.229 16.724 17.292 17.796 18.341 18.886 19.418 19.93 20.3 20.45 20.221 19.496 18.654 17.728 16.797 15.92 15.112 14.35 13.664 12.984 12.387 11.829 11.261 10.708 10.174 9.665 9.134 8.641 8.196 7.747 7.311 6.943 6.54 6.119 5.785 5.437 5.064 4.656 4.23 3.934 3.617 3.116 2.779 2.425 2.233 1.838 1.434 0.995 0.763 0.182 -0.062 -0.366 -0.702 -1.47 -1.891 -2.332 -2.818 -3.365 -4.003 -4.83 -7.406 -8 ,15051 ,KEBNE ,17025140,Wed Dec 22 11:59:21 CET,Wed Dec 22 13:33:15 CET,0.0 3.062 3.844 4.385 4.853 5.265 5.632 5.959 6.505 6.746 6.979 7.066 7.596 7.786 8.177 8.557 8.906 9.082 9.418 9.713 10.107 10.365 10.629 10.998 11.344 11.664 11.97 12.266 12.642 13.022 13.363 13.771 14.16 14.516 14.939 15.412 15.852 16.296 16.752 17.22 17.704 18.212 18.72 19.165 19.618 20.101 20.618 21.1 21.514 21.725 21.446 20.577 19.534 18.478 17.521 16.602 15.737 14.975 14.291 13.519 12.794 12.201 11.683 11.164 10.643 10.145 9.622 9.143 8.704 8.22 7.73 7.337 6.913 6.477 6.135 5.773 5.407 5.009 4.587 4.296 3.963 3.407 3.05 2.699 2.515 2.115 1.704 1.247 0.992 0.415 0.247 -0.038 -0.332 -0.989 -1.365 -1.76 -2.204 -2.683 -3.303 -4.222 -7.533 -9 ,24704 ,KEBNE ,17025141,Wed Dec 22 11:59:22 CET,Wed Dec 22 13:33:16 CET,0.0 2.215 2.993 3.505 3.908 4.266 4.579 4.866 5.387 5.631 5.861 5.946 6.482 6.679 7.036 7.393 7.745 7.906 8.219 8.538 9.01 9.314 9.602 9.981 10.329 10.669 10.991 11.285 11.64 11.984 12.322 12.725 13.101 13.459 13.859 14.286 14.672 15.089 15.534 15.982 16.433 16.954 17.533 18.027 18.547 19.052 19.551 20.023 20.447 20.724 20.626 19.968 19.091 18.136 17.216 16.356 15.569 14.843 14.181 13.489 12.867 12.269 11.643 11.058 10.515 9.991 9.469 8.968 8.522 8.081 7.614 7.217 6.796 6.351 6.001 5.642 5.258 4.851 4.416 4.109 3.799 3.294 2.953 2.618 2.437 2.051 1.638 1.206 0.977 0.38 0.14 -0.135 -0.417 -1.064 -1.418 -1.82 -2.277 -2.784 -3.439 -4.322 -7.523 -10 ,2562 ,KEBNE ,17025142,Wed Dec 22 12:00:23 CET,Wed Dec 22 13:36:14 CET,0.0 3.044 3.751 4.293 4.756 5.147 5.457 5.76 6.348 6.613 6.864 6.988 7.52 7.72 8.116 8.476 8.817 8.985 9.305 9.601 10.016 10.269 10.522 10.892 11.228 11.557 11.866 12.145 12.497 12.851 13.208 13.623 13.986 14.321 14.715 15.172 15.583 15.987 16.413 16.875 17.349 17.844 18.39 18.922 19.493 20.036 20.583 21.09 21.491 21.732 21.595 20.889 19.981 19.031 18.113 17.26 16.457 15.692 15.016 14.286 13.601 12.945 12.312 11.721 11.174 10.647 10.08 9.581 9.138 8.659 8.14 7.707 7.234 6.736 6.378 6.01 5.64 5.253 4.838 4.545 4.241 3.772 3.434 3.07 2.887 2.493 2.077 1.627 1.373 0.786 0.585 0.282 -0.055 -0.793 -1.178 -1.593 -2.062 -2.574 -3.182 -3.982 -6.942 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23475_23468.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23475_23468.txt deleted file mode 100644 index fd114ff8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23475_23468.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5028 ,KEBNE ,17025143,Wed Dec 22 12:00:24 CET,Wed Dec 22 13:35:05 CET,0.0 1.528 2.206 2.748 3.173 3.534 3.866 4.174 4.716 4.971 5.215 5.36 5.917 6.115 6.522 6.915 7.276 7.447 7.77 8.091 8.564 8.845 9.097 9.441 9.788 10.149 10.484 10.777 11.158 11.525 11.866 12.277 12.662 13.026 13.421 13.832 14.222 14.642 15.095 15.571 16.05 16.571 17.1 17.552 18.038 18.501 18.989 19.536 19.972 20.017 19.472 18.21 16.718 15.249 13.925 12.688 11.592 10.571 9.66 8.782 7.999 7.249 6.529 5.861 5.239 4.67 4.067 3.495 2.998 2.508 1.971 1.5 1.028 0.557 0.182 -0.223 -0.65 -1.094 -1.605 -1.955 -2.288 -2.819 -3.178 -3.558 -3.758 -4.184 -4.661 -5.143 -5.376 -5.982 -6.135 -6.418 -6.728 -7.396 -7.763 -8.162 -8.593 -9.065 -9.631 -10.342 -11.807 -2 ,25525 ,KEBNE ,17025144,Wed Dec 22 12:02:27 CET,Wed Dec 22 13:36:14 CET,0.0 1.16 1.829 2.359 2.757 3.139 3.494 3.818 4.411 4.675 4.927 5.06 5.608 5.801 6.179 6.547 6.895 7.066 7.397 7.704 8.149 8.433 8.706 9.105 9.473 9.793 10.099 10.413 10.823 11.201 11.527 11.952 12.363 12.727 13.143 13.586 13.988 14.41 14.867 15.321 15.782 16.304 16.895 17.45 18.03 18.607 19.164 19.642 20.004 20.118 19.484 18.179 16.874 15.474 14.153 12.942 11.837 10.817 9.907 8.985 8.184 7.46 6.77 6.097 5.456 4.865 4.236 3.654 3.154 2.642 2.126 1.714 1.249 0.744 0.344 -0.074 -0.489 -0.948 -1.45 -1.773 -2.084 -2.581 -2.946 -3.336 -3.532 -3.928 -4.362 -4.81 -5.047 -5.658 -5.827 -6.114 -6.418 -7.081 -7.442 -7.834 -8.256 -8.736 -9.303 -10.024 -11.837 -3 ,7818 ,KEBNE ,17025145,Wed Dec 22 12:02:26 CET,Wed Dec 22 13:36:12 CET,0.0 1.393 2.023 2.511 2.918 3.296 3.642 3.945 4.508 4.763 4.989 5.079 5.629 5.839 6.246 6.598 6.924 7.103 7.439 7.732 8.15 8.427 8.696 9.075 9.435 9.772 10.085 10.399 10.8 11.167 11.521 11.965 12.403 12.786 13.19 13.636 14.074 14.531 14.99 15.476 15.957 16.459 17.034 17.581 18.117 18.583 19.088 19.6 19.966 20.09 19.48 18.072 16.658 15.343 14.044 12.793 11.707 10.74 9.866 8.925 8.128 7.403 6.696 6.017 5.404 4.836 4.242 3.714 3.238 2.74 2.202 1.744 1.263 0.763 0.371 -0.046 -0.479 -0.917 -1.376 -1.705 -2.052 -2.576 -2.927 -3.297 -3.49 -3.897 -4.316 -4.759 -4.99 -5.595 -5.766 -6.036 -6.311 -6.913 -7.252 -7.605 -7.99 -8.469 -9.036 -9.759 -11.648 -4 ,13136 ,KEBNE ,17025146,Wed Dec 22 12:02:26 CET,Wed Dec 22 13:36:32 CET,0.0 1.572 2.338 2.856 3.251 3.582 3.92 4.256 4.825 5.073 5.318 5.451 5.998 6.2 6.596 6.965 7.335 7.522 7.859 8.169 8.612 8.899 9.171 9.532 9.874 10.22 10.545 10.841 11.224 11.619 11.999 12.43 12.838 13.215 13.637 14.099 14.54 14.996 15.43 15.864 16.304 16.794 17.349 17.852 18.384 18.913 19.44 19.946 20.35 20.466 19.943 18.62 17.103 15.637 14.315 13.129 12.077 11.104 10.222 9.291 8.491 7.754 7.019 6.346 5.702 5.076 4.429 3.863 3.37 2.845 2.312 1.874 1.405 0.893 0.502 0.108 -0.319 -0.792 -1.3 -1.632 -1.955 -2.484 -2.873 -3.269 -3.473 -3.885 -4.287 -4.737 -4.985 -5.603 -5.807 -6.106 -6.421 -7.066 -7.414 -7.833 -8.311 -8.827 -9.421 -10.121 -12.243 -5 ,26168 ,KEBNE ,17025147,Wed Dec 22 12:02:27 CET,Wed Dec 22 13:36:12 CET,0.0 1.351 2.054 2.577 3.014 3.396 3.733 4.043 4.614 4.884 5.159 5.327 5.882 6.093 6.478 6.842 7.193 7.357 7.665 7.96 8.395 8.674 8.93 9.283 9.617 9.948 10.26 10.562 10.968 11.348 11.69 12.103 12.5 12.877 13.309 13.765 14.172 14.589 15.032 15.517 15.999 16.499 17.029 17.529 18.065 18.585 19.06 19.457 19.725 19.724 19.111 17.691 16.248 14.896 13.656 12.462 11.342 10.262 9.311 8.393 7.584 6.835 6.117 5.449 4.832 4.26 3.654 3.092 2.614 2.101 1.549 1.099 0.626 0.13 -0.266 -0.675 -1.116 -1.576 -2.016 -2.308 -2.624 -3.126 -3.491 -3.884 -4.078 -4.473 -4.886 -5.315 -5.55 -6.158 -6.304 -6.584 -6.88 -7.512 -7.875 -8.264 -8.675 -9.161 -9.74 -10.463 -12.443 -6 ,15639 ,KEBNE ,17025148,Wed Dec 22 12:02:27 CET,Wed Dec 22 13:37:01 CET,0.0 1.591 2.27 2.792 3.223 3.604 3.95 4.264 4.821 5.076 5.318 5.448 6.01 6.23 6.662 7.051 7.405 7.585 7.937 8.237 8.654 8.918 9.171 9.545 9.901 10.243 10.553 10.829 11.172 11.533 11.887 12.3 12.705 13.075 13.473 13.932 14.379 14.842 15.347 15.843 16.34 16.876 17.427 17.949 18.493 18.996 19.492 19.935 20.272 20.382 19.799 18.356 16.838 15.439 14.137 12.853 11.721 10.699 9.772 8.828 8.006 7.265 6.545 5.865 5.22 4.632 4.032 3.473 2.984 2.47 1.892 1.416 0.944 0.439 0.039 -0.357 -0.764 -1.199 -1.659 -1.99 -2.35 -2.895 -3.254 -3.637 -3.836 -4.234 -4.662 -5.137 -5.383 -5.992 -6.154 -6.435 -6.742 -7.376 -7.703 -8.092 -8.531 -9.016 -9.614 -10.371 -12.263 -7 ,11545 ,KEBNE ,17025149,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:39:26 CET,0.0 1.556 2.289 2.824 3.308 3.726 4.121 4.475 5.037 5.291 5.538 5.67 6.235 6.448 6.844 7.212 7.557 7.727 8.052 8.339 8.736 9.001 9.267 9.647 9.993 10.326 10.641 10.928 11.304 11.673 12.041 12.499 12.905 13.252 13.645 14.079 14.507 14.97 15.444 15.937 16.423 16.957 17.566 18.09 18.626 19.141 19.657 20.16 20.546 20.558 19.831 18.52 17.128 15.793 14.538 13.353 12.276 11.211 10.253 9.287 8.45 7.708 6.994 6.322 5.707 5.138 4.539 3.995 3.52 3.022 2.517 2.079 1.578 1.067 0.658 0.218 -0.223 -0.667 -1.12 -1.426 -1.744 -2.306 -2.69 -3.075 -3.277 -3.698 -4.159 -4.63 -4.866 -5.479 -5.665 -5.935 -6.213 -6.811 -7.138 -7.504 -7.937 -8.416 -8.944 -9.626 -11.431 -8 ,29048 ,KEBNE ,17025150,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:37:20 CET,0.0 1.501 2.152 2.668 3.111 3.494 3.846 4.158 4.708 4.982 5.243 5.357 5.91 6.119 6.514 6.886 7.223 7.387 7.699 7.98 8.391 8.664 8.928 9.31 9.659 9.96 10.264 10.567 10.951 11.314 11.653 12.054 12.435 12.792 13.206 13.671 14.064 14.462 14.888 15.324 15.784 16.282 16.819 17.333 17.888 18.44 18.992 19.443 19.759 19.92 19.49 18.191 16.758 15.332 14.06 12.831 11.668 10.649 9.752 8.809 8.018 7.308 6.571 5.85 5.164 4.544 3.923 3.371 2.866 2.337 1.823 1.391 0.931 0.45 0.062 -0.35 -0.795 -1.254 -1.727 -2.049 -2.382 -2.895 -3.251 -3.639 -3.839 -4.278 -4.725 -5.17 -5.43 -6.051 -6.24 -6.535 -6.831 -7.48 -7.841 -8.228 -8.657 -9.14 -9.758 -10.521 -12.535 -9 ,26327 ,KEBNE ,17025151,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:38:28 CET,0.0 1.451 2.06 2.545 3.002 3.395 3.732 4.038 4.616 4.885 5.131 5.243 5.796 5.999 6.373 6.724 7.054 7.219 7.54 7.84 8.257 8.516 8.761 9.123 9.48 9.8 10.111 10.426 10.823 11.2 11.558 11.973 12.346 12.701 13.122 13.588 14.013 14.459 14.915 15.359 15.829 16.342 16.878 17.408 17.971 18.489 19.019 19.465 19.728 19.703 19.025 17.558 16.087 14.639 13.29 12.116 11.026 10.008 9.136 8.179 7.358 6.635 5.912 5.216 4.571 3.99 3.36 2.777 2.277 1.754 1.222 0.756 0.261 -0.246 -0.642 -1.034 -1.457 -1.894 -2.343 -2.657 -2.982 -3.492 -3.846 -4.226 -4.419 -4.818 -5.228 -5.644 -5.87 -6.47 -6.632 -6.907 -7.222 -7.911 -8.254 -8.657 -9.136 -9.628 -10.164 -10.836 -12.695 -10 ,31079 ,KEBNE ,17025152,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:37:17 CET,0.0 1.163 1.94 2.485 2.87 3.235 3.583 3.893 4.456 4.736 5.003 5.132 5.685 5.893 6.289 6.651 6.972 7.128 7.443 7.738 8.166 8.449 8.709 9.083 9.439 9.761 10.062 10.352 10.72 11.078 11.429 11.843 12.217 12.568 12.999 13.454 13.843 14.239 14.676 15.159 15.641 16.122 16.601 17.069 17.618 18.167 18.672 19.091 19.391 19.437 18.759 17.324 15.886 14.421 13.036 11.817 10.762 9.749 8.8 7.838 7.004 6.248 5.521 4.853 4.231 3.648 3.041 2.498 2.02 1.499 0.954 0.505 0.033 -0.463 -0.87 -1.286 -1.701 -2.136 -2.594 -2.918 -3.25 -3.794 -4.19 -4.581 -4.774 -5.179 -5.595 -6.035 -6.272 -6.879 -7.07 -7.361 -7.666 -8.286 -8.63 -9.012 -9.426 -9.933 -10.497 -11.246 -13.499 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt deleted file mode 100644 index 9d5b1aac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_20670-2qbs-.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18148 ,KEBNE ,16690507,Thu Nov 25 08:18:07 CET,Thu Nov 25 08:19:19 CET,0.0 1.92 2.626 3.123 3.57 3.958 4.283 4.571 5.1 5.348 5.573 5.645 6.171 6.357 6.713 7.046 7.372 7.541 7.858 8.144 8.546 8.799 9.062 9.435 9.77 10.093 10.396 10.696 11.065 11.389 11.718 12.146 12.564 12.937 13.341 13.778 14.17 14.6 15.053 15.539 16.008 16.487 17.053 17.615 18.241 18.879 19.571 20.22 20.793 21.232 21.321 20.827 20.126 19.325 18.543 17.823 17.122 16.434 15.792 15.113 14.513 13.989 13.494 12.994 12.474 11.985 11.476 11.019 10.616 10.183 9.727 9.359 8.972 8.553 8.215 7.844 7.462 7.082 6.694 6.401 6.093 5.648 5.331 4.988 4.817 4.454 4.054 3.631 3.403 2.821 2.652 2.388 2.114 1.509 1.177 0.81 0.382 -0.068 -0.607 -1.394 -3.304 -2 ,11677 ,KEBNE ,16691233,Thu Nov 25 12:04:47 CET,Thu Nov 25 13:34:01 CET,0.0 1.686 2.348 2.84 3.263 3.641 3.982 4.292 4.815 5.06 5.315 5.458 5.998 6.196 6.585 6.96 7.303 7.459 7.751 8.034 8.441 8.701 8.935 9.273 9.59 9.871 10.14 10.422 10.826 11.186 11.504 11.901 12.28 12.635 13.039 13.506 13.966 14.415 14.868 15.356 15.823 16.318 16.868 17.391 17.991 18.642 19.347 19.938 20.44 20.915 21.138 20.767 20.03 19.139 18.348 17.603 16.856 16.144 15.499 14.804 14.198 13.66 13.134 12.599 12.084 11.596 11.052 10.573 10.184 9.757 9.287 8.898 8.472 8.029 7.697 7.358 7.003 6.625 6.214 5.919 5.627 5.178 4.856 4.52 4.346 3.971 3.576 3.155 2.924 2.351 2.237 1.991 1.714 1.123 0.792 0.415 -0.015 -0.523 -1.125 -1.894 -4.066 -3 ,1826 ,KEBNE ,16690509,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:13 CET,0.0 2.062 2.744 3.3 3.764 4.132 4.459 4.77 5.341 5.6 5.838 5.916 6.468 6.681 7.06 7.396 7.705 7.844 8.129 8.41 8.829 9.1 9.344 9.691 10.022 10.351 10.659 10.936 11.288 11.643 11.977 12.343 12.722 13.097 13.492 13.906 14.306 14.723 15.146 15.611 16.091 16.602 17.166 17.691 18.275 18.92 19.647 20.32 20.893 21.358 21.495 21.029 20.327 19.489 18.597 17.688 16.826 16.028 15.271 14.45 13.697 13.025 12.409 11.801 11.22 10.675 10.103 9.574 9.126 8.657 8.128 7.699 7.232 6.736 6.375 5.994 5.584 5.141 4.658 4.311 3.949 3.385 2.99 2.574 2.35 1.888 1.423 0.933 0.677 0.075 -0.15 -0.446 -0.758 -1.454 -1.863 -2.322 -2.815 -3.38 -4.041 -4.871 -7.774 -4 ,25516 ,KEBNE ,16691235,Thu Nov 25 12:04:43 CET,Thu Nov 25 13:39:49 CET,0.0 1.62 2.207 2.703 3.148 3.556 3.897 4.204 4.759 5.02 5.263 5.37 5.916 6.113 6.491 6.847 7.199 7.365 7.663 7.949 8.358 8.608 8.871 9.265 9.619 9.962 10.303 10.624 11.002 11.35 11.678 12.089 12.488 12.864 13.278 13.715 14.138 14.608 15.115 15.624 16.114 16.64 17.227 17.785 18.384 18.998 19.654 20.294 20.908 21.395 21.589 21.15 20.473 19.741 18.968 18.147 17.379 16.7 16.085 15.43 14.83 14.301 13.798 13.253 12.753 12.304 11.799 11.351 10.946 10.501 10.042 9.666 9.257 8.82 8.485 8.145 7.775 7.391 6.995 6.716 6.429 5.976 5.658 5.321 5.146 4.784 4.394 3.973 3.748 3.179 3.051 2.787 2.495 1.885 1.547 1.174 0.777 0.325 -0.187 -0.806 -2.887 -5 ,30904 ,KEBNE ,16690511,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:11 CET,0.0 1.678 2.423 2.883 3.35 3.782 4.114 4.425 4.997 5.248 5.489 5.589 6.128 6.335 6.724 7.075 7.41 7.577 7.896 8.174 8.576 8.846 9.108 9.476 9.81 10.119 10.421 10.718 11.075 11.437 11.804 12.223 12.602 12.965 13.369 13.813 14.214 14.611 15.058 15.539 16.024 16.566 17.159 17.701 18.293 18.904 19.553 20.248 20.891 21.351 21.545 21.14 20.456 19.72 18.973 18.229 17.49 16.743 16.106 15.453 14.857 14.316 13.789 13.271 12.744 12.23 11.721 11.248 10.785 10.319 9.836 9.43 9.006 8.56 8.222 7.855 7.457 7.058 6.656 6.373 6.071 5.583 5.255 4.912 4.732 4.351 3.917 3.466 3.241 2.674 2.531 2.272 2.001 1.414 1.066 0.679 0.281 -0.195 -0.758 -1.514 -3.88 -6 ,23373 ,KEBNE ,16690512,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:12 CET,0.0 2.108 2.812 3.392 3.819 4.216 4.555 4.827 5.348 5.583 5.803 5.898 6.447 6.65 7.035 7.4 7.725 7.879 8.2 8.502 8.921 9.182 9.427 9.79 10.136 10.461 10.761 11.042 11.411 11.763 12.079 12.448 12.821 13.185 13.592 14.022 14.409 14.841 15.327 15.801 16.284 16.853 17.458 18.009 18.635 19.271 19.876 20.421 20.93 21.348 21.471 21.02 20.311 19.493 18.71 17.97 17.255 16.557 15.906 15.184 14.544 13.997 13.461 12.942 12.454 11.966 11.431 10.971 10.584 10.16 9.687 9.292 8.878 8.433 8.069 7.695 7.338 6.962 6.538 6.236 5.939 5.49 5.168 4.819 4.637 4.276 3.894 3.45 3.2 2.611 2.365 2.04 1.704 1.002 0.624 0.191 -0.274 -0.798 -1.376 -2.057 -4.667 -7 ,16612 ,KEBNE ,16691238,Thu Nov 25 12:04:47 CET,Thu Nov 25 13:40:56 CET,0.0 2.115 2.806 3.312 3.696 4.017 4.299 4.574 5.118 5.38 5.626 5.741 6.281 6.465 6.824 7.181 7.516 7.672 7.969 8.243 8.643 8.901 9.133 9.457 9.791 10.126 10.441 10.752 11.151 11.501 11.817 12.221 12.625 13.005 13.444 13.893 14.267 14.689 15.175 15.672 16.156 16.683 17.272 17.801 18.388 19.005 19.646 20.278 20.884 21.44 21.663 21.217 20.464 19.687 18.947 18.192 17.404 16.664 16.042 15.4 14.823 14.28 13.77 13.283 12.777 12.276 11.764 11.331 10.928 10.489 10.019 9.617 9.237 8.856 8.535 8.2 7.854 7.478 7.061 6.75 6.443 5.974 5.645 5.307 5.126 4.76 4.361 3.923 3.694 3.112 2.969 2.693 2.394 1.747 1.398 1.033 0.636 0.184 -0.356 -1.063 -2.66 -8 ,23487 ,KEBNE ,16690514,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:02 CET,0.0 2.375 3.039 3.506 3.912 4.274 4.602 4.924 5.533 5.783 5.998 6.09 6.639 6.846 7.229 7.596 7.938 8.094 8.402 8.707 9.138 9.401 9.634 9.985 10.326 10.649 10.983 11.299 11.688 12.054 12.365 12.728 13.082 13.416 13.785 14.216 14.671 15.128 15.588 16.071 16.531 17.036 17.602 18.119 18.709 19.349 19.991 20.593 21.176 21.694 21.91 21.35 20.495 19.581 18.642 17.698 16.727 15.795 15.016 14.24 13.534 12.842 12.159 11.548 10.97 10.4 9.806 9.251 8.756 8.241 7.714 7.266 6.791 6.307 5.924 5.525 5.087 4.626 4.159 3.823 3.479 2.94 2.554 2.151 1.936 1.515 1.073 0.589 0.335 -0.281 -0.529 -0.832 -1.146 -1.823 -2.206 -2.657 -3.187 -3.776 -4.508 -5.454 -7.892 -9 ,27257 ,KEBNE ,16690515,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:02 CET,0.0 1.624 2.245 2.744 3.171 3.523 3.837 4.124 4.628 4.862 5.091 5.194 5.754 5.957 6.317 6.655 6.985 7.139 7.421 7.7 8.103 8.351 8.597 8.966 9.313 9.627 9.916 10.181 10.536 10.882 11.199 11.566 11.916 12.282 12.705 13.144 13.569 14.02 14.48 14.921 15.373 15.915 16.522 17.087 17.707 18.319 18.924 19.525 20.082 20.59 20.841 20.41 19.694 18.901 18.107 17.325 16.591 15.842 15.161 14.485 13.879 13.301 12.749 12.236 11.752 11.311 10.784 10.289 9.87 9.405 8.912 8.514 8.102 7.692 7.36 6.993 6.631 6.238 5.809 5.525 5.242 4.787 4.468 4.149 3.978 3.618 3.231 2.808 2.585 2.021 1.865 1.581 1.289 0.654 0.313 -0.058 -0.473 -0.94 -1.504 -2.235 -4.269 -10 ,9797 ,KEBNE ,16690516,Thu Nov 25 08:18:05 CET,Thu Nov 25 08:19:25 CET,0.0 1.776 2.423 2.945 3.394 3.771 4.103 4.399 4.949 5.209 5.473 5.652 6.217 6.413 6.781 7.148 7.507 7.674 7.971 8.244 8.629 8.876 9.11 9.452 9.786 10.116 10.44 10.748 11.13 11.497 11.836 12.215 12.589 12.948 13.347 13.768 14.164 14.613 15.07 15.546 16.028 16.513 17.039 17.538 18.108 18.721 19.359 19.969 20.573 21.058 21.211 20.865 20.229 19.459 18.667 17.906 17.207 16.479 15.834 15.209 14.619 14.061 13.503 12.982 12.522 12.048 11.523 11.077 10.668 10.236 9.806 9.43 9.024 8.591 8.239 7.877 7.515 7.13 6.697 6.402 6.096 5.614 5.288 4.925 4.737 4.361 3.97 3.548 3.324 2.758 2.619 2.35 2.048 1.408 1.055 0.682 0.29 -0.138 -0.703 -1.466 -3.079 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23474.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23474.txt deleted file mode 100644 index 66984a72..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23474.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13288 ,KEBNE ,16690517,Thu Nov 25 08:18:05 CET,Thu Nov 25 08:19:26 CET,0.0 2.049 2.775 3.251 3.68 4.084 4.444 4.759 5.347 5.628 5.908 6.111 6.69 6.914 7.34 7.726 8.104 8.294 8.636 8.952 9.431 9.743 10.03 10.428 10.812 11.199 11.611 11.986 12.4 12.828 13.254 13.724 14.153 14.574 15.058 15.603 16.145 16.712 17.268 17.859 18.444 19.048 19.772 20.464 21.19 21.947 22.805 23.681 24.563 25.427 26.173 26.353 26.036 25.522 24.973 24.392 23.8 23.202 22.643 22.08 21.576 21.073 20.544 20.007 19.489 19.02 18.533 18.077 17.676 17.252 16.773 16.378 15.978 15.551 15.222 14.885 14.503 14.071 13.61 13.308 13.027 12.578 12.25 11.901 11.713 11.309 10.894 10.467 10.24 9.661 9.462 9.183 8.898 8.268 7.909 7.516 7.094 6.608 5.961 5.108 3.19 -2 ,9296 ,KEBNE ,16691243,Thu Nov 25 12:04:43 CET,Thu Nov 25 13:41:02 CET,0.0 1.819 2.544 3.063 3.485 3.871 4.221 4.53 5.117 5.39 5.657 5.821 6.378 6.579 6.977 7.373 7.758 7.945 8.32 8.698 9.199 9.494 9.783 10.207 10.607 10.967 11.298 11.622 12.043 12.451 12.85 13.321 13.747 14.153 14.62 15.124 15.603 16.087 16.575 17.108 17.656 18.244 18.94 19.619 20.341 21.145 22.077 23.025 23.931 24.79 25.51 25.673 25.421 24.967 24.42 23.798 23.182 22.628 22.083 21.44 20.891 20.379 19.836 19.316 18.824 18.352 17.818 17.329 16.916 16.51 16.068 15.66 15.24 14.808 14.471 14.127 13.746 13.326 12.908 12.631 12.356 11.898 11.558 11.191 11.004 10.641 10.247 9.822 9.6 9.029 8.82 8.53 8.243 7.586 7.213 6.839 6.439 5.96 5.356 4.536 2.336 -3 ,13387 ,KEBNE ,16690519,Thu Nov 25 08:18:05 CET,Thu Nov 25 08:19:25 CET,0.0 2.341 3.17 3.747 4.214 4.635 5.014 5.341 5.912 6.19 6.449 6.572 7.127 7.34 7.747 8.14 8.511 8.688 9.053 9.388 9.838 10.123 10.39 10.783 11.167 11.538 11.906 12.25 12.67 13.063 13.453 13.919 14.345 14.751 15.22 15.757 16.259 16.788 17.36 17.982 18.594 19.248 19.984 20.661 21.409 22.292 23.297 24.223 25.093 25.953 26.68 26.752 26.419 25.964 25.393 24.734 24.08 23.458 22.88 22.271 21.715 21.158 20.57 20.053 19.579 19.07 18.553 18.125 17.711 17.209 16.673 16.244 15.823 15.413 15.093 14.75 14.388 13.995 13.568 13.27 12.974 12.526 12.196 11.823 11.619 11.199 10.761 10.301 10.061 9.476 9.326 9.073 8.78 8.137 7.767 7.324 6.834 6.322 5.794 5.013 2.499 -4 ,25759 ,KEBNE ,16691245,Thu Nov 25 12:04:43 CET,Thu Nov 25 13:41:24 CET,0.0 2.219 2.941 3.498 3.966 4.37 4.739 5.083 5.708 6.002 6.273 6.425 6.993 7.233 7.686 8.071 8.41 8.571 8.883 9.191 9.66 9.96 10.236 10.622 10.992 11.34 11.671 11.997 12.391 12.752 13.125 13.574 13.998 14.421 14.875 15.357 15.866 16.412 16.953 17.527 18.101 18.723 19.437 20.107 20.835 21.576 22.393 23.311 24.35 25.378 26.182 26.267 25.92 25.431 24.894 24.281 23.657 23.062 22.511 21.925 21.345 20.814 20.3 19.794 19.34 18.89 18.394 17.912 17.495 17.103 16.659 16.292 15.924 15.504 15.157 14.812 14.465 14.075 13.637 13.341 13.033 12.532 12.192 11.824 11.627 11.213 10.79 10.362 10.136 9.56 9.339 9.028 8.691 8.011 7.636 7.229 6.803 6.306 5.685 4.874 1.284 -5 ,4812 ,KEBNE ,16690521,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:13 CET,0.0 2.929 3.753 4.342 4.829 5.266 5.663 5.998 6.568 6.837 7.099 7.261 7.832 8.047 8.465 8.854 9.223 9.399 9.725 10.043 10.491 10.764 11.032 11.422 11.808 12.206 12.598 12.944 13.35 13.731 14.081 14.496 14.895 15.309 15.821 16.369 16.89 17.454 18.017 18.587 19.155 19.774 20.445 21.068 21.845 22.714 23.564 24.386 25.261 26.156 26.906 27.036 26.705 26.195 25.585 24.937 24.306 23.689 23.111 22.495 21.983 21.507 21.016 20.516 19.982 19.454 18.897 18.412 17.986 17.539 17.099 16.723 16.308 15.867 15.516 15.147 14.766 14.359 13.928 13.638 13.338 12.846 12.5 12.134 11.945 11.548 11.132 10.715 10.498 9.941 9.823 9.563 9.273 8.685 8.359 7.961 7.499 6.968 6.379 5.523 2.691 -6 ,21619 ,KEBNE ,16690522,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:12 CET,0.0 3.206 3.955 4.49 4.948 5.338 5.705 6.05 6.674 6.975 7.255 7.435 8.017 8.245 8.649 9.027 9.39 9.565 9.896 10.207 10.661 10.938 11.194 11.577 11.936 12.282 12.639 12.994 13.452 13.879 14.285 14.762 15.198 15.605 16.07 16.57 17.056 17.615 18.192 18.764 19.331 19.974 20.714 21.377 22.12 22.927 23.793 24.682 25.631 26.556 27.321 27.55 27.3 26.86 26.309 25.718 25.091 24.418 23.824 23.193 22.605 22.09 21.58 21.062 20.53 20.017 19.502 18.994 18.542 18.105 17.643 17.252 16.842 16.417 16.067 15.66 15.216 14.79 14.366 14.083 13.804 13.32 12.982 12.646 12.464 12.073 11.649 11.191 10.954 10.389 10.221 9.934 9.65 9.056 8.709 8.338 7.917 7.396 6.77 6.051 3.247 -7 ,25110 ,KEBNE ,16690523,Thu Nov 25 08:18:05 CET,Thu Nov 25 08:19:24 CET,0.0 2.214 2.912 3.5 4.0 4.415 4.77 5.095 5.679 5.95 6.21 6.364 6.927 7.147 7.571 7.944 8.295 8.471 8.804 9.11 9.537 9.819 10.099 10.499 10.863 11.21 11.556 11.877 12.288 12.714 13.131 13.593 14.074 14.543 15.031 15.56 16.045 16.58 17.11 17.633 18.204 18.842 19.521 20.199 21.024 21.839 22.72 23.618 24.445 25.336 26.136 26.286 26.029 25.521 24.908 24.307 23.657 23.011 22.451 21.839 21.27 20.729 20.224 19.735 19.221 18.745 18.237 17.761 17.345 16.907 16.438 16.04 15.637 15.19 14.839 14.492 14.135 13.764 13.35 13.072 12.792 12.326 12.0 11.654 11.47 11.062 10.632 10.192 9.966 9.39 9.22 8.961 8.669 8.041 7.699 7.319 6.897 6.419 5.866 5.145 1.206 -8 ,20162 ,KEBNE ,16691249,Thu Nov 25 12:04:43 CET,Thu Nov 25 13:41:23 CET,0.0 2.654 3.411 3.987 4.506 4.942 5.308 5.626 6.215 6.483 6.724 6.839 7.405 7.635 8.062 8.448 8.835 9.029 9.389 9.718 10.203 10.502 10.794 11.234 11.634 12.021 12.386 12.711 13.149 13.581 13.982 14.45 14.884 15.312 15.821 16.358 16.852 17.382 17.967 18.56 19.138 19.816 20.578 21.297 22.112 22.918 23.731 24.62 25.567 26.457 27.226 27.337 26.946 26.454 25.924 25.324 24.736 24.113 23.496 22.85 22.268 21.724 21.195 20.681 20.178 19.703 19.179 18.692 18.261 17.812 17.375 16.996 16.583 16.161 15.841 15.489 15.098 14.714 14.321 14.038 13.739 13.289 12.976 12.629 12.458 12.09 11.672 11.225 11.0 10.436 10.244 9.962 9.688 9.108 8.778 8.395 7.973 7.529 7.005 6.267 3.981 -9 ,16670 ,KEBNE ,16690525,Thu Nov 25 08:18:05 CET,Thu Nov 25 08:19:19 CET,0.0 2.084 2.892 3.434 3.875 4.286 4.667 5.011 5.626 5.922 6.191 6.306 6.872 7.092 7.498 7.877 8.238 8.4 8.724 9.05 9.506 9.796 10.083 10.498 10.886 11.26 11.618 11.935 12.338 12.74 13.115 13.545 13.981 14.412 14.904 15.448 15.955 16.499 17.027 17.574 18.175 18.831 19.534 20.197 20.936 21.753 22.623 23.499 24.442 25.364 26.078 26.27 26.004 25.479 24.901 24.288 23.676 23.076 22.508 21.863 21.28 20.755 20.206 19.689 19.181 18.674 18.16 17.697 17.289 16.852 16.335 15.887 15.437 14.954 14.561 14.133 13.679 13.227 12.771 12.465 12.131 11.579 11.198 10.813 10.611 10.165 9.709 9.233 8.978 8.381 8.138 7.822 7.481 6.727 6.321 5.884 5.417 4.855 4.186 3.275 0.505 -10 ,9125 ,KEBNE ,16691251,Thu Nov 25 12:09:57 CET,Thu Nov 25 13:48:52 CET,0.0 2.489 3.229 3.795 4.238 4.626 5.01 5.361 5.975 6.258 6.517 6.667 7.244 7.478 7.914 8.308 8.674 8.858 9.209 9.538 10.01 10.295 10.563 10.979 11.383 11.768 12.132 12.47 12.914 13.337 13.729 14.19 14.629 15.054 15.536 16.07 16.623 17.181 17.728 18.295 18.846 19.438 20.135 20.876 21.667 22.489 23.386 24.261 25.206 26.074 26.649 26.671 26.432 26.022 25.491 24.898 24.28 23.603 22.918 22.243 21.691 21.161 20.62 20.122 19.657 19.207 18.716 18.235 17.806 17.375 16.884 16.471 16.078 15.672 15.344 14.977 14.592 14.191 13.771 13.494 13.204 12.729 12.391 12.055 11.885 11.517 11.097 10.653 10.42 9.836 9.657 9.385 9.084 8.421 8.076 7.694 7.266 6.796 6.224 5.417 2.451 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23475.txt deleted file mode 100644 index ea42bd86..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19914 ,KEBNE ,16691252,Thu Nov 25 12:09:57 CET,Thu Nov 25 13:46:25 CET,0.0 1.307 1.852 2.315 2.722 3.09 3.455 3.787 4.335 4.587 4.829 4.903 5.435 5.638 6.013 6.32 6.606 6.759 7.074 7.399 7.831 8.089 8.346 8.711 9.063 9.386 9.685 9.974 10.333 10.661 10.981 11.37 11.758 12.123 12.507 12.914 13.306 13.728 14.151 14.577 15.04 15.581 16.158 16.683 17.265 17.843 18.427 19.035 19.612 20.065 20.173 19.632 18.9 18.161 17.378 16.592 15.839 15.072 14.405 13.744 13.172 12.632 12.029 11.432 10.901 10.396 9.88 9.432 9.026 8.587 8.112 7.706 7.288 6.855 6.504 6.136 5.754 5.351 4.918 4.604 4.277 3.763 3.393 3.005 2.813 2.433 2.025 1.577 1.347 0.776 0.592 0.308 0.013 -0.602 -0.953 -1.344 -1.776 -2.311 -2.911 -3.665 -7.118 -2 ,14432 ,KEBNE ,16690528,Thu Nov 25 08:18:03 CET,Thu Nov 25 08:19:14 CET,0.0 1.463 2.027 2.505 2.925 3.298 3.65 3.964 4.53 4.774 4.986 5.045 5.588 5.781 6.129 6.469 6.799 6.956 7.261 7.552 7.963 8.213 8.457 8.823 9.168 9.485 9.787 10.099 10.495 10.843 11.159 11.546 11.901 12.241 12.627 13.028 13.398 13.826 14.294 14.733 15.194 15.699 16.235 16.743 17.307 17.885 18.524 19.178 19.784 20.292 20.44 20.029 19.356 18.63 17.908 17.15 16.427 15.741 15.1 14.42 13.792 13.191 12.579 11.986 11.421 10.923 10.402 9.896 9.478 9.052 8.576 8.177 7.763 7.31 6.952 6.592 6.211 5.796 5.338 5.031 4.738 4.274 3.933 3.578 3.399 3.024 2.588 2.125 1.891 1.304 1.128 0.853 0.557 -0.091 -0.443 -0.811 -1.223 -1.728 -2.338 -3.231 -5.549 -3 ,29607 ,KEBNE ,16690529,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:26 CET,0.0 1.307 1.954 2.44 2.855 3.236 3.592 3.878 4.34 4.567 4.808 4.916 5.449 5.635 5.994 6.327 6.643 6.798 7.084 7.37 7.803 8.082 8.347 8.71 9.054 9.365 9.656 9.939 10.29 10.63 10.977 11.392 11.776 12.132 12.526 12.96 13.384 13.832 14.294 14.792 15.289 15.791 16.342 16.864 17.441 18.056 18.68 19.256 19.84 20.367 20.524 20.068 19.393 18.623 17.867 17.163 16.432 15.682 15.03 14.352 13.722 13.141 12.59 12.021 11.477 10.967 10.41 9.919 9.485 9.04 8.556 8.138 7.695 7.243 6.897 6.505 6.09 5.689 5.274 4.958 4.596 4.008 3.601 3.188 2.988 2.584 2.142 1.676 1.443 0.866 0.666 0.37 0.08 -0.51 -0.852 -1.255 -1.718 -2.252 -2.862 -3.677 -5.648 -4 ,22570 ,KEBNE ,16690530,Thu Nov 25 08:18:04 CET,Thu Nov 25 08:19:16 CET,0.0 1.354 1.952 2.43 2.802 3.164 3.5 3.792 4.336 4.59 4.83 4.921 5.456 5.649 6.013 6.338 6.645 6.794 7.094 7.386 7.772 8.01 8.243 8.587 8.925 9.247 9.531 9.799 10.166 10.517 10.833 11.215 11.605 11.973 12.371 12.819 13.24 13.676 14.129 14.578 15.032 15.54 16.122 16.653 17.24 17.845 18.446 19.047 19.634 20.147 20.328 19.97 19.297 18.488 17.684 16.88 16.14 15.389 14.681 13.959 13.276 12.647 12.064 11.501 10.933 10.407 9.866 9.37 8.922 8.437 7.955 7.561 7.117 6.665 6.329 5.956 5.545 5.107 4.653 4.359 4.069 3.597 3.254 2.896 2.697 2.254 1.792 1.326 1.094 0.505 0.33 0.078 -0.2 -0.853 -1.222 -1.604 -2.033 -2.517 -3.112 -3.909 -6.04 -5 ,11865 ,KEBNE ,16690531,Thu Nov 25 08:18:05 CET,Thu Nov 25 08:19:08 CET,0.0 2.705 3.282 3.703 4.086 4.432 4.744 5.028 5.542 5.78 6.008 6.077 6.603 6.796 7.167 7.511 7.849 8.01 8.308 8.588 8.969 9.225 9.483 9.847 10.188 10.5 10.804 11.103 11.498 11.873 12.2 12.603 13.0 13.372 13.799 14.265 14.677 15.117 15.57 16.004 16.464 16.995 17.589 18.18 18.827 19.442 20.071 20.657 21.239 21.738 21.9 21.538 20.862 20.11 19.39 18.6 17.828 17.078 16.381 15.677 15.068 14.533 13.999 13.471 12.957 12.472 11.948 11.461 11.031 10.586 10.121 9.719 9.319 8.909 8.559 8.204 7.845 7.435 6.991 6.679 6.366 5.902 5.572 5.215 5.028 4.633 4.216 3.789 3.57 2.984 2.769 2.473 2.167 1.493 1.113 0.693 0.26 -0.197 -0.771 -1.493 -3.953 -6 ,2898 ,KEBNE ,16690532,Thu Nov 25 08:18:05 CET,Thu Nov 25 08:19:08 CET,0.0 1.56 2.274 2.79 3.185 3.516 3.816 4.107 4.628 4.851 5.065 5.148 5.692 5.885 6.23 6.553 6.865 7.007 7.295 7.578 7.98 8.25 8.513 8.867 9.19 9.51 9.815 10.09 10.445 10.777 11.108 11.518 11.899 12.291 12.734 13.172 13.556 13.983 14.47 14.962 15.446 15.974 16.551 17.126 17.745 18.346 18.961 19.538 20.108 20.615 20.798 20.393 19.768 19.043 18.316 17.55 16.782 16.008 15.301 14.62 14.021 13.482 12.972 12.476 11.959 11.463 10.937 10.425 9.995 9.576 9.126 8.72 8.298 7.878 7.541 7.184 6.791 6.365 5.902 5.565 5.229 4.713 4.339 3.945 3.736 3.297 2.833 2.346 2.088 1.474 1.216 0.889 0.553 -0.172 -0.588 -1.037 -1.524 -2.069 -2.81 -3.87 -6.643 -7 ,21171 ,KEBNE ,16690533,Thu Nov 25 08:18:05 CET,Thu Nov 25 08:19:08 CET,0.0 1.134 1.743 2.251 2.651 2.964 3.259 3.557 4.104 4.347 4.567 4.633 5.162 5.35 5.698 6.019 6.322 6.468 6.767 7.045 7.431 7.685 7.924 8.265 8.605 8.922 9.214 9.497 9.862 10.213 10.537 10.914 11.287 11.662 12.092 12.522 12.914 13.354 13.819 14.294 14.767 15.281 15.835 16.399 17.02 17.638 18.276 18.87 19.508 20.016 20.209 19.857 19.221 18.418 17.605 16.841 16.086 15.343 14.673 13.987 13.403 12.829 12.269 11.739 11.194 10.678 10.159 9.689 9.255 8.822 8.372 7.959 7.521 7.061 6.69 6.299 5.896 5.456 4.995 4.689 4.38 3.9 3.561 3.209 3.025 2.662 2.272 1.828 1.595 1.015 0.858 0.592 0.29 -0.422 -0.819 -1.258 -1.721 -2.227 -2.881 -3.952 -8.293 -8 ,2661 ,KEBNE ,16690534,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:22 CET,0.0 1.447 2.069 2.605 3.013 3.367 3.691 3.977 4.487 4.72 4.942 5.027 5.576 5.778 6.118 6.454 6.777 6.934 7.243 7.526 7.918 8.174 8.421 8.767 9.128 9.46 9.741 10.037 10.453 10.846 11.19 11.593 11.992 12.363 12.781 13.221 13.603 14.01 14.46 14.924 15.371 15.892 16.501 17.043 17.628 18.244 18.889 19.5 20.067 20.572 20.831 20.421 19.691 18.887 18.175 17.468 16.759 16.056 15.391 14.72 14.113 13.558 13.028 12.493 11.954 11.435 10.882 10.382 9.968 9.535 9.077 8.697 8.287 7.849 7.461 7.036 6.64 6.242 5.836 5.566 5.26 4.754 4.406 3.995 3.778 3.367 2.926 2.438 2.176 1.57 1.355 1.069 0.755 0.031 -0.396 -0.881 -1.401 -2.002 -2.733 -3.699 -6.414 -9 ,10009 ,KEBNE ,16690535,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:16 CET,0.0 1.436 2.096 2.607 3.039 3.381 3.669 3.934 4.413 4.648 4.888 4.977 5.513 5.701 6.043 6.39 6.731 6.878 7.157 7.436 7.823 8.063 8.299 8.639 8.987 9.319 9.619 9.908 10.266 10.602 10.941 11.349 11.728 12.064 12.437 12.855 13.271 13.741 14.224 14.741 15.257 15.75 16.301 16.852 17.436 18.051 18.707 19.298 19.884 20.369 20.505 20.034 19.333 18.562 17.774 16.988 16.224 15.486 14.817 14.105 13.471 12.897 12.345 11.813 11.266 10.74 10.173 9.674 9.253 8.79 8.3 7.917 7.508 7.038 6.676 6.294 5.891 5.498 5.078 4.768 4.467 3.996 3.624 3.207 2.994 2.563 2.086 1.542 1.259 0.626 0.35 0.03 -0.311 -1.085 -1.503 -1.966 -2.47 -3.041 -3.726 -4.575 -6.422 -10 ,11217 ,KEBNE ,16690536,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:05 CET,0.0 1.486 2.107 2.569 2.937 3.27 3.571 3.86 4.401 4.645 4.874 4.964 5.508 5.703 6.082 6.421 6.73 6.879 7.166 7.435 7.828 8.098 8.351 8.693 9.024 9.364 9.679 9.974 10.341 10.671 10.998 11.392 11.77 12.128 12.516 12.936 13.354 13.796 14.223 14.666 15.137 15.643 16.218 16.78 17.389 18.0 18.611 19.235 19.818 20.295 20.451 20.021 19.317 18.577 17.871 17.099 16.336 15.633 14.973 14.235 13.603 13.018 12.41 11.818 11.266 10.749 10.218 9.754 9.336 8.886 8.396 7.965 7.498 7.018 6.653 6.279 5.866 5.423 4.986 4.683 4.368 3.885 3.552 3.194 2.995 2.575 2.116 1.603 1.338 0.72 0.478 0.175 -0.147 -0.827 -1.242 -1.718 -2.216 -2.785 -3.462 -4.375 -7.336 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23477.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23477.txt deleted file mode 100644 index bfa0728f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23476_23477.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27116 ,KEBNE ,17069898,Fri Dec 24 12:42:23 CET,Fri Dec 24 14:17:52 CET,0.0 2.114 2.795 3.397 3.86 4.209 4.542 4.857 5.399 5.645 5.887 6.033 6.594 6.811 7.22 7.563 7.858 8.004 8.304 8.583 8.956 9.19 9.409 9.728 10.033 10.311 10.576 10.827 11.148 11.46 11.76 12.127 12.47 12.766 13.095 13.469 13.855 14.265 14.631 15.005 15.441 15.911 16.35 16.721 17.071 17.417 17.753 17.947 17.974 17.657 16.608 14.938 13.248 11.595 10.119 8.837 7.722 6.711 5.793 4.806 3.894 3.048 2.271 1.552 0.866 0.231 -0.458 -1.096 -1.639 -2.226 -2.841 -3.318 -3.821 -4.367 -4.793 -5.234 -5.708 -6.185 -6.669 -7.015 -7.372 -7.932 -8.337 -8.746 -8.952 -9.385 -9.849 -10.338 -10.587 -11.219 -11.485 -11.818 -12.147 -12.851 -13.245 -13.674 -14.162 -14.711 -15.402 -16.361 -18.799 -2 ,7350 ,KEBNE ,17069899,Fri Dec 24 12:43:25 CET,Fri Dec 24 14:19:24 CET,0.0 2.151 2.884 3.361 3.789 4.202 4.556 4.877 5.431 5.679 5.916 6.002 6.553 6.765 7.149 7.506 7.848 8.011 8.321 8.621 9.044 9.309 9.554 9.89 10.212 10.528 10.834 11.13 11.517 11.877 12.197 12.575 12.965 13.357 13.78 14.218 14.613 15.014 15.441 15.831 16.194 16.65 17.193 17.673 18.157 18.624 19.06 19.402 19.562 19.425 18.652 17.126 15.63 14.167 12.767 11.54 10.443 9.441 8.551 7.626 6.791 6.021 5.268 4.554 3.88 3.242 2.573 1.959 1.422 0.853 0.245 -0.279 -0.808 -1.327 -1.736 -2.177 -2.633 -3.107 -3.621 -3.972 -4.321 -4.887 -5.288 -5.705 -5.92 -6.361 -6.81 -7.301 -7.563 -8.186 -8.385 -8.686 -9.031 -9.879 -10.346 -10.814 -11.33 -11.913 -12.66 -13.675 -16.066 -3 ,9237 ,KEBNE ,17069900,Fri Dec 24 12:43:25 CET,Fri Dec 24 14:20:10 CET,0.0 1.632 2.325 2.868 3.293 3.651 3.974 4.262 4.809 5.064 5.293 5.365 5.901 6.095 6.442 6.754 7.055 7.206 7.508 7.786 8.17 8.427 8.687 9.055 9.382 9.706 10.014 10.284 10.626 10.963 11.281 11.644 11.998 12.33 12.684 13.061 13.416 13.797 14.169 14.576 15.001 15.433 15.902 16.337 16.799 17.219 17.632 17.951 18.125 18.017 17.122 15.611 14.133 12.741 11.481 10.21 9.05 8.053 7.149 6.15 5.279 4.529 3.824 3.142 2.482 1.836 1.117 0.485 -0.04 -0.591 -1.142 -1.602 -2.102 -2.621 -3.034 -3.453 -3.881 -4.364 -4.859 -5.182 -5.535 -6.1 -6.482 -6.889 -7.098 -7.557 -8.072 -8.59 -8.866 -9.518 -9.755 -10.072 -10.403 -11.204 -11.666 -12.136 -12.634 -13.208 -13.88 -14.722 -17.382 -4 ,4521 ,KEBNE ,17069901,Fri Dec 24 12:44:28 CET,Fri Dec 24 14:20:38 CET,0.0 2.254 2.928 3.406 3.83 4.22 4.552 4.835 5.385 5.645 5.895 6.029 6.564 6.743 7.097 7.415 7.723 7.87 8.169 8.469 8.871 9.121 9.353 9.688 10.002 10.292 10.584 10.857 11.168 11.479 11.793 12.145 12.467 12.782 13.127 13.497 13.865 14.247 14.643 15.089 15.534 15.961 16.443 16.867 17.283 17.698 18.063 18.303 18.333 18.06 16.964 15.161 13.438 11.899 10.509 9.223 8.094 7.031 6.075 5.095 4.215 3.436 2.677 1.912 1.242 0.632 -0.053 -0.66 -1.183 -1.702 -2.238 -2.716 -3.215 -3.749 -4.175 -4.607 -5.042 -5.495 -5.979 -6.315 -6.674 -7.259 -7.681 -8.113 -8.326 -8.773 -9.259 -9.762 -10.012 -10.635 -10.84 -11.149 -11.472 -12.188 -12.568 -12.961 -13.401 -13.924 -14.57 -15.413 -17.405 -5 ,31928 ,KEBNE ,17069902,Fri Dec 24 12:46:37 CET,Fri Dec 24 14:15:58 CET,0.0 2.488 3.157 3.642 4.045 4.42 4.772 5.092 5.687 5.95 6.182 6.283 6.825 7.019 7.38 7.702 7.998 8.148 8.463 8.77 9.183 9.42 9.632 9.948 10.258 10.55 10.845 11.128 11.465 11.777 12.066 12.408 12.739 13.044 13.373 13.749 14.116 14.494 14.855 15.193 15.564 15.961 16.361 16.737 17.14 17.526 17.867 18.09 18.132 17.866 16.925 15.336 13.776 12.365 11.041 9.787 8.637 7.538 6.606 5.671 4.851 4.075 3.293 2.551 1.845 1.171 0.436 -0.218 -0.764 -1.33 -1.933 -2.44 -2.966 -3.526 -3.966 -4.411 -4.878 -5.361 -5.866 -6.23 -6.609 -7.163 -7.579 -8.033 -8.247 -8.704 -9.2 -9.711 -9.973 -10.614 -10.868 -11.19 -11.557 -12.357 -12.804 -13.294 -13.843 -14.467 -15.224 -16.224 -18.842 -6 ,7561 ,KEBNE ,17069903,Fri Dec 24 12:47:35 CET,Fri Dec 24 14:21:52 CET,0.0 2.026 2.693 3.271 3.774 4.18 4.549 4.895 5.527 5.793 6.019 6.085 6.621 6.813 7.156 7.482 7.8 7.949 8.222 8.477 8.852 9.074 9.28 9.599 9.908 10.187 10.455 10.733 11.084 11.393 11.684 12.025 12.336 12.623 12.943 13.318 13.694 14.109 14.53 14.956 15.369 15.808 16.316 16.748 17.142 17.505 17.795 18.003 18.12 17.937 16.95 15.204 13.527 11.983 10.578 9.266 8.053 6.955 6.033 5.079 4.219 3.442 2.702 1.982 1.274 0.626 -0.043 -0.668 -1.198 -1.753 -2.322 -2.78 -3.276 -3.788 -4.2 -4.629 -5.068 -5.532 -6.007 -6.352 -6.733 -7.323 -7.738 -8.192 -8.435 -8.929 -9.427 -9.985 -10.284 -10.936 -11.205 -11.551 -11.892 -12.64 -13.073 -13.547 -14.09 -14.711 -15.395 -16.306 -19.37 -7 ,27579 ,KEBNE ,17069904,Fri Dec 24 12:50:43 CET,Fri Dec 24 14:26:22 CET,0.0 1.667 2.401 2.939 3.343 3.691 4.001 4.279 4.819 5.054 5.272 5.385 5.93 6.124 6.501 6.865 7.184 7.321 7.582 7.841 8.214 8.452 8.676 8.989 9.294 9.606 9.906 10.177 10.509 10.816 11.116 11.468 11.776 12.073 12.421 12.774 13.106 13.466 13.819 14.139 14.457 14.858 15.279 15.624 15.985 16.284 16.489 16.588 16.428 15.87 14.58 12.646 10.874 9.259 7.833 6.472 5.291 4.239 3.311 2.328 1.428 0.658 -0.075 -0.8 -1.478 -2.103 -2.783 -3.401 -3.935 -4.51 -5.101 -5.594 -6.114 -6.632 -7.037 -7.47 -7.942 -8.421 -8.934 -9.31 -9.675 -10.22 -10.622 -11.058 -11.279 -11.713 -12.168 -12.658 -12.912 -13.536 -13.742 -14.043 -14.366 -15.071 -15.457 -15.897 -16.357 -16.894 -17.576 -18.481 -22.124 -8 ,25062 ,KEBNE ,17069905,Fri Dec 24 12:55:55 CET,Fri Dec 24 14:30:20 CET,0.0 2.481 3.368 3.92 4.355 4.73 5.065 5.377 5.937 6.176 6.393 6.471 7.004 7.191 7.577 7.942 8.278 8.437 8.745 9.034 9.416 9.669 9.912 10.24 10.566 10.889 11.2 11.502 11.892 12.261 12.602 13.001 13.358 13.69 14.086 14.526 14.916 15.303 15.705 16.124 16.524 16.953 17.433 17.852 18.287 18.705 19.05 19.335 19.497 19.335 18.563 17.121 15.6 14.141 12.795 11.52 10.366 9.258 8.284 7.338 6.494 5.719 4.924 4.136 3.42 2.781 2.096 1.468 0.933 0.356 -0.228 -0.711 -1.225 -1.735 -2.149 -2.609 -3.055 -3.508 -4.0 -4.339 -4.692 -5.219 -5.575 -5.979 -6.201 -6.655 -7.128 -7.634 -7.91 -8.553 -8.801 -9.125 -9.479 -10.265 -10.705 -11.158 -11.634 -12.19 -12.853 -13.742 -15.937 -9 ,7659 ,KEBNE ,17069906,Fri Dec 24 13:00:13 CET,Fri Dec 24 14:36:38 CET,0.0 2.264 2.908 3.449 3.904 4.292 4.637 4.93 5.47 5.725 5.959 6.055 6.594 6.775 7.121 7.464 7.782 7.935 8.235 8.502 8.881 9.143 9.39 9.711 10.007 10.297 10.571 10.807 11.13 11.439 11.71 12.061 12.397 12.717 13.094 13.466 13.791 14.144 14.495 14.87 15.24 15.595 16.016 16.381 16.717 17.006 17.227 17.397 17.389 16.966 15.775 13.861 12.09 10.501 9.059 7.74 6.543 5.428 4.492 3.542 2.672 1.886 1.148 0.403 -0.328 -0.987 -1.649 -2.246 -2.779 -3.341 -3.952 -4.46 -4.988 -5.533 -5.956 -6.413 -6.883 -7.37 -7.872 -8.234 -8.623 -9.213 -9.632 -10.076 -10.301 -10.746 -11.207 -11.696 -11.953 -12.597 -12.833 -13.157 -13.506 -14.222 -14.617 -15.055 -15.517 -16.035 -16.655 -17.549 -20.368 -10 ,28813 ,KEBNE ,17069907,Fri Dec 24 13:02:20 CET,Fri Dec 24 14:38:43 CET,0.0 2.043 2.707 3.24 3.667 4.011 4.317 4.594 5.077 5.31 5.545 5.627 6.149 6.329 6.671 6.99 7.295 7.434 7.7 7.983 8.374 8.618 8.866 9.208 9.526 9.844 10.139 10.418 10.794 11.13 11.421 11.765 12.091 12.389 12.729 13.111 13.461 13.837 14.212 14.538 14.858 15.216 15.551 15.809 16.098 16.389 16.647 16.83 16.822 16.412 15.216 13.271 11.504 9.935 8.458 7.057 5.819 4.689 3.685 2.65 1.775 1.027 0.251 -0.526 -1.21 -1.826 -2.483 -3.078 -3.616 -4.186 -4.765 -5.258 -5.776 -6.304 -6.714 -7.17 -7.658 -8.142 -8.638 -8.986 -9.349 -9.925 -10.331 -10.778 -11.017 -11.509 -12.05 -12.585 -12.849 -13.485 -13.714 -14.038 -14.349 -15.026 -15.421 -15.844 -16.308 -16.857 -17.526 -18.379 -21.12 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23477_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23477_23475.txt deleted file mode 100644 index eb3ae604..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23477_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10590 ,KEBNE ,16691262,Thu Nov 25 12:09:58 CET,Thu Nov 25 13:45:00 CET,0.0 2.003 2.752 3.334 3.764 4.159 4.504 4.815 5.396 5.664 5.92 6.012 6.599 6.821 7.226 7.645 8.04 8.22 8.564 8.912 9.421 9.725 10.003 10.422 10.839 11.24 11.629 11.988 12.462 12.917 13.343 13.854 14.336 14.815 15.352 15.94 16.515 17.109 17.748 18.449 19.166 19.941 20.852 21.747 22.739 23.84 25.059 26.395 27.846 29.371 31.007 32.014 32.34 32.335 32.168 31.845 31.421 31.054 30.713 30.304 29.889 29.496 29.153 28.794 28.397 28.046 27.692 27.363 27.057 26.727 26.394 26.106 25.776 25.422 25.135 24.838 24.547 24.251 23.944 23.709 23.459 23.088 22.818 22.548 22.412 22.112 21.794 21.451 21.263 20.721 20.615 20.382 20.13 19.582 19.271 18.953 18.615 18.216 17.713 17.005 14.987 -2 ,1740 ,KEBNE ,16691263,Thu Nov 25 12:09:57 CET,Thu Nov 25 13:43:19 CET,0.0 1.926 2.636 3.167 3.62 3.998 4.348 4.695 5.315 5.566 5.797 5.898 6.489 6.712 7.136 7.511 7.866 8.045 8.389 8.729 9.208 9.516 9.815 10.25 10.661 11.033 11.397 11.752 12.184 12.586 12.976 13.463 13.94 14.393 14.923 15.5 16.048 16.619 17.231 17.897 18.57 19.314 20.113 20.888 21.813 22.878 24.128 25.449 26.814 28.272 29.796 30.658 30.839 30.712 30.444 30.129 29.775 29.403 28.973 28.442 27.998 27.61 27.227 26.855 26.475 26.104 25.707 25.322 24.965 24.596 24.217 23.908 23.577 23.201 22.889 22.574 22.235 21.871 21.526 21.289 21.04 20.657 20.363 20.041 19.88 19.551 19.204 18.832 18.637 18.094 17.975 17.724 17.46 16.854 16.513 16.183 15.826 15.424 14.943 14.3 12.54 -3 ,463 ,KEBNE ,16690539,Thu Nov 25 08:20:10 CET,Thu Nov 25 08:21:26 CET,0.0 1.818 2.483 3.002 3.455 3.825 4.141 4.431 4.987 5.246 5.487 5.605 6.19 6.401 6.811 7.207 7.581 7.762 8.119 8.464 8.939 9.239 9.531 9.96 10.368 10.753 11.125 11.466 11.889 12.302 12.73 13.264 13.766 14.228 14.741 15.326 15.869 16.455 17.065 17.714 18.393 19.135 20.016 20.864 21.8 22.798 23.947 25.249 26.658 28.097 29.582 30.539 30.861 30.795 30.59 30.326 29.998 29.636 29.311 28.904 28.483 28.09 27.693 27.324 26.959 26.575 26.124 25.734 25.416 25.087 24.722 24.376 24.021 23.675 23.378 23.051 22.719 22.383 22.04 21.807 21.552 21.13 20.856 20.562 20.402 20.089 19.767 19.421 19.229 18.681 18.584 18.356 18.109 17.544 17.244 16.94 16.593 16.177 15.655 14.948 12.613 -4 ,16259 ,KEBNE ,16691265,Thu Nov 25 12:09:57 CET,Thu Nov 25 13:44:46 CET,0.0 1.909 2.685 3.299 3.755 4.118 4.486 4.828 5.394 5.662 5.922 6.049 6.642 6.869 7.293 7.683 8.071 8.263 8.605 8.93 9.424 9.742 10.046 10.481 10.908 11.33 11.738 12.12 12.593 13.033 13.453 13.966 14.445 14.889 15.406 16.007 16.58 17.2 17.844 18.474 19.136 19.874 20.716 21.522 22.415 23.432 24.595 25.846 27.168 28.563 30.046 30.897 31.109 31.067 30.844 30.498 30.123 29.72 29.316 28.883 28.485 28.045 27.569 27.124 26.714 26.301 25.836 25.425 25.059 24.683 24.286 23.933 23.555 23.19 22.904 22.588 22.258 21.89 21.517 21.271 21.01 20.598 20.299 19.967 19.788 19.419 19.044 18.642 18.422 17.855 17.683 17.403 17.113 16.504 16.157 15.799 15.406 14.966 14.451 13.747 12.425 -5 ,28111 ,KEBNE ,16690541,Thu Nov 25 08:20:13 CET,Thu Nov 25 08:21:18 CET,0.0 2.015 2.725 3.26 3.719 4.126 4.489 4.816 5.428 5.704 5.962 6.084 6.671 6.897 7.312 7.698 8.088 8.282 8.638 8.962 9.41 9.709 10.0 10.405 10.818 11.215 11.578 11.924 12.36 12.793 13.22 13.735 14.234 14.696 15.235 15.831 16.368 16.949 17.601 18.274 18.966 19.777 20.699 21.584 22.579 23.615 24.784 26.064 27.491 28.993 30.467 31.363 31.578 31.498 31.281 30.953 30.572 30.165 29.769 29.339 28.93 28.523 28.11 27.71 27.309 26.915 26.454 26.036 25.677 25.291 24.876 24.507 24.139 23.766 23.472 23.159 22.833 22.486 22.109 21.856 21.601 21.192 20.907 20.6 20.432 20.093 19.74 19.32 19.096 18.559 18.459 18.202 17.933 17.362 17.066 16.74 16.349 15.893 15.348 14.644 13.015 -6 ,19540 ,KEBNE ,16691267,Thu Nov 25 12:09:58 CET,Thu Nov 25 13:43:33 CET,0.0 1.635 2.459 3.208 3.817 4.275 4.62 4.936 5.517 5.781 6.027 6.138 6.733 6.965 7.398 7.807 8.176 8.356 8.717 9.064 9.546 9.842 10.128 10.519 10.909 11.309 11.69 12.045 12.484 12.907 13.339 13.884 14.362 14.813 15.377 15.991 16.54 17.104 17.696 18.344 19.034 19.812 20.709 21.559 22.527 23.592 24.754 26.002 27.416 28.984 30.671 31.77 32.093 32.051 31.84 31.562 31.199 30.794 30.434 30.017 29.572 29.149 28.759 28.37 27.983 27.585 27.185 26.869 26.56 26.185 25.79 25.483 25.153 24.781 24.493 24.209 23.896 23.57 23.239 22.999 22.75 22.359 22.083 21.795 21.641 21.314 20.957 20.579 20.383 19.837 19.741 19.522 19.279 18.731 18.438 18.113 17.747 17.323 16.812 16.209 13.918 -7 ,14404 ,KEBNE ,16690543,Thu Nov 25 08:20:09 CET,Thu Nov 25 08:21:13 CET,0.0 1.531 2.197 2.741 3.206 3.598 3.96 4.296 4.895 5.177 5.447 5.588 6.164 6.371 6.781 7.157 7.52 7.698 8.036 8.375 8.872 9.169 9.46 9.903 10.294 10.648 10.99 11.338 11.784 12.19 12.601 13.111 13.597 14.059 14.572 15.141 15.687 16.271 16.893 17.546 18.204 18.973 19.904 20.764 21.722 22.756 23.881 25.125 26.497 27.954 29.475 30.255 30.37 30.227 29.929 29.569 29.17 28.728 28.308 27.876 27.485 27.099 26.688 26.24 25.778 25.374 24.975 24.614 24.285 23.915 23.515 23.163 22.814 22.481 22.21 21.899 21.562 21.202 20.833 20.591 20.326 19.908 19.627 19.327 19.173 18.839 18.484 18.098 17.891 17.349 17.235 16.977 16.722 16.188 15.866 15.505 15.113 14.638 14.097 13.421 11.468 -8 ,8799 ,KEBNE ,16691269,Thu Nov 25 12:09:58 CET,Thu Nov 25 13:45:42 CET,0.0 1.612 2.4 2.928 3.373 3.79 4.187 4.559 5.222 5.519 5.787 5.935 6.53 6.766 7.213 7.64 8.043 8.234 8.607 8.965 9.484 9.807 10.115 10.576 11.016 11.432 11.833 12.227 12.753 13.236 13.701 14.258 14.764 15.242 15.766 16.371 16.967 17.591 18.243 18.902 19.584 20.366 21.276 22.185 23.194 24.269 25.455 26.73 28.112 29.603 31.199 32.24 32.509 32.441 32.222 31.893 31.55 31.164 30.723 30.252 29.806 29.355 28.92 28.489 28.065 27.661 27.222 26.834 26.509 26.174 25.834 25.543 25.223 24.884 24.59 24.269 23.944 23.61 23.251 23.004 22.754 22.336 22.018 21.688 21.528 21.18 20.806 20.436 20.248 19.715 19.631 19.402 19.168 18.646 18.342 18.002 17.627 17.224 16.761 16.125 14.59 -9 ,4619 ,KEBNE ,16691270,Thu Nov 25 12:09:58 CET,Thu Nov 25 13:46:21 CET,0.0 1.709 2.539 3.152 3.648 4.091 4.49 4.87 5.539 5.838 6.115 6.268 6.887 7.135 7.601 8.049 8.458 8.645 9.014 9.364 9.848 10.172 10.502 10.982 11.425 11.859 12.301 12.714 13.203 13.653 14.088 14.625 15.137 15.614 16.165 16.765 17.332 17.961 18.622 19.311 20.038 20.831 21.762 22.705 23.731 24.812 26.083 27.519 29.097 30.785 32.577 33.782 34.241 34.294 34.07 33.757 33.466 33.143 32.799 32.457 32.141 31.804 31.424 31.032 30.668 30.335 29.96 29.601 29.292 28.966 28.596 28.271 27.921 27.559 27.272 26.987 26.69 26.332 25.946 25.672 25.392 24.963 24.671 24.357 24.19 23.851 23.487 23.074 22.855 22.287 22.128 21.879 21.598 21.004 20.697 20.332 19.917 19.454 18.917 18.197 16.359 -10 ,14689 ,KEBNE ,16690546,Thu Nov 25 08:20:06 CET,Thu Nov 25 08:21:21 CET,0.0 3.028 3.717 4.248 4.675 5.028 5.358 5.697 6.315 6.589 6.841 6.949 7.535 7.749 8.143 8.512 8.873 9.051 9.398 9.732 10.222 10.542 10.848 11.284 11.692 12.076 12.452 12.819 13.284 13.726 14.134 14.648 15.146 15.599 16.123 16.722 17.297 17.89 18.499 19.153 19.847 20.601 21.483 22.395 23.417 24.532 25.753 27.069 28.519 30.003 31.52 32.386 32.586 32.621 32.605 32.415 32.068 31.755 31.487 31.147 30.785 30.43 30.087 29.744 29.37 28.982 28.567 28.238 27.972 27.644 27.273 26.976 26.662 26.326 26.062 25.785 25.487 25.168 24.831 24.589 24.334 23.912 23.607 23.301 23.151 22.839 22.506 22.153 21.961 21.414 21.303 21.059 20.807 20.265 19.97 19.623 19.177 18.675 18.139 17.401 14.705 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23475.txt deleted file mode 100644 index b177555f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20141 ,KEBNE ,16690547,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:21 CET,0.0 2.039 2.833 3.423 3.935 4.39 4.805 5.19 5.915 6.248 6.574 6.806 7.506 7.788 8.306 8.799 9.272 9.497 9.931 10.357 10.989 11.387 11.762 12.312 12.842 13.367 13.894 14.41 15.09 15.745 16.363 17.083 17.778 18.47 19.275 20.18 21.043 21.996 23.054 24.162 25.337 26.707 28.299 29.924 31.878 34.05 36.557 39.419 42.828 47.064 52.357 56.868 59.651 61.472 62.628 63.361 63.843 64.106 64.249 64.327 64.329 64.307 64.237 64.126 63.981 63.828 63.65 63.46 63.267 63.054 62.813 62.589 62.357 62.111 61.892 61.659 61.417 61.141 60.849 60.652 60.432 60.075 59.827 59.56 59.424 59.125 58.782 58.409 58.205 57.659 57.541 57.287 57.025 56.428 56.091 55.715 55.263 54.731 54.1 53.15 50.079 -2 ,14885 ,KEBNE ,16690548,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:12 CET,0.0 1.391 2.0 2.464 2.896 3.33 3.734 4.114 4.828 5.162 5.462 5.628 6.294 6.548 7.039 7.508 7.978 8.218 8.689 9.144 9.83 10.232 10.583 11.105 11.608 12.112 12.604 13.063 13.666 14.277 14.909 15.658 16.33 16.982 17.767 18.672 19.554 20.507 21.55 22.677 23.833 25.132 26.645 28.227 30.122 32.224 34.664 37.478 40.891 45.047 50.288 54.808 57.48 59.141 60.236 60.952 61.404 61.727 61.908 61.999 62.044 62.003 61.89 61.758 61.586 61.427 61.261 61.076 60.878 60.628 60.326 60.079 59.836 59.561 59.347 59.111 58.818 58.511 58.218 58.014 57.792 57.432 57.181 56.904 56.754 56.441 56.101 55.731 55.54 55.006 54.876 54.619 54.364 53.791 53.447 53.064 52.619 52.099 51.501 50.665 46.932 -3 ,3316 ,KEBNE ,16690549,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:11 CET,0.0 2.077 2.942 3.626 4.179 4.64 5.057 5.409 6.054 6.383 6.695 6.86 7.524 7.772 8.266 8.733 9.19 9.415 9.854 10.281 10.896 11.295 11.676 12.22 12.745 13.261 13.753 14.226 14.859 15.474 16.07 16.804 17.495 18.141 18.9 19.764 20.591 21.501 22.481 23.555 24.753 26.119 27.711 29.321 31.19 33.298 35.795 38.644 42.058 46.261 51.488 56.016 58.746 60.436 61.526 62.306 62.818 63.138 63.299 63.377 63.425 63.388 63.274 63.129 62.969 62.802 62.584 62.348 62.116 61.873 61.607 61.371 61.127 60.867 60.641 60.398 60.167 59.908 59.591 59.347 59.082 58.691 58.433 58.155 58.021 57.716 57.35 56.967 56.769 56.219 56.066 55.805 55.55 54.948 54.57 54.151 53.721 53.228 52.602 51.699 48.581 -4 ,459 ,KEBNE ,16690550,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:29 CET,0.0 2.247 3.016 3.536 3.979 4.375 4.763 5.145 5.823 6.118 6.415 6.619 7.299 7.558 8.043 8.518 8.994 9.222 9.645 10.06 10.676 11.071 11.456 12.003 12.524 13.024 13.51 13.995 14.628 15.23 15.8 16.506 17.215 17.904 18.687 19.53 20.368 21.312 22.342 23.466 24.629 25.916 27.454 29.069 30.948 33.029 35.492 38.348 41.735 45.805 50.967 55.387 58.002 59.776 60.998 61.824 62.31 62.575 62.735 62.845 62.844 62.798 62.747 62.669 62.533 62.343 62.131 61.93 61.747 61.538 61.286 61.077 60.854 60.591 60.358 60.129 59.897 59.635 59.352 59.151 58.939 58.564 58.29 58.011 57.865 57.562 57.234 56.858 56.651 56.095 55.967 55.716 55.433 54.79 54.43 54.052 53.623 53.093 52.402 51.365 47.467 -5 ,24345 ,KEBNE ,16690551,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:27 CET,0.0 2.413 3.283 3.932 4.484 4.978 5.436 5.873 6.69 7.059 7.392 7.632 8.332 8.613 9.136 9.617 10.077 10.297 10.718 11.143 11.771 12.165 12.547 13.099 13.609 14.107 14.591 15.072 15.714 16.314 16.906 17.638 18.33 18.988 19.744 20.604 21.436 22.349 23.349 24.442 25.598 26.857 28.322 29.866 31.706 33.732 36.094 38.856 42.22 46.319 51.364 55.699 58.245 59.82 60.856 61.588 62.084 62.414 62.569 62.624 62.628 62.556 62.435 62.296 62.127 61.916 61.66 61.426 61.212 60.972 60.698 60.429 60.153 59.872 59.633 59.403 59.15 58.867 58.574 58.363 58.122 57.709 57.405 57.089 56.941 56.632 56.266 55.854 55.649 55.117 55.011 54.752 54.447 53.775 53.43 53.06 52.626 52.127 51.505 50.522 47.412 -6 ,13147 ,KEBNE ,16690552,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:25 CET,0.0 1.416 2.078 2.621 3.087 3.495 3.868 4.236 4.916 5.219 5.498 5.647 6.319 6.571 7.055 7.529 7.989 8.218 8.673 9.104 9.708 10.099 10.475 11.021 11.55 12.077 12.593 13.072 13.708 14.346 14.958 15.702 16.413 17.085 17.866 18.734 19.561 20.492 21.492 22.523 23.65 24.979 26.583 28.172 29.966 32.035 34.522 37.406 40.859 45.019 50.232 54.689 57.346 59.041 60.151 60.921 61.459 61.813 61.982 62.046 62.047 62.0 61.875 61.732 61.594 61.429 61.229 61.021 60.841 60.627 60.38 60.155 59.896 59.652 59.459 59.242 58.99 58.717 58.427 58.221 58.012 57.674 57.432 57.165 57.03 56.758 56.442 56.076 55.882 55.343 55.162 54.828 54.491 53.737 53.308 52.87 52.356 51.718 50.936 49.95 46.428 -7 ,25161 ,KEBNE ,16691278,Thu Nov 25 12:09:57 CET,Thu Nov 25 13:46:25 CET,0.0 1.988 2.692 3.268 3.733 4.185 4.639 5.013 5.629 5.912 6.195 6.347 7.004 7.261 7.751 8.215 8.664 8.883 9.302 9.697 10.287 10.681 11.054 11.591 12.135 12.663 13.178 13.681 14.311 14.918 15.522 16.251 16.947 17.634 18.435 19.327 20.178 21.124 22.151 23.239 24.379 25.666 27.194 28.719 30.507 32.57 35.032 37.857 41.235 45.375 50.475 55.005 57.799 59.507 60.655 61.432 61.935 62.269 62.429 62.548 62.616 62.605 62.526 62.357 62.153 61.971 61.76 61.571 61.384 61.122 60.846 60.601 60.319 60.007 59.743 59.466 59.164 58.855 58.539 58.331 58.117 57.742 57.466 57.185 57.044 56.748 56.408 55.991 55.77 55.227 55.1 54.844 54.56 53.951 53.62 53.265 52.864 52.317 51.625 50.688 48.168 -8 ,13635 ,KEBNE ,16691279,Thu Nov 25 12:09:57 CET,Thu Nov 25 13:46:03 CET,0.0 2.018 2.783 3.359 3.854 4.309 4.719 5.076 5.727 6.031 6.318 6.477 7.136 7.4 7.914 8.39 8.839 9.054 9.468 9.868 10.456 10.831 11.193 11.719 12.25 12.756 13.252 13.736 14.338 14.951 15.535 16.217 16.903 17.59 18.39 19.261 20.093 21.015 21.977 23.033 24.164 25.405 26.927 28.502 30.35 32.426 34.861 37.688 41.103 45.291 50.49 54.888 57.595 59.281 60.365 61.131 61.605 61.907 62.081 62.144 62.125 62.048 61.913 61.774 61.652 61.498 61.273 61.037 60.833 60.621 60.38 60.159 59.917 59.654 59.455 59.237 58.985 58.719 58.44 58.223 57.987 57.61 57.339 57.056 56.908 56.597 56.243 55.856 55.654 55.098 54.992 54.754 54.474 53.871 53.53 53.144 52.708 52.171 51.506 50.641 47.758 -9 ,8252 ,KEBNE ,16691280,Thu Nov 25 12:10:01 CET,Thu Nov 25 13:46:07 CET,0.0 1.825 2.52 3.11 3.605 4.021 4.407 4.768 5.442 5.756 6.054 6.223 6.898 7.179 7.68 8.136 8.582 8.804 9.245 9.665 10.262 10.657 11.043 11.581 12.103 12.6 13.091 13.563 14.15 14.74 15.3 15.978 16.657 17.337 18.142 19.027 19.87 20.797 21.779 22.825 23.977 25.329 26.913 28.476 30.361 32.543 35.017 37.786 41.151 45.311 50.505 55.001 57.756 59.504 60.669 61.436 61.85 62.087 62.234 62.29 62.272 62.21 62.1 61.941 61.766 61.594 61.393 61.187 60.984 60.738 60.459 60.253 60.045 59.793 59.57 59.324 59.052 58.752 58.443 58.231 57.998 57.618 57.349 57.066 56.921 56.604 56.283 55.925 55.727 55.173 55.048 54.803 54.545 53.974 53.63 53.261 52.828 52.271 51.61 50.772 47.592 -10 ,4288 ,KEBNE ,16691281,Thu Nov 25 12:09:57 CET,Thu Nov 25 13:46:43 CET,0.0 1.493 2.261 2.857 3.363 3.818 4.257 4.668 5.397 5.734 6.038 6.195 6.854 7.109 7.603 8.097 8.574 8.806 9.24 9.655 10.248 10.62 10.996 11.553 12.076 12.581 13.082 13.586 14.229 14.818 15.418 16.165 16.874 17.57 18.378 19.268 20.133 21.114 22.189 23.345 24.547 25.894 27.454 29.015 30.84 32.942 35.494 38.414 41.876 46.076 51.243 55.58 58.165 59.88 60.988 61.678 62.088 62.312 62.392 62.372 62.289 62.154 62.01 61.852 61.648 61.434 61.199 60.964 60.728 60.504 60.278 60.031 59.772 59.518 59.294 59.03 58.757 58.48 58.199 58.0 57.767 57.41 57.16 56.874 56.727 56.421 56.077 55.704 55.503 54.96 54.857 54.608 54.351 53.802 53.465 53.054 52.59 52.024 51.352 50.503 45.792 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23476.txt deleted file mode 100644 index 06c013a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23479_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31542 ,KEBNE ,16691282,Thu Nov 25 12:09:57 CET,Thu Nov 25 13:47:50 CET,0.0 2.753 3.633 4.268 4.829 5.35 5.826 6.287 7.099 7.452 7.81 8.106 8.816 9.127 9.74 10.317 10.837 11.09 11.579 12.034 12.682 13.115 13.55 14.182 14.794 15.377 15.935 16.469 17.154 17.813 18.453 19.246 20.021 20.767 21.643 22.621 23.541 24.541 25.618 26.777 28.028 29.438 31.1 32.769 34.651 36.764 39.315 42.299 45.925 50.28 55.569 60.07 62.796 64.509 65.515 66.201 66.648 66.899 67.046 67.097 67.087 67.037 66.948 66.842 66.71 66.578 66.41 66.219 66.032 65.833 65.604 65.39 65.147 64.872 64.657 64.437 64.189 63.919 63.636 63.428 63.2 62.814 62.539 62.259 62.114 61.809 61.434 61.006 60.806 60.272 60.177 59.925 59.634 59.012 58.667 58.284 57.889 57.433 56.848 56.069 52.152 -2 ,10977 ,KEBNE ,16690558,Thu Nov 25 08:20:06 CET,Thu Nov 25 08:21:16 CET,0.0 3.803 4.721 5.377 5.942 6.434 6.905 7.355 8.153 8.518 8.872 9.147 9.853 10.141 10.693 11.217 11.715 11.953 12.418 12.867 13.519 13.946 14.364 14.967 15.539 16.095 16.654 17.216 17.919 18.601 19.275 20.052 20.793 21.519 22.359 23.313 24.264 25.331 26.442 27.592 28.839 30.256 31.922 33.61 35.596 37.835 40.408 43.367 46.914 51.156 56.414 60.801 63.353 64.956 65.956 66.624 67.042 67.289 67.451 67.597 67.669 67.682 67.636 67.537 67.416 67.251 67.029 66.828 66.662 66.449 66.189 65.983 65.747 65.48 65.275 65.042 64.787 64.509 64.191 63.985 63.774 63.411 63.14 62.833 62.662 62.285 61.867 61.453 61.247 60.673 60.471 60.198 59.904 59.243 58.908 58.544 58.115 57.613 57.008 56.076 52.859 -3 ,8463 ,KEBNE ,16690559,Thu Nov 25 08:20:06 CET,Thu Nov 25 08:21:17 CET,0.0 2.8 3.699 4.37 4.962 5.497 5.958 6.389 7.165 7.523 7.865 8.105 8.825 9.138 9.724 10.278 10.808 11.069 11.581 12.083 12.792 13.234 13.655 14.287 14.904 15.484 16.043 16.584 17.288 17.973 18.648 19.457 20.198 20.897 21.707 22.601 23.496 24.509 25.591 26.76 27.991 29.41 31.086 32.776 34.734 36.959 39.65 42.668 46.205 50.527 55.939 60.482 63.181 64.783 65.792 66.529 66.984 67.252 67.369 67.393 67.339 67.201 67.058 66.917 66.723 66.538 66.298 66.032 65.797 65.537 65.257 65.015 64.744 64.427 64.193 63.957 63.667 63.378 63.082 62.856 62.631 62.302 62.069 61.809 61.665 61.375 61.074 60.734 60.544 60.0 59.899 59.67 59.428 58.901 58.595 58.248 57.829 57.346 56.772 56.002 53.084 -4 ,18201 ,KEBNE ,16690560,Thu Nov 25 08:20:06 CET,Thu Nov 25 08:21:27 CET,0.0 2.523 3.471 4.177 4.798 5.303 5.773 6.196 6.994 7.378 7.736 8.012 8.72 9.014 9.611 10.204 10.759 11.022 11.517 11.993 12.69 13.114 13.526 14.137 14.725 15.301 15.872 16.415 17.109 17.791 18.477 19.329 20.103 20.805 21.59 22.456 23.332 24.329 25.415 26.577 27.756 29.136 30.778 32.375 34.23 36.322 38.805 41.643 45.013 49.179 54.416 58.818 61.428 63.11 64.189 64.881 65.342 65.627 65.742 65.739 65.651 65.54 65.418 65.265 65.095 64.911 64.685 64.47 64.268 64.054 63.786 63.535 63.287 63.012 62.782 62.538 62.283 62.016 61.717 61.492 61.251 60.878 60.616 60.334 60.184 59.877 59.568 59.191 58.975 58.421 58.287 58.036 57.773 57.199 56.887 56.535 56.105 55.604 55.039 54.214 51.552 -5 ,515 ,KEBNE ,16690561,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:15 CET,0.0 3.585 4.514 5.189 5.753 6.232 6.679 7.132 7.937 8.292 8.65 8.916 9.629 9.928 10.466 10.995 11.531 11.787 12.276 12.743 13.438 13.879 14.301 14.927 15.539 16.14 16.723 17.278 17.965 18.633 19.292 20.083 20.831 21.559 22.409 23.377 24.307 25.329 26.432 27.597 28.833 30.272 31.993 33.647 35.546 37.731 40.297 43.258 46.767 51.017 56.298 60.735 63.399 65.088 66.096 66.753 67.222 67.521 67.679 67.775 67.792 67.698 67.586 67.472 67.316 67.149 66.958 66.758 66.573 66.36 66.125 65.936 65.715 65.442 65.217 64.98 64.717 64.44 64.138 63.931 63.711 63.33 63.061 62.772 62.623 62.309 61.937 61.54 61.319 60.73 60.533 60.258 59.987 59.402 59.072 58.73 58.331 57.861 57.302 56.425 52.394 -6 ,10786 ,KEBNE ,16690562,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:15 CET,0.0 2.595 3.538 4.315 5.003 5.604 6.144 6.63 7.501 7.908 8.293 8.592 9.332 9.651 10.285 10.92 11.506 11.786 12.363 12.924 13.65 14.116 14.585 15.265 15.915 16.542 17.151 17.718 18.445 19.177 19.893 20.769 21.623 22.444 23.386 24.43 25.462 26.629 27.825 29.019 30.283 31.694 33.272 34.86 36.781 38.985 41.584 44.59 48.25 52.599 57.853 62.318 64.955 66.577 67.537 68.079 68.403 68.589 68.619 68.571 68.486 68.344 68.186 67.982 67.745 67.539 67.317 67.077 66.859 66.631 66.291 66.003 65.771 65.532 65.335 65.087 64.818 64.544 64.245 64.042 63.835 63.486 63.235 62.949 62.774 62.384 61.994 61.616 61.411 60.846 60.677 60.382 60.068 59.443 59.123 58.76 58.341 57.856 57.242 56.402 52.268 -7 ,2887 ,KEBNE ,16690563,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:06 CET,0.0 2.239 3.009 3.651 4.197 4.686 5.138 5.573 6.386 6.763 7.103 7.316 8.029 8.343 8.941 9.499 10.03 10.279 10.749 11.204 11.863 12.282 12.69 13.292 13.877 14.446 15.0 15.524 16.208 16.867 17.5 18.273 19.035 19.8 20.687 21.683 22.62 23.638 24.742 25.947 27.192 28.567 30.242 31.917 33.859 36.044 38.576 41.529 45.089 49.312 54.579 59.132 61.755 63.358 64.339 65.025 65.482 65.693 65.786 65.824 65.801 65.727 65.548 65.37 65.185 64.968 64.723 64.459 64.212 63.944 63.656 63.401 63.12 62.834 62.616 62.381 62.132 61.866 61.555 61.338 61.122 60.777 60.522 60.244 60.1 59.794 59.454 59.086 58.889 58.342 58.222 57.97 57.709 57.174 56.865 56.506 56.096 55.618 54.99 54.041 51.074 -8 ,28309 ,KEBNE ,16691289,Thu Nov 25 12:09:57 CET,Thu Nov 25 13:45:41 CET,0.0 2.345 3.272 3.929 4.503 5.042 5.559 6.028 6.786 7.119 7.454 7.719 8.43 8.747 9.351 9.894 10.428 10.687 11.178 11.655 12.33 12.761 13.171 13.771 14.397 15.026 15.61 16.159 16.864 17.538 18.194 18.965 19.694 20.422 21.267 22.202 23.132 24.15 25.235 26.416 27.659 29.043 30.652 32.283 34.27 36.536 39.152 42.117 45.654 49.903 55.103 59.476 62.234 64.031 65.174 65.921 66.35 66.646 66.868 66.996 67.02 66.952 66.836 66.728 66.589 66.41 66.225 66.042 65.831 65.568 65.299 65.087 64.815 64.471 64.215 63.978 63.714 63.417 63.094 62.876 62.654 62.26 61.966 61.676 61.537 61.253 60.926 60.548 60.343 59.795 59.656 59.401 59.138 58.544 58.208 57.832 57.389 56.874 56.215 55.261 50.907 -9 ,12673 ,KEBNE ,16691290,Thu Nov 25 12:09:58 CET,Thu Nov 25 13:47:35 CET,0.0 2.976 3.91 4.605 5.161 5.65 6.072 6.485 7.317 7.686 8.013 8.245 8.961 9.269 9.849 10.426 11.015 11.287 11.773 12.238 12.937 13.38 13.789 14.376 14.959 15.551 16.132 16.675 17.367 18.039 18.67 19.427 20.164 20.899 21.746 22.676 23.582 24.595 25.682 26.823 28.01 29.358 30.994 32.664 34.646 36.866 39.362 42.211 45.669 49.807 54.978 59.521 62.281 64.011 65.147 65.943 66.45 66.734 66.919 67.088 67.129 67.053 66.926 66.795 66.646 66.469 66.268 66.057 65.823 65.581 65.352 65.132 64.885 64.614 64.393 64.163 63.924 63.669 63.389 63.188 62.97 62.626 62.373 62.106 61.967 61.637 61.264 60.873 60.664 60.106 59.984 59.754 59.506 58.931 58.618 58.249 57.811 57.282 56.616 55.815 51.663 -10 ,32685 ,KEBNE ,16691291,Thu Nov 25 12:10:58 CET,Thu Nov 25 13:49:02 CET,0.0 2.631 3.516 4.147 4.692 5.187 5.635 6.049 6.854 7.234 7.579 7.812 8.522 8.834 9.411 9.956 10.48 10.733 11.218 11.698 12.402 12.848 13.268 13.883 14.473 15.039 15.579 16.104 16.794 17.465 18.125 18.922 19.669 20.355 21.13 22.054 22.999 24.014 25.089 26.214 27.431 28.832 30.474 32.14 34.125 36.399 39.008 41.966 45.472 49.655 54.812 59.151 61.716 63.313 64.33 64.974 65.381 65.614 65.716 65.763 65.709 65.595 65.464 65.313 65.151 64.971 64.742 64.529 64.347 64.122 63.866 63.659 63.411 63.128 62.914 62.672 62.405 62.115 61.786 61.544 61.291 60.895 60.601 60.271 60.102 59.763 59.389 58.989 58.787 58.237 58.105 57.867 57.615 57.038 56.698 56.321 55.906 55.409 54.821 53.889 50.834 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23479.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23479.txt deleted file mode 100644 index ed626e56..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23479.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26251 ,KEBNE ,16690567,Thu Nov 25 08:20:06 CET,Thu Nov 25 08:21:29 CET,0.0 2.415 3.364 4.033 4.576 5.062 5.484 5.853 6.503 6.791 7.055 7.176 7.796 8.016 8.453 8.868 9.233 9.405 9.761 10.093 10.56 10.864 11.165 11.587 11.966 12.319 12.662 13.013 13.475 13.905 14.29 14.749 15.186 15.577 16.031 16.522 16.979 17.46 17.958 18.505 19.032 19.545 20.094 20.594 21.116 21.654 22.21 22.708 23.059 23.111 22.537 21.272 19.925 18.585 17.331 16.16 15.077 14.084 13.198 12.264 11.467 10.768 10.053 9.324 8.65 8.043 7.402 6.821 6.324 5.824 5.278 4.796 4.294 3.769 3.365 2.96 2.533 2.086 1.602 1.253 0.902 0.369 0.001 -0.38 -0.582 -1.013 -1.461 -1.956 -2.221 -2.882 -3.025 -3.319 -3.654 -4.401 -4.81 -5.247 -5.716 -6.256 -6.908 -7.805 -9.971 -2 ,966 ,KEBNE ,16690568,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:28 CET,0.0 1.335 1.961 2.484 2.951 3.37 3.726 4.058 4.622 4.867 5.111 5.186 5.792 6.0 6.402 6.764 7.097 7.257 7.562 7.848 8.257 8.519 8.783 9.174 9.537 9.897 10.256 10.587 11.011 11.401 11.771 12.215 12.592 12.926 13.319 13.775 14.198 14.631 15.1 15.587 16.038 16.518 17.002 17.437 17.971 18.508 18.994 19.397 19.692 19.66 19.009 17.787 16.512 15.257 14.032 12.93 12.014 11.118 10.279 9.444 8.717 8.042 7.393 6.771 6.176 5.64 5.043 4.49 4.036 3.565 3.038 2.593 2.122 1.61 1.221 0.841 0.452 0.016 -0.445 -0.767 -1.094 -1.597 -1.946 -2.316 -2.513 -2.909 -3.32 -3.756 -3.997 -4.645 -4.764 -5.041 -5.32 -5.931 -6.273 -6.608 -6.985 -7.412 -7.955 -8.668 -10.66 -3 ,4658 ,KEBNE ,16691294,Thu Nov 25 12:09:58 CET,Thu Nov 25 13:51:39 CET,0.0 1.414 2.131 2.775 3.382 3.877 4.238 4.531 5.058 5.313 5.55 5.588 6.185 6.396 6.822 7.202 7.547 7.72 8.049 8.374 8.83 9.098 9.371 9.777 10.138 10.471 10.778 11.074 11.456 11.814 12.166 12.585 12.966 13.314 13.694 14.127 14.534 14.994 15.519 16.029 16.52 17.025 17.544 18.047 18.568 19.033 19.456 19.828 20.085 20.062 19.453 18.159 16.856 15.605 14.417 13.32 12.326 11.392 10.577 9.701 8.91 8.193 7.533 6.926 6.346 5.784 5.179 4.649 4.192 3.719 3.205 2.768 2.316 1.829 1.461 1.076 0.655 0.227 -0.215 -0.525 -0.845 -1.343 -1.699 -2.077 -2.273 -2.675 -3.088 -3.53 -3.762 -4.399 -4.512 -4.78 -5.057 -5.689 -6.044 -6.413 -6.788 -7.229 -7.77 -8.416 -9.914 -4 ,26355 ,KEBNE ,16690570,Thu Nov 25 08:20:06 CET,Thu Nov 25 08:21:29 CET,0.0 1.159 1.712 2.169 2.563 2.915 3.247 3.545 4.092 4.356 4.598 4.647 5.253 5.467 5.865 6.219 6.547 6.716 7.055 7.372 7.789 8.053 8.336 8.727 9.052 9.349 9.647 9.944 10.334 10.7 11.041 11.436 11.806 12.168 12.565 13.016 13.435 13.863 14.298 14.701 15.102 15.547 16.046 16.522 17.057 17.591 18.058 18.478 18.714 18.519 17.809 16.47 15.026 13.62 12.305 11.101 10.045 9.063 8.181 7.267 6.502 5.77 5.028 4.352 3.721 3.128 2.476 1.867 1.36 0.842 0.298 -0.171 -0.658 -1.163 -1.56 -1.951 -2.357 -2.775 -3.218 -3.542 -3.872 -4.376 -4.743 -5.127 -5.321 -5.73 -6.168 -6.605 -6.824 -7.465 -7.574 -7.847 -8.144 -8.755 -9.067 -9.414 -9.787 -10.21 -10.69 -11.346 -12.738 -5 ,18326 ,KEBNE ,16690571,Thu Nov 25 08:20:06 CET,Thu Nov 25 08:21:14 CET,0.0 1.305 1.933 2.442 2.876 3.242 3.577 3.891 4.432 4.669 4.904 4.971 5.571 5.782 6.218 6.617 6.964 7.129 7.445 7.754 8.186 8.449 8.718 9.089 9.404 9.731 10.068 10.391 10.802 11.167 11.497 11.887 12.282 12.676 13.12 13.58 13.995 14.428 14.858 15.295 15.749 16.25 16.827 17.327 17.799 18.27 18.738 19.113 19.393 19.42 18.799 17.551 16.218 14.971 13.818 12.703 11.689 10.747 9.919 9.039 8.274 7.607 6.962 6.338 5.747 5.2 4.627 4.109 3.649 3.156 2.648 2.219 1.753 1.273 0.905 0.536 0.149 -0.269 -0.71 -1.02 -1.349 -1.872 -2.237 -2.614 -2.812 -3.207 -3.613 -4.051 -4.278 -4.91 -5.015 -5.295 -5.584 -6.167 -6.503 -6.877 -7.279 -7.717 -8.218 -8.953 -10.449 -6 ,23326 ,KEBNE ,16690572,Thu Nov 25 08:20:06 CET,Thu Nov 25 08:21:14 CET,0.0 1.331 2.048 2.594 2.98 3.356 3.71 3.993 4.499 4.741 4.973 5.033 5.633 5.844 6.226 6.561 6.877 7.036 7.335 7.619 8.05 8.321 8.572 8.933 9.269 9.617 9.953 10.256 10.63 10.975 11.315 11.709 12.082 12.456 12.882 13.324 13.743 14.176 14.64 15.154 15.656 16.166 16.678 17.127 17.558 17.979 18.417 18.764 18.964 18.882 18.191 16.943 15.691 14.469 13.322 12.22 11.229 10.292 9.446 8.514 7.693 7.021 6.373 5.738 5.154 4.617 4.03 3.501 3.035 2.527 1.979 1.514 1.041 0.569 0.214 -0.155 -0.547 -0.944 -1.367 -1.679 -2.0 -2.484 -2.818 -3.167 -3.347 -3.731 -4.144 -4.569 -4.782 -5.39 -5.416 -5.652 -5.91 -6.51 -6.861 -7.25 -7.677 -8.1 -8.549 -9.164 -10.494 -7 ,9462 ,KEBNE ,16690573,Thu Nov 25 08:20:06 CET,Thu Nov 25 08:21:27 CET,0.0 1.491 2.144 2.649 3.09 3.487 3.832 4.137 4.686 4.948 5.191 5.229 5.82 6.009 6.365 6.703 7.036 7.202 7.525 7.841 8.264 8.522 8.771 9.109 9.47 9.828 10.147 10.473 10.905 11.303 11.65 12.06 12.461 12.831 13.239 13.691 14.116 14.566 15.036 15.507 15.978 16.468 16.974 17.43 17.886 18.324 18.757 19.143 19.381 19.369 18.784 17.438 16.116 14.928 13.775 12.658 11.657 10.657 9.777 8.983 8.296 7.601 6.898 6.234 5.628 5.086 4.51 3.998 3.538 3.045 2.519 2.065 1.595 1.098 0.731 0.361 -0.05 -0.48 -0.924 -1.219 -1.518 -1.981 -2.321 -2.684 -2.865 -3.241 -3.64 -4.075 -4.311 -4.948 -5.05 -5.328 -5.636 -6.265 -6.595 -6.978 -7.388 -7.832 -8.363 -9.023 -10.384 -8 ,23834 ,KEBNE ,16691299,Thu Nov 25 12:09:58 CET,Thu Nov 25 13:48:49 CET,0.0 1.548 2.225 2.707 3.112 3.492 3.861 4.207 4.782 5.047 5.323 5.452 6.074 6.277 6.649 7.006 7.34 7.504 7.832 8.135 8.558 8.822 9.074 9.455 9.819 10.156 10.472 10.758 11.135 11.507 11.847 12.244 12.62 12.964 13.342 13.763 14.173 14.627 15.073 15.526 16.021 16.566 17.123 17.58 18.021 18.462 18.891 19.239 19.48 19.518 19.059 17.976 16.797 15.622 14.52 13.459 12.461 11.528 10.728 9.904 9.147 8.444 7.772 7.137 6.536 5.968 5.352 4.808 4.346 3.846 3.31 2.875 2.436 1.971 1.613 1.234 0.819 0.398 -0.031 -0.33 -0.653 -1.184 -1.556 -1.954 -2.152 -2.547 -2.968 -3.416 -3.654 -4.293 -4.383 -4.648 -4.931 -5.535 -5.873 -6.26 -6.672 -7.105 -7.621 -8.283 -9.756 -9 ,3568 ,KEBNE ,16690575,Thu Nov 25 08:20:06 CET,Thu Nov 25 08:21:18 CET,0.0 1.227 1.889 2.392 2.837 3.222 3.551 3.852 4.399 4.645 4.891 4.98 5.581 5.783 6.179 6.54 6.895 7.069 7.388 7.689 8.097 8.367 8.63 8.987 9.325 9.66 9.976 10.255 10.625 10.997 11.354 11.765 12.12 12.448 12.839 13.281 13.698 14.132 14.585 15.012 15.436 15.943 16.474 16.921 17.376 17.822 18.271 18.689 19.01 19.027 18.389 17.126 15.85 14.664 13.505 12.355 11.299 10.326 9.488 8.64 7.899 7.222 6.551 5.916 5.311 4.749 4.18 3.669 3.234 2.782 2.285 1.873 1.43 0.963 0.602 0.221 -0.17 -0.59 -1.022 -1.317 -1.642 -2.14 -2.477 -2.829 -3.008 -3.396 -3.821 -4.267 -4.494 -5.131 -5.234 -5.489 -5.77 -6.392 -6.711 -7.033 -7.365 -7.723 -8.168 -8.76 -9.818 -10 ,24808 ,KEBNE ,16691301,Thu Nov 25 12:10:59 CET,Thu Nov 25 13:49:20 CET,0.0 1.05 1.679 2.184 2.613 3.018 3.374 3.689 4.267 4.529 4.772 4.82 5.424 5.629 6.009 6.37 6.738 6.913 7.223 7.529 7.999 8.286 8.546 8.926 9.283 9.621 9.946 10.251 10.632 10.976 11.309 11.725 12.124 12.501 12.957 13.462 13.914 14.42 14.934 15.45 15.989 16.542 17.124 17.673 18.255 18.771 19.22 19.656 19.985 20.062 19.573 18.309 16.978 15.705 14.536 13.411 12.329 11.314 10.464 9.637 8.883 8.219 7.614 6.989 6.37 5.846 5.304 4.779 4.324 3.83 3.27 2.813 2.359 1.885 1.503 1.084 0.647 0.208 -0.237 -0.536 -0.847 -1.365 -1.748 -2.124 -2.304 -2.695 -3.125 -3.573 -3.807 -4.453 -4.535 -4.804 -5.087 -5.715 -6.079 -6.46 -6.887 -7.365 -7.842 -8.458 -9.921 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23482.txt deleted file mode 100644 index 9f22fb74..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23480_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9496 ,KEBNE ,16691302,Thu Nov 25 12:10:58 CET,Thu Nov 25 13:49:04 CET,0.0 2.594 3.381 3.962 4.419 4.81 5.188 5.498 6.011 6.243 6.442 6.416 6.97 7.126 7.423 7.676 7.905 8.013 8.201 8.37 8.595 8.75 8.889 9.067 9.217 9.343 9.463 9.557 9.681 9.801 9.909 10.006 10.066 10.072 10.03 9.987 9.878 9.677 9.449 9.19 8.814 8.31 7.576 6.66 5.438 3.841 1.8 -0.829 -4.589 -10.086 -18.365 -27.372 -34.302 -39.803 -44.252 -48.052 -51.244 -54.016 -56.342 -58.599 -60.53 -62.286 -63.898 -65.359 -66.706 -67.9 -69.124 -70.213 -71.144 -72.11 -73.127 -73.971 -74.81 -75.663 -76.333 -77.009 -77.685 -78.389 -79.125 -79.634 -80.168 -80.986 -81.548 -82.122 -82.411 -83.001 -83.597 -84.229 -84.568 -85.401 -85.657 -86.045 -86.44 -87.305 -87.761 -88.221 -88.737 -89.321 -89.994 -90.799 -92.352 -2 ,17823 ,KEBNE ,16690578,Thu Nov 25 08:20:06 CET,Thu Nov 25 08:21:16 CET,0.0 2.351 3.063 3.627 4.081 4.469 4.796 5.069 5.536 5.74 5.947 5.934 6.485 6.638 6.916 7.19 7.444 7.547 7.718 7.876 8.115 8.257 8.385 8.59 8.758 8.897 9.024 9.11 9.195 9.271 9.336 9.385 9.43 9.453 9.423 9.329 9.204 9.041 8.825 8.528 8.174 7.722 6.994 6.11 4.942 3.454 1.51 -1.167 -4.966 -10.242 -18.447 -27.5 -34.277 -39.662 -44.094 -47.928 -51.156 -53.956 -56.305 -58.612 -60.544 -62.189 -63.736 -65.173 -66.497 -67.717 -68.971 -70.057 -70.998 -71.969 -72.957 -73.773 -74.605 -75.473 -76.143 -76.831 -77.533 -78.247 -78.974 -79.474 -79.974 -80.71 -81.224 -81.759 -82.04 -82.644 -83.274 -83.921 -84.245 -85.056 -85.263 -85.628 -86.027 -86.856 -87.292 -87.779 -88.322 -88.93 -89.596 -90.396 -92.159 -3 ,21277 ,KEBNE ,16691304,Thu Nov 25 12:10:59 CET,Thu Nov 25 13:48:08 CET,0.0 2.407 3.285 3.955 4.418 4.807 5.153 5.425 5.903 6.129 6.339 6.327 6.882 7.035 7.32 7.562 7.771 7.868 8.059 8.228 8.45 8.599 8.746 8.938 9.107 9.276 9.428 9.547 9.678 9.789 9.876 9.958 10.004 10.011 10.015 9.972 9.834 9.665 9.522 9.301 8.913 8.389 7.724 6.853 5.628 4.103 2.046 -0.667 -4.453 -9.885 -18.103 -26.982 -33.816 -39.415 -43.966 -47.804 -51.102 -53.949 -56.265 -58.545 -60.503 -62.205 -63.748 -65.193 -66.55 -67.737 -68.966 -70.079 -71.02 -71.959 -72.934 -73.763 -74.603 -75.449 -76.106 -76.789 -77.473 -78.165 -78.897 -79.398 -79.895 -80.643 -81.166 -81.742 -82.04 -82.618 -83.201 -83.806 -84.127 -84.943 -85.145 -85.508 -85.883 -86.721 -87.171 -87.618 -88.122 -88.731 -89.375 -90.118 -91.972 -4 ,26803 ,KEBNE ,16690580,Thu Nov 25 08:20:06 CET,Thu Nov 25 08:21:18 CET,0.0 2.202 3.028 3.648 4.061 4.413 4.753 5.056 5.559 5.773 5.98 5.963 6.502 6.646 6.927 7.174 7.407 7.519 7.716 7.888 8.139 8.287 8.403 8.591 8.796 8.948 9.066 9.171 9.266 9.331 9.387 9.421 9.439 9.467 9.47 9.426 9.334 9.149 8.908 8.63 8.253 7.757 7.073 6.268 5.174 3.731 1.762 -0.878 -4.514 -9.752 -17.954 -27.0 -33.907 -39.409 -43.878 -47.701 -50.937 -53.742 -56.117 -58.417 -60.331 -62.02 -63.587 -65.025 -66.324 -67.516 -68.757 -69.835 -70.76 -71.728 -72.722 -73.524 -74.356 -75.226 -75.896 -76.557 -77.237 -77.974 -78.758 -79.283 -79.797 -80.59 -81.124 -81.669 -81.955 -82.554 -83.15 -83.775 -84.112 -84.947 -85.204 -85.585 -85.973 -86.794 -87.234 -87.71 -88.245 -88.861 -89.534 -90.303 -91.557 -5 ,7826 ,KEBNE ,16690581,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:10 CET,0.0 2.194 2.891 3.359 3.767 4.131 4.429 4.724 5.261 5.467 5.648 5.641 6.202 6.355 6.645 6.919 7.157 7.255 7.44 7.604 7.832 7.961 8.073 8.239 8.4 8.555 8.685 8.786 8.905 9.004 9.062 9.116 9.184 9.199 9.18 9.139 9.012 8.823 8.578 8.246 7.823 7.338 6.673 5.802 4.681 3.227 1.193 -1.502 -5.289 -10.672 -18.852 -27.836 -34.749 -40.288 -44.776 -48.576 -51.758 -54.557 -56.915 -59.195 -61.101 -62.765 -64.349 -65.825 -67.172 -68.381 -69.581 -70.645 -71.608 -72.602 -73.603 -74.452 -75.327 -76.199 -76.866 -77.543 -78.217 -78.887 -79.602 -80.112 -80.621 -81.395 -81.922 -82.446 -82.726 -83.316 -83.927 -84.595 -84.943 -85.754 -85.904 -86.255 -86.619 -87.367 -87.766 -88.188 -88.649 -89.207 -89.897 -90.83 -93.838 -6 ,29525 ,KEBNE ,16691307,Thu Nov 25 12:10:59 CET,Thu Nov 25 13:50:53 CET,0.0 2.417 3.174 3.724 4.162 4.535 4.861 5.146 5.644 5.846 6.032 5.995 6.538 6.692 6.998 7.284 7.538 7.642 7.825 7.993 8.227 8.368 8.489 8.677 8.836 8.97 9.104 9.21 9.334 9.45 9.525 9.589 9.64 9.658 9.65 9.598 9.522 9.393 9.167 8.84 8.452 7.946 7.19 6.37 5.282 3.816 1.879 -0.685 -4.254 -9.486 -17.64 -26.569 -33.387 -38.83 -43.288 -47.113 -50.332 -53.116 -55.44 -57.713 -59.632 -61.295 -62.866 -64.374 -65.726 -66.926 -68.166 -69.269 -70.234 -71.201 -72.192 -73.021 -73.873 -74.749 -75.405 -76.065 -76.751 -77.467 -78.186 -78.664 -79.165 -79.934 -80.462 -81.01 -81.29 -81.867 -82.47 -83.09 -83.408 -84.224 -84.446 -84.824 -85.234 -86.136 -86.579 -87.037 -87.573 -88.207 -88.916 -89.718 -91.28 -7 ,23414 ,KEBNE ,16690583,Thu Nov 25 08:20:05 CET,Thu Nov 25 08:21:09 CET,0.0 2.233 3.07 3.722 4.175 4.538 4.862 5.139 5.64 5.869 6.07 6.046 6.61 6.749 6.974 7.207 7.442 7.546 7.724 7.896 8.143 8.287 8.414 8.581 8.729 8.845 8.943 9.04 9.133 9.22 9.295 9.321 9.308 9.279 9.245 9.181 9.077 8.919 8.648 8.286 7.872 7.356 6.612 5.678 4.411 2.898 0.935 -1.717 -5.483 -10.823 -18.942 -27.972 -34.86 -40.315 -44.752 -48.528 -51.719 -54.484 -56.807 -59.098 -60.992 -62.618 -64.132 -65.567 -66.903 -68.094 -69.304 -70.366 -71.257 -72.184 -73.194 -74.042 -74.871 -75.68 -76.32 -77.029 -77.745 -78.439 -79.149 -79.642 -80.153 -80.941 -81.485 -82.039 -82.317 -82.896 -83.505 -84.13 -84.454 -85.268 -85.453 -85.817 -86.198 -86.96 -87.39 -87.859 -88.331 -88.846 -89.448 -90.215 -91.654 -8 ,4056 ,KEBNE ,16691309,Thu Nov 25 12:10:59 CET,Thu Nov 25 13:50:15 CET,0.0 2.739 3.496 4.054 4.521 4.896 5.237 5.54 6.087 6.334 6.559 6.563 7.115 7.274 7.577 7.837 8.093 8.216 8.409 8.572 8.818 8.967 9.1 9.314 9.525 9.677 9.769 9.871 10.005 10.087 10.155 10.23 10.289 10.318 10.301 10.247 10.157 10.031 9.806 9.465 9.082 8.602 7.872 7.014 5.902 4.462 2.532 -0.083 -3.74 -8.961 -17.172 -26.164 -33.039 -38.638 -43.166 -46.989 -50.229 -53.02 -55.323 -57.61 -59.559 -61.251 -62.857 -64.335 -65.685 -66.903 -68.165 -69.3 -70.253 -71.233 -72.238 -73.035 -73.848 -74.685 -75.327 -75.989 -76.664 -77.363 -78.117 -78.612 -79.102 -79.865 -80.395 -80.993 -81.302 -81.879 -82.465 -83.095 -83.427 -84.259 -84.498 -84.874 -85.261 -86.126 -86.61 -87.119 -87.637 -88.209 -88.877 -89.676 -91.582 -9 ,1194 ,KEBNE ,16691310,Thu Nov 25 12:10:59 CET,Thu Nov 25 13:52:20 CET,0.0 3.644 4.743 5.468 5.993 6.423 6.758 7.058 7.574 7.804 8.007 7.99 8.559 8.724 8.998 9.232 9.454 9.555 9.744 9.908 10.126 10.253 10.374 10.566 10.71 10.825 10.956 11.073 11.22 11.342 11.451 11.516 11.521 11.527 11.483 11.374 11.222 11.016 10.75 10.421 10.034 9.515 8.836 8.011 6.862 5.38 3.398 0.767 -2.967 -8.253 -16.322 -25.271 -32.154 -37.616 -42.043 -45.824 -49.085 -51.979 -54.359 -56.65 -58.615 -60.322 -61.939 -63.444 -64.832 -66.097 -67.364 -68.449 -69.361 -70.327 -71.334 -72.138 -72.948 -73.78 -74.425 -75.08 -75.737 -76.423 -77.149 -77.644 -78.154 -78.961 -79.505 -80.057 -80.342 -80.936 -81.564 -82.22 -82.555 -83.385 -83.64 -84.019 -84.398 -85.187 -85.624 -86.101 -86.641 -87.218 -87.842 -88.662 -90.49 -10 ,3407 ,KEBNE ,16690586,Thu Nov 25 08:22:07 CET,Thu Nov 25 08:23:06 CET,0.0 1.966 2.68 3.206 3.626 3.972 4.276 4.552 4.993 5.196 5.402 5.365 5.905 6.063 6.38 6.672 6.926 7.029 7.211 7.383 7.639 7.792 7.925 8.094 8.224 8.337 8.439 8.533 8.653 8.748 8.815 8.857 8.872 8.867 8.83 8.781 8.71 8.582 8.382 8.115 7.808 7.4 6.757 5.921 4.799 3.392 1.465 -1.159 -4.745 -9.963 -18.166 -26.959 -33.665 -39.198 -43.755 -47.6 -50.847 -53.678 -56.052 -58.389 -60.353 -62.062 -63.663 -65.098 -66.395 -67.58 -68.803 -69.9 -70.834 -71.77 -72.737 -73.536 -74.369 -75.252 -75.92 -76.611 -77.346 -78.081 -78.8 -79.274 -79.769 -80.557 -81.101 -81.668 -81.955 -82.538 -83.147 -83.778 -84.108 -84.923 -85.122 -85.482 -85.847 -86.669 -87.149 -87.625 -88.115 -88.661 -89.251 -90.052 -91.599 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23475.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23475.txt deleted file mode 100644 index 66aa63ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23475.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27145 ,KEBNE ,17025153,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:41:45 CET,0.0 2.521 3.562 4.299 4.956 5.582 6.157 6.652 7.486 7.886 8.276 8.557 9.401 9.768 10.495 11.18 11.831 12.14 12.744 13.351 14.239 14.803 15.36 16.176 16.971 17.764 18.545 19.307 20.299 21.29 22.301 23.558 24.773 25.915 27.239 28.771 30.252 31.916 33.743 35.715 37.85 40.346 43.353 46.416 50.097 54.352 59.437 65.53 73.164 82.773 95.745 108.003 116.126 122.002 126.319 129.648 132.263 134.367 135.967 137.353 138.39 139.232 139.917 140.475 140.924 141.289 141.611 141.854 142.055 142.207 142.355 142.459 142.508 142.561 142.569 142.523 142.492 142.425 142.304 142.216 142.116 141.929 141.755 141.549 141.452 141.244 140.986 140.706 140.556 140.05 140.012 139.78 139.515 138.943 138.611 138.267 137.865 137.307 136.559 135.453 131.396 -2 ,24103 ,KEBNE ,17025154,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:39:27 CET,0.0 2.888 3.93 4.724 5.378 5.955 6.477 6.936 7.791 8.202 8.61 8.891 9.728 10.074 10.772 11.465 12.125 12.441 13.073 13.702 14.614 15.197 15.768 16.605 17.404 18.189 18.974 19.732 20.701 21.664 22.611 23.768 24.91 26.066 27.428 28.954 30.443 32.115 33.949 35.95 38.11 40.569 43.516 46.549 50.237 54.538 59.715 65.812 73.372 83.073 96.065 108.176 116.194 121.908 126.038 129.249 131.736 133.713 135.233 136.596 137.643 138.477 139.111 139.654 140.158 140.541 140.898 141.16 141.325 141.455 141.567 141.622 141.649 141.656 141.633 141.617 141.614 141.6 141.55 141.484 141.383 141.213 141.085 140.925 140.839 140.631 140.415 140.189 140.051 139.582 139.594 139.391 139.19 138.737 138.437 138.109 137.69 137.175 136.59 135.804 131.12 -3 ,4028 ,KEBNE ,17025155,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:40:35 CET,0.0 2.186 3.225 3.985 4.586 5.118 5.592 6.046 6.926 7.352 7.754 8.035 8.877 9.221 9.914 10.592 11.246 11.567 12.185 12.789 13.661 14.215 14.777 15.616 16.41 17.192 17.967 18.732 19.741 20.716 21.671 22.83 23.985 25.129 26.474 28.032 29.531 31.206 33.064 35.059 37.176 39.603 42.529 45.565 49.211 53.448 58.564 64.684 72.359 82.126 95.171 107.406 115.451 121.133 125.245 128.435 130.909 132.901 134.431 135.75 136.738 137.555 138.308 138.932 139.423 139.832 140.197 140.459 140.632 140.801 140.961 141.053 141.137 141.219 141.252 141.266 141.256 141.226 141.177 141.13 141.06 140.934 140.839 140.696 140.611 140.419 140.211 139.971 139.835 139.355 139.37 139.192 138.988 138.417 138.063 137.699 137.265 136.735 136.072 135.029 129.165 -4 ,5061 ,KEBNE ,17025156,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:39:26 CET,0.0 2.008 2.934 3.578 4.137 4.659 5.143 5.61 6.527 6.965 7.381 7.693 8.56 8.922 9.626 10.323 10.974 11.277 11.869 12.456 13.322 13.91 14.486 15.324 16.142 16.943 17.725 18.486 19.499 20.469 21.388 22.551 23.721 24.832 26.113 27.602 29.078 30.727 32.546 34.507 36.609 39.059 42.007 45.023 48.669 52.962 58.095 64.205 71.807 81.452 94.493 106.759 115.017 120.871 125.078 128.357 130.901 132.901 134.376 135.684 136.718 137.582 138.317 138.893 139.359 139.743 140.093 140.345 140.535 140.738 140.888 140.956 141.019 141.048 141.04 141.004 140.94 140.867 140.757 140.643 140.519 140.326 140.178 140.012 139.927 139.734 139.499 139.227 139.074 138.578 138.535 138.332 138.109 137.552 137.231 136.838 136.386 135.884 135.152 133.853 128.039 -5 ,1333 ,KEBNE ,17025157,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:39:31 CET,0.0 2.053 2.923 3.607 4.224 4.801 5.303 5.759 6.604 7.0 7.387 7.649 8.508 8.896 9.659 10.365 11.012 11.33 11.951 12.555 13.445 14.022 14.586 15.422 16.223 16.996 17.766 18.529 19.542 20.527 21.488 22.676 23.85 25.031 26.4 27.941 29.44 31.091 32.934 34.969 37.14 39.626 42.565 45.639 49.408 53.762 58.997 65.143 72.792 82.505 95.601 107.991 116.131 121.901 126.158 129.417 131.891 133.889 135.444 136.827 137.821 138.59 139.287 139.85 140.276 140.607 140.889 141.115 141.319 141.503 141.629 141.672 141.684 141.667 141.626 141.583 141.518 141.423 141.311 141.217 141.108 140.913 140.768 140.588 140.468 140.228 139.97 139.672 139.523 139.032 139.051 138.853 138.595 138.011 137.648 137.2 136.757 136.281 135.684 134.643 130.816 -6 ,9450 ,KEBNE ,17025158,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:40:43 CET,0.0 1.979 2.878 3.661 4.304 4.884 5.387 5.826 6.648 7.051 7.449 7.724 8.594 8.959 9.649 10.321 10.966 11.28 11.899 12.516 13.443 14.037 14.594 15.416 16.233 17.021 17.781 18.522 19.5 20.541 21.587 22.809 23.979 25.13 26.495 28.074 29.619 31.305 33.142 35.111 37.257 39.806 42.815 45.906 49.668 54.001 59.214 65.399 73.085 82.832 95.788 107.866 115.902 121.608 125.833 129.156 131.692 133.698 135.203 136.542 137.598 138.455 139.179 139.782 140.266 140.654 141.014 141.283 141.429 141.54 141.676 141.766 141.825 141.868 141.891 141.896 141.874 141.839 141.802 141.713 141.583 141.425 141.311 141.191 141.127 140.964 140.768 140.567 140.449 139.964 139.941 139.756 139.572 139.127 138.831 138.484 138.077 137.564 136.891 135.842 130.815 -7 ,14639 ,KEBNE ,17025159,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:39:27 CET,0.0 2.194 3.214 3.959 4.604 5.174 5.681 6.152 7.041 7.459 7.86 8.121 8.956 9.304 9.964 10.603 11.233 11.549 12.183 12.804 13.691 14.277 14.846 15.66 16.466 17.258 18.038 18.799 19.802 20.793 21.742 22.928 24.101 25.217 26.546 28.054 29.527 31.225 33.093 35.109 37.259 39.71 42.653 45.711 49.373 53.606 58.718 64.805 72.441 82.197 95.358 107.693 115.843 121.642 125.942 129.318 131.862 133.851 135.425 136.846 137.905 138.748 139.448 140.027 140.526 140.91 141.25 141.511 141.684 141.832 141.978 142.073 142.154 142.202 142.197 142.185 142.16 142.066 141.911 141.788 141.657 141.455 141.298 141.119 141.038 140.859 140.616 140.318 140.153 139.643 139.55 139.302 139.022 138.396 138.054 137.678 137.239 136.772 136.187 135.133 125.058 -8 ,27843 ,KEBNE ,17025160,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:39:28 CET,0.0 2.58 3.416 4.082 4.661 5.204 5.715 6.179 7.033 7.432 7.822 8.111 8.977 9.346 10.058 10.724 11.357 11.67 12.307 12.927 13.835 14.423 14.999 15.842 16.658 17.465 18.249 18.998 19.965 20.937 21.91 23.085 24.245 25.361 26.66 28.191 29.696 31.388 33.216 35.181 37.327 39.801 42.744 45.806 49.545 53.842 58.932 65.0 72.656 82.386 95.428 107.692 115.878 121.776 126.113 129.451 132.001 134.09 135.709 137.061 138.127 139.007 139.723 140.308 140.759 141.098 141.406 141.645 141.815 141.972 142.115 142.206 142.24 142.232 142.237 142.211 142.152 142.12 142.067 141.997 141.916 141.767 141.657 141.523 141.438 141.236 141.031 140.818 140.69 140.219 140.28 140.103 139.871 139.334 139.011 138.625 138.159 137.648 136.998 136.008 131.662 -9 ,22420 ,KEBNE ,17025161,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:40:48 CET,0.0 2.304 3.106 3.725 4.286 4.795 5.272 5.724 6.587 6.999 7.394 7.67 8.506 8.849 9.528 10.181 10.82 11.137 11.751 12.333 13.169 13.729 14.288 15.118 15.931 16.721 17.501 18.265 19.28 20.26 21.201 22.36 23.471 24.594 25.942 27.459 28.917 30.513 32.311 34.316 36.463 38.892 41.844 44.955 48.677 52.907 58.008 64.12 71.809 81.685 94.817 107.02 115.106 120.909 125.194 128.527 131.078 133.121 134.673 136.028 137.076 137.91 138.645 139.287 139.778 140.141 140.46 140.696 140.872 140.996 141.074 141.13 141.169 141.173 141.167 141.157 141.11 141.05 140.954 140.844 140.725 140.551 140.392 140.192 140.084 139.84 139.563 139.252 139.086 138.58 138.532 138.308 138.072 137.542 137.224 136.852 136.419 135.876 135.194 134.073 128.879 -10 ,143 ,KEBNE ,17025162,Wed Dec 22 12:04:30 CET,Wed Dec 22 13:39:16 CET,0.0 2.344 3.235 3.91 4.535 5.066 5.544 6.006 6.867 7.283 7.672 7.918 8.766 9.141 9.873 10.556 11.232 11.562 12.18 12.771 13.633 14.19 14.738 15.568 16.384 17.185 17.97 18.722 19.703 20.666 21.609 22.783 23.959 25.109 26.457 28.003 29.483 31.117 32.919 34.891 36.998 39.404 42.316 45.362 49.007 53.252 58.402 64.432 71.929 81.586 94.49 106.54 114.54 120.179 124.302 127.52 129.967 131.946 133.462 134.765 135.752 136.51 137.132 137.65 138.069 138.398 138.676 138.885 139.031 139.172 139.265 139.28 139.284 139.299 139.305 139.275 139.213 139.084 138.899 138.793 138.686 138.465 138.304 138.09 137.953 137.685 137.391 137.043 136.872 136.356 136.294 136.057 135.8 135.224 134.927 134.566 134.111 133.561 132.865 131.925 126.079 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23476.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23476.txt deleted file mode 100644 index 947bf9b3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23476.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9890 ,KEBNE ,16691312,Thu Nov 25 12:10:59 CET,Thu Nov 25 13:49:50 CET,0.0 3.138 4.121 4.936 5.638 6.237 6.783 7.298 8.243 8.693 9.122 9.443 10.316 10.688 11.425 12.148 12.838 13.175 13.843 14.5 15.448 16.049 16.646 17.547 18.424 19.275 20.105 20.918 21.972 23.007 24.022 25.278 26.495 27.671 29.046 30.609 32.168 33.907 35.817 37.885 40.096 42.641 45.671 48.775 52.472 56.788 62.047 68.255 75.913 85.7 98.85 111.136 119.223 124.981 129.181 132.399 134.901 136.948 138.542 139.955 141.017 141.848 142.508 143.043 143.505 143.819 144.083 144.347 144.513 144.621 144.749 144.825 144.859 144.876 144.86 144.847 144.814 144.753 144.687 144.628 144.555 144.435 144.335 144.19 144.089 143.867 143.681 143.471 143.329 142.833 142.807 142.613 142.409 141.916 141.623 141.308 140.935 140.498 139.989 139.262 134.863 -2 ,9523 ,KEBNE ,16691313,Thu Nov 25 12:10:59 CET,Thu Nov 25 13:49:37 CET,0.0 2.447 3.362 4.074 4.714 5.296 5.824 6.33 7.287 7.738 8.172 8.472 9.331 9.699 10.415 11.118 11.794 12.132 12.8 13.427 14.339 14.948 15.553 16.412 17.237 18.05 18.836 19.625 20.68 21.698 22.693 23.893 25.057 26.218 27.618 29.215 30.739 32.431 34.303 36.35 38.585 41.141 44.157 47.278 51.012 55.308 60.528 66.801 74.612 84.427 97.583 109.783 117.813 123.61 127.787 130.941 133.33 135.217 136.662 137.973 138.972 139.762 140.453 141.029 141.561 142.021 142.356 142.594 142.799 142.969 143.093 143.176 143.24 143.266 143.267 143.228 143.172 143.144 143.087 143.02 142.94 142.815 142.719 142.599 142.528 142.332 142.095 141.848 141.722 141.231 141.241 141.059 140.858 140.412 140.129 139.784 139.355 138.817 138.167 137.179 134.589 -3 ,98 ,KEBNE ,16690589,Thu Nov 25 08:22:11 CET,Thu Nov 25 08:23:27 CET,0.0 2.782 3.716 4.472 5.147 5.776 6.319 6.808 7.724 8.173 8.596 8.913 9.789 10.177 10.932 11.648 12.332 12.68 13.37 14.026 14.991 15.611 16.204 17.062 17.922 18.782 19.603 20.392 21.429 22.452 23.428 24.624 25.833 27.019 28.405 29.982 31.547 33.308 35.207 37.253 39.477 42.066 45.137 48.243 51.998 56.367 61.587 67.768 75.465 85.232 98.314 110.466 118.445 124.202 128.373 131.58 134.114 136.143 137.668 138.985 140.011 140.849 141.548 142.14 142.643 143.019 143.344 143.599 143.778 143.961 144.114 144.187 144.245 144.296 144.304 144.284 144.243 144.171 144.082 144.011 143.921 143.752 143.637 143.488 143.4 143.22 142.977 142.684 142.522 142.012 142.034 141.849 141.619 141.134 140.868 140.533 140.111 139.598 138.935 137.986 134.662 -4 ,30862 ,KEBNE ,16690590,Thu Nov 25 08:22:15 CET,Thu Nov 25 08:23:22 CET,0.0 2.801 3.909 4.786 5.552 6.222 6.849 7.43 8.508 9.033 9.532 9.932 10.866 11.308 12.146 12.963 13.748 14.12 14.844 15.565 16.614 17.275 17.915 18.856 19.779 20.662 21.524 22.362 23.418 24.458 25.465 26.653 27.838 29.047 30.458 32.034 33.551 35.25 37.154 39.22 41.443 44.035 47.128 50.258 54.006 58.443 63.776 69.992 77.739 87.602 100.825 113.062 121.051 126.761 130.984 134.305 136.831 138.781 140.283 141.65 142.716 143.536 144.223 144.788 145.241 145.632 146.025 146.319 146.485 146.621 146.719 146.779 146.841 146.88 146.889 146.894 146.885 146.831 146.759 146.693 146.612 146.445 146.32 146.188 146.098 145.877 145.619 145.33 145.186 144.724 144.753 144.561 144.333 143.785 143.479 143.15 142.739 142.184 141.494 140.55 134.692 -5 ,2856 ,KEBNE ,16691316,Thu Nov 25 12:12:01 CET,Thu Nov 25 13:51:19 CET,0.0 3.175 4.201 5.004 5.719 6.391 6.988 7.552 8.624 9.115 9.589 10.003 10.906 11.313 12.103 12.875 13.617 13.96 14.599 15.244 16.204 16.806 17.392 18.275 19.128 19.947 20.755 21.558 22.611 23.63 24.634 25.854 27.049 28.243 29.647 31.245 32.818 34.56 36.409 38.417 40.586 43.081 46.087 49.213 52.987 57.357 62.568 68.717 76.412 86.254 99.472 111.861 120.094 125.88 130.076 133.32 135.776 137.709 139.195 140.52 141.537 142.355 143.047 143.615 144.103 144.464 144.726 144.984 145.215 145.388 145.505 145.573 145.623 145.64 145.632 145.621 145.596 145.522 145.439 145.377 145.305 145.179 145.03 144.874 144.789 144.584 144.366 144.105 143.962 143.481 143.555 143.367 143.123 142.601 142.287 141.911 141.483 141.0 140.396 139.423 135.252 -6 ,19781 ,KEBNE ,16691317,Thu Nov 25 12:12:01 CET,Thu Nov 25 13:52:03 CET,0.0 3.514 4.526 5.285 5.885 6.452 7.021 7.56 8.51 8.961 9.407 9.764 10.643 11.023 11.753 12.453 13.138 13.475 14.116 14.723 15.641 16.236 16.811 17.689 18.544 19.381 20.189 20.976 22.047 23.092 24.088 25.313 26.501 27.669 29.029 30.576 32.13 33.846 35.714 37.752 39.944 42.498 45.585 48.752 52.57 56.952 62.246 68.577 76.346 86.235 99.519 111.794 119.76 125.445 129.742 133.072 135.572 137.505 139.037 140.449 141.51 142.339 143.053 143.659 144.115 144.459 144.769 145.007 145.174 145.311 145.425 145.503 145.568 145.587 145.604 145.613 145.565 145.481 145.398 145.345 145.261 145.113 144.993 144.841 144.76 144.597 144.412 144.203 144.067 143.582 143.601 143.412 143.21 142.758 142.48 142.166 141.794 141.287 140.653 139.829 130.067 -7 ,27885 ,KEBNE ,16690593,Thu Nov 25 08:22:15 CET,Thu Nov 25 08:23:17 CET,0.0 2.67 3.587 4.361 5.029 5.674 6.24 6.758 7.736 8.174 8.593 8.922 9.807 10.192 10.947 11.651 12.323 12.662 13.328 13.982 14.941 15.558 16.164 17.062 17.932 18.772 19.599 20.409 21.457 22.469 23.453 24.646 25.828 26.998 28.395 30.018 31.597 33.377 35.319 37.396 39.627 42.209 45.292 48.414 52.113 56.465 61.761 68.004 75.829 85.694 98.785 111.137 119.303 125.067 129.31 132.587 135.102 137.135 138.712 140.091 141.158 142.02 142.739 143.318 143.775 144.143 144.482 144.753 144.948 145.119 145.256 145.345 145.388 145.363 145.319 145.272 145.258 145.243 145.201 145.152 145.06 144.907 144.774 144.601 144.52 144.357 144.151 143.894 143.75 143.261 143.254 143.051 142.85 142.436 142.156 141.819 141.419 140.963 140.448 139.663 135.902 -8 ,21208 ,KEBNE ,16690594,Thu Nov 25 08:22:07 CET,Thu Nov 25 08:23:05 CET,0.0 3.457 4.46 5.22 5.887 6.46 6.977 7.48 8.442 8.896 9.333 9.693 10.568 10.953 11.722 12.452 13.154 13.497 14.155 14.803 15.747 16.361 16.954 17.82 18.659 19.484 20.304 21.089 22.124 23.151 24.141 25.354 26.559 27.734 29.122 30.731 32.293 34.036 35.96 38.029 40.235 42.775 45.814 48.955 52.745 57.144 62.363 68.511 76.2 86.037 99.193 111.528 119.681 125.444 129.635 132.901 135.379 137.339 138.878 140.182 141.18 142.042 142.779 143.351 143.789 144.138 144.491 144.754 144.931 145.065 145.168 145.255 145.337 145.373 145.371 145.345 145.314 145.285 145.175 145.063 144.962 144.782 144.634 144.465 144.375 144.202 143.999 143.729 143.582 143.066 142.986 142.776 142.538 142.028 141.754 141.424 141.062 140.644 140.042 139.158 136.458 -9 ,7727 ,KEBNE ,16691320,Thu Nov 25 12:13:03 CET,Thu Nov 25 13:51:12 CET,0.0 3.301 4.338 5.055 5.691 6.254 6.769 7.283 8.241 8.685 9.118 9.435 10.294 10.675 11.45 12.181 12.881 13.222 13.9 14.566 15.488 16.091 16.698 17.567 18.4 19.234 20.035 20.817 21.852 22.859 23.866 25.111 26.306 27.466 28.819 30.373 31.92 33.638 35.532 37.612 39.807 42.322 45.386 48.544 52.336 56.744 61.996 68.199 75.919 85.718 98.905 111.176 119.196 124.916 129.138 132.404 134.943 136.978 138.488 139.794 140.795 141.569 142.2 142.724 143.195 143.586 143.925 144.168 144.35 144.513 144.643 144.734 144.785 144.804 144.809 144.802 144.777 144.729 144.642 144.556 144.454 144.268 144.144 143.995 143.915 143.736 143.486 143.187 143.026 142.533 142.513 142.307 142.071 141.54 141.25 140.912 140.474 139.942 139.256 138.304 134.229 -10 ,3263 ,KEBNE ,16690596,Thu Nov 25 08:22:07 CET,Thu Nov 25 08:23:23 CET,0.0 2.804 3.834 4.668 5.422 6.086 6.679 7.212 8.168 8.632 9.082 9.452 10.358 10.782 11.561 12.278 12.951 13.275 13.926 14.561 15.5 16.111 16.703 17.607 18.512 19.355 20.151 20.93 21.961 22.971 23.954 25.159 26.361 27.534 28.913 30.488 32.039 33.761 35.652 37.719 39.931 42.471 45.485 48.606 52.383 56.754 61.999 68.201 75.88 85.591 98.601 110.902 119.165 125.125 129.436 132.746 135.317 137.359 138.906 140.305 141.339 142.148 142.875 143.451 143.903 144.256 144.56 144.819 145.002 145.14 145.274 145.362 145.415 145.444 145.444 145.442 145.441 145.392 145.315 145.262 145.216 145.101 144.996 144.883 144.818 144.675 144.491 144.278 144.146 143.668 143.717 143.531 143.328 142.863 142.58 142.258 141.886 141.503 140.952 140.114 137.292 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23479.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23479.txt deleted file mode 100644 index c9568f43..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23482_23479.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13438 ,KEBNE ,16690597,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:23 CET,0.0 1.673 2.475 3.038 3.559 4.046 4.51 4.941 5.711 6.098 6.477 6.681 7.498 7.815 8.417 8.985 9.519 9.787 10.326 10.815 11.525 12.0 12.458 13.144 13.85 14.547 15.209 15.845 16.638 17.401 18.167 19.092 19.966 20.832 21.859 23.018 24.151 25.407 26.762 28.233 29.797 31.574 33.675 35.795 38.356 41.341 44.897 49.105 54.222 60.434 68.453 75.59 80.112 83.251 85.495 87.161 88.34 89.205 89.864 90.406 90.778 91.035 91.214 91.335 91.408 91.429 91.383 91.344 91.306 91.234 91.121 90.998 90.855 90.734 90.618 90.43 90.241 90.058 89.826 89.648 89.476 89.228 89.045 88.832 88.718 88.464 88.169 87.856 87.681 87.106 87.134 86.922 86.69 86.161 85.873 85.567 85.222 84.784 84.18 83.423 81.885 -2 ,11920 ,KEBNE ,16691323,Thu Nov 25 12:13:04 CET,Thu Nov 25 13:50:59 CET,0.0 1.78 2.574 3.197 3.695 4.127 4.544 4.933 5.663 6.017 6.362 6.505 7.286 7.589 8.176 8.737 9.302 9.577 10.105 10.624 11.369 11.866 12.341 12.993 13.631 14.274 14.906 15.507 16.299 17.082 17.849 18.764 19.637 20.488 21.475 22.564 23.605 24.811 26.181 27.686 29.258 31.082 33.229 35.37 37.958 40.904 44.401 48.475 53.454 59.773 68.038 75.425 80.11 83.341 85.619 87.313 88.587 89.526 90.175 90.719 91.109 91.412 91.691 91.909 92.022 92.084 92.103 92.064 92.009 91.938 91.855 91.777 91.644 91.474 91.343 91.203 91.037 90.839 90.631 90.473 90.298 90.026 89.84 89.63 89.511 89.253 88.995 88.737 88.585 88.028 88.063 87.849 87.629 87.123 86.826 86.501 86.151 85.717 85.162 84.369 82.024 -3 ,10214 ,KEBNE ,16690599,Thu Nov 25 08:22:07 CET,Thu Nov 25 08:23:10 CET,0.0 1.699 2.479 3.143 3.726 4.245 4.714 5.163 5.977 6.354 6.726 6.953 7.78 8.108 8.725 9.319 9.884 10.157 10.701 11.231 12.012 12.517 12.987 13.641 14.272 14.911 15.551 16.165 16.954 17.724 18.473 19.379 20.263 21.115 22.089 23.208 24.311 25.541 26.878 28.323 29.869 31.668 33.813 35.959 38.51 41.444 44.937 49.028 54.027 60.351 68.627 76.147 80.961 84.142 86.447 88.245 89.504 90.419 91.092 91.643 92.013 92.298 92.508 92.602 92.666 92.737 92.783 92.775 92.732 92.664 92.577 92.509 92.408 92.267 92.143 91.999 91.839 91.664 91.472 91.327 91.176 90.938 90.755 90.544 90.428 90.191 89.935 89.641 89.488 88.922 88.957 88.759 88.549 88.051 87.75 87.39 86.967 86.488 85.992 85.364 82.75 -4 ,26582 ,KEBNE ,16690600,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:30 CET,0.0 1.581 2.303 2.903 3.423 3.889 4.324 4.733 5.532 5.904 6.248 6.414 7.234 7.577 8.208 8.775 9.337 9.626 10.179 10.71 11.481 11.956 12.424 13.156 13.862 14.53 15.171 15.784 16.594 17.402 18.174 19.116 20.051 20.98 22.066 23.229 24.371 25.637 27.006 28.536 30.136 31.926 34.098 36.286 38.786 41.661 45.134 49.21 54.226 60.569 68.739 75.984 80.692 83.852 86.07 87.785 88.986 89.822 90.504 91.103 91.455 91.721 91.945 92.115 92.236 92.283 92.286 92.258 92.204 92.139 92.032 91.932 91.84 91.689 91.548 91.407 91.248 91.055 90.833 90.686 90.538 90.278 90.074 89.846 89.717 89.437 89.114 88.753 88.567 87.977 87.991 87.774 87.544 87.021 86.674 86.261 85.8 85.289 84.732 83.972 80.374 -5 ,12662 ,KEBNE ,16690601,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:28 CET,0.0 1.923 2.726 3.361 3.943 4.455 4.927 5.386 6.187 6.539 6.883 7.062 7.865 8.179 8.807 9.405 9.969 10.24 10.754 11.266 12.018 12.515 12.993 13.664 14.333 15.005 15.658 16.295 17.127 17.921 18.671 19.605 20.519 21.375 22.395 23.575 24.739 26.047 27.434 28.944 30.568 32.366 34.462 36.612 39.254 42.212 45.629 49.663 54.65 60.899 69.053 76.482 81.201 84.527 86.905 88.663 90.05 91.043 91.71 92.294 92.719 93.03 93.227 93.343 93.456 93.552 93.599 93.602 93.582 93.54 93.448 93.351 93.234 93.086 92.966 92.831 92.684 92.495 92.28 92.12 91.93 91.633 91.425 91.216 91.102 90.834 90.539 90.233 90.073 89.499 89.503 89.3 89.087 88.578 88.256 87.876 87.472 86.988 86.355 85.352 79.964 -6 ,31377 ,KEBNE ,16690602,Thu Nov 25 08:22:06 CET,Thu Nov 25 08:23:27 CET,0.0 1.466 2.194 2.777 3.33 3.828 4.305 4.759 5.56 5.931 6.274 6.435 7.235 7.544 8.155 8.758 9.344 9.618 10.131 10.624 11.346 11.815 12.278 12.949 13.595 14.237 14.859 15.467 16.277 17.096 17.875 18.778 19.697 20.612 21.67 22.857 24.005 25.275 26.631 28.086 29.66 31.477 33.681 35.962 38.617 41.676 45.324 49.476 54.473 60.699 68.827 76.199 80.875 84.054 86.284 87.947 89.157 90.1 90.799 91.371 91.8 92.102 92.347 92.549 92.716 92.829 92.851 92.837 92.813 92.757 92.647 92.505 92.364 92.268 92.191 92.074 91.932 91.762 91.58 91.451 91.301 91.057 90.877 90.691 90.597 90.371 90.107 89.812 89.659 89.106 89.201 89.025 88.827 88.422 88.186 87.898 87.571 87.206 86.771 86.151 84.288 -7 ,68 ,KEBNE ,16690603,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:25 CET,0.0 1.673 2.502 3.152 3.685 4.16 4.608 5.026 5.8 6.163 6.527 6.757 7.561 7.857 8.442 9.002 9.545 9.817 10.341 10.855 11.639 12.151 12.64 13.342 14.034 14.717 15.383 16.021 16.816 17.589 18.354 19.305 20.25 21.143 22.159 23.301 24.422 25.687 27.082 28.566 30.159 31.984 34.127 36.335 38.985 41.967 45.458 49.54 54.595 60.924 69.061 76.491 81.245 84.521 86.88 88.636 89.895 90.884 91.627 92.199 92.634 92.957 93.169 93.288 93.35 93.375 93.37 93.355 93.316 93.25 93.168 93.083 92.967 92.84 92.731 92.603 92.44 92.239 92.046 91.904 91.739 91.47 91.268 91.059 90.946 90.727 90.498 90.23 90.078 89.499 89.478 89.259 89.025 88.514 88.213 87.914 87.623 87.249 86.747 86.072 84.149 -8 ,3322 ,KEBNE ,16691329,Thu Nov 25 12:15:10 CET,Thu Nov 25 13:56:22 CET,0.0 1.94 2.785 3.445 4.02 4.562 5.068 5.542 6.359 6.709 7.054 7.241 8.053 8.375 8.994 9.566 10.115 10.387 10.92 11.441 12.186 12.653 13.123 13.813 14.467 15.118 15.756 16.371 17.172 17.941 18.674 19.588 20.498 21.373 22.376 23.503 24.615 25.87 27.274 28.784 30.373 32.16 34.266 36.435 39.046 42.052 45.592 49.738 54.764 61.045 69.388 76.943 81.756 85.132 87.583 89.354 90.61 91.607 92.289 92.822 93.249 93.584 93.785 93.854 93.914 93.957 93.957 93.912 93.858 93.805 93.746 93.685 93.607 93.485 93.335 93.182 93.026 92.85 92.665 92.52 92.361 92.097 91.903 91.686 91.576 91.351 91.093 90.808 90.638 90.043 90.044 89.8 89.528 88.965 88.663 88.341 87.954 87.469 86.883 86.112 83.562 -9 ,13671 ,KEBNE ,16691330,Thu Nov 25 12:16:13 CET,Thu Nov 25 13:52:50 CET,0.0 1.364 2.129 2.745 3.3 3.799 4.248 4.675 5.474 5.843 6.189 6.371 7.185 7.503 8.111 8.679 9.218 9.478 9.993 10.512 11.236 11.693 12.163 12.85 13.522 14.197 14.848 15.488 16.323 17.11 17.862 18.795 19.698 20.57 21.602 22.779 23.884 25.097 26.467 27.915 29.485 31.317 33.402 35.494 38.075 41.056 44.571 48.642 53.661 59.973 68.102 75.415 80.175 83.482 85.768 87.531 88.771 89.691 90.416 91.013 91.428 91.731 91.955 92.133 92.252 92.277 92.275 92.254 92.195 92.116 92.023 91.937 91.846 91.748 91.648 91.511 91.34 91.133 90.889 90.725 90.578 90.324 90.131 89.935 89.835 89.609 89.33 89.044 88.88 88.282 88.264 88.048 87.826 87.351 87.064 86.728 86.335 85.868 85.286 84.553 82.441 -10 ,26535 ,KEBNE ,16690606,Thu Nov 25 08:22:07 CET,Thu Nov 25 08:23:26 CET,0.0 2.446 3.307 4.058 4.735 5.333 5.878 6.384 7.252 7.63 8.004 8.234 9.057 9.391 10.032 10.663 11.283 11.57 12.133 12.703 13.517 14.034 14.523 15.243 15.969 16.662 17.329 17.979 18.827 19.65 20.443 21.434 22.402 23.302 24.318 25.505 26.68 27.935 29.322 30.82 32.376 34.192 36.327 38.539 41.244 44.326 48.007 52.259 57.32 63.568 71.826 79.303 83.984 87.043 89.151 90.736 91.9 92.831 93.555 94.125 94.48 94.676 94.857 95.035 95.111 95.127 95.102 95.035 94.938 94.823 94.685 94.557 94.41 94.213 94.057 93.892 93.681 93.448 93.186 92.994 92.796 92.466 92.233 91.974 91.829 91.53 91.223 90.898 90.718 90.122 90.089 89.854 89.601 89.038 88.713 88.337 87.885 87.309 86.65 85.899 82.92 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23483_23482.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23483_23482.txt deleted file mode 100644 index f29a7b5f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23483_23482.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21137 ,KEBNE ,16690607,Thu Nov 25 08:22:11 CET,Thu Nov 25 08:23:22 CET,0.0 0.855 1.37 1.802 2.152 2.457 2.741 3.01 3.528 3.77 3.995 3.927 4.606 4.809 5.203 5.552 5.878 6.024 6.321 6.622 7.036 7.307 7.556 7.9 8.212 8.496 8.782 9.058 9.412 9.745 10.049 10.398 10.746 11.08 11.403 11.743 12.092 12.443 12.78 13.123 13.454 13.77 14.054 14.292 14.564 14.762 14.756 14.556 14.077 12.924 10.621 7.532 4.757 2.347 0.274 -1.558 -3.219 -4.765 -6.116 -7.414 -8.478 -9.463 -10.466 -11.448 -12.337 -13.122 -13.947 -14.693 -15.331 -15.995 -16.731 -17.371 -18.021 -18.676 -19.163 -19.663 -20.228 -20.828 -21.426 -21.863 -22.329 -23.03 -23.532 -24.048 -24.315 -24.892 -25.466 -26.073 -26.412 -27.255 -27.489 -27.859 -28.263 -29.191 -29.701 -30.237 -30.88 -31.616 -32.499 -33.689 -37.742 -2 ,5832 ,KEBNE ,16690608,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:13 CET,0.0 1.667 2.266 2.83 3.331 3.746 4.085 4.401 4.992 5.245 5.485 5.485 6.173 6.385 6.827 7.263 7.66 7.841 8.162 8.468 8.894 9.168 9.437 9.816 10.181 10.516 10.828 11.142 11.528 11.874 12.214 12.624 13.035 13.409 13.781 14.178 14.523 14.903 15.317 15.75 16.163 16.54 16.928 17.256 17.551 17.81 17.976 17.878 17.501 16.602 14.558 11.664 9.08 6.797 4.803 2.985 1.433 0.048 -1.173 -2.42 -3.528 -4.534 -5.527 -6.449 -7.276 -8.018 -8.809 -9.576 -10.274 -10.977 -11.718 -12.344 -12.985 -13.661 -14.169 -14.713 -15.281 -15.88 -16.519 -16.946 -17.4 -18.123 -18.625 -19.146 -19.42 -20.004 -20.61 -21.255 -21.593 -22.411 -22.652 -23.054 -23.484 -24.499 -25.044 -25.588 -26.224 -26.976 -27.897 -29.162 -33.811 -3 ,3801 ,KEBNE ,16690609,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:14 CET,0.0 1.814 2.507 2.99 3.448 3.839 4.183 4.503 5.061 5.325 5.573 5.545 6.215 6.406 6.793 7.19 7.537 7.704 8.047 8.342 8.743 9.011 9.282 9.656 10.018 10.372 10.696 10.998 11.374 11.736 12.069 12.456 12.829 13.183 13.57 13.957 14.297 14.657 15.036 15.468 15.886 16.229 16.633 17.007 17.32 17.564 17.619 17.476 17.1 16.142 14.041 11.169 8.7 6.491 4.501 2.7 1.076 -0.4 -1.672 -2.901 -3.948 -4.93 -5.896 -6.85 -7.755 -8.558 -9.378 -10.086 -10.715 -11.395 -12.1 -12.672 -13.27 -13.879 -14.356 -14.883 -15.431 -15.995 -16.549 -16.915 -17.32 -17.993 -18.442 -18.909 -19.157 -19.67 -20.22 -20.783 -21.077 -21.875 -22.051 -22.4 -22.777 -23.662 -24.186 -24.717 -25.272 -25.917 -26.715 -27.784 -30.682 -4 ,18294 ,KEBNE ,16691335,Thu Nov 25 12:18:19 CET,Thu Nov 25 13:56:50 CET,0.0 1.874 2.578 3.093 3.533 3.935 4.292 4.583 5.08 5.33 5.565 5.527 6.19 6.374 6.727 7.051 7.349 7.499 7.81 8.103 8.488 8.735 8.991 9.366 9.705 10.01 10.307 10.601 10.956 11.289 11.614 11.997 12.344 12.653 13.033 13.438 13.768 14.126 14.509 14.896 15.246 15.593 15.954 16.252 16.45 16.565 16.655 16.512 16.003 14.909 12.726 9.823 7.286 5.013 2.933 0.999 -0.699 -2.228 -3.52 -4.822 -5.982 -7.016 -7.982 -8.905 -9.776 -10.564 -11.387 -12.147 -12.827 -13.522 -14.213 -14.795 -15.416 -16.057 -16.567 -17.086 -17.631 -18.229 -18.854 -19.277 -19.695 -20.372 -20.841 -21.32 -21.581 -22.123 -22.679 -23.254 -23.548 -24.332 -24.527 -24.911 -25.301 -26.103 -26.528 -26.988 -27.486 -28.076 -28.836 -29.947 -33.875 -5 ,3929 ,KEBNE ,16690611,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:17 CET,0.0 2.124 2.867 3.422 3.907 4.341 4.717 5.04 5.605 5.879 6.144 6.164 6.871 7.076 7.439 7.784 8.117 8.277 8.593 8.875 9.263 9.52 9.777 10.152 10.5 10.838 11.168 11.468 11.82 12.154 12.506 12.942 13.304 13.636 14.034 14.459 14.829 15.217 15.627 16.013 16.386 16.778 17.129 17.413 17.662 17.834 17.912 17.787 17.293 16.225 14.021 11.018 8.394 6.13 4.161 2.398 0.903 -0.45 -1.67 -2.99 -4.128 -5.097 -6.03 -6.921 -7.768 -8.534 -9.316 -10.035 -10.662 -11.323 -12.033 -12.613 -13.238 -13.914 -14.428 -14.983 -15.555 -16.122 -16.743 -17.172 -17.597 -18.283 -18.762 -19.282 -19.555 -20.116 -20.718 -21.354 -21.691 -22.529 -22.852 -23.269 -23.695 -24.665 -25.183 -25.782 -26.464 -27.283 -28.322 -29.738 -39.922 -6 ,26622 ,KEBNE ,16691337,Thu Nov 25 12:19:22 CET,Thu Nov 25 13:57:24 CET,0.0 1.346 2.016 2.628 3.104 3.485 3.842 4.159 4.708 4.965 5.213 5.167 5.841 6.042 6.427 6.805 7.187 7.362 7.676 7.963 8.375 8.65 8.912 9.278 9.608 9.925 10.242 10.547 10.906 11.239 11.556 11.93 12.287 12.621 12.991 13.379 13.745 14.109 14.467 14.827 15.24 15.665 16.017 16.302 16.55 16.693 16.671 16.431 15.968 15.034 12.996 10.086 7.489 5.259 3.322 1.508 -0.079 -1.466 -2.702 -4.002 -5.138 -6.148 -7.099 -8.006 -8.88 -9.673 -10.483 -11.197 -11.831 -12.5 -13.174 -13.746 -14.373 -15.02 -15.521 -16.059 -16.609 -17.164 -17.727 -18.111 -18.53 -19.193 -19.643 -20.129 -20.391 -20.921 -21.451 -22.012 -22.315 -23.113 -23.308 -23.669 -24.054 -24.861 -25.315 -25.842 -26.45 -27.129 -27.949 -29.046 -33.419 -7 ,21203 ,KEBNE ,16690613,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:05 CET,0.0 1.853 2.512 3.003 3.463 3.86 4.201 4.517 5.059 5.313 5.567 5.564 6.261 6.475 6.854 7.219 7.582 7.752 8.068 8.354 8.743 9.008 9.272 9.622 9.933 10.216 10.497 10.759 11.078 11.402 11.736 12.151 12.55 12.916 13.32 13.751 14.118 14.499 14.88 15.234 15.564 15.908 16.319 16.668 17.035 17.406 17.614 17.602 17.262 16.393 14.539 11.698 9.142 7.002 5.15 3.454 1.9 0.412 -0.934 -2.297 -3.474 -4.506 -5.455 -6.41 -7.35 -8.205 -9.08 -9.858 -10.558 -11.261 -11.961 -12.536 -13.168 -13.869 -14.389 -14.916 -15.468 -16.058 -16.699 -17.142 -17.596 -18.307 -18.823 -19.361 -19.632 -20.207 -20.831 -21.502 -21.829 -22.624 -22.838 -23.229 -23.64 -24.554 -25.115 -25.711 -26.375 -27.158 -28.1 -29.415 -34.565 -8 ,3730 ,KEBNE ,16690614,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:05 CET,0.0 1.81 2.38 2.882 3.327 3.665 3.953 4.223 4.743 4.985 5.22 5.161 5.808 5.981 6.322 6.644 6.944 7.093 7.405 7.699 8.087 8.322 8.54 8.861 9.183 9.465 9.713 9.952 10.263 10.56 10.85 11.216 11.515 11.769 12.084 12.419 12.701 13.014 13.352 13.683 13.984 14.241 14.462 14.649 14.807 14.95 14.974 14.696 14.085 12.955 10.72 7.797 5.283 3.061 1.163 -0.598 -2.126 -3.538 -4.768 -5.956 -7.05 -8.047 -8.949 -9.787 -10.627 -11.407 -12.19 -12.913 -13.528 -14.141 -14.806 -15.376 -15.984 -16.625 -17.117 -17.632 -18.174 -18.705 -19.263 -19.654 -20.046 -20.683 -21.139 -21.613 -21.858 -22.361 -22.893 -23.476 -23.786 -24.598 -24.794 -25.148 -25.539 -26.447 -26.933 -27.391 -27.909 -28.57 -29.367 -30.452 -34.603 -9 ,6767 ,KEBNE ,16691340,Thu Nov 25 12:20:25 CET,Thu Nov 25 13:57:52 CET,0.0 1.763 2.416 2.917 3.344 3.727 4.094 4.422 4.974 5.222 5.467 5.441 6.115 6.311 6.7 7.068 7.421 7.589 7.894 8.18 8.605 8.886 9.152 9.546 9.92 10.259 10.59 10.893 11.279 11.646 11.964 12.361 12.741 13.099 13.496 13.924 14.335 14.727 15.112 15.463 15.818 16.213 16.612 16.948 17.242 17.452 17.514 17.46 17.06 16.095 14.045 11.351 9.005 6.821 4.976 3.355 1.87 0.438 -0.879 -2.191 -3.295 -4.292 -5.265 -6.176 -7.001 -7.754 -8.522 -9.199 -9.81 -10.445 -11.106 -11.667 -12.233 -12.816 -13.275 -13.755 -14.25 -14.739 -15.276 -15.683 -16.081 -16.667 -17.107 -17.598 -17.856 -18.37 -18.884 -19.436 -19.743 -20.544 -20.728 -21.083 -21.453 -22.309 -22.776 -23.334 -23.976 -24.632 -25.429 -26.517 -29.846 -10 ,20777 ,KEBNE ,16690616,Thu Nov 25 08:22:07 CET,Thu Nov 25 08:23:28 CET,0.0 1.87 2.539 3.072 3.538 3.907 4.236 4.543 5.103 5.365 5.615 5.591 6.274 6.481 6.877 7.256 7.621 7.788 8.092 8.387 8.833 9.12 9.376 9.722 10.03 10.356 10.691 10.989 11.378 11.73 12.036 12.386 12.718 13.061 13.469 13.888 14.236 14.61 15.011 15.432 15.848 16.25 16.627 16.91 17.234 17.471 17.505 17.412 17.012 15.998 13.788 10.878 8.387 6.15 4.234 2.503 0.986 -0.362 -1.553 -2.797 -3.921 -4.923 -5.876 -6.77 -7.57 -8.329 -9.168 -9.913 -10.548 -11.198 -11.87 -12.443 -13.078 -13.726 -14.215 -14.736 -15.3 -15.889 -16.466 -16.86 -17.277 -17.908 -18.353 -18.843 -19.094 -19.6 -20.123 -20.72 -21.044 -21.854 -22.029 -22.384 -22.763 -23.555 -24.019 -24.524 -25.074 -25.692 -26.437 -27.445 -31.078 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23484.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23484.txt deleted file mode 100644 index 3aa9505a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23484.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13785 ,KEBNE ,16690617,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:30 CET,0.0 0.803 1.197 1.567 1.873 2.135 2.39 2.634 3.089 3.303 3.517 3.434 4.1 4.298 4.659 4.969 5.271 5.425 5.723 6.008 6.459 6.738 6.976 7.322 7.657 7.988 8.32 8.641 9.04 9.445 9.847 10.314 10.789 11.256 11.755 12.299 12.816 13.394 14.025 14.711 15.428 16.169 17.001 17.82 18.801 19.942 21.222 22.633 24.251 26.055 27.886 29.056 29.488 29.492 29.323 29.04 28.64 28.222 27.841 27.416 27.017 26.623 26.216 25.833 25.495 25.169 24.798 24.455 24.158 23.838 23.463 23.143 22.807 22.442 22.162 21.894 21.62 21.312 20.984 20.763 20.534 20.129 19.818 19.506 19.354 19.029 18.669 18.301 18.122 17.467 17.485 17.25 16.989 16.395 16.081 15.773 15.428 15.007 14.5 13.813 12.002 -2 ,17982 ,KEBNE ,16690618,Thu Nov 25 08:22:07 CET,Thu Nov 25 08:23:27 CET,0.0 0.74 1.197 1.601 1.949 2.238 2.501 2.736 3.165 3.384 3.583 3.466 4.114 4.298 4.653 4.961 5.251 5.389 5.675 5.969 6.391 6.649 6.891 7.252 7.6 7.939 8.254 8.565 8.989 9.37 9.73 10.208 10.668 11.085 11.561 12.096 12.601 13.164 13.768 14.4 15.069 15.811 16.726 17.629 18.632 19.741 20.99 22.333 23.866 25.536 27.353 28.504 28.906 28.888 28.598 28.286 27.961 27.591 27.213 26.765 26.36 25.977 25.578 25.18 24.785 24.422 24.037 23.68 23.361 23.023 22.667 22.352 22.011 21.646 21.373 21.101 20.795 20.465 20.123 19.897 19.669 19.279 18.981 18.653 18.488 18.15 17.805 17.452 17.272 16.62 16.649 16.405 16.15 15.63 15.346 15.044 14.689 14.199 13.6 12.963 11.654 -3 ,27567 ,KEBNE ,16691344,Thu Nov 25 12:21:27 CET,Thu Nov 25 14:03:08 CET,0.0 0.631 1.12 1.492 1.803 2.118 2.408 2.666 3.147 3.363 3.57 3.501 4.167 4.347 4.704 5.041 5.346 5.49 5.778 6.07 6.489 6.76 7.015 7.385 7.737 8.057 8.393 8.729 9.146 9.556 9.941 10.406 10.877 11.327 11.869 12.491 13.045 13.644 14.26 14.886 15.59 16.359 17.208 18.099 19.134 20.212 21.453 22.853 24.376 26.061 27.85 28.968 29.319 29.342 29.169 28.844 28.464 28.075 27.709 27.284 26.854 26.432 26.032 25.656 25.285 24.947 24.592 24.264 23.955 23.605 23.226 22.912 22.596 22.256 21.978 21.693 21.388 21.058 20.721 20.487 20.239 19.845 19.578 19.291 19.137 18.802 18.448 18.106 17.925 17.259 17.324 17.106 16.87 16.342 16.045 15.731 15.398 14.991 14.481 13.798 12.528 -4 ,7759 ,KEBNE ,16690620,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:29 CET,0.0 0.986 1.494 1.89 2.222 2.521 2.778 3.025 3.499 3.71 3.913 3.84 4.495 4.663 4.993 5.313 5.61 5.768 6.098 6.417 6.861 7.139 7.394 7.75 8.11 8.458 8.811 9.151 9.564 9.938 10.298 10.757 11.205 11.641 12.152 12.735 13.285 13.864 14.498 15.186 15.896 16.664 17.528 18.388 19.449 20.658 22.026 23.498 25.07 26.762 28.568 29.7 30.009 29.93 29.72 29.41 29.058 28.669 28.299 27.895 27.486 27.079 26.681 26.319 25.976 25.645 25.27 24.916 24.601 24.273 23.916 23.607 23.273 22.927 22.665 22.384 22.085 21.772 21.429 21.188 20.933 20.527 20.254 19.953 19.8 19.494 19.163 18.785 18.573 17.897 17.957 17.744 17.498 16.944 16.634 16.273 15.88 15.449 14.934 14.323 13.101 -5 ,3939 ,KEBNE ,16691346,Thu Nov 25 12:21:27 CET,Thu Nov 25 14:04:44 CET,0.0 0.957 1.391 1.791 2.125 2.392 2.63 2.875 3.347 3.565 3.79 3.744 4.412 4.588 4.925 5.271 5.604 5.756 6.037 6.325 6.754 7.027 7.293 7.668 8.023 8.362 8.685 8.997 9.415 9.821 10.199 10.655 11.107 11.558 12.076 12.617 13.13 13.704 14.295 14.912 15.579 16.356 17.269 18.175 19.25 20.385 21.615 23.047 24.66 26.337 28.042 29.085 29.445 29.459 29.29 29.012 28.599 28.194 27.832 27.407 27.033 26.633 26.18 25.76 25.394 25.048 24.673 24.31 23.971 23.642 23.296 22.994 22.674 22.323 22.046 21.758 21.446 21.12 20.792 20.568 20.316 19.92 19.644 19.345 19.181 18.811 18.423 18.015 17.79 17.093 17.077 16.836 16.59 16.045 15.747 15.424 15.045 14.622 14.105 13.426 12.013 -6 ,12278 ,KEBNE ,16691347,Thu Nov 25 12:21:31 CET,Thu Nov 25 13:57:59 CET,0.0 0.935 1.453 1.826 2.147 2.431 2.706 2.955 3.394 3.601 3.799 3.673 4.328 4.521 4.914 5.277 5.598 5.76 6.086 6.392 6.82 7.102 7.364 7.72 8.058 8.388 8.722 9.028 9.424 9.881 10.314 10.762 11.196 11.608 12.092 12.639 13.164 13.74 14.338 14.994 15.697 16.442 17.322 18.241 19.225 20.292 21.531 22.879 24.446 26.194 28.097 29.23 29.538 29.534 29.305 28.966 28.599 28.189 27.787 27.338 26.908 26.499 26.088 25.688 25.327 25.001 24.646 24.312 23.999 23.645 23.264 22.928 22.573 22.169 21.843 21.528 21.199 20.838 20.439 20.163 19.893 19.466 19.157 18.842 18.682 18.347 17.988 17.6 17.4 16.742 16.772 16.535 16.245 15.611 15.287 14.96 14.591 14.149 13.622 12.955 11.459 -7 ,23020 ,KEBNE ,16691348,Thu Nov 25 12:21:27 CET,Thu Nov 25 14:03:19 CET,0.0 0.883 1.325 1.678 1.991 2.283 2.554 2.822 3.341 3.552 3.76 3.711 4.368 4.541 4.899 5.257 5.584 5.733 6.021 6.308 6.732 6.994 7.245 7.596 7.935 8.271 8.598 8.897 9.27 9.649 10.029 10.481 10.934 11.382 11.887 12.458 12.988 13.538 14.114 14.711 15.329 16.039 16.873 17.74 18.802 19.976 21.24 22.622 24.211 25.95 27.841 29.011 29.418 29.509 29.377 29.091 28.763 28.441 28.102 27.678 27.272 26.9 26.508 26.111 25.737 25.381 24.998 24.647 24.334 23.997 23.616 23.295 22.957 22.588 22.316 22.037 21.743 21.444 21.113 20.885 20.64 20.24 19.937 19.601 19.436 19.103 18.735 18.336 18.137 17.47 17.479 17.217 16.93 16.302 15.969 15.644 15.262 14.797 14.214 13.397 11.284 -8 ,14347 ,KEBNE ,16691349,Thu Nov 25 12:21:27 CET,Thu Nov 25 14:03:02 CET,0.0 0.862 1.403 1.791 2.103 2.379 2.661 2.935 3.402 3.609 3.809 3.739 4.415 4.607 4.962 5.3 5.637 5.8 6.104 6.392 6.802 7.063 7.313 7.662 7.987 8.306 8.637 8.982 9.396 9.786 10.177 10.637 11.097 11.542 12.04 12.592 13.1 13.638 14.245 14.917 15.622 16.382 17.235 18.126 19.175 20.272 21.485 22.824 24.332 26.028 27.859 29.056 29.502 29.517 29.31 29.001 28.638 28.254 27.899 27.477 27.058 26.664 26.289 25.914 25.536 25.187 24.802 24.422 24.079 23.731 23.382 23.093 22.775 22.438 22.164 21.866 21.56 21.261 20.956 20.714 20.448 20.025 19.716 19.402 19.239 18.906 18.581 18.244 18.059 17.405 17.505 17.289 17.07 16.575 16.29 15.977 15.593 15.146 14.624 14.004 12.875 -9 ,11384 ,KEBNE ,16691350,Thu Nov 25 12:22:30 CET,Thu Nov 25 14:04:19 CET,0.0 1.152 1.638 2.048 2.421 2.735 2.992 3.233 3.685 3.911 4.124 4.034 4.702 4.892 5.232 5.55 5.865 6.02 6.313 6.615 7.057 7.319 7.568 7.94 8.307 8.662 9.008 9.34 9.759 10.171 10.577 11.04 11.481 11.91 12.393 12.917 13.44 14.055 14.712 15.414 16.127 16.892 17.81 18.726 19.754 20.866 22.133 23.523 25.05 26.763 28.589 29.728 30.093 30.073 29.874 29.539 29.164 28.774 28.395 27.981 27.567 27.156 26.758 26.371 25.966 25.578 25.182 24.812 24.482 24.138 23.765 23.44 23.106 22.766 22.478 22.174 21.858 21.51 21.136 20.885 20.633 20.208 19.916 19.61 19.443 19.1 18.747 18.361 18.155 17.495 17.533 17.299 17.056 16.5 16.184 15.842 15.46 15.035 14.534 13.879 11.134 -10 ,20849 ,KEBNE ,16691351,Thu Nov 25 12:22:30 CET,Thu Nov 25 14:04:42 CET,0.0 1.023 1.495 1.893 2.27 2.603 2.879 3.117 3.561 3.772 3.959 3.823 4.47 4.65 4.997 5.311 5.601 5.743 6.038 6.331 6.756 7.019 7.262 7.617 7.97 8.324 8.673 8.993 9.396 9.792 10.152 10.564 11.004 11.458 11.961 12.5 13.011 13.573 14.184 14.827 15.49 16.238 17.118 18.046 19.122 20.254 21.539 22.924 24.485 26.298 28.267 29.415 29.805 29.823 29.627 29.334 29.008 28.633 28.248 27.833 27.44 27.046 26.656 26.249 25.823 25.463 25.087 24.717 24.383 24.019 23.655 23.366 23.047 22.68 22.402 22.131 21.825 21.501 21.16 20.926 20.688 20.278 19.98 19.695 19.553 19.244 18.913 18.554 18.358 17.683 17.698 17.466 17.228 16.704 16.399 16.086 15.777 15.427 14.977 14.422 13.319 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23485.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23485.txt deleted file mode 100644 index 251ca1ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/PTP1B/water/Summary_FEP_23486_23485.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1100 ,KEBNE ,16690627,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:20 CET,0.0 3.294 4.282 5.003 5.544 6.033 6.46 6.833 7.545 7.862 8.145 8.184 8.906 9.14 9.587 10.012 10.409 10.598 10.966 11.317 11.832 12.155 12.46 12.901 13.311 13.686 14.057 14.435 14.91 15.344 15.736 16.197 16.668 17.133 17.66 18.251 18.805 19.397 20.019 20.633 21.263 21.957 22.75 23.535 24.42 25.403 26.515 27.707 28.994 30.363 31.635 32.256 32.28 31.983 31.632 31.198 30.688 30.188 29.729 29.214 28.741 28.315 27.87 27.419 26.981 26.578 26.138 25.743 25.414 25.05 24.654 24.322 23.982 23.645 23.379 23.062 22.729 22.393 22.023 21.769 21.506 21.104 20.832 20.534 20.375 20.053 19.715 19.343 19.146 18.461 18.473 18.236 17.983 17.47 17.193 16.85 16.485 16.111 15.666 15.059 13.893 -2 ,4597 ,KEBNE ,16690628,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:20 CET,0.0 2.437 3.307 3.951 4.486 4.96 5.371 5.735 6.356 6.63 6.918 7.0 7.737 7.975 8.44 8.854 9.257 9.454 9.811 10.156 10.65 10.962 11.277 11.737 12.162 12.558 12.943 13.309 13.776 14.247 14.679 15.187 15.671 16.117 16.639 17.224 17.758 18.331 18.946 19.593 20.278 21.045 21.908 22.745 23.684 24.666 25.723 26.861 28.138 29.562 30.957 31.572 31.564 31.279 30.86 30.349 29.801 29.282 28.83 28.326 27.819 27.354 26.919 26.476 26.049 25.662 25.242 24.846 24.505 24.164 23.803 23.49 23.141 22.751 22.434 22.105 21.784 21.466 21.137 20.91 20.671 20.291 20.022 19.711 19.548 19.225 18.881 18.504 18.299 17.632 17.707 17.493 17.25 16.696 16.392 16.077 15.701 15.3 14.866 14.298 12.977 -3 ,24489 ,KEBNE ,16690629,Thu Nov 25 08:22:08 CET,Thu Nov 25 08:23:28 CET,0.0 3.663 4.613 5.306 5.816 6.256 6.664 7.048 7.696 7.998 8.278 8.305 9.024 9.253 9.711 10.161 10.571 10.768 11.142 11.481 11.949 12.266 12.579 13.014 13.421 13.808 14.194 14.562 15.012 15.448 15.863 16.355 16.849 17.306 17.808 18.369 18.896 19.439 20.004 20.626 21.269 21.991 22.816 23.63 24.571 25.539 26.626 27.848 29.135 30.482 31.811 32.56 32.669 32.418 32.022 31.6 31.199 30.782 30.339 29.795 29.311 28.902 28.452 27.993 27.566 27.145 26.694 26.295 25.928 25.54 25.151 24.815 24.441 24.035 23.74 23.448 23.133 22.792 22.422 22.153 21.878 21.474 21.193 20.901 20.743 20.404 20.037 19.638 19.433 18.762 18.776 18.529 18.278 17.7 17.384 17.073 16.726 16.324 15.84 15.146 13.649 -4 ,27793 ,KEBNE ,16691355,Thu Nov 25 12:23:33 CET,Thu Nov 25 14:08:01 CET,0.0 2.303 3.209 3.915 4.47 4.94 5.33 5.673 6.316 6.614 6.901 6.966 7.687 7.91 8.364 8.818 9.237 9.432 9.824 10.192 10.706 11.037 11.351 11.804 12.23 12.619 12.987 13.345 13.794 14.217 14.614 15.075 15.551 16.042 16.559 17.077 17.564 18.102 18.695 19.342 20.032 20.805 21.69 22.554 23.507 24.532 25.667 26.816 28.079 29.464 30.787 31.451 31.498 31.29 30.974 30.519 29.99 29.493 29.001 28.464 28.016 27.585 27.133 26.709 26.3 25.879 25.46 25.098 24.764 24.398 24.011 23.681 23.324 22.957 22.674 22.371 22.054 21.721 21.38 21.157 20.916 20.525 20.23 19.909 19.747 19.413 19.086 18.738 18.547 17.877 17.9 17.667 17.422 16.866 16.571 16.261 15.908 15.494 14.96 14.284 13.235 -5 ,1132 ,KEBNE ,16691356,Thu Nov 25 12:23:33 CET,Thu Nov 25 14:06:26 CET,0.0 2.415 3.313 3.989 4.569 5.058 5.459 5.82 6.488 6.782 7.042 7.061 7.786 8.015 8.448 8.864 9.245 9.427 9.8 10.16 10.633 10.92 11.208 11.615 12.007 12.403 12.77 13.12 13.584 14.032 14.471 14.959 15.413 15.869 16.378 16.948 17.483 18.049 18.657 19.313 20.016 20.795 21.645 22.469 23.406 24.388 25.414 26.544 27.888 29.279 30.602 31.277 31.301 31.076 30.766 30.376 29.937 29.453 28.998 28.542 28.115 27.716 27.33 26.936 26.509 26.098 25.676 25.275 24.94 24.571 24.154 23.813 23.453 23.078 22.799 22.524 22.216 21.882 21.542 21.304 21.056 20.669 20.396 20.103 19.934 19.597 19.271 18.916 18.724 18.057 18.093 17.866 17.622 17.09 16.8 16.466 16.107 15.745 15.289 14.64 13.365 -6 ,10702 ,KEBNE ,16691357,Thu Nov 25 12:23:33 CET,Thu Nov 25 14:05:53 CET,0.0 2.525 3.4 4.046 4.578 5.074 5.506 5.883 6.54 6.817 7.099 7.177 7.901 8.138 8.616 9.063 9.442 9.626 9.993 10.337 10.845 11.181 11.488 11.893 12.303 12.707 13.091 13.458 13.929 14.383 14.786 15.269 15.749 16.22 16.771 17.357 17.913 18.492 19.08 19.709 20.375 21.079 21.823 22.556 23.424 24.375 25.444 26.62 27.87 29.244 30.741 31.555 31.699 31.497 31.118 30.68 30.18 29.604 29.092 28.552 28.052 27.621 27.211 26.782 26.37 26.008 25.574 25.162 24.815 24.448 24.06 23.72 23.355 22.994 22.717 22.42 22.109 21.784 21.418 21.165 20.925 20.54 20.27 19.989 19.839 19.505 19.133 18.758 18.56 17.877 17.911 17.68 17.44 16.866 16.537 16.209 15.886 15.522 15.067 14.488 13.269 -7 ,4784 ,KEBNE ,16691358,Thu Nov 25 12:23:36 CET,Thu Nov 25 14:02:08 CET,0.0 2.355 3.309 4.008 4.574 5.046 5.467 5.827 6.492 6.787 7.066 7.116 7.839 8.062 8.485 8.912 9.32 9.511 9.88 10.237 10.729 11.043 11.352 11.797 12.21 12.616 13.003 13.364 13.832 14.282 14.7 15.184 15.635 16.058 16.58 17.165 17.698 18.27 18.882 19.523 20.188 20.938 21.757 22.517 23.384 24.385 25.457 26.564 27.847 29.175 30.494 31.218 31.209 30.923 30.576 30.212 29.823 29.356 28.88 28.368 27.869 27.396 26.951 26.53 26.129 25.732 25.296 24.891 24.534 24.163 23.766 23.446 23.121 22.771 22.482 22.165 21.835 21.496 21.157 20.913 20.652 20.248 19.955 19.641 19.479 19.145 18.789 18.401 18.201 17.535 17.594 17.363 17.123 16.618 16.349 16.033 15.686 15.307 14.822 14.27 12.727 -8 ,10589 ,KEBNE ,16690634,Thu Nov 25 08:24:09 CET,Thu Nov 25 08:25:28 CET,0.0 2.04 2.93 3.621 4.165 4.629 5.051 5.434 6.095 6.384 6.672 6.746 7.484 7.732 8.184 8.577 8.962 9.159 9.533 9.881 10.365 10.678 10.992 11.449 11.868 12.265 12.649 13.01 13.462 13.907 14.328 14.812 15.268 15.717 16.222 16.775 17.292 17.847 18.472 19.116 19.784 20.524 21.375 22.223 23.173 24.154 25.197 26.334 27.62 29.009 30.337 31.003 31.124 30.899 30.446 29.977 29.559 29.123 28.648 28.116 27.638 27.194 26.747 26.295 25.879 25.492 25.067 24.656 24.279 23.9 23.501 23.162 22.812 22.435 22.136 21.836 21.513 21.161 20.787 20.531 20.263 19.857 19.574 19.274 19.121 18.802 18.473 18.115 17.927 17.262 17.278 17.056 16.827 16.294 15.989 15.664 15.295 14.859 14.349 13.701 12.482 -9 ,14106 ,KEBNE ,16690635,Thu Nov 25 08:24:09 CET,Thu Nov 25 08:25:21 CET,0.0 2.575 3.456 4.099 4.611 5.046 5.433 5.797 6.448 6.753 7.05 7.108 7.824 8.055 8.507 8.947 9.351 9.55 9.936 10.281 10.78 11.092 11.388 11.837 12.263 12.673 13.081 13.457 13.918 14.341 14.745 15.237 15.71 16.168 16.681 17.227 17.752 18.307 18.905 19.591 20.318 21.089 21.912 22.679 23.508 24.451 25.564 26.704 27.983 29.401 30.791 31.472 31.472 31.179 30.732 30.252 29.816 29.338 28.841 28.33 27.867 27.393 26.929 26.512 26.103 25.708 25.278 24.892 24.541 24.164 23.777 23.438 23.092 22.729 22.437 22.135 21.821 21.474 21.095 20.846 20.596 20.208 19.928 19.617 19.458 19.133 18.785 18.397 18.196 17.532 17.535 17.289 17.042 16.501 16.209 15.889 15.537 15.145 14.675 14.006 12.657 -10 ,10374 ,KEBNE ,16690636,Thu Nov 25 08:24:09 CET,Thu Nov 25 08:25:22 CET,0.0 2.579 3.464 4.116 4.631 5.058 5.447 5.807 6.436 6.722 6.998 7.031 7.739 7.974 8.446 8.887 9.28 9.468 9.821 10.16 10.645 10.951 11.241 11.644 12.023 12.388 12.779 13.158 13.646 14.135 14.571 15.08 15.595 16.066 16.569 17.157 17.693 18.234 18.837 19.473 20.126 20.832 21.637 22.43 23.317 24.278 25.353 26.529 27.812 29.161 30.551 31.311 31.373 31.158 30.847 30.458 29.978 29.464 29.017 28.49 27.945 27.445 26.984 26.532 26.104 25.73 25.304 24.886 24.544 24.186 23.798 23.469 23.132 22.783 22.49 22.19 21.875 21.513 21.131 20.886 20.636 20.233 19.941 19.635 19.49 19.189 18.844 18.467 18.272 17.603 17.629 17.385 17.158 16.667 16.343 15.982 15.637 15.251 14.732 14.141 12.907 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1a_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1a_5.txt deleted file mode 100644 index 28298206..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1a_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1587 ,KEBNE ,16691381,Thu Nov 25 12:24:35 CET,Thu Nov 25 14:26:20 CET,0.0 0.72 0.967 1.152 1.338 1.508 1.651 1.776 2.01 2.114 2.227 2.342 2.544 2.628 2.81 2.99 3.144 3.212 3.371 3.53 3.74 3.874 4.003 4.181 4.363 4.536 4.692 4.847 5.051 5.241 5.422 5.638 5.833 6.029 6.255 6.495 6.749 7.04 7.333 7.641 7.95 8.287 8.699 9.105 9.542 10.0 10.532 11.116 11.71 12.321 12.883 13.053 12.925 12.689 12.401 12.102 11.831 11.559 11.297 11.005 10.757 10.534 10.312 10.11 9.916 9.73 9.509 9.303 9.143 8.981 8.809 8.66 8.496 8.327 8.193 8.057 7.92 7.754 7.569 7.449 7.325 7.129 6.989 6.839 6.768 6.627 6.483 6.316 6.228 6.042 5.968 5.869 5.755 5.502 5.367 5.205 5.013 4.789 4.57 4.337 3.679 -2 ,30584 ,KEBNE ,16691382,Thu Nov 25 12:24:35 CET,Thu Nov 25 14:26:22 CET,0.0 0.495 0.741 0.911 1.083 1.255 1.415 1.56 1.803 1.927 2.038 2.126 2.337 2.443 2.66 2.832 2.996 3.08 3.241 3.395 3.589 3.715 3.852 4.045 4.219 4.379 4.537 4.695 4.895 5.095 5.287 5.504 5.727 5.953 6.201 6.467 6.708 6.964 7.249 7.542 7.833 8.184 8.606 9.009 9.432 9.907 10.452 10.989 11.57 12.163 12.621 12.753 12.639 12.411 12.127 11.785 11.481 11.225 10.964 10.666 10.407 10.158 9.939 9.74 9.544 9.354 9.12 8.924 8.756 8.573 8.399 8.254 8.085 7.91 7.775 7.643 7.514 7.378 7.226 7.106 6.978 6.763 6.617 6.476 6.409 6.267 6.11 5.933 5.846 5.667 5.585 5.476 5.348 5.087 4.965 4.84 4.706 4.526 4.296 4.031 3.428 -3 ,1015 ,KEBNE ,16691383,Thu Nov 25 12:24:35 CET,Thu Nov 25 14:26:28 CET,0.0 1.094 1.358 1.556 1.739 1.925 2.069 2.204 2.466 2.571 2.663 2.734 2.948 3.056 3.247 3.404 3.567 3.653 3.813 3.958 4.157 4.291 4.418 4.601 4.774 4.935 5.089 5.231 5.411 5.586 5.767 6.0 6.213 6.408 6.636 6.903 7.155 7.417 7.708 8.017 8.335 8.661 9.013 9.368 9.781 10.234 10.77 11.349 11.934 12.56 13.108 13.234 13.113 12.886 12.612 12.27 11.937 11.65 11.399 11.12 10.856 10.634 10.404 10.178 9.964 9.754 9.525 9.328 9.165 8.988 8.81 8.658 8.491 8.326 8.197 8.066 7.933 7.783 7.609 7.496 7.378 7.176 7.044 6.91 6.844 6.695 6.515 6.33 6.239 6.041 5.95 5.86 5.752 5.488 5.352 5.221 5.081 4.927 4.675 4.406 3.735 -4 ,29518 ,KEBNE ,16691384,Thu Nov 25 12:25:37 CET,Thu Nov 25 14:27:40 CET,0.0 0.542 0.838 1.063 1.233 1.369 1.497 1.629 1.878 2.006 2.122 2.231 2.44 2.539 2.743 2.932 3.101 3.173 3.33 3.495 3.709 3.836 3.972 4.167 4.334 4.493 4.66 4.826 5.019 5.193 5.37 5.599 5.802 5.983 6.204 6.439 6.666 6.925 7.224 7.544 7.867 8.226 8.618 8.988 9.41 9.893 10.434 10.991 11.603 12.162 12.566 12.664 12.527 12.27 11.971 11.69 11.417 11.145 10.885 10.588 10.321 10.07 9.825 9.585 9.361 9.16 8.931 8.728 8.553 8.38 8.202 8.053 7.903 7.733 7.597 7.466 7.347 7.228 7.095 6.995 6.882 6.696 6.567 6.433 6.362 6.223 6.085 5.927 5.838 5.63 5.503 5.397 5.298 5.064 4.936 4.817 4.664 4.493 4.28 4.013 3.523 -5 ,31570 ,KEBNE ,16691385,Thu Nov 25 12:25:38 CET,Thu Nov 25 14:27:42 CET,0.0 0.771 1.079 1.299 1.503 1.658 1.801 1.928 2.173 2.285 2.388 2.461 2.651 2.731 2.916 3.097 3.25 3.331 3.496 3.643 3.862 3.995 4.118 4.303 4.472 4.631 4.785 4.933 5.124 5.319 5.504 5.696 5.879 6.076 6.296 6.528 6.758 7.013 7.28 7.561 7.838 8.155 8.541 8.926 9.365 9.835 10.38 10.936 11.545 12.17 12.593 12.691 12.589 12.313 11.978 11.666 11.386 11.102 10.832 10.537 10.263 10.013 9.788 9.586 9.395 9.227 9.053 8.87 8.693 8.513 8.324 8.165 8.01 7.859 7.727 7.579 7.433 7.284 7.114 6.997 6.87 6.681 6.565 6.442 6.37 6.203 6.04 5.854 5.759 5.567 5.494 5.396 5.291 5.074 4.94 4.806 4.653 4.419 4.119 3.796 3.181 -6 ,15909 ,KEBNE ,16691386,Thu Nov 25 12:25:38 CET,Thu Nov 25 14:28:38 CET,0.0 0.473 0.725 0.918 1.085 1.254 1.421 1.578 1.815 1.914 2.016 2.096 2.297 2.377 2.526 2.68 2.826 2.902 3.063 3.215 3.415 3.54 3.671 3.867 4.055 4.23 4.396 4.559 4.768 4.956 5.15 5.389 5.614 5.825 6.064 6.355 6.631 6.937 7.283 7.617 7.944 8.301 8.702 9.115 9.59 10.079 10.598 11.134 11.736 12.404 13.026 13.318 13.232 12.967 12.701 12.421 12.133 11.86 11.59 11.28 11.013 10.791 10.567 10.327 10.091 9.869 9.644 9.445 9.259 9.062 8.869 8.696 8.494 8.309 8.176 8.036 7.899 7.746 7.585 7.476 7.366 7.187 7.05 6.918 6.851 6.7 6.533 6.36 6.257 6.041 5.92 5.802 5.677 5.376 5.21 5.045 4.859 4.675 4.484 4.224 3.702 -7 ,11105 ,KEBNE ,16691387,Thu Nov 25 12:26:40 CET,Thu Nov 25 14:28:30 CET,0.0 0.834 1.144 1.386 1.587 1.773 1.943 2.093 2.348 2.481 2.601 2.709 2.937 3.042 3.237 3.43 3.611 3.689 3.838 3.997 4.226 4.366 4.51 4.718 4.912 5.095 5.265 5.428 5.635 5.837 6.023 6.252 6.481 6.699 6.95 7.223 7.482 7.766 8.052 8.344 8.674 9.043 9.458 9.862 10.319 10.809 11.307 11.823 12.4 12.958 13.425 13.567 13.439 13.193 12.901 12.581 12.267 11.971 11.697 11.403 11.132 10.865 10.626 10.404 10.204 10.015 9.796 9.58 9.388 9.209 9.024 8.862 8.679 8.487 8.348 8.206 8.068 7.922 7.76 7.652 7.539 7.367 7.231 7.086 7.019 6.889 6.736 6.559 6.472 6.272 6.172 6.069 5.952 5.728 5.588 5.444 5.299 5.126 4.932 4.663 3.916 -8 ,19929 ,KEBNE ,16691388,Thu Nov 25 12:26:40 CET,Thu Nov 25 14:30:49 CET,0.0 0.682 0.957 1.19 1.335 1.456 1.57 1.681 1.906 2.016 2.118 2.191 2.401 2.496 2.684 2.849 2.996 3.07 3.209 3.357 3.567 3.688 3.821 4.031 4.209 4.371 4.53 4.697 4.905 5.078 5.255 5.489 5.726 5.938 6.157 6.427 6.716 7.018 7.304 7.606 7.934 8.284 8.667 9.074 9.566 10.081 10.597 11.118 11.736 12.376 12.897 13.045 12.894 12.607 12.318 12.032 11.726 11.461 11.232 10.972 10.737 10.508 10.274 10.045 9.821 9.601 9.367 9.158 8.979 8.801 8.617 8.457 8.275 8.078 7.938 7.806 7.667 7.527 7.365 7.247 7.126 6.932 6.799 6.664 6.597 6.448 6.295 6.146 6.063 5.868 5.802 5.711 5.605 5.351 5.213 5.057 4.901 4.74 4.553 4.24 3.033 -9 ,489 ,KEBNE ,16691389,Thu Nov 25 12:27:43 CET,Thu Nov 25 14:29:29 CET,0.0 0.857 1.179 1.436 1.653 1.856 2.029 2.175 2.411 2.524 2.637 2.751 2.972 3.07 3.268 3.48 3.659 3.74 3.917 4.076 4.297 4.448 4.594 4.804 5.007 5.184 5.346 5.515 5.737 5.938 6.13 6.367 6.597 6.819 7.09 7.373 7.626 7.92 8.255 8.604 8.935 9.287 9.696 10.09 10.527 11.025 11.587 12.119 12.637 13.215 13.793 13.999 13.898 13.693 13.462 13.22 13.006 12.742 12.471 12.189 11.943 11.734 11.518 11.292 11.085 10.899 10.681 10.469 10.291 10.123 9.935 9.782 9.624 9.466 9.35 9.207 9.06 8.91 8.755 8.645 8.527 8.341 8.211 8.091 8.028 7.898 7.752 7.586 7.503 7.313 7.211 7.086 6.971 6.707 6.551 6.398 6.249 6.065 5.843 5.558 5.121 -10 ,23759 ,KEBNE ,16691390,Thu Nov 25 12:27:43 CET,Thu Nov 25 14:31:46 CET,0.0 0.512 0.737 0.953 1.154 1.321 1.465 1.602 1.852 1.961 2.064 2.146 2.335 2.409 2.568 2.732 2.894 2.963 3.092 3.221 3.408 3.539 3.655 3.813 3.98 4.144 4.31 4.472 4.668 4.845 5.016 5.209 5.386 5.563 5.774 6.02 6.246 6.493 6.762 7.039 7.329 7.676 8.106 8.496 8.911 9.36 9.838 10.357 10.948 11.51 12.011 12.241 12.175 11.975 11.74 11.48 11.208 10.937 10.693 10.445 10.194 9.94 9.704 9.497 9.307 9.12 8.913 8.714 8.537 8.359 8.188 8.055 7.915 7.761 7.628 7.488 7.342 7.184 7.026 6.919 6.803 6.63 6.525 6.416 6.354 6.215 6.066 5.921 5.853 5.677 5.612 5.518 5.412 5.198 5.094 4.964 4.802 4.608 4.354 4.061 3.343 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt deleted file mode 100644 index 5c16fc65..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8367 ,KEBNE ,16691391,Thu Nov 25 12:27:43 CET,Thu Nov 25 14:29:01 CET,0.0 0.567 0.805 1.059 1.34 1.579 1.765 1.91 2.163 2.291 2.403 2.497 2.706 2.794 2.947 3.085 3.222 3.294 3.425 3.541 3.719 3.839 3.954 4.123 4.282 4.434 4.575 4.715 4.903 5.073 5.254 5.483 5.681 5.857 6.056 6.265 6.463 6.686 6.924 7.172 7.41 7.639 7.924 8.217 8.544 8.897 9.243 9.551 9.842 10.101 10.117 9.756 9.297 8.759 8.234 7.766 7.335 6.926 6.564 6.193 5.884 5.6 5.322 5.053 4.789 4.556 4.315 4.09 3.888 3.673 3.448 3.261 3.062 2.863 2.71 2.547 2.383 2.208 2.016 1.885 1.745 1.522 1.365 1.179 1.084 0.912 0.73 0.534 0.424 0.198 0.096 -0.002 -0.114 -0.364 -0.507 -0.673 -0.846 -1.027 -1.255 -1.561 -2.589 -2 ,23575 ,KEBNE ,16691392,Thu Nov 25 12:27:42 CET,Thu Nov 25 14:29:21 CET,0.0 0.788 1.076 1.29 1.472 1.631 1.775 1.911 2.132 2.242 2.351 2.402 2.586 2.667 2.837 2.998 3.154 3.233 3.366 3.478 3.643 3.768 3.889 4.065 4.227 4.369 4.495 4.612 4.774 4.929 5.067 5.238 5.407 5.565 5.765 5.976 6.158 6.356 6.568 6.79 7.029 7.296 7.576 7.835 8.155 8.495 8.813 9.158 9.507 9.755 9.777 9.478 9.048 8.545 8.037 7.538 7.104 6.721 6.384 6.048 5.736 5.45 5.188 4.942 4.702 4.468 4.227 4.019 3.816 3.583 3.355 3.17 2.979 2.786 2.64 2.49 2.338 2.193 2.035 1.919 1.804 1.618 1.477 1.339 1.275 1.107 0.918 0.76 0.68 0.482 0.368 0.248 0.129 -0.121 -0.25 -0.415 -0.591 -0.744 -0.926 -1.202 -1.718 -3 ,24317 ,KEBNE ,16691393,Thu Nov 25 12:28:45 CET,Thu Nov 25 14:31:31 CET,0.0 0.6 0.793 0.929 1.07 1.224 1.372 1.5 1.747 1.851 1.934 2.014 2.212 2.287 2.441 2.597 2.752 2.823 2.953 3.082 3.266 3.385 3.504 3.653 3.804 3.972 4.135 4.288 4.48 4.658 4.825 5.026 5.218 5.388 5.586 5.799 5.994 6.228 6.485 6.746 7.005 7.306 7.635 7.922 8.247 8.617 9.001 9.344 9.635 9.871 9.895 9.544 9.055 8.557 8.128 7.696 7.276 6.892 6.565 6.214 5.892 5.614 5.336 5.041 4.76 4.521 4.281 4.051 3.842 3.627 3.395 3.203 3.01 2.807 2.655 2.499 2.329 2.158 1.977 1.844 1.714 1.512 1.363 1.217 1.145 0.984 0.799 0.611 0.507 0.295 0.202 0.097 0.003 -0.229 -0.384 -0.553 -0.722 -0.907 -1.123 -1.402 -2.12 -4 ,21788 ,KEBNE ,16691394,Thu Nov 25 12:28:45 CET,Thu Nov 25 14:31:29 CET,0.0 0.607 0.854 1.053 1.206 1.354 1.499 1.629 1.889 2.008 2.102 2.166 2.355 2.44 2.612 2.77 2.921 2.99 3.124 3.249 3.426 3.539 3.648 3.819 3.996 4.17 4.332 4.478 4.656 4.823 4.969 5.154 5.342 5.512 5.717 5.938 6.132 6.352 6.6 6.87 7.135 7.401 7.71 8.043 8.413 8.781 9.138 9.469 9.797 10.038 10.062 9.76 9.316 8.845 8.401 7.953 7.529 7.111 6.712 6.29 5.916 5.602 5.301 4.992 4.698 4.453 4.217 4.0 3.785 3.561 3.343 3.144 2.937 2.741 2.589 2.415 2.231 2.05 1.865 1.739 1.606 1.415 1.293 1.149 1.069 0.897 0.708 0.518 0.419 0.201 0.094 -0.011 -0.122 -0.36 -0.485 -0.615 -0.76 -0.985 -1.232 -1.466 -2.207 -5 ,31221 ,KEBNE ,16691395,Thu Nov 25 12:29:47 CET,Thu Nov 25 14:31:40 CET,0.0 0.592 0.88 1.119 1.332 1.492 1.637 1.766 1.976 2.082 2.182 2.26 2.464 2.561 2.744 2.91 3.062 3.131 3.265 3.412 3.614 3.736 3.864 4.043 4.188 4.329 4.479 4.631 4.814 4.98 5.144 5.335 5.519 5.711 5.917 6.127 6.338 6.586 6.852 7.12 7.383 7.661 7.978 8.29 8.631 8.99 9.39 9.785 10.114 10.325 10.364 10.082 9.606 9.144 8.699 8.22 7.795 7.414 7.084 6.724 6.392 6.107 5.832 5.553 5.296 5.057 4.794 4.55 4.352 4.155 3.937 3.766 3.577 3.375 3.216 3.056 2.9 2.733 2.561 2.44 2.317 2.126 1.98 1.824 1.741 1.557 1.361 1.158 1.046 0.832 0.735 0.612 0.494 0.239 0.095 -0.067 -0.262 -0.457 -0.656 -0.945 -1.841 -6 ,10981 ,KEBNE ,16691396,Thu Nov 25 12:29:48 CET,Thu Nov 25 14:34:27 CET,0.0 0.556 0.784 0.997 1.164 1.322 1.449 1.548 1.776 1.897 2.007 2.092 2.277 2.359 2.528 2.695 2.858 2.929 3.052 3.176 3.354 3.469 3.581 3.739 3.89 4.035 4.172 4.302 4.475 4.632 4.79 5.015 5.213 5.393 5.606 5.83 6.055 6.282 6.523 6.809 7.097 7.392 7.73 8.053 8.414 8.807 9.21 9.626 10.052 10.341 10.363 10.03 9.559 9.058 8.548 8.051 7.63 7.247 6.905 6.577 6.284 6.002 5.716 5.438 5.173 4.94 4.71 4.495 4.299 4.091 3.873 3.69 3.503 3.291 3.121 2.956 2.785 2.598 2.402 2.279 2.142 1.915 1.765 1.614 1.542 1.383 1.193 0.998 0.902 0.695 0.608 0.495 0.382 0.161 0.034 -0.123 -0.311 -0.523 -0.77 -1.077 -1.824 -7 ,22980 ,KEBNE ,16691397,Thu Nov 25 12:30:49 CET,Thu Nov 25 14:32:09 CET,0.0 0.391 0.663 0.883 1.072 1.237 1.359 1.472 1.679 1.79 1.903 1.971 2.159 2.23 2.354 2.473 2.605 2.675 2.8 2.919 3.098 3.212 3.321 3.473 3.616 3.754 3.899 4.033 4.197 4.376 4.56 4.773 4.958 5.115 5.291 5.5 5.707 5.95 6.205 6.447 6.689 6.938 7.213 7.506 7.824 8.123 8.448 8.809 9.164 9.421 9.48 9.167 8.719 8.272 7.805 7.345 6.93 6.573 6.264 5.924 5.606 5.291 5.018 4.778 4.533 4.313 4.089 3.887 3.713 3.528 3.321 3.145 2.974 2.793 2.637 2.467 2.294 2.118 1.943 1.822 1.695 1.497 1.354 1.202 1.133 1.002 0.85 0.676 0.568 0.341 0.22 0.107 -0.002 -0.233 -0.379 -0.526 -0.671 -0.843 -1.062 -1.387 -2.11 -8 ,8151 ,KEBNE ,16691398,Thu Nov 25 12:30:49 CET,Thu Nov 25 14:32:37 CET,0.0 0.41 0.6 0.795 0.984 1.149 1.294 1.425 1.685 1.826 1.954 2.058 2.27 2.371 2.569 2.742 2.896 2.983 3.163 3.315 3.522 3.65 3.773 3.948 4.112 4.27 4.419 4.556 4.741 4.926 5.086 5.258 5.438 5.619 5.814 6.029 6.24 6.465 6.693 6.939 7.184 7.453 7.756 8.048 8.358 8.653 8.991 9.334 9.646 9.844 9.773 9.38 8.897 8.389 7.854 7.324 6.845 6.407 6.024 5.65 5.339 5.032 4.724 4.448 4.189 3.951 3.702 3.476 3.276 3.067 2.846 2.659 2.464 2.27 2.117 1.942 1.775 1.601 1.406 1.278 1.142 0.921 0.77 0.602 0.515 0.331 0.125 -0.075 -0.169 -0.381 -0.485 -0.6 -0.746 -1.069 -1.239 -1.427 -1.603 -1.757 -1.943 -2.222 -2.941 -9 ,31290 ,KEBNE ,16691399,Thu Nov 25 12:30:50 CET,Thu Nov 25 14:38:44 CET,0.0 0.44 0.642 0.804 0.959 1.105 1.263 1.415 1.656 1.751 1.845 1.932 2.117 2.188 2.319 2.453 2.6 2.672 2.795 2.904 3.081 3.199 3.301 3.464 3.609 3.739 3.877 4.004 4.151 4.298 4.446 4.609 4.763 4.927 5.144 5.383 5.59 5.798 6.014 6.257 6.499 6.764 7.081 7.371 7.703 8.055 8.441 8.809 9.127 9.416 9.46 9.168 8.709 8.164 7.653 7.157 6.7 6.276 5.9 5.521 5.21 4.93 4.642 4.354 4.09 3.872 3.632 3.404 3.22 3.032 2.823 2.647 2.464 2.266 2.121 1.978 1.832 1.675 1.502 1.386 1.265 1.059 0.918 0.782 0.713 0.553 0.377 0.197 0.094 -0.138 -0.261 -0.362 -0.469 -0.722 -0.862 -1.014 -1.196 -1.378 -1.551 -1.778 -2.596 -10 ,22507 ,KEBNE ,16691400,Thu Nov 25 12:31:55 CET,Thu Nov 25 14:31:42 CET,0.0 0.402 0.613 0.789 0.97 1.111 1.231 1.373 1.648 1.76 1.875 2.001 2.216 2.311 2.487 2.671 2.837 2.908 3.041 3.17 3.343 3.446 3.554 3.705 3.836 3.972 4.106 4.239 4.427 4.597 4.762 4.956 5.136 5.306 5.487 5.703 5.915 6.137 6.371 6.613 6.867 7.145 7.429 7.694 8.009 8.336 8.686 9.054 9.46 9.775 9.86 9.6 9.091 8.553 8.093 7.657 7.252 6.861 6.503 6.119 5.797 5.528 5.26 4.997 4.746 4.516 4.261 4.025 3.827 3.631 3.401 3.193 3.003 2.802 2.641 2.478 2.3 2.119 1.958 1.849 1.724 1.521 1.392 1.251 1.169 1.016 0.856 0.679 0.587 0.368 0.258 0.153 0.048 -0.191 -0.336 -0.496 -0.647 -0.82 -1.054 -1.345 -1.973 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1c.txt deleted file mode 100644 index de778b4d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4376 ,KEBNE ,16691401,Thu Nov 25 12:31:51 CET,Thu Nov 25 14:32:26 CET,0.0 0.755 1.025 1.251 1.424 1.575 1.746 1.908 2.174 2.308 2.428 2.548 2.769 2.861 3.017 3.173 3.325 3.397 3.545 3.689 3.881 4.015 4.158 4.339 4.494 4.643 4.784 4.912 5.087 5.255 5.418 5.614 5.791 5.966 6.163 6.387 6.593 6.804 7.034 7.269 7.496 7.724 7.972 8.229 8.535 8.854 9.18 9.519 9.879 10.133 10.087 9.749 9.313 8.789 8.293 7.787 7.306 6.88 6.51 6.153 5.832 5.529 5.241 4.981 4.722 4.481 4.212 3.962 3.75 3.52 3.303 3.14 2.984 2.822 2.68 2.521 2.355 2.186 1.999 1.873 1.738 1.517 1.366 1.215 1.145 1.0 0.844 0.684 0.594 0.388 0.31 0.202 0.079 -0.187 -0.335 -0.507 -0.702 -0.934 -1.186 -1.427 -2.137 -2 ,28796 ,KEBNE ,16691402,Thu Nov 25 12:31:51 CET,Thu Nov 25 14:34:12 CET,0.0 0.812 1.117 1.341 1.537 1.717 1.845 1.953 2.179 2.302 2.421 2.528 2.745 2.833 2.979 3.128 3.281 3.356 3.507 3.649 3.861 3.991 4.107 4.291 4.459 4.609 4.76 4.911 5.083 5.23 5.384 5.571 5.743 5.91 6.095 6.288 6.472 6.671 6.911 7.184 7.451 7.707 7.977 8.251 8.521 8.818 9.126 9.402 9.689 9.897 9.891 9.461 8.879 8.307 7.778 7.267 6.799 6.374 5.995 5.612 5.284 4.974 4.653 4.364 4.104 3.84 3.545 3.292 3.108 2.926 2.707 2.516 2.321 2.11 1.944 1.78 1.602 1.412 1.236 1.116 0.994 0.809 0.683 0.549 0.476 0.32 0.162 -0.004 -0.109 -0.328 -0.39 -0.49 -0.606 -0.853 -0.992 -1.155 -1.315 -1.523 -1.796 -2.101 -2.712 -3 ,12272 ,KEBNE ,16691403,Thu Nov 25 12:32:53 CET,Thu Nov 25 14:35:28 CET,0.0 1.023 1.355 1.651 1.841 1.988 2.117 2.241 2.491 2.591 2.678 2.76 2.954 3.024 3.17 3.32 3.476 3.556 3.696 3.819 4.016 4.158 4.299 4.502 4.683 4.84 4.985 5.13 5.326 5.495 5.639 5.83 6.017 6.182 6.37 6.585 6.781 6.985 7.198 7.428 7.674 7.954 8.275 8.606 8.945 9.265 9.582 9.853 10.143 10.329 10.208 9.714 9.165 8.606 8.084 7.615 7.216 6.835 6.47 6.098 5.785 5.485 5.181 4.907 4.658 4.431 4.174 3.944 3.764 3.577 3.372 3.194 2.997 2.797 2.649 2.472 2.281 2.095 1.907 1.783 1.649 1.441 1.295 1.158 1.087 0.927 0.748 0.533 0.42 0.185 0.078 -0.027 -0.146 -0.378 -0.507 -0.669 -0.858 -1.096 -1.376 -1.644 -2.491 -4 ,9868 ,KEBNE ,16691404,Thu Nov 25 12:32:53 CET,Thu Nov 25 14:34:35 CET,0.0 0.669 0.979 1.186 1.343 1.481 1.622 1.767 2.025 2.14 2.249 2.332 2.533 2.622 2.792 2.949 3.097 3.174 3.321 3.446 3.642 3.759 3.859 4.024 4.189 4.345 4.497 4.638 4.82 5.001 5.177 5.373 5.547 5.718 5.918 6.125 6.314 6.524 6.761 7.01 7.263 7.538 7.804 8.051 8.351 8.665 8.951 9.17 9.354 9.514 9.473 9.047 8.483 7.887 7.31 6.818 6.378 5.954 5.584 5.2 4.869 4.545 4.233 3.961 3.709 3.463 3.205 2.993 2.813 2.622 2.419 2.257 2.091 1.918 1.773 1.616 1.449 1.268 1.071 0.934 0.804 0.614 0.47 0.3 0.217 0.054 -0.121 -0.293 -0.386 -0.609 -0.724 -0.842 -0.96 -1.215 -1.367 -1.535 -1.697 -1.867 -2.037 -2.289 -2.946 -5 ,21870 ,KEBNE ,16691405,Thu Nov 25 12:33:55 CET,Thu Nov 25 14:36:32 CET,0.0 0.805 1.11 1.314 1.513 1.672 1.795 1.91 2.154 2.278 2.392 2.491 2.72 2.836 3.046 3.232 3.404 3.488 3.634 3.778 3.988 4.122 4.254 4.446 4.616 4.778 4.952 5.107 5.271 5.416 5.559 5.753 5.959 6.149 6.364 6.591 6.789 7.012 7.265 7.526 7.764 8.015 8.319 8.609 8.953 9.307 9.633 9.945 10.245 10.473 10.329 9.816 9.279 8.737 8.204 7.718 7.295 6.874 6.471 6.084 5.766 5.47 5.191 4.917 4.654 4.41 4.156 3.931 3.708 3.467 3.221 3.012 2.807 2.604 2.44 2.272 2.097 1.918 1.74 1.611 1.472 1.241 1.08 0.916 0.832 0.652 0.466 0.299 0.222 0.017 -0.066 -0.163 -0.263 -0.496 -0.626 -0.761 -0.92 -1.081 -1.259 -1.571 -2.76 -6 ,30883 ,KEBNE ,16691406,Thu Nov 25 12:33:55 CET,Thu Nov 25 14:36:23 CET,0.0 1.058 1.461 1.707 1.896 2.056 2.196 2.319 2.531 2.632 2.749 2.881 3.096 3.183 3.341 3.489 3.64 3.715 3.848 3.969 4.154 4.275 4.397 4.575 4.746 4.934 5.109 5.247 5.418 5.587 5.747 5.936 6.109 6.276 6.478 6.696 6.891 7.109 7.333 7.554 7.803 8.08 8.362 8.629 8.956 9.284 9.61 9.934 10.207 10.32 10.148 9.638 9.051 8.446 7.892 7.374 6.898 6.477 6.119 5.748 5.407 5.086 4.788 4.508 4.235 3.968 3.698 3.477 3.278 3.057 2.826 2.633 2.434 2.235 2.082 1.925 1.762 1.604 1.449 1.335 1.205 0.992 0.852 0.718 0.655 0.517 0.357 0.198 0.114 -0.082 -0.177 -0.284 -0.388 -0.627 -0.761 -0.899 -1.037 -1.242 -1.513 -1.758 -2.61 -7 ,2894 ,KEBNE ,16691407,Thu Nov 25 12:33:55 CET,Thu Nov 25 14:36:27 CET,0.0 0.636 0.94 1.144 1.324 1.474 1.605 1.737 2.001 2.12 2.224 2.306 2.503 2.599 2.785 2.942 3.097 3.175 3.327 3.462 3.653 3.784 3.912 4.098 4.272 4.422 4.563 4.706 4.891 5.072 5.239 5.415 5.586 5.771 5.984 6.197 6.389 6.575 6.776 7.001 7.239 7.509 7.793 8.061 8.378 8.716 9.051 9.381 9.654 9.84 9.775 9.365 8.848 8.313 7.805 7.312 6.847 6.407 6.025 5.607 5.259 4.965 4.672 4.41 4.169 3.93 3.68 3.45 3.248 3.047 2.829 2.651 2.47 2.267 2.109 1.946 1.767 1.592 1.423 1.304 1.188 0.997 0.847 0.675 0.589 0.444 0.299 0.135 0.051 -0.138 -0.25 -0.38 -0.5 -0.762 -0.907 -1.049 -1.181 -1.311 -1.491 -1.779 -2.682 -8 ,1533 ,KEBNE ,16691408,Thu Nov 25 12:33:59 CET,Thu Nov 25 14:33:56 CET,0.0 1.068 1.41 1.654 1.849 1.998 2.128 2.244 2.47 2.587 2.696 2.789 2.99 3.07 3.227 3.396 3.555 3.634 3.79 3.931 4.122 4.251 4.374 4.535 4.687 4.841 4.982 5.111 5.268 5.422 5.57 5.741 5.91 6.06 6.239 6.459 6.656 6.86 7.086 7.34 7.605 7.879 8.141 8.398 8.708 9.025 9.367 9.727 10.07 10.255 10.192 9.823 9.346 8.807 8.287 7.803 7.348 6.929 6.54 6.122 5.758 5.452 5.183 4.924 4.65 4.393 4.124 3.878 3.669 3.472 3.284 3.132 2.961 2.76 2.587 2.404 2.249 2.097 1.946 1.845 1.732 1.561 1.441 1.302 1.219 1.034 0.856 0.692 0.613 0.423 0.346 0.235 0.103 -0.164 -0.295 -0.439 -0.591 -0.739 -0.901 -1.097 -1.415 -9 ,27123 ,KEBNE ,16691409,Thu Nov 25 12:34:56 CET,Thu Nov 25 14:37:25 CET,0.0 0.555 0.862 1.13 1.325 1.46 1.604 1.744 1.989 2.112 2.228 2.31 2.523 2.617 2.775 2.919 3.05 3.12 3.263 3.396 3.6 3.727 3.854 4.041 4.214 4.373 4.524 4.673 4.858 5.048 5.234 5.457 5.653 5.839 6.074 6.312 6.517 6.742 6.977 7.202 7.436 7.739 8.082 8.38 8.686 8.976 9.267 9.611 9.952 10.177 10.169 9.868 9.416 8.883 8.367 7.876 7.403 6.939 6.552 6.195 5.887 5.599 5.295 4.983 4.715 4.464 4.181 3.951 3.756 3.548 3.332 3.144 2.949 2.743 2.577 2.413 2.254 2.085 1.91 1.781 1.636 1.408 1.25 1.104 1.037 0.886 0.725 0.551 0.457 0.237 0.133 0.032 -0.068 -0.325 -0.484 -0.644 -0.792 -0.933 -1.147 -1.492 -2.413 -10 ,30625 ,KEBNE ,16691410,Thu Nov 25 12:35:00 CET,Thu Nov 25 14:37:24 CET,0.0 0.552 0.871 1.13 1.38 1.571 1.715 1.864 2.1 2.193 2.286 2.38 2.593 2.693 2.866 3.031 3.194 3.266 3.4 3.531 3.72 3.846 3.959 4.112 4.258 4.41 4.568 4.718 4.918 5.102 5.271 5.471 5.644 5.816 6.031 6.263 6.459 6.672 6.897 7.128 7.342 7.584 7.888 8.168 8.472 8.772 9.038 9.301 9.587 9.748 9.62 9.139 8.611 8.049 7.521 6.986 6.486 6.069 5.712 5.362 5.072 4.799 4.516 4.248 3.994 3.752 3.498 3.262 3.053 2.859 2.674 2.492 2.291 2.081 1.919 1.756 1.593 1.415 1.215 1.082 0.953 0.748 0.606 0.46 0.378 0.206 0.017 -0.187 -0.291 -0.499 -0.582 -0.682 -0.797 -1.098 -1.264 -1.432 -1.605 -1.789 -1.996 -2.346 -3.554 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1d.txt deleted file mode 100644 index b1338dee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_1d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15273 ,KEBNE ,16691411,Thu Nov 25 12:34:56 CET,Thu Nov 25 14:38:28 CET,0.0 0.774 1.073 1.292 1.459 1.605 1.774 1.925 2.159 2.277 2.402 2.535 2.766 2.879 3.053 3.214 3.376 3.444 3.566 3.693 3.883 4.005 4.116 4.296 4.469 4.629 4.795 4.957 5.161 5.347 5.532 5.764 5.987 6.193 6.416 6.666 6.92 7.189 7.438 7.697 7.984 8.284 8.595 8.86 9.156 9.486 9.817 10.095 10.305 10.365 10.072 9.501 8.861 8.184 7.597 7.085 6.591 6.112 5.706 5.303 4.97 4.672 4.36 4.063 3.8 3.577 3.325 3.082 2.874 2.653 2.437 2.254 2.045 1.817 1.644 1.471 1.292 1.119 0.936 0.805 0.659 0.446 0.306 0.154 0.078 -0.087 -0.265 -0.443 -0.533 -0.748 -0.851 -0.969 -1.091 -1.325 -1.451 -1.592 -1.743 -1.899 -2.109 -2.397 -2.84 -2 ,13208 ,KEBNE ,16691412,Thu Nov 25 12:34:56 CET,Thu Nov 25 14:38:26 CET,0.0 1.107 1.457 1.749 1.985 2.169 2.34 2.494 2.803 2.931 3.024 3.109 3.327 3.43 3.639 3.853 4.047 4.133 4.291 4.448 4.68 4.823 4.971 5.186 5.387 5.574 5.734 5.876 6.061 6.251 6.427 6.654 6.877 7.066 7.277 7.516 7.748 8.027 8.324 8.609 8.894 9.185 9.466 9.706 9.975 10.27 10.611 10.958 11.315 11.597 11.517 11.04 10.444 9.789 9.2 8.697 8.219 7.762 7.364 6.945 6.609 6.318 6.032 5.759 5.498 5.259 5.006 4.779 4.579 4.366 4.144 3.984 3.814 3.601 3.438 3.285 3.121 2.941 2.759 2.639 2.505 2.27 2.125 1.975 1.89 1.729 1.561 1.373 1.282 1.09 1.028 0.931 0.831 0.561 0.423 0.298 0.148 -0.019 -0.208 -0.44 -1.333 -3 ,5502 ,KEBNE ,16691413,Thu Nov 25 12:37:00 CET,Thu Nov 25 14:39:11 CET,0.0 1.202 1.56 1.8 1.997 2.181 2.347 2.495 2.73 2.832 2.946 3.047 3.24 3.325 3.511 3.675 3.844 3.931 4.071 4.2 4.394 4.52 4.642 4.791 4.942 5.106 5.257 5.406 5.583 5.748 5.916 6.11 6.306 6.504 6.723 6.972 7.2 7.467 7.747 7.999 8.281 8.599 8.937 9.255 9.603 9.97 10.345 10.672 10.964 11.169 11.193 10.804 10.22 9.624 9.087 8.573 8.091 7.636 7.227 6.822 6.457 6.125 5.823 5.544 5.264 4.992 4.725 4.49 4.289 4.09 3.885 3.699 3.492 3.288 3.135 2.963 2.78 2.601 2.411 2.268 2.118 1.9 1.754 1.59 1.501 1.33 1.162 0.96 0.861 0.651 0.547 0.434 0.32 0.028 -0.12 -0.243 -0.384 -0.572 -0.841 -1.165 -1.931 -4 ,14065 ,KEBNE ,16691414,Thu Nov 25 12:38:03 CET,Thu Nov 25 14:42:33 CET,0.0 1.088 1.353 1.627 1.882 2.067 2.257 2.441 2.743 2.886 3.017 3.142 3.368 3.475 3.651 3.829 4.026 4.121 4.306 4.489 4.728 4.867 4.996 5.19 5.388 5.567 5.735 5.903 6.107 6.291 6.48 6.713 6.925 7.126 7.343 7.595 7.832 8.069 8.319 8.583 8.85 9.114 9.423 9.74 10.067 10.422 10.789 11.122 11.4 11.588 11.502 10.98 10.326 9.685 9.158 8.624 8.105 7.626 7.207 6.8 6.453 6.134 5.826 5.523 5.218 4.953 4.702 4.478 4.276 4.087 3.898 3.713 3.505 3.293 3.131 2.951 2.768 2.582 2.394 2.279 2.151 1.925 1.775 1.629 1.554 1.413 1.275 1.122 1.031 0.819 0.736 0.633 0.543 0.354 0.232 0.083 -0.096 -0.307 -0.526 -0.733 -1.269 -5 ,10001 ,KEBNE ,16691415,Thu Nov 25 12:38:02 CET,Thu Nov 25 14:41:05 CET,0.0 1.009 1.373 1.668 1.895 2.137 2.339 2.485 2.733 2.847 2.965 3.091 3.3 3.399 3.596 3.746 3.88 3.96 4.119 4.258 4.456 4.582 4.705 4.909 5.094 5.251 5.414 5.577 5.769 5.948 6.127 6.321 6.495 6.677 6.867 7.056 7.242 7.472 7.753 8.044 8.321 8.608 8.922 9.223 9.534 9.821 10.111 10.437 10.718 10.869 10.779 10.292 9.752 9.15 8.526 7.979 7.484 7.008 6.618 6.253 5.916 5.6 5.316 5.039 4.77 4.532 4.282 4.041 3.843 3.655 3.449 3.264 3.07 2.864 2.703 2.543 2.382 2.219 2.066 1.967 1.832 1.621 1.485 1.331 1.246 1.077 0.919 0.735 0.629 0.405 0.299 0.199 0.099 -0.141 -0.263 -0.401 -0.595 -0.841 -1.102 -1.375 -1.905 -6 ,3849 ,KEBNE ,16691416,Thu Nov 25 12:39:05 CET,Thu Nov 25 14:42:13 CET,0.0 1.216 1.568 1.84 2.042 2.227 2.405 2.564 2.831 2.964 3.11 3.257 3.48 3.582 3.761 3.936 4.096 4.172 4.317 4.458 4.66 4.797 4.943 5.142 5.325 5.505 5.676 5.842 6.058 6.261 6.443 6.66 6.855 7.051 7.288 7.547 7.811 8.086 8.355 8.636 8.924 9.229 9.573 9.893 10.223 10.568 10.925 11.276 11.594 11.756 11.666 11.228 10.695 10.144 9.587 9.041 8.568 8.116 7.715 7.333 6.979 6.653 6.309 5.979 5.704 5.46 5.213 5.001 4.797 4.569 4.338 4.146 3.958 3.752 3.591 3.429 3.258 3.095 2.914 2.771 2.622 2.39 2.248 2.12 2.046 1.878 1.695 1.511 1.411 1.195 1.096 0.981 0.863 0.571 0.42 0.294 0.158 -0.01 -0.209 -0.444 -1.274 -7 ,6380 ,KEBNE ,16691417,Thu Nov 25 12:50:28 CET,Thu Nov 25 14:52:24 CET,0.0 0.885 1.293 1.573 1.79 1.945 2.07 2.203 2.502 2.645 2.764 2.876 3.089 3.188 3.4 3.611 3.81 3.898 4.061 4.209 4.405 4.54 4.673 4.854 5.031 5.215 5.386 5.532 5.711 5.895 6.09 6.325 6.552 6.773 7.0 7.224 7.441 7.71 7.991 8.264 8.536 8.806 9.127 9.472 9.817 10.159 10.478 10.739 11.035 11.247 11.04 10.456 9.868 9.206 8.563 7.997 7.497 7.004 6.567 6.154 5.794 5.48 5.199 4.916 4.654 4.425 4.174 3.945 3.736 3.506 3.276 3.088 2.887 2.689 2.549 2.391 2.196 2.002 1.824 1.702 1.576 1.384 1.24 1.086 1.014 0.867 0.706 0.511 0.413 0.202 0.097 -0.024 -0.151 -0.426 -0.571 -0.725 -0.91 -1.132 -1.363 -1.625 -2.353 -8 ,6934 ,KEBNE ,16691418,Thu Nov 25 12:51:29 CET,Thu Nov 25 14:52:28 CET,0.0 0.852 1.135 1.363 1.566 1.723 1.868 2.026 2.295 2.413 2.526 2.625 2.828 2.922 3.11 3.292 3.444 3.517 3.663 3.811 4.023 4.144 4.266 4.447 4.62 4.785 4.932 5.063 5.249 5.441 5.618 5.831 6.018 6.18 6.376 6.597 6.819 7.085 7.358 7.606 7.84 8.107 8.454 8.784 9.114 9.431 9.734 10.012 10.227 10.376 10.329 9.954 9.432 8.843 8.276 7.707 7.213 6.756 6.346 5.942 5.595 5.285 4.956 4.645 4.384 4.146 3.898 3.671 3.467 3.259 3.044 2.879 2.714 2.52 2.356 2.185 2.017 1.853 1.673 1.547 1.42 1.225 1.092 0.951 0.866 0.684 0.511 0.336 0.247 0.041 -0.029 -0.119 -0.229 -0.485 -0.623 -0.77 -0.933 -1.133 -1.342 -1.596 -2.478 -9 ,6334 ,KEBNE ,16691419,Thu Nov 25 13:03:51 CET,Thu Nov 25 15:06:19 CET,0.0 1.107 1.49 1.713 1.88 2.072 2.258 2.403 2.647 2.763 2.885 2.995 3.205 3.309 3.5 3.667 3.814 3.89 4.039 4.182 4.402 4.554 4.688 4.845 5.004 5.172 5.343 5.503 5.685 5.859 6.041 6.263 6.46 6.654 6.884 7.126 7.346 7.572 7.805 8.022 8.255 8.537 8.868 9.193 9.508 9.818 10.159 10.523 10.867 11.036 10.912 10.423 9.854 9.263 8.659 8.12 7.672 7.255 6.857 6.444 6.108 5.801 5.485 5.188 4.925 4.68 4.428 4.205 4.005 3.793 3.57 3.391 3.208 3.018 2.869 2.714 2.54 2.348 2.168 2.053 1.925 1.737 1.606 1.457 1.383 1.213 1.035 0.868 0.775 0.551 0.449 0.351 0.228 -0.065 -0.206 -0.353 -0.542 -0.745 -0.977 -1.273 -2.1 -10 ,13252 ,KEBNE ,16691420,Thu Nov 25 13:03:51 CET,Thu Nov 25 15:05:40 CET,0.0 0.898 1.18 1.424 1.671 1.878 2.06 2.221 2.5 2.624 2.727 2.828 3.032 3.131 3.32 3.503 3.683 3.762 3.907 4.056 4.277 4.407 4.527 4.714 4.864 5.0 5.144 5.286 5.475 5.649 5.816 6.035 6.25 6.456 6.685 6.931 7.162 7.395 7.64 7.919 8.195 8.487 8.867 9.235 9.586 9.926 10.29 10.612 10.918 11.122 11.005 10.513 9.919 9.263 8.682 8.177 7.7 7.215 6.765 6.347 6.004 5.695 5.399 5.108 4.836 4.604 4.376 4.178 3.989 3.783 3.566 3.389 3.212 3.022 2.882 2.729 2.561 2.379 2.186 2.064 1.942 1.74 1.602 1.451 1.373 1.23 1.082 0.907 0.812 0.605 0.498 0.387 0.273 -0.018 -0.186 -0.346 -0.5 -0.667 -0.902 -1.287 -2.14 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_5.txt deleted file mode 100644 index 7f531504..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1b_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23232 ,KEBNE ,16691421,Thu Nov 25 13:07:59 CET,Thu Nov 25 15:11:52 CET,0.0 0.991 1.353 1.635 1.842 2.034 2.198 2.332 2.582 2.705 2.813 2.922 3.141 3.249 3.446 3.623 3.799 3.877 4.018 4.156 4.357 4.487 4.603 4.773 4.937 5.083 5.239 5.403 5.605 5.813 6.001 6.206 6.401 6.584 6.792 7.007 7.222 7.476 7.733 8.004 8.286 8.601 8.975 9.33 9.701 10.117 10.578 11.02 11.497 12.001 12.403 12.397 12.168 11.905 11.57 11.194 10.862 10.529 10.218 9.904 9.594 9.318 9.069 8.814 8.565 8.33 8.097 7.886 7.688 7.49 7.3 7.13 6.947 6.77 6.634 6.483 6.302 6.115 5.931 5.802 5.668 5.459 5.305 5.154 5.081 4.927 4.749 4.544 4.446 4.239 4.108 3.993 3.863 3.542 3.358 3.187 2.989 2.753 2.519 2.164 0.227 -2 ,16634 ,KEBNE ,16691422,Thu Nov 25 13:14:08 CET,Thu Nov 25 15:18:24 CET,0.0 0.962 1.362 1.657 1.855 2.031 2.193 2.325 2.568 2.689 2.797 2.886 3.096 3.19 3.361 3.545 3.716 3.793 3.954 4.12 4.35 4.485 4.623 4.828 5.008 5.187 5.367 5.535 5.736 5.923 6.11 6.329 6.514 6.684 6.881 7.116 7.366 7.625 7.892 8.159 8.434 8.733 9.042 9.343 9.736 10.194 10.692 11.211 11.75 12.259 12.616 12.585 12.321 11.987 11.647 11.297 10.944 10.594 10.279 9.97 9.695 9.428 9.179 8.946 8.722 8.515 8.274 8.045 7.839 7.627 7.419 7.239 7.045 6.859 6.72 6.565 6.402 6.221 6.033 5.913 5.773 5.536 5.387 5.222 5.135 4.98 4.81 4.632 4.541 4.34 4.255 4.152 4.047 3.834 3.709 3.558 3.329 3.057 2.819 2.495 1.716 -3 ,20333 ,KEBNE ,16691423,Thu Nov 25 13:15:10 CET,Thu Nov 25 15:19:33 CET,0.0 1.024 1.326 1.545 1.74 1.898 2.04 2.175 2.423 2.534 2.638 2.756 2.977 3.078 3.253 3.432 3.61 3.7 3.88 4.032 4.227 4.343 4.451 4.618 4.793 4.973 5.137 5.294 5.495 5.669 5.835 6.041 6.237 6.415 6.631 6.866 7.075 7.314 7.582 7.877 8.189 8.526 8.891 9.238 9.635 10.054 10.509 10.997 11.518 12.06 12.507 12.625 12.51 12.283 12.007 11.649 11.28 10.892 10.515 10.162 9.882 9.622 9.352 9.122 8.898 8.686 8.463 8.261 8.098 7.918 7.717 7.542 7.351 7.148 7.012 6.881 6.732 6.545 6.341 6.212 6.086 5.885 5.735 5.584 5.501 5.331 5.164 4.977 4.884 4.686 4.578 4.457 4.324 4.014 3.848 3.638 3.397 3.175 2.939 2.619 1.439 -4 ,15040 ,KEBNE ,16691424,Thu Nov 25 13:31:38 CET,Thu Nov 25 15:31:49 CET,0.0 0.737 1.094 1.367 1.58 1.76 1.917 2.071 2.349 2.481 2.612 2.729 2.947 3.052 3.233 3.418 3.602 3.692 3.843 3.973 4.191 4.345 4.49 4.693 4.887 5.072 5.229 5.372 5.577 5.777 5.963 6.193 6.42 6.651 6.921 7.2 7.456 7.72 8.014 8.358 8.691 9.012 9.411 9.803 10.222 10.712 11.237 11.8 12.473 13.117 13.539 13.566 13.318 12.93 12.564 12.174 11.808 11.487 11.183 10.836 10.523 10.256 10.003 9.742 9.498 9.293 9.061 8.855 8.67 8.462 8.261 8.081 7.888 7.689 7.518 7.329 7.147 6.967 6.765 6.637 6.51 6.305 6.149 5.977 5.897 5.735 5.557 5.361 5.259 5.051 4.922 4.807 4.702 4.45 4.283 4.109 3.929 3.72 3.488 3.146 1.511 -5 ,24695 ,KEBNE ,16691425,Thu Nov 25 13:32:39 CET,Thu Nov 25 15:32:27 CET,0.0 0.94 1.328 1.62 1.841 2.04 2.217 2.373 2.672 2.803 2.912 3.005 3.206 3.294 3.498 3.689 3.866 3.959 4.119 4.264 4.464 4.596 4.736 4.929 5.105 5.279 5.451 5.623 5.838 6.039 6.237 6.466 6.673 6.867 7.098 7.375 7.641 7.924 8.225 8.543 8.861 9.184 9.583 9.976 10.402 10.863 11.324 11.819 12.355 12.874 13.28 13.251 12.982 12.654 12.309 11.913 11.552 11.252 10.969 10.649 10.366 10.109 9.848 9.598 9.369 9.162 8.939 8.736 8.564 8.366 8.133 7.946 7.768 7.579 7.435 7.283 7.118 6.943 6.763 6.639 6.503 6.296 6.151 6.003 5.926 5.75 5.571 5.384 5.275 5.048 4.902 4.766 4.621 4.308 4.14 3.967 3.733 3.46 3.135 2.62 1.148 -6 ,7233 ,KEBNE ,16691426,Thu Nov 25 13:33:41 CET,Thu Nov 25 15:34:17 CET,0.0 1.066 1.335 1.517 1.688 1.84 1.977 2.116 2.376 2.497 2.596 2.674 2.87 2.954 3.113 3.286 3.452 3.53 3.684 3.825 4.027 4.156 4.282 4.451 4.617 4.782 4.928 5.063 5.256 5.452 5.628 5.835 6.049 6.249 6.451 6.665 6.885 7.137 7.388 7.664 7.966 8.3 8.697 9.094 9.498 9.924 10.385 10.795 11.232 11.721 12.079 12.035 11.776 11.387 11.012 10.678 10.333 9.979 9.675 9.386 9.143 8.876 8.601 8.365 8.125 7.881 7.615 7.396 7.228 7.045 6.858 6.702 6.514 6.315 6.169 6.015 5.846 5.671 5.508 5.404 5.288 5.097 4.957 4.812 4.74 4.576 4.395 4.211 4.116 3.917 3.84 3.751 3.653 3.383 3.224 3.062 2.88 2.669 2.37 2.02 1.12 -7 ,20787 ,KEBNE ,16691427,Thu Nov 25 13:33:41 CET,Thu Nov 25 15:34:07 CET,0.0 0.485 0.782 1.056 1.248 1.411 1.567 1.707 1.959 2.079 2.193 2.281 2.487 2.578 2.751 2.932 3.11 3.192 3.345 3.483 3.687 3.826 3.953 4.125 4.295 4.459 4.618 4.773 4.966 5.147 5.33 5.556 5.766 5.958 6.17 6.416 6.661 6.908 7.154 7.426 7.711 8.043 8.439 8.787 9.158 9.547 9.977 10.458 10.97 11.454 11.738 11.667 11.384 10.978 10.575 10.184 9.81 9.467 9.177 8.867 8.558 8.276 8.017 7.77 7.521 7.279 7.023 6.804 6.614 6.406 6.176 5.98 5.801 5.618 5.479 5.332 5.16 4.98 4.805 4.691 4.576 4.396 4.253 4.077 3.986 3.8 3.617 3.438 3.334 3.118 2.997 2.878 2.757 2.502 2.346 2.179 2.003 1.804 1.62 1.389 0.321 -8 ,9698 ,KEBNE ,16691428,Thu Nov 25 13:34:42 CET,Thu Nov 25 15:33:35 CET,0.0 0.602 0.881 1.133 1.363 1.532 1.679 1.832 2.085 2.213 2.35 2.469 2.667 2.753 2.925 3.097 3.249 3.325 3.481 3.623 3.842 3.979 4.1 4.294 4.491 4.668 4.829 4.983 5.188 5.369 5.544 5.758 5.955 6.159 6.406 6.667 6.898 7.153 7.417 7.679 7.94 8.251 8.643 9.021 9.444 9.903 10.432 11.016 11.608 12.211 12.738 12.8 12.594 12.311 12.007 11.669 11.326 11.013 10.723 10.398 10.124 9.876 9.618 9.37 9.113 8.866 8.629 8.435 8.26 8.065 7.859 7.679 7.479 7.273 7.109 6.927 6.736 6.53 6.323 6.201 6.084 5.882 5.728 5.585 5.511 5.342 5.176 5.005 4.908 4.707 4.624 4.519 4.401 4.112 3.96 3.786 3.569 3.328 3.064 2.753 1.188 -9 ,1820 ,KEBNE ,16691429,Thu Nov 25 13:35:40 CET,Thu Nov 25 15:37:22 CET,0.0 0.566 1.029 1.321 1.54 1.742 1.913 2.066 2.376 2.5 2.616 2.751 2.974 3.073 3.273 3.474 3.643 3.727 3.89 4.035 4.231 4.354 4.477 4.658 4.821 4.993 5.175 5.344 5.544 5.728 5.909 6.127 6.346 6.57 6.822 7.076 7.31 7.555 7.824 8.123 8.433 8.776 9.148 9.539 10.004 10.468 10.937 11.426 11.94 12.48 12.947 13.0 12.791 12.479 12.157 11.818 11.462 11.121 10.808 10.471 10.188 9.938 9.688 9.418 9.166 8.953 8.723 8.503 8.324 8.129 7.91 7.739 7.563 7.385 7.243 7.086 6.924 6.764 6.59 6.46 6.316 6.099 5.956 5.805 5.719 5.522 5.345 5.171 5.075 4.87 4.77 4.649 4.519 4.244 4.083 3.907 3.74 3.552 3.29 2.988 2.219 -10 ,31817 ,KEBNE ,16691430,Thu Nov 25 13:37:42 CET,Thu Nov 25 15:40:20 CET,0.0 0.843 1.2 1.485 1.703 1.855 2.0 2.153 2.411 2.526 2.641 2.724 2.919 3.009 3.168 3.317 3.476 3.555 3.703 3.839 4.048 4.188 4.316 4.518 4.716 4.897 5.051 5.184 5.376 5.569 5.752 5.964 6.165 6.362 6.599 6.862 7.108 7.398 7.681 7.963 8.266 8.597 8.949 9.296 9.708 10.132 10.61 11.169 11.813 12.422 12.9 12.942 12.803 12.552 12.194 11.835 11.544 11.241 10.928 10.619 10.343 10.057 9.761 9.473 9.217 8.976 8.722 8.517 8.342 8.148 7.943 7.778 7.593 7.388 7.226 7.062 6.895 6.718 6.53 6.4 6.259 6.033 5.891 5.733 5.645 5.474 5.31 5.138 5.038 4.829 4.718 4.601 4.481 4.221 4.075 3.91 3.722 3.513 3.242 2.873 1.925 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1c_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1c_5.txt deleted file mode 100644 index 41177c96..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1c_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19897 ,KEBNE ,16691431,Thu Nov 25 13:38:43 CET,Thu Nov 25 15:42:27 CET,0.0 1.141 1.467 1.726 1.904 2.064 2.225 2.376 2.672 2.808 2.93 3.045 3.261 3.364 3.538 3.707 3.878 3.961 4.12 4.273 4.481 4.607 4.74 4.945 5.132 5.311 5.477 5.63 5.841 6.053 6.255 6.511 6.746 6.962 7.225 7.515 7.781 8.072 8.391 8.741 9.109 9.49 9.927 10.358 10.84 11.33 11.854 12.477 13.234 14.016 14.735 15.113 15.099 14.893 14.637 14.377 14.108 13.825 13.586 13.326 13.088 12.866 12.615 12.368 12.142 11.939 11.735 11.542 11.354 11.161 10.97 10.793 10.602 10.407 10.254 10.092 9.92 9.732 9.54 9.404 9.245 8.996 8.841 8.683 8.597 8.392 8.17 7.975 7.878 7.669 7.545 7.419 7.27 6.924 6.737 6.51 6.196 5.818 5.38 4.813 3.566 -2 ,25325 ,KEBNE ,16691432,Thu Nov 25 13:38:43 CET,Thu Nov 25 15:42:08 CET,0.0 1.172 1.539 1.845 2.127 2.331 2.494 2.641 2.925 3.054 3.173 3.293 3.509 3.603 3.792 3.988 4.173 4.258 4.426 4.578 4.791 4.929 5.057 5.243 5.425 5.615 5.802 5.966 6.176 6.377 6.574 6.805 7.024 7.241 7.503 7.805 8.082 8.402 8.73 9.048 9.377 9.747 10.178 10.589 11.051 11.539 12.07 12.644 13.285 13.984 14.665 14.985 14.978 14.814 14.575 14.264 13.944 13.632 13.356 13.089 12.845 12.612 12.381 12.155 11.918 11.679 11.413 11.198 11.026 10.835 10.631 10.452 10.263 10.062 9.893 9.716 9.557 9.396 9.227 9.103 8.971 8.773 8.611 8.426 8.331 8.148 7.972 7.79 7.672 7.445 7.316 7.177 7.03 6.737 6.589 6.433 6.275 6.083 5.804 5.335 3.349 -3 ,12656 ,KEBNE ,16691433,Thu Nov 25 13:39:49 CET,Thu Nov 25 15:40:48 CET,0.0 1.295 1.673 1.975 2.193 2.378 2.557 2.713 2.963 3.088 3.208 3.315 3.525 3.627 3.823 3.997 4.162 4.241 4.397 4.554 4.784 4.94 5.097 5.304 5.495 5.674 5.85 6.021 6.229 6.438 6.636 6.865 7.108 7.337 7.591 7.863 8.106 8.394 8.698 8.997 9.332 9.719 10.184 10.623 11.082 11.608 12.184 12.808 13.488 14.189 14.84 15.118 15.107 14.921 14.657 14.385 14.142 13.897 13.657 13.406 13.159 12.914 12.659 12.392 12.147 11.946 11.731 11.534 11.36 11.161 10.969 10.817 10.632 10.443 10.297 10.137 9.971 9.803 9.637 9.521 9.393 9.182 9.041 8.893 8.81 8.633 8.448 8.245 8.129 7.904 7.763 7.63 7.496 7.181 7.009 6.838 6.662 6.466 6.194 5.779 4.388 -4 ,6971 ,KEBNE ,16691434,Thu Nov 25 13:40:46 CET,Thu Nov 25 15:42:44 CET,0.0 0.969 1.266 1.513 1.742 1.957 2.143 2.319 2.642 2.77 2.883 2.966 3.186 3.292 3.495 3.702 3.891 3.973 4.133 4.277 4.499 4.644 4.778 4.988 5.178 5.359 5.55 5.734 5.971 6.185 6.388 6.633 6.86 7.074 7.335 7.64 7.923 8.244 8.57 8.878 9.221 9.62 10.061 10.517 11.055 11.621 12.229 12.863 13.553 14.316 15.047 15.372 15.311 15.119 14.885 14.623 14.383 14.136 13.893 13.625 13.379 13.144 12.916 12.708 12.511 12.324 12.127 11.944 11.784 11.619 11.427 11.26 11.088 10.912 10.783 10.642 10.487 10.314 10.132 10.007 9.871 9.641 9.487 9.347 9.271 9.094 8.918 8.738 8.644 8.424 8.29 8.166 8.023 7.737 7.585 7.419 7.217 6.996 6.76 6.358 4.579 -5 ,2189 ,KEBNE ,16691435,Thu Nov 25 13:40:46 CET,Thu Nov 25 15:42:42 CET,0.0 1.06 1.344 1.558 1.741 1.923 2.076 2.217 2.494 2.614 2.724 2.823 3.036 3.125 3.29 3.444 3.604 3.681 3.824 3.959 4.149 4.278 4.4 4.593 4.777 4.945 5.107 5.267 5.474 5.671 5.867 6.11 6.337 6.549 6.797 7.061 7.299 7.575 7.875 8.17 8.469 8.816 9.241 9.676 10.156 10.662 11.238 11.85 12.506 13.216 13.852 14.121 14.086 13.882 13.638 13.375 13.063 12.732 12.459 12.17 11.914 11.689 11.46 11.221 10.984 10.77 10.533 10.288 10.054 9.82 9.596 9.403 9.202 8.988 8.817 8.649 8.475 8.291 8.103 7.98 7.837 7.6 7.439 7.269 7.176 6.977 6.749 6.494 6.37 6.133 5.961 5.822 5.676 5.327 5.137 4.949 4.717 4.382 4.028 3.599 1.885 -6 ,30312 ,KEBNE ,16691436,Thu Nov 25 13:40:46 CET,Thu Nov 25 15:42:39 CET,0.0 1.05 1.359 1.592 1.797 1.989 2.161 2.309 2.572 2.683 2.804 2.952 3.171 3.272 3.454 3.613 3.772 3.848 3.991 4.129 4.33 4.458 4.589 4.775 4.96 5.142 5.308 5.473 5.688 5.895 6.079 6.287 6.507 6.725 6.967 7.234 7.48 7.746 8.054 8.366 8.657 8.984 9.382 9.777 10.221 10.708 11.253 11.853 12.523 13.209 13.848 14.082 13.986 13.789 13.558 13.288 13.015 12.716 12.449 12.186 11.906 11.635 11.387 11.144 10.912 10.701 10.482 10.275 10.088 9.885 9.683 9.53 9.357 9.166 9.012 8.856 8.694 8.51 8.307 8.159 8.011 7.803 7.657 7.482 7.391 7.211 7.033 6.845 6.735 6.516 6.375 6.25 6.118 5.815 5.634 5.421 5.217 4.981 4.678 4.3 2.916 -7 ,23276 ,KEBNE ,16691437,Thu Nov 25 13:40:46 CET,Thu Nov 25 15:43:12 CET,0.0 1.328 1.652 1.912 2.125 2.292 2.446 2.591 2.872 3.02 3.148 3.247 3.455 3.547 3.74 3.921 4.094 4.183 4.362 4.527 4.735 4.858 4.975 5.157 5.343 5.524 5.697 5.865 6.08 6.28 6.481 6.756 7.025 7.263 7.51 7.774 8.039 8.318 8.6 8.896 9.218 9.593 9.997 10.396 10.876 11.423 12.044 12.683 13.347 14.032 14.717 14.98 14.898 14.691 14.466 14.241 13.991 13.728 13.478 13.176 12.871 12.595 12.359 12.134 11.925 11.743 11.536 11.327 11.13 10.949 10.76 10.594 10.412 10.208 10.066 9.933 9.792 9.62 9.438 9.319 9.178 8.944 8.806 8.655 8.565 8.397 8.229 8.055 7.964 7.766 7.671 7.554 7.426 7.162 7.006 6.794 6.59 6.378 6.093 5.697 4.256 -8 ,16386 ,KEBNE ,16691438,Thu Nov 25 13:40:46 CET,Thu Nov 25 15:42:40 CET,0.0 0.694 1.053 1.385 1.639 1.828 2.018 2.185 2.496 2.64 2.763 2.856 3.077 3.198 3.399 3.586 3.766 3.843 4.007 4.169 4.388 4.542 4.684 4.872 5.055 5.244 5.429 5.59 5.809 6.024 6.217 6.454 6.678 6.895 7.15 7.422 7.701 8.018 8.328 8.627 8.947 9.309 9.736 10.152 10.6 11.09 11.613 12.192 12.82 13.462 14.045 14.24 14.179 13.928 13.651 13.367 13.1 12.855 12.596 12.295 12.019 11.778 11.549 11.336 11.133 10.92 10.695 10.504 10.326 10.12 9.894 9.702 9.484 9.264 9.099 8.92 8.73 8.541 8.363 8.242 8.103 7.852 7.68 7.504 7.407 7.222 7.048 6.86 6.757 6.537 6.378 6.245 6.117 5.854 5.714 5.53 5.321 5.08 4.793 4.492 3.423 -9 ,2526 ,KEBNE ,16691439,Thu Nov 25 13:40:46 CET,Thu Nov 25 15:43:12 CET,0.0 0.965 1.268 1.477 1.671 1.82 1.961 2.094 2.317 2.42 2.546 2.693 2.903 3.014 3.23 3.406 3.579 3.664 3.812 3.967 4.194 4.344 4.487 4.677 4.86 5.037 5.216 5.389 5.611 5.822 6.023 6.256 6.485 6.703 6.944 7.224 7.503 7.812 8.123 8.436 8.765 9.132 9.538 9.955 10.457 10.956 11.517 12.154 12.812 13.46 14.082 14.388 14.322 14.134 13.893 13.573 13.248 12.922 12.628 12.337 12.065 11.824 11.564 11.303 11.072 10.857 10.598 10.351 10.159 9.967 9.751 9.568 9.381 9.17 9.01 8.857 8.695 8.516 8.327 8.194 8.052 7.83 7.682 7.528 7.453 7.299 7.129 6.928 6.814 6.595 6.452 6.33 6.21 5.979 5.821 5.625 5.447 5.223 4.945 4.663 3.784 -10 ,23069 ,KEBNE ,16691440,Thu Nov 25 13:41:48 CET,Thu Nov 25 15:44:42 CET,0.0 1.016 1.452 1.729 1.911 2.071 2.241 2.394 2.653 2.778 2.892 3.009 3.242 3.36 3.575 3.777 3.957 4.036 4.199 4.369 4.591 4.724 4.86 5.075 5.283 5.477 5.657 5.819 6.023 6.221 6.418 6.68 6.912 7.104 7.337 7.597 7.849 8.138 8.453 8.794 9.153 9.552 9.992 10.4 10.877 11.425 12.026 12.669 13.354 14.042 14.58 14.708 14.567 14.214 13.831 13.453 13.084 12.726 12.386 12.052 11.767 11.497 11.228 10.979 10.742 10.513 10.268 10.045 9.851 9.659 9.463 9.291 9.092 8.863 8.667 8.468 8.267 8.044 7.82 7.672 7.511 7.25 7.069 6.884 6.784 6.564 6.351 6.132 6.016 5.796 5.658 5.527 5.389 5.033 4.839 4.643 4.427 4.191 3.895 3.497 1.471 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1d_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1d_5.txt deleted file mode 100644 index c92174e3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_1d_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19969 ,KEBNE ,16691441,Thu Nov 25 13:41:48 CET,Thu Nov 25 15:44:15 CET,0.0 0.807 1.135 1.399 1.64 1.85 2.036 2.199 2.469 2.593 2.71 2.815 3.025 3.124 3.322 3.512 3.68 3.765 3.932 4.085 4.312 4.469 4.622 4.835 5.038 5.23 5.412 5.592 5.811 6.024 6.227 6.438 6.647 6.874 7.147 7.434 7.693 7.973 8.259 8.578 8.947 9.362 9.822 10.263 10.752 11.261 11.864 12.502 13.176 13.943 14.615 14.827 14.688 14.46 14.195 13.847 13.441 13.039 12.713 12.386 12.074 11.763 11.464 11.18 10.91 10.67 10.434 10.208 9.997 9.78 9.572 9.41 9.214 9.004 8.862 8.723 8.564 8.381 8.198 8.079 7.952 7.742 7.598 7.45 7.367 7.201 6.997 6.766 6.654 6.446 6.323 6.19 6.052 5.781 5.641 5.463 5.256 5.041 4.786 4.401 2.933 -2 ,5804 ,KEBNE ,16691442,Thu Nov 25 13:41:52 CET,Thu Nov 25 15:44:16 CET,0.0 1.188 1.571 1.803 1.989 2.157 2.316 2.482 2.799 2.929 3.04 3.129 3.347 3.442 3.617 3.788 3.965 4.057 4.216 4.352 4.553 4.693 4.831 5.011 5.178 5.358 5.538 5.704 5.922 6.141 6.344 6.589 6.827 7.047 7.306 7.587 7.849 8.13 8.415 8.729 9.06 9.415 9.834 10.301 10.843 11.388 11.995 12.638 13.343 14.069 14.689 14.849 14.679 14.381 14.082 13.808 13.544 13.257 12.949 12.62 12.336 12.078 11.816 11.557 11.297 11.044 10.802 10.58 10.38 10.187 9.985 9.79 9.583 9.382 9.216 9.038 8.86 8.694 8.52 8.377 8.21 7.967 7.801 7.625 7.529 7.31 7.098 6.878 6.77 6.552 6.435 6.303 6.132 5.785 5.599 5.368 5.117 4.885 4.597 4.074 2.228 -3 ,4680 ,KEBNE ,16691443,Thu Nov 25 13:41:47 CET,Thu Nov 25 15:43:26 CET,0.0 0.705 0.961 1.167 1.353 1.534 1.683 1.816 2.11 2.237 2.341 2.424 2.626 2.719 2.9 3.081 3.265 3.351 3.504 3.649 3.852 3.983 4.113 4.294 4.458 4.619 4.791 4.952 5.154 5.358 5.559 5.793 6.026 6.269 6.528 6.806 7.082 7.365 7.67 8.008 8.376 8.791 9.241 9.663 10.123 10.644 11.239 11.889 12.654 13.466 14.27 14.599 14.573 14.427 14.229 13.966 13.669 13.378 13.086 12.775 12.512 12.232 11.939 11.653 11.369 11.129 10.877 10.665 10.486 10.272 10.036 9.848 9.667 9.481 9.332 9.177 9.016 8.842 8.658 8.515 8.339 8.052 7.853 7.647 7.548 7.342 7.102 6.86 6.747 6.526 6.387 6.258 6.114 5.797 5.641 5.476 5.274 5.044 4.717 4.269 2.365 -4 ,8072 ,KEBNE ,16691444,Thu Nov 25 13:41:48 CET,Thu Nov 25 15:44:20 CET,0.0 1.042 1.374 1.639 1.854 2.052 2.24 2.391 2.667 2.807 2.943 3.083 3.307 3.4 3.598 3.799 3.985 4.069 4.236 4.402 4.626 4.755 4.882 5.08 5.273 5.468 5.664 5.848 6.08 6.308 6.513 6.735 6.953 7.182 7.455 7.742 8.011 8.29 8.593 8.923 9.263 9.671 10.118 10.53 11.016 11.551 12.152 12.798 13.509 14.196 14.83 15.071 14.951 14.72 14.455 14.194 13.908 13.572 13.247 12.923 12.642 12.357 12.064 11.739 11.432 11.185 10.922 10.703 10.515 10.295 10.069 9.867 9.648 9.436 9.258 9.058 8.862 8.68 8.472 8.319 8.178 7.948 7.779 7.618 7.526 7.319 7.117 6.883 6.748 6.513 6.346 6.191 6.023 5.719 5.547 5.332 5.129 4.884 4.571 4.167 3.101 -5 ,12891 ,KEBNE ,16691445,Thu Nov 25 13:41:48 CET,Thu Nov 25 15:44:40 CET,0.0 0.936 1.241 1.473 1.698 1.907 2.098 2.268 2.58 2.723 2.846 2.945 3.174 3.292 3.488 3.658 3.838 3.932 4.124 4.313 4.55 4.688 4.828 5.019 5.217 5.412 5.59 5.773 5.983 6.18 6.37 6.598 6.834 7.059 7.325 7.622 7.899 8.19 8.511 8.848 9.194 9.605 10.091 10.574 11.111 11.674 12.303 13.02 13.828 14.637 15.302 15.475 15.419 15.211 14.882 14.514 14.175 13.83 13.494 13.099 12.71 12.378 12.071 11.754 11.456 11.188 10.887 10.601 10.337 10.076 9.813 9.592 9.362 9.1 8.894 8.707 8.511 8.287 8.055 7.896 7.723 7.429 7.231 7.039 6.943 6.747 6.535 6.282 6.152 5.919 5.747 5.585 5.431 5.133 4.956 4.75 4.497 4.213 3.881 3.427 1.333 -6 ,11260 ,KEBNE ,16691446,Thu Nov 25 13:41:48 CET,Thu Nov 25 15:44:09 CET,0.0 1.191 1.525 1.777 1.993 2.175 2.363 2.525 2.782 2.895 3.002 3.114 3.338 3.429 3.608 3.783 3.948 4.027 4.192 4.359 4.583 4.715 4.842 5.03 5.194 5.351 5.518 5.678 5.887 6.09 6.29 6.55 6.794 7.018 7.267 7.554 7.842 8.142 8.44 8.787 9.162 9.541 9.967 10.391 10.885 11.471 12.173 12.895 13.693 14.605 15.499 16.036 16.128 15.969 15.759 15.533 15.276 14.962 14.655 14.376 14.12 13.858 13.58 13.306 13.071 12.862 12.63 12.397 12.189 11.969 11.732 11.537 11.336 11.105 10.934 10.775 10.589 10.389 10.187 10.043 9.902 9.69 9.532 9.361 9.284 9.129 8.952 8.759 8.656 8.444 8.335 8.218 8.084 7.775 7.618 7.47 7.267 7.024 6.752 6.358 4.87 -7 ,26711 ,KEBNE ,16691447,Thu Nov 25 13:41:48 CET,Thu Nov 25 15:43:53 CET,0.0 0.869 1.133 1.336 1.586 1.805 1.953 2.093 2.364 2.496 2.624 2.742 2.964 3.067 3.25 3.417 3.578 3.655 3.815 3.974 4.194 4.327 4.455 4.65 4.843 5.032 5.214 5.385 5.6 5.82 6.024 6.251 6.467 6.687 6.956 7.249 7.519 7.833 8.154 8.477 8.821 9.207 9.644 10.067 10.548 11.107 11.783 12.522 13.297 14.096 14.999 15.508 15.565 15.398 15.191 14.98 14.729 14.457 14.196 13.886 13.584 13.292 12.987 12.703 12.437 12.188 11.916 11.655 11.432 11.215 10.998 10.808 10.598 10.387 10.217 10.031 9.838 9.633 9.423 9.275 9.115 8.853 8.676 8.496 8.404 8.213 8.022 7.831 7.722 7.508 7.394 7.26 7.11 6.797 6.631 6.434 6.162 5.88 5.574 5.146 3.617 -8 ,8223 ,KEBNE ,16691448,Thu Nov 25 13:41:48 CET,Thu Nov 25 15:44:26 CET,0.0 0.974 1.469 1.781 1.991 2.179 2.355 2.52 2.809 2.946 3.088 3.24 3.464 3.567 3.762 3.956 4.125 4.205 4.361 4.499 4.715 4.847 4.966 5.148 5.328 5.518 5.711 5.883 6.091 6.29 6.477 6.708 6.929 7.151 7.401 7.664 7.929 8.22 8.558 8.909 9.269 9.658 10.085 10.527 11.016 11.518 12.113 12.768 13.447 14.14 14.793 15.079 15.014 14.753 14.451 14.116 13.761 13.426 13.126 12.809 12.528 12.277 12.004 11.741 11.499 11.261 11.014 10.795 10.61 10.41 10.184 9.98 9.756 9.518 9.333 9.148 8.972 8.759 8.541 8.418 8.28 8.026 7.837 7.646 7.537 7.317 7.123 6.906 6.787 6.572 6.416 6.278 6.142 5.774 5.575 5.348 5.099 4.83 4.518 4.141 0.363 -9 ,2465 ,KEBNE ,16691449,Thu Nov 25 13:42:49 CET,Thu Nov 25 15:45:01 CET,0.0 0.796 1.131 1.371 1.573 1.734 1.854 1.99 2.258 2.392 2.527 2.633 2.837 2.932 3.128 3.296 3.445 3.523 3.675 3.84 4.083 4.227 4.362 4.55 4.741 4.927 5.115 5.293 5.511 5.725 5.933 6.191 6.441 6.681 6.961 7.26 7.529 7.836 8.172 8.526 8.9 9.318 9.817 10.3 10.828 11.424 12.118 12.87 13.687 14.483 15.261 15.671 15.717 15.56 15.262 14.902 14.545 14.199 13.863 13.475 13.123 12.823 12.531 12.246 11.964 11.704 11.441 11.203 10.995 10.772 10.548 10.368 10.18 9.988 9.834 9.657 9.467 9.277 9.089 8.96 8.819 8.572 8.385 8.186 8.083 7.887 7.69 7.474 7.359 7.136 6.997 6.858 6.71 6.407 6.208 5.977 5.748 5.482 5.215 4.899 2.949 -10 ,15259 ,KEBNE ,16691450,Thu Nov 25 13:42:49 CET,Thu Nov 25 15:45:36 CET,0.0 0.714 1.047 1.322 1.55 1.723 1.889 2.045 2.302 2.428 2.548 2.677 2.897 2.992 3.186 3.378 3.555 3.642 3.803 3.952 4.171 4.311 4.434 4.618 4.804 4.983 5.155 5.321 5.549 5.771 5.978 6.215 6.445 6.687 6.983 7.29 7.556 7.854 8.195 8.566 8.929 9.312 9.753 10.198 10.702 11.254 11.851 12.448 13.148 13.949 14.642 14.939 14.998 14.882 14.669 14.411 14.13 13.834 13.552 13.223 12.914 12.622 12.329 12.062 11.826 11.611 11.37 11.12 10.892 10.669 10.436 10.233 10.018 9.782 9.595 9.421 9.216 8.976 8.719 8.561 8.417 8.168 7.995 7.809 7.712 7.534 7.334 7.1 6.98 6.757 6.612 6.474 6.314 5.973 5.81 5.624 5.417 5.173 4.901 4.549 3.068 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_3a_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_3a_5.txt deleted file mode 100644 index 25423698..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_3a_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17271 ,KEBNE ,16691451,Thu Nov 25 13:42:50 CET,Thu Nov 25 15:47:14 CET,0.0 0.503 0.826 1.019 1.156 1.33 1.482 1.61 1.847 1.949 2.068 2.179 2.404 2.503 2.718 2.921 3.096 3.176 3.324 3.487 3.726 3.88 4.031 4.238 4.424 4.615 4.804 4.974 5.188 5.392 5.586 5.824 6.07 6.319 6.581 6.855 7.124 7.419 7.726 8.049 8.404 8.789 9.262 9.762 10.318 10.922 11.591 12.357 13.214 14.105 15.034 15.585 15.697 15.614 15.472 15.269 15.039 14.782 14.527 14.25 13.998 13.776 13.554 13.338 13.116 12.907 12.68 12.455 12.253 12.047 11.828 11.647 11.448 11.219 11.045 10.861 10.673 10.5 10.31 10.162 10.011 9.761 9.597 9.428 9.336 9.148 8.956 8.755 8.649 8.432 8.306 8.178 8.025 7.686 7.514 7.315 7.09 6.827 6.512 6.161 5.416 -2 ,28968 ,KEBNE ,16691452,Thu Nov 25 13:42:53 CET,Thu Nov 25 15:45:07 CET,0.0 0.914 1.176 1.358 1.538 1.715 1.884 2.016 2.239 2.343 2.448 2.573 2.796 2.894 3.073 3.252 3.421 3.497 3.647 3.797 4.008 4.153 4.302 4.5 4.69 4.879 5.052 5.216 5.436 5.654 5.865 6.119 6.343 6.546 6.806 7.108 7.379 7.673 7.995 8.309 8.625 9.031 9.549 10.042 10.566 11.122 11.724 12.399 13.204 14.166 15.193 15.805 16.041 16.097 15.993 15.837 15.654 15.467 15.298 15.073 14.889 14.732 14.547 14.357 14.179 13.995 13.786 13.595 13.437 13.273 13.102 12.943 12.763 12.603 12.482 12.337 12.187 12.041 11.872 11.752 11.616 11.392 11.245 11.091 11.022 10.876 10.696 10.507 10.412 10.213 10.113 10.0 9.877 9.578 9.414 9.253 9.098 8.916 8.697 8.413 7.572 -3 ,20168 ,KEBNE ,16691453,Thu Nov 25 13:43:51 CET,Thu Nov 25 15:46:41 CET,0.0 0.544 0.759 0.992 1.184 1.324 1.471 1.605 1.844 1.959 2.072 2.159 2.358 2.446 2.619 2.79 2.954 3.03 3.176 3.311 3.504 3.626 3.743 3.91 4.077 4.246 4.415 4.583 4.794 4.997 5.195 5.44 5.683 5.902 6.139 6.403 6.664 6.944 7.244 7.595 7.945 8.317 8.774 9.214 9.703 10.256 10.897 11.607 12.434 13.361 14.338 14.893 14.988 14.893 14.736 14.521 14.254 13.992 13.772 13.536 13.286 13.045 12.81 12.555 12.296 12.052 11.799 11.586 11.421 11.228 11.004 10.832 10.656 10.482 10.352 10.2 10.035 9.87 9.685 9.564 9.448 9.255 9.115 8.966 8.888 8.712 8.536 8.364 8.26 8.049 7.957 7.844 7.717 7.432 7.263 7.093 6.899 6.673 6.386 5.986 4.905 -4 ,30680 ,KEBNE ,16691454,Thu Nov 25 13:43:51 CET,Thu Nov 25 15:46:49 CET,0.0 0.409 0.711 0.955 1.129 1.268 1.412 1.554 1.824 1.949 2.073 2.17 2.378 2.463 2.622 2.784 2.941 3.014 3.146 3.289 3.527 3.685 3.824 4.015 4.201 4.373 4.542 4.699 4.899 5.099 5.293 5.527 5.76 5.978 6.228 6.525 6.792 7.075 7.393 7.72 8.05 8.426 8.867 9.318 9.852 10.428 11.087 11.79 12.591 13.495 14.428 14.984 15.091 15.064 14.97 14.808 14.609 14.383 14.174 13.926 13.677 13.455 13.245 13.046 12.844 12.642 12.428 12.233 12.052 11.87 11.688 11.526 11.354 11.186 11.044 10.878 10.719 10.57 10.413 10.29 10.155 9.949 9.804 9.636 9.552 9.378 9.175 8.985 8.9 8.702 8.569 8.445 8.319 8.038 7.885 7.698 7.483 7.266 6.975 6.597 5.736 -5 ,20446 ,KEBNE ,16691455,Thu Nov 25 13:43:51 CET,Thu Nov 25 15:46:03 CET,0.0 0.724 0.974 1.181 1.369 1.543 1.671 1.804 2.098 2.22 2.332 2.443 2.671 2.773 2.953 3.117 3.259 3.337 3.511 3.669 3.872 4.01 4.146 4.352 4.55 4.725 4.893 5.056 5.266 5.478 5.688 5.927 6.148 6.36 6.608 6.877 7.123 7.416 7.757 8.114 8.475 8.846 9.293 9.792 10.359 10.95 11.612 12.326 13.147 14.088 15.022 15.513 15.599 15.476 15.288 15.058 14.793 14.542 14.309 14.063 13.843 13.615 13.379 13.153 12.93 12.714 12.462 12.231 12.006 11.783 11.565 11.354 11.134 10.901 10.724 10.556 10.388 10.204 9.999 9.856 9.704 9.479 9.333 9.172 9.069 8.848 8.646 8.433 8.315 8.088 7.991 7.878 7.711 7.334 7.155 6.952 6.735 6.509 6.201 5.743 4.243 -6 ,15070 ,KEBNE ,16691456,Thu Nov 25 13:44:53 CET,Thu Nov 25 15:47:18 CET,0.0 0.482 0.7 0.899 1.081 1.255 1.426 1.564 1.796 1.928 2.066 2.174 2.382 2.475 2.643 2.8 2.953 3.035 3.197 3.335 3.535 3.675 3.805 3.989 4.166 4.338 4.503 4.653 4.853 5.044 5.225 5.454 5.678 5.898 6.168 6.465 6.739 7.042 7.354 7.689 8.047 8.423 8.86 9.324 9.86 10.441 11.106 11.834 12.622 13.42 14.21 14.731 14.927 14.91 14.779 14.637 14.429 14.139 13.867 13.594 13.367 13.156 12.932 12.712 12.521 12.344 12.116 11.919 11.747 11.544 11.329 11.153 10.98 10.791 10.645 10.488 10.313 10.14 9.942 9.793 9.653 9.464 9.335 9.2 9.123 8.946 8.791 8.627 8.521 8.307 8.182 8.057 7.935 7.685 7.532 7.357 7.141 6.901 6.684 6.404 5.426 -7 ,32266 ,KEBNE ,16691457,Thu Nov 25 13:44:52 CET,Thu Nov 25 15:47:06 CET,0.0 0.526 0.748 0.931 1.103 1.273 1.426 1.553 1.828 1.961 2.081 2.198 2.41 2.5 2.689 2.865 3.022 3.096 3.252 3.401 3.62 3.765 3.898 4.083 4.264 4.441 4.612 4.78 4.994 5.196 5.382 5.597 5.805 6.015 6.268 6.554 6.824 7.118 7.443 7.776 8.105 8.473 8.904 9.339 9.843 10.394 11.049 11.807 12.604 13.392 14.2 14.654 14.75 14.72 14.634 14.453 14.227 14.007 13.767 13.498 13.266 13.045 12.83 12.61 12.403 12.206 11.979 11.783 11.612 11.428 11.244 11.097 10.921 10.737 10.6 10.449 10.286 10.1 9.889 9.744 9.616 9.442 9.314 9.167 9.085 8.896 8.687 8.488 8.388 8.171 8.04 7.919 7.792 7.514 7.366 7.206 6.997 6.741 6.424 5.992 4.91 -8 ,29971 ,KEBNE ,16691458,Thu Nov 25 13:44:52 CET,Thu Nov 25 15:48:13 CET,0.0 0.345 0.55 0.724 0.875 1.007 1.143 1.261 1.482 1.601 1.711 1.797 2.01 2.098 2.27 2.44 2.599 2.685 2.854 2.992 3.171 3.299 3.435 3.64 3.848 4.034 4.203 4.358 4.573 4.794 4.988 5.211 5.422 5.629 5.87 6.148 6.437 6.751 7.066 7.39 7.732 8.118 8.559 9.011 9.53 10.08 10.703 11.41 12.179 12.913 13.682 14.248 14.417 14.319 14.149 13.966 13.739 13.494 13.24 12.951 12.702 12.461 12.235 12.039 11.831 11.636 11.433 11.236 11.047 10.859 10.674 10.504 10.324 10.16 10.033 9.89 9.739 9.578 9.416 9.31 9.195 8.999 8.856 8.706 8.632 8.464 8.277 8.092 7.993 7.787 7.662 7.531 7.395 7.117 6.968 6.795 6.568 6.316 5.987 5.54 4.435 -9 ,19348 ,KEBNE ,16691459,Thu Nov 25 13:45:54 CET,Thu Nov 25 15:49:04 CET,0.0 0.657 0.93 1.163 1.37 1.548 1.711 1.876 2.158 2.281 2.374 2.46 2.682 2.774 2.947 3.118 3.307 3.392 3.541 3.694 3.904 4.037 4.17 4.371 4.554 4.729 4.896 5.057 5.274 5.473 5.66 5.9 6.137 6.365 6.628 6.929 7.201 7.485 7.797 8.141 8.512 8.911 9.367 9.832 10.403 11.008 11.671 12.396 13.154 13.981 14.892 15.48 15.636 15.6 15.459 15.279 15.093 14.865 14.642 14.43 14.208 14.004 13.797 13.577 13.378 13.189 12.979 12.801 12.651 12.47 12.263 12.082 11.9 11.723 11.573 11.407 11.245 11.064 10.867 10.74 10.602 10.391 10.242 10.088 10.012 9.823 9.626 9.415 9.281 9.054 8.922 8.783 8.646 8.363 8.183 7.993 7.793 7.557 7.3 6.947 5.784 -10 ,13699 ,KEBNE ,16691460,Thu Nov 25 13:45:54 CET,Thu Nov 25 15:47:38 CET,0.0 0.815 1.066 1.261 1.449 1.64 1.831 1.987 2.255 2.371 2.486 2.571 2.772 2.859 3.02 3.177 3.339 3.42 3.578 3.735 3.955 4.097 4.235 4.43 4.605 4.773 4.935 5.086 5.287 5.478 5.658 5.884 6.104 6.317 6.576 6.875 7.155 7.444 7.746 8.078 8.431 8.812 9.26 9.706 10.192 10.753 11.429 12.168 12.957 13.819 14.746 15.222 15.282 15.16 15.02 14.856 14.664 14.453 14.242 13.988 13.716 13.473 13.268 13.065 12.847 12.649 12.438 12.238 12.077 11.914 11.743 11.587 11.41 11.235 11.098 10.943 10.777 10.588 10.4 10.279 10.144 9.941 9.796 9.635 9.554 9.397 9.226 9.013 8.902 8.692 8.591 8.499 8.397 8.135 7.994 7.822 7.618 7.405 7.163 6.874 6.035 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt deleted file mode 100644 index 3b7f663e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13620 ,KEBNE ,16691461,Thu Nov 25 13:46:56 CET,Thu Nov 25 15:55:04 CET,0.0 0.762 1.077 1.284 1.473 1.635 1.776 1.901 2.102 2.191 2.278 2.358 2.551 2.637 2.796 2.941 3.068 3.123 3.235 3.352 3.532 3.656 3.773 3.923 4.062 4.199 4.339 4.469 4.624 4.767 4.911 5.098 5.252 5.395 5.58 5.776 5.958 6.149 6.347 6.568 6.777 6.981 7.227 7.472 7.718 7.971 8.226 8.407 8.526 8.488 8.079 7.332 6.551 5.841 5.189 4.562 3.987 3.469 3.04 2.603 2.182 1.808 1.477 1.161 0.863 0.573 0.263 -0.006 -0.236 -0.494 -0.783 -1.009 -1.229 -1.457 -1.64 -1.842 -2.056 -2.289 -2.545 -2.713 -2.869 -3.121 -3.298 -3.493 -3.593 -3.781 -3.986 -4.199 -4.315 -4.558 -4.679 -4.81 -4.972 -5.333 -5.515 -5.719 -5.958 -6.214 -6.56 -7.008 -8.212 -2 ,237 ,KEBNE ,16691462,Thu Nov 25 13:45:54 CET,Thu Nov 25 15:53:16 CET,0.0 0.783 1.106 1.294 1.451 1.598 1.73 1.838 2.051 2.161 2.265 2.349 2.541 2.626 2.774 2.917 3.072 3.144 3.258 3.377 3.583 3.707 3.808 3.952 4.104 4.253 4.387 4.502 4.651 4.796 4.926 5.078 5.22 5.37 5.546 5.739 5.915 6.119 6.332 6.538 6.753 6.968 7.231 7.479 7.728 7.985 8.199 8.359 8.508 8.541 8.186 7.483 6.838 6.177 5.518 4.924 4.376 3.831 3.355 2.858 2.405 2.012 1.663 1.321 0.982 0.688 0.403 0.113 -0.173 -0.465 -0.74 -0.975 -1.238 -1.494 -1.681 -1.886 -2.112 -2.344 -2.58 -2.734 -2.887 -3.148 -3.346 -3.556 -3.656 -3.852 -4.063 -4.284 -4.411 -4.659 -4.805 -4.949 -5.102 -5.412 -5.586 -5.772 -5.957 -6.198 -6.516 -6.932 -8.051 -3 ,24665 ,KEBNE ,16691463,Thu Nov 25 13:45:54 CET,Thu Nov 25 15:54:01 CET,0.0 0.849 1.117 1.337 1.516 1.685 1.838 1.974 2.218 2.327 2.429 2.511 2.704 2.792 2.944 3.085 3.232 3.309 3.456 3.579 3.744 3.854 3.963 4.117 4.277 4.435 4.578 4.712 4.857 4.98 5.105 5.267 5.419 5.557 5.736 5.946 6.139 6.361 6.588 6.802 7.006 7.239 7.509 7.73 7.965 8.217 8.478 8.711 8.852 8.837 8.507 7.689 6.876 6.157 5.49 4.873 4.274 3.72 3.252 2.761 2.32 1.932 1.576 1.224 0.88 0.569 0.229 -0.088 -0.346 -0.607 -0.877 -1.099 -1.346 -1.613 -1.815 -2.031 -2.262 -2.496 -2.732 -2.895 -3.071 -3.341 -3.531 -3.728 -3.824 -4.022 -4.236 -4.452 -4.562 -4.796 -4.945 -5.099 -5.257 -5.588 -5.786 -6.007 -6.265 -6.569 -6.879 -7.306 -8.528 -4 ,20054 ,KEBNE ,16691464,Thu Nov 25 13:45:55 CET,Thu Nov 25 15:54:19 CET,0.0 0.655 0.876 1.056 1.219 1.354 1.485 1.612 1.819 1.925 2.03 2.085 2.272 2.358 2.511 2.655 2.786 2.846 2.971 3.102 3.291 3.4 3.496 3.649 3.8 3.938 4.082 4.227 4.401 4.551 4.7 4.884 5.049 5.207 5.392 5.578 5.751 5.953 6.177 6.408 6.61 6.819 7.069 7.285 7.497 7.711 7.892 8.077 8.255 8.285 7.996 7.365 6.627 5.957 5.324 4.681 4.107 3.583 3.14 2.69 2.295 1.942 1.591 1.245 0.906 0.587 0.245 -0.058 -0.331 -0.617 -0.892 -1.121 -1.36 -1.593 -1.783 -1.988 -2.195 -2.404 -2.623 -2.772 -2.927 -3.179 -3.363 -3.56 -3.662 -3.884 -4.117 -4.35 -4.478 -4.74 -4.911 -5.053 -5.213 -5.533 -5.704 -5.894 -6.098 -6.359 -6.659 -7.065 -8.064 -5 ,25746 ,KEBNE ,16691465,Thu Nov 25 13:45:54 CET,Thu Nov 25 15:54:17 CET,0.0 0.449 0.752 0.954 1.101 1.222 1.34 1.462 1.692 1.805 1.92 2.004 2.199 2.288 2.442 2.569 2.691 2.76 2.897 3.028 3.247 3.373 3.469 3.616 3.763 3.899 4.028 4.159 4.315 4.46 4.599 4.765 4.957 5.133 5.315 5.52 5.712 5.921 6.119 6.311 6.543 6.798 7.061 7.323 7.609 7.895 8.16 8.375 8.49 8.486 8.185 7.511 6.754 6.031 5.406 4.821 4.269 3.726 3.232 2.78 2.402 2.02 1.603 1.219 0.897 0.6 0.291 0.013 -0.235 -0.507 -0.767 -0.972 -1.207 -1.468 -1.664 -1.864 -2.066 -2.283 -2.509 -2.657 -2.828 -3.115 -3.316 -3.512 -3.606 -3.812 -4.049 -4.277 -4.392 -4.63 -4.769 -4.905 -5.057 -5.4 -5.559 -5.729 -5.966 -6.2 -6.469 -6.852 -8.056 -6 ,12850 ,KEBNE ,16691466,Thu Nov 25 13:45:54 CET,Thu Nov 25 15:53:42 CET,0.0 0.825 1.143 1.362 1.525 1.687 1.836 1.97 2.191 2.278 2.372 2.442 2.613 2.686 2.838 2.998 3.147 3.215 3.354 3.479 3.641 3.743 3.844 3.99 4.143 4.293 4.424 4.552 4.716 4.859 5.001 5.177 5.352 5.52 5.705 5.903 6.095 6.302 6.517 6.74 6.953 7.168 7.376 7.587 7.862 8.094 8.266 8.411 8.478 8.404 7.98 7.244 6.506 5.79 5.135 4.438 3.744 3.075 2.491 1.916 1.416 0.968 0.532 0.112 -0.271 -0.623 -0.983 -1.3 -1.593 -1.891 -2.182 -2.435 -2.702 -2.97 -3.164 -3.357 -3.567 -3.779 -4.007 -4.173 -4.357 -4.632 -4.806 -4.994 -5.091 -5.291 -5.503 -5.718 -5.833 -6.087 -6.264 -6.408 -6.565 -6.904 -7.087 -7.282 -7.486 -7.719 -8.02 -8.417 -9.666 -7 ,13620 ,KEBNE ,16691467,Thu Nov 25 13:45:54 CET,Thu Nov 25 15:53:55 CET,0.0 0.762 1.077 1.284 1.473 1.635 1.776 1.901 2.102 2.191 2.278 2.358 2.551 2.637 2.796 2.941 3.068 3.123 3.235 3.352 3.532 3.656 3.773 3.923 4.062 4.199 4.339 4.469 4.624 4.767 4.911 5.098 5.252 5.395 5.58 5.776 5.958 6.149 6.347 6.568 6.777 6.981 7.227 7.472 7.718 7.971 8.226 8.407 8.526 8.488 8.079 7.332 6.551 5.841 5.189 4.562 3.987 3.469 3.04 2.603 2.182 1.808 1.477 1.161 0.863 0.573 0.263 -0.006 -0.236 -0.494 -0.783 -1.009 -1.229 -1.457 -1.64 -1.842 -2.056 -2.289 -2.545 -2.713 -2.869 -3.121 -3.298 -3.493 -3.593 -3.781 -3.986 -4.199 -4.315 -4.558 -4.679 -4.81 -4.972 -5.333 -5.515 -5.719 -5.958 -6.214 -6.56 -7.008 -8.212 -8 ,10906 ,KEBNE ,16691468,Thu Nov 25 13:45:54 CET,Thu Nov 25 15:53:34 CET,0.0 1.119 1.402 1.603 1.765 1.928 2.081 2.21 2.473 2.587 2.682 2.752 2.947 3.035 3.197 3.356 3.51 3.582 3.702 3.821 4.018 4.134 4.24 4.385 4.517 4.641 4.762 4.887 5.054 5.217 5.376 5.555 5.706 5.848 6.003 6.17 6.346 6.552 6.762 6.961 7.16 7.382 7.604 7.783 8.008 8.289 8.552 8.768 8.917 8.92 8.601 7.865 7.065 6.353 5.736 5.165 4.653 4.119 3.61 3.119 2.718 2.348 1.995 1.647 1.316 1.026 0.713 0.418 0.155 -0.105 -0.36 -0.578 -0.831 -1.097 -1.299 -1.512 -1.723 -1.959 -2.217 -2.378 -2.55 -2.835 -3.024 -3.222 -3.324 -3.53 -3.746 -3.962 -4.077 -4.324 -4.483 -4.624 -4.785 -5.186 -5.403 -5.599 -5.862 -6.15 -6.408 -6.75 -8.035 -9 ,26532 ,KEBNE ,16691469,Thu Nov 25 13:45:54 CET,Thu Nov 25 15:52:18 CET,0.0 0.561 0.814 1.029 1.195 1.317 1.453 1.616 1.882 1.991 2.106 2.206 2.408 2.491 2.618 2.745 2.877 2.941 3.083 3.214 3.378 3.486 3.584 3.727 3.869 4.014 4.15 4.283 4.456 4.615 4.766 4.953 5.124 5.28 5.467 5.663 5.835 6.003 6.191 6.403 6.617 6.859 7.124 7.38 7.616 7.829 8.058 8.258 8.332 8.219 7.75 6.889 6.044 5.298 4.679 4.112 3.557 3.03 2.562 2.101 1.718 1.357 0.984 0.606 0.228 -0.11 -0.421 -0.687 -0.938 -1.207 -1.49 -1.734 -1.975 -2.208 -2.382 -2.571 -2.792 -3.021 -3.231 -3.382 -3.542 -3.79 -3.976 -4.164 -4.266 -4.474 -4.676 -4.876 -4.992 -5.236 -5.386 -5.542 -5.71 -6.048 -6.214 -6.402 -6.653 -6.947 -7.228 -7.582 -8.778 -10 ,7436 ,KEBNE ,16691470,Thu Nov 25 13:46:56 CET,Thu Nov 25 15:55:09 CET,0.0 0.578 0.87 1.078 1.224 1.367 1.501 1.629 1.869 1.977 2.08 2.179 2.39 2.489 2.663 2.82 2.961 3.033 3.176 3.307 3.48 3.577 3.679 3.835 3.99 4.144 4.29 4.423 4.577 4.726 4.877 5.085 5.275 5.439 5.623 5.818 6.023 6.243 6.424 6.612 6.818 7.027 7.271 7.495 7.76 8.017 8.234 8.419 8.542 8.537 8.141 7.4 6.703 5.948 5.205 4.504 3.866 3.29 2.787 2.269 1.779 1.315 0.896 0.54 0.224 -0.068 -0.387 -0.676 -0.945 -1.235 -1.51 -1.726 -1.959 -2.212 -2.423 -2.653 -2.872 -3.083 -3.316 -3.498 -3.685 -3.95 -4.132 -4.314 -4.407 -4.628 -4.878 -5.132 -5.256 -5.497 -5.674 -5.835 -5.997 -6.361 -6.564 -6.766 -6.99 -7.241 -7.526 -7.912 -9.284 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_5.txt deleted file mode 100644 index a02e38d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_3b_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19897 ,KEBNE ,16691471,Thu Nov 25 13:46:56 CET,Thu Nov 25 15:54:11 CET,0.0 0.446 0.681 0.861 1.067 1.298 1.477 1.594 1.782 1.876 1.966 2.026 2.207 2.284 2.445 2.613 2.762 2.828 2.96 3.098 3.304 3.434 3.56 3.742 3.918 4.092 4.268 4.422 4.621 4.836 5.028 5.246 5.461 5.669 5.899 6.16 6.413 6.683 6.97 7.263 7.589 7.947 8.344 8.734 9.168 9.686 10.266 10.795 11.31 11.8 12.079 11.953 11.629 11.193 10.743 10.316 9.901 9.461 9.078 8.708 8.348 8.007 7.675 7.345 7.055 6.784 6.512 6.274 6.053 5.827 5.58 5.373 5.149 4.912 4.73 4.527 4.308 4.087 3.851 3.701 3.561 3.295 3.097 2.91 2.821 2.621 2.398 2.169 2.042 1.806 1.663 1.514 1.346 0.938 0.691 0.413 0.122 -0.176 -0.509 -0.963 -2.579 -2 ,1945 ,KEBNE ,16691472,Thu Nov 25 13:46:56 CET,Thu Nov 25 15:53:59 CET,0.0 0.305 0.482 0.668 0.844 1.014 1.169 1.311 1.577 1.696 1.802 1.9 2.107 2.201 2.377 2.562 2.742 2.819 2.973 3.121 3.334 3.467 3.59 3.766 3.918 4.057 4.202 4.351 4.563 4.766 4.938 5.153 5.357 5.541 5.759 6.03 6.288 6.546 6.813 7.098 7.415 7.751 8.131 8.504 8.923 9.374 9.843 10.365 10.969 11.547 12.041 12.156 11.99 11.735 11.467 11.157 10.791 10.419 10.109 9.787 9.49 9.207 8.907 8.601 8.312 8.048 7.767 7.521 7.316 7.109 6.871 6.656 6.447 6.237 6.073 5.898 5.705 5.499 5.283 5.122 4.957 4.715 4.545 4.363 4.264 4.066 3.859 3.611 3.486 3.252 3.089 2.958 2.805 2.451 2.271 2.064 1.827 1.608 1.363 0.979 -0.685 -3 ,7591 ,KEBNE ,16691473,Thu Nov 25 13:46:56 CET,Thu Nov 25 15:54:16 CET,0.0 0.582 0.893 1.129 1.329 1.509 1.671 1.808 2.044 2.158 2.267 2.385 2.594 2.683 2.837 2.989 3.136 3.209 3.354 3.499 3.713 3.846 3.967 4.151 4.334 4.497 4.646 4.791 4.982 5.172 5.358 5.581 5.791 5.992 6.212 6.474 6.739 7.0 7.261 7.54 7.83 8.149 8.493 8.83 9.232 9.661 10.108 10.579 11.096 11.636 12.078 12.118 11.919 11.574 11.177 10.762 10.336 9.887 9.455 8.99 8.576 8.229 7.906 7.6 7.284 6.984 6.686 6.438 6.229 5.984 5.71 5.471 5.231 4.986 4.782 4.565 4.347 4.101 3.837 3.66 3.471 3.182 2.982 2.781 2.678 2.48 2.285 2.044 1.911 1.666 1.447 1.293 1.132 0.762 0.559 0.356 0.122 -0.187 -0.57 -1.022 -2.358 -4 ,9360 ,KEBNE ,16691474,Thu Nov 25 13:46:56 CET,Thu Nov 25 15:55:00 CET,0.0 0.538 0.766 0.99 1.175 1.313 1.437 1.558 1.782 1.884 1.979 2.049 2.26 2.352 2.537 2.714 2.862 2.933 3.062 3.188 3.379 3.494 3.618 3.813 3.99 4.157 4.33 4.498 4.692 4.877 5.066 5.279 5.481 5.702 5.942 6.207 6.452 6.7 6.973 7.246 7.535 7.881 8.275 8.645 9.08 9.564 10.087 10.642 11.201 11.675 12.002 11.947 11.646 11.301 10.862 10.386 9.983 9.619 9.297 8.932 8.566 8.256 7.966 7.686 7.424 7.166 6.91 6.7 6.511 6.279 6.027 5.809 5.584 5.372 5.204 5.024 4.84 4.666 4.477 4.341 4.192 3.976 3.831 3.648 3.55 3.356 3.163 2.942 2.816 2.588 2.418 2.272 2.131 1.768 1.568 1.34 1.084 0.82 0.503 0.067 -1.607 -5 ,4414 ,KEBNE ,16691475,Thu Nov 25 13:47:00 CET,Thu Nov 25 15:47:07 CET,0.0 0.333 0.593 0.845 1.034 1.198 1.34 1.459 1.669 1.784 1.888 1.946 2.137 2.227 2.396 2.552 2.701 2.774 2.917 3.04 3.233 3.369 3.49 3.66 3.823 3.977 4.131 4.289 4.477 4.642 4.802 4.994 5.188 5.384 5.603 5.848 6.09 6.356 6.623 6.896 7.196 7.517 7.886 8.279 8.737 9.196 9.705 10.287 10.875 11.44 11.88 11.916 11.707 11.381 11.047 10.7 10.318 9.909 9.518 9.084 8.72 8.406 8.1 7.806 7.532 7.258 6.938 6.633 6.373 6.13 5.87 5.654 5.45 5.221 5.039 4.854 4.648 4.441 4.224 4.051 3.873 3.605 3.415 3.211 3.106 2.89 2.638 2.385 2.278 2.065 1.921 1.772 1.609 1.291 1.134 0.962 0.763 0.491 0.138 -0.323 -2.321 -6 ,27179 ,KEBNE ,16691476,Thu Nov 25 13:46:56 CET,Thu Nov 25 15:54:07 CET,0.0 0.607 0.866 1.044 1.223 1.389 1.541 1.685 1.922 2.028 2.135 2.211 2.405 2.49 2.656 2.81 2.976 3.058 3.199 3.332 3.542 3.678 3.792 3.946 4.094 4.242 4.404 4.57 4.763 4.942 5.136 5.355 5.541 5.721 5.938 6.172 6.362 6.586 6.85 7.122 7.422 7.771 8.16 8.523 8.925 9.385 9.902 10.437 10.987 11.564 12.094 12.208 12.048 11.782 11.498 11.166 10.804 10.464 10.148 9.839 9.562 9.278 8.981 8.684 8.382 8.107 7.831 7.562 7.322 7.045 6.734 6.492 6.263 6.016 5.828 5.633 5.417 5.198 4.971 4.824 4.679 4.444 4.273 4.098 4.007 3.784 3.535 3.301 3.19 2.971 2.814 2.653 2.49 2.157 1.932 1.677 1.423 1.164 0.833 0.372 -0.649 -7 ,19538 ,KEBNE ,16691477,Thu Nov 25 13:46:56 CET,Thu Nov 25 15:53:31 CET,0.0 0.499 0.712 0.913 1.088 1.232 1.361 1.491 1.733 1.863 1.982 2.04 2.227 2.316 2.488 2.657 2.812 2.882 3.014 3.153 3.349 3.469 3.576 3.733 3.886 4.026 4.169 4.319 4.522 4.719 4.887 5.085 5.283 5.481 5.716 5.971 6.221 6.501 6.781 7.057 7.369 7.749 8.169 8.547 8.994 9.482 9.961 10.443 11.015 11.636 12.078 12.071 11.791 11.446 11.129 10.798 10.469 10.148 9.831 9.477 9.165 8.893 8.602 8.282 7.982 7.705 7.418 7.161 6.913 6.646 6.383 6.144 5.89 5.651 5.467 5.265 5.04 4.805 4.578 4.42 4.252 3.986 3.797 3.609 3.512 3.309 3.089 2.854 2.731 2.491 2.334 2.189 2.033 1.71 1.524 1.324 1.068 0.78 0.511 0.096 -1.341 -8 ,14378 ,KEBNE ,16691478,Thu Nov 25 13:46:56 CET,Thu Nov 25 15:52:35 CET,0.0 0.545 0.794 0.99 1.153 1.279 1.402 1.516 1.74 1.857 1.964 2.041 2.239 2.334 2.522 2.698 2.862 2.936 3.076 3.216 3.413 3.534 3.649 3.81 3.968 4.121 4.271 4.416 4.598 4.771 4.94 5.152 5.353 5.535 5.738 5.984 6.227 6.479 6.755 7.061 7.388 7.734 8.086 8.428 8.83 9.254 9.764 10.306 10.854 11.424 11.889 11.96 11.732 11.359 10.939 10.515 10.095 9.679 9.324 8.942 8.576 8.241 7.943 7.654 7.333 7.018 6.706 6.439 6.182 5.898 5.618 5.394 5.182 4.972 4.803 4.621 4.423 4.212 3.98 3.811 3.634 3.371 3.182 2.97 2.864 2.654 2.443 2.214 2.08 1.83 1.645 1.5 1.338 1.0 0.802 0.596 0.4 0.153 -0.164 -0.612 -2.318 -9 ,1520 ,KEBNE ,16691479,Thu Nov 25 13:47:00 CET,Thu Nov 25 15:54:08 CET,0.0 0.803 1.038 1.245 1.427 1.574 1.694 1.812 2.014 2.11 2.213 2.294 2.494 2.579 2.735 2.89 3.027 3.093 3.233 3.378 3.578 3.689 3.798 3.965 4.137 4.301 4.443 4.58 4.772 4.96 5.137 5.341 5.55 5.757 5.985 6.238 6.483 6.757 7.04 7.339 7.634 7.964 8.357 8.718 9.136 9.603 10.136 10.697 11.267 11.876 12.445 12.583 12.391 12.088 11.801 11.459 11.1 10.778 10.486 10.197 9.92 9.638 9.369 9.094 8.844 8.614 8.377 8.158 7.951 7.739 7.514 7.329 7.14 6.927 6.745 6.546 6.32 6.095 5.875 5.711 5.548 5.303 5.126 4.945 4.85 4.639 4.414 4.181 4.061 3.82 3.638 3.49 3.336 3.043 2.887 2.682 2.436 2.172 1.879 1.455 0.334 -10 ,15955 ,KEBNE ,16691480,Thu Nov 25 13:46:56 CET,Thu Nov 25 15:54:19 CET,0.0 0.811 1.061 1.253 1.444 1.612 1.748 1.882 2.107 2.214 2.328 2.425 2.628 2.715 2.878 3.034 3.185 3.261 3.401 3.532 3.717 3.833 3.944 4.106 4.265 4.422 4.57 4.711 4.92 5.129 5.321 5.542 5.745 5.935 6.15 6.398 6.646 6.905 7.166 7.443 7.73 8.054 8.44 8.811 9.258 9.759 10.28 10.789 11.316 11.861 12.403 12.614 12.461 12.185 11.841 11.457 11.115 10.797 10.481 10.181 9.888 9.591 9.313 9.026 8.751 8.488 8.224 8.015 7.834 7.629 7.387 7.201 7.015 6.805 6.644 6.463 6.263 6.066 5.862 5.724 5.579 5.354 5.194 5.025 4.933 4.738 4.542 4.316 4.19 3.956 3.817 3.681 3.538 3.232 3.028 2.802 2.581 2.36 2.079 1.487 -0.797 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_1b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_1b.txt deleted file mode 100644 index 6b95b97c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_1b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2095 ,KEBNE ,16691481,Thu Nov 25 13:46:56 CET,Thu Nov 25 15:48:56 CET,0.0 0.498 0.741 0.978 1.172 1.338 1.506 1.671 1.98 2.118 2.25 2.395 2.653 2.776 2.976 3.169 3.348 3.435 3.605 3.757 3.989 4.154 4.309 4.536 4.746 4.938 5.138 5.333 5.572 5.811 6.04 6.303 6.551 6.805 7.112 7.451 7.801 8.166 8.527 8.9 9.281 9.729 10.272 10.821 11.45 12.116 12.868 13.75 14.72 15.745 16.906 17.799 18.234 18.349 18.308 18.225 18.103 17.934 17.75 17.543 17.333 17.12 16.914 16.722 16.545 16.364 16.16 16.001 15.863 15.702 15.529 15.38 15.215 15.041 14.911 14.76 14.597 14.426 14.235 14.107 13.978 13.767 13.627 13.491 13.413 13.253 13.1 12.924 12.824 12.615 12.483 12.354 12.221 11.915 11.724 11.525 11.313 11.062 10.789 10.462 9.619 -2 ,4509 ,KEBNE ,16691482,Thu Nov 25 13:47:58 CET,Thu Nov 25 15:51:24 CET,0.0 1.042 1.322 1.533 1.699 1.864 2.025 2.151 2.394 2.515 2.639 2.753 2.969 3.082 3.327 3.518 3.691 3.782 3.964 4.131 4.379 4.544 4.692 4.9 5.103 5.301 5.492 5.678 5.918 6.158 6.402 6.702 6.969 7.226 7.531 7.864 8.191 8.553 8.93 9.337 9.755 10.221 10.78 11.334 11.981 12.687 13.489 14.406 15.42 16.61 18.036 19.019 19.42 19.484 19.445 19.37 19.231 19.03 18.811 18.588 18.366 18.169 17.981 17.794 17.63 17.471 17.278 17.091 16.919 16.74 16.559 16.405 16.255 16.105 15.974 15.825 15.677 15.505 15.32 15.211 15.09 14.863 14.704 14.539 14.449 14.281 14.127 13.957 13.853 13.624 13.499 13.374 13.237 12.949 12.788 12.592 12.38 12.144 11.883 11.566 10.682 -3 ,12672 ,KEBNE ,16691483,Thu Nov 25 13:47:58 CET,Thu Nov 25 15:50:48 CET,0.0 0.839 1.084 1.273 1.444 1.608 1.779 1.937 2.217 2.35 2.47 2.576 2.807 2.908 3.098 3.286 3.478 3.575 3.761 3.93 4.163 4.311 4.465 4.689 4.892 5.088 5.278 5.453 5.681 5.909 6.148 6.438 6.712 6.974 7.276 7.613 7.933 8.264 8.609 9.002 9.435 9.917 10.463 11.02 11.668 12.38 13.187 14.095 15.152 16.304 17.543 18.349 18.648 18.704 18.66 18.546 18.385 18.211 18.026 17.817 17.593 17.397 17.245 17.078 16.902 16.735 16.53 16.312 16.119 15.91 15.694 15.506 15.311 15.136 14.997 14.843 14.675 14.497 14.298 14.155 14.012 13.789 13.632 13.487 13.415 13.242 13.033 12.799 12.694 12.484 12.362 12.234 12.095 11.765 11.573 11.376 11.138 10.888 10.594 10.168 9.292 -4 ,22812 ,KEBNE ,16691484,Thu Nov 25 13:47:58 CET,Thu Nov 25 15:51:10 CET,0.0 0.471 0.73 0.917 1.061 1.23 1.411 1.546 1.786 1.903 2.016 2.097 2.316 2.427 2.65 2.852 3.033 3.125 3.316 3.484 3.714 3.869 4.017 4.218 4.413 4.617 4.825 5.025 5.274 5.506 5.724 5.977 6.235 6.48 6.754 7.081 7.389 7.712 8.077 8.479 8.881 9.326 9.873 10.428 11.055 11.751 12.552 13.404 14.372 15.55 16.85 17.68 18.001 18.067 18.031 17.916 17.721 17.498 17.295 17.084 16.883 16.688 16.476 16.253 16.037 15.848 15.643 15.444 15.255 15.051 14.846 14.669 14.487 14.296 14.144 13.992 13.823 13.645 13.451 13.31 13.173 12.969 12.824 12.658 12.574 12.402 12.201 11.974 11.85 11.622 11.501 11.371 11.248 10.978 10.81 10.634 10.463 10.241 9.954 9.595 8.618 -5 ,18471 ,KEBNE ,16691485,Thu Nov 25 13:47:57 CET,Thu Nov 25 15:50:34 CET,0.0 0.643 0.955 1.172 1.345 1.536 1.723 1.88 2.134 2.266 2.387 2.483 2.708 2.808 3.005 3.188 3.359 3.443 3.6 3.749 3.978 4.133 4.276 4.484 4.701 4.914 5.123 5.304 5.542 5.784 6.016 6.305 6.574 6.825 7.123 7.463 7.777 8.115 8.486 8.877 9.289 9.755 10.282 10.796 11.423 12.138 12.965 13.892 14.91 15.989 17.186 18.037 18.374 18.468 18.451 18.355 18.204 17.996 17.76 17.509 17.317 17.159 16.976 16.78 16.585 16.391 16.179 15.993 15.823 15.638 15.456 15.293 15.11 14.922 14.779 14.625 14.453 14.272 14.074 13.93 13.788 13.574 13.432 13.287 13.214 13.052 12.853 12.657 12.55 12.316 12.195 12.072 11.94 11.647 11.484 11.305 11.134 10.935 10.716 10.39 9.823 -6 ,228 ,KEBNE ,16691486,Thu Nov 25 13:47:58 CET,Thu Nov 25 15:50:40 CET,0.0 0.685 0.919 1.084 1.257 1.415 1.579 1.746 1.995 2.117 2.254 2.384 2.617 2.729 2.941 3.134 3.309 3.395 3.575 3.748 3.994 4.151 4.295 4.503 4.705 4.906 5.108 5.3 5.553 5.796 6.024 6.302 6.581 6.864 7.177 7.496 7.804 8.152 8.545 8.954 9.379 9.851 10.369 10.876 11.508 12.221 13.05 13.972 14.991 16.156 17.399 18.218 18.499 18.607 18.591 18.496 18.381 18.166 17.929 17.684 17.443 17.213 16.992 16.783 16.568 16.377 16.198 16.033 15.872 15.681 15.486 15.327 15.162 14.994 14.852 14.698 14.543 14.379 14.189 14.059 13.938 13.75 13.609 13.453 13.375 13.222 13.058 12.88 12.779 12.552 12.406 12.283 12.156 11.817 11.617 11.439 11.267 11.064 10.85 10.602 10.089 -7 ,6793 ,KEBNE ,16691487,Thu Nov 25 13:47:58 CET,Thu Nov 25 15:50:49 CET,0.0 0.501 0.799 1.044 1.245 1.429 1.603 1.749 2.002 2.126 2.25 2.362 2.6 2.708 2.899 3.08 3.251 3.34 3.52 3.69 3.921 4.072 4.223 4.452 4.682 4.885 5.077 5.26 5.495 5.742 5.993 6.274 6.546 6.815 7.124 7.48 7.81 8.168 8.563 8.996 9.454 9.978 10.563 11.119 11.743 12.472 13.296 14.145 15.119 16.244 17.553 18.42 18.785 18.889 18.838 18.701 18.523 18.317 18.098 17.849 17.636 17.46 17.265 17.055 16.856 16.675 16.496 16.337 16.178 16.005 15.828 15.67 15.495 15.287 15.128 14.982 14.825 14.672 14.505 14.375 14.241 14.034 13.899 13.75 13.669 13.495 13.311 13.115 13.011 12.787 12.658 12.54 12.396 12.111 11.964 11.794 11.618 11.416 11.159 10.809 9.94 -8 ,994 ,KEBNE ,16691488,Thu Nov 25 13:47:58 CET,Thu Nov 25 15:50:53 CET,0.0 0.496 0.839 1.05 1.226 1.383 1.536 1.671 1.905 2.019 2.133 2.236 2.46 2.561 2.745 2.924 3.1 3.184 3.355 3.514 3.736 3.884 4.039 4.255 4.457 4.659 4.838 5.01 5.231 5.43 5.629 5.87 6.102 6.342 6.619 6.935 7.262 7.623 8.004 8.404 8.831 9.304 9.85 10.394 11.026 11.738 12.566 13.473 14.472 15.601 16.874 17.708 18.048 18.128 18.053 17.944 17.768 17.555 17.313 17.024 16.755 16.491 16.217 15.938 15.684 15.452 15.217 15.027 14.866 14.686 14.496 14.332 14.142 13.945 13.808 13.674 13.531 13.362 13.169 13.038 12.909 12.692 12.533 12.369 12.284 12.119 11.937 11.722 11.615 11.397 11.284 11.159 11.02 10.745 10.596 10.425 10.241 10.031 9.813 9.432 8.264 -9 ,6322 ,KEBNE ,16691489,Thu Nov 25 13:47:58 CET,Thu Nov 25 15:50:47 CET,0.0 0.704 0.974 1.225 1.409 1.567 1.757 1.947 2.259 2.379 2.499 2.635 2.881 3.004 3.227 3.417 3.6 3.687 3.848 3.998 4.218 4.368 4.512 4.719 4.91 5.094 5.288 5.475 5.719 5.962 6.198 6.468 6.733 6.995 7.284 7.618 7.949 8.316 8.699 9.07 9.475 9.964 10.537 11.093 11.726 12.401 13.169 14.024 15.001 16.152 17.498 18.473 18.776 18.848 18.832 18.698 18.544 18.396 18.226 18.022 17.83 17.655 17.469 17.268 17.074 16.869 16.659 16.473 16.312 16.155 15.975 15.822 15.672 15.514 15.38 15.234 15.071 14.889 14.685 14.542 14.397 14.188 14.055 13.892 13.81 13.654 13.47 13.272 13.172 12.954 12.808 12.67 12.539 12.254 12.088 11.897 11.671 11.45 11.175 10.774 9.856 -10 ,8372 ,KEBNE ,16691490,Thu Nov 25 13:47:58 CET,Thu Nov 25 15:49:41 CET,0.0 0.401 0.67 0.855 1.024 1.214 1.378 1.525 1.808 1.928 2.047 2.157 2.381 2.487 2.68 2.865 3.043 3.129 3.303 3.468 3.694 3.842 3.989 4.198 4.404 4.623 4.831 5.014 5.247 5.481 5.707 5.988 6.253 6.494 6.766 7.073 7.39 7.745 8.12 8.524 8.931 9.37 9.878 10.394 10.998 11.71 12.539 13.415 14.391 15.483 16.673 17.478 17.77 17.805 17.777 17.665 17.5 17.349 17.187 16.95 16.712 16.474 16.224 15.997 15.766 15.534 15.286 15.084 14.928 14.749 14.56 14.402 14.225 14.03 13.867 13.71 13.55 13.373 13.175 13.035 12.899 12.686 12.535 12.364 12.276 12.089 11.879 11.651 11.531 11.308 11.165 11.037 10.901 10.589 10.422 10.243 10.056 9.854 9.552 9.137 7.978 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_6b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_6b.txt deleted file mode 100644 index 4194142a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6a_6b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17205 ,KEBNE ,16691491,Thu Nov 25 13:47:58 CET,Thu Nov 25 15:52:00 CET,0.0 1.01 1.282 1.481 1.679 1.882 2.054 2.204 2.502 2.638 2.775 2.918 3.152 3.272 3.48 3.667 3.86 3.949 4.122 4.287 4.536 4.695 4.837 5.053 5.274 5.479 5.678 5.877 6.141 6.387 6.613 6.879 7.116 7.344 7.627 7.945 8.229 8.529 8.87 9.227 9.593 10.007 10.47 10.914 11.417 11.978 12.592 13.244 13.905 14.549 15.155 15.301 15.156 14.916 14.615 14.263 13.907 13.581 13.268 12.946 12.667 12.397 12.131 11.871 11.638 11.438 11.211 10.997 10.825 10.631 10.422 10.253 10.076 9.899 9.76 9.602 9.421 9.232 9.048 8.915 8.782 8.592 8.449 8.296 8.22 8.068 7.914 7.738 7.643 7.427 7.342 7.231 7.109 6.856 6.688 6.5 6.336 6.142 5.896 5.574 4.778 -2 ,4648 ,KEBNE ,16691492,Thu Nov 25 13:47:58 CET,Thu Nov 25 15:51:06 CET,0.0 0.772 1.195 1.478 1.697 1.903 2.1 2.27 2.565 2.697 2.82 2.95 3.19 3.314 3.532 3.732 3.911 3.999 4.177 4.366 4.637 4.801 4.951 5.166 5.366 5.553 5.75 5.936 6.17 6.407 6.63 6.883 7.123 7.369 7.635 7.945 8.244 8.542 8.863 9.19 9.532 9.907 10.338 10.789 11.29 11.815 12.421 13.062 13.73 14.394 14.981 15.115 14.97 14.805 14.605 14.327 14.025 13.722 13.447 13.181 12.934 12.684 12.436 12.202 11.974 11.762 11.553 11.346 11.143 10.935 10.727 10.554 10.36 10.135 9.974 9.813 9.643 9.473 9.281 9.149 9.017 8.809 8.673 8.519 8.442 8.298 8.128 7.938 7.845 7.642 7.569 7.468 7.365 7.157 7.029 6.877 6.714 6.543 6.35 6.108 5.47 -3 ,30015 ,KEBNE ,16691493,Thu Nov 25 13:49:00 CET,Thu Nov 25 15:52:18 CET,0.0 1.145 1.567 1.775 1.965 2.177 2.371 2.533 2.809 2.932 3.066 3.22 3.456 3.567 3.789 3.99 4.176 4.264 4.441 4.621 4.874 5.027 5.183 5.411 5.612 5.81 6.003 6.197 6.446 6.664 6.874 7.127 7.363 7.603 7.895 8.197 8.488 8.82 9.154 9.494 9.841 10.258 10.753 11.211 11.722 12.257 12.827 13.444 14.194 15.003 15.661 15.844 15.748 15.55 15.264 14.935 14.592 14.237 13.906 13.599 13.368 13.138 12.876 12.608 12.357 12.13 11.887 11.674 11.491 11.321 11.136 10.957 10.77 10.576 10.432 10.282 10.122 9.957 9.779 9.65 9.511 9.293 9.143 8.977 8.886 8.713 8.523 8.311 8.204 7.968 7.845 7.72 7.594 7.346 7.206 7.048 6.88 6.702 6.468 6.191 5.634 -4 ,28764 ,KEBNE ,16691494,Thu Nov 25 13:49:00 CET,Thu Nov 25 15:53:22 CET,0.0 0.648 0.979 1.271 1.486 1.671 1.861 2.023 2.287 2.419 2.556 2.687 2.93 3.046 3.259 3.449 3.647 3.747 3.92 4.087 4.33 4.478 4.606 4.797 4.996 5.173 5.337 5.502 5.732 5.97 6.203 6.473 6.711 6.952 7.24 7.558 7.854 8.173 8.533 8.899 9.258 9.682 10.177 10.625 11.146 11.703 12.27 12.87 13.513 14.187 14.79 15.024 14.907 14.619 14.291 13.961 13.611 13.268 12.983 12.711 12.461 12.206 11.963 11.734 11.514 11.314 11.096 10.877 10.672 10.458 10.238 10.047 9.857 9.679 9.533 9.358 9.17 8.999 8.821 8.697 8.575 8.352 8.192 8.04 7.968 7.823 7.632 7.414 7.302 7.083 6.996 6.883 6.775 6.541 6.409 6.268 6.079 5.841 5.588 5.195 4.033 -5 ,3686 ,KEBNE ,16691495,Thu Nov 25 13:49:00 CET,Thu Nov 25 15:52:25 CET,0.0 1.145 1.502 1.771 1.997 2.203 2.398 2.571 2.859 2.984 3.113 3.239 3.482 3.607 3.834 4.021 4.204 4.298 4.475 4.638 4.87 5.015 5.158 5.374 5.596 5.81 6.009 6.188 6.414 6.644 6.861 7.119 7.367 7.607 7.893 8.204 8.487 8.792 9.123 9.465 9.821 10.227 10.684 11.146 11.681 12.272 12.94 13.638 14.404 15.15 15.7 15.874 15.75 15.529 15.27 14.994 14.692 14.357 14.047 13.738 13.473 13.226 12.989 12.732 12.467 12.238 12.019 11.818 11.621 11.423 11.224 11.051 10.866 10.663 10.51 10.358 10.197 10.009 9.805 9.672 9.544 9.352 9.213 9.041 8.947 8.776 8.608 8.421 8.321 8.11 8.011 7.892 7.771 7.469 7.287 7.107 6.948 6.753 6.524 6.263 5.581 -6 ,23024 ,KEBNE ,16691496,Thu Nov 25 13:49:00 CET,Thu Nov 25 15:52:54 CET,0.0 0.99 1.294 1.519 1.744 1.96 2.142 2.306 2.63 2.771 2.896 3.02 3.258 3.364 3.58 3.792 3.99 4.085 4.266 4.448 4.721 4.902 5.063 5.281 5.491 5.705 5.908 6.096 6.366 6.632 6.871 7.168 7.44 7.679 7.956 8.26 8.541 8.873 9.233 9.568 9.908 10.325 10.817 11.263 11.744 12.288 12.903 13.556 14.269 14.959 15.605 15.926 15.863 15.635 15.363 15.049 14.75 14.48 14.183 13.873 13.629 13.388 13.151 12.921 12.692 12.472 12.243 12.045 11.864 11.659 11.434 11.255 11.088 10.915 10.76 10.586 10.41 10.236 10.062 9.934 9.806 9.611 9.47 9.327 9.242 9.059 8.886 8.686 8.589 8.388 8.302 8.181 8.058 7.824 7.694 7.542 7.346 7.124 6.886 6.616 6.193 -7 ,6127 ,KEBNE ,16691497,Thu Nov 25 13:49:00 CET,Thu Nov 25 15:54:28 CET,0.0 0.769 1.084 1.346 1.563 1.765 1.959 2.124 2.421 2.574 2.719 2.876 3.127 3.241 3.46 3.66 3.838 3.927 4.094 4.253 4.503 4.665 4.815 5.04 5.266 5.481 5.677 5.868 6.123 6.371 6.607 6.877 7.128 7.365 7.639 7.942 8.247 8.597 8.972 9.37 9.781 10.208 10.674 11.158 11.74 12.336 12.958 13.648 14.367 15.043 15.593 15.772 15.654 15.446 15.19 14.854 14.47 14.092 13.777 13.443 13.14 12.881 12.627 12.378 12.141 11.921 11.69 11.487 11.295 11.085 10.866 10.686 10.499 10.294 10.131 9.961 9.793 9.625 9.429 9.281 9.142 8.932 8.773 8.617 8.543 8.374 8.197 8.02 7.933 7.722 7.643 7.521 7.392 7.123 6.985 6.847 6.676 6.479 6.269 5.957 5.367 -8 ,20829 ,KEBNE ,16691498,Thu Nov 25 13:49:00 CET,Thu Nov 25 15:52:20 CET,0.0 0.929 1.246 1.494 1.725 1.948 2.146 2.308 2.593 2.723 2.856 2.985 3.235 3.357 3.58 3.787 3.966 4.044 4.194 4.34 4.56 4.713 4.874 5.105 5.316 5.518 5.709 5.873 6.108 6.349 6.57 6.832 7.078 7.319 7.596 7.886 8.176 8.518 8.86 9.181 9.529 9.948 10.401 10.855 11.372 11.926 12.63 13.415 14.161 14.879 15.463 15.555 15.38 15.135 14.87 14.558 14.216 13.881 13.606 13.3 13.017 12.772 12.511 12.251 12.022 11.819 11.595 11.369 11.186 10.989 10.755 10.564 10.378 10.191 10.035 9.881 9.728 9.563 9.385 9.255 9.128 8.944 8.809 8.662 8.587 8.426 8.256 8.092 8.001 7.777 7.687 7.555 7.407 7.112 6.971 6.841 6.705 6.531 6.312 6.043 5.433 -9 ,18229 ,KEBNE ,16691499,Thu Nov 25 13:49:00 CET,Thu Nov 25 15:52:56 CET,0.0 0.455 0.727 0.998 1.251 1.462 1.654 1.823 2.128 2.281 2.423 2.566 2.819 2.954 3.178 3.383 3.577 3.665 3.84 4.021 4.269 4.413 4.572 4.802 5.002 5.204 5.413 5.62 5.874 6.097 6.297 6.547 6.797 7.045 7.307 7.58 7.886 8.22 8.553 8.901 9.251 9.644 10.117 10.597 11.129 11.705 12.362 13.05 13.699 14.347 14.975 15.142 15.071 14.824 14.529 14.256 14.0 13.748 13.472 13.181 12.92 12.692 12.485 12.266 12.037 11.814 11.57 11.345 11.152 10.955 10.753 10.552 10.339 10.15 10.009 9.85 9.689 9.53 9.337 9.205 9.081 8.886 8.756 8.605 8.518 8.353 8.196 8.033 7.953 7.753 7.675 7.557 7.426 7.152 7.001 6.844 6.676 6.514 6.34 6.077 5.599 -10 ,22663 ,KEBNE ,16691500,Thu Nov 25 13:48:59 CET,Thu Nov 25 15:52:02 CET,0.0 0.987 1.316 1.562 1.779 1.989 2.191 2.386 2.754 2.904 3.044 3.167 3.396 3.504 3.715 3.943 4.162 4.258 4.433 4.599 4.836 4.986 5.134 5.355 5.58 5.79 5.989 6.191 6.45 6.686 6.905 7.162 7.399 7.618 7.862 8.141 8.449 8.789 9.114 9.456 9.823 10.236 10.699 11.155 11.672 12.22 12.827 13.455 14.121 14.791 15.418 15.648 15.535 15.288 14.981 14.669 14.376 14.073 13.781 13.461 13.156 12.883 12.628 12.369 12.1 11.86 11.626 11.395 11.201 11.022 10.816 10.639 10.47 10.297 10.154 9.976 9.795 9.637 9.455 9.319 9.178 8.948 8.794 8.65 8.57 8.407 8.239 8.063 7.975 7.761 7.661 7.541 7.4 7.092 6.949 6.825 6.699 6.555 6.353 6.054 5.162 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_7a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_7a.txt deleted file mode 100644 index 476723b8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6b_7a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,612 ,KEBNE ,16691501,Thu Nov 25 13:49:00 CET,Thu Nov 25 15:54:02 CET,0.0 1.256 1.623 1.908 2.14 2.335 2.517 2.695 3.003 3.149 3.294 3.436 3.67 3.797 4.034 4.236 4.42 4.511 4.68 4.841 5.082 5.225 5.358 5.561 5.757 5.928 6.084 6.242 6.441 6.628 6.811 7.015 7.195 7.373 7.567 7.777 7.97 8.189 8.419 8.643 8.865 9.096 9.341 9.554 9.773 10.011 10.209 10.269 10.276 10.11 9.339 8.037 6.814 5.808 4.954 4.164 3.406 2.692 2.125 1.556 1.048 0.599 0.17 -0.245 -0.634 -1.004 -1.397 -1.718 -1.991 -2.29 -2.588 -2.838 -3.115 -3.396 -3.607 -3.823 -4.049 -4.289 -4.537 -4.711 -4.883 -5.155 -5.354 -5.56 -5.665 -5.889 -6.131 -6.386 -6.519 -6.778 -6.918 -7.06 -7.215 -7.581 -7.799 -8.015 -8.237 -8.506 -8.851 -9.274 -9.973 -2 ,1039 ,KEBNE ,16691502,Thu Nov 25 13:48:59 CET,Thu Nov 25 15:54:06 CET,0.0 2.0 2.444 2.75 3.011 3.226 3.432 3.629 3.98 4.149 4.291 4.394 4.63 4.748 4.971 5.195 5.412 5.509 5.702 5.885 6.111 6.249 6.385 6.578 6.769 6.948 7.118 7.281 7.469 7.649 7.824 8.034 8.233 8.408 8.6 8.808 9.011 9.227 9.445 9.682 9.93 10.161 10.411 10.677 10.961 11.157 11.295 11.464 11.545 11.304 10.491 9.279 8.176 7.158 6.232 5.365 4.616 3.969 3.403 2.863 2.412 1.985 1.577 1.2 0.827 0.461 0.084 -0.232 -0.514 -0.826 -1.147 -1.419 -1.683 -1.933 -2.136 -2.346 -2.568 -2.814 -3.079 -3.262 -3.445 -3.753 -3.98 -4.203 -4.314 -4.533 -4.746 -4.983 -5.12 -5.379 -5.515 -5.663 -5.832 -6.201 -6.399 -6.612 -6.853 -7.096 -7.429 -7.884 -9.056 -3 ,3351 ,KEBNE ,16691503,Thu Nov 25 13:50:01 CET,Thu Nov 25 15:55:34 CET,0.0 1.095 1.511 1.834 2.117 2.374 2.608 2.784 3.08 3.207 3.335 3.481 3.726 3.843 4.062 4.269 4.454 4.532 4.693 4.863 5.103 5.255 5.398 5.608 5.805 5.985 6.151 6.323 6.541 6.729 6.916 7.136 7.332 7.528 7.751 7.997 8.216 8.416 8.63 8.867 9.079 9.308 9.579 9.812 10.064 10.307 10.506 10.619 10.548 10.273 9.615 8.519 7.398 6.334 5.408 4.588 3.83 3.096 2.492 1.914 1.409 0.956 0.538 0.149 -0.234 -0.578 -0.929 -1.254 -1.524 -1.805 -2.101 -2.344 -2.606 -2.876 -3.073 -3.274 -3.495 -3.731 -3.982 -4.165 -4.349 -4.628 -4.819 -5.032 -5.146 -5.368 -5.615 -5.884 -6.026 -6.29 -6.468 -6.618 -6.762 -7.089 -7.27 -7.477 -7.716 -7.984 -8.269 -8.596 -9.498 -4 ,22560 ,KEBNE ,16691504,Thu Nov 25 13:50:02 CET,Thu Nov 25 15:55:26 CET,0.0 1.008 1.401 1.714 1.979 2.218 2.438 2.645 2.99 3.133 3.273 3.453 3.695 3.803 4.004 4.205 4.41 4.502 4.669 4.856 5.115 5.261 5.397 5.603 5.793 5.956 6.118 6.273 6.473 6.664 6.841 7.068 7.284 7.491 7.745 8.013 8.248 8.496 8.776 9.049 9.29 9.565 9.861 10.115 10.384 10.645 10.866 11.034 11.137 11.006 10.321 9.117 7.974 6.935 6.014 5.2 4.459 3.784 3.226 2.664 2.152 1.699 1.273 0.861 0.485 0.159 -0.179 -0.511 -0.816 -1.142 -1.472 -1.737 -2.007 -2.285 -2.503 -2.718 -2.939 -3.17 -3.412 -3.581 -3.752 -4.002 -4.181 -4.39 -4.495 -4.701 -4.931 -5.169 -5.292 -5.56 -5.762 -5.94 -6.109 -6.469 -6.651 -6.854 -7.097 -7.365 -7.657 -8.032 -8.825 -5 ,29420 ,KEBNE ,16691505,Thu Nov 25 13:50:01 CET,Thu Nov 25 15:55:23 CET,0.0 1.303 1.711 1.992 2.258 2.491 2.682 2.861 3.193 3.348 3.492 3.652 3.897 4.01 4.234 4.45 4.646 4.743 4.937 5.113 5.351 5.506 5.659 5.879 6.083 6.271 6.438 6.603 6.829 7.019 7.187 7.405 7.594 7.762 7.965 8.179 8.362 8.555 8.771 8.989 9.191 9.437 9.712 9.968 10.263 10.487 10.651 10.772 10.752 10.443 9.668 8.554 7.485 6.49 5.603 4.757 3.995 3.321 2.757 2.216 1.74 1.288 0.861 0.465 0.085 -0.273 -0.653 -0.979 -1.264 -1.573 -1.887 -2.14 -2.404 -2.675 -2.887 -3.111 -3.346 -3.595 -3.86 -4.035 -4.218 -4.509 -4.713 -4.933 -5.044 -5.259 -5.486 -5.735 -5.865 -6.135 -6.309 -6.468 -6.641 -7.002 -7.206 -7.43 -7.648 -7.884 -8.17 -8.51 -9.888 -6 ,9787 ,KEBNE ,16691506,Thu Nov 25 13:50:02 CET,Thu Nov 25 15:54:10 CET,0.0 1.355 1.838 2.186 2.46 2.717 2.946 3.132 3.443 3.593 3.733 3.864 4.114 4.23 4.44 4.64 4.838 4.934 5.108 5.281 5.541 5.705 5.864 6.076 6.254 6.425 6.596 6.774 6.992 7.168 7.328 7.532 7.721 7.9 8.106 8.313 8.504 8.709 8.939 9.178 9.402 9.651 9.923 10.15 10.398 10.633 10.816 10.912 10.857 10.596 9.854 8.692 7.623 6.644 5.801 4.979 4.229 3.592 3.045 2.476 1.979 1.535 1.1 0.705 0.34 -0.012 -0.39 -0.732 -1.032 -1.336 -1.638 -1.891 -2.162 -2.444 -2.667 -2.902 -3.146 -3.398 -3.659 -3.839 -4.009 -4.262 -4.444 -4.644 -4.759 -4.979 -5.197 -5.437 -5.569 -5.833 -5.973 -6.106 -6.248 -6.582 -6.768 -6.984 -7.222 -7.516 -7.87 -8.282 -8.98 -7 ,797 ,KEBNE ,16691507,Thu Nov 25 13:50:02 CET,Thu Nov 25 15:56:05 CET,0.0 0.908 1.331 1.633 1.911 2.153 2.363 2.555 2.896 3.055 3.2 3.339 3.579 3.695 3.911 4.1 4.281 4.374 4.562 4.733 4.976 5.134 5.289 5.499 5.682 5.863 6.04 6.214 6.434 6.63 6.817 7.009 7.173 7.341 7.553 7.789 8.015 8.271 8.505 8.73 8.959 9.218 9.495 9.739 9.98 10.173 10.345 10.493 10.534 10.312 9.613 8.44 7.324 6.305 5.399 4.544 3.766 3.094 2.524 1.96 1.473 1.029 0.597 0.181 -0.215 -0.572 -0.947 -1.267 -1.543 -1.842 -2.145 -2.402 -2.67 -2.935 -3.151 -3.377 -3.602 -3.83 -4.061 -4.231 -4.411 -4.697 -4.911 -5.138 -5.249 -5.474 -5.72 -5.982 -6.129 -6.403 -6.556 -6.694 -6.84 -7.211 -7.422 -7.622 -7.838 -8.091 -8.402 -8.845 -10.657 -8 ,4309 ,KEBNE ,16691508,Thu Nov 25 13:50:01 CET,Thu Nov 25 15:56:03 CET,0.0 1.36 1.815 2.152 2.417 2.635 2.828 3.027 3.419 3.576 3.72 3.89 4.126 4.245 4.478 4.674 4.868 4.962 5.13 5.29 5.525 5.669 5.805 6.008 6.2 6.393 6.58 6.746 6.936 7.127 7.322 7.548 7.753 7.946 8.158 8.363 8.567 8.779 8.986 9.206 9.437 9.703 9.978 10.204 10.421 10.624 10.846 11.018 11.002 10.731 10.013 8.916 7.846 6.864 5.988 5.172 4.472 3.821 3.234 2.664 2.151 1.691 1.262 0.853 0.474 0.127 -0.247 -0.585 -0.869 -1.165 -1.484 -1.742 -2.001 -2.289 -2.518 -2.753 -2.993 -3.235 -3.49 -3.668 -3.849 -4.139 -4.353 -4.572 -4.681 -4.906 -5.132 -5.386 -5.528 -5.801 -5.972 -6.115 -6.283 -6.663 -6.896 -7.192 -7.555 -7.969 -8.433 -8.964 -10.049 -9 ,32754 ,KEBNE ,16691509,Thu Nov 25 13:51:03 CET,Thu Nov 25 15:57:41 CET,0.0 1.796 2.267 2.607 2.882 3.121 3.337 3.536 3.859 4.002 4.146 4.31 4.556 4.679 4.908 5.109 5.304 5.403 5.586 5.76 6.008 6.154 6.298 6.53 6.768 6.969 7.134 7.302 7.509 7.709 7.908 8.119 8.308 8.508 8.743 8.98 9.211 9.463 9.703 9.945 10.195 10.455 10.718 10.979 11.249 11.487 11.685 11.838 11.922 11.748 11.046 9.889 8.827 7.855 6.944 6.1 5.372 4.702 4.12 3.538 3.025 2.558 2.133 1.751 1.371 1.027 0.661 0.32 0.035 -0.26 -0.558 -0.807 -1.078 -1.364 -1.603 -1.86 -2.116 -2.38 -2.648 -2.827 -3.011 -3.292 -3.474 -3.674 -3.781 -3.997 -4.236 -4.482 -4.619 -4.893 -5.06 -5.216 -5.381 -5.712 -5.903 -6.1 -6.311 -6.569 -6.899 -7.308 -8.414 -10 ,10626 ,KEBNE ,16691510,Thu Nov 25 13:51:03 CET,Thu Nov 25 15:57:47 CET,0.0 1.201 1.603 1.948 2.189 2.41 2.624 2.824 3.175 3.322 3.458 3.587 3.83 3.951 4.163 4.346 4.534 4.631 4.809 4.973 5.211 5.353 5.486 5.681 5.856 6.016 6.167 6.312 6.501 6.7 6.893 7.102 7.289 7.472 7.677 7.91 8.136 8.341 8.536 8.744 8.955 9.175 9.398 9.602 9.82 9.991 10.142 10.247 10.167 9.791 8.956 7.682 6.529 5.512 4.553 3.676 2.948 2.269 1.676 1.089 0.582 0.151 -0.256 -0.644 -1.003 -1.341 -1.704 -2.029 -2.322 -2.63 -2.94 -3.191 -3.457 -3.741 -3.957 -4.178 -4.415 -4.664 -4.929 -5.114 -5.305 -5.613 -5.822 -6.039 -6.153 -6.38 -6.619 -6.886 -7.026 -7.302 -7.475 -7.643 -7.822 -8.191 -8.377 -8.57 -8.811 -9.073 -9.406 -9.834 -11.027 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6a.txt deleted file mode 100644 index e67b6816..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7206 ,KEBNE ,16691511,Thu Nov 25 13:51:03 CET,Thu Nov 25 15:55:00 CET,0.0 0.901 1.19 1.414 1.622 1.8 1.974 2.137 2.461 2.603 2.717 2.828 3.051 3.146 3.331 3.526 3.71 3.796 3.966 4.14 4.378 4.501 4.617 4.815 5.014 5.195 5.377 5.538 5.731 5.929 6.1 6.316 6.549 6.755 6.99 7.258 7.501 7.784 8.096 8.424 8.767 9.161 9.608 10.027 10.488 10.932 11.367 11.776 12.176 12.506 12.549 12.166 11.68 11.177 10.672 10.174 9.701 9.25 8.865 8.49 8.17 7.853 7.536 7.252 6.979 6.718 6.446 6.193 5.979 5.783 5.575 5.38 5.17 4.961 4.799 4.623 4.422 4.221 4.031 3.903 3.761 3.531 3.377 3.212 3.133 2.984 2.816 2.616 2.512 2.295 2.192 2.079 1.963 1.726 1.594 1.435 1.278 1.126 0.909 0.597 -0.034 -2 ,14484 ,KEBNE ,16691512,Thu Nov 25 13:51:03 CET,Thu Nov 25 15:55:14 CET,0.0 0.785 1.178 1.406 1.607 1.807 1.993 2.157 2.453 2.583 2.698 2.794 3.019 3.127 3.318 3.509 3.695 3.775 3.945 4.111 4.321 4.454 4.591 4.801 5.007 5.195 5.372 5.549 5.746 5.928 6.118 6.353 6.582 6.791 7.022 7.283 7.52 7.78 8.07 8.367 8.671 9.001 9.397 9.783 10.192 10.659 11.166 11.605 11.98 12.344 12.595 12.467 12.102 11.664 11.191 10.757 10.353 9.921 9.538 9.162 8.814 8.507 8.217 7.933 7.667 7.42 7.173 6.96 6.758 6.545 6.322 6.129 5.938 5.747 5.592 5.436 5.284 5.115 4.915 4.764 4.617 4.405 4.254 4.074 3.986 3.835 3.667 3.478 3.383 3.162 3.078 2.966 2.844 2.603 2.455 2.264 2.052 1.843 1.654 1.447 0.702 -3 ,31873 ,KEBNE ,16691513,Thu Nov 25 13:51:03 CET,Thu Nov 25 15:53:39 CET,0.0 0.61 0.875 1.12 1.362 1.567 1.728 1.875 2.135 2.269 2.405 2.543 2.773 2.888 3.12 3.343 3.537 3.623 3.779 3.937 4.158 4.292 4.417 4.609 4.814 4.999 5.169 5.332 5.533 5.729 5.921 6.153 6.361 6.561 6.8 7.071 7.327 7.575 7.845 8.123 8.416 8.746 9.107 9.524 9.916 10.27 10.675 11.092 11.547 11.856 11.888 11.604 11.139 10.562 10.035 9.539 9.06 8.621 8.239 7.846 7.485 7.134 6.812 6.511 6.238 6.005 5.772 5.548 5.35 5.147 4.93 4.754 4.553 4.334 4.169 4.005 3.846 3.675 3.478 3.342 3.212 3.01 2.879 2.739 2.664 2.524 2.363 2.195 2.112 1.903 1.836 1.725 1.611 1.362 1.211 1.056 0.913 0.746 0.501 0.156 -0.984 -4 ,18580 ,KEBNE ,16691514,Thu Nov 25 13:51:07 CET,Thu Nov 25 15:52:35 CET,0.0 0.829 1.142 1.37 1.548 1.715 1.872 2.032 2.343 2.475 2.591 2.704 2.929 3.034 3.252 3.46 3.641 3.725 3.885 4.046 4.297 4.457 4.597 4.801 4.989 5.165 5.343 5.508 5.711 5.91 6.116 6.366 6.591 6.798 7.039 7.312 7.57 7.86 8.173 8.472 8.752 9.094 9.513 9.934 10.4 10.875 11.374 11.812 12.207 12.608 12.895 12.731 12.358 11.951 11.523 11.088 10.679 10.284 9.932 9.587 9.261 8.946 8.639 8.347 8.076 7.84 7.583 7.345 7.142 6.926 6.714 6.544 6.353 6.137 5.982 5.823 5.648 5.473 5.303 5.186 5.047 4.828 4.691 4.538 4.454 4.277 4.084 3.897 3.804 3.585 3.506 3.4 3.274 2.989 2.836 2.656 2.463 2.249 1.957 1.637 1.003 -5 ,23025 ,KEBNE ,16691515,Thu Nov 25 13:52:05 CET,Thu Nov 25 15:54:57 CET,0.0 0.601 0.911 1.125 1.35 1.562 1.752 1.926 2.224 2.368 2.505 2.62 2.845 2.958 3.17 3.342 3.499 3.58 3.731 3.874 4.101 4.247 4.382 4.576 4.774 4.971 5.167 5.35 5.564 5.768 5.944 6.136 6.357 6.586 6.82 7.065 7.313 7.602 7.885 8.168 8.477 8.822 9.223 9.605 10.013 10.438 10.879 11.254 11.608 11.919 11.957 11.634 11.169 10.685 10.17 9.633 9.167 8.762 8.413 8.066 7.75 7.455 7.152 6.853 6.596 6.361 6.086 5.841 5.649 5.456 5.257 5.086 4.891 4.681 4.524 4.362 4.184 4.012 3.84 3.715 3.59 3.388 3.248 3.093 3.005 2.84 2.664 2.466 2.362 2.136 2.033 1.915 1.814 1.614 1.49 1.341 1.173 0.985 0.728 0.407 -0.074 -6 ,20682 ,KEBNE ,16691516,Thu Nov 25 13:52:05 CET,Thu Nov 25 15:56:04 CET,0.0 0.576 0.911 1.161 1.377 1.575 1.73 1.879 2.195 2.327 2.441 2.525 2.74 2.841 3.049 3.236 3.424 3.514 3.678 3.834 4.062 4.217 4.356 4.535 4.715 4.902 5.086 5.25 5.457 5.65 5.852 6.084 6.281 6.487 6.728 6.987 7.233 7.505 7.793 8.101 8.408 8.746 9.118 9.466 9.864 10.256 10.643 10.993 11.265 11.465 11.516 11.151 10.686 10.22 9.739 9.281 8.85 8.436 8.086 7.741 7.418 7.112 6.821 6.545 6.285 6.05 5.794 5.543 5.322 5.092 4.849 4.646 4.443 4.235 4.076 3.925 3.761 3.593 3.42 3.292 3.151 2.935 2.792 2.647 2.569 2.393 2.207 2.022 1.927 1.703 1.609 1.495 1.371 1.125 0.991 0.844 0.694 0.535 0.335 0.039 -0.611 -7 ,8235 ,KEBNE ,16691517,Thu Nov 25 13:52:05 CET,Thu Nov 25 15:55:17 CET,0.0 0.846 1.156 1.397 1.568 1.737 1.921 2.105 2.427 2.565 2.688 2.796 3.027 3.126 3.287 3.448 3.605 3.679 3.827 3.99 4.238 4.379 4.507 4.709 4.897 5.068 5.243 5.411 5.637 5.867 6.074 6.318 6.561 6.768 6.982 7.256 7.517 7.787 8.072 8.365 8.667 9.007 9.402 9.778 10.203 10.643 11.1 11.564 12.054 12.565 12.953 12.818 12.341 11.846 11.407 10.937 10.48 10.041 9.64 9.245 8.915 8.604 8.304 8.028 7.753 7.51 7.268 7.035 6.821 6.599 6.386 6.204 6.012 5.796 5.632 5.465 5.282 5.114 4.935 4.805 4.675 4.476 4.326 4.169 4.094 3.939 3.746 3.542 3.442 3.221 3.131 3.027 2.901 2.638 2.508 2.357 2.183 1.997 1.775 1.488 0.874 -8 ,13779 ,KEBNE ,16691518,Thu Nov 25 13:52:05 CET,Thu Nov 25 15:54:13 CET,0.0 0.671 1.011 1.269 1.496 1.678 1.837 1.989 2.293 2.424 2.529 2.606 2.82 2.919 3.115 3.304 3.48 3.568 3.751 3.939 4.188 4.33 4.461 4.657 4.853 5.04 5.218 5.376 5.569 5.756 5.927 6.142 6.367 6.574 6.816 7.086 7.331 7.595 7.876 8.147 8.439 8.793 9.198 9.567 9.958 10.387 10.862 11.313 11.719 12.076 12.197 11.894 11.434 10.922 10.409 9.892 9.435 9.041 8.709 8.359 8.044 7.751 7.446 7.142 6.843 6.568 6.292 6.041 5.822 5.613 5.397 5.216 5.023 4.803 4.626 4.455 4.283 4.105 3.923 3.791 3.651 3.444 3.3 3.139 3.05 2.873 2.698 2.503 2.393 2.163 2.062 1.952 1.838 1.559 1.397 1.226 1.05 0.86 0.62 0.349 -0.041 -9 ,10713 ,KEBNE ,16691519,Thu Nov 25 13:52:05 CET,Thu Nov 25 15:55:59 CET,0.0 0.471 0.807 1.058 1.263 1.439 1.623 1.798 2.077 2.195 2.304 2.389 2.607 2.702 2.89 3.067 3.243 3.326 3.474 3.624 3.855 3.997 4.145 4.361 4.555 4.744 4.919 5.087 5.303 5.489 5.651 5.862 6.081 6.288 6.514 6.762 7.016 7.299 7.59 7.916 8.241 8.601 9.043 9.457 9.912 10.41 10.897 11.31 11.709 12.066 12.303 12.147 11.769 11.363 10.946 10.509 10.082 9.674 9.325 8.977 8.671 8.366 8.068 7.809 7.556 7.304 7.055 6.841 6.649 6.45 6.233 6.043 5.852 5.669 5.532 5.374 5.195 5.025 4.851 4.723 4.597 4.403 4.252 4.077 3.994 3.839 3.682 3.524 3.439 3.231 3.159 3.048 2.942 2.714 2.563 2.396 2.233 2.024 1.754 1.457 0.815 -10 ,2107 ,KEBNE ,16691520,Thu Nov 25 13:52:05 CET,Thu Nov 25 15:57:31 CET,0.0 0.402 0.683 0.906 1.12 1.306 1.445 1.585 1.863 1.978 2.086 2.18 2.411 2.531 2.754 2.961 3.151 3.237 3.405 3.601 3.864 4.009 4.159 4.379 4.567 4.731 4.899 5.063 5.258 5.448 5.641 5.873 6.084 6.285 6.526 6.798 7.045 7.312 7.601 7.911 8.248 8.573 8.944 9.336 9.741 10.165 10.616 11.057 11.519 11.962 12.108 11.757 11.275 10.796 10.306 9.818 9.391 8.971 8.577 8.183 7.866 7.592 7.31 7.034 6.751 6.48 6.211 5.995 5.813 5.62 5.41 5.224 5.026 4.812 4.644 4.48 4.32 4.155 3.98 3.867 3.746 3.527 3.375 3.224 3.145 2.985 2.819 2.626 2.526 2.306 2.201 2.071 1.948 1.732 1.607 1.472 1.326 1.118 0.8 0.459 -0.187 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6b.txt deleted file mode 100644 index 0a5d0ce5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_6e_6b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3012 ,KEBNE ,16691521,Thu Nov 25 13:52:05 CET,Thu Nov 25 15:57:44 CET,0.0 0.915 1.267 1.524 1.764 1.991 2.196 2.383 2.72 2.873 3.013 3.15 3.391 3.513 3.742 3.966 4.199 4.301 4.477 4.657 4.917 5.082 5.24 5.468 5.719 5.956 6.15 6.344 6.6 6.846 7.095 7.379 7.644 7.895 8.2 8.543 8.859 9.202 9.557 9.92 10.303 10.712 11.142 11.577 12.091 12.609 13.145 13.737 14.445 15.197 15.719 15.825 15.684 15.33 14.95 14.578 14.182 13.792 13.478 13.179 12.902 12.64 12.369 12.1 11.839 11.604 11.365 11.138 10.938 10.735 10.519 10.343 10.161 9.96 9.815 9.673 9.509 9.328 9.156 9.038 8.901 8.682 8.529 8.395 8.334 8.192 8.018 7.818 7.724 7.523 7.429 7.308 7.175 6.856 6.718 6.602 6.463 6.301 6.113 5.891 5.618 -2 ,9253 ,KEBNE ,16691522,Thu Nov 25 13:53:07 CET,Thu Nov 25 15:58:07 CET,0.0 0.827 1.219 1.485 1.726 1.926 2.088 2.262 2.634 2.797 2.939 3.096 3.341 3.458 3.677 3.892 4.08 4.17 4.363 4.543 4.791 4.95 5.11 5.332 5.533 5.731 5.935 6.129 6.363 6.6 6.826 7.086 7.335 7.563 7.826 8.127 8.423 8.741 9.065 9.424 9.775 10.151 10.634 11.095 11.612 12.172 12.746 13.301 13.861 14.467 14.97 15.044 14.825 14.546 14.203 13.805 13.435 13.082 12.763 12.427 12.131 11.86 11.594 11.328 11.062 10.809 10.555 10.344 10.156 9.966 9.782 9.61 9.428 9.227 9.067 8.913 8.734 8.55 8.372 8.258 8.132 7.926 7.789 7.647 7.573 7.419 7.261 7.084 6.993 6.785 6.69 6.578 6.471 6.273 6.161 6.031 5.89 5.739 5.555 5.259 4.328 -3 ,31984 ,KEBNE ,16691525,Thu Nov 25 13:53:07 CET,Thu Nov 25 15:59:13 CET,0.0 1.141 1.545 1.854 2.087 2.294 2.525 2.744 3.095 3.255 3.394 3.525 3.77 3.874 4.1 4.325 4.518 4.611 4.8 5.001 5.304 5.499 5.684 5.921 6.129 6.326 6.512 6.695 6.938 7.163 7.388 7.685 7.972 8.236 8.536 8.861 9.169 9.504 9.858 10.25 10.644 11.035 11.452 11.885 12.382 12.909 13.471 14.026 14.637 15.332 16.008 16.235 16.009 15.622 15.256 14.836 14.429 14.059 13.756 13.447 13.151 12.879 12.614 12.375 12.148 11.923 11.681 11.468 11.287 11.101 10.892 10.711 10.531 10.338 10.185 10.038 9.891 9.733 9.552 9.422 9.288 9.077 8.943 8.79 8.712 8.568 8.408 8.231 8.135 7.913 7.815 7.709 7.581 7.307 7.176 7.033 6.876 6.722 6.505 6.232 5.731 -4 ,4714 ,KEBNE ,16691526,Thu Nov 25 13:53:07 CET,Thu Nov 25 15:58:17 CET,0.0 0.884 1.31 1.637 1.891 2.077 2.246 2.426 2.756 2.919 3.077 3.232 3.486 3.621 3.861 4.079 4.261 4.351 4.552 4.743 5.013 5.187 5.362 5.604 5.827 6.036 6.235 6.436 6.705 6.975 7.229 7.525 7.806 8.057 8.34 8.65 8.938 9.256 9.582 9.93 10.326 10.747 11.198 11.622 12.137 12.718 13.331 13.972 14.604 15.211 15.689 15.781 15.598 15.253 14.88 14.565 14.252 13.916 13.603 13.268 12.979 12.703 12.406 12.135 11.884 11.652 11.436 11.249 11.07 10.873 10.653 10.475 10.294 10.092 9.936 9.778 9.619 9.449 9.276 9.159 9.024 8.8 8.654 8.503 8.423 8.266 8.107 7.922 7.817 7.594 7.507 7.397 7.285 7.035 6.894 6.696 6.483 6.29 6.048 5.77 5.385 -5 ,4766 ,KEBNE ,16691527,Thu Nov 25 13:53:07 CET,Thu Nov 25 15:56:41 CET,0.0 0.627 0.918 1.17 1.404 1.619 1.808 1.971 2.285 2.435 2.572 2.713 2.961 3.089 3.313 3.511 3.713 3.818 4.019 4.223 4.511 4.691 4.855 5.086 5.308 5.513 5.724 5.935 6.202 6.45 6.69 6.989 7.271 7.53 7.831 8.157 8.458 8.794 9.143 9.513 9.908 10.32 10.792 11.278 11.812 12.328 12.851 13.461 14.106 14.733 15.229 15.233 14.989 14.746 14.472 14.133 13.751 13.376 13.074 12.725 12.421 12.159 11.889 11.635 11.393 11.162 10.926 10.712 10.526 10.316 10.085 9.898 9.714 9.525 9.367 9.212 9.06 8.888 8.707 8.583 8.441 8.221 8.072 7.919 7.848 7.705 7.529 7.333 7.241 7.036 6.945 6.837 6.737 6.527 6.372 6.193 6.022 5.851 5.666 5.464 4.828 -6 ,30636 ,KEBNE ,16691528,Thu Nov 25 13:53:07 CET,Thu Nov 25 15:58:55 CET,0.0 1.013 1.412 1.738 1.994 2.198 2.395 2.585 2.963 3.141 3.302 3.48 3.724 3.839 4.07 4.293 4.515 4.624 4.843 5.053 5.329 5.509 5.679 5.926 6.161 6.381 6.579 6.774 7.043 7.269 7.477 7.762 8.053 8.33 8.636 8.961 9.281 9.624 9.967 10.332 10.698 11.088 11.516 11.932 12.408 12.875 13.4 14.031 14.691 15.268 15.672 15.777 15.648 15.4 15.134 14.823 14.532 14.248 13.958 13.647 13.374 13.107 12.844 12.611 12.377 12.161 11.938 11.709 11.499 11.289 11.074 10.902 10.72 10.536 10.397 10.248 10.087 9.923 9.754 9.626 9.48 9.269 9.138 9.003 8.928 8.769 8.61 8.428 8.329 8.098 8.0 7.899 7.787 7.536 7.411 7.284 7.126 6.907 6.672 6.417 5.943 -7 ,3643 ,KEBNE ,16691529,Thu Nov 25 13:53:07 CET,Thu Nov 25 15:58:56 CET,0.0 0.858 1.202 1.495 1.735 1.932 2.134 2.322 2.642 2.798 2.945 3.102 3.349 3.478 3.71 3.92 4.146 4.259 4.454 4.629 4.892 5.064 5.235 5.48 5.708 5.929 6.142 6.343 6.609 6.863 7.084 7.344 7.594 7.832 8.12 8.456 8.779 9.132 9.509 9.891 10.247 10.626 11.065 11.491 11.945 12.419 12.995 13.617 14.277 14.971 15.593 15.733 15.554 15.22 14.814 14.446 14.109 13.763 13.417 13.046 12.742 12.481 12.221 11.984 11.746 11.5 11.23 10.986 10.774 10.554 10.339 10.168 10.003 9.821 9.667 9.502 9.328 9.153 8.983 8.861 8.728 8.531 8.408 8.268 8.183 8.001 7.834 7.667 7.568 7.341 7.248 7.136 6.999 6.681 6.52 6.341 6.122 5.907 5.666 5.297 3.91 -8 ,10732 ,KEBNE ,16691530,Thu Nov 25 13:54:09 CET,Thu Nov 25 15:59:42 CET,0.0 1.028 1.367 1.633 1.853 2.04 2.224 2.403 2.749 2.911 3.05 3.2 3.436 3.554 3.798 4.015 4.213 4.318 4.51 4.673 4.908 5.064 5.211 5.422 5.63 5.837 6.033 6.22 6.457 6.684 6.907 7.18 7.444 7.685 7.949 8.257 8.549 8.833 9.124 9.447 9.827 10.254 10.718 11.186 11.718 12.334 13.019 13.707 14.344 14.886 15.322 15.409 15.238 14.932 14.568 14.235 13.932 13.574 13.233 12.894 12.586 12.304 12.032 11.748 11.476 11.235 11.005 10.804 10.613 10.404 10.198 10.025 9.828 9.624 9.479 9.336 9.183 9.032 8.87 8.742 8.613 8.411 8.268 8.123 8.046 7.884 7.71 7.528 7.424 7.198 7.121 7.021 6.897 6.621 6.464 6.3 6.124 5.919 5.718 5.494 5.001 -9 ,3471 ,KEBNE ,16691531,Thu Nov 25 13:55:11 CET,Thu Nov 25 15:59:31 CET,0.0 0.653 1.021 1.307 1.535 1.738 1.922 2.089 2.389 2.535 2.68 2.813 3.061 3.188 3.411 3.627 3.825 3.921 4.128 4.317 4.568 4.732 4.893 5.13 5.351 5.55 5.724 5.904 6.157 6.399 6.62 6.884 7.157 7.418 7.707 8.022 8.333 8.665 9.014 9.377 9.715 10.078 10.524 10.957 11.481 12.088 12.67 13.249 13.884 14.453 14.842 14.853 14.639 14.311 13.936 13.546 13.188 12.837 12.49 12.158 11.894 11.653 11.424 11.213 11.011 10.804 10.583 10.404 10.238 10.062 9.868 9.69 9.513 9.325 9.172 9.005 8.835 8.649 8.449 8.321 8.197 7.984 7.831 7.688 7.616 7.455 7.278 7.085 6.978 6.761 6.675 6.563 6.44 6.203 6.083 5.929 5.749 5.583 5.362 5.031 4.615 -10 ,17977 ,KEBNE ,16691532,Thu Nov 25 13:55:11 CET,Thu Nov 25 16:00:10 CET,0.0 0.777 1.136 1.409 1.662 1.848 2.021 2.191 2.505 2.667 2.822 3.001 3.268 3.397 3.658 3.928 4.166 4.272 4.489 4.695 4.982 5.167 5.352 5.598 5.809 6.028 6.238 6.437 6.715 6.981 7.216 7.484 7.744 7.987 8.26 8.58 8.893 9.235 9.593 9.947 10.312 10.734 11.257 11.783 12.332 12.896 13.516 14.145 14.779 15.484 16.062 16.131 15.992 15.674 15.272 14.893 14.542 14.23 13.954 13.63 13.342 13.079 12.816 12.557 12.314 12.098 11.87 11.659 11.469 11.278 11.069 10.889 10.713 10.518 10.354 10.192 10.038 9.879 9.685 9.543 9.406 9.214 9.085 8.942 8.868 8.712 8.544 8.378 8.298 8.1 8.035 7.935 7.821 7.561 7.411 7.267 7.128 6.975 6.802 6.557 6.114 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_7a_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_7a_3a.txt deleted file mode 100644 index 7ec3ef3c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/protein/Summary_FEP_7a_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31239 ,KEBNE ,16691533,Thu Nov 25 13:56:12 CET,Thu Nov 25 16:01:34 CET,0.0 0.382 0.592 0.789 0.975 1.135 1.28 1.418 1.697 1.825 1.935 2.028 2.263 2.369 2.568 2.753 2.928 3.011 3.173 3.335 3.569 3.714 3.852 4.06 4.257 4.439 4.611 4.775 4.988 5.217 5.441 5.695 5.95 6.197 6.468 6.767 7.078 7.432 7.788 8.164 8.568 9.019 9.56 10.1 10.727 11.417 12.218 13.092 14.101 15.203 16.329 17.124 17.465 17.571 17.459 17.194 16.849 16.491 16.175 15.861 15.626 15.377 15.071 14.751 14.456 14.198 13.929 13.661 13.404 13.171 12.976 12.804 12.594 12.372 12.189 11.99 11.794 11.586 11.362 11.208 11.052 10.818 10.668 10.51 10.427 10.255 10.066 9.87 9.761 9.53 9.404 9.271 9.127 8.835 8.649 8.438 8.234 7.978 7.666 7.251 5.737 -2 ,6637 ,KEBNE ,16691534,Thu Nov 25 13:56:12 CET,Thu Nov 25 16:01:17 CET,0.0 0.762 0.987 1.171 1.346 1.52 1.672 1.805 2.055 2.168 2.269 2.342 2.563 2.666 2.879 3.069 3.227 3.307 3.455 3.595 3.816 3.964 4.089 4.265 4.455 4.648 4.83 5.009 5.239 5.442 5.636 5.878 6.118 6.349 6.623 6.944 7.256 7.579 7.928 8.291 8.66 9.092 9.593 10.091 10.663 11.302 12.036 12.898 13.891 14.956 16.09 16.792 17.031 17.025 16.945 16.823 16.644 16.429 16.218 15.975 15.75 15.555 15.352 15.144 14.932 14.729 14.523 14.328 14.157 13.992 13.819 13.664 13.49 13.307 13.166 13.019 12.865 12.708 12.537 12.393 12.228 11.972 11.813 11.66 11.573 11.392 11.191 10.973 10.865 10.649 10.508 10.379 10.251 9.936 9.749 9.558 9.329 9.075 8.792 8.444 7.113 -3 ,25879 ,KEBNE ,16691535,Thu Nov 25 13:57:15 CET,Thu Nov 25 16:05:32 CET,0.0 0.887 1.213 1.432 1.591 1.738 1.884 2.027 2.304 2.442 2.57 2.661 2.879 2.977 3.181 3.359 3.525 3.603 3.759 3.913 4.147 4.306 4.45 4.66 4.862 5.064 5.259 5.445 5.685 5.91 6.115 6.356 6.612 6.868 7.162 7.484 7.791 8.133 8.494 8.864 9.237 9.678 10.205 10.696 11.268 11.92 12.676 13.5 14.401 15.437 16.596 17.273 17.471 17.402 17.222 17.029 16.769 16.483 16.247 16.002 15.791 15.581 15.354 15.121 14.883 14.676 14.444 14.211 14.008 13.783 13.53 13.335 13.132 12.905 12.74 12.576 12.405 12.215 12.001 11.849 11.684 11.426 11.252 11.071 10.97 10.76 10.54 10.289 10.158 9.921 9.771 9.618 9.451 9.124 8.94 8.726 8.477 8.193 7.882 7.461 6.378 -4 ,108 ,KEBNE ,16691536,Thu Nov 25 13:57:15 CET,Thu Nov 25 16:06:56 CET,0.0 0.584 0.865 1.077 1.26 1.415 1.558 1.688 1.902 2.003 2.105 2.161 2.366 2.45 2.625 2.797 2.969 3.051 3.206 3.357 3.563 3.696 3.837 4.04 4.214 4.381 4.551 4.722 4.942 5.144 5.348 5.613 5.875 6.118 6.392 6.718 7.035 7.39 7.766 8.149 8.542 8.983 9.488 9.964 10.539 11.249 12.065 12.942 13.925 15.017 16.219 17.013 17.205 17.126 17.032 16.916 16.756 16.578 16.392 16.161 15.934 15.727 15.524 15.287 15.036 14.804 14.571 14.371 14.194 13.996 13.79 13.624 13.452 13.263 13.117 12.956 12.777 12.604 12.424 12.301 12.176 11.955 11.796 11.619 11.519 11.314 11.081 10.834 10.722 10.502 10.362 10.211 10.052 9.736 9.544 9.325 9.092 8.839 8.519 8.099 6.606 -5 ,23654 ,KEBNE ,16691537,Thu Nov 25 13:57:15 CET,Thu Nov 25 16:03:41 CET,0.0 0.628 0.906 1.134 1.314 1.475 1.627 1.771 2.024 2.146 2.282 2.401 2.613 2.713 2.885 3.058 3.243 3.331 3.502 3.682 3.937 4.082 4.213 4.412 4.621 4.825 5.012 5.198 5.455 5.689 5.896 6.158 6.421 6.655 6.924 7.252 7.561 7.917 8.33 8.745 9.151 9.587 10.104 10.62 11.229 11.892 12.667 13.581 14.601 15.694 16.843 17.572 17.866 17.905 17.853 17.735 17.541 17.321 17.115 16.893 16.698 16.508 16.321 16.153 15.981 15.789 15.598 15.431 15.264 15.071 14.856 14.677 14.491 14.294 14.13 13.952 13.777 13.599 13.39 13.246 13.104 12.896 12.739 12.56 12.473 12.271 12.058 11.845 11.729 11.497 11.352 11.218 11.075 10.737 10.55 10.352 10.115 9.804 9.465 9.012 7.491 -6 ,5167 ,KEBNE ,16691538,Thu Nov 25 13:58:16 CET,Thu Nov 25 16:04:22 CET,0.0 0.37 0.594 0.798 0.974 1.112 1.249 1.385 1.636 1.748 1.858 1.95 2.186 2.293 2.48 2.685 2.888 2.975 3.142 3.3 3.513 3.662 3.814 4.007 4.19 4.381 4.576 4.768 5.001 5.209 5.406 5.655 5.905 6.15 6.427 6.727 7.022 7.348 7.701 8.066 8.443 8.854 9.321 9.82 10.389 11.002 11.712 12.503 13.454 14.548 15.832 16.72 16.983 17.015 16.964 16.899 16.817 16.653 16.454 16.251 16.08 15.899 15.723 15.542 15.323 15.1 14.86 14.65 14.467 14.263 14.024 13.822 13.632 13.441 13.293 13.138 12.973 12.803 12.612 12.463 12.307 12.065 11.892 11.72 11.632 11.442 11.233 10.997 10.879 10.648 10.48 10.333 10.185 9.829 9.626 9.428 9.209 8.968 8.601 8.025 5.988 -7 ,11032 ,KEBNE ,16691539,Thu Nov 25 13:58:16 CET,Thu Nov 25 16:03:25 CET,0.0 0.876 1.165 1.364 1.514 1.653 1.793 1.933 2.186 2.303 2.414 2.51 2.735 2.842 3.042 3.22 3.387 3.471 3.645 3.81 4.037 4.183 4.323 4.52 4.704 4.896 5.081 5.245 5.456 5.666 5.884 6.142 6.38 6.614 6.888 7.186 7.471 7.813 8.183 8.546 8.921 9.34 9.828 10.324 10.951 11.64 12.328 13.108 14.036 15.023 16.026 16.701 16.952 16.972 16.91 16.768 16.549 16.33 16.103 15.843 15.61 15.369 15.148 14.926 14.679 14.444 14.213 14.0 13.799 13.596 13.381 13.2 13.011 12.811 12.653 12.488 12.315 12.129 11.955 11.831 11.694 11.48 11.322 11.153 11.064 10.887 10.693 10.473 10.359 10.128 9.965 9.834 9.693 9.348 9.146 8.917 8.676 8.35 7.931 7.321 4.978 -8 ,21808 ,KEBNE ,16691540,Thu Nov 25 13:58:17 CET,Thu Nov 25 16:02:58 CET,0.0 0.678 0.988 1.213 1.413 1.581 1.75 1.912 2.179 2.291 2.403 2.492 2.714 2.821 3.029 3.223 3.395 3.48 3.647 3.793 3.993 4.139 4.303 4.519 4.71 4.902 5.103 5.297 5.557 5.808 6.042 6.334 6.605 6.856 7.145 7.46 7.773 8.125 8.492 8.908 9.342 9.786 10.31 10.863 11.508 12.207 12.984 13.841 14.861 15.937 17.048 17.886 18.157 18.115 17.957 17.737 17.452 17.199 16.963 16.68 16.434 16.181 15.934 15.699 15.475 15.258 15.013 14.81 14.632 14.425 14.211 14.036 13.844 13.634 13.47 13.301 13.114 12.909 12.694 12.554 12.414 12.17 11.99 11.805 11.716 11.539 11.351 11.147 11.027 10.781 10.611 10.471 10.342 10.029 9.852 9.672 9.463 9.223 8.935 8.496 7.497 -9 ,2652 ,KEBNE ,16691541,Thu Nov 25 13:58:16 CET,Thu Nov 25 16:03:15 CET,0.0 0.529 0.809 1.03 1.192 1.345 1.507 1.659 1.916 2.025 2.124 2.202 2.417 2.516 2.726 2.924 3.091 3.174 3.335 3.483 3.701 3.846 3.995 4.214 4.413 4.611 4.797 4.965 5.207 5.453 5.68 5.94 6.188 6.429 6.703 7.014 7.314 7.64 7.997 8.364 8.757 9.201 9.717 10.244 10.841 11.499 12.242 13.004 13.859 14.899 16.038 16.718 16.862 16.804 16.674 16.477 16.256 16.017 15.785 15.526 15.277 15.035 14.799 14.592 14.378 14.141 13.865 13.624 13.406 13.172 12.942 12.741 12.53 12.291 12.097 11.906 11.704 11.484 11.248 11.088 10.917 10.64 10.44 10.23 10.126 9.912 9.695 9.456 9.326 9.072 8.89 8.729 8.542 8.133 7.938 7.726 7.472 7.181 6.842 6.38 5.183 -10 ,24364 ,KEBNE ,16691542,Thu Nov 25 13:58:16 CET,Thu Nov 25 16:04:14 CET,0.0 0.557 0.794 1.019 1.218 1.349 1.504 1.643 1.881 1.998 2.105 2.171 2.384 2.478 2.656 2.829 2.994 3.073 3.224 3.371 3.579 3.71 3.84 4.035 4.226 4.413 4.594 4.762 4.986 5.206 5.406 5.649 5.886 6.109 6.365 6.651 6.914 7.21 7.549 7.913 8.305 8.759 9.301 9.84 10.425 11.059 11.791 12.61 13.576 14.645 15.882 16.743 16.997 17.014 16.975 16.888 16.726 16.521 16.325 16.114 15.922 15.719 15.508 15.325 15.158 14.968 14.75 14.579 14.428 14.254 14.061 13.891 13.729 13.582 13.454 13.3 13.113 12.901 12.703 12.562 12.412 12.184 12.01 11.822 11.724 11.534 11.346 11.131 11.01 10.784 10.662 10.536 10.397 10.093 9.936 9.778 9.575 9.332 9.076 8.719 7.55 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1a_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1a_5.txt deleted file mode 100644 index 83d20c87..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1a_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26561 ,KEBNE ,16691543,Thu Nov 25 13:58:16 CET,Thu Nov 25 15:36:23 CET,0.0 1.031 1.374 1.624 1.83 2.025 2.184 2.321 2.562 2.672 2.782 2.874 3.09 3.191 3.371 3.543 3.699 3.767 3.907 4.053 4.283 4.425 4.556 4.728 4.881 5.046 5.215 5.368 5.552 5.732 5.917 6.149 6.367 6.57 6.795 7.041 7.279 7.545 7.824 8.112 8.407 8.743 9.136 9.515 9.947 10.41 10.933 11.479 12.032 12.587 12.986 13.068 12.89 12.579 12.249 11.894 11.509 11.154 10.871 10.588 10.33 10.092 9.855 9.635 9.406 9.181 8.955 8.747 8.565 8.355 8.147 7.992 7.809 7.614 7.473 7.335 7.19 7.036 6.878 6.765 6.653 6.482 6.342 6.186 6.114 5.96 5.781 5.599 5.509 5.293 5.201 5.092 4.984 4.764 4.621 4.447 4.25 4.002 3.765 3.467 2.271 -2 ,9413 ,KEBNE ,16691544,Thu Nov 25 13:58:17 CET,Thu Nov 25 15:36:28 CET,0.0 0.893 1.204 1.449 1.67 1.871 2.041 2.176 2.408 2.523 2.625 2.695 2.913 3.012 3.196 3.349 3.49 3.565 3.719 3.854 4.038 4.159 4.276 4.442 4.614 4.786 4.95 5.105 5.301 5.482 5.655 5.88 6.098 6.292 6.522 6.789 7.028 7.279 7.573 7.894 8.209 8.549 8.944 9.34 9.77 10.236 10.725 11.231 11.792 12.337 12.848 12.921 12.755 12.518 12.189 11.848 11.48 11.12 10.847 10.575 10.304 10.05 9.825 9.618 9.409 9.199 8.973 8.771 8.597 8.422 8.224 8.054 7.868 7.666 7.514 7.351 7.183 7.016 6.834 6.712 6.585 6.371 6.227 6.077 6.001 5.847 5.682 5.495 5.39 5.172 5.087 4.975 4.863 4.588 4.423 4.253 4.08 3.887 3.62 3.332 2.724 -3 ,23941 ,KEBNE ,16691545,Thu Nov 25 13:58:19 CET,Thu Nov 25 15:33:16 CET,0.0 0.933 1.237 1.472 1.654 1.822 1.984 2.131 2.418 2.536 2.64 2.713 2.938 3.04 3.211 3.377 3.542 3.622 3.757 3.885 4.095 4.239 4.377 4.567 4.733 4.884 5.035 5.195 5.413 5.615 5.802 6.02 6.231 6.439 6.659 6.907 7.151 7.403 7.702 8.021 8.323 8.639 9.006 9.377 9.781 10.195 10.632 11.12 11.684 12.201 12.616 12.652 12.449 12.192 11.875 11.542 11.21 10.887 10.625 10.332 10.034 9.763 9.508 9.27 9.046 8.842 8.62 8.407 8.222 8.022 7.801 7.623 7.438 7.253 7.117 6.968 6.802 6.629 6.459 6.341 6.221 6.038 5.886 5.718 5.643 5.489 5.331 5.188 5.11 4.912 4.85 4.74 4.613 4.374 4.247 4.099 3.924 3.704 3.456 3.12 1.732 -4 ,17455 ,KEBNE ,16691546,Thu Nov 25 13:58:21 CET,Thu Nov 25 15:32:54 CET,0.0 0.476 0.717 0.958 1.174 1.355 1.5 1.624 1.834 1.944 2.059 2.122 2.333 2.421 2.577 2.707 2.838 2.907 3.046 3.183 3.379 3.494 3.606 3.767 3.936 4.103 4.264 4.431 4.643 4.828 4.996 5.21 5.41 5.592 5.81 6.054 6.296 6.575 6.872 7.187 7.507 7.828 8.211 8.592 9.008 9.499 10.002 10.481 11.086 11.705 12.149 12.263 12.141 11.884 11.573 11.249 10.929 10.63 10.342 10.039 9.792 9.548 9.292 9.059 8.836 8.615 8.385 8.185 8.009 7.821 7.626 7.46 7.283 7.107 6.969 6.818 6.666 6.512 6.353 6.23 6.1 5.92 5.789 5.641 5.565 5.397 5.228 5.064 4.973 4.764 4.669 4.547 4.417 4.17 4.031 3.861 3.684 3.482 3.265 3.041 2.512 -5 ,6685 ,KEBNE ,16691547,Thu Nov 25 13:58:20 CET,Thu Nov 25 15:32:32 CET,0.0 1.229 1.551 1.818 2.045 2.215 2.371 2.518 2.746 2.857 2.969 3.067 3.285 3.382 3.545 3.694 3.855 3.937 4.077 4.21 4.421 4.561 4.693 4.862 5.017 5.179 5.335 5.475 5.65 5.823 6.004 6.227 6.431 6.615 6.838 7.101 7.337 7.609 7.907 8.208 8.519 8.842 9.225 9.623 10.068 10.54 11.042 11.567 12.165 12.748 13.162 13.239 13.066 12.796 12.508 12.172 11.821 11.483 11.188 10.902 10.657 10.431 10.19 9.949 9.722 9.506 9.271 9.068 8.9 8.724 8.533 8.363 8.2 8.029 7.881 7.726 7.576 7.413 7.237 7.118 6.991 6.78 6.628 6.474 6.397 6.239 6.071 5.89 5.784 5.567 5.485 5.376 5.256 4.996 4.864 4.72 4.55 4.316 3.971 3.398 1.308 -6 ,25926 ,KEBNE ,16691548,Thu Nov 25 14:01:21 CET,Thu Nov 25 15:43:40 CET,0.0 0.309 0.495 0.661 0.816 0.94 1.05 1.163 1.359 1.458 1.559 1.639 1.845 1.919 2.072 2.212 2.334 2.405 2.55 2.68 2.855 2.967 3.077 3.228 3.377 3.532 3.681 3.823 4.016 4.207 4.4 4.62 4.818 5.017 5.248 5.503 5.743 6.002 6.291 6.587 6.9 7.238 7.61 7.979 8.409 8.875 9.389 9.92 10.445 10.985 11.415 11.46 11.302 11.061 10.732 10.374 10.028 9.684 9.385 9.099 8.85 8.61 8.381 8.157 7.925 7.705 7.476 7.273 7.093 6.902 6.694 6.516 6.346 6.173 6.023 5.863 5.712 5.552 5.371 5.251 5.134 4.941 4.802 4.667 4.606 4.483 4.345 4.202 4.123 3.918 3.837 3.737 3.635 3.401 3.276 3.154 3.019 2.872 2.703 2.498 2.226 -7 ,22090 ,KEBNE ,16691549,Thu Nov 25 14:01:21 CET,Thu Nov 25 15:45:03 CET,0.0 0.428 0.709 0.99 1.226 1.381 1.531 1.695 1.988 2.102 2.209 2.272 2.477 2.578 2.791 2.982 3.144 3.222 3.375 3.515 3.705 3.826 3.947 4.129 4.309 4.478 4.639 4.792 4.974 5.145 5.312 5.513 5.718 5.926 6.161 6.425 6.665 6.922 7.192 7.472 7.789 8.16 8.566 8.943 9.353 9.799 10.284 10.805 11.408 12.005 12.439 12.498 12.277 12.002 11.733 11.449 11.127 10.791 10.505 10.206 9.922 9.654 9.402 9.168 8.943 8.733 8.505 8.303 8.121 7.932 7.746 7.58 7.404 7.22 7.085 6.949 6.794 6.626 6.449 6.331 6.196 5.987 5.868 5.739 5.666 5.514 5.335 5.151 5.063 4.852 4.756 4.648 4.529 4.25 4.067 3.875 3.695 3.484 3.207 2.902 1.966 -8 ,13815 ,KEBNE ,16691550,Thu Nov 25 14:01:23 CET,Thu Nov 25 15:34:31 CET,0.0 0.729 1.037 1.262 1.454 1.64 1.822 1.982 2.246 2.364 2.466 2.555 2.781 2.875 3.047 3.214 3.371 3.445 3.583 3.718 3.927 4.061 4.187 4.371 4.559 4.74 4.908 5.083 5.308 5.507 5.689 5.919 6.14 6.327 6.546 6.802 7.035 7.282 7.56 7.852 8.137 8.448 8.818 9.212 9.666 10.148 10.679 11.239 11.781 12.247 12.69 12.766 12.546 12.281 11.964 11.643 11.339 11.033 10.768 10.484 10.215 9.966 9.725 9.477 9.236 9.019 8.782 8.575 8.398 8.207 8.017 7.867 7.693 7.504 7.369 7.224 7.061 6.896 6.727 6.602 6.47 6.253 6.111 5.966 5.89 5.749 5.594 5.419 5.325 5.104 5.012 4.905 4.778 4.483 4.329 4.149 3.95 3.737 3.506 3.184 2.191 -9 ,27745 ,KEBNE ,16691551,Thu Nov 25 14:02:26 CET,Thu Nov 25 15:38:42 CET,0.0 0.832 1.054 1.219 1.336 1.457 1.586 1.709 1.913 2.015 2.118 2.183 2.389 2.47 2.628 2.778 2.919 2.981 3.106 3.229 3.402 3.511 3.617 3.795 3.991 4.166 4.319 4.463 4.652 4.84 5.019 5.24 5.452 5.649 5.882 6.125 6.352 6.607 6.88 7.167 7.472 7.823 8.208 8.584 8.991 9.454 9.99 10.519 11.073 11.653 12.119 12.164 11.958 11.635 11.292 10.943 10.575 10.236 9.948 9.638 9.36 9.099 8.825 8.568 8.359 8.164 7.926 7.711 7.537 7.35 7.153 6.993 6.821 6.645 6.51 6.354 6.187 6.03 5.854 5.726 5.591 5.391 5.26 5.121 5.043 4.886 4.738 4.557 4.458 4.241 4.16 4.065 3.963 3.72 3.584 3.434 3.261 3.069 2.857 2.629 1.862 -10 ,2207 ,KEBNE ,16691552,Thu Nov 25 14:03:24 CET,Thu Nov 25 15:42:37 CET,0.0 1.207 1.531 1.779 1.965 2.126 2.275 2.402 2.644 2.754 2.851 2.938 3.153 3.242 3.417 3.591 3.758 3.834 3.991 4.14 4.349 4.487 4.62 4.815 5.009 5.187 5.347 5.507 5.709 5.908 6.1 6.319 6.53 6.738 6.967 7.216 7.468 7.751 8.042 8.335 8.644 8.987 9.367 9.765 10.233 10.714 11.222 11.747 12.295 12.872 13.396 13.395 13.152 12.875 12.557 12.206 11.86 11.532 11.236 10.923 10.659 10.417 10.171 9.935 9.722 9.518 9.296 9.094 8.932 8.772 8.588 8.419 8.242 8.066 7.925 7.786 7.643 7.49 7.328 7.212 7.087 6.886 6.74 6.593 6.519 6.357 6.185 5.995 5.897 5.685 5.585 5.476 5.364 5.123 4.963 4.77 4.581 4.32 3.935 3.473 2.568 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1a.txt deleted file mode 100644 index fd872a5f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4576 ,KEBNE ,16691553,Thu Nov 25 14:03:23 CET,Thu Nov 25 15:43:11 CET,0.0 0.907 1.167 1.375 1.551 1.7 1.856 2.008 2.282 2.404 2.512 2.606 2.817 2.9 3.069 3.242 3.409 3.482 3.605 3.741 3.938 4.062 4.177 4.337 4.497 4.648 4.793 4.939 5.128 5.306 5.476 5.659 5.84 6.037 6.265 6.496 6.694 6.903 7.126 7.391 7.661 7.917 8.224 8.525 8.854 9.187 9.522 9.84 10.099 10.262 10.277 9.92 9.388 8.883 8.384 7.89 7.429 7.01 6.647 6.265 5.903 5.565 5.257 4.966 4.67 4.407 4.147 3.911 3.711 3.501 3.272 3.09 2.901 2.696 2.547 2.39 2.215 2.036 1.842 1.713 1.588 1.37 1.214 1.053 0.969 0.791 0.6 0.405 0.31 0.1 -0.006 -0.134 -0.258 -0.521 -0.677 -0.847 -1.035 -1.222 -1.447 -1.756 -2.816 -2 ,10665 ,KEBNE ,16691554,Thu Nov 25 14:04:25 CET,Thu Nov 25 15:43:52 CET,0.0 0.986 1.266 1.491 1.71 1.881 2.037 2.187 2.435 2.557 2.671 2.765 2.976 3.067 3.24 3.4 3.552 3.623 3.767 3.904 4.085 4.206 4.321 4.478 4.633 4.791 4.945 5.079 5.242 5.398 5.552 5.748 5.924 6.092 6.305 6.519 6.722 6.95 7.175 7.392 7.615 7.873 8.167 8.445 8.748 9.054 9.374 9.71 10.004 10.203 10.174 9.791 9.294 8.748 8.27 7.83 7.398 6.978 6.599 6.186 5.829 5.517 5.204 4.903 4.604 4.332 4.081 3.869 3.687 3.478 3.244 3.057 2.869 2.676 2.527 2.362 2.186 2.01 1.841 1.722 1.588 1.362 1.199 1.035 0.951 0.784 0.623 0.466 0.379 0.167 0.099 -0.001 -0.098 -0.326 -0.452 -0.586 -0.736 -0.909 -1.116 -1.393 -2.212 -3 ,2219 ,KEBNE ,16691555,Thu Nov 25 14:04:26 CET,Thu Nov 25 15:44:53 CET,0.0 0.538 0.779 0.982 1.137 1.269 1.374 1.475 1.68 1.769 1.85 1.901 2.093 2.163 2.308 2.448 2.599 2.673 2.806 2.93 3.102 3.22 3.339 3.518 3.682 3.835 3.981 4.113 4.288 4.462 4.626 4.819 4.998 5.166 5.368 5.577 5.76 5.972 6.201 6.434 6.672 6.924 7.201 7.465 7.764 8.085 8.421 8.757 9.044 9.207 9.151 8.753 8.245 7.662 7.075 6.556 6.081 5.628 5.244 4.863 4.523 4.193 3.889 3.626 3.367 3.127 2.871 2.634 2.442 2.252 2.05 1.874 1.694 1.512 1.358 1.195 1.017 0.825 0.64 0.515 0.387 0.181 0.034 -0.11 -0.181 -0.326 -0.484 -0.661 -0.757 -0.963 -1.016 -1.117 -1.221 -1.439 -1.553 -1.685 -1.844 -2.036 -2.267 -2.575 -3.465 -4 ,25617 ,KEBNE ,16691556,Thu Nov 25 14:04:25 CET,Thu Nov 25 15:44:01 CET,0.0 0.381 0.556 0.694 0.819 0.944 1.061 1.17 1.365 1.465 1.554 1.583 1.781 1.859 2.001 2.138 2.255 2.307 2.425 2.553 2.727 2.833 2.943 3.107 3.256 3.398 3.536 3.672 3.86 4.032 4.191 4.402 4.594 4.762 4.955 5.155 5.355 5.567 5.772 6.008 6.263 6.523 6.793 7.064 7.371 7.661 7.958 8.284 8.63 8.857 8.799 8.365 7.878 7.362 6.797 6.291 5.858 5.44 5.059 4.687 4.362 4.062 3.771 3.492 3.226 2.989 2.737 2.501 2.308 2.107 1.893 1.705 1.496 1.287 1.132 0.974 0.815 0.644 0.456 0.33 0.189 -0.031 -0.181 -0.339 -0.421 -0.594 -0.765 -0.946 -1.049 -1.272 -1.359 -1.484 -1.622 -1.893 -2.045 -2.228 -2.432 -2.674 -2.981 -3.329 -4.257 -5 ,25533 ,KEBNE ,16691557,Thu Nov 25 14:05:27 CET,Thu Nov 25 15:45:39 CET,0.0 1.232 1.545 1.775 1.969 2.158 2.331 2.483 2.729 2.83 2.928 3.014 3.235 3.337 3.511 3.664 3.814 3.886 4.02 4.153 4.334 4.453 4.559 4.709 4.864 4.998 5.13 5.267 5.45 5.609 5.75 5.941 6.117 6.28 6.484 6.704 6.899 7.125 7.363 7.61 7.877 8.155 8.455 8.745 9.046 9.351 9.693 10.015 10.312 10.489 10.438 9.994 9.41 8.827 8.269 7.767 7.335 6.905 6.486 6.061 5.71 5.388 5.081 4.803 4.531 4.289 4.05 3.831 3.636 3.439 3.226 3.033 2.82 2.608 2.456 2.295 2.115 1.927 1.736 1.608 1.472 1.255 1.103 0.928 0.839 0.665 0.477 0.255 0.144 -0.083 -0.21 -0.33 -0.459 -0.727 -0.881 -1.056 -1.227 -1.435 -1.718 -2.137 -3.239 -6 ,286 ,KEBNE ,16691558,Thu Nov 25 14:05:27 CET,Thu Nov 25 15:43:14 CET,0.0 0.881 1.28 1.528 1.722 1.905 2.044 2.184 2.453 2.56 2.665 2.753 2.957 3.036 3.192 3.345 3.488 3.556 3.677 3.797 3.981 4.094 4.194 4.36 4.544 4.702 4.84 4.963 5.128 5.3 5.457 5.631 5.797 5.971 6.162 6.365 6.576 6.801 7.02 7.257 7.506 7.751 8.014 8.261 8.524 8.834 9.189 9.521 9.837 10.063 9.999 9.543 9.018 8.512 7.965 7.422 6.947 6.492 6.059 5.65 5.311 4.99 4.68 4.379 4.097 3.85 3.596 3.363 3.172 2.972 2.768 2.593 2.394 2.2 2.064 1.928 1.77 1.599 1.423 1.303 1.187 1.015 0.887 0.755 0.692 0.56 0.407 0.226 0.133 -0.08 -0.141 -0.239 -0.346 -0.604 -0.748 -0.885 -1.03 -1.183 -1.36 -1.58 -2.091 -7 ,17751 ,KEBNE ,16691559,Thu Nov 25 14:05:27 CET,Thu Nov 25 15:46:19 CET,0.0 0.59 0.829 0.997 1.164 1.3 1.414 1.529 1.748 1.855 1.943 1.973 2.176 2.239 2.369 2.515 2.652 2.71 2.832 2.963 3.157 3.291 3.41 3.569 3.735 3.895 4.052 4.198 4.38 4.555 4.72 4.921 5.111 5.282 5.472 5.697 5.912 6.128 6.363 6.616 6.89 7.17 7.463 7.754 8.074 8.415 8.779 9.132 9.431 9.628 9.553 9.121 8.612 8.085 7.585 7.074 6.602 6.178 5.807 5.452 5.13 4.831 4.552 4.27 3.991 3.733 3.457 3.208 2.999 2.774 2.543 2.373 2.196 2.016 1.873 1.71 1.535 1.357 1.172 1.03 0.886 0.652 0.493 0.35 0.279 0.124 -0.046 -0.219 -0.309 -0.53 -0.619 -0.718 -0.83 -1.083 -1.206 -1.341 -1.494 -1.68 -1.894 -2.131 -3.066 -8 ,10146 ,KEBNE ,16691560,Thu Nov 25 14:06:29 CET,Thu Nov 25 15:45:32 CET,0.0 0.854 1.162 1.425 1.625 1.785 1.949 2.092 2.337 2.466 2.586 2.667 2.872 2.96 3.123 3.269 3.431 3.505 3.638 3.77 3.955 4.068 4.172 4.334 4.503 4.657 4.802 4.942 5.099 5.249 5.405 5.6 5.797 5.975 6.172 6.399 6.611 6.828 7.059 7.304 7.569 7.845 8.118 8.401 8.715 9.023 9.344 9.641 9.905 10.085 10.056 9.713 9.207 8.657 8.128 7.638 7.191 6.765 6.395 6.004 5.646 5.341 5.042 4.749 4.491 4.265 4.013 3.778 3.583 3.381 3.155 2.956 2.76 2.559 2.408 2.25 2.072 1.881 1.684 1.556 1.424 1.205 1.05 0.87 0.777 0.614 0.444 0.26 0.16 -0.062 -0.169 -0.292 -0.414 -0.696 -0.855 -1.021 -1.218 -1.444 -1.671 -1.923 -2.735 -9 ,25044 ,KEBNE ,16691561,Thu Nov 25 14:07:30 CET,Thu Nov 25 15:44:08 CET,0.0 0.481 0.692 0.876 1.031 1.169 1.29 1.406 1.598 1.679 1.772 1.83 2.024 2.1 2.259 2.403 2.528 2.589 2.701 2.809 2.972 3.076 3.174 3.311 3.449 3.588 3.716 3.844 4.009 4.15 4.288 4.462 4.626 4.788 4.981 5.197 5.392 5.608 5.835 6.078 6.335 6.606 6.914 7.205 7.503 7.807 8.137 8.443 8.727 8.955 8.914 8.506 7.981 7.442 6.925 6.439 6.02 5.581 5.138 4.725 4.349 4.023 3.746 3.475 3.225 2.995 2.747 2.522 2.321 2.098 1.861 1.673 1.476 1.271 1.111 0.929 0.744 0.566 0.377 0.25 0.119 -0.089 -0.237 -0.395 -0.476 -0.639 -0.807 -0.996 -1.096 -1.322 -1.457 -1.583 -1.697 -1.95 -2.1 -2.256 -2.42 -2.626 -2.881 -3.223 -4.331 -10 ,14906 ,KEBNE ,16691562,Thu Nov 25 14:07:30 CET,Thu Nov 25 15:46:59 CET,0.0 0.844 1.199 1.513 1.733 1.895 2.043 2.185 2.453 2.576 2.698 2.794 3.001 3.099 3.284 3.438 3.595 3.667 3.793 3.919 4.112 4.239 4.364 4.528 4.667 4.808 4.952 5.099 5.292 5.466 5.617 5.794 5.972 6.141 6.336 6.544 6.73 6.936 7.179 7.448 7.697 7.958 8.24 8.501 8.816 9.129 9.442 9.767 10.065 10.281 10.227 9.761 9.232 8.696 8.2 7.703 7.207 6.757 6.354 5.946 5.621 5.32 5.031 4.776 4.527 4.274 4.009 3.791 3.597 3.374 3.146 2.96 2.774 2.579 2.409 2.228 2.048 1.877 1.71 1.584 1.445 1.22 1.065 0.921 0.849 0.691 0.523 0.368 0.276 0.054 -0.039 -0.146 -0.277 -0.575 -0.745 -0.935 -1.136 -1.354 -1.627 -1.958 -2.687 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1c.txt deleted file mode 100644 index 0dfd9681..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6559 ,KEBNE ,16691563,Thu Nov 25 14:08:32 CET,Thu Nov 25 15:49:00 CET,0.0 0.985 1.292 1.521 1.686 1.834 1.967 2.094 2.31 2.408 2.512 2.573 2.771 2.844 3.018 3.184 3.311 3.376 3.5 3.61 3.792 3.908 4.017 4.18 4.339 4.488 4.634 4.786 4.978 5.152 5.306 5.502 5.7 5.877 6.084 6.307 6.506 6.729 6.975 7.24 7.54 7.869 8.204 8.494 8.816 9.177 9.558 9.894 10.211 10.461 10.497 10.2 9.71 9.188 8.682 8.191 7.764 7.362 6.981 6.577 6.243 5.944 5.648 5.381 5.133 4.905 4.671 4.459 4.277 4.085 3.865 3.658 3.445 3.26 3.123 2.97 2.807 2.633 2.45 2.329 2.204 2.014 1.886 1.753 1.681 1.519 1.36 1.178 1.074 0.86 0.776 0.655 0.529 0.298 0.168 0.004 -0.17 -0.364 -0.645 -1.008 -2.003 -2 ,4098 ,KEBNE ,16691564,Thu Nov 25 14:08:31 CET,Thu Nov 25 15:50:02 CET,0.0 1.685 2.064 2.37 2.605 2.793 2.957 3.093 3.342 3.472 3.606 3.704 3.918 4.018 4.189 4.347 4.513 4.596 4.746 4.893 5.099 5.231 5.359 5.519 5.661 5.82 5.978 6.123 6.318 6.498 6.658 6.849 7.059 7.256 7.446 7.656 7.875 8.129 8.387 8.648 8.918 9.207 9.536 9.818 10.107 10.444 10.835 11.205 11.519 11.806 11.889 11.542 11.003 10.448 9.944 9.49 9.017 8.578 8.212 7.805 7.447 7.139 6.852 6.59 6.35 6.119 5.873 5.643 5.448 5.24 4.989 4.776 4.567 4.354 4.189 4.026 3.86 3.672 3.468 3.332 3.197 2.985 2.849 2.704 2.63 2.484 2.303 2.126 2.043 1.826 1.733 1.618 1.492 1.21 1.051 0.895 0.733 0.535 0.345 0.117 -0.637 -3 ,3849 ,KEBNE ,16691565,Thu Nov 25 14:09:33 CET,Thu Nov 25 15:50:13 CET,0.0 1.188 1.563 1.835 2.051 2.238 2.393 2.524 2.768 2.89 3.0 3.091 3.309 3.418 3.614 3.801 3.961 4.027 4.169 4.311 4.515 4.648 4.783 4.972 5.143 5.299 5.45 5.59 5.767 5.937 6.093 6.276 6.455 6.641 6.864 7.106 7.321 7.566 7.825 8.092 8.371 8.642 8.925 9.221 9.553 9.89 10.218 10.521 10.834 11.068 11.091 10.731 10.215 9.688 9.19 8.713 8.281 7.845 7.476 7.112 6.772 6.473 6.197 5.923 5.66 5.4 5.121 4.894 4.687 4.471 4.243 4.053 3.854 3.648 3.496 3.33 3.149 2.971 2.778 2.653 2.534 2.341 2.21 2.049 1.965 1.801 1.625 1.447 1.358 1.153 1.085 0.983 0.875 0.638 0.51 0.371 0.229 0.097 -0.084 -0.347 -0.852 -4 ,7158 ,KEBNE ,16691566,Thu Nov 25 14:08:32 CET,Thu Nov 25 15:47:22 CET,0.0 0.944 1.25 1.468 1.682 1.862 2.034 2.184 2.421 2.534 2.65 2.764 2.983 3.087 3.285 3.455 3.623 3.702 3.849 4.003 4.231 4.356 4.464 4.631 4.795 4.947 5.086 5.228 5.422 5.601 5.771 5.965 6.158 6.345 6.546 6.781 7.007 7.248 7.498 7.733 7.981 8.251 8.546 8.828 9.148 9.492 9.84 10.17 10.466 10.692 10.697 10.305 9.782 9.248 8.717 8.233 7.792 7.342 6.956 6.578 6.239 5.946 5.666 5.385 5.141 4.934 4.7 4.469 4.272 4.076 3.842 3.65 3.471 3.27 3.108 2.947 2.783 2.604 2.404 2.271 2.139 1.922 1.775 1.623 1.538 1.366 1.193 1.007 0.905 0.677 0.565 0.446 0.322 0.055 -0.096 -0.252 -0.42 -0.654 -0.953 -1.31 -2.272 -5 ,24562 ,KEBNE ,16691567,Thu Nov 25 14:27:08 CET,Thu Nov 25 16:04:04 CET,0.0 1.202 1.718 2.028 2.236 2.416 2.602 2.747 2.976 3.089 3.203 3.317 3.539 3.644 3.839 4.004 4.151 4.234 4.397 4.534 4.725 4.856 4.99 5.178 5.353 5.517 5.661 5.79 5.966 6.145 6.319 6.524 6.719 6.91 7.14 7.389 7.588 7.807 8.071 8.348 8.617 8.886 9.188 9.485 9.807 10.181 10.559 10.9 11.234 11.469 11.466 11.096 10.616 10.12 9.67 9.219 8.794 8.406 8.041 7.663 7.317 6.996 6.692 6.399 6.13 5.887 5.64 5.418 5.225 5.021 4.811 4.634 4.451 4.273 4.137 3.997 3.853 3.7 3.536 3.411 3.282 3.097 2.969 2.838 2.771 2.642 2.517 2.377 2.306 2.106 2.041 1.938 1.832 1.625 1.521 1.403 1.268 1.134 0.94 0.684 0.099 -6 ,13034 ,KEBNE ,16691568,Thu Nov 25 14:27:08 CET,Thu Nov 25 16:04:29 CET,0.0 0.651 0.895 1.066 1.215 1.358 1.483 1.61 1.845 1.947 2.041 2.097 2.301 2.381 2.522 2.655 2.782 2.849 2.982 3.096 3.259 3.362 3.461 3.606 3.767 3.933 4.097 4.245 4.415 4.589 4.75 4.951 5.155 5.341 5.559 5.793 6.023 6.266 6.489 6.726 6.979 7.257 7.566 7.856 8.173 8.5 8.851 9.215 9.597 9.919 9.954 9.567 9.034 8.509 8.046 7.582 7.15 6.761 6.418 6.06 5.74 5.434 5.118 4.825 4.534 4.273 4.039 3.818 3.613 3.41 3.204 3.025 2.835 2.631 2.468 2.296 2.118 1.939 1.74 1.604 1.475 1.27 1.125 0.966 0.881 0.722 0.563 0.373 0.278 0.068 -0.006 -0.095 -0.187 -0.405 -0.534 -0.657 -0.778 -0.923 -1.087 -1.309 -1.664 -7 ,12143 ,KEBNE ,16691569,Thu Nov 25 14:27:09 CET,Thu Nov 25 16:04:35 CET,0.0 0.919 1.249 1.469 1.647 1.822 1.976 2.122 2.417 2.555 2.697 2.823 3.031 3.125 3.297 3.456 3.606 3.671 3.814 3.954 4.151 4.275 4.395 4.574 4.731 4.86 4.997 5.144 5.337 5.529 5.706 5.922 6.121 6.297 6.497 6.711 6.919 7.154 7.396 7.639 7.899 8.184 8.488 8.779 9.118 9.449 9.777 10.129 10.424 10.612 10.579 10.162 9.691 9.185 8.656 8.192 7.754 7.335 6.995 6.631 6.296 5.985 5.685 5.393 5.116 4.872 4.63 4.416 4.211 3.999 3.797 3.631 3.452 3.254 3.099 2.947 2.79 2.609 2.411 2.281 2.148 1.948 1.796 1.615 1.529 1.377 1.225 1.038 0.936 0.724 0.637 0.523 0.395 0.127 -0.005 -0.143 -0.308 -0.506 -0.768 -1.087 -1.991 -8 ,10363 ,KEBNE ,16691570,Thu Nov 25 14:28:11 CET,Thu Nov 25 16:07:14 CET,0.0 1.196 1.544 1.861 2.113 2.328 2.519 2.695 3.011 3.155 3.284 3.369 3.597 3.692 3.89 4.072 4.24 4.32 4.453 4.579 4.787 4.922 5.045 5.232 5.408 5.564 5.712 5.841 6.008 6.183 6.357 6.567 6.772 6.967 7.175 7.388 7.596 7.831 8.077 8.344 8.613 8.895 9.207 9.507 9.828 10.15 10.508 10.866 11.198 11.433 11.376 10.962 10.451 9.864 9.301 8.774 8.308 7.917 7.585 7.217 6.87 6.561 6.275 5.99 5.719 5.489 5.243 5.025 4.842 4.634 4.399 4.217 4.025 3.826 3.676 3.519 3.354 3.178 2.997 2.864 2.722 2.502 2.357 2.196 2.106 1.932 1.744 1.536 1.43 1.206 1.097 0.991 0.889 0.639 0.497 0.335 0.147 -0.073 -0.347 -0.647 -1.579 -9 ,10395 ,KEBNE ,16691571,Thu Nov 25 14:28:11 CET,Thu Nov 25 16:05:26 CET,0.0 0.898 1.263 1.516 1.775 2.015 2.169 2.307 2.571 2.685 2.8 2.899 3.118 3.213 3.411 3.612 3.793 3.866 4.01 4.151 4.355 4.48 4.584 4.744 4.905 5.068 5.232 5.378 5.558 5.74 5.908 6.103 6.298 6.475 6.692 6.941 7.155 7.395 7.641 7.877 8.115 8.38 8.678 8.98 9.326 9.662 10.027 10.394 10.733 10.976 10.93 10.5 9.974 9.401 8.875 8.411 7.961 7.539 7.181 6.824 6.522 6.243 5.953 5.658 5.399 5.174 4.936 4.726 4.548 4.353 4.125 3.922 3.706 3.487 3.329 3.175 3.013 2.838 2.661 2.54 2.407 2.193 2.064 1.945 1.88 1.736 1.569 1.396 1.314 1.094 0.966 0.852 0.734 0.451 0.312 0.171 0.002 -0.193 -0.437 -0.834 -2.008 -10 ,3674 ,KEBNE ,16691572,Thu Nov 25 14:29:14 CET,Thu Nov 25 16:06:20 CET,0.0 0.904 1.158 1.376 1.552 1.697 1.818 1.922 2.132 2.23 2.322 2.374 2.588 2.686 2.853 3.002 3.129 3.195 3.327 3.456 3.642 3.751 3.856 4.013 4.16 4.287 4.414 4.544 4.704 4.856 4.997 5.176 5.366 5.542 5.749 5.987 6.193 6.414 6.66 6.918 7.179 7.463 7.785 8.1 8.437 8.759 9.096 9.432 9.732 9.965 9.978 9.593 9.108 8.628 8.16 7.656 7.169 6.738 6.371 6.008 5.692 5.38 5.07 4.791 4.554 4.333 4.075 3.851 3.651 3.428 3.209 3.037 2.853 2.666 2.516 2.343 2.161 1.985 1.813 1.687 1.538 1.307 1.159 1.002 0.915 0.74 0.575 0.418 0.329 0.097 -0.019 -0.13 -0.257 -0.54 -0.686 -0.847 -1.039 -1.257 -1.477 -1.739 -2.619 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1d.txt deleted file mode 100644 index a8622933..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_1d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23542 ,KEBNE ,16691573,Thu Nov 25 14:29:14 CET,Thu Nov 25 16:06:44 CET,0.0 1.088 1.478 1.723 1.901 2.07 2.237 2.407 2.742 2.892 3.02 3.128 3.355 3.464 3.66 3.852 4.034 4.124 4.312 4.484 4.71 4.847 4.973 5.161 5.351 5.534 5.709 5.875 6.084 6.276 6.465 6.687 6.902 7.11 7.337 7.592 7.824 8.058 8.313 8.593 8.875 9.181 9.523 9.862 10.22 10.551 10.909 11.248 11.574 11.785 11.67 11.197 10.658 10.121 9.607 9.112 8.64 8.221 7.867 7.489 7.144 6.842 6.551 6.255 5.995 5.763 5.513 5.294 5.095 4.888 4.674 4.485 4.282 4.071 3.916 3.756 3.58 3.402 3.23 3.113 2.996 2.784 2.626 2.469 2.387 2.222 2.059 1.881 1.78 1.568 1.489 1.356 1.219 0.966 0.813 0.641 0.471 0.249 0.002 -0.272 -0.628 -2 ,16501 ,KEBNE ,16691574,Thu Nov 25 14:29:14 CET,Thu Nov 25 16:07:55 CET,0.0 0.967 1.375 1.687 1.942 2.157 2.353 2.538 2.83 2.974 3.113 3.256 3.494 3.604 3.8 3.989 4.162 4.242 4.407 4.559 4.799 4.95 5.084 5.298 5.509 5.706 5.894 6.075 6.291 6.481 6.663 6.904 7.135 7.327 7.534 7.779 8.004 8.237 8.495 8.768 9.046 9.358 9.691 10.0 10.314 10.612 10.975 11.355 11.666 11.84 11.749 11.333 10.797 10.218 9.693 9.223 8.772 8.343 7.965 7.576 7.238 6.919 6.617 6.339 6.071 5.811 5.557 5.345 5.141 4.917 4.691 4.511 4.329 4.129 3.971 3.81 3.64 3.463 3.3 3.193 3.076 2.905 2.785 2.664 2.599 2.465 2.329 2.176 2.104 1.902 1.83 1.735 1.647 1.45 1.332 1.199 1.064 0.914 0.723 0.469 -0.17 -3 ,30848 ,KEBNE ,16691575,Thu Nov 25 14:30:17 CET,Thu Nov 25 16:07:31 CET,0.0 0.906 1.234 1.469 1.712 1.933 2.121 2.296 2.627 2.767 2.896 3.048 3.288 3.4 3.609 3.805 3.981 4.06 4.219 4.374 4.595 4.743 4.87 5.042 5.216 5.381 5.54 5.691 5.891 6.084 6.268 6.502 6.706 6.886 7.11 7.366 7.6 7.858 8.125 8.379 8.65 8.945 9.263 9.566 9.876 10.234 10.613 10.948 11.255 11.434 11.326 10.787 10.147 9.552 9.003 8.459 7.972 7.519 7.095 6.685 6.351 6.033 5.731 5.451 5.179 4.938 4.683 4.438 4.238 4.04 3.823 3.637 3.447 3.25 3.089 2.918 2.75 2.575 2.396 2.278 2.144 1.937 1.8 1.64 1.556 1.391 1.233 1.07 0.976 0.758 0.667 0.556 0.436 0.182 0.015 -0.153 -0.313 -0.514 -0.747 -1.067 -2.132 -4 ,2698 ,KEBNE ,16691576,Thu Nov 25 14:30:16 CET,Thu Nov 25 16:07:40 CET,0.0 1.086 1.422 1.676 1.922 2.143 2.337 2.507 2.796 2.926 3.051 3.162 3.38 3.478 3.675 3.86 4.033 4.116 4.278 4.438 4.657 4.798 4.945 5.148 5.335 5.513 5.682 5.859 6.079 6.28 6.474 6.685 6.879 7.075 7.304 7.546 7.77 8.0 8.247 8.512 8.784 9.067 9.374 9.679 9.991 10.322 10.679 10.999 11.3 11.5 11.415 10.95 10.394 9.859 9.353 8.842 8.332 7.869 7.512 7.156 6.806 6.488 6.191 5.907 5.636 5.381 5.099 4.847 4.639 4.416 4.199 4.013 3.803 3.596 3.445 3.283 3.111 2.93 2.745 2.627 2.499 2.284 2.143 1.998 1.917 1.744 1.561 1.379 1.277 1.054 0.973 0.844 0.722 0.529 0.432 0.321 0.184 0.045 -0.108 -0.337 -0.985 -5 ,30398 ,KEBNE ,16691577,Thu Nov 25 14:31:19 CET,Thu Nov 25 16:13:12 CET,0.0 1.992 2.567 2.915 3.174 3.371 3.549 3.76 4.102 4.229 4.362 4.519 4.761 4.866 5.066 5.26 5.429 5.511 5.675 5.835 6.057 6.197 6.329 6.522 6.708 6.873 7.034 7.19 7.381 7.584 7.785 8.004 8.214 8.418 8.647 8.897 9.129 9.367 9.625 9.883 10.137 10.431 10.735 11.025 11.365 11.698 12.045 12.397 12.713 12.875 12.763 12.317 11.725 11.149 10.605 10.106 9.649 9.206 8.817 8.397 8.01 7.693 7.417 7.149 6.889 6.64 6.38 6.152 5.943 5.721 5.505 5.331 5.144 4.942 4.791 4.634 4.47 4.31 4.154 4.042 3.913 3.705 3.563 3.423 3.351 3.2 3.039 2.831 2.723 2.501 2.402 2.292 2.176 1.94 1.812 1.668 1.498 1.276 1.019 0.698 -0.281 -6 ,29767 ,KEBNE ,16691578,Thu Nov 25 14:32:21 CET,Thu Nov 25 16:14:36 CET,0.0 0.953 1.299 1.565 1.789 1.954 2.091 2.23 2.475 2.592 2.709 2.818 3.051 3.155 3.329 3.486 3.639 3.72 3.874 4.03 4.258 4.392 4.52 4.709 4.877 5.034 5.191 5.344 5.555 5.756 5.942 6.17 6.377 6.573 6.806 7.051 7.272 7.507 7.747 7.994 8.266 8.558 8.888 9.207 9.568 9.965 10.353 10.714 11.042 11.211 11.146 10.737 10.226 9.697 9.185 8.712 8.266 7.838 7.461 7.101 6.766 6.441 6.146 5.887 5.636 5.395 5.156 4.933 4.732 4.532 4.32 4.141 3.953 3.757 3.606 3.451 3.281 3.089 2.879 2.735 2.599 2.411 2.256 2.075 1.997 1.844 1.681 1.522 1.433 1.206 1.093 0.969 0.828 0.55 0.403 0.262 0.134 -0.022 -0.19 -0.368 -0.786 -7 ,23802 ,KEBNE ,16691579,Thu Nov 25 14:32:26 CET,Thu Nov 25 16:06:30 CET,0.0 1.546 2.033 2.38 2.621 2.826 3.028 3.201 3.495 3.634 3.782 3.944 4.183 4.304 4.52 4.705 4.888 4.973 5.126 5.284 5.52 5.663 5.797 6.004 6.193 6.359 6.519 6.68 6.897 7.093 7.264 7.474 7.682 7.866 8.079 8.313 8.542 8.798 9.051 9.326 9.619 9.933 10.27 10.579 10.907 11.251 11.622 11.931 12.178 12.397 12.365 11.898 11.332 10.807 10.293 9.763 9.285 8.854 8.456 8.051 7.723 7.435 7.156 6.897 6.637 6.393 6.154 5.918 5.708 5.501 5.293 5.107 4.914 4.721 4.561 4.381 4.195 4.022 3.833 3.693 3.563 3.374 3.23 3.077 2.998 2.819 2.652 2.477 2.381 2.168 2.079 1.963 1.833 1.574 1.444 1.294 1.115 0.912 0.667 0.29 -0.91 -8 ,6849 ,KEBNE ,16691580,Thu Nov 25 14:32:22 CET,Thu Nov 25 16:11:05 CET,0.0 1.7 2.161 2.505 2.737 2.968 3.18 3.345 3.65 3.797 3.932 4.056 4.281 4.384 4.606 4.799 4.968 5.051 5.206 5.374 5.629 5.779 5.925 6.132 6.312 6.485 6.653 6.817 7.018 7.196 7.361 7.568 7.782 7.975 8.192 8.443 8.667 8.91 9.176 9.455 9.723 9.989 10.303 10.645 11.018 11.373 11.719 12.047 12.305 12.451 12.368 11.875 11.313 10.752 10.208 9.691 9.238 8.811 8.412 8.023 7.702 7.387 7.088 6.825 6.565 6.319 6.077 5.863 5.655 5.436 5.224 5.047 4.869 4.678 4.527 4.371 4.21 4.046 3.87 3.753 3.624 3.419 3.282 3.133 3.053 2.883 2.722 2.569 2.483 2.266 2.188 2.078 1.961 1.694 1.54 1.366 1.158 0.919 0.661 0.369 -0.308 -9 ,28339 ,KEBNE ,16691581,Thu Nov 25 14:32:21 CET,Thu Nov 25 16:09:32 CET,0.0 1.204 1.583 1.855 2.084 2.276 2.439 2.579 2.863 2.993 3.099 3.181 3.394 3.49 3.672 3.835 3.988 4.062 4.21 4.355 4.55 4.679 4.811 5.001 5.18 5.344 5.488 5.617 5.792 5.97 6.134 6.338 6.525 6.71 6.933 7.174 7.41 7.665 7.934 8.201 8.482 8.78 9.116 9.428 9.752 10.135 10.5 10.779 11.018 11.18 11.082 10.612 9.99 9.362 8.856 8.41 7.962 7.506 7.096 6.675 6.31 6.01 5.731 5.445 5.169 4.924 4.656 4.409 4.215 4.018 3.799 3.619 3.428 3.21 3.034 2.865 2.703 2.536 2.35 2.216 2.084 1.875 1.72 1.553 1.466 1.29 1.11 0.906 0.798 0.568 0.458 0.342 0.22 -0.024 -0.147 -0.279 -0.431 -0.59 -0.786 -1.071 -2.306 -10 ,27606 ,KEBNE ,16691582,Thu Nov 25 14:32:21 CET,Thu Nov 25 16:10:04 CET,0.0 1.539 1.946 2.295 2.565 2.803 2.987 3.143 3.412 3.533 3.657 3.801 4.041 4.156 4.355 4.541 4.721 4.804 4.965 5.129 5.339 5.471 5.611 5.798 5.978 6.153 6.328 6.492 6.697 6.905 7.097 7.311 7.512 7.692 7.885 8.118 8.355 8.606 8.85 9.1 9.375 9.675 10.039 10.376 10.7 11.056 11.442 11.83 12.145 12.309 12.279 11.877 11.296 10.723 10.178 9.667 9.204 8.786 8.4 7.975 7.612 7.307 6.997 6.691 6.413 6.163 5.906 5.671 5.467 5.258 5.029 4.843 4.675 4.485 4.331 4.184 4.026 3.855 3.681 3.555 3.419 3.221 3.076 2.913 2.829 2.662 2.485 2.3 2.205 1.979 1.891 1.78 1.66 1.392 1.249 1.099 0.881 0.623 0.391 0.111 -0.469 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_5.txt deleted file mode 100644 index 68c84b9e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1b_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23944 ,KEBNE ,16691583,Thu Nov 25 14:32:22 CET,Thu Nov 25 16:10:55 CET,0.0 0.916 1.211 1.426 1.62 1.798 1.945 2.08 2.332 2.461 2.591 2.723 2.949 3.056 3.262 3.445 3.611 3.693 3.86 4.021 4.24 4.374 4.515 4.706 4.865 5.032 5.192 5.33 5.521 5.711 5.879 6.088 6.295 6.499 6.724 6.965 7.193 7.445 7.737 8.042 8.344 8.681 9.069 9.45 9.876 10.325 10.792 11.247 11.686 12.079 12.299 12.09 11.677 11.205 10.771 10.313 9.869 9.468 9.105 8.745 8.424 8.124 7.831 7.557 7.311 7.073 6.816 6.574 6.368 6.162 5.94 5.743 5.523 5.309 5.153 4.991 4.818 4.62 4.408 4.282 4.162 3.971 3.832 3.668 3.581 3.41 3.249 3.089 2.991 2.765 2.682 2.561 2.426 2.124 1.939 1.763 1.597 1.385 1.12 0.694 -0.374 -2 ,9148 ,KEBNE ,16691584,Thu Nov 25 14:33:24 CET,Thu Nov 25 16:11:12 CET,0.0 0.94 1.18 1.374 1.554 1.689 1.819 1.937 2.164 2.259 2.342 2.408 2.613 2.703 2.878 3.043 3.204 3.282 3.428 3.569 3.782 3.912 4.039 4.226 4.396 4.549 4.694 4.85 5.065 5.264 5.452 5.67 5.865 6.065 6.296 6.546 6.802 7.07 7.332 7.616 7.913 8.213 8.549 8.887 9.289 9.709 10.137 10.593 11.081 11.518 11.712 11.488 11.148 10.723 10.288 9.848 9.43 9.067 8.711 8.336 8.007 7.711 7.423 7.145 6.901 6.667 6.391 6.136 5.908 5.669 5.431 5.239 5.041 4.837 4.679 4.496 4.288 4.09 3.898 3.761 3.614 3.365 3.2 3.043 2.957 2.766 2.579 2.377 2.264 2.033 1.898 1.748 1.602 1.33 1.164 0.981 0.763 0.509 0.204 -0.289 -1.947 -3 ,18238 ,KEBNE ,16691585,Thu Nov 25 14:33:24 CET,Thu Nov 25 16:10:00 CET,0.0 0.801 1.097 1.323 1.497 1.657 1.812 1.945 2.162 2.259 2.349 2.413 2.612 2.698 2.874 3.039 3.188 3.26 3.401 3.533 3.727 3.862 3.991 4.172 4.35 4.514 4.664 4.807 5.004 5.203 5.386 5.611 5.826 6.016 6.238 6.499 6.754 7.01 7.268 7.553 7.859 8.179 8.528 8.901 9.341 9.782 10.223 10.679 11.175 11.634 11.916 11.744 11.373 10.939 10.484 10.039 9.64 9.248 8.873 8.484 8.144 7.855 7.585 7.302 7.032 6.781 6.522 6.28 6.056 5.822 5.585 5.387 5.181 4.969 4.804 4.623 4.441 4.252 4.054 3.915 3.764 3.529 3.356 3.179 3.09 2.9 2.695 2.469 2.354 2.117 1.946 1.798 1.658 1.35 1.175 0.962 0.715 0.454 0.126 -0.326 -1.597 -4 ,3474 ,KEBNE ,16691586,Thu Nov 25 14:34:27 CET,Thu Nov 25 16:12:38 CET,0.0 1.101 1.442 1.721 1.952 2.149 2.326 2.489 2.773 2.9 3.032 3.163 3.388 3.489 3.668 3.847 4.014 4.085 4.234 4.384 4.592 4.727 4.866 5.058 5.23 5.398 5.558 5.703 5.898 6.089 6.252 6.466 6.682 6.876 7.108 7.359 7.576 7.815 8.089 8.38 8.662 8.972 9.333 9.685 10.088 10.53 11.025 11.517 12.008 12.475 12.799 12.695 12.287 11.829 11.415 10.984 10.567 10.182 9.816 9.425 9.101 8.812 8.527 8.25 7.977 7.705 7.43 7.211 7.014 6.793 6.565 6.374 6.18 5.973 5.809 5.635 5.452 5.268 5.06 4.917 4.77 4.519 4.355 4.187 4.101 3.923 3.742 3.556 3.445 3.214 3.095 2.98 2.859 2.542 2.342 2.125 1.907 1.619 1.259 0.795 -1.168 -5 ,10464 ,KEBNE ,16691587,Thu Nov 25 14:34:31 CET,Thu Nov 25 16:10:11 CET,0.0 0.696 0.985 1.233 1.449 1.632 1.799 1.947 2.216 2.35 2.476 2.59 2.811 2.904 3.07 3.243 3.419 3.5 3.654 3.804 4.001 4.135 4.269 4.432 4.592 4.761 4.917 5.068 5.264 5.456 5.637 5.849 6.057 6.268 6.499 6.72 6.938 7.195 7.467 7.743 8.029 8.335 8.698 9.07 9.469 9.899 10.347 10.803 11.26 11.653 11.88 11.676 11.262 10.826 10.369 9.882 9.429 9.01 8.642 8.282 7.94 7.613 7.332 7.077 6.85 6.622 6.348 6.096 5.881 5.66 5.429 5.23 5.025 4.812 4.641 4.475 4.318 4.156 3.984 3.869 3.749 3.545 3.393 3.235 3.155 2.992 2.814 2.635 2.541 2.322 2.214 2.085 1.958 1.701 1.55 1.377 1.185 0.962 0.633 0.17 -0.928 -6 ,18351 ,KEBNE ,16691588,Thu Nov 25 14:35:30 CET,Thu Nov 25 16:18:12 CET,0.0 0.543 0.806 1.033 1.251 1.44 1.598 1.746 2.035 2.168 2.29 2.399 2.614 2.711 2.916 3.1 3.257 3.334 3.485 3.626 3.834 3.983 4.118 4.293 4.474 4.656 4.816 4.964 5.165 5.35 5.527 5.741 5.949 6.155 6.387 6.635 6.864 7.111 7.362 7.623 7.909 8.257 8.668 9.034 9.448 9.88 10.308 10.75 11.179 11.604 11.988 11.928 11.552 11.135 10.733 10.297 9.851 9.435 9.062 8.685 8.354 8.059 7.769 7.473 7.189 6.939 6.682 6.442 6.23 6.01 5.79 5.607 5.4 5.179 4.998 4.809 4.617 4.417 4.225 4.093 3.946 3.689 3.521 3.367 3.284 3.105 2.927 2.739 2.639 2.413 2.285 2.156 2.009 1.665 1.444 1.202 0.937 0.638 0.289 -0.19 -1.866 -7 ,10892 ,KEBNE ,16691589,Thu Nov 25 14:35:29 CET,Thu Nov 25 16:13:19 CET,0.0 0.83 1.255 1.525 1.744 1.95 2.126 2.273 2.522 2.637 2.749 2.852 3.061 3.153 3.34 3.513 3.676 3.758 3.905 4.047 4.26 4.386 4.509 4.695 4.879 5.047 5.208 5.367 5.56 5.759 5.95 6.17 6.392 6.602 6.831 7.067 7.284 7.531 7.81 8.09 8.384 8.739 9.131 9.48 9.859 10.308 10.8 11.285 11.788 12.236 12.493 12.351 11.946 11.486 11.092 10.673 10.266 9.902 9.542 9.167 8.847 8.536 8.224 7.954 7.708 7.456 7.186 6.945 6.723 6.497 6.265 6.067 5.858 5.629 5.452 5.282 5.101 4.889 4.676 4.541 4.395 4.155 3.991 3.813 3.718 3.536 3.348 3.161 3.062 2.835 2.737 2.625 2.504 2.23 2.078 1.899 1.707 1.506 1.207 0.823 -0.399 -8 ,25923 ,KEBNE ,16691590,Thu Nov 25 14:36:32 CET,Thu Nov 25 16:14:52 CET,0.0 1.019 1.362 1.629 1.822 1.998 2.179 2.349 2.632 2.753 2.857 2.954 3.173 3.268 3.447 3.624 3.795 3.877 4.032 4.178 4.388 4.516 4.638 4.824 5.023 5.201 5.359 5.536 5.747 5.939 6.135 6.364 6.597 6.814 7.051 7.302 7.521 7.77 8.055 8.354 8.676 9.028 9.423 9.821 10.232 10.648 11.101 11.545 11.97 12.37 12.639 12.524 12.155 11.705 11.242 10.783 10.37 9.972 9.611 9.237 8.916 8.633 8.343 8.054 7.795 7.539 7.228 6.967 6.764 6.545 6.309 6.122 5.929 5.723 5.557 5.38 5.199 5.01 4.822 4.679 4.524 4.284 4.116 3.938 3.846 3.662 3.46 3.243 3.136 2.903 2.744 2.589 2.422 2.042 1.828 1.615 1.376 1.102 0.783 0.369 -0.934 -9 ,20249 ,KEBNE ,16691591,Thu Nov 25 14:36:32 CET,Thu Nov 25 16:14:10 CET,0.0 0.944 1.263 1.465 1.647 1.819 1.979 2.129 2.42 2.554 2.668 2.759 2.974 3.067 3.253 3.44 3.608 3.684 3.824 3.965 4.185 4.324 4.456 4.648 4.833 5.011 5.184 5.355 5.562 5.752 5.939 6.173 6.381 6.568 6.799 7.046 7.278 7.541 7.823 8.116 8.427 8.774 9.164 9.532 9.934 10.344 10.796 11.275 11.758 12.178 12.427 12.404 12.133 11.747 11.32 10.885 10.483 10.1 9.777 9.439 9.11 8.81 8.509 8.21 7.933 7.68 7.407 7.161 6.964 6.765 6.553 6.34 6.12 5.919 5.743 5.532 5.315 5.113 4.902 4.757 4.612 4.388 4.244 4.082 3.993 3.809 3.61 3.405 3.297 3.061 2.925 2.788 2.63 2.286 2.096 1.855 1.591 1.329 0.993 0.488 -1.025 -10 ,32646 ,KEBNE ,16691592,Thu Nov 25 14:37:35 CET,Thu Nov 25 16:16:14 CET,0.0 1.137 1.461 1.673 1.861 2.014 2.161 2.303 2.55 2.659 2.76 2.844 3.055 3.142 3.312 3.479 3.627 3.704 3.848 3.974 4.149 4.26 4.38 4.568 4.754 4.926 5.086 5.245 5.454 5.648 5.846 6.085 6.285 6.485 6.722 6.97 7.207 7.475 7.749 8.04 8.361 8.693 9.025 9.348 9.736 10.152 10.573 11.031 11.513 11.946 12.203 12.061 11.7 11.247 10.78 10.346 9.93 9.527 9.158 8.78 8.47 8.182 7.892 7.614 7.359 7.113 6.842 6.616 6.419 6.2 5.965 5.766 5.56 5.356 5.19 5.008 4.825 4.631 4.427 4.288 4.141 3.908 3.738 3.565 3.477 3.287 3.083 2.867 2.756 2.505 2.345 2.224 2.085 1.755 1.567 1.368 1.135 0.837 0.508 0.018 -1.401 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1c_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1c_5.txt deleted file mode 100644 index ae61f5db..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1c_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13312 ,KEBNE ,16691593,Thu Nov 25 14:38:41 CET,Thu Nov 25 16:15:07 CET,0.0 0.606 0.859 1.022 1.156 1.297 1.43 1.551 1.776 1.888 1.998 2.088 2.311 2.41 2.59 2.759 2.922 3.004 3.172 3.338 3.567 3.704 3.855 4.067 4.247 4.433 4.603 4.765 4.998 5.212 5.393 5.633 5.892 6.12 6.349 6.595 6.826 7.073 7.359 7.67 7.986 8.345 8.723 9.088 9.522 9.999 10.538 11.101 11.678 12.228 12.625 12.68 12.497 12.189 11.874 11.545 11.205 10.847 10.529 10.196 9.886 9.615 9.342 9.078 8.827 8.616 8.389 8.163 7.977 7.766 7.54 7.364 7.167 6.955 6.79 6.617 6.447 6.259 6.03 5.866 5.717 5.489 5.335 5.158 5.058 4.857 4.645 4.428 4.311 4.072 3.924 3.779 3.625 3.28 3.083 2.885 2.646 2.377 2.009 1.471 -0.396 -2 ,2966 ,KEBNE ,16691594,Thu Nov 25 14:37:35 CET,Thu Nov 25 16:17:14 CET,0.0 1.144 1.554 1.828 2.053 2.252 2.406 2.556 2.864 2.991 3.103 3.199 3.417 3.519 3.717 3.901 4.068 4.145 4.293 4.434 4.636 4.775 4.915 5.109 5.279 5.445 5.627 5.794 5.984 6.176 6.375 6.623 6.848 7.045 7.278 7.551 7.817 8.097 8.379 8.681 9.001 9.352 9.754 10.16 10.595 11.057 11.575 12.116 12.689 13.221 13.624 13.664 13.456 13.159 12.805 12.452 12.103 11.765 11.472 11.153 10.851 10.585 10.338 10.077 9.816 9.573 9.339 9.141 8.955 8.757 8.542 8.34 8.128 7.926 7.765 7.581 7.393 7.222 7.033 6.892 6.744 6.511 6.34 6.167 6.079 5.879 5.688 5.508 5.419 5.201 5.097 4.986 4.859 4.563 4.41 4.265 4.09 3.874 3.64 3.296 1.715 -3 ,4612 ,KEBNE ,16691595,Thu Nov 25 14:37:35 CET,Thu Nov 25 16:16:23 CET,0.0 1.147 1.514 1.765 2.007 2.193 2.357 2.531 2.872 3.02 3.155 3.258 3.466 3.563 3.755 3.925 4.1 4.187 4.343 4.484 4.697 4.838 4.953 5.12 5.3 5.475 5.638 5.8 6.022 6.227 6.406 6.633 6.852 7.046 7.277 7.544 7.795 8.081 8.377 8.668 8.974 9.302 9.694 10.073 10.493 10.954 11.431 11.959 12.56 13.15 13.608 13.694 13.441 13.111 12.775 12.417 12.088 11.759 11.429 11.073 10.764 10.493 10.248 9.994 9.739 9.516 9.276 9.043 8.835 8.639 8.435 8.259 8.068 7.842 7.659 7.465 7.26 7.065 6.881 6.751 6.623 6.415 6.257 6.087 5.996 5.822 5.641 5.443 5.329 5.075 4.875 4.728 4.594 4.261 4.054 3.82 3.557 3.229 2.797 2.282 0.504 -4 ,27987 ,KEBNE ,16691596,Thu Nov 25 14:38:38 CET,Thu Nov 25 16:18:52 CET,0.0 1.512 1.909 2.166 2.381 2.576 2.736 2.87 3.102 3.216 3.341 3.453 3.667 3.75 3.926 4.108 4.278 4.36 4.511 4.647 4.859 5.01 5.151 5.346 5.534 5.709 5.872 6.027 6.236 6.446 6.638 6.869 7.102 7.323 7.575 7.845 8.09 8.353 8.635 8.934 9.247 9.618 10.027 10.4 10.823 11.289 11.813 12.392 13.023 13.614 14.018 14.03 13.779 13.46 13.151 12.77 12.391 12.026 11.704 11.385 11.109 10.865 10.591 10.302 10.048 9.816 9.563 9.343 9.14 8.914 8.694 8.514 8.296 8.072 7.899 7.714 7.523 7.325 7.127 6.978 6.809 6.566 6.403 6.213 6.123 5.945 5.744 5.522 5.402 5.157 4.998 4.856 4.713 4.381 4.198 3.973 3.714 3.431 3.053 2.527 -0.807 -5 ,11920 ,KEBNE ,16691597,Thu Nov 25 14:38:37 CET,Thu Nov 25 16:19:43 CET,0.0 0.951 1.252 1.484 1.696 1.88 2.031 2.176 2.435 2.55 2.667 2.768 2.996 3.104 3.298 3.481 3.645 3.727 3.901 4.078 4.319 4.463 4.603 4.81 4.997 5.175 5.346 5.511 5.723 5.934 6.131 6.342 6.541 6.742 6.967 7.229 7.489 7.792 8.121 8.437 8.761 9.123 9.515 9.883 10.323 10.775 11.271 11.845 12.432 13.014 13.524 13.615 13.477 13.194 12.884 12.537 12.168 11.815 11.484 11.137 10.848 10.58 10.295 10.026 9.763 9.517 9.241 9.002 8.822 8.62 8.397 8.207 8.009 7.796 7.623 7.456 7.274 7.059 6.827 6.668 6.508 6.26 6.094 5.925 5.831 5.644 5.456 5.236 5.125 4.9 4.759 4.612 4.467 4.179 4.024 3.851 3.649 3.408 3.116 2.645 0.646 -6 ,26916 ,KEBNE ,16691598,Thu Nov 25 14:39:40 CET,Thu Nov 25 16:18:52 CET,0.0 0.683 0.939 1.133 1.312 1.48 1.639 1.815 2.144 2.275 2.403 2.535 2.753 2.842 3.027 3.218 3.399 3.478 3.621 3.765 3.97 4.109 4.239 4.431 4.628 4.8 4.965 5.123 5.322 5.531 5.727 5.947 6.154 6.366 6.614 6.874 7.115 7.379 7.667 7.972 8.288 8.623 9.012 9.42 9.883 10.36 10.873 11.439 12.044 12.62 13.006 12.984 12.72 12.405 12.061 11.684 11.36 11.049 10.714 10.373 10.068 9.792 9.527 9.245 8.981 8.732 8.467 8.231 8.027 7.817 7.606 7.42 7.208 6.997 6.832 6.656 6.476 6.275 6.052 5.895 5.729 5.478 5.316 5.143 5.051 4.844 4.629 4.423 4.314 4.077 3.927 3.79 3.643 3.296 3.096 2.875 2.605 2.307 1.937 1.388 0.219 -7 ,15490 ,KEBNE ,16691599,Thu Nov 25 14:39:41 CET,Thu Nov 25 16:26:01 CET,0.0 0.711 0.901 1.085 1.255 1.415 1.549 1.659 1.919 2.042 2.132 2.193 2.405 2.493 2.672 2.846 3.0 3.066 3.195 3.328 3.522 3.644 3.765 3.949 4.123 4.301 4.478 4.635 4.851 5.067 5.272 5.504 5.72 5.945 6.211 6.492 6.746 7.031 7.336 7.649 7.984 8.354 8.757 9.149 9.569 10.004 10.493 10.997 11.573 12.192 12.72 12.787 12.559 12.198 11.821 11.485 11.156 10.825 10.528 10.223 9.926 9.632 9.355 9.096 8.836 8.593 8.36 8.149 7.96 7.764 7.531 7.332 7.127 6.9 6.727 6.561 6.366 6.156 5.938 5.793 5.644 5.404 5.248 5.071 4.975 4.782 4.569 4.328 4.203 3.969 3.839 3.683 3.518 3.21 3.043 2.814 2.542 2.242 1.9 1.472 -0.085 -8 ,20276 ,KEBNE ,16691600,Thu Nov 25 14:41:46 CET,Thu Nov 25 16:21:49 CET,0.0 0.839 1.121 1.348 1.551 1.705 1.834 1.976 2.246 2.358 2.463 2.543 2.768 2.872 3.044 3.188 3.335 3.409 3.551 3.691 3.869 3.982 4.101 4.272 4.436 4.602 4.761 4.916 5.126 5.328 5.514 5.723 5.934 6.158 6.409 6.682 6.946 7.219 7.484 7.793 8.138 8.488 8.891 9.29 9.708 10.168 10.688 11.211 11.761 12.307 12.755 12.821 12.548 12.233 11.947 11.602 11.214 10.834 10.502 10.153 9.841 9.567 9.304 9.066 8.837 8.59 8.333 8.107 7.904 7.676 7.419 7.215 7.009 6.781 6.6 6.415 6.223 6.034 5.842 5.702 5.566 5.344 5.18 5.016 4.928 4.743 4.555 4.352 4.235 3.999 3.839 3.69 3.549 3.218 3.034 2.838 2.618 2.349 2.028 1.576 0.112 -9 ,26120 ,KEBNE ,16691601,Thu Nov 25 14:42:48 CET,Thu Nov 25 16:23:32 CET,0.0 1.466 1.903 2.139 2.332 2.519 2.702 2.88 3.179 3.301 3.431 3.555 3.772 3.875 4.093 4.289 4.471 4.564 4.741 4.895 5.096 5.229 5.362 5.558 5.748 5.91 6.062 6.223 6.452 6.667 6.847 7.054 7.256 7.465 7.707 7.969 8.222 8.515 8.832 9.152 9.468 9.818 10.224 10.619 11.058 11.523 12.033 12.571 13.121 13.666 14.154 14.205 14.008 13.74 13.431 13.062 12.693 12.337 11.992 11.653 11.375 11.119 10.85 10.561 10.297 10.061 9.802 9.57 9.374 9.167 8.938 8.731 8.529 8.325 8.164 7.993 7.805 7.604 7.394 7.259 7.111 6.835 6.647 6.48 6.394 6.204 6.001 5.769 5.646 5.413 5.257 5.109 4.944 4.58 4.384 4.163 3.909 3.632 3.27 2.74 1.03 -10 ,26680 ,KEBNE ,16691602,Thu Nov 25 14:42:48 CET,Thu Nov 25 16:24:02 CET,0.0 0.67 0.962 1.194 1.373 1.512 1.637 1.764 1.983 2.077 2.173 2.226 2.439 2.545 2.746 2.944 3.12 3.2 3.364 3.527 3.753 3.889 4.021 4.212 4.399 4.58 4.753 4.93 5.141 5.324 5.511 5.734 5.942 6.15 6.411 6.687 6.926 7.178 7.447 7.75 8.071 8.41 8.798 9.184 9.623 10.106 10.667 11.258 11.843 12.375 12.807 12.942 12.787 12.481 12.14 11.808 11.498 11.173 10.844 10.473 10.141 9.873 9.634 9.389 9.143 8.902 8.646 8.414 8.197 7.98 7.767 7.589 7.402 7.204 7.045 6.876 6.711 6.551 6.37 6.24 6.106 5.893 5.753 5.609 5.53 5.357 5.156 4.953 4.857 4.631 4.523 4.407 4.277 3.982 3.805 3.608 3.408 3.204 2.957 2.543 0.921 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1d_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1d_5.txt deleted file mode 100644 index 30cb1def..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_1d_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6144 ,KEBNE ,16691603,Thu Nov 25 14:46:58 CET,Thu Nov 25 16:23:56 CET,0.0 0.796 1.094 1.345 1.577 1.764 1.926 2.094 2.403 2.529 2.648 2.772 3.001 3.107 3.321 3.523 3.701 3.78 3.948 4.119 4.343 4.488 4.625 4.805 4.982 5.163 5.332 5.488 5.693 5.891 6.083 6.318 6.549 6.768 7.011 7.27 7.513 7.795 8.106 8.425 8.765 9.149 9.621 10.077 10.57 11.103 11.716 12.358 12.974 13.578 14.127 14.283 14.152 13.917 13.614 13.255 12.884 12.52 12.196 11.839 11.51 11.219 10.953 10.694 10.427 10.177 9.918 9.68 9.467 9.233 8.989 8.799 8.6 8.376 8.186 7.973 7.762 7.554 7.328 7.17 6.987 6.69 6.499 6.301 6.199 5.994 5.77 5.509 5.381 5.137 4.954 4.785 4.628 4.256 4.024 3.809 3.547 3.226 2.888 2.347 0.138 -2 ,7880 ,KEBNE ,16691604,Thu Nov 25 14:50:06 CET,Thu Nov 25 16:27:05 CET,0.0 1.096 1.479 1.742 1.93 2.111 2.29 2.459 2.764 2.903 3.03 3.131 3.355 3.454 3.633 3.82 3.994 4.072 4.234 4.4 4.643 4.791 4.933 5.148 5.342 5.522 5.705 5.872 6.081 6.288 6.498 6.746 6.977 7.211 7.482 7.774 8.045 8.318 8.595 8.911 9.234 9.582 10.011 10.42 10.872 11.401 11.993 12.573 13.175 13.837 14.472 14.697 14.603 14.346 13.979 13.626 13.308 12.96 12.635 12.316 12.011 11.718 11.433 11.177 10.947 10.705 10.428 10.164 9.933 9.719 9.497 9.303 9.097 8.86 8.669 8.469 8.272 8.066 7.817 7.65 7.498 7.256 7.077 6.895 6.794 6.569 6.343 6.091 5.945 5.693 5.536 5.373 5.201 4.784 4.534 4.267 3.952 3.547 3.061 2.559 0.232 -3 ,32281 ,KEBNE ,16691605,Thu Nov 25 14:53:14 CET,Thu Nov 25 16:31:05 CET,0.0 0.663 0.969 1.157 1.312 1.44 1.551 1.657 1.906 2.047 2.168 2.24 2.453 2.54 2.707 2.863 3.013 3.093 3.247 3.377 3.573 3.694 3.81 4.014 4.211 4.388 4.562 4.727 4.947 5.152 5.345 5.587 5.828 6.063 6.306 6.564 6.826 7.121 7.415 7.721 8.048 8.426 8.863 9.268 9.765 10.311 10.864 11.449 12.082 12.767 13.321 13.379 13.192 12.911 12.58 12.221 11.869 11.518 11.196 10.835 10.509 10.218 9.916 9.62 9.351 9.106 8.827 8.568 8.351 8.121 7.879 7.671 7.437 7.185 6.992 6.81 6.627 6.426 6.216 6.061 5.894 5.625 5.438 5.235 5.124 4.888 4.63 4.376 4.248 4.006 3.845 3.688 3.513 3.107 2.895 2.691 2.441 2.135 1.781 1.215 -0.775 -4 ,25153 ,KEBNE ,16691606,Thu Nov 25 14:53:13 CET,Thu Nov 25 16:30:11 CET,0.0 1.373 1.752 2.043 2.291 2.476 2.633 2.779 3.031 3.151 3.281 3.417 3.651 3.759 3.966 4.197 4.418 4.506 4.665 4.825 5.079 5.237 5.373 5.564 5.759 5.947 6.128 6.301 6.51 6.719 6.933 7.193 7.435 7.67 7.945 8.232 8.511 8.821 9.166 9.521 9.867 10.276 10.731 11.15 11.641 12.166 12.736 13.294 13.842 14.502 15.112 15.3 15.161 14.87 14.567 14.227 13.885 13.552 13.23 12.914 12.616 12.291 11.988 11.697 11.412 11.165 10.885 10.604 10.37 10.147 9.923 9.734 9.515 9.286 9.105 8.894 8.696 8.489 8.224 8.039 7.863 7.599 7.417 7.22 7.116 6.879 6.65 6.427 6.299 6.061 5.893 5.745 5.584 5.173 4.971 4.734 4.45 4.163 3.809 3.366 1.106 -5 ,24456 ,KEBNE ,16691607,Thu Nov 25 15:06:46 CET,Thu Nov 25 16:45:18 CET,0.0 0.996 1.345 1.626 1.861 2.062 2.235 2.395 2.701 2.825 2.938 3.045 3.258 3.356 3.56 3.753 3.948 4.039 4.203 4.353 4.572 4.711 4.848 5.053 5.244 5.423 5.593 5.757 5.963 6.164 6.359 6.587 6.813 7.034 7.287 7.561 7.832 8.132 8.436 8.752 9.091 9.482 9.916 10.313 10.78 11.315 11.893 12.484 13.091 13.701 14.272 14.491 14.318 13.935 13.551 13.186 12.841 12.49 12.152 11.81 11.485 11.197 10.925 10.643 10.365 10.093 9.836 9.601 9.381 9.144 8.883 8.67 8.45 8.21 8.036 7.883 7.711 7.518 7.308 7.164 7.027 6.804 6.632 6.452 6.358 6.155 5.936 5.71 5.589 5.341 5.164 5.004 4.86 4.546 4.334 4.077 3.786 3.482 3.116 2.634 0.904 -6 ,12778 ,KEBNE ,16691608,Thu Nov 25 15:06:46 CET,Thu Nov 25 16:44:17 CET,0.0 1.057 1.474 1.716 1.943 2.187 2.444 2.663 2.965 3.082 3.19 3.291 3.511 3.609 3.805 3.987 4.167 4.256 4.408 4.549 4.749 4.882 5.022 5.233 5.42 5.598 5.766 5.928 6.144 6.359 6.571 6.833 7.074 7.291 7.544 7.828 8.099 8.393 8.703 9.019 9.367 9.746 10.162 10.596 11.087 11.622 12.198 12.792 13.443 14.105 14.695 14.904 14.72 14.42 14.095 13.71 13.336 12.987 12.687 12.378 12.098 11.81 11.52 11.247 10.96 10.708 10.46 10.206 9.976 9.738 9.492 9.275 9.051 8.832 8.654 8.455 8.24 8.023 7.82 7.684 7.527 7.26 7.066 6.868 6.77 6.559 6.326 6.072 5.94 5.688 5.512 5.345 5.149 4.738 4.516 4.259 3.942 3.584 3.253 2.805 0.952 -7 ,24858 ,KEBNE ,16691609,Thu Nov 25 15:11:58 CET,Thu Nov 25 16:53:20 CET,0.0 0.759 1.092 1.373 1.643 1.837 1.994 2.161 2.471 2.59 2.701 2.786 3.0 3.101 3.322 3.517 3.675 3.75 3.91 4.061 4.281 4.426 4.572 4.799 4.993 5.165 5.339 5.513 5.733 5.938 6.129 6.36 6.581 6.783 7.033 7.312 7.569 7.853 8.15 8.459 8.78 9.16 9.595 10.006 10.47 10.99 11.591 12.191 12.819 13.478 14.044 14.172 14.009 13.701 13.343 12.97 12.606 12.254 11.945 11.625 11.32 11.049 10.779 10.486 10.205 9.958 9.687 9.439 9.216 8.984 8.757 8.558 8.351 8.145 7.981 7.797 7.583 7.363 7.147 6.989 6.825 6.587 6.406 6.197 6.092 5.879 5.63 5.364 5.219 4.957 4.757 4.569 4.392 4.007 3.756 3.495 3.192 2.797 2.32 1.72 -0.7 -8 ,28284 ,KEBNE ,16691610,Thu Nov 25 15:19:17 CET,Thu Nov 25 17:01:16 CET,0.0 0.929 1.299 1.571 1.781 1.973 2.148 2.307 2.591 2.715 2.83 2.924 3.142 3.252 3.456 3.652 3.84 3.922 4.083 4.237 4.457 4.607 4.756 4.965 5.152 5.338 5.524 5.69 5.892 6.077 6.259 6.493 6.717 6.937 7.205 7.503 7.763 8.042 8.343 8.656 8.99 9.361 9.802 10.231 10.713 11.257 11.837 12.427 13.032 13.58 14.066 14.221 14.078 13.816 13.496 13.121 12.746 12.377 12.052 11.682 11.349 11.065 10.773 10.49 10.224 9.966 9.679 9.441 9.236 9.008 8.779 8.59 8.381 8.148 7.97 7.775 7.558 7.35 7.155 7.014 6.855 6.606 6.431 6.236 6.129 5.905 5.652 5.398 5.285 5.037 4.853 4.704 4.54 4.155 3.93 3.666 3.373 3.067 2.742 2.31 -0.647 -9 ,5038 ,KEBNE ,16691611,Thu Nov 25 15:20:19 CET,Thu Nov 25 17:02:39 CET,0.0 1.12 1.523 1.844 2.08 2.282 2.457 2.615 2.909 3.037 3.158 3.259 3.488 3.597 3.796 3.99 4.182 4.269 4.434 4.579 4.795 4.943 5.083 5.281 5.46 5.635 5.804 5.967 6.158 6.332 6.527 6.784 7.033 7.262 7.503 7.775 8.051 8.345 8.653 8.992 9.335 9.69 10.112 10.544 11.021 11.525 12.083 12.704 13.324 13.934 14.513 14.651 14.427 14.117 13.796 13.475 13.135 12.761 12.45 12.111 11.776 11.466 11.183 10.921 10.666 10.431 10.166 9.92 9.694 9.441 9.191 8.98 8.753 8.535 8.36 8.166 7.96 7.749 7.543 7.396 7.237 6.957 6.75 6.554 6.46 6.27 6.057 5.806 5.671 5.407 5.186 5.025 4.863 4.519 4.35 4.168 3.944 3.666 3.347 2.837 -0.314 -10 ,21863 ,KEBNE ,16691612,Thu Nov 25 15:34:56 CET,Thu Nov 25 17:09:49 CET,0.0 0.913 1.177 1.4 1.582 1.76 1.943 2.116 2.424 2.551 2.66 2.759 2.993 3.099 3.29 3.464 3.636 3.72 3.865 3.996 4.217 4.369 4.509 4.705 4.897 5.102 5.293 5.456 5.659 5.856 6.055 6.297 6.53 6.746 6.983 7.272 7.55 7.831 8.123 8.435 8.764 9.135 9.583 10.019 10.488 11.004 11.572 12.151 12.828 13.539 14.111 14.28 14.123 13.85 13.531 13.183 12.849 12.496 12.165 11.821 11.502 11.199 10.921 10.644 10.351 10.074 9.777 9.502 9.262 9.009 8.742 8.527 8.303 8.065 7.888 7.697 7.483 7.257 7.003 6.838 6.669 6.404 6.208 5.99 5.885 5.676 5.456 5.214 5.07 4.795 4.608 4.45 4.282 3.867 3.618 3.327 2.99 2.609 2.131 1.57 -1.101 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_3a_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_3a_5.txt deleted file mode 100644 index c16bcfbc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_3a_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32151 ,KEBNE ,16691613,Thu Nov 25 15:34:58 CET,Thu Nov 25 17:07:28 CET,0.0 1.012 1.341 1.58 1.787 1.964 2.136 2.286 2.553 2.674 2.779 2.851 3.076 3.174 3.344 3.509 3.683 3.769 3.924 4.08 4.299 4.431 4.562 4.748 4.92 5.094 5.263 5.422 5.621 5.805 5.985 6.228 6.465 6.68 6.925 7.194 7.469 7.781 8.1 8.451 8.813 9.192 9.623 10.041 10.518 11.054 11.697 12.418 13.201 14.073 14.965 15.38 15.369 15.252 15.115 14.884 14.626 14.379 14.151 13.89 13.658 13.447 13.224 13.0 12.773 12.552 12.32 12.098 11.903 11.713 11.511 11.358 11.197 11.015 10.866 10.705 10.54 10.375 10.194 10.069 9.941 9.739 9.603 9.456 9.372 9.207 9.039 8.859 8.766 8.542 8.459 8.35 8.227 7.945 7.792 7.653 7.5 7.322 7.115 6.811 6.037 -2 ,20324 ,KEBNE ,16691614,Thu Nov 25 15:34:56 CET,Thu Nov 25 17:07:23 CET,0.0 0.755 1.091 1.36 1.574 1.754 1.923 2.056 2.277 2.392 2.519 2.613 2.833 2.933 3.112 3.283 3.456 3.544 3.715 3.867 4.091 4.231 4.369 4.575 4.762 4.94 5.115 5.274 5.472 5.674 5.871 6.103 6.324 6.531 6.771 7.031 7.286 7.604 7.949 8.3 8.662 9.055 9.52 9.985 10.51 11.051 11.65 12.344 13.106 13.891 14.683 15.104 15.129 15.001 14.783 14.565 14.36 14.14 13.911 13.659 13.437 13.224 13.003 12.787 12.592 12.41 12.216 12.033 11.869 11.689 11.48 11.306 11.126 10.949 10.812 10.654 10.488 10.332 10.178 10.065 9.945 9.773 9.654 9.521 9.45 9.292 9.133 8.967 8.869 8.653 8.587 8.487 8.382 8.128 7.994 7.855 7.696 7.501 7.261 6.942 5.928 -3 ,8696 ,KEBNE ,16691615,Thu Nov 25 15:34:58 CET,Thu Nov 25 17:07:39 CET,0.0 1.026 1.404 1.714 1.923 2.067 2.22 2.392 2.689 2.828 2.956 3.05 3.278 3.381 3.566 3.736 3.901 3.987 4.149 4.293 4.514 4.657 4.788 5.001 5.218 5.414 5.602 5.771 5.969 6.178 6.38 6.606 6.836 7.069 7.328 7.624 7.914 8.227 8.563 8.907 9.266 9.659 10.135 10.616 11.138 11.686 12.308 12.987 13.752 14.57 15.346 15.761 15.807 15.683 15.471 15.232 15.019 14.789 14.578 14.354 14.117 13.901 13.696 13.477 13.244 13.031 12.806 12.601 12.433 12.261 12.082 11.917 11.741 11.566 11.43 11.274 11.09 10.905 10.747 10.626 10.488 10.298 10.158 9.996 9.917 9.754 9.573 9.397 9.298 9.07 8.939 8.809 8.679 8.411 8.257 8.071 7.852 7.629 7.359 6.854 5.337 -4 ,21116 ,KEBNE ,16691616,Thu Nov 25 15:34:58 CET,Thu Nov 25 17:11:03 CET,0.0 0.758 1.065 1.3 1.502 1.69 1.856 2.02 2.303 2.43 2.562 2.673 2.898 3.002 3.181 3.337 3.492 3.566 3.702 3.838 4.054 4.194 4.324 4.494 4.656 4.837 5.015 5.181 5.395 5.594 5.79 6.044 6.287 6.513 6.768 7.032 7.27 7.539 7.851 8.19 8.525 8.908 9.353 9.791 10.355 10.974 11.623 12.32 13.077 13.912 14.781 15.227 15.293 15.174 14.992 14.77 14.556 14.335 14.107 13.871 13.65 13.435 13.235 13.037 12.833 12.653 12.461 12.267 12.104 11.944 11.759 11.595 11.413 11.219 11.075 10.927 10.779 10.621 10.445 10.317 10.182 9.986 9.854 9.702 9.622 9.453 9.265 9.067 8.965 8.745 8.626 8.505 8.385 8.102 7.93 7.744 7.556 7.352 7.11 6.758 5.011 -5 ,11578 ,KEBNE ,16691617,Thu Nov 25 15:34:58 CET,Thu Nov 25 17:11:28 CET,0.0 0.583 0.893 1.166 1.393 1.58 1.743 1.878 2.135 2.258 2.374 2.481 2.723 2.822 2.992 3.159 3.335 3.416 3.569 3.729 3.941 4.079 4.211 4.406 4.603 4.78 4.956 5.135 5.356 5.57 5.764 5.976 6.195 6.418 6.682 6.962 7.21 7.482 7.784 8.132 8.486 8.855 9.29 9.744 10.263 10.826 11.467 12.145 12.902 13.754 14.6 15.042 15.112 15.021 14.875 14.664 14.406 14.146 13.897 13.647 13.421 13.186 12.973 12.77 12.556 12.364 12.176 11.99 11.823 11.654 11.462 11.301 11.126 10.949 10.815 10.67 10.516 10.349 10.179 10.061 9.931 9.723 9.576 9.417 9.334 9.151 8.978 8.816 8.721 8.496 8.376 8.262 8.138 7.845 7.663 7.467 7.255 6.994 6.69 6.274 4.624 -6 ,9484 ,KEBNE ,16691618,Thu Nov 25 15:34:58 CET,Thu Nov 25 17:09:06 CET,0.0 1.064 1.365 1.596 1.789 1.987 2.182 2.325 2.566 2.69 2.806 2.897 3.126 3.22 3.4 3.584 3.761 3.846 4.001 4.141 4.335 4.457 4.588 4.801 5.002 5.175 5.345 5.515 5.733 5.943 6.147 6.392 6.626 6.846 7.083 7.337 7.612 7.923 8.242 8.594 8.957 9.353 9.826 10.29 10.765 11.282 11.901 12.559 13.336 14.222 15.057 15.42 15.4 15.292 15.151 14.958 14.739 14.498 14.261 14.016 13.792 13.555 13.327 13.119 12.926 12.745 12.531 12.34 12.178 12.004 11.81 11.635 11.461 11.287 11.14 10.982 10.833 10.681 10.508 10.382 10.255 10.04 9.895 9.747 9.666 9.511 9.349 9.161 9.054 8.828 8.722 8.604 8.479 8.207 8.039 7.839 7.606 7.346 7.029 6.62 5.121 -7 ,18198 ,KEBNE ,16691619,Thu Nov 25 15:35:57 CET,Thu Nov 25 17:15:11 CET,0.0 0.374 0.59 0.767 0.924 1.053 1.169 1.278 1.519 1.625 1.721 1.772 1.98 2.061 2.203 2.346 2.498 2.573 2.719 2.877 3.089 3.224 3.361 3.547 3.719 3.881 4.044 4.21 4.435 4.65 4.847 5.086 5.314 5.531 5.782 6.062 6.334 6.632 6.949 7.275 7.61 8.0 8.466 8.908 9.393 9.932 10.546 11.212 11.968 12.771 13.583 13.995 14.04 13.925 13.737 13.521 13.281 13.025 12.79 12.537 12.309 12.098 11.884 11.68 11.487 11.287 11.067 10.885 10.717 10.537 10.359 10.204 10.042 9.886 9.754 9.612 9.47 9.302 9.111 8.985 8.858 8.646 8.499 8.348 8.268 8.098 7.908 7.725 7.635 7.418 7.275 7.138 6.999 6.667 6.485 6.296 6.095 5.83 5.505 5.15 3.78 -8 ,24613 ,KEBNE ,16691620,Thu Nov 25 15:37:00 CET,Thu Nov 25 17:14:55 CET,0.0 0.561 0.813 1.017 1.208 1.347 1.459 1.57 1.813 1.919 2.01 2.068 2.293 2.377 2.522 2.668 2.815 2.882 3.022 3.171 3.383 3.517 3.64 3.813 3.995 4.182 4.371 4.537 4.736 4.926 5.103 5.328 5.559 5.778 6.021 6.296 6.552 6.852 7.185 7.511 7.867 8.273 8.744 9.202 9.717 10.269 10.883 11.566 12.296 13.071 13.895 14.38 14.476 14.399 14.261 14.092 13.846 13.58 13.347 13.095 12.862 12.631 12.403 12.201 12.005 11.813 11.617 11.442 11.277 11.095 10.907 10.756 10.601 10.425 10.274 10.116 9.951 9.776 9.595 9.479 9.351 9.129 8.97 8.806 8.73 8.557 8.359 8.154 8.048 7.818 7.692 7.569 7.433 7.142 6.983 6.8 6.562 6.24 5.835 5.382 4.079 -9 ,8480 ,KEBNE ,16691621,Thu Nov 25 15:37:00 CET,Thu Nov 25 17:15:32 CET,0.0 0.966 1.33 1.583 1.769 1.938 2.096 2.244 2.504 2.621 2.734 2.823 3.057 3.16 3.331 3.509 3.701 3.789 3.952 4.108 4.334 4.483 4.624 4.814 4.984 5.151 5.332 5.494 5.695 5.897 6.088 6.329 6.572 6.793 7.03 7.302 7.585 7.886 8.207 8.561 8.903 9.265 9.7 10.134 10.623 11.176 11.808 12.511 13.272 14.059 14.874 15.335 15.391 15.291 15.163 14.974 14.725 14.469 14.266 14.048 13.819 13.597 13.37 13.143 12.935 12.74 12.52 12.328 12.158 11.96 11.752 11.583 11.406 11.213 11.055 10.898 10.745 10.59 10.429 10.314 10.186 9.98 9.833 9.676 9.594 9.412 9.222 9.01 8.907 8.697 8.566 8.433 8.309 8.055 7.917 7.753 7.547 7.308 7.064 6.749 5.206 -10 ,21983 ,KEBNE ,16691622,Thu Nov 25 15:38:02 CET,Thu Nov 25 17:16:07 CET,0.0 0.458 0.73 0.954 1.137 1.264 1.383 1.506 1.715 1.804 1.887 1.929 2.145 2.245 2.437 2.62 2.796 2.877 3.029 3.176 3.4 3.551 3.698 3.893 4.077 4.255 4.412 4.563 4.76 4.957 5.161 5.404 5.64 5.867 6.113 6.37 6.614 6.885 7.17 7.48 7.808 8.152 8.542 8.958 9.457 9.993 10.607 11.267 11.996 12.824 13.653 14.159 14.293 14.215 14.03 13.775 13.56 13.372 13.184 12.973 12.746 12.513 12.277 12.068 11.866 11.66 11.455 11.282 11.121 10.948 10.769 10.61 10.443 10.288 10.162 10.015 9.864 9.692 9.506 9.38 9.245 9.029 8.884 8.739 8.672 8.515 8.316 8.117 8.014 7.788 7.678 7.561 7.442 7.145 6.968 6.787 6.577 6.323 6.021 5.534 3.543 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_3a.txt deleted file mode 100644 index 421c74d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17654 ,KEBNE ,16691623,Thu Nov 25 15:39:09 CET,Thu Nov 25 17:16:13 CET,0.0 0.479 0.618 0.742 0.859 0.971 1.074 1.161 1.338 1.422 1.498 1.527 1.712 1.788 1.914 2.027 2.134 2.181 2.27 2.349 2.465 2.549 2.627 2.738 2.856 2.965 3.066 3.168 3.302 3.436 3.56 3.689 3.819 3.951 4.081 4.22 4.352 4.493 4.639 4.788 4.948 5.103 5.279 5.456 5.652 5.878 6.072 6.159 6.214 6.191 5.797 5.042 4.194 3.371 2.625 1.949 1.372 0.856 0.385 -0.117 -0.548 -0.945 -1.301 -1.616 -1.939 -2.242 -2.555 -2.828 -3.05 -3.296 -3.56 -3.774 -4.0 -4.235 -4.416 -4.598 -4.793 -5.005 -5.243 -5.406 -5.558 -5.807 -5.982 -6.158 -6.252 -6.44 -6.647 -6.893 -7.015 -7.256 -7.406 -7.553 -7.699 -8.012 -8.18 -8.362 -8.582 -8.84 -9.161 -9.711 -11.321 -2 ,9771 ,KEBNE ,16691624,Thu Nov 25 15:41:11 CET,Thu Nov 25 17:21:51 CET,0.0 0.513 0.725 0.926 1.06 1.169 1.266 1.354 1.524 1.604 1.683 1.72 1.897 1.952 2.055 2.165 2.275 2.329 2.428 2.519 2.653 2.733 2.817 2.945 3.046 3.14 3.238 3.33 3.445 3.56 3.667 3.792 3.93 4.061 4.19 4.324 4.468 4.641 4.823 5.014 5.194 5.383 5.621 5.859 6.089 6.292 6.513 6.691 6.764 6.653 6.158 5.279 4.407 3.631 2.936 2.297 1.751 1.23 0.775 0.331 -0.071 -0.43 -0.784 -1.148 -1.492 -1.785 -2.084 -2.359 -2.603 -2.858 -3.126 -3.36 -3.593 -3.818 -4.001 -4.207 -4.404 -4.615 -4.853 -5.021 -5.197 -5.458 -5.631 -5.804 -5.904 -6.124 -6.35 -6.59 -6.713 -6.96 -7.09 -7.213 -7.351 -7.651 -7.816 -8.007 -8.243 -8.488 -8.787 -9.163 -10.597 -3 ,19902 ,KEBNE ,16691625,Thu Nov 25 15:41:14 CET,Thu Nov 25 17:19:03 CET,0.0 0.381 0.575 0.703 0.827 0.929 1.017 1.101 1.259 1.329 1.396 1.413 1.589 1.645 1.751 1.858 1.969 2.018 2.126 2.234 2.367 2.446 2.524 2.641 2.742 2.843 2.946 3.05 3.184 3.302 3.418 3.558 3.678 3.792 3.923 4.074 4.222 4.396 4.576 4.766 4.981 5.184 5.405 5.621 5.843 6.09 6.331 6.523 6.643 6.628 6.273 5.404 4.532 3.757 3.034 2.348 1.76 1.243 0.783 0.308 -0.118 -0.512 -0.88 -1.233 -1.571 -1.882 -2.194 -2.464 -2.703 -2.956 -3.231 -3.472 -3.719 -3.98 -4.181 -4.388 -4.606 -4.82 -5.036 -5.192 -5.359 -5.62 -5.789 -5.954 -6.041 -6.221 -6.417 -6.62 -6.726 -6.959 -7.076 -7.2 -7.321 -7.598 -7.746 -7.913 -8.11 -8.366 -8.641 -8.957 -9.872 -4 ,8759 ,KEBNE ,16691626,Thu Nov 25 15:42:14 CET,Thu Nov 25 17:20:42 CET,0.0 0.345 0.52 0.681 0.821 0.95 1.049 1.143 1.338 1.416 1.482 1.486 1.661 1.724 1.851 1.966 2.076 2.13 2.228 2.325 2.483 2.568 2.633 2.738 2.847 2.953 3.059 3.155 3.28 3.403 3.51 3.633 3.753 3.861 4.0 4.165 4.311 4.463 4.609 4.75 4.903 5.065 5.238 5.416 5.633 5.861 6.021 6.115 6.142 5.986 5.519 4.729 3.952 3.234 2.591 2.005 1.466 0.934 0.457 -0.014 -0.446 -0.82 -1.19 -1.538 -1.849 -2.132 -2.446 -2.742 -2.99 -3.25 -3.52 -3.744 -3.958 -4.175 -4.354 -4.546 -4.75 -4.959 -5.173 -5.332 -5.503 -5.753 -5.922 -6.106 -6.198 -6.402 -6.629 -6.855 -6.966 -7.217 -7.342 -7.48 -7.616 -7.872 -8.031 -8.223 -8.45 -8.72 -9.036 -9.513 -11.25 -5 ,87 ,KEBNE ,16691627,Thu Nov 25 15:42:14 CET,Thu Nov 25 17:23:38 CET,0.0 0.515 0.693 0.84 0.971 1.085 1.187 1.289 1.478 1.564 1.652 1.681 1.855 1.919 2.045 2.153 2.248 2.298 2.387 2.474 2.614 2.711 2.815 2.961 3.088 3.2 3.31 3.42 3.571 3.717 3.856 4.025 4.181 4.325 4.486 4.661 4.836 5.035 5.22 5.399 5.604 5.83 6.058 6.267 6.487 6.709 6.911 7.072 7.156 7.092 6.644 5.748 4.963 4.22 3.488 2.789 2.18 1.647 1.166 0.671 0.253 -0.125 -0.507 -0.872 -1.229 -1.528 -1.809 -2.081 -2.331 -2.594 -2.85 -3.056 -3.276 -3.517 -3.704 -3.902 -4.112 -4.322 -4.545 -4.706 -4.878 -5.146 -5.324 -5.5 -5.602 -5.82 -6.027 -6.258 -6.378 -6.616 -6.736 -6.867 -7.007 -7.334 -7.521 -7.719 -7.965 -8.254 -8.558 -8.961 -10.138 -6 ,2130 ,KEBNE ,16691628,Thu Nov 25 15:43:17 CET,Thu Nov 25 17:24:40 CET,0.0 0.421 0.576 0.709 0.834 0.959 1.063 1.152 1.301 1.369 1.442 1.474 1.666 1.738 1.86 1.991 2.104 2.158 2.261 2.36 2.523 2.613 2.693 2.812 2.917 3.021 3.132 3.236 3.388 3.551 3.688 3.848 4.016 4.168 4.33 4.498 4.651 4.82 5.016 5.236 5.444 5.657 5.876 6.059 6.259 6.476 6.698 6.874 6.939 6.896 6.53 5.676 4.816 4.033 3.31 2.655 2.066 1.52 1.049 0.548 0.11 -0.275 -0.639 -0.967 -1.288 -1.594 -1.917 -2.2 -2.447 -2.711 -2.988 -3.217 -3.454 -3.696 -3.889 -4.098 -4.32 -4.55 -4.771 -4.925 -5.08 -5.313 -5.474 -5.644 -5.747 -5.973 -6.188 -6.404 -6.519 -6.764 -6.889 -7.031 -7.196 -7.567 -7.757 -7.943 -8.196 -8.495 -8.782 -9.164 -10.249 -7 ,31179 ,KEBNE ,16691629,Thu Nov 25 15:43:16 CET,Thu Nov 25 17:22:31 CET,0.0 0.443 0.608 0.752 0.875 0.98 1.077 1.155 1.301 1.368 1.435 1.458 1.631 1.691 1.808 1.919 2.04 2.104 2.231 2.341 2.464 2.552 2.645 2.755 2.857 2.964 3.068 3.164 3.294 3.422 3.542 3.681 3.808 3.931 4.057 4.199 4.351 4.502 4.646 4.806 4.961 5.117 5.306 5.48 5.644 5.815 6.02 6.187 6.282 6.222 5.859 5.077 4.272 3.523 2.803 2.117 1.494 0.91 0.411 -0.073 -0.475 -0.838 -1.195 -1.549 -1.894 -2.204 -2.53 -2.812 -3.048 -3.303 -3.561 -3.766 -3.987 -4.221 -4.417 -4.629 -4.837 -5.046 -5.269 -5.432 -5.594 -5.828 -5.997 -6.184 -6.277 -6.472 -6.685 -6.899 -7.007 -7.244 -7.406 -7.559 -7.711 -8.021 -8.197 -8.408 -8.635 -8.871 -9.157 -9.564 -10.639 -8 ,23557 ,KEBNE ,16691630,Thu Nov 25 15:43:17 CET,Thu Nov 25 17:23:25 CET,0.0 0.779 0.948 1.09 1.231 1.348 1.44 1.532 1.711 1.785 1.854 1.881 2.062 2.132 2.27 2.4 2.515 2.567 2.665 2.755 2.891 2.976 3.052 3.156 3.252 3.354 3.457 3.549 3.671 3.784 3.892 4.027 4.151 4.265 4.404 4.566 4.734 4.914 5.104 5.312 5.522 5.751 5.995 6.221 6.457 6.693 6.913 7.045 7.112 7.065 6.655 5.779 4.908 4.147 3.493 2.848 2.2 1.625 1.152 0.684 0.285 -0.109 -0.481 -0.814 -1.158 -1.471 -1.786 -2.07 -2.311 -2.561 -2.821 -3.037 -3.28 -3.55 -3.739 -3.937 -4.147 -4.345 -4.558 -4.697 -4.822 -5.036 -5.194 -5.365 -5.456 -5.643 -5.849 -6.071 -6.18 -6.413 -6.526 -6.647 -6.775 -7.033 -7.153 -7.31 -7.495 -7.672 -7.886 -8.202 -8.971 -9 ,31278 ,KEBNE ,16691631,Thu Nov 25 15:43:17 CET,Thu Nov 25 17:24:11 CET,0.0 0.398 0.57 0.732 0.878 0.994 1.102 1.209 1.39 1.472 1.543 1.56 1.737 1.793 1.917 2.028 2.134 2.189 2.283 2.366 2.485 2.569 2.652 2.775 2.905 3.014 3.106 3.2 3.327 3.455 3.581 3.72 3.832 3.941 4.071 4.208 4.343 4.475 4.628 4.804 4.975 5.17 5.373 5.57 5.804 6.033 6.229 6.39 6.451 6.32 5.863 5.096 4.212 3.35 2.612 1.965 1.378 0.829 0.35 -0.169 -0.636 -1.013 -1.348 -1.688 -2.026 -2.317 -2.618 -2.9 -3.149 -3.416 -3.679 -3.881 -4.1 -4.343 -4.526 -4.722 -4.94 -5.156 -5.367 -5.524 -5.687 -5.923 -6.097 -6.279 -6.369 -6.575 -6.803 -7.02 -7.13 -7.371 -7.543 -7.691 -7.82 -8.161 -8.366 -8.562 -8.774 -9.003 -9.303 -9.742 -11.568 -10 ,18262 ,KEBNE ,16691632,Thu Nov 25 15:43:17 CET,Thu Nov 25 17:22:30 CET,0.0 0.628 0.83 0.952 1.056 1.16 1.252 1.338 1.5 1.573 1.643 1.671 1.853 1.911 2.017 2.124 2.239 2.289 2.375 2.455 2.583 2.677 2.763 2.886 3.006 3.13 3.249 3.353 3.49 3.621 3.733 3.854 3.975 4.105 4.253 4.401 4.539 4.702 4.882 5.07 5.274 5.492 5.736 5.988 6.215 6.411 6.646 6.841 6.934 6.851 6.354 5.523 4.674 3.873 3.186 2.512 1.87 1.283 0.794 0.309 -0.127 -0.531 -0.918 -1.264 -1.58 -1.881 -2.193 -2.487 -2.745 -3.009 -3.274 -3.49 -3.726 -3.978 -4.174 -4.38 -4.583 -4.77 -4.97 -5.123 -5.283 -5.536 -5.701 -5.883 -5.988 -6.191 -6.395 -6.615 -6.726 -6.96 -7.064 -7.195 -7.347 -7.663 -7.828 -8.005 -8.199 -8.412 -8.632 -8.919 -9.696 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_5.txt deleted file mode 100644 index 4eebd795..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_3b_5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19917 ,KEBNE ,16691633,Thu Nov 25 15:44:20 CET,Thu Nov 25 17:27:55 CET,0.0 1.063 1.399 1.643 1.814 1.948 2.083 2.221 2.489 2.613 2.728 2.807 3.002 3.087 3.245 3.397 3.548 3.624 3.773 3.907 4.102 4.233 4.344 4.492 4.637 4.795 4.958 5.113 5.311 5.487 5.655 5.853 6.046 6.232 6.442 6.688 6.924 7.165 7.416 7.694 7.983 8.284 8.619 8.944 9.322 9.73 10.174 10.633 11.067 11.475 11.724 11.529 11.142 10.691 10.218 9.786 9.359 8.914 8.528 8.13 7.783 7.453 7.132 6.827 6.54 6.286 6.012 5.754 5.534 5.31 5.066 4.858 4.649 4.428 4.251 4.052 3.829 3.61 3.378 3.219 3.063 2.809 2.632 2.448 2.358 2.172 1.956 1.713 1.59 1.341 1.155 1.002 0.833 0.434 0.198 -0.061 -0.319 -0.586 -0.913 -1.392 -3.318 -2 ,6317 ,KEBNE ,16691634,Thu Nov 25 15:43:17 CET,Thu Nov 25 17:24:30 CET,0.0 1.125 1.445 1.639 1.814 1.965 2.107 2.26 2.511 2.626 2.73 2.805 3.001 3.083 3.258 3.415 3.564 3.634 3.767 3.904 4.097 4.213 4.323 4.501 4.681 4.855 5.017 5.172 5.371 5.555 5.72 5.924 6.113 6.283 6.493 6.739 6.97 7.211 7.473 7.739 7.985 8.252 8.577 8.896 9.267 9.679 10.128 10.597 11.044 11.429 11.621 11.365 10.995 10.547 10.038 9.575 9.171 8.752 8.36 7.968 7.631 7.329 7.02 6.719 6.433 6.156 5.869 5.613 5.382 5.156 4.931 4.728 4.515 4.288 4.106 3.911 3.709 3.5 3.255 3.083 2.918 2.654 2.461 2.272 2.174 1.969 1.727 1.475 1.361 1.122 0.95 0.801 0.651 0.325 0.132 -0.09 -0.337 -0.63 -0.981 -1.475 -3.67 -3 ,24912 ,KEBNE ,16691635,Thu Nov 25 15:43:18 CET,Thu Nov 25 17:21:59 CET,0.0 1.093 1.433 1.693 1.919 2.117 2.259 2.391 2.629 2.736 2.846 2.943 3.146 3.237 3.425 3.588 3.726 3.795 3.934 4.064 4.251 4.374 4.493 4.666 4.825 4.98 5.132 5.272 5.442 5.595 5.744 5.935 6.131 6.317 6.525 6.756 6.965 7.179 7.414 7.662 7.93 8.231 8.529 8.83 9.199 9.575 9.959 10.354 10.772 11.128 11.33 11.223 10.858 10.4 10.003 9.599 9.151 8.715 8.34 7.954 7.626 7.328 7.039 6.768 6.487 6.211 5.925 5.678 5.459 5.213 4.943 4.729 4.521 4.301 4.13 3.944 3.763 3.577 3.372 3.222 3.069 2.854 2.7 2.522 2.428 2.23 2.023 1.82 1.713 1.468 1.308 1.158 1.006 0.716 0.552 0.358 0.128 -0.157 -0.458 -0.903 -2.309 -4 ,10370 ,KEBNE ,16691636,Thu Nov 25 15:44:20 CET,Thu Nov 25 17:25:12 CET,0.0 0.88 1.157 1.353 1.512 1.648 1.793 1.945 2.212 2.33 2.427 2.5 2.704 2.79 2.949 3.1 3.24 3.309 3.449 3.587 3.785 3.919 4.048 4.212 4.367 4.531 4.687 4.823 4.997 5.167 5.341 5.551 5.742 5.92 6.131 6.376 6.605 6.857 7.132 7.409 7.686 7.983 8.3 8.619 9.011 9.436 9.883 10.355 10.821 11.206 11.395 11.143 10.744 10.279 9.798 9.37 8.956 8.557 8.176 7.778 7.415 7.09 6.78 6.461 6.161 5.893 5.615 5.359 5.131 4.903 4.654 4.424 4.2 3.976 3.796 3.615 3.423 3.212 2.991 2.835 2.67 2.407 2.233 2.042 1.935 1.723 1.489 1.222 1.091 0.833 0.626 0.465 0.303 -0.098 -0.319 -0.541 -0.791 -1.099 -1.455 -1.934 -4.534 -5 ,24516 ,KEBNE ,16691637,Thu Nov 25 15:44:20 CET,Thu Nov 25 17:23:01 CET,0.0 0.758 1.099 1.384 1.584 1.747 1.893 2.029 2.283 2.402 2.512 2.593 2.799 2.897 3.073 3.238 3.405 3.482 3.618 3.739 3.912 4.026 4.141 4.308 4.469 4.619 4.764 4.904 5.081 5.264 5.431 5.617 5.81 5.999 6.21 6.441 6.668 6.91 7.174 7.457 7.725 8.023 8.346 8.637 8.96 9.318 9.763 10.252 10.694 11.095 11.339 11.185 10.84 10.402 9.922 9.43 8.988 8.562 8.164 7.772 7.446 7.15 6.859 6.553 6.256 5.997 5.732 5.487 5.271 5.064 4.85 4.656 4.445 4.203 4.013 3.834 3.631 3.408 3.179 3.013 2.843 2.55 2.314 2.105 2.011 1.813 1.605 1.375 1.242 0.973 0.776 0.624 0.472 0.136 -0.06 -0.289 -0.537 -0.818 -1.16 -1.584 -3.179 -6 ,24502 ,KEBNE ,16691638,Thu Nov 25 15:44:19 CET,Thu Nov 25 17:25:16 CET,0.0 0.68 0.902 1.056 1.186 1.295 1.41 1.526 1.716 1.808 1.902 1.96 2.156 2.245 2.424 2.592 2.734 2.803 2.953 3.09 3.279 3.4 3.512 3.679 3.845 3.998 4.144 4.292 4.474 4.629 4.792 5.003 5.2 5.383 5.592 5.815 6.02 6.237 6.469 6.734 7.015 7.317 7.663 7.995 8.371 8.8 9.232 9.655 10.134 10.574 10.76 10.528 10.086 9.569 9.062 8.6 8.149 7.707 7.302 6.898 6.562 6.246 5.94 5.647 5.371 5.101 4.814 4.578 4.386 4.172 3.945 3.755 3.532 3.294 3.111 2.911 2.703 2.501 2.284 2.135 1.976 1.722 1.552 1.358 1.262 1.063 0.838 0.609 0.487 0.241 0.069 -0.08 -0.241 -0.616 -0.819 -1.039 -1.286 -1.59 -1.971 -2.542 -4.576 -7 ,27800 ,KEBNE ,16691639,Thu Nov 25 15:44:19 CET,Thu Nov 25 17:23:56 CET,0.0 0.641 0.91 1.073 1.201 1.327 1.44 1.541 1.745 1.842 1.936 2.013 2.207 2.282 2.424 2.57 2.731 2.809 2.956 3.104 3.319 3.456 3.58 3.748 3.917 4.071 4.22 4.369 4.541 4.701 4.866 5.064 5.262 5.456 5.677 5.911 6.132 6.381 6.649 6.923 7.204 7.519 7.841 8.14 8.485 8.876 9.326 9.787 10.253 10.643 10.825 10.677 10.33 9.938 9.485 9.031 8.63 8.22 7.838 7.45 7.1 6.785 6.493 6.201 5.923 5.671 5.376 5.098 4.859 4.619 4.378 4.175 3.965 3.729 3.539 3.355 3.172 2.952 2.719 2.575 2.427 2.186 2.017 1.851 1.758 1.55 1.345 1.14 1.036 0.801 0.651 0.506 0.358 0.041 -0.134 -0.33 -0.582 -0.867 -1.141 -1.546 -3.378 -8 ,18015 ,KEBNE ,16691640,Thu Nov 25 15:44:20 CET,Thu Nov 25 17:22:19 CET,0.0 1.282 1.563 1.796 1.984 2.148 2.294 2.437 2.709 2.837 2.953 3.051 3.263 3.349 3.515 3.698 3.858 3.928 4.078 4.223 4.427 4.553 4.673 4.864 5.05 5.201 5.333 5.469 5.654 5.841 6.015 6.221 6.414 6.59 6.784 6.997 7.213 7.463 7.727 7.996 8.284 8.61 8.953 9.278 9.673 10.117 10.605 11.052 11.428 11.773 11.994 11.804 11.383 10.947 10.516 10.053 9.615 9.185 8.788 8.39 8.054 7.728 7.396 7.104 6.826 6.566 6.29 6.033 5.806 5.553 5.303 5.107 4.896 4.676 4.5 4.31 4.106 3.884 3.638 3.477 3.319 3.082 2.916 2.727 2.626 2.419 2.191 1.932 1.802 1.545 1.358 1.19 1.01 0.617 0.391 0.159 -0.084 -0.352 -0.697 -1.243 -3.672 -9 ,5504 ,KEBNE ,16691641,Thu Nov 25 15:44:20 CET,Thu Nov 25 17:24:05 CET,0.0 0.665 0.88 1.021 1.145 1.283 1.406 1.508 1.693 1.78 1.872 1.922 2.105 2.179 2.322 2.458 2.598 2.662 2.778 2.901 3.095 3.233 3.364 3.54 3.704 3.851 3.994 4.145 4.322 4.483 4.654 4.859 5.048 5.241 5.46 5.69 5.909 6.153 6.403 6.646 6.915 7.225 7.562 7.878 8.235 8.643 9.078 9.485 9.911 10.284 10.457 10.233 9.837 9.392 8.964 8.515 8.084 7.697 7.324 6.894 6.479 6.125 5.817 5.53 5.259 4.989 4.697 4.437 4.195 3.95 3.714 3.511 3.293 3.062 2.879 2.685 2.478 2.268 2.028 1.865 1.71 1.444 1.25 1.04 0.932 0.723 0.506 0.265 0.142 -0.109 -0.297 -0.475 -0.655 -0.997 -1.175 -1.366 -1.579 -1.847 -2.185 -2.601 -4.272 -10 ,12939 ,KEBNE ,16691642,Thu Nov 25 15:44:20 CET,Thu Nov 25 17:23:59 CET,0.0 0.757 1.048 1.279 1.469 1.638 1.785 1.916 2.133 2.233 2.335 2.41 2.611 2.703 2.869 3.025 3.185 3.258 3.394 3.529 3.73 3.849 3.957 4.123 4.297 4.466 4.611 4.755 4.944 5.116 5.284 5.484 5.674 5.855 6.045 6.245 6.448 6.693 6.956 7.222 7.519 7.851 8.206 8.545 8.932 9.352 9.789 10.224 10.661 11.076 11.339 11.146 10.764 10.37 9.957 9.516 9.077 8.66 8.264 7.874 7.567 7.271 6.97 6.683 6.417 6.168 5.902 5.661 5.435 5.199 4.958 4.744 4.514 4.273 4.082 3.888 3.683 3.466 3.242 3.082 2.913 2.652 2.481 2.289 2.177 1.953 1.742 1.519 1.388 1.141 0.987 0.844 0.686 0.332 0.136 -0.087 -0.333 -0.647 -1.045 -1.578 -3.519 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_1b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_1b.txt deleted file mode 100644 index 07db0afa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_1b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22456 ,KEBNE ,16691643,Thu Nov 25 15:44:20 CET,Thu Nov 25 17:21:37 CET,0.0 0.712 1.029 1.271 1.458 1.639 1.828 2.006 2.294 2.412 2.531 2.622 2.836 2.931 3.117 3.29 3.47 3.556 3.73 3.891 4.105 4.249 4.39 4.587 4.778 4.968 5.147 5.328 5.554 5.766 5.976 6.22 6.442 6.657 6.917 7.206 7.489 7.805 8.15 8.514 8.901 9.34 9.847 10.377 10.983 11.644 12.366 13.126 13.953 14.882 15.947 16.539 16.695 16.669 16.542 16.356 16.165 15.96 15.753 15.526 15.308 15.095 14.873 14.655 14.44 14.245 14.043 13.85 13.682 13.505 13.299 13.131 12.959 12.774 12.64 12.507 12.375 12.237 12.094 11.991 11.873 11.692 11.575 11.459 11.394 11.256 11.102 10.942 10.863 10.658 10.587 10.486 10.381 10.135 9.995 9.852 9.676 9.478 9.265 8.986 8.027 -2 ,9306 ,KEBNE ,16691644,Thu Nov 25 15:44:20 CET,Thu Nov 25 17:21:53 CET,0.0 1.243 1.539 1.794 2.045 2.257 2.42 2.561 2.839 2.962 3.081 3.197 3.426 3.52 3.706 3.889 4.073 4.159 4.319 4.474 4.706 4.862 5.001 5.202 5.409 5.605 5.785 5.953 6.17 6.389 6.6 6.836 7.076 7.308 7.563 7.845 8.139 8.476 8.809 9.172 9.569 10.016 10.539 11.03 11.584 12.21 12.92 13.687 14.518 15.437 16.423 17.047 17.207 17.118 16.947 16.742 16.52 16.293 16.092 15.853 15.612 15.41 15.221 15.015 14.808 14.608 14.41 14.225 14.044 13.87 13.689 13.527 13.345 13.143 12.994 12.841 12.677 12.518 12.357 12.227 12.096 11.903 11.753 11.586 11.505 11.358 11.191 11.0 10.898 10.68 10.591 10.478 10.353 10.061 9.898 9.722 9.539 9.338 9.049 8.66 7.549 -3 ,14970 ,KEBNE ,16691645,Thu Nov 25 15:45:23 CET,Thu Nov 25 17:24:03 CET,0.0 0.484 0.715 0.898 1.041 1.162 1.291 1.422 1.646 1.746 1.842 1.912 2.149 2.259 2.436 2.612 2.782 2.867 3.05 3.218 3.431 3.567 3.707 3.916 4.118 4.307 4.487 4.667 4.895 5.11 5.319 5.573 5.83 6.066 6.332 6.657 6.973 7.31 7.651 8.017 8.412 8.819 9.297 9.806 10.395 11.047 11.814 12.625 13.47 14.422 15.483 16.132 16.334 16.337 16.211 16.037 15.841 15.634 15.428 15.181 14.938 14.727 14.518 14.303 14.113 13.929 13.722 13.534 13.368 13.199 13.029 12.876 12.696 12.521 12.374 12.205 12.039 11.865 11.686 11.566 11.431 11.217 11.08 10.926 10.845 10.693 10.515 10.315 10.212 9.99 9.9 9.778 9.64 9.325 9.158 8.968 8.731 8.462 8.158 7.774 6.831 -4 ,21424 ,KEBNE ,16691646,Thu Nov 25 15:45:22 CET,Thu Nov 25 17:23:35 CET,0.0 0.792 1.107 1.382 1.605 1.791 1.974 2.145 2.441 2.572 2.689 2.784 3.018 3.121 3.309 3.492 3.669 3.754 3.921 4.088 4.329 4.482 4.632 4.851 5.056 5.236 5.41 5.589 5.821 6.04 6.25 6.507 6.755 6.986 7.256 7.557 7.85 8.175 8.528 8.92 9.298 9.693 10.185 10.695 11.287 11.924 12.617 13.357 14.229 15.224 16.284 16.922 17.051 17.007 16.863 16.674 16.462 16.248 16.029 15.756 15.505 15.277 15.05 14.838 14.619 14.413 14.213 14.04 13.888 13.726 13.556 13.405 13.241 13.051 12.898 12.747 12.596 12.427 12.253 12.133 12.013 11.843 11.724 11.604 11.538 11.4 11.261 11.107 11.029 10.833 10.777 10.682 10.571 10.307 10.177 10.039 9.881 9.726 9.548 9.296 8.534 -5 ,19527 ,KEBNE ,16691647,Thu Nov 25 15:45:23 CET,Thu Nov 25 17:24:08 CET,0.0 1.011 1.317 1.607 1.849 2.01 2.166 2.321 2.594 2.722 2.844 2.931 3.151 3.245 3.435 3.627 3.804 3.885 4.032 4.175 4.399 4.547 4.692 4.895 5.083 5.262 5.426 5.597 5.819 6.019 6.22 6.468 6.716 6.958 7.236 7.548 7.846 8.174 8.504 8.847 9.228 9.668 10.152 10.635 11.219 11.825 12.496 13.232 14.082 15.023 16.033 16.655 16.799 16.74 16.576 16.364 16.136 15.884 15.665 15.439 15.204 14.984 14.771 14.549 14.338 14.157 13.951 13.749 13.581 13.402 13.208 13.052 12.882 12.686 12.545 12.404 12.242 12.082 11.898 11.766 11.638 11.446 11.308 11.153 11.067 10.884 10.705 10.513 10.41 10.188 10.057 9.939 9.814 9.511 9.337 9.163 8.961 8.699 8.414 8.113 7.342 -6 ,12826 ,KEBNE ,16691648,Thu Nov 25 15:45:23 CET,Thu Nov 25 17:24:22 CET,0.0 0.801 1.097 1.312 1.509 1.715 1.888 2.039 2.325 2.451 2.574 2.668 2.907 3.011 3.232 3.434 3.621 3.718 3.912 4.083 4.308 4.449 4.581 4.774 4.971 5.163 5.353 5.53 5.752 5.974 6.184 6.436 6.68 6.9 7.164 7.492 7.787 8.095 8.433 8.778 9.151 9.574 10.066 10.545 11.091 11.735 12.479 13.309 14.226 15.168 16.138 16.698 16.855 16.811 16.689 16.498 16.257 16.017 15.784 15.549 15.349 15.147 14.931 14.718 14.505 14.312 14.114 13.919 13.744 13.546 13.333 13.164 12.98 12.802 12.67 12.512 12.341 12.166 11.979 11.845 11.71 11.507 11.363 11.214 11.128 10.924 10.715 10.516 10.404 10.156 10.038 9.916 9.788 9.534 9.407 9.277 9.117 8.922 8.715 8.43 7.491 -7 ,1199 ,KEBNE ,16691649,Thu Nov 25 15:45:22 CET,Thu Nov 25 17:23:41 CET,0.0 0.723 1.057 1.293 1.472 1.68 1.871 2.023 2.306 2.444 2.565 2.675 2.916 3.012 3.207 3.391 3.563 3.647 3.813 3.98 4.214 4.353 4.494 4.717 4.927 5.124 5.31 5.486 5.724 5.961 6.168 6.406 6.636 6.86 7.144 7.461 7.748 8.064 8.428 8.815 9.195 9.633 10.142 10.65 11.237 11.891 12.629 13.393 14.251 15.245 16.334 16.934 17.04 16.965 16.834 16.683 16.506 16.279 16.062 15.822 15.576 15.346 15.118 14.913 14.714 14.504 14.284 14.082 13.886 13.686 13.49 13.319 13.133 12.938 12.775 12.616 12.46 12.285 12.115 11.992 11.855 11.651 11.499 11.336 11.26 11.104 10.927 10.728 10.623 10.407 10.274 10.13 9.99 9.678 9.505 9.3 9.09 8.882 8.631 8.276 6.993 -8 ,31151 ,KEBNE ,16691650,Thu Nov 25 15:45:23 CET,Thu Nov 25 17:29:04 CET,0.0 1.135 1.474 1.729 1.921 2.06 2.222 2.392 2.669 2.79 2.904 3.001 3.237 3.342 3.535 3.716 3.893 3.982 4.152 4.322 4.566 4.719 4.873 5.081 5.266 5.451 5.648 5.833 6.07 6.295 6.506 6.78 7.036 7.267 7.522 7.839 8.151 8.455 8.781 9.132 9.503 9.932 10.431 10.921 11.491 12.121 12.835 13.621 14.468 15.41 16.452 16.981 17.08 17.024 16.869 16.649 16.416 16.175 15.95 15.698 15.477 15.275 15.058 14.85 14.628 14.417 14.215 14.031 13.874 13.697 13.507 13.359 13.207 13.033 12.89 12.756 12.623 12.484 12.329 12.217 12.108 11.932 11.8 11.68 11.62 11.478 11.317 11.133 11.043 10.842 10.769 10.674 10.568 10.33 10.193 10.043 9.905 9.759 9.56 9.308 8.474 -9 ,22770 ,KEBNE ,16691651,Thu Nov 25 15:45:23 CET,Thu Nov 25 17:23:44 CET,0.0 0.464 0.725 0.93 1.1 1.241 1.384 1.513 1.735 1.845 1.95 2.02 2.252 2.359 2.554 2.718 2.883 2.966 3.118 3.267 3.483 3.621 3.764 3.981 4.179 4.361 4.537 4.705 4.915 5.127 5.335 5.595 5.86 6.105 6.394 6.702 6.992 7.306 7.641 8.018 8.419 8.895 9.428 9.921 10.506 11.154 11.869 12.669 13.554 14.495 15.53 16.158 16.282 16.232 16.158 15.997 15.774 15.537 15.307 15.068 14.856 14.666 14.459 14.262 14.083 13.896 13.699 13.515 13.338 13.159 12.968 12.797 12.615 12.431 12.29 12.139 11.967 11.793 11.629 11.5 11.36 11.14 10.991 10.836 10.751 10.556 10.366 10.182 10.081 9.853 9.734 9.616 9.495 9.271 9.145 8.97 8.764 8.557 8.244 7.821 6.604 -10 ,3168 ,KEBNE ,16691652,Thu Nov 25 15:45:23 CET,Thu Nov 25 17:24:04 CET,0.0 0.818 1.156 1.385 1.568 1.772 1.975 2.141 2.426 2.56 2.686 2.781 3.01 3.108 3.294 3.48 3.66 3.747 3.913 4.065 4.277 4.419 4.569 4.792 4.989 5.181 5.374 5.561 5.786 5.996 6.202 6.44 6.675 6.92 7.2 7.498 7.781 8.08 8.415 8.782 9.172 9.615 10.103 10.584 11.133 11.743 12.428 13.159 13.988 14.938 15.949 16.598 16.836 16.852 16.682 16.448 16.185 15.868 15.57 15.288 15.057 14.818 14.586 14.368 14.166 14.001 13.816 13.629 13.464 13.29 13.094 12.922 12.75 12.577 12.437 12.287 12.13 11.969 11.795 11.668 11.531 11.315 11.167 11.014 10.944 10.8 10.628 10.45 10.351 10.129 10.03 9.912 9.785 9.507 9.347 9.165 8.977 8.747 8.463 8.057 6.888 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_6b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_6b.txt deleted file mode 100644 index 419399c2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6a_6b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27448 ,KEBNE ,16691653,Thu Nov 25 15:45:27 CET,Thu Nov 25 17:20:42 CET,0.0 0.401 0.654 0.857 1.072 1.267 1.428 1.588 1.893 2.032 2.163 2.271 2.506 2.613 2.819 3.025 3.227 3.321 3.493 3.66 3.902 4.055 4.202 4.427 4.641 4.823 4.992 5.152 5.364 5.567 5.749 5.975 6.209 6.439 6.699 6.995 7.26 7.534 7.848 8.173 8.493 8.851 9.259 9.677 10.139 10.6 11.129 11.725 12.388 13.078 13.669 13.814 13.69 13.457 13.161 12.846 12.546 12.23 11.921 11.605 11.324 11.057 10.795 10.56 10.337 10.126 9.905 9.69 9.501 9.322 9.133 8.961 8.791 8.614 8.463 8.309 8.15 7.984 7.805 7.679 7.562 7.395 7.276 7.158 7.1 6.985 6.851 6.714 6.641 6.439 6.393 6.307 6.215 6.021 5.906 5.771 5.628 5.459 5.259 5.053 4.565 -2 ,2780 ,KEBNE ,16691654,Thu Nov 25 15:45:27 CET,Thu Nov 25 17:23:34 CET,0.0 1.224 1.573 1.856 2.098 2.297 2.459 2.619 2.935 3.079 3.216 3.327 3.56 3.663 3.865 4.08 4.28 4.37 4.552 4.729 4.97 5.119 5.261 5.458 5.642 5.832 6.026 6.205 6.441 6.668 6.882 7.133 7.368 7.59 7.858 8.17 8.452 8.734 9.042 9.366 9.694 10.035 10.433 10.859 11.352 11.884 12.498 13.156 13.792 14.376 14.968 15.19 15.067 14.841 14.554 14.219 13.895 13.591 13.304 13.019 12.775 12.534 12.275 12.016 11.788 11.581 11.342 11.141 10.973 10.795 10.617 10.459 10.287 10.109 9.971 9.827 9.682 9.534 9.379 9.271 9.139 8.931 8.791 8.64 8.565 8.412 8.261 8.086 7.987 7.767 7.687 7.588 7.495 7.299 7.187 7.067 6.946 6.809 6.639 6.414 5.985 -3 ,6272 ,KEBNE ,16691655,Thu Nov 25 15:46:26 CET,Thu Nov 25 17:26:53 CET,0.0 0.996 1.456 1.726 1.941 2.123 2.306 2.485 2.803 2.926 3.042 3.152 3.394 3.517 3.737 3.939 4.137 4.23 4.395 4.547 4.789 4.945 5.089 5.297 5.492 5.678 5.858 6.041 6.278 6.496 6.699 6.94 7.165 7.375 7.624 7.93 8.203 8.482 8.793 9.126 9.461 9.829 10.255 10.649 11.1 11.591 12.152 12.759 13.383 13.985 14.502 14.681 14.597 14.346 14.032 13.737 13.445 13.123 12.815 12.496 12.222 11.975 11.731 11.492 11.261 11.047 10.837 10.652 10.476 10.29 10.088 9.901 9.705 9.514 9.364 9.207 9.051 8.882 8.718 8.612 8.479 8.265 8.129 7.995 7.92 7.758 7.604 7.415 7.319 7.124 7.098 7.011 6.908 6.673 6.54 6.406 6.275 6.124 5.943 5.724 5.197 -4 ,12711 ,KEBNE ,16691656,Thu Nov 25 15:46:26 CET,Thu Nov 25 17:26:15 CET,0.0 0.759 1.094 1.394 1.648 1.854 2.026 2.172 2.438 2.577 2.707 2.818 3.055 3.167 3.367 3.544 3.724 3.816 3.985 4.133 4.368 4.526 4.664 4.88 5.098 5.295 5.484 5.67 5.918 6.141 6.345 6.606 6.855 7.076 7.323 7.604 7.867 8.148 8.458 8.8 9.151 9.525 9.944 10.359 10.841 11.354 11.913 12.484 13.063 13.658 14.194 14.365 14.216 13.948 13.651 13.348 13.037 12.703 12.374 12.026 11.73 11.453 11.187 10.927 10.683 10.474 10.254 10.055 9.889 9.713 9.535 9.386 9.21 9.023 8.892 8.752 8.596 8.439 8.279 8.165 8.041 7.851 7.723 7.578 7.497 7.337 7.177 6.989 6.881 6.653 6.543 6.417 6.289 6.021 5.886 5.748 5.576 5.382 5.162 4.886 4.064 -5 ,27034 ,KEBNE ,16691657,Thu Nov 25 15:46:26 CET,Thu Nov 25 17:26:53 CET,0.0 1.009 1.34 1.646 1.915 2.126 2.308 2.478 2.779 2.914 3.048 3.194 3.449 3.56 3.766 3.948 4.137 4.226 4.393 4.557 4.779 4.917 5.059 5.278 5.487 5.681 5.848 5.995 6.202 6.418 6.626 6.871 7.105 7.331 7.606 7.91 8.171 8.442 8.739 9.072 9.405 9.78 10.233 10.654 11.135 11.664 12.26 12.907 13.541 14.153 14.66 14.674 14.406 14.126 13.847 13.517 13.169 12.817 12.521 12.251 12.008 11.763 11.524 11.312 11.09 10.872 10.646 10.452 10.28 10.084 9.873 9.696 9.527 9.355 9.213 9.066 8.905 8.733 8.566 8.447 8.328 8.151 8.023 7.885 7.804 7.638 7.479 7.304 7.213 6.997 6.923 6.811 6.697 6.464 6.334 6.19 6.032 5.849 5.651 5.412 4.551 -6 ,29691 ,KEBNE ,16691658,Thu Nov 25 15:46:25 CET,Thu Nov 25 17:23:58 CET,0.0 0.76 1.043 1.226 1.382 1.512 1.627 1.753 1.988 2.095 2.203 2.274 2.497 2.594 2.777 2.956 3.125 3.201 3.336 3.466 3.664 3.801 3.94 4.157 4.358 4.541 4.72 4.893 5.112 5.327 5.539 5.784 6.024 6.261 6.527 6.815 7.077 7.351 7.657 7.998 8.344 8.704 9.133 9.57 10.084 10.626 11.217 11.83 12.468 13.108 13.699 13.939 13.821 13.556 13.192 12.809 12.515 12.245 11.969 11.664 11.413 11.194 10.96 10.72 10.487 10.28 10.06 9.848 9.666 9.476 9.267 9.092 8.92 8.738 8.594 8.457 8.308 8.147 7.986 7.873 7.75 7.532 7.391 7.251 7.176 7.029 6.874 6.714 6.633 6.415 6.316 6.201 6.082 5.824 5.682 5.524 5.365 5.179 4.932 4.617 3.796 -7 ,20660 ,KEBNE ,16691659,Thu Nov 25 15:46:25 CET,Thu Nov 25 17:26:13 CET,0.0 0.797 1.052 1.284 1.46 1.6 1.73 1.852 2.083 2.193 2.304 2.4 2.634 2.739 2.934 3.122 3.278 3.352 3.514 3.678 3.915 4.059 4.188 4.377 4.575 4.775 4.966 5.159 5.407 5.629 5.835 6.095 6.339 6.557 6.819 7.118 7.388 7.675 7.986 8.311 8.641 9.013 9.443 9.864 10.352 10.9 11.477 12.057 12.666 13.228 13.729 13.883 13.743 13.45 13.097 12.777 12.493 12.177 11.893 11.617 11.342 11.099 10.869 10.65 10.455 10.264 10.049 9.842 9.657 9.458 9.263 9.104 8.922 8.729 8.572 8.418 8.272 8.115 7.933 7.8 7.673 7.499 7.378 7.231 7.153 6.987 6.809 6.648 6.573 6.37 6.327 6.234 6.126 5.883 5.753 5.627 5.492 5.331 5.148 4.912 4.104 -8 ,7202 ,KEBNE ,16691660,Thu Nov 25 15:47:28 CET,Thu Nov 25 17:25:00 CET,0.0 0.726 1.076 1.33 1.516 1.686 1.837 1.995 2.296 2.425 2.56 2.687 2.936 3.064 3.284 3.484 3.676 3.766 3.933 4.09 4.315 4.468 4.623 4.824 5.007 5.194 5.385 5.57 5.774 5.982 6.21 6.459 6.692 6.918 7.167 7.457 7.733 8.044 8.38 8.723 9.084 9.473 9.908 10.321 10.789 11.304 11.846 12.46 13.108 13.69 14.214 14.342 14.184 13.892 13.573 13.261 12.941 12.646 12.374 12.096 11.851 11.613 11.371 11.127 10.899 10.688 10.444 10.24 10.076 9.894 9.708 9.532 9.333 9.145 9.016 8.883 8.73 8.568 8.395 8.274 8.158 7.971 7.833 7.692 7.621 7.479 7.312 7.116 7.02 6.807 6.742 6.636 6.515 6.221 6.016 5.81 5.63 5.434 5.187 4.838 3.753 -9 ,32488 ,KEBNE ,16691661,Thu Nov 25 15:47:28 CET,Thu Nov 25 17:24:54 CET,0.0 0.783 1.185 1.52 1.79 1.992 2.166 2.324 2.623 2.761 2.904 3.034 3.281 3.387 3.62 3.845 4.042 4.133 4.306 4.474 4.722 4.878 5.022 5.23 5.427 5.622 5.811 5.978 6.187 6.381 6.571 6.813 7.051 7.288 7.559 7.854 8.135 8.445 8.784 9.135 9.497 9.878 10.296 10.754 11.271 11.793 12.361 12.936 13.551 14.181 14.676 14.762 14.626 14.381 14.104 13.796 13.479 13.178 12.918 12.609 12.328 12.087 11.844 11.628 11.422 11.22 11.008 10.826 10.678 10.505 10.299 10.125 9.948 9.747 9.596 9.434 9.254 9.081 8.91 8.792 8.662 8.473 8.36 8.25 8.195 8.066 7.912 7.769 7.692 7.474 7.376 7.265 7.161 6.955 6.857 6.739 6.596 6.423 6.231 5.956 5.197 -10 ,4057 ,KEBNE ,16691662,Thu Nov 25 15:47:28 CET,Thu Nov 25 17:27:14 CET,0.0 1.338 1.631 1.822 2.008 2.153 2.294 2.445 2.72 2.832 2.929 3.005 3.237 3.355 3.581 3.786 3.988 4.083 4.247 4.395 4.61 4.768 4.92 5.127 5.32 5.502 5.689 5.87 6.076 6.266 6.458 6.705 6.946 7.162 7.417 7.713 7.996 8.306 8.617 8.936 9.277 9.644 10.073 10.52 11.028 11.557 12.127 12.717 13.35 14.004 14.58 14.708 14.562 14.293 13.952 13.592 13.237 12.896 12.616 12.341 12.07 11.823 11.566 11.306 11.09 10.885 10.656 10.451 10.267 10.08 9.89 9.727 9.556 9.369 9.227 9.081 8.922 8.746 8.562 8.443 8.32 8.12 7.98 7.839 7.764 7.612 7.452 7.266 7.175 6.963 6.884 6.778 6.669 6.415 6.269 6.131 5.978 5.774 5.521 5.166 4.107 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_7a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_7a.txt deleted file mode 100644 index 5b4b279c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6b_7a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9951 ,KEBNE ,16691663,Thu Nov 25 15:48:30 CET,Thu Nov 25 17:26:56 CET,0.0 0.734 1.072 1.274 1.422 1.568 1.711 1.832 2.047 2.152 2.247 2.305 2.507 2.594 2.764 2.926 3.078 3.145 3.279 3.405 3.596 3.723 3.836 4.002 4.173 4.334 4.48 4.619 4.799 4.968 5.132 5.313 5.458 5.615 5.803 6.003 6.182 6.35 6.546 6.738 6.917 7.121 7.331 7.513 7.686 7.837 7.96 7.985 7.841 7.417 6.49 5.156 3.971 2.91 2.023 1.267 0.575 -0.061 -0.621 -1.199 -1.711 -2.152 -2.55 -2.943 -3.333 -3.674 -4.015 -4.32 -4.594 -4.879 -5.161 -5.406 -5.663 -5.932 -6.138 -6.343 -6.566 -6.795 -7.031 -7.199 -7.37 -7.624 -7.797 -7.982 -8.076 -8.269 -8.485 -8.707 -8.818 -9.069 -9.182 -9.313 -9.463 -9.774 -9.936 -10.104 -10.285 -10.503 -10.758 -11.065 -11.874 -2 ,15139 ,KEBNE ,16691664,Thu Nov 25 15:47:28 CET,Thu Nov 25 17:26:13 CET,0.0 1.078 1.339 1.508 1.696 1.892 2.039 2.151 2.378 2.485 2.594 2.689 2.919 3.016 3.201 3.386 3.56 3.644 3.804 3.941 4.13 4.263 4.389 4.569 4.741 4.905 5.058 5.183 5.358 5.532 5.693 5.897 6.074 6.241 6.429 6.642 6.822 6.995 7.188 7.371 7.544 7.71 7.891 8.064 8.23 8.377 8.489 8.501 8.323 7.937 7.103 5.769 4.597 3.565 2.634 1.777 1.039 0.385 -0.192 -0.778 -1.279 -1.72 -2.151 -2.55 -2.906 -3.237 -3.591 -3.903 -4.167 -4.451 -4.762 -5.02 -5.281 -5.549 -5.75 -5.959 -6.18 -6.409 -6.638 -6.789 -6.95 -7.211 -7.385 -7.561 -7.649 -7.833 -8.025 -8.227 -8.343 -8.597 -8.698 -8.827 -8.961 -9.267 -9.441 -9.612 -9.771 -9.944 -10.172 -10.465 -11.96 -3 ,1102 ,KEBNE ,16691665,Thu Nov 25 15:47:28 CET,Thu Nov 25 17:26:32 CET,0.0 0.787 1.047 1.207 1.383 1.533 1.655 1.778 2.006 2.105 2.207 2.269 2.476 2.557 2.702 2.836 2.967 3.032 3.159 3.272 3.424 3.523 3.62 3.765 3.908 4.051 4.188 4.326 4.496 4.661 4.826 5.008 5.186 5.366 5.556 5.742 5.918 6.102 6.284 6.461 6.639 6.817 6.994 7.152 7.305 7.426 7.486 7.483 7.365 7.022 6.203 5.003 3.895 2.836 1.917 1.103 0.326 -0.379 -0.968 -1.546 -2.052 -2.524 -2.962 -3.348 -3.714 -4.067 -4.42 -4.719 -4.985 -5.278 -5.577 -5.807 -6.054 -6.311 -6.509 -6.727 -6.947 -7.174 -7.42 -7.596 -7.783 -8.072 -8.26 -8.445 -8.546 -8.751 -8.97 -9.211 -9.339 -9.608 -9.754 -9.895 -10.042 -10.343 -10.526 -10.756 -10.993 -11.27 -11.627 -12.035 -13.057 -4 ,1034 ,KEBNE ,16691666,Thu Nov 25 15:47:28 CET,Thu Nov 25 17:28:26 CET,0.0 0.872 1.123 1.322 1.492 1.678 1.841 1.975 2.241 2.356 2.468 2.561 2.789 2.893 3.064 3.239 3.42 3.503 3.662 3.816 4.028 4.152 4.271 4.449 4.603 4.751 4.896 5.045 5.228 5.397 5.563 5.742 5.91 6.053 6.198 6.369 6.552 6.75 6.942 7.12 7.303 7.51 7.72 7.915 8.093 8.218 8.337 8.397 8.292 7.928 7.026 5.715 4.594 3.592 2.651 1.805 1.086 0.42 -0.185 -0.762 -1.227 -1.656 -2.085 -2.499 -2.89 -3.244 -3.598 -3.914 -4.196 -4.491 -4.799 -5.05 -5.304 -5.57 -5.776 -5.995 -6.216 -6.439 -6.676 -6.85 -7.034 -7.318 -7.509 -7.709 -7.811 -8.021 -8.235 -8.443 -8.547 -8.79 -8.899 -9.026 -9.164 -9.488 -9.662 -9.85 -10.042 -10.253 -10.498 -10.8 -12.021 -5 ,23178 ,KEBNE ,16691667,Thu Nov 25 15:47:32 CET,Thu Nov 25 17:19:10 CET,0.0 0.99 1.255 1.474 1.653 1.794 1.937 2.062 2.29 2.406 2.512 2.572 2.796 2.888 3.05 3.202 3.345 3.414 3.555 3.682 3.889 4.026 4.151 4.324 4.492 4.639 4.769 4.915 5.107 5.265 5.41 5.602 5.769 5.928 6.127 6.327 6.517 6.705 6.9 7.116 7.319 7.521 7.707 7.865 8.046 8.232 8.363 8.382 8.237 7.787 6.806 5.469 4.259 3.167 2.239 1.434 0.732 0.096 -0.471 -1.044 -1.52 -1.958 -2.382 -2.774 -3.148 -3.502 -3.864 -4.189 -4.471 -4.76 -5.061 -5.303 -5.554 -5.819 -6.026 -6.225 -6.422 -6.63 -6.859 -7.023 -7.188 -7.437 -7.598 -7.757 -7.845 -8.029 -8.221 -8.423 -8.53 -8.775 -8.856 -8.985 -9.122 -9.398 -9.541 -9.69 -9.861 -10.051 -10.26 -10.531 -11.209 -6 ,15248 ,KEBNE ,16691668,Thu Nov 25 15:48:31 CET,Thu Nov 25 17:29:09 CET,0.0 0.706 0.934 1.097 1.256 1.407 1.546 1.7 1.977 2.095 2.214 2.3 2.512 2.598 2.763 2.919 3.074 3.141 3.279 3.433 3.655 3.792 3.92 4.096 4.253 4.397 4.534 4.668 4.839 5.005 5.171 5.343 5.501 5.667 5.831 5.995 6.17 6.369 6.568 6.758 6.937 7.132 7.351 7.544 7.73 7.913 8.062 8.085 7.939 7.554 6.692 5.337 4.139 3.111 2.183 1.325 0.584 -0.095 -0.673 -1.247 -1.736 -2.166 -2.587 -2.997 -3.365 -3.69 -4.05 -4.367 -4.642 -4.929 -5.226 -5.482 -5.739 -5.997 -6.204 -6.418 -6.637 -6.876 -7.129 -7.294 -7.464 -7.74 -7.92 -8.097 -8.199 -8.419 -8.644 -8.879 -8.997 -9.262 -9.398 -9.533 -9.674 -10.024 -10.236 -10.45 -10.685 -10.961 -11.274 -11.653 -13.512 -7 ,27942 ,KEBNE ,16691669,Thu Nov 25 15:48:31 CET,Thu Nov 25 17:28:42 CET,0.0 0.835 1.122 1.375 1.543 1.674 1.783 1.885 2.085 2.179 2.268 2.341 2.551 2.635 2.796 2.946 3.085 3.157 3.3 3.442 3.658 3.793 3.92 4.102 4.271 4.425 4.576 4.716 4.905 5.086 5.239 5.419 5.591 5.745 5.916 6.117 6.302 6.492 6.693 6.887 7.069 7.263 7.46 7.647 7.84 8.008 8.126 8.156 8.028 7.684 6.867 5.554 4.333 3.244 2.327 1.511 0.764 0.097 -0.481 -1.083 -1.593 -2.053 -2.51 -2.925 -3.295 -3.632 -3.991 -4.325 -4.595 -4.861 -5.144 -5.376 -5.624 -5.89 -6.107 -6.34 -6.569 -6.785 -7.001 -7.153 -7.313 -7.586 -7.776 -7.979 -8.086 -8.305 -8.529 -8.764 -8.878 -9.127 -9.259 -9.396 -9.543 -9.894 -10.087 -10.296 -10.552 -10.838 -11.141 -11.483 -12.359 -8 ,20295 ,KEBNE ,16691670,Thu Nov 25 15:49:33 CET,Thu Nov 25 17:29:26 CET,0.0 0.766 1.05 1.28 1.475 1.637 1.776 1.893 2.132 2.252 2.357 2.454 2.682 2.765 2.923 3.067 3.213 3.291 3.443 3.595 3.803 3.924 4.041 4.212 4.372 4.522 4.662 4.795 4.976 5.146 5.294 5.467 5.633 5.795 5.984 6.17 6.333 6.51 6.698 6.876 7.048 7.252 7.464 7.657 7.838 7.973 8.111 8.117 7.985 7.681 6.855 5.614 4.432 3.375 2.417 1.547 0.813 0.157 -0.413 -0.968 -1.464 -1.915 -2.342 -2.749 -3.132 -3.476 -3.82 -4.129 -4.395 -4.672 -4.971 -5.22 -5.474 -5.729 -5.932 -6.156 -6.377 -6.597 -6.853 -7.037 -7.216 -7.477 -7.66 -7.856 -7.954 -8.137 -8.312 -8.503 -8.607 -8.856 -8.943 -9.06 -9.194 -9.474 -9.617 -9.776 -9.941 -10.152 -10.41 -10.724 -11.727 -9 ,10244 ,KEBNE ,16691671,Thu Nov 25 15:49:33 CET,Thu Nov 25 17:28:28 CET,0.0 0.707 0.995 1.189 1.344 1.466 1.58 1.691 1.889 1.984 2.08 2.145 2.346 2.418 2.56 2.686 2.803 2.868 3.005 3.133 3.299 3.397 3.493 3.631 3.759 3.882 4.004 4.122 4.264 4.397 4.521 4.652 4.778 4.907 5.049 5.2 5.348 5.508 5.668 5.834 6.011 6.198 6.377 6.529 6.712 6.891 7.019 7.073 6.966 6.632 5.864 4.641 3.416 2.346 1.469 0.639 -0.103 -0.765 -1.335 -1.894 -2.366 -2.796 -3.208 -3.601 -3.978 -4.333 -4.704 -5.019 -5.291 -5.57 -5.865 -6.122 -6.388 -6.648 -6.854 -7.073 -7.301 -7.546 -7.814 -7.986 -8.152 -8.426 -8.614 -8.816 -8.926 -9.141 -9.335 -9.548 -9.675 -9.948 -10.088 -10.237 -10.395 -10.683 -10.841 -11.025 -11.246 -11.492 -11.801 -12.214 -13.801 -10 ,12970 ,KEBNE ,16691672,Thu Nov 25 15:49:33 CET,Thu Nov 25 17:32:10 CET,0.0 0.808 1.052 1.255 1.432 1.579 1.698 1.809 2.002 2.101 2.197 2.247 2.452 2.527 2.668 2.82 2.954 3.013 3.128 3.236 3.393 3.498 3.606 3.755 3.89 4.01 4.137 4.278 4.456 4.621 4.785 4.978 5.15 5.299 5.477 5.674 5.839 6.019 6.206 6.385 6.555 6.742 6.963 7.173 7.345 7.468 7.553 7.563 7.447 7.055 6.17 4.891 3.696 2.624 1.696 0.862 0.154 -0.481 -1.061 -1.637 -2.117 -2.572 -3.012 -3.413 -3.801 -4.143 -4.501 -4.83 -5.101 -5.381 -5.676 -5.925 -6.19 -6.458 -6.671 -6.89 -7.117 -7.358 -7.589 -7.75 -7.931 -8.24 -8.445 -8.646 -8.749 -8.947 -9.168 -9.39 -9.503 -9.766 -9.903 -10.05 -10.205 -10.56 -10.757 -10.941 -11.134 -11.328 -11.556 -11.872 -12.509 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6a.txt deleted file mode 100644 index 312deef8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4823 ,KEBNE ,16691673,Thu Nov 25 15:50:36 CET,Thu Nov 25 17:31:48 CET,0.0 0.735 1.058 1.308 1.513 1.709 1.872 2.004 2.248 2.368 2.479 2.566 2.782 2.866 3.031 3.195 3.363 3.444 3.607 3.766 3.973 4.111 4.245 4.422 4.592 4.75 4.894 5.035 5.224 5.404 5.581 5.797 6.003 6.198 6.423 6.686 6.938 7.212 7.498 7.786 8.079 8.372 8.697 9.043 9.445 9.862 10.265 10.684 11.117 11.474 11.662 11.498 11.126 10.657 10.184 9.766 9.365 8.954 8.577 8.213 7.91 7.641 7.373 7.118 6.888 6.671 6.444 6.241 6.058 5.865 5.643 5.448 5.252 5.058 4.911 4.748 4.581 4.416 4.246 4.129 4.008 3.805 3.658 3.51 3.428 3.263 3.087 2.903 2.813 2.597 2.527 2.417 2.289 2.019 1.879 1.701 1.493 1.272 1.028 0.758 0.109 -2 ,11555 ,KEBNE ,16691674,Thu Nov 25 15:50:36 CET,Thu Nov 25 17:31:03 CET,0.0 0.872 1.078 1.245 1.397 1.519 1.634 1.747 1.951 2.044 2.134 2.2 2.411 2.483 2.63 2.771 2.914 2.992 3.141 3.263 3.442 3.564 3.68 3.86 4.046 4.223 4.382 4.523 4.711 4.893 5.074 5.294 5.492 5.681 5.91 6.167 6.403 6.666 6.945 7.237 7.539 7.874 8.228 8.578 9.008 9.418 9.821 10.214 10.629 11.061 11.303 11.141 10.766 10.306 9.866 9.456 9.064 8.659 8.293 7.933 7.617 7.326 7.059 6.798 6.531 6.289 6.049 5.827 5.624 5.414 5.195 5.007 4.824 4.637 4.487 4.336 4.183 4.024 3.852 3.735 3.605 3.395 3.252 3.088 3.008 2.851 2.686 2.508 2.414 2.187 2.084 1.977 1.881 1.673 1.553 1.431 1.322 1.177 0.981 0.796 0.385 -3 ,26033 ,KEBNE ,16691675,Thu Nov 25 15:50:35 CET,Thu Nov 25 17:28:27 CET,0.0 0.62 0.87 1.071 1.242 1.404 1.54 1.656 1.894 2.003 2.106 2.169 2.379 2.457 2.611 2.766 2.921 2.994 3.123 3.257 3.439 3.555 3.68 3.876 4.069 4.246 4.404 4.557 4.764 4.964 5.161 5.397 5.615 5.812 6.025 6.268 6.501 6.758 7.041 7.33 7.607 7.918 8.28 8.627 9.03 9.461 9.914 10.369 10.871 11.275 11.396 11.158 10.745 10.315 9.892 9.455 9.054 8.68 8.359 8.05 7.764 7.48 7.195 6.925 6.681 6.464 6.229 5.994 5.783 5.578 5.367 5.19 5.011 4.822 4.677 4.529 4.367 4.192 4.022 3.902 3.772 3.602 3.495 3.377 3.313 3.18 3.041 2.89 2.81 2.608 2.56 2.469 2.382 2.177 2.056 1.928 1.79 1.635 1.465 1.239 0.865 -4 ,8336 ,KEBNE ,16691676,Thu Nov 25 15:51:38 CET,Thu Nov 25 17:31:01 CET,0.0 0.759 1.106 1.335 1.524 1.706 1.852 1.995 2.255 2.386 2.502 2.589 2.819 2.92 3.114 3.293 3.463 3.543 3.699 3.857 4.085 4.234 4.375 4.572 4.752 4.92 5.085 5.243 5.438 5.632 5.812 6.01 6.22 6.441 6.68 6.933 7.166 7.41 7.663 7.928 8.216 8.531 8.874 9.207 9.583 9.968 10.349 10.734 11.131 11.457 11.598 11.392 11.017 10.558 10.083 9.621 9.184 8.775 8.413 8.054 7.742 7.446 7.156 6.895 6.657 6.418 6.159 5.944 5.761 5.551 5.325 5.15 4.967 4.775 4.627 4.472 4.3 4.12 3.928 3.795 3.67 3.476 3.321 3.162 3.091 2.949 2.791 2.609 2.511 2.275 2.153 2.034 1.932 1.713 1.574 1.418 1.252 1.079 0.926 0.767 0.487 -5 ,7318 ,KEBNE ,16691677,Thu Nov 25 15:51:39 CET,Thu Nov 25 17:30:39 CET,0.0 1.126 1.484 1.755 1.98 2.168 2.334 2.489 2.785 2.915 3.029 3.121 3.347 3.441 3.622 3.807 3.975 4.046 4.194 4.341 4.534 4.659 4.773 4.949 5.13 5.291 5.436 5.576 5.763 5.956 6.149 6.377 6.597 6.797 7.005 7.242 7.481 7.752 8.034 8.309 8.58 8.884 9.251 9.598 10.004 10.422 10.838 11.257 11.663 12.018 12.127 11.85 11.413 10.947 10.494 10.026 9.601 9.218 8.904 8.58 8.262 7.964 7.676 7.405 7.152 6.908 6.656 6.443 6.241 6.02 5.797 5.615 5.424 5.228 5.08 4.924 4.748 4.563 4.379 4.254 4.127 3.922 3.776 3.632 3.566 3.431 3.283 3.107 3.014 2.804 2.749 2.643 2.514 2.21 2.052 1.88 1.698 1.515 1.269 0.905 0.049 -6 ,24532 ,KEBNE ,16691678,Thu Nov 25 15:51:39 CET,Thu Nov 25 17:30:17 CET,0.0 0.846 1.212 1.482 1.706 1.899 2.068 2.215 2.482 2.606 2.728 2.827 3.048 3.148 3.364 3.571 3.746 3.828 3.997 4.151 4.364 4.499 4.629 4.813 4.997 5.167 5.327 5.479 5.678 5.865 6.028 6.223 6.433 6.644 6.875 7.129 7.348 7.577 7.843 8.131 8.407 8.702 9.058 9.41 9.794 10.182 10.607 11.06 11.526 11.968 12.195 11.974 11.579 11.153 10.7 10.278 9.939 9.595 9.274 8.916 8.595 8.317 8.056 7.79 7.529 7.299 7.052 6.838 6.644 6.423 6.212 6.04 5.856 5.682 5.541 5.387 5.228 5.049 4.879 4.769 4.649 4.471 4.351 4.206 4.126 3.968 3.804 3.637 3.55 3.337 3.268 3.164 3.049 2.785 2.645 2.505 2.321 2.113 1.889 1.607 0.587 -7 ,26458 ,KEBNE ,16691679,Thu Nov 25 15:51:39 CET,Thu Nov 25 17:30:55 CET,0.0 0.422 0.627 0.822 0.982 1.11 1.234 1.361 1.598 1.698 1.786 1.827 2.032 2.11 2.262 2.411 2.566 2.638 2.757 2.878 3.059 3.184 3.306 3.486 3.666 3.842 4.006 4.161 4.369 4.573 4.768 4.994 5.211 5.405 5.625 5.902 6.159 6.422 6.711 7.005 7.285 7.592 7.945 8.284 8.676 9.092 9.526 9.985 10.441 10.782 10.945 10.786 10.432 9.995 9.534 9.094 8.693 8.312 7.993 7.675 7.394 7.123 6.857 6.633 6.414 6.196 5.955 5.742 5.552 5.351 5.135 4.945 4.761 4.574 4.426 4.274 4.125 3.964 3.795 3.685 3.579 3.412 3.298 3.177 3.114 2.991 2.859 2.724 2.652 2.439 2.388 2.301 2.215 2.0 1.866 1.739 1.614 1.471 1.326 1.169 0.813 -8 ,14363 ,KEBNE ,16691680,Thu Nov 25 15:53:44 CET,Thu Nov 25 17:30:38 CET,0.0 1.015 1.389 1.653 1.871 2.053 2.202 2.351 2.651 2.781 2.897 2.986 3.198 3.293 3.501 3.67 3.827 3.902 4.04 4.168 4.358 4.482 4.598 4.779 4.963 5.132 5.286 5.44 5.65 5.842 6.033 6.272 6.486 6.686 6.911 7.154 7.38 7.631 7.905 8.184 8.47 8.793 9.17 9.541 9.949 10.378 10.799 11.173 11.566 11.98 12.164 11.846 11.446 11.038 10.573 10.087 9.636 9.248 8.929 8.601 8.314 8.048 7.779 7.506 7.251 7.038 6.812 6.602 6.41 6.204 6.006 5.843 5.672 5.471 5.313 5.168 5.006 4.829 4.646 4.513 4.378 4.192 4.062 3.914 3.836 3.681 3.519 3.327 3.224 2.994 2.914 2.8 2.679 2.405 2.244 2.073 1.88 1.665 1.419 1.144 0.674 -9 ,2644 ,KEBNE ,16691681,Thu Nov 25 15:52:42 CET,Thu Nov 25 17:31:18 CET,0.0 0.859 1.137 1.373 1.565 1.749 1.937 2.109 2.408 2.543 2.66 2.772 3.012 3.115 3.321 3.514 3.678 3.754 3.902 4.027 4.206 4.338 4.469 4.657 4.824 4.992 5.174 5.338 5.529 5.709 5.891 6.122 6.337 6.535 6.765 7.023 7.26 7.518 7.799 8.083 8.364 8.696 9.072 9.404 9.758 10.138 10.526 10.948 11.377 11.745 11.961 11.724 11.317 10.854 10.375 9.932 9.533 9.167 8.841 8.486 8.162 7.868 7.58 7.318 7.087 6.868 6.628 6.401 6.209 6.019 5.818 5.654 5.49 5.305 5.158 5.007 4.851 4.698 4.527 4.398 4.267 4.075 3.935 3.779 3.706 3.567 3.412 3.239 3.149 2.928 2.856 2.752 2.637 2.36 2.207 2.043 1.865 1.678 1.452 1.194 0.819 -10 ,16239 ,KEBNE ,16691682,Thu Nov 25 15:52:41 CET,Thu Nov 25 17:31:12 CET,0.0 0.788 1.132 1.375 1.587 1.799 1.961 2.102 2.37 2.5 2.62 2.712 2.938 3.036 3.23 3.406 3.562 3.635 3.776 3.917 4.12 4.249 4.372 4.554 4.732 4.903 5.062 5.214 5.41 5.583 5.744 5.946 6.149 6.355 6.586 6.837 7.085 7.345 7.605 7.865 8.145 8.454 8.827 9.185 9.577 10.017 10.453 10.894 11.35 11.734 11.953 11.79 11.45 11.032 10.589 10.165 9.78 9.41 9.089 8.755 8.428 8.13 7.871 7.629 7.383 7.158 6.925 6.713 6.526 6.328 6.117 5.947 5.78 5.596 5.438 5.279 5.122 4.958 4.792 4.672 4.543 4.349 4.199 4.044 3.972 3.804 3.627 3.452 3.361 3.145 3.062 2.942 2.811 2.548 2.407 2.241 2.066 1.882 1.613 1.302 0.501 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6b.txt deleted file mode 100644 index 850f113f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_6e_6b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8903 ,KEBNE ,16691683,Thu Nov 25 15:53:43 CET,Thu Nov 25 17:31:47 CET,0.0 0.658 0.936 1.206 1.421 1.579 1.726 1.863 2.118 2.24 2.361 2.462 2.689 2.782 2.947 3.113 3.288 3.369 3.53 3.689 3.927 4.089 4.247 4.464 4.662 4.855 5.045 5.226 5.469 5.712 5.939 6.19 6.439 6.675 6.937 7.231 7.517 7.831 8.177 8.561 8.94 9.339 9.78 10.205 10.677 11.23 11.855 12.466 13.08 13.75 14.349 14.404 14.157 13.86 13.514 13.113 12.761 12.45 12.161 11.865 11.601 11.36 11.128 10.918 10.723 10.524 10.298 10.08 9.905 9.724 9.534 9.373 9.195 9.02 8.891 8.752 8.601 8.424 8.213 8.076 7.95 7.752 7.615 7.467 7.392 7.231 7.043 6.865 6.777 6.554 6.489 6.38 6.26 5.989 5.857 5.706 5.527 5.287 4.987 4.629 3.579 -2 ,28358 ,KEBNE ,16691684,Thu Nov 25 15:52:41 CET,Thu Nov 25 17:33:10 CET,0.0 1.063 1.463 1.773 2.022 2.216 2.402 2.584 2.904 3.036 3.164 3.282 3.517 3.631 3.829 3.997 4.18 4.281 4.463 4.629 4.871 5.023 5.17 5.389 5.605 5.801 5.974 6.154 6.389 6.61 6.821 7.066 7.304 7.542 7.807 8.077 8.322 8.597 8.903 9.223 9.576 9.966 10.427 10.886 11.339 11.818 12.388 13.066 13.769 14.379 14.87 14.935 14.723 14.401 14.067 13.733 13.396 13.059 12.755 12.455 12.176 11.911 11.675 11.454 11.241 11.038 10.812 10.612 10.437 10.245 10.046 9.878 9.695 9.508 9.356 9.197 9.042 8.888 8.72 8.598 8.476 8.289 8.154 8.01 7.931 7.764 7.588 7.406 7.315 7.097 7.013 6.907 6.795 6.541 6.389 6.231 6.084 5.889 5.672 5.36 4.716 -3 ,14062 ,KEBNE ,16691685,Thu Nov 25 15:52:41 CET,Thu Nov 25 17:30:08 CET,0.0 1.042 1.366 1.58 1.765 1.925 2.056 2.196 2.494 2.622 2.739 2.823 3.048 3.158 3.373 3.564 3.741 3.835 4.016 4.181 4.418 4.573 4.727 4.942 5.152 5.359 5.551 5.736 5.969 6.191 6.402 6.663 6.913 7.137 7.401 7.7 7.995 8.318 8.642 8.981 9.352 9.767 10.236 10.697 11.216 11.765 12.363 12.996 13.601 14.163 14.638 14.703 14.512 14.26 13.953 13.643 13.362 13.078 12.812 12.507 12.234 11.976 11.733 11.504 11.259 11.015 10.771 10.562 10.379 10.19 9.99 9.82 9.636 9.449 9.308 9.167 9.02 8.855 8.689 8.574 8.464 8.294 8.153 7.988 7.908 7.756 7.576 7.369 7.27 7.042 6.932 6.816 6.708 6.448 6.285 6.114 5.944 5.728 5.425 5.074 4.325 -4 ,12358 ,KEBNE ,16691686,Thu Nov 25 15:52:41 CET,Thu Nov 25 17:32:54 CET,0.0 0.515 0.802 1.076 1.31 1.522 1.717 1.891 2.184 2.321 2.446 2.572 2.821 2.93 3.135 3.325 3.51 3.605 3.783 3.947 4.176 4.321 4.463 4.66 4.858 5.046 5.232 5.417 5.644 5.87 6.086 6.344 6.593 6.849 7.157 7.471 7.741 8.025 8.344 8.674 9.028 9.429 9.886 10.35 10.863 11.413 11.985 12.57 13.166 13.683 14.084 14.187 14.038 13.764 13.444 13.115 12.804 12.499 12.243 11.984 11.735 11.499 11.255 11.033 10.828 10.628 10.408 10.214 10.048 9.864 9.687 9.536 9.363 9.185 9.044 8.888 8.732 8.569 8.385 8.255 8.119 7.926 7.791 7.638 7.562 7.411 7.252 7.083 7.001 6.793 6.716 6.618 6.515 6.253 6.109 5.956 5.794 5.598 5.369 5.056 4.233 -5 ,29788 ,KEBNE ,16691687,Thu Nov 25 15:52:41 CET,Thu Nov 25 17:30:46 CET,0.0 1.289 1.69 1.988 2.223 2.403 2.593 2.764 3.042 3.179 3.296 3.38 3.621 3.742 3.96 4.155 4.351 4.446 4.623 4.785 5.02 5.18 5.332 5.552 5.757 5.947 6.151 6.348 6.581 6.811 7.032 7.287 7.524 7.756 8.023 8.308 8.589 8.91 9.244 9.612 9.992 10.378 10.812 11.24 11.756 12.316 12.969 13.611 14.235 14.955 15.501 15.629 15.496 15.246 14.978 14.648 14.301 13.991 13.704 13.403 13.149 12.923 12.675 12.433 12.213 12.024 11.825 11.61 11.415 11.215 11.004 10.821 10.649 10.477 10.331 10.176 10.018 9.873 9.711 9.587 9.46 9.267 9.147 9.017 8.946 8.792 8.636 8.486 8.406 8.203 8.181 8.103 8.021 7.818 7.702 7.587 7.454 7.287 7.114 6.938 6.458 -6 ,19544 ,KEBNE ,16691688,Thu Nov 25 15:53:44 CET,Thu Nov 25 17:35:03 CET,0.0 0.911 1.311 1.615 1.872 2.102 2.29 2.454 2.765 2.909 3.051 3.196 3.446 3.558 3.774 3.973 4.152 4.241 4.42 4.589 4.826 4.978 5.117 5.315 5.511 5.693 5.878 6.058 6.267 6.473 6.668 6.903 7.14 7.363 7.624 7.921 8.219 8.541 8.864 9.202 9.565 9.995 10.478 10.923 11.416 11.963 12.58 13.193 13.833 14.454 14.927 15.067 14.95 14.689 14.354 13.992 13.675 13.374 13.079 12.77 12.488 12.225 11.992 11.769 11.529 11.314 11.098 10.898 10.712 10.515 10.325 10.171 10.004 9.823 9.688 9.542 9.377 9.212 9.043 8.927 8.798 8.581 8.432 8.291 8.225 8.073 7.905 7.731 7.636 7.407 7.305 7.183 7.043 6.757 6.608 6.456 6.289 6.088 5.879 5.58 4.969 -7 ,22002 ,KEBNE ,16691689,Thu Nov 25 15:53:44 CET,Thu Nov 25 17:33:32 CET,0.0 1.34 1.727 1.985 2.191 2.396 2.586 2.773 3.107 3.251 3.405 3.569 3.809 3.919 4.149 4.385 4.584 4.676 4.859 5.046 5.309 5.471 5.627 5.838 6.038 6.23 6.413 6.6 6.849 7.073 7.28 7.529 7.776 8.009 8.257 8.553 8.856 9.169 9.473 9.786 10.114 10.501 10.95 11.371 11.834 12.366 12.985 13.611 14.273 14.909 15.357 15.448 15.262 14.939 14.588 14.218 13.877 13.582 13.288 12.981 12.716 12.47 12.234 11.994 11.776 11.573 11.341 11.13 10.944 10.754 10.563 10.398 10.223 10.042 9.908 9.754 9.586 9.432 9.261 9.137 9.013 8.809 8.663 8.53 8.466 8.327 8.18 8.015 7.914 7.68 7.586 7.491 7.395 7.169 7.036 6.889 6.732 6.561 6.355 6.075 5.197 -8 ,25290 ,KEBNE ,16691690,Thu Nov 25 15:53:44 CET,Thu Nov 25 17:33:35 CET,0.0 0.648 0.917 1.154 1.346 1.532 1.691 1.829 2.058 2.163 2.278 2.37 2.599 2.69 2.852 3.018 3.184 3.271 3.436 3.579 3.78 3.916 4.052 4.255 4.45 4.625 4.799 4.972 5.178 5.398 5.626 5.886 6.129 6.361 6.626 6.896 7.16 7.474 7.814 8.159 8.51 8.919 9.372 9.8 10.277 10.788 11.356 11.931 12.584 13.205 13.711 13.903 13.739 13.426 13.044 12.699 12.407 12.104 11.833 11.556 11.284 11.025 10.788 10.573 10.355 10.145 9.918 9.707 9.539 9.361 9.167 9.015 8.849 8.667 8.532 8.392 8.242 8.086 7.915 7.786 7.659 7.468 7.322 7.168 7.088 6.921 6.747 6.567 6.483 6.271 6.216 6.115 6.025 5.852 5.745 5.626 5.518 5.386 5.21 5.023 4.59 -9 ,29641 ,KEBNE ,16691691,Thu Nov 25 15:53:48 CET,Thu Nov 25 17:30:31 CET,0.0 1.008 1.379 1.685 1.942 2.169 2.357 2.522 2.842 2.998 3.133 3.25 3.489 3.6 3.811 4.03 4.225 4.32 4.498 4.655 4.894 5.04 5.177 5.375 5.566 5.757 5.94 6.123 6.364 6.591 6.805 7.055 7.292 7.521 7.787 8.078 8.349 8.656 8.987 9.322 9.68 10.091 10.568 11.025 11.532 12.058 12.612 13.256 13.952 14.566 15.016 15.098 14.928 14.617 14.25 13.889 13.58 13.289 13.009 12.688 12.392 12.116 11.851 11.608 11.376 11.154 10.933 10.736 10.557 10.385 10.204 10.036 9.862 9.685 9.557 9.433 9.28 9.119 8.957 8.832 8.701 8.514 8.385 8.248 8.175 8.018 7.862 7.693 7.604 7.399 7.339 7.235 7.113 6.859 6.727 6.584 6.422 6.236 6.012 5.69 4.476 -10 ,32620 ,KEBNE ,16691692,Thu Nov 25 15:53:44 CET,Thu Nov 25 17:33:09 CET,0.0 1.021 1.405 1.726 1.992 2.201 2.385 2.571 2.876 3.005 3.131 3.258 3.509 3.627 3.848 4.054 4.238 4.334 4.518 4.674 4.889 5.043 5.187 5.394 5.614 5.819 6.006 6.179 6.407 6.629 6.831 7.063 7.299 7.536 7.79 8.069 8.345 8.642 8.968 9.326 9.684 10.069 10.531 10.976 11.415 11.912 12.52 13.131 13.774 14.455 14.972 15.057 14.89 14.641 14.365 14.019 13.685 13.392 13.099 12.779 12.502 12.264 12.005 11.725 11.493 11.29 11.068 10.872 10.71 10.518 10.302 10.135 9.945 9.745 9.591 9.429 9.28 9.129 8.954 8.824 8.695 8.494 8.361 8.236 8.172 8.043 7.897 7.728 7.643 7.443 7.399 7.3 7.207 7.021 6.901 6.772 6.629 6.473 6.335 6.143 5.773 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_7a_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_7a_3a.txt deleted file mode 100644 index 9885332f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Thrombin/water/Summary_FEP_7a_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10481 ,KEBNE ,16691693,Thu Nov 25 15:53:44 CET,Thu Nov 25 17:32:03 CET,0.0 0.726 0.93 1.119 1.264 1.381 1.502 1.614 1.808 1.898 1.989 2.047 2.281 2.379 2.568 2.752 2.927 3.011 3.182 3.351 3.58 3.726 3.869 4.062 4.263 4.464 4.651 4.831 5.065 5.282 5.493 5.75 6.0 6.243 6.522 6.828 7.117 7.434 7.781 8.157 8.553 8.992 9.503 10.021 10.608 11.259 12.005 12.822 13.778 14.909 16.088 16.803 17.087 17.174 17.112 16.955 16.8 16.666 16.491 16.271 16.078 15.891 15.697 15.481 15.275 15.1 14.913 14.736 14.564 14.385 14.205 14.056 13.905 13.739 13.593 13.433 13.262 13.088 12.896 12.759 12.626 12.411 12.274 12.144 12.077 11.927 11.781 11.636 11.542 11.318 11.251 11.152 11.054 10.831 10.689 10.534 10.369 10.159 9.92 9.55 8.761 -2 ,5591 ,KEBNE ,16691694,Thu Nov 25 15:54:46 CET,Thu Nov 25 17:33:25 CET,0.0 0.649 0.883 1.036 1.158 1.284 1.411 1.532 1.733 1.826 1.924 1.959 2.184 2.278 2.457 2.629 2.802 2.881 3.036 3.199 3.42 3.554 3.691 3.912 4.134 4.34 4.536 4.725 4.965 5.195 5.429 5.695 5.936 6.172 6.446 6.765 7.07 7.391 7.738 8.125 8.532 8.97 9.485 10.017 10.61 11.253 11.987 12.8 13.744 14.8 15.92 16.644 16.927 16.998 16.933 16.761 16.569 16.399 16.227 16.008 15.8 15.614 15.426 15.234 15.048 14.865 14.669 14.508 14.368 14.211 14.051 13.93 13.792 13.619 13.484 13.358 13.228 13.093 12.947 12.832 12.709 12.541 12.432 12.306 12.235 12.094 11.935 11.771 11.688 11.475 11.438 11.351 11.241 11.001 10.87 10.723 10.552 10.359 10.152 9.874 9.191 -3 ,1009 ,KEBNE ,16691695,Thu Nov 25 15:54:47 CET,Thu Nov 25 17:33:17 CET,0.0 0.357 0.586 0.824 1.061 1.246 1.391 1.558 1.88 2.011 2.139 2.237 2.476 2.58 2.781 2.965 3.146 3.229 3.383 3.54 3.775 3.924 4.068 4.265 4.44 4.619 4.805 4.986 5.222 5.448 5.659 5.91 6.155 6.404 6.697 6.996 7.284 7.617 7.951 8.308 8.698 9.157 9.693 10.198 10.81 11.488 12.261 13.135 14.088 15.132 16.414 17.257 17.504 17.555 17.488 17.401 17.298 17.132 16.959 16.748 16.526 16.318 16.108 15.909 15.723 15.544 15.356 15.188 15.044 14.893 14.715 14.558 14.396 14.232 14.11 13.986 13.862 13.73 13.582 13.475 13.361 13.189 13.078 12.96 12.892 12.757 12.62 12.464 12.384 12.171 12.09 11.978 11.861 11.585 11.447 11.312 11.15 10.959 10.762 10.442 9.719 -4 ,21535 ,KEBNE ,16691696,Thu Nov 25 15:54:47 CET,Thu Nov 25 17:35:17 CET,0.0 0.702 0.945 1.113 1.269 1.426 1.558 1.674 1.893 1.993 2.091 2.133 2.362 2.456 2.628 2.797 2.961 3.033 3.176 3.318 3.518 3.646 3.781 3.994 4.183 4.366 4.559 4.744 4.988 5.217 5.432 5.696 5.944 6.187 6.487 6.811 7.111 7.458 7.837 8.219 8.589 9.003 9.511 10.03 10.615 11.279 12.047 12.888 13.835 14.937 16.214 16.981 17.256 17.368 17.335 17.243 17.127 16.96 16.759 16.511 16.274 16.077 15.874 15.665 15.476 15.29 15.102 14.933 14.763 14.579 14.402 14.258 14.079 13.886 13.743 13.597 13.437 13.264 13.094 12.976 12.856 12.671 12.532 12.373 12.285 12.117 11.952 11.773 11.683 11.466 11.396 11.291 11.179 10.929 10.804 10.679 10.541 10.373 10.154 9.885 9.293 -5 ,5227 ,KEBNE ,16691697,Thu Nov 25 15:54:46 CET,Thu Nov 25 17:36:01 CET,0.0 0.475 0.689 0.864 1.01 1.133 1.275 1.435 1.719 1.839 1.955 2.042 2.279 2.379 2.571 2.766 2.951 3.034 3.194 3.352 3.568 3.711 3.858 4.061 4.27 4.477 4.667 4.857 5.093 5.307 5.512 5.782 6.047 6.278 6.54 6.848 7.16 7.499 7.848 8.215 8.603 9.033 9.539 10.052 10.632 11.299 12.083 12.932 13.936 15.115 16.296 17.084 17.401 17.445 17.405 17.309 17.186 17.02 16.826 16.602 16.386 16.209 16.039 15.859 15.691 15.532 15.342 15.145 14.973 14.81 14.633 14.489 14.33 14.138 14.0 13.865 13.707 13.533 13.356 13.225 13.08 12.859 12.709 12.562 12.493 12.352 12.188 12.012 11.929 11.717 11.658 11.548 11.442 11.218 11.091 10.939 10.743 10.541 10.33 10.007 9.094 -6 ,2356 ,KEBNE ,16691698,Thu Nov 25 15:54:47 CET,Thu Nov 25 17:35:00 CET,0.0 0.831 1.172 1.445 1.644 1.817 1.986 2.144 2.443 2.576 2.684 2.749 2.985 3.091 3.302 3.501 3.681 3.769 3.932 4.076 4.273 4.397 4.527 4.719 4.917 5.12 5.313 5.496 5.718 5.929 6.142 6.4 6.654 6.908 7.203 7.533 7.849 8.19 8.56 8.946 9.35 9.804 10.314 10.827 11.404 12.061 12.821 13.631 14.601 15.684 16.861 17.618 17.885 17.951 17.879 17.728 17.561 17.345 17.093 16.859 16.676 16.501 16.32 16.115 15.916 15.748 15.558 15.385 15.232 15.064 14.894 14.727 14.547 14.369 14.221 14.074 13.922 13.775 13.623 13.522 13.428 13.271 13.158 13.029 12.959 12.821 12.674 12.518 12.44 12.237 12.183 12.081 11.969 11.72 11.604 11.484 11.328 11.15 10.927 10.62 9.776 -7 ,20746 ,KEBNE ,16691699,Thu Nov 25 15:54:46 CET,Thu Nov 25 17:34:58 CET,0.0 0.403 0.615 0.779 0.914 1.06 1.177 1.278 1.485 1.584 1.684 1.729 1.953 2.052 2.242 2.414 2.583 2.662 2.815 2.975 3.204 3.354 3.504 3.713 3.902 4.078 4.261 4.44 4.674 4.901 5.109 5.358 5.599 5.824 6.078 6.378 6.671 6.997 7.352 7.731 8.116 8.553 9.102 9.625 10.191 10.83 11.581 12.422 13.357 14.401 15.561 16.344 16.682 16.753 16.674 16.561 16.419 16.233 16.04 15.819 15.611 15.396 15.189 15.014 14.835 14.666 14.479 14.286 14.107 13.932 13.759 13.606 13.444 13.284 13.147 12.988 12.828 12.665 12.482 12.353 12.219 11.993 11.832 11.674 11.59 11.406 11.214 10.989 10.863 10.622 10.536 10.422 10.3 10.017 9.872 9.74 9.588 9.385 9.17 8.879 7.765 -8 ,18909 ,KEBNE ,16691700,Thu Nov 25 15:54:47 CET,Thu Nov 25 17:34:20 CET,0.0 0.348 0.537 0.702 0.835 0.967 1.093 1.203 1.398 1.493 1.592 1.632 1.856 1.948 2.13 2.31 2.495 2.581 2.738 2.881 3.1 3.259 3.413 3.636 3.852 4.058 4.248 4.428 4.655 4.873 5.096 5.36 5.604 5.833 6.1 6.399 6.688 7.002 7.34 7.723 8.108 8.543 9.052 9.564 10.181 10.838 11.563 12.386 13.318 14.401 15.586 16.417 16.795 16.887 16.863 16.783 16.635 16.439 16.25 16.008 15.77 15.575 15.39 15.204 15.01 14.815 14.622 14.441 14.262 14.078 13.893 13.722 13.53 13.348 13.216 13.074 12.928 12.769 12.58 12.445 12.308 12.087 11.921 11.76 11.687 11.522 11.332 11.141 11.041 10.801 10.672 10.55 10.409 10.067 9.871 9.658 9.433 9.195 8.912 8.453 7.457 -9 ,11515 ,KEBNE ,16691701,Thu Nov 25 15:54:51 CET,Thu Nov 25 17:35:35 CET,0.0 0.272 0.474 0.631 0.762 0.873 0.99 1.109 1.319 1.409 1.503 1.54 1.76 1.846 2.02 2.182 2.33 2.401 2.546 2.691 2.905 3.043 3.186 3.396 3.589 3.772 3.948 4.124 4.358 4.585 4.793 5.031 5.267 5.5 5.771 6.074 6.372 6.701 7.042 7.414 7.825 8.303 8.858 9.391 9.982 10.649 11.434 12.279 13.227 14.312 15.536 16.412 16.764 16.79 16.686 16.535 16.361 16.183 16.004 15.782 15.563 15.341 15.115 14.918 14.732 14.54 14.331 14.139 13.978 13.808 13.623 13.462 13.29 13.13 13.01 12.883 12.739 12.583 12.422 12.306 12.185 12.023 11.915 11.789 11.721 11.576 11.42 11.24 11.148 10.923 10.853 10.75 10.634 10.383 10.231 10.067 9.903 9.697 9.48 9.192 8.503 -10 ,6753 ,KEBNE ,16691702,Thu Nov 25 15:54:46 CET,Thu Nov 25 17:36:04 CET,0.0 0.382 0.601 0.799 0.951 1.076 1.191 1.304 1.52 1.617 1.7 1.733 1.957 2.036 2.192 2.349 2.506 2.579 2.709 2.838 3.032 3.157 3.283 3.464 3.633 3.791 3.937 4.085 4.282 4.483 4.68 4.912 5.133 5.349 5.61 5.909 6.194 6.494 6.812 7.15 7.517 7.951 8.465 8.984 9.611 10.274 11.015 11.844 12.753 13.813 15.006 15.782 16.077 16.156 16.126 15.995 15.827 15.647 15.457 15.232 15.038 14.854 14.643 14.435 14.226 14.031 13.846 13.67 13.498 13.324 13.152 12.994 12.825 12.644 12.495 12.346 12.199 12.043 11.877 11.755 11.624 11.423 11.279 11.12 11.044 10.898 10.74 10.583 10.503 10.29 10.234 10.126 10.022 9.799 9.644 9.5 9.355 9.172 8.965 8.696 7.466 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 483e75b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26985 ,TETRA ,17664647,Thu Dec 2 13:52:09 CET,Thu Dec 2 15:44:23 CET,0.0 0.971 1.37 1.654 1.898 2.122 2.323 2.506 2.825 2.974 3.127 3.141 3.528 3.648 3.889 4.118 4.33 4.428 4.613 4.793 5.047 5.21 5.377 5.618 5.842 6.049 6.245 6.431 6.675 6.912 7.133 7.393 7.64 7.871 8.136 8.425 8.699 8.984 9.265 9.56 9.853 10.159 10.479 10.765 11.052 11.294 11.499 11.646 11.675 11.398 10.566 9.309 8.103 7.012 5.994 5.023 4.204 3.456 2.769 2.056 1.451 0.925 0.4 -0.102 -0.571 -0.992 -1.426 -1.831 -2.187 -2.561 -2.948 -3.264 -3.594 -3.97 -4.272 -4.562 -4.853 -5.17 -5.529 -5.772 -6.02 -6.414 -6.677 -6.937 -7.075 -7.36 -7.67 -8.01 -8.192 -8.66 -8.794 -9.001 -9.212 -9.681 -9.939 -10.208 -10.492 -10.821 -11.229 -11.808 -13.131 -2 ,25704 ,TETRA ,17664648,Thu Dec 2 13:46:13 CET,Thu Dec 2 15:38:46 CET,0.0 0.707 1.082 1.357 1.596 1.815 2.015 2.201 2.562 2.721 2.868 2.887 3.288 3.419 3.658 3.88 4.086 4.184 4.381 4.571 4.835 5.005 5.163 5.392 5.607 5.801 6.0 6.19 6.424 6.646 6.855 7.102 7.346 7.585 7.842 8.106 8.345 8.596 8.855 9.135 9.42 9.697 9.995 10.264 10.516 10.743 10.94 11.076 11.094 10.849 10.08 8.764 7.387 6.16 5.129 4.163 3.306 2.544 1.871 1.16 0.535 -0.011 -0.518 -0.997 -1.445 -1.869 -2.331 -2.744 -3.117 -3.512 -3.911 -4.246 -4.589 -4.947 -5.236 -5.537 -5.845 -6.167 -6.507 -6.743 -6.979 -7.336 -7.587 -7.859 -7.999 -8.286 -8.592 -8.921 -9.087 -9.542 -9.671 -9.878 -10.089 -10.534 -10.78 -11.056 -11.359 -11.718 -12.133 -12.629 -13.571 -3 ,6901 ,TETRA ,17664649,Thu Dec 2 13:46:13 CET,Thu Dec 2 15:50:57 CET,0.0 0.841 1.225 1.523 1.781 2.012 2.222 2.423 2.802 2.96 3.102 3.1 3.491 3.618 3.874 4.109 4.309 4.41 4.621 4.819 5.093 5.261 5.427 5.65 5.854 6.054 6.241 6.417 6.64 6.847 7.05 7.297 7.534 7.752 7.981 8.229 8.473 8.741 9.02 9.287 9.54 9.837 10.165 10.448 10.733 10.976 11.2 11.359 11.367 11.146 10.325 9.038 7.841 6.709 5.631 4.622 3.737 2.941 2.275 1.607 1.006 0.455 -0.058 -0.548 -1.025 -1.481 -1.977 -2.412 -2.799 -3.194 -3.584 -3.915 -4.264 -4.634 -4.926 -5.219 -5.521 -5.844 -6.185 -6.426 -6.674 -7.059 -7.317 -7.578 -7.716 -7.995 -8.293 -8.627 -8.795 -9.236 -9.325 -9.522 -9.722 -10.146 -10.387 -10.663 -10.963 -11.296 -11.688 -12.22 -13.573 -4 ,17576 ,TETRA ,17664650,Thu Dec 2 13:46:13 CET,Thu Dec 2 15:41:27 CET,0.0 0.823 1.197 1.498 1.759 2.001 2.203 2.387 2.746 2.909 3.062 3.092 3.487 3.611 3.852 4.069 4.27 4.369 4.562 4.745 5.014 5.189 5.356 5.585 5.793 5.996 6.195 6.379 6.61 6.838 7.056 7.296 7.515 7.729 7.964 8.213 8.448 8.681 8.918 9.178 9.435 9.702 9.994 10.261 10.522 10.758 10.955 11.083 11.118 10.881 10.041 8.756 7.559 6.466 5.456 4.508 3.684 2.901 2.207 1.514 0.913 0.356 -0.199 -0.701 -1.163 -1.594 -2.053 -2.478 -2.841 -3.209 -3.591 -3.917 -4.263 -4.622 -4.906 -5.198 -5.494 -5.817 -6.17 -6.407 -6.649 -7.03 -7.286 -7.554 -7.69 -7.976 -8.3 -8.632 -8.8 -9.244 -9.338 -9.533 -9.74 -10.203 -10.443 -10.714 -11.041 -11.391 -11.81 -12.41 -13.658 -5 ,21340 ,TETRA ,17664651,Thu Dec 2 13:46:13 CET,Thu Dec 2 15:39:36 CET,0.0 0.385 0.662 0.912 1.131 1.334 1.532 1.714 2.043 2.186 2.327 2.331 2.711 2.837 3.076 3.299 3.51 3.61 3.804 3.991 4.256 4.422 4.583 4.814 5.029 5.237 5.44 5.627 5.866 6.096 6.309 6.552 6.779 6.997 7.239 7.506 7.76 8.036 8.331 8.621 8.891 9.172 9.467 9.754 10.065 10.328 10.528 10.66 10.675 10.436 9.683 8.403 7.161 6.066 5.077 4.147 3.318 2.557 1.871 1.151 0.543 0.023 -0.485 -0.991 -1.465 -1.899 -2.345 -2.745 -3.108 -3.485 -3.875 -4.201 -4.544 -4.909 -5.187 -5.478 -5.78 -6.092 -6.417 -6.638 -6.872 -7.241 -7.504 -7.782 -7.924 -8.216 -8.52 -8.826 -8.985 -9.425 -9.53 -9.722 -9.921 -10.344 -10.576 -10.829 -11.103 -11.416 -11.751 -12.122 -12.602 -6 ,31695 ,TETRA ,17664652,Thu Dec 2 13:46:13 CET,Thu Dec 2 15:50:41 CET,0.0 0.616 0.933 1.224 1.477 1.692 1.893 2.083 2.414 2.569 2.719 2.734 3.128 3.253 3.497 3.721 3.929 4.03 4.217 4.385 4.619 4.778 4.932 5.147 5.353 5.547 5.733 5.914 6.158 6.396 6.613 6.871 7.113 7.326 7.57 7.855 8.118 8.384 8.658 8.936 9.199 9.461 9.739 9.994 10.257 10.471 10.65 10.803 10.815 10.563 9.74 8.425 7.216 6.101 5.093 4.164 3.328 2.552 1.878 1.201 0.592 0.036 -0.499 -1.002 -1.459 -1.88 -2.326 -2.731 -3.081 -3.455 -3.844 -4.153 -4.495 -4.865 -5.149 -5.447 -5.767 -6.096 -6.433 -6.676 -6.927 -7.308 -7.566 -7.828 -7.961 -8.238 -8.551 -8.891 -9.068 -9.523 -9.607 -9.804 -10.011 -10.469 -10.731 -11.017 -11.329 -11.652 -12.065 -12.584 -13.453 -7 ,9980 ,TETRA ,17664653,Thu Dec 2 13:46:13 CET,Thu Dec 2 16:10:44 CET,0.0 0.587 0.96 1.27 1.516 1.74 1.954 2.154 2.523 2.683 2.822 2.849 3.25 3.374 3.606 3.844 4.065 4.165 4.362 4.554 4.828 4.996 5.153 5.376 5.602 5.825 6.03 6.221 6.46 6.684 6.896 7.15 7.391 7.632 7.906 8.204 8.471 8.738 9.007 9.273 9.549 9.849 10.18 10.471 10.752 11.021 11.252 11.429 11.473 11.26 10.539 9.306 8.111 6.98 5.969 5.035 4.198 3.417 2.717 2.04 1.462 0.934 0.408 -0.09 -0.55 -0.984 -1.433 -1.829 -2.184 -2.573 -2.978 -3.315 -3.667 -4.034 -4.31 -4.595 -4.899 -5.215 -5.542 -5.762 -5.989 -6.345 -6.6 -6.861 -6.992 -7.27 -7.572 -7.891 -8.058 -8.511 -8.642 -8.852 -9.067 -9.523 -9.761 -10.014 -10.316 -10.669 -11.066 -11.537 -12.794 -8 ,28851 ,TETRA ,17664654,Thu Dec 2 13:46:13 CET,Thu Dec 2 15:41:22 CET,0.0 0.691 1.097 1.441 1.736 1.982 2.2 2.404 2.762 2.913 3.056 3.078 3.479 3.614 3.867 4.09 4.291 4.391 4.599 4.798 5.066 5.244 5.415 5.641 5.864 6.069 6.252 6.438 6.684 6.916 7.132 7.379 7.609 7.812 8.044 8.307 8.549 8.808 9.07 9.34 9.605 9.873 10.184 10.483 10.78 11.04 11.261 11.411 11.44 11.186 10.362 8.999 7.75 6.653 5.665 4.739 3.91 3.176 2.544 1.875 1.262 0.709 0.178 -0.331 -0.823 -1.259 -1.7 -2.096 -2.448 -2.832 -3.228 -3.544 -3.886 -4.24 -4.506 -4.797 -5.097 -5.409 -5.74 -5.963 -6.184 -6.542 -6.802 -7.059 -7.185 -7.451 -7.758 -8.088 -8.268 -8.726 -8.838 -9.048 -9.254 -9.691 -9.944 -10.213 -10.5 -10.819 -11.159 -11.595 -12.515 -9 ,18988 ,TETRA ,17664655,Thu Dec 2 13:46:13 CET,Thu Dec 2 15:46:48 CET,0.0 0.543 0.931 1.236 1.499 1.744 1.962 2.151 2.487 2.639 2.78 2.802 3.193 3.316 3.55 3.764 3.973 4.072 4.261 4.448 4.709 4.869 5.028 5.255 5.478 5.689 5.876 6.06 6.293 6.516 6.724 6.969 7.208 7.431 7.696 7.975 8.221 8.482 8.745 9.011 9.285 9.577 9.872 10.123 10.371 10.626 10.837 10.962 10.965 10.722 9.981 8.713 7.502 6.366 5.296 4.286 3.404 2.618 1.942 1.274 0.672 0.099 -0.445 -0.959 -1.445 -1.885 -2.346 -2.755 -3.121 -3.516 -3.93 -4.281 -4.643 -5.023 -5.319 -5.622 -5.927 -6.259 -6.621 -6.858 -7.087 -7.448 -7.712 -7.987 -8.128 -8.418 -8.72 -9.046 -9.221 -9.691 -9.833 -10.043 -10.248 -10.723 -10.989 -11.255 -11.554 -11.907 -12.312 -12.844 -14.011 -10 ,2470 ,TETRA ,17664656,Thu Dec 2 13:46:13 CET,Thu Dec 2 15:41:34 CET,0.0 0.825 1.236 1.554 1.83 2.063 2.258 2.445 2.778 2.934 3.088 3.113 3.517 3.647 3.89 4.113 4.332 4.439 4.63 4.808 5.067 5.225 5.379 5.602 5.815 6.026 6.229 6.413 6.64 6.855 7.058 7.306 7.537 7.747 7.984 8.257 8.505 8.763 9.057 9.352 9.643 9.966 10.312 10.601 10.887 11.155 11.387 11.542 11.562 11.335 10.559 9.28 8.051 6.929 5.927 4.992 4.137 3.367 2.684 1.994 1.409 0.866 0.337 -0.17 -0.659 -1.116 -1.588 -2.012 -2.382 -2.764 -3.169 -3.504 -3.848 -4.214 -4.499 -4.788 -5.088 -5.401 -5.742 -5.977 -6.211 -6.589 -6.867 -7.154 -7.299 -7.604 -7.926 -8.257 -8.422 -8.868 -8.971 -9.174 -9.404 -9.91 -10.184 -10.483 -10.817 -11.173 -11.582 -12.091 -13.244 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index dde6515b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21838 ,TETRA ,17664657,Thu Dec 2 13:46:15 CET,Thu Dec 2 15:41:36 CET,0.0 0.42 0.71 0.987 1.247 1.486 1.703 1.901 2.272 2.43 2.579 2.619 3.014 3.14 3.363 3.57 3.77 3.864 4.034 4.197 4.447 4.613 4.765 4.982 5.193 5.396 5.583 5.744 5.947 6.141 6.319 6.521 6.711 6.888 7.076 7.276 7.453 7.626 7.787 7.932 8.068 8.204 8.33 8.402 8.408 8.348 8.174 7.819 7.202 6.04 3.92 1.385 -0.759 -2.573 -4.12 -5.504 -6.711 -7.795 -8.732 -9.684 -10.512 -11.216 -11.873 -12.507 -13.092 -13.622 -14.183 -14.684 -15.13 -15.593 -16.054 -16.427 -16.819 -17.23 -17.544 -17.865 -18.199 -18.556 -18.925 -19.174 -19.435 -19.838 -20.11 -20.401 -20.554 -20.865 -21.191 -21.528 -21.704 -22.186 -22.275 -22.469 -22.682 -23.134 -23.368 -23.628 -23.907 -24.216 -24.558 -24.997 -25.783 -2 ,539 ,TETRA ,17664658,Thu Dec 2 13:46:15 CET,Thu Dec 2 15:41:21 CET,0.0 0.65 1.054 1.39 1.677 1.916 2.137 2.348 2.722 2.88 3.026 3.039 3.432 3.555 3.794 4.014 4.218 4.318 4.506 4.688 4.944 5.098 5.241 5.44 5.635 5.818 5.983 6.146 6.35 6.537 6.711 6.913 7.113 7.294 7.483 7.688 7.864 8.031 8.209 8.386 8.535 8.683 8.823 8.887 8.867 8.794 8.625 8.286 7.662 6.54 4.486 1.878 -0.358 -2.281 -3.864 -5.215 -6.397 -7.463 -8.366 -9.273 -10.083 -10.809 -11.503 -12.156 -12.743 -13.273 -13.826 -14.326 -14.771 -15.232 -15.697 -16.074 -16.471 -16.891 -17.208 -17.535 -17.888 -18.246 -18.616 -18.872 -19.124 -19.525 -19.806 -20.098 -20.249 -20.546 -20.853 -21.192 -21.374 -21.851 -21.959 -22.164 -22.373 -22.826 -23.071 -23.327 -23.613 -23.945 -24.308 -24.739 -25.426 -3 ,11920 ,TETRA ,17664659,Thu Dec 2 13:46:15 CET,Thu Dec 2 15:40:50 CET,0.0 0.741 1.143 1.473 1.74 1.949 2.134 2.307 2.616 2.765 2.909 2.886 3.277 3.399 3.626 3.837 4.038 4.134 4.312 4.484 4.739 4.89 5.032 5.245 5.449 5.641 5.823 5.992 6.198 6.389 6.57 6.789 6.979 7.142 7.336 7.541 7.721 7.907 8.08 8.246 8.397 8.535 8.676 8.76 8.777 8.706 8.526 8.18 7.527 6.383 4.399 1.965 -0.149 -1.972 -3.531 -4.951 -6.193 -7.29 -8.249 -9.201 -9.997 -10.7 -11.375 -12.006 -12.597 -13.132 -13.68 -14.182 -14.626 -15.086 -15.558 -15.942 -16.322 -16.722 -17.041 -17.373 -17.721 -18.086 -18.457 -18.694 -18.942 -19.363 -19.653 -19.946 -20.097 -20.405 -20.723 -21.07 -21.243 -21.697 -21.781 -21.98 -22.188 -22.648 -22.902 -23.192 -23.517 -23.852 -24.22 -24.633 -25.303 -4 ,11036 ,TETRA ,17664660,Thu Dec 2 13:46:15 CET,Thu Dec 2 15:54:26 CET,0.0 0.431 0.76 1.039 1.277 1.499 1.702 1.875 2.191 2.342 2.489 2.499 2.894 3.023 3.267 3.495 3.704 3.798 3.981 4.16 4.409 4.565 4.709 4.911 5.108 5.298 5.471 5.631 5.826 6.009 6.178 6.379 6.571 6.743 6.92 7.118 7.309 7.485 7.652 7.835 7.996 8.125 8.258 8.345 8.362 8.289 8.105 7.742 7.126 6.104 4.092 1.625 -0.457 -2.283 -3.855 -5.247 -6.434 -7.527 -8.481 -9.427 -10.245 -10.986 -11.68 -12.319 -12.911 -13.449 -14.012 -14.518 -14.954 -15.407 -15.869 -16.241 -16.624 -17.024 -17.34 -17.67 -18.001 -18.334 -18.689 -18.939 -19.192 -19.585 -19.862 -20.153 -20.298 -20.595 -20.914 -21.261 -21.445 -21.914 -22.008 -22.222 -22.444 -22.911 -23.167 -23.432 -23.705 -23.996 -24.33 -24.734 -25.805 -5 ,31908 ,TETRA ,17664661,Thu Dec 2 13:46:15 CET,Thu Dec 2 16:00:50 CET,0.0 0.518 0.865 1.174 1.432 1.644 1.836 2.021 2.365 2.515 2.654 2.664 3.047 3.173 3.411 3.63 3.843 3.943 4.134 4.314 4.559 4.709 4.853 5.061 5.26 5.458 5.652 5.824 6.028 6.211 6.385 6.593 6.777 6.953 7.138 7.344 7.542 7.74 7.953 8.139 8.272 8.398 8.506 8.58 8.614 8.544 8.346 7.98 7.36 6.293 4.266 1.717 -0.438 -2.227 -3.717 -5.09 -6.294 -7.395 -8.358 -9.327 -10.175 -10.919 -11.607 -12.239 -12.83 -13.357 -13.899 -14.391 -14.809 -15.251 -15.721 -16.111 -16.513 -16.927 -17.252 -17.59 -17.945 -18.314 -18.697 -18.949 -19.203 -19.608 -19.886 -20.171 -20.326 -20.657 -20.999 -21.36 -21.543 -22.004 -22.092 -22.305 -22.523 -22.99 -23.249 -23.52 -23.817 -24.156 -24.537 -24.978 -25.938 -6 ,27708 ,TETRA ,17664662,Thu Dec 2 13:46:16 CET,Thu Dec 2 15:41:38 CET,0.0 1.095 1.457 1.751 2.012 2.249 2.45 2.644 2.995 3.142 3.275 3.273 3.663 3.778 3.987 4.193 4.39 4.482 4.657 4.815 5.045 5.2 5.346 5.552 5.743 5.926 6.099 6.251 6.43 6.602 6.77 6.966 7.144 7.31 7.492 7.679 7.853 8.03 8.19 8.341 8.492 8.636 8.772 8.865 8.891 8.825 8.654 8.319 7.675 6.523 4.472 1.825 -0.463 -2.384 -3.985 -5.402 -6.62 -7.716 -8.697 -9.687 -10.509 -11.23 -11.916 -12.546 -13.123 -13.64 -14.196 -14.712 -15.142 -15.581 -16.046 -16.423 -16.807 -17.228 -17.562 -17.896 -18.24 -18.591 -18.949 -19.195 -19.454 -19.854 -20.134 -20.43 -20.58 -20.895 -21.224 -21.564 -21.741 -22.213 -22.313 -22.515 -22.726 -23.19 -23.456 -23.745 -24.052 -24.373 -24.731 -25.174 -26.096 -7 ,6288 ,TETRA ,17664663,Thu Dec 2 13:46:15 CET,Thu Dec 2 15:52:04 CET,0.0 0.398 0.679 0.942 1.178 1.386 1.569 1.74 2.058 2.208 2.354 2.368 2.758 2.878 3.119 3.348 3.553 3.65 3.836 4.013 4.262 4.407 4.549 4.759 4.948 5.114 5.28 5.44 5.633 5.814 5.98 6.176 6.362 6.538 6.741 6.95 7.127 7.294 7.443 7.588 7.72 7.846 7.951 7.989 7.981 7.91 7.75 7.408 6.746 5.621 3.588 1.041 -1.125 -2.971 -4.515 -5.901 -7.094 -8.149 -9.061 -9.974 -10.771 -11.482 -12.147 -12.763 -13.349 -13.882 -14.443 -14.949 -15.389 -15.847 -16.316 -16.696 -17.082 -17.482 -17.791 -18.111 -18.438 -18.784 -19.143 -19.379 -19.623 -20.01 -20.283 -20.563 -20.709 -21.01 -21.327 -21.684 -21.879 -22.352 -22.451 -22.654 -22.871 -23.321 -23.556 -23.807 -24.071 -24.381 -24.733 -25.192 -26.248 -8 ,10701 ,TETRA ,17664664,Thu Dec 2 13:46:15 CET,Thu Dec 2 15:56:46 CET,0.0 0.683 1.048 1.35 1.628 1.869 2.077 2.259 2.59 2.746 2.894 2.905 3.297 3.417 3.652 3.868 4.059 4.152 4.33 4.507 4.759 4.918 5.072 5.28 5.474 5.652 5.818 5.974 6.171 6.359 6.533 6.72 6.892 7.067 7.267 7.468 7.64 7.81 7.968 8.126 8.275 8.407 8.515 8.589 8.629 8.608 8.431 8.063 7.447 6.321 4.167 1.599 -0.531 -2.357 -3.894 -5.27 -6.483 -7.579 -8.491 -9.391 -10.177 -10.886 -11.561 -12.194 -12.778 -13.307 -13.872 -14.357 -14.765 -15.2 -15.658 -16.038 -16.432 -16.84 -17.162 -17.494 -17.831 -18.187 -18.561 -18.824 -19.092 -19.503 -19.783 -20.077 -20.238 -20.564 -20.892 -21.238 -21.426 -21.909 -22.014 -22.226 -22.446 -22.896 -23.14 -23.426 -23.741 -24.078 -24.476 -25.019 -26.181 -9 ,17969 ,TETRA ,17664665,Thu Dec 2 13:46:15 CET,Thu Dec 2 15:39:29 CET,0.0 0.685 0.991 1.257 1.493 1.715 1.911 2.093 2.441 2.603 2.753 2.755 3.139 3.262 3.489 3.705 3.919 4.024 4.22 4.396 4.629 4.77 4.912 5.121 5.317 5.514 5.702 5.869 6.072 6.263 6.442 6.637 6.816 6.989 7.183 7.393 7.568 7.746 7.943 8.125 8.288 8.425 8.539 8.613 8.629 8.556 8.374 8.007 7.355 6.252 4.189 1.624 -0.516 -2.367 -3.96 -5.364 -6.599 -7.728 -8.681 -9.617 -10.425 -11.144 -11.816 -12.449 -13.043 -13.587 -14.149 -14.656 -15.097 -15.55 -16.018 -16.403 -16.802 -17.215 -17.535 -17.876 -18.229 -18.585 -18.957 -19.208 -19.463 -19.859 -20.132 -20.415 -20.568 -20.896 -21.246 -21.606 -21.795 -22.284 -22.395 -22.595 -22.801 -23.274 -23.548 -23.848 -24.168 -24.517 -24.934 -25.432 -26.749 -10 ,6895 ,TETRA ,17664666,Thu Dec 2 13:46:16 CET,Thu Dec 2 15:39:09 CET,0.0 1.015 1.466 1.826 2.094 2.323 2.529 2.714 3.076 3.244 3.394 3.415 3.803 3.931 4.174 4.397 4.601 4.696 4.877 5.039 5.27 5.415 5.55 5.753 5.947 6.126 6.302 6.461 6.654 6.841 7.014 7.209 7.391 7.557 7.733 7.915 8.069 8.222 8.383 8.523 8.629 8.733 8.825 8.882 8.897 8.818 8.602 8.206 7.514 6.355 4.229 1.607 -0.552 -2.434 -4.014 -5.39 -6.595 -7.676 -8.606 -9.555 -10.364 -11.092 -11.791 -12.425 -13.008 -13.543 -14.107 -14.606 -15.03 -15.472 -15.937 -16.326 -16.727 -17.128 -17.444 -17.778 -18.109 -18.455 -18.829 -19.085 -19.346 -19.752 -20.044 -20.347 -20.497 -20.805 -21.121 -21.447 -21.615 -22.071 -22.134 -22.319 -22.511 -22.915 -23.146 -23.401 -23.669 -23.982 -24.326 -24.737 -25.756 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 5cbc0ac5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23828 ,TETRA ,17664667,Thu Dec 2 13:46:15 CET,Thu Dec 2 15:37:56 CET,0.0 0.564 0.88 1.128 1.35 1.553 1.741 1.91 2.228 2.367 2.495 2.495 2.861 2.971 3.172 3.364 3.551 3.64 3.813 3.981 4.21 4.35 4.487 4.675 4.86 5.042 5.206 5.359 5.559 5.752 5.929 6.134 6.319 6.488 6.684 6.899 7.09 7.27 7.446 7.635 7.819 7.999 8.172 8.287 8.358 8.375 8.309 8.124 7.707 6.875 5.294 3.237 1.45 -0.063 -1.362 -2.551 -3.626 -4.59 -5.41 -6.279 -7.054 -7.742 -8.406 -9.047 -9.661 -10.222 -10.829 -11.387 -11.852 -12.315 -12.792 -13.186 -13.612 -14.065 -14.408 -14.749 -15.098 -15.471 -15.864 -16.138 -16.423 -16.859 -17.166 -17.482 -17.64 -17.978 -18.333 -18.714 -18.923 -19.425 -19.648 -19.908 -20.176 -20.73 -21.026 -21.345 -21.715 -22.165 -22.661 -23.301 -25.367 -2 ,13372 ,TETRA ,17664668,Thu Dec 2 13:46:15 CET,Thu Dec 2 15:37:37 CET,0.0 0.522 0.823 1.064 1.273 1.475 1.673 1.852 2.196 2.354 2.487 2.491 2.861 2.978 3.194 3.383 3.57 3.662 3.855 4.043 4.296 4.452 4.595 4.809 5.011 5.199 5.373 5.542 5.755 5.943 6.113 6.306 6.483 6.651 6.834 7.032 7.205 7.375 7.553 7.731 7.892 8.043 8.19 8.31 8.396 8.438 8.392 8.212 7.803 6.922 5.247 3.143 1.277 -0.372 -1.765 -3.028 -4.188 -5.245 -6.114 -6.951 -7.671 -8.322 -8.944 -9.532 -10.087 -10.611 -11.158 -11.65 -12.077 -12.527 -13.017 -13.42 -13.839 -14.282 -14.623 -14.962 -15.303 -15.663 -16.04 -16.306 -16.585 -17.023 -17.319 -17.627 -17.793 -18.123 -18.487 -18.902 -19.113 -19.61 -19.85 -20.107 -20.356 -20.865 -21.144 -21.455 -21.799 -22.192 -22.627 -23.197 -24.354 -3 ,8857 ,TETRA ,17664669,Thu Dec 2 13:46:15 CET,Thu Dec 2 15:37:01 CET,0.0 0.882 1.242 1.522 1.763 1.983 2.194 2.377 2.694 2.844 2.985 2.999 3.368 3.488 3.703 3.894 4.072 4.16 4.324 4.487 4.727 4.873 5.008 5.202 5.383 5.558 5.728 5.894 6.092 6.271 6.443 6.632 6.805 6.966 7.149 7.334 7.495 7.671 7.862 8.064 8.257 8.436 8.602 8.73 8.826 8.887 8.867 8.698 8.306 7.526 5.969 3.843 1.99 0.402 -0.996 -2.284 -3.42 -4.447 -5.343 -6.226 -7.001 -7.694 -8.336 -8.973 -9.604 -10.174 -10.739 -11.242 -11.696 -12.17 -12.666 -13.086 -13.533 -14.006 -14.368 -14.743 -15.13 -15.518 -15.912 -16.187 -16.482 -16.949 -17.282 -17.647 -17.834 -18.21 -18.61 -19.041 -19.259 -19.75 -19.969 -20.237 -20.499 -21.081 -21.411 -21.767 -22.158 -22.596 -23.123 -23.811 -25.331 -4 ,16790 ,TETRA ,17664670,Thu Dec 2 13:46:16 CET,Thu Dec 2 15:37:38 CET,0.0 0.699 1.034 1.277 1.498 1.702 1.882 2.043 2.332 2.478 2.621 2.639 3.022 3.142 3.371 3.595 3.809 3.909 4.1 4.282 4.52 4.675 4.833 5.051 5.253 5.442 5.616 5.776 5.971 6.154 6.332 6.534 6.72 6.897 7.095 7.303 7.494 7.7 7.898 8.097 8.294 8.489 8.692 8.86 8.995 9.085 9.081 8.942 8.548 7.714 6.104 3.998 2.186 0.603 -0.78 -2.026 -3.139 -4.183 -5.064 -5.948 -6.759 -7.476 -8.137 -8.774 -9.386 -9.938 -10.507 -11.008 -11.449 -11.903 -12.361 -12.752 -13.153 -13.576 -13.916 -14.289 -14.67 -15.035 -15.418 -15.691 -15.972 -16.401 -16.702 -17.031 -17.204 -17.544 -17.9 -18.272 -18.46 -18.929 -19.082 -19.317 -19.566 -20.1 -20.396 -20.723 -21.063 -21.42 -21.883 -22.525 -24.393 -5 ,23615 ,TETRA ,17664671,Thu Dec 2 13:46:16 CET,Thu Dec 2 15:37:29 CET,0.0 0.674 1.053 1.317 1.545 1.744 1.918 2.09 2.41 2.562 2.705 2.708 3.087 3.199 3.417 3.632 3.83 3.914 4.082 4.256 4.507 4.66 4.803 5.009 5.196 5.367 5.528 5.679 5.869 6.051 6.222 6.42 6.616 6.803 6.997 7.198 7.375 7.546 7.721 7.896 8.065 8.233 8.399 8.532 8.617 8.638 8.56 8.298 7.805 6.93 5.262 3.097 1.249 -0.404 -1.879 -3.151 -4.226 -5.236 -6.17 -7.088 -7.848 -8.555 -9.23 -9.865 -10.467 -11.034 -11.642 -12.171 -12.626 -13.099 -13.603 -14.028 -14.47 -14.918 -15.262 -15.63 -16.008 -16.393 -16.782 -17.046 -17.327 -17.784 -18.11 -18.444 -18.612 -18.962 -19.337 -19.752 -19.971 -20.45 -20.601 -20.831 -21.091 -21.651 -21.942 -22.259 -22.63 -23.064 -23.564 -24.212 -25.554 -6 ,9176 ,TETRA ,17664672,Thu Dec 2 13:46:16 CET,Thu Dec 2 15:38:02 CET,0.0 0.519 0.853 1.128 1.361 1.587 1.806 1.989 2.297 2.435 2.567 2.579 2.955 3.079 3.298 3.5 3.701 3.797 3.981 4.164 4.416 4.566 4.706 4.912 5.111 5.302 5.487 5.668 5.905 6.126 6.321 6.542 6.75 6.942 7.163 7.408 7.633 7.867 8.101 8.336 8.559 8.774 9.0 9.191 9.358 9.466 9.48 9.373 9.058 8.331 6.787 4.686 2.898 1.371 -0.058 -1.392 -2.542 -3.565 -4.464 -5.367 -6.153 -6.863 -7.541 -8.198 -8.804 -9.344 -9.906 -10.408 -10.852 -11.324 -11.813 -12.211 -12.618 -13.05 -13.387 -13.749 -14.142 -14.533 -14.93 -15.212 -15.51 -15.986 -16.319 -16.642 -16.799 -17.148 -17.51 -17.887 -18.095 -18.583 -18.75 -18.977 -19.202 -19.662 -19.914 -20.216 -20.557 -20.932 -21.375 -21.933 -22.646 -7 ,27885 ,TETRA ,17664673,Thu Dec 2 13:46:16 CET,Thu Dec 2 15:37:32 CET,0.0 0.623 0.946 1.224 1.443 1.622 1.8 1.983 2.299 2.425 2.55 2.542 2.905 3.016 3.23 3.432 3.623 3.716 3.894 4.062 4.308 4.465 4.605 4.804 4.993 5.164 5.333 5.502 5.702 5.899 6.089 6.303 6.501 6.691 6.91 7.135 7.325 7.519 7.724 7.931 8.125 8.307 8.472 8.588 8.675 8.72 8.66 8.472 8.065 7.17 5.46 3.333 1.492 -0.091 -1.451 -2.684 -3.809 -4.899 -5.89 -6.863 -7.662 -8.387 -9.084 -9.722 -10.307 -10.843 -11.415 -11.938 -12.395 -12.88 -13.386 -13.8 -14.235 -14.694 -15.038 -15.383 -15.745 -16.125 -16.538 -16.832 -17.124 -17.544 -17.83 -18.147 -18.325 -18.694 -19.075 -19.477 -19.688 -20.19 -20.398 -20.637 -20.892 -21.486 -21.787 -22.103 -22.473 -22.887 -23.352 -23.912 -25.533 -8 ,18742 ,TETRA ,17664674,Thu Dec 2 13:46:16 CET,Thu Dec 2 15:38:00 CET,0.0 0.353 0.646 0.918 1.146 1.341 1.517 1.684 1.996 2.137 2.277 2.307 2.678 2.788 2.991 3.188 3.388 3.484 3.666 3.831 4.045 4.181 4.319 4.523 4.712 4.89 5.063 5.227 5.423 5.606 5.789 5.998 6.183 6.363 6.566 6.789 7.005 7.222 7.431 7.642 7.843 8.026 8.202 8.367 8.511 8.571 8.549 8.417 8.07 7.334 5.791 3.692 1.862 0.3 -1.039 -2.267 -3.35 -4.332 -5.208 -6.095 -6.866 -7.593 -8.274 -8.871 -9.43 -9.973 -10.545 -11.05 -11.486 -11.925 -12.375 -12.749 -13.153 -13.584 -13.905 -14.227 -14.57 -14.924 -15.301 -15.568 -15.832 -16.259 -16.563 -16.871 -17.038 -17.401 -17.771 -18.146 -18.342 -18.819 -18.96 -19.183 -19.424 -19.95 -20.237 -20.538 -20.879 -21.263 -21.688 -22.2 -23.344 -9 ,5019 ,TETRA ,17664675,Thu Dec 2 13:46:16 CET,Thu Dec 2 15:50:39 CET,0.0 0.536 0.841 1.089 1.323 1.532 1.74 1.944 2.286 2.428 2.561 2.567 2.958 3.082 3.307 3.52 3.728 3.824 4.004 4.182 4.433 4.588 4.734 4.936 5.123 5.308 5.48 5.638 5.835 6.026 6.205 6.41 6.608 6.793 6.995 7.211 7.411 7.615 7.816 8.018 8.201 8.385 8.571 8.708 8.815 8.863 8.841 8.682 8.299 7.557 6.076 4.049 2.272 0.635 -0.789 -2.007 -3.076 -4.064 -4.974 -5.916 -6.701 -7.398 -8.088 -8.763 -9.389 -9.956 -10.56 -11.109 -11.579 -12.052 -12.553 -12.974 -13.415 -13.87 -14.216 -14.571 -14.952 -15.358 -15.765 -16.048 -16.344 -16.817 -17.148 -17.478 -17.642 -17.983 -18.355 -18.755 -18.971 -19.467 -19.645 -19.889 -20.146 -20.705 -21.002 -21.308 -21.642 -22.057 -22.562 -23.17 -24.532 -10 ,646 ,TETRA ,17664676,Thu Dec 2 13:46:17 CET,Thu Dec 2 15:50:16 CET,0.0 0.436 0.747 0.994 1.202 1.393 1.568 1.719 2.01 2.154 2.284 2.275 2.649 2.767 2.99 3.196 3.399 3.496 3.673 3.836 4.057 4.201 4.341 4.54 4.73 4.916 5.087 5.245 5.454 5.65 5.833 6.05 6.262 6.457 6.665 6.884 7.083 7.301 7.534 7.747 7.944 8.121 8.272 8.407 8.522 8.583 8.554 8.393 7.988 7.188 5.592 3.537 1.749 0.157 -1.194 -2.398 -3.469 -4.449 -5.315 -6.244 -7.055 -7.759 -8.457 -9.113 -9.709 -10.248 -10.797 -11.292 -11.729 -12.186 -12.683 -13.104 -13.529 -13.954 -14.289 -14.648 -15.014 -15.391 -15.778 -16.058 -16.351 -16.813 -17.144 -17.474 -17.64 -17.977 -18.356 -18.79 -19.016 -19.524 -19.739 -19.984 -20.22 -20.793 -21.11 -21.425 -21.769 -22.149 -22.591 -23.173 -24.619 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index 16d8a8af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5627 ,TETRA ,17664677,Thu Dec 2 13:46:16 CET,Thu Dec 2 15:53:58 CET,0.0 0.624 1.011 1.298 1.524 1.734 1.924 2.092 2.405 2.551 2.688 2.688 3.057 3.171 3.385 3.578 3.761 3.852 4.03 4.198 4.417 4.553 4.688 4.877 5.051 5.206 5.343 5.48 5.661 5.835 6.0 6.178 6.33 6.47 6.615 6.763 6.897 7.036 7.171 7.288 7.386 7.468 7.496 7.459 7.355 7.164 6.825 6.244 5.261 3.639 0.738 -2.748 -5.558 -7.909 -9.877 -11.586 -13.04 -14.345 -15.464 -16.562 -17.514 -18.377 -19.188 -19.95 -20.659 -21.305 -22.025 -22.68 -23.218 -23.764 -24.322 -24.786 -25.272 -25.799 -26.213 -26.635 -27.07 -27.493 -27.927 -28.23 -28.536 -29.023 -29.373 -29.745 -29.936 -30.35 -30.777 -31.198 -31.416 -31.931 -32.136 -32.413 -32.699 -33.291 -33.607 -33.929 -34.281 -34.709 -35.211 -35.841 -37.48 -2 ,10206 ,TETRA ,17664678,Thu Dec 2 13:46:18 CET,Thu Dec 2 15:54:50 CET,0.0 0.597 0.965 1.216 1.437 1.647 1.83 2.001 2.325 2.471 2.605 2.601 2.966 3.075 3.276 3.454 3.613 3.693 3.85 3.993 4.196 4.324 4.447 4.618 4.771 4.917 5.062 5.21 5.391 5.554 5.709 5.887 6.049 6.189 6.335 6.501 6.651 6.785 6.9 7.011 7.104 7.174 7.225 7.209 7.119 6.896 6.484 5.894 4.944 3.355 0.58 -2.788 -5.586 -7.893 -9.795 -11.53 -13.033 -14.318 -15.426 -16.568 -17.55 -18.44 -19.308 -20.089 -20.81 -21.469 -22.146 -22.754 -23.273 -23.789 -24.313 -24.751 -25.202 -25.673 -26.042 -26.418 -26.81 -27.212 -27.63 -27.92 -28.237 -28.775 -29.141 -29.509 -29.692 -30.069 -30.482 -30.92 -31.145 -31.656 -31.836 -32.089 -32.346 -32.891 -33.206 -33.573 -33.968 -34.394 -34.883 -35.481 -36.803 -3 ,16537 ,TETRA ,17664679,Thu Dec 2 13:52:09 CET,Thu Dec 2 15:58:07 CET,0.0 0.578 0.95 1.225 1.439 1.633 1.817 1.989 2.3 2.443 2.577 2.568 2.942 3.059 3.265 3.446 3.616 3.697 3.86 4.018 4.228 4.357 4.482 4.665 4.833 4.99 5.142 5.279 5.447 5.61 5.755 5.923 6.078 6.215 6.356 6.502 6.633 6.749 6.855 6.921 6.954 6.982 6.991 6.952 6.82 6.564 6.158 5.507 4.448 2.738 -0.197 -3.642 -6.449 -8.807 -10.777 -12.537 -14.09 -15.484 -16.659 -17.8 -18.78 -19.661 -20.513 -21.314 -22.034 -22.689 -23.388 -24.005 -24.535 -25.094 -25.649 -26.088 -26.554 -27.047 -27.434 -27.836 -28.248 -28.678 -29.126 -29.422 -29.713 -30.179 -30.526 -30.893 -31.074 -31.439 -31.82 -32.204 -32.404 -32.907 -33.086 -33.326 -33.567 -34.077 -34.389 -34.719 -35.044 -35.412 -35.884 -36.489 -37.766 -4 ,6870 ,TETRA ,17664680,Thu Dec 2 13:52:09 CET,Thu Dec 2 15:56:42 CET,0.0 0.527 0.851 1.123 1.371 1.591 1.789 1.963 2.276 2.41 2.534 2.511 2.871 2.979 3.186 3.378 3.554 3.636 3.793 3.947 4.168 4.293 4.41 4.582 4.735 4.868 4.991 5.115 5.271 5.416 5.552 5.707 5.852 5.99 6.143 6.295 6.426 6.533 6.609 6.681 6.727 6.735 6.701 6.615 6.435 6.141 5.674 4.967 3.887 2.181 -0.743 -4.161 -6.943 -9.309 -11.266 -12.975 -14.449 -15.767 -16.891 -18.004 -18.964 -19.791 -20.581 -21.361 -22.081 -22.713 -23.368 -23.965 -24.472 -24.986 -25.529 -25.991 -26.472 -26.964 -27.341 -27.734 -28.151 -28.568 -28.978 -29.269 -29.571 -30.027 -30.342 -30.678 -30.861 -31.247 -31.636 -32.021 -32.229 -32.734 -32.893 -33.147 -33.414 -33.953 -34.25 -34.569 -34.927 -35.315 -35.727 -36.243 -37.508 -5 ,30339 ,TETRA ,17664681,Thu Dec 2 13:52:11 CET,Thu Dec 2 15:57:12 CET,0.0 0.659 0.983 1.256 1.501 1.716 1.897 2.067 2.37 2.516 2.66 2.677 3.047 3.16 3.385 3.6 3.796 3.889 4.066 4.23 4.463 4.616 4.752 4.938 5.119 5.283 5.437 5.583 5.772 5.945 6.098 6.271 6.434 6.587 6.748 6.916 7.064 7.202 7.334 7.46 7.557 7.62 7.627 7.568 7.463 7.252 6.857 6.236 5.22 3.571 0.736 -2.665 -5.484 -7.851 -9.829 -11.608 -13.134 -14.449 -15.534 -16.591 -17.501 -18.336 -19.142 -19.87 -20.541 -21.157 -21.78 -22.338 -22.842 -23.359 -23.879 -24.301 -24.758 -25.251 -25.632 -26.022 -26.41 -26.817 -27.263 -27.564 -27.868 -28.364 -28.714 -29.074 -29.258 -29.642 -30.053 -30.475 -30.688 -31.2 -31.398 -31.659 -31.937 -32.539 -32.862 -33.201 -33.58 -34.021 -34.506 -35.086 -36.402 -6 ,4750 ,TETRA ,17664682,Thu Dec 2 13:52:11 CET,Thu Dec 2 15:43:19 CET,0.0 0.455 0.781 1.067 1.318 1.535 1.727 1.891 2.196 2.339 2.479 2.498 2.865 2.979 3.198 3.396 3.585 3.674 3.84 3.997 4.227 4.371 4.504 4.69 4.866 5.022 5.171 5.313 5.475 5.631 5.794 5.989 6.149 6.283 6.431 6.583 6.717 6.835 6.93 7.021 7.092 7.138 7.119 7.031 6.845 6.552 6.137 5.514 4.462 2.76 -0.012 -3.382 -6.145 -8.392 -10.261 -11.93 -13.358 -14.622 -15.711 -16.814 -17.781 -18.634 -19.462 -20.23 -20.91 -21.552 -22.235 -22.849 -23.393 -23.948 -24.502 -24.958 -25.423 -25.896 -26.282 -26.701 -27.135 -27.551 -27.956 -28.251 -28.563 -29.051 -29.389 -29.745 -29.93 -30.3 -30.684 -31.096 -31.305 -31.795 -31.992 -32.245 -32.49 -33.012 -33.307 -33.632 -33.991 -34.357 -34.757 -35.32 -36.684 -7 ,22102 ,TETRA ,17664683,Thu Dec 2 13:52:11 CET,Thu Dec 2 15:43:57 CET,0.0 0.559 0.914 1.196 1.433 1.637 1.827 2.008 2.319 2.455 2.583 2.578 2.94 3.048 3.242 3.423 3.593 3.673 3.825 3.973 4.187 4.323 4.45 4.631 4.798 4.951 5.102 5.245 5.421 5.574 5.706 5.854 5.983 6.103 6.24 6.386 6.51 6.627 6.733 6.811 6.859 6.892 6.876 6.814 6.674 6.407 5.984 5.314 4.229 2.512 -0.268 -3.556 -6.288 -8.605 -10.575 -12.296 -13.855 -15.324 -16.604 -17.886 -18.954 -19.907 -20.82 -21.631 -22.364 -23.046 -23.766 -24.413 -24.964 -25.529 -26.124 -26.636 -27.167 -27.699 -28.118 -28.55 -28.996 -29.447 -29.903 -30.217 -30.539 -31.057 -31.417 -31.786 -31.977 -32.378 -32.807 -33.25 -33.46 -33.964 -34.151 -34.396 -34.66 -35.258 -35.589 -35.945 -36.339 -36.802 -37.326 -37.936 -39.396 -8 ,3162 ,TETRA ,17664684,Thu Dec 2 13:52:11 CET,Thu Dec 2 15:43:18 CET,0.0 0.805 1.171 1.473 1.715 1.902 2.091 2.28 2.611 2.756 2.895 2.896 3.249 3.353 3.561 3.758 3.944 4.031 4.19 4.342 4.555 4.683 4.803 4.97 5.131 5.291 5.433 5.558 5.708 5.851 5.996 6.167 6.32 6.457 6.604 6.76 6.897 7.019 7.119 7.201 7.262 7.304 7.283 7.207 7.051 6.763 6.305 5.616 4.573 2.892 -0.03 -3.531 -6.314 -8.596 -10.527 -12.224 -13.648 -14.919 -16.044 -17.171 -18.129 -19.001 -19.843 -20.594 -21.275 -21.899 -22.531 -23.104 -23.623 -24.19 -24.78 -25.262 -25.758 -26.273 -26.668 -27.075 -27.499 -27.953 -28.453 -28.795 -29.141 -29.667 -30.022 -30.382 -30.567 -30.954 -31.35 -31.757 -31.966 -32.474 -32.696 -32.963 -33.239 -33.852 -34.181 -34.552 -34.958 -35.397 -35.896 -36.522 -38.393 -9 ,9121 ,TETRA ,17664685,Thu Dec 2 13:52:11 CET,Thu Dec 2 15:44:30 CET,0.0 0.676 1.069 1.342 1.587 1.807 2.011 2.208 2.52 2.655 2.787 2.76 3.127 3.24 3.443 3.634 3.814 3.899 4.062 4.215 4.422 4.563 4.714 4.931 5.119 5.285 5.439 5.585 5.758 5.905 6.049 6.225 6.391 6.536 6.686 6.846 6.98 7.111 7.223 7.315 7.394 7.412 7.371 7.283 7.125 6.893 6.461 5.764 4.697 2.989 0.104 -3.287 -6.013 -8.319 -10.264 -11.992 -13.51 -14.872 -16.023 -17.159 -18.141 -18.998 -19.803 -20.56 -21.258 -21.89 -22.553 -23.143 -23.659 -24.198 -24.762 -25.251 -25.732 -26.181 -26.538 -26.938 -27.363 -27.792 -28.225 -28.515 -28.841 -29.346 -29.681 -30.047 -30.227 -30.602 -31.014 -31.436 -31.655 -32.165 -32.323 -32.565 -32.826 -33.364 -33.686 -34.058 -34.429 -34.827 -35.33 -36.06 -38.073 -10 ,11219 ,TETRA ,17664686,Thu Dec 2 13:52:11 CET,Thu Dec 2 15:43:51 CET,0.0 0.514 0.82 1.077 1.321 1.538 1.711 1.863 2.149 2.283 2.411 2.405 2.769 2.884 3.083 3.262 3.43 3.506 3.655 3.798 3.997 4.121 4.244 4.416 4.576 4.734 4.873 4.999 5.162 5.316 5.451 5.61 5.758 5.88 6.021 6.164 6.28 6.406 6.51 6.586 6.64 6.665 6.656 6.599 6.472 6.24 5.777 5.056 3.964 2.269 -0.647 -4.179 -6.992 -9.267 -11.215 -12.943 -14.423 -15.757 -16.909 -18.07 -19.098 -20.003 -20.84 -21.611 -22.304 -22.916 -23.554 -24.143 -24.65 -25.167 -25.704 -26.148 -26.615 -27.094 -27.452 -27.833 -28.254 -28.669 -29.069 -29.354 -29.646 -30.079 -30.386 -30.724 -30.903 -31.258 -31.624 -32.024 -32.236 -32.744 -32.912 -33.144 -33.401 -33.949 -34.229 -34.525 -34.868 -35.264 -35.699 -36.229 -37.759 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index e44d99ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7990 ,TETRA ,17664687,Thu Dec 2 13:52:11 CET,Thu Dec 2 16:02:36 CET,0.0 0.564 0.902 1.163 1.384 1.579 1.762 1.93 2.23 2.378 2.515 2.513 2.875 2.985 3.189 3.384 3.571 3.664 3.841 4.001 4.23 4.374 4.514 4.712 4.911 5.101 5.27 5.435 5.648 5.846 6.024 6.228 6.418 6.593 6.784 6.998 7.192 7.376 7.555 7.732 7.891 8.038 8.182 8.277 8.331 8.356 8.277 8.032 7.492 6.442 4.588 2.155 0.054 -1.739 -3.297 -4.689 -5.875 -6.947 -7.9 -8.864 -9.698 -10.445 -11.173 -11.863 -12.484 -13.051 -13.67 -14.228 -14.714 -15.207 -15.715 -16.148 -16.59 -17.055 -17.433 -17.823 -18.244 -18.683 -19.133 -19.449 -19.769 -20.266 -20.618 -20.987 -21.175 -21.57 -21.987 -22.43 -22.658 -23.175 -23.448 -23.741 -24.06 -24.76 -25.149 -25.579 -26.04 -26.532 -27.124 -27.991 -30.45 -2 ,17711 ,TETRA ,17664688,Thu Dec 2 13:52:11 CET,Thu Dec 2 15:43:09 CET,0.0 0.648 0.967 1.223 1.446 1.647 1.827 2.0 2.325 2.465 2.592 2.582 2.947 3.058 3.263 3.474 3.674 3.766 3.941 4.095 4.308 4.455 4.595 4.784 4.96 5.133 5.303 5.47 5.68 5.874 6.055 6.274 6.466 6.636 6.821 7.014 7.201 7.396 7.587 7.776 7.956 8.132 8.294 8.407 8.479 8.518 8.467 8.221 7.69 6.7 4.911 2.572 0.551 -1.139 -2.606 -3.983 -5.219 -6.362 -7.367 -8.365 -9.23 -10.02 -10.778 -11.496 -12.165 -12.751 -13.358 -13.906 -14.4 -14.931 -15.485 -15.956 -16.443 -16.963 -17.381 -17.819 -18.255 -18.687 -19.125 -19.424 -19.736 -20.251 -20.627 -21.002 -21.199 -21.617 -22.052 -22.51 -22.74 -23.257 -23.535 -23.809 -24.098 -24.743 -25.086 -25.454 -25.878 -26.365 -26.99 -27.856 -30.235 -3 ,15843 ,TETRA ,17664689,Thu Dec 2 13:52:11 CET,Thu Dec 2 15:43:22 CET,0.0 0.396 0.672 0.928 1.151 1.345 1.528 1.706 2.025 2.163 2.291 2.278 2.643 2.759 2.986 3.192 3.386 3.48 3.655 3.817 4.06 4.22 4.371 4.575 4.762 4.943 5.122 5.288 5.485 5.673 5.853 6.066 6.264 6.455 6.662 6.88 7.069 7.258 7.482 7.702 7.878 8.053 8.25 8.407 8.519 8.561 8.534 8.384 7.965 7.115 5.473 3.32 1.43 -0.255 -1.741 -3.114 -4.345 -5.455 -6.392 -7.318 -8.158 -8.936 -9.692 -10.413 -11.071 -11.662 -12.282 -12.84 -13.325 -13.811 -14.292 -14.708 -15.14 -15.565 -15.914 -16.279 -16.649 -17.016 -17.379 -17.653 -17.945 -18.398 -18.714 -19.051 -19.222 -19.566 -19.947 -20.345 -20.554 -21.052 -21.258 -21.513 -21.778 -22.368 -22.712 -23.07 -23.44 -23.876 -24.41 -25.175 -27.481 -4 ,25094 ,TETRA ,17664690,Thu Dec 2 13:52:11 CET,Thu Dec 2 15:42:59 CET,0.0 0.479 0.759 1.002 1.23 1.433 1.625 1.807 2.129 2.278 2.417 2.41 2.779 2.892 3.124 3.341 3.529 3.618 3.802 3.986 4.229 4.374 4.518 4.736 4.948 5.141 5.314 5.472 5.684 5.888 6.067 6.278 6.474 6.656 6.866 7.091 7.297 7.51 7.718 7.894 8.059 8.23 8.395 8.524 8.603 8.62 8.552 8.339 7.898 7.038 5.351 3.121 1.134 -0.622 -2.186 -3.623 -4.877 -6.004 -6.971 -7.913 -8.716 -9.432 -10.134 -10.807 -11.45 -12.052 -12.667 -13.196 -13.662 -14.171 -14.68 -15.106 -15.573 -16.062 -16.444 -16.835 -17.23 -17.617 -18.012 -18.308 -18.621 -19.122 -19.487 -19.858 -20.042 -20.448 -20.879 -21.321 -21.564 -22.076 -22.307 -22.592 -22.891 -23.535 -23.882 -24.28 -24.75 -25.277 -25.86 -26.636 -29.258 -5 ,11414 ,TETRA ,17664691,Thu Dec 2 13:52:11 CET,Thu Dec 2 16:02:01 CET,0.0 0.753 1.085 1.35 1.59 1.797 1.979 2.142 2.446 2.59 2.724 2.711 3.081 3.196 3.407 3.607 3.8 3.892 4.075 4.252 4.498 4.65 4.794 4.988 5.169 5.342 5.506 5.658 5.844 6.025 6.202 6.41 6.598 6.779 6.98 7.194 7.38 7.573 7.788 8.003 8.194 8.386 8.569 8.698 8.783 8.817 8.793 8.594 8.16 7.375 5.78 3.626 1.675 -0.034 -1.512 -2.85 -4.043 -5.131 -6.071 -7.017 -7.862 -8.627 -9.331 -10.007 -10.631 -11.198 -11.803 -12.339 -12.799 -13.283 -13.816 -14.266 -14.724 -15.206 -15.573 -15.938 -16.307 -16.698 -17.124 -17.414 -17.714 -18.195 -18.539 -18.912 -19.099 -19.476 -19.899 -20.345 -20.574 -21.085 -21.353 -21.63 -21.902 -22.489 -22.815 -23.16 -23.557 -23.991 -24.465 -25.129 -27.204 -6 ,12028 ,TETRA ,17664692,Thu Dec 2 13:52:11 CET,Thu Dec 2 15:42:49 CET,0.0 0.496 0.794 1.041 1.258 1.462 1.644 1.818 2.144 2.299 2.438 2.434 2.801 2.906 3.105 3.293 3.464 3.546 3.701 3.851 4.073 4.226 4.377 4.584 4.777 4.962 5.13 5.288 5.488 5.669 5.838 6.033 6.219 6.388 6.569 6.763 6.935 7.109 7.286 7.455 7.611 7.762 7.907 8.026 8.11 8.114 8.01 7.749 7.233 6.259 4.422 1.992 -0.157 -1.998 -3.555 -4.94 -6.173 -7.315 -8.307 -9.281 -10.133 -10.914 -11.667 -12.372 -13.02 -13.599 -14.19 -14.734 -15.232 -15.766 -16.278 -16.696 -17.16 -17.648 -18.021 -18.397 -18.778 -19.167 -19.583 -19.885 -20.218 -20.74 -21.088 -21.45 -21.645 -22.041 -22.432 -22.841 -23.059 -23.569 -23.829 -24.106 -24.409 -25.083 -25.427 -25.788 -26.175 -26.609 -27.127 -27.821 -29.547 -7 ,7112 ,TETRA ,17664693,Thu Dec 2 13:52:12 CET,Thu Dec 2 15:42:52 CET,0.0 0.643 0.967 1.213 1.42 1.618 1.813 1.995 2.314 2.454 2.583 2.581 2.951 3.062 3.277 3.477 3.67 3.768 3.96 4.138 4.376 4.523 4.665 4.871 5.069 5.26 5.438 5.609 5.825 6.027 6.213 6.421 6.612 6.783 6.981 7.198 7.397 7.611 7.827 8.042 8.24 8.442 8.659 8.82 8.942 9.032 9.041 8.897 8.499 7.695 6.105 3.883 1.951 0.293 -1.21 -2.559 -3.749 -4.863 -5.804 -6.746 -7.616 -8.41 -9.133 -9.819 -10.483 -11.094 -11.717 -12.279 -12.759 -13.253 -13.772 -14.194 -14.641 -15.11 -15.474 -15.844 -16.238 -16.679 -17.127 -17.431 -17.763 -18.274 -18.62 -18.993 -19.183 -19.562 -19.97 -20.424 -20.671 -21.193 -21.435 -21.743 -22.068 -22.716 -23.065 -23.437 -23.848 -24.379 -25.053 -25.835 -28.619 -8 ,12278 ,TETRA ,17664694,Thu Dec 2 13:52:12 CET,Thu Dec 2 15:42:23 CET,0.0 0.922 1.268 1.553 1.783 1.98 2.157 2.322 2.626 2.772 2.912 2.923 3.297 3.404 3.61 3.81 3.997 4.095 4.291 4.469 4.704 4.848 4.987 5.185 5.374 5.545 5.711 5.874 6.07 6.25 6.421 6.608 6.767 6.925 7.115 7.321 7.506 7.685 7.866 8.048 8.222 8.396 8.553 8.651 8.712 8.717 8.648 8.417 7.932 7.064 5.396 3.215 1.261 -0.509 -2.049 -3.465 -4.721 -5.817 -6.825 -7.86 -8.707 -9.458 -10.189 -10.862 -11.475 -12.073 -12.726 -13.306 -13.785 -14.282 -14.848 -15.33 -15.808 -16.286 -16.664 -17.064 -17.474 -17.895 -18.323 -18.62 -18.948 -19.484 -19.86 -20.234 -20.433 -20.846 -21.254 -21.678 -21.905 -22.418 -22.675 -22.954 -23.236 -23.892 -24.255 -24.628 -25.022 -25.477 -26.077 -26.855 -28.711 -9 ,25596 ,TETRA ,17664695,Thu Dec 2 13:52:12 CET,Thu Dec 2 15:42:32 CET,0.0 0.554 0.899 1.139 1.349 1.547 1.731 1.903 2.215 2.353 2.483 2.475 2.842 2.952 3.162 3.361 3.547 3.638 3.816 3.977 4.205 4.36 4.507 4.702 4.88 5.047 5.211 5.37 5.561 5.736 5.909 6.119 6.303 6.478 6.685 6.907 7.101 7.28 7.445 7.604 7.754 7.907 8.062 8.196 8.305 8.364 8.349 8.185 7.744 6.831 5.102 2.869 0.955 -0.698 -2.193 -3.611 -4.83 -5.894 -6.808 -7.715 -8.508 -9.242 -9.984 -10.672 -11.283 -11.848 -12.439 -12.976 -13.456 -13.965 -14.491 -14.924 -15.376 -15.841 -16.205 -16.596 -17.014 -17.445 -17.895 -18.202 -18.512 -19.016 -19.353 -19.704 -19.895 -20.286 -20.703 -21.15 -21.375 -21.894 -22.165 -22.45 -22.759 -23.506 -23.9 -24.301 -24.736 -25.244 -25.897 -26.638 -28.518 -10 ,12134 ,TETRA ,17664696,Thu Dec 2 13:52:12 CET,Thu Dec 2 16:00:46 CET,0.0 0.713 1.017 1.279 1.501 1.684 1.855 2.017 2.307 2.439 2.573 2.581 2.96 3.079 3.289 3.48 3.671 3.767 3.948 4.108 4.345 4.499 4.647 4.854 5.037 5.211 5.383 5.54 5.739 5.944 6.145 6.368 6.573 6.774 6.989 7.2 7.408 7.646 7.875 8.093 8.293 8.491 8.707 8.868 9.01 9.116 9.106 8.993 8.618 7.775 6.062 3.651 1.548 -0.263 -1.798 -3.165 -4.391 -5.519 -6.493 -7.485 -8.339 -9.107 -9.885 -10.615 -11.281 -11.895 -12.522 -13.067 -13.551 -14.079 -14.639 -15.108 -15.59 -16.095 -16.511 -16.929 -17.34 -17.774 -18.221 -18.53 -18.86 -19.385 -19.738 -20.115 -20.318 -20.701 -21.091 -21.537 -21.778 -22.286 -22.506 -22.768 -23.065 -23.719 -24.064 -24.435 -24.836 -25.335 -25.946 -26.686 -28.69 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt deleted file mode 100644 index b6c8dcda..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19129 ,KEBNE ,17125512,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:28:11 CET,0.0 0.676 1.036 1.351 1.615 1.843 2.053 2.243 2.582 2.745 2.905 2.959 3.36 3.503 3.755 3.993 4.231 4.345 4.564 4.776 5.081 5.279 5.464 5.721 5.971 6.209 6.434 6.658 6.957 7.247 7.518 7.826 8.116 8.4 8.727 9.076 9.411 9.779 10.168 10.58 10.987 11.417 11.912 12.396 12.934 13.479 14.047 14.59 15.05 15.454 15.596 15.184 14.612 13.945 13.197 12.445 11.774 11.156 10.594 9.995 9.462 8.973 8.477 7.999 7.562 7.147 6.695 6.304 5.972 5.619 5.235 4.918 4.58 4.21 3.929 3.64 3.346 3.047 2.73 2.511 2.282 1.928 1.683 1.423 1.288 1.008 0.7 0.364 0.2 -0.222 -0.335 -0.524 -0.72 -1.157 -1.391 -1.64 -1.922 -2.241 -2.606 -3.05 -4.087 -2 ,9601 ,KEBNE ,17069940,Fri Dec 24 13:44:32 CET,Fri Dec 24 15:31:59 CET,0.0 0.73 1.104 1.424 1.695 1.924 2.126 2.323 2.708 2.874 3.03 3.088 3.482 3.626 3.905 4.169 4.41 4.529 4.771 5.002 5.317 5.511 5.706 5.981 6.245 6.502 6.744 6.98 7.284 7.577 7.858 8.191 8.506 8.804 9.139 9.498 9.829 10.216 10.632 11.031 11.453 11.923 12.429 12.889 13.402 13.969 14.569 15.131 15.631 16.022 16.044 15.484 14.796 14.077 13.327 12.553 11.846 11.185 10.593 9.972 9.413 8.902 8.396 7.913 7.463 7.023 6.548 6.143 5.783 5.408 5.008 4.67 4.328 3.989 3.724 3.433 3.136 2.828 2.496 2.258 2.011 1.637 1.378 1.094 0.938 0.633 0.32 -0.021 -0.192 -0.626 -0.775 -0.989 -1.207 -1.684 -1.948 -2.224 -2.534 -2.88 -3.286 -3.825 -5.112 -4 ,13242 ,KEBNE ,17125515,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:27:31 CET,0.0 0.549 0.903 1.221 1.5 1.744 1.962 2.171 2.548 2.724 2.891 2.936 3.333 3.479 3.744 3.997 4.237 4.351 4.578 4.795 5.126 5.343 5.546 5.828 6.082 6.317 6.541 6.766 7.048 7.321 7.596 7.921 8.225 8.51 8.833 9.187 9.525 9.902 10.313 10.729 11.136 11.582 12.072 12.545 13.087 13.632 14.205 14.762 15.221 15.606 15.792 15.404 14.8 14.071 13.325 12.603 11.929 11.301 10.728 10.101 9.529 9.028 8.551 8.079 7.621 7.197 6.759 6.372 6.034 5.685 5.312 4.998 4.677 4.35 4.093 3.805 3.493 3.196 2.895 2.675 2.44 2.068 1.817 1.56 1.427 1.154 0.867 0.564 0.406 -0.007 -0.118 -0.31 -0.503 -0.954 -1.21 -1.467 -1.74 -2.041 -2.404 -2.85 -3.769 -5 ,836 ,KEBNE ,17125516,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:27:56 CET,0.0 0.631 0.965 1.232 1.484 1.723 1.935 2.135 2.504 2.669 2.826 2.869 3.267 3.413 3.688 3.942 4.181 4.296 4.514 4.722 5.03 5.233 5.421 5.677 5.923 6.163 6.393 6.614 6.9 7.187 7.477 7.813 8.126 8.426 8.763 9.133 9.478 9.854 10.263 10.672 11.077 11.531 12.065 12.576 13.118 13.681 14.276 14.896 15.523 16.098 16.414 16.095 15.523 14.844 14.111 13.418 12.809 12.194 11.618 11.008 10.467 9.997 9.534 9.069 8.614 8.193 7.744 7.349 7.02 6.674 6.314 6.012 5.693 5.356 5.087 4.802 4.522 4.239 3.929 3.72 3.499 3.136 2.89 2.642 2.518 2.258 1.988 1.691 1.525 1.106 0.999 0.811 0.617 0.193 -0.052 -0.319 -0.614 -0.925 -1.288 -1.752 -2.654 -6 ,29717 ,KEBNE ,17069944,Fri Dec 24 14:02:34 CET,Fri Dec 24 15:47:28 CET,0.0 0.622 0.934 1.215 1.485 1.727 1.941 2.135 2.48 2.649 2.815 2.859 3.255 3.396 3.656 3.898 4.144 4.266 4.495 4.708 5.018 5.219 5.406 5.671 5.922 6.152 6.372 6.589 6.87 7.143 7.408 7.725 8.024 8.308 8.628 8.979 9.323 9.7 10.093 10.501 10.93 11.409 11.937 12.435 13.007 13.607 14.244 14.872 15.469 15.953 16.126 15.765 15.096 14.331 13.575 12.8 12.075 11.432 10.864 10.252 9.703 9.22 8.773 8.338 7.907 7.505 7.079 6.699 6.359 5.991 5.606 5.284 4.955 4.612 4.342 4.053 3.765 3.471 3.153 2.93 2.699 2.351 2.108 1.855 1.723 1.44 1.127 0.79 0.606 0.164 0.041 -0.142 -0.341 -0.785 -1.026 -1.294 -1.575 -1.884 -2.282 -2.804 -3.631 -8 ,22914 ,KEBNE ,17125519,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:27:37 CET,0.0 0.677 1.108 1.435 1.695 1.925 2.14 2.334 2.673 2.833 2.989 3.038 3.441 3.583 3.854 4.109 4.354 4.472 4.702 4.917 5.227 5.436 5.635 5.905 6.158 6.408 6.655 6.898 7.201 7.484 7.742 8.03 8.307 8.582 8.913 9.276 9.615 9.971 10.342 10.738 11.148 11.585 12.036 12.499 13.052 13.58 14.137 14.72 15.277 15.755 15.991 15.634 14.975 14.218 13.452 12.73 12.067 11.443 10.893 10.298 9.759 9.262 8.766 8.284 7.832 7.41 6.955 6.55 6.205 5.84 5.443 5.127 4.803 4.448 4.167 3.872 3.561 3.244 2.919 2.691 2.453 2.08 1.815 1.534 1.392 1.095 0.778 0.453 0.288 -0.144 -0.272 -0.47 -0.672 -1.097 -1.342 -1.601 -1.876 -2.204 -2.584 -3.037 -4.039 -9 ,5197 ,KEBNE ,17125520,Thu Dec 30 16:40:32 CET,Thu Dec 30 18:28:41 CET,0.0 0.583 0.927 1.214 1.457 1.682 1.893 2.083 2.438 2.595 2.743 2.784 3.187 3.337 3.605 3.851 4.092 4.207 4.426 4.634 4.938 5.132 5.32 5.594 5.849 6.09 6.333 6.57 6.856 7.118 7.375 7.69 7.988 8.269 8.603 8.968 9.315 9.69 10.077 10.489 10.91 11.365 11.874 12.387 12.969 13.543 14.138 14.721 15.263 15.698 15.822 15.468 14.861 14.122 13.388 12.631 11.905 11.243 10.647 10.039 9.527 9.054 8.584 8.132 7.694 7.298 6.884 6.505 6.156 5.784 5.382 5.037 4.693 4.349 4.086 3.791 3.47 3.145 2.801 2.562 2.319 1.939 1.673 1.407 1.277 0.993 0.686 0.349 0.18 -0.231 -0.377 -0.58 -0.773 -1.203 -1.445 -1.705 -1.993 -2.321 -2.676 -3.086 -3.958 -10 ,6559 ,KEBNE ,17069948,Fri Dec 24 14:07:56 CET,Fri Dec 24 15:54:09 CET,0.0 0.695 1.072 1.379 1.642 1.881 2.101 2.304 2.674 2.847 3.014 3.077 3.472 3.606 3.86 4.096 4.323 4.435 4.652 4.858 5.15 5.342 5.526 5.783 6.035 6.272 6.492 6.708 7.002 7.289 7.554 7.881 8.199 8.506 8.847 9.211 9.564 9.958 10.362 10.759 11.171 11.625 12.113 12.594 13.116 13.668 14.292 14.845 15.343 15.752 15.82 15.427 14.835 14.136 13.401 12.685 12.025 11.368 10.792 10.227 9.724 9.264 8.786 8.315 7.88 7.471 7.034 6.644 6.305 5.932 5.548 5.235 4.894 4.531 4.253 3.977 3.692 3.394 3.083 2.869 2.643 2.29 2.043 1.783 1.652 1.389 1.097 0.776 0.612 0.186 0.068 -0.124 -0.317 -0.75 -1.017 -1.302 -1.602 -1.952 -2.37 -2.94 -4.214 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index dd2656e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16059 ,TETRA ,17664697,Thu Dec 2 13:52:13 CET,Thu Dec 2 15:56:39 CET,0.0 0.844 1.213 1.462 1.68 1.871 2.048 2.21 2.497 2.64 2.788 2.824 3.212 3.333 3.549 3.748 3.933 4.027 4.213 4.379 4.61 4.75 4.878 5.063 5.227 5.369 5.497 5.622 5.783 5.933 6.066 6.21 6.335 6.457 6.606 6.767 6.904 7.028 7.136 7.222 7.278 7.295 7.27 7.191 7.034 6.774 6.339 5.688 4.637 2.899 -0.063 -3.585 -6.503 -8.982 -11.063 -12.972 -14.626 -16.036 -17.262 -18.514 -19.587 -20.537 -21.437 -22.294 -23.116 -23.859 -24.612 -25.286 -25.869 -26.467 -27.112 -27.644 -28.192 -28.757 -29.186 -29.634 -30.102 -30.585 -31.104 -31.463 -31.829 -32.421 -32.827 -33.239 -33.449 -33.879 -34.323 -34.806 -35.074 -35.626 -35.929 -36.246 -36.576 -37.343 -37.753 -38.196 -38.664 -39.149 -39.801 -40.755 -43.037 -2 ,10688 ,TETRA ,17664698,Thu Dec 2 13:52:13 CET,Thu Dec 2 15:43:18 CET,0.0 0.732 1.102 1.362 1.569 1.757 1.945 2.12 2.417 2.549 2.677 2.661 3.018 3.125 3.335 3.521 3.705 3.792 3.95 4.097 4.305 4.445 4.577 4.761 4.938 5.096 5.242 5.389 5.577 5.748 5.91 6.088 6.232 6.356 6.503 6.659 6.784 6.901 7.019 7.131 7.208 7.238 7.227 7.163 6.998 6.735 6.319 5.682 4.673 3.049 0.237 -3.136 -5.895 -8.237 -10.195 -11.909 -13.417 -14.784 -15.985 -17.22 -18.256 -19.172 -20.075 -20.91 -21.675 -22.367 -23.079 -23.711 -24.253 -24.853 -25.488 -26.002 -26.549 -27.105 -27.53 -27.981 -28.452 -28.925 -29.403 -29.735 -30.075 -30.612 -30.989 -31.36 -31.544 -31.946 -32.392 -32.877 -33.13 -33.681 -33.93 -34.205 -34.488 -35.092 -35.427 -35.802 -36.228 -36.716 -37.274 -38.044 -40.533 -3 ,1772 ,TETRA ,17664699,Thu Dec 2 13:52:13 CET,Thu Dec 2 15:43:07 CET,0.0 0.646 0.999 1.293 1.53 1.74 1.938 2.126 2.45 2.603 2.75 2.754 3.121 3.226 3.432 3.624 3.806 3.89 4.051 4.206 4.425 4.561 4.69 4.88 5.059 5.22 5.366 5.496 5.67 5.824 5.963 6.13 6.265 6.383 6.516 6.635 6.726 6.833 6.936 7.015 7.079 7.112 7.092 7.013 6.835 6.555 6.119 5.435 4.326 2.607 -0.288 -3.875 -6.762 -9.161 -11.232 -13.064 -14.651 -16.058 -17.269 -18.499 -19.56 -20.497 -21.356 -22.149 -22.885 -23.558 -24.274 -24.902 -25.45 -26.04 -26.648 -27.14 -27.637 -28.17 -28.599 -29.024 -29.449 -29.904 -30.369 -30.686 -31.045 -31.599 -31.961 -32.333 -32.527 -32.936 -33.376 -33.833 -34.067 -34.602 -34.851 -35.128 -35.407 -36.044 -36.399 -36.766 -37.215 -37.762 -38.404 -39.177 -41.689 -4 ,25694 ,TETRA ,17664700,Thu Dec 2 13:52:13 CET,Thu Dec 2 15:59:34 CET,0.0 0.579 0.924 1.19 1.388 1.573 1.743 1.914 2.228 2.368 2.504 2.497 2.864 2.981 3.197 3.398 3.583 3.67 3.832 3.985 4.21 4.349 4.484 4.676 4.854 5.019 5.174 5.316 5.484 5.641 5.78 5.942 6.096 6.235 6.394 6.566 6.706 6.836 6.946 7.0 7.042 7.099 7.07 6.982 6.863 6.61 6.202 5.586 4.564 2.872 -0.049 -3.536 -6.346 -8.708 -10.732 -12.575 -14.175 -15.586 -16.808 -18.055 -19.132 -20.06 -20.939 -21.784 -22.548 -23.227 -23.928 -24.533 -25.079 -25.665 -26.261 -26.759 -27.256 -27.767 -28.177 -28.597 -29.033 -29.502 -29.971 -30.286 -30.62 -31.157 -31.55 -31.972 -32.189 -32.631 -33.105 -33.613 -33.868 -34.42 -34.711 -35.014 -35.324 -35.974 -36.346 -36.747 -37.178 -37.698 -38.374 -39.228 -41.779 -5 ,5191 ,TETRA ,17664701,Thu Dec 2 13:52:12 CET,Thu Dec 2 15:42:30 CET,0.0 0.918 1.318 1.643 1.916 2.148 2.36 2.556 2.882 3.028 3.169 3.166 3.53 3.636 3.841 4.031 4.208 4.296 4.463 4.611 4.818 4.95 5.075 5.246 5.399 5.551 5.689 5.814 5.965 6.102 6.246 6.4 6.524 6.645 6.775 6.893 6.982 7.07 7.144 7.192 7.226 7.235 7.168 7.024 6.808 6.514 6.118 5.494 4.395 2.636 -0.381 -3.979 -6.883 -9.327 -11.408 -13.212 -14.741 -16.119 -17.321 -18.537 -19.547 -20.438 -21.309 -22.134 -22.896 -23.614 -24.394 -25.084 -25.662 -26.246 -26.85 -27.367 -27.907 -28.45 -28.89 -29.344 -29.784 -30.245 -30.716 -31.048 -31.401 -31.936 -32.297 -32.674 -32.871 -33.275 -33.707 -34.189 -34.452 -35.008 -35.29 -35.603 -35.917 -36.636 -37.017 -37.408 -37.877 -38.426 -39.023 -39.674 -41.659 -6 ,16982 ,TETRA ,17664702,Thu Dec 2 13:52:12 CET,Thu Dec 2 15:42:41 CET,0.0 1.003 1.431 1.727 1.969 2.182 2.367 2.543 2.88 3.032 3.183 3.202 3.571 3.689 3.912 4.101 4.288 4.385 4.56 4.71 4.913 5.049 5.177 5.36 5.531 5.691 5.846 5.98 6.139 6.29 6.434 6.594 6.729 6.856 6.997 7.141 7.271 7.402 7.518 7.611 7.667 7.68 7.656 7.588 7.423 7.128 6.696 6.05 5.01 3.329 0.413 -3.055 -5.848 -8.201 -10.228 -12.021 -13.558 -14.966 -16.203 -17.429 -18.489 -19.398 -20.239 -21.055 -21.815 -22.514 -23.233 -23.851 -24.374 -24.939 -25.582 -26.103 -26.607 -27.126 -27.535 -27.966 -28.42 -28.912 -29.439 -29.788 -30.142 -30.706 -31.099 -31.491 -31.684 -32.069 -32.479 -32.931 -33.174 -33.719 -34.006 -34.329 -34.667 -35.34 -35.689 -36.06 -36.5 -36.994 -37.577 -38.317 -40.507 -7 ,6955 ,TETRA ,17664703,Thu Dec 2 13:52:14 CET,Thu Dec 2 15:45:26 CET,0.0 1.017 1.433 1.722 1.977 2.203 2.393 2.569 2.887 3.028 3.165 3.17 3.554 3.676 3.878 4.054 4.213 4.296 4.466 4.626 4.853 4.989 5.117 5.3 5.472 5.631 5.77 5.897 6.052 6.194 6.34 6.512 6.646 6.761 6.881 7.02 7.152 7.281 7.413 7.534 7.636 7.725 7.78 7.766 7.658 7.447 7.081 6.421 5.306 3.574 0.648 -2.861 -5.686 -8.043 -10.083 -11.895 -13.444 -14.847 -16.047 -17.228 -18.243 -19.164 -20.074 -20.914 -21.675 -22.357 -23.053 -23.696 -24.262 -24.836 -25.423 -25.887 -26.357 -26.856 -27.252 -27.666 -28.107 -28.56 -29.043 -29.364 -29.659 -30.125 -30.473 -30.839 -31.016 -31.375 -31.732 -32.107 -32.318 -32.828 -32.986 -33.216 -33.47 -34.029 -34.34 -34.666 -35.054 -35.506 -36.042 -36.749 -38.574 -8 ,20087 ,TETRA ,17664704,Thu Dec 2 13:53:02 CET,Thu Dec 2 15:43:24 CET,0.0 0.64 0.959 1.24 1.507 1.729 1.913 2.082 2.393 2.537 2.67 2.667 3.035 3.147 3.363 3.57 3.766 3.86 4.038 4.195 4.412 4.544 4.669 4.848 5.01 5.168 5.311 5.442 5.608 5.762 5.909 6.079 6.238 6.379 6.525 6.673 6.806 6.932 7.049 7.169 7.249 7.272 7.254 7.181 7.003 6.692 6.239 5.555 4.452 2.732 -0.184 -3.651 -6.458 -8.845 -10.885 -12.685 -14.244 -15.631 -16.832 -18.024 -19.023 -19.907 -20.746 -21.531 -22.248 -22.906 -23.602 -24.225 -24.769 -25.339 -25.929 -26.435 -26.966 -27.497 -27.906 -28.339 -28.805 -29.29 -29.788 -30.126 -30.478 -31.041 -31.432 -31.841 -32.063 -32.521 -32.996 -33.504 -33.77 -34.336 -34.624 -34.919 -35.242 -35.962 -36.364 -36.788 -37.241 -37.729 -38.326 -39.171 -41.663 -9 ,16189 ,TETRA ,17664705,Thu Dec 2 13:53:02 CET,Thu Dec 2 15:43:54 CET,0.0 0.637 0.938 1.2 1.426 1.629 1.805 1.966 2.265 2.39 2.503 2.483 2.834 2.938 3.149 3.343 3.518 3.604 3.769 3.916 4.122 4.247 4.365 4.531 4.688 4.838 4.969 5.095 5.253 5.39 5.518 5.668 5.799 5.915 6.047 6.183 6.296 6.402 6.502 6.585 6.631 6.643 6.602 6.5 6.307 6.035 5.593 4.869 3.748 2.007 -0.935 -4.503 -7.401 -9.82 -11.917 -13.783 -15.388 -16.833 -18.096 -19.383 -20.473 -21.416 -22.321 -23.182 -23.968 -24.685 -25.443 -26.109 -26.668 -27.239 -27.826 -28.323 -28.849 -29.396 -29.809 -30.236 -30.698 -31.192 -31.715 -32.067 -32.417 -32.973 -33.379 -33.808 -34.016 -34.431 -34.887 -35.393 -35.648 -36.178 -36.397 -36.668 -36.956 -37.576 -37.92 -38.326 -38.776 -39.283 -39.846 -40.538 -42.439 -10 ,8358 ,TETRA ,17664706,Thu Dec 2 13:53:02 CET,Thu Dec 2 15:51:02 CET,0.0 0.691 1.073 1.36 1.568 1.755 1.936 2.106 2.401 2.536 2.667 2.663 3.029 3.137 3.334 3.504 3.667 3.747 3.903 4.054 4.265 4.4 4.533 4.721 4.891 5.047 5.192 5.322 5.494 5.662 5.811 5.983 6.143 6.288 6.424 6.554 6.667 6.763 6.839 6.902 6.936 6.946 6.927 6.858 6.691 6.398 5.893 5.151 4.027 2.221 -0.726 -4.235 -7.104 -9.56 -11.586 -13.345 -14.872 -16.243 -17.432 -18.604 -19.615 -20.531 -21.439 -22.306 -23.075 -23.754 -24.452 -25.074 -25.62 -26.188 -26.767 -27.244 -27.759 -28.312 -28.752 -29.235 -29.768 -30.314 -30.858 -31.236 -31.62 -32.201 -32.601 -33.001 -33.207 -33.642 -34.113 -34.627 -34.901 -35.471 -35.783 -36.105 -36.442 -37.161 -37.604 -38.1 -38.588 -39.131 -39.797 -40.584 -42.805 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 151e67d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28906 ,KEBNE ,17069949,Fri Dec 24 14:08:59 CET,Fri Dec 24 15:53:48 CET,0.0 0.838 1.238 1.589 1.899 2.153 2.38 2.595 3.0 3.182 3.354 3.407 3.825 3.968 4.248 4.515 4.755 4.874 5.121 5.364 5.702 5.914 6.123 6.428 6.707 6.977 7.231 7.473 7.795 8.101 8.397 8.735 9.062 9.389 9.741 10.127 10.506 10.916 11.346 11.799 12.26 12.755 13.32 13.859 14.46 15.114 15.815 16.519 17.237 17.962 18.516 18.506 18.22 17.813 17.344 16.812 16.28 15.8 15.375 14.927 14.507 14.105 13.718 13.35 12.99 12.645 12.275 11.929 11.619 11.28 10.917 10.626 10.322 9.997 9.742 9.475 9.182 8.885 8.589 8.379 8.16 7.814 7.568 7.3 7.159 6.872 6.589 6.276 6.078 5.603 5.468 5.283 5.083 4.624 4.365 4.104 3.834 3.504 3.11 2.556 1.123 -2 ,11309 ,KEBNE ,17125523,Thu Dec 30 16:40:30 CET,Thu Dec 30 18:27:20 CET,0.0 0.645 0.974 1.233 1.459 1.675 1.889 2.088 2.435 2.597 2.754 2.787 3.197 3.333 3.592 3.843 4.086 4.204 4.435 4.662 4.994 5.209 5.413 5.702 5.98 6.234 6.475 6.713 7.027 7.335 7.625 7.973 8.304 8.625 9.004 9.408 9.782 10.177 10.6 11.048 11.518 12.039 12.604 13.124 13.708 14.319 14.971 15.646 16.369 17.092 17.607 17.625 17.302 16.835 16.325 15.788 15.259 14.764 14.332 13.87 13.436 13.019 12.618 12.246 11.874 11.5 11.104 10.765 10.471 10.153 9.803 9.501 9.202 8.877 8.625 8.38 8.123 7.845 7.534 7.322 7.11 6.79 6.565 6.312 6.165 5.867 5.588 5.267 5.095 4.669 4.612 4.434 4.229 3.756 3.493 3.221 2.927 2.574 2.132 1.522 -0.23 -3 ,19175 ,KEBNE ,17069951,Fri Dec 24 14:12:11 CET,Fri Dec 24 15:57:42 CET,0.0 0.547 0.922 1.255 1.535 1.761 1.968 2.17 2.553 2.731 2.896 2.93 3.326 3.467 3.747 4.017 4.272 4.39 4.625 4.858 5.185 5.398 5.601 5.887 6.161 6.422 6.675 6.926 7.238 7.529 7.812 8.143 8.457 8.768 9.122 9.51 9.885 10.281 10.679 11.102 11.525 11.998 12.54 13.061 13.642 14.255 14.95 15.672 16.41 17.139 17.722 17.739 17.397 16.9 16.349 15.764 15.189 14.645 14.156 13.659 13.198 12.767 12.35 11.925 11.504 11.129 10.74 10.374 10.053 9.714 9.36 9.069 8.759 8.44 8.187 7.911 7.627 7.344 7.044 6.822 6.593 6.241 5.992 5.725 5.587 5.293 4.975 4.664 4.504 4.069 3.943 3.726 3.474 2.86 2.526 2.222 1.956 1.593 1.028 0.25 -1.706 -4 ,17129 ,KEBNE ,17125525,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:28:53 CET,0.0 0.62 0.971 1.27 1.555 1.817 2.046 2.247 2.62 2.801 2.973 3.019 3.437 3.574 3.839 4.097 4.341 4.463 4.706 4.93 5.243 5.443 5.636 5.907 6.171 6.428 6.673 6.908 7.209 7.508 7.794 8.128 8.445 8.739 9.076 9.457 9.822 10.214 10.617 11.047 11.495 11.978 12.518 13.054 13.656 14.276 14.957 15.661 16.389 17.123 17.66 17.619 17.261 16.777 16.223 15.685 15.19 14.675 14.207 13.71 13.25 12.811 12.381 11.99 11.606 11.258 10.901 10.558 10.262 9.97 9.656 9.374 9.055 8.713 8.457 8.196 7.923 7.642 7.347 7.129 6.897 6.542 6.285 6.019 5.885 5.59 5.279 4.969 4.811 4.38 4.289 4.089 3.869 3.374 3.11 2.845 2.567 2.236 1.799 1.253 0.191 -5 ,27113 ,KEBNE ,17125526,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:26:47 CET,0.0 0.818 1.202 1.53 1.815 2.062 2.296 2.509 2.894 3.069 3.228 3.271 3.695 3.839 4.116 4.384 4.635 4.751 4.993 5.236 5.567 5.77 5.962 6.24 6.507 6.766 7.014 7.242 7.542 7.829 8.099 8.428 8.739 9.051 9.406 9.8 10.178 10.572 10.974 11.397 11.842 12.309 12.828 13.327 13.91 14.569 15.239 15.897 16.613 17.302 17.807 17.828 17.569 17.133 16.59 16.043 15.533 14.997 14.505 13.986 13.502 13.061 12.645 12.261 11.886 11.528 11.152 10.825 10.54 10.222 9.875 9.592 9.302 8.995 8.751 8.482 8.192 7.895 7.576 7.361 7.145 6.807 6.574 6.313 6.174 5.886 5.578 5.253 5.088 4.647 4.51 4.268 4.014 3.534 3.279 2.989 2.671 2.313 1.874 1.339 -0.008 -6 ,29974 ,KEBNE ,17125527,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:27:37 CET,0.0 0.62 0.967 1.259 1.509 1.748 1.983 2.184 2.531 2.691 2.848 2.884 3.29 3.422 3.673 3.921 4.166 4.282 4.505 4.727 5.049 5.243 5.431 5.712 5.986 6.242 6.476 6.713 7.031 7.319 7.585 7.907 8.235 8.564 8.934 9.325 9.682 10.084 10.516 10.954 11.404 11.919 12.484 13.02 13.645 14.295 14.981 15.712 16.472 17.191 17.768 17.759 17.412 16.953 16.447 15.953 15.482 14.977 14.489 13.981 13.526 13.115 12.732 12.365 11.987 11.612 11.206 10.858 10.549 10.207 9.865 9.577 9.276 8.954 8.689 8.409 8.118 7.83 7.532 7.318 7.091 6.742 6.487 6.203 6.054 5.74 5.414 5.075 4.905 4.472 4.311 4.068 3.831 3.344 3.092 2.775 2.429 2.1 1.71 1.185 -0.047 -7 ,8785 ,KEBNE ,17069955,Fri Dec 24 14:15:28 CET,Fri Dec 24 15:53:45 CET,0.0 0.749 1.11 1.425 1.697 1.929 2.149 2.37 2.769 2.937 3.1 3.143 3.565 3.709 3.977 4.228 4.477 4.599 4.832 5.055 5.377 5.58 5.773 6.052 6.331 6.606 6.858 7.099 7.407 7.702 7.982 8.319 8.641 8.943 9.291 9.681 10.047 10.454 10.884 11.316 11.756 12.244 12.798 13.329 13.941 14.608 15.313 16.009 16.713 17.407 17.905 17.925 17.667 17.257 16.793 16.279 15.755 15.236 14.769 14.277 13.84 13.441 13.024 12.609 12.218 11.867 11.5 11.15 10.839 10.503 10.147 9.856 9.546 9.218 8.962 8.704 8.435 8.123 7.791 7.584 7.37 7.022 6.783 6.535 6.393 6.092 5.777 5.439 5.246 4.763 4.627 4.427 4.197 3.703 3.439 3.15 2.817 2.432 1.995 1.41 -0.68 -8 ,11824 ,KEBNE ,17125529,Thu Dec 30 16:40:30 CET,Thu Dec 30 18:29:28 CET,0.0 0.808 1.22 1.551 1.833 2.082 2.327 2.575 3.003 3.175 3.347 3.414 3.831 3.976 4.247 4.5 4.74 4.859 5.085 5.302 5.629 5.834 6.025 6.297 6.553 6.797 7.037 7.27 7.568 7.858 8.131 8.456 8.763 9.066 9.42 9.79 10.144 10.542 10.967 11.415 11.872 12.349 12.888 13.427 14.011 14.636 15.324 16.01 16.728 17.486 18.096 18.183 17.908 17.514 17.079 16.587 16.111 15.664 15.225 14.751 14.327 13.918 13.524 13.13 12.719 12.331 11.946 11.596 11.266 10.936 10.615 10.346 10.062 9.761 9.512 9.248 8.961 8.662 8.352 8.128 7.901 7.565 7.329 7.072 6.94 6.67 6.37 6.048 5.884 5.454 5.36 5.18 4.987 4.512 4.25 3.973 3.675 3.329 2.9 2.372 1.004 -9 ,26586 ,KEBNE ,17125530,Thu Dec 30 16:40:30 CET,Thu Dec 30 18:28:28 CET,0.0 0.621 1.012 1.331 1.609 1.845 2.057 2.253 2.587 2.738 2.888 2.915 3.335 3.484 3.757 4.014 4.268 4.39 4.619 4.837 5.159 5.366 5.565 5.858 6.15 6.417 6.66 6.885 7.171 7.451 7.727 8.062 8.381 8.681 9.011 9.386 9.748 10.151 10.579 11.014 11.481 11.998 12.569 13.113 13.711 14.315 14.995 15.752 16.527 17.274 17.862 17.89 17.603 17.155 16.624 16.064 15.488 14.92 14.393 13.868 13.417 12.995 12.571 12.157 11.746 11.357 10.964 10.615 10.306 9.979 9.644 9.349 9.036 8.717 8.474 8.229 7.976 7.708 7.414 7.193 6.955 6.59 6.331 6.052 5.909 5.636 5.357 5.037 4.858 4.392 4.188 3.943 3.695 3.201 2.937 2.646 2.307 1.905 1.427 0.811 -0.437 -10 ,29345 ,KEBNE ,17125531,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:28:25 CET,0.0 0.529 0.912 1.208 1.45 1.661 1.853 2.049 2.441 2.628 2.808 2.885 3.313 3.461 3.74 4.005 4.249 4.367 4.599 4.819 5.131 5.336 5.541 5.843 6.128 6.401 6.662 6.905 7.201 7.485 7.765 8.093 8.414 8.721 9.063 9.445 9.821 10.229 10.638 11.062 11.521 12.031 12.588 13.13 13.743 14.369 15.037 15.735 16.444 17.159 17.771 17.827 17.47 16.993 16.489 15.923 15.34 14.768 14.251 13.732 13.251 12.805 12.373 11.956 11.555 11.168 10.758 10.402 10.092 9.761 9.41 9.113 8.805 8.471 8.181 7.869 7.564 7.265 6.967 6.754 6.529 6.178 5.924 5.661 5.522 5.217 4.906 4.579 4.408 3.973 3.858 3.65 3.426 2.94 2.69 2.419 2.095 1.695 1.198 0.696 -0.727 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 0ca39d74..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15312 ,TETRA ,17664707,Thu Dec 2 13:53:01 CET,Thu Dec 2 16:02:03 CET,0.0 0.839 1.217 1.552 1.836 2.085 2.309 2.523 2.926 3.11 3.287 3.353 3.774 3.925 4.215 4.485 4.742 4.868 5.111 5.352 5.704 5.931 6.171 6.509 6.81 7.098 7.372 7.642 8.0 8.348 8.685 9.074 9.431 9.772 10.168 10.61 11.032 11.502 12.007 12.545 13.083 13.646 14.305 14.992 15.79 16.643 17.585 18.599 19.697 20.926 22.298 23.077 23.264 23.188 22.992 22.725 22.415 22.103 21.804 21.431 21.084 20.759 20.426 20.084 19.75 19.455 19.125 18.811 18.54 18.266 17.981 17.746 17.498 17.225 17.001 16.773 16.537 16.282 16.014 15.824 15.611 15.275 15.062 14.825 14.698 14.457 14.201 13.923 13.783 13.388 13.336 13.169 12.983 12.575 12.362 12.129 11.865 11.567 11.213 10.777 9.644 -2 ,15982 ,TETRA ,17664708,Thu Dec 2 13:53:01 CET,Thu Dec 2 15:44:40 CET,0.0 0.858 1.28 1.622 1.906 2.149 2.374 2.596 3.013 3.201 3.386 3.465 3.886 4.039 4.337 4.616 4.888 5.019 5.271 5.52 5.869 6.087 6.305 6.622 6.926 7.222 7.5 7.768 8.108 8.429 8.739 9.124 9.515 9.877 10.278 10.721 11.136 11.607 12.125 12.649 13.203 13.816 14.487 15.164 15.949 16.779 17.703 18.69 19.797 21.032 22.265 22.942 23.149 23.054 22.804 22.511 22.191 21.83 21.471 21.08 20.723 20.4 20.07 19.74 19.424 19.12 18.787 18.489 18.206 17.907 17.619 17.364 17.097 16.823 16.593 16.342 16.089 15.84 15.576 15.388 15.177 14.835 14.607 14.38 14.26 14.008 13.753 13.459 13.293 12.878 12.781 12.589 12.377 11.926 11.678 11.411 11.086 10.707 10.287 9.747 8.087 -3 ,22783 ,TETRA ,17664709,Thu Dec 2 13:53:02 CET,Thu Dec 2 16:02:37 CET,0.0 0.822 1.188 1.498 1.821 2.107 2.345 2.571 2.971 3.161 3.343 3.409 3.841 4.001 4.296 4.566 4.827 4.954 5.204 5.449 5.791 6.008 6.219 6.534 6.838 7.115 7.379 7.639 7.962 8.274 8.591 8.961 9.301 9.635 10.033 10.484 10.9 11.344 11.828 12.33 12.852 13.445 14.127 14.797 15.57 16.431 17.386 18.431 19.577 20.796 22.092 22.9 23.104 22.994 22.743 22.461 22.143 21.774 21.441 21.056 20.664 20.328 20.013 19.684 19.35 19.022 18.674 18.379 18.105 17.806 17.509 17.265 17.004 16.721 16.498 16.25 15.972 15.692 15.395 15.196 15.01 14.685 14.449 14.221 14.104 13.853 13.581 13.295 13.149 12.732 12.658 12.48 12.281 11.841 11.597 11.323 11.034 10.694 10.273 9.691 8.116 -4 ,22063 ,TETRA ,17664710,Thu Dec 2 13:53:02 CET,Thu Dec 2 16:02:41 CET,0.0 0.628 1.019 1.321 1.587 1.832 2.052 2.27 2.694 2.888 3.06 3.116 3.547 3.699 3.982 4.256 4.525 4.653 4.895 5.127 5.465 5.696 5.919 6.229 6.519 6.796 7.075 7.353 7.705 8.038 8.363 8.748 9.116 9.464 9.866 10.325 10.759 11.215 11.685 12.202 12.756 13.359 14.054 14.738 15.479 16.291 17.26 18.316 19.439 20.697 22.065 22.885 23.084 23.002 22.833 22.571 22.266 21.919 21.553 21.164 20.812 20.483 20.159 19.83 19.504 19.201 18.884 18.587 18.301 17.994 17.677 17.419 17.152 16.866 16.637 16.391 16.122 15.834 15.536 15.339 15.122 14.756 14.513 14.266 14.14 13.876 13.58 13.254 13.089 12.668 12.561 12.355 12.139 11.668 11.407 11.145 10.859 10.512 10.105 9.589 8.366 -5 ,29009 ,TETRA ,17664711,Thu Dec 2 13:53:02 CET,Thu Dec 2 16:16:11 CET,0.0 1.081 1.495 1.832 2.093 2.331 2.564 2.785 3.189 3.381 3.566 3.641 4.067 4.234 4.556 4.836 5.098 5.23 5.478 5.725 6.085 6.297 6.504 6.818 7.13 7.42 7.686 7.941 8.286 8.627 8.952 9.336 9.697 10.044 10.448 10.896 11.311 11.769 12.273 12.797 13.324 13.905 14.591 15.27 16.052 16.897 17.832 18.861 20.013 21.303 22.676 23.579 23.881 23.82 23.624 23.387 23.149 22.856 22.527 22.176 21.866 21.572 21.249 20.93 20.605 20.284 19.963 19.66 19.378 19.074 18.745 18.473 18.192 17.901 17.673 17.438 17.187 16.913 16.633 16.427 16.208 15.86 15.611 15.352 15.215 14.928 14.628 14.319 14.163 13.753 13.669 13.492 13.316 12.939 12.697 12.425 12.16 11.885 11.552 11.145 10.088 -6 ,24267 ,TETRA ,17664712,Thu Dec 2 13:53:02 CET,Thu Dec 2 15:45:31 CET,0.0 0.867 1.312 1.659 1.984 2.262 2.508 2.733 3.142 3.33 3.514 3.59 4.017 4.177 4.489 4.778 5.049 5.18 5.433 5.671 6.011 6.229 6.445 6.754 7.047 7.336 7.621 7.904 8.26 8.602 8.94 9.336 9.71 10.081 10.512 10.977 11.418 11.9 12.426 13.003 13.596 14.247 15.01 15.782 16.638 17.53 18.508 19.539 20.656 21.889 23.167 23.912 24.118 24.078 23.87 23.541 23.187 22.827 22.496 22.148 21.803 21.478 21.155 20.85 20.563 20.268 19.941 19.639 19.372 19.102 18.808 18.553 18.28 17.98 17.757 17.529 17.291 17.044 16.767 16.571 16.378 16.079 15.856 15.613 15.488 15.218 14.939 14.648 14.48 14.071 13.99 13.822 13.649 13.257 13.046 12.816 12.565 12.245 11.794 11.258 10.137 -7 ,7842 ,TETRA ,17664713,Thu Dec 2 13:53:02 CET,Thu Dec 2 15:44:56 CET,0.0 0.807 1.19 1.517 1.788 2.047 2.283 2.501 2.909 3.093 3.261 3.313 3.735 3.886 4.184 4.477 4.769 4.909 5.168 5.413 5.761 5.983 6.197 6.508 6.813 7.108 7.393 7.686 8.062 8.406 8.73 9.113 9.488 9.853 10.283 10.752 11.181 11.66 12.168 12.694 13.255 13.881 14.598 15.294 16.052 16.907 17.891 18.957 20.162 21.489 22.826 23.582 23.82 23.813 23.611 23.321 22.99 22.637 22.314 21.959 21.615 21.267 20.897 20.519 20.157 19.823 19.453 19.09 18.783 18.479 18.164 17.901 17.621 17.338 17.122 16.902 16.667 16.412 16.143 15.962 15.781 15.489 15.287 15.07 14.951 14.692 14.425 14.161 14.017 13.6 13.515 13.342 13.163 12.746 12.504 12.246 11.958 11.638 11.268 10.736 9.877 -8 ,24975 ,TETRA ,17664714,Thu Dec 2 13:53:03 CET,Thu Dec 2 15:45:06 CET,0.0 0.719 1.139 1.451 1.713 1.948 2.187 2.426 2.86 3.054 3.23 3.287 3.698 3.842 4.122 4.396 4.661 4.787 5.035 5.279 5.632 5.856 6.071 6.396 6.71 7.01 7.298 7.571 7.929 8.273 8.599 9.001 9.396 9.766 10.194 10.661 11.079 11.527 12.011 12.531 13.077 13.672 14.337 15.003 15.791 16.651 17.572 18.572 19.677 20.886 22.185 22.992 23.23 23.168 22.965 22.646 22.302 21.939 21.605 21.264 20.931 20.621 20.298 19.977 19.657 19.359 19.022 18.712 18.449 18.164 17.891 17.655 17.39 17.115 16.892 16.645 16.393 16.142 15.871 15.672 15.456 15.099 14.86 14.631 14.513 14.271 13.99 13.681 13.526 13.106 12.992 12.796 12.598 12.192 11.964 11.71 11.436 11.112 10.717 10.225 8.87 -9 ,21631 ,TETRA ,17664715,Thu Dec 2 13:53:03 CET,Thu Dec 2 15:45:06 CET,0.0 0.771 1.187 1.504 1.813 2.102 2.364 2.613 3.058 3.254 3.445 3.525 3.958 4.121 4.428 4.723 5.005 5.139 5.379 5.606 5.934 6.157 6.384 6.694 6.989 7.274 7.541 7.802 8.142 8.462 8.766 9.121 9.469 9.824 10.216 10.643 11.067 11.532 12.023 12.533 13.048 13.633 14.339 15.033 15.823 16.693 17.663 18.656 19.75 21.002 22.302 23.071 23.313 23.302 23.155 22.859 22.516 22.185 21.845 21.444 21.1 20.792 20.448 20.101 19.789 19.514 19.216 18.948 18.706 18.429 18.139 17.886 17.614 17.338 17.124 16.893 16.648 16.402 16.146 15.961 15.772 15.452 15.212 14.981 14.868 14.597 14.273 13.945 13.793 13.391 13.332 13.161 12.979 12.573 12.355 12.111 11.832 11.486 11.086 10.568 9.171 -10 ,11451 ,TETRA ,17664716,Thu Dec 2 13:53:03 CET,Thu Dec 2 15:45:03 CET,0.0 0.644 1.076 1.42 1.701 1.953 2.194 2.417 2.796 2.978 3.157 3.214 3.635 3.784 4.079 4.358 4.617 4.745 5.005 5.259 5.623 5.857 6.09 6.426 6.743 7.04 7.324 7.599 7.965 8.321 8.655 9.059 9.447 9.82 10.237 10.688 11.118 11.591 12.115 12.681 13.248 13.853 14.546 15.221 15.99 16.809 17.723 18.765 19.927 21.16 22.413 23.204 23.539 23.542 23.328 23.035 22.751 22.442 22.126 21.78 21.41 21.053 20.715 20.371 20.031 19.721 19.406 19.126 18.88 18.601 18.293 18.041 17.776 17.495 17.265 17.021 16.768 16.5 16.218 16.017 15.796 15.451 15.206 14.945 14.811 14.502 14.148 13.81 13.662 13.245 13.112 12.913 12.719 12.295 12.063 11.79 11.512 11.23 10.886 10.467 9.529 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt deleted file mode 100644 index 18cf3f7f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1303 ,TETRA ,17664717,Thu Dec 2 13:53:02 CET,Thu Dec 2 15:44:21 CET,0.0 0.988 1.485 1.888 2.235 2.54 2.814 3.067 3.528 3.744 3.954 4.08 4.545 4.744 5.127 5.484 5.832 6.0 6.324 6.629 7.053 7.327 7.602 8.01 8.407 8.802 9.185 9.539 9.99 10.429 10.862 11.399 11.927 12.441 13.037 13.704 14.354 15.067 15.842 16.673 17.549 18.54 19.693 20.869 22.272 23.886 25.773 27.938 30.529 33.526 37.12 40.299 42.242 43.416 44.107 44.539 44.85 45.005 44.993 44.913 44.815 44.7 44.57 44.412 44.202 43.983 43.745 43.532 43.349 43.131 42.896 42.7 42.495 42.286 42.109 41.909 41.695 41.472 41.238 41.069 40.879 40.564 40.354 40.148 40.037 39.809 39.572 39.283 39.111 38.709 38.596 38.394 38.173 37.686 37.402 37.059 36.632 36.154 35.603 34.777 30.259 -2 ,3606 ,TETRA ,17664718,Thu Dec 2 13:53:03 CET,Thu Dec 2 15:58:45 CET,0.0 0.799 1.196 1.528 1.842 2.132 2.413 2.668 3.121 3.345 3.561 3.691 4.151 4.331 4.671 5.014 5.35 5.507 5.813 6.112 6.534 6.804 7.078 7.473 7.857 8.241 8.608 8.959 9.408 9.841 10.275 10.806 11.322 11.827 12.413 13.069 13.696 14.379 15.133 15.959 16.825 17.812 18.988 20.177 21.583 23.167 25.03 27.223 29.904 33.15 37.158 40.622 42.736 44.096 44.975 45.538 45.84 45.944 45.933 45.851 45.756 45.647 45.492 45.299 45.112 44.926 44.7 44.499 44.321 44.099 43.835 43.629 43.432 43.185 42.969 42.75 42.504 42.243 41.983 41.806 41.603 41.246 40.995 40.74 40.603 40.293 39.93 39.542 39.337 38.873 38.652 38.403 38.158 37.611 37.286 36.925 36.568 36.197 35.669 34.899 31.541 -3 ,2775 ,TETRA ,17664719,Thu Dec 2 13:53:05 CET,Thu Dec 2 16:08:35 CET,0.0 0.711 1.124 1.467 1.783 2.073 2.342 2.575 3.013 3.226 3.435 3.572 4.034 4.221 4.591 4.948 5.292 5.462 5.793 6.111 6.561 6.846 7.124 7.528 7.937 8.337 8.711 9.072 9.549 10.004 10.442 10.977 11.49 11.995 12.59 13.256 13.901 14.627 15.414 16.254 17.16 18.197 19.384 20.561 21.975 23.645 25.6 27.807 30.463 33.699 37.76 41.36 43.498 44.68 45.399 45.9 46.22 46.453 46.586 46.608 46.574 46.514 46.431 46.312 46.138 45.98 45.801 45.604 45.433 45.236 45.014 44.842 44.671 44.477 44.301 44.099 43.886 43.658 43.419 43.257 43.092 42.81 42.605 42.401 42.295 42.071 41.841 41.573 41.41 40.999 40.816 40.556 40.289 39.779 39.469 39.116 38.724 38.31 37.818 37.231 35.463 -4 ,18253 ,TETRA ,17664720,Thu Dec 2 13:53:05 CET,Thu Dec 2 15:44:19 CET,0.0 0.622 1.0 1.322 1.617 1.885 2.149 2.396 2.851 3.062 3.26 3.384 3.852 4.038 4.38 4.707 5.019 5.176 5.484 5.78 6.221 6.508 6.789 7.201 7.602 7.994 8.365 8.716 9.174 9.64 10.096 10.626 11.135 11.643 12.234 12.895 13.53 14.229 14.98 15.79 16.672 17.685 18.883 20.091 21.528 23.142 25.018 27.203 29.792 33.003 37.08 40.589 42.674 43.952 44.828 45.444 45.792 45.993 46.11 46.071 45.954 45.845 45.718 45.556 45.361 45.18 44.971 44.738 44.536 44.36 44.187 44.029 43.862 43.695 43.549 43.362 43.14 42.912 42.687 42.543 42.386 42.132 41.949 41.745 41.637 41.376 41.118 40.87 40.732 40.349 40.247 40.057 39.82 39.35 39.119 38.838 38.507 38.099 37.554 36.894 34.915 -5 ,5155 ,TETRA ,17664721,Thu Dec 2 13:53:05 CET,Thu Dec 2 15:44:04 CET,0.0 0.773 1.159 1.496 1.787 2.045 2.308 2.561 3.012 3.212 3.401 3.501 3.952 4.14 4.483 4.804 5.129 5.29 5.595 5.885 6.308 6.578 6.838 7.232 7.613 7.973 8.321 8.664 9.115 9.556 9.985 10.507 11.007 11.493 12.079 12.745 13.382 14.09 14.874 15.719 16.602 17.585 18.735 19.921 21.332 22.932 24.821 26.989 29.557 32.701 36.669 40.065 42.01 43.142 43.886 44.464 44.841 45.003 45.019 44.996 44.92 44.783 44.622 44.452 44.228 43.99 43.765 43.576 43.414 43.217 42.996 42.792 42.563 42.33 42.136 41.939 41.749 41.528 41.298 41.128 40.914 40.555 40.305 40.056 39.923 39.641 39.333 38.989 38.812 38.387 38.232 38.051 37.841 37.274 36.945 36.591 36.182 35.732 35.217 34.448 31.538 -6 ,28349 ,TETRA ,17664722,Thu Dec 2 13:53:05 CET,Thu Dec 2 15:44:05 CET,0.0 0.86 1.315 1.661 1.959 2.248 2.516 2.772 3.254 3.467 3.674 3.801 4.253 4.44 4.808 5.148 5.461 5.613 5.921 6.226 6.666 6.94 7.206 7.6 7.983 8.363 8.73 9.082 9.54 9.99 10.432 10.978 11.514 12.019 12.602 13.263 13.901 14.622 15.403 16.264 17.182 18.189 19.377 20.574 21.979 23.582 25.461 27.609 30.186 33.332 37.3 40.696 42.65 43.689 44.346 44.817 45.053 45.145 45.127 45.006 44.844 44.696 44.548 44.352 44.147 43.966 43.761 43.565 43.368 43.143 42.905 42.698 42.482 42.254 42.075 41.9 41.683 41.422 41.17 40.998 40.82 40.554 40.361 40.142 40.03 39.775 39.49 39.211 39.04 38.625 38.523 38.343 38.136 37.668 37.375 37.049 36.665 36.157 35.555 34.706 32.309 -7 ,8018 ,TETRA ,17664723,Thu Dec 2 13:53:05 CET,Thu Dec 2 15:44:27 CET,0.0 0.631 1.048 1.391 1.701 1.997 2.275 2.529 3.014 3.241 3.444 3.564 4.025 4.206 4.557 4.886 5.209 5.365 5.663 5.958 6.391 6.677 6.957 7.36 7.741 8.103 8.452 8.804 9.27 9.708 10.141 10.681 11.192 11.686 12.267 12.919 13.556 14.274 15.036 15.842 16.72 17.724 18.894 20.122 21.601 23.23 25.119 27.323 29.991 33.143 36.907 40.099 41.995 43.277 44.115 44.628 44.987 45.209 45.269 45.268 45.259 45.205 45.13 45.051 44.911 44.752 44.579 44.382 44.194 43.979 43.702 43.455 43.203 42.944 42.731 42.505 42.267 41.987 41.638 41.405 41.162 40.757 40.476 40.176 40.031 39.719 39.397 39.051 38.855 38.439 38.252 38.001 37.747 37.223 36.94 36.596 36.164 35.609 34.919 34.161 32.036 -8 ,1662 ,TETRA ,17664724,Thu Dec 2 13:53:05 CET,Thu Dec 2 15:44:41 CET,0.0 0.704 1.141 1.501 1.807 2.086 2.35 2.608 3.075 3.288 3.495 3.617 4.072 4.256 4.606 4.939 5.27 5.432 5.734 6.028 6.454 6.728 7.006 7.419 7.811 8.183 8.542 8.899 9.37 9.824 10.268 10.814 11.344 11.853 12.44 13.106 13.771 14.503 15.269 16.091 16.976 17.981 19.174 20.414 21.863 23.483 25.402 27.611 30.224 33.395 37.368 40.808 42.934 44.262 45.085 45.614 45.904 46.073 46.206 46.297 46.291 46.214 46.088 45.951 45.798 45.608 45.381 45.149 44.94 44.736 44.512 44.288 44.016 43.734 43.527 43.269 42.976 42.715 42.453 42.259 42.054 41.736 41.522 41.271 41.128 40.853 40.537 40.143 39.937 39.516 39.332 39.086 38.836 38.286 38.004 37.722 37.349 36.85 36.254 35.495 32.988 -9 ,10705 ,TETRA ,17664725,Thu Dec 2 13:53:05 CET,Thu Dec 2 15:44:18 CET,0.0 0.759 1.177 1.534 1.842 2.123 2.392 2.64 3.092 3.311 3.525 3.666 4.137 4.319 4.664 5.009 5.351 5.513 5.817 6.116 6.551 6.83 7.107 7.513 7.9 8.266 8.624 8.984 9.451 9.896 10.323 10.84 11.343 11.83 12.402 13.054 13.676 14.37 15.145 15.98 16.855 17.848 19.008 20.174 21.561 23.155 25.042 27.197 29.79 32.954 36.779 40.026 42.038 43.269 44.018 44.531 44.779 44.887 44.898 44.824 44.714 44.586 44.47 44.328 44.16 43.998 43.814 43.635 43.473 43.272 43.026 42.763 42.473 42.23 42.037 41.764 41.45 41.178 40.924 40.733 40.521 40.162 39.874 39.575 39.431 39.141 38.779 38.394 38.197 37.733 37.51 37.274 37.039 36.495 36.157 35.811 35.436 34.984 34.342 33.336 30.564 -10 ,23000 ,TETRA ,17664726,Thu Dec 2 13:53:05 CET,Thu Dec 2 15:44:45 CET,0.0 0.707 1.176 1.574 1.922 2.229 2.506 2.771 3.27 3.495 3.712 3.855 4.317 4.504 4.857 5.203 5.546 5.706 6.01 6.302 6.73 7.008 7.288 7.697 8.083 8.465 8.833 9.184 9.641 10.086 10.53 11.077 11.596 12.093 12.676 13.335 13.981 14.699 15.474 16.324 17.223 18.245 19.461 20.669 22.102 23.738 25.619 27.821 30.492 33.728 37.972 41.618 43.743 45.089 45.971 46.566 46.916 47.118 47.206 47.23 47.216 47.159 47.053 46.934 46.805 46.621 46.392 46.199 46.04 45.862 45.669 45.481 45.266 45.059 44.885 44.639 44.338 44.073 43.823 43.634 43.439 43.146 42.937 42.717 42.6 42.345 42.057 41.695 41.508 41.098 40.911 40.691 40.477 39.983 39.696 39.358 38.936 38.415 37.789 37.063 34.918 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 8008b69e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20968 ,KEBNE ,17069959,Fri Dec 24 14:20:48 CET,Fri Dec 24 16:09:01 CET,0.0 0.48 0.795 1.081 1.34 1.577 1.792 1.982 2.329 2.484 2.627 2.655 3.047 3.177 3.422 3.649 3.866 3.974 4.186 4.384 4.663 4.834 4.999 5.241 5.474 5.703 5.917 6.123 6.387 6.634 6.87 7.153 7.425 7.665 7.93 8.235 8.514 8.807 9.126 9.45 9.763 10.102 10.482 10.845 11.237 11.59 11.916 12.166 12.308 12.213 11.634 10.627 9.578 8.575 7.655 6.801 6.034 5.33 4.716 4.09 3.545 3.049 2.56 2.081 1.629 1.219 0.782 0.387 0.041 -0.307 -0.661 -0.969 -1.295 -1.624 -1.89 -2.173 -2.453 -2.741 -3.06 -3.285 -3.512 -3.854 -4.09 -4.349 -4.488 -4.778 -5.074 -5.378 -5.537 -5.97 -6.059 -6.249 -6.456 -6.876 -7.086 -7.314 -7.577 -7.874 -8.19 -8.563 -9.299 -2 ,21435 ,KEBNE ,17125533,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:30:10 CET,0.0 0.783 1.183 1.508 1.777 2.011 2.232 2.429 2.79 2.961 3.113 3.151 3.551 3.685 3.922 4.148 4.37 4.477 4.692 4.902 5.193 5.368 5.532 5.768 5.997 6.221 6.434 6.64 6.897 7.14 7.382 7.672 7.937 8.19 8.482 8.792 9.089 9.397 9.705 10.029 10.356 10.701 11.089 11.447 11.813 12.157 12.475 12.738 12.86 12.792 12.321 11.317 10.237 9.242 8.379 7.576 6.838 6.137 5.511 4.897 4.349 3.839 3.357 2.898 2.485 2.099 1.68 1.312 0.989 0.658 0.31 0.004 -0.314 -0.643 -0.905 -1.17 -1.44 -1.734 -2.057 -2.282 -2.513 -2.877 -3.127 -3.381 -3.514 -3.787 -4.073 -4.375 -4.524 -4.943 -5.033 -5.231 -5.437 -5.907 -6.162 -6.422 -6.703 -7.014 -7.384 -7.852 -8.753 -3 ,11859 ,KEBNE ,17069961,Fri Dec 24 14:22:54 CET,Fri Dec 24 16:10:03 CET,0.0 0.77 1.125 1.412 1.661 1.877 2.089 2.302 2.666 2.818 2.97 3.005 3.39 3.527 3.802 4.055 4.279 4.388 4.586 4.772 5.04 5.209 5.374 5.611 5.838 6.054 6.268 6.473 6.725 6.967 7.192 7.456 7.705 7.94 8.215 8.512 8.785 9.079 9.387 9.701 10.02 10.373 10.746 11.082 11.441 11.803 12.152 12.432 12.616 12.589 12.095 11.149 10.172 9.207 8.313 7.486 6.733 6.021 5.371 4.694 4.109 3.612 3.134 2.671 2.255 1.867 1.446 1.065 0.727 0.375 0.011 -0.282 -0.592 -0.927 -1.184 -1.446 -1.718 -2.004 -2.301 -2.507 -2.726 -3.067 -3.31 -3.565 -3.699 -3.975 -4.258 -4.553 -4.706 -5.13 -5.235 -5.427 -5.61 -5.998 -6.216 -6.459 -6.724 -6.987 -7.278 -7.659 -8.237 -4 ,29914 ,KEBNE ,17069962,Fri Dec 24 14:27:04 CET,Fri Dec 24 16:14:58 CET,0.0 0.793 1.208 1.531 1.794 2.022 2.224 2.408 2.736 2.891 3.046 3.08 3.477 3.612 3.871 4.109 4.327 4.43 4.645 4.851 5.135 5.313 5.478 5.716 5.944 6.153 6.355 6.563 6.825 7.068 7.306 7.586 7.845 8.083 8.349 8.643 8.919 9.202 9.495 9.804 10.107 10.426 10.776 11.111 11.469 11.814 12.134 12.366 12.472 12.406 11.927 10.861 9.734 8.722 7.772 6.876 6.092 5.4 4.793 4.165 3.617 3.114 2.643 2.202 1.776 1.384 0.973 0.584 0.237 -0.11 -0.474 -0.79 -1.116 -1.465 -1.73 -1.993 -2.269 -2.56 -2.862 -3.083 -3.313 -3.646 -3.893 -4.157 -4.293 -4.574 -4.853 -5.148 -5.312 -5.743 -5.822 -6.005 -6.194 -6.629 -6.875 -7.133 -7.419 -7.737 -8.076 -8.47 -9.367 -5 ,7585 ,KEBNE ,17069963,Fri Dec 24 14:31:24 CET,Fri Dec 24 16:18:41 CET,0.0 0.568 0.917 1.219 1.488 1.727 1.936 2.121 2.488 2.655 2.803 2.826 3.215 3.34 3.583 3.823 4.044 4.154 4.362 4.557 4.837 5.015 5.19 5.436 5.669 5.888 6.088 6.279 6.533 6.773 7.001 7.274 7.528 7.772 8.049 8.343 8.616 8.904 9.203 9.514 9.824 10.139 10.485 10.823 11.174 11.513 11.828 12.056 12.155 12.044 11.466 10.457 9.441 8.507 7.647 6.828 6.083 5.377 4.736 4.097 3.567 3.084 2.607 2.155 1.736 1.323 0.877 0.48 0.136 -0.216 -0.598 -0.915 -1.235 -1.575 -1.849 -2.127 -2.41 -2.694 -3.001 -3.214 -3.435 -3.795 -4.035 -4.282 -4.409 -4.677 -4.975 -5.295 -5.466 -5.901 -6.016 -6.226 -6.438 -6.902 -7.151 -7.408 -7.688 -7.974 -8.312 -8.778 -9.702 -6 ,8945 ,KEBNE ,17069964,Fri Dec 24 14:34:34 CET,Fri Dec 24 16:22:45 CET,0.0 0.488 0.811 1.087 1.323 1.544 1.755 1.946 2.284 2.446 2.605 2.648 3.045 3.175 3.426 3.666 3.884 3.99 4.203 4.4 4.674 4.855 5.028 5.27 5.505 5.728 5.943 6.155 6.416 6.662 6.897 7.158 7.401 7.646 7.926 8.239 8.534 8.828 9.14 9.468 9.789 10.129 10.498 10.841 11.2 11.534 11.839 12.083 12.239 12.224 11.734 10.776 9.778 8.76 7.83 7.01 6.256 5.538 4.897 4.245 3.699 3.205 2.717 2.253 1.821 1.41 0.968 0.584 0.252 -0.093 -0.453 -0.764 -1.089 -1.425 -1.688 -1.956 -2.227 -2.515 -2.818 -3.025 -3.246 -3.595 -3.844 -4.101 -4.234 -4.518 -4.807 -5.114 -5.273 -5.701 -5.784 -5.966 -6.168 -6.602 -6.833 -7.098 -7.387 -7.699 -8.06 -8.515 -9.478 -7 ,17400 ,KEBNE ,17125538,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:30:11 CET,0.0 0.59 0.956 1.237 1.479 1.693 1.889 2.068 2.395 2.552 2.704 2.739 3.142 3.284 3.535 3.757 3.973 4.083 4.292 4.483 4.765 4.947 5.118 5.355 5.58 5.802 6.017 6.215 6.469 6.724 6.956 7.212 7.451 7.687 7.959 8.257 8.541 8.85 9.176 9.507 9.82 10.149 10.498 10.815 11.171 11.495 11.761 11.997 12.163 12.134 11.662 10.715 9.712 8.675 7.743 6.916 6.141 5.419 4.791 4.135 3.549 3.022 2.537 2.066 1.62 1.201 0.748 0.355 0.017 -0.338 -0.704 -1.019 -1.344 -1.678 -1.946 -2.226 -2.516 -2.805 -3.101 -3.314 -3.55 -3.914 -4.15 -4.39 -4.516 -4.79 -5.085 -5.392 -5.554 -5.976 -6.049 -6.236 -6.428 -6.85 -7.075 -7.306 -7.568 -7.86 -8.18 -8.559 -9.209 -8 ,18590 ,KEBNE ,17069966,Fri Dec 24 14:39:48 CET,Fri Dec 24 16:28:22 CET,0.0 0.659 0.964 1.199 1.421 1.655 1.891 2.099 2.483 2.663 2.82 2.859 3.246 3.373 3.618 3.851 4.068 4.175 4.378 4.565 4.838 5.019 5.194 5.437 5.668 5.88 6.079 6.27 6.525 6.772 7.005 7.282 7.537 7.787 8.069 8.37 8.643 8.932 9.237 9.549 9.861 10.189 10.551 10.87 11.172 11.503 11.851 12.148 12.346 12.335 11.861 10.894 9.875 8.924 8.039 7.19 6.455 5.763 5.108 4.437 3.846 3.319 2.845 2.388 1.958 1.575 1.166 0.783 0.45 0.116 -0.24 -0.543 -0.867 -1.201 -1.456 -1.734 -2.038 -2.343 -2.649 -2.865 -3.087 -3.436 -3.691 -3.959 -4.094 -4.37 -4.655 -4.963 -5.13 -5.563 -5.647 -5.833 -6.031 -6.453 -6.694 -6.96 -7.234 -7.564 -7.976 -8.443 -9.24 -9 ,13918 ,KEBNE ,17125540,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:29:54 CET,0.0 0.591 0.946 1.237 1.475 1.683 1.875 2.055 2.386 2.553 2.715 2.744 3.134 3.264 3.509 3.733 3.94 4.041 4.235 4.423 4.701 4.881 5.049 5.292 5.52 5.739 5.952 6.154 6.41 6.647 6.875 7.144 7.401 7.643 7.91 8.201 8.468 8.761 9.082 9.396 9.703 10.033 10.378 10.696 11.048 11.399 11.745 12.045 12.224 12.175 11.683 10.662 9.591 8.607 7.709 6.872 6.134 5.446 4.84 4.231 3.708 3.225 2.733 2.269 1.838 1.42 0.984 0.61 0.29 -0.052 -0.419 -0.721 -1.037 -1.368 -1.633 -1.908 -2.191 -2.48 -2.794 -3.008 -3.218 -3.562 -3.802 -4.043 -4.172 -4.442 -4.729 -5.027 -5.173 -5.584 -5.682 -5.878 -6.071 -6.493 -6.727 -6.972 -7.245 -7.544 -7.867 -8.291 -9.001 -10 ,241 ,KEBNE ,17125541,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:30:36 CET,0.0 0.99 1.405 1.711 1.985 2.225 2.421 2.606 2.948 3.098 3.241 3.273 3.657 3.783 4.025 4.256 4.48 4.593 4.807 5.003 5.284 5.458 5.623 5.869 6.104 6.327 6.544 6.751 7.004 7.236 7.465 7.742 8.014 8.271 8.536 8.824 9.099 9.388 9.677 9.969 10.272 10.592 10.948 11.263 11.575 11.891 12.196 12.478 12.682 12.653 12.095 11.018 10.013 9.095 8.237 7.427 6.711 6.05 5.439 4.78 4.207 3.706 3.225 2.762 2.321 1.904 1.463 1.084 0.748 0.399 0.042 -0.26 -0.584 -0.927 -1.187 -1.466 -1.757 -2.052 -2.378 -2.604 -2.825 -3.167 -3.421 -3.691 -3.826 -4.107 -4.41 -4.735 -4.904 -5.327 -5.406 -5.586 -5.773 -6.199 -6.438 -6.695 -6.98 -7.282 -7.613 -8.016 -8.781 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index f6c07fb2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17057 ,TETRA ,17664727,Thu Dec 2 13:53:05 CET,Thu Dec 2 15:45:36 CET,0.0 0.457 0.77 1.056 1.319 1.555 1.755 1.931 2.275 2.444 2.604 2.638 3.029 3.168 3.426 3.68 3.924 4.037 4.257 4.467 4.754 4.941 5.126 5.397 5.658 5.903 6.136 6.362 6.652 6.937 7.207 7.51 7.798 8.083 8.423 8.785 9.128 9.51 9.931 10.365 10.777 11.233 11.776 12.296 12.857 13.455 14.14 14.837 15.488 16.061 16.458 16.327 15.848 15.295 14.733 14.18 13.668 13.17 12.723 12.239 11.791 11.366 10.948 10.556 10.17 9.815 9.446 9.103 8.783 8.453 8.114 7.831 7.533 7.196 6.948 6.703 6.427 6.135 5.85 5.644 5.419 5.064 4.817 4.571 4.443 4.188 3.923 3.629 3.471 3.04 2.946 2.76 2.567 2.108 1.836 1.556 1.257 0.935 0.584 0.083 -1.177 -3 ,4158 ,TETRA ,17664729,Thu Dec 2 13:53:05 CET,Thu Dec 2 15:59:16 CET,0.0 0.887 1.32 1.673 1.981 2.265 2.508 2.721 3.113 3.284 3.442 3.485 3.891 4.033 4.307 4.568 4.818 4.939 5.171 5.387 5.688 5.883 6.07 6.338 6.599 6.845 7.078 7.307 7.606 7.883 8.155 8.483 8.795 9.095 9.428 9.796 10.136 10.504 10.892 11.273 11.671 12.121 12.616 13.094 13.635 14.219 14.854 15.46 16.062 16.646 17.022 16.939 16.599 16.11 15.568 15.007 14.483 14.012 13.582 13.109 12.662 12.249 11.859 11.467 11.068 10.71 10.329 9.987 9.711 9.41 9.078 8.803 8.509 8.209 7.989 7.748 7.474 7.19 6.904 6.704 6.497 6.165 5.927 5.688 5.569 5.316 5.044 4.76 4.615 4.201 4.096 3.912 3.735 3.332 3.095 2.855 2.612 2.343 1.994 1.549 0.524 -4 ,14620 ,TETRA ,17664730,Thu Dec 2 13:53:06 CET,Thu Dec 2 15:45:23 CET,0.0 0.512 0.839 1.135 1.404 1.643 1.836 2.005 2.332 2.488 2.646 2.713 3.121 3.259 3.533 3.791 4.025 4.134 4.349 4.565 4.878 5.079 5.27 5.548 5.817 6.074 6.321 6.557 6.853 7.138 7.415 7.751 8.075 8.381 8.716 9.082 9.433 9.805 10.197 10.615 11.037 11.498 12.039 12.572 13.145 13.743 14.393 15.025 15.676 16.373 16.876 16.754 16.354 15.865 15.343 14.802 14.274 13.783 13.314 12.774 12.318 11.923 11.518 11.126 10.727 10.345 9.953 9.606 9.306 8.999 8.686 8.413 8.132 7.838 7.598 7.336 7.063 6.786 6.481 6.272 6.066 5.732 5.503 5.265 5.14 4.881 4.596 4.288 4.134 3.723 3.637 3.453 3.268 2.843 2.598 2.347 2.077 1.758 1.382 0.879 -0.371 -5 ,11624 ,TETRA ,17664731,Thu Dec 2 13:53:06 CET,Thu Dec 2 15:57:53 CET,0.0 0.527 0.856 1.142 1.404 1.637 1.858 2.069 2.46 2.64 2.807 2.873 3.285 3.422 3.69 3.95 4.206 4.332 4.568 4.784 5.092 5.297 5.484 5.742 5.993 6.229 6.451 6.675 6.964 7.232 7.493 7.803 8.093 8.383 8.724 9.099 9.459 9.843 10.224 10.616 11.022 11.445 11.921 12.398 12.937 13.511 14.135 14.791 15.448 16.008 16.368 16.264 15.853 15.33 14.784 14.232 13.71 13.231 12.796 12.328 11.879 11.451 11.048 10.662 10.288 9.946 9.572 9.235 8.939 8.619 8.278 7.965 7.639 7.322 7.077 6.823 6.549 6.268 5.986 5.774 5.54 5.187 4.949 4.705 4.576 4.307 4.023 3.717 3.558 3.131 3.021 2.835 2.638 2.221 2.006 1.782 1.527 1.218 0.835 0.327 -0.642 -6 ,13308 ,TETRA ,17664732,Thu Dec 2 13:53:06 CET,Thu Dec 2 16:04:27 CET,0.0 0.571 0.942 1.24 1.506 1.735 1.951 2.162 2.536 2.705 2.863 2.902 3.296 3.441 3.711 3.967 4.211 4.326 4.56 4.786 5.1 5.299 5.492 5.766 6.022 6.262 6.492 6.715 7.004 7.289 7.558 7.872 8.159 8.416 8.713 9.061 9.397 9.761 10.141 10.528 10.936 11.389 11.897 12.39 12.947 13.525 14.119 14.749 15.381 15.919 16.317 16.249 15.813 15.288 14.801 14.295 13.805 13.296 12.813 12.335 11.903 11.486 11.092 10.737 10.394 10.07 9.723 9.392 9.098 8.792 8.465 8.173 7.869 7.574 7.349 7.104 6.838 6.572 6.301 6.112 5.9 5.564 5.343 5.104 4.98 4.725 4.448 4.161 4.013 3.609 3.54 3.349 3.133 2.661 2.429 2.189 1.908 1.587 1.239 0.776 -0.126 -7 ,25120 ,TETRA ,17664733,Thu Dec 2 14:31:21 CET,Thu Dec 2 16:32:05 CET,0.0 0.727 1.15 1.491 1.744 1.972 2.201 2.415 2.786 2.955 3.117 3.162 3.578 3.725 4.004 4.267 4.52 4.639 4.86 5.082 5.407 5.608 5.805 6.098 6.376 6.634 6.876 7.111 7.407 7.689 7.959 8.282 8.591 8.883 9.219 9.588 9.928 10.309 10.699 11.093 11.507 11.96 12.504 13.029 13.594 14.187 14.827 15.507 16.181 16.81 17.347 17.41 17.077 16.556 16.022 15.49 14.98 14.468 14.004 13.535 13.114 12.72 12.321 11.937 11.579 11.25 10.895 10.553 10.241 9.928 9.608 9.327 9.04 8.741 8.493 8.232 7.959 7.685 7.425 7.242 7.039 6.726 6.506 6.247 6.108 5.832 5.561 5.273 5.114 4.707 4.615 4.443 4.252 3.831 3.62 3.371 3.081 2.763 2.413 2.003 1.163 -8 ,13368 ,TETRA ,17664734,Thu Dec 2 14:31:21 CET,Thu Dec 2 16:39:16 CET,0.0 0.926 1.328 1.65 1.912 2.15 2.371 2.577 2.945 3.11 3.275 3.333 3.749 3.895 4.156 4.397 4.631 4.747 4.97 5.184 5.487 5.684 5.885 6.17 6.433 6.685 6.919 7.148 7.456 7.748 8.019 8.347 8.67 8.96 9.279 9.649 10.011 10.398 10.801 11.213 11.632 12.079 12.588 13.083 13.631 14.233 14.9 15.592 16.286 16.897 17.281 17.208 16.91 16.466 15.946 15.422 14.921 14.439 14.006 13.555 13.138 12.726 12.313 11.923 11.563 11.236 10.875 10.534 10.24 9.936 9.601 9.312 9.031 8.746 8.509 8.248 7.958 7.671 7.393 7.188 6.971 6.63 6.388 6.148 6.025 5.761 5.485 5.208 5.064 4.651 4.561 4.373 4.177 3.729 3.475 3.211 2.953 2.675 2.343 1.946 1.125 -9 ,4543 ,TETRA ,17664735,Thu Dec 2 14:31:21 CET,Thu Dec 2 16:43:18 CET,0.0 0.843 1.249 1.599 1.924 2.213 2.461 2.673 3.026 3.198 3.368 3.431 3.83 3.966 4.23 4.486 4.729 4.844 5.068 5.292 5.609 5.806 5.997 6.276 6.531 6.778 7.032 7.268 7.554 7.832 8.106 8.422 8.707 8.979 9.302 9.664 10.007 10.381 10.772 11.192 11.62 12.083 12.645 13.173 13.711 14.291 14.925 15.543 16.167 16.796 17.267 17.113 16.689 16.21 15.706 15.19 14.673 14.163 13.687 13.183 12.735 12.324 11.919 11.535 11.186 10.868 10.503 10.16 9.88 9.586 9.269 9.003 8.716 8.411 8.173 7.919 7.648 7.363 7.045 6.833 6.625 6.288 6.054 5.794 5.656 5.392 5.126 4.837 4.685 4.264 4.154 3.956 3.751 3.278 3.025 2.771 2.486 2.189 1.808 1.303 -0.054 -10 ,5690 ,TETRA ,17664736,Thu Dec 2 14:31:21 CET,Thu Dec 2 16:32:45 CET,0.0 0.566 0.969 1.305 1.564 1.788 2.006 2.222 2.601 2.77 2.935 2.993 3.391 3.523 3.768 4.002 4.226 4.336 4.546 4.747 5.039 5.231 5.417 5.679 5.936 6.19 6.429 6.665 6.984 7.279 7.548 7.867 8.175 8.465 8.795 9.152 9.506 9.907 10.317 10.74 11.173 11.642 12.167 12.682 13.262 13.86 14.491 15.143 15.793 16.419 16.827 16.7 16.31 15.766 15.181 14.582 14.023 13.523 13.072 12.581 12.121 11.701 11.275 10.85 10.446 10.072 9.68 9.331 9.028 8.705 8.345 8.041 7.73 7.405 7.159 6.912 6.643 6.347 6.038 5.825 5.605 5.267 5.028 4.778 4.645 4.382 4.112 3.81 3.644 3.208 3.104 2.918 2.728 2.313 2.079 1.813 1.545 1.248 0.871 0.44 -0.283 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt deleted file mode 100644 index 049c6875..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23749 ,TETRA ,17664737,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:33:23 CET,0.0 0.722 1.118 1.426 1.693 1.951 2.209 2.454 2.859 3.038 3.222 3.311 3.711 3.854 4.131 4.383 4.624 4.734 4.938 5.131 5.414 5.598 5.768 6.013 6.253 6.474 6.689 6.893 7.15 7.401 7.641 7.92 8.193 8.457 8.746 9.05 9.327 9.627 9.932 10.226 10.529 10.844 11.183 11.497 11.814 12.126 12.418 12.65 12.762 12.66 12.065 10.931 9.803 8.765 7.834 6.956 6.159 5.417 4.74 4.058 3.458 2.928 2.438 1.964 1.507 1.085 0.648 0.251 -0.102 -0.468 -0.843 -1.159 -1.489 -1.83 -2.1 -2.387 -2.685 -2.975 -3.274 -3.481 -3.696 -4.052 -4.298 -4.549 -4.682 -4.959 -5.243 -5.536 -5.695 -6.13 -6.221 -6.405 -6.591 -6.984 -7.212 -7.462 -7.735 -8.043 -8.366 -8.759 -9.649 -2 ,32028 ,TETRA ,17664738,Thu Dec 2 14:31:21 CET,Thu Dec 2 16:30:10 CET,0.0 1.084 1.509 1.843 2.155 2.447 2.702 2.928 3.337 3.521 3.703 3.782 4.191 4.335 4.612 4.875 5.116 5.23 5.454 5.668 5.973 6.163 6.347 6.607 6.856 7.095 7.33 7.565 7.857 8.129 8.376 8.663 8.951 9.229 9.543 9.881 10.185 10.51 10.855 11.201 11.534 11.902 12.306 12.659 13.027 13.362 13.693 13.98 14.15 14.128 13.603 12.572 11.542 10.545 9.634 8.751 7.948 7.244 6.622 5.978 5.415 4.909 4.414 3.927 3.474 3.063 2.631 2.252 1.916 1.555 1.192 0.888 0.566 0.22 -0.049 -0.315 -0.591 -0.888 -1.215 -1.435 -1.656 -2.012 -2.269 -2.537 -2.667 -2.919 -3.194 -3.504 -3.665 -4.102 -4.207 -4.385 -4.572 -5.013 -5.246 -5.477 -5.751 -6.057 -6.363 -6.711 -7.5 -3 ,7266 ,TETRA ,17664739,Thu Dec 2 14:31:21 CET,Thu Dec 2 16:24:17 CET,0.0 1.019 1.463 1.831 2.149 2.414 2.637 2.842 3.216 3.396 3.561 3.624 4.039 4.186 4.467 4.732 4.984 5.104 5.332 5.555 5.885 6.084 6.271 6.546 6.806 7.06 7.312 7.547 7.835 8.112 8.383 8.712 9.011 9.282 9.586 9.92 10.232 10.577 10.94 11.293 11.655 12.029 12.412 12.776 13.145 13.497 13.866 14.167 14.357 14.363 13.844 12.783 11.672 10.653 9.768 8.884 8.057 7.317 6.639 5.939 5.359 4.851 4.36 3.874 3.407 2.974 2.534 2.151 1.807 1.441 1.054 0.72 0.386 0.043 -0.231 -0.507 -0.794 -1.092 -1.397 -1.616 -1.85 -2.218 -2.48 -2.739 -2.87 -3.139 -3.418 -3.721 -3.89 -4.333 -4.403 -4.589 -4.784 -5.197 -5.426 -5.67 -5.928 -6.213 -6.553 -7.008 -8.181 -4 ,23489 ,TETRA ,17664740,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:24:34 CET,0.0 0.931 1.386 1.739 2.061 2.337 2.573 2.793 3.189 3.374 3.555 3.627 4.042 4.195 4.479 4.735 4.977 5.09 5.308 5.516 5.81 6.007 6.196 6.467 6.732 6.977 7.211 7.433 7.713 7.982 8.228 8.511 8.774 9.018 9.304 9.619 9.912 10.239 10.588 10.932 11.239 11.532 11.88 12.256 12.661 13.038 13.386 13.65 13.818 13.766 13.135 11.989 10.88 9.823 8.88 8.007 7.223 6.513 5.867 5.194 4.605 4.091 3.603 3.128 2.674 2.252 1.806 1.415 1.069 0.699 0.318 0.007 -0.309 -0.643 -0.907 -1.182 -1.481 -1.809 -2.149 -2.381 -2.61 -2.945 -3.179 -3.433 -3.564 -3.84 -4.123 -4.419 -4.578 -5.003 -5.092 -5.273 -5.466 -5.885 -6.106 -6.341 -6.606 -6.889 -7.182 -7.562 -8.204 -5 ,892 ,TETRA ,17664741,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:24:17 CET,0.0 0.812 1.245 1.611 1.896 2.137 2.362 2.582 2.963 3.133 3.299 3.375 3.786 3.931 4.209 4.461 4.702 4.818 5.042 5.263 5.587 5.785 5.976 6.249 6.507 6.765 7.006 7.225 7.5 7.767 8.031 8.348 8.626 8.874 9.163 9.482 9.772 10.086 10.434 10.764 11.08 11.433 11.833 12.204 12.568 12.905 13.193 13.473 13.691 13.603 13.037 12.072 11.066 10.066 9.181 8.362 7.607 6.912 6.267 5.586 5.001 4.49 4.008 3.541 3.088 2.669 2.227 1.829 1.49 1.145 0.778 0.46 0.129 -0.212 -0.489 -0.779 -1.073 -1.377 -1.683 -1.883 -2.102 -2.452 -2.688 -2.946 -3.081 -3.349 -3.637 -3.957 -4.128 -4.571 -4.649 -4.834 -5.029 -5.439 -5.654 -5.882 -6.122 -6.373 -6.667 -7.067 -7.826 -6 ,4358 ,TETRA ,17664742,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:40:51 CET,0.0 0.948 1.354 1.714 2.009 2.265 2.521 2.773 3.211 3.394 3.556 3.6 4.002 4.137 4.396 4.635 4.864 4.976 5.187 5.403 5.745 5.947 6.123 6.38 6.623 6.849 7.06 7.266 7.532 7.793 8.033 8.323 8.606 8.868 9.164 9.479 9.763 10.057 10.375 10.703 11.046 11.419 11.795 12.15 12.543 12.92 13.235 13.467 13.61 13.563 13.031 11.94 10.829 9.781 8.839 7.992 7.236 6.506 5.856 5.212 4.648 4.13 3.617 3.128 2.677 2.265 1.823 1.418 1.079 0.722 0.337 0.016 -0.319 -0.673 -0.949 -1.219 -1.504 -1.81 -2.13 -2.348 -2.572 -2.924 -3.161 -3.407 -3.537 -3.821 -4.112 -4.432 -4.604 -5.043 -5.131 -5.32 -5.518 -5.928 -6.155 -6.405 -6.674 -6.993 -7.38 -7.875 -8.844 -7 ,20994 ,TETRA ,17664743,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:38:36 CET,0.0 1.177 1.667 2.045 2.368 2.642 2.881 3.109 3.524 3.7 3.862 3.918 4.308 4.453 4.743 5.009 5.259 5.376 5.603 5.821 6.123 6.319 6.511 6.778 7.019 7.244 7.451 7.658 7.922 8.162 8.392 8.665 8.932 9.187 9.481 9.806 10.112 10.431 10.751 11.07 11.398 11.757 12.13 12.469 12.816 13.164 13.502 13.767 13.951 13.893 13.336 12.296 11.257 10.245 9.304 8.448 7.677 6.941 6.284 5.579 4.961 4.426 3.898 3.4 2.928 2.487 2.031 1.627 1.27 0.908 0.541 0.225 -0.105 -0.453 -0.721 -0.993 -1.281 -1.586 -1.901 -2.114 -2.334 -2.7 -2.956 -3.221 -3.361 -3.64 -3.923 -4.238 -4.41 -4.849 -4.935 -5.126 -5.329 -5.766 -6.012 -6.271 -6.532 -6.824 -7.156 -7.594 -8.494 -8 ,19462 ,TETRA ,17664744,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:24:12 CET,0.0 0.705 1.136 1.481 1.772 2.02 2.252 2.464 2.841 3.023 3.198 3.261 3.656 3.801 4.074 4.322 4.551 4.663 4.885 5.091 5.376 5.57 5.755 6.017 6.274 6.519 6.746 6.964 7.25 7.511 7.755 8.058 8.347 8.619 8.914 9.223 9.527 9.853 10.192 10.539 10.874 11.244 11.666 12.049 12.444 12.826 13.173 13.456 13.582 13.431 12.828 11.748 10.664 9.635 8.679 7.788 6.984 6.191 5.497 4.825 4.234 3.695 3.186 2.707 2.252 1.832 1.397 1.005 0.653 0.297 -0.065 -0.375 -0.705 -1.074 -1.362 -1.656 -1.967 -2.286 -2.61 -2.833 -3.062 -3.412 -3.659 -3.909 -4.034 -4.301 -4.584 -4.884 -5.055 -5.501 -5.59 -5.779 -5.982 -6.442 -6.69 -6.946 -7.217 -7.513 -7.859 -8.28 -9.389 -9 ,5784 ,TETRA ,17664745,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:24:31 CET,0.0 1.209 1.688 2.05 2.356 2.629 2.875 3.088 3.488 3.674 3.838 3.889 4.299 4.445 4.725 5.002 5.262 5.387 5.64 5.868 6.174 6.369 6.555 6.821 7.064 7.287 7.511 7.731 8.008 8.277 8.533 8.827 9.101 9.367 9.678 9.997 10.292 10.612 10.947 11.291 11.617 11.968 12.381 12.781 13.203 13.627 14.025 14.339 14.557 14.533 14.066 13.173 12.166 11.133 10.197 9.373 8.623 7.847 7.16 6.504 5.926 5.392 4.856 4.344 3.864 3.411 2.927 2.487 2.108 1.718 1.324 0.993 0.638 0.264 -0.024 -0.311 -0.604 -0.913 -1.246 -1.479 -1.71 -2.071 -2.318 -2.581 -2.717 -2.987 -3.266 -3.562 -3.719 -4.159 -4.288 -4.486 -4.685 -5.102 -5.317 -5.549 -5.806 -6.085 -6.429 -6.882 -7.81 -10 ,7964 ,TETRA ,17664746,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:23:43 CET,0.0 0.825 1.294 1.656 1.972 2.23 2.45 2.662 3.063 3.252 3.429 3.498 3.915 4.069 4.355 4.615 4.872 5.003 5.247 5.462 5.783 5.997 6.191 6.464 6.737 7.008 7.267 7.507 7.81 8.098 8.356 8.669 8.971 9.259 9.591 9.952 10.276 10.611 10.965 11.326 11.68 12.04 12.439 12.825 13.237 13.627 13.984 14.281 14.456 14.388 13.884 12.845 11.73 10.657 9.675 8.758 7.943 7.212 6.539 5.846 5.241 4.684 4.168 3.675 3.19 2.753 2.319 1.92 1.573 1.213 0.822 0.494 0.151 -0.208 -0.484 -0.766 -1.06 -1.36 -1.658 -1.867 -2.091 -2.444 -2.687 -2.94 -3.071 -3.341 -3.632 -3.943 -4.099 -4.53 -4.615 -4.796 -4.992 -5.436 -5.669 -5.911 -6.168 -6.447 -6.774 -7.193 -7.884 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index a52a966c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,22038 ,TETRA ,17664748,Thu Dec 2 14:31:24 CET,Thu Dec 2 16:44:02 CET,0.0 0.704 1.042 1.332 1.588 1.812 2.023 2.236 2.632 2.806 2.966 3.011 3.42 3.57 3.851 4.109 4.353 4.468 4.686 4.893 5.199 5.398 5.59 5.874 6.148 6.408 6.672 6.932 7.253 7.555 7.842 8.182 8.508 8.818 9.175 9.573 9.957 10.38 10.826 11.284 11.761 12.309 12.932 13.522 14.172 14.857 15.581 16.371 17.237 18.123 18.962 19.225 19.075 18.731 18.331 17.934 17.524 17.082 16.664 16.19 15.728 15.31 14.909 14.526 14.147 13.767 13.354 12.989 12.657 12.301 11.958 11.667 11.328 10.944 10.634 10.319 9.99 9.645 9.296 9.044 8.781 8.381 8.095 7.8 7.655 7.349 7.02 6.659 6.466 6.021 5.883 5.66 5.417 4.866 4.547 4.203 3.835 3.407 2.879 2.286 0.828 -3 ,17795 ,TETRA ,17664749,Thu Dec 2 14:31:24 CET,Thu Dec 2 16:21:49 CET,0.0 0.746 1.143 1.43 1.686 1.916 2.137 2.347 2.72 2.891 3.057 3.093 3.509 3.653 3.93 4.202 4.455 4.579 4.823 5.054 5.367 5.564 5.762 6.049 6.322 6.582 6.831 7.079 7.398 7.696 7.983 8.333 8.667 9.004 9.387 9.792 10.176 10.588 11.013 11.46 11.932 12.454 13.042 13.626 14.323 15.078 15.881 16.704 17.604 18.59 19.531 19.982 19.915 19.604 19.221 18.763 18.288 17.832 17.381 16.888 16.444 16.049 15.631 15.185 14.784 14.416 14.03 13.677 13.357 13.016 12.654 12.355 12.031 11.689 11.43 11.156 10.862 10.549 10.217 9.99 9.762 9.384 9.101 8.826 8.688 8.395 8.098 7.777 7.609 7.177 7.085 6.902 6.685 6.196 5.942 5.669 5.35 4.968 4.525 3.947 2.487 -4 ,16625 ,TETRA ,17664750,Thu Dec 2 14:31:24 CET,Thu Dec 2 16:33:40 CET,0.0 0.765 1.131 1.435 1.709 1.954 2.174 2.374 2.745 2.916 3.073 3.117 3.532 3.675 3.943 4.199 4.452 4.575 4.808 5.037 5.376 5.582 5.776 6.058 6.319 6.576 6.832 7.079 7.402 7.705 7.983 8.307 8.628 8.939 9.288 9.679 10.042 10.442 10.879 11.338 11.814 12.345 12.95 13.549 14.237 14.968 15.779 16.65 17.571 18.493 19.359 19.748 19.665 19.359 18.963 18.526 18.068 17.616 17.208 16.764 16.369 15.992 15.605 15.235 14.879 14.521 14.123 13.768 13.462 13.143 12.806 12.504 12.179 11.849 11.585 11.306 11.034 10.763 10.447 10.211 9.95 9.535 9.272 8.99 8.84 8.554 8.255 7.924 7.745 7.297 7.116 6.879 6.637 6.143 5.871 5.581 5.279 4.953 4.599 4.12 2.793 -5 ,5930 ,TETRA ,17664751,Thu Dec 2 14:31:24 CET,Thu Dec 2 16:36:18 CET,0.0 0.511 0.834 1.111 1.379 1.62 1.847 2.051 2.407 2.579 2.746 2.791 3.199 3.345 3.632 3.902 4.163 4.281 4.51 4.737 5.062 5.274 5.483 5.778 6.053 6.323 6.586 6.828 7.132 7.425 7.705 8.041 8.356 8.663 9.02 9.42 9.822 10.251 10.694 11.163 11.646 12.187 12.785 13.345 14.002 14.715 15.51 16.375 17.324 18.308 19.22 19.52 19.364 19.035 18.562 17.98 17.429 16.912 16.417 15.914 15.464 15.025 14.555 14.072 13.61 13.174 12.718 12.321 11.969 11.6 11.21 10.877 10.541 10.185 9.905 9.599 9.281 8.974 8.655 8.436 8.193 7.766 7.463 7.152 6.997 6.683 6.338 5.98 5.802 5.376 5.23 5.014 4.805 4.316 4.03 3.734 3.407 3.023 2.584 1.985 0.712 -6 ,15206 ,TETRA ,17664752,Thu Dec 2 14:31:24 CET,Thu Dec 2 16:38:17 CET,0.0 0.477 0.826 1.098 1.318 1.535 1.75 1.955 2.335 2.507 2.678 2.746 3.163 3.313 3.598 3.857 4.096 4.207 4.428 4.651 4.973 5.179 5.377 5.652 5.915 6.17 6.414 6.647 6.932 7.205 7.478 7.809 8.121 8.423 8.771 9.156 9.526 9.934 10.368 10.83 11.301 11.806 12.392 12.951 13.558 14.221 14.97 15.741 16.589 17.508 18.294 18.514 18.356 18.06 17.704 17.274 16.812 16.339 15.871 15.382 14.937 14.508 14.086 13.681 13.29 12.907 12.495 12.126 11.799 11.441 11.026 10.675 10.326 9.984 9.729 9.461 9.172 8.871 8.563 8.343 8.11 7.743 7.469 7.173 7.028 6.741 6.43 6.09 5.914 5.475 5.318 5.096 4.866 4.361 4.073 3.777 3.47 3.105 2.674 2.04 0.734 -7 ,19391 ,TETRA ,17664753,Thu Dec 2 14:31:24 CET,Thu Dec 2 16:22:00 CET,0.0 0.799 1.161 1.475 1.741 1.987 2.214 2.429 2.82 3.002 3.172 3.229 3.643 3.788 4.07 4.333 4.583 4.7 4.925 5.147 5.471 5.673 5.865 6.139 6.404 6.664 6.914 7.154 7.48 7.797 8.095 8.445 8.773 9.087 9.445 9.84 10.22 10.623 11.048 11.503 11.967 12.482 13.085 13.68 14.37 15.083 15.863 16.7 17.572 18.489 19.395 19.826 19.763 19.428 19.031 18.608 18.173 17.736 17.32 16.872 16.43 16.014 15.626 15.251 14.879 14.526 14.154 13.816 13.538 13.247 12.929 12.66 12.365 12.031 11.754 11.481 11.2 10.911 10.623 10.416 10.197 9.86 9.621 9.373 9.242 8.968 8.677 8.362 8.202 7.766 7.602 7.38 7.139 6.623 6.355 6.069 5.748 5.365 4.898 4.337 2.75 -8 ,1899 ,TETRA ,17664754,Thu Dec 2 14:31:24 CET,Thu Dec 2 16:21:22 CET,0.0 0.691 1.069 1.365 1.618 1.854 2.074 2.28 2.692 2.886 3.055 3.119 3.532 3.684 3.964 4.22 4.474 4.598 4.826 5.047 5.369 5.576 5.78 6.075 6.351 6.61 6.863 7.106 7.426 7.737 8.023 8.364 8.688 9.001 9.371 9.772 10.147 10.559 11.009 11.484 11.964 12.508 13.13 13.74 14.432 15.153 15.928 16.731 17.586 18.497 19.396 19.817 19.712 19.362 18.94 18.476 18.02 17.583 17.147 16.665 16.238 15.849 15.447 15.032 14.646 14.295 13.92 13.575 13.275 12.96 12.634 12.362 12.07 11.745 11.49 11.228 10.945 10.652 10.341 10.127 9.908 9.578 9.366 9.14 9.018 8.751 8.456 8.145 7.986 7.576 7.475 7.296 7.109 6.704 6.486 6.228 5.94 5.633 5.259 4.803 3.814 -9 ,27854 ,TETRA ,17664755,Thu Dec 2 14:31:24 CET,Thu Dec 2 16:33:58 CET,0.0 0.549 0.881 1.16 1.414 1.654 1.861 2.044 2.403 2.572 2.733 2.77 3.17 3.306 3.565 3.822 4.065 4.18 4.411 4.63 4.947 5.15 5.352 5.645 5.92 6.182 6.426 6.657 6.957 7.248 7.541 7.887 8.207 8.516 8.884 9.309 9.711 10.127 10.551 11.001 11.469 11.977 12.56 13.133 13.795 14.509 15.269 16.072 16.988 17.941 18.759 19.073 18.972 18.648 18.262 17.798 17.294 16.835 16.425 15.967 15.539 15.135 14.731 14.333 13.942 13.582 13.197 12.842 12.536 12.202 11.832 11.505 11.141 10.79 10.531 10.257 9.978 9.69 9.375 9.15 8.927 8.569 8.315 8.037 7.884 7.565 7.238 6.906 6.732 6.295 6.161 5.938 5.695 5.167 4.869 4.573 4.261 3.898 3.491 2.977 1.899 -10 ,5735 ,TETRA ,17664756,Thu Dec 2 14:31:24 CET,Thu Dec 2 16:21:50 CET,0.0 0.644 0.975 1.281 1.572 1.84 2.056 2.248 2.606 2.762 2.921 2.978 3.387 3.534 3.821 4.088 4.345 4.473 4.721 4.949 5.268 5.477 5.677 5.976 6.265 6.531 6.787 7.037 7.356 7.653 7.94 8.289 8.613 8.918 9.272 9.672 10.042 10.447 10.885 11.351 11.83 12.35 12.955 13.555 14.216 14.921 15.739 16.654 17.602 18.496 19.24 19.457 19.312 19.028 18.679 18.238 17.75 17.257 16.812 16.344 15.904 15.502 15.087 14.665 14.28 13.923 13.532 13.185 12.882 12.556 12.214 11.923 11.605 11.271 11.002 10.704 10.386 10.054 9.713 9.476 9.225 8.837 8.57 8.285 8.137 7.818 7.456 7.087 6.903 6.45 6.296 6.067 5.817 5.295 5.012 4.7 4.342 3.977 3.557 2.993 1.809 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt deleted file mode 100644 index b7fa3f51..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30077 ,TETRA ,17664757,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:40:08 CET,0.0 0.726 1.082 1.384 1.646 1.879 2.105 2.301 2.648 2.812 2.974 3.034 3.448 3.595 3.867 4.127 4.369 4.488 4.72 4.944 5.273 5.486 5.694 5.979 6.249 6.52 6.773 7.006 7.311 7.613 7.894 8.217 8.532 8.839 9.198 9.583 9.944 10.333 10.738 11.16 11.582 12.045 12.616 13.181 13.813 14.472 15.178 15.968 16.807 17.589 18.199 18.34 18.16 17.799 17.336 16.854 16.386 15.915 15.457 14.953 14.529 14.143 13.746 13.368 13.002 12.656 12.28 11.943 11.651 11.34 11.009 10.729 10.448 10.154 9.913 9.655 9.388 9.116 8.825 8.621 8.418 8.073 7.807 7.538 7.413 7.158 6.883 6.584 6.426 6.012 5.932 5.749 5.55 5.12 4.884 4.612 4.326 4.025 3.669 3.248 2.491 -2 ,4795 ,TETRA ,17664758,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:22:13 CET,0.0 0.703 1.053 1.328 1.568 1.79 1.995 2.187 2.528 2.682 2.835 2.873 3.281 3.416 3.666 3.917 4.161 4.278 4.5 4.718 5.031 5.229 5.422 5.711 5.988 6.236 6.481 6.727 7.041 7.328 7.606 7.944 8.261 8.577 8.937 9.327 9.694 10.092 10.521 10.969 11.423 11.924 12.502 13.075 13.717 14.364 15.059 15.803 16.588 17.321 17.863 17.938 17.626 17.129 16.618 16.12 15.61 15.079 14.613 14.142 13.709 13.311 12.923 12.522 12.141 11.799 11.434 11.097 10.798 10.493 10.162 9.888 9.596 9.278 9.024 8.752 8.485 8.218 7.931 7.73 7.526 7.2 6.978 6.746 6.614 6.338 6.068 5.787 5.63 5.202 5.113 4.926 4.727 4.324 4.099 3.853 3.58 3.273 2.933 2.509 1.64 -3 ,12592 ,TETRA ,17664759,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:22:16 CET,0.0 0.685 1.041 1.319 1.557 1.779 1.985 2.196 2.593 2.76 2.919 2.954 3.347 3.477 3.748 4.021 4.279 4.399 4.621 4.829 5.14 5.343 5.533 5.807 6.066 6.309 6.548 6.781 7.077 7.354 7.616 7.936 8.247 8.552 8.904 9.281 9.637 10.03 10.454 10.894 11.334 11.806 12.338 12.856 13.434 14.039 14.678 15.364 16.101 16.84 17.417 17.459 17.194 16.76 16.255 15.751 15.295 14.822 14.346 13.847 13.407 12.983 12.564 12.17 11.798 11.445 11.069 10.716 10.404 10.091 9.757 9.474 9.177 8.866 8.62 8.367 8.109 7.827 7.531 7.33 7.127 6.805 6.575 6.342 6.22 5.956 5.669 5.365 5.213 4.803 4.713 4.533 4.348 3.959 3.748 3.512 3.268 3.013 2.696 2.296 1.634 -4 ,3860 ,TETRA ,17664760,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:21:56 CET,0.0 0.504 0.839 1.132 1.391 1.616 1.829 2.029 2.412 2.593 2.755 2.794 3.198 3.342 3.611 3.868 4.122 4.244 4.469 4.684 4.979 5.169 5.371 5.65 5.905 6.156 6.396 6.632 6.936 7.216 7.487 7.814 8.128 8.428 8.766 9.145 9.503 9.889 10.31 10.756 11.215 11.727 12.285 12.812 13.422 14.05 14.735 15.468 16.214 16.95 17.584 17.707 17.489 17.12 16.657 16.166 15.664 15.189 14.744 14.258 13.861 13.503 13.132 12.733 12.336 11.99 11.638 11.311 11.018 10.711 10.385 10.117 9.833 9.53 9.29 9.036 8.771 8.489 8.194 7.992 7.787 7.457 7.222 6.98 6.852 6.58 6.294 6.002 5.849 5.423 5.315 5.131 4.942 4.532 4.299 4.047 3.777 3.462 3.067 2.596 1.664 -5 ,22054 ,TETRA ,17664761,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:22:11 CET,0.0 0.488 0.836 1.122 1.362 1.581 1.778 1.97 2.342 2.515 2.679 2.723 3.13 3.274 3.541 3.8 4.047 4.163 4.39 4.606 4.921 5.122 5.312 5.597 5.871 6.12 6.361 6.599 6.897 7.176 7.447 7.784 8.108 8.419 8.773 9.152 9.516 9.917 10.327 10.759 11.232 11.755 12.324 12.879 13.507 14.165 14.886 15.64 16.408 17.16 17.834 18.026 17.784 17.389 16.975 16.513 16.025 15.564 15.148 14.682 14.248 13.837 13.439 13.047 12.671 12.338 11.978 11.646 11.359 11.047 10.712 10.428 10.115 9.783 9.53 9.264 8.982 8.681 8.354 8.129 7.903 7.537 7.283 7.028 6.902 6.635 6.334 6.027 5.871 5.454 5.378 5.201 5.008 4.589 4.358 4.116 3.852 3.539 3.193 2.807 1.971 -6 ,10328 ,TETRA ,17664762,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:22:17 CET,0.0 0.538 0.896 1.193 1.455 1.688 1.895 2.087 2.451 2.62 2.787 2.855 3.26 3.398 3.664 3.915 4.161 4.28 4.508 4.724 5.058 5.274 5.469 5.755 6.028 6.29 6.539 6.771 7.074 7.356 7.625 7.962 8.291 8.604 8.961 9.365 9.75 10.161 10.587 11.029 11.475 11.973 12.551 13.113 13.758 14.47 15.219 15.945 16.74 17.58 18.288 18.474 18.271 17.882 17.42 16.945 16.48 16.016 15.547 15.04 14.594 14.164 13.751 13.38 13.03 12.683 12.313 11.976 11.681 11.37 11.042 10.77 10.486 10.19 9.941 9.683 9.421 9.149 8.869 8.668 8.464 8.149 7.93 7.699 7.57 7.303 7.035 6.744 6.586 6.181 6.111 5.929 5.737 5.338 5.122 4.895 4.647 4.338 3.998 3.587 2.66 -7 ,16164 ,TETRA ,17664763,Thu Dec 2 14:31:23 CET,Thu Dec 2 16:22:08 CET,0.0 0.685 1.069 1.403 1.675 1.912 2.152 2.373 2.772 2.954 3.107 3.139 3.557 3.707 3.982 4.243 4.498 4.622 4.856 5.079 5.409 5.62 5.829 6.117 6.384 6.646 6.887 7.128 7.443 7.735 8.024 8.363 8.68 8.988 9.327 9.676 10.016 10.394 10.795 11.226 11.668 12.177 12.75 13.275 13.876 14.535 15.259 15.997 16.754 17.451 18.007 18.09 17.802 17.367 16.877 16.324 15.781 15.292 14.862 14.41 13.989 13.6 13.212 12.826 12.437 12.055 11.661 11.317 11.022 10.702 10.354 10.051 9.732 9.422 9.191 8.939 8.665 8.375 8.062 7.852 7.639 7.291 7.048 6.8 6.675 6.418 6.145 5.872 5.725 5.305 5.226 5.041 4.839 4.399 4.172 3.928 3.664 3.377 3.038 2.607 1.759 -8 ,10283 ,TETRA ,17664764,Thu Dec 2 14:32:20 CET,Thu Dec 2 16:22:59 CET,0.0 0.688 1.05 1.352 1.595 1.823 2.03 2.233 2.62 2.796 2.959 3.006 3.416 3.562 3.841 4.108 4.366 4.489 4.722 4.936 5.247 5.455 5.656 5.937 6.212 6.482 6.738 6.987 7.299 7.602 7.896 8.232 8.544 8.853 9.216 9.61 9.983 10.385 10.802 11.249 11.722 12.243 12.818 13.36 14.0 14.693 15.409 16.159 16.964 17.785 18.479 18.602 18.294 17.841 17.39 16.925 16.451 15.969 15.516 15.024 14.581 14.172 13.765 13.365 12.975 12.61 12.222 11.876 11.582 11.277 10.947 10.663 10.363 10.053 9.825 9.589 9.321 9.023 8.719 8.507 8.288 7.962 7.73 7.489 7.365 7.105 6.84 6.568 6.417 5.987 5.9 5.706 5.499 5.073 4.853 4.613 4.34 4.031 3.704 3.303 2.527 -9 ,24649 ,TETRA ,17664765,Thu Dec 2 14:32:20 CET,Thu Dec 2 16:44:09 CET,0.0 0.535 0.927 1.267 1.562 1.807 2.038 2.252 2.625 2.806 2.976 3.032 3.442 3.596 3.866 4.11 4.347 4.462 4.675 4.878 5.173 5.368 5.563 5.834 6.103 6.371 6.626 6.865 7.169 7.462 7.745 8.089 8.416 8.715 9.048 9.42 9.784 10.18 10.596 11.021 11.46 11.952 12.482 13.013 13.633 14.302 15.009 15.733 16.514 17.303 17.998 18.191 17.959 17.529 17.06 16.568 16.068 15.585 15.116 14.602 14.14 13.72 13.335 12.955 12.57 12.225 11.871 11.536 11.247 10.942 10.61 10.33 10.032 9.707 9.457 9.216 8.965 8.697 8.408 8.206 8.004 7.682 7.452 7.209 7.084 6.82 6.551 6.262 6.101 5.669 5.566 5.378 5.186 4.78 4.553 4.292 3.994 3.663 3.282 2.826 1.991 -10 ,852 ,TETRA ,17664766,Thu Dec 2 14:32:20 CET,Thu Dec 2 16:22:57 CET,0.0 0.874 1.274 1.57 1.821 2.048 2.26 2.445 2.793 2.96 3.116 3.15 3.554 3.692 3.956 4.201 4.427 4.54 4.769 5.001 5.336 5.554 5.761 6.053 6.333 6.601 6.861 7.098 7.397 7.693 7.969 8.289 8.605 8.916 9.274 9.672 10.037 10.425 10.841 11.282 11.726 12.218 12.783 13.328 13.95 14.621 15.347 16.085 16.891 17.7 18.33 18.522 18.295 17.866 17.406 16.897 16.368 15.888 15.463 15.003 14.582 14.17 13.729 13.288 12.89 12.532 12.149 11.817 11.529 11.192 10.843 10.564 10.258 9.947 9.703 9.433 9.145 8.853 8.557 8.348 8.122 7.772 7.539 7.292 7.166 6.914 6.652 6.366 6.205 5.784 5.717 5.532 5.333 4.913 4.698 4.459 4.171 3.86 3.509 3.083 2.313 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 43b00ac0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9004 ,TETRA ,17664767,Thu Dec 2 14:32:21 CET,Thu Dec 2 16:37:12 CET,0.0 0.523 0.83 1.092 1.332 1.55 1.739 1.912 2.224 2.37 2.507 2.496 2.863 2.977 3.181 3.369 3.556 3.653 3.843 4.015 4.249 4.395 4.538 4.745 4.942 5.124 5.284 5.43 5.619 5.795 5.971 6.182 6.364 6.533 6.721 6.915 7.089 7.265 7.431 7.591 7.756 7.91 8.028 8.136 8.209 8.16 7.996 7.68 7.052 5.891 3.739 1.038 -1.23 -3.202 -4.876 -6.375 -7.709 -8.947 -10.019 -11.078 -11.994 -12.805 -13.569 -14.298 -14.987 -15.603 -16.239 -16.831 -17.337 -17.848 -18.381 -18.826 -19.305 -19.83 -20.251 -20.679 -21.108 -21.56 -22.047 -22.373 -22.698 -23.242 -23.621 -24.011 -24.22 -24.641 -25.095 -25.578 -25.841 -26.394 -26.665 -26.952 -27.239 -27.896 -28.306 -28.753 -29.201 -29.746 -30.479 -31.405 -34.802 -2 ,9301 ,TETRA ,17664768,Thu Dec 2 14:32:20 CET,Thu Dec 2 16:22:17 CET,0.0 0.569 0.906 1.185 1.462 1.711 1.91 2.085 2.427 2.589 2.725 2.731 3.104 3.216 3.429 3.647 3.849 3.938 4.107 4.265 4.504 4.648 4.774 4.959 5.141 5.312 5.461 5.595 5.776 5.944 6.103 6.29 6.448 6.585 6.747 6.928 7.09 7.249 7.404 7.531 7.633 7.735 7.818 7.869 7.864 7.771 7.568 7.231 6.607 5.459 3.353 0.607 -1.697 -3.58 -5.17 -6.612 -7.892 -9.05 -10.054 -11.05 -11.924 -12.726 -13.496 -14.199 -14.84 -15.46 -16.138 -16.729 -17.236 -17.763 -18.292 -18.734 -19.208 -19.71 -20.095 -20.488 -20.893 -21.336 -21.799 -22.117 -22.452 -22.968 -23.337 -23.735 -23.932 -24.319 -24.723 -25.176 -25.43 -25.963 -26.227 -26.517 -26.84 -27.561 -27.947 -28.375 -28.84 -29.332 -29.941 -30.772 -33.801 -3 ,8406 ,TETRA ,17664769,Thu Dec 2 14:32:20 CET,Thu Dec 2 16:23:11 CET,0.0 0.561 0.88 1.154 1.38 1.58 1.78 1.961 2.294 2.44 2.568 2.56 2.916 3.021 3.217 3.417 3.606 3.691 3.855 3.995 4.184 4.31 4.436 4.621 4.809 4.989 5.149 5.295 5.477 5.658 5.833 6.036 6.22 6.383 6.545 6.713 6.876 7.057 7.223 7.37 7.504 7.622 7.728 7.766 7.757 7.704 7.508 7.108 6.432 5.294 3.205 0.576 -1.608 -3.523 -5.245 -6.797 -8.143 -9.339 -10.376 -11.419 -12.356 -13.192 -13.956 -14.726 -15.457 -16.093 -16.754 -17.348 -17.864 -18.381 -18.919 -19.386 -19.876 -20.371 -20.753 -21.164 -21.583 -22.025 -22.498 -22.817 -23.145 -23.649 -23.997 -24.366 -24.564 -24.969 -25.375 -25.791 -26.007 -26.501 -26.698 -26.955 -27.268 -28.011 -28.434 -28.921 -29.437 -29.956 -30.647 -31.641 -35.833 -4 ,18803 ,TETRA ,17664770,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:23:09 CET,0.0 0.38 0.667 0.936 1.169 1.363 1.542 1.703 1.994 2.129 2.252 2.245 2.599 2.708 2.909 3.091 3.269 3.356 3.533 3.707 3.942 4.086 4.222 4.414 4.595 4.769 4.931 5.08 5.272 5.463 5.633 5.814 5.972 6.127 6.315 6.495 6.646 6.807 6.977 7.147 7.288 7.414 7.509 7.552 7.573 7.53 7.362 6.987 6.294 5.133 2.988 0.215 -2.122 -4.151 -5.9 -7.448 -8.796 -10.024 -11.127 -12.235 -13.167 -13.976 -14.743 -15.466 -16.132 -16.747 -17.413 -18.006 -18.503 -19.045 -19.634 -20.109 -20.597 -21.093 -21.481 -21.896 -22.307 -22.747 -23.245 -23.575 -23.912 -24.452 -24.81 -25.194 -25.4 -25.812 -26.223 -26.661 -26.896 -27.437 -27.742 -28.052 -28.395 -29.072 -29.457 -29.937 -30.46 -31.012 -31.661 -32.51 -35.566 -5 ,13199 ,TETRA ,17664771,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:42:47 CET,0.0 0.989 1.375 1.636 1.869 2.08 2.265 2.438 2.753 2.904 3.046 3.057 3.436 3.553 3.773 3.974 4.155 4.245 4.419 4.575 4.795 4.932 5.058 5.237 5.406 5.575 5.751 5.918 6.114 6.29 6.458 6.665 6.848 7.013 7.186 7.365 7.538 7.71 7.861 7.994 8.113 8.218 8.288 8.295 8.246 8.149 7.938 7.544 6.881 5.691 3.528 0.88 -1.375 -3.38 -5.119 -6.604 -7.896 -9.102 -10.175 -11.229 -12.103 -12.892 -13.655 -14.399 -15.1 -15.724 -16.387 -16.97 -17.456 -17.962 -18.506 -18.98 -19.464 -19.938 -20.293 -20.656 -21.048 -21.475 -21.925 -22.238 -22.571 -23.078 -23.425 -23.805 -23.999 -24.418 -24.893 -25.384 -25.631 -26.158 -26.464 -26.765 -27.085 -27.799 -28.176 -28.584 -29.04 -29.553 -30.199 -31.07 -34.172 -6 ,8501 ,TETRA ,17664772,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:22:59 CET,0.0 0.641 0.958 1.225 1.437 1.632 1.828 2.007 2.321 2.475 2.615 2.623 2.989 3.109 3.344 3.556 3.756 3.852 4.033 4.198 4.408 4.542 4.679 4.881 5.075 5.256 5.431 5.602 5.81 5.995 6.157 6.346 6.519 6.674 6.852 7.034 7.195 7.357 7.51 7.658 7.784 7.885 7.971 8.049 8.08 7.995 7.777 7.389 6.769 5.632 3.315 0.387 -1.995 -4.017 -5.797 -7.349 -8.661 -9.859 -10.903 -11.956 -12.888 -13.742 -14.542 -15.279 -15.967 -16.589 -17.236 -17.827 -18.344 -18.878 -19.449 -19.931 -20.416 -20.909 -21.302 -21.728 -22.166 -22.622 -23.099 -23.426 -23.763 -24.268 -24.623 -25.007 -25.206 -25.626 -26.066 -26.571 -26.837 -27.379 -27.75 -28.074 -28.407 -29.147 -29.574 -30.048 -30.519 -31.108 -31.798 -32.669 -35.984 -7 ,30168 ,TETRA ,17664773,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:22:45 CET,0.0 0.716 1.062 1.331 1.551 1.748 1.939 2.124 2.434 2.574 2.709 2.701 3.074 3.191 3.398 3.601 3.784 3.868 4.029 4.179 4.396 4.536 4.679 4.879 5.06 5.225 5.373 5.516 5.7 5.874 6.035 6.22 6.387 6.534 6.694 6.863 7.009 7.149 7.284 7.406 7.517 7.618 7.695 7.712 7.696 7.618 7.419 7.029 6.334 5.152 2.934 0.246 -1.987 -3.906 -5.581 -7.137 -8.502 -9.685 -10.712 -11.752 -12.646 -13.46 -14.26 -15.005 -15.658 -16.263 -16.923 -17.51 -17.994 -18.502 -19.027 -19.468 -19.951 -20.444 -20.828 -21.232 -21.645 -22.076 -22.53 -22.848 -23.183 -23.712 -24.087 -24.483 -24.684 -25.1 -25.528 -25.955 -26.184 -26.713 -26.996 -27.251 -27.506 -28.108 -28.473 -28.906 -29.382 -29.955 -30.63 -31.444 -34.912 -8 ,22492 ,TETRA ,17664774,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:22:52 CET,0.0 0.78 1.17 1.462 1.686 1.895 2.089 2.266 2.59 2.737 2.88 2.888 3.254 3.37 3.582 3.765 3.945 4.033 4.194 4.355 4.574 4.703 4.826 5.012 5.198 5.367 5.53 5.692 5.88 6.055 6.219 6.401 6.572 6.728 6.883 7.042 7.181 7.319 7.466 7.589 7.696 7.815 7.925 7.965 7.938 7.831 7.602 7.231 6.545 5.313 3.002 0.091 -2.231 -4.187 -5.859 -7.339 -8.654 -9.867 -10.926 -12.003 -12.918 -13.703 -14.465 -15.187 -15.866 -16.5 -17.169 -17.755 -18.266 -18.804 -19.341 -19.791 -20.278 -20.795 -21.187 -21.573 -21.982 -22.45 -22.941 -23.259 -23.585 -24.111 -24.479 -24.849 -25.037 -25.449 -25.93 -26.416 -26.675 -27.223 -27.517 -27.828 -28.139 -28.79 -29.189 -29.649 -30.137 -30.682 -31.33 -32.258 -36.545 -9 ,2790 ,TETRA ,17664775,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:22:54 CET,0.0 0.852 1.184 1.467 1.705 1.915 2.091 2.269 2.619 2.773 2.915 2.924 3.292 3.408 3.637 3.851 4.039 4.131 4.307 4.472 4.701 4.846 4.994 5.202 5.393 5.584 5.765 5.927 6.137 6.335 6.532 6.77 6.969 7.151 7.361 7.578 7.762 7.95 8.128 8.299 8.495 8.677 8.814 8.903 8.96 8.945 8.824 8.549 7.919 6.708 4.472 1.626 -0.791 -2.867 -4.679 -6.316 -7.715 -8.957 -10.087 -11.248 -12.234 -13.071 -13.856 -14.631 -15.365 -16.015 -16.664 -17.252 -17.771 -18.3 -18.851 -19.341 -19.872 -20.408 -20.814 -21.212 -21.614 -22.054 -22.548 -22.891 -23.211 -23.704 -24.055 -24.435 -24.644 -25.079 -25.534 -26.016 -26.269 -26.803 -27.048 -27.329 -27.658 -28.407 -28.811 -29.219 -29.659 -30.235 -31.059 -32.152 -37.023 -10 ,2590 ,TETRA ,17664776,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:34:52 CET,0.0 0.526 0.899 1.177 1.395 1.609 1.828 2.02 2.348 2.49 2.614 2.604 2.962 3.072 3.271 3.467 3.646 3.728 3.899 4.062 4.285 4.417 4.539 4.72 4.881 5.029 5.18 5.32 5.497 5.671 5.837 6.037 6.211 6.361 6.523 6.703 6.875 7.027 7.166 7.298 7.405 7.498 7.594 7.673 7.704 7.658 7.483 7.093 6.394 5.195 3.04 0.381 -1.944 -3.99 -5.733 -7.263 -8.593 -9.821 -10.896 -11.968 -12.871 -13.674 -14.476 -15.228 -15.902 -16.538 -17.21 -17.807 -18.33 -18.867 -19.427 -19.897 -20.368 -20.86 -21.244 -21.645 -22.08 -22.531 -23.006 -23.342 -23.697 -24.254 -24.625 -24.999 -25.204 -25.632 -26.082 -26.578 -26.813 -27.302 -27.519 -27.791 -28.077 -28.724 -29.114 -29.571 -30.053 -30.55 -31.172 -32.037 -34.517 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt deleted file mode 100644 index b2d4db21..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15916 ,KEBNE ,17069969,Fri Dec 24 15:08:22 CET,Fri Dec 24 16:53:05 CET,0.0 0.875 1.318 1.691 1.984 2.259 2.498 2.711 3.112 3.297 3.472 3.561 3.954 4.105 4.397 4.66 4.903 5.024 5.254 5.471 5.794 5.99 6.166 6.42 6.661 6.887 7.107 7.323 7.599 7.857 8.093 8.372 8.649 8.924 9.228 9.545 9.856 10.201 10.572 10.952 11.338 11.751 12.206 12.66 13.121 13.479 13.814 14.118 14.315 14.361 14.03 13.177 12.145 11.116 10.121 9.176 8.315 7.512 6.825 6.132 5.519 4.948 4.405 3.894 3.413 2.969 2.506 2.091 1.729 1.336 0.899 0.545 0.183 -0.219 -0.537 -0.855 -1.191 -1.54 -1.896 -2.142 -2.397 -2.791 -3.073 -3.357 -3.498 -3.813 -4.167 -4.546 -4.739 -5.19 -5.38 -5.612 -5.848 -6.332 -6.604 -6.917 -7.255 -7.67 -8.203 -8.898 -10.712 -2 ,11572 ,KEBNE ,17069970,Fri Dec 24 15:08:22 CET,Fri Dec 24 16:53:12 CET,0.0 1.565 2.049 2.407 2.743 3.034 3.292 3.536 3.952 4.123 4.283 4.367 4.759 4.891 5.154 5.416 5.676 5.795 6.023 6.239 6.542 6.738 6.934 7.215 7.481 7.724 7.938 8.137 8.407 8.671 8.935 9.272 9.592 9.886 10.216 10.578 10.905 11.254 11.645 12.05 12.433 12.828 13.256 13.656 14.052 14.444 14.839 15.132 15.358 15.391 14.842 13.739 12.581 11.469 10.503 9.539 8.631 7.828 7.107 6.36 5.707 5.097 4.51 3.965 3.457 2.981 2.477 2.052 1.681 1.278 0.855 0.492 0.108 -0.29 -0.595 -0.903 -1.227 -1.58 -1.947 -2.193 -2.444 -2.835 -3.116 -3.403 -3.551 -3.873 -4.231 -4.612 -4.797 -5.243 -5.414 -5.642 -5.878 -6.382 -6.688 -7.029 -7.398 -7.83 -8.321 -8.856 -10.512 -3 ,263 ,KEBNE ,17069971,Fri Dec 24 15:10:29 CET,Fri Dec 24 16:55:07 CET,0.0 0.855 1.314 1.651 1.95 2.23 2.482 2.702 3.088 3.277 3.463 3.566 3.959 4.106 4.398 4.674 4.934 5.059 5.307 5.54 5.86 6.051 6.244 6.544 6.826 7.092 7.336 7.571 7.884 8.179 8.452 8.788 9.09 9.351 9.653 9.983 10.296 10.628 10.958 11.313 11.68 12.048 12.451 12.839 13.247 13.648 14.023 14.379 14.637 14.666 14.256 13.351 12.419 11.443 10.462 9.561 8.748 7.978 7.303 6.579 5.896 5.296 4.752 4.225 3.732 3.286 2.83 2.41 2.026 1.622 1.197 0.845 0.479 0.094 -0.206 -0.509 -0.819 -1.146 -1.491 -1.731 -1.976 -2.353 -2.619 -2.894 -3.044 -3.35 -3.666 -4.015 -4.21 -4.671 -4.839 -5.053 -5.286 -5.814 -6.107 -6.419 -6.766 -7.222 -7.769 -8.473 -10.306 -4 ,16060 ,KEBNE ,17125545,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:28:35 CET,0.0 1.08 1.527 1.878 2.164 2.418 2.646 2.859 3.247 3.428 3.593 3.658 4.049 4.202 4.499 4.776 5.035 5.155 5.376 5.598 5.924 6.119 6.307 6.579 6.828 7.067 7.304 7.533 7.825 8.103 8.372 8.701 9.008 9.298 9.626 9.973 10.282 10.613 10.974 11.349 11.728 12.137 12.585 12.99 13.403 13.814 14.205 14.516 14.712 14.632 14.153 13.128 11.976 10.877 9.884 8.95 8.078 7.287 6.6 5.881 5.228 4.636 4.054 3.509 3.028 2.585 2.101 1.664 1.293 0.906 0.482 0.108 -0.266 -0.644 -0.933 -1.23 -1.542 -1.865 -2.2 -2.433 -2.692 -3.083 -3.347 -3.64 -3.792 -4.102 -4.436 -4.794 -4.974 -5.408 -5.558 -5.765 -5.992 -6.506 -6.769 -7.045 -7.375 -7.742 -8.148 -8.733 -10.163 -5 ,25027 ,KEBNE ,17125546,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:27:43 CET,0.0 1.175 1.646 2.065 2.415 2.704 2.957 3.189 3.628 3.819 3.991 4.076 4.476 4.616 4.889 5.15 5.405 5.53 5.777 6.012 6.354 6.581 6.8 7.109 7.39 7.645 7.893 8.131 8.435 8.726 8.993 9.305 9.593 9.88 10.214 10.575 10.913 11.265 11.624 11.997 12.378 12.758 13.207 13.673 14.177 14.655 15.103 15.486 15.646 15.611 15.107 14.037 12.92 11.778 10.769 9.847 8.988 8.177 7.428 6.663 6.002 5.409 4.87 4.347 3.835 3.341 2.82 2.393 2.025 1.627 1.205 0.858 0.52 0.159 -0.147 -0.458 -0.771 -1.107 -1.477 -1.728 -1.974 -2.378 -2.663 -2.963 -3.124 -3.466 -3.819 -4.168 -4.357 -4.824 -4.99 -5.194 -5.418 -5.98 -6.279 -6.586 -6.956 -7.358 -7.793 -8.402 -10.227 -6 ,18670 ,KEBNE ,17069974,Fri Dec 24 15:13:38 CET,Fri Dec 24 17:00:12 CET,0.0 0.957 1.394 1.774 2.125 2.422 2.69 2.925 3.333 3.52 3.696 3.777 4.179 4.323 4.604 4.882 5.141 5.26 5.497 5.715 6.002 6.18 6.362 6.631 6.889 7.136 7.366 7.574 7.844 8.112 8.372 8.686 8.964 9.222 9.523 9.832 10.11 10.416 10.754 11.103 11.449 11.802 12.171 12.527 12.932 13.308 13.663 14.008 14.187 14.089 13.579 12.502 11.357 10.276 9.294 8.396 7.547 6.762 6.064 5.337 4.707 4.122 3.543 2.992 2.474 1.998 1.501 1.058 0.673 0.274 -0.148 -0.506 -0.882 -1.266 -1.562 -1.877 -2.212 -2.555 -2.91 -3.163 -3.439 -3.858 -4.128 -4.412 -4.562 -4.875 -5.211 -5.558 -5.738 -6.19 -6.359 -6.579 -6.803 -7.294 -7.561 -7.834 -8.112 -8.437 -8.813 -9.32 -10.279 -7 ,24253 ,KEBNE ,17125548,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:29:19 CET,0.0 0.855 1.234 1.543 1.835 2.101 2.351 2.583 2.999 3.197 3.392 3.481 3.873 4.009 4.294 4.558 4.8 4.913 5.125 5.333 5.639 5.838 6.032 6.304 6.549 6.784 7.02 7.243 7.52 7.775 8.023 8.325 8.612 8.887 9.2 9.526 9.808 10.117 10.468 10.829 11.187 11.569 11.985 12.336 12.726 13.166 13.657 14.078 14.359 14.519 14.176 13.218 12.181 11.12 10.139 9.195 8.292 7.469 6.766 6.052 5.427 4.866 4.321 3.778 3.257 2.788 2.304 1.876 1.501 1.106 0.683 0.313 -0.073 -0.475 -0.779 -1.085 -1.406 -1.737 -2.088 -2.342 -2.616 -3.042 -3.332 -3.629 -3.781 -4.096 -4.426 -4.772 -4.943 -5.374 -5.521 -5.734 -5.948 -6.442 -6.722 -7.011 -7.31 -7.641 -8.037 -8.555 -9.931 -8 ,28920 ,KEBNE ,17069976,Fri Dec 24 15:15:45 CET,Fri Dec 24 17:00:27 CET,0.0 1.328 1.913 2.354 2.713 3.027 3.295 3.524 3.959 4.159 4.339 4.44 4.864 5.018 5.296 5.574 5.846 5.972 6.214 6.442 6.751 6.96 7.171 7.461 7.728 7.981 8.223 8.454 8.745 9.032 9.315 9.648 9.961 10.253 10.579 10.944 11.295 11.662 12.027 12.395 12.779 13.199 13.649 14.065 14.517 14.965 15.419 15.886 16.254 16.326 15.797 14.679 13.557 12.474 11.484 10.525 9.638 8.833 8.125 7.418 6.805 6.223 5.66 5.138 4.646 4.183 3.684 3.241 2.85 2.459 2.056 1.703 1.334 0.957 0.655 0.345 0.029 -0.301 -0.669 -0.94 -1.201 -1.587 -1.848 -2.12 -2.259 -2.551 -2.857 -3.181 -3.366 -3.817 -3.982 -4.196 -4.419 -4.923 -5.191 -5.483 -5.835 -6.217 -6.649 -7.14 -8.427 -9 ,5031 ,KEBNE ,17125550,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:28:12 CET,0.0 1.304 1.771 2.135 2.475 2.774 3.025 3.251 3.667 3.861 4.038 4.106 4.512 4.673 4.982 5.274 5.542 5.671 5.932 6.178 6.497 6.693 6.887 7.175 7.455 7.707 7.949 8.193 8.5 8.791 9.056 9.36 9.66 9.955 10.291 10.644 10.972 11.32 11.682 12.069 12.457 12.88 13.357 13.782 14.219 14.643 15.053 15.425 15.745 15.935 15.616 14.756 13.775 12.727 11.766 10.864 10.021 9.225 8.558 7.908 7.309 6.741 6.202 5.701 5.208 4.751 4.268 3.82 3.437 3.045 2.642 2.311 1.954 1.574 1.297 1.024 0.723 0.393 0.044 -0.2 -0.464 -0.876 -1.151 -1.437 -1.587 -1.91 -2.244 -2.591 -2.775 -3.224 -3.384 -3.606 -3.84 -4.328 -4.595 -4.879 -5.197 -5.591 -6.08 -6.708 -8.133 -10 ,29720 ,KEBNE ,17069978,Fri Dec 24 15:16:49 CET,Fri Dec 24 17:02:36 CET,0.0 0.956 1.429 1.795 2.063 2.29 2.517 2.738 3.118 3.295 3.456 3.511 3.893 4.04 4.324 4.579 4.814 4.931 5.157 5.379 5.712 5.91 6.092 6.353 6.602 6.839 7.055 7.268 7.544 7.801 8.049 8.343 8.629 8.904 9.213 9.548 9.864 10.195 10.524 10.853 11.189 11.587 12.076 12.539 12.992 13.443 13.911 14.348 14.69 14.824 14.515 13.645 12.723 11.744 10.733 9.783 8.916 8.104 7.374 6.637 6.004 5.419 4.862 4.331 3.83 3.388 2.924 2.51 2.145 1.763 1.366 1.013 0.628 0.246 -0.029 -0.324 -0.64 -0.971 -1.333 -1.595 -1.868 -2.278 -2.558 -2.851 -3.006 -3.307 -3.633 -3.99 -4.178 -4.628 -4.804 -5.044 -5.271 -5.781 -6.079 -6.373 -6.694 -7.078 -7.522 -8.071 -9.601 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 76d5bf8d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24945 ,TETRA ,17664777,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:37:01 CET,0.0 0.87 1.309 1.635 1.911 2.15 2.391 2.628 3.032 3.219 3.403 3.478 3.881 4.021 4.295 4.558 4.816 4.938 5.164 5.378 5.696 5.899 6.094 6.379 6.638 6.874 7.11 7.34 7.624 7.896 8.149 8.433 8.718 8.996 9.298 9.624 9.934 10.275 10.629 10.994 11.357 11.746 12.187 12.588 13.012 13.398 13.77 14.106 14.344 14.411 14.025 13.076 12.026 11.005 10.075 9.182 8.308 7.476 6.756 6.004 5.353 4.778 4.21 3.668 3.157 2.677 2.162 1.707 1.313 0.908 0.476 0.097 -0.292 -0.68 -0.992 -1.335 -1.69 -2.053 -2.436 -2.707 -2.994 -3.458 -3.782 -4.105 -4.271 -4.621 -4.974 -5.344 -5.537 -5.995 -6.215 -6.472 -6.721 -7.271 -7.584 -7.907 -8.264 -8.702 -9.263 -10.026 -12.023 -2 ,24336 ,TETRA ,17664778,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:24:11 CET,0.0 1.278 1.766 2.108 2.406 2.689 2.939 3.17 3.586 3.768 3.947 4.041 4.449 4.599 4.883 5.154 5.418 5.545 5.781 6.001 6.319 6.52 6.702 6.963 7.21 7.444 7.681 7.905 8.181 8.433 8.684 8.977 9.248 9.517 9.818 10.143 10.457 10.778 11.099 11.449 11.799 12.169 12.574 12.929 13.328 13.737 14.133 14.45 14.653 14.648 14.15 13.128 12.015 10.932 9.917 8.962 8.091 7.299 6.602 5.856 5.2 4.607 4.036 3.491 2.959 2.452 1.94 1.483 1.067 0.645 0.199 -0.197 -0.608 -1.004 -1.319 -1.663 -2.022 -2.387 -2.739 -2.989 -3.261 -3.705 -4.032 -4.365 -4.539 -4.885 -5.242 -5.638 -5.854 -6.333 -6.542 -6.808 -7.086 -7.68 -8.008 -8.378 -8.768 -9.2 -9.744 -10.341 -11.524 -3 ,20849 ,TETRA ,17664779,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:24:13 CET,0.0 0.976 1.397 1.732 2.019 2.291 2.531 2.732 3.099 3.267 3.429 3.5 3.892 4.033 4.313 4.576 4.818 4.933 5.165 5.386 5.697 5.896 6.083 6.342 6.594 6.847 7.087 7.303 7.58 7.858 8.112 8.395 8.673 8.947 9.254 9.593 9.905 10.24 10.608 10.972 11.345 11.746 12.174 12.586 13.001 13.4 13.777 14.132 14.404 14.45 14.023 12.993 11.925 10.864 9.871 8.969 8.153 7.371 6.65 5.92 5.258 4.657 4.109 3.596 3.12 2.673 2.193 1.745 1.324 0.899 0.469 0.106 -0.276 -0.703 -1.033 -1.368 -1.725 -2.13 -2.552 -2.828 -3.098 -3.519 -3.827 -4.133 -4.293 -4.62 -4.954 -5.348 -5.56 -6.018 -6.215 -6.441 -6.67 -7.203 -7.502 -7.842 -8.222 -8.653 -9.188 -9.875 -12.072 -4 ,19419 ,TETRA ,17664780,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:23:25 CET,0.0 1.323 1.805 2.171 2.479 2.757 3.024 3.268 3.695 3.886 4.069 4.167 4.568 4.706 4.99 5.261 5.494 5.605 5.829 6.045 6.343 6.536 6.725 6.98 7.221 7.449 7.667 7.886 8.158 8.413 8.663 8.945 9.196 9.442 9.735 10.036 10.309 10.61 10.915 11.215 11.52 11.856 12.237 12.588 12.936 13.26 13.577 13.854 14.004 13.942 13.388 12.246 11.09 9.977 8.942 7.95 7.051 6.232 5.507 4.738 4.066 3.487 2.933 2.405 1.888 1.395 0.885 0.419 0.008 -0.41 -0.869 -1.267 -1.668 -2.074 -2.392 -2.716 -3.059 -3.428 -3.797 -4.039 -4.291 -4.713 -5.014 -5.318 -5.481 -5.824 -6.185 -6.567 -6.771 -7.228 -7.42 -7.674 -7.945 -8.511 -8.827 -9.179 -9.56 -9.987 -10.487 -11.085 -13.015 -5 ,3727 ,TETRA ,17664781,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:39:06 CET,0.0 1.009 1.452 1.795 2.107 2.371 2.616 2.842 3.238 3.422 3.592 3.643 4.042 4.193 4.481 4.753 5.01 5.132 5.359 5.576 5.904 6.113 6.308 6.589 6.84 7.067 7.293 7.517 7.788 8.037 8.289 8.591 8.872 9.132 9.435 9.771 10.074 10.387 10.699 11.023 11.355 11.698 12.06 12.422 12.822 13.202 13.545 13.852 14.059 14.035 13.54 12.458 11.377 10.316 9.302 8.347 7.472 6.631 5.883 5.144 4.504 3.914 3.342 2.803 2.277 1.787 1.27 0.825 0.46 0.054 -0.408 -0.791 -1.185 -1.6 -1.924 -2.25 -2.587 -2.973 -3.379 -3.666 -3.969 -4.416 -4.719 -5.044 -5.21 -5.554 -5.924 -6.309 -6.506 -6.971 -7.184 -7.446 -7.712 -8.263 -8.573 -8.897 -9.286 -9.75 -10.241 -10.91 -12.487 -6 ,19608 ,TETRA ,17664782,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:23:28 CET,0.0 1.1 1.559 1.919 2.205 2.454 2.684 2.881 3.254 3.439 3.619 3.706 4.106 4.246 4.517 4.767 4.991 5.109 5.349 5.581 5.913 6.121 6.319 6.61 6.884 7.133 7.374 7.602 7.885 8.154 8.41 8.71 9.001 9.274 9.573 9.9 10.202 10.52 10.85 11.184 11.526 11.897 12.323 12.751 13.244 13.717 14.183 14.646 15.01 15.171 14.774 13.731 12.599 11.489 10.478 9.498 8.565 7.703 6.948 6.167 5.493 4.898 4.306 3.728 3.204 2.722 2.193 1.717 1.316 0.903 0.468 0.111 -0.27 -0.678 -0.99 -1.32 -1.664 -2.004 -2.35 -2.608 -2.899 -3.324 -3.603 -3.916 -4.091 -4.46 -4.838 -5.242 -5.452 -5.917 -6.117 -6.362 -6.609 -7.132 -7.418 -7.743 -8.11 -8.539 -9.035 -9.728 -12.324 -7 ,7716 ,TETRA ,17664783,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:24:08 CET,0.0 1.459 1.995 2.412 2.755 3.043 3.293 3.535 3.959 4.142 4.324 4.414 4.833 4.986 5.26 5.502 5.751 5.877 6.115 6.354 6.687 6.892 7.098 7.394 7.663 7.908 8.142 8.363 8.638 8.9 9.145 9.441 9.73 9.999 10.3 10.643 10.981 11.333 11.672 12.012 12.35 12.71 13.127 13.514 13.913 14.304 14.669 15.008 15.272 15.359 15.031 14.167 13.214 12.199 11.281 10.405 9.562 8.781 8.087 7.361 6.682 6.058 5.506 4.997 4.515 4.051 3.536 3.076 2.664 2.235 1.802 1.446 1.065 0.67 0.384 0.088 -0.242 -0.604 -0.991 -1.264 -1.54 -1.987 -2.329 -2.682 -2.854 -3.207 -3.572 -3.954 -4.162 -4.634 -4.827 -5.053 -5.284 -5.795 -6.086 -6.41 -6.757 -7.136 -7.582 -8.206 -9.913 -8 ,19571 ,TETRA ,17664784,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:24:15 CET,0.0 0.926 1.355 1.696 1.984 2.241 2.462 2.668 3.045 3.22 3.396 3.473 3.885 4.046 4.324 4.575 4.821 4.936 5.159 5.369 5.653 5.834 6.006 6.249 6.488 6.712 6.931 7.148 7.426 7.691 7.947 8.255 8.535 8.802 9.095 9.416 9.719 10.027 10.355 10.687 11.024 11.402 11.841 12.244 12.703 13.156 13.541 13.872 14.106 14.161 13.744 12.78 11.698 10.577 9.532 8.596 7.744 6.96 6.254 5.477 4.775 4.15 3.543 2.969 2.452 1.978 1.476 1.023 0.627 0.213 -0.221 -0.599 -1.008 -1.447 -1.776 -2.105 -2.455 -2.811 -3.191 -3.46 -3.745 -4.197 -4.511 -4.823 -4.977 -5.317 -5.668 -6.042 -6.257 -6.743 -6.974 -7.223 -7.495 -8.085 -8.392 -8.742 -9.143 -9.594 -10.168 -10.91 -12.955 -9 ,23969 ,TETRA ,17664785,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:36:15 CET,0.0 0.789 1.207 1.549 1.834 2.072 2.296 2.515 2.916 3.1 3.276 3.377 3.778 3.925 4.2 4.461 4.707 4.824 5.052 5.267 5.578 5.78 5.978 6.265 6.541 6.812 7.069 7.307 7.607 7.898 8.183 8.505 8.802 9.082 9.379 9.707 10.028 10.376 10.75 11.138 11.498 11.858 12.26 12.648 13.111 13.574 13.959 14.245 14.472 14.529 14.07 13.174 12.164 11.066 10.043 9.07 8.18 7.354 6.598 5.812 5.15 4.552 3.967 3.424 2.896 2.38 1.837 1.349 0.919 0.477 0.014 -0.371 -0.762 -1.188 -1.542 -1.904 -2.271 -2.65 -3.037 -3.306 -3.587 -4.037 -4.356 -4.696 -4.867 -5.217 -5.583 -5.964 -6.18 -6.66 -6.848 -7.091 -7.355 -7.921 -8.243 -8.614 -9.003 -9.425 -9.971 -10.708 -12.346 -10 ,17210 ,TETRA ,17664786,Thu Dec 2 14:32:22 CET,Thu Dec 2 16:24:12 CET,0.0 0.918 1.334 1.651 1.927 2.174 2.406 2.631 3.03 3.209 3.373 3.448 3.84 3.979 4.245 4.51 4.769 4.891 5.123 5.339 5.639 5.828 6.014 6.282 6.526 6.762 6.996 7.223 7.509 7.775 8.031 8.345 8.644 8.933 9.261 9.615 9.961 10.328 10.707 11.107 11.515 11.93 12.375 12.811 13.283 13.745 14.165 14.517 14.783 14.827 14.412 13.481 12.52 11.56 10.624 9.762 8.976 8.196 7.51 6.831 6.226 5.676 5.14 4.628 4.129 3.649 3.149 2.706 2.31 1.902 1.489 1.15 0.777 0.376 0.076 -0.229 -0.567 -0.925 -1.296 -1.56 -1.828 -2.249 -2.551 -2.859 -3.016 -3.341 -3.665 -4.009 -4.192 -4.627 -4.803 -5.034 -5.28 -5.852 -6.165 -6.484 -6.825 -7.202 -7.654 -8.321 -10.245 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index b510cf19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25059 ,KEBNE ,17069979,Fri Dec 24 15:16:49 CET,Fri Dec 24 17:03:56 CET,0.0 0.641 0.919 1.135 1.336 1.511 1.678 1.842 2.123 2.242 2.354 2.331 2.664 2.761 2.926 3.093 3.253 3.331 3.476 3.593 3.751 3.855 3.96 4.112 4.24 4.357 4.476 4.586 4.72 4.828 4.916 5.029 5.14 5.245 5.356 5.46 5.536 5.576 5.58 5.555 5.5 5.399 5.205 4.969 4.655 4.193 3.439 2.3 0.671 -1.703 -5.642 -10.176 -13.695 -16.55 -18.908 -20.939 -22.693 -24.237 -25.514 -26.782 -27.848 -28.78 -29.661 -30.478 -31.243 -31.937 -32.652 -33.286 -33.833 -34.4 -34.986 -35.468 -35.955 -36.45 -36.839 -37.236 -37.639 -38.053 -38.481 -38.776 -39.076 -39.539 -39.858 -40.189 -40.355 -40.702 -41.068 -41.435 -41.623 -42.095 -42.236 -42.454 -42.697 -43.194 -43.443 -43.715 -44.025 -44.355 -44.726 -45.142 -45.902 -2 ,21177 ,KEBNE ,17125553,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:30:23 CET,0.0 0.664 0.969 1.241 1.471 1.668 1.829 1.972 2.238 2.367 2.493 2.487 2.827 2.927 3.103 3.277 3.448 3.523 3.664 3.804 3.992 4.101 4.203 4.35 4.492 4.625 4.744 4.842 4.966 5.074 5.169 5.285 5.396 5.492 5.583 5.67 5.741 5.774 5.776 5.781 5.763 5.67 5.485 5.234 4.838 4.305 3.553 2.462 0.799 -1.786 -5.843 -10.377 -13.965 -16.883 -19.255 -21.249 -22.95 -24.459 -25.731 -26.994 -28.072 -29.013 -29.904 -30.748 -31.521 -32.209 -32.909 -33.526 -34.05 -34.593 -35.156 -35.624 -36.101 -36.586 -36.959 -37.34 -37.738 -38.154 -38.585 -38.869 -39.152 -39.591 -39.899 -40.228 -40.4 -40.751 -41.103 -41.48 -41.672 -42.134 -42.257 -42.471 -42.698 -43.179 -43.446 -43.726 -44.013 -44.337 -44.714 -45.143 -45.874 -3 ,8379 ,KEBNE ,17069981,Fri Dec 24 15:19:58 CET,Fri Dec 24 17:08:33 CET,0.0 0.928 1.298 1.591 1.826 2.019 2.184 2.342 2.631 2.764 2.891 2.884 3.22 3.323 3.521 3.711 3.888 3.971 4.123 4.257 4.44 4.553 4.655 4.786 4.912 5.035 5.139 5.241 5.382 5.502 5.614 5.726 5.805 5.868 5.93 5.988 6.025 6.058 6.088 6.078 6.032 5.94 5.769 5.54 5.168 4.648 3.881 2.772 1.104 -1.338 -5.176 -9.591 -13.083 -16.0 -18.376 -20.418 -22.171 -23.711 -25.017 -26.299 -27.378 -28.33 -29.223 -30.058 -30.818 -31.512 -32.224 -32.847 -33.394 -33.957 -34.532 -34.996 -35.469 -35.962 -36.35 -36.753 -37.154 -37.557 -37.972 -38.252 -38.552 -39.019 -39.329 -39.664 -39.837 -40.184 -40.535 -40.899 -41.092 -41.564 -41.706 -41.923 -42.149 -42.632 -42.885 -43.155 -43.452 -43.781 -44.14 -44.592 -45.602 -4 ,21232 ,KEBNE ,17125555,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:29:57 CET,0.0 0.651 1.044 1.309 1.542 1.744 1.908 2.072 2.386 2.524 2.649 2.632 2.982 3.084 3.267 3.452 3.624 3.698 3.84 3.973 4.153 4.263 4.363 4.505 4.644 4.773 4.903 5.024 5.164 5.275 5.364 5.467 5.563 5.638 5.708 5.761 5.788 5.817 5.843 5.809 5.714 5.592 5.397 5.145 4.779 4.258 3.546 2.567 1.017 -1.386 -5.2 -9.614 -13.187 -16.092 -18.465 -20.484 -22.194 -23.706 -25.012 -26.319 -27.399 -28.34 -29.227 -30.053 -30.812 -31.505 -32.216 -32.843 -33.383 -33.936 -34.511 -34.983 -35.468 -35.966 -36.344 -36.73 -37.131 -37.54 -37.969 -38.268 -38.567 -39.017 -39.325 -39.644 -39.807 -40.145 -40.505 -40.893 -41.092 -41.563 -41.707 -41.929 -42.154 -42.63 -42.888 -43.152 -43.437 -43.764 -44.135 -44.591 -45.283 -5 ,18284 ,KEBNE ,17069983,Fri Dec 24 15:21:02 CET,Fri Dec 24 17:08:14 CET,0.0 0.407 0.676 0.913 1.144 1.343 1.509 1.666 1.961 2.09 2.21 2.212 2.546 2.645 2.825 2.984 3.131 3.203 3.353 3.502 3.699 3.815 3.927 4.088 4.237 4.376 4.5 4.617 4.776 4.901 4.994 5.112 5.21 5.285 5.373 5.459 5.518 5.572 5.628 5.641 5.572 5.44 5.264 5.045 4.7 4.223 3.499 2.421 0.837 -1.6 -5.573 -10.077 -13.549 -16.372 -18.711 -20.75 -22.488 -24.003 -25.299 -26.609 -27.715 -28.68 -29.588 -30.415 -31.191 -31.901 -32.631 -33.263 -33.788 -34.332 -34.904 -35.37 -35.837 -36.319 -36.698 -37.09 -37.493 -37.902 -38.322 -38.606 -38.9 -39.368 -39.693 -40.036 -40.212 -40.56 -40.914 -41.284 -41.471 -41.937 -42.084 -42.305 -42.53 -42.985 -43.24 -43.527 -43.834 -44.192 -44.618 -45.139 -46.181 -6 ,19841 ,KEBNE ,17069984,Fri Dec 24 15:21:02 CET,Fri Dec 24 17:08:45 CET,0.0 0.78 1.133 1.396 1.622 1.82 2.004 2.177 2.471 2.604 2.726 2.725 3.07 3.177 3.373 3.545 3.71 3.784 3.911 4.026 4.186 4.287 4.386 4.523 4.644 4.758 4.869 4.967 5.089 5.208 5.31 5.432 5.561 5.672 5.77 5.851 5.898 5.937 5.952 5.924 5.864 5.75 5.543 5.282 4.919 4.407 3.658 2.563 1.054 -1.14 -4.977 -9.551 -13.047 -15.872 -18.243 -20.287 -22.047 -23.629 -24.959 -26.255 -27.346 -28.308 -29.217 -30.057 -30.829 -31.531 -32.257 -32.882 -33.405 -33.954 -34.523 -34.984 -35.465 -35.974 -36.377 -36.777 -37.176 -37.598 -38.028 -38.317 -38.621 -39.098 -39.417 -39.752 -39.925 -40.284 -40.656 -41.037 -41.235 -41.711 -41.862 -42.085 -42.314 -42.797 -43.054 -43.327 -43.639 -44.003 -44.445 -44.984 -45.751 -7 ,3164 ,KEBNE ,17125558,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:30:30 CET,0.0 0.672 1.009 1.278 1.51 1.707 1.876 2.023 2.293 2.425 2.553 2.554 2.893 2.995 3.18 3.351 3.505 3.58 3.74 3.895 4.093 4.206 4.308 4.451 4.591 4.721 4.846 4.962 5.092 5.204 5.304 5.404 5.484 5.568 5.664 5.758 5.83 5.891 5.932 5.932 5.908 5.844 5.692 5.466 5.103 4.594 3.84 2.762 1.23 -1.13 -5.089 -9.628 -13.15 -16.047 -18.479 -20.573 -22.345 -23.902 -25.222 -26.505 -27.562 -28.483 -29.354 -30.179 -30.933 -31.609 -32.309 -32.921 -33.455 -34.011 -34.583 -35.053 -35.533 -36.022 -36.395 -36.772 -37.157 -37.557 -37.983 -38.282 -38.582 -39.045 -39.365 -39.698 -39.87 -40.217 -40.564 -40.936 -41.132 -41.605 -41.77 -41.998 -42.229 -42.757 -43.044 -43.333 -43.65 -43.992 -44.372 -44.858 -45.617 -8 ,6444 ,KEBNE ,17069986,Fri Dec 24 15:22:07 CET,Fri Dec 24 17:10:02 CET,0.0 0.756 1.127 1.408 1.645 1.865 2.063 2.235 2.534 2.676 2.808 2.788 3.124 3.224 3.404 3.578 3.731 3.8 3.937 4.055 4.212 4.311 4.401 4.528 4.651 4.765 4.872 4.975 5.101 5.202 5.289 5.388 5.466 5.526 5.571 5.6 5.631 5.65 5.628 5.577 5.503 5.396 5.228 4.965 4.544 3.984 3.22 2.206 0.7 -1.698 -5.645 -10.19 -13.773 -16.659 -19.04 -21.096 -22.831 -24.346 -25.617 -26.863 -27.927 -28.877 -29.77 -30.585 -31.337 -32.017 -32.723 -33.371 -33.918 -34.468 -35.035 -35.487 -35.962 -36.46 -36.84 -37.232 -37.64 -38.06 -38.481 -38.768 -39.062 -39.525 -39.849 -40.183 -40.353 -40.704 -41.079 -41.469 -41.664 -42.138 -42.298 -42.524 -42.758 -43.289 -43.563 -43.833 -44.139 -44.486 -44.9 -45.403 -46.182 -9 ,478 ,KEBNE ,17069987,Fri Dec 24 15:22:08 CET,Fri Dec 24 17:11:25 CET,0.0 0.613 0.94 1.181 1.381 1.558 1.726 1.881 2.144 2.264 2.379 2.366 2.705 2.803 2.985 3.155 3.32 3.397 3.536 3.659 3.833 3.953 4.07 4.225 4.366 4.497 4.613 4.716 4.85 4.97 5.076 5.199 5.312 5.414 5.51 5.604 5.683 5.728 5.736 5.75 5.757 5.722 5.598 5.374 5.053 4.669 4.046 3.042 1.54 -0.684 -4.419 -8.913 -12.504 -15.468 -17.949 -20.071 -21.846 -23.412 -24.733 -26.018 -27.099 -28.061 -28.977 -29.832 -30.616 -31.324 -32.038 -32.66 -33.206 -33.776 -34.348 -34.806 -35.286 -35.788 -36.179 -36.58 -36.989 -37.409 -37.837 -38.123 -38.417 -38.899 -39.233 -39.551 -39.711 -40.039 -40.387 -40.768 -40.967 -41.452 -41.615 -41.839 -42.063 -42.564 -42.84 -43.126 -43.412 -43.72 -44.081 -44.515 -45.277 -10 ,11834 ,KEBNE ,17125561,Thu Dec 30 16:40:31 CET,Thu Dec 30 18:29:39 CET,0.0 0.653 0.981 1.254 1.481 1.665 1.831 1.987 2.269 2.386 2.506 2.51 2.847 2.948 3.146 3.321 3.478 3.555 3.711 3.861 4.055 4.168 4.276 4.424 4.555 4.679 4.801 4.912 5.037 5.151 5.257 5.365 5.477 5.586 5.684 5.764 5.816 5.856 5.872 5.872 5.842 5.768 5.641 5.433 5.09 4.571 3.823 2.733 1.044 -1.461 -5.428 -9.917 -13.447 -16.342 -18.764 -20.827 -22.564 -24.11 -25.404 -26.669 -27.754 -28.711 -29.61 -30.427 -31.178 -31.862 -32.557 -33.179 -33.713 -34.263 -34.844 -35.315 -35.779 -36.251 -36.612 -36.992 -37.392 -37.8 -38.219 -38.51 -38.812 -39.283 -39.605 -39.936 -40.104 -40.443 -40.811 -41.21 -41.41 -41.885 -42.043 -42.267 -42.494 -42.986 -43.262 -43.543 -43.826 -44.161 -44.545 -44.988 -45.757 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 224743e2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26954 ,TETRA ,17664787,Thu Dec 2 14:32:21 CET,Thu Dec 2 16:26:49 CET,0.0 1.201 1.687 2.074 2.387 2.679 2.923 3.122 3.484 3.646 3.81 3.898 4.268 4.403 4.676 4.918 5.146 5.259 5.466 5.66 5.92 6.073 6.218 6.426 6.638 6.842 7.021 7.182 7.391 7.592 7.777 7.981 8.163 8.349 8.541 8.707 8.849 9.026 9.217 9.387 9.527 9.606 9.664 9.644 9.519 9.326 8.959 8.364 7.366 5.723 2.94 -0.416 -3.207 -5.578 -7.542 -9.269 -10.709 -11.993 -13.103 -14.183 -15.099 -15.916 -16.696 -17.418 -18.08 -18.677 -19.289 -19.826 -20.291 -20.765 -21.254 -21.661 -22.081 -22.522 -22.863 -23.206 -23.558 -23.922 -24.298 -24.559 -24.834 -25.265 -25.57 -25.881 -26.032 -26.33 -26.636 -26.979 -27.167 -27.62 -27.72 -27.909 -28.107 -28.561 -28.816 -29.081 -29.37 -29.703 -30.084 -30.536 -31.273 -2 ,2883 ,TETRA ,17664788,Thu Dec 2 14:32:21 CET,Thu Dec 2 16:27:09 CET,0.0 1.211 1.674 2.055 2.36 2.622 2.893 3.131 3.514 3.686 3.852 3.926 4.303 4.441 4.695 4.928 5.151 5.262 5.476 5.672 5.934 6.097 6.269 6.518 6.74 6.942 7.119 7.289 7.514 7.724 7.908 8.119 8.31 8.463 8.636 8.831 8.989 9.131 9.255 9.352 9.449 9.51 9.528 9.506 9.409 9.208 8.838 8.271 7.31 5.719 2.825 -0.787 -3.714 -6.135 -8.12 -9.877 -11.385 -12.7 -13.81 -14.905 -15.845 -16.656 -17.408 -18.126 -18.807 -19.424 -20.049 -20.611 -21.09 -21.584 -22.097 -22.508 -22.931 -23.372 -23.713 -24.071 -24.444 -24.82 -25.203 -25.464 -25.727 -26.149 -26.448 -26.749 -26.901 -27.206 -27.534 -27.881 -28.056 -28.498 -28.608 -28.809 -29.019 -29.49 -29.735 -29.977 -30.247 -30.537 -30.882 -31.327 -32.009 -3 ,15121 ,TETRA ,17664789,Thu Dec 2 14:32:21 CET,Thu Dec 2 16:42:43 CET,0.0 1.125 1.598 1.946 2.249 2.52 2.76 2.982 3.371 3.552 3.717 3.781 4.149 4.291 4.568 4.806 5.024 5.127 5.323 5.509 5.767 5.927 6.087 6.302 6.487 6.662 6.831 7.0 7.21 7.4 7.567 7.752 7.906 8.053 8.227 8.406 8.563 8.696 8.825 8.941 9.001 9.029 9.028 8.998 8.911 8.689 8.289 7.625 6.532 4.794 1.85 -1.692 -4.561 -6.942 -8.942 -10.72 -12.245 -13.578 -14.71 -15.822 -16.757 -17.577 -18.356 -19.088 -19.754 -20.354 -20.968 -21.516 -21.995 -22.48 -22.979 -23.394 -23.835 -24.285 -24.62 -24.968 -25.323 -25.684 -26.058 -26.322 -26.592 -27.009 -27.29 -27.581 -27.731 -28.03 -28.347 -28.684 -28.861 -29.311 -29.443 -29.635 -29.845 -30.332 -30.598 -30.868 -31.179 -31.515 -31.889 -32.359 -33.166 -4 ,7554 ,TETRA ,17664790,Thu Dec 2 14:32:21 CET,Thu Dec 2 16:41:17 CET,0.0 1.356 1.866 2.222 2.505 2.758 2.983 3.192 3.603 3.784 3.955 4.059 4.44 4.579 4.841 5.098 5.348 5.468 5.683 5.873 6.143 6.305 6.456 6.674 6.874 7.063 7.238 7.386 7.548 7.71 7.885 8.086 8.27 8.44 8.604 8.76 8.93 9.106 9.25 9.374 9.452 9.53 9.604 9.572 9.429 9.2 8.88 8.31 7.26 5.557 2.661 -0.887 -3.802 -6.131 -8.124 -9.918 -11.421 -12.741 -13.864 -14.963 -15.885 -16.7 -17.473 -18.205 -18.872 -19.461 -20.075 -20.615 -21.084 -21.579 -22.087 -22.5 -22.935 -23.377 -23.702 -24.046 -24.414 -24.78 -25.158 -25.427 -25.703 -26.125 -26.408 -26.708 -26.862 -27.189 -27.534 -27.886 -28.072 -28.523 -28.653 -28.851 -29.043 -29.472 -29.703 -29.935 -30.197 -30.513 -30.878 -31.28 -31.792 -5 ,6249 ,TETRA ,17664791,Thu Dec 2 14:32:21 CET,Thu Dec 2 16:42:02 CET,0.0 1.679 2.155 2.526 2.826 3.075 3.285 3.481 3.832 3.991 4.139 4.188 4.563 4.705 4.968 5.224 5.454 5.554 5.75 5.941 6.196 6.348 6.503 6.712 6.9 7.083 7.247 7.396 7.599 7.8 7.976 8.171 8.372 8.553 8.742 8.937 9.107 9.281 9.43 9.558 9.666 9.746 9.79 9.773 9.669 9.451 9.076 8.432 7.363 5.683 2.759 -0.768 -3.684 -6.111 -8.074 -9.77 -11.209 -12.496 -13.608 -14.714 -15.646 -16.448 -17.221 -17.951 -18.609 -19.201 -19.818 -20.356 -20.819 -21.303 -21.8 -22.211 -22.632 -23.06 -23.393 -23.733 -24.075 -24.439 -24.819 -25.075 -25.342 -25.756 -26.044 -26.342 -26.494 -26.802 -27.124 -27.471 -27.653 -28.091 -28.201 -28.393 -28.594 -29.024 -29.265 -29.516 -29.795 -30.119 -30.484 -30.897 -31.772 -6 ,2003 ,TETRA ,17664792,Thu Dec 2 14:32:21 CET,Thu Dec 2 16:46:19 CET,0.0 1.145 1.714 2.106 2.379 2.636 2.859 3.059 3.472 3.659 3.825 3.91 4.267 4.401 4.661 4.904 5.133 5.244 5.468 5.676 5.955 6.13 6.295 6.524 6.723 6.903 7.095 7.295 7.534 7.74 7.918 8.117 8.287 8.434 8.607 8.797 8.936 9.069 9.193 9.293 9.37 9.435 9.484 9.462 9.341 9.084 8.639 8.025 7.126 5.536 2.59 -0.973 -3.811 -6.19 -8.194 -9.925 -11.409 -12.716 -13.823 -14.924 -15.869 -16.697 -17.482 -18.207 -18.875 -19.492 -20.115 -20.673 -21.165 -21.649 -22.137 -22.542 -22.96 -23.399 -23.746 -24.099 -24.458 -24.82 -25.185 -25.434 -25.692 -26.099 -26.386 -26.68 -26.827 -27.13 -27.455 -27.797 -27.969 -28.403 -28.508 -28.704 -28.9 -29.3 -29.528 -29.783 -30.057 -30.352 -30.669 -31.033 -31.65 -7 ,29420 ,TETRA ,17664793,Thu Dec 2 14:32:21 CET,Thu Dec 2 16:26:23 CET,0.0 1.261 1.782 2.136 2.442 2.712 2.939 3.161 3.58 3.775 3.961 4.074 4.462 4.605 4.88 5.128 5.34 5.446 5.649 5.833 6.106 6.292 6.477 6.704 6.904 7.103 7.285 7.459 7.703 7.941 8.147 8.375 8.591 8.768 8.948 9.137 9.313 9.475 9.604 9.732 9.855 9.971 10.05 10.063 10.043 9.905 9.519 8.931 7.988 6.287 3.24 -0.375 -3.248 -5.632 -7.626 -9.347 -10.804 -12.12 -13.244 -14.337 -15.273 -16.107 -16.903 -17.643 -18.305 -18.9 -19.514 -20.052 -20.522 -21.014 -21.528 -21.938 -22.349 -22.783 -23.125 -23.482 -23.839 -24.2 -24.579 -24.836 -25.099 -25.51 -25.798 -26.097 -26.251 -26.572 -26.9 -27.236 -27.412 -27.86 -27.999 -28.215 -28.433 -28.88 -29.1 -29.327 -29.582 -29.863 -30.185 -30.582 -31.28 -8 ,18235 ,TETRA ,17664794,Thu Dec 2 14:32:21 CET,Thu Dec 2 16:39:21 CET,0.0 1.061 1.569 1.949 2.259 2.517 2.747 2.971 3.375 3.552 3.721 3.801 4.172 4.302 4.55 4.773 4.982 5.081 5.276 5.461 5.696 5.848 6.001 6.214 6.427 6.646 6.861 7.07 7.316 7.523 7.718 7.933 8.131 8.304 8.47 8.665 8.853 9.029 9.164 9.272 9.362 9.45 9.516 9.484 9.365 9.131 8.741 8.118 7.032 5.326 2.491 -0.953 -3.762 -6.142 -8.114 -9.817 -11.299 -12.625 -13.735 -14.805 -15.72 -16.527 -17.281 -17.998 -18.673 -19.268 -19.877 -20.413 -20.867 -21.341 -21.84 -22.25 -22.664 -23.094 -23.431 -23.773 -24.127 -24.49 -24.868 -25.132 -25.403 -25.817 -26.108 -26.418 -26.573 -26.885 -27.214 -27.564 -27.739 -28.178 -28.298 -28.498 -28.707 -29.182 -29.437 -29.694 -29.967 -30.264 -30.619 -31.053 -31.908 -9 ,13730 ,TETRA ,17664795,Thu Dec 2 14:32:21 CET,Thu Dec 2 16:27:06 CET,0.0 0.818 1.252 1.578 1.882 2.152 2.387 2.611 3.016 3.194 3.358 3.422 3.805 3.937 4.206 4.471 4.701 4.801 5.0 5.201 5.482 5.655 5.82 6.049 6.266 6.467 6.637 6.813 7.036 7.229 7.416 7.635 7.835 8.01 8.193 8.395 8.584 8.762 8.911 9.058 9.188 9.298 9.363 9.345 9.22 8.977 8.566 7.944 7.047 5.481 2.585 -1.049 -3.945 -6.287 -8.262 -10.004 -11.512 -12.856 -13.989 -15.078 -16.002 -16.826 -17.605 -18.334 -19.001 -19.596 -20.209 -20.752 -21.223 -21.713 -22.211 -22.62 -23.057 -23.52 -23.874 -24.226 -24.587 -24.953 -25.322 -25.578 -25.838 -26.249 -26.544 -26.84 -26.995 -27.319 -27.655 -27.991 -28.157 -28.6 -28.695 -28.89 -29.118 -29.594 -29.841 -30.1 -30.373 -30.68 -31.019 -31.413 -32.038 -10 ,21663 ,TETRA ,17664796,Thu Dec 2 14:38:08 CET,Thu Dec 2 16:36:36 CET,0.0 0.983 1.445 1.796 2.101 2.357 2.593 2.831 3.271 3.458 3.628 3.711 4.071 4.194 4.436 4.668 4.884 4.987 5.188 5.379 5.655 5.818 5.961 6.182 6.401 6.599 6.782 6.959 7.18 7.378 7.551 7.737 7.911 8.09 8.275 8.449 8.609 8.758 8.898 9.032 9.163 9.276 9.352 9.359 9.261 9.08 8.714 8.101 7.112 5.482 2.72 -0.708 -3.538 -5.872 -7.853 -9.61 -11.117 -12.453 -13.609 -14.76 -15.726 -16.562 -17.336 -18.053 -18.714 -19.309 -19.924 -20.473 -20.941 -21.411 -21.895 -22.3 -22.728 -23.18 -23.526 -23.87 -24.232 -24.62 -25.02 -25.29 -25.559 -25.97 -26.257 -26.555 -26.707 -27.03 -27.366 -27.712 -27.9 -28.358 -28.477 -28.681 -28.887 -29.32 -29.561 -29.817 -30.094 -30.415 -30.772 -31.234 -32.519 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index c03b6acb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11132 ,TETRA ,17664797,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:43:27 CET,0.0 0.846 1.226 1.532 1.829 2.089 2.319 2.536 2.962 3.165 3.356 3.423 3.899 4.071 4.404 4.712 5.015 5.165 5.451 5.727 6.124 6.371 6.601 6.947 7.295 7.632 7.956 8.257 8.648 9.031 9.406 9.856 10.291 10.712 11.202 11.749 12.265 12.843 13.468 14.132 14.83 15.61 16.533 17.467 18.539 19.739 21.117 22.647 24.424 26.531 29.145 31.205 32.315 32.966 33.287 33.4 33.402 33.34 33.236 33.07 32.912 32.771 32.595 32.37 32.139 31.938 31.727 31.512 31.318 31.107 30.849 30.631 30.416 30.184 29.985 29.77 29.552 29.324 29.081 28.899 28.704 28.403 28.192 27.982 27.866 27.618 27.347 27.039 26.887 26.458 26.402 26.213 26.004 25.57 25.319 25.033 24.721 24.374 23.963 23.438 21.468 -2 ,9826 ,TETRA ,17664798,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:25:45 CET,0.0 0.685 1.08 1.419 1.718 1.977 2.233 2.473 2.921 3.13 3.328 3.416 3.903 4.071 4.374 4.673 4.974 5.121 5.401 5.672 6.055 6.299 6.543 6.902 7.247 7.578 7.897 8.198 8.595 8.982 9.345 9.785 10.216 10.633 11.112 11.662 12.189 12.762 13.393 14.046 14.713 15.483 16.395 17.32 18.388 19.557 20.896 22.43 24.251 26.411 29.023 31.119 32.28 32.942 33.293 33.455 33.513 33.492 33.401 33.248 33.101 32.94 32.738 32.529 32.327 32.131 31.909 31.69 31.49 31.279 31.052 30.846 30.603 30.333 30.116 29.886 29.651 29.407 29.149 28.972 28.802 28.54 28.34 28.133 28.024 27.773 27.496 27.197 27.041 26.604 26.518 26.324 26.104 25.623 25.336 25.01 24.677 24.295 23.841 23.223 21.193 -3 ,8947 ,TETRA ,17664799,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:25:52 CET,0.0 0.942 1.46 1.821 2.135 2.455 2.72 2.953 3.4 3.606 3.802 3.869 4.347 4.517 4.855 5.177 5.47 5.61 5.888 6.159 6.56 6.818 7.063 7.423 7.768 8.105 8.432 8.748 9.162 9.56 9.949 10.412 10.851 11.269 11.748 12.308 12.842 13.414 14.039 14.701 15.394 16.195 17.125 18.059 19.141 20.32 21.659 23.19 25.034 27.234 29.843 31.901 33.036 33.693 34.031 34.166 34.172 34.136 34.053 33.872 33.694 33.503 33.271 33.022 32.779 32.561 32.322 32.106 31.91 31.692 31.452 31.239 30.999 30.726 30.515 30.306 30.082 29.834 29.587 29.422 29.248 28.946 28.724 28.503 28.384 28.126 27.857 27.575 27.43 27.006 26.936 26.74 26.541 26.137 25.929 25.664 25.33 24.965 24.526 23.882 22.321 -4 ,280 ,TETRA ,17664800,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:41:13 CET,0.0 1.395 1.924 2.347 2.692 2.982 3.246 3.501 3.946 4.15 4.353 4.418 4.901 5.079 5.415 5.72 6.011 6.154 6.431 6.699 7.091 7.343 7.593 7.965 8.318 8.652 8.981 9.295 9.682 10.064 10.443 10.895 11.333 11.757 12.247 12.803 13.337 13.927 14.562 15.235 15.946 16.736 17.649 18.574 19.656 20.871 22.276 23.871 25.735 27.943 30.642 32.817 33.951 34.573 34.907 35.031 35.051 35.034 34.98 34.829 34.656 34.504 34.312 34.106 33.91 33.71 33.484 33.281 33.095 32.881 32.67 32.483 32.258 32.02 31.849 31.679 31.491 31.272 31.008 30.827 30.639 30.337 30.14 29.941 29.833 29.609 29.367 29.069 28.91 28.483 28.408 28.22 28.006 27.526 27.278 26.991 26.659 26.272 25.776 25.049 22.879 -5 ,13650 ,TETRA ,17664801,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:26:07 CET,0.0 0.838 1.27 1.652 1.986 2.265 2.516 2.757 3.206 3.424 3.631 3.712 4.203 4.375 4.715 5.03 5.324 5.471 5.756 6.029 6.421 6.674 6.916 7.281 7.643 7.984 8.303 8.606 9.014 9.403 9.764 10.208 10.63 11.04 11.536 12.094 12.623 13.197 13.812 14.467 15.146 15.901 16.791 17.692 18.745 19.937 21.324 22.865 24.705 26.931 29.62 31.738 32.903 33.588 33.942 34.11 34.16 34.144 34.083 33.934 33.763 33.605 33.437 33.237 33.049 32.88 32.666 32.434 32.23 32.023 31.784 31.582 31.364 31.117 30.934 30.745 30.521 30.271 30.0 29.806 29.604 29.306 29.106 28.87 28.741 28.466 28.167 27.875 27.713 27.251 27.159 26.965 26.741 26.248 25.984 25.663 25.325 24.976 24.539 23.972 21.813 -6 ,13334 ,TETRA ,17664802,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:25:42 CET,0.0 0.885 1.295 1.636 1.932 2.199 2.456 2.693 3.108 3.321 3.533 3.606 4.09 4.265 4.589 4.895 5.199 5.346 5.627 5.895 6.276 6.519 6.764 7.126 7.466 7.798 8.123 8.437 8.845 9.229 9.589 10.037 10.481 10.896 11.366 11.9 12.417 12.979 13.595 14.256 14.943 15.714 16.606 17.497 18.563 19.752 21.103 22.666 24.53 26.69 29.212 31.232 32.423 33.13 33.507 33.666 33.688 33.667 33.57 33.384 33.19 32.994 32.8 32.615 32.414 32.194 31.955 31.736 31.552 31.366 31.15 30.964 30.765 30.548 30.366 30.173 29.968 29.731 29.47 29.277 29.085 28.81 28.615 28.408 28.306 28.088 27.825 27.547 27.406 26.985 26.912 26.736 26.541 26.099 25.853 25.581 25.267 24.892 24.444 23.846 21.814 -7 ,27326 ,TETRA ,17664803,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:24:34 CET,0.0 0.897 1.315 1.653 1.974 2.273 2.542 2.782 3.207 3.412 3.619 3.705 4.193 4.364 4.677 4.972 5.268 5.411 5.696 5.975 6.363 6.608 6.854 7.217 7.562 7.894 8.219 8.53 8.929 9.31 9.669 10.11 10.551 10.976 11.459 12.007 12.531 13.099 13.718 14.375 15.058 15.831 16.744 17.662 18.698 19.856 21.234 22.822 24.699 26.887 29.564 31.766 33.021 33.751 34.139 34.343 34.406 34.353 34.244 34.085 33.909 33.741 33.564 33.36 33.151 32.96 32.763 32.559 32.353 32.119 31.858 31.636 31.395 31.118 30.893 30.675 30.453 30.214 29.96 29.781 29.597 29.3 29.085 28.847 28.724 28.476 28.201 27.887 27.724 27.294 27.201 26.993 26.779 26.339 26.104 25.834 25.519 25.162 24.747 24.129 22.449 -8 ,7997 ,TETRA ,17664804,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:43:36 CET,0.0 0.832 1.226 1.559 1.866 2.152 2.413 2.642 3.067 3.283 3.494 3.565 4.048 4.221 4.54 4.839 5.128 5.269 5.536 5.797 6.173 6.417 6.662 7.022 7.358 7.679 7.996 8.302 8.701 9.086 9.472 9.928 10.354 10.777 11.282 11.853 12.4 13.0 13.647 14.321 15.026 15.831 16.761 17.694 18.783 20.009 21.409 22.98 24.83 27.018 29.708 31.9 33.058 33.682 34.046 34.192 34.203 34.177 34.103 33.937 33.742 33.551 33.33 33.098 32.877 32.651 32.418 32.196 31.981 31.766 31.537 31.331 31.108 30.869 30.674 30.469 30.252 30.014 29.769 29.602 29.428 29.16 28.967 28.749 28.628 28.393 28.158 27.913 27.78 27.346 27.276 27.091 26.889 26.463 26.237 25.984 25.695 25.346 24.955 24.43 23.198 -9 ,13392 ,TETRA ,17664805,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:52:18 CET,0.0 1.057 1.529 1.887 2.218 2.497 2.754 2.999 3.424 3.618 3.81 3.881 4.357 4.523 4.846 5.148 5.43 5.566 5.836 6.094 6.46 6.697 6.933 7.278 7.611 7.941 8.267 8.579 8.977 9.368 9.743 10.185 10.615 11.037 11.533 12.089 12.6 13.16 13.78 14.44 15.148 15.948 16.867 17.779 18.864 20.064 21.438 22.995 24.812 26.98 29.587 31.669 32.833 33.538 33.912 34.074 34.118 34.097 34.029 33.903 33.742 33.567 33.391 33.212 33.018 32.826 32.607 32.393 32.205 32.014 31.813 31.639 31.438 31.209 31.016 30.815 30.607 30.394 30.156 29.972 29.775 29.477 29.271 29.038 28.917 28.655 28.358 28.055 27.904 27.475 27.407 27.227 27.02 26.523 26.273 26.011 25.714 25.377 24.949 24.384 21.364 -10 ,6582 ,TETRA ,17664806,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:42:40 CET,0.0 1.115 1.577 1.927 2.218 2.47 2.704 2.925 3.348 3.561 3.762 3.816 4.296 4.477 4.805 5.111 5.411 5.557 5.836 6.108 6.508 6.762 7.007 7.362 7.71 8.045 8.363 8.667 9.052 9.425 9.795 10.249 10.694 11.118 11.603 12.158 12.699 13.286 13.902 14.554 15.252 16.034 16.933 17.831 18.88 20.058 21.456 23.058 24.92 27.073 29.634 31.659 32.789 33.465 33.838 34.01 34.031 33.971 33.891 33.764 33.614 33.462 33.282 33.098 32.913 32.714 32.447 32.183 31.97 31.747 31.487 31.261 31.049 30.822 30.632 30.423 30.196 29.949 29.684 29.5 29.298 28.986 28.766 28.536 28.419 28.156 27.868 27.577 27.417 26.956 26.83 26.611 26.373 25.878 25.609 25.317 24.987 24.561 24.059 23.465 21.49 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 15b1cb43..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9794 ,TETRA ,17664807,Thu Dec 2 14:35:13 CET,Thu Dec 2 16:27:09 CET,0.0 0.718 1.135 1.518 1.857 2.153 2.445 2.706 3.189 3.425 3.641 3.741 4.224 4.4 4.745 5.095 5.439 5.599 5.899 6.193 6.621 6.897 7.161 7.544 7.916 8.28 8.631 8.975 9.432 9.867 10.299 10.829 11.328 11.808 12.369 13.013 13.628 14.303 15.041 15.824 16.654 17.612 18.731 19.849 21.169 22.624 24.306 26.285 28.699 31.656 35.33 38.455 40.359 41.589 42.371 42.86 43.157 43.313 43.386 43.404 43.384 43.346 43.265 43.16 43.043 42.909 42.747 42.594 42.453 42.303 42.14 41.987 41.815 41.619 41.453 41.284 41.106 40.911 40.703 40.559 40.402 40.151 39.982 39.804 39.707 39.484 39.262 39.037 38.907 38.504 38.478 38.325 38.174 37.818 37.592 37.355 37.122 36.885 36.568 36.121 35.256 -2 ,17668 ,TETRA ,17664808,Thu Dec 2 14:35:13 CET,Thu Dec 2 16:25:49 CET,0.0 0.668 1.077 1.433 1.787 2.108 2.384 2.646 3.106 3.315 3.522 3.638 4.144 4.332 4.682 5.027 5.372 5.537 5.851 6.155 6.589 6.868 7.141 7.543 7.929 8.295 8.657 9.009 9.457 9.883 10.291 10.796 11.297 11.776 12.329 12.947 13.545 14.209 14.92 15.681 16.484 17.402 18.484 19.579 20.872 22.335 24.062 26.035 28.385 31.251 34.815 37.854 39.648 40.785 41.537 42.048 42.392 42.611 42.712 42.745 42.736 42.714 42.671 42.591 42.495 42.372 42.22 42.088 41.97 41.833 41.67 41.528 41.367 41.186 41.05 40.907 40.742 40.554 40.359 40.22 40.074 39.841 39.658 39.471 39.381 39.185 38.969 38.751 38.64 38.251 38.232 38.079 37.906 37.542 37.356 37.137 36.881 36.592 36.251 35.767 34.444 -3 ,29588 ,TETRA ,17664809,Thu Dec 2 14:35:13 CET,Thu Dec 2 16:25:45 CET,0.0 0.895 1.4 1.8 2.131 2.442 2.726 2.984 3.461 3.679 3.883 3.987 4.488 4.679 5.05 5.394 5.713 5.87 6.177 6.471 6.909 7.192 7.465 7.855 8.231 8.604 8.968 9.317 9.755 10.178 10.597 11.121 11.637 12.129 12.693 13.326 13.937 14.61 15.353 16.146 16.979 17.925 19.023 20.128 21.425 22.875 24.558 26.497 28.833 31.709 35.32 38.379 40.234 41.425 42.174 42.679 43.011 43.238 43.383 43.46 43.476 43.442 43.38 43.309 43.211 43.101 42.965 42.82 42.683 42.536 42.377 42.235 42.084 41.912 41.774 41.615 41.435 41.257 41.072 40.941 40.792 40.552 40.381 40.189 40.088 39.892 39.683 39.457 39.34 38.951 38.935 38.784 38.624 38.277 38.085 37.859 37.609 37.314 36.968 36.55 35.356 -4 ,26589 ,TETRA ,17664810,Thu Dec 2 14:35:13 CET,Thu Dec 2 16:46:08 CET,0.0 0.564 0.964 1.311 1.608 1.89 2.16 2.412 2.874 3.079 3.281 3.382 3.881 4.075 4.429 4.761 5.086 5.251 5.578 5.886 6.32 6.602 6.871 7.257 7.644 8.019 8.372 8.713 9.163 9.594 10.006 10.52 11.016 11.491 12.055 12.692 13.305 13.986 14.742 15.548 16.377 17.299 18.373 19.469 20.783 22.265 23.991 25.992 28.382 31.278 34.923 38.013 39.848 41.043 41.844 42.351 42.666 42.902 43.047 43.135 43.172 43.155 43.101 43.03 42.932 42.822 42.698 42.593 42.485 42.344 42.168 42.003 41.841 41.668 41.526 41.374 41.209 41.028 40.829 40.684 40.534 40.304 40.134 39.953 39.861 39.668 39.447 39.205 39.078 38.694 38.66 38.501 38.34 37.979 37.759 37.524 37.263 36.947 36.568 36.105 34.847 -5 ,12228 ,TETRA ,17664811,Thu Dec 2 14:35:13 CET,Thu Dec 2 16:25:54 CET,0.0 0.723 1.122 1.487 1.819 2.119 2.42 2.701 3.176 3.398 3.614 3.724 4.226 4.418 4.781 5.118 5.441 5.605 5.921 6.219 6.657 6.937 7.207 7.596 7.978 8.347 8.702 9.057 9.512 9.962 10.398 10.919 11.433 11.924 12.49 13.134 13.769 14.471 15.223 16.025 16.856 17.784 18.894 20.02 21.346 22.866 24.631 26.622 28.986 31.864 35.468 38.532 40.367 41.558 42.33 42.831 43.133 43.314 43.398 43.414 43.364 43.281 43.196 43.099 42.993 42.883 42.754 42.633 42.517 42.38 42.243 42.109 41.934 41.753 41.601 41.426 41.25 41.073 40.893 40.762 40.606 40.362 40.201 40.024 39.929 39.729 39.512 39.273 39.143 38.751 38.714 38.548 38.366 37.945 37.723 37.491 37.222 36.918 36.592 36.165 34.725 -6 ,659 ,TETRA ,17664812,Thu Dec 2 14:35:13 CET,Thu Dec 2 16:25:52 CET,0.0 0.979 1.486 1.869 2.199 2.504 2.771 3.019 3.507 3.741 3.965 4.074 4.574 4.762 5.14 5.506 5.836 5.993 6.307 6.61 7.06 7.35 7.628 8.032 8.425 8.809 9.184 9.552 10.021 10.476 10.909 11.417 11.914 12.414 12.986 13.627 14.247 14.92 15.644 16.426 17.257 18.184 19.284 20.41 21.717 23.199 24.945 26.942 29.306 32.096 35.602 38.688 40.572 41.711 42.441 42.966 43.285 43.479 43.583 43.608 43.57 43.501 43.429 43.328 43.199 43.072 42.915 42.754 42.621 42.474 42.311 42.163 41.979 41.794 41.656 41.508 41.35 41.178 40.984 40.841 40.693 40.456 40.282 40.1 40.004 39.795 39.575 39.353 39.234 38.842 38.818 38.655 38.49 38.142 37.944 37.722 37.469 37.178 36.819 36.343 35.459 -7 ,16609 ,TETRA ,17664813,Thu Dec 2 14:35:13 CET,Thu Dec 2 16:26:52 CET,0.0 0.875 1.358 1.721 2.042 2.336 2.611 2.877 3.338 3.542 3.747 3.847 4.338 4.517 4.865 5.203 5.532 5.692 5.997 6.285 6.7 6.963 7.225 7.603 7.963 8.317 8.673 9.026 9.47 9.905 10.333 10.849 11.343 11.812 12.361 12.993 13.612 14.29 15.019 15.82 16.675 17.633 18.748 19.868 21.205 22.734 24.49 26.467 28.817 31.677 35.303 38.436 40.297 41.473 42.218 42.709 43.024 43.221 43.327 43.381 43.38 43.336 43.269 43.172 43.064 42.948 42.791 42.64 42.496 42.343 42.181 42.028 41.87 41.704 41.568 41.43 41.275 41.101 40.898 40.747 40.596 40.362 40.195 40.024 39.936 39.749 39.554 39.333 39.212 38.819 38.806 38.66 38.498 38.155 37.972 37.77 37.554 37.306 36.978 36.525 35.609 -8 ,24032 ,TETRA ,17664814,Thu Dec 2 14:35:13 CET,Thu Dec 2 16:45:19 CET,0.0 0.773 1.24 1.629 1.946 2.231 2.499 2.75 3.218 3.439 3.648 3.725 4.209 4.394 4.755 5.098 5.422 5.578 5.878 6.177 6.611 6.884 7.148 7.531 7.901 8.256 8.611 8.971 9.433 9.872 10.289 10.793 11.287 11.769 12.339 12.975 13.588 14.269 15.006 15.79 16.611 17.547 18.648 19.753 21.064 22.552 24.275 26.28 28.704 31.59 35.137 38.243 40.057 41.142 41.833 42.276 42.56 42.742 42.854 42.908 42.868 42.812 42.746 42.651 42.539 42.409 42.259 42.112 41.977 41.822 41.655 41.511 41.336 41.138 40.978 40.812 40.656 40.483 40.279 40.14 39.987 39.731 39.567 39.395 39.298 39.083 38.849 38.61 38.488 38.089 38.064 37.92 37.77 37.439 37.248 37.047 36.823 36.553 36.223 35.771 34.836 -9 ,29069 ,TETRA ,17664815,Thu Dec 2 14:35:13 CET,Thu Dec 2 16:26:58 CET,0.0 0.693 1.118 1.472 1.79 2.09 2.372 2.622 3.085 3.31 3.522 3.614 4.115 4.304 4.656 4.987 5.307 5.471 5.798 6.108 6.552 6.83 7.101 7.505 7.893 8.258 8.602 8.947 9.423 9.867 10.284 10.795 11.282 11.756 12.31 12.937 13.539 14.2 14.922 15.708 16.529 17.452 18.542 19.647 20.965 22.454 24.164 26.118 28.456 31.218 34.748 37.852 39.686 40.798 41.451 41.897 42.21 42.414 42.535 42.586 42.579 42.559 42.516 42.429 42.321 42.212 42.08 41.932 41.79 41.629 41.447 41.296 41.13 40.948 40.812 40.665 40.495 40.316 40.134 39.998 39.851 39.61 39.446 39.272 39.173 38.966 38.738 38.492 38.366 37.97 37.939 37.785 37.638 37.296 37.101 36.895 36.669 36.392 36.022 35.556 34.426 -10 ,12288 ,TETRA ,17664816,Thu Dec 2 14:35:13 CET,Thu Dec 2 16:26:29 CET,0.0 0.886 1.363 1.77 2.107 2.398 2.672 2.93 3.406 3.65 3.894 3.998 4.486 4.668 5.012 5.351 5.677 5.827 6.13 6.428 6.854 7.13 7.395 7.781 8.153 8.514 8.862 9.2 9.639 10.063 10.482 10.999 11.494 11.966 12.506 13.121 13.72 14.374 15.092 15.871 16.693 17.634 18.754 19.882 21.175 22.633 24.39 26.41 28.792 31.677 35.307 38.43 40.325 41.489 42.239 42.763 43.103 43.324 43.434 43.48 43.48 43.458 43.406 43.323 43.239 43.147 43.021 42.894 42.767 42.607 42.434 42.289 42.132 41.968 41.834 41.679 41.512 41.332 41.135 41.001 40.872 40.65 40.478 40.293 40.182 39.952 39.74 39.498 39.372 38.986 38.98 38.823 38.653 38.286 38.091 37.87 37.609 37.298 36.932 36.472 35.225 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 633f3668..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32585 ,TETRA ,17664817,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:26:09 CET,0.0 0.669 1.054 1.386 1.675 1.924 2.152 2.374 2.789 2.975 3.153 3.191 3.641 3.799 4.098 4.392 4.665 4.796 5.058 5.305 5.658 5.889 6.108 6.418 6.715 7.002 7.287 7.558 7.895 8.22 8.542 8.931 9.291 9.627 10.016 10.455 10.883 11.361 11.878 12.417 12.96 13.57 14.283 14.972 15.757 16.605 17.582 18.68 19.908 21.28 22.777 23.757 24.109 24.184 24.105 23.93 23.714 23.445 23.133 22.778 22.471 22.179 21.885 21.585 21.293 21.037 20.762 20.494 20.246 19.987 19.723 19.491 19.234 18.973 18.772 18.557 18.313 18.066 17.821 17.642 17.449 17.147 16.948 16.733 16.619 16.377 16.114 15.815 15.656 15.238 15.192 15.014 14.83 14.434 14.204 13.934 13.623 13.285 12.923 12.519 11.677 -2 ,1165 ,TETRA ,17664818,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:25:30 CET,0.0 1.011 1.414 1.761 2.083 2.358 2.611 2.854 3.292 3.482 3.66 3.716 4.163 4.314 4.609 4.881 5.138 5.263 5.504 5.74 6.095 6.324 6.548 6.875 7.175 7.462 7.742 8.01 8.351 8.679 9.003 9.4 9.783 10.152 10.567 11.032 11.486 11.973 12.476 13.008 13.565 14.164 14.868 15.602 16.412 17.276 18.274 19.365 20.616 22.01 23.53 24.513 24.847 24.877 24.757 24.553 24.285 24.004 23.735 23.432 23.128 22.824 22.517 22.209 21.921 21.657 21.36 21.079 20.829 20.563 20.284 20.042 19.784 19.511 19.296 19.072 18.826 18.573 18.317 18.139 17.959 17.674 17.476 17.269 17.157 16.912 16.652 16.381 16.241 15.81 15.743 15.571 15.398 15.001 14.766 14.513 14.245 13.945 13.571 13.069 11.985 -3 ,19556 ,TETRA ,17664819,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:26:50 CET,0.0 0.892 1.409 1.771 2.083 2.363 2.603 2.823 3.224 3.401 3.575 3.618 4.064 4.222 4.507 4.766 5.028 5.162 5.427 5.668 6.012 6.246 6.469 6.788 7.102 7.395 7.677 7.956 8.302 8.626 8.955 9.352 9.722 10.069 10.457 10.903 11.343 11.833 12.363 12.911 13.457 14.06 14.791 15.511 16.328 17.225 18.203 19.26 20.477 21.908 23.464 24.479 24.86 24.903 24.784 24.583 24.322 24.03 23.728 23.378 23.056 22.748 22.432 22.11 21.81 21.54 21.252 20.98 20.732 20.472 20.178 19.932 19.687 19.428 19.22 18.995 18.758 18.503 18.232 18.046 17.845 17.53 17.317 17.092 16.974 16.735 16.487 16.21 16.063 15.637 15.575 15.397 15.21 14.82 14.612 14.378 14.101 13.778 13.411 12.945 11.784 -4 ,23898 ,TETRA ,17664820,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:26:31 CET,0.0 1.001 1.462 1.815 2.105 2.377 2.627 2.842 3.232 3.421 3.61 3.669 4.119 4.273 4.558 4.838 5.114 5.249 5.509 5.75 6.097 6.32 6.539 6.865 7.172 7.448 7.712 7.973 8.318 8.646 8.956 9.328 9.686 10.039 10.451 10.905 11.322 11.769 12.254 12.77 13.323 13.939 14.635 15.336 16.154 17.036 18.032 19.131 20.366 21.742 23.21 24.172 24.518 24.582 24.492 24.314 24.087 23.834 23.585 23.285 22.97 22.674 22.388 22.086 21.785 21.513 21.233 20.966 20.711 20.451 20.188 19.953 19.706 19.458 19.264 19.052 18.828 18.589 18.335 18.157 17.959 17.648 17.442 17.228 17.12 16.887 16.64 16.375 16.229 15.803 15.717 15.517 15.316 14.911 14.692 14.453 14.171 13.841 13.466 12.956 11.386 -5 ,17472 ,TETRA ,17664821,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:27:03 CET,0.0 0.81 1.194 1.542 1.84 2.109 2.358 2.582 3.005 3.2 3.388 3.453 3.906 4.065 4.374 4.669 4.949 5.078 5.316 5.541 5.87 6.086 6.294 6.595 6.894 7.181 7.454 7.72 8.057 8.376 8.693 9.075 9.44 9.802 10.206 10.666 11.13 11.628 12.152 12.701 13.264 13.874 14.574 15.258 16.061 16.964 17.984 19.091 20.347 21.756 23.263 24.247 24.6 24.696 24.65 24.462 24.211 23.955 23.698 23.343 23.025 22.756 22.481 22.202 21.924 21.648 21.338 21.049 20.793 20.53 20.252 20.008 19.749 19.486 19.28 19.062 18.829 18.588 18.339 18.16 17.974 17.675 17.462 17.244 17.129 16.884 16.634 16.366 16.221 15.796 15.733 15.542 15.356 14.957 14.74 14.52 14.277 13.997 13.646 13.118 11.82 -6 ,440 ,TETRA ,17664822,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:26:14 CET,0.0 0.78 1.178 1.512 1.819 2.087 2.335 2.567 2.976 3.168 3.353 3.403 3.854 4.006 4.315 4.62 4.9 5.032 5.296 5.549 5.902 6.13 6.353 6.672 6.97 7.258 7.536 7.808 8.163 8.497 8.817 9.206 9.575 9.934 10.351 10.811 11.243 11.715 12.228 12.767 13.323 13.96 14.708 15.436 16.261 17.132 18.098 19.168 20.397 21.778 23.217 24.125 24.449 24.49 24.381 24.192 23.933 23.638 23.355 23.027 22.721 22.44 22.15 21.865 21.583 21.304 21.01 20.755 20.52 20.266 19.987 19.741 19.487 19.214 18.997 18.771 18.538 18.296 18.035 17.857 17.663 17.339 17.122 16.9 16.786 16.544 16.28 16.002 15.851 15.417 15.385 15.216 15.032 14.628 14.409 14.138 13.831 13.526 13.18 12.703 11.727 -7 ,11527 ,TETRA ,17664823,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:27:09 CET,0.0 0.73 1.076 1.341 1.604 1.842 2.054 2.263 2.661 2.846 3.019 3.059 3.506 3.663 3.957 4.24 4.523 4.661 4.912 5.155 5.505 5.724 5.939 6.247 6.555 6.845 7.112 7.371 7.715 8.05 8.375 8.767 9.135 9.485 9.894 10.346 10.776 11.26 11.775 12.301 12.844 13.464 14.188 14.886 15.676 16.551 17.514 18.603 19.859 21.232 22.694 23.661 24.058 24.12 24.021 23.843 23.604 23.339 23.076 22.762 22.457 22.173 21.892 21.609 21.338 21.077 20.792 20.52 20.263 20.005 19.737 19.501 19.254 18.984 18.767 18.539 18.299 18.051 17.789 17.603 17.41 17.094 16.873 16.651 16.532 16.286 16.032 15.748 15.595 15.17 15.109 14.931 14.727 14.27 14.036 13.786 13.506 13.187 12.838 12.366 10.532 -8 ,17722 ,TETRA ,17664824,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:26:07 CET,0.0 0.751 1.181 1.512 1.801 2.067 2.317 2.556 2.983 3.173 3.35 3.402 3.853 4.008 4.309 4.594 4.871 5.008 5.269 5.514 5.867 6.096 6.322 6.639 6.938 7.229 7.514 7.794 8.146 8.486 8.806 9.184 9.554 9.909 10.314 10.776 11.211 11.684 12.2 12.738 13.3 13.927 14.651 15.4 16.304 17.279 18.318 19.454 20.719 22.148 23.676 24.571 24.915 25.009 24.909 24.735 24.545 24.331 24.08 23.75 23.447 23.16 22.851 22.525 22.197 21.877 21.542 21.248 20.983 20.714 20.439 20.212 19.977 19.721 19.516 19.298 19.056 18.81 18.542 18.349 18.154 17.862 17.652 17.424 17.308 17.072 16.823 16.526 16.376 15.96 15.919 15.751 15.574 15.202 14.983 14.749 14.495 14.183 13.794 13.316 12.33 -9 ,16151 ,TETRA ,17664825,Thu Dec 2 14:35:12 CET,Thu Dec 2 16:26:21 CET,0.0 0.868 1.248 1.574 1.855 2.11 2.337 2.56 3.006 3.203 3.389 3.454 3.912 4.086 4.411 4.713 4.999 5.132 5.384 5.619 5.963 6.189 6.403 6.706 7.001 7.294 7.578 7.844 8.19 8.535 8.855 9.225 9.592 9.95 10.359 10.815 11.256 11.736 12.244 12.781 13.349 13.978 14.691 15.406 16.234 17.129 18.108 19.182 20.396 21.786 23.367 24.335 24.643 24.69 24.576 24.391 24.145 23.851 23.58 23.266 22.979 22.708 22.419 22.13 21.85 21.591 21.305 21.037 20.787 20.525 20.251 20.019 19.769 19.502 19.298 19.088 18.858 18.614 18.37 18.195 18.002 17.697 17.486 17.253 17.128 16.87 16.607 16.341 16.203 15.783 15.738 15.555 15.355 14.95 14.72 14.468 14.196 13.909 13.568 13.124 11.941 -10 ,24557 ,TETRA ,17664826,Thu Dec 2 14:38:08 CET,Thu Dec 2 16:38:32 CET,0.0 1.058 1.487 1.841 2.144 2.425 2.676 2.883 3.269 3.46 3.641 3.692 4.146 4.301 4.594 4.873 5.135 5.263 5.509 5.739 6.07 6.295 6.524 6.85 7.154 7.446 7.722 7.997 8.35 8.678 8.991 9.369 9.732 10.09 10.5 10.939 11.353 11.807 12.291 12.816 13.371 13.985 14.723 15.457 16.271 17.167 18.203 19.341 20.578 21.922 23.367 24.41 24.791 24.801 24.639 24.419 24.184 23.913 23.621 23.301 23.008 22.725 22.431 22.134 21.858 21.6 21.311 21.045 20.821 20.578 20.3 20.048 19.788 19.524 19.318 19.106 18.866 18.601 18.32 18.13 17.947 17.655 17.436 17.211 17.092 16.847 16.587 16.296 16.142 15.706 15.636 15.462 15.281 14.88 14.649 14.392 14.118 13.795 13.402 12.924 11.931 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 1e348ae2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19000 ,TETRA ,17664827,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:34 CET,0.0 0.738 1.105 1.442 1.743 2.003 2.222 2.415 2.774 2.948 3.113 3.167 3.584 3.742 4.032 4.295 4.557 4.686 4.935 5.18 5.526 5.741 5.955 6.249 6.525 6.81 7.089 7.351 7.677 7.989 8.294 8.658 9.007 9.349 9.741 10.162 10.569 11.017 11.489 11.998 12.529 13.106 13.77 14.414 15.158 15.975 16.888 17.898 18.998 20.166 21.301 21.925 22.018 21.897 21.713 21.407 21.062 20.679 20.296 19.917 19.563 19.239 18.925 18.588 18.255 17.949 17.64 17.378 17.152 16.907 16.635 16.377 16.091 15.807 15.592 15.367 15.133 14.894 14.626 14.433 14.225 13.875 13.65 13.408 13.275 12.992 12.704 12.403 12.245 11.845 11.756 11.58 11.396 10.994 10.773 10.507 10.19 9.865 9.526 9.114 8.231 -2 ,7706 ,TETRA ,17664828,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:33:01 CET,0.0 0.613 0.996 1.319 1.584 1.808 2.019 2.215 2.585 2.756 2.921 2.982 3.404 3.557 3.844 4.123 4.388 4.511 4.743 4.973 5.299 5.5 5.695 5.99 6.28 6.554 6.814 7.068 7.398 7.72 8.035 8.412 8.776 9.119 9.5 9.926 10.337 10.776 11.24 11.722 12.231 12.816 13.516 14.211 14.968 15.781 16.691 17.654 18.711 19.859 21.061 21.801 21.962 21.867 21.68 21.385 21.044 20.706 20.373 19.989 19.635 19.313 19.012 18.705 18.38 18.072 17.75 17.461 17.206 16.934 16.633 16.364 16.076 15.78 15.565 15.347 15.104 14.84 14.582 14.409 14.21 13.894 13.67 13.427 13.301 13.042 12.774 12.463 12.292 11.869 11.769 11.572 11.369 10.902 10.641 10.373 10.094 9.77 9.381 8.867 7.832 -3 ,23768 ,TETRA ,17664829,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:33:55 CET,0.0 0.493 0.853 1.187 1.492 1.751 1.977 2.189 2.579 2.758 2.923 2.971 3.385 3.54 3.86 4.16 4.438 4.568 4.812 5.051 5.39 5.601 5.809 6.118 6.407 6.693 6.981 7.249 7.59 7.918 8.219 8.575 8.916 9.249 9.631 10.065 10.503 10.983 11.486 12.009 12.542 13.125 13.81 14.481 15.23 16.066 17.024 18.076 19.211 20.345 21.521 22.237 22.402 22.317 22.077 21.805 21.508 21.157 20.83 20.454 20.086 19.732 19.376 19.049 18.745 18.457 18.145 17.838 17.562 17.274 16.973 16.73 16.453 16.157 15.929 15.673 15.408 15.141 14.865 14.683 14.504 14.201 13.979 13.74 13.619 13.372 13.105 12.821 12.669 12.257 12.186 12.012 11.829 11.413 11.196 10.974 10.697 10.39 10.057 9.617 8.395 -4 ,672 ,TETRA ,17664830,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:48:04 CET,0.0 0.712 1.065 1.386 1.671 1.914 2.127 2.319 2.683 2.852 3.019 3.09 3.524 3.677 3.965 4.242 4.512 4.642 4.883 5.109 5.455 5.681 5.899 6.216 6.521 6.804 7.068 7.328 7.658 7.97 8.277 8.646 9.007 9.357 9.749 10.187 10.615 11.1 11.622 12.156 12.715 13.331 14.022 14.726 15.557 16.414 17.323 18.357 19.513 20.774 22.037 22.715 22.862 22.664 22.34 22.012 21.682 21.317 20.971 20.592 20.228 19.884 19.546 19.211 18.881 18.587 18.278 17.996 17.745 17.475 17.186 16.923 16.645 16.364 16.148 15.919 15.672 15.413 15.14 14.948 14.75 14.451 14.236 14.008 13.888 13.635 13.358 13.062 12.901 12.474 12.394 12.204 12.007 11.602 11.367 11.101 10.849 10.593 10.278 9.872 8.85 -5 ,13713 ,TETRA ,17664831,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:50:14 CET,0.0 0.748 1.143 1.459 1.725 1.967 2.196 2.413 2.811 3.005 3.182 3.221 3.642 3.793 4.07 4.33 4.581 4.705 4.942 5.16 5.484 5.694 5.898 6.206 6.501 6.776 7.029 7.272 7.585 7.891 8.188 8.547 8.906 9.239 9.621 10.07 10.506 10.973 11.447 11.943 12.478 13.077 13.756 14.41 15.147 15.978 16.901 17.872 18.948 20.139 21.393 22.152 22.344 22.242 22.036 21.71 21.338 20.938 20.565 20.198 19.842 19.506 19.172 18.813 18.456 18.146 17.829 17.541 17.294 17.031 16.726 16.469 16.205 15.92 15.698 15.461 15.21 14.959 14.702 14.513 14.307 13.987 13.778 13.554 13.428 13.171 12.91 12.635 12.496 12.101 12.041 11.861 11.669 11.244 11.019 10.785 10.505 10.177 9.785 9.254 8.173 -6 ,27523 ,TETRA ,17664832,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:28 CET,0.0 0.694 1.064 1.349 1.614 1.853 2.079 2.3 2.686 2.861 3.031 3.085 3.496 3.645 3.942 4.212 4.456 4.574 4.809 5.044 5.38 5.591 5.804 6.125 6.415 6.685 6.949 7.204 7.534 7.859 8.173 8.551 8.921 9.265 9.645 10.077 10.49 10.939 11.437 11.98 12.573 13.219 13.923 14.603 15.372 16.193 17.103 18.101 19.187 20.345 21.538 22.209 22.369 22.292 22.09 21.765 21.402 21.024 20.646 20.25 19.879 19.533 19.185 18.831 18.491 18.186 17.881 17.607 17.347 17.077 16.806 16.572 16.313 16.022 15.79 15.546 15.298 15.047 14.779 14.585 14.375 14.044 13.812 13.571 13.454 13.211 12.935 12.631 12.472 12.059 11.984 11.8 11.601 11.179 10.938 10.681 10.415 10.123 9.764 9.312 8.373 -7 ,21812 ,TETRA ,17664833,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:47:03 CET,0.0 1.092 1.471 1.78 2.053 2.289 2.503 2.71 3.102 3.277 3.435 3.483 3.908 4.056 4.353 4.636 4.886 5.005 5.24 5.472 5.809 6.018 6.214 6.494 6.775 7.062 7.341 7.605 7.934 8.255 8.574 8.949 9.301 9.645 10.045 10.478 10.89 11.354 11.839 12.339 12.868 13.445 14.1 14.744 15.49 16.281 17.137 18.058 19.121 20.273 21.394 22.052 22.169 22.085 21.882 21.575 21.228 20.849 20.491 20.096 19.731 19.387 19.043 18.711 18.395 18.101 17.796 17.516 17.26 16.985 16.7 16.455 16.182 15.874 15.63 15.364 15.089 14.835 14.577 14.399 14.217 13.904 13.67 13.416 13.285 13.03 12.758 12.463 12.306 11.881 11.787 11.606 11.427 11.048 10.828 10.586 10.325 10.014 9.609 9.108 7.784 -8 ,6011 ,TETRA ,17664834,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:57 CET,0.0 0.669 1.039 1.364 1.652 1.916 2.156 2.378 2.774 2.973 3.168 3.256 3.695 3.86 4.176 4.483 4.773 4.906 5.155 5.397 5.752 5.976 6.187 6.492 6.784 7.06 7.33 7.598 7.939 8.264 8.568 8.929 9.275 9.605 9.979 10.394 10.797 11.24 11.715 12.206 12.732 13.32 13.987 14.648 15.377 16.14 16.999 17.949 19.007 20.186 21.378 22.076 22.24 22.122 21.861 21.559 21.238 20.871 20.516 20.115 19.74 19.409 19.075 18.75 18.458 18.185 17.908 17.653 17.421 17.171 16.875 16.625 16.375 16.092 15.856 15.611 15.375 15.14 14.87 14.677 14.454 14.058 13.807 13.574 13.452 13.192 12.922 12.647 12.507 12.114 12.049 11.88 11.702 11.295 11.077 10.854 10.605 10.32 10.005 9.642 8.825 -9 ,9545 ,TETRA ,17664835,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:45:43 CET,0.0 0.861 1.246 1.536 1.784 2.019 2.243 2.456 2.846 3.023 3.196 3.247 3.665 3.811 4.093 4.365 4.626 4.748 4.986 5.221 5.555 5.775 5.982 6.273 6.561 6.844 7.122 7.391 7.739 8.075 8.391 8.774 9.144 9.494 9.891 10.35 10.799 11.278 11.789 12.319 12.874 13.497 14.202 14.909 15.693 16.546 17.535 18.577 19.693 20.904 22.106 22.787 22.985 22.922 22.653 22.267 21.887 21.499 21.093 20.646 20.259 19.899 19.529 19.171 18.832 18.511 18.166 17.859 17.59 17.282 16.95 16.69 16.425 16.146 15.919 15.667 15.402 15.126 14.837 14.641 14.426 14.095 13.88 13.653 13.534 13.283 13.02 12.739 12.593 12.19 12.114 11.933 11.736 11.299 11.072 10.816 10.539 10.248 9.898 9.489 8.76 -10 ,23355 ,TETRA ,17664836,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 17:02:44 CET,0.0 0.753 1.117 1.412 1.669 1.922 2.161 2.385 2.791 2.967 3.136 3.189 3.616 3.77 4.052 4.316 4.575 4.696 4.932 5.162 5.487 5.699 5.914 6.222 6.508 6.786 7.063 7.327 7.655 7.97 8.285 8.658 9.009 9.344 9.729 10.168 10.582 11.031 11.506 12.006 12.532 13.097 13.741 14.407 15.165 15.967 16.835 17.75 18.775 19.896 21.065 21.726 21.809 21.634 21.389 21.111 20.778 20.411 20.077 19.714 19.35 19.013 18.675 18.35 18.047 17.745 17.424 17.133 16.862 16.566 16.268 16.027 15.763 15.48 15.245 14.988 14.729 14.467 14.181 13.98 13.773 13.464 13.251 13.018 12.901 12.653 12.373 12.097 11.948 11.515 11.437 11.267 11.085 10.678 10.457 10.244 9.986 9.659 9.271 8.761 7.298 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt deleted file mode 100644 index fe02e8a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25915 ,TETRA ,17664837,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:24 CET,0.0 0.933 1.338 1.654 1.903 2.134 2.356 2.558 2.905 3.066 3.245 3.324 3.744 3.889 4.15 4.398 4.629 4.735 4.935 5.121 5.396 5.575 5.741 5.982 6.217 6.427 6.624 6.817 7.06 7.286 7.498 7.76 8.004 8.241 8.525 8.817 9.089 9.378 9.675 9.991 10.294 10.597 10.927 11.223 11.526 11.805 12.055 12.221 12.229 11.985 11.241 10.037 8.862 7.794 6.806 5.869 5.033 4.25 3.554 2.854 2.24 1.685 1.163 0.674 0.211 -0.228 -0.691 -1.107 -1.471 -1.844 -2.233 -2.556 -2.886 -3.238 -3.514 -3.792 -4.083 -4.388 -4.713 -4.934 -5.163 -5.525 -5.771 -6.029 -6.164 -6.437 -6.716 -7.008 -7.16 -7.6 -7.665 -7.859 -8.054 -8.447 -8.679 -8.963 -9.264 -9.58 -9.967 -10.407 -11.216 -2 ,30583 ,TETRA ,17664838,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:44:52 CET,0.0 0.667 1.092 1.418 1.719 1.993 2.241 2.464 2.855 3.024 3.179 3.196 3.602 3.737 3.986 4.232 4.482 4.601 4.829 5.039 5.314 5.483 5.643 5.888 6.118 6.34 6.557 6.751 6.992 7.231 7.473 7.754 8.002 8.227 8.47 8.747 9.028 9.33 9.637 9.931 10.198 10.488 10.816 11.12 11.438 11.718 11.962 12.131 12.179 11.959 11.138 9.813 8.541 7.37 6.299 5.287 4.389 3.578 2.901 2.225 1.631 1.105 0.595 0.101 -0.364 -0.799 -1.267 -1.671 -2.01 -2.367 -2.743 -3.064 -3.402 -3.756 -4.036 -4.319 -4.609 -4.922 -5.254 -5.481 -5.729 -6.112 -6.357 -6.608 -6.747 -7.038 -7.342 -7.677 -7.851 -8.305 -8.395 -8.587 -8.783 -9.213 -9.489 -9.83 -10.242 -10.709 -11.179 -11.756 -13.109 -3 ,26817 ,TETRA ,17664839,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:34 CET,0.0 0.669 1.082 1.42 1.691 1.917 2.137 2.34 2.714 2.895 3.063 3.121 3.554 3.702 3.965 4.21 4.432 4.537 4.745 4.942 5.218 5.387 5.547 5.787 6.012 6.218 6.424 6.618 6.865 7.12 7.358 7.623 7.87 8.113 8.373 8.647 8.921 9.214 9.516 9.817 10.118 10.423 10.738 11.016 11.295 11.589 11.866 12.048 12.125 11.953 11.215 9.929 8.701 7.581 6.53 5.589 4.745 3.973 3.3 2.582 1.929 1.337 0.785 0.286 -0.181 -0.619 -1.082 -1.495 -1.861 -2.243 -2.627 -2.96 -3.321 -3.692 -3.975 -4.265 -4.563 -4.89 -5.242 -5.478 -5.72 -6.092 -6.357 -6.642 -6.783 -7.075 -7.385 -7.711 -7.886 -8.347 -8.434 -8.624 -8.836 -9.348 -9.619 -9.888 -10.197 -10.589 -11.041 -11.584 -12.973 -4 ,5745 ,TETRA ,17664840,Thu Dec 2 14:38:08 CET,Thu Dec 2 16:32:26 CET,0.0 0.976 1.325 1.608 1.871 2.113 2.337 2.548 2.921 3.1 3.261 3.281 3.683 3.811 4.063 4.306 4.539 4.65 4.862 5.073 5.378 5.568 5.742 5.987 6.217 6.423 6.618 6.822 7.086 7.322 7.544 7.799 8.036 8.259 8.508 8.782 9.04 9.318 9.613 9.907 10.216 10.564 10.909 11.212 11.534 11.812 12.038 12.162 12.173 11.987 11.232 9.958 8.731 7.603 6.61 5.698 4.864 4.087 3.392 2.7 2.102 1.569 1.057 0.549 0.061 -0.376 -0.841 -1.284 -1.653 -2.026 -2.434 -2.774 -3.123 -3.511 -3.815 -4.129 -4.459 -4.778 -5.103 -5.33 -5.568 -5.93 -6.181 -6.455 -6.599 -6.887 -7.175 -7.493 -7.661 -8.112 -8.184 -8.375 -8.585 -9.029 -9.304 -9.603 -9.916 -10.296 -10.699 -11.187 -12.082 -5 ,29320 ,TETRA ,17664841,Thu Dec 2 14:38:08 CET,Thu Dec 2 16:32:28 CET,0.0 0.686 1.103 1.423 1.697 1.927 2.118 2.305 2.708 2.901 3.071 3.137 3.568 3.709 3.981 4.237 4.48 4.591 4.789 4.973 5.239 5.412 5.584 5.833 6.058 6.268 6.476 6.678 6.94 7.186 7.42 7.697 7.947 8.177 8.44 8.741 9.013 9.309 9.612 9.901 10.183 10.481 10.821 11.104 11.379 11.666 11.896 12.009 12.004 11.804 11.07 9.809 8.526 7.323 6.274 5.292 4.361 3.481 2.713 1.952 1.306 0.718 0.146 -0.393 -0.891 -1.335 -1.792 -2.21 -2.575 -2.94 -3.327 -3.672 -4.025 -4.378 -4.66 -4.952 -5.239 -5.549 -5.882 -6.109 -6.344 -6.717 -6.974 -7.244 -7.387 -7.69 -8.004 -8.326 -8.492 -8.941 -9.027 -9.219 -9.422 -9.876 -10.129 -10.391 -10.665 -10.984 -11.322 -11.71 -12.623 -6 ,8371 ,TETRA ,17664842,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:32 CET,0.0 0.632 0.966 1.243 1.49 1.722 1.96 2.184 2.574 2.751 2.925 2.977 3.375 3.506 3.763 4.015 4.244 4.347 4.546 4.743 5.033 5.22 5.396 5.638 5.857 6.063 6.275 6.491 6.757 6.989 7.199 7.446 7.683 7.909 8.182 8.49 8.77 9.072 9.368 9.648 9.927 10.236 10.586 10.893 11.193 11.467 11.702 11.881 11.958 11.804 11.129 9.909 8.712 7.597 6.567 5.621 4.799 4.057 3.382 2.671 2.055 1.509 0.966 0.44 -0.047 -0.479 -0.929 -1.348 -1.715 -2.092 -2.481 -2.806 -3.153 -3.511 -3.782 -4.064 -4.353 -4.652 -4.959 -5.177 -5.414 -5.791 -6.037 -6.28 -6.41 -6.689 -6.993 -7.31 -7.477 -7.929 -8.015 -8.205 -8.399 -8.831 -9.061 -9.325 -9.613 -9.904 -10.249 -10.719 -11.643 -7 ,18755 ,TETRA ,17664843,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:35 CET,0.0 0.455 0.747 0.999 1.229 1.467 1.691 1.879 2.23 2.4 2.568 2.612 3.021 3.153 3.392 3.622 3.846 3.949 4.152 4.35 4.62 4.796 4.975 5.221 5.445 5.661 5.869 6.059 6.305 6.548 6.776 7.037 7.286 7.521 7.794 8.102 8.379 8.671 8.965 9.268 9.591 9.926 10.268 10.585 10.91 11.209 11.49 11.66 11.688 11.467 10.665 9.358 8.054 6.826 5.722 4.708 3.811 3.0 2.29 1.559 0.908 0.324 -0.244 -0.78 -1.268 -1.719 -2.21 -2.638 -3.004 -3.395 -3.802 -4.15 -4.505 -4.865 -5.15 -5.452 -5.777 -6.109 -6.435 -6.657 -6.897 -7.273 -7.536 -7.813 -7.95 -8.236 -8.544 -8.868 -9.035 -9.484 -9.543 -9.726 -9.921 -10.358 -10.6 -10.839 -11.095 -11.391 -11.754 -12.181 -13.082 -8 ,5083 ,TETRA ,17664844,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:46 CET,0.0 0.786 1.149 1.466 1.75 2.004 2.231 2.446 2.839 3.016 3.178 3.2 3.604 3.74 4.0 4.242 4.462 4.567 4.78 4.985 5.271 5.453 5.626 5.88 6.119 6.335 6.55 6.758 7.006 7.23 7.45 7.713 7.964 8.194 8.443 8.713 8.952 9.206 9.475 9.752 10.052 10.393 10.746 11.031 11.325 11.626 11.892 12.066 12.069 11.859 11.123 9.788 8.559 7.453 6.475 5.567 4.749 4.0 3.345 2.668 2.063 1.523 0.984 0.464 0.0 -0.419 -0.871 -1.28 -1.634 -2.007 -2.397 -2.725 -3.06 -3.403 -3.675 -3.972 -4.272 -4.561 -4.869 -5.089 -5.329 -5.704 -5.964 -6.237 -6.375 -6.668 -6.981 -7.307 -7.474 -7.926 -8.021 -8.212 -8.404 -8.852 -9.113 -9.399 -9.724 -10.069 -10.412 -10.824 -11.987 -9 ,9657 ,TETRA ,17664845,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:23 CET,0.0 0.628 0.986 1.256 1.52 1.774 1.996 2.19 2.523 2.68 2.831 2.849 3.244 3.368 3.632 3.881 4.098 4.205 4.412 4.608 4.901 5.085 5.261 5.516 5.751 5.966 6.182 6.398 6.679 6.943 7.18 7.463 7.722 7.962 8.245 8.563 8.845 9.132 9.438 9.742 10.063 10.435 10.806 11.114 11.448 11.768 12.036 12.23 12.28 12.131 11.493 10.299 9.087 7.948 6.927 5.956 5.095 4.317 3.625 2.912 2.295 1.736 1.214 0.74 0.292 -0.134 -0.603 -1.03 -1.394 -1.768 -2.162 -2.497 -2.833 -3.165 -3.433 -3.725 -4.036 -4.356 -4.686 -4.925 -5.172 -5.558 -5.824 -6.092 -6.232 -6.515 -6.809 -7.128 -7.29 -7.738 -7.822 -8.02 -8.224 -8.639 -8.872 -9.124 -9.401 -9.742 -10.135 -10.625 -11.653 -10 ,400 ,TETRA ,17664846,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:34 CET,0.0 0.623 0.977 1.32 1.628 1.863 2.068 2.259 2.609 2.77 2.923 2.944 3.342 3.467 3.719 3.952 4.168 4.272 4.47 4.665 4.941 5.122 5.309 5.573 5.809 6.042 6.267 6.471 6.726 6.966 7.191 7.449 7.695 7.932 8.201 8.49 8.747 9.009 9.296 9.62 9.92 10.201 10.513 10.818 11.124 11.386 11.604 11.753 11.76 11.502 10.76 9.575 8.356 7.212 6.214 5.327 4.54 3.805 3.14 2.451 1.84 1.282 0.747 0.239 -0.235 -0.657 -1.1 -1.495 -1.844 -2.227 -2.624 -2.943 -3.278 -3.623 -3.892 -4.178 -4.472 -4.779 -5.099 -5.314 -5.529 -5.879 -6.133 -6.402 -6.541 -6.823 -7.113 -7.429 -7.595 -8.051 -8.137 -8.329 -8.536 -8.996 -9.243 -9.5 -9.798 -10.162 -10.539 -10.962 -12.027 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt deleted file mode 100644 index 14c06c81..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14006 ,TETRA ,17664847,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:48:38 CET,0.0 1.337 1.813 2.204 2.549 2.849 3.119 3.367 3.799 4.007 4.203 4.29 4.726 4.896 5.211 5.503 5.793 5.932 6.183 6.414 6.748 6.97 7.194 7.506 7.804 8.101 8.385 8.656 9.002 9.334 9.652 10.032 10.396 10.742 11.119 11.534 11.936 12.372 12.831 13.312 13.816 14.358 14.964 15.576 16.293 17.036 17.84 18.693 19.573 20.462 21.26 21.517 21.376 21.077 20.67 20.217 19.786 19.371 18.998 18.588 18.2 17.849 17.495 17.123 16.769 16.455 16.12 15.8 15.524 15.244 14.937 14.681 14.412 14.123 13.899 13.67 13.436 13.177 12.914 12.738 12.549 12.244 12.024 11.798 11.684 11.445 11.187 10.899 10.745 10.334 10.294 10.126 9.937 9.514 9.291 9.04 8.751 8.44 8.082 7.593 6.389 -2 ,13785 ,TETRA ,17664848,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:21 CET,0.0 0.69 1.132 1.49 1.802 2.088 2.357 2.605 3.044 3.243 3.449 3.586 4.031 4.201 4.526 4.834 5.14 5.284 5.543 5.798 6.171 6.407 6.637 6.991 7.316 7.611 7.909 8.193 8.553 8.886 9.202 9.594 9.956 10.296 10.703 11.15 11.561 12.014 12.515 13.027 13.539 14.106 14.743 15.362 16.042 16.76 17.55 18.388 19.273 20.232 21.135 21.455 21.291 20.991 20.654 20.257 19.839 19.389 18.967 18.538 18.165 17.804 17.438 17.098 16.789 16.494 16.158 15.842 15.555 15.258 14.967 14.735 14.487 14.223 14.003 13.775 13.534 13.283 13.032 12.851 12.66 12.361 12.129 11.88 11.759 11.508 11.253 10.98 10.839 10.435 10.376 10.204 10.027 9.656 9.454 9.225 8.967 8.667 8.304 7.821 6.616 -3 ,30313 ,TETRA ,17664849,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:33:45 CET,0.0 1.034 1.549 1.942 2.247 2.532 2.792 3.029 3.471 3.673 3.869 3.968 4.404 4.564 4.88 5.171 5.449 5.586 5.841 6.077 6.424 6.659 6.886 7.203 7.504 7.794 8.065 8.335 8.685 9.011 9.332 9.72 10.086 10.423 10.786 11.189 11.577 11.992 12.428 12.907 13.417 13.954 14.564 15.165 15.845 16.594 17.426 18.275 19.124 19.965 20.752 21.097 20.981 20.656 20.27 19.82 19.363 18.927 18.518 18.103 17.732 17.384 17.032 16.693 16.365 16.054 15.734 15.442 15.184 14.913 14.617 14.366 14.11 13.835 13.611 13.385 13.144 12.882 12.613 12.424 12.229 11.919 11.698 11.473 11.357 11.106 10.833 10.561 10.421 9.993 9.901 9.724 9.535 9.134 8.918 8.684 8.418 8.093 7.721 7.258 6.136 -4 ,32021 ,TETRA ,17664850,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:46:35 CET,0.0 1.128 1.698 2.125 2.483 2.795 3.064 3.311 3.781 3.996 4.197 4.306 4.751 4.924 5.247 5.537 5.813 5.943 6.2 6.451 6.823 7.064 7.282 7.584 7.884 8.177 8.455 8.709 9.041 9.367 9.672 10.046 10.4 10.734 11.123 11.552 11.963 12.404 12.863 13.341 13.834 14.383 15.028 15.655 16.361 17.15 18.025 18.899 19.786 20.689 21.551 21.903 21.837 21.591 21.244 20.866 20.495 20.148 19.816 19.439 19.099 18.769 18.421 18.089 17.782 17.5 17.191 16.891 16.629 16.358 16.074 15.832 15.563 15.273 15.05 14.817 14.564 14.297 14.031 13.848 13.657 13.332 13.1 12.868 12.75 12.505 12.243 11.968 11.828 11.435 11.382 11.22 11.047 10.664 10.463 10.242 9.997 9.729 9.431 9.116 8.685 -5 ,16219 ,TETRA ,17664851,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:33:03 CET,0.0 1.289 1.731 2.106 2.452 2.767 3.056 3.322 3.788 3.999 4.192 4.28 4.707 4.861 5.154 5.45 5.723 5.854 6.109 6.363 6.737 6.971 7.192 7.506 7.809 8.104 8.391 8.664 9.016 9.339 9.646 10.019 10.366 10.691 11.065 11.51 11.947 12.401 12.869 13.356 13.876 14.469 15.139 15.785 16.472 17.162 17.908 18.711 19.622 20.572 21.421 21.737 21.614 21.361 20.998 20.546 20.119 19.739 19.384 18.992 18.637 18.299 17.953 17.626 17.316 17.016 16.693 16.392 16.117 15.816 15.51 15.256 14.985 14.711 14.499 14.27 14.022 13.767 13.501 13.31 13.113 12.811 12.603 12.383 12.265 12.022 11.769 11.489 11.342 10.929 10.862 10.695 10.518 10.149 9.951 9.734 9.498 9.228 8.897 8.445 7.404 -6 ,18927 ,TETRA ,17664852,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:40 CET,0.0 1.013 1.567 1.973 2.272 2.542 2.815 3.074 3.515 3.719 3.911 4.004 4.445 4.604 4.905 5.205 5.497 5.63 5.874 6.111 6.466 6.688 6.898 7.207 7.507 7.803 8.088 8.364 8.719 9.051 9.359 9.731 10.095 10.44 10.82 11.236 11.635 12.058 12.513 13.001 13.502 14.064 14.696 15.315 16.03 16.785 17.576 18.4 19.317 20.267 21.039 21.202 20.993 20.643 20.225 19.794 19.384 18.978 18.587 18.169 17.781 17.42 17.06 16.71 16.381 16.068 15.731 15.421 15.137 14.828 14.516 14.269 14.007 13.718 13.494 13.26 13.019 12.769 12.502 12.319 12.136 11.855 11.663 11.455 11.343 11.116 10.879 10.619 10.48 10.066 9.998 9.831 9.661 9.274 9.052 8.829 8.6 8.34 8.028 7.634 6.648 -7 ,19632 ,TETRA ,17664853,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:33:00 CET,0.0 1.047 1.537 1.936 2.288 2.616 2.906 3.17 3.609 3.803 3.995 4.106 4.556 4.729 5.046 5.328 5.59 5.72 5.983 6.242 6.61 6.839 7.061 7.387 7.699 7.988 8.263 8.524 8.856 9.176 9.481 9.846 10.193 10.522 10.899 11.327 11.742 12.193 12.653 13.108 13.565 14.074 14.678 15.293 15.991 16.729 17.517 18.335 19.248 20.224 21.2 21.623 21.558 21.282 20.939 20.558 20.142 19.736 19.354 18.934 18.566 18.211 17.847 17.518 17.225 16.944 16.623 16.323 16.068 15.799 15.51 15.278 15.028 14.728 14.476 14.239 14.009 13.757 13.497 13.315 13.119 12.806 12.573 12.324 12.193 11.924 11.649 11.361 11.204 10.784 10.72 10.537 10.35 9.961 9.747 9.494 9.193 8.852 8.485 8.071 7.012 -8 ,8197 ,TETRA ,17664854,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:33:10 CET,0.0 1.207 1.724 2.076 2.36 2.643 2.927 3.186 3.671 3.902 4.121 4.251 4.7 4.885 5.235 5.549 5.847 5.987 6.25 6.509 6.891 7.129 7.349 7.666 7.981 8.272 8.537 8.797 9.123 9.434 9.745 10.131 10.515 10.873 11.272 11.712 12.121 12.551 12.991 13.457 13.952 14.493 15.118 15.728 16.412 17.154 17.986 18.864 19.761 20.665 21.487 21.812 21.705 21.418 21.073 20.662 20.262 19.878 19.511 19.12 18.73 18.353 17.989 17.653 17.342 17.044 16.727 16.43 16.157 15.876 15.585 15.33 15.056 14.774 14.567 14.357 14.118 13.859 13.593 13.405 13.215 12.921 12.712 12.499 12.39 12.157 11.896 11.614 11.471 11.063 11.014 10.844 10.642 10.212 10.003 9.772 9.5 9.174 8.812 8.384 7.342 -9 ,16985 ,TETRA ,17664855,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:33:39 CET,0.0 0.992 1.473 1.856 2.208 2.522 2.792 3.042 3.501 3.709 3.904 4.014 4.465 4.64 4.964 5.28 5.572 5.702 5.953 6.204 6.561 6.789 7.004 7.326 7.648 7.944 8.224 8.496 8.86 9.222 9.566 9.965 10.338 10.681 11.066 11.502 11.919 12.365 12.838 13.34 13.861 14.431 15.068 15.675 16.339 17.051 17.848 18.684 19.548 20.406 21.226 21.603 21.576 21.331 20.968 20.564 20.145 19.724 19.353 18.965 18.601 18.246 17.891 17.552 17.223 16.92 16.591 16.29 16.034 15.76 15.444 15.177 14.92 14.651 14.434 14.207 13.96 13.701 13.437 13.253 13.069 12.779 12.575 12.365 12.258 12.02 11.76 11.484 11.332 10.92 10.88 10.719 10.55 10.163 9.95 9.732 9.481 9.165 8.801 8.384 7.525 -10 ,28988 ,TETRA ,17664856,Thu Dec 2 14:38:09 CET,Thu Dec 2 16:32:30 CET,0.0 1.624 2.159 2.501 2.805 3.098 3.347 3.583 4.041 4.239 4.418 4.504 4.943 5.115 5.433 5.724 6.01 6.161 6.438 6.684 7.049 7.285 7.513 7.837 8.155 8.466 8.759 9.038 9.401 9.745 10.071 10.459 10.83 11.18 11.586 12.065 12.502 12.954 13.447 13.952 14.462 15.036 15.696 16.34 17.071 17.831 18.654 19.548 20.525 21.532 22.42 22.805 22.734 22.446 22.077 21.605 21.11 20.627 20.19 19.736 19.31 18.912 18.526 18.137 17.766 17.426 17.063 16.739 16.463 16.169 15.846 15.577 15.298 15.006 14.781 14.551 14.304 14.043 13.767 13.574 13.376 13.06 12.847 12.625 12.503 12.256 11.99 11.705 11.561 11.15 11.092 10.922 10.731 10.31 10.088 9.845 9.594 9.322 9.005 8.687 8.071 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 5c761c24..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7201 ,KEBNE ,17125562,Thu Dec 30 16:41:32 CET,Thu Dec 30 18:30:00 CET,0.0 0.568 0.919 1.215 1.487 1.749 1.996 2.211 2.593 2.767 2.934 2.993 3.41 3.56 3.832 4.093 4.346 4.466 4.696 4.914 5.225 5.43 5.637 5.927 6.194 6.448 6.699 6.941 7.236 7.522 7.793 8.125 8.453 8.766 9.116 9.499 9.871 10.283 10.729 11.182 11.631 12.121 12.679 13.207 13.796 14.441 15.132 15.832 16.56 17.267 17.83 17.915 17.706 17.299 16.759 16.226 15.712 15.185 14.692 14.179 13.723 13.307 12.887 12.467 12.073 11.705 11.314 10.962 10.654 10.336 9.993 9.703 9.4 9.071 8.807 8.533 8.242 7.938 7.624 7.409 7.189 6.836 6.6 6.353 6.224 5.956 5.642 5.313 5.156 4.735 4.634 4.457 4.269 3.856 3.625 3.353 3.037 2.696 2.3 1.822 0.814 -2 ,2962 ,KEBNE ,17125563,Thu Dec 30 16:41:32 CET,Thu Dec 30 18:30:26 CET,0.0 0.607 0.959 1.259 1.519 1.766 1.988 2.177 2.552 2.735 2.91 2.984 3.39 3.536 3.816 4.072 4.326 4.447 4.681 4.908 5.228 5.434 5.634 5.924 6.192 6.451 6.706 6.952 7.26 7.547 7.818 8.146 8.467 8.779 9.137 9.538 9.913 10.312 10.738 11.178 11.648 12.18 12.789 13.388 14.043 14.744 15.505 16.248 17.025 17.763 18.361 18.501 18.21 17.781 17.354 16.909 16.444 15.951 15.48 14.97 14.494 14.068 13.667 13.289 12.907 12.541 12.156 11.795 11.481 11.156 10.836 10.573 10.284 9.958 9.692 9.408 9.121 8.842 8.554 8.355 8.148 7.811 7.565 7.307 7.178 6.915 6.639 6.35 6.197 5.772 5.644 5.44 5.218 4.73 4.459 4.172 3.851 3.477 3.051 2.47 1.577 -3 ,32735 ,KEBNE ,17069991,Fri Dec 24 15:31:41 CET,Fri Dec 24 17:17:15 CET,0.0 0.705 1.072 1.375 1.648 1.895 2.108 2.304 2.668 2.828 2.986 3.033 3.436 3.572 3.849 4.113 4.352 4.473 4.707 4.926 5.249 5.458 5.662 5.96 6.23 6.477 6.731 6.981 7.289 7.586 7.865 8.203 8.526 8.83 9.185 9.588 9.967 10.371 10.804 11.255 11.721 12.226 12.797 13.361 13.962 14.599 15.307 16.023 16.758 17.513 18.11 18.197 17.925 17.45 16.956 16.48 16.024 15.563 15.109 14.645 14.243 13.863 13.479 13.105 12.751 12.422 12.063 11.727 11.443 11.147 10.813 10.511 10.215 9.923 9.675 9.412 9.143 8.871 8.592 8.385 8.162 7.818 7.57 7.302 7.161 6.869 6.578 6.281 6.127 5.702 5.567 5.353 5.126 4.634 4.365 4.093 3.805 3.455 3.035 2.48 1.294 -4 ,23420 ,KEBNE ,17125565,Thu Dec 30 16:41:31 CET,Thu Dec 30 18:29:09 CET,0.0 0.838 1.207 1.491 1.751 1.995 2.22 2.424 2.78 2.952 3.123 3.177 3.584 3.727 4.014 4.286 4.536 4.655 4.885 5.105 5.424 5.63 5.82 6.099 6.379 6.637 6.877 7.124 7.444 7.741 8.027 8.366 8.7 9.021 9.381 9.782 10.157 10.569 11.007 11.462 11.905 12.382 12.941 13.499 14.134 14.779 15.478 16.207 16.954 17.716 18.331 18.438 18.208 17.864 17.449 16.986 16.553 16.105 15.65 15.137 14.681 14.287 13.908 13.521 13.15 12.799 12.433 12.101 11.8 11.485 11.157 10.883 10.579 10.269 10.039 9.794 9.518 9.229 8.932 8.722 8.503 8.163 7.923 7.655 7.517 7.242 6.945 6.616 6.436 6.004 5.879 5.678 5.47 5.006 4.738 4.438 4.124 3.773 3.396 2.974 2.06 -5 ,14732 ,KEBNE ,17069993,Fri Dec 24 15:32:44 CET,Fri Dec 24 17:19:33 CET,0.0 0.59 0.908 1.173 1.43 1.664 1.881 2.086 2.471 2.648 2.806 2.85 3.262 3.404 3.68 3.932 4.177 4.296 4.52 4.736 5.048 5.247 5.434 5.704 5.967 6.216 6.465 6.707 7.013 7.305 7.578 7.905 8.221 8.526 8.876 9.278 9.662 10.071 10.503 10.96 11.426 11.92 12.489 13.043 13.641 14.265 14.956 15.681 16.443 17.223 17.881 18.027 17.806 17.454 17.041 16.563 16.099 15.639 15.188 14.724 14.306 13.908 13.52 13.151 12.798 12.457 12.094 11.787 11.529 11.246 10.933 10.653 10.351 10.047 9.814 9.56 9.288 9.006 8.72 8.509 8.269 7.91 7.665 7.391 7.247 6.958 6.656 6.321 6.14 5.701 5.592 5.377 5.141 4.665 4.404 4.114 3.798 3.457 3.076 2.486 1.327 -6 ,26523 ,KEBNE ,17125567,Thu Dec 30 16:41:31 CET,Thu Dec 30 18:29:49 CET,0.0 0.686 1.03 1.323 1.6 1.846 2.084 2.315 2.701 2.87 3.037 3.088 3.488 3.633 3.897 4.147 4.392 4.512 4.735 4.946 5.252 5.461 5.671 5.955 6.227 6.5 6.761 7.01 7.327 7.629 7.91 8.239 8.556 8.853 9.193 9.572 9.936 10.343 10.774 11.222 11.67 12.145 12.674 13.188 13.789 14.455 15.176 15.903 16.712 17.567 18.205 18.314 18.088 17.685 17.203 16.716 16.238 15.711 15.2 14.668 14.181 13.744 13.318 12.908 12.523 12.154 11.777 11.44 11.145 10.817 10.46 10.172 9.864 9.533 9.274 9.01 8.731 8.436 8.124 7.891 7.642 7.276 7.024 6.76 6.63 6.377 6.093 5.771 5.604 5.184 5.082 4.889 4.694 4.256 4.014 3.751 3.474 3.172 2.791 2.274 1.28 -7 ,355 ,KEBNE ,17069995,Fri Dec 24 15:36:56 CET,Fri Dec 24 17:23:07 CET,0.0 0.812 1.167 1.505 1.806 2.05 2.281 2.496 2.872 3.054 3.241 3.322 3.741 3.896 4.183 4.447 4.695 4.818 5.061 5.281 5.58 5.776 5.971 6.255 6.525 6.787 7.047 7.289 7.601 7.902 8.179 8.512 8.832 9.13 9.482 9.88 10.254 10.668 11.107 11.542 11.988 12.486 13.048 13.592 14.229 14.922 15.652 16.393 17.18 18.008 18.696 18.886 18.683 18.286 17.834 17.383 16.929 16.472 16.065 15.61 15.198 14.832 14.465 14.096 13.725 13.371 13.017 12.691 12.396 12.095 11.758 11.463 11.156 10.817 10.547 10.273 9.988 9.685 9.359 9.139 8.913 8.545 8.287 8.018 7.879 7.598 7.299 6.978 6.808 6.381 6.282 6.08 5.866 5.413 5.165 4.889 4.566 4.181 3.729 3.167 1.931 -8 ,4189 ,KEBNE ,17125569,Thu Dec 30 16:41:32 CET,Thu Dec 30 18:30:52 CET,0.0 0.977 1.39 1.723 2.029 2.293 2.517 2.74 3.164 3.349 3.514 3.582 4.005 4.157 4.448 4.722 4.976 5.098 5.328 5.542 5.856 6.06 6.252 6.539 6.824 7.089 7.33 7.57 7.878 8.166 8.447 8.791 9.115 9.421 9.773 10.171 10.559 10.97 11.38 11.807 12.249 12.738 13.317 13.882 14.5 15.131 15.816 16.566 17.411 18.264 18.963 19.162 18.95 18.576 18.14 17.686 17.264 16.829 16.397 15.899 15.472 15.111 14.74 14.365 13.99 13.645 13.27 12.911 12.616 12.318 12.0 11.725 11.422 11.088 10.841 10.591 10.325 10.035 9.723 9.509 9.289 8.935 8.676 8.422 8.301 8.051 7.79 7.485 7.311 6.881 6.778 6.59 6.398 5.962 5.717 5.458 5.181 4.883 4.533 4.093 3.057 -9 ,22640 ,KEBNE ,17069997,Fri Dec 24 15:46:29 CET,Fri Dec 24 17:28:00 CET,0.0 0.634 1.022 1.33 1.587 1.826 2.046 2.259 2.659 2.844 3.021 3.078 3.494 3.639 3.914 4.177 4.43 4.551 4.779 4.993 5.296 5.501 5.703 5.997 6.278 6.538 6.783 7.023 7.336 7.627 7.895 8.226 8.56 8.881 9.243 9.633 9.998 10.399 10.821 11.252 11.694 12.177 12.747 13.323 13.946 14.599 15.31 16.042 16.828 17.615 18.228 18.212 17.911 17.568 17.106 16.536 15.987 15.482 15.01 14.51 14.057 13.626 13.202 12.772 12.371 12.018 11.628 11.266 10.95 10.628 10.292 9.999 9.689 9.368 9.118 8.863 8.576 8.259 7.934 7.716 7.501 7.162 6.904 6.627 6.487 6.205 5.905 5.561 5.38 4.937 4.806 4.597 4.368 3.89 3.64 3.364 3.052 2.726 2.367 1.914 0.901 -10 ,25576 ,KEBNE ,17069998,Fri Dec 24 15:48:33 CET,Fri Dec 24 17:33:03 CET,0.0 1.051 1.442 1.768 2.048 2.305 2.535 2.729 3.077 3.245 3.405 3.464 3.88 4.027 4.31 4.578 4.836 4.96 5.195 5.413 5.73 5.936 6.136 6.428 6.711 6.971 7.213 7.445 7.74 8.028 8.315 8.644 8.94 9.241 9.6 9.993 10.368 10.768 11.182 11.623 12.089 12.589 13.142 13.688 14.289 14.91 15.564 16.252 16.999 17.759 18.336 18.302 17.938 17.436 16.927 16.424 15.913 15.397 14.954 14.475 14.019 13.614 13.23 12.854 12.489 12.139 11.764 11.442 11.15 10.838 10.5 10.205 9.915 9.611 9.362 9.112 8.853 8.589 8.32 8.127 7.927 7.601 7.356 7.095 6.955 6.651 6.351 6.041 5.872 5.432 5.301 5.105 4.899 4.446 4.187 3.909 3.608 3.263 2.829 2.273 1.0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt deleted file mode 100644 index f5b68f24..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30659 ,TETRA ,17664857,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:45:48 CET,0.0 0.718 1.086 1.383 1.654 1.886 2.079 2.275 2.647 2.801 2.942 2.95 3.335 3.454 3.684 3.896 4.095 4.195 4.388 4.573 4.821 4.971 5.132 5.367 5.577 5.768 5.964 6.162 6.398 6.61 6.817 7.061 7.283 7.495 7.725 7.975 8.199 8.43 8.662 8.898 9.145 9.396 9.662 9.88 10.061 10.19 10.255 10.21 10.005 9.429 8.108 6.234 4.534 3.019 1.715 0.579 -0.413 -1.319 -2.104 -2.89 -3.585 -4.208 -4.803 -5.371 -5.911 -6.409 -6.91 -7.365 -7.777 -8.205 -8.644 -9.003 -9.378 -9.775 -10.088 -10.407 -10.736 -11.078 -11.426 -11.669 -11.918 -12.303 -12.573 -12.861 -13.015 -13.334 -13.66 -14.0 -14.176 -14.637 -14.744 -14.964 -15.194 -15.687 -15.954 -16.228 -16.535 -16.886 -17.273 -17.759 -18.576 -2 ,1807 ,TETRA ,17664858,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:45:43 CET,0.0 0.743 1.11 1.399 1.646 1.874 2.082 2.283 2.635 2.789 2.94 2.961 3.359 3.486 3.728 3.961 4.18 4.283 4.481 4.668 4.935 5.102 5.265 5.514 5.736 5.925 6.104 6.273 6.484 6.693 6.897 7.132 7.351 7.565 7.787 8.021 8.237 8.464 8.692 8.915 9.134 9.375 9.621 9.809 9.953 10.05 10.096 10.024 9.774 9.155 7.811 5.981 4.208 2.636 1.31 0.11 -0.938 -1.908 -2.755 -3.603 -4.338 -4.993 -5.615 -6.201 -6.752 -7.261 -7.801 -8.306 -8.743 -9.194 -9.668 -10.054 -10.451 -10.855 -11.16 -11.479 -11.817 -12.174 -12.546 -12.806 -13.071 -13.479 -13.769 -14.076 -14.237 -14.552 -14.875 -15.239 -15.431 -15.902 -16.02 -16.248 -16.494 -16.993 -17.274 -17.583 -17.905 -18.27 -18.707 -19.236 -20.32 -3 ,21077 ,TETRA ,17664859,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:57:21 CET,0.0 0.701 1.041 1.314 1.56 1.802 2.026 2.216 2.562 2.726 2.878 2.896 3.294 3.424 3.66 3.891 4.112 4.216 4.408 4.59 4.862 5.029 5.19 5.437 5.658 5.868 6.076 6.267 6.52 6.761 6.981 7.23 7.452 7.672 7.926 8.192 8.425 8.666 8.947 9.251 9.526 9.773 10.016 10.22 10.396 10.528 10.586 10.553 10.313 9.691 8.34 6.432 4.765 3.247 1.93 0.746 -0.318 -1.302 -2.199 -3.116 -3.871 -4.527 -5.174 -5.788 -6.335 -6.82 -7.337 -7.815 -8.239 -8.704 -9.18 -9.554 -9.941 -10.336 -10.638 -10.949 -11.271 -11.61 -11.972 -12.225 -12.488 -12.913 -13.21 -13.511 -13.67 -13.999 -14.344 -14.705 -14.893 -15.362 -15.467 -15.671 -15.885 -16.361 -16.626 -16.912 -17.239 -17.588 -17.981 -18.497 -19.683 -4 ,32069 ,TETRA ,17664860,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:52:10 CET,0.0 0.648 0.977 1.266 1.527 1.751 1.956 2.143 2.494 2.65 2.797 2.815 3.205 3.329 3.571 3.825 4.057 4.162 4.37 4.561 4.832 5.006 5.173 5.412 5.632 5.855 6.068 6.258 6.498 6.731 6.953 7.196 7.416 7.62 7.854 8.101 8.338 8.593 8.827 9.077 9.316 9.523 9.746 9.967 10.185 10.337 10.398 10.381 10.165 9.539 8.151 6.289 4.661 3.198 1.896 0.716 -0.342 -1.319 -2.164 -2.995 -3.707 -4.348 -4.967 -5.571 -6.151 -6.663 -7.192 -7.686 -8.112 -8.553 -9.015 -9.396 -9.802 -10.229 -10.565 -10.929 -11.288 -11.632 -11.998 -12.257 -12.52 -12.938 -13.229 -13.52 -13.674 -14.004 -14.355 -14.732 -14.928 -15.415 -15.571 -15.794 -16.03 -16.561 -16.839 -17.129 -17.452 -17.814 -18.249 -18.807 -20.015 -5 ,26533 ,TETRA ,17664861,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:45:33 CET,0.0 0.797 1.174 1.477 1.734 1.942 2.159 2.366 2.718 2.878 3.028 3.044 3.432 3.559 3.803 4.022 4.231 4.339 4.562 4.767 5.037 5.197 5.351 5.583 5.803 6.005 6.19 6.367 6.601 6.822 7.035 7.279 7.499 7.7 7.928 8.176 8.4 8.631 8.857 9.08 9.303 9.525 9.743 9.913 10.083 10.238 10.3 10.238 9.995 9.411 8.11 6.319 4.741 3.363 2.125 0.978 -0.073 -1.048 -1.872 -2.726 -3.475 -4.16 -4.817 -5.424 -5.98 -6.492 -7.038 -7.509 -7.902 -8.313 -8.74 -9.098 -9.475 -9.867 -10.178 -10.501 -10.847 -11.213 -11.579 -11.831 -12.087 -12.492 -12.784 -13.083 -13.235 -13.561 -13.905 -14.264 -14.446 -14.908 -15.032 -15.25 -15.47 -15.933 -16.188 -16.464 -16.772 -17.125 -17.567 -18.119 -19.703 -6 ,1622 ,TETRA ,17664862,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:45:18 CET,0.0 0.804 1.201 1.477 1.71 1.929 2.133 2.346 2.762 2.926 3.078 3.124 3.53 3.662 3.898 4.109 4.294 4.387 4.578 4.757 5.009 5.172 5.326 5.543 5.756 5.964 6.163 6.351 6.573 6.783 6.979 7.212 7.437 7.636 7.861 8.114 8.34 8.566 8.795 9.019 9.239 9.451 9.664 9.838 9.993 10.135 10.196 10.142 9.924 9.239 7.678 5.69 3.889 2.296 0.952 -0.231 -1.234 -2.134 -2.912 -3.712 -4.415 -5.056 -5.682 -6.256 -6.81 -7.329 -7.85 -8.326 -8.731 -9.137 -9.566 -9.92 -10.287 -10.679 -10.998 -11.336 -11.693 -12.05 -12.405 -12.658 -12.921 -13.345 -13.632 -13.916 -14.06 -14.358 -14.678 -15.016 -15.193 -15.661 -15.781 -15.991 -16.215 -16.702 -16.969 -17.266 -17.593 -17.951 -18.352 -18.853 -19.785 -7 ,11111 ,TETRA ,17664863,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:44:35 CET,0.0 0.661 1.048 1.334 1.604 1.853 2.06 2.245 2.581 2.742 2.896 2.925 3.325 3.454 3.683 3.911 4.13 4.226 4.412 4.599 4.858 5.014 5.159 5.37 5.573 5.765 5.96 6.149 6.389 6.613 6.82 7.066 7.296 7.515 7.766 8.019 8.239 8.475 8.722 8.974 9.211 9.461 9.726 9.946 10.152 10.302 10.379 10.358 10.17 9.636 8.382 6.52 4.853 3.458 2.251 1.15 0.191 -0.714 -1.516 -2.317 -3.017 -3.648 -4.255 -4.826 -5.357 -5.84 -6.35 -6.801 -7.194 -7.602 -8.037 -8.409 -8.781 -9.157 -9.45 -9.76 -10.091 -10.429 -10.773 -11.008 -11.263 -11.67 -11.957 -12.268 -12.428 -12.758 -13.104 -13.445 -13.619 -14.092 -14.234 -14.449 -14.683 -15.199 -15.476 -15.783 -16.113 -16.443 -16.859 -17.457 -19.442 -8 ,31893 ,TETRA ,17664864,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:45:34 CET,0.0 0.776 1.157 1.46 1.751 1.999 2.203 2.399 2.726 2.869 3.019 3.035 3.427 3.558 3.811 4.05 4.263 4.368 4.572 4.764 5.039 5.203 5.356 5.588 5.809 6.02 6.221 6.409 6.659 6.9 7.113 7.36 7.59 7.794 8.013 8.248 8.465 8.688 8.912 9.135 9.364 9.597 9.834 10.037 10.22 10.383 10.486 10.469 10.244 9.607 8.174 6.21 4.466 3.0 1.755 0.595 -0.429 -1.332 -2.108 -2.905 -3.626 -4.273 -4.881 -5.44 -5.963 -6.457 -6.973 -7.433 -7.825 -8.229 -8.67 -9.046 -9.44 -9.843 -10.154 -10.489 -10.828 -11.178 -11.544 -11.802 -12.078 -12.5 -12.794 -13.098 -13.259 -13.593 -13.925 -14.27 -14.46 -14.938 -15.108 -15.341 -15.569 -16.069 -16.349 -16.657 -17.006 -17.403 -17.869 -18.438 -19.923 -9 ,22802 ,TETRA ,17664865,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:45:47 CET,0.0 0.635 0.978 1.291 1.57 1.821 2.042 2.245 2.617 2.795 2.974 3.074 3.495 3.63 3.869 4.088 4.283 4.379 4.572 4.753 5.003 5.166 5.335 5.582 5.804 6.009 6.208 6.394 6.614 6.831 7.05 7.304 7.542 7.769 8.015 8.277 8.517 8.757 8.992 9.222 9.455 9.688 9.91 10.123 10.305 10.416 10.487 10.442 10.191 9.637 8.388 6.671 5.171 3.812 2.563 1.397 0.404 -0.482 -1.265 -2.072 -2.761 -3.375 -3.971 -4.525 -5.046 -5.524 -6.02 -6.48 -6.893 -7.31 -7.727 -8.069 -8.428 -8.822 -9.131 -9.447 -9.789 -10.142 -10.492 -10.725 -10.972 -11.363 -11.644 -11.95 -12.11 -12.435 -12.762 -13.115 -13.312 -13.796 -13.919 -14.134 -14.372 -14.892 -15.165 -15.478 -15.821 -16.195 -16.641 -17.247 -18.359 -10 ,9171 ,TETRA ,17664866,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:44:45 CET,0.0 0.592 0.94 1.27 1.552 1.805 2.047 2.242 2.583 2.746 2.898 2.922 3.317 3.441 3.667 3.88 4.079 4.177 4.367 4.55 4.812 4.982 5.147 5.365 5.573 5.778 5.964 6.155 6.398 6.608 6.807 7.042 7.263 7.472 7.706 7.95 8.179 8.419 8.665 8.9 9.112 9.355 9.609 9.807 10.016 10.21 10.333 10.346 10.165 9.657 8.431 6.688 5.099 3.656 2.423 1.276 0.256 -0.656 -1.472 -2.28 -2.977 -3.617 -4.219 -4.792 -5.328 -5.822 -6.372 -6.871 -7.289 -7.722 -8.174 -8.539 -8.922 -9.336 -9.657 -9.982 -10.318 -10.667 -11.033 -11.281 -11.533 -11.938 -12.22 -12.512 -12.667 -12.975 -13.302 -13.668 -13.859 -14.329 -14.476 -14.705 -14.925 -15.39 -15.649 -15.944 -16.286 -16.695 -17.148 -17.674 -19.016 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt deleted file mode 100644 index bed53926..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18922 ,TETRA ,17664867,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 17:02:41 CET,0.0 0.784 1.201 1.538 1.824 2.082 2.31 2.523 2.919 3.096 3.273 3.36 3.778 3.924 4.217 4.504 4.776 4.903 5.151 5.397 5.731 5.935 6.138 6.436 6.718 6.982 7.224 7.46 7.76 8.045 8.317 8.645 8.961 9.261 9.605 9.979 10.335 10.728 11.127 11.515 11.923 12.37 12.873 13.374 13.907 14.471 15.097 15.714 16.316 16.826 17.082 16.836 16.316 15.663 15.03 14.401 13.763 13.16 12.639 12.085 11.577 11.143 10.729 10.326 9.952 9.611 9.244 8.905 8.619 8.319 7.995 7.71 7.406 7.096 6.859 6.601 6.324 6.038 5.76 5.571 5.356 5.011 4.761 4.492 4.361 4.098 3.808 3.503 3.321 2.854 2.721 2.505 2.283 1.807 1.563 1.304 1.005 0.66 0.239 -0.216 -1.211 -2 ,13151 ,TETRA ,17664868,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:45:44 CET,0.0 0.985 1.39 1.739 2.062 2.354 2.63 2.895 3.342 3.524 3.698 3.774 4.195 4.341 4.611 4.865 5.099 5.206 5.424 5.655 6.001 6.213 6.411 6.692 6.956 7.205 7.432 7.657 7.948 8.219 8.483 8.808 9.124 9.439 9.79 10.173 10.536 10.906 11.295 11.706 12.138 12.608 13.124 13.61 14.128 14.657 15.248 15.839 16.396 16.885 17.086 16.766 16.169 15.495 14.876 14.289 13.729 13.181 12.689 12.176 11.699 11.281 10.886 10.491 10.101 9.739 9.369 9.025 8.719 8.411 8.085 7.804 7.517 7.21 6.96 6.696 6.419 6.138 5.847 5.643 5.425 5.066 4.821 4.576 4.443 4.166 3.88 3.579 3.426 2.995 2.905 2.72 2.534 2.107 1.867 1.617 1.325 0.951 0.521 0.046 -1.283 -3 ,28202 ,TETRA ,17664869,Thu Dec 2 14:53:06 CET,Thu Dec 2 17:10:34 CET,0.0 1.114 1.618 1.975 2.283 2.554 2.802 3.016 3.394 3.584 3.769 3.836 4.263 4.409 4.703 4.987 5.248 5.372 5.622 5.868 6.217 6.43 6.634 6.941 7.221 7.468 7.702 7.926 8.212 8.497 8.766 9.071 9.356 9.635 9.971 10.356 10.724 11.095 11.47 11.864 12.274 12.715 13.203 13.688 14.229 14.77 15.321 15.887 16.433 16.89 17.143 16.841 16.278 15.674 15.081 14.507 13.912 13.311 12.812 12.302 11.837 11.419 11.003 10.594 10.205 9.832 9.435 9.083 8.786 8.483 8.163 7.892 7.607 7.299 7.047 6.785 6.522 6.251 5.946 5.745 5.55 5.204 4.94 4.67 4.54 4.274 3.988 3.671 3.481 3.019 2.933 2.762 2.571 2.113 1.846 1.569 1.256 0.87 0.453 -0.089 -1.649 -4 ,3981 ,TETRA ,17664870,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:45:37 CET,0.0 0.831 1.217 1.525 1.827 2.11 2.359 2.577 2.955 3.135 3.31 3.372 3.79 3.937 4.215 4.483 4.74 4.864 5.091 5.305 5.625 5.83 6.024 6.294 6.556 6.815 7.053 7.275 7.562 7.84 8.118 8.457 8.786 9.096 9.435 9.807 10.162 10.547 10.948 11.354 11.751 12.198 12.713 13.188 13.719 14.272 14.812 15.302 15.842 16.411 16.716 16.522 16.087 15.54 14.961 14.335 13.689 13.062 12.542 12.018 11.548 11.126 10.71 10.298 9.898 9.54 9.165 8.823 8.523 8.205 7.851 7.549 7.241 6.919 6.665 6.392 6.092 5.776 5.465 5.254 5.043 4.718 4.478 4.223 4.091 3.811 3.516 3.206 3.037 2.593 2.528 2.336 2.136 1.713 1.472 1.226 0.932 0.568 0.166 -0.367 -2.089 -5 ,22399 ,TETRA ,17664871,Thu Dec 2 14:53:04 CET,Thu Dec 2 16:45:42 CET,0.0 0.871 1.337 1.691 1.98 2.234 2.47 2.686 3.106 3.295 3.464 3.514 3.935 4.09 4.396 4.674 4.924 5.045 5.282 5.504 5.819 6.029 6.233 6.537 6.822 7.091 7.347 7.595 7.911 8.209 8.488 8.807 9.103 9.392 9.714 10.064 10.413 10.809 11.232 11.652 12.068 12.51 13.04 13.577 14.154 14.745 15.368 16.024 16.673 17.188 17.462 17.184 16.618 15.978 15.324 14.666 14.047 13.46 12.941 12.382 11.875 11.421 10.971 10.545 10.153 9.79 9.394 9.029 8.717 8.392 8.035 7.726 7.417 7.099 6.844 6.584 6.315 6.038 5.746 5.536 5.325 5.001 4.765 4.514 4.385 4.122 3.839 3.527 3.358 2.921 2.846 2.653 2.439 1.996 1.739 1.46 1.163 0.832 0.449 -0.009 -1.204 -6 ,29210 ,TETRA ,17664872,Thu Dec 2 14:53:05 CET,Thu Dec 2 16:45:26 CET,0.0 0.577 0.932 1.226 1.493 1.747 1.974 2.176 2.566 2.75 2.929 2.981 3.402 3.569 3.881 4.142 4.376 4.493 4.736 4.974 5.309 5.511 5.719 6.031 6.319 6.584 6.83 7.07 7.371 7.656 7.923 8.23 8.529 8.814 9.133 9.489 9.832 10.203 10.589 10.988 11.403 11.845 12.34 12.84 13.381 13.936 14.537 15.097 15.599 16.043 16.239 15.89 15.351 14.763 14.151 13.536 12.943 12.368 11.855 11.302 10.829 10.412 9.997 9.597 9.211 8.849 8.479 8.143 7.845 7.518 7.18 6.906 6.607 6.287 6.021 5.742 5.452 5.144 4.83 4.618 4.401 4.052 3.815 3.574 3.45 3.189 2.916 2.634 2.483 2.063 1.965 1.771 1.571 1.132 0.89 0.625 0.34 0.047 -0.28 -0.699 -1.908 -7 ,6131 ,TETRA ,17664873,Thu Dec 2 14:53:05 CET,Thu Dec 2 16:45:41 CET,0.0 0.846 1.272 1.589 1.856 2.095 2.32 2.546 2.962 3.14 3.309 3.378 3.807 3.966 4.274 4.56 4.835 4.963 5.213 5.454 5.78 5.997 6.207 6.496 6.763 7.03 7.292 7.543 7.858 8.155 8.437 8.767 9.079 9.371 9.699 10.065 10.406 10.779 11.191 11.619 12.067 12.563 13.086 13.599 14.185 14.767 15.339 15.94 16.609 17.211 17.596 17.426 16.966 16.431 15.869 15.284 14.704 14.139 13.608 13.062 12.589 12.141 11.697 11.27 10.88 10.535 10.154 9.784 9.467 9.14 8.793 8.508 8.222 7.901 7.632 7.361 7.089 6.817 6.533 6.33 6.108 5.717 5.454 5.209 5.075 4.718 4.336 4.006 3.845 3.422 3.323 3.123 2.918 2.46 2.192 1.899 1.589 1.273 0.897 0.374 -0.855 -8 ,14171 ,TETRA ,17664874,Thu Dec 2 14:53:06 CET,Thu Dec 2 16:45:44 CET,0.0 0.901 1.321 1.665 1.954 2.237 2.496 2.714 3.116 3.296 3.468 3.524 3.96 4.119 4.398 4.659 4.931 5.07 5.322 5.543 5.891 6.115 6.307 6.605 6.895 7.166 7.422 7.665 7.967 8.253 8.534 8.87 9.188 9.48 9.824 10.208 10.569 10.954 11.357 11.78 12.21 12.676 13.194 13.684 14.2 14.748 15.352 15.926 16.464 16.938 17.136 16.787 16.264 15.705 15.114 14.497 13.909 13.349 12.855 12.332 11.87 11.434 10.991 10.566 10.166 9.793 9.411 9.077 8.778 8.458 8.101 7.793 7.474 7.142 6.885 6.62 6.352 6.072 5.773 5.56 5.334 4.985 4.755 4.511 4.382 4.118 3.817 3.508 3.346 2.907 2.806 2.611 2.421 2.014 1.785 1.517 1.233 0.929 0.552 0.055 -1.555 -9 ,26089 ,TETRA ,17664875,Thu Dec 2 14:53:05 CET,Thu Dec 2 16:58:39 CET,0.0 0.802 1.258 1.638 1.942 2.217 2.469 2.7 3.127 3.329 3.524 3.605 4.038 4.191 4.477 4.749 5.011 5.141 5.4 5.639 5.971 6.173 6.368 6.651 6.934 7.195 7.433 7.675 7.99 8.281 8.569 8.916 9.228 9.52 9.84 10.202 10.554 10.97 11.421 11.851 12.279 12.72 13.2 13.66 14.175 14.714 15.29 15.888 16.468 16.936 17.141 16.822 16.247 15.616 14.994 14.357 13.756 13.194 12.673 12.103 11.612 11.177 10.761 10.368 9.979 9.611 9.218 8.867 8.547 8.209 7.882 7.61 7.326 7.023 6.781 6.515 6.236 5.942 5.633 5.423 5.208 4.87 4.627 4.379 4.251 3.973 3.679 3.382 3.226 2.799 2.732 2.553 2.351 1.872 1.598 1.32 1.032 0.717 0.358 -0.22 -2.178 -10 ,2420 ,TETRA ,17664876,Thu Dec 2 14:53:06 CET,Thu Dec 2 16:46:05 CET,0.0 0.499 0.881 1.199 1.474 1.735 1.972 2.196 2.649 2.861 3.064 3.147 3.579 3.736 4.029 4.302 4.564 4.687 4.933 5.167 5.487 5.691 5.89 6.172 6.438 6.691 6.938 7.179 7.483 7.775 8.057 8.381 8.686 8.99 9.337 9.713 10.075 10.479 10.906 11.346 11.789 12.279 12.823 13.334 13.889 14.459 15.076 15.688 16.288 16.831 17.111 16.82 16.265 15.591 14.883 14.174 13.5 12.882 12.343 11.753 11.212 10.727 10.264 9.829 9.421 9.03 8.611 8.248 7.933 7.6 7.247 6.947 6.644 6.329 6.071 5.785 5.486 5.185 4.878 4.667 4.444 4.087 3.837 3.575 3.44 3.155 2.85 2.528 2.357 1.913 1.822 1.628 1.425 0.986 0.751 0.504 0.23 -0.074 -0.431 -0.878 -1.86 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt deleted file mode 100644 index 6199a34b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/protein/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30611 ,TETRA ,17664877,Thu Dec 2 14:53:06 CET,Thu Dec 2 16:45:45 CET,0.0 0.972 1.435 1.791 2.09 2.367 2.606 2.82 3.253 3.46 3.645 3.715 4.14 4.296 4.598 4.898 5.186 5.314 5.554 5.801 6.163 6.396 6.62 6.926 7.216 7.503 7.793 8.066 8.418 8.76 9.075 9.458 9.814 10.142 10.513 10.934 11.35 11.791 12.279 12.796 13.315 13.887 14.54 15.16 15.883 16.714 17.608 18.512 19.487 20.528 21.429 21.747 21.634 21.274 20.804 20.316 19.845 19.382 18.96 18.536 18.159 17.795 17.424 17.057 16.694 16.351 15.991 15.663 15.372 15.063 14.73 14.446 14.159 13.861 13.632 13.397 13.145 12.875 12.597 12.403 12.199 11.865 11.625 11.379 11.259 11.022 10.761 10.47 10.317 9.897 9.828 9.656 9.48 9.077 8.849 8.59 8.306 8.018 7.697 7.279 6.075 -2 ,2165 ,TETRA ,17664878,Thu Dec 2 14:53:06 CET,Thu Dec 2 17:00:40 CET,0.0 0.754 1.17 1.53 1.846 2.114 2.367 2.62 3.067 3.256 3.435 3.508 3.938 4.096 4.401 4.696 4.983 5.118 5.367 5.614 5.964 6.183 6.392 6.695 6.987 7.269 7.551 7.819 8.144 8.46 8.766 9.128 9.481 9.823 10.219 10.658 11.057 11.488 11.96 12.459 12.97 13.509 14.123 14.733 15.399 16.1 16.906 17.788 18.692 19.613 20.478 20.773 20.618 20.3 19.881 19.396 18.914 18.465 18.052 17.595 17.184 16.798 16.423 16.07 15.705 15.358 15.007 14.689 14.419 14.136 13.834 13.578 13.295 12.99 12.76 12.535 12.296 12.043 11.759 11.556 11.356 11.05 10.834 10.608 10.494 10.24 9.96 9.675 9.532 9.123 9.077 8.904 8.721 8.32 8.089 7.853 7.584 7.275 6.921 6.463 5.146 -4 ,14177 ,TETRA ,17664880,Thu Dec 2 14:53:06 CET,Thu Dec 2 16:47:02 CET,0.0 0.843 1.253 1.582 1.887 2.149 2.376 2.602 3.036 3.235 3.416 3.485 3.908 4.056 4.346 4.634 4.907 5.038 5.291 5.527 5.871 6.101 6.317 6.623 6.922 7.211 7.484 7.741 8.071 8.397 8.716 9.09 9.438 9.776 10.165 10.608 11.038 11.491 11.985 12.489 12.996 13.558 14.19 14.823 15.544 16.323 17.178 18.063 19.003 19.951 20.76 21.02 20.878 20.561 20.173 19.749 19.3 18.844 18.43 18.003 17.6 17.22 16.867 16.512 16.145 15.8 15.453 15.139 14.854 14.55 14.237 13.975 13.686 13.388 13.167 12.933 12.677 12.41 12.137 11.939 11.726 11.405 11.184 10.945 10.818 10.561 10.287 9.996 9.847 9.431 9.374 9.203 9.01 8.604 8.383 8.147 7.911 7.626 7.274 6.811 5.767 -5 ,5502 ,TETRA ,17664881,Thu Dec 2 14:53:06 CET,Thu Dec 2 16:45:42 CET,0.0 0.746 1.155 1.488 1.767 2.023 2.262 2.479 2.872 3.06 3.248 3.328 3.757 3.917 4.22 4.522 4.811 4.947 5.214 5.46 5.806 6.032 6.25 6.568 6.865 7.145 7.423 7.693 8.027 8.339 8.655 9.036 9.397 9.752 10.143 10.56 10.97 11.418 11.904 12.427 12.94 13.471 14.065 14.653 15.338 16.094 16.88 17.653 18.488 19.349 20.11 20.449 20.361 20.004 19.531 19.027 18.548 18.093 17.647 17.158 16.737 16.357 15.985 15.615 15.259 14.927 14.564 14.23 13.948 13.662 13.357 13.095 12.821 12.525 12.29 12.046 11.791 11.524 11.248 11.054 10.854 10.53 10.31 10.09 9.975 9.715 9.427 9.134 8.987 8.572 8.502 8.33 8.152 7.747 7.518 7.275 7.002 6.711 6.394 5.926 5.215 -6 ,26880 ,TETRA ,17664882,Thu Dec 2 14:53:06 CET,Thu Dec 2 16:58:06 CET,0.0 0.844 1.284 1.646 1.948 2.202 2.446 2.684 3.112 3.313 3.502 3.585 4.03 4.198 4.511 4.816 5.099 5.229 5.477 5.723 6.075 6.293 6.508 6.822 7.124 7.415 7.684 7.949 8.298 8.612 8.905 9.273 9.64 9.989 10.376 10.786 11.18 11.615 12.077 12.574 13.08 13.621 14.242 14.85 15.536 16.255 17.046 17.901 18.793 19.678 20.498 20.784 20.598 20.237 19.816 19.36 18.916 18.482 18.055 17.588 17.183 16.807 16.427 16.069 15.732 15.401 15.051 14.733 14.442 14.142 13.832 13.57 13.297 13.003 12.762 12.512 12.257 11.997 11.732 11.544 11.345 11.044 10.832 10.6 10.478 10.219 9.934 9.632 9.482 9.071 8.989 8.802 8.608 8.174 7.939 7.705 7.433 7.121 6.797 6.443 5.641 -7 ,9384 ,TETRA ,17664883,Thu Dec 2 14:53:06 CET,Thu Dec 2 17:01:11 CET,0.0 0.849 1.237 1.584 1.896 2.173 2.434 2.662 3.088 3.297 3.486 3.563 3.998 4.156 4.456 4.735 4.998 5.121 5.36 5.596 5.944 6.173 6.401 6.735 7.037 7.322 7.601 7.87 8.22 8.557 8.868 9.236 9.588 9.924 10.313 10.751 11.159 11.606 12.082 12.562 13.053 13.608 14.252 14.887 15.583 16.314 17.13 17.969 18.796 19.593 20.261 20.389 20.198 19.862 19.451 19.002 18.551 18.1 17.695 17.26 16.866 16.497 16.127 15.783 15.458 15.147 14.794 14.468 14.196 13.908 13.579 13.314 13.063 12.793 12.576 12.336 12.081 11.825 11.559 11.372 11.184 10.892 10.677 10.447 10.336 10.106 9.832 9.525 9.371 8.946 8.867 8.689 8.506 8.126 7.918 7.696 7.443 7.155 6.816 6.337 5.253 -8 ,28741 ,TETRA ,17664884,Thu Dec 2 14:53:05 CET,Thu Dec 2 16:46:09 CET,0.0 0.922 1.343 1.705 2.032 2.311 2.552 2.787 3.213 3.396 3.568 3.618 4.05 4.208 4.509 4.799 5.085 5.224 5.487 5.746 6.122 6.359 6.585 6.899 7.201 7.504 7.782 8.055 8.403 8.724 9.037 9.397 9.736 10.07 10.467 10.901 11.306 11.764 12.262 12.779 13.314 13.91 14.578 15.188 15.85 16.58 17.372 18.214 19.143 20.021 20.768 20.974 20.729 20.337 19.901 19.401 18.894 18.434 18.011 17.546 17.133 16.751 16.357 15.95 15.579 15.247 14.899 14.586 14.308 14.014 13.698 13.433 13.154 12.854 12.62 12.37 12.101 11.829 11.538 11.333 11.128 10.809 10.584 10.343 10.221 9.978 9.713 9.427 9.276 8.862 8.789 8.61 8.424 8.012 7.791 7.562 7.302 7.019 6.705 6.295 5.406 -9 ,10807 ,TETRA ,17664885,Thu Dec 2 14:53:06 CET,Thu Dec 2 17:01:31 CET,0.0 0.918 1.351 1.686 1.992 2.249 2.48 2.703 3.115 3.307 3.492 3.551 3.979 4.136 4.432 4.704 4.981 5.122 5.387 5.646 6.015 6.241 6.455 6.768 7.081 7.382 7.668 7.941 8.281 8.605 8.927 9.312 9.679 10.036 10.43 10.871 11.291 11.724 12.206 12.748 13.304 13.877 14.516 15.148 15.852 16.629 17.496 18.394 19.332 20.239 20.971 21.199 21.04 20.715 20.299 19.811 19.321 18.855 18.443 18.008 17.611 17.224 16.829 16.458 16.101 15.761 15.404 15.066 14.759 14.451 14.135 13.864 13.585 13.305 13.077 12.826 12.571 12.322 12.065 11.879 11.68 11.373 11.162 10.934 10.805 10.532 10.255 9.956 9.794 9.365 9.287 9.103 8.902 8.475 8.235 7.983 7.688 7.33 6.94 6.437 5.398 -10 ,24615 ,TETRA ,17664886,Thu Dec 2 14:53:06 CET,Thu Dec 2 16:46:24 CET,0.0 0.702 1.101 1.449 1.757 2.018 2.258 2.49 2.912 3.106 3.287 3.369 3.82 3.99 4.291 4.596 4.882 5.018 5.285 5.534 5.891 6.121 6.346 6.658 6.946 7.229 7.505 7.781 8.144 8.478 8.792 9.175 9.547 9.908 10.326 10.783 11.218 11.691 12.184 12.7 13.231 13.805 14.444 15.064 15.767 16.484 17.228 18.006 18.861 19.725 20.382 20.521 20.289 19.922 19.522 19.029 18.524 18.048 17.598 17.121 16.706 16.309 15.923 15.568 15.215 14.882 14.532 14.212 13.925 13.617 13.298 13.028 12.742 12.446 12.207 11.953 11.7 11.442 11.168 10.978 10.778 10.449 10.22 9.987 9.865 9.614 9.334 9.043 8.894 8.473 8.402 8.215 8.014 7.599 7.38 7.14 6.859 6.542 6.211 5.81 4.901 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 973c3364..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31451 ,KEBNE ,16691991,Thu Nov 25 16:21:40 CET,Thu Nov 25 17:56:52 CET,0.0 0.46 0.764 1.022 1.245 1.444 1.628 1.809 2.15 2.309 2.458 2.475 2.854 2.98 3.223 3.449 3.655 3.753 3.948 4.13 4.39 4.55 4.706 4.939 5.155 5.362 5.567 5.758 6.002 6.233 6.448 6.693 6.912 7.123 7.38 7.661 7.905 8.165 8.426 8.679 8.962 9.291 9.651 9.929 10.158 10.413 10.654 10.772 10.775 10.529 9.673 8.308 7.038 5.901 4.909 3.97 3.11 2.294 1.573 0.881 0.278 -0.267 -0.828 -1.397 -1.895 -2.336 -2.813 -3.252 -3.638 -4.053 -4.486 -4.828 -5.189 -5.573 -5.866 -6.16 -6.465 -6.782 -7.12 -7.361 -7.602 -7.978 -8.241 -8.525 -8.677 -8.99 -9.319 -9.663 -9.844 -10.289 -10.397 -10.599 -10.818 -11.294 -11.558 -11.833 -12.149 -12.501 -12.895 -13.418 -14.657 -2 ,10539 ,KEBNE ,16691992,Thu Nov 25 16:21:40 CET,Thu Nov 25 17:53:23 CET,0.0 0.43 0.717 0.969 1.182 1.376 1.563 1.736 2.063 2.216 2.353 2.366 2.741 2.857 3.093 3.315 3.512 3.612 3.813 4.001 4.258 4.419 4.584 4.821 5.034 5.226 5.404 5.582 5.815 6.021 6.225 6.486 6.726 6.941 7.184 7.466 7.721 7.987 8.225 8.441 8.693 8.962 9.24 9.482 9.705 9.92 10.106 10.231 10.197 9.931 9.143 7.817 6.538 5.372 4.359 3.427 2.55 1.725 1.004 0.3 -0.293 -0.836 -1.399 -1.972 -2.51 -2.998 -3.5 -3.954 -4.338 -4.71 -5.113 -5.478 -5.854 -6.233 -6.53 -6.841 -7.182 -7.554 -7.915 -8.149 -8.401 -8.803 -9.079 -9.359 -9.5 -9.795 -10.113 -10.45 -10.627 -11.074 -11.198 -11.398 -11.603 -12.058 -12.32 -12.614 -12.937 -13.293 -13.7 -14.202 -15.15 -3 ,7882 ,KEBNE ,16691993,Thu Nov 25 16:21:40 CET,Thu Nov 25 17:54:44 CET,0.0 0.567 0.896 1.155 1.376 1.586 1.777 1.948 2.263 2.415 2.557 2.584 2.971 3.088 3.307 3.512 3.709 3.811 4.003 4.192 4.457 4.62 4.776 4.99 5.195 5.406 5.61 5.78 5.999 6.229 6.44 6.688 6.928 7.158 7.415 7.686 7.95 8.231 8.502 8.752 8.986 9.246 9.519 9.734 9.951 10.123 10.219 10.267 10.194 9.871 9.109 7.882 6.677 5.593 4.541 3.525 2.655 1.897 1.238 0.547 -0.082 -0.665 -1.219 -1.748 -2.217 -2.633 -3.102 -3.562 -3.961 -4.357 -4.774 -5.111 -5.45 -5.819 -6.122 -6.444 -6.782 -7.131 -7.489 -7.736 -7.995 -8.39 -8.665 -8.957 -9.102 -9.403 -9.723 -10.061 -10.238 -10.683 -10.833 -11.051 -11.269 -11.734 -11.99 -12.27 -12.592 -12.964 -13.383 -13.912 -15.169 -4 ,7231 ,KEBNE ,16691994,Thu Nov 25 16:21:40 CET,Thu Nov 25 17:57:15 CET,0.0 0.512 0.817 1.09 1.319 1.515 1.698 1.876 2.188 2.328 2.471 2.49 2.873 3.001 3.241 3.463 3.674 3.777 3.97 4.144 4.392 4.562 4.722 4.944 5.159 5.366 5.567 5.744 5.973 6.208 6.423 6.671 6.916 7.146 7.408 7.696 7.949 8.199 8.447 8.706 8.938 9.179 9.464 9.684 9.899 10.089 10.244 10.342 10.301 10.002 9.146 7.834 6.608 5.505 4.479 3.492 2.593 1.759 1.034 0.313 -0.32 -0.894 -1.452 -1.975 -2.466 -2.936 -3.447 -3.91 -4.303 -4.703 -5.126 -5.493 -5.874 -6.266 -6.571 -6.886 -7.209 -7.535 -7.868 -8.107 -8.359 -8.746 -9.018 -9.306 -9.452 -9.75 -10.072 -10.414 -10.595 -11.042 -11.169 -11.379 -11.606 -12.075 -12.334 -12.627 -12.933 -13.264 -13.66 -14.203 -15.252 -5 ,12772 ,KEBNE ,16691995,Thu Nov 25 16:21:40 CET,Thu Nov 25 17:55:26 CET,0.0 0.467 0.748 1.007 1.235 1.435 1.626 1.799 2.107 2.249 2.39 2.4 2.782 2.909 3.143 3.364 3.578 3.682 3.877 4.057 4.315 4.48 4.634 4.859 5.08 5.276 5.459 5.649 5.895 6.121 6.338 6.595 6.823 7.033 7.29 7.57 7.796 8.025 8.274 8.532 8.778 9.019 9.314 9.613 9.919 10.198 10.404 10.517 10.5 10.234 9.455 8.127 6.864 5.723 4.665 3.695 2.865 2.105 1.421 0.751 0.179 -0.332 -0.824 -1.328 -1.834 -2.307 -2.789 -3.22 -3.585 -3.952 -4.357 -4.703 -5.069 -5.465 -5.772 -6.083 -6.39 -6.693 -7.026 -7.271 -7.528 -7.939 -8.216 -8.5 -8.648 -8.943 -9.24 -9.566 -9.743 -10.197 -10.35 -10.56 -10.78 -11.218 -11.454 -11.73 -12.018 -12.344 -12.76 -13.31 -14.393 -6 ,21721 ,KEBNE ,16691996,Thu Nov 25 16:21:40 CET,Thu Nov 25 17:57:36 CET,0.0 0.506 0.835 1.106 1.331 1.539 1.725 1.888 2.189 2.341 2.482 2.484 2.862 2.981 3.204 3.419 3.638 3.738 3.923 4.101 4.352 4.511 4.661 4.874 5.093 5.303 5.498 5.687 5.925 6.15 6.368 6.604 6.826 7.038 7.238 7.452 7.681 7.945 8.216 8.45 8.687 8.979 9.263 9.491 9.769 10.054 10.261 10.445 10.532 10.245 9.43 8.18 6.992 5.93 4.915 3.953 3.108 2.294 1.578 0.866 0.276 -0.264 -0.839 -1.358 -1.841 -2.322 -2.816 -3.248 -3.625 -4.027 -4.445 -4.789 -5.152 -5.53 -5.827 -6.131 -6.457 -6.802 -7.15 -7.397 -7.662 -8.074 -8.355 -8.652 -8.799 -9.102 -9.427 -9.769 -9.948 -10.4 -10.563 -10.785 -11.015 -11.517 -11.788 -12.08 -12.382 -12.723 -13.146 -13.698 -14.936 -7 ,23285 ,KEBNE ,16691997,Thu Nov 25 16:21:40 CET,Thu Nov 25 17:55:20 CET,0.0 0.675 0.983 1.237 1.453 1.658 1.865 2.051 2.358 2.506 2.652 2.668 3.047 3.167 3.391 3.617 3.824 3.916 4.101 4.286 4.557 4.728 4.889 5.124 5.334 5.537 5.755 5.964 6.21 6.438 6.662 6.93 7.179 7.409 7.664 7.913 8.141 8.41 8.69 8.961 9.229 9.512 9.779 10.022 10.277 10.473 10.661 10.811 10.792 10.513 9.695 8.413 7.212 6.099 5.115 4.196 3.337 2.545 1.837 1.103 0.472 -0.109 -0.679 -1.179 -1.655 -2.116 -2.607 -3.066 -3.47 -3.89 -4.317 -4.671 -5.03 -5.394 -5.687 -6.0 -6.325 -6.657 -6.987 -7.218 -7.469 -7.854 -8.125 -8.406 -8.547 -8.85 -9.159 -9.469 -9.639 -10.08 -10.2 -10.397 -10.603 -11.087 -11.367 -11.68 -12.019 -12.366 -12.739 -13.197 -14.571 -8 ,13152 ,KEBNE ,16691998,Thu Nov 25 16:21:41 CET,Thu Nov 25 17:57:33 CET,0.0 0.636 0.955 1.212 1.415 1.602 1.792 1.98 2.345 2.514 2.673 2.695 3.065 3.178 3.391 3.61 3.824 3.919 4.099 4.269 4.525 4.698 4.852 5.066 5.275 5.474 5.662 5.841 6.081 6.311 6.528 6.776 7.0 7.217 7.472 7.747 8.005 8.259 8.506 8.795 9.087 9.363 9.663 9.952 10.206 10.413 10.614 10.715 10.626 10.274 9.451 8.173 6.898 5.727 4.694 3.77 2.926 2.14 1.426 0.671 0.035 -0.561 -1.156 -1.691 -2.181 -2.646 -3.159 -3.606 -3.973 -4.372 -4.796 -5.142 -5.501 -5.867 -6.149 -6.456 -6.777 -7.091 -7.426 -7.676 -7.935 -8.319 -8.596 -8.879 -9.025 -9.343 -9.675 -10.029 -10.208 -10.646 -10.759 -10.971 -11.197 -11.709 -11.999 -12.289 -12.6 -12.955 -13.379 -13.943 -15.037 -9 ,14384 ,KEBNE ,16691999,Thu Nov 25 16:21:40 CET,Thu Nov 25 17:57:15 CET,0.0 0.442 0.775 1.016 1.23 1.421 1.599 1.774 2.094 2.241 2.385 2.392 2.768 2.891 3.118 3.347 3.575 3.678 3.867 4.038 4.287 4.445 4.605 4.841 5.056 5.263 5.47 5.659 5.895 6.128 6.345 6.603 6.844 7.059 7.304 7.564 7.77 7.997 8.267 8.563 8.849 9.131 9.414 9.67 9.972 10.258 10.489 10.593 10.529 10.257 9.445 8.13 6.918 5.812 4.787 3.849 3.018 2.19 1.45 0.764 0.163 -0.389 -0.916 -1.448 -1.921 -2.347 -2.827 -3.238 -3.596 -3.986 -4.395 -4.725 -5.066 -5.438 -5.743 -6.055 -6.348 -6.658 -6.996 -7.231 -7.476 -7.861 -8.132 -8.421 -8.572 -8.883 -9.199 -9.543 -9.727 -10.18 -10.347 -10.561 -10.765 -11.22 -11.487 -11.766 -12.056 -12.375 -12.75 -13.245 -14.312 -10 ,21681 ,KEBNE ,16692000,Thu Nov 25 16:22:42 CET,Thu Nov 25 17:54:28 CET,0.0 0.373 0.646 0.891 1.106 1.298 1.484 1.656 1.986 2.137 2.276 2.294 2.669 2.791 3.026 3.235 3.432 3.529 3.722 3.908 4.171 4.331 4.482 4.708 4.92 5.112 5.305 5.494 5.724 5.946 6.161 6.41 6.653 6.89 7.162 7.448 7.705 7.964 8.221 8.497 8.782 9.057 9.299 9.545 9.799 10.018 10.196 10.223 10.105 9.792 9.031 7.81 6.66 5.601 4.665 3.8 2.98 2.18 1.443 0.673 0.038 -0.499 -1.043 -1.575 -2.096 -2.582 -3.095 -3.537 -3.902 -4.289 -4.715 -5.081 -5.455 -5.84 -6.14 -6.459 -6.776 -7.083 -7.425 -7.672 -7.923 -8.324 -8.611 -8.898 -9.047 -9.363 -9.691 -10.035 -10.212 -10.651 -10.756 -10.963 -11.185 -11.63 -11.876 -12.159 -12.457 -12.806 -13.26 -13.855 -15.014 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index cde4e7ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-42_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5450 ,KEBNE ,16692001,Thu Nov 25 16:22:42 CET,Thu Nov 25 17:54:07 CET,0.0 0.5 0.823 1.089 1.303 1.512 1.716 1.901 2.229 2.377 2.527 2.557 2.945 3.073 3.308 3.535 3.766 3.875 4.076 4.275 4.545 4.718 4.89 5.138 5.373 5.59 5.788 5.983 6.245 6.479 6.688 6.923 7.126 7.31 7.53 7.773 7.976 8.168 8.359 8.551 8.695 8.816 8.931 9.045 9.118 9.077 8.967 8.688 8.104 7.049 5.102 2.607 0.519 -1.309 -2.887 -4.26 -5.491 -6.603 -7.568 -8.547 -9.374 -10.116 -10.824 -11.473 -12.068 -12.597 -13.159 -13.68 -14.133 -14.609 -15.106 -15.523 -15.964 -16.41 -16.743 -17.096 -17.447 -17.811 -18.203 -18.463 -18.726 -19.129 -19.413 -19.704 -19.857 -20.18 -20.517 -20.883 -21.072 -21.544 -21.691 -21.91 -22.136 -22.632 -22.907 -23.197 -23.499 -23.831 -24.232 -24.727 -25.831 -2 ,2179 ,KEBNE ,16692002,Thu Nov 25 16:22:42 CET,Thu Nov 25 17:55:24 CET,0.0 0.417 0.733 1.0 1.242 1.455 1.658 1.865 2.244 2.41 2.57 2.613 3.003 3.14 3.405 3.652 3.878 3.988 4.199 4.396 4.674 4.851 5.024 5.274 5.505 5.719 5.931 6.128 6.36 6.587 6.8 7.018 7.204 7.393 7.616 7.853 8.072 8.311 8.577 8.844 9.054 9.201 9.349 9.48 9.571 9.576 9.412 9.041 8.404 7.372 5.436 2.921 0.8 -1.008 -2.58 -3.969 -5.122 -6.162 -7.063 -7.924 -8.684 -9.436 -10.136 -10.749 -11.348 -11.905 -12.479 -12.968 -13.393 -13.863 -14.356 -14.757 -15.171 -15.606 -15.952 -16.308 -16.662 -17.027 -17.419 -17.689 -17.969 -18.392 -18.678 -18.975 -19.126 -19.435 -19.77 -20.127 -20.306 -20.767 -20.894 -21.115 -21.343 -21.804 -22.062 -22.352 -22.673 -23.014 -23.413 -23.903 -24.689 -3 ,10361 ,KEBNE ,16692003,Thu Nov 25 16:22:42 CET,Thu Nov 25 17:55:43 CET,0.0 0.649 0.977 1.24 1.466 1.672 1.866 2.053 2.414 2.588 2.751 2.802 3.197 3.34 3.601 3.818 4.019 4.128 4.348 4.543 4.815 4.993 5.172 5.423 5.648 5.861 6.069 6.269 6.523 6.76 6.987 7.244 7.474 7.701 7.955 8.196 8.389 8.595 8.802 8.971 9.139 9.319 9.484 9.577 9.617 9.63 9.566 9.296 8.714 7.692 5.748 3.226 1.075 -0.706 -2.255 -3.68 -4.877 -5.937 -6.888 -7.817 -8.593 -9.311 -10.006 -10.665 -11.279 -11.849 -12.45 -12.958 -13.395 -13.87 -14.361 -14.766 -15.19 -15.634 -15.977 -16.332 -16.694 -17.06 -17.445 -17.714 -17.995 -18.428 -18.725 -19.034 -19.195 -19.533 -19.889 -20.264 -20.453 -20.919 -21.067 -21.293 -21.517 -22.009 -22.275 -22.565 -22.886 -23.244 -23.627 -24.086 -25.109 -4 ,26862 ,KEBNE ,16692004,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:00:43 CET,0.0 0.864 1.321 1.697 2.03 2.322 2.59 2.84 3.255 3.449 3.638 3.729 4.138 4.284 4.556 4.808 5.039 5.146 5.352 5.539 5.793 5.967 6.138 6.365 6.573 6.774 6.988 7.191 7.432 7.655 7.862 8.102 8.323 8.53 8.75 8.952 9.12 9.309 9.493 9.676 9.859 10.052 10.239 10.363 10.427 10.428 10.347 10.085 9.537 8.491 6.504 3.992 1.898 0.145 -1.348 -2.691 -3.891 -4.979 -5.909 -6.839 -7.664 -8.361 -8.997 -9.65 -10.238 -10.766 -11.318 -11.813 -12.261 -12.71 -13.174 -13.569 -13.982 -14.411 -14.745 -15.104 -15.473 -15.849 -16.242 -16.504 -16.761 -17.166 -17.463 -17.771 -17.926 -18.242 -18.581 -18.93 -19.11 -19.574 -19.7 -19.92 -20.147 -20.621 -20.877 -21.158 -21.467 -21.818 -22.25 -22.792 -23.743 -5 ,4385 ,KEBNE ,16692005,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:00:22 CET,0.0 0.559 0.916 1.195 1.428 1.644 1.868 2.085 2.457 2.625 2.785 2.843 3.239 3.379 3.657 3.915 4.143 4.248 4.462 4.658 4.904 5.069 5.238 5.479 5.707 5.916 6.11 6.29 6.51 6.731 6.935 7.178 7.407 7.626 7.857 8.078 8.275 8.478 8.718 8.96 9.164 9.332 9.487 9.645 9.731 9.717 9.586 9.291 8.722 7.629 5.601 3.091 1.005 -0.723 -2.223 -3.579 -4.731 -5.784 -6.687 -7.574 -8.364 -9.083 -9.753 -10.379 -10.966 -11.507 -12.095 -12.628 -13.082 -13.555 -14.048 -14.453 -14.877 -15.309 -15.633 -15.979 -16.339 -16.713 -17.109 -17.369 -17.631 -18.059 -18.363 -18.674 -18.837 -19.169 -19.511 -19.878 -20.067 -20.536 -20.674 -20.889 -21.126 -21.659 -21.929 -22.213 -22.537 -22.898 -23.305 -23.809 -24.94 -6 ,21977 ,KEBNE ,16692006,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:00:24 CET,0.0 0.783 1.193 1.503 1.756 1.984 2.2 2.411 2.813 2.996 3.162 3.217 3.602 3.736 4.002 4.258 4.484 4.588 4.792 4.986 5.269 5.447 5.606 5.84 6.07 6.273 6.452 6.649 6.917 7.134 7.33 7.577 7.795 7.977 8.179 8.379 8.575 8.812 9.05 9.295 9.517 9.712 9.886 10.008 10.086 10.054 9.895 9.625 9.068 8.004 6.03 3.526 1.451 -0.306 -1.831 -3.239 -4.474 -5.567 -6.512 -7.45 -8.265 -8.998 -9.68 -10.309 -10.884 -11.408 -11.968 -12.462 -12.894 -13.369 -13.86 -14.251 -14.667 -15.12 -15.463 -15.802 -16.154 -16.528 -16.917 -17.181 -17.449 -17.886 -18.19 -18.504 -18.67 -19.015 -19.369 -19.725 -19.915 -20.392 -20.536 -20.748 -20.975 -21.478 -21.743 -22.022 -22.327 -22.661 -23.052 -23.575 -24.672 -7 ,4176 ,KEBNE ,16692007,Thu Nov 25 16:28:55 CET,Thu Nov 25 17:58:25 CET,0.0 0.464 0.817 1.09 1.308 1.506 1.686 1.856 2.183 2.335 2.48 2.5 2.886 3.02 3.278 3.515 3.734 3.834 4.027 4.221 4.515 4.704 4.868 5.107 5.374 5.636 5.873 6.103 6.403 6.69 6.96 7.263 7.514 7.726 7.944 8.149 8.333 8.528 8.716 8.873 9.046 9.217 9.343 9.46 9.563 9.55 9.394 9.082 8.506 7.515 5.544 3.01 0.89 -0.927 -2.469 -3.845 -5.043 -6.126 -7.084 -8.038 -8.854 -9.596 -10.284 -10.938 -11.579 -12.159 -12.732 -13.237 -13.682 -14.14 -14.616 -15.019 -15.431 -15.866 -16.219 -16.586 -16.959 -17.342 -17.738 -18.005 -18.273 -18.699 -19.001 -19.315 -19.478 -19.82 -20.177 -20.543 -20.725 -21.192 -21.335 -21.559 -21.785 -22.256 -22.512 -22.787 -23.114 -23.495 -23.935 -24.479 -25.417 -8 ,19298 ,KEBNE ,16692008,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:03:07 CET,0.0 0.477 0.821 1.104 1.359 1.573 1.758 1.934 2.261 2.414 2.567 2.633 3.038 3.178 3.459 3.719 3.953 4.063 4.268 4.471 4.764 4.946 5.119 5.357 5.586 5.805 5.993 6.157 6.376 6.601 6.817 7.043 7.235 7.429 7.661 7.929 8.149 8.36 8.568 8.784 9.004 9.178 9.327 9.418 9.447 9.408 9.257 8.918 8.294 7.225 5.217 2.73 0.694 -1.025 -2.498 -3.799 -4.938 -6.033 -7.004 -7.923 -8.694 -9.376 -10.037 -10.683 -11.314 -11.879 -12.449 -12.969 -13.418 -13.9 -14.415 -14.819 -15.218 -15.626 -15.941 -16.292 -16.669 -17.049 -17.445 -17.71 -17.987 -18.436 -18.753 -19.074 -19.232 -19.551 -19.889 -20.25 -20.436 -20.902 -21.042 -21.271 -21.503 -21.998 -22.284 -22.585 -22.9 -23.258 -23.679 -24.203 -24.976 -9 ,20466 ,KEBNE ,16692009,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 17:59:56 CET,0.0 0.474 0.789 1.053 1.287 1.49 1.669 1.84 2.155 2.297 2.434 2.449 2.837 2.97 3.221 3.451 3.67 3.778 3.987 4.185 4.454 4.62 4.776 5.002 5.23 5.456 5.667 5.844 6.065 6.299 6.517 6.753 6.987 7.218 7.453 7.697 7.921 8.148 8.357 8.555 8.757 8.921 9.071 9.208 9.239 9.16 9.018 8.714 8.112 7.056 5.073 2.575 0.464 -1.336 -2.87 -4.223 -5.422 -6.492 -7.381 -8.274 -9.058 -9.769 -10.463 -11.124 -11.744 -12.311 -12.898 -13.431 -13.887 -14.354 -14.851 -15.281 -15.722 -16.166 -16.513 -16.87 -17.238 -17.615 -17.998 -18.26 -18.53 -18.947 -19.245 -19.561 -19.723 -20.043 -20.377 -20.734 -20.923 -21.403 -21.537 -21.737 -21.95 -22.442 -22.715 -23.001 -23.296 -23.638 -24.029 -24.514 -25.458 -10 ,29941 ,KEBNE ,16692010,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:02:49 CET,0.0 0.469 0.774 1.065 1.307 1.503 1.678 1.846 2.193 2.354 2.5 2.529 2.909 3.033 3.272 3.493 3.719 3.833 4.046 4.245 4.505 4.67 4.841 5.084 5.306 5.509 5.696 5.879 6.113 6.326 6.533 6.783 7.017 7.231 7.44 7.66 7.874 8.073 8.246 8.411 8.595 8.747 8.851 8.951 8.992 8.955 8.812 8.491 7.903 6.834 4.835 2.319 0.251 -1.51 -3.07 -4.444 -5.618 -6.695 -7.64 -8.603 -9.45 -10.19 -10.884 -11.533 -12.117 -12.649 -13.184 -13.654 -14.086 -14.555 -15.044 -15.469 -15.899 -16.352 -16.721 -17.074 -17.426 -17.783 -18.148 -18.409 -18.685 -19.111 -19.402 -19.694 -19.844 -20.154 -20.484 -20.85 -21.042 -21.519 -21.674 -21.909 -22.14 -22.604 -22.886 -23.188 -23.482 -23.791 -24.178 -24.633 -25.677 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 88946992..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12174 ,KEBNE ,16692011,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:03:06 CET,0.0 0.411 0.661 0.865 1.056 1.244 1.421 1.578 1.866 2.002 2.127 2.118 2.472 2.582 2.793 2.988 3.18 3.273 3.44 3.593 3.817 3.962 4.107 4.31 4.488 4.658 4.817 4.967 5.165 5.362 5.547 5.75 5.924 6.072 6.243 6.456 6.647 6.821 6.991 7.146 7.315 7.499 7.67 7.811 7.894 7.887 7.796 7.582 7.131 6.273 4.616 2.469 0.665 -0.903 -2.255 -3.481 -4.566 -5.551 -6.413 -7.294 -8.068 -8.762 -9.422 -10.048 -10.639 -11.172 -11.722 -12.224 -12.669 -13.13 -13.602 -13.992 -14.402 -14.819 -15.14 -15.491 -15.878 -16.282 -16.69 -16.971 -17.265 -17.713 -18.034 -18.378 -18.55 -18.906 -19.294 -19.711 -19.92 -20.388 -20.555 -20.792 -21.04 -21.551 -21.837 -22.17 -22.534 -22.925 -23.382 -24.003 -25.419 -2 ,138 ,KEBNE ,16692012,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:02:54 CET,0.0 0.448 0.739 0.97 1.169 1.349 1.514 1.667 1.943 2.068 2.195 2.202 2.56 2.675 2.894 3.085 3.255 3.343 3.525 3.701 3.955 4.112 4.255 4.454 4.639 4.809 4.974 5.131 5.325 5.507 5.684 5.889 6.078 6.259 6.462 6.665 6.836 7.017 7.203 7.381 7.558 7.744 7.911 8.048 8.169 8.211 8.154 7.945 7.495 6.63 4.968 2.865 1.107 -0.47 -1.88 -3.092 -4.135 -5.087 -5.931 -6.825 -7.615 -8.326 -9.008 -9.663 -10.242 -10.757 -11.335 -11.849 -12.283 -12.753 -13.239 -13.638 -14.072 -14.528 -14.875 -15.241 -15.631 -16.022 -16.428 -16.715 -17.01 -17.461 -17.779 -18.119 -18.296 -18.661 -19.038 -19.444 -19.661 -20.138 -20.323 -20.563 -20.817 -21.366 -21.667 -21.984 -22.339 -22.771 -23.313 -23.974 -25.571 -3 ,16255 ,KEBNE ,16692013,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:08:27 CET,0.0 0.398 0.66 0.891 1.099 1.29 1.482 1.653 1.952 2.095 2.225 2.211 2.561 2.669 2.877 3.065 3.251 3.341 3.502 3.659 3.887 4.026 4.162 4.359 4.537 4.702 4.872 5.049 5.267 5.458 5.627 5.8 5.956 6.111 6.298 6.511 6.69 6.866 7.034 7.208 7.388 7.562 7.715 7.816 7.854 7.817 7.711 7.442 6.909 5.963 4.246 2.049 0.152 -1.428 -2.8 -4.076 -5.177 -6.195 -7.102 -8.003 -8.798 -9.487 -10.144 -10.79 -11.371 -11.911 -12.49 -13.006 -13.446 -13.908 -14.398 -14.805 -15.223 -15.668 -16.024 -16.386 -16.758 -17.141 -17.54 -17.818 -18.105 -18.564 -18.896 -19.236 -19.407 -19.755 -20.124 -20.516 -20.72 -21.194 -21.384 -21.63 -21.873 -22.398 -22.719 -23.058 -23.423 -23.853 -24.342 -24.931 -26.656 -4 ,12942 ,KEBNE ,16692014,Thu Nov 25 16:28:54 CET,Thu Nov 25 17:55:46 CET,0.0 0.418 0.727 0.977 1.192 1.367 1.53 1.691 1.989 2.124 2.253 2.26 2.617 2.725 2.932 3.131 3.32 3.407 3.572 3.733 3.969 4.127 4.271 4.459 4.658 4.848 5.015 5.172 5.365 5.551 5.73 5.92 6.071 6.226 6.408 6.595 6.762 6.928 7.105 7.278 7.417 7.545 7.687 7.781 7.817 7.797 7.686 7.381 6.819 5.863 4.113 1.967 0.19 -1.35 -2.703 -3.97 -5.084 -6.081 -6.957 -7.853 -8.612 -9.283 -9.929 -10.529 -11.107 -11.655 -12.226 -12.749 -13.214 -13.686 -14.177 -14.586 -15.019 -15.473 -15.83 -16.2 -16.58 -16.985 -17.402 -17.686 -17.98 -18.446 -18.779 -19.119 -19.297 -19.668 -20.051 -20.451 -20.673 -21.161 -21.342 -21.585 -21.832 -22.343 -22.647 -22.995 -23.349 -23.738 -24.204 -24.782 -26.43 -5 ,17213 ,KEBNE ,16692015,Thu Nov 25 16:28:55 CET,Thu Nov 25 17:57:13 CET,0.0 0.617 0.912 1.144 1.367 1.578 1.758 1.928 2.247 2.386 2.518 2.521 2.877 2.984 3.183 3.371 3.555 3.641 3.805 3.967 4.186 4.317 4.442 4.615 4.797 4.979 5.135 5.287 5.476 5.64 5.803 5.987 6.157 6.317 6.497 6.682 6.856 7.066 7.257 7.422 7.585 7.747 7.896 7.984 8.022 8.014 7.921 7.692 7.189 6.235 4.503 2.304 0.434 -1.179 -2.617 -3.895 -4.999 -6.02 -6.919 -7.84 -8.611 -9.269 -9.907 -10.531 -11.143 -11.731 -12.34 -12.879 -13.337 -13.807 -14.304 -14.703 -15.109 -15.561 -15.924 -16.286 -16.657 -17.057 -17.474 -17.754 -18.035 -18.493 -18.831 -19.167 -19.342 -19.71 -20.075 -20.461 -20.672 -21.15 -21.336 -21.577 -21.841 -22.399 -22.682 -22.997 -23.34 -23.714 -24.138 -24.651 -26.278 -6 ,28409 ,KEBNE ,16692016,Thu Nov 25 16:28:55 CET,Thu Nov 25 17:59:17 CET,0.0 0.546 0.86 1.11 1.318 1.509 1.685 1.853 2.156 2.294 2.425 2.424 2.783 2.893 3.097 3.294 3.483 3.572 3.74 3.902 4.137 4.281 4.414 4.608 4.799 4.979 5.154 5.322 5.52 5.707 5.885 6.083 6.267 6.458 6.679 6.887 7.066 7.244 7.402 7.551 7.687 7.828 7.987 8.119 8.209 8.237 8.154 7.913 7.394 6.456 4.786 2.536 0.578 -1.1 -2.557 -3.866 -5.034 -6.089 -7.007 -7.93 -8.702 -9.43 -10.13 -10.765 -11.391 -11.957 -12.545 -13.071 -13.525 -14.006 -14.502 -14.912 -15.327 -15.769 -16.124 -16.484 -16.848 -17.218 -17.604 -17.881 -18.173 -18.637 -18.961 -19.292 -19.452 -19.778 -20.132 -20.526 -20.738 -21.215 -21.406 -21.644 -21.902 -22.462 -22.761 -23.083 -23.441 -23.85 -24.319 -24.902 -26.171 -7 ,14319 ,KEBNE ,16692017,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:02:02 CET,0.0 0.453 0.738 0.976 1.179 1.355 1.517 1.67 1.953 2.083 2.211 2.225 2.593 2.714 2.934 3.134 3.317 3.41 3.593 3.75 3.96 4.1 4.242 4.45 4.637 4.801 4.959 5.122 5.322 5.486 5.641 5.842 6.029 6.17 6.314 6.482 6.635 6.817 7.003 7.174 7.354 7.535 7.688 7.794 7.869 7.854 7.749 7.51 7.025 6.118 4.399 2.192 0.257 -1.41 -2.864 -4.159 -5.274 -6.328 -7.276 -8.182 -8.948 -9.651 -10.319 -10.987 -11.611 -12.15 -12.702 -13.221 -13.696 -14.198 -14.72 -15.141 -15.569 -16.012 -16.363 -16.727 -17.097 -17.48 -17.889 -18.18 -18.476 -18.931 -19.262 -19.605 -19.778 -20.127 -20.488 -20.876 -21.092 -21.568 -21.74 -21.983 -22.244 -22.807 -23.098 -23.432 -23.785 -24.157 -24.643 -25.25 -26.942 -8 ,6558 ,KEBNE ,16692018,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:01:19 CET,0.0 0.379 0.658 0.872 1.07 1.259 1.427 1.578 1.874 2.015 2.149 2.163 2.529 2.643 2.843 3.024 3.197 3.286 3.461 3.617 3.83 3.969 4.103 4.299 4.488 4.669 4.837 4.986 5.17 5.33 5.489 5.701 5.894 6.064 6.245 6.428 6.593 6.782 6.985 7.157 7.311 7.473 7.606 7.712 7.771 7.719 7.567 7.299 6.839 5.959 4.236 2.017 0.152 -1.418 -2.774 -4.035 -5.154 -6.167 -7.033 -7.905 -8.659 -9.339 -10.036 -10.699 -11.292 -11.838 -12.44 -12.98 -13.426 -13.888 -14.385 -14.793 -15.221 -15.675 -16.024 -16.387 -16.77 -17.158 -17.547 -17.819 -18.119 -18.592 -18.905 -19.223 -19.394 -19.759 -20.143 -20.552 -20.755 -21.224 -21.427 -21.668 -21.917 -22.471 -22.781 -23.096 -23.443 -23.834 -24.269 -24.866 -26.208 -9 ,12277 ,KEBNE ,16692019,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:00:15 CET,0.0 0.438 0.756 1.011 1.211 1.397 1.57 1.73 2.02 2.153 2.277 2.276 2.631 2.738 2.94 3.129 3.307 3.394 3.562 3.725 3.943 4.076 4.208 4.397 4.581 4.764 4.944 5.106 5.304 5.505 5.699 5.938 6.166 6.352 6.553 6.799 6.991 7.168 7.374 7.558 7.725 7.895 8.064 8.198 8.286 8.284 8.142 7.865 7.404 6.543 4.852 2.642 0.765 -0.865 -2.263 -3.49 -4.637 -5.748 -6.694 -7.624 -8.432 -9.146 -9.822 -10.477 -11.106 -11.675 -12.286 -12.849 -13.313 -13.763 -14.229 -14.627 -15.054 -15.499 -15.835 -16.172 -16.528 -16.922 -17.321 -17.599 -17.897 -18.347 -18.671 -19.007 -19.172 -19.516 -19.886 -20.278 -20.482 -20.959 -21.157 -21.396 -21.639 -22.152 -22.433 -22.768 -23.16 -23.578 -24.053 -24.678 -26.092 -10 ,818 ,KEBNE ,16692020,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:01:20 CET,0.0 0.493 0.798 1.032 1.245 1.433 1.619 1.794 2.091 2.225 2.356 2.361 2.716 2.831 3.06 3.288 3.489 3.577 3.758 3.932 4.157 4.291 4.427 4.636 4.833 5.005 5.164 5.323 5.529 5.719 5.894 6.085 6.259 6.431 6.628 6.835 7.025 7.216 7.386 7.552 7.687 7.828 7.986 8.098 8.164 8.141 7.972 7.649 7.159 6.268 4.559 2.401 0.588 -0.988 -2.378 -3.602 -4.667 -5.639 -6.475 -7.327 -8.093 -8.785 -9.449 -10.089 -10.68 -11.228 -11.803 -12.301 -12.733 -13.209 -13.699 -14.1 -14.532 -14.99 -15.344 -15.683 -16.034 -16.422 -16.822 -17.087 -17.362 -17.816 -18.134 -18.467 -18.634 -18.964 -19.316 -19.693 -19.886 -20.352 -20.566 -20.823 -21.073 -21.625 -21.933 -22.271 -22.66 -23.078 -23.561 -24.214 -26.009 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index f48f0530..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-43_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,85 ,KEBNE ,16692021,Thu Nov 25 16:28:50 CET,Thu Nov 25 17:59:55 CET,0.0 0.517 0.806 1.05 1.28 1.515 1.737 1.93 2.29 2.466 2.624 2.65 3.019 3.148 3.39 3.608 3.813 3.911 4.1 4.285 4.536 4.691 4.835 5.039 5.237 5.426 5.598 5.753 5.947 6.15 6.378 6.629 6.826 6.994 7.162 7.343 7.505 7.671 7.829 7.957 8.049 8.085 8.076 8.026 7.887 7.638 7.198 6.495 5.379 3.648 0.825 -2.517 -5.236 -7.504 -9.372 -11.056 -12.528 -13.827 -14.919 -15.983 -16.919 -17.797 -18.628 -19.398 -20.127 -20.793 -21.497 -22.113 -22.637 -23.189 -23.771 -24.247 -24.74 -25.238 -25.615 -26.009 -26.425 -26.862 -27.3 -27.597 -27.919 -28.431 -28.773 -29.125 -29.305 -29.664 -30.051 -30.462 -30.673 -31.165 -31.361 -31.617 -31.874 -32.394 -32.689 -33.017 -33.36 -33.753 -34.266 -34.898 -36.262 -2 ,23920 ,KEBNE ,16692022,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:02:29 CET,0.0 0.534 0.843 1.122 1.366 1.576 1.78 1.968 2.297 2.456 2.615 2.687 3.072 3.203 3.447 3.676 3.878 3.971 4.158 4.333 4.573 4.734 4.887 5.085 5.278 5.472 5.628 5.766 5.961 6.153 6.327 6.506 6.651 6.796 6.986 7.176 7.334 7.484 7.616 7.711 7.754 7.782 7.778 7.725 7.618 7.362 6.881 6.182 5.125 3.417 0.521 -2.883 -5.643 -7.897 -9.805 -11.507 -13.004 -14.391 -15.554 -16.706 -17.677 -18.481 -19.255 -20.006 -20.687 -21.32 -21.99 -22.575 -23.086 -23.61 -24.168 -24.645 -25.142 -25.663 -26.051 -26.458 -26.892 -27.333 -27.791 -28.118 -28.47 -29.025 -29.384 -29.736 -29.915 -30.287 -30.668 -31.077 -31.294 -31.79 -31.989 -32.241 -32.506 -33.082 -33.395 -33.717 -34.053 -34.423 -34.865 -35.455 -36.95 -3 ,10694 ,KEBNE ,16692023,Thu Nov 25 16:28:50 CET,Thu Nov 25 18:00:02 CET,0.0 0.712 1.119 1.448 1.71 1.929 2.145 2.339 2.664 2.82 2.975 3.02 3.394 3.523 3.767 3.995 4.215 4.322 4.518 4.683 4.916 5.064 5.202 5.413 5.605 5.782 5.95 6.1 6.288 6.48 6.66 6.864 7.066 7.239 7.429 7.626 7.766 7.874 7.975 8.073 8.162 8.197 8.166 8.106 7.973 7.775 7.41 6.794 5.784 4.105 1.286 -2.024 -4.787 -7.129 -9.099 -10.812 -12.246 -13.541 -14.662 -15.771 -16.704 -17.536 -18.359 -19.152 -19.904 -20.538 -21.162 -21.738 -22.246 -22.79 -23.35 -23.809 -24.289 -24.787 -25.182 -25.587 -25.993 -26.41 -26.844 -27.149 -27.468 -27.96 -28.284 -28.622 -28.8 -29.17 -29.563 -29.982 -30.202 -30.697 -30.891 -31.148 -31.41 -31.981 -32.282 -32.614 -32.997 -33.395 -33.836 -34.407 -35.917 -4 ,22535 ,KEBNE ,16692024,Thu Nov 25 16:28:50 CET,Thu Nov 25 18:01:12 CET,0.0 0.43 0.72 0.975 1.194 1.379 1.545 1.701 1.986 2.109 2.229 2.229 2.593 2.721 2.964 3.183 3.397 3.501 3.691 3.872 4.126 4.287 4.44 4.645 4.83 5.007 5.181 5.348 5.53 5.696 5.865 6.058 6.227 6.383 6.55 6.72 6.867 7.01 7.164 7.271 7.32 7.379 7.405 7.339 7.2 6.959 6.543 5.895 4.846 3.151 0.294 -3.075 -5.836 -8.189 -10.142 -11.783 -13.196 -14.538 -15.7 -16.827 -17.782 -18.634 -19.456 -20.231 -20.958 -21.618 -22.304 -22.918 -23.439 -23.978 -24.539 -24.997 -25.468 -25.948 -26.317 -26.704 -27.118 -27.556 -27.998 -28.303 -28.617 -29.098 -29.441 -29.793 -29.973 -30.348 -30.745 -31.173 -31.395 -31.89 -32.076 -32.322 -32.58 -33.152 -33.452 -33.77 -34.134 -34.541 -34.998 -35.595 -37.031 -5 ,29892 ,KEBNE ,16692025,Thu Nov 25 16:28:50 CET,Thu Nov 25 18:00:44 CET,0.0 0.462 0.759 1.03 1.28 1.518 1.729 1.941 2.336 2.495 2.647 2.69 3.054 3.178 3.429 3.654 3.863 3.96 4.134 4.291 4.523 4.68 4.827 5.031 5.225 5.397 5.551 5.7 5.898 6.093 6.27 6.464 6.625 6.789 6.977 7.157 7.322 7.487 7.627 7.733 7.841 7.943 7.947 7.856 7.689 7.386 6.894 6.235 5.218 3.525 0.641 -2.713 -5.406 -7.626 -9.513 -11.212 -12.701 -13.998 -15.085 -16.178 -17.122 -17.985 -18.8 -19.581 -20.325 -20.98 -21.634 -22.222 -22.747 -23.278 -23.839 -24.318 -24.808 -25.309 -25.696 -26.114 -26.567 -27.026 -27.488 -27.805 -28.133 -28.643 -28.992 -29.334 -29.509 -29.882 -30.263 -30.665 -30.883 -31.375 -31.56 -31.813 -32.086 -32.647 -32.956 -33.292 -33.663 -34.071 -34.522 -35.104 -36.724 -6 ,1607 ,KEBNE ,16692026,Thu Nov 25 16:28:50 CET,Thu Nov 25 18:02:21 CET,0.0 0.454 0.757 1.008 1.223 1.422 1.611 1.781 2.065 2.195 2.33 2.338 2.692 2.799 3.003 3.191 3.382 3.476 3.657 3.837 4.084 4.238 4.394 4.592 4.762 4.945 5.127 5.293 5.494 5.68 5.844 6.013 6.151 6.278 6.431 6.607 6.762 6.927 7.081 7.181 7.243 7.301 7.326 7.282 7.183 6.924 6.437 5.745 4.724 3.035 0.105 -3.273 -6.009 -8.281 -10.19 -11.913 -13.362 -14.627 -15.714 -16.82 -17.778 -18.626 -19.427 -20.188 -20.916 -21.582 -22.269 -22.877 -23.405 -23.947 -24.507 -24.951 -25.407 -25.913 -26.303 -26.699 -27.116 -27.555 -27.993 -28.283 -28.604 -29.111 -29.438 -29.78 -29.959 -30.324 -30.696 -31.086 -31.305 -31.802 -31.992 -32.253 -32.53 -33.098 -33.422 -33.77 -34.128 -34.545 -35.02 -35.63 -36.858 -7 ,15119 ,KEBNE ,16692027,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:05:05 CET,0.0 0.49 0.786 1.022 1.232 1.425 1.601 1.767 2.072 2.21 2.345 2.361 2.725 2.855 3.103 3.319 3.512 3.601 3.773 3.939 4.173 4.321 4.469 4.669 4.833 4.975 5.121 5.277 5.464 5.628 5.77 5.938 6.099 6.233 6.393 6.565 6.68 6.789 6.906 7.004 7.092 7.149 7.144 7.124 7.007 6.702 6.209 5.515 4.479 2.85 0.037 -3.325 -6.088 -8.401 -10.357 -12.036 -13.451 -14.788 -15.953 -17.074 -18.024 -18.874 -19.684 -20.429 -21.119 -21.76 -22.458 -23.092 -23.61 -24.135 -24.681 -25.133 -25.598 -26.079 -26.465 -26.868 -27.287 -27.713 -28.146 -28.454 -28.777 -29.268 -29.613 -29.958 -30.132 -30.513 -30.906 -31.317 -31.532 -32.017 -32.184 -32.432 -32.699 -33.277 -33.587 -33.92 -34.289 -34.675 -35.121 -35.701 -37.232 -8 ,32375 ,KEBNE ,16692028,Thu Nov 25 16:28:50 CET,Thu Nov 25 17:59:49 CET,0.0 0.554 0.86 1.111 1.34 1.565 1.777 1.965 2.31 2.474 2.622 2.628 2.992 3.126 3.375 3.587 3.783 3.876 4.069 4.266 4.536 4.695 4.837 5.024 5.199 5.378 5.55 5.707 5.886 6.06 6.236 6.427 6.606 6.768 6.916 7.049 7.183 7.348 7.517 7.628 7.693 7.761 7.795 7.762 7.642 7.439 7.097 6.51 5.457 3.757 1.001 -2.276 -4.963 -7.163 -9.063 -10.79 -12.304 -13.661 -14.855 -16.054 -17.058 -17.917 -18.711 -19.447 -20.123 -20.746 -21.424 -22.037 -22.567 -23.128 -23.694 -24.152 -24.618 -25.098 -25.483 -25.888 -26.313 -26.746 -27.192 -27.499 -27.796 -28.263 -28.591 -28.936 -29.124 -29.505 -29.883 -30.283 -30.492 -30.982 -31.163 -31.413 -31.675 -32.26 -32.595 -32.94 -33.298 -33.684 -34.176 -34.799 -36.198 -9 ,32681 ,KEBNE ,16692029,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:04:09 CET,0.0 0.434 0.739 1.014 1.276 1.514 1.726 1.933 2.29 2.462 2.637 2.694 3.062 3.189 3.428 3.644 3.849 3.947 4.127 4.3 4.551 4.709 4.853 5.051 5.235 5.417 5.593 5.739 5.909 6.076 6.237 6.43 6.629 6.807 6.972 7.122 7.263 7.385 7.489 7.594 7.65 7.663 7.632 7.59 7.507 7.315 6.909 6.222 5.21 3.6 0.77 -2.598 -5.305 -7.502 -9.341 -11.02 -12.514 -13.852 -14.958 -16.038 -16.998 -17.868 -18.692 -19.475 -20.194 -20.837 -21.514 -22.125 -22.646 -23.17 -23.718 -24.183 -24.659 -25.155 -25.532 -25.905 -26.296 -26.711 -27.156 -27.461 -27.774 -28.261 -28.6 -28.955 -29.138 -29.515 -29.894 -30.287 -30.496 -30.977 -31.149 -31.399 -31.668 -32.249 -32.571 -32.911 -33.28 -33.697 -34.173 -34.774 -36.336 -10 ,5239 ,KEBNE ,16692030,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:02:21 CET,0.0 0.576 0.892 1.134 1.352 1.56 1.755 1.951 2.322 2.483 2.64 2.702 3.077 3.201 3.411 3.598 3.79 3.89 4.077 4.25 4.482 4.629 4.765 4.943 5.125 5.316 5.494 5.648 5.824 5.986 6.146 6.337 6.498 6.611 6.742 6.903 7.051 7.19 7.303 7.373 7.436 7.492 7.486 7.43 7.258 6.945 6.479 5.818 4.766 3.106 0.298 -3.061 -5.76 -7.999 -9.907 -11.61 -13.065 -14.363 -15.502 -16.659 -17.646 -18.493 -19.294 -20.065 -20.786 -21.415 -22.06 -22.665 -23.2 -23.753 -24.306 -24.773 -25.269 -25.776 -26.154 -26.525 -26.913 -27.323 -27.769 -28.082 -28.401 -28.901 -29.241 -29.59 -29.767 -30.13 -30.511 -30.903 -31.104 -31.585 -31.764 -32.011 -32.283 -32.893 -33.214 -33.548 -33.91 -34.319 -34.806 -35.437 -36.751 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index bd5b22ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32626 ,KEBNE ,16692032,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:04:14 CET,0.0 0.522 0.824 1.064 1.263 1.438 1.604 1.763 2.076 2.217 2.341 2.328 2.682 2.793 3.004 3.206 3.384 3.471 3.646 3.81 4.053 4.205 4.35 4.569 4.774 4.961 5.135 5.301 5.505 5.693 5.877 6.113 6.319 6.494 6.695 6.9 7.07 7.254 7.445 7.64 7.815 7.961 8.108 8.204 8.234 8.208 8.132 7.847 7.256 6.341 4.579 2.364 0.515 -1.105 -2.491 -3.687 -4.735 -5.723 -6.632 -7.556 -8.338 -9.036 -9.706 -10.317 -10.854 -11.371 -11.959 -12.506 -12.982 -13.472 -13.976 -14.386 -14.823 -15.288 -15.639 -15.997 -16.384 -16.791 -17.211 -17.501 -17.795 -18.246 -18.579 -18.929 -19.099 -19.45 -19.816 -20.195 -20.393 -20.867 -21.076 -21.323 -21.582 -22.161 -22.507 -22.886 -23.287 -23.759 -24.308 -24.996 -26.528 -2 ,462 ,KEBNE ,16692033,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:00:24 CET,0.0 0.544 0.835 1.08 1.306 1.505 1.671 1.827 2.115 2.251 2.384 2.383 2.749 2.866 3.083 3.292 3.484 3.574 3.748 3.922 4.162 4.306 4.448 4.657 4.853 5.031 5.206 5.381 5.593 5.79 5.969 6.172 6.362 6.545 6.754 6.955 7.1 7.239 7.399 7.569 7.701 7.832 7.992 8.133 8.252 8.279 8.159 7.859 7.324 6.389 4.607 2.338 0.481 -1.079 -2.459 -3.747 -4.888 -5.967 -6.902 -7.804 -8.6 -9.302 -9.992 -10.651 -11.25 -11.826 -12.457 -13.004 -13.471 -13.959 -14.452 -14.862 -15.31 -15.796 -16.162 -16.539 -16.927 -17.324 -17.744 -18.04 -18.342 -18.788 -19.106 -19.45 -19.626 -19.986 -20.365 -20.765 -20.969 -21.441 -21.664 -21.94 -22.219 -22.776 -23.083 -23.411 -23.752 -24.185 -24.732 -25.384 -27.48 -3 ,19793 ,KEBNE ,16692034,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:00:42 CET,0.0 0.392 0.704 0.971 1.21 1.412 1.591 1.753 2.047 2.181 2.31 2.304 2.665 2.778 2.989 3.184 3.37 3.46 3.635 3.802 4.021 4.156 4.293 4.49 4.689 4.878 5.051 5.204 5.395 5.564 5.719 5.924 6.126 6.319 6.522 6.727 6.922 7.119 7.319 7.495 7.632 7.758 7.879 7.988 8.06 8.034 7.914 7.678 7.164 6.218 4.526 2.312 0.454 -1.146 -2.584 -3.884 -5.027 -6.074 -7.001 -7.905 -8.67 -9.356 -10.014 -10.631 -11.218 -11.78 -12.329 -12.803 -13.251 -13.728 -14.218 -14.629 -15.047 -15.469 -15.804 -16.162 -16.535 -16.942 -17.377 -17.674 -17.979 -18.454 -18.783 -19.135 -19.315 -19.675 -20.066 -20.501 -20.719 -21.198 -21.415 -21.666 -21.92 -22.462 -22.769 -23.113 -23.481 -23.897 -24.4 -25.082 -27.109 -4 ,29765 ,KEBNE ,16692035,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:02:45 CET,0.0 0.544 0.831 1.059 1.265 1.461 1.644 1.803 2.086 2.222 2.364 2.389 2.752 2.866 3.072 3.254 3.427 3.51 3.667 3.825 4.056 4.203 4.341 4.535 4.715 4.883 5.05 5.218 5.42 5.594 5.758 5.953 6.135 6.303 6.494 6.702 6.886 7.072 7.284 7.484 7.652 7.796 7.892 7.965 8.032 8.036 7.914 7.632 7.099 6.112 4.338 2.093 0.098 -1.623 -3.062 -4.322 -5.422 -6.427 -7.316 -8.203 -8.974 -9.694 -10.358 -10.934 -11.491 -12.052 -12.66 -13.209 -13.683 -14.169 -14.673 -15.092 -15.531 -15.991 -16.34 -16.705 -17.086 -17.485 -17.908 -18.195 -18.479 -18.918 -19.232 -19.561 -19.735 -20.102 -20.487 -20.876 -21.087 -21.573 -21.778 -22.033 -22.298 -22.865 -23.166 -23.478 -23.831 -24.259 -24.8 -25.449 -26.944 -5 ,3453 ,KEBNE ,16692036,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:02:09 CET,0.0 0.358 0.614 0.84 1.058 1.25 1.426 1.588 1.863 1.994 2.126 2.117 2.472 2.583 2.791 2.986 3.173 3.262 3.431 3.596 3.837 3.987 4.133 4.336 4.522 4.701 4.865 5.022 5.214 5.401 5.594 5.811 6.015 6.202 6.403 6.636 6.839 7.033 7.238 7.441 7.631 7.821 7.978 8.065 8.133 8.166 8.1 7.859 7.317 6.381 4.685 2.472 0.567 -1.056 -2.44 -3.677 -4.765 -5.774 -6.644 -7.529 -8.343 -9.066 -9.741 -10.412 -11.057 -11.643 -12.242 -12.765 -13.21 -13.677 -14.164 -14.565 -14.997 -15.453 -15.823 -16.219 -16.633 -17.063 -17.502 -17.8 -18.098 -18.552 -18.87 -19.211 -19.388 -19.762 -20.163 -20.599 -20.833 -21.333 -21.56 -21.828 -22.107 -22.674 -22.982 -23.328 -23.731 -24.211 -24.768 -25.483 -27.164 -6 ,19028 ,KEBNE ,16692037,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:04:22 CET,0.0 0.364 0.612 0.839 1.046 1.238 1.412 1.572 1.861 1.996 2.127 2.135 2.498 2.606 2.812 3.003 3.182 3.274 3.456 3.624 3.864 4.014 4.148 4.332 4.513 4.695 4.871 5.032 5.243 5.442 5.622 5.827 6.02 6.203 6.405 6.605 6.783 6.955 7.118 7.287 7.446 7.619 7.807 7.958 8.04 8.03 7.893 7.565 7.029 6.101 4.35 2.169 0.274 -1.41 -2.857 -4.132 -5.227 -6.249 -7.143 -8.039 -8.829 -9.553 -10.226 -10.819 -11.392 -11.947 -12.528 -13.069 -13.562 -14.067 -14.579 -15.002 -15.434 -15.882 -16.234 -16.599 -16.981 -17.382 -17.797 -18.077 -18.369 -18.827 -19.143 -19.482 -19.661 -20.034 -20.414 -20.815 -21.03 -21.511 -21.708 -21.959 -22.232 -22.802 -23.1 -23.423 -23.788 -24.215 -24.744 -25.405 -26.869 -7 ,23019 ,KEBNE ,16692038,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:02:36 CET,0.0 0.409 0.685 0.922 1.135 1.327 1.509 1.67 1.954 2.097 2.231 2.233 2.599 2.712 2.933 3.137 3.321 3.413 3.592 3.761 4.004 4.152 4.295 4.504 4.696 4.877 5.048 5.22 5.437 5.632 5.826 6.034 6.215 6.394 6.582 6.794 7.002 7.213 7.426 7.643 7.841 8.03 8.239 8.381 8.443 8.439 8.34 8.088 7.557 6.616 4.91 2.742 0.858 -0.79 -2.153 -3.38 -4.491 -5.495 -6.371 -7.262 -8.051 -8.74 -9.402 -10.057 -10.685 -11.259 -11.825 -12.338 -12.817 -13.327 -13.849 -14.283 -14.728 -15.177 -15.531 -15.898 -16.266 -16.648 -17.058 -17.348 -17.648 -18.114 -18.438 -18.766 -18.939 -19.314 -19.723 -20.139 -20.344 -20.813 -20.994 -21.234 -21.49 -22.037 -22.343 -22.686 -23.067 -23.518 -24.058 -24.821 -26.991 -8 ,4654 ,KEBNE ,16692039,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:01:03 CET,0.0 0.451 0.724 0.967 1.183 1.367 1.535 1.7 2.012 2.146 2.269 2.262 2.618 2.725 2.926 3.123 3.316 3.407 3.576 3.736 3.962 4.104 4.242 4.439 4.625 4.798 4.95 5.106 5.309 5.498 5.679 5.897 6.088 6.265 6.473 6.694 6.892 7.077 7.269 7.479 7.668 7.842 7.996 8.128 8.248 8.285 8.217 8.03 7.587 6.647 4.887 2.715 0.92 -0.67 -2.092 -3.382 -4.49 -5.478 -6.362 -7.248 -7.978 -8.643 -9.301 -9.941 -10.537 -11.08 -11.678 -12.219 -12.674 -13.149 -13.633 -14.044 -14.465 -14.888 -15.255 -15.651 -16.039 -16.429 -16.839 -17.131 -17.435 -17.912 -18.235 -18.561 -18.737 -19.106 -19.494 -19.903 -20.116 -20.595 -20.798 -21.05 -21.314 -21.938 -22.276 -22.646 -23.093 -23.568 -24.069 -24.745 -26.497 -9 ,27551 ,KEBNE ,16692040,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:07:29 CET,0.0 0.404 0.68 0.903 1.11 1.301 1.467 1.611 1.887 2.024 2.157 2.151 2.507 2.621 2.845 3.043 3.223 3.311 3.479 3.642 3.878 4.026 4.174 4.379 4.563 4.74 4.909 5.071 5.273 5.465 5.658 5.88 6.077 6.25 6.424 6.605 6.79 6.977 7.154 7.337 7.489 7.647 7.824 7.946 8.014 8.023 7.903 7.577 7.008 6.034 4.272 2.056 0.169 -1.523 -2.93 -4.138 -5.208 -6.179 -7.081 -8.035 -8.817 -9.476 -10.118 -10.749 -11.357 -11.907 -12.452 -12.956 -13.413 -13.893 -14.394 -14.801 -15.218 -15.678 -16.042 -16.42 -16.813 -17.197 -17.607 -17.9 -18.19 -18.646 -18.97 -19.3 -19.473 -19.831 -20.216 -20.642 -20.862 -21.35 -21.559 -21.822 -22.107 -22.713 -23.055 -23.442 -23.882 -24.347 -24.873 -25.594 -27.772 -10 ,10457 ,KEBNE ,16692041,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:05:19 CET,0.0 0.429 0.691 0.95 1.183 1.375 1.546 1.711 2.001 2.133 2.264 2.26 2.616 2.729 2.947 3.147 3.335 3.427 3.608 3.775 4.012 4.156 4.294 4.502 4.687 4.863 5.037 5.196 5.402 5.599 5.784 6.002 6.199 6.375 6.567 6.747 6.884 7.057 7.26 7.453 7.639 7.823 7.987 8.093 8.126 8.074 7.924 7.623 7.084 6.175 4.473 2.238 0.329 -1.341 -2.818 -4.131 -5.254 -6.311 -7.234 -8.157 -8.969 -9.673 -10.316 -10.91 -11.494 -12.057 -12.651 -13.191 -13.64 -14.102 -14.575 -14.966 -15.395 -15.833 -16.177 -16.547 -16.934 -17.334 -17.751 -18.051 -18.365 -18.833 -19.168 -19.54 -19.726 -20.11 -20.523 -20.958 -21.186 -21.678 -21.915 -22.194 -22.48 -23.082 -23.412 -23.777 -24.196 -24.649 -25.176 -25.966 -27.758 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt deleted file mode 100644 index 0e3d7b06..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25029 ,KEBNE ,17131958,Sat Jan 1 01:32:26 CET,Sat Jan 1 03:05:49 CET,0.0 0.65 1.069 1.432 1.726 1.994 2.246 2.481 2.92 3.116 3.305 3.406 3.804 3.958 4.259 4.55 4.812 4.934 5.172 5.404 5.745 5.96 6.165 6.466 6.753 7.024 7.278 7.527 7.854 8.168 8.469 8.828 9.171 9.508 9.904 10.295 10.644 11.034 11.431 11.825 12.241 12.71 13.224 13.733 14.311 14.845 15.364 15.875 16.36 16.828 16.966 16.648 16.106 15.449 14.757 14.059 13.457 12.852 12.277 11.665 11.164 10.73 10.298 9.859 9.41 8.989 8.548 8.163 7.811 7.416 7.019 6.696 6.358 6.032 5.763 5.468 5.176 4.861 4.531 4.318 4.092 3.727 3.48 3.214 3.076 2.788 2.489 2.178 2.009 1.598 1.455 1.252 1.052 0.622 0.386 0.124 -0.182 -0.532 -0.943 -1.464 -2.435 -2 ,7070 ,KEBNE ,17131959,Sat Jan 1 01:32:26 CET,Sat Jan 1 03:05:37 CET,0.0 0.95 1.456 1.834 2.13 2.378 2.616 2.843 3.272 3.467 3.642 3.719 4.114 4.265 4.548 4.822 5.076 5.198 5.445 5.691 6.041 6.255 6.456 6.762 7.058 7.319 7.579 7.838 8.166 8.473 8.763 9.122 9.459 9.781 10.14 10.516 10.87 11.261 11.675 12.098 12.5 12.941 13.492 13.97 14.482 15.073 15.674 16.21 16.736 17.211 17.415 17.131 16.581 15.951 15.36 14.773 14.163 13.615 13.134 12.575 12.062 11.586 11.107 10.646 10.249 9.876 9.476 9.108 8.775 8.437 8.063 7.76 7.46 7.121 6.858 6.589 6.292 5.979 5.654 5.427 5.192 4.829 4.568 4.289 4.148 3.863 3.573 3.255 3.074 2.66 2.554 2.367 2.177 1.776 1.565 1.329 1.056 0.754 0.427 0.047 -0.775 -3 ,21046 ,KEBNE ,17131960,Sat Jan 1 01:32:25 CET,Sat Jan 1 03:06:11 CET,0.0 0.905 1.323 1.654 1.953 2.223 2.479 2.721 3.142 3.335 3.52 3.625 4.024 4.174 4.462 4.734 5.001 5.127 5.35 5.576 5.93 6.146 6.344 6.632 6.907 7.168 7.419 7.667 7.984 8.28 8.555 8.888 9.217 9.517 9.823 10.184 10.565 10.964 11.375 11.798 12.209 12.651 13.166 13.639 14.193 14.799 15.393 15.952 16.465 16.865 17.017 16.716 16.173 15.49 14.781 14.127 13.502 12.898 12.35 11.746 11.196 10.725 10.297 9.879 9.477 9.096 8.701 8.338 8.002 7.653 7.283 6.968 6.64 6.307 6.047 5.768 5.476 5.175 4.845 4.61 4.379 4.033 3.78 3.508 3.371 3.079 2.758 2.418 2.247 1.841 1.726 1.518 1.296 0.842 0.584 0.3 -0.025 -0.407 -0.85 -1.41 -2.262 -4 ,26779 ,KEBNE ,17131961,Sat Jan 1 01:32:26 CET,Sat Jan 1 03:06:52 CET,0.0 0.77 1.153 1.444 1.722 1.973 2.202 2.425 2.825 3.008 3.184 3.275 3.681 3.834 4.119 4.392 4.656 4.788 5.047 5.286 5.605 5.82 6.043 6.383 6.726 7.047 7.357 7.634 7.949 8.245 8.522 8.837 9.126 9.415 9.765 10.153 10.513 10.896 11.286 11.664 12.078 12.553 13.095 13.614 14.12 14.597 15.162 15.738 16.241 16.71 16.957 16.679 16.139 15.526 14.922 14.274 13.608 12.982 12.483 11.976 11.461 10.952 10.452 9.999 9.599 9.223 8.828 8.457 8.113 7.773 7.419 7.099 6.763 6.416 6.139 5.857 5.568 5.254 4.932 4.722 4.496 4.132 3.872 3.584 3.436 3.144 2.845 2.507 2.324 1.899 1.763 1.564 1.358 0.913 0.66 0.399 0.108 -0.227 -0.593 -1.042 -1.934 -5 ,27246 ,KEBNE ,17131962,Sat Jan 1 01:32:25 CET,Sat Jan 1 03:05:49 CET,0.0 0.925 1.342 1.682 1.972 2.238 2.471 2.689 3.111 3.31 3.497 3.603 4.006 4.158 4.446 4.725 4.989 5.117 5.37 5.613 5.956 6.176 6.385 6.669 6.94 7.219 7.485 7.726 8.027 8.333 8.643 8.999 9.322 9.634 9.995 10.384 10.743 11.132 11.558 11.987 12.406 12.866 13.349 13.801 14.289 14.822 15.423 16.03 16.63 17.138 17.388 17.048 16.473 15.855 15.262 14.652 14.063 13.498 12.977 12.412 11.878 11.387 10.906 10.445 10.033 9.685 9.307 8.921 8.571 8.203 7.828 7.505 7.167 6.832 6.576 6.291 5.978 5.661 5.338 5.121 4.896 4.518 4.255 3.989 3.847 3.553 3.255 2.919 2.744 2.333 2.203 2.004 1.802 1.371 1.136 0.892 0.619 0.297 -0.075 -0.513 -1.43 -6 ,7193 ,KEBNE ,17131963,Sat Jan 1 02:03:59 CET,Sat Jan 1 03:37:38 CET,0.0 0.68 1.143 1.503 1.793 2.038 2.278 2.514 2.931 3.135 3.326 3.431 3.838 3.99 4.276 4.552 4.825 4.958 5.207 5.442 5.774 5.976 6.176 6.47 6.77 7.06 7.328 7.577 7.88 8.175 8.47 8.818 9.144 9.454 9.802 10.173 10.52 10.897 11.291 11.697 12.138 12.65 13.231 13.755 14.292 14.83 15.394 15.973 16.547 16.997 17.098 16.731 16.195 15.583 14.944 14.304 13.678 13.108 12.572 11.97 11.441 10.973 10.514 10.049 9.616 9.206 8.79 8.442 8.132 7.792 7.416 7.101 6.769 6.406 6.116 5.839 5.556 5.252 4.935 4.715 4.475 4.074 3.814 3.549 3.404 3.108 2.793 2.463 2.301 1.893 1.766 1.577 1.378 0.939 0.679 0.388 0.095 -0.26 -0.703 -1.166 -2.545 -7 ,12767 ,KEBNE ,17131964,Sat Jan 1 02:03:59 CET,Sat Jan 1 03:38:54 CET,0.0 0.742 1.163 1.508 1.828 2.096 2.326 2.552 2.988 3.183 3.368 3.455 3.849 4.011 4.316 4.598 4.872 5.004 5.252 5.491 5.839 6.052 6.258 6.55 6.821 7.085 7.336 7.581 7.89 8.181 8.471 8.823 9.157 9.486 9.854 10.237 10.605 11.027 11.471 11.906 12.327 12.759 13.25 13.745 14.32 14.938 15.564 16.129 16.7 17.181 17.312 16.925 16.33 15.716 15.089 14.44 13.813 13.217 12.647 12.022 11.487 10.985 10.487 10.003 9.566 9.169 8.727 8.349 8.026 7.672 7.311 7.008 6.679 6.323 6.046 5.766 5.477 5.182 4.869 4.651 4.426 4.053 3.803 3.548 3.406 3.105 2.772 2.445 2.285 1.874 1.732 1.524 1.31 0.802 0.523 0.262 -0.004 -0.303 -0.656 -1.087 -1.955 -8 ,22533 ,KEBNE ,17131965,Sat Jan 1 02:13:22 CET,Sat Jan 1 03:46:39 CET,0.0 0.769 1.217 1.584 1.904 2.19 2.436 2.659 3.061 3.245 3.419 3.486 3.876 4.033 4.34 4.632 4.901 5.024 5.257 5.484 5.824 6.037 6.24 6.518 6.782 7.059 7.315 7.566 7.901 8.206 8.497 8.851 9.188 9.509 9.868 10.259 10.642 11.052 11.446 11.845 12.258 12.691 13.199 13.683 14.201 14.751 15.336 15.925 16.494 16.972 17.123 16.775 16.226 15.614 14.944 14.262 13.652 13.079 12.534 11.952 11.434 10.974 10.512 10.056 9.648 9.277 8.881 8.515 8.168 7.786 7.399 7.075 6.729 6.373 6.097 5.805 5.506 5.208 4.89 4.661 4.437 4.095 3.848 3.576 3.431 3.131 2.822 2.506 2.336 1.916 1.766 1.555 1.345 0.918 0.676 0.414 0.121 -0.232 -0.658 -1.167 -2.179 -9 ,9174 ,KEBNE ,17131966,Sat Jan 1 02:13:22 CET,Sat Jan 1 03:48:08 CET,0.0 0.686 1.103 1.468 1.776 2.046 2.3 2.529 2.928 3.115 3.303 3.415 3.82 3.981 4.288 4.576 4.848 4.973 5.206 5.429 5.757 5.969 6.175 6.469 6.752 7.036 7.298 7.547 7.88 8.205 8.511 8.872 9.214 9.5 9.796 10.16 10.526 10.912 11.342 11.787 12.207 12.66 13.157 13.616 14.155 14.714 15.312 15.918 16.485 16.926 17.027 16.7 16.165 15.545 14.901 14.233 13.57 12.936 12.391 11.811 11.27 10.784 10.322 9.877 9.454 9.052 8.624 8.25 7.925 7.585 7.21 6.89 6.577 6.229 5.943 5.659 5.36 5.035 4.7 4.49 4.28 3.921 3.66 3.396 3.263 2.979 2.672 2.365 2.208 1.794 1.662 1.468 1.26 0.793 0.531 0.249 -0.061 -0.407 -0.783 -1.236 -2.291 -10 ,4586 ,KEBNE ,17131967,Sat Jan 1 03:05:49 CET,Sat Jan 1 04:38:54 CET,0.0 0.72 1.116 1.413 1.69 1.949 2.188 2.416 2.832 3.025 3.203 3.292 3.688 3.846 4.15 4.435 4.702 4.831 5.085 5.331 5.679 5.899 6.111 6.415 6.701 6.966 7.218 7.459 7.771 8.072 8.346 8.665 8.973 9.259 9.609 10.013 10.384 10.786 11.211 11.657 12.098 12.546 13.03 13.515 14.059 14.608 15.149 15.683 16.274 16.778 16.996 16.672 16.079 15.472 14.847 14.174 13.531 12.933 12.387 11.806 11.273 10.791 10.364 9.952 9.537 9.152 8.723 8.31 7.963 7.605 7.218 6.886 6.54 6.174 5.879 5.589 5.295 4.984 4.667 4.457 4.239 3.884 3.645 3.384 3.237 2.953 2.667 2.345 2.178 1.756 1.634 1.449 1.245 0.784 0.537 0.282 -0.006 -0.313 -0.666 -1.113 -1.914 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt deleted file mode 100644 index e8ab26e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-44_ejm-55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26941 ,KEBNE ,16692042,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:06:29 CET,0.0 0.519 0.859 1.141 1.385 1.617 1.851 2.066 2.43 2.595 2.751 2.785 3.158 3.276 3.511 3.732 3.934 4.029 4.209 4.38 4.601 4.732 4.856 5.043 5.225 5.396 5.561 5.713 5.897 6.078 6.268 6.488 6.671 6.828 6.988 7.153 7.299 7.435 7.553 7.655 7.734 7.779 7.763 7.668 7.505 7.25 6.86 6.214 5.085 3.332 0.456 -2.956 -5.752 -8.115 -10.071 -11.799 -13.309 -14.633 -15.774 -16.93 -17.894 -18.729 -19.568 -20.36 -21.055 -21.711 -22.42 -23.038 -23.585 -24.161 -24.739 -25.239 -25.768 -26.303 -26.724 -27.155 -27.588 -28.035 -28.494 -28.821 -29.148 -29.647 -30.014 -30.399 -30.599 -31.016 -31.454 -31.925 -32.167 -32.676 -32.896 -33.167 -33.444 -34.073 -34.421 -34.799 -35.22 -35.688 -36.267 -37.024 -39.069 -2 ,22994 ,KEBNE ,16692043,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:05:52 CET,0.0 0.534 0.822 1.084 1.322 1.516 1.688 1.853 2.152 2.29 2.429 2.434 2.791 2.902 3.114 3.313 3.52 3.625 3.812 3.979 4.205 4.352 4.494 4.7 4.903 5.095 5.262 5.415 5.619 5.799 5.966 6.15 6.319 6.482 6.636 6.784 6.922 7.057 7.166 7.267 7.364 7.425 7.392 7.325 7.206 6.916 6.438 5.754 4.689 2.952 0.052 -3.316 -6.089 -8.507 -10.519 -12.251 -13.731 -15.07 -16.26 -17.428 -18.405 -19.297 -20.131 -20.925 -21.674 -22.329 -23.011 -23.622 -24.154 -24.702 -25.28 -25.76 -26.259 -26.79 -27.199 -27.623 -28.055 -28.488 -28.93 -29.248 -29.593 -30.113 -30.47 -30.845 -31.039 -31.446 -31.861 -32.311 -32.556 -33.071 -33.295 -33.562 -33.843 -34.461 -34.795 -35.164 -35.581 -36.034 -36.58 -37.299 -39.164 -3 ,2211 ,KEBNE ,16692044,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:01:17 CET,0.0 0.496 0.786 1.058 1.328 1.566 1.775 1.98 2.347 2.506 2.66 2.717 3.097 3.222 3.451 3.652 3.847 3.944 4.132 4.315 4.577 4.725 4.853 5.035 5.23 5.415 5.583 5.744 5.948 6.137 6.305 6.493 6.654 6.784 6.929 7.107 7.262 7.393 7.495 7.594 7.688 7.734 7.713 7.642 7.489 7.205 6.729 6.022 4.969 3.307 0.378 -3.121 -5.893 -8.195 -10.194 -11.929 -13.363 -14.666 -15.832 -17.014 -18.005 -18.892 -19.763 -20.6 -21.38 -22.05 -22.727 -23.345 -23.891 -24.456 -25.043 -25.534 -26.021 -26.531 -26.948 -27.38 -27.817 -28.273 -28.746 -29.072 -29.41 -29.938 -30.298 -30.659 -30.851 -31.258 -31.674 -32.134 -32.378 -32.894 -33.131 -33.395 -33.667 -34.277 -34.608 -34.957 -35.36 -35.82 -36.356 -37.011 -39.04 -4 ,860 ,KEBNE ,16692045,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:04:03 CET,0.0 0.427 0.704 0.938 1.149 1.334 1.504 1.668 1.969 2.115 2.256 2.283 2.662 2.788 3.011 3.219 3.427 3.531 3.719 3.888 4.127 4.273 4.414 4.626 4.828 5.021 5.206 5.377 5.588 5.791 5.976 6.158 6.318 6.477 6.653 6.822 6.991 7.167 7.305 7.412 7.479 7.506 7.494 7.426 7.269 7.042 6.653 6.004 4.914 3.2 0.377 -3.019 -5.838 -8.221 -10.196 -11.933 -13.438 -14.825 -16.044 -17.24 -18.277 -19.19 -20.036 -20.851 -21.588 -22.223 -22.902 -23.539 -24.105 -24.688 -25.26 -25.72 -26.226 -26.766 -27.175 -27.603 -28.041 -28.478 -28.935 -29.257 -29.592 -30.116 -30.468 -30.839 -31.038 -31.443 -31.86 -32.302 -32.532 -33.053 -33.318 -33.583 -33.855 -34.443 -34.772 -35.14 -35.551 -36.02 -36.562 -37.239 -39.469 -5 ,18150 ,KEBNE ,16692046,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:04:57 CET,0.0 0.511 0.828 1.066 1.271 1.47 1.651 1.817 2.119 2.249 2.37 2.372 2.733 2.845 3.066 3.284 3.502 3.601 3.786 3.97 4.212 4.366 4.517 4.73 4.937 5.129 5.302 5.458 5.647 5.799 5.95 6.144 6.285 6.421 6.608 6.804 6.953 7.055 7.161 7.283 7.397 7.451 7.432 7.406 7.288 7.034 6.587 5.871 4.782 3.058 0.104 -3.36 -6.117 -8.442 -10.426 -12.2 -13.733 -15.081 -16.244 -17.366 -18.312 -19.158 -19.968 -20.743 -21.459 -22.11 -22.83 -23.474 -24.012 -24.552 -25.115 -25.591 -26.085 -26.596 -26.997 -27.404 -27.81 -28.214 -28.655 -28.981 -29.314 -29.839 -30.202 -30.584 -30.78 -31.178 -31.588 -32.048 -32.3 -32.818 -33.025 -33.28 -33.554 -34.161 -34.5 -34.866 -35.249 -35.684 -36.236 -36.963 -38.781 -6 ,19847 ,KEBNE ,16692047,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:02:08 CET,0.0 0.494 0.824 1.076 1.287 1.478 1.661 1.849 2.205 2.369 2.528 2.581 2.958 3.091 3.325 3.552 3.767 3.866 4.052 4.215 4.448 4.601 4.75 4.963 5.158 5.348 5.52 5.675 5.889 6.091 6.257 6.434 6.594 6.726 6.868 7.032 7.189 7.339 7.472 7.616 7.732 7.797 7.841 7.837 7.669 7.369 6.919 6.186 5.069 3.357 0.487 -2.957 -5.776 -8.155 -10.174 -11.921 -13.451 -14.787 -15.908 -17.048 -18.051 -18.94 -19.759 -20.538 -21.247 -21.899 -22.616 -23.268 -23.835 -24.393 -24.943 -25.408 -25.909 -26.426 -26.83 -27.257 -27.679 -28.119 -28.577 -28.892 -29.233 -29.766 -30.118 -30.482 -30.675 -31.082 -31.505 -31.961 -32.205 -32.719 -32.945 -33.225 -33.515 -34.126 -34.458 -34.836 -35.263 -35.731 -36.271 -36.947 -38.921 -7 ,32177 ,KEBNE ,16692048,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:02:11 CET,0.0 0.624 0.92 1.163 1.379 1.579 1.774 1.95 2.244 2.39 2.543 2.578 2.949 3.076 3.297 3.503 3.711 3.809 3.998 4.184 4.447 4.597 4.729 4.924 5.128 5.326 5.504 5.663 5.843 6.013 6.177 6.373 6.538 6.657 6.82 7.009 7.122 7.197 7.252 7.314 7.376 7.431 7.473 7.438 7.302 7.019 6.545 5.855 4.76 3.039 0.097 -3.444 -6.329 -8.757 -10.802 -12.616 -14.198 -15.601 -16.752 -17.897 -18.89 -19.779 -20.633 -21.432 -22.203 -22.911 -23.615 -24.227 -24.739 -25.265 -25.862 -26.353 -26.845 -27.371 -27.783 -28.212 -28.651 -29.096 -29.542 -29.855 -30.187 -30.707 -31.081 -31.468 -31.66 -32.059 -32.481 -32.938 -33.172 -33.68 -33.919 -34.204 -34.495 -35.098 -35.427 -35.773 -36.183 -36.646 -37.191 -37.894 -39.733 -8 ,28234 ,KEBNE ,16692049,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:01:22 CET,0.0 0.463 0.769 1.029 1.243 1.439 1.63 1.805 2.143 2.309 2.464 2.499 2.863 2.98 3.216 3.437 3.641 3.738 3.934 4.113 4.35 4.495 4.64 4.853 5.053 5.233 5.392 5.558 5.77 5.953 6.131 6.347 6.543 6.704 6.868 7.039 7.176 7.272 7.339 7.401 7.455 7.491 7.516 7.491 7.348 7.063 6.603 5.958 4.922 3.225 0.343 -3.112 -5.912 -8.247 -10.226 -12.006 -13.568 -14.936 -16.096 -17.253 -18.219 -19.078 -19.914 -20.704 -21.466 -22.174 -22.878 -23.486 -24.0 -24.542 -25.131 -25.623 -26.122 -26.648 -27.061 -27.484 -27.921 -28.375 -28.836 -29.167 -29.515 -30.038 -30.405 -30.792 -30.993 -31.397 -31.819 -32.27 -32.497 -33.008 -33.237 -33.502 -33.781 -34.362 -34.684 -35.049 -35.465 -35.952 -36.503 -37.221 -39.304 -9 ,1008 ,KEBNE ,16692050,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:02:59 CET,0.0 0.481 0.778 1.001 1.199 1.389 1.565 1.729 2.024 2.163 2.305 2.347 2.722 2.851 3.079 3.288 3.488 3.589 3.78 3.952 4.194 4.344 4.488 4.696 4.898 5.084 5.245 5.401 5.61 5.807 5.987 6.184 6.344 6.474 6.61 6.759 6.902 7.032 7.142 7.252 7.363 7.452 7.458 7.406 7.308 7.079 6.708 6.111 5.08 3.392 0.507 -2.909 -5.709 -8.106 -10.154 -11.881 -13.388 -14.802 -15.991 -17.159 -18.179 -19.06 -19.843 -20.572 -21.274 -21.945 -22.627 -23.234 -23.778 -24.33 -24.922 -25.415 -25.917 -26.442 -26.853 -27.277 -27.729 -28.19 -28.652 -28.967 -29.295 -29.82 -30.18 -30.538 -30.727 -31.134 -31.557 -32.011 -32.256 -32.775 -33.004 -33.287 -33.578 -34.16 -34.48 -34.839 -35.244 -35.731 -36.315 -37.026 -38.827 -10 ,3799 ,KEBNE ,16692051,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:05:20 CET,0.0 0.445 0.728 0.957 1.177 1.392 1.595 1.783 2.12 2.276 2.421 2.458 2.83 2.954 3.187 3.392 3.595 3.694 3.866 4.035 4.288 4.437 4.57 4.762 4.954 5.144 5.328 5.488 5.678 5.871 6.053 6.257 6.44 6.6 6.776 6.95 7.092 7.251 7.407 7.516 7.627 7.726 7.764 7.763 7.688 7.455 6.966 6.21 5.115 3.453 0.607 -2.84 -5.631 -7.941 -9.876 -11.585 -13.095 -14.43 -15.562 -16.698 -17.685 -18.546 -19.381 -20.195 -20.921 -21.571 -22.278 -22.927 -23.472 -24.016 -24.59 -25.082 -25.579 -26.106 -26.527 -26.948 -27.39 -27.867 -28.33 -28.639 -28.971 -29.478 -29.831 -30.206 -30.404 -30.823 -31.243 -31.67 -31.905 -32.435 -32.682 -32.944 -33.226 -33.844 -34.177 -34.553 -34.954 -35.44 -36.058 -36.798 -38.449 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index c85ce947..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4186 ,KEBNE ,17131968,Sat Jan 1 03:06:53 CET,Sat Jan 1 04:39:43 CET,0.0 0.86 1.315 1.682 2.016 2.302 2.531 2.753 3.181 3.379 3.57 3.663 4.088 4.251 4.546 4.821 5.07 5.198 5.456 5.701 6.05 6.265 6.479 6.805 7.108 7.383 7.643 7.892 8.211 8.522 8.812 9.155 9.498 9.832 10.192 10.584 10.96 11.377 11.797 12.224 12.684 13.183 13.733 14.212 14.728 15.302 15.95 16.671 17.391 18.019 18.484 18.487 18.216 17.783 17.275 16.741 16.247 15.754 15.252 14.741 14.318 13.916 13.486 13.039 12.611 12.207 11.774 11.39 11.053 10.717 10.373 10.08 9.788 9.474 9.215 8.93 8.629 8.324 7.995 7.767 7.546 7.208 6.949 6.666 6.521 6.217 5.881 5.528 5.349 4.914 4.774 4.562 4.327 3.808 3.542 3.258 2.945 2.578 2.115 1.509 -0.031 -2 ,31592 ,KEBNE ,17131969,Sat Jan 1 03:06:52 CET,Sat Jan 1 04:39:09 CET,0.0 0.944 1.371 1.683 1.976 2.26 2.516 2.761 3.206 3.409 3.596 3.673 4.087 4.243 4.531 4.809 5.091 5.228 5.479 5.718 6.071 6.294 6.506 6.813 7.113 7.412 7.689 7.949 8.276 8.575 8.868 9.235 9.602 9.949 10.332 10.742 11.128 11.532 11.977 12.472 12.967 13.512 14.107 14.673 15.314 15.963 16.647 17.343 18.051 18.727 19.225 19.209 18.844 18.344 17.842 17.312 16.784 16.241 15.754 15.261 14.771 14.306 13.858 13.464 13.082 12.695 12.279 11.887 11.549 11.203 10.815 10.485 10.149 9.794 9.525 9.254 8.967 8.663 8.334 8.104 7.863 7.472 7.205 6.919 6.767 6.462 6.14 5.814 5.643 5.204 5.047 4.836 4.616 4.136 3.865 3.569 3.228 2.811 2.334 1.735 0.449 -3 ,4126 ,KEBNE ,17131970,Sat Jan 1 03:06:52 CET,Sat Jan 1 04:39:00 CET,0.0 0.956 1.425 1.781 2.072 2.34 2.614 2.865 3.293 3.487 3.676 3.784 4.212 4.371 4.676 4.962 5.232 5.366 5.629 5.867 6.2 6.421 6.643 6.962 7.257 7.554 7.833 8.075 8.397 8.724 9.027 9.389 9.731 10.038 10.4 10.812 11.182 11.6 12.056 12.5 12.966 13.502 14.108 14.683 15.293 15.908 16.571 17.252 17.941 18.554 18.987 19.005 18.675 18.204 17.694 17.176 16.641 16.115 15.625 15.074 14.582 14.149 13.733 13.313 12.91 12.533 12.12 11.687 11.258 10.818 10.373 10.012 9.641 9.267 8.999 8.736 8.457 8.15 7.821 7.591 7.356 7.003 6.743 6.465 6.331 6.062 5.761 5.414 5.225 4.787 4.654 4.45 4.239 3.739 3.459 3.175 2.851 2.475 2.042 1.465 0.064 -4 ,24519 ,KEBNE ,17131971,Sat Jan 1 03:07:55 CET,Sat Jan 1 04:41:21 CET,0.0 0.851 1.231 1.569 1.874 2.143 2.393 2.614 3.02 3.219 3.405 3.493 3.916 4.08 4.385 4.679 4.954 5.085 5.343 5.58 5.916 6.131 6.34 6.646 6.954 7.26 7.552 7.828 8.169 8.488 8.791 9.149 9.492 9.828 10.209 10.617 11.02 11.474 11.919 12.328 12.763 13.29 13.898 14.466 15.041 15.647 16.283 16.922 17.62 18.241 18.674 18.649 18.33 17.891 17.361 16.816 16.3 15.77 15.281 14.753 14.283 13.861 13.425 12.989 12.583 12.214 11.817 11.44 11.106 10.752 10.372 10.066 9.746 9.412 9.155 8.885 8.608 8.319 8.008 7.783 7.544 7.159 6.882 6.601 6.458 6.171 5.862 5.514 5.34 4.916 4.783 4.57 4.356 3.865 3.58 3.272 2.922 2.54 2.092 1.486 0.248 -5 ,15518 ,KEBNE ,17131972,Sat Jan 1 03:39:25 CET,Sat Jan 1 05:11:46 CET,0.0 0.862 1.312 1.677 1.985 2.241 2.501 2.732 3.15 3.35 3.535 3.624 4.046 4.209 4.512 4.798 5.078 5.212 5.464 5.701 6.059 6.286 6.496 6.805 7.102 7.391 7.666 7.919 8.239 8.542 8.843 9.194 9.504 9.829 10.218 10.619 10.976 11.367 11.79 12.24 12.723 13.235 13.814 14.414 15.091 15.768 16.406 17.073 17.86 18.614 19.092 18.987 18.602 18.076 17.53 16.979 16.455 15.952 15.464 14.915 14.425 14.001 13.57 13.13 12.696 12.307 11.919 11.548 11.208 10.849 10.457 10.142 9.815 9.463 9.187 8.912 8.635 8.327 7.994 7.767 7.53 7.154 6.884 6.598 6.451 6.145 5.824 5.485 5.311 4.881 4.737 4.515 4.292 3.786 3.496 3.212 2.901 2.54 2.101 1.522 0.126 -6 ,5527 ,KEBNE ,17131973,Sat Jan 1 03:39:24 CET,Sat Jan 1 05:13:06 CET,0.0 0.855 1.251 1.616 1.951 2.224 2.467 2.709 3.159 3.359 3.545 3.634 4.064 4.234 4.542 4.825 5.094 5.223 5.469 5.711 6.052 6.272 6.494 6.802 7.083 7.35 7.612 7.879 8.223 8.542 8.847 9.214 9.571 9.909 10.27 10.669 11.072 11.502 11.933 12.374 12.833 13.348 13.923 14.433 15.004 15.668 16.357 17.054 17.769 18.464 19.016 19.06 18.763 18.312 17.746 17.121 16.571 16.038 15.532 14.991 14.482 14.035 13.61 13.193 12.795 12.418 11.998 11.605 11.282 10.947 10.566 10.236 9.908 9.57 9.32 9.046 8.741 8.435 8.125 7.91 7.685 7.323 7.041 6.743 6.584 6.258 5.939 5.622 5.449 5.007 4.848 4.627 4.402 3.911 3.635 3.31 2.971 2.632 2.193 1.583 0.004 -7 ,16736 ,KEBNE ,17131974,Sat Jan 1 03:46:45 CET,Sat Jan 1 05:19:08 CET,0.0 0.767 1.148 1.487 1.771 2.026 2.276 2.508 2.919 3.105 3.28 3.369 3.795 3.962 4.27 4.561 4.834 4.967 5.224 5.469 5.82 6.044 6.256 6.556 6.853 7.149 7.432 7.694 8.02 8.314 8.59 8.949 9.285 9.604 9.994 10.432 10.825 11.214 11.627 12.041 12.432 12.894 13.432 13.966 14.567 15.186 15.856 16.563 17.306 18.016 18.553 18.579 18.197 17.648 17.145 16.684 16.18 15.63 15.126 14.614 14.124 13.65 13.183 12.72 12.306 11.931 11.546 11.205 10.877 10.523 10.135 9.811 9.483 9.135 8.856 8.569 8.271 7.961 7.638 7.407 7.17 6.807 6.557 6.284 6.136 5.844 5.538 5.196 5.016 4.59 4.473 4.274 4.046 3.532 3.254 2.959 2.636 2.252 1.786 1.179 -0.562 -8 ,4845 ,KEBNE ,17131975,Sat Jan 1 03:48:51 CET,Sat Jan 1 05:22:29 CET,0.0 0.636 1.072 1.43 1.73 2.004 2.262 2.489 2.933 3.137 3.329 3.444 3.867 4.025 4.331 4.614 4.873 5.004 5.259 5.502 5.847 6.062 6.263 6.551 6.844 7.133 7.411 7.672 8.015 8.346 8.649 9.016 9.377 9.711 10.076 10.488 10.873 11.276 11.741 12.216 12.66 13.17 13.76 14.312 14.907 15.527 16.197 16.925 17.667 18.325 18.762 18.705 18.376 17.916 17.384 16.803 16.208 15.636 15.133 14.591 14.122 13.696 13.255 12.822 12.408 12.007 11.6 11.249 10.926 10.583 10.21 9.896 9.578 9.261 9.021 8.756 8.48 8.181 7.837 7.603 7.369 6.985 6.71 6.432 6.293 5.986 5.65 5.311 5.134 4.702 4.568 4.363 4.147 3.654 3.39 3.111 2.801 2.416 1.954 1.323 -0.649 -9 ,5027 ,KEBNE ,17131976,Sat Jan 1 04:39:12 CET,Sat Jan 1 06:11:37 CET,0.0 0.902 1.367 1.747 2.046 2.319 2.56 2.79 3.212 3.406 3.594 3.69 4.107 4.261 4.56 4.848 5.124 5.253 5.5 5.728 6.066 6.296 6.518 6.84 7.134 7.399 7.657 7.901 8.214 8.538 8.837 9.18 9.519 9.849 10.221 10.63 11.022 11.448 11.882 12.335 12.841 13.407 14.006 14.573 15.211 15.862 16.546 17.221 17.911 18.562 19.042 19.076 18.731 18.2 17.661 17.131 16.607 16.111 15.638 15.146 14.727 14.306 13.855 13.409 12.994 12.615 12.231 11.902 11.6 11.263 10.898 10.589 10.262 9.911 9.642 9.366 9.08 8.784 8.454 8.223 7.995 7.641 7.386 7.108 6.964 6.657 6.338 5.996 5.809 5.379 5.268 5.069 4.859 4.388 4.113 3.817 3.492 3.075 2.548 1.923 0.423 -10 ,9660 ,KEBNE ,17131977,Sat Jan 1 04:39:12 CET,Sat Jan 1 06:11:10 CET,0.0 0.792 1.216 1.54 1.827 2.101 2.364 2.607 3.05 3.251 3.432 3.522 3.939 4.096 4.404 4.691 4.959 5.087 5.34 5.568 5.884 6.106 6.329 6.631 6.919 7.198 7.453 7.699 8.039 8.368 8.664 9.0 9.339 9.687 10.085 10.538 10.964 11.398 11.869 12.353 12.801 13.294 13.858 14.394 14.965 15.542 16.169 16.779 17.438 18.108 18.579 18.582 18.308 17.895 17.422 16.924 16.401 15.873 15.383 14.889 14.43 13.977 13.561 13.17 12.816 12.495 12.11 11.721 11.378 11.026 10.644 10.309 9.972 9.638 9.371 9.082 8.771 8.463 8.149 7.916 7.675 7.307 7.042 6.752 6.603 6.297 5.972 5.633 5.457 5.018 4.855 4.634 4.402 3.909 3.639 3.347 3.013 2.583 2.074 1.436 -0.323 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 89679c41..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20007 ,KEBNE ,16692052,Thu Nov 25 16:28:50 CET,Thu Nov 25 18:00:51 CET,0.0 0.79 1.246 1.605 1.904 2.174 2.426 2.661 3.079 3.279 3.479 3.597 4.024 4.191 4.502 4.788 5.063 5.202 5.486 5.76 6.14 6.386 6.629 6.979 7.311 7.612 7.903 8.188 8.554 8.921 9.278 9.701 10.108 10.5 10.915 11.369 11.826 12.345 12.879 13.4 13.972 14.631 15.368 16.084 16.864 17.687 18.657 19.698 20.818 22.045 23.36 24.182 24.449 24.516 24.422 24.151 23.809 23.443 23.092 22.728 22.353 21.995 21.675 21.331 21.016 20.737 20.432 20.147 19.886 19.624 19.339 19.078 18.791 18.491 18.262 18.011 17.741 17.47 17.187 16.982 16.768 16.429 16.198 15.958 15.826 15.562 15.293 14.99 14.823 14.404 14.262 14.069 13.867 13.419 13.169 12.898 12.601 12.284 11.903 11.373 10.174 -2 ,26248 ,KEBNE ,16692053,Thu Nov 25 16:28:52 CET,Thu Nov 25 18:01:18 CET,0.0 0.804 1.266 1.654 1.974 2.261 2.519 2.758 3.212 3.425 3.628 3.747 4.176 4.348 4.68 4.988 5.291 5.439 5.723 5.994 6.379 6.626 6.864 7.218 7.55 7.847 8.135 8.426 8.824 9.203 9.551 9.966 10.368 10.753 11.194 11.68 12.133 12.627 13.138 13.666 14.239 14.868 15.574 16.338 17.244 18.182 19.16 20.149 21.263 22.52 23.83 24.676 24.98 24.935 24.77 24.499 24.192 23.867 23.481 23.049 22.672 22.353 22.038 21.725 21.433 21.151 20.825 20.508 20.233 19.94 19.606 19.333 19.057 18.756 18.513 18.257 17.996 17.73 17.454 17.258 17.049 16.712 16.47 16.218 16.091 15.828 15.536 15.202 15.018 14.6 14.445 14.235 14.028 13.557 13.301 13.028 12.736 12.412 12.02 11.524 10.495 -3 ,14424 ,KEBNE ,16692054,Thu Nov 25 16:28:51 CET,Thu Nov 25 18:00:54 CET,0.0 0.836 1.288 1.668 1.994 2.271 2.527 2.776 3.243 3.454 3.649 3.777 4.216 4.389 4.716 5.027 5.316 5.456 5.724 5.988 6.362 6.59 6.81 7.135 7.47 7.793 8.087 8.367 8.732 9.076 9.396 9.78 10.183 10.584 11.036 11.522 11.956 12.423 12.94 13.498 14.058 14.708 15.456 16.111 16.851 17.681 18.657 19.726 20.853 22.101 23.419 24.242 24.52 24.5 24.353 24.104 23.777 23.443 23.099 22.695 22.316 21.977 21.69 21.404 21.085 20.777 20.457 20.164 19.903 19.613 19.295 19.03 18.738 18.416 18.177 17.941 17.675 17.383 17.096 16.894 16.674 16.337 16.099 15.848 15.72 15.458 15.178 14.861 14.692 14.276 14.136 13.94 13.748 13.301 13.039 12.769 12.458 12.078 11.635 11.1 10.018 -4 ,16799 ,KEBNE ,16692055,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:02:10 CET,0.0 0.806 1.295 1.666 1.959 2.247 2.52 2.774 3.233 3.445 3.641 3.74 4.166 4.339 4.665 4.971 5.264 5.404 5.675 5.944 6.338 6.578 6.811 7.151 7.479 7.786 8.079 8.362 8.728 9.089 9.445 9.885 10.291 10.639 11.042 11.507 11.948 12.449 13.0 13.548 14.086 14.683 15.369 16.079 16.892 17.733 18.642 19.617 20.727 22.013 23.386 24.213 24.5 24.51 24.332 24.038 23.69 23.362 23.032 22.634 22.302 22.017 21.704 21.365 21.025 20.703 20.354 20.05 19.776 19.448 19.112 18.839 18.545 18.241 17.998 17.727 17.446 17.169 16.885 16.689 16.491 16.184 15.964 15.72 15.581 15.291 14.985 14.67 14.494 14.068 13.945 13.75 13.552 13.122 12.881 12.609 12.282 11.916 11.491 10.878 9.671 -5 ,17645 ,KEBNE ,16692056,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:03:29 CET,0.0 1.04 1.525 1.911 2.247 2.532 2.784 3.031 3.483 3.693 3.894 3.993 4.419 4.593 4.921 5.228 5.518 5.657 5.927 6.191 6.555 6.78 6.998 7.329 7.657 7.963 8.257 8.548 8.918 9.272 9.617 10.037 10.428 10.787 11.207 11.669 12.101 12.574 13.101 13.659 14.251 14.892 15.589 16.294 17.078 17.919 18.902 19.975 21.18 22.463 23.806 24.693 24.978 24.985 24.827 24.594 24.356 24.055 23.703 23.308 22.986 22.685 22.362 22.069 21.77 21.463 21.13 20.817 20.534 20.226 19.897 19.622 19.331 19.019 18.787 18.56 18.301 18.018 17.717 17.505 17.286 16.942 16.707 16.463 16.339 16.052 15.744 15.451 15.3 14.895 14.775 14.595 14.409 13.945 13.672 13.401 13.099 12.739 12.339 11.84 10.76 -6 ,25940 ,KEBNE ,16692057,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:02:47 CET,0.0 0.931 1.393 1.759 2.089 2.389 2.649 2.892 3.349 3.556 3.762 3.896 4.33 4.498 4.815 5.121 5.413 5.547 5.822 6.101 6.477 6.707 6.923 7.233 7.529 7.817 8.112 8.4 8.776 9.143 9.49 9.91 10.299 10.672 11.118 11.593 12.044 12.553 13.101 13.67 14.262 14.909 15.647 16.363 17.128 17.939 18.865 19.895 21.063 22.338 23.676 24.534 24.843 24.881 24.715 24.433 24.111 23.748 23.386 23.031 22.706 22.358 22.012 21.662 21.311 20.976 20.606 20.273 19.986 19.693 19.397 19.157 18.888 18.591 18.35 18.085 17.833 17.586 17.312 17.121 16.925 16.607 16.371 16.12 15.987 15.695 15.386 15.066 14.888 14.468 14.368 14.176 13.964 13.495 13.246 12.98 12.675 12.308 11.892 11.348 10.173 -7 ,29441 ,KEBNE ,16692058,Thu Nov 25 16:29:54 CET,Thu Nov 25 18:07:17 CET,0.0 0.896 1.353 1.718 2.044 2.337 2.594 2.826 3.25 3.456 3.654 3.772 4.204 4.374 4.691 4.997 5.287 5.429 5.711 5.972 6.341 6.575 6.808 7.158 7.491 7.797 8.078 8.352 8.724 9.094 9.434 9.841 10.216 10.579 11.025 11.516 11.999 12.516 13.046 13.598 14.173 14.814 15.543 16.219 16.974 17.842 18.773 19.742 20.878 22.136 23.437 24.296 24.556 24.492 24.271 24.002 23.695 23.338 23.04 22.705 22.348 22.014 21.655 21.293 20.968 20.666 20.329 19.999 19.725 19.454 19.149 18.885 18.608 18.308 18.056 17.801 17.561 17.3 17.001 16.785 16.559 16.202 15.971 15.733 15.607 15.349 15.066 14.771 14.613 14.205 14.098 13.903 13.685 13.214 12.975 12.712 12.39 12.026 11.612 11.022 9.703 -8 ,7146 ,KEBNE ,16692059,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:02:09 CET,0.0 0.811 1.276 1.652 1.957 2.249 2.533 2.79 3.213 3.413 3.612 3.729 4.161 4.338 4.672 4.985 5.278 5.419 5.685 5.94 6.318 6.561 6.799 7.14 7.459 7.773 8.074 8.355 8.712 9.062 9.4 9.808 10.202 10.569 10.997 11.478 11.913 12.367 12.863 13.395 13.952 14.578 15.315 16.033 16.851 17.733 18.697 19.755 20.944 22.232 23.571 24.456 24.783 24.808 24.687 24.483 24.191 23.867 23.523 23.134 22.793 22.463 22.108 21.773 21.481 21.179 20.833 20.525 20.25 19.942 19.599 19.309 18.998 18.682 18.442 18.19 17.933 17.656 17.355 17.146 16.934 16.59 16.352 16.112 15.975 15.651 15.3 14.935 14.763 14.361 14.247 14.051 13.844 13.39 13.139 12.866 12.557 12.229 11.836 11.284 10.241 -9 ,1474 ,KEBNE ,16692060,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:03:55 CET,0.0 0.907 1.403 1.785 2.101 2.395 2.663 2.899 3.32 3.52 3.711 3.812 4.232 4.396 4.717 5.015 5.309 5.452 5.729 6.002 6.39 6.633 6.868 7.204 7.522 7.824 8.125 8.433 8.825 9.183 9.516 9.918 10.297 10.663 11.09 11.559 12.018 12.52 13.021 13.509 14.018 14.603 15.306 16.031 16.867 17.756 18.76 19.811 20.963 22.248 23.557 24.389 24.704 24.756 24.646 24.433 24.133 23.814 23.532 23.189 22.859 22.559 22.228 21.891 21.566 21.25 20.942 20.653 20.383 20.079 19.744 19.491 19.234 18.93 18.681 18.424 18.158 17.892 17.625 17.433 17.226 16.899 16.652 16.407 16.284 16.026 15.747 15.418 15.241 14.826 14.69 14.496 14.302 13.83 13.572 13.306 12.978 12.629 12.241 11.727 10.763 -10 ,9829 ,KEBNE ,16692061,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:02:10 CET,0.0 1.039 1.532 1.928 2.285 2.608 2.891 3.151 3.625 3.834 4.029 4.145 4.576 4.74 5.059 5.372 5.669 5.813 6.096 6.363 6.743 7.0 7.248 7.602 7.936 8.244 8.535 8.807 9.167 9.513 9.848 10.266 10.667 11.051 11.477 11.938 12.393 12.887 13.395 13.939 14.506 15.117 15.798 16.454 17.225 18.119 19.131 20.21 21.437 22.731 24.003 24.784 25.025 25.033 24.916 24.676 24.398 24.079 23.74 23.364 23.023 22.7 22.347 21.983 21.633 21.306 20.985 20.697 20.42 20.128 19.822 19.557 19.274 18.958 18.715 18.472 18.216 17.95 17.668 17.471 17.26 16.928 16.698 16.464 16.339 16.067 15.784 15.471 15.313 14.916 14.811 14.628 14.421 13.966 13.711 13.433 13.121 12.769 12.355 11.841 10.627 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt deleted file mode 100644 index 08278973..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-45_ejm-50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14637 ,KEBNE ,16692062,Thu Nov 25 16:29:54 CET,Thu Nov 25 18:06:31 CET,0.0 0.867 1.375 1.78 2.139 2.469 2.779 3.062 3.57 3.804 4.023 4.168 4.618 4.818 5.202 5.571 5.912 6.072 6.389 6.706 7.175 7.475 7.757 8.173 8.592 9.005 9.408 9.804 10.32 10.817 11.299 11.857 12.387 12.924 13.543 14.253 14.932 15.647 16.439 17.278 18.174 19.185 20.338 21.519 22.904 24.454 26.235 28.353 30.962 34.014 37.82 41.165 43.098 44.165 44.772 45.195 45.444 45.51 45.455 45.347 45.236 45.092 44.899 44.696 44.467 44.24 44.005 43.772 43.554 43.312 43.055 42.87 42.652 42.373 42.163 41.947 41.704 41.444 41.17 40.967 40.753 40.407 40.149 39.871 39.733 39.461 39.169 38.827 38.648 38.249 38.081 37.863 37.631 37.113 36.809 36.475 36.081 35.623 35.098 34.418 32.328 -2 ,29899 ,KEBNE ,16692063,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:04:50 CET,0.0 0.828 1.249 1.606 1.958 2.287 2.571 2.838 3.323 3.554 3.775 3.933 4.397 4.6 4.971 5.327 5.677 5.838 6.146 6.456 6.923 7.231 7.531 7.96 8.37 8.773 9.169 9.553 10.037 10.499 10.948 11.5 12.047 12.594 13.217 13.914 14.585 15.319 16.091 16.904 17.766 18.734 19.918 21.147 22.584 24.169 26.075 28.287 30.895 34.104 38.126 41.254 42.886 43.876 44.531 45.003 45.294 45.37 45.37 45.322 45.191 45.041 44.854 44.652 44.446 44.239 44.048 43.878 43.694 43.488 43.276 43.071 42.83 42.585 42.394 42.179 41.947 41.705 41.434 41.246 41.044 40.703 40.462 40.193 40.059 39.786 39.458 39.105 38.929 38.528 38.343 38.115 37.879 37.375 37.082 36.756 36.407 35.977 35.434 34.715 32.173 -3 ,8819 ,KEBNE ,16692064,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:05:30 CET,0.0 0.675 1.155 1.553 1.882 2.193 2.492 2.763 3.245 3.47 3.694 3.857 4.311 4.505 4.885 5.257 5.617 5.785 6.115 6.437 6.916 7.23 7.527 7.958 8.366 8.751 9.125 9.489 9.968 10.439 10.886 11.431 11.97 12.492 13.11 13.807 14.464 15.186 15.963 16.802 17.682 18.659 19.815 21.029 22.476 24.072 25.932 28.06 30.602 33.731 37.652 40.809 42.567 43.648 44.234 44.546 44.728 44.803 44.77 44.649 44.501 44.324 44.165 44.021 43.842 43.676 43.461 43.234 43.047 42.842 42.599 42.376 42.141 41.888 41.685 41.47 41.231 40.976 40.718 40.537 40.329 40.003 39.783 39.543 39.417 39.135 38.824 38.499 38.326 37.917 37.74 37.537 37.322 36.823 36.529 36.218 35.866 35.453 34.965 34.302 32.039 -4 ,15416 ,KEBNE ,16692065,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:05:21 CET,0.0 0.978 1.473 1.858 2.183 2.485 2.769 3.027 3.509 3.742 3.962 4.131 4.591 4.779 5.147 5.503 5.838 6.004 6.332 6.643 7.078 7.354 7.62 8.024 8.432 8.817 9.19 9.561 10.039 10.498 10.957 11.523 12.057 12.574 13.166 13.811 14.463 15.227 16.042 16.897 17.817 18.849 20.024 21.244 22.712 24.301 26.116 28.226 30.706 33.714 37.498 40.641 42.462 43.513 44.117 44.475 44.682 44.81 44.845 44.757 44.627 44.473 44.286 44.107 43.923 43.757 43.559 43.328 43.12 42.895 42.65 42.429 42.18 41.91 41.694 41.476 41.252 41.016 40.756 40.547 40.333 40.012 39.775 39.533 39.406 39.132 38.842 38.53 38.36 37.96 37.778 37.567 37.344 36.807 36.517 36.199 35.816 35.376 34.891 34.24 31.578 -5 ,26469 ,KEBNE ,16692066,Thu Nov 25 16:29:54 CET,Thu Nov 25 18:05:08 CET,0.0 0.663 1.119 1.518 1.867 2.177 2.456 2.718 3.218 3.452 3.674 3.845 4.307 4.506 4.885 5.238 5.583 5.759 6.099 6.414 6.867 7.17 7.467 7.891 8.283 8.651 9.018 9.383 9.875 10.333 10.759 11.285 11.807 12.339 12.94 13.582 14.221 14.95 15.726 16.536 17.396 18.387 19.567 20.756 22.124 23.659 25.423 27.491 30.057 33.083 36.887 40.118 42.015 43.176 43.855 44.284 44.491 44.602 44.652 44.6 44.46 44.298 44.168 44.019 43.838 43.647 43.408 43.184 42.983 42.772 42.536 42.309 42.068 41.839 41.652 41.425 41.187 40.938 40.669 40.481 40.269 39.948 39.733 39.464 39.315 39.031 38.747 38.447 38.288 37.902 37.746 37.511 37.256 36.749 36.462 36.115 35.701 35.224 34.666 33.863 30.952 -6 ,10894 ,KEBNE ,16692067,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:06:31 CET,0.0 0.747 1.246 1.65 1.995 2.31 2.594 2.867 3.385 3.625 3.856 4.036 4.502 4.692 5.058 5.421 5.774 5.942 6.273 6.605 7.078 7.378 7.679 8.118 8.535 8.945 9.343 9.727 10.221 10.692 11.149 11.706 12.226 12.741 13.357 14.033 14.698 15.424 16.19 17.029 17.932 18.955 20.162 21.399 22.806 24.356 26.233 28.407 30.966 34.034 37.957 41.268 43.103 44.199 44.929 45.339 45.488 45.537 45.567 45.556 45.479 45.366 45.164 44.915 44.695 44.479 44.219 43.984 43.808 43.634 43.416 43.199 42.96 42.692 42.461 42.223 42.004 41.774 41.493 41.299 41.106 40.801 40.563 40.307 40.174 39.893 39.597 39.281 39.108 38.699 38.547 38.331 38.086 37.539 37.23 36.891 36.505 36.046 35.499 34.826 32.44 -7 ,24128 ,KEBNE ,16692068,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:04:26 CET,0.0 0.924 1.397 1.789 2.144 2.452 2.736 3.007 3.5 3.729 3.952 4.125 4.578 4.769 5.148 5.499 5.833 5.998 6.323 6.641 7.095 7.398 7.697 8.108 8.49 8.878 9.272 9.652 10.139 10.607 11.059 11.607 12.146 12.678 13.308 14.021 14.716 15.494 16.297 17.122 18.033 19.098 20.31 21.521 22.916 24.448 26.267 28.343 30.82 33.886 37.747 40.808 42.582 43.769 44.48 44.857 45.041 45.135 45.14 45.033 44.912 44.801 44.658 44.512 44.336 44.103 43.828 43.604 43.408 43.194 42.942 42.719 42.484 42.218 41.997 41.757 41.503 41.242 40.952 40.739 40.52 40.19 39.949 39.693 39.563 39.286 38.985 38.653 38.467 38.046 37.861 37.65 37.43 36.937 36.65 36.337 35.986 35.567 35.055 34.298 31.969 -8 ,2380 ,KEBNE ,16692069,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:01:21 CET,0.0 0.993 1.476 1.871 2.226 2.568 2.875 3.139 3.638 3.881 4.103 4.271 4.741 4.949 5.334 5.696 6.034 6.202 6.534 6.854 7.307 7.608 7.903 8.329 8.744 9.136 9.517 9.885 10.356 10.827 11.293 11.845 12.382 12.915 13.522 14.2 14.849 15.548 16.31 17.15 18.046 19.057 20.235 21.408 22.846 24.47 26.316 28.437 30.969 33.925 37.583 40.815 42.668 43.834 44.58 44.949 45.139 45.201 45.162 45.072 44.907 44.703 44.503 44.299 44.079 43.872 43.637 43.394 43.165 42.922 42.67 42.443 42.194 41.945 41.747 41.525 41.288 41.031 40.758 40.571 40.365 40.038 39.782 39.503 39.373 39.092 38.795 38.481 38.311 37.9 37.69 37.465 37.237 36.709 36.42 36.103 35.719 35.31 34.84 34.127 32.007 -9 ,11583 ,KEBNE ,16692070,Thu Nov 25 16:29:54 CET,Thu Nov 25 18:08:24 CET,0.0 0.828 1.33 1.714 2.034 2.327 2.611 2.884 3.396 3.632 3.854 4.007 4.462 4.658 5.031 5.388 5.727 5.896 6.223 6.543 7.03 7.33 7.615 8.046 8.454 8.844 9.231 9.616 10.105 10.566 11.023 11.58 12.119 12.641 13.235 13.916 14.584 15.314 16.109 16.948 17.823 18.822 20.006 21.185 22.558 24.15 25.999 28.141 30.748 33.872 37.733 40.915 42.753 43.854 44.559 45.067 45.33 45.373 45.328 45.295 45.223 45.09 44.931 44.732 44.53 44.362 44.149 43.929 43.731 43.491 43.239 43.023 42.783 42.537 42.345 42.141 41.921 41.673 41.405 41.211 41.007 40.659 40.401 40.153 40.019 39.728 39.436 39.125 38.953 38.549 38.37 38.168 37.94 37.406 37.124 36.817 36.459 36.036 35.517 34.762 31.98 -10 ,29501 ,KEBNE ,16692071,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:02:49 CET,0.0 0.843 1.343 1.765 2.099 2.406 2.69 2.94 3.397 3.623 3.852 4.031 4.497 4.696 5.074 5.449 5.81 5.978 6.3 6.609 7.068 7.373 7.669 8.093 8.5 8.904 9.285 9.655 10.159 10.656 11.137 11.707 12.237 12.746 13.349 14.012 14.639 15.362 16.176 17.043 17.959 19.004 20.206 21.392 22.782 24.37 26.227 28.356 30.93 33.984 37.615 40.691 42.594 43.791 44.512 44.918 45.169 45.351 45.41 45.356 45.27 45.151 44.978 44.788 44.585 44.38 44.163 43.95 43.753 43.536 43.292 43.079 42.849 42.611 42.419 42.191 41.946 41.71 41.456 41.272 41.083 40.764 40.534 40.299 40.172 39.912 39.623 39.302 39.134 38.735 38.57 38.348 38.104 37.556 37.231 36.914 36.578 36.165 35.672 34.959 31.938 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index d07f027e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-46_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28004 ,KEBNE ,17131978,Sat Jan 1 04:40:15 CET,Sat Jan 1 06:13:20 CET,0.0 0.746 1.111 1.428 1.701 1.936 2.155 2.356 2.705 2.873 3.039 3.098 3.478 3.617 3.889 4.13 4.351 4.463 4.696 4.916 5.208 5.395 5.575 5.837 6.092 6.34 6.578 6.795 7.054 7.3 7.548 7.844 8.115 8.35 8.607 8.922 9.225 9.528 9.826 10.127 10.43 10.762 11.155 11.474 11.786 12.113 12.412 12.637 12.69 12.529 11.945 10.874 9.79 8.729 7.744 6.844 6.041 5.294 4.619 3.93 3.34 2.827 2.332 1.828 1.345 0.911 0.467 0.06 -0.318 -0.709 -1.112 -1.444 -1.796 -2.178 -2.473 -2.773 -3.08 -3.395 -3.723 -3.949 -4.184 -4.562 -4.821 -5.089 -5.231 -5.532 -5.846 -6.162 -6.33 -6.752 -6.867 -7.072 -7.288 -7.733 -7.963 -8.21 -8.488 -8.812 -9.186 -9.632 -10.472 -2 ,1642 ,KEBNE ,17131979,Sat Jan 1 04:40:15 CET,Sat Jan 1 06:13:05 CET,0.0 0.657 1.05 1.352 1.61 1.851 2.082 2.297 2.663 2.834 3.005 3.081 3.46 3.594 3.867 4.136 4.379 4.492 4.704 4.908 5.205 5.387 5.559 5.806 6.04 6.274 6.504 6.719 6.989 7.247 7.505 7.813 8.1 8.359 8.65 8.991 9.301 9.616 9.94 10.272 10.607 10.928 11.234 11.576 11.95 12.254 12.534 12.761 12.854 12.685 12.051 10.964 9.89 8.828 7.839 6.926 6.074 5.273 4.572 3.857 3.254 2.718 2.193 1.687 1.202 0.75 0.268 -0.175 -0.553 -0.929 -1.334 -1.674 -2.016 -2.37 -2.643 -2.932 -3.231 -3.539 -3.873 -4.102 -4.336 -4.701 -4.952 -5.224 -5.367 -5.661 -5.963 -6.277 -6.439 -6.861 -6.986 -7.193 -7.401 -7.827 -8.069 -8.339 -8.622 -8.935 -9.297 -9.74 -10.663 -3 ,5646 ,KEBNE ,17131980,Sat Jan 1 04:42:19 CET,Sat Jan 1 06:16:03 CET,0.0 0.801 1.18 1.492 1.757 1.985 2.209 2.432 2.833 3.01 3.178 3.261 3.65 3.793 4.056 4.308 4.542 4.652 4.863 5.069 5.377 5.572 5.755 6.018 6.267 6.501 6.733 6.942 7.201 7.447 7.673 7.961 8.236 8.499 8.8 9.111 9.383 9.656 9.962 10.305 10.655 10.995 11.338 11.678 12.018 12.328 12.608 12.852 13.005 12.869 12.224 11.095 9.954 8.923 7.994 7.168 6.443 5.711 5.046 4.388 3.814 3.274 2.747 2.266 1.788 1.331 0.856 0.433 0.079 -0.301 -0.719 -1.067 -1.415 -1.769 -2.056 -2.364 -2.67 -2.982 -3.307 -3.53 -3.772 -4.15 -4.408 -4.68 -4.825 -5.113 -5.402 -5.73 -5.906 -6.328 -6.441 -6.641 -6.849 -7.311 -7.56 -7.826 -8.119 -8.45 -8.836 -9.311 -10.106 -4 ,20922 ,KEBNE ,17131981,Sat Jan 1 05:12:30 CET,Sat Jan 1 06:45:29 CET,0.0 0.748 1.149 1.471 1.756 2.013 2.244 2.456 2.858 3.041 3.208 3.266 3.649 3.785 4.038 4.282 4.517 4.63 4.851 5.055 5.341 5.534 5.721 5.984 6.249 6.495 6.718 6.929 7.207 7.492 7.759 8.051 8.317 8.572 8.853 9.167 9.477 9.809 10.145 10.472 10.785 11.116 11.493 11.842 12.199 12.514 12.767 12.938 12.996 12.863 12.231 11.082 9.944 8.884 7.889 6.965 6.198 5.502 4.843 4.151 3.533 2.955 2.426 1.928 1.448 1.029 0.58 0.15 -0.222 -0.608 -1.022 -1.365 -1.714 -2.079 -2.367 -2.669 -2.981 -3.311 -3.641 -3.863 -4.105 -4.484 -4.738 -5.0 -5.142 -5.436 -5.751 -6.098 -6.267 -6.689 -6.834 -7.033 -7.233 -7.681 -7.93 -8.204 -8.48 -8.765 -9.08 -9.485 -10.357 -5 ,29470 ,KEBNE ,17131982,Sat Jan 1 05:13:33 CET,Sat Jan 1 06:47:26 CET,0.0 0.776 1.193 1.486 1.741 2.005 2.244 2.451 2.814 2.988 3.156 3.236 3.633 3.781 4.035 4.266 4.5 4.615 4.827 5.032 5.332 5.527 5.711 5.965 6.208 6.448 6.672 6.885 7.16 7.412 7.658 7.952 8.232 8.507 8.804 9.116 9.396 9.673 10.0 10.339 10.617 10.894 11.211 11.539 11.886 12.195 12.481 12.699 12.816 12.724 12.121 11.062 9.966 8.914 7.944 7.053 6.309 5.626 4.996 4.317 3.688 3.133 2.644 2.181 1.727 1.28 0.799 0.409 0.08 -0.289 -0.684 -1.024 -1.383 -1.749 -2.035 -2.319 -2.601 -2.915 -3.253 -3.482 -3.719 -4.095 -4.356 -4.642 -4.789 -5.077 -5.385 -5.712 -5.876 -6.297 -6.406 -6.608 -6.826 -7.28 -7.525 -7.799 -8.102 -8.436 -8.828 -9.346 -10.319 -6 ,7350 ,KEBNE ,17131983,Sat Jan 1 05:19:51 CET,Sat Jan 1 06:52:34 CET,0.0 0.944 1.336 1.648 1.944 2.195 2.416 2.631 3.025 3.197 3.362 3.455 3.851 4.001 4.293 4.561 4.799 4.917 5.146 5.348 5.623 5.813 6.0 6.264 6.517 6.763 6.998 7.216 7.483 7.74 7.988 8.275 8.54 8.8 9.102 9.406 9.694 10.02 10.334 10.626 10.907 11.212 11.557 11.875 12.205 12.516 12.808 12.981 13.028 12.897 12.292 11.156 10.013 8.942 7.977 7.118 6.343 5.583 4.908 4.23 3.627 3.08 2.565 2.094 1.66 1.223 0.728 0.298 -0.065 -0.457 -0.875 -1.211 -1.561 -1.918 -2.188 -2.477 -2.784 -3.106 -3.446 -3.681 -3.918 -4.286 -4.55 -4.832 -4.975 -5.27 -5.568 -5.884 -6.057 -6.483 -6.587 -6.774 -6.972 -7.421 -7.664 -7.919 -8.204 -8.526 -8.892 -9.322 -10.121 -7 ,19969 ,KEBNE ,17131984,Sat Jan 1 05:22:55 CET,Sat Jan 1 06:57:13 CET,0.0 0.652 1.083 1.421 1.711 1.965 2.201 2.416 2.791 2.969 3.139 3.221 3.61 3.755 4.025 4.264 4.49 4.602 4.828 5.041 5.34 5.531 5.723 5.993 6.239 6.478 6.703 6.918 7.196 7.459 7.715 8.011 8.284 8.542 8.836 9.169 9.444 9.726 10.05 10.372 10.694 11.073 11.497 11.822 12.107 12.381 12.657 12.896 13.03 12.953 12.367 11.231 10.134 9.124 8.189 7.312 6.493 5.702 5.047 4.39 3.754 3.172 2.626 2.092 1.59 1.146 0.695 0.272 -0.101 -0.465 -0.841 -1.171 -1.526 -1.89 -2.171 -2.47 -2.788 -3.11 -3.442 -3.668 -3.898 -4.259 -4.511 -4.774 -4.918 -5.228 -5.547 -5.872 -6.04 -6.471 -6.6 -6.795 -7.001 -7.45 -7.689 -7.956 -8.253 -8.578 -8.948 -9.396 -10.353 -8 ,27910 ,KEBNE ,17131985,Sat Jan 1 06:11:53 CET,Sat Jan 1 07:44:44 CET,0.0 0.861 1.245 1.568 1.851 2.091 2.316 2.529 2.924 3.105 3.277 3.359 3.751 3.896 4.168 4.417 4.645 4.756 4.976 5.212 5.559 5.759 5.946 6.202 6.451 6.707 6.948 7.168 7.438 7.692 7.948 8.263 8.558 8.849 9.16 9.476 9.782 10.099 10.424 10.746 11.063 11.404 11.763 12.11 12.461 12.758 13.064 13.316 13.451 13.413 12.874 11.768 10.651 9.638 8.69 7.794 7.028 6.335 5.682 4.949 4.295 3.73 3.196 2.722 2.278 1.857 1.424 1.017 0.643 0.25 -0.141 -0.479 -0.841 -1.207 -1.485 -1.775 -2.086 -2.408 -2.746 -2.979 -3.221 -3.609 -3.869 -4.133 -4.271 -4.556 -4.865 -5.201 -5.378 -5.809 -5.931 -6.138 -6.355 -6.8 -7.04 -7.311 -7.615 -7.929 -8.299 -8.798 -9.815 -9 ,27882 ,KEBNE ,17131986,Sat Jan 1 06:11:53 CET,Sat Jan 1 07:45:18 CET,0.0 0.756 1.181 1.497 1.775 2.014 2.243 2.467 2.86 3.035 3.2 3.257 3.636 3.771 4.046 4.308 4.547 4.661 4.878 5.081 5.381 5.571 5.748 6.009 6.259 6.501 6.742 6.965 7.226 7.485 7.733 8.024 8.293 8.546 8.842 9.165 9.481 9.797 10.113 10.466 10.832 11.203 11.565 11.88 12.207 12.524 12.832 13.108 13.273 13.18 12.593 11.556 10.458 9.346 8.355 7.455 6.682 5.981 5.308 4.627 4.046 3.502 2.984 2.505 2.061 1.618 1.126 0.707 0.358 0.006 -0.371 -0.692 -1.012 -1.365 -1.656 -1.951 -2.252 -2.574 -2.923 -3.159 -3.392 -3.758 -4.017 -4.293 -4.432 -4.708 -5.004 -5.325 -5.496 -5.918 -6.025 -6.211 -6.406 -6.85 -7.081 -7.327 -7.608 -7.931 -8.328 -8.821 -9.566 -10 ,31323 ,KEBNE ,17131987,Sat Jan 1 06:13:58 CET,Sat Jan 1 07:46:27 CET,0.0 0.715 1.114 1.435 1.708 1.964 2.197 2.408 2.796 2.969 3.133 3.201 3.596 3.747 4.014 4.253 4.479 4.596 4.826 5.043 5.336 5.511 5.685 5.937 6.168 6.382 6.587 6.783 7.051 7.308 7.55 7.823 8.069 8.328 8.64 8.973 9.276 9.613 9.972 10.337 10.675 11.028 11.46 11.812 12.133 12.457 12.737 12.975 13.12 12.991 12.34 11.211 10.07 9.003 8.031 7.095 6.279 5.541 4.879 4.245 3.679 3.136 2.621 2.11 1.602 1.13 0.656 0.236 -0.136 -0.516 -0.922 -1.256 -1.595 -1.955 -2.241 -2.534 -2.829 -3.139 -3.463 -3.69 -3.921 -4.278 -4.53 -4.799 -4.935 -5.211 -5.514 -5.847 -6.023 -6.449 -6.562 -6.75 -6.963 -7.442 -7.691 -7.949 -8.243 -8.566 -8.939 -9.406 -10.269 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index c4b8e588..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17981 ,KEBNE ,16692072,Thu Nov 25 16:29:54 CET,Thu Nov 25 18:04:51 CET,0.0 0.988 1.423 1.764 2.053 2.32 2.557 2.79 3.225 3.426 3.61 3.702 4.108 4.26 4.546 4.815 5.082 5.212 5.453 5.69 6.037 6.257 6.457 6.757 7.059 7.34 7.593 7.83 8.154 8.47 8.773 9.133 9.475 9.802 10.185 10.599 10.958 11.35 11.796 12.261 12.721 13.21 13.73 14.237 14.871 15.563 16.308 17.05 17.772 18.44 18.914 18.888 18.577 18.164 17.689 17.222 16.7 16.127 15.642 15.181 14.725 14.279 13.891 13.523 13.16 12.791 12.39 12.042 11.753 11.46 11.131 10.844 10.533 10.202 9.945 9.679 9.405 9.114 8.794 8.565 8.335 7.992 7.747 7.493 7.364 7.099 6.825 6.525 6.352 5.931 5.811 5.628 5.433 5.0 4.76 4.482 4.185 3.863 3.479 2.977 1.834 -2 ,22052 ,KEBNE ,16692073,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:03:28 CET,0.0 0.683 1.134 1.504 1.795 2.034 2.255 2.471 2.873 3.064 3.242 3.321 3.729 3.888 4.171 4.442 4.707 4.832 5.08 5.318 5.656 5.867 6.068 6.366 6.65 6.919 7.183 7.436 7.77 8.091 8.385 8.736 9.071 9.394 9.768 10.183 10.575 10.995 11.412 11.844 12.319 12.85 13.441 13.999 14.634 15.278 15.94 16.63 17.329 17.943 18.295 18.229 17.878 17.349 16.778 16.188 15.612 15.09 14.605 14.107 13.664 13.237 12.816 12.407 12.019 11.662 11.286 10.933 10.635 10.307 9.94 9.656 9.362 9.046 8.793 8.531 8.255 7.967 7.654 7.44 7.227 6.887 6.649 6.392 6.254 5.966 5.669 5.36 5.195 4.782 4.654 4.457 4.273 3.875 3.64 3.385 3.111 2.792 2.426 2.013 1.116 -3 ,4029 ,KEBNE ,16692074,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:04:58 CET,0.0 0.685 1.116 1.463 1.758 2.019 2.243 2.455 2.846 3.034 3.233 3.37 3.778 3.926 4.219 4.498 4.777 4.914 5.167 5.406 5.756 5.98 6.191 6.499 6.783 7.058 7.337 7.599 7.922 8.235 8.547 8.926 9.288 9.604 9.957 10.365 10.753 11.173 11.6 12.039 12.486 12.976 13.509 13.993 14.548 15.139 15.779 16.451 17.105 17.674 18.09 18.038 17.679 17.218 16.717 16.235 15.743 15.198 14.734 14.232 13.764 13.354 12.962 12.601 12.234 11.874 11.503 11.155 10.856 10.538 10.182 9.883 9.567 9.239 9.002 8.763 8.481 8.173 7.862 7.646 7.424 7.074 6.823 6.561 6.431 6.155 5.849 5.542 5.384 4.976 4.855 4.674 4.486 4.048 3.812 3.547 3.266 2.966 2.576 2.054 1.047 -4 ,29985 ,KEBNE ,16692075,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:03:39 CET,0.0 0.988 1.403 1.743 2.038 2.3 2.555 2.798 3.261 3.475 3.664 3.78 4.209 4.374 4.669 4.959 5.251 5.398 5.681 5.941 6.322 6.565 6.79 7.111 7.413 7.703 7.975 8.224 8.542 8.855 9.148 9.509 9.867 10.184 10.554 10.988 11.381 11.78 12.185 12.606 13.056 13.59 14.195 14.733 15.305 15.9 16.538 17.159 17.808 18.465 18.915 18.827 18.38 17.889 17.408 16.875 16.334 15.787 15.316 14.807 14.341 13.917 13.497 13.113 12.752 12.397 11.987 11.595 11.266 10.937 10.585 10.296 10.007 9.701 9.443 9.175 8.913 8.637 8.333 8.114 7.885 7.537 7.312 7.069 6.938 6.677 6.388 6.079 5.921 5.511 5.4 5.214 5.012 4.583 4.352 4.102 3.811 3.475 3.111 2.657 1.692 -5 ,32402 ,KEBNE ,16692076,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:03:34 CET,0.0 0.884 1.311 1.661 1.954 2.213 2.455 2.688 3.113 3.311 3.488 3.534 3.916 4.055 4.335 4.597 4.854 4.983 5.226 5.458 5.8 6.018 6.22 6.497 6.768 7.045 7.311 7.564 7.902 8.218 8.507 8.889 9.263 9.595 9.956 10.339 10.712 11.127 11.564 12.009 12.467 13.001 13.609 14.169 14.763 15.34 16.009 16.725 17.413 18.035 18.455 18.369 17.933 17.481 17.025 16.473 15.906 15.358 14.865 14.356 13.908 13.519 13.114 12.71 12.332 11.972 11.612 11.287 10.992 10.693 10.353 10.049 9.742 9.425 9.177 8.918 8.65 8.369 8.066 7.848 7.622 7.267 7.013 6.748 6.616 6.35 6.068 5.763 5.599 5.186 5.061 4.875 4.681 4.24 3.996 3.733 3.452 3.156 2.805 2.377 1.388 -6 ,8325 ,KEBNE ,16692077,Thu Nov 25 16:29:52 CET,Thu Nov 25 18:01:55 CET,0.0 0.799 1.232 1.612 1.94 2.224 2.474 2.698 3.099 3.293 3.476 3.568 3.976 4.127 4.408 4.669 4.913 5.037 5.288 5.524 5.865 6.094 6.297 6.585 6.89 7.191 7.476 7.75 8.098 8.411 8.708 9.059 9.382 9.694 10.053 10.455 10.817 11.21 11.668 12.102 12.507 13.003 13.595 14.152 14.773 15.405 16.069 16.782 17.524 18.208 18.655 18.521 18.075 17.573 17.052 16.503 15.99 15.512 15.093 14.61 14.154 13.73 13.322 12.91 12.518 12.177 11.789 11.44 11.157 10.858 10.514 10.216 9.92 9.608 9.36 9.108 8.841 8.557 8.254 8.04 7.811 7.439 7.181 6.911 6.779 6.52 6.228 5.921 5.767 5.366 5.264 5.078 4.884 4.469 4.227 3.947 3.654 3.343 2.967 2.472 1.755 -7 ,13175 ,KEBNE ,16692078,Thu Nov 25 16:29:52 CET,Thu Nov 25 18:02:21 CET,0.0 0.911 1.354 1.704 2.016 2.287 2.522 2.745 3.168 3.364 3.554 3.654 4.054 4.204 4.507 4.789 5.057 5.188 5.438 5.67 5.983 6.182 6.383 6.684 6.98 7.244 7.489 7.723 8.031 8.356 8.676 9.048 9.369 9.671 10.042 10.459 10.851 11.248 11.667 12.136 12.624 13.129 13.646 14.127 14.727 15.416 16.114 16.74 17.357 17.908 18.299 18.237 17.834 17.329 16.807 16.295 15.827 15.385 14.958 14.518 14.121 13.715 13.289 12.895 12.513 12.147 11.768 11.423 11.11 10.744 10.358 10.056 9.737 9.401 9.145 8.878 8.596 8.288 7.977 7.769 7.543 7.19 6.939 6.682 6.551 6.269 5.971 5.65 5.488 5.083 4.959 4.763 4.565 4.15 3.919 3.667 3.375 3.037 2.655 2.185 1.2 -8 ,18906 ,KEBNE ,16692079,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:02:17 CET,0.0 0.72 1.157 1.496 1.789 2.053 2.286 2.498 2.893 3.073 3.251 3.357 3.774 3.932 4.213 4.495 4.772 4.901 5.155 5.397 5.732 5.951 6.168 6.481 6.771 7.045 7.302 7.55 7.879 8.18 8.465 8.813 9.148 9.482 9.872 10.276 10.651 11.056 11.468 11.898 12.328 12.793 13.31 13.818 14.382 14.962 15.573 16.19 16.842 17.487 17.933 17.866 17.493 17.039 16.554 16.001 15.433 14.878 14.385 13.877 13.419 12.995 12.57 12.157 11.751 11.382 10.994 10.644 10.337 10.003 9.657 9.378 9.095 8.792 8.545 8.284 8.015 7.737 7.428 7.21 6.991 6.655 6.43 6.181 6.043 5.769 5.487 5.184 5.025 4.61 4.477 4.275 4.064 3.618 3.383 3.139 2.857 2.548 2.162 1.632 0.604 -9 ,27483 ,KEBNE ,16692080,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:04:46 CET,0.0 0.84 1.297 1.635 1.924 2.192 2.431 2.661 3.094 3.295 3.486 3.569 3.964 4.121 4.422 4.696 4.962 5.092 5.345 5.588 5.931 6.147 6.352 6.648 6.935 7.21 7.471 7.712 8.041 8.366 8.669 9.019 9.345 9.652 10.01 10.415 10.769 11.16 11.614 12.091 12.576 13.103 13.707 14.281 14.876 15.464 16.131 16.854 17.519 18.117 18.554 18.5 18.139 17.68 17.163 16.603 16.102 15.586 15.088 14.59 14.123 13.661 13.247 12.884 12.529 12.189 11.825 11.504 11.215 10.878 10.523 10.245 9.946 9.615 9.35 9.088 8.825 8.532 8.217 8.007 7.796 7.456 7.213 6.962 6.834 6.558 6.256 5.952 5.8 5.397 5.295 5.107 4.905 4.488 4.251 3.985 3.683 3.328 2.924 2.465 1.549 -10 ,8284 ,KEBNE ,16692081,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:01:56 CET,0.0 0.699 1.089 1.404 1.697 1.961 2.21 2.435 2.856 3.048 3.231 3.338 3.755 3.919 4.227 4.499 4.742 4.861 5.101 5.338 5.679 5.894 6.105 6.408 6.694 6.973 7.234 7.492 7.834 8.156 8.464 8.807 9.114 9.415 9.783 10.184 10.56 10.958 11.349 11.762 12.206 12.692 13.237 13.743 14.266 14.838 15.461 16.124 16.866 17.487 17.854 17.767 17.406 16.943 16.474 16.002 15.496 14.991 14.55 14.061 13.574 13.13 12.725 12.334 11.96 11.589 11.174 10.811 10.499 10.167 9.813 9.518 9.211 8.886 8.633 8.368 8.079 7.771 7.447 7.232 7.018 6.685 6.429 6.149 6.016 5.742 5.456 5.151 4.992 4.587 4.465 4.276 4.086 3.675 3.442 3.182 2.901 2.587 2.21 1.743 0.755 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt deleted file mode 100644 index 252867ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-47_jmc-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16412 ,KEBNE ,16692082,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:02:02 CET,0.0 0.947 1.422 1.822 2.18 2.49 2.765 3.018 3.495 3.706 3.908 4.044 4.459 4.615 4.913 5.211 5.497 5.633 5.885 6.127 6.478 6.698 6.911 7.208 7.487 7.757 8.02 8.268 8.579 8.886 9.188 9.527 9.824 10.092 10.379 10.7 11.024 11.378 11.754 12.16 12.553 12.975 13.442 13.84 14.229 14.619 15.048 15.403 15.661 15.777 15.443 14.538 13.533 12.561 11.679 10.848 10.102 9.399 8.766 8.099 7.497 6.957 6.456 5.977 5.506 5.088 4.664 4.252 3.87 3.471 3.06 2.719 2.356 1.995 1.715 1.411 1.098 0.769 0.427 0.197 -0.047 -0.435 -0.697 -0.971 -1.114 -1.395 -1.683 -1.999 -2.167 -2.592 -2.716 -2.907 -3.104 -3.53 -3.769 -4.033 -4.314 -4.611 -4.958 -5.43 -6.211 -2 ,11749 ,KEBNE ,16692083,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:03:21 CET,0.0 1.095 1.593 1.963 2.296 2.587 2.85 3.095 3.547 3.756 3.948 4.044 4.451 4.616 4.934 5.227 5.5 5.629 5.886 6.141 6.498 6.721 6.928 7.235 7.546 7.835 8.101 8.341 8.633 8.926 9.218 9.56 9.868 10.168 10.504 10.863 11.23 11.606 11.987 12.368 12.729 13.11 13.527 13.915 14.335 14.785 15.241 15.651 15.923 15.966 15.571 14.652 13.688 12.71 11.788 10.896 10.052 9.289 8.605 7.907 7.325 6.786 6.262 5.772 5.309 4.885 4.429 4.003 3.623 3.22 2.82 2.497 2.142 1.772 1.492 1.185 0.858 0.533 0.204 -0.022 -0.256 -0.646 -0.921 -1.186 -1.313 -1.578 -1.877 -2.201 -2.376 -2.809 -2.927 -3.119 -3.307 -3.71 -3.947 -4.214 -4.51 -4.85 -5.253 -5.731 -6.532 -3 ,31418 ,KEBNE ,16692084,Thu Nov 25 16:29:53 CET,Thu Nov 25 18:04:42 CET,0.0 1.0 1.474 1.855 2.194 2.503 2.776 3.027 3.472 3.673 3.866 3.995 4.411 4.57 4.896 5.209 5.481 5.607 5.872 6.13 6.467 6.685 6.891 7.179 7.464 7.73 7.99 8.237 8.559 8.874 9.175 9.53 9.858 10.171 10.51 10.849 11.201 11.609 12.03 12.45 12.866 13.309 13.74 14.111 14.478 14.835 15.175 15.497 15.78 15.795 15.362 14.479 13.44 12.448 11.572 10.704 9.874 9.071 8.382 7.712 7.126 6.607 6.11 5.617 5.161 4.743 4.296 3.889 3.513 3.132 2.736 2.392 2.043 1.688 1.412 1.142 0.849 0.525 0.186 -0.054 -0.299 -0.668 -0.92 -1.18 -1.314 -1.596 -1.901 -2.228 -2.392 -2.817 -2.955 -3.153 -3.353 -3.785 -4.041 -4.317 -4.59 -4.894 -5.27 -5.75 -6.678 -4 ,28226 ,KEBNE ,16692085,Thu Nov 25 16:53:57 CET,Thu Nov 25 18:25:43 CET,0.0 1.028 1.523 1.885 2.216 2.513 2.782 3.027 3.461 3.667 3.846 3.923 4.33 4.488 4.784 5.082 5.366 5.499 5.763 6.016 6.367 6.588 6.802 7.107 7.388 7.652 7.899 8.149 8.474 8.775 9.071 9.415 9.717 10.001 10.357 10.743 11.088 11.464 11.834 12.176 12.524 12.909 13.357 13.832 14.319 14.764 15.17 15.469 15.664 15.668 15.249 14.313 13.293 12.313 11.424 10.562 9.784 9.092 8.467 7.802 7.213 6.678 6.158 5.666 5.204 4.766 4.321 3.925 3.56 3.168 2.758 2.419 2.075 1.732 1.462 1.17 0.853 0.528 0.201 -0.029 -0.264 -0.633 -0.895 -1.174 -1.312 -1.588 -1.89 -2.212 -2.377 -2.791 -2.91 -3.108 -3.321 -3.79 -4.029 -4.287 -4.58 -4.905 -5.286 -5.791 -6.804 -5 ,30526 ,KEBNE ,16692086,Thu Nov 25 17:05:28 CET,Thu Nov 25 18:42:22 CET,0.0 0.854 1.37 1.763 2.094 2.383 2.648 2.902 3.356 3.568 3.771 3.89 4.3 4.455 4.744 5.04 5.324 5.454 5.709 5.959 6.298 6.505 6.707 6.986 7.272 7.556 7.818 8.069 8.387 8.677 8.945 9.271 9.582 9.884 10.207 10.568 10.937 11.307 11.688 12.072 12.434 12.842 13.283 13.67 14.102 14.508 14.881 15.25 15.507 15.585 15.294 14.46 13.493 12.498 11.578 10.752 9.996 9.263 8.624 7.946 7.336 6.796 6.28 5.778 5.301 4.862 4.375 3.938 3.579 3.211 2.816 2.482 2.139 1.792 1.523 1.23 0.934 0.631 0.313 0.087 -0.15 -0.505 -0.75 -1.01 -1.148 -1.427 -1.74 -2.08 -2.249 -2.676 -2.785 -2.968 -3.156 -3.584 -3.829 -4.086 -4.365 -4.677 -5.037 -5.5 -6.538 -6 ,9495 ,KEBNE ,16692087,Thu Nov 25 17:05:28 CET,Thu Nov 25 18:38:03 CET,0.0 1.01 1.544 1.947 2.282 2.553 2.803 3.043 3.47 3.673 3.866 3.998 4.417 4.581 4.9 5.197 5.467 5.6 5.853 6.079 6.409 6.622 6.829 7.13 7.417 7.693 7.951 8.188 8.5 8.816 9.124 9.462 9.756 10.048 10.381 10.732 11.052 11.419 11.814 12.206 12.61 13.063 13.541 13.943 14.344 14.746 15.154 15.471 15.674 15.712 15.305 14.35 13.338 12.372 11.512 10.697 9.919 9.215 8.587 7.882 7.237 6.691 6.168 5.645 5.152 4.704 4.237 3.812 3.435 3.063 2.679 2.332 1.963 1.594 1.317 1.032 0.729 0.412 0.092 -0.134 -0.381 -0.782 -1.045 -1.307 -1.444 -1.725 -2.021 -2.332 -2.506 -2.943 -3.075 -3.272 -3.491 -3.958 -4.198 -4.452 -4.738 -5.067 -5.433 -5.89 -6.74 -7 ,16195 ,KEBNE ,16692088,Thu Nov 25 17:05:28 CET,Thu Nov 25 18:38:40 CET,0.0 0.965 1.473 1.868 2.169 2.459 2.732 2.975 3.431 3.637 3.83 3.96 4.38 4.541 4.84 5.13 5.402 5.528 5.757 5.984 6.33 6.542 6.745 7.041 7.339 7.625 7.883 8.129 8.452 8.757 9.025 9.346 9.662 9.968 10.328 10.699 11.016 11.324 11.639 11.996 12.408 12.86 13.337 13.802 14.26 14.641 15.002 15.319 15.555 15.606 15.266 14.451 13.51 12.573 11.755 10.948 10.168 9.459 8.835 8.195 7.616 7.094 6.601 6.142 5.7 5.279 4.856 4.474 4.122 3.753 3.39 3.087 2.769 2.427 2.141 1.837 1.522 1.198 0.861 0.623 0.385 0.028 -0.231 -0.498 -0.632 -0.916 -1.223 -1.56 -1.736 -2.164 -2.293 -2.499 -2.712 -3.159 -3.404 -3.675 -3.968 -4.311 -4.729 -5.267 -6.089 -8 ,21475 ,KEBNE ,16692089,Thu Nov 25 17:05:28 CET,Thu Nov 25 18:38:07 CET,0.0 0.905 1.389 1.748 2.049 2.325 2.568 2.8 3.243 3.445 3.635 3.735 4.148 4.321 4.654 4.948 5.219 5.355 5.601 5.824 6.174 6.409 6.625 6.932 7.243 7.54 7.812 8.061 8.364 8.659 8.939 9.261 9.57 9.86 10.178 10.528 10.885 11.271 11.671 12.091 12.484 12.854 13.274 13.724 14.187 14.558 14.903 15.284 15.549 15.559 15.144 14.175 13.161 12.229 11.356 10.535 9.744 8.991 8.354 7.706 7.148 6.624 6.114 5.618 5.12 4.663 4.198 3.793 3.432 3.048 2.637 2.287 1.922 1.543 1.255 0.955 0.635 0.314 -0.006 -0.225 -0.448 -0.818 -1.084 -1.353 -1.492 -1.78 -2.086 -2.402 -2.568 -2.991 -3.089 -3.286 -3.511 -3.967 -4.205 -4.462 -4.732 -5.048 -5.419 -5.886 -6.902 -9 ,15905 ,KEBNE ,16692090,Thu Nov 25 17:05:28 CET,Thu Nov 25 18:42:09 CET,0.0 1.007 1.508 1.895 2.237 2.535 2.797 3.051 3.511 3.719 3.917 4.045 4.465 4.628 4.93 5.22 5.482 5.607 5.86 6.103 6.456 6.675 6.88 7.17 7.441 7.708 7.977 8.233 8.555 8.864 9.151 9.478 9.789 10.087 10.436 10.82 11.173 11.542 11.915 12.31 12.713 13.15 13.6 13.997 14.414 14.872 15.36 15.717 15.984 16.058 15.661 14.736 13.756 12.881 12.06 11.211 10.41 9.709 9.112 8.485 7.916 7.388 6.863 6.352 5.863 5.411 4.965 4.566 4.201 3.813 3.397 3.044 2.668 2.268 1.98 1.704 1.398 1.074 0.729 0.48 0.232 -0.14 -0.387 -0.651 -0.791 -1.071 -1.383 -1.725 -1.906 -2.338 -2.452 -2.646 -2.856 -3.33 -3.58 -3.851 -4.141 -4.457 -4.84 -5.315 -6.259 -10 ,12309 ,KEBNE ,16692091,Thu Nov 25 17:05:29 CET,Thu Nov 25 18:41:22 CET,0.0 0.948 1.499 1.913 2.227 2.52 2.807 3.063 3.497 3.7 3.893 4.025 4.445 4.607 4.915 5.222 5.509 5.645 5.903 6.144 6.494 6.715 6.921 7.231 7.53 7.816 8.09 8.336 8.643 8.938 9.222 9.561 9.871 10.173 10.53 10.911 11.259 11.635 12.039 12.439 12.847 13.316 13.791 14.152 14.528 14.96 15.392 15.683 15.854 15.887 15.457 14.497 13.47 12.436 11.492 10.667 9.88 9.11 8.443 7.801 7.239 6.721 6.223 5.728 5.26 4.847 4.422 4.009 3.635 3.243 2.83 2.487 2.133 1.777 1.51 1.228 0.936 0.634 0.299 0.065 -0.168 -0.54 -0.808 -1.082 -1.221 -1.512 -1.811 -2.133 -2.309 -2.732 -2.859 -3.061 -3.264 -3.736 -3.997 -4.261 -4.541 -4.849 -5.236 -5.76 -6.688 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index c64192cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22501 ,KEBNE ,16692093,Thu Nov 25 17:07:34 CET,Thu Nov 25 18:35:13 CET,0.0 1.026 1.459 1.821 2.139 2.422 2.678 2.915 3.332 3.526 3.717 3.825 4.234 4.386 4.669 4.941 5.219 5.361 5.621 5.859 6.204 6.43 6.651 6.966 7.258 7.532 7.785 8.028 8.361 8.683 8.981 9.355 9.731 10.093 10.495 10.943 11.353 11.773 12.24 12.745 13.268 13.835 14.488 15.121 15.821 16.579 17.41 18.298 19.203 20.075 20.892 21.191 21.115 20.897 20.544 20.128 19.688 19.211 18.789 18.356 17.919 17.478 17.052 16.671 16.298 15.942 15.573 15.227 14.922 14.598 14.235 13.922 13.591 13.251 12.986 12.707 12.427 12.132 11.821 11.598 11.356 10.991 10.74 10.477 10.333 10.014 9.692 9.358 9.181 8.758 8.608 8.395 8.172 7.688 7.419 7.145 6.845 6.49 6.088 5.542 4.24 -2 ,2999 ,KEBNE ,16692094,Thu Nov 25 17:08:39 CET,Thu Nov 25 18:36:17 CET,0.0 0.911 1.39 1.777 2.094 2.367 2.61 2.831 3.22 3.404 3.588 3.668 4.069 4.217 4.504 4.774 5.03 5.161 5.421 5.668 6.011 6.229 6.44 6.744 7.027 7.303 7.583 7.855 8.192 8.517 8.843 9.229 9.603 9.955 10.342 10.779 11.2 11.651 12.096 12.533 13.007 13.546 14.145 14.728 15.447 16.221 17.06 17.918 18.822 19.76 20.632 21.013 20.93 20.669 20.293 19.85 19.404 18.924 18.476 18.0 17.54 17.123 16.71 16.296 15.899 15.528 15.152 14.816 14.53 14.214 13.856 13.564 13.249 12.91 12.646 12.36 12.067 11.783 11.48 11.258 11.024 10.648 10.39 10.128 9.991 9.691 9.374 9.053 8.883 8.461 8.316 8.12 7.916 7.458 7.196 6.91 6.607 6.27 5.881 5.389 4.428 -3 ,2084 ,KEBNE ,16692095,Thu Nov 25 17:08:38 CET,Thu Nov 25 18:38:28 CET,0.0 0.831 1.309 1.666 1.977 2.25 2.497 2.734 3.173 3.369 3.554 3.65 4.063 4.226 4.531 4.809 5.084 5.214 5.449 5.684 6.038 6.26 6.47 6.766 7.039 7.302 7.571 7.847 8.197 8.516 8.82 9.205 9.563 9.905 10.308 10.743 11.165 11.637 12.115 12.61 13.102 13.603 14.225 14.842 15.48 16.148 16.885 17.746 18.716 19.652 20.486 20.856 20.799 20.507 20.051 19.521 19.036 18.573 18.143 17.654 17.18 16.769 16.412 16.049 15.665 15.315 14.944 14.582 14.26 13.927 13.584 13.311 13.01 12.683 12.429 12.169 11.897 11.599 11.281 11.063 10.848 10.489 10.227 9.96 9.822 9.539 9.248 8.926 8.748 8.325 8.188 7.999 7.791 7.317 7.056 6.767 6.442 6.07 5.64 5.092 3.909 -4 ,28322 ,KEBNE ,16692096,Thu Nov 25 17:09:41 CET,Thu Nov 25 18:38:59 CET,0.0 0.86 1.309 1.663 1.977 2.242 2.478 2.709 3.133 3.324 3.507 3.616 4.034 4.19 4.49 4.778 5.054 5.189 5.448 5.701 6.067 6.284 6.492 6.81 7.113 7.401 7.675 7.921 8.234 8.552 8.86 9.237 9.596 9.931 10.311 10.718 11.106 11.532 11.984 12.469 13.003 13.583 14.207 14.781 15.455 16.244 17.096 17.987 18.95 19.887 20.707 21.074 21.01 20.774 20.448 20.03 19.568 19.072 18.615 18.11 17.622 17.221 16.836 16.46 16.1 15.728 15.329 14.974 14.653 14.305 13.939 13.634 13.33 13.028 12.779 12.496 12.196 11.878 11.528 11.292 11.054 10.676 10.415 10.142 10.003 9.724 9.418 9.087 8.913 8.483 8.294 8.073 7.848 7.379 7.131 6.845 6.525 6.157 5.714 5.172 3.923 -5 ,7785 ,KEBNE ,16692097,Thu Nov 25 17:10:42 CET,Thu Nov 25 18:41:12 CET,0.0 0.84 1.26 1.622 1.931 2.199 2.454 2.69 3.081 3.268 3.454 3.568 3.985 4.143 4.427 4.708 4.982 5.118 5.382 5.618 5.953 6.169 6.376 6.684 6.983 7.26 7.538 7.814 8.159 8.487 8.792 9.144 9.484 9.825 10.226 10.685 11.125 11.585 12.067 12.578 13.094 13.645 14.296 14.92 15.613 16.38 17.256 18.158 19.053 19.987 20.807 21.133 21.084 20.816 20.419 19.952 19.458 18.959 18.537 18.097 17.703 17.351 16.982 16.609 16.226 15.85 15.443 15.104 14.83 14.515 14.173 13.876 13.557 13.229 12.969 12.692 12.399 12.108 11.801 11.566 11.331 11.002 10.76 10.481 10.336 10.031 9.712 9.391 9.221 8.799 8.641 8.436 8.228 7.751 7.486 7.21 6.911 6.571 6.165 5.615 4.447 -6 ,30355 ,KEBNE ,16692098,Thu Nov 25 17:11:46 CET,Thu Nov 25 18:42:32 CET,0.0 0.811 1.271 1.668 2.004 2.303 2.565 2.813 3.268 3.471 3.655 3.739 4.141 4.292 4.588 4.878 5.15 5.278 5.535 5.785 6.141 6.366 6.578 6.892 7.203 7.512 7.799 8.067 8.396 8.704 9.018 9.403 9.768 10.119 10.535 11.002 11.432 11.86 12.312 12.796 13.3 13.871 14.498 15.109 15.808 16.581 17.461 18.362 19.277 20.21 21.095 21.426 21.282 20.957 20.557 20.115 19.718 19.311 18.869 18.398 17.975 17.594 17.218 16.785 16.385 16.024 15.616 15.269 14.965 14.641 14.294 14.002 13.698 13.36 13.082 12.797 12.51 12.213 11.899 11.671 11.442 11.091 10.843 10.585 10.446 10.153 9.831 9.484 9.308 8.886 8.75 8.541 8.317 7.839 7.588 7.314 7.009 6.66 6.268 5.758 4.6 -7 ,24514 ,KEBNE ,16692099,Thu Nov 25 17:11:46 CET,Thu Nov 25 18:42:49 CET,0.0 0.641 1.023 1.358 1.652 1.916 2.171 2.416 2.864 3.072 3.262 3.361 3.782 3.95 4.264 4.553 4.82 4.947 5.19 5.427 5.783 6.016 6.24 6.549 6.86 7.166 7.446 7.717 8.076 8.408 8.708 9.064 9.428 9.777 10.175 10.628 11.052 11.5 11.973 12.493 13.04 13.627 14.282 14.926 15.672 16.435 17.211 18.08 19.068 20.07 20.94 21.312 21.281 21.034 20.639 20.149 19.642 19.168 18.743 18.273 17.866 17.487 17.088 16.674 16.258 15.881 15.468 15.083 14.774 14.464 14.134 13.85 13.531 13.192 12.938 12.68 12.399 12.096 11.788 11.566 11.319 10.928 10.66 10.388 10.248 9.939 9.618 9.287 9.112 8.697 8.557 8.347 8.133 7.64 7.369 7.087 6.769 6.425 6.038 5.523 4.284 -8 ,16685 ,KEBNE ,16692100,Thu Nov 25 17:15:53 CET,Thu Nov 25 18:50:15 CET,0.0 0.724 1.115 1.455 1.749 2.017 2.257 2.469 2.879 3.079 3.268 3.366 3.781 3.949 4.261 4.552 4.825 4.959 5.217 5.461 5.825 6.059 6.283 6.603 6.896 7.172 7.453 7.721 8.038 8.339 8.632 8.992 9.311 9.617 9.999 10.415 10.792 11.197 11.665 12.167 12.682 13.272 13.929 14.52 15.205 15.942 16.692 17.479 18.355 19.306 20.199 20.613 20.6 20.359 19.925 19.437 18.993 18.532 18.101 17.654 17.235 16.835 16.434 16.042 15.669 15.296 14.9 14.545 14.226 13.889 13.525 13.225 12.903 12.558 12.296 12.017 11.73 11.434 11.116 10.908 10.696 10.337 10.068 9.799 9.669 9.408 9.125 8.793 8.625 8.218 8.064 7.849 7.629 7.155 6.891 6.609 6.305 5.933 5.479 4.923 3.584 -9 ,5538 ,KEBNE ,16692101,Thu Nov 25 17:15:53 CET,Thu Nov 25 18:49:11 CET,0.0 0.939 1.361 1.704 1.999 2.271 2.512 2.735 3.16 3.353 3.535 3.641 4.06 4.22 4.526 4.813 5.083 5.216 5.472 5.72 6.07 6.291 6.508 6.824 7.128 7.411 7.677 7.941 8.289 8.617 8.919 9.284 9.615 9.911 10.28 10.725 11.149 11.585 12.056 12.586 13.116 13.683 14.317 14.883 15.503 16.227 17.084 17.969 18.853 19.783 20.686 21.004 20.923 20.655 20.277 19.834 19.362 18.896 18.486 18.044 17.603 17.169 16.764 16.382 16.025 15.68 15.291 14.936 14.618 14.286 13.942 13.66 13.367 13.04 12.777 12.5 12.22 11.935 11.622 11.401 11.168 10.806 10.548 10.275 10.139 9.858 9.555 9.221 9.041 8.61 8.458 8.255 8.033 7.524 7.239 6.936 6.588 6.21 5.786 5.266 4.041 -10 ,27552 ,KEBNE ,16692102,Thu Nov 25 17:15:53 CET,Thu Nov 25 18:49:09 CET,0.0 0.727 1.19 1.574 1.89 2.171 2.416 2.648 3.103 3.314 3.509 3.615 4.028 4.191 4.504 4.787 5.06 5.2 5.464 5.71 6.064 6.281 6.492 6.814 7.127 7.427 7.711 7.975 8.301 8.612 8.925 9.312 9.668 9.997 10.386 10.836 11.266 11.736 12.241 12.759 13.297 13.864 14.469 15.053 15.746 16.483 17.266 18.089 18.945 19.882 20.777 21.142 21.066 20.784 20.34 19.85 19.363 18.894 18.48 18.032 17.607 17.209 16.806 16.384 15.977 15.61 15.203 14.846 14.55 14.232 13.889 13.588 13.257 12.901 12.624 12.354 12.082 11.783 11.445 11.212 10.977 10.602 10.339 10.059 9.911 9.609 9.295 8.958 8.78 8.363 8.221 8.013 7.783 7.275 7.008 6.728 6.412 6.07 5.694 5.201 4.185 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt deleted file mode 100644 index 7c8dca3d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-48_ejm-47.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22103 ,KEBNE ,16692103,Thu Nov 25 17:16:55 CET,Thu Nov 25 18:50:37 CET,0.0 0.896 1.297 1.622 1.929 2.223 2.497 2.731 3.126 3.307 3.48 3.558 3.958 4.11 4.403 4.678 4.955 5.096 5.352 5.58 5.921 6.153 6.378 6.693 6.982 7.262 7.545 7.802 8.127 8.45 8.75 9.089 9.412 9.726 10.093 10.524 10.947 11.404 11.891 12.382 12.881 13.445 14.058 14.631 15.286 15.982 16.686 17.428 18.183 18.843 19.43 19.561 19.269 18.879 18.464 17.978 17.52 17.044 16.589 16.073 15.606 15.199 14.81 14.43 14.059 13.698 13.326 12.993 12.671 12.349 12.003 11.698 11.381 11.052 10.806 10.548 10.271 9.982 9.698 9.504 9.29 8.932 8.679 8.409 8.263 7.975 7.681 7.367 7.203 6.793 6.691 6.498 6.282 5.828 5.588 5.315 4.992 4.635 4.259 3.828 2.973 -2 ,30970 ,KEBNE ,16692104,Thu Nov 25 17:16:59 CET,Thu Nov 25 18:48:46 CET,0.0 0.609 0.982 1.303 1.587 1.832 2.061 2.289 2.7 2.885 3.063 3.154 3.558 3.708 4.01 4.307 4.576 4.693 4.929 5.177 5.535 5.757 5.974 6.288 6.584 6.858 7.124 7.394 7.734 8.054 8.354 8.71 9.059 9.381 9.751 10.171 10.55 10.964 11.412 11.877 12.35 12.863 13.438 13.98 14.6 15.229 15.908 16.658 17.435 18.163 18.722 18.836 18.636 18.257 17.789 17.308 16.784 16.246 15.813 15.413 15.037 14.657 14.27 13.88 13.475 13.096 12.728 12.394 12.096 11.81 11.51 11.232 10.932 10.619 10.364 10.095 9.818 9.545 9.27 9.059 8.818 8.453 8.213 7.958 7.823 7.549 7.244 6.921 6.759 6.348 6.229 6.027 5.812 5.346 5.107 4.863 4.578 4.246 3.857 3.413 2.725 -3 ,487 ,KEBNE ,16692105,Thu Nov 25 17:19:04 CET,Thu Nov 25 18:47:02 CET,0.0 0.67 1.077 1.452 1.773 2.044 2.282 2.501 2.891 3.073 3.257 3.341 3.738 3.88 4.172 4.457 4.734 4.866 5.111 5.354 5.706 5.926 6.137 6.439 6.731 7.017 7.299 7.569 7.902 8.223 8.53 8.897 9.25 9.585 9.965 10.403 10.828 11.26 11.675 12.098 12.585 13.151 13.78 14.349 14.986 15.636 16.276 16.992 17.755 18.49 19.144 19.298 19.102 18.759 18.351 17.876 17.386 16.922 16.5 16.017 15.556 15.134 14.743 14.356 13.949 13.58 13.216 12.879 12.569 12.255 11.938 11.667 11.375 11.054 10.792 10.519 10.224 9.911 9.599 9.383 9.156 8.81 8.565 8.297 8.155 7.876 7.584 7.276 7.119 6.705 6.594 6.409 6.216 5.786 5.543 5.276 4.996 4.692 4.327 3.881 3.057 -4 ,19746 ,KEBNE ,16692106,Thu Nov 25 17:20:06 CET,Thu Nov 25 18:46:22 CET,0.0 0.811 1.252 1.57 1.849 2.132 2.39 2.61 3.007 3.196 3.379 3.479 3.888 4.037 4.322 4.599 4.863 4.989 5.229 5.458 5.796 6.02 6.237 6.557 6.869 7.155 7.42 7.668 7.979 8.285 8.596 8.966 9.312 9.644 10.019 10.435 10.792 11.159 11.592 12.07 12.537 13.014 13.566 14.082 14.642 15.312 16.066 16.829 17.653 18.459 19.09 19.198 18.945 18.558 18.086 17.537 17.006 16.537 16.123 15.67 15.23 14.81 14.4 13.995 13.595 13.217 12.821 12.465 12.153 11.825 11.475 11.19 10.887 10.548 10.284 10.007 9.713 9.409 9.092 8.878 8.653 8.302 8.059 7.804 7.676 7.405 7.115 6.803 6.642 6.234 6.114 5.919 5.722 5.296 5.063 4.796 4.499 4.175 3.813 3.377 2.505 -5 ,2981 ,KEBNE ,16692107,Thu Nov 25 17:20:06 CET,Thu Nov 25 18:52:21 CET,0.0 0.605 1.013 1.37 1.678 1.943 2.195 2.424 2.836 3.037 3.22 3.284 3.679 3.835 4.141 4.425 4.695 4.822 5.065 5.291 5.63 5.861 6.079 6.383 6.673 6.95 7.218 7.482 7.811 8.123 8.427 8.774 9.116 9.447 9.803 10.209 10.619 11.07 11.498 11.903 12.362 12.911 13.536 14.091 14.696 15.368 16.133 16.92 17.732 18.544 19.161 19.229 18.928 18.472 17.967 17.486 17.003 16.466 16.008 15.568 15.141 14.755 14.365 13.971 13.591 13.23 12.851 12.499 12.194 11.896 11.593 11.325 11.02 10.683 10.424 10.157 9.866 9.567 9.263 9.056 8.846 8.511 8.27 8.01 7.871 7.572 7.276 6.98 6.821 6.407 6.297 6.116 5.921 5.495 5.263 5.001 4.718 4.431 4.095 3.632 2.65 -6 ,10594 ,KEBNE ,16692108,Thu Nov 25 17:21:05 CET,Thu Nov 25 18:54:12 CET,0.0 0.508 0.877 1.217 1.531 1.797 2.041 2.273 2.703 2.902 3.09 3.179 3.58 3.729 4.028 4.323 4.609 4.744 4.993 5.226 5.558 5.772 5.981 6.269 6.554 6.844 7.107 7.353 7.673 7.99 8.296 8.662 9.011 9.33 9.687 10.101 10.49 10.913 11.37 11.825 12.295 12.834 13.455 14.007 14.585 15.224 15.966 16.728 17.497 18.252 18.846 18.982 18.754 18.358 17.924 17.485 16.981 16.449 15.964 15.436 14.968 14.533 14.081 13.652 13.256 12.867 12.448 12.086 11.773 11.443 11.102 10.808 10.492 10.159 9.907 9.659 9.396 9.101 8.778 8.562 8.326 7.917 7.652 7.4 7.267 6.997 6.722 6.427 6.265 5.849 5.727 5.537 5.343 4.932 4.712 4.468 4.191 3.866 3.518 3.116 2.471 -7 ,8140 ,KEBNE ,16692109,Thu Nov 25 17:21:09 CET,Thu Nov 25 18:51:56 CET,0.0 0.746 1.191 1.519 1.816 2.106 2.376 2.612 3.017 3.201 3.382 3.5 3.918 4.072 4.363 4.64 4.89 5.014 5.264 5.491 5.83 6.053 6.26 6.553 6.829 7.106 7.383 7.646 7.962 8.254 8.543 8.895 9.249 9.603 10.011 10.454 10.86 11.27 11.668 12.078 12.522 13.011 13.579 14.115 14.711 15.393 16.145 16.89 17.633 18.351 18.978 19.113 18.882 18.512 18.091 17.65 17.197 16.723 16.25 15.768 15.308 14.84 14.408 14.0 13.606 13.243 12.866 12.513 12.179 11.829 11.473 11.19 10.9 10.568 10.301 10.03 9.761 9.49 9.191 8.983 8.773 8.437 8.185 7.921 7.795 7.532 7.241 6.922 6.755 6.346 6.23 6.033 5.839 5.43 5.199 4.948 4.667 4.353 3.982 3.507 2.713 -8 ,9448 ,KEBNE ,16692110,Thu Nov 25 17:22:07 CET,Thu Nov 25 18:57:26 CET,0.0 0.788 1.189 1.523 1.825 2.092 2.325 2.543 2.958 3.156 3.334 3.402 3.802 3.952 4.238 4.497 4.748 4.871 5.104 5.338 5.688 5.919 6.14 6.456 6.744 7.015 7.293 7.546 7.855 8.161 8.472 8.855 9.223 9.555 9.904 10.295 10.675 11.082 11.539 12.036 12.523 12.994 13.538 14.144 14.837 15.546 16.267 16.966 17.677 18.439 19.1 19.282 19.089 18.729 18.327 17.885 17.426 16.915 16.426 15.952 15.536 15.131 14.734 14.352 13.972 13.603 13.207 12.851 12.543 12.207 11.84 11.549 11.255 10.929 10.662 10.371 10.077 9.79 9.492 9.283 9.062 8.71 8.465 8.21 8.082 7.811 7.508 7.198 7.039 6.625 6.523 6.328 6.121 5.691 5.469 5.22 4.928 4.611 4.24 3.732 2.929 -9 ,21496 ,KEBNE ,16692111,Thu Nov 25 17:22:08 CET,Thu Nov 25 18:55:52 CET,0.0 0.766 1.192 1.562 1.855 2.117 2.37 2.591 2.99 3.183 3.374 3.463 3.861 4.018 4.333 4.621 4.886 5.018 5.271 5.513 5.861 6.083 6.302 6.613 6.906 7.193 7.48 7.76 8.075 8.365 8.666 9.007 9.333 9.665 10.017 10.395 10.791 11.208 11.634 12.095 12.577 13.099 13.654 14.203 14.833 15.515 16.27 17.031 17.801 18.574 19.193 19.285 19.052 18.675 18.195 17.682 17.208 16.759 16.359 15.923 15.502 15.104 14.72 14.339 13.941 13.548 13.142 12.792 12.484 12.153 11.821 11.543 11.257 10.943 10.685 10.415 10.135 9.858 9.561 9.343 9.108 8.749 8.503 8.244 8.11 7.832 7.541 7.219 7.04 6.607 6.47 6.276 6.075 5.637 5.397 5.14 4.848 4.518 4.144 3.703 2.705 -10 ,6386 ,KEBNE ,16692112,Thu Nov 25 17:22:08 CET,Thu Nov 25 18:55:42 CET,0.0 0.652 1.004 1.307 1.588 1.841 2.077 2.31 2.741 2.932 3.112 3.195 3.592 3.744 4.052 4.348 4.624 4.757 5.015 5.25 5.586 5.806 6.018 6.334 6.646 6.943 7.224 7.492 7.82 8.131 8.436 8.796 9.133 9.463 9.867 10.294 10.671 11.066 11.468 11.894 12.331 12.817 13.412 13.992 14.649 15.343 16.06 16.796 17.513 18.176 18.71 18.819 18.581 18.19 17.762 17.337 16.876 16.39 15.954 15.479 15.045 14.631 14.213 13.817 13.421 13.039 12.645 12.287 11.949 11.588 11.233 10.946 10.637 10.313 10.066 9.806 9.542 9.263 8.954 8.742 8.521 8.159 7.903 7.64 7.503 7.217 6.917 6.596 6.431 6.021 5.907 5.711 5.507 5.081 4.831 4.552 4.261 3.937 3.544 3.039 1.896 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 161bcfe5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17305 ,KEBNE ,16692113,Thu Nov 25 17:22:08 CET,Thu Nov 25 18:53:47 CET,0.0 0.635 0.939 1.19 1.406 1.595 1.769 1.92 2.211 2.348 2.477 2.487 2.832 2.933 3.133 3.331 3.52 3.61 3.776 3.934 4.164 4.294 4.41 4.578 4.74 4.905 5.059 5.199 5.378 5.553 5.702 5.873 6.044 6.205 6.382 6.574 6.747 6.908 7.045 7.167 7.288 7.395 7.485 7.503 7.454 7.344 7.093 6.641 5.861 4.516 2.161 -0.786 -3.248 -5.303 -7.056 -8.595 -9.893 -11.057 -12.121 -13.234 -14.188 -14.993 -15.733 -16.402 -17.04 -17.681 -18.372 -18.982 -19.496 -20.02 -20.567 -21.03 -21.486 -21.951 -22.343 -22.746 -23.16 -23.605 -24.068 -24.377 -24.695 -25.187 -25.51 -25.851 -26.038 -26.423 -26.806 -27.24 -27.486 -27.992 -28.233 -28.493 -28.76 -29.373 -29.723 -30.089 -30.494 -30.994 -31.56 -32.287 -34.797 -2 ,11521 ,KEBNE ,16692114,Thu Nov 25 17:23:10 CET,Thu Nov 25 18:54:31 CET,0.0 0.474 0.748 0.987 1.206 1.406 1.578 1.738 2.034 2.165 2.289 2.297 2.648 2.754 2.945 3.122 3.301 3.386 3.54 3.689 3.91 4.045 4.163 4.335 4.513 4.67 4.806 4.94 5.128 5.283 5.401 5.537 5.682 5.845 6.034 6.22 6.369 6.496 6.609 6.728 6.836 6.943 7.02 7.014 6.914 6.72 6.43 5.942 5.13 3.789 1.372 -1.606 -4.027 -6.056 -7.746 -9.243 -10.598 -11.838 -12.886 -13.916 -14.831 -15.648 -16.408 -17.118 -17.764 -18.377 -19.042 -19.61 -20.113 -20.629 -21.163 -21.627 -22.103 -22.581 -22.963 -23.362 -23.772 -24.216 -24.662 -24.961 -25.279 -25.792 -26.156 -26.528 -26.71 -27.084 -27.505 -27.956 -28.188 -28.69 -28.931 -29.203 -29.492 -30.1 -30.438 -30.815 -31.247 -31.753 -32.395 -33.265 -36.109 -3 ,25411 ,KEBNE ,16692115,Thu Nov 25 17:23:10 CET,Thu Nov 25 18:54:46 CET,0.0 0.408 0.692 0.929 1.137 1.325 1.505 1.667 1.965 2.1 2.221 2.222 2.567 2.671 2.878 3.08 3.271 3.359 3.528 3.693 3.914 4.047 4.186 4.389 4.562 4.729 4.896 5.044 5.223 5.402 5.567 5.757 5.923 6.064 6.216 6.355 6.48 6.619 6.763 6.903 7.024 7.114 7.119 7.061 6.989 6.846 6.541 6.009 5.142 3.773 1.41 -1.485 -3.901 -5.96 -7.742 -9.35 -10.742 -11.997 -13.086 -14.153 -15.063 -15.864 -16.619 -17.365 -18.068 -18.692 -19.339 -19.926 -20.425 -20.933 -21.461 -21.919 -22.395 -22.867 -23.234 -23.62 -24.041 -24.476 -24.912 -25.22 -25.542 -26.027 -26.356 -26.707 -26.887 -27.268 -27.684 -28.112 -28.335 -28.833 -29.097 -29.379 -29.67 -30.316 -30.684 -31.075 -31.504 -32.022 -32.606 -33.366 -35.728 -4 ,4004 ,KEBNE ,16692116,Thu Nov 25 17:23:10 CET,Thu Nov 25 18:54:51 CET,0.0 0.524 0.858 1.112 1.332 1.533 1.712 1.884 2.186 2.329 2.466 2.467 2.816 2.925 3.139 3.348 3.53 3.616 3.774 3.923 4.15 4.282 4.404 4.59 4.764 4.926 5.093 5.246 5.407 5.56 5.717 5.893 6.041 6.184 6.337 6.492 6.63 6.748 6.861 6.994 7.1 7.162 7.217 7.227 7.16 7.013 6.715 6.227 5.416 4.07 1.693 -1.162 -3.532 -5.527 -7.237 -8.825 -10.209 -11.428 -12.489 -13.568 -14.466 -15.26 -16.033 -16.774 -17.461 -18.091 -18.767 -19.361 -19.865 -20.384 -20.929 -21.384 -21.856 -22.338 -22.713 -23.102 -23.512 -23.951 -24.399 -24.704 -25.021 -25.515 -25.863 -26.237 -26.422 -26.813 -27.245 -27.695 -27.923 -28.425 -28.666 -28.921 -29.2 -29.803 -30.139 -30.523 -30.947 -31.441 -32.009 -32.748 -35.496 -5 ,26786 ,KEBNE ,16692117,Thu Nov 25 17:23:10 CET,Thu Nov 25 18:54:10 CET,0.0 0.375 0.665 0.918 1.133 1.325 1.493 1.645 1.927 2.06 2.184 2.179 2.526 2.64 2.85 3.039 3.222 3.305 3.468 3.637 3.866 4.006 4.135 4.306 4.471 4.622 4.772 4.913 5.071 5.222 5.369 5.535 5.682 5.827 6.004 6.184 6.341 6.485 6.624 6.755 6.853 6.924 6.965 6.984 6.971 6.885 6.621 6.079 5.208 3.794 1.368 -1.529 -3.889 -5.874 -7.533 -9.036 -10.381 -11.561 -12.595 -13.64 -14.511 -15.286 -16.002 -16.669 -17.336 -17.991 -18.694 -19.289 -19.78 -20.298 -20.863 -21.328 -21.801 -22.307 -22.708 -23.108 -23.516 -23.951 -24.422 -24.762 -25.102 -25.6 -25.948 -26.306 -26.492 -26.898 -27.327 -27.787 -28.029 -28.529 -28.768 -29.045 -29.334 -29.95 -30.286 -30.648 -31.084 -31.602 -32.189 -33.022 -35.997 -6 ,10079 ,KEBNE ,16692118,Thu Nov 25 17:24:12 CET,Thu Nov 25 18:56:34 CET,0.0 0.418 0.69 0.914 1.12 1.301 1.463 1.618 1.9 2.034 2.16 2.15 2.491 2.599 2.812 3.002 3.173 3.258 3.424 3.573 3.787 3.926 4.057 4.248 4.426 4.573 4.719 4.873 5.053 5.216 5.381 5.566 5.715 5.831 5.973 6.157 6.341 6.526 6.683 6.822 6.951 7.069 7.125 7.123 7.044 6.844 6.472 5.896 5.051 3.668 1.266 -1.577 -3.923 -5.953 -7.681 -9.197 -10.542 -11.793 -12.92 -14.051 -15.027 -15.867 -16.642 -17.351 -18.004 -18.629 -19.298 -19.875 -20.378 -20.916 -21.46 -21.907 -22.365 -22.85 -23.234 -23.629 -24.041 -24.479 -24.947 -25.268 -25.587 -26.08 -26.436 -26.805 -26.986 -27.365 -27.76 -28.162 -28.387 -28.889 -29.14 -29.417 -29.693 -30.316 -30.666 -31.026 -31.454 -31.984 -32.65 -33.557 -36.55 -7 ,4894 ,KEBNE ,16692119,Thu Nov 25 17:24:13 CET,Thu Nov 25 18:58:06 CET,0.0 0.466 0.758 1.012 1.22 1.396 1.567 1.737 2.034 2.159 2.278 2.268 2.608 2.711 2.913 3.104 3.291 3.38 3.536 3.685 3.913 4.055 4.182 4.356 4.529 4.7 4.847 4.97 5.142 5.32 5.476 5.65 5.816 5.97 6.146 6.339 6.507 6.687 6.841 6.957 7.068 7.158 7.241 7.298 7.293 7.166 6.883 6.41 5.583 4.232 1.858 -1.061 -3.529 -5.586 -7.294 -8.828 -10.178 -11.413 -12.453 -13.474 -14.375 -15.192 -15.997 -16.754 -17.428 -18.024 -18.647 -19.242 -19.776 -20.315 -20.848 -21.288 -21.759 -22.244 -22.608 -22.983 -23.382 -23.805 -24.262 -24.578 -24.904 -25.416 -25.762 -26.119 -26.308 -26.692 -27.1 -27.544 -27.774 -28.287 -28.54 -28.806 -29.096 -29.783 -30.159 -30.532 -30.959 -31.476 -32.129 -32.903 -36.062 -8 ,13206 ,KEBNE ,16692120,Thu Nov 25 17:24:17 CET,Thu Nov 25 18:56:28 CET,0.0 0.6 0.898 1.141 1.349 1.536 1.701 1.848 2.134 2.276 2.411 2.421 2.766 2.879 3.091 3.272 3.444 3.531 3.698 3.852 4.069 4.204 4.331 4.507 4.667 4.826 4.979 5.1 5.246 5.402 5.558 5.745 5.89 6.01 6.168 6.348 6.49 6.618 6.761 6.9 7.013 7.072 7.099 7.114 7.057 6.879 6.533 6.026 5.237 3.898 1.451 -1.477 -3.82 -5.84 -7.624 -9.213 -10.591 -11.795 -12.775 -13.769 -14.681 -15.462 -16.163 -16.816 -17.425 -18.005 -18.628 -19.175 -19.666 -20.184 -20.716 -21.178 -21.66 -22.151 -22.54 -22.955 -23.358 -23.754 -24.184 -24.489 -24.798 -25.287 -25.63 -25.973 -26.142 -26.536 -26.981 -27.425 -27.652 -28.158 -28.426 -28.689 -28.966 -29.599 -29.952 -30.317 -30.729 -31.204 -31.776 -32.502 -35.212 -9 ,639 ,KEBNE ,16692121,Thu Nov 25 17:24:12 CET,Thu Nov 25 18:56:33 CET,0.0 0.527 0.805 1.031 1.221 1.399 1.562 1.717 2.021 2.164 2.294 2.292 2.638 2.751 2.966 3.16 3.342 3.426 3.586 3.744 3.969 4.113 4.247 4.43 4.601 4.759 4.91 5.056 5.232 5.389 5.548 5.729 5.871 6.004 6.169 6.337 6.475 6.633 6.773 6.852 6.934 7.039 7.118 7.16 7.163 7.074 6.855 6.413 5.613 4.279 1.876 -1.13 -3.565 -5.592 -7.349 -8.963 -10.374 -11.646 -12.732 -13.765 -14.605 -15.389 -16.176 -16.904 -17.588 -18.227 -18.879 -19.447 -19.933 -20.416 -20.946 -21.409 -21.887 -22.37 -22.74 -23.133 -23.543 -23.96 -24.398 -24.701 -25.004 -25.487 -25.838 -26.217 -26.407 -26.775 -27.166 -27.61 -27.839 -28.332 -28.585 -28.859 -29.141 -29.775 -30.132 -30.529 -30.983 -31.513 -32.139 -32.912 -36.049 -10 ,21955 ,KEBNE ,16692122,Thu Nov 25 17:24:13 CET,Thu Nov 25 18:57:02 CET,0.0 0.479 0.762 0.997 1.197 1.378 1.544 1.704 2.009 2.146 2.274 2.274 2.621 2.731 2.944 3.128 3.304 3.396 3.575 3.746 3.963 4.095 4.226 4.419 4.6 4.765 4.918 5.057 5.227 5.389 5.552 5.749 5.923 6.08 6.261 6.437 6.565 6.686 6.811 6.942 7.03 7.056 7.029 6.952 6.81 6.608 6.274 5.732 4.874 3.462 1.064 -1.783 -4.118 -6.113 -7.861 -9.385 -10.691 -11.875 -12.885 -13.901 -14.775 -15.564 -16.328 -17.052 -17.709 -18.295 -18.9 -19.431 -19.908 -20.414 -20.944 -21.389 -21.858 -22.343 -22.717 -23.113 -23.531 -23.965 -24.407 -24.706 -25.009 -25.496 -25.862 -26.252 -26.442 -26.829 -27.25 -27.678 -27.909 -28.418 -28.678 -28.957 -29.235 -29.815 -30.137 -30.494 -30.922 -31.421 -32.019 -32.803 -35.806 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt deleted file mode 100644 index 64accb8f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15800 ,KEBNE ,17131988,Sat Jan 1 06:13:58 CET,Sat Jan 1 07:48:34 CET,0.0 0.936 1.375 1.753 2.091 2.391 2.65 2.885 3.297 3.493 3.679 3.801 4.204 4.37 4.665 4.946 5.237 5.371 5.615 5.858 6.182 6.379 6.585 6.891 7.176 7.428 7.672 7.92 8.249 8.566 8.836 9.145 9.46 9.764 10.101 10.446 10.778 11.141 11.503 11.882 12.268 12.656 13.043 13.409 13.79 14.171 14.557 14.891 15.166 15.263 14.79 13.705 12.613 11.575 10.613 9.733 8.962 8.192 7.493 6.807 6.188 5.621 5.049 4.492 3.99 3.535 3.049 2.616 2.239 1.839 1.418 1.064 0.694 0.295 -0.024 -0.348 -0.671 -0.999 -1.348 -1.603 -1.868 -2.281 -2.575 -2.881 -3.033 -3.338 -3.663 -4.01 -4.192 -4.629 -4.828 -5.057 -5.303 -5.832 -6.115 -6.419 -6.749 -7.133 -7.603 -8.178 -9.9 -2 ,10355 ,KEBNE ,17131989,Sat Jan 1 06:17:05 CET,Sat Jan 1 07:52:06 CET,0.0 0.917 1.368 1.726 2.042 2.341 2.611 2.859 3.295 3.49 3.675 3.782 4.177 4.336 4.636 4.918 5.177 5.294 5.529 5.759 6.077 6.278 6.477 6.771 7.058 7.335 7.602 7.858 8.165 8.454 8.753 9.11 9.436 9.748 10.082 10.425 10.741 11.078 11.428 11.808 12.207 12.625 13.055 13.424 13.875 14.305 14.692 15.03 15.252 15.222 14.637 13.591 12.492 11.456 10.525 9.622 8.809 8.022 7.303 6.574 5.928 5.373 4.834 4.3 3.795 3.331 2.851 2.42 2.03 1.599 1.162 0.812 0.454 0.086 -0.217 -0.533 -0.873 -1.236 -1.612 -1.869 -2.136 -2.562 -2.849 -3.143 -3.295 -3.62 -3.95 -4.291 -4.481 -4.92 -5.079 -5.289 -5.532 -6.047 -6.332 -6.647 -6.958 -7.317 -7.799 -8.41 -9.928 -3 ,18322 ,KEBNE ,17131990,Sat Jan 1 06:46:06 CET,Sat Jan 1 08:20:03 CET,0.0 0.813 1.298 1.682 2.01 2.301 2.561 2.8 3.256 3.458 3.636 3.738 4.135 4.29 4.592 4.876 5.141 5.27 5.519 5.76 6.118 6.35 6.557 6.84 7.121 7.396 7.655 7.902 8.218 8.519 8.803 9.139 9.439 9.718 10.039 10.368 10.681 11.042 11.447 11.862 12.254 12.662 13.075 13.454 13.91 14.377 14.782 15.123 15.379 15.398 14.959 14.015 12.96 11.93 10.945 10.018 9.182 8.44 7.784 7.067 6.42 5.827 5.27 4.76 4.248 3.767 3.273 2.841 2.483 2.107 1.695 1.342 0.963 0.561 0.249 -0.075 -0.403 -0.735 -1.086 -1.337 -1.606 -2.03 -2.319 -2.61 -2.762 -3.067 -3.376 -3.716 -3.896 -4.331 -4.524 -4.746 -4.975 -5.486 -5.762 -6.07 -6.415 -6.823 -7.29 -7.832 -9.103 -4 ,27024 ,KEBNE ,17131991,Sat Jan 1 06:48:10 CET,Sat Jan 1 08:23:13 CET,0.0 0.908 1.42 1.796 2.1 2.372 2.611 2.847 3.296 3.5 3.697 3.84 4.247 4.409 4.719 5.005 5.265 5.396 5.64 5.87 6.208 6.423 6.629 6.907 7.163 7.407 7.655 7.903 8.222 8.526 8.809 9.149 9.455 9.742 10.052 10.378 10.695 11.04 11.419 11.791 12.17 12.556 12.95 13.364 13.824 14.238 14.617 14.964 15.198 15.24 14.788 13.711 12.605 11.564 10.587 9.613 8.749 7.995 7.331 6.61 5.961 5.392 4.826 4.308 3.85 3.394 2.886 2.422 2.008 1.581 1.151 0.797 0.436 0.054 -0.249 -0.569 -0.92 -1.286 -1.661 -1.91 -2.161 -2.571 -2.869 -3.176 -3.332 -3.651 -4.011 -4.394 -4.577 -5.007 -5.169 -5.372 -5.596 -6.092 -6.355 -6.636 -6.97 -7.379 -7.867 -8.451 -10.189 -5 ,29875 ,KEBNE ,17131992,Sat Jan 1 06:53:20 CET,Sat Jan 1 08:27:55 CET,0.0 1.033 1.582 1.962 2.268 2.542 2.802 3.045 3.466 3.657 3.839 3.938 4.327 4.477 4.758 5.02 5.262 5.383 5.627 5.872 6.22 6.424 6.622 6.912 7.187 7.459 7.718 7.964 8.273 8.569 8.848 9.171 9.484 9.776 10.093 10.438 10.772 11.112 11.439 11.805 12.183 12.604 13.074 13.483 13.876 14.257 14.636 14.943 15.149 15.19 14.709 13.584 12.409 11.353 10.414 9.525 8.714 7.957 7.255 6.543 5.91 5.312 4.734 4.191 3.687 3.243 2.769 2.331 1.952 1.534 1.093 0.722 0.333 -0.066 -0.368 -0.678 -1.013 -1.372 -1.742 -1.993 -2.256 -2.681 -2.975 -3.273 -3.424 -3.734 -4.068 -4.422 -4.599 -5.024 -5.187 -5.407 -5.647 -6.164 -6.45 -6.768 -7.12 -7.491 -7.946 -8.527 -9.695 -6 ,15051 ,KEBNE ,17131993,Sat Jan 1 06:57:27 CET,Sat Jan 1 08:32:43 CET,0.0 1.011 1.524 1.927 2.252 2.558 2.832 3.078 3.531 3.733 3.926 4.059 4.449 4.599 4.89 5.182 5.471 5.602 5.851 6.092 6.43 6.642 6.851 7.147 7.411 7.659 7.898 8.143 8.458 8.758 9.04 9.369 9.684 9.964 10.28 10.661 11.038 11.411 11.784 12.152 12.489 12.855 13.262 13.641 14.009 14.417 14.9 15.304 15.588 15.661 15.243 14.292 13.233 12.164 11.169 10.23 9.408 8.646 7.931 7.193 6.57 6.04 5.499 4.959 4.454 4.019 3.553 3.102 2.725 2.305 1.86 1.514 1.141 0.771 0.499 0.202 -0.122 -0.467 -0.815 -1.061 -1.316 -1.724 -2.015 -2.309 -2.461 -2.761 -3.085 -3.453 -3.642 -4.074 -4.255 -4.478 -4.708 -5.233 -5.52 -5.816 -6.157 -6.564 -7.037 -7.638 -9.218 -7 ,6799 ,KEBNE ,17131994,Sat Jan 1 17:22:54 CET,Sat Jan 1 18:57:34 CET,0.0 0.956 1.452 1.836 2.143 2.431 2.704 2.963 3.415 3.606 3.789 3.909 4.307 4.471 4.777 5.062 5.343 5.475 5.715 5.95 6.29 6.508 6.72 7.02 7.307 7.578 7.828 8.064 8.369 8.666 8.951 9.277 9.583 9.871 10.172 10.512 10.864 11.251 11.643 11.992 12.327 12.732 13.191 13.581 14.006 14.466 14.879 15.199 15.395 15.361 14.87 13.868 12.823 11.818 10.841 9.921 9.099 8.299 7.577 6.885 6.274 5.681 5.105 4.555 4.035 3.559 3.066 2.631 2.272 1.9 1.487 1.131 0.757 0.378 0.083 -0.226 -0.554 -0.9 -1.257 -1.511 -1.783 -2.209 -2.496 -2.8 -2.959 -3.276 -3.609 -3.969 -4.161 -4.6 -4.77 -4.983 -5.216 -5.75 -6.047 -6.387 -6.76 -7.15 -7.616 -8.248 -9.555 -8 ,21496 ,KEBNE ,17131996,Sat Jan 1 17:22:54 CET,Sat Jan 1 18:56:47 CET,0.0 1.175 1.675 2.07 2.411 2.698 2.964 3.204 3.622 3.818 4.01 4.136 4.535 4.684 4.976 5.263 5.532 5.656 5.895 6.136 6.49 6.71 6.914 7.202 7.473 7.736 7.989 8.232 8.54 8.827 9.107 9.45 9.765 10.047 10.369 10.712 11.023 11.38 11.741 12.087 12.47 12.86 13.288 13.731 14.189 14.619 15.039 15.463 15.718 15.608 15.086 14.099 13.04 11.993 10.973 10.018 9.202 8.45 7.781 7.118 6.519 5.932 5.37 4.836 4.335 3.88 3.413 2.993 2.618 2.231 1.813 1.455 1.09 0.71 0.406 0.087 -0.239 -0.58 -0.947 -1.203 -1.462 -1.865 -2.156 -2.446 -2.588 -2.916 -3.282 -3.645 -3.842 -4.312 -4.533 -4.768 -5.03 -5.589 -5.873 -6.164 -6.476 -6.854 -7.328 -7.901 -9.331 -9 ,20758 ,KEBNE ,17131997,Sat Jan 1 17:22:54 CET,Sat Jan 1 18:57:00 CET,0.0 1.278 1.786 2.14 2.425 2.698 2.944 3.171 3.6 3.8 3.999 4.138 4.54 4.704 4.996 5.26 5.526 5.659 5.904 6.131 6.471 6.697 6.896 7.166 7.442 7.725 7.997 8.245 8.549 8.848 9.154 9.52 9.843 10.134 10.482 10.867 11.22 11.602 11.984 12.368 12.774 13.2 13.645 14.072 14.493 14.841 15.168 15.511 15.777 15.805 15.354 14.371 13.307 12.253 11.271 10.369 9.574 8.838 8.176 7.448 6.782 6.212 5.678 5.148 4.646 4.196 3.73 3.282 2.87 2.451 2.018 1.679 1.33 0.946 0.638 0.31 -0.034 -0.37 -0.707 -0.955 -1.221 -1.625 -1.901 -2.2 -2.358 -2.69 -3.044 -3.415 -3.611 -4.054 -4.232 -4.453 -4.695 -5.211 -5.509 -5.847 -6.183 -6.554 -7.018 -7.649 -9.023 -10 ,23992 ,KEBNE ,17131998,Sat Jan 1 17:22:54 CET,Sat Jan 1 18:56:39 CET,0.0 1.033 1.476 1.83 2.133 2.405 2.662 2.902 3.356 3.559 3.752 3.889 4.297 4.45 4.732 4.998 5.25 5.377 5.621 5.855 6.188 6.4 6.604 6.88 7.15 7.42 7.674 7.918 8.234 8.535 8.805 9.122 9.444 9.74 10.068 10.448 10.812 11.164 11.525 11.917 12.311 12.732 13.175 13.584 14.004 14.407 14.805 15.155 15.399 15.442 15.017 13.953 12.868 11.878 10.944 10.087 9.279 8.478 7.782 7.074 6.423 5.838 5.282 4.785 4.348 3.925 3.43 2.976 2.594 2.204 1.808 1.465 1.097 0.721 0.418 0.094 -0.242 -0.585 -0.924 -1.158 -1.411 -1.815 -2.101 -2.391 -2.543 -2.872 -3.215 -3.573 -3.76 -4.199 -4.379 -4.62 -4.873 -5.369 -5.646 -5.956 -6.299 -6.673 -7.119 -7.772 -9.289 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 7da44e61..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-49_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,964 ,KEBNE ,16692123,Thu Nov 25 17:24:12 CET,Thu Nov 25 18:57:43 CET,0.0 0.885 1.32 1.669 1.969 2.231 2.486 2.733 3.159 3.337 3.505 3.606 4.003 4.156 4.431 4.703 4.969 5.088 5.306 5.519 5.826 6.028 6.227 6.505 6.777 7.04 7.284 7.513 7.779 8.024 8.28 8.6 8.917 9.222 9.554 9.905 10.23 10.575 10.96 11.355 11.683 12.026 12.448 12.845 13.246 13.654 14.035 14.356 14.604 14.612 14.087 12.992 11.786 10.632 9.65 8.755 7.916 7.145 6.488 5.808 5.2 4.631 4.075 3.554 3.066 2.587 2.077 1.626 1.226 0.791 0.335 -0.031 -0.418 -0.82 -1.125 -1.437 -1.759 -2.109 -2.481 -2.736 -3.009 -3.431 -3.72 -4.022 -4.171 -4.478 -4.821 -5.195 -5.39 -5.831 -5.995 -6.199 -6.435 -6.967 -7.239 -7.541 -7.885 -8.278 -8.756 -9.342 -10.719 -2 ,18962 ,KEBNE ,16692124,Thu Nov 25 17:24:13 CET,Thu Nov 25 18:56:27 CET,0.0 1.066 1.534 1.877 2.172 2.453 2.721 2.971 3.404 3.605 3.802 3.937 4.332 4.488 4.788 5.058 5.318 5.444 5.688 5.92 6.251 6.46 6.659 6.948 7.228 7.49 7.727 7.969 8.282 8.571 8.844 9.163 9.467 9.748 10.06 10.391 10.707 11.071 11.438 11.806 12.183 12.586 13.023 13.415 13.836 14.232 14.579 14.815 14.96 14.953 14.408 13.343 12.232 11.168 10.158 9.166 8.285 7.52 6.898 6.236 5.624 5.044 4.465 3.921 3.405 2.935 2.428 1.967 1.563 1.139 0.699 0.322 -0.08 -0.488 -0.799 -1.138 -1.491 -1.839 -2.189 -2.435 -2.692 -3.107 -3.389 -3.69 -3.856 -4.189 -4.533 -4.895 -5.084 -5.53 -5.707 -5.93 -6.171 -6.7 -6.995 -7.303 -7.637 -8.037 -8.532 -9.19 -10.83 -3 ,31250 ,KEBNE ,16692125,Thu Nov 25 17:24:13 CET,Thu Nov 25 18:58:13 CET,0.0 1.066 1.569 1.938 2.243 2.53 2.783 2.996 3.382 3.577 3.762 3.862 4.257 4.413 4.703 4.966 5.205 5.324 5.56 5.781 6.096 6.3 6.495 6.78 7.046 7.289 7.529 7.755 8.05 8.338 8.61 8.924 9.211 9.482 9.793 10.124 10.43 10.77 11.127 11.479 11.812 12.17 12.614 13.022 13.429 13.831 14.165 14.443 14.617 14.526 13.909 12.809 11.736 10.689 9.72 8.845 8.055 7.3 6.608 5.906 5.27 4.693 4.132 3.575 3.053 2.583 2.089 1.623 1.217 0.801 0.353 -0.015 -0.402 -0.807 -1.114 -1.437 -1.784 -2.139 -2.499 -2.759 -3.029 -3.437 -3.718 -4.015 -4.171 -4.496 -4.827 -5.176 -5.372 -5.826 -6.019 -6.233 -6.463 -6.985 -7.283 -7.611 -7.957 -8.349 -8.815 -9.42 -10.88 -4 ,2514 ,KEBNE ,16692126,Thu Nov 25 17:24:13 CET,Thu Nov 25 18:57:47 CET,0.0 1.069 1.579 1.937 2.245 2.516 2.762 2.987 3.4 3.595 3.771 3.876 4.267 4.418 4.712 4.989 5.242 5.365 5.603 5.828 6.153 6.355 6.55 6.846 7.134 7.398 7.645 7.883 8.181 8.47 8.745 9.053 9.351 9.625 9.933 10.267 10.559 10.89 11.261 11.653 12.047 12.458 12.86 13.214 13.575 13.907 14.208 14.436 14.559 14.457 13.914 12.833 11.718 10.633 9.629 8.7 7.862 7.123 6.479 5.792 5.197 4.675 4.156 3.618 3.085 2.615 2.14 1.706 1.313 0.892 0.449 0.067 -0.337 -0.747 -1.061 -1.384 -1.721 -2.066 -2.427 -2.685 -2.943 -3.349 -3.637 -3.942 -4.105 -4.448 -4.793 -5.14 -5.326 -5.772 -5.974 -6.204 -6.44 -6.969 -7.267 -7.596 -7.97 -8.382 -8.855 -9.45 -11.142 -5 ,23217 ,KEBNE ,16692127,Thu Nov 25 17:24:13 CET,Thu Nov 25 18:57:28 CET,0.0 0.862 1.332 1.685 1.967 2.238 2.483 2.706 3.125 3.322 3.511 3.613 4.002 4.157 4.457 4.731 4.983 5.104 5.34 5.569 5.873 6.073 6.275 6.571 6.855 7.114 7.365 7.587 7.861 8.146 8.426 8.752 9.049 9.335 9.638 9.963 10.295 10.663 11.027 11.39 11.778 12.183 12.589 12.947 13.317 13.678 13.974 14.225 14.422 14.394 13.881 12.81 11.695 10.671 9.736 8.828 7.974 7.171 6.462 5.756 5.125 4.536 3.977 3.447 2.932 2.457 1.964 1.536 1.171 0.756 0.298 -0.075 -0.476 -0.902 -1.221 -1.544 -1.89 -2.256 -2.612 -2.856 -3.126 -3.545 -3.843 -4.155 -4.312 -4.634 -4.96 -5.301 -5.485 -5.928 -6.111 -6.342 -6.6 -7.154 -7.453 -7.782 -8.134 -8.537 -8.995 -9.532 -10.597 -6 ,5032 ,KEBNE ,16692128,Thu Nov 25 17:24:13 CET,Thu Nov 25 18:57:48 CET,0.0 0.908 1.376 1.725 2.024 2.306 2.551 2.771 3.181 3.368 3.551 3.646 4.025 4.177 4.476 4.757 5.022 5.145 5.38 5.606 5.925 6.131 6.332 6.624 6.899 7.167 7.421 7.659 7.954 8.222 8.469 8.759 9.032 9.3 9.613 9.956 10.273 10.623 10.98 11.335 11.703 12.063 12.482 12.923 13.379 13.786 14.103 14.338 14.494 14.42 13.794 12.623 11.468 10.393 9.423 8.465 7.57 6.788 6.097 5.37 4.74 4.142 3.549 2.988 2.464 1.999 1.529 1.103 0.699 0.266 -0.173 -0.521 -0.895 -1.299 -1.612 -1.946 -2.269 -2.602 -2.967 -3.232 -3.513 -3.922 -4.202 -4.498 -4.65 -4.978 -5.322 -5.674 -5.859 -6.294 -6.473 -6.699 -6.944 -7.466 -7.75 -8.066 -8.418 -8.797 -9.253 -9.851 -11.51 -7 ,27946 ,KEBNE ,16692129,Thu Nov 25 17:25:15 CET,Thu Nov 25 18:57:18 CET,0.0 0.92 1.353 1.7 2.012 2.28 2.52 2.749 3.152 3.333 3.508 3.614 4.007 4.158 4.458 4.746 5.008 5.127 5.351 5.58 5.915 6.124 6.325 6.616 6.885 7.127 7.37 7.604 7.904 8.189 8.457 8.774 9.066 9.35 9.68 10.021 10.337 10.705 11.086 11.441 11.79 12.162 12.559 12.915 13.312 13.73 14.13 14.448 14.644 14.598 14.014 12.955 11.892 10.842 9.859 8.947 8.124 7.366 6.718 6.06 5.457 4.871 4.305 3.795 3.327 2.892 2.426 1.975 1.58 1.183 0.759 0.389 0.003 -0.392 -0.705 -1.016 -1.34 -1.673 -2.015 -2.257 -2.513 -2.925 -3.213 -3.52 -3.68 -4.005 -4.347 -4.706 -4.909 -5.354 -5.526 -5.754 -6.0 -6.529 -6.82 -7.132 -7.478 -7.888 -8.344 -8.946 -10.378 -8 ,15019 ,KEBNE ,16692130,Thu Nov 25 17:25:15 CET,Thu Nov 25 18:59:28 CET,0.0 0.918 1.365 1.686 1.981 2.242 2.486 2.721 3.138 3.327 3.502 3.595 3.988 4.136 4.406 4.663 4.925 5.05 5.269 5.479 5.802 6.014 6.21 6.48 6.749 7.02 7.289 7.535 7.824 8.085 8.333 8.651 8.941 9.209 9.52 9.846 10.153 10.49 10.845 11.206 11.543 11.878 12.286 12.685 13.054 13.381 13.729 14.036 14.235 14.185 13.609 12.526 11.435 10.404 9.469 8.602 7.785 7.047 6.363 5.615 4.961 4.362 3.803 3.285 2.767 2.261 1.74 1.292 0.941 0.569 0.148 -0.2 -0.573 -0.965 -1.279 -1.619 -1.973 -2.329 -2.682 -2.927 -3.183 -3.59 -3.891 -4.205 -4.362 -4.684 -5.02 -5.374 -5.569 -6.01 -6.186 -6.413 -6.649 -7.161 -7.45 -7.771 -8.118 -8.494 -8.986 -9.663 -11.234 -9 ,30037 ,KEBNE ,16692131,Thu Nov 25 17:25:15 CET,Thu Nov 25 18:57:09 CET,0.0 0.879 1.337 1.678 1.987 2.285 2.555 2.783 3.179 3.368 3.553 3.662 4.052 4.199 4.477 4.758 5.015 5.139 5.38 5.612 5.934 6.126 6.32 6.611 6.875 7.11 7.343 7.576 7.865 8.139 8.406 8.703 8.983 9.27 9.602 9.938 10.225 10.568 10.954 11.339 11.724 12.132 12.577 12.971 13.35 13.682 13.989 14.283 14.472 14.428 13.948 12.917 11.826 10.751 9.773 8.872 8.05 7.272 6.552 5.811 5.161 4.609 4.09 3.557 3.038 2.554 2.039 1.56 1.147 0.726 0.291 -0.078 -0.477 -0.882 -1.186 -1.501 -1.829 -2.161 -2.508 -2.771 -3.049 -3.47 -3.756 -4.046 -4.19 -4.501 -4.833 -5.197 -5.395 -5.832 -6.013 -6.236 -6.473 -6.98 -7.258 -7.577 -7.924 -8.313 -8.768 -9.375 -10.916 -10 ,21819 ,KEBNE ,16692132,Thu Nov 25 17:25:15 CET,Thu Nov 25 18:59:25 CET,0.0 0.798 1.266 1.651 1.965 2.234 2.482 2.705 3.109 3.303 3.484 3.598 3.998 4.152 4.436 4.708 4.965 5.081 5.313 5.554 5.892 6.095 6.296 6.601 6.896 7.159 7.398 7.639 7.942 8.221 8.485 8.791 9.083 9.339 9.606 9.933 10.252 10.606 10.979 11.355 11.75 12.112 12.486 12.889 13.298 13.702 14.109 14.437 14.627 14.556 13.975 12.899 11.75 10.621 9.6 8.637 7.799 7.005 6.258 5.517 4.881 4.338 3.849 3.363 2.908 2.493 2.017 1.563 1.165 0.746 0.322 -0.028 -0.392 -0.777 -1.091 -1.412 -1.742 -2.092 -2.462 -2.712 -2.968 -3.392 -3.694 -3.997 -4.148 -4.461 -4.791 -5.156 -5.35 -5.791 -5.957 -6.174 -6.412 -6.966 -7.256 -7.56 -7.906 -8.306 -8.774 -9.377 -10.875 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index 8085c55c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15436 ,KEBNE ,17131999,Sat Jan 1 17:23:56 CET,Sat Jan 1 18:56:13 CET,0.0 0.437 0.715 0.967 1.198 1.4 1.568 1.712 1.983 2.114 2.234 2.219 2.545 2.644 2.829 2.998 3.152 3.22 3.354 3.49 3.7 3.827 3.94 4.105 4.244 4.369 4.501 4.619 4.739 4.843 4.946 5.078 5.206 5.314 5.405 5.49 5.555 5.595 5.619 5.637 5.622 5.55 5.431 5.234 4.906 4.445 3.766 2.779 1.294 -0.997 -4.781 -9.126 -12.563 -15.39 -17.766 -19.827 -21.584 -23.176 -24.531 -25.85 -26.957 -27.919 -28.839 -29.726 -30.532 -31.225 -31.935 -32.582 -33.142 -33.714 -34.302 -34.787 -35.284 -35.789 -36.183 -36.592 -37.012 -37.451 -37.909 -38.224 -38.549 -39.025 -39.347 -39.688 -39.859 -40.217 -40.599 -41.004 -41.218 -41.691 -41.868 -42.095 -42.332 -42.877 -43.16 -43.445 -43.768 -44.16 -44.618 -45.151 -45.987 -2 ,15249 ,KEBNE ,17132000,Sat Jan 1 17:23:56 CET,Sat Jan 1 18:56:00 CET,0.0 0.577 0.911 1.2 1.439 1.647 1.828 1.996 2.301 2.435 2.553 2.538 2.867 2.97 3.161 3.348 3.515 3.587 3.728 3.87 4.069 4.185 4.287 4.427 4.571 4.715 4.85 4.978 5.137 5.286 5.416 5.553 5.684 5.786 5.89 6.023 6.104 6.138 6.194 6.262 6.262 6.189 6.067 5.882 5.549 5.012 4.219 3.162 1.649 -0.679 -4.505 -8.907 -12.43 -15.33 -17.77 -19.894 -21.671 -23.237 -24.521 -25.781 -26.89 -27.844 -28.717 -29.562 -30.346 -31.037 -31.757 -32.418 -32.981 -33.531 -34.091 -34.562 -35.055 -35.568 -35.955 -36.342 -36.761 -37.206 -37.668 -37.99 -38.313 -38.792 -39.128 -39.484 -39.663 -40.023 -40.388 -40.78 -40.99 -41.462 -41.643 -41.883 -42.136 -42.678 -42.959 -43.258 -43.597 -43.987 -44.431 -44.917 -45.855 -3 ,3462 ,KEBNE ,17132001,Sat Jan 1 17:25:00 CET,Sat Jan 1 18:51:56 CET,0.0 0.439 0.746 0.98 1.175 1.361 1.524 1.664 1.921 2.04 2.149 2.131 2.464 2.564 2.745 2.909 3.064 3.142 3.287 3.418 3.602 3.71 3.804 3.943 4.079 4.211 4.335 4.449 4.584 4.708 4.828 4.945 5.045 5.135 5.195 5.218 5.25 5.289 5.304 5.321 5.317 5.253 5.096 4.89 4.577 4.072 3.316 2.24 0.659 -1.749 -5.561 -9.872 -13.341 -16.231 -18.606 -20.679 -22.444 -23.986 -25.31 -26.603 -27.708 -28.697 -29.624 -30.489 -31.273 -31.983 -32.729 -33.385 -33.945 -34.528 -35.12 -35.606 -36.11 -36.626 -37.024 -37.428 -37.841 -38.269 -38.692 -38.982 -39.299 -39.785 -40.123 -40.476 -40.651 -40.999 -41.356 -41.751 -41.964 -42.443 -42.645 -42.894 -43.154 -43.734 -44.044 -44.38 -44.739 -45.111 -45.529 -46.047 -47.055 -4 ,17586 ,KEBNE ,17132002,Sat Jan 1 17:28:04 CET,Sat Jan 1 19:00:19 CET,0.0 0.487 0.737 0.96 1.152 1.331 1.502 1.653 1.93 2.053 2.169 2.173 2.51 2.604 2.775 2.947 3.11 3.187 3.338 3.473 3.667 3.797 3.917 4.087 4.247 4.401 4.547 4.662 4.798 4.943 5.083 5.228 5.358 5.48 5.584 5.677 5.764 5.841 5.865 5.863 5.823 5.71 5.559 5.319 4.949 4.487 3.793 2.812 1.336 -1.03 -4.888 -9.338 -12.831 -15.671 -18.004 -20.0 -21.743 -23.31 -24.656 -25.94 -27.004 -27.958 -28.864 -29.722 -30.524 -31.251 -31.998 -32.652 -33.207 -33.778 -34.376 -34.858 -35.361 -35.88 -36.269 -36.681 -37.108 -37.556 -38.018 -38.329 -38.644 -39.126 -39.469 -39.818 -39.99 -40.357 -40.729 -41.107 -41.309 -41.772 -41.944 -42.176 -42.426 -42.953 -43.231 -43.525 -43.827 -44.17 -44.601 -45.095 -46.067 -5 ,4091 ,KEBNE ,17132003,Sat Jan 1 17:29:02 CET,Sat Jan 1 18:59:54 CET,0.0 0.87 1.253 1.547 1.795 2.026 2.225 2.405 2.736 2.892 3.035 3.062 3.408 3.528 3.748 3.957 4.133 4.208 4.343 4.471 4.668 4.798 4.918 5.082 5.226 5.344 5.463 5.585 5.731 5.879 6.015 6.135 6.221 6.314 6.43 6.539 6.62 6.697 6.763 6.798 6.806 6.786 6.691 6.479 6.138 5.695 5.014 3.964 2.411 0.043 -3.937 -8.423 -11.894 -14.706 -17.04 -19.096 -20.86 -22.413 -23.687 -24.955 -26.026 -26.925 -27.779 -28.614 -29.404 -30.11 -30.868 -31.538 -32.097 -32.688 -33.308 -33.815 -34.314 -34.79 -35.168 -35.581 -36.006 -36.439 -36.882 -37.177 -37.474 -37.948 -38.288 -38.643 -38.826 -39.197 -39.566 -39.949 -40.15 -40.624 -40.809 -41.038 -41.282 -41.819 -42.106 -42.422 -42.754 -43.094 -43.495 -43.995 -44.881 -6 ,30200 ,KEBNE ,17132004,Sat Jan 1 17:29:10 CET,Sat Jan 1 19:00:12 CET,0.0 0.559 0.842 1.081 1.304 1.502 1.688 1.861 2.189 2.345 2.494 2.531 2.873 2.99 3.21 3.4 3.588 3.682 3.85 4.011 4.25 4.388 4.505 4.661 4.823 4.997 5.148 5.278 5.425 5.533 5.619 5.741 5.885 6.015 6.141 6.227 6.271 6.326 6.381 6.404 6.386 6.338 6.242 6.068 5.717 5.222 4.537 3.483 1.886 -0.485 -4.338 -8.745 -12.126 -14.92 -17.314 -19.395 -21.158 -22.672 -23.928 -25.149 -26.247 -27.214 -28.066 -28.878 -29.659 -30.384 -31.126 -31.786 -32.356 -32.935 -33.522 -34.011 -34.534 -35.062 -35.454 -35.872 -36.311 -36.746 -37.196 -37.512 -37.834 -38.317 -38.657 -39.004 -39.179 -39.543 -39.924 -40.323 -40.522 -40.986 -41.164 -41.404 -41.65 -42.165 -42.443 -42.739 -43.057 -43.399 -43.802 -44.288 -45.297 -7 ,328 ,KEBNE ,17132005,Sat Jan 1 17:29:03 CET,Sat Jan 1 18:59:50 CET,0.0 0.387 0.649 0.872 1.063 1.248 1.413 1.562 1.842 1.976 2.1 2.091 2.415 2.513 2.703 2.876 3.039 3.114 3.252 3.388 3.566 3.676 3.787 3.946 4.097 4.233 4.359 4.474 4.601 4.719 4.849 5.017 5.159 5.26 5.354 5.462 5.564 5.636 5.675 5.697 5.672 5.613 5.52 5.318 4.947 4.454 3.773 2.73 1.158 -1.218 -5.158 -9.698 -13.272 -16.166 -18.551 -20.597 -22.366 -23.928 -25.26 -26.576 -27.661 -28.639 -29.57 -30.423 -31.191 -31.879 -32.615 -33.287 -33.867 -34.426 -34.986 -35.466 -35.962 -36.473 -36.879 -37.302 -37.731 -38.162 -38.608 -38.916 -39.225 -39.705 -40.043 -40.397 -40.58 -40.96 -41.348 -41.758 -41.971 -42.444 -42.621 -42.849 -43.095 -43.633 -43.904 -44.193 -44.516 -44.87 -45.273 -45.749 -46.682 -8 ,24342 ,KEBNE ,17132006,Sat Jan 1 17:30:04 CET,Sat Jan 1 19:01:11 CET,0.0 0.568 0.831 1.067 1.269 1.446 1.606 1.752 2.008 2.122 2.235 2.224 2.552 2.651 2.84 3.025 3.212 3.3 3.464 3.62 3.833 3.966 4.09 4.26 4.418 4.567 4.704 4.826 4.976 5.1 5.193 5.317 5.454 5.594 5.735 5.851 5.94 6.012 6.049 6.069 6.06 5.989 5.85 5.621 5.244 4.738 4.031 2.997 1.395 -1.055 -5.047 -9.4 -12.769 -15.626 -18.051 -20.121 -21.84 -23.389 -24.743 -26.084 -27.173 -28.142 -29.044 -29.868 -30.637 -31.327 -32.061 -32.721 -33.295 -33.887 -34.483 -34.972 -35.484 -36.02 -36.442 -36.891 -37.363 -37.854 -38.363 -38.707 -39.048 -39.574 -39.947 -40.323 -40.509 -40.891 -41.285 -41.698 -41.909 -42.382 -42.55 -42.773 -43.006 -43.518 -43.811 -44.12 -44.446 -44.812 -45.22 -45.716 -46.571 -9 ,8221 ,KEBNE ,17132007,Sat Jan 1 17:30:04 CET,Sat Jan 1 19:01:12 CET,0.0 0.667 0.996 1.221 1.413 1.592 1.766 1.93 2.22 2.356 2.477 2.463 2.789 2.89 3.099 3.307 3.491 3.572 3.724 3.876 4.102 4.241 4.371 4.549 4.7 4.837 4.98 5.113 5.251 5.378 5.513 5.651 5.772 5.894 6.006 6.119 6.217 6.282 6.321 6.37 6.383 6.315 6.167 5.981 5.644 5.113 4.377 3.311 1.673 -0.833 -4.827 -9.326 -12.76 -15.582 -17.99 -20.057 -21.843 -23.447 -24.806 -26.157 -27.283 -28.243 -29.134 -29.985 -30.769 -31.454 -32.172 -32.803 -33.327 -33.881 -34.468 -34.961 -35.467 -35.991 -36.406 -36.831 -37.259 -37.695 -38.146 -38.456 -38.78 -39.284 -39.622 -39.972 -40.151 -40.499 -40.872 -41.276 -41.483 -41.951 -42.136 -42.378 -42.622 -43.135 -43.411 -43.701 -44.018 -44.36 -44.737 -45.246 -46.257 -10 ,15043 ,KEBNE ,17132008,Sat Jan 1 17:31:10 CET,Sat Jan 1 18:59:11 CET,0.0 0.49 0.817 1.063 1.264 1.455 1.619 1.771 2.048 2.18 2.3 2.286 2.614 2.71 2.873 3.025 3.181 3.252 3.383 3.501 3.671 3.787 3.898 4.059 4.21 4.345 4.46 4.556 4.675 4.808 4.937 5.072 5.17 5.23 5.311 5.427 5.526 5.617 5.666 5.675 5.672 5.603 5.401 5.167 4.895 4.456 3.777 2.775 1.279 -1.044 -4.895 -9.303 -12.791 -15.666 -18.041 -20.094 -21.838 -23.374 -24.686 -25.958 -27.019 -27.965 -28.875 -29.709 -30.479 -31.152 -31.841 -32.497 -33.063 -33.644 -34.244 -34.715 -35.201 -35.723 -36.132 -36.545 -36.964 -37.395 -37.842 -38.147 -38.454 -38.94 -39.272 -39.605 -39.773 -40.125 -40.511 -40.918 -41.123 -41.59 -41.762 -41.991 -42.219 -42.71 -42.99 -43.284 -43.587 -43.937 -44.359 -44.874 -46.116 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 9fa6d869..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-50_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2318 ,KEBNE ,16692133,Thu Nov 25 17:25:15 CET,Thu Nov 25 18:58:46 CET,0.0 1.196 1.626 1.997 2.294 2.577 2.835 3.061 3.478 3.67 3.844 3.929 4.297 4.445 4.722 4.965 5.188 5.304 5.526 5.722 6.005 6.191 6.363 6.574 6.77 6.976 7.171 7.358 7.584 7.798 8.017 8.272 8.48 8.66 8.846 9.057 9.263 9.437 9.584 9.72 9.842 9.923 9.987 10.046 9.957 9.726 9.346 8.712 7.799 6.273 3.48 0.133 -2.638 -4.962 -6.889 -8.586 -10.047 -11.357 -12.457 -13.519 -14.422 -15.247 -16.067 -16.812 -17.475 -18.096 -18.752 -19.342 -19.838 -20.35 -20.881 -21.312 -21.77 -22.238 -22.591 -22.959 -23.342 -23.739 -24.152 -24.436 -24.721 -25.156 -25.466 -25.79 -25.954 -26.292 -26.656 -27.038 -27.233 -27.688 -27.854 -28.067 -28.279 -28.736 -29.003 -29.287 -29.583 -29.924 -30.333 -30.809 -31.528 -2 ,20720 ,KEBNE ,16692134,Thu Nov 25 17:25:15 CET,Thu Nov 25 18:58:37 CET,0.0 1.188 1.701 2.083 2.385 2.651 2.895 3.114 3.496 3.679 3.869 4.003 4.391 4.542 4.813 5.061 5.28 5.386 5.608 5.822 6.105 6.283 6.465 6.711 6.919 7.103 7.287 7.484 7.723 7.939 8.151 8.404 8.623 8.807 9.024 9.24 9.415 9.618 9.841 10.045 10.218 10.338 10.373 10.364 10.294 10.127 9.774 9.149 8.123 6.497 3.645 0.2 -2.584 -4.96 -6.994 -8.773 -10.263 -11.572 -12.696 -13.806 -14.753 -15.589 -16.375 -17.109 -17.827 -18.485 -19.124 -19.698 -20.197 -20.706 -21.242 -21.684 -22.14 -22.594 -22.933 -23.291 -23.65 -24.008 -24.409 -24.701 -24.995 -25.443 -25.758 -26.092 -26.266 -26.622 -26.978 -27.336 -27.526 -27.983 -28.159 -28.379 -28.607 -29.085 -29.342 -29.625 -29.943 -30.309 -30.722 -31.22 -32.096 -3 ,11729 ,KEBNE ,16692135,Thu Nov 25 17:25:15 CET,Thu Nov 25 18:58:49 CET,0.0 1.214 1.685 2.05 2.365 2.646 2.903 3.139 3.559 3.743 3.913 4.004 4.38 4.526 4.792 5.029 5.259 5.375 5.584 5.782 6.072 6.252 6.427 6.668 6.884 7.08 7.26 7.435 7.667 7.897 8.123 8.371 8.567 8.733 8.935 9.135 9.301 9.48 9.659 9.843 9.993 10.092 10.17 10.203 10.144 9.993 9.703 9.175 8.259 6.687 3.952 0.573 -2.208 -4.537 -6.498 -8.218 -9.705 -11.027 -12.179 -13.322 -14.3 -15.186 -16.015 -16.76 -17.446 -18.083 -18.744 -19.336 -19.837 -20.361 -20.897 -21.324 -21.762 -22.223 -22.59 -22.964 -23.347 -23.739 -24.141 -24.415 -24.697 -25.135 -25.44 -25.759 -25.919 -26.254 -26.628 -27.02 -27.221 -27.687 -27.89 -28.111 -28.337 -28.836 -29.107 -29.402 -29.717 -30.039 -30.427 -30.91 -31.617 -4 ,275 ,KEBNE ,16692136,Thu Nov 25 17:26:17 CET,Thu Nov 25 19:00:25 CET,0.0 1.127 1.594 1.961 2.286 2.587 2.845 3.059 3.452 3.636 3.807 3.921 4.303 4.451 4.731 4.989 5.222 5.326 5.528 5.734 6.027 6.21 6.373 6.613 6.843 7.062 7.269 7.447 7.668 7.874 8.063 8.298 8.528 8.734 8.947 9.157 9.348 9.548 9.732 9.905 10.063 10.209 10.329 10.395 10.381 10.198 9.759 9.036 7.929 6.239 3.335 -0.154 -2.989 -5.348 -7.287 -8.999 -10.488 -11.826 -12.994 -14.131 -15.087 -15.927 -16.679 -17.382 -18.068 -18.701 -19.365 -19.949 -20.453 -20.992 -21.527 -21.96 -22.424 -22.896 -23.257 -23.629 -24.008 -24.401 -24.814 -25.103 -25.4 -25.868 -26.184 -26.501 -26.667 -27.003 -27.353 -27.727 -27.919 -28.373 -28.549 -28.768 -28.992 -29.479 -29.741 -30.014 -30.327 -30.676 -31.077 -31.583 -32.415 -5 ,6456 ,KEBNE ,16692137,Thu Nov 25 17:26:17 CET,Thu Nov 25 18:59:45 CET,0.0 1.082 1.572 1.94 2.263 2.554 2.806 3.028 3.434 3.624 3.802 3.885 4.249 4.395 4.666 4.921 5.153 5.26 5.472 5.681 5.984 6.159 6.323 6.57 6.812 7.032 7.232 7.417 7.63 7.844 8.066 8.331 8.566 8.768 8.978 9.199 9.398 9.601 9.78 9.91 10.018 10.101 10.174 10.166 10.043 9.79 9.375 8.798 7.868 6.321 3.474 0.044 -2.745 -5.066 -7.013 -8.754 -10.257 -11.592 -12.738 -13.877 -14.861 -15.735 -16.551 -17.304 -18.003 -18.646 -19.306 -19.896 -20.414 -20.954 -21.508 -21.963 -22.436 -22.897 -23.239 -23.601 -23.995 -24.405 -24.817 -25.091 -25.367 -25.806 -26.117 -26.431 -26.6 -26.961 -27.317 -27.706 -27.905 -28.351 -28.513 -28.729 -28.947 -29.401 -29.654 -29.938 -30.264 -30.626 -31.043 -31.519 -32.384 -6 ,22760 ,KEBNE ,16692138,Thu Nov 25 17:27:21 CET,Thu Nov 25 18:58:17 CET,0.0 1.639 2.12 2.488 2.811 3.1 3.352 3.591 4.015 4.206 4.382 4.489 4.875 5.021 5.293 5.551 5.782 5.893 6.11 6.312 6.601 6.78 6.944 7.184 7.408 7.615 7.817 8.017 8.249 8.454 8.648 8.879 9.098 9.295 9.506 9.734 9.945 10.14 10.326 10.503 10.636 10.741 10.79 10.762 10.68 10.53 10.232 9.641 8.608 7.039 4.227 0.71 -2.134 -4.494 -6.462 -8.199 -9.686 -11.011 -12.137 -13.25 -14.224 -15.104 -15.901 -16.609 -17.286 -17.923 -18.597 -19.171 -19.66 -20.179 -20.705 -21.144 -21.611 -22.102 -22.471 -22.841 -23.225 -23.617 -24.007 -24.28 -24.58 -25.041 -25.351 -25.675 -25.845 -26.191 -26.539 -26.901 -27.09 -27.536 -27.696 -27.915 -28.148 -28.649 -28.923 -29.221 -29.537 -29.899 -30.304 -30.763 -31.647 -7 ,14189 ,KEBNE ,16692140,Thu Nov 25 17:27:21 CET,Thu Nov 25 19:01:02 CET,0.0 1.173 1.668 2.025 2.349 2.657 2.92 3.157 3.566 3.743 3.901 3.974 4.343 4.49 4.764 5.01 5.229 5.341 5.564 5.774 6.056 6.23 6.393 6.619 6.849 7.066 7.254 7.434 7.698 7.946 8.169 8.41 8.612 8.805 8.994 9.182 9.376 9.595 9.806 9.98 10.129 10.269 10.342 10.349 10.323 10.188 9.854 9.259 8.276 6.598 3.685 0.374 -2.324 -4.639 -6.564 -8.26 -9.747 -11.054 -12.151 -13.234 -14.176 -15.03 -15.848 -16.596 -17.28 -17.924 -18.602 -19.201 -19.719 -20.25 -20.796 -21.239 -21.699 -22.188 -22.55 -22.91 -23.29 -23.693 -24.106 -24.384 -24.672 -25.11 -25.419 -25.752 -25.92 -26.253 -26.602 -26.973 -27.174 -27.633 -27.815 -28.041 -28.27 -28.775 -29.064 -29.348 -29.638 -29.975 -30.357 -30.818 -31.778 -8 ,31496 ,KEBNE ,16692141,Thu Nov 25 17:27:21 CET,Thu Nov 25 19:00:10 CET,0.0 1.287 1.801 2.182 2.476 2.746 2.993 3.222 3.627 3.808 3.987 4.092 4.459 4.597 4.866 5.123 5.373 5.492 5.703 5.902 6.189 6.366 6.52 6.735 6.947 7.148 7.346 7.523 7.728 7.931 8.121 8.352 8.559 8.744 8.974 9.226 9.425 9.596 9.764 9.959 10.131 10.27 10.369 10.353 10.285 10.146 9.804 9.261 8.325 6.701 3.806 0.341 -2.434 -4.784 -6.75 -8.428 -9.843 -11.137 -12.243 -13.342 -14.312 -15.173 -15.973 -16.728 -17.439 -18.084 -18.741 -19.338 -19.86 -20.371 -20.882 -21.317 -21.777 -22.246 -22.61 -22.985 -23.37 -23.759 -24.156 -24.445 -24.743 -25.186 -25.501 -25.833 -26.002 -26.356 -26.715 -27.08 -27.269 -27.716 -27.9 -28.136 -28.378 -28.868 -29.156 -29.489 -29.823 -30.167 -30.573 -31.027 -31.773 -9 ,2316 ,KEBNE ,16692142,Thu Nov 25 17:27:21 CET,Thu Nov 25 18:58:43 CET,0.0 1.069 1.573 1.969 2.306 2.587 2.828 3.048 3.458 3.643 3.819 3.934 4.316 4.464 4.743 5.003 5.241 5.35 5.557 5.744 5.998 6.165 6.326 6.549 6.759 6.966 7.167 7.347 7.562 7.78 7.995 8.238 8.453 8.657 8.876 9.086 9.243 9.395 9.555 9.719 9.878 10.005 10.077 10.069 9.996 9.817 9.465 8.887 7.884 6.156 3.164 -0.358 -3.116 -5.397 -7.344 -9.069 -10.586 -11.93 -13.054 -14.163 -15.141 -16.0 -16.819 -17.553 -18.2 -18.808 -19.458 -20.052 -20.544 -21.023 -21.529 -21.966 -22.425 -22.913 -23.289 -23.675 -24.077 -24.485 -24.889 -25.151 -25.424 -25.874 -26.191 -26.508 -26.671 -27.015 -27.378 -27.763 -27.962 -28.413 -28.579 -28.798 -29.016 -29.497 -29.774 -30.086 -30.421 -30.779 -31.21 -31.716 -32.733 -10 ,32288 ,KEBNE ,16692143,Thu Nov 25 17:27:21 CET,Thu Nov 25 19:00:02 CET,0.0 0.912 1.351 1.734 2.079 2.383 2.645 2.879 3.292 3.479 3.657 3.761 4.146 4.3 4.579 4.821 5.029 5.136 5.363 5.564 5.829 5.995 6.157 6.395 6.614 6.82 7.014 7.2 7.427 7.633 7.834 8.065 8.276 8.472 8.678 8.88 9.053 9.24 9.433 9.587 9.725 9.836 9.936 10.0 9.922 9.743 9.412 8.818 7.894 6.348 3.604 0.283 -2.523 -4.826 -6.766 -8.522 -10.015 -11.317 -12.413 -13.492 -14.45 -15.304 -16.122 -16.895 -17.599 -18.248 -18.907 -19.473 -19.964 -20.477 -21.001 -21.438 -21.889 -22.35 -22.72 -23.097 -23.48 -23.88 -24.298 -24.586 -24.884 -25.337 -25.643 -25.963 -26.129 -26.475 -26.851 -27.233 -27.42 -27.872 -28.08 -28.316 -28.547 -29.019 -29.272 -29.56 -29.869 -30.207 -30.595 -31.055 -31.806 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index f7006c3e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,917 ,KEBNE ,16692144,Thu Nov 25 17:27:21 CET,Thu Nov 25 19:01:00 CET,0.0 0.639 1.008 1.339 1.645 1.912 2.148 2.369 2.802 3.0 3.182 3.237 3.697 3.865 4.186 4.503 4.82 4.969 5.262 5.551 5.956 6.229 6.503 6.89 7.264 7.61 7.936 8.257 8.669 9.069 9.465 9.94 10.4 10.841 11.359 11.932 12.477 13.081 13.739 14.426 15.121 15.917 16.829 17.715 18.789 20.02 21.369 22.853 24.654 26.796 29.287 31.289 32.444 33.038 33.285 33.364 33.332 33.273 33.14 32.923 32.722 32.513 32.274 32.035 31.806 31.557 31.289 31.052 30.825 30.577 30.312 30.083 29.824 29.515 29.292 29.066 28.82 28.574 28.314 28.132 27.922 27.592 27.371 27.123 26.997 26.761 26.502 26.187 26.016 25.588 25.493 25.285 25.06 24.583 24.321 24.047 23.732 23.329 22.841 22.274 20.374 -2 ,28708 ,KEBNE ,16692145,Thu Nov 25 17:27:20 CET,Thu Nov 25 18:58:19 CET,0.0 0.884 1.249 1.546 1.818 2.058 2.28 2.501 2.918 3.122 3.317 3.359 3.812 3.976 4.301 4.627 4.944 5.095 5.375 5.649 6.068 6.339 6.595 6.964 7.319 7.664 7.994 8.317 8.739 9.149 9.563 10.062 10.52 10.949 11.445 11.986 12.509 13.085 13.702 14.398 15.131 15.929 16.891 17.866 18.969 20.173 21.559 23.083 24.846 26.994 29.508 31.45 32.532 33.072 33.329 33.438 33.404 33.311 33.192 33.036 32.831 32.607 32.371 32.132 31.905 31.689 31.479 31.275 31.064 30.83 30.588 30.363 30.115 29.855 29.65 29.436 29.209 28.976 28.725 28.533 28.332 28.017 27.783 27.539 27.413 27.147 26.87 26.572 26.408 25.979 25.88 25.68 25.458 24.99 24.721 24.428 24.112 23.729 23.295 22.727 20.788 -3 ,22613 ,KEBNE ,16692146,Thu Nov 25 17:27:21 CET,Thu Nov 25 19:00:26 CET,0.0 0.662 1.033 1.367 1.656 1.908 2.157 2.382 2.78 2.975 3.169 3.267 3.749 3.936 4.29 4.63 4.959 5.115 5.411 5.698 6.13 6.403 6.666 7.033 7.383 7.739 8.081 8.412 8.841 9.239 9.627 10.112 10.565 10.989 11.477 12.046 12.607 13.195 13.808 14.46 15.141 15.937 16.863 17.766 18.806 19.979 21.328 22.783 24.543 26.649 29.081 31.055 32.157 32.771 33.098 33.252 33.278 33.169 33.024 32.852 32.642 32.431 32.227 32.017 31.784 31.55 31.31 31.076 30.847 30.594 30.336 30.141 29.921 29.662 29.456 29.235 29.006 28.766 28.507 28.324 28.128 27.797 27.57 27.34 27.214 26.949 26.683 26.379 26.212 25.787 25.675 25.473 25.263 24.819 24.58 24.311 23.998 23.648 23.237 22.693 20.288 -4 ,11963 ,KEBNE ,16692147,Thu Nov 25 17:28:24 CET,Thu Nov 25 19:04:36 CET,0.0 0.984 1.496 1.904 2.233 2.549 2.816 3.049 3.48 3.673 3.862 3.936 4.4 4.563 4.876 5.182 5.472 5.616 5.891 6.156 6.557 6.815 7.063 7.426 7.781 8.129 8.458 8.768 9.178 9.583 9.979 10.449 10.887 11.32 11.827 12.388 12.937 13.52 14.14 14.794 15.447 16.207 17.117 18.012 19.07 20.265 21.655 23.222 25.008 27.066 29.51 31.474 32.586 33.215 33.474 33.585 33.615 33.531 33.382 33.181 32.974 32.784 32.594 32.396 32.176 31.955 31.731 31.495 31.267 31.022 30.777 30.569 30.329 30.066 29.855 29.641 29.425 29.195 28.929 28.739 28.547 28.232 28.0 27.756 27.626 27.347 27.068 26.763 26.602 26.173 26.06 25.862 25.656 25.184 24.921 24.638 24.308 23.923 23.471 22.913 20.996 -5 ,7012 ,KEBNE ,16692148,Thu Nov 25 17:29:26 CET,Thu Nov 25 19:00:43 CET,0.0 0.805 1.211 1.566 1.903 2.21 2.499 2.777 3.276 3.486 3.677 3.752 4.225 4.403 4.75 5.077 5.375 5.52 5.814 6.103 6.524 6.797 7.063 7.44 7.812 8.178 8.52 8.842 9.256 9.668 10.079 10.566 11.026 11.471 11.985 12.548 13.077 13.675 14.32 14.957 15.607 16.395 17.35 18.267 19.297 20.451 21.775 23.245 24.994 27.062 29.526 31.454 32.495 33.076 33.358 33.462 33.436 33.332 33.197 32.997 32.811 32.636 32.422 32.182 31.955 31.726 31.452 31.221 31.025 30.806 30.55 30.308 30.045 29.793 29.624 29.466 29.27 29.015 28.745 28.554 28.359 28.051 27.83 27.593 27.469 27.203 26.9 26.57 26.409 25.995 25.896 25.683 25.47 24.982 24.702 24.411 24.086 23.706 23.232 22.61 20.913 -6 ,4543 ,KEBNE ,16692149,Thu Nov 25 17:29:26 CET,Thu Nov 25 19:02:45 CET,0.0 0.764 1.17 1.496 1.77 2.018 2.249 2.464 2.887 3.082 3.264 3.333 3.801 3.968 4.292 4.592 4.884 5.025 5.292 5.552 5.937 6.196 6.442 6.802 7.156 7.483 7.79 8.089 8.489 8.889 9.285 9.764 10.237 10.699 11.216 11.793 12.36 12.991 13.673 14.352 15.051 15.879 16.863 17.826 18.882 20.074 21.416 22.873 24.616 26.656 29.107 31.126 32.202 32.681 32.914 33.035 33.02 32.906 32.737 32.524 32.321 32.102 31.873 31.666 31.457 31.229 30.968 30.735 30.536 30.31 30.038 29.795 29.548 29.278 29.056 28.835 28.613 28.377 28.128 27.942 27.739 27.431 27.209 26.97 26.845 26.573 26.284 25.997 25.833 25.382 25.252 25.047 24.829 24.383 24.128 23.832 23.518 23.18 22.74 22.15 20.525 -7 ,18673 ,KEBNE ,16692150,Thu Nov 25 17:29:26 CET,Thu Nov 25 19:06:58 CET,0.0 0.562 0.95 1.244 1.519 1.786 2.044 2.285 2.717 2.922 3.118 3.211 3.688 3.87 4.225 4.571 4.888 5.035 5.33 5.625 6.046 6.313 6.573 6.959 7.325 7.668 8.005 8.33 8.749 9.159 9.552 10.007 10.447 10.891 11.405 11.98 12.529 13.138 13.797 14.485 15.199 15.981 16.876 17.78 18.831 19.993 21.324 22.784 24.531 26.673 29.136 31.054 32.1 32.705 33.022 33.092 33.051 32.949 32.821 32.657 32.478 32.293 32.091 31.896 31.682 31.44 31.159 30.902 30.678 30.426 30.168 29.967 29.723 29.43 29.208 28.985 28.747 28.492 28.243 28.077 27.897 27.597 27.383 27.154 27.03 26.763 26.483 26.196 26.044 25.613 25.504 25.309 25.104 24.627 24.348 24.049 23.717 23.327 22.888 22.279 20.616 -8 ,1362 ,KEBNE ,16692151,Thu Nov 25 17:29:26 CET,Thu Nov 25 19:01:51 CET,0.0 0.643 1.03 1.357 1.641 1.908 2.153 2.379 2.792 2.988 3.174 3.231 3.692 3.855 4.174 4.482 4.785 4.933 5.23 5.514 5.91 6.174 6.421 6.77 7.133 7.477 7.805 8.13 8.542 8.929 9.297 9.776 10.259 10.703 11.21 11.754 12.274 12.89 13.556 14.245 14.945 15.738 16.694 17.602 18.631 19.808 21.197 22.744 24.486 26.573 29.087 31.004 32.047 32.616 32.886 33.012 33.062 33.031 32.907 32.685 32.456 32.237 31.996 31.755 31.511 31.264 30.985 30.73 30.502 30.271 30.024 29.788 29.52 29.244 29.035 28.8 28.552 28.305 28.031 27.846 27.662 27.353 27.129 26.891 26.76 26.496 26.226 25.926 25.751 25.318 25.225 25.024 24.814 24.332 24.062 23.777 23.466 23.113 22.656 22.052 20.21 -9 ,24752 ,KEBNE ,16692152,Thu Nov 25 17:29:26 CET,Thu Nov 25 19:02:56 CET,0.0 0.655 1.009 1.348 1.642 1.901 2.146 2.384 2.852 3.069 3.273 3.383 3.865 4.047 4.397 4.734 5.057 5.216 5.518 5.804 6.217 6.468 6.722 7.109 7.465 7.805 8.138 8.475 8.906 9.306 9.695 10.181 10.656 11.097 11.614 12.204 12.743 13.327 13.977 14.639 15.343 16.172 17.123 18.099 19.236 20.44 21.827 23.435 25.237 27.271 29.695 31.522 32.496 33.041 33.276 33.382 33.404 33.323 33.192 33.029 32.84 32.64 32.444 32.234 32.011 31.8 31.558 31.309 31.071 30.819 30.567 30.358 30.121 29.854 29.643 29.42 29.2 28.974 28.703 28.512 28.328 28.019 27.777 27.529 27.408 27.148 26.86 26.552 26.394 25.964 25.858 25.657 25.437 24.963 24.72 24.459 24.152 23.816 23.421 22.854 21.116 -10 ,2647 ,KEBNE ,16692153,Thu Nov 25 17:29:26 CET,Thu Nov 25 19:01:06 CET,0.0 0.54 0.915 1.257 1.549 1.801 2.034 2.251 2.672 2.874 3.065 3.125 3.592 3.76 4.07 4.365 4.664 4.816 5.105 5.385 5.808 6.073 6.337 6.727 7.08 7.423 7.767 8.099 8.516 8.918 9.318 9.818 10.297 10.722 11.193 11.748 12.258 12.803 13.42 14.058 14.719 15.494 16.42 17.365 18.45 19.616 20.943 22.377 24.088 26.167 28.63 30.553 31.648 32.225 32.449 32.557 32.536 32.441 32.322 32.112 31.892 31.663 31.431 31.176 30.933 30.719 30.455 30.207 29.986 29.735 29.466 29.251 29.006 28.735 28.538 28.34 28.11 27.868 27.64 27.459 27.251 26.925 26.698 26.475 26.356 26.09 25.808 25.517 25.36 24.931 24.846 24.658 24.452 24.006 23.759 23.461 23.13 22.781 22.382 21.843 20.028 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt deleted file mode 100644 index 9f898f7e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-54_ejm-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21234 ,KEBNE ,16692154,Thu Nov 25 17:30:29 CET,Thu Nov 25 19:02:57 CET,0.0 1.077 1.567 1.974 2.316 2.622 2.921 3.192 3.673 3.91 4.142 4.277 4.766 4.966 5.358 5.728 6.078 6.247 6.572 6.887 7.346 7.637 7.917 8.332 8.739 9.13 9.51 9.882 10.36 10.829 11.28 11.81 12.334 12.836 13.385 14.012 14.634 15.33 16.092 16.892 17.75 18.725 19.877 21.047 22.391 23.89 25.669 27.708 30.081 32.908 36.339 39.223 40.95 42.023 42.76 43.285 43.6 43.732 43.782 43.811 43.768 43.675 43.578 43.458 43.29 43.141 42.994 42.841 42.685 42.497 42.296 42.144 41.991 41.808 41.651 41.48 41.3 41.112 40.901 40.752 40.601 40.357 40.169 39.963 39.855 39.627 39.384 39.128 38.994 38.604 38.564 38.408 38.231 37.823 37.6 37.356 37.089 36.782 36.397 35.932 35.111 -2 ,5036 ,KEBNE ,16692155,Thu Nov 25 17:30:29 CET,Thu Nov 25 19:03:33 CET,0.0 1.122 1.665 2.073 2.414 2.737 3.033 3.309 3.849 4.096 4.321 4.467 4.966 5.164 5.543 5.902 6.249 6.416 6.733 7.048 7.507 7.803 8.098 8.532 8.935 9.324 9.704 10.066 10.517 10.951 11.375 11.888 12.416 12.931 13.521 14.21 14.854 15.55 16.324 17.123 17.931 18.863 19.98 21.099 22.406 23.848 25.534 27.495 29.848 32.712 36.262 39.231 40.98 42.136 42.914 43.452 43.78 43.981 44.125 44.171 44.131 44.067 43.982 43.871 43.748 43.613 43.457 43.304 43.146 42.978 42.795 42.626 42.437 42.227 42.053 41.861 41.664 41.469 41.258 41.115 40.96 40.699 40.517 40.324 40.224 40.002 39.764 39.524 39.399 39.01 38.951 38.788 38.623 38.26 38.044 37.805 37.556 37.284 36.937 36.472 35.033 -3 ,18377 ,KEBNE ,16692156,Thu Nov 25 17:31:32 CET,Thu Nov 25 19:04:20 CET,0.0 0.884 1.369 1.763 2.128 2.483 2.814 3.123 3.693 3.956 4.197 4.357 4.862 5.07 5.462 5.822 6.17 6.345 6.68 6.995 7.449 7.744 8.03 8.451 8.862 9.259 9.64 10.003 10.493 10.967 11.396 11.915 12.453 13.001 13.613 14.278 14.937 15.645 16.391 17.187 18.029 19.014 20.162 21.284 22.594 24.04 25.683 27.559 29.906 32.822 36.408 39.37 41.109 42.204 42.882 43.345 43.623 43.72 43.766 43.811 43.759 43.655 43.513 43.371 43.23 43.068 42.899 42.765 42.651 42.5 42.321 42.166 41.985 41.775 41.607 41.437 41.255 41.067 40.877 40.735 40.575 40.332 40.16 39.957 39.841 39.604 39.36 39.097 38.963 38.57 38.519 38.357 38.182 37.773 37.539 37.3 37.043 36.752 36.408 35.959 35.073 -4 ,22011 ,KEBNE ,16692157,Thu Nov 25 17:31:32 CET,Thu Nov 25 19:06:22 CET,0.0 0.914 1.454 1.891 2.253 2.572 2.858 3.124 3.639 3.884 4.113 4.245 4.729 4.915 5.291 5.656 5.997 6.161 6.48 6.793 7.242 7.528 7.817 8.238 8.644 9.041 9.424 9.793 10.271 10.738 11.19 11.736 12.273 12.793 13.382 14.037 14.668 15.372 16.105 16.879 17.716 18.644 19.724 20.873 22.237 23.735 25.475 27.464 29.785 32.557 36.063 39.061 40.815 41.911 42.643 43.129 43.393 43.493 43.551 43.576 43.538 43.454 43.333 43.233 43.14 43.008 42.845 42.681 42.52 42.357 42.166 42.003 41.843 41.666 41.517 41.36 41.185 40.989 40.776 40.624 40.458 40.181 39.993 39.808 39.712 39.492 39.25 39.013 38.889 38.502 38.45 38.283 38.099 37.671 37.441 37.195 36.92 36.619 36.27 35.814 34.558 -5 ,1940 ,KEBNE ,16692158,Thu Nov 25 17:31:32 CET,Thu Nov 25 19:04:26 CET,0.0 1.017 1.538 1.942 2.317 2.647 2.935 3.205 3.702 3.936 4.161 4.3 4.798 4.999 5.379 5.723 6.064 6.236 6.566 6.882 7.33 7.62 7.908 8.34 8.76 9.149 9.517 9.89 10.374 10.83 11.28 11.836 12.379 12.892 13.456 14.099 14.746 15.47 16.232 17.017 17.852 18.804 19.941 21.084 22.382 23.832 25.532 27.516 29.913 32.741 36.239 39.248 41.068 42.196 42.878 43.324 43.597 43.795 43.906 43.92 43.893 43.84 43.765 43.689 43.579 43.467 43.323 43.137 42.956 42.784 42.593 42.405 42.209 42.012 41.857 41.675 41.476 41.282 41.085 40.937 40.777 40.509 40.308 40.108 40.001 39.772 39.54 39.303 39.175 38.78 38.717 38.55 38.373 37.96 37.727 37.482 37.225 36.923 36.532 36.053 34.856 -6 ,24660 ,KEBNE ,16692159,Thu Nov 25 17:31:32 CET,Thu Nov 25 19:03:01 CET,0.0 0.848 1.368 1.755 2.083 2.408 2.702 2.969 3.439 3.666 3.894 4.032 4.529 4.726 5.105 5.472 5.821 5.988 6.307 6.621 7.066 7.35 7.638 8.067 8.477 8.874 9.265 9.626 10.083 10.538 10.977 11.516 12.049 12.561 13.127 13.756 14.397 15.1 15.842 16.632 17.464 18.419 19.525 20.611 21.937 23.459 25.175 27.157 29.499 32.247 35.617 38.548 40.337 41.489 42.253 42.772 43.103 43.27 43.348 43.371 43.341 43.28 43.175 43.05 42.937 42.832 42.696 42.543 42.401 42.255 42.103 41.955 41.775 41.576 41.42 41.257 41.089 40.913 40.721 40.573 40.409 40.136 39.939 39.736 39.628 39.397 39.155 38.895 38.753 38.353 38.3 38.135 37.958 37.602 37.394 37.157 36.898 36.578 36.179 35.72 34.726 -7 ,7666 ,KEBNE ,16692160,Thu Nov 25 17:31:35 CET,Thu Nov 25 19:02:16 CET,0.0 1.157 1.599 1.99 2.367 2.711 3.018 3.294 3.796 4.028 4.252 4.403 4.899 5.097 5.466 5.824 6.177 6.349 6.667 6.966 7.409 7.707 8.01 8.457 8.88 9.267 9.643 10.017 10.49 10.953 11.405 11.929 12.428 12.916 13.471 14.078 14.68 15.368 16.122 16.938 17.802 18.771 19.881 20.969 22.255 23.698 25.366 27.292 29.62 32.493 36.039 39.017 40.805 41.933 42.634 43.096 43.403 43.621 43.734 43.795 43.775 43.692 43.58 43.447 43.305 43.153 43.006 42.873 42.731 42.576 42.388 42.224 42.048 41.844 41.676 41.497 41.307 41.102 40.894 40.751 40.599 40.345 40.16 39.969 39.87 39.65 39.419 39.184 39.042 38.642 38.582 38.406 38.23 37.838 37.618 37.404 37.149 36.809 36.417 35.963 34.996 -8 ,4610 ,KEBNE ,16692161,Thu Nov 25 17:31:31 CET,Thu Nov 25 19:05:25 CET,0.0 1.105 1.585 1.969 2.292 2.581 2.869 3.164 3.717 3.955 4.175 4.304 4.794 4.994 5.387 5.765 6.116 6.286 6.612 6.916 7.361 7.66 7.947 8.354 8.75 9.132 9.509 9.891 10.386 10.858 11.308 11.845 12.336 12.811 13.393 14.063 14.706 15.404 16.154 16.953 17.813 18.79 19.904 20.987 22.296 23.784 25.502 27.47 29.79 32.585 36.088 39.102 40.853 41.926 42.627 43.101 43.392 43.575 43.649 43.652 43.604 43.521 43.417 43.258 43.085 42.924 42.738 42.565 42.407 42.234 42.034 41.854 41.653 41.431 41.261 41.085 40.898 40.693 40.494 40.355 40.196 39.942 39.764 39.58 39.485 39.264 39.005 38.715 38.563 38.159 38.098 37.933 37.763 37.409 37.197 36.955 36.685 36.383 36.018 35.528 34.322 -9 ,20843 ,KEBNE ,16692162,Thu Nov 25 17:31:32 CET,Thu Nov 25 19:04:51 CET,0.0 1.053 1.576 1.983 2.358 2.7 2.986 3.244 3.734 3.965 4.192 4.334 4.827 5.029 5.431 5.805 6.157 6.325 6.654 6.977 7.443 7.737 8.026 8.455 8.852 9.225 9.605 9.976 10.446 10.897 11.319 11.836 12.341 12.845 13.45 14.117 14.758 15.459 16.207 17.001 17.837 18.802 19.95 21.109 22.475 23.976 25.664 27.569 29.878 32.711 36.227 39.233 41.02 42.141 42.864 43.351 43.649 43.801 43.873 43.88 43.832 43.772 43.696 43.59 43.476 43.344 43.165 42.991 42.83 42.652 42.458 42.284 42.113 41.936 41.773 41.589 41.395 41.188 40.97 40.827 40.682 40.416 40.218 40.001 39.888 39.677 39.452 39.202 39.064 38.667 38.578 38.393 38.211 37.814 37.608 37.377 37.123 36.823 36.43 35.933 34.54 -10 ,24701 ,KEBNE ,16692163,Thu Nov 25 17:31:31 CET,Thu Nov 25 19:05:07 CET,0.0 1.09 1.601 1.968 2.306 2.642 2.933 3.206 3.741 3.984 4.208 4.333 4.823 5.028 5.412 5.77 6.103 6.268 6.601 6.924 7.398 7.7 7.994 8.43 8.858 9.268 9.651 10.014 10.475 10.924 11.363 11.898 12.412 12.905 13.475 14.123 14.751 15.438 16.159 16.904 17.687 18.599 19.675 20.743 22.008 23.47 25.182 27.168 29.517 32.302 35.819 38.797 40.582 41.739 42.506 42.991 43.245 43.355 43.362 43.329 43.275 43.192 43.076 42.948 42.802 42.652 42.492 42.31 42.128 41.94 41.724 41.549 41.386 41.202 41.042 40.862 40.667 40.458 40.227 40.063 39.903 39.644 39.451 39.257 39.156 38.937 38.701 38.423 38.271 37.87 37.811 37.651 37.477 37.069 36.845 36.621 36.367 36.069 35.712 35.287 34.218 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt deleted file mode 100644 index ed2fc4c4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_ejm-55_ejm-31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7366 ,KEBNE ,16692164,Thu Nov 25 17:31:32 CET,Thu Nov 25 19:02:07 CET,0.0 0.562 0.898 1.181 1.443 1.683 1.91 2.138 2.586 2.788 2.981 3.081 3.533 3.7 4.008 4.291 4.577 4.721 4.983 5.231 5.596 5.842 6.088 6.427 6.728 7.006 7.29 7.573 7.922 8.273 8.625 9.037 9.43 9.808 10.234 10.703 11.142 11.598 12.087 12.608 13.161 13.786 14.467 15.148 15.975 16.858 17.879 19.023 20.253 21.516 22.894 23.803 24.114 24.143 23.946 23.652 23.344 22.966 22.622 22.268 21.905 21.54 21.134 20.72 20.354 20.011 19.623 19.267 18.953 18.626 18.266 17.953 17.655 17.348 17.082 16.809 16.525 16.218 15.9 15.688 15.472 15.12 14.86 14.576 14.429 14.119 13.8 13.471 13.294 12.849 12.737 12.535 12.312 11.805 11.536 11.252 10.939 10.594 10.156 9.581 8.33 -2 ,21302 ,KEBNE ,16692165,Thu Nov 25 17:32:35 CET,Thu Nov 25 19:02:35 CET,0.0 0.826 1.199 1.526 1.825 2.088 2.323 2.53 2.91 3.087 3.262 3.323 3.754 3.905 4.192 4.472 4.748 4.879 5.128 5.366 5.715 5.943 6.165 6.472 6.774 7.083 7.38 7.673 8.058 8.42 8.771 9.197 9.593 9.972 10.42 10.93 11.404 11.903 12.438 12.995 13.595 14.259 14.993 15.711 16.501 17.367 18.325 19.395 20.612 21.872 23.242 24.146 24.452 24.484 24.371 24.125 23.801 23.422 23.064 22.707 22.357 22.011 21.666 21.331 21.033 20.744 20.387 20.036 19.72 19.393 19.072 18.806 18.515 18.206 17.962 17.71 17.451 17.175 16.881 16.672 16.458 16.127 15.896 15.647 15.511 15.233 14.959 14.666 14.507 14.073 13.982 13.797 13.603 13.175 12.944 12.709 12.454 12.125 11.746 11.297 10.174 -3 ,25137 ,KEBNE ,16692166,Thu Nov 25 17:32:34 CET,Thu Nov 25 19:03:27 CET,0.0 0.59 0.955 1.247 1.5 1.738 1.976 2.195 2.583 2.766 2.943 2.986 3.413 3.564 3.873 4.184 4.49 4.638 4.934 5.22 5.606 5.845 6.077 6.423 6.754 7.062 7.36 7.646 8.023 8.383 8.715 9.105 9.504 9.896 10.326 10.824 11.303 11.8 12.308 12.829 13.401 14.081 14.829 15.547 16.371 17.291 18.336 19.457 20.703 22.068 23.483 24.346 24.592 24.578 24.402 24.113 23.775 23.405 23.063 22.716 22.419 22.144 21.83 21.477 21.135 20.816 20.475 20.184 19.923 19.629 19.323 19.049 18.743 18.428 18.187 17.938 17.679 17.404 17.103 16.893 16.682 16.351 16.131 15.895 15.764 15.496 15.204 14.88 14.718 14.288 14.18 13.979 13.773 13.338 13.092 12.823 12.515 12.18 11.833 11.421 10.118 -4 ,5790 ,KEBNE ,16692167,Thu Nov 25 17:32:35 CET,Thu Nov 25 19:06:23 CET,0.0 0.561 0.934 1.251 1.528 1.785 2.02 2.225 2.612 2.795 2.969 3.025 3.462 3.614 3.899 4.169 4.43 4.558 4.812 5.061 5.413 5.636 5.858 6.167 6.477 6.792 7.092 7.376 7.714 8.057 8.394 8.777 9.133 9.481 9.899 10.354 10.779 11.246 11.76 12.316 12.876 13.488 14.182 14.884 15.741 16.677 17.683 18.735 19.902 21.177 22.583 23.478 23.734 23.748 23.629 23.374 23.052 22.716 22.376 22.032 21.708 21.362 21.016 20.667 20.305 19.969 19.63 19.314 19.024 18.715 18.386 18.107 17.828 17.537 17.304 17.052 16.777 16.505 16.231 16.037 15.835 15.516 15.292 15.056 14.933 14.669 14.379 14.073 13.902 13.464 13.381 13.186 12.981 12.533 12.284 12.026 11.75 11.458 11.107 10.596 9.371 -5 ,17802 ,KEBNE ,16692168,Thu Nov 25 17:32:35 CET,Thu Nov 25 19:07:14 CET,0.0 0.542 0.952 1.313 1.647 1.95 2.21 2.445 2.89 3.097 3.298 3.408 3.87 4.045 4.366 4.667 4.962 5.105 5.384 5.663 6.065 6.309 6.541 6.875 7.199 7.502 7.802 8.093 8.447 8.788 9.125 9.538 9.931 10.3 10.723 11.206 11.662 12.162 12.687 13.23 13.807 14.444 15.169 15.927 16.794 17.699 18.683 19.753 20.95 22.255 23.66 24.477 24.764 24.789 24.587 24.307 24.019 23.721 23.44 23.12 22.795 22.46 22.115 21.779 21.467 21.178 20.851 20.526 20.237 19.931 19.62 19.354 19.063 18.762 18.524 18.269 18.005 17.73 17.433 17.232 17.019 16.683 16.451 16.203 16.074 15.802 15.513 15.213 15.054 14.625 14.52 14.324 14.129 13.7 13.459 13.205 12.926 12.624 12.309 11.905 11.029 -6 ,354 ,KEBNE ,16692169,Thu Nov 25 17:33:37 CET,Thu Nov 25 19:06:50 CET,0.0 0.909 1.42 1.781 2.093 2.393 2.658 2.9 3.367 3.575 3.763 3.841 4.293 4.467 4.795 5.109 5.407 5.552 5.829 6.089 6.474 6.712 6.945 7.301 7.639 7.956 8.257 8.553 8.947 9.312 9.644 10.032 10.413 10.781 11.196 11.653 12.103 12.599 13.09 13.599 14.135 14.724 15.429 16.168 17.004 17.909 18.91 19.966 21.105 22.411 23.861 24.78 25.108 25.145 25.034 24.82 24.509 24.125 23.773 23.37 23.005 22.655 22.26 21.916 21.618 21.315 20.97 20.652 20.375 20.08 19.758 19.483 19.199 18.9 18.662 18.402 18.124 17.851 17.558 17.349 17.138 16.802 16.565 16.333 16.208 15.932 15.652 15.352 15.19 14.754 14.659 14.474 14.272 13.844 13.614 13.336 13.015 12.654 12.241 11.727 10.829 -7 ,5341 ,KEBNE ,16692170,Thu Nov 25 17:33:37 CET,Thu Nov 25 19:03:53 CET,0.0 0.559 0.926 1.23 1.5 1.74 1.969 2.181 2.555 2.74 2.925 2.986 3.423 3.574 3.864 4.147 4.413 4.534 4.769 5.004 5.339 5.552 5.769 6.091 6.39 6.675 6.962 7.234 7.565 7.895 8.223 8.606 8.971 9.315 9.712 10.168 10.609 11.109 11.639 12.176 12.713 13.346 14.098 14.789 15.585 16.468 17.445 18.535 19.756 21.059 22.463 23.361 23.69 23.761 23.651 23.435 23.191 22.882 22.543 22.169 21.821 21.508 21.215 20.923 20.63 20.327 19.968 19.637 19.344 19.044 18.749 18.493 18.205 17.901 17.658 17.392 17.121 16.842 16.537 16.33 16.112 15.778 15.549 15.301 15.18 14.929 14.645 14.346 14.19 13.768 13.678 13.49 13.301 12.889 12.648 12.38 12.098 11.786 11.389 10.915 9.846 -8 ,12791 ,KEBNE ,16692171,Thu Nov 25 17:33:37 CET,Thu Nov 25 19:06:25 CET,0.0 0.593 0.968 1.267 1.527 1.769 1.99 2.205 2.602 2.784 2.967 3.024 3.454 3.607 3.902 4.19 4.464 4.594 4.84 5.072 5.42 5.649 5.877 6.197 6.492 6.784 7.076 7.356 7.708 8.05 8.386 8.786 9.171 9.56 10.001 10.469 10.943 11.481 12.035 12.597 13.17 13.801 14.521 15.222 16.032 16.91 17.895 18.995 20.211 21.507 22.865 23.77 24.084 24.094 23.973 23.75 23.454 23.117 22.766 22.352 21.994 21.685 21.366 21.059 20.752 20.463 20.139 19.823 19.561 19.313 19.039 18.779 18.512 18.215 17.974 17.734 17.467 17.177 16.88 16.67 16.458 16.144 15.911 15.655 15.524 15.245 14.953 14.646 14.488 14.063 13.98 13.789 13.584 13.146 12.9 12.634 12.345 12.026 11.649 11.156 9.936 -9 ,10050 ,KEBNE ,16692172,Thu Nov 25 17:33:37 CET,Thu Nov 25 19:03:55 CET,0.0 0.467 0.82 1.105 1.345 1.585 1.818 2.024 2.398 2.576 2.751 2.804 3.24 3.398 3.695 3.973 4.246 4.379 4.631 4.873 5.224 5.443 5.656 5.981 6.295 6.582 6.855 7.132 7.492 7.832 8.153 8.535 8.917 9.301 9.743 10.233 10.692 11.194 11.751 12.334 12.917 13.595 14.389 15.138 16.008 16.961 18.025 19.174 20.457 21.824 23.208 24.092 24.393 24.38 24.196 23.931 23.612 23.27 22.946 22.606 22.29 21.947 21.577 21.251 20.94 20.629 20.31 20.026 19.748 19.44 19.132 18.868 18.581 18.275 18.041 17.8 17.557 17.303 17.016 16.814 16.609 16.276 16.04 15.786 15.647 15.364 15.065 14.759 14.6 14.168 14.076 13.892 13.693 13.241 12.984 12.713 12.426 12.081 11.666 11.185 10.152 -10 ,13362 ,KEBNE ,16692173,Thu Nov 25 17:33:37 CET,Thu Nov 25 19:05:31 CET,0.0 0.734 1.059 1.323 1.575 1.812 2.032 2.249 2.641 2.819 2.992 3.047 3.483 3.637 3.93 4.207 4.475 4.611 4.883 5.144 5.531 5.782 6.018 6.375 6.728 7.053 7.363 7.654 8.011 8.354 8.699 9.132 9.54 9.928 10.376 10.886 11.372 11.863 12.362 12.88 13.407 13.994 14.687 15.403 16.222 17.113 18.111 19.159 20.317 21.594 22.978 23.838 24.114 24.137 23.999 23.772 23.461 23.121 22.815 22.469 22.154 21.875 21.573 21.218 20.851 20.519 20.193 19.918 19.653 19.361 19.063 18.793 18.503 18.211 17.98 17.741 17.485 17.202 16.918 16.729 16.526 16.189 15.949 15.707 15.584 15.322 15.043 14.738 14.582 14.158 14.067 13.885 13.699 13.274 13.023 12.751 12.443 12.11 11.752 11.298 10.314 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index 74ba2f76..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7381 ,KEBNE ,16692175,Thu Nov 25 17:34:40 CET,Thu Nov 25 19:06:45 CET,0.0 0.996 1.486 1.839 2.119 2.368 2.602 2.82 3.217 3.416 3.605 3.711 4.132 4.289 4.606 4.925 5.221 5.359 5.617 5.865 6.219 6.444 6.665 6.993 7.313 7.619 7.908 8.186 8.533 8.871 9.208 9.607 9.979 10.327 10.74 11.205 11.635 12.104 12.61 13.142 13.706 14.301 14.939 15.596 16.341 17.11 17.969 18.897 19.953 21.087 22.162 22.724 22.886 22.826 22.611 22.256 21.885 21.548 21.202 20.794 20.414 20.075 19.712 19.333 18.974 18.66 18.346 18.036 17.739 17.415 17.073 16.79 16.493 16.169 15.918 15.654 15.373 15.103 14.822 14.617 14.4 14.068 13.835 13.572 13.434 13.154 12.863 12.564 12.402 11.99 11.88 11.691 11.495 11.09 10.852 10.581 10.293 9.974 9.591 9.076 7.878 -2 ,8863 ,KEBNE ,16692176,Thu Nov 25 17:34:40 CET,Thu Nov 25 19:08:40 CET,0.0 0.818 1.284 1.626 1.921 2.195 2.443 2.675 3.121 3.34 3.548 3.702 4.16 4.358 4.695 4.986 5.256 5.386 5.642 5.896 6.269 6.508 6.732 7.048 7.343 7.634 7.914 8.18 8.529 8.863 9.199 9.593 9.972 10.343 10.755 11.213 11.65 12.131 12.656 13.197 13.72 14.268 14.905 15.582 16.386 17.198 18.03 18.911 19.866 20.857 21.825 22.368 22.418 22.193 21.905 21.575 21.175 20.767 20.436 20.109 19.8 19.468 19.111 18.744 18.397 18.06 17.689 17.373 17.097 16.802 16.482 16.203 15.915 15.608 15.369 15.12 14.843 14.549 14.237 14.024 13.821 13.507 13.27 13.018 12.892 12.628 12.341 12.028 11.864 11.453 11.314 11.111 10.899 10.432 10.188 9.936 9.636 9.272 8.853 8.342 7.266 -3 ,8501 ,KEBNE ,16692177,Thu Nov 25 17:34:40 CET,Thu Nov 25 19:07:59 CET,0.0 0.821 1.24 1.595 1.915 2.202 2.477 2.718 3.135 3.344 3.538 3.632 4.046 4.202 4.508 4.81 5.108 5.25 5.525 5.784 6.139 6.359 6.581 6.927 7.256 7.557 7.845 8.125 8.488 8.828 9.145 9.544 9.947 10.32 10.746 11.194 11.6 12.065 12.548 13.043 13.561 14.159 14.84 15.508 16.25 17.035 17.976 18.985 20.025 21.16 22.327 22.942 23.024 22.871 22.601 22.256 21.888 21.485 21.122 20.732 20.386 20.052 19.676 19.336 19.039 18.732 18.372 18.039 17.755 17.463 17.14 16.866 16.578 16.271 16.034 15.795 15.538 15.259 14.959 14.747 14.533 14.2 13.965 13.718 13.593 13.338 13.064 12.748 12.577 12.168 12.041 11.844 11.642 11.185 10.938 10.678 10.385 10.058 9.655 9.139 7.9 -4 ,6855 ,KEBNE ,16692178,Thu Nov 25 17:35:43 CET,Thu Nov 25 19:09:14 CET,0.0 0.809 1.215 1.57 1.883 2.151 2.396 2.634 3.083 3.292 3.489 3.584 3.996 4.159 4.463 4.762 5.058 5.197 5.457 5.716 6.09 6.32 6.546 6.871 7.178 7.474 7.744 8.01 8.363 8.688 9.005 9.403 9.762 10.078 10.461 10.917 11.355 11.822 12.32 12.857 13.398 13.988 14.683 15.352 16.084 16.871 17.745 18.68 19.684 20.772 21.866 22.494 22.581 22.41 22.14 21.805 21.423 20.988 20.58 20.148 19.757 19.41 19.057 18.684 18.351 18.061 17.721 17.4 17.116 16.814 16.489 16.213 15.91 15.582 15.338 15.084 14.818 14.535 14.243 14.046 13.847 13.532 13.303 13.053 12.918 12.626 12.319 12.014 11.846 11.424 11.277 11.076 10.868 10.405 10.158 9.897 9.618 9.312 8.918 8.363 7.248 -5 ,25270 ,KEBNE ,16692179,Thu Nov 25 17:36:45 CET,Thu Nov 25 19:10:36 CET,0.0 0.828 1.24 1.599 1.902 2.175 2.438 2.675 3.116 3.317 3.501 3.597 4.016 4.18 4.491 4.785 5.066 5.2 5.448 5.683 6.033 6.266 6.49 6.813 7.111 7.386 7.665 7.944 8.284 8.598 8.915 9.291 9.643 9.998 10.405 10.828 11.234 11.695 12.191 12.73 13.276 13.845 14.51 15.125 15.789 16.528 17.372 18.29 19.319 20.427 21.553 22.141 22.189 22.035 21.773 21.415 21.032 20.655 20.304 19.916 19.544 19.192 18.84 18.486 18.114 17.758 17.4 17.083 16.795 16.478 16.145 15.864 15.569 15.268 15.018 14.757 14.496 14.218 13.934 13.736 13.524 13.189 12.954 12.703 12.571 12.303 12.003 11.668 11.504 11.09 10.932 10.731 10.536 10.121 9.87 9.585 9.278 8.945 8.535 8.002 6.859 -6 ,1681 ,KEBNE ,16692180,Thu Nov 25 17:35:43 CET,Thu Nov 25 19:10:45 CET,0.0 0.523 0.913 1.25 1.562 1.836 2.083 2.322 2.755 2.946 3.123 3.202 3.617 3.779 4.092 4.388 4.656 4.788 5.054 5.315 5.687 5.921 6.139 6.452 6.762 7.049 7.329 7.612 7.974 8.32 8.66 9.07 9.46 9.827 10.236 10.677 11.109 11.587 12.09 12.623 13.181 13.798 14.472 15.102 15.793 16.552 17.411 18.308 19.294 20.386 21.497 22.141 22.229 22.048 21.807 21.544 21.176 20.792 20.446 20.031 19.664 19.33 18.982 18.627 18.309 18.019 17.683 17.36 17.061 16.731 16.388 16.107 15.805 15.481 15.23 14.98 14.722 14.451 14.16 13.95 13.732 13.388 13.152 12.903 12.769 12.5 12.225 11.928 11.768 11.355 11.217 11.021 10.812 10.338 10.085 9.822 9.522 9.187 8.816 8.351 7.462 -7 ,3091 ,KEBNE ,16692181,Thu Nov 25 17:35:44 CET,Thu Nov 25 19:08:32 CET,0.0 0.678 1.073 1.4 1.681 1.939 2.19 2.424 2.83 3.022 3.209 3.308 3.726 3.888 4.191 4.482 4.767 4.901 5.157 5.413 5.758 5.969 6.179 6.494 6.808 7.119 7.412 7.686 8.018 8.332 8.659 9.064 9.458 9.813 10.211 10.679 11.115 11.591 12.098 12.59 13.118 13.733 14.41 15.056 15.798 16.589 17.434 18.347 19.335 20.418 21.518 22.106 22.129 21.933 21.65 21.318 20.998 20.688 20.356 19.955 19.569 19.198 18.84 18.485 18.132 17.8 17.428 17.085 16.799 16.489 16.16 15.902 15.634 15.339 15.104 14.855 14.61 14.351 14.061 13.856 13.639 13.297 13.06 12.813 12.686 12.427 12.154 11.852 11.686 11.276 11.156 10.966 10.768 10.334 10.096 9.836 9.525 9.152 8.746 8.244 7.28 -8 ,7965 ,KEBNE ,16692182,Thu Nov 25 17:35:43 CET,Thu Nov 25 19:08:59 CET,0.0 0.807 1.249 1.594 1.919 2.222 2.473 2.699 3.113 3.307 3.496 3.592 4.014 4.177 4.47 4.762 5.049 5.186 5.45 5.7 6.051 6.28 6.507 6.832 7.127 7.417 7.711 7.991 8.346 8.693 9.028 9.435 9.837 10.208 10.598 11.036 11.451 11.919 12.435 12.964 13.525 14.137 14.838 15.488 16.211 17.025 17.934 18.872 19.922 21.057 22.182 22.794 22.857 22.672 22.358 21.965 21.578 21.204 20.851 20.506 20.179 19.848 19.503 19.156 18.836 18.558 18.27 17.993 17.732 17.436 17.121 16.841 16.537 16.217 15.962 15.708 15.445 15.172 14.884 14.678 14.457 14.112 13.876 13.628 13.497 13.237 12.957 12.647 12.484 12.073 11.968 11.785 11.591 11.176 10.946 10.686 10.39 10.073 9.704 9.237 8.293 -9 ,30579 ,KEBNE ,16692183,Thu Nov 25 17:36:50 CET,Thu Nov 25 19:09:48 CET,0.0 0.878 1.366 1.721 2.015 2.283 2.528 2.762 3.203 3.406 3.587 3.674 4.088 4.251 4.564 4.858 5.133 5.267 5.54 5.805 6.163 6.394 6.625 6.946 7.263 7.572 7.857 8.125 8.463 8.782 9.105 9.507 9.887 10.252 10.664 11.117 11.559 12.043 12.551 13.065 13.55 14.111 14.806 15.491 16.269 17.086 17.973 18.893 19.88 20.999 22.175 22.761 22.809 22.691 22.461 22.104 21.707 21.33 21.004 20.618 20.219 19.833 19.443 19.066 18.716 18.378 18.003 17.659 17.357 17.044 16.719 16.454 16.163 15.847 15.599 15.335 15.069 14.799 14.512 14.311 14.101 13.749 13.496 13.238 13.109 12.845 12.55 12.241 12.086 11.68 11.561 11.371 11.168 10.74 10.509 10.251 9.967 9.639 9.229 8.712 7.468 -10 ,27339 ,KEBNE ,16692184,Thu Nov 25 17:36:45 CET,Thu Nov 25 19:10:38 CET,0.0 0.839 1.291 1.636 1.935 2.235 2.501 2.733 3.155 3.343 3.532 3.639 4.063 4.233 4.553 4.854 5.13 5.269 5.531 5.772 6.122 6.349 6.577 6.917 7.262 7.608 7.951 8.282 8.664 9.002 9.322 9.712 10.072 10.405 10.807 11.256 11.701 12.189 12.692 13.227 13.779 14.397 15.134 15.851 16.64 17.495 18.431 19.398 20.422 21.495 22.592 23.191 23.256 23.098 22.854 22.547 22.188 21.828 21.48 21.075 20.702 20.352 20.012 19.673 19.338 19.012 18.655 18.331 18.065 17.777 17.451 17.194 16.914 16.589 16.337 16.09 15.843 15.571 15.265 15.043 14.807 14.445 14.201 13.95 13.817 13.538 13.25 12.937 12.773 12.361 12.226 12.021 11.807 11.362 11.11 10.839 10.547 10.208 9.786 9.272 8.111 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt deleted file mode 100644 index 9d3b7979..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24003 ,KEBNE ,16692185,Thu Nov 25 17:45:05 CET,Thu Nov 25 19:16:29 CET,0.0 0.681 1.158 1.529 1.847 2.116 2.357 2.574 2.949 3.121 3.289 3.352 3.754 3.898 4.184 4.456 4.703 4.821 5.059 5.295 5.633 5.846 6.038 6.319 6.597 6.848 7.076 7.292 7.56 7.824 8.093 8.398 8.687 8.968 9.26 9.56 9.855 10.159 10.487 10.846 11.188 11.552 11.955 12.32 12.675 12.968 13.237 13.458 13.527 13.292 12.527 11.226 9.952 8.775 7.732 6.805 5.946 5.091 4.327 3.595 2.983 2.414 1.845 1.295 0.798 0.361 -0.121 -0.577 -0.969 -1.368 -1.792 -2.144 -2.512 -2.909 -3.215 -3.517 -3.821 -4.154 -4.517 -4.756 -4.989 -5.36 -5.629 -5.917 -6.068 -6.397 -6.754 -7.117 -7.297 -7.737 -7.848 -8.07 -8.31 -8.812 -9.079 -9.357 -9.673 -10.034 -10.46 -11.01 -11.986 -2 ,12608 ,KEBNE ,16692186,Thu Nov 25 17:45:05 CET,Thu Nov 25 19:17:51 CET,0.0 0.843 1.27 1.596 1.882 2.153 2.402 2.618 3.011 3.194 3.363 3.432 3.842 3.994 4.28 4.547 4.789 4.909 5.146 5.371 5.682 5.875 6.072 6.345 6.605 6.848 7.076 7.299 7.573 7.845 8.124 8.458 8.743 8.992 9.278 9.614 9.918 10.242 10.569 10.882 11.188 11.492 11.769 12.01 12.344 12.657 12.873 12.996 13.001 12.762 11.971 10.634 9.366 8.215 7.15 6.157 5.318 4.585 3.896 3.124 2.457 1.868 1.306 0.773 0.265 -0.208 -0.708 -1.136 -1.507 -1.917 -2.35 -2.703 -3.067 -3.453 -3.758 -4.084 -4.422 -4.771 -5.118 -5.36 -5.612 -5.995 -6.266 -6.547 -6.695 -7.007 -7.344 -7.705 -7.883 -8.325 -8.452 -8.667 -8.89 -9.373 -9.645 -9.942 -10.279 -10.668 -11.128 -11.7 -12.715 -3 ,29732 ,KEBNE ,16692187,Thu Nov 25 17:54:27 CET,Thu Nov 25 19:26:26 CET,0.0 0.92 1.382 1.733 2.029 2.306 2.54 2.746 3.116 3.292 3.464 3.533 3.928 4.072 4.358 4.612 4.858 4.98 5.202 5.425 5.746 5.939 6.119 6.373 6.631 6.883 7.12 7.346 7.619 7.88 8.136 8.444 8.733 8.994 9.278 9.596 9.897 10.19 10.485 10.816 11.155 11.492 11.84 12.123 12.397 12.643 12.866 13.027 13.006 12.692 11.846 10.537 9.288 8.154 7.122 6.151 5.279 4.434 3.64 2.833 2.153 1.575 1.026 0.512 0.026 -0.431 -0.926 -1.374 -1.762 -2.163 -2.59 -2.947 -3.317 -3.711 -4.017 -4.33 -4.649 -4.982 -5.33 -5.575 -5.829 -6.23 -6.513 -6.811 -6.953 -7.252 -7.587 -7.911 -8.078 -8.525 -8.645 -8.854 -9.077 -9.557 -9.824 -10.109 -10.418 -10.76 -11.159 -11.662 -12.763 -4 ,19067 ,KEBNE ,16692188,Thu Nov 25 17:54:27 CET,Thu Nov 25 19:26:47 CET,0.0 0.671 1.073 1.437 1.757 2.016 2.234 2.443 2.839 3.02 3.191 3.263 3.669 3.822 4.099 4.359 4.618 4.739 4.964 5.185 5.509 5.719 5.916 6.193 6.451 6.699 6.936 7.158 7.437 7.696 7.942 8.236 8.516 8.767 9.054 9.388 9.681 9.969 10.297 10.664 11.034 11.409 11.768 12.072 12.38 12.655 12.879 13.012 12.995 12.76 11.978 10.704 9.465 8.319 7.301 6.37 5.546 4.744 4.009 3.298 2.662 2.061 1.479 0.936 0.443 -0.026 -0.515 -0.97 -1.383 -1.786 -2.201 -2.547 -2.907 -3.291 -3.585 -3.89 -4.218 -4.56 -4.913 -5.171 -5.441 -5.853 -6.133 -6.42 -6.569 -6.888 -7.222 -7.572 -7.754 -8.215 -8.37 -8.586 -8.817 -9.315 -9.592 -9.882 -10.199 -10.556 -10.955 -11.481 -12.693 -5 ,5544 ,KEBNE ,16692189,Thu Nov 25 17:55:30 CET,Thu Nov 25 19:28:19 CET,0.0 0.799 1.243 1.599 1.907 2.18 2.415 2.632 3.024 3.205 3.383 3.459 3.854 4.0 4.281 4.544 4.798 4.923 5.157 5.375 5.68 5.87 6.052 6.312 6.567 6.804 7.031 7.249 7.53 7.792 8.042 8.347 8.616 8.849 9.101 9.376 9.637 9.952 10.286 10.618 10.968 11.32 11.689 12.019 12.358 12.647 12.906 13.111 13.154 12.947 12.155 10.85 9.568 8.435 7.408 6.396 5.492 4.681 3.979 3.252 2.587 1.966 1.382 0.842 0.328 -0.155 -0.665 -1.116 -1.502 -1.909 -2.346 -2.686 -3.031 -3.407 -3.699 -4.003 -4.333 -4.683 -5.022 -5.25 -5.497 -5.911 -6.2 -6.494 -6.65 -6.97 -7.299 -7.637 -7.811 -8.255 -8.384 -8.593 -8.817 -9.295 -9.554 -9.835 -10.142 -10.506 -10.937 -11.442 -12.462 -6 ,3140 ,KEBNE ,16692190,Thu Nov 25 17:56:32 CET,Thu Nov 25 19:29:37 CET,0.0 0.678 1.101 1.455 1.731 1.958 2.183 2.411 2.824 3.006 3.181 3.269 3.674 3.813 4.076 4.337 4.583 4.704 4.92 5.124 5.445 5.646 5.832 6.113 6.364 6.598 6.84 7.066 7.33 7.578 7.837 8.138 8.418 8.684 8.984 9.309 9.581 9.841 10.113 10.407 10.732 11.132 11.52 11.802 12.096 12.397 12.671 12.87 12.931 12.708 11.93 10.579 9.277 8.114 7.043 6.061 5.181 4.389 3.684 2.925 2.276 1.688 1.091 0.526 0.006 -0.47 -1.008 -1.507 -1.89 -2.258 -2.646 -2.981 -3.344 -3.727 -4.016 -4.303 -4.603 -4.922 -5.28 -5.531 -5.785 -6.2 -6.497 -6.798 -6.949 -7.275 -7.614 -7.966 -8.151 -8.598 -8.717 -8.931 -9.159 -9.654 -9.914 -10.175 -10.457 -10.792 -11.225 -11.767 -12.686 -7 ,23566 ,KEBNE ,16692191,Thu Nov 25 17:55:30 CET,Thu Nov 25 19:29:39 CET,0.0 0.707 1.052 1.361 1.671 1.949 2.2 2.421 2.846 3.053 3.236 3.314 3.72 3.871 4.153 4.4 4.627 4.736 4.949 5.157 5.463 5.661 5.851 6.114 6.356 6.586 6.803 7.012 7.295 7.564 7.818 8.105 8.369 8.622 8.921 9.266 9.573 9.874 10.174 10.484 10.784 11.092 11.438 11.775 12.131 12.417 12.6 12.724 12.784 12.542 11.722 10.431 9.175 8.034 7.015 6.042 5.12 4.28 3.547 2.785 2.155 1.604 1.041 0.492 -0.013 -0.465 -0.932 -1.381 -1.782 -2.189 -2.624 -2.976 -3.329 -3.7 -3.994 -4.309 -4.646 -5.005 -5.364 -5.609 -5.866 -6.25 -6.508 -6.772 -6.918 -7.22 -7.546 -7.909 -8.089 -8.538 -8.689 -8.9 -9.115 -9.605 -9.869 -10.146 -10.469 -10.841 -11.246 -11.746 -12.854 -8 ,511 ,KEBNE ,16692192,Thu Nov 25 17:55:30 CET,Thu Nov 25 19:30:03 CET,0.0 0.871 1.26 1.598 1.902 2.167 2.397 2.611 3.0 3.182 3.354 3.405 3.798 3.943 4.246 4.536 4.786 4.902 5.126 5.336 5.634 5.828 6.013 6.279 6.536 6.767 6.986 7.208 7.485 7.742 7.993 8.281 8.543 8.808 9.124 9.461 9.749 10.031 10.343 10.682 11.021 11.372 11.75 12.103 12.446 12.763 13.016 13.192 13.251 13.015 12.149 10.839 9.606 8.417 7.355 6.382 5.569 4.794 4.046 3.321 2.743 2.201 1.646 1.125 0.653 0.198 -0.317 -0.77 -1.157 -1.562 -1.974 -2.321 -2.673 -3.033 -3.328 -3.638 -3.963 -4.293 -4.634 -4.872 -5.127 -5.544 -5.824 -6.107 -6.259 -6.571 -6.894 -7.251 -7.439 -7.891 -7.998 -8.195 -8.404 -8.887 -9.159 -9.454 -9.778 -10.149 -10.565 -11.055 -11.905 -9 ,21892 ,KEBNE ,16692193,Thu Nov 25 17:56:36 CET,Thu Nov 25 19:24:42 CET,0.0 0.9 1.382 1.739 2.025 2.286 2.539 2.766 3.159 3.343 3.516 3.593 3.997 4.145 4.424 4.695 4.943 5.056 5.287 5.519 5.841 6.035 6.224 6.505 6.771 7.024 7.265 7.485 7.763 8.021 8.263 8.563 8.842 9.102 9.398 9.722 10.026 10.357 10.685 11.002 11.33 11.684 12.042 12.372 12.74 13.075 13.35 13.522 13.514 13.24 12.47 11.124 9.827 8.659 7.619 6.64 5.762 4.954 4.242 3.498 2.841 2.288 1.792 1.298 0.805 0.345 -0.145 -0.598 -1.001 -1.407 -1.831 -2.191 -2.555 -2.941 -3.251 -3.569 -3.889 -4.22 -4.579 -4.816 -5.047 -5.416 -5.687 -5.98 -6.127 -6.427 -6.746 -7.091 -7.272 -7.719 -7.864 -8.084 -8.319 -8.81 -9.076 -9.366 -9.685 -10.029 -10.441 -10.981 -11.761 -10 ,12440 ,KEBNE ,16692194,Thu Nov 25 17:56:32 CET,Thu Nov 25 19:30:32 CET,0.0 0.88 1.294 1.602 1.867 2.124 2.374 2.603 2.998 3.183 3.361 3.444 3.847 3.983 4.236 4.486 4.726 4.84 5.064 5.278 5.591 5.798 6.004 6.294 6.555 6.795 7.026 7.254 7.536 7.802 8.05 8.351 8.638 8.898 9.201 9.532 9.838 10.169 10.492 10.795 11.127 11.495 11.882 12.205 12.493 12.788 13.077 13.255 13.289 13.061 12.273 11.028 9.81 8.671 7.64 6.672 5.798 5.002 4.329 3.636 3.036 2.508 1.973 1.418 0.878 0.41 -0.066 -0.489 -0.863 -1.257 -1.678 -2.042 -2.403 -2.772 -3.053 -3.349 -3.671 -4.008 -4.368 -4.615 -4.869 -5.28 -5.561 -5.85 -6.0 -6.301 -6.623 -6.971 -7.15 -7.595 -7.729 -7.949 -8.18 -8.67 -8.936 -9.232 -9.562 -9.928 -10.336 -10.846 -11.792 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt deleted file mode 100644 index d8c9ccc3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-27_jmc-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32423 ,KEBNE ,16692195,Thu Nov 25 17:56:32 CET,Thu Nov 25 19:31:47 CET,0.0 1.052 1.518 1.914 2.286 2.596 2.866 3.12 3.599 3.817 4.028 4.182 4.61 4.779 5.115 5.428 5.726 5.878 6.165 6.417 6.773 7.015 7.256 7.603 7.934 8.232 8.496 8.751 9.099 9.448 9.794 10.198 10.575 10.943 11.343 11.78 12.198 12.653 13.138 13.618 14.128 14.714 15.409 16.093 16.816 17.547 18.299 19.105 19.981 20.821 21.55 21.757 21.534 21.168 20.734 20.241 19.744 19.27 18.813 18.316 17.89 17.517 17.115 16.696 16.281 15.906 15.535 15.187 14.861 14.497 14.133 13.863 13.605 13.31 13.044 12.769 12.503 12.228 11.929 11.706 11.486 11.145 10.896 10.644 10.513 10.241 9.947 9.639 9.476 9.06 8.962 8.774 8.576 8.142 7.893 7.618 7.327 6.978 6.568 6.08 5.181 -2 ,3480 ,KEBNE ,16692196,Thu Nov 25 17:57:38 CET,Thu Nov 25 19:26:40 CET,0.0 1.22 1.768 2.173 2.536 2.861 3.157 3.421 3.883 4.092 4.293 4.433 4.868 5.045 5.373 5.676 5.967 6.109 6.38 6.634 7.011 7.268 7.512 7.856 8.177 8.479 8.758 9.026 9.383 9.73 10.056 10.446 10.818 11.154 11.55 12.016 12.438 12.872 13.35 13.86 14.366 14.919 15.55 16.143 16.841 17.608 18.403 19.216 20.059 20.921 21.663 21.867 21.675 21.359 20.973 20.488 19.945 19.4 18.924 18.455 18.046 17.649 17.24 16.841 16.466 16.135 15.786 15.45 15.159 14.842 14.491 14.227 13.958 13.64 13.375 13.098 12.822 12.534 12.229 12.025 11.807 11.464 11.225 10.96 10.824 10.56 10.275 9.954 9.779 9.359 9.25 9.055 8.85 8.43 8.205 7.943 7.654 7.315 6.929 6.441 5.494 -3 ,20325 ,KEBNE ,16692197,Thu Nov 25 17:57:35 CET,Thu Nov 25 19:34:21 CET,0.0 1.082 1.623 1.992 2.327 2.632 2.919 3.201 3.655 3.858 4.054 4.168 4.594 4.772 5.117 5.452 5.764 5.904 6.177 6.445 6.821 7.058 7.295 7.633 7.957 8.277 8.562 8.817 9.163 9.499 9.829 10.229 10.616 10.984 11.377 11.835 12.282 12.739 13.194 13.635 14.08 14.578 15.147 15.744 16.47 17.252 18.073 18.929 19.822 20.685 21.42 21.616 21.463 21.175 20.793 20.361 19.9 19.377 18.858 18.325 17.861 17.416 16.978 16.559 16.163 15.816 15.469 15.133 14.828 14.517 14.178 13.903 13.606 13.287 13.027 12.751 12.495 12.24 11.951 11.741 11.529 11.184 10.929 10.67 10.537 10.265 9.984 9.689 9.534 9.129 9.046 8.848 8.641 8.206 7.976 7.742 7.477 7.174 6.821 6.371 5.458 -4 ,24609 ,KEBNE ,16692198,Thu Nov 25 17:57:35 CET,Thu Nov 25 19:34:34 CET,0.0 1.091 1.632 2.062 2.421 2.732 2.998 3.239 3.704 3.913 4.107 4.237 4.673 4.852 5.192 5.515 5.829 5.982 6.25 6.502 6.889 7.136 7.378 7.719 8.028 8.342 8.649 8.933 9.313 9.689 10.036 10.42 10.788 11.156 11.592 12.072 12.497 12.942 13.427 13.943 14.48 15.069 15.689 16.263 16.932 17.609 18.336 19.179 20.07 20.878 21.556 21.697 21.444 21.062 20.619 20.183 19.733 19.24 18.783 18.342 17.96 17.567 17.147 16.735 16.345 15.993 15.604 15.249 14.959 14.638 14.297 14.005 13.693 13.368 13.099 12.826 12.552 12.253 11.938 11.719 11.497 11.16 10.926 10.681 10.557 10.298 9.997 9.677 9.514 9.102 8.996 8.804 8.596 8.15 7.915 7.65 7.364 7.024 6.656 6.217 5.453 -5 ,31525 ,KEBNE ,16692199,Thu Nov 25 17:57:35 CET,Thu Nov 25 19:34:40 CET,0.0 1.129 1.66 2.097 2.461 2.773 3.042 3.296 3.749 3.96 4.17 4.309 4.743 4.918 5.255 5.565 5.865 6.011 6.287 6.552 6.926 7.172 7.413 7.76 8.083 8.377 8.665 8.948 9.291 9.627 9.965 10.341 10.691 11.036 11.436 11.907 12.36 12.846 13.331 13.834 14.363 14.929 15.594 16.216 16.858 17.549 18.322 19.169 20.051 20.861 21.505 21.642 21.37 20.987 20.509 19.996 19.562 19.11 18.69 18.28 17.855 17.415 16.977 16.56 16.164 15.802 15.419 15.063 14.744 14.421 14.087 13.799 13.5 13.179 12.907 12.627 12.355 12.058 11.735 11.513 11.293 10.952 10.705 10.442 10.308 10.034 9.748 9.418 9.238 8.824 8.739 8.561 8.373 7.957 7.718 7.462 7.167 6.838 6.454 5.953 4.854 -6 ,1850 ,KEBNE ,16692200,Thu Nov 25 17:58:41 CET,Thu Nov 25 19:29:29 CET,0.0 1.363 1.918 2.362 2.698 2.985 3.255 3.508 3.986 4.204 4.409 4.545 4.971 5.14 5.481 5.815 6.151 6.306 6.584 6.851 7.23 7.467 7.696 8.036 8.355 8.65 8.941 9.237 9.616 9.969 10.3 10.695 11.077 11.438 11.848 12.315 12.767 13.234 13.728 14.232 14.717 15.249 15.882 16.472 17.117 17.841 18.621 19.43 20.264 21.02 21.663 21.806 21.602 21.336 21.003 20.603 20.225 19.799 19.365 18.904 18.464 18.056 17.651 17.245 16.865 16.501 16.096 15.739 15.443 15.139 14.796 14.512 14.215 13.899 13.653 13.382 13.1 12.808 12.485 12.261 12.047 11.713 11.462 11.201 11.07 10.791 10.505 10.2 10.036 9.628 9.509 9.304 9.101 8.662 8.411 8.132 7.819 7.471 7.064 6.55 5.192 -7 ,20377 ,KEBNE ,16692201,Thu Nov 25 17:58:37 CET,Thu Nov 25 19:35:41 CET,0.0 1.186 1.738 2.161 2.485 2.78 3.067 3.326 3.804 4.023 4.227 4.344 4.771 4.942 5.271 5.599 5.904 6.052 6.341 6.602 6.963 7.203 7.437 7.758 8.062 8.349 8.632 8.915 9.273 9.63 9.976 10.382 10.749 11.1 11.515 11.957 12.354 12.776 13.251 13.764 14.278 14.836 15.474 16.065 16.701 17.39 18.111 18.876 19.751 20.602 21.267 21.478 21.286 20.894 20.472 19.987 19.495 19.003 18.546 18.044 17.553 17.095 16.686 16.307 15.914 15.548 15.161 14.799 14.486 14.159 13.809 13.507 13.184 12.854 12.6 12.323 12.038 11.753 11.437 11.218 10.994 10.642 10.404 10.143 10.011 9.749 9.464 9.166 9.001 8.572 8.444 8.245 8.037 7.573 7.318 7.041 6.74 6.409 6.035 5.558 4.79 -8 ,2495 ,KEBNE ,16692202,Thu Nov 25 17:58:37 CET,Thu Nov 25 19:35:55 CET,0.0 1.183 1.683 2.103 2.463 2.782 3.088 3.362 3.838 4.054 4.263 4.428 4.873 5.051 5.378 5.686 5.979 6.125 6.401 6.643 7.003 7.247 7.483 7.837 8.167 8.477 8.786 9.077 9.435 9.778 10.09 10.466 10.853 11.228 11.656 12.136 12.581 13.034 13.513 14.011 14.506 15.04 15.655 16.248 16.908 17.638 18.444 19.243 20.084 20.975 21.651 21.79 21.569 21.166 20.729 20.295 19.89 19.456 19.02 18.576 18.187 17.796 17.386 16.978 16.593 16.25 15.864 15.515 15.217 14.886 14.527 14.219 13.896 13.573 13.314 13.042 12.767 12.476 12.171 11.964 11.747 11.388 11.135 10.873 10.734 10.455 10.18 9.882 9.72 9.303 9.184 8.988 8.787 8.331 8.079 7.824 7.558 7.235 6.856 6.403 5.532 -9 ,25987 ,KEBNE ,16692203,Thu Nov 25 17:59:44 CET,Thu Nov 25 19:30:41 CET,0.0 1.067 1.673 2.082 2.428 2.735 3.007 3.266 3.717 3.919 4.123 4.244 4.669 4.847 5.183 5.513 5.822 5.964 6.238 6.497 6.872 7.117 7.361 7.708 8.036 8.345 8.65 8.951 9.303 9.64 9.966 10.339 10.704 11.052 11.426 11.847 12.28 12.746 13.201 13.7 14.231 14.798 15.47 16.12 16.814 17.548 18.345 19.124 19.955 20.854 21.64 21.846 21.603 21.188 20.732 20.253 19.733 19.191 18.696 18.173 17.706 17.299 16.931 16.548 16.161 15.807 15.408 15.028 14.703 14.377 14.03 13.733 13.424 13.104 12.868 12.626 12.37 12.088 11.773 11.548 11.318 10.971 10.728 10.468 10.335 10.059 9.769 9.473 9.311 8.89 8.771 8.579 8.378 7.925 7.677 7.41 7.107 6.759 6.324 5.789 4.949 -10 ,1805 ,KEBNE ,16692204,Thu Nov 25 18:00:41 CET,Thu Nov 25 19:33:08 CET,0.0 1.143 1.686 2.108 2.459 2.747 3.03 3.297 3.759 3.978 4.193 4.326 4.754 4.932 5.274 5.605 5.922 6.073 6.368 6.639 7.023 7.269 7.493 7.818 8.129 8.441 8.756 9.032 9.395 9.76 10.091 10.484 10.856 11.21 11.634 12.097 12.527 12.998 13.466 13.94 14.436 14.973 15.607 16.276 17.014 17.736 18.521 19.328 20.155 21.012 21.813 22.105 21.902 21.471 20.955 20.426 19.935 19.442 18.992 18.502 18.033 17.617 17.196 16.777 16.364 15.98 15.608 15.275 14.965 14.615 14.25 13.98 13.703 13.396 13.134 12.851 12.572 12.271 11.962 11.75 11.522 11.173 10.939 10.69 10.561 10.295 10.002 9.682 9.514 9.098 8.999 8.812 8.612 8.179 7.947 7.696 7.404 7.086 6.72 6.267 5.205 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt deleted file mode 100644 index ea748f2d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_ejm-46.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22890 ,KEBNE ,17132009,Sat Jan 1 17:32:07 CET,Sat Jan 1 19:05:57 CET,0.0 0.731 1.163 1.518 1.832 2.106 2.352 2.58 2.984 3.179 3.366 3.45 3.862 4.027 4.339 4.634 4.917 5.055 5.31 5.538 5.875 6.096 6.317 6.671 7.014 7.325 7.612 7.882 8.232 8.551 8.852 9.23 9.597 9.947 10.334 10.75 11.135 11.549 11.996 12.484 12.981 13.476 14.045 14.628 15.272 15.928 16.651 17.454 18.254 19.018 19.675 19.783 19.535 19.13 18.637 18.148 17.646 17.123 16.642 16.111 15.655 15.241 14.83 14.432 14.051 13.686 13.301 12.956 12.654 12.335 11.969 11.672 11.37 11.028 10.761 10.487 10.186 9.867 9.548 9.327 9.09 8.715 8.451 8.172 8.025 7.729 7.421 7.081 6.897 6.458 6.275 6.058 5.838 5.346 5.074 4.783 4.46 4.088 3.674 3.15 1.928 -2 ,5170 ,KEBNE ,17132010,Sat Jan 1 17:32:07 CET,Sat Jan 1 19:05:46 CET,0.0 0.952 1.386 1.723 2.02 2.28 2.525 2.754 3.206 3.412 3.591 3.692 4.103 4.26 4.556 4.844 5.123 5.256 5.495 5.72 6.055 6.272 6.482 6.796 7.099 7.387 7.669 7.935 8.26 8.572 8.885 9.263 9.628 9.963 10.328 10.756 11.176 11.601 12.047 12.546 13.049 13.579 14.205 14.823 15.463 16.127 16.871 17.682 18.52 19.332 20.018 20.166 19.954 19.597 19.16 18.679 18.2 17.733 17.273 16.759 16.289 15.838 15.377 14.938 14.513 14.101 13.681 13.329 13.026 12.695 12.357 12.067 11.75 11.401 11.122 10.845 10.557 10.259 9.946 9.727 9.496 9.133 8.875 8.595 8.45 8.151 7.847 7.53 7.35 6.918 6.756 6.542 6.333 5.875 5.608 5.324 4.97 4.543 4.116 3.624 2.644 -3 ,11977 ,KEBNE ,17132011,Sat Jan 1 17:32:07 CET,Sat Jan 1 19:05:41 CET,0.0 0.826 1.278 1.634 1.951 2.244 2.52 2.778 3.22 3.411 3.601 3.72 4.127 4.273 4.564 4.839 5.099 5.222 5.466 5.706 6.042 6.257 6.464 6.762 7.058 7.359 7.652 7.924 8.263 8.598 8.919 9.292 9.65 9.988 10.344 10.733 11.122 11.555 12.02 12.47 12.935 13.483 14.132 14.751 15.414 16.081 16.771 17.458 18.202 19.011 19.684 19.827 19.629 19.275 18.825 18.402 17.97 17.486 17.058 16.593 16.127 15.71 15.325 14.919 14.503 14.109 13.702 13.349 13.046 12.714 12.344 12.03 11.702 11.367 11.105 10.826 10.535 10.227 9.911 9.7 9.462 9.072 8.817 8.555 8.415 8.111 7.797 7.462 7.285 6.863 6.721 6.525 6.315 5.839 5.581 5.279 4.943 4.597 4.17 3.586 2.372 -4 ,31901 ,KEBNE ,17132012,Sat Jan 1 17:33:08 CET,Sat Jan 1 19:06:15 CET,0.0 0.765 1.173 1.51 1.794 2.04 2.284 2.512 2.94 3.145 3.337 3.445 3.853 4.011 4.317 4.599 4.862 4.987 5.234 5.477 5.824 6.044 6.259 6.56 6.846 7.129 7.407 7.675 8.013 8.34 8.658 9.035 9.396 9.747 10.165 10.631 11.059 11.499 11.962 12.444 12.932 13.469 14.053 14.6 15.255 16.002 16.777 17.528 18.332 19.192 19.887 19.981 19.694 19.295 18.855 18.378 17.924 17.456 16.991 16.49 16.026 15.599 15.165 14.748 14.376 14.003 13.596 13.244 12.927 12.574 12.191 11.861 11.519 11.171 10.906 10.63 10.334 10.017 9.688 9.463 9.231 8.877 8.618 8.355 8.221 7.923 7.609 7.285 7.109 6.676 6.502 6.278 6.05 5.57 5.301 5.002 4.679 4.33 3.909 3.36 1.992 -5 ,8317 ,KEBNE ,17132013,Sat Jan 1 17:33:12 CET,Sat Jan 1 19:04:02 CET,0.0 0.738 1.158 1.495 1.782 2.035 2.266 2.484 2.913 3.102 3.276 3.382 3.799 3.962 4.26 4.527 4.788 4.922 5.189 5.444 5.791 5.999 6.205 6.52 6.815 7.101 7.386 7.654 7.985 8.317 8.637 8.998 9.345 9.692 10.073 10.482 10.873 11.315 11.801 12.279 12.744 13.291 13.911 14.451 15.097 15.826 16.62 17.38 18.134 18.953 19.645 19.834 19.634 19.257 18.765 18.203 17.662 17.166 16.73 16.247 15.783 15.322 14.849 14.398 13.996 13.634 13.256 12.931 12.63 12.284 11.91 11.599 11.272 10.901 10.615 10.324 10.017 9.713 9.391 9.16 8.928 8.573 8.317 8.041 7.896 7.61 7.307 6.951 6.767 6.344 6.191 5.987 5.775 5.32 5.054 4.772 4.482 4.134 3.702 3.147 1.883 -6 ,28734 ,KEBNE ,17132014,Sat Jan 1 17:34:10 CET,Sat Jan 1 19:10:26 CET,0.0 0.777 1.248 1.604 1.919 2.204 2.462 2.684 3.087 3.293 3.491 3.592 3.993 4.135 4.402 4.676 4.941 5.066 5.312 5.553 5.902 6.124 6.343 6.652 6.93 7.193 7.469 7.738 8.066 8.389 8.693 9.038 9.38 9.707 10.081 10.49 10.91 11.447 12.031 12.612 13.147 13.644 14.169 14.743 15.422 16.08 16.779 17.556 18.437 19.303 20.0 20.186 19.993 19.63 19.182 18.696 18.202 17.722 17.286 16.83 16.374 15.956 15.56 15.145 14.744 14.402 14.058 13.718 13.394 13.049 12.695 12.391 12.057 11.696 11.42 11.155 10.87 10.555 10.231 10.011 9.776 9.391 9.135 8.874 8.736 8.44 8.123 7.779 7.59 7.159 6.999 6.775 6.543 6.076 5.807 5.501 5.179 4.821 4.383 3.807 2.385 -7 ,5271 ,KEBNE ,17132015,Sat Jan 1 17:34:10 CET,Sat Jan 1 19:09:38 CET,0.0 0.801 1.32 1.724 2.047 2.336 2.603 2.842 3.291 3.504 3.694 3.821 4.252 4.416 4.707 4.994 5.275 5.408 5.665 5.896 6.224 6.446 6.649 6.927 7.219 7.513 7.775 8.019 8.346 8.663 8.972 9.345 9.695 10.027 10.459 10.955 11.382 11.827 12.287 12.752 13.224 13.712 14.231 14.736 15.335 16.011 16.804 17.659 18.466 19.216 19.862 19.973 19.682 19.236 18.775 18.33 17.837 17.317 16.831 16.301 15.866 15.475 15.052 14.63 14.226 13.848 13.437 13.089 12.801 12.463 12.101 11.809 11.489 11.165 10.916 10.65 10.361 10.042 9.697 9.465 9.23 8.851 8.583 8.319 8.184 7.89 7.573 7.228 7.05 6.629 6.491 6.293 6.083 5.62 5.362 5.085 4.753 4.373 3.969 3.423 1.972 -8 ,11673 ,KEBNE ,17132016,Sat Jan 1 17:34:10 CET,Sat Jan 1 19:07:26 CET,0.0 0.847 1.31 1.673 1.972 2.228 2.469 2.69 3.091 3.274 3.449 3.543 3.954 4.119 4.425 4.71 4.971 5.104 5.366 5.608 5.966 6.192 6.408 6.728 7.035 7.326 7.6 7.86 8.192 8.512 8.829 9.212 9.57 9.903 10.27 10.678 11.063 11.462 11.904 12.354 12.797 13.323 13.936 14.502 15.117 15.757 16.489 17.337 18.237 19.126 19.939 20.118 19.881 19.526 19.1 18.65 18.216 17.797 17.374 16.898 16.479 16.061 15.617 15.2 14.798 14.405 13.983 13.592 13.274 12.957 12.593 12.275 11.939 11.6 11.356 11.107 10.823 10.504 10.174 9.953 9.719 9.371 9.125 8.845 8.702 8.41 8.099 7.762 7.583 7.162 7.024 6.807 6.583 6.132 5.87 5.573 5.246 4.882 4.468 3.915 2.224 -9 ,21059 ,KEBNE ,17132017,Sat Jan 1 17:34:10 CET,Sat Jan 1 19:07:41 CET,0.0 0.825 1.218 1.556 1.864 2.14 2.395 2.635 3.058 3.254 3.444 3.548 3.964 4.133 4.454 4.752 5.027 5.15 5.387 5.624 5.97 6.188 6.39 6.681 6.969 7.242 7.497 7.754 8.105 8.424 8.699 9.056 9.426 9.748 10.099 10.529 10.945 11.387 11.857 12.362 12.897 13.459 14.083 14.662 15.276 15.983 16.797 17.63 18.49 19.347 20.04 20.207 19.99 19.619 19.138 18.623 18.107 17.593 17.123 16.588 16.114 15.7 15.283 14.881 14.51 14.139 13.714 13.325 13.006 12.693 12.348 12.036 11.714 11.386 11.136 10.869 10.565 10.244 9.917 9.685 9.454 9.103 8.844 8.567 8.423 8.132 7.828 7.495 7.319 6.899 6.755 6.545 6.329 5.859 5.582 5.29 4.966 4.588 4.154 3.611 2.332 -10 ,31122 ,KEBNE ,17132018,Sat Jan 1 17:34:09 CET,Sat Jan 1 19:08:21 CET,0.0 0.897 1.382 1.743 2.043 2.311 2.559 2.788 3.203 3.403 3.593 3.689 4.103 4.262 4.561 4.851 5.122 5.251 5.497 5.739 6.085 6.311 6.535 6.834 7.13 7.431 7.717 7.989 8.308 8.594 8.884 9.237 9.579 9.924 10.341 10.794 11.205 11.645 12.121 12.628 13.153 13.718 14.337 14.911 15.541 16.205 16.908 17.664 18.445 19.186 19.778 19.895 19.709 19.384 18.943 18.432 17.961 17.473 16.972 16.431 15.939 15.515 15.127 14.743 14.352 13.969 13.556 13.182 12.861 12.516 12.132 11.802 11.479 11.147 10.871 10.582 10.291 9.98 9.65 9.428 9.199 8.834 8.574 8.301 8.161 7.866 7.548 7.214 7.04 6.617 6.458 6.25 6.035 5.563 5.302 4.996 4.67 4.326 3.923 3.366 2.029 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt deleted file mode 100644 index d6ff3920..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-28_jmc-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19683 ,KEBNE ,16692205,Thu Nov 25 18:00:42 CET,Thu Nov 25 19:33:13 CET,0.0 0.967 1.41 1.724 2.016 2.277 2.507 2.717 3.09 3.272 3.452 3.517 3.908 4.046 4.312 4.568 4.806 4.921 5.15 5.37 5.668 5.856 6.05 6.328 6.583 6.824 7.053 7.27 7.556 7.828 8.067 8.339 8.584 8.817 9.095 9.395 9.66 9.952 10.281 10.598 10.877 11.152 11.448 11.744 12.063 12.334 12.495 12.514 12.288 11.715 10.519 8.843 7.272 5.871 4.668 3.562 2.534 1.563 0.728 -0.094 -0.792 -1.392 -1.973 -2.577 -3.169 -3.705 -4.236 -4.73 -5.174 -5.615 -6.071 -6.449 -6.836 -7.238 -7.567 -7.915 -8.262 -8.63 -9.018 -9.273 -9.548 -9.978 -10.259 -10.561 -10.724 -11.061 -11.407 -11.782 -11.982 -12.441 -12.604 -12.834 -13.068 -13.556 -13.832 -14.136 -14.493 -14.895 -15.311 -15.819 -16.859 -2 ,24691 ,KEBNE ,16692206,Thu Nov 25 18:00:42 CET,Thu Nov 25 19:33:32 CET,0.0 0.696 1.104 1.44 1.723 1.98 2.217 2.432 2.822 3.008 3.19 3.274 3.677 3.824 4.086 4.335 4.579 4.694 4.919 5.135 5.438 5.635 5.819 6.082 6.332 6.583 6.819 7.027 7.302 7.555 7.778 8.038 8.297 8.557 8.84 9.138 9.396 9.687 9.995 10.288 10.561 10.84 11.187 11.496 11.759 11.96 12.099 12.093 11.88 11.341 10.146 8.466 6.889 5.438 4.128 2.937 1.879 0.921 0.099 -0.719 -1.413 -2.047 -2.678 -3.29 -3.873 -4.404 -4.96 -5.461 -5.876 -6.318 -6.786 -7.171 -7.568 -7.989 -8.324 -8.675 -9.031 -9.4 -9.793 -10.062 -10.338 -10.775 -11.082 -11.403 -11.567 -11.899 -12.262 -12.634 -12.819 -13.27 -13.422 -13.647 -13.881 -14.416 -14.707 -15.027 -15.378 -15.761 -16.198 -16.706 -17.85 -3 ,22804 ,KEBNE ,16692207,Thu Nov 25 18:00:42 CET,Thu Nov 25 19:32:48 CET,0.0 0.95 1.419 1.74 2.012 2.282 2.534 2.773 3.179 3.352 3.525 3.593 3.991 4.143 4.423 4.674 4.915 5.031 5.257 5.468 5.768 5.958 6.138 6.401 6.644 6.875 7.102 7.321 7.588 7.833 8.067 8.334 8.585 8.826 9.11 9.417 9.669 9.952 10.25 10.54 10.849 11.162 11.479 11.717 11.936 12.189 12.379 12.388 12.183 11.644 10.432 8.731 7.139 5.711 4.486 3.373 2.408 1.51 0.688 -0.129 -0.839 -1.478 -2.083 -2.673 -3.215 -3.708 -4.236 -4.727 -5.159 -5.609 -6.089 -6.485 -6.894 -7.33 -7.658 -7.966 -8.289 -8.649 -9.015 -9.281 -9.574 -10.014 -10.309 -10.611 -10.764 -11.09 -11.441 -11.82 -12.011 -12.459 -12.61 -12.833 -13.066 -13.563 -13.834 -14.126 -14.446 -14.803 -15.253 -15.815 -17.081 -4 ,27000 ,KEBNE ,16692208,Thu Nov 25 18:00:42 CET,Thu Nov 25 19:32:27 CET,0.0 0.835 1.286 1.65 1.965 2.243 2.483 2.699 3.082 3.257 3.422 3.492 3.886 4.027 4.293 4.548 4.79 4.906 5.126 5.345 5.66 5.846 6.023 6.283 6.518 6.745 6.981 7.197 7.45 7.7 7.948 8.238 8.491 8.708 8.962 9.21 9.421 9.676 9.945 10.221 10.507 10.795 11.072 11.284 11.489 11.706 11.881 11.913 11.733 11.16 9.872 8.184 6.664 5.291 4.063 2.88 1.846 0.937 0.156 -0.655 -1.399 -2.085 -2.738 -3.347 -3.916 -4.443 -4.996 -5.479 -5.905 -6.364 -6.846 -7.253 -7.673 -8.101 -8.436 -8.785 -9.144 -9.511 -9.88 -10.135 -10.409 -10.838 -11.131 -11.432 -11.586 -11.914 -12.286 -12.672 -12.868 -13.325 -13.459 -13.685 -13.93 -14.438 -14.714 -15.021 -15.356 -15.738 -16.186 -16.708 -17.953 -5 ,5391 ,KEBNE ,16692209,Thu Nov 25 18:00:42 CET,Thu Nov 25 19:33:54 CET,0.0 1.005 1.482 1.84 2.151 2.431 2.69 2.924 3.321 3.487 3.647 3.734 4.14 4.286 4.557 4.813 5.062 5.186 5.429 5.665 6.011 6.228 6.429 6.693 6.929 7.157 7.387 7.602 7.848 8.079 8.307 8.58 8.847 9.084 9.363 9.686 9.95 10.213 10.486 10.771 11.076 11.384 11.688 11.958 12.22 12.458 12.6 12.567 12.346 11.805 10.551 8.782 7.238 5.876 4.639 3.456 2.44 1.522 0.681 -0.149 -0.846 -1.476 -2.105 -2.698 -3.247 -3.766 -4.292 -4.744 -5.135 -5.558 -6.03 -6.438 -6.846 -7.242 -7.549 -7.883 -8.236 -8.596 -8.975 -9.242 -9.522 -9.957 -10.247 -10.549 -10.706 -11.051 -11.416 -11.773 -11.97 -12.44 -12.594 -12.82 -13.06 -13.564 -13.838 -14.155 -14.503 -14.88 -15.31 -15.899 -17.385 -6 ,23690 ,KEBNE ,16692210,Thu Nov 25 18:00:42 CET,Thu Nov 25 19:32:22 CET,0.0 0.92 1.398 1.738 1.992 2.243 2.494 2.718 3.118 3.301 3.474 3.54 3.933 4.081 4.363 4.617 4.854 4.971 5.194 5.392 5.677 5.867 6.044 6.298 6.538 6.761 6.976 7.177 7.43 7.679 7.921 8.211 8.481 8.739 9.031 9.326 9.607 9.893 10.178 10.469 10.737 10.988 11.251 11.514 11.736 11.887 11.999 11.994 11.8 11.275 10.06 8.334 6.752 5.304 4.0 2.797 1.748 0.803 -0.045 -0.924 -1.704 -2.368 -2.929 -3.464 -4.008 -4.51 -5.025 -5.489 -5.906 -6.364 -6.85 -7.246 -7.658 -8.083 -8.391 -8.72 -9.084 -9.465 -9.846 -10.102 -10.372 -10.801 -11.099 -11.393 -11.547 -11.876 -12.21 -12.555 -12.745 -13.205 -13.364 -13.598 -13.84 -14.356 -14.657 -14.983 -15.334 -15.72 -16.165 -16.816 -18.198 -7 ,1194 ,KEBNE ,16692211,Thu Nov 25 18:00:42 CET,Thu Nov 25 19:32:36 CET,0.0 0.98 1.433 1.776 2.058 2.318 2.553 2.763 3.161 3.356 3.541 3.633 4.037 4.181 4.454 4.705 4.937 5.048 5.273 5.495 5.798 5.981 6.162 6.427 6.686 6.924 7.138 7.356 7.631 7.875 8.114 8.394 8.656 8.909 9.189 9.499 9.786 10.071 10.384 10.694 10.979 11.265 11.535 11.774 12.014 12.212 12.335 12.331 12.13 11.6 10.406 8.669 7.042 5.605 4.318 3.122 2.112 1.153 0.31 -0.526 -1.267 -1.938 -2.589 -3.203 -3.788 -4.33 -4.894 -5.399 -5.827 -6.249 -6.701 -7.088 -7.483 -7.897 -8.215 -8.535 -8.879 -9.248 -9.626 -9.887 -10.156 -10.585 -10.889 -11.205 -11.369 -11.704 -12.07 -12.473 -12.678 -13.148 -13.331 -13.566 -13.802 -14.3 -14.574 -14.879 -15.203 -15.56 -16.01 -16.605 -17.827 -8 ,24098 ,KEBNE ,16692212,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:35:21 CET,0.0 0.92 1.356 1.721 2.05 2.318 2.556 2.774 3.156 3.339 3.512 3.568 3.97 4.123 4.414 4.69 4.946 5.061 5.279 5.494 5.816 6.022 6.21 6.473 6.71 6.926 7.148 7.371 7.658 7.924 8.154 8.397 8.636 8.882 9.165 9.466 9.754 10.059 10.372 10.703 11.004 11.266 11.565 11.848 12.051 12.19 12.318 12.326 12.134 11.582 10.306 8.575 7.051 5.694 4.475 3.368 2.413 1.472 0.634 -0.169 -0.9 -1.588 -2.244 -2.866 -3.438 -3.96 -4.509 -4.991 -5.406 -5.839 -6.298 -6.684 -7.085 -7.511 -7.848 -8.19 -8.545 -8.922 -9.318 -9.596 -9.876 -10.299 -10.59 -10.902 -11.068 -11.412 -11.773 -12.147 -12.331 -12.778 -12.927 -13.158 -13.403 -13.929 -14.223 -14.525 -14.856 -15.247 -15.687 -16.242 -17.542 -9 ,32300 ,KEBNE ,16692213,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:34:30 CET,0.0 0.715 1.159 1.495 1.792 2.058 2.293 2.509 2.892 3.069 3.247 3.335 3.73 3.874 4.156 4.402 4.631 4.744 4.958 5.16 5.466 5.675 5.877 6.18 6.477 6.744 6.98 7.19 7.468 7.74 7.987 8.272 8.51 8.712 8.966 9.282 9.586 9.886 10.181 10.473 10.753 11.047 11.365 11.655 11.914 12.079 12.177 12.211 12.045 11.545 10.415 8.713 7.166 5.807 4.566 3.427 2.371 1.362 0.487 -0.349 -1.077 -1.766 -2.417 -3.035 -3.603 -4.097 -4.6 -5.069 -5.487 -5.918 -6.382 -6.77 -7.159 -7.579 -7.903 -8.235 -8.596 -8.967 -9.353 -9.624 -9.901 -10.335 -10.636 -10.943 -11.105 -11.442 -11.797 -12.177 -12.375 -12.836 -12.982 -13.205 -13.44 -13.919 -14.189 -14.484 -14.805 -15.177 -15.578 -16.059 -17.225 -10 ,13988 ,KEBNE ,16692214,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:33:32 CET,0.0 1.047 1.514 1.841 2.138 2.413 2.661 2.879 3.269 3.452 3.625 3.689 4.087 4.226 4.497 4.757 5.001 5.128 5.37 5.593 5.898 6.074 6.246 6.519 6.778 7.012 7.247 7.461 7.74 8.023 8.278 8.56 8.831 9.089 9.372 9.691 9.974 10.242 10.522 10.806 11.101 11.374 11.621 11.858 12.058 12.2 12.284 12.234 11.991 11.476 10.256 8.476 6.902 5.496 4.238 3.053 1.983 1.006 0.155 -0.694 -1.423 -2.079 -2.693 -3.262 -3.821 -4.365 -4.936 -5.431 -5.843 -6.261 -6.688 -7.047 -7.436 -7.854 -8.186 -8.534 -8.891 -9.256 -9.648 -9.925 -10.205 -10.631 -10.929 -11.251 -11.421 -11.77 -12.124 -12.503 -12.696 -13.152 -13.316 -13.541 -13.773 -14.272 -14.55 -14.858 -15.189 -15.528 -15.953 -16.483 -17.504 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt deleted file mode 100644 index aa2a2dfe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2562 ,KEBNE ,16692215,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:33:13 CET,0.0 1.145 1.629 2.014 2.332 2.602 2.855 3.109 3.588 3.816 4.033 4.167 4.594 4.753 5.081 5.39 5.678 5.821 6.097 6.359 6.723 6.955 7.182 7.492 7.769 8.033 8.291 8.544 8.874 9.185 9.481 9.843 10.208 10.558 10.94 11.347 11.718 12.108 12.54 13.003 13.433 13.891 14.445 14.999 15.575 16.145 16.728 17.266 17.782 18.211 18.385 18.009 17.436 16.826 16.194 15.524 14.859 14.255 13.736 13.168 12.634 12.149 11.681 11.229 10.827 10.425 9.978 9.596 9.267 8.928 8.559 8.249 7.927 7.586 7.315 7.027 6.718 6.401 6.084 5.857 5.603 5.199 4.926 4.638 4.486 4.191 3.892 3.577 3.423 3.008 2.882 2.675 2.458 1.975 1.71 1.431 1.138 0.783 0.342 -0.196 -1.061 -2 ,24910 ,KEBNE ,16692216,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:34:27 CET,0.0 0.956 1.368 1.756 2.077 2.355 2.634 2.895 3.417 3.658 3.853 3.958 4.378 4.535 4.836 5.132 5.428 5.572 5.835 6.072 6.411 6.63 6.843 7.139 7.433 7.723 8.005 8.273 8.614 8.949 9.271 9.657 10.0 10.327 10.707 11.133 11.529 11.932 12.363 12.802 13.229 13.696 14.238 14.754 15.309 15.897 16.563 17.177 17.7 18.094 18.25 17.941 17.362 16.702 16.079 15.502 14.909 14.306 13.752 13.18 12.683 12.199 11.718 11.25 10.8 10.414 10.028 9.67 9.332 8.972 8.6 8.287 7.963 7.62 7.342 7.055 6.761 6.451 6.115 5.884 5.659 5.315 5.057 4.792 4.659 4.366 4.057 3.726 3.551 3.13 3.019 2.817 2.599 2.139 1.886 1.61 1.302 0.959 0.565 0.056 -1.233 -3 ,15662 ,KEBNE ,16692217,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:34:52 CET,0.0 1.153 1.617 2.013 2.371 2.663 2.932 3.18 3.628 3.836 4.038 4.163 4.588 4.764 5.097 5.397 5.668 5.797 6.055 6.306 6.673 6.903 7.12 7.422 7.715 8.004 8.27 8.53 8.871 9.184 9.492 9.865 10.191 10.485 10.852 11.267 11.646 12.089 12.55 12.995 13.439 13.926 14.473 14.987 15.533 16.111 16.76 17.405 17.998 18.487 18.651 18.304 17.826 17.277 16.661 16.029 15.45 14.902 14.396 13.822 13.282 12.788 12.309 11.859 11.43 11.017 10.577 10.172 9.82 9.467 9.09 8.772 8.443 8.094 7.819 7.541 7.259 6.948 6.606 6.377 6.145 5.773 5.514 5.245 5.104 4.816 4.503 4.176 3.998 3.551 3.412 3.217 3.01 2.523 2.252 1.951 1.623 1.279 0.892 0.339 -0.746 -4 ,9710 ,KEBNE ,16692218,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:34:27 CET,0.0 0.85 1.329 1.777 2.157 2.462 2.723 2.961 3.406 3.622 3.831 3.943 4.361 4.532 4.864 5.166 5.445 5.582 5.85 6.101 6.453 6.683 6.898 7.191 7.477 7.75 8.019 8.293 8.64 8.958 9.258 9.646 10.031 10.391 10.779 11.178 11.54 11.922 12.322 12.741 13.186 13.667 14.178 14.669 15.19 15.693 16.216 16.807 17.448 17.967 18.094 17.71 17.101 16.449 15.829 15.224 14.638 13.999 13.374 12.747 12.226 11.768 11.319 10.897 10.463 10.039 9.615 9.226 8.868 8.489 8.112 7.793 7.443 7.083 6.808 6.513 6.2 5.89 5.582 5.354 5.11 4.734 4.469 4.194 4.056 3.772 3.474 3.157 2.987 2.559 2.441 2.243 2.026 1.556 1.287 1.001 0.709 0.37 -0.004 -0.436 -1.357 -5 ,6496 ,KEBNE ,16692219,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:33:48 CET,0.0 0.99 1.504 1.885 2.218 2.502 2.764 3.012 3.461 3.661 3.847 3.941 4.357 4.511 4.823 5.114 5.395 5.526 5.78 6.033 6.404 6.642 6.867 7.181 7.475 7.748 7.997 8.248 8.566 8.875 9.181 9.545 9.903 10.243 10.614 10.991 11.339 11.746 12.189 12.619 13.026 13.498 14.056 14.591 15.17 15.723 16.26 16.771 17.309 17.789 17.979 17.614 16.988 16.315 15.706 15.087 14.459 13.865 13.329 12.756 12.229 11.75 11.289 10.829 10.38 9.961 9.529 9.151 8.813 8.446 8.052 7.728 7.396 7.046 6.771 6.494 6.211 5.908 5.586 5.354 5.111 4.737 4.475 4.202 4.062 3.787 3.491 3.172 3.009 2.578 2.451 2.249 2.029 1.542 1.272 0.979 0.665 0.345 -0.047 -0.568 -1.569 -6 ,23103 ,KEBNE ,16692220,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:33:34 CET,0.0 0.734 1.173 1.572 1.92 2.217 2.473 2.726 3.208 3.423 3.622 3.733 4.152 4.323 4.633 4.931 5.229 5.373 5.639 5.895 6.253 6.469 6.68 7.0 7.316 7.616 7.907 8.177 8.525 8.853 9.156 9.532 9.892 10.237 10.616 11.036 11.422 11.819 12.26 12.684 13.094 13.577 14.138 14.639 15.181 15.779 16.405 16.982 17.518 17.952 18.051 17.697 17.164 16.509 15.855 15.222 14.583 13.958 13.427 12.857 12.345 11.905 11.482 11.065 10.656 10.265 9.83 9.437 9.104 8.744 8.38 8.076 7.734 7.368 7.086 6.795 6.494 6.185 5.864 5.636 5.414 5.069 4.806 4.523 4.384 4.108 3.813 3.494 3.317 2.881 2.758 2.568 2.355 1.881 1.638 1.371 1.076 0.76 0.363 -0.156 -1.326 -7 ,16170 ,KEBNE ,16692221,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:34:26 CET,0.0 1.151 1.689 2.087 2.409 2.703 2.98 3.241 3.685 3.875 4.058 4.17 4.591 4.765 5.092 5.377 5.656 5.79 6.053 6.304 6.663 6.901 7.131 7.454 7.756 8.032 8.292 8.553 8.887 9.203 9.514 9.874 10.195 10.487 10.827 11.234 11.636 12.069 12.506 12.96 13.438 13.958 14.552 15.097 15.655 16.209 16.782 17.34 17.835 18.217 18.344 17.993 17.409 16.733 16.037 15.332 14.659 13.998 13.427 12.842 12.328 11.85 11.358 10.914 10.499 10.114 9.716 9.321 8.98 8.643 8.264 7.951 7.635 7.296 7.021 6.726 6.409 6.087 5.767 5.538 5.289 4.899 4.622 4.334 4.191 3.892 3.578 3.24 3.069 2.642 2.511 2.306 2.091 1.623 1.38 1.137 0.867 0.534 0.121 -0.374 -1.622 -8 ,54 ,KEBNE ,16692222,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:33:40 CET,0.0 0.931 1.48 1.913 2.231 2.504 2.767 3.037 3.522 3.733 3.936 4.07 4.503 4.668 4.978 5.273 5.557 5.691 5.96 6.215 6.578 6.813 7.042 7.36 7.645 7.924 8.198 8.468 8.807 9.105 9.39 9.766 10.128 10.469 10.853 11.26 11.654 12.065 12.508 12.972 13.409 13.88 14.41 14.926 15.483 16.02 16.567 17.118 17.683 18.18 18.368 17.989 17.362 16.757 16.122 15.465 14.871 14.269 13.704 13.137 12.632 12.173 11.716 11.266 10.836 10.417 9.952 9.544 9.208 8.872 8.506 8.195 7.871 7.52 7.246 6.969 6.681 6.363 6.021 5.785 5.546 5.163 4.902 4.643 4.513 4.238 3.938 3.615 3.439 3.012 2.893 2.697 2.495 2.051 1.796 1.514 1.181 0.79 0.39 -0.125 -1.608 -9 ,20962 ,KEBNE ,16692223,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:33:49 CET,0.0 1.313 1.829 2.205 2.519 2.803 3.089 3.355 3.811 4.025 4.215 4.322 4.749 4.916 5.223 5.513 5.795 5.933 6.202 6.46 6.821 7.048 7.264 7.575 7.849 8.116 8.397 8.655 8.97 9.288 9.594 9.956 10.315 10.66 11.043 11.473 11.88 12.276 12.674 13.109 13.561 14.039 14.564 15.043 15.566 16.161 16.767 17.355 17.904 18.329 18.489 18.157 17.578 16.9 16.237 15.636 15.08 14.5 13.964 13.398 12.842 12.318 11.831 11.372 10.959 10.6 10.18 9.767 9.409 9.019 8.618 8.296 7.972 7.634 7.357 7.065 6.77 6.468 6.139 5.907 5.654 5.257 4.995 4.727 4.584 4.294 3.983 3.634 3.461 3.04 2.927 2.723 2.502 2.041 1.797 1.54 1.242 0.883 0.476 -0.077 -1.469 -10 ,11691 ,KEBNE ,16692224,Thu Nov 25 18:01:45 CET,Thu Nov 25 19:33:14 CET,0.0 1.161 1.668 2.06 2.393 2.699 2.976 3.233 3.707 3.917 4.113 4.217 4.642 4.812 5.149 5.452 5.729 5.868 6.125 6.362 6.7 6.91 7.121 7.441 7.739 8.033 8.313 8.577 8.906 9.223 9.522 9.846 10.157 10.466 10.813 11.223 11.624 12.026 12.458 12.922 13.364 13.848 14.411 14.94 15.502 16.02 16.549 17.123 17.714 18.232 18.445 18.047 17.431 16.783 16.144 15.514 14.906 14.316 13.794 13.242 12.769 12.305 11.825 11.366 10.926 10.532 10.119 9.743 9.414 9.059 8.656 8.323 7.995 7.657 7.398 7.119 6.833 6.537 6.224 6.003 5.761 5.393 5.142 4.871 4.726 4.428 4.123 3.802 3.636 3.212 3.078 2.877 2.654 2.175 1.933 1.659 1.338 0.979 0.565 0.052 -0.852 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt deleted file mode 100644 index bdc03b94..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/Tyk2/water/Summary_FEP_jmc-30_jmc-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30171 ,KEBNE ,16692225,Thu Nov 25 18:02:48 CET,Thu Nov 25 19:37:27 CET,0.0 0.892 1.324 1.723 2.095 2.402 2.676 2.931 3.401 3.618 3.813 3.921 4.342 4.516 4.872 5.208 5.515 5.658 5.934 6.212 6.61 6.85 7.076 7.41 7.734 8.043 8.344 8.612 8.928 9.257 9.596 10.003 10.393 10.766 11.189 11.672 12.127 12.588 13.09 13.647 14.186 14.728 15.382 16.044 16.765 17.555 18.372 19.192 20.108 20.969 21.612 21.734 21.455 20.97 20.415 19.87 19.358 18.836 18.34 17.793 17.319 16.904 16.467 16.026 15.623 15.25 14.843 14.473 14.144 13.775 13.356 12.981 12.565 12.153 11.86 11.567 11.274 10.98 10.677 10.468 10.244 9.891 9.649 9.39 9.254 8.974 8.671 8.364 8.208 7.793 7.668 7.466 7.255 6.785 6.532 6.272 5.991 5.656 5.238 4.723 3.568 -2 ,11388 ,KEBNE ,16692226,Thu Nov 25 18:02:47 CET,Thu Nov 25 19:37:10 CET,0.0 0.984 1.416 1.799 2.16 2.481 2.769 3.015 3.451 3.659 3.854 3.98 4.423 4.602 4.933 5.242 5.546 5.695 5.981 6.251 6.622 6.843 7.064 7.384 7.678 7.968 8.262 8.556 8.933 9.301 9.644 10.049 10.444 10.818 11.226 11.679 12.117 12.584 13.074 13.595 14.127 14.671 15.296 15.953 16.675 17.361 18.076 18.825 19.641 20.472 21.075 21.09 20.79 20.403 19.93 19.428 18.96 18.476 18.002 17.451 16.935 16.498 16.057 15.616 15.207 14.826 14.433 14.083 13.776 13.455 13.127 12.842 12.526 12.186 11.914 11.627 11.332 11.021 10.704 10.48 10.244 9.895 9.646 9.385 9.245 8.952 8.661 8.353 8.183 7.753 7.613 7.413 7.197 6.726 6.473 6.204 5.907 5.565 5.164 4.684 3.666 -3 ,29437 ,KEBNE ,16692227,Thu Nov 25 18:02:48 CET,Thu Nov 25 19:37:02 CET,0.0 0.973 1.374 1.688 1.979 2.24 2.483 2.714 3.121 3.316 3.511 3.611 4.021 4.169 4.468 4.749 5.008 5.151 5.454 5.755 6.18 6.427 6.66 6.994 7.313 7.632 7.927 8.199 8.564 8.913 9.223 9.601 9.986 10.34 10.752 11.21 11.63 12.087 12.578 13.1 13.64 14.244 14.913 15.533 16.207 16.919 17.679 18.497 19.416 20.281 20.913 20.977 20.662 20.215 19.683 19.12 18.579 18.055 17.601 17.142 16.726 16.346 15.95 15.561 15.189 14.816 14.407 14.025 13.676 13.318 12.951 12.65 12.351 12.038 11.781 11.509 11.229 10.924 10.598 10.378 10.147 9.787 9.535 9.27 9.134 8.844 8.535 8.209 8.039 7.622 7.525 7.342 7.145 6.689 6.433 6.155 5.849 5.497 5.061 4.526 3.542 -4 ,15141 ,KEBNE ,16692228,Thu Nov 25 18:02:48 CET,Thu Nov 25 19:35:37 CET,0.0 0.888 1.37 1.767 2.122 2.425 2.707 2.965 3.427 3.646 3.857 3.992 4.422 4.598 4.931 5.252 5.557 5.701 5.978 6.231 6.588 6.824 7.053 7.377 7.687 7.988 8.27 8.554 8.943 9.313 9.671 10.088 10.47 10.827 11.227 11.683 12.122 12.592 13.069 13.55 14.043 14.59 15.245 15.872 16.576 17.351 18.162 18.996 19.898 20.763 21.388 21.46 21.187 20.709 20.107 19.499 18.968 18.462 17.962 17.443 16.974 16.514 16.069 15.643 15.229 14.867 14.486 14.116 13.79 13.445 13.08 12.768 12.432 12.079 11.805 11.533 11.252 10.948 10.633 10.422 10.196 9.818 9.553 9.282 9.139 8.841 8.519 8.189 8.025 7.604 7.478 7.273 7.056 6.584 6.318 6.053 5.77 5.441 5.041 4.524 3.79 -5 ,31034 ,KEBNE ,16692229,Thu Nov 25 18:02:47 CET,Thu Nov 25 19:35:17 CET,0.0 0.82 1.288 1.702 2.075 2.385 2.665 2.923 3.411 3.639 3.858 4.02 4.462 4.637 4.968 5.277 5.565 5.705 5.976 6.237 6.61 6.857 7.093 7.433 7.77 8.083 8.375 8.652 9.007 9.355 9.685 10.083 10.457 10.798 11.197 11.647 12.08 12.561 13.072 13.567 14.071 14.623 15.255 15.933 16.698 17.459 18.239 19.083 19.926 20.7 21.352 21.455 21.186 20.742 20.251 19.756 19.247 18.736 18.289 17.787 17.3 16.877 16.456 16.039 15.656 15.288 14.87 14.49 14.156 13.806 13.455 13.17 12.857 12.511 12.233 11.944 11.662 11.371 11.059 10.841 10.616 10.263 10.007 9.747 9.616 9.337 9.035 8.712 8.546 8.128 8.001 7.799 7.592 7.154 6.914 6.661 6.384 6.067 5.722 5.281 4.647 -6 ,22931 ,KEBNE ,16692230,Thu Nov 25 18:02:48 CET,Thu Nov 25 19:37:25 CET,0.0 1.104 1.619 2.025 2.358 2.664 2.952 3.207 3.667 3.888 4.099 4.242 4.686 4.869 5.206 5.522 5.835 5.983 6.247 6.508 6.893 7.123 7.347 7.671 7.971 8.266 8.577 8.885 9.253 9.607 9.957 10.371 10.769 11.134 11.528 11.977 12.416 12.89 13.397 13.894 14.397 14.982 15.654 16.278 16.976 17.749 18.552 19.355 20.177 20.986 21.676 21.786 21.482 21.003 20.476 19.965 19.473 18.993 18.546 18.074 17.626 17.208 16.774 16.314 15.867 15.469 15.063 14.683 14.341 14.004 13.659 13.371 13.056 12.696 12.417 12.14 11.867 11.575 11.257 11.047 10.825 10.453 10.196 9.922 9.776 9.486 9.185 8.868 8.694 8.251 8.11 7.917 7.709 7.252 7.007 6.751 6.452 6.114 5.732 5.265 4.395 -7 ,28277 ,KEBNE ,16692231,Thu Nov 25 18:02:48 CET,Thu Nov 25 19:37:05 CET,0.0 0.906 1.366 1.756 2.086 2.386 2.676 2.941 3.414 3.629 3.825 3.945 4.376 4.555 4.9 5.217 5.52 5.661 5.918 6.177 6.558 6.8 7.038 7.356 7.673 8.002 8.292 8.562 8.926 9.27 9.582 9.962 10.341 10.718 11.151 11.625 12.084 12.576 13.077 13.601 14.135 14.728 15.408 16.021 16.688 17.425 18.248 19.092 19.95 20.821 21.479 21.509 21.153 20.625 20.068 19.531 19.029 18.511 18.042 17.555 17.057 16.592 16.158 15.722 15.303 14.924 14.513 14.131 13.797 13.45 13.092 12.789 12.47 12.135 11.859 11.572 11.283 10.972 10.655 10.434 10.2 9.844 9.602 9.342 9.201 8.9 8.593 8.276 8.103 7.681 7.571 7.377 7.172 6.73 6.49 6.222 5.927 5.599 5.209 4.794 3.801 -8 ,17715 ,KEBNE ,16692232,Thu Nov 25 18:02:48 CET,Thu Nov 25 19:36:11 CET,0.0 1.157 1.603 1.978 2.325 2.643 2.928 3.176 3.609 3.806 3.996 4.123 4.563 4.75 5.091 5.396 5.688 5.825 6.083 6.341 6.715 6.965 7.207 7.55 7.882 8.199 8.501 8.791 9.179 9.544 9.876 10.275 10.65 11.013 11.439 11.887 12.283 12.717 13.21 13.734 14.255 14.828 15.477 16.041 16.63 17.305 18.096 18.928 19.801 20.652 21.333 21.44 21.211 20.783 20.248 19.644 19.083 18.535 18.02 17.541 17.092 16.615 16.145 15.727 15.337 14.963 14.563 14.195 13.86 13.509 13.14 12.83 12.5 12.149 11.881 11.594 11.295 10.987 10.66 10.437 10.202 9.836 9.591 9.335 9.203 8.922 8.616 8.298 8.135 7.719 7.611 7.419 7.215 6.764 6.512 6.25 5.968 5.642 5.245 4.745 3.573 -9 ,27163 ,KEBNE ,16692233,Thu Nov 25 18:02:48 CET,Thu Nov 25 19:36:21 CET,0.0 0.949 1.461 1.834 2.135 2.425 2.698 2.949 3.409 3.619 3.814 3.941 4.38 4.565 4.92 5.232 5.513 5.653 5.935 6.205 6.589 6.828 7.057 7.384 7.691 7.986 8.276 8.561 8.922 9.267 9.6 9.996 10.345 10.667 11.058 11.481 11.892 12.383 12.917 13.466 14.002 14.588 15.256 15.88 16.594 17.374 18.207 19.037 19.884 20.737 21.422 21.527 21.207 20.718 20.182 19.649 19.129 18.586 18.074 17.536 17.028 16.559 16.135 15.736 15.351 15.003 14.611 14.204 13.858 13.527 13.178 12.871 12.53 12.17 11.892 11.602 11.313 11.016 10.705 10.486 10.264 9.929 9.683 9.412 9.265 8.969 8.675 8.368 8.212 7.79 7.654 7.451 7.237 6.771 6.496 6.208 5.911 5.577 5.185 4.683 3.669 -10 ,28074 ,KEBNE ,16692234,Thu Nov 25 18:02:47 CET,Thu Nov 25 19:35:47 CET,0.0 0.782 1.225 1.601 1.934 2.222 2.493 2.757 3.243 3.463 3.682 3.846 4.288 4.465 4.793 5.104 5.402 5.547 5.824 6.089 6.471 6.716 6.95 7.283 7.621 7.95 8.249 8.547 8.921 9.264 9.598 10.005 10.392 10.759 11.19 11.67 12.104 12.568 13.096 13.669 14.22 14.802 15.438 15.999 16.638 17.387 18.255 19.146 19.989 20.765 21.37 21.437 21.185 20.768 20.257 19.687 19.139 18.642 18.176 17.645 17.154 16.688 16.252 15.871 15.518 15.166 14.754 14.386 14.078 13.746 13.376 13.062 12.752 12.399 12.108 11.817 11.539 11.248 10.92 10.7 10.478 10.119 9.864 9.597 9.462 9.182 8.879 8.545 8.362 7.93 7.823 7.631 7.426 6.992 6.742 6.478 6.21 5.899 5.535 5.061 4.251 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_15_14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_15_14.txt deleted file mode 100644 index 17af3319..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_15_14.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2938 ,TETRA ,17556055,Fri Nov 26 06:35:37 CET,Fri Nov 26 08:45:45 CET,0.0 1.195 1.488 1.714 1.903 2.071 2.219 2.364 2.618 2.729 2.838 2.963 3.167 3.277 3.497 3.711 3.889 3.965 4.137 4.32 4.569 4.72 4.853 5.038 5.213 5.376 5.54 5.72 5.948 6.157 6.356 6.59 6.823 7.062 7.345 7.655 7.937 8.224 8.566 8.949 9.345 9.822 10.399 10.958 11.586 12.303 13.167 14.1 15.091 16.213 17.52 18.208 18.228 17.999 17.618 17.196 16.811 16.393 15.964 15.533 15.153 14.774 14.384 14.01 13.656 13.29 12.89 12.544 12.227 11.879 11.481 11.155 10.843 10.517 10.232 9.914 9.595 9.254 8.878 8.618 8.349 7.927 7.637 7.341 7.19 6.863 6.458 6.011 5.801 5.526 5.196 4.959 4.701 4.129 3.823 3.444 2.969 2.427 1.7 0.811 -9.003 -2 ,23653 ,TETRA ,17556056,Fri Nov 26 06:35:37 CET,Fri Nov 26 08:46:15 CET,0.0 1.406 1.76 1.977 2.163 2.33 2.503 2.656 2.905 3.026 3.146 3.276 3.478 3.576 3.748 3.906 4.06 4.131 4.26 4.396 4.607 4.736 4.857 5.041 5.228 5.423 5.595 5.756 5.987 6.205 6.401 6.645 6.888 7.112 7.376 7.669 7.944 8.267 8.618 8.991 9.399 9.852 10.386 10.933 11.574 12.316 13.202 14.206 15.304 16.437 17.645 18.244 18.245 18.115 17.853 17.569 17.27 16.953 16.676 16.345 15.979 15.635 15.292 14.925 14.521 14.123 13.741 13.392 13.065 12.716 12.346 12.008 11.628 11.226 10.921 10.614 10.295 9.977 9.668 9.448 9.213 8.814 8.491 8.132 7.947 7.571 7.162 6.737 6.521 6.204 5.755 5.471 5.164 4.559 4.23 3.808 3.359 2.838 2.163 1.006 -5.91 -3 ,23512 ,TETRA ,17556057,Fri Nov 26 06:35:37 CET,Fri Nov 26 08:43:30 CET,0.0 0.953 1.242 1.469 1.633 1.777 1.914 2.036 2.254 2.363 2.465 2.549 2.741 2.84 3.025 3.205 3.366 3.442 3.582 3.721 3.934 4.073 4.219 4.431 4.624 4.81 4.997 5.173 5.384 5.593 5.805 6.075 6.339 6.575 6.838 7.13 7.421 7.742 8.079 8.462 8.873 9.298 9.801 10.329 10.922 11.539 12.285 13.185 14.204 15.319 16.466 17.141 17.367 17.23 16.93 16.599 16.186 15.713 15.254 14.8 14.399 14.019 13.633 13.196 12.775 12.422 12.031 11.665 11.329 10.928 10.464 10.065 9.644 9.222 8.909 8.537 8.122 7.719 7.306 7.04 6.778 6.325 6.0 5.701 5.547 5.194 4.784 4.332 4.098 3.752 3.256 2.913 2.546 1.82 1.424 1.002 0.514 -0.116 -0.826 -1.928 -9.037 -4 ,19737 ,TETRA ,17556058,Fri Nov 26 06:35:37 CET,Fri Nov 26 08:42:53 CET,0.0 0.765 0.967 1.127 1.278 1.43 1.585 1.753 2.028 2.139 2.25 2.366 2.56 2.659 2.846 3.019 3.176 3.256 3.415 3.568 3.785 3.923 4.052 4.237 4.421 4.603 4.79 4.982 5.23 5.456 5.662 5.916 6.168 6.402 6.675 6.998 7.315 7.651 8.024 8.42 8.831 9.3 9.841 10.389 10.972 11.628 12.379 13.196 14.196 15.267 16.429 17.251 17.404 17.278 17.044 16.72 16.302 15.809 15.344 14.861 14.456 14.119 13.781 13.416 13.077 12.749 12.383 12.012 11.646 11.295 10.944 10.638 10.304 9.934 9.652 9.356 9.04 8.718 8.379 8.141 7.861 7.386 7.077 6.778 6.613 6.239 5.825 5.361 5.104 4.743 4.224 3.907 3.537 2.592 2.058 1.472 0.852 0.142 -0.736 -1.969 -6.081 -5 ,13798 ,TETRA ,17556059,Fri Nov 26 06:35:37 CET,Fri Nov 26 08:42:02 CET,0.0 0.693 0.972 1.185 1.319 1.45 1.591 1.72 1.963 2.082 2.201 2.32 2.505 2.591 2.769 2.941 3.112 3.193 3.345 3.486 3.676 3.81 3.944 4.128 4.311 4.487 4.65 4.814 5.037 5.265 5.492 5.756 6.011 6.245 6.512 6.826 7.134 7.465 7.809 8.175 8.566 8.991 9.461 9.968 10.611 11.383 12.255 13.139 14.147 15.31 16.525 17.206 17.354 17.107 16.577 15.972 15.399 14.876 14.369 13.807 13.335 12.944 12.579 12.227 11.901 11.619 11.334 11.052 10.776 10.478 10.183 9.947 9.698 9.425 9.217 9.023 8.793 8.541 8.293 8.099 7.898 7.515 7.174 6.792 6.587 6.162 5.738 5.255 5.023 4.747 4.418 4.189 3.934 3.384 3.119 2.829 2.395 1.825 1.118 0.018 -9.523 -7 ,6951 ,TETRA ,17556061,Fri Nov 26 06:36:37 CET,Fri Nov 26 08:43:35 CET,0.0 0.456 0.637 0.79 0.949 1.086 1.217 1.346 1.575 1.684 1.789 1.871 2.049 2.132 2.295 2.458 2.605 2.668 2.796 2.918 3.095 3.216 3.336 3.526 3.718 3.891 4.045 4.199 4.41 4.619 4.825 5.069 5.323 5.566 5.826 6.132 6.433 6.773 7.15 7.532 7.921 8.37 8.928 9.466 10.039 10.703 11.478 12.34 13.335 14.475 15.761 16.581 16.616 16.382 16.088 15.797 15.531 15.186 14.864 14.526 14.182 13.869 13.515 13.142 12.816 12.526 12.194 11.846 11.524 11.188 10.824 10.494 10.141 9.756 9.446 9.124 8.806 8.489 8.139 7.892 7.647 7.261 6.98 6.67 6.502 6.167 5.814 5.373 5.129 4.788 4.306 4.033 3.765 3.164 2.821 2.397 1.845 1.128 0.221 -1.162 -6.324 -9 ,22011 ,TETRA ,17556063,Fri Nov 26 06:36:37 CET,Fri Nov 26 08:40:05 CET,0.0 1.906 2.224 2.444 2.629 2.758 2.888 3.035 3.314 3.433 3.552 3.679 3.867 3.968 4.158 4.328 4.479 4.552 4.697 4.834 5.033 5.161 5.289 5.477 5.657 5.837 6.006 6.17 6.393 6.604 6.799 7.032 7.255 7.47 7.732 8.023 8.302 8.646 9.045 9.458 9.889 10.369 10.913 11.462 12.107 12.775 13.492 14.273 15.232 16.337 17.43 17.993 18.001 17.837 17.575 17.208 16.862 16.49 16.09 15.682 15.336 14.996 14.607 14.24 13.884 13.521 13.146 12.808 12.503 12.178 11.839 11.533 11.192 10.878 10.671 10.448 10.146 9.791 9.423 9.144 8.853 8.444 8.141 7.827 7.679 7.363 7.012 6.64 6.443 6.135 5.678 5.379 5.052 4.365 4.009 3.575 2.999 2.287 1.472 0.353 -5.174 -10 ,21352 ,TETRA ,17556064,Fri Nov 26 06:36:37 CET,Fri Nov 26 08:44:12 CET,0.0 1.442 1.748 1.989 2.18 2.337 2.486 2.637 2.897 3.023 3.145 3.252 3.438 3.519 3.677 3.837 3.995 4.078 4.248 4.401 4.621 4.762 4.897 5.099 5.303 5.495 5.682 5.862 6.086 6.306 6.524 6.794 7.057 7.313 7.623 7.967 8.275 8.608 8.984 9.395 9.808 10.249 10.756 11.272 11.935 12.715 13.533 14.375 15.345 16.499 17.721 18.229 18.209 18.073 17.84 17.529 17.163 16.777 16.436 16.045 15.613 15.137 14.643 14.166 13.721 13.321 12.898 12.513 12.18 11.838 11.451 11.095 10.7 10.281 9.982 9.703 9.364 8.95 8.577 8.305 7.98 7.461 7.093 6.732 6.545 6.098 5.586 5.075 4.822 4.484 3.974 3.649 3.315 2.476 2.011 1.444 0.824 0.214 -0.613 -1.633 -10.847 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_15_16.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_15_16.txt deleted file mode 100644 index f74e06d4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_15_16.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28960 ,TETRA ,17556065,Fri Nov 26 06:36:37 CET,Fri Nov 26 08:45:27 CET,0.0 0.604 0.8 0.951 1.059 1.139 1.227 1.317 1.496 1.573 1.652 1.72 1.878 1.931 2.029 2.136 2.236 2.278 2.375 2.474 2.596 2.675 2.756 2.87 2.981 3.092 3.197 3.289 3.419 3.554 3.684 3.849 3.999 4.126 4.279 4.459 4.626 4.804 4.998 5.207 5.427 5.669 5.944 6.216 6.535 6.865 7.165 7.467 7.813 8.102 8.238 8.002 7.459 6.921 6.431 5.916 5.42 4.93 4.444 3.918 3.458 3.037 2.646 2.279 1.92 1.575 1.224 0.895 0.591 0.285 -0.048 -0.347 -0.665 -0.975 -1.209 -1.449 -1.7 -1.967 -2.235 -2.431 -2.655 -2.992 -3.206 -3.436 -3.569 -3.843 -4.135 -4.454 -4.627 -4.892 -5.159 -5.352 -5.55 -5.997 -6.236 -6.486 -6.783 -7.164 -7.636 -8.237 -10.138 -2 ,32362 ,TETRA ,17556066,Fri Nov 26 06:37:35 CET,Fri Nov 26 08:47:01 CET,0.0 0.459 0.621 0.769 0.882 0.974 1.056 1.127 1.256 1.325 1.405 1.472 1.637 1.704 1.839 1.938 2.02 2.068 2.161 2.238 2.364 2.453 2.538 2.673 2.795 2.907 3.012 3.112 3.241 3.372 3.505 3.665 3.821 3.975 4.159 4.371 4.561 4.756 4.965 5.198 5.445 5.706 6.004 6.307 6.65 7.013 7.423 7.831 8.194 8.478 8.614 8.385 7.871 7.238 6.564 5.833 5.22 4.688 4.161 3.592 3.105 2.668 2.241 1.851 1.505 1.164 0.771 0.392 0.066 -0.254 -0.601 -0.891 -1.193 -1.534 -1.801 -2.066 -2.336 -2.63 -2.958 -3.189 -3.42 -3.769 -4.017 -4.279 -4.411 -4.686 -4.984 -5.303 -5.478 -5.761 -6.073 -6.295 -6.521 -6.997 -7.276 -7.604 -7.956 -8.369 -8.895 -9.535 -11.524 -3 ,10391 ,TETRA ,17556067,Fri Nov 26 06:37:37 CET,Fri Nov 26 08:45:16 CET,0.0 0.391 0.532 0.615 0.703 0.791 0.872 0.956 1.131 1.204 1.263 1.307 1.47 1.535 1.659 1.768 1.877 1.93 2.022 2.114 2.259 2.347 2.433 2.566 2.677 2.784 2.897 2.997 3.12 3.235 3.351 3.496 3.635 3.761 3.904 4.079 4.244 4.42 4.614 4.814 5.017 5.237 5.484 5.761 6.094 6.401 6.733 7.092 7.448 7.853 8.03 7.686 7.129 6.539 5.929 5.278 4.678 4.1 3.599 3.109 2.649 2.223 1.829 1.44 1.055 0.692 0.293 -0.074 -0.392 -0.732 -1.088 -1.384 -1.697 -2.019 -2.266 -2.522 -2.795 -3.097 -3.403 -3.616 -3.827 -4.147 -4.383 -4.631 -4.762 -5.045 -5.369 -5.7 -5.864 -6.134 -6.432 -6.632 -6.834 -7.314 -7.595 -7.892 -8.197 -8.533 -8.91 -9.478 -11.873 -4 ,8013 ,TETRA ,17556068,Fri Nov 26 06:37:38 CET,Fri Nov 26 08:45:38 CET,0.0 0.47 0.676 0.809 0.938 1.042 1.128 1.224 1.406 1.481 1.537 1.548 1.703 1.761 1.882 2.001 2.117 2.173 2.275 2.368 2.502 2.59 2.677 2.795 2.914 3.039 3.15 3.251 3.396 3.546 3.683 3.839 3.983 4.124 4.292 4.485 4.665 4.861 5.075 5.298 5.535 5.818 6.141 6.433 6.732 7.055 7.413 7.819 8.245 8.615 8.848 8.586 8.055 7.519 6.958 6.331 5.701 5.052 4.436 3.796 3.263 2.786 2.304 1.838 1.372 0.931 0.483 0.072 -0.302 -0.691 -1.087 -1.435 -1.801 -2.172 -2.464 -2.78 -3.109 -3.421 -3.757 -4.007 -4.258 -4.629 -4.877 -5.137 -5.276 -5.563 -5.849 -6.127 -6.287 -6.566 -6.865 -7.069 -7.29 -7.808 -8.085 -8.363 -8.677 -9.051 -9.474 -10.07 -12.226 -5 ,10217 ,TETRA ,17556069,Fri Nov 26 06:37:37 CET,Fri Nov 26 08:47:39 CET,0.0 0.222 0.367 0.458 0.533 0.606 0.684 0.761 0.904 0.982 1.052 1.074 1.237 1.299 1.413 1.53 1.645 1.7 1.806 1.909 2.071 2.168 2.248 2.364 2.476 2.583 2.692 2.809 2.964 3.104 3.231 3.382 3.539 3.694 3.859 4.045 4.226 4.414 4.604 4.802 5.033 5.325 5.659 5.975 6.306 6.652 7.048 7.435 7.784 8.106 8.28 7.963 7.367 6.72 6.131 5.543 4.873 4.195 3.655 3.089 2.5 1.945 1.424 0.956 0.514 0.083 -0.375 -0.771 -1.098 -1.443 -1.815 -2.133 -2.461 -2.802 -3.067 -3.342 -3.634 -3.93 -4.224 -4.425 -4.631 -4.937 -5.157 -5.429 -5.573 -5.844 -6.132 -6.463 -6.64 -6.903 -7.161 -7.363 -7.592 -8.074 -8.337 -8.62 -8.917 -9.3 -9.739 -10.293 -12.031 -6 ,14765 ,TETRA ,17556070,Fri Nov 26 06:37:37 CET,Fri Nov 26 08:45:22 CET,0.0 0.318 0.463 0.561 0.651 0.705 0.759 0.818 0.936 0.991 1.043 1.049 1.192 1.253 1.382 1.489 1.573 1.613 1.693 1.773 1.908 1.995 2.079 2.196 2.306 2.413 2.517 2.615 2.737 2.865 2.984 3.116 3.253 3.381 3.53 3.698 3.869 4.067 4.266 4.468 4.691 4.939 5.217 5.505 5.836 6.175 6.59 7.016 7.404 7.777 7.808 7.379 6.867 6.274 5.708 5.131 4.596 4.153 3.675 3.146 2.728 2.342 1.913 1.48 1.07 0.674 0.272 -0.082 -0.402 -0.73 -1.064 -1.339 -1.61 -1.887 -2.1 -2.326 -2.586 -2.868 -3.162 -3.368 -3.59 -3.906 -4.115 -4.35 -4.474 -4.745 -5.021 -5.292 -5.437 -5.691 -5.943 -6.138 -6.363 -6.791 -7.03 -7.299 -7.603 -7.928 -8.274 -8.746 -10.272 -7 ,21249 ,TETRA ,17556071,Fri Nov 26 05:46:10 CET,Fri Nov 26 07:55:42 CET,0.0 0.3 0.456 0.587 0.689 0.794 0.882 0.943 1.083 1.168 1.242 1.262 1.414 1.475 1.596 1.691 1.785 1.83 1.921 2.024 2.144 2.213 2.284 2.397 2.512 2.618 2.715 2.819 2.956 3.072 3.18 3.312 3.439 3.557 3.678 3.819 3.977 4.156 4.348 4.545 4.746 4.977 5.254 5.512 5.81 6.157 6.522 6.873 7.22 7.541 7.531 7.104 6.63 5.985 5.31 4.712 4.143 3.611 3.145 2.646 2.19 1.773 1.37 0.966 0.575 0.204 -0.197 -0.55 -0.861 -1.21 -1.578 -1.87 -2.18 -2.517 -2.773 -3.036 -3.318 -3.612 -3.914 -4.127 -4.351 -4.695 -4.936 -5.172 -5.3 -5.582 -5.868 -6.192 -6.384 -6.666 -6.948 -7.144 -7.397 -7.981 -8.275 -8.568 -8.899 -9.301 -9.756 -10.481 -12.613 -8 ,26037 ,TETRA ,17556072,Fri Nov 26 05:46:10 CET,Fri Nov 26 07:38:46 CET,0.0 0.266 0.409 0.533 0.648 0.759 0.844 0.926 1.078 1.151 1.212 1.227 1.379 1.438 1.554 1.67 1.757 1.8 1.905 1.998 2.127 2.209 2.29 2.432 2.567 2.682 2.8 2.909 3.034 3.145 3.259 3.416 3.579 3.753 3.938 4.133 4.321 4.512 4.734 4.968 5.176 5.387 5.636 5.918 6.269 6.644 7.028 7.405 7.783 8.171 8.371 8.01 7.518 7.054 6.492 5.86 5.275 4.77 4.295 3.757 3.28 2.829 2.376 1.904 1.434 1.029 0.614 0.239 -0.08 -0.413 -0.764 -1.053 -1.349 -1.66 -1.894 -2.138 -2.415 -2.714 -3.023 -3.236 -3.453 -3.799 -4.042 -4.297 -4.429 -4.707 -5.015 -5.324 -5.483 -5.748 -6.057 -6.266 -6.479 -6.935 -7.206 -7.538 -7.893 -8.253 -8.7 -9.286 -11.503 -9 ,4818 ,TETRA ,17556073,Fri Nov 26 05:46:10 CET,Fri Nov 26 07:34:45 CET,0.0 0.163 0.263 0.361 0.447 0.529 0.606 0.676 0.818 0.878 0.932 0.942 1.088 1.152 1.262 1.344 1.422 1.465 1.554 1.643 1.775 1.853 1.925 2.033 2.143 2.247 2.352 2.451 2.576 2.698 2.803 2.923 3.051 3.183 3.323 3.486 3.648 3.809 3.985 4.168 4.36 4.588 4.849 5.088 5.383 5.752 6.127 6.502 6.903 7.221 7.355 6.984 6.408 5.825 5.282 4.788 4.25 3.718 3.256 2.721 2.199 1.733 1.298 0.903 0.537 0.187 -0.176 -0.484 -0.746 -1.052 -1.413 -1.716 -2.006 -2.298 -2.514 -2.733 -2.978 -3.237 -3.525 -3.741 -3.96 -4.302 -4.542 -4.8 -4.937 -5.2 -5.482 -5.799 -5.967 -6.225 -6.473 -6.677 -6.901 -7.328 -7.562 -7.863 -8.199 -8.58 -9.029 -9.671 -11.812 -10 ,23496 ,TETRA ,17556074,Fri Nov 26 05:46:11 CET,Fri Nov 26 07:55:01 CET,0.0 0.356 0.57 0.712 0.818 0.91 1.001 1.092 1.25 1.324 1.391 1.441 1.615 1.677 1.798 1.913 2.026 2.084 2.191 2.286 2.427 2.523 2.611 2.736 2.861 2.983 3.109 3.235 3.384 3.53 3.665 3.817 3.977 4.136 4.323 4.527 4.726 4.955 5.195 5.448 5.715 6.017 6.341 6.66 7.048 7.456 7.812 8.145 8.57 8.984 9.178 8.871 8.301 7.651 7.005 6.404 5.895 5.404 4.927 4.409 3.916 3.434 2.978 2.574 2.179 1.811 1.434 1.084 0.76 0.412 0.041 -0.263 -0.563 -0.886 -1.153 -1.425 -1.708 -1.997 -2.283 -2.486 -2.695 -3.034 -3.276 -3.53 -3.659 -3.966 -4.311 -4.663 -4.847 -5.125 -5.419 -5.617 -5.842 -6.409 -6.735 -7.046 -7.369 -7.717 -8.114 -8.64 -10.066 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_16_14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_16_14.txt deleted file mode 100644 index 8774908c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_16_14.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5360 ,TETRA ,17556075,Fri Nov 26 05:48:13 CET,Fri Nov 26 07:52:56 CET,0.0 0.905 1.239 1.56 1.782 1.941 2.099 2.246 2.542 2.677 2.794 2.915 3.107 3.207 3.379 3.539 3.69 3.769 3.933 4.09 4.318 4.455 4.575 4.761 4.951 5.131 5.302 5.475 5.704 5.915 6.111 6.344 6.59 6.837 7.109 7.409 7.708 8.035 8.389 8.781 9.183 9.617 10.119 10.603 11.149 11.743 12.448 13.24 14.092 15.127 16.376 17.274 17.6 17.668 17.669 17.649 17.593 17.5 17.353 17.132 16.954 16.799 16.602 16.381 16.168 15.949 15.698 15.499 15.36 15.209 14.999 14.783 14.551 14.343 14.198 14.053 13.905 13.734 13.536 13.39 13.243 13.039 12.907 12.764 12.674 12.48 12.284 12.06 11.945 11.746 11.599 11.469 11.317 10.967 10.763 10.548 10.307 9.972 9.529 8.927 6.08 -2 ,6041 ,TETRA ,17556076,Fri Nov 26 05:47:11 CET,Fri Nov 26 07:51:02 CET,0.0 1.534 1.928 2.169 2.362 2.538 2.714 2.882 3.164 3.282 3.396 3.537 3.732 3.825 4.006 4.191 4.367 4.451 4.608 4.747 4.944 5.079 5.22 5.419 5.599 5.772 5.942 6.093 6.282 6.485 6.681 6.904 7.127 7.331 7.563 7.832 8.098 8.401 8.712 9.041 9.396 9.78 10.205 10.657 11.182 11.71 12.291 12.957 13.757 14.7 15.75 16.436 16.724 16.874 16.947 16.986 16.961 16.897 16.834 16.726 16.595 16.452 16.315 16.194 16.085 15.971 15.828 15.68 15.541 15.414 15.246 15.072 14.896 14.722 14.576 14.42 14.278 14.123 13.954 13.834 13.721 13.54 13.404 13.243 13.168 13.032 12.846 12.61 12.497 12.297 12.149 12.035 11.884 11.496 11.248 10.947 10.653 10.346 9.969 9.484 7.519 -3 ,5443 ,TETRA ,17556077,Fri Nov 26 05:48:14 CET,Fri Nov 26 07:53:53 CET,0.0 1.131 1.381 1.592 1.797 1.969 2.12 2.258 2.516 2.634 2.743 2.852 3.033 3.127 3.309 3.458 3.596 3.674 3.824 3.975 4.219 4.374 4.515 4.717 4.912 5.094 5.27 5.438 5.645 5.855 6.064 6.314 6.546 6.766 7.016 7.316 7.604 7.903 8.213 8.523 8.866 9.279 9.743 10.204 10.749 11.339 12.05 12.873 13.815 14.915 16.093 16.839 17.105 17.185 17.177 17.073 16.954 16.827 16.671 16.504 16.352 16.175 15.973 15.793 15.652 15.522 15.336 15.116 14.919 14.675 14.381 14.149 13.926 13.706 13.543 13.381 13.212 13.019 12.768 12.592 12.417 12.148 11.954 11.744 11.642 11.402 11.101 10.765 10.597 10.347 10.087 9.913 9.743 9.351 9.115 8.835 8.469 8.057 7.483 6.655 2.633 -4 ,28773 ,TETRA ,17556078,Fri Nov 26 05:48:14 CET,Fri Nov 26 07:52:00 CET,0.0 1.95 2.285 2.443 2.593 2.742 2.879 2.997 3.212 3.311 3.409 3.51 3.679 3.76 3.93 4.086 4.242 4.318 4.459 4.595 4.795 4.941 5.086 5.282 5.464 5.64 5.826 6.021 6.257 6.461 6.665 6.909 7.135 7.347 7.592 7.87 8.13 8.41 8.728 9.101 9.493 9.897 10.357 10.839 11.421 12.064 12.76 13.538 14.477 15.521 16.654 17.418 17.641 17.725 17.787 17.731 17.581 17.411 17.263 17.12 16.963 16.785 16.565 16.295 16.041 15.794 15.516 15.253 15.043 14.855 14.629 14.44 14.268 14.092 13.93 13.752 13.583 13.408 13.21 13.066 12.922 12.704 12.543 12.363 12.279 12.125 11.933 11.702 11.596 11.411 11.237 11.079 10.914 10.557 10.344 10.149 9.953 9.71 9.394 8.903 6.606 -6 ,13003 ,TETRA ,17556080,Fri Nov 26 05:49:12 CET,Fri Nov 26 07:54:04 CET,0.0 1.426 1.799 2.071 2.297 2.505 2.687 2.814 3.033 3.134 3.243 3.381 3.571 3.657 3.826 4.004 4.172 4.259 4.42 4.577 4.8 4.931 5.067 5.264 5.444 5.627 5.796 5.955 6.172 6.39 6.608 6.873 7.111 7.345 7.62 7.905 8.188 8.505 8.838 9.189 9.556 9.982 10.459 10.912 11.465 12.116 12.842 13.589 14.436 15.325 16.179 16.632 16.727 16.802 16.835 16.775 16.542 16.205 15.901 15.596 15.32 15.083 14.889 14.676 14.442 14.207 13.943 13.719 13.519 13.319 13.132 12.969 12.812 12.661 12.52 12.33 12.107 11.874 11.627 11.459 11.311 11.071 10.881 10.705 10.623 10.437 10.219 9.995 9.873 9.669 9.479 9.307 9.125 8.753 8.549 8.341 8.118 7.831 7.425 6.877 4.587 -7 ,18970 ,TETRA ,17556081,Fri Nov 26 05:49:12 CET,Fri Nov 26 07:53:45 CET,0.0 0.644 0.838 1.011 1.154 1.288 1.43 1.547 1.766 1.874 1.974 2.068 2.251 2.341 2.527 2.693 2.841 2.913 3.048 3.199 3.419 3.533 3.644 3.831 4.012 4.173 4.334 4.496 4.7 4.888 5.063 5.279 5.49 5.686 5.933 6.23 6.507 6.807 7.136 7.468 7.814 8.213 8.673 9.148 9.682 10.312 11.091 11.903 12.758 13.526 14.105 14.316 14.157 13.939 13.707 13.428 13.174 12.901 12.652 12.42 12.201 11.999 11.764 11.491 11.222 10.965 10.709 10.514 10.336 10.132 9.924 9.771 9.632 9.448 9.288 9.142 8.985 8.79 8.585 8.443 8.298 8.072 7.905 7.709 7.606 7.429 7.251 7.067 6.977 6.787 6.635 6.515 6.383 6.089 5.925 5.688 5.439 5.224 4.959 4.529 1.893 -8 ,5019 ,TETRA ,17556082,Fri Nov 26 05:49:12 CET,Fri Nov 26 07:53:30 CET,0.0 0.781 1.12 1.402 1.578 1.722 1.848 1.967 2.212 2.337 2.461 2.584 2.769 2.86 3.041 3.224 3.397 3.485 3.644 3.786 3.987 4.123 4.253 4.445 4.635 4.81 4.986 5.154 5.374 5.583 5.78 6.004 6.215 6.432 6.684 6.975 7.272 7.577 7.884 8.207 8.539 8.933 9.406 9.868 10.393 10.965 11.613 12.356 13.185 14.054 15.01 15.664 15.87 15.859 15.749 15.607 15.435 15.239 15.048 14.809 14.589 14.386 14.178 13.987 13.832 13.723 13.579 13.403 13.24 13.055 12.866 12.716 12.532 12.318 12.159 12.005 11.837 11.676 11.516 11.38 11.227 11.009 10.859 10.671 10.578 10.403 10.195 9.969 9.85 9.64 9.464 9.309 9.139 8.831 8.641 8.389 8.116 7.806 7.46 6.865 3.846 -9 ,21071 ,TETRA ,17556083,Fri Nov 26 05:49:12 CET,Fri Nov 26 07:44:07 CET,0.0 1.311 1.565 1.749 1.919 2.067 2.196 2.324 2.569 2.682 2.793 2.897 3.075 3.162 3.327 3.486 3.629 3.696 3.845 3.999 4.2 4.335 4.464 4.656 4.851 5.014 5.173 5.335 5.53 5.719 5.896 6.112 6.331 6.536 6.785 7.079 7.371 7.69 8.046 8.443 8.85 9.295 9.806 10.324 10.887 11.465 12.187 13.049 13.977 15.027 16.233 17.038 17.37 17.457 17.462 17.424 17.349 17.228 17.057 16.87 16.709 16.547 16.398 16.261 16.126 15.952 15.76 15.624 15.474 15.289 15.077 14.892 14.707 14.509 14.354 14.208 14.074 13.922 13.77 13.681 13.585 13.375 13.194 13.003 12.919 12.759 12.571 12.361 12.249 12.055 11.941 11.826 11.673 11.373 11.22 10.989 10.702 10.395 9.979 9.414 7.828 -10 ,1821 ,TETRA ,17556084,Fri Nov 26 05:49:12 CET,Fri Nov 26 07:52:30 CET,0.0 1.286 1.672 1.997 2.23 2.408 2.587 2.745 2.974 3.079 3.188 3.327 3.519 3.616 3.79 3.954 4.115 4.193 4.343 4.494 4.719 4.858 4.992 5.177 5.362 5.548 5.719 5.875 6.09 6.313 6.525 6.778 7.027 7.273 7.534 7.814 8.091 8.398 8.736 9.086 9.447 9.846 10.301 10.768 11.322 11.919 12.57 13.317 14.199 15.193 16.361 17.197 17.555 17.67 17.646 17.533 17.334 17.093 16.862 16.636 16.445 16.251 16.069 15.898 15.733 15.595 15.445 15.286 15.114 14.93 14.742 14.573 14.402 14.202 14.048 13.889 13.686 13.488 13.316 13.194 13.076 12.906 12.782 12.645 12.565 12.383 12.182 11.978 11.863 11.64 11.487 11.38 11.257 10.977 10.801 10.572 10.287 9.94 9.536 9.087 6.726 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_17_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_17_15.txt deleted file mode 100644 index 1ab34978..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_17_15.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27011 ,TETRA ,17556085,Fri Nov 26 05:49:14 CET,Fri Nov 26 07:56:02 CET,0.0 1.408 1.833 2.175 2.459 2.701 2.931 3.123 3.471 3.627 3.779 3.997 4.261 4.422 4.737 5.025 5.295 5.42 5.657 5.88 6.204 6.406 6.593 6.866 7.121 7.353 7.578 7.809 8.1 8.378 8.654 9.014 9.388 9.754 10.158 10.61 11.052 11.542 12.077 12.63 13.196 13.817 14.524 15.212 16.021 16.913 17.895 18.987 20.226 21.555 22.859 23.695 24.069 24.183 24.252 24.249 24.137 23.999 23.878 23.773 23.667 23.541 23.405 23.263 23.115 22.969 22.809 22.661 22.53 22.405 22.29 22.19 22.083 21.979 21.899 21.8 21.69 21.584 21.47 21.392 21.318 21.2 21.113 21.013 20.958 20.842 20.731 20.616 20.55 20.385 20.342 20.266 20.18 19.972 19.863 19.741 19.599 19.472 19.334 19.134 18.543 -2 ,29921 ,TETRA ,17556086,Fri Nov 26 05:49:12 CET,Fri Nov 26 07:55:15 CET,0.0 0.918 1.323 1.682 1.989 2.237 2.479 2.712 3.082 3.254 3.435 3.673 3.933 4.084 4.355 4.592 4.819 4.932 5.17 5.403 5.736 5.951 6.162 6.463 6.736 7.009 7.276 7.534 7.879 8.219 8.52 8.856 9.197 9.543 9.954 10.439 10.884 11.344 11.859 12.393 12.96 13.583 14.289 15.008 15.814 16.678 17.635 18.629 19.697 20.866 22.039 22.827 23.128 23.167 23.035 22.833 22.611 22.371 22.154 21.895 21.661 21.464 21.283 21.118 20.94 20.751 20.546 20.357 20.197 20.04 19.878 19.727 19.547 19.373 19.252 19.132 19.013 18.884 18.758 18.668 18.552 18.363 18.255 18.154 18.097 17.98 17.836 17.668 17.582 17.403 17.34 17.265 17.179 16.955 16.824 16.687 16.519 16.342 16.152 15.946 15.31 -3 ,12423 ,TETRA ,17556087,Fri Nov 26 05:50:12 CET,Fri Nov 26 07:57:39 CET,0.0 1.06 1.428 1.719 1.988 2.238 2.448 2.639 3.009 3.199 3.377 3.564 3.817 3.945 4.196 4.449 4.696 4.815 5.04 5.256 5.562 5.756 5.949 6.222 6.482 6.733 6.995 7.254 7.565 7.854 8.131 8.48 8.817 9.138 9.509 9.934 10.342 10.773 11.232 11.721 12.251 12.851 13.523 14.193 14.972 15.866 16.916 18.023 19.307 20.677 22.089 22.96 23.206 23.199 23.093 22.955 22.746 22.532 22.364 22.159 21.958 21.794 21.628 21.464 21.312 21.177 21.041 20.911 20.797 20.674 20.533 20.419 20.311 20.197 20.102 20.002 19.906 19.811 19.695 19.619 19.533 19.387 19.293 19.195 19.144 19.041 18.933 18.807 18.73 18.562 18.535 18.463 18.382 18.22 18.139 18.051 17.947 17.808 17.59 17.292 16.76 -4 ,18274 ,TETRA ,17556088,Fri Nov 26 05:50:12 CET,Fri Nov 26 07:58:50 CET,0.0 0.82 1.163 1.516 1.833 2.099 2.324 2.514 2.884 3.063 3.23 3.433 3.686 3.823 4.09 4.336 4.559 4.663 4.868 5.068 5.369 5.554 5.731 5.998 6.251 6.501 6.742 6.966 7.274 7.582 7.865 8.183 8.501 8.839 9.227 9.645 10.041 10.456 10.911 11.403 11.915 12.478 13.104 13.749 14.536 15.424 16.436 17.535 18.71 19.999 21.355 22.19 22.489 22.552 22.48 22.337 22.22 22.105 21.966 21.811 21.667 21.533 21.405 21.275 21.151 21.039 20.916 20.818 20.736 20.638 20.532 20.438 20.326 20.211 20.126 20.032 19.937 19.842 19.746 19.673 19.592 19.484 19.396 19.291 19.242 19.15 19.055 18.954 18.889 18.724 18.699 18.64 18.57 18.394 18.308 18.221 18.103 17.954 17.791 17.596 16.862 -5 ,9891 ,TETRA ,17556089,Fri Nov 26 05:50:12 CET,Fri Nov 26 07:59:17 CET,0.0 0.64 1.039 1.362 1.674 1.95 2.169 2.384 2.787 2.982 3.179 3.441 3.711 3.871 4.188 4.482 4.744 4.872 5.123 5.344 5.645 5.842 6.048 6.356 6.641 6.906 7.159 7.396 7.696 7.983 8.265 8.617 8.948 9.269 9.674 10.136 10.552 10.992 11.471 11.981 12.507 13.085 13.772 14.473 15.276 16.104 16.982 18.018 19.307 20.777 22.373 23.509 23.992 24.179 24.195 24.122 23.97 23.821 23.72 23.587 23.445 23.278 23.092 22.918 22.785 22.664 22.539 22.457 22.376 22.27 22.147 22.046 21.946 21.846 21.764 21.669 21.569 21.458 21.329 21.229 21.125 20.962 20.839 20.725 20.674 20.572 20.463 20.333 20.263 20.094 20.034 19.938 19.845 19.664 19.56 19.449 19.323 19.181 18.975 18.695 18.001 -6 ,26669 ,TETRA ,17556090,Fri Nov 26 05:50:12 CET,Fri Nov 26 07:57:08 CET,0.0 1.668 2.214 2.58 2.893 3.184 3.451 3.696 4.137 4.337 4.535 4.797 5.066 5.225 5.52 5.783 6.034 6.158 6.409 6.659 7.011 7.235 7.457 7.782 8.089 8.377 8.653 8.917 9.252 9.571 9.877 10.239 10.587 10.925 11.308 11.731 12.147 12.597 13.067 13.564 14.089 14.683 15.364 16.034 16.795 17.63 18.565 19.6 20.803 22.18 23.736 24.835 25.267 25.344 25.337 25.32 25.277 25.195 25.076 24.923 24.766 24.616 24.478 24.332 24.174 24.033 23.894 23.752 23.622 23.503 23.362 23.242 23.123 22.994 22.896 22.789 22.679 22.557 22.422 22.329 22.244 22.134 22.049 21.947 21.893 21.777 21.658 21.521 21.449 21.285 21.232 21.163 21.088 20.931 20.865 20.792 20.703 20.594 20.431 20.155 19.402 -7 ,28428 ,TETRA ,17556091,Fri Nov 26 05:50:15 CET,Fri Nov 26 07:57:18 CET,0.0 2.301 2.793 3.15 3.467 3.731 3.972 4.194 4.584 4.774 4.963 5.227 5.516 5.685 5.986 6.247 6.51 6.635 6.866 7.084 7.385 7.586 7.779 8.054 8.329 8.598 8.846 9.08 9.398 9.73 10.055 10.435 10.788 11.123 11.525 11.967 12.378 12.83 13.319 13.837 14.37 14.971 15.673 16.373 17.178 18.076 19.129 20.255 21.476 22.886 24.563 25.691 26.067 26.234 26.281 26.174 26.042 25.896 25.728 25.545 25.378 25.212 25.064 24.917 24.751 24.607 24.473 24.355 24.245 24.118 23.97 23.856 23.753 23.633 23.536 23.432 23.327 23.236 23.128 23.049 22.969 22.826 22.733 22.649 22.608 22.519 22.404 22.28 22.218 22.06 22.016 21.946 21.876 21.712 21.619 21.521 21.387 21.216 20.977 20.729 19.737 -8 ,24215 ,TETRA ,17556092,Fri Nov 26 05:50:12 CET,Fri Nov 26 07:56:33 CET,0.0 0.996 1.409 1.759 2.05 2.314 2.562 2.798 3.247 3.45 3.624 3.843 4.115 4.285 4.607 4.887 5.145 5.28 5.548 5.819 6.205 6.448 6.685 7.002 7.308 7.596 7.876 8.162 8.538 8.888 9.214 9.618 10.008 10.375 10.796 11.299 11.787 12.296 12.865 13.47 14.083 14.754 15.482 16.189 16.996 17.828 18.765 19.899 21.127 22.401 23.749 24.576 24.887 24.965 24.901 24.839 24.801 24.68 24.501 24.306 24.136 23.965 23.758 23.542 23.364 23.22 23.077 22.947 22.814 22.677 22.537 22.4 22.249 22.115 22.022 21.921 21.813 21.707 21.612 21.539 21.456 21.323 21.226 21.124 21.072 20.967 20.856 20.739 20.682 20.534 20.503 20.437 20.371 20.234 20.144 20.025 19.89 19.738 19.551 19.334 18.382 -9 ,12981 ,TETRA ,17556093,Fri Nov 26 05:50:12 CET,Fri Nov 26 07:57:49 CET,0.0 1.149 1.679 2.095 2.411 2.681 2.911 3.143 3.58 3.767 3.938 4.15 4.415 4.557 4.843 5.128 5.382 5.503 5.739 5.974 6.299 6.509 6.723 7.03 7.333 7.621 7.887 8.137 8.449 8.765 9.083 9.454 9.802 10.138 10.509 10.915 11.296 11.695 12.143 12.658 13.197 13.788 14.484 15.2 16.019 16.903 17.897 18.944 20.152 21.492 22.962 23.918 24.281 24.442 24.463 24.382 24.268 24.12 23.95 23.771 23.61 23.467 23.33 23.206 23.077 22.94 22.784 22.636 22.52 22.402 22.274 22.157 22.027 21.896 21.791 21.687 21.565 21.429 21.298 21.203 21.104 20.959 20.86 20.757 20.701 20.578 20.449 20.321 20.26 20.1 20.058 19.979 19.89 19.695 19.595 19.495 19.373 19.24 19.053 18.772 17.749 -10 ,10375 ,TETRA ,17556094,Fri Nov 26 05:50:15 CET,Fri Nov 26 07:57:24 CET,0.0 1.287 1.776 2.177 2.543 2.868 3.15 3.4 3.828 4.015 4.189 4.433 4.724 4.895 5.226 5.528 5.8 5.934 6.191 6.435 6.795 7.024 7.244 7.57 7.886 8.188 8.468 8.728 9.068 9.39 9.7 10.073 10.418 10.74 11.099 11.499 11.882 12.318 12.795 13.289 13.775 14.322 14.998 15.68 16.475 17.331 18.313 19.414 20.616 22.01 23.527 24.515 24.919 25.023 25.012 24.949 24.808 24.648 24.512 24.358 24.235 24.127 23.982 23.809 23.663 23.539 23.398 23.269 23.153 23.034 22.909 22.809 22.699 22.571 22.476 22.393 22.297 22.179 22.068 21.995 21.912 21.774 21.68 21.587 21.543 21.437 21.321 21.222 21.163 21.004 20.951 20.874 20.805 20.65 20.551 20.418 20.271 20.088 19.896 19.673 19.126 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_18_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_18_15.txt deleted file mode 100644 index 8bd77068..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_18_15.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7247 ,KEBNE ,17025348,Wed Dec 22 12:17:57 CET,Wed Dec 22 14:06:26 CET,0.0 1.275 1.692 2.082 2.427 2.725 2.975 3.204 3.606 3.795 3.982 4.213 4.47 4.625 4.914 5.189 5.457 5.587 5.835 6.059 6.368 6.57 6.758 7.038 7.319 7.589 7.847 8.088 8.383 8.668 8.943 9.269 9.585 9.901 10.274 10.67 11.052 11.486 11.95 12.418 12.888 13.411 14.003 14.593 15.285 16.03 16.863 17.788 18.789 19.851 20.95 21.542 21.724 21.758 21.654 21.467 21.252 21.032 20.835 20.647 20.47 20.285 20.126 19.983 19.841 19.712 19.583 19.473 19.376 19.257 19.131 19.033 18.916 18.792 18.701 18.596 18.484 18.375 18.262 18.175 18.084 17.948 17.856 17.767 17.716 17.592 17.473 17.345 17.269 17.106 17.037 16.952 16.88 16.708 16.605 16.501 16.383 16.25 16.112 15.916 15.483 -2 ,18071 ,KEBNE ,17025349,Wed Dec 22 12:17:57 CET,Wed Dec 22 14:05:30 CET,0.0 1.521 1.979 2.315 2.626 2.887 3.109 3.329 3.728 3.905 4.068 4.285 4.552 4.707 5.003 5.29 5.551 5.678 5.927 6.159 6.472 6.672 6.864 7.139 7.409 7.665 7.894 8.108 8.396 8.684 8.962 9.311 9.644 9.945 10.286 10.662 11.029 11.445 11.887 12.371 12.911 13.529 14.203 14.877 15.625 16.385 17.232 18.113 19.045 20.011 20.983 21.605 21.858 21.933 21.873 21.758 21.612 21.449 21.291 21.119 20.954 20.786 20.61 20.452 20.315 20.169 20.013 19.869 19.739 19.612 19.482 19.385 19.279 19.162 19.061 18.963 18.857 18.731 18.621 18.556 18.479 18.351 18.259 18.152 18.1 18.006 17.909 17.807 17.749 17.59 17.547 17.465 17.392 17.254 17.177 17.097 16.983 16.839 16.686 16.514 16.185 -3 ,9447 ,KEBNE ,17025350,Wed Dec 22 12:18:01 CET,Wed Dec 22 14:02:31 CET,0.0 1.603 2.087 2.46 2.761 3.056 3.334 3.577 4.004 4.189 4.375 4.637 4.902 5.069 5.382 5.676 5.946 6.073 6.342 6.619 7.005 7.233 7.449 7.766 8.055 8.315 8.575 8.848 9.207 9.542 9.869 10.25 10.591 10.922 11.31 11.749 12.169 12.6 13.036 13.48 13.932 14.436 14.987 15.587 16.314 17.055 17.86 18.728 19.73 20.806 21.904 22.586 22.825 22.834 22.705 22.503 22.317 22.116 21.887 21.677 21.541 21.41 21.262 21.105 20.95 20.815 20.659 20.515 20.407 20.303 20.191 20.091 19.982 19.858 19.755 19.638 19.521 19.417 19.306 19.219 19.137 19.006 18.904 18.79 18.732 18.623 18.521 18.416 18.364 18.22 18.214 18.147 18.078 17.946 17.863 17.775 17.681 17.564 17.444 17.28 17.003 -4 ,873 ,KEBNE ,17025351,Wed Dec 22 12:18:04 CET,Wed Dec 22 14:04:39 CET,0.0 1.209 1.629 1.989 2.317 2.616 2.862 3.081 3.444 3.599 3.765 3.957 4.201 4.35 4.637 4.913 5.182 5.306 5.532 5.749 6.064 6.264 6.457 6.734 6.996 7.231 7.46 7.697 8.016 8.312 8.591 8.937 9.252 9.55 9.9 10.286 10.648 11.057 11.524 11.998 12.488 13.059 13.724 14.44 15.275 16.13 17.046 17.986 19.086 20.318 21.482 22.113 22.298 22.254 22.114 21.959 21.801 21.625 21.453 21.283 21.129 20.991 20.848 20.69 20.54 20.405 20.256 20.127 20.019 19.902 19.774 19.665 19.569 19.484 19.416 19.327 19.235 19.134 19.02 18.949 18.877 18.744 18.649 18.563 18.526 18.448 18.351 18.244 18.183 18.027 17.983 17.906 17.831 17.666 17.59 17.523 17.441 17.321 17.208 17.023 16.723 -5 ,12265 ,KEBNE ,17025352,Wed Dec 22 12:18:04 CET,Wed Dec 22 14:05:05 CET,0.0 1.28 1.762 2.111 2.433 2.76 3.027 3.261 3.702 3.914 4.119 4.406 4.694 4.871 5.204 5.519 5.81 5.942 6.198 6.447 6.785 7.005 7.233 7.559 7.866 8.169 8.446 8.704 9.034 9.341 9.638 9.994 10.34 10.672 11.041 11.457 11.871 12.322 12.804 13.314 13.827 14.394 15.09 15.829 16.628 17.444 18.332 19.19 20.096 21.066 22.068 22.749 22.954 22.952 22.868 22.69 22.521 22.388 22.228 22.082 21.958 21.787 21.618 21.488 21.363 21.22 21.054 20.927 20.815 20.689 20.565 20.457 20.337 20.203 20.106 20.019 19.921 19.821 19.727 19.661 19.6 19.492 19.4 19.311 19.268 19.175 19.082 18.977 18.917 18.751 18.713 18.656 18.582 18.419 18.345 18.263 18.174 18.045 17.877 17.676 16.968 -6 ,29140 ,KEBNE ,17025353,Wed Dec 22 12:20:00 CET,Wed Dec 22 14:09:00 CET,0.0 1.568 2.017 2.361 2.638 2.909 3.149 3.353 3.746 3.936 4.123 4.372 4.62 4.752 5.023 5.297 5.556 5.676 5.904 6.119 6.435 6.631 6.812 7.092 7.37 7.633 7.879 8.135 8.474 8.798 9.131 9.509 9.842 10.171 10.555 10.978 11.374 11.812 12.264 12.731 13.219 13.72 14.289 14.876 15.597 16.402 17.316 18.292 19.243 20.276 21.436 22.13 22.376 22.387 22.263 22.083 21.894 21.722 21.577 21.428 21.254 21.084 20.923 20.771 20.652 20.552 20.433 20.328 20.234 20.118 20.0 19.909 19.813 19.703 19.616 19.529 19.436 19.327 19.207 19.126 19.042 18.916 18.832 18.735 18.685 18.591 18.486 18.364 18.302 18.144 18.098 18.037 17.986 17.858 17.775 17.672 17.544 17.421 17.298 17.146 16.796 -7 ,19023 ,KEBNE ,17025354,Wed Dec 22 12:20:00 CET,Wed Dec 22 14:09:08 CET,0.0 1.638 2.128 2.472 2.797 3.095 3.365 3.604 4.013 4.204 4.388 4.623 4.889 5.034 5.314 5.578 5.83 5.95 6.187 6.419 6.735 6.93 7.107 7.364 7.628 7.868 8.092 8.313 8.59 8.856 9.119 9.432 9.73 10.024 10.372 10.751 11.115 11.529 11.955 12.43 12.942 13.48 14.116 14.747 15.429 16.167 17.03 17.961 18.897 19.83 20.841 21.513 21.702 21.649 21.539 21.42 21.254 21.039 20.877 20.737 20.602 20.461 20.301 20.151 20.002 19.854 19.703 19.57 19.444 19.312 19.177 19.07 18.957 18.826 18.726 18.622 18.512 18.402 18.299 18.228 18.152 18.027 17.941 17.853 17.812 17.725 17.623 17.498 17.426 17.267 17.248 17.174 17.083 16.911 16.828 16.729 16.618 16.511 16.387 16.186 15.811 -8 ,24961 ,KEBNE ,17025355,Wed Dec 22 12:18:59 CET,Wed Dec 22 14:06:43 CET,0.0 1.984 2.578 2.981 3.299 3.572 3.843 4.09 4.468 4.64 4.815 5.069 5.338 5.49 5.76 6.013 6.276 6.404 6.643 6.883 7.237 7.455 7.661 7.97 8.253 8.509 8.756 8.998 9.304 9.599 9.892 10.227 10.551 10.885 11.275 11.684 12.063 12.493 12.974 13.47 13.95 14.477 15.107 15.77 16.528 17.363 18.362 19.355 20.274 21.143 21.972 22.413 22.454 22.374 22.261 22.126 21.959 21.791 21.648 21.486 21.347 21.209 21.084 20.968 20.844 20.735 20.609 20.482 20.363 20.249 20.13 20.026 19.93 19.815 19.71 19.617 19.53 19.43 19.322 19.242 19.147 19.008 18.918 18.826 18.781 18.67 18.548 18.425 18.364 18.21 18.158 18.076 17.991 17.784 17.68 17.578 17.485 17.39 17.256 17.085 16.595 -9 ,22816 ,KEBNE ,17025356,Wed Dec 22 12:18:59 CET,Wed Dec 22 14:08:15 CET,0.0 1.273 1.762 2.126 2.454 2.734 2.996 3.255 3.717 3.911 4.079 4.311 4.584 4.746 5.057 5.353 5.636 5.773 6.044 6.314 6.717 6.977 7.216 7.544 7.835 8.113 8.384 8.644 8.988 9.321 9.616 9.946 10.285 10.617 11.006 11.442 11.845 12.265 12.711 13.206 13.726 14.297 14.965 15.616 16.356 17.139 17.948 18.826 19.78 20.764 21.89 22.662 22.876 22.923 22.9 22.83 22.729 22.586 22.438 22.253 22.065 21.903 21.767 21.626 21.48 21.359 21.243 21.134 21.023 20.918 20.818 20.707 20.586 20.475 20.384 20.278 20.164 20.043 19.922 19.851 19.782 19.671 19.587 19.488 19.431 19.307 19.187 19.06 18.997 18.84 18.799 18.732 18.658 18.498 18.397 18.273 18.118 17.971 17.82 17.616 16.927 -10 ,2352 ,KEBNE ,17025357,Wed Dec 22 12:20:00 CET,Wed Dec 22 14:08:24 CET,0.0 1.678 2.219 2.609 2.918 3.22 3.495 3.733 4.177 4.39 4.596 4.887 5.178 5.359 5.711 6.018 6.307 6.443 6.704 6.961 7.332 7.566 7.787 8.119 8.45 8.763 9.041 9.303 9.665 10.018 10.333 10.703 11.05 11.374 11.743 12.149 12.539 12.956 13.421 13.919 14.418 14.968 15.633 16.311 17.063 17.855 18.709 19.646 20.738 22.006 23.281 23.937 24.195 24.288 24.219 24.095 23.956 23.805 23.667 23.491 23.333 23.192 23.053 22.911 22.764 22.637 22.516 22.395 22.275 22.142 22.005 21.9 21.787 21.666 21.569 21.462 21.339 21.214 21.099 21.019 20.942 20.827 20.745 20.656 20.607 20.493 20.367 20.243 20.177 20.009 19.956 19.881 19.796 19.615 19.517 19.397 19.268 19.146 19.009 18.825 18.338 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_18_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_18_17.txt deleted file mode 100644 index d09aa9c4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_18_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23327 ,TETRA ,17556095,Fri Nov 26 05:50:12 CET,Fri Nov 26 07:58:09 CET,0.0 0.781 1.037 1.23 1.407 1.566 1.689 1.792 1.977 2.065 2.156 2.217 2.396 2.472 2.618 2.761 2.891 2.958 3.082 3.192 3.341 3.435 3.528 3.664 3.779 3.88 3.981 4.081 4.212 4.333 4.448 4.582 4.718 4.855 5.002 5.17 5.346 5.536 5.744 5.96 6.177 6.421 6.679 6.903 7.138 7.39 7.654 7.884 8.076 8.195 8.137 7.81 7.405 6.961 6.527 6.138 5.805 5.47 5.16 4.818 4.494 4.238 4.005 3.785 3.591 3.407 3.211 3.033 2.861 2.672 2.477 2.328 2.179 2.01 1.871 1.729 1.591 1.453 1.315 1.211 1.091 0.921 0.806 0.687 0.634 0.516 0.373 0.221 0.153 -0.018 -0.088 -0.183 -0.271 -0.471 -0.595 -0.742 -0.897 -1.061 -1.258 -1.527 -2.239 -2 ,31024 ,TETRA ,17556096,Fri Nov 26 05:50:12 CET,Fri Nov 26 07:58:30 CET,0.0 0.651 0.958 1.165 1.304 1.425 1.531 1.627 1.796 1.882 1.975 2.034 2.218 2.293 2.439 2.574 2.7 2.756 2.873 2.993 3.142 3.237 3.337 3.485 3.625 3.751 3.864 3.975 4.125 4.269 4.395 4.545 4.684 4.818 4.972 5.147 5.321 5.499 5.676 5.85 6.042 6.249 6.45 6.668 6.931 7.206 7.525 7.875 8.166 8.324 8.21 7.81 7.372 6.888 6.436 6.001 5.586 5.219 4.893 4.552 4.262 4.008 3.762 3.528 3.326 3.133 2.898 2.687 2.525 2.363 2.187 2.036 1.881 1.732 1.611 1.475 1.336 1.202 1.065 0.964 0.864 0.704 0.583 0.458 0.395 0.268 0.119 -0.048 -0.137 -0.339 -0.405 -0.486 -0.581 -0.781 -0.878 -0.989 -1.114 -1.274 -1.464 -1.67 -2.259 -3 ,8656 ,TETRA ,17556097,Fri Nov 26 05:50:12 CET,Fri Nov 26 07:46:26 CET,0.0 1.144 1.386 1.548 1.68 1.8 1.912 2.02 2.19 2.264 2.336 2.356 2.512 2.576 2.718 2.834 2.948 3.01 3.121 3.218 3.358 3.456 3.543 3.665 3.796 3.916 4.029 4.142 4.284 4.401 4.515 4.662 4.797 4.937 5.092 5.262 5.439 5.64 5.865 6.094 6.297 6.521 6.785 7.035 7.307 7.594 7.902 8.185 8.465 8.697 8.643 8.269 7.822 7.381 6.982 6.628 6.319 6.016 5.736 5.477 5.244 5.026 4.82 4.607 4.399 4.208 4.012 3.834 3.684 3.519 3.33 3.178 3.027 2.876 2.764 2.64 2.51 2.377 2.229 2.127 2.026 1.867 1.759 1.65 1.591 1.454 1.315 1.185 1.119 0.935 0.876 0.798 0.729 0.548 0.403 0.263 0.141 -0.015 -0.219 -0.453 -1.07 -4 ,24238 ,TETRA ,17556098,Fri Nov 26 05:51:09 CET,Fri Nov 26 08:00:53 CET,0.0 0.698 0.904 1.084 1.234 1.374 1.515 1.656 1.856 1.93 2.005 2.049 2.224 2.289 2.429 2.555 2.683 2.746 2.856 2.957 3.098 3.196 3.3 3.445 3.577 3.695 3.815 3.929 4.076 4.227 4.373 4.543 4.696 4.839 4.998 5.16 5.309 5.491 5.708 5.932 6.151 6.383 6.633 6.881 7.152 7.426 7.71 7.967 8.209 8.435 8.482 8.257 7.854 7.402 6.991 6.602 6.251 5.927 5.648 5.348 5.086 4.847 4.614 4.408 4.217 4.036 3.84 3.658 3.5 3.324 3.165 3.044 2.916 2.788 2.679 2.575 2.457 2.325 2.191 2.093 1.995 1.842 1.734 1.616 1.551 1.42 1.302 1.194 1.131 0.941 0.882 0.8 0.703 0.5 0.395 0.292 0.18 0.03 -0.171 -0.479 -1.507 -5 ,29174 ,TETRA ,17556099,Fri Nov 26 05:51:09 CET,Fri Nov 26 08:02:19 CET,0.0 0.631 0.885 1.081 1.232 1.367 1.496 1.599 1.787 1.881 1.966 2.008 2.189 2.262 2.394 2.53 2.658 2.708 2.814 2.927 3.076 3.173 3.265 3.392 3.512 3.631 3.748 3.848 3.991 4.129 4.249 4.388 4.524 4.666 4.835 5.035 5.228 5.448 5.691 5.919 6.129 6.366 6.632 6.891 7.198 7.511 7.818 8.144 8.501 8.795 8.891 8.625 8.199 7.731 7.3 6.904 6.553 6.237 5.965 5.66 5.38 5.151 4.937 4.724 4.529 4.333 4.125 3.951 3.802 3.643 3.461 3.319 3.175 3.023 2.905 2.785 2.651 2.507 2.357 2.257 2.156 1.984 1.864 1.739 1.67 1.536 1.395 1.238 1.156 0.955 0.87 0.779 0.691 0.501 0.403 0.287 0.148 0.004 -0.153 -0.362 -1.271 -6 ,3789 ,TETRA ,17556100,Fri Nov 26 05:51:11 CET,Fri Nov 26 08:00:26 CET,0.0 0.511 0.806 1.019 1.195 1.348 1.48 1.593 1.778 1.866 1.954 2.009 2.17 2.23 2.363 2.486 2.595 2.654 2.784 2.896 3.049 3.153 3.254 3.411 3.566 3.7 3.824 3.948 4.103 4.253 4.41 4.593 4.752 4.896 5.07 5.279 5.477 5.679 5.896 6.139 6.392 6.645 6.943 7.259 7.564 7.897 8.312 8.717 9.101 9.45 9.628 9.403 8.969 8.553 8.18 7.811 7.455 7.099 6.781 6.448 6.147 5.883 5.628 5.375 5.156 4.968 4.765 4.587 4.437 4.287 4.125 3.991 3.857 3.725 3.628 3.528 3.412 3.286 3.161 3.078 2.991 2.864 2.794 2.706 2.649 2.529 2.413 2.295 2.226 2.044 1.988 1.91 1.828 1.6 1.484 1.372 1.251 1.119 0.98 0.772 -0.115 -7 ,18297 ,TETRA ,17556101,Fri Nov 26 05:51:11 CET,Fri Nov 26 07:59:58 CET,0.0 0.604 0.919 1.148 1.305 1.448 1.576 1.687 1.911 2.015 2.098 2.141 2.313 2.38 2.511 2.653 2.784 2.843 2.964 3.086 3.258 3.378 3.497 3.653 3.79 3.915 4.028 4.141 4.294 4.435 4.566 4.726 4.869 5.015 5.201 5.39 5.558 5.771 6.006 6.245 6.494 6.738 7.011 7.302 7.625 7.97 8.271 8.534 8.826 9.003 8.921 8.561 8.181 7.797 7.397 7.041 6.75 6.463 6.193 5.906 5.647 5.422 5.193 4.957 4.724 4.517 4.314 4.111 3.922 3.725 3.528 3.373 3.2 3.013 2.86 2.701 2.545 2.372 2.215 2.122 2.021 1.845 1.713 1.58 1.517 1.394 1.271 1.148 1.079 0.889 0.777 0.662 0.558 0.322 0.174 0.01 -0.164 -0.36 -0.564 -0.841 -1.717 -8 ,25347 ,TETRA ,17556102,Fri Nov 26 05:51:11 CET,Fri Nov 26 08:00:48 CET,0.0 0.715 0.986 1.211 1.373 1.491 1.608 1.732 1.937 2.017 2.088 2.134 2.307 2.381 2.532 2.661 2.784 2.844 2.953 3.061 3.225 3.334 3.436 3.58 3.729 3.864 4.0 4.143 4.301 4.443 4.578 4.74 4.92 5.098 5.311 5.542 5.732 5.928 6.125 6.357 6.616 6.892 7.183 7.447 7.745 8.043 8.35 8.651 8.882 8.975 8.831 8.446 7.976 7.46 6.986 6.542 6.152 5.799 5.443 5.09 4.816 4.557 4.312 4.084 3.86 3.65 3.443 3.267 3.102 2.919 2.73 2.575 2.412 2.241 2.118 1.995 1.871 1.745 1.615 1.526 1.423 1.247 1.131 1.022 0.968 0.846 0.721 0.591 0.514 0.327 0.266 0.187 0.112 -0.075 -0.183 -0.303 -0.425 -0.563 -0.756 -1.043 -1.981 -9 ,23438 ,TETRA ,17556103,Fri Nov 26 05:52:09 CET,Fri Nov 26 07:59:19 CET,0.0 1.092 1.366 1.533 1.676 1.788 1.905 2.015 2.205 2.29 2.367 2.44 2.622 2.7 2.852 2.999 3.139 3.202 3.319 3.435 3.614 3.732 3.831 3.96 4.091 4.224 4.35 4.461 4.588 4.716 4.839 4.995 5.144 5.261 5.407 5.587 5.758 5.942 6.124 6.311 6.512 6.734 6.974 7.177 7.394 7.61 7.851 8.131 8.383 8.482 8.296 7.858 7.382 6.922 6.517 6.117 5.75 5.42 5.116 4.81 4.553 4.299 4.052 3.82 3.599 3.398 3.184 2.992 2.819 2.642 2.457 2.322 2.204 2.061 1.941 1.828 1.714 1.582 1.44 1.338 1.22 1.047 0.935 0.825 0.772 0.654 0.525 0.388 0.316 0.142 0.085 0.005 -0.073 -0.274 -0.393 -0.494 -0.596 -0.734 -0.922 -1.167 -1.968 -10 ,29535 ,TETRA ,17556104,Fri Nov 26 05:52:11 CET,Fri Nov 26 07:59:39 CET,0.0 1.137 1.393 1.542 1.692 1.847 1.98 2.096 2.315 2.413 2.5 2.581 2.762 2.834 2.979 3.103 3.205 3.252 3.353 3.45 3.588 3.674 3.757 3.879 3.994 4.105 4.212 4.327 4.472 4.595 4.719 4.874 4.998 5.097 5.22 5.374 5.512 5.64 5.802 5.996 6.18 6.378 6.612 6.851 7.14 7.407 7.665 7.973 8.264 8.501 8.539 8.261 7.846 7.404 7.022 6.657 6.346 6.059 5.756 5.441 5.171 4.929 4.708 4.498 4.301 4.123 3.931 3.761 3.624 3.479 3.339 3.226 3.083 2.936 2.82 2.698 2.59 2.477 2.358 2.278 2.196 2.059 1.967 1.856 1.791 1.671 1.551 1.425 1.359 1.183 1.097 1.008 0.918 0.722 0.619 0.481 0.305 0.132 -0.026 -0.233 -0.973 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_19_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_19_17.txt deleted file mode 100644 index 0d837aa5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_19_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10642 ,TETRA ,17556105,Fri Nov 26 05:52:09 CET,Fri Nov 26 08:01:14 CET,0.0 0.802 1.084 1.317 1.519 1.701 1.869 2.007 2.248 2.373 2.492 2.592 2.813 2.919 3.094 3.249 3.418 3.505 3.669 3.823 4.039 4.176 4.308 4.495 4.674 4.862 5.051 5.221 5.434 5.631 5.836 6.086 6.331 6.584 6.859 7.166 7.469 7.8 8.157 8.538 8.936 9.373 9.864 10.341 10.924 11.564 12.253 13.01 13.96 15.111 16.422 17.308 17.672 17.832 17.842 17.787 17.682 17.537 17.41 17.283 17.118 16.896 16.655 16.439 16.25 16.085 15.902 15.729 15.578 15.415 15.264 15.145 14.985 14.808 14.68 14.533 14.369 14.195 14.046 13.95 13.834 13.639 13.487 13.328 13.25 13.08 12.895 12.714 12.629 12.432 12.324 12.2 12.065 11.755 11.571 11.376 11.155 10.864 10.529 10.091 7.486 -2 ,21623 ,TETRA ,17556107,Fri Nov 26 05:52:11 CET,Fri Nov 26 08:01:07 CET,0.0 1.476 1.827 2.134 2.387 2.583 2.755 2.917 3.208 3.358 3.499 3.631 3.866 3.979 4.187 4.377 4.549 4.635 4.806 4.964 5.186 5.329 5.473 5.678 5.88 6.068 6.238 6.401 6.618 6.832 7.041 7.268 7.481 7.7 7.971 8.301 8.613 8.936 9.283 9.65 10.027 10.448 10.938 11.44 12.036 12.739 13.532 14.344 15.334 16.495 17.731 18.597 18.998 19.194 19.214 19.132 19.025 18.888 18.73 18.536 18.351 18.191 18.009 17.813 17.636 17.459 17.276 17.102 16.926 16.743 16.593 16.473 16.333 16.173 16.024 15.854 15.662 15.458 15.262 15.14 15.02 14.813 14.646 14.459 14.37 14.218 14.07 13.924 13.838 13.622 13.516 13.393 13.243 12.844 12.629 12.395 12.155 11.912 11.569 11.103 9.358 -3 ,22322 ,TETRA ,17556108,Fri Nov 26 05:52:09 CET,Fri Nov 26 08:02:52 CET,0.0 0.784 1.071 1.319 1.544 1.773 1.974 2.149 2.454 2.587 2.71 2.826 3.068 3.186 3.425 3.642 3.85 3.948 4.117 4.283 4.531 4.677 4.815 5.041 5.262 5.468 5.67 5.87 6.137 6.37 6.582 6.86 7.116 7.362 7.656 7.987 8.311 8.651 9.01 9.398 9.796 10.233 10.746 11.216 11.734 12.339 13.017 13.767 14.693 15.806 17.015 17.734 17.961 17.937 17.775 17.555 17.305 17.034 16.776 16.536 16.339 16.176 15.982 15.764 15.588 15.426 15.231 15.039 14.878 14.731 14.585 14.452 14.292 14.105 13.97 13.841 13.71 13.561 13.392 13.291 13.187 13.022 12.912 12.775 12.695 12.525 12.342 12.146 12.05 11.843 11.708 11.579 11.441 11.104 10.913 10.673 10.413 10.163 9.863 9.439 7.961 -4 ,6082 ,TETRA ,17556109,Fri Nov 26 05:52:09 CET,Fri Nov 26 07:46:29 CET,0.0 1.554 1.996 2.296 2.54 2.741 2.914 3.086 3.387 3.53 3.664 3.798 4.033 4.145 4.356 4.552 4.752 4.854 5.048 5.233 5.481 5.631 5.771 5.977 6.181 6.378 6.567 6.752 6.984 7.209 7.429 7.683 7.942 8.195 8.47 8.762 9.02 9.294 9.588 9.916 10.273 10.677 11.183 11.688 12.255 12.915 13.694 14.555 15.554 16.734 18.013 18.903 19.366 19.551 19.594 19.558 19.49 19.418 19.336 19.212 19.064 18.929 18.805 18.696 18.581 18.42 18.212 18.011 17.843 17.683 17.501 17.35 17.218 17.05 16.909 16.746 16.561 16.419 16.29 16.178 16.054 15.868 15.724 15.551 15.449 15.218 14.966 14.699 14.571 14.354 14.256 14.132 13.984 13.623 13.424 13.208 12.968 12.718 12.409 11.991 10.038 -5 ,29267 ,TETRA ,17556110,Fri Nov 26 05:52:09 CET,Fri Nov 26 08:00:59 CET,0.0 1.065 1.343 1.559 1.785 2.009 2.198 2.366 2.652 2.777 2.895 3.012 3.258 3.379 3.598 3.797 4.0 4.1 4.292 4.482 4.736 4.891 5.042 5.257 5.464 5.67 5.864 6.056 6.304 6.539 6.764 7.026 7.284 7.544 7.846 8.182 8.505 8.852 9.237 9.633 10.034 10.49 11.012 11.525 12.101 12.718 13.432 14.284 15.272 16.31 17.359 17.941 18.049 17.998 17.897 17.728 17.49 17.239 17.004 16.761 16.55 16.374 16.204 16.022 15.849 15.68 15.494 15.323 15.159 14.982 14.789 14.612 14.416 14.21 14.059 13.904 13.722 13.511 13.283 13.14 13.023 12.836 12.693 12.546 12.469 12.295 12.106 11.874 11.748 11.519 11.356 11.208 11.078 10.782 10.599 10.392 10.147 9.852 9.458 8.883 6.088 -6 ,7322 ,TETRA ,17556111,Fri Nov 26 05:52:08 CET,Fri Nov 26 08:00:50 CET,0.0 1.404 1.811 2.099 2.339 2.554 2.729 2.885 3.166 3.285 3.397 3.487 3.701 3.797 3.976 4.143 4.291 4.373 4.539 4.688 4.885 5.01 5.143 5.33 5.506 5.685 5.866 6.037 6.249 6.448 6.639 6.86 7.068 7.276 7.513 7.8 8.069 8.359 8.686 9.024 9.38 9.796 10.281 10.766 11.309 11.889 12.598 13.39 14.309 15.422 16.563 17.341 17.732 17.861 17.836 17.686 17.561 17.442 17.265 17.062 16.888 16.762 16.638 16.498 16.349 16.178 15.984 15.824 15.679 15.505 15.32 15.18 15.041 14.899 14.796 14.691 14.585 14.468 14.327 14.228 14.112 13.91 13.764 13.599 13.516 13.348 13.167 12.973 12.879 12.663 12.516 12.384 12.241 11.946 11.778 11.601 11.41 11.133 10.771 10.207 7.794 -7 ,5675 ,TETRA ,17556112,Fri Nov 26 05:53:12 CET,Fri Nov 26 07:49:06 CET,0.0 1.398 1.745 2.07 2.333 2.534 2.701 2.852 3.112 3.218 3.332 3.462 3.689 3.781 3.976 4.164 4.339 4.417 4.571 4.735 4.96 5.089 5.215 5.41 5.596 5.76 5.913 6.068 6.288 6.504 6.697 6.922 7.154 7.383 7.653 7.955 8.24 8.549 8.902 9.29 9.677 10.121 10.627 11.117 11.657 12.256 12.978 13.715 14.553 15.59 16.761 17.705 18.182 18.362 18.338 18.243 18.136 17.947 17.718 17.489 17.304 17.152 16.985 16.794 16.609 16.44 16.247 16.077 15.909 15.71 15.516 15.349 15.144 14.936 14.797 14.65 14.486 14.315 14.117 13.969 13.816 13.586 13.427 13.284 13.22 13.072 12.895 12.701 12.598 12.359 12.217 12.082 11.934 11.62 11.411 11.177 10.972 10.73 10.428 9.923 6.728 -8 ,12522 ,TETRA ,17556113,Fri Nov 26 05:53:12 CET,Fri Nov 26 08:05:37 CET,0.0 0.911 1.274 1.594 1.86 2.069 2.254 2.421 2.726 2.87 3.002 3.113 3.326 3.432 3.663 3.859 4.036 4.123 4.281 4.443 4.695 4.843 4.973 5.153 5.338 5.518 5.681 5.842 6.056 6.264 6.455 6.673 6.896 7.119 7.385 7.702 8.004 8.324 8.661 9.016 9.374 9.765 10.245 10.768 11.366 12.014 12.765 13.543 14.391 15.359 16.515 17.262 17.53 17.662 17.657 17.577 17.447 17.243 17.039 16.886 16.742 16.585 16.428 16.276 16.139 15.972 15.771 15.599 15.435 15.236 15.042 14.869 14.668 14.472 14.305 14.139 13.99 13.85 13.702 13.592 13.475 13.274 13.122 12.96 12.877 12.709 12.502 12.257 12.137 11.906 11.756 11.633 11.511 11.213 11.049 10.877 10.667 10.391 10.128 9.76 7.419 -9 ,7418 ,TETRA ,17556114,Fri Nov 26 05:54:07 CET,Fri Nov 26 07:58:39 CET,0.0 1.498 1.888 2.191 2.43 2.638 2.823 2.96 3.209 3.338 3.46 3.568 3.787 3.891 4.101 4.285 4.452 4.535 4.686 4.822 5.032 5.19 5.344 5.538 5.704 5.871 6.043 6.208 6.42 6.618 6.803 7.046 7.306 7.571 7.877 8.212 8.528 8.88 9.257 9.636 10.019 10.462 10.979 11.484 12.068 12.711 13.43 14.226 15.082 16.017 17.043 17.745 18.033 18.099 18.053 17.955 17.761 17.542 17.365 17.162 16.933 16.695 16.455 16.255 16.085 15.925 15.777 15.614 15.453 15.306 15.16 15.035 14.884 14.695 14.548 14.411 14.261 14.092 13.91 13.788 13.659 13.416 13.24 13.078 13.004 12.833 12.626 12.428 12.326 12.103 11.981 11.86 11.742 11.479 11.313 11.139 10.936 10.669 10.383 10.043 8.21 -10 ,4210 ,TETRA ,17556115,Fri Nov 26 05:53:11 CET,Fri Nov 26 08:03:01 CET,0.0 1.181 1.447 1.677 1.86 2.028 2.187 2.346 2.66 2.793 2.912 3.036 3.261 3.359 3.546 3.719 3.873 3.942 4.077 4.224 4.431 4.561 4.694 4.888 5.061 5.23 5.393 5.547 5.766 5.985 6.189 6.418 6.634 6.867 7.145 7.429 7.699 7.985 8.271 8.611 8.973 9.36 9.833 10.312 10.872 11.495 12.199 12.981 13.915 15.067 16.346 17.135 17.465 17.554 17.481 17.389 17.295 17.12 16.932 16.705 16.462 16.231 16.012 15.81 15.623 15.468 15.312 15.166 15.008 14.836 14.68 14.552 14.404 14.234 14.085 13.934 13.794 13.632 13.455 13.338 13.222 13.0 12.81 12.637 12.561 12.391 12.2 12.013 11.929 11.722 11.581 11.448 11.322 11.078 10.925 10.742 10.55 10.32 10.025 9.645 7.155 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_19_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_19_24.txt deleted file mode 100644 index a3d3304c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_19_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18336 ,TETRA ,17556116,Fri Nov 26 05:54:07 CET,Fri Nov 26 08:03:13 CET,0.0 1.319 1.686 1.957 2.169 2.339 2.487 2.595 2.819 2.932 3.035 3.102 3.293 3.382 3.557 3.706 3.837 3.894 4.004 4.103 4.232 4.312 4.403 4.541 4.653 4.757 4.858 4.956 5.068 5.168 5.264 5.381 5.49 5.58 5.676 5.783 5.873 5.96 6.027 6.081 6.139 6.182 6.201 6.191 6.141 6.024 5.771 5.31 4.6 3.514 1.697 -0.493 -2.275 -3.767 -5.004 -6.074 -7.033 -7.879 -8.571 -9.252 -9.838 -10.34 -10.819 -11.275 -11.676 -12.042 -12.424 -12.745 -13.017 -13.289 -13.559 -13.782 -14.02 -14.267 -14.448 -14.638 -14.848 -15.063 -15.271 -15.419 -15.568 -15.801 -15.954 -16.121 -16.22 -16.406 -16.592 -16.805 -16.91 -17.165 -17.251 -17.359 -17.481 -17.722 -17.841 -17.989 -18.16 -18.363 -18.623 -18.915 -19.59 -2 ,14926 ,TETRA ,17556117,Fri Nov 26 05:54:09 CET,Fri Nov 26 08:04:16 CET,0.0 1.294 1.634 1.869 2.049 2.206 2.355 2.485 2.701 2.808 2.917 2.986 3.186 3.262 3.42 3.571 3.693 3.753 3.869 3.973 4.118 4.211 4.296 4.407 4.516 4.619 4.714 4.809 4.911 4.997 5.083 5.198 5.308 5.409 5.516 5.617 5.708 5.797 5.9 6.006 6.082 6.131 6.153 6.142 6.09 5.989 5.788 5.41 4.767 3.639 1.584 -0.855 -2.786 -4.306 -5.603 -6.759 -7.707 -8.538 -9.231 -9.914 -10.509 -11.014 -11.467 -11.897 -12.298 -12.661 -13.022 -13.337 -13.609 -13.905 -14.218 -14.458 -14.702 -14.951 -15.139 -15.338 -15.529 -15.721 -15.929 -16.078 -16.238 -16.486 -16.658 -16.829 -16.919 -17.105 -17.312 -17.531 -17.633 -17.886 -17.997 -18.133 -18.28 -18.593 -18.752 -18.933 -19.16 -19.414 -19.68 -20.064 -21.559 -3 ,3203 ,TETRA ,17556118,Fri Nov 26 05:54:06 CET,Fri Nov 26 08:05:50 CET,0.0 1.474 1.759 2.0 2.198 2.346 2.47 2.59 2.794 2.888 2.975 3.019 3.217 3.293 3.448 3.597 3.723 3.784 3.908 4.032 4.192 4.279 4.368 4.499 4.605 4.697 4.785 4.872 4.974 5.067 5.154 5.246 5.33 5.409 5.489 5.561 5.62 5.658 5.694 5.748 5.773 5.754 5.721 5.679 5.61 5.447 5.128 4.673 3.985 2.874 0.962 -1.379 -3.214 -4.712 -5.983 -7.046 -7.925 -8.737 -9.435 -10.118 -10.7 -11.203 -11.677 -12.119 -12.505 -12.857 -13.239 -13.574 -13.871 -14.174 -14.472 -14.713 -14.958 -15.205 -15.388 -15.574 -15.769 -15.962 -16.157 -16.301 -16.451 -16.662 -16.808 -16.981 -17.067 -17.235 -17.422 -17.633 -17.745 -17.995 -18.059 -18.162 -18.282 -18.562 -18.709 -18.885 -19.066 -19.237 -19.427 -19.67 -20.386 -4 ,29780 ,TETRA ,17556119,Fri Nov 26 05:54:08 CET,Fri Nov 26 08:04:37 CET,0.0 1.155 1.448 1.669 1.852 2.015 2.151 2.263 2.458 2.546 2.636 2.691 2.887 2.957 3.095 3.233 3.366 3.422 3.523 3.629 3.777 3.864 3.953 4.075 4.173 4.277 4.374 4.456 4.576 4.69 4.78 4.876 4.963 5.048 5.145 5.235 5.311 5.392 5.467 5.53 5.583 5.608 5.59 5.553 5.475 5.292 4.96 4.499 3.861 2.942 1.282 -0.85 -2.523 -3.877 -5.042 -6.108 -7.03 -7.836 -8.533 -9.206 -9.757 -10.253 -10.718 -11.139 -11.525 -11.875 -12.239 -12.569 -12.848 -13.122 -13.416 -13.672 -13.939 -14.223 -14.433 -14.639 -14.851 -15.071 -15.295 -15.447 -15.603 -15.843 -16.015 -16.191 -16.278 -16.461 -16.647 -16.859 -16.981 -17.243 -17.342 -17.477 -17.618 -17.915 -18.087 -18.262 -18.471 -18.714 -18.969 -19.298 -20.551 -5 ,11717 ,TETRA ,17556120,Fri Nov 26 05:54:08 CET,Fri Nov 26 08:05:23 CET,0.0 0.885 1.163 1.389 1.594 1.765 1.906 2.027 2.245 2.353 2.458 2.53 2.738 2.82 2.977 3.134 3.266 3.327 3.455 3.592 3.786 3.894 3.999 4.153 4.286 4.417 4.557 4.687 4.837 4.977 5.091 5.215 5.346 5.458 5.578 5.723 5.863 5.998 6.107 6.194 6.251 6.273 6.27 6.236 6.18 6.085 5.884 5.558 5.09 4.267 2.666 0.794 -0.756 -2.152 -3.335 -4.364 -5.252 -6.008 -6.619 -7.215 -7.722 -8.175 -8.594 -8.985 -9.362 -9.706 -10.069 -10.399 -10.675 -10.954 -11.253 -11.498 -11.749 -12.008 -12.21 -12.415 -12.62 -12.834 -13.049 -13.207 -13.376 -13.63 -13.812 -14.002 -14.098 -14.303 -14.511 -14.727 -14.844 -15.11 -15.241 -15.382 -15.523 -15.828 -15.992 -16.162 -16.356 -16.587 -16.827 -17.134 -18.096 -6 ,19487 ,TETRA ,17556121,Fri Nov 26 05:54:08 CET,Fri Nov 26 08:05:41 CET,0.0 1.593 1.941 2.16 2.33 2.485 2.618 2.752 3.003 3.111 3.206 3.258 3.457 3.534 3.654 3.77 3.885 3.943 4.055 4.162 4.305 4.387 4.479 4.617 4.724 4.822 4.933 5.029 5.143 5.248 5.335 5.432 5.51 5.576 5.661 5.744 5.804 5.864 5.917 5.958 6.004 6.034 6.019 5.989 5.904 5.751 5.468 5.058 4.462 3.37 1.396 -0.774 -2.466 -3.927 -5.183 -6.287 -7.216 -8.015 -8.694 -9.369 -9.925 -10.388 -10.819 -11.225 -11.616 -11.965 -12.315 -12.627 -12.894 -13.164 -13.449 -13.692 -13.942 -14.198 -14.4 -14.602 -14.796 -15.007 -15.227 -15.372 -15.528 -15.768 -15.927 -16.101 -16.195 -16.383 -16.588 -16.807 -16.915 -17.17 -17.272 -17.413 -17.55 -17.844 -18.017 -18.189 -18.375 -18.595 -18.861 -19.182 -20.422 -7 ,8672 ,TETRA ,17556122,Fri Nov 26 05:54:08 CET,Fri Nov 26 08:04:35 CET,0.0 1.232 1.465 1.666 1.864 2.029 2.153 2.254 2.46 2.556 2.641 2.675 2.873 2.943 3.07 3.193 3.316 3.379 3.503 3.611 3.756 3.846 3.933 4.054 4.167 4.263 4.344 4.43 4.535 4.616 4.71 4.83 4.926 4.995 5.066 5.139 5.198 5.248 5.292 5.322 5.322 5.325 5.337 5.286 5.151 4.983 4.759 4.423 3.812 2.742 0.824 -1.489 -3.325 -4.826 -6.052 -7.13 -8.042 -8.859 -9.566 -10.254 -10.839 -11.355 -11.839 -12.28 -12.679 -13.041 -13.413 -13.73 -14.009 -14.317 -14.638 -14.911 -15.195 -15.472 -15.68 -15.886 -16.091 -16.305 -16.542 -16.713 -16.894 -17.175 -17.352 -17.543 -17.649 -17.855 -18.07 -18.28 -18.385 -18.646 -18.767 -18.913 -19.063 -19.365 -19.506 -19.663 -19.853 -20.111 -20.432 -20.782 -21.659 -8 ,20025 ,TETRA ,17556123,Fri Nov 26 05:54:08 CET,Fri Nov 26 08:04:03 CET,0.0 1.415 1.768 2.033 2.263 2.429 2.557 2.679 2.895 2.985 3.065 3.106 3.299 3.364 3.509 3.67 3.821 3.883 3.986 4.089 4.241 4.328 4.406 4.522 4.632 4.738 4.825 4.895 4.995 5.098 5.191 5.296 5.388 5.461 5.536 5.616 5.688 5.759 5.833 5.871 5.894 5.939 5.917 5.811 5.64 5.409 5.108 4.656 3.939 2.779 0.787 -1.505 -3.325 -4.825 -6.058 -7.137 -8.064 -8.88 -9.564 -10.227 -10.798 -11.309 -11.806 -12.264 -12.659 -13.026 -13.421 -13.757 -14.042 -14.34 -14.638 -14.889 -15.155 -15.419 -15.619 -15.818 -16.026 -16.257 -16.491 -16.647 -16.805 -17.048 -17.224 -17.401 -17.489 -17.683 -17.898 -18.116 -18.217 -18.459 -18.526 -18.645 -18.77 -19.043 -19.216 -19.414 -19.608 -19.806 -20.077 -20.467 -21.721 -9 ,1980 ,TETRA ,17556124,Fri Nov 26 05:54:08 CET,Fri Nov 26 08:05:54 CET,0.0 1.477 1.815 2.036 2.23 2.43 2.624 2.779 3.033 3.14 3.243 3.322 3.529 3.614 3.753 3.877 3.981 4.036 4.136 4.222 4.359 4.448 4.531 4.65 4.766 4.87 4.961 5.051 5.17 5.278 5.388 5.515 5.627 5.738 5.845 5.94 6.019 6.079 6.15 6.231 6.303 6.365 6.398 6.409 6.394 6.312 6.125 5.8 5.227 4.272 2.568 0.455 -1.251 -2.656 -3.846 -4.892 -5.78 -6.555 -7.22 -7.889 -8.453 -8.933 -9.382 -9.824 -10.232 -10.592 -10.962 -11.279 -11.562 -11.854 -12.141 -12.369 -12.611 -12.875 -13.069 -13.273 -13.489 -13.694 -13.911 -14.067 -14.228 -14.479 -14.649 -14.83 -14.922 -15.114 -15.328 -15.553 -15.664 -15.923 -16.026 -16.129 -16.241 -16.519 -16.708 -16.906 -17.122 -17.329 -17.525 -17.858 -19.788 -10 ,17567 ,TETRA ,17556125,Fri Nov 26 05:55:07 CET,Fri Nov 26 07:45:29 CET,0.0 1.06 1.373 1.656 1.897 2.069 2.2 2.322 2.543 2.651 2.754 2.812 3.004 3.067 3.196 3.335 3.46 3.522 3.645 3.774 3.956 4.066 4.161 4.298 4.436 4.562 4.681 4.787 4.914 5.029 5.138 5.267 5.39 5.51 5.631 5.747 5.836 5.922 6.03 6.117 6.176 6.213 6.207 6.175 6.089 5.943 5.705 5.296 4.667 3.647 1.829 -0.367 -2.163 -3.653 -4.914 -6.027 -6.977 -7.798 -8.496 -9.205 -9.794 -10.302 -10.788 -11.238 -11.63 -11.985 -12.369 -12.699 -12.965 -13.236 -13.524 -13.762 -14.014 -14.276 -14.476 -14.689 -14.905 -15.125 -15.349 -15.503 -15.669 -15.929 -16.105 -16.282 -16.367 -16.551 -16.766 -16.984 -17.087 -17.329 -17.383 -17.493 -17.622 -17.903 -18.046 -18.19 -18.347 -18.508 -18.721 -19.059 -20.497 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_19_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_19_32.txt deleted file mode 100644 index 9b2a9acb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_19_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15712 ,TETRA ,17556126,Fri Nov 26 05:55:07 CET,Fri Nov 26 07:46:06 CET,0.0 0.477 0.661 0.765 0.853 0.905 0.951 1.005 1.095 1.13 1.164 1.119 1.279 1.323 1.407 1.496 1.585 1.62 1.673 1.728 1.82 1.876 1.918 1.975 2.035 2.084 2.125 2.17 2.229 2.277 2.318 2.368 2.412 2.446 2.472 2.493 2.511 2.531 2.547 2.551 2.534 2.489 2.413 2.315 2.18 1.979 1.662 1.221 0.558 -0.494 -2.285 -4.356 -5.997 -7.397 -8.553 -9.568 -10.439 -11.211 -11.853 -12.447 -13.0 -13.52 -13.99 -14.41 -14.807 -15.187 -15.576 -15.909 -16.183 -16.436 -16.687 -16.917 -17.183 -17.479 -17.689 -17.892 -18.127 -18.371 -18.615 -18.786 -18.964 -19.244 -19.425 -19.595 -19.683 -19.862 -20.059 -20.264 -20.366 -20.619 -20.746 -20.881 -21.001 -21.269 -21.416 -21.564 -21.73 -21.909 -22.141 -22.438 -22.966 -2 ,15845 ,TETRA ,17556127,Fri Nov 26 05:55:06 CET,Fri Nov 26 08:05:17 CET,0.0 0.455 0.633 0.744 0.832 0.907 0.959 1.009 1.127 1.185 1.239 1.209 1.364 1.401 1.46 1.512 1.566 1.58 1.617 1.665 1.716 1.746 1.782 1.832 1.875 1.912 1.945 1.985 2.021 2.043 2.061 2.072 2.094 2.108 2.109 2.106 2.102 2.082 2.058 2.024 1.958 1.879 1.774 1.636 1.448 1.203 0.838 0.325 -0.421 -1.541 -3.334 -5.444 -7.138 -8.484 -9.575 -10.539 -11.356 -12.062 -12.672 -13.279 -13.788 -14.23 -14.665 -15.07 -15.423 -15.758 -16.126 -16.456 -16.735 -17.001 -17.249 -17.465 -17.71 -17.96 -18.153 -18.352 -18.555 -18.778 -19.045 -19.236 -19.419 -19.688 -19.854 -20.023 -20.111 -20.282 -20.48 -20.682 -20.781 -21.02 -21.061 -21.159 -21.279 -21.542 -21.686 -21.88 -22.103 -22.334 -22.639 -22.992 -24.045 -3 ,17844 ,TETRA ,17556128,Fri Nov 26 05:56:07 CET,Fri Nov 26 07:45:57 CET,0.0 0.217 0.382 0.555 0.667 0.746 0.822 0.873 0.937 0.975 1.014 0.954 1.098 1.138 1.216 1.275 1.327 1.352 1.4 1.446 1.51 1.534 1.551 1.587 1.621 1.661 1.71 1.745 1.77 1.796 1.827 1.872 1.905 1.91 1.912 1.931 1.948 1.955 1.942 1.91 1.864 1.812 1.763 1.657 1.458 1.205 0.866 0.374 -0.366 -1.462 -3.223 -5.288 -6.986 -8.44 -9.67 -10.784 -11.771 -12.625 -13.32 -14.004 -14.539 -14.98 -15.414 -15.822 -16.187 -16.503 -16.845 -17.161 -17.433 -17.692 -17.936 -18.134 -18.335 -18.547 -18.712 -18.888 -19.083 -19.29 -19.499 -19.64 -19.78 -20.001 -20.167 -20.346 -20.43 -20.59 -20.765 -20.955 -21.055 -21.316 -21.488 -21.624 -21.727 -21.94 -22.053 -22.171 -22.3 -22.463 -22.636 -22.832 -23.555 -4 ,672 ,TETRA ,17556129,Fri Nov 26 05:56:07 CET,Fri Nov 26 08:04:57 CET,0.0 0.154 0.287 0.429 0.559 0.653 0.719 0.793 0.94 1.004 1.062 1.028 1.185 1.225 1.291 1.347 1.405 1.436 1.497 1.558 1.644 1.693 1.727 1.767 1.807 1.852 1.897 1.945 2.007 2.054 2.099 2.145 2.168 2.192 2.211 2.226 2.237 2.241 2.236 2.212 2.188 2.147 2.066 1.961 1.814 1.605 1.293 0.838 0.131 -0.941 -2.703 -4.776 -6.43 -7.805 -8.964 -9.958 -10.795 -11.506 -12.114 -12.725 -13.24 -13.697 -14.123 -14.505 -14.865 -15.212 -15.588 -15.922 -16.203 -16.496 -16.782 -17.026 -17.292 -17.569 -17.782 -17.991 -18.205 -18.431 -18.657 -18.812 -18.979 -19.226 -19.398 -19.57 -19.657 -19.855 -20.054 -20.248 -20.349 -20.605 -20.717 -20.833 -20.948 -21.181 -21.293 -21.445 -21.62 -21.758 -21.921 -22.129 -22.672 -5 ,13414 ,TETRA ,17556130,Fri Nov 26 05:56:07 CET,Fri Nov 26 08:04:52 CET,0.0 0.184 0.265 0.343 0.432 0.519 0.587 0.657 0.79 0.842 0.89 0.859 1.014 1.058 1.135 1.194 1.26 1.288 1.337 1.385 1.461 1.508 1.542 1.585 1.635 1.683 1.718 1.749 1.793 1.83 1.86 1.89 1.92 1.949 1.981 2.008 2.016 2.024 2.026 2.011 1.97 1.907 1.805 1.66 1.439 1.133 0.728 0.179 -0.579 -1.71 -3.563 -5.67 -7.327 -8.785 -10.07 -11.175 -12.1 -12.88 -13.524 -14.156 -14.681 -15.132 -15.555 -15.966 -16.356 -16.719 -17.109 -17.468 -17.753 -18.043 -18.349 -18.596 -18.844 -19.099 -19.294 -19.5 -19.71 -19.918 -20.134 -20.287 -20.44 -20.663 -20.827 -20.995 -21.071 -21.226 -21.383 -21.547 -21.642 -21.881 -21.955 -22.08 -22.21 -22.485 -22.64 -22.787 -22.94 -23.116 -23.381 -23.752 -24.646 -6 ,1134 ,TETRA ,17556131,Fri Nov 26 05:57:07 CET,Fri Nov 26 08:03:01 CET,0.0 0.353 0.534 0.624 0.72 0.803 0.871 0.943 1.077 1.133 1.183 1.155 1.324 1.368 1.454 1.524 1.581 1.611 1.663 1.717 1.79 1.828 1.866 1.928 1.992 2.046 2.097 2.137 2.185 2.242 2.295 2.345 2.384 2.409 2.438 2.468 2.482 2.492 2.507 2.515 2.488 2.449 2.389 2.297 2.163 1.952 1.629 1.186 0.508 -0.629 -2.475 -4.615 -6.309 -7.674 -8.826 -9.859 -10.742 -11.519 -12.177 -12.811 -13.356 -13.834 -14.298 -14.74 -15.138 -15.493 -15.86 -16.188 -16.461 -16.736 -17.018 -17.245 -17.476 -17.708 -17.879 -18.078 -18.308 -18.524 -18.734 -18.889 -19.066 -19.348 -19.538 -19.727 -19.821 -20.014 -20.213 -20.426 -20.534 -20.782 -20.853 -20.976 -21.105 -21.359 -21.483 -21.629 -21.836 -22.115 -22.483 -22.885 -24.071 -7 ,25702 ,TETRA ,17556132,Fri Nov 26 05:57:07 CET,Fri Nov 26 08:06:19 CET,0.0 0.381 0.522 0.626 0.692 0.749 0.807 0.85 0.915 0.947 0.985 0.943 1.089 1.124 1.188 1.237 1.283 1.303 1.356 1.406 1.463 1.497 1.519 1.547 1.586 1.63 1.664 1.691 1.731 1.765 1.795 1.835 1.866 1.877 1.882 1.896 1.903 1.897 1.878 1.852 1.805 1.742 1.65 1.509 1.346 1.118 0.744 0.237 -0.472 -1.539 -3.31 -5.373 -7.003 -8.353 -9.503 -10.481 -11.322 -12.057 -12.659 -13.249 -13.747 -14.196 -14.604 -15.009 -15.398 -15.724 -16.07 -16.392 -16.662 -16.941 -17.242 -17.478 -17.717 -17.966 -18.153 -18.342 -18.534 -18.741 -18.964 -19.114 -19.258 -19.483 -19.645 -19.811 -19.9 -20.08 -20.271 -20.465 -20.556 -20.801 -20.91 -21.043 -21.173 -21.45 -21.607 -21.792 -21.978 -22.146 -22.345 -22.699 -23.469 -8 ,25409 ,TETRA ,17556133,Fri Nov 26 05:58:08 CET,Fri Nov 26 07:47:59 CET,0.0 0.561 0.714 0.842 0.939 1.043 1.142 1.223 1.36 1.404 1.441 1.413 1.569 1.605 1.68 1.738 1.79 1.822 1.885 1.939 2.01 2.048 2.083 2.121 2.152 2.187 2.222 2.252 2.287 2.323 2.343 2.361 2.38 2.396 2.405 2.404 2.396 2.39 2.395 2.372 2.327 2.281 2.178 2.037 1.855 1.611 1.278 0.795 0.083 -1.023 -2.852 -4.873 -6.538 -7.996 -9.21 -10.234 -11.059 -11.804 -12.479 -13.14 -13.68 -14.151 -14.607 -15.041 -15.432 -15.774 -16.123 -16.447 -16.737 -17.034 -17.335 -17.578 -17.83 -18.087 -18.29 -18.506 -18.728 -18.95 -19.181 -19.342 -19.514 -19.778 -19.948 -20.13 -20.227 -20.42 -20.629 -20.875 -20.999 -21.254 -21.363 -21.5 -21.648 -21.953 -22.115 -22.302 -22.503 -22.688 -22.917 -23.28 -24.386 -9 ,14843 ,TETRA ,17556134,Fri Nov 26 05:58:07 CET,Fri Nov 26 07:47:41 CET,0.0 0.143 0.313 0.44 0.527 0.609 0.658 0.691 0.779 0.817 0.848 0.794 0.938 0.973 1.051 1.12 1.169 1.188 1.229 1.278 1.335 1.364 1.388 1.423 1.459 1.49 1.533 1.579 1.628 1.662 1.7 1.747 1.774 1.793 1.798 1.805 1.817 1.812 1.801 1.78 1.74 1.672 1.58 1.472 1.287 1.011 0.658 0.194 -0.513 -1.644 -3.515 -5.634 -7.288 -8.679 -9.818 -10.804 -11.676 -12.447 -13.127 -13.8 -14.342 -14.821 -15.282 -15.705 -16.092 -16.455 -16.835 -17.158 -17.424 -17.706 -18.004 -18.25 -18.503 -18.776 -19.002 -19.226 -19.45 -19.687 -19.944 -20.128 -20.303 -20.541 -20.715 -20.913 -21.017 -21.224 -21.433 -21.647 -21.769 -22.038 -22.172 -22.304 -22.442 -22.753 -22.908 -23.082 -23.285 -23.512 -23.769 -24.085 -25.093 -10 ,25243 ,TETRA ,17556135,Fri Nov 26 05:58:08 CET,Fri Nov 26 08:06:52 CET,0.0 0.277 0.404 0.491 0.576 0.659 0.72 0.785 0.95 1.012 1.059 1.033 1.194 1.224 1.263 1.312 1.365 1.39 1.442 1.492 1.552 1.589 1.627 1.674 1.713 1.751 1.787 1.816 1.848 1.87 1.896 1.924 1.95 1.973 1.981 1.993 2.002 1.99 1.966 1.937 1.897 1.839 1.735 1.599 1.416 1.173 0.819 0.335 -0.377 -1.469 -3.244 -5.335 -7.042 -8.458 -9.578 -10.567 -11.426 -12.134 -12.735 -13.367 -13.933 -14.446 -14.925 -15.372 -15.778 -16.142 -16.511 -16.83 -17.104 -17.389 -17.684 -17.91 -18.128 -18.364 -18.547 -18.723 -18.904 -19.106 -19.317 -19.453 -19.596 -19.85 -20.024 -20.185 -20.263 -20.433 -20.622 -20.81 -20.904 -21.149 -21.239 -21.359 -21.5 -21.827 -21.999 -22.179 -22.387 -22.613 -22.852 -23.164 -23.854 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_20_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_20_19.txt deleted file mode 100644 index 0b261a9f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_20_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21999 ,TETRA ,17556136,Fri Nov 26 05:59:08 CET,Fri Nov 26 08:13:37 CET,0.0 0.236 0.372 0.497 0.603 0.718 0.835 0.938 1.136 1.23 1.322 1.346 1.576 1.659 1.829 1.988 2.131 2.199 2.323 2.455 2.662 2.788 2.917 3.113 3.298 3.479 3.655 3.832 4.072 4.312 4.548 4.845 5.134 5.409 5.741 6.107 6.451 6.842 7.282 7.751 8.253 8.845 9.552 10.272 11.141 12.136 13.286 14.627 16.233 18.141 20.574 22.658 23.754 24.316 24.679 24.947 25.116 25.213 25.226 25.173 25.097 25.008 24.917 24.812 24.71 24.622 24.512 24.401 24.297 24.151 23.996 23.878 23.742 23.592 23.46 23.319 23.19 23.036 22.867 22.758 22.612 22.351 22.161 21.934 21.832 21.645 21.426 21.205 21.082 20.826 20.653 20.506 20.357 20.025 19.821 19.597 19.348 19.092 18.734 18.097 15.771 -2 ,21547 ,TETRA ,17556137,Fri Nov 26 05:59:08 CET,Fri Nov 26 08:11:43 CET,0.0 0.352 0.571 0.721 0.858 0.991 1.125 1.252 1.462 1.554 1.637 1.655 1.884 1.968 2.137 2.287 2.433 2.506 2.648 2.791 2.996 3.132 3.271 3.466 3.649 3.838 4.023 4.202 4.444 4.691 4.935 5.225 5.525 5.812 6.127 6.521 6.924 7.345 7.795 8.305 8.874 9.526 10.292 11.079 12.039 13.167 14.447 15.894 17.66 19.788 22.578 24.807 25.966 26.649 27.059 27.303 27.457 27.517 27.529 27.473 27.325 27.19 27.058 26.944 26.847 26.702 26.536 26.409 26.291 26.165 26.024 25.891 25.754 25.603 25.467 25.319 25.16 24.987 24.809 24.67 24.533 24.315 24.171 24.03 23.953 23.797 23.574 23.306 23.179 22.932 22.793 22.652 22.503 22.094 21.871 21.654 21.414 21.163 20.82 20.277 17.394 -3 ,31409 ,TETRA ,17556138,Fri Nov 26 06:00:07 CET,Fri Nov 26 08:09:46 CET,0.0 0.184 0.354 0.513 0.645 0.761 0.881 0.997 1.198 1.298 1.399 1.448 1.708 1.801 1.959 2.139 2.32 2.402 2.565 2.731 2.971 3.126 3.275 3.483 3.675 3.856 4.043 4.233 4.47 4.71 4.956 5.25 5.534 5.812 6.153 6.547 6.937 7.374 7.83 8.323 8.862 9.483 10.24 11.017 11.903 12.911 14.107 15.461 16.98 18.766 21.072 23.108 24.286 24.97 25.428 25.74 25.89 25.964 25.983 25.952 25.867 25.746 25.645 25.537 25.391 25.238 25.082 24.928 24.789 24.669 24.539 24.405 24.256 24.097 23.969 23.836 23.682 23.527 23.371 23.257 23.151 23.0 22.883 22.715 22.634 22.489 22.298 22.069 21.93 21.687 21.576 21.451 21.301 20.951 20.737 20.529 20.293 19.985 19.61 19.076 16.254 -4 ,13757 ,TETRA ,17556139,Fri Nov 26 06:00:06 CET,Fri Nov 26 08:11:29 CET,0.0 0.423 0.551 0.678 0.809 0.923 1.024 1.118 1.311 1.413 1.525 1.594 1.834 1.923 2.098 2.266 2.421 2.494 2.644 2.788 3.006 3.146 3.279 3.488 3.688 3.892 4.096 4.297 4.557 4.795 5.028 5.324 5.616 5.885 6.197 6.573 6.936 7.321 7.739 8.206 8.722 9.309 10.008 10.744 11.611 12.618 13.818 15.225 16.91 18.96 21.57 23.745 25.104 25.971 26.487 26.778 26.905 26.959 26.934 26.876 26.807 26.731 26.638 26.512 26.415 26.339 26.241 26.125 26.007 25.899 25.798 25.694 25.569 25.44 25.323 25.193 25.053 24.909 24.745 24.619 24.489 24.279 24.151 24.013 23.925 23.746 23.563 23.356 23.248 23.017 22.871 22.723 22.544 22.133 21.917 21.67 21.402 21.1 20.685 20.199 17.896 -5 ,7822 ,TETRA ,17556140,Fri Nov 26 06:00:06 CET,Fri Nov 26 08:15:26 CET,0.0 0.25 0.407 0.551 0.692 0.815 0.93 1.031 1.238 1.35 1.456 1.506 1.749 1.847 2.021 2.185 2.352 2.435 2.587 2.731 2.95 3.096 3.234 3.446 3.652 3.838 4.021 4.207 4.452 4.704 4.963 5.262 5.543 5.815 6.134 6.52 6.897 7.328 7.802 8.267 8.766 9.359 10.068 10.812 11.701 12.708 13.892 15.241 16.894 18.998 21.449 23.217 24.24 24.889 25.221 25.378 25.489 25.492 25.41 25.334 25.23 25.115 25.019 24.91 24.808 24.729 24.619 24.492 24.363 24.214 24.063 23.938 23.789 23.61 23.466 23.303 23.118 22.917 22.695 22.535 22.354 22.075 21.891 21.698 21.607 21.446 21.278 21.075 20.961 20.713 20.549 20.395 20.226 19.88 19.702 19.439 19.067 18.729 18.33 17.644 14.396 -6 ,24536 ,TETRA ,17556141,Fri Nov 26 06:00:07 CET,Fri Nov 26 08:09:43 CET,0.0 0.262 0.451 0.633 0.773 0.883 0.998 1.123 1.347 1.441 1.537 1.587 1.825 1.913 2.068 2.227 2.394 2.471 2.614 2.757 2.968 3.108 3.251 3.46 3.664 3.866 4.057 4.246 4.509 4.765 5.012 5.333 5.656 5.964 6.322 6.738 7.153 7.613 8.104 8.631 9.184 9.788 10.497 11.222 12.043 12.969 14.102 15.445 17.096 19.124 21.736 23.893 25.071 25.808 26.227 26.448 26.58 26.619 26.628 26.648 26.638 26.571 26.491 26.421 26.344 26.258 26.153 26.044 25.936 25.81 25.667 25.555 25.43 25.279 25.149 25.001 24.839 24.663 24.465 24.342 24.234 24.048 23.902 23.756 23.682 23.527 23.364 23.167 23.049 22.825 22.717 22.581 22.424 22.044 21.85 21.616 21.334 21.001 20.502 19.789 17.216 -7 ,10938 ,TETRA ,17556142,Fri Nov 26 06:01:07 CET,Fri Nov 26 07:58:12 CET,0.0 0.592 0.789 0.922 1.084 1.237 1.359 1.467 1.699 1.795 1.872 1.896 2.135 2.225 2.392 2.567 2.74 2.821 2.984 3.14 3.378 3.532 3.677 3.892 4.101 4.303 4.501 4.697 4.957 5.202 5.421 5.698 5.975 6.256 6.593 6.968 7.346 7.778 8.223 8.701 9.232 9.831 10.542 11.271 12.136 13.151 14.356 15.743 17.356 19.284 21.75 23.748 24.794 25.456 25.864 26.098 26.196 26.241 26.256 26.236 26.204 26.129 26.039 25.95 25.851 25.707 25.524 25.394 25.261 25.103 24.908 24.73 24.581 24.432 24.303 24.172 24.029 23.856 23.682 23.569 23.443 23.227 23.069 22.894 22.797 22.616 22.429 22.211 22.09 21.841 21.703 21.551 21.365 20.963 20.762 20.519 20.193 19.854 19.423 18.783 16.015 -8 ,25956 ,TETRA ,17556143,Fri Nov 26 06:01:07 CET,Fri Nov 26 07:51:12 CET,0.0 0.202 0.366 0.524 0.662 0.776 0.888 1.001 1.225 1.325 1.427 1.482 1.718 1.81 1.993 2.155 2.304 2.382 2.541 2.694 2.923 3.078 3.224 3.439 3.643 3.832 4.025 4.222 4.485 4.742 4.979 5.266 5.555 5.833 6.165 6.544 6.897 7.285 7.719 8.198 8.709 9.275 9.982 10.747 11.646 12.653 13.814 15.184 16.814 18.722 21.116 23.104 24.093 24.642 25.025 25.219 25.31 25.325 25.276 25.21 25.116 25.006 24.87 24.728 24.581 24.412 24.248 24.095 23.933 23.776 23.639 23.513 23.367 23.213 23.085 22.949 22.813 22.671 22.505 22.39 22.254 22.046 21.915 21.772 21.705 21.53 21.33 21.131 21.029 20.787 20.596 20.436 20.272 19.92 19.709 19.441 19.17 18.884 18.45 17.741 15.297 -9 ,13928 ,TETRA ,17556144,Fri Nov 26 06:01:07 CET,Fri Nov 26 08:16:24 CET,0.0 0.359 0.556 0.72 0.884 1.037 1.173 1.294 1.495 1.588 1.684 1.727 1.967 2.057 2.232 2.398 2.564 2.648 2.803 2.95 3.176 3.32 3.457 3.666 3.874 4.075 4.272 4.462 4.718 4.961 5.191 5.474 5.756 6.037 6.361 6.719 7.065 7.468 7.929 8.43 8.949 9.546 10.276 11.015 11.868 12.848 14.037 15.451 17.165 19.232 21.761 23.849 25.15 25.983 26.475 26.769 26.906 26.984 27.01 27.0 26.996 26.973 26.904 26.805 26.703 26.562 26.378 26.206 26.055 25.917 25.777 25.651 25.487 25.311 25.168 25.022 24.902 24.774 24.629 24.504 24.367 24.165 24.026 23.868 23.776 23.572 23.354 23.123 23.004 22.761 22.593 22.453 22.299 21.953 21.773 21.562 21.306 20.965 20.519 19.987 17.85 -10 ,13607 ,TETRA ,17556145,Fri Nov 26 06:01:08 CET,Fri Nov 26 08:09:28 CET,0.0 0.202 0.379 0.52 0.653 0.783 0.899 1.01 1.235 1.337 1.435 1.468 1.695 1.783 1.966 2.143 2.31 2.389 2.54 2.684 2.905 3.051 3.181 3.372 3.558 3.752 3.949 4.128 4.373 4.63 4.872 5.15 5.409 5.664 5.983 6.36 6.722 7.117 7.555 8.034 8.543 9.132 9.847 10.583 11.451 12.44 13.609 14.999 16.68 18.677 21.219 23.257 24.412 25.1 25.55 25.875 26.063 26.18 26.217 26.213 26.184 26.156 26.101 26.003 25.91 25.836 25.741 25.612 25.492 25.341 25.158 25.03 24.904 24.746 24.608 24.475 24.322 24.147 23.955 23.823 23.697 23.499 23.36 23.197 23.11 22.939 22.751 22.517 22.398 22.171 22.017 21.884 21.756 21.458 21.249 21.008 20.79 20.49 20.017 19.313 16.46 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_20_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_20_33.txt deleted file mode 100644 index cffdc9d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_20_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25743 ,TETRA ,17556146,Fri Nov 26 06:01:08 CET,Fri Nov 26 07:55:25 CET,0.0 1.213 1.721 2.064 2.356 2.649 2.936 3.179 3.532 3.687 3.854 4.065 4.389 4.56 4.869 5.177 5.457 5.587 5.823 6.028 6.304 6.48 6.665 6.931 7.165 7.402 7.636 7.831 8.075 8.332 8.583 8.885 9.181 9.475 9.833 10.24 10.63 11.107 11.624 12.141 12.704 13.319 13.989 14.672 15.521 16.48 17.553 18.686 19.964 21.557 23.609 24.867 25.265 25.376 25.304 25.17 25.046 24.916 24.754 24.577 24.427 24.255 24.025 23.832 23.691 23.53 23.335 23.138 22.956 22.735 22.502 22.355 22.191 22.009 21.879 21.713 21.538 21.358 21.164 21.041 20.929 20.744 20.604 20.464 20.377 20.191 19.998 19.769 19.64 19.377 19.22 19.08 18.934 18.583 18.381 18.169 17.923 17.589 17.151 16.658 15.047 -2 ,11024 ,TETRA ,17556147,Fri Nov 26 06:02:07 CET,Fri Nov 26 08:14:06 CET,0.0 0.908 1.272 1.566 1.829 2.077 2.304 2.517 2.905 3.087 3.27 3.462 3.771 3.92 4.202 4.479 4.737 4.868 5.121 5.353 5.703 5.94 6.159 6.476 6.8 7.111 7.412 7.694 8.066 8.447 8.808 9.217 9.579 9.907 10.276 10.663 11.072 11.534 11.961 12.405 12.861 13.387 13.985 14.588 15.296 16.085 17.005 18.015 19.159 20.462 21.997 23.128 23.642 23.811 23.849 23.827 23.716 23.584 23.455 23.298 23.139 22.96 22.755 22.541 22.334 22.123 21.889 21.682 21.5 21.318 21.138 20.967 20.766 20.541 20.364 20.204 20.07 19.91 19.699 19.565 19.444 19.266 19.138 18.966 18.862 18.651 18.441 18.203 18.077 17.83 17.687 17.52 17.315 16.897 16.678 16.422 16.107 15.735 15.256 14.539 11.089 -3 ,6341 ,TETRA ,17556148,Fri Nov 26 06:03:23 CET,Fri Nov 26 08:15:07 CET,0.0 1.476 1.998 2.379 2.692 2.936 3.157 3.38 3.808 3.998 4.165 4.335 4.643 4.809 5.171 5.509 5.807 5.95 6.218 6.463 6.818 7.062 7.291 7.604 7.913 8.221 8.525 8.807 9.166 9.527 9.832 10.149 10.444 10.764 11.123 11.442 11.757 12.126 12.533 13.008 13.496 13.983 14.555 15.15 15.846 16.624 17.53 18.605 19.842 21.231 22.917 24.198 24.881 25.237 25.322 25.28 25.149 24.963 24.758 24.55 24.329 24.072 23.848 23.631 23.39 23.171 22.945 22.734 22.513 22.281 22.053 21.865 21.667 21.447 21.292 21.111 20.919 20.729 20.501 20.337 20.171 19.927 19.746 19.548 19.448 19.242 19.036 18.824 18.717 18.472 18.319 18.161 17.978 17.554 17.303 17.003 16.649 16.261 15.85 15.226 11.019 -4 ,24417 ,TETRA ,17556149,Fri Nov 26 06:02:07 CET,Fri Nov 26 08:10:54 CET,0.0 0.808 1.256 1.622 1.935 2.206 2.431 2.639 3.025 3.209 3.388 3.578 3.862 4.003 4.308 4.607 4.885 5.025 5.302 5.55 5.903 6.139 6.365 6.692 6.976 7.249 7.511 7.727 8.006 8.287 8.54 8.834 9.128 9.423 9.768 10.15 10.524 10.907 11.311 11.755 12.267 12.859 13.477 14.076 14.753 15.529 16.459 17.479 18.675 20.093 21.814 23.054 23.516 23.638 23.625 23.519 23.401 23.267 23.099 22.913 22.737 22.585 22.447 22.282 22.108 21.918 21.675 21.46 21.251 21.048 20.871 20.701 20.51 20.306 20.133 19.93 19.711 19.498 19.262 19.087 18.926 18.695 18.532 18.346 18.246 18.038 17.795 17.533 17.412 17.148 16.916 16.737 16.567 16.184 15.973 15.757 15.531 15.242 14.809 14.22 11.582 -5 ,27675 ,TETRA ,17556150,Fri Nov 26 06:02:07 CET,Fri Nov 26 07:54:42 CET,0.0 1.154 1.529 1.847 2.131 2.352 2.545 2.731 3.101 3.284 3.456 3.618 3.894 4.021 4.257 4.492 4.714 4.819 5.038 5.251 5.573 5.785 5.974 6.24 6.512 6.771 7.025 7.285 7.625 7.948 8.268 8.663 9.035 9.4 9.827 10.273 10.675 11.158 11.72 12.354 13.031 13.743 14.524 15.286 16.131 17.069 18.21 19.53 21.068 22.824 24.955 26.461 27.048 27.265 27.312 27.321 27.299 27.22 27.117 26.947 26.75 26.584 26.41 26.204 26.032 25.86 25.674 25.527 25.374 25.182 24.98 24.823 24.647 24.434 24.249 24.048 23.872 23.7 23.448 23.251 23.067 22.802 22.648 22.474 22.371 22.159 21.907 21.601 21.452 21.184 20.989 20.818 20.595 20.094 19.855 19.621 19.377 19.07 18.644 18.147 15.806 -6 ,24453 ,TETRA ,17556151,Fri Nov 26 06:04:07 CET,Fri Nov 26 07:55:31 CET,0.0 0.672 1.019 1.286 1.524 1.759 1.98 2.183 2.542 2.704 2.867 3.03 3.314 3.451 3.726 4.005 4.26 4.387 4.654 4.904 5.252 5.453 5.617 5.853 6.078 6.302 6.545 6.781 7.069 7.334 7.587 7.89 8.189 8.476 8.791 9.131 9.478 9.859 10.259 10.713 11.179 11.686 12.315 12.957 13.714 14.56 15.522 16.779 18.327 20.096 22.328 24.054 24.974 25.463 25.584 25.53 25.443 25.296 25.148 24.992 24.795 24.561 24.321 24.076 23.819 23.583 23.324 23.086 22.86 22.616 22.401 22.246 22.07 21.866 21.736 21.576 21.367 21.171 20.964 20.813 20.646 20.402 20.256 20.099 20.01 19.8 19.569 19.341 19.229 18.976 18.811 18.641 18.467 18.051 17.804 17.554 17.288 16.991 16.537 15.938 13.856 -7 ,2274 ,TETRA ,17556152,Fri Nov 26 06:03:23 CET,Fri Nov 26 08:17:02 CET,0.0 1.356 1.841 2.199 2.449 2.681 2.906 3.094 3.442 3.624 3.814 4.041 4.355 4.525 4.852 5.152 5.438 5.577 5.832 6.067 6.42 6.64 6.847 7.136 7.373 7.604 7.869 8.133 8.447 8.733 8.983 9.257 9.536 9.82 10.134 10.471 10.818 11.225 11.661 12.111 12.574 13.154 13.849 14.498 15.217 16.008 16.93 17.971 19.219 20.652 22.104 23.075 23.533 23.705 23.7 23.583 23.406 23.2 22.939 22.617 22.359 22.1 21.816 21.534 21.288 21.076 20.827 20.597 20.41 20.205 19.976 19.792 19.609 19.402 19.209 18.998 18.785 18.557 18.342 18.201 18.046 17.806 17.623 17.392 17.276 17.064 16.838 16.592 16.454 16.198 16.014 15.836 15.659 15.299 15.082 14.794 14.503 14.132 13.644 13.144 10.231 -8 ,6858 ,TETRA ,17556153,Fri Nov 26 06:03:23 CET,Fri Nov 26 08:18:12 CET,0.0 1.177 1.576 1.9 2.189 2.458 2.702 2.926 3.34 3.531 3.716 3.919 4.224 4.374 4.674 4.953 5.235 5.375 5.642 5.894 6.224 6.436 6.659 6.989 7.291 7.586 7.868 8.102 8.379 8.624 8.878 9.232 9.539 9.828 10.22 10.702 11.147 11.61 12.094 12.606 13.117 13.651 14.274 14.903 15.671 16.51 17.434 18.453 19.657 21.059 22.541 23.557 24.043 24.232 24.34 24.378 24.312 24.207 24.037 23.853 23.731 23.616 23.488 23.33 23.178 23.051 22.875 22.706 22.569 22.409 22.239 22.084 21.908 21.73 21.565 21.4 21.239 21.061 20.863 20.694 20.532 20.324 20.179 20.023 19.927 19.735 19.532 19.301 19.19 18.949 18.82 18.667 18.483 18.118 17.937 17.736 17.527 17.277 16.886 16.259 13.829 -9 ,3827 ,TETRA ,17556154,Fri Nov 26 06:03:23 CET,Fri Nov 26 08:14:40 CET,0.0 1.071 1.505 1.822 2.134 2.427 2.647 2.85 3.238 3.419 3.585 3.753 4.052 4.196 4.46 4.718 4.977 5.107 5.362 5.606 5.948 6.17 6.394 6.716 7.016 7.301 7.569 7.822 8.137 8.425 8.704 9.064 9.393 9.679 10.005 10.372 10.761 11.222 11.69 12.166 12.652 13.175 13.786 14.404 15.132 15.943 16.882 17.966 19.266 20.745 22.376 23.669 24.345 24.686 24.839 24.883 24.785 24.572 24.332 24.045 23.836 23.69 23.519 23.339 23.157 22.963 22.75 22.568 22.411 22.226 22.022 21.868 21.703 21.526 21.378 21.208 21.033 20.836 20.634 20.498 20.365 20.179 20.043 19.87 19.773 19.579 19.376 19.139 19.002 18.75 18.632 18.508 18.38 18.066 17.874 17.651 17.339 16.977 16.604 16.028 13.271 -10 ,2555 ,TETRA ,17556155,Fri Nov 26 06:04:07 CET,Fri Nov 26 08:14:53 CET,0.0 1.106 1.535 1.905 2.211 2.439 2.654 2.847 3.229 3.427 3.617 3.815 4.128 4.286 4.587 4.871 5.143 5.269 5.505 5.751 6.1 6.313 6.532 6.854 7.168 7.47 7.756 8.024 8.371 8.703 8.985 9.3 9.631 9.942 10.323 10.754 11.12 11.519 11.955 12.396 12.848 13.396 14.061 14.723 15.462 16.267 17.2 18.266 19.507 20.975 22.71 23.946 24.395 24.514 24.561 24.512 24.379 24.216 24.068 23.922 23.725 23.486 23.293 23.113 22.892 22.668 22.43 22.227 22.038 21.814 21.61 21.441 21.242 21.041 20.883 20.719 20.548 20.363 20.156 20.011 19.861 19.614 19.429 19.242 19.151 18.974 18.784 18.558 18.437 18.177 17.981 17.834 17.702 17.315 17.066 16.814 16.51 16.183 15.787 15.171 12.654 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_21_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_21_22.txt deleted file mode 100644 index 545557b5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_21_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3900 ,TETRA ,17556156,Fri Nov 26 06:04:07 CET,Fri Nov 26 07:57:40 CET,0.0 0.957 1.259 1.514 1.723 1.922 2.097 2.25 2.535 2.649 2.759 2.865 3.055 3.142 3.316 3.488 3.646 3.721 3.852 3.974 4.152 4.266 4.373 4.533 4.705 4.875 5.033 5.181 5.362 5.536 5.691 5.871 6.039 6.203 6.391 6.587 6.774 6.999 7.268 7.537 7.795 8.113 8.535 8.897 9.226 9.596 10.057 10.547 10.997 11.348 11.621 11.625 11.412 11.159 10.895 10.596 10.292 10.001 9.759 9.519 9.296 9.083 8.864 8.653 8.449 8.252 8.053 7.888 7.748 7.591 7.412 7.256 7.096 6.934 6.799 6.651 6.499 6.336 6.161 6.05 5.931 5.716 5.576 5.433 5.357 5.199 5.01 4.808 4.703 4.501 4.401 4.302 4.192 3.91 3.745 3.566 3.378 3.15 2.884 2.551 1.329 -2 ,26692 ,TETRA ,17556157,Fri Nov 26 06:04:07 CET,Fri Nov 26 08:08:31 CET,0.0 0.993 1.366 1.648 1.863 2.056 2.231 2.394 2.66 2.788 2.912 3.054 3.276 3.391 3.598 3.798 3.991 4.083 4.262 4.443 4.708 4.855 4.999 5.214 5.413 5.6 5.779 5.953 6.173 6.364 6.528 6.728 6.922 7.117 7.328 7.552 7.783 8.049 8.332 8.627 8.918 9.222 9.551 9.872 10.257 10.678 11.156 11.678 12.201 12.715 13.242 13.475 13.422 13.221 12.951 12.707 12.473 12.244 12.037 11.794 11.569 11.344 11.12 10.907 10.705 10.537 10.367 10.193 10.039 9.878 9.691 9.536 9.371 9.189 9.057 8.93 8.796 8.661 8.513 8.403 8.288 8.109 7.982 7.853 7.787 7.651 7.503 7.336 7.243 7.051 6.962 6.859 6.758 6.54 6.412 6.276 6.13 5.948 5.726 5.397 3.942 -3 ,3638 ,TETRA ,17556158,Fri Nov 26 06:04:08 CET,Fri Nov 26 08:15:57 CET,0.0 1.082 1.407 1.637 1.82 1.994 2.156 2.301 2.556 2.667 2.775 2.875 3.067 3.157 3.338 3.525 3.694 3.765 3.903 4.036 4.232 4.366 4.488 4.648 4.808 4.963 5.108 5.248 5.43 5.605 5.771 5.966 6.148 6.321 6.517 6.737 6.946 7.167 7.392 7.626 7.876 8.144 8.451 8.744 9.047 9.399 9.757 10.094 10.476 10.852 11.119 11.091 10.871 10.556 10.273 9.992 9.711 9.438 9.186 8.922 8.673 8.449 8.241 8.053 7.878 7.703 7.51 7.333 7.174 7.001 6.829 6.685 6.517 6.34 6.212 6.09 5.959 5.798 5.61 5.49 5.366 5.175 5.053 4.904 4.821 4.659 4.498 4.335 4.247 4.058 3.955 3.857 3.748 3.489 3.352 3.207 3.067 2.929 2.693 2.382 1.401 -4 ,8817 ,TETRA ,17556159,Fri Nov 26 06:05:08 CET,Fri Nov 26 07:58:38 CET,0.0 1.02 1.363 1.592 1.807 2.011 2.178 2.32 2.569 2.692 2.812 2.937 3.13 3.228 3.429 3.602 3.768 3.847 3.999 4.144 4.335 4.452 4.563 4.736 4.905 5.062 5.218 5.379 5.58 5.761 5.941 6.148 6.341 6.537 6.758 6.997 7.226 7.479 7.759 8.036 8.327 8.662 9.021 9.371 9.755 10.139 10.538 10.932 11.333 11.716 12.0 11.908 11.618 11.282 10.936 10.621 10.345 10.07 9.79 9.502 9.251 9.014 8.78 8.557 8.354 8.175 7.98 7.8 7.641 7.461 7.269 7.118 6.971 6.802 6.654 6.502 6.341 6.175 6.008 5.892 5.77 5.561 5.425 5.291 5.217 5.053 4.872 4.682 4.588 4.396 4.31 4.226 4.135 3.895 3.754 3.584 3.407 3.213 2.985 2.738 1.468 -5 ,11941 ,TETRA ,17556160,Fri Nov 26 06:05:08 CET,Fri Nov 26 08:18:40 CET,0.0 1.057 1.401 1.609 1.791 1.957 2.112 2.26 2.511 2.621 2.743 2.884 3.09 3.198 3.389 3.554 3.732 3.82 3.984 4.134 4.331 4.464 4.585 4.736 4.882 5.038 5.189 5.339 5.526 5.695 5.861 6.053 6.234 6.403 6.608 6.833 7.034 7.241 7.456 7.681 7.914 8.172 8.455 8.737 9.072 9.428 9.803 10.172 10.569 10.957 11.266 11.288 11.074 10.749 10.448 10.161 9.876 9.624 9.385 9.118 8.887 8.674 8.466 8.272 8.08 7.894 7.705 7.541 7.398 7.243 7.082 6.944 6.805 6.661 6.54 6.416 6.28 6.14 6.003 5.904 5.79 5.592 5.458 5.321 5.249 5.102 4.932 4.727 4.619 4.426 4.324 4.209 4.085 3.756 3.565 3.413 3.262 3.053 2.774 2.429 0.855 -6 ,1487 ,TETRA ,17556161,Fri Nov 26 06:05:08 CET,Fri Nov 26 08:21:25 CET,0.0 1.179 1.514 1.778 1.992 2.168 2.321 2.452 2.684 2.79 2.901 3.008 3.189 3.273 3.455 3.639 3.815 3.898 4.048 4.175 4.36 4.481 4.596 4.754 4.906 5.065 5.215 5.341 5.491 5.659 5.832 6.009 6.17 6.332 6.53 6.736 6.91 7.102 7.324 7.553 7.783 8.046 8.356 8.66 8.995 9.392 9.848 10.299 10.722 11.072 11.308 11.246 11.019 10.771 10.496 10.206 9.909 9.596 9.315 9.03 8.794 8.579 8.351 8.121 7.901 7.706 7.495 7.287 7.108 6.909 6.682 6.504 6.331 6.144 5.994 5.848 5.701 5.543 5.366 5.246 5.126 4.919 4.776 4.643 4.575 4.415 4.242 4.057 3.959 3.766 3.674 3.563 3.448 3.22 3.085 2.935 2.76 2.597 2.399 2.068 0.924 -7 ,30750 ,TETRA ,17556162,Fri Nov 26 06:05:08 CET,Fri Nov 26 08:14:19 CET,0.0 0.949 1.261 1.526 1.713 1.868 2.0 2.124 2.376 2.486 2.591 2.697 2.889 2.982 3.151 3.297 3.439 3.513 3.646 3.776 3.982 4.109 4.233 4.41 4.573 4.717 4.841 4.972 5.161 5.325 5.476 5.68 5.873 6.057 6.266 6.496 6.712 6.931 7.154 7.393 7.633 7.908 8.23 8.534 8.87 9.23 9.594 9.952 10.384 10.83 11.091 11.04 10.803 10.414 10.038 9.727 9.4 9.04 8.728 8.402 8.13 7.915 7.697 7.476 7.273 7.092 6.91 6.74 6.582 6.419 6.235 6.075 5.921 5.759 5.626 5.486 5.339 5.186 5.041 4.933 4.813 4.652 4.543 4.419 4.354 4.209 4.043 3.87 3.781 3.6 3.525 3.439 3.355 3.151 3.023 2.87 2.692 2.507 2.255 1.923 0.219 -8 ,27047 ,TETRA ,17556163,Fri Nov 26 06:06:08 CET,Fri Nov 26 07:59:45 CET,0.0 1.112 1.428 1.686 1.912 2.106 2.269 2.403 2.648 2.763 2.879 2.994 3.2 3.288 3.446 3.604 3.756 3.831 3.977 4.121 4.319 4.45 4.578 4.753 4.922 5.08 5.233 5.382 5.57 5.752 5.924 6.126 6.331 6.519 6.72 6.942 7.15 7.376 7.609 7.861 8.108 8.39 8.731 9.04 9.385 9.758 10.177 10.638 11.093 11.509 11.944 12.02 11.868 11.641 11.354 11.061 10.782 10.505 10.247 9.982 9.747 9.53 9.323 9.108 8.872 8.662 8.443 8.228 8.031 7.835 7.651 7.494 7.326 7.146 7.013 6.878 6.723 6.569 6.417 6.309 6.187 5.986 5.851 5.699 5.618 5.456 5.297 5.129 5.033 4.836 4.732 4.626 4.523 4.323 4.188 4.027 3.848 3.634 3.381 3.045 1.368 -9 ,29746 ,TETRA ,17556164,Fri Nov 26 06:05:08 CET,Fri Nov 26 07:57:54 CET,0.0 1.336 1.747 2.046 2.28 2.481 2.661 2.817 3.108 3.233 3.342 3.449 3.643 3.736 3.906 4.071 4.228 4.3 4.437 4.562 4.74 4.851 4.955 5.112 5.261 5.398 5.531 5.658 5.813 5.953 6.113 6.329 6.528 6.711 6.922 7.152 7.369 7.608 7.872 8.182 8.51 8.868 9.254 9.622 10.046 10.477 10.931 11.416 11.931 12.416 12.758 12.793 12.619 12.349 12.07 11.778 11.487 11.216 10.987 10.726 10.481 10.235 9.998 9.784 9.576 9.39 9.207 9.031 8.874 8.723 8.55 8.39 8.213 8.028 7.877 7.713 7.554 7.375 7.188 7.063 6.937 6.763 6.647 6.52 6.453 6.305 6.129 5.961 5.881 5.693 5.606 5.511 5.412 5.192 5.076 4.944 4.782 4.586 4.368 4.062 2.877 -10 ,12278 ,TETRA ,17556165,Fri Nov 26 06:05:08 CET,Fri Nov 26 08:19:53 CET,0.0 1.329 1.65 1.871 2.085 2.266 2.408 2.548 2.814 2.928 3.03 3.106 3.289 3.385 3.567 3.734 3.885 3.956 4.088 4.211 4.399 4.521 4.638 4.798 4.946 5.084 5.216 5.353 5.54 5.723 5.892 6.093 6.307 6.521 6.736 6.935 7.13 7.347 7.559 7.804 8.089 8.419 8.796 9.145 9.527 9.931 10.351 10.786 11.209 11.637 12.039 12.048 11.825 11.538 11.22 10.885 10.56 10.242 9.965 9.695 9.439 9.172 8.93 8.716 8.503 8.299 8.071 7.877 7.706 7.516 7.34 7.198 7.032 6.85 6.704 6.553 6.397 6.231 6.054 5.926 5.801 5.622 5.495 5.366 5.296 5.151 4.98 4.791 4.696 4.502 4.401 4.299 4.189 3.934 3.791 3.634 3.46 3.258 3.006 2.645 0.973 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_21_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_21_32.txt deleted file mode 100644 index cde3685d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_21_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23942 ,KEBNE ,17025358,Wed Dec 22 12:20:00 CET,Wed Dec 22 14:10:16 CET,0.0 0.618 0.793 0.93 1.044 1.13 1.189 1.252 1.384 1.437 1.477 1.447 1.581 1.624 1.705 1.775 1.832 1.855 1.893 1.925 1.963 1.982 2.002 2.027 2.042 2.057 2.068 2.073 2.082 2.083 2.073 2.06 2.035 1.995 1.932 1.845 1.757 1.646 1.521 1.388 1.229 1.013 0.737 0.437 0.025 -0.546 -1.32 -2.334 -3.734 -5.763 -8.93 -12.453 -15.225 -17.39 -19.136 -20.66 -21.957 -23.13 -24.124 -25.084 -25.861 -26.539 -27.199 -27.826 -28.412 -28.953 -29.513 -29.983 -30.385 -30.819 -31.284 -31.653 -32.003 -32.362 -32.65 -32.944 -33.235 -33.529 -33.841 -34.052 -34.261 -34.592 -34.823 -35.057 -35.187 -35.478 -35.764 -36.063 -36.218 -36.531 -36.783 -36.971 -37.172 -37.624 -37.845 -38.078 -38.367 -38.716 -39.132 -39.635 -41.76 -2 ,3237 ,KEBNE ,17025359,Wed Dec 22 12:20:01 CET,Wed Dec 22 14:10:41 CET,0.0 0.495 0.632 0.732 0.843 0.95 1.05 1.134 1.295 1.367 1.415 1.383 1.513 1.548 1.617 1.686 1.774 1.816 1.883 1.931 1.99 2.029 2.063 2.11 2.153 2.19 2.225 2.259 2.295 2.313 2.325 2.326 2.304 2.282 2.265 2.244 2.21 2.139 2.053 1.951 1.819 1.657 1.459 1.23 0.888 0.411 -0.219 -1.076 -2.31 -4.119 -6.993 -10.245 -12.816 -14.898 -16.616 -18.076 -19.267 -20.303 -21.183 -22.04 -22.757 -23.407 -24.055 -24.647 -25.18 -25.659 -26.134 -26.563 -26.949 -27.356 -27.787 -28.133 -28.472 -28.828 -29.095 -29.358 -29.668 -30.02 -30.372 -30.598 -30.811 -31.155 -31.418 -31.69 -31.821 -32.084 -32.388 -32.753 -32.942 -33.267 -33.518 -33.713 -33.908 -34.426 -34.735 -35.073 -35.412 -35.712 -36.019 -36.476 -39.175 -3 ,8478 ,KEBNE ,17025360,Wed Dec 22 12:20:01 CET,Wed Dec 22 14:12:02 CET,0.0 0.172 0.272 0.364 0.485 0.575 0.645 0.713 0.836 0.889 0.921 0.889 1.014 1.038 1.097 1.148 1.188 1.207 1.249 1.288 1.332 1.355 1.373 1.395 1.414 1.431 1.442 1.449 1.466 1.474 1.476 1.473 1.458 1.438 1.408 1.37 1.314 1.238 1.163 1.046 0.901 0.727 0.478 0.179 -0.227 -0.735 -1.398 -2.296 -3.602 -5.486 -8.411 -11.631 -14.158 -16.239 -17.946 -19.404 -20.634 -21.729 -22.642 -23.5 -24.186 -24.785 -25.358 -25.88 -26.371 -26.819 -27.279 -27.69 -28.042 -28.407 -28.771 -29.055 -29.347 -29.657 -29.893 -30.137 -30.401 -30.685 -30.975 -31.157 -31.342 -31.621 -31.811 -32.011 -32.108 -32.313 -32.526 -32.76 -32.903 -33.216 -33.443 -33.616 -33.8 -34.182 -34.378 -34.559 -34.76 -35.047 -35.437 -35.9 -38.664 -4 ,9666 ,KEBNE ,17025361,Wed Dec 22 12:20:01 CET,Wed Dec 22 14:10:34 CET,0.0 0.191 0.261 0.313 0.37 0.429 0.488 0.539 0.637 0.681 0.712 0.686 0.823 0.852 0.906 0.954 0.99 1.004 1.033 1.066 1.109 1.129 1.145 1.163 1.181 1.203 1.216 1.22 1.227 1.234 1.227 1.204 1.175 1.153 1.124 1.072 1.021 0.963 0.882 0.761 0.61 0.417 0.16 -0.124 -0.499 -0.973 -1.613 -2.447 -3.56 -5.233 -8.063 -11.283 -13.736 -15.698 -17.296 -18.681 -19.912 -21.032 -21.937 -22.814 -23.565 -24.216 -24.851 -25.45 -26.003 -26.51 -27.019 -27.471 -27.871 -28.277 -28.693 -29.031 -29.346 -29.674 -29.935 -30.191 -30.459 -30.758 -31.077 -31.296 -31.53 -31.911 -32.175 -32.434 -32.556 -32.798 -33.052 -33.311 -33.449 -33.726 -33.873 -34.026 -34.185 -34.521 -34.721 -34.934 -35.14 -35.465 -35.905 -36.576 -39.419 -5 ,17954 ,KEBNE ,17025362,Wed Dec 22 12:20:01 CET,Wed Dec 22 14:11:59 CET,0.0 0.232 0.349 0.437 0.501 0.555 0.614 0.678 0.794 0.843 0.892 0.878 1.003 1.023 1.055 1.087 1.113 1.125 1.148 1.166 1.206 1.225 1.238 1.255 1.27 1.283 1.287 1.29 1.292 1.283 1.269 1.269 1.263 1.245 1.214 1.167 1.112 1.03 0.938 0.821 0.69 0.537 0.286 -0.029 -0.435 -0.98 -1.725 -2.67 -4.027 -5.958 -8.899 -12.264 -14.863 -16.925 -18.598 -20.023 -21.286 -22.421 -23.374 -24.295 -25.04 -25.69 -26.344 -26.964 -27.522 -28.023 -28.521 -28.992 -29.409 -29.832 -30.294 -30.665 -31.023 -31.422 -31.75 -32.087 -32.424 -32.795 -33.21 -33.489 -33.763 -34.155 -34.43 -34.741 -34.907 -35.243 -35.606 -35.997 -36.191 -36.526 -36.792 -36.999 -37.204 -37.671 -37.973 -38.295 -38.61 -38.965 -39.437 -40.106 -44.424 -6 ,25389 ,KEBNE ,17025363,Wed Dec 22 12:21:03 CET,Wed Dec 22 14:10:29 CET,0.0 0.268 0.459 0.613 0.719 0.791 0.83 0.868 0.931 0.967 1.0 0.936 1.055 1.074 1.1 1.127 1.158 1.168 1.187 1.212 1.235 1.241 1.262 1.283 1.28 1.278 1.272 1.269 1.267 1.236 1.197 1.169 1.139 1.098 1.045 0.981 0.911 0.814 0.672 0.516 0.349 0.116 -0.189 -0.52 -0.968 -1.563 -2.341 -3.367 -4.847 -7.004 -10.288 -13.835 -16.528 -18.713 -20.53 -22.096 -23.407 -24.573 -25.59 -26.604 -27.463 -28.217 -28.926 -29.582 -30.181 -30.698 -31.193 -31.624 -31.995 -32.385 -32.83 -33.204 -33.585 -33.999 -34.293 -34.561 -34.836 -35.113 -35.381 -35.56 -35.759 -36.08 -36.295 -36.54 -36.67 -36.925 -37.185 -37.452 -37.592 -37.884 -38.091 -38.264 -38.444 -38.82 -39.007 -39.21 -39.451 -39.677 -39.922 -40.311 -41.914 -7 ,622 ,KEBNE ,17025364,Wed Dec 22 12:21:03 CET,Wed Dec 22 14:11:51 CET,0.0 0.428 0.556 0.66 0.753 0.832 0.892 0.95 1.046 1.076 1.106 1.066 1.207 1.251 1.318 1.358 1.406 1.431 1.469 1.503 1.55 1.57 1.585 1.604 1.615 1.625 1.638 1.64 1.64 1.645 1.649 1.652 1.645 1.62 1.587 1.55 1.507 1.436 1.344 1.222 1.056 0.868 0.613 0.313 -0.111 -0.698 -1.473 -2.432 -3.724 -5.664 -8.76 -12.169 -14.828 -17.048 -18.811 -20.272 -21.543 -22.659 -23.594 -24.493 -25.239 -25.935 -26.621 -27.283 -27.879 -28.364 -28.851 -29.278 -29.661 -30.087 -30.517 -30.862 -31.232 -31.612 -31.901 -32.196 -32.507 -32.85 -33.218 -33.466 -33.708 -34.09 -34.386 -34.686 -34.816 -35.055 -35.324 -35.648 -35.8 -36.076 -36.247 -36.419 -36.636 -37.141 -37.383 -37.616 -37.869 -38.15 -38.48 -38.97 -41.494 -8 ,9158 ,KEBNE ,17025365,Wed Dec 22 12:21:03 CET,Wed Dec 22 14:11:08 CET,0.0 0.395 0.574 0.694 0.795 0.87 0.928 0.982 1.071 1.114 1.16 1.132 1.253 1.282 1.34 1.398 1.451 1.474 1.515 1.547 1.586 1.611 1.635 1.666 1.695 1.724 1.749 1.767 1.788 1.802 1.799 1.786 1.767 1.742 1.719 1.68 1.624 1.561 1.473 1.353 1.202 0.999 0.728 0.41 -0.01 -0.534 -1.24 -2.151 -3.424 -5.286 -8.229 -11.558 -14.145 -16.211 -17.925 -19.391 -20.619 -21.702 -22.597 -23.469 -24.208 -24.833 -25.407 -25.955 -26.492 -26.984 -27.494 -27.939 -28.296 -28.67 -29.09 -29.432 -29.765 -30.108 -30.378 -30.649 -30.91 -31.18 -31.475 -31.684 -31.898 -32.254 -32.519 -32.786 -32.909 -33.152 -33.402 -33.673 -33.824 -34.117 -34.298 -34.454 -34.612 -34.948 -35.129 -35.345 -35.62 -35.946 -36.308 -36.735 -39.613 -9 ,10213 ,KEBNE ,17025366,Wed Dec 22 12:21:03 CET,Wed Dec 22 14:11:55 CET,0.0 0.234 0.343 0.465 0.57 0.642 0.713 0.779 0.892 0.95 1.005 1.006 1.154 1.188 1.25 1.309 1.361 1.385 1.428 1.468 1.519 1.548 1.575 1.61 1.635 1.657 1.683 1.707 1.74 1.762 1.767 1.759 1.738 1.718 1.693 1.638 1.552 1.445 1.34 1.202 1.029 0.836 0.576 0.279 -0.123 -0.707 -1.479 -2.454 -3.852 -5.759 -8.69 -12.112 -14.797 -16.966 -18.741 -20.271 -21.578 -22.727 -23.718 -24.702 -25.516 -26.239 -26.92 -27.549 -28.118 -28.63 -29.16 -29.618 -30.01 -30.421 -30.863 -31.233 -31.608 -32.02 -32.332 -32.63 -32.952 -33.304 -33.655 -33.891 -34.136 -34.552 -34.862 -35.186 -35.357 -35.7 -36.048 -36.399 -36.59 -36.93 -37.195 -37.415 -37.64 -38.166 -38.473 -38.788 -39.147 -39.567 -40.06 -40.723 -42.786 -10 ,7219 ,KEBNE ,17025367,Wed Dec 22 12:21:03 CET,Wed Dec 22 14:12:10 CET,0.0 0.256 0.359 0.435 0.488 0.535 0.571 0.599 0.67 0.706 0.737 0.701 0.824 0.852 0.905 0.938 0.981 1.008 1.04 1.054 1.083 1.103 1.114 1.132 1.145 1.143 1.146 1.147 1.13 1.116 1.101 1.074 1.044 1.005 0.949 0.874 0.793 0.698 0.577 0.414 0.231 0.007 -0.264 -0.558 -0.974 -1.53 -2.257 -3.209 -4.512 -6.418 -9.611 -13.118 -15.792 -18.017 -19.886 -21.454 -22.696 -23.778 -24.745 -25.714 -26.524 -27.214 -27.859 -28.467 -29.025 -29.52 -30.048 -30.536 -30.936 -31.333 -31.753 -32.109 -32.499 -32.904 -33.198 -33.494 -33.797 -34.094 -34.422 -34.661 -34.894 -35.231 -35.461 -35.732 -35.885 -36.21 -36.57 -36.912 -37.067 -37.373 -37.598 -37.79 -37.981 -38.354 -38.551 -38.795 -39.063 -39.356 -39.696 -40.12 -41.897 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_22_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_22_19.txt deleted file mode 100644 index 997487bf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_22_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28698 ,TETRA ,17556167,Fri Nov 26 06:06:08 CET,Fri Nov 26 07:58:13 CET,0.0 0.32 0.463 0.581 0.658 0.717 0.775 0.839 0.993 1.068 1.129 1.149 1.3 1.346 1.426 1.499 1.587 1.63 1.698 1.764 1.863 1.921 1.974 2.056 2.133 2.205 2.276 2.348 2.433 2.515 2.587 2.657 2.726 2.795 2.871 2.952 3.031 3.104 3.152 3.197 3.243 3.3 3.362 3.385 3.365 3.328 3.221 2.973 2.524 1.732 0.331 -1.332 -2.662 -3.828 -4.824 -5.623 -6.304 -6.935 -7.505 -8.09 -8.582 -9.014 -9.417 -9.799 -10.179 -10.549 -10.937 -11.285 -11.587 -11.899 -12.223 -12.492 -12.761 -13.029 -13.245 -13.47 -13.696 -13.941 -14.205 -14.384 -14.572 -14.876 -15.07 -15.257 -15.359 -15.594 -15.841 -16.096 -16.234 -16.487 -16.679 -16.832 -16.996 -17.387 -17.582 -17.795 -18.031 -18.297 -18.635 -19.067 -20.427 -2 ,11078 ,TETRA ,17556168,Fri Nov 26 06:06:08 CET,Fri Nov 26 07:58:12 CET,0.0 0.868 1.102 1.252 1.38 1.494 1.583 1.662 1.802 1.865 1.921 1.924 2.077 2.124 2.204 2.279 2.356 2.402 2.491 2.555 2.637 2.698 2.764 2.846 2.92 3.001 3.071 3.143 3.238 3.311 3.364 3.435 3.519 3.579 3.632 3.689 3.75 3.814 3.873 3.929 3.966 3.973 3.96 3.949 3.94 3.9 3.775 3.532 3.136 2.491 1.193 -0.419 -1.726 -2.941 -3.957 -4.763 -5.445 -6.104 -6.671 -7.211 -7.663 -8.058 -8.44 -8.8 -9.131 -9.456 -9.812 -10.145 -10.427 -10.697 -11.008 -11.296 -11.586 -11.854 -12.059 -12.281 -12.512 -12.762 -13.028 -13.21 -13.393 -13.676 -13.871 -14.061 -14.159 -14.366 -14.588 -14.834 -14.958 -15.196 -15.338 -15.48 -15.631 -15.971 -16.156 -16.322 -16.488 -16.683 -16.934 -17.305 -18.779 -3 ,3051 ,TETRA ,17556169,Fri Nov 26 06:06:08 CET,Fri Nov 26 07:59:01 CET,0.0 0.258 0.374 0.483 0.585 0.683 0.764 0.83 0.958 1.011 1.067 1.078 1.217 1.263 1.355 1.44 1.525 1.565 1.63 1.681 1.76 1.829 1.895 1.99 2.075 2.138 2.198 2.25 2.313 2.37 2.409 2.471 2.557 2.63 2.685 2.747 2.813 2.87 2.926 2.962 3.003 3.038 3.045 3.036 3.001 2.908 2.725 2.496 2.103 1.353 0.003 -1.705 -3.062 -4.158 -5.091 -5.922 -6.654 -7.322 -7.872 -8.424 -8.921 -9.36 -9.798 -10.211 -10.567 -10.891 -11.252 -11.589 -11.871 -12.146 -12.432 -12.659 -12.88 -13.135 -13.34 -13.534 -13.74 -13.962 -14.205 -14.385 -14.561 -14.825 -14.995 -15.163 -15.26 -15.463 -15.678 -15.915 -16.034 -16.272 -16.445 -16.598 -16.754 -17.108 -17.292 -17.471 -17.668 -17.883 -18.138 -18.434 -19.482 -4 ,24918 ,TETRA ,17556170,Fri Nov 26 06:06:08 CET,Fri Nov 26 07:58:25 CET,0.0 0.427 0.627 0.807 0.909 0.989 1.078 1.146 1.27 1.332 1.377 1.356 1.505 1.556 1.642 1.724 1.803 1.838 1.912 1.994 2.11 2.174 2.227 2.298 2.36 2.418 2.477 2.533 2.603 2.674 2.74 2.821 2.894 2.955 3.034 3.124 3.184 3.237 3.287 3.337 3.376 3.414 3.468 3.462 3.37 3.267 3.156 2.921 2.517 1.904 0.758 -0.753 -2.141 -3.386 -4.451 -5.346 -6.075 -6.745 -7.332 -7.919 -8.416 -8.853 -9.283 -9.69 -10.063 -10.408 -10.764 -11.085 -11.379 -11.678 -11.987 -12.248 -12.515 -12.778 -12.979 -13.18 -13.376 -13.598 -13.859 -14.032 -14.203 -14.479 -14.657 -14.831 -14.921 -15.117 -15.32 -15.532 -15.642 -15.872 -16.007 -16.139 -16.283 -16.617 -16.819 -17.025 -17.241 -17.48 -17.782 -18.169 -19.252 -5 ,16974 ,TETRA ,17556171,Fri Nov 26 06:07:08 CET,Fri Nov 26 08:20:18 CET,0.0 0.348 0.488 0.618 0.747 0.854 0.929 0.991 1.123 1.188 1.244 1.251 1.398 1.455 1.562 1.659 1.742 1.778 1.844 1.903 2.013 2.087 2.144 2.223 2.301 2.37 2.444 2.514 2.604 2.676 2.741 2.83 2.895 2.952 3.011 3.063 3.114 3.172 3.223 3.262 3.317 3.354 3.344 3.344 3.341 3.271 3.116 2.858 2.384 1.637 0.371 -1.234 -2.564 -3.687 -4.599 -5.452 -6.254 -6.967 -7.551 -8.129 -8.646 -9.088 -9.494 -9.886 -10.267 -10.628 -10.991 -11.299 -11.561 -11.842 -12.122 -12.333 -12.567 -12.81 -12.997 -13.213 -13.434 -13.653 -13.873 -14.023 -14.178 -14.415 -14.587 -14.767 -14.858 -15.05 -15.259 -15.476 -15.598 -15.85 -16.028 -16.183 -16.342 -16.693 -16.902 -17.125 -17.37 -17.641 -17.952 -18.36 -19.719 -6 ,7292 ,TETRA ,17556172,Fri Nov 26 06:07:08 CET,Fri Nov 26 07:58:53 CET,0.0 0.213 0.332 0.429 0.52 0.584 0.655 0.727 0.863 0.939 1.004 1.022 1.179 1.236 1.331 1.401 1.469 1.501 1.562 1.627 1.715 1.773 1.827 1.903 1.973 2.028 2.083 2.146 2.218 2.278 2.336 2.409 2.484 2.548 2.606 2.664 2.728 2.817 2.89 2.947 3.004 3.046 3.072 3.051 2.992 2.898 2.711 2.393 1.886 1.108 -0.242 -1.912 -3.279 -4.462 -5.511 -6.487 -7.299 -7.995 -8.622 -9.225 -9.718 -10.154 -10.569 -10.956 -11.314 -11.654 -12.014 -12.341 -12.634 -12.933 -13.218 -13.462 -13.727 -14.008 -14.218 -14.425 -14.647 -14.88 -15.118 -15.276 -15.435 -15.691 -15.866 -16.055 -16.157 -16.377 -16.597 -16.816 -16.94 -17.175 -17.304 -17.432 -17.567 -17.904 -18.092 -18.285 -18.508 -18.748 -18.986 -19.241 -21.713 -7 ,28239 ,TETRA ,17556173,Fri Nov 26 06:07:08 CET,Fri Nov 26 07:59:17 CET,0.0 0.281 0.452 0.552 0.636 0.727 0.832 0.925 1.05 1.099 1.151 1.16 1.304 1.35 1.444 1.529 1.608 1.649 1.721 1.79 1.884 1.935 1.986 2.065 2.142 2.209 2.269 2.33 2.402 2.463 2.527 2.609 2.699 2.79 2.868 2.939 3.005 3.074 3.146 3.208 3.26 3.309 3.351 3.354 3.335 3.279 3.122 2.852 2.4 1.734 0.637 -0.734 -1.96 -3.022 -3.932 -4.764 -5.501 -6.168 -6.712 -7.242 -7.714 -8.147 -8.565 -8.969 -9.337 -9.668 -10.006 -10.296 -10.559 -10.85 -11.132 -11.34 -11.568 -11.839 -12.047 -12.249 -12.453 -12.67 -12.906 -13.065 -13.22 -13.478 -13.668 -13.858 -13.946 -14.118 -14.305 -14.521 -14.633 -14.852 -14.983 -15.113 -15.273 -15.616 -15.783 -15.966 -16.162 -16.408 -16.726 -17.126 -18.243 -8 ,4793 ,TETRA ,17556174,Fri Nov 26 06:08:07 CET,Fri Nov 26 08:23:57 CET,0.0 0.38 0.533 0.611 0.691 0.772 0.839 0.908 1.062 1.137 1.204 1.237 1.387 1.427 1.514 1.603 1.686 1.726 1.808 1.881 1.963 2.011 2.057 2.12 2.189 2.258 2.318 2.372 2.449 2.526 2.601 2.687 2.768 2.836 2.903 2.971 3.028 3.093 3.156 3.2 3.233 3.264 3.271 3.253 3.215 3.143 2.995 2.725 2.28 1.562 0.135 -1.604 -2.923 -4.138 -5.124 -5.928 -6.666 -7.299 -7.83 -8.388 -8.887 -9.316 -9.697 -10.061 -10.412 -10.771 -11.16 -11.467 -11.744 -12.048 -12.347 -12.576 -12.807 -13.063 -13.263 -13.477 -13.702 -13.934 -14.171 -14.336 -14.52 -14.811 -15.015 -15.216 -15.312 -15.523 -15.721 -15.913 -16.018 -16.262 -16.43 -16.574 -16.721 -17.037 -17.204 -17.377 -17.578 -17.841 -18.2 -18.639 -20.005 -9 ,30542 ,TETRA ,17556175,Fri Nov 26 06:08:07 CET,Fri Nov 26 08:19:56 CET,0.0 0.282 0.429 0.571 0.691 0.796 0.871 0.939 1.095 1.158 1.211 1.201 1.338 1.375 1.443 1.536 1.637 1.673 1.732 1.786 1.874 1.944 2.01 2.087 2.156 2.231 2.293 2.353 2.44 2.508 2.561 2.626 2.683 2.725 2.768 2.824 2.882 2.936 2.996 3.042 3.064 3.076 3.083 3.078 3.031 2.952 2.815 2.553 2.095 1.338 0.027 -1.64 -2.957 -4.071 -5.05 -5.934 -6.733 -7.407 -7.934 -8.469 -8.967 -9.437 -9.89 -10.314 -10.69 -11.031 -11.404 -11.74 -12.045 -12.382 -12.714 -12.977 -13.25 -13.531 -13.737 -13.956 -14.189 -14.418 -14.654 -14.814 -14.978 -15.23 -15.413 -15.618 -15.726 -15.926 -16.155 -16.404 -16.525 -16.77 -16.928 -17.071 -17.212 -17.507 -17.671 -17.907 -18.217 -18.534 -18.854 -19.251 -20.506 -10 ,1461 ,TETRA ,17556176,Fri Nov 26 06:08:08 CET,Fri Nov 26 07:59:34 CET,0.0 0.484 0.683 0.818 0.934 1.044 1.153 1.233 1.35 1.405 1.457 1.447 1.602 1.658 1.746 1.831 1.923 1.965 2.02 2.079 2.172 2.221 2.276 2.366 2.437 2.495 2.546 2.595 2.667 2.731 2.789 2.869 2.951 3.017 3.069 3.119 3.17 3.222 3.277 3.322 3.357 3.396 3.411 3.382 3.307 3.195 3.014 2.725 2.257 1.527 0.298 -1.242 -2.599 -3.801 -4.785 -5.607 -6.337 -7.002 -7.584 -8.209 -8.75 -9.203 -9.634 -10.021 -10.36 -10.68 -11.017 -11.325 -11.577 -11.832 -12.125 -12.358 -12.592 -12.846 -13.037 -13.244 -13.475 -13.707 -13.95 -14.118 -14.29 -14.561 -14.741 -14.924 -15.021 -15.232 -15.449 -15.666 -15.781 -16.02 -16.158 -16.292 -16.422 -16.72 -16.889 -17.065 -17.278 -17.515 -17.795 -18.17 -19.398 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_23_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_23_21.txt deleted file mode 100644 index 6ea29806..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_23_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17604 ,TETRA ,17556177,Fri Nov 26 06:09:07 CET,Fri Nov 26 08:23:07 CET,0.0 1.002 1.359 1.659 1.947 2.207 2.454 2.686 3.096 3.31 3.531 3.739 4.113 4.285 4.629 4.968 5.3 5.466 5.793 6.115 6.608 6.937 7.254 7.705 8.136 8.559 8.968 9.373 9.909 10.435 10.962 11.615 12.25 12.876 13.62 14.462 15.317 16.297 17.382 18.552 19.773 21.18 22.938 24.788 26.987 29.565 32.706 36.424 41.122 47.318 55.738 63.414 68.546 72.401 75.252 77.455 79.217 80.661 81.774 82.786 83.594 84.254 84.828 85.34 85.78 86.148 86.495 86.779 87.009 87.234 87.451 87.615 87.765 87.905 88.01 88.122 88.235 88.342 88.443 88.499 88.549 88.623 88.668 88.713 88.727 88.741 88.749 88.75 88.752 88.648 88.701 88.674 88.648 88.582 88.54 88.497 88.429 88.337 88.21 88.024 87.289 -2 ,27909 ,TETRA ,17556178,Fri Nov 26 06:09:07 CET,Fri Nov 26 08:27:33 CET,0.0 0.598 0.904 1.153 1.377 1.606 1.819 2.021 2.408 2.587 2.762 2.919 3.261 3.42 3.731 4.038 4.348 4.503 4.799 5.084 5.504 5.782 6.06 6.469 6.867 7.267 7.666 8.055 8.549 9.028 9.51 10.114 10.719 11.328 12.044 12.857 13.666 14.579 15.587 16.678 17.858 19.266 20.987 22.741 24.887 27.435 30.453 34.018 38.521 44.269 52.174 59.84 65.04 68.797 71.579 73.802 75.547 76.979 78.118 79.161 79.989 80.681 81.314 81.852 82.305 82.712 83.108 83.424 83.681 83.938 84.184 84.367 84.547 84.736 84.88 85.013 85.134 85.249 85.362 85.431 85.486 85.564 85.607 85.653 85.685 85.74 85.771 85.772 85.766 85.667 85.762 85.743 85.719 85.696 85.69 85.661 85.6 85.536 85.479 85.396 84.862 -3 ,4309 ,TETRA ,17556179,Fri Nov 26 06:09:07 CET,Fri Nov 26 08:03:06 CET,0.0 1.18 1.678 2.021 2.288 2.527 2.763 2.985 3.382 3.577 3.774 3.951 4.327 4.516 4.875 5.211 5.532 5.691 6.015 6.344 6.834 7.136 7.425 7.85 8.276 8.698 9.124 9.548 10.095 10.639 11.188 11.878 12.511 13.092 13.805 14.632 15.445 16.381 17.433 18.575 19.793 21.219 22.949 24.7 26.806 29.325 32.392 36.01 40.54 46.445 54.503 62.162 67.367 71.088 73.81 75.927 77.599 78.992 80.09 81.099 81.89 82.534 83.107 83.6 84.022 84.388 84.749 85.048 85.284 85.506 85.713 85.874 86.034 86.182 86.279 86.373 86.481 86.591 86.687 86.747 86.799 86.872 86.906 86.927 86.933 86.938 86.945 86.954 86.95 86.844 86.935 86.917 86.896 86.845 86.808 86.773 86.726 86.631 86.515 86.38 85.989 -4 ,5567 ,TETRA ,17556180,Fri Nov 26 06:09:07 CET,Fri Nov 26 08:02:55 CET,0.0 0.715 1.081 1.392 1.653 1.883 2.11 2.324 2.708 2.898 3.085 3.254 3.612 3.784 4.104 4.403 4.706 4.859 5.167 5.469 5.91 6.199 6.498 6.93 7.331 7.726 8.118 8.515 9.033 9.528 10.025 10.648 11.267 11.871 12.597 13.44 14.254 15.169 16.186 17.286 18.475 19.868 21.545 23.296 25.45 27.965 31.045 34.775 39.437 45.348 53.284 60.864 65.977 69.738 72.578 74.779 76.465 77.876 78.993 79.983 80.772 81.424 82.016 82.545 83.002 83.39 83.762 84.081 84.338 84.579 84.799 84.965 85.121 85.266 85.372 85.466 85.554 85.637 85.727 85.786 85.832 85.871 85.897 85.937 85.959 85.988 86.014 86.05 86.056 85.96 86.067 86.061 86.05 86.026 85.993 85.938 85.879 85.798 85.688 85.5 84.473 -5 ,29676 ,TETRA ,17556181,Fri Nov 26 06:10:09 CET,Fri Nov 26 08:23:32 CET,0.0 1.051 1.473 1.83 2.096 2.338 2.56 2.779 3.219 3.421 3.604 3.782 4.139 4.3 4.646 4.987 5.314 5.476 5.801 6.125 6.607 6.914 7.225 7.706 8.149 8.563 8.98 9.398 9.943 10.475 11.007 11.666 12.309 12.944 13.691 14.53 15.338 16.219 17.191 18.262 19.431 20.824 22.549 24.368 26.544 29.007 31.958 35.537 40.071 45.927 54.051 61.872 67.105 70.86 73.719 75.989 77.788 79.283 80.447 81.496 82.32 83.027 83.687 84.261 84.76 85.194 85.604 85.936 86.201 86.447 86.689 86.893 87.084 87.259 87.386 87.502 87.612 87.734 87.847 87.903 87.949 88.025 88.081 88.134 88.158 88.196 88.229 88.249 88.258 88.169 88.27 88.272 88.265 88.24 88.228 88.213 88.193 88.163 88.123 88.03 87.622 -6 ,1420 ,TETRA ,17556182,Fri Nov 26 06:10:08 CET,Fri Nov 26 08:26:17 CET,0.0 0.69 1.035 1.285 1.506 1.733 1.946 2.144 2.504 2.672 2.837 2.993 3.348 3.514 3.832 4.131 4.427 4.577 4.859 5.123 5.516 5.784 6.054 6.451 6.844 7.224 7.602 7.98 8.483 8.991 9.502 10.14 10.782 11.41 12.142 12.959 13.755 14.669 15.668 16.721 17.833 19.153 20.758 22.422 24.47 26.882 29.833 33.372 37.781 43.454 51.194 58.58 63.684 67.432 70.176 72.34 74.044 75.403 76.465 77.455 78.246 78.886 79.447 79.956 80.411 80.802 81.165 81.461 81.712 81.957 82.181 82.342 82.508 82.678 82.8 82.918 83.033 83.133 83.214 83.265 83.312 83.373 83.415 83.443 83.457 83.491 83.515 83.544 83.559 83.468 83.577 83.568 83.544 83.498 83.477 83.457 83.421 83.357 83.289 83.183 82.889 -7 ,1165 ,TETRA ,17556183,Fri Nov 26 06:10:08 CET,Fri Nov 26 08:07:22 CET,0.0 0.972 1.31 1.586 1.805 2.01 2.218 2.41 2.795 2.981 3.161 3.327 3.68 3.839 4.147 4.446 4.736 4.879 5.158 5.44 5.856 6.122 6.377 6.746 7.122 7.514 7.91 8.302 8.808 9.306 9.808 10.422 11.026 11.628 12.346 13.172 13.944 14.811 15.798 16.873 18.038 19.397 21.021 22.744 24.88 27.339 30.298 33.866 38.413 44.292 52.296 59.952 65.201 69.047 71.86 74.028 75.73 77.139 78.237 79.227 80.027 80.697 81.278 81.764 82.173 82.531 82.885 83.171 83.413 83.665 83.913 84.1 84.291 84.486 84.616 84.724 84.819 84.912 85.004 85.065 85.121 85.195 85.25 85.318 85.35 85.393 85.425 85.462 85.475 85.383 85.481 85.476 85.468 85.439 85.413 85.388 85.33 85.252 85.21 85.132 84.89 -8 ,8726 ,TETRA ,17556184,Fri Nov 26 06:10:08 CET,Fri Nov 26 08:03:37 CET,0.0 1.123 1.531 1.83 2.067 2.302 2.537 2.749 3.163 3.371 3.574 3.757 4.124 4.294 4.63 4.971 5.297 5.456 5.772 6.086 6.562 6.867 7.166 7.616 8.061 8.487 8.893 9.294 9.826 10.376 10.92 11.572 12.218 12.85 13.592 14.446 15.274 16.202 17.261 18.423 19.658 21.08 22.779 24.557 26.753 29.338 32.535 36.351 41.054 47.122 55.308 63.072 68.418 72.357 75.25 77.494 79.272 80.722 81.874 82.951 83.819 84.515 85.11 85.62 86.044 86.397 86.74 87.02 87.237 87.431 87.616 87.769 87.935 88.105 88.221 88.332 88.442 88.548 88.643 88.702 88.749 88.83 88.892 88.939 88.963 88.993 88.994 88.987 88.984 88.882 88.969 88.953 88.928 88.854 88.81 88.765 88.728 88.681 88.586 88.438 87.898 -9 ,29500 ,TETRA ,17556185,Fri Nov 26 06:11:06 CET,Fri Nov 26 08:25:18 CET,0.0 0.992 1.392 1.732 2.03 2.282 2.516 2.742 3.163 3.366 3.565 3.752 4.133 4.33 4.725 5.099 5.453 5.622 5.948 6.27 6.765 7.086 7.391 7.845 8.291 8.722 9.143 9.559 10.101 10.629 11.16 11.824 12.459 13.084 13.848 14.734 15.61 16.596 17.676 18.855 20.129 21.596 23.358 25.192 27.432 30.024 33.161 36.915 41.668 47.773 55.926 63.77 69.005 72.76 75.616 77.9 79.685 81.111 82.204 83.219 84.03 84.695 85.286 85.797 86.24 86.612 86.98 87.298 87.548 87.758 87.949 88.114 88.284 88.448 88.568 88.678 88.781 88.869 88.949 89.004 89.055 89.13 89.168 89.19 89.192 89.178 89.168 89.156 89.14 89.019 89.081 89.063 89.04 88.98 88.931 88.857 88.779 88.676 88.544 88.348 87.659 -10 ,26702 ,TETRA ,17556186,Fri Nov 26 06:11:06 CET,Fri Nov 26 08:26:12 CET,0.0 0.647 0.917 1.163 1.405 1.642 1.842 2.034 2.379 2.54 2.706 2.847 3.195 3.363 3.689 3.995 4.29 4.433 4.717 4.994 5.412 5.685 5.942 6.34 6.741 7.136 7.539 7.932 8.433 8.918 9.396 10.0 10.594 11.197 11.908 12.696 13.465 14.341 15.298 16.339 17.49 18.826 20.438 22.127 24.199 26.631 29.596 33.168 37.703 43.606 51.703 59.542 64.849 68.724 71.683 74.042 75.932 77.49 78.709 79.821 80.695 81.435 82.113 82.701 83.198 83.617 84.028 84.378 84.669 84.96 85.239 85.445 85.639 85.818 85.951 86.084 86.215 86.35 86.483 86.564 86.638 86.757 86.832 86.893 86.919 86.97 87.017 87.052 87.074 87.011 87.12 87.109 87.092 87.071 87.055 87.03 87.005 86.981 86.936 86.758 86.358 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_23_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_23_22.txt deleted file mode 100644 index ebb587cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_23_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2689 ,TETRA ,17556187,Fri Nov 26 06:11:07 CET,Fri Nov 26 08:28:47 CET,0.0 1.018 1.379 1.702 1.985 2.236 2.461 2.668 3.074 3.268 3.452 3.619 3.97 4.143 4.48 4.808 5.118 5.27 5.577 5.876 6.307 6.594 6.869 7.274 7.685 8.093 8.49 8.874 9.38 9.877 10.364 10.978 11.581 12.157 12.85 13.654 14.45 15.365 16.394 17.52 18.744 20.176 21.914 23.716 25.909 28.466 31.524 35.218 39.891 45.893 54.026 61.815 67.106 70.975 73.902 76.236 78.04 79.434 80.53 81.53 82.313 82.969 83.551 84.071 84.538 84.942 85.31 85.618 85.882 86.128 86.348 86.527 86.715 86.893 87.018 87.142 87.262 87.362 87.443 87.494 87.534 87.592 87.634 87.655 87.659 87.678 87.702 87.722 87.726 87.621 87.693 87.678 87.66 87.623 87.595 87.548 87.493 87.42 87.314 87.179 86.285 -2 ,10958 ,TETRA ,17556188,Fri Nov 26 06:11:06 CET,Fri Nov 26 08:25:51 CET,0.0 0.839 1.24 1.563 1.859 2.135 2.392 2.619 3.029 3.227 3.43 3.645 4.022 4.205 4.576 4.927 5.258 5.425 5.754 6.077 6.569 6.902 7.217 7.651 8.082 8.507 8.928 9.339 9.884 10.436 10.979 11.646 12.304 12.951 13.71 14.584 15.434 16.397 17.477 18.637 19.878 21.329 23.112 24.95 27.199 29.887 33.143 36.956 41.682 47.748 56.103 64.122 69.378 73.182 76.072 78.339 80.094 81.533 82.664 83.679 84.494 85.193 85.826 86.359 86.798 87.168 87.544 87.86 88.102 88.336 88.565 88.751 88.933 89.087 89.202 89.322 89.431 89.535 89.629 89.682 89.732 89.793 89.814 89.816 89.816 89.816 89.788 89.738 89.716 89.596 89.632 89.591 89.553 89.458 89.383 89.303 89.183 89.048 88.914 88.692 87.922 -3 ,32009 ,TETRA ,17556189,Fri Nov 26 06:13:07 CET,Fri Nov 26 08:22:31 CET,0.0 1.151 1.574 1.879 2.167 2.419 2.648 2.903 3.365 3.573 3.779 3.976 4.352 4.529 4.89 5.247 5.586 5.752 6.084 6.4 6.855 7.158 7.465 7.937 8.398 8.821 9.24 9.667 10.217 10.774 11.333 11.992 12.63 13.273 14.047 14.93 15.776 16.732 17.804 18.977 20.244 21.676 23.351 25.095 27.243 29.817 33.02 36.744 41.231 47.066 55.27 63.161 68.398 72.179 74.989 77.161 78.884 80.345 81.502 82.552 83.377 84.014 84.562 85.043 85.43 85.763 86.108 86.39 86.619 86.859 87.086 87.256 87.416 87.567 87.686 87.804 87.928 88.043 88.135 88.201 88.27 88.355 88.404 88.455 88.482 88.531 88.576 88.622 88.636 88.542 88.607 88.599 88.601 88.546 88.519 88.503 88.469 88.394 88.294 88.143 87.236 -4 ,22753 ,TETRA ,17556190,Fri Nov 26 06:13:07 CET,Fri Nov 26 08:26:56 CET,0.0 0.968 1.396 1.695 1.995 2.284 2.524 2.75 3.206 3.43 3.647 3.857 4.236 4.421 4.793 5.154 5.498 5.667 6.002 6.319 6.779 7.085 7.378 7.825 8.264 8.696 9.133 9.557 10.109 10.649 11.178 11.842 12.502 13.139 13.893 14.781 15.646 16.615 17.701 18.891 20.185 21.687 23.477 25.344 27.556 30.093 33.233 37.07 41.795 47.703 55.81 63.613 68.862 72.602 75.332 77.491 79.239 80.685 81.772 82.746 83.53 84.188 84.783 85.28 85.719 86.108 86.463 86.753 86.986 87.195 87.399 87.55 87.683 87.826 87.943 88.051 88.135 88.227 88.315 88.361 88.404 88.451 88.477 88.509 88.522 88.526 88.529 88.528 88.511 88.395 88.472 88.444 88.402 88.31 88.251 88.188 88.109 88.03 87.904 87.7 86.763 -5 ,22449 ,TETRA ,17556191,Fri Nov 26 06:15:07 CET,Fri Nov 26 08:20:46 CET,0.0 1.277 1.776 2.132 2.446 2.701 2.93 3.16 3.619 3.839 4.038 4.212 4.575 4.747 5.101 5.457 5.792 5.959 6.29 6.612 7.081 7.394 7.707 8.168 8.627 9.071 9.5 9.928 10.485 11.036 11.578 12.237 12.893 13.551 14.317 15.198 16.057 16.983 18.031 19.215 20.496 21.962 23.758 25.673 27.925 30.512 33.618 37.236 41.91 47.974 56.07 63.755 69.001 72.862 75.718 77.963 79.77 81.251 82.401 83.403 84.13 84.736 85.312 85.846 86.317 86.711 87.09 87.407 87.67 87.919 88.137 88.28 88.4 88.531 88.635 88.73 88.817 88.896 88.964 89.007 89.036 89.084 89.132 89.183 89.204 89.211 89.209 89.227 89.239 89.15 89.235 89.228 89.208 89.107 89.041 88.965 88.875 88.742 88.54 88.313 87.677 -6 ,5714 ,TETRA ,17556192,Fri Nov 26 06:15:06 CET,Fri Nov 26 08:28:40 CET,0.0 0.855 1.231 1.538 1.816 2.067 2.303 2.538 2.98 3.187 3.398 3.618 4.012 4.204 4.572 4.94 5.306 5.475 5.802 6.132 6.61 6.929 7.241 7.697 8.157 8.613 9.057 9.491 10.047 10.585 11.111 11.774 12.435 13.083 13.861 14.751 15.617 16.595 17.673 18.843 20.07 21.465 23.183 24.973 27.119 29.608 32.642 36.316 40.915 46.767 54.708 62.351 67.514 71.308 74.136 76.33 78.101 79.581 80.711 81.721 82.538 83.212 83.802 84.331 84.796 85.201 85.593 85.9 86.157 86.421 86.655 86.836 87.031 87.222 87.354 87.461 87.541 87.609 87.66 87.693 87.737 87.808 87.858 87.896 87.909 87.939 87.971 87.993 87.998 87.919 87.991 87.977 87.954 87.873 87.834 87.787 87.712 87.62 87.5 87.296 86.527 -7 ,5316 ,TETRA ,17556193,Fri Nov 26 06:15:08 CET,Fri Nov 26 08:31:17 CET,0.0 0.818 1.202 1.574 1.914 2.211 2.463 2.709 3.195 3.436 3.666 3.899 4.29 4.484 4.849 5.192 5.543 5.717 6.042 6.358 6.838 7.151 7.447 7.878 8.313 8.749 9.182 9.607 10.16 10.703 11.24 11.909 12.579 13.243 14.036 14.946 15.844 16.851 17.956 19.165 20.474 21.972 23.748 25.621 27.904 30.562 33.703 37.411 42.133 48.089 56.013 63.636 68.751 72.426 75.171 77.336 79.0 80.371 81.483 82.498 83.343 84.056 84.681 85.235 85.71 86.11 86.507 86.824 87.07 87.307 87.518 87.676 87.835 87.984 88.094 88.186 88.252 88.335 88.427 88.478 88.519 88.564 88.588 88.613 88.615 88.607 88.609 88.607 88.599 88.493 88.569 88.553 88.531 88.468 88.425 88.362 88.262 88.128 87.958 87.712 86.997 -8 ,8107 ,TETRA ,17556195,Fri Nov 26 06:15:08 CET,Fri Nov 26 08:28:07 CET,0.0 1.144 1.645 2.026 2.359 2.646 2.897 3.125 3.548 3.741 3.931 4.136 4.52 4.708 5.074 5.428 5.779 5.95 6.295 6.641 7.137 7.449 7.759 8.225 8.675 9.116 9.559 9.998 10.553 11.104 11.645 12.314 12.968 13.608 14.37 15.264 16.147 17.134 18.249 19.454 20.751 22.275 24.108 26.027 28.341 30.982 34.234 38.232 43.188 49.426 57.787 65.637 70.876 74.658 77.485 79.68 81.381 82.775 83.877 84.871 85.663 86.354 86.977 87.512 87.965 88.332 88.657 88.92 89.148 89.368 89.572 89.723 89.851 89.984 90.089 90.187 90.276 90.355 90.426 90.462 90.496 90.533 90.543 90.537 90.533 90.518 90.488 90.461 90.439 90.32 90.355 90.311 90.262 90.158 90.103 90.034 89.946 89.809 89.598 89.325 88.664 -9 ,23487 ,TETRA ,17556196,Fri Nov 26 06:15:08 CET,Fri Nov 26 08:28:26 CET,0.0 1.216 1.681 2.053 2.346 2.61 2.856 3.071 3.48 3.686 3.893 4.087 4.465 4.648 5.004 5.365 5.708 5.876 6.22 6.548 7.019 7.334 7.643 8.109 8.556 8.987 9.419 9.842 10.394 10.938 11.467 12.105 12.739 13.379 14.141 15.0 15.85 16.835 17.892 19.025 20.282 21.748 23.558 25.455 27.677 30.278 33.501 37.382 42.195 48.346 56.749 64.653 69.844 73.607 76.502 78.786 80.563 81.996 83.156 84.243 85.04 85.686 86.27 86.764 87.183 87.541 87.894 88.183 88.418 88.658 88.88 89.047 89.215 89.36 89.468 89.582 89.689 89.787 89.872 89.922 89.979 90.077 90.135 90.183 90.191 90.187 90.191 90.191 90.191 90.09 90.141 90.106 90.052 89.955 89.902 89.832 89.742 89.643 89.52 89.284 88.234 -10 ,27713 ,TETRA ,17556197,Fri Nov 26 06:15:07 CET,Fri Nov 26 08:15:16 CET,0.0 1.514 1.959 2.317 2.618 2.887 3.14 3.394 3.869 4.08 4.294 4.514 4.898 5.11 5.504 5.86 6.202 6.367 6.71 7.046 7.519 7.83 8.15 8.614 9.058 9.498 9.933 10.362 10.936 11.513 12.07 12.738 13.397 14.049 14.821 15.715 16.588 17.565 18.652 19.834 21.111 22.608 24.438 26.34 28.626 31.293 34.486 38.25 42.993 48.997 57.118 64.907 70.148 73.952 76.854 79.173 80.977 82.44 83.607 84.669 85.459 86.071 86.643 87.153 87.586 87.953 88.294 88.566 88.784 88.992 89.178 89.323 89.481 89.632 89.73 89.816 89.884 89.934 89.975 90.018 90.066 90.119 90.141 90.148 90.155 90.165 90.162 90.173 90.178 90.076 90.146 90.126 90.097 90.004 89.954 89.911 89.853 89.763 89.62 89.434 88.772 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_25_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_25_19.txt deleted file mode 100644 index 121e7cf9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_25_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8360 ,KEBNE ,17025368,Wed Dec 22 12:21:03 CET,Wed Dec 22 14:11:30 CET,0.0 1.187 1.572 1.852 2.125 2.396 2.666 2.925 3.412 3.659 3.892 4.099 4.571 4.779 5.209 5.643 6.055 6.263 6.674 7.074 7.65 8.027 8.401 8.951 9.502 10.04 10.574 11.111 11.826 12.541 13.254 14.136 14.997 15.842 16.85 18.012 19.164 20.467 21.913 23.523 25.304 27.398 29.92 32.56 35.779 39.519 44.095 49.659 56.602 65.415 77.119 87.976 95.273 100.569 104.535 107.66 110.088 112.079 113.648 115.082 116.226 117.179 118.04 118.813 119.489 120.053 120.589 121.043 121.39 121.726 122.087 122.335 122.554 122.795 122.968 123.113 123.26 123.423 123.57 123.666 123.759 123.869 123.926 123.983 124.006 124.02 124.036 124.059 124.063 123.948 124.047 124.03 124.016 123.966 123.912 123.837 123.767 123.671 123.508 123.231 122.153 -2 ,20111 ,KEBNE ,17025369,Wed Dec 22 12:22:06 CET,Wed Dec 22 14:13:04 CET,0.0 1.365 1.851 2.255 2.567 2.845 3.108 3.359 3.817 4.047 4.297 4.518 4.985 5.201 5.625 6.025 6.411 6.608 7.004 7.384 7.951 8.317 8.682 9.235 9.778 10.314 10.844 11.373 12.065 12.749 13.424 14.246 15.058 15.866 16.836 17.961 19.068 20.317 21.728 23.289 24.983 26.982 29.432 32.001 35.103 38.731 43.221 48.638 55.447 64.236 76.14 87.633 95.524 101.273 105.602 109.04 111.758 114.005 115.776 117.423 118.774 119.869 120.796 121.613 122.332 122.937 123.524 124.022 124.436 124.841 125.222 125.526 125.823 126.098 126.318 126.539 126.735 126.909 127.069 127.168 127.249 127.342 127.393 127.437 127.451 127.47 127.478 127.437 127.413 127.279 127.314 127.257 127.181 126.952 126.824 126.683 126.53 126.346 126.087 125.664 123.705 -3 ,28749 ,KEBNE ,17025370,Wed Dec 22 12:22:06 CET,Wed Dec 22 14:13:05 CET,0.0 1.048 1.459 1.785 2.093 2.374 2.642 2.888 3.389 3.651 3.903 4.153 4.634 4.847 5.261 5.68 6.099 6.31 6.725 7.128 7.702 8.064 8.433 9.005 9.583 10.15 10.694 11.231 11.954 12.678 13.4 14.299 15.17 16.002 16.994 18.169 19.359 20.702 22.197 23.826 25.583 27.652 30.123 32.685 35.809 39.471 43.923 49.297 55.959 64.252 75.339 86.022 93.393 98.725 102.769 106.053 108.624 110.682 112.272 113.757 114.926 115.865 116.702 117.437 118.093 118.674 119.233 119.656 119.972 120.295 120.633 120.898 121.154 121.396 121.567 121.735 121.898 122.061 122.209 122.303 122.392 122.515 122.592 122.652 122.683 122.735 122.781 122.806 122.809 122.702 122.826 122.832 122.836 122.815 122.781 122.73 122.664 122.561 122.38 122.018 120.609 -4 ,20063 ,KEBNE ,17025371,Wed Dec 22 12:22:06 CET,Wed Dec 22 14:11:43 CET,0.0 0.629 1.021 1.327 1.58 1.835 2.073 2.292 2.736 2.964 3.193 3.381 3.836 4.044 4.464 4.88 5.285 5.484 5.88 6.276 6.861 7.248 7.627 8.176 8.728 9.291 9.853 10.409 11.137 11.849 12.54 13.398 14.262 15.115 16.109 17.262 18.411 19.714 21.174 22.756 24.477 26.507 28.966 31.544 34.694 38.425 43.03 48.521 55.372 63.892 75.13 85.979 93.271 98.652 102.78 106.04 108.547 110.566 112.194 113.71 114.897 115.895 116.807 117.612 118.301 118.891 119.479 119.967 120.357 120.726 121.075 121.349 121.631 121.909 122.091 122.253 122.423 122.603 122.758 122.846 122.938 123.084 123.182 123.26 123.294 123.369 123.415 123.436 123.45 123.365 123.525 123.548 123.564 123.55 123.514 123.444 123.371 123.31 123.21 123.014 121.479 -5 ,12178 ,KEBNE ,17025372,Wed Dec 22 12:22:06 CET,Wed Dec 22 14:12:32 CET,0.0 1.207 1.599 1.949 2.298 2.616 2.899 3.176 3.693 3.942 4.193 4.421 4.905 5.14 5.585 6.014 6.46 6.685 7.112 7.518 8.117 8.529 8.944 9.548 10.117 10.665 11.221 11.78 12.527 13.266 13.991 14.902 15.825 16.732 17.8 19.008 20.203 21.568 23.04 24.653 26.425 28.467 30.936 33.505 36.636 40.401 44.966 50.34 57.087 65.695 77.374 88.624 96.204 101.609 105.58 108.684 111.125 113.122 114.731 116.236 117.423 118.404 119.295 120.083 120.76 121.348 121.923 122.395 122.779 123.143 123.478 123.742 124.021 124.298 124.479 124.64 124.822 125.012 125.158 125.239 125.315 125.417 125.505 125.587 125.617 125.678 125.737 125.794 125.804 125.689 125.799 125.786 125.763 125.692 125.614 125.504 125.354 125.183 124.982 124.654 122.611 -6 ,13433 ,KEBNE ,17025373,Wed Dec 22 12:22:06 CET,Wed Dec 22 14:12:45 CET,0.0 0.843 1.215 1.536 1.826 2.116 2.402 2.672 3.177 3.406 3.628 3.838 4.302 4.517 4.943 5.364 5.772 5.966 6.36 6.758 7.35 7.739 8.114 8.679 9.255 9.811 10.356 10.896 11.611 12.307 12.981 13.813 14.618 15.422 16.411 17.533 18.655 19.958 21.412 23.019 24.778 26.858 29.401 32.049 35.253 38.961 43.335 48.539 55.278 63.941 75.74 86.891 94.043 99.201 103.06 106.072 108.417 110.362 111.921 113.352 114.469 115.366 116.174 116.92 117.567 118.104 118.618 119.048 119.418 119.787 120.133 120.391 120.647 120.912 121.102 121.277 121.452 121.616 121.77 121.869 121.965 122.109 122.195 122.262 122.287 122.349 122.411 122.449 122.456 122.35 122.487 122.484 122.464 122.384 122.325 122.258 122.189 122.102 121.969 121.778 120.869 -7 ,13717 ,KEBNE ,17025374,Wed Dec 22 12:22:06 CET,Wed Dec 22 14:12:27 CET,0.0 0.857 1.258 1.64 1.984 2.299 2.589 2.846 3.342 3.579 3.813 4.045 4.527 4.756 5.21 5.651 6.065 6.265 6.678 7.089 7.674 8.06 8.453 9.052 9.648 10.226 10.794 11.358 12.094 12.826 13.558 14.428 15.25 16.064 17.053 18.204 19.338 20.617 22.027 23.581 25.283 27.257 29.659 32.173 35.275 38.91 43.196 48.28 54.708 63.035 74.337 85.074 92.399 97.804 101.838 104.985 107.52 109.596 111.174 112.584 113.717 114.661 115.475 116.216 116.888 117.454 117.99 118.423 118.775 119.133 119.49 119.753 120.012 120.268 120.446 120.622 120.801 120.965 121.116 121.218 121.311 121.416 121.472 121.543 121.587 121.653 121.684 121.708 121.71 121.585 121.667 121.644 121.618 121.538 121.48 121.405 121.306 121.204 121.045 120.756 119.712 -8 ,14552 ,KEBNE ,17025375,Wed Dec 22 12:23:09 CET,Wed Dec 22 14:13:24 CET,0.0 0.656 0.984 1.237 1.499 1.772 2.036 2.282 2.752 2.991 3.234 3.468 3.936 4.153 4.575 4.987 5.388 5.58 5.957 6.346 6.94 7.328 7.713 8.275 8.821 9.369 9.913 10.441 11.14 11.841 12.541 13.412 14.271 15.122 16.132 17.303 18.464 19.777 21.238 22.858 24.63 26.674 29.075 31.547 34.582 38.148 42.48 47.64 54.08 62.366 73.65 84.351 91.626 96.957 100.969 104.126 106.592 108.613 110.211 111.676 112.867 113.854 114.65 115.321 115.967 116.527 117.032 117.474 117.851 118.191 118.528 118.813 119.072 119.324 119.515 119.707 119.889 120.038 120.156 120.227 120.299 120.416 120.5 120.571 120.599 120.66 120.734 120.778 120.791 120.686 120.785 120.766 120.753 120.73 120.712 120.682 120.604 120.456 120.195 119.889 118.819 -9 ,8580 ,KEBNE ,17025376,Wed Dec 22 12:23:08 CET,Wed Dec 22 14:13:50 CET,0.0 1.42 1.869 2.246 2.558 2.823 3.066 3.313 3.815 4.069 4.323 4.556 5.025 5.241 5.67 6.105 6.539 6.759 7.199 7.625 8.245 8.661 9.073 9.661 10.247 10.841 11.428 12.004 12.758 13.5 14.22 15.104 15.997 16.882 17.923 19.114 20.3 21.641 23.116 24.756 26.563 28.687 31.28 34.036 37.396 41.317 45.902 51.132 57.757 66.311 78.029 89.323 96.995 102.583 106.77 110.088 112.719 114.872 116.58 118.161 119.406 120.434 121.37 122.204 122.941 123.575 124.183 124.699 125.13 125.548 125.929 126.223 126.518 126.804 127.016 127.213 127.406 127.592 127.747 127.85 127.973 128.147 128.24 128.331 128.379 128.47 128.544 128.615 128.639 128.532 128.661 128.67 128.674 128.6 128.54 128.509 128.479 128.419 128.301 128.13 126.422 -10 ,15099 ,KEBNE ,17025377,Wed Dec 22 12:23:08 CET,Wed Dec 22 14:13:04 CET,0.0 1.653 2.093 2.463 2.805 3.116 3.398 3.665 4.203 4.442 4.672 4.879 5.352 5.567 5.977 6.379 6.784 6.984 7.365 7.738 8.303 8.689 9.062 9.6 10.129 10.654 11.186 11.72 12.407 13.083 13.758 14.598 15.423 16.235 17.205 18.327 19.446 20.718 22.138 23.699 25.369 27.295 29.65 32.148 35.242 38.886 43.293 48.488 54.956 63.354 74.92 86.101 93.553 98.975 103.147 106.462 108.954 110.976 112.636 114.175 115.394 116.393 117.215 117.885 118.505 119.061 119.591 120.008 120.334 120.649 120.963 121.206 121.436 121.67 121.83 121.971 122.099 122.217 122.331 122.392 122.443 122.503 122.532 122.562 122.589 122.646 122.675 122.664 122.633 122.477 122.521 122.485 122.44 122.325 122.255 122.156 122.012 121.846 121.643 121.377 120.359 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_25_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_25_24.txt deleted file mode 100644 index 3bae076a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_25_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20791 ,TETRA ,17556198,Fri Nov 26 06:15:07 CET,Fri Nov 26 08:13:22 CET,0.0 2.202 2.845 3.344 3.782 4.199 4.548 4.857 5.476 5.768 6.038 6.324 6.832 7.081 7.574 8.032 8.482 8.714 9.159 9.591 10.228 10.657 11.081 11.685 12.266 12.85 13.434 13.997 14.734 15.465 16.199 17.098 17.946 18.782 19.783 20.934 22.073 23.356 24.77 26.306 27.93 29.814 32.166 34.602 37.53 40.886 44.818 49.567 55.531 62.85 72.223 80.988 86.906 91.204 94.401 96.912 98.876 100.47 101.729 102.884 103.774 104.492 105.144 105.683 106.073 106.419 106.788 107.102 107.346 107.579 107.828 107.993 108.127 108.275 108.407 108.554 108.691 108.808 108.911 108.98 109.044 109.121 109.166 109.197 109.203 109.203 109.195 109.176 109.167 109.014 109.102 109.056 109.031 108.968 108.902 108.824 108.724 108.582 108.382 108.065 106.448 -2 ,5594 ,TETRA ,17556199,Fri Nov 26 06:16:08 CET,Fri Nov 26 08:27:09 CET,0.0 0.629 1.019 1.371 1.712 2.016 2.288 2.533 3.031 3.266 3.478 3.646 4.09 4.282 4.661 5.038 5.414 5.599 5.95 6.306 6.861 7.223 7.565 8.066 8.562 9.033 9.496 9.964 10.583 11.185 11.785 12.532 13.276 14.013 14.887 15.889 16.872 17.989 19.222 20.567 22.027 23.718 25.755 27.848 30.35 33.287 36.87 41.128 46.518 53.61 63.237 72.318 78.563 83.129 86.579 89.339 91.504 93.246 94.592 95.824 96.799 97.606 98.314 98.927 99.471 99.942 100.394 100.766 101.048 101.328 101.625 101.836 102.031 102.234 102.395 102.544 102.67 102.785 102.902 102.987 103.054 103.123 103.16 103.18 103.179 103.186 103.219 103.241 103.237 103.084 103.194 103.164 103.116 103.0 102.91 102.802 102.687 102.539 102.291 101.887 100.686 -3 ,7462 ,TETRA ,17556200,Fri Nov 26 06:16:08 CET,Fri Nov 26 08:26:48 CET,0.0 2.558 3.227 3.8 4.286 4.729 5.128 5.501 6.22 6.55 6.861 7.211 7.758 8.039 8.565 9.078 9.587 9.822 10.282 10.762 11.485 11.945 12.384 13.009 13.58 14.113 14.629 15.124 15.775 16.429 17.07 17.86 18.626 19.378 20.256 21.24 22.238 23.373 24.64 26.045 27.537 29.262 31.377 33.542 36.105 39.08 42.687 46.93 52.168 58.877 67.782 76.135 81.64 85.537 88.526 90.919 92.756 94.224 95.364 96.442 97.293 97.992 98.611 99.137 99.582 99.956 100.293 100.539 100.721 100.896 101.077 101.202 101.299 101.378 101.437 101.496 101.54 101.545 101.546 101.564 101.605 101.682 101.729 101.762 101.767 101.728 101.651 101.558 101.511 101.328 101.348 101.292 101.218 100.997 100.852 100.672 100.469 100.217 99.843 99.287 97.595 -4 ,27754 ,TETRA ,17556201,Fri Nov 26 06:16:08 CET,Fri Nov 26 08:09:16 CET,0.0 1.221 1.738 2.147 2.497 2.83 3.142 3.461 4.082 4.361 4.628 4.896 5.387 5.623 6.075 6.527 6.979 7.191 7.607 8.034 8.68 9.098 9.493 10.075 10.663 11.23 11.776 12.317 13.009 13.675 14.325 15.136 15.938 16.72 17.649 18.729 19.834 21.116 22.52 24.018 25.628 27.489 29.743 32.1 34.972 38.381 42.387 47.012 52.741 59.921 69.435 78.186 83.942 88.131 91.281 93.763 95.7 97.287 98.553 99.706 100.626 101.37 102.021 102.606 103.124 103.584 104.021 104.385 104.675 104.94 105.198 105.404 105.601 105.761 105.847 105.924 106.005 106.067 106.105 106.132 106.173 106.199 106.199 106.186 106.161 106.115 106.069 106.0 105.965 105.794 105.823 105.737 105.659 105.529 105.429 105.272 105.074 104.827 104.462 103.914 101.099 -5 ,14131 ,TETRA ,17556202,Fri Nov 26 06:17:08 CET,Fri Nov 26 08:30:34 CET,0.0 0.732 1.139 1.517 1.838 2.137 2.425 2.695 3.22 3.456 3.684 3.894 4.358 4.569 4.983 5.383 5.773 5.967 6.348 6.713 7.261 7.63 7.984 8.497 9.017 9.525 10.014 10.506 11.158 11.79 12.407 13.168 13.914 14.671 15.596 16.666 17.735 18.91 20.164 21.533 23.042 24.809 26.964 29.223 31.945 35.135 39.014 43.673 49.619 57.251 67.239 76.701 83.115 87.738 91.271 94.11 96.323 98.135 99.593 100.943 101.97 102.808 103.559 104.217 104.763 105.213 105.656 106.014 106.317 106.611 106.869 107.069 107.276 107.467 107.596 107.722 107.841 107.954 108.072 108.155 108.226 108.304 108.354 108.396 108.41 108.445 108.478 108.485 108.481 108.327 108.409 108.383 108.344 108.21 108.12 108.017 107.909 107.771 107.542 107.204 105.663 -6 ,17790 ,TETRA ,17556203,Fri Nov 26 06:17:10 CET,Fri Nov 26 08:30:43 CET,0.0 0.788 1.183 1.533 1.857 2.154 2.424 2.685 3.164 3.383 3.599 3.765 4.218 4.413 4.79 5.191 5.586 5.77 6.143 6.512 7.031 7.366 7.705 8.205 8.69 9.159 9.623 10.086 10.696 11.299 11.899 12.638 13.366 14.087 14.938 15.915 16.883 17.966 19.153 20.467 21.921 23.669 25.806 28.024 30.726 33.884 37.688 42.144 47.636 54.621 64.053 73.024 79.087 83.43 86.686 89.239 91.165 92.719 93.933 95.0 95.807 96.47 97.074 97.59 98.018 98.377 98.704 98.961 99.17 99.373 99.555 99.686 99.801 99.89 99.943 99.988 100.039 100.105 100.177 100.218 100.248 100.279 100.288 100.284 100.276 100.247 100.186 100.089 100.038 99.854 99.893 99.826 99.743 99.547 99.43 99.289 99.126 98.982 98.74 98.226 95.371 -7 ,27906 ,TETRA ,17556204,Fri Nov 26 06:17:08 CET,Fri Nov 26 08:30:24 CET,0.0 2.096 2.787 3.346 3.79 4.205 4.611 4.976 5.643 5.961 6.255 6.566 7.11 7.416 7.992 8.505 8.979 9.214 9.695 10.193 10.917 11.329 11.704 12.263 12.815 13.363 13.892 14.411 15.09 15.75 16.405 17.22 18.024 18.809 19.725 20.762 21.794 22.956 24.256 25.711 27.288 29.109 31.278 33.49 36.114 39.131 42.735 46.992 52.295 59.135 68.552 77.651 83.799 87.991 90.977 93.303 95.071 96.491 97.649 98.741 99.579 100.268 100.913 101.505 102.014 102.402 102.697 102.892 103.082 103.31 103.523 103.675 103.812 103.959 104.054 104.15 104.268 104.37 104.469 104.543 104.612 104.692 104.722 104.741 104.755 104.779 104.791 104.777 104.753 104.566 104.603 104.554 104.486 104.325 104.253 104.172 104.08 103.901 103.628 103.264 101.745 -8 ,17977 ,TETRA ,17556205,Fri Nov 26 06:17:08 CET,Fri Nov 26 08:33:48 CET,0.0 0.468 0.846 1.163 1.456 1.746 2.008 2.249 2.711 2.94 3.164 3.325 3.776 3.971 4.359 4.731 5.097 5.285 5.659 6.022 6.544 6.886 7.223 7.722 8.218 8.706 9.185 9.656 10.261 10.853 11.445 12.191 12.93 13.645 14.484 15.442 16.39 17.459 18.648 19.959 21.368 23.009 25.008 27.097 29.659 32.655 36.314 40.726 46.197 53.242 62.746 71.673 77.736 82.019 85.169 87.698 89.67 91.257 92.496 93.63 94.537 95.277 95.935 96.51 96.984 97.371 97.747 98.078 98.336 98.572 98.799 98.981 99.163 99.321 99.401 99.489 99.596 99.7 99.798 99.848 99.889 99.914 99.899 99.884 99.88 99.857 99.804 99.718 99.674 99.521 99.627 99.597 99.555 99.391 99.245 99.051 98.799 98.505 98.144 97.564 95.366 -9 ,1734 ,TETRA ,17556206,Fri Nov 26 06:17:08 CET,Fri Nov 26 08:29:22 CET,0.0 1.322 1.844 2.257 2.636 2.99 3.318 3.617 4.205 4.509 4.788 5.039 5.54 5.791 6.26 6.721 7.181 7.408 7.85 8.281 8.903 9.31 9.712 10.288 10.85 11.411 11.967 12.51 13.225 13.928 14.61 15.439 16.246 17.046 18.0 19.099 20.165 21.347 22.66 24.105 25.675 27.481 29.666 31.904 34.523 37.701 41.658 46.287 51.942 59.103 68.796 77.776 83.84 88.176 91.402 93.973 95.956 97.56 98.805 99.952 100.877 101.657 102.352 102.963 103.486 103.895 104.26 104.555 104.783 104.99 105.164 105.317 105.507 105.673 105.781 105.873 105.974 106.085 106.184 106.229 106.221 106.162 106.14 106.136 106.135 106.144 106.165 106.171 106.163 106.013 106.08 106.032 105.961 105.719 105.547 105.341 105.09 104.779 104.36 103.778 100.601 -10 ,26656 ,TETRA ,17556207,Fri Nov 26 06:18:03 CET,Fri Nov 26 08:32:18 CET,0.0 0.697 1.187 1.623 1.983 2.317 2.614 2.885 3.454 3.738 3.998 4.235 4.719 4.94 5.352 5.762 6.185 6.394 6.801 7.192 7.756 8.131 8.503 9.04 9.577 10.12 10.638 11.123 11.754 12.387 13.026 13.808 14.572 15.314 16.199 17.247 18.253 19.386 20.641 21.984 23.438 25.129 27.209 29.415 32.036 35.071 38.842 43.349 48.798 55.589 64.89 73.595 79.275 83.332 86.438 88.904 90.792 92.343 93.583 94.72 95.588 96.274 96.871 97.372 97.772 98.105 98.447 98.755 99.013 99.265 99.502 99.664 99.83 100.007 100.129 100.237 100.315 100.341 100.322 100.303 100.298 100.265 100.213 100.157 100.13 100.06 99.969 99.856 99.786 99.566 99.535 99.44 99.343 99.128 98.973 98.779 98.55 98.248 97.84 97.217 93.284 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_27_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_27_24.txt deleted file mode 100644 index 0fccb288..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_27_24.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3273 ,TETRA ,17556208,Fri Nov 26 06:17:08 CET,Fri Nov 26 08:31:21 CET,0.0 0.969 1.292 1.599 1.861 2.09 2.296 2.5 2.887 3.047 3.196 3.309 3.575 3.705 3.949 4.167 4.372 4.472 4.668 4.868 5.15 5.321 5.488 5.736 5.965 6.177 6.395 6.62 6.902 7.165 7.422 7.729 8.016 8.288 8.614 8.981 9.318 9.692 10.099 10.531 10.994 11.536 12.159 12.752 13.465 14.264 15.168 16.151 17.227 18.385 19.36 19.613 19.588 19.396 19.037 18.713 18.38 18.002 17.589 17.15 16.772 16.387 16.001 15.625 15.259 14.888 14.463 14.084 13.77 13.458 13.122 12.845 12.537 12.178 11.915 11.641 11.361 11.083 10.756 10.526 10.283 9.907 9.664 9.395 9.256 8.954 8.589 8.189 7.991 7.662 7.432 7.212 6.987 6.556 6.315 6.044 5.761 5.389 4.88 4.267 1.999 -2 ,25519 ,TETRA ,17556209,Fri Nov 26 06:17:08 CET,Fri Nov 26 08:16:48 CET,0.0 1.037 1.341 1.601 1.85 2.067 2.273 2.464 2.798 2.958 3.101 3.235 3.513 3.635 3.896 4.14 4.377 4.497 4.723 4.941 5.239 5.421 5.611 5.885 6.134 6.389 6.629 6.844 7.123 7.399 7.662 7.973 8.277 8.575 8.919 9.302 9.665 10.042 10.454 10.899 11.366 11.908 12.514 13.124 13.842 14.612 15.457 16.389 17.625 18.946 19.671 19.614 19.197 18.785 18.413 17.948 17.446 16.946 16.461 15.947 15.528 15.106 14.678 14.302 13.963 13.623 13.226 12.851 12.526 12.207 11.859 11.574 11.279 10.963 10.703 10.416 10.138 9.842 9.528 9.322 9.101 8.756 8.528 8.267 8.128 7.855 7.536 7.175 6.999 6.678 6.435 6.227 5.983 5.393 5.067 4.725 4.372 3.917 3.336 2.693 -2.153 -4 ,27664 ,TETRA ,17556211,Fri Nov 26 06:18:04 CET,Fri Nov 26 08:31:59 CET,0.0 1.588 2.061 2.382 2.676 2.968 3.228 3.445 3.85 4.049 4.232 4.44 4.762 4.902 5.149 5.411 5.68 5.812 6.066 6.305 6.651 6.862 7.055 7.334 7.58 7.793 8.008 8.226 8.525 8.828 9.124 9.464 9.787 10.125 10.533 10.992 11.427 11.883 12.334 12.82 13.336 13.877 14.48 15.079 15.833 16.663 17.576 18.607 19.66 20.675 21.639 21.989 21.828 21.558 21.288 20.909 20.475 20.098 19.769 19.355 18.938 18.586 18.236 17.875 17.549 17.243 16.913 16.621 16.353 16.078 15.762 15.492 15.253 14.983 14.763 14.557 14.334 14.094 13.838 13.651 13.439 13.053 12.774 12.483 12.327 12.012 11.671 11.318 11.14 10.81 10.554 10.343 10.112 9.583 9.275 8.888 8.457 7.97 7.33 6.429 -0.425 -7 ,30952 ,TETRA ,17556214,Fri Nov 26 06:18:05 CET,Fri Nov 26 08:18:16 CET,0.0 2.195 2.72 3.06 3.356 3.648 3.906 4.144 4.55 4.727 4.911 5.124 5.431 5.589 5.886 6.163 6.427 6.537 6.74 6.947 7.26 7.457 7.637 7.903 8.162 8.412 8.663 8.919 9.267 9.604 9.94 10.343 10.698 11.04 11.445 11.853 12.189 12.543 12.921 13.312 13.712 14.183 14.748 15.288 15.898 16.544 17.276 18.224 19.238 20.164 21.065 21.363 21.271 21.029 20.67 20.203 19.649 19.089 18.649 18.223 17.821 17.458 17.108 16.771 16.453 16.161 15.862 15.568 15.309 15.063 14.786 14.53 14.261 13.974 13.741 13.495 13.249 13.022 12.813 12.677 12.531 12.302 12.137 11.936 11.827 11.614 11.395 11.152 11.006 10.669 10.383 10.161 9.913 9.399 9.088 8.766 8.451 8.067 7.557 6.806 -2.508 -8 ,15442 ,TETRA ,17556215,Fri Nov 26 06:18:05 CET,Fri Nov 26 08:31:12 CET,0.0 2.341 2.799 3.088 3.349 3.588 3.796 3.988 4.365 4.525 4.688 4.839 5.139 5.284 5.542 5.797 6.047 6.169 6.388 6.599 6.912 7.109 7.294 7.556 7.81 8.059 8.307 8.557 8.892 9.225 9.54 9.882 10.192 10.491 10.852 11.277 11.688 12.108 12.536 13.016 13.526 14.076 14.696 15.329 16.009 16.778 17.721 18.546 19.424 20.401 21.012 21.046 20.759 20.358 19.974 19.552 19.115 18.737 18.398 18.011 17.679 17.377 17.067 16.803 16.562 16.309 16.046 15.823 15.636 15.446 15.216 15.025 14.832 14.641 14.492 14.295 14.042 13.757 13.479 13.301 13.131 12.871 12.68 12.487 12.394 12.199 11.992 11.754 11.606 11.305 11.066 10.838 10.599 10.152 9.938 9.706 9.42 9.124 8.838 8.389 5.588 -9 ,11777 ,TETRA ,17556216,Fri Nov 26 06:19:07 CET,Fri Nov 26 08:18:26 CET,0.0 1.925 2.521 2.911 3.179 3.404 3.596 3.744 4.039 4.193 4.329 4.428 4.688 4.803 5.032 5.255 5.468 5.574 5.772 5.952 6.222 6.4 6.575 6.806 7.008 7.207 7.421 7.64 7.915 8.178 8.441 8.771 9.09 9.401 9.762 10.141 10.495 10.887 11.309 11.764 12.236 12.771 13.352 13.95 14.714 15.485 16.246 17.107 18.151 19.28 20.31 20.692 20.396 19.883 19.435 18.969 18.519 18.082 17.687 17.301 16.961 16.637 16.296 15.948 15.581 15.228 14.865 14.55 14.274 13.964 13.646 13.382 13.104 12.827 12.62 12.405 12.174 11.92 11.591 11.344 11.08 10.612 10.274 9.92 9.736 9.385 9.091 8.817 8.645 8.302 8.01 7.802 7.589 7.057 6.77 6.479 6.144 5.665 4.988 4.176 0.059 -10 ,11447 ,TETRA ,17556217,Fri Nov 26 06:19:06 CET,Fri Nov 26 08:20:55 CET,0.0 2.692 3.175 3.558 3.85 4.177 4.479 4.67 4.997 5.174 5.335 5.481 5.774 5.907 6.173 6.448 6.677 6.782 7.008 7.236 7.561 7.758 7.95 8.213 8.443 8.682 8.918 9.137 9.417 9.693 9.988 10.358 10.699 11.02 11.372 11.77 12.16 12.582 13.029 13.498 14.015 14.651 15.447 16.202 17.015 17.874 18.77 19.678 20.594 21.455 22.301 22.784 22.723 22.494 22.278 21.948 21.438 20.831 20.259 19.715 19.233 18.796 18.426 18.099 17.732 17.358 16.968 16.597 16.273 15.942 15.586 15.278 14.932 14.563 14.29 14.012 13.709 13.386 13.056 12.826 12.585 12.212 11.95 11.676 11.536 11.242 10.929 10.583 10.398 10.066 9.792 9.566 9.345 8.863 8.561 8.198 7.81 7.349 6.732 5.878 2.088 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_27_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_27_25.txt deleted file mode 100644 index c52acc72..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_27_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21039 ,TETRA ,17556218,Fri Nov 26 06:19:06 CET,Fri Nov 26 08:19:57 CET,0.0 0.702 0.922 1.079 1.201 1.31 1.423 1.521 1.638 1.674 1.703 1.586 1.743 1.755 1.774 1.766 1.741 1.726 1.692 1.649 1.582 1.53 1.471 1.377 1.274 1.159 1.041 0.924 0.75 0.542 0.336 0.075 -0.19 -0.449 -0.749 -1.105 -1.504 -1.995 -2.559 -3.189 -3.916 -4.792 -5.847 -6.976 -8.44 -10.286 -12.636 -15.594 -19.537 -25.005 -33.402 -42.45 -49.168 -54.401 -58.561 -62.06 -64.992 -67.51 -69.599 -71.635 -73.328 -74.799 -76.13 -77.367 -78.522 -79.539 -80.541 -81.395 -82.121 -82.851 -83.593 -84.189 -84.802 -85.458 -85.965 -86.504 -87.068 -87.629 -88.179 -88.541 -88.92 -89.507 -89.93 -90.359 -90.561 -90.981 -91.427 -91.895 -92.149 -92.676 -92.965 -93.252 -93.537 -94.125 -94.447 -94.81 -95.199 -95.622 -96.149 -96.688 -99.713 -2 ,29063 ,TETRA ,17556219,Fri Nov 26 06:19:08 CET,Fri Nov 26 08:33:30 CET,0.0 0.941 1.169 1.359 1.532 1.621 1.702 1.769 1.849 1.876 1.899 1.794 1.954 1.957 1.943 1.921 1.909 1.907 1.894 1.857 1.781 1.727 1.677 1.604 1.502 1.374 1.244 1.128 0.992 0.86 0.703 0.475 0.243 0.008 -0.306 -0.698 -1.096 -1.552 -2.082 -2.694 -3.393 -4.256 -5.361 -6.567 -8.092 -9.96 -12.37 -15.473 -19.662 -25.419 -34.128 -43.272 -49.781 -54.858 -59.016 -62.592 -65.591 -68.168 -70.295 -72.332 -74.004 -75.447 -76.809 -78.071 -79.201 -80.199 -81.21 -82.086 -82.827 -83.591 -84.385 -85.037 -85.69 -86.351 -86.866 -87.41 -87.947 -88.475 -89.064 -89.472 -89.867 -90.465 -90.879 -91.309 -91.525 -91.979 -92.447 -92.925 -93.173 -93.696 -93.995 -94.279 -94.595 -95.248 -95.591 -95.965 -96.377 -96.866 -97.435 -98.216 -102.505 -3 ,22008 ,TETRA ,17556220,Fri Nov 26 06:19:10 CET,Fri Nov 26 08:33:17 CET,0.0 0.361 0.563 0.72 0.868 0.968 1.031 1.078 1.152 1.166 1.192 1.108 1.271 1.276 1.265 1.249 1.228 1.215 1.181 1.149 1.112 1.063 0.994 0.882 0.763 0.646 0.519 0.38 0.191 0.002 -0.19 -0.442 -0.712 -0.98 -1.313 -1.73 -2.16 -2.678 -3.282 -3.966 -4.731 -5.627 -6.749 -7.987 -9.608 -11.612 -14.16 -17.395 -21.664 -27.574 -36.515 -45.991 -52.913 -58.396 -62.761 -66.365 -69.361 -71.921 -74.007 -76.027 -77.714 -79.155 -80.471 -81.67 -82.763 -83.739 -84.769 -85.686 -86.448 -87.23 -88.046 -88.704 -89.369 -90.034 -90.542 -91.059 -91.596 -92.17 -92.772 -93.168 -93.567 -94.189 -94.601 -95.025 -95.245 -95.69 -96.143 -96.641 -96.907 -97.416 -97.651 -97.914 -98.188 -98.792 -99.146 -99.504 -99.87 -100.291 -100.824 -101.524 -104.964 -4 ,5599 ,TETRA ,17556221,Fri Nov 26 06:19:08 CET,Fri Nov 26 08:33:00 CET,0.0 0.756 1.024 1.169 1.252 1.342 1.444 1.54 1.681 1.73 1.773 1.695 1.865 1.868 1.856 1.836 1.816 1.804 1.752 1.696 1.606 1.546 1.487 1.382 1.267 1.151 1.026 0.904 0.757 0.591 0.41 0.167 -0.102 -0.378 -0.725 -1.147 -1.575 -2.08 -2.654 -3.294 -4.009 -4.88 -6.01 -7.252 -8.829 -10.709 -13.057 -16.0 -19.892 -25.265 -33.249 -41.684 -48.048 -53.09 -57.194 -60.722 -63.613 -66.033 -68.064 -70.014 -71.6 -73.008 -74.352 -75.589 -76.698 -77.684 -78.66 -79.479 -80.203 -80.966 -81.768 -82.424 -83.082 -83.73 -84.221 -84.73 -85.255 -85.796 -86.371 -86.781 -87.18 -87.814 -88.254 -88.69 -88.911 -89.346 -89.803 -90.303 -90.579 -91.103 -91.353 -91.611 -91.893 -92.473 -92.771 -93.119 -93.493 -93.848 -94.22 -94.789 -97.229 -5 ,5873 ,TETRA ,17556222,Fri Nov 26 06:20:05 CET,Fri Nov 26 08:33:30 CET,0.0 1.003 1.209 1.366 1.496 1.595 1.659 1.715 1.777 1.798 1.826 1.7 1.852 1.857 1.879 1.883 1.865 1.852 1.813 1.781 1.729 1.676 1.615 1.524 1.419 1.307 1.212 1.105 0.938 0.774 0.595 0.351 0.114 -0.134 -0.463 -0.842 -1.218 -1.675 -2.232 -2.873 -3.587 -4.479 -5.597 -6.777 -8.249 -10.067 -12.428 -15.424 -19.475 -24.958 -32.942 -41.388 -47.771 -52.945 -57.193 -60.721 -63.603 -66.104 -68.167 -70.139 -71.77 -73.167 -74.463 -75.694 -76.854 -77.877 -78.899 -79.795 -80.546 -81.291 -82.035 -82.646 -83.286 -83.95 -84.464 -84.966 -85.468 -85.983 -86.522 -86.897 -87.261 -87.795 -88.177 -88.602 -88.823 -89.285 -89.753 -90.227 -90.473 -90.986 -91.286 -91.574 -91.868 -92.511 -92.858 -93.208 -93.584 -94.016 -94.485 -95.172 -98.461 -6 ,12840 ,TETRA ,17556223,Fri Nov 26 06:21:07 CET,Fri Nov 26 08:36:43 CET,0.0 0.742 0.923 1.071 1.201 1.273 1.323 1.382 1.473 1.49 1.496 1.34 1.48 1.475 1.475 1.472 1.456 1.442 1.418 1.389 1.324 1.281 1.24 1.161 1.061 0.955 0.842 0.713 0.534 0.363 0.185 -0.046 -0.266 -0.485 -0.783 -1.158 -1.565 -2.057 -2.607 -3.211 -3.867 -4.64 -5.615 -6.753 -8.345 -10.299 -12.73 -15.771 -19.844 -25.651 -34.344 -43.453 -50.14 -55.335 -59.564 -63.076 -65.978 -68.564 -70.718 -72.76 -74.469 -75.996 -77.355 -78.568 -79.711 -80.739 -81.798 -82.701 -83.495 -84.307 -85.077 -85.718 -86.377 -87.031 -87.545 -88.075 -88.611 -89.158 -89.719 -90.105 -90.499 -91.111 -91.53 -91.964 -92.175 -92.601 -93.082 -93.573 -93.817 -94.31 -94.555 -94.829 -95.117 -95.718 -96.045 -96.421 -96.849 -97.333 -97.867 -98.454 -101.79 -7 ,4204 ,TETRA ,17556224,Fri Nov 26 06:21:08 CET,Fri Nov 26 08:35:29 CET,0.0 0.546 0.694 0.806 0.897 0.969 1.018 1.055 1.12 1.153 1.187 1.069 1.228 1.234 1.247 1.252 1.232 1.221 1.189 1.124 1.022 0.961 0.91 0.823 0.704 0.575 0.441 0.305 0.114 -0.077 -0.281 -0.555 -0.823 -1.098 -1.438 -1.849 -2.276 -2.758 -3.314 -3.975 -4.721 -5.622 -6.764 -7.992 -9.555 -11.466 -13.843 -16.868 -20.978 -26.679 -35.219 -44.146 -50.757 -55.954 -60.081 -63.689 -66.826 -69.517 -71.746 -73.908 -75.689 -77.217 -78.603 -79.852 -80.991 -81.997 -83.042 -83.961 -84.743 -85.532 -86.333 -87.016 -87.69 -88.362 -88.881 -89.41 -89.977 -90.561 -91.122 -91.49 -91.876 -92.452 -92.811 -93.19 -93.393 -93.845 -94.289 -94.704 -94.933 -95.432 -95.688 -95.946 -96.221 -96.836 -97.143 -97.437 -97.771 -98.177 -98.648 -99.28 -102.56 -8 ,20606 ,TETRA ,17556225,Fri Nov 26 06:22:06 CET,Fri Nov 26 08:36:57 CET,0.0 1.26 1.452 1.592 1.701 1.774 1.835 1.882 1.945 1.964 1.978 1.866 2.027 2.042 2.059 2.062 2.068 2.055 2.005 1.966 1.925 1.9 1.844 1.727 1.603 1.472 1.331 1.181 0.984 0.787 0.588 0.319 0.025 -0.267 -0.621 -1.05 -1.48 -1.975 -2.53 -3.171 -3.915 -4.859 -6.046 -7.281 -8.861 -10.798 -13.351 -16.762 -21.218 -27.345 -36.769 -46.76 -54.124 -59.844 -64.332 -68.012 -71.025 -73.569 -75.677 -77.721 -79.448 -80.95 -82.335 -83.582 -84.721 -85.741 -86.775 -87.682 -88.447 -89.239 -90.063 -90.734 -91.409 -92.076 -92.594 -93.151 -93.711 -94.258 -94.808 -95.178 -95.54 -96.086 -96.483 -96.918 -97.142 -97.576 -98.0 -98.457 -98.701 -99.191 -99.425 -99.711 -100.007 -100.582 -100.899 -101.237 -101.581 -101.969 -102.462 -103.194 -107.964 -9 ,15633 ,TETRA ,17556226,Fri Nov 26 06:21:07 CET,Fri Nov 26 08:35:55 CET,0.0 2.162 2.366 2.489 2.605 2.705 2.763 2.794 2.834 2.853 2.877 2.773 2.934 2.939 2.934 2.92 2.911 2.896 2.863 2.818 2.708 2.632 2.569 2.466 2.347 2.215 2.078 1.938 1.738 1.548 1.36 1.103 0.837 0.573 0.248 -0.145 -0.553 -1.027 -1.563 -2.172 -2.856 -3.673 -4.703 -5.834 -7.28 -9.026 -11.251 -14.135 -18.084 -23.618 -32.069 -41.065 -47.605 -52.771 -56.977 -60.575 -63.55 -66.093 -68.201 -70.227 -71.889 -73.31 -74.641 -75.837 -76.908 -77.883 -78.857 -79.691 -80.444 -81.27 -82.13 -82.807 -83.48 -84.158 -84.68 -85.232 -85.787 -86.343 -86.921 -87.31 -87.699 -88.3 -88.717 -89.138 -89.372 -89.883 -90.394 -90.919 -91.183 -91.705 -91.99 -92.269 -92.557 -93.128 -93.462 -93.845 -94.235 -94.714 -95.335 -96.034 -100.083 -10 ,11802 ,TETRA ,17556227,Fri Nov 26 06:21:08 CET,Fri Nov 26 08:35:18 CET,0.0 0.312 0.501 0.647 0.739 0.812 0.879 0.944 1.074 1.109 1.113 0.981 1.143 1.153 1.164 1.156 1.143 1.132 1.112 1.085 1.008 0.945 0.885 0.801 0.712 0.606 0.487 0.371 0.193 -0.013 -0.222 -0.447 -0.664 -0.931 -1.261 -1.638 -2.011 -2.442 -2.962 -3.573 -4.289 -5.143 -6.211 -7.396 -8.862 -10.63 -12.908 -15.809 -19.738 -25.268 -33.496 -42.226 -48.801 -53.912 -58.006 -61.482 -64.32 -66.735 -68.739 -70.68 -72.276 -73.649 -74.948 -76.139 -77.273 -78.297 -79.313 -80.176 -80.936 -81.761 -82.521 -83.094 -83.701 -84.324 -84.797 -85.283 -85.777 -86.284 -86.837 -87.219 -87.606 -88.182 -88.557 -88.964 -89.177 -89.618 -90.094 -90.593 -90.857 -91.374 -91.687 -92.001 -92.336 -92.98 -93.302 -93.647 -94.043 -94.487 -94.95 -95.599 -100.744 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_28_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_28_21.txt deleted file mode 100644 index fbe92d53..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_28_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32060 ,KEBNE ,17025378,Wed Dec 22 12:23:09 CET,Wed Dec 22 14:16:41 CET,0.0 1.065 1.426 1.679 1.902 2.089 2.234 2.366 2.591 2.679 2.764 2.848 2.987 3.067 3.207 3.32 3.414 3.452 3.529 3.621 3.776 3.876 3.959 4.055 4.136 4.23 4.333 4.433 4.546 4.647 4.732 4.823 4.894 4.967 5.036 5.086 5.151 5.231 5.327 5.398 5.394 5.367 5.274 5.08 4.888 4.704 4.423 3.9 2.965 1.434 -1.104 -3.981 -6.386 -8.419 -10.087 -11.585 -12.852 -13.905 -14.788 -15.664 -16.392 -17.03 -17.655 -18.246 -18.801 -19.296 -19.791 -20.225 -20.6 -20.991 -21.395 -21.743 -22.113 -22.485 -22.771 -23.071 -23.383 -23.7 -24.001 -24.195 -24.404 -24.738 -24.959 -25.175 -25.288 -25.516 -25.772 -26.046 -26.181 -26.409 -26.592 -26.722 -26.855 -27.177 -27.343 -27.51 -27.697 -27.92 -28.213 -28.536 -29.288 -2 ,22414 ,KEBNE ,17025379,Wed Dec 22 12:23:09 CET,Wed Dec 22 14:16:34 CET,0.0 1.054 1.356 1.578 1.756 1.898 2.021 2.12 2.299 2.391 2.477 2.554 2.689 2.755 2.892 3.007 3.109 3.159 3.257 3.375 3.531 3.61 3.692 3.819 3.931 4.014 4.086 4.159 4.243 4.32 4.389 4.463 4.533 4.593 4.651 4.692 4.736 4.791 4.825 4.838 4.837 4.779 4.662 4.525 4.343 4.067 3.599 2.957 1.995 0.548 -1.734 -4.46 -6.72 -8.593 -10.117 -11.433 -12.561 -13.593 -14.488 -15.339 -16.043 -16.687 -17.314 -17.895 -18.475 -19.024 -19.572 -20.051 -20.457 -20.854 -21.248 -21.581 -21.942 -22.313 -22.586 -22.865 -23.159 -23.469 -23.786 -23.996 -24.207 -24.534 -24.76 -24.99 -25.109 -25.347 -25.589 -25.836 -25.965 -26.198 -26.345 -26.484 -26.643 -27.005 -27.222 -27.467 -27.733 -28.01 -28.33 -28.667 -29.326 -3 ,6691 ,KEBNE ,17025380,Wed Dec 22 12:23:09 CET,Wed Dec 22 14:15:23 CET,0.0 0.986 1.343 1.592 1.797 1.959 2.087 2.206 2.418 2.515 2.596 2.684 2.845 2.929 3.086 3.234 3.366 3.428 3.559 3.692 3.845 3.925 4.019 4.173 4.309 4.425 4.529 4.63 4.763 4.895 5.007 5.119 5.229 5.346 5.458 5.539 5.612 5.696 5.793 5.869 5.907 5.903 5.837 5.713 5.504 5.218 4.699 3.871 2.711 0.989 -1.827 -4.821 -7.084 -8.956 -10.519 -11.888 -13.069 -14.162 -15.12 -16.068 -16.855 -17.491 -18.078 -18.627 -19.131 -19.598 -20.08 -20.514 -20.888 -21.277 -21.677 -22.004 -22.347 -22.719 -23.007 -23.285 -23.575 -23.879 -24.198 -24.412 -24.628 -24.96 -25.187 -25.433 -25.56 -25.821 -26.079 -26.341 -26.484 -26.731 -26.955 -27.126 -27.287 -27.645 -27.843 -28.059 -28.282 -28.492 -28.742 -29.034 -29.706 -4 ,5201 ,KEBNE ,17025381,Wed Dec 22 12:24:10 CET,Wed Dec 22 14:17:21 CET,0.0 1.292 1.685 1.969 2.151 2.285 2.417 2.552 2.796 2.907 3.004 3.103 3.236 3.304 3.436 3.553 3.639 3.674 3.75 3.835 3.961 4.039 4.127 4.263 4.378 4.468 4.537 4.59 4.655 4.721 4.795 4.878 4.934 4.979 5.024 5.082 5.137 5.177 5.19 5.159 5.088 4.988 4.883 4.742 4.484 4.109 3.573 2.841 1.791 0.147 -2.575 -5.627 -8.051 -10.037 -11.644 -13.017 -14.181 -15.181 -16.014 -16.853 -17.573 -18.208 -18.794 -19.335 -19.843 -20.298 -20.768 -21.192 -21.551 -21.912 -22.28 -22.58 -22.89 -23.203 -23.451 -23.715 -23.981 -24.261 -24.551 -24.744 -24.937 -25.232 -25.44 -25.666 -25.786 -26.031 -26.27 -26.503 -26.623 -26.849 -27.017 -27.167 -27.328 -27.677 -27.888 -28.131 -28.359 -28.588 -28.858 -29.19 -30.163 -5 ,21387 ,KEBNE ,17025382,Wed Dec 22 12:24:10 CET,Wed Dec 22 14:17:38 CET,0.0 0.8 1.009 1.128 1.217 1.353 1.497 1.626 1.869 1.976 2.071 2.157 2.296 2.353 2.455 2.571 2.68 2.724 2.802 2.866 2.949 3.007 3.064 3.14 3.208 3.278 3.342 3.39 3.449 3.515 3.577 3.635 3.68 3.748 3.832 3.875 3.887 3.89 3.913 3.948 3.953 3.924 3.838 3.719 3.503 3.182 2.71 1.992 0.925 -0.738 -3.209 -5.973 -8.32 -10.279 -12.01 -13.569 -14.836 -15.934 -16.889 -17.837 -18.622 -19.306 -19.965 -20.598 -21.163 -21.653 -22.171 -22.632 -23.014 -23.4 -23.794 -24.104 -24.429 -24.799 -25.09 -25.371 -25.653 -25.949 -26.24 -26.436 -26.633 -26.925 -27.147 -27.392 -27.511 -27.75 -28.003 -28.282 -28.432 -28.679 -28.894 -29.063 -29.239 -29.593 -29.763 -29.947 -30.164 -30.438 -30.706 -31.003 -32.175 -6 ,23225 ,KEBNE ,17025383,Wed Dec 22 12:24:10 CET,Wed Dec 22 14:17:26 CET,0.0 1.185 1.537 1.841 2.079 2.253 2.402 2.543 2.818 2.951 3.061 3.187 3.358 3.457 3.637 3.784 3.907 3.963 4.066 4.161 4.311 4.397 4.469 4.589 4.712 4.833 4.947 5.05 5.164 5.268 5.359 5.435 5.483 5.521 5.552 5.561 5.556 5.583 5.641 5.648 5.592 5.478 5.321 5.175 4.942 4.574 4.066 3.326 2.191 0.541 -2.129 -5.285 -7.728 -9.743 -11.43 -12.889 -14.159 -15.288 -16.245 -17.173 -17.957 -18.654 -19.316 -19.928 -20.492 -20.978 -21.466 -21.91 -22.271 -22.639 -23.019 -23.311 -23.613 -23.953 -24.223 -24.496 -24.768 -25.034 -25.297 -25.476 -25.665 -25.947 -26.136 -26.347 -26.46 -26.695 -26.937 -27.178 -27.297 -27.516 -27.672 -27.813 -27.977 -28.362 -28.561 -28.761 -28.982 -29.218 -29.493 -29.835 -30.586 -7 ,9915 ,KEBNE ,17025384,Wed Dec 22 12:24:10 CET,Wed Dec 22 14:17:30 CET,0.0 0.944 1.351 1.61 1.789 1.937 2.062 2.18 2.382 2.474 2.56 2.643 2.781 2.86 3.014 3.146 3.261 3.31 3.4 3.49 3.615 3.689 3.771 3.925 4.088 4.234 4.364 4.486 4.636 4.752 4.838 4.917 4.998 5.074 5.125 5.158 5.181 5.194 5.218 5.246 5.256 5.237 5.167 5.058 4.819 4.437 3.973 3.344 2.331 0.624 -2.186 -5.251 -7.66 -9.604 -11.283 -12.764 -13.921 -14.922 -15.788 -16.646 -17.403 -18.068 -18.709 -19.336 -19.911 -20.446 -21.005 -21.467 -21.845 -22.232 -22.624 -22.941 -23.271 -23.608 -23.865 -24.123 -24.395 -24.685 -24.968 -25.163 -25.366 -25.704 -25.941 -26.172 -26.296 -26.542 -26.781 -27.038 -27.176 -27.411 -27.586 -27.73 -27.887 -28.239 -28.434 -28.654 -28.875 -29.109 -29.358 -29.651 -30.403 -8 ,28152 ,KEBNE ,17025385,Wed Dec 22 12:24:11 CET,Wed Dec 22 14:17:35 CET,0.0 1.089 1.419 1.667 1.858 2.026 2.178 2.33 2.595 2.698 2.795 2.9 3.054 3.146 3.29 3.411 3.545 3.61 3.72 3.81 3.942 4.026 4.095 4.183 4.267 4.343 4.419 4.499 4.593 4.689 4.785 4.882 4.969 5.053 5.141 5.232 5.292 5.339 5.405 5.452 5.478 5.492 5.46 5.344 5.084 4.737 4.241 3.473 2.36 0.764 -1.79 -4.716 -7.083 -9.079 -10.764 -12.231 -13.476 -14.503 -15.396 -16.36 -17.195 -17.956 -18.671 -19.314 -19.899 -20.426 -20.943 -21.407 -21.819 -22.223 -22.633 -22.973 -23.321 -23.685 -23.962 -24.233 -24.509 -24.792 -25.089 -25.293 -25.499 -25.848 -26.098 -26.337 -26.461 -26.727 -27.002 -27.297 -27.445 -27.683 -27.87 -28.024 -28.178 -28.485 -28.657 -28.833 -29.028 -29.261 -29.527 -29.835 -30.685 -9 ,16159 ,KEBNE ,17025386,Wed Dec 22 12:25:13 CET,Wed Dec 22 14:19:13 CET,0.0 1.144 1.548 1.851 2.058 2.243 2.415 2.556 2.782 2.905 3.021 3.114 3.26 3.344 3.503 3.651 3.808 3.88 4.004 4.116 4.238 4.303 4.371 4.474 4.57 4.663 4.748 4.828 4.931 5.038 5.141 5.243 5.32 5.395 5.482 5.584 5.683 5.761 5.811 5.855 5.917 5.975 5.963 5.882 5.689 5.304 4.749 4.028 3.03 1.485 -1.17 -4.209 -6.544 -8.409 -9.946 -11.287 -12.429 -13.496 -14.454 -15.426 -16.274 -17.017 -17.716 -18.372 -18.939 -19.437 -19.952 -20.39 -20.766 -21.153 -21.568 -21.921 -22.29 -22.663 -22.956 -23.261 -23.56 -23.863 -24.157 -24.356 -24.574 -24.927 -25.16 -25.4 -25.518 -25.752 -25.993 -26.239 -26.371 -26.612 -26.816 -26.974 -27.143 -27.484 -27.665 -27.883 -28.107 -28.352 -28.599 -28.873 -29.761 -10 ,9617 ,KEBNE ,17025387,Wed Dec 22 12:25:13 CET,Wed Dec 22 14:19:09 CET,0.0 0.727 0.984 1.174 1.335 1.466 1.571 1.68 1.92 2.037 2.133 2.238 2.384 2.456 2.583 2.685 2.794 2.85 2.958 3.065 3.191 3.262 3.322 3.396 3.475 3.559 3.622 3.686 3.782 3.866 3.939 4.011 4.091 4.159 4.214 4.25 4.252 4.251 4.258 4.235 4.167 4.058 3.891 3.681 3.439 3.13 2.674 1.999 0.998 -0.506 -3.017 -5.949 -8.261 -10.142 -11.663 -13.035 -14.283 -15.387 -16.31 -17.19 -17.964 -18.702 -19.408 -20.058 -20.637 -21.134 -21.639 -22.092 -22.48 -22.873 -23.263 -23.593 -23.944 -24.298 -24.572 -24.858 -25.148 -25.442 -25.749 -25.966 -26.194 -26.512 -26.713 -26.94 -27.061 -27.286 -27.525 -27.776 -27.899 -28.135 -28.334 -28.484 -28.649 -29.021 -29.231 -29.456 -29.669 -29.893 -30.205 -30.578 -31.792 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_28_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_28_26.txt deleted file mode 100644 index 07ada8ff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_28_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30741 ,TETRA ,17556228,Fri Nov 26 06:21:07 CET,Fri Nov 26 08:26:41 CET,0.0 0.488 0.743 0.925 1.074 1.211 1.321 1.418 1.566 1.633 1.703 1.763 1.881 1.93 2.027 2.109 2.186 2.224 2.292 2.344 2.405 2.451 2.491 2.562 2.627 2.673 2.722 2.78 2.865 2.933 2.981 3.016 3.024 3.017 3.001 2.97 2.933 2.881 2.797 2.671 2.519 2.32 2.019 1.702 1.3 0.653 -0.329 -1.624 -3.405 -5.976 -9.898 -14.258 -17.754 -20.603 -22.966 -25.031 -26.792 -28.318 -29.567 -30.74 -31.717 -32.591 -33.414 -34.163 -34.847 -35.466 -36.104 -36.679 -37.152 -37.616 -38.105 -38.504 -38.927 -39.353 -39.668 -40.002 -40.335 -40.661 -40.994 -41.224 -41.464 -41.842 -42.099 -42.362 -42.488 -42.738 -42.991 -43.245 -43.383 -43.649 -43.843 -44.004 -44.174 -44.539 -44.724 -44.927 -45.164 -45.45 -45.739 -46.084 -47.083 -2 ,13559 ,TETRA ,17556229,Fri Nov 26 06:21:08 CET,Fri Nov 26 08:36:26 CET,0.0 0.463 0.669 0.868 1.028 1.15 1.268 1.368 1.533 1.614 1.699 1.789 1.921 1.982 2.085 2.169 2.249 2.289 2.365 2.43 2.505 2.55 2.586 2.627 2.672 2.716 2.77 2.828 2.883 2.932 2.974 3.005 3.018 3.013 2.995 2.971 2.942 2.882 2.786 2.665 2.516 2.306 2.012 1.702 1.254 0.581 -0.283 -1.461 -3.174 -5.631 -9.429 -13.645 -17.026 -19.786 -22.037 -23.981 -25.634 -27.032 -28.199 -29.338 -30.268 -31.078 -31.855 -32.578 -33.23 -33.826 -34.457 -35.012 -35.478 -35.952 -36.448 -36.872 -37.294 -37.706 -38.023 -38.349 -38.683 -39.032 -39.375 -39.598 -39.838 -40.224 -40.489 -40.744 -40.866 -41.113 -41.384 -41.662 -41.8 -42.056 -42.27 -42.448 -42.631 -42.978 -43.152 -43.345 -43.553 -43.772 -43.999 -44.267 -44.815 -3 ,14495 ,TETRA ,17556230,Fri Nov 26 06:21:08 CET,Fri Nov 26 08:35:31 CET,0.0 0.598 0.81 0.978 1.146 1.284 1.396 1.493 1.641 1.715 1.788 1.853 1.968 2.002 2.052 2.108 2.167 2.199 2.255 2.305 2.394 2.447 2.482 2.527 2.566 2.6 2.634 2.665 2.687 2.693 2.697 2.72 2.734 2.719 2.691 2.656 2.614 2.562 2.487 2.359 2.19 1.995 1.692 1.334 0.906 0.345 -0.387 -1.355 -2.864 -5.217 -9.143 -13.649 -17.151 -20.066 -22.475 -24.555 -26.33 -27.862 -29.118 -30.305 -31.273 -32.132 -32.943 -33.675 -34.343 -34.949 -35.572 -36.12 -36.575 -37.031 -37.506 -37.897 -38.294 -38.699 -39.008 -39.333 -39.666 -39.994 -40.33 -40.562 -40.796 -41.141 -41.391 -41.648 -41.77 -42.021 -42.282 -42.544 -42.684 -42.949 -43.139 -43.305 -43.479 -43.823 -43.994 -44.176 -44.396 -44.639 -44.902 -45.201 -45.688 -4 ,3809 ,TETRA ,17556231,Fri Nov 26 06:21:08 CET,Fri Nov 26 08:39:15 CET,0.0 0.284 0.417 0.522 0.636 0.743 0.832 0.925 1.096 1.168 1.241 1.311 1.447 1.515 1.636 1.724 1.795 1.831 1.906 1.969 2.045 2.091 2.137 2.211 2.272 2.328 2.374 2.406 2.43 2.449 2.472 2.487 2.487 2.469 2.442 2.398 2.326 2.235 2.121 1.956 1.761 1.497 1.104 0.672 0.145 -0.515 -1.463 -2.756 -4.57 -7.252 -11.465 -16.099 -19.651 -22.53 -24.878 -26.835 -28.502 -29.998 -31.268 -32.502 -33.501 -34.343 -35.145 -35.875 -36.528 -37.128 -37.751 -38.284 -38.725 -39.18 -39.66 -40.046 -40.429 -40.824 -41.135 -41.458 -41.778 -42.106 -42.438 -42.663 -42.891 -43.237 -43.477 -43.719 -43.852 -44.13 -44.415 -44.717 -44.865 -45.112 -45.256 -45.401 -45.549 -45.852 -46.019 -46.191 -46.379 -46.593 -46.867 -47.298 -48.317 -5 ,11388 ,TETRA ,17556232,Fri Nov 26 06:21:10 CET,Fri Nov 26 08:35:39 CET,0.0 0.401 0.551 0.658 0.763 0.87 0.959 1.041 1.199 1.272 1.343 1.406 1.532 1.591 1.705 1.801 1.89 1.934 2.015 2.094 2.204 2.265 2.321 2.383 2.417 2.465 2.523 2.569 2.611 2.65 2.684 2.721 2.758 2.779 2.788 2.781 2.76 2.718 2.655 2.567 2.42 2.204 1.904 1.529 1.073 0.51 -0.304 -1.447 -3.096 -5.432 -8.997 -12.978 -16.049 -18.569 -20.662 -22.408 -23.888 -25.21 -26.321 -27.386 -28.267 -29.05 -29.786 -30.455 -31.067 -31.613 -32.189 -32.717 -33.173 -33.652 -34.145 -34.539 -34.937 -35.348 -35.667 -35.993 -36.324 -36.655 -37.005 -37.245 -37.481 -37.84 -38.091 -38.36 -38.488 -38.741 -39.02 -39.305 -39.448 -39.714 -39.914 -40.067 -40.227 -40.567 -40.751 -40.935 -41.127 -41.337 -41.558 -41.813 -42.405 -6 ,17970 ,TETRA ,17556233,Fri Nov 26 06:21:08 CET,Fri Nov 26 08:35:57 CET,0.0 0.906 1.162 1.386 1.547 1.674 1.785 1.881 2.051 2.118 2.175 2.203 2.314 2.35 2.41 2.478 2.545 2.578 2.635 2.681 2.766 2.819 2.86 2.91 2.938 2.959 2.99 3.022 3.055 3.082 3.096 3.102 3.104 3.103 3.093 3.061 3.028 2.981 2.91 2.821 2.693 2.474 2.19 1.904 1.46 0.822 -0.103 -1.341 -3.053 -5.58 -9.451 -13.719 -16.993 -19.587 -21.8 -23.73 -25.333 -26.734 -27.938 -29.117 -30.115 -31.006 -31.819 -32.522 -33.151 -33.729 -34.339 -34.873 -35.333 -35.808 -36.278 -36.674 -37.082 -37.489 -37.807 -38.133 -38.459 -38.787 -39.129 -39.359 -39.587 -39.931 -40.163 -40.399 -40.522 -40.778 -41.037 -41.309 -41.454 -41.719 -41.933 -42.106 -42.281 -42.631 -42.814 -43.001 -43.195 -43.454 -43.774 -44.176 -44.854 -7 ,27436 ,TETRA ,17556234,Fri Nov 26 06:21:08 CET,Fri Nov 26 08:35:46 CET,0.0 0.453 0.658 0.852 0.987 1.098 1.204 1.286 1.423 1.495 1.553 1.58 1.691 1.733 1.815 1.893 1.964 1.995 2.063 2.14 2.23 2.273 2.315 2.369 2.414 2.451 2.489 2.523 2.545 2.557 2.567 2.592 2.606 2.596 2.577 2.536 2.478 2.397 2.294 2.185 2.046 1.86 1.584 1.258 0.859 0.327 -0.424 -1.475 -2.981 -5.238 -8.764 -12.748 -16.007 -18.773 -21.058 -22.938 -24.536 -25.982 -27.182 -28.345 -29.348 -30.233 -31.044 -31.81 -32.512 -33.141 -33.802 -34.382 -34.867 -35.361 -35.877 -36.29 -36.701 -37.111 -37.416 -37.723 -38.038 -38.356 -38.687 -38.913 -39.137 -39.481 -39.712 -39.951 -40.076 -40.337 -40.612 -40.899 -41.043 -41.304 -41.509 -41.672 -41.832 -42.168 -42.344 -42.521 -42.721 -42.929 -43.173 -43.502 -44.325 -8 ,1523 ,TETRA ,17556235,Fri Nov 26 06:22:06 CET,Fri Nov 26 08:24:23 CET,0.0 0.731 1.024 1.251 1.429 1.556 1.66 1.763 1.955 2.025 2.098 2.173 2.306 2.37 2.479 2.594 2.702 2.754 2.856 2.951 3.081 3.143 3.183 3.24 3.287 3.324 3.365 3.405 3.444 3.457 3.46 3.475 3.491 3.51 3.528 3.529 3.51 3.463 3.38 3.262 3.099 2.875 2.573 2.259 1.836 1.288 0.592 -0.435 -2.006 -4.334 -8.024 -12.263 -15.503 -18.039 -20.16 -21.969 -23.475 -24.787 -25.867 -26.911 -27.806 -28.599 -29.336 -30.018 -30.636 -31.191 -31.775 -32.295 -32.738 -33.199 -33.662 -34.037 -34.427 -34.827 -35.14 -35.453 -35.771 -36.102 -36.428 -36.649 -36.888 -37.255 -37.512 -37.771 -37.896 -38.175 -38.456 -38.727 -38.877 -39.138 -39.333 -39.494 -39.661 -40.058 -40.261 -40.466 -40.701 -40.97 -41.271 -41.613 -42.207 -9 ,5749 ,TETRA ,17556236,Fri Nov 26 06:22:06 CET,Fri Nov 26 08:36:42 CET,0.0 0.458 0.684 0.861 1.009 1.12 1.226 1.332 1.501 1.572 1.637 1.683 1.804 1.852 1.94 2.022 2.1 2.138 2.209 2.274 2.353 2.412 2.474 2.555 2.621 2.684 2.749 2.803 2.862 2.9 2.931 2.968 3.006 3.039 3.05 3.039 3.019 2.982 2.927 2.857 2.736 2.55 2.272 1.901 1.421 0.802 -0.016 -1.068 -2.681 -5.157 -8.795 -12.782 -15.922 -18.427 -20.546 -22.426 -24.081 -25.532 -26.713 -27.843 -28.778 -29.569 -30.295 -30.999 -31.672 -32.266 -32.84 -33.327 -33.746 -34.176 -34.604 -34.955 -35.316 -35.704 -36.002 -36.299 -36.605 -36.916 -37.239 -37.463 -37.689 -38.038 -38.277 -38.514 -38.637 -38.882 -39.133 -39.417 -39.563 -39.814 -39.996 -40.143 -40.278 -40.559 -40.71 -40.88 -41.077 -41.303 -41.602 -41.975 -42.63 -10 ,275 ,TETRA ,17556238,Fri Nov 26 06:22:06 CET,Fri Nov 26 08:41:01 CET,0.0 0.727 0.973 1.169 1.341 1.476 1.58 1.676 1.866 1.944 2.003 2.06 2.18 2.235 2.341 2.43 2.504 2.531 2.59 2.654 2.743 2.794 2.857 2.951 3.023 3.087 3.149 3.205 3.261 3.322 3.384 3.443 3.483 3.513 3.535 3.554 3.555 3.518 3.481 3.438 3.348 3.177 2.917 2.642 2.306 1.861 1.279 0.507 -0.699 -2.775 -6.443 -10.682 -13.952 -16.521 -18.725 -20.582 -22.049 -23.331 -24.412 -25.474 -26.369 -27.173 -27.934 -28.634 -29.278 -29.848 -30.424 -30.918 -31.332 -31.766 -32.21 -32.572 -32.935 -33.302 -33.6 -33.9 -34.195 -34.492 -34.787 -34.991 -35.207 -35.546 -35.778 -36.012 -36.131 -36.386 -36.66 -36.946 -37.086 -37.326 -37.498 -37.655 -37.815 -38.153 -38.348 -38.548 -38.742 -38.959 -39.215 -39.532 -40.384 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_29_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_29_25.txt deleted file mode 100644 index 34eb8d3e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_29_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12742 ,TETRA ,17556239,Fri Nov 26 06:22:08 CET,Fri Nov 26 08:35:36 CET,0.0 1.308 1.688 1.963 2.21 2.433 2.617 2.778 3.079 3.21 3.333 3.328 3.655 3.753 3.936 4.114 4.284 4.369 4.525 4.679 4.896 5.036 5.169 5.359 5.55 5.727 5.889 6.025 6.183 6.338 6.487 6.67 6.854 7.022 7.206 7.417 7.635 7.868 8.11 8.365 8.622 8.889 9.158 9.43 9.704 9.92 10.145 10.288 10.178 9.542 8.031 5.925 4.244 2.741 1.267 -0.046 -1.157 -2.133 -2.998 -3.849 -4.516 -5.092 -5.678 -6.259 -6.788 -7.256 -7.718 -8.113 -8.461 -8.812 -9.165 -9.474 -9.785 -10.083 -10.33 -10.608 -10.922 -11.268 -11.589 -11.795 -12.01 -12.352 -12.588 -12.84 -12.978 -13.23 -13.46 -13.739 -13.922 -14.367 -14.495 -14.676 -14.868 -15.258 -15.469 -15.725 -16.017 -16.376 -16.829 -17.458 -19.882 -2 ,32487 ,TETRA ,17556240,Fri Nov 26 06:22:08 CET,Fri Nov 26 08:36:11 CET,0.0 0.704 0.972 1.213 1.444 1.637 1.81 1.972 2.27 2.403 2.521 2.536 2.88 2.978 3.159 3.329 3.497 3.585 3.746 3.872 4.049 4.169 4.284 4.459 4.623 4.78 4.937 5.093 5.305 5.51 5.714 5.963 6.177 6.365 6.603 6.872 7.113 7.384 7.66 7.935 8.234 8.567 8.936 9.283 9.646 9.986 10.337 10.682 10.787 10.488 9.695 8.515 7.372 6.314 5.314 4.307 3.462 2.703 2.001 1.286 0.711 0.23 -0.228 -0.663 -1.06 -1.402 -1.773 -2.132 -2.48 -2.864 -3.236 -3.529 -3.831 -4.144 -4.371 -4.599 -4.844 -5.125 -5.44 -5.629 -5.824 -6.119 -6.332 -6.588 -6.712 -6.933 -7.153 -7.412 -7.56 -7.954 -8.023 -8.197 -8.379 -8.795 -9.02 -9.264 -9.539 -9.846 -10.218 -10.712 -12.664 -3 ,20902 ,TETRA ,17556241,Fri Nov 26 06:22:08 CET,Fri Nov 26 08:22:12 CET,0.0 1.658 2.069 2.388 2.673 2.898 3.078 3.232 3.515 3.649 3.787 3.82 4.173 4.288 4.483 4.664 4.849 4.946 5.132 5.293 5.521 5.669 5.808 6.006 6.194 6.382 6.554 6.7 6.889 7.082 7.29 7.542 7.764 7.963 8.211 8.493 8.71 8.919 9.131 9.377 9.64 9.91 10.206 10.48 10.743 10.983 11.224 11.413 11.39 10.961 9.898 8.304 6.882 5.638 4.618 3.763 3.018 2.372 1.846 1.299 0.79 0.335 -0.077 -0.472 -0.87 -1.214 -1.55 -1.844 -2.093 -2.372 -2.668 -2.895 -3.127 -3.387 -3.598 -3.835 -4.081 -4.339 -4.612 -4.781 -4.942 -5.212 -5.417 -5.619 -5.708 -5.897 -6.132 -6.395 -6.547 -6.947 -7.013 -7.162 -7.292 -7.592 -7.806 -8.045 -8.319 -8.626 -9.087 -9.642 -14.126 -4 ,32206 ,TETRA ,17556242,Fri Nov 26 06:23:08 CET,Fri Nov 26 08:46:45 CET,0.0 1.408 1.876 2.18 2.433 2.663 2.856 3.029 3.336 3.474 3.615 3.66 4.015 4.124 4.337 4.535 4.722 4.811 4.981 5.152 5.39 5.538 5.681 5.897 6.098 6.286 6.484 6.666 6.86 7.055 7.253 7.468 7.666 7.859 8.11 8.411 8.656 8.861 9.067 9.3 9.543 9.801 10.077 10.373 10.656 10.803 10.95 11.072 11.045 10.676 9.682 8.257 6.964 5.772 4.664 3.599 2.618 1.727 0.954 0.191 -0.442 -1.001 -1.535 -2.068 -2.577 -2.987 -3.396 -3.785 -4.123 -4.467 -4.808 -5.079 -5.374 -5.693 -5.938 -6.184 -6.416 -6.653 -6.926 -7.118 -7.326 -7.701 -7.963 -8.247 -8.392 -8.666 -8.94 -9.225 -9.389 -9.803 -9.928 -10.125 -10.329 -10.76 -11.002 -11.262 -11.549 -11.926 -12.36 -12.881 -14.945 -5 ,26730 ,TETRA ,17556243,Fri Nov 26 06:23:07 CET,Fri Nov 26 08:36:25 CET,0.0 0.97 1.365 1.691 1.932 2.138 2.304 2.458 2.779 2.931 3.054 3.035 3.353 3.452 3.633 3.8 3.97 4.045 4.189 4.333 4.535 4.666 4.777 4.928 5.086 5.243 5.383 5.51 5.677 5.831 5.968 6.134 6.291 6.437 6.603 6.8 7.028 7.27 7.487 7.717 7.944 8.188 8.463 8.724 9.025 9.326 9.619 9.804 9.793 9.577 9.031 7.884 6.727 5.644 4.618 3.703 2.938 2.273 1.689 1.114 0.597 0.06 -0.492 -0.973 -1.384 -1.787 -2.202 -2.552 -2.852 -3.147 -3.452 -3.743 -4.098 -4.471 -4.76 -5.042 -5.31 -5.62 -5.985 -6.247 -6.515 -6.923 -7.201 -7.503 -7.672 -8.011 -8.375 -8.748 -8.938 -9.404 -9.592 -9.844 -10.111 -10.676 -10.987 -11.317 -11.7 -12.155 -12.764 -13.613 -18.118 -6 ,4434 ,TETRA ,17556244,Fri Nov 26 06:23:08 CET,Fri Nov 26 08:35:49 CET,0.0 1.254 1.711 2.083 2.34 2.546 2.747 2.948 3.318 3.474 3.611 3.631 3.975 4.098 4.357 4.603 4.824 4.923 5.098 5.268 5.499 5.642 5.792 5.996 6.179 6.344 6.507 6.674 6.883 7.073 7.254 7.46 7.657 7.857 8.074 8.296 8.487 8.702 8.95 9.192 9.46 9.766 10.083 10.361 10.632 10.923 11.202 11.411 11.513 11.332 10.606 9.393 8.155 7.006 6.015 5.144 4.378 3.61 2.896 2.17 1.497 0.876 0.271 -0.292 -0.814 -1.341 -1.91 -2.414 -2.818 -3.205 -3.608 -3.935 -4.246 -4.583 -4.863 -5.132 -5.4 -5.681 -5.987 -6.201 -6.419 -6.749 -6.961 -7.184 -7.318 -7.626 -7.939 -8.268 -8.432 -8.852 -8.983 -9.175 -9.375 -9.82 -10.07 -10.355 -10.674 -11.047 -11.459 -12.018 -14.103 -7 ,6707 ,TETRA ,17556245,Fri Nov 26 06:24:08 CET,Fri Nov 26 08:35:32 CET,0.0 2.249 2.71 3.032 3.288 3.506 3.705 3.881 4.185 4.325 4.452 4.465 4.812 4.926 5.144 5.337 5.515 5.608 5.794 5.949 6.147 6.269 6.4 6.6 6.77 6.925 7.091 7.247 7.427 7.594 7.761 7.954 8.131 8.306 8.5 8.697 8.86 9.064 9.313 9.574 9.869 10.204 10.585 10.921 11.186 11.355 11.427 11.392 11.23 10.808 9.812 8.307 6.957 5.84 4.886 4.002 3.212 2.489 1.875 1.243 0.705 0.238 -0.228 -0.652 -1.054 -1.448 -1.871 -2.256 -2.577 -2.903 -3.245 -3.536 -3.85 -4.178 -4.428 -4.671 -4.947 -5.247 -5.544 -5.77 -6.01 -6.361 -6.616 -6.874 -7.0 -7.28 -7.562 -7.826 -7.963 -8.351 -8.468 -8.681 -8.889 -9.323 -9.551 -9.802 -10.079 -10.385 -10.751 -11.216 -12.966 -8 ,29930 ,TETRA ,17556246,Fri Nov 26 06:25:08 CET,Fri Nov 26 08:40:24 CET,0.0 1.029 1.375 1.671 1.928 2.135 2.307 2.472 2.75 2.876 3.005 3.023 3.365 3.465 3.673 3.878 4.066 4.159 4.328 4.479 4.712 4.865 5.003 5.195 5.389 5.566 5.708 5.843 6.028 6.219 6.407 6.654 6.879 7.051 7.257 7.513 7.75 7.994 8.265 8.537 8.798 9.081 9.397 9.691 9.985 10.232 10.442 10.663 10.769 10.475 9.596 7.933 6.142 4.634 3.342 2.064 0.923 -0.102 -0.988 -1.9 -2.73 -3.393 -3.938 -4.461 -5.011 -5.533 -6.058 -6.562 -7.013 -7.435 -7.885 -8.296 -8.722 -9.152 -9.468 -9.772 -10.077 -10.387 -10.731 -11.003 -11.293 -11.702 -11.979 -12.263 -12.404 -12.73 -13.089 -13.484 -13.704 -14.171 -14.374 -14.605 -14.857 -15.388 -15.665 -15.963 -16.286 -16.635 -17.084 -17.728 -21.125 -9 ,19901 ,TETRA ,17556247,Fri Nov 26 06:24:08 CET,Fri Nov 26 08:36:49 CET,0.0 1.806 2.237 2.511 2.721 2.924 3.102 3.272 3.573 3.69 3.791 3.744 4.059 4.139 4.31 4.475 4.62 4.696 4.837 4.944 5.097 5.214 5.32 5.457 5.619 5.768 5.893 6.0 6.134 6.293 6.471 6.673 6.838 6.968 7.111 7.261 7.382 7.516 7.657 7.785 7.928 8.08 8.199 8.307 8.434 8.559 8.638 8.554 8.362 7.998 6.822 5.189 3.833 2.666 1.706 0.828 -0.004 -0.783 -1.468 -2.15 -2.742 -3.252 -3.716 -4.162 -4.597 -4.988 -5.362 -5.714 -6.049 -6.375 -6.702 -6.998 -7.315 -7.637 -7.911 -8.202 -8.472 -8.745 -9.019 -9.199 -9.373 -9.627 -9.814 -10.022 -10.13 -10.357 -10.609 -10.851 -10.966 -11.331 -11.358 -11.515 -11.692 -12.133 -12.378 -12.598 -12.828 -13.093 -13.425 -13.88 -15.697 -10 ,20620 ,TETRA ,17556248,Fri Nov 26 06:24:10 CET,Fri Nov 26 08:37:15 CET,0.0 1.625 2.031 2.345 2.621 2.828 3.035 3.227 3.537 3.69 3.831 3.866 4.205 4.313 4.536 4.753 4.954 5.043 5.216 5.394 5.658 5.815 5.977 6.216 6.43 6.633 6.83 7.015 7.244 7.471 7.696 7.961 8.208 8.442 8.71 9.022 9.311 9.621 9.943 10.222 10.465 10.691 10.918 11.091 11.275 11.481 11.588 11.58 11.394 10.92 9.926 8.48 7.161 5.965 4.889 3.825 2.978 2.286 1.647 0.982 0.354 -0.245 -0.848 -1.411 -1.897 -2.335 -2.799 -3.222 -3.59 -3.97 -4.355 -4.681 -5.021 -5.378 -5.662 -5.945 -6.245 -6.553 -6.848 -7.044 -7.242 -7.553 -7.792 -8.046 -8.174 -8.433 -8.681 -8.948 -9.101 -9.505 -9.596 -9.766 -9.949 -10.403 -10.667 -10.925 -11.168 -11.481 -11.878 -12.359 -15.038 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_29_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_29_33.txt deleted file mode 100644 index 451f45aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_29_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9749 ,TETRA ,17556249,Fri Nov 26 06:24:07 CET,Fri Nov 26 08:37:53 CET,0.0 0.606 0.998 1.338 1.679 1.978 2.268 2.534 2.996 3.218 3.417 3.579 3.986 4.168 4.557 4.926 5.272 5.449 5.786 6.105 6.552 6.845 7.158 7.627 8.073 8.512 8.947 9.375 9.93 10.481 11.023 11.705 12.404 13.084 13.894 14.86 15.787 16.817 17.959 19.206 20.565 22.097 23.958 25.938 28.305 31.086 34.509 38.533 43.585 50.116 59.069 67.659 73.533 77.808 81.017 83.593 85.596 87.214 88.512 89.744 90.72 91.518 92.231 92.833 93.346 93.801 94.239 94.609 94.921 95.212 95.489 95.705 95.909 96.102 96.241 96.375 96.504 96.638 96.763 96.827 96.876 96.947 96.975 97.0 97.024 97.067 97.092 97.1 97.097 96.961 97.038 97.011 97.001 96.938 96.889 96.847 96.767 96.628 96.465 96.252 95.758 -2 ,28123 ,TETRA ,17556250,Fri Nov 26 06:24:08 CET,Fri Nov 26 08:38:17 CET,0.0 1.608 2.163 2.571 2.927 3.267 3.594 3.906 4.511 4.778 5.027 5.275 5.717 5.935 6.374 6.8 7.205 7.393 7.758 8.119 8.673 9.043 9.404 9.918 10.427 10.939 11.419 11.881 12.496 13.1 13.689 14.403 15.104 15.784 16.612 17.588 18.517 19.548 20.693 21.937 23.278 24.876 26.756 28.646 30.976 33.717 37.06 41.051 46.066 52.564 61.543 70.158 76.004 80.222 83.372 85.888 87.921 89.577 90.859 92.028 92.946 93.712 94.399 95.007 95.536 95.992 96.423 96.772 97.065 97.343 97.59 97.789 97.996 98.193 98.332 98.469 98.598 98.723 98.852 98.925 98.997 99.098 99.145 99.184 99.2 99.235 99.248 99.244 99.252 99.136 99.257 99.236 99.203 99.13 99.082 99.015 98.928 98.816 98.66 98.465 98.008 -3 ,1375 ,TETRA ,17556251,Fri Nov 26 06:25:08 CET,Fri Nov 26 08:40:54 CET,0.0 1.168 1.557 1.92 2.288 2.61 2.893 3.176 3.707 3.955 4.204 4.451 4.891 5.095 5.484 5.856 6.235 6.427 6.807 7.171 7.695 8.042 8.376 8.877 9.363 9.85 10.342 10.818 11.44 12.051 12.652 13.402 14.145 14.861 15.712 16.68 17.626 18.704 19.908 21.235 22.67 24.323 26.324 28.436 31.027 34.055 37.676 42.01 47.393 54.212 63.431 72.17 78.146 82.582 85.952 88.615 90.726 92.394 93.685 94.906 95.87 96.676 97.419 98.087 98.662 99.154 99.636 100.023 100.335 100.653 100.972 101.21 101.443 101.687 101.842 101.985 102.138 102.287 102.441 102.536 102.622 102.734 102.806 102.873 102.896 102.931 102.97 102.964 102.941 102.805 102.89 102.873 102.855 102.767 102.711 102.654 102.563 102.443 102.316 102.061 100.199 -4 ,19010 ,TETRA ,17556252,Fri Nov 26 06:25:10 CET,Fri Nov 26 08:39:44 CET,0.0 0.784 1.154 1.438 1.718 1.993 2.238 2.473 2.91 3.111 3.313 3.494 3.905 4.09 4.456 4.823 5.187 5.361 5.689 5.993 6.443 6.743 7.042 7.487 7.928 8.358 8.779 9.199 9.745 10.274 10.803 11.461 12.134 12.796 13.557 14.438 15.307 16.286 17.386 18.597 19.927 21.491 23.393 25.369 27.747 30.55 33.959 38.094 43.306 49.99 59.252 68.203 74.258 78.711 82.153 84.923 87.089 88.882 90.312 91.603 92.604 93.435 94.196 94.862 95.433 95.888 96.311 96.668 96.97 97.294 97.611 97.854 98.084 98.306 98.473 98.637 98.788 98.939 99.087 99.176 99.25 99.364 99.443 99.512 99.551 99.628 99.672 99.703 99.711 99.575 99.653 99.637 99.624 99.574 99.538 99.491 99.43 99.347 99.183 98.85 97.49 -5 ,11726 ,TETRA ,17556253,Fri Nov 26 06:25:08 CET,Fri Nov 26 08:33:24 CET,0.0 0.713 1.149 1.528 1.862 2.18 2.49 2.763 3.277 3.516 3.756 4.001 4.453 4.681 5.126 5.536 5.93 6.118 6.462 6.796 7.291 7.631 7.963 8.413 8.845 9.287 9.719 10.119 10.662 11.218 11.765 12.443 13.117 13.786 14.57 15.505 16.433 17.446 18.573 19.815 21.166 22.757 24.687 26.691 29.128 31.989 35.428 39.526 44.721 51.417 60.676 69.652 75.656 79.998 83.252 85.807 87.809 89.447 90.747 91.951 92.917 93.693 94.382 95.007 95.542 95.988 96.416 96.777 97.062 97.345 97.64 97.87 98.096 98.309 98.458 98.607 98.751 98.889 99.027 99.117 99.197 99.315 99.378 99.429 99.46 99.51 99.519 99.497 99.486 99.35 99.429 99.396 99.375 99.305 99.235 99.155 99.033 98.875 98.717 98.439 97.239 -6 ,23036 ,TETRA ,17556254,Fri Nov 26 06:25:08 CET,Fri Nov 26 08:40:42 CET,0.0 0.805 1.219 1.59 1.871 2.104 2.34 2.577 3.023 3.232 3.424 3.591 4.0 4.193 4.593 4.963 5.329 5.514 5.87 6.196 6.65 6.951 7.252 7.713 8.167 8.594 9.015 9.455 10.06 10.639 11.213 11.904 12.562 13.207 13.997 14.927 15.821 16.817 17.924 19.149 20.471 22.025 23.925 25.915 28.337 31.133 34.542 38.653 43.847 50.6 59.907 68.811 74.867 79.375 82.758 85.453 87.622 89.383 90.774 92.049 93.065 93.932 94.697 95.356 95.927 96.426 96.917 97.321 97.655 97.985 98.294 98.546 98.801 99.034 99.198 99.354 99.493 99.622 99.753 99.842 99.919 100.014 100.057 100.093 100.118 100.177 100.226 100.255 100.264 100.154 100.254 100.218 100.189 100.146 100.128 100.106 100.012 99.836 99.642 99.439 98.711 -7 ,26355 ,TETRA ,17556255,Fri Nov 26 06:25:08 CET,Fri Nov 26 08:40:13 CET,0.0 0.727 1.065 1.355 1.654 1.93 2.165 2.403 2.894 3.121 3.337 3.532 3.962 4.165 4.556 4.926 5.295 5.473 5.82 6.159 6.631 6.943 7.265 7.73 8.188 8.635 9.085 9.551 10.166 10.758 11.318 12.006 12.697 13.382 14.197 15.121 16.035 17.101 18.27 19.527 20.902 22.503 24.453 26.502 28.986 31.908 35.41 39.571 45.003 52.161 61.976 71.42 77.69 82.177 85.569 88.225 90.271 91.953 93.305 94.547 95.507 96.294 97.001 97.601 98.118 98.563 98.992 99.352 99.653 99.933 100.197 100.415 100.631 100.824 100.951 101.065 101.181 101.312 101.445 101.521 101.592 101.682 101.711 101.72 101.723 101.69 101.646 101.631 101.614 101.453 101.515 101.479 101.407 101.213 101.094 100.979 100.861 100.678 100.482 100.229 99.102 -8 ,11765 ,TETRA ,17556256,Fri Nov 26 06:25:08 CET,Fri Nov 26 08:38:05 CET,0.0 1.429 1.917 2.345 2.714 3.039 3.339 3.593 4.095 4.356 4.612 4.859 5.3 5.509 5.942 6.359 6.764 6.965 7.334 7.683 8.196 8.529 8.867 9.39 9.899 10.379 10.858 11.333 11.975 12.586 13.153 13.87 14.589 15.307 16.162 17.153 18.143 19.251 20.439 21.706 23.085 24.701 26.681 28.715 31.11 33.911 37.35 41.544 46.81 53.58 63.039 72.185 78.265 82.505 85.689 88.292 90.367 91.994 93.232 94.383 95.325 96.122 96.796 97.392 97.92 98.359 98.793 99.148 99.426 99.68 99.913 100.101 100.29 100.485 100.634 100.787 100.944 101.067 101.174 101.254 101.331 101.395 101.408 101.422 101.43 101.456 101.487 101.501 101.481 101.314 101.373 101.341 101.309 101.24 101.149 101.013 100.893 100.744 100.558 100.287 98.97 -9 ,800 ,TETRA ,17556257,Fri Nov 26 06:25:08 CET,Fri Nov 26 08:38:45 CET,0.0 1.46 2.043 2.516 2.927 3.289 3.593 3.86 4.404 4.662 4.892 5.104 5.559 5.781 6.187 6.577 6.986 7.191 7.588 7.982 8.544 8.884 9.209 9.69 10.156 10.599 11.049 11.499 12.09 12.699 13.289 13.999 14.706 15.414 16.248 17.21 18.161 19.209 20.36 21.632 23.016 24.607 26.556 28.626 31.13 34.042 37.608 41.874 47.162 53.892 62.93 71.627 77.671 82.19 85.561 88.164 90.206 91.897 93.227 94.439 95.402 96.195 96.885 97.5 98.055 98.526 98.958 99.304 99.593 99.88 100.155 100.358 100.553 100.742 100.871 100.985 101.105 101.226 101.328 101.392 101.455 101.527 101.564 101.599 101.611 101.627 101.634 101.632 101.622 101.476 101.565 101.542 101.515 101.461 101.387 101.274 101.162 101.036 100.852 100.639 99.941 -10 ,27646 ,TETRA ,17556258,Fri Nov 26 06:25:08 CET,Fri Nov 26 08:36:47 CET,0.0 1.228 1.608 1.925 2.247 2.519 2.749 2.982 3.405 3.609 3.809 3.948 4.35 4.519 4.877 5.229 5.576 5.751 6.082 6.415 6.907 7.216 7.524 8.009 8.485 8.926 9.369 9.812 10.38 10.969 11.548 12.221 12.896 13.598 14.455 15.409 16.326 17.353 18.495 19.771 21.158 22.772 24.73 26.79 29.315 32.265 35.857 40.184 45.643 52.755 62.521 71.646 77.688 82.052 85.341 87.967 90.039 91.748 93.106 94.352 95.338 96.148 96.888 97.539 98.085 98.554 99.019 99.388 99.68 99.979 100.258 100.478 100.703 100.927 101.086 101.243 101.385 101.505 101.608 101.659 101.724 101.827 101.891 101.944 101.96 101.99 102.002 102.005 102.004 101.864 101.937 101.901 101.855 101.747 101.673 101.601 101.521 101.406 101.287 101.162 100.465 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_30_13.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_30_13.txt deleted file mode 100644 index 7d53e5b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_30_13.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1751 ,TETRA ,17556259,Fri Nov 26 06:25:09 CET,Fri Nov 26 08:40:21 CET,0.0 1.094 1.434 1.685 1.89 2.08 2.22 2.334 2.548 2.668 2.79 2.892 3.098 3.171 3.311 3.452 3.586 3.652 3.786 3.917 4.098 4.21 4.319 4.461 4.59 4.712 4.82 4.919 5.044 5.16 5.265 5.408 5.544 5.664 5.801 5.944 6.058 6.18 6.311 6.43 6.534 6.631 6.763 6.868 6.896 6.83 6.716 6.534 6.043 5.121 3.531 1.476 -0.242 -1.736 -3.021 -4.094 -4.985 -5.805 -6.538 -7.273 -7.905 -8.446 -8.964 -9.452 -9.881 -10.28 -10.702 -11.052 -11.349 -11.679 -12.04 -12.349 -12.67 -12.984 -13.22 -13.463 -13.698 -13.94 -14.213 -14.409 -14.605 -14.912 -15.136 -15.367 -15.487 -15.746 -16.029 -16.327 -16.472 -16.742 -16.939 -17.118 -17.293 -17.664 -17.876 -18.164 -18.473 -18.763 -19.146 -19.737 -22.045 -2 ,13751 ,TETRA ,17556260,Fri Nov 26 06:25:09 CET,Fri Nov 26 08:41:00 CET,0.0 1.128 1.44 1.693 1.912 2.083 2.231 2.384 2.687 2.816 2.94 3.056 3.266 3.359 3.53 3.679 3.823 3.894 4.027 4.155 4.332 4.44 4.543 4.687 4.823 4.963 5.1 5.24 5.418 5.581 5.755 5.96 6.146 6.321 6.502 6.664 6.818 6.988 7.114 7.223 7.357 7.488 7.619 7.714 7.783 7.813 7.77 7.569 7.131 6.369 4.876 2.951 1.321 -0.097 -1.35 -2.469 -3.414 -4.246 -4.99 -5.752 -6.378 -6.905 -7.392 -7.843 -8.271 -8.675 -9.099 -9.475 -9.779 -10.09 -10.463 -10.759 -11.011 -11.301 -11.552 -11.819 -12.083 -12.371 -12.702 -12.917 -13.14 -13.496 -13.734 -13.997 -14.142 -14.44 -14.744 -15.065 -15.24 -15.558 -15.8 -15.991 -16.21 -16.679 -16.936 -17.252 -17.64 -18.103 -18.679 -19.675 -32.113 -3 ,24561 ,TETRA ,17556261,Fri Nov 26 06:25:09 CET,Fri Nov 26 08:39:32 CET,0.0 0.872 1.19 1.461 1.673 1.838 2.004 2.139 2.413 2.546 2.671 2.788 3.001 3.095 3.291 3.47 3.626 3.691 3.81 3.924 4.084 4.198 4.312 4.479 4.625 4.742 4.844 4.954 5.084 5.205 5.364 5.569 5.722 5.844 5.98 6.13 6.295 6.446 6.555 6.65 6.751 6.848 6.955 7.112 7.282 7.365 7.341 7.189 6.871 6.184 4.716 2.784 1.024 -0.443 -1.642 -2.781 -3.756 -4.587 -5.327 -6.079 -6.72 -7.267 -7.767 -8.23 -8.665 -9.07 -9.499 -9.887 -10.203 -10.517 -10.852 -11.135 -11.468 -11.818 -12.073 -12.337 -12.596 -12.854 -13.135 -13.348 -13.59 -13.968 -14.201 -14.431 -14.547 -14.798 -15.078 -15.365 -15.509 -15.802 -16.008 -16.168 -16.351 -16.816 -17.058 -17.314 -17.639 -18.039 -18.477 -18.971 -23.243 -4 ,8704 ,TETRA ,17556262,Fri Nov 26 06:25:09 CET,Fri Nov 26 08:40:28 CET,0.0 0.876 1.192 1.413 1.638 1.845 1.989 2.118 2.379 2.5 2.617 2.705 2.904 2.986 3.139 3.284 3.42 3.49 3.625 3.75 3.918 4.028 4.133 4.269 4.408 4.555 4.688 4.793 4.926 5.07 5.197 5.328 5.438 5.539 5.679 5.865 6.05 6.24 6.412 6.555 6.696 6.845 6.966 7.034 7.074 7.114 7.078 6.854 6.428 5.636 4.095 2.123 0.483 -0.894 -2.116 -3.283 -4.29 -5.128 -5.822 -6.534 -7.169 -7.736 -8.268 -8.737 -9.154 -9.539 -9.954 -10.324 -10.638 -10.938 -11.242 -11.514 -11.822 -12.156 -12.421 -12.715 -13.006 -13.287 -13.58 -13.791 -14.022 -14.374 -14.593 -14.833 -14.963 -15.223 -15.503 -15.833 -16.005 -16.308 -16.554 -16.741 -16.925 -17.348 -17.616 -17.894 -18.211 -18.561 -18.95 -19.414 -22.069 -5 ,6541 ,TETRA ,17556263,Fri Nov 26 06:25:09 CET,Fri Nov 26 08:27:09 CET,0.0 0.784 1.134 1.364 1.529 1.707 1.867 2.005 2.252 2.366 2.474 2.565 2.778 2.879 3.063 3.229 3.381 3.448 3.575 3.711 3.905 4.018 4.13 4.294 4.451 4.583 4.71 4.836 5.0 5.15 5.284 5.463 5.64 5.793 5.936 6.068 6.178 6.3 6.438 6.596 6.774 6.94 7.06 7.104 7.137 7.137 7.042 6.868 6.523 5.782 4.309 2.377 0.763 -0.655 -1.903 -2.963 -3.812 -4.593 -5.294 -6.012 -6.636 -7.181 -7.709 -8.186 -8.613 -9.034 -9.473 -9.83 -10.136 -10.453 -10.772 -11.039 -11.323 -11.613 -11.838 -12.094 -12.37 -12.656 -12.959 -13.168 -13.384 -13.708 -13.945 -14.204 -14.329 -14.586 -14.879 -15.209 -15.412 -15.799 -16.185 -16.43 -16.68 -17.165 -17.436 -17.735 -18.088 -18.511 -19.015 -19.796 -28.61 -6 ,13137 ,TETRA ,17556264,Fri Nov 26 06:26:07 CET,Fri Nov 26 08:40:34 CET,0.0 0.521 0.737 0.899 1.06 1.222 1.357 1.507 1.775 1.878 1.978 2.037 2.233 2.324 2.483 2.624 2.768 2.838 2.955 3.053 3.188 3.276 3.367 3.511 3.643 3.758 3.86 3.964 4.111 4.269 4.415 4.583 4.765 4.969 5.184 5.344 5.459 5.585 5.73 5.874 5.999 6.097 6.185 6.268 6.326 6.322 6.186 5.932 5.545 4.761 3.188 1.179 -0.456 -1.878 -3.241 -4.461 -5.518 -6.478 -7.283 -8.033 -8.68 -9.295 -9.865 -10.381 -10.896 -11.367 -11.833 -12.26 -12.633 -12.998 -13.374 -13.678 -13.978 -14.295 -14.55 -14.832 -15.121 -15.406 -15.683 -15.876 -16.082 -16.412 -16.666 -16.927 -17.061 -17.376 -17.721 -18.07 -18.264 -18.608 -18.926 -19.179 -19.453 -19.994 -20.255 -20.538 -20.894 -21.363 -22.056 -23.078 -27.523 -7 ,4275 ,TETRA ,17556265,Fri Nov 26 06:26:07 CET,Fri Nov 26 08:41:13 CET,0.0 0.743 0.997 1.196 1.369 1.518 1.656 1.805 2.085 2.207 2.312 2.381 2.587 2.676 2.847 3.02 3.18 3.247 3.365 3.499 3.699 3.82 3.934 4.099 4.253 4.393 4.526 4.651 4.807 4.971 5.145 5.331 5.472 5.59 5.746 5.912 6.036 6.174 6.297 6.387 6.479 6.557 6.645 6.704 6.675 6.627 6.529 6.354 6.005 5.308 3.959 2.054 0.376 -0.978 -2.11 -3.128 -4.018 -4.813 -5.51 -6.21 -6.813 -7.345 -7.829 -8.284 -8.722 -9.14 -9.566 -9.97 -10.326 -10.676 -11.034 -11.32 -11.609 -11.92 -12.157 -12.395 -12.673 -12.963 -13.234 -13.413 -13.6 -13.903 -14.113 -14.322 -14.431 -14.669 -14.912 -15.155 -15.294 -15.574 -15.746 -15.917 -16.126 -16.591 -16.828 -17.085 -17.442 -17.862 -18.291 -18.904 -20.761 -8 ,7078 ,TETRA ,17556266,Fri Nov 26 06:26:07 CET,Fri Nov 26 08:41:18 CET,0.0 0.77 1.08 1.281 1.459 1.633 1.807 1.946 2.188 2.295 2.394 2.474 2.681 2.778 2.954 3.113 3.259 3.328 3.466 3.595 3.768 3.873 3.979 4.14 4.283 4.407 4.522 4.64 4.779 4.905 5.041 5.211 5.348 5.47 5.624 5.777 5.888 6.009 6.164 6.326 6.489 6.674 6.869 6.996 7.048 7.131 7.265 7.183 6.822 6.131 4.692 2.717 0.923 -0.542 -1.76 -2.823 -3.781 -4.62 -5.303 -5.98 -6.521 -6.98 -7.442 -7.903 -8.342 -8.744 -9.153 -9.518 -9.847 -10.193 -10.537 -10.83 -11.135 -11.447 -11.682 -11.924 -12.186 -12.455 -12.727 -12.917 -13.109 -13.412 -13.629 -13.846 -13.967 -14.222 -14.504 -14.879 -15.077 -15.4 -15.73 -15.959 -16.243 -16.869 -17.194 -17.54 -17.891 -18.336 -18.894 -19.679 -24.015 -9 ,12980 ,TETRA ,17556267,Fri Nov 26 06:26:07 CET,Fri Nov 26 08:41:45 CET,0.0 0.792 1.151 1.415 1.626 1.794 1.96 2.123 2.427 2.574 2.699 2.816 3.039 3.138 3.338 3.501 3.632 3.695 3.824 3.946 4.1 4.192 4.298 4.455 4.585 4.7 4.809 4.919 5.07 5.214 5.349 5.521 5.706 5.847 5.963 6.086 6.191 6.312 6.481 6.67 6.836 7.011 7.177 7.258 7.284 7.307 7.315 7.196 6.789 5.976 4.355 2.338 0.643 -0.827 -2.064 -3.167 -4.111 -4.947 -5.677 -6.408 -7.048 -7.621 -8.139 -8.582 -8.988 -9.364 -9.781 -10.163 -10.51 -10.874 -11.223 -11.508 -11.802 -12.118 -12.372 -12.629 -12.912 -13.222 -13.506 -13.69 -13.899 -14.228 -14.447 -14.683 -14.809 -15.057 -15.327 -15.612 -15.757 -16.044 -16.279 -16.499 -16.72 -17.139 -17.376 -17.657 -17.951 -18.265 -18.654 -19.139 -22.838 -10 ,27320 ,TETRA ,17556268,Fri Nov 26 06:26:07 CET,Fri Nov 26 08:40:43 CET,0.0 1.145 1.525 1.836 2.061 2.25 2.408 2.542 2.781 2.903 3.019 3.108 3.313 3.405 3.591 3.767 3.933 4.014 4.163 4.31 4.52 4.649 4.764 4.936 5.108 5.269 5.432 5.584 5.774 5.932 6.07 6.272 6.457 6.596 6.758 6.933 7.073 7.202 7.326 7.432 7.532 7.659 7.815 7.942 8.016 8.047 7.991 7.785 7.416 6.737 5.187 3.071 1.29 -0.178 -1.366 -2.371 -3.241 -4.052 -4.77 -5.469 -6.063 -6.59 -7.083 -7.567 -8.039 -8.457 -8.885 -9.276 -9.62 -9.986 -10.346 -10.625 -10.904 -11.174 -11.407 -11.671 -11.93 -12.194 -12.477 -12.694 -12.924 -13.266 -13.488 -13.714 -13.838 -14.092 -14.347 -14.613 -14.751 -15.015 -15.196 -15.384 -15.606 -16.126 -16.409 -16.748 -17.166 -17.633 -18.17 -18.879 -22.749 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_30_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_30_35.txt deleted file mode 100644 index 981933b1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_30_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17972 ,TETRA ,17556269,Fri Nov 26 06:26:07 CET,Fri Nov 26 08:34:00 CET,0.0 0.483 0.753 0.969 1.098 1.241 1.396 1.528 1.747 1.858 1.966 2.032 2.236 2.334 2.522 2.699 2.87 2.959 3.123 3.261 3.463 3.599 3.731 3.936 4.137 4.313 4.483 4.652 4.857 5.059 5.262 5.508 5.765 6.005 6.262 6.552 6.831 7.16 7.519 7.889 8.283 8.748 9.307 9.883 10.563 11.298 12.134 13.07 14.144 15.431 16.899 18.027 18.509 18.507 18.338 18.142 17.993 17.831 17.602 17.328 17.065 16.832 16.621 16.4 16.158 15.933 15.715 15.514 15.327 15.145 14.947 14.772 14.602 14.419 14.284 14.146 13.997 13.833 13.639 13.511 13.386 13.171 13.007 12.837 12.756 12.588 12.397 12.194 12.089 11.871 11.727 11.589 11.436 11.101 10.908 10.711 10.513 10.281 10.009 9.661 8.549 -2 ,25729 ,TETRA ,17556270,Fri Nov 26 06:27:05 CET,Fri Nov 26 08:49:54 CET,0.0 0.31 0.462 0.625 0.786 0.923 1.05 1.179 1.396 1.486 1.575 1.646 1.851 1.935 2.118 2.307 2.467 2.539 2.685 2.83 3.027 3.154 3.278 3.458 3.628 3.785 3.941 4.096 4.291 4.489 4.696 4.934 5.155 5.38 5.647 5.937 6.212 6.525 6.866 7.215 7.591 8.041 8.587 9.129 9.733 10.416 11.194 12.075 13.15 14.367 15.652 16.525 16.896 16.969 16.829 16.655 16.564 16.424 16.22 16.025 15.826 15.628 15.456 15.283 15.124 14.979 14.784 14.591 14.436 14.245 14.018 13.834 13.647 13.447 13.292 13.14 12.981 12.8 12.617 12.495 12.357 12.139 11.991 11.838 11.755 11.584 11.398 11.192 11.08 10.854 10.713 10.593 10.465 10.184 10.026 9.848 9.654 9.449 9.197 8.856 8.183 -3 ,5556 ,TETRA ,17556271,Fri Nov 26 06:27:05 CET,Fri Nov 26 08:43:16 CET,0.0 0.281 0.462 0.641 0.813 0.947 1.068 1.181 1.377 1.464 1.552 1.632 1.847 1.944 2.102 2.253 2.408 2.482 2.624 2.763 2.966 3.101 3.228 3.412 3.602 3.778 3.952 4.127 4.336 4.55 4.778 5.025 5.247 5.476 5.73 6.001 6.25 6.546 6.913 7.317 7.727 8.167 8.665 9.185 9.824 10.501 11.262 12.156 13.186 14.409 15.836 16.806 17.236 17.44 17.402 17.197 17.037 16.875 16.697 16.508 16.287 16.09 15.897 15.691 15.513 15.33 15.116 14.916 14.749 14.578 14.385 14.218 14.054 13.883 13.736 13.589 13.44 13.284 13.128 13.026 12.91 12.715 12.568 12.405 12.325 12.174 12.005 11.821 11.723 11.519 11.424 11.313 11.202 10.95 10.795 10.644 10.478 10.274 10.049 9.707 9.058 -4 ,2829 ,TETRA ,17556272,Fri Nov 26 06:27:05 CET,Fri Nov 26 08:46:25 CET,0.0 0.522 0.746 0.941 1.104 1.248 1.377 1.492 1.715 1.828 1.925 1.998 2.195 2.277 2.446 2.611 2.76 2.831 2.974 3.116 3.335 3.483 3.627 3.835 4.032 4.227 4.411 4.579 4.789 4.999 5.205 5.453 5.697 5.935 6.219 6.546 6.877 7.242 7.631 8.068 8.56 9.071 9.637 10.231 10.91 11.681 12.606 13.597 14.713 16.018 17.511 18.561 19.004 19.145 19.139 19.028 18.843 18.624 18.396 18.137 17.88 17.667 17.476 17.277 17.065 16.879 16.679 16.492 16.362 16.216 16.046 15.883 15.706 15.531 15.395 15.256 15.093 14.896 14.692 14.565 14.441 14.229 14.062 13.877 13.792 13.629 13.446 13.244 13.135 12.931 12.818 12.687 12.536 12.232 12.08 11.915 11.741 11.545 11.288 10.936 10.313 -5 ,23775 ,TETRA ,17556273,Fri Nov 26 06:28:05 CET,Fri Nov 26 08:28:31 CET,0.0 0.239 0.394 0.545 0.692 0.816 0.931 1.052 1.278 1.383 1.494 1.585 1.793 1.886 2.077 2.27 2.434 2.509 2.671 2.825 3.025 3.152 3.28 3.47 3.664 3.857 4.042 4.225 4.454 4.663 4.878 5.151 5.403 5.658 5.959 6.291 6.61 6.97 7.368 7.794 8.257 8.793 9.417 10.057 10.817 11.626 12.528 13.557 14.79 16.263 17.961 19.078 19.66 19.981 20.038 19.866 19.555 19.199 18.904 18.659 18.435 18.205 17.988 17.775 17.555 17.362 17.171 16.992 16.82 16.635 16.448 16.291 16.13 15.965 15.827 15.672 15.513 15.346 15.154 15.024 14.891 14.677 14.526 14.38 14.306 14.136 13.954 13.769 13.679 13.48 13.367 13.251 13.141 12.876 12.73 12.582 12.41 12.205 11.949 11.595 10.653 -6 ,22319 ,TETRA ,17556274,Fri Nov 26 06:27:04 CET,Fri Nov 26 08:23:54 CET,0.0 0.642 0.885 1.071 1.205 1.322 1.446 1.556 1.762 1.863 1.956 2.016 2.211 2.296 2.446 2.588 2.744 2.821 2.951 3.085 3.303 3.434 3.549 3.71 3.871 4.036 4.208 4.384 4.605 4.812 5.013 5.248 5.492 5.738 6.034 6.36 6.651 6.978 7.333 7.718 8.124 8.553 9.049 9.58 10.213 10.918 11.725 12.654 13.723 14.861 16.122 17.095 17.492 17.545 17.498 17.337 17.036 16.7 16.389 16.099 15.858 15.608 15.369 15.154 14.938 14.752 14.567 14.361 14.161 13.967 13.764 13.564 13.36 13.181 13.041 12.887 12.724 12.556 12.383 12.26 12.125 11.898 11.745 11.596 11.518 11.361 11.203 11.017 10.915 10.713 10.586 10.463 10.342 10.076 9.92 9.74 9.514 9.258 8.971 8.564 7.631 -7 ,26370 ,TETRA ,17556275,Fri Nov 26 06:27:05 CET,Fri Nov 26 08:38:58 CET,0.0 0.315 0.527 0.675 0.817 0.938 1.06 1.177 1.37 1.466 1.56 1.612 1.811 1.9 2.072 2.224 2.364 2.435 2.574 2.699 2.883 3.013 3.136 3.309 3.493 3.68 3.856 4.033 4.264 4.467 4.654 4.895 5.112 5.315 5.566 5.87 6.161 6.493 6.881 7.276 7.713 8.227 8.813 9.383 10.038 10.792 11.758 12.891 14.033 15.25 16.597 17.585 18.004 18.01 17.927 17.913 17.878 17.715 17.481 17.212 16.979 16.777 16.567 16.344 16.117 15.905 15.677 15.476 15.315 15.143 14.959 14.794 14.624 14.443 14.294 14.148 13.998 13.839 13.667 13.55 13.439 13.239 13.074 12.905 12.823 12.654 12.481 12.271 12.154 11.928 11.77 11.641 11.512 11.218 11.067 10.891 10.683 10.487 10.228 9.888 9.117 -8 ,501 ,TETRA ,17556276,Fri Nov 26 06:27:05 CET,Fri Nov 26 08:42:35 CET,0.0 0.454 0.66 0.848 0.998 1.14 1.285 1.42 1.687 1.808 1.903 1.967 2.173 2.27 2.457 2.616 2.774 2.853 3.007 3.154 3.371 3.512 3.647 3.843 4.035 4.224 4.395 4.554 4.776 5.006 5.248 5.55 5.817 6.076 6.377 6.701 7.02 7.354 7.717 8.105 8.488 8.932 9.522 10.162 10.876 11.605 12.42 13.386 14.482 15.631 16.87 17.574 17.785 17.922 17.98 17.887 17.665 17.403 17.154 16.883 16.637 16.409 16.191 15.994 15.804 15.63 15.461 15.3 15.159 14.995 14.796 14.634 14.465 14.289 14.145 13.984 13.819 13.637 13.444 13.324 13.207 12.999 12.831 12.66 12.571 12.377 12.169 11.944 11.825 11.601 11.459 11.329 11.203 10.912 10.74 10.54 10.314 10.052 9.754 9.387 8.274 -9 ,22876 ,TETRA ,17556277,Fri Nov 26 06:27:05 CET,Fri Nov 26 08:39:55 CET,0.0 0.351 0.54 0.684 0.834 0.959 1.066 1.199 1.45 1.545 1.629 1.686 1.875 1.951 2.104 2.253 2.405 2.476 2.636 2.798 3.012 3.143 3.271 3.464 3.647 3.822 3.997 4.168 4.383 4.584 4.782 5.019 5.255 5.492 5.774 6.095 6.396 6.734 7.093 7.484 7.912 8.409 8.997 9.589 10.286 11.027 11.877 12.822 13.908 15.304 16.924 18.067 18.666 18.94 18.931 18.78 18.685 18.63 18.512 18.328 18.148 17.97 17.799 17.659 17.511 17.318 17.074 16.847 16.666 16.481 16.268 16.106 15.956 15.8 15.67 15.524 15.372 15.212 15.048 14.932 14.803 14.619 14.503 14.382 14.315 14.168 14.018 13.854 13.753 13.549 13.44 13.325 13.201 12.921 12.773 12.619 12.436 12.219 11.952 11.633 10.86 -10 ,159 ,TETRA ,17556278,Fri Nov 26 06:28:05 CET,Fri Nov 26 08:46:12 CET,0.0 0.334 0.564 0.724 0.83 0.954 1.072 1.164 1.366 1.473 1.575 1.674 1.88 1.949 2.093 2.254 2.411 2.481 2.622 2.758 2.96 3.091 3.207 3.369 3.531 3.692 3.865 4.039 4.24 4.435 4.639 4.886 5.127 5.364 5.631 5.945 6.258 6.608 6.983 7.391 7.814 8.272 8.819 9.385 10.028 10.741 11.554 12.486 13.547 14.617 15.719 16.476 16.703 16.782 16.869 16.817 16.689 16.539 16.352 16.171 15.997 15.798 15.585 15.374 15.171 14.949 14.709 14.496 14.31 14.137 13.952 13.777 13.594 13.4 13.242 13.078 12.93 12.797 12.64 12.517 12.404 12.235 12.102 11.956 11.877 11.715 11.554 11.377 11.289 11.102 11.01 10.904 10.789 10.502 10.346 10.182 9.985 9.753 9.462 9.052 7.937 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_30_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_30_37.txt deleted file mode 100644 index f892219b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_30_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12656 ,TETRA ,17556279,Fri Nov 26 06:28:06 CET,Fri Nov 26 08:45:43 CET,0.0 0.437 0.665 0.845 1.028 1.185 1.313 1.433 1.656 1.767 1.872 1.947 2.156 2.245 2.421 2.582 2.725 2.792 2.939 3.086 3.29 3.421 3.54 3.712 3.893 4.071 4.238 4.392 4.579 4.757 4.934 5.159 5.371 5.587 5.835 6.097 6.341 6.61 6.909 7.238 7.584 7.939 8.374 8.818 9.302 9.825 10.426 11.074 11.667 12.226 12.738 12.789 12.582 12.318 12.025 11.708 11.428 11.172 10.941 10.72 10.534 10.343 10.124 9.922 9.742 9.57 9.38 9.209 9.052 8.882 8.718 8.577 8.428 8.271 8.144 8.013 7.882 7.748 7.604 7.506 7.4 7.217 7.094 6.973 6.91 6.777 6.642 6.497 6.42 6.217 6.123 6.034 5.942 5.737 5.608 5.469 5.313 5.147 4.958 4.678 3.997 -2 ,26455 ,TETRA ,17556280,Fri Nov 26 06:28:05 CET,Fri Nov 26 08:44:02 CET,0.0 0.604 0.91 1.131 1.32 1.497 1.649 1.766 1.975 2.091 2.211 2.313 2.515 2.598 2.775 2.929 3.064 3.135 3.277 3.409 3.6 3.732 3.852 4.018 4.18 4.332 4.478 4.617 4.815 5.003 5.166 5.365 5.553 5.73 5.941 6.186 6.414 6.645 6.889 7.156 7.454 7.789 8.182 8.556 8.959 9.42 9.948 10.514 11.131 11.834 12.554 12.844 12.803 12.585 12.275 11.982 11.706 11.42 11.136 10.81 10.517 10.284 10.077 9.854 9.653 9.477 9.284 9.109 8.965 8.816 8.644 8.491 8.33 8.169 8.036 7.896 7.755 7.608 7.463 7.358 7.244 7.077 6.964 6.848 6.785 6.64 6.486 6.33 6.248 6.06 5.985 5.885 5.779 5.527 5.389 5.256 5.091 4.895 4.662 4.346 3.808 -3 ,3500 ,TETRA ,17556281,Fri Nov 26 06:28:05 CET,Fri Nov 26 08:44:39 CET,0.0 0.613 0.903 1.139 1.329 1.493 1.641 1.775 2.043 2.173 2.282 2.354 2.56 2.66 2.829 2.978 3.126 3.2 3.344 3.483 3.695 3.833 3.975 4.175 4.347 4.514 4.675 4.821 5.01 5.194 5.369 5.594 5.828 6.048 6.28 6.525 6.763 7.03 7.317 7.631 7.983 8.395 8.854 9.297 9.8 10.354 10.962 11.621 12.285 12.905 13.471 13.719 13.74 13.544 13.264 12.989 12.696 12.406 12.154 11.897 11.685 11.486 11.279 11.087 10.914 10.753 10.588 10.441 10.298 10.135 9.951 9.789 9.633 9.488 9.379 9.273 9.151 9.009 8.856 8.751 8.643 8.473 8.346 8.214 8.145 8.003 7.87 7.722 7.644 7.458 7.381 7.288 7.194 6.986 6.865 6.734 6.595 6.417 6.214 5.941 5.267 -4 ,20823 ,TETRA ,17556282,Fri Nov 26 06:28:05 CET,Fri Nov 26 08:39:37 CET,0.0 0.6 0.863 1.069 1.236 1.382 1.522 1.639 1.843 1.947 2.053 2.14 2.342 2.432 2.6 2.763 2.917 2.986 3.114 3.246 3.438 3.563 3.695 3.875 4.043 4.204 4.349 4.49 4.683 4.868 5.034 5.231 5.434 5.627 5.837 6.069 6.314 6.594 6.884 7.191 7.527 7.901 8.337 8.797 9.319 9.867 10.5 11.201 11.914 12.605 13.263 13.479 13.349 13.148 12.879 12.549 12.284 12.039 11.8 11.571 11.374 11.188 10.996 10.807 10.623 10.437 10.241 10.068 9.912 9.743 9.571 9.442 9.308 9.159 9.032 8.895 8.753 8.6 8.446 8.353 8.256 8.079 7.95 7.802 7.726 7.579 7.431 7.285 7.201 6.994 6.896 6.79 6.664 6.404 6.273 6.135 5.986 5.82 5.608 5.344 4.74 -5 ,5648 ,TETRA ,17556283,Fri Nov 26 06:28:05 CET,Fri Nov 26 08:37:29 CET,0.0 0.578 0.857 1.074 1.257 1.426 1.569 1.71 1.967 2.071 2.178 2.269 2.477 2.564 2.731 2.91 3.083 3.16 3.296 3.438 3.664 3.807 3.935 4.111 4.277 4.439 4.608 4.781 4.982 5.153 5.323 5.537 5.752 5.965 6.202 6.46 6.709 6.96 7.213 7.488 7.784 8.137 8.558 8.985 9.462 9.923 10.386 10.903 11.469 12.038 12.471 12.518 12.362 12.097 11.827 11.526 11.231 10.961 10.733 10.487 10.251 10.038 9.818 9.585 9.355 9.161 8.964 8.784 8.632 8.465 8.267 8.103 7.96 7.819 7.704 7.575 7.445 7.312 7.165 7.06 6.947 6.778 6.647 6.516 6.451 6.291 6.127 5.971 5.891 5.702 5.624 5.53 5.434 5.222 5.097 4.954 4.803 4.642 4.464 4.272 3.896 -6 ,28536 ,TETRA ,17556284,Fri Nov 26 06:28:05 CET,Fri Nov 26 08:44:57 CET,0.0 0.706 0.948 1.145 1.333 1.496 1.624 1.736 1.961 2.076 2.203 2.322 2.533 2.632 2.804 2.977 3.14 3.213 3.351 3.494 3.695 3.81 3.921 4.09 4.256 4.404 4.542 4.682 4.864 5.037 5.213 5.422 5.617 5.811 6.045 6.285 6.492 6.726 6.974 7.258 7.579 7.938 8.354 8.75 9.216 9.721 10.229 10.771 11.336 11.9 12.341 12.362 12.174 11.955 11.724 11.489 11.245 10.972 10.732 10.487 10.247 10.016 9.78 9.546 9.306 9.095 8.896 8.707 8.538 8.364 8.181 8.035 7.901 7.758 7.635 7.514 7.391 7.253 7.099 6.988 6.881 6.716 6.601 6.481 6.418 6.28 6.124 5.95 5.86 5.66 5.58 5.488 5.383 5.148 5.02 4.877 4.729 4.568 4.373 4.133 3.601 -7 ,4965 ,TETRA ,17556285,Fri Nov 26 06:28:05 CET,Fri Nov 26 08:38:39 CET,0.0 0.644 0.924 1.146 1.336 1.491 1.64 1.791 2.048 2.166 2.276 2.361 2.574 2.677 2.856 3.02 3.186 3.268 3.432 3.582 3.784 3.91 4.035 4.22 4.397 4.567 4.734 4.892 5.085 5.28 5.468 5.683 5.893 6.097 6.328 6.581 6.839 7.118 7.405 7.743 8.1 8.464 8.878 9.292 9.783 10.332 10.891 11.473 12.131 12.744 13.141 13.193 13.111 12.926 12.671 12.401 12.15 11.923 11.679 11.406 11.17 10.939 10.697 10.46 10.249 10.047 9.842 9.677 9.537 9.392 9.216 9.056 8.898 8.752 8.649 8.54 8.423 8.288 8.144 8.041 7.938 7.785 7.676 7.55 7.485 7.358 7.209 7.032 6.938 6.751 6.698 6.606 6.508 6.308 6.195 6.057 5.899 5.755 5.587 5.358 5.014 -8 ,28354 ,TETRA ,17556286,Fri Nov 26 06:28:05 CET,Fri Nov 26 08:40:37 CET,0.0 0.58 0.813 1.015 1.206 1.385 1.525 1.652 1.868 1.958 2.048 2.13 2.337 2.419 2.575 2.725 2.858 2.921 3.047 3.174 3.373 3.497 3.612 3.778 3.944 4.1 4.254 4.397 4.551 4.706 4.877 5.094 5.308 5.51 5.756 6.029 6.261 6.512 6.783 7.059 7.334 7.64 7.983 8.323 8.724 9.187 9.734 10.278 10.804 11.313 11.686 11.739 11.621 11.408 11.128 10.836 10.552 10.28 10.05 9.798 9.566 9.377 9.192 8.99 8.785 8.598 8.399 8.216 8.06 7.903 7.733 7.591 7.443 7.296 7.178 7.053 6.922 6.779 6.627 6.518 6.411 6.256 6.157 6.053 5.995 5.863 5.726 5.584 5.51 5.33 5.289 5.205 5.11 4.903 4.78 4.644 4.5 4.334 4.13 3.828 2.933 -9 ,22088 ,TETRA ,17556287,Fri Nov 26 06:29:05 CET,Fri Nov 26 08:22:40 CET,0.0 0.63 0.908 1.132 1.319 1.479 1.626 1.777 2.02 2.128 2.239 2.331 2.539 2.623 2.791 2.965 3.128 3.208 3.359 3.499 3.701 3.82 3.94 4.117 4.277 4.444 4.623 4.794 4.999 5.188 5.373 5.589 5.787 5.999 6.262 6.513 6.726 6.97 7.233 7.526 7.839 8.159 8.534 8.904 9.308 9.752 10.243 10.718 11.186 11.664 12.031 11.988 11.797 11.559 11.244 10.907 10.574 10.282 10.029 9.734 9.486 9.28 9.061 8.853 8.669 8.487 8.28 8.094 7.933 7.758 7.568 7.405 7.256 7.104 6.977 6.847 6.699 6.549 6.396 6.284 6.174 5.991 5.85 5.721 5.66 5.531 5.388 5.223 5.138 4.946 4.851 4.748 4.657 4.467 4.35 4.206 4.045 3.857 3.66 3.445 3.029 -10 ,28124 ,TETRA ,17556288,Fri Nov 26 06:29:05 CET,Fri Nov 26 08:45:30 CET,0.0 0.738 1.015 1.227 1.434 1.639 1.812 1.957 2.228 2.356 2.479 2.571 2.781 2.875 3.031 3.159 3.295 3.372 3.515 3.642 3.833 3.969 4.101 4.274 4.433 4.591 4.749 4.907 5.102 5.269 5.431 5.632 5.828 6.004 6.204 6.44 6.675 6.952 7.259 7.57 7.864 8.202 8.613 9.016 9.467 9.901 10.45 11.139 11.861 12.639 13.397 13.777 13.82 13.714 13.55 13.31 13.045 12.777 12.524 12.265 12.046 11.849 11.633 11.42 11.229 11.051 10.87 10.698 10.534 10.371 10.206 10.061 9.912 9.761 9.634 9.505 9.376 9.246 9.097 8.985 8.875 8.713 8.6 8.472 8.403 8.256 8.09 7.904 7.817 7.628 7.555 7.461 7.352 7.123 6.991 6.826 6.659 6.499 6.292 6.017 5.413 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_30_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_30_42.txt deleted file mode 100644 index f23457e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_30_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3611 ,TETRA ,17556289,Fri Nov 26 06:29:05 CET,Fri Nov 26 08:44:45 CET,0.0 0.604 0.936 1.197 1.423 1.64 1.83 1.983 2.267 2.402 2.517 2.635 2.866 2.977 3.206 3.415 3.598 3.69 3.869 4.05 4.325 4.489 4.642 4.881 5.116 5.318 5.499 5.679 5.913 6.158 6.407 6.684 6.932 7.173 7.451 7.779 8.126 8.509 8.887 9.274 9.68 10.148 10.72 11.302 11.97 12.682 13.524 14.466 15.48 16.616 17.997 18.869 19.174 19.284 19.197 19.015 18.85 18.67 18.437 18.158 17.92 17.68 17.453 17.238 16.997 16.784 16.562 16.331 16.125 15.947 15.751 15.545 15.347 15.17 15.021 14.869 14.711 14.525 14.332 14.188 14.042 13.826 13.656 13.472 13.388 13.236 13.033 12.799 12.676 12.435 12.27 12.134 11.984 11.65 11.476 11.277 11.038 10.747 10.402 9.9 8.117 -2 ,15614 ,TETRA ,17556290,Fri Nov 26 06:29:05 CET,Fri Nov 26 08:31:19 CET,0.0 0.702 1.019 1.251 1.404 1.556 1.721 1.88 2.136 2.269 2.412 2.551 2.769 2.868 3.062 3.26 3.469 3.566 3.746 3.925 4.196 4.376 4.542 4.783 5.022 5.23 5.423 5.628 5.889 6.143 6.397 6.681 6.942 7.189 7.484 7.814 8.12 8.478 8.864 9.249 9.682 10.161 10.706 11.262 11.882 12.585 13.411 14.3 15.322 16.466 17.743 18.605 19.003 19.163 19.133 19.04 18.886 18.713 18.538 18.341 18.131 17.887 17.665 17.475 17.294 17.094 16.855 16.624 16.403 16.167 15.927 15.751 15.573 15.387 15.23 15.048 14.869 14.669 14.459 14.323 14.172 13.933 13.772 13.603 13.51 13.308 13.082 12.845 12.731 12.518 12.348 12.18 12.0 11.602 11.376 11.152 10.923 10.651 10.34 9.959 8.771 -3 ,9695 ,TETRA ,17556291,Fri Nov 26 06:29:05 CET,Fri Nov 26 08:44:06 CET,0.0 0.627 0.938 1.231 1.46 1.668 1.881 2.063 2.341 2.472 2.603 2.708 2.921 3.022 3.217 3.393 3.562 3.645 3.801 3.956 4.177 4.324 4.472 4.682 4.893 5.094 5.283 5.487 5.762 6.005 6.221 6.487 6.757 7.034 7.366 7.728 8.057 8.411 8.785 9.178 9.611 10.105 10.666 11.23 11.921 12.697 13.531 14.417 15.397 16.424 17.655 18.535 18.844 18.931 18.881 18.706 18.5 18.297 18.06 17.756 17.458 17.212 17.007 16.786 16.573 16.381 16.151 15.951 15.783 15.587 15.364 15.187 15.016 14.835 14.669 14.475 14.27 14.051 13.841 13.692 13.534 13.284 13.08 12.868 12.762 12.516 12.262 12.022 11.906 11.676 11.504 11.357 11.2 10.877 10.685 10.481 10.251 9.965 9.614 9.112 7.008 -4 ,30419 ,TETRA ,17556292,Fri Nov 26 06:29:05 CET,Fri Nov 26 08:45:43 CET,0.0 0.847 1.181 1.459 1.711 1.932 2.132 2.31 2.639 2.786 2.925 3.073 3.302 3.41 3.613 3.808 3.996 4.087 4.266 4.464 4.742 4.902 5.063 5.318 5.573 5.792 5.994 6.201 6.466 6.712 6.937 7.201 7.48 7.75 8.036 8.366 8.694 9.054 9.444 9.876 10.324 10.8 11.354 11.932 12.622 13.375 14.174 15.036 16.017 17.125 18.294 19.012 19.185 19.17 19.143 19.067 18.959 18.806 18.624 18.437 18.268 18.029 17.755 17.556 17.356 17.119 16.868 16.666 16.488 16.288 16.055 15.864 15.684 15.472 15.284 15.107 14.947 14.769 14.556 14.396 14.242 14.007 13.843 13.67 13.577 13.392 13.184 12.946 12.819 12.594 12.462 12.332 12.17 11.794 11.568 11.325 11.067 10.817 10.517 10.043 7.813 -5 ,5698 ,TETRA ,17556293,Fri Nov 26 06:30:04 CET,Fri Nov 26 08:45:25 CET,0.0 1.115 1.441 1.68 1.881 2.077 2.301 2.501 2.825 2.979 3.128 3.297 3.53 3.634 3.844 4.052 4.234 4.325 4.498 4.661 4.919 5.089 5.25 5.465 5.667 5.877 6.069 6.252 6.5 6.73 6.96 7.253 7.528 7.779 8.083 8.428 8.749 9.107 9.488 9.888 10.314 10.786 11.334 11.876 12.468 13.145 13.959 14.887 15.981 17.217 18.661 19.748 20.169 20.088 19.852 19.649 19.41 19.172 18.965 18.685 18.402 18.158 17.912 17.679 17.478 17.283 17.071 16.858 16.651 16.43 16.168 15.948 15.739 15.511 15.347 15.187 15.013 14.842 14.66 14.528 14.381 14.148 14.0 13.828 13.728 13.531 13.345 13.144 13.025 12.784 12.587 12.424 12.265 11.894 11.646 11.403 11.172 10.909 10.568 9.981 7.731 -6 ,5910 ,TETRA ,17556294,Fri Nov 26 06:30:04 CET,Fri Nov 26 08:45:58 CET,0.0 1.048 1.36 1.608 1.825 2.013 2.181 2.32 2.579 2.689 2.794 2.895 3.113 3.219 3.428 3.62 3.794 3.88 4.049 4.223 4.484 4.655 4.819 5.045 5.261 5.465 5.66 5.85 6.095 6.334 6.567 6.839 7.111 7.394 7.717 8.059 8.378 8.745 9.18 9.645 10.094 10.576 11.141 11.706 12.407 13.235 14.166 15.163 16.288 17.51 18.662 19.369 19.683 19.701 19.621 19.509 19.301 19.028 18.776 18.519 18.276 18.003 17.734 17.491 17.278 17.092 16.854 16.614 16.406 16.215 15.994 15.779 15.562 15.334 15.157 14.961 14.751 14.545 14.316 14.171 14.032 13.812 13.656 13.494 13.414 13.233 13.037 12.84 12.727 12.504 12.351 12.198 12.039 11.683 11.482 11.26 10.984 10.656 10.277 9.757 7.412 -7 ,12323 ,TETRA ,17556295,Fri Nov 26 06:30:04 CET,Fri Nov 26 08:45:24 CET,0.0 0.96 1.258 1.463 1.629 1.794 1.954 2.107 2.381 2.502 2.624 2.75 2.974 3.077 3.259 3.431 3.611 3.705 3.885 4.048 4.265 4.41 4.556 4.763 4.974 5.208 5.445 5.652 5.895 6.135 6.368 6.642 6.929 7.209 7.529 7.888 8.228 8.598 8.966 9.354 9.768 10.248 10.802 11.357 12.033 12.747 13.545 14.476 15.57 16.784 18.145 19.14 19.465 19.455 19.275 19.031 18.819 18.631 18.461 18.187 17.896 17.666 17.43 17.195 16.96 16.706 16.464 16.283 16.117 15.92 15.696 15.517 15.35 15.176 15.015 14.836 14.647 14.447 14.234 14.08 13.935 13.709 13.522 13.312 13.206 12.999 12.792 12.578 12.471 12.266 12.124 11.999 11.874 11.594 11.441 11.249 11.014 10.751 10.421 9.883 7.518 -8 ,18120 ,TETRA ,17556296,Fri Nov 26 06:30:04 CET,Fri Nov 26 08:45:43 CET,0.0 0.737 1.06 1.292 1.486 1.675 1.84 1.987 2.254 2.383 2.504 2.612 2.828 2.929 3.122 3.301 3.477 3.562 3.724 3.891 4.128 4.274 4.417 4.636 4.86 5.085 5.302 5.507 5.779 6.062 6.328 6.624 6.909 7.183 7.514 7.878 8.202 8.55 8.932 9.356 9.798 10.328 10.956 11.561 12.228 12.923 13.745 14.667 15.686 16.829 17.974 18.729 19.123 19.23 19.174 19.01 18.815 18.61 18.37 18.087 17.83 17.596 17.362 17.133 16.901 16.7 16.478 16.265 16.096 15.932 15.744 15.558 15.355 15.159 15.006 14.832 14.659 14.486 14.315 14.2 14.064 13.836 13.675 13.473 13.363 13.174 12.961 12.666 12.495 12.24 12.105 12.005 11.9 11.629 11.453 11.238 10.952 10.645 10.229 9.704 7.693 -9 ,5488 ,TETRA ,17556297,Fri Nov 26 06:30:04 CET,Fri Nov 26 08:46:21 CET,0.0 0.677 0.986 1.221 1.424 1.614 1.789 1.948 2.226 2.35 2.476 2.603 2.833 2.952 3.16 3.352 3.56 3.663 3.846 4.018 4.264 4.426 4.587 4.832 5.071 5.295 5.515 5.719 5.951 6.173 6.4 6.676 6.94 7.216 7.552 7.916 8.251 8.612 9.01 9.445 9.917 10.425 10.976 11.521 12.168 12.858 13.652 14.545 15.556 16.779 18.166 19.112 19.516 19.596 19.51 19.334 19.141 18.972 18.801 18.604 18.409 18.197 18.002 17.826 17.621 17.413 17.208 17.016 16.863 16.685 16.494 16.341 16.162 15.985 15.855 15.705 15.532 15.362 15.171 15.038 14.91 14.677 14.513 14.347 14.256 14.065 13.867 13.654 13.53 13.297 13.126 12.974 12.813 12.492 12.3 12.049 11.759 11.44 11.034 10.401 7.903 -10 ,30740 ,TETRA ,17556298,Fri Nov 26 06:31:40 CET,Fri Nov 26 08:46:14 CET,0.0 0.804 1.132 1.336 1.525 1.707 1.866 2.023 2.305 2.435 2.558 2.666 2.887 2.991 3.182 3.369 3.552 3.636 3.792 3.954 4.19 4.331 4.484 4.713 4.904 5.102 5.303 5.48 5.71 5.948 6.181 6.464 6.74 7.009 7.324 7.677 8.007 8.36 8.724 9.139 9.614 10.111 10.643 11.197 11.845 12.548 13.32 14.213 15.262 16.393 17.61 18.446 18.771 18.787 18.682 18.546 18.359 18.13 17.923 17.692 17.493 17.27 17.01 16.78 16.565 16.355 16.109 15.876 15.682 15.488 15.284 15.117 14.934 14.732 14.581 14.421 14.246 14.068 13.888 13.76 13.627 13.418 13.284 13.145 13.069 12.89 12.699 12.503 12.393 12.157 11.94 11.764 11.572 11.156 10.951 10.727 10.478 10.24 9.933 9.377 7.13 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_31_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_31_35.txt deleted file mode 100644 index 0711c1ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_31_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26808 ,TETRA ,17556299,Fri Nov 26 06:31:37 CET,Fri Nov 26 08:48:10 CET,0.0 0.306 0.503 0.667 0.834 0.977 1.099 1.221 1.456 1.562 1.668 1.76 1.971 2.058 2.23 2.41 2.576 2.659 2.824 2.971 3.181 3.316 3.437 3.619 3.811 3.994 4.173 4.361 4.602 4.834 5.071 5.344 5.602 5.857 6.147 6.466 6.785 7.148 7.537 7.964 8.443 8.977 9.587 10.204 10.957 11.754 12.657 13.763 14.994 16.302 17.587 18.376 18.709 18.687 18.482 18.232 17.948 17.659 17.411 17.082 16.737 16.447 16.196 15.965 15.741 15.53 15.297 15.079 14.895 14.697 14.46 14.265 14.055 13.818 13.647 13.49 13.339 13.156 12.927 12.768 12.622 12.392 12.226 12.066 11.98 11.789 11.594 11.397 11.293 11.083 10.965 10.844 10.717 10.452 10.31 10.138 9.916 9.663 9.399 9.019 8.321 -2 ,18245 ,TETRA ,17556300,Fri Nov 26 06:31:37 CET,Fri Nov 26 08:46:51 CET,0.0 0.395 0.588 0.767 0.924 1.086 1.227 1.349 1.576 1.685 1.783 1.832 2.046 2.147 2.337 2.509 2.68 2.77 2.928 3.076 3.297 3.434 3.556 3.742 3.935 4.119 4.297 4.479 4.717 4.939 5.135 5.369 5.615 5.852 6.13 6.479 6.802 7.145 7.552 7.969 8.385 8.872 9.454 10.064 10.832 11.668 12.519 13.478 14.538 15.621 16.868 17.752 18.099 17.987 17.599 17.165 16.794 16.478 16.164 15.832 15.551 15.274 15.024 14.807 14.597 14.387 14.167 13.976 13.811 13.624 13.423 13.249 13.05 12.837 12.67 12.499 12.322 12.127 11.926 11.802 11.674 11.477 11.342 11.199 11.119 10.937 10.754 10.57 10.471 10.261 10.141 10.021 9.899 9.656 9.51 9.355 9.188 9.004 8.752 8.419 7.486 -3 ,16287 ,TETRA ,17556301,Fri Nov 26 06:31:37 CET,Fri Nov 26 08:47:10 CET,0.0 0.435 0.682 0.861 1.014 1.154 1.294 1.419 1.606 1.693 1.785 1.852 2.057 2.145 2.319 2.491 2.659 2.736 2.882 3.019 3.229 3.372 3.508 3.709 3.909 4.105 4.279 4.444 4.673 4.892 5.114 5.387 5.644 5.906 6.209 6.542 6.873 7.227 7.604 8.028 8.471 8.975 9.59 10.219 10.977 11.874 12.897 13.962 15.191 16.632 18.16 19.13 19.674 19.973 20.042 20.014 19.882 19.679 19.427 19.161 18.93 18.673 18.43 18.222 18.015 17.831 17.625 17.406 17.231 17.052 16.842 16.664 16.5 16.335 16.186 16.023 15.849 15.663 15.478 15.351 15.223 15.032 14.9 14.751 14.673 14.528 14.361 14.174 14.086 13.904 13.798 13.679 13.554 13.282 13.152 13.007 12.827 12.606 12.316 11.989 11.111 -4 ,17391 ,TETRA ,17556302,Fri Nov 26 06:31:37 CET,Fri Nov 26 08:44:41 CET,0.0 0.434 0.67 0.841 1.002 1.146 1.272 1.387 1.579 1.668 1.755 1.821 2.031 2.116 2.277 2.432 2.597 2.675 2.82 2.964 3.185 3.33 3.481 3.704 3.904 4.09 4.26 4.43 4.667 4.906 5.144 5.451 5.737 6.004 6.31 6.648 6.991 7.366 7.779 8.237 8.707 9.202 9.795 10.437 11.175 12.012 12.982 14.064 15.32 16.783 18.582 19.884 20.551 20.892 21.0 21.038 20.984 20.851 20.639 20.334 20.065 19.802 19.529 19.27 19.017 18.795 18.577 18.374 18.203 18.026 17.805 17.617 17.442 17.27 17.151 17.019 16.844 16.65 16.465 16.349 16.224 16.026 15.883 15.727 15.65 15.479 15.298 15.116 15.013 14.798 14.676 14.559 14.432 14.12 13.941 13.748 13.53 13.29 13.019 12.602 11.428 -5 ,15630 ,TETRA ,17556303,Fri Nov 26 06:31:37 CET,Fri Nov 26 08:44:30 CET,0.0 0.553 0.781 0.986 1.158 1.295 1.425 1.546 1.765 1.869 1.963 2.024 2.237 2.326 2.488 2.669 2.847 2.922 3.061 3.205 3.419 3.554 3.696 3.916 4.123 4.309 4.485 4.665 4.906 5.137 5.364 5.631 5.876 6.119 6.404 6.733 7.054 7.391 7.776 8.241 8.74 9.291 9.916 10.533 11.244 12.087 13.097 14.184 15.492 17.055 19.006 20.255 20.409 20.272 20.096 19.91 19.665 19.426 19.225 18.96 18.681 18.426 18.201 17.984 17.78 17.594 17.389 17.195 17.011 16.804 16.598 16.432 16.239 16.026 15.862 15.7 15.539 15.376 15.218 15.115 14.989 14.757 14.615 14.462 14.372 14.194 14.0 13.79 13.688 13.475 13.342 13.214 13.082 12.791 12.632 12.466 12.286 12.086 11.86 11.531 10.724 -6 ,10009 ,TETRA ,17556304,Fri Nov 26 06:32:37 CET,Fri Nov 26 08:50:20 CET,0.0 0.375 0.542 0.704 0.856 0.974 1.067 1.177 1.413 1.514 1.61 1.689 1.901 1.99 2.166 2.357 2.538 2.619 2.776 2.938 3.165 3.303 3.443 3.651 3.86 4.061 4.24 4.428 4.681 4.906 5.132 5.408 5.67 5.943 6.261 6.619 6.984 7.377 7.77 8.176 8.64 9.187 9.798 10.412 11.08 11.826 12.712 13.665 14.835 16.3 17.827 18.543 18.68 18.5 18.229 18.094 17.907 17.586 17.257 16.95 16.705 16.484 16.275 16.063 15.837 15.622 15.402 15.208 15.041 14.873 14.694 14.529 14.341 14.134 13.982 13.83 13.651 13.462 13.258 13.1 12.947 12.721 12.564 12.406 12.323 12.143 11.945 11.721 11.61 11.405 11.242 11.094 10.952 10.663 10.505 10.295 10.054 9.811 9.552 9.166 8.014 -7 ,5635 ,TETRA ,17556305,Fri Nov 26 06:31:37 CET,Fri Nov 26 08:33:45 CET,0.0 0.418 0.596 0.747 0.895 1.015 1.143 1.288 1.544 1.653 1.763 1.86 2.079 2.182 2.385 2.578 2.77 2.864 3.048 3.218 3.463 3.629 3.781 3.973 4.167 4.367 4.555 4.743 4.995 5.235 5.467 5.754 6.036 6.291 6.598 6.963 7.299 7.669 8.082 8.526 8.998 9.518 10.127 10.738 11.442 12.233 13.18 14.232 15.29 16.317 17.39 17.829 17.744 17.565 17.304 16.964 16.527 16.061 15.729 15.4 15.109 14.863 14.609 14.365 14.12 13.882 13.674 13.482 13.284 13.078 12.859 12.669 12.483 12.29 12.131 11.971 11.814 11.655 11.494 11.377 11.245 11.057 10.921 10.772 10.693 10.517 10.354 10.192 10.101 9.906 9.805 9.686 9.56 9.289 9.145 8.972 8.755 8.528 8.27 7.942 7.174 -8 ,16004 ,TETRA ,17556306,Fri Nov 26 06:31:37 CET,Fri Nov 26 08:47:29 CET,0.0 0.453 0.682 0.871 1.023 1.156 1.274 1.396 1.624 1.732 1.838 1.925 2.145 2.24 2.425 2.593 2.745 2.82 2.977 3.14 3.375 3.528 3.68 3.898 4.106 4.314 4.508 4.686 4.915 5.142 5.365 5.643 5.928 6.205 6.51 6.849 7.19 7.573 7.981 8.415 8.88 9.397 10.001 10.621 11.342 12.164 13.147 14.246 15.485 16.842 18.064 18.805 19.11 19.149 19.067 18.787 18.441 18.073 17.704 17.356 17.052 16.758 16.493 16.243 15.989 15.75 15.504 15.287 15.102 14.919 14.742 14.578 14.395 14.207 14.055 13.901 13.732 13.536 13.339 13.2 13.053 12.835 12.677 12.508 12.428 12.278 12.106 11.918 11.818 11.617 11.504 11.379 11.252 10.945 10.767 10.584 10.371 10.145 9.902 9.58 8.631 -9 ,2466 ,TETRA ,17556307,Fri Nov 26 06:31:37 CET,Fri Nov 26 08:47:58 CET,0.0 0.31 0.539 0.743 0.902 1.063 1.214 1.337 1.562 1.666 1.775 1.849 2.053 2.138 2.325 2.496 2.642 2.719 2.871 3.014 3.221 3.354 3.48 3.661 3.851 4.05 4.239 4.418 4.658 4.904 5.143 5.437 5.705 5.956 6.261 6.593 6.92 7.298 7.709 8.155 8.619 9.146 9.764 10.409 11.177 11.994 12.911 13.989 15.268 16.595 18.068 19.088 19.369 19.368 19.223 19.037 18.834 18.587 18.329 18.032 17.774 17.54 17.316 17.115 16.925 16.724 16.494 16.296 16.128 15.944 15.749 15.59 15.444 15.294 15.161 15.013 14.86 14.705 14.532 14.398 14.256 14.016 13.852 13.708 13.637 13.47 13.275 13.081 12.986 12.793 12.685 12.566 12.43 12.141 11.986 11.823 11.63 11.419 11.182 10.9 10.318 -10 ,9562 ,TETRA ,17556308,Fri Nov 26 06:31:40 CET,Fri Nov 26 08:38:46 CET,0.0 0.306 0.496 0.658 0.796 0.915 1.022 1.133 1.371 1.476 1.581 1.688 1.917 2.021 2.195 2.364 2.555 2.645 2.815 2.981 3.223 3.378 3.52 3.73 3.944 4.145 4.334 4.511 4.743 4.972 5.207 5.496 5.758 6.017 6.336 6.69 7.024 7.388 7.796 8.256 8.734 9.263 9.898 10.54 11.272 12.106 13.051 14.115 15.409 16.91 18.588 19.905 20.495 20.634 20.635 20.461 20.274 20.077 19.818 19.533 19.275 19.04 18.797 18.548 18.307 18.096 17.87 17.643 17.448 17.256 17.056 16.87 16.676 16.496 16.365 16.221 16.06 15.894 15.732 15.61 15.48 15.287 15.151 15.017 14.947 14.794 14.631 14.456 14.362 14.164 14.046 13.936 13.846 13.637 13.49 13.319 13.151 12.958 12.72 12.401 11.53 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_31_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_31_37.txt deleted file mode 100644 index 679d9e10..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_31_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2047 ,TETRA ,17556309,Fri Nov 26 06:32:37 CET,Fri Nov 26 08:48:51 CET,0.0 0.804 1.112 1.338 1.521 1.68 1.836 1.969 2.212 2.341 2.457 2.537 2.742 2.831 3.022 3.198 3.342 3.415 3.569 3.718 3.927 4.053 4.178 4.371 4.565 4.743 4.909 5.075 5.282 5.468 5.652 5.889 6.116 6.318 6.554 6.838 7.121 7.425 7.74 8.097 8.482 8.848 9.26 9.704 10.167 10.664 11.157 11.716 12.359 12.871 13.251 13.238 12.976 12.617 12.209 11.798 11.453 11.171 10.905 10.59 10.306 10.038 9.76 9.507 9.282 9.077 8.871 8.676 8.484 8.289 8.102 7.945 7.772 7.588 7.445 7.301 7.15 6.994 6.824 6.705 6.588 6.404 6.273 6.144 6.074 5.925 5.769 5.609 5.523 5.327 5.227 5.116 5.006 4.774 4.637 4.468 4.3 4.124 3.887 3.606 2.975 -2 ,31710 ,TETRA ,17556310,Fri Nov 26 06:32:37 CET,Fri Nov 26 08:49:38 CET,0.0 0.509 0.734 0.937 1.12 1.267 1.391 1.508 1.754 1.869 1.975 2.065 2.275 2.363 2.527 2.683 2.838 2.913 3.062 3.209 3.41 3.544 3.674 3.853 4.02 4.192 4.363 4.529 4.741 4.939 5.126 5.347 5.571 5.784 6.026 6.308 6.566 6.841 7.144 7.451 7.754 8.109 8.552 9.003 9.517 10.085 10.725 11.393 12.076 12.785 13.38 13.563 13.398 13.034 12.661 12.31 11.995 11.695 11.433 11.146 10.871 10.61 10.344 10.091 9.872 9.683 9.478 9.295 9.121 8.925 8.726 8.558 8.369 8.175 8.032 7.887 7.742 7.592 7.429 7.316 7.203 7.011 6.884 6.754 6.683 6.553 6.409 6.238 6.153 5.963 5.89 5.795 5.687 5.458 5.317 5.142 4.97 4.794 4.574 4.276 3.669 -3 ,22701 ,TETRA ,17556311,Fri Nov 26 06:32:37 CET,Fri Nov 26 08:49:31 CET,0.0 0.718 1.021 1.243 1.41 1.571 1.734 1.873 2.119 2.236 2.352 2.472 2.701 2.802 2.981 3.157 3.33 3.419 3.602 3.759 3.956 4.086 4.215 4.4 4.576 4.738 4.909 5.073 5.284 5.509 5.724 5.964 6.185 6.417 6.703 7.011 7.295 7.617 7.981 8.353 8.727 9.176 9.691 10.168 10.699 11.308 12.024 12.647 13.266 13.966 14.386 14.332 14.21 14.013 13.682 13.33 13.016 12.697 12.389 12.083 11.829 11.604 11.392 11.171 10.973 10.786 10.57 10.383 10.206 9.998 9.787 9.634 9.476 9.295 9.136 8.946 8.757 8.593 8.42 8.29 8.158 7.948 7.795 7.636 7.55 7.35 7.128 6.917 6.815 6.602 6.485 6.364 6.24 5.965 5.829 5.671 5.466 5.242 4.946 4.526 3.548 -4 ,20744 ,TETRA ,17556312,Fri Nov 26 06:32:37 CET,Fri Nov 26 08:45:58 CET,0.0 0.589 0.898 1.144 1.325 1.503 1.672 1.827 2.105 2.218 2.324 2.407 2.624 2.726 2.917 3.097 3.271 3.353 3.511 3.655 3.838 3.961 4.081 4.263 4.474 4.676 4.857 5.029 5.253 5.463 5.663 5.896 6.118 6.334 6.563 6.819 7.053 7.31 7.598 7.878 8.172 8.538 8.97 9.39 9.846 10.337 10.919 11.505 12.047 12.558 12.958 12.975 12.783 12.486 12.137 11.804 11.488 11.171 10.906 10.619 10.341 10.061 9.798 9.538 9.26 9.016 8.754 8.509 8.316 8.105 7.875 7.695 7.496 7.279 7.101 6.927 6.768 6.598 6.422 6.286 6.145 5.945 5.815 5.67 5.587 5.422 5.247 5.072 4.984 4.775 4.672 4.55 4.397 4.102 3.967 3.81 3.616 3.401 3.171 2.834 1.753 -5 ,27831 ,TETRA ,17556313,Fri Nov 26 06:32:37 CET,Fri Nov 26 08:49:25 CET,0.0 0.76 1.128 1.367 1.529 1.676 1.807 1.939 2.183 2.289 2.392 2.478 2.703 2.794 2.964 3.136 3.297 3.371 3.517 3.672 3.915 4.067 4.211 4.417 4.601 4.777 4.947 5.109 5.318 5.516 5.708 5.939 6.163 6.392 6.648 6.926 7.2 7.499 7.837 8.216 8.603 9.022 9.474 9.919 10.379 10.828 11.462 12.23 13.074 13.965 14.792 15.15 14.986 14.61 14.249 13.924 13.58 13.277 13.049 12.77 12.508 12.286 12.056 11.825 11.609 11.408 11.188 10.992 10.825 10.648 10.447 10.28 10.095 9.885 9.727 9.567 9.407 9.235 9.054 8.935 8.812 8.629 8.501 8.376 8.314 8.172 8.026 7.866 7.775 7.574 7.5 7.412 7.316 7.094 6.977 6.857 6.719 6.563 6.376 6.076 5.561 -6 ,22812 ,TETRA ,17556314,Fri Nov 26 06:32:37 CET,Fri Nov 26 08:48:48 CET,0.0 0.42 0.713 0.921 1.107 1.261 1.39 1.521 1.767 1.884 1.996 2.067 2.28 2.38 2.555 2.719 2.879 2.95 3.095 3.243 3.455 3.589 3.721 3.921 4.124 4.317 4.48 4.62 4.817 5.027 5.223 5.443 5.657 5.879 6.135 6.409 6.673 6.966 7.287 7.648 8.013 8.392 8.854 9.358 9.948 10.525 11.148 11.882 12.707 13.52 14.249 14.532 14.381 14.111 13.824 13.511 13.203 12.909 12.612 12.292 12.03 11.787 11.545 11.317 11.1 10.906 10.708 10.519 10.349 10.164 9.967 9.811 9.654 9.484 9.345 9.198 9.056 8.913 8.754 8.644 8.53 8.352 8.221 8.077 8.007 7.871 7.714 7.535 7.449 7.252 7.178 7.083 6.961 6.707 6.59 6.46 6.327 6.172 5.945 5.62 4.834 -7 ,15923 ,TETRA ,17556315,Fri Nov 26 06:32:39 CET,Fri Nov 26 08:50:30 CET,0.0 0.387 0.615 0.839 1.046 1.224 1.375 1.516 1.757 1.866 1.974 2.064 2.285 2.384 2.567 2.737 2.915 2.998 3.139 3.281 3.483 3.602 3.721 3.899 4.069 4.245 4.419 4.58 4.799 5.017 5.216 5.446 5.673 5.898 6.168 6.473 6.749 7.051 7.392 7.745 8.105 8.524 9.022 9.486 10.028 10.597 11.143 11.666 12.139 12.594 12.949 12.995 12.815 12.544 12.217 11.846 11.473 11.145 10.893 10.606 10.317 10.081 9.882 9.674 9.461 9.251 9.028 8.819 8.626 8.442 8.255 8.091 7.92 7.739 7.596 7.45 7.302 7.145 6.982 6.872 6.762 6.569 6.425 6.286 6.219 6.074 5.909 5.732 5.643 5.447 5.341 5.231 5.117 4.879 4.755 4.606 4.423 4.222 4.006 3.754 3.146 -8 ,7046 ,TETRA ,17556316,Fri Nov 26 06:32:37 CET,Fri Nov 26 08:48:46 CET,0.0 0.895 1.209 1.409 1.594 1.751 1.899 2.046 2.302 2.423 2.544 2.632 2.845 2.949 3.154 3.348 3.527 3.607 3.751 3.895 4.116 4.259 4.395 4.592 4.785 4.964 5.132 5.297 5.501 5.696 5.882 6.097 6.315 6.527 6.771 7.063 7.338 7.624 7.927 8.244 8.598 8.996 9.445 9.88 10.4 11.004 11.566 12.073 12.673 13.373 13.872 13.886 13.688 13.299 12.882 12.519 12.188 11.901 11.648 11.359 11.063 10.769 10.501 10.252 10.007 9.758 9.505 9.293 9.106 8.922 8.726 8.549 8.363 8.167 8.012 7.849 7.677 7.5 7.319 7.189 7.052 6.85 6.713 6.548 6.46 6.288 6.115 5.918 5.809 5.595 5.478 5.367 5.247 4.966 4.816 4.644 4.447 4.247 3.977 3.619 2.947 -9 ,15001 ,TETRA ,17556317,Fri Nov 26 06:32:39 CET,Fri Nov 26 08:49:39 CET,0.0 0.734 1.016 1.235 1.429 1.6 1.734 1.864 2.097 2.21 2.336 2.455 2.669 2.76 2.931 3.106 3.271 3.349 3.497 3.634 3.823 3.949 4.076 4.26 4.438 4.608 4.76 4.911 5.111 5.309 5.503 5.73 5.949 6.155 6.353 6.564 6.793 7.063 7.36 7.652 7.969 8.35 8.808 9.288 9.84 10.404 10.966 11.482 12.062 12.681 13.076 13.105 12.893 12.649 12.361 11.986 11.61 11.273 10.984 10.671 10.391 10.135 9.872 9.607 9.361 9.159 8.957 8.775 8.612 8.436 8.24 8.062 7.881 7.709 7.574 7.419 7.274 7.135 6.973 6.845 6.704 6.503 6.38 6.254 6.186 6.035 5.889 5.746 5.662 5.464 5.386 5.283 5.166 4.907 4.765 4.615 4.46 4.275 4.02 3.668 3.037 -10 ,6995 ,TETRA ,17556318,Fri Nov 26 06:32:37 CET,Fri Nov 26 08:53:01 CET,0.0 0.711 1.053 1.32 1.518 1.674 1.807 1.929 2.158 2.275 2.395 2.494 2.715 2.803 2.957 3.098 3.25 3.326 3.451 3.575 3.762 3.895 4.026 4.203 4.383 4.566 4.739 4.902 5.113 5.314 5.508 5.755 5.983 6.185 6.43 6.707 6.967 7.259 7.566 7.879 8.226 8.643 9.117 9.545 9.971 10.485 11.15 11.873 12.68 13.583 14.483 15.004 15.102 14.984 14.735 14.419 14.095 13.737 13.402 13.047 12.744 12.494 12.256 12.028 11.792 11.573 11.365 11.182 11.012 10.82 10.624 10.461 10.283 10.106 9.969 9.818 9.672 9.525 9.359 9.243 9.137 8.971 8.836 8.694 8.618 8.461 8.299 8.109 7.998 7.78 7.64 7.512 7.383 7.122 6.967 6.797 6.604 6.395 6.167 5.855 5.235 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_33_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_33_19.txt deleted file mode 100644 index e8c18818..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_33_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18851 ,TETRA ,17556319,Fri Nov 26 06:33:37 CET,Fri Nov 26 08:46:50 CET,0.0 0.172 0.31 0.477 0.621 0.741 0.846 0.934 1.116 1.196 1.274 1.299 1.496 1.562 1.688 1.811 1.93 1.988 2.101 2.207 2.369 2.471 2.564 2.701 2.84 2.98 3.117 3.245 3.394 3.545 3.695 3.873 4.05 4.224 4.442 4.677 4.883 5.126 5.387 5.651 5.946 6.292 6.694 7.085 7.524 8.016 8.6 9.273 10.061 10.979 11.958 12.646 12.95 13.05 13.057 13.027 12.947 12.804 12.636 12.423 12.22 12.046 11.872 11.657 11.452 11.28 11.096 10.942 10.811 10.636 10.391 10.165 9.93 9.682 9.494 9.299 9.102 8.902 8.664 8.49 8.316 8.041 7.843 7.645 7.538 7.305 7.058 6.817 6.7 6.443 6.25 6.089 5.924 5.55 5.333 5.104 4.855 4.598 4.334 3.995 2.731 -2 ,6011 ,TETRA ,17556320,Fri Nov 26 06:33:37 CET,Fri Nov 26 08:46:50 CET,0.0 0.276 0.438 0.564 0.67 0.77 0.863 0.958 1.135 1.214 1.281 1.289 1.493 1.573 1.722 1.864 1.98 2.03 2.133 2.233 2.382 2.484 2.585 2.723 2.854 2.982 3.109 3.233 3.402 3.573 3.747 3.952 4.121 4.296 4.495 4.696 4.9 5.134 5.375 5.637 5.931 6.266 6.645 7.059 7.539 8.057 8.655 9.308 10.112 11.091 12.172 12.9 13.193 13.28 13.246 13.072 12.884 12.748 12.615 12.43 12.19 11.975 11.791 11.573 11.319 11.064 10.802 10.585 10.389 10.141 9.895 9.751 9.621 9.471 9.312 9.108 8.898 8.686 8.498 8.37 8.221 8.006 7.865 7.707 7.622 7.45 7.276 7.068 6.96 6.742 6.616 6.485 6.331 5.966 5.794 5.591 5.35 5.108 4.815 4.406 3.647 -3 ,17353 ,TETRA ,17556321,Fri Nov 26 06:33:37 CET,Fri Nov 26 08:45:22 CET,0.0 0.241 0.366 0.468 0.559 0.638 0.716 0.789 0.945 1.032 1.118 1.147 1.342 1.41 1.548 1.681 1.798 1.855 1.969 2.08 2.244 2.345 2.442 2.592 2.741 2.88 3.011 3.139 3.305 3.471 3.632 3.811 3.997 4.194 4.414 4.662 4.906 5.171 5.451 5.753 6.07 6.41 6.795 7.189 7.648 8.157 8.755 9.44 10.239 11.177 12.205 12.92 13.234 13.36 13.397 13.355 13.287 13.187 13.073 12.955 12.818 12.687 12.571 12.365 12.091 11.855 11.627 11.413 11.216 11.003 10.781 10.611 10.431 10.211 10.045 9.893 9.737 9.576 9.402 9.273 9.14 8.93 8.787 8.626 8.529 8.335 8.154 7.965 7.854 7.62 7.499 7.377 7.252 6.959 6.788 6.605 6.419 6.176 5.893 5.616 4.838 -4 ,13219 ,TETRA ,17556322,Fri Nov 26 06:33:36 CET,Fri Nov 26 08:46:01 CET,0.0 0.42 0.605 0.733 0.864 0.998 1.111 1.226 1.41 1.479 1.54 1.542 1.738 1.807 1.935 2.07 2.201 2.267 2.389 2.501 2.675 2.795 2.909 3.068 3.218 3.368 3.513 3.638 3.791 3.951 4.112 4.306 4.487 4.666 4.874 5.097 5.307 5.559 5.848 6.136 6.436 6.78 7.195 7.62 8.089 8.596 9.176 9.823 10.602 11.495 12.492 13.232 13.556 13.661 13.666 13.63 13.578 13.495 13.338 13.129 12.975 12.841 12.683 12.519 12.339 12.121 11.878 11.632 11.388 11.146 10.891 10.692 10.503 10.3 10.12 9.928 9.736 9.521 9.295 9.141 8.984 8.742 8.557 8.362 8.26 8.033 7.791 7.541 7.411 7.162 7.03 6.897 6.756 6.446 6.266 6.1 5.919 5.685 5.378 4.977 4.133 -5 ,7564 ,TETRA ,17556323,Fri Nov 26 06:33:36 CET,Fri Nov 26 08:42:08 CET,0.0 0.454 0.638 0.79 0.907 1.001 1.102 1.193 1.354 1.423 1.488 1.495 1.685 1.752 1.889 2.013 2.126 2.181 2.288 2.389 2.537 2.629 2.724 2.867 3.013 3.152 3.281 3.421 3.614 3.797 3.962 4.156 4.342 4.524 4.729 4.951 5.175 5.418 5.672 5.945 6.239 6.579 6.971 7.349 7.789 8.252 8.797 9.465 10.205 11.047 11.967 12.51 12.679 12.706 12.686 12.604 12.484 12.357 12.204 12.038 11.892 11.764 11.649 11.507 11.339 11.188 11.049 10.908 10.767 10.624 10.481 10.365 10.236 10.082 9.969 9.849 9.717 9.551 9.334 9.18 9.013 8.752 8.568 8.379 8.281 8.074 7.857 7.63 7.519 7.296 7.159 7.009 6.837 6.453 6.266 6.072 5.857 5.618 5.353 5.001 3.887 -6 ,11651 ,TETRA ,17556324,Fri Nov 26 06:34:38 CET,Fri Nov 26 08:46:56 CET,0.0 0.29 0.472 0.603 0.719 0.847 0.949 1.034 1.208 1.307 1.39 1.409 1.605 1.674 1.809 1.94 2.071 2.13 2.245 2.357 2.513 2.608 2.7 2.836 2.97 3.102 3.229 3.353 3.513 3.671 3.814 3.991 4.175 4.338 4.526 4.766 5.01 5.268 5.534 5.826 6.14 6.483 6.877 7.288 7.78 8.297 8.871 9.49 10.23 11.1 12.062 12.787 13.06 12.964 12.658 12.382 12.209 12.038 11.811 11.528 11.234 10.952 10.659 10.375 10.13 9.92 9.699 9.467 9.258 9.042 8.813 8.622 8.423 8.201 8.026 7.841 7.657 7.477 7.282 7.156 7.026 6.8 6.633 6.459 6.369 6.174 5.98 5.774 5.656 5.423 5.293 5.149 4.991 4.659 4.489 4.319 4.134 3.892 3.596 3.228 2.237 -7 ,26247 ,TETRA ,17556325,Fri Nov 26 06:33:36 CET,Fri Nov 26 08:46:08 CET,0.0 0.315 0.449 0.531 0.613 0.707 0.807 0.905 1.079 1.159 1.239 1.264 1.463 1.533 1.653 1.782 1.907 1.964 2.075 2.172 2.318 2.429 2.541 2.689 2.824 2.952 3.069 3.187 3.335 3.478 3.626 3.799 3.965 4.135 4.325 4.528 4.729 4.972 5.245 5.541 5.856 6.191 6.569 6.936 7.369 7.865 8.427 9.07 9.798 10.544 11.321 11.892 12.12 12.011 11.792 11.646 11.538 11.42 11.255 11.032 10.802 10.627 10.513 10.322 10.119 10.0 9.88 9.757 9.633 9.466 9.246 9.038 8.801 8.564 8.412 8.259 8.106 7.966 7.786 7.649 7.519 7.306 7.146 6.973 6.879 6.678 6.485 6.291 6.184 5.954 5.807 5.65 5.494 5.154 4.952 4.743 4.534 4.305 4.002 3.57 2.057 -8 ,13914 ,TETRA ,17556326,Fri Nov 26 06:33:37 CET,Fri Nov 26 08:41:39 CET,0.0 0.29 0.437 0.581 0.707 0.828 0.934 1.034 1.231 1.323 1.401 1.42 1.605 1.663 1.775 1.878 1.983 2.036 2.135 2.236 2.388 2.486 2.583 2.718 2.843 2.968 3.088 3.208 3.368 3.521 3.671 3.852 4.03 4.204 4.405 4.638 4.873 5.121 5.384 5.686 5.999 6.329 6.724 7.125 7.591 8.11 8.684 9.331 10.115 11.008 11.954 12.609 12.931 13.084 13.108 13.072 12.986 12.832 12.684 12.523 12.359 12.207 12.046 11.868 11.683 11.516 11.339 11.169 10.992 10.775 10.554 10.374 10.18 9.975 9.819 9.659 9.478 9.275 9.059 8.904 8.747 8.523 8.377 8.225 8.139 7.952 7.771 7.583 7.476 7.233 7.084 6.945 6.789 6.463 6.297 6.127 5.949 5.736 5.399 4.915 3.958 -9 ,22805 ,TETRA ,17556327,Fri Nov 26 06:34:38 CET,Fri Nov 26 08:47:53 CET,0.0 0.498 0.672 0.817 0.95 1.064 1.181 1.296 1.495 1.584 1.68 1.723 1.919 1.993 2.138 2.283 2.422 2.485 2.602 2.714 2.88 2.992 3.089 3.232 3.369 3.496 3.626 3.754 3.91 4.067 4.22 4.395 4.569 4.732 4.935 5.172 5.394 5.649 5.939 6.241 6.552 6.909 7.327 7.736 8.2 8.744 9.386 10.067 10.836 11.751 12.785 13.502 13.859 13.782 13.586 13.516 13.418 13.27 13.114 12.949 12.792 12.644 12.509 12.372 12.213 12.079 11.951 11.836 11.684 11.484 11.26 11.044 10.826 10.627 10.493 10.344 10.189 10.029 9.859 9.742 9.612 9.413 9.276 9.122 9.039 8.87 8.698 8.497 8.387 8.149 7.979 7.833 7.693 7.345 7.134 6.92 6.669 6.358 6.011 5.595 4.445 -10 ,26007 ,TETRA ,17556328,Fri Nov 26 06:34:38 CET,Fri Nov 26 08:47:53 CET,0.0 0.197 0.341 0.463 0.589 0.709 0.795 0.876 1.041 1.12 1.202 1.225 1.418 1.486 1.607 1.715 1.826 1.879 1.982 2.103 2.28 2.385 2.49 2.64 2.773 2.901 3.031 3.153 3.312 3.475 3.624 3.799 3.981 4.149 4.343 4.557 4.77 5.009 5.269 5.557 5.869 6.215 6.61 7.002 7.463 7.998 8.617 9.279 10.036 10.943 11.979 12.674 13.0 13.141 13.188 13.144 12.952 12.638 12.327 11.983 11.651 11.425 11.274 11.12 10.951 10.781 10.599 10.443 10.299 10.144 9.963 9.785 9.579 9.369 9.218 9.073 8.929 8.762 8.563 8.417 8.272 8.042 7.885 7.725 7.636 7.454 7.26 7.056 6.942 6.71 6.59 6.443 6.282 5.92 5.704 5.465 5.213 4.952 4.612 4.192 3.116 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_34_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_34_37.txt deleted file mode 100644 index 51e9fc75..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_34_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17679 ,TETRA ,17556329,Fri Nov 26 06:34:37 CET,Fri Nov 26 08:36:24 CET,0.0 1.208 1.578 1.86 2.088 2.289 2.471 2.616 2.856 2.965 3.074 3.213 3.407 3.49 3.662 3.817 3.954 4.021 4.156 4.275 4.418 4.506 4.603 4.748 4.875 4.993 5.104 5.22 5.362 5.484 5.605 5.75 5.891 6.025 6.182 6.349 6.5 6.675 6.834 6.979 7.118 7.246 7.379 7.515 7.645 7.758 7.82 7.829 7.731 7.346 6.532 5.438 4.533 3.704 2.966 2.304 1.709 1.195 0.764 0.336 -0.028 -0.353 -0.665 -0.964 -1.238 -1.478 -1.742 -1.998 -2.212 -2.425 -2.645 -2.823 -3.0 -3.196 -3.356 -3.518 -3.69 -3.874 -4.07 -4.203 -4.333 -4.523 -4.655 -4.806 -4.89 -5.056 -5.232 -5.402 -5.494 -5.705 -5.793 -5.887 -5.991 -6.213 -6.34 -6.518 -6.711 -6.91 -7.133 -7.438 -8.281 -2 ,11567 ,TETRA ,17556330,Fri Nov 26 06:37:36 CET,Fri Nov 26 08:53:18 CET,0.0 1.301 1.724 2.034 2.252 2.434 2.615 2.794 3.102 3.243 3.367 3.488 3.689 3.784 3.978 4.17 4.323 4.385 4.512 4.635 4.803 4.912 5.018 5.163 5.294 5.431 5.572 5.697 5.849 5.982 6.102 6.25 6.383 6.504 6.652 6.793 6.92 7.065 7.215 7.371 7.515 7.657 7.81 7.922 8.034 8.16 8.231 8.225 8.142 7.878 7.129 6.071 5.139 4.329 3.661 3.037 2.472 1.945 1.489 1.052 0.688 0.368 0.029 -0.29 -0.565 -0.813 -1.079 -1.316 -1.516 -1.729 -1.962 -2.149 -2.328 -2.515 -2.665 -2.829 -2.992 -3.159 -3.34 -3.456 -3.574 -3.766 -3.904 -4.048 -4.123 -4.286 -4.458 -4.632 -4.718 -4.913 -5.009 -5.109 -5.218 -5.467 -5.607 -5.748 -5.906 -6.089 -6.366 -6.813 -8.333 -3 ,10707 ,TETRA ,17556331,Fri Nov 26 06:37:38 CET,Fri Nov 26 08:52:33 CET,0.0 1.682 2.118 2.38 2.603 2.794 2.977 3.155 3.47 3.597 3.705 3.809 4.0 4.097 4.287 4.447 4.586 4.659 4.803 4.934 5.12 5.227 5.324 5.469 5.609 5.743 5.877 5.999 6.145 6.279 6.401 6.537 6.655 6.766 6.904 7.061 7.201 7.353 7.516 7.682 7.864 8.053 8.252 8.438 8.624 8.751 8.84 8.907 8.83 8.487 7.692 6.616 5.626 4.725 3.936 3.237 2.628 2.097 1.655 1.217 0.83 0.473 0.141 -0.175 -0.47 -0.724 -0.98 -1.206 -1.414 -1.641 -1.863 -2.042 -2.232 -2.431 -2.576 -2.725 -2.881 -3.038 -3.207 -3.319 -3.433 -3.627 -3.756 -3.892 -3.973 -4.158 -4.331 -4.506 -4.598 -4.793 -4.895 -5.006 -5.111 -5.32 -5.429 -5.56 -5.709 -5.899 -6.135 -6.406 -6.955 -4 ,3405 ,TETRA ,17556332,Fri Nov 26 06:37:40 CET,Fri Nov 26 08:52:38 CET,0.0 1.279 1.673 1.955 2.205 2.433 2.633 2.792 3.06 3.187 3.309 3.435 3.638 3.742 3.927 4.104 4.27 4.349 4.494 4.629 4.829 4.958 5.078 5.228 5.363 5.492 5.61 5.718 5.853 5.98 6.101 6.256 6.401 6.532 6.676 6.836 6.988 7.131 7.27 7.404 7.534 7.672 7.792 7.88 7.983 8.088 8.146 8.128 8.005 7.668 6.855 5.714 4.701 3.817 3.033 2.314 1.728 1.217 0.765 0.313 -0.08 -0.425 -0.746 -1.062 -1.364 -1.638 -1.921 -2.165 -2.379 -2.598 -2.816 -2.996 -3.187 -3.381 -3.523 -3.672 -3.827 -3.991 -4.173 -4.299 -4.419 -4.601 -4.735 -4.879 -4.954 -5.117 -5.275 -5.428 -5.523 -5.732 -5.825 -5.92 -6.015 -6.272 -6.412 -6.547 -6.686 -6.829 -7.036 -7.31 -8.162 -5 ,6818 ,TETRA ,17556333,Fri Nov 26 06:37:38 CET,Fri Nov 26 08:52:04 CET,0.0 1.234 1.647 1.922 2.135 2.336 2.524 2.688 2.998 3.134 3.239 3.336 3.535 3.628 3.797 3.937 4.074 4.141 4.289 4.43 4.609 4.723 4.826 4.975 5.118 5.234 5.34 5.449 5.6 5.747 5.878 6.045 6.198 6.327 6.476 6.644 6.798 6.951 7.11 7.264 7.411 7.566 7.703 7.818 7.922 8.007 8.057 8.041 7.935 7.663 7.009 6.028 5.109 4.256 3.528 2.892 2.347 1.858 1.418 0.982 0.604 0.258 -0.069 -0.368 -0.648 -0.9 -1.159 -1.397 -1.615 -1.853 -2.106 -2.307 -2.504 -2.707 -2.866 -3.027 -3.188 -3.366 -3.555 -3.679 -3.801 -3.986 -4.123 -4.262 -4.332 -4.489 -4.665 -4.832 -4.91 -5.11 -5.209 -5.322 -5.429 -5.631 -5.76 -5.936 -6.134 -6.336 -6.55 -6.776 -7.512 -6 ,801 ,TETRA ,17556334,Fri Nov 26 06:37:38 CET,Fri Nov 26 08:55:20 CET,0.0 1.451 1.887 2.193 2.45 2.667 2.843 3.004 3.296 3.419 3.54 3.67 3.873 3.97 4.146 4.314 4.467 4.538 4.667 4.789 4.973 5.09 5.208 5.381 5.535 5.655 5.78 5.926 6.08 6.207 6.327 6.464 6.589 6.703 6.835 6.976 7.107 7.249 7.403 7.56 7.713 7.882 8.044 8.182 8.322 8.423 8.484 8.491 8.479 8.253 7.545 6.552 5.65 4.824 4.107 3.488 2.96 2.475 2.03 1.587 1.2 0.856 0.535 0.216 -0.074 -0.32 -0.561 -0.783 -1.004 -1.215 -1.427 -1.62 -1.805 -1.999 -2.156 -2.32 -2.491 -2.662 -2.843 -2.965 -3.093 -3.318 -3.469 -3.605 -3.676 -3.823 -3.989 -4.158 -4.232 -4.419 -4.492 -4.592 -4.694 -4.917 -5.045 -5.168 -5.303 -5.464 -5.647 -5.857 -6.333 -7 ,17866 ,TETRA ,17556335,Fri Nov 26 06:37:38 CET,Fri Nov 26 08:53:53 CET,0.0 1.438 1.828 2.102 2.33 2.535 2.731 2.91 3.207 3.328 3.443 3.572 3.767 3.847 4.015 4.17 4.307 4.37 4.484 4.594 4.754 4.854 4.953 5.09 5.216 5.349 5.479 5.594 5.741 5.876 6.005 6.155 6.292 6.415 6.544 6.686 6.813 6.948 7.091 7.236 7.382 7.545 7.727 7.863 7.981 8.094 8.188 8.234 8.146 7.834 7.151 6.13 5.167 4.33 3.628 2.997 2.448 1.958 1.522 1.08 0.711 0.392 0.079 -0.216 -0.487 -0.762 -1.056 -1.317 -1.539 -1.76 -1.982 -2.167 -2.368 -2.577 -2.744 -2.916 -3.1 -3.282 -3.46 -3.592 -3.737 -3.964 -4.111 -4.259 -4.338 -4.495 -4.666 -4.843 -4.928 -5.123 -5.21 -5.321 -5.427 -5.64 -5.771 -5.906 -6.062 -6.253 -6.459 -6.702 -7.312 -8 ,18616 ,TETRA ,17556336,Fri Nov 26 06:37:38 CET,Fri Nov 26 08:53:34 CET,0.0 1.312 1.712 1.997 2.255 2.476 2.662 2.826 3.115 3.247 3.385 3.534 3.735 3.833 4.008 4.182 4.338 4.409 4.529 4.634 4.805 4.916 5.016 5.158 5.283 5.395 5.506 5.62 5.76 5.883 6.009 6.161 6.294 6.422 6.567 6.699 6.82 6.957 7.1 7.245 7.394 7.565 7.762 7.912 8.039 8.184 8.259 8.233 8.113 7.799 7.089 6.054 5.135 4.314 3.621 3.025 2.479 1.971 1.529 1.091 0.716 0.381 0.074 -0.206 -0.46 -0.696 -0.95 -1.183 -1.395 -1.604 -1.817 -2.007 -2.214 -2.41 -2.551 -2.702 -2.864 -3.026 -3.188 -3.299 -3.428 -3.64 -3.783 -3.943 -4.019 -4.164 -4.319 -4.491 -4.579 -4.791 -4.92 -5.028 -5.131 -5.328 -5.434 -5.573 -5.738 -5.909 -6.13 -6.409 -6.898 -9 ,16220 ,TETRA ,17556337,Fri Nov 26 06:37:38 CET,Fri Nov 26 08:37:50 CET,0.0 1.331 1.722 1.995 2.233 2.441 2.631 2.79 3.029 3.135 3.248 3.362 3.561 3.666 3.852 4.019 4.181 4.252 4.377 4.501 4.698 4.826 4.938 5.085 5.23 5.363 5.478 5.581 5.705 5.828 5.959 6.121 6.259 6.386 6.554 6.725 6.875 7.038 7.19 7.326 7.452 7.592 7.741 7.873 8.004 8.094 8.171 8.185 8.081 7.791 7.019 5.946 5.004 4.148 3.386 2.722 2.158 1.663 1.229 0.784 0.408 0.079 -0.23 -0.516 -0.803 -1.075 -1.348 -1.587 -1.791 -1.995 -2.214 -2.395 -2.578 -2.782 -2.938 -3.098 -3.26 -3.414 -3.568 -3.68 -3.794 -3.966 -4.097 -4.237 -4.307 -4.448 -4.589 -4.741 -4.827 -5.028 -5.117 -5.208 -5.313 -5.558 -5.685 -5.799 -5.93 -6.101 -6.297 -6.548 -7.058 -10 ,474 ,TETRA ,17556338,Fri Nov 26 06:38:37 CET,Fri Nov 26 08:55:01 CET,0.0 1.585 2.053 2.364 2.591 2.785 2.962 3.123 3.394 3.514 3.639 3.774 3.964 4.049 4.215 4.383 4.544 4.62 4.769 4.9 5.089 5.206 5.311 5.473 5.634 5.771 5.904 6.039 6.2 6.351 6.487 6.656 6.807 6.944 7.104 7.259 7.409 7.587 7.755 7.9 8.051 8.198 8.34 8.484 8.605 8.654 8.661 8.639 8.561 8.341 7.71 6.732 5.829 5.002 4.269 3.577 2.984 2.497 2.093 1.685 1.329 1.001 0.696 0.406 0.127 -0.12 -0.377 -0.6 -0.796 -1.011 -1.23 -1.402 -1.586 -1.789 -1.945 -2.103 -2.275 -2.449 -2.634 -2.763 -2.886 -3.097 -3.243 -3.38 -3.457 -3.619 -3.789 -3.969 -4.059 -4.258 -4.327 -4.42 -4.526 -4.75 -4.874 -5.02 -5.2 -5.379 -5.591 -5.83 -6.197 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_35_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_35_19.txt deleted file mode 100644 index 2ee25346..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_35_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16239 ,KEBNE ,17070010,Fri Dec 24 15:51:44 CET,Fri Dec 24 17:42:43 CET,0.0 0.314 0.516 0.699 0.836 0.937 1.005 1.061 1.153 1.2 1.246 1.25 1.413 1.457 1.536 1.611 1.687 1.722 1.792 1.866 1.974 2.042 2.103 2.195 2.292 2.378 2.453 2.534 2.642 2.733 2.818 2.919 3.005 3.091 3.204 3.304 3.391 3.501 3.616 3.738 3.843 3.923 4.035 4.128 4.165 4.163 4.15 3.998 3.574 2.99 1.921 0.353 -1.069 -2.333 -3.41 -4.363 -5.175 -5.891 -6.5 -7.07 -7.542 -8.024 -8.498 -8.904 -9.271 -9.597 -9.922 -10.21 -10.47 -10.748 -11.05 -11.308 -11.561 -11.801 -12.004 -12.223 -12.446 -12.668 -12.878 -13.024 -13.176 -13.421 -13.601 -13.786 -13.881 -14.076 -14.28 -14.492 -14.606 -14.852 -15.011 -15.14 -15.276 -15.644 -15.89 -16.177 -16.496 -16.866 -17.246 -17.649 -18.682 -2 ,13658 ,KEBNE ,17070011,Fri Dec 24 15:51:44 CET,Fri Dec 24 17:44:55 CET,0.0 0.285 0.442 0.566 0.667 0.757 0.833 0.909 1.036 1.089 1.147 1.15 1.31 1.373 1.49 1.61 1.71 1.751 1.827 1.896 2.007 2.071 2.131 2.225 2.319 2.417 2.5 2.565 2.667 2.761 2.839 2.94 3.03 3.103 3.182 3.283 3.396 3.509 3.608 3.706 3.793 3.889 4.005 4.099 4.183 4.211 4.166 4.015 3.655 3.039 2.02 0.591 -0.745 -1.85 -2.809 -3.653 -4.356 -4.995 -5.575 -6.151 -6.639 -7.095 -7.529 -7.934 -8.326 -8.685 -9.051 -9.408 -9.728 -10.018 -10.3 -10.544 -10.794 -11.042 -11.261 -11.508 -11.771 -12.05 -12.322 -12.494 -12.665 -12.924 -13.116 -13.354 -13.477 -13.707 -13.951 -14.23 -14.371 -14.623 -14.781 -14.909 -15.065 -15.468 -15.685 -15.911 -16.206 -16.545 -16.865 -17.272 -19.014 -3 ,10287 ,KEBNE ,17070012,Fri Dec 24 15:54:55 CET,Fri Dec 24 17:47:00 CET,0.0 0.244 0.356 0.46 0.552 0.622 0.705 0.809 0.956 1.012 1.077 1.093 1.241 1.282 1.362 1.438 1.514 1.548 1.609 1.683 1.784 1.84 1.897 1.98 2.062 2.136 2.207 2.286 2.384 2.454 2.517 2.614 2.715 2.802 2.89 2.972 3.041 3.113 3.189 3.265 3.339 3.429 3.507 3.563 3.65 3.696 3.689 3.668 3.52 3.107 2.16 0.648 -0.796 -2.006 -3.055 -3.989 -4.786 -5.532 -6.177 -6.819 -7.354 -7.808 -8.215 -8.58 -8.927 -9.243 -9.568 -9.86 -10.118 -10.392 -10.686 -10.927 -11.173 -11.426 -11.636 -11.865 -12.091 -12.331 -12.577 -12.729 -12.885 -13.14 -13.325 -13.516 -13.611 -13.811 -14.018 -14.24 -14.354 -14.585 -14.731 -14.863 -14.999 -15.309 -15.496 -15.689 -15.898 -16.161 -16.494 -16.909 -18.487 -4 ,32219 ,KEBNE ,17070013,Fri Dec 24 15:54:55 CET,Fri Dec 24 17:46:30 CET,0.0 0.183 0.274 0.364 0.442 0.516 0.599 0.675 0.807 0.869 0.925 0.962 1.127 1.17 1.269 1.374 1.483 1.533 1.612 1.691 1.798 1.863 1.926 2.025 2.116 2.194 2.266 2.341 2.438 2.523 2.606 2.69 2.772 2.87 2.983 3.075 3.156 3.248 3.32 3.384 3.463 3.534 3.605 3.68 3.745 3.762 3.703 3.533 3.137 2.338 0.939 -0.657 -1.889 -2.954 -3.89 -4.749 -5.535 -6.264 -6.909 -7.557 -8.11 -8.603 -9.074 -9.49 -9.867 -10.223 -10.594 -10.907 -11.162 -11.426 -11.715 -11.969 -12.23 -12.511 -12.733 -12.955 -13.17 -13.396 -13.654 -13.834 -14.008 -14.269 -14.457 -14.656 -14.765 -15.002 -15.251 -15.527 -15.663 -15.908 -16.067 -16.222 -16.393 -16.78 -16.995 -17.245 -17.555 -17.904 -18.267 -18.725 -21.13 -5 ,19755 ,KEBNE ,17070014,Fri Dec 24 15:54:57 CET,Fri Dec 24 17:41:24 CET,0.0 0.407 0.603 0.744 0.843 0.928 1.012 1.081 1.208 1.273 1.329 1.337 1.502 1.556 1.66 1.762 1.849 1.89 1.97 2.048 2.145 2.213 2.277 2.35 2.425 2.505 2.583 2.66 2.763 2.851 2.927 3.025 3.104 3.169 3.253 3.344 3.417 3.489 3.585 3.688 3.77 3.847 3.903 3.918 3.921 3.95 3.883 3.638 3.236 2.482 1.213 -0.451 -2.02 -3.299 -4.382 -5.348 -6.203 -6.941 -7.537 -8.172 -8.707 -9.178 -9.626 -10.003 -10.356 -10.697 -11.037 -11.335 -11.587 -11.855 -12.168 -12.419 -12.671 -12.953 -13.186 -13.401 -13.593 -13.795 -14.012 -14.171 -14.333 -14.585 -14.761 -14.945 -15.037 -15.223 -15.426 -15.64 -15.751 -15.989 -16.13 -16.244 -16.368 -16.672 -16.835 -17.035 -17.286 -17.535 -17.796 -18.203 -19.119 -6 ,23568 ,KEBNE ,17070015,Fri Dec 24 15:57:04 CET,Fri Dec 24 17:48:36 CET,0.0 0.124 0.238 0.352 0.456 0.556 0.637 0.719 0.896 0.969 1.025 1.02 1.169 1.217 1.315 1.386 1.452 1.487 1.556 1.63 1.736 1.808 1.877 1.986 2.081 2.156 2.227 2.301 2.411 2.5 2.571 2.661 2.751 2.838 2.948 3.059 3.163 3.276 3.392 3.506 3.586 3.649 3.688 3.69 3.679 3.64 3.533 3.283 2.811 1.978 0.522 -1.269 -2.72 -3.922 -4.909 -5.772 -6.556 -7.237 -7.822 -8.41 -8.887 -9.314 -9.719 -10.088 -10.424 -10.725 -11.028 -11.291 -11.537 -11.811 -12.088 -12.309 -12.537 -12.773 -12.953 -13.131 -13.323 -13.534 -13.767 -13.922 -14.072 -14.335 -14.535 -14.766 -14.885 -15.107 -15.337 -15.568 -15.682 -15.919 -16.077 -16.218 -16.368 -16.695 -16.872 -17.06 -17.246 -17.438 -17.699 -18.133 -19.337 -7 ,2185 ,KEBNE ,17070016,Fri Dec 24 15:57:08 CET,Fri Dec 24 17:43:01 CET,0.0 0.265 0.424 0.544 0.661 0.748 0.823 0.893 1.029 1.095 1.157 1.18 1.337 1.38 1.462 1.553 1.645 1.692 1.779 1.866 1.98 2.036 2.097 2.204 2.296 2.38 2.466 2.536 2.622 2.714 2.807 2.912 3.007 3.1 3.195 3.291 3.388 3.501 3.604 3.697 3.816 3.939 4.039 4.123 4.196 4.214 4.156 4.054 3.879 3.442 2.29 0.861 -0.275 -1.361 -2.383 -3.35 -4.188 -4.899 -5.485 -6.114 -6.662 -7.108 -7.532 -7.952 -8.346 -8.718 -9.112 -9.439 -9.71 -9.992 -10.304 -10.573 -10.847 -11.132 -11.35 -11.573 -11.805 -12.043 -12.291 -12.457 -12.633 -12.926 -13.135 -13.342 -13.446 -13.684 -13.932 -14.165 -14.279 -14.513 -14.682 -14.855 -15.052 -15.427 -15.596 -15.822 -16.087 -16.381 -16.733 -17.135 -18.344 -8 ,899 ,KEBNE ,17070017,Fri Dec 24 15:58:07 CET,Fri Dec 24 17:50:46 CET,0.0 0.242 0.396 0.473 0.555 0.624 0.691 0.783 0.965 1.035 1.095 1.091 1.239 1.285 1.362 1.455 1.552 1.597 1.682 1.756 1.872 1.941 2.006 2.105 2.19 2.27 2.354 2.437 2.527 2.606 2.692 2.798 2.888 2.957 3.033 3.123 3.213 3.302 3.39 3.497 3.596 3.696 3.81 3.902 3.966 4.003 3.98 3.867 3.623 3.074 1.79 0.225 -0.915 -1.979 -2.905 -3.75 -4.492 -5.142 -5.71 -6.283 -6.81 -7.274 -7.708 -8.111 -8.473 -8.808 -9.164 -9.506 -9.821 -10.11 -10.414 -10.695 -10.971 -11.244 -11.455 -11.68 -11.921 -12.156 -12.393 -12.558 -12.728 -13.009 -13.201 -13.408 -13.517 -13.714 -13.94 -14.192 -14.335 -14.609 -14.829 -14.982 -15.139 -15.536 -15.772 -16.061 -16.368 -16.664 -17.019 -17.439 -19.171 -9 ,15602 ,KEBNE ,17070018,Fri Dec 24 15:58:06 CET,Fri Dec 24 17:50:05 CET,0.0 0.278 0.419 0.539 0.622 0.709 0.805 0.884 1.036 1.106 1.165 1.166 1.319 1.368 1.459 1.548 1.636 1.677 1.751 1.819 1.925 1.993 2.048 2.115 2.187 2.266 2.337 2.411 2.503 2.586 2.678 2.791 2.899 2.995 3.093 3.206 3.295 3.373 3.478 3.587 3.674 3.749 3.836 3.921 3.989 4.024 3.941 3.791 3.545 3.066 2.132 0.672 -0.64 -1.74 -2.698 -3.54 -4.276 -4.94 -5.516 -6.106 -6.655 -7.185 -7.697 -8.134 -8.492 -8.801 -9.14 -9.449 -9.701 -9.965 -10.239 -10.465 -10.707 -10.953 -11.139 -11.345 -11.564 -11.801 -12.079 -12.275 -12.458 -12.715 -12.895 -13.092 -13.199 -13.417 -13.638 -13.888 -14.018 -14.256 -14.425 -14.578 -14.724 -15.026 -15.21 -15.443 -15.689 -15.97 -16.373 -16.945 -19.1 -10 ,23672 ,KEBNE ,17070019,Fri Dec 24 15:58:06 CET,Fri Dec 24 17:49:53 CET,0.0 0.328 0.459 0.568 0.679 0.768 0.828 0.896 1.065 1.136 1.196 1.195 1.339 1.383 1.478 1.568 1.648 1.685 1.764 1.84 1.943 2.01 2.074 2.171 2.271 2.36 2.443 2.515 2.587 2.658 2.73 2.811 2.876 2.932 3.016 3.114 3.204 3.323 3.431 3.514 3.596 3.689 3.778 3.835 3.877 3.871 3.759 3.49 3.076 2.393 1.063 -0.584 -1.954 -3.153 -4.193 -5.058 -5.785 -6.449 -6.998 -7.549 -8.053 -8.508 -8.941 -9.337 -9.683 -10.011 -10.364 -10.667 -10.923 -11.186 -11.481 -11.74 -11.994 -12.253 -12.471 -12.71 -12.971 -13.242 -13.509 -13.681 -13.844 -14.111 -14.306 -14.496 -14.588 -14.785 -15.008 -15.24 -15.369 -15.63 -15.784 -15.923 -16.08 -16.481 -16.707 -16.936 -17.167 -17.42 -17.76 -18.225 -19.617 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_35_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_35_44.txt deleted file mode 100644 index d58d1fee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_35_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6630 ,KEBNE ,17025388,Wed Dec 22 12:25:13 CET,Wed Dec 22 14:18:01 CET,0.0 1.012 1.406 1.716 1.978 2.188 2.382 2.578 2.935 3.093 3.228 3.38 3.605 3.726 3.962 4.196 4.428 4.543 4.756 4.942 5.197 5.358 5.52 5.753 5.966 6.172 6.378 6.578 6.835 7.091 7.346 7.642 7.908 8.172 8.493 8.856 9.215 9.636 10.11 10.571 11.017 11.535 12.134 12.731 13.48 14.351 15.263 16.226 17.396 18.598 19.703 20.46 20.785 20.751 20.503 20.163 19.818 19.532 19.311 19.103 18.936 18.78 18.606 18.387 18.174 18.011 17.819 17.638 17.473 17.272 17.089 16.932 16.746 16.552 16.387 16.223 16.054 15.864 15.671 15.54 15.402 15.197 15.045 14.883 14.801 14.601 14.384 14.191 14.099 13.913 13.754 13.621 13.485 13.142 12.937 12.702 12.467 12.233 11.875 11.368 9.532 -2 ,23451 ,KEBNE ,17025389,Wed Dec 22 12:25:17 CET,Wed Dec 22 14:14:30 CET,0.0 0.874 1.225 1.529 1.774 2.009 2.208 2.385 2.746 2.904 3.046 3.251 3.497 3.625 3.856 4.074 4.289 4.388 4.576 4.771 5.058 5.242 5.429 5.688 5.931 6.166 6.38 6.588 6.875 7.182 7.47 7.805 8.13 8.448 8.803 9.186 9.549 9.95 10.396 10.859 11.353 11.923 12.62 13.326 14.164 15.152 16.206 17.295 18.59 19.994 21.417 22.223 22.455 22.45 22.312 22.175 21.966 21.7 21.424 21.135 20.92 20.744 20.541 20.3 20.063 19.824 19.58 19.376 19.198 19.033 18.84 18.667 18.517 18.353 18.21 18.073 17.919 17.721 17.52 17.391 17.262 17.063 16.915 16.764 16.688 16.509 16.299 16.056 15.928 15.732 15.607 15.466 15.31 14.97 14.783 14.577 14.346 14.059 13.711 13.229 11.006 -3 ,30420 ,KEBNE ,17025390,Wed Dec 22 12:25:17 CET,Wed Dec 22 14:11:04 CET,0.0 1.02 1.371 1.598 1.791 1.983 2.187 2.372 2.723 2.886 3.033 3.203 3.437 3.568 3.787 3.986 4.183 4.282 4.471 4.655 4.935 5.109 5.261 5.475 5.688 5.898 6.102 6.297 6.557 6.813 7.057 7.342 7.608 7.867 8.173 8.53 8.868 9.24 9.664 10.104 10.568 11.092 11.693 12.321 13.066 13.893 14.813 15.857 17.054 18.362 19.828 20.851 21.318 21.47 21.431 21.283 21.055 20.796 20.541 20.287 20.073 19.895 19.713 19.514 19.345 19.182 18.974 18.782 18.647 18.513 18.359 18.2 18.029 17.843 17.663 17.481 17.297 17.096 16.891 16.765 16.642 16.451 16.313 16.166 16.085 15.908 15.722 15.508 15.39 15.179 15.016 14.877 14.709 14.347 14.164 13.97 13.755 13.52 13.206 12.668 9.808 -4 ,66 ,KEBNE ,17025391,Wed Dec 22 12:25:13 CET,Wed Dec 22 14:18:05 CET,0.0 1.437 1.799 2.09 2.331 2.543 2.756 2.942 3.243 3.378 3.508 3.675 3.896 4.013 4.246 4.473 4.704 4.812 5.01 5.197 5.47 5.642 5.812 6.051 6.258 6.48 6.72 6.953 7.203 7.43 7.67 7.978 8.268 8.518 8.819 9.173 9.519 9.881 10.258 10.676 11.142 11.673 12.279 12.875 13.586 14.398 15.345 16.299 17.327 18.551 19.786 20.642 21.046 21.112 21.024 20.924 20.729 20.432 20.152 19.865 19.624 19.417 19.203 18.962 18.707 18.474 18.222 18.011 17.865 17.701 17.492 17.3 17.106 16.892 16.721 16.575 16.421 16.231 16.029 15.876 15.716 15.502 15.341 15.156 15.06 14.862 14.654 14.428 14.324 14.12 13.94 13.802 13.636 13.225 13.008 12.769 12.503 12.23 11.928 11.498 9.01 -5 ,11695 ,KEBNE ,17025392,Wed Dec 22 12:25:13 CET,Wed Dec 22 14:18:47 CET,0.0 0.951 1.317 1.621 1.86 2.063 2.241 2.413 2.712 2.839 2.958 3.078 3.3 3.421 3.638 3.817 3.975 4.054 4.224 4.389 4.646 4.82 4.976 5.197 5.406 5.622 5.849 6.061 6.322 6.567 6.793 7.072 7.329 7.569 7.882 8.242 8.572 8.934 9.365 9.809 10.281 10.844 11.438 12.038 12.755 13.531 14.416 15.362 16.4 17.539 18.768 19.466 19.593 19.518 19.392 19.234 19.049 18.86 18.657 18.403 18.144 17.939 17.743 17.524 17.304 17.08 16.835 16.611 16.424 16.233 16.012 15.835 15.674 15.483 15.315 15.141 14.964 14.79 14.586 14.44 14.289 14.052 13.884 13.692 13.59 13.396 13.209 13.003 12.885 12.676 12.506 12.366 12.248 11.979 11.812 11.633 11.418 11.153 10.823 10.38 8.447 -6 ,21344 ,KEBNE ,17025393,Wed Dec 22 12:26:15 CET,Wed Dec 22 14:19:45 CET,0.0 1.738 2.154 2.396 2.597 2.763 2.897 3.042 3.354 3.502 3.638 3.791 4.027 4.152 4.384 4.629 4.857 4.957 5.148 5.326 5.587 5.755 5.912 6.143 6.381 6.609 6.824 7.047 7.341 7.601 7.849 8.146 8.424 8.708 9.043 9.397 9.737 10.131 10.551 10.967 11.435 11.997 12.584 13.166 13.878 14.665 15.531 16.432 17.459 18.638 19.91 20.746 21.139 21.282 21.199 21.009 20.801 20.552 20.306 20.096 19.917 19.717 19.505 19.295 19.102 18.917 18.703 18.497 18.302 18.094 17.894 17.707 17.495 17.292 17.13 16.955 16.779 16.602 16.418 16.292 16.166 15.966 15.83 15.698 15.619 15.417 15.189 14.962 14.849 14.632 14.458 14.326 14.199 13.898 13.68 13.437 13.159 12.854 12.543 12.083 9.966 -7 ,8628 ,KEBNE ,17025394,Wed Dec 22 12:26:17 CET,Wed Dec 22 14:12:01 CET,0.0 0.707 1.068 1.346 1.575 1.792 2.023 2.24 2.608 2.763 2.901 3.041 3.263 3.389 3.629 3.821 4.009 4.111 4.303 4.482 4.73 4.88 5.027 5.26 5.498 5.725 5.935 6.142 6.426 6.689 6.931 7.218 7.483 7.735 8.039 8.391 8.725 9.085 9.477 9.914 10.384 10.906 11.5 12.078 12.722 13.429 14.276 15.288 16.42 17.505 18.561 19.234 19.397 19.412 19.39 19.28 19.138 18.948 18.731 18.495 18.275 18.079 17.855 17.629 17.446 17.242 17.001 16.761 16.523 16.292 16.086 15.93 15.758 15.569 15.415 15.255 15.112 14.946 14.738 14.599 14.472 14.286 14.139 13.976 13.896 13.72 13.541 13.345 13.24 13.037 12.888 12.769 12.627 12.249 12.04 11.839 11.612 11.35 11.053 10.639 9.032 -8 ,12671 ,KEBNE ,17025395,Wed Dec 22 12:26:20 CET,Wed Dec 22 14:15:20 CET,0.0 0.631 0.953 1.223 1.463 1.658 1.838 2.008 2.312 2.45 2.584 2.745 2.977 3.1 3.339 3.556 3.751 3.84 4.023 4.219 4.527 4.727 4.913 5.17 5.417 5.654 5.867 6.063 6.343 6.631 6.885 7.172 7.451 7.724 8.036 8.379 8.725 9.117 9.544 10.0 10.468 11.01 11.694 12.404 13.22 14.094 15.056 16.15 17.479 18.884 20.175 20.939 21.225 21.292 21.173 21.002 20.831 20.601 20.338 20.002 19.652 19.323 19.081 18.903 18.734 18.574 18.355 18.139 17.979 17.831 17.626 17.436 17.25 17.056 16.881 16.683 16.476 16.26 16.037 15.865 15.669 15.377 15.19 14.992 14.886 14.667 14.442 14.212 14.088 13.847 13.58 13.41 13.259 12.854 12.6 12.309 11.983 11.627 11.194 10.527 8.492 -9 ,7607 ,KEBNE ,17025396,Wed Dec 22 12:26:16 CET,Wed Dec 22 14:19:03 CET,0.0 1.053 1.363 1.628 1.853 2.037 2.192 2.355 2.661 2.815 2.967 3.116 3.33 3.439 3.662 3.878 4.09 4.203 4.415 4.599 4.877 5.054 5.211 5.433 5.653 5.863 6.073 6.294 6.561 6.802 7.046 7.346 7.638 7.931 8.258 8.622 8.99 9.37 9.769 10.19 10.635 11.155 11.764 12.348 13.015 13.78 14.658 15.676 16.85 18.201 19.642 20.584 20.966 21.027 21.002 20.894 20.703 20.468 20.267 20.053 19.805 19.575 19.358 19.162 18.978 18.809 18.622 18.418 18.224 18.031 17.841 17.676 17.5 17.283 17.099 16.944 16.797 16.615 16.445 16.329 16.187 15.971 15.821 15.66 15.569 15.39 15.199 14.993 14.894 14.705 14.562 14.438 14.308 13.982 13.787 13.562 13.34 13.076 12.814 12.41 10.721 -10 ,16288 ,KEBNE ,17025397,Wed Dec 22 12:26:15 CET,Wed Dec 22 14:18:35 CET,0.0 0.472 0.705 0.918 1.148 1.365 1.534 1.68 1.964 2.104 2.244 2.402 2.643 2.767 2.997 3.224 3.449 3.551 3.732 3.921 4.201 4.369 4.532 4.776 5.01 5.247 5.481 5.689 5.951 6.218 6.487 6.815 7.133 7.424 7.745 8.098 8.446 8.826 9.247 9.699 10.166 10.728 11.38 12.009 12.714 13.52 14.499 15.545 16.742 18.091 19.446 20.281 20.649 20.797 20.727 20.53 20.346 20.155 19.964 19.747 19.538 19.338 19.156 18.991 18.812 18.631 18.428 18.225 18.054 17.875 17.662 17.477 17.287 17.09 16.939 16.798 16.665 16.508 16.325 16.198 16.062 15.853 15.715 15.555 15.468 15.289 15.063 14.838 14.73 14.51 14.355 14.222 14.063 13.691 13.477 13.226 12.957 12.684 12.378 11.949 9.992 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_36_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_36_35.txt deleted file mode 100644 index afb59709..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_36_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12313 ,TETRA ,17556339,Fri Nov 26 06:37:38 CET,Fri Nov 26 08:57:56 CET,0.0 0.463 0.644 0.777 0.898 1.015 1.131 1.252 1.494 1.599 1.688 1.758 1.945 2.024 2.184 2.35 2.497 2.567 2.692 2.801 2.965 3.082 3.197 3.357 3.498 3.622 3.74 3.868 4.033 4.174 4.317 4.519 4.724 4.908 5.125 5.377 5.591 5.831 6.106 6.387 6.662 6.976 7.373 7.77 8.197 8.648 9.18 9.726 10.273 10.859 11.433 11.577 11.33 10.994 10.71 10.406 10.046 9.625 9.175 8.733 8.353 7.964 7.58 7.224 6.904 6.638 6.349 6.073 5.837 5.59 5.334 5.116 4.882 4.638 4.451 4.257 4.033 3.808 3.586 3.428 3.265 3.005 2.838 2.667 2.58 2.393 2.184 1.977 1.865 1.624 1.432 1.287 1.139 0.801 0.625 0.457 0.236 -0.043 -0.318 -0.633 -1.256 -2 ,8427 ,TETRA ,17556340,Fri Nov 26 06:37:38 CET,Fri Nov 26 08:54:11 CET,0.0 0.445 0.66 0.823 0.964 1.103 1.227 1.335 1.527 1.629 1.721 1.773 1.936 2.006 2.155 2.285 2.415 2.478 2.595 2.711 2.877 2.986 3.093 3.242 3.372 3.497 3.622 3.754 3.929 4.09 4.245 4.428 4.603 4.764 4.934 5.125 5.32 5.538 5.78 6.035 6.288 6.569 6.904 7.243 7.627 8.057 8.54 9.003 9.515 10.039 10.418 10.403 10.201 9.941 9.54 9.063 8.606 8.141 7.695 7.257 6.898 6.567 6.279 6.026 5.718 5.41 5.081 4.785 4.534 4.263 3.995 3.774 3.538 3.284 3.099 2.922 2.716 2.501 2.285 2.134 1.978 1.725 1.532 1.336 1.244 1.053 0.853 0.642 0.535 0.328 0.206 0.096 -0.014 -0.272 -0.424 -0.58 -0.745 -0.935 -1.196 -1.57 -2.379 -3 ,15983 ,TETRA ,17556341,Fri Nov 26 06:38:40 CET,Fri Nov 26 08:54:27 CET,0.0 0.363 0.545 0.71 0.869 1.014 1.129 1.231 1.438 1.548 1.651 1.732 1.92 2.002 2.149 2.294 2.433 2.502 2.634 2.765 2.96 3.074 3.181 3.342 3.49 3.619 3.747 3.868 4.017 4.168 4.312 4.477 4.636 4.796 4.987 5.212 5.432 5.676 5.934 6.198 6.478 6.793 7.146 7.488 7.889 8.318 8.714 9.151 9.726 10.308 10.796 10.903 10.658 10.313 9.924 9.417 8.945 8.574 8.194 7.754 7.383 7.069 6.763 6.449 6.159 5.894 5.606 5.343 5.106 4.841 4.567 4.35 4.13 3.883 3.676 3.459 3.237 3.015 2.778 2.617 2.448 2.168 1.982 1.785 1.679 1.46 1.222 0.981 0.864 0.648 0.484 0.338 0.186 -0.123 -0.293 -0.467 -0.649 -0.882 -1.16 -1.519 -2.797 -4 ,14488 ,TETRA ,17556342,Fri Nov 26 06:38:38 CET,Fri Nov 26 08:55:07 CET,0.0 0.455 0.667 0.851 1.0 1.13 1.254 1.369 1.554 1.628 1.704 1.761 1.946 2.018 2.145 2.281 2.429 2.496 2.627 2.755 2.932 3.056 3.174 3.333 3.497 3.668 3.832 3.976 4.159 4.331 4.495 4.699 4.889 5.066 5.271 5.505 5.736 5.991 6.276 6.569 6.84 7.13 7.481 7.851 8.239 8.65 9.143 9.661 10.18 10.649 11.03 10.976 10.469 9.96 9.466 8.943 8.507 8.085 7.685 7.265 6.888 6.541 6.202 5.853 5.498 5.179 4.854 4.573 4.334 4.05 3.749 3.51 3.257 3.002 2.796 2.585 2.367 2.136 1.908 1.744 1.553 1.242 1.044 0.845 0.73 0.493 0.272 0.045 -0.076 -0.303 -0.486 -0.622 -0.781 -1.174 -1.349 -1.542 -1.764 -1.956 -2.201 -2.605 -3.532 -5 ,27326 ,TETRA ,17556343,Fri Nov 26 06:38:38 CET,Fri Nov 26 08:55:17 CET,0.0 0.271 0.465 0.624 0.769 0.885 0.988 1.102 1.331 1.431 1.518 1.588 1.775 1.86 2.013 2.145 2.283 2.351 2.481 2.606 2.784 2.891 3.002 3.182 3.34 3.494 3.637 3.763 3.918 4.065 4.211 4.413 4.618 4.817 5.057 5.311 5.553 5.814 6.072 6.346 6.639 6.978 7.355 7.71 8.113 8.531 8.976 9.42 9.835 10.226 10.442 10.151 9.784 9.517 9.206 8.83 8.469 8.035 7.583 7.114 6.694 6.321 5.968 5.621 5.302 5.004 4.694 4.409 4.132 3.842 3.548 3.302 3.052 2.809 2.621 2.414 2.195 1.969 1.743 1.584 1.419 1.155 0.966 0.776 0.681 0.476 0.257 0.033 -0.089 -0.324 -0.478 -0.616 -0.758 -1.039 -1.193 -1.371 -1.61 -1.888 -2.143 -2.417 -3.274 -6 ,32645 ,TETRA ,17556344,Fri Nov 26 06:38:38 CET,Fri Nov 26 08:54:54 CET,0.0 0.341 0.558 0.709 0.858 1.001 1.111 1.204 1.388 1.473 1.542 1.578 1.751 1.823 1.958 2.085 2.22 2.281 2.399 2.522 2.693 2.801 2.908 3.073 3.222 3.35 3.481 3.623 3.815 3.983 4.135 4.31 4.495 4.689 4.901 5.123 5.325 5.562 5.827 6.097 6.381 6.724 7.094 7.452 7.892 8.363 8.882 9.429 9.965 10.435 10.832 10.842 10.607 10.331 9.916 9.421 8.851 8.186 7.624 7.067 6.583 6.166 5.762 5.389 5.073 4.795 4.477 4.202 3.975 3.721 3.434 3.199 2.955 2.689 2.486 2.279 2.055 1.818 1.584 1.413 1.23 0.946 0.749 0.546 0.446 0.242 0.017 -0.216 -0.335 -0.568 -0.741 -0.886 -1.025 -1.286 -1.441 -1.608 -1.783 -2.023 -2.359 -2.714 -3.873 -7 ,19944 ,TETRA ,17556345,Fri Nov 26 06:38:38 CET,Fri Nov 26 08:56:03 CET,0.0 0.394 0.589 0.721 0.858 0.981 1.075 1.171 1.392 1.497 1.583 1.625 1.791 1.862 2.002 2.142 2.285 2.355 2.482 2.617 2.801 2.914 3.031 3.191 3.34 3.477 3.603 3.735 3.903 4.05 4.197 4.377 4.542 4.715 4.919 5.14 5.344 5.558 5.793 6.065 6.388 6.74 7.093 7.442 7.849 8.25 8.725 9.221 9.644 10.128 10.54 10.492 10.186 9.819 9.451 9.018 8.56 8.153 7.797 7.41 7.109 6.855 6.63 6.43 6.198 5.933 5.618 5.316 5.056 4.791 4.514 4.3 4.078 3.826 3.63 3.431 3.231 3.031 2.825 2.674 2.522 2.295 2.126 1.947 1.851 1.621 1.361 1.086 0.944 0.697 0.514 0.381 0.236 -0.089 -0.246 -0.422 -0.614 -0.817 -1.063 -1.362 -2.398 -8 ,13195 ,TETRA ,17556346,Fri Nov 26 06:38:38 CET,Fri Nov 26 08:41:07 CET,0.0 0.328 0.536 0.729 0.902 1.025 1.128 1.237 1.459 1.556 1.652 1.731 1.919 2.005 2.166 2.332 2.482 2.549 2.678 2.808 2.986 3.084 3.179 3.329 3.472 3.61 3.741 3.884 4.084 4.26 4.426 4.646 4.871 5.075 5.283 5.507 5.734 5.99 6.248 6.507 6.782 7.082 7.452 7.816 8.226 8.673 9.156 9.679 10.22 10.697 10.997 10.93 10.63 10.339 9.95 9.449 9.041 8.626 8.244 7.907 7.597 7.315 7.063 6.835 6.613 6.393 6.162 5.943 5.745 5.534 5.298 5.097 4.861 4.614 4.435 4.242 4.031 3.809 3.599 3.463 3.32 3.088 2.917 2.73 2.639 2.463 2.272 2.046 1.929 1.716 1.569 1.443 1.307 1.022 0.848 0.651 0.451 0.216 -0.059 -0.399 -1.696 -9 ,5571 ,TETRA ,17556347,Fri Nov 26 06:38:38 CET,Fri Nov 26 08:54:27 CET,0.0 0.417 0.646 0.818 0.957 1.096 1.24 1.371 1.594 1.694 1.782 1.837 2.009 2.086 2.248 2.404 2.553 2.623 2.767 2.887 3.059 3.178 3.292 3.443 3.59 3.746 3.903 4.057 4.242 4.419 4.61 4.819 5.001 5.189 5.414 5.677 5.908 6.158 6.436 6.745 7.073 7.454 7.839 8.129 8.476 8.887 9.345 9.837 10.365 10.918 11.415 11.492 11.257 10.801 10.239 9.732 9.293 8.887 8.55 8.211 7.865 7.517 7.196 6.891 6.607 6.361 6.09 5.833 5.61 5.383 5.138 4.926 4.711 4.492 4.313 4.112 3.91 3.719 3.537 3.395 3.229 2.959 2.758 2.549 2.443 2.226 2.002 1.782 1.672 1.464 1.347 1.228 1.084 0.772 0.602 0.412 0.225 0.013 -0.204 -0.502 -1.108 -10 ,9916 ,TETRA ,17556348,Fri Nov 26 06:39:37 CET,Fri Nov 26 08:57:50 CET,0.0 0.572 0.788 0.948 1.099 1.229 1.337 1.437 1.638 1.738 1.831 1.897 2.082 2.164 2.328 2.476 2.61 2.673 2.802 2.925 3.089 3.195 3.299 3.447 3.584 3.711 3.836 3.975 4.155 4.317 4.463 4.636 4.818 5.001 5.216 5.454 5.693 5.95 6.209 6.477 6.77 7.098 7.458 7.815 8.199 8.657 9.191 9.666 10.136 10.618 10.982 10.934 10.64 10.255 9.758 9.178 8.676 8.253 7.891 7.487 7.098 6.766 6.426 6.103 5.838 5.597 5.334 5.085 4.875 4.669 4.441 4.252 4.074 3.89 3.756 3.613 3.43 3.236 3.037 2.905 2.766 2.528 2.372 2.21 2.12 1.927 1.75 1.573 1.464 1.254 1.133 1.012 0.879 0.599 0.418 0.203 -0.018 -0.266 -0.529 -0.848 -1.423 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_36_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_36_37.txt deleted file mode 100644 index 6b71f99d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_36_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8618 ,TETRA ,17556349,Fri Nov 26 06:39:38 CET,Fri Nov 26 08:44:54 CET,0.0 1.156 1.545 1.841 2.079 2.274 2.453 2.608 2.897 3.03 3.143 3.254 3.458 3.559 3.73 3.884 4.022 4.089 4.238 4.375 4.549 4.665 4.777 4.931 5.08 5.224 5.365 5.495 5.644 5.789 5.932 6.101 6.268 6.414 6.564 6.757 6.946 7.128 7.307 7.497 7.691 7.893 8.122 8.332 8.55 8.762 8.938 9.052 9.084 8.944 8.41 7.514 6.649 5.896 5.267 4.657 4.108 3.633 3.197 2.721 2.303 1.939 1.559 1.184 0.849 0.557 0.268 -0.002 -0.246 -0.479 -0.726 -0.931 -1.15 -1.401 -1.602 -1.815 -2.047 -2.288 -2.522 -2.679 -2.842 -3.092 -3.283 -3.488 -3.581 -3.756 -3.94 -4.146 -4.263 -4.489 -4.613 -4.737 -4.875 -5.188 -5.364 -5.562 -5.78 -6.006 -6.263 -6.597 -7.924 -2 ,17749 ,TETRA ,17556350,Fri Nov 26 06:39:38 CET,Fri Nov 26 08:58:39 CET,0.0 1.48 1.874 2.153 2.381 2.583 2.754 2.913 3.203 3.336 3.467 3.599 3.802 3.905 4.106 4.269 4.401 4.474 4.616 4.735 4.906 5.019 5.13 5.298 5.458 5.612 5.765 5.909 6.085 6.244 6.404 6.595 6.763 6.926 7.113 7.315 7.499 7.68 7.868 8.088 8.312 8.533 8.78 9.008 9.245 9.488 9.719 9.934 10.091 10.029 9.573 8.753 7.989 7.281 6.648 6.099 5.625 5.166 4.757 4.348 3.978 3.67 3.389 3.107 2.838 2.585 2.322 2.085 1.87 1.641 1.391 1.175 0.945 0.702 0.521 0.361 0.199 0.008 -0.184 -0.317 -0.464 -0.699 -0.874 -1.059 -1.142 -1.312 -1.495 -1.676 -1.79 -2.02 -2.141 -2.264 -2.388 -2.656 -2.833 -3.007 -3.166 -3.377 -3.661 -4.006 -4.974 -3 ,13457 ,TETRA ,17556351,Fri Nov 26 06:39:37 CET,Fri Nov 26 08:56:29 CET,0.0 1.418 1.823 2.081 2.311 2.526 2.715 2.895 3.206 3.338 3.457 3.57 3.778 3.877 4.044 4.206 4.363 4.439 4.59 4.735 4.93 5.049 5.159 5.316 5.466 5.605 5.749 5.883 6.036 6.19 6.355 6.547 6.709 6.855 7.014 7.175 7.319 7.482 7.678 7.899 8.128 8.341 8.524 8.689 8.889 9.095 9.306 9.584 9.767 9.59 8.971 7.985 7.03 6.199 5.428 4.73 4.147 3.61 3.152 2.679 2.253 1.847 1.451 1.082 0.735 0.442 0.136 -0.152 -0.394 -0.626 -0.857 -1.055 -1.266 -1.488 -1.667 -1.847 -2.021 -2.243 -2.472 -2.61 -2.772 -3.021 -3.171 -3.335 -3.425 -3.596 -3.774 -4.006 -4.127 -4.352 -4.509 -4.644 -4.788 -5.103 -5.264 -5.43 -5.607 -5.815 -6.087 -6.445 -7.259 -4 ,21569 ,TETRA ,17556352,Fri Nov 26 06:39:38 CET,Fri Nov 26 08:56:17 CET,0.0 1.495 1.935 2.232 2.484 2.712 2.913 3.08 3.359 3.486 3.612 3.739 3.945 4.049 4.247 4.403 4.542 4.612 4.757 4.901 5.101 5.228 5.355 5.547 5.722 5.888 6.043 6.178 6.344 6.506 6.656 6.842 7.015 7.161 7.324 7.481 7.614 7.778 7.966 8.158 8.352 8.548 8.755 8.952 9.144 9.309 9.462 9.576 9.558 9.329 8.717 7.83 7.013 6.235 5.545 4.955 4.41 3.892 3.419 2.898 2.454 2.085 1.742 1.413 1.111 0.821 0.517 0.267 0.054 -0.164 -0.402 -0.625 -0.88 -1.14 -1.341 -1.549 -1.744 -1.937 -2.149 -2.299 -2.457 -2.702 -2.877 -3.066 -3.162 -3.35 -3.541 -3.737 -3.85 -4.095 -4.265 -4.394 -4.522 -4.808 -4.988 -5.178 -5.368 -5.618 -5.953 -6.337 -7.312 -5 ,26410 ,TETRA ,17556353,Fri Nov 26 06:40:39 CET,Fri Nov 26 08:58:34 CET,0.0 1.238 1.67 1.965 2.215 2.435 2.636 2.823 3.129 3.271 3.405 3.534 3.742 3.848 4.042 4.223 4.375 4.443 4.578 4.713 4.912 5.035 5.15 5.322 5.486 5.637 5.785 5.919 6.073 6.225 6.373 6.533 6.683 6.823 6.971 7.129 7.283 7.45 7.62 7.789 7.959 8.14 8.339 8.518 8.725 8.932 9.09 9.216 9.262 9.142 8.69 7.936 7.171 6.432 5.75 5.114 4.556 4.029 3.562 3.038 2.594 2.256 1.912 1.55 1.234 0.96 0.629 0.32 0.059 -0.221 -0.511 -0.739 -0.98 -1.229 -1.42 -1.632 -1.853 -2.076 -2.306 -2.464 -2.628 -2.88 -3.054 -3.237 -3.335 -3.54 -3.747 -3.984 -4.118 -4.358 -4.496 -4.612 -4.739 -5.046 -5.221 -5.407 -5.607 -5.852 -6.175 -6.547 -8.007 -6 ,28687 ,TETRA ,17556354,Fri Nov 26 06:40:39 CET,Fri Nov 26 08:56:07 CET,0.0 1.443 1.914 2.234 2.466 2.663 2.849 3.024 3.326 3.457 3.568 3.645 3.84 3.93 4.102 4.261 4.412 4.48 4.596 4.712 4.878 4.979 5.075 5.218 5.356 5.486 5.622 5.752 5.912 6.067 6.219 6.402 6.572 6.728 6.897 7.074 7.247 7.444 7.647 7.868 8.071 8.254 8.469 8.666 8.879 9.079 9.199 9.228 9.163 8.971 8.555 7.729 6.798 5.953 5.274 4.644 4.05 3.476 2.934 2.382 1.909 1.507 1.133 0.762 0.411 0.084 -0.235 -0.499 -0.728 -0.969 -1.226 -1.438 -1.664 -1.896 -2.085 -2.29 -2.509 -2.743 -2.969 -3.13 -3.29 -3.535 -3.715 -3.894 -3.977 -4.143 -4.344 -4.568 -4.679 -4.891 -5.005 -5.133 -5.267 -5.54 -5.692 -5.871 -6.113 -6.363 -6.575 -6.831 -7.958 -7 ,9826 ,TETRA ,17556355,Fri Nov 26 06:40:39 CET,Fri Nov 26 08:53:56 CET,0.0 1.215 1.623 1.892 2.138 2.341 2.516 2.677 2.945 3.074 3.196 3.315 3.51 3.591 3.762 3.92 4.05 4.11 4.236 4.371 4.569 4.69 4.801 4.961 5.102 5.235 5.372 5.497 5.632 5.762 5.892 6.055 6.219 6.37 6.539 6.728 6.912 7.118 7.339 7.545 7.763 7.989 8.18 8.36 8.551 8.711 8.857 8.972 9.003 8.896 8.434 7.619 6.903 6.236 5.565 4.924 4.391 3.923 3.516 3.097 2.729 2.392 2.064 1.765 1.479 1.219 0.955 0.689 0.447 0.219 -0.023 -0.247 -0.484 -0.724 -0.922 -1.127 -1.343 -1.577 -1.81 -1.972 -2.132 -2.37 -2.538 -2.704 -2.79 -2.981 -3.181 -3.368 -3.479 -3.711 -3.862 -3.983 -4.094 -4.383 -4.551 -4.759 -4.994 -5.214 -5.432 -5.731 -6.925 -8 ,24259 ,TETRA ,17556356,Fri Nov 26 06:41:39 CET,Fri Nov 26 08:57:01 CET,0.0 1.851 2.333 2.661 2.908 3.12 3.301 3.469 3.793 3.928 4.041 4.147 4.346 4.444 4.631 4.793 4.935 5.009 5.152 5.293 5.497 5.625 5.748 5.922 6.08 6.225 6.367 6.502 6.659 6.822 6.983 7.154 7.32 7.48 7.648 7.832 8.026 8.233 8.425 8.626 8.85 9.067 9.276 9.488 9.696 9.934 10.204 10.381 10.442 10.366 10.045 9.261 8.376 7.6 6.905 6.261 5.69 5.169 4.717 4.279 3.906 3.582 3.277 2.961 2.663 2.387 2.1 1.858 1.643 1.408 1.155 0.948 0.734 0.498 0.311 0.11 -0.11 -0.328 -0.545 -0.684 -0.823 -1.059 -1.221 -1.392 -1.484 -1.681 -1.875 -2.071 -2.18 -2.396 -2.516 -2.64 -2.774 -3.066 -3.222 -3.38 -3.561 -3.772 -4.024 -4.319 -5.515 -9 ,22438 ,TETRA ,17556357,Fri Nov 26 06:41:38 CET,Fri Nov 26 08:44:17 CET,0.0 1.529 1.96 2.249 2.481 2.69 2.876 3.04 3.332 3.465 3.593 3.738 3.954 4.056 4.243 4.411 4.573 4.652 4.808 4.949 5.142 5.262 5.375 5.556 5.741 5.904 6.053 6.186 6.358 6.54 6.718 6.924 7.088 7.24 7.443 7.687 7.902 8.126 8.355 8.576 8.783 8.992 9.267 9.55 9.848 10.133 10.391 10.493 10.436 10.276 9.798 9.014 8.207 7.436 6.739 6.126 5.559 4.989 4.515 4.055 3.646 3.286 2.949 2.606 2.27 1.969 1.65 1.378 1.15 0.919 0.678 0.474 0.276 0.065 -0.109 -0.269 -0.431 -0.621 -0.826 -0.968 -1.118 -1.34 -1.487 -1.645 -1.727 -1.892 -2.067 -2.258 -2.362 -2.587 -2.714 -2.833 -2.957 -3.211 -3.359 -3.532 -3.705 -3.878 -4.112 -4.499 -6.946 -10 ,29586 ,TETRA ,17556358,Fri Nov 26 06:41:39 CET,Fri Nov 26 09:00:45 CET,0.0 1.698 2.199 2.577 2.839 3.041 3.22 3.388 3.662 3.782 3.899 4.007 4.201 4.3 4.495 4.674 4.836 4.907 5.043 5.177 5.36 5.472 5.583 5.748 5.892 6.032 6.169 6.284 6.42 6.549 6.682 6.844 6.979 7.101 7.255 7.428 7.591 7.753 7.932 8.136 8.349 8.592 8.849 9.059 9.243 9.417 9.582 9.697 9.752 9.639 9.193 8.463 7.69 6.953 6.27 5.641 5.084 4.565 4.111 3.683 3.342 3.03 2.722 2.414 2.102 1.827 1.554 1.287 1.036 0.773 0.492 0.266 0.045 -0.186 -0.358 -0.547 -0.752 -0.953 -1.169 -1.314 -1.46 -1.699 -1.872 -2.052 -2.147 -2.333 -2.495 -2.673 -2.773 -2.982 -3.091 -3.21 -3.335 -3.604 -3.779 -3.981 -4.163 -4.342 -4.577 -4.887 -6.644 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_37_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_37_19.txt deleted file mode 100644 index e9ae76ea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_37_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,173 ,TETRA ,17556359,Fri Nov 26 06:42:37 CET,Fri Nov 26 08:56:16 CET,0.0 0.302 0.433 0.537 0.63 0.726 0.823 0.905 1.047 1.109 1.167 1.166 1.318 1.37 1.489 1.587 1.664 1.703 1.782 1.854 1.942 1.996 2.049 2.128 2.212 2.298 2.376 2.449 2.542 2.621 2.697 2.804 2.903 2.987 3.079 3.179 3.267 3.363 3.48 3.593 3.683 3.772 3.882 3.983 4.079 4.186 4.255 4.27 4.205 4.011 3.436 2.483 1.592 0.758 0.0 -0.744 -1.43 -2.02 -2.527 -3.119 -3.635 -4.061 -4.449 -4.81 -5.151 -5.464 -5.812 -6.118 -6.373 -6.655 -6.95 -7.177 -7.423 -7.688 -7.891 -8.106 -8.335 -8.582 -8.853 -9.059 -9.298 -9.674 -9.926 -10.177 -10.305 -10.571 -10.865 -11.232 -11.425 -11.712 -11.913 -12.085 -12.272 -12.694 -12.927 -13.172 -13.45 -13.785 -14.251 -14.943 -16.686 -2 ,6097 ,TETRA ,17556360,Fri Nov 26 06:42:38 CET,Fri Nov 26 08:35:37 CET,0.0 0.265 0.382 0.469 0.537 0.601 0.664 0.729 0.835 0.886 0.937 0.94 1.106 1.158 1.261 1.348 1.42 1.457 1.533 1.606 1.703 1.767 1.834 1.913 1.987 2.065 2.134 2.201 2.289 2.371 2.452 2.539 2.622 2.705 2.808 2.917 3.011 3.119 3.232 3.344 3.463 3.577 3.713 3.858 4.012 4.159 4.276 4.353 4.358 4.257 3.851 3.082 2.356 1.631 0.901 0.226 -0.325 -0.809 -1.249 -1.753 -2.214 -2.608 -2.962 -3.28 -3.595 -3.902 -4.215 -4.476 -4.695 -4.935 -5.197 -5.43 -5.665 -5.89 -6.07 -6.264 -6.475 -6.699 -6.927 -7.078 -7.238 -7.495 -7.677 -7.881 -7.984 -8.202 -8.464 -8.751 -8.882 -9.123 -9.289 -9.444 -9.619 -10.006 -10.215 -10.465 -10.748 -11.045 -11.395 -11.92 -13.892 -3 ,17145 ,TETRA ,17556361,Fri Nov 26 06:43:41 CET,Fri Nov 26 09:00:47 CET,0.0 0.186 0.332 0.466 0.558 0.634 0.733 0.823 0.959 1.03 1.089 1.077 1.231 1.281 1.397 1.508 1.601 1.643 1.723 1.8 1.932 2.015 2.085 2.19 2.292 2.392 2.484 2.561 2.658 2.761 2.865 2.977 3.074 3.173 3.292 3.424 3.567 3.715 3.855 4.005 4.158 4.319 4.496 4.672 4.856 4.987 5.077 5.14 5.125 4.986 4.495 3.694 2.984 2.312 1.646 1.027 0.476 -0.054 -0.504 -0.944 -1.322 -1.675 -2.023 -2.354 -2.664 -2.929 -3.223 -3.529 -3.791 -4.043 -4.334 -4.59 -4.857 -5.135 -5.366 -5.602 -5.834 -6.099 -6.368 -6.546 -6.746 -7.085 -7.31 -7.547 -7.679 -7.966 -8.272 -8.608 -8.786 -9.078 -9.34 -9.541 -9.758 -10.213 -10.447 -10.724 -11.08 -11.506 -12.102 -13.028 -16.283 -4 ,23274 ,TETRA ,17556362,Fri Nov 26 06:43:40 CET,Fri Nov 26 08:57:34 CET,0.0 0.403 0.522 0.59 0.681 0.764 0.827 0.892 1.011 1.067 1.123 1.121 1.284 1.335 1.443 1.547 1.633 1.673 1.752 1.84 1.965 2.042 2.115 2.214 2.313 2.405 2.487 2.565 2.661 2.745 2.835 2.966 3.089 3.187 3.294 3.413 3.516 3.634 3.753 3.879 4.018 4.168 4.331 4.482 4.636 4.772 4.917 5.01 5.023 4.963 4.568 3.86 3.106 2.354 1.698 1.047 0.393 -0.188 -0.632 -1.062 -1.426 -1.755 -2.098 -2.435 -2.774 -3.089 -3.4 -3.67 -3.902 -4.154 -4.409 -4.629 -4.862 -5.11 -5.317 -5.507 -5.684 -5.887 -6.121 -6.317 -6.552 -6.948 -7.207 -7.458 -7.594 -7.857 -8.119 -8.401 -8.533 -8.777 -8.967 -9.12 -9.283 -9.64 -9.843 -10.105 -10.436 -10.857 -11.315 -11.813 -13.385 -5 ,17800 ,TETRA ,17556363,Fri Nov 26 06:43:41 CET,Fri Nov 26 08:58:26 CET,0.0 0.389 0.527 0.622 0.728 0.83 0.92 0.988 1.105 1.16 1.218 1.235 1.403 1.465 1.568 1.656 1.734 1.774 1.859 1.933 2.044 2.12 2.187 2.276 2.362 2.445 2.525 2.601 2.699 2.777 2.85 2.962 3.071 3.164 3.271 3.381 3.48 3.596 3.725 3.865 4.001 4.144 4.292 4.417 4.548 4.668 4.798 4.902 4.904 4.801 4.384 3.636 2.871 2.149 1.521 0.954 0.445 -0.051 -0.498 -0.94 -1.325 -1.735 -2.206 -2.645 -3.019 -3.361 -3.711 -4.015 -4.271 -4.535 -4.805 -5.007 -5.233 -5.517 -5.744 -5.958 -6.183 -6.453 -6.727 -6.913 -7.126 -7.463 -7.703 -7.959 -8.098 -8.394 -8.682 -8.975 -9.142 -9.444 -9.731 -9.959 -10.178 -10.603 -10.857 -11.164 -11.495 -11.865 -12.318 -12.914 -14.744 -6 ,31059 ,TETRA ,17556364,Fri Nov 26 06:43:41 CET,Fri Nov 26 08:58:33 CET,0.0 0.356 0.606 0.744 0.839 0.933 1.023 1.083 1.195 1.259 1.315 1.315 1.483 1.54 1.635 1.721 1.809 1.85 1.928 2.003 2.12 2.193 2.259 2.363 2.456 2.541 2.624 2.7 2.8 2.893 2.998 3.129 3.236 3.335 3.451 3.561 3.664 3.791 3.917 4.046 4.179 4.312 4.44 4.54 4.651 4.778 4.909 4.971 4.915 4.721 4.224 3.364 2.458 1.606 0.865 0.184 -0.444 -0.968 -1.417 -1.897 -2.317 -2.679 -3.019 -3.365 -3.729 -4.086 -4.434 -4.724 -4.987 -5.261 -5.552 -5.798 -6.042 -6.31 -6.529 -6.75 -6.978 -7.218 -7.471 -7.662 -7.857 -8.163 -8.371 -8.581 -8.701 -8.971 -9.284 -9.64 -9.828 -10.136 -10.424 -10.619 -10.82 -11.308 -11.604 -11.928 -12.271 -12.643 -13.037 -13.512 -15.583 -7 ,8033 ,TETRA ,17556365,Fri Nov 26 06:43:41 CET,Fri Nov 26 08:44:29 CET,0.0 0.459 0.618 0.744 0.843 0.918 1.002 1.079 1.215 1.276 1.329 1.317 1.466 1.512 1.617 1.711 1.807 1.849 1.928 2.003 2.101 2.174 2.249 2.345 2.436 2.529 2.613 2.693 2.798 2.907 3.013 3.136 3.25 3.348 3.457 3.571 3.687 3.814 3.936 4.059 4.177 4.295 4.423 4.532 4.654 4.771 4.85 4.908 4.93 4.784 4.256 3.405 2.537 1.782 1.133 0.542 0.042 -0.441 -0.895 -1.345 -1.72 -2.063 -2.406 -2.742 -3.075 -3.405 -3.761 -4.081 -4.368 -4.662 -4.962 -5.215 -5.48 -5.765 -5.989 -6.223 -6.45 -6.656 -6.879 -7.04 -7.212 -7.486 -7.668 -7.863 -7.97 -8.197 -8.428 -8.67 -8.813 -9.097 -9.364 -9.564 -9.758 -10.197 -10.46 -10.742 -11.084 -11.478 -11.95 -12.589 -14.8 -8 ,9850 ,TETRA ,17556366,Fri Nov 26 06:43:41 CET,Fri Nov 26 08:58:24 CET,0.0 0.241 0.36 0.466 0.566 0.637 0.711 0.79 0.927 0.99 1.05 1.057 1.216 1.267 1.363 1.464 1.561 1.609 1.703 1.789 1.9 1.961 2.02 2.106 2.19 2.271 2.359 2.448 2.551 2.65 2.744 2.847 2.941 3.028 3.129 3.237 3.338 3.463 3.592 3.715 3.842 3.975 4.118 4.261 4.394 4.506 4.614 4.661 4.622 4.418 3.909 3.091 2.219 1.438 0.755 0.097 -0.488 -1.005 -1.469 -1.934 -2.346 -2.732 -3.081 -3.405 -3.731 -4.052 -4.414 -4.735 -5.001 -5.263 -5.53 -5.759 -5.992 -6.242 -6.436 -6.641 -6.889 -7.196 -7.497 -7.681 -7.901 -8.268 -8.503 -8.729 -8.848 -9.101 -9.381 -9.709 -9.876 -10.137 -10.322 -10.489 -10.676 -11.115 -11.378 -11.684 -12.005 -12.337 -12.768 -13.4 -16.192 -9 ,10553 ,TETRA ,17556367,Fri Nov 26 06:43:42 CET,Fri Nov 26 08:57:56 CET,0.0 0.155 0.289 0.422 0.508 0.581 0.654 0.721 0.823 0.861 0.908 0.902 1.049 1.104 1.205 1.27 1.339 1.38 1.467 1.55 1.667 1.733 1.799 1.904 2.003 2.089 2.169 2.255 2.375 2.48 2.572 2.682 2.78 2.861 2.956 3.092 3.234 3.383 3.551 3.714 3.858 4.002 4.154 4.283 4.411 4.542 4.634 4.692 4.725 4.635 4.261 3.588 2.895 2.167 1.466 0.897 0.391 -0.108 -0.507 -0.925 -1.327 -1.687 -2.021 -2.346 -2.651 -2.936 -3.25 -3.542 -3.781 -4.027 -4.309 -4.565 -4.848 -5.149 -5.391 -5.632 -5.865 -6.109 -6.375 -6.569 -6.771 -7.074 -7.295 -7.517 -7.626 -7.876 -8.148 -8.428 -8.566 -8.82 -8.988 -9.14 -9.316 -9.732 -9.962 -10.177 -10.432 -10.744 -11.126 -11.712 -13.537 -10 ,17197 ,TETRA ,17556368,Fri Nov 26 06:43:41 CET,Fri Nov 26 08:59:34 CET,0.0 0.417 0.563 0.663 0.745 0.832 0.911 0.976 1.104 1.166 1.214 1.201 1.368 1.438 1.545 1.643 1.739 1.778 1.844 1.911 2.007 2.077 2.142 2.22 2.301 2.385 2.467 2.546 2.644 2.733 2.811 2.902 2.998 3.099 3.209 3.314 3.409 3.504 3.609 3.725 3.83 3.933 4.035 4.131 4.249 4.376 4.496 4.559 4.51 4.281 3.759 2.949 2.116 1.328 0.618 -0.041 -0.609 -1.139 -1.604 -2.058 -2.461 -2.843 -3.187 -3.491 -3.827 -4.145 -4.469 -4.775 -5.022 -5.272 -5.56 -5.805 -6.032 -6.269 -6.466 -6.672 -6.899 -7.147 -7.397 -7.562 -7.726 -7.996 -8.202 -8.419 -8.531 -8.772 -9.03 -9.288 -9.427 -9.713 -9.96 -10.139 -10.34 -10.756 -10.985 -11.253 -11.558 -11.907 -12.367 -12.978 -14.902 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_37_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_37_26.txt deleted file mode 100644 index 1697dd6f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_37_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14583 ,TETRA ,17556369,Fri Nov 26 06:44:39 CET,Fri Nov 26 08:48:09 CET,0.0 0.521 0.815 1.065 1.282 1.455 1.601 1.733 1.971 2.082 2.189 2.283 2.486 2.582 2.768 2.971 3.169 3.256 3.412 3.558 3.778 3.914 4.045 4.237 4.412 4.58 4.739 4.879 5.051 5.218 5.384 5.583 5.767 5.932 6.119 6.32 6.511 6.719 6.933 7.167 7.398 7.64 7.881 8.066 8.294 8.557 8.772 8.92 9.058 9.059 8.642 7.886 7.216 6.604 6.018 5.427 4.851 4.316 3.887 3.432 3.013 2.656 2.311 1.998 1.677 1.37 1.043 0.736 0.503 0.27 -0.04 -0.339 -0.615 -0.86 -1.047 -1.266 -1.517 -1.765 -1.995 -2.156 -2.327 -2.598 -2.793 -2.987 -3.088 -3.314 -3.548 -3.789 -3.918 -4.171 -4.404 -4.601 -4.784 -5.187 -5.413 -5.639 -5.902 -6.206 -6.617 -7.268 -9.06 -2 ,23280 ,TETRA ,17556370,Fri Nov 26 06:45:38 CET,Fri Nov 26 09:02:13 CET,0.0 0.86 1.152 1.379 1.591 1.79 1.957 2.099 2.349 2.475 2.59 2.662 2.864 2.956 3.114 3.265 3.412 3.491 3.645 3.786 3.967 4.085 4.204 4.37 4.533 4.691 4.838 4.987 5.192 5.375 5.541 5.744 5.935 6.116 6.331 6.561 6.75 6.951 7.171 7.423 7.694 7.963 8.242 8.506 8.78 9.034 9.256 9.453 9.633 9.661 9.317 8.589 7.831 7.118 6.458 5.82 5.258 4.749 4.279 3.817 3.421 3.049 2.707 2.358 2.007 1.705 1.407 1.133 0.876 0.607 0.336 0.109 -0.127 -0.355 -0.525 -0.718 -0.927 -1.15 -1.391 -1.539 -1.696 -1.954 -2.129 -2.327 -2.425 -2.621 -2.83 -3.063 -3.196 -3.446 -3.636 -3.797 -3.968 -4.349 -4.561 -4.793 -5.061 -5.36 -5.761 -6.372 -9.152 -3 ,32470 ,TETRA ,17556371,Fri Nov 26 06:44:38 CET,Fri Nov 26 09:00:52 CET,0.0 0.577 0.873 1.098 1.284 1.444 1.606 1.759 2.021 2.138 2.237 2.325 2.531 2.634 2.82 2.98 3.149 3.233 3.395 3.537 3.734 3.86 3.984 4.159 4.313 4.455 4.587 4.696 4.842 4.997 5.156 5.348 5.523 5.695 5.897 6.12 6.327 6.538 6.753 6.978 7.218 7.492 7.76 8.013 8.29 8.515 8.74 8.963 9.143 9.226 9.034 8.482 7.815 7.113 6.453 5.834 5.254 4.714 4.276 3.821 3.409 3.055 2.728 2.419 2.125 1.865 1.584 1.317 1.069 0.79 0.529 0.328 0.101 -0.154 -0.359 -0.552 -0.757 -0.983 -1.228 -1.41 -1.616 -1.969 -2.211 -2.446 -2.556 -2.768 -2.984 -3.222 -3.356 -3.611 -3.829 -3.992 -4.162 -4.561 -4.766 -5.01 -5.315 -5.645 -6.058 -6.692 -8.436 -4 ,24509 ,TETRA ,17556372,Fri Nov 26 06:44:39 CET,Fri Nov 26 08:59:45 CET,0.0 1.035 1.355 1.57 1.736 1.867 1.997 2.136 2.404 2.518 2.63 2.75 2.951 3.046 3.233 3.416 3.581 3.66 3.803 3.934 4.13 4.264 4.383 4.53 4.685 4.845 4.997 5.133 5.309 5.477 5.628 5.806 5.968 6.133 6.322 6.526 6.717 6.91 7.103 7.301 7.524 7.744 7.968 8.199 8.453 8.69 8.913 9.091 9.192 9.188 8.8 8.043 7.241 6.484 5.87 5.295 4.746 4.238 3.775 3.313 2.937 2.57 2.206 1.873 1.57 1.302 1.016 0.764 0.542 0.295 0.034 -0.191 -0.417 -0.659 -0.861 -1.071 -1.3 -1.523 -1.751 -1.913 -2.07 -2.336 -2.517 -2.703 -2.807 -3.045 -3.312 -3.567 -3.692 -3.934 -4.104 -4.253 -4.428 -4.828 -5.04 -5.265 -5.514 -5.827 -6.18 -6.653 -7.893 -5 ,31815 ,TETRA ,17556373,Fri Nov 26 06:44:41 CET,Fri Nov 26 08:59:50 CET,0.0 1.027 1.399 1.638 1.812 1.944 2.087 2.24 2.496 2.606 2.717 2.813 3.009 3.102 3.276 3.441 3.608 3.684 3.821 3.958 4.172 4.303 4.42 4.596 4.756 4.902 5.052 5.184 5.352 5.524 5.69 5.878 6.063 6.255 6.454 6.662 6.863 7.075 7.306 7.559 7.829 8.11 8.381 8.641 8.943 9.207 9.468 9.699 9.836 9.838 9.42 8.628 7.918 7.279 6.707 6.149 5.606 5.1 4.682 4.227 3.818 3.475 3.129 2.81 2.542 2.278 1.994 1.749 1.537 1.316 1.09 0.908 0.715 0.506 0.336 0.134 -0.083 -0.306 -0.546 -0.716 -0.897 -1.186 -1.385 -1.592 -1.71 -1.962 -2.212 -2.462 -2.588 -2.833 -3.028 -3.202 -3.383 -3.81 -4.064 -4.344 -4.643 -4.996 -5.407 -5.934 -8.072 -6 ,1472 ,TETRA ,17556374,Fri Nov 26 06:44:40 CET,Fri Nov 26 09:00:37 CET,0.0 0.856 1.124 1.34 1.506 1.669 1.818 1.941 2.158 2.275 2.382 2.444 2.628 2.705 2.864 3.016 3.148 3.214 3.343 3.47 3.668 3.791 3.9 4.056 4.207 4.357 4.503 4.638 4.803 4.954 5.106 5.282 5.457 5.624 5.794 5.976 6.161 6.359 6.565 6.794 7.045 7.328 7.638 7.906 8.17 8.428 8.646 8.832 8.989 9.008 8.651 7.92 7.14 6.39 5.7 5.066 4.519 4.032 3.575 3.069 2.664 2.304 1.95 1.631 1.328 1.067 0.795 0.537 0.331 0.106 -0.147 -0.352 -0.575 -0.821 -1.032 -1.246 -1.437 -1.643 -1.888 -2.064 -2.242 -2.532 -2.749 -2.964 -3.071 -3.286 -3.499 -3.756 -3.89 -4.137 -4.318 -4.474 -4.647 -5.013 -5.219 -5.456 -5.758 -6.105 -6.499 -7.045 -8.848 -7 ,23540 ,TETRA ,17556375,Fri Nov 26 06:44:40 CET,Fri Nov 26 09:05:15 CET,0.0 0.816 1.113 1.364 1.589 1.78 1.944 2.092 2.376 2.512 2.634 2.753 2.953 3.055 3.267 3.471 3.656 3.74 3.898 4.045 4.252 4.378 4.498 4.672 4.837 4.988 5.129 5.262 5.438 5.608 5.773 5.964 6.145 6.327 6.533 6.759 6.96 7.171 7.398 7.618 7.836 8.076 8.337 8.603 8.914 9.218 9.523 9.808 10.043 10.145 9.854 9.114 8.39 7.728 7.1 6.522 5.987 5.497 5.063 4.599 4.217 3.861 3.51 3.18 2.855 2.544 2.204 1.904 1.658 1.399 1.121 0.894 0.649 0.404 0.211 -0.011 -0.252 -0.5 -0.734 -0.896 -1.08 -1.378 -1.561 -1.749 -1.857 -2.086 -2.309 -2.544 -2.673 -2.932 -3.12 -3.276 -3.444 -3.819 -4.032 -4.272 -4.555 -4.897 -5.309 -5.803 -7.427 -8 ,11502 ,TETRA ,17556376,Fri Nov 26 06:45:38 CET,Fri Nov 26 09:03:04 CET,0.0 1.524 1.885 2.135 2.347 2.525 2.673 2.814 3.051 3.183 3.333 3.484 3.696 3.796 3.987 4.152 4.306 4.375 4.52 4.669 4.879 5.009 5.129 5.297 5.445 5.599 5.751 5.908 6.118 6.313 6.494 6.693 6.888 7.071 7.269 7.495 7.712 7.943 8.167 8.386 8.616 8.877 9.154 9.429 9.709 9.943 10.193 10.429 10.619 10.652 10.338 9.609 8.87 8.145 7.392 6.64 5.98 5.441 4.982 4.521 4.124 3.767 3.449 3.149 2.853 2.577 2.295 2.034 1.791 1.52 1.231 0.982 0.714 0.436 0.217 0.005 -0.21 -0.43 -0.651 -0.814 -0.989 -1.24 -1.424 -1.629 -1.727 -1.938 -2.181 -2.433 -2.566 -2.817 -2.979 -3.132 -3.292 -3.682 -3.91 -4.144 -4.397 -4.694 -5.063 -5.553 -7.468 -9 ,15209 ,TETRA ,17556377,Fri Nov 26 06:45:38 CET,Fri Nov 26 09:04:17 CET,0.0 0.994 1.291 1.497 1.681 1.853 1.993 2.129 2.406 2.522 2.623 2.737 2.954 3.055 3.232 3.389 3.539 3.612 3.773 3.927 4.135 4.256 4.369 4.542 4.708 4.864 5.016 5.163 5.35 5.525 5.692 5.897 6.097 6.287 6.496 6.699 6.881 7.076 7.273 7.485 7.707 7.946 8.207 8.443 8.718 9.008 9.259 9.476 9.642 9.739 9.523 8.853 8.187 7.54 6.901 6.291 5.759 5.254 4.797 4.361 3.975 3.62 3.261 2.909 2.611 2.336 2.041 1.791 1.584 1.362 1.12 0.909 0.674 0.425 0.232 0.024 -0.172 -0.358 -0.587 -0.753 -0.916 -1.172 -1.359 -1.566 -1.675 -1.91 -2.149 -2.392 -2.53 -2.795 -2.989 -3.142 -3.31 -3.715 -3.949 -4.216 -4.496 -4.799 -5.179 -5.714 -7.561 -10 ,23917 ,TETRA ,17556378,Fri Nov 26 06:45:38 CET,Fri Nov 26 09:01:53 CET,0.0 0.858 1.14 1.357 1.516 1.646 1.776 1.905 2.123 2.222 2.314 2.378 2.567 2.647 2.806 2.965 3.111 3.183 3.32 3.459 3.648 3.758 3.866 4.029 4.202 4.362 4.499 4.635 4.816 4.997 5.174 5.374 5.553 5.721 5.935 6.173 6.378 6.603 6.858 7.127 7.407 7.705 8.021 8.325 8.639 8.964 9.312 9.626 9.865 9.955 9.74 9.098 8.335 7.614 6.951 6.317 5.751 5.229 4.777 4.299 3.883 3.519 3.16 2.809 2.472 2.176 1.881 1.607 1.365 1.111 0.841 0.62 0.386 0.141 -0.042 -0.233 -0.431 -0.64 -0.861 -1.007 -1.158 -1.397 -1.57 -1.778 -1.881 -2.094 -2.333 -2.58 -2.71 -2.959 -3.126 -3.276 -3.446 -3.881 -4.131 -4.375 -4.657 -4.991 -5.411 -6.008 -8.261 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_37_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_37_32.txt deleted file mode 100644 index 5d3500be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_37_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2029 ,TETRA ,17556379,Fri Nov 26 06:45:39 CET,Fri Nov 26 09:00:00 CET,0.0 0.303 0.451 0.604 0.737 0.812 0.842 0.87 0.96 1.001 1.026 0.968 1.098 1.123 1.166 1.2 1.237 1.253 1.274 1.299 1.331 1.341 1.352 1.369 1.382 1.389 1.402 1.417 1.432 1.435 1.417 1.401 1.385 1.358 1.325 1.279 1.217 1.15 1.089 0.999 0.877 0.726 0.524 0.297 -0.016 -0.424 -0.945 -1.642 -2.652 -4.168 -6.591 -9.286 -11.383 -13.087 -14.522 -15.746 -16.758 -17.69 -18.515 -19.338 -20.047 -20.704 -21.31 -21.829 -22.312 -22.751 -23.222 -23.625 -23.959 -24.344 -24.745 -25.053 -25.398 -25.8 -26.111 -26.421 -26.72 -27.023 -27.332 -27.532 -27.729 -28.035 -28.264 -28.524 -28.654 -28.903 -29.232 -29.622 -29.81 -30.14 -30.414 -30.634 -30.879 -31.359 -31.644 -32.025 -32.462 -32.944 -33.548 -34.344 -38.337 -2 ,13346 ,TETRA ,17556380,Fri Nov 26 06:45:39 CET,Fri Nov 26 09:00:37 CET,0.0 0.203 0.295 0.373 0.43 0.487 0.547 0.6 0.671 0.7 0.734 0.692 0.829 0.857 0.9 0.943 0.979 0.995 1.025 1.063 1.111 1.134 1.162 1.203 1.227 1.244 1.267 1.28 1.284 1.29 1.291 1.271 1.253 1.243 1.219 1.18 1.134 1.08 1.007 0.91 0.806 0.669 0.473 0.249 -0.054 -0.47 -1.025 -1.718 -2.669 -4.106 -6.366 -8.918 -10.927 -12.583 -14.007 -15.253 -16.291 -17.216 -18.034 -18.852 -19.545 -20.165 -20.715 -21.215 -21.726 -22.217 -22.702 -23.107 -23.46 -23.829 -24.211 -24.534 -24.873 -25.216 -25.486 -25.768 -26.057 -26.356 -26.677 -26.918 -27.201 -27.67 -27.986 -28.287 -28.445 -28.816 -29.203 -29.593 -29.81 -30.172 -30.491 -30.743 -31.014 -31.626 -31.983 -32.384 -32.843 -33.391 -34.063 -34.934 -38.467 -3 ,26226 ,TETRA ,17556381,Fri Nov 26 06:45:39 CET,Fri Nov 26 09:01:33 CET,0.0 0.319 0.426 0.487 0.553 0.618 0.676 0.749 0.868 0.916 0.973 0.954 1.092 1.123 1.191 1.239 1.283 1.307 1.354 1.401 1.465 1.498 1.531 1.574 1.595 1.61 1.633 1.654 1.67 1.693 1.711 1.717 1.712 1.705 1.701 1.684 1.653 1.609 1.558 1.498 1.438 1.326 1.117 0.876 0.563 0.148 -0.459 -1.254 -2.319 -3.829 -6.248 -8.994 -11.144 -12.993 -14.506 -15.792 -16.907 -17.853 -18.655 -19.462 -20.187 -20.826 -21.407 -21.971 -22.502 -22.956 -23.392 -23.791 -24.167 -24.567 -24.986 -25.329 -25.66 -25.985 -26.232 -26.521 -26.877 -27.284 -27.731 -28.033 -28.324 -28.771 -29.069 -29.37 -29.528 -29.84 -30.188 -30.594 -30.822 -31.193 -31.544 -31.826 -32.129 -32.734 -33.069 -33.465 -33.87 -34.339 -34.909 -35.651 -38.295 -4 ,26776 ,TETRA ,17556382,Fri Nov 26 06:46:41 CET,Fri Nov 26 08:59:04 CET,0.0 0.236 0.353 0.444 0.513 0.577 0.629 0.683 0.784 0.819 0.849 0.808 0.941 0.969 1.036 1.088 1.126 1.148 1.195 1.226 1.257 1.295 1.335 1.377 1.406 1.426 1.445 1.46 1.472 1.48 1.494 1.509 1.509 1.497 1.468 1.417 1.36 1.302 1.238 1.154 1.05 0.91 0.704 0.482 0.179 -0.221 -0.749 -1.466 -2.463 -3.956 -6.39 -9.175 -11.34 -13.083 -14.541 -15.804 -16.869 -17.814 -18.637 -19.445 -20.142 -20.744 -21.274 -21.792 -22.289 -22.758 -23.272 -23.74 -24.122 -24.492 -24.882 -25.202 -25.503 -25.812 -26.07 -26.335 -26.612 -26.89 -27.196 -27.425 -27.663 -28.065 -28.336 -28.591 -28.722 -29.0 -29.281 -29.585 -29.742 -30.034 -30.246 -30.472 -30.772 -31.339 -31.602 -31.97 -32.38 -32.831 -33.474 -34.298 -37.095 -5 ,20161 ,TETRA ,17556383,Fri Nov 26 06:46:41 CET,Fri Nov 26 09:02:12 CET,0.0 0.306 0.437 0.542 0.624 0.694 0.765 0.818 0.882 0.922 0.958 0.914 1.047 1.063 1.106 1.15 1.185 1.206 1.243 1.272 1.319 1.347 1.377 1.419 1.46 1.502 1.54 1.557 1.569 1.579 1.588 1.584 1.578 1.576 1.559 1.532 1.513 1.479 1.426 1.353 1.252 1.107 0.916 0.707 0.405 -0.022 -0.606 -1.313 -2.314 -3.769 -6.019 -8.692 -10.881 -12.594 -13.968 -15.163 -16.185 -17.12 -17.921 -18.697 -19.345 -19.911 -20.466 -20.976 -21.437 -21.838 -22.253 -22.676 -23.079 -23.524 -23.977 -24.35 -24.753 -25.179 -25.472 -25.777 -26.145 -26.522 -26.926 -27.212 -27.469 -27.81 -28.041 -28.274 -28.39 -28.641 -28.937 -29.277 -29.452 -29.776 -30.088 -30.328 -30.602 -31.201 -31.471 -31.774 -32.141 -32.517 -33.006 -33.771 -36.464 -6 ,11001 ,TETRA ,17556384,Fri Nov 26 06:46:41 CET,Fri Nov 26 08:59:22 CET,0.0 0.177 0.247 0.301 0.364 0.422 0.466 0.504 0.585 0.619 0.647 0.603 0.741 0.769 0.799 0.833 0.884 0.902 0.945 0.993 1.032 1.052 1.071 1.094 1.118 1.138 1.15 1.153 1.153 1.164 1.173 1.182 1.192 1.194 1.182 1.151 1.114 1.069 1.01 0.928 0.821 0.683 0.493 0.269 -0.023 -0.411 -0.943 -1.63 -2.598 -4.068 -6.435 -9.154 -11.264 -12.944 -14.356 -15.595 -16.662 -17.59 -18.386 -19.186 -19.844 -20.423 -20.991 -21.541 -22.031 -22.448 -22.892 -23.301 -23.654 -24.019 -24.393 -24.707 -25.042 -25.422 -25.749 -26.082 -26.413 -26.764 -27.151 -27.436 -27.733 -28.206 -28.519 -28.857 -29.036 -29.388 -29.769 -30.196 -30.447 -30.809 -31.079 -31.303 -31.538 -32.136 -32.457 -32.772 -33.184 -33.723 -34.405 -35.259 -38.504 -7 ,9693 ,TETRA ,17556385,Fri Nov 26 06:46:41 CET,Fri Nov 26 08:58:59 CET,0.0 0.128 0.215 0.266 0.333 0.405 0.473 0.543 0.665 0.712 0.756 0.721 0.858 0.881 0.922 0.967 1.006 1.019 1.047 1.075 1.104 1.128 1.15 1.174 1.195 1.209 1.215 1.222 1.233 1.237 1.241 1.237 1.223 1.206 1.193 1.183 1.144 1.094 1.046 0.963 0.868 0.752 0.559 0.35 0.073 -0.309 -0.808 -1.482 -2.49 -3.995 -6.318 -9.02 -11.176 -12.947 -14.43 -15.708 -16.781 -17.703 -18.467 -19.243 -19.958 -20.592 -21.16 -21.662 -22.132 -22.564 -23.002 -23.386 -23.722 -24.083 -24.446 -24.744 -25.062 -25.376 -25.633 -25.909 -26.165 -26.435 -26.738 -26.946 -27.164 -27.513 -27.763 -28.035 -28.167 -28.439 -28.751 -29.074 -29.255 -29.577 -29.829 -30.038 -30.271 -30.796 -31.09 -31.42 -31.838 -32.308 -32.888 -33.886 -39.421 -8 ,1986 ,TETRA ,17556386,Fri Nov 26 06:47:38 CET,Fri Nov 26 08:40:59 CET,0.0 0.24 0.328 0.389 0.446 0.5 0.551 0.587 0.639 0.664 0.697 0.657 0.787 0.82 0.886 0.928 0.962 0.978 1.015 1.041 1.062 1.073 1.087 1.11 1.126 1.146 1.163 1.176 1.189 1.187 1.184 1.189 1.192 1.185 1.168 1.139 1.106 1.073 1.035 0.964 0.858 0.718 0.53 0.314 0.029 -0.365 -0.905 -1.639 -2.655 -4.072 -6.387 -8.983 -11.067 -12.796 -14.225 -15.462 -16.519 -17.453 -18.265 -19.104 -19.833 -20.438 -20.99 -21.505 -21.993 -22.458 -22.936 -23.362 -23.733 -24.127 -24.518 -24.822 -25.154 -25.517 -25.798 -26.092 -26.423 -26.766 -27.122 -27.378 -27.636 -28.037 -28.303 -28.572 -28.713 -29.033 -29.378 -29.686 -29.843 -30.156 -30.397 -30.607 -30.826 -31.323 -31.6 -31.88 -32.204 -32.758 -33.588 -34.454 -37.933 -9 ,25122 ,TETRA ,17556387,Fri Nov 26 06:47:38 CET,Fri Nov 26 08:59:53 CET,0.0 0.481 0.595 0.653 0.706 0.753 0.8 0.852 0.93 0.967 1.005 0.957 1.091 1.116 1.154 1.193 1.223 1.238 1.283 1.332 1.396 1.424 1.439 1.461 1.49 1.506 1.52 1.534 1.546 1.556 1.564 1.581 1.593 1.605 1.616 1.608 1.568 1.499 1.429 1.365 1.279 1.138 0.948 0.727 0.45 0.079 -0.439 -1.099 -2.07 -3.537 -5.792 -8.345 -10.414 -12.1 -13.525 -14.784 -15.848 -16.793 -17.594 -18.391 -19.087 -19.705 -20.287 -20.821 -21.305 -21.732 -22.179 -22.603 -22.97 -23.341 -23.724 -24.03 -24.349 -24.693 -24.978 -25.274 -25.556 -25.849 -26.164 -26.384 -26.598 -26.936 -27.172 -27.41 -27.534 -27.803 -28.088 -28.382 -28.532 -28.817 -29.047 -29.253 -29.455 -29.913 -30.169 -30.426 -30.724 -31.05 -31.472 -32.159 -35.04 -10 ,7979 ,TETRA ,17556388,Fri Nov 26 06:48:39 CET,Fri Nov 26 09:04:37 CET,0.0 0.249 0.337 0.418 0.488 0.541 0.587 0.624 0.675 0.702 0.732 0.687 0.822 0.852 0.923 0.979 1.028 1.048 1.081 1.11 1.15 1.182 1.205 1.224 1.242 1.26 1.276 1.283 1.29 1.306 1.319 1.321 1.317 1.301 1.281 1.269 1.243 1.198 1.144 1.06 0.948 0.83 0.668 0.456 0.155 -0.242 -0.77 -1.471 -2.447 -3.902 -6.266 -8.878 -10.939 -12.639 -14.029 -15.25 -16.305 -17.267 -18.098 -18.919 -19.609 -20.194 -20.759 -21.331 -21.887 -22.4 -22.923 -23.372 -23.765 -24.187 -24.616 -24.942 -25.274 -25.626 -25.879 -26.146 -26.42 -26.702 -27.033 -27.263 -27.482 -27.851 -28.151 -28.454 -28.611 -28.958 -29.332 -29.787 -30.033 -30.387 -30.651 -30.864 -31.087 -31.641 -31.975 -32.32 -32.722 -33.207 -33.817 -34.68 -37.899 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_37_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_37_35.txt deleted file mode 100644 index 2296cb4b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_37_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14393 ,TETRA ,17556389,Fri Nov 26 06:47:39 CET,Fri Nov 26 08:51:22 CET,0.0 0.657 0.916 1.117 1.281 1.414 1.55 1.68 1.901 1.994 2.081 2.141 2.335 2.427 2.601 2.75 2.892 2.964 3.103 3.232 3.422 3.549 3.664 3.83 3.986 4.136 4.289 4.442 4.638 4.825 5.011 5.223 5.43 5.637 5.871 6.113 6.346 6.627 6.928 7.263 7.629 8.018 8.451 8.854 9.272 9.73 10.262 10.885 11.687 12.467 13.092 13.348 13.382 13.287 13.082 12.9 12.699 12.458 12.207 11.921 11.68 11.463 11.236 11.007 10.79 10.581 10.35 10.136 9.95 9.757 9.552 9.373 9.177 8.98 8.844 8.707 8.55 8.381 8.228 8.129 8.014 7.817 7.673 7.52 7.442 7.28 7.102 6.922 6.833 6.64 6.524 6.403 6.275 6.006 5.833 5.629 5.431 5.214 4.963 4.654 3.787 -2 ,26581 ,TETRA ,17556390,Fri Nov 26 06:47:38 CET,Fri Nov 26 09:02:47 CET,0.0 0.37 0.568 0.711 0.842 0.969 1.093 1.224 1.45 1.544 1.638 1.701 1.886 1.97 2.132 2.29 2.435 2.505 2.642 2.781 2.971 3.078 3.189 3.359 3.526 3.692 3.851 4.002 4.188 4.371 4.558 4.788 5.011 5.214 5.456 5.737 5.991 6.263 6.562 6.899 7.268 7.691 8.192 8.666 9.201 9.812 10.48 11.19 12.013 13.006 14.136 14.864 15.156 15.184 15.065 14.855 14.651 14.443 14.236 14.011 13.764 13.501 13.243 12.993 12.75 12.521 12.298 12.121 11.972 11.821 11.657 11.508 11.346 11.17 11.034 10.893 10.746 10.593 10.431 10.318 10.203 10.03 9.906 9.78 9.716 9.572 9.414 9.251 9.165 8.974 8.877 8.783 8.684 8.413 8.264 8.107 7.936 7.75 7.551 7.294 6.473 -3 ,16502 ,TETRA ,17556391,Fri Nov 26 06:47:40 CET,Fri Nov 26 09:02:24 CET,0.0 0.258 0.422 0.555 0.672 0.802 0.939 1.059 1.284 1.383 1.473 1.533 1.723 1.801 1.935 2.072 2.206 2.275 2.411 2.541 2.731 2.857 2.976 3.139 3.29 3.427 3.571 3.725 3.911 4.089 4.272 4.489 4.685 4.871 5.092 5.352 5.607 5.877 6.171 6.493 6.837 7.214 7.621 8.044 8.543 9.107 9.792 10.535 11.366 12.332 13.375 13.961 14.13 14.129 14.031 13.851 13.571 13.313 13.112 12.878 12.66 12.465 12.285 12.103 11.936 11.765 11.57 11.39 11.217 11.044 10.869 10.705 10.517 10.33 10.193 10.063 9.935 9.807 9.656 9.543 9.437 9.268 9.145 9.016 8.943 8.792 8.636 8.474 8.386 8.19 8.115 8.024 7.928 7.695 7.571 7.447 7.294 7.09 6.819 6.469 5.903 -4 ,7453 ,TETRA ,17556392,Fri Nov 26 06:48:39 CET,Fri Nov 26 09:04:11 CET,0.0 0.269 0.481 0.641 0.793 0.943 1.08 1.213 1.445 1.553 1.663 1.757 1.958 2.051 2.23 2.385 2.518 2.583 2.714 2.84 3.024 3.144 3.258 3.423 3.589 3.757 3.922 4.076 4.276 4.457 4.621 4.838 5.046 5.242 5.492 5.762 6.011 6.28 6.566 6.889 7.224 7.609 8.065 8.509 9.018 9.592 10.282 11.07 11.978 12.996 13.938 14.419 14.592 14.538 14.397 14.222 13.975 13.683 13.412 13.153 12.918 12.67 12.448 12.261 12.067 11.877 11.673 11.508 11.383 11.24 11.061 10.895 10.722 10.538 10.391 10.255 10.132 10.007 9.856 9.746 9.638 9.468 9.341 9.194 9.112 8.942 8.755 8.555 8.467 8.271 8.171 8.065 7.943 7.648 7.498 7.35 7.172 6.953 6.711 6.346 5.427 -5 ,2861 ,TETRA ,17556393,Fri Nov 26 06:48:39 CET,Fri Nov 26 09:10:10 CET,0.0 0.333 0.546 0.717 0.854 0.978 1.087 1.19 1.399 1.505 1.61 1.69 1.88 1.959 2.108 2.264 2.409 2.475 2.608 2.73 2.897 3.007 3.126 3.298 3.458 3.614 3.762 3.914 4.106 4.284 4.458 4.66 4.853 5.045 5.268 5.518 5.762 6.026 6.304 6.597 6.907 7.253 7.67 8.118 8.628 9.183 9.848 10.569 11.294 12.046 12.926 13.551 13.731 13.65 13.4 13.096 12.797 12.49 12.242 11.951 11.65 11.393 11.13 10.868 10.632 10.422 10.202 10.006 9.837 9.649 9.455 9.303 9.13 8.93 8.776 8.619 8.455 8.288 8.116 8.008 7.896 7.709 7.584 7.437 7.359 7.203 7.026 6.849 6.76 6.562 6.482 6.387 6.273 5.987 5.815 5.635 5.441 5.232 4.993 4.685 4.089 -6 ,14681 ,TETRA ,17556394,Fri Nov 26 06:49:41 CET,Fri Nov 26 09:03:51 CET,0.0 0.339 0.546 0.748 0.932 1.071 1.188 1.303 1.518 1.619 1.724 1.804 1.987 2.068 2.249 2.403 2.533 2.599 2.728 2.852 3.037 3.153 3.271 3.451 3.604 3.759 3.913 4.055 4.25 4.433 4.604 4.821 5.02 5.207 5.439 5.713 5.969 6.246 6.554 6.877 7.227 7.627 8.072 8.522 9.053 9.645 10.326 11.104 12.013 13.002 13.86 14.277 14.353 14.305 14.181 13.921 13.729 13.552 13.314 13.043 12.794 12.565 12.326 12.069 11.824 11.608 11.384 11.19 11.016 10.835 10.649 10.49 10.317 10.137 10.016 9.892 9.752 9.581 9.388 9.261 9.133 8.947 8.812 8.67 8.599 8.433 8.246 8.058 7.969 7.783 7.685 7.564 7.442 7.216 7.091 6.93 6.737 6.505 6.239 5.899 5.079 -7 ,4984 ,TETRA ,17556395,Fri Nov 26 06:48:39 CET,Fri Nov 26 08:45:34 CET,0.0 0.254 0.406 0.53 0.672 0.798 0.902 1.0 1.185 1.278 1.37 1.433 1.61 1.684 1.827 1.968 2.111 2.175 2.296 2.43 2.637 2.768 2.893 3.058 3.224 3.388 3.537 3.682 3.862 4.03 4.194 4.395 4.595 4.799 5.027 5.278 5.522 5.776 6.054 6.36 6.696 7.082 7.518 7.959 8.498 9.108 9.767 10.476 11.349 12.195 12.886 13.378 13.622 13.591 13.396 13.182 12.966 12.752 12.551 12.32 12.075 11.844 11.625 11.405 11.194 10.976 10.729 10.503 10.316 10.137 9.951 9.793 9.631 9.46 9.312 9.162 9.019 8.873 8.718 8.615 8.51 8.329 8.201 8.066 7.994 7.853 7.702 7.536 7.452 7.265 7.162 7.053 6.941 6.71 6.593 6.456 6.287 6.1 5.879 5.575 4.601 -8 ,19541 ,TETRA ,17556396,Fri Nov 26 06:48:38 CET,Fri Nov 26 09:05:39 CET,0.0 0.398 0.67 0.829 0.974 1.112 1.243 1.363 1.603 1.708 1.794 1.869 2.065 2.152 2.304 2.445 2.582 2.65 2.796 2.938 3.116 3.225 3.33 3.496 3.667 3.818 3.967 4.107 4.287 4.464 4.636 4.855 5.069 5.275 5.51 5.772 6.009 6.264 6.557 6.874 7.192 7.551 7.973 8.395 8.875 9.397 10.029 10.766 11.613 12.598 13.636 14.15 14.261 14.239 14.168 14.051 13.877 13.69 13.5 13.268 13.042 12.827 12.632 12.45 12.273 12.12 11.947 11.777 11.617 11.444 11.246 11.066 10.896 10.733 10.591 10.43 10.273 10.129 9.966 9.836 9.708 9.507 9.373 9.247 9.175 9.031 8.882 8.703 8.615 8.42 8.333 8.244 8.145 7.886 7.731 7.566 7.378 7.17 6.93 6.557 5.876 -9 ,5638 ,TETRA ,17556397,Fri Nov 26 06:48:39 CET,Fri Nov 26 09:04:00 CET,0.0 0.245 0.435 0.595 0.725 0.854 0.971 1.076 1.253 1.341 1.434 1.509 1.705 1.791 1.956 2.095 2.239 2.314 2.456 2.601 2.793 2.908 3.024 3.194 3.357 3.509 3.66 3.811 4.001 4.186 4.364 4.578 4.795 5.002 5.243 5.518 5.779 6.071 6.377 6.687 7.015 7.374 7.806 8.257 8.773 9.367 10.041 10.755 11.542 12.473 13.454 14.046 14.324 14.367 14.252 14.035 13.759 13.496 13.255 12.994 12.773 12.567 12.347 12.136 11.945 11.759 11.558 11.371 11.2 11.009 10.796 10.626 10.45 10.269 10.139 9.984 9.815 9.654 9.484 9.366 9.244 9.054 8.919 8.779 8.705 8.556 8.404 8.229 8.142 7.948 7.847 7.74 7.634 7.405 7.267 7.109 6.928 6.733 6.518 6.269 5.54 -10 ,23108 ,TETRA ,17556398,Fri Nov 26 06:49:40 CET,Fri Nov 26 09:05:11 CET,0.0 0.362 0.509 0.676 0.843 0.969 1.067 1.163 1.36 1.461 1.562 1.634 1.822 1.902 2.069 2.232 2.377 2.441 2.568 2.695 2.873 2.985 3.089 3.251 3.407 3.549 3.691 3.84 4.039 4.218 4.405 4.633 4.832 5.035 5.274 5.536 5.799 6.087 6.378 6.684 7.0 7.367 7.816 8.222 8.694 9.218 9.808 10.488 11.254 12.076 12.995 13.526 13.642 13.545 13.304 13.055 12.784 12.469 12.168 11.84 11.554 11.298 11.025 10.772 10.553 10.341 10.103 9.883 9.704 9.524 9.321 9.142 8.944 8.735 8.589 8.456 8.324 8.187 8.034 7.912 7.786 7.614 7.484 7.336 7.264 7.119 6.964 6.796 6.714 6.539 6.477 6.398 6.314 6.085 5.943 5.801 5.663 5.493 5.26 4.886 4.068 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_38_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_38_34.txt deleted file mode 100644 index e9674037..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_38_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23490 ,TETRA ,17556399,Fri Nov 26 06:49:43 CET,Fri Nov 26 09:06:14 CET,0.0 0.617 0.835 1.019 1.153 1.273 1.395 1.504 1.711 1.809 1.895 1.95 2.14 2.227 2.398 2.567 2.721 2.788 2.91 3.029 3.22 3.352 3.482 3.671 3.855 4.03 4.185 4.331 4.535 4.736 4.931 5.158 5.377 5.597 5.843 6.101 6.345 6.622 6.928 7.263 7.617 8.025 8.489 8.946 9.474 10.087 10.781 11.505 12.333 13.317 14.449 15.136 15.377 15.417 15.345 15.219 15.047 14.839 14.653 14.475 14.304 14.135 13.974 13.811 13.649 13.495 13.322 13.159 13.025 12.887 12.711 12.561 12.42 12.262 12.129 11.994 11.857 11.711 11.551 11.441 11.331 11.145 10.992 10.841 10.771 10.622 10.458 10.276 10.175 9.968 9.828 9.704 9.58 9.276 9.101 8.917 8.704 8.425 8.07 7.584 6.056 -2 ,10520 ,TETRA ,17556400,Fri Nov 26 06:49:40 CET,Fri Nov 26 09:05:03 CET,0.0 1.526 1.821 2.032 2.222 2.36 2.484 2.605 2.83 2.934 3.029 3.089 3.278 3.359 3.518 3.666 3.81 3.88 4.01 4.152 4.354 4.466 4.565 4.718 4.877 5.032 5.184 5.331 5.532 5.723 5.895 6.106 6.318 6.522 6.741 6.986 7.223 7.495 7.802 8.137 8.493 8.881 9.323 9.76 10.243 10.744 11.352 12.103 12.954 13.925 15.101 15.906 16.208 16.252 16.172 16.049 15.908 15.757 15.584 15.354 15.133 14.923 14.718 14.531 14.348 14.164 13.956 13.769 13.611 13.443 13.263 13.118 12.976 12.82 12.693 12.556 12.4 12.243 12.091 11.982 11.867 11.678 11.549 11.403 11.319 11.145 10.961 10.772 10.67 10.468 10.34 10.216 10.072 9.748 9.567 9.373 9.159 8.883 8.56 8.074 6.212 -3 ,16367 ,TETRA ,17556401,Fri Nov 26 06:49:42 CET,Fri Nov 26 09:06:48 CET,0.0 0.597 0.868 1.091 1.249 1.393 1.534 1.661 1.9 2.006 2.103 2.159 2.353 2.446 2.632 2.797 2.948 3.021 3.153 3.274 3.455 3.578 3.695 3.863 4.02 4.172 4.329 4.477 4.659 4.856 5.055 5.284 5.513 5.736 5.977 6.25 6.523 6.801 7.105 7.44 7.777 8.164 8.607 9.014 9.504 10.085 10.735 11.486 12.309 13.173 14.114 14.761 14.979 14.982 14.924 14.874 14.764 14.61 14.476 14.315 14.11 13.908 13.737 13.56 13.38 13.211 13.028 12.864 12.734 12.584 12.398 12.253 12.11 11.936 11.79 11.645 11.511 11.382 11.23 11.12 11.011 10.83 10.695 10.555 10.488 10.357 10.21 10.039 9.953 9.761 9.638 9.518 9.383 9.109 8.964 8.8 8.603 8.38 8.103 7.734 6.323 -4 ,21093 ,TETRA ,17556402,Fri Nov 26 06:49:42 CET,Fri Nov 26 08:47:26 CET,0.0 0.768 1.006 1.208 1.397 1.568 1.709 1.823 2.02 2.111 2.209 2.314 2.506 2.585 2.766 2.936 3.087 3.16 3.298 3.426 3.622 3.746 3.861 4.052 4.238 4.4 4.554 4.711 4.92 5.122 5.314 5.545 5.76 5.96 6.19 6.456 6.722 7.003 7.292 7.606 7.946 8.332 8.782 9.236 9.755 10.314 10.935 11.651 12.47 13.403 14.441 15.159 15.46 15.563 15.57 15.461 15.351 15.241 15.122 14.986 14.845 14.7 14.555 14.413 14.245 14.079 13.897 13.73 13.595 13.458 13.315 13.18 13.017 12.845 12.711 12.566 12.427 12.286 12.133 12.024 11.915 11.753 11.639 11.504 11.429 11.276 11.111 10.94 10.854 10.668 10.554 10.429 10.303 10.018 9.847 9.65 9.437 9.183 8.869 8.503 7.155 -5 ,32664 ,TETRA ,17556403,Fri Nov 26 06:49:42 CET,Fri Nov 26 09:12:00 CET,0.0 0.971 1.29 1.471 1.624 1.779 1.915 2.035 2.272 2.375 2.467 2.52 2.71 2.793 2.943 3.071 3.204 3.276 3.406 3.529 3.727 3.855 3.98 4.178 4.358 4.513 4.66 4.809 5.005 5.193 5.374 5.593 5.806 6.008 6.231 6.512 6.787 7.063 7.379 7.719 8.074 8.471 8.91 9.344 9.857 10.43 11.099 11.871 12.782 13.79 14.807 15.507 15.852 15.992 16.011 15.945 15.811 15.664 15.522 15.37 15.244 15.105 14.958 14.82 14.673 14.543 14.416 14.278 14.142 13.996 13.848 13.711 13.554 13.401 13.286 13.167 13.032 12.881 12.74 12.644 12.538 12.351 12.21 12.074 12.001 11.835 11.642 11.453 11.364 11.161 11.01 10.867 10.712 10.353 10.153 9.93 9.687 9.428 9.083 8.612 6.818 -6 ,3672 ,TETRA ,17556404,Fri Nov 26 06:49:42 CET,Fri Nov 26 09:11:11 CET,0.0 0.684 0.977 1.225 1.409 1.557 1.695 1.845 2.106 2.204 2.305 2.405 2.599 2.686 2.859 3.007 3.149 3.228 3.375 3.505 3.682 3.803 3.92 4.103 4.283 4.436 4.585 4.724 4.903 5.071 5.231 5.439 5.652 5.858 6.083 6.352 6.616 6.898 7.194 7.503 7.839 8.229 8.68 9.139 9.68 10.255 10.945 11.72 12.543 13.491 14.586 15.384 15.67 15.734 15.745 15.7 15.596 15.439 15.292 15.108 14.923 14.758 14.593 14.428 14.255 14.087 13.911 13.744 13.597 13.449 13.286 13.134 12.968 12.799 12.668 12.525 12.369 12.213 12.037 11.919 11.811 11.62 11.481 11.318 11.235 11.098 10.947 10.773 10.673 10.483 10.39 10.273 10.146 9.877 9.7 9.493 9.272 9.031 8.749 8.324 6.789 -7 ,22027 ,TETRA ,17556405,Fri Nov 26 06:50:39 CET,Fri Nov 26 09:06:20 CET,0.0 1.043 1.38 1.624 1.819 1.967 2.107 2.239 2.471 2.581 2.687 2.775 2.979 3.082 3.26 3.411 3.553 3.618 3.742 3.862 4.05 4.178 4.304 4.479 4.639 4.796 4.964 5.13 5.327 5.51 5.69 5.911 6.109 6.3 6.54 6.814 7.071 7.343 7.639 7.956 8.275 8.638 9.075 9.548 10.085 10.641 11.274 11.975 12.718 13.538 14.545 15.286 15.613 15.621 15.52 15.402 15.268 15.135 14.965 14.774 14.614 14.464 14.324 14.183 14.033 13.887 13.7 13.511 13.351 13.191 13.02 12.877 12.722 12.559 12.43 12.3 12.164 12.026 11.871 11.747 11.635 11.464 11.326 11.173 11.096 10.916 10.7 10.474 10.36 10.156 10.039 9.907 9.758 9.425 9.208 8.978 8.73 8.451 8.119 7.639 6.147 -8 ,3978 ,TETRA ,17556406,Fri Nov 26 06:50:39 CET,Fri Nov 26 09:11:49 CET,0.0 0.905 1.124 1.306 1.471 1.61 1.752 1.906 2.213 2.356 2.487 2.589 2.779 2.854 3.003 3.171 3.325 3.394 3.534 3.661 3.832 3.948 4.065 4.231 4.392 4.539 4.679 4.825 5.035 5.234 5.423 5.651 5.867 6.069 6.304 6.573 6.813 7.092 7.428 7.773 8.109 8.482 8.937 9.396 9.885 10.43 11.091 11.834 12.643 13.556 14.599 15.32 15.64 15.747 15.751 15.667 15.539 15.411 15.293 15.156 14.992 14.837 14.703 14.57 14.436 14.301 14.159 14.016 13.874 13.734 13.593 13.464 13.316 13.168 13.054 12.929 12.779 12.619 12.468 12.358 12.248 12.073 11.94 11.793 11.716 11.574 11.426 11.252 11.156 10.962 10.848 10.72 10.579 10.285 10.113 9.931 9.72 9.446 9.109 8.604 6.817 -9 ,4722 ,TETRA ,17556407,Fri Nov 26 06:50:41 CET,Fri Nov 26 09:11:44 CET,0.0 0.733 1.006 1.216 1.4 1.557 1.68 1.788 2.0 2.088 2.177 2.242 2.42 2.49 2.64 2.777 2.898 2.96 3.094 3.232 3.425 3.546 3.664 3.835 4.006 4.161 4.297 4.432 4.6 4.757 4.917 5.126 5.331 5.527 5.753 6.002 6.244 6.524 6.818 7.131 7.457 7.844 8.313 8.764 9.293 9.887 10.538 11.253 12.083 13.023 14.076 14.777 15.071 15.139 15.023 14.849 14.691 14.521 14.367 14.216 14.063 13.896 13.728 13.561 13.392 13.239 13.068 12.904 12.765 12.621 12.472 12.336 12.183 12.033 11.925 11.808 11.677 11.538 11.38 11.272 11.165 10.98 10.842 10.703 10.631 10.472 10.295 10.104 10.0 9.795 9.664 9.544 9.423 9.12 8.946 8.763 8.557 8.33 8.077 7.632 5.898 -10 ,32108 ,TETRA ,17556408,Fri Nov 26 06:50:39 CET,Fri Nov 26 08:53:38 CET,0.0 1.732 2.212 2.445 2.602 2.75 2.883 2.997 3.216 3.315 3.398 3.455 3.649 3.735 3.905 4.05 4.19 4.265 4.4 4.525 4.693 4.808 4.928 5.103 5.284 5.454 5.602 5.758 5.96 6.138 6.308 6.516 6.715 6.919 7.161 7.422 7.666 7.931 8.231 8.535 8.833 9.183 9.613 10.021 10.477 11.029 11.637 12.272 13.036 13.897 14.89 15.557 15.712 15.682 15.592 15.486 15.379 15.245 15.098 14.929 14.767 14.608 14.439 14.284 14.148 13.999 13.835 13.683 13.54 13.391 13.247 13.134 13.009 12.873 12.756 12.62 12.474 12.328 12.179 12.08 11.968 11.775 11.652 11.515 11.437 11.289 11.125 10.923 10.815 10.618 10.526 10.412 10.287 10.019 9.866 9.705 9.508 9.268 8.952 8.48 6.886 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_38_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_38_37.txt deleted file mode 100644 index 14b65036..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_38_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17420 ,TETRA ,17667845,Fri Dec 3 06:03:43 CET,Fri Dec 3 08:20:25 CET,0.0 0.541 0.783 1.023 1.207 1.346 1.468 1.574 1.767 1.853 1.944 2.025 2.216 2.283 2.413 2.548 2.679 2.744 2.866 2.984 3.151 3.252 3.354 3.505 3.645 3.779 3.901 4.017 4.173 4.33 4.483 4.659 4.831 4.993 5.178 5.388 5.579 5.776 5.979 6.192 6.414 6.661 6.923 7.183 7.485 7.786 8.068 8.34 8.702 8.979 8.991 8.703 8.29 7.885 7.484 7.04 6.635 6.294 5.982 5.644 5.364 5.103 4.858 4.639 4.419 4.221 4.03 3.842 3.663 3.486 3.302 3.153 3.013 2.858 2.735 2.615 2.488 2.345 2.176 2.061 1.943 1.748 1.616 1.483 1.411 1.258 1.117 0.961 0.871 0.673 0.597 0.5 0.389 0.151 0.021 -0.131 -0.286 -0.46 -0.698 -0.989 -1.708 -2 ,8729 ,TETRA ,17667846,Fri Dec 3 06:03:45 CET,Fri Dec 3 08:19:52 CET,0.0 0.685 0.932 1.117 1.279 1.408 1.525 1.644 1.853 1.946 2.038 2.118 2.315 2.388 2.525 2.667 2.799 2.861 2.984 3.098 3.259 3.366 3.464 3.608 3.753 3.897 4.026 4.144 4.291 4.433 4.581 4.752 4.906 5.057 5.229 5.429 5.625 5.826 6.031 6.225 6.423 6.653 6.938 7.244 7.571 7.909 8.307 8.728 9.158 9.493 9.558 9.315 8.959 8.555 8.133 7.715 7.331 6.985 6.678 6.351 6.073 5.807 5.537 5.293 5.069 4.862 4.645 4.458 4.293 4.117 3.938 3.779 3.587 3.388 3.243 3.104 2.973 2.829 2.667 2.546 2.417 2.221 2.086 1.946 1.875 1.731 1.58 1.394 1.299 1.102 1.007 0.907 0.797 0.568 0.443 0.293 0.095 -0.117 -0.355 -0.654 -1.25 -3 ,19305 ,TETRA ,17667847,Fri Dec 3 06:03:46 CET,Fri Dec 3 08:22:24 CET,0.0 0.553 0.815 1.011 1.191 1.341 1.474 1.592 1.796 1.893 1.996 2.08 2.275 2.356 2.5 2.643 2.79 2.861 2.996 3.124 3.301 3.404 3.504 3.652 3.792 3.927 4.053 4.175 4.331 4.481 4.629 4.803 4.971 5.139 5.325 5.521 5.707 5.909 6.129 6.357 6.595 6.852 7.131 7.413 7.712 8.014 8.34 8.71 9.126 9.518 9.796 9.734 9.462 9.073 8.696 8.391 8.1 7.787 7.488 7.197 6.953 6.722 6.48 6.253 6.042 5.839 5.623 5.427 5.249 5.068 4.878 4.71 4.542 4.369 4.226 4.082 3.949 3.807 3.64 3.52 3.402 3.236 3.118 2.975 2.901 2.749 2.582 2.402 2.311 2.113 2.032 1.945 1.841 1.606 1.488 1.356 1.199 0.986 0.731 0.434 -0.212 -4 ,27026 ,TETRA ,17667848,Fri Dec 3 06:03:48 CET,Fri Dec 3 08:21:35 CET,0.0 0.387 0.618 0.804 0.959 1.1 1.227 1.333 1.53 1.624 1.717 1.798 1.984 2.071 2.224 2.35 2.478 2.548 2.672 2.784 2.964 3.079 3.188 3.347 3.488 3.621 3.749 3.878 4.052 4.21 4.345 4.518 4.697 4.867 5.064 5.276 5.49 5.729 5.962 6.197 6.442 6.728 7.04 7.331 7.646 7.957 8.268 8.59 8.962 9.305 9.49 9.325 8.986 8.618 8.244 7.888 7.565 7.226 6.909 6.578 6.291 6.029 5.776 5.543 5.319 5.108 4.895 4.695 4.52 4.345 4.149 3.985 3.82 3.644 3.491 3.338 3.186 3.034 2.877 2.768 2.657 2.457 2.312 2.166 2.091 1.935 1.778 1.613 1.526 1.329 1.258 1.17 1.079 0.865 0.734 0.59 0.431 0.229 -0.032 -0.362 -0.968 -5 ,10535 ,TETRA ,17667849,Fri Dec 3 06:06:43 CET,Fri Dec 3 08:24:04 CET,0.0 0.561 0.786 0.973 1.116 1.243 1.358 1.462 1.649 1.745 1.842 1.929 2.132 2.221 2.384 2.542 2.675 2.734 2.853 2.971 3.135 3.244 3.357 3.509 3.646 3.771 3.892 4.014 4.173 4.324 4.468 4.649 4.805 4.954 5.132 5.319 5.508 5.707 5.912 6.123 6.329 6.543 6.8 7.062 7.354 7.682 8.026 8.375 8.71 9.0 9.184 9.027 8.765 8.444 8.083 7.735 7.402 7.076 6.785 6.479 6.187 5.909 5.635 5.371 5.13 4.919 4.698 4.501 4.341 4.17 3.983 3.817 3.646 3.477 3.354 3.237 3.106 2.957 2.796 2.687 2.571 2.387 2.259 2.113 2.041 1.907 1.763 1.601 1.515 1.323 1.237 1.13 1.011 0.746 0.595 0.438 0.282 0.119 -0.057 -0.325 -1.009 -6 ,20879 ,TETRA ,17667850,Fri Dec 3 06:06:45 CET,Fri Dec 3 08:24:02 CET,0.0 0.597 0.883 1.112 1.308 1.457 1.572 1.68 1.894 1.999 2.107 2.186 2.383 2.482 2.656 2.809 2.945 3.008 3.14 3.258 3.415 3.526 3.635 3.782 3.92 4.055 4.182 4.309 4.465 4.601 4.738 4.905 5.066 5.234 5.406 5.582 5.766 5.969 6.185 6.413 6.633 6.864 7.145 7.431 7.739 8.065 8.422 8.809 9.173 9.425 9.5 9.271 8.911 8.544 8.19 7.84 7.516 7.189 6.859 6.536 6.287 6.065 5.834 5.604 5.389 5.19 4.983 4.799 4.638 4.469 4.282 4.119 3.952 3.785 3.66 3.531 3.382 3.221 3.054 2.94 2.827 2.636 2.503 2.37 2.296 2.14 1.987 1.824 1.745 1.555 1.475 1.367 1.245 0.999 0.873 0.715 0.515 0.299 0.033 -0.32 -1.331 -7 ,27927 ,TETRA ,17667851,Fri Dec 3 06:06:46 CET,Fri Dec 3 08:26:18 CET,0.0 0.629 0.909 1.114 1.287 1.432 1.563 1.695 1.935 2.031 2.125 2.205 2.4 2.484 2.635 2.772 2.901 2.967 3.097 3.213 3.373 3.477 3.579 3.719 3.849 3.973 4.091 4.208 4.356 4.5 4.64 4.805 4.959 5.116 5.311 5.516 5.692 5.892 6.112 6.351 6.609 6.875 7.17 7.462 7.797 8.164 8.562 8.968 9.349 9.689 9.927 9.847 9.59 9.298 8.975 8.591 8.211 7.884 7.611 7.331 7.082 6.849 6.62 6.416 6.219 6.024 5.827 5.646 5.487 5.328 5.161 5.01 4.849 4.69 4.57 4.441 4.296 4.144 3.989 3.882 3.776 3.605 3.484 3.353 3.289 3.16 3.016 2.862 2.772 2.568 2.491 2.397 2.293 2.077 1.959 1.823 1.654 1.491 1.307 1.0 -0.174 -8 ,18370 ,TETRA ,17667852,Fri Dec 3 06:06:49 CET,Fri Dec 3 08:26:13 CET,0.0 0.7 0.967 1.163 1.324 1.468 1.607 1.762 2.041 2.143 2.235 2.291 2.469 2.545 2.707 2.86 3.005 3.074 3.193 3.303 3.46 3.557 3.656 3.812 3.956 4.092 4.225 4.346 4.508 4.67 4.82 4.991 5.152 5.316 5.508 5.724 5.929 6.137 6.335 6.548 6.778 7.009 7.274 7.538 7.835 8.178 8.514 8.803 9.125 9.443 9.653 9.49 9.182 8.881 8.547 8.207 7.876 7.563 7.272 6.952 6.683 6.436 6.179 5.946 5.736 5.553 5.359 5.166 5.004 4.824 4.635 4.475 4.307 4.131 3.987 3.844 3.687 3.519 3.357 3.24 3.118 2.941 2.809 2.664 2.591 2.434 2.26 2.08 1.981 1.772 1.653 1.536 1.426 1.186 1.054 0.915 0.757 0.568 0.315 -0.037 -0.789 -9 ,9084 ,TETRA ,17667853,Fri Dec 3 06:06:43 CET,Fri Dec 3 08:19:57 CET,0.0 0.652 0.9 1.08 1.249 1.395 1.53 1.671 1.921 2.034 2.138 2.213 2.419 2.506 2.664 2.81 2.951 3.018 3.159 3.294 3.465 3.578 3.693 3.855 4.007 4.148 4.277 4.412 4.589 4.748 4.893 5.067 5.227 5.367 5.534 5.753 5.959 6.171 6.404 6.645 6.88 7.101 7.376 7.659 7.962 8.296 8.643 9.002 9.38 9.647 9.672 9.394 9.062 8.74 8.391 8.039 7.722 7.427 7.137 6.825 6.57 6.329 6.077 5.836 5.615 5.411 5.204 5.024 4.85 4.668 4.492 4.336 4.167 3.999 3.88 3.751 3.607 3.459 3.296 3.182 3.066 2.882 2.749 2.6 2.523 2.366 2.204 2.02 1.922 1.722 1.632 1.524 1.407 1.167 1.038 0.906 0.754 0.56 0.329 0.051 -0.664 -10 ,25839 ,TETRA ,17667854,Fri Dec 3 06:06:43 CET,Fri Dec 3 08:22:47 CET,0.0 0.593 0.871 1.1 1.272 1.42 1.559 1.681 1.887 1.985 2.082 2.161 2.36 2.442 2.57 2.688 2.807 2.869 2.981 3.087 3.252 3.353 3.451 3.587 3.718 3.86 4.005 4.139 4.303 4.461 4.616 4.794 4.957 5.118 5.307 5.505 5.689 5.885 6.077 6.288 6.518 6.749 6.988 7.233 7.543 7.885 8.243 8.634 9.056 9.326 9.29 8.942 8.535 8.121 7.749 7.423 7.086 6.732 6.393 6.064 5.783 5.511 5.256 5.019 4.79 4.58 4.342 4.115 3.909 3.693 3.477 3.303 3.131 2.955 2.814 2.672 2.514 2.348 2.194 2.086 1.965 1.763 1.619 1.469 1.391 1.222 1.045 0.866 0.776 0.574 0.451 0.323 0.197 -0.092 -0.259 -0.421 -0.598 -0.8 -1.028 -1.328 -1.981 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_38_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_38_43.txt deleted file mode 100644 index a3d464b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_38_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18658 ,TETRA ,17556409,Fri Nov 26 06:50:40 CET,Fri Nov 26 09:05:27 CET,0.0 0.989 1.224 1.437 1.653 1.828 1.964 2.097 2.35 2.462 2.569 2.671 2.881 2.979 3.159 3.34 3.508 3.58 3.726 3.868 4.061 4.194 4.33 4.513 4.69 4.869 5.056 5.246 5.491 5.729 5.943 6.177 6.405 6.637 6.896 7.179 7.454 7.752 8.076 8.421 8.809 9.274 9.787 10.285 10.867 11.533 12.294 13.149 14.166 15.241 16.444 17.291 17.58 17.678 17.657 17.565 17.467 17.327 17.153 16.96 16.8 16.612 16.39 16.168 15.946 15.779 15.607 15.434 15.283 15.124 14.968 14.834 14.677 14.505 14.351 14.173 13.985 13.789 13.57 13.427 13.302 13.12 12.985 12.828 12.747 12.598 12.433 12.237 12.12 11.898 11.76 11.615 11.455 11.172 11.013 10.814 10.553 10.213 9.812 9.314 7.235 -2 ,18321 ,TETRA ,17556410,Fri Nov 26 06:50:40 CET,Fri Nov 26 09:07:27 CET,0.0 0.78 1.088 1.298 1.496 1.693 1.871 2.032 2.301 2.418 2.529 2.644 2.847 2.946 3.139 3.301 3.448 3.522 3.68 3.838 4.046 4.176 4.309 4.512 4.7 4.881 5.059 5.23 5.451 5.661 5.857 6.104 6.342 6.557 6.817 7.128 7.427 7.76 8.119 8.487 8.865 9.294 9.815 10.308 10.87 11.505 12.2 13.015 14.038 15.235 16.395 17.142 17.494 17.661 17.703 17.658 17.547 17.367 17.178 16.944 16.73 16.534 16.336 16.165 16.0 15.832 15.652 15.479 15.298 15.117 14.956 14.821 14.675 14.512 14.371 14.232 14.085 13.914 13.735 13.61 13.483 13.293 13.135 12.966 12.887 12.717 12.537 12.341 12.245 12.064 11.946 11.805 11.623 11.242 11.068 10.858 10.615 10.367 10.016 9.557 7.671 -3 ,15103 ,TETRA ,17556411,Fri Nov 26 06:50:39 CET,Fri Nov 26 09:06:30 CET,0.0 0.951 1.264 1.487 1.68 1.849 1.994 2.128 2.368 2.477 2.593 2.711 2.923 3.016 3.189 3.353 3.526 3.61 3.768 3.924 4.145 4.287 4.422 4.616 4.802 4.983 5.165 5.34 5.566 5.799 6.031 6.303 6.553 6.806 7.101 7.408 7.696 8.008 8.354 8.738 9.14 9.588 10.101 10.604 11.208 11.878 12.627 13.439 14.416 15.614 16.877 17.679 18.008 18.101 18.005 17.836 17.676 17.459 17.209 16.966 16.773 16.578 16.38 16.214 16.033 15.839 15.658 15.487 15.329 15.165 14.969 14.792 14.612 14.446 14.319 14.187 14.066 13.917 13.729 13.604 13.472 13.273 13.148 12.992 12.911 12.743 12.553 12.36 12.258 12.061 11.917 11.786 11.653 11.366 11.186 10.96 10.729 10.497 10.156 9.601 6.144 -4 ,24937 ,TETRA ,17556412,Fri Nov 26 06:50:40 CET,Fri Nov 26 08:57:27 CET,0.0 1.0 1.222 1.417 1.578 1.729 1.876 2.015 2.244 2.361 2.48 2.578 2.791 2.891 3.081 3.257 3.42 3.502 3.651 3.802 4.028 4.158 4.283 4.478 4.66 4.823 4.974 5.13 5.334 5.517 5.703 5.935 6.169 6.397 6.646 6.925 7.183 7.466 7.782 8.121 8.503 8.952 9.469 9.982 10.544 11.11 11.794 12.65 13.63 14.697 15.885 16.699 17.039 17.189 17.262 17.211 17.048 16.866 16.693 16.478 16.289 16.144 15.982 15.806 15.639 15.458 15.241 15.055 14.897 14.734 14.558 14.413 14.264 14.091 13.959 13.82 13.673 13.533 13.361 13.234 13.111 12.914 12.778 12.614 12.523 12.353 12.181 11.992 11.878 11.673 11.554 11.432 11.299 10.978 10.793 10.608 10.383 10.117 9.79 9.26 6.951 -5 ,12304 ,TETRA ,17556413,Fri Nov 26 06:50:40 CET,Fri Nov 26 09:06:29 CET,0.0 0.684 0.986 1.217 1.379 1.542 1.701 1.855 2.159 2.284 2.383 2.479 2.674 2.768 2.968 3.161 3.356 3.449 3.62 3.771 3.981 4.111 4.236 4.427 4.602 4.759 4.917 5.088 5.319 5.524 5.718 5.97 6.218 6.459 6.73 7.016 7.292 7.578 7.907 8.282 8.662 9.098 9.621 10.127 10.667 11.244 11.953 12.814 13.861 14.989 16.055 16.76 16.992 16.904 16.768 16.584 16.392 16.239 16.066 15.849 15.658 15.449 15.236 15.062 14.902 14.744 14.55 14.345 14.16 13.968 13.77 13.61 13.445 13.277 13.144 12.995 12.834 12.653 12.459 12.339 12.22 12.023 11.867 11.702 11.619 11.437 11.253 11.037 10.917 10.701 10.575 10.465 10.319 10.019 9.864 9.665 9.429 9.176 8.878 8.425 6.863 -6 ,24218 ,TETRA ,17556414,Fri Nov 26 06:50:40 CET,Fri Nov 26 09:08:34 CET,0.0 0.879 1.109 1.286 1.462 1.623 1.754 1.89 2.161 2.274 2.374 2.472 2.685 2.785 2.967 3.139 3.304 3.382 3.54 3.694 3.923 4.074 4.221 4.427 4.627 4.809 4.984 5.158 5.372 5.587 5.808 6.063 6.302 6.552 6.852 7.165 7.458 7.79 8.154 8.536 8.946 9.435 9.988 10.519 11.146 11.873 12.692 13.561 14.486 15.536 16.671 17.39 17.629 17.658 17.586 17.453 17.283 17.059 16.877 16.699 16.51 16.327 16.127 15.916 15.75 15.624 15.461 15.292 15.141 14.962 14.75 14.586 14.445 14.274 14.13 13.99 13.837 13.665 13.484 13.361 13.231 13.02 12.856 12.666 12.562 12.366 12.175 11.946 11.822 11.603 11.434 11.316 11.203 10.95 10.794 10.591 10.366 10.113 9.804 9.339 7.905 -7 ,5344 ,TETRA ,17556415,Fri Nov 26 06:50:41 CET,Fri Nov 26 09:08:59 CET,0.0 0.761 1.012 1.207 1.397 1.589 1.759 1.911 2.185 2.307 2.423 2.539 2.751 2.85 3.048 3.236 3.433 3.526 3.698 3.854 4.071 4.211 4.349 4.545 4.722 4.892 5.069 5.241 5.453 5.673 5.891 6.144 6.381 6.616 6.894 7.216 7.526 7.86 8.21 8.587 8.991 9.42 9.91 10.418 11.024 11.72 12.517 13.393 14.407 15.496 16.528 17.237 17.549 17.573 17.494 17.357 17.204 17.031 16.862 16.649 16.471 16.327 16.142 15.947 15.765 15.58 15.377 15.207 15.06 14.882 14.686 14.517 14.312 14.12 13.987 13.826 13.659 13.497 13.323 13.196 13.045 12.785 12.632 12.474 12.381 12.197 12.027 11.859 11.762 11.545 11.345 11.192 11.053 10.762 10.596 10.382 10.142 9.9 9.641 9.271 7.142 -8 ,16325 ,TETRA ,17556416,Fri Nov 26 06:50:40 CET,Fri Nov 26 09:11:27 CET,0.0 0.966 1.274 1.518 1.685 1.827 1.961 2.081 2.303 2.413 2.51 2.593 2.807 2.906 3.092 3.259 3.425 3.507 3.657 3.794 3.987 4.115 4.246 4.437 4.625 4.803 4.974 5.146 5.362 5.562 5.75 5.991 6.229 6.456 6.714 7.006 7.306 7.636 7.981 8.336 8.711 9.146 9.66 10.167 10.737 11.362 12.1 12.926 13.845 14.844 15.99 16.873 17.281 17.425 17.402 17.228 16.996 16.781 16.576 16.338 16.129 15.959 15.782 15.582 15.393 15.221 15.03 14.864 14.726 14.573 14.385 14.228 14.067 13.897 13.761 13.615 13.463 13.296 13.113 12.988 12.866 12.657 12.506 12.363 12.299 12.128 11.925 11.722 11.606 11.395 11.22 11.051 10.883 10.535 10.328 10.123 9.896 9.628 9.283 8.816 6.823 -9 ,5718 ,TETRA ,17556417,Fri Nov 26 06:51:40 CET,Fri Nov 26 09:15:34 CET,0.0 0.848 1.147 1.344 1.515 1.698 1.856 1.978 2.207 2.321 2.432 2.551 2.769 2.872 3.057 3.24 3.415 3.494 3.646 3.805 4.035 4.17 4.305 4.51 4.711 4.907 5.087 5.26 5.489 5.71 5.924 6.188 6.437 6.669 6.949 7.264 7.558 7.886 8.236 8.589 8.971 9.422 9.935 10.471 11.127 11.844 12.626 13.463 14.41 15.459 16.607 17.527 17.963 18.017 17.952 17.894 17.78 17.647 17.504 17.289 17.066 16.867 16.677 16.497 16.326 16.151 15.945 15.755 15.572 15.367 15.181 15.027 14.846 14.674 14.543 14.382 14.213 14.041 13.857 13.725 13.594 13.389 13.241 13.074 12.982 12.819 12.653 12.445 12.333 12.118 11.976 11.867 11.743 11.395 11.183 10.983 10.792 10.54 10.191 9.74 7.904 -10 ,32442 ,TETRA ,17556422,Fri Nov 26 06:51:40 CET,Fri Nov 26 09:05:29 CET,0.0 0.819 1.097 1.315 1.498 1.658 1.806 1.927 2.147 2.252 2.364 2.465 2.669 2.763 2.935 3.113 3.289 3.365 3.52 3.679 3.894 4.024 4.156 4.36 4.549 4.727 4.909 5.077 5.281 5.478 5.67 5.924 6.183 6.418 6.691 6.992 7.281 7.606 7.955 8.324 8.693 9.133 9.648 10.148 10.758 11.435 12.174 12.992 13.92 14.973 16.202 17.105 17.553 17.672 17.629 17.515 17.348 17.156 16.944 16.748 16.572 16.377 16.193 16.021 15.82 15.617 15.44 15.267 15.09 14.908 14.704 14.538 14.37 14.2 14.065 13.923 13.773 13.6 13.411 13.29 13.161 12.945 12.808 12.673 12.594 12.407 12.203 11.983 11.874 11.682 11.555 11.423 11.284 10.964 10.79 10.611 10.418 10.202 9.939 9.57 7.327 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_39_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_39_19.txt deleted file mode 100644 index 084038a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_39_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29269 ,KEBNE ,17025398,Wed Dec 22 12:27:17 CET,Wed Dec 22 14:20:35 CET,0.0 0.196 0.366 0.454 0.529 0.605 0.67 0.719 0.785 0.82 0.854 0.819 0.936 0.968 1.025 1.077 1.142 1.178 1.239 1.289 1.347 1.385 1.422 1.47 1.504 1.532 1.561 1.59 1.629 1.66 1.695 1.745 1.775 1.795 1.814 1.813 1.811 1.829 1.842 1.834 1.819 1.778 1.681 1.532 1.34 1.092 0.721 0.21 -0.584 -1.825 -3.972 -6.536 -8.605 -10.338 -11.802 -13.085 -14.156 -15.113 -15.937 -16.751 -17.451 -18.07 -18.67 -19.237 -19.735 -20.199 -20.713 -21.159 -21.526 -21.89 -22.285 -22.636 -23.006 -23.392 -23.696 -24.01 -24.323 -24.663 -25.027 -25.262 -25.497 -25.867 -26.117 -26.378 -26.507 -26.774 -27.086 -27.429 -27.61 -27.9 -28.145 -28.343 -28.535 -28.989 -29.259 -29.545 -29.879 -30.259 -30.766 -31.5 -34.927 -2 ,27855 ,KEBNE ,17025399,Wed Dec 22 12:27:17 CET,Wed Dec 22 14:21:19 CET,0.0 0.296 0.434 0.526 0.58 0.63 0.686 0.738 0.812 0.847 0.888 0.87 1.002 1.042 1.095 1.139 1.181 1.201 1.245 1.283 1.33 1.358 1.387 1.419 1.445 1.481 1.511 1.538 1.562 1.576 1.59 1.613 1.631 1.641 1.651 1.64 1.614 1.585 1.542 1.491 1.433 1.348 1.225 1.083 0.849 0.506 0.038 -0.641 -1.627 -2.977 -5.194 -7.913 -10.13 -11.98 -13.533 -14.908 -16.1 -17.16 -18.039 -18.884 -19.619 -20.281 -20.91 -21.49 -22.031 -22.511 -23.0 -23.452 -23.849 -24.261 -24.65 -24.966 -25.333 -25.714 -25.992 -26.272 -26.578 -26.902 -27.245 -27.467 -27.687 -28.037 -28.279 -28.535 -28.671 -28.952 -29.253 -29.569 -29.738 -30.027 -30.3 -30.505 -30.708 -31.165 -31.432 -31.701 -31.978 -32.317 -32.736 -33.343 -35.626 -3 ,32311 ,KEBNE ,17025400,Wed Dec 22 12:27:17 CET,Wed Dec 22 14:20:05 CET,0.0 0.098 0.16 0.229 0.332 0.424 0.493 0.553 0.668 0.718 0.756 0.744 0.871 0.905 0.966 1.021 1.076 1.101 1.142 1.173 1.211 1.238 1.265 1.289 1.324 1.368 1.4 1.433 1.472 1.497 1.511 1.532 1.56 1.578 1.581 1.581 1.577 1.555 1.521 1.472 1.409 1.337 1.226 1.086 0.916 0.674 0.241 -0.385 -1.24 -2.601 -4.813 -7.44 -9.599 -11.352 -12.81 -14.102 -15.232 -16.234 -17.09 -17.925 -18.608 -19.214 -19.79 -20.326 -20.819 -21.263 -21.729 -22.157 -22.542 -22.927 -23.308 -23.616 -23.94 -24.281 -24.548 -24.816 -25.089 -25.371 -25.669 -25.873 -26.086 -26.416 -26.645 -26.919 -27.064 -27.367 -27.674 -27.973 -28.141 -28.436 -28.693 -28.888 -29.105 -29.619 -29.891 -30.181 -30.49 -30.83 -31.214 -31.725 -34.778 -4 ,12181 ,KEBNE ,17025401,Wed Dec 22 12:27:18 CET,Wed Dec 22 14:20:45 CET,0.0 0.215 0.315 0.437 0.525 0.599 0.676 0.745 0.875 0.942 0.999 0.983 1.11 1.146 1.205 1.259 1.324 1.356 1.407 1.453 1.522 1.566 1.609 1.675 1.721 1.753 1.787 1.818 1.849 1.891 1.937 1.99 2.024 2.033 2.045 2.064 2.06 2.048 2.035 2.007 1.967 1.889 1.786 1.676 1.505 1.254 0.882 0.334 -0.527 -1.902 -4.14 -6.685 -8.742 -10.448 -11.871 -13.115 -14.171 -15.08 -15.884 -16.747 -17.489 -18.121 -18.737 -19.317 -19.832 -20.321 -20.808 -21.206 -21.536 -21.895 -22.321 -22.659 -22.977 -23.337 -23.614 -23.888 -24.172 -24.451 -24.757 -24.984 -25.221 -25.596 -25.858 -26.135 -26.276 -26.543 -26.819 -27.135 -27.313 -27.623 -27.901 -28.113 -28.338 -28.834 -29.136 -29.529 -30.007 -30.548 -31.204 -32.062 -36.658 -5 ,25378 ,KEBNE ,17025402,Wed Dec 22 12:27:18 CET,Wed Dec 22 14:21:57 CET,0.0 0.434 0.559 0.672 0.759 0.819 0.864 0.896 0.995 1.045 1.081 1.062 1.182 1.212 1.268 1.315 1.363 1.387 1.433 1.484 1.553 1.595 1.63 1.68 1.733 1.782 1.827 1.866 1.923 1.972 2.011 2.059 2.083 2.1 2.118 2.143 2.156 2.15 2.152 2.139 2.097 2.047 1.964 1.824 1.615 1.344 0.954 0.369 -0.503 -1.762 -3.758 -6.156 -8.14 -9.819 -11.262 -12.524 -13.588 -14.53 -15.345 -16.163 -16.841 -17.405 -17.943 -18.464 -18.949 -19.389 -19.853 -20.262 -20.62 -21.004 -21.384 -21.678 -22.015 -22.394 -22.679 -22.951 -23.218 -23.49 -23.788 -24.02 -24.263 -24.654 -24.935 -25.214 -25.346 -25.647 -26.002 -26.349 -26.522 -26.839 -27.195 -27.436 -27.669 -28.24 -28.592 -28.963 -29.372 -29.888 -30.476 -31.205 -34.77 -6 ,11335 ,KEBNE ,17025403,Wed Dec 22 12:27:18 CET,Wed Dec 22 14:20:15 CET,0.0 0.32 0.456 0.547 0.621 0.699 0.767 0.831 0.925 0.954 0.982 0.944 1.067 1.105 1.184 1.252 1.3 1.323 1.374 1.424 1.486 1.528 1.569 1.619 1.666 1.7 1.726 1.753 1.777 1.807 1.839 1.854 1.862 1.865 1.858 1.849 1.843 1.811 1.761 1.704 1.633 1.545 1.403 1.212 0.969 0.691 0.286 -0.332 -1.242 -2.607 -4.886 -7.568 -9.679 -11.453 -12.965 -14.245 -15.31 -16.267 -17.097 -17.933 -18.647 -19.264 -19.852 -20.4 -20.892 -21.333 -21.797 -22.24 -22.643 -23.063 -23.478 -23.814 -24.165 -24.525 -24.81 -25.103 -25.4 -25.726 -26.081 -26.332 -26.593 -26.989 -27.257 -27.531 -27.672 -27.975 -28.305 -28.653 -28.831 -29.124 -29.387 -29.586 -29.784 -30.219 -30.478 -30.756 -31.088 -31.505 -31.999 -32.608 -35.262 -7 ,11112 ,KEBNE ,17025404,Wed Dec 22 12:28:20 CET,Wed Dec 22 14:21:07 CET,0.0 0.22 0.298 0.363 0.455 0.552 0.623 0.678 0.764 0.802 0.842 0.832 0.953 0.98 1.029 1.079 1.132 1.157 1.202 1.244 1.308 1.341 1.37 1.403 1.425 1.457 1.493 1.521 1.547 1.566 1.578 1.593 1.604 1.609 1.612 1.613 1.614 1.589 1.547 1.501 1.426 1.321 1.178 0.983 0.722 0.4 -0.076 -0.768 -1.766 -3.22 -5.567 -8.284 -10.504 -12.362 -13.888 -15.208 -16.353 -17.355 -18.196 -19.072 -19.854 -20.507 -21.077 -21.614 -22.129 -22.619 -23.126 -23.564 -23.948 -24.34 -24.745 -25.065 -25.391 -25.755 -26.031 -26.321 -26.662 -27.019 -27.379 -27.617 -27.852 -28.227 -28.484 -28.76 -28.9 -29.182 -29.51 -29.906 -30.112 -30.42 -30.73 -30.969 -31.234 -31.853 -32.176 -32.538 -32.92 -33.296 -33.733 -34.319 -37.738 -8 ,14874 ,KEBNE ,17025405,Wed Dec 22 12:28:19 CET,Wed Dec 22 14:21:24 CET,0.0 0.202 0.341 0.455 0.538 0.597 0.652 0.706 0.825 0.894 0.943 0.915 1.039 1.08 1.141 1.171 1.207 1.229 1.285 1.352 1.438 1.473 1.509 1.561 1.603 1.651 1.696 1.745 1.802 1.831 1.855 1.883 1.907 1.93 1.951 1.964 1.958 1.929 1.887 1.833 1.752 1.644 1.529 1.399 1.192 0.941 0.578 0.039 -0.783 -2.123 -4.337 -6.92 -8.965 -10.618 -12.024 -13.255 -14.293 -15.231 -16.017 -16.784 -17.46 -18.072 -18.657 -19.191 -19.665 -20.103 -20.553 -20.94 -21.281 -21.646 -22.034 -22.361 -22.696 -23.032 -23.307 -23.595 -23.898 -24.223 -24.552 -24.785 -25.046 -25.518 -25.836 -26.153 -26.324 -26.654 -26.985 -27.334 -27.525 -27.845 -28.158 -28.397 -28.655 -29.229 -29.548 -29.864 -30.221 -30.665 -31.228 -31.983 -35.129 -9 ,31893 ,KEBNE ,17025406,Wed Dec 22 12:28:19 CET,Wed Dec 22 14:21:49 CET,0.0 0.272 0.478 0.617 0.691 0.75 0.802 0.845 0.964 1.028 1.077 1.064 1.187 1.222 1.289 1.355 1.425 1.456 1.494 1.531 1.603 1.652 1.699 1.76 1.799 1.825 1.857 1.89 1.912 1.937 1.966 1.981 1.997 2.011 2.019 2.033 2.034 2.038 2.031 2.004 1.969 1.9 1.775 1.626 1.466 1.213 0.779 0.164 -0.721 -2.061 -4.313 -6.934 -8.984 -10.671 -12.124 -13.399 -14.506 -15.509 -16.373 -17.234 -17.985 -18.621 -19.213 -19.766 -20.268 -20.755 -21.265 -21.716 -22.112 -22.515 -22.929 -23.288 -23.661 -24.041 -24.335 -24.64 -24.953 -25.256 -25.574 -25.807 -26.047 -26.423 -26.68 -26.941 -27.082 -27.376 -27.671 -27.969 -28.128 -28.424 -28.698 -28.895 -29.136 -29.702 -29.998 -30.36 -30.811 -31.264 -31.774 -32.52 -35.407 -10 ,9234 ,KEBNE ,17025407,Wed Dec 22 12:28:19 CET,Wed Dec 22 14:21:57 CET,0.0 0.243 0.397 0.49 0.565 0.64 0.702 0.759 0.862 0.911 0.954 0.932 1.053 1.084 1.135 1.166 1.208 1.232 1.279 1.328 1.392 1.428 1.467 1.527 1.581 1.62 1.656 1.688 1.724 1.763 1.787 1.801 1.814 1.816 1.817 1.823 1.817 1.8 1.772 1.747 1.715 1.646 1.53 1.36 1.114 0.784 0.33 -0.233 -1.07 -2.43 -4.697 -7.395 -9.633 -11.543 -13.182 -14.598 -15.754 -16.842 -17.832 -18.781 -19.534 -20.2 -20.86 -21.47 -22.015 -22.505 -23.031 -23.502 -23.892 -24.294 -24.724 -25.106 -25.496 -25.876 -26.174 -26.494 -26.805 -27.118 -27.458 -27.693 -27.934 -28.303 -28.548 -28.827 -28.986 -29.348 -29.727 -30.095 -30.282 -30.558 -30.787 -30.976 -31.173 -31.607 -31.843 -32.095 -32.404 -32.827 -33.342 -34.062 -37.503 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_39_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_39_28.txt deleted file mode 100644 index ed2faa93..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_39_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12753 ,TETRA ,17556423,Fri Nov 26 06:51:40 CET,Fri Nov 26 09:12:15 CET,0.0 1.537 1.913 2.189 2.408 2.599 2.762 2.912 3.207 3.361 3.512 3.713 3.947 4.081 4.329 4.566 4.791 4.901 5.116 5.329 5.661 5.873 6.059 6.322 6.587 6.824 7.047 7.295 7.617 7.912 8.199 8.548 8.897 9.237 9.612 10.041 10.454 10.874 11.341 11.847 12.386 12.994 13.697 14.476 15.375 16.288 17.39 18.665 20.084 21.76 23.661 25.048 25.855 26.257 26.409 26.473 26.44 26.343 26.207 26.068 25.945 25.804 25.667 25.516 25.354 25.203 25.018 24.827 24.653 24.468 24.258 24.082 23.904 23.713 23.557 23.37 23.179 22.966 22.73 22.569 22.398 22.144 21.967 21.766 21.667 21.477 21.253 21.002 20.874 20.668 20.4 20.217 20.031 19.602 19.383 19.155 18.858 18.453 17.9 17.169 14.046 -2 ,904 ,TETRA ,17556424,Fri Nov 26 06:52:40 CET,Fri Nov 26 09:10:40 CET,0.0 1.458 1.849 2.141 2.358 2.536 2.719 2.916 3.28 3.464 3.63 3.818 4.037 4.165 4.415 4.637 4.846 4.956 5.185 5.404 5.712 5.904 6.097 6.389 6.682 6.963 7.22 7.479 7.817 8.13 8.432 8.799 9.16 9.52 9.922 10.372 10.8 11.25 11.73 12.247 12.826 13.483 14.247 15.053 16.11 17.311 18.652 20.203 22.01 24.082 26.374 28.022 28.793 29.157 29.256 29.243 29.164 29.033 28.919 28.757 28.59 28.438 28.251 28.031 27.796 27.577 27.349 27.145 26.959 26.75 26.528 26.353 26.167 25.976 25.827 25.648 25.447 25.243 25.04 24.905 24.763 24.531 24.377 24.211 24.114 23.88 23.642 23.411 23.286 23.09 22.865 22.696 22.523 22.167 21.956 21.73 21.427 21.021 20.517 19.855 17.035 -3 ,17565 ,TETRA ,17556425,Fri Nov 26 06:52:40 CET,Fri Nov 26 09:11:40 CET,0.0 1.933 2.222 2.44 2.652 2.864 3.042 3.199 3.476 3.611 3.752 3.924 4.126 4.244 4.494 4.735 4.97 5.081 5.303 5.516 5.818 6.012 6.182 6.408 6.635 6.865 7.086 7.305 7.603 7.889 8.162 8.495 8.822 9.133 9.495 9.906 10.309 10.771 11.293 11.861 12.455 13.098 13.795 14.47 15.288 16.233 17.271 18.4 19.779 21.508 23.561 25.013 25.605 25.781 25.814 25.75 25.591 25.371 25.142 24.897 24.661 24.431 24.208 23.995 23.769 23.53 23.252 23.011 22.817 22.597 22.353 22.167 21.994 21.787 21.609 21.432 21.245 21.052 20.852 20.718 20.577 20.331 20.136 19.929 19.832 19.629 19.399 19.144 19.007 18.794 18.555 18.393 18.215 17.818 17.594 17.341 17.083 16.78 16.335 15.645 12.478 -4 ,16111 ,TETRA ,17556426,Fri Nov 26 06:52:40 CET,Fri Nov 26 09:12:50 CET,0.0 1.477 1.878 2.167 2.44 2.673 2.883 3.08 3.409 3.553 3.691 3.889 4.111 4.24 4.492 4.726 4.93 5.027 5.221 5.412 5.69 5.88 6.063 6.312 6.55 6.786 7.017 7.244 7.547 7.852 8.142 8.471 8.781 9.097 9.485 9.927 10.353 10.803 11.289 11.825 12.39 13.019 13.728 14.457 15.352 16.308 17.344 18.457 19.739 21.233 22.95 24.333 24.997 25.22 25.252 25.297 25.344 25.317 25.244 25.121 25.0 24.87 24.706 24.506 24.264 24.024 23.777 23.562 23.399 23.228 23.043 22.891 22.727 22.542 22.381 22.195 22.005 21.825 21.61 21.456 21.308 21.065 20.887 20.684 20.578 20.368 20.129 19.859 19.718 19.514 19.286 19.108 18.9 18.441 18.194 17.927 17.628 17.273 16.817 16.111 13.393 -5 ,7416 ,TETRA ,17556427,Fri Nov 26 06:53:40 CET,Fri Nov 26 09:17:54 CET,0.0 1.519 1.779 2.008 2.216 2.392 2.563 2.737 3.032 3.169 3.308 3.463 3.681 3.825 4.108 4.367 4.606 4.715 4.923 5.117 5.389 5.57 5.739 5.988 6.242 6.497 6.751 6.998 7.342 7.685 8.004 8.376 8.735 9.1 9.518 9.975 10.432 10.934 11.487 12.095 12.672 13.257 13.993 14.785 15.651 16.575 17.685 18.986 20.476 22.077 23.715 24.834 25.443 25.69 25.697 25.619 25.522 25.424 25.263 25.015 24.778 24.57 24.39 24.23 24.054 23.895 23.752 23.619 23.474 23.295 23.109 22.962 22.803 22.631 22.505 22.356 22.162 21.94 21.724 21.58 21.43 21.213 21.059 20.892 20.799 20.595 20.377 20.147 20.025 19.827 19.609 19.451 19.278 18.901 18.7 18.456 18.176 17.843 17.399 16.848 14.442 -6 ,25905 ,TETRA ,17556428,Fri Nov 26 06:53:40 CET,Fri Nov 26 09:11:45 CET,0.0 1.33 1.783 2.089 2.308 2.504 2.696 2.889 3.25 3.415 3.575 3.771 3.989 4.119 4.386 4.64 4.874 4.995 5.236 5.461 5.778 5.972 6.164 6.445 6.714 6.972 7.223 7.464 7.777 8.089 8.402 8.786 9.148 9.499 9.893 10.348 10.831 11.352 11.902 12.488 13.103 13.802 14.584 15.352 16.265 17.292 18.445 19.644 21.022 22.584 24.3 25.527 26.117 26.413 26.486 26.408 26.248 26.058 25.902 25.699 25.471 25.26 25.071 24.897 24.714 24.536 24.364 24.192 23.998 23.788 23.603 23.464 23.306 23.116 22.962 22.795 22.614 22.426 22.229 22.077 21.893 21.585 21.386 21.188 21.097 20.904 20.679 20.449 20.343 20.171 19.973 19.842 19.696 19.343 19.141 18.896 18.619 18.327 17.965 17.459 14.952 -7 ,27643 ,TETRA ,17556429,Fri Nov 26 06:53:39 CET,Fri Nov 26 09:10:10 CET,0.0 2.484 2.902 3.257 3.519 3.721 3.922 4.113 4.493 4.682 4.839 5.03 5.246 5.376 5.638 5.883 6.114 6.227 6.446 6.661 6.962 7.154 7.351 7.63 7.896 8.152 8.414 8.674 9.013 9.342 9.656 10.044 10.443 10.832 11.269 11.744 12.179 12.636 13.13 13.687 14.301 14.961 15.742 16.545 17.422 18.465 19.755 21.255 22.83 24.378 26.217 27.808 28.721 29.185 29.364 29.409 29.419 29.395 29.292 29.16 29.049 28.92 28.777 28.622 28.468 28.315 28.15 28.013 27.889 27.762 27.611 27.466 27.303 27.097 26.93 26.778 26.62 26.446 26.263 26.13 25.957 25.657 25.471 25.279 25.179 24.967 24.73 24.474 24.345 24.135 23.883 23.713 23.539 23.14 22.937 22.727 22.464 22.163 21.77 21.182 18.223 -8 ,29233 ,TETRA ,17556430,Fri Nov 26 06:53:42 CET,Fri Nov 26 09:09:41 CET,0.0 1.571 1.986 2.33 2.57 2.775 2.97 3.148 3.447 3.599 3.752 3.935 4.159 4.287 4.526 4.761 4.979 5.087 5.3 5.506 5.817 6.019 6.212 6.495 6.77 7.025 7.285 7.545 7.864 8.171 8.476 8.836 9.182 9.54 9.945 10.363 10.786 11.282 11.821 12.406 13.013 13.681 14.49 15.296 16.238 17.306 18.509 19.85 21.383 23.185 25.239 26.753 27.524 27.855 27.932 27.893 27.758 27.592 27.445 27.258 27.024 26.798 26.562 26.293 26.043 25.826 25.586 25.367 25.193 25.014 24.821 24.654 24.466 24.273 24.132 23.982 23.82 23.639 23.452 23.321 23.171 22.937 22.777 22.605 22.509 22.309 22.091 21.849 21.724 21.522 21.293 21.129 20.958 20.582 20.38 20.17 19.93 19.636 19.267 18.72 15.569 -9 ,8169 ,TETRA ,17556431,Fri Nov 26 06:53:44 CET,Fri Nov 26 09:09:40 CET,0.0 1.425 1.862 2.149 2.372 2.582 2.782 2.95 3.24 3.378 3.512 3.681 3.91 4.044 4.307 4.549 4.775 4.884 5.088 5.289 5.572 5.748 5.936 6.225 6.49 6.752 7.005 7.248 7.582 7.909 8.22 8.598 8.976 9.34 9.765 10.241 10.695 11.213 11.79 12.389 12.999 13.678 14.465 15.266 16.226 17.367 18.749 20.33 22.001 23.724 25.774 27.22 27.821 27.94 27.859 27.839 27.83 27.766 27.645 27.448 27.25 27.046 26.811 26.597 26.413 26.247 26.041 25.826 25.641 25.439 25.21 25.01 24.795 24.563 24.385 24.202 24.007 23.796 23.576 23.43 23.28 23.037 22.856 22.673 22.576 22.361 22.125 21.867 21.743 21.557 21.36 21.212 21.053 20.68 20.459 20.205 19.932 19.604 19.197 18.655 15.769 -10 ,18971 ,TETRA ,17556432,Fri Nov 26 06:53:39 CET,Fri Nov 26 09:17:12 CET,0.0 1.136 1.429 1.689 1.916 2.133 2.329 2.515 2.868 3.013 3.155 3.336 3.543 3.66 3.874 4.096 4.318 4.42 4.633 4.84 5.119 5.314 5.515 5.801 6.092 6.37 6.631 6.881 7.199 7.491 7.766 8.123 8.467 8.788 9.162 9.594 10.016 10.483 11.009 11.566 12.152 12.813 13.567 14.363 15.316 16.315 17.43 18.707 20.176 21.893 23.804 24.988 25.446 25.595 25.608 25.564 25.429 25.237 25.053 24.84 24.612 24.371 24.133 23.917 23.721 23.523 23.311 23.1 22.888 22.677 22.465 22.284 22.082 21.845 21.659 21.462 21.243 21.017 20.799 20.653 20.491 20.228 20.058 19.889 19.798 19.598 19.363 19.115 18.996 18.8 18.561 18.39 18.219 17.844 17.63 17.403 17.135 16.815 16.447 15.991 13.067 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_39_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_39_37.txt deleted file mode 100644 index 4c6fc4a4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_39_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21097 ,TETRA ,17556433,Fri Nov 26 06:53:40 CET,Fri Nov 26 09:15:04 CET,0.0 0.787 1.061 1.244 1.436 1.599 1.732 1.857 2.062 2.14 2.222 2.3 2.466 2.532 2.636 2.74 2.837 2.883 2.981 3.068 3.19 3.273 3.355 3.456 3.538 3.627 3.715 3.8 3.891 3.976 4.077 4.197 4.289 4.356 4.436 4.524 4.599 4.663 4.719 4.778 4.826 4.848 4.852 4.822 4.763 4.69 4.554 4.265 3.719 2.777 1.086 -0.958 -2.653 -4.068 -5.224 -6.206 -7.089 -7.894 -8.556 -9.208 -9.761 -10.252 -10.712 -11.133 -11.527 -11.889 -12.274 -12.615 -12.897 -13.18 -13.478 -13.734 -13.99 -14.248 -14.441 -14.639 -14.845 -15.075 -15.32 -15.474 -15.636 -15.908 -16.1 -16.291 -16.392 -16.605 -16.818 -17.028 -17.136 -17.362 -17.503 -17.63 -17.769 -18.075 -18.241 -18.423 -18.63 -18.871 -19.163 -19.599 -21.18 -2 ,4251 ,TETRA ,17556434,Fri Nov 26 06:53:41 CET,Fri Nov 26 09:12:46 CET,0.0 0.599 0.837 1.037 1.177 1.306 1.423 1.534 1.763 1.858 1.938 2.0 2.156 2.23 2.384 2.518 2.625 2.67 2.756 2.842 2.962 3.039 3.111 3.217 3.309 3.394 3.478 3.555 3.646 3.717 3.783 3.863 3.94 4.022 4.12 4.225 4.31 4.364 4.404 4.437 4.484 4.536 4.556 4.546 4.493 4.362 4.154 3.864 3.391 2.533 0.913 -1.091 -2.741 -4.126 -5.324 -6.388 -7.279 -8.039 -8.718 -9.411 -9.993 -10.511 -10.997 -11.433 -11.853 -12.247 -12.641 -12.986 -13.285 -13.609 -13.928 -14.174 -14.433 -14.705 -14.913 -15.13 -15.363 -15.599 -15.853 -16.035 -16.203 -16.463 -16.662 -16.866 -16.967 -17.167 -17.379 -17.606 -17.729 -17.959 -18.087 -18.211 -18.349 -18.661 -18.85 -19.048 -19.241 -19.456 -19.737 -20.142 -21.39 -3 ,25097 ,TETRA ,17556435,Fri Nov 26 06:54:39 CET,Fri Nov 26 09:12:20 CET,0.0 0.535 0.754 0.951 1.122 1.244 1.364 1.477 1.673 1.769 1.853 1.941 2.118 2.185 2.306 2.415 2.517 2.573 2.67 2.764 2.898 2.978 3.054 3.158 3.255 3.344 3.423 3.499 3.597 3.694 3.784 3.879 3.958 4.028 4.103 4.187 4.273 4.356 4.441 4.53 4.6 4.659 4.703 4.704 4.651 4.535 4.345 4.053 3.541 2.651 1.003 -1.017 -2.66 -4.052 -5.195 -6.176 -7.023 -7.783 -8.442 -9.074 -9.619 -10.121 -10.59 -11.031 -11.442 -11.817 -12.205 -12.547 -12.835 -13.146 -13.488 -13.758 -14.037 -14.323 -14.538 -14.767 -15.022 -15.291 -15.553 -15.727 -15.907 -16.193 -16.395 -16.612 -16.719 -16.938 -17.169 -17.412 -17.542 -17.777 -17.936 -18.082 -18.243 -18.59 -18.806 -19.035 -19.248 -19.494 -19.822 -20.269 -21.543 -4 ,13369 ,TETRA ,17556436,Fri Nov 26 06:54:41 CET,Fri Nov 26 09:11:00 CET,0.0 0.697 0.965 1.151 1.308 1.466 1.612 1.719 1.916 2.026 2.131 2.204 2.373 2.455 2.602 2.715 2.83 2.89 2.98 3.054 3.179 3.267 3.348 3.463 3.566 3.653 3.741 3.832 3.939 4.033 4.11 4.222 4.327 4.4 4.488 4.57 4.628 4.697 4.768 4.827 4.89 4.953 4.973 4.966 4.909 4.792 4.59 4.244 3.68 2.799 1.257 -0.695 -2.353 -3.745 -4.885 -5.937 -6.863 -7.663 -8.341 -9.009 -9.567 -10.05 -10.502 -10.94 -11.358 -11.724 -12.104 -12.452 -12.748 -13.044 -13.348 -13.607 -13.876 -14.142 -14.361 -14.614 -14.877 -15.125 -15.37 -15.541 -15.724 -16.017 -16.227 -16.445 -16.545 -16.74 -16.958 -17.215 -17.354 -17.605 -17.8 -17.953 -18.105 -18.427 -18.621 -18.826 -19.059 -19.341 -19.636 -20.061 -21.623 -5 ,19030 ,TETRA ,17556437,Fri Nov 26 06:54:41 CET,Fri Nov 26 09:12:32 CET,0.0 0.714 0.958 1.14 1.302 1.451 1.58 1.696 1.897 1.985 2.068 2.133 2.29 2.357 2.493 2.62 2.729 2.78 2.874 2.963 3.106 3.196 3.28 3.397 3.496 3.587 3.669 3.745 3.844 3.938 4.025 4.121 4.2 4.264 4.331 4.401 4.467 4.553 4.635 4.696 4.747 4.781 4.79 4.768 4.723 4.646 4.492 4.208 3.621 2.616 0.894 -1.188 -2.842 -4.238 -5.45 -6.53 -7.446 -8.247 -8.916 -9.556 -10.1 -10.583 -11.06 -11.503 -11.899 -12.262 -12.642 -12.98 -13.277 -13.579 -13.889 -14.153 -14.422 -14.702 -14.923 -15.156 -15.402 -15.645 -15.886 -16.059 -16.236 -16.514 -16.7 -16.882 -16.98 -17.184 -17.38 -17.582 -17.699 -17.924 -18.055 -18.187 -18.322 -18.651 -18.84 -19.028 -19.232 -19.453 -19.718 -20.103 -21.622 -6 ,2009 ,TETRA ,17556438,Fri Nov 26 06:54:41 CET,Fri Nov 26 09:12:27 CET,0.0 0.487 0.718 0.903 1.055 1.187 1.299 1.399 1.572 1.654 1.74 1.814 1.979 2.048 2.168 2.269 2.369 2.416 2.5 2.579 2.695 2.771 2.844 2.947 3.047 3.139 3.224 3.31 3.413 3.506 3.607 3.717 3.803 3.871 3.957 4.056 4.129 4.211 4.293 4.353 4.414 4.478 4.5 4.477 4.415 4.292 4.071 3.741 3.241 2.413 0.883 -1.078 -2.683 -4.027 -5.156 -6.146 -7.011 -7.791 -8.47 -9.15 -9.715 -10.219 -10.697 -11.117 -11.501 -11.86 -12.24 -12.588 -12.889 -13.183 -13.479 -13.73 -13.987 -14.234 -14.439 -14.666 -14.89 -15.12 -15.355 -15.513 -15.679 -15.932 -16.097 -16.272 -16.364 -16.554 -16.747 -16.941 -17.043 -17.26 -17.379 -17.501 -17.636 -17.953 -18.113 -18.278 -18.468 -18.691 -18.972 -19.344 -20.735 -7 ,20155 ,TETRA ,17556439,Fri Nov 26 06:54:41 CET,Fri Nov 26 09:11:11 CET,0.0 0.64 0.876 1.039 1.168 1.296 1.412 1.521 1.702 1.789 1.878 1.947 2.112 2.183 2.305 2.407 2.507 2.559 2.652 2.742 2.867 2.947 3.032 3.155 3.266 3.369 3.455 3.531 3.63 3.72 3.811 3.919 4.006 4.086 4.177 4.26 4.341 4.411 4.46 4.494 4.522 4.568 4.599 4.581 4.527 4.39 4.153 3.792 3.193 2.268 0.65 -1.338 -2.992 -4.406 -5.6 -6.615 -7.476 -8.248 -8.912 -9.562 -10.134 -10.68 -11.198 -11.665 -12.088 -12.455 -12.837 -13.188 -13.484 -13.788 -14.103 -14.358 -14.617 -14.898 -15.117 -15.342 -15.571 -15.789 -16.024 -16.196 -16.358 -16.596 -16.781 -16.978 -17.084 -17.324 -17.552 -17.783 -17.909 -18.14 -18.293 -18.432 -18.57 -18.857 -19.015 -19.198 -19.399 -19.626 -19.917 -20.307 -21.891 -8 ,25655 ,TETRA ,17556440,Fri Nov 26 06:54:43 CET,Fri Nov 26 09:10:56 CET,0.0 0.882 1.183 1.382 1.544 1.699 1.835 1.948 2.17 2.274 2.363 2.425 2.584 2.648 2.768 2.873 2.987 3.038 3.128 3.221 3.355 3.432 3.505 3.606 3.688 3.772 3.859 3.94 4.039 4.123 4.201 4.294 4.382 4.46 4.538 4.614 4.683 4.765 4.846 4.896 4.912 4.922 4.919 4.906 4.86 4.762 4.588 4.254 3.666 2.753 1.156 -0.86 -2.519 -3.89 -5.013 -6.007 -6.887 -7.688 -8.372 -9.047 -9.616 -10.116 -10.577 -10.994 -11.383 -11.74 -12.11 -12.453 -12.767 -13.098 -13.419 -13.669 -13.921 -14.184 -14.396 -14.609 -14.825 -15.056 -15.3 -15.469 -15.643 -15.912 -16.093 -16.278 -16.373 -16.568 -16.764 -16.977 -17.091 -17.319 -17.462 -17.59 -17.744 -18.085 -18.263 -18.454 -18.663 -18.896 -19.189 -19.578 -20.763 -9 ,24794 ,TETRA ,17556441,Fri Nov 26 06:55:39 CET,Fri Nov 26 09:12:04 CET,0.0 0.802 1.039 1.211 1.378 1.541 1.681 1.795 2.008 2.111 2.213 2.288 2.457 2.529 2.645 2.768 2.883 2.937 3.055 3.166 3.305 3.377 3.448 3.55 3.643 3.739 3.853 3.958 4.076 4.175 4.254 4.336 4.411 4.491 4.585 4.689 4.774 4.844 4.904 4.97 5.021 5.049 5.06 5.054 5.008 4.904 4.737 4.394 3.803 2.906 1.28 -0.708 -2.376 -3.785 -4.919 -5.928 -6.818 -7.611 -8.261 -8.902 -9.469 -9.975 -10.443 -10.871 -11.264 -11.619 -11.995 -12.326 -12.598 -12.879 -13.174 -13.407 -13.643 -13.901 -14.104 -14.31 -14.526 -14.747 -14.967 -15.125 -15.302 -15.59 -15.789 -15.979 -16.072 -16.271 -16.476 -16.688 -16.803 -17.021 -17.159 -17.298 -17.451 -17.777 -17.958 -18.162 -18.387 -18.626 -18.898 -19.277 -20.695 -10 ,19625 ,TETRA ,17556442,Fri Nov 26 06:55:39 CET,Fri Nov 26 09:13:00 CET,0.0 0.691 0.994 1.236 1.478 1.668 1.805 1.927 2.135 2.229 2.323 2.401 2.564 2.627 2.756 2.878 2.974 3.015 3.105 3.191 3.302 3.376 3.452 3.561 3.659 3.738 3.809 3.876 3.956 4.037 4.119 4.219 4.312 4.395 4.492 4.581 4.642 4.693 4.75 4.807 4.844 4.861 4.845 4.803 4.72 4.594 4.41 4.092 3.5 2.573 1.022 -0.895 -2.466 -3.815 -4.95 -5.945 -6.822 -7.632 -8.309 -8.956 -9.502 -9.997 -10.456 -10.866 -11.264 -11.639 -12.028 -12.364 -12.653 -12.95 -13.254 -13.499 -13.741 -14.002 -14.216 -14.43 -14.645 -14.875 -15.121 -15.298 -15.478 -15.754 -15.948 -16.147 -16.244 -16.433 -16.634 -16.861 -16.991 -17.246 -17.459 -17.62 -17.776 -18.112 -18.298 -18.49 -18.708 -18.962 -19.234 -19.62 -21.066 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_40_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_40_37.txt deleted file mode 100644 index c04e8bad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_40_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5076 ,TETRA ,17556443,Fri Nov 26 06:56:40 CET,Fri Nov 26 09:20:14 CET,0.0 0.639 0.824 1.015 1.206 1.336 1.432 1.521 1.688 1.77 1.856 1.935 2.083 2.145 2.254 2.341 2.428 2.471 2.547 2.624 2.75 2.82 2.873 2.954 3.035 3.103 3.16 3.209 3.27 3.339 3.39 3.431 3.484 3.529 3.573 3.591 3.575 3.568 3.548 3.52 3.482 3.414 3.32 3.182 2.973 2.684 2.278 1.707 0.728 -0.794 -3.124 -6.027 -8.469 -10.468 -12.085 -13.496 -14.698 -15.764 -16.683 -17.562 -18.294 -18.931 -19.519 -20.057 -20.534 -20.968 -21.435 -21.872 -22.248 -22.607 -22.969 -23.269 -23.565 -23.874 -24.116 -24.37 -24.631 -24.889 -25.171 -25.378 -25.592 -25.903 -26.112 -26.328 -26.443 -26.678 -26.921 -27.183 -27.319 -27.572 -27.746 -27.893 -28.054 -28.409 -28.612 -28.816 -29.021 -29.25 -29.516 -29.902 -31.255 -2 ,32001 ,TETRA ,17556444,Fri Nov 26 06:55:39 CET,Fri Nov 26 09:13:39 CET,0.0 0.645 0.945 1.167 1.328 1.471 1.594 1.712 1.907 1.991 2.074 2.123 2.274 2.343 2.45 2.543 2.632 2.676 2.767 2.852 2.967 3.033 3.091 3.174 3.257 3.33 3.392 3.439 3.499 3.556 3.61 3.677 3.732 3.767 3.764 3.756 3.791 3.82 3.83 3.83 3.799 3.727 3.598 3.434 3.181 2.805 2.277 1.537 0.474 -1.101 -3.764 -6.89 -9.429 -11.487 -13.144 -14.568 -15.773 -16.828 -17.711 -18.564 -19.288 -19.911 -20.486 -21.033 -21.537 -21.994 -22.473 -22.892 -23.236 -23.583 -23.929 -24.213 -24.522 -24.838 -25.086 -25.343 -25.589 -25.844 -26.104 -26.283 -26.477 -26.775 -26.985 -27.207 -27.319 -27.545 -27.787 -28.04 -28.166 -28.404 -28.585 -28.735 -28.886 -29.196 -29.383 -29.585 -29.79 -30.031 -30.318 -30.668 -32.183 -3 ,11849 ,TETRA ,17556445,Fri Nov 26 06:56:40 CET,Fri Nov 26 09:16:19 CET,0.0 0.623 0.853 1.022 1.176 1.334 1.462 1.571 1.757 1.838 1.919 1.986 2.144 2.213 2.326 2.415 2.497 2.541 2.633 2.728 2.856 2.921 2.983 3.079 3.161 3.223 3.288 3.353 3.42 3.485 3.543 3.598 3.64 3.663 3.681 3.689 3.71 3.734 3.73 3.687 3.604 3.52 3.401 3.222 2.948 2.598 2.093 1.331 0.258 -1.35 -3.907 -6.901 -9.331 -11.309 -12.975 -14.403 -15.583 -16.622 -17.514 -18.38 -19.094 -19.702 -20.272 -20.817 -21.333 -21.803 -22.274 -22.691 -23.059 -23.432 -23.815 -24.127 -24.438 -24.76 -25.015 -25.289 -25.565 -25.83 -26.102 -26.294 -26.493 -26.794 -27.001 -27.223 -27.339 -27.582 -27.834 -28.096 -28.233 -28.471 -28.622 -28.758 -28.901 -29.222 -29.402 -29.583 -29.785 -30.028 -30.323 -30.727 -32.334 -4 ,16371 ,TETRA ,17556446,Fri Nov 26 06:56:40 CET,Fri Nov 26 09:14:42 CET,0.0 0.665 0.949 1.173 1.347 1.484 1.622 1.746 1.93 2.017 2.103 2.181 2.334 2.395 2.5 2.625 2.746 2.8 2.901 2.983 3.099 3.166 3.228 3.327 3.407 3.47 3.533 3.588 3.655 3.719 3.775 3.836 3.87 3.879 3.882 3.899 3.916 3.912 3.872 3.819 3.757 3.673 3.532 3.342 3.124 2.793 2.288 1.589 0.468 -1.305 -4.275 -7.553 -10.032 -12.038 -13.75 -15.227 -16.469 -17.575 -18.493 -19.406 -20.183 -20.842 -21.436 -21.979 -22.485 -22.954 -23.458 -23.905 -24.287 -24.666 -25.047 -25.381 -25.728 -26.08 -26.348 -26.622 -26.902 -27.19 -27.493 -27.696 -27.903 -28.223 -28.439 -28.658 -28.769 -28.995 -29.237 -29.5 -29.634 -29.871 -30.055 -30.203 -30.355 -30.682 -30.863 -31.058 -31.272 -31.537 -31.848 -32.265 -34.196 -5 ,25273 ,TETRA ,17556447,Fri Nov 26 06:56:41 CET,Fri Nov 26 09:14:39 CET,0.0 0.876 1.147 1.33 1.5 1.662 1.815 1.934 2.143 2.236 2.308 2.354 2.506 2.574 2.705 2.819 2.908 2.951 3.033 3.107 3.233 3.316 3.385 3.488 3.584 3.68 3.766 3.83 3.902 3.962 4.001 4.039 4.078 4.111 4.15 4.185 4.212 4.245 4.254 4.231 4.175 4.079 3.939 3.761 3.499 3.137 2.642 1.99 0.932 -0.87 -3.693 -6.826 -9.287 -11.284 -12.952 -14.365 -15.559 -16.626 -17.512 -18.369 -19.093 -19.737 -20.339 -20.897 -21.402 -21.863 -22.337 -22.749 -23.105 -23.466 -23.832 -24.144 -24.474 -24.812 -25.076 -25.332 -25.581 -25.848 -26.117 -26.302 -26.498 -26.808 -27.018 -27.225 -27.33 -27.546 -27.765 -27.981 -28.109 -28.358 -28.523 -28.663 -28.829 -29.205 -29.396 -29.583 -29.771 -30.005 -30.295 -30.675 -32.077 -6 ,6623 ,TETRA ,17556448,Fri Nov 26 06:56:41 CET,Fri Nov 26 09:14:51 CET,0.0 0.545 0.761 0.935 1.093 1.227 1.346 1.459 1.645 1.72 1.793 1.858 1.996 2.057 2.174 2.272 2.363 2.406 2.48 2.554 2.656 2.716 2.782 2.872 2.943 3.006 3.069 3.132 3.19 3.244 3.301 3.347 3.382 3.414 3.448 3.46 3.456 3.458 3.446 3.425 3.39 3.314 3.189 3.021 2.775 2.436 1.949 1.294 0.307 -1.308 -3.938 -6.975 -9.398 -11.39 -13.057 -14.478 -15.689 -16.759 -17.662 -18.538 -19.274 -19.902 -20.497 -21.085 -21.622 -22.096 -22.582 -23.005 -23.364 -23.728 -24.106 -24.418 -24.742 -25.085 -25.34 -25.597 -25.869 -26.146 -26.432 -26.626 -26.818 -27.123 -27.341 -27.567 -27.684 -27.914 -28.145 -28.381 -28.507 -28.755 -28.956 -29.108 -29.257 -29.577 -29.742 -29.941 -30.189 -30.468 -30.757 -31.137 -32.374 -7 ,1137 ,TETRA ,17556449,Fri Nov 26 06:56:41 CET,Fri Nov 26 09:12:35 CET,0.0 0.64 0.893 1.088 1.232 1.345 1.445 1.541 1.705 1.784 1.857 1.906 2.059 2.133 2.251 2.348 2.43 2.474 2.556 2.622 2.72 2.779 2.838 2.92 2.998 3.075 3.135 3.193 3.271 3.325 3.356 3.402 3.455 3.496 3.535 3.564 3.567 3.548 3.528 3.498 3.457 3.378 3.253 3.087 2.82 2.483 2.034 1.396 0.402 -1.201 -3.865 -7.033 -9.506 -11.465 -13.092 -14.49 -15.688 -16.736 -17.611 -18.466 -19.198 -19.847 -20.45 -20.997 -21.487 -21.94 -22.415 -22.817 -23.154 -23.508 -23.882 -24.191 -24.509 -24.831 -25.08 -25.339 -25.609 -25.885 -26.157 -26.348 -26.55 -26.852 -27.049 -27.254 -27.359 -27.578 -27.809 -28.055 -28.187 -28.427 -28.603 -28.756 -28.926 -29.3 -29.505 -29.718 -29.925 -30.157 -30.467 -30.888 -32.199 -8 ,26871 ,TETRA ,17556450,Fri Nov 26 06:56:41 CET,Fri Nov 26 09:15:50 CET,0.0 0.497 0.78 0.995 1.168 1.31 1.434 1.556 1.762 1.837 1.916 2.001 2.151 2.209 2.322 2.434 2.534 2.583 2.67 2.754 2.872 2.934 2.989 3.072 3.147 3.217 3.282 3.34 3.403 3.451 3.506 3.569 3.609 3.634 3.661 3.698 3.744 3.758 3.747 3.722 3.674 3.615 3.512 3.37 3.129 2.794 2.339 1.661 0.643 -0.953 -3.725 -6.914 -9.357 -11.356 -13.021 -14.426 -15.601 -16.636 -17.506 -18.361 -19.089 -19.734 -20.343 -20.906 -21.415 -21.878 -22.348 -22.752 -23.104 -23.467 -23.835 -24.147 -24.468 -24.785 -25.021 -25.261 -25.502 -25.75 -26.027 -26.216 -26.401 -26.698 -26.918 -27.143 -27.252 -27.486 -27.73 -27.991 -28.126 -28.367 -28.548 -28.712 -28.871 -29.178 -29.355 -29.558 -29.759 -29.994 -30.29 -30.648 -31.827 -9 ,19189 ,TETRA ,17556451,Fri Nov 26 06:56:41 CET,Fri Nov 26 09:15:39 CET,0.0 0.599 0.838 1.022 1.165 1.285 1.39 1.476 1.641 1.727 1.804 1.852 1.993 2.047 2.156 2.261 2.34 2.381 2.47 2.546 2.648 2.717 2.779 2.859 2.936 3.013 3.084 3.153 3.233 3.308 3.384 3.465 3.519 3.562 3.616 3.663 3.696 3.727 3.737 3.719 3.685 3.618 3.469 3.279 3.04 2.704 2.246 1.596 0.477 -1.387 -4.445 -7.934 -10.605 -12.708 -14.431 -15.903 -17.162 -18.253 -19.157 -20.065 -20.851 -21.539 -22.177 -22.743 -23.247 -23.717 -24.198 -24.61 -24.967 -25.342 -25.726 -26.038 -26.366 -26.707 -26.978 -27.26 -27.537 -27.807 -28.087 -28.288 -28.49 -28.803 -29.019 -29.234 -29.345 -29.582 -29.847 -30.132 -30.272 -30.52 -30.711 -30.874 -31.048 -31.404 -31.6 -31.823 -32.058 -32.31 -32.64 -33.137 -34.773 -10 ,11999 ,TETRA ,17556452,Fri Nov 26 06:57:40 CET,Fri Nov 26 09:14:53 CET,0.0 0.817 1.115 1.349 1.534 1.678 1.801 1.908 2.105 2.192 2.272 2.34 2.489 2.54 2.633 2.74 2.839 2.881 2.96 3.028 3.123 3.2 3.267 3.328 3.387 3.465 3.55 3.622 3.7 3.767 3.829 3.899 3.949 3.991 4.025 4.047 4.052 4.042 4.019 3.968 3.894 3.778 3.568 3.326 3.036 2.668 2.168 1.42 0.354 -1.244 -4.075 -7.276 -9.711 -11.648 -13.257 -14.672 -15.872 -16.893 -17.766 -18.649 -19.393 -20.057 -20.694 -21.276 -21.787 -22.243 -22.704 -23.108 -23.454 -23.808 -24.176 -24.477 -24.794 -25.133 -25.396 -25.659 -25.928 -26.212 -26.513 -26.719 -26.923 -27.237 -27.459 -27.682 -27.797 -28.043 -28.276 -28.537 -28.675 -28.914 -29.104 -29.27 -29.445 -29.792 -29.97 -30.18 -30.42 -30.667 -30.972 -31.393 -32.775 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_41_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_41_37.txt deleted file mode 100644 index 0050fe65..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_41_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11319 ,TETRA ,17556453,Fri Nov 26 06:57:40 CET,Fri Nov 26 09:14:19 CET,0.0 0.848 1.145 1.329 1.502 1.666 1.825 1.971 2.201 2.31 2.42 2.503 2.69 2.767 2.911 3.032 3.143 3.201 3.312 3.42 3.565 3.664 3.773 3.91 4.025 4.153 4.28 4.399 4.55 4.687 4.825 4.997 5.15 5.295 5.457 5.633 5.8 5.963 6.139 6.335 6.524 6.73 6.986 7.23 7.481 7.748 8.004 8.241 8.413 8.455 8.308 7.817 7.202 6.591 6.002 5.452 4.976 4.522 4.114 3.692 3.316 2.961 2.62 2.302 2.009 1.733 1.426 1.165 0.944 0.715 0.463 0.253 0.054 -0.166 -0.34 -0.502 -0.68 -0.884 -1.094 -1.238 -1.39 -1.63 -1.801 -1.975 -2.065 -2.254 -2.444 -2.637 -2.742 -2.97 -3.135 -3.274 -3.42 -3.732 -3.904 -4.083 -4.262 -4.488 -4.782 -5.186 -6.636 -2 ,21011 ,TETRA ,17556454,Fri Nov 26 06:58:40 CET,Fri Nov 26 09:15:43 CET,0.0 0.992 1.329 1.568 1.777 1.952 2.09 2.221 2.456 2.559 2.657 2.733 2.914 2.982 3.117 3.247 3.365 3.424 3.53 3.635 3.81 3.921 4.021 4.162 4.294 4.418 4.537 4.647 4.795 4.938 5.068 5.218 5.367 5.517 5.679 5.852 6.029 6.224 6.425 6.62 6.814 7.041 7.302 7.551 7.835 8.127 8.419 8.694 8.91 9.035 8.988 8.642 8.175 7.648 7.113 6.613 6.175 5.748 5.364 4.969 4.625 4.324 4.023 3.734 3.485 3.251 2.986 2.747 2.526 2.312 2.12 1.951 1.753 1.544 1.392 1.236 1.071 0.902 0.725 0.602 0.478 0.284 0.144 -0.002 -0.085 -0.246 -0.408 -0.604 -0.705 -0.926 -1.077 -1.196 -1.312 -1.562 -1.705 -1.875 -2.064 -2.271 -2.519 -2.882 -4.351 -3 ,6942 ,TETRA ,17556455,Fri Nov 26 06:58:40 CET,Fri Nov 26 09:21:37 CET,0.0 0.671 0.881 1.048 1.206 1.352 1.475 1.58 1.792 1.902 2.0 2.082 2.279 2.364 2.526 2.669 2.798 2.867 2.989 3.091 3.249 3.358 3.461 3.604 3.743 3.877 4.001 4.112 4.266 4.416 4.557 4.715 4.854 4.999 5.164 5.334 5.501 5.677 5.866 6.071 6.285 6.506 6.749 7.025 7.33 7.596 7.865 8.114 8.308 8.427 8.314 7.836 7.288 6.761 6.22 5.694 5.202 4.71 4.286 3.858 3.474 3.125 2.796 2.486 2.188 1.906 1.591 1.303 1.071 0.857 0.635 0.434 0.233 0.034 -0.122 -0.298 -0.495 -0.692 -0.897 -1.04 -1.188 -1.418 -1.587 -1.767 -1.858 -2.044 -2.236 -2.427 -2.519 -2.719 -2.847 -2.983 -3.116 -3.401 -3.562 -3.74 -3.934 -4.149 -4.444 -4.821 -6.218 -4 ,6771 ,TETRA ,17556456,Fri Nov 26 06:58:41 CET,Fri Nov 26 09:21:00 CET,0.0 0.552 0.84 1.035 1.188 1.336 1.474 1.593 1.783 1.876 1.966 2.06 2.259 2.352 2.526 2.68 2.811 2.873 3.015 3.152 3.321 3.43 3.531 3.662 3.802 3.937 4.056 4.171 4.31 4.45 4.595 4.757 4.904 5.049 5.217 5.391 5.562 5.753 5.958 6.181 6.393 6.589 6.802 7.035 7.296 7.541 7.806 8.038 8.188 8.252 8.081 7.559 6.934 6.329 5.789 5.258 4.812 4.422 4.046 3.642 3.304 3.015 2.733 2.434 2.135 1.853 1.575 1.349 1.14 0.923 0.7 0.507 0.297 0.066 -0.109 -0.28 -0.457 -0.657 -0.871 -1.005 -1.133 -1.354 -1.529 -1.711 -1.797 -1.986 -2.188 -2.411 -2.533 -2.762 -2.921 -3.059 -3.202 -3.547 -3.734 -3.93 -4.144 -4.398 -4.733 -5.213 -6.792 -5 ,26207 ,TETRA ,17556457,Fri Nov 26 06:58:41 CET,Fri Nov 26 08:55:52 CET,0.0 0.538 0.78 0.954 1.095 1.251 1.412 1.544 1.761 1.859 1.957 2.034 2.215 2.288 2.43 2.567 2.694 2.754 2.861 2.964 3.116 3.213 3.315 3.464 3.594 3.721 3.85 3.972 4.12 4.264 4.416 4.584 4.739 4.88 5.039 5.213 5.367 5.543 5.725 5.918 6.108 6.309 6.56 6.815 7.064 7.301 7.563 7.795 8.012 8.18 8.115 7.617 7.022 6.453 5.927 5.41 4.951 4.535 4.153 3.77 3.429 3.112 2.809 2.525 2.247 1.982 1.706 1.457 1.228 0.984 0.736 0.528 0.312 0.091 -0.091 -0.285 -0.47 -0.665 -0.861 -0.992 -1.149 -1.409 -1.575 -1.745 -1.84 -2.043 -2.253 -2.47 -2.585 -2.812 -2.957 -3.079 -3.224 -3.566 -3.757 -3.963 -4.182 -4.447 -4.771 -5.146 -6.446 -6 ,16224 ,TETRA ,17556458,Fri Nov 26 06:58:41 CET,Fri Nov 26 09:20:26 CET,0.0 0.777 1.081 1.267 1.416 1.551 1.683 1.827 2.089 2.191 2.28 2.334 2.516 2.594 2.743 2.882 3.011 3.073 3.191 3.294 3.452 3.567 3.673 3.806 3.927 4.044 4.156 4.273 4.419 4.546 4.674 4.837 5.001 5.151 5.307 5.469 5.638 5.829 6.012 6.211 6.428 6.673 6.93 7.146 7.353 7.565 7.808 8.023 8.148 8.077 7.72 7.104 6.46 5.862 5.34 4.85 4.382 3.947 3.547 3.129 2.771 2.438 2.125 1.84 1.546 1.255 0.971 0.721 0.504 0.293 0.077 -0.109 -0.3 -0.505 -0.687 -0.89 -1.1 -1.313 -1.531 -1.687 -1.84 -2.077 -2.246 -2.417 -2.505 -2.679 -2.876 -3.106 -3.225 -3.447 -3.575 -3.703 -3.855 -4.202 -4.375 -4.549 -4.757 -5.019 -5.345 -5.725 -7.121 -7 ,196 ,TETRA ,17556459,Fri Nov 26 06:58:41 CET,Fri Nov 26 09:15:15 CET,0.0 0.589 0.819 1.012 1.175 1.331 1.468 1.588 1.805 1.899 1.978 2.02 2.195 2.273 2.421 2.558 2.703 2.766 2.885 3.007 3.163 3.26 3.358 3.494 3.619 3.747 3.87 3.979 4.123 4.283 4.429 4.591 4.762 4.913 5.074 5.252 5.421 5.625 5.838 6.038 6.233 6.472 6.76 7.027 7.277 7.497 7.733 7.967 8.184 8.291 8.136 7.743 7.261 6.753 6.241 5.748 5.318 4.915 4.554 4.166 3.808 3.499 3.226 2.957 2.696 2.462 2.216 1.986 1.774 1.546 1.291 1.074 0.861 0.642 0.475 0.308 0.119 -0.096 -0.329 -0.483 -0.627 -0.865 -1.046 -1.227 -1.318 -1.513 -1.726 -1.957 -2.077 -2.306 -2.485 -2.653 -2.821 -3.145 -3.334 -3.537 -3.762 -4.026 -4.349 -4.858 -6.636 -8 ,229 ,TETRA ,17556460,Fri Nov 26 06:59:39 CET,Fri Nov 26 09:16:54 CET,0.0 0.766 1.039 1.22 1.378 1.518 1.666 1.816 2.049 2.134 2.224 2.306 2.48 2.552 2.689 2.805 2.931 2.994 3.112 3.218 3.357 3.454 3.56 3.718 3.855 3.97 4.07 4.174 4.321 4.458 4.577 4.716 4.848 4.978 5.123 5.279 5.431 5.6 5.775 5.953 6.152 6.359 6.575 6.782 7.007 7.246 7.487 7.747 7.975 8.066 7.98 7.575 6.975 6.351 5.774 5.233 4.756 4.301 3.882 3.47 3.127 2.808 2.498 2.197 1.914 1.648 1.359 1.098 0.871 0.641 0.397 0.201 -0.001 -0.227 -0.401 -0.58 -0.761 -0.935 -1.126 -1.265 -1.411 -1.642 -1.803 -1.963 -2.045 -2.236 -2.445 -2.676 -2.789 -3.004 -3.153 -3.303 -3.444 -3.703 -3.869 -4.068 -4.266 -4.471 -4.71 -5.001 -5.834 -9 ,8450 ,TETRA ,17556461,Fri Nov 26 06:59:39 CET,Fri Nov 26 09:17:57 CET,0.0 0.774 1.032 1.231 1.398 1.531 1.647 1.769 1.998 2.101 2.2 2.267 2.44 2.514 2.664 2.797 2.919 2.982 3.101 3.202 3.351 3.455 3.551 3.691 3.827 3.955 4.069 4.178 4.317 4.445 4.565 4.697 4.837 4.981 5.14 5.312 5.463 5.618 5.787 5.968 6.159 6.377 6.625 6.862 7.128 7.411 7.701 7.953 8.14 8.238 8.089 7.667 7.107 6.473 5.937 5.499 5.112 4.717 4.346 3.957 3.59 3.25 2.933 2.615 2.309 2.042 1.767 1.526 1.313 1.086 0.84 0.628 0.405 0.165 -0.02 -0.204 -0.393 -0.589 -0.8 -0.949 -1.088 -1.296 -1.462 -1.646 -1.736 -1.915 -2.102 -2.292 -2.395 -2.611 -2.734 -2.864 -3.003 -3.325 -3.506 -3.696 -3.931 -4.195 -4.522 -5.02 -6.988 -10 ,24426 ,TETRA ,17556462,Fri Nov 26 06:59:39 CET,Fri Nov 26 09:15:53 CET,0.0 0.684 0.982 1.221 1.395 1.527 1.639 1.742 1.944 2.05 2.157 2.237 2.416 2.491 2.644 2.782 2.905 2.961 3.081 3.203 3.375 3.476 3.563 3.706 3.842 3.97 4.099 4.215 4.359 4.513 4.67 4.84 5.005 5.16 5.313 5.49 5.675 5.882 6.096 6.298 6.496 6.729 6.984 7.218 7.483 7.743 8.005 8.248 8.482 8.599 8.49 7.999 7.417 6.873 6.33 5.834 5.405 5.009 4.657 4.283 3.937 3.594 3.248 2.948 2.693 2.456 2.2 1.972 1.773 1.552 1.325 1.156 0.972 0.761 0.589 0.418 0.264 0.093 -0.104 -0.234 -0.367 -0.58 -0.733 -0.89 -0.972 -1.148 -1.349 -1.585 -1.705 -1.931 -2.071 -2.203 -2.342 -2.625 -2.789 -2.984 -3.187 -3.425 -3.736 -4.173 -5.976 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_41_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_41_40.txt deleted file mode 100644 index 054f38c4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_41_40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13545 ,TETRA ,17556463,Fri Nov 26 07:00:40 CET,Fri Nov 26 09:07:00 CET,0.0 1.251 1.573 1.816 2.037 2.244 2.429 2.589 2.901 3.047 3.183 3.344 3.567 3.687 3.916 4.136 4.35 4.45 4.654 4.856 5.129 5.306 5.485 5.744 5.98 6.218 6.461 6.689 6.978 7.265 7.547 7.9 8.246 8.58 8.974 9.422 9.865 10.363 10.896 11.466 12.085 12.77 13.569 14.399 15.398 16.54 17.866 19.403 21.228 23.432 26.232 28.684 30.185 31.192 31.903 32.4 32.746 32.96 33.036 33.08 33.096 33.075 33.044 32.998 32.92 32.835 32.724 32.621 32.535 32.446 32.334 32.216 32.103 31.986 31.887 31.777 31.675 31.568 31.427 31.318 31.211 31.053 30.942 30.82 30.756 30.634 30.483 30.317 30.235 30.062 29.942 29.822 29.694 29.39 29.22 29.047 28.861 28.652 28.395 28.04 26.122 -2 ,27681 ,TETRA ,17556464,Fri Nov 26 07:00:40 CET,Fri Nov 26 09:19:25 CET,0.0 1.43 1.807 2.076 2.309 2.513 2.698 2.869 3.167 3.305 3.441 3.602 3.835 3.96 4.206 4.435 4.646 4.747 4.95 5.146 5.42 5.592 5.759 6.007 6.26 6.52 6.775 7.015 7.323 7.625 7.917 8.27 8.604 8.928 9.316 9.756 10.182 10.659 11.163 11.686 12.238 12.888 13.685 14.524 15.531 16.658 17.964 19.435 21.234 23.481 26.382 28.864 30.332 31.293 31.954 32.404 32.66 32.78 32.844 32.9 32.919 32.903 32.841 32.752 32.657 32.571 32.488 32.399 32.31 32.226 32.134 32.038 31.923 31.799 31.701 31.598 31.474 31.334 31.203 31.116 31.028 30.886 30.779 30.66 30.596 30.453 30.314 30.171 30.087 29.911 29.791 29.684 29.579 29.364 29.239 29.075 28.88 28.663 28.39 28.023 26.434 -3 ,20591 ,TETRA ,17556465,Fri Nov 26 07:00:40 CET,Fri Nov 26 09:20:34 CET,0.0 1.266 1.591 1.863 2.105 2.303 2.472 2.63 2.904 3.044 3.191 3.354 3.585 3.704 3.941 4.164 4.374 4.474 4.674 4.873 5.165 5.347 5.523 5.791 6.054 6.293 6.52 6.761 7.085 7.395 7.689 8.023 8.342 8.666 9.047 9.485 9.908 10.38 10.901 11.456 12.061 12.754 13.552 14.357 15.323 16.441 17.771 19.332 21.191 23.457 26.336 28.796 30.28 31.185 31.785 32.195 32.412 32.581 32.687 32.751 32.774 32.745 32.704 32.641 32.57 32.486 32.364 32.252 32.162 32.048 31.913 31.812 31.716 31.617 31.531 31.446 31.355 31.245 31.111 31.012 30.915 30.741 30.615 30.494 30.421 30.247 30.057 29.855 29.753 29.574 29.444 29.312 29.169 28.871 28.704 28.525 28.33 28.11 27.812 27.346 25.59 -4 ,30230 ,TETRA ,17556466,Fri Nov 26 07:00:40 CET,Fri Nov 26 09:18:21 CET,0.0 1.129 1.442 1.69 1.893 2.077 2.259 2.449 2.792 2.939 3.074 3.223 3.452 3.567 3.795 4.023 4.234 4.334 4.545 4.765 5.076 5.278 5.477 5.756 6.016 6.26 6.498 6.733 7.05 7.372 7.679 8.035 8.371 8.709 9.104 9.552 9.977 10.453 10.98 11.549 12.155 12.84 13.679 14.542 15.583 16.772 18.156 19.772 21.698 24.011 26.867 29.335 30.77 31.602 32.101 32.352 32.561 32.704 32.741 32.758 32.711 32.646 32.597 32.561 32.499 32.421 32.318 32.183 32.043 31.896 31.752 31.619 31.496 31.396 31.309 31.216 31.109 30.986 30.838 30.724 30.617 30.474 30.351 30.203 30.138 29.99 29.815 29.636 29.547 29.374 29.244 29.125 28.994 28.684 28.529 28.373 28.186 27.949 27.676 27.316 25.679 -5 ,16907 ,TETRA ,17556467,Fri Nov 26 07:00:42 CET,Fri Nov 26 09:17:19 CET,0.0 1.386 1.744 2.004 2.238 2.444 2.624 2.802 3.133 3.288 3.443 3.626 3.859 3.978 4.216 4.448 4.668 4.776 4.988 5.181 5.463 5.655 5.838 6.091 6.354 6.608 6.847 7.08 7.391 7.69 7.974 8.332 8.689 9.033 9.428 9.875 10.305 10.778 11.282 11.813 12.384 13.059 13.85 14.631 15.588 16.706 18.026 19.563 21.44 23.77 26.692 29.215 30.733 31.607 32.124 32.452 32.703 32.93 33.037 33.064 33.047 33.018 33.02 32.991 32.93 32.861 32.758 32.65 32.544 32.437 32.322 32.217 32.11 32.001 31.913 31.823 31.724 31.606 31.483 31.387 31.284 31.131 31.024 30.923 30.866 30.726 30.583 30.449 30.38 30.224 30.15 30.052 29.931 29.678 29.534 29.366 29.155 28.912 28.667 28.31 26.788 -6 ,5723 ,TETRA ,17556468,Fri Nov 26 07:00:40 CET,Fri Nov 26 09:20:37 CET,0.0 1.487 1.854 2.131 2.382 2.6 2.789 2.951 3.259 3.417 3.57 3.749 3.986 4.116 4.374 4.61 4.825 4.932 5.14 5.331 5.624 5.818 6.003 6.273 6.533 6.787 7.026 7.263 7.565 7.849 8.139 8.493 8.83 9.162 9.545 9.973 10.388 10.848 11.366 11.935 12.532 13.226 14.033 14.817 15.763 16.895 18.241 19.756 21.58 23.86 26.651 28.965 30.322 31.247 31.92 32.353 32.628 32.81 32.898 32.932 32.924 32.878 32.806 32.727 32.64 32.549 32.432 32.31 32.197 32.081 31.961 31.838 31.714 31.59 31.487 31.382 31.263 31.129 30.994 30.895 30.783 30.603 30.487 30.37 30.308 30.179 30.035 29.88 29.798 29.626 29.496 29.383 29.268 29.018 28.876 28.71 28.527 28.326 28.083 27.734 26.292 -7 ,6371 ,TETRA ,17556469,Fri Nov 26 07:00:41 CET,Fri Nov 26 09:18:27 CET,0.0 1.645 2.041 2.319 2.539 2.74 2.945 3.147 3.495 3.639 3.771 3.937 4.175 4.304 4.542 4.762 4.975 5.079 5.286 5.496 5.795 5.972 6.144 6.402 6.644 6.881 7.115 7.344 7.642 7.939 8.227 8.569 8.911 9.249 9.638 10.07 10.492 10.973 11.491 12.053 12.666 13.345 14.157 15.01 16.014 17.191 18.556 20.087 21.958 24.214 27.097 29.589 31.068 31.986 32.512 32.858 33.109 33.303 33.415 33.457 33.452 33.415 33.371 33.303 33.191 33.084 32.965 32.837 32.72 32.607 32.495 32.37 32.223 32.076 31.951 31.83 31.702 31.556 31.396 31.276 31.154 30.954 30.816 30.682 30.607 30.458 30.303 30.133 30.043 29.858 29.713 29.591 29.446 29.099 28.936 28.764 28.569 28.354 28.073 27.644 26.112 -8 ,20843 ,TETRA ,17556470,Fri Nov 26 07:00:40 CET,Fri Nov 26 09:22:23 CET,0.0 1.486 1.895 2.19 2.44 2.654 2.861 3.053 3.372 3.517 3.662 3.823 4.053 4.181 4.441 4.686 4.91 5.019 5.232 5.443 5.745 5.935 6.128 6.406 6.674 6.936 7.183 7.422 7.722 8.017 8.306 8.66 9.015 9.36 9.76 10.208 10.63 11.102 11.638 12.216 12.834 13.542 14.386 15.227 16.209 17.36 18.743 20.346 22.225 24.479 27.236 29.627 31.032 31.888 32.441 32.807 33.037 33.137 33.186 33.196 33.152 33.121 33.079 33.008 32.951 32.896 32.809 32.713 32.614 32.486 32.34 32.219 32.094 31.96 31.84 31.717 31.602 31.482 31.349 31.246 31.137 30.974 30.849 30.721 30.656 30.522 30.383 30.226 30.142 29.975 29.863 29.743 29.623 29.326 29.159 28.999 28.804 28.554 28.24 27.823 26.46 -9 ,6597 ,TETRA ,17556471,Fri Nov 26 07:01:39 CET,Fri Nov 26 09:19:16 CET,0.0 1.057 1.423 1.705 1.925 2.116 2.285 2.466 2.8 2.937 3.077 3.238 3.466 3.583 3.804 4.026 4.245 4.35 4.551 4.745 5.029 5.216 5.402 5.667 5.923 6.168 6.401 6.631 6.936 7.228 7.514 7.863 8.191 8.517 8.915 9.362 9.78 10.252 10.787 11.359 11.968 12.665 13.479 14.316 15.314 16.467 17.829 19.41 21.323 23.615 26.554 29.056 30.489 31.387 31.913 32.238 32.458 32.594 32.661 32.702 32.713 32.7 32.658 32.564 32.459 32.353 32.227 32.105 31.994 31.879 31.751 31.646 31.539 31.423 31.322 31.208 31.101 30.993 30.863 30.775 30.676 30.511 30.402 30.289 30.227 30.101 29.981 29.839 29.757 29.586 29.481 29.379 29.266 29.017 28.888 28.76 28.613 28.45 28.209 27.844 26.269 -10 ,21639 ,TETRA ,17556472,Fri Nov 26 07:01:39 CET,Fri Nov 26 09:19:11 CET,0.0 1.362 1.758 2.081 2.332 2.547 2.74 2.914 3.223 3.375 3.524 3.693 3.927 4.052 4.296 4.52 4.712 4.81 5.022 5.222 5.507 5.69 5.857 6.12 6.379 6.619 6.852 7.076 7.363 7.644 7.929 8.274 8.613 8.941 9.311 9.739 10.159 10.639 11.165 11.711 12.295 12.971 13.779 14.62 15.593 16.705 18.037 19.575 21.41 23.639 26.52 28.894 30.171 30.958 31.485 31.874 32.148 32.255 32.258 32.261 32.261 32.211 32.109 31.983 31.88 31.808 31.721 31.624 31.529 31.438 31.351 31.262 31.152 31.025 30.924 30.819 30.705 30.586 30.467 30.385 30.294 30.157 30.049 29.932 29.873 29.732 29.578 29.414 29.333 29.17 29.053 28.955 28.85 28.585 28.428 28.272 28.101 27.888 27.622 27.251 25.461 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_42_13.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_42_13.txt deleted file mode 100644 index 17d5f177..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_42_13.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16561 ,TETRA ,17556473,Fri Nov 26 07:01:39 CET,Fri Nov 26 09:19:16 CET,0.0 0.837 1.035 1.174 1.303 1.435 1.564 1.672 1.851 1.945 2.035 2.075 2.244 2.304 2.414 2.509 2.589 2.631 2.705 2.772 2.867 2.928 2.995 3.081 3.166 3.243 3.304 3.368 3.434 3.484 3.559 3.657 3.716 3.752 3.799 3.848 3.871 3.875 3.867 3.888 3.9 3.861 3.778 3.638 3.423 3.117 2.684 2.092 1.093 -0.553 -3.235 -6.413 -8.915 -10.881 -12.528 -13.985 -15.209 -16.233 -17.08 -17.941 -18.686 -19.319 -19.916 -20.504 -21.054 -21.53 -21.978 -22.374 -22.721 -23.067 -23.423 -23.715 -24.002 -24.322 -24.592 -24.851 -25.091 -25.334 -25.6 -25.795 -26.009 -26.349 -26.601 -26.874 -27.016 -27.309 -27.601 -27.894 -28.053 -28.352 -28.572 -28.743 -28.92 -29.349 -29.589 -29.838 -30.108 -30.394 -30.709 -31.173 -32.72 -2 ,29974 ,TETRA ,17556474,Fri Nov 26 07:01:41 CET,Fri Nov 26 09:19:19 CET,0.0 0.42 0.599 0.755 0.919 1.092 1.236 1.341 1.525 1.599 1.672 1.717 1.881 1.937 2.044 2.16 2.273 2.321 2.404 2.499 2.653 2.739 2.816 2.908 2.975 3.026 3.071 3.107 3.176 3.271 3.342 3.409 3.482 3.54 3.564 3.575 3.584 3.577 3.556 3.516 3.458 3.381 3.243 3.097 2.909 2.554 2.033 1.269 0.201 -1.282 -3.771 -6.77 -9.155 -11.066 -12.583 -13.854 -14.956 -15.986 -16.96 -17.894 -18.586 -19.181 -19.767 -20.308 -20.81 -21.31 -21.837 -22.29 -22.661 -23.043 -23.439 -23.733 -24.038 -24.362 -24.617 -24.875 -25.134 -25.397 -25.669 -25.864 -26.073 -26.422 -26.658 -26.901 -27.031 -27.299 -27.572 -27.845 -27.993 -28.296 -28.532 -28.716 -28.912 -29.353 -29.599 -29.843 -30.105 -30.446 -30.854 -31.308 -32.787 -3 ,17940 ,TETRA ,17556475,Fri Nov 26 07:01:39 CET,Fri Nov 26 09:21:31 CET,0.0 0.537 0.744 0.905 1.062 1.198 1.31 1.421 1.644 1.749 1.836 1.904 2.086 2.163 2.288 2.381 2.467 2.508 2.59 2.667 2.761 2.827 2.888 2.987 3.099 3.174 3.213 3.256 3.338 3.418 3.49 3.574 3.652 3.732 3.812 3.896 3.964 4.028 4.096 4.162 4.235 4.297 4.31 4.258 4.064 3.777 3.396 2.839 1.932 0.516 -1.917 -4.95 -7.332 -9.195 -10.721 -12.141 -13.424 -14.527 -15.41 -16.288 -17.072 -17.792 -18.471 -19.086 -19.62 -20.094 -20.603 -21.059 -21.456 -21.862 -22.276 -22.618 -22.962 -23.306 -23.564 -23.841 -24.131 -24.429 -24.75 -24.961 -25.168 -25.513 -25.76 -25.993 -26.107 -26.363 -26.664 -26.972 -27.132 -27.439 -27.676 -27.89 -28.119 -28.595 -28.854 -29.111 -29.381 -29.717 -30.091 -30.601 -32.908 -4 ,28576 ,TETRA ,17556476,Fri Nov 26 07:01:39 CET,Fri Nov 26 09:19:14 CET,0.0 0.56 0.792 0.975 1.116 1.26 1.378 1.471 1.653 1.747 1.827 1.867 2.041 2.101 2.219 2.334 2.438 2.488 2.573 2.651 2.766 2.841 2.918 3.02 3.119 3.209 3.295 3.38 3.488 3.613 3.702 3.771 3.843 3.906 3.959 4.0 4.042 4.098 4.144 4.154 4.151 4.141 4.041 3.926 3.811 3.566 3.222 2.722 1.834 0.429 -1.869 -4.659 -6.841 -8.608 -10.183 -11.616 -12.814 -13.829 -14.67 -15.518 -16.246 -16.875 -17.476 -18.043 -18.555 -19.019 -19.497 -19.917 -20.27 -20.621 -20.982 -21.279 -21.576 -21.875 -22.11 -22.347 -22.592 -22.843 -23.097 -23.289 -23.497 -23.807 -24.023 -24.254 -24.37 -24.596 -24.821 -25.048 -25.168 -25.424 -25.569 -25.732 -25.916 -26.376 -26.652 -26.924 -27.227 -27.569 -27.944 -28.457 -30.22 -5 ,31515 ,TETRA ,17556477,Fri Nov 26 07:02:37 CET,Fri Nov 26 09:05:14 CET,0.0 1.108 1.396 1.611 1.756 1.874 2.006 2.131 2.32 2.41 2.503 2.555 2.722 2.784 2.874 2.967 3.065 3.116 3.21 3.286 3.39 3.455 3.516 3.616 3.708 3.784 3.859 3.919 3.978 4.037 4.098 4.192 4.283 4.351 4.41 4.458 4.496 4.526 4.562 4.612 4.641 4.62 4.54 4.417 4.234 3.936 3.418 2.707 1.659 0.013 -2.576 -5.556 -8.02 -10.034 -11.712 -13.201 -14.495 -15.645 -16.617 -17.599 -18.405 -19.094 -19.765 -20.381 -20.941 -21.449 -21.966 -22.418 -22.824 -23.256 -23.711 -24.098 -24.483 -24.902 -25.233 -25.565 -25.9 -26.24 -26.595 -26.833 -27.087 -27.495 -27.777 -28.084 -28.234 -28.521 -28.838 -29.175 -29.348 -29.668 -29.926 -30.129 -30.342 -30.824 -31.107 -31.414 -31.736 -32.089 -32.503 -33.115 -35.877 -6 ,14408 ,TETRA ,17556478,Fri Nov 26 07:02:37 CET,Fri Nov 26 09:16:46 CET,0.0 0.647 0.844 1.021 1.211 1.381 1.504 1.595 1.788 1.877 1.955 2.0 2.168 2.235 2.373 2.489 2.591 2.636 2.719 2.802 2.926 3.005 3.083 3.199 3.308 3.41 3.501 3.588 3.714 3.832 3.928 4.013 4.088 4.164 4.229 4.286 4.327 4.347 4.359 4.381 4.387 4.355 4.31 4.232 4.065 3.815 3.379 2.752 1.83 0.433 -1.929 -4.866 -7.171 -9.047 -10.644 -12.087 -13.355 -14.485 -15.454 -16.39 -17.127 -17.762 -18.421 -19.05 -19.604 -20.096 -20.596 -21.047 -21.431 -21.825 -22.223 -22.547 -22.895 -23.27 -23.551 -23.833 -24.129 -24.428 -24.744 -24.961 -25.175 -25.523 -25.775 -26.034 -26.167 -26.446 -26.725 -26.999 -27.143 -27.413 -27.594 -27.758 -27.934 -28.321 -28.548 -28.836 -29.142 -29.454 -29.849 -30.445 -32.181 -7 ,3392 ,TETRA ,17556479,Fri Nov 26 07:03:38 CET,Fri Nov 26 09:18:03 CET,0.0 0.563 0.809 0.976 1.131 1.267 1.389 1.504 1.713 1.8 1.886 1.948 2.122 2.186 2.291 2.4 2.515 2.574 2.69 2.784 2.907 2.987 3.058 3.138 3.204 3.288 3.375 3.451 3.537 3.619 3.703 3.807 3.899 3.966 4.039 4.121 4.181 4.224 4.254 4.262 4.243 4.203 4.115 3.998 3.818 3.522 3.068 2.357 1.344 -0.115 -2.652 -5.717 -8.131 -10.111 -11.745 -13.141 -14.325 -15.334 -16.197 -17.06 -17.772 -18.392 -18.963 -19.494 -19.997 -20.44 -20.891 -21.33 -21.722 -22.147 -22.603 -22.949 -23.28 -23.611 -23.871 -24.144 -24.426 -24.709 -25.015 -25.232 -25.462 -25.829 -26.081 -26.351 -26.491 -26.752 -27.017 -27.296 -27.449 -27.748 -27.974 -28.178 -28.401 -28.847 -29.085 -29.34 -29.615 -29.941 -30.368 -30.867 -32.376 -8 ,10851 ,TETRA ,17556480,Fri Nov 26 07:02:38 CET,Fri Nov 26 09:17:50 CET,0.0 0.782 1.056 1.236 1.396 1.543 1.67 1.775 1.964 2.058 2.138 2.199 2.376 2.436 2.548 2.681 2.812 2.871 2.982 3.093 3.243 3.325 3.391 3.483 3.596 3.711 3.817 3.923 4.049 4.142 4.209 4.29 4.393 4.495 4.584 4.663 4.726 4.805 4.888 4.94 4.969 4.981 4.97 4.886 4.708 4.447 4.059 3.548 2.722 1.284 -1.146 -4.191 -6.776 -8.829 -10.614 -12.249 -13.58 -14.703 -15.623 -16.511 -17.24 -17.85 -18.407 -18.922 -19.406 -19.839 -20.3 -20.713 -21.041 -21.379 -21.745 -22.064 -22.427 -22.819 -23.114 -23.419 -23.739 -24.071 -24.421 -24.666 -24.917 -25.294 -25.549 -25.821 -25.963 -26.266 -26.579 -26.903 -27.065 -27.37 -27.638 -27.836 -28.046 -28.488 -28.717 -28.973 -29.273 -29.606 -30.015 -30.551 -31.898 -9 ,27533 ,TETRA ,17556481,Fri Nov 26 07:02:39 CET,Fri Nov 26 09:19:01 CET,0.0 0.433 0.673 0.834 0.961 1.091 1.224 1.33 1.509 1.599 1.689 1.739 1.912 1.977 2.101 2.221 2.343 2.4 2.508 2.617 2.766 2.84 2.917 3.035 3.142 3.231 3.296 3.351 3.424 3.492 3.554 3.625 3.694 3.761 3.847 3.96 4.044 4.1 4.131 4.149 4.137 4.079 3.977 3.803 3.557 3.258 2.847 2.326 1.556 0.12 -2.365 -5.208 -7.405 -9.241 -10.825 -12.166 -13.329 -14.335 -15.175 -16.003 -16.673 -17.273 -17.854 -18.384 -18.86 -19.28 -19.712 -20.131 -20.492 -20.842 -21.232 -21.582 -21.943 -22.316 -22.602 -22.903 -23.207 -23.538 -23.895 -24.109 -24.315 -24.641 -24.867 -25.078 -25.175 -25.392 -25.635 -25.899 -26.046 -26.323 -26.54 -26.751 -26.982 -27.425 -27.668 -27.929 -28.178 -28.454 -28.782 -29.221 -30.394 -10 ,8868 ,TETRA ,17556482,Fri Nov 26 07:02:39 CET,Fri Nov 26 09:17:56 CET,0.0 0.577 0.793 0.99 1.179 1.316 1.431 1.538 1.732 1.82 1.907 1.95 2.131 2.217 2.397 2.547 2.66 2.709 2.808 2.902 3.033 3.127 3.215 3.321 3.413 3.499 3.56 3.611 3.694 3.765 3.814 3.88 3.955 4.027 4.108 4.174 4.21 4.227 4.217 4.176 4.116 4.029 3.914 3.787 3.594 3.256 2.785 2.165 1.319 0.077 -2.215 -5.043 -7.329 -9.268 -10.89 -12.234 -13.385 -14.423 -15.272 -16.093 -16.768 -17.345 -17.925 -18.478 -18.977 -19.416 -19.858 -20.276 -20.67 -21.074 -21.471 -21.804 -22.149 -22.487 -22.737 -22.995 -23.274 -23.559 -23.854 -24.058 -24.259 -24.573 -24.796 -25.039 -25.17 -25.428 -25.696 -25.981 -26.124 -26.406 -26.605 -26.78 -26.966 -27.344 -27.555 -27.802 -28.103 -28.455 -28.833 -29.367 -31.597 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_42_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_42_44.txt deleted file mode 100644 index 10cc1f50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_42_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7514 ,TETRA ,17556483,Fri Nov 26 07:03:21 CET,Fri Nov 26 09:18:53 CET,0.0 0.588 0.858 1.079 1.223 1.354 1.512 1.655 1.887 1.989 2.09 2.189 2.381 2.461 2.628 2.789 2.954 3.034 3.187 3.329 3.538 3.685 3.822 3.999 4.174 4.345 4.51 4.673 4.881 5.084 5.282 5.52 5.749 5.974 6.236 6.521 6.791 7.095 7.413 7.75 8.137 8.558 9.02 9.487 10.045 10.665 11.396 12.251 13.203 14.325 15.669 16.579 16.969 17.103 17.093 17.031 16.943 16.809 16.697 16.562 16.414 16.268 16.123 15.979 15.838 15.7 15.544 15.41 15.288 15.142 14.971 14.815 14.637 14.461 14.341 14.193 14.009 13.82 13.621 13.485 13.348 13.131 12.985 12.838 12.757 12.582 12.395 12.197 12.085 11.876 11.725 11.584 11.43 11.108 10.948 10.759 10.52 10.254 9.98 9.604 8.046 -2 ,3703 ,TETRA ,17556484,Fri Nov 26 07:03:21 CET,Fri Nov 26 09:17:41 CET,0.0 0.897 1.112 1.276 1.428 1.558 1.679 1.781 1.932 2.017 2.115 2.205 2.405 2.495 2.67 2.85 3.023 3.107 3.261 3.4 3.602 3.731 3.873 4.088 4.291 4.493 4.698 4.9 5.137 5.35 5.542 5.756 5.97 6.193 6.447 6.716 6.966 7.263 7.603 7.955 8.314 8.719 9.203 9.747 10.396 11.066 11.844 12.737 13.796 15.015 16.359 17.338 17.796 17.981 18.025 18.0 17.901 17.793 17.71 17.571 17.398 17.235 17.059 16.872 16.701 16.546 16.393 16.235 16.086 15.944 15.78 15.633 15.48 15.297 15.143 14.994 14.832 14.646 14.462 14.341 14.212 14.009 13.874 13.731 13.655 13.5 13.329 13.127 13.018 12.815 12.663 12.543 12.414 12.076 11.888 11.703 11.51 11.286 10.996 10.56 9.235 -3 ,17401 ,TETRA ,17556485,Fri Nov 26 07:03:21 CET,Fri Nov 26 09:17:35 CET,0.0 0.38 0.58 0.803 0.996 1.164 1.305 1.427 1.64 1.75 1.863 1.958 2.146 2.234 2.403 2.558 2.706 2.786 2.961 3.12 3.342 3.496 3.625 3.79 3.96 4.129 4.295 4.454 4.654 4.85 5.041 5.29 5.535 5.76 6.023 6.302 6.571 6.882 7.229 7.591 7.952 8.39 8.906 9.387 9.958 10.628 11.396 12.255 13.222 14.327 15.615 16.516 16.935 17.157 17.273 17.296 17.205 17.081 16.947 16.763 16.602 16.456 16.295 16.135 16.011 15.887 15.71 15.535 15.372 15.221 15.092 14.971 14.82 14.662 14.537 14.408 14.27 14.113 13.943 13.831 13.714 13.517 13.378 13.236 13.16 12.999 12.838 12.672 12.584 12.399 12.262 12.134 12.003 11.741 11.603 11.46 11.295 11.072 10.775 10.4 9.04 -4 ,3064 ,TETRA ,17556486,Fri Nov 26 07:03:21 CET,Fri Nov 26 09:17:53 CET,0.0 0.404 0.605 0.809 1.013 1.168 1.293 1.417 1.661 1.773 1.876 1.953 2.145 2.231 2.393 2.568 2.728 2.798 2.941 3.086 3.292 3.419 3.54 3.713 3.89 4.073 4.244 4.402 4.613 4.826 5.022 5.254 5.483 5.704 5.971 6.298 6.614 6.94 7.303 7.701 8.098 8.54 9.063 9.617 10.289 11.014 11.828 12.719 13.772 14.946 16.266 17.337 17.864 18.035 18.005 17.879 17.729 17.542 17.35 17.148 16.967 16.809 16.641 16.453 16.282 16.109 15.883 15.662 15.466 15.295 15.14 14.989 14.806 14.607 14.461 14.297 14.114 13.939 13.749 13.606 13.468 13.252 13.099 12.947 12.865 12.678 12.475 12.269 12.152 11.927 11.733 11.588 11.449 11.136 10.954 10.733 10.485 10.206 9.867 9.386 7.821 -5 ,17443 ,TETRA ,17556487,Fri Nov 26 07:03:21 CET,Fri Nov 26 09:07:36 CET,0.0 0.476 0.732 0.924 1.107 1.272 1.404 1.546 1.782 1.886 1.997 2.091 2.288 2.373 2.534 2.698 2.868 2.952 3.102 3.241 3.452 3.583 3.7 3.883 4.061 4.223 4.391 4.556 4.77 4.968 5.157 5.399 5.629 5.849 6.121 6.435 6.717 7.024 7.369 7.751 8.173 8.622 9.124 9.656 10.306 10.967 11.711 12.596 13.685 14.963 16.325 17.303 17.801 18.028 18.127 18.173 18.16 18.116 18.027 17.871 17.715 17.545 17.353 17.18 17.016 16.844 16.642 16.463 16.314 16.148 15.978 15.845 15.693 15.529 15.407 15.278 15.146 15.009 14.858 14.751 14.634 14.449 14.326 14.206 14.14 13.99 13.819 13.611 13.508 13.324 13.191 13.066 12.947 12.651 12.479 12.313 12.109 11.839 11.553 11.169 9.317 -6 ,6152 ,TETRA ,17556488,Fri Nov 26 07:03:21 CET,Fri Nov 26 09:20:12 CET,0.0 0.605 0.84 1.045 1.212 1.343 1.496 1.646 1.872 1.96 2.048 2.124 2.314 2.405 2.578 2.753 2.928 3.009 3.158 3.297 3.514 3.657 3.783 3.979 4.177 4.351 4.515 4.68 4.906 5.122 5.322 5.567 5.802 6.023 6.289 6.596 6.887 7.192 7.512 7.854 8.203 8.592 9.095 9.594 10.094 10.687 11.414 12.223 13.203 14.345 15.54 16.37 16.789 17.006 17.053 16.97 16.868 16.759 16.642 16.459 16.22 16.002 15.786 15.571 15.396 15.242 15.073 14.92 14.792 14.649 14.482 14.338 14.18 14.0 13.862 13.721 13.568 13.423 13.27 13.147 13.001 12.766 12.609 12.45 12.37 12.205 12.032 11.822 11.705 11.501 11.361 11.233 11.099 10.803 10.645 10.47 10.273 10.024 9.673 9.218 7.876 -7 ,24553 ,TETRA ,17556489,Fri Nov 26 07:03:21 CET,Fri Nov 26 09:21:51 CET,0.0 0.403 0.62 0.815 0.966 1.106 1.248 1.367 1.577 1.675 1.774 1.889 2.09 2.175 2.327 2.474 2.629 2.701 2.835 2.976 3.196 3.326 3.45 3.619 3.775 3.941 4.114 4.27 4.458 4.648 4.832 5.071 5.335 5.594 5.881 6.206 6.513 6.832 7.182 7.557 7.929 8.308 8.762 9.287 9.888 10.542 11.282 12.081 13.085 14.265 15.534 16.444 16.799 16.855 16.882 16.854 16.738 16.598 16.445 16.232 16.008 15.817 15.619 15.412 15.219 15.019 14.798 14.605 14.436 14.259 14.073 13.93 13.762 13.559 13.412 13.27 13.127 12.971 12.796 12.681 12.573 12.396 12.249 12.09 12.012 11.847 11.657 11.445 11.335 11.126 10.985 10.872 10.748 10.471 10.314 10.139 9.926 9.667 9.33 8.886 7.394 -8 ,7598 ,TETRA ,17556490,Fri Nov 26 07:03:21 CET,Fri Nov 26 09:18:09 CET,0.0 0.727 0.92 1.13 1.303 1.437 1.55 1.663 1.877 1.97 2.07 2.168 2.357 2.437 2.59 2.744 2.894 2.976 3.149 3.306 3.512 3.64 3.774 3.976 4.16 4.325 4.476 4.632 4.842 5.036 5.239 5.476 5.703 5.947 6.234 6.565 6.883 7.229 7.589 7.944 8.337 8.8 9.328 9.851 10.446 11.121 11.949 12.843 13.773 14.847 15.998 16.682 17.005 17.101 17.043 16.912 16.762 16.557 16.327 16.077 15.859 15.65 15.44 15.235 15.055 14.892 14.672 14.463 14.298 14.134 13.963 13.807 13.64 13.464 13.313 13.149 12.978 12.801 12.596 12.46 12.329 12.102 11.939 11.773 11.687 11.516 11.33 11.139 11.039 10.834 10.689 10.564 10.412 10.065 9.886 9.68 9.455 9.199 8.834 8.298 6.65 -9 ,1589 ,TETRA ,17556491,Fri Nov 26 07:03:38 CET,Fri Nov 26 09:19:37 CET,0.0 0.522 0.755 0.944 1.126 1.305 1.432 1.534 1.767 1.891 2.004 2.102 2.307 2.399 2.546 2.696 2.845 2.919 3.058 3.19 3.394 3.533 3.671 3.86 4.034 4.212 4.382 4.53 4.722 4.914 5.093 5.308 5.512 5.704 5.938 6.213 6.486 6.808 7.156 7.552 7.977 8.419 8.967 9.541 10.164 10.847 11.675 12.598 13.649 14.876 16.281 17.259 17.668 17.812 17.779 17.647 17.522 17.391 17.226 16.97 16.731 16.511 16.278 16.069 15.858 15.666 15.477 15.287 15.112 14.947 14.752 14.568 14.386 14.204 14.068 13.918 13.758 13.595 13.428 13.314 13.179 12.945 12.78 12.623 12.549 12.365 12.158 11.928 11.803 11.594 11.44 11.307 11.167 10.862 10.692 10.509 10.318 10.093 9.804 9.333 7.493 -10 ,11539 ,TETRA ,17556492,Fri Nov 26 07:03:38 CET,Fri Nov 26 09:18:08 CET,0.0 0.997 1.29 1.545 1.72 1.875 2.014 2.138 2.355 2.463 2.567 2.64 2.835 2.92 3.089 3.25 3.401 3.475 3.629 3.786 4.016 4.167 4.312 4.529 4.748 4.952 5.15 5.329 5.552 5.772 5.98 6.251 6.525 6.798 7.123 7.481 7.837 8.217 8.606 8.997 9.394 9.833 10.355 10.917 11.56 12.278 13.089 13.929 14.906 16.104 17.466 18.442 18.886 19.066 19.061 19.024 19.003 18.951 18.862 18.685 18.475 18.273 18.105 17.937 17.765 17.62 17.451 17.281 17.134 16.986 16.827 16.685 16.549 16.403 16.28 16.159 16.032 15.902 15.756 15.646 15.523 15.341 15.212 15.061 14.979 14.816 14.645 14.449 14.348 14.149 14.019 13.909 13.782 13.477 13.325 13.171 12.968 12.738 12.484 12.142 11.089 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_42_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_42_45.txt deleted file mode 100644 index a62610e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_42_45.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3451 ,TETRA ,17556493,Fri Nov 26 07:03:38 CET,Fri Nov 26 09:24:10 CET,0.0 0.907 1.252 1.536 1.79 2.035 2.257 2.444 2.781 2.917 3.057 3.234 3.466 3.583 3.809 4.018 4.218 4.328 4.534 4.7 4.933 5.091 5.242 5.464 5.685 5.884 6.085 6.288 6.531 6.749 6.957 7.212 7.444 7.666 7.928 8.232 8.545 8.905 9.279 9.662 10.057 10.485 11.017 11.563 12.177 12.87 13.655 14.485 15.46 16.55 17.756 18.622 19.023 19.153 19.133 19.038 18.89 18.713 18.522 18.323 18.15 17.967 17.764 17.56 17.381 17.205 16.994 16.806 16.656 16.509 16.354 16.217 16.077 15.939 15.811 15.662 15.514 15.364 15.207 15.085 14.961 14.776 14.639 14.492 14.417 14.252 14.079 13.9 13.807 13.62 13.51 13.398 13.274 13.013 12.856 12.678 12.477 12.234 11.907 11.444 10.232 -2 ,14568 ,TETRA ,17556494,Fri Nov 26 07:04:40 CET,Fri Nov 26 09:23:17 CET,0.0 1.964 2.463 2.783 3.021 3.23 3.42 3.585 3.898 4.049 4.19 4.33 4.554 4.668 4.862 5.06 5.26 5.357 5.544 5.724 5.984 6.148 6.304 6.513 6.718 6.923 7.129 7.335 7.594 7.837 8.076 8.356 8.602 8.851 9.159 9.505 9.813 10.14 10.505 10.902 11.318 11.792 12.358 12.9 13.526 14.253 15.132 16.064 16.996 18.016 19.158 19.883 20.127 20.185 20.115 19.964 19.743 19.492 19.295 19.092 18.865 18.628 18.397 18.183 17.967 17.772 17.591 17.425 17.267 17.101 16.924 16.755 16.58 16.41 16.279 16.136 15.966 15.798 15.634 15.512 15.373 15.162 15.028 14.878 14.794 14.633 14.471 14.29 14.201 14.023 13.899 13.785 13.663 13.373 13.221 13.053 12.833 12.562 12.288 11.904 10.827 -3 ,26079 ,TETRA ,17556495,Fri Nov 26 07:04:40 CET,Fri Nov 26 09:18:20 CET,0.0 1.204 1.546 1.772 1.93 2.105 2.282 2.44 2.754 2.897 3.032 3.175 3.398 3.51 3.695 3.889 4.085 4.164 4.321 4.481 4.732 4.894 5.041 5.244 5.434 5.641 5.858 6.053 6.299 6.542 6.787 7.075 7.328 7.581 7.879 8.214 8.522 8.892 9.322 9.744 10.154 10.609 11.139 11.641 12.248 12.945 13.725 14.588 15.557 16.645 17.921 18.823 19.172 19.247 19.228 19.185 19.089 18.978 18.863 18.715 18.574 18.423 18.254 18.089 17.931 17.779 17.616 17.476 17.361 17.236 17.087 16.964 16.843 16.71 16.593 16.469 16.349 16.217 16.068 15.964 15.852 15.663 15.528 15.394 15.329 15.18 15.009 14.847 14.768 14.594 14.482 14.372 14.259 14.012 13.858 13.688 13.521 13.34 13.115 12.833 11.904 -4 ,31297 ,TETRA ,17556496,Fri Nov 26 07:04:40 CET,Fri Nov 26 09:18:42 CET,0.0 1.845 2.3 2.581 2.777 2.974 3.158 3.312 3.572 3.701 3.826 3.994 4.223 4.331 4.528 4.723 4.923 5.015 5.197 5.379 5.648 5.82 5.979 6.201 6.403 6.589 6.775 6.976 7.237 7.496 7.734 7.988 8.259 8.55 8.871 9.211 9.544 9.91 10.3 10.693 11.072 11.504 12.026 12.558 13.2 13.917 14.689 15.438 16.372 17.523 18.642 19.382 19.7 19.767 19.726 19.662 19.566 19.407 19.263 19.097 18.909 18.72 18.525 18.339 18.171 18.021 17.865 17.717 17.582 17.446 17.312 17.19 17.054 16.914 16.807 16.689 16.548 16.417 16.288 16.191 16.092 15.921 15.794 15.657 15.583 15.43 15.265 15.107 15.025 14.844 14.743 14.636 14.52 14.231 14.07 13.907 13.708 13.491 13.258 12.824 11.515 -5 ,13703 ,TETRA ,17556497,Fri Nov 26 07:04:40 CET,Fri Nov 26 09:19:33 CET,0.0 2.325 2.752 3.059 3.317 3.543 3.744 3.918 4.232 4.382 4.529 4.702 4.925 5.046 5.304 5.518 5.704 5.799 5.986 6.162 6.4 6.559 6.722 6.94 7.133 7.326 7.521 7.706 7.962 8.219 8.466 8.751 9.029 9.295 9.585 9.911 10.225 10.576 10.964 11.368 11.765 12.222 12.706 13.152 13.703 14.324 15.048 15.814 16.618 17.515 18.474 19.081 19.349 19.426 19.361 19.22 19.084 18.954 18.821 18.653 18.474 18.275 18.075 17.9 17.745 17.596 17.42 17.246 17.084 16.919 16.754 16.611 16.457 16.287 16.155 16.021 15.881 15.748 15.613 15.516 15.41 15.221 15.092 14.965 14.889 14.732 14.578 14.427 14.337 14.145 14.035 13.919 13.807 13.561 13.394 13.21 13.028 12.786 12.477 12.103 11.051 -6 ,17874 ,TETRA ,17556498,Fri Nov 26 07:05:41 CET,Fri Nov 26 09:02:28 CET,0.0 2.508 2.848 3.085 3.301 3.501 3.674 3.831 4.095 4.198 4.307 4.42 4.624 4.722 4.905 5.096 5.285 5.37 5.535 5.691 5.907 6.054 6.195 6.387 6.58 6.789 6.99 7.162 7.384 7.608 7.827 8.098 8.375 8.629 8.899 9.192 9.485 9.816 10.169 10.548 10.955 11.415 11.949 12.524 13.204 13.98 14.882 15.861 16.992 18.337 19.838 20.862 21.355 21.586 21.677 21.702 21.664 21.554 21.406 21.249 21.111 20.971 20.839 20.695 20.547 20.404 20.24 20.09 19.96 19.818 19.664 19.532 19.39 19.241 19.116 18.984 18.851 18.699 18.518 18.395 18.28 18.087 17.945 17.797 17.717 17.548 17.377 17.199 17.101 16.898 16.759 16.654 16.547 16.312 16.164 15.981 15.801 15.632 15.395 15.052 13.885 -7 ,17215 ,TETRA ,17556499,Fri Nov 26 07:05:41 CET,Fri Nov 26 09:20:16 CET,0.0 0.952 1.316 1.541 1.723 1.894 2.043 2.205 2.521 2.652 2.785 2.954 3.168 3.265 3.456 3.631 3.805 3.891 4.03 4.167 4.401 4.554 4.688 4.868 5.041 5.198 5.353 5.518 5.747 5.959 6.163 6.41 6.652 6.9 7.17 7.465 7.753 8.063 8.382 8.724 9.114 9.567 10.088 10.6 11.211 11.927 12.756 13.669 14.685 15.809 16.979 17.718 17.988 18.108 18.169 18.144 18.046 17.929 17.808 17.643 17.483 17.341 17.186 17.016 16.852 16.686 16.519 16.373 16.246 16.107 15.942 15.8 15.656 15.523 15.416 15.289 15.156 15.038 14.908 14.811 14.717 14.559 14.448 14.334 14.276 14.159 14.029 13.88 13.792 13.599 13.494 13.401 13.306 13.08 12.957 12.816 12.638 12.426 12.204 11.894 10.714 -8 ,19497 ,TETRA ,17556500,Fri Nov 26 07:06:39 CET,Fri Nov 26 09:28:55 CET,0.0 1.121 1.474 1.721 1.932 2.139 2.333 2.506 2.807 2.933 3.052 3.172 3.378 3.493 3.722 3.932 4.138 4.244 4.451 4.617 4.833 4.977 5.118 5.319 5.522 5.72 5.914 6.102 6.339 6.562 6.794 7.08 7.337 7.583 7.849 8.125 8.399 8.724 9.076 9.453 9.84 10.266 10.766 11.279 11.896 12.563 13.3 14.173 15.132 16.158 17.396 18.278 18.624 18.747 18.745 18.674 18.579 18.445 18.299 18.149 17.992 17.824 17.672 17.528 17.392 17.28 17.161 17.031 16.914 16.8 16.663 16.55 16.444 16.313 16.204 16.092 15.972 15.856 15.733 15.635 15.538 15.376 15.246 15.094 15.011 14.858 14.702 14.527 14.438 14.254 14.138 14.034 13.925 13.662 13.507 13.341 13.139 12.918 12.665 12.355 11.355 -9 ,2611 ,TETRA ,17556501,Fri Nov 26 07:06:39 CET,Fri Nov 26 09:01:59 CET,0.0 1.065 1.392 1.63 1.867 2.098 2.298 2.455 2.741 2.893 3.029 3.19 3.421 3.537 3.768 3.965 4.149 4.255 4.467 4.654 4.921 5.099 5.26 5.492 5.705 5.894 6.068 6.245 6.494 6.735 6.963 7.227 7.487 7.748 8.037 8.352 8.662 8.987 9.327 9.723 10.148 10.605 11.129 11.636 12.197 12.802 13.521 14.342 15.249 16.241 17.218 17.791 17.955 17.898 17.833 17.801 17.74 17.651 17.55 17.407 17.256 17.106 16.941 16.783 16.646 16.501 16.314 16.131 15.974 15.833 15.692 15.556 15.395 15.212 15.067 14.918 14.757 14.59 14.427 14.311 14.192 14.024 13.904 13.76 13.689 13.544 13.383 13.225 13.138 12.955 12.821 12.695 12.566 12.295 12.151 12.014 11.852 11.655 11.421 11.036 10.049 -10 ,17238 ,TETRA ,17556502,Fri Nov 26 07:06:39 CET,Fri Nov 26 09:26:35 CET,0.0 2.495 2.88 3.187 3.462 3.679 3.838 3.967 4.212 4.352 4.495 4.64 4.866 4.991 5.194 5.393 5.602 5.698 5.874 6.037 6.276 6.44 6.601 6.833 7.051 7.26 7.474 7.673 7.897 8.119 8.36 8.648 8.907 9.141 9.405 9.734 10.05 10.372 10.711 11.081 11.5 11.979 12.5 13.014 13.651 14.317 15.013 15.832 16.823 17.865 19.016 19.857 20.156 20.294 20.379 20.32 20.153 19.953 19.771 19.577 19.413 19.267 19.114 18.961 18.801 18.645 18.477 18.316 18.17 18.01 17.827 17.671 17.525 17.381 17.258 17.126 16.987 16.832 16.671 16.566 16.449 16.238 16.094 15.946 15.861 15.692 15.52 15.316 15.216 15.024 14.885 14.76 14.633 14.359 14.203 14.039 13.831 13.578 13.258 12.814 11.374 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_43_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_43_42.txt deleted file mode 100644 index 1385efc8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_43_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26598 ,TETRA ,17556503,Fri Nov 26 07:06:42 CET,Fri Nov 26 09:26:13 CET,0.0 0.713 0.995 1.187 1.343 1.479 1.601 1.712 1.908 2.005 2.095 2.165 2.342 2.423 2.565 2.682 2.794 2.853 2.962 3.071 3.24 3.346 3.439 3.554 3.663 3.782 3.906 4.028 4.179 4.321 4.463 4.629 4.787 4.935 5.105 5.304 5.486 5.671 5.881 6.112 6.341 6.587 6.874 7.137 7.42 7.721 8.017 8.284 8.524 8.706 8.662 8.219 7.687 7.117 6.572 6.076 5.608 5.186 4.829 4.473 4.153 3.869 3.595 3.311 3.043 2.824 2.594 2.371 2.171 1.954 1.727 1.551 1.377 1.195 1.062 0.924 0.77 0.609 0.444 0.332 0.221 0.048 -0.085 -0.239 -0.314 -0.468 -0.645 -0.822 -0.92 -1.135 -1.249 -1.357 -1.466 -1.693 -1.83 -1.979 -2.141 -2.339 -2.564 -2.873 -3.698 -2 ,17347 ,TETRA ,17556504,Fri Nov 26 07:07:41 CET,Fri Nov 26 09:31:14 CET,0.0 0.774 1.096 1.313 1.461 1.605 1.731 1.841 2.054 2.164 2.262 2.339 2.512 2.59 2.743 2.888 3.008 3.065 3.192 3.318 3.482 3.585 3.683 3.827 3.968 4.102 4.233 4.363 4.518 4.656 4.785 4.932 5.084 5.236 5.395 5.577 5.755 5.934 6.113 6.302 6.524 6.762 7.02 7.268 7.523 7.773 8.046 8.368 8.693 8.873 8.729 8.254 7.721 7.144 6.634 6.201 5.782 5.421 5.095 4.734 4.416 4.118 3.829 3.572 3.327 3.088 2.838 2.614 2.407 2.179 1.962 1.792 1.617 1.429 1.259 1.083 0.899 0.707 0.514 0.379 0.246 0.016 -0.143 -0.31 -0.398 -0.567 -0.752 -0.958 -1.057 -1.261 -1.363 -1.477 -1.607 -1.884 -2.034 -2.195 -2.371 -2.589 -2.844 -3.224 -4.487 -3 ,1649 ,TETRA ,17556505,Fri Nov 26 07:07:41 CET,Fri Nov 26 09:27:47 CET,0.0 0.644 0.933 1.146 1.327 1.48 1.614 1.732 1.94 2.041 2.131 2.208 2.382 2.453 2.581 2.688 2.807 2.876 3.01 3.129 3.302 3.414 3.516 3.667 3.818 3.953 4.083 4.208 4.361 4.508 4.651 4.815 4.96 5.097 5.264 5.449 5.627 5.822 6.029 6.24 6.45 6.694 6.965 7.211 7.48 7.775 8.104 8.388 8.597 8.705 8.584 8.122 7.526 6.958 6.428 5.881 5.424 5.056 4.701 4.32 3.974 3.658 3.368 3.092 2.837 2.61 2.361 2.133 1.926 1.712 1.495 1.303 1.106 0.915 0.773 0.626 0.476 0.308 0.095 -0.052 -0.185 -0.38 -0.513 -0.651 -0.723 -0.891 -1.078 -1.283 -1.384 -1.592 -1.699 -1.8 -1.918 -2.176 -2.316 -2.486 -2.673 -2.859 -3.084 -3.398 -4.397 -4 ,17262 ,TETRA ,17556506,Fri Nov 26 07:07:41 CET,Fri Nov 26 09:25:38 CET,0.0 0.691 0.962 1.181 1.335 1.465 1.603 1.741 1.979 2.074 2.155 2.227 2.411 2.495 2.646 2.783 2.908 2.968 3.076 3.172 3.33 3.439 3.539 3.679 3.816 3.952 4.073 4.187 4.344 4.5 4.635 4.786 4.937 5.08 5.24 5.412 5.588 5.787 5.982 6.171 6.367 6.586 6.833 7.076 7.37 7.675 7.97 8.248 8.471 8.57 8.378 7.837 7.251 6.666 6.14 5.646 5.198 4.808 4.433 4.04 3.703 3.388 3.099 2.85 2.623 2.406 2.157 1.938 1.751 1.532 1.297 1.103 0.903 0.7 0.541 0.373 0.191 0.007 -0.171 -0.308 -0.457 -0.678 -0.834 -1.003 -1.093 -1.262 -1.435 -1.641 -1.754 -1.972 -2.089 -2.205 -2.324 -2.588 -2.734 -2.9 -3.094 -3.31 -3.54 -3.831 -4.929 -5 ,18813 ,TETRA ,17556507,Fri Nov 26 07:07:41 CET,Fri Nov 26 09:22:31 CET,0.0 0.663 0.901 1.093 1.244 1.395 1.546 1.683 1.927 2.032 2.138 2.227 2.405 2.488 2.663 2.82 2.954 3.021 3.147 3.252 3.416 3.526 3.63 3.783 3.925 4.058 4.184 4.302 4.471 4.639 4.782 4.936 5.087 5.248 5.441 5.645 5.821 6.011 6.213 6.423 6.632 6.88 7.187 7.471 7.812 8.174 8.48 8.733 8.987 9.209 9.19 8.786 8.262 7.697 7.19 6.689 6.219 5.783 5.382 4.974 4.635 4.325 4.017 3.746 3.501 3.259 2.997 2.754 2.546 2.326 2.102 1.933 1.758 1.568 1.406 1.246 1.096 0.921 0.729 0.606 0.479 0.266 0.118 -0.028 -0.111 -0.285 -0.459 -0.64 -0.733 -0.936 -1.038 -1.148 -1.268 -1.517 -1.667 -1.833 -1.994 -2.186 -2.424 -2.731 -3.815 -6 ,7832 ,TETRA ,17556508,Fri Nov 26 07:07:41 CET,Fri Nov 26 09:22:45 CET,0.0 0.646 0.945 1.171 1.31 1.422 1.537 1.653 1.86 1.953 2.046 2.105 2.277 2.359 2.495 2.611 2.729 2.793 2.919 3.033 3.192 3.292 3.387 3.533 3.68 3.821 3.942 4.053 4.21 4.354 4.472 4.615 4.768 4.935 5.121 5.297 5.463 5.642 5.815 5.995 6.201 6.412 6.655 6.891 7.159 7.493 7.836 8.161 8.43 8.519 8.391 7.976 7.446 6.905 6.343 5.739 5.214 4.775 4.413 4.067 3.762 3.468 3.187 2.933 2.695 2.478 2.242 2.019 1.82 1.611 1.399 1.221 1.027 0.822 0.662 0.506 0.36 0.197 0.026 -0.094 -0.223 -0.41 -0.552 -0.708 -0.784 -0.951 -1.128 -1.326 -1.434 -1.638 -1.738 -1.85 -1.967 -2.229 -2.38 -2.53 -2.69 -2.889 -3.12 -3.443 -4.62 -7 ,29186 ,TETRA ,17556509,Fri Nov 26 07:07:41 CET,Fri Nov 26 09:24:05 CET,0.0 0.619 0.87 1.066 1.221 1.361 1.496 1.62 1.847 1.945 2.039 2.136 2.321 2.402 2.543 2.677 2.826 2.897 3.016 3.125 3.292 3.401 3.504 3.653 3.801 3.942 4.068 4.187 4.339 4.47 4.596 4.746 4.899 5.059 5.224 5.401 5.571 5.751 5.96 6.18 6.39 6.622 6.883 7.14 7.423 7.694 8.008 8.326 8.62 8.878 8.844 8.329 7.75 7.161 6.594 6.077 5.61 5.205 4.848 4.461 4.127 3.796 3.48 3.19 2.925 2.676 2.392 2.138 1.931 1.713 1.47 1.276 1.08 0.867 0.715 0.565 0.407 0.239 0.068 -0.051 -0.179 -0.372 -0.5 -0.632 -0.703 -0.849 -1.007 -1.178 -1.27 -1.474 -1.575 -1.69 -1.813 -2.072 -2.212 -2.359 -2.508 -2.702 -2.952 -3.253 -4.281 -8 ,2274 ,TETRA ,17556510,Fri Nov 26 07:08:38 CET,Fri Nov 26 09:12:25 CET,0.0 0.676 0.883 1.036 1.182 1.318 1.441 1.566 1.807 1.92 2.025 2.124 2.307 2.382 2.523 2.672 2.821 2.885 3.001 3.129 3.322 3.432 3.523 3.652 3.788 3.917 4.037 4.152 4.316 4.468 4.598 4.752 4.897 5.04 5.2 5.389 5.589 5.791 6.003 6.236 6.455 6.687 6.945 7.178 7.458 7.793 8.133 8.434 8.656 8.748 8.62 8.161 7.553 6.998 6.494 5.986 5.526 5.149 4.814 4.429 4.1 3.813 3.54 3.281 3.033 2.804 2.567 2.358 2.168 1.959 1.738 1.563 1.37 1.158 1.011 0.876 0.735 0.57 0.389 0.274 0.161 -0.026 -0.159 -0.294 -0.363 -0.501 -0.646 -0.793 -0.87 -1.061 -1.173 -1.292 -1.413 -1.671 -1.814 -1.955 -2.111 -2.287 -2.494 -2.771 -3.525 -9 ,15041 ,TETRA ,17556511,Fri Nov 26 07:08:39 CET,Fri Nov 26 09:24:52 CET,0.0 0.459 0.681 0.895 1.075 1.222 1.339 1.449 1.653 1.743 1.835 1.91 2.082 2.162 2.309 2.445 2.578 2.642 2.763 2.878 3.035 3.129 3.222 3.374 3.518 3.647 3.758 3.867 4.019 4.15 4.27 4.419 4.555 4.687 4.85 5.029 5.203 5.396 5.598 5.795 6.001 6.238 6.513 6.775 7.049 7.334 7.617 7.901 8.135 8.22 8.055 7.622 7.169 6.644 6.152 5.714 5.308 4.94 4.592 4.207 3.891 3.635 3.385 3.132 2.891 2.67 2.433 2.223 2.038 1.835 1.624 1.45 1.264 1.083 0.948 0.802 0.653 0.496 0.324 0.205 0.088 -0.109 -0.259 -0.405 -0.477 -0.633 -0.793 -0.966 -1.057 -1.253 -1.331 -1.429 -1.535 -1.785 -1.928 -2.088 -2.279 -2.476 -2.719 -3.063 -4.112 -10 ,2327 ,TETRA ,17556512,Fri Nov 26 07:08:39 CET,Fri Nov 26 09:26:56 CET,0.0 0.704 0.944 1.143 1.32 1.475 1.607 1.713 1.922 2.022 2.112 2.207 2.399 2.482 2.63 2.788 2.942 3.01 3.136 3.26 3.433 3.548 3.674 3.846 3.994 4.139 4.274 4.392 4.545 4.689 4.837 5.021 5.185 5.335 5.512 5.699 5.867 6.054 6.257 6.454 6.675 6.938 7.218 7.462 7.72 8.013 8.316 8.617 8.902 9.156 9.22 8.882 8.431 7.997 7.566 7.135 6.686 6.239 5.853 5.48 5.172 4.874 4.581 4.289 3.995 3.733 3.473 3.212 2.972 2.729 2.488 2.305 2.122 1.934 1.788 1.632 1.476 1.319 1.14 1.004 0.864 0.64 0.49 0.339 0.254 0.081 -0.09 -0.27 -0.368 -0.571 -0.674 -0.78 -0.885 -1.116 -1.26 -1.402 -1.547 -1.716 -1.946 -2.262 -3.094 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_43_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_43_44.txt deleted file mode 100644 index 05f4bd7a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_43_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,347 ,TETRA ,17672966,Fri Dec 3 09:27:01 CET,Fri Dec 3 11:42:39 CET,0.0 0.351 0.592 0.814 0.963 1.094 1.236 1.371 1.607 1.713 1.802 1.875 2.062 2.143 2.284 2.413 2.54 2.605 2.732 2.861 3.046 3.165 3.28 3.439 3.604 3.764 3.912 4.054 4.232 4.418 4.619 4.853 5.081 5.305 5.555 5.817 6.066 6.362 6.693 7.027 7.372 7.763 8.206 8.667 9.239 9.821 10.416 11.082 11.894 12.895 13.956 14.627 14.904 14.886 14.657 14.427 14.245 14.048 13.798 13.477 13.223 13.021 12.809 12.597 12.396 12.211 12.0 11.809 11.631 11.427 11.222 11.045 10.853 10.67 10.523 10.359 10.199 10.03 9.829 9.687 9.555 9.336 9.172 9.008 8.924 8.731 8.52 8.309 8.209 8.016 7.857 7.712 7.553 7.191 7.013 6.829 6.607 6.367 6.078 5.605 3.947 -2 ,12967 ,TETRA ,17672967,Fri Dec 3 09:27:04 CET,Fri Dec 3 11:40:25 CET,0.0 1.03 1.264 1.4 1.51 1.629 1.744 1.85 2.063 2.165 2.255 2.312 2.48 2.557 2.694 2.824 2.957 3.021 3.143 3.263 3.445 3.563 3.678 3.839 3.995 4.148 4.287 4.43 4.617 4.785 4.958 5.174 5.379 5.577 5.808 6.072 6.337 6.635 6.947 7.272 7.621 8.016 8.463 8.874 9.373 9.98 10.703 11.538 12.45 13.383 14.389 15.117 15.4 15.467 15.434 15.319 15.129 14.893 14.675 14.424 14.19 13.975 13.719 13.444 13.186 12.967 12.744 12.533 12.35 12.161 11.965 11.801 11.641 11.478 11.334 11.168 10.999 10.818 10.612 10.464 10.31 10.06 9.88 9.702 9.615 9.427 9.224 9.008 8.891 8.673 8.511 8.375 8.24 7.921 7.732 7.545 7.332 7.07 6.694 6.165 3.992 -3 ,20602 ,TETRA ,17672968,Fri Dec 3 09:27:01 CET,Fri Dec 3 11:36:20 CET,0.0 0.471 0.68 0.829 0.953 1.069 1.189 1.306 1.547 1.66 1.755 1.829 2.003 2.079 2.238 2.388 2.521 2.584 2.703 2.817 2.998 3.116 3.222 3.375 3.526 3.677 3.829 3.978 4.171 4.366 4.544 4.752 4.96 5.163 5.405 5.685 5.961 6.268 6.577 6.898 7.253 7.658 8.134 8.621 9.177 9.765 10.403 11.136 11.949 12.81 13.882 14.703 14.926 14.888 14.74 14.548 14.373 14.167 13.953 13.729 13.532 13.358 13.143 12.903 12.716 12.557 12.35 12.15 11.987 11.806 11.612 11.448 11.273 11.083 10.928 10.759 10.569 10.357 10.13 9.967 9.807 9.577 9.413 9.245 9.153 8.951 8.755 8.569 8.462 8.253 8.114 7.99 7.858 7.56 7.392 7.179 6.926 6.661 6.35 5.864 3.67 -4 ,6635 ,TETRA ,17672969,Fri Dec 3 09:27:04 CET,Fri Dec 3 11:43:21 CET,0.0 0.501 0.73 0.893 1.035 1.148 1.26 1.376 1.579 1.679 1.779 1.869 2.059 2.144 2.288 2.432 2.562 2.625 2.77 2.919 3.115 3.239 3.356 3.523 3.681 3.842 4.002 4.158 4.36 4.54 4.725 4.958 5.171 5.372 5.608 5.874 6.134 6.423 6.723 7.035 7.376 7.786 8.263 8.704 9.196 9.745 10.401 11.109 11.913 12.915 14.088 14.892 15.216 15.322 15.29 15.14 14.977 14.778 14.588 14.386 14.177 13.984 13.753 13.511 13.274 13.05 12.808 12.586 12.397 12.189 11.967 11.786 11.601 11.392 11.228 11.057 10.876 10.693 10.515 10.401 10.269 10.055 9.906 9.744 9.664 9.498 9.308 9.117 9.016 8.815 8.651 8.521 8.399 8.122 7.966 7.79 7.588 7.308 6.959 6.533 4.908 -5 ,30906 ,TETRA ,17672970,Fri Dec 3 09:27:06 CET,Fri Dec 3 11:43:20 CET,0.0 0.578 0.81 1.026 1.218 1.368 1.484 1.597 1.821 1.919 2.008 2.091 2.269 2.347 2.487 2.631 2.784 2.855 2.985 3.112 3.311 3.445 3.569 3.74 3.891 4.029 4.173 4.326 4.512 4.68 4.849 5.073 5.3 5.513 5.759 6.04 6.308 6.607 6.918 7.243 7.591 7.972 8.431 8.914 9.456 10.049 10.749 11.533 12.4 13.339 14.467 15.249 15.55 15.554 15.326 15.089 14.866 14.579 14.306 14.04 13.813 13.614 13.408 13.187 12.954 12.744 12.526 12.319 12.151 11.945 11.717 11.555 11.385 11.197 11.046 10.889 10.719 10.521 10.313 10.177 10.039 9.797 9.609 9.425 9.335 9.147 8.955 8.753 8.639 8.426 8.29 8.168 8.028 7.692 7.506 7.306 7.096 6.833 6.517 6.136 4.482 -6 ,32647 ,TETRA ,17672971,Fri Dec 3 09:27:01 CET,Fri Dec 3 11:34:07 CET,0.0 0.671 0.925 1.107 1.238 1.357 1.479 1.6 1.843 1.945 2.027 2.092 2.259 2.333 2.487 2.631 2.761 2.828 2.974 3.102 3.267 3.373 3.485 3.656 3.812 3.961 4.107 4.251 4.437 4.622 4.805 5.014 5.214 5.422 5.674 5.954 6.209 6.5 6.818 7.167 7.544 7.96 8.444 8.92 9.474 10.092 10.84 11.683 12.622 13.703 14.84 15.542 15.827 15.846 15.735 15.545 15.316 15.089 14.894 14.685 14.473 14.244 13.995 13.763 13.543 13.362 13.161 12.965 12.804 12.609 12.383 12.2 12.035 11.863 11.696 11.516 11.346 11.185 11.021 10.899 10.766 10.553 10.415 10.261 10.173 9.996 9.818 9.631 9.523 9.313 9.153 9.025 8.891 8.539 8.339 8.141 7.908 7.617 7.252 6.707 4.864 -7 ,22461 ,TETRA ,17672972,Fri Dec 3 09:27:01 CET,Fri Dec 3 11:40:24 CET,0.0 0.539 0.746 0.89 1.035 1.176 1.337 1.488 1.724 1.828 1.919 1.998 2.177 2.263 2.433 2.582 2.711 2.773 2.906 3.04 3.231 3.348 3.463 3.635 3.797 3.949 4.092 4.241 4.437 4.625 4.812 5.037 5.253 5.451 5.688 5.953 6.199 6.477 6.789 7.129 7.461 7.826 8.271 8.728 9.267 9.861 10.544 11.322 12.247 13.233 14.22 14.803 15.021 15.091 15.019 14.83 14.618 14.396 14.179 13.946 13.735 13.529 13.272 13.01 12.807 12.629 12.439 12.267 12.082 11.888 11.69 11.529 11.364 11.185 11.045 10.886 10.726 10.553 10.374 10.262 10.137 9.927 9.763 9.581 9.486 9.299 9.095 8.869 8.757 8.551 8.38 8.237 8.092 7.753 7.556 7.343 7.12 6.855 6.5 6.03 3.911 -8 ,26641 ,TETRA ,17672973,Fri Dec 3 09:27:04 CET,Fri Dec 3 11:39:53 CET,0.0 0.638 0.867 1.044 1.179 1.316 1.45 1.556 1.755 1.855 1.949 2.023 2.202 2.287 2.447 2.581 2.708 2.775 2.912 3.044 3.219 3.325 3.431 3.59 3.746 3.895 4.035 4.184 4.383 4.563 4.736 4.943 5.146 5.343 5.574 5.846 6.091 6.361 6.653 6.963 7.306 7.665 8.073 8.491 9.001 9.605 10.299 11.087 12.004 13.019 14.093 14.697 14.828 14.729 14.593 14.474 14.306 14.058 13.797 13.553 13.363 13.17 12.983 12.829 12.652 12.461 12.266 12.092 11.928 11.758 11.58 11.413 11.236 11.061 10.924 10.776 10.635 10.49 10.329 10.222 10.106 9.917 9.78 9.632 9.545 9.361 9.18 8.98 8.881 8.689 8.574 8.456 8.313 7.995 7.798 7.58 7.36 7.127 6.807 6.343 4.64 -9 ,9233 ,TETRA ,17672974,Fri Dec 3 09:27:03 CET,Fri Dec 3 11:38:49 CET,0.0 0.849 1.017 1.14 1.268 1.399 1.508 1.607 1.79 1.873 1.961 2.028 2.202 2.275 2.406 2.528 2.661 2.726 2.839 2.951 3.128 3.24 3.35 3.505 3.663 3.822 3.975 4.128 4.323 4.509 4.685 4.895 5.096 5.286 5.512 5.783 6.043 6.32 6.619 6.955 7.308 7.692 8.156 8.618 9.12 9.673 10.315 10.984 11.749 12.636 13.684 14.337 14.443 14.307 14.049 13.768 13.486 13.173 12.912 12.671 12.436 12.21 11.971 11.713 11.48 11.263 11.025 10.826 10.645 10.454 10.254 10.08 9.896 9.688 9.518 9.356 9.191 9.004 8.812 8.685 8.553 8.343 8.194 8.038 7.955 7.789 7.618 7.439 7.342 7.137 6.999 6.871 6.717 6.366 6.179 5.989 5.769 5.494 5.16 4.711 2.922 -10 ,16048 ,TETRA ,17672975,Fri Dec 3 09:27:59 CET,Fri Dec 3 11:38:52 CET,0.0 0.531 0.761 0.937 1.106 1.267 1.396 1.51 1.704 1.787 1.868 1.932 2.111 2.195 2.36 2.516 2.676 2.753 2.9 3.045 3.253 3.376 3.487 3.654 3.827 3.99 4.128 4.262 4.431 4.598 4.771 4.992 5.213 5.418 5.663 5.94 6.185 6.458 6.761 7.095 7.447 7.842 8.323 8.808 9.36 9.974 10.703 11.53 12.486 13.587 14.747 15.508 15.859 15.9 15.744 15.54 15.347 15.13 14.871 14.57 14.303 14.084 13.862 13.649 13.472 13.298 13.093 12.915 12.758 12.577 12.38 12.212 12.034 11.853 11.71 11.551 11.369 11.178 10.996 10.868 10.744 10.537 10.365 10.195 10.102 9.909 9.713 9.488 9.377 9.166 9.016 8.893 8.763 8.466 8.29 8.097 7.88 7.633 7.313 6.839 5.02 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_44_18.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_44_18.txt deleted file mode 100644 index 03248f32..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_44_18.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7540 ,TETRA ,17556513,Fri Nov 26 07:08:39 CET,Fri Nov 26 09:20:05 CET,0.0 0.189 0.304 0.395 0.473 0.556 0.625 0.684 0.801 0.855 0.898 0.887 1.029 1.071 1.142 1.213 1.279 1.308 1.359 1.406 1.481 1.53 1.573 1.638 1.706 1.762 1.815 1.869 1.951 2.023 2.085 2.163 2.235 2.288 2.33 2.393 2.465 2.547 2.624 2.693 2.757 2.82 2.894 2.942 2.973 2.963 2.87 2.652 2.292 1.784 0.782 -0.743 -2.105 -3.244 -4.311 -5.362 -6.25 -6.994 -7.625 -8.256 -8.814 -9.313 -9.76 -10.172 -10.584 -10.97 -11.357 -11.697 -11.999 -12.307 -12.621 -12.89 -13.172 -13.481 -13.735 -13.996 -14.267 -14.542 -14.813 -14.994 -15.177 -15.449 -15.641 -15.877 -15.986 -16.178 -16.39 -16.633 -16.752 -16.96 -17.099 -17.254 -17.433 -17.801 -18.028 -18.298 -18.56 -18.801 -19.083 -19.479 -20.718 -2 ,29503 ,TETRA ,17556514,Fri Nov 26 07:08:38 CET,Fri Nov 26 09:21:55 CET,0.0 0.144 0.232 0.306 0.376 0.447 0.51 0.567 0.668 0.719 0.77 0.774 0.903 0.948 1.035 1.111 1.189 1.223 1.286 1.35 1.431 1.478 1.533 1.619 1.694 1.759 1.825 1.894 1.982 2.066 2.126 2.194 2.274 2.342 2.425 2.525 2.61 2.702 2.795 2.881 2.984 3.098 3.202 3.275 3.331 3.364 3.327 3.222 2.974 2.465 1.452 0.06 -1.125 -2.153 -3.067 -3.897 -4.628 -5.279 -5.906 -6.604 -7.16 -7.613 -8.054 -8.458 -8.825 -9.167 -9.516 -9.814 -10.088 -10.393 -10.701 -10.963 -11.24 -11.502 -11.714 -11.94 -12.14 -12.354 -12.612 -12.785 -12.939 -13.2 -13.405 -13.62 -13.736 -13.977 -14.235 -14.494 -14.62 -14.864 -15.058 -15.198 -15.346 -15.661 -15.831 -16.052 -16.304 -16.552 -16.883 -17.359 -18.821 -3 ,28187 ,TETRA ,17556515,Fri Nov 26 07:08:38 CET,Fri Nov 26 09:17:42 CET,0.0 0.158 0.234 0.324 0.391 0.444 0.506 0.568 0.658 0.708 0.767 0.776 0.909 0.943 1.003 1.069 1.14 1.173 1.232 1.28 1.346 1.399 1.46 1.538 1.606 1.679 1.749 1.823 1.903 1.964 2.033 2.12 2.199 2.281 2.366 2.449 2.529 2.607 2.69 2.763 2.828 2.925 3.048 3.141 3.203 3.191 3.104 2.967 2.706 2.214 1.262 -0.093 -1.338 -2.372 -3.253 -4.042 -4.696 -5.325 -5.878 -6.403 -6.862 -7.265 -7.669 -8.081 -8.461 -8.804 -9.143 -9.446 -9.715 -9.993 -10.278 -10.51 -10.751 -10.977 -11.152 -11.356 -11.571 -11.798 -12.051 -12.225 -12.397 -12.658 -12.839 -13.02 -13.103 -13.273 -13.45 -13.642 -13.744 -13.942 -14.062 -14.184 -14.311 -14.588 -14.729 -14.877 -15.057 -15.273 -15.504 -15.821 -16.939 -4 ,2539 ,TETRA ,17556516,Fri Nov 26 07:09:39 CET,Fri Nov 26 09:16:02 CET,0.0 0.168 0.316 0.416 0.494 0.589 0.689 0.767 0.884 0.939 0.994 1.02 1.156 1.2 1.28 1.351 1.435 1.472 1.543 1.617 1.724 1.782 1.838 1.925 2.001 2.074 2.153 2.233 2.329 2.417 2.486 2.56 2.633 2.7 2.766 2.836 2.901 2.967 3.033 3.075 3.114 3.176 3.263 3.33 3.364 3.306 3.17 2.978 2.58 1.807 0.536 -0.962 -2.341 -3.546 -4.546 -5.48 -6.29 -6.988 -7.582 -8.162 -8.671 -9.136 -9.546 -9.895 -10.231 -10.569 -10.946 -11.27 -11.537 -11.82 -12.099 -12.325 -12.565 -12.821 -13.039 -13.274 -13.507 -13.732 -13.963 -14.125 -14.295 -14.575 -14.77 -14.956 -15.051 -15.264 -15.484 -15.698 -15.815 -16.036 -16.191 -16.334 -16.48 -16.77 -16.933 -17.143 -17.401 -17.655 -17.922 -18.294 -19.256 -5 ,25902 ,TETRA ,17556517,Fri Nov 26 07:09:40 CET,Fri Nov 26 09:06:30 CET,0.0 0.161 0.271 0.381 0.468 0.557 0.628 0.684 0.81 0.867 0.921 0.92 1.053 1.095 1.189 1.279 1.361 1.398 1.47 1.536 1.629 1.692 1.753 1.827 1.896 1.963 2.028 2.099 2.195 2.274 2.333 2.411 2.493 2.563 2.635 2.707 2.785 2.874 2.961 3.051 3.126 3.179 3.212 3.217 3.217 3.221 3.197 3.091 2.853 2.344 1.232 -0.28 -1.61 -2.762 -3.754 -4.615 -5.365 -6.043 -6.607 -7.166 -7.649 -8.092 -8.524 -8.922 -9.282 -9.594 -9.925 -10.246 -10.519 -10.781 -11.05 -11.282 -11.523 -11.755 -11.94 -12.143 -12.333 -12.538 -12.772 -12.933 -13.085 -13.327 -13.515 -13.7 -13.788 -13.97 -14.145 -14.319 -14.415 -14.619 -14.755 -14.883 -15.016 -15.308 -15.512 -15.751 -15.967 -16.227 -16.574 -17.032 -18.492 -6 ,27207 ,TETRA ,17556518,Fri Nov 26 07:09:40 CET,Fri Nov 26 09:22:19 CET,0.0 0.181 0.322 0.425 0.522 0.607 0.673 0.722 0.832 0.885 0.922 0.931 1.083 1.132 1.212 1.289 1.354 1.383 1.44 1.511 1.619 1.686 1.746 1.825 1.901 1.973 2.038 2.094 2.173 2.244 2.304 2.381 2.454 2.528 2.628 2.75 2.865 2.994 3.12 3.221 3.326 3.449 3.574 3.676 3.749 3.788 3.764 3.707 3.482 2.763 1.393 -0.268 -1.61 -2.748 -3.716 -4.588 -5.332 -5.992 -6.575 -7.14 -7.615 -8.041 -8.456 -8.859 -9.217 -9.538 -9.868 -10.149 -10.385 -10.637 -10.914 -11.138 -11.367 -11.592 -11.768 -11.967 -12.173 -12.384 -12.592 -12.731 -12.883 -13.126 -13.292 -13.461 -13.547 -13.713 -13.888 -14.097 -14.208 -14.423 -14.54 -14.643 -14.762 -15.065 -15.224 -15.4 -15.617 -15.833 -16.082 -16.475 -17.96 -7 ,7299 ,TETRA ,17556519,Fri Nov 26 07:10:40 CET,Fri Nov 26 09:22:30 CET,0.0 0.199 0.327 0.397 0.454 0.518 0.583 0.654 0.78 0.835 0.872 0.859 1.006 1.052 1.124 1.184 1.24 1.27 1.334 1.395 1.472 1.519 1.57 1.638 1.698 1.761 1.821 1.874 1.951 2.033 2.1 2.174 2.236 2.314 2.419 2.502 2.571 2.651 2.726 2.78 2.829 2.88 2.927 2.979 3.02 3.029 2.983 2.859 2.629 2.116 1.045 -0.355 -1.526 -2.553 -3.454 -4.242 -4.941 -5.594 -6.136 -6.656 -7.113 -7.519 -7.908 -8.264 -8.603 -8.925 -9.257 -9.572 -9.84 -10.109 -10.405 -10.649 -10.877 -11.096 -11.271 -11.457 -11.654 -11.859 -12.067 -12.213 -12.372 -12.621 -12.795 -12.977 -13.071 -13.269 -13.482 -13.704 -13.819 -14.039 -14.173 -14.289 -14.427 -14.764 -14.977 -15.177 -15.355 -15.538 -15.759 -16.046 -17.411 -8 ,21649 ,TETRA ,17556520,Fri Nov 26 07:10:39 CET,Fri Nov 26 09:07:47 CET,0.0 0.151 0.25 0.326 0.409 0.486 0.547 0.604 0.722 0.785 0.844 0.879 1.02 1.06 1.14 1.22 1.305 1.344 1.411 1.472 1.558 1.61 1.665 1.744 1.809 1.872 1.937 2.009 2.102 2.184 2.263 2.348 2.421 2.495 2.595 2.688 2.757 2.834 2.901 2.958 3.024 3.075 3.113 3.164 3.202 3.18 3.069 2.886 2.636 2.209 1.171 -0.283 -1.569 -2.719 -3.66 -4.508 -5.335 -6.036 -6.608 -7.238 -7.76 -8.197 -8.613 -8.992 -9.334 -9.64 -9.951 -10.242 -10.494 -10.749 -11.015 -11.233 -11.451 -11.679 -11.868 -12.059 -12.26 -12.482 -12.71 -12.876 -13.063 -13.337 -13.511 -13.682 -13.772 -13.992 -14.211 -14.413 -14.528 -14.759 -14.911 -15.037 -15.164 -15.493 -15.686 -15.886 -16.094 -16.302 -16.597 -16.961 -18.219 -9 ,20429 ,TETRA ,17556521,Fri Nov 26 07:11:40 CET,Fri Nov 26 09:19:53 CET,0.0 0.342 0.538 0.698 0.785 0.854 0.917 0.968 1.056 1.095 1.13 1.127 1.267 1.306 1.375 1.458 1.542 1.579 1.648 1.714 1.812 1.878 1.936 2.02 2.108 2.196 2.268 2.328 2.411 2.488 2.563 2.663 2.754 2.837 2.927 3.021 3.114 3.201 3.277 3.355 3.448 3.549 3.607 3.648 3.76 3.896 3.998 4.025 3.789 3.168 1.972 0.406 -0.92 -2.04 -3.004 -3.874 -4.638 -5.306 -5.851 -6.391 -6.861 -7.296 -7.706 -8.068 -8.415 -8.751 -9.09 -9.39 -9.651 -9.923 -10.208 -10.441 -10.674 -10.932 -11.142 -11.35 -11.564 -11.787 -12.013 -12.168 -12.331 -12.58 -12.752 -12.94 -13.032 -13.209 -13.414 -13.643 -13.771 -14.048 -14.326 -14.526 -14.724 -15.048 -15.244 -15.541 -15.882 -16.238 -16.741 -17.361 -18.882 -10 ,4006 ,TETRA ,17556522,Fri Nov 26 07:11:40 CET,Fri Nov 26 09:22:49 CET,0.0 0.193 0.354 0.462 0.541 0.618 0.689 0.736 0.816 0.864 0.909 0.891 1.018 1.064 1.152 1.224 1.293 1.326 1.389 1.449 1.53 1.584 1.639 1.705 1.763 1.829 1.897 1.96 2.042 2.108 2.171 2.242 2.296 2.345 2.422 2.517 2.598 2.696 2.773 2.824 2.864 2.884 2.899 2.912 2.892 2.79 2.636 2.467 2.099 1.339 0.069 -1.453 -2.715 -3.797 -4.77 -5.711 -6.58 -7.344 -8.047 -8.775 -9.331 -9.811 -10.266 -10.679 -11.063 -11.41 -11.767 -12.104 -12.396 -12.684 -13.012 -13.303 -13.587 -13.889 -14.146 -14.38 -14.585 -14.797 -15.012 -15.177 -15.364 -15.628 -15.798 -15.992 -16.094 -16.286 -16.477 -16.687 -16.818 -17.069 -17.262 -17.419 -17.584 -17.967 -18.194 -18.429 -18.691 -18.973 -19.26 -19.683 -20.967 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_45_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_45_44.txt deleted file mode 100644 index c4f997c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/protein/Summary_FEP_45_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29108 ,TETRA ,17556523,Fri Nov 26 07:11:39 CET,Fri Nov 26 09:12:13 CET,0.0 0.622 0.9 1.082 1.202 1.335 1.466 1.571 1.76 1.844 1.928 1.992 2.148 2.208 2.309 2.419 2.545 2.608 2.717 2.817 2.976 3.081 3.173 3.303 3.428 3.55 3.666 3.781 3.942 4.098 4.254 4.444 4.624 4.791 4.98 5.194 5.399 5.626 5.876 6.16 6.46 6.772 7.133 7.494 7.933 8.399 8.835 9.215 9.595 9.992 10.293 10.133 9.737 9.252 8.784 8.354 7.858 7.343 6.92 6.521 6.158 5.804 5.477 5.195 4.924 4.675 4.408 4.148 3.941 3.731 3.499 3.299 3.099 2.905 2.758 2.603 2.426 2.209 1.965 1.813 1.678 1.491 1.344 1.148 1.041 0.837 0.631 0.408 0.305 0.117 -0.015 -0.124 -0.235 -0.524 -0.701 -0.89 -1.123 -1.382 -1.657 -2.033 -2.989 -2 ,17539 ,TETRA ,17556524,Fri Nov 26 07:12:39 CET,Fri Nov 26 09:26:02 CET,0.0 0.32 0.453 0.571 0.696 0.813 0.913 1.009 1.18 1.254 1.334 1.404 1.562 1.629 1.755 1.873 1.997 2.054 2.152 2.247 2.401 2.494 2.583 2.722 2.856 2.978 3.089 3.192 3.335 3.477 3.606 3.758 3.906 4.048 4.221 4.426 4.63 4.869 5.11 5.344 5.596 5.866 6.145 6.413 6.743 7.117 7.507 7.882 8.231 8.518 8.697 8.622 8.287 7.75 7.236 6.765 6.319 5.933 5.605 5.252 4.943 4.643 4.341 4.066 3.807 3.584 3.363 3.138 2.941 2.759 2.563 2.384 2.171 1.95 1.784 1.6 1.433 1.282 1.12 1.003 0.887 0.699 0.541 0.381 0.311 0.158 -0.025 -0.213 -0.302 -0.482 -0.593 -0.705 -0.835 -1.106 -1.256 -1.437 -1.626 -1.843 -2.087 -2.479 -4.037 -3 ,19627 ,TETRA ,17556525,Fri Nov 26 07:12:40 CET,Fri Nov 26 09:22:58 CET,0.0 0.349 0.545 0.719 0.88 1.006 1.113 1.218 1.424 1.511 1.6 1.695 1.866 1.947 2.102 2.26 2.411 2.478 2.611 2.742 2.927 3.04 3.155 3.327 3.488 3.637 3.787 3.937 4.121 4.306 4.482 4.687 4.905 5.114 5.342 5.584 5.81 6.072 6.336 6.576 6.807 7.048 7.321 7.627 8.002 8.388 8.845 9.302 9.696 10.019 10.122 9.777 9.291 8.767 8.275 7.825 7.362 6.922 6.559 6.189 5.842 5.529 5.253 4.983 4.722 4.488 4.228 3.976 3.739 3.488 3.241 3.046 2.847 2.637 2.47 2.289 2.105 1.92 1.729 1.589 1.429 1.196 1.06 0.903 0.822 0.653 0.433 0.198 0.077 -0.153 -0.352 -0.494 -0.622 -0.878 -1.032 -1.234 -1.468 -1.695 -1.939 -2.315 -3.727 -4 ,20547 ,TETRA ,17556526,Fri Nov 26 07:13:41 CET,Fri Nov 26 09:23:28 CET,0.0 0.245 0.421 0.552 0.688 0.807 0.917 1.033 1.259 1.334 1.392 1.418 1.573 1.642 1.771 1.892 2.009 2.065 2.166 2.266 2.432 2.544 2.642 2.787 2.928 3.036 3.134 3.244 3.385 3.527 3.665 3.83 3.993 4.151 4.331 4.536 4.72 4.913 5.134 5.354 5.6 5.869 6.152 6.442 6.782 7.192 7.672 8.15 8.648 9.13 9.471 9.407 9.112 8.707 8.213 7.687 7.213 6.779 6.365 5.889 5.501 5.201 4.936 4.652 4.339 4.036 3.718 3.448 3.205 2.957 2.721 2.522 2.298 2.039 1.863 1.722 1.565 1.388 1.202 1.07 0.949 0.757 0.584 0.388 0.288 0.105 -0.052 -0.228 -0.333 -0.537 -0.684 -0.816 -0.945 -1.255 -1.464 -1.698 -1.942 -2.241 -2.691 -3.301 -5.305 -5 ,21546 ,TETRA ,17556527,Fri Nov 26 07:14:38 CET,Fri Nov 26 09:27:45 CET,0.0 0.312 0.464 0.599 0.711 0.799 0.881 0.968 1.135 1.207 1.278 1.338 1.488 1.551 1.701 1.842 1.963 2.028 2.154 2.265 2.415 2.509 2.603 2.743 2.886 3.016 3.146 3.265 3.402 3.546 3.673 3.821 3.97 4.118 4.288 4.473 4.661 4.879 5.112 5.353 5.597 5.844 6.121 6.405 6.739 7.129 7.59 8.026 8.378 8.719 8.998 8.927 8.6 8.233 7.862 7.461 7.028 6.634 6.313 5.974 5.687 5.429 5.187 4.957 4.723 4.491 4.236 4.026 3.852 3.658 3.447 3.268 3.076 2.864 2.703 2.553 2.399 2.226 2.029 1.887 1.744 1.533 1.386 1.236 1.16 1.01 0.855 0.678 0.594 0.425 0.316 0.212 0.109 -0.162 -0.311 -0.441 -0.592 -0.782 -1.018 -1.334 -2.768 -6 ,12849 ,TETRA ,17556528,Fri Nov 26 07:14:38 CET,Fri Nov 26 09:26:22 CET,0.0 0.303 0.486 0.676 0.839 0.967 1.092 1.208 1.4 1.498 1.586 1.642 1.807 1.874 1.995 2.115 2.225 2.274 2.384 2.498 2.667 2.77 2.861 3.0 3.144 3.283 3.402 3.515 3.678 3.829 3.978 4.169 4.351 4.521 4.712 4.932 5.149 5.382 5.606 5.833 6.076 6.361 6.719 7.078 7.475 7.901 8.333 8.72 9.155 9.642 10.068 10.087 9.736 9.31 8.932 8.515 8.09 7.658 7.285 6.948 6.657 6.362 6.05 5.795 5.551 5.291 5.039 4.827 4.637 4.448 4.248 4.071 3.881 3.688 3.532 3.36 3.182 2.996 2.806 2.669 2.518 2.285 2.126 1.947 1.86 1.684 1.492 1.302 1.197 0.98 0.81 0.67 0.518 0.191 0.019 -0.158 -0.352 -0.568 -0.842 -1.24 -2.61 -7 ,26292 ,TETRA ,17556529,Fri Nov 26 07:15:39 CET,Fri Nov 26 09:28:19 CET,0.0 0.231 0.376 0.504 0.631 0.753 0.855 0.936 1.097 1.181 1.259 1.298 1.445 1.502 1.631 1.761 1.892 1.953 2.055 2.15 2.306 2.418 2.521 2.665 2.806 2.933 3.06 3.186 3.342 3.491 3.641 3.827 4.025 4.204 4.38 4.589 4.794 5.0 5.205 5.434 5.697 5.986 6.318 6.658 7.004 7.343 7.752 8.22 8.691 9.028 9.066 8.729 8.265 7.771 7.278 6.78 6.339 5.981 5.643 5.224 4.837 4.504 4.222 3.98 3.749 3.526 3.3 3.1 2.913 2.71 2.503 2.312 2.117 1.934 1.787 1.624 1.454 1.285 1.109 0.977 0.823 0.587 0.428 0.259 0.172 0.014 -0.136 -0.313 -0.42 -0.62 -0.748 -0.877 -1.007 -1.275 -1.435 -1.61 -1.801 -2.003 -2.24 -2.61 -3.806 -8 ,15959 ,TETRA ,17556530,Fri Nov 26 07:15:39 CET,Fri Nov 26 09:20:24 CET,0.0 0.336 0.536 0.703 0.826 0.926 1.023 1.124 1.307 1.393 1.479 1.547 1.709 1.777 1.912 2.027 2.142 2.202 2.314 2.422 2.571 2.655 2.741 2.88 3.011 3.132 3.244 3.357 3.509 3.662 3.807 3.972 4.133 4.296 4.481 4.662 4.82 4.987 5.182 5.395 5.61 5.834 6.079 6.362 6.708 7.055 7.418 7.785 8.143 8.416 8.487 8.185 7.81 7.459 6.992 6.474 6.061 5.658 5.263 4.869 4.51 4.175 3.88 3.609 3.35 3.093 2.819 2.566 2.33 2.086 1.879 1.719 1.528 1.344 1.199 1.035 0.872 0.705 0.508 0.373 0.241 0.033 -0.107 -0.261 -0.341 -0.526 -0.735 -0.951 -1.068 -1.275 -1.421 -1.538 -1.674 -1.969 -2.135 -2.33 -2.538 -2.768 -3.038 -3.409 -4.634 -9 ,30309 ,TETRA ,17556531,Fri Nov 26 07:15:39 CET,Fri Nov 26 09:20:24 CET,0.0 0.734 0.911 1.031 1.15 1.284 1.408 1.501 1.657 1.729 1.799 1.857 2.027 2.107 2.24 2.359 2.48 2.541 2.651 2.749 2.893 2.985 3.074 3.207 3.329 3.444 3.56 3.678 3.835 3.99 4.157 4.365 4.548 4.72 4.911 5.138 5.338 5.536 5.762 6.012 6.286 6.589 6.922 7.233 7.592 7.954 8.323 8.728 9.165 9.577 9.864 9.775 9.439 8.971 8.416 7.888 7.45 7.047 6.684 6.312 5.982 5.7 5.435 5.172 4.934 4.728 4.489 4.244 4.045 3.846 3.637 3.447 3.222 3.003 2.849 2.697 2.551 2.383 2.172 2.029 1.894 1.674 1.524 1.369 1.286 1.115 0.947 0.773 0.664 0.449 0.323 0.216 0.099 -0.157 -0.3 -0.471 -0.672 -0.936 -1.258 -1.675 -3.199 -10 ,15321 ,TETRA ,17556532,Fri Nov 26 07:15:39 CET,Fri Nov 26 09:35:52 CET,0.0 0.309 0.509 0.672 0.815 0.948 1.066 1.149 1.316 1.395 1.469 1.522 1.684 1.754 1.905 2.057 2.207 2.278 2.406 2.525 2.676 2.778 2.887 3.047 3.192 3.322 3.45 3.581 3.745 3.887 4.026 4.193 4.347 4.494 4.662 4.857 5.055 5.289 5.539 5.79 6.066 6.349 6.667 6.978 7.341 7.694 8.046 8.424 8.795 9.096 9.158 8.789 8.183 7.566 6.947 6.404 5.999 5.636 5.293 4.87 4.464 4.112 3.777 3.449 3.153 2.892 2.618 2.349 2.098 1.851 1.593 1.374 1.169 0.974 0.837 0.697 0.55 0.398 0.221 0.088 -0.053 -0.263 -0.402 -0.547 -0.64 -0.838 -1.034 -1.252 -1.358 -1.545 -1.677 -1.801 -1.943 -2.277 -2.469 -2.687 -2.946 -3.198 -3.461 -3.822 -5.042 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_15_14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_15_14.txt deleted file mode 100644 index fc480bc6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_15_14.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8709 ,TETRA ,17556533,Fri Nov 26 07:15:41 CET,Fri Nov 26 09:11:31 CET,0.0 0.307 0.48 0.609 0.709 0.787 0.872 0.953 1.097 1.167 1.228 1.26 1.405 1.473 1.603 1.713 1.825 1.874 1.959 2.044 2.174 2.259 2.348 2.494 2.614 2.722 2.835 2.948 3.092 3.22 3.357 3.542 3.732 3.92 4.136 4.381 4.603 4.839 5.086 5.332 5.627 5.964 6.31 6.638 7.031 7.472 7.937 8.416 8.901 9.343 9.618 9.495 9.089 8.564 8.01 7.463 6.964 6.491 6.049 5.595 5.185 4.769 4.363 3.998 3.641 3.308 2.968 2.673 2.406 2.103 1.789 1.529 1.24 0.941 0.714 0.465 0.171 -0.133 -0.408 -0.589 -0.777 -1.089 -1.309 -1.53 -1.644 -1.876 -2.133 -2.434 -2.585 -2.824 -3.095 -3.28 -3.492 -3.943 -4.194 -4.485 -4.8 -5.19 -5.732 -6.408 -9.482 -2 ,26169 ,TETRA ,17556534,Fri Nov 26 07:16:38 CET,Fri Nov 26 09:05:22 CET,0.0 0.331 0.485 0.605 0.708 0.818 0.934 1.046 1.251 1.345 1.441 1.525 1.679 1.748 1.893 2.028 2.153 2.215 2.324 2.429 2.608 2.727 2.84 3.006 3.161 3.311 3.463 3.609 3.786 3.951 4.101 4.279 4.469 4.649 4.857 5.092 5.305 5.542 5.808 6.076 6.339 6.654 7.018 7.363 7.77 8.203 8.665 9.155 9.68 10.161 10.372 10.1 9.618 9.084 8.545 8.021 7.523 7.014 6.549 6.089 5.693 5.33 4.947 4.562 4.21 3.874 3.52 3.186 2.889 2.578 2.245 1.971 1.675 1.353 1.098 0.826 0.541 0.254 -0.058 -0.28 -0.498 -0.836 -1.077 -1.347 -1.488 -1.775 -2.083 -2.422 -2.598 -2.851 -3.134 -3.334 -3.564 -4.096 -4.395 -4.748 -5.136 -5.554 -6.165 -7.061 -15.707 -4 ,20596 ,TETRA ,17556536,Fri Nov 26 07:16:38 CET,Fri Nov 26 08:52:15 CET,0.0 0.663 0.878 1.022 1.18 1.313 1.413 1.515 1.705 1.797 1.886 1.951 2.099 2.167 2.304 2.446 2.572 2.627 2.738 2.852 3.02 3.119 3.216 3.364 3.498 3.622 3.739 3.861 4.03 4.191 4.351 4.538 4.72 4.896 5.084 5.293 5.495 5.709 5.929 6.169 6.42 6.695 7.027 7.369 7.763 8.198 8.662 9.151 9.67 10.107 10.277 10.044 9.614 9.119 8.577 7.98 7.463 7.004 6.549 6.074 5.676 5.304 4.934 4.577 4.215 3.881 3.534 3.223 2.968 2.674 2.349 2.096 1.826 1.54 1.312 1.056 0.794 0.533 0.258 0.067 -0.132 -0.463 -0.694 -0.922 -1.045 -1.293 -1.542 -1.837 -2.005 -2.247 -2.534 -2.721 -2.925 -3.427 -3.706 -4.037 -4.399 -4.849 -5.457 -6.334 -10.6 -5 ,20672 ,TETRA ,17556537,Fri Nov 26 07:17:39 CET,Fri Nov 26 09:09:02 CET,0.0 0.809 1.105 1.338 1.507 1.649 1.781 1.889 2.08 2.167 2.252 2.331 2.486 2.562 2.71 2.848 2.968 3.018 3.12 3.242 3.42 3.517 3.614 3.764 3.903 4.029 4.153 4.28 4.436 4.582 4.722 4.879 5.035 5.197 5.384 5.586 5.787 6.001 6.228 6.486 6.749 7.032 7.333 7.623 7.988 8.382 8.774 9.149 9.545 9.995 10.293 10.055 9.56 9.022 8.459 7.873 7.337 6.814 6.348 5.893 5.483 5.115 4.749 4.37 4.006 3.665 3.311 3.003 2.734 2.458 2.173 1.928 1.68 1.428 1.22 1.008 0.786 0.539 0.279 0.101 -0.087 -0.4 -0.623 -0.859 -0.983 -1.234 -1.48 -1.769 -1.932 -2.173 -2.435 -2.613 -2.818 -3.278 -3.522 -3.787 -4.112 -4.501 -4.988 -5.768 -9.769 -6 ,22662 ,TETRA ,17556538,Fri Nov 26 07:17:38 CET,Fri Nov 26 09:05:42 CET,0.0 0.535 0.729 0.924 1.094 1.239 1.366 1.489 1.721 1.829 1.931 2.026 2.196 2.277 2.422 2.569 2.716 2.783 2.908 3.032 3.205 3.316 3.418 3.56 3.712 3.859 3.999 4.133 4.302 4.471 4.637 4.84 5.038 5.233 5.451 5.692 5.938 6.195 6.462 6.743 7.009 7.301 7.654 8.008 8.408 8.851 9.324 9.784 10.217 10.588 10.745 10.443 9.923 9.383 8.849 8.281 7.73 7.244 6.825 6.364 5.919 5.514 5.127 4.749 4.393 4.084 3.754 3.447 3.183 2.891 2.572 2.309 2.04 1.769 1.562 1.329 1.072 0.795 0.499 0.3 0.093 -0.219 -0.434 -0.674 -0.807 -1.08 -1.352 -1.632 -1.785 -2.031 -2.327 -2.515 -2.711 -3.149 -3.428 -3.745 -4.062 -4.475 -5.022 -5.772 -11.62 -7 ,600 ,TETRA ,17556539,Fri Nov 26 07:17:39 CET,Fri Nov 26 09:04:39 CET,0.0 0.209 0.363 0.505 0.616 0.704 0.806 0.893 1.028 1.106 1.188 1.241 1.379 1.436 1.559 1.677 1.792 1.848 1.962 2.075 2.238 2.342 2.437 2.566 2.69 2.82 2.947 3.063 3.217 3.365 3.509 3.688 3.864 4.029 4.223 4.436 4.625 4.848 5.096 5.344 5.581 5.837 6.135 6.447 6.802 7.207 7.648 8.09 8.55 8.888 9.1 8.92 8.412 7.865 7.315 6.725 6.158 5.65 5.201 4.716 4.287 3.908 3.539 3.176 2.821 2.485 2.136 1.808 1.524 1.247 0.96 0.7 0.403 0.102 -0.124 -0.364 -0.612 -0.881 -1.167 -1.359 -1.555 -1.887 -2.116 -2.33 -2.452 -2.72 -2.998 -3.3 -3.457 -3.686 -3.946 -4.145 -4.376 -4.906 -5.194 -5.546 -5.962 -6.377 -6.884 -7.69 -11.139 -8 ,19633 ,TETRA ,17556540,Fri Nov 26 07:18:39 CET,Fri Nov 26 09:10:04 CET,0.0 0.408 0.577 0.731 0.883 1.029 1.154 1.272 1.489 1.597 1.704 1.793 1.955 2.028 2.17 2.315 2.449 2.516 2.652 2.779 2.955 3.065 3.161 3.315 3.472 3.609 3.75 3.896 4.082 4.255 4.412 4.613 4.8 4.97 5.174 5.391 5.583 5.794 6.035 6.284 6.555 6.875 7.237 7.58 7.957 8.385 8.903 9.444 9.944 10.427 10.736 10.579 10.084 9.494 8.959 8.44 7.928 7.403 6.921 6.443 6.026 5.632 5.255 4.9 4.554 4.243 3.936 3.67 3.42 3.143 2.862 2.628 2.365 2.057 1.811 1.571 1.326 1.062 0.78 0.577 0.366 0.064 -0.164 -0.425 -0.564 -0.858 -1.158 -1.483 -1.653 -1.899 -2.231 -2.455 -2.675 -3.194 -3.502 -3.825 -4.167 -4.572 -5.119 -5.962 -12.239 -10 ,9385 ,TETRA ,17556542,Fri Nov 26 07:18:39 CET,Fri Nov 26 08:55:24 CET,0.0 0.299 0.483 0.622 0.726 0.814 0.901 0.983 1.122 1.202 1.297 1.379 1.532 1.601 1.739 1.888 2.039 2.102 2.206 2.304 2.451 2.547 2.64 2.783 2.936 3.084 3.216 3.335 3.486 3.632 3.768 3.942 4.119 4.285 4.472 4.67 4.861 5.082 5.318 5.578 5.842 6.109 6.443 6.789 7.163 7.573 8.01 8.433 8.868 9.289 9.456 9.185 8.73 8.171 7.593 6.996 6.443 5.931 5.452 4.97 4.56 4.187 3.825 3.479 3.15 2.831 2.481 2.147 1.863 1.597 1.287 1.005 0.714 0.421 0.182 -0.073 -0.314 -0.556 -0.831 -1.039 -1.241 -1.553 -1.783 -2.042 -2.168 -2.416 -2.69 -2.991 -3.148 -3.377 -3.65 -3.854 -4.07 -4.55 -4.791 -5.062 -5.458 -5.891 -6.363 -7.102 -11.365 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_15_16.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_15_16.txt deleted file mode 100644 index 4a1dc0cd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_15_16.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17805 ,TETRA ,17556543,Fri Nov 26 07:18:39 CET,Fri Nov 26 09:11:13 CET,0.0 0.52 0.641 0.735 0.831 0.923 1.005 1.087 1.233 1.293 1.347 1.37 1.505 1.558 1.668 1.765 1.863 1.913 2.005 2.077 2.175 2.245 2.315 2.407 2.498 2.592 2.693 2.789 2.904 3.017 3.117 3.229 3.333 3.449 3.601 3.754 3.895 4.069 4.267 4.472 4.662 4.868 5.092 5.29 5.571 5.873 6.125 6.339 6.494 6.534 6.348 5.782 5.096 4.393 3.71 3.058 2.46 1.921 1.434 0.923 0.501 0.127 -0.238 -0.598 -0.936 -1.253 -1.597 -1.884 -2.135 -2.415 -2.691 -2.924 -3.189 -3.477 -3.707 -3.951 -4.203 -4.447 -4.695 -4.873 -5.065 -5.375 -5.591 -5.805 -5.914 -6.161 -6.42 -6.692 -6.84 -7.073 -7.309 -7.482 -7.668 -8.092 -8.323 -8.551 -8.816 -9.158 -9.601 -10.211 -11.899 -2 ,926 ,TETRA ,17556544,Fri Nov 26 07:18:38 CET,Fri Nov 26 09:04:42 CET,0.0 0.487 0.646 0.747 0.831 0.905 0.971 1.041 1.178 1.237 1.295 1.314 1.447 1.5 1.612 1.725 1.835 1.888 1.996 2.1 2.255 2.352 2.437 2.545 2.649 2.76 2.866 2.966 3.099 3.229 3.354 3.501 3.641 3.77 3.91 4.069 4.225 4.401 4.593 4.785 4.979 5.195 5.427 5.639 5.838 6.054 6.319 6.575 6.766 6.885 6.806 6.225 5.432 4.636 3.944 3.285 2.673 2.108 1.622 1.131 0.707 0.33 -0.043 -0.413 -0.761 -1.08 -1.434 -1.761 -2.041 -2.322 -2.6 -2.834 -3.088 -3.36 -3.57 -3.783 -4.006 -4.237 -4.475 -4.642 -4.815 -5.086 -5.278 -5.47 -5.567 -5.768 -5.978 -6.199 -6.314 -6.517 -6.7 -6.839 -6.984 -7.312 -7.496 -7.695 -7.936 -8.223 -8.571 -9.047 -10.558 -3 ,12630 ,TETRA ,17556545,Fri Nov 26 07:19:42 CET,Fri Nov 26 09:08:13 CET,0.0 0.409 0.569 0.684 0.783 0.888 0.973 1.034 1.131 1.179 1.236 1.275 1.423 1.478 1.582 1.68 1.768 1.807 1.879 1.949 2.056 2.129 2.198 2.307 2.42 2.513 2.594 2.68 2.79 2.904 3.022 3.153 3.268 3.383 3.519 3.681 3.834 3.998 4.173 4.348 4.528 4.736 4.969 5.187 5.424 5.682 5.971 6.216 6.396 6.505 6.299 5.608 4.9 4.2 3.533 2.906 2.31 1.754 1.233 0.711 0.27 -0.133 -0.515 -0.891 -1.238 -1.568 -1.919 -2.216 -2.476 -2.753 -3.038 -3.284 -3.547 -3.816 -4.014 -4.214 -4.423 -4.635 -4.854 -5.008 -5.169 -5.426 -5.607 -5.793 -5.893 -6.102 -6.306 -6.521 -6.64 -6.856 -7.058 -7.2 -7.344 -7.693 -7.886 -8.069 -8.281 -8.54 -8.849 -9.25 -10.786 -4 ,11483 ,TETRA ,17556546,Fri Nov 26 07:19:42 CET,Fri Nov 26 09:08:18 CET,0.0 0.308 0.493 0.596 0.691 0.776 0.845 0.913 1.046 1.106 1.151 1.156 1.306 1.367 1.459 1.538 1.624 1.669 1.76 1.844 1.95 2.019 2.088 2.194 2.292 2.388 2.483 2.576 2.689 2.799 2.92 3.058 3.19 3.322 3.472 3.643 3.813 4.006 4.187 4.351 4.524 4.72 4.956 5.204 5.486 5.774 6.043 6.276 6.462 6.547 6.272 5.643 4.971 4.248 3.579 2.94 2.352 1.814 1.351 0.86 0.418 0.014 -0.373 -0.716 -1.036 -1.345 -1.705 -2.053 -2.34 -2.642 -2.975 -3.261 -3.548 -3.839 -4.074 -4.319 -4.57 -4.823 -5.093 -5.281 -5.483 -5.824 -6.055 -6.294 -6.417 -6.667 -6.945 -7.243 -7.406 -7.654 -7.942 -8.146 -8.343 -8.773 -9.041 -9.357 -9.718 -10.134 -10.64 -11.32 -13.353 -5 ,15967 ,TETRA ,17556547,Fri Nov 26 07:19:42 CET,Fri Nov 26 09:08:11 CET,0.0 0.382 0.509 0.622 0.716 0.79 0.864 0.942 1.06 1.115 1.17 1.2 1.341 1.392 1.487 1.575 1.672 1.719 1.809 1.896 2.022 2.097 2.163 2.271 2.37 2.465 2.555 2.644 2.767 2.883 2.992 3.109 3.218 3.324 3.453 3.595 3.729 3.888 4.066 4.265 4.46 4.658 4.867 5.062 5.283 5.533 5.798 6.023 6.219 6.314 6.129 5.515 4.809 4.137 3.444 2.796 2.213 1.632 1.127 0.616 0.181 -0.218 -0.612 -1.0 -1.382 -1.71 -2.03 -2.307 -2.541 -2.794 -3.083 -3.336 -3.595 -3.858 -4.067 -4.283 -4.492 -4.704 -4.935 -5.088 -5.245 -5.503 -5.68 -5.867 -5.969 -6.178 -6.392 -6.625 -6.751 -6.952 -7.131 -7.284 -7.438 -7.804 -8.008 -8.21 -8.446 -8.714 -9.014 -9.451 -11.412 -6 ,662 ,TETRA ,17556548,Fri Nov 26 07:20:39 CET,Fri Nov 26 09:09:56 CET,0.0 0.266 0.418 0.552 0.673 0.768 0.84 0.904 1.032 1.093 1.149 1.172 1.312 1.366 1.47 1.566 1.653 1.697 1.782 1.859 1.978 2.053 2.12 2.219 2.313 2.403 2.493 2.575 2.679 2.785 2.89 3.024 3.16 3.279 3.397 3.529 3.655 3.798 3.954 4.12 4.287 4.462 4.666 4.865 5.09 5.333 5.569 5.725 5.83 5.848 5.526 4.873 4.232 3.601 2.953 2.296 1.694 1.156 0.691 0.2 -0.241 -0.63 -1.016 -1.39 -1.733 -2.045 -2.374 -2.666 -2.916 -3.185 -3.469 -3.713 -3.98 -4.255 -4.463 -4.679 -4.908 -5.155 -5.414 -5.579 -5.744 -6.04 -6.261 -6.471 -6.574 -6.794 -7.048 -7.329 -7.47 -7.697 -7.92 -8.083 -8.266 -8.712 -8.965 -9.229 -9.509 -9.808 -10.122 -10.543 -12.106 -7 ,21768 ,TETRA ,17556549,Fri Nov 26 07:20:39 CET,Fri Nov 26 09:11:19 CET,0.0 0.435 0.576 0.702 0.792 0.875 0.967 1.046 1.187 1.247 1.31 1.352 1.489 1.536 1.632 1.731 1.824 1.866 1.947 2.022 2.134 2.205 2.27 2.375 2.479 2.576 2.671 2.759 2.861 2.955 3.056 3.186 3.314 3.435 3.579 3.739 3.89 4.046 4.199 4.364 4.542 4.722 4.927 5.143 5.385 5.611 5.833 6.061 6.243 6.302 6.063 5.441 4.733 4.047 3.411 2.797 2.249 1.742 1.294 0.821 0.392 0.005 -0.374 -0.75 -1.092 -1.39 -1.717 -2.005 -2.251 -2.524 -2.824 -3.087 -3.353 -3.614 -3.819 -4.047 -4.285 -4.534 -4.792 -4.966 -5.142 -5.408 -5.61 -5.828 -5.94 -6.171 -6.401 -6.638 -6.781 -7.012 -7.231 -7.402 -7.594 -8.015 -8.23 -8.45 -8.673 -8.93 -9.245 -9.692 -11.496 -8 ,1629 ,TETRA ,17556550,Fri Nov 26 07:20:39 CET,Fri Nov 26 09:08:57 CET,0.0 0.43 0.578 0.701 0.807 0.892 0.959 1.039 1.196 1.251 1.296 1.308 1.443 1.509 1.638 1.753 1.861 1.91 2.016 2.124 2.268 2.352 2.426 2.532 2.639 2.749 2.856 2.959 3.094 3.222 3.347 3.494 3.632 3.763 3.921 4.101 4.263 4.44 4.636 4.842 5.048 5.248 5.478 5.723 5.968 6.219 6.469 6.662 6.806 6.878 6.663 5.921 5.09 4.309 3.573 2.902 2.311 1.778 1.305 0.791 0.346 -0.04 -0.417 -0.785 -1.125 -1.445 -1.79 -2.084 -2.332 -2.591 -2.876 -3.124 -3.376 -3.617 -3.811 -4.025 -4.25 -4.488 -4.733 -4.905 -5.087 -5.378 -5.58 -5.791 -5.909 -6.16 -6.412 -6.693 -6.841 -7.059 -7.293 -7.464 -7.631 -8.02 -8.253 -8.498 -8.768 -9.085 -9.493 -10.092 -12.136 -9 ,3738 ,TETRA ,17556551,Fri Nov 26 07:21:39 CET,Fri Nov 26 09:13:41 CET,0.0 0.167 0.284 0.37 0.442 0.521 0.598 0.659 0.779 0.842 0.904 0.938 1.073 1.123 1.222 1.31 1.391 1.433 1.515 1.593 1.692 1.752 1.825 1.928 2.023 2.124 2.217 2.304 2.42 2.539 2.659 2.796 2.927 3.053 3.203 3.369 3.521 3.689 3.87 4.058 4.232 4.418 4.636 4.854 5.096 5.341 5.625 5.891 6.098 6.196 5.963 5.301 4.596 3.881 3.206 2.553 1.931 1.371 0.884 0.367 -0.074 -0.445 -0.813 -1.163 -1.486 -1.783 -2.105 -2.396 -2.648 -2.918 -3.217 -3.471 -3.728 -3.99 -4.193 -4.406 -4.639 -4.877 -5.114 -5.286 -5.467 -5.758 -5.965 -6.175 -6.279 -6.493 -6.724 -6.978 -7.116 -7.341 -7.555 -7.723 -7.901 -8.296 -8.506 -8.701 -8.901 -9.18 -9.551 -9.972 -11.32 -10 ,11529 ,TETRA ,17556552,Fri Nov 26 07:21:40 CET,Fri Nov 26 09:10:02 CET,0.0 0.413 0.584 0.72 0.835 0.93 1.003 1.079 1.233 1.296 1.349 1.364 1.501 1.553 1.654 1.751 1.843 1.884 1.954 2.031 2.143 2.214 2.284 2.385 2.481 2.569 2.66 2.759 2.887 3.002 3.123 3.279 3.418 3.554 3.706 3.867 4.032 4.192 4.363 4.551 4.738 4.953 5.186 5.421 5.68 5.928 6.209 6.465 6.635 6.685 6.396 5.699 4.982 4.298 3.673 3.042 2.415 1.846 1.378 0.905 0.466 0.083 -0.291 -0.679 -1.049 -1.369 -1.699 -2.012 -2.291 -2.586 -2.888 -3.123 -3.371 -3.629 -3.828 -4.042 -4.279 -4.543 -4.837 -5.042 -5.247 -5.584 -5.823 -6.069 -6.197 -6.462 -6.733 -6.995 -7.128 -7.353 -7.596 -7.769 -7.945 -8.342 -8.574 -8.833 -9.098 -9.374 -9.701 -10.141 -11.654 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_16_14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_16_14.txt deleted file mode 100644 index 6f3051d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_16_14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8593 ,TETRA ,17556553,Fri Nov 26 07:21:40 CET,Fri Nov 26 09:07:52 CET,0.0 0.239 0.389 0.521 0.621 0.721 0.822 0.907 1.066 1.14 1.215 1.26 1.395 1.446 1.547 1.657 1.768 1.824 1.939 2.048 2.198 2.294 2.385 2.514 2.648 2.77 2.881 2.991 3.134 3.275 3.417 3.587 3.738 3.876 4.06 4.266 4.455 4.669 4.901 5.133 5.383 5.678 5.999 6.297 6.653 7.064 7.538 8.05 8.586 9.172 9.743 9.982 9.952 9.833 9.633 9.433 9.248 9.05 8.854 8.656 8.485 8.32 8.154 7.995 7.841 7.697 7.531 7.372 7.243 7.102 6.942 6.808 6.668 6.522 6.417 6.298 6.154 6.019 5.876 5.768 5.661 5.502 5.387 5.262 5.194 5.036 4.852 4.674 4.575 4.403 4.288 4.177 4.07 3.833 3.678 3.508 3.334 3.121 2.817 2.445 0.56 -2 ,2071 ,TETRA ,17556554,Fri Nov 26 07:21:42 CET,Fri Nov 26 09:08:46 CET,0.0 0.57 0.83 1.023 1.162 1.293 1.416 1.522 1.745 1.846 1.931 2.015 2.169 2.238 2.371 2.496 2.619 2.676 2.795 2.917 3.084 3.183 3.272 3.395 3.517 3.642 3.774 3.901 4.057 4.202 4.341 4.51 4.663 4.817 5.009 5.212 5.407 5.641 5.892 6.141 6.398 6.684 7.018 7.357 7.737 8.108 8.539 9.035 9.592 10.185 10.714 10.932 10.896 10.762 10.58 10.391 10.21 10.02 9.82 9.59 9.379 9.196 9.027 8.866 8.698 8.525 8.35 8.195 8.06 7.912 7.759 7.637 7.497 7.344 7.229 7.108 6.974 6.822 6.67 6.574 6.478 6.313 6.183 6.054 5.989 5.85 5.715 5.568 5.492 5.346 5.237 5.12 5.005 4.765 4.64 4.509 4.358 4.171 3.908 3.512 1.62 -3 ,3561 ,TETRA ,17556555,Fri Nov 26 07:21:39 CET,Fri Nov 26 09:08:50 CET,0.0 0.432 0.659 0.837 1.013 1.173 1.298 1.401 1.601 1.694 1.78 1.878 2.041 2.114 2.239 2.357 2.48 2.542 2.668 2.795 2.964 3.059 3.149 3.295 3.428 3.546 3.676 3.801 3.951 4.099 4.241 4.405 4.562 4.71 4.863 5.037 5.226 5.443 5.675 5.906 6.141 6.411 6.728 7.047 7.417 7.819 8.282 8.774 9.295 9.857 10.357 10.612 10.599 10.457 10.268 10.058 9.844 9.623 9.442 9.258 9.088 8.932 8.762 8.59 8.428 8.264 8.086 7.94 7.806 7.667 7.522 7.381 7.235 7.09 6.984 6.865 6.737 6.618 6.496 6.398 6.291 6.142 6.033 5.908 5.845 5.734 5.609 5.468 5.385 5.217 5.102 4.997 4.888 4.632 4.478 4.318 4.147 3.94 3.667 3.288 1.051 -4 ,15732 ,TETRA ,17556556,Fri Nov 26 07:21:40 CET,Fri Nov 26 09:07:56 CET,0.0 0.355 0.505 0.628 0.74 0.847 0.946 1.019 1.157 1.227 1.292 1.328 1.467 1.524 1.637 1.739 1.834 1.884 1.989 2.086 2.232 2.34 2.438 2.556 2.684 2.825 2.952 3.068 3.217 3.372 3.521 3.68 3.823 3.965 4.132 4.333 4.526 4.725 4.964 5.238 5.523 5.84 6.195 6.533 6.909 7.334 7.775 8.246 8.762 9.307 9.856 10.063 10.011 9.821 9.567 9.337 9.129 8.933 8.725 8.495 8.319 8.162 7.983 7.785 7.595 7.432 7.256 7.088 6.958 6.828 6.678 6.547 6.421 6.291 6.182 6.068 5.95 5.835 5.709 5.611 5.514 5.367 5.248 5.122 5.069 4.956 4.822 4.661 4.575 4.417 4.319 4.226 4.115 3.863 3.729 3.588 3.436 3.237 2.998 2.628 1.149 -5 ,13169 ,TETRA ,17556557,Fri Nov 26 07:21:39 CET,Fri Nov 26 09:09:01 CET,0.0 0.566 0.759 0.888 1.01 1.126 1.233 1.333 1.502 1.579 1.658 1.75 1.918 1.994 2.132 2.262 2.39 2.453 2.57 2.682 2.841 2.935 3.027 3.161 3.296 3.429 3.554 3.671 3.819 3.964 4.11 4.281 4.446 4.598 4.764 4.973 5.172 5.372 5.585 5.804 6.034 6.285 6.581 6.904 7.266 7.647 8.059 8.49 8.937 9.395 9.896 10.132 10.107 9.961 9.731 9.452 9.208 8.992 8.788 8.549 8.336 8.154 7.969 7.801 7.641 7.478 7.314 7.179 7.04 6.885 6.735 6.597 6.439 6.28 6.176 6.073 5.956 5.84 5.714 5.608 5.501 5.349 5.243 5.128 5.068 4.937 4.778 4.615 4.537 4.379 4.247 4.131 4.032 3.824 3.678 3.5 3.311 3.093 2.747 2.266 0.058 -6 ,26917 ,TETRA ,17556558,Fri Nov 26 07:22:38 CET,Fri Nov 26 09:13:03 CET,0.0 0.436 0.614 0.747 0.888 1.018 1.157 1.293 1.515 1.623 1.725 1.817 1.976 2.049 2.186 2.314 2.433 2.495 2.618 2.739 2.904 3.015 3.123 3.273 3.412 3.529 3.649 3.771 3.924 4.077 4.224 4.393 4.547 4.698 4.873 5.067 5.265 5.487 5.723 5.97 6.207 6.459 6.75 7.056 7.425 7.8 8.218 8.629 9.044 9.537 10.01 10.176 10.035 9.839 9.617 9.364 9.135 8.899 8.697 8.501 8.304 8.13 7.976 7.795 7.598 7.43 7.262 7.095 6.942 6.786 6.638 6.52 6.386 6.247 6.143 6.032 5.91 5.788 5.646 5.538 5.434 5.272 5.155 5.037 4.981 4.871 4.728 4.573 4.497 4.343 4.252 4.163 4.063 3.82 3.689 3.539 3.36 3.162 2.902 2.471 0.52 -7 ,18848 ,TETRA ,17556559,Fri Nov 26 07:22:38 CET,Fri Nov 26 09:10:23 CET,0.0 0.588 0.754 0.931 1.077 1.181 1.273 1.35 1.491 1.552 1.61 1.66 1.808 1.864 1.962 2.056 2.151 2.198 2.296 2.404 2.574 2.679 2.776 2.91 3.039 3.163 3.281 3.391 3.533 3.674 3.824 4.001 4.159 4.315 4.485 4.663 4.842 5.078 5.313 5.537 5.785 6.068 6.397 6.712 7.078 7.451 7.816 8.24 8.714 9.23 9.776 9.991 9.956 9.82 9.647 9.442 9.237 9.034 8.848 8.641 8.447 8.265 8.094 7.95 7.804 7.655 7.49 7.339 7.211 7.075 6.924 6.794 6.654 6.507 6.395 6.269 6.131 5.998 5.861 5.757 5.644 5.464 5.336 5.198 5.126 4.974 4.811 4.64 4.549 4.385 4.264 4.161 4.062 3.822 3.67 3.482 3.308 3.109 2.827 2.48 1.029 -8 ,9896 ,TETRA ,17556560,Fri Nov 26 07:22:37 CET,Fri Nov 26 09:09:44 CET,0.0 0.525 0.71 0.846 0.973 1.088 1.172 1.254 1.411 1.48 1.558 1.613 1.75 1.81 1.932 2.043 2.148 2.198 2.303 2.417 2.591 2.695 2.789 2.932 3.069 3.181 3.288 3.403 3.544 3.684 3.827 3.997 4.151 4.309 4.503 4.709 4.906 5.125 5.347 5.578 5.834 6.136 6.463 6.752 7.068 7.445 7.919 8.434 8.955 9.421 9.826 9.96 9.876 9.67 9.459 9.234 9.017 8.795 8.57 8.354 8.155 7.965 7.78 7.6 7.431 7.274 7.117 6.983 6.84 6.701 6.57 6.443 6.307 6.167 6.053 5.939 5.822 5.691 5.566 5.478 5.372 5.21 5.086 4.946 4.881 4.743 4.601 4.463 4.386 4.231 4.138 4.043 3.934 3.672 3.539 3.392 3.204 2.986 2.728 2.363 1.156 -9 ,12631 ,TETRA ,17556561,Fri Nov 26 07:23:37 CET,Fri Nov 26 09:05:37 CET,0.0 0.369 0.508 0.636 0.749 0.873 0.994 1.088 1.25 1.33 1.407 1.479 1.641 1.715 1.853 1.965 2.068 2.126 2.246 2.35 2.493 2.591 2.687 2.822 2.936 3.045 3.16 3.273 3.42 3.559 3.699 3.873 4.03 4.174 4.342 4.54 4.743 4.962 5.197 5.451 5.704 5.97 6.278 6.616 7.017 7.435 7.892 8.405 8.945 9.528 10.109 10.331 10.307 10.177 10.004 9.822 9.627 9.429 9.217 8.996 8.828 8.657 8.484 8.331 8.16 7.984 7.811 7.678 7.556 7.405 7.237 7.1 6.959 6.807 6.693 6.575 6.44 6.292 6.149 6.042 5.914 5.716 5.582 5.452 5.382 5.216 5.044 4.882 4.802 4.649 4.528 4.42 4.309 4.027 3.873 3.713 3.546 3.36 3.1 2.761 1.18 -10 ,2021 ,TETRA ,17556562,Fri Nov 26 07:23:36 CET,Fri Nov 26 09:11:17 CET,0.0 0.375 0.537 0.67 0.786 0.886 0.992 1.088 1.244 1.317 1.386 1.422 1.57 1.637 1.766 1.893 2.011 2.065 2.184 2.301 2.477 2.595 2.701 2.842 2.988 3.138 3.27 3.396 3.557 3.706 3.86 4.053 4.243 4.418 4.611 4.828 5.033 5.262 5.509 5.772 6.047 6.348 6.705 7.064 7.471 7.914 8.396 8.909 9.482 10.049 10.546 10.76 10.743 10.622 10.439 10.231 10.035 9.824 9.621 9.417 9.224 9.05 8.891 8.721 8.555 8.405 8.223 8.039 7.897 7.759 7.613 7.478 7.33 7.193 7.083 6.972 6.856 6.731 6.6 6.507 6.418 6.26 6.145 6.035 5.976 5.84 5.709 5.569 5.49 5.334 5.231 5.132 5.031 4.811 4.681 4.545 4.393 4.207 3.948 3.558 1.201 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_17_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_17_15.txt deleted file mode 100644 index a07a5e06..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_17_15.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20685 ,TETRA ,17556563,Fri Nov 26 07:23:36 CET,Fri Nov 26 09:12:57 CET,0.0 1.799 2.367 2.823 3.198 3.515 3.799 4.043 4.498 4.709 4.9 5.163 5.433 5.604 5.909 6.195 6.495 6.627 6.846 7.048 7.347 7.543 7.73 7.997 8.251 8.491 8.735 8.98 9.292 9.586 9.875 10.252 10.608 10.945 11.345 11.78 12.195 12.639 13.069 13.518 14.017 14.586 15.23 15.868 16.643 17.504 18.461 19.543 20.8 22.252 23.94 25.28 25.96 26.339 26.555 26.659 26.711 26.731 26.698 26.636 26.565 26.495 26.416 26.342 26.276 26.197 26.104 26.013 25.93 25.826 25.714 25.635 25.556 25.474 25.417 25.36 25.295 25.223 25.143 25.09 25.033 24.936 24.868 24.794 24.758 24.686 24.609 24.518 24.466 24.33 24.301 24.244 24.184 24.042 23.963 23.879 23.786 23.693 23.583 23.381 22.821 -2 ,24242 ,TETRA ,17556564,Fri Nov 26 07:23:38 CET,Fri Nov 26 09:16:01 CET,0.0 1.98 2.586 3.055 3.461 3.802 4.087 4.351 4.83 5.049 5.254 5.53 5.802 5.963 6.274 6.572 6.853 6.991 7.267 7.529 7.883 8.114 8.346 8.67 8.972 9.269 9.552 9.825 10.174 10.5 10.82 11.22 11.598 11.948 12.349 12.808 13.234 13.677 14.147 14.637 15.142 15.695 16.357 17.035 17.807 18.657 19.648 20.764 22.046 23.54 25.219 26.525 27.258 27.639 27.84 27.983 28.039 28.033 28.021 27.98 27.924 27.884 27.808 27.71 27.621 27.536 27.463 27.391 27.317 27.235 27.139 27.056 26.965 26.861 26.782 26.699 26.615 26.526 26.422 26.349 26.275 26.151 26.067 25.977 25.93 25.841 25.75 25.64 25.58 25.435 25.377 25.307 25.245 25.102 25.017 24.929 24.835 24.708 24.565 24.343 23.7 -3 ,2699 ,TETRA ,17556565,Fri Nov 26 07:23:38 CET,Fri Nov 26 09:12:56 CET,0.0 1.143 1.584 1.919 2.205 2.456 2.686 2.88 3.238 3.411 3.577 3.804 4.061 4.211 4.501 4.764 5.008 5.13 5.368 5.597 5.943 6.176 6.405 6.72 7.012 7.296 7.576 7.849 8.188 8.517 8.83 9.181 9.51 9.812 10.164 10.561 10.935 11.354 11.829 12.333 12.828 13.375 14.034 14.706 15.47 16.316 17.308 18.422 19.705 21.223 22.953 24.286 24.966 25.278 25.489 25.63 25.684 25.697 25.676 25.645 25.608 25.55 25.472 25.38 25.302 25.238 25.145 25.045 24.964 24.881 24.786 24.712 24.632 24.537 24.461 24.382 24.303 24.213 24.12 24.061 23.996 23.89 23.81 23.732 23.696 23.608 23.517 23.425 23.383 23.252 23.212 23.147 23.078 22.947 22.883 22.809 22.731 22.612 22.437 22.217 21.521 -4 ,30560 ,TETRA ,17556566,Fri Nov 26 07:24:38 CET,Fri Nov 26 09:15:02 CET,0.0 1.517 2.104 2.545 2.881 3.18 3.463 3.723 4.159 4.351 4.53 4.771 5.034 5.19 5.487 5.77 6.041 6.173 6.435 6.691 7.049 7.267 7.48 7.801 8.095 8.354 8.59 8.811 9.114 9.408 9.691 10.032 10.343 10.651 11.009 11.418 11.837 12.305 12.774 13.242 13.764 14.347 14.994 15.644 16.396 17.223 18.162 19.217 20.468 21.919 23.658 25.018 25.671 26.057 26.317 26.44 26.459 26.416 26.345 26.265 26.191 26.121 26.033 25.938 25.851 25.766 25.659 25.569 25.498 25.423 25.338 25.258 25.176 25.087 25.012 24.935 24.851 24.755 24.656 24.584 24.496 24.367 24.268 24.165 24.122 24.016 23.904 23.786 23.721 23.577 23.524 23.444 23.36 23.2 23.118 23.037 22.935 22.799 22.65 22.455 21.913 -5 ,11615 ,TETRA ,17556567,Fri Nov 26 07:24:40 CET,Fri Nov 26 09:15:02 CET,0.0 1.255 1.635 1.934 2.179 2.385 2.582 2.769 3.085 3.228 3.376 3.547 3.769 3.891 4.123 4.333 4.541 4.647 4.838 5.021 5.297 5.47 5.636 5.871 6.106 6.335 6.542 6.742 7.027 7.309 7.58 7.93 8.26 8.566 8.922 9.315 9.692 10.112 10.555 11.016 11.502 12.05 12.699 13.354 14.116 14.983 15.976 17.041 18.281 19.75 21.514 22.867 23.587 24.026 24.231 24.301 24.313 24.325 24.329 24.291 24.237 24.179 24.092 24.0 23.921 23.834 23.738 23.649 23.571 23.483 23.383 23.306 23.223 23.131 23.06 22.99 22.912 22.83 22.745 22.68 22.61 22.485 22.401 22.327 22.291 22.221 22.151 22.075 22.036 21.903 21.863 21.791 21.723 21.604 21.519 21.416 21.305 21.165 21.021 20.838 20.141 -6 ,29540 ,TETRA ,17556568,Fri Nov 26 07:24:37 CET,Fri Nov 26 09:14:12 CET,0.0 0.943 1.356 1.685 1.93 2.143 2.347 2.534 2.86 3.005 3.148 3.329 3.559 3.679 3.907 4.122 4.331 4.43 4.604 4.779 5.058 5.25 5.435 5.708 5.971 6.221 6.465 6.693 6.976 7.248 7.521 7.858 8.175 8.48 8.833 9.222 9.585 10.005 10.468 10.95 11.454 12.03 12.709 13.374 14.145 15.004 15.979 17.079 18.357 19.834 21.553 22.865 23.544 23.934 24.18 24.322 24.369 24.358 24.303 24.224 24.161 24.088 23.997 23.919 23.86 23.797 23.709 23.624 23.543 23.457 23.373 23.309 23.244 23.155 23.07 22.99 22.913 22.822 22.718 22.649 22.567 22.443 22.365 22.272 22.225 22.124 22.011 21.895 21.831 21.669 21.585 21.51 21.436 21.297 21.218 21.125 21.028 20.908 20.772 20.606 19.917 -7 ,11697 ,TETRA ,17556569,Fri Nov 26 07:24:39 CET,Fri Nov 26 09:15:25 CET,0.0 1.745 2.344 2.755 3.056 3.299 3.52 3.723 4.101 4.289 4.474 4.704 4.947 5.096 5.364 5.6 5.831 5.947 6.179 6.391 6.677 6.868 7.062 7.341 7.606 7.854 8.097 8.342 8.644 8.919 9.184 9.511 9.833 10.139 10.492 10.9 11.291 11.692 12.138 12.615 13.106 13.685 14.337 14.989 15.767 16.633 17.647 18.79 20.078 21.541 23.31 24.697 25.428 25.843 26.024 26.106 26.139 26.113 26.076 26.047 25.992 25.885 25.795 25.722 25.639 25.57 25.488 25.402 25.322 25.235 25.147 25.072 24.983 24.882 24.805 24.724 24.636 24.549 24.453 24.384 24.313 24.195 24.114 24.025 23.977 23.878 23.785 23.683 23.621 23.477 23.411 23.324 23.245 23.106 23.032 22.954 22.86 22.73 22.542 22.315 21.761 -8 ,29439 ,TETRA ,17556570,Fri Nov 26 07:25:38 CET,Fri Nov 26 09:16:43 CET,0.0 1.977 2.482 2.851 3.119 3.346 3.573 3.771 4.12 4.289 4.454 4.655 4.889 5.022 5.283 5.534 5.76 5.87 6.096 6.317 6.635 6.827 7.012 7.282 7.531 7.77 8.003 8.233 8.537 8.829 9.108 9.442 9.755 10.053 10.403 10.802 11.188 11.601 12.044 12.543 13.079 13.655 14.299 14.943 15.725 16.577 17.536 18.644 19.949 21.452 23.191 24.531 25.223 25.599 25.852 26.003 26.039 26.029 25.995 25.939 25.892 25.833 25.743 25.652 25.576 25.494 25.404 25.317 25.232 25.136 25.045 24.971 24.886 24.79 24.724 24.669 24.604 24.533 24.457 24.396 24.337 24.258 24.194 24.123 24.086 24.01 23.937 23.84 23.784 23.649 23.62 23.558 23.483 23.334 23.261 23.16 23.054 22.948 22.825 22.693 22.183 -9 ,7256 ,TETRA ,17556571,Fri Nov 26 07:26:37 CET,Fri Nov 26 09:18:11 CET,0.0 1.094 1.612 1.99 2.291 2.527 2.753 2.981 3.393 3.583 3.767 4.019 4.292 4.465 4.784 5.079 5.353 5.486 5.756 6.017 6.383 6.608 6.814 7.13 7.439 7.724 7.983 8.215 8.504 8.779 9.041 9.36 9.672 9.987 10.354 10.737 11.106 11.527 11.983 12.456 12.945 13.491 14.125 14.785 15.548 16.388 17.366 18.469 19.721 21.132 22.77 24.021 24.713 25.122 25.358 25.487 25.523 25.519 25.503 25.462 25.398 25.335 25.269 25.194 25.103 25.017 24.938 24.865 24.799 24.708 24.595 24.514 24.437 24.354 24.286 24.21 24.142 24.07 23.983 23.926 23.874 23.792 23.725 23.653 23.619 23.546 23.449 23.351 23.306 23.168 23.141 23.085 23.017 22.868 22.792 22.709 22.631 22.534 22.414 22.212 21.386 -10 ,31215 ,TETRA ,17556572,Fri Nov 26 07:26:37 CET,Fri Nov 26 09:10:03 CET,0.0 1.518 1.981 2.312 2.584 2.831 3.059 3.263 3.656 3.847 4.033 4.291 4.561 4.73 5.046 5.341 5.611 5.742 6.013 6.274 6.64 6.865 7.075 7.381 7.68 7.98 8.276 8.557 8.905 9.216 9.496 9.833 10.159 10.48 10.837 11.221 11.595 12.005 12.44 12.917 13.422 13.976 14.623 15.292 16.073 16.917 17.89 18.955 20.205 21.735 23.54 24.981 25.759 26.199 26.478 26.621 26.655 26.656 26.618 26.534 26.458 26.381 26.303 26.218 26.13 26.055 25.975 25.904 25.831 25.75 25.67 25.592 25.507 25.418 25.353 25.29 25.217 25.139 25.057 24.991 24.922 24.816 24.748 24.683 24.646 24.571 24.494 24.415 24.371 24.232 24.214 24.166 24.106 23.938 23.857 23.783 23.686 23.575 23.445 23.266 22.644 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_18_15.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_18_15.txt deleted file mode 100644 index 1ca4ea30..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_18_15.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25332 ,KEBNE ,17025408,Wed Dec 22 12:28:23 CET,Wed Dec 22 13:54:34 CET,0.0 1.254 1.617 1.903 2.126 2.325 2.501 2.668 2.983 3.134 3.272 3.411 3.617 3.733 3.967 4.169 4.344 4.428 4.603 4.781 5.033 5.191 5.338 5.544 5.748 5.954 6.159 6.364 6.621 6.859 7.094 7.389 7.681 7.965 8.293 8.64 8.956 9.321 9.735 10.165 10.599 11.094 11.67 12.267 12.947 13.671 14.537 15.514 16.593 17.803 19.199 20.175 20.621 20.857 20.993 21.025 20.948 20.84 20.755 20.653 20.544 20.445 20.329 20.221 20.14 20.062 19.975 19.883 19.8 19.726 19.641 19.566 19.488 19.396 19.32 19.244 19.164 19.092 19.02 18.966 18.911 18.811 18.735 18.652 18.61 18.515 18.418 18.335 18.292 18.162 18.133 18.071 18.009 17.879 17.797 17.706 17.606 17.493 17.367 17.17 16.622 -2 ,7289 ,KEBNE ,17025409,Wed Dec 22 12:28:20 CET,Wed Dec 22 14:02:27 CET,0.0 0.796 1.156 1.398 1.609 1.793 1.951 2.09 2.375 2.529 2.667 2.823 3.042 3.158 3.359 3.567 3.77 3.861 4.041 4.223 4.501 4.684 4.859 5.112 5.347 5.567 5.784 5.992 6.273 6.561 6.85 7.216 7.554 7.852 8.172 8.516 8.852 9.233 9.658 10.093 10.531 11.031 11.623 12.208 12.867 13.592 14.448 15.415 16.497 17.732 19.171 20.184 20.676 20.897 20.97 20.973 20.918 20.838 20.761 20.676 20.589 20.498 20.4 20.285 20.173 20.083 19.985 19.872 19.785 19.717 19.625 19.552 19.48 19.389 19.32 19.244 19.164 19.082 18.987 18.926 18.861 18.744 18.664 18.585 18.547 18.461 18.375 18.281 18.231 18.097 18.055 17.976 17.9 17.75 17.671 17.594 17.497 17.38 17.234 17.07 16.716 -3 ,21295 ,KEBNE ,17025410,Wed Dec 22 12:28:19 CET,Wed Dec 22 14:02:13 CET,0.0 0.618 0.964 1.26 1.476 1.656 1.807 1.969 2.306 2.44 2.555 2.704 2.941 3.101 3.409 3.678 3.926 4.046 4.285 4.523 4.867 5.092 5.306 5.594 5.858 6.118 6.381 6.632 6.924 7.188 7.445 7.761 8.056 8.336 8.672 9.054 9.409 9.785 10.204 10.653 11.102 11.595 12.174 12.762 13.462 14.222 15.066 16.01 17.093 18.373 19.812 20.869 21.355 21.554 21.648 21.642 21.563 21.485 21.412 21.309 21.205 21.105 20.999 20.871 20.752 20.651 20.532 20.429 20.34 20.241 20.116 20.007 19.912 19.824 19.76 19.691 19.619 19.538 19.452 19.391 19.327 19.221 19.135 19.048 19.003 18.914 18.828 18.739 18.691 18.557 18.532 18.463 18.4 18.263 18.184 18.104 18.018 17.915 17.785 17.606 17.194 -4 ,23672 ,KEBNE ,17025411,Wed Dec 22 12:28:21 CET,Wed Dec 22 13:54:41 CET,0.0 1.186 1.528 1.857 2.096 2.303 2.499 2.663 2.948 3.098 3.248 3.406 3.618 3.732 3.948 4.158 4.362 4.461 4.632 4.789 5.039 5.214 5.385 5.631 5.873 6.1 6.324 6.542 6.82 7.089 7.344 7.642 7.928 8.224 8.579 8.947 9.286 9.655 10.044 10.483 10.926 11.415 12.017 12.622 13.31 14.077 14.955 15.883 16.953 18.175 19.573 20.613 21.123 21.373 21.467 21.475 21.428 21.352 21.277 21.172 21.07 20.97 20.843 20.71 20.589 20.487 20.377 20.26 20.146 20.038 19.933 19.844 19.749 19.651 19.588 19.522 19.441 19.358 19.267 19.195 19.123 19.01 18.934 18.858 18.82 18.741 18.65 18.549 18.498 18.36 18.336 18.283 18.227 18.097 18.019 17.94 17.862 17.763 17.633 17.477 17.069 -5 ,27797 ,KEBNE ,17025412,Wed Dec 22 12:28:23 CET,Wed Dec 22 13:54:39 CET,0.0 1.421 1.822 2.14 2.42 2.649 2.851 3.022 3.329 3.466 3.599 3.751 3.96 4.086 4.315 4.516 4.721 4.824 5.015 5.197 5.474 5.647 5.814 6.062 6.301 6.539 6.762 6.975 7.236 7.488 7.74 8.036 8.333 8.614 8.936 9.3 9.635 10.017 10.443 10.887 11.359 11.871 12.451 13.038 13.709 14.454 15.295 16.234 17.308 18.544 19.973 21.006 21.529 21.74 21.791 21.787 21.717 21.602 21.495 21.421 21.353 21.258 21.15 21.021 20.888 20.782 20.665 20.552 20.456 20.348 20.246 20.163 20.054 19.941 19.856 19.771 19.684 19.581 19.463 19.378 19.296 19.173 19.092 19.012 18.968 18.885 18.81 18.717 18.659 18.518 18.48 18.417 18.36 18.219 18.139 18.052 17.944 17.819 17.689 17.532 17.18 -6 ,9726 ,KEBNE ,17025413,Wed Dec 22 12:29:23 CET,Wed Dec 22 14:03:20 CET,0.0 0.831 1.21 1.537 1.835 2.088 2.296 2.483 2.82 2.984 3.148 3.361 3.595 3.734 4.001 4.244 4.474 4.587 4.807 5.024 5.331 5.533 5.726 6.017 6.309 6.582 6.848 7.101 7.39 7.65 7.915 8.235 8.531 8.812 9.141 9.508 9.842 10.211 10.627 11.08 11.548 12.048 12.616 13.216 13.928 14.69 15.554 16.52 17.594 18.816 20.213 21.168 21.6 21.799 21.901 21.924 21.902 21.863 21.795 21.697 21.591 21.475 21.362 21.235 21.105 21.002 20.894 20.788 20.68 20.573 20.471 20.371 20.272 20.175 20.085 19.991 19.896 19.798 19.707 19.641 19.556 19.422 19.335 19.243 19.198 19.1 18.986 18.866 18.804 18.662 18.617 18.55 18.468 18.288 18.213 18.129 18.028 17.92 17.777 17.569 17.17 -7 ,7075 ,KEBNE ,17025414,Wed Dec 22 12:29:23 CET,Wed Dec 22 14:04:26 CET,0.0 1.189 1.562 1.844 2.085 2.299 2.479 2.638 2.932 3.069 3.194 3.352 3.57 3.689 3.913 4.117 4.304 4.394 4.572 4.743 4.983 5.147 5.316 5.565 5.804 6.035 6.261 6.484 6.771 7.053 7.322 7.622 7.905 8.196 8.533 8.898 9.238 9.6 10.005 10.436 10.89 11.414 12.001 12.588 13.289 14.068 14.939 15.868 16.91 18.129 19.539 20.522 20.967 21.208 21.282 21.282 21.257 21.197 21.107 20.957 20.82 20.717 20.615 20.509 20.403 20.308 20.221 20.144 20.064 19.973 19.881 19.802 19.713 19.63 19.558 19.47 19.391 19.312 19.223 19.168 19.105 19.004 18.937 18.847 18.802 18.714 18.612 18.513 18.472 18.335 18.284 18.22 18.157 18.007 17.932 17.854 17.754 17.632 17.482 17.278 16.838 -8 ,13956 ,KEBNE ,17025415,Wed Dec 22 12:29:23 CET,Wed Dec 22 14:02:55 CET,0.0 0.707 1.12 1.498 1.848 2.145 2.406 2.652 3.092 3.288 3.476 3.746 4.008 4.167 4.427 4.654 4.864 4.97 5.208 5.449 5.801 6.023 6.23 6.51 6.776 7.041 7.305 7.556 7.851 8.111 8.359 8.661 8.95 9.226 9.544 9.919 10.299 10.716 11.179 11.67 12.182 12.744 13.351 13.942 14.643 15.381 16.204 17.171 18.288 19.528 20.879 21.856 22.351 22.511 22.468 22.42 22.391 22.325 22.249 22.171 22.061 21.961 21.864 21.739 21.617 21.529 21.44 21.341 21.253 21.161 21.071 20.99 20.898 20.809 20.735 20.651 20.567 20.49 20.412 20.35 20.279 20.164 20.082 19.995 19.952 19.864 19.781 19.703 19.659 19.526 19.494 19.433 19.377 19.249 19.172 19.082 18.986 18.897 18.759 18.554 18.079 -9 ,20728 ,KEBNE ,17025416,Wed Dec 22 12:29:23 CET,Wed Dec 22 14:02:50 CET,0.0 1.112 1.511 1.777 1.982 2.178 2.342 2.497 2.813 2.954 3.088 3.257 3.473 3.59 3.81 4.028 4.241 4.343 4.549 4.743 5.019 5.198 5.367 5.615 5.854 6.089 6.32 6.541 6.829 7.099 7.363 7.679 7.983 8.274 8.596 8.965 9.317 9.692 10.101 10.525 10.983 11.508 12.109 12.705 13.374 14.115 14.963 15.915 17.013 18.279 19.739 20.782 21.262 21.474 21.561 21.605 21.549 21.453 21.357 21.218 21.1 20.995 20.876 20.761 20.664 20.564 20.447 20.349 20.264 20.174 20.078 19.999 19.916 19.822 19.744 19.664 19.58 19.5 19.415 19.357 19.297 19.184 19.105 19.027 18.986 18.898 18.811 18.733 18.682 18.542 18.517 18.464 18.397 18.235 18.152 18.075 17.974 17.851 17.73 17.574 17.052 -10 ,31725 ,KEBNE ,17025417,Wed Dec 22 12:29:23 CET,Wed Dec 22 14:04:35 CET,0.0 1.125 1.474 1.738 1.956 2.15 2.323 2.49 2.812 2.958 3.09 3.243 3.459 3.57 3.788 4.014 4.232 4.338 4.536 4.725 5.004 5.184 5.36 5.617 5.859 6.088 6.317 6.537 6.803 7.056 7.314 7.643 7.954 8.227 8.543 8.897 9.226 9.608 10.025 10.462 10.909 11.389 11.988 12.592 13.255 13.975 14.796 15.748 16.863 18.101 19.474 20.459 20.919 21.14 21.211 21.241 21.208 21.126 21.047 20.954 20.868 20.777 20.691 20.607 20.515 20.428 20.337 20.258 20.18 20.082 19.98 19.904 19.823 19.721 19.64 19.574 19.5 19.411 19.317 19.25 19.179 19.06 18.985 18.909 18.871 18.796 18.708 18.608 18.557 18.423 18.388 18.325 18.261 18.123 18.053 17.963 17.859 17.745 17.612 17.441 17.049 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_18_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_18_17.txt deleted file mode 100644 index e401f47f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_18_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28196 ,TETRA ,17556573,Fri Nov 26 07:28:39 CET,Fri Nov 26 09:20:26 CET,0.0 0.585 0.74 0.883 1.017 1.141 1.239 1.316 1.481 1.555 1.62 1.649 1.807 1.869 1.968 2.07 2.161 2.201 2.288 2.374 2.496 2.585 2.669 2.765 2.85 2.935 3.022 3.103 3.198 3.291 3.386 3.498 3.607 3.71 3.843 4.013 4.173 4.321 4.47 4.631 4.794 4.988 5.183 5.355 5.542 5.716 5.895 6.077 6.234 6.312 6.154 5.673 5.146 4.646 4.193 3.774 3.42 3.095 2.799 2.487 2.205 1.96 1.739 1.525 1.31 1.108 0.907 0.733 0.587 0.429 0.253 0.105 -0.048 -0.2 -0.32 -0.451 -0.599 -0.748 -0.896 -1.007 -1.121 -1.29 -1.408 -1.526 -1.592 -1.74 -1.888 -2.02 -2.09 -2.271 -2.358 -2.455 -2.557 -2.778 -2.907 -3.041 -3.186 -3.363 -3.551 -3.808 -4.335 -2 ,5022 ,TETRA ,17556574,Fri Nov 26 07:28:40 CET,Fri Nov 26 09:19:02 CET,0.0 0.734 0.925 1.074 1.186 1.266 1.348 1.427 1.565 1.636 1.714 1.767 1.925 1.992 2.118 2.238 2.356 2.413 2.507 2.596 2.732 2.819 2.903 3.028 3.139 3.233 3.326 3.424 3.558 3.686 3.818 3.969 4.102 4.237 4.383 4.527 4.661 4.805 4.966 5.129 5.295 5.472 5.629 5.775 5.963 6.138 6.314 6.485 6.604 6.623 6.413 5.929 5.405 4.905 4.465 4.068 3.677 3.311 3.003 2.703 2.432 2.178 1.935 1.7 1.479 1.284 1.085 0.901 0.74 0.575 0.409 0.275 0.136 -0.008 -0.115 -0.225 -0.332 -0.454 -0.599 -0.69 -0.776 -0.909 -1.004 -1.097 -1.143 -1.249 -1.367 -1.481 -1.545 -1.712 -1.76 -1.84 -1.922 -2.088 -2.164 -2.253 -2.344 -2.467 -2.648 -2.859 -3.428 -3 ,9136 ,TETRA ,17556575,Fri Nov 26 07:30:37 CET,Fri Nov 26 09:19:10 CET,0.0 0.42 0.612 0.771 0.892 0.986 1.075 1.164 1.311 1.373 1.446 1.496 1.653 1.72 1.85 1.967 2.083 2.141 2.252 2.358 2.498 2.591 2.681 2.788 2.89 3.003 3.102 3.188 3.308 3.435 3.552 3.673 3.79 3.913 4.059 4.212 4.353 4.504 4.643 4.788 4.942 5.116 5.306 5.468 5.661 5.853 6.039 6.226 6.357 6.346 6.122 5.699 5.203 4.732 4.291 3.874 3.488 3.123 2.813 2.49 2.207 1.97 1.745 1.527 1.325 1.129 0.915 0.729 0.581 0.427 0.267 0.144 0.013 -0.14 -0.26 -0.375 -0.488 -0.606 -0.73 -0.82 -0.915 -1.062 -1.163 -1.257 -1.305 -1.412 -1.528 -1.652 -1.716 -1.881 -1.922 -1.993 -2.067 -2.248 -2.359 -2.485 -2.622 -2.767 -2.921 -3.128 -3.706 -4 ,25513 ,TETRA ,17556576,Fri Nov 26 07:29:37 CET,Fri Nov 26 09:17:58 CET,0.0 0.616 0.772 0.878 0.983 1.082 1.186 1.276 1.41 1.48 1.561 1.603 1.752 1.811 1.918 2.014 2.1 2.15 2.254 2.343 2.472 2.554 2.631 2.745 2.852 2.955 3.063 3.167 3.299 3.418 3.529 3.666 3.795 3.918 4.064 4.225 4.382 4.536 4.683 4.84 4.995 5.165 5.341 5.502 5.681 5.876 6.079 6.287 6.445 6.454 6.224 5.728 5.222 4.759 4.324 3.896 3.516 3.159 2.841 2.534 2.272 2.025 1.787 1.574 1.38 1.188 0.975 0.797 0.644 0.477 0.298 0.148 0.004 -0.142 -0.254 -0.366 -0.49 -0.618 -0.735 -0.815 -0.903 -1.04 -1.137 -1.232 -1.282 -1.387 -1.498 -1.626 -1.692 -1.856 -1.907 -1.995 -2.086 -2.274 -2.374 -2.489 -2.613 -2.75 -2.905 -3.096 -3.704 -5 ,4390 ,TETRA ,17556577,Fri Nov 26 07:31:39 CET,Fri Nov 26 09:20:15 CET,0.0 0.535 0.739 0.881 0.989 1.08 1.165 1.253 1.412 1.482 1.545 1.574 1.729 1.796 1.939 2.076 2.193 2.241 2.337 2.433 2.571 2.658 2.739 2.863 2.977 3.088 3.189 3.287 3.413 3.516 3.619 3.759 3.891 4.011 4.156 4.331 4.484 4.633 4.801 4.981 5.155 5.342 5.55 5.746 5.959 6.154 6.338 6.469 6.53 6.532 6.34 5.9 5.378 4.866 4.435 4.031 3.647 3.293 2.981 2.682 2.433 2.199 1.971 1.756 1.551 1.361 1.172 0.999 0.845 0.693 0.542 0.417 0.278 0.138 0.039 -0.078 -0.214 -0.362 -0.512 -0.618 -0.726 -0.883 -1.001 -1.135 -1.2 -1.331 -1.469 -1.599 -1.67 -1.844 -1.911 -2.002 -2.109 -2.358 -2.481 -2.614 -2.773 -2.985 -3.21 -3.479 -4.529 -6 ,16164 ,TETRA ,17556578,Fri Nov 26 07:34:42 CET,Fri Nov 26 09:23:50 CET,0.0 0.634 0.855 1.031 1.156 1.263 1.364 1.446 1.586 1.657 1.732 1.782 1.936 1.992 2.108 2.219 2.312 2.352 2.432 2.516 2.644 2.724 2.802 2.913 3.015 3.125 3.229 3.324 3.441 3.555 3.666 3.787 3.9 4.016 4.15 4.295 4.434 4.59 4.749 4.902 5.057 5.217 5.39 5.552 5.73 5.925 6.136 6.31 6.417 6.439 6.28 5.792 5.265 4.847 4.435 4.002 3.622 3.271 2.948 2.622 2.359 2.131 1.902 1.681 1.476 1.278 1.072 0.89 0.724 0.553 0.384 0.24 0.098 -0.052 -0.173 -0.294 -0.42 -0.552 -0.701 -0.809 -0.914 -1.08 -1.199 -1.325 -1.388 -1.516 -1.663 -1.811 -1.891 -2.076 -2.157 -2.253 -2.352 -2.589 -2.727 -2.862 -2.99 -3.122 -3.275 -3.459 -3.88 -7 ,17190 ,TETRA ,17556579,Fri Nov 26 07:34:42 CET,Fri Nov 26 09:24:56 CET,0.0 0.562 0.713 0.846 0.952 1.059 1.168 1.257 1.398 1.454 1.509 1.538 1.695 1.763 1.895 2.019 2.125 2.176 2.274 2.359 2.479 2.566 2.648 2.762 2.886 3.002 3.102 3.203 3.329 3.443 3.557 3.688 3.814 3.938 4.075 4.24 4.396 4.549 4.715 4.884 5.041 5.189 5.374 5.581 5.777 5.963 6.159 6.346 6.491 6.549 6.361 5.878 5.355 4.849 4.42 4.014 3.63 3.246 2.911 2.596 2.316 2.077 1.838 1.606 1.397 1.206 1.007 0.818 0.654 0.476 0.285 0.133 -0.033 -0.2 -0.326 -0.463 -0.603 -0.751 -0.903 -1.016 -1.139 -1.302 -1.401 -1.507 -1.566 -1.697 -1.838 -1.989 -2.069 -2.246 -2.324 -2.426 -2.545 -2.772 -2.882 -2.995 -3.116 -3.257 -3.435 -3.713 -4.309 -8 ,15333 ,TETRA ,17556580,Fri Nov 26 07:34:42 CET,Fri Nov 26 09:25:28 CET,0.0 0.601 0.757 0.876 0.983 1.085 1.175 1.272 1.468 1.548 1.613 1.637 1.791 1.852 1.98 2.08 2.159 2.2 2.295 2.388 2.513 2.598 2.684 2.812 2.937 3.05 3.161 3.262 3.378 3.486 3.593 3.728 3.853 3.972 4.112 4.266 4.422 4.587 4.754 4.92 5.081 5.276 5.51 5.713 5.92 6.148 6.371 6.552 6.664 6.687 6.507 6.06 5.549 5.039 4.572 4.165 3.806 3.476 3.178 2.875 2.596 2.33 2.086 1.86 1.651 1.455 1.257 1.069 0.91 0.756 0.577 0.426 0.277 0.117 -0.013 -0.149 -0.282 -0.416 -0.561 -0.659 -0.768 -0.943 -1.052 -1.166 -1.231 -1.361 -1.491 -1.646 -1.726 -1.905 -1.992 -2.086 -2.192 -2.416 -2.533 -2.673 -2.841 -3.03 -3.24 -3.521 -4.626 -9 ,27837 ,TETRA ,17556581,Fri Nov 26 07:35:39 CET,Fri Nov 26 09:24:10 CET,0.0 0.508 0.702 0.892 1.078 1.232 1.374 1.496 1.723 1.827 1.921 1.997 2.158 2.223 2.353 2.466 2.574 2.626 2.728 2.825 2.969 3.058 3.137 3.248 3.362 3.479 3.59 3.694 3.815 3.925 4.036 4.171 4.289 4.399 4.527 4.668 4.795 4.937 5.085 5.224 5.37 5.544 5.736 5.911 6.084 6.254 6.437 6.609 6.733 6.771 6.544 5.999 5.485 5.0 4.545 4.12 3.735 3.365 3.027 2.696 2.416 2.156 1.919 1.695 1.463 1.257 1.057 0.869 0.7 0.523 0.347 0.208 0.052 -0.125 -0.256 -0.386 -0.523 -0.665 -0.806 -0.896 -0.995 -1.166 -1.288 -1.416 -1.483 -1.615 -1.737 -1.88 -1.959 -2.131 -2.222 -2.329 -2.442 -2.693 -2.838 -2.979 -3.112 -3.304 -3.539 -3.835 -4.624 -10 ,27335 ,TETRA ,17556582,Fri Nov 26 07:35:38 CET,Fri Nov 26 09:13:49 CET,0.0 0.803 0.999 1.145 1.262 1.387 1.489 1.581 1.753 1.834 1.915 1.95 2.096 2.147 2.261 2.369 2.471 2.517 2.591 2.663 2.775 2.841 2.905 3.006 3.115 3.227 3.331 3.434 3.555 3.654 3.762 3.897 4.017 4.125 4.261 4.419 4.553 4.702 4.865 5.041 5.217 5.419 5.636 5.838 6.071 6.298 6.512 6.7 6.842 6.889 6.729 6.299 5.804 5.293 4.792 4.343 3.961 3.626 3.338 3.034 2.767 2.529 2.3 2.062 1.852 1.674 1.47 1.277 1.115 0.958 0.786 0.641 0.491 0.337 0.212 0.072 -0.069 -0.213 -0.356 -0.461 -0.583 -0.761 -0.873 -0.995 -1.058 -1.186 -1.318 -1.464 -1.55 -1.735 -1.814 -1.9 -2.002 -2.213 -2.331 -2.461 -2.576 -2.693 -2.839 -3.047 -3.913 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_19_17.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_19_17.txt deleted file mode 100644 index 87defe96..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_19_17.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32099 ,TETRA ,17556583,Fri Nov 26 07:36:40 CET,Fri Nov 26 09:27:41 CET,0.0 0.681 0.946 1.138 1.323 1.519 1.664 1.775 1.972 2.081 2.195 2.298 2.502 2.598 2.78 2.949 3.1 3.174 3.312 3.451 3.65 3.771 3.895 4.066 4.233 4.397 4.563 4.723 4.922 5.118 5.306 5.526 5.745 5.96 6.198 6.469 6.724 6.989 7.286 7.62 7.96 8.331 8.746 9.161 9.656 10.241 10.912 11.592 12.346 13.18 14.007 14.455 14.487 14.385 14.236 14.031 13.792 13.54 13.296 13.032 12.8 12.575 12.367 12.164 11.96 11.759 11.538 11.338 11.177 11.015 10.827 10.674 10.522 10.353 10.203 10.04 9.887 9.728 9.562 9.451 9.33 9.143 9.01 8.866 8.788 8.637 8.484 8.306 8.207 8.002 7.877 7.761 7.641 7.366 7.214 7.029 6.806 6.558 6.21 5.736 2.382 -2 ,29607 ,TETRA ,17556584,Fri Nov 26 07:36:40 CET,Fri Nov 26 09:27:10 CET,0.0 1.276 1.527 1.758 1.951 2.102 2.226 2.332 2.531 2.63 2.716 2.77 2.959 3.041 3.212 3.367 3.51 3.581 3.729 3.873 4.081 4.206 4.316 4.476 4.636 4.791 4.94 5.086 5.284 5.473 5.645 5.85 6.05 6.248 6.484 6.752 6.992 7.275 7.598 7.922 8.256 8.611 9.016 9.426 9.917 10.467 11.076 11.722 12.466 13.288 14.162 14.655 14.737 14.691 14.566 14.37 14.137 13.888 13.664 13.43 13.176 12.955 12.746 12.537 12.331 12.131 11.901 11.695 11.537 11.362 11.175 11.028 10.871 10.702 10.56 10.395 10.234 10.083 9.925 9.808 9.679 9.477 9.338 9.172 9.079 8.898 8.72 8.532 8.444 8.262 8.139 8.013 7.888 7.622 7.488 7.313 7.068 6.782 6.495 6.048 3.45 -3 ,8940 ,TETRA ,17556585,Fri Nov 26 07:36:41 CET,Fri Nov 26 09:26:18 CET,0.0 1.393 1.631 1.856 2.058 2.214 2.349 2.481 2.722 2.835 2.944 3.037 3.231 3.319 3.501 3.655 3.798 3.869 3.997 4.134 4.339 4.466 4.577 4.741 4.921 5.096 5.262 5.417 5.599 5.775 5.953 6.163 6.358 6.55 6.783 7.047 7.301 7.565 7.843 8.157 8.491 8.855 9.269 9.673 10.143 10.679 11.319 11.994 12.722 13.519 14.333 14.788 14.879 14.839 14.686 14.446 14.168 13.889 13.617 13.344 13.137 12.934 12.711 12.49 12.284 12.084 11.864 11.684 11.532 11.364 11.173 11.004 10.843 10.675 10.538 10.385 10.217 10.038 9.838 9.714 9.592 9.364 9.206 9.058 8.98 8.801 8.608 8.407 8.29 8.07 7.917 7.782 7.629 7.289 7.092 6.891 6.703 6.473 6.203 5.751 3.755 -4 ,17429 ,TETRA ,17556586,Fri Nov 26 07:36:40 CET,Fri Nov 26 09:26:09 CET,0.0 1.015 1.377 1.624 1.823 2.012 2.188 2.319 2.552 2.673 2.79 2.9 3.096 3.194 3.378 3.549 3.71 3.783 3.916 4.048 4.242 4.365 4.484 4.648 4.806 4.952 5.097 5.241 5.42 5.605 5.795 6.013 6.224 6.426 6.652 6.903 7.148 7.422 7.717 8.021 8.348 8.731 9.169 9.59 10.071 10.6 11.143 11.747 12.493 13.304 14.096 14.565 14.709 14.627 14.425 14.166 13.887 13.603 13.386 13.147 12.903 12.676 12.464 12.255 12.042 11.845 11.629 11.424 11.251 11.075 10.876 10.705 10.528 10.345 10.207 10.053 9.89 9.736 9.562 9.436 9.309 9.116 8.98 8.822 8.735 8.559 8.375 8.179 8.08 7.873 7.718 7.588 7.458 7.156 6.98 6.775 6.548 6.326 6.036 5.622 2.174 -5 ,22294 ,TETRA ,17556587,Fri Nov 26 07:36:41 CET,Fri Nov 26 09:26:23 CET,0.0 0.856 1.129 1.341 1.487 1.628 1.772 1.894 2.112 2.214 2.315 2.398 2.593 2.678 2.832 2.979 3.119 3.186 3.317 3.44 3.618 3.732 3.84 3.988 4.133 4.287 4.444 4.605 4.805 5.005 5.208 5.438 5.658 5.868 6.111 6.395 6.657 6.937 7.238 7.554 7.87 8.224 8.667 9.109 9.617 10.19 10.837 11.575 12.373 13.17 14.013 14.525 14.57 14.456 14.264 14.099 13.939 13.697 13.455 13.202 12.968 12.742 12.529 12.323 12.11 11.937 11.774 11.585 11.398 11.2 11.003 10.833 10.648 10.454 10.304 10.159 10.019 9.866 9.689 9.569 9.439 9.244 9.126 8.989 8.911 8.765 8.612 8.43 8.337 8.147 8.028 7.911 7.767 7.441 7.261 7.063 6.855 6.599 6.263 5.807 4.051 -6 ,2489 ,TETRA ,17556588,Fri Nov 26 07:37:41 CET,Fri Nov 26 09:27:56 CET,0.0 1.263 1.51 1.713 1.873 2.013 2.154 2.284 2.491 2.601 2.71 2.809 3.008 3.104 3.298 3.466 3.623 3.701 3.865 4.022 4.223 4.342 4.455 4.632 4.806 4.968 5.123 5.272 5.461 5.657 5.85 6.08 6.298 6.497 6.723 6.984 7.223 7.495 7.802 8.132 8.479 8.888 9.348 9.751 10.214 10.752 11.357 12.02 12.786 13.583 14.332 14.783 14.788 14.561 14.361 14.182 13.957 13.734 13.494 13.218 12.984 12.773 12.549 12.331 12.127 11.942 11.757 11.565 11.394 11.233 11.041 10.87 10.693 10.509 10.371 10.225 10.077 9.909 9.72 9.591 9.464 9.25 9.084 8.911 8.819 8.626 8.415 8.19 8.078 7.865 7.704 7.56 7.419 7.129 6.945 6.724 6.502 6.23 5.849 5.296 2.31 -7 ,9795 ,TETRA ,17556589,Fri Nov 26 07:37:43 CET,Fri Nov 26 09:28:07 CET,0.0 1.184 1.511 1.75 1.916 2.055 2.193 2.322 2.553 2.655 2.768 2.883 3.073 3.147 3.313 3.488 3.649 3.72 3.851 3.977 4.175 4.309 4.428 4.594 4.765 4.93 5.088 5.241 5.431 5.612 5.788 6.002 6.209 6.411 6.647 6.914 7.168 7.441 7.736 8.05 8.379 8.751 9.167 9.593 10.115 10.656 11.239 11.908 12.685 13.59 14.534 14.969 15.063 14.992 14.823 14.66 14.475 14.234 13.973 13.674 13.43 13.224 13.019 12.82 12.626 12.44 12.239 12.047 11.876 11.699 11.512 11.351 11.195 11.027 10.883 10.728 10.569 10.414 10.246 10.125 10.002 9.805 9.66 9.504 9.428 9.267 9.085 8.896 8.789 8.581 8.466 8.352 8.225 7.92 7.748 7.568 7.354 7.062 6.689 6.237 2.666 -8 ,14584 ,TETRA ,17556590,Fri Nov 26 07:37:40 CET,Fri Nov 26 09:20:46 CET,0.0 1.384 1.663 1.87 2.043 2.186 2.324 2.46 2.683 2.773 2.859 2.913 3.099 3.179 3.327 3.461 3.58 3.637 3.754 3.883 4.061 4.164 4.275 4.45 4.612 4.775 4.943 5.099 5.29 5.478 5.671 5.901 6.12 6.334 6.567 6.828 7.092 7.372 7.666 7.982 8.311 8.688 9.128 9.546 10.043 10.613 11.272 11.98 12.707 13.566 14.392 14.728 14.756 14.626 14.426 14.2 13.979 13.689 13.411 13.154 12.919 12.715 12.507 12.285 12.063 11.863 11.66 11.481 11.33 11.171 10.994 10.841 10.692 10.543 10.416 10.284 10.146 9.989 9.803 9.673 9.539 9.308 9.152 8.992 8.911 8.751 8.573 8.364 8.241 8.026 7.897 7.771 7.624 7.326 7.167 6.991 6.785 6.488 6.155 5.638 2.3 -9 ,28923 ,TETRA ,17556591,Fri Nov 26 07:37:41 CET,Fri Nov 26 09:29:02 CET,0.0 1.086 1.357 1.55 1.708 1.845 1.961 2.069 2.283 2.387 2.48 2.539 2.722 2.806 2.97 3.106 3.237 3.303 3.421 3.54 3.716 3.83 3.937 4.079 4.225 4.376 4.517 4.653 4.838 5.017 5.186 5.408 5.622 5.799 6.013 6.258 6.489 6.762 7.065 7.388 7.728 8.096 8.541 8.982 9.475 10.027 10.662 11.377 12.15 12.969 13.812 14.229 14.263 14.147 13.961 13.761 13.566 13.351 13.104 12.861 12.647 12.447 12.241 12.027 11.831 11.646 11.432 11.228 11.071 10.906 10.716 10.544 10.354 10.18 10.06 9.919 9.748 9.565 9.4 9.291 9.167 8.97 8.822 8.679 8.607 8.449 8.286 8.097 8.006 7.82 7.704 7.569 7.434 7.156 6.985 6.79 6.573 6.287 5.874 5.254 1.133 -10 ,23048 ,TETRA ,17556592,Fri Nov 26 07:37:43 CET,Fri Nov 26 09:29:06 CET,0.0 1.282 1.569 1.75 1.916 2.067 2.184 2.298 2.54 2.651 2.755 2.827 3.019 3.101 3.247 3.38 3.516 3.585 3.712 3.832 4.004 4.126 4.252 4.433 4.6 4.762 4.925 5.081 5.271 5.457 5.642 5.854 6.057 6.256 6.475 6.717 6.955 7.224 7.527 7.86 8.215 8.604 9.057 9.503 10.038 10.631 11.266 11.95 12.7 13.485 14.294 14.71 14.695 14.557 14.356 14.082 13.814 13.57 13.335 13.057 12.789 12.564 12.357 12.137 11.917 11.71 11.501 11.324 11.163 10.99 10.799 10.638 10.474 10.306 10.184 10.041 9.881 9.722 9.552 9.432 9.306 9.104 8.956 8.798 8.714 8.535 8.342 8.145 8.042 7.834 7.7 7.57 7.429 7.085 6.892 6.714 6.497 6.213 5.839 5.304 2.072 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_19_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_19_24.txt deleted file mode 100644 index 5e1e986c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_19_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8141 ,TETRA ,17556593,Fri Nov 26 07:38:38 CET,Fri Nov 26 09:29:09 CET,0.0 0.646 0.917 1.112 1.272 1.426 1.57 1.703 1.923 2.029 2.14 2.236 2.435 2.526 2.696 2.858 3.016 3.093 3.237 3.361 3.537 3.651 3.767 3.942 4.098 4.233 4.364 4.49 4.666 4.814 4.898 4.986 5.071 5.137 5.195 5.247 5.282 5.321 5.354 5.347 5.33 5.312 5.273 5.199 5.022 4.745 4.325 3.748 2.943 1.69 -0.361 -2.736 -4.624 -6.091 -7.34 -8.464 -9.43 -10.303 -11.035 -11.742 -12.336 -12.844 -13.33 -13.789 -14.201 -14.566 -14.926 -15.237 -15.523 -15.831 -16.132 -16.373 -16.64 -16.914 -17.106 -17.307 -17.518 -17.723 -17.926 -18.063 -18.2 -18.42 -18.566 -18.728 -18.822 -18.996 -19.17 -19.351 -19.441 -19.668 -19.725 -19.824 -19.926 -20.151 -20.27 -20.398 -20.543 -20.712 -20.922 -21.186 -22.402 -2 ,22108 ,TETRA ,17556594,Fri Nov 26 07:39:38 CET,Fri Nov 26 09:17:38 CET,0.0 1.268 1.629 1.867 2.031 2.209 2.372 2.491 2.696 2.796 2.889 2.93 3.106 3.178 3.316 3.435 3.539 3.593 3.692 3.785 3.926 4.015 4.102 4.218 4.31 4.395 4.482 4.56 4.649 4.737 4.818 4.908 4.984 5.043 5.106 5.183 5.253 5.303 5.352 5.383 5.385 5.376 5.346 5.285 5.143 4.926 4.561 4.037 3.265 2.001 -0.124 -2.566 -4.455 -5.993 -7.326 -8.5 -9.469 -10.328 -11.05 -11.737 -12.327 -12.838 -13.317 -13.787 -14.212 -14.576 -14.961 -15.314 -15.608 -15.905 -16.206 -16.459 -16.724 -16.982 -17.181 -17.376 -17.565 -17.765 -17.968 -18.101 -18.238 -18.448 -18.591 -18.733 -18.812 -18.986 -19.168 -19.355 -19.453 -19.679 -19.73 -19.84 -19.955 -20.175 -20.297 -20.427 -20.569 -20.724 -20.914 -21.199 -21.976 -3 ,986 ,TETRA ,17556595,Fri Nov 26 07:39:39 CET,Fri Nov 26 09:30:01 CET,0.0 1.24 1.532 1.75 1.936 2.084 2.211 2.319 2.517 2.608 2.693 2.76 2.942 3.005 3.133 3.266 3.384 3.436 3.541 3.642 3.769 3.845 3.918 4.027 4.123 4.208 4.288 4.371 4.474 4.547 4.607 4.68 4.743 4.796 4.848 4.891 4.915 4.935 4.949 4.96 4.978 4.987 4.938 4.833 4.681 4.44 4.063 3.51 2.701 1.512 -0.494 -2.888 -4.769 -6.299 -7.534 -8.598 -9.554 -10.402 -11.099 -11.762 -12.321 -12.82 -13.295 -13.74 -14.143 -14.5 -14.87 -15.197 -15.472 -15.756 -16.045 -16.268 -16.504 -16.75 -16.934 -17.134 -17.335 -17.529 -17.726 -17.855 -17.984 -18.192 -18.341 -18.488 -18.561 -18.717 -18.89 -19.069 -19.161 -19.395 -19.473 -19.582 -19.699 -19.941 -20.055 -20.171 -20.302 -20.453 -20.617 -20.833 -21.686 -4 ,19021 ,TETRA ,17556596,Fri Nov 26 07:39:39 CET,Fri Nov 26 09:34:14 CET,0.0 0.883 1.16 1.383 1.573 1.725 1.857 1.984 2.215 2.32 2.421 2.511 2.704 2.781 2.911 3.02 3.129 3.186 3.296 3.398 3.525 3.601 3.671 3.762 3.849 3.937 4.017 4.087 4.191 4.291 4.365 4.442 4.503 4.55 4.595 4.652 4.708 4.739 4.763 4.774 4.747 4.705 4.622 4.502 4.337 4.078 3.693 3.151 2.325 1.069 -0.949 -3.275 -5.153 -6.68 -7.945 -9.049 -9.996 -10.853 -11.564 -12.246 -12.818 -13.294 -13.742 -14.171 -14.552 -14.875 -15.221 -15.54 -15.811 -16.095 -16.379 -16.607 -16.848 -17.101 -17.298 -17.488 -17.669 -17.864 -18.062 -18.194 -18.332 -18.543 -18.685 -18.839 -18.917 -19.07 -19.238 -19.431 -19.525 -19.749 -19.8 -19.889 -19.975 -20.167 -20.287 -20.425 -20.582 -20.762 -20.947 -21.16 -22.042 -5 ,19274 ,TETRA ,17556597,Fri Nov 26 07:40:38 CET,Fri Nov 26 09:33:42 CET,0.0 1.092 1.4 1.637 1.856 2.03 2.165 2.289 2.518 2.609 2.691 2.736 2.916 2.987 3.114 3.234 3.342 3.39 3.486 3.582 3.71 3.784 3.85 3.947 4.048 4.141 4.233 4.32 4.404 4.48 4.546 4.617 4.692 4.751 4.805 4.872 4.936 4.976 4.989 4.996 4.986 4.954 4.894 4.787 4.617 4.349 3.956 3.391 2.54 1.28 -0.787 -3.158 -5.012 -6.535 -7.798 -8.89 -9.83 -10.661 -11.361 -12.053 -12.625 -13.127 -13.604 -14.043 -14.455 -14.825 -15.194 -15.512 -15.781 -16.062 -16.345 -16.574 -16.803 -17.039 -17.228 -17.418 -17.613 -17.81 -18.007 -18.15 -18.298 -18.521 -18.668 -18.814 -18.889 -19.048 -19.223 -19.416 -19.512 -19.735 -19.797 -19.904 -20.013 -20.225 -20.341 -20.469 -20.607 -20.775 -20.983 -21.266 -22.712 -6 ,19950 ,TETRA ,17556598,Fri Nov 26 07:40:38 CET,Fri Nov 26 09:30:16 CET,0.0 1.075 1.396 1.643 1.84 2.007 2.161 2.302 2.526 2.615 2.696 2.748 2.932 3.007 3.129 3.247 3.365 3.415 3.515 3.612 3.732 3.801 3.868 3.969 4.054 4.135 4.216 4.298 4.398 4.469 4.534 4.609 4.677 4.734 4.795 4.851 4.899 4.953 4.988 5.017 5.018 4.984 4.92 4.83 4.675 4.417 4.06 3.549 2.729 1.484 -0.54 -2.969 -4.869 -6.398 -7.656 -8.727 -9.647 -10.469 -11.158 -11.846 -12.438 -12.968 -13.463 -13.913 -14.322 -14.68 -15.062 -15.442 -15.787 -16.153 -16.534 -16.834 -17.145 -17.467 -17.715 -17.965 -18.22 -18.486 -18.756 -18.932 -19.113 -19.406 -19.604 -19.798 -19.897 -20.11 -20.322 -20.53 -20.642 -20.893 -21.017 -21.152 -21.278 -21.538 -21.677 -21.823 -21.984 -22.17 -22.388 -22.659 -23.294 -7 ,23400 ,TETRA ,17556599,Fri Nov 26 07:40:41 CET,Fri Nov 26 09:32:43 CET,0.0 0.962 1.245 1.454 1.626 1.784 1.938 2.075 2.299 2.388 2.476 2.548 2.734 2.815 2.986 3.131 3.257 3.324 3.456 3.569 3.707 3.793 3.881 4.008 4.12 4.217 4.319 4.421 4.547 4.654 4.736 4.833 4.93 5.001 5.066 5.139 5.202 5.252 5.293 5.323 5.326 5.309 5.272 5.186 5.026 4.802 4.468 3.98 3.202 1.934 -0.209 -2.739 -4.677 -6.207 -7.49 -8.617 -9.571 -10.408 -11.138 -11.879 -12.478 -12.98 -13.456 -13.89 -14.298 -14.672 -15.057 -15.385 -15.664 -15.963 -16.275 -16.528 -16.765 -16.988 -17.166 -17.352 -17.539 -17.733 -17.942 -18.086 -18.222 -18.43 -18.574 -18.725 -18.81 -18.979 -19.153 -19.348 -19.442 -19.661 -19.715 -19.823 -19.93 -20.124 -20.231 -20.351 -20.488 -20.66 -20.865 -21.096 -21.996 -8 ,32702 ,TETRA ,17556600,Fri Nov 26 07:40:38 CET,Fri Nov 26 09:31:49 CET,0.0 1.142 1.423 1.662 1.864 2.036 2.188 2.317 2.535 2.647 2.755 2.841 3.035 3.123 3.294 3.449 3.598 3.671 3.809 3.943 4.111 4.195 4.266 4.368 4.473 4.563 4.637 4.71 4.808 4.903 4.984 5.073 5.152 5.214 5.265 5.325 5.384 5.435 5.453 5.46 5.471 5.455 5.402 5.322 5.158 4.887 4.511 3.946 3.092 1.858 -0.108 -2.472 -4.417 -5.952 -7.176 -8.267 -9.213 -10.026 -10.717 -11.403 -11.995 -12.528 -13.01 -13.447 -13.863 -14.244 -14.617 -14.948 -15.241 -15.534 -15.844 -16.106 -16.362 -16.618 -16.814 -17.004 -17.189 -17.374 -17.572 -17.707 -17.855 -18.086 -18.237 -18.385 -18.462 -18.63 -18.806 -18.972 -19.061 -19.285 -19.343 -19.447 -19.551 -19.776 -19.901 -20.057 -20.226 -20.39 -20.568 -20.782 -21.819 -9 ,5757 ,TETRA ,17556601,Fri Nov 26 07:42:40 CET,Fri Nov 26 09:32:13 CET,0.0 1.334 1.649 1.841 2.033 2.204 2.348 2.469 2.673 2.782 2.882 2.939 3.12 3.188 3.318 3.434 3.536 3.591 3.702 3.794 3.922 4.011 4.088 4.187 4.292 4.386 4.468 4.547 4.641 4.733 4.814 4.907 4.998 5.074 5.141 5.212 5.279 5.331 5.375 5.413 5.41 5.376 5.33 5.251 5.083 4.85 4.528 4.012 3.229 1.992 -0.168 -2.67 -4.601 -6.159 -7.467 -8.609 -9.553 -10.392 -11.114 -11.807 -12.406 -12.928 -13.407 -13.85 -14.271 -14.652 -15.043 -15.368 -15.627 -15.902 -16.192 -16.433 -16.682 -16.939 -17.136 -17.33 -17.517 -17.709 -17.92 -18.059 -18.197 -18.413 -18.565 -18.733 -18.821 -19.0 -19.179 -19.365 -19.466 -19.697 -19.748 -19.852 -19.963 -20.188 -20.317 -20.451 -20.579 -20.73 -20.933 -21.18 -22.061 -10 ,9307 ,TETRA ,17556602,Fri Nov 26 07:42:42 CET,Fri Nov 26 09:34:33 CET,0.0 0.75 1.041 1.259 1.44 1.602 1.75 1.896 2.146 2.259 2.371 2.477 2.684 2.78 2.959 3.121 3.259 3.328 3.473 3.61 3.793 3.91 4.033 4.209 4.378 4.533 4.634 4.705 4.807 4.893 4.962 5.04 5.111 5.174 5.229 5.28 5.321 5.374 5.418 5.444 5.459 5.448 5.417 5.392 5.289 5.06 4.737 4.218 3.425 2.241 0.219 -2.153 -4.091 -5.711 -7.034 -8.169 -9.127 -9.978 -10.683 -11.358 -11.948 -12.482 -12.969 -13.418 -13.822 -14.179 -14.542 -14.858 -15.144 -15.445 -15.769 -16.024 -16.265 -16.518 -16.712 -16.901 -17.099 -17.315 -17.533 -17.674 -17.813 -18.034 -18.189 -18.345 -18.428 -18.601 -18.786 -18.979 -19.069 -19.292 -19.337 -19.431 -19.538 -19.747 -19.858 -19.991 -20.143 -20.296 -20.474 -20.716 -21.376 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_19_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_19_32.txt deleted file mode 100644 index 6e2efc4e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_19_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6388 ,TETRA ,17556603,Fri Nov 26 07:43:38 CET,Fri Nov 26 09:33:12 CET,0.0 0.108 0.202 0.28 0.343 0.393 0.454 0.515 0.599 0.632 0.663 0.611 0.748 0.775 0.815 0.852 0.893 0.916 0.957 1.004 1.068 1.101 1.137 1.191 1.242 1.282 1.311 1.341 1.383 1.421 1.449 1.48 1.509 1.528 1.54 1.546 1.533 1.516 1.505 1.486 1.454 1.378 1.254 1.103 0.893 0.624 0.209 -0.379 -1.149 -2.306 -4.199 -6.325 -7.997 -9.38 -10.507 -11.464 -12.293 -13.022 -13.637 -14.259 -14.785 -15.222 -15.638 -16.026 -16.37 -16.674 -16.992 -17.267 -17.502 -17.758 -18.018 -18.228 -18.443 -18.666 -18.839 -19.011 -19.188 -19.375 -19.573 -19.711 -19.85 -20.06 -20.214 -20.371 -20.452 -20.627 -20.804 -20.997 -21.096 -21.316 -21.391 -21.503 -21.615 -21.874 -22.011 -22.134 -22.273 -22.443 -22.655 -22.957 -23.755 -2 ,24278 ,TETRA ,17556604,Fri Nov 26 07:44:39 CET,Fri Nov 26 09:37:27 CET,0.0 0.117 0.191 0.245 0.298 0.359 0.411 0.445 0.498 0.521 0.547 0.496 0.623 0.642 0.684 0.725 0.765 0.789 0.827 0.849 0.879 0.904 0.937 0.966 0.991 1.014 1.03 1.043 1.05 1.054 1.056 1.06 1.065 1.064 1.06 1.053 1.039 1.009 0.955 0.889 0.91 1.016 1.076 1.123 1.127 0.927 0.524 -0.016 -0.818 -1.989 -3.837 -5.962 -7.667 -9.096 -10.243 -11.196 -12.008 -12.715 -13.3 -13.879 -14.392 -14.843 -15.291 -15.718 -16.08 -16.414 -16.78 -17.093 -17.346 -17.603 -17.877 -18.105 -18.329 -18.536 -18.693 -18.875 -19.066 -19.243 -19.432 -19.579 -19.733 -19.963 -20.115 -20.265 -20.341 -20.493 -20.656 -20.837 -20.931 -21.153 -21.232 -21.348 -21.46 -21.712 -21.869 -22.022 -22.166 -22.339 -22.571 -22.887 -23.745 -3 ,105 ,TETRA ,17556605,Fri Nov 26 07:44:38 CET,Fri Nov 26 09:34:21 CET,0.0 0.103 0.189 0.279 0.339 0.381 0.427 0.474 0.55 0.593 0.65 0.639 0.785 0.825 0.885 0.948 1.013 1.046 1.11 1.163 1.235 1.275 1.306 1.362 1.419 1.46 1.496 1.529 1.561 1.592 1.623 1.661 1.684 1.683 1.673 1.654 1.635 1.604 1.559 1.51 1.46 1.368 1.224 1.055 0.816 0.513 0.114 -0.461 -1.313 -2.503 -4.412 -6.574 -8.241 -9.615 -10.748 -11.71 -12.542 -13.3 -13.928 -14.542 -15.072 -15.514 -15.906 -16.283 -16.633 -16.93 -17.237 -17.53 -17.786 -18.038 -18.287 -18.492 -18.706 -18.926 -19.1 -19.271 -19.439 -19.619 -19.798 -19.92 -20.053 -20.272 -20.424 -20.583 -20.665 -20.831 -21.003 -21.184 -21.283 -21.516 -21.604 -21.715 -21.829 -22.059 -22.192 -22.356 -22.548 -22.731 -22.952 -23.221 -24.238 -4 ,18963 ,TETRA ,17556606,Fri Nov 26 07:44:39 CET,Fri Nov 26 09:34:24 CET,0.0 0.056 0.116 0.182 0.244 0.282 0.317 0.348 0.405 0.436 0.469 0.426 0.559 0.584 0.631 0.682 0.735 0.754 0.777 0.806 0.854 0.88 0.901 0.936 0.971 0.998 1.013 1.019 1.029 1.043 1.054 1.057 1.048 1.043 1.038 1.016 0.991 0.965 0.931 0.897 0.844 0.763 0.658 0.533 0.348 0.067 -0.313 -0.832 -1.585 -2.748 -4.701 -6.901 -8.615 -10.008 -11.143 -12.131 -12.947 -13.663 -14.27 -14.857 -15.38 -15.823 -16.221 -16.596 -16.943 -17.251 -17.568 -17.861 -18.106 -18.343 -18.596 -18.811 -19.023 -19.241 -19.403 -19.56 -19.735 -19.924 -20.118 -20.259 -20.401 -20.603 -20.742 -20.895 -20.975 -21.146 -21.33 -21.52 -21.617 -21.841 -21.909 -22.006 -22.11 -22.357 -22.484 -22.645 -22.827 -23.034 -23.293 -23.608 -24.779 -5 ,3414 ,TETRA ,17556607,Fri Nov 26 07:45:40 CET,Fri Nov 26 09:35:13 CET,0.0 0.174 0.244 0.318 0.385 0.437 0.486 0.529 0.59 0.622 0.654 0.603 0.736 0.761 0.808 0.848 0.891 0.912 0.941 0.969 1.02 1.048 1.065 1.086 1.105 1.119 1.132 1.152 1.18 1.203 1.229 1.252 1.265 1.271 1.255 1.233 1.215 1.175 1.116 1.034 0.955 0.88 0.756 0.598 0.393 0.133 -0.217 -0.71 -1.446 -2.603 -4.474 -6.636 -8.353 -9.758 -10.919 -11.888 -12.691 -13.414 -14.038 -14.643 -15.133 -15.573 -15.994 -16.38 -16.732 -17.04 -17.354 -17.64 -17.883 -18.13 -18.39 -18.601 -18.814 -19.029 -19.204 -19.38 -19.556 -19.738 -19.934 -20.076 -20.214 -20.427 -20.577 -20.735 -20.818 -20.973 -21.144 -21.328 -21.417 -21.636 -21.697 -21.811 -21.925 -22.136 -22.267 -22.428 -22.585 -22.748 -22.932 -23.211 -24.265 -6 ,28916 ,TETRA ,17556608,Fri Nov 26 07:45:39 CET,Fri Nov 26 09:35:36 CET,0.0 0.184 0.286 0.359 0.419 0.465 0.505 0.545 0.623 0.658 0.685 0.623 0.753 0.775 0.82 0.858 0.885 0.9 0.935 0.968 1.017 1.042 1.06 1.092 1.116 1.137 1.16 1.171 1.18 1.197 1.205 1.209 1.213 1.216 1.22 1.199 1.161 1.126 1.097 1.053 1.002 0.951 0.861 0.719 0.507 0.23 -0.152 -0.717 -1.538 -2.743 -4.656 -6.848 -8.571 -9.936 -11.06 -12.056 -12.882 -13.604 -14.217 -14.794 -15.296 -15.749 -16.175 -16.571 -16.925 -17.237 -17.552 -17.851 -18.116 -18.366 -18.618 -18.835 -19.054 -19.283 -19.461 -19.633 -19.82 -20.02 -20.226 -20.367 -20.508 -20.723 -20.873 -21.043 -21.124 -21.287 -21.457 -21.634 -21.726 -21.948 -22.027 -22.134 -22.24 -22.469 -22.602 -22.753 -22.923 -23.1 -23.319 -23.623 -24.531 -7 ,17371 ,TETRA ,17556609,Fri Nov 26 07:46:38 CET,Fri Nov 26 09:36:37 CET,0.0 0.154 0.277 0.358 0.42 0.48 0.53 0.573 0.654 0.693 0.721 0.654 0.785 0.813 0.86 0.897 0.93 0.945 0.97 0.993 1.058 1.098 1.12 1.143 1.151 1.159 1.185 1.203 1.207 1.206 1.211 1.224 1.227 1.217 1.198 1.179 1.154 1.116 1.072 1.019 0.95 0.856 0.717 0.561 0.371 0.095 -0.321 -0.86 -1.628 -2.786 -4.64 -6.763 -8.442 -9.788 -10.898 -11.873 -12.68 -13.386 -13.998 -14.615 -15.145 -15.606 -16.045 -16.445 -16.812 -17.153 -17.52 -17.831 -18.081 -18.345 -18.605 -18.802 -18.998 -19.224 -19.404 -19.579 -19.767 -19.964 -20.168 -20.309 -20.454 -20.678 -20.834 -20.984 -21.058 -21.225 -21.401 -21.578 -21.672 -21.899 -21.979 -22.099 -22.225 -22.448 -22.585 -22.755 -22.951 -23.165 -23.388 -23.673 -24.528 -8 ,8534 ,TETRA ,17556610,Fri Nov 26 07:46:38 CET,Fri Nov 26 09:19:44 CET,0.0 0.112 0.198 0.28 0.347 0.392 0.433 0.474 0.548 0.586 0.62 0.568 0.705 0.735 0.796 0.846 0.886 0.906 0.939 0.97 1.008 1.027 1.04 1.065 1.096 1.122 1.146 1.159 1.164 1.172 1.182 1.197 1.209 1.206 1.188 1.168 1.148 1.11 1.064 1.008 0.931 0.822 0.681 0.514 0.291 -0.001 -0.406 -0.957 -1.758 -2.93 -4.8 -6.984 -8.711 -10.096 -11.255 -12.301 -13.179 -13.909 -14.526 -15.149 -15.679 -16.154 -16.595 -16.997 -17.378 -17.709 -18.054 -18.362 -18.623 -18.89 -19.165 -19.409 -19.661 -19.905 -20.083 -20.265 -20.452 -20.662 -20.884 -21.031 -21.177 -21.395 -21.541 -21.691 -21.774 -21.94 -22.112 -22.295 -22.392 -22.613 -22.681 -22.791 -22.903 -23.134 -23.266 -23.418 -23.602 -23.803 -24.026 -24.292 -25.087 -9 ,4691 ,TETRA ,17556611,Fri Nov 26 07:46:38 CET,Fri Nov 26 09:19:48 CET,0.0 0.143 0.211 0.274 0.331 0.391 0.452 0.504 0.587 0.62 0.656 0.629 0.77 0.793 0.829 0.865 0.906 0.93 0.969 0.999 1.042 1.065 1.091 1.133 1.167 1.198 1.224 1.246 1.274 1.291 1.298 1.307 1.31 1.304 1.299 1.291 1.274 1.238 1.193 1.138 1.063 0.973 0.854 0.712 0.519 0.256 -0.124 -0.629 -1.362 -2.493 -4.346 -6.457 -8.12 -9.507 -10.673 -11.667 -12.493 -13.229 -13.841 -14.447 -14.968 -15.43 -15.858 -16.251 -16.625 -16.966 -17.329 -17.647 -17.909 -18.176 -18.454 -18.681 -18.905 -19.142 -19.327 -19.504 -19.681 -19.872 -20.082 -20.212 -20.342 -20.558 -20.704 -20.855 -20.933 -21.089 -21.255 -21.44 -21.527 -21.74 -21.792 -21.9 -22.019 -22.277 -22.422 -22.568 -22.74 -22.944 -23.186 -23.467 -24.163 -10 ,15405 ,TETRA ,17556612,Fri Nov 26 07:46:39 CET,Fri Nov 26 09:19:45 CET,0.0 0.188 0.298 0.392 0.472 0.538 0.617 0.687 0.801 0.861 0.918 0.925 1.078 1.124 1.215 1.305 1.392 1.434 1.508 1.575 1.681 1.733 1.756 1.783 1.813 1.839 1.858 1.884 1.93 1.964 1.994 2.036 2.078 2.107 2.124 2.151 2.167 2.154 2.139 2.104 2.046 1.967 1.86 1.715 1.488 1.206 0.802 0.262 -0.465 -1.59 -3.482 -5.686 -7.4 -8.809 -9.983 -11.002 -11.87 -12.625 -13.255 -13.869 -14.394 -14.856 -15.285 -15.704 -16.077 -16.401 -16.737 -17.031 -17.306 -17.59 -17.876 -18.118 -18.358 -18.602 -18.795 -18.988 -19.176 -19.361 -19.553 -19.684 -19.827 -20.06 -20.23 -20.402 -20.479 -20.639 -20.794 -20.939 -21.022 -21.245 -21.33 -21.44 -21.552 -21.793 -21.929 -22.081 -22.267 -22.482 -22.719 -23.005 -24.053 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_20_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_20_19.txt deleted file mode 100644 index 4e516e7e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_20_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16532 ,TETRA ,17556613,Fri Nov 26 07:46:38 CET,Fri Nov 26 09:40:40 CET,0.0 0.428 0.615 0.784 0.912 1.015 1.114 1.213 1.389 1.467 1.54 1.557 1.773 1.85 1.997 2.143 2.277 2.345 2.485 2.615 2.801 2.925 3.047 3.231 3.411 3.593 3.771 3.941 4.162 4.379 4.586 4.848 5.118 5.371 5.671 6.006 6.323 6.692 7.089 7.513 7.965 8.486 9.131 9.811 10.583 11.459 12.537 13.725 15.174 16.994 19.14 20.881 21.815 22.372 22.781 23.033 23.133 23.186 23.223 23.209 23.156 23.091 23.012 22.926 22.826 22.726 22.635 22.546 22.449 22.335 22.215 22.112 21.988 21.866 21.774 21.674 21.569 21.431 21.263 21.154 21.036 20.849 20.706 20.53 20.441 20.264 20.082 19.877 19.77 19.555 19.406 19.26 19.091 18.72 18.494 18.243 18.006 17.733 17.416 16.919 15.133 -2 ,2888 ,TETRA ,17556614,Fri Nov 26 07:46:38 CET,Fri Nov 26 09:39:12 CET,0.0 0.303 0.435 0.545 0.651 0.747 0.835 0.929 1.099 1.175 1.259 1.295 1.505 1.579 1.721 1.849 1.987 2.057 2.185 2.321 2.517 2.639 2.765 2.962 3.153 3.332 3.501 3.678 3.913 4.126 4.327 4.588 4.85 5.104 5.406 5.749 6.075 6.435 6.854 7.314 7.785 8.313 8.953 9.633 10.426 11.326 12.381 13.612 15.103 16.894 19.048 20.829 21.889 22.493 22.863 23.096 23.227 23.287 23.312 23.33 23.319 23.251 23.166 23.07 22.961 22.856 22.74 22.636 22.552 22.456 22.331 22.226 22.117 21.977 21.855 21.727 21.586 21.435 21.264 21.146 21.033 20.843 20.72 20.595 20.517 20.34 20.163 19.954 19.846 19.635 19.506 19.374 19.216 18.885 18.719 18.529 18.307 18.017 17.697 17.253 14.962 -3 ,687 ,TETRA ,17556615,Fri Nov 26 07:47:38 CET,Fri Nov 26 09:28:30 CET,0.0 0.251 0.435 0.555 0.649 0.759 0.861 0.954 1.126 1.205 1.289 1.319 1.528 1.602 1.742 1.871 1.994 2.055 2.186 2.323 2.518 2.639 2.761 2.945 3.116 3.282 3.454 3.623 3.842 4.058 4.279 4.544 4.798 5.052 5.348 5.682 6.002 6.359 6.768 7.218 7.668 8.197 8.85 9.503 10.284 11.174 12.244 13.507 15.017 16.803 19.022 20.859 21.777 22.279 22.676 22.919 22.994 23.038 23.05 23.013 22.958 22.893 22.802 22.697 22.606 22.532 22.43 22.327 22.223 22.107 21.995 21.904 21.804 21.687 21.597 21.499 21.375 21.228 21.08 20.977 20.881 20.724 20.601 20.479 20.408 20.245 20.072 19.859 19.737 19.519 19.373 19.227 19.072 18.71 18.504 18.288 18.041 17.748 17.363 16.863 14.212 -4 ,8734 ,TETRA ,17556616,Fri Nov 26 07:48:39 CET,Fri Nov 26 09:24:08 CET,0.0 0.217 0.359 0.457 0.547 0.644 0.741 0.83 1.005 1.083 1.155 1.174 1.384 1.462 1.614 1.761 1.897 1.965 2.097 2.22 2.399 2.514 2.632 2.805 2.975 3.144 3.315 3.485 3.708 3.933 4.16 4.425 4.67 4.911 5.192 5.523 5.84 6.183 6.577 7.004 7.457 7.989 8.628 9.29 10.045 10.894 11.934 13.152 14.618 16.424 18.658 20.505 21.607 22.284 22.668 22.892 23.03 23.075 23.057 23.01 22.957 22.888 22.813 22.744 22.65 22.552 22.449 22.345 22.254 22.159 22.048 21.938 21.812 21.689 21.579 21.46 21.342 21.217 21.066 20.951 20.847 20.679 20.55 20.43 20.368 20.208 20.011 19.794 19.679 19.442 19.247 19.101 18.959 18.616 18.391 18.142 17.856 17.515 17.151 16.663 14.269 -5 ,28320 ,TETRA ,17556617,Fri Nov 26 07:48:39 CET,Fri Nov 26 09:24:56 CET,0.0 0.301 0.461 0.58 0.69 0.793 0.893 0.976 1.135 1.22 1.306 1.342 1.55 1.622 1.763 1.906 2.055 2.122 2.254 2.39 2.583 2.705 2.824 3.012 3.194 3.364 3.528 3.685 3.891 4.096 4.304 4.563 4.815 5.062 5.353 5.687 6.012 6.371 6.755 7.187 7.661 8.189 8.81 9.44 10.218 11.128 12.221 13.481 14.932 16.707 18.94 20.683 21.702 22.365 22.748 22.981 23.12 23.173 23.196 23.206 23.155 23.088 23.036 22.967 22.872 22.77 22.672 22.576 22.475 22.379 22.274 22.174 22.065 21.95 21.853 21.741 21.621 21.497 21.366 21.266 21.154 20.977 20.855 20.735 20.671 20.509 20.332 20.154 20.057 19.844 19.678 19.527 19.382 19.072 18.894 18.694 18.479 18.253 17.924 17.432 14.667 -6 ,20881 ,TETRA ,17556618,Fri Nov 26 07:48:39 CET,Fri Nov 26 09:42:24 CET,0.0 0.245 0.372 0.477 0.578 0.68 0.775 0.856 1.039 1.135 1.215 1.231 1.446 1.522 1.665 1.809 1.952 2.021 2.155 2.296 2.499 2.632 2.764 2.95 3.127 3.306 3.481 3.649 3.872 4.087 4.281 4.519 4.78 5.041 5.345 5.693 6.015 6.364 6.766 7.218 7.687 8.229 8.894 9.567 10.372 11.291 12.343 13.551 15.061 16.908 19.196 20.987 21.96 22.548 22.892 23.107 23.232 23.288 23.297 23.296 23.285 23.248 23.198 23.147 23.064 22.943 22.812 22.695 22.596 22.488 22.364 22.26 22.144 22.013 21.897 21.782 21.662 21.535 21.387 21.284 21.181 21.005 20.887 20.763 20.694 20.556 20.403 20.218 20.122 19.927 19.825 19.709 19.571 19.231 19.049 18.874 18.675 18.395 18.058 17.499 15.091 -7 ,13886 ,TETRA ,17556619,Fri Nov 26 07:48:38 CET,Fri Nov 26 09:42:24 CET,0.0 0.215 0.368 0.499 0.615 0.723 0.823 0.915 1.085 1.158 1.226 1.251 1.466 1.543 1.695 1.838 1.974 2.039 2.167 2.296 2.488 2.62 2.742 2.918 3.092 3.266 3.441 3.607 3.827 4.036 4.238 4.501 4.761 5.01 5.301 5.636 5.968 6.341 6.751 7.195 7.672 8.219 8.866 9.535 10.344 11.249 12.283 13.503 15.034 16.829 18.924 20.675 21.687 22.296 22.694 22.942 23.046 23.1 23.115 23.081 23.051 23.034 22.985 22.914 22.845 22.758 22.666 22.587 22.505 22.407 22.303 22.213 22.108 21.993 21.899 21.787 21.664 21.539 21.397 21.297 21.192 20.996 20.865 20.738 20.667 20.52 20.391 20.24 20.141 19.934 19.78 19.627 19.474 19.1 18.889 18.688 18.455 18.127 17.704 17.176 15.162 -8 ,13306 ,TETRA ,17556620,Fri Nov 26 07:49:39 CET,Fri Nov 26 09:41:53 CET,0.0 0.183 0.305 0.428 0.532 0.636 0.739 0.836 1.022 1.1 1.182 1.231 1.445 1.518 1.666 1.809 1.949 2.022 2.156 2.281 2.473 2.594 2.71 2.886 3.061 3.229 3.39 3.548 3.76 3.974 4.181 4.433 4.679 4.924 5.217 5.54 5.852 6.215 6.611 7.044 7.503 8.018 8.659 9.306 10.043 10.921 12.005 13.299 14.841 16.684 18.961 20.755 21.735 22.324 22.667 22.909 23.051 23.097 23.112 23.08 23.017 22.96 22.885 22.816 22.742 22.642 22.534 22.423 22.328 22.234 22.124 22.021 21.891 21.744 21.632 21.518 21.4 21.282 21.143 21.041 20.939 20.765 20.644 20.515 20.441 20.272 20.091 19.909 19.81 19.602 19.471 19.345 19.217 18.882 18.694 18.509 18.282 17.98 17.561 16.944 14.235 -9 ,3809 ,TETRA ,17556621,Fri Nov 26 07:49:39 CET,Fri Nov 26 09:52:32 CET,0.0 0.254 0.407 0.546 0.682 0.796 0.883 0.96 1.123 1.202 1.278 1.293 1.502 1.575 1.716 1.862 2.003 2.065 2.195 2.327 2.507 2.621 2.737 2.913 3.092 3.263 3.427 3.592 3.815 4.037 4.245 4.505 4.766 5.02 5.321 5.647 5.961 6.313 6.709 7.138 7.619 8.178 8.82 9.48 10.28 11.189 12.21 13.393 14.883 16.69 18.816 20.527 21.519 22.119 22.5 22.739 22.848 22.916 22.966 22.951 22.885 22.814 22.744 22.681 22.616 22.545 22.45 22.355 22.263 22.144 22.021 21.916 21.789 21.657 21.548 21.427 21.312 21.187 21.032 20.931 20.829 20.632 20.493 20.36 20.286 20.133 19.962 19.757 19.648 19.425 19.27 19.138 19.002 18.678 18.477 18.274 18.058 17.791 17.451 16.932 14.337 -10 ,31283 ,TETRA ,17556622,Fri Nov 26 07:49:38 CET,Fri Nov 26 09:32:12 CET,0.0 0.195 0.309 0.425 0.536 0.637 0.734 0.828 1.002 1.088 1.171 1.2 1.422 1.51 1.666 1.811 1.952 2.017 2.146 2.278 2.475 2.602 2.727 2.918 3.109 3.291 3.46 3.619 3.834 4.062 4.285 4.546 4.796 5.035 5.319 5.645 5.97 6.345 6.744 7.162 7.613 8.154 8.804 9.471 10.293 11.261 12.412 13.674 15.129 16.867 19.007 20.828 21.887 22.574 22.983 23.2 23.331 23.39 23.401 23.4 23.367 23.32 23.244 23.143 23.057 22.959 22.824 22.72 22.637 22.547 22.443 22.341 22.22 22.085 21.982 21.872 21.748 21.612 21.469 21.377 21.28 21.124 20.992 20.825 20.752 20.602 20.412 20.212 20.123 19.939 19.842 19.725 19.597 19.289 19.112 18.929 18.721 18.463 18.119 17.604 15.473 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_20_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_20_33.txt deleted file mode 100644 index c02dcd4c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_20_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10215 ,TETRA ,17556623,Fri Nov 26 07:49:39 CET,Fri Nov 26 09:42:04 CET,0.0 0.81 1.074 1.312 1.535 1.725 1.902 2.069 2.37 2.513 2.658 2.781 3.037 3.153 3.362 3.568 3.762 3.862 4.058 4.234 4.496 4.666 4.832 5.07 5.31 5.551 5.783 6.001 6.271 6.538 6.787 7.107 7.441 7.752 8.112 8.493 8.85 9.268 9.704 10.172 10.711 11.32 11.955 12.558 13.324 14.156 15.073 16.13 17.454 19.077 20.718 21.739 22.258 22.495 22.539 22.466 22.333 22.182 22.029 21.86 21.69 21.517 21.35 21.176 20.998 20.824 20.655 20.491 20.331 20.175 19.997 19.837 19.665 19.488 19.347 19.21 19.075 18.935 18.795 18.683 18.554 18.363 18.233 18.097 18.024 17.859 17.674 17.447 17.337 17.132 17.051 16.95 16.819 16.509 16.317 16.112 15.921 15.704 15.421 14.981 12.842 -2 ,23387 ,TETRA ,17556624,Fri Nov 26 07:49:38 CET,Fri Nov 26 09:44:41 CET,0.0 0.92 1.276 1.541 1.772 1.965 2.142 2.309 2.608 2.75 2.891 3.014 3.269 3.38 3.606 3.819 4.014 4.114 4.301 4.476 4.739 4.915 5.084 5.314 5.54 5.77 5.996 6.21 6.486 6.77 7.051 7.384 7.688 7.963 8.308 8.723 9.105 9.495 9.911 10.341 10.787 11.298 11.878 12.482 13.215 13.997 14.907 15.905 16.959 18.159 19.538 20.475 20.835 20.932 20.836 20.719 20.597 20.393 20.202 20.013 19.849 19.667 19.464 19.304 19.153 18.985 18.787 18.628 18.505 18.383 18.252 18.116 17.968 17.817 17.69 17.557 17.428 17.292 17.133 17.022 16.917 16.742 16.602 16.452 16.37 16.212 16.051 15.868 15.762 15.533 15.404 15.275 15.143 14.83 14.631 14.416 14.2 13.919 13.522 13.029 11.894 -3 ,24714 ,TETRA ,17556625,Fri Nov 26 07:50:39 CET,Fri Nov 26 09:43:31 CET,0.0 0.68 0.971 1.227 1.46 1.656 1.824 1.984 2.285 2.436 2.595 2.743 2.996 3.106 3.326 3.536 3.744 3.846 4.046 4.235 4.502 4.681 4.847 5.084 5.325 5.557 5.785 6.009 6.286 6.539 6.785 7.101 7.426 7.744 8.094 8.468 8.822 9.203 9.606 10.031 10.496 11.008 11.562 12.156 12.939 13.772 14.675 15.658 16.75 18.041 19.484 20.484 20.939 21.112 21.099 21.047 20.951 20.804 20.634 20.46 20.283 20.096 19.898 19.712 19.546 19.381 19.226 19.097 18.968 18.805 18.646 18.536 18.415 18.257 18.121 17.986 17.842 17.682 17.507 17.394 17.274 17.082 16.945 16.791 16.717 16.572 16.407 16.23 16.124 15.887 15.766 15.651 15.514 15.192 15.006 14.823 14.645 14.382 14.034 13.56 10.769 -4 ,31303 ,TETRA ,17556626,Fri Nov 26 07:51:42 CET,Fri Nov 26 09:44:08 CET,0.0 0.839 1.156 1.404 1.601 1.785 1.971 2.143 2.462 2.605 2.726 2.827 3.076 3.175 3.376 3.589 3.799 3.903 4.106 4.294 4.556 4.728 4.907 5.161 5.399 5.63 5.849 6.072 6.373 6.652 6.905 7.196 7.503 7.815 8.16 8.543 8.91 9.335 9.779 10.221 10.69 11.217 11.897 12.625 13.413 14.251 15.177 16.143 17.24 18.483 19.849 20.854 21.326 21.498 21.468 21.33 21.207 21.074 20.908 20.708 20.514 20.339 20.156 19.962 19.79 19.631 19.446 19.265 19.109 18.952 18.775 18.61 18.451 18.317 18.204 18.075 17.953 17.805 17.638 17.532 17.421 17.232 17.082 16.918 16.827 16.627 16.446 16.232 16.113 15.893 15.76 15.621 15.499 15.215 15.03 14.83 14.607 14.354 14.002 13.535 11.572 -5 ,12213 ,TETRA ,17556627,Fri Nov 26 07:51:43 CET,Fri Nov 26 09:44:28 CET,0.0 0.817 1.068 1.303 1.538 1.754 1.95 2.12 2.433 2.574 2.703 2.822 3.081 3.202 3.439 3.655 3.85 3.948 4.141 4.326 4.573 4.72 4.868 5.097 5.323 5.541 5.761 5.99 6.274 6.547 6.822 7.137 7.449 7.77 8.118 8.494 8.874 9.271 9.715 10.192 10.677 11.219 11.863 12.516 13.225 14.003 14.898 15.863 17.006 18.35 19.908 21.002 21.488 21.704 21.719 21.623 21.492 21.348 21.205 21.052 20.904 20.721 20.539 20.363 20.167 19.992 19.806 19.636 19.499 19.353 19.192 19.069 18.947 18.807 18.685 18.556 18.412 18.255 18.101 17.992 17.872 17.691 17.55 17.383 17.295 17.118 16.918 16.696 16.583 16.348 16.227 16.108 15.981 15.692 15.523 15.321 15.078 14.845 14.608 14.127 12.076 -6 ,16185 ,TETRA ,17556628,Fri Nov 26 07:52:40 CET,Fri Nov 26 09:45:29 CET,0.0 0.889 1.222 1.468 1.67 1.852 2.025 2.196 2.514 2.649 2.786 2.918 3.17 3.286 3.521 3.743 3.942 4.038 4.234 4.435 4.724 4.899 5.067 5.314 5.551 5.782 5.992 6.198 6.479 6.735 6.987 7.304 7.625 7.938 8.268 8.646 9.037 9.475 9.936 10.411 10.934 11.539 12.217 12.858 13.611 14.424 15.317 16.329 17.503 18.825 20.201 21.117 21.503 21.675 21.749 21.669 21.53 21.433 21.331 21.137 20.936 20.746 20.573 20.408 20.237 20.074 19.881 19.708 19.552 19.381 19.2 19.044 18.875 18.693 18.56 18.405 18.222 18.055 17.876 17.739 17.597 17.366 17.204 17.037 16.942 16.735 16.544 16.337 16.225 15.997 15.83 15.679 15.522 15.169 14.977 14.786 14.548 14.292 14.014 13.572 9.862 -7 ,1469 ,TETRA ,17556629,Fri Nov 26 07:52:40 CET,Fri Nov 26 09:45:46 CET,0.0 0.642 0.934 1.166 1.379 1.57 1.749 1.92 2.222 2.358 2.485 2.587 2.847 2.973 3.206 3.411 3.601 3.698 3.892 4.078 4.333 4.488 4.657 4.914 5.158 5.405 5.633 5.854 6.155 6.439 6.702 7.006 7.303 7.607 7.964 8.359 8.731 9.126 9.561 10.047 10.55 11.136 11.844 12.556 13.387 14.261 15.157 16.235 17.582 18.932 20.321 21.393 21.877 22.06 22.107 22.058 21.944 21.808 21.643 21.446 21.256 21.065 20.885 20.711 20.539 20.386 20.194 20.016 19.878 19.707 19.497 19.314 19.14 18.973 18.843 18.697 18.533 18.363 18.185 18.064 17.931 17.71 17.541 17.36 17.269 17.074 16.867 16.64 16.522 16.287 16.132 16.007 15.871 15.559 15.381 15.181 14.961 14.716 14.41 13.897 11.953 -8 ,20145 ,TETRA ,17556630,Fri Nov 26 07:52:40 CET,Fri Nov 26 09:28:33 CET,0.0 0.746 1.062 1.309 1.549 1.775 1.973 2.148 2.458 2.597 2.734 2.856 3.107 3.226 3.463 3.692 3.895 3.989 4.185 4.376 4.639 4.81 4.978 5.21 5.423 5.628 5.841 6.056 6.34 6.617 6.858 7.128 7.407 7.673 7.988 8.391 8.782 9.181 9.599 10.034 10.51 11.067 11.671 12.279 13.032 13.896 14.838 15.874 17.048 18.332 19.734 20.724 21.252 21.491 21.521 21.468 21.354 21.202 21.047 20.869 20.667 20.475 20.306 20.11 19.902 19.738 19.571 19.385 19.228 19.078 18.924 18.794 18.664 18.528 18.403 18.267 18.125 17.962 17.793 17.684 17.562 17.364 17.222 17.054 16.968 16.815 16.65 16.457 16.342 16.108 15.953 15.808 15.673 15.372 15.19 15.006 14.8 14.506 14.159 13.69 11.913 -9 ,25932 ,TETRA ,17556631,Fri Nov 26 07:52:40 CET,Fri Nov 26 09:46:08 CET,0.0 1.098 1.42 1.669 1.902 2.086 2.265 2.43 2.72 2.86 2.991 3.1 3.355 3.472 3.696 3.911 4.119 4.216 4.404 4.586 4.847 5.015 5.176 5.427 5.669 5.899 6.123 6.328 6.585 6.85 7.113 7.392 7.659 7.946 8.289 8.651 8.957 9.337 9.764 10.212 10.702 11.195 11.766 12.397 13.126 13.88 14.779 15.846 17.024 18.356 19.935 21.126 21.631 21.829 21.87 21.822 21.73 21.605 21.483 21.335 21.198 21.054 20.888 20.73 20.586 20.453 20.275 20.092 19.949 19.81 19.655 19.504 19.343 19.185 19.051 18.913 18.769 18.606 18.43 18.303 18.169 17.949 17.793 17.648 17.57 17.392 17.202 16.998 16.891 16.683 16.591 16.473 16.334 15.993 15.791 15.575 15.358 15.058 14.695 14.145 11.958 -10 ,26536 ,TETRA ,17556632,Fri Nov 26 07:52:40 CET,Fri Nov 26 09:45:37 CET,0.0 0.885 1.194 1.442 1.655 1.834 1.998 2.155 2.443 2.59 2.729 2.846 3.108 3.228 3.449 3.653 3.852 3.945 4.132 4.315 4.58 4.757 4.924 5.173 5.405 5.606 5.803 6.011 6.279 6.545 6.807 7.114 7.411 7.704 8.049 8.425 8.785 9.192 9.59 9.989 10.426 10.965 11.657 12.379 13.216 14.073 15.025 16.087 17.351 18.853 20.543 21.752 22.307 22.559 22.623 22.581 22.487 22.389 22.271 22.111 21.958 21.821 21.703 21.578 21.428 21.278 21.118 20.964 20.835 20.709 20.555 20.414 20.264 20.112 19.996 19.861 19.725 19.569 19.389 19.271 19.145 18.942 18.792 18.624 18.539 18.372 18.194 17.97 17.843 17.597 17.41 17.261 17.104 16.749 16.541 16.315 16.088 15.797 15.372 14.806 12.878 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_21_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_21_22.txt deleted file mode 100644 index 7515518e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_21_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21523 ,TETRA ,17556633,Fri Nov 26 07:53:39 CET,Fri Nov 26 09:45:11 CET,0.0 0.84 1.149 1.391 1.601 1.773 1.904 2.026 2.261 2.368 2.469 2.553 2.719 2.798 2.956 3.101 3.236 3.305 3.439 3.561 3.726 3.828 3.939 4.105 4.263 4.409 4.552 4.694 4.881 5.061 5.216 5.411 5.606 5.781 5.987 6.226 6.445 6.676 6.925 7.203 7.495 7.795 8.135 8.473 8.847 9.251 9.694 10.174 10.688 11.19 11.62 11.857 11.831 11.671 11.486 11.263 11.055 10.819 10.588 10.359 10.136 9.932 9.743 9.573 9.424 9.28 9.117 8.963 8.833 8.714 8.59 8.477 8.36 8.243 8.15 8.049 7.939 7.821 7.691 7.606 7.527 7.39 7.298 7.205 7.155 7.046 6.925 6.805 6.745 6.593 6.527 6.444 6.359 6.194 6.091 5.974 5.852 5.697 5.495 5.251 4.576 -2 ,26702 ,TETRA ,17556634,Fri Nov 26 07:54:39 CET,Fri Nov 26 09:45:53 CET,0.0 0.96 1.226 1.441 1.617 1.774 1.921 2.051 2.291 2.409 2.511 2.602 2.779 2.865 3.026 3.17 3.298 3.363 3.489 3.611 3.801 3.921 4.031 4.187 4.338 4.47 4.59 4.709 4.868 5.03 5.189 5.366 5.525 5.674 5.856 6.069 6.266 6.479 6.698 6.926 7.155 7.417 7.765 8.112 8.459 8.795 9.2 9.677 10.207 10.737 11.22 11.433 11.376 11.222 11.06 10.855 10.645 10.42 10.192 9.989 9.828 9.677 9.52 9.361 9.207 9.063 8.917 8.788 8.673 8.526 8.379 8.253 8.104 7.974 7.882 7.78 7.672 7.556 7.439 7.359 7.277 7.149 7.056 6.968 6.917 6.807 6.688 6.563 6.503 6.358 6.316 6.244 6.167 6.0 5.905 5.784 5.651 5.489 5.294 5.064 4.174 -3 ,2205 ,TETRA ,17556635,Fri Nov 26 07:54:40 CET,Fri Nov 26 09:46:16 CET,0.0 1.067 1.329 1.53 1.694 1.827 1.966 2.107 2.397 2.529 2.636 2.723 2.889 2.969 3.126 3.277 3.426 3.498 3.625 3.748 3.924 4.029 4.135 4.29 4.436 4.564 4.686 4.811 4.976 5.132 5.283 5.467 5.637 5.809 6.009 6.213 6.411 6.625 6.828 7.039 7.277 7.55 7.85 8.153 8.52 8.927 9.371 9.859 10.412 10.916 11.325 11.541 11.557 11.455 11.307 11.134 10.944 10.74 10.561 10.364 10.169 10.012 9.858 9.707 9.572 9.445 9.302 9.16 9.041 8.918 8.788 8.681 8.549 8.41 8.316 8.225 8.133 8.03 7.918 7.835 7.741 7.585 7.49 7.398 7.35 7.245 7.128 7.014 6.949 6.793 6.715 6.631 6.549 6.39 6.302 6.188 6.038 5.828 5.576 5.268 4.389 -4 ,10104 ,TETRA ,17556636,Fri Nov 26 07:54:40 CET,Fri Nov 26 09:47:44 CET,0.0 1.099 1.406 1.63 1.826 2.004 2.16 2.298 2.541 2.657 2.759 2.864 3.043 3.126 3.289 3.44 3.58 3.646 3.779 3.91 4.106 4.227 4.334 4.481 4.636 4.791 4.926 5.048 5.207 5.361 5.511 5.689 5.848 6.008 6.194 6.399 6.596 6.804 7.025 7.259 7.509 7.791 8.13 8.454 8.798 9.182 9.614 10.097 10.633 11.129 11.52 11.692 11.658 11.494 11.289 11.094 10.919 10.735 10.535 10.311 10.102 9.877 9.673 9.52 9.363 9.198 9.031 8.888 8.772 8.649 8.519 8.414 8.306 8.207 8.119 8.004 7.894 7.783 7.665 7.585 7.503 7.38 7.282 7.18 7.132 7.024 6.909 6.79 6.727 6.574 6.516 6.451 6.373 6.191 6.108 6.005 5.883 5.755 5.582 5.331 4.656 -5 ,9447 ,TETRA ,17556637,Fri Nov 26 07:54:40 CET,Fri Nov 26 09:46:37 CET,0.0 1.249 1.602 1.852 2.061 2.23 2.374 2.512 2.775 2.887 2.986 3.082 3.27 3.362 3.518 3.668 3.813 3.88 4.002 4.117 4.284 4.39 4.492 4.629 4.761 4.901 5.05 5.192 5.369 5.535 5.678 5.857 6.034 6.205 6.392 6.583 6.767 6.982 7.23 7.498 7.771 8.059 8.389 8.726 9.092 9.473 9.887 10.356 10.86 11.368 11.851 12.004 11.903 11.724 11.52 11.288 11.047 10.806 10.588 10.355 10.137 9.936 9.746 9.579 9.41 9.254 9.109 8.971 8.843 8.71 8.561 8.431 8.316 8.211 8.115 8.01 7.907 7.802 7.687 7.61 7.531 7.413 7.337 7.238 7.185 7.085 6.976 6.843 6.759 6.591 6.524 6.445 6.356 6.178 6.09 6.003 5.894 5.764 5.615 5.387 4.447 -6 ,14132 ,TETRA ,17556638,Fri Nov 26 07:54:40 CET,Fri Nov 26 09:46:45 CET,0.0 0.997 1.362 1.607 1.794 1.95 2.075 2.197 2.418 2.519 2.609 2.677 2.851 2.932 3.102 3.271 3.42 3.496 3.654 3.816 4.036 4.161 4.274 4.426 4.587 4.756 4.916 5.07 5.26 5.437 5.602 5.792 5.973 6.148 6.355 6.583 6.802 7.056 7.332 7.594 7.853 8.136 8.463 8.81 9.188 9.579 9.989 10.396 10.857 11.372 11.811 11.98 11.913 11.736 11.538 11.34 11.144 10.954 10.788 10.602 10.41 10.242 10.097 9.963 9.835 9.707 9.562 9.425 9.304 9.181 9.058 8.95 8.825 8.701 8.607 8.508 8.406 8.287 8.157 8.074 7.987 7.845 7.746 7.645 7.591 7.489 7.384 7.259 7.194 7.044 6.984 6.905 6.819 6.627 6.528 6.421 6.273 6.109 5.922 5.589 4.351 -7 ,19275 ,TETRA ,17556639,Fri Nov 26 07:54:40 CET,Fri Nov 26 09:46:54 CET,0.0 1.068 1.353 1.559 1.73 1.886 2.02 2.14 2.354 2.465 2.578 2.688 2.875 2.967 3.132 3.275 3.41 3.483 3.623 3.738 3.893 4.004 4.113 4.268 4.408 4.534 4.667 4.804 4.972 5.129 5.273 5.435 5.599 5.749 5.924 6.142 6.356 6.596 6.853 7.125 7.415 7.739 8.111 8.465 8.849 9.243 9.67 10.143 10.603 10.99 11.35 11.538 11.449 11.287 11.117 10.907 10.682 10.446 10.254 10.035 9.843 9.674 9.477 9.298 9.146 9.002 8.855 8.716 8.599 8.492 8.374 8.275 8.174 8.054 7.948 7.834 7.721 7.602 7.493 7.424 7.342 7.207 7.113 7.009 6.951 6.835 6.718 6.605 6.551 6.407 6.351 6.274 6.187 5.996 5.892 5.785 5.665 5.534 5.379 5.159 4.222 -8 ,12938 ,TETRA ,17556640,Fri Nov 26 07:55:40 CET,Fri Nov 26 09:31:09 CET,0.0 1.179 1.482 1.703 1.899 2.08 2.239 2.384 2.636 2.753 2.863 2.962 3.137 3.223 3.393 3.559 3.714 3.789 3.93 4.05 4.223 4.332 4.436 4.58 4.712 4.848 4.987 5.124 5.304 5.494 5.694 5.913 6.103 6.272 6.466 6.69 6.905 7.145 7.407 7.662 7.912 8.199 8.531 8.833 9.173 9.562 9.985 10.426 10.92 11.477 11.96 12.088 11.983 11.782 11.571 11.347 11.108 10.888 10.696 10.483 10.282 10.088 9.9 9.724 9.55 9.391 9.219 9.054 8.92 8.8 8.671 8.547 8.422 8.288 8.188 8.076 7.943 7.811 7.68 7.592 7.504 7.364 7.273 7.189 7.141 7.037 6.927 6.817 6.764 6.621 6.574 6.497 6.407 6.188 6.079 5.971 5.85 5.689 5.48 5.226 4.397 -9 ,4946 ,TETRA ,17556641,Fri Nov 26 07:55:40 CET,Fri Nov 26 09:31:05 CET,0.0 0.81 1.106 1.301 1.471 1.64 1.802 1.933 2.154 2.252 2.344 2.428 2.608 2.708 2.884 3.042 3.187 3.258 3.407 3.54 3.715 3.823 3.927 4.081 4.233 4.387 4.531 4.662 4.827 4.989 5.148 5.342 5.54 5.722 5.921 6.141 6.35 6.574 6.81 7.067 7.314 7.579 7.888 8.17 8.502 8.892 9.327 9.782 10.263 10.752 11.162 11.334 11.241 11.057 10.834 10.602 10.397 10.183 9.976 9.747 9.545 9.362 9.173 8.985 8.814 8.659 8.488 8.335 8.203 8.057 7.897 7.768 7.633 7.491 7.376 7.261 7.15 7.025 6.89 6.796 6.7 6.564 6.474 6.384 6.335 6.233 6.128 6.011 5.941 5.779 5.709 5.632 5.559 5.399 5.285 5.164 5.029 4.887 4.745 4.518 3.668 -10 ,26425 ,TETRA ,17556642,Fri Nov 26 07:55:39 CET,Fri Nov 26 09:47:47 CET,0.0 0.974 1.212 1.415 1.596 1.761 1.907 2.054 2.314 2.421 2.523 2.61 2.779 2.856 3.0 3.141 3.272 3.336 3.462 3.576 3.755 3.874 3.98 4.134 4.279 4.41 4.535 4.665 4.831 4.98 5.131 5.329 5.52 5.701 5.919 6.167 6.395 6.648 6.915 7.166 7.436 7.754 8.118 8.473 8.842 9.227 9.691 10.211 10.762 11.31 11.777 11.884 11.79 11.624 11.424 11.195 10.953 10.711 10.473 10.228 10.001 9.783 9.563 9.366 9.192 9.026 8.851 8.706 8.578 8.431 8.288 8.172 8.034 7.883 7.77 7.648 7.514 7.352 7.184 7.093 7.008 6.855 6.759 6.67 6.622 6.529 6.433 6.327 6.26 6.104 6.053 5.986 5.919 5.762 5.64 5.484 5.331 5.153 4.924 4.597 3.476 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_21_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_21_32.txt deleted file mode 100644 index 330022bf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_21_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2396 ,KEBNE ,17025418,Wed Dec 22 12:29:23 CET,Wed Dec 22 14:04:38 CET,0.0 0.248 0.349 0.406 0.46 0.498 0.524 0.558 0.618 0.64 0.659 0.594 0.696 0.712 0.727 0.735 0.747 0.749 0.748 0.741 0.729 0.728 0.725 0.73 0.74 0.732 0.717 0.693 0.648 0.614 0.589 0.559 0.525 0.484 0.426 0.356 0.277 0.176 0.06 -0.087 -0.282 -0.511 -0.798 -1.131 -1.548 -2.091 -2.854 -3.856 -5.22 -7.176 -10.275 -13.682 -16.314 -18.471 -20.222 -21.74 -23.006 -24.08 -25.012 -25.913 -26.638 -27.279 -27.883 -28.435 -28.92 -29.356 -29.814 -30.233 -30.598 -30.967 -31.346 -31.643 -31.944 -32.253 -32.491 -32.732 -32.997 -33.285 -33.572 -33.769 -33.977 -34.287 -34.5 -34.733 -34.855 -35.088 -35.33 -35.589 -35.72 -35.989 -36.162 -36.321 -36.49 -36.888 -37.104 -37.339 -37.606 -37.885 -38.206 -38.716 -41.731 -2 ,19533 ,KEBNE ,17025419,Wed Dec 22 12:30:24 CET,Wed Dec 22 14:05:32 CET,0.0 0.24 0.354 0.455 0.526 0.569 0.596 0.62 0.659 0.683 0.704 0.659 0.765 0.786 0.825 0.843 0.854 0.863 0.872 0.868 0.858 0.856 0.851 0.84 0.837 0.829 0.811 0.794 0.767 0.73 0.697 0.657 0.609 0.557 0.478 0.394 0.319 0.217 0.096 -0.047 -0.218 -0.45 -0.75 -1.086 -1.546 -2.13 -2.904 -3.897 -5.271 -7.305 -10.404 -13.817 -16.467 -18.594 -20.335 -21.794 -23.027 -24.091 -24.95 -25.798 -26.525 -27.149 -27.747 -28.305 -28.798 -29.262 -29.748 -30.181 -30.548 -30.926 -31.309 -31.618 -31.935 -32.257 -32.507 -32.764 -33.032 -33.322 -33.625 -33.816 -34.015 -34.335 -34.552 -34.777 -34.89 -35.134 -35.397 -35.669 -35.803 -36.063 -36.208 -36.364 -36.528 -36.874 -37.081 -37.306 -37.58 -37.889 -38.261 -38.855 -40.665 -3 ,17828 ,KEBNE ,17025420,Wed Dec 22 12:31:26 CET,Wed Dec 22 14:06:45 CET,0.0 0.104 0.166 0.23 0.299 0.351 0.388 0.422 0.471 0.488 0.502 0.44 0.54 0.549 0.563 0.585 0.61 0.621 0.634 0.64 0.648 0.641 0.629 0.623 0.608 0.581 0.554 0.532 0.5 0.465 0.427 0.381 0.327 0.268 0.203 0.117 0.022 -0.093 -0.224 -0.378 -0.568 -0.799 -1.107 -1.462 -1.928 -2.511 -3.238 -4.2 -5.611 -7.599 -10.627 -14.076 -16.739 -18.883 -20.645 -22.14 -23.401 -24.516 -25.442 -26.323 -27.094 -27.767 -28.396 -28.98 -29.511 -30.0 -30.507 -30.941 -31.303 -31.667 -32.039 -32.354 -32.675 -32.995 -33.255 -33.539 -33.827 -34.112 -34.41 -34.612 -34.814 -35.143 -35.361 -35.563 -35.665 -35.886 -36.133 -36.419 -36.572 -36.85 -37.048 -37.212 -37.376 -37.772 -38.012 -38.257 -38.519 -38.831 -39.206 -39.703 -42.909 -4 ,32287 ,KEBNE ,17025421,Wed Dec 22 12:32:28 CET,Wed Dec 22 14:07:51 CET,0.0 0.21 0.347 0.424 0.468 0.506 0.533 0.564 0.635 0.675 0.711 0.663 0.772 0.787 0.798 0.814 0.836 0.845 0.857 0.859 0.865 0.868 0.864 0.857 0.849 0.849 0.851 0.853 0.848 0.838 0.829 0.808 0.782 0.75 0.708 0.641 0.556 0.438 0.292 0.128 -0.064 -0.299 -0.607 -0.95 -1.4 -1.966 -2.723 -3.743 -5.156 -7.173 -10.276 -13.781 -16.431 -18.507 -20.256 -21.784 -23.087 -24.21 -25.132 -26.018 -26.782 -27.447 -28.055 -28.636 -29.168 -29.642 -30.118 -30.539 -30.91 -31.283 -31.669 -31.998 -32.32 -32.637 -32.889 -33.165 -33.444 -33.724 -34.023 -34.234 -34.446 -34.772 -35.005 -35.229 -35.345 -35.604 -35.883 -36.165 -36.309 -36.587 -36.782 -36.958 -37.154 -37.546 -37.744 -37.951 -38.167 -38.452 -38.844 -39.421 -42.47 -5 ,20995 ,KEBNE ,17025422,Wed Dec 22 12:32:27 CET,Wed Dec 22 14:07:23 CET,0.0 0.285 0.367 0.436 0.497 0.552 0.597 0.623 0.66 0.679 0.696 0.624 0.726 0.744 0.785 0.811 0.818 0.821 0.829 0.835 0.831 0.826 0.818 0.814 0.819 0.815 0.8 0.776 0.741 0.712 0.677 0.631 0.594 0.546 0.478 0.401 0.317 0.212 0.077 -0.083 -0.265 -0.507 -0.809 -1.134 -1.555 -2.092 -2.85 -3.842 -5.195 -7.16 -10.271 -13.707 -16.34 -18.467 -20.222 -21.702 -22.933 -24.026 -24.937 -25.848 -26.621 -27.268 -27.882 -28.468 -29.002 -29.485 -29.971 -30.412 -30.793 -31.167 -31.557 -31.871 -32.199 -32.555 -32.817 -33.075 -33.345 -33.631 -33.929 -34.142 -34.352 -34.664 -34.881 -35.118 -35.243 -35.497 -35.765 -36.029 -36.164 -36.438 -36.61 -36.765 -36.946 -37.367 -37.587 -37.829 -38.077 -38.332 -38.691 -39.234 -41.322 -6 ,12750 ,KEBNE ,17025423,Wed Dec 22 12:33:30 CET,Wed Dec 22 14:08:42 CET,0.0 0.102 0.18 0.245 0.289 0.329 0.38 0.424 0.482 0.51 0.537 0.495 0.601 0.61 0.617 0.618 0.624 0.632 0.643 0.652 0.659 0.658 0.654 0.642 0.633 0.629 0.621 0.6 0.569 0.531 0.485 0.428 0.368 0.299 0.207 0.116 0.019 -0.109 -0.241 -0.389 -0.565 -0.778 -1.071 -1.413 -1.836 -2.397 -3.186 -4.244 -5.654 -7.619 -10.691 -14.088 -16.742 -18.916 -20.687 -22.209 -23.51 -24.654 -25.585 -26.482 -27.225 -27.879 -28.509 -29.093 -29.629 -30.107 -30.591 -31.013 -31.376 -31.743 -32.127 -32.453 -32.787 -33.131 -33.393 -33.657 -33.931 -34.21 -34.496 -34.684 -34.873 -35.18 -35.385 -35.589 -35.698 -35.924 -36.171 -36.443 -36.581 -36.851 -37.051 -37.224 -37.394 -37.769 -37.977 -38.213 -38.485 -38.791 -39.224 -39.78 -42.643 -7 ,1033 ,KEBNE ,17025424,Wed Dec 22 12:33:29 CET,Wed Dec 22 14:08:53 CET,0.0 0.305 0.345 0.406 0.465 0.517 0.57 0.617 0.695 0.717 0.731 0.666 0.766 0.781 0.806 0.832 0.847 0.852 0.859 0.859 0.854 0.844 0.832 0.809 0.787 0.766 0.751 0.739 0.712 0.68 0.645 0.593 0.531 0.463 0.385 0.298 0.19 0.059 -0.096 -0.289 -0.497 -0.751 -1.086 -1.457 -1.938 -2.529 -3.287 -4.272 -5.648 -7.628 -10.716 -14.203 -16.91 -19.016 -20.717 -22.197 -23.438 -24.497 -25.4 -26.306 -27.075 -27.749 -28.382 -28.958 -29.459 -29.92 -30.41 -30.838 -31.219 -31.595 -31.98 -32.305 -32.638 -32.986 -33.241 -33.507 -33.777 -34.043 -34.322 -34.517 -34.721 -35.043 -35.255 -35.467 -35.586 -35.834 -36.073 -36.334 -36.486 -36.762 -36.94 -37.113 -37.293 -37.687 -37.912 -38.146 -38.424 -38.764 -39.12 -39.611 -41.64 -8 ,8296 ,KEBNE ,17025427,Wed Dec 22 12:33:29 CET,Wed Dec 22 14:09:48 CET,0.0 0.115 0.197 0.289 0.352 0.387 0.426 0.47 0.532 0.554 0.568 0.502 0.603 0.618 0.646 0.668 0.678 0.679 0.675 0.679 0.689 0.687 0.684 0.676 0.658 0.641 0.623 0.595 0.555 0.523 0.493 0.451 0.397 0.333 0.246 0.136 0.022 -0.103 -0.243 -0.409 -0.621 -0.886 -1.211 -1.556 -2.014 -2.616 -3.392 -4.407 -5.814 -7.812 -10.898 -14.285 -16.842 -18.89 -20.574 -22.07 -23.378 -24.507 -25.423 -26.326 -27.072 -27.73 -28.368 -28.95 -29.477 -29.942 -30.414 -30.846 -31.222 -31.592 -31.969 -32.274 -32.589 -32.916 -33.165 -33.42 -33.686 -33.959 -34.243 -34.434 -34.616 -34.908 -35.129 -35.384 -35.504 -35.734 -36.014 -36.305 -36.447 -36.721 -36.915 -37.078 -37.245 -37.603 -37.796 -38.013 -38.254 -38.53 -38.882 -39.411 -41.55 -9 ,10092 ,KEBNE ,17025428,Wed Dec 22 12:33:29 CET,Wed Dec 22 14:08:27 CET,0.0 0.217 0.333 0.39 0.424 0.453 0.481 0.508 0.566 0.588 0.608 0.562 0.666 0.68 0.696 0.708 0.732 0.743 0.756 0.772 0.784 0.777 0.766 0.76 0.754 0.739 0.722 0.703 0.672 0.636 0.6 0.556 0.524 0.496 0.444 0.366 0.274 0.154 0.02 -0.139 -0.313 -0.517 -0.81 -1.149 -1.579 -2.118 -2.868 -3.887 -5.316 -7.371 -10.495 -13.947 -16.588 -18.721 -20.475 -21.938 -23.138 -24.196 -25.085 -25.974 -26.737 -27.381 -27.993 -28.547 -29.04 -29.497 -29.974 -30.394 -30.747 -31.1 -31.447 -31.741 -32.057 -32.386 -32.649 -32.908 -33.165 -33.445 -33.727 -33.919 -34.132 -34.468 -34.701 -34.931 -35.046 -35.279 -35.515 -35.762 -35.89 -36.159 -36.337 -36.505 -36.689 -37.076 -37.29 -37.51 -37.745 -38.051 -38.434 -38.915 -41.343 -10 ,27168 ,KEBNE ,17025429,Wed Dec 22 12:33:29 CET,Wed Dec 22 14:09:35 CET,0.0 0.237 0.345 0.417 0.477 0.523 0.565 0.605 0.66 0.675 0.692 0.624 0.724 0.74 0.75 0.757 0.761 0.767 0.778 0.777 0.776 0.778 0.777 0.778 0.782 0.776 0.76 0.747 0.728 0.697 0.656 0.599 0.532 0.469 0.408 0.321 0.234 0.128 -0.019 -0.176 -0.353 -0.585 -0.893 -1.256 -1.723 -2.295 -3.047 -4.041 -5.427 -7.409 -10.47 -13.894 -16.555 -18.655 -20.383 -21.858 -23.094 -24.206 -25.139 -26.033 -26.792 -27.444 -28.049 -28.619 -29.131 -29.593 -30.078 -30.51 -30.883 -31.279 -31.699 -32.027 -32.341 -32.668 -32.932 -33.202 -33.483 -33.779 -34.074 -34.265 -34.471 -34.822 -35.062 -35.299 -35.42 -35.673 -35.928 -36.195 -36.34 -36.617 -36.79 -36.957 -37.144 -37.523 -37.735 -37.969 -38.239 -38.59 -38.958 -39.458 -42.502 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_22_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_22_19.txt deleted file mode 100644 index d3bb1e20..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_22_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16408 ,TETRA ,17556643,Fri Nov 26 07:55:40 CET,Fri Nov 26 09:45:55 CET,0.0 0.272 0.403 0.509 0.579 0.647 0.719 0.793 0.907 0.954 1.006 1.011 1.134 1.176 1.243 1.301 1.363 1.395 1.454 1.504 1.57 1.617 1.665 1.725 1.779 1.834 1.889 1.946 2.011 2.068 2.132 2.199 2.259 2.34 2.438 2.53 2.598 2.654 2.722 2.794 2.852 2.888 2.907 2.913 2.896 2.806 2.62 2.331 1.827 0.983 -0.366 -1.971 -3.268 -4.315 -5.277 -6.212 -6.993 -7.671 -8.28 -8.895 -9.423 -9.886 -10.309 -10.717 -11.09 -11.419 -11.793 -12.131 -12.399 -12.677 -12.982 -13.232 -13.478 -13.731 -13.939 -14.153 -14.356 -14.568 -14.81 -14.969 -15.134 -15.4 -15.585 -15.791 -15.889 -16.089 -16.309 -16.522 -16.64 -16.872 -17.014 -17.137 -17.283 -17.617 -17.799 -18.007 -18.242 -18.501 -18.795 -19.216 -20.521 -2 ,25696 ,TETRA ,17556644,Fri Nov 26 07:56:40 CET,Fri Nov 26 09:30:49 CET,0.0 0.234 0.345 0.466 0.564 0.644 0.72 0.791 0.908 0.953 1.0 0.999 1.134 1.178 1.269 1.359 1.426 1.456 1.51 1.563 1.638 1.681 1.729 1.797 1.864 1.933 1.995 2.061 2.138 2.206 2.276 2.369 2.459 2.524 2.599 2.679 2.739 2.808 2.872 2.926 2.972 3.002 3.007 2.976 2.897 2.787 2.616 2.286 1.787 1.053 -0.316 -1.94 -3.33 -4.566 -5.569 -6.44 -7.209 -7.898 -8.506 -9.107 -9.63 -10.092 -10.512 -10.913 -11.293 -11.65 -12.026 -12.344 -12.608 -12.887 -13.172 -13.412 -13.668 -13.933 -14.15 -14.377 -14.598 -14.816 -15.043 -15.202 -15.37 -15.633 -15.814 -15.992 -16.087 -16.306 -16.542 -16.803 -16.942 -17.185 -17.377 -17.54 -17.705 -18.055 -18.256 -18.487 -18.738 -19.012 -19.349 -19.812 -21.25 -3 ,8493 ,TETRA ,17556645,Fri Nov 26 07:57:39 CET,Fri Nov 26 09:49:58 CET,0.0 0.426 0.603 0.707 0.799 0.878 0.942 1.0 1.104 1.159 1.208 1.212 1.341 1.377 1.459 1.545 1.633 1.674 1.747 1.806 1.873 1.917 1.963 2.026 2.071 2.116 2.173 2.231 2.31 2.401 2.493 2.592 2.678 2.749 2.808 2.875 2.951 3.024 3.071 3.11 3.151 3.168 3.177 3.174 3.169 3.134 3.03 2.841 2.464 1.762 0.493 -1.037 -2.355 -3.523 -4.536 -5.46 -6.288 -7.039 -7.657 -8.231 -8.732 -9.191 -9.613 -10.008 -10.381 -10.723 -11.063 -11.377 -11.681 -11.98 -12.257 -12.496 -12.741 -13.0 -13.213 -13.428 -13.653 -13.879 -14.122 -14.297 -14.471 -14.73 -14.905 -15.098 -15.205 -15.434 -15.683 -15.956 -16.092 -16.34 -16.567 -16.749 -16.936 -17.321 -17.531 -17.745 -17.976 -18.234 -18.585 -19.035 -20.26 -4 ,24029 ,TETRA ,17556646,Fri Nov 26 07:56:40 CET,Fri Nov 26 09:47:40 CET,0.0 0.485 0.633 0.726 0.799 0.863 0.936 1.006 1.126 1.185 1.249 1.311 1.459 1.515 1.636 1.751 1.859 1.913 1.999 2.066 2.162 2.221 2.278 2.37 2.458 2.541 2.625 2.7 2.79 2.865 2.929 3.008 3.079 3.157 3.248 3.337 3.409 3.468 3.535 3.613 3.661 3.672 3.668 3.661 3.658 3.602 3.449 3.22 2.797 2.013 0.686 -0.978 -2.388 -3.626 -4.671 -5.605 -6.406 -7.097 -7.695 -8.305 -8.851 -9.344 -9.789 -10.179 -10.549 -10.89 -11.223 -11.535 -11.817 -12.096 -12.384 -12.623 -12.868 -13.113 -13.309 -13.517 -13.716 -13.924 -14.155 -14.317 -14.483 -14.734 -14.918 -15.135 -15.244 -15.45 -15.678 -15.925 -16.061 -16.314 -16.497 -16.648 -16.808 -17.148 -17.344 -17.582 -17.852 -18.137 -18.469 -18.92 -20.766 -5 ,17847 ,TETRA ,17556647,Fri Nov 26 07:56:40 CET,Fri Nov 26 09:50:09 CET,0.0 0.346 0.476 0.582 0.66 0.726 0.789 0.845 0.953 1.004 1.056 1.065 1.19 1.231 1.305 1.367 1.429 1.461 1.523 1.582 1.674 1.739 1.802 1.888 1.969 2.047 2.124 2.188 2.267 2.347 2.423 2.507 2.586 2.655 2.742 2.855 2.952 3.046 3.115 3.162 3.204 3.241 3.264 3.254 3.212 3.105 2.877 2.557 2.079 1.291 -0.104 -1.735 -3.058 -4.201 -5.181 -6.039 -6.795 -7.466 -8.033 -8.624 -9.135 -9.604 -10.053 -10.447 -10.804 -11.136 -11.477 -11.788 -12.065 -12.345 -12.641 -12.896 -13.151 -13.419 -13.627 -13.833 -14.051 -14.279 -14.507 -14.667 -14.832 -15.084 -15.264 -15.455 -15.555 -15.751 -15.967 -16.231 -16.367 -16.614 -16.797 -16.947 -17.105 -17.426 -17.599 -17.799 -18.037 -18.334 -18.68 -19.147 -20.715 -6 ,13827 ,TETRA ,17556648,Fri Nov 26 07:57:39 CET,Fri Nov 26 09:51:19 CET,0.0 0.327 0.459 0.579 0.66 0.733 0.797 0.851 0.95 1.001 1.05 1.042 1.174 1.222 1.296 1.358 1.408 1.43 1.481 1.541 1.623 1.668 1.707 1.762 1.817 1.871 1.924 1.968 2.034 2.106 2.172 2.25 2.334 2.414 2.491 2.569 2.646 2.713 2.768 2.832 2.887 2.928 2.95 2.927 2.856 2.755 2.608 2.337 1.83 1.029 -0.265 -1.849 -3.155 -4.269 -5.274 -6.176 -6.93 -7.598 -8.192 -8.775 -9.252 -9.688 -10.109 -10.491 -10.856 -11.189 -11.523 -11.824 -12.1 -12.379 -12.664 -12.896 -13.128 -13.381 -13.586 -13.807 -14.042 -14.29 -14.55 -14.726 -14.901 -15.159 -15.336 -15.528 -15.633 -15.859 -16.088 -16.329 -16.454 -16.696 -16.865 -17.007 -17.154 -17.465 -17.656 -17.871 -18.145 -18.444 -18.766 -19.229 -20.609 -7 ,31234 ,TETRA ,17556649,Fri Nov 26 07:57:39 CET,Fri Nov 26 09:48:22 CET,0.0 0.238 0.346 0.448 0.527 0.609 0.678 0.73 0.836 0.892 0.944 0.947 1.071 1.113 1.198 1.271 1.336 1.369 1.427 1.471 1.54 1.59 1.643 1.73 1.806 1.868 1.934 1.991 2.054 2.115 2.174 2.255 2.324 2.389 2.477 2.579 2.662 2.726 2.784 2.838 2.87 2.877 2.875 2.863 2.79 2.653 2.448 2.168 1.755 1.0 -0.416 -2.149 -3.53 -4.692 -5.698 -6.64 -7.467 -8.183 -8.812 -9.449 -9.973 -10.427 -10.864 -11.282 -11.669 -12.014 -12.391 -12.719 -13.004 -13.308 -13.625 -13.876 -14.12 -14.386 -14.586 -14.797 -15.02 -15.244 -15.478 -15.638 -15.803 -16.071 -16.255 -16.452 -16.559 -16.777 -16.996 -17.247 -17.374 -17.588 -17.762 -17.926 -18.096 -18.468 -18.687 -18.924 -19.171 -19.433 -19.743 -20.193 -22.024 -8 ,10059 ,TETRA ,17556650,Fri Nov 26 07:57:39 CET,Fri Nov 26 09:48:22 CET,0.0 0.36 0.534 0.634 0.728 0.813 0.901 0.978 1.102 1.17 1.238 1.268 1.406 1.458 1.555 1.647 1.73 1.774 1.861 1.928 2.034 2.11 2.173 2.251 2.332 2.418 2.503 2.582 2.667 2.734 2.804 2.884 2.94 2.984 3.036 3.087 3.12 3.152 3.177 3.209 3.235 3.253 3.271 3.267 3.22 3.107 2.922 2.618 2.16 1.462 0.179 -1.475 -2.831 -3.951 -4.904 -5.793 -6.594 -7.273 -7.851 -8.456 -8.953 -9.366 -9.769 -10.171 -10.539 -10.861 -11.195 -11.495 -11.763 -12.042 -12.34 -12.589 -12.836 -13.092 -13.289 -13.503 -13.725 -13.963 -14.213 -14.377 -14.55 -14.821 -14.994 -15.16 -15.252 -15.455 -15.691 -15.952 -16.096 -16.353 -16.54 -16.695 -16.867 -17.273 -17.522 -17.777 -18.026 -18.326 -18.696 -19.151 -20.528 -9 ,923 ,TETRA ,17556651,Fri Nov 26 07:57:40 CET,Fri Nov 26 09:47:57 CET,0.0 0.168 0.294 0.39 0.484 0.573 0.635 0.705 0.841 0.892 0.937 0.934 1.062 1.098 1.153 1.222 1.291 1.317 1.371 1.432 1.511 1.558 1.61 1.687 1.766 1.848 1.921 1.99 2.083 2.164 2.234 2.322 2.401 2.473 2.556 2.642 2.713 2.785 2.858 2.931 2.992 3.038 3.093 3.12 3.115 3.07 2.919 2.641 2.232 1.542 0.221 -1.42 -2.819 -4.005 -5.009 -5.909 -6.674 -7.361 -7.955 -8.539 -9.073 -9.53 -9.943 -10.354 -10.727 -11.056 -11.419 -11.757 -12.049 -12.351 -12.642 -12.888 -13.16 -13.44 -13.663 -13.89 -14.123 -14.371 -14.625 -14.798 -14.971 -15.234 -15.423 -15.624 -15.732 -15.957 -16.188 -16.435 -16.575 -16.822 -16.999 -17.144 -17.292 -17.66 -17.868 -18.1 -18.358 -18.642 -19.01 -19.497 -21.076 -10 ,16520 ,TETRA ,17556652,Fri Nov 26 07:57:39 CET,Fri Nov 26 09:48:29 CET,0.0 0.472 0.627 0.758 0.856 0.933 1.0 1.068 1.201 1.257 1.307 1.321 1.457 1.499 1.572 1.638 1.698 1.725 1.773 1.813 1.874 1.914 1.951 2.009 2.07 2.133 2.182 2.214 2.261 2.317 2.372 2.437 2.496 2.55 2.621 2.705 2.77 2.845 2.912 2.955 3.0 3.06 3.113 3.085 2.975 2.858 2.697 2.435 1.972 1.112 -0.33 -2.036 -3.482 -4.717 -5.692 -6.501 -7.225 -7.906 -8.495 -9.064 -9.571 -10.018 -10.42 -10.793 -11.146 -11.468 -11.796 -12.088 -12.346 -12.622 -12.923 -13.168 -13.435 -13.758 -14.018 -14.283 -14.564 -14.846 -15.139 -15.348 -15.547 -15.852 -16.065 -16.281 -16.399 -16.634 -16.878 -17.151 -17.291 -17.543 -17.773 -17.943 -18.111 -18.484 -18.678 -18.887 -19.137 -19.42 -19.763 -20.197 -21.385 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_23_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_23_21.txt deleted file mode 100644 index 952705cf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_23_21.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7178 ,TETRA ,17556653,Fri Nov 26 07:58:39 CET,Fri Nov 26 09:34:00 CET,0.0 0.373 0.631 0.85 1.05 1.244 1.434 1.617 1.966 2.142 2.317 2.47 2.8 2.949 3.242 3.534 3.82 3.956 4.227 4.496 4.9 5.166 5.429 5.807 6.165 6.533 6.901 7.271 7.763 8.243 8.72 9.306 9.895 10.477 11.155 11.93 12.695 13.565 14.539 15.601 16.768 18.135 19.758 21.472 23.56 25.984 28.956 32.568 37.087 42.862 50.728 58.27 63.474 67.282 70.153 72.424 74.228 75.721 76.906 78.003 78.859 79.577 80.242 80.82 81.319 81.744 82.14 82.466 82.732 82.999 83.27 83.482 83.694 83.9 84.045 84.19 84.33 84.459 84.585 84.664 84.738 84.838 84.915 84.998 85.032 85.085 85.125 85.167 85.186 85.12 85.242 85.257 85.276 85.301 85.31 85.311 85.296 85.263 85.211 85.134 84.872 -2 ,9908 ,TETRA ,17556654,Fri Nov 26 07:58:39 CET,Fri Nov 26 09:33:32 CET,0.0 0.516 0.778 1.012 1.247 1.449 1.612 1.771 2.107 2.269 2.423 2.559 2.891 3.036 3.334 3.635 3.925 4.072 4.359 4.63 5.046 5.329 5.606 6.004 6.394 6.791 7.184 7.574 8.07 8.554 9.041 9.635 10.211 10.778 11.451 12.254 13.061 13.941 14.908 15.981 17.156 18.514 20.167 21.905 23.989 26.431 29.403 32.973 37.514 43.382 51.307 58.868 63.977 67.688 70.507 72.745 74.526 76.011 77.179 78.232 79.08 79.801 80.428 80.974 81.457 81.872 82.285 82.641 82.933 83.21 83.472 83.689 83.901 84.104 84.254 84.393 84.534 84.672 84.802 84.887 84.968 85.093 85.171 85.234 85.263 85.321 85.375 85.42 85.439 85.374 85.501 85.519 85.538 85.547 85.532 85.519 85.51 85.471 85.419 85.33 84.97 -3 ,7990 ,TETRA ,17556655,Fri Nov 26 07:58:39 CET,Fri Nov 26 09:33:36 CET,0.0 0.512 0.806 1.088 1.323 1.541 1.751 1.944 2.3 2.466 2.648 2.837 3.18 3.34 3.64 3.941 4.231 4.368 4.659 4.953 5.373 5.649 5.918 6.31 6.702 7.091 7.468 7.846 8.341 8.816 9.28 9.851 10.411 10.973 11.652 12.437 13.214 14.095 15.081 16.166 17.337 18.688 20.313 22.016 24.122 26.59 29.565 33.131 37.66 43.531 51.43 59.024 64.224 68.043 70.94 73.229 75.029 76.519 77.704 78.787 79.643 80.337 80.946 81.491 81.973 82.383 82.78 83.106 83.362 83.612 83.878 84.077 84.265 84.463 84.607 84.745 84.88 85.015 85.149 85.232 85.305 85.421 85.498 85.572 85.603 85.664 85.734 85.777 85.791 85.722 85.844 85.857 85.875 85.904 85.902 85.896 85.887 85.853 85.803 85.721 85.172 -4 ,1443 ,TETRA ,17556656,Fri Nov 26 07:58:39 CET,Fri Nov 26 09:50:12 CET,0.0 0.534 0.78 0.992 1.185 1.364 1.55 1.734 2.058 2.227 2.407 2.588 2.94 3.11 3.421 3.724 4.033 4.182 4.464 4.741 5.149 5.409 5.665 6.048 6.428 6.799 7.168 7.535 8.018 8.501 8.978 9.555 10.123 10.687 11.354 12.13 12.911 13.794 14.768 15.819 16.957 18.318 19.969 21.658 23.709 26.115 29.002 32.532 37.013 42.762 50.663 58.287 63.504 67.334 70.174 72.433 74.237 75.714 76.896 78.0 78.894 79.639 80.281 80.848 81.35 81.773 82.19 82.533 82.799 83.052 83.303 83.502 83.679 83.852 83.979 84.108 84.224 84.332 84.441 84.513 84.592 84.704 84.772 84.849 84.89 84.954 85.01 85.069 85.091 85.014 85.132 85.143 85.141 85.133 85.128 85.112 85.08 85.037 84.979 84.902 84.67 -5 ,31822 ,TETRA ,17556657,Fri Nov 26 07:58:39 CET,Fri Nov 26 09:39:54 CET,0.0 0.378 0.599 0.821 1.023 1.206 1.392 1.586 1.937 2.087 2.239 2.376 2.709 2.861 3.162 3.451 3.731 3.869 4.142 4.415 4.814 5.081 5.346 5.723 6.099 6.478 6.861 7.231 7.705 8.178 8.658 9.26 9.856 10.435 11.124 11.919 12.698 13.589 14.578 15.648 16.777 18.107 19.778 21.51 23.614 26.058 29.024 32.649 37.192 43.014 50.943 58.536 63.754 67.572 70.47 72.795 74.617 76.127 77.326 78.419 79.278 79.972 80.59 81.144 81.64 82.068 82.485 82.837 83.121 83.415 83.703 83.923 84.141 84.351 84.507 84.653 84.785 84.926 85.065 85.146 85.226 85.347 85.418 85.486 85.526 85.595 85.64 85.676 85.696 85.636 85.781 85.803 85.819 85.827 85.813 85.794 85.771 85.736 85.665 85.59 85.211 -6 ,13506 ,TETRA ,17556658,Fri Nov 26 07:58:39 CET,Fri Nov 26 09:33:18 CET,0.0 0.779 1.083 1.307 1.503 1.702 1.892 2.065 2.409 2.574 2.723 2.828 3.147 3.294 3.592 3.877 4.151 4.292 4.575 4.849 5.252 5.519 5.777 6.169 6.569 6.95 7.326 7.707 8.21 8.699 9.182 9.778 10.37 10.948 11.62 12.389 13.164 14.063 15.054 16.127 17.303 18.683 20.333 22.069 24.179 26.601 29.526 33.102 37.608 43.355 51.197 58.753 63.893 67.635 70.485 72.783 74.625 76.134 77.326 78.405 79.248 79.944 80.556 81.108 81.604 82.016 82.418 82.763 83.043 83.317 83.582 83.786 83.987 84.19 84.336 84.471 84.598 84.734 84.881 84.967 85.044 85.158 85.226 85.293 85.327 85.381 85.426 85.472 85.492 85.43 85.552 85.56 85.569 85.555 85.54 85.525 85.504 85.477 85.416 85.304 85.073 -7 ,16456 ,TETRA ,17556659,Fri Nov 26 07:58:39 CET,Fri Nov 26 09:50:30 CET,0.0 0.442 0.695 0.911 1.11 1.291 1.482 1.677 2.053 2.224 2.38 2.496 2.822 2.973 3.277 3.581 3.866 4.013 4.317 4.611 5.046 5.332 5.62 6.03 6.415 6.784 7.145 7.515 8.001 8.484 8.965 9.546 10.123 10.697 11.37 12.126 12.876 13.733 14.692 15.755 16.916 18.255 19.883 21.618 23.731 26.156 29.098 32.668 37.186 43.04 50.998 58.628 63.838 67.624 70.49 72.805 74.644 76.14 77.31 78.383 79.221 79.926 80.588 81.154 81.637 82.075 82.502 82.851 83.126 83.396 83.668 83.879 84.079 84.263 84.392 84.525 84.655 84.766 84.874 84.949 85.018 85.125 85.203 85.278 85.315 85.387 85.453 85.512 85.535 85.467 85.594 85.603 85.618 85.638 85.62 85.594 85.573 85.564 85.531 85.43 85.156 -8 ,3723 ,TETRA ,17556660,Fri Nov 26 07:58:39 CET,Fri Nov 26 09:34:03 CET,0.0 0.55 0.799 0.992 1.169 1.351 1.538 1.717 2.07 2.237 2.401 2.543 2.869 3.024 3.338 3.648 3.953 4.104 4.408 4.7 5.115 5.387 5.655 6.051 6.442 6.831 7.206 7.571 8.062 8.552 9.037 9.631 10.204 10.77 11.447 12.213 12.976 13.857 14.834 15.881 17.016 18.356 19.999 21.734 23.829 26.274 29.279 32.871 37.315 43.032 50.92 58.539 63.69 67.441 70.285 72.563 74.354 75.81 76.95 78.005 78.853 79.555 80.188 80.752 81.247 81.661 82.069 82.428 82.72 83.002 83.273 83.484 83.697 83.909 84.064 84.218 84.353 84.475 84.61 84.698 84.781 84.901 84.974 85.045 85.079 85.138 85.189 85.244 85.274 85.205 85.313 85.32 85.325 85.331 85.324 85.318 85.302 85.278 85.251 85.184 84.846 -9 ,1189 ,TETRA ,17556661,Fri Nov 26 07:58:39 CET,Fri Nov 26 09:50:12 CET,0.0 0.501 0.717 0.916 1.116 1.307 1.498 1.673 1.995 2.159 2.324 2.444 2.763 2.904 3.194 3.48 3.752 3.894 4.176 4.447 4.844 5.099 5.346 5.717 6.1 6.482 6.854 7.216 7.696 8.177 8.649 9.225 9.802 10.382 11.077 11.878 12.653 13.525 14.492 15.556 16.713 18.043 19.678 21.39 23.47 25.905 28.848 32.383 36.817 42.536 50.424 58.001 63.147 66.923 69.799 72.098 73.891 75.39 76.58 77.661 78.526 79.249 79.909 80.484 80.973 81.385 81.759 82.057 82.312 82.573 82.841 83.055 83.253 83.444 83.589 83.73 83.873 84.014 84.144 84.229 84.311 84.432 84.516 84.584 84.615 84.692 84.753 84.81 84.838 84.771 84.894 84.913 84.923 84.927 84.919 84.902 84.885 84.845 84.773 84.694 84.389 -10 ,17411 ,TETRA ,17556662,Fri Nov 26 07:59:38 CET,Fri Nov 26 09:52:46 CET,0.0 0.522 0.771 0.995 1.19 1.361 1.538 1.719 2.046 2.201 2.356 2.468 2.784 2.928 3.211 3.496 3.78 3.916 4.182 4.449 4.842 5.102 5.361 5.759 6.164 6.556 6.932 7.311 7.816 8.312 8.808 9.404 9.99 10.589 11.302 12.103 12.883 13.749 14.716 15.795 16.981 18.363 20.014 21.722 23.787 26.221 29.169 32.688 37.104 42.85 50.757 58.359 63.567 67.334 70.157 72.42 74.203 75.703 76.881 77.947 78.815 79.536 80.179 80.728 81.19 81.584 81.975 82.304 82.566 82.823 83.075 83.266 83.448 83.63 83.761 83.89 84.017 84.134 84.243 84.315 84.388 84.487 84.542 84.589 84.617 84.675 84.724 84.77 84.791 84.724 84.844 84.861 84.878 84.896 84.884 84.852 84.821 84.792 84.755 84.697 84.419 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_23_22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_23_22.txt deleted file mode 100644 index c78bb6d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_23_22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25123 ,TETRA ,17556663,Fri Nov 26 07:59:38 CET,Fri Nov 26 09:51:03 CET,0.0 0.873 1.273 1.591 1.866 2.123 2.376 2.631 3.117 3.341 3.554 3.79 4.164 4.357 4.733 5.095 5.443 5.613 5.94 6.257 6.74 7.059 7.36 7.797 8.242 8.667 9.077 9.498 10.052 10.585 11.116 11.785 12.425 13.049 13.79 14.647 15.508 16.48 17.539 18.69 19.933 21.391 23.175 25.019 27.222 29.802 32.973 36.772 41.54 47.702 56.017 63.885 69.283 73.19 76.151 78.514 80.347 81.84 82.995 84.044 84.894 85.594 86.218 86.772 87.254 87.661 88.047 88.361 88.62 88.881 89.135 89.334 89.522 89.689 89.806 89.926 90.049 90.17 90.27 90.329 90.389 90.477 90.528 90.57 90.586 90.62 90.648 90.65 90.651 90.57 90.632 90.605 90.573 90.489 90.442 90.372 90.286 90.219 90.143 89.978 89.347 -2 ,32706 ,TETRA ,17556664,Fri Nov 26 07:59:38 CET,Fri Nov 26 09:34:54 CET,0.0 1.101 1.477 1.796 2.091 2.352 2.591 2.806 3.217 3.411 3.592 3.772 4.127 4.3 4.64 4.982 5.307 5.461 5.766 6.066 6.514 6.805 7.095 7.531 7.956 8.364 8.762 9.163 9.699 10.224 10.743 11.386 12.013 12.637 13.367 14.217 15.066 15.99 17.001 18.116 19.335 20.75 22.501 24.354 26.576 29.198 32.367 36.127 40.874 46.977 55.254 63.129 68.496 72.468 75.444 77.766 79.587 81.079 82.265 83.355 84.231 84.961 85.608 86.193 86.717 87.163 87.585 87.921 88.203 88.488 88.766 88.986 89.196 89.404 89.552 89.687 89.826 89.958 90.07 90.141 90.205 90.306 90.374 90.423 90.448 90.502 90.559 90.615 90.628 90.543 90.638 90.647 90.647 90.63 90.613 90.583 90.535 90.476 90.392 90.287 89.732 -3 ,20866 ,TETRA ,17556665,Fri Nov 26 07:59:38 CET,Fri Nov 26 09:46:08 CET,0.0 0.98 1.346 1.647 1.935 2.205 2.432 2.65 3.083 3.281 3.476 3.666 4.023 4.194 4.525 4.851 5.181 5.345 5.652 5.954 6.415 6.713 7.007 7.458 7.9 8.321 8.739 9.171 9.737 10.276 10.794 11.443 12.084 12.709 13.464 14.331 15.181 16.142 17.211 18.394 19.659 21.118 22.885 24.729 26.966 29.542 32.67 36.486 41.269 47.372 55.666 63.544 68.97 72.928 75.9 78.272 80.127 81.65 82.859 83.979 84.868 85.592 86.218 86.778 87.271 87.688 88.115 88.479 88.759 89.023 89.295 89.513 89.713 89.905 90.047 90.18 90.316 90.452 90.568 90.646 90.727 90.831 90.904 90.967 90.988 91.028 91.073 91.115 91.13 91.064 91.163 91.155 91.154 91.123 91.103 91.081 91.03 90.969 90.892 90.771 90.254 -4 ,8357 ,TETRA ,17556666,Fri Nov 26 07:59:38 CET,Fri Nov 26 09:53:06 CET,0.0 0.984 1.317 1.63 1.928 2.179 2.397 2.603 3.018 3.215 3.405 3.598 3.959 4.144 4.488 4.824 5.157 5.318 5.638 5.944 6.397 6.694 6.97 7.375 7.787 8.203 8.622 9.035 9.578 10.09 10.596 11.252 11.901 12.519 13.232 14.069 14.917 15.853 16.886 18.02 19.24 20.655 22.363 24.174 26.377 28.951 32.07 35.803 40.492 46.52 54.816 62.823 68.228 72.164 75.143 77.528 79.381 80.89 82.073 83.165 84.042 84.758 85.382 85.913 86.384 86.789 87.19 87.529 87.804 88.09 88.378 88.599 88.803 88.993 89.136 89.281 89.422 89.544 89.661 89.745 89.828 89.945 90.013 90.069 90.093 90.137 90.185 90.22 90.229 90.155 90.243 90.241 90.231 90.184 90.163 90.14 90.09 90.014 89.91 89.735 89.192 -5 ,19628 ,TETRA ,17556667,Fri Nov 26 07:59:38 CET,Fri Nov 26 09:35:00 CET,0.0 1.141 1.506 1.828 2.102 2.334 2.548 2.765 3.184 3.372 3.56 3.752 4.11 4.277 4.603 4.937 5.258 5.411 5.707 6.006 6.447 6.742 7.035 7.457 7.877 8.289 8.692 9.086 9.608 10.128 10.635 11.261 11.893 12.523 13.274 14.136 14.974 15.911 16.961 18.12 19.368 20.82 22.562 24.377 26.592 29.191 32.373 36.148 40.876 47.001 55.284 63.278 68.678 72.548 75.436 77.714 79.523 80.988 82.136 83.231 84.106 84.823 85.474 86.031 86.505 86.913 87.301 87.629 87.899 88.153 88.394 88.575 88.756 88.938 89.065 89.177 89.275 89.364 89.461 89.535 89.604 89.698 89.764 89.815 89.831 89.869 89.913 89.956 89.97 89.886 89.978 89.99 90.001 89.986 89.966 89.924 89.864 89.805 89.722 89.572 89.073 -6 ,30611 ,TETRA ,17556668,Fri Nov 26 07:59:38 CET,Fri Nov 26 09:34:55 CET,0.0 1.013 1.314 1.571 1.832 2.079 2.312 2.525 2.913 3.107 3.298 3.477 3.826 4.002 4.35 4.681 5.01 5.173 5.493 5.808 6.255 6.536 6.822 7.252 7.663 8.069 8.476 8.885 9.417 9.94 10.472 11.139 11.794 12.424 13.153 14.008 14.863 15.826 16.906 18.086 19.362 20.846 22.627 24.466 26.676 29.279 32.477 36.325 41.099 47.172 55.431 63.375 68.774 72.708 75.682 78.038 79.885 81.409 82.618 83.732 84.616 85.337 85.982 86.552 87.043 87.47 87.889 88.246 88.538 88.817 89.067 89.266 89.476 89.666 89.807 89.951 90.09 90.216 90.342 90.425 90.504 90.623 90.697 90.76 90.785 90.831 90.872 90.898 90.907 90.824 90.928 90.94 90.937 90.924 90.912 90.874 90.808 90.732 90.63 90.466 90.028 -7 ,1499 ,TETRA ,17556669,Fri Nov 26 07:59:38 CET,Fri Nov 26 09:34:53 CET,0.0 1.215 1.59 1.85 2.112 2.379 2.61 2.82 3.229 3.418 3.592 3.751 4.1 4.275 4.613 4.936 5.24 5.389 5.687 5.984 6.43 6.728 7.02 7.437 7.848 8.258 8.659 9.06 9.596 10.123 10.644 11.286 11.917 12.527 13.237 14.078 14.911 15.843 16.873 18.009 19.274 20.755 22.545 24.418 26.666 29.262 32.367 36.08 40.795 46.801 54.947 62.779 68.085 71.944 74.878 77.197 79.025 80.534 81.72 82.832 83.724 84.467 85.131 85.71 86.213 86.643 87.05 87.39 87.675 87.952 88.218 88.421 88.622 88.821 88.961 89.097 89.231 89.355 89.484 89.559 89.623 89.721 89.778 89.838 89.869 89.921 89.969 90.012 90.024 89.952 90.042 90.043 90.048 90.001 89.968 89.93 89.875 89.818 89.74 89.619 89.169 -8 ,23608 ,TETRA ,17556670,Fri Nov 26 07:59:38 CET,Fri Nov 26 09:51:40 CET,0.0 1.038 1.422 1.743 2.025 2.259 2.471 2.688 3.108 3.31 3.509 3.688 4.036 4.204 4.528 4.839 5.128 5.275 5.573 5.871 6.313 6.593 6.87 7.309 7.744 8.168 8.584 8.996 9.551 10.103 10.638 11.283 11.916 12.536 13.276 14.13 14.96 15.909 16.961 18.109 19.359 20.778 22.487 24.281 26.468 29.053 32.188 35.945 40.673 46.721 54.981 62.84 68.167 72.068 75.005 77.318 79.145 80.682 81.898 83.026 83.934 84.659 85.304 85.88 86.374 86.8 87.208 87.563 87.855 88.123 88.394 88.608 88.816 89.019 89.165 89.302 89.43 89.555 89.668 89.744 89.826 89.932 89.984 90.035 90.06 90.103 90.14 90.163 90.169 90.09 90.166 90.166 90.176 90.173 90.15 90.11 90.072 90.022 89.949 89.833 89.352 -9 ,4463 ,TETRA ,17556671,Fri Nov 26 08:00:39 CET,Fri Nov 26 09:51:59 CET,0.0 0.801 1.193 1.487 1.729 1.969 2.2 2.411 2.815 3.005 3.192 3.38 3.74 3.918 4.259 4.593 4.913 5.07 5.385 5.698 6.166 6.459 6.741 7.15 7.557 7.969 8.378 8.792 9.338 9.867 10.376 11.004 11.629 12.244 12.97 13.805 14.622 15.535 16.552 17.667 18.885 20.315 22.024 23.818 26.024 28.595 31.725 35.506 40.241 46.302 54.498 62.385 67.84 71.866 74.892 77.264 79.12 80.664 81.871 82.948 83.804 84.529 85.176 85.726 86.212 86.646 87.058 87.389 87.651 87.886 88.119 88.319 88.521 88.716 88.855 88.994 89.118 89.238 89.371 89.452 89.519 89.617 89.682 89.743 89.766 89.799 89.817 89.832 89.839 89.76 89.852 89.847 89.85 89.849 89.829 89.774 89.706 89.634 89.531 89.42 88.778 -10 ,32493 ,TETRA ,17556672,Fri Nov 26 08:00:40 CET,Fri Nov 26 09:35:41 CET,0.0 1.245 1.642 1.949 2.204 2.426 2.635 2.849 3.25 3.443 3.638 3.821 4.179 4.357 4.712 5.062 5.405 5.574 5.901 6.229 6.715 7.027 7.333 7.791 8.237 8.666 9.093 9.518 10.064 10.589 11.119 11.777 12.42 13.059 13.8 14.651 15.506 16.45 17.469 18.598 19.822 21.26 23.007 24.844 27.068 29.609 32.723 36.438 41.084 47.093 55.303 63.143 68.439 72.364 75.355 77.685 79.524 81.052 82.27 83.405 84.26 84.955 85.607 86.182 86.695 87.145 87.569 87.912 88.192 88.466 88.724 88.926 89.126 89.317 89.462 89.6 89.733 89.861 89.983 90.061 90.138 90.243 90.307 90.369 90.393 90.436 90.472 90.512 90.539 90.466 90.556 90.566 90.576 90.559 90.514 90.474 90.442 90.387 90.313 90.204 89.705 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_25_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_25_19.txt deleted file mode 100644 index effefa53..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_25_19.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26241 ,KEBNE ,17025430,Wed Dec 22 12:34:31 CET,Wed Dec 22 14:09:46 CET,0.0 1.308 1.71 2.015 2.277 2.53 2.793 3.059 3.555 3.781 4.019 4.248 4.702 4.902 5.304 5.71 6.099 6.291 6.669 7.057 7.623 7.975 8.317 8.823 9.339 9.855 10.368 10.889 11.581 12.272 12.937 13.753 14.575 15.391 16.375 17.512 18.628 19.899 21.314 22.85 24.529 26.503 28.884 31.418 34.506 38.126 42.596 47.947 54.722 63.447 75.353 86.909 94.793 100.56 104.901 108.347 111.063 113.282 115.045 116.677 117.977 119.058 120.012 120.847 121.588 122.225 122.829 123.325 123.742 124.164 124.581 124.897 125.204 125.516 125.744 125.961 126.173 126.363 126.534 126.656 126.775 126.949 127.06 127.169 127.221 127.3 127.344 127.389 127.414 127.323 127.43 127.425 127.411 127.361 127.316 127.241 127.141 127.036 126.879 126.566 124.762 -2 ,21672 ,KEBNE ,17025431,Wed Dec 22 12:37:36 CET,Wed Dec 22 14:13:55 CET,0.0 0.582 0.976 1.341 1.666 1.949 2.211 2.451 2.919 3.145 3.368 3.58 4.035 4.25 4.686 5.101 5.505 5.71 6.11 6.512 7.124 7.533 7.947 8.537 9.105 9.684 10.278 10.882 11.669 12.404 13.106 13.989 14.864 15.735 16.796 18.036 19.259 20.637 22.181 23.882 25.726 27.857 30.404 33.118 36.466 40.339 44.982 50.545 57.564 66.505 78.611 90.089 97.839 103.548 107.862 111.285 113.987 116.188 117.935 119.573 120.863 121.936 122.901 123.742 124.48 125.114 125.725 126.232 126.649 127.049 127.451 127.773 128.068 128.353 128.563 128.78 129.005 129.195 129.37 129.498 129.608 129.745 129.836 129.925 129.965 130.052 130.15 130.224 130.247 130.166 130.299 130.296 130.277 130.224 130.189 130.106 129.991 129.887 129.766 129.54 127.72 -3 ,17092 ,KEBNE ,17025432,Wed Dec 22 12:37:36 CET,Wed Dec 22 14:14:16 CET,0.0 1.154 1.588 1.944 2.251 2.533 2.807 3.081 3.577 3.814 4.048 4.273 4.729 4.936 5.363 5.799 6.227 6.439 6.855 7.274 7.9 8.301 8.695 9.295 9.898 10.483 11.051 11.602 12.326 13.049 13.772 14.674 15.569 16.459 17.524 18.753 19.929 21.256 22.784 24.472 26.294 28.403 30.98 33.724 37.061 40.906 45.534 51.075 58.089 67.306 79.81 91.488 99.297 104.852 109.0 112.325 114.918 117.002 118.618 120.1 121.345 122.418 123.391 124.236 124.968 125.608 126.238 126.767 127.197 127.613 128.003 128.309 128.609 128.894 129.101 129.299 129.487 129.673 129.842 129.952 130.054 130.179 130.258 130.331 130.36 130.393 130.414 130.42 130.405 130.279 130.329 130.305 130.287 130.224 130.163 130.087 129.992 129.835 129.63 129.361 128.013 -4 ,23652 ,KEBNE ,17025433,Wed Dec 22 12:38:39 CET,Wed Dec 22 14:13:43 CET,0.0 1.343 1.712 2.02 2.282 2.524 2.753 2.984 3.428 3.637 3.855 4.049 4.495 4.697 5.11 5.508 5.898 6.096 6.48 6.85 7.418 7.797 8.163 8.713 9.268 9.813 10.342 10.879 11.588 12.275 12.961 13.811 14.647 15.475 16.451 17.569 18.687 19.965 21.393 22.958 24.654 26.651 29.078 31.626 34.743 38.372 42.811 48.227 55.1 63.952 76.019 87.494 95.311 101.072 105.43 108.879 111.592 113.824 115.547 117.138 118.412 119.463 120.416 121.262 121.992 122.602 123.206 123.725 124.148 124.559 124.948 125.245 125.53 125.787 125.945 126.076 126.195 126.312 126.44 126.521 126.593 126.697 126.75 126.788 126.799 126.82 126.847 126.848 126.842 126.722 126.781 126.771 126.757 126.672 126.612 126.549 126.46 126.32 126.089 125.76 124.69 -5 ,21282 ,KEBNE ,17025434,Wed Dec 22 12:38:39 CET,Wed Dec 22 14:14:35 CET,0.0 1.149 1.519 1.828 2.089 2.343 2.583 2.816 3.28 3.508 3.732 3.922 4.37 4.579 4.996 5.405 5.818 6.023 6.431 6.834 7.403 7.768 8.137 8.681 9.233 9.786 10.315 10.836 11.529 12.224 12.917 13.766 14.625 15.476 16.471 17.615 18.761 20.071 21.503 23.079 24.795 26.806 29.283 31.883 35.007 38.68 43.178 48.514 55.249 64.028 76.076 87.565 95.413 101.169 105.459 108.845 111.512 113.725 115.421 116.892 118.036 118.951 119.778 120.537 121.157 121.65 122.143 122.56 122.891 123.218 123.529 123.765 123.996 124.213 124.359 124.501 124.637 124.757 124.881 124.953 125.019 125.122 125.181 125.221 125.237 125.268 125.286 125.299 125.298 125.183 125.272 125.254 125.218 125.126 125.074 125.007 124.915 124.801 124.633 124.372 123.102 -6 ,20888 ,KEBNE ,17025435,Wed Dec 22 12:38:39 CET,Wed Dec 22 14:13:40 CET,0.0 0.797 1.198 1.512 1.763 2.02 2.273 2.521 3.002 3.226 3.438 3.612 4.053 4.253 4.665 5.056 5.435 5.622 5.99 6.358 6.931 7.31 7.689 8.257 8.795 9.324 9.852 10.371 11.062 11.768 12.5 13.386 14.232 15.068 16.056 17.175 18.284 19.553 20.978 22.563 24.268 26.247 28.667 31.19 34.263 37.879 42.295 47.668 54.477 63.228 75.21 86.773 94.634 100.371 104.661 108.072 110.787 113.028 114.81 116.443 117.727 118.805 119.772 120.603 121.314 121.932 122.529 123.022 123.439 123.851 124.253 124.562 124.863 125.159 125.374 125.582 125.776 125.961 126.134 126.25 126.358 126.499 126.594 126.681 126.72 126.803 126.895 126.942 126.944 126.85 126.94 126.918 126.893 126.788 126.723 126.653 126.556 126.41 126.231 125.977 124.708 -7 ,15234 ,KEBNE ,17025436,Wed Dec 22 12:39:40 CET,Wed Dec 22 14:14:47 CET,0.0 1.532 1.941 2.261 2.545 2.802 3.053 3.294 3.746 3.973 4.191 4.375 4.839 5.056 5.473 5.877 6.257 6.445 6.832 7.23 7.846 8.246 8.619 9.171 9.72 10.264 10.81 11.351 12.074 12.789 13.49 14.322 15.123 15.948 16.973 18.149 19.286 20.565 21.992 23.567 25.267 27.249 29.662 32.173 35.241 38.877 43.337 48.718 55.517 64.317 76.385 87.879 95.703 101.444 105.756 109.201 111.912 114.143 115.929 117.567 118.87 119.929 120.869 121.721 122.468 123.112 123.755 124.283 124.692 125.08 125.467 125.785 126.095 126.39 126.605 126.811 127.0 127.173 127.347 127.463 127.58 127.726 127.797 127.846 127.863 127.89 127.91 127.915 127.908 127.792 127.854 127.821 127.788 127.717 127.64 127.558 127.475 127.341 127.168 126.944 126.148 -8 ,27698 ,KEBNE ,17025437,Wed Dec 22 12:39:40 CET,Wed Dec 22 14:14:40 CET,0.0 0.73 1.102 1.436 1.73 2.007 2.277 2.529 3.026 3.284 3.525 3.747 4.22 4.444 4.862 5.284 5.712 5.922 6.344 6.756 7.371 7.775 8.171 8.772 9.369 9.961 10.55 11.135 11.939 12.747 13.523 14.463 15.402 16.342 17.449 18.709 19.921 21.265 22.743 24.355 26.092 28.112 30.58 33.154 36.302 39.984 44.446 49.755 56.507 65.348 77.393 88.922 96.708 102.386 106.738 110.206 112.914 115.151 116.895 118.482 119.763 120.826 121.783 122.622 123.319 123.896 124.478 124.981 125.365 125.732 126.123 126.44 126.743 127.028 127.239 127.451 127.659 127.849 128.022 128.125 128.223 128.345 128.434 128.537 128.577 128.65 128.714 128.751 128.771 128.683 128.799 128.793 128.777 128.717 128.671 128.578 128.392 128.188 127.973 127.66 125.656 -9 ,25536 ,KEBNE ,17025438,Wed Dec 22 12:39:41 CET,Wed Dec 22 14:14:36 CET,0.0 1.467 1.886 2.218 2.484 2.728 2.966 3.2 3.649 3.865 4.075 4.241 4.684 4.88 5.268 5.656 6.044 6.236 6.612 6.987 7.535 7.889 8.246 8.797 9.333 9.849 10.363 10.871 11.542 12.22 12.899 13.725 14.558 15.414 16.424 17.577 18.738 20.074 21.557 23.151 24.843 26.822 29.23 31.769 34.889 38.549 43.009 48.42 55.23 64.0 76.005 87.576 95.433 101.112 105.426 108.876 111.578 113.803 115.594 117.239 118.522 119.587 120.528 121.356 122.083 122.699 123.299 123.81 124.239 124.658 125.054 125.361 125.66 125.959 126.183 126.391 126.586 126.78 126.967 127.086 127.202 127.346 127.428 127.508 127.543 127.604 127.659 127.694 127.696 127.599 127.711 127.697 127.676 127.603 127.541 127.457 127.353 127.219 127.035 126.769 125.026 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_25_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_25_24.txt deleted file mode 100644 index ef6a8672..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_25_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32533 ,TETRA ,17556673,Fri Nov 26 08:00:40 CET,Fri Nov 26 09:50:56 CET,0.0 0.937 1.334 1.632 1.91 2.17 2.396 2.613 3.032 3.231 3.423 3.555 3.98 4.16 4.51 4.862 5.215 5.389 5.739 6.077 6.578 6.906 7.226 7.705 8.186 8.672 9.163 9.651 10.277 10.873 11.464 12.2 12.928 13.675 14.57 15.596 16.616 17.747 18.962 20.266 21.682 23.34 25.334 27.417 29.975 32.984 36.67 41.043 46.536 53.72 63.505 72.742 79.006 83.538 86.904 89.579 91.682 93.411 94.806 96.115 97.164 98.009 98.761 99.442 100.016 100.499 100.984 101.389 101.711 102.031 102.33 102.542 102.763 102.981 103.126 103.259 103.392 103.523 103.647 103.737 103.806 103.866 103.914 103.963 103.984 104.003 104.003 103.999 104.001 103.888 104.041 104.048 104.044 103.991 103.953 103.911 103.849 103.75 103.593 103.392 102.28 -2 ,2116 ,TETRA ,17556674,Fri Nov 26 08:00:40 CET,Fri Nov 26 09:34:52 CET,0.0 0.708 1.05 1.337 1.617 1.876 2.134 2.385 2.831 3.028 3.223 3.4 3.852 4.059 4.459 4.849 5.243 5.436 5.819 6.199 6.75 7.104 7.451 7.955 8.448 8.945 9.434 9.917 10.547 11.155 11.754 12.491 13.186 13.873 14.712 15.678 16.633 17.718 18.972 20.39 21.922 23.682 25.751 27.869 30.438 33.433 37.079 41.467 46.991 54.094 63.785 73.096 79.359 83.933 87.392 90.144 92.292 94.037 95.431 96.717 97.725 98.548 99.29 99.948 100.503 100.971 101.446 101.845 102.155 102.44 102.732 102.959 103.169 103.367 103.515 103.671 103.818 103.961 104.085 104.149 104.205 104.283 104.351 104.425 104.453 104.508 104.547 104.569 104.582 104.466 104.611 104.608 104.591 104.499 104.443 104.383 104.293 104.161 104.007 103.844 103.291 -3 ,5640 ,TETRA ,17556675,Fri Nov 26 08:00:40 CET,Fri Nov 26 09:51:56 CET,0.0 0.562 0.869 1.145 1.4 1.639 1.866 2.09 2.521 2.743 2.964 3.135 3.584 3.789 4.173 4.551 4.94 5.133 5.498 5.855 6.387 6.741 7.075 7.555 8.04 8.508 8.958 9.385 9.964 10.586 11.221 12.014 12.789 13.542 14.419 15.39 16.333 17.4 18.583 19.878 21.279 22.936 24.957 27.056 29.604 32.61 36.257 40.592 46.06 53.135 62.846 72.105 78.334 82.887 86.349 89.094 91.223 92.978 94.382 95.652 96.665 97.525 98.297 98.982 99.573 100.085 100.584 100.995 101.33 101.646 101.943 102.177 102.412 102.607 102.73 102.858 103.001 103.144 103.268 103.345 103.421 103.52 103.586 103.658 103.69 103.739 103.794 103.838 103.847 103.716 103.832 103.819 103.796 103.752 103.717 103.658 103.588 103.492 103.364 103.181 102.024 -4 ,23415 ,TETRA ,17556676,Fri Nov 26 08:00:40 CET,Fri Nov 26 09:50:53 CET,0.0 0.791 1.193 1.502 1.817 2.114 2.376 2.627 3.113 3.348 3.567 3.746 4.186 4.39 4.799 5.193 5.578 5.77 6.15 6.521 7.054 7.406 7.756 8.271 8.784 9.281 9.754 10.207 10.797 11.387 11.979 12.713 13.447 14.171 15.012 15.971 16.917 17.992 19.259 20.684 22.15 23.807 25.801 27.908 30.489 33.455 37.107 41.478 46.894 53.971 63.607 72.797 79.059 83.631 87.069 89.778 91.926 93.692 95.096 96.381 97.398 98.272 99.038 99.68 100.23 100.687 101.142 101.529 101.824 102.114 102.406 102.622 102.83 103.047 103.202 103.347 103.49 103.607 103.713 103.784 103.842 103.913 103.953 103.979 103.99 104.022 104.039 104.025 104.017 103.88 103.986 103.964 103.95 103.884 103.835 103.793 103.722 103.631 103.502 103.329 102.08 -5 ,27644 ,TETRA ,17556677,Fri Nov 26 08:01:40 CET,Fri Nov 26 09:51:47 CET,0.0 0.58 0.944 1.252 1.525 1.804 2.074 2.33 2.805 3.02 3.219 3.362 3.792 3.977 4.337 4.685 5.034 5.213 5.567 5.903 6.41 6.757 7.104 7.618 8.116 8.584 9.025 9.464 10.058 10.652 11.244 11.971 12.678 13.371 14.185 15.127 16.061 17.107 18.268 19.547 20.936 22.567 24.569 26.674 29.256 32.258 35.906 40.284 45.749 52.827 62.541 71.8 78.065 82.687 86.109 88.842 91.029 92.813 94.236 95.55 96.615 97.511 98.29 98.963 99.556 100.076 100.568 100.966 101.3 101.628 101.948 102.204 102.453 102.677 102.835 102.998 103.154 103.303 103.426 103.501 103.577 103.693 103.782 103.855 103.883 103.933 103.983 104.019 104.033 103.915 104.055 104.055 104.035 103.952 103.906 103.852 103.773 103.686 103.556 103.314 101.895 -6 ,14381 ,TETRA ,17556678,Fri Nov 26 08:01:41 CET,Fri Nov 26 09:51:41 CET,0.0 0.735 1.095 1.402 1.684 1.946 2.19 2.423 2.877 3.095 3.299 3.444 3.877 4.075 4.462 4.848 5.224 5.409 5.778 6.139 6.671 7.008 7.338 7.836 8.327 8.809 9.279 9.741 10.35 10.954 11.551 12.301 13.051 13.786 14.639 15.598 16.541 17.622 18.858 20.204 21.635 23.293 25.286 27.367 29.93 32.951 36.587 40.924 46.435 53.545 63.158 72.305 78.555 83.142 86.601 89.368 91.502 93.221 94.619 95.918 96.917 97.732 98.482 99.13 99.662 100.141 100.614 100.977 101.282 101.592 101.88 102.107 102.342 102.561 102.692 102.818 102.954 103.089 103.217 103.298 103.379 103.487 103.557 103.616 103.642 103.681 103.695 103.703 103.707 103.58 103.695 103.67 103.647 103.576 103.519 103.453 103.336 103.208 103.091 102.851 101.925 -7 ,2895 ,TETRA ,17556679,Fri Nov 26 08:01:40 CET,Fri Nov 26 09:51:47 CET,0.0 0.687 1.06 1.38 1.65 1.898 2.145 2.376 2.796 2.997 3.198 3.343 3.781 3.973 4.329 4.69 5.051 5.222 5.556 5.892 6.396 6.744 7.095 7.586 8.044 8.488 8.928 9.375 9.983 10.575 11.173 11.939 12.695 13.444 14.304 15.261 16.216 17.303 18.501 19.8 21.238 22.944 25.009 27.137 29.684 32.676 36.301 40.634 46.132 53.218 62.815 71.996 78.201 82.749 86.189 88.894 91.025 92.785 94.171 95.437 96.437 97.241 97.946 98.595 99.165 99.624 100.058 100.435 100.762 101.083 101.374 101.589 101.8 102.016 102.176 102.331 102.488 102.644 102.78 102.858 102.934 103.042 103.117 103.186 103.219 103.267 103.295 103.328 103.339 103.221 103.358 103.35 103.333 103.254 103.211 103.158 103.067 102.957 102.842 102.628 101.732 -8 ,5911 ,TETRA ,17556680,Fri Nov 26 08:01:40 CET,Fri Nov 26 09:52:01 CET,0.0 0.576 0.929 1.233 1.518 1.802 2.053 2.288 2.738 2.947 3.141 3.277 3.711 3.899 4.26 4.604 4.952 5.122 5.467 5.817 6.311 6.623 6.944 7.446 7.934 8.404 8.857 9.293 9.861 10.439 11.011 11.716 12.419 13.113 13.93 14.881 15.837 16.918 18.108 19.402 20.812 22.463 24.475 26.569 29.116 32.09 35.717 40.114 45.61 52.647 62.241 71.449 77.724 82.258 85.647 88.379 90.57 92.348 93.702 94.931 95.918 96.753 97.5 98.154 98.728 99.221 99.688 100.045 100.342 100.654 100.968 101.213 101.412 101.604 101.758 101.904 102.029 102.143 102.263 102.335 102.397 102.451 102.478 102.509 102.526 102.566 102.576 102.557 102.544 102.407 102.52 102.508 102.496 102.435 102.384 102.32 102.25 102.172 102.052 101.884 100.849 -9 ,18684 ,TETRA ,17556681,Fri Nov 26 08:01:40 CET,Fri Nov 26 09:53:11 CET,0.0 0.925 1.294 1.621 1.901 2.153 2.407 2.649 3.106 3.329 3.553 3.727 4.163 4.357 4.726 5.081 5.428 5.604 5.97 6.333 6.877 7.23 7.574 8.087 8.59 9.08 9.56 10.038 10.681 11.311 11.919 12.65 13.353 14.046 14.867 15.838 16.807 17.913 19.177 20.539 21.982 23.636 25.633 27.721 30.253 33.239 36.88 41.271 46.786 53.84 63.415 72.578 78.891 83.52 86.998 89.762 91.913 93.683 95.106 96.425 97.46 98.303 99.051 99.705 100.289 100.793 101.287 101.695 102.013 102.337 102.651 102.885 103.114 103.34 103.511 103.672 103.837 103.996 104.142 104.237 104.326 104.43 104.48 104.541 104.576 104.632 104.657 104.655 104.661 104.536 104.666 104.653 104.633 104.546 104.495 104.453 104.394 104.304 104.148 103.947 103.128 -10 ,29162 ,TETRA ,17556682,Fri Nov 26 08:01:40 CET,Fri Nov 26 09:53:29 CET,0.0 0.549 0.887 1.185 1.464 1.721 1.956 2.18 2.601 2.8 3.003 3.179 3.619 3.814 4.206 4.585 4.959 5.147 5.514 5.873 6.395 6.736 7.072 7.574 8.063 8.535 8.994 9.435 10.021 10.616 11.207 11.927 12.65 13.379 14.25 15.246 16.225 17.328 18.524 19.81 21.209 22.856 24.875 26.994 29.532 32.519 36.159 40.51 46.028 53.119 62.738 71.968 78.272 82.85 86.288 88.978 91.082 92.831 94.21 95.492 96.515 97.353 98.109 98.772 99.317 99.775 100.247 100.639 100.946 101.246 101.54 101.772 101.997 102.221 102.392 102.551 102.71 102.881 103.033 103.118 103.193 103.291 103.355 103.431 103.471 103.521 103.567 103.614 103.63 103.502 103.63 103.62 103.606 103.554 103.492 103.425 103.323 103.18 103.024 102.778 101.674 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_27_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_27_24.txt deleted file mode 100644 index ed8bee6d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_27_24.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29675 ,TETRA ,17556683,Fri Nov 26 08:01:39 CET,Fri Nov 26 09:53:22 CET,0.0 0.781 1.06 1.289 1.48 1.648 1.797 1.932 2.174 2.281 2.387 2.451 2.693 2.783 2.955 3.122 3.286 3.368 3.522 3.668 3.885 4.022 4.151 4.34 4.529 4.72 4.898 5.069 5.294 5.502 5.7 5.94 6.182 6.452 6.811 7.215 7.58 7.969 8.364 8.764 9.176 9.644 10.197 10.717 11.318 11.981 12.749 13.601 14.535 15.505 16.455 17.079 17.312 17.252 17.015 16.703 16.4 16.084 15.763 15.434 15.137 14.851 14.535 14.224 13.938 13.692 13.465 13.252 13.054 12.824 12.535 12.293 12.065 11.845 11.681 11.509 11.33 11.139 10.927 10.774 10.611 10.376 10.21 10.01 9.91 9.713 9.484 9.261 9.144 8.869 8.714 8.574 8.431 8.084 7.879 7.669 7.423 7.147 6.8 6.273 2.422 -2 ,31070 ,TETRA ,17556684,Fri Nov 26 08:02:39 CET,Fri Nov 26 09:55:42 CET,0.0 1.329 1.687 1.93 2.131 2.302 2.447 2.585 2.841 2.957 3.066 3.141 3.397 3.513 3.749 3.989 4.199 4.297 4.488 4.672 4.93 5.086 5.234 5.469 5.694 5.903 6.106 6.295 6.544 6.775 6.982 7.242 7.515 7.771 8.067 8.4 8.697 9.011 9.348 9.714 10.102 10.538 11.05 11.565 12.151 12.777 13.462 14.264 15.206 16.21 17.256 17.858 18.033 18.017 17.864 17.604 17.341 17.04 16.697 16.344 16.025 15.732 15.425 15.082 14.795 14.546 14.286 14.024 13.749 13.461 13.171 12.949 12.723 12.471 12.268 12.088 11.908 11.701 11.487 11.336 11.187 10.969 10.799 10.618 10.529 10.318 10.109 9.919 9.81 9.561 9.435 9.285 9.124 8.766 8.565 8.352 8.105 7.837 7.481 6.928 4.359 -3 ,7860 ,TETRA ,17556685,Fri Nov 26 08:03:38 CET,Fri Nov 26 09:54:58 CET,0.0 0.934 1.205 1.424 1.655 1.867 2.061 2.241 2.56 2.705 2.842 2.963 3.23 3.336 3.521 3.704 3.876 3.96 4.137 4.313 4.541 4.682 4.818 5.008 5.187 5.359 5.527 5.694 5.924 6.142 6.349 6.598 6.849 7.102 7.381 7.696 8.002 8.324 8.659 9.006 9.371 9.799 10.305 10.82 11.413 12.063 12.792 13.594 14.504 15.484 16.422 16.942 17.044 16.903 16.662 16.426 16.173 15.901 15.64 15.334 15.072 14.769 14.43 14.092 13.765 13.473 13.158 12.881 12.646 12.394 12.135 11.926 11.688 11.443 11.251 11.025 10.794 10.569 10.318 10.138 9.969 9.733 9.571 9.388 9.287 9.082 8.882 8.659 8.521 8.246 8.093 7.939 7.764 7.343 7.115 6.877 6.596 6.252 5.813 5.182 1.306 -4 ,1888 ,TETRA ,17556686,Fri Nov 26 08:03:38 CET,Fri Nov 26 09:55:17 CET,0.0 0.483 0.788 1.02 1.222 1.406 1.575 1.719 1.973 2.088 2.2 2.262 2.498 2.596 2.787 2.961 3.122 3.199 3.351 3.504 3.746 3.9 4.041 4.246 4.441 4.628 4.801 4.965 5.181 5.386 5.575 5.82 6.07 6.309 6.587 6.886 7.161 7.472 7.82 8.218 8.623 9.045 9.538 10.024 10.586 11.217 11.923 12.662 13.541 14.55 15.597 16.213 16.329 16.235 16.103 15.932 15.685 15.391 15.106 14.785 14.471 14.161 13.843 13.554 13.285 13.038 12.77 12.525 12.28 12.005 11.744 11.535 11.311 11.073 10.885 10.684 10.467 10.235 9.988 9.808 9.633 9.377 9.189 9.006 8.908 8.682 8.461 8.229 8.109 7.854 7.643 7.448 7.26 6.844 6.632 6.38 6.038 5.672 5.294 4.804 0.9 -5 ,22285 ,TETRA ,17556687,Fri Nov 26 08:03:38 CET,Fri Nov 26 09:55:33 CET,0.0 0.641 0.909 1.151 1.343 1.51 1.652 1.793 2.069 2.186 2.287 2.347 2.59 2.69 2.883 3.072 3.245 3.321 3.471 3.624 3.844 3.98 4.113 4.311 4.501 4.683 4.857 5.019 5.233 5.453 5.66 5.899 6.14 6.377 6.664 6.994 7.293 7.623 7.979 8.361 8.765 9.217 9.737 10.257 10.894 11.612 12.405 13.237 14.138 15.175 16.216 16.73 16.837 16.712 16.474 16.215 15.923 15.571 15.179 14.717 14.308 13.957 13.635 13.34 13.051 12.759 12.464 12.216 12.0 11.766 11.511 11.294 11.063 10.844 10.679 10.485 10.295 10.094 9.88 9.733 9.575 9.34 9.176 8.986 8.889 8.68 8.454 8.22 8.103 7.861 7.716 7.569 7.417 7.06 6.863 6.657 6.422 6.151 5.78 5.292 0.985 -6 ,14328 ,TETRA ,17556688,Fri Nov 26 08:03:39 CET,Fri Nov 26 09:55:11 CET,0.0 0.555 0.851 1.08 1.276 1.464 1.631 1.768 2.017 2.13 2.24 2.317 2.566 2.671 2.88 3.081 3.261 3.345 3.502 3.643 3.851 3.992 4.131 4.336 4.542 4.749 4.955 5.147 5.393 5.634 5.87 6.15 6.414 6.665 6.954 7.274 7.569 7.895 8.263 8.662 9.089 9.581 10.168 10.735 11.38 12.1 12.916 13.781 14.698 15.634 16.492 16.893 16.842 16.541 16.156 15.741 15.312 14.895 14.526 14.114 13.738 13.41 13.097 12.791 12.495 12.234 11.955 11.694 11.472 11.246 10.97 10.736 10.508 10.265 10.081 9.883 9.677 9.466 9.261 9.134 8.989 8.741 8.566 8.388 8.3 8.115 7.907 7.685 7.57 7.314 7.17 7.011 6.847 6.499 6.325 6.136 5.917 5.669 5.341 4.756 1.792 -7 ,20571 ,TETRA ,17556689,Fri Nov 26 08:03:38 CET,Fri Nov 26 09:54:56 CET,0.0 0.677 0.912 1.101 1.281 1.448 1.591 1.715 1.963 2.083 2.195 2.262 2.512 2.613 2.791 2.967 3.142 3.223 3.379 3.526 3.741 3.879 4.012 4.208 4.388 4.571 4.752 4.919 5.135 5.349 5.548 5.789 6.021 6.242 6.514 6.817 7.098 7.412 7.743 8.088 8.476 8.924 9.412 9.9 10.489 11.149 11.914 12.701 13.572 14.578 15.562 16.197 16.338 16.246 16.088 15.853 15.587 15.329 15.092 14.829 14.605 14.375 14.119 13.838 13.542 13.252 12.937 12.627 12.364 12.13 11.877 11.673 11.471 11.245 11.063 10.874 10.689 10.489 10.271 10.134 9.994 9.752 9.574 9.394 9.302 9.103 8.901 8.689 8.565 8.303 8.175 8.034 7.891 7.55 7.347 7.153 6.92 6.611 6.308 5.919 2.596 -8 ,8780 ,TETRA ,17556690,Fri Nov 26 08:03:38 CET,Fri Nov 26 09:38:58 CET,0.0 1.292 1.743 2.079 2.32 2.54 2.746 2.938 3.258 3.384 3.502 3.587 3.839 3.96 4.2 4.427 4.635 4.733 4.907 5.057 5.279 5.428 5.572 5.774 5.965 6.14 6.306 6.486 6.731 6.95 7.153 7.401 7.632 7.857 8.115 8.406 8.709 9.039 9.381 9.75 10.128 10.534 11.005 11.491 12.066 12.689 13.392 14.18 15.031 15.946 16.924 17.454 17.555 17.494 17.313 17.081 16.819 16.522 16.248 15.958 15.687 15.446 15.216 14.92 14.577 14.288 14.028 13.811 13.602 13.369 13.149 12.968 12.739 12.466 12.266 12.057 11.841 11.635 11.408 11.24 11.062 10.808 10.637 10.449 10.35 10.118 9.872 9.611 9.474 9.203 9.001 8.826 8.662 8.296 8.067 7.8 7.496 7.076 6.588 5.954 1.416 -9 ,30728 ,TETRA ,17556691,Fri Nov 26 08:03:38 CET,Fri Nov 26 09:39:00 CET,0.0 0.99 1.361 1.629 1.864 2.107 2.308 2.46 2.723 2.844 2.961 3.066 3.326 3.426 3.611 3.795 3.97 4.058 4.221 4.379 4.63 4.78 4.919 5.136 5.352 5.543 5.719 5.887 6.114 6.339 6.541 6.785 7.033 7.268 7.533 7.835 8.123 8.443 8.79 9.15 9.541 9.977 10.477 10.98 11.543 12.178 12.905 13.731 14.689 15.67 16.651 17.21 17.296 17.034 16.642 16.265 15.903 15.53 15.215 14.904 14.587 14.274 13.955 13.635 13.335 13.061 12.773 12.519 12.307 12.09 11.849 11.628 11.384 11.137 10.941 10.73 10.506 10.274 10.053 9.905 9.745 9.497 9.31 9.112 9.009 8.783 8.556 8.325 8.205 7.955 7.816 7.675 7.545 7.218 7.021 6.786 6.513 6.217 5.873 5.395 1.386 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_27_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_27_25.txt deleted file mode 100644 index 12fd2161..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_27_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14500 ,TETRA ,17556693,Fri Nov 26 08:04:39 CET,Fri Nov 26 09:39:50 CET,0.0 0.717 0.918 1.101 1.232 1.314 1.389 1.45 1.547 1.582 1.601 1.497 1.649 1.66 1.681 1.694 1.704 1.703 1.698 1.69 1.661 1.627 1.577 1.504 1.434 1.35 1.253 1.143 0.994 0.835 0.67 0.457 0.232 -0.006 -0.315 -0.688 -1.059 -1.486 -1.989 -2.566 -3.21 -4.005 -5.026 -6.164 -7.618 -9.408 -11.731 -14.743 -18.929 -24.814 -33.643 -43.04 -50.003 -55.524 -59.939 -63.604 -66.645 -69.214 -71.328 -73.397 -75.121 -76.599 -77.958 -79.173 -80.26 -81.248 -82.286 -83.224 -84.014 -84.798 -85.59 -86.226 -86.88 -87.571 -88.113 -88.645 -89.157 -89.67 -90.193 -90.554 -90.923 -91.503 -91.907 -92.314 -92.514 -92.91 -93.335 -93.789 -94.015 -94.473 -94.69 -94.921 -95.174 -95.735 -96.008 -96.303 -96.617 -96.957 -97.357 -97.89 -100.43 -2 ,17738 ,TETRA ,17556694,Fri Nov 26 08:04:39 CET,Fri Nov 26 09:56:40 CET,0.0 1.404 1.677 1.814 1.921 2.04 2.122 2.18 2.269 2.29 2.309 2.199 2.353 2.358 2.355 2.336 2.32 2.306 2.273 2.253 2.202 2.146 2.102 2.044 1.991 1.914 1.804 1.697 1.573 1.436 1.276 1.083 0.878 0.661 0.383 0.04 -0.324 -0.793 -1.342 -1.943 -2.604 -3.428 -4.482 -5.591 -7.021 -8.832 -11.222 -14.36 -18.533 -24.281 -32.948 -42.111 -49.011 -54.399 -58.654 -62.258 -65.246 -67.784 -69.877 -71.899 -73.592 -75.046 -76.37 -77.567 -78.669 -79.659 -80.654 -81.516 -82.236 -82.976 -83.717 -84.318 -84.964 -85.643 -86.152 -86.668 -87.19 -87.705 -88.223 -88.58 -88.938 -89.485 -89.848 -90.207 -90.399 -90.8 -91.218 -91.658 -91.881 -92.327 -92.531 -92.779 -93.034 -93.584 -93.9 -94.213 -94.535 -94.925 -95.356 -95.845 -99.195 -3 ,7203 ,TETRA ,17556695,Fri Nov 26 08:05:39 CET,Fri Nov 26 09:58:33 CET,0.0 1.242 1.442 1.562 1.654 1.718 1.76 1.805 1.879 1.894 1.905 1.772 1.907 1.908 1.899 1.875 1.86 1.848 1.808 1.771 1.707 1.655 1.593 1.489 1.369 1.239 1.119 1.007 0.845 0.683 0.509 0.275 0.036 -0.221 -0.553 -0.958 -1.358 -1.811 -2.333 -2.935 -3.635 -4.498 -5.563 -6.681 -8.156 -10.035 -12.447 -15.542 -19.648 -25.374 -33.992 -43.249 -50.204 -55.64 -59.896 -63.447 -66.421 -68.974 -71.113 -73.213 -74.961 -76.45 -77.833 -79.098 -80.234 -81.262 -82.277 -83.152 -83.915 -84.71 -85.507 -86.146 -86.787 -87.42 -87.909 -88.407 -88.916 -89.46 -90.019 -90.385 -90.765 -91.342 -91.725 -92.12 -92.325 -92.739 -93.146 -93.574 -93.796 -94.272 -94.537 -94.794 -95.041 -95.568 -95.87 -96.181 -96.503 -96.861 -97.304 -97.915 -101.11 -4 ,20888 ,TETRA ,17556696,Fri Nov 26 08:05:39 CET,Fri Nov 26 09:58:47 CET,0.0 0.795 1.0 1.125 1.23 1.309 1.369 1.427 1.525 1.563 1.594 1.5 1.658 1.678 1.7 1.712 1.718 1.715 1.695 1.673 1.637 1.598 1.551 1.481 1.404 1.31 1.224 1.126 0.967 0.799 0.622 0.403 0.179 -0.05 -0.338 -0.709 -1.085 -1.501 -2.015 -2.609 -3.271 -4.094 -5.144 -6.308 -7.796 -9.663 -12.091 -15.154 -19.227 -24.808 -33.225 -42.4 -49.465 -55.027 -59.444 -63.138 -66.245 -68.939 -71.083 -73.13 -74.849 -76.367 -77.8 -79.078 -80.193 -81.177 -82.211 -83.121 -83.864 -84.623 -85.393 -86.02 -86.669 -87.322 -87.808 -88.305 -88.825 -89.353 -89.903 -90.28 -90.662 -91.235 -91.624 -92.021 -92.222 -92.63 -93.059 -93.508 -93.726 -94.185 -94.45 -94.716 -94.978 -95.496 -95.776 -96.085 -96.4 -96.732 -97.123 -97.659 -99.37 -5 ,20984 ,TETRA ,17556697,Fri Nov 26 08:05:39 CET,Fri Nov 26 09:57:34 CET,0.0 0.755 1.045 1.202 1.304 1.398 1.48 1.542 1.625 1.662 1.693 1.588 1.729 1.733 1.745 1.751 1.748 1.748 1.74 1.712 1.663 1.625 1.582 1.496 1.404 1.314 1.234 1.148 0.992 0.825 0.669 0.455 0.219 -0.022 -0.323 -0.676 -1.043 -1.473 -1.969 -2.541 -3.172 -3.958 -5.011 -6.18 -7.663 -9.483 -11.821 -14.826 -18.857 -24.507 -33.122 -42.362 -49.238 -54.678 -59.053 -62.717 -65.695 -68.289 -70.474 -72.568 -74.324 -75.845 -77.287 -78.59 -79.709 -80.693 -81.726 -82.649 -83.415 -84.167 -84.917 -85.54 -86.167 -86.781 -87.279 -87.802 -88.316 -88.838 -89.393 -89.763 -90.133 -90.72 -91.108 -91.49 -91.686 -92.094 -92.515 -92.96 -93.184 -93.649 -93.867 -94.093 -94.327 -94.87 -95.165 -95.476 -95.818 -96.206 -96.647 -97.167 -100.294 -6 ,3810 ,TETRA ,17556698,Fri Nov 26 08:05:39 CET,Fri Nov 26 09:58:31 CET,0.0 0.917 1.183 1.355 1.496 1.592 1.652 1.71 1.82 1.864 1.894 1.783 1.937 1.953 1.973 1.983 1.985 1.984 1.965 1.938 1.898 1.864 1.822 1.741 1.652 1.565 1.455 1.347 1.229 1.098 0.94 0.725 0.495 0.244 -0.056 -0.408 -0.782 -1.231 -1.747 -2.327 -2.975 -3.788 -4.842 -5.949 -7.343 -9.107 -11.406 -14.361 -18.393 -24.102 -32.795 -42.153 -49.056 -54.45 -58.811 -62.483 -65.478 -68.023 -70.151 -72.219 -73.929 -75.408 -76.777 -78.025 -79.15 -80.148 -81.183 -82.106 -82.897 -83.717 -84.543 -85.217 -85.895 -86.576 -87.1 -87.637 -88.185 -88.736 -89.312 -89.703 -90.083 -90.676 -91.105 -91.532 -91.745 -92.177 -92.621 -93.071 -93.289 -93.742 -93.939 -94.18 -94.442 -95.009 -95.307 -95.617 -95.97 -96.353 -96.802 -97.487 -100.298 -7 ,16613 ,TETRA ,17556699,Fri Nov 26 08:05:39 CET,Fri Nov 26 09:57:42 CET,0.0 1.598 1.858 2.016 2.102 2.158 2.219 2.268 2.317 2.337 2.358 2.255 2.414 2.417 2.429 2.45 2.447 2.441 2.439 2.414 2.33 2.278 2.23 2.154 2.057 1.943 1.826 1.709 1.557 1.4 1.236 1.018 0.791 0.545 0.237 -0.121 -0.478 -0.922 -1.44 -2.029 -2.719 -3.546 -4.605 -5.753 -7.232 -9.094 -11.464 -14.508 -18.669 -24.451 -33.005 -42.224 -49.178 -54.701 -59.125 -62.798 -65.878 -68.52 -70.673 -72.732 -74.462 -75.951 -77.331 -78.576 -79.687 -80.712 -81.747 -82.614 -83.349 -84.083 -84.824 -85.454 -86.086 -86.718 -87.211 -87.694 -88.179 -88.688 -89.207 -89.557 -89.924 -90.519 -90.919 -91.333 -91.536 -91.905 -92.293 -92.724 -92.959 -93.425 -93.633 -93.896 -94.171 -94.692 -94.976 -95.284 -95.609 -96.046 -96.581 -97.219 -100.805 -8 ,348 ,TETRA ,17556700,Fri Nov 26 08:06:37 CET,Fri Nov 26 10:02:24 CET,0.0 0.902 1.118 1.243 1.346 1.417 1.461 1.506 1.569 1.593 1.617 1.529 1.683 1.686 1.684 1.691 1.692 1.689 1.674 1.645 1.602 1.571 1.529 1.451 1.381 1.317 1.239 1.164 1.059 0.923 0.756 0.538 0.308 0.041 -0.298 -0.681 -1.074 -1.554 -2.086 -2.662 -3.352 -4.243 -5.382 -6.603 -8.117 -9.954 -12.317 -15.341 -19.398 -25.079 -33.749 -43.133 -50.114 -55.576 -59.937 -63.563 -66.589 -69.214 -71.351 -73.43 -75.2 -76.715 -78.11 -79.401 -80.548 -81.551 -82.573 -83.47 -84.232 -84.989 -85.751 -86.365 -86.988 -87.635 -88.131 -88.65 -89.174 -89.701 -90.234 -90.588 -90.956 -91.514 -91.889 -92.279 -92.485 -92.919 -93.356 -93.809 -94.033 -94.512 -94.761 -95.005 -95.271 -95.819 -96.091 -96.387 -96.736 -97.122 -97.588 -98.159 -101.849 -9 ,31311 ,TETRA ,17556701,Fri Nov 26 08:06:38 CET,Fri Nov 26 09:58:20 CET,0.0 0.706 0.873 1.021 1.123 1.206 1.272 1.31 1.383 1.413 1.427 1.288 1.426 1.426 1.406 1.372 1.35 1.341 1.307 1.269 1.224 1.178 1.123 1.038 0.955 0.867 0.772 0.671 0.517 0.365 0.219 0.031 -0.176 -0.407 -0.695 -1.042 -1.432 -1.911 -2.451 -3.049 -3.746 -4.606 -5.677 -6.866 -8.393 -10.263 -12.667 -15.719 -19.818 -25.52 -34.055 -43.098 -49.928 -55.359 -59.683 -63.284 -66.254 -68.794 -70.929 -73.015 -74.723 -76.211 -77.609 -78.879 -80.021 -81.022 -82.042 -82.93 -83.658 -84.407 -85.198 -85.839 -86.483 -87.139 -87.638 -88.141 -88.655 -89.184 -89.721 -90.075 -90.444 -91.053 -91.484 -91.913 -92.116 -92.531 -92.962 -93.391 -93.609 -94.075 -94.298 -94.538 -94.801 -95.386 -95.688 -96.008 -96.355 -96.724 -97.148 -97.691 -100.045 -10 ,9042 ,TETRA ,17556702,Fri Nov 26 08:06:38 CET,Fri Nov 26 09:59:45 CET,0.0 0.578 0.736 0.86 0.965 1.056 1.116 1.15 1.21 1.238 1.267 1.155 1.298 1.295 1.282 1.266 1.232 1.21 1.171 1.124 1.062 1.037 1.001 0.935 0.87 0.789 0.688 0.578 0.423 0.254 0.069 -0.172 -0.407 -0.648 -0.931 -1.274 -1.651 -2.104 -2.63 -3.223 -3.902 -4.746 -5.805 -6.894 -8.284 -10.12 -12.561 -15.581 -19.573 -25.164 -33.58 -42.68 -49.549 -54.922 -59.225 -62.903 -65.979 -68.62 -70.798 -72.906 -74.628 -76.113 -77.521 -78.777 -79.926 -80.983 -82.025 -82.907 -83.666 -84.441 -85.214 -85.829 -86.453 -87.098 -87.613 -88.106 -88.585 -89.077 -89.59 -89.957 -90.322 -90.87 -91.252 -91.656 -91.868 -92.29 -92.715 -93.159 -93.384 -93.854 -94.092 -94.331 -94.6 -95.186 -95.475 -95.804 -96.164 -96.576 -97.133 -97.775 -101.651 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_28_21.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_28_21.txt deleted file mode 100644 index a1e11c53..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_28_21.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,14269 ,KEBNE ,17025441,Wed Dec 22 12:39:41 CET,Wed Dec 22 14:16:36 CET,0.0 0.626 0.844 0.98 1.087 1.2 1.293 1.366 1.504 1.571 1.636 1.696 1.812 1.858 1.952 2.037 2.113 2.149 2.218 2.284 2.357 2.403 2.453 2.52 2.571 2.62 2.669 2.71 2.764 2.819 2.878 2.937 2.98 3.008 3.042 3.084 3.123 3.165 3.19 3.191 3.158 3.103 3.031 2.929 2.746 2.455 2.031 1.443 0.512 -0.902 -3.308 -6.263 -8.602 -10.559 -12.209 -13.599 -14.765 -15.813 -16.728 -17.633 -18.391 -19.067 -19.692 -20.273 -20.819 -21.3 -21.766 -22.163 -22.53 -22.926 -23.33 -23.649 -23.973 -24.297 -24.543 -24.804 -25.08 -25.376 -25.683 -25.883 -26.085 -26.388 -26.592 -26.816 -26.932 -27.168 -27.418 -27.671 -27.799 -28.017 -28.205 -28.346 -28.492 -28.808 -28.98 -29.156 -29.345 -29.541 -29.757 -30.054 -31.269 -3 ,14897 ,KEBNE ,17025442,Wed Dec 22 12:39:45 CET,Wed Dec 22 14:08:42 CET,0.0 0.819 1.04 1.203 1.34 1.445 1.517 1.584 1.721 1.78 1.833 1.877 1.985 2.037 2.134 2.214 2.288 2.328 2.403 2.468 2.566 2.616 2.655 2.705 2.749 2.804 2.859 2.902 2.946 2.985 3.029 3.086 3.118 3.129 3.147 3.177 3.201 3.2 3.185 3.157 3.107 3.042 2.948 2.821 2.638 2.37 1.975 1.386 0.427 -1.089 -3.513 -6.348 -8.665 -10.603 -12.215 -13.633 -14.912 -16.025 -16.945 -17.841 -18.611 -19.289 -19.91 -20.484 -21.021 -21.514 -22.015 -22.456 -22.823 -23.2 -23.595 -23.924 -24.277 -24.637 -24.914 -25.195 -25.476 -25.771 -26.075 -26.267 -26.448 -26.745 -26.97 -27.193 -27.304 -27.538 -27.778 -28.032 -28.16 -28.377 -28.533 -28.659 -28.803 -29.124 -29.292 -29.469 -29.672 -29.889 -30.139 -30.43 -31.609 -4 ,30729 ,KEBNE ,17025443,Wed Dec 22 12:39:41 CET,Wed Dec 22 14:16:41 CET,0.0 0.961 1.215 1.399 1.528 1.629 1.722 1.795 1.935 2.005 2.062 2.102 2.207 2.255 2.359 2.448 2.509 2.54 2.597 2.642 2.722 2.773 2.815 2.881 2.951 3.01 3.064 3.118 3.185 3.239 3.274 3.311 3.355 3.395 3.418 3.434 3.438 3.426 3.433 3.443 3.406 3.333 3.225 3.083 2.89 2.621 2.208 1.634 0.782 -0.572 -2.93 -5.717 -7.941 -9.855 -11.511 -12.904 -14.081 -15.163 -16.089 -16.98 -17.738 -18.407 -19.026 -19.585 -20.091 -20.549 -21.023 -21.437 -21.787 -22.155 -22.539 -22.855 -23.172 -23.495 -23.736 -23.981 -24.243 -24.513 -24.795 -24.99 -25.189 -25.49 -25.697 -25.918 -26.029 -26.253 -26.491 -26.731 -26.849 -27.062 -27.234 -27.376 -27.524 -27.839 -28.018 -28.204 -28.383 -28.58 -28.798 -29.075 -30.062 -5 ,30729 ,KEBNE ,17025444,Wed Dec 22 12:39:41 CET,Wed Dec 22 14:17:51 CET,0.0 0.961 1.215 1.399 1.528 1.629 1.722 1.795 1.935 2.005 2.062 2.102 2.207 2.255 2.359 2.448 2.509 2.54 2.597 2.642 2.722 2.773 2.815 2.881 2.951 3.01 3.064 3.118 3.185 3.239 3.274 3.311 3.355 3.395 3.418 3.434 3.438 3.426 3.433 3.443 3.406 3.333 3.225 3.083 2.89 2.621 2.208 1.634 0.782 -0.572 -2.93 -5.717 -7.941 -9.855 -11.511 -12.904 -14.081 -15.163 -16.089 -16.98 -17.738 -18.407 -19.026 -19.585 -20.091 -20.549 -21.023 -21.437 -21.787 -22.155 -22.539 -22.855 -23.172 -23.495 -23.736 -23.981 -24.243 -24.513 -24.795 -24.99 -25.189 -25.49 -25.697 -25.918 -26.029 -26.253 -26.491 -26.731 -26.849 -27.062 -27.234 -27.376 -27.524 -27.839 -28.018 -28.204 -28.383 -28.58 -28.798 -29.075 -30.062 -6 ,26948 ,KEBNE ,17025445,Wed Dec 22 12:39:41 CET,Wed Dec 22 14:16:39 CET,0.0 0.771 0.971 1.116 1.235 1.344 1.452 1.544 1.678 1.737 1.793 1.853 1.97 2.01 2.1 2.178 2.242 2.279 2.35 2.416 2.516 2.577 2.631 2.72 2.794 2.861 2.922 2.97 3.032 3.089 3.145 3.222 3.282 3.335 3.391 3.431 3.476 3.512 3.531 3.525 3.48 3.414 3.314 3.179 2.991 2.745 2.403 1.853 0.964 -0.456 -2.838 -5.591 -7.845 -9.837 -11.554 -13.012 -14.235 -15.264 -16.152 -17.073 -17.861 -18.52 -19.139 -19.743 -20.269 -20.73 -21.221 -21.65 -22.033 -22.423 -22.803 -23.122 -23.451 -23.802 -24.076 -24.346 -24.604 -24.872 -25.158 -25.348 -25.543 -25.854 -26.071 -26.29 -26.405 -26.631 -26.854 -27.094 -27.218 -27.446 -27.646 -27.785 -27.934 -28.259 -28.419 -28.585 -28.777 -28.989 -29.225 -29.522 -30.614 -7 ,28225 ,KEBNE ,17025446,Wed Dec 22 12:39:41 CET,Wed Dec 22 14:16:50 CET,0.0 0.841 1.067 1.221 1.358 1.477 1.582 1.682 1.839 1.897 1.96 2.024 2.135 2.183 2.264 2.355 2.448 2.49 2.562 2.625 2.729 2.802 2.869 2.962 3.054 3.13 3.184 3.239 3.304 3.359 3.411 3.472 3.54 3.602 3.654 3.678 3.693 3.71 3.719 3.698 3.652 3.588 3.488 3.365 3.146 2.816 2.336 1.69 0.786 -0.625 -2.988 -5.737 -7.959 -9.872 -11.545 -12.994 -14.212 -15.302 -16.191 -17.046 -17.795 -18.446 -19.064 -19.647 -20.174 -20.645 -21.117 -21.539 -21.912 -22.293 -22.689 -23.001 -23.306 -23.627 -23.869 -24.124 -24.398 -24.663 -24.932 -25.118 -25.309 -25.612 -25.817 -26.029 -26.137 -26.355 -26.589 -26.849 -26.983 -27.203 -27.38 -27.528 -27.688 -28.001 -28.16 -28.34 -28.546 -28.763 -28.981 -29.249 -30.085 -8 ,11499 ,KEBNE ,17025447,Wed Dec 22 12:39:40 CET,Wed Dec 22 14:16:30 CET,0.0 1.233 1.455 1.623 1.76 1.869 1.971 2.056 2.208 2.271 2.331 2.394 2.509 2.559 2.649 2.728 2.817 2.858 2.93 2.986 3.057 3.115 3.173 3.243 3.32 3.401 3.457 3.507 3.564 3.611 3.655 3.701 3.736 3.765 3.806 3.876 3.931 3.972 4.015 4.033 4.01 3.966 3.9 3.772 3.57 3.314 2.927 2.348 1.467 -0.025 -2.569 -5.487 -7.939 -9.966 -11.601 -13.079 -14.351 -15.44 -16.343 -17.221 -17.979 -18.654 -19.284 -19.868 -20.413 -20.897 -21.396 -21.832 -22.201 -22.571 -22.956 -23.287 -23.619 -23.956 -24.211 -24.469 -24.736 -25.008 -25.286 -25.485 -25.686 -25.979 -26.192 -26.413 -26.523 -26.745 -26.975 -27.22 -27.349 -27.574 -27.773 -27.918 -28.064 -28.397 -28.575 -28.756 -28.947 -29.162 -29.415 -29.724 -30.472 -9 ,24922 ,KEBNE ,17025448,Wed Dec 22 12:39:40 CET,Wed Dec 22 14:16:39 CET,0.0 0.723 0.967 1.131 1.275 1.397 1.48 1.555 1.687 1.745 1.807 1.872 1.984 2.032 2.118 2.197 2.266 2.299 2.363 2.428 2.512 2.553 2.607 2.704 2.786 2.863 2.931 2.995 3.074 3.145 3.202 3.275 3.354 3.402 3.441 3.478 3.502 3.526 3.56 3.58 3.55 3.505 3.439 3.293 3.053 2.773 2.395 1.792 0.841 -0.594 -2.968 -5.76 -8.021 -9.989 -11.677 -13.056 -14.206 -15.274 -16.184 -17.061 -17.793 -18.431 -19.03 -19.608 -20.146 -20.621 -21.096 -21.522 -21.892 -22.255 -22.626 -22.929 -23.241 -23.558 -23.796 -24.046 -24.314 -24.591 -24.872 -25.064 -25.266 -25.588 -25.802 -26.028 -26.141 -26.367 -26.606 -26.856 -26.988 -27.207 -27.382 -27.524 -27.671 -27.995 -28.169 -28.354 -28.546 -28.738 -28.968 -29.252 -30.286 -10 ,310 ,KEBNE ,17025449,Wed Dec 22 12:39:40 CET,Wed Dec 22 14:16:31 CET,0.0 0.945 1.137 1.269 1.379 1.477 1.57 1.647 1.784 1.855 1.912 1.962 2.082 2.131 2.214 2.292 2.366 2.401 2.459 2.522 2.622 2.673 2.722 2.793 2.847 2.896 2.953 3.003 3.062 3.11 3.147 3.189 3.227 3.272 3.315 3.336 3.37 3.407 3.418 3.415 3.396 3.379 3.323 3.204 3.017 2.77 2.385 1.787 0.859 -0.553 -2.875 -5.692 -8.023 -9.942 -11.572 -13.002 -14.204 -15.285 -16.226 -17.126 -17.87 -18.56 -19.195 -19.761 -20.284 -20.757 -21.255 -21.698 -22.063 -22.427 -22.815 -23.13 -23.469 -23.826 -24.091 -24.37 -24.648 -24.936 -25.234 -25.433 -25.643 -25.972 -26.21 -26.452 -26.57 -26.814 -27.073 -27.337 -27.473 -27.699 -27.883 -28.024 -28.178 -28.524 -28.7 -28.871 -29.067 -29.309 -29.574 -29.96 -30.922 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_28_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_28_26.txt deleted file mode 100644 index 2b17c649..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_28_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6987 ,TETRA ,17556703,Fri Nov 26 08:06:37 CET,Fri Nov 26 09:59:24 CET,0.0 0.393 0.552 0.687 0.799 0.899 0.983 1.061 1.19 1.257 1.335 1.435 1.556 1.608 1.713 1.812 1.905 1.947 2.024 2.106 2.21 2.261 2.306 2.384 2.466 2.525 2.574 2.616 2.666 2.713 2.751 2.797 2.833 2.843 2.835 2.832 2.828 2.788 2.721 2.651 2.553 2.404 2.197 1.925 1.531 1.014 0.288 -0.758 -2.236 -4.397 -7.951 -12.143 -15.503 -18.206 -20.435 -22.359 -23.984 -25.438 -26.67 -27.838 -28.789 -29.618 -30.415 -31.163 -31.837 -32.432 -33.03 -33.553 -33.994 -34.439 -34.901 -35.28 -35.662 -36.058 -36.364 -36.673 -36.997 -37.328 -37.654 -37.876 -38.103 -38.46 -38.7 -38.942 -39.07 -39.324 -39.572 -39.829 -39.952 -40.173 -40.332 -40.475 -40.614 -40.893 -41.051 -41.224 -41.412 -41.613 -41.805 -42.005 -42.394 -2 ,4943 ,TETRA ,17556704,Fri Nov 26 08:06:38 CET,Fri Nov 26 10:00:15 CET,0.0 0.539 0.717 0.858 0.963 1.049 1.135 1.213 1.329 1.372 1.417 1.448 1.548 1.595 1.68 1.745 1.806 1.831 1.882 1.936 2.01 2.057 2.093 2.141 2.192 2.234 2.27 2.309 2.371 2.418 2.445 2.475 2.498 2.514 2.535 2.555 2.557 2.525 2.462 2.364 2.231 2.06 1.818 1.503 1.057 0.5 -0.248 -1.296 -2.744 -4.859 -8.5 -12.752 -16.134 -18.891 -21.157 -23.083 -24.695 -26.074 -27.206 -28.329 -29.272 -30.089 -30.851 -31.556 -32.185 -32.741 -33.319 -33.851 -34.319 -34.777 -35.225 -35.597 -35.978 -36.352 -36.63 -36.918 -37.223 -37.528 -37.837 -38.043 -38.249 -38.576 -38.8 -39.023 -39.133 -39.371 -39.617 -39.857 -39.982 -40.212 -40.383 -40.535 -40.682 -40.992 -41.149 -41.314 -41.525 -41.76 -41.997 -42.282 -42.831 -3 ,7304 ,TETRA ,17556705,Fri Nov 26 08:06:39 CET,Fri Nov 26 10:02:29 CET,0.0 0.418 0.563 0.683 0.802 0.899 0.986 1.066 1.217 1.285 1.34 1.372 1.48 1.528 1.612 1.688 1.746 1.771 1.822 1.869 1.943 1.985 2.026 2.084 2.134 2.191 2.243 2.288 2.351 2.404 2.44 2.469 2.49 2.494 2.471 2.457 2.454 2.429 2.396 2.334 2.223 2.084 1.869 1.581 1.187 0.658 -0.084 -1.145 -2.64 -4.781 -8.27 -12.3 -15.599 -18.414 -20.73 -22.665 -24.293 -25.692 -26.858 -27.988 -28.932 -29.769 -30.544 -31.247 -31.883 -32.453 -33.04 -33.558 -34.003 -34.463 -34.932 -35.308 -35.681 -36.075 -36.382 -36.697 -37.016 -37.343 -37.677 -37.899 -38.127 -38.483 -38.726 -38.97 -39.09 -39.347 -39.625 -39.9 -40.039 -40.278 -40.441 -40.578 -40.718 -41.009 -41.166 -41.323 -41.491 -41.7 -41.931 -42.152 -42.601 -4 ,16155 ,TETRA ,17556706,Fri Nov 26 08:07:40 CET,Fri Nov 26 10:01:50 CET,0.0 0.282 0.452 0.568 0.666 0.766 0.863 0.944 1.077 1.139 1.202 1.253 1.352 1.385 1.463 1.543 1.625 1.659 1.713 1.77 1.84 1.879 1.919 1.977 2.018 2.05 2.076 2.1 2.136 2.163 2.176 2.177 2.171 2.167 2.157 2.128 2.086 2.04 1.967 1.869 1.754 1.59 1.388 1.162 0.805 0.275 -0.47 -1.431 -2.817 -4.958 -8.499 -12.672 -16.039 -18.822 -21.075 -22.991 -24.616 -26.044 -27.228 -28.359 -29.316 -30.168 -30.977 -31.712 -32.374 -32.983 -33.595 -34.128 -34.577 -35.035 -35.505 -35.874 -36.243 -36.637 -36.939 -37.231 -37.528 -37.828 -38.132 -38.339 -38.546 -38.864 -39.086 -39.322 -39.44 -39.67 -39.911 -40.168 -40.305 -40.546 -40.745 -40.893 -41.034 -41.327 -41.481 -41.641 -41.824 -42.04 -42.243 -42.469 -43.094 -5 ,23916 ,TETRA ,17556707,Fri Nov 26 08:07:40 CET,Fri Nov 26 09:45:33 CET,0.0 0.347 0.505 0.635 0.742 0.837 0.934 1.03 1.164 1.209 1.263 1.315 1.415 1.457 1.542 1.612 1.683 1.722 1.798 1.867 1.96 2.011 2.064 2.138 2.2 2.265 2.317 2.353 2.396 2.442 2.481 2.516 2.545 2.56 2.58 2.593 2.586 2.554 2.489 2.405 2.29 2.125 1.901 1.632 1.242 0.774 0.106 -0.897 -2.349 -4.541 -8.135 -12.395 -15.817 -18.559 -20.833 -22.84 -24.49 -25.924 -27.134 -28.299 -29.287 -30.155 -30.959 -31.676 -32.328 -32.92 -33.514 -34.042 -34.499 -34.958 -35.419 -35.792 -36.18 -36.585 -36.896 -37.205 -37.519 -37.848 -38.189 -38.422 -38.65 -38.994 -39.233 -39.481 -39.608 -39.87 -40.139 -40.411 -40.549 -40.79 -40.958 -41.104 -41.257 -41.564 -41.724 -41.898 -42.074 -42.274 -42.521 -42.787 -43.238 -6 ,2777 ,TETRA ,17556708,Fri Nov 26 08:08:41 CET,Fri Nov 26 10:03:37 CET,0.0 0.511 0.743 0.868 0.974 1.066 1.157 1.238 1.384 1.447 1.5 1.574 1.69 1.74 1.846 1.961 2.069 2.116 2.197 2.264 2.374 2.444 2.493 2.554 2.613 2.659 2.713 2.767 2.815 2.87 2.913 2.938 2.959 2.966 2.98 2.993 2.98 2.957 2.901 2.826 2.743 2.593 2.374 2.114 1.718 1.201 0.479 -0.506 -1.956 -4.068 -7.541 -11.717 -15.022 -17.776 -20.067 -22.043 -23.714 -25.152 -26.341 -27.468 -28.418 -29.269 -30.055 -30.787 -31.457 -32.057 -32.656 -33.165 -33.604 -34.051 -34.522 -34.914 -35.31 -35.714 -36.016 -36.323 -36.641 -36.965 -37.291 -37.514 -37.749 -38.112 -38.359 -38.614 -38.741 -39.0 -39.27 -39.543 -39.687 -39.943 -40.14 -40.298 -40.473 -40.847 -41.047 -41.247 -41.462 -41.694 -41.933 -42.201 -43.074 -7 ,2595 ,TETRA ,17556709,Fri Nov 26 08:08:40 CET,Fri Nov 26 10:01:22 CET,0.0 0.449 0.65 0.773 0.878 0.97 1.051 1.141 1.302 1.368 1.432 1.476 1.581 1.629 1.718 1.808 1.895 1.925 1.993 2.073 2.171 2.225 2.271 2.338 2.399 2.455 2.511 2.553 2.6 2.656 2.695 2.72 2.73 2.736 2.742 2.737 2.727 2.699 2.642 2.571 2.476 2.338 2.118 1.825 1.44 0.935 0.19 -0.86 -2.419 -4.7 -8.292 -12.571 -15.991 -18.778 -21.057 -22.994 -24.64 -26.084 -27.284 -28.431 -29.396 -30.231 -31.004 -31.707 -32.342 -32.911 -33.485 -33.989 -34.43 -34.871 -35.303 -35.663 -36.033 -36.41 -36.702 -36.991 -37.271 -37.566 -37.874 -38.086 -38.297 -38.611 -38.827 -39.064 -39.188 -39.423 -39.666 -39.941 -40.08 -40.317 -40.491 -40.64 -40.796 -41.099 -41.265 -41.463 -41.673 -41.862 -42.042 -42.324 -42.987 -8 ,1054 ,TETRA ,17556710,Fri Nov 26 08:09:40 CET,Fri Nov 26 10:02:37 CET,0.0 0.308 0.484 0.595 0.693 0.79 0.864 0.934 1.082 1.143 1.19 1.223 1.33 1.373 1.436 1.491 1.548 1.571 1.62 1.67 1.73 1.759 1.789 1.841 1.884 1.92 1.947 1.98 2.01 2.03 2.045 2.058 2.083 2.093 2.082 2.075 2.059 2.02 1.955 1.864 1.747 1.583 1.373 1.123 0.78 0.283 -0.479 -1.525 -2.996 -5.134 -8.772 -13.04 -16.458 -19.251 -21.53 -23.49 -25.121 -26.565 -27.774 -28.927 -29.896 -30.728 -31.489 -32.201 -32.863 -33.464 -34.07 -34.587 -35.028 -35.492 -35.98 -36.365 -36.746 -37.154 -37.472 -37.797 -38.119 -38.437 -38.78 -39.017 -39.249 -39.603 -39.845 -40.086 -40.207 -40.454 -40.701 -40.946 -41.075 -41.32 -41.531 -41.699 -41.868 -42.227 -42.415 -42.591 -42.769 -42.981 -43.213 -43.472 -44.119 -9 ,30405 ,TETRA ,17556711,Fri Nov 26 08:09:40 CET,Fri Nov 26 10:03:38 CET,0.0 0.319 0.471 0.604 0.725 0.819 0.895 0.97 1.09 1.15 1.213 1.284 1.398 1.45 1.559 1.637 1.696 1.723 1.782 1.834 1.902 1.953 2.0 2.054 2.102 2.14 2.17 2.202 2.238 2.276 2.317 2.357 2.393 2.418 2.426 2.428 2.433 2.406 2.337 2.236 2.114 1.969 1.759 1.491 1.089 0.533 -0.212 -1.163 -2.582 -4.812 -8.465 -12.68 -15.966 -18.681 -20.97 -22.899 -24.517 -25.918 -27.048 -28.157 -29.109 -29.925 -30.679 -31.384 -32.02 -32.583 -33.156 -33.661 -34.087 -34.509 -34.945 -35.307 -35.682 -36.068 -36.361 -36.654 -36.95 -37.253 -37.567 -37.781 -37.996 -38.328 -38.547 -38.762 -38.873 -39.117 -39.371 -39.624 -39.756 -40.001 -40.19 -40.337 -40.486 -40.79 -40.952 -41.12 -41.292 -41.484 -41.725 -41.996 -42.617 -10 ,28036 ,TETRA ,17556712,Fri Nov 26 08:09:40 CET,Fri Nov 26 10:02:36 CET,0.0 0.369 0.529 0.651 0.759 0.843 0.928 1.003 1.11 1.173 1.238 1.278 1.381 1.426 1.508 1.576 1.639 1.668 1.718 1.765 1.843 1.888 1.923 1.973 2.017 2.061 2.104 2.143 2.19 2.231 2.263 2.289 2.317 2.347 2.352 2.332 2.308 2.277 2.22 2.123 2.007 1.866 1.64 1.341 0.953 0.443 -0.279 -1.277 -2.668 -4.819 -8.497 -12.722 -16.033 -18.688 -20.922 -22.87 -24.522 -25.973 -27.157 -28.292 -29.265 -30.131 -30.925 -31.651 -32.317 -32.923 -33.532 -34.061 -34.518 -34.972 -35.438 -35.829 -36.207 -36.583 -36.88 -37.181 -37.484 -37.792 -38.104 -38.314 -38.533 -38.871 -39.093 -39.321 -39.441 -39.691 -39.952 -40.199 -40.32 -40.551 -40.719 -40.86 -40.996 -41.288 -41.446 -41.598 -41.765 -41.954 -42.191 -42.461 -42.959 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_29_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_29_25.txt deleted file mode 100644 index 0c674033..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_29_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29991 ,TETRA ,17556713,Fri Nov 26 08:09:40 CET,Fri Nov 26 09:44:58 CET,0.0 1.119 1.443 1.659 1.842 1.991 2.14 2.279 2.505 2.62 2.739 2.741 3.057 3.147 3.321 3.478 3.618 3.687 3.82 3.946 4.127 4.231 4.334 4.485 4.64 4.791 4.925 5.065 5.244 5.41 5.57 5.757 5.941 6.146 6.377 6.598 6.801 6.994 7.167 7.329 7.494 7.663 7.837 7.967 8.086 8.203 8.248 8.133 7.781 7.095 5.585 3.607 1.994 0.58 -0.618 -1.694 -2.688 -3.622 -4.378 -5.078 -5.693 -6.23 -6.748 -7.249 -7.705 -8.115 -8.555 -8.928 -9.221 -9.542 -9.891 -10.173 -10.462 -10.748 -10.964 -11.204 -11.457 -11.702 -11.952 -12.126 -12.301 -12.601 -12.831 -13.073 -13.193 -13.411 -13.651 -13.917 -14.044 -14.409 -14.483 -14.649 -14.812 -15.179 -15.391 -15.619 -15.86 -16.162 -16.553 -17.018 -19.566 -2 ,14713 ,TETRA ,17556714,Fri Nov 26 08:10:40 CET,Fri Nov 26 10:03:02 CET,0.0 0.856 1.184 1.492 1.739 1.937 2.126 2.307 2.638 2.8 2.946 2.986 3.306 3.41 3.617 3.786 3.943 4.016 4.169 4.32 4.529 4.653 4.778 4.969 5.146 5.337 5.533 5.7 5.904 6.08 6.218 6.388 6.556 6.72 6.918 7.149 7.359 7.551 7.753 7.967 8.156 8.324 8.489 8.634 8.756 8.903 8.999 8.888 8.601 8.024 6.708 4.84 3.235 1.816 0.513 -0.64 -1.614 -2.486 -3.259 -4.024 -4.657 -5.23 -5.742 -6.212 -6.661 -7.067 -7.495 -7.869 -8.194 -8.556 -8.919 -9.198 -9.495 -9.799 -10.037 -10.293 -10.572 -10.87 -11.186 -11.402 -11.631 -11.976 -12.219 -12.52 -12.666 -12.887 -13.122 -13.398 -13.547 -13.942 -14.04 -14.216 -14.395 -14.789 -15.023 -15.294 -15.587 -15.892 -16.257 -16.704 -19.235 -3 ,17924 ,TETRA ,17556715,Fri Nov 26 08:11:40 CET,Fri Nov 26 10:04:57 CET,0.0 0.993 1.279 1.567 1.812 1.992 2.142 2.27 2.507 2.63 2.741 2.726 3.044 3.128 3.29 3.437 3.563 3.629 3.769 3.908 4.104 4.245 4.391 4.587 4.757 4.919 5.07 5.202 5.362 5.521 5.693 5.923 6.141 6.315 6.493 6.675 6.852 7.042 7.246 7.473 7.669 7.845 8.036 8.177 8.303 8.376 8.349 8.271 8.014 7.412 6.172 4.362 2.619 1.051 -0.253 -1.331 -2.252 -3.089 -3.806 -4.539 -5.169 -5.719 -6.256 -6.753 -7.204 -7.623 -8.049 -8.428 -8.772 -9.119 -9.457 -9.734 -10.019 -10.339 -10.611 -10.885 -11.163 -11.459 -11.76 -11.961 -12.167 -12.493 -12.716 -12.949 -13.06 -13.282 -13.521 -13.768 -13.906 -14.296 -14.371 -14.545 -14.719 -15.063 -15.282 -15.562 -15.824 -16.102 -16.542 -17.102 -20.4 -4 ,30001 ,TETRA ,17556716,Fri Nov 26 08:10:40 CET,Fri Nov 26 10:01:35 CET,0.0 0.88 1.149 1.361 1.512 1.673 1.833 1.967 2.199 2.317 2.427 2.394 2.709 2.805 2.971 3.139 3.304 3.373 3.502 3.623 3.793 3.906 4.02 4.191 4.351 4.502 4.658 4.808 4.986 5.153 5.294 5.459 5.625 5.781 5.968 6.17 6.356 6.548 6.731 6.916 7.08 7.283 7.503 7.645 7.77 7.877 7.935 7.829 7.476 6.813 5.468 3.509 1.816 0.357 -0.902 -2.016 -2.979 -3.845 -4.591 -5.342 -6.023 -6.613 -7.159 -7.681 -8.14 -8.537 -8.963 -9.344 -9.653 -9.971 -10.33 -10.642 -10.972 -11.303 -11.553 -11.832 -12.121 -12.413 -12.71 -12.904 -13.098 -13.403 -13.604 -13.82 -13.94 -14.171 -14.415 -14.681 -14.827 -15.221 -15.317 -15.503 -15.701 -16.128 -16.354 -16.597 -16.897 -17.246 -17.627 -18.183 -21.663 -5 ,18232 ,TETRA ,17556717,Fri Nov 26 08:11:40 CET,Fri Nov 26 10:02:40 CET,0.0 0.739 0.973 1.184 1.398 1.578 1.732 1.876 2.108 2.221 2.329 2.319 2.636 2.72 2.882 3.04 3.195 3.268 3.431 3.599 3.813 3.939 4.057 4.239 4.451 4.661 4.828 4.971 5.15 5.31 5.457 5.64 5.817 5.972 6.139 6.318 6.494 6.682 6.855 7.072 7.304 7.481 7.669 7.8 7.865 7.92 7.985 7.949 7.644 6.93 5.497 3.672 2.012 0.517 -0.725 -1.794 -2.738 -3.575 -4.322 -5.123 -5.778 -6.328 -6.851 -7.36 -7.821 -8.203 -8.596 -8.952 -9.257 -9.585 -9.935 -10.217 -10.501 -10.795 -11.021 -11.261 -11.503 -11.743 -11.999 -12.169 -12.35 -12.655 -12.886 -13.135 -13.261 -13.512 -13.76 -14.018 -14.148 -14.517 -14.589 -14.759 -14.927 -15.283 -15.508 -15.755 -15.992 -16.267 -16.629 -17.115 -19.811 -6 ,26895 ,TETRA ,17556718,Fri Nov 26 08:11:40 CET,Fri Nov 26 10:03:01 CET,0.0 1.055 1.371 1.628 1.837 2.03 2.202 2.339 2.571 2.679 2.79 2.77 3.085 3.171 3.329 3.494 3.656 3.73 3.88 4.023 4.19 4.294 4.4 4.573 4.739 4.876 5.005 5.129 5.278 5.414 5.547 5.723 5.901 6.073 6.266 6.478 6.656 6.82 6.981 7.152 7.349 7.561 7.736 7.864 7.978 8.072 8.109 8.009 7.786 7.196 5.774 3.835 2.131 0.702 -0.496 -1.582 -2.56 -3.436 -4.153 -4.86 -5.479 -6.034 -6.571 -7.066 -7.511 -7.913 -8.352 -8.74 -9.067 -9.414 -9.766 -10.059 -10.388 -10.751 -11.003 -11.261 -11.546 -11.83 -12.125 -12.335 -12.53 -12.8 -13.031 -13.328 -13.496 -13.851 -14.185 -14.519 -14.702 -15.119 -15.272 -15.471 -15.646 -15.98 -16.206 -16.466 -16.739 -17.078 -17.463 -17.973 -25.313 -7 ,19058 ,TETRA ,17556719,Fri Nov 26 08:11:41 CET,Fri Nov 26 10:03:52 CET,0.0 0.999 1.321 1.599 1.827 2.042 2.252 2.434 2.734 2.876 3.01 3.011 3.332 3.428 3.607 3.788 3.959 4.036 4.189 4.331 4.521 4.639 4.764 4.95 5.118 5.271 5.417 5.549 5.722 5.928 6.141 6.408 6.63 6.794 6.95 7.126 7.335 7.539 7.731 7.925 8.099 8.29 8.478 8.635 8.76 8.813 8.847 8.774 8.433 7.707 6.294 4.445 2.803 1.329 0.03 -1.094 -2.02 -2.863 -3.619 -4.371 -5.011 -5.58 -6.108 -6.592 -7.04 -7.451 -7.886 -8.254 -8.543 -8.838 -9.179 -9.487 -9.813 -10.136 -10.366 -10.601 -10.844 -11.076 -11.305 -11.481 -11.672 -11.96 -12.156 -12.384 -12.511 -12.76 -13.01 -13.251 -13.376 -13.757 -13.831 -13.993 -14.164 -14.563 -14.803 -15.052 -15.305 -15.58 -15.974 -16.693 -20.11 -8 ,13299 ,TETRA ,17556720,Fri Nov 26 08:12:39 CET,Fri Nov 26 10:07:10 CET,0.0 2.163 2.549 2.825 3.056 3.266 3.454 3.62 3.942 4.092 4.228 4.232 4.559 4.676 4.903 5.105 5.3 5.385 5.531 5.687 5.91 6.044 6.18 6.394 6.603 6.79 6.945 7.082 7.281 7.482 7.689 7.927 8.104 8.284 8.504 8.75 8.976 9.207 9.467 9.717 9.977 10.227 10.453 10.686 10.929 11.097 11.232 11.221 10.883 10.194 8.644 6.477 4.62 2.989 1.612 0.37 -0.658 -1.531 -2.301 -3.056 -3.659 -4.209 -4.749 -5.241 -5.685 -6.078 -6.498 -6.879 -7.206 -7.539 -7.898 -8.211 -8.536 -8.875 -9.142 -9.429 -9.715 -9.975 -10.243 -10.424 -10.616 -10.931 -11.152 -11.394 -11.522 -11.764 -11.997 -12.246 -12.379 -12.763 -12.879 -13.082 -13.304 -13.806 -14.08 -14.354 -14.611 -14.941 -15.377 -15.901 -19.75 -9 ,6381 ,TETRA ,17556721,Fri Nov 26 08:12:39 CET,Fri Nov 26 10:04:08 CET,0.0 1.405 1.805 2.102 2.322 2.506 2.661 2.801 3.087 3.222 3.346 3.354 3.685 3.798 3.977 4.118 4.262 4.33 4.456 4.606 4.819 4.925 5.035 5.209 5.365 5.499 5.627 5.748 5.905 6.038 6.175 6.361 6.519 6.662 6.832 7.027 7.206 7.383 7.592 7.818 8.014 8.202 8.387 8.543 8.681 8.796 8.88 8.859 8.59 7.926 6.522 4.633 3.019 1.586 0.352 -0.752 -1.762 -2.666 -3.393 -4.075 -4.668 -5.196 -5.702 -6.177 -6.622 -7.043 -7.481 -7.852 -8.173 -8.526 -8.875 -9.159 -9.476 -9.805 -10.051 -10.312 -10.579 -10.851 -11.125 -11.311 -11.503 -11.807 -12.043 -12.303 -12.422 -12.657 -12.899 -13.154 -13.291 -13.671 -13.731 -13.883 -14.057 -14.453 -14.668 -14.928 -15.242 -15.612 -16.072 -16.653 -18.653 -10 ,8456 ,TETRA ,17556723,Fri Nov 26 08:12:39 CET,Fri Nov 26 10:06:39 CET,0.0 1.456 1.819 2.082 2.298 2.459 2.599 2.732 2.95 3.049 3.161 3.14 3.448 3.532 3.716 3.909 4.069 4.138 4.285 4.435 4.618 4.734 4.855 5.014 5.16 5.314 5.483 5.643 5.83 5.977 6.107 6.289 6.458 6.625 6.831 7.052 7.25 7.443 7.614 7.778 7.964 8.187 8.413 8.578 8.742 8.886 8.97 8.92 8.676 8.027 6.639 4.817 3.196 1.73 0.408 -0.701 -1.625 -2.472 -3.182 -3.902 -4.522 -5.058 -5.611 -6.156 -6.617 -7.016 -7.446 -7.853 -8.223 -8.587 -8.951 -9.256 -9.56 -9.888 -10.152 -10.401 -10.639 -10.912 -11.217 -11.406 -11.592 -11.897 -12.098 -12.304 -12.408 -12.622 -12.88 -13.165 -13.3 -13.669 -13.73 -13.888 -14.064 -14.474 -14.689 -14.906 -15.147 -15.443 -15.851 -16.384 -19.63 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_29_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_29_33.txt deleted file mode 100644 index 0d508972..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_29_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23214 ,TETRA ,17556724,Fri Nov 26 08:12:39 CET,Fri Nov 26 10:05:39 CET,0.0 1.159 1.635 2.049 2.406 2.723 3.028 3.303 3.84 4.117 4.368 4.592 5.023 5.252 5.69 6.093 6.473 6.665 7.079 7.465 8.01 8.364 8.707 9.202 9.696 10.201 10.693 11.174 11.799 12.421 13.048 13.811 14.542 15.244 16.074 17.077 18.088 19.236 20.496 21.841 23.282 24.961 27.02 29.169 31.773 34.818 38.498 42.966 48.577 55.677 65.257 74.299 80.37 84.776 88.171 90.869 92.929 94.612 95.945 97.172 98.133 98.911 99.596 100.195 100.718 101.169 101.628 102.005 102.306 102.604 102.883 103.094 103.308 103.523 103.683 103.846 103.998 104.121 104.218 104.267 104.307 104.387 104.44 104.48 104.498 104.52 104.53 104.551 104.559 104.451 104.551 104.536 104.52 104.453 104.395 104.341 104.288 104.197 104.02 103.781 103.031 -2 ,10919 ,TETRA ,17556725,Fri Nov 26 08:13:41 CET,Fri Nov 26 09:54:10 CET,0.0 1.399 1.894 2.29 2.634 2.94 3.222 3.49 3.949 4.162 4.387 4.622 5.069 5.281 5.695 6.104 6.48 6.661 7.02 7.377 7.907 8.251 8.593 9.097 9.563 10.008 10.448 10.888 11.492 12.124 12.748 13.514 14.285 15.059 15.949 16.954 17.959 19.074 20.303 21.683 23.193 24.943 27.05 29.243 31.852 34.89 38.627 43.077 48.697 56.016 65.879 75.081 81.209 85.63 88.951 91.568 93.641 95.34 96.661 97.877 98.854 99.656 100.341 100.933 101.425 101.853 102.3 102.668 102.963 103.249 103.533 103.749 103.938 104.102 104.221 104.331 104.447 104.565 104.667 104.733 104.798 104.891 104.928 104.941 104.947 104.964 104.98 104.978 104.966 104.845 104.898 104.852 104.814 104.702 104.615 104.513 104.412 104.303 104.17 103.973 102.893 -3 ,13507 ,TETRA ,17556726,Fri Nov 26 08:13:41 CET,Fri Nov 26 10:05:16 CET,0.0 1.774 2.261 2.648 2.973 3.256 3.529 3.796 4.325 4.596 4.853 5.083 5.507 5.706 6.114 6.51 6.908 7.103 7.486 7.867 8.413 8.767 9.116 9.64 10.138 10.623 11.122 11.604 12.21 12.815 13.416 14.144 14.844 15.528 16.374 17.375 18.39 19.524 20.74 22.061 23.466 25.142 27.232 29.387 31.961 34.943 38.523 42.804 48.179 55.104 64.596 73.78 79.907 84.303 87.635 90.284 92.355 94.041 95.365 96.586 97.545 98.338 99.061 99.699 100.251 100.727 101.199 101.597 101.921 102.238 102.537 102.76 102.971 103.179 103.338 103.497 103.652 103.796 103.927 103.998 104.062 104.168 104.226 104.281 104.307 104.349 104.391 104.428 104.434 104.31 104.404 104.396 104.373 104.316 104.272 104.185 104.074 103.941 103.795 103.594 102.631 -4 ,30024 ,TETRA ,17556727,Fri Nov 26 08:14:41 CET,Fri Nov 26 10:07:33 CET,0.0 1.245 1.727 2.082 2.421 2.735 3.006 3.255 3.748 3.992 4.224 4.444 4.865 5.065 5.481 5.875 6.254 6.438 6.802 7.163 7.692 8.031 8.351 8.825 9.318 9.823 10.327 10.813 11.424 12.017 12.611 13.36 14.1 14.811 15.656 16.664 17.673 18.775 19.976 21.305 22.775 24.507 26.562 28.687 31.27 34.288 37.981 42.455 48.105 55.351 64.987 74.052 80.171 84.615 87.978 90.626 92.732 94.483 95.855 97.097 98.066 98.868 99.574 100.184 100.707 101.162 101.606 101.974 102.278 102.562 102.835 103.041 103.234 103.428 103.564 103.688 103.806 103.917 104.014 104.064 104.115 104.186 104.226 104.247 104.25 104.246 104.247 104.249 104.242 104.12 104.199 104.18 104.155 104.094 104.054 104.002 103.911 103.76 103.579 103.257 101.748 -5 ,14868 ,TETRA ,17556728,Fri Nov 26 08:14:41 CET,Fri Nov 26 10:10:32 CET,0.0 1.348 1.833 2.215 2.535 2.832 3.133 3.415 3.918 4.157 4.385 4.586 5.017 5.227 5.62 5.982 6.373 6.588 6.989 7.35 7.881 8.218 8.539 9.038 9.537 10.03 10.511 10.99 11.651 12.28 12.885 13.631 14.361 15.112 15.996 16.987 17.953 19.044 20.273 21.627 23.094 24.807 26.902 29.059 31.683 34.763 38.526 43.031 48.649 55.826 65.429 74.556 80.768 85.328 88.754 91.417 93.49 95.191 96.53 97.774 98.768 99.574 100.28 100.897 101.434 101.885 102.329 102.702 102.993 103.262 103.532 103.747 103.958 104.176 104.333 104.477 104.608 104.737 104.862 104.933 104.992 105.079 105.124 105.156 105.168 105.179 105.169 105.151 105.145 105.027 105.093 105.048 104.99 104.861 104.782 104.695 104.589 104.428 104.212 103.913 102.986 -6 ,28870 ,TETRA ,17556729,Fri Nov 26 08:14:41 CET,Fri Nov 26 10:09:20 CET,0.0 1.349 1.845 2.206 2.542 2.831 3.084 3.323 3.799 4.03 4.246 4.434 4.845 5.036 5.397 5.749 6.094 6.271 6.621 6.955 7.453 7.785 8.128 8.637 9.156 9.686 10.173 10.629 11.239 11.859 12.494 13.286 14.038 14.775 15.665 16.688 17.698 18.819 20.08 21.471 22.943 24.656 26.717 28.873 31.526 34.657 38.451 42.97 48.567 55.634 65.246 74.455 80.665 85.105 88.424 91.053 93.094 94.774 96.089 97.31 98.29 99.073 99.749 100.368 100.916 101.378 101.831 102.219 102.53 102.835 103.133 103.359 103.578 103.787 103.941 104.09 104.221 104.348 104.466 104.541 104.606 104.679 104.733 104.783 104.803 104.842 104.872 104.891 104.901 104.789 104.887 104.883 104.874 104.813 104.774 104.727 104.669 104.575 104.402 104.171 102.454 -7 ,1463 ,TETRA ,17556730,Fri Nov 26 08:14:41 CET,Fri Nov 26 10:07:47 CET,0.0 1.496 1.98 2.394 2.771 3.121 3.439 3.727 4.256 4.515 4.779 5.062 5.52 5.755 6.209 6.668 7.131 7.348 7.77 8.187 8.781 9.172 9.562 10.115 10.663 11.205 11.738 12.273 12.954 13.642 14.319 15.123 15.913 16.696 17.592 18.603 19.586 20.703 21.952 23.266 24.661 26.306 28.347 30.506 33.105 36.105 39.715 43.958 49.277 56.202 65.733 74.769 80.827 85.202 88.503 91.158 93.213 94.857 96.184 97.418 98.387 99.192 99.913 100.557 101.124 101.612 102.087 102.474 102.775 103.077 103.379 103.608 103.828 104.037 104.196 104.35 104.488 104.613 104.719 104.798 104.875 104.962 105.02 105.07 105.094 105.133 105.149 105.123 105.103 104.991 105.098 105.086 105.069 105.008 104.936 104.828 104.678 104.526 104.373 104.11 103.008 -8 ,7409 ,TETRA ,17556731,Fri Nov 26 08:14:41 CET,Fri Nov 26 10:07:13 CET,0.0 1.183 1.686 2.11 2.452 2.736 3.002 3.25 3.711 3.93 4.14 4.348 4.777 4.98 5.39 5.785 6.174 6.37 6.746 7.109 7.646 7.997 8.341 8.852 9.361 9.863 10.349 10.822 11.429 12.025 12.634 13.388 14.122 14.822 15.66 16.661 17.649 18.732 19.928 21.275 22.722 24.382 26.369 28.446 30.966 33.923 37.643 42.098 47.559 54.474 63.853 72.899 79.06 83.531 86.877 89.55 91.632 93.283 94.61 95.848 96.815 97.613 98.311 98.931 99.466 99.915 100.35 100.714 101.011 101.299 101.583 101.815 102.043 102.259 102.425 102.588 102.734 102.867 103.007 103.101 103.178 103.282 103.35 103.415 103.44 103.47 103.49 103.488 103.482 103.358 103.438 103.416 103.386 103.318 103.263 103.185 103.097 102.957 102.759 102.508 101.707 -9 ,2351 ,TETRA ,17556732,Fri Nov 26 08:14:41 CET,Fri Nov 26 10:09:17 CET,0.0 1.341 1.79 2.118 2.401 2.671 2.917 3.147 3.593 3.805 4.024 4.278 4.727 4.952 5.368 5.766 6.187 6.398 6.794 7.169 7.687 8.047 8.414 8.939 9.472 9.982 10.494 10.996 11.637 12.256 12.845 13.57 14.269 14.958 15.783 16.758 17.728 18.801 19.98 21.274 22.68 24.321 26.321 28.433 31.038 34.083 37.764 42.159 47.657 54.795 64.442 73.524 79.652 84.122 87.494 90.182 92.268 93.987 95.371 96.645 97.652 98.475 99.201 99.828 100.373 100.842 101.296 101.692 102.01 102.302 102.594 102.824 103.049 103.271 103.425 103.57 103.714 103.856 103.973 104.037 104.106 104.207 104.269 104.32 104.344 104.377 104.386 104.4 104.399 104.271 104.35 104.343 104.323 104.271 104.242 104.191 104.128 104.044 103.89 103.62 102.756 -10 ,27204 ,TETRA ,17556733,Fri Nov 26 08:15:42 CET,Fri Nov 26 10:09:12 CET,0.0 0.437 0.767 1.062 1.334 1.604 1.839 2.056 2.488 2.7 2.904 3.078 3.486 3.672 4.048 4.422 4.789 4.965 5.32 5.684 6.209 6.545 6.868 7.346 7.827 8.311 8.792 9.258 9.873 10.467 11.061 11.817 12.594 13.349 14.176 15.13 16.11 17.218 18.425 19.793 21.251 22.91 24.935 27.047 29.647 32.677 36.341 40.744 46.209 53.165 62.62 71.707 77.905 82.433 85.794 88.458 90.578 92.281 93.619 94.853 95.814 96.605 97.293 97.888 98.402 98.844 99.282 99.631 99.922 100.208 100.467 100.668 100.876 101.076 101.202 101.328 101.455 101.569 101.657 101.716 101.781 101.865 101.908 101.959 101.986 102.026 102.054 102.071 102.076 101.965 102.017 101.988 101.96 101.842 101.75 101.638 101.504 101.337 101.175 100.937 100.138 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_30_13.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_30_13.txt deleted file mode 100644 index e3c247f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_30_13.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30693 ,TETRA ,17556734,Fri Nov 26 08:15:43 CET,Fri Nov 26 10:08:17 CET,0.0 1.948 2.407 2.726 2.952 3.157 3.339 3.507 3.805 3.933 4.039 4.138 4.343 4.444 4.626 4.8 4.957 5.034 5.193 5.348 5.546 5.661 5.783 5.951 6.103 6.258 6.403 6.538 6.717 6.874 7.006 7.168 7.331 7.482 7.65 7.832 7.982 8.129 8.31 8.472 8.585 8.697 8.796 8.864 8.875 8.812 8.673 8.399 7.897 6.927 5.139 2.992 1.037 -0.701 -2.131 -3.381 -4.474 -5.487 -6.354 -7.2 -7.942 -8.593 -9.189 -9.738 -10.233 -10.684 -11.162 -11.602 -11.984 -12.365 -12.781 -13.126 -13.466 -13.829 -14.121 -14.423 -14.723 -15.025 -15.333 -15.557 -15.804 -16.176 -16.426 -16.692 -16.83 -17.124 -17.432 -17.728 -17.885 -18.175 -18.451 -18.673 -18.91 -19.423 -19.692 -19.991 -20.367 -20.801 -21.31 -22.035 -26.017 -2 ,18223 ,TETRA ,17556735,Fri Nov 26 08:15:43 CET,Fri Nov 26 10:10:41 CET,0.0 1.561 1.968 2.287 2.549 2.772 2.966 3.15 3.492 3.642 3.763 3.887 4.1 4.211 4.409 4.59 4.757 4.833 4.983 5.128 5.331 5.446 5.552 5.712 5.845 5.96 6.086 6.219 6.371 6.503 6.629 6.788 6.954 7.11 7.296 7.484 7.625 7.773 7.934 8.074 8.186 8.303 8.415 8.487 8.513 8.485 8.37 8.082 7.588 6.702 4.851 2.365 0.273 -1.452 -2.871 -4.112 -5.215 -6.214 -7.098 -7.981 -8.727 -9.372 -9.957 -10.507 -11.03 -11.504 -11.989 -12.424 -12.788 -13.167 -13.571 -13.889 -14.222 -14.6 -14.885 -15.141 -15.431 -15.778 -16.148 -16.388 -16.619 -17.002 -17.265 -17.535 -17.676 -17.956 -18.264 -18.614 -18.798 -19.105 -19.393 -19.609 -19.821 -20.329 -20.607 -20.903 -21.234 -21.606 -22.122 -22.79 -26.051 -3 ,21314 ,TETRA ,17556736,Fri Nov 26 08:15:43 CET,Fri Nov 26 09:56:12 CET,0.0 1.156 1.58 1.871 2.095 2.296 2.49 2.658 2.942 3.078 3.193 3.306 3.511 3.611 3.796 3.959 4.108 4.184 4.338 4.488 4.691 4.812 4.936 5.125 5.304 5.458 5.605 5.759 5.935 6.09 6.244 6.409 6.57 6.735 6.892 7.056 7.217 7.362 7.499 7.626 7.741 7.846 7.938 7.988 7.963 7.91 7.758 7.456 7.013 6.159 4.336 1.954 -0.063 -1.776 -3.221 -4.526 -5.654 -6.592 -7.41 -8.291 -9.051 -9.697 -10.282 -10.85 -11.399 -11.891 -12.389 -12.826 -13.205 -13.607 -14.03 -14.388 -14.772 -15.166 -15.461 -15.752 -16.056 -16.375 -16.711 -16.944 -17.193 -17.552 -17.778 -18.019 -18.149 -18.429 -18.725 -19.049 -19.212 -19.508 -19.771 -19.974 -20.193 -20.669 -20.933 -21.245 -21.61 -21.968 -22.461 -23.216 -27.336 -4 ,10366 ,TETRA ,17556737,Fri Nov 26 08:15:43 CET,Fri Nov 26 10:08:16 CET,0.0 1.777 2.224 2.564 2.866 3.093 3.287 3.476 3.806 3.952 4.077 4.21 4.415 4.511 4.684 4.852 5.03 5.11 5.244 5.369 5.533 5.631 5.731 5.883 6.033 6.179 6.32 6.447 6.607 6.791 6.967 7.153 7.303 7.44 7.621 7.815 7.975 8.122 8.289 8.449 8.563 8.662 8.767 8.838 8.879 8.885 8.814 8.566 8.081 7.215 5.423 3.013 1.023 -0.67 -2.188 -3.506 -4.662 -5.696 -6.57 -7.454 -8.171 -8.795 -9.393 -9.947 -10.46 -10.933 -11.429 -11.884 -12.282 -12.688 -13.102 -13.447 -13.786 -14.146 -14.441 -14.745 -15.062 -15.383 -15.73 -15.97 -16.212 -16.614 -16.893 -17.171 -17.322 -17.634 -17.948 -18.276 -18.446 -18.757 -19.06 -19.29 -19.522 -20.011 -20.291 -20.58 -20.9 -21.328 -21.836 -22.508 -27.84 -5 ,2829 ,TETRA ,17556738,Fri Nov 26 08:16:42 CET,Fri Nov 26 10:09:05 CET,0.0 1.71 2.199 2.529 2.775 2.984 3.169 3.345 3.644 3.771 3.889 4.037 4.256 4.361 4.561 4.749 4.917 4.996 5.149 5.291 5.478 5.597 5.727 5.908 6.066 6.244 6.409 6.547 6.729 6.894 7.04 7.207 7.376 7.548 7.71 7.871 8.024 8.186 8.361 8.512 8.647 8.793 8.928 9.057 9.139 9.125 9.029 8.724 8.161 7.174 5.381 3.054 0.959 -0.805 -2.254 -3.554 -4.686 -5.699 -6.597 -7.468 -8.185 -8.827 -9.415 -9.943 -10.444 -10.917 -11.405 -11.841 -12.233 -12.644 -13.054 -13.407 -13.793 -14.176 -14.448 -14.724 -15.036 -15.357 -15.686 -15.917 -16.154 -16.529 -16.793 -17.062 -17.204 -17.513 -17.825 -18.13 -18.294 -18.589 -18.829 -19.029 -19.254 -19.748 -20.022 -20.352 -20.717 -21.095 -21.593 -22.475 -26.56 -6 ,13873 ,TETRA ,17556739,Fri Nov 26 08:16:42 CET,Fri Nov 26 10:10:08 CET,0.0 1.194 1.628 1.922 2.201 2.405 2.575 2.744 3.065 3.199 3.315 3.434 3.64 3.75 3.945 4.115 4.275 4.356 4.522 4.682 4.911 5.042 5.15 5.316 5.473 5.623 5.772 5.924 6.124 6.292 6.442 6.617 6.755 6.887 7.047 7.214 7.367 7.533 7.7 7.85 7.987 8.09 8.215 8.312 8.358 8.355 8.248 8.017 7.554 6.637 4.87 2.645 0.726 -0.983 -2.413 -3.668 -4.781 -5.761 -6.582 -7.454 -8.19 -8.818 -9.406 -9.952 -10.477 -10.965 -11.48 -11.936 -12.32 -12.727 -13.145 -13.464 -13.792 -14.138 -14.426 -14.729 -15.027 -15.357 -15.716 -15.951 -16.198 -16.577 -16.829 -17.103 -17.246 -17.55 -17.873 -18.23 -18.415 -18.733 -19.06 -19.291 -19.508 -19.99 -20.272 -20.588 -20.954 -21.385 -21.917 -22.602 -25.739 -7 ,5388 ,TETRA ,17556740,Fri Nov 26 08:17:40 CET,Fri Nov 26 10:10:02 CET,0.0 2.368 2.831 3.155 3.433 3.653 3.825 3.975 4.247 4.368 4.489 4.632 4.836 4.938 5.141 5.331 5.518 5.603 5.754 5.899 6.095 6.207 6.308 6.468 6.64 6.798 6.938 7.082 7.274 7.456 7.612 7.751 7.876 8.02 8.188 8.332 8.469 8.632 8.788 8.925 9.067 9.218 9.334 9.416 9.475 9.465 9.352 9.106 8.634 7.772 6.05 3.779 1.832 0.193 -1.19 -2.449 -3.541 -4.503 -5.362 -6.22 -6.949 -7.593 -8.193 -8.769 -9.306 -9.785 -10.276 -10.708 -11.086 -11.466 -11.846 -12.182 -12.552 -12.919 -13.184 -13.457 -13.755 -14.06 -14.364 -14.581 -14.811 -15.176 -15.424 -15.679 -15.812 -16.097 -16.391 -16.687 -16.847 -17.142 -17.376 -17.571 -17.786 -18.259 -18.538 -18.86 -19.239 -19.661 -20.136 -20.929 -25.473 -8 ,21063 ,TETRA ,17556741,Fri Nov 26 08:17:41 CET,Fri Nov 26 10:15:34 CET,0.0 1.498 1.886 2.153 2.375 2.598 2.801 2.958 3.239 3.379 3.511 3.629 3.829 3.933 4.117 4.317 4.504 4.579 4.738 4.892 5.101 5.229 5.345 5.499 5.661 5.812 5.922 6.044 6.219 6.364 6.496 6.655 6.815 6.965 7.105 7.255 7.423 7.586 7.716 7.842 7.955 8.07 8.198 8.249 8.23 8.18 8.062 7.86 7.402 6.504 4.707 2.392 0.456 -1.282 -2.777 -4.113 -5.223 -6.162 -7.041 -7.954 -8.708 -9.363 -9.969 -10.531 -11.037 -11.49 -12.001 -12.482 -12.874 -13.26 -13.677 -14.027 -14.384 -14.75 -15.039 -15.333 -15.625 -15.95 -16.274 -16.495 -16.74 -17.122 -17.391 -17.665 -17.808 -18.094 -18.376 -18.681 -18.849 -19.149 -19.421 -19.634 -19.857 -20.35 -20.627 -20.934 -21.268 -21.613 -22.017 -22.657 -29.664 -9 ,10971 ,TETRA ,17556742,Fri Nov 26 08:17:41 CET,Fri Nov 26 10:10:10 CET,0.0 1.48 1.907 2.188 2.43 2.658 2.877 3.061 3.347 3.474 3.6 3.724 3.925 4.038 4.231 4.387 4.539 4.619 4.773 4.916 5.116 5.248 5.383 5.58 5.764 5.935 6.097 6.23 6.374 6.518 6.664 6.831 6.989 7.129 7.277 7.432 7.576 7.715 7.856 8.031 8.184 8.309 8.425 8.48 8.486 8.443 8.346 8.154 7.711 6.798 5.003 2.658 0.697 -0.957 -2.416 -3.754 -4.865 -5.886 -6.758 -7.579 -8.291 -8.965 -9.615 -10.184 -10.694 -11.18 -11.697 -12.141 -12.523 -12.919 -13.324 -13.659 -14.007 -14.382 -14.668 -14.963 -15.276 -15.586 -15.915 -16.156 -16.4 -16.749 -17.003 -17.271 -17.403 -17.684 -17.974 -18.288 -18.464 -18.774 -19.067 -19.271 -19.48 -19.955 -20.225 -20.535 -20.878 -21.271 -21.79 -22.576 -26.979 -10 ,1083 ,TETRA ,17556743,Fri Nov 26 08:17:41 CET,Fri Nov 26 10:09:22 CET,0.0 1.355 1.745 1.972 2.162 2.327 2.485 2.639 2.893 3.003 3.11 3.208 3.406 3.491 3.631 3.756 3.89 3.964 4.102 4.245 4.44 4.545 4.641 4.789 4.939 5.083 5.231 5.378 5.572 5.742 5.874 6.021 6.155 6.289 6.465 6.629 6.763 6.911 7.07 7.227 7.382 7.531 7.639 7.733 7.808 7.83 7.742 7.455 6.934 5.991 4.087 1.761 -0.143 -1.818 -3.259 -4.564 -5.692 -6.65 -7.45 -8.294 -9.042 -9.677 -10.275 -10.846 -11.362 -11.834 -12.337 -12.801 -13.196 -13.606 -14.05 -14.397 -14.736 -15.096 -15.375 -15.674 -15.999 -16.336 -16.673 -16.898 -17.131 -17.505 -17.778 -18.062 -18.206 -18.516 -18.853 -19.222 -19.41 -19.726 -20.006 -20.226 -20.468 -21.009 -21.311 -21.633 -21.998 -22.409 -22.893 -23.672 -27.575 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_30_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_30_35.txt deleted file mode 100644 index 0a210916..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_30_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23723 ,TETRA ,17556744,Fri Nov 26 08:17:40 CET,Fri Nov 26 09:59:00 CET,0.0 0.281 0.449 0.609 0.757 0.881 1.007 1.136 1.369 1.467 1.56 1.64 1.833 1.917 2.086 2.246 2.4 2.474 2.619 2.76 2.964 3.096 3.232 3.43 3.621 3.819 4.01 4.187 4.411 4.612 4.811 5.06 5.304 5.548 5.827 6.142 6.447 6.766 7.125 7.53 7.949 8.431 9.043 9.685 10.397 11.167 12.027 12.956 14.027 15.223 16.611 17.461 17.768 17.841 17.702 17.558 17.359 17.1 16.85 16.526 16.251 16.021 15.767 15.507 15.291 15.097 14.878 14.681 14.487 14.293 14.096 13.919 13.74 13.541 13.382 13.208 13.02 12.829 12.638 12.51 12.376 12.153 11.985 11.8 11.705 11.522 11.335 11.118 10.996 10.79 10.629 10.501 10.363 10.066 9.925 9.736 9.521 9.297 9.02 8.648 7.542 -2 ,15647 ,TETRA ,17556745,Fri Nov 26 08:18:43 CET,Fri Nov 26 10:13:19 CET,0.0 0.338 0.524 0.706 0.852 0.971 1.096 1.214 1.426 1.524 1.615 1.692 1.874 1.958 2.118 2.275 2.429 2.504 2.656 2.8 3.0 3.131 3.262 3.448 3.619 3.785 3.958 4.138 4.379 4.611 4.829 5.085 5.332 5.565 5.844 6.169 6.46 6.788 7.153 7.561 8.002 8.49 9.075 9.676 10.37 11.128 12.068 13.106 14.198 15.52 16.955 17.793 18.084 18.025 17.848 17.673 17.454 17.18 16.941 16.677 16.419 16.16 15.879 15.614 15.383 15.175 14.94 14.721 14.527 14.324 14.131 13.964 13.782 13.593 13.438 13.283 13.134 12.956 12.766 12.634 12.494 12.289 12.145 11.995 11.919 11.742 11.558 11.385 11.295 11.102 10.954 10.836 10.706 10.395 10.228 10.051 9.863 9.668 9.442 9.103 8.308 -3 ,23756 ,TETRA ,17556746,Fri Nov 26 08:18:43 CET,Fri Nov 26 10:01:53 CET,0.0 0.421 0.63 0.785 0.924 1.061 1.189 1.306 1.519 1.617 1.708 1.781 1.97 2.052 2.212 2.372 2.525 2.604 2.756 2.898 3.106 3.238 3.367 3.557 3.735 3.908 4.077 4.244 4.47 4.679 4.883 5.137 5.387 5.644 5.955 6.294 6.606 6.95 7.343 7.759 8.178 8.664 9.218 9.767 10.425 11.123 11.899 12.764 13.751 14.9 16.111 16.776 16.917 16.835 16.684 16.508 16.292 16.066 15.841 15.564 15.322 15.11 14.852 14.582 14.361 14.163 13.93 13.722 13.546 13.369 13.175 12.991 12.791 12.572 12.389 12.204 12.029 11.823 11.599 11.456 11.31 11.084 10.932 10.782 10.701 10.529 10.341 10.12 10.006 9.817 9.703 9.59 9.464 9.171 9.018 8.858 8.661 8.427 8.169 7.812 6.954 -4 ,4118 ,TETRA ,17556747,Fri Nov 26 08:18:43 CET,Fri Nov 26 10:00:03 CET,0.0 0.225 0.425 0.605 0.746 0.874 1.001 1.129 1.37 1.478 1.581 1.66 1.849 1.936 2.104 2.278 2.435 2.507 2.67 2.834 3.047 3.183 3.323 3.521 3.706 3.887 4.058 4.233 4.473 4.694 4.907 5.165 5.408 5.645 5.932 6.259 6.562 6.895 7.265 7.665 8.102 8.598 9.18 9.775 10.46 11.188 12.014 12.982 14.142 15.41 16.689 17.496 17.789 17.857 17.812 17.654 17.452 17.22 16.99 16.758 16.545 16.34 16.126 15.913 15.711 15.505 15.271 15.059 14.867 14.674 14.465 14.279 14.097 13.908 13.752 13.588 13.414 13.238 13.06 12.936 12.807 12.604 12.46 12.303 12.22 12.047 11.878 11.706 11.61 11.414 11.267 11.143 11.023 10.766 10.613 10.431 10.211 9.974 9.713 9.362 8.605 -5 ,3810 ,TETRA ,17556748,Fri Nov 26 08:19:40 CET,Fri Nov 26 10:12:40 CET,0.0 0.506 0.716 0.887 1.014 1.145 1.276 1.399 1.618 1.717 1.808 1.899 2.098 2.185 2.345 2.494 2.637 2.709 2.848 2.984 3.185 3.313 3.435 3.623 3.815 4.004 4.181 4.362 4.604 4.826 5.034 5.286 5.525 5.766 6.051 6.356 6.652 6.972 7.328 7.736 8.172 8.645 9.202 9.772 10.431 11.164 11.971 12.848 13.884 15.101 16.408 17.248 17.477 17.465 17.364 17.179 16.979 16.742 16.489 16.241 16.01 15.783 15.549 15.317 15.106 14.912 14.683 14.454 14.259 14.063 13.855 13.679 13.485 13.277 13.104 12.929 12.754 12.571 12.38 12.244 12.111 11.898 11.745 11.591 11.509 11.338 11.153 10.955 10.855 10.668 10.529 10.407 10.286 10.004 9.839 9.669 9.485 9.281 9.052 8.744 7.632 -6 ,6439 ,TETRA ,17556749,Fri Nov 26 08:20:41 CET,Fri Nov 26 10:15:21 CET,0.0 0.421 0.616 0.78 0.929 1.076 1.219 1.336 1.554 1.653 1.745 1.826 2.021 2.103 2.263 2.425 2.574 2.647 2.785 2.922 3.131 3.263 3.391 3.58 3.762 3.945 4.129 4.303 4.521 4.725 4.93 5.188 5.444 5.704 6.001 6.311 6.617 6.971 7.363 7.774 8.198 8.705 9.309 9.896 10.597 11.381 12.269 13.274 14.402 15.675 17.025 17.838 18.106 18.123 18.043 17.838 17.578 17.327 17.096 16.848 16.595 16.373 16.15 15.909 15.678 15.441 15.182 14.966 14.771 14.566 14.36 14.171 13.976 13.777 13.622 13.459 13.291 13.128 12.949 12.831 12.719 12.543 12.427 12.303 12.229 12.066 11.892 11.702 11.605 11.429 11.327 11.22 11.109 10.877 10.733 10.566 10.402 10.213 9.961 9.619 8.901 -7 ,27376 ,TETRA ,17556750,Fri Nov 26 08:20:41 CET,Fri Nov 26 10:14:04 CET,0.0 0.345 0.514 0.656 0.78 0.913 1.037 1.154 1.37 1.465 1.558 1.642 1.831 1.916 2.087 2.251 2.403 2.478 2.617 2.754 2.953 3.087 3.222 3.412 3.599 3.786 3.967 4.139 4.369 4.588 4.792 5.048 5.295 5.538 5.824 6.144 6.444 6.781 7.164 7.59 8.041 8.516 9.071 9.617 10.218 10.92 11.778 12.763 13.894 15.13 16.396 17.314 17.734 17.767 17.656 17.498 17.302 17.069 16.82 16.566 16.324 16.092 15.869 15.639 15.408 15.194 14.983 14.801 14.632 14.426 14.204 14.022 13.828 13.635 13.501 13.361 13.2 13.015 12.812 12.673 12.519 12.282 12.132 11.974 11.889 11.701 11.504 11.283 11.168 10.974 10.841 10.729 10.615 10.33 10.168 9.996 9.802 9.603 9.362 9.037 8.005 -8 ,30543 ,TETRA ,17556751,Fri Nov 26 08:20:41 CET,Fri Nov 26 10:14:24 CET,0.0 0.253 0.433 0.587 0.727 0.855 0.981 1.096 1.308 1.411 1.503 1.588 1.78 1.867 2.047 2.218 2.38 2.462 2.617 2.767 2.978 3.102 3.219 3.397 3.585 3.781 3.966 4.146 4.384 4.612 4.847 5.121 5.362 5.596 5.876 6.174 6.455 6.773 7.133 7.513 7.903 8.35 8.9 9.526 10.248 10.987 11.808 12.725 13.796 14.934 16.224 17.162 17.427 17.404 17.289 17.091 16.851 16.643 16.449 16.192 15.937 15.731 15.524 15.286 15.057 14.86 14.66 14.45 14.26 14.074 13.879 13.705 13.52 13.335 13.183 13.009 12.822 12.631 12.437 12.3 12.153 11.928 11.773 11.603 11.518 11.328 11.104 10.875 10.759 10.554 10.362 10.214 10.069 9.777 9.619 9.445 9.254 9.021 8.753 8.421 7.536 -9 ,28730 ,TETRA ,17556752,Fri Nov 26 08:20:41 CET,Fri Nov 26 10:03:53 CET,0.0 0.305 0.483 0.627 0.763 0.898 1.03 1.152 1.379 1.489 1.594 1.692 1.885 1.972 2.138 2.292 2.45 2.525 2.669 2.815 3.03 3.159 3.286 3.482 3.674 3.86 4.033 4.193 4.393 4.582 4.776 5.02 5.257 5.485 5.744 6.036 6.324 6.64 6.994 7.369 7.748 8.21 8.81 9.44 10.134 10.855 11.712 12.656 13.775 15.043 16.323 17.296 17.707 17.713 17.601 17.451 17.232 16.988 16.743 16.465 16.219 15.977 15.705 15.461 15.238 15.016 14.786 14.577 14.373 14.16 13.953 13.784 13.591 13.38 13.221 13.054 12.861 12.66 12.475 12.34 12.193 11.966 11.809 11.651 11.563 11.361 11.159 10.954 10.837 10.613 10.438 10.297 10.135 9.831 9.676 9.494 9.277 9.013 8.686 8.256 6.857 -10 ,11494 ,TETRA ,17556753,Fri Nov 26 08:21:40 CET,Fri Nov 26 10:07:45 CET,0.0 0.486 0.69 0.866 1.008 1.141 1.259 1.365 1.562 1.651 1.741 1.822 2.015 2.11 2.301 2.463 2.617 2.697 2.848 2.992 3.194 3.326 3.458 3.652 3.843 4.026 4.201 4.37 4.593 4.811 5.015 5.263 5.512 5.765 6.078 6.424 6.739 7.089 7.473 7.873 8.311 8.829 9.393 9.934 10.573 11.306 12.168 13.068 14.053 15.216 16.517 17.345 17.639 17.644 17.449 17.218 17.001 16.748 16.524 16.26 15.964 15.703 15.468 15.239 15.024 14.824 14.6 14.396 14.218 14.023 13.814 13.633 13.447 13.255 13.098 12.932 12.752 12.562 12.38 12.255 12.119 11.889 11.723 11.558 11.476 11.307 11.109 10.897 10.787 10.581 10.402 10.258 10.116 9.793 9.596 9.374 9.129 8.845 8.544 8.222 7.519 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_30_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_30_37.txt deleted file mode 100644 index f941618e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_30_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17173 ,TETRA ,17556754,Fri Nov 26 08:21:40 CET,Fri Nov 26 10:20:09 CET,0.0 0.64 0.92 1.122 1.29 1.424 1.56 1.691 1.909 2.011 2.111 2.193 2.386 2.478 2.648 2.808 2.968 3.048 3.214 3.375 3.599 3.737 3.873 4.088 4.29 4.481 4.662 4.835 5.065 5.286 5.488 5.735 5.97 6.185 6.433 6.709 6.958 7.221 7.536 7.875 8.213 8.581 8.994 9.409 9.907 10.449 11.012 11.576 12.169 12.823 13.342 13.452 13.344 13.074 12.721 12.367 12.052 11.757 11.494 11.207 10.936 10.683 10.45 10.226 10.004 9.794 9.574 9.393 9.245 9.085 8.927 8.795 8.653 8.494 8.366 8.239 8.107 7.967 7.818 7.712 7.6 7.424 7.308 7.191 7.132 6.998 6.847 6.695 6.62 6.454 6.373 6.274 6.177 5.965 5.843 5.713 5.577 5.424 5.248 5.019 4.54 -2 ,17307 ,TETRA ,17556755,Fri Nov 26 08:21:39 CET,Fri Nov 26 10:04:27 CET,0.0 0.756 1.014 1.217 1.386 1.532 1.668 1.786 2.008 2.119 2.221 2.309 2.497 2.575 2.732 2.89 3.032 3.104 3.245 3.374 3.577 3.715 3.851 4.043 4.215 4.386 4.567 4.741 4.953 5.154 5.357 5.603 5.831 6.039 6.277 6.544 6.824 7.133 7.438 7.76 8.09 8.459 8.887 9.323 9.82 10.369 10.977 11.573 12.222 12.938 13.614 13.851 13.744 13.525 13.245 12.926 12.601 12.273 11.982 11.7 11.445 11.192 10.949 10.728 10.516 10.322 10.114 9.913 9.743 9.572 9.373 9.2 9.031 8.85 8.701 8.556 8.404 8.241 8.086 7.982 7.885 7.73 7.603 7.472 7.413 7.296 7.171 7.031 6.953 6.783 6.703 6.612 6.519 6.298 6.169 6.037 5.905 5.747 5.543 5.283 4.562 -3 ,23452 ,TETRA ,17556756,Fri Nov 26 08:22:41 CET,Fri Nov 26 10:16:02 CET,0.0 0.501 0.749 0.961 1.14 1.315 1.47 1.601 1.837 1.941 2.033 2.112 2.297 2.378 2.541 2.696 2.842 2.91 3.044 3.178 3.375 3.509 3.644 3.837 4.021 4.203 4.373 4.537 4.752 4.959 5.167 5.408 5.643 5.858 6.1 6.377 6.628 6.908 7.214 7.526 7.891 8.291 8.73 9.17 9.661 10.172 10.741 11.415 12.115 12.757 13.304 13.385 13.2 12.947 12.617 12.294 12.007 11.688 11.371 11.064 10.816 10.591 10.37 10.158 9.953 9.743 9.523 9.335 9.171 9.003 8.822 8.668 8.5 8.309 8.16 8.009 7.859 7.705 7.545 7.425 7.299 7.112 6.975 6.828 6.748 6.583 6.412 6.218 6.118 5.929 5.799 5.686 5.564 5.265 5.099 4.917 4.701 4.449 4.148 3.743 2.724 -4 ,15062 ,TETRA ,17556757,Fri Nov 26 08:22:41 CET,Fri Nov 26 10:04:58 CET,0.0 0.744 1.052 1.332 1.572 1.809 2.016 2.179 2.485 2.629 2.753 2.879 3.094 3.21 3.407 3.585 3.756 3.839 4.0 4.165 4.406 4.551 4.69 4.887 5.076 5.267 5.451 5.627 5.852 6.049 6.232 6.468 6.697 6.921 7.185 7.459 7.71 7.993 8.297 8.618 8.952 9.319 9.749 10.19 10.718 11.253 11.801 12.392 13.014 13.689 14.24 14.296 14.169 13.944 13.654 13.333 13.01 12.697 12.417 12.128 11.871 11.626 11.39 11.15 10.924 10.721 10.506 10.319 10.161 10.009 9.84 9.697 9.55 9.382 9.254 9.13 8.991 8.849 8.713 8.619 8.523 8.366 8.252 8.126 8.061 7.936 7.804 7.663 7.586 7.411 7.336 7.25 7.148 6.921 6.812 6.699 6.551 6.352 6.142 5.91 5.323 -5 ,17827 ,TETRA ,17556758,Fri Nov 26 08:23:42 CET,Fri Nov 26 10:18:13 CET,0.0 0.517 0.741 0.933 1.102 1.259 1.39 1.496 1.713 1.824 1.926 2.006 2.19 2.268 2.423 2.572 2.714 2.784 2.917 3.049 3.247 3.37 3.488 3.667 3.844 4.003 4.157 4.307 4.503 4.696 4.883 5.093 5.282 5.476 5.704 5.948 6.181 6.441 6.727 7.031 7.333 7.672 8.059 8.446 8.918 9.425 9.979 10.579 11.246 11.868 12.355 12.472 12.303 12.061 11.729 11.393 11.095 10.771 10.489 10.2 9.922 9.679 9.457 9.236 9.007 8.792 8.579 8.381 8.212 8.04 7.837 7.66 7.48 7.285 7.133 6.982 6.825 6.662 6.494 6.39 6.285 6.12 6.008 5.89 5.829 5.702 5.573 5.426 5.342 5.167 5.084 4.996 4.91 4.718 4.61 4.487 4.348 4.189 4.018 3.813 3.23 -6 ,28866 ,TETRA ,17556759,Fri Nov 26 08:23:42 CET,Fri Nov 26 09:58:28 CET,0.0 0.413 0.639 0.815 0.967 1.114 1.25 1.367 1.603 1.729 1.862 2.005 2.208 2.307 2.501 2.699 2.887 2.973 3.135 3.287 3.52 3.666 3.804 4.01 4.204 4.384 4.553 4.721 4.948 5.163 5.366 5.611 5.838 6.053 6.301 6.586 6.863 7.15 7.47 7.808 8.147 8.55 8.988 9.396 9.864 10.375 10.953 11.551 12.193 12.797 13.302 13.407 13.264 13.004 12.673 12.346 12.054 11.776 11.502 11.212 10.966 10.739 10.519 10.299 10.087 9.903 9.708 9.527 9.364 9.191 9.006 8.844 8.675 8.5 8.369 8.241 8.108 7.967 7.809 7.7 7.593 7.434 7.324 7.198 7.132 7.0 6.86 6.694 6.609 6.44 6.364 6.264 6.157 5.937 5.823 5.706 5.568 5.403 5.203 4.918 4.318 -7 ,17656 ,TETRA ,17556760,Fri Nov 26 08:23:42 CET,Fri Nov 26 10:16:04 CET,0.0 0.561 0.814 1.032 1.201 1.349 1.488 1.612 1.839 1.938 2.032 2.12 2.311 2.393 2.547 2.703 2.847 2.916 3.049 3.178 3.372 3.505 3.634 3.798 3.948 4.111 4.267 4.411 4.607 4.8 4.979 5.184 5.394 5.605 5.834 6.083 6.324 6.59 6.883 7.189 7.5 7.847 8.257 8.676 9.148 9.653 10.198 10.774 11.434 12.183 12.809 12.921 12.819 12.607 12.355 12.069 11.796 11.528 11.286 11.029 10.785 10.559 10.338 10.117 9.9 9.704 9.493 9.305 9.145 8.987 8.821 8.68 8.526 8.365 8.247 8.115 7.976 7.836 7.696 7.598 7.488 7.311 7.192 7.076 7.018 6.891 6.742 6.59 6.513 6.337 6.246 6.149 6.048 5.82 5.695 5.566 5.429 5.271 5.085 4.84 4.259 -8 ,12869 ,TETRA ,17556761,Fri Nov 26 08:24:41 CET,Fri Nov 26 10:03:06 CET,0.0 0.698 0.965 1.178 1.377 1.558 1.706 1.838 2.06 2.162 2.269 2.371 2.559 2.638 2.805 2.96 3.098 3.167 3.302 3.442 3.65 3.777 3.897 4.064 4.232 4.393 4.546 4.703 4.9 5.083 5.258 5.467 5.682 5.905 6.164 6.446 6.704 6.983 7.283 7.608 7.956 8.334 8.78 9.238 9.746 10.231 10.738 11.327 11.899 12.472 13.081 13.249 13.129 12.889 12.6 12.281 11.951 11.651 11.38 11.092 10.842 10.614 10.398 10.186 9.967 9.768 9.561 9.354 9.181 9.01 8.812 8.638 8.466 8.297 8.163 8.02 7.878 7.724 7.544 7.408 7.277 7.08 6.931 6.775 6.694 6.525 6.335 6.137 6.035 5.836 5.69 5.56 5.424 5.171 5.049 4.915 4.762 4.597 4.383 4.114 3.677 -9 ,28209 ,TETRA ,17556762,Fri Nov 26 08:24:42 CET,Fri Nov 26 10:07:59 CET,0.0 0.6 0.896 1.104 1.284 1.447 1.608 1.759 2.044 2.178 2.299 2.43 2.638 2.737 2.933 3.113 3.272 3.35 3.518 3.683 3.908 4.047 4.173 4.367 4.551 4.712 4.875 5.044 5.263 5.469 5.662 5.893 6.119 6.341 6.577 6.838 7.113 7.401 7.694 8.023 8.384 8.778 9.204 9.612 10.062 10.581 11.189 11.767 12.399 13.052 13.6 13.751 13.606 13.345 13.028 12.704 12.401 12.1 11.827 11.552 11.304 11.071 10.839 10.625 10.443 10.288 10.119 9.952 9.808 9.669 9.517 9.384 9.244 9.099 8.981 8.85 8.726 8.61 8.481 8.391 8.284 8.11 7.993 7.866 7.805 7.683 7.549 7.403 7.328 7.156 7.077 6.987 6.894 6.659 6.511 6.336 6.157 5.991 5.794 5.536 5.083 -10 ,15687 ,TETRA ,17556763,Fri Nov 26 08:24:41 CET,Fri Nov 26 10:19:08 CET,0.0 0.538 0.81 0.998 1.156 1.309 1.434 1.551 1.773 1.878 1.984 2.087 2.278 2.366 2.524 2.672 2.83 2.912 3.082 3.249 3.487 3.631 3.774 3.975 4.153 4.328 4.499 4.669 4.878 5.063 5.253 5.49 5.719 5.937 6.183 6.465 6.728 7.007 7.311 7.637 7.979 8.358 8.764 9.179 9.693 10.213 10.773 11.396 12.121 12.854 13.447 13.583 13.422 13.169 12.88 12.546 12.223 11.91 11.608 11.295 11.031 10.786 10.538 10.304 10.089 9.885 9.687 9.519 9.367 9.22 9.075 8.958 8.823 8.67 8.559 8.454 8.341 8.209 8.068 7.969 7.857 7.685 7.578 7.459 7.399 7.279 7.144 7.002 6.923 6.743 6.656 6.567 6.474 6.263 6.137 5.998 5.846 5.683 5.493 5.259 4.858 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_30_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_30_42.txt deleted file mode 100644 index 5d485e01..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_30_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7506 ,TETRA ,17556764,Fri Nov 26 08:24:41 CET,Fri Nov 26 10:19:29 CET,0.0 0.813 1.083 1.32 1.526 1.698 1.845 1.998 2.307 2.45 2.583 2.732 2.95 3.065 3.283 3.475 3.663 3.754 3.936 4.118 4.368 4.525 4.681 4.91 5.117 5.311 5.504 5.69 5.918 6.139 6.364 6.641 6.903 7.155 7.467 7.825 8.178 8.565 8.957 9.376 9.849 10.41 11.073 11.718 12.399 13.097 13.909 14.839 15.917 17.151 18.421 19.094 19.267 19.216 19.036 18.793 18.543 18.262 17.969 17.662 17.379 17.136 16.899 16.645 16.383 16.149 15.884 15.606 15.351 15.087 14.829 14.615 14.382 14.146 13.962 13.765 13.564 13.35 13.107 12.943 12.775 12.482 12.268 12.059 11.956 11.757 11.527 11.261 11.133 10.916 10.707 10.551 10.388 9.966 9.726 9.482 9.207 8.893 8.497 7.874 4.459 -2 ,22180 ,TETRA ,17556765,Fri Nov 26 08:25:41 CET,Fri Nov 26 10:18:36 CET,0.0 0.758 1.024 1.234 1.427 1.615 1.772 1.905 2.143 2.265 2.38 2.487 2.697 2.807 3.016 3.197 3.383 3.48 3.662 3.837 4.106 4.275 4.432 4.665 4.902 5.126 5.337 5.539 5.799 6.062 6.323 6.633 6.904 7.155 7.455 7.806 8.165 8.558 8.961 9.419 9.925 10.475 11.078 11.635 12.318 13.106 13.913 14.795 15.83 16.972 18.133 18.81 19.096 19.114 18.945 18.681 18.37 17.996 17.644 17.326 17.05 16.797 16.527 16.23 15.942 15.688 15.415 15.134 14.874 14.608 14.345 14.135 13.916 13.685 13.503 13.307 13.092 12.883 12.67 12.508 12.333 12.056 11.87 11.677 11.572 11.356 11.122 10.858 10.731 10.503 10.256 10.087 9.915 9.515 9.274 9.023 8.749 8.419 7.989 7.391 4.613 -3 ,2411 ,TETRA ,17556766,Fri Nov 26 08:26:42 CET,Fri Nov 26 10:19:21 CET,0.0 0.768 1.052 1.267 1.459 1.635 1.798 1.949 2.245 2.38 2.504 2.631 2.844 2.956 3.175 3.388 3.589 3.685 3.863 4.042 4.306 4.471 4.634 4.87 5.102 5.327 5.529 5.72 5.978 6.216 6.432 6.714 7.016 7.289 7.581 7.935 8.289 8.669 9.071 9.532 10.01 10.504 11.119 11.725 12.387 13.13 13.955 14.831 15.848 16.987 18.129 18.758 18.883 18.742 18.523 18.217 17.889 17.596 17.318 17.035 16.743 16.451 16.155 15.861 15.562 15.262 14.988 14.761 14.54 14.288 14.035 13.824 13.612 13.39 13.19 12.993 12.806 12.598 12.365 12.201 12.024 11.738 11.54 11.331 11.227 11.01 10.775 10.532 10.398 10.167 9.935 9.757 9.56 9.155 8.94 8.7 8.416 8.089 7.659 7.019 4.744 -4 ,3096 ,TETRA ,17556767,Fri Nov 26 08:26:40 CET,Fri Nov 26 10:20:54 CET,0.0 0.571 0.829 1.065 1.253 1.415 1.58 1.74 2.029 2.161 2.283 2.416 2.626 2.726 2.929 3.13 3.327 3.423 3.601 3.786 4.059 4.222 4.37 4.572 4.765 4.951 5.13 5.304 5.533 5.757 5.973 6.228 6.484 6.732 7.021 7.385 7.722 8.056 8.461 8.924 9.388 9.889 10.506 11.131 11.841 12.607 13.456 14.441 15.508 16.652 17.884 18.572 18.705 18.608 18.44 18.192 17.86 17.535 17.236 16.896 16.602 16.327 16.036 15.763 15.504 15.243 14.984 14.758 14.555 14.341 14.107 13.913 13.712 13.479 13.289 13.097 12.881 12.646 12.423 12.279 12.114 11.829 11.624 11.415 11.311 11.112 10.895 10.652 10.523 10.301 10.087 9.922 9.756 9.369 9.139 8.89 8.616 8.263 7.739 7.042 4.035 -5 ,21506 ,TETRA ,17556768,Fri Nov 26 08:26:40 CET,Fri Nov 26 10:19:53 CET,0.0 0.744 1.01 1.221 1.407 1.561 1.706 1.842 2.098 2.22 2.333 2.449 2.651 2.752 2.943 3.122 3.307 3.402 3.592 3.774 4.013 4.168 4.32 4.524 4.72 4.924 5.139 5.339 5.581 5.81 6.033 6.291 6.543 6.795 7.081 7.402 7.713 8.064 8.44 8.837 9.265 9.733 10.277 10.853 11.506 12.244 13.09 13.986 14.984 16.074 17.271 18.06 18.29 18.245 18.076 17.838 17.523 17.159 16.849 16.549 16.262 15.999 15.763 15.513 15.245 14.995 14.739 14.51 14.294 14.062 13.806 13.575 13.354 13.132 12.957 12.778 12.583 12.366 12.128 11.955 11.773 11.479 11.298 11.127 11.031 10.812 10.567 10.302 10.157 9.907 9.643 9.467 9.285 8.879 8.66 8.415 8.129 7.779 7.384 6.849 4.307 -6 ,29518 ,TETRA ,17556769,Fri Nov 26 08:27:38 CET,Fri Nov 26 10:20:01 CET,0.0 0.932 1.247 1.485 1.69 1.871 2.044 2.203 2.505 2.645 2.779 2.932 3.153 3.269 3.494 3.706 3.911 4.009 4.184 4.344 4.563 4.712 4.863 5.084 5.301 5.503 5.692 5.881 6.128 6.377 6.622 6.901 7.157 7.42 7.761 8.128 8.439 8.78 9.154 9.555 9.995 10.518 11.142 11.797 12.514 13.265 14.139 15.035 16.032 17.074 18.141 18.712 18.796 18.698 18.54 18.308 17.994 17.666 17.372 17.1 16.816 16.535 16.263 16.0 15.758 15.512 15.227 14.963 14.754 14.536 14.302 14.09 13.846 13.59 13.38 13.153 12.928 12.713 12.491 12.33 12.155 11.886 11.691 11.487 11.382 11.15 10.917 10.678 10.551 10.321 10.072 9.889 9.69 9.263 9.038 8.786 8.504 8.165 7.729 7.166 5.29 -7 ,3434 ,TETRA ,17556770,Fri Nov 26 08:27:38 CET,Fri Nov 26 10:20:02 CET,0.0 0.779 1.075 1.287 1.469 1.641 1.795 1.947 2.255 2.397 2.523 2.662 2.884 2.993 3.186 3.378 3.554 3.634 3.812 4.006 4.27 4.424 4.562 4.77 4.991 5.195 5.378 5.555 5.792 6.022 6.254 6.554 6.832 7.094 7.404 7.741 8.053 8.382 8.741 9.164 9.608 10.082 10.635 11.172 11.788 12.492 13.316 14.276 15.373 16.498 17.533 18.292 18.594 18.517 18.288 18.001 17.743 17.434 17.111 16.781 16.505 16.264 16.008 15.739 15.478 15.224 14.939 14.685 14.45 14.182 13.927 13.707 13.471 13.243 13.047 12.839 12.619 12.38 12.155 11.997 11.822 11.538 11.343 11.166 11.069 10.85 10.616 10.376 10.238 10.01 9.801 9.627 9.442 9.036 8.792 8.523 8.231 7.869 7.435 6.767 3.702 -8 ,4833 ,TETRA ,17556771,Fri Nov 26 08:27:38 CET,Fri Nov 26 10:19:53 CET,0.0 0.663 0.958 1.173 1.382 1.573 1.741 1.895 2.198 2.335 2.465 2.617 2.839 2.945 3.15 3.355 3.545 3.641 3.826 4.003 4.242 4.385 4.526 4.732 4.94 5.138 5.316 5.492 5.733 5.97 6.203 6.516 6.814 7.079 7.375 7.695 8.01 8.359 8.728 9.122 9.548 10.011 10.56 11.127 11.767 12.555 13.478 14.382 15.393 16.529 17.686 18.305 18.368 18.272 18.082 17.827 17.522 17.217 16.938 16.638 16.354 16.066 15.788 15.523 15.261 15.011 14.757 14.504 14.271 14.036 13.793 13.585 13.382 13.146 12.919 12.691 12.467 12.238 12.011 11.86 11.697 11.439 11.261 11.066 10.967 10.752 10.51 10.255 10.109 9.864 9.627 9.458 9.28 8.876 8.642 8.354 8.037 7.708 7.294 6.732 5.184 -9 ,4584 ,TETRA ,17556772,Fri Nov 26 08:27:40 CET,Fri Nov 26 10:20:30 CET,0.0 0.861 1.104 1.283 1.46 1.636 1.779 1.908 2.158 2.279 2.394 2.516 2.727 2.829 3.026 3.207 3.391 3.483 3.659 3.824 4.054 4.202 4.348 4.559 4.773 4.986 5.196 5.404 5.684 5.963 6.221 6.535 6.821 7.086 7.432 7.804 8.114 8.45 8.823 9.238 9.695 10.207 10.8 11.372 12.049 12.804 13.636 14.553 15.587 16.818 18.033 18.578 18.702 18.671 18.537 18.27 17.97 17.69 17.436 17.158 16.906 16.636 16.342 16.071 15.827 15.611 15.356 15.086 14.863 14.644 14.396 14.185 13.963 13.72 13.524 13.326 13.118 12.894 12.662 12.514 12.368 12.122 11.94 11.749 11.647 11.417 11.18 10.946 10.828 10.604 10.36 10.191 10.017 9.649 9.44 9.22 8.97 8.648 8.245 7.655 5.218 -10 ,4185 ,TETRA ,17556773,Fri Nov 26 08:27:40 CET,Fri Nov 26 10:09:28 CET,0.0 0.937 1.25 1.478 1.679 1.847 2.017 2.187 2.472 2.594 2.709 2.831 3.042 3.152 3.366 3.582 3.785 3.885 4.072 4.247 4.494 4.651 4.806 5.018 5.211 5.395 5.577 5.752 5.982 6.194 6.391 6.653 6.919 7.179 7.475 7.796 8.102 8.44 8.864 9.358 9.818 10.286 10.857 11.443 12.122 12.865 13.669 14.519 15.48 16.496 17.562 18.283 18.451 18.383 18.185 17.93 17.65 17.356 17.117 16.844 16.552 16.266 16.018 15.783 15.547 15.329 15.087 14.849 14.633 14.408 14.162 13.951 13.734 13.505 13.313 13.104 12.882 12.654 12.42 12.256 12.082 11.813 11.623 11.422 11.327 11.12 10.874 10.609 10.482 10.265 10.06 9.893 9.714 9.34 9.109 8.86 8.585 8.233 7.774 7.14 4.023 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_31_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_31_35.txt deleted file mode 100644 index 96493504..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_31_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,886 ,TETRA ,17556774,Fri Nov 26 08:28:41 CET,Fri Nov 26 10:25:25 CET,0.0 0.242 0.386 0.532 0.69 0.835 0.943 1.054 1.292 1.398 1.506 1.615 1.816 1.92 2.126 2.333 2.53 2.623 2.8 2.973 3.217 3.368 3.521 3.745 3.958 4.17 4.375 4.566 4.803 5.031 5.265 5.552 5.821 6.079 6.398 6.743 7.068 7.447 7.845 8.258 8.718 9.237 9.832 10.444 11.151 11.907 12.788 13.75 14.84 16.172 17.621 18.481 18.754 18.755 18.576 18.315 18.04 17.77 17.497 17.192 16.951 16.744 16.52 16.292 16.083 15.874 15.637 15.44 15.275 15.109 14.945 14.8 14.645 14.469 14.328 14.187 14.039 13.886 13.725 13.603 13.477 13.298 13.166 13.02 12.945 12.79 12.635 12.456 12.351 12.152 12.014 11.888 11.746 11.43 11.263 11.092 10.913 10.699 10.393 10.032 8.996 -2 ,22772 ,TETRA ,17556775,Fri Nov 26 08:28:41 CET,Fri Nov 26 10:21:42 CET,0.0 0.412 0.641 0.841 1.019 1.173 1.299 1.422 1.646 1.743 1.835 1.914 2.1 2.188 2.371 2.543 2.705 2.78 2.923 3.063 3.264 3.395 3.528 3.724 3.91 4.093 4.274 4.458 4.698 4.922 5.135 5.391 5.644 5.885 6.163 6.486 6.811 7.167 7.533 7.925 8.325 8.776 9.321 9.864 10.523 11.289 12.128 13.011 14.119 15.384 16.565 17.322 17.574 17.612 17.539 17.369 17.128 16.881 16.638 16.361 16.125 15.921 15.667 15.407 15.177 14.961 14.719 14.491 14.303 14.106 13.872 13.674 13.487 13.291 13.137 12.983 12.813 12.623 12.422 12.277 12.122 11.883 11.722 11.562 11.484 11.31 11.112 10.915 10.801 10.59 10.442 10.319 10.191 9.917 9.774 9.615 9.419 9.201 8.941 8.581 7.409 -3 ,9042 ,TETRA ,17556776,Fri Nov 26 08:28:42 CET,Fri Nov 26 10:22:56 CET,0.0 0.689 0.933 1.082 1.227 1.358 1.478 1.591 1.785 1.876 1.966 2.029 2.218 2.302 2.454 2.604 2.76 2.836 2.989 3.135 3.336 3.466 3.591 3.772 3.952 4.125 4.292 4.452 4.659 4.876 5.089 5.331 5.569 5.8 6.065 6.367 6.666 6.989 7.33 7.7 8.102 8.544 9.052 9.584 10.2 10.896 11.756 12.714 13.814 14.979 16.118 16.849 17.14 17.187 17.073 16.81 16.504 16.219 15.942 15.652 15.39 15.142 14.904 14.658 14.413 14.18 13.936 13.722 13.536 13.334 13.102 12.906 12.714 12.518 12.359 12.192 12.02 11.832 11.635 11.505 11.369 11.155 10.999 10.83 10.743 10.567 10.381 10.182 10.076 9.87 9.735 9.617 9.494 9.214 9.048 8.856 8.654 8.444 8.185 7.852 6.923 -4 ,9001 ,TETRA ,17556777,Fri Nov 26 08:29:38 CET,Fri Nov 26 10:26:13 CET,0.0 0.345 0.563 0.75 0.908 1.038 1.152 1.256 1.46 1.56 1.651 1.711 1.887 1.972 2.13 2.267 2.418 2.493 2.625 2.759 2.964 3.099 3.228 3.415 3.59 3.768 3.947 4.111 4.323 4.529 4.731 4.98 5.217 5.44 5.698 5.998 6.287 6.615 6.974 7.343 7.731 8.186 8.737 9.272 9.893 10.597 11.428 12.344 13.309 14.402 15.67 16.492 16.78 16.869 16.734 16.484 16.236 15.962 15.692 15.409 15.16 14.938 14.728 14.493 14.266 14.058 13.838 13.661 13.512 13.338 13.166 13.019 12.861 12.697 12.56 12.422 12.271 12.097 11.909 11.784 11.66 11.459 11.318 11.177 11.102 10.939 10.755 10.577 10.494 10.306 10.166 10.04 9.906 9.637 9.478 9.297 9.101 8.876 8.593 8.213 7.067 -5 ,23763 ,TETRA ,17556778,Fri Nov 26 08:29:38 CET,Fri Nov 26 10:22:27 CET,0.0 0.47 0.684 0.847 1.017 1.168 1.297 1.42 1.623 1.725 1.824 1.908 2.099 2.183 2.356 2.53 2.695 2.774 2.923 3.062 3.269 3.4 3.529 3.731 3.928 4.112 4.291 4.463 4.686 4.903 5.102 5.347 5.589 5.826 6.106 6.421 6.731 7.073 7.433 7.804 8.207 8.675 9.221 9.754 10.355 11.041 11.891 12.85 13.865 15.063 16.477 17.422 17.734 17.777 17.679 17.422 17.152 16.88 16.599 16.341 16.099 15.862 15.629 15.385 15.151 14.928 14.695 14.49 14.314 14.118 13.889 13.696 13.502 13.311 13.167 13.003 12.827 12.64 12.446 12.317 12.174 11.951 11.8 11.643 11.562 11.397 11.217 11.005 10.895 10.705 10.583 10.464 10.343 10.088 9.936 9.756 9.554 9.341 9.075 8.733 7.916 -6 ,22529 ,TETRA ,17556779,Fri Nov 26 08:29:38 CET,Fri Nov 26 10:23:58 CET,0.0 0.5 0.694 0.874 1.029 1.161 1.289 1.414 1.63 1.719 1.806 1.885 2.074 2.163 2.326 2.481 2.641 2.718 2.874 3.021 3.219 3.349 3.48 3.674 3.859 4.033 4.204 4.368 4.583 4.809 5.02 5.265 5.513 5.749 6.03 6.361 6.691 7.048 7.421 7.821 8.247 8.746 9.327 9.904 10.567 11.306 12.154 13.08 14.148 15.415 16.789 17.518 17.681 17.583 17.37 17.11 16.844 16.6 16.381 16.145 15.91 15.675 15.466 15.268 15.06 14.85 14.613 14.401 14.232 14.049 13.836 13.653 13.467 13.277 13.123 12.955 12.777 12.58 12.373 12.226 12.075 11.856 11.702 11.538 11.447 11.253 11.052 10.834 10.73 10.534 10.394 10.267 10.148 9.907 9.758 9.595 9.413 9.21 8.984 8.669 7.78 -7 ,5268 ,TETRA ,17556780,Fri Nov 26 08:30:38 CET,Fri Nov 26 10:10:57 CET,0.0 0.517 0.73 0.917 1.081 1.234 1.395 1.53 1.742 1.84 1.943 2.029 2.221 2.312 2.492 2.66 2.81 2.884 3.036 3.179 3.376 3.504 3.625 3.807 3.98 4.146 4.312 4.476 4.699 4.924 5.147 5.405 5.647 5.87 6.134 6.469 6.792 7.131 7.488 7.87 8.287 8.773 9.345 9.905 10.608 11.402 12.276 13.248 14.295 15.393 16.632 17.51 17.868 17.874 17.747 17.553 17.258 16.987 16.752 16.472 16.196 15.911 15.645 15.39 15.157 14.948 14.712 14.496 14.311 14.104 13.865 13.672 13.482 13.278 13.114 12.951 12.776 12.603 12.403 12.251 12.099 11.839 11.665 11.5 11.406 11.211 11.003 10.763 10.64 10.426 10.227 10.08 9.913 9.53 9.351 9.176 8.962 8.728 8.472 8.09 7.06 -8 ,11324 ,TETRA ,17556781,Fri Nov 26 08:30:38 CET,Fri Nov 26 10:26:05 CET,0.0 0.56 0.782 0.977 1.135 1.273 1.393 1.504 1.727 1.836 1.933 1.995 2.174 2.252 2.406 2.564 2.707 2.771 2.901 3.035 3.234 3.367 3.507 3.721 3.915 4.089 4.262 4.434 4.65 4.865 5.077 5.329 5.572 5.797 6.062 6.375 6.676 6.991 7.34 7.714 8.097 8.53 9.038 9.549 10.177 10.921 11.782 12.766 13.847 15.039 16.455 17.196 17.363 17.387 17.231 16.984 16.766 16.585 16.398 16.153 15.899 15.637 15.379 15.123 14.876 14.685 14.485 14.289 14.117 13.918 13.702 13.521 13.341 13.136 12.968 12.798 12.615 12.407 12.193 12.046 11.889 11.648 11.484 11.313 11.222 11.037 10.852 10.638 10.523 10.322 10.155 10.017 9.883 9.542 9.347 9.163 8.966 8.747 8.511 8.178 7.274 -9 ,992 ,TETRA ,17556782,Fri Nov 26 08:31:42 CET,Fri Nov 26 10:24:56 CET,0.0 0.591 0.799 0.959 1.105 1.241 1.365 1.479 1.705 1.807 1.899 1.974 2.17 2.262 2.424 2.574 2.715 2.787 2.931 3.075 3.287 3.419 3.54 3.711 3.886 4.055 4.213 4.378 4.6 4.814 5.023 5.265 5.494 5.726 6.002 6.313 6.608 6.926 7.278 7.657 8.054 8.49 9.007 9.565 10.212 10.911 11.711 12.618 13.645 14.75 15.893 16.64 16.958 17.018 16.911 16.679 16.394 16.116 15.872 15.596 15.318 15.055 14.804 14.573 14.34 14.111 13.852 13.63 13.448 13.262 13.073 12.902 12.738 12.581 12.453 12.306 12.135 11.957 11.775 11.641 11.508 11.31 11.155 10.985 10.904 10.746 10.578 10.396 10.297 10.106 9.987 9.864 9.732 9.429 9.269 9.105 8.917 8.7 8.417 8.047 7.133 -10 ,16782 ,TETRA ,17556783,Fri Nov 26 08:31:45 CET,Fri Nov 26 10:25:19 CET,0.0 0.4 0.622 0.81 0.973 1.124 1.265 1.389 1.598 1.697 1.794 1.875 2.061 2.151 2.322 2.493 2.66 2.74 2.894 3.033 3.231 3.366 3.503 3.709 3.904 4.077 4.249 4.424 4.651 4.871 5.091 5.353 5.597 5.835 6.12 6.448 6.773 7.122 7.483 7.896 8.342 8.826 9.372 9.915 10.598 11.352 12.211 13.228 14.372 15.608 16.912 17.746 17.973 17.918 17.809 17.663 17.443 17.214 17.001 16.721 16.468 16.254 16.001 15.732 15.49 15.266 15.029 14.816 14.623 14.418 14.199 14.015 13.827 13.626 13.464 13.31 13.143 12.955 12.78 12.659 12.527 12.32 12.181 12.03 11.947 11.795 11.648 11.452 11.346 11.156 11.014 10.891 10.766 10.489 10.328 10.162 9.988 9.771 9.499 9.144 8.2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_31_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_31_37.txt deleted file mode 100644 index ce24b901..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_31_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3905 ,TETRA ,17556784,Fri Nov 26 08:31:43 CET,Fri Nov 26 10:26:06 CET,0.0 0.635 0.898 1.089 1.269 1.432 1.584 1.721 1.965 2.072 2.169 2.264 2.455 2.54 2.713 2.883 3.037 3.116 3.269 3.414 3.614 3.738 3.856 4.025 4.197 4.363 4.515 4.663 4.851 5.021 5.193 5.405 5.605 5.798 6.015 6.266 6.508 6.768 7.054 7.376 7.714 8.081 8.531 8.986 9.459 9.928 10.483 11.105 11.754 12.376 12.89 13.025 12.851 12.556 12.192 11.845 11.537 11.224 10.944 10.658 10.4 10.181 9.96 9.727 9.502 9.283 9.063 8.877 8.726 8.552 8.363 8.229 8.085 7.906 7.756 7.618 7.489 7.344 7.19 7.086 6.975 6.809 6.69 6.562 6.498 6.348 6.173 5.998 5.913 5.741 5.654 5.552 5.447 5.239 5.13 4.994 4.84 4.668 4.47 4.204 3.524 -2 ,29836 ,TETRA ,17556785,Fri Nov 26 08:31:43 CET,Fri Nov 26 10:13:49 CET,0.0 0.49 0.728 0.919 1.075 1.201 1.326 1.456 1.712 1.829 1.939 2.037 2.235 2.327 2.5 2.659 2.809 2.883 3.02 3.159 3.374 3.509 3.642 3.835 4.016 4.193 4.381 4.564 4.781 4.973 5.16 5.392 5.606 5.818 6.061 6.331 6.596 6.881 7.173 7.482 7.805 8.165 8.582 8.983 9.453 9.927 10.393 10.878 11.471 12.073 12.476 12.536 12.369 12.152 11.899 11.599 11.301 11.003 10.743 10.498 10.28 10.067 9.854 9.661 9.482 9.302 9.11 8.939 8.785 8.629 8.467 8.316 8.158 8.005 7.879 7.74 7.598 7.457 7.317 7.221 7.117 6.952 6.834 6.703 6.631 6.49 6.34 6.182 6.107 5.936 5.835 5.738 5.646 5.439 5.316 5.178 5.039 4.886 4.676 4.414 3.793 -3 ,27036 ,TETRA ,17556786,Fri Nov 26 08:31:43 CET,Fri Nov 26 10:25:06 CET,0.0 0.705 1.025 1.262 1.453 1.604 1.736 1.868 2.121 2.233 2.34 2.447 2.649 2.734 2.894 3.059 3.218 3.298 3.464 3.618 3.84 3.983 4.117 4.319 4.516 4.709 4.893 5.06 5.271 5.463 5.646 5.875 6.096 6.309 6.552 6.814 7.063 7.338 7.63 7.928 8.234 8.601 9.033 9.446 9.917 10.428 10.959 11.506 12.108 12.666 13.083 13.158 12.988 12.753 12.507 12.224 11.932 11.647 11.369 11.099 10.888 10.679 10.459 10.252 10.058 9.872 9.679 9.511 9.358 9.191 9.02 8.885 8.745 8.59 8.465 8.333 8.192 8.038 7.882 7.778 7.673 7.516 7.398 7.267 7.203 7.058 6.906 6.75 6.665 6.489 6.379 6.273 6.167 5.937 5.804 5.655 5.508 5.343 5.139 4.858 4.119 -4 ,8205 ,TETRA ,17556787,Fri Nov 26 08:31:43 CET,Fri Nov 26 10:26:06 CET,0.0 0.503 0.73 0.924 1.082 1.231 1.377 1.511 1.753 1.864 1.974 2.095 2.302 2.408 2.618 2.82 3.007 3.092 3.259 3.432 3.672 3.811 3.949 4.152 4.354 4.541 4.711 4.883 5.108 5.315 5.503 5.717 5.926 6.131 6.376 6.645 6.893 7.189 7.509 7.832 8.156 8.529 8.948 9.337 9.805 10.303 10.867 11.456 12.036 12.646 13.173 13.328 13.213 12.955 12.653 12.359 12.073 11.812 11.57 11.298 11.069 10.871 10.658 10.434 10.236 10.055 9.87 9.694 9.533 9.369 9.191 9.045 8.897 8.739 8.617 8.495 8.364 8.223 8.077 7.982 7.875 7.701 7.587 7.465 7.398 7.247 7.086 6.931 6.853 6.683 6.611 6.517 6.409 6.169 6.039 5.895 5.725 5.543 5.338 5.047 4.329 -5 ,7051 ,TETRA ,17556788,Fri Nov 26 08:32:41 CET,Fri Nov 26 10:28:15 CET,0.0 0.77 1.051 1.256 1.462 1.657 1.8 1.93 2.191 2.314 2.422 2.518 2.722 2.813 2.969 3.123 3.274 3.345 3.478 3.611 3.812 3.945 4.077 4.268 4.463 4.656 4.838 5.017 5.247 5.459 5.66 5.892 6.108 6.331 6.58 6.842 7.092 7.385 7.689 8.006 8.342 8.709 9.132 9.545 10.025 10.563 11.128 11.682 12.227 12.794 13.376 13.581 13.52 13.285 12.975 12.649 12.339 12.067 11.822 11.549 11.304 11.102 10.901 10.693 10.501 10.319 10.11 9.92 9.771 9.625 9.463 9.319 9.168 9.006 8.885 8.758 8.615 8.472 8.328 8.23 8.129 7.962 7.833 7.696 7.632 7.501 7.35 7.189 7.109 6.938 6.845 6.741 6.632 6.391 6.248 6.111 5.956 5.769 5.549 5.271 4.757 -6 ,22703 ,TETRA ,17556789,Fri Nov 26 08:33:41 CET,Fri Nov 26 10:27:14 CET,0.0 0.448 0.702 0.901 1.074 1.231 1.367 1.503 1.751 1.864 1.968 2.05 2.238 2.321 2.48 2.639 2.783 2.849 2.979 3.1 3.275 3.393 3.519 3.704 3.875 4.038 4.186 4.334 4.516 4.688 4.858 5.066 5.268 5.448 5.66 5.9 6.126 6.374 6.636 6.915 7.222 7.567 7.973 8.409 8.901 9.423 9.992 10.575 11.201 11.811 12.33 12.421 12.234 12.003 11.732 11.403 11.086 10.805 10.551 10.277 10.043 9.837 9.617 9.408 9.209 9.02 8.827 8.661 8.513 8.348 8.176 8.045 7.907 7.744 7.613 7.484 7.359 7.228 7.08 6.971 6.862 6.696 6.575 6.453 6.39 6.258 6.115 5.945 5.861 5.687 5.587 5.483 5.378 5.161 5.04 4.901 4.747 4.58 4.39 4.141 3.475 -7 ,29664 ,TETRA ,17556790,Fri Nov 26 08:32:41 CET,Fri Nov 26 10:26:47 CET,0.0 0.737 1.015 1.23 1.413 1.553 1.671 1.783 1.989 2.087 2.177 2.252 2.445 2.528 2.69 2.846 2.997 3.069 3.202 3.327 3.52 3.645 3.758 3.919 4.081 4.234 4.377 4.519 4.714 4.918 5.128 5.388 5.614 5.812 6.067 6.363 6.644 6.942 7.231 7.52 7.819 8.173 8.598 8.989 9.431 9.905 10.399 10.933 11.537 12.143 12.694 12.884 12.738 12.461 12.161 11.846 11.538 11.27 11.028 10.746 10.505 10.304 10.097 9.887 9.69 9.505 9.307 9.129 8.968 8.808 8.652 8.523 8.384 8.221 8.086 7.953 7.833 7.704 7.559 7.458 7.351 7.182 7.067 6.944 6.876 6.738 6.604 6.453 6.37 6.195 6.102 6.01 5.915 5.697 5.564 5.413 5.258 5.09 4.878 4.606 3.912 -8 ,16580 ,TETRA ,17556791,Fri Nov 26 08:33:41 CET,Fri Nov 26 10:27:11 CET,0.0 0.476 0.718 0.929 1.102 1.238 1.369 1.495 1.736 1.858 1.971 2.061 2.247 2.335 2.505 2.657 2.811 2.891 3.04 3.173 3.376 3.51 3.634 3.808 3.971 4.121 4.272 4.419 4.611 4.799 4.974 5.183 5.386 5.589 5.821 6.085 6.338 6.603 6.889 7.185 7.495 7.848 8.249 8.625 9.068 9.586 10.155 10.721 11.309 11.917 12.406 12.463 12.301 12.065 11.789 11.508 11.236 10.965 10.71 10.442 10.206 9.991 9.782 9.59 9.403 9.225 9.037 8.857 8.697 8.541 8.377 8.237 8.093 7.943 7.826 7.697 7.56 7.418 7.27 7.167 7.055 6.876 6.756 6.632 6.565 6.434 6.303 6.143 6.056 5.879 5.786 5.693 5.599 5.381 5.251 5.1 4.938 4.762 4.555 4.304 3.611 -9 ,9472 ,TETRA ,17556792,Fri Nov 26 08:33:43 CET,Fri Nov 26 10:27:58 CET,0.0 0.567 0.837 1.073 1.301 1.495 1.665 1.835 2.148 2.284 2.424 2.586 2.791 2.894 3.094 3.289 3.465 3.551 3.725 3.875 4.099 4.246 4.395 4.613 4.799 4.983 5.164 5.328 5.542 5.745 5.931 6.16 6.379 6.593 6.841 7.13 7.408 7.68 7.969 8.28 8.615 8.99 9.395 9.775 10.236 10.776 11.348 11.947 12.57 13.164 13.66 13.765 13.529 13.166 12.819 12.483 12.205 11.936 11.652 11.339 11.071 10.801 10.527 10.283 10.05 9.837 9.606 9.407 9.237 9.051 8.847 8.665 8.494 8.322 8.182 8.035 7.872 7.698 7.519 7.401 7.275 7.05 6.895 6.737 6.653 6.482 6.296 6.093 5.995 5.806 5.678 5.561 5.435 5.152 4.994 4.82 4.63 4.407 4.151 3.849 3.099 -10 ,6329 ,TETRA ,17556793,Fri Nov 26 08:33:43 CET,Fri Nov 26 10:21:06 CET,0.0 0.908 1.326 1.649 1.901 2.113 2.31 2.496 2.798 2.927 3.053 3.198 3.418 3.537 3.759 3.952 4.116 4.197 4.364 4.526 4.754 4.903 5.041 5.226 5.419 5.597 5.76 5.924 6.136 6.354 6.575 6.812 7.031 7.256 7.502 7.788 8.065 8.354 8.667 8.99 9.334 9.709 10.122 10.55 11.037 11.537 12.083 12.658 13.263 13.911 14.401 14.401 14.191 13.895 13.574 13.236 12.886 12.569 12.281 11.959 11.674 11.421 11.183 10.964 10.761 10.547 10.322 10.141 9.985 9.807 9.611 9.443 9.267 9.082 8.935 8.788 8.643 8.485 8.303 8.174 8.043 7.847 7.717 7.585 7.521 7.388 7.247 7.1 7.02 6.844 6.749 6.645 6.535 6.301 6.161 6.007 5.841 5.652 5.436 5.176 4.496 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_33_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_33_19.txt deleted file mode 100644 index 40b6ea01..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_33_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10013 ,TETRA ,17556794,Fri Nov 26 08:33:43 CET,Fri Nov 26 10:24:25 CET,0.0 0.189 0.308 0.409 0.49 0.564 0.636 0.706 0.84 0.907 0.972 0.976 1.14 1.195 1.305 1.413 1.523 1.572 1.658 1.739 1.858 1.935 2.005 2.107 2.209 2.323 2.437 2.538 2.682 2.842 2.993 3.172 3.349 3.521 3.723 3.958 4.174 4.393 4.634 4.892 5.152 5.441 5.794 6.152 6.578 7.066 7.611 8.182 8.856 9.666 10.521 11.078 11.266 11.255 11.154 11.05 10.932 10.803 10.668 10.506 10.325 10.173 10.023 9.823 9.674 9.562 9.392 9.199 9.038 8.876 8.703 8.563 8.439 8.312 8.198 8.071 7.936 7.794 7.643 7.54 7.43 7.259 7.137 6.996 6.92 6.76 6.604 6.449 6.364 6.159 6.07 5.975 5.859 5.594 5.454 5.292 5.116 4.946 4.715 4.38 3.565 -2 ,3510 ,TETRA ,17556795,Fri Nov 26 08:33:43 CET,Fri Nov 26 10:24:52 CET,0.0 0.207 0.328 0.424 0.504 0.587 0.678 0.761 0.902 0.961 1.024 1.034 1.206 1.267 1.39 1.496 1.59 1.64 1.738 1.822 1.945 2.026 2.103 2.206 2.303 2.409 2.514 2.615 2.754 2.888 3.011 3.163 3.321 3.473 3.65 3.852 4.048 4.263 4.507 4.777 5.054 5.366 5.718 6.062 6.468 6.908 7.401 7.977 8.632 9.355 10.108 10.576 10.742 10.768 10.717 10.589 10.414 10.184 9.942 9.697 9.489 9.272 9.045 8.841 8.658 8.514 8.343 8.167 8.032 7.888 7.716 7.571 7.411 7.254 7.139 7.01 6.865 6.711 6.548 6.428 6.317 6.142 6.01 5.868 5.797 5.667 5.529 5.374 5.286 5.083 4.98 4.873 4.756 4.507 4.374 4.229 4.063 3.871 3.647 3.367 2.726 -3 ,9711 ,TETRA ,17556796,Fri Nov 26 08:33:44 CET,Fri Nov 26 10:24:52 CET,0.0 0.183 0.332 0.425 0.495 0.562 0.642 0.718 0.848 0.907 0.962 0.953 1.117 1.163 1.258 1.356 1.458 1.503 1.588 1.672 1.79 1.875 1.961 2.076 2.181 2.291 2.395 2.497 2.628 2.752 2.878 3.031 3.177 3.318 3.487 3.687 3.878 4.088 4.34 4.623 4.898 5.212 5.613 6.002 6.458 6.961 7.49 8.11 8.813 9.565 10.366 10.897 11.116 11.145 11.045 10.917 10.772 10.619 10.501 10.358 10.192 9.994 9.802 9.616 9.41 9.239 9.054 8.854 8.685 8.531 8.377 8.238 8.092 7.933 7.793 7.651 7.514 7.358 7.192 7.077 6.947 6.753 6.635 6.502 6.431 6.286 6.128 5.945 5.855 5.672 5.599 5.489 5.363 5.08 4.931 4.786 4.627 4.428 4.211 3.925 2.864 -4 ,18198 ,TETRA ,17556797,Fri Nov 26 08:33:43 CET,Fri Nov 26 10:24:44 CET,0.0 0.239 0.345 0.437 0.516 0.596 0.666 0.731 0.869 0.93 0.985 0.995 1.166 1.215 1.321 1.431 1.527 1.576 1.68 1.778 1.907 1.988 2.068 2.185 2.293 2.393 2.495 2.593 2.722 2.862 3.009 3.18 3.344 3.492 3.648 3.83 4.021 4.234 4.452 4.679 4.909 5.17 5.484 5.816 6.214 6.634 7.113 7.674 8.308 9.032 9.849 10.386 10.488 10.486 10.492 10.447 10.339 10.228 10.086 9.9 9.766 9.633 9.485 9.309 9.134 8.978 8.788 8.603 8.448 8.303 8.127 7.979 7.816 7.643 7.521 7.385 7.237 7.076 6.908 6.783 6.652 6.468 6.339 6.201 6.131 5.981 5.813 5.636 5.548 5.358 5.286 5.187 5.069 4.771 4.603 4.434 4.277 4.1 3.859 3.547 2.846 -5 ,32391 ,TETRA ,17556798,Fri Nov 26 08:33:43 CET,Fri Nov 26 10:26:37 CET,0.0 0.325 0.431 0.518 0.613 0.701 0.775 0.848 0.987 1.053 1.118 1.136 1.304 1.355 1.454 1.547 1.638 1.683 1.77 1.863 1.995 2.07 2.146 2.257 2.368 2.484 2.598 2.708 2.84 2.963 3.105 3.287 3.463 3.639 3.846 4.069 4.275 4.514 4.764 5.018 5.281 5.58 5.948 6.306 6.696 7.143 7.694 8.286 8.907 9.619 10.386 10.855 10.979 10.953 10.899 10.766 10.591 10.374 10.195 10.012 9.785 9.565 9.349 9.169 9.028 8.875 8.69 8.518 8.385 8.249 8.085 7.932 7.758 7.592 7.46 7.331 7.207 7.075 6.945 6.833 6.704 6.512 6.385 6.269 6.206 6.055 5.898 5.731 5.636 5.431 5.351 5.247 5.129 4.852 4.699 4.551 4.374 4.171 3.937 3.63 2.846 -6 ,3633 ,TETRA ,17556799,Fri Nov 26 08:33:43 CET,Fri Nov 26 10:24:39 CET,0.0 0.143 0.268 0.362 0.439 0.519 0.611 0.687 0.812 0.872 0.93 0.923 1.09 1.144 1.247 1.343 1.435 1.486 1.59 1.679 1.807 1.89 1.967 2.072 2.183 2.302 2.42 2.538 2.695 2.837 2.972 3.146 3.311 3.466 3.653 3.87 4.085 4.31 4.558 4.845 5.133 5.448 5.798 6.147 6.57 7.074 7.682 8.318 8.984 9.709 10.462 10.981 11.189 11.139 10.948 10.813 10.703 10.56 10.371 10.165 9.986 9.805 9.635 9.482 9.337 9.195 9.02 8.828 8.65 8.477 8.31 8.163 8.02 7.874 7.739 7.587 7.427 7.26 7.082 6.959 6.826 6.612 6.471 6.31 6.219 6.05 5.875 5.671 5.567 5.359 5.227 5.095 4.961 4.658 4.491 4.319 4.135 3.905 3.628 3.269 2.317 -7 ,12777 ,TETRA ,17556800,Fri Nov 26 08:33:44 CET,Fri Nov 26 10:24:34 CET,0.0 0.33 0.432 0.527 0.616 0.679 0.745 0.812 0.935 1.0 1.067 1.083 1.254 1.308 1.411 1.506 1.593 1.638 1.724 1.81 1.946 2.034 2.119 2.249 2.373 2.489 2.606 2.722 2.88 3.033 3.187 3.365 3.531 3.7 3.889 4.104 4.314 4.541 4.784 5.054 5.341 5.644 6.002 6.374 6.822 7.31 7.826 8.427 9.118 9.862 10.682 11.179 11.363 11.353 11.257 11.138 11.008 10.872 10.725 10.562 10.424 10.248 10.014 9.815 9.66 9.517 9.361 9.212 9.054 8.894 8.75 8.621 8.481 8.331 8.204 8.056 7.917 7.786 7.629 7.513 7.397 7.208 7.08 6.959 6.891 6.732 6.563 6.391 6.3 6.099 6.019 5.922 5.806 5.563 5.44 5.3 5.145 4.959 4.759 4.443 3.624 -8 ,24740 ,TETRA ,17556801,Fri Nov 26 08:33:43 CET,Fri Nov 26 10:25:26 CET,0.0 0.152 0.265 0.384 0.48 0.571 0.649 0.715 0.835 0.898 0.954 0.938 1.105 1.164 1.279 1.379 1.468 1.509 1.592 1.675 1.794 1.875 1.961 2.081 2.182 2.273 2.372 2.479 2.619 2.754 2.879 3.029 3.183 3.341 3.529 3.739 3.935 4.151 4.383 4.627 4.889 5.194 5.563 5.938 6.363 6.836 7.405 8.007 8.662 9.383 10.188 10.727 10.787 10.714 10.641 10.55 10.422 10.251 10.085 9.883 9.67 9.442 9.203 8.984 8.773 8.601 8.436 8.256 8.083 7.898 7.703 7.546 7.39 7.243 7.127 6.989 6.837 6.679 6.517 6.405 6.284 6.096 5.966 5.826 5.756 5.611 5.462 5.3 5.202 4.994 4.904 4.799 4.693 4.441 4.291 4.138 3.969 3.775 3.564 3.306 2.601 -9 ,11305 ,TETRA ,17556802,Fri Nov 26 08:34:41 CET,Fri Nov 26 10:28:46 CET,0.0 0.215 0.386 0.515 0.61 0.692 0.756 0.828 0.976 1.035 1.088 1.09 1.261 1.314 1.423 1.531 1.638 1.685 1.777 1.861 1.977 2.053 2.126 2.242 2.357 2.464 2.564 2.665 2.787 2.913 3.046 3.2 3.351 3.499 3.669 3.857 4.041 4.243 4.46 4.698 4.951 5.242 5.58 5.92 6.332 6.783 7.274 7.832 8.512 9.252 10.051 10.581 10.732 10.624 10.465 10.346 10.221 10.109 10.015 9.911 9.798 9.661 9.498 9.335 9.165 9.005 8.86 8.717 8.558 8.394 8.217 8.077 7.939 7.772 7.648 7.517 7.378 7.237 7.086 6.975 6.861 6.684 6.555 6.436 6.368 6.22 6.07 5.901 5.811 5.611 5.515 5.419 5.321 5.087 4.953 4.804 4.635 4.453 4.238 3.949 3.221 -10 ,22010 ,TETRA ,17556803,Fri Nov 26 08:34:41 CET,Fri Nov 26 10:27:01 CET,0.0 0.209 0.325 0.412 0.502 0.576 0.636 0.708 0.844 0.906 0.968 0.965 1.135 1.196 1.309 1.41 1.509 1.557 1.651 1.735 1.856 1.933 2.007 2.129 2.246 2.356 2.461 2.565 2.708 2.85 2.998 3.183 3.361 3.53 3.731 3.954 4.175 4.416 4.666 4.928 5.194 5.498 5.869 6.235 6.637 7.092 7.624 8.213 8.861 9.559 10.406 10.972 11.151 11.192 11.138 11.031 10.9 10.741 10.581 10.409 10.244 10.07 9.918 9.752 9.577 9.399 9.192 9.028 8.896 8.759 8.603 8.477 8.34 8.194 8.087 7.952 7.794 7.645 7.509 7.41 7.295 7.126 7.003 6.866 6.794 6.633 6.467 6.293 6.207 6.01 5.912 5.801 5.689 5.43 5.27 5.108 4.954 4.782 4.562 4.215 3.386 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_34_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_34_37.txt deleted file mode 100644 index 336d4421..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_34_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7304 ,TETRA ,17556804,Fri Nov 26 08:34:41 CET,Fri Nov 26 10:16:16 CET,0.0 0.939 1.235 1.465 1.658 1.823 1.977 2.122 2.37 2.483 2.589 2.708 2.893 2.985 3.146 3.303 3.449 3.514 3.632 3.747 3.922 4.031 4.132 4.274 4.41 4.54 4.667 4.786 4.929 5.064 5.182 5.308 5.425 5.539 5.668 5.816 5.948 6.087 6.254 6.423 6.586 6.771 6.978 7.161 7.349 7.541 7.701 7.788 7.797 7.654 7.097 6.163 5.328 4.616 3.965 3.326 2.776 2.304 1.889 1.464 1.097 0.766 0.453 0.162 -0.114 -0.358 -0.606 -0.834 -1.031 -1.253 -1.492 -1.682 -1.882 -2.066 -2.206 -2.361 -2.527 -2.695 -2.864 -2.976 -3.09 -3.269 -3.386 -3.517 -3.583 -3.722 -3.866 -4.001 -4.072 -4.239 -4.3 -4.384 -4.482 -4.694 -4.807 -4.94 -5.112 -5.282 -5.477 -5.791 -6.846 -2 ,20803 ,TETRA ,17556805,Fri Nov 26 08:34:42 CET,Fri Nov 26 10:29:05 CET,0.0 1.178 1.474 1.709 1.924 2.112 2.28 2.421 2.691 2.827 2.949 3.091 3.275 3.37 3.552 3.736 3.902 3.979 4.115 4.247 4.457 4.583 4.705 4.897 5.065 5.204 5.341 5.472 5.632 5.775 5.908 6.075 6.238 6.39 6.553 6.723 6.888 7.073 7.272 7.448 7.613 7.798 8.016 8.224 8.404 8.572 8.718 8.828 8.847 8.671 8.126 7.269 6.438 5.693 5.036 4.44 3.903 3.397 2.968 2.543 2.202 1.909 1.628 1.372 1.118 0.887 0.646 0.421 0.233 0.037 -0.179 -0.348 -0.52 -0.714 -0.862 -1.004 -1.16 -1.326 -1.484 -1.595 -1.71 -1.884 -2.004 -2.132 -2.198 -2.332 -2.494 -2.662 -2.751 -2.936 -3.021 -3.109 -3.196 -3.375 -3.475 -3.592 -3.72 -3.87 -4.058 -4.363 -5.104 -3 ,25977 ,TETRA ,17556806,Fri Nov 26 08:35:41 CET,Fri Nov 26 10:29:07 CET,0.0 1.161 1.52 1.783 1.996 2.164 2.317 2.467 2.735 2.843 2.939 3.061 3.245 3.337 3.513 3.676 3.824 3.898 4.052 4.194 4.385 4.503 4.625 4.803 4.969 5.12 5.259 5.394 5.566 5.719 5.855 6.015 6.181 6.341 6.509 6.68 6.844 7.013 7.186 7.378 7.568 7.749 7.946 8.152 8.368 8.546 8.675 8.774 8.769 8.571 8.038 7.186 6.356 5.614 4.949 4.349 3.836 3.374 2.969 2.555 2.223 1.935 1.648 1.376 1.126 0.905 0.672 0.462 0.282 0.095 -0.102 -0.275 -0.453 -0.626 -0.761 -0.896 -1.03 -1.174 -1.327 -1.437 -1.55 -1.723 -1.84 -1.962 -2.027 -2.165 -2.3 -2.432 -2.507 -2.682 -2.767 -2.86 -2.958 -3.178 -3.297 -3.41 -3.541 -3.709 -3.898 -4.1 -4.587 -4 ,809 ,TETRA ,17556807,Fri Nov 26 08:35:41 CET,Fri Nov 26 10:29:06 CET,0.0 1.217 1.544 1.829 2.049 2.219 2.367 2.495 2.719 2.833 2.939 3.032 3.196 3.273 3.422 3.57 3.706 3.767 3.889 4.01 4.182 4.283 4.384 4.534 4.672 4.8 4.915 5.019 5.149 5.278 5.411 5.567 5.7 5.828 5.975 6.141 6.291 6.434 6.591 6.755 6.9 7.053 7.219 7.367 7.542 7.681 7.763 7.796 7.798 7.658 7.134 6.311 5.542 4.847 4.2 3.638 3.149 2.665 2.266 1.895 1.542 1.23 0.957 0.692 0.444 0.229 0.0 -0.212 -0.392 -0.584 -0.774 -0.94 -1.123 -1.3 -1.439 -1.584 -1.743 -1.912 -2.105 -2.231 -2.341 -2.523 -2.651 -2.786 -2.858 -2.996 -3.134 -3.28 -3.357 -3.529 -3.614 -3.709 -3.804 -4.004 -4.125 -4.252 -4.379 -4.52 -4.683 -4.951 -5.851 -5 ,160 ,TETRA ,17556808,Fri Nov 26 08:35:41 CET,Fri Nov 26 10:29:48 CET,0.0 1.018 1.337 1.584 1.789 1.971 2.12 2.253 2.502 2.612 2.708 2.812 2.986 3.068 3.227 3.388 3.527 3.593 3.723 3.841 4.016 4.132 4.24 4.388 4.53 4.668 4.809 4.94 5.107 5.278 5.426 5.586 5.736 5.872 6.024 6.198 6.367 6.545 6.717 6.897 7.092 7.289 7.49 7.673 7.854 8.038 8.218 8.353 8.393 8.229 7.676 6.826 6.029 5.304 4.655 4.04 3.478 2.976 2.564 2.15 1.782 1.454 1.122 0.792 0.488 0.223 -0.059 -0.312 -0.514 -0.722 -0.956 -1.17 -1.377 -1.581 -1.746 -1.92 -2.104 -2.301 -2.489 -2.616 -2.76 -2.986 -3.131 -3.27 -3.345 -3.502 -3.65 -3.793 -3.866 -4.033 -4.122 -4.232 -4.348 -4.561 -4.676 -4.793 -4.919 -5.075 -5.272 -5.504 -5.989 -6 ,31179 ,TETRA ,17556809,Fri Nov 26 08:36:42 CET,Fri Nov 26 10:29:33 CET,0.0 1.092 1.458 1.728 1.952 2.138 2.277 2.402 2.633 2.748 2.87 3.012 3.188 3.27 3.425 3.569 3.703 3.767 3.885 3.998 4.163 4.264 4.362 4.5 4.633 4.759 4.871 4.98 5.118 5.241 5.359 5.505 5.648 5.785 5.941 6.111 6.265 6.44 6.631 6.806 6.977 7.162 7.358 7.536 7.744 7.948 8.112 8.238 8.263 8.072 7.556 6.707 5.836 5.052 4.35 3.719 3.186 2.715 2.293 1.847 1.477 1.155 0.836 0.533 0.257 0.007 -0.252 -0.485 -0.695 -0.898 -1.091 -1.26 -1.428 -1.589 -1.715 -1.851 -1.995 -2.135 -2.289 -2.401 -2.516 -2.698 -2.818 -2.944 -3.012 -3.146 -3.287 -3.447 -3.531 -3.711 -3.81 -3.908 -4.015 -4.218 -4.319 -4.457 -4.609 -4.758 -4.958 -5.231 -6.035 -7 ,7054 ,TETRA ,17556810,Fri Nov 26 08:36:42 CET,Fri Nov 26 10:29:28 CET,0.0 0.874 1.183 1.415 1.62 1.789 1.936 2.073 2.313 2.425 2.53 2.626 2.797 2.891 3.063 3.205 3.344 3.413 3.551 3.676 3.845 3.949 4.053 4.206 4.337 4.452 4.569 4.687 4.834 4.961 5.075 5.225 5.366 5.496 5.651 5.82 5.986 6.187 6.381 6.56 6.735 6.918 7.128 7.32 7.514 7.684 7.825 7.916 7.907 7.744 7.232 6.391 5.629 4.924 4.25 3.615 3.085 2.62 2.203 1.775 1.402 1.066 0.743 0.449 0.194 -0.054 -0.331 -0.564 -0.753 -0.977 -1.216 -1.408 -1.622 -1.838 -2.006 -2.183 -2.368 -2.557 -2.741 -2.87 -3.005 -3.203 -3.332 -3.474 -3.55 -3.712 -3.879 -4.062 -4.169 -4.37 -4.497 -4.609 -4.731 -5.017 -5.187 -5.365 -5.556 -5.749 -5.975 -6.213 -6.761 -8 ,9641 ,TETRA ,17556811,Fri Nov 26 08:36:42 CET,Fri Nov 26 10:11:26 CET,0.0 1.161 1.526 1.764 1.973 2.161 2.321 2.46 2.706 2.819 2.924 3.04 3.214 3.303 3.469 3.63 3.791 3.867 4.012 4.156 4.366 4.498 4.618 4.785 4.947 5.101 5.243 5.369 5.526 5.691 5.851 6.028 6.183 6.328 6.492 6.684 6.852 7.019 7.214 7.4 7.585 7.792 8.023 8.209 8.376 8.546 8.71 8.821 8.86 8.727 8.218 7.392 6.599 5.855 5.172 4.528 3.951 3.451 3.026 2.612 2.247 1.916 1.616 1.338 1.07 0.83 0.561 0.305 0.1 -0.115 -0.334 -0.525 -0.721 -0.906 -1.045 -1.184 -1.327 -1.475 -1.634 -1.745 -1.848 -2.012 -2.134 -2.259 -2.32 -2.467 -2.628 -2.784 -2.859 -3.026 -3.111 -3.204 -3.303 -3.527 -3.658 -3.791 -3.925 -4.09 -4.287 -4.517 -4.926 -9 ,21638 ,TETRA ,17556812,Fri Nov 26 08:36:42 CET,Fri Nov 26 10:29:34 CET,0.0 1.32 1.706 2.003 2.221 2.394 2.563 2.71 2.952 3.064 3.168 3.281 3.448 3.531 3.696 3.858 4.009 4.074 4.197 4.316 4.493 4.605 4.7 4.831 4.964 5.092 5.217 5.332 5.468 5.608 5.76 5.936 6.101 6.259 6.435 6.619 6.783 6.966 7.172 7.362 7.527 7.722 7.941 8.132 8.344 8.536 8.699 8.819 8.836 8.694 8.118 7.139 6.287 5.537 4.863 4.245 3.724 3.272 2.851 2.406 2.017 1.685 1.363 1.046 0.769 0.518 0.254 0.026 -0.169 -0.381 -0.603 -0.781 -0.962 -1.148 -1.298 -1.453 -1.605 -1.751 -1.898 -2.004 -2.112 -2.286 -2.409 -2.535 -2.598 -2.726 -2.874 -3.063 -3.153 -3.312 -3.378 -3.467 -3.547 -3.717 -3.815 -3.935 -4.089 -4.242 -4.422 -4.674 -5.374 -10 ,12829 ,TETRA ,17556813,Fri Nov 26 08:36:41 CET,Fri Nov 26 10:29:05 CET,0.0 1.228 1.575 1.823 2.038 2.215 2.372 2.519 2.773 2.885 2.99 3.105 3.283 3.375 3.545 3.7 3.839 3.903 4.035 4.165 4.347 4.459 4.568 4.725 4.866 5.002 5.141 5.279 5.434 5.569 5.719 5.9 6.062 6.219 6.394 6.576 6.74 6.903 7.063 7.231 7.39 7.564 7.781 7.983 8.172 8.356 8.509 8.601 8.643 8.5 7.955 7.096 6.271 5.473 4.769 4.156 3.613 3.121 2.672 2.203 1.812 1.46 1.123 0.814 0.535 0.283 0.025 -0.215 -0.426 -0.646 -0.876 -1.062 -1.258 -1.471 -1.647 -1.831 -2.007 -2.186 -2.38 -2.505 -2.632 -2.843 -2.992 -3.15 -3.228 -3.376 -3.527 -3.685 -3.77 -3.947 -4.013 -4.089 -4.173 -4.395 -4.538 -4.698 -4.891 -5.094 -5.259 -5.437 -5.994 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_35_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_35_19.txt deleted file mode 100644 index d3284373..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_35_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12788 ,KEBNE ,17070020,Fri Dec 24 15:59:09 CET,Fri Dec 24 17:35:01 CET,0.0 0.23 0.331 0.404 0.463 0.51 0.562 0.634 0.754 0.795 0.85 0.858 0.989 1.026 1.089 1.144 1.202 1.234 1.293 1.348 1.43 1.479 1.522 1.581 1.63 1.686 1.742 1.795 1.867 1.936 1.995 2.061 2.125 2.199 2.283 2.349 2.408 2.467 2.519 2.577 2.62 2.662 2.686 2.679 2.671 2.635 2.512 2.274 1.85 0.996 -0.551 -2.498 -4.166 -5.523 -6.662 -7.677 -8.563 -9.361 -10.047 -10.746 -11.354 -11.868 -12.349 -12.828 -13.272 -13.663 -14.079 -14.448 -14.762 -15.073 -15.383 -15.648 -15.921 -16.212 -16.449 -16.682 -16.921 -17.16 -17.41 -17.59 -17.782 -18.087 -18.287 -18.495 -18.605 -18.835 -19.071 -19.329 -19.471 -19.721 -19.917 -20.077 -20.23 -20.583 -20.791 -21.008 -21.237 -21.496 -21.805 -22.251 -23.682 -2 ,12793 ,KEBNE ,17070021,Fri Dec 24 16:01:14 CET,Fri Dec 24 17:38:26 CET,0.0 0.243 0.306 0.384 0.461 0.528 0.587 0.642 0.746 0.787 0.827 0.834 0.972 1.019 1.096 1.165 1.235 1.266 1.326 1.373 1.436 1.482 1.53 1.593 1.656 1.709 1.762 1.822 1.903 1.975 2.031 2.089 2.141 2.197 2.258 2.304 2.347 2.381 2.409 2.463 2.51 2.533 2.556 2.577 2.56 2.479 2.32 2.078 1.647 0.892 -0.57 -2.5 -4.148 -5.507 -6.667 -7.695 -8.575 -9.366 -10.052 -10.735 -11.319 -11.833 -12.297 -12.735 -13.153 -13.52 -13.893 -14.224 -14.503 -14.801 -15.122 -15.386 -15.634 -15.902 -16.131 -16.354 -16.563 -16.79 -17.042 -17.225 -17.422 -17.717 -17.906 -18.104 -18.21 -18.431 -18.668 -18.916 -19.044 -19.282 -19.471 -19.623 -19.772 -20.112 -20.303 -20.499 -20.733 -21.017 -21.352 -21.814 -23.539 -3 ,9589 ,KEBNE ,17070022,Fri Dec 24 16:05:31 CET,Fri Dec 24 17:40:43 CET,0.0 0.331 0.445 0.524 0.593 0.654 0.717 0.776 0.868 0.918 0.966 0.971 1.105 1.146 1.22 1.28 1.338 1.367 1.426 1.475 1.543 1.6 1.661 1.735 1.793 1.851 1.918 1.989 2.074 2.141 2.217 2.305 2.39 2.479 2.561 2.644 2.725 2.793 2.854 2.92 3.001 3.088 3.125 3.112 3.078 3.013 2.879 2.627 2.225 1.509 0.021 -1.847 -3.469 -4.865 -6.004 -7.02 -7.883 -8.647 -9.291 -9.938 -10.499 -10.976 -11.417 -11.852 -12.274 -12.638 -13.006 -13.348 -13.662 -13.974 -14.284 -14.557 -14.83 -15.118 -15.357 -15.598 -15.832 -16.08 -16.337 -16.504 -16.672 -16.942 -17.137 -17.338 -17.449 -17.677 -17.899 -18.116 -18.224 -18.438 -18.586 -18.714 -18.835 -19.097 -19.26 -19.454 -19.676 -19.882 -20.087 -20.443 -22.095 -4 ,11776 ,KEBNE ,17070023,Fri Dec 24 16:05:31 CET,Fri Dec 24 17:42:39 CET,0.0 0.306 0.448 0.57 0.656 0.712 0.769 0.833 0.947 1.007 1.066 1.085 1.238 1.297 1.412 1.521 1.607 1.646 1.716 1.786 1.883 1.947 2.01 2.087 2.168 2.261 2.361 2.451 2.552 2.64 2.73 2.847 2.956 3.051 3.152 3.252 3.336 3.431 3.508 3.576 3.66 3.748 3.816 3.849 3.859 3.832 3.719 3.493 3.139 2.438 1.019 -0.879 -2.52 -3.887 -5.009 -5.986 -6.842 -7.575 -8.221 -8.898 -9.466 -9.972 -10.455 -10.929 -11.376 -11.773 -12.163 -12.514 -12.825 -13.132 -13.452 -13.735 -14.033 -14.327 -14.539 -14.741 -14.954 -15.191 -15.441 -15.617 -15.794 -16.06 -16.258 -16.467 -16.574 -16.793 -17.029 -17.286 -17.415 -17.649 -17.808 -17.947 -18.109 -18.45 -18.636 -18.852 -19.093 -19.359 -19.677 -20.114 -21.616 -5 ,22959 ,KEBNE ,17070024,Fri Dec 24 16:09:46 CET,Fri Dec 24 17:46:53 CET,0.0 0.207 0.338 0.447 0.523 0.576 0.628 0.687 0.789 0.838 0.894 0.9 1.028 1.06 1.12 1.184 1.244 1.273 1.332 1.388 1.474 1.521 1.562 1.626 1.687 1.745 1.789 1.827 1.883 1.944 2.005 2.062 2.118 2.173 2.232 2.282 2.324 2.395 2.473 2.54 2.61 2.661 2.691 2.681 2.625 2.559 2.466 2.233 1.69 0.831 -0.587 -2.407 -3.962 -5.309 -6.494 -7.584 -8.5 -9.284 -9.952 -10.602 -11.155 -11.675 -12.177 -12.661 -13.118 -13.52 -13.926 -14.288 -14.61 -14.953 -15.305 -15.588 -15.889 -16.208 -16.446 -16.669 -16.89 -17.14 -17.404 -17.585 -17.772 -18.066 -18.263 -18.479 -18.591 -18.809 -19.057 -19.334 -19.472 -19.705 -19.886 -20.038 -20.2 -20.578 -20.782 -20.993 -21.217 -21.466 -21.768 -22.117 -23.062 -6 ,32302 ,KEBNE ,17070025,Fri Dec 24 16:10:53 CET,Fri Dec 24 17:45:56 CET,0.0 0.279 0.38 0.465 0.543 0.604 0.665 0.727 0.84 0.895 0.946 0.95 1.078 1.11 1.172 1.242 1.307 1.338 1.409 1.48 1.573 1.626 1.677 1.752 1.823 1.879 1.929 1.99 2.065 2.13 2.189 2.258 2.328 2.394 2.449 2.494 2.544 2.602 2.667 2.731 2.794 2.845 2.857 2.881 2.888 2.801 2.618 2.374 1.927 1.117 -0.274 -2.063 -3.642 -5.045 -6.264 -7.329 -8.244 -9.03 -9.669 -10.317 -10.907 -11.435 -11.94 -12.425 -12.845 -13.226 -13.625 -13.974 -14.289 -14.603 -14.936 -15.217 -15.509 -15.806 -16.049 -16.306 -16.551 -16.814 -17.087 -17.264 -17.443 -17.737 -17.94 -18.146 -18.261 -18.492 -18.714 -18.939 -19.061 -19.291 -19.472 -19.623 -19.783 -20.153 -20.363 -20.581 -20.806 -21.07 -21.391 -21.801 -23.114 -7 ,16389 ,KEBNE ,17070026,Fri Dec 24 16:10:51 CET,Fri Dec 24 17:48:52 CET,0.0 0.256 0.402 0.5 0.569 0.636 0.702 0.763 0.868 0.916 0.973 0.985 1.119 1.165 1.243 1.316 1.384 1.424 1.512 1.591 1.702 1.781 1.862 1.971 2.066 2.146 2.219 2.285 2.368 2.448 2.53 2.638 2.742 2.834 2.923 3.0 3.065 3.139 3.214 3.279 3.325 3.382 3.458 3.5 3.502 3.478 3.387 3.163 2.722 1.953 0.594 -1.247 -2.879 -4.25 -5.406 -6.434 -7.33 -8.126 -8.804 -9.496 -10.095 -10.629 -11.145 -11.616 -12.035 -12.416 -12.82 -13.194 -13.528 -13.861 -14.204 -14.483 -14.756 -15.026 -15.23 -15.439 -15.661 -15.895 -16.133 -16.299 -16.475 -16.756 -16.945 -17.145 -17.248 -17.444 -17.647 -17.865 -17.986 -18.226 -18.426 -18.581 -18.733 -19.091 -19.278 -19.46 -19.671 -19.922 -20.224 -20.643 -21.861 -8 ,29291 ,KEBNE ,17070027,Fri Dec 24 16:16:08 CET,Fri Dec 24 17:51:43 CET,0.0 0.294 0.382 0.467 0.549 0.632 0.721 0.822 0.999 1.063 1.136 1.203 1.356 1.413 1.52 1.618 1.7 1.739 1.823 1.903 2.009 2.071 2.128 2.201 2.276 2.355 2.426 2.488 2.568 2.644 2.709 2.774 2.845 2.917 2.997 3.088 3.175 3.265 3.352 3.431 3.491 3.535 3.568 3.57 3.522 3.4 3.229 2.99 2.587 1.875 0.463 -1.332 -2.775 -4.041 -5.189 -6.21 -7.079 -7.855 -8.535 -9.212 -9.792 -10.313 -10.795 -11.256 -11.679 -12.074 -12.494 -12.844 -13.115 -13.376 -13.675 -13.941 -14.22 -14.51 -14.723 -14.932 -15.139 -15.365 -15.604 -15.769 -15.946 -16.23 -16.425 -16.632 -16.738 -16.927 -17.127 -17.356 -17.477 -17.705 -17.868 -18.018 -18.175 -18.521 -18.716 -18.925 -19.149 -19.405 -19.696 -20.048 -21.157 -9 ,22494 ,KEBNE ,17070028,Fri Dec 24 16:19:20 CET,Fri Dec 24 17:54:39 CET,0.0 0.177 0.271 0.351 0.43 0.503 0.566 0.621 0.727 0.779 0.828 0.831 0.964 1.0 1.064 1.131 1.196 1.223 1.287 1.35 1.418 1.459 1.502 1.578 1.641 1.689 1.74 1.791 1.858 1.931 1.991 2.052 2.103 2.156 2.222 2.285 2.347 2.415 2.492 2.567 2.633 2.702 2.748 2.769 2.779 2.766 2.697 2.488 2.049 1.337 -0.016 -1.949 -3.602 -5.03 -6.224 -7.241 -8.108 -8.885 -9.534 -10.166 -10.719 -11.21 -11.684 -12.152 -12.587 -12.966 -13.361 -13.71 -14.008 -14.31 -14.611 -14.869 -15.15 -15.446 -15.673 -15.898 -16.12 -16.348 -16.588 -16.758 -16.926 -17.186 -17.386 -17.6 -17.708 -17.929 -18.155 -18.401 -18.534 -18.779 -18.959 -19.097 -19.229 -19.542 -19.724 -19.933 -20.184 -20.435 -20.74 -21.187 -23.141 -10 ,8453 ,KEBNE ,17070029,Fri Dec 24 16:20:25 CET,Fri Dec 24 17:58:13 CET,0.0 0.254 0.363 0.462 0.539 0.621 0.687 0.748 0.856 0.904 0.953 0.962 1.098 1.142 1.229 1.309 1.376 1.406 1.463 1.518 1.6 1.65 1.704 1.796 1.877 1.932 1.995 2.056 2.124 2.199 2.264 2.331 2.399 2.477 2.548 2.62 2.701 2.778 2.854 2.942 3.018 3.072 3.151 3.219 3.261 3.262 3.159 2.936 2.509 1.719 0.296 -1.53 -3.143 -4.512 -5.639 -6.619 -7.444 -8.218 -8.914 -9.561 -10.113 -10.638 -11.146 -11.615 -12.041 -12.415 -12.802 -13.132 -13.427 -13.738 -14.043 -14.301 -14.557 -14.817 -15.016 -15.222 -15.438 -15.681 -15.943 -16.115 -16.295 -16.572 -16.771 -16.99 -17.1 -17.318 -17.541 -17.77 -17.896 -18.14 -18.328 -18.48 -18.629 -18.969 -19.168 -19.39 -19.613 -19.864 -20.182 -20.598 -22.148 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_35_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_35_44.txt deleted file mode 100644 index cccfee44..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_35_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12081 ,KEBNE ,17025450,Wed Dec 22 12:39:41 CET,Wed Dec 22 14:16:51 CET,0.0 1.146 1.505 1.77 1.984 2.175 2.347 2.512 2.794 2.921 3.053 3.225 3.442 3.561 3.768 3.963 4.159 4.249 4.424 4.607 4.874 5.033 5.184 5.409 5.628 5.847 6.052 6.252 6.519 6.766 7.015 7.324 7.616 7.901 8.228 8.594 8.938 9.315 9.735 10.178 10.648 11.22 11.876 12.493 13.202 14.018 14.987 16.04 17.185 18.397 19.68 20.323 20.286 20.089 19.885 19.594 19.324 19.063 18.773 18.443 18.144 17.843 17.533 17.251 16.989 16.754 16.485 16.201 15.958 15.73 15.499 15.295 15.069 14.834 14.661 14.489 14.302 14.109 13.91 13.76 13.601 13.36 13.175 12.976 12.879 12.674 12.461 12.229 12.1 11.89 11.663 11.502 11.334 10.992 10.801 10.561 10.275 9.946 9.525 8.989 6.729 -2 ,4827 ,KEBNE ,17025451,Wed Dec 22 12:39:41 CET,Wed Dec 22 14:15:06 CET,0.0 0.605 0.866 1.066 1.227 1.38 1.528 1.679 1.952 2.073 2.19 2.307 2.49 2.587 2.791 2.99 3.175 3.263 3.44 3.617 3.874 4.033 4.182 4.402 4.626 4.837 5.04 5.24 5.49 5.751 6.018 6.336 6.627 6.908 7.268 7.684 8.068 8.479 8.925 9.391 9.865 10.417 11.05 11.672 12.413 13.228 14.13 15.113 16.239 17.442 18.608 19.185 19.168 19.064 18.876 18.519 18.15 17.824 17.5 17.104 16.751 16.445 16.144 15.86 15.583 15.312 15.039 14.779 14.536 14.287 14.026 13.811 13.571 13.317 13.121 12.922 12.716 12.503 12.269 12.12 11.971 11.733 11.561 11.358 11.255 11.029 10.771 10.517 10.4 10.197 9.984 9.823 9.642 9.287 9.081 8.816 8.529 8.222 7.825 7.311 5.3 -3 ,26936 ,KEBNE ,17025452,Wed Dec 22 12:39:40 CET,Wed Dec 22 14:15:28 CET,0.0 0.968 1.248 1.458 1.669 1.866 2.04 2.201 2.484 2.617 2.751 2.915 3.12 3.223 3.429 3.624 3.83 3.937 4.132 4.313 4.588 4.767 4.94 5.195 5.437 5.673 5.911 6.133 6.401 6.668 6.934 7.252 7.561 7.858 8.208 8.599 8.971 9.371 9.81 10.317 10.867 11.45 12.07 12.703 13.464 14.256 15.134 16.175 17.338 18.619 19.968 20.708 20.754 20.518 20.242 19.909 19.6 19.273 18.905 18.497 18.136 17.8 17.498 17.207 16.91 16.652 16.384 16.124 15.88 15.628 15.363 15.133 14.888 14.651 14.478 14.296 14.086 13.858 13.641 13.492 13.318 13.04 12.849 12.639 12.537 12.329 12.109 11.878 11.75 11.539 11.328 11.162 10.965 10.572 10.36 10.114 9.784 9.396 9.004 8.44 5.307 -4 ,3160 ,KEBNE ,17025453,Wed Dec 22 12:40:42 CET,Wed Dec 22 14:17:44 CET,0.0 1.429 1.737 1.971 2.178 2.356 2.507 2.644 2.892 3.024 3.157 3.308 3.506 3.611 3.83 4.044 4.244 4.336 4.515 4.691 4.947 5.117 5.274 5.496 5.709 5.923 6.138 6.345 6.625 6.902 7.173 7.501 7.809 8.119 8.48 8.873 9.265 9.687 10.124 10.607 11.118 11.668 12.343 13.041 13.869 14.793 15.717 16.715 17.916 19.217 20.473 21.104 21.162 20.959 20.661 20.323 19.981 19.626 19.306 18.947 18.599 18.302 18.026 17.74 17.458 17.196 16.916 16.672 16.451 16.204 15.952 15.748 15.524 15.283 15.094 14.888 14.67 14.452 14.227 14.07 13.902 13.622 13.431 13.241 13.143 12.93 12.697 12.438 12.303 12.095 11.882 11.718 11.548 11.174 10.96 10.738 10.492 10.192 9.818 9.347 6.959 -5 ,21963 ,KEBNE ,17025454,Wed Dec 22 12:40:42 CET,Wed Dec 22 14:17:56 CET,0.0 1.106 1.458 1.726 1.955 2.162 2.364 2.537 2.803 2.933 3.064 3.225 3.434 3.543 3.739 3.927 4.127 4.235 4.426 4.594 4.844 5.005 5.172 5.428 5.667 5.905 6.126 6.331 6.607 6.865 7.112 7.414 7.702 7.994 8.34 8.727 9.105 9.516 9.94 10.376 10.844 11.402 12.079 12.751 13.514 14.348 15.298 16.345 17.511 18.748 20.057 20.836 20.994 20.797 20.541 20.258 19.937 19.612 19.292 18.937 18.632 18.336 18.013 17.692 17.404 17.168 16.903 16.652 16.44 16.216 15.965 15.753 15.53 15.296 15.1 14.889 14.689 14.484 14.266 14.115 13.955 13.694 13.518 13.334 13.232 13.028 12.827 12.612 12.498 12.285 12.043 11.884 11.703 11.307 11.062 10.789 10.514 10.187 9.743 9.028 5.986 -6 ,13736 ,KEBNE ,17025455,Wed Dec 22 12:40:42 CET,Wed Dec 22 14:17:42 CET,0.0 0.96 1.301 1.577 1.793 1.975 2.138 2.298 2.598 2.737 2.874 3.032 3.233 3.343 3.548 3.754 3.958 4.058 4.268 4.484 4.784 4.972 5.15 5.405 5.653 5.887 6.112 6.327 6.614 6.905 7.175 7.49 7.805 8.111 8.462 8.855 9.236 9.67 10.13 10.619 11.143 11.726 12.412 13.101 13.851 14.659 15.602 16.651 17.894 19.277 20.635 21.47 21.642 21.491 21.204 20.875 20.533 20.165 19.836 19.467 19.159 18.866 18.561 18.264 17.965 17.682 17.378 17.122 16.907 16.675 16.434 16.229 15.99 15.743 15.555 15.34 15.113 14.881 14.633 14.449 14.25 13.949 13.738 13.52 13.409 13.179 12.947 12.694 12.55 12.328 12.108 11.941 11.766 11.393 11.181 10.912 10.626 10.335 9.983 9.458 5.981 -7 ,8262 ,KEBNE ,17025456,Wed Dec 22 12:40:42 CET,Wed Dec 22 14:16:43 CET,0.0 1.095 1.435 1.663 1.888 2.112 2.299 2.455 2.74 2.876 3.006 3.163 3.368 3.476 3.69 3.893 4.077 4.174 4.373 4.557 4.813 4.982 5.147 5.392 5.629 5.847 6.06 6.265 6.524 6.794 7.06 7.372 7.681 7.979 8.313 8.689 9.057 9.44 9.845 10.311 10.818 11.383 12.039 12.712 13.5 14.368 15.349 16.399 17.595 18.878 20.13 20.849 20.912 20.757 20.517 20.221 19.914 19.621 19.317 18.971 18.632 18.302 18.008 17.732 17.464 17.196 16.891 16.608 16.378 16.153 15.897 15.67 15.446 15.209 15.026 14.843 14.636 14.424 14.202 14.043 13.876 13.616 13.433 13.236 13.129 12.912 12.69 12.432 12.291 12.071 11.843 11.677 11.507 11.151 10.938 10.692 10.42 10.101 9.736 9.263 6.643 -8 ,14691 ,KEBNE ,17025457,Wed Dec 22 12:40:42 CET,Wed Dec 22 14:17:54 CET,0.0 0.784 1.078 1.322 1.524 1.687 1.853 2.0 2.266 2.391 2.501 2.632 2.826 2.923 3.118 3.305 3.477 3.561 3.725 3.889 4.142 4.307 4.464 4.69 4.917 5.152 5.377 5.581 5.849 6.136 6.403 6.706 7.003 7.301 7.64 8.001 8.36 8.754 9.176 9.618 10.104 10.674 11.317 11.927 12.658 13.499 14.406 15.396 16.575 17.888 19.078 19.667 19.813 19.734 19.501 19.195 18.913 18.597 18.266 17.932 17.634 17.349 17.049 16.765 16.494 16.225 15.939 15.688 15.464 15.22 14.969 14.756 14.524 14.268 14.066 13.859 13.639 13.405 13.168 13.009 12.856 12.638 12.474 12.275 12.169 11.955 11.728 11.493 11.372 11.16 10.923 10.76 10.588 10.211 10.004 9.774 9.492 9.133 8.613 7.915 5.407 -9 ,25849 ,KEBNE ,17025459,Wed Dec 22 12:41:46 CET,Wed Dec 22 14:11:31 CET,0.0 0.979 1.333 1.61 1.841 2.018 2.169 2.308 2.559 2.68 2.801 2.963 3.171 3.279 3.475 3.654 3.822 3.907 4.092 4.272 4.526 4.689 4.849 5.073 5.278 5.478 5.671 5.858 6.13 6.413 6.677 6.973 7.252 7.524 7.838 8.198 8.553 8.937 9.359 9.831 10.334 10.902 11.582 12.255 13.012 13.887 14.888 15.942 17.038 18.114 19.286 19.908 20.024 19.86 19.538 19.227 18.912 18.569 18.26 17.92 17.584 17.295 17.037 16.781 16.505 16.259 16.029 15.795 15.576 15.341 15.091 14.89 14.654 14.411 14.253 14.065 13.841 13.616 13.396 13.246 13.085 12.819 12.63 12.437 12.336 12.123 11.899 11.668 11.531 11.318 11.117 10.974 10.818 10.461 10.262 10.06 9.826 9.541 9.174 8.611 5.919 -10 ,11609 ,KEBNE ,17025460,Wed Dec 22 12:41:48 CET,Wed Dec 22 14:10:00 CET,0.0 0.93 1.204 1.47 1.718 1.911 2.073 2.24 2.527 2.658 2.795 2.963 3.171 3.279 3.476 3.676 3.879 3.975 4.162 4.341 4.596 4.758 4.913 5.137 5.349 5.562 5.782 6.01 6.303 6.572 6.827 7.145 7.446 7.728 8.082 8.495 8.868 9.274 9.72 10.197 10.702 11.275 11.949 12.586 13.295 14.091 15.029 16.037 17.174 18.425 19.721 20.432 20.6 20.499 20.226 19.88 19.559 19.275 18.984 18.647 18.329 18.06 17.828 17.582 17.314 17.058 16.789 16.546 16.332 16.101 15.844 15.625 15.406 15.18 14.998 14.82 14.637 14.429 14.198 14.037 13.86 13.581 13.383 13.171 13.071 12.865 12.646 12.418 12.305 12.107 11.88 11.717 11.552 11.205 11.002 10.754 10.491 10.189 9.835 9.278 5.927 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_36_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_36_35.txt deleted file mode 100644 index 1fe6179e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_36_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15086 ,TETRA ,17556814,Fri Nov 26 08:36:43 CET,Fri Nov 26 10:29:27 CET,0.0 0.293 0.439 0.575 0.695 0.789 0.884 0.971 1.143 1.229 1.3 1.347 1.504 1.568 1.707 1.832 1.946 2.008 2.134 2.253 2.419 2.519 2.607 2.739 2.88 3.021 3.156 3.29 3.461 3.618 3.776 3.966 4.144 4.31 4.496 4.716 4.931 5.167 5.406 5.661 5.955 6.316 6.698 7.059 7.511 7.993 8.492 9.006 9.576 10.098 10.48 10.474 10.102 9.639 9.147 8.663 8.233 7.826 7.425 6.985 6.596 6.249 5.924 5.625 5.341 5.055 4.751 4.483 4.233 3.977 3.728 3.5 3.243 2.96 2.754 2.558 2.359 2.165 1.967 1.823 1.657 1.405 1.244 1.078 0.994 0.831 0.647 0.429 0.311 0.1 -0.064 -0.206 -0.346 -0.632 -0.809 -1.014 -1.259 -1.527 -1.791 -2.156 -3.13 -2 ,30553 ,TETRA ,17556815,Fri Nov 26 08:36:42 CET,Fri Nov 26 10:29:38 CET,0.0 0.262 0.389 0.538 0.679 0.805 0.917 1.015 1.182 1.256 1.33 1.384 1.535 1.599 1.718 1.835 1.948 2.008 2.129 2.238 2.388 2.487 2.587 2.723 2.857 2.984 3.108 3.238 3.397 3.545 3.688 3.872 4.046 4.203 4.38 4.587 4.792 5.013 5.234 5.469 5.722 6.011 6.343 6.677 7.071 7.484 7.957 8.505 9.069 9.583 9.971 9.815 9.427 9.006 8.554 8.129 7.695 7.256 6.874 6.488 6.137 5.812 5.498 5.184 4.89 4.628 4.347 4.095 3.865 3.609 3.353 3.135 2.88 2.62 2.446 2.272 2.076 1.844 1.595 1.426 1.246 0.986 0.821 0.659 0.577 0.397 0.201 -0.012 -0.122 -0.32 -0.458 -0.569 -0.686 -0.945 -1.108 -1.291 -1.487 -1.71 -1.954 -2.267 -3.245 -3 ,23170 ,TETRA ,17556816,Fri Nov 26 08:36:41 CET,Fri Nov 26 10:30:18 CET,0.0 0.328 0.518 0.699 0.868 1.04 1.208 1.364 1.645 1.78 1.895 2.024 2.205 2.297 2.484 2.656 2.825 2.913 3.076 3.219 3.437 3.579 3.71 3.885 4.038 4.198 4.349 4.487 4.678 4.881 5.07 5.281 5.485 5.683 5.915 6.173 6.43 6.706 6.985 7.268 7.558 7.887 8.281 8.686 9.148 9.663 10.211 10.782 11.377 11.911 12.297 12.191 11.875 11.529 11.126 10.672 10.211 9.789 9.41 8.994 8.622 8.29 7.98 7.672 7.366 7.067 6.76 6.485 6.249 6.023 5.779 5.561 5.338 5.11 4.92 4.719 4.513 4.306 4.105 3.953 3.783 3.532 3.356 3.155 3.059 2.868 2.652 2.43 2.316 2.113 1.955 1.81 1.652 1.314 1.124 0.914 0.67 0.416 0.118 -0.297 -1.812 -4 ,29290 ,TETRA ,17556817,Fri Nov 26 08:36:41 CET,Fri Nov 26 10:29:24 CET,0.0 0.236 0.409 0.556 0.679 0.786 0.878 0.961 1.125 1.211 1.291 1.349 1.508 1.574 1.701 1.831 1.951 2.004 2.109 2.213 2.362 2.456 2.552 2.703 2.848 2.981 3.105 3.229 3.397 3.558 3.722 3.934 4.132 4.321 4.541 4.781 5.019 5.291 5.577 5.87 6.182 6.535 6.923 7.282 7.701 8.148 8.613 9.09 9.598 10.111 10.522 10.423 10.03 9.513 9.043 8.617 8.162 7.753 7.392 6.98 6.577 6.228 5.91 5.594 5.276 4.967 4.649 4.374 4.139 3.884 3.597 3.346 3.098 2.837 2.63 2.423 2.191 1.953 1.72 1.545 1.37 1.093 0.894 0.71 0.61 0.381 0.14 -0.109 -0.239 -0.458 -0.664 -0.826 -0.975 -1.287 -1.459 -1.634 -1.837 -2.07 -2.309 -2.609 -3.979 -5 ,6953 ,TETRA ,17556818,Fri Nov 26 08:36:41 CET,Fri Nov 26 10:30:54 CET,0.0 0.437 0.608 0.748 0.889 1.031 1.157 1.254 1.438 1.532 1.621 1.693 1.849 1.917 2.057 2.182 2.306 2.367 2.481 2.593 2.754 2.857 2.96 3.11 3.25 3.395 3.541 3.674 3.837 3.985 4.127 4.319 4.516 4.711 4.944 5.198 5.435 5.698 5.972 6.25 6.56 6.923 7.332 7.719 8.136 8.567 9.052 9.6 10.193 10.777 11.263 11.232 10.895 10.454 9.987 9.503 9.055 8.654 8.284 7.854 7.439 7.097 6.786 6.477 6.173 5.885 5.604 5.355 5.129 4.883 4.618 4.406 4.191 3.983 3.822 3.635 3.436 3.245 3.055 2.911 2.765 2.527 2.341 2.158 2.067 1.864 1.654 1.437 1.314 1.097 0.942 0.817 0.685 0.414 0.27 0.119 -0.054 -0.256 -0.492 -0.792 -1.887 -6 ,21196 ,TETRA ,17556819,Fri Nov 26 08:36:41 CET,Fri Nov 26 10:29:35 CET,0.0 0.433 0.6 0.712 0.813 0.915 1.023 1.126 1.314 1.405 1.501 1.588 1.743 1.813 1.963 2.094 2.217 2.277 2.39 2.503 2.672 2.78 2.883 3.034 3.164 3.288 3.41 3.521 3.679 3.849 4.01 4.199 4.393 4.581 4.805 5.059 5.296 5.562 5.85 6.12 6.398 6.741 7.147 7.528 7.973 8.462 8.968 9.503 10.048 10.55 10.915 10.83 10.524 10.137 9.673 9.179 8.737 8.314 7.918 7.54 7.22 6.903 6.592 6.279 5.965 5.676 5.361 5.079 4.832 4.582 4.33 4.113 3.887 3.664 3.484 3.269 3.031 2.782 2.541 2.374 2.201 1.956 1.787 1.614 1.53 1.353 1.141 0.905 0.795 0.604 0.46 0.336 0.205 -0.104 -0.271 -0.453 -0.66 -0.896 -1.172 -1.52 -3.0 -7 ,21411 ,TETRA ,17556820,Fri Nov 26 08:36:42 CET,Fri Nov 26 10:29:43 CET,0.0 0.254 0.451 0.611 0.742 0.853 0.963 1.068 1.26 1.358 1.449 1.524 1.684 1.753 1.893 2.039 2.172 2.236 2.36 2.478 2.662 2.79 2.921 3.093 3.247 3.405 3.566 3.721 3.906 4.084 4.262 4.48 4.692 4.907 5.142 5.376 5.607 5.861 6.139 6.451 6.764 7.096 7.479 7.872 8.325 8.818 9.36 9.912 10.481 11.012 11.406 11.297 10.875 10.435 10.03 9.556 9.066 8.626 8.239 7.848 7.499 7.174 6.845 6.527 6.248 6.005 5.741 5.476 5.236 4.997 4.736 4.516 4.299 4.08 3.908 3.72 3.537 3.361 3.182 3.055 2.909 2.655 2.487 2.323 2.24 2.077 1.891 1.688 1.579 1.367 1.209 1.079 0.938 0.638 0.489 0.316 0.112 -0.104 -0.377 -0.74 -1.698 -8 ,31208 ,TETRA ,17556821,Fri Nov 26 08:36:42 CET,Fri Nov 26 10:29:39 CET,0.0 0.567 0.829 1.04 1.201 1.332 1.45 1.566 1.773 1.865 1.95 2.021 2.183 2.256 2.398 2.527 2.648 2.705 2.824 2.957 3.143 3.255 3.357 3.508 3.66 3.8 3.929 4.059 4.22 4.373 4.533 4.733 4.921 5.1 5.318 5.57 5.812 6.073 6.333 6.616 6.929 7.275 7.672 8.078 8.545 9.014 9.493 10.011 10.566 11.115 11.598 11.603 11.285 10.878 10.375 9.85 9.366 8.857 8.378 7.889 7.475 7.122 6.782 6.459 6.162 5.891 5.588 5.286 5.029 4.751 4.473 4.256 4.019 3.761 3.548 3.328 3.106 2.879 2.645 2.488 2.32 2.039 1.843 1.652 1.558 1.372 1.18 0.966 0.857 0.663 0.528 0.392 0.242 -0.069 -0.237 -0.415 -0.617 -0.863 -1.137 -1.494 -2.767 -9 ,19866 ,TETRA ,17556822,Fri Nov 26 08:36:44 CET,Fri Nov 26 10:19:18 CET,0.0 0.428 0.621 0.768 0.902 1.028 1.135 1.228 1.399 1.475 1.55 1.607 1.76 1.827 1.955 2.09 2.217 2.276 2.401 2.518 2.668 2.761 2.86 3.0 3.126 3.258 3.391 3.517 3.684 3.834 3.97 4.145 4.313 4.47 4.677 4.931 5.158 5.392 5.651 5.936 6.245 6.585 6.959 7.305 7.686 8.115 8.6 9.094 9.594 10.088 10.527 10.565 10.255 9.879 9.473 9.061 8.667 8.25 7.869 7.482 7.139 6.829 6.532 6.274 6.03 5.81 5.577 5.348 5.151 4.936 4.693 4.501 4.299 4.093 3.938 3.764 3.578 3.382 3.164 3.005 2.834 2.569 2.388 2.207 2.114 1.93 1.743 1.534 1.423 1.215 1.044 0.907 0.77 0.492 0.311 0.122 -0.045 -0.26 -0.533 -0.833 -2.171 -10 ,19558 ,TETRA ,17556823,Fri Nov 26 08:37:40 CET,Fri Nov 26 10:30:53 CET,0.0 0.344 0.516 0.678 0.808 0.913 1.016 1.117 1.294 1.379 1.465 1.53 1.685 1.749 1.891 2.024 2.144 2.202 2.303 2.4 2.538 2.636 2.738 2.896 3.054 3.208 3.361 3.518 3.72 3.91 4.09 4.308 4.521 4.717 4.94 5.196 5.446 5.721 5.998 6.292 6.605 6.946 7.343 7.733 8.19 8.656 9.061 9.465 9.908 10.27 10.546 10.459 10.123 9.769 9.343 8.887 8.471 8.087 7.709 7.28 6.885 6.536 6.23 5.923 5.613 5.339 5.047 4.793 4.546 4.252 3.982 3.77 3.537 3.29 3.104 2.909 2.71 2.529 2.342 2.197 2.051 1.822 1.655 1.459 1.359 1.163 0.953 0.728 0.607 0.391 0.211 0.07 -0.083 -0.436 -0.616 -0.803 -1.006 -1.23 -1.489 -1.898 -3.295 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_36_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_36_37.txt deleted file mode 100644 index 7c0adcb3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_36_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31297 ,TETRA ,17556824,Fri Nov 26 08:37:41 CET,Fri Nov 26 10:30:46 CET,0.0 1.154 1.499 1.753 1.949 2.123 2.265 2.396 2.667 2.796 2.908 3.028 3.21 3.29 3.45 3.61 3.753 3.823 3.961 4.087 4.261 4.378 4.493 4.662 4.823 4.966 5.106 5.238 5.393 5.531 5.661 5.825 5.982 6.125 6.276 6.431 6.578 6.745 6.913 7.102 7.297 7.512 7.766 7.975 8.189 8.425 8.679 8.88 8.971 8.922 8.555 7.823 7.101 6.406 5.733 5.155 4.647 4.148 3.705 3.247 2.852 2.486 2.144 1.807 1.463 1.184 0.924 0.683 0.485 0.293 0.082 -0.101 -0.289 -0.476 -0.621 -0.791 -0.981 -1.173 -1.366 -1.498 -1.623 -1.822 -1.984 -2.148 -2.224 -2.378 -2.539 -2.694 -2.766 -2.927 -3.007 -3.117 -3.247 -3.531 -3.675 -3.812 -3.976 -4.192 -4.415 -4.684 -5.177 -2 ,13685 ,TETRA ,17556825,Fri Nov 26 08:37:40 CET,Fri Nov 26 10:31:45 CET,0.0 1.535 1.885 2.145 2.344 2.526 2.697 2.847 3.12 3.241 3.342 3.439 3.618 3.708 3.883 4.045 4.183 4.249 4.38 4.504 4.705 4.832 4.943 5.109 5.26 5.394 5.522 5.639 5.783 5.923 6.058 6.224 6.371 6.508 6.672 6.837 6.995 7.176 7.355 7.538 7.718 7.909 8.158 8.419 8.684 8.94 9.194 9.411 9.535 9.437 8.986 8.197 7.421 6.71 6.022 5.381 4.831 4.342 3.92 3.478 3.087 2.74 2.418 2.113 1.805 1.495 1.173 0.902 0.68 0.448 0.196 -0.012 -0.226 -0.464 -0.651 -0.848 -1.069 -1.291 -1.522 -1.681 -1.831 -2.067 -2.233 -2.407 -2.504 -2.709 -2.931 -3.159 -3.273 -3.483 -3.635 -3.75 -3.864 -4.124 -4.279 -4.469 -4.681 -4.89 -5.108 -5.378 -6.04 -3 ,27303 ,TETRA ,17556826,Fri Nov 26 08:37:40 CET,Fri Nov 26 10:30:53 CET,0.0 1.56 1.929 2.214 2.429 2.614 2.783 2.932 3.182 3.287 3.387 3.491 3.672 3.764 3.946 4.119 4.286 4.363 4.497 4.617 4.793 4.91 5.018 5.167 5.304 5.441 5.575 5.706 5.88 6.032 6.167 6.325 6.476 6.63 6.803 6.978 7.141 7.33 7.524 7.695 7.895 8.122 8.34 8.542 8.757 8.981 9.179 9.328 9.401 9.302 8.851 8.049 7.281 6.578 5.953 5.371 4.832 4.28 3.807 3.381 3.03 2.705 2.391 2.106 1.833 1.577 1.303 1.059 0.863 0.658 0.451 0.287 0.097 -0.112 -0.268 -0.443 -0.635 -0.824 -1.027 -1.173 -1.323 -1.565 -1.735 -1.902 -1.987 -2.159 -2.331 -2.523 -2.624 -2.812 -2.939 -3.058 -3.178 -3.427 -3.564 -3.726 -3.925 -4.142 -4.358 -4.603 -5.575 -4 ,31497 ,TETRA ,17556827,Fri Nov 26 08:37:41 CET,Fri Nov 26 10:31:29 CET,0.0 1.088 1.385 1.641 1.855 2.049 2.209 2.348 2.62 2.73 2.836 2.969 3.147 3.238 3.415 3.583 3.742 3.815 3.948 4.064 4.246 4.374 4.487 4.623 4.751 4.882 5.014 5.154 5.339 5.506 5.671 5.854 6.027 6.203 6.391 6.578 6.749 6.934 7.12 7.325 7.525 7.73 7.946 8.143 8.365 8.554 8.739 8.895 8.952 8.839 8.336 7.535 6.719 5.982 5.346 4.761 4.237 3.759 3.351 2.942 2.593 2.265 1.946 1.664 1.416 1.171 0.902 0.663 0.445 0.221 0.011 -0.149 -0.322 -0.507 -0.649 -0.799 -0.973 -1.161 -1.368 -1.518 -1.671 -1.914 -2.075 -2.237 -2.319 -2.487 -2.653 -2.809 -2.893 -3.084 -3.214 -3.336 -3.475 -3.759 -3.9 -4.044 -4.208 -4.388 -4.607 -4.908 -5.557 -5 ,2699 ,TETRA ,17556828,Fri Nov 26 08:37:42 CET,Fri Nov 26 10:30:53 CET,0.0 1.033 1.404 1.685 1.918 2.135 2.332 2.507 2.814 2.94 3.06 3.208 3.401 3.507 3.709 3.899 4.071 4.153 4.305 4.435 4.629 4.767 4.902 5.098 5.283 5.442 5.598 5.763 5.968 6.156 6.328 6.528 6.711 6.876 7.068 7.273 7.459 7.671 7.879 8.093 8.32 8.561 8.83 9.065 9.31 9.547 9.775 10.005 10.172 10.122 9.668 8.836 8.043 7.289 6.616 6.021 5.485 4.984 4.553 4.139 3.786 3.469 3.142 2.839 2.564 2.297 2.013 1.756 1.547 1.35 1.112 0.897 0.691 0.496 0.346 0.178 0.01 -0.147 -0.303 -0.407 -0.52 -0.698 -0.82 -0.96 -1.036 -1.194 -1.352 -1.536 -1.635 -1.813 -1.898 -2.003 -2.112 -2.35 -2.496 -2.677 -2.88 -3.089 -3.324 -3.669 -5.269 -6 ,21946 ,TETRA ,17556829,Fri Nov 26 08:37:41 CET,Fri Nov 26 10:32:00 CET,0.0 1.258 1.615 1.916 2.164 2.365 2.527 2.659 2.907 3.01 3.106 3.212 3.393 3.486 3.651 3.789 3.922 3.989 4.109 4.231 4.42 4.534 4.637 4.777 4.914 5.048 5.178 5.302 5.442 5.588 5.737 5.894 6.035 6.187 6.372 6.555 6.711 6.869 7.043 7.234 7.42 7.642 7.914 8.161 8.404 8.658 8.907 9.079 9.203 9.261 8.919 8.141 7.369 6.585 5.893 5.303 4.763 4.264 3.826 3.375 2.966 2.6 2.266 1.94 1.621 1.32 1.013 0.743 0.518 0.288 0.042 -0.161 -0.365 -0.565 -0.719 -0.884 -1.072 -1.278 -1.475 -1.611 -1.763 -2.009 -2.175 -2.344 -2.427 -2.598 -2.784 -2.977 -3.066 -3.241 -3.342 -3.449 -3.557 -3.799 -3.942 -4.108 -4.281 -4.444 -4.671 -4.989 -6.033 -7 ,19751 ,TETRA ,17556830,Fri Nov 26 08:37:41 CET,Fri Nov 26 10:32:16 CET,0.0 1.2 1.528 1.785 1.997 2.173 2.323 2.46 2.713 2.827 2.937 3.045 3.216 3.304 3.475 3.632 3.786 3.863 4.002 4.127 4.306 4.427 4.539 4.685 4.824 4.962 5.089 5.202 5.35 5.499 5.648 5.823 5.994 6.157 6.343 6.56 6.771 6.991 7.21 7.428 7.639 7.868 8.104 8.329 8.57 8.81 9.037 9.177 9.25 9.152 8.744 8.015 7.173 6.344 5.604 4.892 4.244 3.646 3.145 2.689 2.327 2.001 1.669 1.352 1.065 0.792 0.494 0.227 0.007 -0.209 -0.448 -0.644 -0.854 -1.102 -1.287 -1.472 -1.671 -1.877 -2.099 -2.257 -2.415 -2.643 -2.807 -2.993 -3.096 -3.299 -3.529 -3.766 -3.88 -4.094 -4.275 -4.413 -4.556 -4.882 -5.056 -5.253 -5.473 -5.711 -5.989 -6.377 -7.53 -8 ,29822 ,TETRA ,17556831,Fri Nov 26 08:37:42 CET,Fri Nov 26 10:31:35 CET,0.0 1.161 1.571 1.88 2.11 2.292 2.449 2.588 2.84 2.95 3.058 3.16 3.334 3.422 3.585 3.734 3.876 3.946 4.086 4.209 4.368 4.47 4.568 4.715 4.853 4.98 5.101 5.219 5.363 5.493 5.632 5.824 6.0 6.174 6.379 6.578 6.77 6.981 7.194 7.4 7.613 7.834 8.068 8.285 8.517 8.787 9.063 9.273 9.36 9.289 8.834 8.015 7.224 6.461 5.772 5.139 4.58 4.108 3.689 3.246 2.854 2.487 2.137 1.808 1.506 1.232 0.947 0.698 0.481 0.242 -0.018 -0.246 -0.475 -0.706 -0.893 -1.085 -1.278 -1.461 -1.653 -1.811 -1.978 -2.198 -2.327 -2.46 -2.533 -2.69 -2.87 -3.066 -3.157 -3.334 -3.452 -3.57 -3.683 -3.932 -4.071 -4.234 -4.435 -4.643 -4.857 -5.186 -6.002 -9 ,4166 ,TETRA ,17556832,Fri Nov 26 08:37:41 CET,Fri Nov 26 10:31:09 CET,0.0 0.768 1.109 1.38 1.578 1.752 1.93 2.092 2.339 2.458 2.566 2.671 2.845 2.933 3.09 3.236 3.383 3.453 3.588 3.719 3.903 4.017 4.123 4.277 4.431 4.563 4.68 4.794 4.941 5.092 5.232 5.395 5.543 5.678 5.832 6.01 6.173 6.341 6.517 6.691 6.864 7.063 7.267 7.451 7.651 7.874 8.122 8.295 8.377 8.289 7.861 7.176 6.505 5.862 5.279 4.726 4.194 3.7 3.273 2.851 2.476 2.146 1.856 1.574 1.304 1.036 0.75 0.508 0.274 0.025 -0.209 -0.396 -0.595 -0.82 -0.994 -1.165 -1.325 -1.496 -1.681 -1.809 -1.942 -2.15 -2.298 -2.447 -2.52 -2.668 -2.848 -3.036 -3.129 -3.314 -3.418 -3.525 -3.651 -3.924 -4.056 -4.195 -4.35 -4.559 -4.829 -5.124 -6.666 -10 ,14906 ,TETRA ,17556833,Fri Nov 26 08:37:41 CET,Fri Nov 26 10:30:59 CET,0.0 1.335 1.745 2.027 2.251 2.452 2.632 2.792 3.064 3.191 3.313 3.472 3.674 3.771 3.955 4.12 4.274 4.345 4.476 4.604 4.806 4.926 5.032 5.182 5.331 5.466 5.584 5.699 5.854 6.003 6.13 6.269 6.413 6.566 6.76 6.99 7.194 7.393 7.595 7.794 8.003 8.235 8.466 8.659 8.871 9.085 9.285 9.456 9.52 9.398 8.946 8.112 7.296 6.515 5.824 5.216 4.658 4.125 3.661 3.224 2.862 2.522 2.178 1.855 1.559 1.278 0.953 0.646 0.386 0.137 -0.094 -0.288 -0.509 -0.738 -0.905 -1.068 -1.232 -1.4 -1.582 -1.715 -1.849 -2.054 -2.2 -2.351 -2.427 -2.576 -2.745 -2.94 -3.037 -3.224 -3.338 -3.453 -3.581 -3.875 -4.033 -4.182 -4.346 -4.558 -4.791 -5.094 -5.712 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_37_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_37_19.txt deleted file mode 100644 index 0675941c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_37_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9695 ,TETRA ,17556834,Fri Nov 26 08:38:40 CET,Fri Nov 26 10:30:43 CET,0.0 0.239 0.34 0.408 0.479 0.566 0.648 0.724 0.85 0.9 0.944 0.923 1.049 1.086 1.158 1.233 1.321 1.36 1.417 1.47 1.556 1.619 1.67 1.736 1.82 1.92 2.003 2.062 2.148 2.23 2.309 2.424 2.52 2.603 2.704 2.803 2.885 2.975 3.074 3.175 3.28 3.402 3.514 3.6 3.702 3.77 3.765 3.69 3.505 3.11 2.297 1.189 0.239 -0.608 -1.443 -2.274 -2.993 -3.634 -4.189 -4.737 -5.208 -5.627 -6.018 -6.371 -6.712 -7.04 -7.389 -7.714 -8.013 -8.353 -8.689 -8.952 -9.237 -9.525 -9.744 -9.976 -10.224 -10.475 -10.74 -10.93 -11.135 -11.461 -11.689 -11.941 -12.07 -12.348 -12.65 -12.951 -13.106 -13.375 -13.622 -13.809 -14.017 -14.474 -14.721 -14.99 -15.286 -15.591 -15.949 -16.47 -18.396 -2 ,29115 ,TETRA ,17556835,Fri Nov 26 08:38:42 CET,Fri Nov 26 10:30:34 CET,0.0 0.18 0.256 0.333 0.401 0.456 0.511 0.575 0.703 0.753 0.802 0.822 0.961 0.995 1.07 1.141 1.218 1.256 1.317 1.376 1.459 1.506 1.549 1.625 1.701 1.759 1.816 1.885 1.974 2.055 2.131 2.219 2.301 2.378 2.459 2.53 2.591 2.66 2.744 2.833 2.899 2.958 3.02 3.081 3.133 3.185 3.178 3.074 2.857 2.414 1.523 0.328 -0.784 -1.831 -2.774 -3.601 -4.327 -4.974 -5.503 -6.033 -6.487 -6.9 -7.319 -7.724 -8.099 -8.428 -8.782 -9.095 -9.358 -9.649 -9.964 -10.215 -10.47 -10.755 -10.978 -11.201 -11.434 -11.681 -11.95 -12.142 -12.345 -12.658 -12.858 -13.063 -13.172 -13.398 -13.647 -13.929 -14.072 -14.325 -14.567 -14.738 -14.905 -15.328 -15.575 -15.832 -16.156 -16.533 -16.968 -17.568 -19.615 -3 ,13001 ,TETRA ,17556836,Fri Nov 26 08:38:40 CET,Fri Nov 26 10:31:18 CET,0.0 0.359 0.47 0.558 0.624 0.693 0.759 0.816 0.926 0.974 1.017 1.001 1.128 1.172 1.258 1.329 1.394 1.428 1.497 1.554 1.631 1.683 1.738 1.832 1.93 2.021 2.104 2.181 2.282 2.376 2.457 2.564 2.656 2.738 2.845 2.974 3.086 3.191 3.302 3.407 3.516 3.624 3.725 3.816 3.888 3.936 3.977 3.94 3.76 3.309 2.354 1.211 0.24 -0.693 -1.543 -2.335 -3.053 -3.675 -4.211 -4.753 -5.22 -5.654 -6.078 -6.458 -6.814 -7.149 -7.509 -7.836 -8.112 -8.394 -8.697 -8.96 -9.23 -9.522 -9.754 -9.982 -10.225 -10.481 -10.748 -10.947 -11.158 -11.485 -11.714 -11.967 -12.093 -12.33 -12.58 -12.843 -12.984 -13.238 -13.464 -13.644 -13.832 -14.244 -14.485 -14.738 -15.013 -15.346 -15.759 -16.311 -18.062 -4 ,2010 ,TETRA ,17556838,Fri Nov 26 08:38:42 CET,Fri Nov 26 10:20:55 CET,0.0 0.307 0.424 0.517 0.592 0.667 0.728 0.784 0.907 0.959 1.004 0.996 1.131 1.173 1.242 1.315 1.387 1.419 1.482 1.538 1.61 1.655 1.703 1.785 1.869 1.943 2.017 2.088 2.171 2.26 2.357 2.465 2.564 2.655 2.742 2.844 2.938 3.037 3.155 3.263 3.374 3.48 3.568 3.632 3.671 3.729 3.751 3.687 3.567 3.225 2.429 1.35 0.31 -0.606 -1.413 -2.152 -2.826 -3.443 -3.986 -4.519 -4.981 -5.393 -5.783 -6.166 -6.544 -6.921 -7.294 -7.614 -7.893 -8.189 -8.5 -8.757 -9.042 -9.34 -9.561 -9.784 -10.022 -10.274 -10.523 -10.693 -10.873 -11.149 -11.35 -11.566 -11.673 -11.903 -12.156 -12.42 -12.558 -12.814 -13.047 -13.23 -13.408 -13.814 -14.051 -14.287 -14.573 -14.925 -15.337 -15.887 -17.651 -5 ,16083 ,TETRA ,17556839,Fri Nov 26 08:39:42 CET,Fri Nov 26 10:30:53 CET,0.0 0.271 0.406 0.502 0.574 0.635 0.692 0.748 0.859 0.913 0.962 0.948 1.079 1.121 1.205 1.295 1.375 1.406 1.47 1.535 1.62 1.674 1.73 1.801 1.864 1.927 1.993 2.065 2.155 2.241 2.323 2.431 2.533 2.627 2.745 2.866 2.967 3.07 3.179 3.293 3.388 3.468 3.569 3.661 3.722 3.748 3.74 3.69 3.521 3.132 2.389 1.337 0.275 -0.696 -1.511 -2.242 -2.899 -3.533 -4.101 -4.669 -5.165 -5.607 -6.043 -6.446 -6.811 -7.154 -7.516 -7.844 -8.135 -8.424 -8.709 -8.951 -9.206 -9.486 -9.714 -9.936 -10.146 -10.378 -10.631 -10.805 -10.988 -11.291 -11.503 -11.711 -11.822 -12.074 -12.337 -12.607 -12.754 -13.024 -13.282 -13.47 -13.679 -14.136 -14.353 -14.587 -14.888 -15.242 -15.689 -16.244 -18.475 -6 ,22689 ,TETRA ,17556840,Fri Nov 26 08:39:42 CET,Fri Nov 26 10:31:36 CET,0.0 0.267 0.41 0.556 0.683 0.794 0.891 0.979 1.149 1.223 1.292 1.349 1.505 1.566 1.667 1.759 1.855 1.901 1.997 2.08 2.181 2.249 2.327 2.443 2.547 2.635 2.709 2.778 2.868 2.952 3.034 3.141 3.238 3.321 3.411 3.506 3.597 3.709 3.84 3.958 4.066 4.182 4.297 4.373 4.428 4.462 4.447 4.387 4.237 3.867 3.049 1.941 0.941 0.034 -0.758 -1.484 -2.142 -2.736 -3.255 -3.791 -4.232 -4.615 -4.983 -5.332 -5.669 -5.974 -6.309 -6.606 -6.851 -7.129 -7.422 -7.646 -7.891 -8.172 -8.383 -8.588 -8.801 -9.036 -9.274 -9.435 -9.615 -9.916 -10.107 -10.306 -10.423 -10.66 -10.894 -11.147 -11.284 -11.531 -11.718 -11.866 -12.034 -12.442 -12.683 -12.972 -13.28 -13.623 -14.07 -14.668 -16.41 -7 ,21695 ,TETRA ,17556841,Fri Nov 26 08:39:42 CET,Fri Nov 26 10:31:34 CET,0.0 0.173 0.267 0.354 0.43 0.498 0.558 0.616 0.719 0.779 0.839 0.832 0.961 1.001 1.075 1.14 1.192 1.221 1.288 1.353 1.446 1.507 1.559 1.625 1.691 1.756 1.826 1.899 1.992 2.08 2.166 2.269 2.37 2.485 2.594 2.705 2.821 2.932 3.045 3.142 3.238 3.353 3.475 3.586 3.682 3.752 3.812 3.781 3.603 3.206 2.355 1.203 0.148 -0.809 -1.592 -2.33 -3.029 -3.667 -4.241 -4.814 -5.291 -5.737 -6.165 -6.568 -6.954 -7.291 -7.647 -7.969 -8.26 -8.574 -8.892 -9.157 -9.429 -9.727 -9.963 -10.2 -10.451 -10.713 -10.981 -11.173 -11.375 -11.683 -11.903 -12.137 -12.257 -12.495 -12.75 -13.033 -13.185 -13.443 -13.65 -13.823 -14.012 -14.403 -14.614 -14.836 -15.115 -15.458 -15.849 -16.384 -18.2 -8 ,26565 ,TETRA ,17556842,Fri Nov 26 08:39:42 CET,Fri Nov 26 10:33:40 CET,0.0 0.218 0.322 0.405 0.492 0.575 0.642 0.706 0.838 0.897 0.958 0.971 1.1 1.132 1.196 1.262 1.327 1.359 1.419 1.475 1.559 1.619 1.678 1.75 1.802 1.861 1.933 1.999 2.082 2.157 2.225 2.309 2.389 2.464 2.559 2.652 2.721 2.814 2.945 3.071 3.153 3.23 3.335 3.423 3.492 3.555 3.594 3.575 3.431 3.063 2.243 1.149 0.152 -0.748 -1.569 -2.325 -2.992 -3.602 -4.122 -4.66 -5.12 -5.541 -5.956 -6.337 -6.712 -7.068 -7.45 -7.79 -8.075 -8.367 -8.686 -8.969 -9.275 -9.584 -9.815 -10.054 -10.305 -10.57 -10.857 -11.062 -11.28 -11.641 -11.879 -12.116 -12.237 -12.479 -12.72 -12.969 -13.115 -13.382 -13.647 -13.847 -14.048 -14.471 -14.715 -14.975 -15.23 -15.522 -15.905 -16.429 -18.012 -9 ,6001 ,TETRA ,17556843,Fri Nov 26 08:39:44 CET,Fri Nov 26 10:33:40 CET,0.0 0.155 0.226 0.309 0.397 0.466 0.524 0.572 0.679 0.748 0.824 0.874 1.019 1.081 1.192 1.289 1.382 1.421 1.494 1.578 1.701 1.771 1.837 1.93 2.023 2.118 2.207 2.295 2.407 2.511 2.601 2.692 2.779 2.858 2.953 3.06 3.152 3.238 3.334 3.444 3.563 3.684 3.777 3.842 3.89 3.918 3.902 3.834 3.621 3.193 2.339 1.145 0.081 -0.872 -1.708 -2.457 -3.192 -3.886 -4.441 -4.986 -5.477 -5.895 -6.297 -6.688 -7.06 -7.402 -7.735 -8.057 -8.35 -8.627 -8.9 -9.13 -9.384 -9.663 -9.892 -10.138 -10.38 -10.629 -10.914 -11.108 -11.304 -11.638 -11.862 -12.088 -12.208 -12.452 -12.725 -13.014 -13.157 -13.416 -13.619 -13.788 -13.969 -14.338 -14.559 -14.827 -15.116 -15.463 -15.883 -16.452 -18.683 -10 ,15541 ,TETRA ,17556844,Fri Nov 26 08:39:44 CET,Fri Nov 26 10:32:18 CET,0.0 0.2 0.336 0.441 0.526 0.599 0.656 0.709 0.814 0.863 0.914 0.94 1.093 1.147 1.258 1.362 1.459 1.503 1.586 1.66 1.762 1.825 1.88 1.969 2.063 2.147 2.228 2.311 2.412 2.505 2.596 2.711 2.827 2.932 3.03 3.134 3.226 3.325 3.434 3.545 3.663 3.772 3.881 3.965 4.006 4.042 4.061 3.977 3.746 3.304 2.328 1.107 0.061 -0.915 -1.778 -2.574 -3.274 -3.907 -4.431 -4.973 -5.444 -5.839 -6.216 -6.592 -6.967 -7.304 -7.642 -7.945 -8.209 -8.494 -8.791 -9.038 -9.313 -9.587 -9.809 -10.042 -10.265 -10.512 -10.761 -10.934 -11.135 -11.457 -11.683 -11.925 -12.051 -12.293 -12.534 -12.799 -12.949 -13.206 -13.437 -13.622 -13.828 -14.282 -14.539 -14.827 -15.122 -15.479 -15.915 -16.481 -19.427 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_37_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_37_26.txt deleted file mode 100644 index 09707741..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_37_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22509 ,TETRA ,17556845,Fri Nov 26 08:39:43 CET,Fri Nov 26 10:32:21 CET,0.0 0.757 1.046 1.256 1.442 1.604 1.746 1.872 2.108 2.215 2.308 2.403 2.584 2.673 2.829 2.965 3.114 3.19 3.322 3.445 3.622 3.737 3.846 3.991 4.142 4.296 4.433 4.558 4.719 4.872 5.015 5.187 5.355 5.502 5.667 5.856 6.008 6.156 6.333 6.541 6.744 6.943 7.155 7.345 7.563 7.781 7.893 7.887 7.811 7.537 6.736 5.483 4.352 3.344 2.449 1.649 0.934 0.264 -0.301 -0.874 -1.367 -1.801 -2.217 -2.613 -2.979 -3.321 -3.703 -4.053 -4.338 -4.618 -4.939 -5.202 -5.465 -5.74 -5.947 -6.173 -6.411 -6.639 -6.878 -7.052 -7.235 -7.512 -7.693 -7.889 -7.995 -8.224 -8.479 -8.741 -8.87 -9.108 -9.288 -9.447 -9.62 -9.98 -10.189 -10.432 -10.689 -10.975 -11.336 -11.813 -13.359 -2 ,14584 ,TETRA ,17556846,Fri Nov 26 08:40:41 CET,Fri Nov 26 10:33:39 CET,0.0 0.62 0.854 1.063 1.25 1.421 1.554 1.686 1.938 2.042 2.142 2.24 2.416 2.5 2.652 2.798 2.943 3.014 3.151 3.287 3.467 3.58 3.684 3.819 3.947 4.079 4.204 4.325 4.483 4.63 4.778 4.944 5.087 5.241 5.439 5.643 5.808 5.982 6.168 6.356 6.535 6.723 6.916 7.078 7.239 7.397 7.488 7.503 7.486 7.237 6.468 5.358 4.347 3.402 2.553 1.816 1.171 0.583 0.067 -0.477 -0.955 -1.417 -1.916 -2.413 -2.876 -3.255 -3.594 -3.88 -4.121 -4.383 -4.663 -4.92 -5.194 -5.481 -5.714 -5.953 -6.21 -6.466 -6.738 -6.923 -7.092 -7.364 -7.552 -7.739 -7.849 -8.088 -8.346 -8.623 -8.763 -9.014 -9.214 -9.379 -9.546 -9.91 -10.109 -10.311 -10.544 -10.821 -11.121 -11.525 -12.893 -3 ,13379 ,TETRA ,17556847,Fri Nov 26 08:40:42 CET,Fri Nov 26 10:34:43 CET,0.0 0.759 1.038 1.242 1.435 1.619 1.753 1.877 2.126 2.224 2.316 2.4 2.58 2.666 2.821 2.959 3.088 3.154 3.281 3.404 3.572 3.677 3.789 3.965 4.124 4.263 4.396 4.528 4.696 4.84 4.974 5.149 5.313 5.456 5.62 5.82 6.004 6.196 6.387 6.572 6.762 6.947 7.134 7.295 7.444 7.606 7.769 7.817 7.721 7.406 6.633 5.436 4.329 3.361 2.52 1.757 0.908 0.067 -0.657 -1.436 -2.083 -2.59 -3.005 -3.405 -3.785 -4.115 -4.47 -4.779 -5.056 -5.364 -5.69 -5.943 -6.182 -6.436 -6.628 -6.833 -7.053 -7.288 -7.536 -7.707 -7.887 -8.16 -8.345 -8.538 -8.638 -8.849 -9.071 -9.308 -9.435 -9.67 -9.853 -10.014 -10.179 -10.538 -10.738 -10.981 -11.251 -11.568 -11.944 -12.42 -14.172 -4 ,12470 ,TETRA ,17556848,Fri Nov 26 08:40:41 CET,Fri Nov 26 10:33:34 CET,0.0 0.752 0.985 1.172 1.339 1.482 1.608 1.73 1.966 2.074 2.174 2.265 2.446 2.534 2.705 2.865 2.999 3.059 3.183 3.317 3.513 3.624 3.726 3.862 3.992 4.119 4.241 4.366 4.523 4.669 4.805 4.959 5.093 5.216 5.374 5.553 5.731 5.923 6.099 6.279 6.448 6.615 6.819 7.01 7.171 7.277 7.333 7.277 7.071 6.664 5.754 4.44 3.292 2.311 1.468 0.723 0.075 -0.515 -1.03 -1.555 -2.024 -2.449 -2.857 -3.267 -3.663 -4.02 -4.38 -4.703 -5.001 -5.31 -5.623 -5.884 -6.14 -6.406 -6.634 -6.859 -7.07 -7.296 -7.549 -7.728 -7.9 -8.146 -8.321 -8.522 -8.63 -8.843 -9.075 -9.326 -9.456 -9.692 -9.868 -10.026 -10.198 -10.587 -10.786 -10.982 -11.208 -11.468 -11.822 -12.341 -13.849 -5 ,25876 ,TETRA ,17556849,Fri Nov 26 08:40:42 CET,Fri Nov 26 10:33:12 CET,0.0 0.923 1.172 1.368 1.545 1.688 1.812 1.925 2.138 2.245 2.35 2.438 2.619 2.696 2.84 2.978 3.112 3.177 3.295 3.404 3.562 3.654 3.74 3.878 4.016 4.144 4.275 4.403 4.556 4.722 4.9 5.093 5.25 5.403 5.603 5.82 6.0 6.183 6.366 6.534 6.713 6.928 7.238 7.482 7.584 7.668 7.707 7.616 7.404 6.955 5.957 4.658 3.518 2.513 1.647 0.847 0.161 -0.412 -0.919 -1.474 -1.967 -2.398 -2.791 -3.157 -3.509 -3.834 -4.161 -4.437 -4.692 -4.967 -5.255 -5.493 -5.737 -5.981 -6.182 -6.396 -6.605 -6.837 -7.078 -7.244 -7.413 -7.668 -7.857 -8.062 -8.165 -8.376 -8.617 -8.875 -9.011 -9.26 -9.449 -9.604 -9.771 -10.145 -10.347 -10.574 -10.835 -11.128 -11.5 -11.966 -13.421 -6 ,26658 ,TETRA ,17556850,Fri Nov 26 08:40:43 CET,Fri Nov 26 10:33:59 CET,0.0 0.937 1.181 1.359 1.511 1.656 1.785 1.899 2.113 2.219 2.32 2.409 2.584 2.666 2.818 2.962 3.11 3.186 3.324 3.446 3.619 3.724 3.817 3.957 4.098 4.224 4.345 4.461 4.616 4.773 4.909 5.068 5.227 5.384 5.599 5.831 6.045 6.312 6.617 6.894 7.114 7.324 7.512 7.678 7.867 8.011 8.085 8.057 7.88 7.444 6.487 5.227 4.138 3.196 2.347 1.529 0.799 0.156 -0.41 -0.955 -1.423 -1.873 -2.298 -2.684 -3.062 -3.429 -3.819 -4.16 -4.44 -4.723 -5.029 -5.293 -5.556 -5.832 -6.048 -6.275 -6.511 -6.757 -7.03 -7.216 -7.413 -7.714 -7.921 -8.147 -8.259 -8.492 -8.748 -9.014 -9.15 -9.397 -9.602 -9.763 -9.928 -10.286 -10.486 -10.693 -10.931 -11.212 -11.522 -11.96 -14.079 -7 ,21285 ,TETRA ,17556851,Fri Nov 26 08:40:42 CET,Fri Nov 26 10:32:59 CET,0.0 0.676 0.94 1.155 1.316 1.463 1.597 1.73 1.978 2.084 2.181 2.262 2.436 2.52 2.663 2.781 2.904 2.972 3.108 3.241 3.421 3.527 3.62 3.758 3.902 4.051 4.201 4.33 4.478 4.623 4.787 5.011 5.196 5.345 5.502 5.649 5.796 5.959 6.122 6.29 6.497 6.723 6.957 7.139 7.277 7.413 7.527 7.568 7.433 7.116 6.424 5.229 4.074 3.016 2.079 1.246 0.508 -0.158 -0.721 -1.284 -1.777 -2.224 -2.659 -3.072 -3.451 -3.808 -4.183 -4.51 -4.797 -5.105 -5.418 -5.679 -5.974 -6.306 -6.561 -6.818 -7.092 -7.387 -7.687 -7.88 -8.07 -8.352 -8.549 -8.775 -8.896 -9.138 -9.397 -9.665 -9.798 -10.035 -10.22 -10.376 -10.541 -10.905 -11.109 -11.323 -11.55 -11.814 -12.167 -12.633 -14.217 -8 ,3142 ,TETRA ,17556852,Fri Nov 26 08:40:43 CET,Fri Nov 26 10:33:40 CET,0.0 1.0 1.289 1.532 1.707 1.848 1.979 2.102 2.331 2.439 2.53 2.619 2.8 2.882 3.046 3.206 3.35 3.413 3.542 3.672 3.852 3.963 4.066 4.222 4.382 4.529 4.661 4.788 4.946 5.083 5.22 5.398 5.561 5.731 5.917 6.103 6.278 6.46 6.701 6.983 7.243 7.471 7.673 7.841 8.047 8.246 8.386 8.401 8.273 7.963 7.215 6.024 4.913 3.923 3.076 2.287 1.573 0.91 0.282 -0.324 -0.798 -1.246 -1.69 -2.103 -2.476 -2.813 -3.173 -3.497 -3.786 -4.082 -4.377 -4.63 -4.905 -5.192 -5.414 -5.631 -5.843 -6.067 -6.307 -6.484 -6.663 -6.93 -7.113 -7.313 -7.422 -7.629 -7.856 -8.107 -8.235 -8.473 -8.663 -8.824 -9.001 -9.393 -9.618 -9.864 -10.112 -10.396 -10.76 -11.251 -12.901 -9 ,7677 ,TETRA ,17556853,Fri Nov 26 08:40:42 CET,Fri Nov 26 10:33:08 CET,0.0 0.664 0.955 1.155 1.317 1.474 1.621 1.742 1.957 2.059 2.155 2.242 2.418 2.5 2.665 2.818 2.947 3.013 3.149 3.28 3.455 3.56 3.663 3.817 3.969 4.107 4.237 4.35 4.499 4.65 4.79 4.976 5.143 5.285 5.441 5.608 5.769 5.94 6.112 6.285 6.477 6.7 6.933 7.143 7.331 7.459 7.55 7.564 7.431 7.084 6.325 5.166 4.076 3.122 2.288 1.487 0.757 0.109 -0.441 -0.984 -1.433 -1.839 -2.254 -2.654 -3.038 -3.382 -3.73 -4.046 -4.33 -4.634 -4.947 -5.188 -5.433 -5.703 -5.909 -6.116 -6.325 -6.548 -6.786 -6.958 -7.135 -7.402 -7.6 -7.809 -7.909 -8.122 -8.363 -8.613 -8.749 -8.995 -9.171 -9.324 -9.478 -9.833 -10.036 -10.241 -10.46 -10.711 -11.048 -11.558 -13.277 -10 ,16084 ,TETRA ,17556854,Fri Nov 26 08:40:42 CET,Fri Nov 26 10:33:05 CET,0.0 0.677 0.934 1.145 1.326 1.477 1.604 1.725 1.949 2.041 2.13 2.233 2.423 2.524 2.709 2.869 3.006 3.073 3.21 3.35 3.527 3.626 3.726 3.865 3.995 4.134 4.271 4.399 4.562 4.711 4.849 5.018 5.184 5.344 5.534 5.763 6.02 6.269 6.484 6.689 6.862 7.036 7.268 7.476 7.63 7.744 7.798 7.809 7.718 7.42 6.619 5.372 4.227 3.208 2.303 1.466 0.739 0.084 -0.489 -1.083 -1.594 -2.052 -2.472 -2.882 -3.262 -3.608 -3.985 -4.32 -4.611 -4.912 -5.211 -5.458 -5.735 -6.021 -6.23 -6.449 -6.688 -6.935 -7.189 -7.362 -7.544 -7.835 -8.037 -8.25 -8.359 -8.571 -8.802 -9.068 -9.207 -9.449 -9.626 -9.773 -9.931 -10.304 -10.5 -10.702 -10.924 -11.195 -11.534 -12.024 -13.693 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_37_32.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_37_32.txt deleted file mode 100644 index 3f7ffce6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_37_32.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25737 ,TETRA ,17556855,Fri Nov 26 08:40:43 CET,Fri Nov 26 10:31:40 CET,0.0 0.168 0.244 0.306 0.359 0.416 0.463 0.497 0.564 0.591 0.612 0.551 0.658 0.683 0.729 0.756 0.777 0.787 0.813 0.828 0.829 0.837 0.848 0.869 0.88 0.882 0.877 0.866 0.855 0.843 0.832 0.809 0.775 0.739 0.692 0.626 0.553 0.453 0.341 0.205 0.031 -0.171 -0.431 -0.729 -1.125 -1.64 -2.338 -3.239 -4.489 -6.337 -9.273 -12.522 -15.057 -17.101 -18.8 -20.291 -21.558 -22.659 -23.585 -24.499 -25.247 -25.891 -26.536 -27.16 -27.736 -28.259 -28.798 -29.29 -29.723 -30.156 -30.598 -30.971 -31.368 -31.778 -32.091 -32.404 -32.718 -33.048 -33.392 -33.646 -33.921 -34.326 -34.599 -34.898 -35.054 -35.368 -35.689 -36.028 -36.212 -36.538 -36.818 -37.033 -37.275 -37.802 -38.086 -38.401 -38.757 -39.17 -39.69 -40.473 -43.94 -2 ,11407 ,TETRA ,17556856,Fri Nov 26 08:40:42 CET,Fri Nov 26 10:33:41 CET,0.0 0.098 0.153 0.221 0.28 0.323 0.363 0.4 0.463 0.491 0.516 0.478 0.587 0.601 0.638 0.678 0.707 0.719 0.746 0.765 0.79 0.81 0.83 0.855 0.893 0.928 0.939 0.955 0.98 0.986 0.981 0.976 0.963 0.939 0.9 0.859 0.819 0.753 0.676 0.573 0.452 0.295 0.058 -0.206 -0.568 -1.036 -1.675 -2.56 -3.796 -5.613 -8.453 -11.667 -14.208 -16.245 -17.96 -19.455 -20.7 -21.799 -22.697 -23.587 -24.38 -25.07 -25.702 -26.298 -26.836 -27.31 -27.817 -28.27 -28.657 -29.058 -29.482 -29.828 -30.201 -30.58 -30.861 -31.157 -31.462 -31.796 -32.142 -32.386 -32.642 -33.048 -33.332 -33.616 -33.768 -34.087 -34.446 -34.84 -35.04 -35.355 -35.639 -35.868 -36.11 -36.689 -37.013 -37.354 -37.742 -38.175 -38.717 -39.616 -44.489 -3 ,17876 ,TETRA ,17556857,Fri Nov 26 08:41:41 CET,Fri Nov 26 10:16:12 CET,0.0 0.263 0.353 0.43 0.479 0.536 0.584 0.621 0.697 0.729 0.748 0.681 0.778 0.786 0.812 0.839 0.86 0.867 0.882 0.896 0.916 0.923 0.93 0.947 0.956 0.96 0.966 0.971 0.977 0.979 0.973 0.966 0.958 0.952 0.931 0.889 0.832 0.74 0.631 0.514 0.381 0.196 -0.036 -0.308 -0.694 -1.176 -1.839 -2.702 -3.858 -5.636 -8.516 -11.628 -14.021 -16.004 -17.649 -19.081 -20.343 -21.455 -22.36 -23.257 -24.033 -24.719 -25.371 -25.978 -26.519 -27.011 -27.545 -28.016 -28.425 -28.862 -29.301 -29.658 -30.044 -30.459 -30.777 -31.083 -31.401 -31.746 -32.117 -32.378 -32.641 -33.018 -33.281 -33.578 -33.731 -34.06 -34.399 -34.739 -34.916 -35.228 -35.517 -35.744 -35.98 -36.482 -36.741 -37.049 -37.402 -37.859 -38.445 -39.255 -41.836 -4 ,7634 ,TETRA ,17556858,Fri Nov 26 08:41:41 CET,Fri Nov 26 10:34:30 CET,0.0 0.185 0.301 0.347 0.395 0.44 0.471 0.502 0.574 0.608 0.637 0.608 0.728 0.76 0.828 0.885 0.941 0.969 1.004 1.039 1.089 1.106 1.121 1.149 1.176 1.19 1.199 1.21 1.222 1.231 1.237 1.222 1.201 1.175 1.139 1.107 1.057 0.989 0.903 0.805 0.69 0.52 0.303 0.054 -0.313 -0.793 -1.431 -2.302 -3.523 -5.312 -8.182 -11.281 -13.739 -15.869 -17.623 -19.091 -20.331 -21.442 -22.43 -23.397 -24.189 -24.859 -25.473 -26.056 -26.597 -27.074 -27.565 -28.02 -28.407 -28.811 -29.244 -29.6 -29.945 -30.281 -30.546 -30.844 -31.165 -31.489 -31.834 -32.079 -32.328 -32.7 -32.955 -33.223 -33.36 -33.646 -33.955 -34.276 -34.454 -34.791 -35.141 -35.37 -35.596 -36.099 -36.395 -36.76 -37.175 -37.617 -38.144 -38.838 -41.996 -5 ,18759 ,TETRA ,17556859,Fri Nov 26 08:41:41 CET,Fri Nov 26 10:34:17 CET,0.0 0.169 0.231 0.278 0.332 0.384 0.414 0.446 0.499 0.521 0.541 0.488 0.6 0.62 0.657 0.679 0.69 0.697 0.714 0.721 0.728 0.736 0.75 0.763 0.765 0.767 0.765 0.759 0.741 0.717 0.694 0.663 0.625 0.583 0.522 0.454 0.391 0.296 0.201 0.109 -0.023 -0.223 -0.498 -0.805 -1.192 -1.692 -2.381 -3.224 -4.367 -6.115 -8.884 -12.033 -14.491 -16.528 -18.267 -19.72 -20.888 -21.935 -22.855 -23.783 -24.59 -25.287 -25.929 -26.545 -27.101 -27.582 -28.102 -28.579 -28.971 -29.378 -29.812 -30.188 -30.594 -30.99 -31.287 -31.601 -31.923 -32.267 -32.649 -32.902 -33.138 -33.5 -33.764 -34.037 -34.185 -34.506 -34.829 -35.153 -35.325 -35.634 -35.9 -36.121 -36.381 -36.927 -37.23 -37.572 -37.948 -38.378 -38.952 -39.828 -43.337 -6 ,11484 ,TETRA ,17556860,Fri Nov 26 08:41:41 CET,Fri Nov 26 10:33:20 CET,0.0 0.123 0.217 0.305 0.357 0.41 0.454 0.486 0.533 0.549 0.566 0.515 0.627 0.641 0.665 0.685 0.71 0.725 0.754 0.776 0.801 0.808 0.814 0.831 0.844 0.858 0.869 0.873 0.871 0.866 0.859 0.848 0.826 0.799 0.764 0.715 0.676 0.629 0.548 0.442 0.308 0.154 -0.058 -0.349 -0.738 -1.233 -1.933 -2.874 -4.141 -5.88 -8.564 -11.709 -14.261 -16.323 -18.038 -19.532 -20.783 -21.907 -22.852 -23.758 -24.551 -25.257 -25.924 -26.571 -27.148 -27.633 -28.128 -28.587 -29.006 -29.432 -29.884 -30.275 -30.656 -31.054 -31.353 -31.643 -31.94 -32.26 -32.592 -32.813 -33.06 -33.45 -33.712 -33.98 -34.123 -34.432 -34.758 -35.113 -35.303 -35.643 -35.958 -36.171 -36.389 -36.873 -37.167 -37.485 -37.841 -38.291 -38.86 -39.596 -42.966 -7 ,22833 ,TETRA ,17556861,Fri Nov 26 08:41:40 CET,Fri Nov 26 10:32:37 CET,0.0 0.165 0.264 0.332 0.405 0.47 0.503 0.531 0.593 0.617 0.641 0.591 0.701 0.722 0.759 0.789 0.811 0.817 0.831 0.847 0.871 0.887 0.896 0.891 0.897 0.909 0.917 0.929 0.937 0.934 0.927 0.919 0.922 0.915 0.881 0.839 0.785 0.706 0.618 0.523 0.394 0.208 -0.039 -0.315 -0.696 -1.18 -1.795 -2.633 -3.874 -5.7 -8.568 -11.755 -14.24 -16.325 -18.09 -19.622 -20.927 -22.038 -22.936 -23.817 -24.587 -25.292 -25.939 -26.498 -27.035 -27.552 -28.086 -28.544 -28.951 -29.373 -29.806 -30.172 -30.546 -30.926 -31.225 -31.542 -31.886 -32.242 -32.609 -32.859 -33.092 -33.46 -33.725 -34.0 -34.139 -34.431 -34.77 -35.126 -35.319 -35.64 -35.928 -36.157 -36.395 -36.903 -37.183 -37.519 -37.93 -38.412 -38.966 -39.783 -44.246 -8 ,20753 ,TETRA ,17556862,Fri Nov 26 08:41:41 CET,Fri Nov 26 10:32:37 CET,0.0 0.152 0.244 0.314 0.372 0.416 0.446 0.486 0.568 0.594 0.615 0.571 0.678 0.693 0.735 0.765 0.778 0.787 0.803 0.809 0.817 0.831 0.844 0.85 0.855 0.858 0.847 0.83 0.811 0.798 0.788 0.771 0.744 0.707 0.665 0.617 0.556 0.472 0.364 0.232 0.063 -0.122 -0.319 -0.567 -0.917 -1.388 -2.066 -2.948 -4.151 -5.875 -8.592 -11.708 -14.124 -16.094 -17.772 -19.242 -20.469 -21.537 -22.486 -23.415 -24.178 -24.866 -25.514 -26.122 -26.685 -27.184 -27.703 -28.162 -28.553 -28.956 -29.385 -29.745 -30.106 -30.469 -30.756 -31.06 -31.376 -31.7 -32.034 -32.268 -32.501 -32.841 -33.088 -33.368 -33.504 -33.766 -34.073 -34.425 -34.615 -34.944 -35.247 -35.463 -35.687 -36.184 -36.487 -36.834 -37.231 -37.732 -38.348 -39.169 -42.26 -9 ,29135 ,TETRA ,17556863,Fri Nov 26 08:41:41 CET,Fri Nov 26 10:32:30 CET,0.0 0.101 0.165 0.212 0.263 0.323 0.359 0.386 0.44 0.46 0.48 0.426 0.539 0.563 0.61 0.639 0.66 0.674 0.701 0.714 0.715 0.716 0.717 0.72 0.723 0.726 0.728 0.723 0.718 0.709 0.684 0.677 0.69 0.667 0.598 0.521 0.452 0.382 0.305 0.189 0.04 -0.145 -0.379 -0.641 -1.011 -1.489 -2.11 -2.961 -4.186 -5.946 -8.813 -12.021 -14.441 -16.451 -18.213 -19.753 -21.017 -22.116 -23.035 -23.936 -24.716 -25.387 -26.012 -26.603 -27.133 -27.611 -28.109 -28.557 -28.928 -29.296 -29.701 -30.036 -30.388 -30.759 -31.039 -31.327 -31.621 -31.936 -32.281 -32.527 -32.767 -33.134 -33.382 -33.635 -33.772 -34.049 -34.353 -34.662 -34.81 -35.114 -35.424 -35.642 -35.894 -36.451 -36.743 -37.076 -37.51 -38.035 -38.629 -39.51 -43.189 -10 ,21911 ,TETRA ,17556864,Fri Nov 26 08:41:40 CET,Fri Nov 26 10:23:21 CET,0.0 0.161 0.229 0.276 0.326 0.363 0.395 0.429 0.479 0.497 0.522 0.477 0.598 0.625 0.656 0.681 0.712 0.729 0.764 0.801 0.844 0.854 0.854 0.852 0.855 0.862 0.858 0.854 0.853 0.836 0.811 0.779 0.755 0.744 0.732 0.675 0.607 0.533 0.421 0.281 0.127 -0.062 -0.329 -0.628 -1.007 -1.523 -2.221 -3.128 -4.413 -6.186 -8.885 -11.93 -14.336 -16.31 -17.965 -19.417 -20.624 -21.675 -22.537 -23.38 -24.137 -24.816 -25.456 -26.057 -26.619 -27.131 -27.655 -28.116 -28.508 -28.911 -29.346 -29.688 -30.02 -30.38 -30.676 -30.975 -31.28 -31.595 -31.928 -32.183 -32.454 -32.835 -33.093 -33.385 -33.535 -33.832 -34.131 -34.44 -34.633 -34.971 -35.26 -35.489 -35.725 -36.259 -36.581 -36.94 -37.331 -37.778 -38.322 -39.099 -43.013 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_37_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_37_35.txt deleted file mode 100644 index 0fdbfcc6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_37_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4724 ,TETRA ,17556865,Fri Nov 26 08:41:40 CET,Fri Nov 26 10:33:55 CET,0.0 0.556 0.741 0.894 1.037 1.161 1.278 1.389 1.572 1.664 1.756 1.816 1.974 2.045 2.178 2.303 2.419 2.474 2.586 2.701 2.869 2.974 3.075 3.217 3.365 3.512 3.661 3.812 3.999 4.18 4.361 4.598 4.821 5.036 5.3 5.571 5.817 6.097 6.413 6.769 7.134 7.53 7.971 8.408 8.915 9.458 10.089 10.817 11.611 12.468 13.35 13.753 13.792 13.687 13.479 13.214 12.925 12.62 12.358 12.097 11.847 11.615 11.385 11.174 10.976 10.78 10.58 10.407 10.245 10.062 9.878 9.732 9.587 9.437 9.308 9.174 9.041 8.905 8.759 8.655 8.546 8.377 8.244 8.096 8.023 7.864 7.699 7.533 7.441 7.254 7.142 7.042 6.938 6.684 6.535 6.37 6.198 6.019 5.796 5.511 4.67 -2 ,9419 ,TETRA ,17556866,Fri Nov 26 08:41:41 CET,Fri Nov 26 10:35:23 CET,0.0 0.345 0.56 0.722 0.862 0.984 1.08 1.174 1.376 1.484 1.596 1.739 1.938 2.033 2.217 2.385 2.541 2.617 2.757 2.896 3.092 3.211 3.332 3.521 3.704 3.875 4.046 4.217 4.431 4.618 4.795 5.025 5.245 5.453 5.687 5.937 6.18 6.458 6.768 7.102 7.454 7.857 8.324 8.788 9.305 9.853 10.494 11.206 12.023 12.893 13.674 14.174 14.283 14.119 13.873 13.636 13.401 13.18 12.96 12.702 12.469 12.246 12.024 11.813 11.628 11.455 11.269 11.099 10.942 10.766 10.579 10.432 10.282 10.103 9.966 9.826 9.68 9.53 9.368 9.258 9.143 8.958 8.837 8.707 8.634 8.489 8.321 8.132 8.033 7.841 7.718 7.614 7.504 7.278 7.155 7.004 6.84 6.663 6.446 6.143 5.254 -3 ,20010 ,TETRA ,17556867,Fri Nov 26 08:41:41 CET,Fri Nov 26 10:34:51 CET,0.0 0.42 0.582 0.722 0.865 0.984 1.089 1.19 1.357 1.444 1.525 1.585 1.755 1.834 1.991 2.135 2.278 2.353 2.504 2.646 2.856 2.994 3.118 3.294 3.478 3.648 3.804 3.958 4.154 4.338 4.518 4.747 4.957 5.158 5.412 5.697 5.966 6.249 6.553 6.879 7.207 7.574 8.033 8.499 9.017 9.58 10.221 10.932 11.716 12.545 13.477 13.96 13.987 13.869 13.651 13.416 13.14 12.863 12.608 12.305 12.027 11.767 11.513 11.285 11.057 10.833 10.619 10.416 10.233 10.052 9.85 9.671 9.483 9.284 9.137 8.995 8.844 8.679 8.513 8.394 8.255 8.028 7.869 7.7 7.61 7.428 7.246 7.042 6.941 6.753 6.645 6.545 6.432 6.189 6.048 5.893 5.731 5.543 5.325 5.051 4.29 -4 ,32068 ,TETRA ,17556868,Fri Nov 26 08:42:44 CET,Fri Nov 26 10:36:59 CET,0.0 0.637 0.92 1.17 1.398 1.583 1.721 1.846 2.075 2.185 2.292 2.389 2.566 2.661 2.851 3.038 3.204 3.276 3.413 3.552 3.752 3.871 3.988 4.165 4.34 4.512 4.671 4.826 5.024 5.208 5.396 5.64 5.87 6.072 6.31 6.588 6.854 7.146 7.456 7.773 8.097 8.467 8.895 9.339 9.825 10.306 10.856 11.49 12.192 12.952 13.796 14.252 14.253 14.111 13.888 13.619 13.371 13.126 12.888 12.617 12.386 12.176 11.952 11.726 11.515 11.326 11.135 10.968 10.812 10.649 10.476 10.329 10.177 10.008 9.87 9.72 9.57 9.404 9.221 9.105 8.992 8.817 8.699 8.57 8.503 8.361 8.206 8.05 7.962 7.777 7.658 7.543 7.429 7.181 7.042 6.886 6.723 6.555 6.346 6.046 5.432 -5 ,8666 ,TETRA ,17556869,Fri Nov 26 08:42:44 CET,Fri Nov 26 10:38:34 CET,0.0 0.303 0.471 0.644 0.813 0.97 1.128 1.285 1.586 1.714 1.832 1.957 2.141 2.236 2.417 2.602 2.783 2.861 3.013 3.157 3.353 3.474 3.59 3.769 3.949 4.118 4.277 4.433 4.639 4.836 5.019 5.25 5.481 5.703 5.951 6.212 6.459 6.742 7.05 7.368 7.694 8.055 8.499 8.927 9.395 9.911 10.464 11.05 11.714 12.46 13.268 13.743 13.854 13.772 13.621 13.416 13.188 12.954 12.729 12.468 12.232 12.025 11.805 11.58 11.364 11.154 10.94 10.758 10.589 10.41 10.21 10.028 9.854 9.682 9.543 9.395 9.245 9.089 8.91 8.782 8.656 8.465 8.326 8.181 8.107 7.956 7.784 7.582 7.477 7.283 7.149 7.04 6.927 6.667 6.514 6.359 6.191 5.99 5.755 5.463 4.664 -6 ,13710 ,TETRA ,17556870,Fri Nov 26 08:42:44 CET,Fri Nov 26 10:36:29 CET,0.0 0.313 0.507 0.655 0.779 0.898 1.014 1.123 1.332 1.437 1.542 1.649 1.832 1.932 2.128 2.298 2.46 2.542 2.691 2.827 3.044 3.186 3.315 3.496 3.661 3.822 3.986 4.143 4.336 4.523 4.711 4.944 5.168 5.389 5.635 5.896 6.142 6.415 6.711 7.032 7.381 7.756 8.182 8.608 9.092 9.604 10.169 10.824 11.594 12.453 13.318 13.681 13.768 13.664 13.45 13.285 13.111 12.87 12.612 12.336 12.088 11.865 11.636 11.419 11.221 11.028 10.821 10.641 10.488 10.325 10.147 9.99 9.819 9.648 9.525 9.385 9.242 9.101 8.941 8.827 8.708 8.529 8.405 8.273 8.209 8.072 7.925 7.77 7.689 7.52 7.423 7.301 7.181 6.959 6.824 6.651 6.462 6.25 6.002 5.691 4.87 -7 ,7978 ,TETRA ,17556871,Fri Nov 26 08:42:44 CET,Fri Nov 26 10:36:02 CET,0.0 0.636 0.933 1.142 1.323 1.474 1.625 1.761 2.009 2.128 2.234 2.356 2.545 2.64 2.81 2.959 3.113 3.187 3.328 3.456 3.642 3.777 3.913 4.107 4.283 4.444 4.591 4.754 4.971 5.162 5.351 5.583 5.808 6.026 6.277 6.552 6.824 7.115 7.41 7.73 8.069 8.439 8.894 9.364 9.888 10.47 11.129 11.853 12.685 13.606 14.537 15.015 15.063 14.962 14.752 14.459 14.183 13.917 13.659 13.376 13.137 12.93 12.71 12.474 12.263 12.079 11.88 11.706 11.553 11.391 11.221 11.076 10.923 10.762 10.628 10.488 10.349 10.192 10.032 9.93 9.817 9.629 9.491 9.346 9.269 9.096 8.895 8.698 8.604 8.415 8.29 8.174 8.067 7.833 7.695 7.538 7.352 7.148 6.914 6.563 5.654 -8 ,27998 ,TETRA ,17556872,Fri Nov 26 08:42:44 CET,Fri Nov 26 10:35:06 CET,0.0 0.53 0.746 0.917 1.054 1.183 1.293 1.397 1.599 1.688 1.768 1.829 1.998 2.076 2.214 2.349 2.492 2.557 2.671 2.783 2.955 3.066 3.18 3.346 3.492 3.628 3.762 3.901 4.089 4.275 4.463 4.69 4.906 5.112 5.345 5.603 5.858 6.142 6.454 6.793 7.136 7.505 7.947 8.376 8.874 9.425 10.072 10.806 11.589 12.416 13.274 13.818 13.901 13.761 13.53 13.254 12.943 12.648 12.385 12.09 11.853 11.623 11.367 11.124 10.887 10.666 10.456 10.268 10.078 9.881 9.683 9.521 9.36 9.193 9.066 8.941 8.805 8.658 8.507 8.391 8.272 8.108 7.989 7.859 7.793 7.639 7.457 7.27 7.181 6.998 6.871 6.762 6.659 6.45 6.33 6.185 6.025 5.839 5.574 5.252 4.311 -9 ,21090 ,TETRA ,17556873,Fri Nov 26 08:42:44 CET,Fri Nov 26 10:35:27 CET,0.0 0.636 0.965 1.198 1.388 1.554 1.705 1.853 2.117 2.239 2.354 2.482 2.674 2.768 2.956 3.135 3.294 3.367 3.515 3.671 3.884 4.02 4.149 4.332 4.506 4.674 4.832 4.983 5.19 5.384 5.561 5.768 5.981 6.192 6.426 6.685 6.953 7.249 7.547 7.877 8.228 8.603 9.037 9.49 10.031 10.632 11.28 11.946 12.744 13.645 14.564 15.083 15.182 15.076 14.874 14.63 14.364 14.097 13.857 13.603 13.355 13.125 12.89 12.649 12.413 12.197 11.978 11.772 11.581 11.392 11.206 11.038 10.862 10.689 10.562 10.424 10.266 10.103 9.947 9.844 9.74 9.578 9.458 9.33 9.259 9.101 8.929 8.75 8.661 8.475 8.357 8.253 8.144 7.887 7.749 7.614 7.465 7.295 7.075 6.744 5.554 -10 ,10660 ,TETRA ,17556874,Fri Nov 26 08:44:47 CET,Fri Nov 26 10:37:12 CET,0.0 0.397 0.568 0.722 0.846 0.953 1.072 1.183 1.381 1.477 1.562 1.631 1.806 1.899 2.079 2.245 2.392 2.466 2.619 2.758 2.957 3.08 3.204 3.403 3.586 3.749 3.902 4.06 4.261 4.441 4.618 4.831 5.029 5.225 5.467 5.73 5.978 6.243 6.503 6.791 7.116 7.484 7.924 8.36 8.855 9.421 10.035 10.665 11.352 12.137 13.148 13.746 13.804 13.709 13.567 13.365 13.119 12.844 12.599 12.347 12.137 11.937 11.72 11.508 11.3 11.115 10.915 10.745 10.602 10.444 10.274 10.121 9.962 9.798 9.666 9.515 9.356 9.203 9.044 8.928 8.804 8.606 8.459 8.315 8.243 8.084 7.911 7.725 7.633 7.452 7.33 7.215 7.092 6.829 6.684 6.506 6.321 6.126 5.872 5.553 4.712 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_38_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_38_34.txt deleted file mode 100644 index 951c5fa0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_38_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10264 ,TETRA ,17556875,Fri Nov 26 08:43:42 CET,Fri Nov 26 10:37:17 CET,0.0 0.719 0.95 1.091 1.246 1.395 1.517 1.629 1.835 1.931 2.019 2.091 2.258 2.335 2.498 2.652 2.788 2.851 2.969 3.084 3.25 3.354 3.454 3.605 3.763 3.926 4.082 4.233 4.435 4.628 4.815 5.038 5.25 5.465 5.71 5.971 6.219 6.489 6.794 7.121 7.463 7.854 8.288 8.707 9.19 9.727 10.367 11.097 11.946 12.896 13.913 14.59 14.836 14.879 14.83 14.693 14.498 14.304 14.106 13.912 13.739 13.559 13.383 13.199 13.017 12.839 12.637 12.469 12.33 12.177 12.003 11.852 11.686 11.509 11.38 11.244 11.094 10.93 10.754 10.631 10.5 10.307 10.173 10.02 9.942 9.767 9.582 9.367 9.257 9.067 8.885 8.755 8.613 8.315 8.153 7.97 7.757 7.492 7.155 6.705 4.373 -2 ,20076 ,TETRA ,17556876,Fri Nov 26 08:43:43 CET,Fri Nov 26 10:39:10 CET,0.0 0.391 0.593 0.807 0.994 1.128 1.246 1.358 1.549 1.642 1.734 1.812 1.98 2.058 2.211 2.344 2.471 2.535 2.662 2.785 2.973 3.092 3.203 3.366 3.524 3.683 3.828 3.962 4.137 4.313 4.483 4.694 4.908 5.118 5.367 5.637 5.889 6.164 6.469 6.799 7.142 7.527 7.981 8.439 8.953 9.502 10.134 10.851 11.642 12.557 13.61 14.315 14.574 14.593 14.526 14.409 14.243 14.07 13.906 13.715 13.533 13.361 13.199 13.05 12.906 12.758 12.604 12.483 12.37 12.241 12.102 11.989 11.87 11.73 11.62 11.512 11.395 11.258 11.102 10.989 10.883 10.706 10.575 10.446 10.375 10.215 10.063 9.914 9.832 9.658 9.543 9.438 9.312 9.007 8.854 8.703 8.528 8.305 8.011 7.614 5.911 -3 ,30075 ,TETRA ,17556877,Fri Nov 26 08:43:43 CET,Fri Nov 26 10:36:28 CET,0.0 0.337 0.499 0.683 0.842 0.972 1.118 1.249 1.446 1.537 1.63 1.708 1.883 1.968 2.116 2.254 2.386 2.446 2.561 2.684 2.858 2.97 3.078 3.229 3.373 3.516 3.656 3.791 3.961 4.115 4.27 4.467 4.657 4.842 5.066 5.317 5.552 5.826 6.122 6.428 6.747 7.114 7.561 8.038 8.57 9.112 9.759 10.515 11.38 12.317 13.321 13.94 14.14 14.197 14.176 14.074 13.93 13.753 13.576 13.394 13.205 12.99 12.767 12.57 12.395 12.238 12.063 11.878 11.717 11.559 11.368 11.213 11.063 10.901 10.786 10.673 10.547 10.401 10.232 10.122 10.017 9.862 9.746 9.618 9.557 9.418 9.258 9.095 9.01 8.824 8.682 8.568 8.451 8.2 8.053 7.88 7.678 7.468 7.212 6.818 5.329 -4 ,32566 ,TETRA ,17556878,Fri Nov 26 08:43:43 CET,Fri Nov 26 10:36:18 CET,0.0 0.842 1.083 1.27 1.421 1.559 1.669 1.778 2.018 2.141 2.247 2.35 2.537 2.637 2.827 3.008 3.169 3.241 3.384 3.521 3.722 3.844 3.969 4.163 4.337 4.498 4.656 4.815 5.019 5.215 5.409 5.646 5.876 6.099 6.344 6.61 6.864 7.142 7.44 7.765 8.126 8.533 8.989 9.438 9.954 10.505 11.144 11.863 12.694 13.628 14.624 15.279 15.534 15.598 15.514 15.364 15.188 14.994 14.818 14.62 14.433 14.27 14.114 13.936 13.753 13.582 13.396 13.22 13.064 12.889 12.707 12.564 12.422 12.29 12.191 12.062 11.925 11.798 11.665 11.579 11.483 11.326 11.214 11.086 11.01 10.846 10.686 10.517 10.426 10.246 10.11 9.998 9.898 9.682 9.557 9.399 9.202 8.973 8.704 8.305 6.693 -5 ,24768 ,TETRA ,17556879,Fri Nov 26 08:44:48 CET,Fri Nov 26 10:37:04 CET,0.0 0.986 1.231 1.41 1.562 1.691 1.799 1.913 2.137 2.23 2.318 2.386 2.557 2.638 2.781 2.931 3.089 3.157 3.278 3.397 3.575 3.687 3.788 3.946 4.112 4.269 4.411 4.541 4.72 4.9 5.057 5.244 5.431 5.612 5.823 6.059 6.285 6.53 6.803 7.107 7.428 7.791 8.212 8.655 9.195 9.789 10.427 11.139 11.981 12.899 13.927 14.627 14.918 14.974 14.925 14.836 14.687 14.529 14.357 14.145 13.966 13.8 13.632 13.463 13.287 13.124 12.958 12.8 12.66 12.494 12.303 12.154 12.005 11.839 11.708 11.567 11.406 11.234 11.064 10.954 10.837 10.668 10.549 10.421 10.352 10.193 10.031 9.854 9.762 9.593 9.477 9.366 9.251 9.006 8.867 8.69 8.488 8.262 7.981 7.594 6.42 -6 ,23353 ,TETRA ,17556880,Fri Nov 26 08:44:48 CET,Fri Nov 26 10:26:07 CET,0.0 0.548 0.755 0.92 1.078 1.21 1.338 1.463 1.672 1.756 1.834 1.919 2.099 2.179 2.331 2.472 2.611 2.679 2.805 2.935 3.127 3.247 3.359 3.517 3.676 3.819 3.958 4.11 4.3 4.464 4.627 4.831 5.028 5.22 5.434 5.673 5.906 6.185 6.515 6.849 7.181 7.558 7.994 8.432 8.946 9.526 10.203 10.928 11.72 12.648 13.679 14.335 14.61 14.66 14.614 14.509 14.343 14.163 13.998 13.811 13.631 13.447 13.253 13.047 12.861 12.696 12.515 12.35 12.204 12.054 11.881 11.716 11.537 11.36 11.221 11.077 10.937 10.783 10.605 10.491 10.388 10.227 10.105 9.971 9.904 9.768 9.622 9.46 9.374 9.19 9.054 8.936 8.82 8.567 8.408 8.228 8.023 7.786 7.496 7.095 5.717 -7 ,2143 ,TETRA ,17556881,Fri Nov 26 08:44:48 CET,Fri Nov 26 10:26:57 CET,0.0 0.69 0.908 1.084 1.251 1.411 1.548 1.659 1.884 1.988 2.083 2.166 2.34 2.425 2.588 2.728 2.862 2.927 3.048 3.164 3.334 3.447 3.555 3.71 3.855 3.997 4.137 4.27 4.45 4.64 4.815 5.011 5.22 5.415 5.628 5.898 6.162 6.46 6.777 7.106 7.474 7.868 8.298 8.729 9.248 9.828 10.463 11.165 11.994 12.921 13.938 14.641 14.883 14.93 14.86 14.716 14.55 14.355 14.163 13.955 13.765 13.601 13.426 13.248 13.083 12.919 12.742 12.583 12.451 12.311 12.146 11.988 11.819 11.659 11.527 11.386 11.241 11.076 10.895 10.775 10.657 10.467 10.307 10.133 10.051 9.879 9.707 9.538 9.451 9.284 9.176 9.057 8.943 8.726 8.58 8.416 8.243 8.045 7.771 7.387 5.53 -8 ,11566 ,TETRA ,17556882,Fri Nov 26 08:44:48 CET,Fri Nov 26 10:37:07 CET,0.0 0.614 0.782 0.945 1.102 1.227 1.331 1.434 1.626 1.715 1.801 1.881 2.048 2.123 2.279 2.418 2.543 2.604 2.738 2.861 3.03 3.147 3.263 3.428 3.58 3.723 3.855 3.986 4.169 4.348 4.508 4.706 4.908 5.098 5.308 5.531 5.749 5.994 6.259 6.554 6.877 7.229 7.626 8.042 8.517 9.053 9.669 10.347 11.121 11.986 13.021 13.801 14.152 14.234 14.221 14.177 14.057 13.905 13.759 13.583 13.413 13.248 13.065 12.88 12.712 12.554 12.383 12.218 12.061 11.904 11.742 11.606 11.471 11.322 11.203 11.078 10.938 10.786 10.631 10.531 10.432 10.284 10.183 10.068 10.001 9.853 9.688 9.504 9.407 9.229 9.104 8.992 8.873 8.609 8.463 8.301 8.125 7.913 7.633 7.279 5.82 -9 ,27579 ,TETRA ,17556883,Fri Nov 26 08:44:48 CET,Fri Nov 26 10:37:06 CET,0.0 0.664 0.857 1.012 1.149 1.272 1.391 1.5 1.697 1.786 1.877 1.963 2.132 2.207 2.347 2.482 2.617 2.682 2.813 2.946 3.136 3.252 3.36 3.508 3.664 3.828 3.988 4.143 4.353 4.558 4.754 4.983 5.184 5.396 5.651 5.92 6.171 6.44 6.73 7.052 7.404 7.797 8.242 8.691 9.199 9.764 10.42 11.147 11.967 12.847 13.834 14.554 14.816 14.89 14.847 14.707 14.549 14.373 14.205 14.014 13.84 13.677 13.498 13.322 13.143 12.985 12.847 12.706 12.572 12.442 12.301 12.166 12.031 11.903 11.797 11.68 11.556 11.418 11.268 11.17 11.071 10.918 10.799 10.671 10.61 10.487 10.342 10.174 10.084 9.904 9.765 9.648 9.518 9.233 9.086 8.925 8.731 8.497 8.2 7.77 6.459 -10 ,22384 ,TETRA ,17556884,Fri Nov 26 08:46:47 CET,Fri Nov 26 10:39:02 CET,0.0 0.394 0.607 0.809 0.967 1.116 1.256 1.372 1.571 1.667 1.774 1.871 2.043 2.116 2.246 2.374 2.505 2.57 2.692 2.808 2.976 3.085 3.193 3.349 3.498 3.642 3.785 3.928 4.109 4.273 4.434 4.632 4.82 5.016 5.251 5.511 5.749 6.025 6.325 6.621 6.923 7.269 7.693 8.131 8.627 9.162 9.801 10.509 11.329 12.227 13.174 13.866 14.181 14.334 14.375 14.328 14.224 14.072 13.897 13.698 13.518 13.351 13.178 13.015 12.846 12.666 12.489 12.331 12.185 12.027 11.849 11.693 11.529 11.342 11.21 11.082 10.94 10.803 10.662 10.567 10.466 10.298 10.181 10.046 9.977 9.828 9.671 9.503 9.404 9.224 9.108 8.999 8.88 8.616 8.471 8.296 8.092 7.867 7.604 7.183 5.841 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_38_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_38_37.txt deleted file mode 100644 index 4fb3d19a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_38_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15689 ,TETRA ,17667865,Fri Dec 3 06:07:42 CET,Fri Dec 3 07:55:07 CET,0.0 0.452 0.72 0.904 1.074 1.227 1.352 1.468 1.69 1.8 1.907 1.991 2.159 2.24 2.395 2.537 2.663 2.725 2.847 2.96 3.127 3.237 3.343 3.502 3.662 3.808 3.957 4.104 4.281 4.448 4.611 4.8 4.97 5.141 5.353 5.575 5.773 5.993 6.23 6.492 6.761 7.047 7.379 7.712 8.073 8.435 8.838 9.256 9.678 10.068 10.342 10.236 9.944 9.654 9.358 9.027 8.695 8.386 8.112 7.816 7.534 7.267 7.023 6.782 6.551 6.343 6.107 5.895 5.71 5.512 5.301 5.117 4.942 4.776 4.635 4.487 4.338 4.183 4.013 3.892 3.769 3.574 3.432 3.278 3.192 3.014 2.822 2.61 2.509 2.316 2.167 2.048 1.931 1.65 1.474 1.292 1.091 0.839 0.565 0.257 -0.547 -2 ,6683 ,TETRA ,17667866,Fri Dec 3 06:07:42 CET,Fri Dec 3 07:59:33 CET,0.0 0.865 1.306 1.561 1.751 1.912 2.075 2.223 2.469 2.58 2.695 2.844 3.047 3.157 3.351 3.524 3.696 3.777 3.925 4.06 4.241 4.362 4.493 4.679 4.85 5.012 5.161 5.305 5.495 5.674 5.828 6.007 6.188 6.367 6.572 6.791 6.998 7.234 7.475 7.727 8.002 8.289 8.594 8.891 9.243 9.631 10.026 10.441 10.878 11.297 11.551 11.487 11.242 10.875 10.504 10.141 9.799 9.506 9.248 8.955 8.667 8.39 8.141 7.91 7.698 7.5 7.291 7.108 6.95 6.772 6.578 6.418 6.25 6.074 5.943 5.823 5.7 5.561 5.409 5.313 5.213 5.039 4.919 4.791 4.729 4.606 4.468 4.322 4.238 4.054 3.968 3.873 3.773 3.559 3.436 3.297 3.148 2.975 2.743 2.464 1.789 -3 ,14809 ,TETRA ,17667867,Fri Dec 3 06:07:44 CET,Fri Dec 3 07:58:49 CET,0.0 0.498 0.738 0.926 1.09 1.23 1.354 1.479 1.716 1.811 1.899 1.983 2.155 2.235 2.394 2.533 2.656 2.72 2.848 2.99 3.197 3.32 3.449 3.627 3.786 3.936 4.081 4.222 4.394 4.556 4.721 4.927 5.127 5.323 5.533 5.751 5.954 6.167 6.412 6.661 6.902 7.174 7.47 7.751 8.082 8.406 8.733 9.074 9.428 9.754 9.926 9.823 9.589 9.296 8.968 8.622 8.324 8.07 7.828 7.554 7.305 7.08 6.874 6.676 6.481 6.303 6.109 5.921 5.756 5.596 5.441 5.307 5.169 5.029 4.907 4.771 4.639 4.49 4.326 4.213 4.095 3.912 3.782 3.649 3.582 3.445 3.289 3.121 3.037 2.856 2.754 2.65 2.541 2.308 2.183 2.052 1.908 1.741 1.545 1.266 0.569 -4 ,13775 ,TETRA ,17667868,Fri Dec 3 06:08:42 CET,Fri Dec 3 08:01:37 CET,0.0 0.528 0.766 0.972 1.156 1.29 1.412 1.539 1.761 1.86 1.955 2.048 2.232 2.317 2.482 2.645 2.8 2.876 3.028 3.168 3.362 3.486 3.61 3.789 3.946 4.096 4.246 4.388 4.562 4.741 4.915 5.121 5.321 5.489 5.676 5.893 6.098 6.323 6.563 6.818 7.091 7.397 7.747 8.07 8.42 8.793 9.177 9.54 9.909 10.262 10.488 10.472 10.246 9.891 9.574 9.288 8.98 8.67 8.403 8.138 7.891 7.655 7.433 7.23 7.035 6.855 6.67 6.493 6.332 6.167 6.0 5.86 5.713 5.554 5.42 5.277 5.139 5.0 4.842 4.732 4.632 4.467 4.349 4.227 4.159 4.02 3.882 3.738 3.664 3.488 3.389 3.29 3.18 2.948 2.814 2.658 2.496 2.315 2.088 1.807 1.063 -5 ,22674 ,TETRA ,17667869,Fri Dec 3 06:08:44 CET,Fri Dec 3 08:01:40 CET,0.0 0.46 0.714 0.901 1.063 1.201 1.324 1.445 1.651 1.737 1.822 1.897 2.061 2.135 2.283 2.424 2.554 2.616 2.742 2.855 3.01 3.11 3.21 3.355 3.484 3.623 3.772 3.912 4.092 4.27 4.434 4.618 4.802 4.982 5.178 5.398 5.6 5.815 6.048 6.29 6.55 6.844 7.155 7.462 7.829 8.216 8.623 9.042 9.512 10.007 10.341 10.264 9.997 9.67 9.342 8.979 8.646 8.344 8.069 7.785 7.522 7.275 7.026 6.792 6.575 6.384 6.189 6.012 5.868 5.72 5.557 5.413 5.262 5.101 4.974 4.843 4.711 4.568 4.412 4.308 4.198 4.023 3.899 3.772 3.708 3.556 3.402 3.261 3.185 3.011 2.909 2.803 2.69 2.444 2.309 2.153 1.985 1.819 1.635 1.402 0.478 -6 ,22681 ,TETRA ,17667870,Fri Dec 3 06:08:47 CET,Fri Dec 3 08:02:07 CET,0.0 0.483 0.723 0.917 1.098 1.249 1.372 1.473 1.662 1.758 1.856 1.95 2.123 2.197 2.344 2.484 2.613 2.675 2.79 2.899 3.058 3.166 3.263 3.397 3.529 3.65 3.772 3.89 4.035 4.179 4.324 4.489 4.655 4.829 5.017 5.223 5.408 5.607 5.823 6.043 6.286 6.567 6.856 7.13 7.492 7.877 8.26 8.648 9.039 9.432 9.68 9.605 9.407 9.14 8.844 8.555 8.274 7.991 7.734 7.479 7.252 7.044 6.834 6.638 6.459 6.276 6.083 5.915 5.769 5.622 5.47 5.344 5.204 5.051 4.934 4.808 4.682 4.554 4.413 4.314 4.208 4.04 3.925 3.793 3.723 3.599 3.464 3.308 3.225 3.051 2.965 2.867 2.76 2.541 2.42 2.287 2.154 1.998 1.756 1.465 0.743 -7 ,7510 ,TETRA ,17667871,Fri Dec 3 06:09:12 CET,Fri Dec 3 08:02:34 CET,0.0 0.499 0.741 0.95 1.124 1.273 1.398 1.51 1.73 1.83 1.92 2.0 2.168 2.231 2.362 2.5 2.634 2.696 2.815 2.926 3.082 3.182 3.282 3.42 3.55 3.684 3.813 3.928 4.072 4.218 4.354 4.528 4.712 4.89 5.087 5.303 5.527 5.759 5.986 6.244 6.506 6.78 7.121 7.457 7.823 8.21 8.595 9.019 9.48 9.836 10.085 10.012 9.695 9.314 8.941 8.579 8.257 7.949 7.642 7.335 7.068 6.816 6.572 6.33 6.105 5.915 5.725 5.524 5.334 5.158 4.98 4.825 4.663 4.478 4.331 4.193 4.052 3.906 3.752 3.647 3.541 3.375 3.257 3.13 3.067 2.941 2.794 2.643 2.566 2.389 2.305 2.204 2.106 1.911 1.799 1.67 1.528 1.361 1.14 0.862 0.11 -8 ,15525 ,TETRA ,17667872,Fri Dec 3 06:08:42 CET,Fri Dec 3 08:01:36 CET,0.0 0.443 0.69 0.875 1.028 1.164 1.282 1.395 1.605 1.694 1.783 1.857 2.03 2.108 2.253 2.395 2.523 2.582 2.701 2.814 2.974 3.077 3.172 3.314 3.457 3.597 3.731 3.852 4.0 4.151 4.307 4.504 4.69 4.869 5.069 5.277 5.461 5.661 5.879 6.1 6.34 6.608 6.901 7.19 7.509 7.835 8.171 8.496 8.843 9.194 9.46 9.433 9.222 8.952 8.671 8.352 8.031 7.756 7.519 7.261 7.023 6.804 6.584 6.373 6.176 5.984 5.779 5.597 5.446 5.293 5.124 4.98 4.831 4.678 4.559 4.425 4.285 4.15 4.009 3.905 3.804 3.644 3.516 3.38 3.315 3.184 3.039 2.875 2.785 2.61 2.532 2.437 2.337 2.135 2.008 1.864 1.7 1.51 1.278 0.992 0.351 -9 ,1387 ,TETRA ,17667873,Fri Dec 3 06:08:44 CET,Fri Dec 3 08:01:36 CET,0.0 0.611 0.831 1.017 1.157 1.276 1.399 1.527 1.765 1.869 1.966 2.041 2.206 2.282 2.434 2.586 2.725 2.79 2.922 3.051 3.234 3.354 3.469 3.632 3.792 3.942 4.082 4.217 4.381 4.552 4.727 4.925 5.11 5.28 5.471 5.694 5.898 6.133 6.388 6.637 6.898 7.202 7.546 7.869 8.227 8.608 9.047 9.528 9.985 10.375 10.646 10.529 10.205 9.867 9.545 9.218 8.908 8.593 8.296 7.988 7.721 7.464 7.221 6.994 6.76 6.543 6.318 6.114 5.936 5.746 5.551 5.394 5.235 5.081 4.954 4.824 4.692 4.543 4.392 4.287 4.169 3.987 3.864 3.732 3.662 3.516 3.37 3.22 3.14 2.963 2.878 2.784 2.677 2.451 2.316 2.167 2.01 1.841 1.654 1.41 0.488 -10 ,31938 ,TETRA ,17667874,Fri Dec 3 06:08:46 CET,Fri Dec 3 08:01:36 CET,0.0 0.411 0.615 0.791 0.961 1.113 1.246 1.369 1.596 1.703 1.8 1.869 2.036 2.113 2.261 2.41 2.553 2.617 2.741 2.858 3.022 3.131 3.24 3.401 3.564 3.732 3.882 4.02 4.193 4.366 4.528 4.708 4.882 5.047 5.247 5.469 5.681 5.918 6.173 6.442 6.707 6.979 7.303 7.626 7.971 8.343 8.758 9.159 9.552 9.946 10.229 10.157 9.863 9.553 9.229 8.898 8.589 8.285 7.99 7.687 7.456 7.247 7.039 6.826 6.61 6.42 6.232 6.067 5.921 5.765 5.603 5.467 5.333 5.184 5.06 4.936 4.805 4.674 4.526 4.419 4.311 4.139 4.021 3.891 3.823 3.68 3.536 3.397 3.323 3.15 3.044 2.945 2.852 2.654 2.533 2.385 2.217 2.037 1.838 1.586 0.638 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_38_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_38_43.txt deleted file mode 100644 index 94818fb6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_38_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31724 ,TETRA ,17556885,Fri Nov 26 08:45:47 CET,Fri Nov 26 10:40:11 CET,0.0 0.858 1.126 1.324 1.496 1.667 1.811 1.938 2.191 2.306 2.409 2.524 2.708 2.801 2.982 3.161 3.325 3.403 3.571 3.725 3.939 4.083 4.212 4.395 4.581 4.759 4.941 5.127 5.361 5.576 5.783 6.025 6.261 6.499 6.766 7.052 7.322 7.63 7.976 8.348 8.751 9.215 9.737 10.261 10.883 11.601 12.424 13.304 14.311 15.441 16.654 17.421 17.667 17.647 17.501 17.337 17.147 16.9 16.681 16.443 16.202 15.977 15.757 15.525 15.313 15.111 14.885 14.685 14.498 14.295 14.084 13.891 13.678 13.473 13.321 13.167 13.007 12.826 12.634 12.495 12.341 12.115 11.952 11.779 11.691 11.506 11.309 11.069 10.939 10.733 10.54 10.391 10.222 9.818 9.596 9.377 9.117 8.784 8.398 7.897 4.885 -2 ,19807 ,TETRA ,17556886,Fri Nov 26 08:45:47 CET,Fri Nov 26 10:37:53 CET,0.0 0.742 1.009 1.22 1.405 1.574 1.733 1.881 2.147 2.255 2.355 2.45 2.635 2.737 2.936 3.123 3.293 3.372 3.532 3.691 3.914 4.057 4.199 4.397 4.58 4.749 4.923 5.096 5.309 5.512 5.706 5.943 6.18 6.408 6.671 6.977 7.281 7.618 7.979 8.365 8.76 9.182 9.697 10.228 10.848 11.54 12.338 13.231 14.237 15.309 16.393 17.04 17.231 17.195 17.009 16.735 16.465 16.222 15.999 15.735 15.484 15.262 15.009 14.767 14.54 14.314 14.074 13.864 13.697 13.52 13.312 13.116 12.919 12.727 12.567 12.392 12.198 12.012 11.833 11.689 11.524 11.276 11.099 10.912 10.823 10.616 10.387 10.152 10.027 9.816 9.632 9.494 9.326 8.947 8.733 8.511 8.276 7.966 7.587 7.024 3.975 -3 ,24772 ,TETRA ,17556887,Fri Nov 26 08:45:46 CET,Fri Nov 26 10:39:27 CET,0.0 0.675 0.943 1.147 1.308 1.467 1.63 1.778 2.05 2.167 2.274 2.395 2.589 2.697 2.9 3.081 3.253 3.336 3.513 3.685 3.921 4.069 4.215 4.439 4.654 4.858 5.056 5.249 5.497 5.732 5.951 6.228 6.506 6.756 7.043 7.376 7.683 8.01 8.378 8.783 9.227 9.709 10.239 10.776 11.404 12.07 12.794 13.627 14.621 15.778 16.998 17.694 17.861 17.808 17.65 17.459 17.211 16.937 16.697 16.425 16.192 15.96 15.729 15.522 15.316 15.118 14.887 14.654 14.448 14.23 14.002 13.819 13.63 13.435 13.29 13.129 12.953 12.764 12.566 12.429 12.281 12.05 11.886 11.716 11.628 11.443 11.247 11.016 10.89 10.674 10.463 10.325 10.168 9.779 9.544 9.299 9.044 8.736 8.328 7.712 4.523 -4 ,4470 ,TETRA ,17556888,Fri Nov 26 08:45:46 CET,Fri Nov 26 10:28:42 CET,0.0 0.566 0.83 1.046 1.235 1.398 1.543 1.674 1.917 2.032 2.144 2.259 2.452 2.55 2.739 2.924 3.108 3.192 3.345 3.493 3.699 3.834 3.966 4.167 4.369 4.557 4.75 4.939 5.169 5.398 5.628 5.914 6.189 6.454 6.759 7.089 7.399 7.736 8.118 8.514 8.924 9.385 9.909 10.458 11.08 11.775 12.578 13.463 14.498 15.684 16.868 17.498 17.623 17.599 17.473 17.26 17.041 16.788 16.532 16.265 16.022 15.789 15.575 15.363 15.152 14.953 14.748 14.552 14.359 14.142 13.918 13.743 13.554 13.356 13.202 13.04 12.869 12.694 12.494 12.353 12.221 11.982 11.799 11.622 11.539 11.367 11.169 10.946 10.82 10.611 10.44 10.299 10.149 9.793 9.586 9.379 9.097 8.775 8.404 7.881 5.851 -5 ,5321 ,TETRA ,17556889,Fri Nov 26 08:45:45 CET,Fri Nov 26 10:37:55 CET,0.0 0.453 0.703 0.914 1.105 1.283 1.46 1.623 1.927 2.062 2.185 2.315 2.509 2.606 2.784 2.954 3.128 3.213 3.365 3.506 3.709 3.844 3.981 4.184 4.374 4.552 4.73 4.912 5.152 5.375 5.583 5.835 6.087 6.344 6.649 6.988 7.302 7.654 8.053 8.443 8.845 9.313 9.858 10.417 11.08 11.806 12.601 13.479 14.46 15.554 16.665 17.336 17.474 17.373 17.175 16.937 16.708 16.478 16.248 15.995 15.739 15.507 15.289 15.052 14.816 14.598 14.372 14.17 13.988 13.793 13.583 13.395 13.187 12.982 12.828 12.643 12.444 12.245 12.031 11.893 11.755 11.536 11.371 11.188 11.095 10.916 10.717 10.472 10.346 10.144 9.94 9.786 9.615 9.257 9.065 8.832 8.558 8.259 7.903 7.388 5.153 -6 ,6526 ,TETRA ,17556890,Fri Nov 26 08:45:46 CET,Fri Nov 26 10:38:11 CET,0.0 0.517 0.804 1.022 1.199 1.341 1.472 1.594 1.83 1.937 2.045 2.156 2.341 2.437 2.633 2.829 2.996 3.074 3.225 3.367 3.589 3.731 3.865 4.055 4.235 4.414 4.592 4.759 4.97 5.173 5.369 5.605 5.824 6.043 6.322 6.659 6.98 7.318 7.681 8.082 8.522 9.002 9.548 10.109 10.74 11.397 12.179 13.064 14.081 15.198 16.282 16.851 17.025 17.051 16.902 16.701 16.473 16.184 15.916 15.645 15.399 15.178 14.945 14.722 14.51 14.304 14.078 13.862 13.682 13.491 13.269 13.075 12.869 12.662 12.496 12.325 12.148 11.951 11.732 11.574 11.432 11.22 11.059 10.883 10.792 10.606 10.397 10.172 10.058 9.856 9.652 9.503 9.337 8.936 8.731 8.511 8.245 7.907 7.493 6.918 3.5 -7 ,31372 ,TETRA ,17556891,Fri Nov 26 08:45:46 CET,Fri Nov 26 10:37:37 CET,0.0 0.94 1.216 1.423 1.578 1.718 1.843 1.969 2.227 2.345 2.456 2.578 2.773 2.867 3.047 3.225 3.396 3.477 3.625 3.774 3.985 4.116 4.249 4.441 4.616 4.786 4.955 5.121 5.346 5.558 5.759 6.013 6.262 6.492 6.762 7.072 7.361 7.7 8.088 8.499 8.912 9.355 9.899 10.46 11.082 11.792 12.62 13.475 14.423 15.518 16.777 17.426 17.51 17.461 17.308 17.087 16.855 16.599 16.348 16.102 15.881 15.665 15.459 15.233 15.001 14.794 14.573 14.362 14.165 13.951 13.74 13.568 13.373 13.156 12.99 12.818 12.649 12.475 12.283 12.145 11.994 11.757 11.594 11.406 11.31 11.122 10.889 10.644 10.527 10.314 10.108 9.964 9.79 9.415 9.215 8.993 8.713 8.374 7.962 7.405 5.186 -8 ,8975 ,TETRA ,17556892,Fri Nov 26 08:45:46 CET,Fri Nov 26 10:37:54 CET,0.0 1.036 1.316 1.554 1.742 1.935 2.103 2.247 2.524 2.666 2.806 2.953 3.163 3.279 3.493 3.684 3.867 3.957 4.128 4.305 4.56 4.708 4.864 5.09 5.301 5.514 5.718 5.907 6.141 6.372 6.593 6.86 7.135 7.401 7.689 8.011 8.319 8.651 9.038 9.478 9.9 10.355 10.895 11.445 12.089 12.768 13.55 14.431 15.416 16.52 17.693 18.373 18.543 18.5 18.33 18.094 17.846 17.581 17.321 17.042 16.796 16.581 16.361 16.13 15.909 15.684 15.431 15.214 15.025 14.816 14.596 14.403 14.195 14.001 13.84 13.657 13.473 13.28 13.08 12.939 12.791 12.549 12.387 12.202 12.097 11.89 11.675 11.437 11.307 11.097 10.917 10.774 10.605 10.235 10.033 9.786 9.487 9.159 8.822 8.283 5.771 -9 ,1857 ,TETRA ,17556893,Fri Nov 26 08:45:46 CET,Fri Nov 26 10:37:55 CET,0.0 0.665 0.979 1.212 1.394 1.557 1.704 1.837 2.078 2.189 2.298 2.41 2.597 2.691 2.87 3.051 3.224 3.302 3.459 3.612 3.82 3.951 4.085 4.273 4.456 4.641 4.82 4.991 5.22 5.441 5.646 5.896 6.147 6.383 6.651 6.952 7.241 7.558 7.899 8.281 8.687 9.131 9.65 10.203 10.836 11.533 12.328 13.186 14.166 15.228 16.345 17.024 17.171 17.136 17.073 16.914 16.683 16.426 16.176 15.897 15.638 15.398 15.172 14.953 14.733 14.521 14.304 14.089 13.91 13.744 13.543 13.357 13.174 12.986 12.827 12.662 12.493 12.308 12.117 11.974 11.822 11.591 11.42 11.231 11.136 10.941 10.722 10.503 10.386 10.169 9.961 9.82 9.656 9.289 9.081 8.856 8.609 8.295 7.929 7.426 5.403 -10 ,320 ,TETRA ,17556894,Fri Nov 26 08:45:47 CET,Fri Nov 26 10:37:40 CET,0.0 0.775 1.056 1.269 1.447 1.595 1.738 1.867 2.101 2.21 2.322 2.445 2.631 2.73 2.922 3.104 3.281 3.368 3.548 3.724 3.969 4.119 4.27 4.485 4.685 4.878 5.066 5.242 5.461 5.681 5.899 6.165 6.421 6.673 6.977 7.304 7.609 7.946 8.304 8.696 9.108 9.568 10.103 10.633 11.261 11.967 12.743 13.585 14.59 15.713 16.838 17.517 17.708 17.627 17.438 17.198 16.941 16.707 16.474 16.198 15.939 15.696 15.435 15.181 14.958 14.735 14.493 14.266 14.061 13.839 13.6 13.403 13.208 13.007 12.856 12.71 12.555 12.375 12.178 12.04 11.888 11.661 11.496 11.308 11.214 11.015 10.777 10.525 10.407 10.204 9.983 9.839 9.697 9.329 9.108 8.868 8.623 8.332 7.9 7.291 4.722 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_39_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_39_19.txt deleted file mode 100644 index 81212377..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_39_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17773 ,KEBNE ,17025461,Wed Dec 22 12:42:48 CET,Wed Dec 22 14:19:12 CET,0.0 0.125 0.181 0.262 0.341 0.4 0.457 0.507 0.577 0.611 0.644 0.625 0.745 0.79 0.871 0.951 1.01 1.038 1.089 1.14 1.213 1.25 1.286 1.341 1.387 1.425 1.456 1.487 1.517 1.537 1.561 1.589 1.609 1.623 1.642 1.653 1.646 1.633 1.605 1.564 1.508 1.415 1.292 1.135 0.864 0.492 -0.006 -0.713 -1.734 -3.198 -5.622 -8.564 -10.915 -12.864 -14.498 -15.875 -17.052 -18.12 -19.016 -19.91 -20.703 -21.422 -22.091 -22.683 -23.229 -23.742 -24.272 -24.742 -25.151 -25.58 -26.018 -26.366 -26.731 -27.117 -27.418 -27.742 -28.085 -28.426 -28.766 -29.0 -29.248 -29.637 -29.921 -30.221 -30.366 -30.669 -31.0 -31.351 -31.534 -31.835 -32.142 -32.359 -32.588 -33.091 -33.377 -33.707 -34.091 -34.486 -34.939 -35.608 -38.736 -2 ,4081 ,KEBNE ,17025462,Wed Dec 22 12:57:12 CET,Wed Dec 22 14:34:19 CET,0.0 0.142 0.205 0.268 0.327 0.377 0.428 0.479 0.582 0.64 0.698 0.743 0.861 0.898 0.971 1.041 1.106 1.142 1.203 1.241 1.29 1.317 1.344 1.39 1.432 1.468 1.501 1.536 1.572 1.594 1.615 1.641 1.672 1.693 1.7 1.701 1.692 1.669 1.645 1.609 1.544 1.463 1.331 1.135 0.84 0.473 -0.029 -0.756 -1.738 -3.249 -5.764 -8.699 -11.083 -13.052 -14.67 -16.085 -17.286 -18.334 -19.237 -20.136 -20.895 -21.542 -22.17 -22.772 -23.315 -23.793 -24.321 -24.794 -25.179 -25.583 -26.017 -26.38 -26.736 -27.105 -27.414 -27.746 -28.081 -28.418 -28.758 -28.989 -29.223 -29.59 -29.865 -30.163 -30.314 -30.65 -31.007 -31.341 -31.503 -31.784 -32.07 -32.277 -32.489 -32.919 -33.176 -33.482 -33.803 -34.131 -34.552 -35.196 -38.459 -3 ,711 ,KEBNE ,17025463,Wed Dec 22 12:57:12 CET,Wed Dec 22 14:33:28 CET,0.0 0.153 0.245 0.313 0.353 0.4 0.452 0.492 0.549 0.581 0.619 0.612 0.713 0.735 0.773 0.815 0.857 0.875 0.91 0.936 0.961 0.984 1.01 1.042 1.067 1.089 1.116 1.135 1.143 1.147 1.151 1.155 1.142 1.128 1.122 1.106 1.085 1.051 0.997 0.93 0.83 0.686 0.503 0.294 -0.007 -0.418 -0.983 -1.745 -2.802 -4.305 -6.814 -9.704 -11.946 -13.77 -15.338 -16.784 -18.016 -19.079 -19.99 -20.874 -21.63 -22.325 -22.977 -23.582 -24.148 -24.636 -25.135 -25.607 -26.021 -26.437 -26.877 -27.247 -27.629 -28.036 -28.347 -28.662 -28.983 -29.322 -29.674 -29.91 -30.166 -30.578 -30.852 -31.126 -31.271 -31.569 -31.897 -32.25 -32.424 -32.72 -33.056 -33.281 -33.527 -34.067 -34.362 -34.69 -35.051 -35.46 -35.992 -36.768 -40.339 -4 ,27550 ,KEBNE ,17025464,Wed Dec 22 12:57:13 CET,Wed Dec 22 14:33:06 CET,0.0 0.161 0.241 0.306 0.371 0.43 0.485 0.53 0.602 0.633 0.668 0.656 0.758 0.79 0.847 0.888 0.928 0.945 0.973 1.004 1.045 1.057 1.065 1.086 1.092 1.102 1.131 1.155 1.179 1.191 1.199 1.191 1.165 1.156 1.155 1.152 1.124 1.064 1.008 0.955 0.878 0.744 0.547 0.354 0.109 -0.268 -0.817 -1.552 -2.592 -4.076 -6.428 -9.182 -11.462 -13.325 -14.908 -16.347 -17.546 -18.548 -19.452 -20.411 -21.194 -21.879 -22.526 -23.125 -23.706 -24.227 -24.734 -25.172 -25.568 -25.982 -26.401 -26.746 -27.119 -27.51 -27.806 -28.108 -28.41 -28.716 -29.022 -29.234 -29.464 -29.84 -30.111 -30.41 -30.575 -30.911 -31.229 -31.55 -31.724 -32.002 -32.263 -32.458 -32.663 -33.152 -33.442 -33.764 -34.134 -34.578 -35.141 -35.892 -39.727 -5 ,7025 ,KEBNE ,17025465,Wed Dec 22 12:57:12 CET,Wed Dec 22 14:34:48 CET,0.0 0.246 0.325 0.393 0.441 0.483 0.528 0.578 0.663 0.694 0.721 0.688 0.787 0.819 0.877 0.923 0.959 0.978 1.004 1.02 1.051 1.072 1.089 1.114 1.141 1.156 1.165 1.172 1.175 1.186 1.193 1.198 1.207 1.201 1.185 1.184 1.182 1.165 1.108 1.012 0.91 0.762 0.557 0.373 0.095 -0.305 -0.832 -1.584 -2.643 -4.228 -6.799 -9.632 -11.847 -13.676 -15.198 -16.542 -17.695 -18.727 -19.608 -20.483 -21.236 -21.888 -22.52 -23.111 -23.65 -24.128 -24.593 -25.028 -25.412 -25.787 -26.169 -26.471 -26.784 -27.139 -27.423 -27.721 -28.031 -28.347 -28.681 -28.91 -29.14 -29.497 -29.762 -30.045 -30.184 -30.468 -30.774 -31.096 -31.273 -31.572 -31.905 -32.144 -32.392 -32.947 -33.253 -33.587 -33.938 -34.342 -34.909 -35.701 -39.172 -6 ,13679 ,KEBNE ,17025466,Wed Dec 22 12:57:11 CET,Wed Dec 22 14:33:07 CET,0.0 0.182 0.269 0.362 0.437 0.49 0.538 0.581 0.647 0.679 0.71 0.691 0.786 0.805 0.851 0.9 0.955 0.982 1.028 1.064 1.114 1.146 1.169 1.203 1.239 1.265 1.279 1.295 1.309 1.308 1.308 1.298 1.306 1.313 1.302 1.289 1.269 1.233 1.181 1.125 1.059 0.959 0.812 0.632 0.336 -0.074 -0.605 -1.354 -2.442 -3.994 -6.479 -9.395 -11.791 -13.804 -15.496 -16.967 -18.221 -19.309 -20.219 -21.13 -21.916 -22.61 -23.265 -23.895 -24.505 -25.033 -25.564 -26.042 -26.436 -26.827 -27.225 -27.544 -27.904 -28.304 -28.606 -28.912 -29.244 -29.62 -29.989 -30.237 -30.494 -30.866 -31.118 -31.398 -31.546 -31.849 -32.154 -32.493 -32.686 -32.988 -33.307 -33.54 -33.78 -34.298 -34.596 -34.896 -35.217 -35.595 -36.055 -36.733 -41.078 -7 ,28167 ,KEBNE ,17025467,Wed Dec 22 12:57:11 CET,Wed Dec 22 14:33:34 CET,0.0 0.372 0.456 0.545 0.625 0.688 0.758 0.808 0.885 0.921 0.953 0.93 1.026 1.056 1.12 1.178 1.233 1.259 1.301 1.35 1.42 1.457 1.499 1.56 1.606 1.638 1.68 1.723 1.77 1.803 1.825 1.846 1.875 1.89 1.9 1.914 1.906 1.876 1.828 1.771 1.728 1.638 1.465 1.283 1.045 0.722 0.239 -0.473 -1.505 -2.958 -5.309 -8.161 -10.471 -12.453 -14.112 -15.485 -16.656 -17.738 -18.662 -19.556 -20.328 -21.018 -21.675 -22.284 -22.831 -23.339 -23.888 -24.378 -24.784 -25.19 -25.606 -25.947 -26.301 -26.68 -26.975 -27.257 -27.545 -27.848 -28.163 -28.403 -28.675 -29.068 -29.316 -29.572 -29.706 -29.994 -30.314 -30.659 -30.849 -31.153 -31.441 -31.652 -31.882 -32.406 -32.703 -33.005 -33.351 -33.775 -34.299 -35.047 -38.401 -8 ,28870 ,KEBNE ,17025468,Wed Dec 22 12:57:12 CET,Wed Dec 22 14:33:33 CET,0.0 0.104 0.165 0.222 0.278 0.323 0.356 0.397 0.479 0.519 0.556 0.531 0.63 0.656 0.696 0.727 0.768 0.79 0.827 0.858 0.896 0.912 0.921 0.939 0.959 0.971 0.981 0.991 1.006 1.033 1.053 1.059 1.059 1.053 1.038 1.012 0.976 0.939 0.881 0.79 0.692 0.568 0.39 0.17 -0.112 -0.498 -1.034 -1.769 -2.806 -4.284 -6.716 -9.602 -11.88 -13.774 -15.361 -16.716 -17.915 -18.996 -19.893 -20.777 -21.553 -22.248 -22.886 -23.474 -24.013 -24.506 -25.023 -25.463 -25.837 -26.251 -26.674 -26.982 -27.307 -27.682 -27.972 -28.269 -28.578 -28.89 -29.205 -29.409 -29.615 -29.95 -30.191 -30.447 -30.584 -30.87 -31.186 -31.527 -31.698 -31.979 -32.227 -32.412 -32.652 -33.2 -33.483 -33.791 -34.148 -34.601 -35.124 -35.837 -39.244 -9 ,21731 ,KEBNE ,17025469,Wed Dec 22 12:57:13 CET,Wed Dec 22 14:32:56 CET,0.0 0.194 0.296 0.349 0.395 0.444 0.488 0.532 0.612 0.647 0.684 0.68 0.781 0.805 0.848 0.884 0.926 0.944 0.976 1.005 1.038 1.057 1.081 1.107 1.122 1.134 1.155 1.184 1.199 1.206 1.211 1.223 1.251 1.269 1.276 1.295 1.306 1.291 1.252 1.195 1.124 1.018 0.868 0.682 0.394 -0.017 -0.54 -1.201 -2.229 -3.785 -6.203 -9.109 -11.497 -13.492 -15.181 -16.589 -17.739 -18.739 -19.603 -20.488 -21.24 -21.893 -22.511 -23.084 -23.627 -24.153 -24.665 -25.101 -25.498 -25.9 -26.34 -26.733 -27.149 -27.595 -27.932 -28.266 -28.607 -28.963 -29.313 -29.536 -29.785 -30.202 -30.492 -30.798 -30.95 -31.249 -31.57 -31.918 -32.103 -32.393 -32.673 -32.882 -33.112 -33.614 -33.915 -34.252 -34.598 -34.979 -35.454 -36.096 -38.667 -10 ,13657 ,KEBNE ,17025470,Wed Dec 22 12:57:13 CET,Wed Dec 22 14:33:26 CET,0.0 0.16 0.23 0.275 0.314 0.361 0.414 0.457 0.529 0.565 0.597 0.58 0.677 0.701 0.746 0.776 0.797 0.808 0.833 0.859 0.896 0.915 0.926 0.952 0.985 1.001 1.024 1.051 1.083 1.106 1.125 1.139 1.136 1.132 1.133 1.111 1.075 1.038 0.981 0.904 0.816 0.715 0.556 0.355 0.101 -0.251 -0.74 -1.397 -2.415 -3.972 -6.418 -9.259 -11.611 -13.591 -15.172 -16.549 -17.787 -18.875 -19.803 -20.692 -21.447 -22.137 -22.782 -23.388 -23.939 -24.423 -24.928 -25.393 -25.818 -26.261 -26.702 -27.064 -27.434 -27.822 -28.124 -28.427 -28.741 -29.078 -29.427 -29.673 -29.925 -30.312 -30.578 -30.86 -31.007 -31.304 -31.621 -31.974 -32.166 -32.47 -32.77 -32.984 -33.222 -33.739 -34.002 -34.287 -34.604 -34.997 -35.483 -36.159 -39.661 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_39_28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_39_28.txt deleted file mode 100644 index 40ef76c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_39_28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,890 ,TETRA ,17556895,Fri Nov 26 08:45:48 CET,Fri Nov 26 10:38:43 CET,0.0 1.268 1.543 1.765 1.941 2.111 2.281 2.428 2.689 2.816 2.938 3.108 3.314 3.45 3.689 3.916 4.131 4.237 4.445 4.638 4.929 5.114 5.288 5.56 5.832 6.087 6.337 6.58 6.886 7.188 7.48 7.816 8.143 8.454 8.808 9.236 9.642 10.072 10.548 11.061 11.611 12.232 12.938 13.658 14.496 15.407 16.495 17.708 18.997 20.305 21.802 22.942 23.305 23.203 22.934 22.67 22.381 22.087 21.826 21.489 21.122 20.79 20.498 20.232 19.97 19.709 19.427 19.181 18.98 18.777 18.556 18.362 18.163 17.96 17.786 17.582 17.374 17.156 16.918 16.75 16.572 16.294 16.117 15.935 15.834 15.619 15.368 15.105 14.97 14.758 14.489 14.313 14.117 13.717 13.489 13.222 12.927 12.582 12.137 11.508 7.943 -2 ,8970 ,TETRA ,17556896,Fri Nov 26 08:45:46 CET,Fri Nov 26 10:38:34 CET,0.0 1.193 1.459 1.683 1.871 2.047 2.211 2.359 2.64 2.77 2.894 3.059 3.251 3.362 3.563 3.763 3.965 4.06 4.242 4.418 4.677 4.84 5.001 5.244 5.478 5.71 5.941 6.165 6.47 6.774 7.053 7.4 7.751 8.075 8.445 8.885 9.303 9.761 10.273 10.791 11.344 11.999 12.741 13.416 14.231 15.184 16.257 17.507 18.906 20.361 21.793 22.723 22.951 22.807 22.601 22.341 22.07 21.746 21.418 21.111 20.811 20.524 20.229 19.907 19.606 19.356 19.101 18.85 18.624 18.375 18.099 17.876 17.651 17.416 17.222 17.013 16.793 16.56 16.316 16.14 15.959 15.685 15.494 15.285 15.176 14.962 14.732 14.462 14.312 14.097 13.83 13.665 13.478 13.067 12.833 12.57 12.272 11.902 11.471 10.897 7.229 -3 ,18684 ,TETRA ,17556897,Fri Nov 26 08:45:47 CET,Fri Nov 26 10:40:15 CET,0.0 1.486 1.793 2.033 2.221 2.392 2.56 2.724 3.024 3.166 3.306 3.463 3.637 3.743 3.965 4.19 4.397 4.495 4.692 4.888 5.182 5.378 5.566 5.83 6.091 6.334 6.565 6.803 7.109 7.404 7.701 8.074 8.433 8.774 9.168 9.589 9.985 10.429 10.932 11.479 12.053 12.676 13.368 14.061 14.899 15.849 16.92 18.157 19.648 21.295 23.013 24.161 24.565 24.596 24.486 24.264 23.972 23.668 23.339 23.01 22.752 22.471 22.174 21.897 21.626 21.372 21.083 20.788 20.533 20.289 20.057 19.857 19.641 19.425 19.241 19.046 18.845 18.636 18.426 18.267 18.077 17.775 17.585 17.395 17.294 17.081 16.853 16.608 16.474 16.278 16.047 15.89 15.729 15.315 15.072 14.82 14.544 14.205 13.743 13.115 10.48 -4 ,232 ,TETRA ,17556899,Fri Nov 26 08:45:46 CET,Fri Nov 26 10:39:38 CET,0.0 0.815 1.089 1.317 1.527 1.712 1.868 2.017 2.305 2.44 2.561 2.726 2.925 3.034 3.241 3.446 3.654 3.755 3.953 4.152 4.44 4.626 4.8 5.061 5.33 5.583 5.825 6.062 6.384 6.674 6.952 7.303 7.625 7.946 8.313 8.72 9.111 9.536 9.997 10.506 11.057 11.667 12.378 13.12 14.01 14.973 16.06 17.31 18.735 20.262 21.772 22.616 22.828 22.747 22.563 22.366 22.125 21.807 21.478 21.115 20.794 20.508 20.209 19.893 19.61 19.357 19.069 18.795 18.558 18.32 18.087 17.879 17.64 17.422 17.274 17.109 16.924 16.733 16.531 16.373 16.205 15.943 15.742 15.522 15.408 15.19 14.982 14.753 14.63 14.437 14.191 14.031 13.866 13.505 13.305 13.07 12.808 12.512 12.143 11.636 9.507 -5 ,387 ,TETRA ,17556900,Fri Nov 26 08:45:47 CET,Fri Nov 26 10:38:42 CET,0.0 1.292 1.621 1.892 2.113 2.31 2.485 2.628 2.9 3.041 3.181 3.362 3.55 3.661 3.879 4.079 4.265 4.362 4.556 4.737 4.994 5.158 5.325 5.56 5.774 5.99 6.207 6.427 6.717 6.987 7.252 7.596 7.936 8.27 8.649 9.071 9.478 9.917 10.391 10.896 11.439 12.07 12.827 13.581 14.444 15.408 16.538 17.793 19.175 20.703 22.308 23.347 23.757 23.866 23.756 23.492 23.17 22.811 22.523 22.24 21.959 21.698 21.426 21.148 20.878 20.607 20.313 20.049 19.824 19.605 19.383 19.183 18.952 18.691 18.488 18.274 18.044 17.825 17.597 17.425 17.244 16.959 16.738 16.508 16.4 16.165 15.916 15.665 15.525 15.316 15.051 14.883 14.707 14.322 14.075 13.794 13.481 13.119 12.62 11.905 8.575 -6 ,4702 ,TETRA ,17556901,Fri Nov 26 08:46:46 CET,Fri Nov 26 10:40:53 CET,0.0 1.151 1.396 1.626 1.842 2.006 2.154 2.304 2.585 2.711 2.835 2.994 3.179 3.283 3.493 3.718 3.936 4.033 4.227 4.431 4.706 4.876 5.054 5.324 5.582 5.819 6.049 6.273 6.558 6.85 7.136 7.458 7.765 8.07 8.433 8.838 9.234 9.671 10.139 10.672 11.232 11.839 12.572 13.343 14.245 15.212 16.253 17.411 18.749 20.224 21.785 22.734 23.025 23.017 22.868 22.66 22.429 22.119 21.804 21.469 21.151 20.866 20.589 20.302 20.025 19.774 19.494 19.235 19.015 18.798 18.568 18.375 18.167 17.915 17.717 17.513 17.28 17.045 16.801 16.626 16.451 16.174 15.972 15.765 15.664 15.443 15.193 14.933 14.792 14.577 14.312 14.145 13.964 13.575 13.357 13.117 12.842 12.488 12.061 11.534 8.319 -7 ,26034 ,TETRA ,17556902,Fri Nov 26 08:46:46 CET,Fri Nov 26 10:42:09 CET,0.0 1.084 1.421 1.696 1.91 2.088 2.26 2.419 2.715 2.853 2.982 3.144 3.343 3.468 3.684 3.889 4.094 4.194 4.388 4.571 4.835 5.012 5.19 5.464 5.738 5.99 6.231 6.475 6.784 7.08 7.367 7.728 8.081 8.401 8.772 9.199 9.604 10.044 10.535 11.055 11.585 12.181 12.912 13.69 14.584 15.543 16.666 17.92 19.278 20.788 22.376 23.351 23.684 23.719 23.583 23.362 23.11 22.811 22.521 22.223 21.953 21.698 21.449 21.205 20.931 20.65 20.357 20.085 19.849 19.613 19.365 19.147 18.902 18.635 18.439 18.243 18.042 17.833 17.609 17.456 17.281 17.001 16.81 16.602 16.492 16.261 16.022 15.767 15.625 15.409 15.153 14.99 14.819 14.437 14.222 13.977 13.698 13.376 12.966 12.403 9.783 -8 ,798 ,TETRA ,17556903,Fri Nov 26 08:46:46 CET,Fri Nov 26 10:42:30 CET,0.0 1.076 1.364 1.589 1.769 1.929 2.091 2.238 2.511 2.643 2.766 2.939 3.141 3.268 3.511 3.733 3.943 4.048 4.265 4.479 4.758 4.932 5.106 5.358 5.602 5.844 6.072 6.29 6.586 6.879 7.158 7.49 7.823 8.152 8.527 8.947 9.345 9.787 10.275 10.787 11.325 11.925 12.633 13.37 14.186 15.105 16.205 17.39 18.824 20.39 21.896 22.946 23.333 23.406 23.372 23.236 22.952 22.587 22.26 21.936 21.669 21.374 21.058 20.789 20.538 20.264 19.956 19.699 19.464 19.223 18.968 18.75 18.531 18.289 18.109 17.922 17.718 17.509 17.283 17.131 16.98 16.729 16.546 16.35 16.251 16.055 15.836 15.577 15.445 15.251 15.019 14.859 14.683 14.326 14.109 13.853 13.544 13.187 12.773 12.221 9.303 -9 ,32165 ,TETRA ,17556904,Fri Nov 26 08:46:46 CET,Fri Nov 26 10:40:21 CET,0.0 1.646 1.948 2.17 2.399 2.619 2.812 2.971 3.255 3.396 3.531 3.696 3.879 3.984 4.206 4.414 4.608 4.706 4.889 5.067 5.347 5.532 5.708 5.976 6.248 6.507 6.756 7.002 7.312 7.592 7.878 8.249 8.601 8.942 9.331 9.743 10.139 10.595 11.092 11.612 12.155 12.8 13.527 14.238 15.11 16.012 16.978 18.115 19.504 21.081 22.698 23.686 24.059 24.07 23.857 23.545 23.224 22.863 22.499 22.168 21.907 21.636 21.357 21.086 20.798 20.522 20.243 19.996 19.783 19.56 19.306 19.086 18.851 18.585 18.383 18.184 17.963 17.73 17.496 17.324 17.129 16.813 16.595 16.366 16.248 16.006 15.75 15.485 15.342 15.138 14.886 14.722 14.548 14.118 13.879 13.637 13.369 13.049 12.607 11.945 8.318 -10 ,29363 ,TETRA ,17556905,Fri Nov 26 08:46:46 CET,Fri Nov 26 10:41:38 CET,0.0 1.875 2.184 2.37 2.537 2.699 2.852 2.994 3.249 3.361 3.481 3.645 3.823 3.931 4.136 4.332 4.522 4.62 4.826 5.024 5.318 5.508 5.694 5.969 6.232 6.473 6.702 6.933 7.238 7.538 7.818 8.16 8.502 8.831 9.2 9.622 10.044 10.502 10.997 11.528 12.108 12.769 13.513 14.245 15.109 16.09 17.195 18.395 19.713 21.197 22.854 23.816 24.15 24.176 24.068 23.869 23.631 23.373 23.054 22.693 22.349 22.046 21.784 21.512 21.259 21.032 20.76 20.499 20.271 20.029 19.769 19.56 19.341 19.097 18.91 18.706 18.491 18.286 18.068 17.908 17.748 17.51 17.343 17.149 17.044 16.831 16.593 16.338 16.209 16.013 15.775 15.61 15.44 15.067 14.859 14.644 14.404 14.122 13.76 13.178 9.368 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_39_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_39_37.txt deleted file mode 100644 index 1c113770..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_39_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14460 ,TETRA ,17556906,Fri Nov 26 08:46:47 CET,Fri Nov 26 10:40:14 CET,0.0 0.411 0.61 0.773 0.934 1.07 1.185 1.293 1.492 1.585 1.677 1.769 1.916 1.986 2.12 2.242 2.349 2.405 2.506 2.595 2.736 2.815 2.886 2.992 3.081 3.154 3.229 3.311 3.419 3.513 3.583 3.648 3.71 3.77 3.835 3.89 3.943 4.008 4.07 4.118 4.149 4.181 4.189 4.143 4.056 3.917 3.671 3.298 2.753 1.891 0.298 -1.672 -3.265 -4.61 -5.746 -6.732 -7.581 -8.32 -8.935 -9.558 -10.1 -10.591 -11.068 -11.509 -11.917 -12.285 -12.665 -13.015 -13.312 -13.61 -13.929 -14.198 -14.469 -14.746 -14.961 -15.187 -15.427 -15.67 -15.926 -16.104 -16.273 -16.529 -16.719 -16.923 -17.026 -17.243 -17.473 -17.711 -17.836 -18.056 -18.255 -18.404 -18.569 -18.923 -19.124 -19.354 -19.64 -19.953 -20.327 -20.865 -22.738 -2 ,23976 ,TETRA ,17556907,Fri Nov 26 08:46:47 CET,Fri Nov 26 10:25:12 CET,0.0 0.572 0.791 0.958 1.099 1.224 1.337 1.447 1.638 1.72 1.805 1.884 2.023 2.089 2.208 2.315 2.421 2.473 2.578 2.684 2.814 2.887 2.955 3.037 3.12 3.202 3.279 3.343 3.415 3.487 3.557 3.637 3.71 3.776 3.842 3.928 4.003 4.057 4.107 4.15 4.165 4.176 4.19 4.18 4.122 3.982 3.767 3.452 2.915 2.04 0.426 -1.545 -3.153 -4.523 -5.641 -6.6 -7.415 -8.158 -8.792 -9.399 -9.933 -10.401 -10.849 -11.271 -11.654 -12.022 -12.415 -12.755 -13.037 -13.325 -13.617 -13.867 -14.128 -14.378 -14.565 -14.764 -14.97 -15.18 -15.416 -15.581 -15.746 -16.016 -16.197 -16.373 -16.462 -16.651 -16.871 -17.114 -17.24 -17.459 -17.627 -17.762 -17.898 -18.215 -18.409 -18.609 -18.804 -19.024 -19.304 -19.677 -20.879 -3 ,28742 ,TETRA ,17556908,Fri Nov 26 08:46:47 CET,Fri Nov 26 10:40:29 CET,0.0 0.592 0.854 1.031 1.182 1.311 1.421 1.519 1.697 1.784 1.869 1.955 2.1 2.162 2.277 2.39 2.496 2.546 2.633 2.712 2.825 2.894 2.967 3.071 3.172 3.259 3.339 3.421 3.506 3.58 3.651 3.744 3.839 3.923 4.011 4.089 4.154 4.225 4.298 4.364 4.416 4.466 4.498 4.472 4.398 4.257 4.004 3.619 3.008 2.028 0.368 -1.624 -3.213 -4.506 -5.579 -6.514 -7.332 -8.065 -8.696 -9.318 -9.861 -10.356 -10.813 -11.234 -11.632 -12.002 -12.393 -12.734 -13.032 -13.364 -13.692 -13.95 -14.229 -14.506 -14.718 -14.943 -15.181 -15.431 -15.687 -15.863 -16.048 -16.358 -16.583 -16.809 -16.922 -17.143 -17.37 -17.607 -17.724 -17.937 -18.115 -18.254 -18.4 -18.707 -18.871 -19.048 -19.252 -19.481 -19.743 -20.073 -21.515 -4 ,18051 ,TETRA ,17556909,Fri Nov 26 08:46:47 CET,Fri Nov 26 10:40:12 CET,0.0 0.563 0.803 0.992 1.141 1.251 1.36 1.472 1.65 1.727 1.798 1.846 1.979 2.038 2.154 2.274 2.389 2.441 2.528 2.603 2.713 2.783 2.843 2.935 3.025 3.102 3.182 3.265 3.362 3.445 3.516 3.594 3.677 3.756 3.838 3.917 3.978 4.044 4.094 4.132 4.158 4.178 4.192 4.169 4.1 3.993 3.801 3.488 2.993 2.148 0.564 -1.371 -2.931 -4.214 -5.267 -6.22 -7.107 -7.886 -8.558 -9.254 -9.824 -10.321 -10.802 -11.252 -11.653 -11.995 -12.363 -12.683 -12.948 -13.238 -13.533 -13.776 -14.028 -14.287 -14.48 -14.683 -14.902 -15.129 -15.359 -15.514 -15.674 -15.915 -16.092 -16.275 -16.369 -16.58 -16.791 -16.992 -17.099 -17.31 -17.483 -17.622 -17.77 -18.069 -18.229 -18.406 -18.601 -18.817 -19.074 -19.42 -20.866 -5 ,21486 ,TETRA ,17556910,Fri Nov 26 08:46:47 CET,Fri Nov 26 10:40:15 CET,0.0 0.84 1.108 1.305 1.449 1.568 1.675 1.771 1.955 2.05 2.131 2.204 2.351 2.41 2.525 2.632 2.727 2.777 2.871 2.953 3.07 3.14 3.205 3.298 3.396 3.48 3.547 3.615 3.703 3.782 3.847 3.927 3.997 4.051 4.111 4.175 4.243 4.308 4.344 4.37 4.402 4.43 4.436 4.402 4.309 4.162 3.948 3.621 3.075 2.111 0.433 -1.558 -3.179 -4.537 -5.682 -6.678 -7.524 -8.283 -8.904 -9.494 -9.999 -10.457 -10.914 -11.333 -11.707 -12.042 -12.398 -12.715 -12.981 -13.256 -13.553 -13.813 -14.08 -14.356 -14.576 -14.809 -15.045 -15.287 -15.542 -15.711 -15.88 -16.148 -16.333 -16.52 -16.622 -16.846 -17.089 -17.347 -17.483 -17.709 -17.905 -18.059 -18.223 -18.563 -18.751 -18.96 -19.203 -19.515 -19.875 -20.337 -21.743 -6 ,8129 ,TETRA ,17556911,Fri Nov 26 08:46:47 CET,Fri Nov 26 10:39:54 CET,0.0 0.824 1.109 1.307 1.477 1.62 1.742 1.845 2.02 2.101 2.181 2.257 2.4 2.461 2.575 2.682 2.786 2.832 2.914 2.994 3.107 3.178 3.249 3.337 3.407 3.482 3.553 3.613 3.69 3.766 3.844 3.922 3.986 4.064 4.148 4.235 4.319 4.386 4.431 4.451 4.459 4.472 4.474 4.433 4.353 4.235 3.998 3.599 2.97 1.977 0.311 -1.671 -3.256 -4.54 -5.634 -6.631 -7.494 -8.27 -8.925 -9.557 -10.09 -10.56 -11.011 -11.448 -11.877 -12.27 -12.666 -13.01 -13.3 -13.615 -13.949 -14.206 -14.457 -14.716 -14.916 -15.117 -15.323 -15.533 -15.744 -15.896 -16.062 -16.312 -16.482 -16.656 -16.744 -16.93 -17.122 -17.333 -17.45 -17.658 -17.809 -17.942 -18.083 -18.402 -18.566 -18.729 -18.945 -19.176 -19.4 -19.753 -20.946 -7 ,17759 ,TETRA ,17556912,Fri Nov 26 08:46:47 CET,Fri Nov 26 10:41:21 CET,0.0 0.671 0.937 1.128 1.287 1.41 1.52 1.62 1.815 1.902 1.981 2.043 2.176 2.232 2.333 2.437 2.541 2.591 2.676 2.758 2.886 2.96 3.031 3.132 3.223 3.306 3.383 3.454 3.54 3.623 3.7 3.796 3.886 3.958 4.03 4.102 4.161 4.22 4.283 4.345 4.39 4.405 4.385 4.336 4.25 4.115 3.877 3.492 2.926 2.026 0.46 -1.479 -3.107 -4.45 -5.586 -6.599 -7.46 -8.224 -8.89 -9.574 -10.164 -10.651 -11.118 -11.574 -11.988 -12.37 -12.772 -13.113 -13.39 -13.69 -14.012 -14.269 -14.538 -14.835 -15.053 -15.271 -15.511 -15.759 -16.014 -16.188 -16.364 -16.639 -16.832 -17.026 -17.122 -17.317 -17.517 -17.74 -17.86 -18.075 -18.232 -18.359 -18.504 -18.824 -18.986 -19.164 -19.375 -19.609 -19.869 -20.204 -21.698 -8 ,24251 ,TETRA ,17556913,Fri Nov 26 08:46:47 CET,Fri Nov 26 10:40:05 CET,0.0 0.668 1.003 1.227 1.381 1.509 1.632 1.745 1.945 2.03 2.106 2.172 2.306 2.367 2.475 2.57 2.665 2.709 2.791 2.871 2.995 3.069 3.136 3.227 3.3 3.38 3.459 3.528 3.608 3.676 3.735 3.811 3.888 3.955 4.026 4.1 4.154 4.203 4.248 4.276 4.302 4.325 4.33 4.314 4.256 4.126 3.889 3.5 2.874 1.86 0.149 -1.844 -3.391 -4.71 -5.854 -6.847 -7.7 -8.437 -9.06 -9.705 -10.279 -10.798 -11.271 -11.715 -12.144 -12.516 -12.89 -13.226 -13.514 -13.808 -14.109 -14.351 -14.588 -14.841 -15.049 -15.262 -15.471 -15.684 -15.905 -16.051 -16.206 -16.456 -16.629 -16.808 -16.899 -17.1 -17.311 -17.527 -17.64 -17.84 -17.982 -18.107 -18.246 -18.543 -18.702 -18.878 -19.08 -19.322 -19.596 -19.935 -20.994 -9 ,15041 ,TETRA ,17556914,Fri Nov 26 08:46:47 CET,Fri Nov 26 10:39:59 CET,0.0 0.749 1.008 1.215 1.372 1.511 1.63 1.738 1.928 2.015 2.1 2.167 2.305 2.366 2.49 2.599 2.696 2.743 2.831 2.909 3.015 3.086 3.153 3.245 3.33 3.401 3.464 3.533 3.628 3.714 3.785 3.857 3.936 4.004 4.076 4.146 4.202 4.264 4.32 4.371 4.406 4.425 4.43 4.394 4.274 4.074 3.816 3.435 2.841 1.935 0.329 -1.615 -3.225 -4.601 -5.766 -6.791 -7.702 -8.488 -9.14 -9.789 -10.355 -10.86 -11.321 -11.748 -12.149 -12.502 -12.855 -13.169 -13.455 -13.748 -14.041 -14.279 -14.52 -14.771 -14.966 -15.167 -15.373 -15.579 -15.787 -15.931 -16.081 -16.322 -16.487 -16.656 -16.748 -16.937 -17.123 -17.321 -17.428 -17.629 -17.765 -17.9 -18.042 -18.327 -18.493 -18.68 -18.879 -19.095 -19.367 -19.706 -21.017 -10 ,7513 ,TETRA ,17556915,Fri Nov 26 08:47:48 CET,Fri Nov 26 10:41:03 CET,0.0 0.612 0.845 1.033 1.194 1.35 1.495 1.626 1.847 1.951 2.042 2.107 2.243 2.302 2.421 2.536 2.645 2.692 2.781 2.867 2.969 3.036 3.103 3.195 3.285 3.363 3.43 3.498 3.581 3.66 3.724 3.792 3.866 3.924 3.97 4.021 4.074 4.129 4.183 4.219 4.244 4.256 4.243 4.225 4.158 4.028 3.828 3.458 2.84 1.878 0.236 -1.668 -3.209 -4.565 -5.685 -6.631 -7.47 -8.243 -8.884 -9.511 -10.058 -10.567 -11.044 -11.47 -11.86 -12.208 -12.572 -12.9 -13.176 -13.466 -13.767 -14.011 -14.258 -14.513 -14.715 -14.917 -15.119 -15.34 -15.572 -15.731 -15.888 -16.123 -16.294 -16.477 -16.57 -16.755 -16.951 -17.148 -17.253 -17.461 -17.622 -17.752 -17.887 -18.177 -18.333 -18.497 -18.671 -18.868 -19.1 -19.419 -20.771 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_40_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_40_37.txt deleted file mode 100644 index 6eac54dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_40_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26652 ,TETRA ,17556916,Fri Nov 26 08:48:43 CET,Fri Nov 26 10:42:36 CET,0.0 0.767 1.031 1.236 1.391 1.527 1.649 1.753 1.939 2.011 2.072 2.123 2.251 2.319 2.442 2.555 2.652 2.69 2.761 2.826 2.911 2.965 3.019 3.094 3.161 3.226 3.279 3.322 3.378 3.432 3.474 3.514 3.548 3.575 3.6 3.628 3.645 3.654 3.664 3.654 3.6 3.515 3.375 3.191 2.933 2.559 2.021 1.309 0.269 -1.442 -4.248 -7.334 -9.786 -11.788 -13.462 -14.91 -16.085 -17.069 -17.909 -18.754 -19.458 -20.068 -20.655 -21.213 -21.741 -22.21 -22.679 -23.096 -23.459 -23.828 -24.208 -24.526 -24.848 -25.187 -25.451 -25.717 -25.984 -26.26 -26.543 -26.741 -26.961 -27.31 -27.541 -27.763 -27.877 -28.121 -28.376 -28.638 -28.779 -29.016 -29.251 -29.426 -29.613 -30.023 -30.241 -30.478 -30.749 -31.105 -31.54 -32.066 -33.705 -2 ,26864 ,TETRA ,17556917,Fri Nov 26 08:47:46 CET,Fri Nov 26 10:41:20 CET,0.0 0.549 0.823 1.036 1.193 1.319 1.434 1.533 1.715 1.803 1.881 1.94 2.062 2.123 2.232 2.329 2.42 2.462 2.541 2.614 2.715 2.772 2.82 2.882 2.945 3.012 3.073 3.128 3.199 3.264 3.333 3.426 3.505 3.556 3.602 3.642 3.656 3.659 3.652 3.626 3.58 3.503 3.372 3.198 2.954 2.621 2.056 1.241 0.133 -1.555 -4.344 -7.506 -9.963 -11.979 -13.666 -15.097 -16.316 -17.407 -18.294 -19.132 -19.815 -20.422 -20.994 -21.529 -22.029 -22.489 -22.971 -23.4 -23.758 -24.113 -24.486 -24.78 -25.074 -25.387 -25.627 -25.866 -26.113 -26.37 -26.635 -26.819 -27.007 -27.296 -27.488 -27.681 -27.784 -28.002 -28.225 -28.466 -28.595 -28.816 -28.998 -29.137 -29.278 -29.597 -29.779 -29.973 -30.184 -30.427 -30.719 -31.105 -32.608 -3 ,23574 ,TETRA ,17556918,Fri Nov 26 08:47:47 CET,Fri Nov 26 10:41:17 CET,0.0 0.648 0.92 1.11 1.259 1.392 1.51 1.615 1.808 1.891 1.968 2.043 2.169 2.227 2.333 2.426 2.52 2.569 2.661 2.734 2.824 2.879 2.934 3.008 3.071 3.129 3.183 3.234 3.295 3.347 3.39 3.437 3.465 3.472 3.486 3.494 3.493 3.485 3.451 3.41 3.357 3.256 3.107 2.928 2.663 2.313 1.848 1.175 0.09 -1.586 -4.33 -7.544 -10.062 -12.12 -13.815 -15.24 -16.416 -17.459 -18.348 -19.186 -19.871 -20.468 -21.057 -21.6 -22.082 -22.534 -23.003 -23.412 -23.76 -24.108 -24.473 -24.786 -25.112 -25.448 -25.699 -25.952 -26.225 -26.5 -26.785 -26.99 -27.197 -27.518 -27.736 -27.963 -28.082 -28.333 -28.6 -28.879 -29.033 -29.287 -29.518 -29.676 -29.833 -30.196 -30.419 -30.672 -30.979 -31.325 -31.749 -32.317 -33.958 -4 ,4789 ,TETRA ,17556919,Fri Nov 26 08:47:50 CET,Fri Nov 26 10:41:31 CET,0.0 1.248 1.615 1.869 2.083 2.274 2.439 2.589 2.859 2.969 3.072 3.198 3.342 3.423 3.586 3.738 3.855 3.906 4.004 4.092 4.208 4.283 4.359 4.461 4.553 4.643 4.72 4.782 4.859 4.932 4.991 5.039 5.089 5.133 5.174 5.22 5.259 5.281 5.262 5.222 5.177 5.133 5.033 4.852 4.599 4.241 3.686 2.909 1.761 0.053 -2.618 -5.619 -8.039 -10.067 -11.726 -13.14 -14.306 -15.342 -16.238 -17.096 -17.825 -18.473 -19.065 -19.628 -20.149 -20.607 -21.066 -21.455 -21.786 -22.122 -22.472 -22.773 -23.081 -23.388 -23.623 -23.857 -24.103 -24.355 -24.612 -24.794 -24.985 -25.281 -25.483 -25.693 -25.803 -26.031 -26.257 -26.496 -26.622 -26.832 -26.992 -27.134 -27.282 -27.63 -27.814 -28.009 -28.226 -28.463 -28.746 -29.144 -30.625 -5 ,16343 ,TETRA ,17556920,Fri Nov 26 08:47:47 CET,Fri Nov 26 10:48:57 CET,0.0 0.842 1.125 1.341 1.511 1.651 1.777 1.889 2.076 2.157 2.233 2.302 2.423 2.483 2.604 2.713 2.804 2.847 2.923 2.987 3.085 3.142 3.198 3.275 3.344 3.417 3.476 3.531 3.601 3.657 3.706 3.757 3.799 3.836 3.876 3.913 3.925 3.915 3.886 3.845 3.776 3.66 3.525 3.345 3.06 2.664 2.09 1.308 0.101 -1.679 -4.497 -7.762 -10.271 -12.317 -13.997 -15.42 -16.615 -17.63 -18.491 -19.342 -20.043 -20.655 -21.222 -21.757 -22.244 -22.683 -23.134 -23.517 -23.85 -24.194 -24.557 -24.861 -25.183 -25.515 -25.76 -26.012 -26.267 -26.533 -26.804 -26.991 -27.177 -27.454 -27.65 -27.851 -27.955 -28.176 -28.404 -28.647 -28.782 -29.009 -29.184 -29.326 -29.479 -29.818 -29.997 -30.192 -30.409 -30.625 -30.892 -31.277 -32.768 -6 ,32011 ,TETRA ,17556921,Fri Nov 26 08:47:47 CET,Fri Nov 26 10:26:11 CET,0.0 0.519 0.728 0.888 1.031 1.159 1.287 1.403 1.609 1.709 1.795 1.872 2.001 2.059 2.164 2.26 2.355 2.408 2.515 2.603 2.72 2.787 2.848 2.93 3.009 3.094 3.168 3.234 3.325 3.416 3.49 3.561 3.613 3.654 3.698 3.755 3.816 3.867 3.912 3.948 3.944 3.898 3.84 3.758 3.58 3.318 2.933 2.348 1.442 0.011 -2.515 -5.653 -8.051 -9.967 -11.555 -12.929 -14.104 -15.137 -16.016 -16.881 -17.616 -18.265 -18.862 -19.425 -19.935 -20.383 -20.84 -21.247 -21.604 -21.964 -22.347 -22.668 -22.988 -23.323 -23.588 -23.857 -24.136 -24.434 -24.739 -24.943 -25.149 -25.464 -25.686 -25.931 -26.057 -26.304 -26.557 -26.82 -26.964 -27.196 -27.391 -27.532 -27.687 -28.035 -28.217 -28.419 -28.634 -28.852 -29.099 -29.454 -30.43 -7 ,1568 ,TETRA ,17556922,Fri Nov 26 08:47:47 CET,Fri Nov 26 10:41:01 CET,0.0 1.336 1.715 2.004 2.218 2.391 2.537 2.661 2.888 2.999 3.097 3.203 3.34 3.415 3.563 3.699 3.821 3.871 3.965 4.053 4.166 4.241 4.323 4.438 4.53 4.609 4.677 4.737 4.81 4.877 4.946 5.023 5.084 5.129 5.174 5.214 5.231 5.243 5.241 5.206 5.149 5.065 4.944 4.784 4.564 4.253 3.722 2.932 1.807 0.061 -2.793 -5.931 -8.347 -10.328 -11.945 -13.36 -14.597 -15.677 -16.579 -17.453 -18.188 -18.836 -19.459 -20.02 -20.528 -21.002 -21.498 -21.937 -22.308 -22.676 -23.054 -23.369 -23.681 -23.997 -24.249 -24.503 -24.764 -25.034 -25.306 -25.491 -25.689 -25.994 -26.195 -26.401 -26.511 -26.728 -26.938 -27.169 -27.292 -27.507 -27.684 -27.825 -27.966 -28.283 -28.462 -28.66 -28.883 -29.122 -29.39 -29.75 -31.137 -8 ,20790 ,TETRA ,17556923,Fri Nov 26 08:47:47 CET,Fri Nov 26 10:41:13 CET,0.0 0.607 0.857 1.059 1.211 1.317 1.411 1.51 1.723 1.824 1.91 1.998 2.133 2.192 2.289 2.379 2.475 2.52 2.594 2.659 2.753 2.817 2.887 2.981 3.048 3.106 3.16 3.203 3.246 3.293 3.345 3.4 3.448 3.472 3.503 3.553 3.582 3.6 3.608 3.607 3.593 3.505 3.341 3.163 2.891 2.516 2.017 1.264 0.094 -1.697 -4.599 -7.818 -10.367 -12.411 -14.056 -15.447 -16.645 -17.713 -18.599 -19.473 -20.22 -20.877 -21.491 -22.061 -22.588 -23.056 -23.523 -23.935 -24.293 -24.661 -25.042 -25.356 -25.683 -26.023 -26.286 -26.557 -26.82 -27.085 -27.371 -27.562 -27.751 -28.036 -28.233 -28.439 -28.543 -28.755 -28.982 -29.221 -29.34 -29.555 -29.743 -29.896 -30.053 -30.396 -30.574 -30.761 -30.968 -31.202 -31.47 -31.857 -33.209 -9 ,10558 ,TETRA ,17556924,Fri Nov 26 08:47:47 CET,Fri Nov 26 10:41:07 CET,0.0 0.533 0.774 0.974 1.146 1.29 1.413 1.515 1.674 1.751 1.828 1.92 2.053 2.128 2.279 2.415 2.532 2.583 2.679 2.771 2.891 2.967 3.043 3.14 3.232 3.317 3.396 3.468 3.548 3.614 3.666 3.731 3.789 3.827 3.869 3.917 3.948 3.954 3.966 3.968 3.935 3.866 3.74 3.581 3.333 2.937 2.38 1.627 0.499 -1.197 -4.039 -7.234 -9.681 -11.697 -13.356 -14.782 -15.973 -17.018 -17.919 -18.807 -19.544 -20.186 -20.808 -21.389 -21.912 -22.381 -22.851 -23.26 -23.627 -24.01 -24.399 -24.725 -25.057 -25.388 -25.649 -25.924 -26.205 -26.502 -26.804 -27.004 -27.219 -27.554 -27.775 -28.011 -28.136 -28.398 -28.673 -28.962 -29.108 -29.341 -29.561 -29.724 -29.9 -30.299 -30.535 -30.791 -31.045 -31.347 -31.714 -32.197 -33.879 -10 ,1545 ,TETRA ,17556925,Fri Nov 26 08:47:47 CET,Fri Nov 26 10:43:09 CET,0.0 0.755 1.031 1.215 1.363 1.494 1.62 1.738 1.938 2.029 2.114 2.198 2.339 2.411 2.543 2.682 2.815 2.873 2.972 3.064 3.197 3.265 3.34 3.456 3.535 3.608 3.672 3.722 3.79 3.856 3.916 3.982 4.048 4.101 4.138 4.165 4.171 4.154 4.116 4.07 4.015 3.929 3.798 3.643 3.417 3.077 2.563 1.864 0.821 -0.931 -3.907 -7.203 -9.731 -11.755 -13.413 -14.846 -16.051 -17.113 -18.01 -18.87 -19.603 -20.258 -20.869 -21.441 -21.961 -22.417 -22.879 -23.281 -23.625 -23.968 -24.317 -24.617 -24.912 -25.207 -25.439 -25.673 -25.923 -26.176 -26.432 -26.62 -26.809 -27.094 -27.301 -27.513 -27.619 -27.841 -28.075 -28.313 -28.437 -28.658 -28.844 -28.996 -29.155 -29.491 -29.661 -29.844 -30.045 -30.26 -30.53 -30.906 -32.489 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_41_37.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_41_37.txt deleted file mode 100644 index c4cfc338..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_41_37.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2200 ,TETRA ,17556926,Fri Nov 26 08:47:47 CET,Fri Nov 26 10:43:30 CET,0.0 0.558 0.778 0.962 1.105 1.215 1.324 1.433 1.631 1.72 1.814 1.906 2.065 2.133 2.278 2.414 2.537 2.596 2.698 2.797 2.94 3.022 3.107 3.246 3.374 3.481 3.585 3.685 3.819 3.961 4.107 4.275 4.431 4.588 4.773 4.963 5.118 5.287 5.48 5.665 5.85 6.064 6.292 6.485 6.699 6.935 7.203 7.459 7.663 7.802 7.722 7.284 6.77 6.241 5.728 5.263 4.832 4.4 4.005 3.608 3.274 2.964 2.648 2.352 2.087 1.833 1.556 1.316 1.116 0.91 0.689 0.502 0.309 0.099 -0.059 -0.208 -0.367 -0.533 -0.708 -0.835 -0.96 -1.157 -1.303 -1.468 -1.548 -1.695 -1.863 -2.041 -2.136 -2.338 -2.475 -2.591 -2.709 -2.985 -3.139 -3.314 -3.506 -3.709 -3.95 -4.277 -5.797 -2 ,17736 ,TETRA ,17556927,Fri Nov 26 08:48:43 CET,Fri Nov 26 10:27:09 CET,0.0 0.395 0.65 0.834 0.976 1.098 1.208 1.312 1.513 1.599 1.673 1.746 1.914 1.985 2.117 2.244 2.37 2.427 2.531 2.632 2.772 2.857 2.944 3.076 3.197 3.312 3.425 3.525 3.654 3.782 3.908 4.064 4.21 4.336 4.48 4.645 4.791 4.948 5.111 5.282 5.466 5.663 5.881 6.1 6.335 6.562 6.799 7.037 7.241 7.344 7.228 6.798 6.286 5.782 5.308 4.835 4.391 3.978 3.609 3.236 2.893 2.569 2.277 2.011 1.744 1.493 1.233 0.982 0.76 0.528 0.29 0.097 -0.104 -0.315 -0.473 -0.631 -0.796 -0.963 -1.135 -1.257 -1.39 -1.606 -1.754 -1.907 -1.986 -2.139 -2.299 -2.477 -2.568 -2.754 -2.882 -2.998 -3.12 -3.382 -3.533 -3.702 -3.875 -4.072 -4.33 -4.682 -6.384 -3 ,23264 ,TETRA ,17556928,Fri Nov 26 08:48:43 CET,Fri Nov 26 10:44:11 CET,0.0 0.945 1.208 1.414 1.574 1.69 1.804 1.921 2.107 2.187 2.271 2.332 2.491 2.558 2.69 2.823 2.943 3.002 3.105 3.214 3.389 3.501 3.608 3.761 3.917 4.066 4.212 4.35 4.517 4.673 4.817 4.99 5.154 5.302 5.474 5.68 5.869 6.059 6.27 6.488 6.697 6.917 7.157 7.383 7.611 7.837 8.083 8.331 8.558 8.655 8.465 7.931 7.329 6.784 6.262 5.768 5.314 4.871 4.493 4.117 3.787 3.475 3.177 2.903 2.64 2.416 2.185 1.959 1.768 1.572 1.362 1.185 1.014 0.837 0.689 0.534 0.367 0.196 0.032 -0.085 -0.213 -0.415 -0.559 -0.715 -0.794 -0.949 -1.122 -1.303 -1.398 -1.597 -1.728 -1.84 -1.965 -2.233 -2.371 -2.532 -2.73 -2.943 -3.198 -3.588 -5.22 -4 ,6773 ,TETRA ,17556929,Fri Nov 26 08:48:45 CET,Fri Nov 26 10:41:43 CET,0.0 0.639 0.894 1.073 1.225 1.344 1.462 1.573 1.767 1.858 1.945 2.02 2.187 2.26 2.395 2.524 2.652 2.712 2.821 2.928 3.085 3.181 3.277 3.427 3.581 3.732 3.876 4.015 4.189 4.355 4.511 4.7 4.87 5.031 5.223 5.432 5.615 5.813 6.039 6.257 6.474 6.721 6.994 7.265 7.559 7.861 8.182 8.484 8.761 8.958 8.96 8.643 8.252 7.836 7.42 6.997 6.609 6.268 5.965 5.644 5.355 5.091 4.849 4.623 4.406 4.204 4.003 3.813 3.627 3.439 3.256 3.106 2.94 2.765 2.635 2.494 2.347 2.199 2.031 1.917 1.81 1.62 1.475 1.335 1.263 1.107 0.943 0.751 0.653 0.468 0.353 0.241 0.119 -0.152 -0.304 -0.476 -0.662 -0.885 -1.166 -1.566 -3.33 -5 ,12942 ,TETRA ,17556930,Fri Nov 26 08:48:45 CET,Fri Nov 26 10:45:04 CET,0.0 0.535 0.73 0.89 1.048 1.201 1.337 1.46 1.661 1.748 1.84 1.928 2.096 2.184 2.365 2.547 2.707 2.776 2.909 3.04 3.22 3.328 3.434 3.596 3.749 3.882 4.015 4.148 4.312 4.466 4.606 4.766 4.924 5.076 5.243 5.422 5.592 5.785 5.98 6.171 6.374 6.596 6.842 7.063 7.296 7.546 7.804 8.069 8.279 8.372 8.253 7.79 7.241 6.681 6.155 5.689 5.283 4.865 4.465 4.08 3.774 3.503 3.228 2.969 2.718 2.474 2.228 2.017 1.832 1.643 1.451 1.289 1.115 0.925 0.779 0.632 0.482 0.323 0.156 0.035 -0.1 -0.305 -0.447 -0.61 -0.693 -0.857 -1.041 -1.235 -1.331 -1.523 -1.655 -1.775 -1.9 -2.19 -2.348 -2.512 -2.699 -2.898 -3.158 -3.556 -5.512 -6 ,12557 ,TETRA ,17556931,Fri Nov 26 08:48:45 CET,Fri Nov 26 10:42:27 CET,0.0 0.613 0.884 1.067 1.212 1.352 1.475 1.588 1.785 1.878 1.972 2.062 2.227 2.302 2.444 2.579 2.708 2.764 2.868 2.968 3.114 3.208 3.293 3.418 3.549 3.68 3.804 3.915 4.068 4.225 4.373 4.549 4.711 4.865 5.031 5.208 5.386 5.592 5.806 6.007 6.207 6.439 6.703 6.944 7.229 7.512 7.773 8.052 8.281 8.385 8.279 7.879 7.334 6.78 6.254 5.756 5.336 4.946 4.598 4.246 3.929 3.649 3.379 3.123 2.887 2.656 2.405 2.192 2.012 1.81 1.596 1.418 1.23 1.04 0.9 0.758 0.592 0.408 0.225 0.104 -0.021 -0.22 -0.36 -0.507 -0.579 -0.729 -0.893 -1.078 -1.174 -1.361 -1.492 -1.614 -1.746 -2.045 -2.204 -2.371 -2.565 -2.789 -3.048 -3.395 -5.43 -7 ,3741 ,TETRA ,17556932,Fri Nov 26 08:48:45 CET,Fri Nov 26 10:42:19 CET,0.0 0.712 0.944 1.123 1.283 1.414 1.523 1.622 1.817 1.907 1.994 2.068 2.23 2.298 2.422 2.547 2.661 2.711 2.812 2.91 3.053 3.154 3.249 3.377 3.504 3.623 3.73 3.835 3.97 4.094 4.207 4.351 4.504 4.647 4.797 4.958 5.123 5.284 5.449 5.641 5.829 6.009 6.201 6.397 6.627 6.867 7.11 7.333 7.535 7.689 7.595 7.145 6.632 6.116 5.607 5.132 4.69 4.248 3.847 3.451 3.118 2.813 2.523 2.244 1.969 1.725 1.484 1.272 1.086 0.886 0.679 0.503 0.316 0.118 -0.038 -0.193 -0.344 -0.506 -0.686 -0.812 -0.951 -1.182 -1.326 -1.468 -1.543 -1.703 -1.871 -2.049 -2.146 -2.339 -2.471 -2.58 -2.698 -2.957 -3.103 -3.273 -3.452 -3.663 -3.936 -4.324 -5.785 -8 ,25352 ,TETRA ,17556933,Fri Nov 26 08:50:43 CET,Fri Nov 26 10:49:50 CET,0.0 0.623 0.859 1.035 1.177 1.313 1.441 1.568 1.806 1.906 1.996 2.072 2.235 2.311 2.458 2.588 2.7 2.76 2.884 2.991 3.139 3.229 3.314 3.444 3.563 3.673 3.783 3.885 4.005 4.128 4.247 4.376 4.499 4.638 4.803 4.966 5.106 5.253 5.426 5.609 5.798 6.023 6.291 6.529 6.769 7.005 7.238 7.511 7.743 7.837 7.716 7.243 6.68 6.114 5.61 5.125 4.67 4.232 3.842 3.471 3.154 2.845 2.541 2.248 1.971 1.724 1.469 1.234 1.024 0.793 0.551 0.356 0.146 -0.073 -0.235 -0.4 -0.574 -0.759 -0.967 -1.114 -1.259 -1.479 -1.645 -1.836 -1.931 -2.12 -2.312 -2.51 -2.619 -2.823 -2.977 -3.122 -3.286 -3.627 -3.814 -4.018 -4.254 -4.511 -4.792 -5.19 -6.692 -9 ,10590 ,TETRA ,17556934,Fri Nov 26 08:49:44 CET,Fri Nov 26 10:43:06 CET,0.0 0.487 0.708 0.881 1.042 1.191 1.312 1.417 1.609 1.693 1.771 1.826 1.99 2.059 2.196 2.325 2.45 2.513 2.628 2.727 2.861 2.955 3.044 3.165 3.286 3.4 3.503 3.597 3.726 3.855 3.984 4.135 4.263 4.389 4.547 4.727 4.894 5.062 5.238 5.427 5.625 5.851 6.103 6.332 6.576 6.831 7.096 7.346 7.578 7.716 7.583 7.159 6.641 6.109 5.617 5.126 4.665 4.236 3.843 3.437 3.081 2.773 2.466 2.159 1.881 1.624 1.345 1.095 0.89 0.666 0.416 0.21 -0.006 -0.232 -0.408 -0.599 -0.799 -1.002 -1.213 -1.349 -1.485 -1.684 -1.816 -1.946 -2.014 -2.166 -2.327 -2.506 -2.608 -2.81 -2.954 -3.076 -3.206 -3.475 -3.612 -3.761 -3.937 -4.148 -4.404 -4.753 -5.928 -10 ,3455 ,TETRA ,17556935,Fri Nov 26 08:50:42 CET,Fri Nov 26 10:45:01 CET,0.0 0.628 0.874 1.038 1.186 1.337 1.479 1.594 1.799 1.897 1.986 2.053 2.214 2.286 2.424 2.55 2.668 2.722 2.822 2.917 3.054 3.145 3.235 3.363 3.485 3.599 3.707 3.811 3.949 4.082 4.207 4.35 4.482 4.622 4.773 4.917 5.058 5.215 5.389 5.564 5.731 5.907 6.12 6.336 6.589 6.863 7.137 7.413 7.637 7.748 7.604 7.142 6.633 6.104 5.618 5.143 4.706 4.301 3.931 3.56 3.229 2.92 2.631 2.368 2.113 1.861 1.579 1.329 1.116 0.902 0.681 0.493 0.292 0.079 -0.088 -0.257 -0.434 -0.615 -0.808 -0.948 -1.097 -1.332 -1.49 -1.663 -1.757 -1.948 -2.148 -2.381 -2.504 -2.718 -2.879 -3.008 -3.15 -3.498 -3.699 -3.915 -4.151 -4.392 -4.657 -5.008 -6.632 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_41_40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_41_40.txt deleted file mode 100644 index 02bb3cc3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_41_40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28868 ,TETRA ,17556936,Fri Nov 26 08:49:44 CET,Fri Nov 26 10:43:34 CET,0.0 1.303 1.629 1.889 2.103 2.294 2.466 2.645 2.973 3.111 3.238 3.388 3.582 3.692 3.915 4.122 4.322 4.421 4.619 4.803 5.067 5.24 5.402 5.645 5.888 6.129 6.359 6.595 6.921 7.229 7.53 7.897 8.259 8.613 9.01 9.459 9.908 10.399 10.913 11.46 12.042 12.738 13.589 14.452 15.47 16.612 17.976 19.567 21.453 23.725 26.563 28.942 30.375 31.369 32.023 32.419 32.668 32.817 32.914 32.964 32.984 33.006 32.973 32.92 32.865 32.788 32.68 32.563 32.476 32.392 32.294 32.197 32.086 31.963 31.862 31.771 31.668 31.547 31.433 31.357 31.269 31.103 30.982 30.866 30.799 30.651 30.511 30.361 30.277 30.113 29.951 29.837 29.705 29.387 29.223 29.059 28.849 28.603 28.305 27.851 26.478 -2 ,29598 ,TETRA ,17556937,Fri Nov 26 08:49:44 CET,Fri Nov 26 10:43:41 CET,0.0 2.191 2.57 2.87 3.098 3.291 3.482 3.665 3.985 4.133 4.268 4.425 4.633 4.751 4.979 5.175 5.367 5.466 5.655 5.831 6.094 6.264 6.419 6.652 6.896 7.141 7.386 7.63 7.942 8.246 8.543 8.901 9.229 9.544 9.933 10.371 10.792 11.266 11.786 12.345 12.944 13.629 14.444 15.294 16.31 17.471 18.825 20.372 22.272 24.622 27.582 30.177 31.737 32.731 33.374 33.797 34.04 34.188 34.269 34.314 34.33 34.314 34.284 34.234 34.179 34.113 34.008 33.903 33.823 33.753 33.67 33.591 33.508 33.415 33.331 33.241 33.153 33.055 32.946 32.87 32.79 32.655 32.555 32.46 32.413 32.308 32.19 32.049 31.97 31.83 31.73 31.629 31.517 31.266 31.127 30.973 30.795 30.589 30.341 29.971 28.001 -3 ,7011 ,TETRA ,17556938,Fri Nov 26 08:49:44 CET,Fri Nov 26 10:43:41 CET,0.0 1.195 1.595 1.907 2.17 2.409 2.633 2.834 3.188 3.338 3.474 3.651 3.87 3.995 4.271 4.531 4.76 4.871 5.082 5.293 5.592 5.782 5.972 6.241 6.508 6.765 7.014 7.258 7.565 7.867 8.162 8.511 8.846 9.185 9.583 10.015 10.435 10.893 11.389 11.936 12.525 13.217 14.049 14.882 15.849 16.968 18.312 19.85 21.714 24.009 26.934 29.388 30.847 31.839 32.529 32.985 33.25 33.384 33.463 33.51 33.512 33.499 33.485 33.441 33.368 33.297 33.21 33.13 33.043 32.949 32.853 32.753 32.649 32.552 32.471 32.379 32.284 32.174 32.047 31.954 31.844 31.687 31.58 31.463 31.402 31.266 31.124 30.956 30.862 30.7 30.567 30.464 30.353 30.12 29.972 29.805 29.636 29.442 29.198 28.857 27.234 -4 ,1365 ,TETRA ,17556939,Fri Nov 26 08:49:45 CET,Fri Nov 26 10:43:59 CET,0.0 1.258 1.576 1.832 2.052 2.236 2.399 2.559 2.858 2.998 3.123 3.275 3.49 3.604 3.815 4.016 4.213 4.309 4.493 4.675 4.942 5.125 5.304 5.546 5.782 6.018 6.247 6.468 6.756 7.028 7.304 7.647 7.971 8.285 8.655 9.072 9.48 9.943 10.44 10.967 11.523 12.16 12.939 13.746 14.727 15.885 17.25 18.827 20.743 23.047 25.982 28.559 30.077 31.111 31.817 32.292 32.637 32.848 32.991 33.1 33.148 33.139 33.086 33.027 32.955 32.862 32.756 32.667 32.593 32.502 32.397 32.305 32.191 32.062 31.948 31.83 31.726 31.612 31.489 31.4 31.306 31.161 31.06 30.955 30.898 30.781 30.663 30.533 30.445 30.29 30.176 30.065 29.949 29.698 29.545 29.392 29.238 29.063 28.841 28.502 27.046 -5 ,30191 ,TETRA ,17556940,Fri Nov 26 08:49:44 CET,Fri Nov 26 10:45:52 CET,0.0 1.145 1.479 1.748 1.959 2.132 2.297 2.457 2.751 2.888 3.018 3.179 3.388 3.499 3.72 3.942 4.153 4.25 4.443 4.633 4.907 5.081 5.243 5.483 5.719 5.943 6.178 6.419 6.733 7.036 7.327 7.683 8.032 8.368 8.771 9.23 9.653 10.112 10.617 11.174 11.778 12.477 13.315 14.159 15.159 16.306 17.656 19.232 21.142 23.411 26.287 28.908 30.499 31.528 32.214 32.643 32.901 33.098 33.214 33.288 33.315 33.297 33.264 33.211 33.14 33.078 33.008 32.928 32.853 32.753 32.645 32.557 32.452 32.348 32.273 32.193 32.095 31.983 31.853 31.758 31.664 31.515 31.392 31.261 31.197 31.066 30.912 30.733 30.643 30.486 30.345 30.242 30.138 29.892 29.751 29.61 29.468 29.278 29.018 28.687 27.543 -6 ,21778 ,TETRA ,17556941,Fri Nov 26 08:50:42 CET,Fri Nov 26 10:46:48 CET,0.0 1.342 1.696 1.964 2.172 2.366 2.554 2.732 3.044 3.18 3.311 3.484 3.694 3.81 4.037 4.246 4.455 4.561 4.765 4.964 5.273 5.476 5.667 5.932 6.185 6.433 6.675 6.919 7.232 7.522 7.813 8.165 8.5 8.827 9.215 9.645 10.063 10.546 11.074 11.656 12.282 12.998 13.847 14.71 15.72 16.844 18.195 19.774 21.681 24.082 27.134 29.684 31.177 32.083 32.62 32.942 33.2 33.407 33.522 33.573 33.579 33.566 33.541 33.508 33.438 33.349 33.254 33.169 33.094 33.019 32.94 32.861 32.771 32.678 32.609 32.532 32.437 32.332 32.227 32.157 32.087 31.973 31.889 31.797 31.743 31.613 31.468 31.317 31.246 31.11 31.002 30.902 30.79 30.557 30.432 30.28 30.113 29.916 29.668 29.3 27.936 -7 ,27120 ,TETRA ,17556942,Fri Nov 26 08:50:42 CET,Fri Nov 26 10:47:33 CET,0.0 1.408 1.741 2.005 2.216 2.393 2.552 2.703 2.974 3.1 3.224 3.372 3.579 3.696 3.922 4.139 4.339 4.434 4.619 4.795 5.05 5.219 5.382 5.626 5.871 6.102 6.319 6.538 6.82 7.098 7.376 7.711 8.029 8.339 8.702 9.106 9.505 9.946 10.435 10.969 11.534 12.191 12.976 13.787 14.747 15.814 17.073 18.591 20.474 22.75 25.715 28.289 29.811 30.828 31.487 31.913 32.173 32.349 32.45 32.475 32.471 32.459 32.411 32.343 32.283 32.224 32.152 32.074 31.986 31.879 31.78 31.686 31.572 31.465 31.386 31.302 31.217 31.132 31.038 30.956 30.869 30.748 30.653 30.549 30.499 30.39 30.272 30.127 30.045 29.902 29.798 29.707 29.61 29.382 29.252 29.11 28.944 28.736 28.482 28.104 26.252 -8 ,26038 ,TETRA ,17556943,Fri Nov 26 08:50:42 CET,Fri Nov 26 10:45:54 CET,0.0 1.371 1.703 1.953 2.161 2.35 2.529 2.696 2.978 3.111 3.253 3.428 3.635 3.75 3.978 4.188 4.392 4.49 4.677 4.864 5.134 5.3 5.461 5.699 5.933 6.169 6.405 6.631 6.92 7.21 7.5 7.854 8.203 8.543 8.943 9.398 9.831 10.308 10.849 11.436 12.033 12.72 13.548 14.381 15.382 16.548 17.936 19.537 21.467 23.759 26.568 28.986 30.414 31.254 31.795 32.178 32.44 32.628 32.738 32.793 32.822 32.826 32.78 32.723 32.68 32.622 32.53 32.447 32.371 32.277 32.162 32.05 31.935 31.801 31.698 31.599 31.492 31.368 31.234 31.142 31.047 30.888 30.77 30.647 30.583 30.447 30.299 30.138 30.05 29.895 29.744 29.63 29.515 29.249 29.082 28.868 28.636 28.372 28.043 27.601 25.826 -9 ,20508 ,TETRA ,17556944,Fri Nov 26 08:50:42 CET,Fri Nov 26 10:46:29 CET,0.0 1.444 1.772 2.022 2.246 2.435 2.599 2.757 3.057 3.193 3.32 3.479 3.69 3.806 4.021 4.232 4.438 4.537 4.733 4.919 5.183 5.354 5.527 5.779 6.02 6.253 6.474 6.683 6.96 7.241 7.52 7.854 8.173 8.489 8.86 9.284 9.693 10.141 10.627 11.147 11.707 12.353 13.132 13.938 14.895 16.003 17.318 18.831 20.668 22.925 25.775 28.26 29.696 30.625 31.31 31.758 32.036 32.211 32.288 32.321 32.341 32.333 32.291 32.237 32.169 32.085 31.998 31.926 31.853 31.763 31.647 31.546 31.437 31.328 31.253 31.173 31.082 30.981 30.881 30.807 30.719 30.568 30.464 30.365 30.318 30.199 30.051 29.902 29.825 29.686 29.584 29.481 29.371 29.129 28.995 28.835 28.655 28.464 28.219 27.859 26.448 -10 ,13703 ,TETRA ,17556945,Fri Nov 26 08:51:46 CET,Fri Nov 26 10:47:25 CET,0.0 1.416 1.769 2.028 2.239 2.429 2.604 2.767 3.065 3.209 3.345 3.513 3.727 3.846 4.06 4.263 4.446 4.538 4.729 4.915 5.185 5.354 5.515 5.759 6.005 6.24 6.47 6.692 6.978 7.254 7.523 7.863 8.18 8.478 8.848 9.288 9.713 10.178 10.696 11.247 11.819 12.477 13.248 14.034 14.981 16.061 17.362 18.87 20.653 22.821 25.663 28.17 29.649 30.619 31.239 31.625 31.844 31.978 32.078 32.135 32.168 32.182 32.18 32.161 32.119 32.071 32.005 31.934 31.872 31.796 31.7 31.617 31.536 31.453 31.376 31.293 31.204 31.108 31.016 30.942 30.845 30.688 30.579 30.471 30.414 30.285 30.149 30.013 29.941 29.795 29.687 29.594 29.498 29.28 29.154 29.009 28.838 28.645 28.404 28.044 26.767 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_42_13.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_42_13.txt deleted file mode 100644 index 98ae7147..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_42_13.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10556 ,TETRA ,17556946,Fri Nov 26 08:52:43 CET,Fri Nov 26 10:44:08 CET,0.0 1.159 1.562 1.829 1.996 2.118 2.242 2.359 2.578 2.684 2.781 2.866 3.034 3.1 3.226 3.351 3.475 3.527 3.623 3.715 3.839 3.925 4.01 4.119 4.206 4.273 4.347 4.438 4.546 4.623 4.682 4.754 4.818 4.874 4.926 4.973 5.016 5.05 5.078 5.097 5.102 5.104 5.074 4.963 4.729 4.42 4.0 3.266 2.125 0.505 -2.109 -5.057 -7.464 -9.583 -11.395 -12.951 -14.29 -15.455 -16.402 -17.338 -18.162 -18.897 -19.558 -20.137 -20.665 -21.173 -21.715 -22.179 -22.585 -22.99 -23.393 -23.745 -24.11 -24.475 -24.758 -25.049 -25.349 -25.663 -25.985 -26.217 -26.457 -26.831 -27.092 -27.354 -27.476 -27.723 -28.001 -28.314 -28.476 -28.757 -28.965 -29.15 -29.364 -29.798 -30.024 -30.284 -30.563 -30.898 -31.323 -31.88 -33.67 -2 ,18085 ,TETRA ,17556947,Fri Nov 26 08:52:42 CET,Fri Nov 26 10:31:36 CET,0.0 1.383 1.778 1.981 2.112 2.227 2.337 2.431 2.626 2.727 2.815 2.881 3.03 3.085 3.205 3.319 3.408 3.447 3.528 3.624 3.781 3.882 3.968 4.086 4.209 4.331 4.434 4.517 4.628 4.737 4.843 4.949 5.031 5.105 5.181 5.264 5.337 5.409 5.449 5.493 5.529 5.504 5.451 5.328 5.114 4.848 4.447 3.791 2.818 1.285 -1.356 -4.456 -6.994 -9.112 -10.888 -12.445 -13.786 -14.967 -15.98 -16.952 -17.761 -18.468 -19.135 -19.738 -20.284 -20.8 -21.319 -21.773 -22.168 -22.591 -23.039 -23.386 -23.737 -24.105 -24.391 -24.691 -24.985 -25.275 -25.58 -25.802 -26.029 -26.373 -26.618 -26.883 -27.021 -27.306 -27.589 -27.892 -28.055 -28.346 -28.594 -28.779 -28.968 -29.385 -29.639 -29.913 -30.206 -30.571 -31.019 -31.655 -33.384 -3 ,28388 ,TETRA ,17556948,Fri Nov 26 08:53:42 CET,Fri Nov 26 10:45:44 CET,0.0 1.297 1.645 1.905 2.132 2.334 2.513 2.677 2.965 3.089 3.201 3.318 3.502 3.591 3.737 3.869 3.999 4.061 4.186 4.314 4.485 4.585 4.679 4.819 4.953 5.067 5.166 5.254 5.37 5.483 5.575 5.67 5.75 5.816 5.891 5.971 6.058 6.138 6.201 6.244 6.237 6.231 6.199 6.087 5.889 5.597 5.188 4.582 3.607 2.044 -0.653 -3.723 -6.158 -8.151 -9.851 -11.426 -12.784 -13.966 -14.939 -15.891 -16.724 -17.478 -18.181 -18.794 -19.343 -19.861 -20.433 -20.921 -21.316 -21.75 -22.193 -22.548 -22.915 -23.296 -23.598 -23.911 -24.22 -24.531 -24.86 -25.086 -25.317 -25.676 -25.922 -26.183 -26.313 -26.596 -26.904 -27.214 -27.374 -27.662 -27.928 -28.111 -28.303 -28.748 -28.972 -29.196 -29.462 -29.815 -30.213 -30.655 -32.049 -4 ,147 ,TETRA ,17556949,Fri Nov 26 08:53:41 CET,Fri Nov 26 10:44:58 CET,0.0 0.554 0.807 0.956 1.094 1.24 1.364 1.466 1.671 1.757 1.836 1.907 2.079 2.159 2.3 2.419 2.523 2.573 2.673 2.768 2.885 2.947 3.019 3.138 3.245 3.343 3.427 3.488 3.556 3.628 3.714 3.798 3.86 3.944 4.032 4.075 4.131 4.196 4.211 4.194 4.157 4.106 4.011 3.851 3.605 3.295 2.855 2.231 1.253 -0.321 -2.913 -6.033 -8.54 -10.583 -12.314 -13.85 -15.144 -16.263 -17.211 -18.124 -18.895 -19.564 -20.221 -20.841 -21.405 -21.914 -22.424 -22.862 -23.224 -23.622 -24.06 -24.413 -24.763 -25.139 -25.433 -25.719 -25.999 -26.299 -26.628 -26.851 -27.085 -27.437 -27.666 -27.921 -28.058 -28.334 -28.619 -28.913 -29.074 -29.356 -29.544 -29.713 -29.906 -30.364 -30.604 -30.854 -31.138 -31.466 -31.867 -32.332 -33.771 -5 ,4560 ,TETRA ,17556950,Fri Nov 26 08:53:42 CET,Fri Nov 26 10:44:58 CET,0.0 1.386 1.834 2.136 2.351 2.523 2.681 2.833 3.078 3.172 3.272 3.387 3.573 3.658 3.824 3.979 4.117 4.182 4.305 4.422 4.574 4.669 4.766 4.898 5.009 5.108 5.192 5.266 5.372 5.472 5.587 5.725 5.837 5.918 5.976 6.063 6.153 6.223 6.263 6.287 6.285 6.261 6.192 6.082 5.93 5.673 5.218 4.529 3.527 1.964 -0.721 -3.897 -6.391 -8.381 -10.041 -11.51 -12.763 -13.871 -14.795 -15.713 -16.49 -17.16 -17.811 -18.44 -19.02 -19.533 -20.062 -20.556 -20.982 -21.399 -21.824 -22.186 -22.579 -22.973 -23.261 -23.549 -23.844 -24.145 -24.458 -24.687 -24.936 -25.314 -25.556 -25.806 -25.936 -26.205 -26.486 -26.788 -26.947 -27.241 -27.503 -27.702 -27.898 -28.334 -28.576 -28.838 -29.145 -29.509 -29.956 -30.599 -32.498 -6 ,9265 ,TETRA ,17556951,Fri Nov 26 08:54:42 CET,Fri Nov 26 10:45:28 CET,0.0 0.84 1.16 1.403 1.626 1.815 1.977 2.132 2.405 2.525 2.636 2.745 2.922 3.012 3.172 3.317 3.466 3.539 3.679 3.812 3.993 4.092 4.178 4.299 4.413 4.522 4.618 4.711 4.829 4.937 5.05 5.164 5.252 5.345 5.462 5.571 5.652 5.748 5.821 5.844 5.837 5.812 5.789 5.747 5.585 5.28 4.858 4.23 3.268 1.698 -1.031 -4.293 -6.915 -9.042 -10.783 -12.297 -13.581 -14.681 -15.592 -16.516 -17.355 -18.069 -18.741 -19.384 -19.948 -20.452 -20.97 -21.432 -21.825 -22.245 -22.693 -23.047 -23.411 -23.803 -24.099 -24.395 -24.694 -24.998 -25.321 -25.542 -25.766 -26.109 -26.351 -26.609 -26.744 -27.018 -27.295 -27.589 -27.743 -28.023 -28.216 -28.39 -28.584 -29.008 -29.236 -29.474 -29.744 -30.066 -30.475 -31.061 -33.573 -7 ,4680 ,TETRA ,17556952,Fri Nov 26 08:53:42 CET,Fri Nov 26 10:46:20 CET,0.0 0.722 0.995 1.191 1.332 1.457 1.574 1.684 1.886 1.975 2.052 2.124 2.288 2.351 2.484 2.593 2.692 2.742 2.844 2.934 3.038 3.11 3.184 3.301 3.416 3.513 3.597 3.662 3.731 3.8 3.865 3.953 4.041 4.1 4.157 4.218 4.264 4.287 4.285 4.262 4.26 4.276 4.246 4.159 3.972 3.673 3.256 2.676 1.688 0.105 -2.484 -5.546 -8.039 -10.111 -11.841 -13.334 -14.553 -15.618 -16.534 -17.471 -18.282 -19.007 -19.676 -20.26 -20.803 -21.319 -21.873 -22.358 -22.763 -23.162 -23.567 -23.93 -24.33 -24.748 -25.057 -25.345 -25.636 -25.953 -26.281 -26.501 -26.734 -27.101 -27.344 -27.582 -27.705 -27.967 -28.241 -28.524 -28.682 -28.965 -29.188 -29.365 -29.545 -29.969 -30.207 -30.464 -30.739 -31.047 -31.448 -31.957 -33.738 -8 ,19311 ,TETRA ,17556953,Fri Nov 26 08:54:42 CET,Fri Nov 26 10:36:59 CET,0.0 0.721 0.993 1.156 1.285 1.404 1.513 1.623 1.843 1.944 2.046 2.161 2.338 2.417 2.553 2.652 2.732 2.779 2.873 2.96 3.097 3.189 3.277 3.407 3.532 3.654 3.77 3.867 3.976 4.08 4.195 4.314 4.402 4.474 4.534 4.594 4.661 4.745 4.825 4.867 4.879 4.866 4.8 4.698 4.522 4.271 3.825 3.15 2.164 0.54 -2.137 -5.272 -7.826 -9.909 -11.653 -13.184 -14.536 -15.769 -16.796 -17.813 -18.64 -19.332 -19.987 -20.586 -21.16 -21.697 -22.245 -22.732 -23.138 -23.539 -23.965 -24.341 -24.734 -25.111 -25.389 -25.689 -26.001 -26.321 -26.641 -26.857 -27.074 -27.419 -27.672 -27.919 -28.042 -28.308 -28.597 -28.896 -29.049 -29.324 -29.545 -29.72 -29.906 -30.321 -30.563 -30.822 -31.103 -31.439 -31.815 -32.318 -34.201 -9 ,12354 ,TETRA ,17556954,Fri Nov 26 08:54:45 CET,Fri Nov 26 10:47:21 CET,0.0 0.624 0.879 1.078 1.249 1.389 1.499 1.606 1.813 1.909 1.993 2.053 2.211 2.278 2.403 2.522 2.624 2.668 2.754 2.837 2.959 3.045 3.121 3.217 3.301 3.374 3.445 3.511 3.608 3.697 3.769 3.852 3.919 3.982 4.05 4.103 4.126 4.138 4.156 4.16 4.159 4.131 4.039 3.928 3.719 3.389 2.936 2.232 1.164 -0.324 -2.815 -5.905 -8.43 -10.542 -12.25 -13.735 -15.0 -16.08 -16.989 -17.91 -18.705 -19.389 -20.026 -20.619 -21.162 -21.656 -22.195 -22.673 -23.069 -23.471 -23.892 -24.243 -24.609 -24.998 -25.28 -25.581 -25.923 -26.258 -26.588 -26.824 -27.07 -27.44 -27.694 -27.949 -28.081 -28.368 -28.66 -28.959 -29.115 -29.41 -29.634 -29.82 -30.02 -30.444 -30.676 -30.919 -31.192 -31.499 -31.874 -32.414 -34.015 -10 ,17323 ,TETRA ,17556955,Fri Nov 26 08:54:43 CET,Fri Nov 26 10:48:21 CET,0.0 1.833 2.225 2.527 2.765 2.963 3.123 3.272 3.547 3.662 3.766 3.87 4.039 4.117 4.269 4.41 4.544 4.604 4.718 4.831 4.971 5.062 5.17 5.322 5.451 5.573 5.683 5.769 5.866 5.969 6.066 6.181 6.285 6.363 6.445 6.542 6.622 6.666 6.698 6.724 6.749 6.741 6.678 6.575 6.383 6.078 5.615 4.999 4.062 2.558 -0.104 -3.329 -5.893 -8.024 -9.844 -11.447 -12.759 -13.893 -14.858 -15.796 -16.597 -17.297 -17.927 -18.516 -19.053 -19.533 -20.051 -20.526 -20.937 -21.361 -21.799 -22.151 -22.504 -22.879 -23.176 -23.464 -23.769 -24.088 -24.412 -24.636 -24.861 -25.204 -25.451 -25.718 -25.852 -26.13 -26.435 -26.749 -26.909 -27.206 -27.459 -27.649 -27.834 -28.224 -28.452 -28.728 -29.026 -29.346 -29.747 -30.326 -31.697 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_42_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_42_44.txt deleted file mode 100644 index 9e40ec42..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_42_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16728 ,TETRA ,17556956,Fri Nov 26 08:54:43 CET,Fri Nov 26 10:46:41 CET,0.0 0.787 0.956 1.101 1.238 1.361 1.477 1.605 1.837 1.939 2.04 2.137 2.32 2.404 2.561 2.725 2.887 2.96 3.101 3.234 3.418 3.54 3.66 3.835 4.012 4.184 4.355 4.524 4.742 4.955 5.153 5.39 5.628 5.851 6.101 6.381 6.653 6.946 7.296 7.732 8.174 8.666 9.259 9.856 10.554 11.287 12.113 13.054 14.162 15.309 16.503 17.391 17.732 17.788 17.737 17.586 17.385 17.211 17.064 16.892 16.729 16.549 16.346 16.165 16.024 15.903 15.731 15.539 15.371 15.229 15.09 14.961 14.831 14.694 14.581 14.463 14.334 14.179 14.017 13.903 13.786 13.613 13.484 13.346 13.267 13.095 12.929 12.751 12.654 12.472 12.325 12.209 12.089 11.844 11.706 11.544 11.36 11.139 10.866 10.504 8.985 -2 ,8574 ,TETRA ,17556957,Fri Nov 26 08:54:44 CET,Fri Nov 26 10:46:11 CET,0.0 0.473 0.751 0.961 1.126 1.275 1.405 1.526 1.752 1.853 1.955 2.064 2.252 2.338 2.495 2.647 2.785 2.85 2.988 3.127 3.324 3.447 3.56 3.737 3.928 4.112 4.28 4.436 4.641 4.847 5.051 5.3 5.537 5.755 5.998 6.277 6.538 6.837 7.173 7.529 7.929 8.402 8.976 9.535 10.168 10.883 11.723 12.664 13.71 14.864 16.083 16.924 17.317 17.481 17.491 17.367 17.197 17.003 16.825 16.639 16.447 16.263 16.066 15.86 15.664 15.49 15.289 15.096 14.944 14.794 14.634 14.495 14.336 14.143 13.981 13.825 13.659 13.487 13.33 13.225 13.104 12.895 12.751 12.609 12.542 12.404 12.242 12.053 11.95 11.76 11.615 11.488 11.355 11.091 10.942 10.773 10.553 10.285 9.983 9.601 8.146 -3 ,30410 ,TETRA ,17556958,Fri Nov 26 08:54:44 CET,Fri Nov 26 10:46:10 CET,0.0 0.732 0.97 1.163 1.347 1.517 1.64 1.752 1.96 2.055 2.151 2.253 2.443 2.543 2.706 2.844 2.992 3.062 3.196 3.325 3.509 3.638 3.774 3.972 4.151 4.322 4.491 4.657 4.879 5.094 5.293 5.544 5.799 6.039 6.317 6.621 6.905 7.235 7.596 7.977 8.378 8.845 9.406 9.959 10.572 11.263 12.101 13.037 14.048 15.168 16.451 17.328 17.666 17.77 17.814 17.742 17.594 17.451 17.262 17.041 16.869 16.671 16.458 16.255 16.055 15.879 15.669 15.463 15.279 15.068 14.848 14.675 14.51 14.324 14.167 14.002 13.833 13.671 13.492 13.361 13.229 13.027 12.885 12.727 12.648 12.489 12.308 12.096 11.984 11.797 11.655 11.528 11.393 11.135 10.999 10.823 10.607 10.376 10.106 9.768 8.477 -4 ,30009 ,TETRA ,17556959,Fri Nov 26 08:54:44 CET,Fri Nov 26 10:45:54 CET,0.0 0.451 0.649 0.815 0.955 1.086 1.207 1.322 1.513 1.605 1.701 1.808 1.996 2.086 2.249 2.4 2.552 2.629 2.786 2.936 3.138 3.258 3.378 3.578 3.774 3.956 4.134 4.308 4.53 4.742 4.943 5.183 5.443 5.718 6.03 6.355 6.651 6.987 7.369 7.789 8.211 8.644 9.125 9.621 10.267 10.999 11.796 12.65 13.621 14.769 16.056 16.942 17.321 17.476 17.497 17.409 17.222 16.994 16.8 16.582 16.369 16.168 15.989 15.8 15.59 15.4 15.189 14.992 14.829 14.657 14.483 14.339 14.181 14.034 13.926 13.805 13.669 13.518 13.349 13.225 13.11 12.932 12.81 12.674 12.603 12.458 12.295 12.123 12.022 11.84 11.708 11.602 11.483 11.216 11.067 10.902 10.708 10.471 10.213 9.854 8.682 -5 ,29601 ,TETRA ,17556960,Fri Nov 26 08:55:42 CET,Fri Nov 26 10:49:07 CET,0.0 0.505 0.743 0.901 1.042 1.171 1.299 1.42 1.622 1.717 1.82 1.935 2.124 2.214 2.37 2.524 2.678 2.747 2.883 3.018 3.227 3.364 3.497 3.694 3.873 4.043 4.226 4.41 4.629 4.834 5.037 5.288 5.518 5.726 5.963 6.248 6.554 6.867 7.182 7.546 7.912 8.332 8.885 9.452 10.101 10.804 11.579 12.445 13.435 14.594 15.914 16.746 17.099 17.243 17.246 17.177 17.047 16.834 16.633 16.446 16.252 16.069 15.866 15.692 15.536 15.378 15.229 15.083 14.942 14.81 14.671 14.539 14.396 14.232 14.11 13.991 13.869 13.748 13.605 13.498 13.385 13.194 13.07 12.951 12.883 12.726 12.561 12.374 12.271 12.084 11.946 11.833 11.713 11.462 11.319 11.149 10.933 10.692 10.406 10.022 8.853 -6 ,13777 ,TETRA ,17556961,Fri Nov 26 08:55:42 CET,Fri Nov 26 10:47:48 CET,0.0 0.253 0.464 0.644 0.792 0.928 1.049 1.162 1.381 1.48 1.571 1.663 1.851 1.942 2.113 2.284 2.451 2.533 2.686 2.836 3.063 3.2 3.327 3.52 3.713 3.896 4.055 4.209 4.423 4.631 4.832 5.098 5.352 5.588 5.871 6.202 6.521 6.868 7.267 7.709 8.138 8.602 9.167 9.731 10.38 11.075 11.85 12.728 13.801 14.925 16.109 17.028 17.41 17.553 17.572 17.507 17.376 17.223 17.084 16.891 16.699 16.522 16.333 16.121 15.922 15.744 15.528 15.323 15.153 14.979 14.795 14.631 14.463 14.297 14.147 13.995 13.839 13.669 13.486 13.35 13.209 12.984 12.822 12.651 12.568 12.402 12.228 12.049 11.952 11.776 11.652 11.543 11.424 11.134 10.973 10.797 10.604 10.392 10.137 9.812 8.317 -7 ,29005 ,TETRA ,17556962,Fri Nov 26 08:55:42 CET,Fri Nov 26 10:46:38 CET,0.0 0.377 0.579 0.756 0.889 1.002 1.111 1.231 1.458 1.542 1.62 1.694 1.871 1.957 2.125 2.28 2.432 2.514 2.679 2.834 3.066 3.21 3.347 3.554 3.757 3.949 4.129 4.3 4.527 4.77 5.013 5.27 5.524 5.793 6.101 6.442 6.764 7.111 7.48 7.881 8.311 8.786 9.329 9.878 10.515 11.232 12.008 12.828 13.85 15.083 16.364 17.22 17.594 17.731 17.693 17.599 17.485 17.312 17.15 16.989 16.809 16.608 16.431 16.232 16.014 15.816 15.589 15.398 15.23 15.033 14.815 14.639 14.467 14.302 14.168 14.004 13.84 13.67 13.467 13.324 13.187 12.984 12.845 12.697 12.62 12.468 12.296 12.119 12.024 11.847 11.726 11.614 11.493 11.236 11.084 10.91 10.724 10.508 10.233 9.872 8.674 -8 ,2705 ,TETRA ,17556963,Fri Nov 26 08:55:43 CET,Fri Nov 26 10:47:25 CET,0.0 0.691 0.94 1.113 1.272 1.405 1.517 1.624 1.851 1.954 2.046 2.131 2.309 2.395 2.561 2.715 2.861 2.936 3.077 3.211 3.409 3.548 3.684 3.874 4.054 4.211 4.365 4.527 4.738 4.954 5.184 5.451 5.681 5.886 6.124 6.412 6.702 7.036 7.419 7.852 8.284 8.781 9.352 9.882 10.52 11.262 12.085 12.952 13.956 15.107 16.336 17.19 17.582 17.717 17.731 17.668 17.49 17.279 17.11 16.936 16.741 16.515 16.287 16.101 15.922 15.739 15.536 15.349 15.17 14.974 14.783 14.599 14.401 14.208 14.057 13.895 13.711 13.516 13.325 13.188 13.035 12.806 12.657 12.502 12.418 12.24 12.061 11.859 11.746 11.555 11.412 11.305 11.2 10.956 10.798 10.614 10.418 10.208 9.918 9.507 8.239 -9 ,24857 ,TETRA ,17556964,Fri Nov 26 08:55:43 CET,Fri Nov 26 10:49:02 CET,0.0 0.671 0.836 1.006 1.168 1.31 1.44 1.555 1.757 1.86 1.958 2.045 2.219 2.298 2.458 2.623 2.782 2.859 3.007 3.159 3.376 3.502 3.619 3.791 3.96 4.119 4.274 4.427 4.625 4.817 5.01 5.258 5.501 5.75 6.066 6.425 6.747 7.084 7.451 7.834 8.255 8.736 9.308 9.882 10.534 11.269 12.053 12.889 13.915 15.06 16.298 17.221 17.602 17.709 17.702 17.61 17.452 17.258 17.072 16.85 16.599 16.358 16.12 15.889 15.679 15.489 15.283 15.096 14.916 14.723 14.531 14.379 14.212 14.028 13.891 13.739 13.559 13.372 13.198 13.073 12.947 12.749 12.598 12.439 12.359 12.185 12.007 11.816 11.713 11.535 11.388 11.256 11.131 10.842 10.662 10.47 10.26 10.009 9.684 9.24 7.668 -10 ,18353 ,TETRA ,17556965,Fri Nov 26 08:55:45 CET,Fri Nov 26 10:47:52 CET,0.0 0.515 0.702 0.848 0.996 1.141 1.267 1.386 1.618 1.726 1.826 1.918 2.099 2.188 2.348 2.502 2.668 2.75 2.902 3.042 3.259 3.401 3.526 3.695 3.861 4.027 4.204 4.372 4.578 4.785 4.98 5.225 5.482 5.721 6.012 6.36 6.682 7.038 7.431 7.837 8.244 8.689 9.215 9.754 10.396 11.118 11.883 12.743 13.747 14.863 16.119 17.001 17.362 17.47 17.475 17.39 17.259 17.085 16.904 16.672 16.441 16.257 16.071 15.887 15.727 15.585 15.415 15.222 15.042 14.875 14.711 14.559 14.373 14.176 14.044 13.913 13.764 13.598 13.423 13.293 13.158 12.947 12.8 12.656 12.583 12.439 12.292 12.117 12.012 11.83 11.701 11.587 11.465 11.206 11.056 10.883 10.686 10.465 10.216 9.821 8.144 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_42_45.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_42_45.txt deleted file mode 100644 index 73b6c7f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_42_45.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20556 ,TETRA ,17556966,Fri Nov 26 08:55:42 CET,Fri Nov 26 10:36:53 CET,0.0 1.117 1.414 1.649 1.83 1.984 2.149 2.312 2.597 2.719 2.828 2.937 3.131 3.235 3.43 3.604 3.771 3.855 4.028 4.215 4.484 4.64 4.789 5.013 5.221 5.428 5.638 5.832 6.076 6.317 6.542 6.808 7.098 7.367 7.648 7.976 8.296 8.644 9.024 9.428 9.842 10.321 10.894 11.45 12.103 12.813 13.586 14.46 15.487 16.659 17.86 18.72 19.067 19.151 19.143 19.032 18.836 18.635 18.431 18.165 17.932 17.749 17.552 17.337 17.142 16.964 16.772 16.589 16.421 16.253 16.083 15.938 15.773 15.602 15.482 15.368 15.241 15.098 14.96 14.866 14.769 14.604 14.491 14.38 14.319 14.185 14.032 13.86 13.772 13.608 13.483 13.386 13.276 13.01 12.872 12.726 12.566 12.355 12.104 11.79 10.642 -2 ,18476 ,TETRA ,17556967,Fri Nov 26 08:55:43 CET,Fri Nov 26 10:48:54 CET,0.0 1.455 1.78 2.034 2.252 2.428 2.58 2.734 3.041 3.176 3.303 3.449 3.652 3.759 3.969 4.173 4.368 4.465 4.669 4.854 5.085 5.224 5.361 5.565 5.776 5.978 6.164 6.356 6.597 6.831 7.051 7.307 7.564 7.831 8.143 8.482 8.82 9.177 9.546 9.958 10.385 10.869 11.453 12.018 12.644 13.356 14.172 15.05 16.071 17.191 18.506 19.43 19.711 19.714 19.613 19.468 19.288 19.063 18.827 18.561 18.31 18.091 17.889 17.678 17.474 17.291 17.083 16.883 16.711 16.528 16.343 16.176 16.002 15.83 15.684 15.541 15.391 15.218 15.046 14.929 14.795 14.583 14.437 14.276 14.194 14.032 13.847 13.654 13.56 13.387 13.251 13.142 13.016 12.737 12.601 12.439 12.241 12.032 11.781 11.374 9.593 -3 ,15626 ,TETRA ,17556968,Fri Nov 26 08:55:43 CET,Fri Nov 26 10:48:11 CET,0.0 0.826 1.12 1.374 1.604 1.787 1.949 2.095 2.352 2.47 2.596 2.756 2.966 3.087 3.305 3.488 3.665 3.752 3.918 4.07 4.286 4.423 4.555 4.741 4.924 5.109 5.281 5.449 5.67 5.892 6.108 6.363 6.613 6.867 7.156 7.482 7.782 8.115 8.491 8.896 9.338 9.818 10.36 10.914 11.552 12.238 13.016 13.928 14.972 16.098 17.415 18.226 18.479 18.551 18.51 18.393 18.242 18.062 17.853 17.618 17.402 17.216 17.028 16.817 16.616 16.42 16.208 16.03 15.881 15.715 15.54 15.408 15.268 15.114 14.992 14.863 14.726 14.585 14.445 14.347 14.243 14.071 13.947 13.814 13.75 13.613 13.454 13.286 13.198 13.026 12.887 12.777 12.654 12.384 12.239 12.068 11.877 11.666 11.418 11.087 9.449 -4 ,3804 ,TETRA ,17556969,Fri Nov 26 08:56:43 CET,Fri Nov 26 10:48:58 CET,0.0 1.021 1.346 1.57 1.752 1.909 2.064 2.212 2.47 2.59 2.707 2.83 3.01 3.101 3.283 3.464 3.652 3.742 3.897 4.045 4.275 4.427 4.583 4.805 5.003 5.202 5.401 5.585 5.811 6.037 6.267 6.564 6.857 7.13 7.439 7.777 8.106 8.47 8.865 9.295 9.722 10.209 10.793 11.35 12.039 12.854 13.745 14.701 15.721 16.861 18.03 18.553 18.779 18.814 18.705 18.509 18.272 18.055 17.868 17.657 17.44 17.233 17.009 16.79 16.607 16.44 16.244 16.067 15.917 15.741 15.562 15.427 15.288 15.141 15.027 14.913 14.798 14.675 14.54 14.445 14.343 14.169 14.044 13.914 13.851 13.722 13.57 13.409 13.327 13.168 13.079 12.985 12.868 12.61 12.476 12.322 12.149 11.971 11.772 11.5 10.471 -5 ,24294 ,TETRA ,17556970,Fri Nov 26 08:56:42 CET,Fri Nov 26 10:50:17 CET,0.0 1.146 1.488 1.743 1.931 2.096 2.256 2.403 2.667 2.792 2.914 3.058 3.258 3.373 3.593 3.811 4.018 4.111 4.292 4.459 4.691 4.842 4.992 5.221 5.435 5.636 5.824 6.004 6.253 6.498 6.724 7.007 7.297 7.571 7.877 8.233 8.579 8.958 9.356 9.767 10.231 10.763 11.34 11.892 12.552 13.3 14.117 15.011 16.116 17.392 18.783 19.727 20.135 20.293 20.274 20.174 20.07 19.959 19.788 19.557 19.365 19.206 19.039 18.875 18.716 18.532 18.341 18.176 18.026 17.854 17.651 17.49 17.326 17.156 17.031 16.887 16.717 16.545 16.376 16.253 16.116 15.893 15.741 15.589 15.509 15.352 15.193 15.011 14.899 14.706 14.541 14.417 14.281 13.992 13.829 13.657 13.484 13.268 13.012 12.688 11.49 -6 ,31892 ,TETRA ,17556971,Fri Nov 26 08:56:43 CET,Fri Nov 26 10:33:31 CET,0.0 1.052 1.397 1.675 1.904 2.089 2.246 2.378 2.618 2.738 2.858 2.978 3.167 3.27 3.474 3.674 3.861 3.949 4.118 4.285 4.526 4.686 4.853 5.079 5.287 5.479 5.66 5.848 6.091 6.336 6.603 6.928 7.208 7.476 7.807 8.161 8.505 8.895 9.299 9.708 10.128 10.617 11.227 11.843 12.497 13.242 14.055 14.912 15.974 17.13 18.32 18.989 19.186 19.232 19.158 18.978 18.781 18.595 18.408 18.178 17.956 17.76 17.561 17.348 17.136 16.955 16.763 16.586 16.421 16.242 16.056 15.908 15.753 15.567 15.426 15.285 15.14 14.994 14.836 14.72 14.6 14.392 14.241 14.085 14.0 13.833 13.66 13.474 13.372 13.19 13.047 12.942 12.833 12.6 12.471 12.318 12.154 11.958 11.727 11.443 10.28 -7 ,11373 ,TETRA ,17556972,Fri Nov 26 08:56:43 CET,Fri Nov 26 10:48:38 CET,0.0 1.463 1.741 1.953 2.14 2.315 2.473 2.621 2.883 3.007 3.131 3.271 3.468 3.568 3.768 3.967 4.15 4.242 4.432 4.607 4.853 5.01 5.168 5.409 5.628 5.823 6.006 6.182 6.41 6.634 6.857 7.117 7.368 7.621 7.919 8.236 8.533 8.875 9.248 9.643 10.053 10.512 11.041 11.59 12.252 13.035 13.962 14.891 15.952 17.132 18.317 19.109 19.422 19.526 19.501 19.406 19.264 19.088 18.896 18.664 18.46 18.277 18.096 17.901 17.716 17.557 17.376 17.213 17.066 16.899 16.733 16.604 16.463 16.31 16.192 16.066 15.943 15.82 15.68 15.583 15.481 15.319 15.201 15.068 15.002 14.868 14.723 14.579 14.495 14.328 14.229 14.127 14.009 13.767 13.639 13.497 13.338 13.149 12.923 12.631 11.571 -8 ,15116 ,TETRA ,17556973,Fri Nov 26 08:56:43 CET,Fri Nov 26 10:49:21 CET,0.0 1.79 2.103 2.353 2.54 2.687 2.835 2.995 3.299 3.426 3.538 3.668 3.863 3.96 4.145 4.316 4.479 4.561 4.736 4.915 5.163 5.329 5.492 5.719 5.927 6.124 6.331 6.516 6.741 6.976 7.198 7.456 7.711 7.969 8.269 8.604 8.945 9.303 9.647 10.032 10.462 10.951 11.528 12.096 12.745 13.48 14.299 15.15 16.143 17.302 18.522 19.452 19.879 19.926 19.854 19.721 19.555 19.383 19.186 18.946 18.741 18.561 18.375 18.185 17.992 17.807 17.623 17.461 17.306 17.141 16.964 16.824 16.683 16.534 16.421 16.304 16.183 16.06 15.918 15.814 15.695 15.503 15.383 15.26 15.193 15.048 14.897 14.725 14.623 14.447 14.318 14.207 14.085 13.819 13.683 13.535 13.354 13.154 12.913 12.593 11.443 -9 ,6583 ,TETRA ,17556974,Fri Nov 26 08:56:43 CET,Fri Nov 26 10:48:33 CET,0.0 1.197 1.552 1.829 2.055 2.234 2.377 2.504 2.752 2.875 2.988 3.103 3.304 3.401 3.592 3.777 3.958 4.05 4.243 4.432 4.686 4.841 4.996 5.219 5.431 5.653 5.872 6.078 6.341 6.599 6.839 7.108 7.381 7.653 7.964 8.321 8.656 9.013 9.397 9.808 10.238 10.704 11.243 11.784 12.444 13.19 14.038 14.976 15.977 17.096 18.324 19.078 19.344 19.365 19.219 19.017 18.794 18.55 18.326 18.086 17.878 17.685 17.482 17.308 17.158 17.007 16.84 16.687 16.555 16.402 16.234 16.102 15.951 15.785 15.657 15.525 15.384 15.249 15.114 15.014 14.916 14.739 14.605 14.484 14.423 14.292 14.156 14.004 13.924 13.761 13.658 13.566 13.465 13.235 13.111 12.971 12.812 12.611 12.365 12.062 11.078 -10 ,16770 ,TETRA ,17556975,Fri Nov 26 08:56:43 CET,Fri Nov 26 10:48:16 CET,0.0 0.723 1.052 1.307 1.509 1.71 1.899 2.073 2.341 2.461 2.586 2.738 2.938 3.044 3.248 3.45 3.627 3.707 3.873 4.032 4.262 4.407 4.546 4.766 4.983 5.181 5.364 5.55 5.804 6.06 6.306 6.595 6.861 7.119 7.426 7.768 8.11 8.495 8.91 9.337 9.755 10.218 10.739 11.293 11.991 12.747 13.581 14.476 15.504 16.711 17.986 18.774 19.044 19.096 19.043 18.877 18.684 18.466 18.235 17.993 17.764 17.553 17.33 17.102 16.909 16.747 16.563 16.378 16.218 16.062 15.893 15.748 15.592 15.432 15.3 15.149 15.004 14.852 14.7 14.594 14.478 14.298 14.173 14.033 13.961 13.819 13.676 13.522 13.438 13.27 13.149 13.045 12.935 12.7 12.573 12.429 12.263 12.071 11.831 11.502 10.308 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_43_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_43_42.txt deleted file mode 100644 index f9ae0b85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_43_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16503 ,TETRA ,17556976,Fri Nov 26 08:57:46 CET,Fri Nov 26 10:49:00 CET,0.0 0.478 0.657 0.81 0.943 1.068 1.18 1.288 1.477 1.565 1.649 1.711 1.858 1.927 2.067 2.193 2.316 2.374 2.478 2.586 2.754 2.851 2.93 3.055 3.186 3.309 3.421 3.527 3.655 3.786 3.916 4.051 4.185 4.324 4.473 4.632 4.785 4.947 5.121 5.301 5.503 5.743 5.989 6.203 6.496 6.831 7.13 7.419 7.659 7.846 7.853 7.461 7.039 6.595 6.087 5.593 5.11 4.643 4.224 3.81 3.483 3.172 2.855 2.575 2.323 2.084 1.827 1.611 1.427 1.229 1.029 0.857 0.677 0.503 0.365 0.212 0.062 -0.088 -0.243 -0.346 -0.456 -0.641 -0.782 -0.934 -1.008 -1.158 -1.312 -1.481 -1.571 -1.746 -1.846 -1.955 -2.079 -2.347 -2.48 -2.619 -2.773 -2.961 -3.181 -3.516 -4.221 -2 ,6521 ,TETRA ,17556977,Fri Nov 26 08:57:46 CET,Fri Nov 26 10:50:18 CET,0.0 0.74 1.069 1.335 1.543 1.721 1.879 2.044 2.355 2.483 2.593 2.712 2.887 2.984 3.15 3.291 3.427 3.492 3.619 3.749 3.942 4.062 4.175 4.337 4.492 4.645 4.795 4.941 5.109 5.257 5.403 5.574 5.737 5.899 6.082 6.293 6.492 6.697 6.928 7.179 7.417 7.67 7.948 8.211 8.523 8.846 9.21 9.55 9.825 10.05 9.99 9.555 9.05 8.512 7.947 7.402 6.869 6.365 5.951 5.556 5.209 4.855 4.543 4.287 4.038 3.805 3.561 3.33 3.122 2.904 2.679 2.501 2.316 2.124 1.977 1.826 1.675 1.515 1.34 1.222 1.099 0.91 0.775 0.62 0.544 0.391 0.224 0.042 -0.059 -0.263 -0.402 -0.523 -0.651 -0.911 -1.055 -1.218 -1.403 -1.598 -1.8 -2.108 -2.96 -3 ,16813 ,TETRA ,17556978,Fri Nov 26 08:57:46 CET,Fri Nov 26 10:49:33 CET,0.0 0.446 0.649 0.826 0.985 1.11 1.222 1.323 1.485 1.564 1.649 1.749 1.909 1.979 2.114 2.236 2.349 2.403 2.505 2.606 2.752 2.85 2.942 3.069 3.184 3.291 3.393 3.499 3.642 3.776 3.899 4.041 4.194 4.34 4.489 4.659 4.82 4.984 5.155 5.344 5.539 5.747 5.999 6.251 6.518 6.777 7.055 7.322 7.586 7.833 7.88 7.479 6.891 6.338 5.811 5.289 4.816 4.371 3.991 3.592 3.232 2.917 2.615 2.323 2.05 1.808 1.558 1.329 1.124 0.908 0.687 0.497 0.302 0.084 -0.098 -0.286 -0.469 -0.648 -0.847 -0.978 -1.107 -1.311 -1.445 -1.586 -1.659 -1.805 -1.957 -2.125 -2.214 -2.396 -2.511 -2.634 -2.758 -3.004 -3.135 -3.293 -3.483 -3.686 -3.91 -4.211 -4.977 -4 ,11248 ,TETRA ,17556979,Fri Nov 26 08:57:47 CET,Fri Nov 26 10:43:34 CET,0.0 0.506 0.76 0.958 1.112 1.243 1.349 1.452 1.654 1.739 1.817 1.887 2.04 2.109 2.235 2.359 2.486 2.549 2.671 2.779 2.941 3.046 3.146 3.297 3.439 3.573 3.694 3.807 3.967 4.127 4.27 4.444 4.604 4.747 4.904 5.072 5.235 5.418 5.613 5.827 6.073 6.342 6.619 6.885 7.169 7.434 7.697 7.981 8.261 8.418 8.368 8.048 7.575 7.053 6.549 6.06 5.61 5.181 4.788 4.379 4.022 3.696 3.395 3.118 2.86 2.63 2.369 2.128 1.92 1.692 1.444 1.237 1.021 0.799 0.628 0.44 0.238 0.031 -0.178 -0.324 -0.474 -0.705 -0.861 -1.026 -1.12 -1.313 -1.505 -1.694 -1.778 -1.953 -2.04 -2.137 -2.247 -2.482 -2.612 -2.753 -2.902 -3.064 -3.271 -3.569 -4.482 -5 ,24178 ,TETRA ,17556980,Fri Nov 26 09:00:46 CET,Fri Nov 26 10:52:16 CET,0.0 0.889 1.196 1.411 1.571 1.707 1.835 1.951 2.17 2.272 2.365 2.463 2.627 2.698 2.839 2.985 3.124 3.186 3.303 3.412 3.567 3.668 3.766 3.914 4.052 4.174 4.288 4.397 4.544 4.692 4.83 4.986 5.133 5.276 5.452 5.648 5.822 6.007 6.195 6.401 6.621 6.845 7.079 7.309 7.582 7.87 8.193 8.544 8.855 9.035 9.017 8.641 8.153 7.631 7.127 6.658 6.218 5.802 5.421 5.02 4.665 4.343 4.021 3.724 3.451 3.2 2.936 2.697 2.493 2.277 2.054 1.869 1.672 1.471 1.305 1.115 0.929 0.754 0.581 0.467 0.345 0.125 -0.028 -0.168 -0.243 -0.413 -0.588 -0.774 -0.872 -1.06 -1.188 -1.299 -1.409 -1.68 -1.839 -2.007 -2.184 -2.37 -2.6 -2.928 -3.702 -6 ,3998 ,TETRA ,17556981,Fri Nov 26 08:58:42 CET,Fri Nov 26 10:51:19 CET,0.0 0.641 0.849 0.998 1.13 1.253 1.354 1.439 1.618 1.708 1.794 1.888 2.048 2.115 2.246 2.381 2.509 2.57 2.685 2.794 2.945 3.034 3.123 3.252 3.375 3.491 3.597 3.708 3.856 3.994 4.13 4.29 4.428 4.551 4.696 4.873 5.058 5.249 5.428 5.609 5.802 6.027 6.301 6.562 6.859 7.201 7.519 7.77 7.999 8.18 8.157 7.817 7.436 6.986 6.518 6.027 5.562 5.156 4.791 4.417 4.072 3.737 3.411 3.111 2.839 2.57 2.278 2.029 1.814 1.582 1.341 1.142 0.933 0.72 0.556 0.395 0.228 0.046 -0.131 -0.249 -0.371 -0.57 -0.706 -0.844 -0.923 -1.086 -1.243 -1.419 -1.515 -1.695 -1.799 -1.903 -2.013 -2.258 -2.395 -2.54 -2.697 -2.87 -3.069 -3.34 -4.081 -7 ,16377 ,TETRA ,17556982,Fri Nov 26 08:58:43 CET,Fri Nov 26 10:51:48 CET,0.0 0.645 0.889 1.084 1.247 1.376 1.489 1.6 1.799 1.889 1.974 2.044 2.195 2.265 2.394 2.516 2.63 2.683 2.792 2.896 3.045 3.143 3.239 3.37 3.486 3.597 3.709 3.824 3.973 4.106 4.237 4.401 4.544 4.675 4.82 4.987 5.136 5.285 5.469 5.669 5.877 6.097 6.332 6.583 6.877 7.142 7.408 7.706 8.013 8.296 8.307 7.926 7.479 6.98 6.46 5.991 5.551 5.156 4.799 4.414 4.075 3.745 3.429 3.154 2.899 2.642 2.349 2.09 1.866 1.624 1.375 1.171 0.96 0.743 0.58 0.42 0.249 0.053 -0.156 -0.291 -0.437 -0.663 -0.808 -0.964 -1.042 -1.189 -1.339 -1.509 -1.609 -1.798 -1.921 -2.039 -2.153 -2.401 -2.531 -2.675 -2.835 -3.009 -3.204 -3.473 -4.362 -8 ,22103 ,TETRA ,17556983,Fri Nov 26 08:58:42 CET,Fri Nov 26 10:52:04 CET,0.0 0.667 0.926 1.119 1.274 1.41 1.532 1.638 1.832 1.93 2.027 2.119 2.282 2.36 2.502 2.627 2.737 2.798 2.921 3.037 3.208 3.312 3.407 3.548 3.686 3.812 3.937 4.054 4.192 4.332 4.474 4.645 4.807 4.96 5.135 5.322 5.496 5.68 5.87 6.083 6.309 6.532 6.781 7.007 7.227 7.494 7.794 8.039 8.227 8.414 8.349 7.821 7.269 6.729 6.222 5.759 5.325 4.91 4.551 4.174 3.85 3.567 3.277 2.995 2.735 2.504 2.266 2.044 1.858 1.666 1.46 1.288 1.117 0.936 0.788 0.625 0.457 0.299 0.141 0.031 -0.098 -0.306 -0.444 -0.588 -0.659 -0.806 -0.956 -1.132 -1.233 -1.423 -1.529 -1.633 -1.747 -2.005 -2.14 -2.286 -2.439 -2.62 -2.85 -3.147 -4.0 -9 ,27481 ,TETRA ,17556984,Fri Nov 26 08:59:42 CET,Fri Nov 26 10:53:42 CET,0.0 0.485 0.721 0.931 1.098 1.232 1.357 1.469 1.663 1.757 1.847 1.92 2.07 2.146 2.296 2.434 2.564 2.622 2.726 2.837 3.001 3.095 3.191 3.335 3.469 3.589 3.704 3.819 3.963 4.109 4.252 4.42 4.581 4.736 4.915 5.103 5.278 5.47 5.675 5.903 6.135 6.375 6.638 6.892 7.173 7.434 7.667 7.919 8.175 8.351 8.263 7.785 7.258 6.665 6.092 5.554 5.065 4.609 4.203 3.782 3.415 3.084 2.76 2.464 2.171 1.892 1.623 1.385 1.178 0.952 0.711 0.508 0.301 0.103 -0.063 -0.232 -0.39 -0.574 -0.76 -0.874 -0.996 -1.186 -1.317 -1.446 -1.516 -1.678 -1.847 -2.015 -2.095 -2.271 -2.391 -2.511 -2.634 -2.92 -3.07 -3.227 -3.393 -3.565 -3.787 -4.072 -4.913 -10 ,21272 ,TETRA ,17556985,Fri Nov 26 08:58:43 CET,Fri Nov 26 11:04:43 CET,0.0 0.509 0.717 0.899 1.051 1.192 1.319 1.428 1.636 1.733 1.817 1.889 2.042 2.112 2.245 2.377 2.505 2.562 2.672 2.787 2.961 3.071 3.163 3.281 3.404 3.529 3.637 3.739 3.875 4.008 4.135 4.288 4.43 4.561 4.708 4.862 5.01 5.174 5.34 5.537 5.759 5.995 6.256 6.519 6.832 7.147 7.464 7.795 8.134 8.373 8.416 8.084 7.597 7.137 6.643 6.114 5.615 5.122 4.701 4.292 3.948 3.636 3.303 2.968 2.667 2.395 2.12 1.895 1.694 1.483 1.265 1.088 0.907 0.697 0.52 0.344 0.172 -0.007 -0.182 -0.299 -0.423 -0.626 -0.767 -0.919 -1.003 -1.161 -1.328 -1.512 -1.61 -1.799 -1.892 -1.998 -2.118 -2.398 -2.548 -2.703 -2.872 -3.078 -3.322 -3.611 -4.272 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_43_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_43_44.txt deleted file mode 100644 index b579e8bd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_43_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7988 ,TETRA ,17672976,Fri Dec 3 09:28:00 CET,Fri Dec 3 11:20:05 CET,0.0 0.766 0.97 1.149 1.326 1.48 1.597 1.696 1.888 1.975 2.056 2.126 2.273 2.344 2.486 2.623 2.757 2.821 2.947 3.065 3.239 3.352 3.458 3.607 3.75 3.893 4.033 4.173 4.352 4.529 4.697 4.888 5.076 5.267 5.485 5.719 5.958 6.238 6.547 6.89 7.26 7.661 8.121 8.583 9.124 9.755 10.498 11.319 12.225 13.213 14.288 15.031 15.26 15.257 15.128 14.921 14.701 14.455 14.216 13.969 13.751 13.559 13.375 13.201 13.016 12.824 12.598 12.378 12.198 12.026 11.85 11.705 11.545 11.367 11.218 11.063 10.909 10.733 10.545 10.431 10.309 10.108 9.966 9.813 9.736 9.554 9.357 9.161 9.058 8.872 8.69 8.548 8.397 8.022 7.819 7.627 7.425 7.176 6.868 6.46 5.135 -2 ,19293 ,TETRA ,17672977,Fri Dec 3 09:28:02 CET,Fri Dec 3 11:19:27 CET,0.0 0.692 0.888 1.055 1.219 1.371 1.488 1.59 1.791 1.885 1.969 2.053 2.215 2.289 2.436 2.573 2.701 2.762 2.882 3.002 3.187 3.311 3.432 3.619 3.8 3.961 4.124 4.291 4.493 4.683 4.88 5.135 5.379 5.598 5.849 6.127 6.389 6.697 7.037 7.396 7.78 8.223 8.719 9.199 9.775 10.403 11.107 11.861 12.742 13.751 14.792 15.353 15.519 15.548 15.423 15.201 14.943 14.705 14.509 14.279 14.046 13.839 13.619 13.384 13.159 12.947 12.709 12.493 12.31 12.117 11.917 11.745 11.562 11.374 11.22 11.07 10.926 10.762 10.589 10.47 10.344 10.116 9.964 9.835 9.762 9.594 9.407 9.205 9.1 8.918 8.764 8.64 8.503 8.196 8.038 7.861 7.669 7.46 7.191 6.79 5.402 -3 ,4329 ,TETRA ,17672978,Fri Dec 3 09:28:03 CET,Fri Dec 3 11:19:03 CET,0.0 0.999 1.252 1.441 1.563 1.673 1.788 1.906 2.113 2.213 2.307 2.383 2.54 2.614 2.764 2.899 3.024 3.089 3.206 3.321 3.501 3.609 3.717 3.879 4.031 4.172 4.315 4.461 4.637 4.801 4.963 5.163 5.359 5.564 5.804 6.066 6.327 6.617 6.926 7.25 7.583 7.956 8.401 8.866 9.445 10.124 10.878 11.653 12.527 13.584 14.709 15.351 15.489 15.387 15.255 15.059 14.817 14.539 14.271 14.031 13.794 13.544 13.319 13.103 12.898 12.708 12.499 12.305 12.106 11.908 11.713 11.54 11.352 11.147 10.99 10.829 10.654 10.477 10.288 10.156 10.028 9.807 9.649 9.48 9.386 9.179 8.946 8.694 8.563 8.361 8.17 8.03 7.882 7.535 7.346 7.156 6.946 6.687 6.378 5.98 4.278 -4 ,18102 ,TETRA ,17672979,Fri Dec 3 09:28:00 CET,Fri Dec 3 11:19:05 CET,0.0 0.629 0.889 1.088 1.24 1.392 1.519 1.621 1.824 1.911 1.991 2.071 2.227 2.3 2.451 2.596 2.743 2.816 2.956 3.09 3.273 3.397 3.522 3.693 3.862 4.032 4.192 4.344 4.553 4.746 4.929 5.162 5.388 5.599 5.848 6.136 6.408 6.692 6.99 7.315 7.652 8.038 8.483 8.916 9.433 10.014 10.684 11.444 12.311 13.291 14.418 15.066 15.338 15.391 15.259 15.036 14.779 14.523 14.293 14.067 13.86 13.659 13.478 13.298 13.122 12.951 12.757 12.59 12.448 12.288 12.111 11.964 11.807 11.648 11.519 11.378 11.226 11.069 10.907 10.794 10.678 10.492 10.352 10.21 10.14 9.98 9.819 9.644 9.544 9.353 9.17 9.031 8.903 8.651 8.505 8.326 8.118 7.85 7.516 7.112 5.3 -5 ,319 ,TETRA ,17672980,Fri Dec 3 09:28:02 CET,Fri Dec 3 11:19:01 CET,0.0 1.147 1.311 1.448 1.579 1.699 1.83 1.948 2.125 2.207 2.299 2.393 2.552 2.63 2.77 2.902 3.036 3.1 3.226 3.353 3.533 3.65 3.758 3.917 4.082 4.242 4.386 4.533 4.721 4.897 5.075 5.286 5.481 5.669 5.889 6.13 6.372 6.652 6.947 7.256 7.582 7.951 8.382 8.811 9.323 9.887 10.526 11.253 12.12 13.132 14.275 15.123 15.402 15.413 15.329 15.166 14.996 14.829 14.601 14.334 14.099 13.861 13.613 13.368 13.151 12.956 12.755 12.567 12.388 12.194 11.997 11.851 11.709 11.539 11.388 11.225 11.056 10.886 10.702 10.569 10.438 10.211 10.052 9.914 9.841 9.675 9.493 9.306 9.21 9.026 8.864 8.739 8.596 8.267 8.106 7.938 7.739 7.476 7.151 6.738 5.308 -6 ,24100 ,TETRA ,17672981,Fri Dec 3 09:28:03 CET,Fri Dec 3 11:19:15 CET,0.0 0.779 0.954 1.119 1.269 1.396 1.508 1.613 1.804 1.888 1.971 2.042 2.196 2.277 2.434 2.58 2.724 2.789 2.905 3.016 3.177 3.285 3.387 3.538 3.693 3.835 3.968 4.101 4.273 4.442 4.609 4.804 4.99 5.18 5.416 5.687 5.953 6.244 6.543 6.869 7.245 7.665 8.135 8.615 9.188 9.821 10.525 11.333 12.246 13.202 14.084 14.566 14.779 14.818 14.688 14.441 14.196 13.954 13.722 13.475 13.256 13.061 12.835 12.622 12.431 12.25 12.065 11.875 11.699 11.524 11.335 11.175 11.013 10.832 10.692 10.543 10.381 10.205 10.021 9.895 9.765 9.56 9.4 9.242 9.172 9.018 8.84 8.647 8.544 8.353 8.187 8.051 7.903 7.58 7.395 7.189 6.981 6.74 6.433 6.011 3.504 -7 ,17890 ,TETRA ,17672982,Fri Dec 3 09:28:05 CET,Fri Dec 3 11:18:57 CET,0.0 0.731 0.973 1.124 1.275 1.406 1.512 1.619 1.825 1.928 2.036 2.129 2.289 2.367 2.515 2.651 2.775 2.834 2.954 3.075 3.246 3.364 3.476 3.632 3.786 3.936 4.081 4.225 4.421 4.617 4.817 5.067 5.311 5.537 5.783 6.067 6.338 6.639 6.973 7.315 7.663 8.07 8.547 9.023 9.598 10.223 10.909 11.69 12.555 13.517 14.644 15.369 15.559 15.53 15.398 15.184 14.948 14.721 14.505 14.248 14.006 13.811 13.614 13.393 13.18 12.983 12.791 12.612 12.437 12.265 12.088 11.926 11.756 11.585 11.443 11.292 11.138 10.97 10.791 10.668 10.55 10.362 10.212 10.045 9.968 9.816 9.639 9.461 9.365 9.178 9.032 8.917 8.788 8.484 8.301 8.11 7.91 7.651 7.344 6.956 5.216 -8 ,21885 ,TETRA ,17672983,Fri Dec 3 09:28:00 CET,Fri Dec 3 11:02:27 CET,0.0 0.356 0.54 0.691 0.848 0.982 1.085 1.193 1.407 1.496 1.576 1.655 1.816 1.891 2.038 2.181 2.316 2.378 2.502 2.63 2.811 2.933 3.048 3.195 3.34 3.484 3.635 3.78 3.948 4.117 4.288 4.495 4.706 4.924 5.181 5.48 5.771 6.088 6.428 6.769 7.133 7.546 8.008 8.483 9.033 9.642 10.373 11.16 12.042 13.034 14.058 14.675 14.877 14.819 14.644 14.477 14.263 14.024 13.809 13.542 13.283 13.05 12.813 12.568 12.324 12.102 11.854 11.626 11.446 11.278 11.095 10.943 10.791 10.612 10.475 10.328 10.153 9.965 9.778 9.667 9.552 9.343 9.197 9.055 8.98 8.827 8.655 8.453 8.357 8.179 7.993 7.85 7.717 7.42 7.242 7.051 6.85 6.624 6.33 5.922 4.48 -9 ,10202 ,TETRA ,17672984,Fri Dec 3 09:29:43 CET,Fri Dec 3 11:18:15 CET,0.0 0.329 0.554 0.735 0.884 0.995 1.116 1.229 1.406 1.491 1.573 1.662 1.821 1.896 2.049 2.195 2.343 2.414 2.541 2.656 2.821 2.925 3.031 3.183 3.334 3.499 3.674 3.843 4.054 4.256 4.448 4.694 4.936 5.161 5.418 5.703 5.975 6.279 6.603 6.949 7.309 7.713 8.201 8.687 9.218 9.815 10.505 11.276 12.17 13.148 14.245 15.007 15.239 15.24 15.156 15.013 14.812 14.566 14.338 14.097 13.864 13.641 13.422 13.192 12.975 12.78 12.562 12.369 12.2 12.019 11.825 11.656 11.48 11.296 11.137 10.969 10.803 10.621 10.419 10.282 10.145 9.926 9.771 9.608 9.518 9.325 9.114 8.871 8.754 8.556 8.364 8.222 8.066 7.708 7.501 7.275 7.043 6.795 6.493 6.066 4.15 -10 ,9331 ,TETRA ,17672985,Fri Dec 3 09:28:55 CET,Fri Dec 3 11:22:03 CET,0.0 0.354 0.64 0.852 0.98 1.102 1.23 1.346 1.543 1.632 1.722 1.801 1.954 2.029 2.182 2.327 2.459 2.525 2.655 2.78 2.952 3.061 3.171 3.332 3.494 3.658 3.821 3.981 4.197 4.4 4.583 4.819 5.058 5.281 5.535 5.818 6.087 6.391 6.718 7.064 7.455 7.89 8.377 8.875 9.438 10.059 10.765 11.529 12.438 13.41 14.443 15.153 15.278 15.212 15.056 14.843 14.609 14.374 14.165 13.909 13.664 13.423 13.189 12.977 12.77 12.574 12.355 12.153 11.963 11.749 11.529 11.367 11.181 10.971 10.817 10.649 10.45 10.24 10.05 9.927 9.784 9.537 9.378 9.221 9.137 8.977 8.819 8.651 8.551 8.364 8.225 8.106 7.967 7.656 7.501 7.314 7.092 6.832 6.499 6.123 4.956 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_44_18.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_44_18.txt deleted file mode 100644 index 4a3181ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_44_18.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31878 ,TETRA ,17556986,Fri Nov 26 08:58:42 CET,Fri Nov 26 10:48:30 CET,0.0 0.214 0.338 0.424 0.49 0.544 0.589 0.636 0.722 0.757 0.785 0.775 0.895 0.929 0.981 1.027 1.086 1.115 1.166 1.216 1.28 1.324 1.371 1.44 1.503 1.551 1.597 1.643 1.692 1.737 1.775 1.821 1.864 1.897 1.955 2.027 2.08 2.142 2.187 2.221 2.27 2.291 2.295 2.274 2.197 2.078 1.907 1.665 1.226 0.393 -1.085 -2.868 -4.452 -5.809 -6.905 -7.85 -8.645 -9.369 -9.998 -10.619 -11.144 -11.603 -12.033 -12.451 -12.836 -13.185 -13.576 -13.924 -14.217 -14.518 -14.816 -15.057 -15.316 -15.58 -15.793 -16.024 -16.248 -16.476 -16.713 -16.871 -17.043 -17.331 -17.525 -17.719 -17.823 -18.018 -18.232 -18.461 -18.566 -18.771 -18.94 -19.085 -19.245 -19.61 -19.794 -19.978 -20.183 -20.425 -20.73 -21.209 -22.394 -2 ,17019 ,TETRA ,17556987,Fri Nov 26 08:58:42 CET,Fri Nov 26 10:49:52 CET,0.0 0.18 0.296 0.371 0.428 0.479 0.531 0.588 0.685 0.731 0.773 0.769 0.888 0.922 0.978 1.033 1.087 1.11 1.156 1.198 1.256 1.294 1.337 1.4 1.458 1.512 1.555 1.598 1.65 1.695 1.744 1.794 1.846 1.904 1.96 2.031 2.096 2.15 2.197 2.241 2.289 2.324 2.369 2.381 2.329 2.24 2.063 1.812 1.419 0.702 -0.684 -2.533 -4.095 -5.384 -6.479 -7.438 -8.287 -9.038 -9.671 -10.306 -10.857 -11.372 -11.864 -12.317 -12.729 -13.105 -13.471 -13.758 -14.012 -14.281 -14.562 -14.816 -15.08 -15.325 -15.513 -15.725 -15.941 -16.157 -16.404 -16.575 -16.737 -17.006 -17.21 -17.422 -17.529 -17.744 -17.967 -18.201 -18.32 -18.534 -18.704 -18.839 -18.966 -19.298 -19.496 -19.693 -19.904 -20.158 -20.477 -20.878 -22.573 -3 ,9759 ,TETRA ,17556988,Fri Nov 26 08:58:42 CET,Fri Nov 26 10:48:42 CET,0.0 0.313 0.425 0.505 0.571 0.634 0.689 0.748 0.871 0.926 0.967 0.966 1.088 1.131 1.215 1.286 1.353 1.383 1.437 1.491 1.562 1.61 1.656 1.708 1.765 1.823 1.867 1.911 1.955 1.993 2.043 2.103 2.151 2.191 2.245 2.31 2.357 2.403 2.466 2.543 2.603 2.648 2.7 2.736 2.73 2.668 2.54 2.315 1.935 1.226 -0.199 -2.032 -3.555 -4.864 -6.012 -7.058 -7.953 -8.728 -9.382 -10.036 -10.62 -11.131 -11.595 -12.032 -12.453 -12.832 -13.212 -13.544 -13.829 -14.125 -14.444 -14.719 -15.003 -15.295 -15.527 -15.762 -15.997 -16.227 -16.456 -16.619 -16.793 -17.063 -17.253 -17.44 -17.531 -17.722 -17.919 -18.141 -18.265 -18.488 -18.682 -18.833 -18.983 -19.314 -19.487 -19.683 -19.913 -20.161 -20.448 -20.871 -22.192 -4 ,7086 ,TETRA ,17556989,Fri Nov 26 08:59:45 CET,Fri Nov 26 10:49:25 CET,0.0 0.141 0.245 0.327 0.394 0.457 0.508 0.554 0.644 0.686 0.72 0.705 0.817 0.853 0.928 0.994 1.052 1.081 1.131 1.18 1.259 1.297 1.329 1.389 1.455 1.516 1.558 1.595 1.644 1.684 1.725 1.776 1.83 1.873 1.921 1.989 2.041 2.087 2.127 2.155 2.166 2.171 2.19 2.172 2.121 2.05 1.922 1.693 1.287 0.6 -0.817 -2.667 -4.215 -5.54 -6.646 -7.6 -8.419 -9.164 -9.817 -10.469 -11.01 -11.481 -11.924 -12.356 -12.752 -13.109 -13.511 -13.884 -14.194 -14.51 -14.844 -15.112 -15.382 -15.666 -15.896 -16.136 -16.369 -16.602 -16.843 -17.005 -17.178 -17.455 -17.664 -17.882 -17.991 -18.209 -18.432 -18.679 -18.807 -19.038 -19.237 -19.386 -19.537 -19.853 -20.019 -20.203 -20.428 -20.693 -20.983 -21.354 -23.205 -5 ,20394 ,TETRA ,17556990,Fri Nov 26 08:59:43 CET,Fri Nov 26 10:50:53 CET,0.0 0.267 0.366 0.436 0.493 0.554 0.624 0.682 0.772 0.81 0.854 0.863 0.984 1.02 1.078 1.13 1.185 1.209 1.25 1.292 1.343 1.377 1.418 1.487 1.556 1.619 1.679 1.741 1.822 1.883 1.928 1.976 2.018 2.059 2.113 2.157 2.178 2.218 2.281 2.341 2.372 2.405 2.455 2.467 2.449 2.426 2.328 2.09 1.622 0.876 -0.431 -2.148 -3.614 -4.912 -6.017 -6.991 -7.836 -8.589 -9.25 -9.925 -10.502 -11.003 -11.488 -11.93 -12.336 -12.704 -13.065 -13.379 -13.654 -13.958 -14.256 -14.485 -14.745 -15.008 -15.212 -15.432 -15.653 -15.889 -16.139 -16.308 -16.479 -16.755 -16.938 -17.109 -17.206 -17.42 -17.636 -17.88 -18.013 -18.24 -18.431 -18.591 -18.745 -19.045 -19.228 -19.437 -19.675 -19.956 -20.275 -20.653 -22.106 -6 ,7724 ,TETRA ,17556991,Fri Nov 26 08:59:43 CET,Fri Nov 26 11:04:54 CET,0.0 0.238 0.35 0.427 0.509 0.587 0.646 0.686 0.761 0.797 0.836 0.827 0.936 0.968 1.035 1.108 1.173 1.206 1.267 1.308 1.37 1.418 1.459 1.515 1.584 1.649 1.701 1.745 1.802 1.863 1.923 1.983 2.034 2.096 2.167 2.22 2.265 2.317 2.369 2.415 2.431 2.446 2.471 2.485 2.494 2.456 2.334 2.12 1.749 1.06 -0.33 -2.123 -3.638 -4.948 -6.109 -7.096 -7.918 -8.678 -9.327 -9.973 -10.523 -10.987 -11.42 -11.83 -12.209 -12.568 -12.952 -13.299 -13.596 -13.896 -14.202 -14.458 -14.727 -14.999 -15.215 -15.434 -15.652 -15.893 -16.148 -16.32 -16.493 -16.759 -16.95 -17.151 -17.252 -17.443 -17.653 -17.899 -18.026 -18.244 -18.421 -18.559 -18.697 -19.017 -19.214 -19.44 -19.693 -19.959 -20.255 -20.664 -22.48 -7 ,15168 ,TETRA ,17556992,Fri Nov 26 08:59:43 CET,Fri Nov 26 10:49:12 CET,0.0 0.147 0.242 0.32 0.378 0.43 0.485 0.537 0.638 0.682 0.724 0.721 0.832 0.857 0.911 0.968 1.032 1.064 1.108 1.149 1.224 1.271 1.315 1.385 1.44 1.49 1.547 1.599 1.665 1.734 1.803 1.878 1.94 1.997 2.066 2.137 2.196 2.268 2.357 2.433 2.482 2.539 2.569 2.573 2.559 2.496 2.379 2.151 1.721 1.008 -0.28 -2.004 -3.484 -4.755 -5.861 -6.833 -7.667 -8.423 -9.075 -9.74 -10.304 -10.79 -11.243 -11.66 -12.052 -12.406 -12.75 -13.05 -13.315 -13.601 -13.904 -14.146 -14.395 -14.664 -14.868 -15.08 -15.303 -15.525 -15.756 -15.937 -16.121 -16.386 -16.575 -16.767 -16.862 -17.073 -17.317 -17.574 -17.696 -17.911 -18.073 -18.191 -18.326 -18.685 -18.873 -19.061 -19.285 -19.548 -19.839 -20.232 -21.767 -8 ,15170 ,TETRA ,17556993,Fri Nov 26 08:59:43 CET,Fri Nov 26 10:49:46 CET,0.0 0.224 0.319 0.399 0.474 0.528 0.583 0.638 0.732 0.775 0.809 0.794 0.905 0.934 0.986 1.038 1.096 1.123 1.164 1.204 1.275 1.322 1.357 1.42 1.484 1.54 1.593 1.643 1.708 1.769 1.818 1.865 1.904 1.959 2.034 2.093 2.127 2.159 2.202 2.25 2.307 2.355 2.369 2.345 2.298 2.231 2.099 1.842 1.424 0.76 -0.641 -2.463 -3.966 -5.214 -6.238 -7.16 -7.993 -8.755 -9.392 -10.03 -10.578 -11.062 -11.514 -11.934 -12.313 -12.657 -13.021 -13.344 -13.629 -13.915 -14.198 -14.438 -14.715 -15.007 -15.221 -15.429 -15.637 -15.861 -16.108 -16.286 -16.481 -16.778 -16.974 -17.175 -17.276 -17.488 -17.7 -17.915 -18.034 -18.253 -18.423 -18.573 -18.73 -19.083 -19.287 -19.517 -19.739 -19.967 -20.234 -20.647 -21.761 -9 ,19198 ,TETRA ,17556994,Fri Nov 26 09:00:46 CET,Fri Nov 26 10:50:11 CET,0.0 0.171 0.26 0.355 0.434 0.489 0.54 0.591 0.674 0.71 0.741 0.722 0.834 0.867 0.936 1.011 1.087 1.119 1.18 1.234 1.304 1.345 1.379 1.429 1.494 1.554 1.598 1.64 1.701 1.765 1.809 1.854 1.909 1.966 2.027 2.082 2.127 2.184 2.239 2.276 2.323 2.349 2.33 2.303 2.271 2.196 2.019 1.75 1.296 0.476 -1.006 -2.829 -4.353 -5.675 -6.812 -7.834 -8.726 -9.494 -10.153 -10.837 -11.422 -11.93 -12.398 -12.831 -13.233 -13.592 -13.956 -14.288 -14.573 -14.86 -15.169 -15.427 -15.697 -15.979 -16.199 -16.419 -16.64 -16.887 -17.139 -17.3 -17.472 -17.756 -17.946 -18.151 -18.261 -18.48 -18.704 -18.938 -19.057 -19.28 -19.467 -19.619 -19.774 -20.103 -20.287 -20.479 -20.676 -20.902 -21.208 -21.595 -23.044 -10 ,14051 ,TETRA ,17556995,Fri Nov 26 09:00:46 CET,Fri Nov 26 10:51:55 CET,0.0 0.148 0.259 0.34 0.41 0.468 0.518 0.57 0.679 0.729 0.769 0.759 0.878 0.91 0.975 1.029 1.078 1.107 1.169 1.224 1.299 1.346 1.386 1.452 1.514 1.571 1.622 1.665 1.724 1.782 1.833 1.891 1.938 1.984 2.043 2.111 2.169 2.211 2.251 2.294 2.317 2.332 2.342 2.318 2.251 2.142 2.04 1.88 1.481 0.777 -0.579 -2.47 -4.051 -5.412 -6.554 -7.55 -8.408 -9.171 -9.832 -10.491 -11.047 -11.542 -12.007 -12.452 -12.864 -13.222 -13.581 -13.901 -14.172 -14.443 -14.724 -14.963 -15.221 -15.491 -15.704 -15.913 -16.121 -16.345 -16.593 -16.762 -16.923 -17.17 -17.355 -17.542 -17.64 -17.855 -18.077 -18.317 -18.439 -18.657 -18.842 -18.986 -19.136 -19.474 -19.661 -19.858 -20.067 -20.3 -20.576 -20.995 -22.822 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_45_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_45_44.txt deleted file mode 100644 index 86e22573..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cdk8/water/Summary_FEP_45_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2839 ,TETRA ,17556996,Fri Nov 26 09:00:47 CET,Fri Nov 26 10:53:05 CET,0.0 0.424 0.586 0.729 0.843 0.94 1.039 1.143 1.339 1.433 1.523 1.616 1.766 1.835 1.967 2.086 2.188 2.244 2.362 2.477 2.647 2.755 2.856 2.995 3.137 3.288 3.441 3.599 3.79 3.951 4.117 4.334 4.537 4.734 4.956 5.189 5.421 5.674 5.939 6.219 6.518 6.851 7.232 7.619 8.055 8.509 8.98 9.457 9.994 10.507 10.79 10.647 10.222 9.709 9.209 8.712 8.234 7.822 7.497 7.159 6.842 6.549 6.26 5.967 5.712 5.474 5.206 4.976 4.762 4.536 4.304 4.097 3.872 3.633 3.462 3.294 3.111 2.925 2.744 2.609 2.445 2.198 2.048 1.885 1.789 1.583 1.384 1.197 1.107 0.933 0.795 0.671 0.542 0.221 0.033 -0.154 -0.329 -0.525 -0.755 -1.095 -1.972 -2 ,22352 ,TETRA ,17556997,Fri Nov 26 09:00:47 CET,Fri Nov 26 10:54:02 CET,0.0 0.26 0.436 0.592 0.718 0.838 0.945 1.028 1.19 1.271 1.347 1.422 1.571 1.639 1.77 1.901 2.022 2.085 2.21 2.317 2.471 2.572 2.67 2.817 2.957 3.093 3.226 3.355 3.527 3.685 3.835 4.024 4.202 4.378 4.59 4.805 5.0 5.239 5.517 5.796 6.065 6.386 6.781 7.163 7.582 8.042 8.556 9.076 9.589 9.974 10.151 9.964 9.538 8.99 8.399 7.859 7.401 6.983 6.606 6.183 5.817 5.493 5.176 4.885 4.614 4.348 4.071 3.815 3.584 3.362 3.133 2.934 2.721 2.514 2.358 2.197 2.029 1.853 1.67 1.538 1.414 1.221 1.076 0.931 0.852 0.687 0.526 0.328 0.219 0.038 -0.081 -0.19 -0.318 -0.589 -0.724 -0.887 -1.094 -1.301 -1.538 -1.855 -2.942 -3 ,20489 ,TETRA ,17556998,Fri Nov 26 09:00:47 CET,Fri Nov 26 10:53:21 CET,0.0 0.3 0.502 0.666 0.801 0.921 1.023 1.11 1.298 1.394 1.478 1.567 1.727 1.799 1.925 2.039 2.157 2.221 2.332 2.435 2.598 2.703 2.802 2.936 3.069 3.197 3.325 3.449 3.608 3.784 3.969 4.188 4.391 4.59 4.818 5.055 5.273 5.518 5.791 6.081 6.378 6.697 7.067 7.446 7.873 8.338 8.843 9.392 9.961 10.475 10.841 10.798 10.512 10.102 9.653 9.202 8.748 8.29 7.871 7.446 7.104 6.78 6.432 6.137 5.864 5.604 5.348 5.098 4.871 4.657 4.427 4.213 3.995 3.777 3.624 3.466 3.295 3.107 2.907 2.781 2.653 2.449 2.309 2.156 2.074 1.919 1.763 1.593 1.503 1.331 1.23 1.116 0.978 0.682 0.532 0.376 0.207 -0.021 -0.308 -0.619 -1.693 -4 ,22378 ,TETRA ,17556999,Fri Nov 26 09:00:47 CET,Fri Nov 26 10:54:41 CET,0.0 0.267 0.428 0.566 0.694 0.805 0.904 1.0 1.187 1.286 1.379 1.457 1.603 1.663 1.795 1.931 2.06 2.12 2.224 2.332 2.497 2.594 2.682 2.803 2.929 3.065 3.195 3.314 3.473 3.636 3.787 3.961 4.128 4.291 4.484 4.701 4.928 5.189 5.468 5.765 6.068 6.398 6.768 7.108 7.512 7.975 8.448 8.931 9.432 9.851 10.058 9.895 9.554 9.111 8.632 8.19 7.787 7.39 7.009 6.592 6.226 5.91 5.6 5.292 4.996 4.725 4.454 4.211 3.988 3.766 3.551 3.371 3.185 2.988 2.831 2.678 2.523 2.354 2.175 2.054 1.927 1.718 1.572 1.445 1.374 1.202 1.023 0.835 0.729 0.534 0.403 0.284 0.142 -0.139 -0.274 -0.428 -0.632 -0.909 -1.182 -1.495 -2.662 -5 ,18984 ,TETRA ,17557000,Fri Nov 26 09:00:47 CET,Fri Nov 26 10:53:33 CET,0.0 0.33 0.518 0.654 0.775 0.887 0.986 1.082 1.267 1.355 1.436 1.505 1.656 1.729 1.861 1.981 2.101 2.161 2.279 2.394 2.539 2.635 2.739 2.885 3.037 3.18 3.308 3.427 3.571 3.71 3.844 4.028 4.215 4.392 4.593 4.807 5.021 5.255 5.487 5.726 5.978 6.27 6.617 6.969 7.41 7.87 8.356 8.85 9.373 9.948 10.286 10.104 9.734 9.309 8.863 8.387 7.957 7.583 7.222 6.837 6.479 6.099 5.731 5.395 5.085 4.821 4.564 4.331 4.113 3.875 3.632 3.449 3.252 3.026 2.857 2.706 2.536 2.349 2.172 2.04 1.9 1.682 1.523 1.354 1.271 1.11 0.923 0.726 0.623 0.423 0.247 0.135 0.019 -0.234 -0.369 -0.543 -0.762 -1.042 -1.411 -1.915 -3.174 -6 ,10391 ,TETRA ,17557001,Fri Nov 26 09:01:46 CET,Fri Nov 26 10:56:51 CET,0.0 0.257 0.45 0.599 0.725 0.837 0.932 1.022 1.21 1.302 1.387 1.477 1.632 1.707 1.842 1.967 2.088 2.143 2.254 2.37 2.54 2.646 2.746 2.885 3.021 3.159 3.289 3.413 3.576 3.743 3.903 4.09 4.277 4.46 4.672 4.911 5.136 5.387 5.669 5.962 6.274 6.61 6.958 7.301 7.716 8.169 8.656 9.197 9.776 10.295 10.608 10.465 10.075 9.619 9.168 8.729 8.312 7.886 7.506 7.134 6.804 6.501 6.22 5.938 5.657 5.394 5.124 4.891 4.695 4.493 4.287 4.113 3.945 3.786 3.647 3.482 3.315 3.146 2.965 2.842 2.713 2.514 2.36 2.19 2.111 1.954 1.781 1.59 1.486 1.303 1.178 1.051 0.905 0.625 0.472 0.308 0.111 -0.107 -0.377 -0.756 -2.131 -7 ,14902 ,TETRA ,17557002,Fri Nov 26 09:01:46 CET,Fri Nov 26 10:52:43 CET,0.0 0.427 0.613 0.742 0.863 0.989 1.108 1.213 1.409 1.496 1.583 1.672 1.818 1.892 2.03 2.155 2.288 2.355 2.479 2.598 2.763 2.859 2.961 3.111 3.243 3.376 3.506 3.634 3.801 3.956 4.103 4.284 4.463 4.651 4.879 5.134 5.381 5.644 5.916 6.205 6.507 6.824 7.167 7.516 7.927 8.381 8.891 9.411 9.975 10.503 10.823 10.773 10.416 9.937 9.465 9.046 8.626 8.192 7.825 7.475 7.158 6.866 6.55 6.195 5.879 5.596 5.315 5.083 4.861 4.639 4.422 4.24 4.061 3.866 3.707 3.549 3.396 3.236 3.059 2.931 2.799 2.601 2.445 2.272 2.183 2.0 1.812 1.606 1.504 1.318 1.174 1.063 0.943 0.684 0.54 0.365 0.143 -0.099 -0.359 -0.672 -1.575 -8 ,9411 ,TETRA ,17557003,Fri Nov 26 09:01:46 CET,Fri Nov 26 10:53:29 CET,0.0 0.354 0.568 0.734 0.858 0.975 1.08 1.176 1.359 1.445 1.525 1.601 1.747 1.812 1.942 2.075 2.201 2.259 2.375 2.49 2.654 2.765 2.874 3.034 3.191 3.349 3.502 3.643 3.826 4.009 4.183 4.395 4.607 4.807 5.027 5.263 5.497 5.752 6.024 6.312 6.617 6.978 7.374 7.735 8.161 8.629 9.095 9.567 10.068 10.545 10.938 10.907 10.515 10.006 9.557 9.122 8.678 8.229 7.841 7.466 7.131 6.806 6.478 6.175 5.871 5.574 5.283 5.059 4.86 4.626 4.375 4.17 3.966 3.751 3.591 3.428 3.25 3.055 2.866 2.743 2.623 2.426 2.286 2.14 2.061 1.881 1.684 1.508 1.418 1.232 1.1 0.99 0.865 0.609 0.453 0.289 0.111 -0.127 -0.377 -0.712 -1.793 -9 ,31306 ,TETRA ,17557004,Fri Nov 26 09:01:46 CET,Fri Nov 26 10:53:18 CET,0.0 0.347 0.528 0.655 0.761 0.876 0.996 1.1 1.295 1.386 1.464 1.535 1.68 1.75 1.89 2.011 2.113 2.165 2.269 2.37 2.523 2.618 2.708 2.845 2.979 3.097 3.216 3.338 3.501 3.671 3.834 4.042 4.25 4.442 4.656 4.881 5.102 5.346 5.602 5.89 6.184 6.492 6.873 7.254 7.661 8.107 8.595 9.104 9.596 10.001 10.276 10.154 9.885 9.524 9.052 8.576 8.127 7.681 7.285 6.889 6.555 6.258 5.943 5.623 5.317 5.054 4.8 4.571 4.349 4.103 3.848 3.641 3.43 3.212 3.039 2.859 2.674 2.475 2.27 2.138 1.992 1.726 1.53 1.341 1.252 1.062 0.853 0.625 0.509 0.32 0.144 0.015 -0.116 -0.383 -0.524 -0.7 -0.885 -1.08 -1.318 -1.673 -3.418 -10 ,3911 ,TETRA ,17557005,Fri Nov 26 09:01:46 CET,Fri Nov 26 10:53:00 CET,0.0 0.334 0.517 0.664 0.771 0.876 0.974 1.058 1.209 1.286 1.364 1.443 1.59 1.658 1.778 1.898 2.025 2.092 2.227 2.366 2.575 2.697 2.816 2.995 3.153 3.308 3.47 3.623 3.816 3.997 4.166 4.365 4.551 4.734 4.945 5.171 5.388 5.621 5.873 6.153 6.46 6.795 7.16 7.504 7.892 8.329 8.838 9.362 9.888 10.38 10.705 10.593 10.177 9.716 9.284 8.838 8.408 7.982 7.571 7.15 6.79 6.477 6.183 5.902 5.634 5.357 5.056 4.824 4.626 4.37 4.115 3.93 3.725 3.522 3.367 3.214 3.053 2.876 2.698 2.574 2.436 2.197 2.014 1.828 1.736 1.566 1.394 1.193 1.095 0.922 0.763 0.641 0.521 0.245 0.085 -0.084 -0.253 -0.453 -0.704 -0.964 -1.94 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 1c37b7df..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31867 ,TETRA ,17557034,Fri Nov 26 09:01:46 CET,Fri Nov 26 11:24:53 CET,0.0 3.52 4.288 4.906 5.448 5.924 6.285 6.556 7.112 7.394 7.635 7.936 8.302 8.493 8.863 9.231 9.591 9.755 10.088 10.413 10.846 11.116 11.372 11.757 12.167 12.573 12.954 13.323 13.791 14.223 14.653 15.162 15.619 16.062 16.584 17.168 17.715 18.305 18.93 19.62 20.358 21.135 22.014 22.897 23.907 25.045 26.326 27.667 29.201 30.935 32.469 32.925 32.693 32.153 31.409 30.541 29.715 28.998 28.31 27.511 26.769 26.063 25.37 24.702 24.051 23.435 22.811 22.23 21.718 21.196 20.57 20.018 19.493 18.913 18.444 17.988 17.507 17.016 16.521 16.156 15.763 15.109 14.638 14.134 13.866 13.334 12.786 12.198 11.86 11.353 10.752 10.367 9.942 9.008 8.486 7.915 7.275 6.473 5.495 4.349 0.438 -3 ,13712 ,TETRA ,17557036,Fri Nov 26 09:02:51 CET,Fri Nov 26 11:24:40 CET,0.0 6.694 7.403 8.03 8.497 8.833 9.142 9.442 9.978 10.227 10.464 10.721 11.071 11.272 11.655 12.002 12.341 12.517 12.856 13.168 13.598 13.859 14.109 14.461 14.787 15.103 15.418 15.723 16.109 16.492 16.868 17.308 17.779 18.276 18.819 19.41 19.988 20.627 21.313 22.025 22.762 23.608 24.574 25.522 26.623 27.851 29.303 30.87 32.557 34.32 35.833 36.324 35.889 35.141 34.223 33.28 32.404 31.49 30.619 29.703 28.954 28.255 27.56 26.906 26.257 25.647 24.985 24.348 23.761 23.165 22.561 22.066 21.542 20.979 20.551 20.104 19.605 19.059 18.485 18.082 17.669 17.049 16.614 16.141 15.895 15.402 14.857 14.26 13.957 13.479 12.891 12.55 12.171 11.262 10.738 10.133 9.498 8.757 7.78 6.53 nan -7 ,30086 ,TETRA ,17557040,Fri Nov 26 09:02:52 CET,Fri Nov 26 11:25:55 CET,0.0 4.1 4.602 5.021 5.418 5.763 6.059 6.294 6.763 7.021 7.262 7.554 7.917 8.117 8.492 8.83 9.159 9.333 9.664 9.966 10.385 10.641 10.897 11.281 11.643 11.983 12.314 12.632 13.018 13.392 13.764 14.227 14.666 15.084 15.579 16.124 16.619 17.158 17.751 18.382 19.091 19.927 20.884 21.846 22.953 24.15 25.425 26.765 28.141 29.431 30.587 30.957 30.626 29.826 28.866 27.897 26.959 26.042 25.203 24.312 23.526 22.798 22.089 21.439 20.822 20.208 19.536 18.936 18.411 17.867 17.311 16.834 16.323 15.786 15.36 14.907 14.437 13.937 13.365 12.959 12.532 11.831 11.34 10.853 10.609 10.126 9.609 9.054 8.78 8.335 7.782 7.43 7.057 6.241 5.797 5.281 4.688 3.921 2.887 1.553 -3.984 -8 ,19875 ,TETRA ,17557041,Fri Nov 26 09:02:51 CET,Fri Nov 26 11:24:28 CET,0.0 2.81 3.481 4.028 4.498 4.871 5.226 5.561 6.186 6.457 6.721 7.087 7.474 7.678 8.058 8.439 8.819 8.988 9.311 9.659 10.169 10.491 10.806 11.255 11.681 12.08 12.455 12.832 13.331 13.794 14.242 14.793 15.321 15.852 16.476 17.177 17.874 18.615 19.374 20.19 21.115 22.198 23.449 24.642 25.96 27.421 29.056 30.857 32.928 35.07 37.128 38.271 38.468 38.045 37.258 36.35 35.421 34.508 33.676 32.794 32.051 31.373 30.652 29.964 29.29 28.611 27.913 27.289 26.721 26.111 25.467 24.931 24.38 23.826 23.381 22.9 22.418 21.902 21.346 20.974 20.58 19.901 19.408 18.888 18.618 18.097 17.56 16.953 16.637 16.181 15.6 15.213 14.815 13.9 13.396 12.887 12.283 11.527 10.67 9.242 nan -9 ,3868 ,TETRA ,17557042,Fri Nov 26 09:02:51 CET,Fri Nov 26 11:05:01 CET,0.0 5.43 6.108 6.612 7.013 7.368 7.73 8.069 8.624 8.86 9.105 9.442 9.812 10.025 10.435 10.818 11.203 11.393 11.75 12.095 12.554 12.816 13.091 13.492 13.875 14.238 14.563 14.871 15.279 15.682 16.068 16.555 17.039 17.494 18.012 18.62 19.192 19.807 20.488 21.174 21.871 22.663 23.619 24.611 25.825 27.171 28.554 29.906 31.351 32.821 34.022 34.217 33.862 33.404 32.645 31.749 30.959 30.164 29.435 28.677 27.945 27.226 26.526 25.89 25.279 24.682 24.068 23.511 22.986 22.437 21.872 21.399 20.912 20.391 19.969 19.55 19.123 18.629 18.108 17.773 17.44 16.875 16.441 16.0 15.783 15.336 14.856 14.349 14.079 13.667 13.231 12.895 12.501 11.583 11.049 10.516 9.925 9.21 8.373 7.144 nan diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt deleted file mode 100644 index 3aacd44d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3670 ,TETRA ,17557044,Fri Nov 26 09:02:51 CET,Fri Nov 26 11:27:28 CET,0.0 1.06 1.561 1.955 2.265 2.56 2.851 3.106 3.546 3.759 3.972 4.202 4.536 4.724 5.074 5.367 5.64 5.775 6.037 6.291 6.654 6.883 7.1 7.409 7.714 8.016 8.3 8.572 8.917 9.242 9.554 9.934 10.318 10.688 11.086 11.525 11.941 12.39 12.883 13.407 13.946 14.554 15.225 15.868 16.63 17.416 18.251 19.14 20.088 20.917 21.182 20.502 19.421 18.276 17.14 16.025 15.018 14.093 13.242 12.348 11.579 10.881 10.207 9.537 8.897 8.327 7.721 7.167 6.642 6.077 5.505 4.98 4.412 3.842 3.37 2.86 2.345 1.796 1.237 0.862 0.455 -0.207 -0.654 -1.111 -1.355 -1.866 -2.391 -2.917 -3.194 -3.671 -4.238 -4.592 -4.961 -5.779 -6.225 -6.705 -7.25 -7.844 -8.587 -9.711 -12.455 -2 ,22357 ,TETRA ,17557045,Fri Nov 26 09:02:51 CET,Fri Nov 26 11:26:39 CET,0.0 1.847 2.459 2.912 3.27 3.562 3.832 4.103 4.547 4.747 4.955 5.167 5.5 5.681 6.009 6.326 6.625 6.77 7.043 7.309 7.708 7.967 8.216 8.571 8.904 9.21 9.507 9.8 10.165 10.515 10.868 11.287 11.683 12.06 12.48 12.938 13.371 13.838 14.334 14.857 15.421 16.056 16.748 17.398 18.147 18.94 19.766 20.689 21.61 22.229 22.283 21.513 20.486 19.401 18.32 17.237 16.261 15.344 14.505 13.643 12.874 12.159 11.46 10.773 10.125 9.521 8.894 8.359 7.869 7.345 6.807 6.363 5.924 5.441 5.042 4.622 4.195 3.731 3.236 2.906 2.539 1.947 1.532 1.091 0.872 0.435 -0.019 -0.505 -0.771 -1.205 -1.637 -1.948 -2.278 -2.973 -3.363 -3.807 -4.311 -4.869 -5.539 -6.451 -8.694 -3 ,27566 ,TETRA ,17557046,Fri Nov 26 09:02:51 CET,Fri Nov 26 11:24:58 CET,0.0 0.871 1.319 1.629 1.912 2.205 2.481 2.73 3.191 3.399 3.603 3.847 4.179 4.332 4.608 4.903 5.196 5.326 5.581 5.831 6.186 6.412 6.632 6.974 7.31 7.625 7.901 8.158 8.508 8.852 9.175 9.566 9.939 10.283 10.679 11.112 11.506 11.928 12.402 12.923 13.472 14.083 14.787 15.449 16.184 16.968 17.818 18.625 19.316 19.972 20.153 19.452 18.418 17.323 16.263 15.173 14.155 13.218 12.377 11.49 10.701 9.986 9.297 8.633 8.001 7.434 6.853 6.339 5.878 5.35 4.765 4.287 3.812 3.331 2.96 2.568 2.15 1.721 1.272 0.979 0.673 0.154 -0.212 -0.621 -0.823 -1.241 -1.723 -2.221 -2.481 -2.884 -3.27 -3.565 -3.895 -4.588 -4.959 -5.389 -5.851 -6.359 -6.971 -7.723 -9.487 -4 ,21060 ,TETRA ,17557047,Fri Nov 26 09:02:51 CET,Fri Nov 26 11:26:22 CET,0.0 1.278 1.786 2.182 2.518 2.84 3.146 3.42 3.924 4.159 4.368 4.576 4.906 5.071 5.383 5.68 5.952 6.087 6.356 6.613 6.981 7.213 7.437 7.763 8.071 8.377 8.683 8.972 9.363 9.744 10.101 10.522 10.916 11.301 11.75 12.257 12.73 13.216 13.69 14.165 14.68 15.296 16.006 16.673 17.38 18.124 18.909 19.664 20.402 21.025 21.079 20.281 19.241 18.122 17.002 15.907 14.912 13.974 13.115 12.14 11.304 10.592 9.895 9.241 8.624 8.069 7.474 6.911 6.419 5.927 5.378 4.9 4.415 3.881 3.463 3.034 2.6 2.173 1.735 1.424 1.103 0.584 0.21 -0.19 -0.409 -0.861 -1.334 -1.844 -2.098 -2.496 -2.89 -3.184 -3.492 -4.162 -4.552 -4.995 -5.483 -6.031 -6.778 -7.851 -11.645 -5 ,12690 ,TETRA ,17557048,Fri Nov 26 09:03:48 CET,Fri Nov 26 11:25:59 CET,0.0 0.633 1.041 1.36 1.654 1.94 2.201 2.449 2.91 3.105 3.276 3.46 3.792 3.977 4.338 4.66 4.946 5.089 5.354 5.582 5.932 6.164 6.383 6.685 6.982 7.282 7.572 7.85 8.199 8.532 8.857 9.244 9.607 9.951 10.342 10.792 11.221 11.7 12.212 12.722 13.238 13.839 14.552 15.23 15.961 16.735 17.618 18.584 19.599 20.522 21.02 20.65 19.812 18.771 17.697 16.639 15.637 14.689 13.836 12.954 12.184 11.48 10.791 10.142 9.523 8.929 8.299 7.703 7.181 6.657 6.09 5.598 5.08 4.569 4.193 3.805 3.386 2.933 2.457 2.118 1.765 1.214 0.831 0.431 0.209 -0.25 -0.736 -1.275 -1.549 -1.967 -2.437 -2.762 -3.108 -3.93 -4.361 -4.852 -5.353 -5.851 -6.441 -7.154 -8.751 -6 ,29388 ,TETRA ,17557049,Fri Nov 26 09:03:48 CET,Fri Nov 26 11:28:18 CET,0.0 0.876 1.275 1.581 1.877 2.15 2.4 2.632 3.069 3.257 3.434 3.613 3.931 4.084 4.391 4.682 4.943 5.075 5.335 5.578 5.924 6.151 6.378 6.708 7.01 7.296 7.568 7.842 8.212 8.547 8.867 9.247 9.597 9.949 10.351 10.82 11.282 11.771 12.274 12.794 13.353 13.964 14.687 15.453 16.313 17.168 18.048 18.891 19.657 20.273 20.468 19.68 18.609 17.503 16.365 15.309 14.358 13.413 12.491 11.545 10.756 10.053 9.347 8.666 8.027 7.424 6.78 6.203 5.7 5.167 4.618 4.153 3.662 3.16 2.773 2.366 1.932 1.461 0.96 0.618 0.244 -0.366 -0.789 -1.224 -1.445 -1.927 -2.463 -3.018 -3.292 -3.709 -4.14 -4.466 -4.819 -5.548 -5.939 -6.378 -6.884 -7.481 -8.217 -9.114 -10.958 -7 ,10473 ,TETRA ,17557050,Fri Nov 26 09:03:48 CET,Fri Nov 26 11:27:05 CET,0.0 0.934 1.426 1.823 2.143 2.451 2.738 2.993 3.451 3.655 3.857 4.075 4.404 4.572 4.874 5.153 5.434 5.568 5.829 6.094 6.459 6.676 6.889 7.194 7.469 7.743 8.022 8.294 8.658 9.014 9.339 9.721 10.096 10.447 10.84 11.307 11.772 12.263 12.799 13.371 13.957 14.583 15.222 15.85 16.604 17.47 18.414 19.279 20.203 21.068 21.2 20.42 19.413 18.288 17.218 16.242 15.33 14.383 13.562 12.73 11.935 11.205 10.503 9.825 9.204 8.636 8.011 7.445 6.956 6.459 5.962 5.528 5.072 4.617 4.248 3.851 3.455 3.053 2.637 2.34 2.031 1.55 1.204 0.838 0.656 0.303 -0.07 -0.47 -0.679 -1.052 -1.38 -1.619 -1.885 -2.538 -2.925 -3.34 -3.818 -4.459 -5.152 -5.946 -7.707 -8 ,16281 ,TETRA ,17557051,Fri Nov 26 09:05:46 CET,Fri Nov 26 11:16:05 CET,0.0 2.019 2.569 2.934 3.254 3.547 3.827 4.091 4.558 4.769 4.972 5.214 5.559 5.748 6.104 6.433 6.723 6.857 7.113 7.339 7.687 7.927 8.167 8.544 8.908 9.246 9.57 9.889 10.308 10.708 11.075 11.52 11.937 12.322 12.769 13.255 13.702 14.182 14.707 15.262 15.809 16.41 17.11 17.784 18.521 19.318 20.213 21.071 21.947 22.71 22.942 22.264 21.219 20.075 18.931 17.71 16.565 15.582 14.749 13.897 13.133 12.443 11.738 11.053 10.437 9.879 9.302 8.771 8.29 7.792 7.272 6.83 6.35 5.814 5.394 4.957 4.484 3.983 3.44 3.056 2.69 2.171 1.812 1.424 1.209 0.75 0.279 -0.205 -0.475 -0.89 -1.247 -1.555 -1.887 -2.593 -3.004 -3.482 -4.021 -4.617 -5.311 -6.222 -8.688 -9 ,7283 ,TETRA ,17557052,Fri Nov 26 09:04:44 CET,Fri Nov 26 11:28:40 CET,0.0 1.484 2.116 2.556 2.955 3.294 3.584 3.844 4.282 4.492 4.694 4.927 5.291 5.488 5.833 6.172 6.487 6.642 6.955 7.246 7.676 7.941 8.184 8.539 8.859 9.158 9.468 9.772 10.146 10.503 10.841 11.234 11.612 11.977 12.394 12.842 13.245 13.712 14.248 14.816 15.403 16.043 16.776 17.506 18.319 19.153 19.987 20.83 21.738 22.594 23.046 22.634 21.739 20.674 19.566 18.457 17.408 16.412 15.557 14.718 13.951 13.223 12.526 11.796 11.078 10.447 9.781 9.167 8.667 8.174 7.645 7.207 6.748 6.258 5.855 5.413 4.944 4.48 3.995 3.65 3.298 2.741 2.347 1.958 1.758 1.339 0.901 0.433 0.178 -0.244 -0.654 -0.94 -1.233 -1.932 -2.326 -2.718 -3.129 -3.593 -4.264 -5.186 -7.817 -10 ,25483 ,TETRA ,17557053,Fri Nov 26 09:04:44 CET,Fri Nov 26 11:30:41 CET,0.0 1.033 1.435 1.73 1.978 2.217 2.471 2.713 3.175 3.399 3.597 3.779 4.094 4.263 4.596 4.917 5.222 5.362 5.629 5.885 6.233 6.44 6.651 6.97 7.27 7.558 7.852 8.169 8.569 8.918 9.246 9.62 9.962 10.311 10.726 11.183 11.629 12.11 12.616 13.136 13.682 14.28 14.945 15.596 16.328 17.184 18.17 19.171 20.13 20.927 21.273 20.677 19.702 18.589 17.517 16.466 15.479 14.583 13.739 12.849 12.088 11.398 10.677 9.995 9.354 8.733 8.12 7.594 7.147 6.675 6.145 5.667 5.173 4.689 4.322 3.908 3.443 2.965 2.468 2.113 1.744 1.179 0.785 0.379 0.166 -0.276 -0.756 -1.256 -1.515 -1.93 -2.324 -2.598 -2.897 -3.574 -3.935 -4.321 -4.716 -5.16 -5.756 -6.604 -10.067 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index b7a038e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,13023 ,KEBNE ,17132021,Sat Jan 1 17:35:11 CET,Sat Jan 1 19:33:36 CET,0.0 4.105 4.761 5.247 5.635 5.951 6.234 6.473 6.88 7.071 7.273 7.513 7.815 7.996 8.371 8.72 9.053 9.212 9.501 9.749 10.106 10.351 10.597 10.959 11.304 11.633 11.954 12.261 12.631 12.966 13.285 13.68 14.051 14.409 14.829 15.276 15.705 16.181 16.722 17.312 17.913 18.557 19.304 20.084 20.98 21.952 23.125 24.45 25.878 27.414 29.061 30.22 30.785 30.998 30.974 30.837 30.656 30.442 30.181 29.855 29.563 29.292 29.018 28.737 28.46 28.205 27.905 27.6 27.311 26.987 26.638 26.353 26.063 25.767 25.518 25.256 25.019 24.78 24.497 24.298 24.072 23.652 23.363 23.088 22.944 22.647 22.34 22.0 21.829 21.517 21.205 20.998 20.77 20.213 19.9 19.56 19.174 18.709 18.145 17.379 12.229 -6 ,27183 ,KEBNE ,17132024,Sat Jan 1 17:36:12 CET,Sat Jan 1 19:34:48 CET,0.0 3.488 4.165 4.632 4.996 5.277 5.563 5.838 6.305 6.511 6.724 7.026 7.367 7.556 7.923 8.263 8.585 8.74 9.035 9.35 9.826 10.102 10.367 10.745 11.111 11.475 11.812 12.135 12.533 12.892 13.225 13.603 13.976 14.345 14.767 15.254 15.717 16.224 16.773 17.336 17.913 18.573 19.366 20.186 21.109 22.062 23.164 24.454 25.988 27.748 29.649 30.839 31.385 31.603 31.524 31.357 31.139 30.902 30.695 30.413 30.12 29.844 29.575 29.342 29.103 28.841 28.534 28.26 28.022 27.761 27.451 27.173 26.896 26.584 26.327 26.081 25.851 25.579 25.272 25.065 24.853 24.514 24.259 23.985 23.847 23.554 23.221 22.881 22.727 22.452 22.177 21.95 21.734 21.258 20.982 20.678 20.328 19.891 19.298 18.489 13.086 -10 ,20550 ,KEBNE ,17132028,Sat Jan 1 17:37:14 CET,Sat Jan 1 19:35:26 CET,0.0 9.392 9.874 10.289 10.657 10.957 11.229 11.5 12.054 12.291 12.485 12.713 13.005 13.153 13.443 13.721 13.991 14.119 14.372 14.64 15.025 15.258 15.488 15.829 16.163 16.475 16.781 17.085 17.483 17.86 18.218 18.68 19.1 19.443 19.862 20.335 20.761 21.238 21.746 22.291 22.894 23.574 24.34 25.108 26.024 27.046 28.219 29.523 30.965 32.558 34.311 35.542 36.059 36.257 36.227 36.04 35.824 35.587 35.347 35.092 34.835 34.566 34.274 34.002 33.745 33.478 33.183 32.91 32.632 32.325 32.02 31.737 31.388 31.019 30.737 30.45 30.169 29.87 29.558 29.336 29.098 28.751 28.517 28.281 28.161 27.897 27.615 27.293 27.104 26.78 26.473 26.227 25.958 25.355 25.012 24.673 24.271 23.779 23.189 22.402 19.257 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 87be431a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1674 ,TETRA ,17557054,Fri Nov 26 09:04:44 CET,Fri Nov 26 11:25:26 CET,0.0 1.451 2.021 2.492 2.938 3.308 3.621 3.94 4.524 4.757 4.971 5.243 5.561 5.749 6.107 6.499 6.874 7.036 7.316 7.593 8.014 8.272 8.516 8.87 9.218 9.538 9.828 10.104 10.46 10.821 11.173 11.578 11.946 12.287 12.677 13.143 13.606 14.071 14.523 14.957 15.368 15.824 16.338 16.796 17.275 17.715 18.153 18.585 18.942 19.101 18.734 17.661 16.541 15.5 14.55 13.669 12.856 12.104 11.404 10.673 10.09 9.585 9.03 8.448 7.89 7.367 6.827 6.363 5.972 5.569 5.136 4.763 4.377 3.983 3.695 3.392 3.065 2.733 2.381 2.129 1.858 1.445 1.181 0.921 0.789 0.502 0.192 -0.142 -0.325 -0.643 -0.894 -1.111 -1.336 -1.831 -2.098 -2.372 -2.695 -3.064 -3.479 -4.05 -5.709 -2 ,12060 ,TETRA ,17557055,Fri Nov 26 09:05:46 CET,Fri Nov 26 11:29:42 CET,0.0 1.622 2.183 2.619 2.946 3.223 3.476 3.713 4.097 4.262 4.426 4.609 4.862 4.995 5.281 5.545 5.791 5.908 6.133 6.349 6.654 6.85 7.046 7.329 7.6 7.86 8.1 8.318 8.585 8.846 9.102 9.415 9.727 10.021 10.34 10.672 10.965 11.264 11.593 11.933 12.264 12.609 12.996 13.347 13.705 14.07 14.386 14.621 14.778 14.757 14.332 13.324 12.253 11.248 10.333 9.487 8.679 7.949 7.281 6.539 5.899 5.333 4.768 4.196 3.655 3.171 2.668 2.219 1.833 1.457 1.112 0.834 0.544 0.265 0.043 -0.189 -0.42 -0.664 -0.924 -1.103 -1.283 -1.587 -1.844 -2.101 -2.216 -2.46 -2.708 -2.971 -3.117 -3.391 -3.561 -3.722 -3.867 -4.175 -4.359 -4.592 -4.863 -5.129 -5.427 -5.814 -7.181 -3 ,27445 ,TETRA ,17557056,Fri Nov 26 09:05:46 CET,Fri Nov 26 11:27:13 CET,0.0 1.979 2.602 3.127 3.611 4.043 4.4 4.689 5.19 5.419 5.631 5.896 6.205 6.395 6.761 7.089 7.438 7.61 7.916 8.2 8.599 8.868 9.136 9.485 9.789 10.079 10.361 10.632 10.974 11.311 11.651 12.066 12.45 12.789 13.169 13.584 13.972 14.427 14.909 15.403 15.934 16.506 17.14 17.754 18.465 19.219 19.959 20.562 20.934 21.084 20.765 19.735 18.533 17.349 16.263 15.306 14.519 13.817 13.205 12.588 12.023 11.528 11.085 10.663 10.269 9.882 9.463 9.102 8.798 8.493 8.173 7.9 7.614 7.316 7.08 6.831 6.576 6.319 6.05 5.853 5.644 5.322 5.111 4.904 4.801 4.586 4.356 4.091 3.956 3.687 3.526 3.347 3.151 2.745 2.542 2.317 2.037 1.712 1.378 0.981 0.13 -4 ,18953 ,TETRA ,17557057,Fri Nov 26 09:05:46 CET,Fri Nov 26 11:26:56 CET,0.0 1.293 1.886 2.282 2.584 2.865 3.12 3.352 3.768 3.957 4.136 4.339 4.622 4.77 5.053 5.334 5.586 5.708 5.943 6.161 6.465 6.664 6.879 7.188 7.464 7.726 7.972 8.21 8.52 8.81 9.088 9.409 9.706 9.994 10.307 10.658 11.026 11.416 11.804 12.201 12.613 13.058 13.503 13.915 14.404 14.933 15.442 15.863 16.232 16.44 16.142 15.269 14.314 13.374 12.455 11.604 10.868 10.148 9.516 8.889 8.339 7.84 7.334 6.854 6.43 6.03 5.612 5.234 4.907 4.579 4.225 3.927 3.63 3.325 3.084 2.834 2.555 2.251 1.95 1.753 1.541 1.207 0.982 0.735 0.603 0.305 -0.014 -0.323 -0.481 -0.787 -1.038 -1.246 -1.458 -1.92 -2.184 -2.469 -2.772 -3.181 -3.626 -4.066 -5.03 -5 ,16275 ,TETRA ,17557058,Fri Nov 26 09:05:46 CET,Fri Nov 26 11:29:58 CET,0.0 1.642 2.216 2.655 3.064 3.415 3.729 4.036 4.598 4.838 5.062 5.36 5.694 5.888 6.22 6.512 6.816 6.974 7.262 7.517 7.881 8.13 8.379 8.727 9.056 9.365 9.637 9.887 10.207 10.515 10.806 11.154 11.477 11.785 12.131 12.497 12.875 13.31 13.761 14.214 14.666 15.13 15.615 16.07 16.573 17.106 17.662 18.177 18.554 18.665 18.242 17.194 16.141 15.107 14.127 13.234 12.42 11.646 10.993 10.334 9.74 9.209 8.701 8.224 7.79 7.368 6.889 6.452 6.059 5.601 5.089 4.674 4.265 3.863 3.551 3.217 2.892 2.58 2.241 1.997 1.732 1.302 0.997 0.701 0.556 0.256 -0.064 -0.426 -0.605 -0.917 -1.15 -1.346 -1.595 -2.202 -2.547 -2.946 -3.342 -3.687 -4.104 -4.731 -6.766 -6 ,192 ,TETRA ,17557059,Fri Nov 26 09:05:46 CET,Fri Nov 26 11:26:25 CET,0.0 2.482 3.252 3.703 4.08 4.444 4.755 5.042 5.566 5.822 6.081 6.459 6.791 6.974 7.326 7.657 7.978 8.139 8.437 8.704 9.105 9.357 9.595 9.924 10.212 10.49 10.758 11.006 11.307 11.58 11.847 12.157 12.456 12.732 13.052 13.419 13.771 14.126 14.486 14.854 15.222 15.629 16.104 16.573 17.057 17.559 18.061 18.47 18.764 18.906 18.613 17.649 16.545 15.358 14.172 12.999 11.918 10.957 10.162 9.369 8.673 8.054 7.469 6.908 6.367 5.88 5.386 4.943 4.561 4.153 3.728 3.389 3.036 2.667 2.376 2.064 1.752 1.434 1.064 0.797 0.517 0.066 -0.242 -0.535 -0.68 -1.007 -1.378 -1.754 -1.937 -2.267 -2.587 -2.829 -3.064 -3.587 -3.909 -4.23 -4.553 -4.945 -5.424 -6.015 -7.136 -7 ,22903 ,TETRA ,17557060,Fri Nov 26 09:05:46 CET,Fri Nov 26 11:25:02 CET,0.0 2.067 2.777 3.265 3.693 4.092 4.424 4.715 5.26 5.514 5.76 6.1 6.438 6.636 7.014 7.391 7.75 7.914 8.212 8.482 8.824 9.049 9.284 9.639 10.013 10.36 10.635 10.875 11.203 11.504 11.79 12.127 12.427 12.713 13.035 13.368 13.685 14.07 14.503 14.952 15.419 15.921 16.471 16.995 17.54 18.076 18.68 19.255 19.646 19.79 19.39 18.264 17.114 15.998 14.808 13.622 12.571 11.585 10.727 9.845 9.052 8.349 7.688 7.094 6.549 6.034 5.506 5.037 4.628 4.199 3.754 3.395 3.023 2.615 2.291 1.969 1.64 1.297 0.937 0.693 0.444 0.032 -0.268 -0.596 -0.771 -1.124 -1.448 -1.759 -1.94 -2.286 -2.566 -2.777 -3.033 -3.578 -3.871 -4.2 -4.566 -4.965 -5.396 -6.001 -7.906 -8 ,10215 ,TETRA ,17557061,Fri Nov 26 09:05:46 CET,Fri Nov 26 11:27:19 CET,0.0 1.617 2.254 2.722 3.098 3.365 3.587 3.83 4.288 4.479 4.663 4.902 5.195 5.345 5.617 5.879 6.117 6.228 6.452 6.662 6.985 7.19 7.37 7.636 7.872 8.096 8.324 8.549 8.812 9.039 9.263 9.535 9.798 10.038 10.306 10.62 10.899 11.178 11.475 11.782 12.09 12.447 12.829 13.143 13.491 13.825 14.099 14.316 14.48 14.415 13.865 12.788 11.688 10.654 9.689 8.776 7.975 7.246 6.589 5.928 5.356 4.836 4.336 3.879 3.463 3.088 2.692 2.323 1.998 1.676 1.353 1.082 0.798 0.5 0.25 -0.002 -0.245 -0.504 -0.77 -0.962 -1.167 -1.477 -1.686 -1.898 -2.012 -2.269 -2.536 -2.822 -2.973 -3.256 -3.416 -3.594 -3.772 -4.152 -4.401 -4.696 -4.971 -5.217 -5.513 -5.982 -7.779 -9 ,16471 ,TETRA ,17557062,Fri Nov 26 09:05:46 CET,Fri Nov 26 11:28:50 CET,0.0 1.349 1.864 2.278 2.629 2.911 3.166 3.399 3.807 4.013 4.2 4.403 4.692 4.85 5.152 5.428 5.697 5.836 6.101 6.339 6.672 6.886 7.091 7.381 7.646 7.894 8.129 8.343 8.616 8.882 9.138 9.456 9.75 10.013 10.313 10.656 10.99 11.348 11.707 12.085 12.45 12.862 13.344 13.807 14.333 14.831 15.325 15.776 16.111 16.284 15.941 14.952 13.883 12.858 11.904 11.028 10.255 9.53 8.895 8.242 7.672 7.163 6.671 6.219 5.806 5.414 5.013 4.667 4.328 3.94 3.533 3.196 2.852 2.484 2.195 1.902 1.562 1.181 0.795 0.528 0.25 -0.157 -0.421 -0.728 -0.899 -1.239 -1.59 -1.986 -2.197 -2.558 -2.944 -3.197 -3.428 -3.946 -4.248 -4.561 -4.907 -5.316 -5.757 -6.397 -8.231 -10 ,1984 ,TETRA ,17557063,Fri Nov 26 09:05:46 CET,Fri Nov 26 11:26:47 CET,0.0 1.565 2.157 2.689 3.112 3.471 3.798 4.074 4.601 4.827 5.045 5.378 5.721 5.934 6.34 6.69 7.019 7.175 7.46 7.742 8.14 8.402 8.662 9.056 9.454 9.796 10.103 10.401 10.775 11.134 11.469 11.866 12.238 12.598 13.026 13.488 13.911 14.364 14.842 15.337 15.855 16.428 17.079 17.695 18.376 19.03 19.548 20.001 20.271 20.202 19.604 18.407 17.25 16.195 15.182 14.123 13.138 12.22 11.405 10.613 9.926 9.293 8.711 8.181 7.668 7.172 6.655 6.188 5.779 5.371 4.947 4.596 4.246 3.904 3.643 3.359 3.052 2.71 2.343 2.094 1.829 1.392 1.072 0.723 0.543 0.192 -0.16 -0.544 -0.742 -1.082 -1.404 -1.661 -1.931 -2.455 -2.729 -3.018 -3.312 -3.69 -4.2 -4.829 -6.045 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index 1adce102..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4595 ,TETRA ,17557064,Fri Nov 26 09:06:45 CET,Fri Nov 26 11:28:10 CET,0.0 3.122 3.731 4.185 4.593 4.987 5.319 5.619 6.17 6.419 6.643 6.883 7.165 7.328 7.637 7.914 8.193 8.331 8.59 8.821 9.145 9.351 9.547 9.831 10.118 10.405 10.683 10.944 11.262 11.555 11.843 12.2 12.541 12.862 13.226 13.634 14.034 14.473 14.931 15.423 15.934 16.504 17.151 17.8 18.528 19.265 20.085 20.989 21.998 23.048 24.047 24.492 24.458 24.257 23.98 23.635 23.238 22.849 22.49 22.097 21.776 21.495 21.199 20.904 20.633 20.362 20.054 19.776 19.529 19.286 19.032 18.809 18.576 18.299 18.07 17.846 17.616 17.397 17.124 16.888 16.646 16.295 16.073 15.834 15.706 15.439 15.146 14.813 14.628 14.316 14.037 13.846 13.67 13.273 13.051 12.818 12.542 12.191 11.752 10.989 0.546 -5 ,16560 ,TETRA ,17557068,Fri Nov 26 09:06:44 CET,Fri Nov 26 11:28:05 CET,0.0 2.875 3.423 3.902 4.319 4.615 4.866 5.135 5.626 5.848 6.056 6.29 6.592 6.764 7.086 7.391 7.665 7.789 8.039 8.283 8.636 8.884 9.13 9.463 9.759 10.022 10.296 10.596 10.97 11.311 11.648 12.031 12.379 12.724 13.12 13.552 13.974 14.449 14.939 15.421 15.94 16.52 17.147 17.745 18.438 19.219 20.073 20.983 22.032 23.172 24.365 25.036 25.08 24.893 24.613 24.279 23.945 23.592 23.237 22.868 22.541 22.214 21.861 21.521 21.212 20.917 20.607 20.347 20.119 19.857 19.546 19.237 18.916 18.614 18.388 18.154 17.898 17.629 17.34 17.134 16.916 16.595 16.378 16.147 16.032 15.781 15.501 15.213 15.067 14.786 14.545 14.355 14.172 13.785 13.541 13.252 12.915 12.495 11.942 11.148 9.147 -8 ,30164 ,TETRA ,17557071,Fri Nov 26 09:06:45 CET,Fri Nov 26 11:13:40 CET,0.0 4.404 5.028 5.5 5.884 6.197 6.499 6.785 7.323 7.554 7.769 8.027 8.318 8.472 8.779 9.091 9.378 9.519 9.777 10.011 10.384 10.636 10.87 11.203 11.497 11.789 12.102 12.401 12.766 13.132 13.493 13.892 14.271 14.651 15.052 15.453 15.83 16.257 16.745 17.27 17.802 18.405 19.114 19.782 20.454 21.121 21.82 22.493 23.221 23.929 24.323 23.972 23.289 22.523 21.686 20.83 20.071 19.416 18.842 18.223 17.656 17.143 16.648 16.172 15.724 15.313 14.896 14.528 14.215 13.881 13.509 13.19 12.863 12.518 12.239 11.935 11.608 11.243 10.884 10.66 10.423 10.015 9.727 9.426 9.271 8.964 8.623 8.271 8.085 7.768 7.473 7.232 6.968 6.438 6.127 5.776 5.354 4.858 4.244 3.346 -8.122 -10 ,13657 ,TETRA ,17557073,Fri Nov 26 09:07:45 CET,Fri Nov 26 11:31:04 CET,0.0 2.059 2.581 2.965 3.269 3.563 3.843 4.115 4.641 4.852 5.034 5.243 5.523 5.68 6.011 6.322 6.573 6.681 6.893 7.125 7.459 7.665 7.853 8.137 8.443 8.736 9.029 9.321 9.711 10.07 10.372 10.728 11.075 11.407 11.793 12.256 12.701 13.108 13.522 13.986 14.489 15.042 15.651 16.235 16.912 17.68 18.559 19.526 20.574 21.624 22.606 23.115 23.158 23.057 22.893 22.636 22.318 21.97 21.611 21.21 20.852 20.53 20.241 19.963 19.651 19.356 19.063 18.785 18.519 18.242 17.958 17.724 17.482 17.221 17.012 16.781 16.519 16.235 15.94 15.733 15.529 15.229 15.032 14.812 14.683 14.426 14.15 13.843 13.681 13.379 13.145 12.975 12.792 12.376 12.169 11.933 11.625 11.238 10.823 10.352 7.247 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt deleted file mode 100644 index 9b2480a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9703 ,TETRA ,17557074,Fri Nov 26 09:08:43 CET,Fri Nov 26 11:16:43 CET,0.0 0.504 0.712 0.903 1.1 1.281 1.43 1.58 1.888 2.021 2.142 2.253 2.496 2.61 2.819 3.0 3.171 3.253 3.419 3.591 3.833 3.986 4.121 4.306 4.51 4.719 4.921 5.109 5.342 5.56 5.768 6.027 6.276 6.511 6.799 7.115 7.396 7.71 8.049 8.403 8.769 9.181 9.661 10.134 10.647 11.186 11.807 12.473 13.178 13.92 14.574 14.831 14.761 14.535 14.245 13.899 13.535 13.178 12.855 12.491 12.149 11.842 11.542 11.237 10.947 10.694 10.448 10.212 9.996 9.778 9.512 9.29 9.062 8.82 8.641 8.459 8.281 8.073 7.836 7.673 7.505 7.242 7.066 6.889 6.79 6.583 6.381 6.147 6.016 5.751 5.541 5.373 5.206 4.795 4.565 4.335 4.077 3.802 3.443 2.922 1.583 -2 ,28110 ,TETRA ,17557075,Fri Nov 26 09:07:45 CET,Fri Nov 26 11:17:07 CET,0.0 0.506 0.792 1.018 1.213 1.378 1.526 1.683 1.956 2.074 2.188 2.295 2.533 2.638 2.838 3.035 3.228 3.317 3.492 3.664 3.91 4.065 4.211 4.418 4.622 4.816 4.995 5.164 5.383 5.605 5.828 6.09 6.336 6.577 6.862 7.178 7.471 7.801 8.166 8.532 8.898 9.31 9.8 10.264 10.806 11.425 12.084 12.761 13.478 14.226 14.905 15.094 14.875 14.609 14.351 14.045 13.7 13.345 13.03 12.707 12.405 12.103 11.807 11.529 11.265 11.013 10.765 10.545 10.322 10.095 9.863 9.653 9.43 9.189 8.999 8.817 8.635 8.443 8.243 8.092 7.927 7.668 7.49 7.327 7.239 7.019 6.791 6.555 6.418 6.161 6.027 5.894 5.742 5.337 5.105 4.868 4.597 4.294 3.948 3.49 2.192 -3 ,29193 ,TETRA ,17557076,Fri Nov 26 09:07:45 CET,Fri Nov 26 11:16:11 CET,0.0 0.469 0.747 1.012 1.252 1.443 1.6 1.748 2.055 2.205 2.344 2.476 2.724 2.832 3.036 3.233 3.432 3.526 3.695 3.862 4.105 4.254 4.397 4.61 4.814 5.009 5.202 5.378 5.596 5.82 6.033 6.277 6.518 6.758 7.034 7.338 7.64 7.983 8.34 8.717 9.102 9.526 9.994 10.434 10.97 11.542 12.158 12.819 13.547 14.307 14.997 15.269 15.138 14.817 14.49 14.122 13.732 13.349 13.024 12.697 12.366 12.06 11.753 11.446 11.162 10.894 10.611 10.358 10.158 9.956 9.701 9.465 9.243 9.01 8.814 8.622 8.43 8.239 8.031 7.879 7.719 7.463 7.274 7.086 6.99 6.778 6.574 6.344 6.212 5.953 5.768 5.615 5.449 5.077 4.87 4.653 4.423 4.142 3.792 3.318 1.795 -4 ,24698 ,TETRA ,17557077,Fri Nov 26 09:07:45 CET,Fri Nov 26 11:16:01 CET,0.0 0.446 0.729 0.939 1.148 1.327 1.488 1.633 1.911 2.05 2.182 2.306 2.545 2.651 2.859 3.06 3.247 3.336 3.503 3.662 3.887 4.03 4.174 4.387 4.59 4.772 4.956 5.143 5.37 5.588 5.805 6.058 6.29 6.531 6.823 7.141 7.435 7.741 8.081 8.435 8.774 9.151 9.607 10.065 10.577 11.136 11.792 12.498 13.23 13.987 14.66 14.877 14.722 14.396 14.069 13.749 13.421 13.065 12.739 12.428 12.123 11.827 11.538 11.257 10.975 10.708 10.437 10.202 10.0 9.792 9.565 9.37 9.168 8.958 8.777 8.575 8.369 8.144 7.91 7.75 7.569 7.299 7.127 6.933 6.831 6.62 6.392 6.148 6.014 5.754 5.563 5.401 5.225 4.841 4.649 4.437 4.205 3.923 3.589 3.158 1.724 -5 ,20826 ,TETRA ,17557078,Fri Nov 26 09:07:46 CET,Fri Nov 26 11:15:32 CET,0.0 0.446 0.783 1.034 1.223 1.38 1.537 1.694 1.984 2.111 2.227 2.331 2.566 2.672 2.875 3.067 3.255 3.345 3.511 3.684 3.934 4.079 4.222 4.44 4.649 4.852 5.054 5.242 5.489 5.731 5.947 6.21 6.469 6.707 6.968 7.271 7.571 7.888 8.21 8.562 8.945 9.359 9.829 10.29 10.81 11.382 12.037 12.716 13.374 14.078 14.789 14.964 14.801 14.563 14.272 13.886 13.483 13.149 12.856 12.547 12.262 11.979 11.665 11.364 11.078 10.816 10.546 10.282 10.028 9.786 9.554 9.348 9.127 8.88 8.681 8.486 8.268 8.034 7.802 7.629 7.444 7.184 6.997 6.777 6.66 6.431 6.209 5.981 5.849 5.585 5.411 5.26 5.106 4.749 4.544 4.329 4.084 3.78 3.412 2.938 1.913 -6 ,25420 ,TETRA ,17557079,Fri Nov 26 09:07:45 CET,Fri Nov 26 11:15:45 CET,0.0 0.331 0.614 0.877 1.094 1.274 1.445 1.612 1.921 2.053 2.171 2.275 2.517 2.627 2.83 3.025 3.208 3.296 3.471 3.631 3.855 3.997 4.134 4.338 4.532 4.713 4.885 5.056 5.279 5.489 5.701 5.956 6.214 6.467 6.749 7.08 7.395 7.719 8.064 8.439 8.845 9.3 9.798 10.272 10.807 11.378 11.976 12.61 13.345 14.083 14.684 14.831 14.64 14.372 14.078 13.724 13.387 13.041 12.684 12.33 12.013 11.707 11.392 11.083 10.802 10.551 10.295 10.034 9.803 9.582 9.348 9.134 8.907 8.655 8.463 8.284 8.096 7.897 7.669 7.504 7.334 7.077 6.917 6.751 6.653 6.449 6.231 5.978 5.84 5.583 5.416 5.268 5.116 4.748 4.551 4.329 4.069 3.781 3.427 2.954 1.672 -7 ,15477 ,TETRA ,17557080,Fri Nov 26 09:07:45 CET,Fri Nov 26 11:18:20 CET,0.0 0.601 0.938 1.181 1.375 1.55 1.725 1.896 2.209 2.344 2.468 2.565 2.798 2.902 3.094 3.275 3.445 3.529 3.693 3.854 4.092 4.253 4.406 4.614 4.821 5.01 5.187 5.36 5.586 5.813 6.032 6.288 6.541 6.786 7.046 7.331 7.608 7.93 8.292 8.666 9.04 9.446 9.931 10.425 10.991 11.593 12.242 12.949 13.677 14.385 14.976 15.128 15.06 14.865 14.603 14.282 13.932 13.561 13.221 12.877 12.585 12.322 12.041 11.754 11.474 11.223 10.942 10.677 10.459 10.238 9.992 9.776 9.562 9.342 9.167 8.979 8.771 8.546 8.328 8.184 8.016 7.735 7.54 7.33 7.229 7.02 6.774 6.51 6.379 6.13 5.954 5.798 5.625 5.2 4.97 4.737 4.501 4.241 3.875 3.334 1.665 -8 ,26925 ,TETRA ,17557081,Fri Nov 26 09:07:45 CET,Fri Nov 26 11:05:27 CET,0.0 0.614 0.902 1.124 1.327 1.521 1.696 1.849 2.132 2.265 2.385 2.474 2.707 2.817 3.026 3.201 3.358 3.439 3.606 3.763 3.988 4.144 4.294 4.497 4.688 4.876 5.077 5.271 5.505 5.731 5.945 6.198 6.442 6.674 6.943 7.25 7.535 7.844 8.189 8.554 8.928 9.345 9.811 10.252 10.752 11.279 11.865 12.523 13.185 13.889 14.523 14.708 14.587 14.291 13.963 13.623 13.258 12.875 12.543 12.22 11.931 11.642 11.362 11.086 10.812 10.576 10.315 10.05 9.82 9.585 9.344 9.142 8.931 8.726 8.559 8.359 8.141 7.92 7.679 7.518 7.354 7.083 6.885 6.675 6.582 6.403 6.205 5.972 5.841 5.581 5.4 5.242 5.075 4.659 4.421 4.196 3.937 3.626 3.263 2.749 1.39 -9 ,23770 ,TETRA ,17557082,Fri Nov 26 09:08:43 CET,Fri Nov 26 11:16:50 CET,0.0 0.396 0.636 0.869 1.087 1.264 1.436 1.591 1.862 1.987 2.108 2.217 2.454 2.57 2.775 2.945 3.118 3.21 3.394 3.563 3.791 3.94 4.084 4.296 4.507 4.709 4.895 5.075 5.319 5.544 5.747 5.994 6.227 6.455 6.717 7.007 7.294 7.6 7.925 8.269 8.623 9.033 9.507 9.966 10.49 11.056 11.701 12.404 13.127 13.806 14.37 14.572 14.497 14.25 13.94 13.634 13.305 12.94 12.607 12.286 12.003 11.702 11.402 11.099 10.813 10.582 10.345 10.121 9.906 9.69 9.467 9.269 9.056 8.839 8.672 8.49 8.309 8.106 7.876 7.724 7.57 7.329 7.154 6.962 6.865 6.668 6.45 6.215 6.099 5.859 5.696 5.549 5.401 5.052 4.842 4.605 4.367 4.101 3.751 3.296 2.147 -10 ,9673 ,TETRA ,17557083,Fri Nov 26 09:08:43 CET,Fri Nov 26 11:17:57 CET,0.0 0.43 0.678 0.893 1.084 1.267 1.433 1.586 1.856 1.968 2.071 2.158 2.39 2.493 2.68 2.854 3.025 3.111 3.285 3.455 3.702 3.851 3.989 4.19 4.385 4.578 4.761 4.937 5.164 5.379 5.585 5.84 6.101 6.345 6.617 6.926 7.223 7.539 7.882 8.239 8.59 9.017 9.571 10.086 10.614 11.211 11.873 12.561 13.276 13.981 14.596 14.722 14.539 14.232 13.882 13.497 13.142 12.812 12.5 12.163 11.856 11.57 11.292 11.019 10.756 10.506 10.235 9.975 9.751 9.525 9.292 9.105 8.908 8.689 8.507 8.307 8.098 7.886 7.664 7.499 7.323 7.063 6.886 6.711 6.603 6.379 6.174 5.93 5.804 5.563 5.395 5.231 5.061 4.718 4.533 4.313 4.01 3.668 3.308 2.779 1.526 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt deleted file mode 100644 index 3ca8a51e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2576 ,TETRA ,17557084,Fri Nov 26 09:08:44 CET,Fri Nov 26 11:15:33 CET,0.0 0.468 0.637 0.767 0.87 0.945 1.028 1.115 1.266 1.337 1.41 1.488 1.611 1.675 1.785 1.88 1.975 2.02 2.098 2.176 2.29 2.359 2.428 2.523 2.604 2.689 2.77 2.84 2.937 3.029 3.13 3.247 3.334 3.426 3.537 3.655 3.763 3.88 4.014 4.143 4.254 4.38 4.496 4.599 4.71 4.776 4.81 4.818 4.721 4.412 3.719 2.782 1.965 1.164 0.439 -0.186 -0.738 -1.256 -1.714 -2.174 -2.547 -2.882 -3.202 -3.495 -3.788 -4.057 -4.312 -4.538 -4.741 -4.958 -5.196 -5.39 -5.579 -5.765 -5.912 -6.069 -6.244 -6.422 -6.585 -6.703 -6.84 -7.045 -7.193 -7.349 -7.426 -7.585 -7.751 -7.915 -8.003 -8.166 -8.295 -8.403 -8.52 -8.768 -8.902 -9.038 -9.193 -9.391 -9.663 -9.978 -11.052 -2 ,21664 ,TETRA ,17557085,Fri Nov 26 09:08:44 CET,Fri Nov 26 11:03:31 CET,0.0 0.466 0.657 0.825 0.971 1.09 1.211 1.32 1.511 1.597 1.669 1.778 1.911 1.967 2.064 2.153 2.247 2.299 2.404 2.498 2.624 2.693 2.757 2.857 2.96 3.061 3.157 3.241 3.336 3.424 3.509 3.625 3.739 3.845 3.983 4.15 4.3 4.461 4.628 4.78 4.92 5.062 5.196 5.295 5.395 5.492 5.552 5.572 5.48 5.182 4.589 3.732 2.915 2.144 1.448 0.809 0.26 -0.2 -0.615 -1.02 -1.367 -1.693 -2.0 -2.305 -2.58 -2.832 -3.115 -3.353 -3.56 -3.776 -3.991 -4.17 -4.354 -4.545 -4.694 -4.858 -5.022 -5.179 -5.344 -5.458 -5.576 -5.751 -5.87 -5.989 -6.047 -6.174 -6.321 -6.486 -6.57 -6.728 -6.878 -6.996 -7.123 -7.429 -7.583 -7.737 -7.898 -8.074 -8.266 -8.522 -9.464 -3 ,12478 ,TETRA ,17557086,Fri Nov 26 09:08:43 CET,Fri Nov 26 11:15:34 CET,0.0 0.48 0.688 0.886 1.035 1.139 1.229 1.329 1.5 1.585 1.665 1.736 1.861 1.931 2.05 2.148 2.239 2.293 2.406 2.497 2.618 2.695 2.764 2.864 2.966 3.071 3.17 3.269 3.399 3.501 3.59 3.702 3.817 3.951 4.103 4.257 4.391 4.513 4.635 4.748 4.86 4.978 5.103 5.232 5.381 5.47 5.506 5.499 5.388 5.06 4.332 3.297 2.315 1.471 0.76 0.12 -0.427 -0.946 -1.417 -1.868 -2.26 -2.602 -2.921 -3.234 -3.517 -3.772 -4.049 -4.292 -4.501 -4.717 -4.948 -5.152 -5.354 -5.548 -5.697 -5.871 -6.058 -6.24 -6.433 -6.564 -6.695 -6.89 -7.024 -7.173 -7.25 -7.416 -7.58 -7.752 -7.853 -8.025 -8.155 -8.248 -8.35 -8.58 -8.704 -8.854 -9.061 -9.273 -9.46 -9.756 -10.43 -4 ,10988 ,TETRA ,17557087,Fri Nov 26 09:08:43 CET,Fri Nov 26 11:15:41 CET,0.0 0.556 0.72 0.825 0.926 1.022 1.109 1.194 1.358 1.435 1.502 1.558 1.667 1.726 1.833 1.928 2.015 2.058 2.147 2.223 2.317 2.382 2.451 2.549 2.646 2.753 2.855 2.951 3.065 3.164 3.263 3.381 3.481 3.571 3.662 3.76 3.852 3.954 4.07 4.183 4.296 4.414 4.52 4.619 4.733 4.843 4.937 4.95 4.877 4.615 3.816 2.786 2.029 1.288 0.58 -0.086 -0.665 -1.15 -1.573 -1.985 -2.307 -2.606 -2.906 -3.193 -3.476 -3.735 -4.008 -4.241 -4.43 -4.624 -4.817 -4.981 -5.158 -5.353 -5.506 -5.663 -5.838 -6.027 -6.207 -6.327 -6.462 -6.684 -6.831 -6.985 -7.059 -7.217 -7.387 -7.54 -7.62 -7.779 -7.9 -8.004 -8.11 -8.35 -8.505 -8.661 -8.833 -9.03 -9.239 -9.479 -10.398 -5 ,10462 ,TETRA ,17557088,Fri Nov 26 09:08:44 CET,Fri Nov 26 11:15:39 CET,0.0 0.678 0.924 1.101 1.227 1.343 1.455 1.557 1.716 1.786 1.857 1.939 2.057 2.118 2.239 2.364 2.484 2.542 2.643 2.728 2.85 2.92 2.99 3.109 3.213 3.301 3.381 3.457 3.561 3.649 3.738 3.835 3.914 4.01 4.116 4.216 4.317 4.424 4.56 4.696 4.802 4.894 4.985 5.083 5.183 5.276 5.33 5.324 5.239 4.938 4.193 3.149 2.263 1.481 0.783 0.176 -0.373 -0.885 -1.305 -1.714 -2.078 -2.414 -2.74 -3.041 -3.339 -3.622 -3.903 -4.138 -4.331 -4.541 -4.763 -4.937 -5.107 -5.278 -5.42 -5.565 -5.719 -5.894 -6.066 -6.177 -6.291 -6.48 -6.609 -6.737 -6.805 -6.94 -7.08 -7.225 -7.3 -7.452 -7.555 -7.637 -7.733 -7.985 -8.13 -8.265 -8.4 -8.546 -8.717 -8.944 -9.588 -6 ,9224 ,TETRA ,17557089,Fri Nov 26 09:10:46 CET,Fri Nov 26 11:19:15 CET,0.0 0.329 0.541 0.694 0.817 0.954 1.103 1.226 1.416 1.502 1.573 1.64 1.761 1.822 1.944 2.055 2.162 2.219 2.32 2.414 2.538 2.61 2.687 2.805 2.918 3.018 3.101 3.182 3.287 3.392 3.498 3.625 3.754 3.871 3.992 4.124 4.253 4.391 4.515 4.637 4.773 4.918 5.083 5.234 5.373 5.487 5.607 5.649 5.517 5.207 4.53 3.582 2.673 1.848 1.133 0.511 -0.019 -0.527 -0.97 -1.395 -1.776 -2.123 -2.459 -2.766 -3.027 -3.278 -3.557 -3.797 -4.004 -4.206 -4.41 -4.6 -4.805 -5.019 -5.19 -5.363 -5.54 -5.733 -5.925 -6.043 -6.171 -6.37 -6.515 -6.669 -6.75 -6.916 -7.075 -7.259 -7.362 -7.531 -7.705 -7.826 -7.942 -8.196 -8.326 -8.474 -8.655 -8.866 -9.074 -9.364 -10.415 -7 ,908 ,TETRA ,17557090,Fri Nov 26 09:09:43 CET,Fri Nov 26 11:24:37 CET,0.0 0.475 0.669 0.802 0.929 1.06 1.166 1.257 1.442 1.552 1.65 1.742 1.863 1.922 2.049 2.161 2.262 2.313 2.403 2.492 2.622 2.694 2.757 2.848 2.934 3.018 3.102 3.199 3.314 3.403 3.491 3.608 3.724 3.822 3.927 4.049 4.167 4.285 4.411 4.517 4.607 4.726 4.871 4.984 5.057 5.108 5.173 5.232 5.152 4.9 4.337 3.343 2.445 1.724 1.068 0.45 -0.061 -0.511 -0.91 -1.328 -1.699 -2.028 -2.331 -2.611 -2.873 -3.105 -3.358 -3.589 -3.779 -3.993 -4.223 -4.405 -4.593 -4.795 -4.945 -5.088 -5.24 -5.392 -5.544 -5.66 -5.788 -5.983 -6.102 -6.227 -6.296 -6.446 -6.609 -6.773 -6.859 -7.017 -7.167 -7.277 -7.372 -7.572 -7.68 -7.799 -7.924 -8.088 -8.298 -8.556 -9.213 -8 ,30298 ,TETRA ,17557091,Fri Nov 26 09:09:45 CET,Fri Nov 26 11:24:30 CET,0.0 0.314 0.477 0.615 0.738 0.846 0.941 1.028 1.184 1.253 1.322 1.406 1.521 1.574 1.668 1.764 1.858 1.9 1.983 2.062 2.17 2.246 2.319 2.406 2.486 2.571 2.653 2.737 2.848 2.947 3.045 3.175 3.285 3.384 3.501 3.62 3.725 3.827 3.935 4.049 4.163 4.292 4.417 4.518 4.628 4.704 4.752 4.768 4.673 4.375 3.692 2.707 1.837 1.094 0.425 -0.194 -0.742 -1.224 -1.654 -2.115 -2.514 -2.861 -3.168 -3.44 -3.696 -3.941 -4.209 -4.455 -4.667 -4.886 -5.119 -5.312 -5.5 -5.695 -5.867 -6.041 -6.208 -6.387 -6.567 -6.687 -6.808 -6.997 -7.13 -7.269 -7.35 -7.531 -7.708 -7.888 -7.983 -8.144 -8.245 -8.331 -8.431 -8.646 -8.766 -8.899 -9.059 -9.223 -9.413 -9.686 -10.454 -9 ,25507 ,TETRA ,17557092,Fri Nov 26 09:09:43 CET,Fri Nov 26 11:20:28 CET,0.0 0.398 0.595 0.784 0.938 1.067 1.196 1.31 1.495 1.582 1.667 1.769 1.883 1.953 2.089 2.196 2.299 2.35 2.439 2.523 2.653 2.719 2.772 2.85 2.931 3.022 3.102 3.179 3.282 3.375 3.466 3.573 3.68 3.777 3.887 4.017 4.13 4.245 4.348 4.461 4.566 4.644 4.71 4.78 4.884 4.963 5.022 5.043 4.944 4.68 4.015 2.948 1.961 1.128 0.444 -0.165 -0.698 -1.18 -1.588 -2.006 -2.395 -2.744 -3.053 -3.347 -3.634 -3.887 -4.156 -4.39 -4.6 -4.825 -5.077 -5.295 -5.505 -5.701 -5.854 -6.028 -6.2 -6.378 -6.573 -6.709 -6.843 -7.041 -7.176 -7.309 -7.382 -7.541 -7.698 -7.857 -7.941 -8.094 -8.225 -8.338 -8.466 -8.732 -8.874 -9.031 -9.189 -9.374 -9.627 -9.964 -10.79 -10 ,10354 ,TETRA ,17557093,Fri Nov 26 09:09:43 CET,Fri Nov 26 11:16:37 CET,0.0 0.345 0.515 0.665 0.784 0.889 0.975 1.047 1.222 1.309 1.374 1.437 1.557 1.621 1.747 1.872 1.982 2.033 2.122 2.207 2.337 2.411 2.472 2.557 2.641 2.725 2.817 2.91 3.008 3.092 3.18 3.287 3.391 3.493 3.618 3.745 3.838 3.945 4.055 4.167 4.295 4.421 4.537 4.629 4.723 4.798 4.828 4.794 4.668 4.311 3.582 2.49 1.52 0.713 0.054 -0.543 -1.097 -1.578 -1.991 -2.407 -2.781 -3.114 -3.418 -3.719 -3.998 -4.237 -4.493 -4.73 -4.941 -5.156 -5.381 -5.567 -5.757 -5.955 -6.105 -6.262 -6.431 -6.617 -6.804 -6.924 -7.04 -7.221 -7.361 -7.509 -7.581 -7.727 -7.887 -8.079 -8.179 -8.338 -8.456 -8.557 -8.669 -8.918 -9.045 -9.18 -9.353 -9.559 -9.789 -10.094 -10.954 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt deleted file mode 100644 index 21794f43..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21719 ,TETRA ,17557094,Fri Nov 26 09:09:44 CET,Fri Nov 26 11:16:52 CET,0.0 0.451 0.613 0.749 0.899 1.03 1.126 1.243 1.466 1.551 1.625 1.722 1.839 1.901 2.009 2.099 2.209 2.264 2.354 2.433 2.551 2.635 2.71 2.807 2.889 2.968 3.058 3.142 3.241 3.336 3.425 3.522 3.603 3.68 3.76 3.832 3.908 3.998 4.075 4.136 4.195 4.25 4.291 4.334 4.356 4.317 4.239 4.116 3.858 3.223 1.862 0.297 -0.964 -2.098 -3.057 -3.874 -4.587 -5.225 -5.772 -6.292 -6.705 -7.083 -7.472 -7.834 -8.158 -8.426 -8.69 -8.938 -9.151 -9.373 -9.605 -9.807 -10.018 -10.22 -10.371 -10.542 -10.731 -10.918 -11.119 -11.252 -11.385 -11.609 -11.751 -11.906 -11.99 -12.15 -12.331 -12.528 -12.615 -12.763 -12.891 -12.988 -13.08 -13.292 -13.412 -13.529 -13.673 -13.831 -14.006 -14.273 -15.273 -2 ,25594 ,TETRA ,17557095,Fri Nov 26 09:09:44 CET,Fri Nov 26 11:19:41 CET,0.0 0.486 0.669 0.865 1.044 1.16 1.244 1.322 1.486 1.558 1.622 1.709 1.824 1.887 1.996 2.093 2.194 2.242 2.341 2.437 2.554 2.629 2.697 2.794 2.886 2.957 3.024 3.086 3.174 3.262 3.339 3.443 3.53 3.613 3.726 3.831 3.921 4.004 4.075 4.156 4.236 4.296 4.336 4.366 4.357 4.289 4.151 3.925 3.495 2.709 1.342 -0.265 -1.567 -2.648 -3.562 -4.376 -5.092 -5.737 -6.268 -6.796 -7.258 -7.658 -8.029 -8.379 -8.692 -8.972 -9.257 -9.527 -9.777 -10.022 -10.267 -10.474 -10.702 -10.934 -11.108 -11.282 -11.454 -11.647 -11.848 -11.973 -12.094 -12.276 -12.41 -12.559 -12.633 -12.781 -12.94 -13.115 -13.21 -13.366 -13.507 -13.609 -13.721 -14.004 -14.159 -14.315 -14.463 -14.617 -14.835 -15.094 -15.677 -3 ,28207 ,TETRA ,17557096,Fri Nov 26 09:09:45 CET,Fri Nov 26 11:19:43 CET,0.0 0.611 0.796 0.935 1.074 1.192 1.296 1.384 1.532 1.598 1.663 1.748 1.86 1.928 2.049 2.146 2.244 2.294 2.378 2.457 2.58 2.647 2.71 2.817 2.92 3.01 3.078 3.13 3.21 3.291 3.373 3.475 3.571 3.654 3.744 3.841 3.917 3.991 4.058 4.131 4.204 4.263 4.307 4.325 4.306 4.237 4.096 3.854 3.436 2.73 1.478 -0.09 -1.396 -2.478 -3.374 -4.192 -4.889 -5.514 -6.045 -6.569 -7.019 -7.422 -7.817 -8.166 -8.474 -8.756 -9.059 -9.326 -9.545 -9.77 -10.003 -10.2 -10.411 -10.627 -10.796 -10.961 -11.126 -11.302 -11.473 -11.59 -11.718 -11.912 -12.042 -12.174 -12.244 -12.403 -12.561 -12.709 -12.783 -12.912 -13.0 -13.104 -13.215 -13.433 -13.559 -13.682 -13.822 -14.007 -14.195 -14.393 -14.786 -4 ,26482 ,TETRA ,17557097,Fri Nov 26 09:09:44 CET,Fri Nov 26 11:16:47 CET,0.0 0.825 1.09 1.252 1.366 1.477 1.589 1.686 1.84 1.911 1.981 2.068 2.176 2.237 2.34 2.431 2.513 2.552 2.642 2.719 2.817 2.879 2.942 3.044 3.143 3.231 3.31 3.385 3.497 3.603 3.698 3.799 3.885 3.978 4.071 4.158 4.232 4.311 4.395 4.473 4.546 4.578 4.576 4.564 4.529 4.456 4.328 4.072 3.589 2.852 1.517 -0.203 -1.609 -2.779 -3.759 -4.597 -5.33 -5.999 -6.554 -7.087 -7.543 -7.966 -8.371 -8.728 -9.07 -9.387 -9.703 -9.981 -10.226 -10.484 -10.75 -10.972 -11.196 -11.419 -11.593 -11.774 -11.956 -12.13 -12.307 -12.434 -12.572 -12.797 -12.949 -13.103 -13.19 -13.38 -13.567 -13.761 -13.861 -14.03 -14.183 -14.286 -14.39 -14.588 -14.706 -14.865 -15.016 -15.182 -15.392 -15.631 -16.119 -5 ,25094 ,TETRA ,17557098,Fri Nov 26 09:09:43 CET,Fri Nov 26 11:17:00 CET,0.0 0.843 1.051 1.234 1.403 1.548 1.67 1.779 1.983 2.061 2.123 2.201 2.311 2.369 2.476 2.57 2.667 2.717 2.809 2.895 3.013 3.082 3.148 3.243 3.325 3.393 3.465 3.543 3.639 3.728 3.811 3.907 3.991 4.058 4.136 4.22 4.296 4.366 4.429 4.496 4.546 4.6 4.663 4.692 4.689 4.664 4.536 4.276 3.831 3.099 1.909 0.371 -0.955 -2.06 -2.984 -3.81 -4.541 -5.151 -5.672 -6.205 -6.633 -7.023 -7.404 -7.765 -8.112 -8.413 -8.701 -8.954 -9.188 -9.44 -9.682 -9.893 -10.121 -10.338 -10.502 -10.668 -10.847 -11.035 -11.225 -11.351 -11.483 -11.691 -11.823 -11.952 -12.021 -12.18 -12.353 -12.522 -12.614 -12.769 -12.879 -12.976 -13.072 -13.307 -13.449 -13.581 -13.721 -13.896 -14.104 -14.37 -15.091 -6 ,25849 ,TETRA ,17557099,Fri Nov 26 09:10:46 CET,Fri Nov 26 11:21:43 CET,0.0 0.602 0.798 0.991 1.184 1.333 1.465 1.58 1.729 1.808 1.891 1.98 2.095 2.163 2.288 2.4 2.499 2.551 2.652 2.746 2.891 2.979 3.052 3.148 3.251 3.357 3.449 3.531 3.638 3.731 3.809 3.9 3.992 4.078 4.164 4.258 4.352 4.445 4.543 4.642 4.711 4.773 4.828 4.876 4.879 4.789 4.628 4.42 4.104 3.465 2.236 0.704 -0.574 -1.698 -2.677 -3.511 -4.189 -4.767 -5.29 -5.846 -6.306 -6.693 -7.071 -7.439 -7.795 -8.127 -8.468 -8.745 -8.971 -9.207 -9.449 -9.65 -9.858 -10.072 -10.233 -10.397 -10.564 -10.753 -10.953 -11.085 -11.217 -11.417 -11.56 -11.711 -11.793 -11.947 -12.095 -12.262 -12.342 -12.485 -12.614 -12.724 -12.839 -13.088 -13.202 -13.323 -13.501 -13.685 -13.866 -14.094 -14.847 -7 ,14915 ,TETRA ,17557100,Fri Nov 26 09:10:46 CET,Fri Nov 26 11:20:21 CET,0.0 0.853 1.031 1.182 1.329 1.465 1.596 1.71 1.896 1.973 2.045 2.127 2.234 2.286 2.376 2.461 2.555 2.601 2.687 2.763 2.87 2.944 3.02 3.134 3.22 3.289 3.365 3.445 3.546 3.645 3.741 3.834 3.921 4.012 4.106 4.203 4.293 4.379 4.467 4.533 4.585 4.659 4.716 4.753 4.764 4.717 4.597 4.352 3.967 3.308 2.061 0.536 -0.718 -1.778 -2.685 -3.516 -4.231 -4.875 -5.423 -5.949 -6.418 -6.838 -7.229 -7.58 -7.881 -8.159 -8.458 -8.729 -8.966 -9.205 -9.457 -9.658 -9.847 -10.055 -10.223 -10.388 -10.551 -10.73 -10.916 -11.033 -11.158 -11.358 -11.503 -11.655 -11.729 -11.868 -12.008 -12.172 -12.256 -12.401 -12.506 -12.6 -12.714 -12.996 -13.129 -13.248 -13.385 -13.545 -13.769 -14.069 -14.696 -8 ,31856 ,TETRA ,17557101,Fri Nov 26 09:10:46 CET,Fri Nov 26 11:19:00 CET,0.0 0.514 0.688 0.805 0.918 1.031 1.128 1.21 1.361 1.434 1.506 1.606 1.725 1.788 1.892 1.986 2.064 2.104 2.182 2.242 2.33 2.394 2.463 2.556 2.653 2.748 2.819 2.869 2.933 3.017 3.097 3.192 3.272 3.331 3.406 3.494 3.567 3.632 3.687 3.721 3.747 3.771 3.789 3.8 3.798 3.743 3.599 3.334 2.889 2.146 0.764 -0.952 -2.294 -3.39 -4.337 -5.178 -5.88 -6.482 -7.009 -7.562 -8.028 -8.42 -8.786 -9.16 -9.504 -9.793 -10.095 -10.36 -10.587 -10.838 -11.09 -11.296 -11.513 -11.731 -11.901 -12.079 -12.257 -12.446 -12.637 -12.767 -12.899 -13.099 -13.235 -13.374 -13.449 -13.595 -13.756 -13.929 -14.016 -14.173 -14.324 -14.439 -14.546 -14.776 -14.91 -15.06 -15.21 -15.365 -15.569 -15.847 -16.576 -9 ,31079 ,TETRA ,17557102,Fri Nov 26 09:10:46 CET,Fri Nov 26 11:18:01 CET,0.0 0.509 0.692 0.841 0.981 1.094 1.181 1.266 1.434 1.505 1.574 1.653 1.758 1.816 1.921 2.02 2.113 2.16 2.238 2.306 2.411 2.478 2.537 2.611 2.686 2.762 2.83 2.896 2.978 3.055 3.132 3.216 3.282 3.343 3.415 3.504 3.577 3.646 3.724 3.793 3.844 3.886 3.929 3.95 3.95 3.939 3.838 3.588 3.164 2.471 1.221 -0.361 -1.677 -2.774 -3.698 -4.502 -5.214 -5.846 -6.383 -6.906 -7.343 -7.74 -8.117 -8.471 -8.801 -9.087 -9.374 -9.64 -9.871 -10.089 -10.305 -10.497 -10.7 -10.903 -11.06 -11.231 -11.413 -11.597 -11.772 -11.899 -12.038 -12.227 -12.357 -12.496 -12.569 -12.716 -12.869 -13.022 -13.088 -13.228 -13.322 -13.398 -13.484 -13.685 -13.793 -13.916 -14.057 -14.186 -14.378 -14.641 -15.308 -10 ,24912 ,TETRA ,17557103,Fri Nov 26 09:10:48 CET,Fri Nov 26 11:18:59 CET,0.0 0.755 0.898 1.002 1.106 1.216 1.307 1.384 1.533 1.598 1.664 1.741 1.835 1.873 1.942 2.025 2.115 2.154 2.225 2.293 2.382 2.438 2.499 2.592 2.668 2.746 2.819 2.873 2.928 2.984 3.044 3.114 3.185 3.258 3.34 3.41 3.466 3.531 3.61 3.675 3.687 3.686 3.712 3.736 3.717 3.674 3.559 3.318 2.893 2.147 0.78 -0.925 -2.282 -3.383 -4.323 -5.157 -5.876 -6.51 -7.049 -7.579 -8.041 -8.455 -8.835 -9.181 -9.495 -9.776 -10.073 -10.334 -10.568 -10.808 -11.039 -11.224 -11.416 -11.618 -11.781 -11.95 -12.114 -12.301 -12.505 -12.636 -12.762 -12.961 -13.099 -13.239 -13.309 -13.454 -13.613 -13.768 -13.852 -14.015 -14.153 -14.239 -14.325 -14.536 -14.637 -14.737 -14.866 -15.014 -15.201 -15.436 -16.219 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt deleted file mode 100644 index 80823e43..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8596 ,TETRA ,17557104,Fri Nov 26 09:10:49 CET,Fri Nov 26 11:18:02 CET,0.0 0.381 0.602 0.75 0.868 0.971 1.069 1.169 1.352 1.439 1.518 1.588 1.724 1.789 1.926 2.049 2.153 2.207 2.318 2.424 2.581 2.684 2.781 2.93 3.081 3.224 3.364 3.492 3.647 3.794 3.942 4.131 4.294 4.445 4.623 4.824 5.023 5.247 5.497 5.767 6.042 6.335 6.665 6.973 7.309 7.699 8.161 8.614 9.082 9.626 10.085 10.112 9.942 9.722 9.516 9.3 9.05 8.809 8.571 8.297 8.075 7.886 7.691 7.5 7.328 7.165 6.982 6.825 6.693 6.561 6.416 6.288 6.158 6.002 5.881 5.774 5.663 5.548 5.429 5.341 5.25 5.113 5.018 4.924 4.879 4.779 4.66 4.537 4.476 4.344 4.256 4.177 4.096 3.914 3.812 3.696 3.574 3.439 3.262 3.05 2.74 -2 ,14724 ,TETRA ,17557105,Fri Nov 26 09:10:46 CET,Fri Nov 26 11:24:37 CET,0.0 0.257 0.404 0.52 0.627 0.747 0.862 0.953 1.103 1.187 1.271 1.353 1.485 1.542 1.679 1.813 1.93 1.988 2.1 2.209 2.36 2.454 2.542 2.672 2.797 2.917 3.035 3.142 3.285 3.442 3.584 3.752 3.909 4.048 4.215 4.405 4.605 4.828 5.062 5.319 5.574 5.857 6.204 6.535 6.871 7.211 7.577 7.984 8.501 9.078 9.564 9.729 9.636 9.426 9.193 8.957 8.723 8.488 8.252 7.99 7.777 7.582 7.389 7.216 7.075 6.947 6.792 6.648 6.53 6.397 6.255 6.143 6.023 5.892 5.783 5.67 5.554 5.439 5.317 5.221 5.132 4.991 4.891 4.791 4.736 4.635 4.539 4.427 4.357 4.224 4.144 4.07 3.986 3.795 3.701 3.583 3.465 3.348 3.203 3.032 2.522 -3 ,32518 ,TETRA ,17557106,Fri Nov 26 09:10:46 CET,Fri Nov 26 11:18:50 CET,0.0 0.691 0.883 1.024 1.182 1.304 1.408 1.503 1.664 1.745 1.822 1.922 2.081 2.157 2.269 2.37 2.474 2.528 2.629 2.722 2.873 2.972 3.06 3.19 3.323 3.455 3.579 3.699 3.867 4.022 4.158 4.336 4.507 4.674 4.872 5.082 5.281 5.495 5.711 5.949 6.225 6.52 6.846 7.141 7.473 7.866 8.297 8.749 9.25 9.752 10.181 10.374 10.3 10.116 9.901 9.652 9.418 9.179 8.956 8.725 8.5 8.299 8.126 7.97 7.826 7.694 7.536 7.382 7.255 7.128 7.003 6.892 6.765 6.632 6.533 6.438 6.335 6.215 6.094 6.012 5.915 5.752 5.657 5.564 5.515 5.41 5.298 5.169 5.105 4.971 4.899 4.827 4.735 4.533 4.436 4.355 4.27 4.152 4.028 3.89 3.66 -4 ,17178 ,TETRA ,17557107,Fri Nov 26 09:10:46 CET,Fri Nov 26 11:12:24 CET,0.0 0.683 0.885 1.051 1.204 1.331 1.444 1.549 1.721 1.796 1.879 1.968 2.103 2.17 2.295 2.416 2.524 2.572 2.682 2.8 2.964 3.073 3.169 3.301 3.43 3.554 3.684 3.808 3.956 4.101 4.238 4.395 4.56 4.717 4.88 5.076 5.276 5.485 5.712 5.982 6.256 6.538 6.874 7.211 7.582 7.978 8.391 8.818 9.302 9.781 10.14 10.251 10.208 10.052 9.846 9.601 9.358 9.13 8.901 8.663 8.466 8.269 8.072 7.907 7.758 7.609 7.44 7.294 7.173 7.049 6.919 6.79 6.642 6.48 6.361 6.256 6.157 6.049 5.939 5.87 5.782 5.636 5.541 5.442 5.389 5.268 5.146 5.027 4.968 4.844 4.782 4.718 4.639 4.447 4.346 4.242 4.139 4.013 3.87 3.716 3.143 -5 ,7025 ,TETRA ,17557108,Fri Nov 26 09:10:46 CET,Fri Nov 26 11:17:48 CET,0.0 0.37 0.582 0.745 0.866 0.993 1.12 1.22 1.392 1.466 1.544 1.63 1.771 1.837 1.949 2.075 2.199 2.254 2.361 2.468 2.63 2.736 2.831 2.966 3.103 3.233 3.361 3.491 3.649 3.79 3.937 4.127 4.308 4.472 4.652 4.855 5.045 5.269 5.49 5.705 5.955 6.227 6.54 6.864 7.215 7.609 8.093 8.615 9.161 9.711 10.174 10.291 10.148 9.907 9.672 9.434 9.195 8.967 8.743 8.519 8.337 8.149 7.971 7.813 7.651 7.508 7.368 7.232 7.103 6.969 6.825 6.695 6.565 6.447 6.35 6.237 6.127 6.018 5.904 5.824 5.731 5.585 5.491 5.387 5.326 5.211 5.105 4.998 4.934 4.796 4.714 4.636 4.539 4.325 4.232 4.145 4.045 3.898 3.715 3.484 3.103 -6 ,6799 ,TETRA ,17557109,Fri Nov 26 09:11:44 CET,Fri Nov 26 11:20:15 CET,0.0 0.424 0.569 0.709 0.852 0.967 1.068 1.159 1.347 1.435 1.523 1.636 1.784 1.854 1.992 2.121 2.24 2.296 2.41 2.518 2.687 2.795 2.89 3.021 3.141 3.257 3.379 3.504 3.662 3.802 3.932 4.093 4.244 4.392 4.578 4.798 4.993 5.196 5.419 5.671 5.946 6.223 6.52 6.813 7.167 7.567 7.996 8.442 8.945 9.421 9.771 9.845 9.719 9.529 9.286 9.017 8.757 8.476 8.233 7.984 7.755 7.536 7.338 7.145 6.946 6.779 6.609 6.458 6.325 6.17 6.011 5.884 5.745 5.597 5.486 5.373 5.257 5.134 5.016 4.933 4.836 4.693 4.593 4.496 4.447 4.326 4.201 4.085 4.019 3.879 3.802 3.727 3.65 3.451 3.338 3.249 3.144 3.002 2.84 2.657 2.105 -7 ,23250 ,TETRA ,17557110,Fri Nov 26 09:11:44 CET,Fri Nov 26 11:18:58 CET,0.0 0.399 0.599 0.775 0.911 1.047 1.172 1.281 1.482 1.575 1.659 1.731 1.858 1.917 2.036 2.16 2.282 2.343 2.457 2.565 2.71 2.804 2.899 3.018 3.132 3.252 3.373 3.495 3.648 3.786 3.926 4.089 4.245 4.41 4.589 4.789 4.979 5.17 5.38 5.606 5.836 6.102 6.404 6.688 7.03 7.421 7.863 8.3 8.755 9.259 9.749 9.851 9.73 9.575 9.401 9.218 9.012 8.771 8.531 8.287 8.079 7.915 7.754 7.572 7.413 7.286 7.135 6.987 6.855 6.704 6.572 6.471 6.346 6.212 6.1 5.975 5.854 5.721 5.58 5.489 5.403 5.274 5.175 5.066 5.004 4.871 4.749 4.635 4.579 4.45 4.371 4.308 4.244 4.083 4.006 3.924 3.814 3.67 3.516 3.34 2.669 -8 ,24645 ,TETRA ,17557111,Fri Nov 26 09:11:44 CET,Fri Nov 26 11:20:54 CET,0.0 0.377 0.602 0.777 0.922 1.046 1.157 1.244 1.407 1.482 1.552 1.64 1.784 1.859 2.008 2.156 2.288 2.341 2.44 2.548 2.691 2.778 2.879 3.025 3.158 3.285 3.398 3.505 3.654 3.802 3.948 4.123 4.281 4.445 4.638 4.836 5.034 5.249 5.47 5.696 5.925 6.184 6.509 6.839 7.183 7.568 8.028 8.512 9.022 9.525 9.946 10.026 9.853 9.668 9.465 9.214 8.984 8.757 8.549 8.338 8.149 7.972 7.791 7.619 7.47 7.327 7.174 7.037 6.915 6.796 6.668 6.545 6.405 6.255 6.144 6.033 5.917 5.806 5.694 5.612 5.521 5.37 5.27 5.163 5.105 4.985 4.853 4.727 4.666 4.537 4.451 4.369 4.298 4.15 4.047 3.926 3.809 3.669 3.521 3.354 2.837 -9 ,15301 ,TETRA ,17557112,Fri Nov 26 09:11:44 CET,Fri Nov 26 11:19:19 CET,0.0 0.91 1.142 1.292 1.44 1.56 1.674 1.784 1.958 2.042 2.121 2.192 2.328 2.397 2.52 2.643 2.78 2.846 2.974 3.093 3.248 3.352 3.455 3.604 3.739 3.855 3.973 4.086 4.23 4.384 4.527 4.7 4.876 5.039 5.222 5.424 5.607 5.806 6.026 6.252 6.481 6.744 7.048 7.341 7.699 8.108 8.551 9.024 9.509 9.964 10.422 10.655 10.602 10.426 10.182 9.897 9.644 9.409 9.213 9.02 8.811 8.607 8.437 8.277 8.117 7.969 7.811 7.67 7.556 7.447 7.329 7.222 7.108 6.984 6.882 6.77 6.648 6.521 6.402 6.33 6.255 6.112 6.005 5.907 5.86 5.746 5.631 5.535 5.483 5.353 5.271 5.195 5.117 4.946 4.841 4.728 4.614 4.472 4.301 4.076 3.646 -10 ,5979 ,TETRA ,17557113,Fri Nov 26 09:11:44 CET,Fri Nov 26 11:20:14 CET,0.0 0.495 0.629 0.737 0.856 0.965 1.057 1.136 1.288 1.363 1.45 1.549 1.69 1.767 1.894 2.012 2.143 2.21 2.332 2.446 2.611 2.705 2.805 2.945 3.07 3.192 3.321 3.457 3.629 3.79 3.938 4.115 4.283 4.445 4.629 4.843 5.054 5.277 5.518 5.765 6.013 6.285 6.593 6.913 7.317 7.754 8.211 8.681 9.178 9.69 10.151 10.346 10.278 10.068 9.828 9.563 9.307 9.083 8.87 8.636 8.43 8.263 8.102 7.924 7.763 7.617 7.464 7.334 7.211 7.077 6.936 6.819 6.692 6.56 6.455 6.34 6.221 6.094 5.975 5.898 5.811 5.672 5.58 5.483 5.434 5.329 5.219 5.121 5.066 4.941 4.879 4.807 4.737 4.569 4.471 4.38 4.278 4.162 4.018 3.839 3.284 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt deleted file mode 100644 index cfdcbdb2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27809 ,TETRA ,17557114,Fri Nov 26 09:11:44 CET,Fri Nov 26 11:30:14 CET,0.0 0.444 0.609 0.78 0.915 1.032 1.155 1.262 1.446 1.522 1.585 1.653 1.776 1.841 1.956 2.055 2.154 2.209 2.316 2.407 2.524 2.591 2.655 2.748 2.842 2.942 3.033 3.119 3.239 3.361 3.474 3.612 3.736 3.845 3.969 4.093 4.209 4.35 4.499 4.661 4.834 4.997 5.174 5.335 5.499 5.637 5.743 5.856 5.944 5.92 5.63 5.055 4.468 3.845 3.24 2.668 2.083 1.549 1.128 0.73 0.391 0.098 -0.174 -0.453 -0.721 -0.96 -1.249 -1.534 -1.774 -2.016 -2.275 -2.501 -2.739 -2.984 -3.166 -3.349 -3.542 -3.748 -3.969 -4.115 -4.262 -4.486 -4.633 -4.798 -4.895 -5.099 -5.301 -5.498 -5.589 -5.747 -5.865 -5.965 -6.078 -6.342 -6.493 -6.652 -6.841 -7.036 -7.266 -7.545 -7.869 -2 ,822 ,TETRA ,17557115,Fri Nov 26 09:11:44 CET,Fri Nov 26 11:25:41 CET,0.0 0.539 0.792 0.949 1.069 1.18 1.267 1.352 1.52 1.596 1.671 1.767 1.894 1.954 2.054 2.157 2.266 2.319 2.419 2.508 2.635 2.722 2.81 2.932 3.048 3.154 3.247 3.341 3.467 3.582 3.69 3.813 3.926 4.041 4.17 4.323 4.472 4.628 4.811 4.996 5.167 5.36 5.581 5.769 5.969 6.193 6.42 6.636 6.847 6.945 6.866 6.514 6.035 5.544 5.032 4.494 3.931 3.358 2.858 2.376 1.952 1.566 1.206 0.851 0.517 0.216 -0.071 -0.284 -0.457 -0.637 -0.819 -0.978 -1.163 -1.354 -1.499 -1.652 -1.81 -1.978 -2.147 -2.279 -2.433 -2.672 -2.836 -3.009 -3.1 -3.276 -3.457 -3.664 -3.772 -3.954 -4.134 -4.269 -4.403 -4.672 -4.82 -4.979 -5.151 -5.348 -5.566 -5.838 -6.433 -3 ,28495 ,TETRA ,17557116,Fri Nov 26 09:11:44 CET,Fri Nov 26 11:20:22 CET,0.0 0.499 0.65 0.79 0.904 1.023 1.137 1.226 1.384 1.465 1.56 1.663 1.783 1.85 1.971 2.084 2.181 2.229 2.33 2.42 2.538 2.616 2.7 2.826 2.939 3.029 3.118 3.213 3.32 3.43 3.541 3.673 3.791 3.905 4.041 4.187 4.331 4.487 4.649 4.818 4.989 5.184 5.405 5.609 5.84 6.069 6.325 6.567 6.724 6.766 6.607 6.226 5.74 5.209 4.666 4.179 3.752 3.366 3.025 2.651 2.333 2.051 1.769 1.507 1.263 1.053 0.847 0.641 0.462 0.26 -0.007 -0.229 -0.443 -0.676 -0.867 -1.063 -1.246 -1.446 -1.655 -1.801 -1.961 -2.197 -2.357 -2.525 -2.614 -2.804 -3.011 -3.219 -3.328 -3.498 -3.625 -3.722 -3.833 -4.083 -4.229 -4.387 -4.539 -4.698 -4.874 -5.133 -5.645 -4 ,30321 ,TETRA ,17557117,Fri Nov 26 09:11:45 CET,Fri Nov 26 11:21:19 CET,0.0 0.692 0.889 1.041 1.156 1.249 1.352 1.463 1.618 1.685 1.757 1.841 1.968 2.034 2.156 2.268 2.365 2.412 2.508 2.597 2.716 2.793 2.872 2.993 3.11 3.214 3.316 3.42 3.55 3.669 3.782 3.91 4.046 4.183 4.324 4.476 4.612 4.763 4.922 5.075 5.243 5.437 5.648 5.852 6.076 6.312 6.542 6.756 6.964 7.082 6.872 6.286 5.672 5.041 4.446 3.819 3.2 2.64 2.126 1.597 1.175 0.789 0.383 0.008 -0.34 -0.666 -0.985 -1.257 -1.499 -1.752 -2.026 -2.255 -2.495 -2.745 -2.928 -3.12 -3.324 -3.538 -3.746 -3.886 -4.041 -4.295 -4.466 -4.636 -4.719 -4.888 -5.079 -5.276 -5.376 -5.542 -5.703 -5.832 -5.959 -6.237 -6.377 -6.523 -6.684 -6.876 -7.148 -7.461 -8.148 -5 ,17581 ,TETRA ,17557118,Fri Nov 26 09:11:45 CET,Fri Nov 26 11:27:00 CET,0.0 1.003 1.289 1.463 1.572 1.673 1.773 1.873 2.051 2.135 2.223 2.321 2.449 2.523 2.652 2.759 2.865 2.916 3.014 3.113 3.255 3.35 3.436 3.548 3.664 3.781 3.885 3.986 4.113 4.237 4.353 4.484 4.606 4.727 4.877 5.038 5.184 5.33 5.494 5.671 5.837 6.02 6.221 6.418 6.643 6.867 7.098 7.3 7.427 7.447 7.187 6.631 6.102 5.597 5.088 4.609 4.13 3.575 3.105 2.618 2.166 1.786 1.403 1.038 0.708 0.399 0.098 -0.171 -0.42 -0.675 -0.957 -1.198 -1.425 -1.628 -1.771 -1.915 -2.055 -2.215 -2.424 -2.576 -2.721 -2.948 -3.107 -3.271 -3.361 -3.542 -3.724 -3.926 -4.03 -4.195 -4.354 -4.482 -4.62 -4.898 -5.038 -5.199 -5.391 -5.621 -5.853 -6.1 -6.486 -6 ,19041 ,TETRA ,17557119,Fri Nov 26 09:11:47 CET,Fri Nov 26 11:26:57 CET,0.0 0.395 0.569 0.703 0.822 0.93 1.02 1.106 1.255 1.313 1.372 1.46 1.583 1.642 1.76 1.875 1.988 2.036 2.125 2.216 2.352 2.431 2.498 2.601 2.717 2.839 2.95 3.054 3.18 3.286 3.393 3.524 3.65 3.78 3.924 4.062 4.198 4.365 4.536 4.703 4.87 5.055 5.274 5.48 5.72 5.964 6.206 6.407 6.426 6.244 5.721 4.857 4.0 3.234 2.673 2.233 1.794 1.377 1.038 0.694 0.414 0.18 -0.06 -0.308 -0.545 -0.743 -0.96 -1.181 -1.405 -1.657 -1.929 -2.166 -2.416 -2.666 -2.859 -3.065 -3.274 -3.477 -3.666 -3.8 -3.961 -4.217 -4.389 -4.568 -4.662 -4.838 -5.007 -5.2 -5.305 -5.491 -5.678 -5.795 -5.918 -6.194 -6.347 -6.521 -6.701 -6.877 -7.081 -7.39 -8.136 -7 ,17495 ,TETRA ,17557120,Fri Nov 26 09:12:42 CET,Fri Nov 26 11:27:02 CET,0.0 0.652 0.868 1.03 1.162 1.286 1.39 1.465 1.601 1.679 1.756 1.836 1.962 2.027 2.154 2.276 2.398 2.453 2.549 2.643 2.776 2.852 2.937 3.075 3.195 3.307 3.414 3.525 3.66 3.778 3.903 4.045 4.166 4.297 4.447 4.612 4.776 4.971 5.182 5.366 5.542 5.745 5.959 6.139 6.34 6.551 6.746 6.934 7.077 7.071 6.772 6.195 5.533 4.9 4.378 3.872 3.34 2.84 2.396 1.928 1.49 1.077 0.689 0.312 -0.043 -0.373 -0.715 -1.017 -1.289 -1.56 -1.824 -2.052 -2.281 -2.522 -2.712 -2.902 -3.113 -3.341 -3.575 -3.734 -3.901 -4.154 -4.316 -4.476 -4.556 -4.725 -4.9 -5.092 -5.2 -5.379 -5.536 -5.651 -5.771 -6.034 -6.182 -6.327 -6.491 -6.68 -6.892 -7.159 -7.644 -8 ,2437 ,TETRA ,17557121,Fri Nov 26 09:12:44 CET,Fri Nov 26 11:27:03 CET,0.0 0.584 0.755 0.902 1.03 1.161 1.264 1.348 1.548 1.641 1.718 1.803 1.918 1.981 2.101 2.208 2.302 2.353 2.451 2.54 2.664 2.738 2.816 2.945 3.071 3.184 3.294 3.39 3.498 3.607 3.71 3.827 3.946 4.072 4.228 4.394 4.538 4.684 4.834 4.997 5.169 5.35 5.548 5.735 5.94 6.154 6.376 6.575 6.755 6.838 6.637 6.063 5.309 4.505 3.765 3.07 2.449 1.89 1.393 0.903 0.508 0.145 -0.159 -0.412 -0.694 -0.99 -1.305 -1.59 -1.843 -2.114 -2.384 -2.595 -2.82 -3.058 -3.245 -3.435 -3.621 -3.817 -4.034 -4.187 -4.33 -4.547 -4.694 -4.839 -4.921 -5.094 -5.263 -5.449 -5.553 -5.734 -5.88 -5.978 -6.084 -6.347 -6.491 -6.631 -6.792 -6.985 -7.184 -7.412 -7.962 -9 ,9158 ,TETRA ,17557122,Fri Nov 26 09:12:42 CET,Fri Nov 26 11:16:18 CET,0.0 0.452 0.625 0.748 0.85 0.942 1.028 1.101 1.24 1.321 1.402 1.48 1.599 1.661 1.778 1.879 1.977 2.022 2.111 2.207 2.342 2.415 2.482 2.605 2.727 2.828 2.924 3.02 3.151 3.281 3.391 3.53 3.672 3.803 3.953 4.132 4.3 4.462 4.615 4.777 4.941 5.11 5.294 5.466 5.676 5.891 6.086 6.264 6.397 6.405 6.113 5.52 4.926 4.367 3.861 3.319 2.851 2.477 2.122 1.728 1.38 1.061 0.748 0.465 0.211 -0.02 -0.259 -0.485 -0.695 -0.933 -1.162 -1.323 -1.508 -1.708 -1.848 -1.99 -2.134 -2.272 -2.436 -2.566 -2.698 -2.9 -3.04 -3.18 -3.247 -3.402 -3.587 -3.791 -3.896 -4.059 -4.193 -4.309 -4.425 -4.667 -4.816 -4.973 -5.146 -5.342 -5.562 -5.834 -6.476 -10 ,4455 ,TETRA ,17557123,Fri Nov 26 09:12:42 CET,Fri Nov 26 11:25:20 CET,0.0 0.469 0.684 0.834 0.951 1.064 1.162 1.272 1.463 1.539 1.61 1.683 1.807 1.871 1.987 2.1 2.217 2.269 2.362 2.458 2.604 2.7 2.789 2.916 3.026 3.13 3.234 3.327 3.47 3.601 3.715 3.855 3.972 4.092 4.249 4.401 4.531 4.677 4.835 5.004 5.178 5.36 5.569 5.766 5.981 6.214 6.429 6.611 6.779 6.856 6.689 6.081 5.419 4.861 4.388 3.941 3.528 3.135 2.775 2.417 2.094 1.823 1.582 1.336 1.083 0.806 0.5 0.238 0.003 -0.235 -0.488 -0.706 -0.928 -1.151 -1.326 -1.52 -1.722 -1.913 -2.108 -2.257 -2.415 -2.657 -2.823 -2.983 -3.061 -3.221 -3.382 -3.553 -3.647 -3.811 -3.967 -4.085 -4.195 -4.45 -4.589 -4.714 -4.847 -5.023 -5.218 -5.414 -5.93 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt deleted file mode 100644 index a1f45fe7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16735 ,TETRA ,17557124,Fri Nov 26 09:12:42 CET,Fri Nov 26 11:10:24 CET,0.0 0.822 1.1 1.342 1.535 1.693 1.837 1.959 2.124 2.209 2.302 2.409 2.552 2.635 2.77 2.896 3.018 3.08 3.203 3.318 3.47 3.576 3.677 3.824 3.975 4.102 4.213 4.33 4.491 4.635 4.772 4.932 5.079 5.234 5.408 5.595 5.779 5.976 6.185 6.402 6.63 6.876 7.133 7.388 7.691 8.02 8.38 8.72 9.039 9.344 9.449 9.3 9.056 8.74 8.395 8.056 7.742 7.448 7.192 6.925 6.666 6.427 6.2 5.985 5.775 5.567 5.342 5.149 4.978 4.79 4.605 4.446 4.263 4.06 3.913 3.773 3.617 3.446 3.28 3.169 3.054 2.845 2.689 2.545 2.469 2.308 2.151 1.988 1.907 1.761 1.613 1.49 1.353 1.08 0.933 0.779 0.622 0.447 0.234 -0.026 -0.958 -2 ,19359 ,TETRA ,17557125,Fri Nov 26 09:12:42 CET,Fri Nov 26 11:22:32 CET,0.0 0.77 1.078 1.304 1.473 1.616 1.757 1.878 2.103 2.201 2.283 2.373 2.514 2.599 2.745 2.894 3.036 3.104 3.239 3.368 3.551 3.657 3.752 3.895 4.035 4.169 4.295 4.417 4.561 4.698 4.836 4.992 5.137 5.281 5.452 5.637 5.813 5.998 6.174 6.348 6.552 6.787 7.06 7.334 7.643 7.961 8.289 8.652 8.948 9.155 9.276 9.055 8.691 8.333 7.955 7.577 7.235 6.903 6.591 6.267 6.004 5.779 5.548 5.319 5.095 4.882 4.657 4.459 4.303 4.128 3.942 3.786 3.624 3.462 3.313 3.142 2.972 2.822 2.681 2.58 2.481 2.32 2.203 2.071 1.998 1.844 1.667 1.47 1.365 1.208 1.097 1.004 0.895 0.663 0.526 0.351 0.155 -0.112 -0.432 -0.771 -1.677 -3 ,28887 ,TETRA ,17557126,Fri Nov 26 09:12:42 CET,Fri Nov 26 11:24:01 CET,0.0 0.973 1.297 1.507 1.611 1.705 1.804 1.919 2.152 2.246 2.325 2.427 2.551 2.6 2.712 2.837 2.949 3.001 3.098 3.185 3.329 3.43 3.53 3.676 3.804 3.918 4.029 4.139 4.272 4.407 4.543 4.698 4.834 4.967 5.13 5.299 5.451 5.64 5.846 6.051 6.265 6.483 6.718 6.957 7.237 7.544 7.882 8.221 8.567 8.897 9.058 8.831 8.5 8.156 7.763 7.356 6.976 6.631 6.341 6.034 5.748 5.487 5.244 5.016 4.798 4.595 4.379 4.178 4.004 3.83 3.638 3.471 3.302 3.109 2.938 2.77 2.61 2.455 2.292 2.16 2.024 1.847 1.721 1.583 1.52 1.389 1.241 1.065 0.971 0.82 0.651 0.532 0.407 0.152 0.022 -0.142 -0.326 -0.522 -0.783 -1.131 -2.276 -4 ,18023 ,TETRA ,17557127,Fri Nov 26 09:12:42 CET,Fri Nov 26 11:24:00 CET,0.0 0.906 1.169 1.346 1.498 1.638 1.773 1.902 2.104 2.194 2.279 2.395 2.535 2.623 2.781 2.913 3.047 3.106 3.229 3.352 3.502 3.599 3.69 3.822 3.962 4.089 4.209 4.33 4.501 4.657 4.799 4.976 5.13 5.267 5.431 5.617 5.785 5.973 6.159 6.359 6.587 6.814 7.061 7.323 7.64 7.964 8.289 8.65 9.036 9.304 9.376 9.177 8.767 8.347 7.953 7.57 7.227 6.89 6.595 6.287 6.017 5.786 5.553 5.33 5.106 4.893 4.655 4.437 4.247 4.031 3.82 3.654 3.466 3.278 3.139 2.992 2.851 2.698 2.52 2.406 2.303 2.132 1.997 1.845 1.772 1.638 1.495 1.353 1.271 1.115 0.985 0.891 0.773 0.456 0.27 0.079 -0.121 -0.326 -0.537 -0.831 -2.035 -5 ,15103 ,TETRA ,17557128,Fri Nov 26 09:12:44 CET,Fri Nov 26 11:23:00 CET,0.0 1.476 1.753 1.97 2.145 2.272 2.382 2.498 2.729 2.825 2.906 3.005 3.138 3.208 3.367 3.509 3.627 3.691 3.821 3.926 4.08 4.187 4.284 4.427 4.569 4.704 4.828 4.946 5.101 5.264 5.432 5.625 5.789 5.938 6.104 6.294 6.469 6.655 6.849 7.045 7.255 7.487 7.754 8.022 8.314 8.585 8.874 9.193 9.515 9.831 9.967 9.748 9.432 9.114 8.796 8.452 8.106 7.764 7.455 7.142 6.862 6.598 6.323 6.075 5.871 5.684 5.487 5.303 5.135 4.963 4.779 4.629 4.476 4.3 4.174 4.051 3.915 3.77 3.616 3.517 3.403 3.202 3.063 2.929 2.868 2.73 2.584 2.422 2.328 2.174 2.041 1.934 1.821 1.579 1.442 1.281 1.095 0.907 0.679 0.368 -0.602 -6 ,18368 ,TETRA ,17557129,Fri Nov 26 09:12:43 CET,Fri Nov 26 11:21:19 CET,0.0 0.96 1.256 1.464 1.616 1.747 1.862 1.986 2.227 2.324 2.406 2.529 2.67 2.752 2.924 3.078 3.227 3.301 3.438 3.567 3.736 3.84 3.949 4.115 4.262 4.392 4.522 4.651 4.812 4.954 5.082 5.24 5.403 5.56 5.729 5.913 6.095 6.281 6.463 6.658 6.868 7.093 7.341 7.596 7.905 8.211 8.506 8.849 9.233 9.515 9.574 9.371 9.008 8.631 8.291 7.937 7.575 7.241 6.946 6.638 6.382 6.126 5.857 5.608 5.377 5.161 4.943 4.746 4.576 4.403 4.224 4.075 3.914 3.741 3.613 3.458 3.291 3.136 2.968 2.849 2.724 2.53 2.405 2.267 2.194 2.052 1.892 1.721 1.615 1.437 1.281 1.183 1.067 0.776 0.634 0.491 0.314 0.107 -0.093 -0.347 -1.228 -7 ,14880 ,TETRA ,17557130,Fri Nov 26 09:12:43 CET,Fri Nov 26 11:10:39 CET,0.0 1.228 1.459 1.677 1.862 1.999 2.116 2.25 2.509 2.622 2.729 2.877 3.03 3.111 3.242 3.367 3.484 3.537 3.642 3.752 3.929 4.033 4.117 4.246 4.369 4.486 4.603 4.707 4.844 4.984 5.125 5.3 5.466 5.615 5.772 5.945 6.128 6.328 6.527 6.72 6.926 7.165 7.409 7.655 7.951 8.258 8.609 8.978 9.303 9.575 9.721 9.533 9.209 8.868 8.497 8.131 7.811 7.495 7.216 6.912 6.642 6.401 6.157 5.935 5.718 5.503 5.271 5.062 4.892 4.73 4.563 4.405 4.235 4.054 3.918 3.793 3.659 3.516 3.351 3.238 3.128 2.952 2.829 2.699 2.637 2.509 2.363 2.192 2.097 1.948 1.831 1.74 1.642 1.405 1.263 1.112 0.973 0.825 0.583 0.231 -0.843 -8 ,9072 ,TETRA ,17557131,Fri Nov 26 09:12:44 CET,Fri Nov 26 11:22:53 CET,0.0 0.914 1.241 1.475 1.642 1.792 1.927 2.053 2.271 2.36 2.457 2.562 2.692 2.766 2.91 3.044 3.168 3.234 3.354 3.461 3.618 3.721 3.818 3.948 4.077 4.211 4.339 4.454 4.592 4.728 4.864 5.03 5.182 5.321 5.484 5.665 5.834 6.028 6.254 6.483 6.698 6.931 7.207 7.491 7.819 8.148 8.496 8.824 9.102 9.339 9.456 9.248 8.879 8.47 8.085 7.708 7.37 7.021 6.685 6.351 6.042 5.76 5.51 5.286 5.062 4.848 4.638 4.448 4.273 4.086 3.914 3.778 3.615 3.438 3.298 3.16 3.017 2.856 2.675 2.556 2.45 2.267 2.134 2.008 1.943 1.803 1.656 1.486 1.386 1.217 1.03 0.904 0.773 0.478 0.346 0.215 0.039 -0.156 -0.379 -0.676 -1.786 -9 ,30573 ,TETRA ,17557132,Fri Nov 26 09:12:43 CET,Fri Nov 26 11:26:12 CET,0.0 0.586 0.796 0.945 1.081 1.215 1.328 1.426 1.609 1.691 1.772 1.874 2.004 2.067 2.195 2.329 2.446 2.501 2.607 2.711 2.863 2.965 3.07 3.204 3.323 3.449 3.582 3.708 3.865 4.03 4.18 4.337 4.492 4.637 4.796 4.982 5.157 5.357 5.592 5.808 6.002 6.218 6.471 6.722 7.027 7.348 7.663 7.982 8.291 8.573 8.681 8.421 8.055 7.677 7.308 6.946 6.612 6.299 6.002 5.689 5.432 5.192 4.932 4.679 4.469 4.288 4.078 3.892 3.726 3.549 3.382 3.234 3.085 2.929 2.796 2.661 2.524 2.369 2.188 2.07 1.951 1.766 1.642 1.522 1.464 1.33 1.176 1.01 0.921 0.78 0.645 0.53 0.425 0.228 0.114 -0.046 -0.232 -0.412 -0.63 -0.938 -1.504 -10 ,15688 ,TETRA ,17557133,Fri Nov 26 09:12:44 CET,Fri Nov 26 11:26:45 CET,0.0 1.18 1.48 1.679 1.841 1.977 2.106 2.217 2.416 2.502 2.588 2.699 2.834 2.91 3.06 3.211 3.342 3.401 3.511 3.618 3.789 3.891 3.987 4.128 4.268 4.396 4.519 4.638 4.786 4.936 5.08 5.238 5.381 5.515 5.66 5.821 5.977 6.155 6.343 6.531 6.741 6.986 7.256 7.511 7.787 8.091 8.418 8.724 9.03 9.348 9.522 9.294 8.954 8.616 8.295 7.979 7.662 7.326 7.011 6.718 6.472 6.218 5.971 5.742 5.527 5.339 5.141 4.961 4.8 4.624 4.445 4.289 4.133 3.987 3.864 3.729 3.582 3.434 3.284 3.173 3.047 2.868 2.751 2.631 2.576 2.455 2.324 2.16 2.075 1.944 1.817 1.711 1.622 1.425 1.31 1.168 1.008 0.856 0.702 0.423 -0.586 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt deleted file mode 100644 index b6db9cc7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14140 ,TETRA ,17557134,Fri Nov 26 09:13:42 CET,Fri Nov 26 11:26:37 CET,0.0 0.315 0.499 0.665 0.807 0.918 1.02 1.119 1.305 1.397 1.476 1.548 1.667 1.735 1.875 2.008 2.125 2.183 2.299 2.41 2.561 2.662 2.766 2.912 3.06 3.198 3.335 3.463 3.62 3.778 3.926 4.106 4.3 4.483 4.676 4.893 5.109 5.362 5.622 5.895 6.199 6.535 6.907 7.292 7.766 8.275 8.826 9.428 10.113 10.908 11.755 12.269 12.477 12.519 12.449 12.363 12.263 12.12 11.972 11.789 11.612 11.468 11.312 11.162 11.028 10.892 10.74 10.592 10.475 10.353 10.222 10.112 9.982 9.849 9.755 9.658 9.552 9.438 9.313 9.233 9.157 9.033 8.94 8.83 8.772 8.66 8.542 8.433 8.372 8.252 8.164 8.088 8.007 7.854 7.775 7.671 7.556 7.451 7.366 7.297 6.921 -2 ,18130 ,TETRA ,17557135,Fri Nov 26 09:13:43 CET,Fri Nov 26 11:23:37 CET,0.0 0.304 0.491 0.66 0.772 0.87 0.969 1.071 1.253 1.339 1.423 1.513 1.643 1.72 1.867 1.997 2.124 2.186 2.302 2.416 2.578 2.681 2.78 2.92 3.05 3.173 3.293 3.415 3.571 3.716 3.863 4.041 4.208 4.365 4.543 4.756 4.979 5.217 5.472 5.754 6.053 6.381 6.738 7.103 7.54 8.018 8.573 9.17 9.865 10.666 11.522 12.106 12.278 12.251 12.142 12.024 11.904 11.747 11.598 11.456 11.324 11.188 11.047 10.91 10.777 10.632 10.462 10.324 10.21 10.099 9.986 9.887 9.776 9.651 9.55 9.437 9.326 9.203 9.055 8.958 8.863 8.712 8.614 8.514 8.469 8.375 8.265 8.148 8.089 7.988 7.899 7.814 7.741 7.59 7.51 7.425 7.326 7.204 7.076 6.906 6.607 -3 ,16792 ,TETRA ,17557136,Fri Nov 26 09:13:46 CET,Fri Nov 26 11:23:51 CET,0.0 0.369 0.567 0.735 0.867 0.975 1.067 1.158 1.337 1.42 1.5 1.603 1.731 1.799 1.937 2.073 2.188 2.239 2.349 2.453 2.605 2.71 2.808 2.938 3.068 3.199 3.323 3.453 3.622 3.775 3.924 4.105 4.277 4.442 4.642 4.863 5.062 5.28 5.531 5.804 6.097 6.422 6.792 7.156 7.568 8.032 8.569 9.211 9.926 10.658 11.451 12.031 12.271 12.31 12.269 12.162 12.02 11.882 11.754 11.614 11.487 11.368 11.234 11.089 10.951 10.837 10.703 10.571 10.473 10.375 10.26 10.16 10.05 9.922 9.825 9.722 9.61 9.507 9.398 9.312 9.23 9.109 9.024 8.934 8.885 8.783 8.679 8.575 8.52 8.413 8.324 8.239 8.149 7.988 7.914 7.831 7.718 7.566 7.416 7.253 6.655 -4 ,17740 ,TETRA ,17557137,Fri Nov 26 09:13:46 CET,Fri Nov 26 11:25:08 CET,0.0 0.466 0.596 0.71 0.852 1.0 1.09 1.171 1.365 1.455 1.536 1.623 1.75 1.819 1.951 2.094 2.235 2.295 2.415 2.535 2.706 2.817 2.924 3.077 3.228 3.371 3.497 3.622 3.79 3.953 4.103 4.286 4.455 4.61 4.799 5.012 5.231 5.474 5.724 6.0 6.298 6.623 6.986 7.358 7.815 8.314 8.844 9.441 10.147 10.95 11.785 12.319 12.533 12.557 12.469 12.344 12.208 12.046 11.896 11.746 11.605 11.451 11.291 11.142 10.997 10.87 10.754 10.649 10.537 10.41 10.274 10.154 10.025 9.904 9.804 9.686 9.588 9.499 9.394 9.313 9.229 9.099 9.009 8.917 8.867 8.742 8.607 8.479 8.416 8.307 8.225 8.155 8.081 7.909 7.814 7.729 7.634 7.525 7.418 7.237 6.858 -5 ,20877 ,TETRA ,17557138,Fri Nov 26 09:13:45 CET,Fri Nov 26 11:22:31 CET,0.0 0.442 0.629 0.813 0.952 1.072 1.196 1.294 1.472 1.564 1.642 1.725 1.855 1.928 2.07 2.195 2.321 2.387 2.515 2.63 2.79 2.896 3.005 3.174 3.318 3.451 3.59 3.713 3.865 4.016 4.174 4.377 4.561 4.736 4.943 5.168 5.384 5.632 5.903 6.178 6.463 6.791 7.195 7.589 8.014 8.49 9.038 9.661 10.343 11.093 11.975 12.518 12.723 12.811 12.809 12.754 12.664 12.515 12.368 12.217 12.083 11.955 11.817 11.684 11.558 11.436 11.289 11.158 11.045 10.931 10.823 10.722 10.615 10.502 10.405 10.305 10.217 10.109 9.983 9.903 9.821 9.685 9.593 9.496 9.441 9.34 9.231 9.101 9.03 8.915 8.824 8.747 8.665 8.478 8.395 8.312 8.228 8.135 8.006 7.86 7.494 -6 ,29789 ,TETRA ,17557139,Fri Nov 26 09:13:46 CET,Fri Nov 26 11:25:12 CET,0.0 0.594 0.778 0.903 1.005 1.114 1.226 1.324 1.519 1.615 1.694 1.786 1.909 1.974 2.11 2.234 2.36 2.42 2.529 2.641 2.808 2.919 3.029 3.184 3.333 3.474 3.621 3.771 3.943 4.103 4.256 4.433 4.609 4.795 5.013 5.234 5.431 5.653 5.901 6.173 6.462 6.81 7.204 7.582 8.034 8.531 9.084 9.682 10.374 11.124 11.94 12.524 12.761 12.816 12.768 12.688 12.591 12.435 12.277 12.121 11.957 11.797 11.646 11.498 11.349 11.203 11.056 10.929 10.809 10.691 10.578 10.468 10.335 10.198 10.095 9.989 9.89 9.793 9.696 9.623 9.55 9.442 9.356 9.263 9.216 9.119 9.009 8.889 8.826 8.708 8.604 8.524 8.45 8.312 8.23 8.138 8.049 7.956 7.826 7.613 7.154 -7 ,28539 ,TETRA ,17557140,Fri Nov 26 09:13:46 CET,Fri Nov 26 11:23:49 CET,0.0 0.429 0.598 0.738 0.859 0.976 1.077 1.17 1.367 1.467 1.555 1.645 1.777 1.865 2.014 2.14 2.262 2.32 2.435 2.549 2.709 2.813 2.916 3.06 3.21 3.36 3.504 3.636 3.802 3.961 4.11 4.295 4.476 4.647 4.836 5.051 5.267 5.51 5.759 6.027 6.335 6.678 7.057 7.433 7.888 8.39 8.951 9.629 10.384 11.189 12.071 12.633 12.875 12.942 12.925 12.83 12.674 12.501 12.353 12.212 12.069 11.928 11.794 11.646 11.504 11.38 11.237 11.095 10.981 10.852 10.695 10.574 10.455 10.326 10.217 10.112 10.011 9.894 9.764 9.679 9.596 9.453 9.355 9.256 9.206 9.097 8.984 8.882 8.819 8.693 8.586 8.503 8.414 8.234 8.131 8.027 7.93 7.811 7.678 7.466 6.731 -8 ,29853 ,TETRA ,17557141,Fri Nov 26 09:13:46 CET,Fri Nov 26 11:25:26 CET,0.0 0.547 0.716 0.838 0.95 1.042 1.12 1.201 1.369 1.44 1.499 1.565 1.691 1.757 1.89 2.008 2.111 2.169 2.285 2.392 2.545 2.645 2.748 2.895 3.033 3.166 3.287 3.403 3.561 3.712 3.863 4.053 4.23 4.399 4.605 4.845 5.069 5.303 5.569 5.868 6.165 6.477 6.848 7.238 7.707 8.214 8.752 9.357 10.108 10.967 11.86 12.463 12.685 12.728 12.671 12.53 12.374 12.23 12.11 11.961 11.817 11.681 11.552 11.436 11.318 11.197 11.064 10.947 10.844 10.737 10.626 10.519 10.407 10.301 10.218 10.12 10.01 9.901 9.789 9.714 9.63 9.488 9.387 9.277 9.225 9.13 9.03 8.937 8.881 8.769 8.681 8.606 8.535 8.363 8.264 8.148 8.028 7.891 7.699 7.497 7.025 -9 ,7064 ,TETRA ,17557142,Fri Nov 26 09:13:45 CET,Fri Nov 26 11:23:48 CET,0.0 0.715 0.904 1.033 1.166 1.288 1.388 1.482 1.651 1.73 1.803 1.893 2.027 2.109 2.258 2.387 2.512 2.573 2.693 2.811 2.981 3.087 3.189 3.352 3.5 3.634 3.772 3.898 4.055 4.208 4.364 4.56 4.742 4.905 5.092 5.303 5.511 5.757 6.018 6.289 6.589 6.926 7.313 7.715 8.168 8.658 9.226 9.832 10.514 11.292 12.115 12.651 12.851 12.886 12.828 12.709 12.591 12.456 12.33 12.194 12.052 11.909 11.77 11.628 11.483 11.343 11.191 11.06 10.933 10.795 10.664 10.567 10.466 10.354 10.273 10.189 10.092 9.984 9.872 9.799 9.717 9.578 9.482 9.381 9.333 9.223 9.109 9.002 8.944 8.826 8.738 8.677 8.601 8.419 8.333 8.234 8.105 7.986 7.86 7.701 7.513 -10 ,28676 ,TETRA ,17557143,Fri Nov 26 09:14:45 CET,Fri Nov 26 11:26:09 CET,0.0 0.732 0.988 1.169 1.314 1.432 1.547 1.657 1.867 1.96 2.04 2.132 2.26 2.334 2.48 2.618 2.763 2.837 2.971 3.101 3.287 3.407 3.523 3.683 3.83 3.972 4.109 4.242 4.413 4.564 4.702 4.882 5.068 5.245 5.454 5.676 5.888 6.132 6.385 6.66 6.957 7.304 7.707 8.086 8.508 8.987 9.538 10.136 10.846 11.616 12.428 12.963 13.176 13.23 13.19 13.108 12.992 12.853 12.73 12.609 12.488 12.368 12.257 12.134 12.001 11.876 11.736 11.607 11.497 11.382 11.246 11.127 11.008 10.876 10.763 10.661 10.568 10.458 10.34 10.254 10.158 10.025 9.937 9.841 9.791 9.682 9.572 9.45 9.385 9.266 9.176 9.105 9.025 8.871 8.793 8.7 8.587 8.451 8.272 8.076 7.512 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt deleted file mode 100644 index b7b83347..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4577 ,TETRA ,17557144,Fri Nov 26 09:14:45 CET,Fri Nov 26 11:24:38 CET,0.0 0.261 0.375 0.441 0.471 0.492 0.513 0.524 0.54 0.548 0.543 0.466 0.511 0.511 0.505 0.474 0.422 0.395 0.351 0.303 0.215 0.155 0.098 0.01 -0.093 -0.198 -0.3 -0.402 -0.541 -0.685 -0.838 -1.044 -1.245 -1.441 -1.699 -2.009 -2.328 -2.712 -3.135 -3.618 -4.182 -4.841 -5.654 -6.562 -7.73 -9.156 -10.952 -13.186 -16.17 -20.295 -26.347 -32.691 -37.423 -41.118 -44.031 -46.465 -48.482 -50.223 -51.665 -53.04 -54.162 -55.108 -55.967 -56.759 -57.483 -58.139 -58.812 -59.4 -59.893 -60.409 -60.94 -61.358 -61.773 -62.186 -62.496 -62.809 -63.123 -63.447 -63.787 -64.018 -64.238 -64.581 -64.822 -65.071 -65.196 -65.442 -65.698 -65.961 -66.094 -66.353 -66.509 -66.655 -66.81 -67.116 -67.271 -67.456 -67.658 -67.865 -68.073 -68.298 -68.654 -2 ,30642 ,TETRA ,17557145,Fri Nov 26 09:14:45 CET,Fri Nov 26 11:27:33 CET,0.0 0.21 0.313 0.369 0.42 0.467 0.503 0.52 0.529 0.524 0.518 0.452 0.504 0.498 0.476 0.445 0.411 0.392 0.353 0.316 0.253 0.207 0.158 0.078 -0.013 -0.112 -0.219 -0.32 -0.466 -0.623 -0.773 -0.975 -1.187 -1.388 -1.631 -1.916 -2.198 -2.549 -2.955 -3.417 -3.958 -4.637 -5.49 -6.379 -7.497 -8.875 -10.641 -12.895 -15.911 -20.056 -26.176 -32.555 -37.257 -40.933 -43.857 -46.303 -48.314 -50.029 -51.447 -52.834 -53.976 -54.94 -55.828 -56.653 -57.403 -58.066 -58.733 -59.307 -59.79 -60.276 -60.768 -61.18 -61.605 -62.03 -62.367 -62.707 -63.03 -63.361 -63.698 -63.932 -64.171 -64.522 -64.765 -65.01 -65.132 -65.37 -65.623 -65.901 -66.037 -66.296 -66.46 -66.612 -66.765 -67.075 -67.246 -67.428 -67.628 -67.825 -68.026 -68.281 -68.747 -3 ,6102 ,TETRA ,17557146,Fri Nov 26 09:14:45 CET,Fri Nov 26 11:24:36 CET,0.0 0.314 0.392 0.456 0.486 0.485 0.483 0.471 0.456 0.454 0.45 0.378 0.427 0.414 0.383 0.357 0.318 0.303 0.279 0.242 0.174 0.126 0.076 -0.011 -0.109 -0.206 -0.301 -0.392 -0.517 -0.657 -0.798 -0.973 -1.174 -1.401 -1.664 -1.955 -2.263 -2.633 -3.065 -3.553 -4.087 -4.728 -5.526 -6.396 -7.524 -8.918 -10.687 -12.923 -15.919 -20.045 -26.116 -32.466 -37.209 -40.922 -43.825 -46.241 -48.245 -49.968 -51.387 -52.769 -53.919 -54.898 -55.8 -56.635 -57.406 -58.067 -58.724 -59.307 -59.8 -60.296 -60.797 -61.206 -61.618 -62.039 -62.363 -62.686 -63.006 -63.33 -63.653 -63.872 -64.094 -64.424 -64.658 -64.898 -65.016 -65.276 -65.556 -65.838 -65.981 -66.244 -66.391 -66.529 -66.684 -67.01 -67.16 -67.32 -67.5 -67.696 -67.886 -68.095 -68.475 -4 ,4971 ,TETRA ,17557147,Fri Nov 26 09:14:45 CET,Fri Nov 26 11:25:16 CET,0.0 0.24 0.372 0.44 0.478 0.513 0.553 0.566 0.572 0.565 0.561 0.498 0.549 0.548 0.553 0.532 0.498 0.481 0.458 0.419 0.359 0.328 0.28 0.208 0.132 0.036 -0.06 -0.154 -0.289 -0.424 -0.574 -0.782 -0.978 -1.169 -1.419 -1.721 -2.027 -2.392 -2.814 -3.301 -3.866 -4.551 -5.386 -6.267 -7.397 -8.812 -10.62 -12.897 -15.959 -20.203 -26.371 -32.737 -37.462 -41.165 -44.09 -46.525 -48.537 -50.275 -51.708 -53.069 -54.181 -55.124 -56.024 -56.862 -57.596 -58.246 -58.931 -59.519 -59.998 -60.491 -60.991 -61.387 -61.791 -62.214 -62.538 -62.862 -63.189 -63.524 -63.874 -64.116 -64.352 -64.704 -64.946 -65.195 -65.326 -65.59 -65.86 -66.147 -66.297 -66.568 -66.747 -66.914 -67.093 -67.437 -67.612 -67.797 -67.988 -68.181 -68.374 -68.627 -68.997 -5 ,12681 ,TETRA ,17557148,Fri Nov 26 09:14:45 CET,Fri Nov 26 11:25:47 CET,0.0 0.157 0.227 0.282 0.334 0.36 0.362 0.369 0.39 0.398 0.404 0.348 0.407 0.403 0.38 0.356 0.328 0.311 0.271 0.22 0.153 0.108 0.056 -0.022 -0.108 -0.198 -0.295 -0.403 -0.541 -0.679 -0.823 -1.01 -1.195 -1.379 -1.616 -1.909 -2.214 -2.565 -2.979 -3.458 -3.967 -4.59 -5.412 -6.315 -7.454 -8.85 -10.628 -12.86 -15.882 -20.004 -26.023 -32.402 -37.14 -40.84 -43.793 -46.26 -48.287 -50.028 -51.464 -52.842 -53.986 -54.986 -55.884 -56.698 -57.446 -58.099 -58.769 -59.36 -59.852 -60.348 -60.849 -61.263 -61.689 -62.109 -62.421 -62.745 -63.081 -63.413 -63.747 -63.982 -64.221 -64.577 -64.817 -65.069 -65.204 -65.48 -65.751 -66.02 -66.156 -66.415 -66.569 -66.719 -66.874 -67.192 -67.355 -67.518 -67.698 -67.905 -68.119 -68.348 -68.786 -6 ,25672 ,TETRA ,17557149,Fri Nov 26 09:14:45 CET,Fri Nov 26 11:25:15 CET,0.0 0.166 0.24 0.288 0.304 0.319 0.331 0.355 0.4 0.403 0.404 0.339 0.392 0.388 0.386 0.375 0.345 0.337 0.317 0.286 0.235 0.193 0.144 0.064 -0.018 -0.104 -0.202 -0.308 -0.448 -0.596 -0.757 -0.952 -1.137 -1.325 -1.564 -1.852 -2.153 -2.504 -2.912 -3.375 -3.916 -4.567 -5.375 -6.293 -7.451 -8.845 -10.633 -12.879 -15.819 -19.906 -26.012 -32.457 -37.129 -40.715 -43.632 -46.097 -48.121 -49.846 -51.266 -52.628 -53.757 -54.73 -55.62 -56.423 -57.157 -57.814 -58.47 -59.045 -59.541 -60.039 -60.546 -60.955 -61.374 -61.804 -62.118 -62.439 -62.77 -63.098 -63.432 -63.657 -63.886 -64.245 -64.492 -64.745 -64.871 -65.127 -65.383 -65.643 -65.777 -66.034 -66.206 -66.354 -66.511 -66.848 -67.013 -67.175 -67.34 -67.516 -67.715 -67.976 -68.277 -7 ,5452 ,TETRA ,17557150,Fri Nov 26 09:15:45 CET,Fri Nov 26 11:25:55 CET,0.0 0.262 0.349 0.406 0.421 0.435 0.457 0.469 0.458 0.451 0.455 0.419 0.48 0.475 0.472 0.462 0.437 0.423 0.396 0.364 0.307 0.262 0.217 0.145 0.065 -0.007 -0.083 -0.178 -0.313 -0.464 -0.62 -0.816 -1.019 -1.213 -1.459 -1.75 -2.042 -2.402 -2.843 -3.344 -3.891 -4.556 -5.371 -6.246 -7.376 -8.769 -10.559 -12.814 -15.778 -19.857 -25.921 -32.305 -36.993 -40.632 -43.549 -46.018 -48.056 -49.801 -51.239 -52.622 -53.756 -54.717 -55.599 -56.406 -57.13 -57.771 -58.417 -58.984 -59.495 -60.008 -60.502 -60.904 -61.319 -61.742 -62.063 -62.379 -62.695 -63.014 -63.343 -63.573 -63.813 -64.176 -64.403 -64.626 -64.737 -64.969 -65.217 -65.477 -65.614 -65.874 -66.015 -66.159 -66.312 -66.619 -66.78 -66.947 -67.115 -67.301 -67.532 -67.784 -68.183 -8 ,26372 ,TETRA ,17557151,Fri Nov 26 09:15:45 CET,Fri Nov 26 11:24:57 CET,0.0 0.163 0.252 0.299 0.331 0.342 0.347 0.349 0.338 0.33 0.318 0.23 0.276 0.277 0.269 0.223 0.173 0.154 0.122 0.087 0.021 -0.029 -0.084 -0.16 -0.242 -0.342 -0.437 -0.537 -0.687 -0.835 -0.989 -1.19 -1.4 -1.618 -1.884 -2.203 -2.527 -2.903 -3.328 -3.808 -4.353 -5.026 -5.871 -6.782 -7.957 -9.386 -11.19 -13.429 -16.405 -20.573 -26.727 -33.126 -37.839 -41.528 -44.462 -46.908 -48.932 -50.668 -52.106 -53.488 -54.64 -55.617 -56.502 -57.306 -58.036 -58.691 -59.349 -59.921 -60.408 -60.901 -61.391 -61.794 -62.218 -62.633 -62.953 -63.292 -63.631 -63.981 -64.342 -64.573 -64.804 -65.167 -65.415 -65.667 -65.796 -66.067 -66.345 -66.628 -66.773 -67.038 -67.189 -67.333 -67.477 -67.796 -67.966 -68.139 -68.312 -68.489 -68.715 -68.978 -69.301 -9 ,10982 ,TETRA ,17557152,Fri Nov 26 09:15:46 CET,Fri Nov 26 11:24:52 CET,0.0 0.234 0.372 0.5 0.563 0.581 0.603 0.63 0.657 0.666 0.683 0.639 0.691 0.679 0.664 0.657 0.642 0.625 0.583 0.542 0.491 0.454 0.405 0.34 0.261 0.162 0.061 -0.049 -0.193 -0.322 -0.451 -0.621 -0.805 -1.008 -1.265 -1.569 -1.866 -2.225 -2.639 -3.103 -3.633 -4.297 -5.139 -6.05 -7.214 -8.615 -10.401 -12.661 -15.675 -19.839 -26.012 -32.439 -37.17 -40.891 -43.866 -46.339 -48.384 -50.124 -51.54 -52.912 -54.038 -55.005 -55.89 -56.693 -57.436 -58.088 -58.741 -59.308 -59.786 -60.268 -60.751 -61.146 -61.549 -61.956 -62.264 -62.592 -62.925 -63.245 -63.574 -63.804 -64.036 -64.389 -64.633 -64.886 -65.008 -65.253 -65.512 -65.777 -65.91 -66.17 -66.3 -66.42 -66.544 -66.826 -66.972 -67.142 -67.34 -67.534 -67.726 -67.934 -68.319 -10 ,17540 ,TETRA ,17557153,Fri Nov 26 09:15:45 CET,Fri Nov 26 11:27:04 CET,0.0 0.186 0.279 0.325 0.374 0.41 0.424 0.453 0.512 0.515 0.511 0.436 0.482 0.472 0.449 0.416 0.365 0.342 0.297 0.246 0.171 0.113 0.055 -0.031 -0.121 -0.226 -0.337 -0.437 -0.569 -0.707 -0.85 -1.04 -1.238 -1.441 -1.695 -1.99 -2.289 -2.653 -3.079 -3.558 -4.086 -4.721 -5.536 -6.435 -7.564 -8.935 -10.677 -12.87 -15.815 -19.882 -25.904 -32.216 -36.89 -40.605 -43.562 -46.009 -48.026 -49.75 -51.176 -52.557 -53.712 -54.694 -55.592 -56.433 -57.191 -57.852 -58.527 -59.112 -59.601 -60.103 -60.62 -61.038 -61.451 -61.865 -62.189 -62.524 -62.856 -63.185 -63.527 -63.758 -63.99 -64.342 -64.582 -64.843 -64.971 -65.219 -65.48 -65.737 -65.867 -66.13 -66.273 -66.41 -66.56 -66.89 -67.059 -67.257 -67.501 -67.752 -67.971 -68.199 -68.887 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt deleted file mode 100644 index 126a11db..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1850 ,TETRA ,17557154,Fri Nov 26 09:15:48 CET,Fri Nov 26 11:24:26 CET,0.0 0.556 0.854 1.147 1.398 1.609 1.802 1.984 2.311 2.458 2.599 2.749 3.009 3.14 3.397 3.648 3.891 4.014 4.246 4.473 4.82 5.041 5.259 5.569 5.864 6.164 6.474 6.778 7.174 7.558 7.932 8.386 8.829 9.271 9.805 10.416 10.999 11.667 12.414 13.237 14.145 15.178 16.422 17.728 19.285 21.11 23.314 25.904 29.108 33.159 38.656 43.983 47.525 50.029 51.913 53.385 54.455 55.318 56.01 56.631 57.112 57.49 57.834 58.136 58.378 58.584 58.787 58.951 59.072 59.189 59.297 59.369 59.448 59.51 59.537 59.557 59.571 59.575 59.579 59.58 59.577 59.563 59.546 59.539 59.536 59.508 59.451 59.395 59.364 59.258 59.235 59.185 59.135 59.019 58.969 58.906 58.798 58.657 58.462 58.174 57.134 -2 ,12435 ,TETRA ,17557155,Fri Nov 26 09:15:46 CET,Fri Nov 26 11:23:36 CET,0.0 0.787 1.102 1.342 1.527 1.712 1.893 2.067 2.405 2.56 2.698 2.833 3.089 3.214 3.482 3.734 3.974 4.095 4.335 4.573 4.898 5.106 5.321 5.644 5.954 6.264 6.563 6.849 7.234 7.614 7.982 8.442 8.896 9.333 9.85 10.441 11.015 11.676 12.431 13.267 14.156 15.182 16.415 17.693 19.255 21.042 23.176 25.765 29.046 33.3 38.997 44.301 47.849 50.383 52.236 53.684 54.803 55.68 56.351 56.938 57.402 57.772 58.122 58.431 58.66 58.856 59.055 59.216 59.339 59.448 59.554 59.635 59.706 59.766 59.807 59.852 59.895 59.942 59.982 60.001 60.019 60.041 60.042 60.031 60.016 59.983 59.962 59.924 59.892 59.787 59.768 59.731 59.688 59.57 59.516 59.444 59.311 59.139 58.966 58.726 57.869 -3 ,19862 ,TETRA ,17557156,Fri Nov 26 09:15:45 CET,Fri Nov 26 11:23:27 CET,0.0 0.466 0.763 1.02 1.216 1.397 1.58 1.753 2.074 2.235 2.387 2.566 2.84 2.973 3.222 3.456 3.686 3.8 4.025 4.257 4.58 4.8 5.025 5.342 5.655 5.954 6.253 6.545 6.916 7.292 7.667 8.125 8.572 9.019 9.551 10.153 10.739 11.401 12.13 12.912 13.753 14.747 15.964 17.242 18.77 20.542 22.73 25.34 28.591 32.734 38.332 43.61 47.059 49.541 51.387 52.826 53.969 54.879 55.566 56.198 56.721 57.137 57.482 57.766 58.018 58.223 58.406 58.566 58.705 58.832 58.953 59.037 59.1 59.157 59.186 59.203 59.236 59.275 59.311 59.326 59.325 59.296 59.283 59.278 59.265 59.222 59.161 59.096 59.068 58.973 58.985 58.946 58.879 58.743 58.67 58.577 58.452 58.277 58.103 57.845 56.177 -4 ,20124 ,TETRA ,17557157,Fri Nov 26 09:16:45 CET,Fri Nov 26 11:25:19 CET,0.0 1.569 1.872 2.051 2.199 2.36 2.538 2.688 2.983 3.144 3.289 3.427 3.684 3.803 4.035 4.287 4.537 4.658 4.889 5.106 5.418 5.626 5.845 6.17 6.483 6.794 7.093 7.39 7.794 8.189 8.564 9.012 9.453 9.889 10.402 10.983 11.564 12.214 12.929 13.724 14.586 15.585 16.793 18.038 19.534 21.311 23.485 26.084 29.288 33.335 38.862 44.082 47.513 50.001 51.901 53.361 54.441 55.305 55.984 56.6 57.092 57.503 57.849 58.105 58.297 58.473 58.647 58.787 58.903 59.007 59.099 59.172 59.225 59.262 59.302 59.345 59.389 59.428 59.444 59.438 59.425 59.381 59.339 59.312 59.304 59.284 59.242 59.189 59.155 59.051 59.041 58.997 58.95 58.811 58.739 58.675 58.587 58.488 58.358 58.104 56.779 -5 ,3856 ,TETRA ,17557158,Fri Nov 26 09:15:45 CET,Fri Nov 26 11:27:15 CET,0.0 0.446 0.711 0.937 1.142 1.353 1.549 1.735 2.055 2.203 2.355 2.54 2.809 2.936 3.186 3.438 3.681 3.793 4.013 4.232 4.551 4.761 4.968 5.284 5.585 5.868 6.148 6.424 6.8 7.18 7.55 8.0 8.458 8.916 9.442 10.028 10.607 11.273 12.008 12.814 13.71 14.764 16.009 17.279 18.816 20.629 22.813 25.374 28.573 32.694 38.234 43.429 46.873 49.308 51.129 52.563 53.646 54.531 55.233 55.857 56.332 56.725 57.061 57.359 57.614 57.798 57.993 58.173 58.304 58.434 58.558 58.631 58.687 58.741 58.775 58.813 58.842 58.853 58.861 58.868 58.868 58.844 58.831 58.821 58.817 58.796 58.728 58.639 58.61 58.509 58.466 58.408 58.353 58.237 58.152 58.054 57.95 57.815 57.641 57.356 56.136 -6 ,12916 ,TETRA ,17557159,Fri Nov 26 09:15:45 CET,Fri Nov 26 11:23:25 CET,0.0 0.611 0.863 1.099 1.336 1.551 1.722 1.875 2.193 2.359 2.523 2.685 2.949 3.087 3.337 3.58 3.827 3.944 4.175 4.405 4.728 4.937 5.153 5.465 5.755 6.037 6.316 6.603 6.981 7.357 7.744 8.216 8.68 9.134 9.664 10.281 10.877 11.538 12.257 13.044 13.905 14.922 16.163 17.438 18.972 20.784 22.976 25.58 28.86 33.05 38.714 44.05 47.576 50.073 51.902 53.338 54.464 55.33 55.98 56.582 57.047 57.425 57.77 58.054 58.268 58.448 58.629 58.762 58.867 58.981 59.087 59.17 59.256 59.329 59.372 59.396 59.411 59.409 59.385 59.378 59.374 59.361 59.34 59.311 59.297 59.267 59.238 59.18 59.145 59.056 59.044 58.989 58.927 58.793 58.733 58.674 58.587 58.478 58.365 58.126 57.059 -7 ,32502 ,TETRA ,17557160,Fri Nov 26 09:15:46 CET,Fri Nov 26 11:27:51 CET,0.0 0.749 1.162 1.417 1.614 1.803 1.978 2.154 2.476 2.624 2.77 2.914 3.177 3.316 3.588 3.843 4.094 4.214 4.446 4.682 5.016 5.228 5.44 5.744 6.041 6.337 6.636 6.933 7.324 7.71 8.095 8.558 9.004 9.453 9.981 10.59 11.191 11.857 12.593 13.4 14.291 15.334 16.56 17.825 19.368 21.167 23.34 25.931 29.188 33.333 38.863 44.036 47.576 50.086 51.87 53.287 54.403 55.332 56.056 56.691 57.173 57.561 57.898 58.164 58.395 58.586 58.751 58.879 58.997 59.126 59.239 59.32 59.417 59.501 59.527 59.549 59.59 59.624 59.649 59.65 59.639 59.632 59.626 59.61 59.6 59.596 59.592 59.571 59.556 59.477 59.48 59.427 59.374 59.268 59.204 59.118 59.005 58.863 58.68 58.409 57.257 -8 ,17155 ,TETRA ,17557161,Fri Nov 26 09:16:46 CET,Fri Nov 26 11:24:20 CET,0.0 0.768 1.056 1.312 1.541 1.727 1.894 2.054 2.329 2.454 2.595 2.761 3.025 3.162 3.416 3.655 3.904 4.028 4.265 4.485 4.811 5.025 5.239 5.566 5.883 6.191 6.492 6.794 7.199 7.589 7.972 8.441 8.898 9.345 9.876 10.486 11.073 11.725 12.447 13.25 14.133 15.157 16.366 17.63 19.205 21.039 23.231 25.866 29.223 33.52 39.238 44.579 48.146 50.712 52.605 54.098 55.219 56.113 56.844 57.493 57.978 58.376 58.717 58.98 59.201 59.396 59.587 59.752 59.876 59.983 60.088 60.171 60.225 60.267 60.308 60.35 60.384 60.411 60.418 60.413 60.415 60.405 60.391 60.379 60.376 60.362 60.334 60.293 60.269 60.175 60.17 60.131 60.107 60.04 59.972 59.869 59.752 59.603 59.427 59.155 57.97 -9 ,26087 ,TETRA ,17557162,Fri Nov 26 09:16:45 CET,Fri Nov 26 11:24:26 CET,0.0 0.688 0.964 1.199 1.412 1.623 1.802 1.961 2.256 2.4 2.546 2.682 2.934 3.062 3.299 3.536 3.782 3.909 4.167 4.404 4.727 4.936 5.143 5.463 5.793 6.118 6.421 6.717 7.091 7.449 7.825 8.288 8.723 9.161 9.699 10.32 10.918 11.572 12.305 13.106 13.947 14.938 16.173 17.459 19.011 20.808 22.978 25.592 28.807 32.915 38.522 43.834 47.402 49.991 51.875 53.288 54.417 55.35 56.079 56.745 57.249 57.654 57.99 58.269 58.502 58.702 58.891 59.043 59.177 59.301 59.408 59.491 59.56 59.62 59.669 59.699 59.715 59.736 59.758 59.767 59.763 59.747 59.739 59.733 59.727 59.711 59.676 59.624 59.601 59.517 59.5 59.444 59.385 59.248 59.183 59.106 58.996 58.874 58.743 58.527 57.45 -10 ,644 ,TETRA ,17557163,Fri Nov 26 09:16:47 CET,Fri Nov 26 11:31:29 CET,0.0 1.219 1.526 1.778 1.999 2.208 2.391 2.541 2.824 2.967 3.117 3.284 3.535 3.652 3.883 4.097 4.312 4.43 4.66 4.889 5.235 5.457 5.675 5.982 6.286 6.577 6.873 7.172 7.559 7.947 8.322 8.77 9.212 9.649 10.177 10.779 11.353 12.014 12.761 13.574 14.44 15.45 16.674 17.935 19.468 21.27 23.447 26.003 29.205 33.319 38.776 43.963 47.445 49.939 51.734 53.082 54.16 55.032 55.669 56.236 56.693 57.059 57.371 57.648 57.902 58.115 58.307 58.455 58.568 58.657 58.733 58.796 58.855 58.921 58.971 59.014 59.04 59.051 59.059 59.052 59.04 59.009 58.978 58.946 58.933 58.899 58.852 58.805 58.77 58.664 58.639 58.578 58.515 58.361 58.265 58.174 58.072 57.937 57.802 57.598 56.433 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt deleted file mode 100644 index 9b005fb6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13221 ,TETRA ,17557165,Fri Nov 26 09:16:47 CET,Fri Nov 26 11:26:51 CET,0.0 0.759 1.058 1.293 1.493 1.677 1.843 2.012 2.337 2.492 2.641 2.781 3.036 3.169 3.439 3.704 3.961 4.085 4.324 4.572 4.929 5.138 5.348 5.685 6.011 6.328 6.652 6.968 7.375 7.782 8.172 8.643 9.116 9.58 10.136 10.777 11.4 12.116 12.919 13.787 14.707 15.771 17.068 18.427 20.079 21.998 24.317 27.078 30.554 35.017 41.031 46.703 50.5 53.255 55.3 56.927 58.25 59.342 60.2 60.969 61.56 62.025 62.409 62.721 62.968 63.167 63.369 63.547 63.667 63.767 63.876 63.97 64.041 64.095 64.146 64.209 64.272 64.317 64.345 64.355 64.369 64.389 64.398 64.392 64.383 64.38 64.366 64.327 64.314 64.229 64.235 64.192 64.141 64.067 64.05 63.998 63.907 63.811 63.698 63.451 62.766 -2 ,28242 ,TETRA ,17557166,Fri Nov 26 09:16:47 CET,Fri Nov 26 11:15:42 CET,0.0 0.814 1.125 1.354 1.551 1.74 1.903 2.059 2.36 2.504 2.651 2.826 3.097 3.24 3.53 3.814 4.077 4.2 4.443 4.691 5.054 5.281 5.509 5.85 6.176 6.491 6.803 7.115 7.524 7.933 8.337 8.821 9.296 9.77 10.34 10.976 11.58 12.248 13.008 13.845 14.731 15.768 17.026 18.361 20.012 21.905 24.189 26.951 30.422 34.909 40.994 46.718 50.477 53.191 55.222 56.849 58.155 59.158 59.877 60.578 61.165 61.643 62.054 62.403 62.714 62.986 63.26 63.491 63.66 63.812 63.948 64.026 64.083 64.133 64.179 64.225 64.248 64.26 64.265 64.257 64.242 64.218 64.203 64.186 64.175 64.148 64.111 64.055 64.02 63.911 63.872 63.812 63.76 63.678 63.611 63.529 63.453 63.348 63.2 63.025 62.332 -3 ,26926 ,TETRA ,17557167,Fri Nov 26 09:16:46 CET,Fri Nov 26 11:28:12 CET,0.0 1.391 1.736 1.999 2.244 2.454 2.644 2.819 3.146 3.298 3.441 3.582 3.844 3.985 4.264 4.535 4.806 4.938 5.187 5.44 5.811 6.048 6.277 6.602 6.92 7.235 7.55 7.854 8.255 8.654 9.035 9.505 9.988 10.468 11.041 11.704 12.353 13.087 13.895 14.777 15.731 16.837 18.19 19.601 21.285 23.218 25.577 28.409 31.946 36.461 42.573 48.4 52.266 55.037 57.072 58.67 59.932 60.95 61.716 62.429 63.023 63.502 63.909 64.271 64.566 64.802 65.035 65.213 65.362 65.516 65.65 65.731 65.805 65.873 65.913 65.957 66.0 66.053 66.099 66.107 66.104 66.098 66.091 66.081 66.074 66.058 66.038 66.001 65.967 65.868 65.874 65.828 65.77 65.636 65.557 65.475 65.385 65.263 65.069 64.832 64.149 -4 ,12430 ,TETRA ,17557168,Fri Nov 26 09:16:47 CET,Fri Nov 26 11:25:27 CET,0.0 0.679 1.024 1.286 1.525 1.724 1.902 2.078 2.407 2.574 2.742 2.908 3.175 3.315 3.581 3.834 4.075 4.196 4.434 4.663 4.99 5.209 5.43 5.762 6.089 6.405 6.712 7.013 7.415 7.816 8.214 8.701 9.179 9.64 10.186 10.817 11.441 12.144 12.927 13.781 14.71 15.796 17.093 18.453 20.121 22.057 24.359 27.131 30.677 35.172 41.238 47.049 50.904 53.679 55.741 57.336 58.544 59.389 60.01 60.646 61.204 61.641 61.959 62.21 62.42 62.597 62.767 62.91 63.016 63.106 63.19 63.238 63.281 63.336 63.373 63.401 63.419 63.431 63.438 63.439 63.437 63.424 63.415 63.401 63.393 63.372 63.33 63.296 63.286 63.206 63.22 63.181 63.131 63.025 62.974 62.91 62.825 62.736 62.592 62.348 61.281 -5 ,16194 ,TETRA ,17557169,Fri Nov 26 09:16:46 CET,Fri Nov 26 11:26:00 CET,0.0 0.841 1.161 1.413 1.664 1.904 2.096 2.271 2.597 2.752 2.895 3.064 3.343 3.483 3.752 4.01 4.253 4.377 4.626 4.857 5.203 5.437 5.661 5.993 6.324 6.649 6.977 7.298 7.702 8.099 8.494 8.971 9.431 9.88 10.424 11.048 11.648 12.338 13.121 13.978 14.897 15.951 17.207 18.512 20.124 22.013 24.29 27.043 30.475 34.807 40.767 46.415 50.098 52.757 54.789 56.423 57.716 58.682 59.34 59.922 60.387 60.738 61.029 61.284 61.5 61.68 61.866 62.019 62.131 62.243 62.329 62.381 62.445 62.507 62.537 62.56 62.581 62.612 62.661 62.687 62.704 62.729 62.738 62.729 62.727 62.72 62.683 62.642 62.626 62.539 62.541 62.502 62.455 62.333 62.266 62.209 62.137 62.046 61.942 61.813 61.497 -6 ,21513 ,TETRA ,17557170,Fri Nov 26 09:16:47 CET,Fri Nov 26 11:24:26 CET,0.0 0.588 0.818 1.033 1.221 1.409 1.607 1.787 2.122 2.289 2.458 2.645 2.91 3.046 3.312 3.565 3.818 3.945 4.192 4.435 4.793 5.026 5.26 5.605 5.942 6.275 6.595 6.908 7.325 7.729 8.113 8.595 9.086 9.566 10.121 10.763 11.396 12.112 12.907 13.763 14.698 15.794 17.126 18.51 20.153 22.086 24.461 27.277 30.796 35.262 41.172 46.781 50.612 53.393 55.435 57.047 58.31 59.303 60.07 60.725 61.191 61.537 61.843 62.128 62.353 62.545 62.741 62.888 62.999 63.109 63.202 63.263 63.321 63.374 63.41 63.449 63.478 63.492 63.509 63.508 63.503 63.504 63.501 63.492 63.481 63.449 63.428 63.395 63.37 63.281 63.297 63.261 63.223 63.151 63.112 63.074 63.016 62.901 62.748 62.566 61.987 -7 ,7768 ,TETRA ,17557171,Fri Nov 26 09:16:47 CET,Fri Nov 26 11:26:24 CET,0.0 0.608 0.924 1.179 1.404 1.595 1.756 1.923 2.273 2.438 2.583 2.75 3.037 3.185 3.461 3.727 3.976 4.094 4.331 4.576 4.922 5.144 5.362 5.688 6.012 6.326 6.643 6.953 7.353 7.736 8.12 8.617 9.11 9.581 10.125 10.76 11.394 12.117 12.924 13.79 14.731 15.824 17.121 18.471 20.134 22.085 24.43 27.266 30.804 35.27 41.381 47.146 50.66 52.949 54.673 56.013 57.007 57.809 58.534 59.248 59.801 60.289 60.737 61.115 61.427 61.697 61.958 62.158 62.306 62.436 62.57 62.696 62.805 62.861 62.885 62.911 62.94 62.971 62.99 63.006 63.021 63.04 63.032 63.011 62.998 62.966 62.951 62.907 62.873 62.773 62.782 62.751 62.716 62.626 62.572 62.494 62.395 62.3 62.19 62.023 61.539 -8 ,14966 ,TETRA ,17557172,Fri Nov 26 09:17:47 CET,Fri Nov 26 11:25:30 CET,0.0 0.696 1.009 1.273 1.488 1.687 1.88 2.059 2.369 2.53 2.689 2.852 3.118 3.252 3.507 3.756 3.993 4.113 4.356 4.596 4.952 5.188 5.414 5.751 6.092 6.418 6.737 7.064 7.48 7.878 8.263 8.734 9.218 9.693 10.25 10.895 11.542 12.27 13.062 13.929 14.872 15.964 17.275 18.652 20.321 22.26 24.62 27.42 30.894 35.408 41.129 46.215 49.946 52.783 54.714 56.058 57.061 57.894 58.543 59.112 59.535 59.881 60.202 60.47 60.682 60.856 61.028 61.131 61.215 61.316 61.395 61.448 61.506 61.554 61.581 61.607 61.625 61.628 61.622 61.626 61.642 61.651 61.634 61.604 61.592 61.575 61.559 61.541 61.528 61.428 61.414 61.391 61.36 61.243 61.189 61.135 61.057 60.966 60.855 60.679 60.113 -9 ,4380 ,TETRA ,17557173,Fri Nov 26 09:17:47 CET,Fri Nov 26 11:26:48 CET,0.0 0.895 1.202 1.449 1.648 1.84 2.015 2.18 2.549 2.725 2.893 3.084 3.352 3.48 3.734 3.992 4.239 4.359 4.592 4.819 5.148 5.368 5.598 5.951 6.299 6.631 6.946 7.257 7.673 8.08 8.469 8.949 9.429 9.893 10.439 11.075 11.704 12.415 13.205 14.077 15.024 16.125 17.44 18.801 20.458 22.384 24.734 27.543 31.051 35.555 41.675 47.522 51.473 54.263 56.278 57.869 59.122 60.096 60.815 61.454 61.973 62.423 62.822 63.143 63.414 63.658 63.901 64.054 64.15 64.263 64.391 64.491 64.563 64.617 64.673 64.738 64.78 64.812 64.849 64.868 64.876 64.878 64.878 64.88 64.878 64.85 64.83 64.822 64.813 64.728 64.74 64.706 64.676 64.596 64.539 64.485 64.421 64.311 64.15 63.963 63.417 -10 ,28926 ,TETRA ,17557174,Fri Nov 26 09:17:47 CET,Fri Nov 26 11:30:40 CET,0.0 0.454 0.705 0.955 1.178 1.368 1.545 1.706 1.993 2.136 2.276 2.426 2.69 2.827 3.091 3.351 3.596 3.713 3.946 4.171 4.513 4.734 4.95 5.267 5.572 5.881 6.185 6.477 6.87 7.26 7.631 8.089 8.546 8.995 9.53 10.15 10.755 11.44 12.212 13.051 13.965 15.042 16.335 17.684 19.33 21.226 23.508 26.272 29.747 34.157 40.008 45.444 49.221 51.917 53.868 55.442 56.666 57.651 58.416 59.118 59.659 60.1 60.507 60.865 61.175 61.417 61.603 61.743 61.881 62.033 62.175 62.265 62.331 62.392 62.434 62.466 62.498 62.534 62.546 62.544 62.545 62.551 62.556 62.547 62.54 62.534 62.524 62.508 62.494 62.409 62.447 62.42 62.38 62.27 62.199 62.13 62.058 61.996 61.935 61.796 60.743 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt deleted file mode 100644 index cdce16df..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10260 ,TETRA ,17557175,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:26:36 CET,0.0 0.466 0.699 0.897 1.091 1.284 1.472 1.645 1.978 2.137 2.292 2.472 2.743 2.892 3.185 3.455 3.72 3.852 4.117 4.382 4.761 5.002 5.239 5.59 5.934 6.269 6.598 6.929 7.365 7.791 8.212 8.741 9.267 9.775 10.377 11.074 11.762 12.531 13.382 14.333 15.366 16.565 18.031 19.555 21.381 23.55 26.198 29.347 33.361 38.586 45.649 52.411 57.073 60.478 63.016 65.059 66.692 68.028 69.083 70.071 70.841 71.462 72.028 72.53 72.95 73.299 73.654 73.958 74.197 74.432 74.652 74.825 75.012 75.199 75.336 75.456 75.56 75.661 75.763 75.838 75.914 76.016 76.079 76.136 76.164 76.211 76.245 76.269 76.272 76.232 76.305 76.315 76.308 76.286 76.285 76.281 76.265 76.228 76.16 76.063 75.896 -2 ,25352 ,TETRA ,17557176,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:32:36 CET,0.0 0.343 0.576 0.833 1.079 1.296 1.477 1.647 1.984 2.15 2.302 2.469 2.743 2.886 3.169 3.442 3.702 3.833 4.098 4.352 4.718 4.954 5.174 5.506 5.852 6.188 6.517 6.846 7.277 7.71 8.141 8.664 9.17 9.676 10.294 11.003 11.69 12.478 13.368 14.32 15.339 16.544 18.017 19.552 21.438 23.641 26.289 29.463 33.48 38.709 45.876 52.751 57.428 60.83 63.373 65.396 66.985 68.301 69.367 70.334 71.092 71.723 72.285 72.781 73.219 73.589 73.948 74.258 74.504 74.737 74.957 75.13 75.31 75.478 75.584 75.682 75.772 75.862 75.954 76.011 76.073 76.152 76.202 76.256 76.277 76.308 76.337 76.372 76.387 76.346 76.405 76.406 76.409 76.41 76.392 76.359 76.288 76.187 76.098 75.992 75.653 -3 ,4816 ,TETRA ,17557177,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:26:36 CET,0.0 0.631 0.864 1.099 1.284 1.462 1.642 1.805 2.105 2.249 2.394 2.566 2.83 2.97 3.25 3.521 3.784 3.909 4.154 4.395 4.756 5.014 5.268 5.622 5.963 6.286 6.61 6.943 7.4 7.853 8.284 8.807 9.337 9.861 10.47 11.176 11.888 12.679 13.543 14.491 15.533 16.75 18.196 19.707 21.575 23.773 26.453 29.661 33.676 38.853 45.888 52.743 57.499 60.939 63.499 65.519 67.083 68.371 69.42 70.394 71.152 71.771 72.314 72.802 73.232 73.592 73.942 74.231 74.462 74.692 74.929 75.103 75.268 75.435 75.56 75.676 75.776 75.872 75.971 76.033 76.097 76.201 76.269 76.319 76.337 76.385 76.431 76.46 76.465 76.416 76.474 76.483 76.484 76.482 76.478 76.463 76.425 76.363 76.25 76.098 75.671 -4 ,13733 ,TETRA ,17557178,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:12:04 CET,0.0 0.531 0.789 0.998 1.185 1.368 1.549 1.723 2.04 2.195 2.349 2.555 2.839 2.978 3.259 3.523 3.773 3.903 4.16 4.429 4.833 5.077 5.313 5.657 6.009 6.358 6.685 7.011 7.441 7.859 8.278 8.807 9.34 9.864 10.491 11.23 11.952 12.753 13.637 14.61 15.659 16.87 18.341 19.881 21.729 23.881 26.497 29.65 33.628 38.75 45.82 52.604 57.199 60.601 63.177 65.198 66.784 68.108 69.165 70.129 70.885 71.495 72.035 72.525 72.951 73.317 73.671 73.962 74.2 74.438 74.672 74.844 75.021 75.198 75.323 75.445 75.556 75.663 75.767 75.828 75.89 75.989 76.049 76.103 76.126 76.156 76.187 76.232 76.244 76.208 76.28 76.283 76.291 76.324 76.334 76.319 76.305 76.29 76.249 76.198 76.047 -5 ,2726 ,TETRA ,17557179,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:27:30 CET,0.0 0.628 0.921 1.142 1.329 1.505 1.67 1.837 2.168 2.33 2.493 2.68 2.941 3.078 3.36 3.634 3.892 4.024 4.276 4.51 4.884 5.13 5.362 5.702 6.058 6.406 6.731 7.053 7.467 7.882 8.298 8.815 9.327 9.833 10.431 11.117 11.802 12.577 13.438 14.391 15.434 16.637 18.093 19.609 21.445 23.584 26.194 29.36 33.349 38.478 45.542 52.306 56.881 60.255 62.783 64.792 66.385 67.669 68.669 69.593 70.331 70.946 71.501 71.991 72.409 72.761 73.101 73.385 73.607 73.824 74.046 74.22 74.387 74.549 74.673 74.795 74.906 75.002 75.093 75.152 75.213 75.296 75.334 75.372 75.392 75.437 75.483 75.525 75.547 75.519 75.58 75.57 75.552 75.518 75.505 75.474 75.44 75.406 75.361 75.262 74.896 -6 ,8041 ,TETRA ,17557180,Fri Nov 26 09:18:46 CET,Fri Nov 26 11:23:42 CET,0.0 0.587 0.838 1.05 1.225 1.398 1.563 1.724 2.034 2.19 2.34 2.503 2.769 2.912 3.19 3.455 3.719 3.843 4.083 4.338 4.711 4.947 5.184 5.532 5.877 6.208 6.531 6.862 7.299 7.723 8.145 8.668 9.171 9.67 10.278 10.976 11.661 12.434 13.287 14.224 15.245 16.419 17.847 19.351 21.194 23.355 25.979 29.115 33.098 38.318 45.43 52.273 56.893 60.273 62.87 64.907 66.46 67.749 68.768 69.696 70.457 71.076 71.626 72.133 72.564 72.932 73.305 73.612 73.867 74.123 74.362 74.549 74.735 74.917 75.049 75.176 75.294 75.409 75.524 75.596 75.658 75.733 75.787 75.84 75.854 75.874 75.918 75.967 75.982 75.942 76.008 76.018 76.013 75.992 75.987 75.977 75.936 75.879 75.814 75.69 75.321 -7 ,19744 ,TETRA ,17557181,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:26:35 CET,0.0 0.654 0.934 1.152 1.361 1.551 1.724 1.896 2.223 2.371 2.507 2.664 2.928 3.061 3.323 3.578 3.824 3.944 4.183 4.418 4.771 4.996 5.231 5.601 5.961 6.3 6.628 6.963 7.406 7.841 8.272 8.786 9.284 9.788 10.394 11.106 11.803 12.595 13.471 14.422 15.486 16.721 18.193 19.716 21.562 23.745 26.424 29.618 33.591 38.746 45.856 52.679 57.335 60.772 63.335 65.338 66.93 68.225 69.245 70.167 70.894 71.509 72.049 72.526 72.952 73.302 73.648 73.951 74.173 74.376 74.581 74.76 74.945 75.117 75.236 75.35 75.462 75.569 75.672 75.736 75.798 75.878 75.924 75.971 75.993 76.03 76.059 76.079 76.091 76.061 76.13 76.124 76.123 76.119 76.111 76.097 76.054 76.009 75.949 75.811 75.405 -8 ,12712 ,TETRA ,17557182,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:32:03 CET,0.0 0.474 0.716 0.912 1.117 1.312 1.503 1.68 1.985 2.137 2.292 2.458 2.723 2.863 3.139 3.409 3.669 3.8 4.066 4.321 4.698 4.947 5.186 5.538 5.884 6.22 6.541 6.859 7.288 7.716 8.147 8.67 9.186 9.695 10.303 11.028 11.744 12.538 13.408 14.355 15.384 16.598 18.087 19.642 21.524 23.722 26.36 29.515 33.521 38.676 45.768 52.629 57.268 60.665 63.219 65.234 66.843 68.169 69.224 70.22 71.015 71.649 72.21 72.699 73.121 73.5 73.878 74.19 74.44 74.684 74.923 75.104 75.286 75.464 75.585 75.701 75.807 75.905 76.01 76.079 76.144 76.233 76.282 76.332 76.351 76.381 76.434 76.486 76.503 76.467 76.517 76.517 76.519 76.49 76.459 76.419 76.364 76.311 76.251 76.184 75.923 -9 ,30076 ,TETRA ,17557183,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:28:54 CET,0.0 0.475 0.718 0.929 1.122 1.306 1.471 1.619 1.927 2.073 2.213 2.385 2.652 2.788 3.055 3.309 3.553 3.681 3.937 4.176 4.539 4.777 5.005 5.345 5.687 6.025 6.353 6.686 7.118 7.542 7.963 8.481 8.998 9.51 10.122 10.817 11.494 12.264 13.12 14.072 15.117 16.328 17.779 19.287 21.14 23.308 25.939 29.123 33.143 38.314 45.424 52.243 56.869 60.24 62.775 64.782 66.365 67.679 68.735 69.709 70.471 71.113 71.683 72.177 72.608 72.976 73.34 73.652 73.907 74.155 74.382 74.554 74.736 74.9 75.016 75.135 75.248 75.363 75.479 75.553 75.628 75.716 75.763 75.821 75.848 75.887 75.929 75.956 75.964 75.924 75.992 75.987 75.979 75.984 75.989 75.991 75.964 75.932 75.868 75.708 75.432 -10 ,29271 ,TETRA ,17557184,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:26:46 CET,0.0 0.914 1.246 1.458 1.649 1.826 1.986 2.145 2.475 2.635 2.788 2.952 3.205 3.337 3.611 3.891 4.16 4.289 4.545 4.793 5.151 5.385 5.622 5.976 6.32 6.654 6.982 7.309 7.741 8.163 8.582 9.103 9.63 10.15 10.742 11.434 12.115 12.882 13.742 14.693 15.726 16.913 18.35 19.856 21.696 23.87 26.538 29.74 33.728 38.848 45.907 52.754 57.414 60.806 63.396 65.478 67.094 68.411 69.46 70.419 71.175 71.817 72.385 72.895 73.354 73.721 74.065 74.365 74.623 74.875 75.105 75.287 75.466 75.639 75.766 75.886 76.0 76.098 76.189 76.25 76.3 76.385 76.45 76.512 76.543 76.599 76.637 76.663 76.679 76.64 76.691 76.698 76.704 76.715 76.709 76.684 76.662 76.633 76.594 76.553 76.322 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt deleted file mode 100644 index c8bca5fe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26470 ,TETRA ,17557185,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:26:45 CET,0.0 0.257 0.418 0.548 0.677 0.776 0.852 0.921 1.017 1.061 1.104 1.126 1.186 1.208 1.234 1.254 1.265 1.266 1.273 1.265 1.225 1.198 1.171 1.114 1.045 0.996 0.939 0.858 0.756 0.644 0.505 0.336 0.158 -0.039 -0.273 -0.556 -0.855 -1.201 -1.61 -2.104 -2.652 -3.313 -4.186 -5.139 -6.353 -7.865 -9.792 -12.251 -15.553 -20.192 -27.322 -34.889 -40.509 -44.912 -48.452 -51.486 -53.96 -56.001 -57.667 -59.253 -60.618 -61.852 -62.992 -64.042 -65.001 -65.856 -66.717 -67.487 -68.119 -68.701 -69.288 -69.774 -70.251 -70.745 -71.132 -71.507 -71.898 -72.342 -72.819 -73.137 -73.45 -73.932 -74.276 -74.65 -74.837 -75.183 -75.54 -75.938 -76.148 -76.48 -76.807 -77.034 -77.276 -77.817 -78.078 -78.345 -78.652 -78.986 -79.356 -79.863 -81.123 -2 ,11242 ,TETRA ,17557186,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:26:46 CET,0.0 0.362 0.543 0.729 0.864 0.962 1.048 1.127 1.228 1.264 1.298 1.324 1.377 1.385 1.399 1.404 1.394 1.39 1.382 1.368 1.334 1.302 1.268 1.216 1.158 1.09 1.016 0.939 0.83 0.711 0.591 0.448 0.291 0.117 -0.088 -0.347 -0.638 -0.983 -1.394 -1.894 -2.459 -3.141 -4.021 -4.983 -6.21 -7.719 -9.681 -12.192 -15.534 -20.155 -27.107 -34.515 -40.005 -44.28 -47.702 -50.576 -52.902 -54.882 -56.534 -58.193 -59.645 -60.912 -62.098 -63.171 -64.112 -64.967 -65.856 -66.629 -67.294 -67.941 -68.572 -69.128 -69.71 -70.286 -70.723 -71.172 -71.639 -72.112 -72.591 -72.917 -73.243 -73.735 -74.074 -74.427 -74.612 -74.996 -75.391 -75.792 -75.998 -76.326 -76.642 -76.868 -77.099 -77.607 -77.877 -78.145 -78.429 -78.735 -79.057 -79.415 -80.54 -3 ,5101 ,TETRA ,17557187,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:27:21 CET,0.0 0.355 0.617 0.803 0.938 1.034 1.111 1.166 1.23 1.262 1.29 1.289 1.337 1.352 1.375 1.39 1.407 1.415 1.418 1.408 1.386 1.378 1.364 1.318 1.27 1.218 1.156 1.085 0.982 0.869 0.744 0.58 0.407 0.224 -0.01 -0.302 -0.61 -0.976 -1.411 -1.916 -2.478 -3.147 -3.994 -4.949 -6.178 -7.685 -9.61 -12.091 -15.474 -20.146 -27.124 -34.502 -39.995 -44.317 -47.754 -50.623 -52.993 -55.041 -56.739 -58.352 -59.71 -60.94 -62.093 -63.148 -64.119 -64.989 -65.87 -66.629 -67.28 -67.954 -68.653 -69.221 -69.783 -70.361 -70.79 -71.22 -71.683 -72.164 -72.651 -72.975 -73.312 -73.858 -74.232 -74.603 -74.782 -75.146 -75.53 -75.948 -76.159 -76.476 -76.781 -77.011 -77.245 -77.714 -77.975 -78.249 -78.542 -78.89 -79.277 -79.732 -80.786 -4 ,25159 ,TETRA ,17557188,Fri Nov 26 09:18:45 CET,Fri Nov 26 11:26:45 CET,0.0 0.194 0.383 0.544 0.643 0.734 0.811 0.878 0.974 1.011 1.04 1.06 1.121 1.135 1.156 1.165 1.166 1.175 1.175 1.165 1.16 1.148 1.12 1.064 1.009 0.94 0.859 0.778 0.663 0.55 0.432 0.261 0.079 -0.116 -0.364 -0.652 -0.952 -1.306 -1.715 -2.201 -2.776 -3.485 -4.379 -5.37 -6.64 -8.19 -10.176 -12.721 -16.101 -20.711 -27.732 -35.139 -40.481 -44.66 -48.049 -50.908 -53.258 -55.264 -56.936 -58.561 -59.908 -61.071 -62.144 -63.118 -63.987 -64.778 -65.628 -66.387 -67.038 -67.724 -68.433 -68.998 -69.561 -70.139 -70.59 -71.039 -71.492 -71.955 -72.423 -72.738 -73.05 -73.53 -73.862 -74.19 -74.358 -74.722 -75.097 -75.477 -75.68 -75.991 -76.27 -76.486 -76.708 -77.206 -77.472 -77.733 -78.027 -78.374 -78.718 -79.216 -80.387 -5 ,24255 ,TETRA ,17557189,Fri Nov 26 09:18:46 CET,Fri Nov 26 11:28:07 CET,0.0 0.467 0.628 0.734 0.825 0.897 0.967 1.031 1.15 1.206 1.245 1.28 1.342 1.373 1.412 1.415 1.417 1.416 1.412 1.398 1.371 1.351 1.324 1.269 1.208 1.149 1.09 1.027 0.921 0.792 0.655 0.479 0.304 0.132 -0.092 -0.372 -0.667 -1.029 -1.459 -1.937 -2.488 -3.192 -4.09 -5.053 -6.27 -7.805 -9.776 -12.258 -15.6 -20.23 -27.149 -34.491 -40.032 -44.327 -47.709 -50.557 -52.917 -54.941 -56.593 -58.208 -59.62 -60.876 -62.041 -63.125 -64.105 -64.954 -65.806 -66.545 -67.186 -67.852 -68.526 -69.078 -69.641 -70.211 -70.626 -71.038 -71.492 -71.954 -72.416 -72.733 -73.049 -73.539 -73.886 -74.241 -74.416 -74.773 -75.157 -75.58 -75.799 -76.128 -76.408 -76.619 -76.84 -77.31 -77.573 -77.852 -78.158 -78.518 -78.923 -79.425 -80.862 -6 ,23520 ,TETRA ,17557190,Fri Nov 26 09:18:47 CET,Fri Nov 26 11:26:43 CET,0.0 0.78 0.949 1.096 1.215 1.308 1.388 1.46 1.591 1.641 1.687 1.734 1.805 1.835 1.872 1.879 1.898 1.907 1.9 1.884 1.849 1.833 1.813 1.763 1.703 1.63 1.556 1.484 1.387 1.279 1.159 0.993 0.83 0.654 0.414 0.129 -0.176 -0.548 -0.976 -1.462 -2.03 -2.713 -3.574 -4.515 -5.722 -7.245 -9.163 -11.608 -14.945 -19.567 -26.514 -33.855 -39.306 -43.616 -47.04 -49.856 -52.169 -54.177 -55.818 -57.393 -58.728 -59.874 -60.917 -61.862 -62.744 -63.553 -64.41 -65.176 -65.826 -66.495 -67.159 -67.707 -68.287 -68.865 -69.287 -69.731 -70.193 -70.653 -71.134 -71.456 -71.778 -72.282 -72.626 -72.975 -73.152 -73.516 -73.888 -74.276 -74.479 -74.804 -75.12 -75.352 -75.589 -76.053 -76.285 -76.546 -76.863 -77.225 -77.579 -78.0 -79.144 -7 ,10811 ,TETRA ,17557191,Fri Nov 26 09:18:49 CET,Fri Nov 26 11:27:49 CET,0.0 0.437 0.615 0.736 0.818 0.896 0.972 1.029 1.109 1.139 1.177 1.2 1.247 1.26 1.28 1.288 1.3 1.302 1.292 1.282 1.255 1.23 1.205 1.158 1.104 1.044 0.976 0.899 0.788 0.673 0.552 0.383 0.205 0.018 -0.234 -0.544 -0.849 -1.205 -1.63 -2.128 -2.695 -3.394 -4.265 -5.209 -6.434 -7.941 -9.88 -12.405 -15.815 -20.391 -27.191 -34.438 -39.897 -44.27 -47.71 -50.571 -52.966 -54.993 -56.648 -58.241 -59.582 -60.743 -61.786 -62.774 -63.732 -64.575 -65.377 -66.043 -66.617 -67.247 -67.919 -68.476 -69.047 -69.619 -70.05 -70.496 -70.971 -71.447 -71.921 -72.246 -72.581 -73.098 -73.44 -73.793 -73.975 -74.341 -74.721 -75.107 -75.308 -75.64 -75.951 -76.183 -76.434 -76.932 -77.192 -77.479 -77.809 -78.158 -78.52 -78.945 -79.88 -8 ,8082 ,TETRA ,17557192,Fri Nov 26 09:18:47 CET,Fri Nov 26 11:26:13 CET,0.0 0.415 0.608 0.731 0.818 0.906 0.986 1.044 1.128 1.155 1.182 1.208 1.262 1.28 1.315 1.348 1.359 1.354 1.339 1.324 1.298 1.285 1.268 1.232 1.183 1.112 1.032 0.948 0.845 0.73 0.595 0.421 0.238 0.051 -0.175 -0.46 -0.774 -1.154 -1.587 -2.066 -2.62 -3.302 -4.186 -5.175 -6.439 -8.016 -10.031 -12.552 -15.933 -20.642 -27.588 -34.888 -40.258 -44.454 -47.837 -50.684 -53.04 -55.047 -56.749 -58.411 -59.75 -60.929 -62.086 -63.167 -64.136 -64.997 -65.887 -66.659 -67.325 -68.013 -68.703 -69.266 -69.835 -70.406 -70.846 -71.299 -71.765 -72.236 -72.715 -73.043 -73.383 -73.893 -74.245 -74.605 -74.783 -75.136 -75.496 -75.885 -76.092 -76.43 -76.756 -76.977 -77.209 -77.71 -77.973 -78.25 -78.552 -78.888 -79.289 -79.769 -80.811 -9 ,17223 ,TETRA ,17557193,Fri Nov 26 09:18:47 CET,Fri Nov 26 11:23:20 CET,0.0 0.403 0.595 0.753 0.845 0.922 0.995 1.062 1.165 1.196 1.225 1.258 1.32 1.344 1.383 1.409 1.436 1.447 1.458 1.461 1.455 1.437 1.411 1.38 1.334 1.276 1.208 1.12 0.994 0.871 0.743 0.568 0.376 0.185 -0.047 -0.333 -0.637 -0.996 -1.41 -1.914 -2.489 -3.178 -4.071 -5.047 -6.281 -7.798 -9.729 -12.224 -15.598 -20.262 -27.283 -34.719 -40.208 -44.519 -47.988 -50.893 -53.27 -55.326 -57.033 -58.663 -60.045 -61.231 -62.311 -63.311 -64.203 -64.984 -65.79 -66.497 -67.094 -67.701 -68.363 -68.926 -69.495 -70.045 -70.429 -70.804 -71.185 -71.615 -72.058 -72.34 -72.628 -73.102 -73.447 -73.783 -73.94 -74.265 -74.628 -75.039 -75.257 -75.594 -75.879 -76.072 -76.272 -76.683 -76.902 -77.152 -77.431 -77.732 -78.091 -78.519 -79.601 -10 ,4927 ,TETRA ,17557194,Fri Nov 26 09:18:47 CET,Fri Nov 26 11:28:14 CET,0.0 0.619 0.824 0.972 1.104 1.216 1.31 1.391 1.509 1.558 1.607 1.647 1.709 1.731 1.767 1.798 1.821 1.825 1.819 1.816 1.806 1.791 1.774 1.734 1.687 1.63 1.573 1.515 1.41 1.292 1.161 0.987 0.825 0.646 0.4 0.105 -0.2 -0.563 -0.992 -1.474 -1.992 -2.633 -3.494 -4.463 -5.716 -7.24 -9.165 -11.652 -15.076 -19.81 -26.747 -34.08 -39.562 -43.888 -47.364 -50.298 -52.689 -54.702 -56.41 -58.067 -59.408 -60.558 -61.621 -62.584 -63.464 -64.245 -65.033 -65.725 -66.312 -66.902 -67.497 -67.976 -68.452 -68.941 -69.333 -69.762 -70.192 -70.624 -71.092 -71.427 -71.75 -72.186 -72.505 -72.856 -73.02 -73.34 -73.666 -73.994 -74.166 -74.451 -74.677 -74.864 -75.067 -75.525 -75.772 -76.038 -76.323 -76.623 -76.991 -77.427 -78.545 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt deleted file mode 100644 index ed779d2a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7919 ,TETRA ,17557195,Fri Nov 26 09:19:43 CET,Fri Nov 26 11:31:44 CET,0.0 2.207 2.641 2.959 3.17 3.302 3.406 3.52 3.725 3.811 3.884 3.974 4.064 4.113 4.195 4.269 4.317 4.333 4.359 4.37 4.375 4.362 4.344 4.318 4.282 4.231 4.169 4.113 4.023 3.92 3.801 3.602 3.383 3.18 2.93 2.614 2.302 1.966 1.564 1.033 0.413 -0.297 -1.213 -2.241 -3.573 -5.239 -7.345 -10.005 -13.596 -18.623 -26.107 -34.063 -39.984 -44.583 -48.269 -51.349 -53.885 -56.052 -57.836 -59.563 -61.011 -62.232 -63.346 -64.378 -65.314 -66.135 -66.969 -67.694 -68.306 -68.931 -69.556 -70.064 -70.573 -71.077 -71.462 -71.867 -72.292 -72.73 -73.182 -73.495 -73.806 -74.293 -74.646 -74.982 -75.142 -75.469 -75.789 -76.142 -76.323 -76.633 -76.923 -77.138 -77.366 -77.873 -78.133 -78.417 -78.733 -79.078 -79.494 -80.008 -81.136 -2 ,27653 ,TETRA ,17557196,Fri Nov 26 09:19:43 CET,Fri Nov 26 11:30:11 CET,0.0 2.309 2.754 3.062 3.29 3.477 3.638 3.781 3.97 4.044 4.128 4.224 4.312 4.362 4.449 4.516 4.553 4.559 4.569 4.584 4.594 4.585 4.566 4.523 4.487 4.444 4.387 4.323 4.222 4.11 3.989 3.836 3.66 3.462 3.22 2.906 2.58 2.191 1.718 1.194 0.61 -0.121 -1.077 -2.159 -3.499 -5.135 -7.278 -9.977 -13.587 -18.572 -25.959 -33.761 -39.545 -44.118 -47.777 -50.833 -53.404 -55.559 -57.266 -58.926 -60.317 -61.512 -62.611 -63.668 -64.63 -65.454 -66.334 -67.123 -67.774 -68.436 -69.123 -69.682 -70.259 -70.839 -71.279 -71.729 -72.198 -72.68 -73.169 -73.508 -73.85 -74.364 -74.713 -75.045 -75.21 -75.553 -75.912 -76.315 -76.518 -76.85 -77.181 -77.39 -77.566 -77.948 -78.166 -78.405 -78.663 -78.951 -79.291 -79.725 -81.559 -3 ,3611 ,TETRA ,17557197,Fri Nov 26 09:19:43 CET,Fri Nov 26 11:30:19 CET,0.0 1.945 2.315 2.566 2.743 2.89 3.04 3.16 3.353 3.43 3.495 3.577 3.655 3.691 3.747 3.781 3.801 3.809 3.826 3.845 3.844 3.824 3.805 3.772 3.727 3.678 3.619 3.548 3.447 3.343 3.238 3.085 2.909 2.739 2.532 2.26 1.953 1.59 1.184 0.725 0.179 -0.521 -1.426 -2.44 -3.749 -5.35 -7.397 -10.057 -13.659 -18.625 -26.004 -33.76 -39.514 -44.001 -47.592 -50.623 -53.15 -55.353 -57.142 -58.799 -60.207 -61.472 -62.668 -63.765 -64.766 -65.68 -66.615 -67.424 -68.113 -68.821 -69.548 -70.14 -70.738 -71.353 -71.833 -72.321 -72.802 -73.298 -73.806 -74.136 -74.478 -75.03 -75.388 -75.741 -75.932 -76.319 -76.72 -77.136 -77.342 -77.675 -78.005 -78.253 -78.492 -78.972 -79.242 -79.542 -79.856 -80.173 -80.545 -81.038 -82.486 -4 ,24580 ,TETRA ,17557198,Fri Nov 26 09:19:43 CET,Fri Nov 26 11:29:46 CET,0.0 2.132 2.603 2.903 3.108 3.297 3.469 3.608 3.814 3.882 3.95 4.013 4.084 4.12 4.178 4.221 4.258 4.271 4.273 4.279 4.303 4.305 4.297 4.282 4.245 4.176 4.1 4.028 3.939 3.844 3.719 3.565 3.405 3.225 2.997 2.7 2.387 2.02 1.598 1.107 0.51 -0.23 -1.157 -2.185 -3.506 -5.142 -7.255 -9.957 -13.614 -18.666 -26.254 -34.462 -40.404 -44.925 -48.611 -51.7 -54.204 -56.31 -58.036 -59.704 -61.086 -62.286 -63.4 -64.405 -65.301 -66.11 -66.984 -67.783 -68.444 -69.085 -69.733 -70.254 -70.791 -71.385 -71.829 -72.234 -72.624 -73.037 -73.462 -73.747 -74.044 -74.51 -74.819 -75.108 -75.27 -75.655 -76.058 -76.467 -76.678 -77.015 -77.34 -77.561 -77.773 -78.257 -78.531 -78.809 -79.102 -79.423 -79.795 -80.238 -81.374 -5 ,16477 ,TETRA ,17557199,Fri Nov 26 09:19:43 CET,Fri Nov 26 11:29:17 CET,0.0 1.618 1.992 2.246 2.442 2.621 2.773 2.91 3.128 3.212 3.283 3.363 3.448 3.489 3.556 3.613 3.667 3.683 3.701 3.716 3.718 3.718 3.718 3.712 3.691 3.641 3.586 3.523 3.405 3.287 3.172 3.015 2.841 2.668 2.458 2.178 1.871 1.508 1.109 0.647 0.075 -0.65 -1.594 -2.588 -3.83 -5.423 -7.507 -10.132 -13.682 -18.693 -26.12 -33.973 -39.805 -44.329 -47.983 -51.018 -53.462 -55.554 -57.278 -58.934 -60.307 -61.538 -62.74 -63.86 -64.863 -65.74 -66.64 -67.437 -68.113 -68.797 -69.488 -70.043 -70.614 -71.192 -71.627 -72.067 -72.52 -72.996 -73.493 -73.822 -74.15 -74.657 -75.002 -75.352 -75.524 -75.874 -76.24 -76.638 -76.84 -77.169 -77.47 -77.691 -77.92 -78.41 -78.666 -78.923 -79.205 -79.513 -79.853 -80.298 -82.683 -6 ,25740 ,TETRA ,17557200,Fri Nov 26 09:19:43 CET,Fri Nov 26 11:31:11 CET,0.0 2.045 2.476 2.761 2.992 3.193 3.36 3.483 3.677 3.777 3.859 3.942 4.026 4.073 4.142 4.196 4.258 4.285 4.317 4.333 4.343 4.339 4.325 4.298 4.262 4.209 4.146 4.075 3.984 3.893 3.79 3.631 3.456 3.28 3.055 2.772 2.472 2.125 1.728 1.265 0.684 -0.022 -0.888 -1.918 -3.314 -4.966 -7.031 -9.679 -13.256 -18.233 -25.707 -33.573 -39.364 -43.929 -47.567 -50.594 -53.059 -55.171 -56.945 -58.647 -60.024 -61.195 -62.28 -63.274 -64.17 -64.953 -65.745 -66.443 -67.035 -67.649 -68.291 -68.805 -69.313 -69.843 -70.267 -70.704 -71.166 -71.633 -72.103 -72.433 -72.752 -73.213 -73.515 -73.825 -73.98 -74.313 -74.697 -75.105 -75.313 -75.646 -75.917 -76.111 -76.317 -76.768 -76.999 -77.231 -77.486 -77.763 -78.057 -78.44 -79.936 -7 ,24561 ,TETRA ,17557201,Fri Nov 26 09:19:43 CET,Fri Nov 26 11:31:14 CET,0.0 1.781 2.134 2.371 2.573 2.728 2.861 2.983 3.173 3.24 3.301 3.383 3.476 3.524 3.585 3.634 3.668 3.672 3.685 3.687 3.671 3.667 3.655 3.626 3.58 3.536 3.5 3.44 3.341 3.233 3.111 2.95 2.784 2.618 2.395 2.098 1.763 1.36 0.905 0.383 -0.201 -0.894 -1.784 -2.796 -4.088 -5.693 -7.748 -10.367 -13.918 -18.866 -26.31 -34.112 -39.859 -44.335 -47.895 -50.853 -53.31 -55.436 -57.152 -58.82 -60.267 -61.544 -62.721 -63.799 -64.769 -65.604 -66.398 -67.071 -67.661 -68.302 -68.974 -69.524 -70.092 -70.666 -71.109 -71.557 -72.002 -72.44 -72.874 -73.181 -73.511 -74.008 -74.343 -74.695 -74.873 -75.237 -75.621 -76.016 -76.216 -76.543 -76.832 -77.067 -77.314 -77.806 -78.073 -78.359 -78.662 -78.999 -79.359 -79.838 -81.789 -8 ,13921 ,TETRA ,17557202,Fri Nov 26 09:19:43 CET,Fri Nov 26 11:32:06 CET,0.0 1.84 2.271 2.603 2.852 3.003 3.139 3.264 3.424 3.49 3.571 3.675 3.752 3.791 3.859 3.912 3.946 3.964 4.002 4.015 4.015 4.012 4.011 3.993 3.948 3.897 3.845 3.79 3.693 3.569 3.449 3.305 3.154 2.982 2.747 2.468 2.179 1.827 1.41 0.916 0.332 -0.398 -1.334 -2.347 -3.637 -5.223 -7.24 -9.802 -13.309 -18.281 -25.724 -33.533 -39.285 -43.81 -47.403 -50.494 -53.137 -55.415 -57.315 -59.086 -60.497 -61.725 -62.866 -63.875 -64.764 -65.565 -66.387 -67.1 -67.692 -68.304 -68.952 -69.508 -70.098 -70.688 -71.149 -71.637 -72.124 -72.603 -73.083 -73.414 -73.753 -74.272 -74.617 -74.973 -75.162 -75.549 -75.94 -76.336 -76.536 -76.874 -77.208 -77.437 -77.668 -78.161 -78.417 -78.682 -78.951 -79.257 -79.661 -80.208 -82.236 -9 ,3411 ,TETRA ,17557203,Fri Nov 26 09:19:44 CET,Fri Nov 26 11:31:59 CET,0.0 2.028 2.434 2.686 2.893 3.033 3.158 3.286 3.488 3.569 3.64 3.726 3.797 3.828 3.902 3.972 4.013 4.021 4.037 4.051 4.075 4.073 4.052 3.999 3.935 3.868 3.806 3.73 3.62 3.51 3.382 3.209 3.036 2.858 2.622 2.321 1.996 1.621 1.195 0.69 0.09 -0.653 -1.615 -2.669 -3.988 -5.594 -7.682 -10.376 -14.024 -19.109 -26.61 -34.512 -40.372 -44.896 -48.472 -51.495 -53.973 -56.094 -57.848 -59.501 -60.877 -62.061 -63.136 -64.188 -65.222 -66.125 -67.024 -67.804 -68.466 -69.148 -69.838 -70.39 -70.946 -71.528 -71.976 -72.434 -72.897 -73.361 -73.842 -74.166 -74.498 -75.014 -75.369 -75.73 -75.912 -76.289 -76.688 -77.103 -77.304 -77.636 -77.939 -78.15 -78.357 -78.762 -78.995 -79.271 -79.587 -79.937 -80.322 -80.863 -82.727 -10 ,7063 ,TETRA ,17557204,Fri Nov 26 09:19:43 CET,Fri Nov 26 11:32:55 CET,0.0 2.292 2.704 2.942 3.123 3.279 3.4 3.49 3.664 3.748 3.824 3.924 4.019 4.066 4.114 4.162 4.209 4.224 4.249 4.278 4.285 4.275 4.275 4.275 4.247 4.195 4.148 4.093 3.989 3.877 3.773 3.623 3.451 3.275 3.044 2.759 2.465 2.101 1.644 1.085 0.474 -0.229 -1.148 -2.206 -3.557 -5.18 -7.301 -10.049 -13.674 -18.652 -26.097 -33.969 -39.798 -44.39 -48.033 -51.095 -53.646 -55.813 -57.546 -59.203 -60.612 -61.829 -62.955 -63.997 -64.94 -65.769 -66.606 -67.343 -67.97 -68.607 -69.281 -69.826 -70.347 -70.875 -71.282 -71.692 -72.104 -72.522 -72.965 -73.265 -73.558 -74.011 -74.325 -74.644 -74.804 -75.136 -75.484 -75.865 -76.065 -76.388 -76.678 -76.883 -77.095 -77.555 -77.784 -78.014 -78.291 -78.622 -78.961 -79.401 -81.724 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt deleted file mode 100644 index 581fb45e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10211 ,TETRA ,17557205,Fri Nov 26 09:19:44 CET,Fri Nov 26 11:27:36 CET,0.0 0.454 0.654 0.801 0.928 1.045 1.127 1.192 1.308 1.359 1.402 1.446 1.522 1.563 1.636 1.694 1.751 1.774 1.816 1.859 1.922 1.967 1.995 2.012 2.031 2.057 2.077 2.095 2.107 2.101 2.09 2.076 2.059 2.036 1.993 1.923 1.862 1.798 1.707 1.596 1.444 1.26 1.019 0.726 0.353 -0.159 -0.888 -1.865 -3.217 -5.196 -8.254 -11.482 -13.961 -16.001 -17.691 -19.139 -20.361 -21.43 -22.326 -23.179 -23.895 -24.526 -25.107 -25.642 -26.122 -26.548 -26.996 -27.389 -27.731 -28.087 -28.443 -28.731 -29.032 -29.346 -29.573 -29.804 -30.047 -30.289 -30.539 -30.723 -30.9 -31.142 -31.318 -31.512 -31.611 -31.819 -32.028 -32.247 -32.355 -32.525 -32.694 -32.82 -32.949 -33.24 -33.393 -33.552 -33.713 -33.875 -34.076 -34.36 -34.854 -2 ,32441 ,TETRA ,17557206,Fri Nov 26 09:20:43 CET,Fri Nov 26 11:27:39 CET,0.0 0.449 0.609 0.727 0.841 0.952 1.029 1.076 1.164 1.219 1.282 1.361 1.441 1.467 1.516 1.581 1.637 1.662 1.699 1.727 1.77 1.809 1.853 1.894 1.924 1.944 1.965 1.981 1.994 1.997 1.995 1.989 1.983 1.972 1.942 1.899 1.85 1.779 1.673 1.532 1.374 1.181 0.894 0.549 0.114 -0.397 -1.093 -2.012 -3.293 -5.16 -8.122 -11.458 -13.998 -16.066 -17.778 -19.23 -20.454 -21.555 -22.46 -23.328 -24.057 -24.691 -25.271 -25.792 -26.267 -26.698 -27.152 -27.543 -27.881 -28.234 -28.588 -28.879 -29.171 -29.471 -29.695 -29.912 -30.136 -30.376 -30.631 -30.799 -30.962 -31.227 -31.418 -31.616 -31.718 -31.929 -32.153 -32.378 -32.49 -32.68 -32.856 -32.98 -33.121 -33.414 -33.555 -33.706 -33.876 -34.075 -34.282 -34.535 -35.013 -3 ,4286 ,TETRA ,17557207,Fri Nov 26 09:20:42 CET,Fri Nov 26 11:30:42 CET,0.0 0.521 0.665 0.77 0.866 0.953 1.023 1.081 1.162 1.205 1.256 1.3 1.367 1.404 1.476 1.529 1.575 1.598 1.641 1.676 1.723 1.741 1.747 1.756 1.782 1.806 1.814 1.815 1.812 1.812 1.819 1.82 1.818 1.807 1.769 1.692 1.621 1.562 1.488 1.385 1.256 1.075 0.797 0.502 0.101 -0.451 -1.206 -2.208 -3.596 -5.562 -8.62 -12.047 -14.653 -16.748 -18.434 -19.853 -21.058 -22.126 -23.021 -23.868 -24.572 -25.21 -25.808 -26.353 -26.844 -27.286 -27.754 -28.164 -28.502 -28.841 -29.183 -29.467 -29.753 -30.039 -30.276 -30.521 -30.752 -30.983 -31.233 -31.404 -31.58 -31.846 -32.029 -32.218 -32.308 -32.498 -32.699 -32.914 -33.027 -33.211 -33.383 -33.506 -33.626 -33.874 -34.026 -34.19 -34.36 -34.55 -34.755 -35.01 -36.019 -4 ,1139 ,TETRA ,17557208,Fri Nov 26 09:20:43 CET,Fri Nov 26 11:29:05 CET,0.0 0.501 0.696 0.847 0.951 1.033 1.113 1.179 1.282 1.342 1.396 1.468 1.553 1.601 1.693 1.768 1.83 1.862 1.923 1.963 2.014 2.062 2.098 2.14 2.182 2.2 2.219 2.241 2.259 2.275 2.287 2.301 2.318 2.311 2.284 2.231 2.164 2.094 1.997 1.877 1.752 1.57 1.309 0.994 0.551 -0.004 -0.72 -1.677 -3.034 -4.973 -8.021 -11.433 -14.107 -16.266 -17.995 -19.444 -20.649 -21.696 -22.566 -23.406 -24.131 -24.76 -25.321 -25.851 -26.334 -26.76 -27.205 -27.605 -27.937 -28.27 -28.613 -28.895 -29.188 -29.495 -29.726 -29.961 -30.207 -30.46 -30.714 -30.877 -31.043 -31.316 -31.497 -31.679 -31.773 -31.967 -32.175 -32.405 -32.523 -32.706 -32.889 -33.013 -33.141 -33.402 -33.547 -33.704 -33.861 -34.031 -34.212 -34.491 -35.139 -5 ,2311 ,TETRA ,17557209,Fri Nov 26 09:20:42 CET,Fri Nov 26 11:10:50 CET,0.0 0.329 0.472 0.59 0.704 0.802 0.861 0.927 1.051 1.099 1.139 1.166 1.229 1.265 1.322 1.357 1.394 1.423 1.481 1.514 1.559 1.587 1.617 1.656 1.668 1.678 1.691 1.701 1.704 1.689 1.675 1.673 1.673 1.669 1.649 1.601 1.536 1.46 1.374 1.265 1.122 0.928 0.665 0.366 -0.041 -0.57 -1.278 -2.229 -3.583 -5.555 -8.61 -11.974 -14.559 -16.647 -18.37 -19.823 -21.043 -22.134 -23.029 -23.877 -24.605 -25.232 -25.802 -26.327 -26.809 -27.25 -27.7 -28.086 -28.408 -28.746 -29.101 -29.388 -29.68 -29.978 -30.199 -30.421 -30.654 -30.895 -31.144 -31.319 -31.489 -31.737 -31.915 -32.098 -32.189 -32.376 -32.575 -32.803 -32.93 -33.119 -33.284 -33.405 -33.535 -33.818 -33.966 -34.128 -34.307 -34.472 -34.651 -34.892 -35.637 -6 ,4720 ,TETRA ,17557210,Fri Nov 26 09:20:42 CET,Fri Nov 26 11:09:56 CET,0.0 0.408 0.576 0.716 0.832 0.939 1.025 1.105 1.244 1.308 1.383 1.465 1.541 1.583 1.652 1.712 1.762 1.786 1.844 1.903 1.98 2.026 2.06 2.11 2.168 2.206 2.229 2.249 2.272 2.294 2.312 2.314 2.295 2.276 2.246 2.19 2.142 2.073 1.965 1.837 1.692 1.519 1.263 0.943 0.523 -0.03 -0.78 -1.741 -3.077 -4.979 -7.986 -11.339 -13.866 -15.898 -17.571 -19.028 -20.251 -21.305 -22.196 -23.055 -23.776 -24.39 -24.948 -25.475 -25.957 -26.387 -26.848 -27.256 -27.586 -27.92 -28.268 -28.55 -28.837 -29.137 -29.364 -29.591 -29.825 -30.078 -30.335 -30.507 -30.679 -30.949 -31.154 -31.352 -31.454 -31.667 -31.882 -32.098 -32.209 -32.39 -32.563 -32.695 -32.837 -33.152 -33.305 -33.467 -33.645 -33.838 -34.04 -34.312 -34.955 -7 ,6667 ,TETRA ,17557211,Fri Nov 26 09:20:42 CET,Fri Nov 26 11:25:27 CET,0.0 0.433 0.611 0.766 0.902 1.012 1.102 1.168 1.285 1.337 1.386 1.44 1.514 1.555 1.621 1.676 1.726 1.749 1.806 1.863 1.934 1.974 2.006 2.042 2.075 2.108 2.132 2.149 2.17 2.182 2.2 2.227 2.224 2.207 2.189 2.152 2.096 2.027 1.948 1.85 1.7 1.49 1.207 0.884 0.458 -0.102 -0.837 -1.828 -3.204 -5.126 -8.078 -11.426 -14.048 -16.178 -17.903 -19.358 -20.585 -21.652 -22.542 -23.414 -24.157 -24.81 -25.405 -25.943 -26.424 -26.847 -27.285 -27.672 -28.009 -28.345 -28.694 -28.993 -29.289 -29.583 -29.808 -30.037 -30.265 -30.503 -30.748 -30.912 -31.079 -31.334 -31.512 -31.697 -31.787 -31.972 -32.162 -32.357 -32.467 -32.646 -32.812 -32.931 -33.047 -33.287 -33.425 -33.585 -33.759 -33.932 -34.084 -34.267 -34.585 -8 ,24375 ,TETRA ,17557212,Fri Nov 26 09:20:42 CET,Fri Nov 26 11:10:57 CET,0.0 0.429 0.62 0.731 0.815 0.892 0.97 1.053 1.225 1.3 1.362 1.43 1.515 1.567 1.644 1.69 1.736 1.765 1.808 1.846 1.914 1.952 1.985 2.029 2.059 2.095 2.133 2.168 2.205 2.226 2.239 2.241 2.239 2.227 2.203 2.156 2.097 2.026 1.921 1.799 1.659 1.472 1.233 0.945 0.536 -0.009 -0.725 -1.662 -2.993 -4.893 -7.856 -11.23 -13.863 -15.984 -17.721 -19.194 -20.42 -21.471 -22.336 -23.175 -23.869 -24.462 -25.027 -25.571 -26.06 -26.487 -26.923 -27.304 -27.633 -27.968 -28.316 -28.61 -28.906 -29.197 -29.423 -29.663 -29.912 -30.162 -30.407 -30.569 -30.744 -31.012 -31.187 -31.372 -31.465 -31.656 -31.851 -32.044 -32.148 -32.331 -32.506 -32.635 -32.755 -32.988 -33.145 -33.317 -33.469 -33.638 -33.841 -34.104 -34.894 -9 ,24690 ,TETRA ,17557213,Fri Nov 26 09:20:43 CET,Fri Nov 26 11:22:21 CET,0.0 0.621 0.786 0.937 1.042 1.12 1.194 1.27 1.411 1.463 1.514 1.554 1.619 1.649 1.715 1.771 1.807 1.828 1.867 1.904 1.963 1.996 2.027 2.063 2.096 2.128 2.163 2.196 2.231 2.256 2.266 2.264 2.249 2.224 2.189 2.152 2.095 2.013 1.908 1.766 1.593 1.386 1.121 0.822 0.427 -0.112 -0.848 -1.819 -3.163 -5.133 -8.221 -11.636 -14.287 -16.434 -18.163 -19.587 -20.795 -21.884 -22.801 -23.689 -24.43 -25.059 -25.645 -26.185 -26.685 -27.138 -27.594 -27.987 -28.322 -28.669 -29.024 -29.311 -29.613 -29.917 -30.152 -30.392 -30.627 -30.882 -31.137 -31.303 -31.473 -31.742 -31.932 -32.131 -32.229 -32.426 -32.631 -32.844 -32.954 -33.133 -33.307 -33.428 -33.564 -33.88 -34.032 -34.177 -34.318 -34.46 -34.661 -34.975 -35.497 -10 ,31624 ,TETRA ,17557214,Fri Nov 26 09:20:43 CET,Fri Nov 26 11:22:32 CET,0.0 0.331 0.463 0.583 0.691 0.792 0.863 0.913 1.001 1.046 1.089 1.141 1.208 1.237 1.297 1.359 1.424 1.45 1.5 1.556 1.62 1.649 1.67 1.689 1.704 1.725 1.748 1.764 1.777 1.788 1.787 1.778 1.769 1.759 1.758 1.736 1.68 1.614 1.514 1.386 1.236 1.045 0.777 0.45 0.025 -0.52 -1.224 -2.157 -3.486 -5.387 -8.419 -11.858 -14.463 -16.517 -18.217 -19.678 -20.892 -21.939 -22.821 -23.686 -24.408 -25.025 -25.59 -26.125 -26.638 -27.094 -27.54 -27.931 -28.264 -28.598 -28.934 -29.214 -29.506 -29.801 -30.033 -30.279 -30.53 -30.787 -31.061 -31.254 -31.447 -31.731 -31.918 -32.118 -32.235 -32.472 -32.697 -32.942 -33.063 -33.236 -33.409 -33.545 -33.676 -33.937 -34.085 -34.241 -34.395 -34.584 -34.771 -35.032 -35.579 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt deleted file mode 100644 index a3d7babf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5097 ,TETRA ,17557215,Fri Nov 26 09:20:44 CET,Fri Nov 26 11:36:40 CET,0.0 0.325 0.491 0.623 0.699 0.77 0.861 0.938 1.079 1.145 1.2 1.272 1.351 1.395 1.496 1.569 1.626 1.661 1.733 1.793 1.872 1.925 1.974 2.042 2.113 2.172 2.23 2.293 2.37 2.441 2.501 2.559 2.593 2.618 2.654 2.687 2.708 2.733 2.761 2.758 2.727 2.681 2.6 2.487 2.314 2.056 1.695 1.196 0.414 -0.819 -2.754 -4.997 -6.833 -8.38 -9.691 -10.829 -11.765 -12.575 -13.265 -13.94 -14.512 -15.004 -15.456 -15.874 -16.252 -16.596 -16.953 -17.275 -17.547 -17.823 -18.107 -18.346 -18.586 -18.821 -18.999 -19.165 -19.333 -19.53 -19.735 -19.873 -20.018 -20.239 -20.39 -20.539 -20.612 -20.778 -20.946 -21.11 -21.208 -21.37 -21.508 -21.611 -21.725 -21.964 -22.088 -22.2 -22.327 -22.48 -22.638 -22.815 -23.113 -2 ,5499 ,TETRA ,17557216,Fri Nov 26 09:20:44 CET,Fri Nov 26 11:36:10 CET,0.0 0.495 0.721 0.863 0.952 1.027 1.102 1.17 1.311 1.369 1.421 1.492 1.565 1.602 1.678 1.745 1.803 1.828 1.883 1.945 2.019 2.059 2.099 2.154 2.212 2.274 2.325 2.364 2.409 2.451 2.49 2.527 2.559 2.59 2.612 2.635 2.658 2.657 2.648 2.633 2.585 2.517 2.421 2.3 2.123 1.844 1.449 0.937 0.145 -1.09 -3.067 -5.345 -7.195 -8.735 -9.981 -11.052 -11.982 -12.783 -13.464 -14.117 -14.651 -15.13 -15.59 -16.027 -16.427 -16.796 -17.166 -17.485 -17.756 -18.026 -18.299 -18.53 -18.764 -18.99 -19.164 -19.348 -19.541 -19.748 -19.954 -20.083 -20.224 -20.448 -20.595 -20.738 -20.814 -20.976 -21.129 -21.284 -21.361 -21.501 -21.638 -21.728 -21.81 -21.999 -22.109 -22.224 -22.358 -22.525 -22.681 -22.827 -23.137 -3 ,31726 ,TETRA ,17557217,Fri Nov 26 09:20:44 CET,Fri Nov 26 11:31:53 CET,0.0 0.204 0.33 0.45 0.58 0.689 0.781 0.872 1.017 1.077 1.137 1.217 1.313 1.372 1.472 1.565 1.647 1.682 1.75 1.82 1.91 1.967 2.024 2.091 2.149 2.206 2.263 2.317 2.383 2.44 2.476 2.507 2.537 2.576 2.621 2.651 2.668 2.679 2.667 2.645 2.616 2.548 2.45 2.353 2.214 1.986 1.616 1.084 0.274 -0.926 -2.826 -5.111 -6.99 -8.534 -9.833 -10.965 -11.922 -12.763 -13.445 -14.096 -14.659 -15.15 -15.598 -16.024 -16.415 -16.761 -17.124 -17.453 -17.724 -17.999 -18.282 -18.517 -18.761 -19.009 -19.193 -19.385 -19.579 -19.776 -19.981 -20.109 -20.241 -20.452 -20.601 -20.757 -20.835 -21.001 -21.167 -21.327 -21.407 -21.547 -21.66 -21.748 -21.845 -22.061 -22.178 -22.278 -22.387 -22.505 -22.651 -22.823 -23.33 -4 ,1862 ,TETRA ,17557218,Fri Nov 26 09:20:43 CET,Fri Nov 26 11:33:32 CET,0.0 0.303 0.534 0.675 0.811 0.939 1.031 1.12 1.274 1.337 1.397 1.463 1.552 1.602 1.682 1.77 1.842 1.874 1.935 1.996 2.096 2.153 2.206 2.292 2.363 2.418 2.47 2.513 2.564 2.615 2.667 2.72 2.755 2.789 2.834 2.862 2.865 2.869 2.876 2.869 2.838 2.775 2.702 2.614 2.426 2.137 1.732 1.153 0.286 -0.994 -3.047 -5.451 -7.331 -8.877 -10.184 -11.28 -12.204 -13.035 -13.725 -14.401 -14.982 -15.49 -15.964 -16.397 -16.791 -17.146 -17.507 -17.813 -18.079 -18.368 -18.654 -18.886 -19.126 -19.37 -19.55 -19.736 -19.926 -20.122 -20.326 -20.469 -20.62 -20.849 -21.011 -21.188 -21.282 -21.472 -21.662 -21.848 -21.944 -22.097 -22.226 -22.334 -22.442 -22.66 -22.788 -22.927 -23.067 -23.192 -23.324 -23.527 -23.911 -5 ,17934 ,TETRA ,17557219,Fri Nov 26 09:20:44 CET,Fri Nov 26 11:31:51 CET,0.0 0.529 0.705 0.877 1.023 1.144 1.254 1.322 1.428 1.483 1.545 1.641 1.733 1.78 1.861 1.943 2.028 2.07 2.142 2.2 2.287 2.344 2.399 2.461 2.504 2.547 2.592 2.631 2.678 2.725 2.75 2.773 2.816 2.866 2.918 2.953 2.961 2.976 2.985 2.969 2.942 2.878 2.76 2.599 2.38 2.126 1.77 1.229 0.424 -0.772 -2.736 -5.063 -6.882 -8.403 -9.712 -10.833 -11.769 -12.589 -13.284 -13.946 -14.499 -14.988 -15.446 -15.869 -16.261 -16.624 -16.985 -17.289 -17.552 -17.843 -18.152 -18.397 -18.633 -18.871 -19.058 -19.249 -19.441 -19.643 -19.867 -20.017 -20.162 -20.388 -20.546 -20.71 -20.791 -20.961 -21.151 -21.353 -21.447 -21.598 -21.735 -21.837 -21.939 -22.156 -22.274 -22.404 -22.541 -22.673 -22.817 -23.005 -23.644 -6 ,23516 ,TETRA ,17557220,Fri Nov 26 09:21:43 CET,Fri Nov 26 11:28:18 CET,0.0 0.464 0.61 0.685 0.759 0.842 0.93 1.005 1.134 1.193 1.252 1.347 1.428 1.472 1.57 1.648 1.728 1.767 1.847 1.926 2.017 2.067 2.123 2.213 2.296 2.371 2.433 2.487 2.553 2.61 2.648 2.69 2.74 2.783 2.824 2.859 2.879 2.884 2.883 2.87 2.84 2.771 2.671 2.546 2.349 2.09 1.72 1.203 0.418 -0.775 -2.728 -5.1 -7.021 -8.54 -9.791 -10.87 -11.794 -12.609 -13.271 -13.931 -14.495 -14.993 -15.478 -15.919 -16.318 -16.684 -17.059 -17.375 -17.633 -17.89 -18.152 -18.368 -18.596 -18.837 -19.025 -19.223 -19.42 -19.627 -19.834 -19.974 -20.12 -20.341 -20.499 -20.663 -20.744 -20.906 -21.063 -21.225 -21.321 -21.482 -21.615 -21.707 -21.81 -22.04 -22.158 -22.286 -22.428 -22.58 -22.756 -22.941 -23.128 -7 ,27614 ,TETRA ,17557221,Fri Nov 26 09:21:43 CET,Fri Nov 26 11:31:43 CET,0.0 0.448 0.636 0.77 0.908 1.023 1.123 1.217 1.381 1.451 1.513 1.588 1.669 1.71 1.787 1.871 1.947 1.986 2.06 2.111 2.194 2.255 2.313 2.403 2.485 2.55 2.61 2.666 2.732 2.777 2.805 2.841 2.876 2.905 2.934 2.96 2.986 3.028 3.062 3.068 3.076 3.071 3.004 2.892 2.737 2.49 2.104 1.597 0.777 -0.572 -2.661 -4.997 -6.864 -8.374 -9.624 -10.692 -11.609 -12.414 -13.073 -13.727 -14.299 -14.804 -15.278 -15.708 -16.101 -16.467 -16.839 -17.151 -17.407 -17.672 -17.949 -18.177 -18.403 -18.625 -18.799 -18.987 -19.184 -19.382 -19.581 -19.712 -19.848 -20.059 -20.202 -20.352 -20.428 -20.578 -20.747 -20.92 -21.01 -21.165 -21.291 -21.383 -21.495 -21.738 -21.87 -22.007 -22.143 -22.303 -22.459 -22.617 -22.933 -8 ,2727 ,TETRA ,17557222,Fri Nov 26 09:21:44 CET,Fri Nov 26 11:32:10 CET,0.0 0.449 0.66 0.826 0.981 1.109 1.205 1.285 1.429 1.49 1.55 1.643 1.736 1.788 1.88 1.965 2.038 2.073 2.137 2.19 2.274 2.326 2.378 2.458 2.523 2.581 2.642 2.699 2.761 2.814 2.854 2.903 2.95 2.981 3.016 3.057 3.075 3.088 3.095 3.083 3.065 3.038 2.981 2.883 2.716 2.476 2.145 1.659 0.882 -0.351 -2.453 -4.87 -6.736 -8.251 -9.52 -10.608 -11.517 -12.325 -13.008 -13.685 -14.255 -14.748 -15.207 -15.632 -16.028 -16.388 -16.742 -17.039 -17.303 -17.577 -17.866 -18.115 -18.37 -18.617 -18.799 -18.984 -19.179 -19.378 -19.578 -19.719 -19.861 -20.081 -20.231 -20.387 -20.468 -20.632 -20.809 -21.007 -21.102 -21.247 -21.387 -21.498 -21.603 -21.811 -21.914 -22.034 -22.163 -22.298 -22.443 -22.588 -22.805 -9 ,32553 ,TETRA ,17557223,Fri Nov 26 09:21:43 CET,Fri Nov 26 11:35:36 CET,0.0 0.366 0.533 0.698 0.82 0.913 0.991 1.062 1.205 1.271 1.327 1.405 1.489 1.536 1.64 1.721 1.776 1.81 1.885 1.953 2.043 2.099 2.157 2.24 2.317 2.385 2.439 2.485 2.535 2.576 2.627 2.681 2.704 2.732 2.776 2.826 2.849 2.844 2.834 2.805 2.771 2.768 2.729 2.617 2.479 2.268 1.905 1.346 0.518 -0.703 -2.702 -5.086 -6.977 -8.508 -9.8 -10.926 -11.873 -12.706 -13.4 -14.083 -14.662 -15.158 -15.614 -16.039 -16.43 -16.792 -17.169 -17.484 -17.745 -18.013 -18.292 -18.526 -18.763 -19.006 -19.193 -19.387 -19.577 -19.773 -19.967 -20.097 -20.24 -20.456 -20.594 -20.732 -20.808 -20.974 -21.134 -21.305 -21.397 -21.551 -21.704 -21.819 -21.94 -22.174 -22.3 -22.431 -22.564 -22.714 -22.862 -23.067 -23.464 -10 ,24569 ,TETRA ,17557224,Fri Nov 26 09:21:43 CET,Fri Nov 26 11:31:47 CET,0.0 0.411 0.555 0.673 0.771 0.853 0.95 1.044 1.18 1.233 1.29 1.385 1.466 1.5 1.591 1.679 1.754 1.797 1.865 1.925 2.036 2.109 2.174 2.263 2.332 2.398 2.47 2.528 2.596 2.648 2.682 2.729 2.78 2.81 2.839 2.872 2.898 2.902 2.895 2.896 2.879 2.83 2.728 2.605 2.448 2.208 1.85 1.335 0.549 -0.647 -2.676 -5.072 -6.955 -8.475 -9.733 -10.842 -11.776 -12.581 -13.268 -13.923 -14.469 -14.963 -15.446 -15.879 -16.261 -16.622 -16.995 -17.322 -17.606 -17.895 -18.177 -18.414 -18.659 -18.891 -19.07 -19.267 -19.471 -19.669 -19.871 -20.019 -20.177 -20.407 -20.554 -20.703 -20.778 -20.925 -21.084 -21.26 -21.348 -21.499 -21.648 -21.746 -21.844 -22.04 -22.155 -22.292 -22.425 -22.561 -22.742 -22.974 -23.412 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index 16c77228..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,23327 ,TETRA ,17557228,Fri Nov 26 09:22:45 CET,Fri Nov 26 11:46:56 CET,0.0 6.252 6.89 7.323 7.721 8.085 8.393 8.643 9.086 9.296 9.497 9.753 10.048 10.233 10.574 10.886 11.18 11.315 11.59 11.85 12.226 12.479 12.725 13.052 13.344 13.635 13.921 14.203 14.573 14.918 15.253 15.674 16.058 16.418 16.868 17.361 17.82 18.325 18.849 19.396 19.943 20.514 21.175 21.819 22.531 23.291 24.118 25.022 25.878 26.565 27.133 26.754 25.807 24.873 23.995 23.112 22.182 21.219 20.322 19.438 18.682 17.987 17.313 16.696 16.135 15.633 15.138 14.729 14.337 13.875 13.394 12.998 12.599 12.155 11.806 11.473 11.13 10.773 10.402 10.138 9.854 9.392 9.06 8.726 8.561 8.219 7.863 7.491 7.297 6.958 6.623 6.383 6.136 5.609 5.315 4.99 4.613 4.162 3.644 3.03 -0.71 -5 ,32023 ,TETRA ,17557229,Fri Nov 26 09:22:44 CET,Fri Nov 26 11:49:12 CET,0.0 7.541 8.006 8.345 8.642 8.913 9.157 9.387 9.829 10.045 10.248 10.513 10.8 10.971 11.282 11.553 11.811 11.933 12.168 12.397 12.729 12.941 13.174 13.543 13.869 14.151 14.408 14.651 14.965 15.268 15.547 15.879 16.193 16.5 16.864 17.243 17.589 17.974 18.385 18.829 19.293 19.788 20.361 20.917 21.506 22.114 22.767 23.458 24.103 24.595 24.987 24.686 23.658 22.541 21.633 20.802 20.03 19.263 18.557 17.837 17.207 16.653 16.156 15.631 15.08 14.612 14.141 13.71 13.329 12.919 12.5 12.152 11.811 11.469 11.194 10.906 10.601 10.276 9.927 9.691 9.433 9.015 8.735 8.434 8.28 7.958 7.598 7.225 7.033 6.697 6.399 6.199 5.978 5.439 5.089 4.691 4.25 3.732 3.168 2.452 -6.274 -6 ,17199 ,TETRA ,17557230,Fri Nov 26 09:22:47 CET,Fri Nov 26 11:49:14 CET,0.0 6.88 7.432 7.881 8.298 8.632 8.933 9.217 9.657 9.841 10.023 10.254 10.537 10.711 11.041 11.332 11.58 11.694 11.939 12.178 12.498 12.693 12.875 13.154 13.419 13.66 13.898 14.131 14.413 14.675 14.93 15.231 15.525 15.815 16.13 16.475 16.809 17.178 17.594 18.013 18.441 18.92 19.468 20.012 20.594 21.235 21.956 22.674 23.366 24.006 24.471 24.25 23.735 23.189 22.481 21.708 20.974 20.225 19.559 18.878 18.259 17.67 17.103 16.523 15.941 15.422 14.871 14.357 13.912 13.438 12.933 12.509 12.05 11.601 11.26 10.907 10.525 10.099 9.671 9.372 9.062 8.607 8.297 7.94 7.759 7.385 6.988 6.567 6.347 6.001 5.591 5.29 4.975 4.29 3.923 3.53 3.049 2.44 1.697 0.747 nan -8 ,9217 ,TETRA ,17557232,Fri Nov 26 09:22:45 CET,Fri Nov 26 11:45:22 CET,0.0 5.355 6.505 7.059 7.44 7.749 8.031 8.297 8.784 9.004 9.205 9.458 9.728 9.882 10.179 10.462 10.733 10.866 11.133 11.376 11.717 11.945 12.16 12.45 12.711 12.969 13.222 13.468 13.799 14.127 14.441 14.81 15.157 15.485 15.901 16.374 16.801 17.237 17.709 18.218 18.719 19.282 19.929 20.558 21.288 22.107 22.983 23.877 24.773 25.63 26.265 26.149 25.617 24.826 23.887 22.905 21.948 21.068 20.305 19.494 18.776 18.133 17.499 16.938 16.479 16.02 15.497 15.016 14.607 14.194 13.728 13.336 12.937 12.525 12.222 11.905 11.57 11.231 10.877 10.63 10.358 9.931 9.633 9.323 9.169 8.845 8.48 8.096 7.921 7.613 7.37 7.174 6.969 6.524 6.268 6.012 5.689 5.221 4.65 3.869 -5.228 -9 ,9032 ,TETRA ,17557233,Fri Nov 26 09:22:45 CET,Fri Nov 26 11:46:50 CET,0.0 8.332 8.755 9.105 9.422 9.725 10.021 10.296 10.755 10.962 11.149 11.373 11.656 11.825 12.155 12.462 12.746 12.878 13.142 13.396 13.736 13.953 14.165 14.464 14.748 15.042 15.348 15.645 15.989 16.293 16.596 16.97 17.345 17.681 18.034 18.426 18.791 19.204 19.639 20.098 20.588 21.104 21.733 22.388 23.09 23.83 24.631 25.48 26.439 27.328 27.838 27.677 27.17 26.484 25.684 24.836 24.052 23.331 22.668 21.983 21.399 20.869 20.355 19.871 19.424 18.988 18.531 18.138 17.79 17.433 17.053 16.724 16.379 16.019 15.727 15.418 15.124 14.825 14.488 14.238 13.98 13.582 13.315 13.036 12.878 12.564 12.272 11.911 11.691 11.342 10.987 10.747 10.491 9.885 9.533 9.169 8.772 8.252 7.606 6.758 2.172 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index 2847f9bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,809 ,TETRA ,17557235,Fri Nov 26 09:23:44 CET,Fri Nov 26 11:49:34 CET,0.0 1.072 1.435 1.736 1.983 2.205 2.423 2.634 3.027 3.224 3.396 3.563 3.802 3.943 4.224 4.469 4.707 4.833 5.072 5.291 5.598 5.798 6.008 6.298 6.563 6.821 7.077 7.327 7.652 7.962 8.261 8.655 9.054 9.428 9.863 10.34 10.791 11.279 11.787 12.333 12.924 13.605 14.41 15.221 16.173 17.257 18.524 19.924 21.531 23.36 25.462 27.083 27.823 28.178 28.322 28.327 28.233 28.057 27.876 27.674 27.488 27.289 27.058 26.815 26.57 26.333 26.087 25.885 25.699 25.474 25.227 25.029 24.82 24.595 24.428 24.251 24.067 23.887 23.692 23.557 23.421 23.21 23.054 22.848 22.734 22.516 22.294 22.062 21.947 21.743 21.586 21.433 21.264 20.917 20.733 20.53 20.315 20.059 19.784 19.455 18.271 -2 ,7573 ,TETRA ,17557236,Fri Nov 26 09:23:44 CET,Fri Nov 26 11:50:28 CET,0.0 1.041 1.444 1.729 1.995 2.232 2.425 2.628 3.044 3.224 3.387 3.572 3.822 3.971 4.263 4.545 4.84 4.977 5.227 5.467 5.803 6.008 6.203 6.479 6.742 7.002 7.26 7.512 7.833 8.148 8.45 8.812 9.154 9.485 9.865 10.28 10.666 11.117 11.644 12.2 12.798 13.473 14.247 15.051 16.006 17.028 18.22 19.578 21.112 22.845 24.747 26.278 27.122 27.494 27.695 27.804 27.785 27.715 27.635 27.525 27.387 27.25 27.112 26.954 26.781 26.609 26.448 26.308 26.181 26.053 25.909 25.778 25.641 25.498 25.386 25.265 25.136 25.001 24.857 24.742 24.608 24.391 24.236 24.078 24.004 23.848 23.671 23.481 23.374 23.168 22.992 22.842 22.71 22.412 22.226 22.027 21.812 21.524 21.161 20.723 19.421 -3 ,29098 ,TETRA ,17557237,Fri Nov 26 09:23:44 CET,Fri Nov 26 11:43:27 CET,0.0 1.214 1.615 1.89 2.139 2.362 2.56 2.729 3.06 3.23 3.401 3.637 3.92 4.075 4.351 4.616 4.881 5.022 5.302 5.566 5.946 6.191 6.438 6.772 7.054 7.328 7.602 7.862 8.198 8.516 8.814 9.184 9.534 9.865 10.262 10.715 11.148 11.626 12.141 12.676 13.24 13.87 14.591 15.326 16.196 17.201 18.401 19.752 21.31 23.104 25.208 26.787 27.596 27.987 28.2 28.304 28.244 28.134 28.009 27.845 27.712 27.587 27.428 27.265 27.112 26.95 26.765 26.607 26.457 26.281 26.08 25.908 25.753 25.594 25.456 25.308 25.16 25.009 24.854 24.743 24.622 24.421 24.28 24.144 24.078 23.931 23.768 23.598 23.505 23.295 23.155 23.007 22.822 22.431 22.23 22.035 21.799 21.539 21.249 20.862 19.65 -4 ,32149 ,TETRA ,17557238,Fri Nov 26 09:23:44 CET,Fri Nov 26 11:46:59 CET,0.0 1.47 1.9 2.198 2.46 2.711 2.919 3.084 3.421 3.591 3.744 3.939 4.203 4.366 4.707 5.004 5.273 5.416 5.707 5.981 6.345 6.559 6.759 7.047 7.342 7.636 7.923 8.193 8.517 8.819 9.113 9.469 9.83 10.186 10.601 11.077 11.545 12.066 12.615 13.201 13.811 14.491 15.312 16.156 17.129 18.199 19.385 20.737 22.432 24.394 26.54 27.972 28.647 29.019 29.147 29.147 29.075 28.929 28.753 28.577 28.386 28.196 28.025 27.839 27.643 27.458 27.28 27.13 26.987 26.816 26.613 26.438 26.277 26.098 25.943 25.784 25.601 25.408 25.204 25.069 24.952 24.784 24.654 24.49 24.403 24.237 24.073 23.891 23.792 23.604 23.486 23.352 23.209 22.944 22.799 22.634 22.464 22.277 22.077 21.826 20.569 -5 ,31795 ,TETRA ,17557239,Fri Nov 26 09:23:44 CET,Fri Nov 26 11:47:11 CET,0.0 1.26 1.734 2.114 2.407 2.653 2.861 3.049 3.418 3.6 3.784 4.037 4.309 4.459 4.74 4.992 5.234 5.348 5.602 5.862 6.215 6.419 6.597 6.861 7.123 7.382 7.638 7.879 8.197 8.504 8.802 9.18 9.54 9.886 10.3 10.786 11.275 11.814 12.388 12.959 13.505 14.107 14.816 15.565 16.46 17.435 18.577 19.933 21.572 23.452 25.363 26.648 27.345 27.674 27.85 27.974 27.989 27.973 27.941 27.823 27.681 27.548 27.409 27.255 27.062 26.871 26.655 26.473 26.34 26.192 26.031 25.889 25.751 25.605 25.473 25.323 25.165 24.963 24.72 24.587 24.441 24.181 24.024 23.865 23.776 23.588 23.379 23.146 23.036 22.842 22.718 22.586 22.455 22.197 22.045 21.852 21.625 21.368 21.062 20.665 18.959 -6 ,15550 ,TETRA ,17557240,Fri Nov 26 09:24:44 CET,Fri Nov 26 11:27:37 CET,0.0 1.152 1.597 1.945 2.235 2.439 2.649 2.878 3.272 3.448 3.62 3.823 4.086 4.23 4.511 4.788 5.044 5.16 5.389 5.63 5.98 6.19 6.388 6.67 6.922 7.169 7.424 7.662 7.972 8.294 8.616 9.005 9.373 9.736 10.17 10.647 11.099 11.614 12.153 12.711 13.34 14.059 14.863 15.674 16.604 17.614 18.869 20.378 22.161 24.122 26.273 27.87 28.627 29.061 29.238 29.259 29.213 29.131 29.03 28.827 28.611 28.431 28.258 28.067 27.861 27.655 27.43 27.246 27.069 26.866 26.665 26.512 26.353 26.166 26.004 25.819 25.623 25.418 25.202 25.062 24.908 24.639 24.459 24.287 24.194 23.973 23.731 23.494 23.378 23.156 23.004 22.894 22.778 22.516 22.358 22.182 21.985 21.758 21.506 21.178 20.208 -7 ,4607 ,TETRA ,17557241,Fri Nov 26 09:24:44 CET,Fri Nov 26 11:48:17 CET,0.0 1.122 1.474 1.76 2.05 2.317 2.52 2.679 3.013 3.183 3.325 3.474 3.718 3.849 4.11 4.353 4.583 4.7 4.951 5.204 5.551 5.761 5.954 6.215 6.48 6.749 7.003 7.253 7.594 7.917 8.209 8.574 8.948 9.311 9.704 10.121 10.525 10.953 11.437 11.957 12.485 13.109 13.867 14.619 15.467 16.393 17.452 18.671 20.091 21.738 23.61 25.003 25.719 26.124 26.331 26.405 26.388 26.343 26.275 26.16 26.035 25.897 25.746 25.569 25.387 25.239 25.078 24.902 24.734 24.536 24.317 24.132 23.935 23.738 23.574 23.391 23.211 23.033 22.842 22.706 22.577 22.385 22.236 22.057 21.966 21.799 21.628 21.447 21.359 21.157 21.011 20.891 20.768 20.469 20.297 20.124 19.944 19.699 19.383 19.004 17.898 -8 ,26383 ,TETRA ,17557242,Fri Nov 26 09:24:44 CET,Fri Nov 26 11:47:52 CET,0.0 0.775 1.078 1.302 1.532 1.771 1.974 2.151 2.496 2.652 2.798 2.979 3.236 3.375 3.651 3.913 4.163 4.287 4.533 4.768 5.082 5.278 5.472 5.739 5.984 6.233 6.476 6.701 7.006 7.308 7.589 7.921 8.261 8.605 9.02 9.51 9.978 10.49 11.061 11.667 12.306 13.027 13.885 14.729 15.69 16.817 18.088 19.405 20.91 22.798 25.025 26.647 27.417 27.693 27.784 27.852 27.872 27.842 27.741 27.564 27.365 27.18 27.012 26.824 26.644 26.502 26.359 26.204 26.05 25.897 25.73 25.567 25.38 25.176 25.018 24.846 24.679 24.524 24.347 24.214 24.074 23.868 23.73 23.581 23.505 23.329 23.123 22.931 22.835 22.639 22.555 22.458 22.35 22.122 21.971 21.77 21.484 21.165 20.816 20.328 18.003 -9 ,18402 ,TETRA ,17557243,Fri Nov 26 09:24:44 CET,Fri Nov 26 11:47:00 CET,0.0 0.958 1.284 1.571 1.841 2.062 2.243 2.44 2.801 2.963 3.124 3.292 3.545 3.691 3.964 4.212 4.442 4.549 4.771 4.987 5.292 5.488 5.682 5.949 6.213 6.485 6.765 7.047 7.386 7.716 8.035 8.412 8.778 9.136 9.544 10.015 10.483 10.979 11.511 12.085 12.705 13.4 14.185 14.993 15.948 16.982 18.14 19.469 21.063 23.027 25.253 26.788 27.512 27.805 27.941 27.99 27.979 27.938 27.856 27.741 27.608 27.472 27.355 27.232 27.102 26.968 26.817 26.661 26.498 26.309 26.116 25.958 25.787 25.596 25.434 25.276 25.135 24.993 24.821 24.7 24.58 24.379 24.227 24.06 23.978 23.798 23.602 23.374 23.245 23.022 22.838 22.692 22.546 22.238 22.074 21.877 21.637 21.359 21.051 20.719 19.801 -10 ,18783 ,TETRA ,17557244,Fri Nov 26 09:24:44 CET,Fri Nov 26 11:49:47 CET,0.0 1.687 2.214 2.617 2.965 3.246 3.463 3.658 4.038 4.22 4.413 4.672 4.955 5.099 5.349 5.577 5.784 5.89 6.106 6.318 6.621 6.814 7.01 7.302 7.575 7.837 8.096 8.344 8.662 8.981 9.285 9.634 10.003 10.372 10.77 11.203 11.615 12.096 12.635 13.215 13.865 14.635 15.519 16.404 17.403 18.455 19.706 21.135 22.787 24.719 27.012 28.685 29.416 29.687 29.757 29.758 29.704 29.644 29.545 29.409 29.259 29.068 28.879 28.716 28.553 28.387 28.218 28.057 27.913 27.776 27.624 27.473 27.314 27.159 27.031 26.891 26.748 26.603 26.445 26.339 26.225 26.024 25.878 25.727 25.653 25.493 25.32 25.15 25.062 24.876 24.785 24.687 24.577 24.343 24.199 24.038 23.861 23.663 23.381 22.949 21.364 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index 9cec0141..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17366 ,TETRA ,17557245,Fri Nov 26 09:24:44 CET,Fri Nov 26 11:53:20 CET,0.0 0.31 0.493 0.655 0.795 0.927 1.041 1.148 1.35 1.437 1.531 1.607 1.817 1.909 2.085 2.257 2.409 2.476 2.61 2.737 2.908 3.019 3.115 3.237 3.366 3.505 3.628 3.74 3.887 4.013 4.121 4.267 4.413 4.541 4.68 4.838 4.984 5.14 5.3 5.453 5.605 5.781 5.927 5.987 6.063 6.136 6.179 6.155 5.873 5.133 3.597 1.656 0.048 -1.365 -2.683 -3.874 -4.822 -5.691 -6.504 -7.307 -7.975 -8.545 -9.092 -9.611 -10.088 -10.547 -11.036 -11.445 -11.767 -12.098 -12.46 -12.75 -13.042 -13.353 -13.602 -13.862 -14.114 -14.374 -14.66 -14.857 -15.05 -15.341 -15.534 -15.756 -15.889 -16.148 -16.396 -16.665 -16.804 -17.084 -17.22 -17.371 -17.555 -17.943 -18.133 -18.339 -18.595 -18.888 -19.163 -19.44 -20.187 -2 ,31710 ,TETRA ,17557246,Fri Nov 26 09:25:44 CET,Fri Nov 26 11:29:08 CET,0.0 0.237 0.38 0.541 0.734 0.898 1.031 1.159 1.392 1.491 1.593 1.688 1.897 2.0 2.213 2.419 2.613 2.702 2.877 3.042 3.271 3.408 3.546 3.737 3.892 4.033 4.158 4.265 4.404 4.542 4.673 4.833 4.975 5.092 5.242 5.418 5.564 5.7 5.847 6.004 6.143 6.272 6.399 6.491 6.587 6.675 6.637 6.405 5.946 5.149 3.57 1.575 -0.083 -1.506 -2.803 -4.03 -5.049 -5.949 -6.73 -7.486 -8.115 -8.676 -9.207 -9.679 -10.114 -10.523 -10.958 -11.348 -11.714 -12.117 -12.523 -12.847 -13.17 -13.519 -13.777 -14.015 -14.275 -14.543 -14.822 -15.025 -15.24 -15.589 -15.816 -16.027 -16.136 -16.372 -16.613 -16.857 -16.983 -17.252 -17.426 -17.603 -17.8 -18.244 -18.491 -18.739 -19.016 -19.371 -19.752 -20.236 -21.071 -3 ,14422 ,TETRA ,17557247,Fri Nov 26 09:25:44 CET,Fri Nov 26 11:49:25 CET,0.0 0.383 0.56 0.713 0.869 1.005 1.126 1.262 1.496 1.58 1.665 1.724 1.924 1.996 2.127 2.264 2.398 2.47 2.614 2.75 2.935 3.048 3.159 3.29 3.419 3.555 3.683 3.807 3.961 4.093 4.226 4.386 4.528 4.661 4.827 5.023 5.202 5.394 5.581 5.734 5.882 6.041 6.182 6.302 6.404 6.437 6.408 6.289 5.938 5.243 3.698 1.543 -0.289 -1.835 -3.105 -4.235 -5.255 -6.187 -6.988 -7.758 -8.394 -8.967 -9.526 -10.044 -10.517 -10.938 -11.387 -11.8 -12.157 -12.53 -12.887 -13.184 -13.508 -13.843 -14.1 -14.36 -14.662 -14.967 -15.255 -15.457 -15.663 -15.96 -16.161 -16.382 -16.499 -16.752 -17.034 -17.307 -17.428 -17.697 -17.86 -18.009 -18.164 -18.521 -18.724 -18.999 -19.281 -19.506 -19.747 -20.031 -20.637 -4 ,3655 ,TETRA ,17557248,Fri Nov 26 09:25:44 CET,Fri Nov 26 11:50:40 CET,0.0 0.347 0.48 0.603 0.712 0.825 0.927 1.013 1.204 1.296 1.38 1.42 1.606 1.672 1.816 1.948 2.051 2.099 2.203 2.315 2.481 2.583 2.68 2.819 2.95 3.085 3.229 3.378 3.56 3.705 3.825 3.958 4.078 4.193 4.351 4.54 4.702 4.855 5.01 5.147 5.27 5.405 5.539 5.641 5.703 5.722 5.676 5.528 5.195 4.487 3.143 1.302 -0.304 -1.713 -2.92 -3.972 -4.913 -5.778 -6.524 -7.257 -7.877 -8.421 -8.925 -9.424 -9.869 -10.265 -10.723 -11.12 -11.437 -11.775 -12.153 -12.471 -12.788 -13.108 -13.355 -13.621 -13.9 -14.185 -14.511 -14.735 -14.947 -15.28 -15.506 -15.755 -15.887 -16.141 -16.396 -16.658 -16.795 -17.08 -17.269 -17.424 -17.581 -17.943 -18.168 -18.432 -18.7 -19.007 -19.375 -19.807 -20.725 -5 ,199 ,TETRA ,17557249,Fri Nov 26 09:25:44 CET,Fri Nov 26 11:49:57 CET,0.0 0.394 0.579 0.739 0.884 0.999 1.109 1.236 1.459 1.571 1.686 1.774 1.994 2.085 2.248 2.409 2.559 2.624 2.754 2.877 3.038 3.147 3.245 3.382 3.502 3.61 3.726 3.832 3.972 4.109 4.23 4.374 4.515 4.652 4.796 4.941 5.081 5.228 5.364 5.489 5.62 5.788 5.973 6.1 6.191 6.235 6.214 6.098 5.789 5.097 3.729 1.911 0.318 -1.144 -2.425 -3.512 -4.438 -5.317 -6.101 -6.853 -7.5 -8.055 -8.583 -9.106 -9.571 -10.003 -10.459 -10.863 -11.2 -11.523 -11.866 -12.158 -12.452 -12.76 -12.999 -13.251 -13.53 -13.819 -14.111 -14.32 -14.54 -14.871 -15.102 -15.376 -15.518 -15.772 -16.035 -16.34 -16.493 -16.792 -16.974 -17.131 -17.296 -17.657 -17.885 -18.127 -18.378 -18.681 -18.998 -19.33 -20.351 -6 ,14978 ,TETRA ,17557250,Fri Nov 26 09:25:44 CET,Fri Nov 26 11:49:40 CET,0.0 0.919 1.27 1.5 1.688 1.866 2.016 2.138 2.372 2.485 2.592 2.679 2.897 2.995 3.158 3.304 3.449 3.513 3.632 3.749 3.914 4.013 4.114 4.264 4.383 4.502 4.614 4.713 4.828 4.944 5.058 5.197 5.322 5.432 5.561 5.712 5.871 6.033 6.187 6.333 6.47 6.603 6.727 6.821 6.88 6.88 6.821 6.655 6.263 5.475 3.911 1.866 0.116 -1.394 -2.671 -3.817 -4.828 -5.718 -6.463 -7.218 -7.875 -8.439 -8.991 -9.513 -9.984 -10.425 -10.873 -11.262 -11.603 -11.977 -12.373 -12.687 -12.999 -13.319 -13.566 -13.815 -14.069 -14.355 -14.666 -14.874 -15.085 -15.423 -15.658 -15.901 -16.026 -16.279 -16.554 -16.837 -16.978 -17.26 -17.414 -17.574 -17.759 -18.172 -18.412 -18.652 -18.887 -19.198 -19.565 -20.014 -20.855 -7 ,13812 ,TETRA ,17557251,Fri Nov 26 09:26:44 CET,Fri Nov 26 11:51:21 CET,0.0 0.428 0.659 0.819 0.967 1.096 1.205 1.322 1.559 1.672 1.764 1.816 2.016 2.104 2.28 2.415 2.525 2.594 2.754 2.897 3.076 3.177 3.276 3.408 3.536 3.686 3.827 3.939 4.091 4.251 4.404 4.59 4.764 4.924 5.084 5.234 5.382 5.535 5.673 5.828 6.002 6.181 6.358 6.477 6.529 6.54 6.481 6.287 5.956 5.289 3.736 1.668 -0.067 -1.604 -2.921 -4.065 -5.075 -6.003 -6.769 -7.543 -8.202 -8.766 -9.305 -9.814 -10.285 -10.723 -11.182 -11.586 -11.941 -12.295 -12.641 -12.934 -13.242 -13.55 -13.786 -14.032 -14.301 -14.575 -14.848 -15.047 -15.257 -15.587 -15.825 -16.064 -16.179 -16.435 -16.71 -16.986 -17.137 -17.416 -17.607 -17.778 -17.95 -18.316 -18.533 -18.762 -19.005 -19.267 -19.547 -19.919 -20.713 -8 ,24190 ,TETRA ,17557252,Fri Nov 26 09:26:44 CET,Fri Nov 26 11:49:24 CET,0.0 0.547 0.789 0.994 1.149 1.268 1.379 1.475 1.658 1.764 1.872 1.972 2.178 2.26 2.419 2.57 2.703 2.766 2.888 2.996 3.152 3.25 3.344 3.484 3.638 3.802 3.938 4.049 4.176 4.296 4.431 4.615 4.792 4.942 5.086 5.236 5.386 5.547 5.693 5.827 5.984 6.14 6.262 6.389 6.506 6.557 6.524 6.358 6.013 5.314 3.864 1.992 0.334 -1.07 -2.213 -3.272 -4.186 -5.028 -5.779 -6.518 -7.14 -7.687 -8.22 -8.725 -9.182 -9.581 -10.012 -10.404 -10.734 -11.071 -11.42 -11.704 -11.998 -12.311 -12.561 -12.827 -13.098 -13.377 -13.671 -13.872 -14.076 -14.392 -14.587 -14.786 -14.901 -15.156 -15.439 -15.755 -15.908 -16.167 -16.302 -16.458 -16.62 -16.944 -17.125 -17.336 -17.559 -17.803 -18.045 -18.32 -19.167 -9 ,29158 ,TETRA ,17557253,Fri Nov 26 09:26:44 CET,Fri Nov 26 11:49:23 CET,0.0 0.309 0.499 0.649 0.797 0.96 1.13 1.291 1.558 1.656 1.728 1.763 1.964 2.066 2.282 2.463 2.607 2.671 2.787 2.897 3.068 3.167 3.27 3.42 3.545 3.665 3.784 3.899 4.045 4.182 4.298 4.428 4.566 4.684 4.816 4.975 5.124 5.288 5.454 5.601 5.733 5.833 5.918 6.006 6.071 6.103 6.048 5.877 5.541 4.839 3.426 1.478 -0.215 -1.626 -2.835 -3.894 -4.854 -5.787 -6.565 -7.309 -7.958 -8.517 -9.039 -9.541 -10.022 -10.476 -10.965 -11.418 -11.812 -12.18 -12.518 -12.807 -13.126 -13.443 -13.681 -13.93 -14.186 -14.454 -14.727 -14.916 -15.118 -15.427 -15.631 -15.842 -15.953 -16.18 -16.418 -16.667 -16.809 -17.102 -17.297 -17.452 -17.625 -18.031 -18.262 -18.518 -18.777 -19.088 -19.414 -19.723 -20.553 -10 ,27428 ,TETRA ,17557254,Fri Nov 26 09:26:45 CET,Fri Nov 26 11:53:14 CET,0.0 0.494 0.778 0.963 1.102 1.224 1.355 1.487 1.691 1.772 1.839 1.841 2.026 2.107 2.255 2.376 2.484 2.542 2.659 2.763 2.904 2.986 3.069 3.194 3.308 3.423 3.544 3.649 3.763 3.88 4.003 4.15 4.28 4.412 4.565 4.708 4.833 4.987 5.155 5.317 5.466 5.609 5.754 5.886 6.026 6.16 6.257 6.22 5.924 5.255 3.996 2.382 0.888 -0.456 -1.575 -2.62 -3.601 -4.465 -5.178 -5.917 -6.55 -7.113 -7.662 -8.169 -8.633 -9.055 -9.487 -9.866 -10.213 -10.571 -10.927 -11.225 -11.527 -11.842 -12.084 -12.325 -12.57 -12.811 -13.072 -13.288 -13.527 -13.87 -14.112 -14.38 -14.502 -14.736 -14.999 -15.293 -15.439 -15.714 -15.863 -16.009 -16.159 -16.499 -16.714 -16.955 -17.219 -17.478 -17.723 -18.068 -18.798 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index dec13942..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10955 ,KEBNE ,17132029,Sat Jan 1 17:37:14 CET,Sat Jan 1 19:38:06 CET,0.0 1.785 2.344 2.749 3.062 3.324 3.563 3.8 4.238 4.44 4.638 4.899 5.163 5.329 5.631 5.905 6.165 6.297 6.547 6.78 7.101 7.287 7.459 7.724 7.988 8.228 8.462 8.702 9.009 9.294 9.574 9.891 10.185 10.473 10.769 11.078 11.399 11.756 12.143 12.541 12.928 13.36 13.858 14.309 14.763 15.2 15.598 15.918 16.006 15.543 14.218 12.189 10.242 8.459 6.967 5.588 4.315 3.212 2.272 1.324 0.445 -0.396 -1.198 -1.95 -2.637 -3.253 -3.92 -4.529 -5.029 -5.552 -6.127 -6.617 -7.109 -7.628 -8.04 -8.459 -8.902 -9.351 -9.831 -10.16 -10.483 -10.997 -11.346 -11.718 -11.93 -12.405 -12.893 -13.371 -13.627 -14.015 -14.469 -14.786 -15.102 -15.763 -16.099 -16.432 -16.795 -17.256 -17.831 -18.501 -22.339 -2 ,24798 ,KEBNE ,17132030,Sat Jan 1 17:37:18 CET,Sat Jan 1 19:36:27 CET,0.0 1.959 2.516 2.879 3.174 3.444 3.684 3.927 4.32 4.495 4.668 4.892 5.15 5.314 5.635 5.946 6.26 6.402 6.656 6.88 7.179 7.37 7.551 7.821 8.064 8.294 8.524 8.745 9.029 9.287 9.533 9.812 10.072 10.321 10.59 10.911 11.234 11.578 11.942 12.336 12.737 13.153 13.563 13.926 14.309 14.688 15.093 15.428 15.608 15.345 14.09 11.97 10.102 8.48 7.005 5.658 4.43 3.283 2.337 1.467 0.686 -0.076 -0.776 -1.414 -2.015 -2.542 -3.088 -3.57 -3.995 -4.467 -4.973 -5.365 -5.735 -6.133 -6.457 -6.8 -7.157 -7.521 -7.899 -8.157 -8.424 -8.843 -9.131 -9.452 -9.623 -9.979 -10.348 -10.727 -10.923 -11.247 -11.539 -11.768 -12.027 -12.619 -12.954 -13.313 -13.715 -14.129 -14.631 -15.3 -19.138 -3 ,4711 ,KEBNE ,17132031,Sat Jan 1 17:37:14 CET,Sat Jan 1 19:37:53 CET,0.0 1.53 2.181 2.773 3.296 3.658 3.933 4.198 4.665 4.852 5.031 5.29 5.549 5.714 6.07 6.389 6.668 6.793 7.022 7.252 7.586 7.789 7.989 8.273 8.532 8.793 9.046 9.283 9.58 9.864 10.13 10.447 10.754 11.063 11.417 11.765 12.076 12.434 12.824 13.221 13.615 14.025 14.45 14.855 15.29 15.686 16.066 16.352 16.456 16.252 15.139 13.181 11.355 9.72 8.329 7.004 5.764 4.621 3.634 2.637 1.751 0.909 0.056 -0.755 -1.499 -2.152 -2.847 -3.495 -4.028 -4.562 -5.13 -5.6 -6.087 -6.583 -6.96 -7.352 -7.767 -8.19 -8.616 -8.92 -9.241 -9.735 -10.07 -10.436 -10.631 -11.035 -11.468 -11.906 -12.139 -12.508 -12.9 -13.169 -13.437 -14.05 -14.406 -14.774 -15.182 -15.64 -16.181 -16.911 -19.179 -4 ,22769 ,KEBNE ,17132032,Sat Jan 1 17:37:14 CET,Sat Jan 1 19:38:26 CET,0.0 1.386 1.926 2.333 2.652 2.912 3.157 3.408 3.871 4.074 4.266 4.527 4.807 4.986 5.301 5.602 5.888 6.023 6.279 6.5 6.825 7.055 7.272 7.556 7.803 8.048 8.276 8.483 8.764 9.047 9.335 9.69 9.994 10.25 10.555 10.931 11.281 11.626 11.983 12.378 12.799 13.234 13.737 14.172 14.568 14.959 15.295 15.543 15.611 15.288 13.985 11.772 9.799 8.047 6.534 5.089 3.709 2.378 1.171 -0.016 -1.068 -2.008 -2.852 -3.636 -4.357 -5.031 -5.774 -6.432 -6.985 -7.539 -8.112 -8.588 -9.088 -9.602 -9.991 -10.395 -10.835 -11.296 -11.773 -12.098 -12.43 -12.927 -13.259 -13.614 -13.815 -14.251 -14.684 -15.117 -15.325 -15.676 -16.069 -16.349 -16.647 -17.29 -17.663 -18.074 -18.523 -19.044 -19.702 -20.671 -32.077 -5 ,10850 ,KEBNE ,17132033,Sat Jan 1 17:38:15 CET,Sat Jan 1 19:39:12 CET,0.0 1.754 2.308 2.727 3.105 3.44 3.737 4.0 4.456 4.665 4.886 5.256 5.535 5.672 5.932 6.182 6.422 6.545 6.79 7.008 7.332 7.554 7.774 8.114 8.438 8.714 8.964 9.209 9.506 9.762 10.018 10.333 10.64 10.938 11.245 11.556 11.856 12.197 12.539 12.87 13.218 13.61 14.049 14.459 14.9 15.326 15.694 15.955 15.957 15.484 14.219 12.287 10.526 8.941 7.487 6.104 4.931 3.911 2.903 1.847 0.998 0.222 -0.533 -1.234 -1.9 -2.53 -3.172 -3.729 -4.238 -4.781 -5.35 -5.807 -6.272 -6.771 -7.151 -7.543 -7.928 -8.315 -8.745 -9.044 -9.343 -9.814 -10.137 -10.465 -10.646 -11.032 -11.412 -11.785 -11.99 -12.324 -12.626 -12.882 -13.176 -13.82 -14.181 -14.56 -14.997 -15.498 -16.077 -16.807 -19.531 -6 ,373 ,KEBNE ,17132034,Sat Jan 1 17:38:16 CET,Sat Jan 1 19:38:29 CET,0.0 1.889 2.509 3.009 3.407 3.765 4.098 4.397 4.925 5.142 5.353 5.666 5.952 6.145 6.479 6.772 7.061 7.209 7.464 7.661 7.95 8.171 8.406 8.746 9.057 9.311 9.539 9.762 10.062 10.356 10.619 10.928 11.234 11.514 11.822 12.154 12.465 12.795 13.117 13.468 13.858 14.246 14.635 15.007 15.376 15.75 16.101 16.306 16.338 15.857 14.361 12.303 10.355 8.629 7.116 5.791 4.614 3.492 2.543 1.578 0.719 -0.088 -0.88 -1.619 -2.291 -2.898 -3.542 -4.118 -4.627 -5.148 -5.667 -6.107 -6.589 -7.078 -7.436 -7.814 -8.222 -8.653 -9.105 -9.42 -9.732 -10.169 -10.487 -10.829 -11.005 -11.376 -11.763 -12.162 -12.366 -12.706 -13.034 -13.284 -13.565 -14.203 -14.545 -14.899 -15.294 -15.833 -16.51 -17.473 -21.42 -7 ,18003 ,KEBNE ,17132035,Sat Jan 1 17:38:15 CET,Sat Jan 1 19:39:32 CET,0.0 1.449 1.943 2.314 2.613 2.896 3.161 3.411 3.867 4.067 4.248 4.487 4.738 4.878 5.147 5.429 5.692 5.811 6.041 6.276 6.617 6.833 7.032 7.315 7.584 7.838 8.085 8.325 8.631 8.907 9.148 9.41 9.67 9.932 10.245 10.615 10.971 11.333 11.686 12.038 12.381 12.759 13.179 13.569 14.003 14.387 14.681 14.872 14.791 14.266 12.994 11.05 9.23 7.678 6.269 4.924 3.782 2.658 1.642 0.661 -0.139 -0.806 -1.48 -2.172 -2.853 -3.454 -4.059 -4.635 -5.159 -5.702 -6.271 -6.739 -7.214 -7.728 -8.136 -8.547 -8.952 -9.365 -9.831 -10.173 -10.504 -11.001 -11.346 -11.717 -11.914 -12.331 -12.774 -13.243 -13.472 -13.825 -14.227 -14.499 -14.768 -15.359 -15.714 -16.11 -16.532 -16.984 -17.469 -18.201 -21.799 -8 ,889 ,KEBNE ,17132036,Sat Jan 1 17:38:16 CET,Sat Jan 1 19:38:25 CET,0.0 2.296 2.878 3.267 3.586 3.88 4.134 4.373 4.809 5.007 5.198 5.44 5.705 5.862 6.126 6.387 6.648 6.769 6.995 7.217 7.548 7.765 7.972 8.268 8.546 8.795 9.026 9.236 9.493 9.75 10.008 10.308 10.576 10.854 11.181 11.524 11.837 12.148 12.45 12.761 13.062 13.401 13.827 14.224 14.637 15.007 15.329 15.498 15.446 15.085 13.967 12.073 10.249 8.623 6.9 5.232 3.843 2.572 1.511 0.441 -0.5 -1.334 -2.16 -2.909 -3.557 -4.163 -4.874 -5.526 -6.069 -6.636 -7.205 -7.668 -8.137 -8.656 -9.066 -9.455 -9.865 -10.307 -10.747 -11.047 -11.369 -11.868 -12.213 -12.584 -12.773 -13.146 -13.543 -13.967 -14.184 -14.529 -14.88 -15.137 -15.408 -16.003 -16.337 -16.686 -17.06 -17.522 -18.052 -18.7 -21.609 -9 ,16439 ,KEBNE ,17132037,Sat Jan 1 17:38:16 CET,Sat Jan 1 19:37:46 CET,0.0 1.785 2.461 3.02 3.457 3.83 4.155 4.456 5.002 5.253 5.505 5.866 6.167 6.364 6.732 7.087 7.397 7.529 7.774 8.022 8.378 8.598 8.813 9.11 9.401 9.685 9.966 10.239 10.585 10.912 11.206 11.557 11.886 12.171 12.483 12.842 13.213 13.603 13.993 14.408 14.814 15.223 15.681 16.128 16.589 16.992 17.387 17.721 17.802 17.585 16.681 14.793 12.918 11.231 9.695 8.335 7.12 6.026 5.104 4.186 3.422 2.772 2.111 1.404 0.695 0.024 -0.652 -1.242 -1.735 -2.232 -2.738 -3.149 -3.586 -4.041 -4.407 -4.79 -5.184 -5.591 -6.0 -6.288 -6.635 -7.219 -7.604 -7.994 -8.194 -8.602 -9.043 -9.529 -9.787 -10.184 -10.638 -10.954 -11.285 -11.943 -12.283 -12.668 -13.061 -13.483 -14.015 -14.687 -16.389 -10 ,20844 ,KEBNE ,17132038,Sat Jan 1 17:38:16 CET,Sat Jan 1 19:38:26 CET,0.0 2.384 3.022 3.405 3.768 4.113 4.429 4.736 5.308 5.551 5.765 6.031 6.277 6.451 6.81 7.128 7.43 7.567 7.824 8.067 8.385 8.587 8.784 9.097 9.427 9.729 10.0 10.234 10.502 10.767 11.024 11.32 11.604 11.861 12.164 12.561 12.946 13.326 13.717 14.108 14.479 14.898 15.362 15.744 16.174 16.607 17.032 17.377 17.403 17.093 16.11 14.352 12.571 10.939 9.541 8.264 7.127 6.078 5.163 4.244 3.435 2.722 2.091 1.528 0.987 0.468 -0.072 -0.55 -0.974 -1.451 -1.966 -2.383 -2.81 -3.261 -3.636 -4.033 -4.44 -4.892 -5.345 -5.637 -5.958 -6.5 -6.868 -7.235 -7.44 -7.877 -8.332 -8.811 -9.04 -9.391 -9.781 -10.06 -10.351 -10.998 -11.357 -11.748 -12.196 -12.668 -13.199 -13.957 -16.489 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index df86d096..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26919 ,TETRA ,17557255,Fri Nov 26 09:26:45 CET,Fri Nov 26 11:48:34 CET,0.0 1.638 1.973 2.23 2.474 2.657 2.78 2.907 3.146 3.261 3.374 3.46 3.64 3.711 3.851 3.995 4.12 4.183 4.307 4.411 4.535 4.608 4.686 4.778 4.878 4.987 5.079 5.156 5.234 5.293 5.344 5.408 5.471 5.51 5.517 5.523 5.528 5.517 5.497 5.447 5.36 5.245 5.076 4.851 4.545 4.116 3.475 2.599 1.27 -0.73 -3.918 -7.658 -10.608 -13.027 -15.035 -16.764 -18.218 -19.503 -20.589 -21.656 -22.596 -23.407 -24.168 -24.884 -25.531 -26.114 -26.712 -27.23 -27.659 -28.1 -28.563 -28.945 -29.336 -29.737 -30.045 -30.36 -30.692 -31.039 -31.399 -31.66 -31.926 -32.32 -32.579 -32.839 -32.978 -33.273 -33.59 -33.916 -34.082 -34.378 -34.594 -34.779 -34.97 -35.407 -35.689 -36.0 -36.305 -36.606 -36.923 -37.335 -38.707 -2 ,24219 ,TETRA ,17557256,Fri Nov 26 09:26:45 CET,Fri Nov 26 11:48:48 CET,0.0 1.023 1.332 1.568 1.755 1.888 1.997 2.112 2.309 2.386 2.46 2.504 2.669 2.75 2.893 3.013 3.124 3.174 3.286 3.383 3.505 3.57 3.635 3.742 3.837 3.921 3.987 4.05 4.142 4.231 4.311 4.4 4.484 4.54 4.597 4.676 4.739 4.77 4.783 4.799 4.804 4.741 4.581 4.44 4.225 3.843 3.259 2.412 1.144 -0.763 -3.88 -7.511 -10.48 -13.004 -15.113 -16.932 -18.486 -19.854 -20.994 -22.111 -23.052 -23.878 -24.661 -25.386 -26.054 -26.673 -27.326 -27.897 -28.375 -28.866 -29.368 -29.774 -30.167 -30.551 -30.866 -31.207 -31.555 -31.901 -32.252 -32.507 -32.776 -33.182 -33.48 -33.795 -33.951 -34.278 -34.616 -34.937 -35.104 -35.426 -35.669 -35.874 -36.08 -36.506 -36.772 -37.102 -37.427 -37.745 -38.143 -38.736 -40.946 -3 ,13169 ,TETRA ,17557257,Fri Nov 26 09:26:47 CET,Fri Nov 26 11:47:37 CET,0.0 0.868 1.075 1.261 1.427 1.582 1.729 1.849 2.024 2.103 2.182 2.231 2.387 2.455 2.572 2.671 2.774 2.827 2.939 3.053 3.228 3.32 3.39 3.495 3.588 3.678 3.787 3.904 4.039 4.164 4.286 4.431 4.556 4.649 4.712 4.763 4.817 4.881 4.913 4.883 4.849 4.805 4.705 4.533 4.263 3.878 3.305 2.47 1.174 -0.823 -4.101 -7.866 -10.994 -13.642 -15.765 -17.551 -19.097 -20.473 -21.586 -22.669 -23.607 -24.414 -25.147 -25.844 -26.503 -27.091 -27.673 -28.18 -28.613 -29.065 -29.542 -29.923 -30.309 -30.721 -31.034 -31.353 -31.68 -32.027 -32.412 -32.661 -32.916 -33.331 -33.63 -33.962 -34.114 -34.4 -34.732 -35.067 -35.241 -35.559 -35.786 -35.993 -36.211 -36.642 -36.85 -37.097 -37.4 -37.713 -38.097 -38.579 -39.769 -4 ,25208 ,TETRA ,17557258,Fri Nov 26 09:27:45 CET,Fri Nov 26 11:48:41 CET,0.0 0.89 1.222 1.485 1.662 1.834 2.001 2.142 2.411 2.513 2.59 2.631 2.802 2.881 3.027 3.149 3.262 3.319 3.422 3.527 3.673 3.755 3.821 3.911 4.005 4.097 4.188 4.267 4.35 4.415 4.462 4.512 4.547 4.576 4.612 4.637 4.65 4.639 4.622 4.608 4.583 4.513 4.368 4.183 3.911 3.5 2.892 2.053 0.78 -1.234 -4.654 -8.537 -11.64 -14.199 -16.302 -18.089 -19.578 -20.927 -22.068 -23.175 -24.122 -24.937 -25.705 -26.431 -27.122 -27.739 -28.363 -28.934 -29.437 -29.951 -30.459 -30.878 -31.307 -31.74 -32.086 -32.454 -32.831 -33.207 -33.579 -33.83 -34.086 -34.489 -34.796 -35.128 -35.284 -35.598 -35.921 -36.245 -36.416 -36.737 -36.973 -37.161 -37.375 -37.911 -38.215 -38.505 -38.8 -39.156 -39.648 -40.312 -41.834 -5 ,27149 ,TETRA ,17557259,Fri Nov 26 09:27:45 CET,Fri Nov 26 11:50:26 CET,0.0 1.068 1.405 1.595 1.73 1.889 2.06 2.197 2.445 2.551 2.643 2.71 2.879 2.951 3.085 3.21 3.312 3.354 3.433 3.508 3.617 3.682 3.738 3.84 3.948 4.036 4.124 4.204 4.289 4.351 4.399 4.456 4.507 4.554 4.589 4.602 4.595 4.567 4.528 4.46 4.361 4.235 4.025 3.753 3.401 2.976 2.44 1.698 0.439 -1.544 -4.733 -8.514 -11.497 -13.918 -15.962 -17.744 -19.202 -20.497 -21.637 -22.782 -23.769 -24.642 -25.465 -26.236 -26.928 -27.546 -28.165 -28.706 -29.172 -29.643 -30.138 -30.542 -30.955 -31.386 -31.716 -32.051 -32.399 -32.744 -33.101 -33.358 -33.62 -34.04 -34.335 -34.626 -34.773 -35.097 -35.453 -35.813 -35.991 -36.297 -36.496 -36.68 -36.906 -37.423 -37.68 -37.932 -38.213 -38.493 -38.807 -39.249 -40.385 -6 ,25188 ,TETRA ,17557260,Fri Nov 26 09:27:45 CET,Fri Nov 26 11:50:50 CET,0.0 1.948 2.34 2.657 2.915 3.129 3.324 3.513 3.829 3.955 4.073 4.164 4.333 4.401 4.551 4.68 4.778 4.827 4.947 5.066 5.223 5.322 5.408 5.524 5.645 5.754 5.861 5.951 6.028 6.101 6.18 6.261 6.316 6.372 6.438 6.505 6.554 6.585 6.596 6.58 6.533 6.475 6.382 6.181 5.86 5.407 4.726 3.787 2.431 0.435 -2.738 -6.323 -9.165 -11.513 -13.473 -15.16 -16.617 -17.902 -18.994 -20.129 -21.149 -22.05 -22.87 -23.641 -24.358 -24.945 -25.507 -26.016 -26.47 -26.973 -27.477 -27.855 -28.243 -28.641 -28.943 -29.256 -29.572 -29.894 -30.239 -30.47 -30.712 -31.115 -31.388 -31.662 -31.804 -32.088 -32.4 -32.737 -32.911 -33.227 -33.442 -33.622 -33.817 -34.212 -34.41 -34.639 -34.891 -35.172 -35.497 -35.926 -37.004 -7 ,7001 ,TETRA ,17557261,Fri Nov 26 09:27:45 CET,Fri Nov 26 11:54:17 CET,0.0 2.236 2.69 2.926 3.109 3.29 3.453 3.577 3.773 3.876 3.97 4.02 4.187 4.27 4.442 4.576 4.697 4.754 4.856 4.946 5.07 5.171 5.265 5.385 5.511 5.607 5.666 5.725 5.805 5.876 5.938 6.011 6.087 6.159 6.236 6.304 6.339 6.337 6.337 6.339 6.316 6.26 6.132 5.923 5.635 5.283 4.813 4.124 3.022 1.239 -1.819 -5.456 -8.414 -10.808 -12.807 -14.556 -16.0 -17.246 -18.323 -19.39 -20.292 -21.099 -21.861 -22.543 -23.142 -23.688 -24.27 -24.787 -25.231 -25.69 -26.158 -26.532 -26.935 -27.374 -27.709 -28.04 -28.386 -28.739 -29.089 -29.342 -29.617 -30.037 -30.322 -30.613 -30.77 -31.127 -31.539 -31.959 -32.154 -32.474 -32.699 -32.895 -33.108 -33.545 -33.81 -34.136 -34.492 -34.897 -35.358 -35.961 -37.936 -8 ,9202 ,TETRA ,17557262,Fri Nov 26 09:27:47 CET,Fri Nov 26 11:54:34 CET,0.0 0.815 1.044 1.198 1.36 1.497 1.604 1.728 1.965 2.049 2.111 2.136 2.3 2.378 2.533 2.65 2.738 2.789 2.885 2.958 3.07 3.136 3.197 3.303 3.407 3.489 3.562 3.624 3.699 3.775 3.854 3.966 4.064 4.151 4.24 4.32 4.388 4.433 4.428 4.377 4.321 4.26 4.139 3.94 3.651 3.256 2.645 1.818 0.61 -1.403 -4.724 -8.596 -11.708 -14.148 -16.175 -18.012 -19.594 -20.982 -22.129 -23.244 -24.216 -25.066 -25.858 -26.6 -27.285 -27.908 -28.549 -29.117 -29.599 -30.077 -30.558 -30.955 -31.341 -31.739 -32.074 -32.419 -32.765 -33.118 -33.498 -33.762 -34.023 -34.448 -34.749 -35.043 -35.187 -35.501 -35.834 -36.162 -36.322 -36.618 -36.837 -37.029 -37.229 -37.654 -37.878 -38.123 -38.411 -38.732 -39.114 -39.582 -41.067 -9 ,2310 ,TETRA ,17557263,Fri Nov 26 09:28:44 CET,Fri Nov 26 11:51:09 CET,0.0 0.996 1.241 1.427 1.592 1.735 1.856 1.973 2.2 2.304 2.395 2.471 2.645 2.708 2.838 2.983 3.117 3.177 3.3 3.418 3.554 3.632 3.71 3.831 3.925 3.982 4.056 4.136 4.238 4.323 4.389 4.479 4.573 4.656 4.739 4.823 4.847 4.838 4.852 4.849 4.816 4.747 4.605 4.407 4.112 3.689 3.001 2.088 0.849 -1.163 -4.531 -8.475 -11.655 -14.237 -16.348 -18.146 -19.659 -21.037 -22.248 -23.434 -24.416 -25.258 -26.009 -26.721 -27.415 -28.007 -28.566 -29.046 -29.493 -29.964 -30.43 -30.817 -31.228 -31.687 -32.049 -32.408 -32.764 -33.119 -33.495 -33.745 -33.994 -34.392 -34.658 -34.942 -35.094 -35.415 -35.744 -36.072 -36.245 -36.556 -36.794 -37.008 -37.231 -37.651 -37.87 -38.122 -38.391 -38.68 -38.995 -39.397 -40.344 -10 ,14108 ,TETRA ,17557264,Fri Nov 26 09:28:45 CET,Fri Nov 26 11:50:16 CET,0.0 0.844 1.148 1.381 1.609 1.807 1.979 2.146 2.412 2.504 2.581 2.639 2.811 2.888 3.027 3.156 3.276 3.324 3.418 3.514 3.652 3.73 3.792 3.876 3.953 4.018 4.077 4.128 4.19 4.254 4.304 4.347 4.388 4.432 4.48 4.514 4.512 4.494 4.486 4.458 4.42 4.364 4.234 4.042 3.73 3.276 2.648 1.805 0.534 -1.436 -4.688 -8.501 -11.618 -14.245 -16.431 -18.301 -19.874 -21.309 -22.529 -23.681 -24.628 -25.453 -26.226 -26.952 -27.644 -28.28 -28.93 -29.502 -29.988 -30.51 -31.04 -31.453 -31.876 -32.303 -32.633 -32.968 -33.323 -33.718 -34.126 -34.398 -34.678 -35.131 -35.444 -35.747 -35.891 -36.183 -36.492 -36.803 -36.968 -37.276 -37.509 -37.692 -37.886 -38.305 -38.524 -38.761 -39.035 -39.372 -39.818 -40.487 -43.046 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index 376b5dd2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13105 ,TETRA ,17557265,Fri Nov 26 09:28:44 CET,Fri Nov 26 11:49:37 CET,0.0 0.723 1.01 1.243 1.422 1.581 1.759 1.934 2.26 2.415 2.561 2.726 2.966 3.091 3.359 3.624 3.864 3.97 4.171 4.358 4.635 4.817 4.992 5.237 5.463 5.697 5.928 6.147 6.425 6.7 6.989 7.344 7.666 7.974 8.33 8.746 9.159 9.594 10.065 10.557 11.078 11.662 12.342 13.051 13.859 14.759 15.721 16.805 18.129 19.54 20.871 21.475 21.459 21.231 20.976 20.632 20.287 19.961 19.655 19.343 19.053 18.751 18.422 18.102 17.775 17.434 17.096 16.796 16.526 16.243 15.943 15.691 15.43 15.159 14.942 14.718 14.478 14.224 13.962 13.775 13.569 13.251 13.023 12.754 12.612 12.342 12.078 11.796 11.645 11.389 11.15 10.981 10.808 10.428 10.209 9.947 9.669 9.335 8.896 8.331 6.576 -2 ,28336 ,TETRA ,17557266,Fri Nov 26 09:28:44 CET,Fri Nov 26 11:49:37 CET,0.0 0.62 0.894 1.134 1.365 1.607 1.819 1.989 2.301 2.443 2.566 2.699 2.939 3.051 3.254 3.441 3.635 3.751 3.977 4.163 4.425 4.604 4.791 5.06 5.314 5.565 5.807 6.045 6.34 6.624 6.909 7.258 7.604 7.928 8.29 8.676 9.046 9.476 9.929 10.417 10.975 11.625 12.378 13.112 13.961 14.924 16.035 17.209 18.44 19.705 21.168 22.112 22.296 22.206 21.979 21.659 21.317 20.973 20.655 20.322 19.99 19.651 19.314 18.99 18.685 18.375 18.023 17.727 17.484 17.216 16.937 16.719 16.489 16.245 16.058 15.854 15.642 15.439 15.2 15.026 14.857 14.599 14.424 14.233 14.126 13.905 13.676 13.426 13.304 13.079 12.877 12.703 12.52 12.162 11.959 11.744 11.524 11.245 10.856 10.305 9.012 -3 ,1994 ,TETRA ,17557267,Fri Nov 26 09:28:45 CET,Fri Nov 26 11:34:40 CET,0.0 0.783 1.11 1.345 1.552 1.754 1.933 2.112 2.476 2.634 2.778 2.938 3.168 3.293 3.561 3.805 4.017 4.118 4.328 4.536 4.815 4.989 5.166 5.423 5.662 5.903 6.135 6.355 6.656 6.958 7.254 7.599 7.923 8.245 8.632 9.059 9.465 9.903 10.372 10.893 11.442 12.078 12.867 13.651 14.506 15.4 16.4 17.535 18.866 20.379 22.021 23.029 23.198 23.005 22.679 22.301 21.939 21.583 21.239 20.872 20.524 20.167 19.771 19.383 19.047 18.754 18.438 18.14 17.895 17.632 17.345 17.108 16.857 16.59 16.369 16.128 15.859 15.59 15.323 15.129 14.938 14.639 14.411 14.175 14.061 13.813 13.529 13.252 13.112 12.876 12.689 12.52 12.337 11.964 11.755 11.499 11.202 10.876 10.51 10.055 8.785 -4 ,22089 ,TETRA ,17557268,Fri Nov 26 09:28:45 CET,Fri Nov 26 11:51:50 CET,0.0 0.655 0.986 1.198 1.366 1.53 1.704 1.866 2.164 2.317 2.465 2.614 2.845 2.953 3.162 3.377 3.586 3.685 3.863 4.045 4.323 4.488 4.655 4.913 5.161 5.396 5.617 5.831 6.103 6.369 6.619 6.927 7.249 7.561 7.918 8.313 8.691 9.122 9.594 10.104 10.651 11.253 11.944 12.64 13.42 14.264 15.204 16.257 17.537 19.052 20.606 21.407 21.646 21.582 21.351 21.078 20.784 20.473 20.167 19.798 19.454 19.142 18.848 18.556 18.246 17.955 17.647 17.345 17.081 16.823 16.543 16.286 16.02 15.742 15.533 15.317 15.091 14.86 14.611 14.436 14.264 14.003 13.803 13.577 13.466 13.24 12.987 12.719 12.585 12.343 12.137 11.962 11.778 11.393 11.168 10.944 10.674 10.371 10.023 9.571 7.908 -5 ,574 ,TETRA ,17557269,Fri Nov 26 09:29:44 CET,Fri Nov 26 11:52:56 CET,0.0 0.59 0.902 1.143 1.348 1.537 1.718 1.891 2.175 2.319 2.482 2.678 2.915 3.032 3.287 3.539 3.768 3.879 4.09 4.289 4.572 4.757 4.934 5.195 5.45 5.691 5.924 6.145 6.432 6.708 6.982 7.317 7.638 7.944 8.311 8.738 9.143 9.565 10.031 10.565 11.137 11.787 12.57 13.359 14.263 15.221 16.279 17.461 18.759 20.193 21.614 22.411 22.652 22.631 22.445 22.15 21.817 21.515 21.254 20.938 20.597 20.25 19.919 19.614 19.337 19.066 18.77 18.505 18.256 18.005 17.752 17.533 17.31 17.071 16.881 16.68 16.462 16.215 15.949 15.776 15.6 15.307 15.095 14.854 14.723 14.448 14.131 13.789 13.626 13.371 13.106 12.919 12.734 12.322 12.099 11.843 11.555 11.236 10.848 10.412 9.351 -6 ,22121 ,TETRA ,17557270,Fri Nov 26 09:30:48 CET,Fri Nov 26 11:52:33 CET,0.0 0.804 1.133 1.443 1.716 1.955 2.157 2.341 2.676 2.829 2.991 3.174 3.411 3.533 3.771 3.996 4.2 4.296 4.475 4.65 4.934 5.108 5.269 5.519 5.77 6.015 6.256 6.505 6.824 7.108 7.389 7.747 8.083 8.409 8.783 9.19 9.575 9.987 10.425 10.883 11.344 11.885 12.551 13.212 13.958 14.783 15.764 16.819 18.033 19.484 20.975 21.731 21.807 21.624 21.313 20.972 20.601 20.233 19.89 19.504 19.153 18.796 18.447 18.125 17.809 17.514 17.218 16.952 16.711 16.458 16.201 15.971 15.717 15.459 15.258 15.047 14.832 14.612 14.379 14.208 14.023 13.721 13.515 13.3 13.189 12.967 12.737 12.515 12.409 12.199 12.0 11.843 11.67 11.285 11.077 10.826 10.558 10.277 9.886 9.367 8.172 -7 ,2965 ,TETRA ,17557271,Fri Nov 26 09:29:44 CET,Fri Nov 26 11:53:55 CET,0.0 0.688 0.956 1.188 1.418 1.616 1.821 2.042 2.434 2.599 2.764 2.983 3.246 3.387 3.623 3.83 4.048 4.145 4.327 4.522 4.81 4.987 5.153 5.402 5.643 5.878 6.112 6.343 6.648 6.953 7.232 7.556 7.858 8.154 8.518 8.926 9.308 9.723 10.176 10.656 11.158 11.753 12.478 13.177 13.978 14.857 15.808 16.823 18.034 19.476 20.96 21.731 21.828 21.709 21.569 21.366 21.102 20.817 20.526 20.18 19.853 19.573 19.303 19.013 18.711 18.426 18.123 17.848 17.601 17.328 17.055 16.825 16.579 16.321 16.119 15.905 15.681 15.447 15.185 15.01 14.835 14.556 14.344 14.107 13.986 13.738 13.474 13.183 13.025 12.761 12.494 12.297 12.081 11.614 11.367 11.104 10.81 10.483 10.071 9.616 8.409 -8 ,25161 ,TETRA ,17557272,Fri Nov 26 09:29:46 CET,Fri Nov 26 11:29:59 CET,0.0 0.893 1.267 1.551 1.788 1.992 2.187 2.367 2.685 2.839 3.001 3.193 3.45 3.584 3.828 4.07 4.306 4.415 4.641 4.866 5.162 5.341 5.522 5.796 6.059 6.308 6.556 6.794 7.092 7.377 7.642 7.966 8.282 8.596 8.978 9.398 9.807 10.25 10.705 11.212 11.729 12.289 12.952 13.636 14.474 15.402 16.426 17.539 18.786 20.134 21.686 22.646 22.86 22.765 22.485 22.155 21.833 21.52 21.204 20.834 20.451 20.106 19.798 19.503 19.235 18.959 18.631 18.34 18.11 17.862 17.583 17.34 17.079 16.812 16.621 16.427 16.217 16.016 15.802 15.637 15.454 15.14 14.909 14.664 14.542 14.283 13.992 13.686 13.543 13.317 13.08 12.889 12.694 12.277 12.055 11.798 11.524 11.217 10.821 10.285 8.696 -9 ,26832 ,TETRA ,17557273,Fri Nov 26 09:29:46 CET,Fri Nov 26 11:49:23 CET,0.0 0.719 0.999 1.213 1.395 1.584 1.775 1.945 2.262 2.404 2.539 2.702 2.948 3.079 3.327 3.551 3.768 3.873 4.081 4.279 4.588 4.797 4.976 5.228 5.49 5.741 5.971 6.195 6.496 6.796 7.089 7.428 7.736 8.053 8.438 8.877 9.265 9.646 10.069 10.521 11.009 11.576 12.236 12.892 13.649 14.518 15.558 16.694 17.915 19.143 20.365 21.07 21.155 20.974 20.677 20.347 19.95 19.562 19.252 18.904 18.571 18.255 17.936 17.627 17.324 17.009 16.677 16.403 16.176 15.947 15.7 15.463 15.179 14.889 14.676 14.455 14.224 13.971 13.716 13.528 13.326 13.027 12.813 12.588 12.467 12.224 11.981 11.698 11.543 11.298 11.092 10.915 10.732 10.373 10.146 9.881 9.594 9.265 8.841 8.247 6.776 -10 ,8293 ,TETRA ,17557274,Fri Nov 26 09:29:48 CET,Fri Nov 26 11:49:17 CET,0.0 0.928 1.188 1.412 1.6 1.791 1.968 2.127 2.434 2.587 2.725 2.879 3.122 3.243 3.473 3.694 3.915 4.017 4.207 4.401 4.692 4.879 5.053 5.288 5.515 5.733 5.934 6.144 6.445 6.737 7.009 7.345 7.69 8.04 8.436 8.845 9.235 9.677 10.147 10.642 11.176 11.791 12.49 13.17 13.977 14.884 15.965 17.194 18.443 19.786 21.218 22.053 22.158 21.97 21.649 21.221 20.827 20.45 20.115 19.791 19.475 19.143 18.822 18.513 18.223 17.953 17.658 17.384 17.139 16.876 16.61 16.413 16.196 15.946 15.743 15.528 15.299 15.062 14.814 14.639 14.464 14.17 13.935 13.693 13.576 13.342 13.1 12.842 12.707 12.47 12.239 12.083 11.926 11.553 11.343 11.096 10.818 10.49 10.058 9.532 8.309 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index 3b57ed41..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,26144 ,TETRA ,17557277,Fri Nov 26 09:29:50 CET,Fri Nov 26 11:49:31 CET,0.0 4.105 4.568 4.838 5.082 5.297 5.491 5.661 5.922 6.022 6.11 6.149 6.349 6.441 6.621 6.789 6.932 6.997 7.114 7.22 7.37 7.467 7.562 7.693 7.819 7.936 8.032 8.119 8.224 8.317 8.411 8.544 8.673 8.778 8.892 9.022 9.156 9.289 9.415 9.53 9.622 9.697 9.777 9.857 9.867 9.761 9.571 9.271 8.677 7.581 5.672 3.348 1.357 -0.422 -2.023 -3.447 -4.676 -5.783 -6.738 -7.691 -8.533 -9.26 -9.913 -10.525 -11.109 -11.651 -12.208 -12.689 -13.097 -13.507 -13.962 -14.368 -14.758 -15.144 -15.455 -15.788 -16.143 -16.507 -16.869 -17.13 -17.414 -17.878 -18.216 -18.551 -18.705 -19.043 -19.458 -19.898 -20.109 -20.455 -20.76 -21.008 -21.286 -21.853 -22.134 -22.455 -22.838 -23.3 -23.959 -24.9 -28.79 -4 ,14125 ,TETRA ,17557278,Fri Nov 26 09:29:46 CET,Fri Nov 26 11:51:16 CET,0.0 10.761 11.242 11.517 11.703 11.855 11.985 12.105 12.359 12.482 12.594 12.717 12.945 13.053 13.242 13.403 13.552 13.625 13.79 13.945 14.151 14.299 14.434 14.605 14.768 14.925 15.06 15.178 15.312 15.412 15.515 15.672 15.827 15.941 16.046 16.166 16.278 16.375 16.462 16.542 16.612 16.665 16.703 16.709 16.655 16.529 16.276 15.863 15.187 14.027 11.919 9.335 7.237 5.407 3.827 2.37 1.067 -0.069 -1.025 -1.967 -2.778 -3.486 -4.164 -4.809 -5.388 -5.901 -6.455 -6.935 -7.342 -7.785 -8.224 -8.578 -8.957 -9.388 -9.732 -10.067 -10.419 -10.78 -11.151 -11.414 -11.703 -12.14 -12.426 -12.729 -12.895 -13.256 -13.617 -13.98 -14.185 -14.546 -14.875 -15.116 -15.37 -15.944 -16.245 -16.559 -16.926 -17.314 -17.869 -18.666 -21.758 -5 ,1431 ,TETRA ,17557279,Fri Nov 26 09:30:48 CET,Fri Nov 26 11:53:58 CET,0.0 2.025 2.379 2.652 2.834 2.987 3.118 3.244 3.5 3.62 3.717 3.784 3.98 4.054 4.194 4.314 4.432 4.496 4.645 4.806 5.013 5.109 5.2 5.341 5.472 5.62 5.74 5.827 5.946 6.073 6.209 6.338 6.438 6.547 6.698 6.843 6.938 7.032 7.138 7.232 7.298 7.348 7.371 7.377 7.339 7.213 6.995 6.639 5.993 4.872 2.911 0.365 -1.94 -3.905 -5.562 -7.04 -8.29 -9.372 -10.298 -11.21 -11.986 -12.69 -13.376 -14.026 -14.641 -15.218 -15.837 -16.426 -16.963 -17.513 -18.072 -18.524 -19.005 -19.534 -19.928 -20.307 -20.695 -21.095 -21.499 -21.768 -22.039 -22.442 -22.723 -23.034 -23.2 -23.548 -23.892 -24.269 -24.476 -24.832 -25.196 -25.459 -25.752 -26.429 -26.779 -27.122 -27.484 -27.929 -28.566 -29.435 -33.364 -6 ,28659 ,TETRA ,17557280,Fri Nov 26 09:30:48 CET,Fri Nov 26 11:51:59 CET,0.0 2.231 2.648 2.949 3.163 3.381 3.591 3.785 4.136 4.299 4.448 4.604 4.853 4.992 5.249 5.46 5.632 5.698 5.803 5.941 6.142 6.243 6.336 6.479 6.608 6.713 6.82 6.923 7.035 7.174 7.318 7.482 7.659 7.801 7.943 8.107 8.242 8.364 8.492 8.621 8.709 8.756 8.791 8.797 8.759 8.661 8.438 8.031 7.334 6.054 3.79 1.121 -1.078 -2.996 -4.673 -6.107 -7.282 -8.355 -9.313 -10.258 -11.038 -11.736 -12.409 -13.019 -13.581 -14.091 -14.66 -15.221 -15.694 -16.166 -16.675 -17.109 -17.554 -18.002 -18.33 -18.653 -18.987 -19.368 -19.769 -20.039 -20.315 -20.739 -21.029 -21.332 -21.488 -21.828 -22.177 -22.541 -22.747 -23.082 -23.363 -23.584 -23.819 -24.395 -24.695 -25.016 -25.366 -25.738 -26.293 -27.102 -31.853 -7 ,23263 ,TETRA ,17557281,Fri Nov 26 09:30:48 CET,Fri Nov 26 11:50:40 CET,0.0 1.376 1.852 2.228 2.467 2.676 2.895 3.083 3.363 3.485 3.614 3.778 3.998 4.073 4.22 4.351 4.476 4.549 4.717 4.878 5.079 5.211 5.335 5.53 5.715 5.856 5.965 6.052 6.166 6.283 6.396 6.514 6.633 6.751 6.885 7.009 7.112 7.228 7.326 7.401 7.498 7.597 7.652 7.685 7.665 7.54 7.268 6.846 6.174 5.072 3.098 0.581 -1.552 -3.428 -5.017 -6.422 -7.654 -8.773 -9.736 -10.682 -11.494 -12.24 -12.97 -13.636 -14.204 -14.729 -15.311 -15.845 -16.315 -16.794 -17.28 -17.675 -18.099 -18.527 -18.856 -19.212 -19.563 -19.92 -20.299 -20.555 -20.809 -21.226 -21.519 -21.822 -21.978 -22.294 -22.64 -22.991 -23.163 -23.468 -23.734 -23.992 -24.269 -24.843 -25.198 -25.613 -26.077 -26.646 -27.332 -28.198 -31.97 -8 ,8308 ,TETRA ,17557282,Fri Nov 26 09:31:45 CET,Fri Nov 26 11:51:43 CET,0.0 8.962 9.347 9.623 9.852 10.054 10.254 10.432 10.738 10.873 11.008 11.195 11.449 11.568 11.772 11.96 12.144 12.22 12.345 12.459 12.617 12.719 12.803 12.914 13.027 13.142 13.262 13.395 13.561 13.697 13.814 13.925 14.021 14.128 14.258 14.396 14.513 14.615 14.722 14.829 14.92 15.003 15.055 15.08 15.097 15.015 14.793 14.442 13.863 12.824 10.825 8.339 6.256 4.497 2.978 1.583 0.375 -0.688 -1.618 -2.551 -3.353 -4.055 -4.734 -5.39 -5.976 -6.498 -7.066 -7.584 -8.02 -8.485 -9.031 -9.513 -9.979 -10.438 -10.796 -11.166 -11.542 -11.941 -12.351 -12.632 -12.922 -13.381 -13.727 -14.109 -14.307 -14.722 -15.14 -15.542 -15.771 -16.146 -16.461 -16.701 -16.948 -17.488 -17.807 -18.15 -18.519 -18.975 -19.579 -20.341 -23.611 -9 ,17237 ,TETRA ,17557283,Fri Nov 26 09:31:45 CET,Fri Nov 26 11:53:46 CET,0.0 3.071 3.573 3.84 4.073 4.291 4.49 4.685 5.047 5.18 5.288 5.435 5.687 5.806 6.003 6.204 6.386 6.468 6.622 6.776 6.983 7.096 7.203 7.359 7.493 7.605 7.718 7.826 7.953 8.064 8.174 8.323 8.467 8.588 8.702 8.829 8.954 9.082 9.231 9.355 9.431 9.506 9.602 9.687 9.699 9.591 9.339 8.923 8.307 7.266 5.211 2.509 0.262 -1.67 -3.309 -4.771 -6.032 -7.126 -8.09 -9.079 -9.932 -10.694 -11.414 -12.058 -12.657 -13.204 -13.735 -14.2 -14.633 -15.096 -15.584 -16.005 -16.457 -16.911 -17.24 -17.611 -18.007 -18.396 -18.776 -19.024 -19.284 -19.717 -20.04 -20.374 -20.542 -20.875 -21.192 -21.525 -21.697 -22.03 -22.399 -22.695 -23.033 -23.784 -24.184 -24.579 -25.034 -25.552 -26.171 -27.009 -31.271 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index fc7b3f19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3900 ,TETRA ,17557285,Fri Nov 26 09:31:45 CET,Fri Nov 26 12:00:41 CET,0.0 0.575 1.041 1.403 1.701 2.004 2.248 2.604 2.751 2.885 3.063 3.315 3.447 3.707 3.98 4.233 4.353 4.575 4.763 5.065 5.26 5.447 5.738 6.02 6.272 6.506 6.744 7.04 7.318 7.585 7.911 8.224 8.513 8.851 9.228 9.581 9.986 10.423 10.897 11.402 11.949 12.575 13.184 13.844 14.585 15.495 16.487 17.5 18.532 19.414 19.623 19.413 18.986 18.492 18.041 17.649 17.28 16.941 16.56 16.201 15.86 15.538 15.239 14.947 14.675 14.399 14.146 13.908 13.656 13.393 13.178 12.959 12.706 12.507 12.274 12.01 11.762 11.505 11.33 11.16 10.896 10.691 10.48 10.368 10.108 9.867 9.629 9.497 9.257 9.046 8.871 8.661 8.131 7.818 7.522 7.189 6.782 6.381 5.844 -2 ,32151 ,TETRA ,17557286,Fri Nov 26 09:31:45 CET,Fri Nov 26 11:35:33 CET,0.0 0.409 0.709 0.986 1.238 1.468 1.665 2.043 2.229 2.384 2.571 2.837 2.991 3.251 3.474 3.696 3.807 4.017 4.214 4.479 4.649 4.826 5.068 5.294 5.522 5.752 5.979 6.278 6.577 6.874 7.227 7.535 7.826 8.157 8.511 8.853 9.245 9.71 10.259 10.832 11.451 12.139 12.8 13.579 14.435 15.405 16.424 17.472 18.566 19.718 20.267 20.206 19.976 19.603 19.188 18.768 18.356 18.022 17.668 17.326 16.978 16.626 16.288 15.964 15.655 15.329 15.031 14.741 14.448 14.167 13.916 13.637 13.344 13.109 12.849 12.607 12.378 12.105 11.917 11.745 11.495 11.325 11.123 11.001 10.762 10.542 10.32 10.197 9.964 9.716 9.533 9.355 8.952 8.707 8.447 8.186 7.94 7.625 7.199 -3 ,30228 ,TETRA ,17557287,Fri Nov 26 09:31:45 CET,Fri Nov 26 11:36:26 CET,0.0 0.65 1.086 1.412 1.716 1.984 2.251 2.741 2.967 3.183 3.46 3.74 3.915 4.265 4.585 4.871 5.005 5.272 5.53 5.903 6.125 6.321 6.603 6.893 7.18 7.451 7.707 8.018 8.331 8.668 9.102 9.513 9.879 10.256 10.66 11.051 11.477 11.972 12.511 13.041 13.625 14.306 14.969 15.689 16.462 17.37 18.357 19.376 20.358 21.149 21.375 21.209 20.881 20.439 19.972 19.566 19.21 18.891 18.532 18.207 17.869 17.546 17.276 17.0 16.726 16.433 16.184 15.976 15.741 15.487 15.255 15.008 14.751 14.538 14.306 14.048 13.775 13.515 13.354 13.184 12.92 12.732 12.518 12.393 12.136 11.904 11.675 11.548 11.289 11.072 10.918 10.734 10.33 10.061 9.75 9.432 8.994 8.465 7.867 -4 ,6699 ,TETRA ,17557288,Fri Nov 26 09:32:42 CET,Fri Nov 26 11:44:20 CET,0.0 0.432 0.763 1.052 1.317 1.549 1.749 2.136 2.326 2.496 2.682 2.943 3.11 3.425 3.712 4.007 4.169 4.476 4.736 5.072 5.274 5.468 5.763 6.051 6.32 6.594 6.863 7.181 7.468 7.75 8.101 8.448 8.779 9.158 9.589 10.03 10.542 11.072 11.576 12.085 12.666 13.356 14.068 14.915 15.817 16.745 17.75 18.894 19.968 20.894 21.299 21.118 20.693 20.23 19.737 19.194 18.677 18.207 17.699 17.267 16.864 16.456 16.048 15.644 15.275 14.895 14.519 14.18 13.84 13.453 13.121 12.805 12.483 12.203 11.896 11.612 11.346 11.075 10.879 10.65 10.284 10.034 9.763 9.614 9.328 9.039 8.736 8.59 8.334 8.07 7.892 7.7 7.233 6.963 6.673 6.388 6.035 5.561 4.961 -5 ,28553 ,TETRA ,17557289,Fri Nov 26 09:32:42 CET,Fri Nov 26 11:57:21 CET,0.0 0.564 1.018 1.384 1.658 1.9 2.114 2.503 2.679 2.824 3.024 3.279 3.411 3.685 3.962 4.236 4.37 4.61 4.832 5.15 5.344 5.519 5.773 6.017 6.25 6.479 6.698 6.977 7.254 7.521 7.847 8.16 8.468 8.85 9.264 9.65 10.064 10.511 10.968 11.419 11.964 12.624 13.279 14.024 14.799 15.613 16.516 17.528 18.526 19.41 19.794 19.662 19.33 18.984 18.608 18.23 17.838 17.456 17.056 16.697 16.351 16.014 15.69 15.374 15.067 14.736 14.432 14.16 13.891 13.635 13.428 13.209 12.973 12.781 12.578 12.371 12.157 11.951 11.806 11.641 11.363 11.17 10.967 10.867 10.673 10.423 10.133 10.004 9.784 9.606 9.463 9.284 8.773 8.461 8.132 7.815 7.464 7.021 6.263 -6 ,24675 ,TETRA ,17557290,Fri Nov 26 09:32:42 CET,Fri Nov 26 11:57:58 CET,0.0 0.595 1.04 1.391 1.704 1.989 2.254 2.708 2.916 3.116 3.334 3.59 3.741 4.051 4.353 4.636 4.772 5.026 5.266 5.583 5.773 5.955 6.217 6.465 6.715 6.954 7.152 7.406 7.659 7.904 8.213 8.515 8.81 9.153 9.526 9.893 10.293 10.713 11.182 11.693 12.242 12.882 13.55 14.317 15.114 16.014 16.998 17.997 19.009 19.935 20.3 20.201 19.904 19.569 19.201 18.782 18.291 17.87 17.453 17.056 16.695 16.344 16.018 15.715 15.417 15.068 14.752 14.502 14.27 14.034 13.828 13.584 13.293 13.079 12.873 12.664 12.459 12.234 12.066 11.882 11.567 11.342 11.087 10.953 10.708 10.457 10.197 10.065 9.836 9.64 9.477 9.283 8.799 8.545 8.228 7.87 7.515 6.978 6.115 -7 ,18363 ,TETRA ,17557291,Fri Nov 26 09:33:46 CET,Fri Nov 26 11:58:16 CET,0.0 0.693 1.095 1.397 1.647 1.87 2.079 2.477 2.662 2.864 3.176 3.479 3.661 3.999 4.304 4.574 4.689 4.898 5.109 5.446 5.668 5.856 6.115 6.386 6.666 6.931 7.184 7.503 7.796 8.085 8.467 8.845 9.184 9.575 10.024 10.461 10.934 11.411 11.872 12.328 12.85 13.475 14.097 14.789 15.524 16.328 17.147 18.098 19.129 20.037 20.364 20.188 19.851 19.445 19.036 18.611 18.163 17.764 17.367 17.004 16.662 16.347 16.039 15.729 15.452 15.151 14.87 14.632 14.389 14.14 13.914 13.672 13.43 13.246 13.07 12.893 12.691 12.456 12.28 12.087 11.761 11.513 11.246 11.109 10.83 10.546 10.256 10.087 9.81 9.553 9.358 9.155 8.718 8.471 8.175 7.822 7.393 6.893 6.18 -8 ,21315 ,TETRA ,17557292,Fri Nov 26 09:33:47 CET,Fri Nov 26 11:37:30 CET,0.0 0.584 0.961 1.301 1.593 1.83 2.044 2.432 2.6 2.741 2.888 3.119 3.235 3.469 3.694 3.895 3.999 4.213 4.42 4.712 4.9 5.087 5.351 5.597 5.852 6.11 6.35 6.67 6.973 7.282 7.647 7.958 8.25 8.594 8.992 9.366 9.759 10.183 10.622 11.053 11.544 12.159 12.781 13.488 14.266 15.118 16.028 17.046 18.117 19.171 19.709 19.72 19.493 19.078 18.586 18.095 17.615 17.208 16.786 16.419 16.108 15.815 15.467 15.088 14.734 14.366 14.034 13.726 13.399 13.078 12.819 12.551 12.306 12.117 11.895 11.651 11.379 11.102 10.923 10.725 10.403 10.171 9.917 9.776 9.46 9.117 8.738 8.552 8.279 7.989 7.78 7.543 6.964 6.663 6.381 6.082 5.723 5.238 4.455 -9 ,25627 ,TETRA ,17557293,Fri Nov 26 09:33:47 CET,Fri Nov 26 11:58:37 CET,0.0 0.549 0.922 1.265 1.545 1.77 1.983 2.398 2.575 2.729 2.914 3.164 3.325 3.65 3.916 4.141 4.257 4.495 4.707 5.015 5.205 5.397 5.685 5.948 6.202 6.449 6.68 6.963 7.239 7.514 7.837 8.139 8.451 8.822 9.215 9.584 9.962 10.367 10.821 11.291 11.83 12.449 13.059 13.756 14.5 15.365 16.267 17.209 18.221 19.237 19.673 19.516 19.209 18.805 18.325 17.918 17.473 16.982 16.465 15.994 15.56 15.16 14.784 14.419 14.064 13.722 13.436 13.179 12.929 12.683 12.457 12.174 11.868 11.648 11.431 11.202 10.94 10.66 10.478 10.309 10.066 9.89 9.706 9.605 9.394 9.169 8.913 8.77 8.531 8.325 8.155 7.946 7.405 7.094 6.785 6.43 5.97 5.4 4.613 -10 ,28049 ,TETRA ,17557294,Fri Nov 26 09:34:44 CET,Fri Nov 26 11:59:42 CET,0.0 0.74 1.227 1.575 1.881 2.188 2.477 2.955 3.17 3.371 3.636 3.918 4.075 4.352 4.621 4.875 5.004 5.227 5.398 5.664 5.846 6.024 6.296 6.587 6.892 7.187 7.462 7.813 8.155 8.469 8.82 9.185 9.539 9.912 10.352 10.793 11.237 11.682 12.146 12.64 13.211 13.856 14.475 15.216 16.064 17.018 18.059 19.272 20.497 21.534 22.053 21.965 21.563 21.071 20.541 20.027 19.541 19.117 18.675 18.301 17.968 17.651 17.338 17.003 16.681 16.332 16.021 15.754 15.454 15.109 14.813 14.532 14.267 14.054 13.803 13.525 13.245 12.986 12.816 12.631 12.358 12.166 11.933 11.806 11.55 11.275 10.958 10.779 10.49 10.149 9.923 9.674 9.091 8.815 8.513 8.154 7.767 7.239 6.524 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt deleted file mode 100644 index a616f8af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7549 ,TETRA ,17557295,Fri Nov 26 09:34:46 CET,Fri Nov 26 11:56:08 CET,0.0 0.23 0.424 0.609 0.78 0.931 1.04 1.246 1.362 1.48 1.611 1.755 1.845 2.011 2.155 2.305 2.382 2.526 2.656 2.874 3.011 3.131 3.303 3.469 3.623 3.769 3.912 4.101 4.287 4.452 4.66 4.865 5.054 5.268 5.519 5.763 6.006 6.266 6.535 6.796 7.088 7.449 7.814 8.203 8.635 8.961 9.114 9.363 9.566 9.193 8.119 7.066 6.078 5.107 4.186 3.443 2.759 2.131 1.526 0.986 0.489 -0.022 -0.521 -0.975 -1.407 -1.825 -2.192 -2.534 -2.895 -3.272 -3.604 -3.966 -4.359 -4.715 -5.075 -5.42 -5.786 -6.168 -6.449 -6.723 -7.087 -7.355 -7.649 -7.788 -8.089 -8.436 -8.833 -9.044 -9.299 -9.691 -9.94 -10.239 -10.983 -11.36 -11.8 -12.346 -13.024 -13.945 -15.148 -2 ,26796 ,TETRA ,17557296,Fri Nov 26 09:34:44 CET,Fri Nov 26 11:34:49 CET,0.0 0.182 0.347 0.488 0.622 0.737 0.845 1.045 1.143 1.24 1.349 1.496 1.584 1.735 1.878 2.016 2.081 2.209 2.339 2.528 2.646 2.758 2.922 3.085 3.237 3.38 3.526 3.728 3.929 4.103 4.293 4.479 4.671 4.883 5.108 5.345 5.599 5.844 6.104 6.363 6.629 6.933 7.228 7.529 7.838 8.206 8.543 8.726 8.722 8.394 7.538 6.532 5.528 4.607 3.728 2.923 2.184 1.547 0.89 0.3 -0.211 -0.697 -1.172 -1.639 -2.091 -2.574 -2.992 -3.338 -3.678 -4.019 -4.315 -4.641 -4.984 -5.286 -5.634 -5.974 -6.332 -6.721 -6.978 -7.238 -7.647 -7.936 -8.236 -8.407 -8.803 -9.183 -9.547 -9.737 -10.003 -10.404 -10.624 -10.882 -11.469 -11.781 -12.137 -12.527 -13.051 -13.773 -14.722 -3 ,26843 ,TETRA ,17557297,Fri Nov 26 09:34:44 CET,Fri Nov 26 11:54:50 CET,0.0 0.2 0.378 0.536 0.684 0.829 0.957 1.19 1.3 1.399 1.523 1.672 1.76 1.943 2.109 2.26 2.332 2.473 2.608 2.801 2.925 3.047 3.206 3.342 3.485 3.634 3.784 3.973 4.144 4.305 4.514 4.725 4.92 5.139 5.379 5.611 5.854 6.099 6.367 6.642 6.946 7.301 7.624 7.983 8.363 8.687 8.869 8.926 8.763 8.184 7.112 5.983 4.927 3.998 3.131 2.332 1.593 0.976 0.386 -0.12 -0.601 -1.094 -1.58 -2.038 -2.445 -2.863 -3.242 -3.572 -3.917 -4.278 -4.579 -4.901 -5.239 -5.507 -5.776 -6.047 -6.34 -6.641 -6.861 -7.111 -7.507 -7.766 -8.022 -8.157 -8.47 -8.857 -9.301 -9.537 -9.818 -10.284 -10.595 -10.903 -11.565 -11.963 -12.453 -12.952 -13.455 -14.111 -15.056 -4 ,7606 ,TETRA ,17557298,Fri Nov 26 09:34:44 CET,Fri Nov 26 11:56:28 CET,0.0 0.247 0.433 0.604 0.764 0.902 1.018 1.229 1.325 1.414 1.524 1.667 1.751 1.922 2.072 2.225 2.298 2.427 2.544 2.718 2.835 2.953 3.123 3.273 3.424 3.571 3.705 3.88 4.042 4.205 4.419 4.63 4.815 5.002 5.237 5.475 5.724 5.976 6.231 6.508 6.805 7.129 7.459 7.83 8.224 8.613 8.981 9.445 9.747 9.462 8.694 7.842 6.987 6.194 5.428 4.665 3.947 3.362 2.778 2.206 1.666 1.159 0.674 0.222 -0.2 -0.644 -1.047 -1.418 -1.803 -2.208 -2.547 -2.917 -3.314 -3.614 -3.909 -4.212 -4.525 -4.849 -5.076 -5.318 -5.698 -5.979 -6.298 -6.472 -6.84 -7.205 -7.584 -7.795 -8.096 -8.576 -8.854 -9.149 -9.793 -10.151 -10.582 -11.15 -11.739 -12.449 -13.468 -5 ,275 ,TETRA ,17557299,Fri Nov 26 09:34:44 CET,Fri Nov 26 11:55:40 CET,0.0 0.309 0.585 0.814 0.987 1.129 1.274 1.54 1.65 1.746 1.866 2.027 2.126 2.331 2.51 2.667 2.743 2.883 3.018 3.226 3.362 3.485 3.653 3.822 3.991 4.151 4.313 4.53 4.724 4.902 5.106 5.304 5.499 5.715 5.942 6.159 6.397 6.643 6.904 7.197 7.527 7.872 8.234 8.661 9.087 9.472 9.839 10.202 10.356 10.121 9.327 8.322 7.319 6.413 5.512 4.621 3.84 3.206 2.525 1.944 1.45 0.957 0.506 0.088 -0.33 -0.764 -1.16 -1.512 -1.871 -2.274 -2.599 -2.907 -3.239 -3.502 -3.784 -4.086 -4.391 -4.717 -4.966 -5.217 -5.603 -5.882 -6.179 -6.336 -6.683 -7.083 -7.513 -7.728 -7.984 -8.388 -8.653 -8.936 -9.59 -9.936 -10.331 -10.833 -11.512 -12.352 -13.529 -6 ,4162 ,TETRA ,17557300,Fri Nov 26 09:34:44 CET,Fri Nov 26 11:34:51 CET,0.0 0.268 0.481 0.636 0.788 0.932 1.037 1.226 1.332 1.432 1.547 1.704 1.785 1.95 2.113 2.26 2.336 2.486 2.628 2.824 2.946 3.065 3.234 3.394 3.551 3.694 3.83 4.01 4.194 4.381 4.599 4.802 5.001 5.229 5.473 5.711 5.982 6.268 6.539 6.825 7.17 7.543 7.852 8.204 8.602 9.028 9.363 9.593 9.609 9.019 7.981 6.907 5.915 5.043 4.139 3.296 2.538 1.894 1.238 0.657 0.11 -0.418 -0.926 -1.404 -1.814 -2.235 -2.64 -3.002 -3.376 -3.768 -4.07 -4.384 -4.73 -4.994 -5.257 -5.543 -5.862 -6.235 -6.523 -6.832 -7.298 -7.607 -7.931 -8.102 -8.466 -8.833 -9.25 -9.48 -9.748 -10.17 -10.437 -10.699 -11.274 -11.645 -12.071 -12.541 -13.123 -13.841 -14.844 -7 ,1384 ,TETRA ,17557301,Fri Nov 26 09:34:44 CET,Fri Nov 26 11:34:36 CET,0.0 0.21 0.389 0.533 0.668 0.787 0.901 1.11 1.205 1.311 1.451 1.604 1.685 1.842 2.008 2.143 2.204 2.337 2.457 2.628 2.746 2.865 3.054 3.246 3.418 3.555 3.69 3.878 4.054 4.218 4.415 4.607 4.789 4.998 5.224 5.434 5.661 5.898 6.152 6.42 6.697 6.991 7.3 7.696 8.122 8.561 8.998 9.378 9.588 9.252 8.211 7.138 6.171 5.283 4.46 3.741 3.056 2.458 1.825 1.24 0.736 0.234 -0.251 -0.698 -1.113 -1.54 -1.921 -2.29 -2.72 -3.164 -3.527 -3.904 -4.294 -4.592 -4.878 -5.196 -5.552 -5.911 -6.171 -6.44 -6.856 -7.149 -7.475 -7.646 -7.982 -8.37 -8.8 -9.028 -9.302 -9.678 -9.916 -10.174 -10.776 -11.1 -11.456 -11.886 -12.473 -13.249 -14.277 -8 ,18300 ,TETRA ,17557302,Fri Nov 26 09:34:44 CET,Fri Nov 26 11:55:39 CET,0.0 0.161 0.309 0.483 0.643 0.747 0.823 1.0 1.095 1.185 1.303 1.451 1.532 1.683 1.824 1.963 2.024 2.145 2.261 2.428 2.542 2.665 2.842 3.003 3.167 3.331 3.5 3.705 3.878 4.053 4.267 4.466 4.664 4.875 5.097 5.309 5.543 5.791 6.047 6.334 6.646 6.971 7.287 7.662 8.027 8.426 8.926 9.367 9.542 9.181 8.24 7.32 6.407 5.51 4.583 3.736 2.985 2.348 1.694 1.118 0.605 0.076 -0.435 -0.887 -1.31 -1.781 -2.234 -2.605 -2.973 -3.374 -3.694 -4.033 -4.383 -4.653 -4.948 -5.244 -5.571 -5.928 -6.171 -6.428 -6.836 -7.123 -7.447 -7.629 -8.006 -8.381 -8.749 -8.951 -9.217 -9.617 -9.895 -10.203 -10.887 -11.308 -11.786 -12.296 -12.88 -13.595 -14.874 -9 ,12318 ,TETRA ,17557303,Fri Nov 26 09:34:44 CET,Fri Nov 26 11:52:01 CET,0.0 0.242 0.427 0.58 0.716 0.826 0.925 1.132 1.226 1.312 1.397 1.539 1.62 1.768 1.902 2.023 2.084 2.213 2.345 2.542 2.661 2.771 2.925 3.074 3.226 3.362 3.48 3.664 3.846 4.008 4.228 4.418 4.592 4.807 5.042 5.25 5.459 5.725 6.037 6.335 6.646 6.996 7.332 7.739 8.185 8.578 8.904 9.158 9.301 8.894 7.87 6.882 5.969 5.062 4.163 3.415 2.729 2.073 1.38 0.799 0.308 -0.189 -0.689 -1.135 -1.552 -2.01 -2.403 -2.734 -3.096 -3.487 -3.825 -4.164 -4.509 -4.781 -5.047 -5.314 -5.62 -5.969 -6.213 -6.46 -6.864 -7.152 -7.423 -7.564 -7.889 -8.213 -8.568 -8.784 -9.083 -9.529 -9.786 -10.08 -10.779 -11.166 -11.623 -12.083 -12.622 -13.584 -14.833 -10 ,2337 ,TETRA ,17557304,Fri Nov 26 09:35:44 CET,Fri Nov 26 11:35:30 CET,0.0 0.31 0.568 0.757 0.918 1.052 1.174 1.386 1.479 1.569 1.707 1.869 1.958 2.123 2.285 2.444 2.514 2.669 2.81 2.989 3.111 3.234 3.423 3.607 3.782 3.941 4.096 4.298 4.481 4.643 4.848 5.061 5.25 5.456 5.694 5.946 6.211 6.463 6.724 7.003 7.318 7.673 7.986 8.298 8.62 8.955 9.241 9.471 9.512 8.935 7.791 6.764 5.803 4.825 3.95 3.197 2.482 1.827 1.192 0.684 0.197 -0.329 -0.868 -1.372 -1.83 -2.295 -2.699 -3.074 -3.463 -3.859 -4.188 -4.538 -4.918 -5.214 -5.508 -5.809 -6.126 -6.45 -6.672 -6.895 -7.242 -7.512 -7.828 -7.986 -8.328 -8.727 -9.146 -9.358 -9.626 -10.007 -10.238 -10.482 -11.025 -11.354 -11.792 -12.293 -12.778 -13.469 -14.756 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt deleted file mode 100644 index 8a70082f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2111 ,TETRA ,17557305,Fri Nov 26 09:35:44 CET,Fri Nov 26 11:34:15 CET,0.0 0.122 0.226 0.325 0.402 0.457 0.5 0.585 0.614 0.637 0.607 0.68 0.683 0.688 0.687 0.689 0.693 0.688 0.678 0.681 0.673 0.647 0.605 0.557 0.497 0.428 0.363 0.264 0.142 0.024 -0.131 -0.297 -0.457 -0.653 -0.897 -1.149 -1.451 -1.817 -2.229 -2.7 -3.318 -4.117 -4.94 -6.004 -7.341 -9.033 -11.262 -14.378 -18.8 -25.452 -32.674 -38.111 -42.356 -45.754 -48.663 -51.13 -53.259 -55.07 -56.841 -58.297 -59.544 -60.688 -61.756 -62.77 -63.684 -64.592 -65.391 -66.068 -66.748 -67.475 -68.084 -68.686 -69.299 -69.798 -70.298 -70.796 -71.331 -71.874 -72.237 -72.617 -73.262 -73.708 -74.163 -74.403 -74.873 -75.348 -75.84 -76.091 -76.505 -77.049 -77.389 -77.733 -78.502 -78.919 -79.408 -79.955 -80.538 -81.224 -82.11 -2 ,27301 ,TETRA ,17557306,Fri Nov 26 09:35:45 CET,Fri Nov 26 11:57:36 CET,0.0 0.089 0.164 0.229 0.282 0.313 0.337 0.377 0.399 0.415 0.364 0.443 0.459 0.468 0.47 0.476 0.478 0.471 0.444 0.4 0.369 0.331 0.272 0.205 0.132 0.056 -0.024 -0.137 -0.245 -0.348 -0.486 -0.623 -0.77 -0.989 -1.271 -1.541 -1.854 -2.226 -2.664 -3.174 -3.794 -4.586 -5.436 -6.539 -7.916 -9.676 -11.926 -14.931 -19.161 -25.553 -32.631 -38.042 -42.29 -45.761 -48.743 -51.222 -53.35 -55.148 -56.865 -58.296 -59.567 -60.723 -61.791 -62.785 -63.682 -64.6 -65.419 -66.122 -66.828 -67.575 -68.197 -68.819 -69.431 -69.909 -70.414 -70.961 -71.546 -72.116 -72.478 -72.866 -73.501 -73.922 -74.337 -74.553 -75.017 -75.5 -76.016 -76.303 -76.724 -77.176 -77.482 -77.831 -78.611 -79.011 -79.401 -79.808 -80.351 -81.14 -82.229 -3 ,3597 ,TETRA ,17557307,Fri Nov 26 09:35:47 CET,Fri Nov 26 11:57:57 CET,0.0 0.16 0.314 0.417 0.485 0.542 0.582 0.632 0.645 0.65 0.595 0.658 0.661 0.658 0.65 0.645 0.642 0.649 0.656 0.639 0.615 0.59 0.556 0.522 0.468 0.404 0.331 0.219 0.111 0.002 -0.141 -0.293 -0.465 -0.682 -0.93 -1.175 -1.46 -1.811 -2.221 -2.675 -3.23 -3.985 -4.845 -5.927 -7.259 -8.93 -11.076 -14.065 -18.301 -24.648 -31.563 -36.907 -41.1 -44.481 -47.365 -49.784 -51.915 -53.729 -55.46 -56.901 -58.176 -59.343 -60.398 -61.376 -62.252 -63.166 -63.987 -64.643 -65.327 -66.065 -66.665 -67.261 -67.858 -68.316 -68.797 -69.31 -69.834 -70.356 -70.728 -71.133 -71.766 -72.203 -72.668 -72.91 -73.382 -73.872 -74.395 -74.663 -75.062 -75.567 -75.926 -76.267 -76.972 -77.418 -77.891 -78.379 -78.966 -79.644 -80.739 -4 ,4364 ,TETRA ,17557308,Fri Nov 26 09:35:44 CET,Fri Nov 26 11:35:25 CET,0.0 0.231 0.366 0.444 0.499 0.552 0.589 0.684 0.729 0.761 0.733 0.804 0.803 0.803 0.806 0.795 0.794 0.785 0.75 0.695 0.659 0.617 0.559 0.491 0.408 0.326 0.242 0.126 0.011 -0.096 -0.237 -0.405 -0.589 -0.803 -1.042 -1.302 -1.62 -1.991 -2.429 -2.92 -3.529 -4.347 -5.298 -6.543 -8.075 -10.041 -12.518 -15.795 -20.287 -27.019 -34.313 -39.862 -44.269 -47.844 -50.821 -53.243 -55.339 -57.087 -58.798 -60.223 -61.475 -62.665 -63.747 -64.748 -65.655 -66.569 -67.376 -68.077 -68.792 -69.502 -70.087 -70.704 -71.333 -71.81 -72.305 -72.812 -73.318 -73.85 -74.241 -74.641 -75.23 -75.645 -76.092 -76.331 -76.795 -77.276 -77.808 -78.084 -78.484 -78.891 -79.19 -79.539 -80.293 -80.747 -81.272 -81.824 -82.475 -83.246 -84.33 -5 ,26875 ,TETRA ,17557309,Fri Nov 26 09:35:45 CET,Fri Nov 26 11:59:53 CET,0.0 0.106 0.204 0.294 0.35 0.391 0.434 0.493 0.525 0.562 0.556 0.631 0.637 0.647 0.666 0.677 0.674 0.657 0.631 0.595 0.566 0.523 0.454 0.409 0.361 0.287 0.208 0.103 0.004 -0.092 -0.222 -0.366 -0.532 -0.742 -0.987 -1.259 -1.598 -1.968 -2.377 -2.872 -3.497 -4.276 -5.114 -6.181 -7.496 -9.17 -11.322 -14.297 -18.572 -25.222 -32.483 -37.823 -42.086 -45.566 -48.484 -50.909 -52.991 -54.768 -56.555 -58.045 -59.31 -60.498 -61.629 -62.688 -63.625 -64.575 -65.405 -66.1 -66.796 -67.529 -68.154 -68.785 -69.438 -69.949 -70.462 -70.986 -71.522 -72.088 -72.491 -72.896 -73.525 -73.992 -74.465 -74.698 -75.189 -75.756 -76.327 -76.593 -77.018 -77.538 -77.857 -78.169 -78.897 -79.329 -79.79 -80.314 -80.888 -81.689 -82.788 -6 ,3201 ,TETRA ,17557310,Fri Nov 26 09:35:45 CET,Fri Nov 26 11:53:40 CET,0.0 0.151 0.242 0.325 0.388 0.44 0.468 0.526 0.547 0.556 0.521 0.616 0.645 0.663 0.666 0.659 0.658 0.647 0.623 0.588 0.558 0.526 0.474 0.438 0.381 0.311 0.251 0.167 0.073 -0.033 -0.176 -0.336 -0.507 -0.718 -0.976 -1.244 -1.568 -1.943 -2.38 -2.87 -3.454 -4.194 -5.028 -6.13 -7.468 -9.195 -11.41 -14.433 -18.802 -25.365 -32.32 -37.611 -41.825 -45.281 -48.225 -50.682 -52.842 -54.667 -56.421 -57.865 -59.117 -60.295 -61.379 -62.355 -63.226 -64.141 -64.946 -65.624 -66.328 -67.046 -67.633 -68.222 -68.829 -69.323 -69.84 -70.36 -70.906 -71.476 -71.857 -72.256 -72.89 -73.298 -73.707 -73.927 -74.398 -74.898 -75.409 -75.698 -76.132 -76.615 -76.928 -77.269 -78.026 -78.43 -78.888 -79.413 -79.987 -80.805 -82.104 -7 ,20251 ,TETRA ,17557311,Fri Nov 26 09:35:45 CET,Fri Nov 26 11:54:04 CET,0.0 0.058 0.138 0.204 0.236 0.272 0.302 0.322 0.321 0.327 0.291 0.355 0.356 0.351 0.331 0.295 0.281 0.268 0.238 0.177 0.141 0.104 0.049 -0.007 -0.068 -0.124 -0.188 -0.294 -0.409 -0.53 -0.706 -0.874 -1.036 -1.246 -1.505 -1.78 -2.109 -2.496 -2.925 -3.401 -3.982 -4.76 -5.666 -6.767 -8.085 -9.749 -11.878 -14.963 -19.519 -26.428 -33.705 -39.144 -43.468 -46.935 -49.895 -52.362 -54.474 -56.234 -57.925 -59.36 -60.622 -61.794 -62.879 -63.88 -64.773 -65.68 -66.481 -67.167 -67.874 -68.599 -69.195 -69.795 -70.417 -70.895 -71.38 -71.857 -72.346 -72.879 -73.246 -73.611 -74.199 -74.627 -75.052 -75.272 -75.738 -76.229 -76.748 -77.045 -77.508 -78.101 -78.489 -78.889 -79.653 -80.052 -80.48 -80.942 -81.521 -82.254 -83.191 -8 ,19647 ,TETRA ,17557312,Fri Nov 26 09:36:45 CET,Fri Nov 26 11:36:10 CET,0.0 0.072 0.128 0.175 0.222 0.273 0.32 0.398 0.436 0.466 0.436 0.511 0.522 0.541 0.528 0.509 0.507 0.505 0.496 0.463 0.43 0.4 0.358 0.31 0.258 0.198 0.119 0.009 -0.095 -0.196 -0.329 -0.487 -0.653 -0.846 -1.085 -1.327 -1.614 -1.969 -2.42 -2.953 -3.597 -4.388 -5.243 -6.373 -7.826 -9.678 -12.081 -15.249 -19.534 -26.133 -33.182 -38.468 -42.678 -46.104 -49.021 -51.457 -53.608 -55.451 -57.226 -58.707 -60.014 -61.238 -62.372 -63.407 -64.347 -65.298 -66.131 -66.857 -67.584 -68.323 -68.957 -69.614 -70.286 -70.81 -71.342 -71.89 -72.466 -73.05 -73.446 -73.861 -74.514 -74.96 -75.426 -75.667 -76.165 -76.695 -77.254 -77.536 -77.936 -78.374 -78.663 -78.964 -79.702 -80.137 -80.598 -81.091 -81.791 -82.683 -83.823 -9 ,14236 ,TETRA ,17557313,Fri Nov 26 09:36:45 CET,Fri Nov 26 11:59:49 CET,0.0 0.242 0.347 0.413 0.458 0.496 0.522 0.578 0.609 0.626 0.576 0.649 0.652 0.649 0.654 0.65 0.653 0.648 0.637 0.631 0.619 0.602 0.558 0.498 0.429 0.361 0.29 0.19 0.097 0.005 -0.138 -0.292 -0.446 -0.638 -0.868 -1.128 -1.459 -1.863 -2.32 -2.807 -3.368 -4.072 -4.883 -5.984 -7.38 -9.169 -11.355 -14.283 -18.579 -25.266 -32.474 -37.903 -42.197 -45.679 -48.622 -51.083 -53.257 -55.087 -56.809 -58.216 -59.46 -60.638 -61.728 -62.717 -63.59 -64.481 -65.288 -66.012 -66.76 -67.494 -68.084 -68.704 -69.374 -69.923 -70.495 -71.057 -71.644 -72.269 -72.695 -73.106 -73.712 -74.132 -74.579 -74.807 -75.262 -75.761 -76.309 -76.608 -77.038 -77.512 -77.829 -78.172 -79.029 -79.553 -80.098 -80.619 -81.231 -82.025 -83.098 -10 ,10671 ,TETRA ,17557314,Fri Nov 26 09:35:45 CET,Fri Nov 26 11:34:24 CET,0.0 0.073 0.149 0.246 0.315 0.358 0.389 0.448 0.474 0.486 0.427 0.492 0.497 0.501 0.491 0.476 0.471 0.453 0.425 0.392 0.371 0.336 0.265 0.198 0.129 0.05 -0.03 -0.133 -0.234 -0.342 -0.503 -0.679 -0.854 -1.073 -1.361 -1.674 -2.037 -2.432 -2.871 -3.376 -3.988 -4.751 -5.606 -6.742 -8.131 -9.925 -12.201 -15.219 -19.395 -25.794 -32.671 -37.812 -41.967 -45.388 -48.304 -50.747 -52.864 -54.65 -56.395 -57.848 -59.088 -60.235 -61.313 -62.303 -63.202 -64.127 -64.941 -65.645 -66.365 -67.117 -67.731 -68.35 -68.999 -69.521 -70.039 -70.555 -71.105 -71.673 -72.057 -72.439 -73.042 -73.477 -73.914 -74.15 -74.651 -75.165 -75.69 -75.947 -76.346 -76.82 -77.174 -77.554 -78.326 -78.792 -79.37 -79.978 -80.56 -81.239 -82.226 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index d751fff0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11816 ,TETRA ,17557315,Fri Nov 26 09:35:44 CET,Fri Nov 26 11:57:40 CET,0.0 0.906 1.276 1.572 1.838 2.111 2.354 2.552 2.894 3.049 3.197 3.358 3.6 3.738 4.003 4.266 4.538 4.666 4.894 5.104 5.41 5.605 5.804 6.102 6.374 6.647 6.918 7.169 7.478 7.787 8.11 8.516 8.899 9.255 9.675 10.15 10.593 11.073 11.608 12.177 12.776 13.489 14.327 15.159 16.158 17.237 18.446 19.787 21.288 22.995 24.885 25.959 26.231 26.198 26.051 25.778 25.42 25.066 24.691 24.211 23.778 23.427 23.064 22.676 22.323 22.035 21.745 21.467 21.207 20.941 20.653 20.4 20.154 19.888 19.65 19.394 19.153 18.912 18.626 18.418 18.209 17.891 17.659 17.408 17.286 17.021 16.711 16.392 16.248 15.999 15.764 15.585 15.396 14.992 14.791 14.599 14.357 13.999 13.522 12.982 11.621 -2 ,9256 ,TETRA ,17557316,Fri Nov 26 09:35:44 CET,Fri Nov 26 11:39:33 CET,0.0 0.574 0.863 1.175 1.511 1.803 2.067 2.308 2.759 2.979 3.184 3.436 3.698 3.83 4.072 4.314 4.559 4.675 4.909 5.13 5.437 5.647 5.85 6.142 6.413 6.665 6.928 7.195 7.538 7.854 8.144 8.504 8.865 9.204 9.596 10.057 10.511 11.015 11.551 12.1 12.679 13.36 14.144 14.912 15.773 16.713 17.878 19.167 20.593 22.156 23.606 24.322 24.413 24.268 24.026 23.709 23.339 22.937 22.569 22.182 21.832 21.463 21.063 20.709 20.387 20.062 19.707 19.403 19.156 18.911 18.65 18.426 18.189 17.943 17.763 17.552 17.316 17.087 16.841 16.668 16.457 16.065 15.827 15.604 15.481 15.214 14.93 14.641 14.494 14.231 13.944 13.756 13.573 13.157 12.923 12.645 12.3 11.881 11.433 10.894 9.019 -3 ,30482 ,TETRA ,17557317,Fri Nov 26 09:36:45 CET,Fri Nov 26 12:10:03 CET,0.0 1.193 1.544 1.806 2.024 2.207 2.372 2.551 2.902 3.061 3.227 3.434 3.698 3.85 4.12 4.364 4.604 4.728 4.978 5.217 5.549 5.767 5.987 6.317 6.625 6.907 7.17 7.421 7.752 8.081 8.417 8.814 9.174 9.543 10.006 10.521 11.007 11.541 12.154 12.828 13.548 14.326 15.188 16.01 16.902 17.862 18.952 20.212 21.7 23.337 25.046 26.107 26.314 26.186 25.984 25.734 25.439 25.151 24.841 24.478 24.167 23.876 23.553 23.21 22.879 22.555 22.197 21.895 21.621 21.319 21.007 20.725 20.425 20.133 19.892 19.645 19.397 19.136 18.869 18.688 18.507 18.197 17.98 17.77 17.644 17.37 17.107 16.821 16.665 16.403 16.155 15.964 15.76 15.3 15.03 14.759 14.499 14.183 13.771 13.159 11.63 -4 ,14236 ,TETRA ,17557318,Fri Nov 26 09:36:45 CET,Fri Nov 26 11:56:30 CET,0.0 0.883 1.211 1.484 1.739 1.943 2.13 2.305 2.612 2.767 2.907 3.046 3.281 3.4 3.633 3.882 4.122 4.246 4.491 4.707 5.012 5.206 5.397 5.686 5.982 6.265 6.543 6.815 7.146 7.486 7.831 8.227 8.582 8.928 9.343 9.81 10.272 10.773 11.279 11.83 12.437 13.136 13.973 14.806 15.771 16.872 18.114 19.495 21.089 22.796 24.504 25.502 25.898 25.877 25.556 25.173 24.783 24.375 23.97 23.52 23.126 22.801 22.476 22.158 21.872 21.597 21.266 20.94 20.674 20.414 20.143 19.916 19.677 19.42 19.211 18.988 18.747 18.482 18.205 18.014 17.807 17.462 17.218 16.968 16.84 16.574 16.296 15.986 15.824 15.583 15.368 15.18 14.975 14.503 14.229 13.949 13.647 13.305 12.84 12.188 10.334 -5 ,23955 ,TETRA ,17557319,Fri Nov 26 09:37:46 CET,Fri Nov 26 12:00:45 CET,0.0 1.343 1.85 2.127 2.364 2.576 2.766 2.963 3.329 3.482 3.636 3.818 4.064 4.194 4.462 4.733 4.996 5.121 5.364 5.598 5.911 6.106 6.298 6.573 6.847 7.119 7.377 7.622 7.935 8.243 8.552 8.929 9.281 9.62 10.022 10.487 10.966 11.489 12.05 12.669 13.329 14.087 14.982 15.849 16.797 17.863 19.081 20.449 22.028 23.662 25.204 26.171 26.51 26.407 26.166 25.882 25.615 25.359 25.098 24.806 24.511 24.215 23.91 23.608 23.323 23.048 22.774 22.533 22.312 22.048 21.761 21.536 21.316 21.071 20.859 20.656 20.454 20.2 19.891 19.684 19.482 19.177 18.974 18.745 18.625 18.375 18.118 17.823 17.661 17.415 17.224 17.073 16.92 16.541 16.291 16.024 15.76 15.465 15.093 14.493 12.941 -6 ,14879 ,TETRA ,17557320,Fri Nov 26 09:37:47 CET,Fri Nov 26 12:06:13 CET,0.0 1.258 1.802 2.178 2.393 2.584 2.767 2.931 3.245 3.397 3.552 3.723 3.973 4.118 4.408 4.681 4.94 5.066 5.322 5.575 5.921 6.14 6.351 6.656 6.955 7.239 7.509 7.778 8.109 8.415 8.706 9.051 9.414 9.777 10.177 10.628 11.077 11.57 12.093 12.666 13.307 14.03 14.851 15.644 16.608 17.725 18.941 20.331 21.915 23.549 25.31 26.402 26.721 26.733 26.534 26.224 25.937 25.635 25.296 24.936 24.606 24.325 24.062 23.745 23.434 23.162 22.886 22.627 22.375 22.079 21.764 21.511 21.231 20.964 20.776 20.572 20.35 20.108 19.86 19.681 19.498 19.205 18.974 18.747 18.634 18.406 18.163 17.882 17.73 17.489 17.291 17.134 16.942 16.498 16.252 15.962 15.657 15.337 14.954 14.404 12.927 -7 ,15671 ,TETRA ,17557321,Fri Nov 26 09:39:44 CET,Fri Nov 26 12:03:41 CET,0.0 0.774 1.112 1.421 1.668 1.835 1.997 2.158 2.46 2.6 2.737 2.908 3.151 3.276 3.509 3.734 3.962 4.07 4.271 4.482 4.807 5.016 5.197 5.436 5.673 5.923 6.177 6.427 6.779 7.128 7.457 7.832 8.175 8.516 8.924 9.392 9.839 10.315 10.865 11.474 12.116 12.863 13.73 14.603 15.622 16.739 18.021 19.446 21.033 22.766 24.56 25.6 25.969 25.999 25.79 25.5 25.164 24.775 24.4 23.998 23.605 23.235 22.903 22.595 22.289 21.992 21.686 21.41 21.157 20.876 20.557 20.285 19.982 19.676 19.467 19.251 19.019 18.759 18.484 18.304 18.105 17.78 17.554 17.316 17.191 16.916 16.617 16.286 16.117 15.848 15.59 15.39 15.174 14.761 14.509 14.229 13.915 13.557 13.163 12.573 10.526 -8 ,30122 ,TETRA ,17557322,Fri Nov 26 09:39:44 CET,Fri Nov 26 11:42:33 CET,0.0 0.869 1.157 1.389 1.633 1.871 2.08 2.265 2.621 2.809 2.986 3.188 3.445 3.588 3.857 4.12 4.379 4.51 4.759 5.004 5.347 5.549 5.758 6.046 6.316 6.587 6.853 7.117 7.448 7.782 8.111 8.49 8.852 9.199 9.608 10.076 10.528 11.033 11.588 12.198 12.83 13.535 14.376 15.217 16.141 17.147 18.311 19.624 21.205 23.004 25.015 26.255 26.52 26.526 26.402 26.123 25.806 25.482 25.153 24.773 24.428 24.134 23.827 23.501 23.182 22.897 22.606 22.302 22.004 21.695 21.365 21.084 20.806 20.519 20.283 20.012 19.746 19.487 19.197 19.01 18.816 18.486 18.259 18.021 17.883 17.591 17.292 16.947 16.753 16.465 16.187 15.995 15.796 15.33 15.048 14.765 14.451 14.07 13.569 12.841 9.751 -9 ,6475 ,TETRA ,17557323,Fri Nov 26 09:39:44 CET,Fri Nov 26 11:43:26 CET,0.0 0.421 0.716 1.0 1.279 1.536 1.74 1.922 2.246 2.396 2.539 2.709 2.956 3.089 3.355 3.598 3.839 3.947 4.148 4.358 4.672 4.877 5.074 5.36 5.638 5.894 6.149 6.42 6.771 7.103 7.425 7.81 8.173 8.522 8.945 9.415 9.848 10.32 10.848 11.417 11.993 12.644 13.413 14.191 15.136 16.172 17.252 18.391 19.732 21.323 23.021 23.926 24.078 23.92 23.622 23.27 22.868 22.387 21.918 21.457 21.059 20.718 20.402 20.084 19.753 19.421 19.071 18.771 18.511 18.254 18.001 17.769 17.498 17.226 17.018 16.792 16.555 16.322 16.095 15.911 15.691 15.369 15.155 14.925 14.816 14.595 14.336 14.039 13.893 13.654 13.433 13.266 13.089 12.685 12.45 12.188 11.883 11.531 11.139 10.599 8.602 -10 ,29222 ,TETRA ,17557324,Fri Nov 26 09:39:44 CET,Fri Nov 26 12:03:42 CET,0.0 0.939 1.25 1.516 1.787 2.049 2.291 2.54 2.943 3.108 3.266 3.447 3.71 3.858 4.138 4.394 4.634 4.753 4.999 5.25 5.603 5.825 6.043 6.35 6.653 6.958 7.261 7.545 7.9 8.248 8.582 8.998 9.389 9.764 10.211 10.697 11.155 11.669 12.24 12.841 13.437 14.094 14.875 15.684 16.657 17.728 18.912 20.174 21.608 23.144 24.666 25.585 25.917 25.941 25.804 25.623 25.336 25.018 24.732 24.365 23.992 23.654 23.317 22.987 22.673 22.377 22.055 21.771 21.557 21.335 21.063 20.813 20.544 20.255 20.019 19.779 19.543 19.305 19.059 18.877 18.673 18.359 18.149 17.928 17.804 17.516 17.246 16.988 16.84 16.567 16.278 16.076 15.883 15.452 15.177 14.892 14.59 14.27 13.916 13.311 11.911 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt deleted file mode 100644 index 0ac73dae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9116 ,KEBNE ,17132039,Sat Jan 1 17:38:16 CET,Sat Jan 1 19:42:43 CET,0.0 2.56 3.125 3.634 4.054 4.408 4.762 5.095 5.632 5.871 6.122 6.483 6.814 7.02 7.416 7.761 8.064 8.215 8.514 8.783 9.149 9.405 9.655 10.018 10.405 10.765 11.078 11.37 11.749 12.121 12.485 12.932 13.362 13.77 14.245 14.789 15.277 15.782 16.313 16.866 17.467 18.114 18.817 19.49 20.292 21.197 22.143 23.036 23.88 24.639 24.958 24.7 24.219 23.612 22.989 22.364 21.671 20.927 20.318 19.724 19.184 18.662 18.123 17.593 17.109 16.686 16.249 15.859 15.534 15.202 14.823 14.496 14.196 13.881 13.592 13.303 13.028 12.727 12.429 12.231 12.017 11.663 11.403 11.135 10.995 10.687 10.371 10.071 9.908 9.604 9.318 9.099 8.848 8.308 8.014 7.68 7.298 6.891 6.353 5.614 -2.912 -2 ,11957 ,KEBNE ,17132040,Sat Jan 1 17:38:15 CET,Sat Jan 1 19:43:15 CET,0.0 3.773 4.455 4.94 5.339 5.706 6.064 6.354 6.86 7.13 7.388 7.716 8.038 8.239 8.606 8.947 9.254 9.398 9.692 9.99 10.413 10.675 10.922 11.27 11.589 11.904 12.218 12.511 12.876 13.217 13.555 13.962 14.375 14.804 15.274 15.785 16.271 16.804 17.384 17.953 18.521 19.164 19.904 20.602 21.366 22.193 23.107 24.057 25.072 26.098 26.706 26.659 26.288 25.723 25.078 24.42 23.761 23.084 22.449 21.797 21.23 20.738 20.263 19.81 19.378 18.972 18.553 18.181 17.851 17.489 17.102 16.773 16.416 16.064 15.81 15.55 15.281 14.998 14.697 14.476 14.261 13.942 13.696 13.446 13.313 13.021 12.707 12.338 12.142 11.855 11.605 11.407 11.198 10.756 10.517 10.246 9.918 9.561 9.164 8.631 6.43 -3 ,21583 ,KEBNE ,17132041,Sat Jan 1 17:38:16 CET,Sat Jan 1 19:43:19 CET,0.0 2.51 3.18 3.719 4.139 4.523 4.844 5.148 5.674 5.882 6.088 6.409 6.717 6.918 7.307 7.644 7.953 8.116 8.447 8.751 9.172 9.433 9.675 10.001 10.32 10.612 10.897 11.183 11.529 11.866 12.196 12.595 12.968 13.317 13.74 14.217 14.668 15.16 15.678 16.187 16.712 17.335 18.016 18.672 19.467 20.29 21.145 22.036 22.916 23.716 24.301 24.101 23.515 22.87 22.127 21.391 20.676 19.945 19.278 18.607 18.025 17.513 17.008 16.497 16.057 15.693 15.324 14.978 14.666 14.319 13.943 13.639 13.313 12.992 12.758 12.494 12.215 11.952 11.68 11.468 11.23 10.855 10.6 10.347 10.225 9.963 9.653 9.308 9.12 8.823 8.561 8.359 8.143 7.633 7.331 7.022 6.661 6.225 5.695 4.914 0.95 -4 ,1076 ,KEBNE ,17132042,Sat Jan 1 17:39:17 CET,Sat Jan 1 19:44:08 CET,0.0 2.287 2.827 3.288 3.686 4.043 4.378 4.69 5.26 5.492 5.697 6.003 6.319 6.501 6.85 7.199 7.516 7.663 7.938 8.215 8.6 8.812 9.034 9.36 9.67 9.985 10.288 10.573 10.913 11.229 11.561 11.995 12.406 12.779 13.208 13.719 14.207 14.733 15.311 15.893 16.448 17.059 17.753 18.424 19.208 20.065 20.976 21.922 22.912 23.873 24.606 24.628 24.141 23.463 22.755 22.049 21.379 20.729 20.168 19.625 19.088 18.601 18.158 17.698 17.24 16.803 16.309 15.87 15.504 15.113 14.729 14.415 14.072 13.723 13.435 13.131 12.832 12.545 12.255 12.033 11.791 11.423 11.184 10.95 10.827 10.57 10.298 10.009 9.867 9.607 9.427 9.258 9.051 8.627 8.389 8.118 7.814 7.461 7.054 6.474 4.285 -5 ,5191 ,KEBNE ,17132043,Sat Jan 1 17:39:17 CET,Sat Jan 1 19:44:57 CET,0.0 3.592 4.344 4.898 5.352 5.746 6.14 6.468 6.979 7.205 7.416 7.715 8.016 8.209 8.551 8.841 9.127 9.268 9.534 9.784 10.17 10.416 10.646 11.002 11.353 11.672 11.979 12.273 12.646 13.013 13.359 13.777 14.17 14.538 14.97 15.457 15.914 16.398 16.941 17.533 18.115 18.74 19.465 20.208 21.047 21.908 22.795 23.741 24.784 25.733 26.505 26.543 25.949 25.186 24.456 23.79 23.191 22.573 21.986 21.391 20.767 20.145 19.589 19.07 18.58 18.15 17.711 17.321 17.001 16.667 16.302 15.988 15.668 15.34 15.084 14.801 14.505 14.224 13.94 13.737 13.512 13.131 12.87 12.613 12.478 12.179 11.859 11.528 11.363 11.088 10.822 10.596 10.355 9.847 9.546 9.217 8.867 8.474 8.047 7.436 3.409 -6 ,3018 ,KEBNE ,17132044,Sat Jan 1 17:39:17 CET,Sat Jan 1 19:45:13 CET,0.0 3.459 4.099 4.577 4.938 5.272 5.602 5.895 6.429 6.671 6.914 7.265 7.58 7.76 8.099 8.406 8.688 8.824 9.11 9.402 9.776 10.02 10.263 10.596 10.909 11.194 11.469 11.754 12.113 12.458 12.792 13.17 13.532 13.881 14.305 14.791 15.231 15.708 16.25 16.844 17.452 18.104 18.78 19.429 20.19 20.951 21.73 22.615 23.566 24.367 24.856 24.628 24.048 23.335 22.592 21.803 21.09 20.48 19.925 19.317 18.782 18.325 17.898 17.469 17.047 16.655 16.208 15.791 15.426 15.055 14.695 14.399 14.069 13.685 13.411 13.15 12.863 12.564 12.269 12.059 11.817 11.428 11.149 10.869 10.729 10.436 10.136 9.809 9.631 9.336 9.069 8.868 8.642 8.13 7.866 7.574 7.194 6.772 6.237 5.439 2.354 -7 ,15413 ,KEBNE ,17132045,Sat Jan 1 17:39:21 CET,Sat Jan 1 19:44:39 CET,0.0 3.528 4.355 4.881 5.3 5.684 6.054 6.396 6.966 7.209 7.43 7.701 7.986 8.161 8.49 8.793 9.095 9.244 9.552 9.841 10.222 10.472 10.723 11.073 11.4 11.701 11.975 12.237 12.578 12.917 13.255 13.653 14.015 14.366 14.799 15.307 15.778 16.292 16.854 17.42 18.004 18.677 19.412 20.044 20.714 21.45 22.298 23.187 24.123 24.945 25.403 25.184 24.585 23.889 23.179 22.42 21.726 21.071 20.453 19.857 19.309 18.787 18.29 17.792 17.337 16.95 16.529 16.137 15.775 15.389 15.009 14.666 14.276 13.873 13.579 13.285 12.984 12.675 12.36 12.132 11.884 11.52 11.275 11.019 10.883 10.572 10.239 9.887 9.695 9.397 9.12 8.913 8.709 8.253 7.977 7.656 7.253 6.787 6.28 5.604 1.916 -8 ,4222 ,KEBNE ,17132046,Sat Jan 1 17:39:21 CET,Sat Jan 1 19:41:49 CET,0.0 2.918 3.731 4.343 4.798 5.182 5.515 5.825 6.42 6.683 6.917 7.215 7.509 7.686 8.042 8.367 8.67 8.817 9.109 9.38 9.74 9.978 10.223 10.573 10.889 11.189 11.469 11.729 12.093 12.446 12.777 13.197 13.593 13.96 14.387 14.873 15.315 15.799 16.322 16.869 17.441 18.031 18.776 19.619 20.521 21.407 22.399 23.465 24.544 25.558 26.345 26.395 25.931 25.232 24.445 23.623 22.838 22.126 21.51 20.867 20.306 19.798 19.334 18.903 18.49 18.096 17.678 17.303 16.951 16.604 16.264 15.967 15.635 15.275 14.995 14.708 14.421 14.11 13.785 13.58 13.342 12.919 12.626 12.349 12.209 11.912 11.621 11.296 11.121 10.836 10.553 10.341 10.115 9.636 9.364 9.03 8.707 8.373 7.87 7.25 3.406 -9 ,21875 ,KEBNE ,17132047,Sat Jan 1 17:40:18 CET,Sat Jan 1 19:44:21 CET,0.0 4.089 4.701 5.143 5.529 5.83 6.073 6.308 6.756 6.957 7.144 7.425 7.723 7.901 8.216 8.537 8.858 8.996 9.25 9.496 9.841 10.05 10.271 10.641 10.982 11.264 11.52 11.784 12.157 12.532 12.886 13.313 13.725 14.076 14.465 14.912 15.334 15.795 16.288 16.804 17.341 17.935 18.627 19.285 20.002 20.887 21.873 22.772 23.638 24.38 24.895 24.703 23.981 23.076 22.25 21.529 20.804 20.109 19.496 18.864 18.334 17.872 17.444 17.024 16.626 16.272 15.905 15.572 15.248 14.891 14.563 14.295 13.998 13.696 13.465 13.211 12.93 12.642 12.341 12.129 11.879 11.479 11.224 10.969 10.827 10.532 10.25 9.947 9.773 9.463 9.191 8.994 8.769 8.277 8.014 7.709 7.383 7.037 6.607 5.989 3.476 -10 ,24595 ,KEBNE ,17132048,Sat Jan 1 17:40:18 CET,Sat Jan 1 19:44:50 CET,0.0 3.6 4.416 4.904 5.273 5.576 5.887 6.192 6.726 6.955 7.175 7.495 7.805 8.009 8.394 8.743 9.108 9.286 9.604 9.915 10.383 10.667 10.939 11.338 11.722 12.098 12.451 12.772 13.15 13.521 13.904 14.368 14.786 15.139 15.547 16.037 16.492 16.973 17.48 17.983 18.516 19.139 19.9 20.621 21.376 22.134 22.978 23.898 24.769 25.63 26.312 26.09 25.455 24.776 24.075 23.352 22.666 22.023 21.401 20.713 20.125 19.584 19.069 18.608 18.193 17.824 17.422 17.04 16.672 16.271 15.851 15.48 15.092 14.681 14.356 14.023 13.675 13.317 12.929 12.653 12.37 11.928 11.631 11.344 11.196 10.865 10.504 10.165 9.994 9.686 9.36 9.116 8.86 8.363 8.094 7.784 7.436 7.017 6.481 5.748 1.811 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt deleted file mode 100644 index 8712e5e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28473 ,TETRA ,17557325,Fri Nov 26 09:40:45 CET,Fri Nov 26 11:52:09 CET,0.0 1.478 1.864 2.146 2.377 2.558 2.707 2.849 3.141 3.278 3.412 3.551 3.766 3.869 4.108 4.341 4.532 4.631 4.836 5.011 5.262 5.429 5.584 5.821 6.054 6.269 6.48 6.671 6.928 7.187 7.445 7.773 8.083 8.398 8.764 9.156 9.525 9.909 10.313 10.723 11.174 11.687 12.242 12.798 13.464 14.174 14.915 15.749 16.758 17.814 18.727 19.115 19.122 18.916 18.597 18.19 17.77 17.318 16.907 16.497 16.125 15.798 15.481 15.157 14.812 14.495 14.182 13.899 13.658 13.418 13.163 12.929 12.664 12.39 12.183 11.964 11.738 11.498 11.248 11.093 10.937 10.688 10.496 10.274 10.159 9.931 9.699 9.443 9.303 9.051 8.853 8.679 8.497 8.102 7.9 7.687 7.434 7.143 6.781 6.314 4.871 -2 ,2090 ,TETRA ,17557326,Fri Nov 26 09:40:45 CET,Fri Nov 26 11:44:22 CET,0.0 0.888 1.186 1.443 1.672 1.847 1.999 2.157 2.451 2.589 2.731 2.87 3.099 3.213 3.429 3.659 3.868 3.966 4.179 4.38 4.648 4.826 4.998 5.252 5.507 5.745 5.972 6.198 6.474 6.736 6.989 7.285 7.571 7.846 8.151 8.491 8.82 9.183 9.556 9.946 10.37 10.829 11.371 11.94 12.572 13.255 14.049 14.914 15.858 16.859 17.839 18.307 18.251 18.038 17.739 17.359 17.01 16.661 16.285 15.905 15.571 15.253 14.94 14.645 14.353 14.06 13.769 13.518 13.293 13.045 12.776 12.555 12.326 12.082 11.882 11.679 11.487 11.293 11.066 10.904 10.744 10.49 10.317 10.126 10.023 9.817 9.596 9.34 9.212 8.975 8.791 8.653 8.501 8.177 7.985 7.768 7.535 7.259 6.924 6.537 5.516 -3 ,6917 ,TETRA ,17557327,Fri Nov 26 09:41:45 CET,Fri Nov 26 12:09:11 CET,0.0 0.917 1.259 1.549 1.788 2.027 2.255 2.445 2.763 2.908 3.035 3.169 3.394 3.499 3.705 3.91 4.118 4.218 4.402 4.582 4.823 4.972 5.124 5.348 5.579 5.813 6.03 6.252 6.537 6.81 7.071 7.374 7.679 7.971 8.294 8.639 8.948 9.297 9.698 10.116 10.553 11.045 11.635 12.243 12.943 13.711 14.469 15.192 16.027 16.969 17.848 18.11 17.959 17.648 17.275 16.862 16.426 16.013 15.673 15.304 14.937 14.592 14.253 13.934 13.635 13.352 13.073 12.81 12.571 12.295 12.006 11.789 11.561 11.321 11.136 10.953 10.747 10.521 10.288 10.118 9.94 9.667 9.48 9.287 9.179 8.948 8.711 8.469 8.348 8.105 7.868 7.691 7.518 7.14 6.929 6.701 6.438 6.127 5.742 5.227 3.586 -4 ,17948 ,TETRA ,17557328,Fri Nov 26 09:41:45 CET,Fri Nov 26 12:05:26 CET,0.0 0.827 1.155 1.376 1.56 1.717 1.863 2.004 2.295 2.455 2.614 2.775 3.009 3.125 3.352 3.571 3.765 3.868 4.072 4.253 4.506 4.675 4.855 5.132 5.396 5.633 5.879 6.126 6.425 6.701 6.961 7.262 7.532 7.786 8.115 8.514 8.878 9.269 9.688 10.126 10.59 11.121 11.712 12.263 12.914 13.676 14.492 15.353 16.293 17.3 18.229 18.569 18.406 18.062 17.681 17.292 16.916 16.544 16.206 15.863 15.544 15.233 14.918 14.592 14.286 14.019 13.72 13.424 13.178 12.931 12.68 12.48 12.24 11.988 11.814 11.636 11.446 11.218 10.977 10.825 10.651 10.354 10.148 9.94 9.839 9.634 9.406 9.165 9.035 8.801 8.658 8.507 8.336 7.966 7.79 7.602 7.365 7.099 6.763 6.31 5.535 -5 ,29647 ,TETRA ,17557329,Fri Nov 26 09:41:45 CET,Fri Nov 26 12:08:17 CET,0.0 0.936 1.228 1.465 1.69 1.893 2.064 2.205 2.446 2.591 2.759 2.966 3.231 3.386 3.665 3.909 4.145 4.257 4.451 4.627 4.894 5.059 5.219 5.461 5.699 5.948 6.192 6.415 6.692 6.975 7.246 7.555 7.845 8.113 8.436 8.818 9.164 9.542 9.965 10.421 10.868 11.35 11.927 12.486 13.074 13.718 14.483 15.305 16.182 17.108 18.1 18.462 18.312 18.031 17.699 17.347 16.941 16.489 16.101 15.73 15.381 15.054 14.724 14.385 14.082 13.814 13.519 13.242 13.002 12.753 12.487 12.277 12.056 11.812 11.612 11.404 11.198 10.973 10.713 10.536 10.355 10.048 9.838 9.623 9.505 9.258 8.998 8.725 8.581 8.316 8.1 7.933 7.745 7.313 7.103 6.907 6.651 6.365 6.03 5.593 4.27 -6 ,20921 ,TETRA ,17557330,Fri Nov 26 09:42:45 CET,Fri Nov 26 12:05:55 CET,0.0 0.809 1.143 1.39 1.625 1.849 2.077 2.279 2.609 2.753 2.884 3.022 3.255 3.368 3.603 3.831 4.039 4.143 4.344 4.536 4.792 4.955 5.121 5.354 5.58 5.815 6.043 6.263 6.537 6.793 7.045 7.34 7.612 7.88 8.199 8.559 8.914 9.299 9.709 10.138 10.594 11.118 11.723 12.308 12.957 13.655 14.405 15.193 16.066 17.051 17.907 18.222 18.137 17.886 17.622 17.29 16.956 16.616 16.257 15.898 15.597 15.303 15.013 14.739 14.459 14.177 13.884 13.601 13.331 13.039 12.722 12.482 12.243 11.992 11.805 11.613 11.414 11.205 10.98 10.813 10.644 10.401 10.223 10.037 9.949 9.753 9.524 9.289 9.168 8.928 8.768 8.621 8.459 8.106 7.915 7.708 7.49 7.261 6.987 6.622 5.611 -7 ,6319 ,TETRA ,17557331,Fri Nov 26 09:42:46 CET,Fri Nov 26 12:07:14 CET,0.0 0.926 1.214 1.449 1.67 1.843 1.996 2.149 2.449 2.597 2.735 2.893 3.129 3.244 3.483 3.697 3.887 3.988 4.195 4.39 4.661 4.823 4.998 5.281 5.549 5.794 6.009 6.208 6.467 6.711 6.958 7.271 7.564 7.842 8.159 8.533 8.916 9.327 9.747 10.191 10.652 11.155 11.732 12.342 13.078 13.873 14.739 15.628 16.596 17.624 18.74 19.29 19.326 19.132 18.791 18.372 17.928 17.472 17.08 16.709 16.336 15.989 15.678 15.389 15.112 14.829 14.54 14.274 14.01 13.738 13.458 13.229 12.987 12.737 12.548 12.342 12.128 11.912 11.686 11.514 11.345 11.099 10.909 10.7 10.586 10.364 10.152 9.927 9.807 9.563 9.362 9.211 9.071 8.757 8.561 8.326 8.03 7.681 7.246 6.798 5.389 -8 ,15624 ,TETRA ,17557332,Fri Nov 26 09:42:45 CET,Fri Nov 26 12:07:07 CET,0.0 0.66 0.961 1.186 1.378 1.534 1.67 1.823 2.124 2.256 2.401 2.574 2.812 2.936 3.212 3.506 3.741 3.835 4.022 4.213 4.503 4.686 4.85 5.082 5.311 5.543 5.779 6.006 6.28 6.526 6.762 7.06 7.36 7.642 7.96 8.316 8.661 9.032 9.433 9.856 10.288 10.832 11.478 12.11 12.858 13.625 14.477 15.389 16.332 17.289 18.236 18.644 18.611 18.444 18.149 17.734 17.322 16.92 16.537 16.132 15.774 15.45 15.147 14.86 14.584 14.339 14.073 13.803 13.551 13.294 13.033 12.818 12.594 12.342 12.127 11.907 11.698 11.492 11.268 11.108 10.95 10.697 10.504 10.296 10.192 9.993 9.78 9.55 9.417 9.177 9.024 8.871 8.712 8.372 8.199 7.994 7.714 7.396 7.061 6.63 5.513 -9 ,19518 ,TETRA ,17557333,Fri Nov 26 09:42:45 CET,Fri Nov 26 12:10:13 CET,0.0 0.598 0.894 1.153 1.355 1.546 1.729 1.898 2.191 2.348 2.501 2.631 2.862 2.986 3.206 3.43 3.638 3.734 3.919 4.105 4.382 4.571 4.759 5.023 5.279 5.511 5.719 5.921 6.179 6.424 6.649 6.941 7.223 7.492 7.824 8.205 8.572 8.954 9.359 9.768 10.194 10.714 11.278 11.789 12.386 13.063 13.847 14.668 15.577 16.536 17.412 17.634 17.409 17.069 16.675 16.278 15.846 15.392 14.966 14.523 14.127 13.771 13.421 13.086 12.787 12.496 12.178 11.91 11.681 11.41 11.118 10.887 10.653 10.413 10.208 9.987 9.76 9.529 9.286 9.117 8.957 8.683 8.486 8.278 8.173 7.967 7.741 7.491 7.353 7.115 6.951 6.784 6.597 6.219 6.02 5.797 5.57 5.27 4.884 4.377 2.769 -10 ,26233 ,TETRA ,17557334,Fri Nov 26 09:43:42 CET,Fri Nov 26 12:06:18 CET,0.0 0.646 0.948 1.201 1.43 1.63 1.814 1.982 2.278 2.419 2.549 2.702 2.944 3.064 3.275 3.49 3.711 3.809 4.021 4.239 4.519 4.7 4.878 5.137 5.377 5.612 5.835 6.047 6.316 6.572 6.817 7.109 7.4 7.688 8.035 8.4 8.735 9.113 9.53 9.957 10.403 10.917 11.502 12.09 12.81 13.548 14.283 15.113 16.0 16.905 17.78 18.053 17.865 17.591 17.232 16.797 16.356 15.934 15.566 15.18 14.811 14.448 14.125 13.826 13.518 13.221 12.899 12.601 12.34 12.086 11.809 11.579 11.353 11.097 10.894 10.685 10.456 10.206 9.946 9.763 9.571 9.269 9.071 8.865 8.754 8.546 8.316 8.063 7.928 7.676 7.493 7.335 7.168 6.794 6.575 6.325 6.003 5.665 5.312 4.774 3.004 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 766fce95..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,31928 ,TETRA ,17557336,Fri Nov 26 09:44:44 CET,Fri Nov 26 12:02:49 CET,0.0 2.446 3.311 3.905 4.28 4.629 4.978 5.327 5.959 6.234 6.482 6.802 7.163 7.328 7.639 7.933 8.229 8.372 8.665 8.958 9.367 9.634 9.892 10.273 10.632 10.966 11.289 11.597 12.019 12.432 12.812 13.266 13.707 14.12 14.591 15.124 15.63 16.195 16.787 17.416 18.089 18.815 19.618 20.371 21.227 22.18 23.261 24.442 25.711 27.126 28.626 29.434 29.517 29.306 28.966 28.57 28.154 27.652 27.158 26.688 26.266 25.838 25.401 24.94 24.481 24.083 23.663 23.277 22.917 22.511 22.07 21.699 21.311 20.916 20.623 20.315 19.996 19.669 19.295 19.042 18.805 18.413 18.126 17.824 17.664 17.314 16.934 16.541 16.333 15.976 15.66 15.411 15.136 14.568 14.255 13.901 13.527 13.04 12.379 11.475 7.226 -4 ,30759 ,TETRA ,17557338,Fri Nov 26 09:45:45 CET,Fri Nov 26 12:08:17 CET,0.0 10.611 11.328 11.903 12.416 12.819 13.135 13.401 13.906 14.147 14.356 14.578 14.918 15.099 15.45 15.785 16.107 16.268 16.584 16.863 17.234 17.471 17.705 18.049 18.393 18.72 19.031 19.337 19.728 20.107 20.474 20.918 21.342 21.741 22.203 22.706 23.173 23.695 24.242 24.8 25.383 26.02 26.795 27.582 28.464 29.571 30.968 32.442 34.079 35.786 37.334 38.272 38.643 38.584 38.206 37.689 37.155 36.597 36.041 35.442 34.906 34.393 33.845 33.313 32.848 32.416 31.915 31.44 31.029 30.608 30.15 29.752 29.353 28.956 28.633 28.288 27.922 27.536 27.138 26.843 26.537 26.081 25.757 25.411 25.234 24.831 24.382 23.939 23.711 23.352 23.061 22.815 22.526 21.861 21.489 21.075 20.623 20.07 19.372 18.442 14.856 -5 ,6714 ,TETRA ,17557339,Fri Nov 26 09:45:46 CET,Fri Nov 26 11:43:35 CET,0.0 3.118 3.821 4.289 4.66 4.994 5.323 5.641 6.158 6.364 6.563 6.813 7.143 7.316 7.639 7.944 8.251 8.398 8.702 9.01 9.424 9.692 9.976 10.373 10.73 11.07 11.418 11.775 12.187 12.56 12.921 13.376 13.805 14.186 14.623 15.121 15.603 16.117 16.678 17.3 17.941 18.629 19.439 20.233 21.132 22.118 23.195 24.408 26.034 28.049 30.066 31.274 31.592 31.539 31.209 30.638 29.993 29.374 28.846 28.272 27.732 27.207 26.68 26.19 25.74 25.318 24.844 24.373 23.939 23.5 23.049 22.666 22.276 21.882 21.588 21.249 20.869 20.502 20.141 19.877 19.593 19.148 18.832 18.494 18.313 17.956 17.532 17.058 16.838 16.484 16.147 15.882 15.594 14.917 14.516 14.092 13.623 13.101 12.481 11.676 7.417 -6 ,27858 ,TETRA ,17557340,Fri Nov 26 09:45:45 CET,Fri Nov 26 12:03:41 CET,0.0 5.726 6.465 7.067 7.55 7.981 8.374 8.738 9.398 9.658 9.887 10.212 10.589 10.804 11.21 11.592 11.937 12.103 12.419 12.694 13.052 13.28 13.516 13.867 14.233 14.597 14.923 15.24 15.642 16.003 16.34 16.773 17.19 17.566 17.978 18.421 18.873 19.394 19.952 20.525 21.118 21.78 22.538 23.312 24.225 25.222 26.328 27.499 28.721 30.023 31.329 31.988 32.037 31.721 31.223 30.658 30.12 29.583 29.088 28.564 28.057 27.576 27.098 26.611 26.136 25.705 25.258 24.842 24.483 24.108 23.699 23.357 23.015 22.658 22.365 22.063 21.732 21.385 21.013 20.75 20.483 20.035 19.704 19.373 19.222 18.872 18.461 18.05 17.844 17.499 17.136 16.838 16.525 15.825 15.405 14.944 14.459 13.923 13.253 12.34 8.483 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index 1d5337c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,12946 ,TETRA ,17557346,Fri Nov 26 09:46:44 CET,Fri Nov 26 12:08:08 CET,0.0 2.863 3.686 4.124 4.4 4.683 4.926 5.128 5.535 5.766 5.968 6.149 6.442 6.597 6.882 7.146 7.389 7.505 7.728 7.939 8.249 8.457 8.644 8.908 9.18 9.44 9.681 9.9 10.187 10.463 10.73 11.063 11.367 11.651 11.979 12.343 12.698 13.076 13.466 13.895 14.352 14.839 15.388 15.942 16.571 17.24 18.008 18.854 19.733 20.575 21.32 21.397 21.041 20.576 20.064 19.549 19.014 18.497 18.054 17.589 17.183 16.806 16.432 16.06 15.692 15.345 14.991 14.665 14.339 13.989 13.63 13.337 13.028 12.696 12.443 12.17 11.874 11.553 11.2 10.933 10.645 10.211 9.928 9.646 9.491 9.171 8.845 8.514 8.354 8.054 7.781 7.57 7.354 6.834 6.536 6.206 5.844 5.378 4.779 3.967 0.584 -3 ,19466 ,TETRA ,17557347,Fri Nov 26 09:46:44 CET,Fri Nov 26 11:50:28 CET,0.0 2.604 3.384 3.951 4.385 4.73 5.038 5.338 5.868 6.095 6.335 6.636 6.95 7.143 7.504 7.813 8.1 8.244 8.534 8.82 9.248 9.518 9.773 10.153 10.523 10.914 11.297 11.617 12.007 12.369 12.725 13.15 13.535 13.898 14.308 14.774 15.205 15.655 16.179 16.761 17.363 18.035 18.789 19.552 20.442 21.406 22.462 23.601 24.927 26.423 27.873 28.504 28.392 27.979 27.523 27.056 26.599 26.131 25.684 25.209 24.766 24.349 23.965 23.598 23.233 22.885 22.512 22.18 21.865 21.529 21.151 20.806 20.465 20.134 19.882 19.614 19.328 19.022 18.705 18.486 18.255 17.878 17.619 17.346 17.197 16.908 16.613 16.284 16.1 15.789 15.52 15.299 15.076 14.59 14.292 13.957 13.576 13.112 12.589 11.902 8.764 -4 ,1057 ,TETRA ,17557348,Fri Nov 26 09:46:44 CET,Fri Nov 26 12:07:18 CET,0.0 2.431 3.108 3.601 3.953 4.283 4.559 4.808 5.277 5.484 5.706 5.991 6.294 6.465 6.791 7.106 7.416 7.558 7.827 8.08 8.457 8.72 8.97 9.333 9.707 10.073 10.404 10.699 11.087 11.474 11.834 12.29 12.738 13.146 13.615 14.131 14.61 15.155 15.73 16.319 16.946 17.635 18.441 19.26 20.197 21.176 22.271 23.476 24.729 25.975 27.093 27.449 27.252 26.84 26.374 25.849 25.283 24.744 24.256 23.715 23.208 22.737 22.294 21.866 21.427 21.026 20.632 20.275 19.947 19.587 19.188 18.837 18.495 18.159 17.919 17.658 17.343 17.017 16.684 16.447 16.19 15.772 15.468 15.171 15.02 14.698 14.355 13.985 13.799 13.478 13.169 12.951 12.706 12.128 11.825 11.48 11.071 10.588 10.014 9.286 6.697 -7 ,14819 ,TETRA ,17557351,Fri Nov 26 09:47:45 CET,Fri Nov 26 12:09:02 CET,0.0 2.108 2.651 3.024 3.349 3.654 3.9 4.137 4.585 4.776 4.965 5.198 5.511 5.683 6.022 6.342 6.618 6.749 7.02 7.314 7.722 7.96 8.192 8.51 8.804 9.107 9.419 9.713 10.088 10.456 10.799 11.183 11.537 11.889 12.31 12.763 13.191 13.663 14.13 14.619 15.109 15.621 16.243 16.863 17.579 18.362 19.167 19.958 20.795 21.661 22.434 22.627 22.243 21.69 21.103 20.49 19.884 19.255 18.699 18.094 17.544 17.038 16.525 16.037 15.576 15.163 14.724 14.33 13.982 13.617 13.262 12.965 12.652 12.313 12.028 11.738 11.446 11.14 10.811 10.565 10.302 9.892 9.62 9.334 9.183 8.894 8.587 8.255 8.073 7.765 7.517 7.316 7.103 6.601 6.319 6.009 5.654 5.215 4.672 3.952 -1.43 -8 ,28897 ,TETRA ,17557352,Fri Nov 26 09:48:46 CET,Fri Nov 26 12:09:15 CET,0.0 1.273 1.668 1.985 2.272 2.534 2.785 3.017 3.441 3.65 3.846 4.042 4.314 4.45 4.713 4.989 5.261 5.386 5.617 5.838 6.16 6.354 6.546 6.822 7.09 7.368 7.64 7.901 8.207 8.469 8.719 9.028 9.344 9.633 9.965 10.384 10.793 11.242 11.734 12.225 12.731 13.314 13.998 14.647 15.363 16.173 17.055 18.007 19.052 20.025 20.754 20.898 20.674 20.282 19.796 19.261 18.774 18.261 17.75 17.212 16.74 16.327 15.936 15.553 15.188 14.849 14.491 14.159 13.851 13.516 13.168 12.856 12.515 12.139 11.843 11.555 11.227 10.854 10.498 10.27 10.025 9.645 9.385 9.1 8.953 8.638 8.297 7.967 7.792 7.478 7.2 6.966 6.738 6.269 5.985 5.677 5.336 4.93 4.453 3.762 0.769 -9 ,328 ,TETRA ,17557353,Fri Nov 26 09:47:44 CET,Fri Nov 26 12:12:09 CET,0.0 1.674 2.181 2.513 2.768 3.022 3.271 3.491 3.94 4.144 4.319 4.544 4.87 5.048 5.376 5.667 5.927 6.052 6.291 6.527 6.861 7.074 7.28 7.577 7.852 8.119 8.363 8.58 8.871 9.177 9.481 9.856 10.222 10.573 10.996 11.469 11.915 12.394 12.879 13.388 13.905 14.499 15.214 15.893 16.643 17.421 18.306 19.313 20.334 21.145 21.748 21.869 21.508 21.04 20.551 20.043 19.534 19.006 18.527 18.028 17.59 17.198 16.786 16.406 16.055 15.703 15.34 14.984 14.669 14.336 13.964 13.681 13.394 13.084 12.848 12.608 12.337 12.04 11.743 11.529 11.304 10.922 10.639 10.374 10.241 9.955 9.638 9.304 9.144 8.838 8.565 8.346 8.09 7.533 7.237 6.911 6.506 6.093 5.631 5.004 3.016 -10 ,12901 ,TETRA ,17557354,Fri Nov 26 09:48:45 CET,Fri Nov 26 12:09:35 CET,0.0 3.313 4.025 4.553 4.973 5.337 5.658 5.924 6.488 6.743 6.976 7.352 7.703 7.879 8.207 8.536 8.865 9.02 9.321 9.615 10.015 10.248 10.458 10.766 11.07 11.363 11.653 11.954 12.355 12.721 13.056 13.448 13.824 14.193 14.619 15.088 15.538 16.036 16.571 17.164 17.79 18.443 19.21 19.992 20.887 21.875 22.921 24.004 25.262 26.664 27.9 28.375 28.356 28.059 27.589 27.094 26.579 26.049 25.59 25.064 24.591 24.165 23.723 23.305 22.933 22.571 22.166 21.802 21.481 21.16 20.822 20.514 20.213 19.91 19.657 19.394 19.129 18.861 18.571 18.365 18.152 17.799 17.522 17.24 17.1 16.802 16.474 16.112 15.906 15.557 15.211 14.955 14.704 14.164 13.873 13.563 13.195 12.799 12.341 11.682 2.273 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index fba81caa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/protein/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19584 ,TETRA ,17557355,Fri Nov 26 09:48:46 CET,Fri Nov 26 12:11:32 CET,0.0 3.473 4.031 4.447 4.786 5.085 5.386 5.686 6.224 6.457 6.672 6.934 7.237 7.395 7.698 7.974 8.228 8.353 8.594 8.832 9.205 9.455 9.701 10.054 10.408 10.76 11.085 11.414 11.839 12.233 12.615 13.068 13.469 13.825 14.226 14.675 15.109 15.572 16.084 16.621 17.154 17.735 18.441 19.177 20.003 20.89 21.908 23.087 24.391 25.715 27.094 27.892 27.995 27.825 27.592 27.282 26.87 26.418 26.011 25.544 25.105 24.707 24.317 23.932 23.556 23.205 22.854 22.532 22.216 21.907 21.593 21.31 21.025 20.738 20.5 20.237 19.951 19.648 19.334 19.122 18.885 18.502 18.242 17.962 17.816 17.531 17.23 16.902 16.73 16.419 16.118 15.91 15.685 15.165 14.901 14.63 14.32 13.903 13.389 12.756 10.201 -2 ,20593 ,TETRA ,17557356,Fri Nov 26 09:48:45 CET,Fri Nov 26 12:12:02 CET,0.0 2.521 3.126 3.495 3.817 4.123 4.357 4.575 5.015 5.227 5.442 5.717 6.039 6.211 6.521 6.786 7.031 7.152 7.394 7.641 7.99 8.206 8.413 8.724 9.03 9.321 9.59 9.839 10.177 10.495 10.797 11.159 11.506 11.852 12.252 12.7 13.146 13.636 14.16 14.696 15.257 15.904 16.643 17.363 18.175 19.062 20.09 21.22 22.474 23.885 25.313 26.141 26.325 26.144 25.783 25.384 24.979 24.536 24.125 23.704 23.326 22.973 22.63 22.31 21.977 21.639 21.271 20.96 20.71 20.43 20.097 19.81 19.515 19.205 18.949 18.664 18.374 18.062 17.73 17.515 17.3 16.948 16.693 16.416 16.273 15.99 15.673 15.352 15.188 14.873 14.542 14.308 14.072 13.586 13.309 12.986 12.594 12.134 11.561 10.756 7.857 -3 ,27483 ,TETRA ,17557357,Fri Nov 26 09:48:46 CET,Fri Nov 26 12:09:21 CET,0.0 2.303 2.787 3.151 3.47 3.699 3.931 4.144 4.526 4.711 4.899 5.15 5.46 5.63 5.966 6.276 6.541 6.677 6.944 7.206 7.568 7.796 8.021 8.333 8.634 8.917 9.191 9.463 9.814 10.134 10.434 10.804 11.156 11.496 11.906 12.371 12.796 13.24 13.724 14.254 14.794 15.386 16.115 16.85 17.659 18.546 19.586 20.709 21.94 23.304 24.634 25.325 25.511 25.438 25.164 24.793 24.414 23.992 23.583 23.183 22.837 22.512 22.166 21.809 21.472 21.157 20.818 20.488 20.193 19.915 19.623 19.35 19.05 18.74 18.505 18.245 17.961 17.668 17.367 17.161 16.94 16.594 16.348 16.067 15.916 15.562 15.171 14.795 14.613 14.307 14.002 13.758 13.487 12.886 12.547 12.176 11.756 11.299 10.726 9.925 7.365 -5 ,460 ,TETRA ,17557359,Fri Nov 26 09:49:45 CET,Fri Nov 26 12:13:05 CET,0.0 2.444 2.986 3.434 3.79 4.118 4.444 4.718 5.144 5.335 5.558 5.909 6.231 6.399 6.718 6.995 7.275 7.43 7.731 7.993 8.354 8.569 8.775 9.078 9.364 9.63 9.894 10.163 10.505 10.829 11.131 11.477 11.811 12.142 12.528 12.959 13.372 13.811 14.283 14.794 15.319 15.919 16.645 17.36 18.149 19.011 20.045 21.197 22.446 23.823 25.119 25.702 25.703 25.453 25.166 24.823 24.434 24.032 23.604 23.125 22.709 22.321 21.938 21.579 21.232 20.917 20.575 20.226 19.92 19.616 19.295 19.005 18.712 18.402 18.12 17.82 17.525 17.232 16.927 16.702 16.46 16.065 15.776 15.448 15.268 14.896 14.472 14.005 13.776 13.442 13.101 12.808 12.523 12.003 11.682 11.336 10.968 10.536 10.007 9.226 3.749 -6 ,21301 ,TETRA ,17557360,Fri Nov 26 09:50:46 CET,Fri Nov 26 12:14:08 CET,0.0 2.149 2.591 2.926 3.188 3.44 3.676 3.918 4.402 4.609 4.802 5.044 5.365 5.548 5.897 6.198 6.456 6.588 6.862 7.14 7.529 7.779 8.015 8.333 8.643 8.948 9.248 9.552 9.952 10.323 10.672 11.087 11.465 11.831 12.276 12.752 13.178 13.636 14.119 14.622 15.145 15.76 16.509 17.256 18.098 18.974 19.97 21.086 22.303 23.655 25.008 25.74 25.88 25.746 25.517 25.223 24.875 24.465 24.092 23.737 23.378 23.01 22.665 22.332 22.005 21.682 21.321 20.996 20.711 20.391 20.042 19.747 19.453 19.146 18.889 18.641 18.39 18.113 17.816 17.614 17.404 17.062 16.811 16.543 16.414 16.162 15.865 15.523 15.342 15.03 14.775 14.57 14.321 13.728 13.377 12.99 12.6 12.16 11.564 10.754 7.354 -9 ,6144 ,TETRA ,17557363,Fri Nov 26 09:50:46 CET,Fri Nov 26 12:12:11 CET,0.0 2.543 3.137 3.579 3.933 4.199 4.403 4.612 5.019 5.227 5.427 5.669 6.002 6.184 6.487 6.754 7.005 7.128 7.365 7.582 7.881 8.076 8.269 8.557 8.846 9.125 9.4 9.659 9.976 10.272 10.568 10.942 11.315 11.667 12.053 12.49 12.891 13.336 13.827 14.328 14.871 15.508 16.242 16.941 17.727 18.607 19.636 20.753 21.982 23.292 24.643 25.445 25.613 25.537 25.303 24.939 24.579 24.246 23.89 23.439 22.994 22.58 22.149 21.713 21.308 20.947 20.578 20.217 19.895 19.547 19.169 18.843 18.509 18.174 17.903 17.601 17.28 16.96 16.635 16.412 16.181 15.828 15.578 15.316 15.186 14.876 14.528 14.172 13.978 13.654 13.339 13.103 12.866 12.348 12.051 11.721 11.328 10.878 10.373 9.672 6.542 -10 ,31630 ,TETRA ,17557364,Fri Nov 26 09:51:46 CET,Fri Nov 26 12:13:19 CET,0.0 3.368 3.969 4.339 4.634 4.893 5.14 5.407 5.937 6.174 6.389 6.632 6.929 7.104 7.439 7.746 8.054 8.199 8.481 8.74 9.11 9.356 9.599 9.955 10.264 10.544 10.818 11.073 11.412 11.743 12.059 12.427 12.779 13.119 13.502 13.925 14.333 14.794 15.286 15.821 16.387 17.019 17.775 18.559 19.465 20.404 21.429 22.566 23.857 25.242 26.712 27.673 27.939 27.781 27.482 27.118 26.705 26.267 25.831 25.369 24.993 24.639 24.283 23.952 23.626 23.316 22.97 22.655 22.377 22.07 21.757 21.492 21.211 20.921 20.694 20.448 20.172 19.876 19.553 19.323 19.089 18.722 18.474 18.218 18.081 17.802 17.492 17.14 16.944 16.609 16.303 16.089 15.883 15.409 15.099 14.743 14.361 13.951 13.399 12.602 8.318 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 17d3de19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27818 ,TETRA ,17557365,Fri Nov 26 09:51:47 CET,Fri Nov 26 11:51:25 CET,0.0 3.098 3.784 4.305 4.746 5.154 5.53 5.861 6.39 6.649 6.906 7.235 7.602 7.805 8.195 8.576 8.922 9.077 9.384 9.675 10.094 10.384 10.68 11.08 11.442 11.817 12.211 12.562 12.961 13.341 13.686 14.1 14.523 14.937 15.403 15.928 16.462 17.064 17.672 18.267 18.922 19.7 20.577 21.428 22.413 23.477 24.587 25.8 27.166 28.556 29.872 30.359 30.062 29.464 28.755 27.955 27.18 26.419 25.653 24.824 24.13 23.501 22.862 22.241 21.636 21.054 20.412 19.838 19.338 18.796 18.225 17.75 17.269 16.79 16.407 15.977 15.516 15.037 14.513 14.129 13.73 13.093 12.631 12.13 11.889 11.409 10.886 10.316 10.006 9.557 9.02 8.679 8.294 7.42 6.96 6.388 5.685 4.941 4.036 2.738 -4.639 -4 ,24666 ,TETRA ,17557368,Fri Nov 26 09:52:45 CET,Fri Nov 26 11:51:02 CET,0.0 4.684 5.412 5.944 6.39 6.806 7.155 7.491 8.126 8.379 8.626 8.956 9.334 9.573 10.026 10.409 10.742 10.901 11.223 11.543 11.983 12.248 12.507 12.874 13.219 13.548 13.866 14.168 14.548 14.927 15.319 15.8 16.227 16.632 17.117 17.65 18.124 18.646 19.22 19.835 20.478 21.183 22.014 22.846 23.811 24.896 26.096 27.396 28.772 30.11 31.316 31.663 31.429 30.825 30.085 29.307 28.466 27.588 26.808 26.018 25.266 24.621 24.002 23.353 22.71 22.072 21.373 20.737 20.205 19.68 19.112 18.628 18.105 17.528 17.072 16.605 16.129 15.62 15.077 14.711 14.339 13.75 13.332 12.889 12.657 12.182 11.675 11.099 10.793 10.33 9.693 9.271 8.819 7.835 7.325 6.775 6.094 5.237 4.172 2.758 -5.073 -5 ,20102 ,TETRA ,17557369,Fri Nov 26 09:52:46 CET,Fri Nov 26 11:50:53 CET,0.0 5.914 6.567 7.02 7.443 7.825 8.131 8.411 8.964 9.212 9.423 9.685 10.041 10.242 10.606 10.984 11.348 11.511 11.811 12.109 12.534 12.789 13.056 13.455 13.829 14.198 14.537 14.853 15.257 15.633 15.996 16.439 16.855 17.267 17.738 18.288 18.86 19.484 20.123 20.777 21.444 22.167 23.001 23.848 24.824 25.839 26.977 28.221 29.579 31.034 32.367 32.712 32.359 31.715 30.949 30.145 29.321 28.456 27.649 26.811 26.058 25.369 24.683 24.004 23.356 22.763 22.134 21.536 20.991 20.41 19.814 19.31 18.755 18.167 17.718 17.271 16.781 16.257 15.744 15.385 14.995 14.363 13.94 13.503 13.269 12.784 12.241 11.63 11.32 10.889 10.354 9.98 9.588 8.737 8.269 7.75 7.191 6.44 5.391 4.119 -1.479 -6 ,8980 ,TETRA ,17557370,Fri Nov 26 09:52:46 CET,Fri Nov 26 12:03:17 CET,0.0 4.919 5.637 6.174 6.6 6.964 7.316 7.653 8.225 8.478 8.718 9.043 9.413 9.61 9.992 10.339 10.655 10.814 11.138 11.448 11.885 12.162 12.413 12.768 13.125 13.486 13.827 14.152 14.569 14.975 15.372 15.837 16.292 16.72 17.161 17.678 18.203 18.74 19.302 19.925 20.588 21.345 22.246 23.17 24.301 25.489 26.726 28.062 29.492 30.977 32.355 32.771 32.39 31.752 31.066 30.285 29.461 28.628 27.859 27.066 26.374 25.705 25.045 24.385 23.747 23.149 22.492 21.91 21.395 20.849 20.26 19.767 19.256 18.713 18.28 17.808 17.298 16.774 16.221 15.84 15.439 14.794 14.374 13.934 13.696 13.176 12.617 12.03 11.703 11.239 10.665 10.281 9.853 8.972 8.509 7.977 7.389 6.631 5.627 4.333 -5.174 -9 ,7312 ,TETRA ,17557373,Fri Nov 26 09:52:47 CET,Fri Nov 26 11:52:33 CET,0.0 2.455 3.072 3.606 4.064 4.433 4.736 5.037 5.601 5.846 6.075 6.352 6.687 6.874 7.232 7.563 7.9 8.068 8.41 8.758 9.252 9.531 9.769 10.149 10.54 10.893 11.23 11.579 12.006 12.384 12.762 13.22 13.655 14.083 14.556 15.081 15.621 16.21 16.79 17.399 18.086 18.868 19.733 20.558 21.488 22.507 23.656 24.915 26.273 27.728 29.034 29.387 29.007 28.327 27.631 26.835 25.981 25.191 24.484 23.703 22.969 22.291 21.63 20.976 20.355 19.783 19.177 18.642 18.151 17.61 17.023 16.528 16.011 15.468 15.038 14.583 14.098 13.554 12.983 12.606 12.218 11.616 11.176 10.69 10.426 9.847 9.261 8.666 8.345 7.86 7.203 6.767 6.306 5.334 4.771 4.154 3.449 2.6 1.629 0.34 -4.432 -10 ,11801 ,TETRA ,17557374,Fri Nov 26 09:52:46 CET,Fri Nov 26 11:50:30 CET,0.0 6.008 6.634 7.138 7.617 8.049 8.431 8.776 9.364 9.63 9.879 10.16 10.514 10.712 11.066 11.402 11.725 11.884 12.191 12.499 12.931 13.193 13.457 13.83 14.211 14.612 14.993 15.341 15.77 16.181 16.563 17.011 17.426 17.843 18.341 18.871 19.42 20.037 20.653 21.291 21.949 22.702 23.572 24.454 25.502 26.63 27.902 29.28 30.801 32.401 33.717 34.055 33.765 33.141 32.301 31.455 30.624 29.762 28.952 28.084 27.345 26.661 25.97 25.275 24.597 23.98 23.354 22.749 22.201 21.665 21.122 20.663 20.156 19.625 19.209 18.771 18.326 17.849 17.304 16.913 16.511 15.884 15.428 14.945 14.712 14.252 13.751 13.188 12.895 12.466 11.908 11.515 11.086 10.137 9.608 9.02 8.354 7.581 6.637 5.394 -1.837 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt deleted file mode 100644 index b2c230ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24123 ,TETRA ,17557375,Fri Nov 26 09:52:46 CET,Fri Nov 26 11:51:09 CET,0.0 1.858 2.523 2.995 3.337 3.659 3.965 4.252 4.789 5.026 5.235 5.467 5.788 5.957 6.264 6.566 6.854 6.993 7.263 7.51 7.881 8.12 8.346 8.681 9.031 9.377 9.688 9.974 10.352 10.712 11.037 11.418 11.792 12.169 12.628 13.104 13.544 14.037 14.549 15.087 15.643 16.249 16.935 17.597 18.344 19.135 20.003 20.929 21.833 22.506 22.595 21.922 20.993 19.952 18.933 17.928 16.988 16.071 15.224 14.374 13.63 12.946 12.262 11.584 10.936 10.361 9.791 9.251 8.76 8.262 7.728 7.262 6.782 6.273 5.873 5.459 5.027 4.59 4.128 3.81 3.488 2.959 2.584 2.204 2.003 1.568 1.114 0.635 0.372 -0.042 -0.454 -0.773 -1.108 -1.762 -2.111 -2.511 -3.009 -3.66 -4.472 -5.48 -8.86 -2 ,20796 ,TETRA ,17557376,Fri Nov 26 09:52:46 CET,Fri Nov 26 11:52:58 CET,0.0 1.499 2.036 2.453 2.81 3.102 3.358 3.611 4.101 4.331 4.558 4.818 5.157 5.348 5.693 6.01 6.304 6.443 6.708 6.969 7.347 7.588 7.83 8.187 8.523 8.843 9.159 9.461 9.826 10.169 10.496 10.893 11.276 11.651 12.075 12.539 12.986 13.482 13.991 14.502 15.021 15.587 16.247 16.917 17.68 18.489 19.379 20.247 21.143 21.96 22.354 21.9 20.965 19.915 18.889 17.894 16.925 15.98 15.153 14.313 13.548 12.86 12.19 11.499 10.832 10.242 9.632 9.078 8.599 8.091 7.568 7.141 6.677 6.159 5.74 5.311 4.872 4.418 3.943 3.616 3.291 2.788 2.416 2.022 1.82 1.399 0.973 0.5 0.246 -0.149 -0.554 -0.843 -1.164 -1.92 -2.312 -2.718 -3.208 -3.829 -4.571 -5.472 -8.565 -3 ,15427 ,TETRA ,17557377,Fri Nov 26 09:52:47 CET,Fri Nov 26 11:48:33 CET,0.0 1.814 2.453 2.908 3.269 3.589 3.895 4.192 4.734 4.964 5.175 5.422 5.753 5.91 6.216 6.532 6.818 6.951 7.218 7.487 7.883 8.125 8.354 8.688 9.026 9.349 9.636 9.926 10.315 10.687 11.034 11.437 11.829 12.192 12.596 13.055 13.489 13.953 14.446 14.976 15.517 16.078 16.718 17.363 18.063 18.802 19.607 20.378 21.082 21.734 21.93 21.305 20.375 19.324 18.285 17.276 16.33 15.411 14.541 13.625 12.842 12.127 11.414 10.727 10.082 9.496 8.887 8.332 7.857 7.36 6.822 6.376 5.936 5.468 5.098 4.71 4.273 3.819 3.363 3.048 2.726 2.204 1.825 1.424 1.221 0.815 0.4 -0.052 -0.297 -0.691 -1.094 -1.401 -1.74 -2.493 -2.907 -3.349 -3.83 -4.379 -5.055 -6.029 -9.086 -4 ,6960 ,TETRA ,17557378,Fri Nov 26 09:53:48 CET,Fri Nov 26 11:54:45 CET,0.0 1.394 1.953 2.362 2.71 3.011 3.312 3.603 4.096 4.315 4.516 4.743 5.069 5.239 5.56 5.894 6.215 6.359 6.634 6.906 7.287 7.539 7.791 8.144 8.46 8.756 9.051 9.325 9.675 10.013 10.342 10.738 11.12 11.501 11.959 12.466 12.894 13.338 13.822 14.343 14.889 15.472 16.108 16.719 17.412 18.107 18.85 19.636 20.44 21.118 21.27 20.609 19.672 18.628 17.586 16.568 15.59 14.617 13.725 12.823 12.077 11.435 10.793 10.155 9.554 9.01 8.436 7.908 7.429 6.922 6.391 5.961 5.516 5.031 4.648 4.246 3.821 3.37 2.91 2.585 2.235 1.672 1.283 0.883 0.664 0.218 -0.236 -0.719 -0.973 -1.386 -1.817 -2.128 -2.466 -3.285 -3.732 -4.235 -4.822 -5.438 -6.143 -7.012 -9.927 -5 ,9783 ,TETRA ,17557379,Fri Nov 26 09:54:46 CET,Fri Nov 26 11:54:52 CET,0.0 1.726 2.39 2.83 3.229 3.562 3.866 4.176 4.718 4.966 5.208 5.517 5.867 6.054 6.391 6.721 7.039 7.185 7.454 7.711 8.1 8.361 8.601 8.948 9.296 9.624 9.924 10.217 10.6 10.946 11.278 11.68 12.04 12.39 12.788 13.244 13.731 14.23 14.708 15.213 15.725 16.298 16.955 17.588 18.332 19.127 19.965 20.852 21.706 22.381 22.626 22.028 21.006 19.893 18.861 17.822 16.802 15.876 15.045 14.153 13.391 12.698 12.029 11.386 10.746 10.157 9.526 8.935 8.429 7.913 7.356 6.874 6.374 5.849 5.452 5.043 4.603 4.136 3.661 3.35 3.021 2.467 2.06 1.649 1.433 0.97 0.497 -0.024 -0.313 -0.757 -1.236 -1.56 -1.912 -2.708 -3.139 -3.604 -4.16 -4.806 -5.506 -6.564 -10.021 -6 ,10483 ,TETRA ,17557380,Fri Nov 26 09:53:48 CET,Fri Nov 26 11:53:53 CET,0.0 1.771 2.384 2.862 3.286 3.652 3.979 4.261 4.773 5.002 5.221 5.505 5.853 6.047 6.402 6.725 7.029 7.177 7.471 7.749 8.15 8.406 8.648 8.979 9.275 9.558 9.835 10.106 10.452 10.794 11.124 11.52 11.907 12.271 12.688 13.154 13.587 14.032 14.494 15.001 15.545 16.133 16.805 17.486 18.245 18.982 19.765 20.592 21.41 22.13 22.343 21.692 20.777 19.787 18.769 17.746 16.765 15.848 15.043 14.201 13.458 12.761 12.075 11.417 10.786 10.193 9.566 8.995 8.495 7.979 7.446 7.006 6.543 6.066 5.693 5.293 4.881 4.45 3.982 3.666 3.337 2.803 2.445 2.081 1.889 1.468 1.017 0.563 0.32 -0.09 -0.524 -0.82 -1.131 -1.895 -2.332 -2.8 -3.304 -3.872 -4.563 -5.511 -8.994 -7 ,9078 ,TETRA ,17557381,Fri Nov 26 09:53:48 CET,Fri Nov 26 11:54:12 CET,0.0 1.726 2.291 2.779 3.149 3.421 3.689 3.96 4.444 4.656 4.853 5.062 5.369 5.535 5.869 6.179 6.476 6.627 6.921 7.186 7.567 7.822 8.061 8.409 8.748 9.083 9.385 9.659 10.03 10.397 10.754 11.158 11.53 11.914 12.329 12.75 13.17 13.628 14.117 14.633 15.165 15.759 16.432 17.046 17.777 18.64 19.5 20.361 21.187 21.692 21.778 21.188 20.193 19.095 18.035 16.967 15.942 14.987 14.143 13.253 12.474 11.784 11.089 10.393 9.714 9.099 8.472 7.896 7.385 6.848 6.259 5.746 5.242 4.73 4.316 3.875 3.413 2.93 2.429 2.084 1.715 1.153 0.774 0.364 0.15 -0.292 -0.753 -1.274 -1.568 -1.983 -2.39 -2.685 -3.004 -3.727 -4.109 -4.524 -5.011 -5.561 -6.217 -7.138 -10.64 -8 ,11720 ,TETRA ,17557382,Fri Nov 26 09:53:48 CET,Fri Nov 26 11:54:55 CET,0.0 1.376 1.884 2.268 2.673 3.012 3.292 3.552 4.011 4.225 4.429 4.676 5.013 5.185 5.5 5.797 6.08 6.212 6.469 6.733 7.114 7.34 7.556 7.857 8.146 8.442 8.74 9.025 9.363 9.687 10.016 10.428 10.824 11.174 11.561 12.034 12.512 13.01 13.518 14.031 14.557 15.138 15.791 16.416 17.108 17.822 18.613 19.422 20.161 20.818 21.113 20.52 19.569 18.495 17.389 16.32 15.349 14.415 13.578 12.716 11.935 11.217 10.53 9.879 9.283 8.72 8.116 7.573 7.075 6.568 6.052 5.609 5.146 4.652 4.267 3.868 3.435 2.99 2.524 2.183 1.828 1.271 0.87 0.441 0.22 -0.236 -0.724 -1.224 -1.477 -1.906 -2.396 -2.73 -3.101 -3.904 -4.323 -4.79 -5.33 -5.944 -6.702 -7.762 -11.598 -9 ,26421 ,TETRA ,17557383,Fri Nov 26 09:53:48 CET,Fri Nov 26 11:53:28 CET,0.0 1.543 2.217 2.69 3.034 3.348 3.668 3.959 4.471 4.698 4.905 5.16 5.493 5.683 6.063 6.409 6.708 6.845 7.118 7.378 7.767 8.024 8.256 8.579 8.893 9.183 9.465 9.742 10.103 10.464 10.808 11.209 11.579 11.916 12.299 12.741 13.163 13.625 14.133 14.675 15.254 15.911 16.609 17.24 17.962 18.744 19.569 20.35 21.108 21.839 22.178 21.577 20.611 19.631 18.643 17.564 16.493 15.509 14.659 13.806 13.072 12.393 11.738 11.105 10.493 9.927 9.333 8.81 8.345 7.858 7.341 6.913 6.472 5.988 5.607 5.203 4.796 4.36 3.885 3.559 3.222 2.733 2.367 1.965 1.772 1.349 0.879 0.386 0.124 -0.273 -0.703 -1.04 -1.397 -2.116 -2.509 -2.989 -3.488 -4.04 -4.735 -5.698 -8.829 -10 ,20003 ,TETRA ,17557384,Fri Nov 26 09:53:48 CET,Fri Nov 26 11:53:37 CET,0.0 1.98 2.664 3.203 3.644 4.025 4.352 4.627 5.103 5.314 5.535 5.799 6.119 6.297 6.667 6.996 7.302 7.455 7.75 8.023 8.398 8.644 8.889 9.229 9.544 9.84 10.113 10.375 10.721 11.036 11.35 11.742 12.111 12.479 12.904 13.372 13.807 14.271 14.756 15.277 15.855 16.486 17.173 17.857 18.617 19.424 20.296 21.126 21.901 22.584 22.881 22.228 21.188 20.14 19.116 18.042 17.069 16.154 15.325 14.477 13.729 13.031 12.343 11.678 11.05 10.498 9.916 9.36 8.871 8.387 7.877 7.434 6.946 6.429 6.026 5.592 5.139 4.663 4.187 3.866 3.532 3.012 2.629 2.225 2.022 1.573 1.111 0.662 0.425 0.033 -0.375 -0.665 -0.983 -1.735 -2.157 -2.575 -3.006 -3.513 -4.121 -4.962 -9.731 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index 2f706a7e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27255 ,KEBNE ,17132049,Sat Jan 1 17:40:19 CET,Sat Jan 1 19:19:40 CET,0.0 5.274 5.927 6.434 6.874 7.193 7.488 7.751 8.227 8.457 8.67 8.954 9.285 9.48 9.854 10.193 10.505 10.656 10.945 11.208 11.564 11.792 12.038 12.399 12.74 13.085 13.416 13.732 14.14 14.536 14.916 15.371 15.791 16.173 16.612 17.12 17.622 18.168 18.743 19.326 19.94 20.597 21.347 22.099 22.935 23.892 24.967 26.125 27.42 28.852 30.448 31.486 31.86 31.884 31.75 31.501 31.155 30.788 30.426 29.999 29.602 29.239 28.901 28.591 28.284 27.986 27.659 27.353 27.077 26.775 26.463 26.205 25.935 25.657 25.435 25.194 24.947 24.683 24.376 24.154 23.939 23.593 23.338 23.059 22.908 22.636 22.382 22.083 21.919 21.639 21.379 21.165 20.919 20.309 19.979 19.646 19.318 18.945 18.444 17.758 13.629 -2 ,18370 ,KEBNE ,17132050,Sat Jan 1 17:41:20 CET,Sat Jan 1 19:20:35 CET,0.0 2.496 3.085 3.544 3.948 4.293 4.62 4.921 5.445 5.699 5.961 6.294 6.634 6.854 7.253 7.63 7.99 8.144 8.434 8.701 9.091 9.354 9.603 9.952 10.286 10.615 10.932 11.244 11.662 12.062 12.435 12.889 13.31 13.699 14.177 14.725 15.231 15.787 16.376 16.989 17.594 18.226 18.992 19.771 20.663 21.664 22.785 23.946 25.288 26.798 28.355 29.302 29.554 29.547 29.343 28.984 28.551 28.102 27.685 27.202 26.757 26.327 25.91 25.531 25.161 24.823 24.477 24.154 23.869 23.55 23.193 22.892 22.586 22.269 22.018 21.769 21.497 21.215 20.917 20.7 20.478 20.121 19.873 19.615 19.485 19.216 18.912 18.575 18.393 18.088 17.789 17.565 17.323 16.783 16.498 16.16 15.75 15.3 14.773 14.056 10.809 -3 ,11767 ,KEBNE ,17132051,Sat Jan 1 17:41:20 CET,Sat Jan 1 19:20:48 CET,0.0 2.842 3.583 4.177 4.662 5.084 5.455 5.769 6.32 6.56 6.794 7.064 7.373 7.551 7.917 8.292 8.651 8.814 9.106 9.391 9.828 10.085 10.314 10.653 10.984 11.328 11.665 11.97 12.347 12.722 13.095 13.553 13.984 14.404 14.882 15.392 15.88 16.411 16.977 17.59 18.253 19.004 19.837 20.618 21.487 22.46 23.542 24.715 26.072 27.47 28.915 29.84 30.111 30.064 29.83 29.53 29.174 28.82 28.477 28.066 27.665 27.281 26.944 26.635 26.325 26.022 25.689 25.379 25.099 24.783 24.457 24.2 23.929 23.642 23.403 23.136 22.864 22.603 22.333 22.129 21.902 21.521 21.253 20.996 20.865 20.59 20.306 19.988 19.812 19.512 19.236 19.037 18.818 18.338 18.062 17.736 17.388 17.0 16.514 15.731 11.469 -5 ,10560 ,KEBNE ,17132053,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:21:11 CET,0.0 11.311 12.071 12.663 13.135 13.494 13.84 14.183 14.78 15.057 15.331 15.745 16.115 16.332 16.739 17.139 17.53 17.709 18.071 18.413 18.895 19.2 19.5 19.951 20.401 20.823 21.212 21.583 22.017 22.429 22.836 23.334 23.817 24.275 24.807 25.445 26.073 26.716 27.359 27.99 28.627 29.326 30.106 30.88 31.806 32.847 33.994 35.198 36.557 38.045 39.527 40.284 40.366 40.168 39.751 39.29 38.838 38.364 37.956 37.534 37.104 36.605 36.098 35.629 35.172 34.742 34.265 33.849 33.503 33.144 32.766 32.431 32.072 31.691 31.392 31.092 30.781 30.448 30.105 29.865 29.608 29.198 28.909 28.616 28.457 28.106 27.755 27.381 27.176 26.838 26.471 26.209 25.929 25.352 25.062 24.715 24.258 23.712 23.118 22.425 19.668 -6 ,695 ,KEBNE ,17132054,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:22:23 CET,0.0 4.102 4.885 5.306 5.692 6.069 6.389 6.684 7.229 7.484 7.711 7.995 8.338 8.549 8.906 9.22 9.521 9.663 9.936 10.202 10.574 10.824 11.082 11.448 11.772 12.079 12.369 12.647 13.055 13.474 13.873 14.329 14.773 15.202 15.669 16.185 16.656 17.138 17.628 18.143 18.719 19.416 20.269 21.144 22.101 23.089 24.196 25.428 26.805 28.256 29.764 30.628 30.814 30.699 30.461 30.165 29.782 29.398 29.088 28.749 28.363 27.959 27.563 27.187 26.847 26.509 26.128 25.78 25.463 25.147 24.828 24.553 24.258 23.946 23.71 23.466 23.195 22.91 22.6 22.367 22.134 21.767 21.501 21.241 21.103 20.793 20.46 20.108 19.896 19.529 19.187 18.978 18.767 18.255 17.898 17.436 16.944 16.476 15.921 15.243 12.192 -7 ,20321 ,KEBNE ,17132055,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:20:58 CET,0.0 4.865 5.588 6.083 6.53 6.953 7.299 7.6 8.219 8.498 8.73 9.015 9.342 9.529 9.871 10.216 10.561 10.716 11.007 11.312 11.757 12.03 12.286 12.625 12.929 13.26 13.599 13.908 14.294 14.677 15.066 15.538 15.979 16.381 16.821 17.29 17.754 18.267 18.795 19.364 19.975 20.684 21.513 22.273 23.117 24.048 25.091 26.23 27.526 29.011 30.551 31.527 31.843 31.841 31.687 31.425 31.079 30.715 30.365 29.963 29.594 29.26 28.962 28.671 28.377 28.1 27.801 27.522 27.26 26.955 26.606 26.313 26.005 25.677 25.426 25.153 24.846 24.542 24.236 24.02 23.809 23.493 23.249 22.957 22.806 22.504 22.184 21.836 21.645 21.335 21.02 20.776 20.532 20.032 19.745 19.403 19.02 18.605 18.053 17.22 13.118 -8 ,21366 ,KEBNE ,17132056,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:22:08 CET,0.0 3.479 4.107 4.661 5.082 5.425 5.771 6.083 6.671 6.931 7.164 7.48 7.833 8.056 8.452 8.789 9.104 9.253 9.532 9.798 10.2 10.477 10.756 11.131 11.447 11.754 12.076 12.376 12.756 13.139 13.498 13.909 14.285 14.642 15.076 15.571 16.034 16.541 17.092 17.7 18.373 19.15 20.043 20.882 21.829 22.899 24.111 25.417 26.912 28.566 30.227 31.245 31.462 31.292 31.03 30.67 30.221 29.773 29.391 28.96 28.539 28.156 27.794 27.463 27.157 26.858 26.528 26.221 25.954 25.679 25.375 25.103 24.823 24.539 24.317 24.084 23.839 23.576 23.298 23.104 22.869 22.446 22.125 21.811 21.662 21.343 21.02 20.675 20.493 20.186 19.902 19.697 19.478 18.973 18.674 18.341 17.917 17.475 17.03 16.268 10.537 -9 ,19404 ,KEBNE ,17132057,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:20:50 CET,0.0 4.0 4.928 5.526 5.948 6.266 6.586 6.883 7.396 7.631 7.846 8.094 8.406 8.599 8.996 9.365 9.705 9.866 10.175 10.499 10.956 11.211 11.459 11.825 12.164 12.466 12.745 13.028 13.401 13.783 14.161 14.561 14.946 15.327 15.771 16.267 16.705 17.201 17.732 18.269 18.847 19.498 20.223 20.971 21.861 22.821 23.91 25.131 26.51 27.981 29.539 30.496 30.798 30.741 30.552 30.296 30.005 29.706 29.398 29.035 28.665 28.34 27.999 27.645 27.33 27.033 26.701 26.395 26.109 25.802 25.483 25.201 24.86 24.505 24.266 24.039 23.816 23.574 23.314 23.125 22.907 22.542 22.295 22.032 21.895 21.62 21.306 20.94 20.741 20.425 20.14 19.935 19.699 19.196 18.953 18.668 18.351 17.944 17.436 16.695 11.406 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index f4b460d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21459 ,TETRA ,17557385,Fri Nov 26 09:54:45 CET,Fri Nov 26 11:38:30 CET,0.0 1.788 2.484 3.006 3.437 3.803 4.148 4.459 5.003 5.258 5.5 5.839 6.171 6.378 6.772 7.138 7.479 7.636 7.938 8.24 8.66 8.927 9.189 9.533 9.855 10.181 10.497 10.807 11.173 11.512 11.84 12.235 12.62 13.005 13.459 13.894 14.25 14.612 15.007 15.433 15.847 16.271 16.705 17.112 17.583 18.092 18.602 19.057 19.441 19.649 19.421 18.594 17.644 16.661 15.679 14.797 14.04 13.336 12.729 12.1 11.529 11.017 10.541 10.077 9.62 9.206 8.784 8.407 8.033 7.596 7.148 6.784 6.404 6.016 5.733 5.429 5.087 4.729 4.347 4.067 3.779 3.353 3.055 2.74 2.578 2.237 1.874 1.529 1.357 1.03 0.726 0.514 0.287 -0.227 -0.522 -0.843 -1.178 -1.604 -2.129 -2.825 -4.851 -2 ,30310 ,TETRA ,17557386,Fri Nov 26 09:55:47 CET,Fri Nov 26 11:50:34 CET,0.0 2.267 3.057 3.604 4.027 4.392 4.706 4.993 5.521 5.758 6.003 6.365 6.69 6.874 7.231 7.582 7.929 8.096 8.388 8.665 9.093 9.369 9.624 9.984 10.331 10.65 10.96 11.261 11.624 11.986 12.313 12.687 13.058 13.407 13.787 14.159 14.483 14.828 15.185 15.557 15.94 16.374 16.893 17.356 17.826 18.285 18.724 19.17 19.645 19.876 19.534 18.645 17.692 16.766 15.916 15.117 14.361 13.661 13.022 12.343 11.783 11.292 10.769 10.236 9.736 9.258 8.755 8.312 7.924 7.526 7.074 6.672 6.255 5.819 5.486 5.152 4.802 4.446 4.093 3.852 3.607 3.21 2.919 2.604 2.438 2.104 1.768 1.403 1.208 0.876 0.575 0.345 0.116 -0.392 -0.706 -1.047 -1.416 -1.816 -2.311 -3.063 -5.03 -3 ,14058 ,TETRA ,17557387,Fri Nov 26 09:55:47 CET,Fri Nov 26 11:51:24 CET,0.0 1.238 1.808 2.228 2.632 2.966 3.221 3.458 3.861 4.039 4.215 4.466 4.766 4.932 5.253 5.555 5.823 5.944 6.191 6.427 6.724 6.916 7.106 7.386 7.675 7.948 8.191 8.421 8.715 8.996 9.262 9.587 9.925 10.26 10.655 11.106 11.538 11.987 12.484 13.026 13.495 13.943 14.452 14.912 15.429 15.966 16.475 16.983 17.453 17.75 17.559 16.581 15.484 14.43 13.426 12.545 11.808 11.111 10.488 9.851 9.288 8.775 8.227 7.646 7.11 6.625 6.113 5.653 5.24 4.823 4.385 4.01 3.627 3.222 2.899 2.558 2.195 1.833 1.471 1.218 0.956 0.549 0.263 -0.037 -0.187 -0.507 -0.852 -1.24 -1.462 -1.812 -2.135 -2.385 -2.656 -3.221 -3.515 -3.818 -4.188 -4.67 -5.197 -5.825 -7.719 -4 ,14942 ,TETRA ,17557388,Fri Nov 26 09:55:47 CET,Fri Nov 26 11:51:10 CET,0.0 2.024 2.604 3.088 3.477 3.799 4.07 4.292 4.728 4.946 5.144 5.393 5.698 5.869 6.179 6.477 6.744 6.875 7.145 7.404 7.762 7.97 8.15 8.397 8.634 8.875 9.11 9.325 9.578 9.815 10.054 10.344 10.614 10.895 11.252 11.647 12.001 12.35 12.691 13.038 13.377 13.77 14.234 14.647 15.162 15.763 16.302 16.751 17.14 17.385 17.184 16.398 15.507 14.571 13.693 12.869 12.09 11.358 10.719 10.071 9.498 8.927 8.314 7.724 7.189 6.707 6.189 5.698 5.283 4.858 4.398 4.017 3.623 3.222 2.909 2.575 2.232 1.89 1.551 1.301 1.025 0.593 0.286 -0.033 -0.199 -0.561 -0.962 -1.381 -1.602 -1.966 -2.308 -2.54 -2.762 -3.23 -3.491 -3.811 -4.172 -4.542 -4.989 -5.639 -7.871 -5 ,2305 ,TETRA ,17557389,Fri Nov 26 09:55:47 CET,Fri Nov 26 11:52:00 CET,0.0 1.857 2.533 3.036 3.457 3.847 4.177 4.466 4.981 5.211 5.429 5.721 6.032 6.22 6.566 6.906 7.249 7.408 7.71 7.987 8.358 8.616 8.88 9.249 9.578 9.866 10.154 10.439 10.8 11.149 11.504 11.936 12.312 12.655 13.043 13.479 13.893 14.348 14.833 15.329 15.823 16.285 16.745 17.17 17.607 18.128 18.724 19.231 19.631 19.813 19.534 18.62 17.658 16.756 15.885 14.974 14.048 13.125 12.312 11.505 10.812 10.209 9.633 9.081 8.561 8.084 7.606 7.171 6.773 6.36 5.914 5.52 5.115 4.724 4.433 4.127 3.798 3.429 3.054 2.805 2.541 2.118 1.831 1.522 1.347 1.005 0.713 0.428 0.27 -0.026 -0.247 -0.422 -0.603 -1.057 -1.317 -1.583 -1.853 -2.149 -2.525 -3.088 -4.772 -6 ,596 ,TETRA ,17557390,Fri Nov 26 09:56:45 CET,Fri Nov 26 11:47:40 CET,0.0 1.476 1.994 2.417 2.799 3.104 3.393 3.667 4.154 4.369 4.568 4.842 5.142 5.317 5.63 5.903 6.152 6.267 6.487 6.704 7.018 7.206 7.383 7.649 7.913 8.182 8.431 8.657 8.934 9.235 9.582 9.98 10.348 10.709 11.076 11.433 11.777 12.16 12.548 12.936 13.351 13.787 14.237 14.67 15.155 15.631 16.11 16.555 16.919 17.083 16.814 16.013 15.068 14.1 13.182 12.313 11.523 10.779 10.133 9.498 8.938 8.428 7.932 7.464 7.02 6.571 6.05 5.576 5.18 4.783 4.345 3.972 3.606 3.21 2.903 2.581 2.233 1.866 1.48 1.211 0.93 0.501 0.2 -0.124 -0.287 -0.619 -0.963 -1.316 -1.502 -1.829 -2.099 -2.318 -2.564 -3.116 -3.414 -3.725 -4.077 -4.484 -4.936 -5.478 -6.995 -7 ,23693 ,TETRA ,17557391,Fri Nov 26 09:56:45 CET,Fri Nov 26 11:54:02 CET,0.0 1.796 2.431 2.944 3.359 3.725 4.071 4.413 4.996 5.234 5.462 5.767 6.077 6.266 6.654 7.01 7.319 7.464 7.766 8.073 8.494 8.746 8.992 9.365 9.741 10.107 10.443 10.74 11.113 11.472 11.81 12.216 12.599 12.946 13.298 13.662 14.007 14.378 14.787 15.215 15.64 16.075 16.557 17.011 17.483 17.995 18.535 19.0 19.363 19.525 19.262 18.39 17.359 16.424 15.615 14.784 14.002 13.317 12.681 11.977 11.392 10.91 10.432 9.977 9.538 9.128 8.736 8.396 8.098 7.797 7.482 7.203 6.91 6.593 6.349 6.108 5.84 5.56 5.267 5.064 4.858 4.528 4.301 4.052 3.917 3.635 3.322 3.001 2.838 2.537 2.303 2.121 1.927 1.455 1.186 0.922 0.639 0.271 -0.177 -0.8 -2.885 -8 ,18758 ,TETRA ,17557392,Fri Nov 26 09:56:45 CET,Fri Nov 26 11:40:14 CET,0.0 2.613 3.288 3.757 4.106 4.41 4.709 4.995 5.536 5.785 6.015 6.312 6.641 6.837 7.187 7.528 7.849 8.011 8.35 8.657 9.072 9.333 9.584 9.95 10.289 10.608 10.923 11.228 11.596 11.946 12.29 12.716 13.127 13.502 13.908 14.348 14.754 15.187 15.663 16.191 16.739 17.325 17.898 18.333 18.801 19.282 19.775 20.224 20.616 20.876 20.674 19.927 19.002 18.039 17.126 16.283 15.542 14.859 14.264 13.643 13.079 12.555 12.066 11.599 11.146 10.718 10.239 9.77 9.379 8.97 8.534 8.181 7.806 7.423 7.116 6.794 6.472 6.143 5.76 5.471 5.177 4.717 4.424 4.148 3.999 3.69 3.371 3.017 2.822 2.496 2.221 2.008 1.773 1.214 0.891 0.556 0.212 -0.167 -0.641 -1.3 -3.435 -9 ,9246 ,TETRA ,17557393,Fri Nov 26 09:57:45 CET,Fri Nov 26 11:52:48 CET,0.0 2.119 2.765 3.276 3.669 3.984 4.275 4.577 5.14 5.404 5.642 5.911 6.224 6.413 6.769 7.09 7.384 7.532 7.818 8.098 8.532 8.822 9.106 9.481 9.786 10.075 10.345 10.573 10.854 11.146 11.418 11.724 12.034 12.333 12.676 13.04 13.356 13.725 14.142 14.556 14.962 15.414 15.906 16.396 16.93 17.429 17.912 18.352 18.746 18.983 18.732 17.853 16.866 15.926 15.066 14.231 13.467 12.763 12.136 11.49 10.951 10.484 10.052 9.632 9.212 8.824 8.421 8.059 7.736 7.41 7.062 6.768 6.468 6.143 5.876 5.607 5.336 5.048 4.758 4.558 4.351 4.006 3.736 3.444 3.305 3.029 2.72 2.382 2.225 1.938 1.721 1.529 1.333 0.921 0.684 0.407 0.057 -0.358 -0.839 -1.517 -3.122 -10 ,31452 ,TETRA ,17557394,Fri Nov 26 09:57:45 CET,Fri Nov 26 11:53:09 CET,0.0 2.476 3.143 3.685 4.122 4.508 4.835 5.128 5.684 5.935 6.177 6.512 6.83 7.029 7.417 7.76 8.081 8.229 8.503 8.774 9.166 9.426 9.673 10.005 10.321 10.643 10.945 11.216 11.574 11.918 12.252 12.662 13.061 13.452 13.884 14.325 14.73 15.15 15.566 15.979 16.379 16.799 17.285 17.736 18.198 18.673 19.151 19.604 20.013 20.203 19.889 19.009 18.025 17.1 16.239 15.398 14.627 13.917 13.323 12.724 12.156 11.635 11.137 10.662 10.234 9.847 9.435 9.062 8.734 8.367 7.983 7.686 7.382 7.063 6.809 6.512 6.171 5.827 5.483 5.238 4.969 4.533 4.242 3.953 3.804 3.478 3.12 2.744 2.538 2.183 1.861 1.623 1.377 0.844 0.557 0.241 -0.113 -0.52 -1.045 -1.673 -3.49 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index f4f10e41..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9607 ,TETRA ,17557395,Fri Nov 26 09:57:45 CET,Fri Nov 26 11:53:37 CET,0.0 4.276 5.043 5.548 5.949 6.292 6.586 6.867 7.441 7.71 7.942 8.196 8.496 8.686 9.049 9.379 9.684 9.818 10.087 10.358 10.728 10.954 11.179 11.496 11.777 12.055 12.337 12.608 12.945 13.242 13.525 13.896 14.241 14.572 14.975 15.447 15.894 16.358 16.835 17.306 17.775 18.318 18.947 19.539 20.229 20.994 21.815 22.668 23.617 24.621 25.514 25.83 25.666 25.24 24.697 24.185 23.751 23.348 22.979 22.576 22.181 21.791 21.404 21.028 20.655 20.304 19.948 19.616 19.317 19.014 18.691 18.415 18.118 17.813 17.575 17.315 17.055 16.787 16.499 16.29 16.088 15.791 15.558 15.292 15.158 14.875 14.582 14.292 14.135 13.847 13.576 13.361 13.135 12.583 12.28 11.954 11.534 11.078 10.605 10.009 7.206 -2 ,17799 ,TETRA ,17557396,Fri Nov 26 09:58:47 CET,Fri Nov 26 11:35:04 CET,0.0 3.672 4.4 4.895 5.307 5.661 6.015 6.362 6.916 7.148 7.378 7.681 7.977 8.155 8.479 8.766 9.037 9.175 9.469 9.758 10.129 10.347 10.57 10.875 11.139 11.399 11.665 11.939 12.301 12.633 12.95 13.347 13.725 14.071 14.475 14.916 15.324 15.805 16.339 16.888 17.47 18.122 18.781 19.367 20.065 20.822 21.628 22.476 23.391 24.369 25.311 25.659 25.57 25.294 24.916 24.459 23.987 23.517 23.053 22.555 22.092 21.656 21.26 20.913 20.595 20.29 19.963 19.646 19.37 19.071 18.717 18.419 18.113 17.787 17.526 17.263 17.011 16.761 16.502 16.316 16.111 15.776 15.521 15.253 15.116 14.826 14.543 14.231 14.05 13.746 13.456 13.204 12.91 12.383 12.115 11.806 11.45 11.023 10.579 9.973 7.138 -3 ,12389 ,TETRA ,17557397,Fri Nov 26 09:58:47 CET,Fri Nov 26 11:53:44 CET,0.0 2.719 3.53 4.168 4.629 4.946 5.218 5.482 5.939 6.144 6.358 6.648 6.958 7.141 7.472 7.776 8.078 8.222 8.511 8.768 9.094 9.304 9.503 9.793 10.108 10.418 10.716 10.99 11.295 11.589 11.878 12.223 12.562 12.888 13.259 13.687 14.095 14.513 14.949 15.428 15.963 16.56 17.19 17.815 18.533 19.306 20.194 21.202 22.273 23.189 23.629 23.256 22.503 21.6 20.677 19.867 19.132 18.414 17.772 17.103 16.553 16.074 15.593 15.121 14.676 14.246 13.777 13.359 12.997 12.614 12.199 11.858 11.516 11.149 10.87 10.565 10.218 9.872 9.542 9.321 9.081 8.687 8.402 8.094 7.925 7.568 7.205 6.849 6.666 6.354 6.071 5.853 5.607 5.067 4.739 4.357 3.938 3.487 2.981 2.331 -1.773 -4 ,12396 ,TETRA ,17557398,Fri Nov 26 09:58:47 CET,Fri Nov 26 11:54:39 CET,0.0 5.327 6.048 6.538 6.973 7.342 7.627 7.877 8.351 8.567 8.804 9.121 9.431 9.614 9.944 10.238 10.523 10.658 10.899 11.137 11.547 11.811 12.019 12.306 12.586 12.842 13.092 13.331 13.627 13.921 14.236 14.614 14.944 15.263 15.646 16.065 16.469 16.923 17.386 17.867 18.367 18.925 19.562 20.173 20.893 21.641 22.448 23.348 24.293 25.24 26.098 26.438 26.307 25.94 25.478 24.954 24.49 24.078 23.689 23.266 22.892 22.563 22.237 21.904 21.531 21.17 20.755 20.351 20.025 19.689 19.365 19.108 18.833 18.556 18.329 18.055 17.769 17.477 17.171 16.958 16.719 16.357 16.128 15.897 15.768 15.487 15.189 14.864 14.686 14.388 14.102 13.896 13.695 13.203 12.93 12.641 12.312 11.944 11.431 10.725 5.527 -5 ,4888 ,TETRA ,17557399,Fri Nov 26 09:58:47 CET,Fri Nov 26 11:53:47 CET,0.0 4.594 5.288 5.794 6.194 6.532 6.847 7.161 7.695 7.922 8.131 8.409 8.729 8.918 9.267 9.581 9.877 10.015 10.281 10.56 10.944 11.186 11.436 11.777 12.095 12.407 12.71 13.009 13.397 13.772 14.101 14.456 14.785 15.113 15.501 15.942 16.382 16.858 17.338 17.818 18.323 18.908 19.595 20.265 20.995 21.738 22.504 23.309 24.214 25.18 26.025 26.225 26.024 25.645 25.23 24.815 24.385 23.968 23.561 23.125 22.745 22.417 22.085 21.743 21.412 21.079 20.726 20.423 20.167 19.9 19.618 19.394 19.152 18.878 18.663 18.432 18.175 17.906 17.619 17.412 17.194 16.853 16.597 16.314 16.172 15.89 15.601 15.292 15.136 14.85 14.552 14.307 14.031 13.354 12.984 12.608 12.198 11.722 11.161 10.456 6.417 -6 ,17202 ,TETRA ,17557400,Fri Nov 26 09:58:47 CET,Fri Nov 26 11:55:02 CET,0.0 3.577 4.191 4.614 4.947 5.276 5.604 5.916 6.449 6.687 6.91 7.198 7.508 7.686 8.013 8.329 8.647 8.8 9.08 9.359 9.761 9.998 10.22 10.544 10.864 11.175 11.449 11.698 12.019 12.326 12.633 13.01 13.376 13.727 14.114 14.539 14.917 15.324 15.779 16.226 16.69 17.233 17.93 18.644 19.368 20.078 20.896 21.827 22.808 23.719 24.491 24.807 24.724 24.465 24.125 23.701 23.284 22.871 22.418 21.927 21.534 21.164 20.808 20.497 20.166 19.846 19.512 19.188 18.873 18.519 18.173 17.923 17.672 17.381 17.132 16.881 16.613 16.321 16.042 15.863 15.664 15.305 15.037 14.775 14.651 14.423 14.157 13.838 13.679 13.391 13.14 12.938 12.728 12.263 12.008 11.708 11.342 10.902 10.407 9.795 4.943 -7 ,17952 ,TETRA ,17557401,Fri Nov 26 10:00:45 CET,Fri Nov 26 12:05:25 CET,0.0 5.231 5.872 6.291 6.648 6.96 7.249 7.521 7.984 8.2 8.417 8.707 9.027 9.216 9.564 9.881 10.164 10.292 10.549 10.802 11.172 11.412 11.644 11.997 12.336 12.637 12.928 13.198 13.5 13.787 14.072 14.421 14.775 15.116 15.486 15.886 16.302 16.78 17.265 17.743 18.243 18.812 19.458 20.106 20.825 21.575 22.409 23.407 24.537 25.607 26.49 26.852 26.638 26.136 25.599 25.038 24.491 23.98 23.526 23.058 22.621 22.2 21.794 21.408 21.058 20.748 20.404 20.085 19.817 19.549 19.243 18.967 18.704 18.428 18.171 17.902 17.651 17.381 17.082 16.877 16.682 16.345 16.086 15.858 15.749 15.477 15.173 14.85 14.681 14.395 14.089 13.868 13.599 12.982 12.667 12.322 11.908 11.423 10.897 10.124 6.17 -8 ,27055 ,TETRA ,17557402,Fri Nov 26 09:59:45 CET,Fri Nov 26 11:54:14 CET,0.0 5.01 5.611 6.094 6.527 6.881 7.174 7.46 7.969 8.179 8.394 8.691 8.984 9.141 9.446 9.726 9.973 10.091 10.335 10.579 10.961 11.212 11.437 11.762 12.076 12.373 12.664 12.931 13.25 13.571 13.869 14.203 14.532 14.848 15.224 15.665 16.086 16.527 16.979 17.46 17.984 18.538 19.133 19.706 20.359 21.106 21.923 22.789 23.758 24.76 25.646 25.889 25.683 25.312 24.895 24.477 24.074 23.659 23.262 22.862 22.52 22.158 21.786 21.442 21.121 20.805 20.443 20.113 19.804 19.485 19.163 18.886 18.601 18.313 18.072 17.799 17.522 17.241 16.946 16.757 16.556 16.223 15.986 15.747 15.633 15.388 15.119 14.803 14.632 14.354 14.139 13.943 13.734 13.28 13.006 12.704 12.364 11.964 11.507 10.859 8.354 -9 ,9567 ,TETRA ,17557403,Fri Nov 26 09:59:45 CET,Fri Nov 26 11:54:41 CET,0.0 3.604 4.388 4.958 5.354 5.684 5.976 6.255 6.756 6.986 7.191 7.439 7.752 7.935 8.287 8.614 8.901 9.03 9.278 9.523 9.874 10.111 10.331 10.64 10.944 11.222 11.495 11.768 12.109 12.42 12.724 13.109 13.47 13.797 14.161 14.567 14.955 15.396 15.874 16.365 16.858 17.414 18.065 18.696 19.452 20.282 21.16 22.109 23.157 24.126 24.959 25.177 24.87 24.435 23.959 23.483 23.074 22.676 22.293 21.845 21.4 20.986 20.578 20.215 19.914 19.61 19.258 18.954 18.663 18.329 17.988 17.698 17.412 17.121 16.89 16.65 16.383 16.095 15.794 15.582 15.367 15.026 14.785 14.53 14.401 14.146 13.888 13.62 13.475 13.192 12.954 12.781 12.574 12.053 11.745 11.437 11.094 10.67 10.219 9.413 5.559 -10 ,11828 ,TETRA ,17557404,Fri Nov 26 09:59:48 CET,Fri Nov 26 11:54:36 CET,0.0 11.217 12.025 12.51 12.816 13.117 13.412 13.701 14.214 14.426 14.622 14.881 15.175 15.339 15.652 15.964 16.258 16.402 16.679 16.925 17.285 17.515 17.723 18.02 18.307 18.589 18.873 19.148 19.485 19.807 20.103 20.45 20.783 21.102 21.473 21.876 22.262 22.69 23.136 23.621 24.134 24.685 25.323 25.967 26.709 27.497 28.336 29.197 30.111 31.053 31.944 32.215 32.036 31.709 31.298 30.821 30.353 29.915 29.454 28.906 28.455 28.101 27.766 27.42 27.083 26.77 26.436 26.13 25.873 25.601 25.293 25.019 24.696 24.373 24.152 23.927 23.69 23.422 23.038 22.716 22.398 21.977 21.738 21.5 21.379 21.114 20.834 20.521 20.334 20.031 19.79 19.603 19.379 18.827 18.525 18.229 17.923 17.529 16.983 16.284 12.295 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt deleted file mode 100644 index 0a8666ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29243 ,TETRA ,17557405,Fri Nov 26 09:59:46 CET,Fri Nov 26 11:50:49 CET,0.0 0.632 0.958 1.242 1.504 1.723 1.906 2.069 2.362 2.491 2.613 2.752 2.973 3.089 3.306 3.498 3.677 3.766 3.939 4.108 4.358 4.512 4.656 4.867 5.064 5.252 5.436 5.604 5.82 6.039 6.258 6.512 6.748 6.985 7.257 7.555 7.832 8.133 8.464 8.803 9.159 9.56 10.001 10.429 10.922 11.462 12.038 12.647 13.315 14.021 14.653 14.833 14.664 14.345 13.999 13.627 13.235 12.857 12.532 12.192 11.886 11.594 11.295 11.006 10.737 10.474 10.183 9.918 9.679 9.429 9.182 8.972 8.742 8.515 8.335 8.137 7.929 7.727 7.52 7.367 7.21 6.952 6.756 6.54 6.437 6.24 6.025 5.786 5.663 5.441 5.276 5.13 4.968 4.628 4.433 4.221 3.994 3.706 3.356 2.904 1.79 -2 ,22644 ,TETRA ,17557406,Fri Nov 26 09:59:46 CET,Fri Nov 26 11:51:02 CET,0.0 0.875 1.312 1.617 1.854 2.078 2.287 2.462 2.755 2.895 3.026 3.159 3.376 3.486 3.686 3.88 4.073 4.165 4.343 4.515 4.753 4.9 5.047 5.256 5.451 5.645 5.831 6.006 6.231 6.448 6.658 6.906 7.142 7.37 7.632 7.936 8.23 8.527 8.855 9.209 9.56 9.947 10.386 10.812 11.316 11.858 12.42 13.036 13.721 14.383 14.917 15.026 14.841 14.537 14.174 13.803 13.438 13.066 12.723 12.351 12.02 11.739 11.459 11.184 10.919 10.651 10.353 10.093 9.86 9.612 9.364 9.151 8.925 8.689 8.509 8.319 8.108 7.892 7.667 7.508 7.342 7.078 6.895 6.705 6.61 6.411 6.188 5.95 5.822 5.585 5.395 5.242 5.088 4.75 4.541 4.315 4.074 3.778 3.417 2.9 1.2 -3 ,1387 ,TETRA ,17557407,Fri Nov 26 09:59:47 CET,Fri Nov 26 11:46:08 CET,0.0 0.377 0.715 0.996 1.224 1.416 1.591 1.752 2.046 2.176 2.299 2.449 2.664 2.766 2.97 3.162 3.349 3.442 3.614 3.769 3.997 4.14 4.277 4.472 4.666 4.86 5.05 5.236 5.466 5.682 5.888 6.133 6.373 6.603 6.857 7.161 7.459 7.761 8.071 8.388 8.717 9.078 9.511 9.951 10.443 10.983 11.59 12.239 12.909 13.62 14.228 14.353 14.148 13.79 13.41 13.019 12.615 12.231 11.898 11.552 11.237 10.926 10.626 10.347 10.061 9.793 9.519 9.272 9.047 8.813 8.591 8.404 8.201 7.996 7.828 7.642 7.442 7.231 7.02 6.869 6.703 6.45 6.269 6.072 5.973 5.784 5.574 5.337 5.222 5.0 4.815 4.676 4.527 4.188 4.005 3.813 3.574 3.287 2.958 2.436 1.349 -4 ,20132 ,TETRA ,17557408,Fri Nov 26 09:59:46 CET,Fri Nov 26 11:38:30 CET,0.0 0.303 0.508 0.685 0.849 1.002 1.149 1.274 1.496 1.605 1.709 1.796 1.993 2.082 2.25 2.412 2.573 2.649 2.803 2.962 3.185 3.331 3.482 3.693 3.897 4.1 4.287 4.471 4.714 4.942 5.151 5.394 5.633 5.86 6.121 6.411 6.686 6.993 7.316 7.655 8.008 8.394 8.821 9.243 9.738 10.273 10.871 11.506 12.178 12.848 13.407 13.494 13.317 13.03 12.659 12.28 11.91 11.529 11.182 10.822 10.504 10.209 9.922 9.653 9.383 9.117 8.833 8.574 8.345 8.105 7.85 7.626 7.393 7.156 6.979 6.791 6.599 6.408 6.195 6.038 5.865 5.595 5.415 5.231 5.132 4.926 4.714 4.482 4.355 4.118 3.931 3.776 3.608 3.225 3.018 2.801 2.546 2.276 1.923 1.379 -0.234 -5 ,32368 ,TETRA ,17557409,Fri Nov 26 10:00:47 CET,Fri Nov 26 11:51:12 CET,0.0 0.263 0.463 0.643 0.819 0.986 1.139 1.294 1.584 1.709 1.824 1.943 2.154 2.262 2.467 2.676 2.871 2.96 3.136 3.312 3.575 3.736 3.886 4.098 4.297 4.488 4.678 4.86 5.1 5.334 5.553 5.808 6.04 6.258 6.51 6.792 7.064 7.377 7.713 8.054 8.407 8.808 9.257 9.688 10.196 10.734 11.332 11.979 12.646 13.325 13.931 14.038 13.847 13.54 13.134 12.701 12.33 11.979 11.627 11.268 10.93 10.602 10.305 10.024 9.75 9.492 9.218 8.982 8.782 8.562 8.315 8.1 7.876 7.651 7.477 7.287 7.077 6.859 6.639 6.487 6.324 6.074 5.898 5.715 5.606 5.361 5.132 4.9 4.776 4.535 4.345 4.202 4.043 3.702 3.518 3.31 3.055 2.759 2.428 1.986 0.766 -6 ,16402 ,TETRA ,17557410,Fri Nov 26 10:00:45 CET,Fri Nov 26 11:51:50 CET,0.0 0.928 1.323 1.629 1.855 2.04 2.226 2.391 2.683 2.822 2.949 3.084 3.301 3.41 3.619 3.818 4.009 4.101 4.274 4.441 4.683 4.832 4.976 5.185 5.384 5.582 5.778 5.973 6.208 6.425 6.641 6.897 7.145 7.385 7.646 7.935 8.207 8.506 8.831 9.161 9.506 9.891 10.339 10.788 11.288 11.824 12.385 12.959 13.629 14.33 14.905 15.001 14.778 14.465 14.107 13.725 13.35 12.973 12.618 12.262 11.924 11.625 11.334 11.019 10.733 10.478 10.201 9.953 9.748 9.533 9.299 9.103 8.888 8.659 8.483 8.284 8.068 7.841 7.608 7.46 7.302 7.046 6.869 6.683 6.585 6.375 6.151 5.91 5.778 5.543 5.359 5.203 5.044 4.714 4.53 4.322 4.071 3.741 3.364 2.926 1.747 -7 ,28711 ,TETRA ,17557411,Fri Nov 26 10:00:45 CET,Fri Nov 26 11:51:52 CET,0.0 0.747 1.096 1.362 1.577 1.765 1.93 2.079 2.349 2.474 2.6 2.748 2.972 3.087 3.306 3.503 3.69 3.782 3.95 4.109 4.341 4.494 4.641 4.843 5.036 5.223 5.4 5.567 5.788 6.009 6.215 6.454 6.695 6.927 7.186 7.497 7.798 8.107 8.433 8.787 9.174 9.59 10.031 10.464 10.985 11.551 12.147 12.764 13.432 14.097 14.61 14.723 14.63 14.379 14.038 13.646 13.263 12.904 12.556 12.169 11.84 11.54 11.224 10.934 10.667 10.419 10.148 9.896 9.675 9.448 9.219 9.014 8.801 8.573 8.388 8.202 8.012 7.807 7.584 7.429 7.271 7.018 6.833 6.628 6.528 6.325 6.106 5.888 5.786 5.57 5.39 5.242 5.084 4.747 4.548 4.325 4.089 3.833 3.512 3.083 1.966 -8 ,12301 ,TETRA ,17557412,Fri Nov 26 10:00:45 CET,Fri Nov 26 11:40:38 CET,0.0 0.341 0.543 0.744 0.923 1.071 1.202 1.329 1.576 1.691 1.809 1.94 2.157 2.278 2.505 2.691 2.861 2.947 3.116 3.283 3.528 3.685 3.832 4.043 4.248 4.434 4.613 4.788 5.007 5.216 5.422 5.673 5.91 6.143 6.415 6.706 6.991 7.304 7.624 7.97 8.332 8.733 9.182 9.591 10.072 10.61 11.183 11.794 12.445 13.08 13.614 13.716 13.521 13.233 12.875 12.5 12.149 11.786 11.452 11.093 10.764 10.461 10.156 9.878 9.622 9.371 9.096 8.839 8.621 8.391 8.135 7.927 7.714 7.489 7.302 7.108 6.916 6.717 6.504 6.352 6.187 5.924 5.752 5.576 5.484 5.275 5.047 4.807 4.68 4.444 4.241 4.083 3.919 3.538 3.33 3.113 2.84 2.53 2.182 1.728 0.68 -9 ,27559 ,TETRA ,17557413,Fri Nov 26 10:01:43 CET,Fri Nov 26 11:50:35 CET,0.0 0.275 0.513 0.718 0.916 1.11 1.286 1.45 1.759 1.89 2.014 2.165 2.384 2.493 2.698 2.893 3.084 3.178 3.356 3.524 3.77 3.923 4.066 4.279 4.492 4.695 4.877 5.044 5.259 5.48 5.685 5.923 6.16 6.389 6.654 6.95 7.238 7.559 7.898 8.236 8.574 8.953 9.389 9.823 10.333 10.868 11.423 12.018 12.705 13.416 14.002 14.174 13.952 13.596 13.269 12.905 12.531 12.162 11.806 11.437 11.102 10.799 10.506 10.211 9.926 9.657 9.372 9.115 8.884 8.644 8.397 8.197 7.988 7.757 7.583 7.41 7.221 7.015 6.801 6.648 6.48 6.226 6.047 5.855 5.757 5.554 5.34 5.111 4.985 4.755 4.582 4.439 4.276 3.894 3.69 3.481 3.251 2.986 2.697 2.306 1.107 -10 ,25765 ,TETRA ,17557414,Fri Nov 26 10:02:45 CET,Fri Nov 26 11:55:34 CET,0.0 0.471 0.732 0.94 1.132 1.323 1.502 1.668 1.973 2.118 2.243 2.37 2.59 2.698 2.917 3.119 3.294 3.38 3.546 3.709 3.943 4.088 4.227 4.439 4.65 4.854 5.043 5.214 5.439 5.656 5.871 6.131 6.367 6.587 6.837 7.113 7.381 7.686 8.017 8.362 8.729 9.116 9.546 9.99 10.488 11.025 11.607 12.217 12.859 13.501 14.049 14.165 13.961 13.63 13.237 12.822 12.426 12.06 11.747 11.427 11.12 10.822 10.524 10.225 9.943 9.686 9.41 9.165 8.94 8.696 8.444 8.221 7.996 7.766 7.59 7.408 7.203 6.991 6.767 6.611 6.447 6.19 6.014 5.823 5.721 5.501 5.265 5.008 4.876 4.649 4.469 4.311 4.129 3.742 3.539 3.317 3.084 2.806 2.461 1.993 0.512 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt deleted file mode 100644 index 2e7e080e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18695 ,TETRA ,17557415,Fri Nov 26 10:02:45 CET,Fri Nov 26 11:51:55 CET,0.0 0.697 0.93 1.096 1.232 1.344 1.456 1.582 1.786 1.861 1.947 2.077 2.193 2.275 2.409 2.532 2.645 2.688 2.765 2.845 2.976 3.059 3.13 3.235 3.333 3.435 3.536 3.627 3.745 3.853 3.947 4.062 4.169 4.268 4.388 4.518 4.636 4.756 4.875 5.002 5.12 5.229 5.329 5.415 5.498 5.558 5.583 5.531 5.38 5.011 4.235 3.161 2.14 1.225 0.449 -0.232 -0.814 -1.345 -1.823 -2.29 -2.688 -3.056 -3.401 -3.709 -3.998 -4.26 -4.535 -4.782 -4.987 -5.204 -5.433 -5.629 -5.829 -6.03 -6.188 -6.348 -6.511 -6.69 -6.875 -7.01 -7.144 -7.343 -7.481 -7.621 -7.691 -7.845 -8.016 -8.182 -8.27 -8.408 -8.559 -8.669 -8.781 -9.044 -9.195 -9.369 -9.588 -9.829 -10.097 -10.401 -11.375 -2 ,11300 ,TETRA ,17557416,Fri Nov 26 10:02:44 CET,Fri Nov 26 11:53:34 CET,0.0 0.605 0.817 0.969 1.11 1.235 1.356 1.473 1.681 1.779 1.868 1.984 2.091 2.152 2.261 2.372 2.485 2.539 2.646 2.741 2.876 2.96 3.031 3.133 3.237 3.341 3.44 3.536 3.663 3.781 3.893 4.021 4.133 4.241 4.359 4.472 4.569 4.664 4.758 4.863 4.982 5.092 5.192 5.296 5.4 5.478 5.523 5.526 5.393 5.003 4.201 3.052 2.031 1.118 0.285 -0.455 -1.056 -1.587 -2.05 -2.521 -2.927 -3.296 -3.638 -3.951 -4.244 -4.511 -4.786 -5.025 -5.227 -5.44 -5.669 -5.849 -6.052 -6.273 -6.436 -6.605 -6.773 -6.944 -7.123 -7.243 -7.365 -7.562 -7.697 -7.838 -7.917 -8.082 -8.25 -8.429 -8.523 -8.664 -8.804 -8.905 -9.018 -9.274 -9.414 -9.566 -9.735 -9.925 -10.159 -10.433 -11.183 -3 ,27953 ,TETRA ,17557417,Fri Nov 26 10:02:44 CET,Fri Nov 26 11:42:03 CET,0.0 0.548 0.832 1.033 1.189 1.322 1.448 1.58 1.792 1.875 1.96 2.084 2.185 2.249 2.39 2.518 2.628 2.679 2.77 2.858 2.989 3.075 3.16 3.271 3.36 3.436 3.519 3.611 3.723 3.826 3.929 4.041 4.145 4.251 4.361 4.485 4.603 4.726 4.843 4.953 5.07 5.185 5.296 5.376 5.457 5.533 5.586 5.572 5.444 5.093 4.221 3.048 2.039 1.167 0.406 -0.275 -0.86 -1.401 -1.885 -2.365 -2.756 -3.09 -3.411 -3.716 -4.01 -4.285 -4.571 -4.808 -5.004 -5.224 -5.465 -5.66 -5.852 -6.048 -6.215 -6.383 -6.546 -6.715 -6.893 -7.017 -7.148 -7.368 -7.523 -7.673 -7.749 -7.912 -8.082 -8.255 -8.349 -8.494 -8.635 -8.737 -8.853 -9.112 -9.254 -9.401 -9.582 -9.788 -10.024 -10.369 -11.338 -4 ,26254 ,TETRA ,17557420,Fri Nov 26 10:02:44 CET,Fri Nov 26 11:51:48 CET,0.0 0.784 1.031 1.181 1.334 1.467 1.574 1.677 1.869 1.959 2.037 2.14 2.258 2.334 2.455 2.589 2.717 2.771 2.873 2.971 3.095 3.176 3.257 3.383 3.498 3.596 3.689 3.771 3.878 3.989 4.096 4.218 4.339 4.449 4.554 4.658 4.762 4.884 5.002 5.102 5.212 5.34 5.444 5.513 5.586 5.663 5.702 5.634 5.452 5.094 4.3 3.191 2.216 1.37 0.597 -0.081 -0.658 -1.213 -1.694 -2.164 -2.571 -2.941 -3.298 -3.614 -3.899 -4.162 -4.423 -4.667 -4.887 -5.107 -5.339 -5.537 -5.742 -5.952 -6.11 -6.28 -6.461 -6.635 -6.816 -6.947 -7.08 -7.279 -7.418 -7.565 -7.645 -7.802 -7.962 -8.13 -8.212 -8.356 -8.535 -8.653 -8.782 -9.053 -9.205 -9.371 -9.539 -9.723 -9.944 -10.23 -11.19 -5 ,9912 ,TETRA ,17557422,Fri Nov 26 10:02:46 CET,Fri Nov 26 11:52:01 CET,0.0 0.557 0.786 0.983 1.15 1.302 1.425 1.514 1.698 1.786 1.852 1.922 2.019 2.077 2.189 2.299 2.396 2.445 2.544 2.637 2.765 2.849 2.928 3.038 3.147 3.256 3.357 3.445 3.562 3.675 3.784 3.927 4.054 4.151 4.253 4.37 4.484 4.613 4.73 4.835 4.94 5.066 5.198 5.298 5.393 5.474 5.525 5.485 5.291 4.903 4.114 2.925 1.85 0.94 0.135 -0.595 -1.199 -1.734 -2.196 -2.652 -3.044 -3.388 -3.713 -4.025 -4.33 -4.594 -4.861 -5.1 -5.303 -5.525 -5.76 -5.945 -6.132 -6.333 -6.487 -6.645 -6.816 -6.997 -7.184 -7.308 -7.429 -7.621 -7.761 -7.902 -7.973 -8.135 -8.313 -8.48 -8.577 -8.731 -8.884 -8.989 -9.107 -9.386 -9.535 -9.68 -9.835 -10.025 -10.28 -10.616 -11.496 -6 ,27999 ,TETRA ,17557423,Fri Nov 26 10:03:46 CET,Fri Nov 26 11:53:01 CET,0.0 0.656 0.918 1.09 1.238 1.377 1.498 1.599 1.776 1.865 1.951 2.071 2.176 2.24 2.356 2.463 2.575 2.629 2.735 2.835 2.965 3.045 3.115 3.217 3.319 3.415 3.513 3.615 3.741 3.858 3.963 4.078 4.184 4.298 4.431 4.563 4.669 4.772 4.883 4.997 5.106 5.225 5.346 5.447 5.543 5.607 5.62 5.544 5.366 4.933 4.031 2.903 1.951 1.04 0.217 -0.474 -1.078 -1.619 -2.098 -2.587 -3.01 -3.37 -3.697 -4.028 -4.328 -4.589 -4.855 -5.099 -5.315 -5.528 -5.751 -5.944 -6.142 -6.343 -6.494 -6.653 -6.827 -7.007 -7.188 -7.316 -7.448 -7.658 -7.8 -7.946 -8.026 -8.19 -8.369 -8.556 -8.647 -8.796 -8.952 -9.061 -9.188 -9.478 -9.625 -9.772 -9.909 -10.077 -10.311 -10.588 -11.28 -7 ,14379 ,TETRA ,17557425,Fri Nov 26 10:03:48 CET,Fri Nov 26 11:54:01 CET,0.0 0.515 0.745 0.938 1.103 1.25 1.374 1.481 1.663 1.742 1.824 1.95 2.057 2.117 2.24 2.359 2.47 2.523 2.611 2.692 2.807 2.882 2.961 3.076 3.184 3.284 3.379 3.472 3.592 3.698 3.795 3.912 4.021 4.127 4.247 4.37 4.489 4.617 4.737 4.855 4.967 5.08 5.212 5.327 5.437 5.482 5.472 5.427 5.255 4.91 4.157 3.03 2.055 1.19 0.404 -0.285 -0.88 -1.439 -1.917 -2.383 -2.788 -3.135 -3.489 -3.823 -4.107 -4.364 -4.642 -4.892 -5.1 -5.323 -5.559 -5.746 -5.934 -6.122 -6.262 -6.417 -6.586 -6.761 -6.944 -7.073 -7.204 -7.407 -7.543 -7.691 -7.773 -7.941 -8.109 -8.271 -8.356 -8.5 -8.657 -8.762 -8.885 -9.129 -9.252 -9.39 -9.561 -9.776 -10.01 -10.317 -11.477 -8 ,29869 ,TETRA ,17557426,Fri Nov 26 10:04:43 CET,Fri Nov 26 11:55:08 CET,0.0 0.592 0.884 1.062 1.218 1.342 1.445 1.543 1.723 1.8 1.874 1.984 2.095 2.158 2.256 2.354 2.461 2.515 2.61 2.682 2.769 2.828 2.894 2.991 3.083 3.176 3.265 3.348 3.455 3.567 3.669 3.794 3.907 3.999 4.113 4.238 4.346 4.457 4.569 4.679 4.789 4.909 5.045 5.157 5.238 5.289 5.298 5.248 5.088 4.709 3.889 2.722 1.69 0.821 0.083 -0.575 -1.18 -1.724 -2.205 -2.684 -3.076 -3.426 -3.747 -4.054 -4.357 -4.623 -4.88 -5.121 -5.346 -5.578 -5.809 -5.998 -6.195 -6.401 -6.562 -6.727 -6.892 -7.07 -7.258 -7.383 -7.518 -7.736 -7.885 -8.035 -8.111 -8.273 -8.439 -8.614 -8.712 -8.85 -8.977 -9.076 -9.186 -9.437 -9.573 -9.72 -9.879 -10.053 -10.269 -10.563 -11.501 -9 ,19193 ,TETRA ,17557427,Fri Nov 26 10:03:45 CET,Fri Nov 26 11:53:52 CET,0.0 0.658 0.895 1.088 1.24 1.367 1.474 1.574 1.78 1.868 1.938 2.044 2.152 2.213 2.342 2.461 2.575 2.628 2.717 2.799 2.919 2.998 3.076 3.197 3.312 3.408 3.492 3.578 3.685 3.777 3.871 3.973 4.061 4.162 4.283 4.405 4.513 4.619 4.733 4.865 5.006 5.128 5.227 5.321 5.414 5.461 5.449 5.378 5.261 4.949 4.179 3.101 2.117 1.213 0.405 -0.309 -0.934 -1.498 -1.97 -2.444 -2.862 -3.227 -3.562 -3.866 -4.151 -4.406 -4.675 -4.919 -5.126 -5.346 -5.573 -5.762 -5.96 -6.165 -6.322 -6.476 -6.639 -6.809 -6.981 -7.109 -7.247 -7.453 -7.603 -7.764 -7.838 -7.989 -8.142 -8.302 -8.392 -8.534 -8.682 -8.785 -8.901 -9.165 -9.302 -9.455 -9.622 -9.816 -10.047 -10.375 -11.311 -10 ,25662 ,TETRA ,17557428,Fri Nov 26 10:03:45 CET,Fri Nov 26 11:53:41 CET,0.0 0.645 0.913 1.122 1.282 1.406 1.524 1.633 1.819 1.903 1.988 2.105 2.208 2.271 2.392 2.511 2.621 2.672 2.773 2.864 2.993 3.077 3.153 3.26 3.357 3.46 3.563 3.645 3.75 3.853 3.955 4.085 4.206 4.321 4.444 4.555 4.654 4.763 4.871 4.986 5.107 5.232 5.349 5.434 5.512 5.572 5.612 5.595 5.465 5.145 4.417 3.256 2.202 1.336 0.554 -0.156 -0.749 -1.265 -1.732 -2.194 -2.596 -2.968 -3.304 -3.607 -3.894 -4.154 -4.43 -4.68 -4.894 -5.121 -5.354 -5.539 -5.733 -5.942 -6.102 -6.255 -6.412 -6.58 -6.762 -6.892 -7.024 -7.214 -7.34 -7.478 -7.552 -7.714 -7.881 -8.052 -8.149 -8.294 -8.441 -8.554 -8.668 -8.914 -9.066 -9.222 -9.405 -9.617 -9.859 -10.145 -11.205 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt deleted file mode 100644 index d1b035ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13478 ,TETRA ,17557429,Fri Nov 26 10:03:45 CET,Fri Nov 26 11:51:06 CET,0.0 0.83 1.092 1.263 1.376 1.495 1.608 1.698 1.837 1.907 1.972 2.065 2.154 2.213 2.319 2.406 2.483 2.523 2.605 2.677 2.772 2.827 2.881 2.973 3.056 3.122 3.192 3.263 3.346 3.422 3.483 3.553 3.618 3.671 3.734 3.802 3.853 3.897 3.949 3.989 4.015 4.035 4.041 4.02 3.966 3.854 3.635 3.318 2.802 1.96 0.499 -1.293 -2.719 -3.913 -4.939 -5.828 -6.588 -7.258 -7.806 -8.36 -8.847 -9.264 -9.646 -10.018 -10.362 -10.656 -10.965 -11.245 -11.486 -11.735 -11.99 -12.195 -12.396 -12.607 -12.772 -12.944 -13.133 -13.334 -13.538 -13.672 -13.811 -14.024 -14.164 -14.317 -14.399 -14.558 -14.718 -14.893 -14.986 -15.124 -15.271 -15.378 -15.487 -15.717 -15.845 -15.98 -16.137 -16.328 -16.568 -16.821 -17.496 -2 ,32354 ,TETRA ,17557430,Fri Nov 26 10:03:45 CET,Fri Nov 26 11:52:42 CET,0.0 0.744 0.992 1.185 1.333 1.46 1.564 1.655 1.826 1.888 1.96 2.074 2.152 2.205 2.31 2.428 2.535 2.578 2.659 2.738 2.834 2.896 2.96 3.045 3.127 3.207 3.282 3.359 3.451 3.519 3.579 3.657 3.726 3.792 3.872 3.941 3.995 4.042 4.082 4.115 4.14 4.152 4.142 4.129 4.098 4.004 3.828 3.517 2.972 2.107 0.632 -1.079 -2.468 -3.661 -4.666 -5.539 -6.293 -6.963 -7.508 -8.045 -8.518 -8.917 -9.294 -9.663 -10.012 -10.323 -10.64 -10.924 -11.161 -11.406 -11.669 -11.885 -12.102 -12.331 -12.506 -12.679 -12.856 -13.038 -13.231 -13.364 -13.499 -13.718 -13.876 -14.039 -14.117 -14.277 -14.45 -14.634 -14.735 -14.884 -15.044 -15.153 -15.266 -15.503 -15.632 -15.774 -15.945 -16.135 -16.35 -16.697 -17.419 -3 ,20011 ,TETRA ,17557431,Fri Nov 26 10:03:45 CET,Fri Nov 26 11:43:30 CET,0.0 0.708 0.934 1.113 1.242 1.356 1.474 1.574 1.754 1.837 1.903 2.001 2.087 2.15 2.264 2.362 2.446 2.487 2.569 2.651 2.764 2.826 2.884 2.964 3.049 3.125 3.185 3.242 3.314 3.389 3.459 3.53 3.605 3.681 3.747 3.816 3.873 3.922 3.969 4.005 4.03 4.047 4.05 4.047 4.002 3.874 3.671 3.368 2.893 2.064 0.563 -1.239 -2.659 -3.833 -4.862 -5.732 -6.442 -7.097 -7.667 -8.208 -8.683 -9.123 -9.517 -9.878 -10.216 -10.521 -10.846 -11.129 -11.369 -11.611 -11.857 -12.067 -12.286 -12.508 -12.673 -12.847 -13.032 -13.214 -13.403 -13.538 -13.68 -13.894 -14.044 -14.206 -14.289 -14.462 -14.635 -14.814 -14.914 -15.058 -15.208 -15.315 -15.436 -15.696 -15.83 -15.989 -16.167 -16.356 -16.571 -16.835 -17.621 -4 ,6495 ,TETRA ,17557432,Fri Nov 26 10:04:43 CET,Fri Nov 26 11:53:36 CET,0.0 0.531 0.795 0.979 1.113 1.222 1.313 1.404 1.601 1.678 1.753 1.862 1.943 2.005 2.131 2.245 2.348 2.396 2.487 2.565 2.676 2.754 2.826 2.914 2.996 3.079 3.147 3.204 3.291 3.371 3.442 3.524 3.595 3.664 3.737 3.814 3.88 3.93 3.966 4.002 4.029 4.055 4.063 4.021 3.927 3.787 3.585 3.254 2.715 1.878 0.41 -1.445 -2.935 -4.154 -5.182 -6.065 -6.795 -7.445 -7.993 -8.532 -9.015 -9.447 -9.85 -10.213 -10.555 -10.864 -11.165 -11.437 -11.683 -11.939 -12.194 -12.404 -12.617 -12.837 -13.014 -13.197 -13.386 -13.595 -13.804 -13.938 -14.071 -14.272 -14.421 -14.576 -14.651 -14.807 -14.981 -15.152 -15.239 -15.388 -15.554 -15.663 -15.787 -16.075 -16.217 -16.362 -16.52 -16.665 -16.853 -17.14 -17.759 -5 ,32158 ,TETRA ,17557433,Fri Nov 26 10:04:43 CET,Fri Nov 26 11:56:40 CET,0.0 0.549 0.766 0.98 1.136 1.264 1.368 1.46 1.65 1.731 1.788 1.888 1.981 2.044 2.168 2.283 2.376 2.413 2.486 2.559 2.664 2.725 2.779 2.852 2.934 3.01 3.067 3.126 3.207 3.275 3.337 3.406 3.477 3.551 3.627 3.704 3.776 3.84 3.891 3.936 3.96 3.967 3.96 3.93 3.876 3.768 3.572 3.25 2.709 1.849 0.42 -1.324 -2.753 -3.915 -4.882 -5.761 -6.518 -7.196 -7.766 -8.304 -8.771 -9.194 -9.602 -9.974 -10.314 -10.634 -10.958 -11.242 -11.482 -11.727 -11.99 -12.208 -12.428 -12.64 -12.801 -12.965 -13.141 -13.335 -13.535 -13.669 -13.804 -14.011 -14.151 -14.292 -14.37 -14.527 -14.693 -14.883 -14.982 -15.123 -15.266 -15.369 -15.487 -15.729 -15.857 -15.995 -16.138 -16.311 -16.525 -16.808 -17.623 -6 ,18879 ,TETRA ,17557434,Fri Nov 26 10:04:47 CET,Fri Nov 26 11:52:07 CET,0.0 0.732 0.976 1.168 1.285 1.373 1.47 1.568 1.74 1.827 1.908 2.008 2.098 2.157 2.267 2.363 2.45 2.489 2.556 2.628 2.734 2.796 2.858 2.945 3.015 3.085 3.146 3.204 3.281 3.352 3.418 3.486 3.546 3.602 3.657 3.729 3.802 3.859 3.901 3.938 3.975 3.996 4.0 3.986 3.913 3.755 3.505 3.178 2.692 1.88 0.442 -1.295 -2.719 -3.935 -4.969 -5.835 -6.602 -7.305 -7.871 -8.406 -8.854 -9.251 -9.631 -9.992 -10.329 -10.64 -10.962 -11.234 -11.476 -11.736 -11.993 -12.2 -12.418 -12.642 -12.812 -12.975 -13.142 -13.325 -13.532 -13.678 -13.812 -14.014 -14.161 -14.316 -14.392 -14.549 -14.717 -14.887 -14.977 -15.119 -15.276 -15.382 -15.5 -15.785 -15.926 -16.059 -16.211 -16.409 -16.629 -16.879 -17.62 -7 ,10341 ,TETRA ,17557435,Fri Nov 26 10:04:43 CET,Fri Nov 26 11:43:21 CET,0.0 0.6 0.802 0.923 1.038 1.131 1.227 1.336 1.532 1.605 1.675 1.789 1.88 1.945 2.049 2.146 2.242 2.29 2.381 2.464 2.575 2.632 2.687 2.776 2.848 2.913 2.984 3.056 3.143 3.213 3.274 3.34 3.409 3.475 3.535 3.599 3.663 3.736 3.796 3.831 3.847 3.852 3.844 3.805 3.721 3.583 3.342 2.994 2.44 1.531 0.06 -1.702 -3.128 -4.307 -5.307 -6.188 -6.94 -7.618 -8.203 -8.771 -9.236 -9.644 -10.034 -10.396 -10.731 -11.036 -11.347 -11.613 -11.842 -12.084 -12.329 -12.526 -12.731 -12.939 -13.101 -13.269 -13.445 -13.633 -13.838 -13.978 -14.117 -14.341 -14.491 -14.638 -14.714 -14.884 -15.075 -15.269 -15.372 -15.521 -15.681 -15.795 -15.916 -16.167 -16.302 -16.462 -16.633 -16.809 -17.026 -17.33 -18.251 -8 ,18742 ,TETRA ,17557436,Fri Nov 26 10:04:45 CET,Fri Nov 26 11:43:51 CET,0.0 0.713 0.949 1.114 1.257 1.385 1.493 1.589 1.786 1.881 1.957 2.053 2.133 2.189 2.3 2.397 2.492 2.542 2.63 2.701 2.797 2.862 2.919 3.001 3.081 3.147 3.202 3.266 3.346 3.41 3.465 3.532 3.587 3.632 3.686 3.75 3.814 3.872 3.921 3.967 3.999 4.004 3.998 3.969 3.898 3.785 3.558 3.216 2.731 1.899 0.464 -1.234 -2.651 -3.853 -4.86 -5.737 -6.498 -7.181 -7.743 -8.289 -8.752 -9.159 -9.554 -9.93 -10.276 -10.577 -10.889 -11.174 -11.411 -11.662 -11.93 -12.145 -12.366 -12.583 -12.751 -12.928 -13.107 -13.291 -13.489 -13.625 -13.757 -13.983 -14.144 -14.305 -14.389 -14.555 -14.707 -14.872 -14.965 -15.101 -15.256 -15.364 -15.475 -15.707 -15.841 -15.995 -16.151 -16.336 -16.545 -16.816 -17.355 -9 ,5539 ,TETRA ,17557437,Fri Nov 26 10:05:42 CET,Fri Nov 26 11:56:44 CET,0.0 0.518 0.816 1.018 1.139 1.244 1.354 1.452 1.621 1.697 1.761 1.855 1.942 2.003 2.113 2.213 2.308 2.356 2.447 2.525 2.636 2.705 2.773 2.859 2.941 3.03 3.106 3.165 3.24 3.319 3.409 3.508 3.577 3.635 3.705 3.773 3.827 3.883 3.934 3.969 3.988 4.004 3.997 3.955 3.887 3.756 3.555 3.246 2.726 1.882 0.395 -1.444 -2.929 -4.119 -5.103 -6.007 -6.779 -7.441 -8.017 -8.597 -9.088 -9.513 -9.906 -10.265 -10.589 -10.895 -11.223 -11.509 -11.745 -11.983 -12.239 -12.448 -12.658 -12.875 -13.045 -13.216 -13.387 -13.572 -13.773 -13.913 -14.046 -14.252 -14.391 -14.532 -14.607 -14.765 -14.94 -15.127 -15.226 -15.369 -15.512 -15.612 -15.729 -16.001 -16.158 -16.323 -16.49 -16.668 -16.897 -17.149 -17.648 -10 ,26201 ,TETRA ,17557438,Fri Nov 26 10:05:43 CET,Fri Nov 26 11:50:32 CET,0.0 0.525 0.775 0.938 1.088 1.224 1.333 1.427 1.572 1.635 1.705 1.824 1.91 1.962 2.065 2.179 2.281 2.326 2.419 2.501 2.609 2.681 2.748 2.843 2.939 3.016 3.085 3.147 3.22 3.29 3.348 3.419 3.489 3.561 3.637 3.697 3.753 3.815 3.854 3.88 3.898 3.912 3.903 3.874 3.828 3.7 3.473 3.155 2.656 1.804 0.329 -1.466 -2.882 -4.033 -5.017 -5.915 -6.686 -7.335 -7.875 -8.421 -8.891 -9.3 -9.698 -10.063 -10.399 -10.717 -11.039 -11.313 -11.544 -11.787 -12.04 -12.251 -12.465 -12.686 -12.856 -13.025 -13.205 -13.387 -13.571 -13.697 -13.826 -14.04 -14.187 -14.333 -14.41 -14.572 -14.734 -14.899 -14.985 -15.124 -15.282 -15.402 -15.538 -15.798 -15.935 -16.109 -16.287 -16.473 -16.705 -17.039 -17.776 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt deleted file mode 100644 index a51690d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27376 ,TETRA ,17557439,Fri Nov 26 10:05:42 CET,Fri Nov 26 11:44:16 CET,0.0 0.979 1.263 1.45 1.601 1.733 1.845 1.938 2.123 2.209 2.295 2.421 2.555 2.638 2.784 2.913 3.041 3.099 3.208 3.318 3.486 3.597 3.697 3.847 3.998 4.13 4.25 4.37 4.53 4.69 4.838 5.002 5.165 5.327 5.52 5.73 5.928 6.137 6.359 6.601 6.852 7.143 7.48 7.792 8.135 8.517 8.934 9.377 9.871 10.388 10.856 11.01 10.916 10.733 10.518 10.278 10.044 9.786 9.569 9.352 9.145 8.976 8.801 8.621 8.451 8.289 8.131 7.994 7.875 7.759 7.647 7.556 7.459 7.352 7.261 7.166 7.076 6.985 6.892 6.822 6.745 6.634 6.551 6.464 6.425 6.336 6.243 6.148 6.087 5.975 5.901 5.839 5.776 5.636 5.559 5.474 5.385 5.299 5.187 5.001 4.744 -2 ,3714 ,TETRA ,17557440,Fri Nov 26 10:06:43 CET,Fri Nov 26 11:55:47 CET,0.0 0.489 0.71 0.838 0.964 1.098 1.217 1.318 1.493 1.569 1.649 1.757 1.876 1.947 2.088 2.229 2.366 2.431 2.551 2.675 2.856 2.957 3.051 3.188 3.328 3.467 3.593 3.721 3.891 4.054 4.22 4.399 4.557 4.711 4.887 5.082 5.26 5.464 5.69 5.935 6.196 6.48 6.804 7.112 7.454 7.829 8.255 8.709 9.194 9.68 10.131 10.316 10.222 10.0 9.804 9.62 9.415 9.204 9.013 8.808 8.632 8.464 8.28 8.118 7.976 7.828 7.659 7.515 7.401 7.272 7.128 7.014 6.894 6.774 6.676 6.562 6.447 6.335 6.201 6.104 6.016 5.881 5.785 5.68 5.626 5.525 5.392 5.23 5.154 5.039 4.956 4.891 4.82 4.676 4.614 4.528 4.427 4.337 4.24 4.133 3.679 -3 ,23862 ,TETRA ,17557441,Fri Nov 26 10:07:43 CET,Fri Nov 26 11:58:53 CET,0.0 0.647 0.876 1.055 1.221 1.363 1.492 1.605 1.813 1.904 1.988 2.116 2.246 2.311 2.437 2.558 2.675 2.733 2.844 2.95 3.098 3.188 3.281 3.439 3.577 3.693 3.813 3.935 4.086 4.232 4.372 4.541 4.711 4.874 5.06 5.27 5.471 5.679 5.898 6.15 6.411 6.684 6.998 7.32 7.683 8.058 8.503 8.991 9.509 10.061 10.583 10.828 10.748 10.514 10.288 10.072 9.846 9.629 9.439 9.22 9.019 8.848 8.673 8.5 8.336 8.18 8.014 7.869 7.736 7.597 7.467 7.357 7.248 7.154 7.081 6.995 6.901 6.801 6.698 6.631 6.564 6.46 6.39 6.314 6.274 6.184 6.087 5.984 5.933 5.838 5.774 5.709 5.636 5.488 5.404 5.308 5.219 5.127 4.994 4.855 4.663 -4 ,32185 ,TETRA ,17557442,Fri Nov 26 10:07:43 CET,Fri Nov 26 11:53:23 CET,0.0 0.722 0.953 1.116 1.27 1.385 1.497 1.609 1.797 1.898 1.996 2.125 2.257 2.326 2.474 2.617 2.741 2.798 2.913 3.023 3.186 3.294 3.388 3.533 3.681 3.821 3.957 4.086 4.253 4.408 4.56 4.733 4.889 5.047 5.232 5.437 5.621 5.824 6.039 6.266 6.517 6.777 7.067 7.391 7.773 8.205 8.686 9.141 9.636 10.158 10.621 10.821 10.745 10.55 10.324 10.091 9.869 9.643 9.437 9.233 9.046 8.866 8.701 8.557 8.416 8.286 8.16 8.038 7.924 7.818 7.714 7.631 7.544 7.446 7.362 7.278 7.195 7.108 7.022 6.954 6.873 6.754 6.677 6.59 6.545 6.456 6.359 6.254 6.204 6.108 6.034 5.972 5.919 5.79 5.707 5.627 5.555 5.465 5.337 5.164 4.851 -5 ,26283 ,TETRA ,17557443,Fri Nov 26 10:07:45 CET,Fri Nov 26 11:56:59 CET,0.0 0.864 1.031 1.185 1.324 1.459 1.584 1.697 1.928 2.038 2.134 2.243 2.361 2.442 2.596 2.729 2.853 2.909 3.019 3.124 3.278 3.383 3.478 3.609 3.736 3.856 3.972 4.085 4.23 4.372 4.515 4.707 4.894 5.055 5.244 5.449 5.631 5.835 6.054 6.277 6.507 6.771 7.08 7.379 7.732 8.106 8.517 8.969 9.437 9.981 10.508 10.668 10.596 10.434 10.255 10.07 9.875 9.657 9.449 9.227 9.025 8.837 8.651 8.475 8.309 8.165 8.004 7.844 7.714 7.587 7.444 7.331 7.212 7.071 6.963 6.854 6.74 6.627 6.511 6.429 6.344 6.225 6.141 6.044 5.995 5.894 5.788 5.669 5.605 5.5 5.439 5.376 5.305 5.144 5.071 4.996 4.902 4.814 4.703 4.552 4.224 -6 ,20618 ,TETRA ,17557444,Fri Nov 26 10:07:46 CET,Fri Nov 26 11:57:22 CET,0.0 0.543 0.789 0.997 1.162 1.292 1.403 1.505 1.694 1.789 1.878 1.987 2.114 2.183 2.31 2.44 2.562 2.618 2.734 2.845 2.994 3.092 3.193 3.331 3.469 3.614 3.739 3.853 4.005 4.159 4.305 4.472 4.625 4.77 4.953 5.172 5.372 5.589 5.823 6.066 6.315 6.597 6.912 7.226 7.607 7.988 8.387 8.832 9.325 9.809 10.233 10.335 10.224 10.059 9.867 9.626 9.373 9.141 8.941 8.738 8.548 8.381 8.23 8.075 7.935 7.811 7.679 7.556 7.444 7.33 7.213 7.115 7.018 6.912 6.833 6.754 6.668 6.581 6.481 6.41 6.343 6.24 6.159 6.07 6.026 5.934 5.844 5.767 5.717 5.606 5.537 5.467 5.392 5.251 5.175 5.092 5.008 4.916 4.786 4.634 4.328 -7 ,21042 ,TETRA ,17557445,Fri Nov 26 10:07:48 CET,Fri Nov 26 11:57:29 CET,0.0 0.684 0.923 1.095 1.232 1.352 1.467 1.573 1.764 1.854 1.938 2.045 2.168 2.232 2.358 2.49 2.615 2.676 2.79 2.903 3.062 3.161 3.265 3.416 3.554 3.688 3.817 3.943 4.104 4.25 4.387 4.552 4.724 4.89 5.072 5.283 5.495 5.711 5.924 6.156 6.418 6.716 7.045 7.342 7.681 8.084 8.551 9.049 9.536 10.023 10.501 10.695 10.646 10.494 10.315 10.12 9.903 9.675 9.461 9.244 9.072 8.921 8.775 8.639 8.511 8.394 8.255 8.134 8.037 7.931 7.808 7.707 7.612 7.507 7.427 7.343 7.256 7.165 7.07 7.0 6.926 6.808 6.719 6.63 6.587 6.497 6.401 6.299 6.245 6.134 6.056 5.99 5.923 5.778 5.693 5.608 5.505 5.396 5.289 5.107 4.67 -8 ,3887 ,TETRA ,17557446,Fri Nov 26 10:07:49 CET,Fri Nov 26 11:47:14 CET,0.0 0.782 1.042 1.242 1.389 1.524 1.644 1.747 1.914 1.996 2.094 2.215 2.335 2.405 2.526 2.647 2.77 2.826 2.936 3.044 3.202 3.301 3.402 3.558 3.702 3.826 3.947 4.08 4.245 4.39 4.533 4.709 4.882 5.04 5.216 5.419 5.609 5.823 6.06 6.294 6.529 6.795 7.133 7.478 7.84 8.222 8.654 9.13 9.624 10.121 10.575 10.702 10.566 10.322 10.087 9.864 9.648 9.435 9.228 9.007 8.82 8.637 8.446 8.279 8.108 7.951 7.785 7.635 7.506 7.355 7.208 7.094 6.969 6.841 6.736 6.619 6.498 6.38 6.262 6.19 6.122 6.019 5.946 5.868 5.826 5.729 5.638 5.548 5.495 5.396 5.346 5.292 5.231 5.078 5.0 4.92 4.826 4.725 4.612 4.454 3.972 -9 ,2547 ,TETRA ,17557447,Fri Nov 26 10:08:42 CET,Fri Nov 26 11:58:25 CET,0.0 0.785 1.058 1.244 1.389 1.535 1.658 1.763 1.972 2.066 2.149 2.258 2.387 2.456 2.579 2.71 2.843 2.904 3.011 3.114 3.284 3.393 3.496 3.648 3.781 3.911 4.041 4.156 4.301 4.442 4.577 4.753 4.922 5.076 5.249 5.444 5.646 5.852 6.071 6.303 6.532 6.812 7.137 7.444 7.792 8.164 8.582 9.054 9.569 10.117 10.621 10.792 10.704 10.541 10.365 10.142 9.904 9.678 9.476 9.265 9.067 8.893 8.717 8.531 8.36 8.209 8.041 7.888 7.754 7.616 7.483 7.372 7.254 7.134 7.039 6.941 6.848 6.756 6.646 6.57 6.495 6.377 6.299 6.213 6.169 6.073 5.964 5.851 5.795 5.693 5.632 5.575 5.514 5.364 5.283 5.212 5.121 5.002 4.884 4.703 4.313 -10 ,28338 ,TETRA ,17557448,Fri Nov 26 10:08:43 CET,Fri Nov 26 11:58:38 CET,0.0 0.794 1.079 1.236 1.386 1.551 1.705 1.835 2.036 2.126 2.213 2.322 2.448 2.522 2.655 2.788 2.911 2.967 3.078 3.185 3.331 3.426 3.523 3.678 3.833 3.975 4.107 4.228 4.373 4.524 4.673 4.85 5.023 5.19 5.37 5.56 5.747 5.956 6.181 6.428 6.7 6.999 7.318 7.621 7.964 8.367 8.818 9.277 9.767 10.273 10.758 10.878 10.783 10.646 10.445 10.215 9.997 9.78 9.569 9.352 9.161 8.983 8.79 8.604 8.446 8.303 8.147 8.008 7.898 7.786 7.67 7.576 7.483 7.385 7.306 7.227 7.142 7.051 6.953 6.884 6.817 6.717 6.644 6.562 6.519 6.438 6.35 6.256 6.21 6.108 6.033 5.973 5.91 5.773 5.701 5.611 5.512 5.406 5.275 5.123 4.648 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt deleted file mode 100644 index 0c2b9bef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10260 ,TETRA ,17557449,Fri Nov 26 10:08:42 CET,Fri Nov 26 11:56:11 CET,0.0 0.735 0.901 1.052 1.174 1.272 1.37 1.465 1.638 1.714 1.786 1.878 1.984 2.058 2.192 2.308 2.418 2.473 2.57 2.657 2.788 2.869 2.945 3.048 3.143 3.239 3.333 3.424 3.532 3.63 3.734 3.856 3.974 4.102 4.241 4.376 4.507 4.651 4.795 4.941 5.096 5.25 5.416 5.58 5.731 5.861 6.009 6.155 6.258 6.219 5.851 5.104 4.3 3.583 2.926 2.277 1.696 1.154 0.681 0.21 -0.2 -0.562 -0.909 -1.235 -1.543 -1.825 -2.111 -2.36 -2.581 -2.827 -3.074 -3.273 -3.489 -3.719 -3.899 -4.077 -4.248 -4.441 -4.654 -4.786 -4.916 -5.128 -5.283 -5.451 -5.54 -5.724 -5.914 -6.118 -6.226 -6.384 -6.554 -6.663 -6.784 -7.082 -7.259 -7.465 -7.667 -7.856 -8.079 -8.437 -9.386 -2 ,18779 ,TETRA ,17557450,Fri Nov 26 10:08:44 CET,Fri Nov 26 11:54:38 CET,0.0 0.461 0.689 0.9 1.053 1.166 1.281 1.388 1.546 1.617 1.692 1.8 1.904 1.973 2.108 2.231 2.341 2.387 2.479 2.58 2.727 2.817 2.899 3.021 3.141 3.249 3.352 3.451 3.576 3.691 3.796 3.921 4.048 4.167 4.303 4.443 4.574 4.708 4.844 5.0 5.157 5.312 5.471 5.632 5.791 5.927 6.08 6.217 6.235 6.091 5.616 4.754 3.926 3.154 2.474 1.86 1.306 0.785 0.323 -0.13 -0.525 -0.884 -1.228 -1.57 -1.895 -2.178 -2.464 -2.718 -2.933 -3.165 -3.412 -3.618 -3.832 -4.054 -4.231 -4.418 -4.614 -4.816 -5.021 -5.155 -5.296 -5.528 -5.681 -5.838 -5.919 -6.084 -6.256 -6.443 -6.552 -6.706 -6.869 -6.984 -7.109 -7.377 -7.524 -7.687 -7.872 -8.065 -8.29 -8.631 -9.679 -3 ,12598 ,TETRA ,17557451,Fri Nov 26 10:08:44 CET,Fri Nov 26 11:53:57 CET,0.0 0.574 0.757 0.915 1.05 1.162 1.274 1.384 1.568 1.643 1.71 1.808 1.909 1.968 2.087 2.206 2.317 2.372 2.47 2.552 2.675 2.76 2.84 2.95 3.068 3.177 3.27 3.362 3.482 3.597 3.709 3.834 3.951 4.059 4.174 4.305 4.428 4.568 4.72 4.875 5.037 5.19 5.347 5.497 5.664 5.837 5.999 6.146 6.196 6.069 5.592 4.765 3.973 3.213 2.55 1.943 1.376 0.852 0.374 -0.074 -0.444 -0.787 -1.132 -1.466 -1.761 -2.031 -2.318 -2.575 -2.819 -3.072 -3.312 -3.527 -3.751 -3.972 -4.14 -4.313 -4.485 -4.648 -4.823 -4.951 -5.087 -5.302 -5.444 -5.593 -5.671 -5.816 -5.972 -6.15 -6.245 -6.385 -6.534 -6.646 -6.749 -6.942 -7.057 -7.197 -7.33 -7.485 -7.692 -7.904 -8.264 -4 ,27027 ,TETRA ,17557452,Fri Nov 26 10:08:44 CET,Fri Nov 26 12:02:45 CET,0.0 0.628 0.833 0.952 1.07 1.206 1.334 1.451 1.627 1.706 1.785 1.881 1.986 2.04 2.14 2.245 2.346 2.394 2.478 2.571 2.715 2.802 2.873 2.977 3.085 3.178 3.264 3.352 3.471 3.58 3.686 3.823 3.951 4.061 4.191 4.341 4.466 4.595 4.73 4.875 5.031 5.197 5.38 5.537 5.687 5.842 5.984 6.06 6.069 5.986 5.596 4.787 3.973 3.259 2.623 2.0 1.428 0.905 0.447 -0.002 -0.396 -0.768 -1.132 -1.458 -1.747 -2.016 -2.307 -2.568 -2.8 -3.036 -3.28 -3.49 -3.702 -3.918 -4.092 -4.288 -4.482 -4.669 -4.868 -5.005 -5.146 -5.358 -5.519 -5.694 -5.779 -5.948 -6.119 -6.304 -6.407 -6.558 -6.696 -6.802 -6.924 -7.192 -7.348 -7.519 -7.693 -7.889 -8.136 -8.431 -9.091 -5 ,26547 ,TETRA ,17557453,Fri Nov 26 10:09:45 CET,Fri Nov 26 12:02:45 CET,0.0 0.644 0.866 1.059 1.226 1.362 1.462 1.541 1.694 1.766 1.836 1.934 2.032 2.095 2.22 2.326 2.428 2.486 2.585 2.663 2.787 2.868 2.946 3.055 3.157 3.248 3.341 3.438 3.558 3.672 3.782 3.911 4.035 4.157 4.285 4.41 4.545 4.692 4.835 4.995 5.161 5.308 5.461 5.606 5.761 5.91 6.034 6.138 6.149 6.013 5.534 4.702 3.934 3.178 2.455 1.806 1.227 0.7 0.251 -0.196 -0.59 -0.959 -1.315 -1.635 -1.934 -2.214 -2.506 -2.768 -2.993 -3.225 -3.479 -3.694 -3.906 -4.124 -4.29 -4.464 -4.651 -4.84 -5.052 -5.207 -5.358 -5.588 -5.75 -5.918 -6.005 -6.193 -6.395 -6.594 -6.696 -6.859 -7.043 -7.158 -7.274 -7.532 -7.685 -7.866 -8.053 -8.241 -8.468 -8.774 -9.622 -6 ,16209 ,TETRA ,17557454,Fri Nov 26 10:09:45 CET,Fri Nov 26 12:02:37 CET,0.0 0.463 0.675 0.85 0.992 1.106 1.202 1.289 1.461 1.537 1.599 1.698 1.808 1.875 1.995 2.112 2.21 2.253 2.341 2.425 2.546 2.628 2.703 2.813 2.926 3.033 3.136 3.235 3.345 3.444 3.553 3.701 3.83 3.947 4.08 4.217 4.348 4.5 4.648 4.78 4.94 5.11 5.271 5.422 5.599 5.782 5.953 6.069 6.105 5.988 5.47 4.665 3.912 3.184 2.53 1.917 1.316 0.771 0.333 -0.115 -0.518 -0.874 -1.215 -1.535 -1.844 -2.127 -2.431 -2.703 -2.935 -3.19 -3.45 -3.656 -3.87 -4.091 -4.262 -4.445 -4.637 -4.834 -5.037 -5.175 -5.313 -5.523 -5.677 -5.843 -5.925 -6.093 -6.268 -6.448 -6.545 -6.7 -6.876 -6.993 -7.13 -7.42 -7.573 -7.755 -7.962 -8.181 -8.444 -8.753 -9.381 -7 ,15389 ,TETRA ,17557455,Fri Nov 26 10:09:45 CET,Fri Nov 26 11:56:19 CET,0.0 0.721 0.956 1.127 1.282 1.412 1.528 1.654 1.871 1.948 2.021 2.137 2.247 2.306 2.428 2.549 2.654 2.704 2.799 2.886 3.012 3.095 3.171 3.27 3.368 3.473 3.571 3.656 3.764 3.87 3.969 4.095 4.212 4.324 4.468 4.626 4.759 4.901 5.072 5.245 5.397 5.557 5.737 5.905 6.075 6.216 6.327 6.414 6.44 6.308 5.844 4.964 4.149 3.437 2.788 2.158 1.577 1.044 0.582 0.123 -0.277 -0.657 -1.017 -1.327 -1.623 -1.915 -2.217 -2.47 -2.693 -2.918 -3.152 -3.355 -3.562 -3.781 -3.959 -4.137 -4.324 -4.514 -4.698 -4.828 -4.97 -5.186 -5.337 -5.503 -5.589 -5.761 -5.948 -6.143 -6.244 -6.404 -6.583 -6.706 -6.832 -7.109 -7.263 -7.434 -7.61 -7.798 -8.018 -8.351 -9.251 -8 ,9833 ,TETRA ,17557456,Fri Nov 26 10:09:45 CET,Fri Nov 26 11:59:32 CET,0.0 0.458 0.661 0.846 0.997 1.132 1.262 1.37 1.545 1.62 1.694 1.793 1.893 1.958 2.073 2.174 2.278 2.325 2.411 2.497 2.639 2.728 2.798 2.891 2.988 3.089 3.191 3.286 3.405 3.522 3.625 3.753 3.882 3.993 4.118 4.256 4.392 4.541 4.676 4.821 4.971 5.132 5.335 5.518 5.665 5.808 5.948 6.068 6.138 6.036 5.531 4.615 3.749 2.979 2.281 1.63 1.073 0.547 0.096 -0.334 -0.723 -1.077 -1.425 -1.76 -2.058 -2.322 -2.598 -2.861 -3.094 -3.333 -3.585 -3.792 -4.002 -4.209 -4.369 -4.535 -4.715 -4.913 -5.12 -5.266 -5.417 -5.653 -5.815 -5.971 -6.05 -6.228 -6.409 -6.598 -6.699 -6.852 -7.028 -7.148 -7.271 -7.567 -7.723 -7.889 -8.092 -8.304 -8.556 -8.909 -10.054 -9 ,14266 ,TETRA ,17557457,Fri Nov 26 10:09:45 CET,Fri Nov 26 11:48:52 CET,0.0 0.446 0.676 0.843 0.96 1.056 1.143 1.236 1.42 1.503 1.579 1.68 1.784 1.85 1.964 2.059 2.156 2.208 2.299 2.383 2.511 2.593 2.669 2.777 2.892 2.995 3.089 3.185 3.309 3.423 3.528 3.647 3.766 3.888 4.016 4.153 4.284 4.424 4.568 4.729 4.884 5.037 5.207 5.369 5.548 5.712 5.856 5.955 5.965 5.869 5.489 4.738 3.939 3.175 2.501 1.867 1.272 0.742 0.302 -0.149 -0.554 -0.923 -1.275 -1.607 -1.919 -2.202 -2.486 -2.739 -2.97 -3.213 -3.451 -3.658 -3.884 -4.103 -4.276 -4.463 -4.662 -4.874 -5.083 -5.224 -5.366 -5.594 -5.762 -5.94 -6.031 -6.217 -6.419 -6.637 -6.745 -6.898 -7.069 -7.183 -7.313 -7.598 -7.742 -7.913 -8.105 -8.307 -8.547 -8.872 -9.783 -10 ,20323 ,TETRA ,17557458,Fri Nov 26 10:10:41 CET,Fri Nov 26 12:00:51 CET,0.0 0.532 0.775 0.942 1.07 1.178 1.286 1.391 1.569 1.638 1.706 1.809 1.913 1.978 2.104 2.221 2.325 2.377 2.477 2.577 2.703 2.775 2.853 2.965 3.07 3.172 3.271 3.367 3.492 3.597 3.69 3.81 3.937 4.05 4.172 4.332 4.483 4.628 4.771 4.916 5.066 5.222 5.386 5.547 5.704 5.832 5.956 6.075 6.138 6.026 5.561 4.696 3.843 3.078 2.385 1.771 1.219 0.686 0.203 -0.266 -0.656 -1.001 -1.335 -1.654 -1.947 -2.222 -2.514 -2.769 -3.002 -3.24 -3.473 -3.692 -3.928 -4.154 -4.324 -4.502 -4.677 -4.866 -5.051 -5.176 -5.326 -5.559 -5.724 -5.904 -5.993 -6.164 -6.349 -6.539 -6.634 -6.787 -6.965 -7.089 -7.223 -7.486 -7.636 -7.802 -7.976 -8.162 -8.407 -8.732 -9.325 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt deleted file mode 100644 index 21e6c9dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28233 ,TETRA ,17557459,Fri Nov 26 10:10:40 CET,Fri Nov 26 11:50:54 CET,0.0 1.261 1.53 1.72 1.883 2.009 2.121 2.238 2.466 2.577 2.674 2.804 2.917 2.987 3.124 3.249 3.382 3.451 3.58 3.7 3.874 3.972 4.056 4.196 4.34 4.476 4.595 4.716 4.879 5.021 5.169 5.353 5.516 5.665 5.827 6.006 6.182 6.374 6.575 6.791 7.015 7.255 7.532 7.822 8.146 8.462 8.827 9.192 9.505 9.738 9.769 9.504 9.101 8.638 8.176 7.709 7.273 6.88 6.533 6.189 5.884 5.611 5.333 5.06 4.815 4.593 4.359 4.143 3.971 3.788 3.571 3.389 3.201 3.01 2.864 2.717 2.559 2.382 2.206 2.087 1.961 1.744 1.585 1.431 1.352 1.181 1.006 0.831 0.722 0.562 0.367 0.243 0.121 -0.134 -0.276 -0.446 -0.652 -0.878 -1.175 -1.547 -2.46 -2 ,16453 ,TETRA ,17557460,Fri Nov 26 10:10:40 CET,Fri Nov 26 12:00:28 CET,0.0 1.167 1.518 1.766 1.946 2.103 2.242 2.368 2.587 2.701 2.812 2.95 3.055 3.121 3.256 3.392 3.525 3.59 3.709 3.818 3.967 4.08 4.199 4.352 4.492 4.621 4.743 4.864 5.021 5.166 5.29 5.438 5.604 5.76 5.924 6.121 6.313 6.525 6.744 6.964 7.194 7.434 7.696 7.96 8.268 8.59 8.921 9.269 9.62 9.914 10.023 9.807 9.436 8.978 8.504 8.084 7.685 7.292 6.95 6.605 6.302 6.023 5.731 5.455 5.197 4.954 4.709 4.496 4.313 4.101 3.88 3.707 3.53 3.336 3.178 3.025 2.865 2.685 2.499 2.376 2.243 2.02 1.861 1.693 1.607 1.443 1.27 1.068 0.965 0.823 0.652 0.539 0.413 0.138 -0.022 -0.2 -0.412 -0.654 -0.892 -1.229 -2.215 -3 ,25933 ,TETRA ,17557461,Fri Nov 26 10:10:40 CET,Fri Nov 26 12:00:37 CET,0.0 0.998 1.327 1.54 1.696 1.825 1.932 2.042 2.257 2.347 2.433 2.571 2.694 2.768 2.903 3.036 3.17 3.233 3.354 3.468 3.617 3.724 3.831 3.976 4.118 4.249 4.371 4.484 4.629 4.773 4.919 5.1 5.263 5.416 5.593 5.781 5.957 6.161 6.386 6.607 6.822 7.067 7.357 7.617 7.901 8.207 8.519 8.819 9.134 9.411 9.527 9.305 8.918 8.475 8.029 7.596 7.175 6.775 6.428 6.061 5.745 5.466 5.185 4.911 4.649 4.421 4.198 3.983 3.782 3.581 3.365 3.183 3.005 2.794 2.629 2.478 2.316 2.132 1.945 1.826 1.703 1.517 1.389 1.25 1.18 1.029 0.861 0.683 0.591 0.464 0.321 0.213 0.095 -0.134 -0.255 -0.399 -0.575 -0.77 -1.02 -1.383 -2.333 -4 ,12322 ,TETRA ,17557462,Fri Nov 26 10:11:42 CET,Fri Nov 26 12:04:51 CET,0.0 1.06 1.299 1.491 1.652 1.798 1.937 2.056 2.276 2.379 2.481 2.621 2.742 2.824 2.963 3.093 3.22 3.281 3.397 3.521 3.7 3.81 3.913 4.046 4.162 4.277 4.399 4.519 4.672 4.815 4.945 5.104 5.274 5.434 5.607 5.798 5.977 6.176 6.393 6.609 6.825 7.078 7.366 7.627 7.912 8.219 8.548 8.883 9.212 9.515 9.68 9.429 9.027 8.601 8.166 7.717 7.276 6.869 6.517 6.159 5.846 5.573 5.313 5.05 4.8 4.576 4.345 4.135 3.955 3.771 3.577 3.403 3.203 2.988 2.831 2.669 2.5 2.325 2.129 1.997 1.866 1.663 1.513 1.349 1.265 1.085 0.897 0.711 0.614 0.476 0.299 0.184 0.059 -0.222 -0.381 -0.564 -0.762 -0.982 -1.271 -1.667 -2.807 -5 ,24058 ,TETRA ,17557463,Fri Nov 26 10:11:42 CET,Fri Nov 26 11:49:50 CET,0.0 0.633 0.896 1.137 1.334 1.473 1.608 1.737 1.989 2.103 2.209 2.36 2.469 2.545 2.694 2.828 2.958 3.014 3.122 3.224 3.388 3.499 3.596 3.735 3.872 3.994 4.102 4.211 4.357 4.493 4.62 4.78 4.938 5.089 5.273 5.475 5.658 5.849 6.05 6.261 6.485 6.747 7.05 7.339 7.663 8.016 8.404 8.789 9.137 9.439 9.544 9.251 8.804 8.351 7.904 7.47 7.066 6.668 6.332 5.993 5.669 5.361 5.072 4.811 4.563 4.335 4.082 3.851 3.661 3.46 3.239 3.065 2.88 2.669 2.497 2.319 2.14 1.957 1.779 1.66 1.529 1.337 1.198 1.029 0.945 0.774 0.582 0.388 0.289 0.152 -0.053 -0.191 -0.322 -0.599 -0.76 -0.929 -1.12 -1.353 -1.626 -1.907 -3.346 -6 ,4082 ,TETRA ,17557464,Fri Nov 26 10:11:42 CET,Fri Nov 26 12:02:20 CET,0.0 1.159 1.5 1.743 1.915 2.084 2.241 2.37 2.615 2.732 2.833 2.968 3.087 3.161 3.306 3.452 3.582 3.642 3.759 3.87 4.033 4.139 4.24 4.389 4.527 4.663 4.795 4.908 5.051 5.199 5.337 5.504 5.667 5.807 5.961 6.149 6.339 6.537 6.741 6.953 7.176 7.425 7.706 7.991 8.315 8.642 8.98 9.303 9.633 9.911 9.926 9.634 9.216 8.776 8.356 7.935 7.539 7.17 6.835 6.474 6.166 5.891 5.602 5.336 5.09 4.85 4.605 4.381 4.193 3.992 3.773 3.588 3.392 3.202 3.056 2.899 2.735 2.566 2.399 2.274 2.122 1.915 1.784 1.625 1.539 1.367 1.185 1.002 0.907 0.759 0.557 0.44 0.316 0.019 -0.15 -0.322 -0.506 -0.701 -0.935 -1.244 -2.59 -7 ,21845 ,TETRA ,17557465,Fri Nov 26 10:11:44 CET,Fri Nov 26 12:02:20 CET,0.0 1.223 1.615 1.845 2.038 2.197 2.35 2.511 2.787 2.897 2.996 3.137 3.258 3.343 3.516 3.679 3.829 3.903 4.025 4.136 4.304 4.406 4.506 4.653 4.793 4.908 5.019 5.133 5.275 5.418 5.56 5.731 5.893 6.05 6.23 6.418 6.6 6.814 7.039 7.259 7.493 7.78 8.09 8.363 8.682 9.016 9.367 9.706 9.982 10.213 10.275 10.026 9.673 9.252 8.823 8.423 8.024 7.609 7.228 6.855 6.53 6.246 5.989 5.735 5.483 5.248 5.0 4.789 4.609 4.413 4.21 4.029 3.842 3.651 3.501 3.343 3.176 3.004 2.826 2.705 2.584 2.37 2.209 2.051 1.974 1.822 1.664 1.481 1.386 1.256 1.076 0.959 0.833 0.56 0.412 0.231 0.038 -0.172 -0.445 -0.798 -1.621 -8 ,1327 ,TETRA ,17557466,Fri Nov 26 10:11:42 CET,Fri Nov 26 12:02:42 CET,0.0 1.384 1.708 1.906 2.068 2.216 2.347 2.462 2.673 2.765 2.848 2.964 3.074 3.147 3.313 3.453 3.569 3.628 3.74 3.843 4.0 4.104 4.195 4.327 4.456 4.579 4.704 4.827 4.988 5.145 5.293 5.467 5.628 5.788 5.962 6.155 6.342 6.539 6.759 6.985 7.209 7.469 7.749 8.001 8.279 8.591 8.928 9.231 9.539 9.853 9.951 9.64 9.244 8.817 8.399 7.945 7.49 7.07 6.714 6.353 6.033 5.737 5.463 5.207 4.959 4.731 4.499 4.302 4.115 3.91 3.702 3.531 3.358 3.167 3.013 2.865 2.706 2.526 2.322 2.184 2.047 1.831 1.693 1.544 1.46 1.294 1.122 0.916 0.805 0.659 0.468 0.351 0.233 -0.067 -0.238 -0.418 -0.614 -0.841 -1.119 -1.476 -2.903 -9 ,32762 ,TETRA ,17557467,Fri Nov 26 10:11:44 CET,Fri Nov 26 12:04:02 CET,0.0 1.26 1.573 1.769 1.94 2.079 2.193 2.315 2.558 2.663 2.763 2.912 3.036 3.113 3.257 3.392 3.525 3.589 3.715 3.836 3.995 4.096 4.199 4.343 4.48 4.616 4.745 4.868 5.017 5.16 5.305 5.483 5.646 5.782 5.952 6.156 6.341 6.527 6.727 6.955 7.198 7.448 7.722 7.977 8.233 8.518 8.852 9.142 9.41 9.672 9.79 9.589 9.16 8.701 8.262 7.814 7.414 7.014 6.634 6.253 5.927 5.638 5.369 5.114 4.868 4.65 4.41 4.191 4.005 3.802 3.588 3.42 3.248 3.055 2.905 2.752 2.589 2.41 2.205 2.067 1.934 1.716 1.556 1.387 1.302 1.134 0.958 0.768 0.671 0.54 0.372 0.26 0.131 -0.158 -0.308 -0.483 -0.685 -0.92 -1.181 -1.577 -3.194 -10 ,14211 ,TETRA ,17557468,Fri Nov 26 10:11:42 CET,Fri Nov 26 11:44:10 CET,0.0 1.486 1.836 2.071 2.234 2.38 2.515 2.634 2.836 2.934 3.031 3.165 3.279 3.354 3.511 3.656 3.783 3.843 3.964 4.081 4.239 4.336 4.433 4.576 4.71 4.831 4.944 5.057 5.204 5.358 5.522 5.705 5.863 6.008 6.176 6.366 6.543 6.727 6.929 7.154 7.381 7.608 7.881 8.167 8.489 8.824 9.131 9.432 9.774 10.031 10.05 9.746 9.322 8.844 8.362 7.926 7.527 7.12 6.748 6.376 6.072 5.818 5.558 5.297 5.039 4.798 4.545 4.307 4.105 3.9 3.681 3.489 3.288 3.089 2.938 2.779 2.603 2.423 2.25 2.122 1.983 1.763 1.612 1.465 1.384 1.209 1.026 0.826 0.73 0.593 0.402 0.274 0.148 -0.114 -0.264 -0.447 -0.658 -0.893 -1.157 -1.573 -3.118 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt deleted file mode 100644 index 8ede732e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17646 ,TETRA ,17557469,Fri Nov 26 10:11:42 CET,Fri Nov 26 12:00:26 CET,0.0 0.496 0.737 0.913 1.093 1.254 1.377 1.496 1.717 1.81 1.902 2.044 2.155 2.237 2.395 2.528 2.657 2.721 2.856 2.988 3.16 3.267 3.37 3.519 3.66 3.792 3.926 4.065 4.24 4.402 4.549 4.737 4.922 5.098 5.309 5.549 5.782 6.043 6.34 6.655 6.987 7.359 7.758 8.151 8.614 9.11 9.693 10.357 11.111 11.959 12.818 13.363 13.576 13.635 13.591 13.483 13.33 13.176 13.026 12.838 12.678 12.529 12.384 12.247 12.116 12.002 11.894 11.793 11.694 11.584 11.475 11.377 11.273 11.161 11.069 10.976 10.879 10.779 10.678 10.614 10.547 10.42 10.331 10.25 10.207 10.109 10.0 9.897 9.843 9.76 9.683 9.623 9.562 9.414 9.329 9.241 9.15 9.039 8.903 8.76 8.484 -2 ,8342 ,TETRA ,17557470,Fri Nov 26 10:11:42 CET,Fri Nov 26 12:03:16 CET,0.0 0.468 0.663 0.837 0.979 1.104 1.221 1.338 1.548 1.643 1.741 1.875 1.982 2.052 2.197 2.342 2.485 2.547 2.658 2.77 2.943 3.059 3.167 3.32 3.48 3.638 3.783 3.923 4.102 4.265 4.42 4.612 4.796 4.972 5.177 5.413 5.65 5.908 6.182 6.472 6.768 7.106 7.509 7.895 8.344 8.876 9.464 10.084 10.788 11.594 12.433 12.922 13.083 13.083 12.992 12.853 12.69 12.517 12.364 12.209 12.048 11.877 11.714 11.56 11.403 11.265 11.126 10.981 10.847 10.723 10.58 10.443 10.319 10.197 10.094 9.98 9.862 9.744 9.625 9.544 9.456 9.311 9.207 9.103 9.046 8.92 8.796 8.664 8.595 8.494 8.337 8.244 8.161 7.98 7.883 7.771 7.628 7.464 7.292 7.077 6.586 -3 ,19930 ,TETRA ,17557471,Fri Nov 26 10:11:43 CET,Fri Nov 26 12:03:21 CET,0.0 0.811 1.067 1.25 1.401 1.547 1.679 1.795 2.006 2.106 2.204 2.346 2.464 2.536 2.684 2.842 2.991 3.062 3.194 3.32 3.501 3.615 3.728 3.882 4.028 4.175 4.318 4.462 4.643 4.798 4.954 5.152 5.345 5.543 5.764 5.993 6.222 6.474 6.735 7.018 7.323 7.667 8.075 8.495 8.98 9.505 10.081 10.708 11.402 12.232 13.158 13.66 13.8 13.789 13.726 13.63 13.492 13.344 13.192 13.02 12.848 12.69 12.535 12.376 12.233 12.098 11.946 11.81 11.687 11.548 11.408 11.287 11.166 11.037 10.934 10.837 10.734 10.63 10.522 10.449 10.379 10.263 10.181 10.1 10.06 9.976 9.873 9.769 9.716 9.626 9.528 9.447 9.354 9.159 9.045 8.92 8.766 8.588 8.408 8.192 7.687 -4 ,27710 ,TETRA ,17557472,Fri Nov 26 10:12:43 CET,Fri Nov 26 11:58:16 CET,0.0 0.576 0.767 0.916 1.039 1.155 1.276 1.412 1.658 1.75 1.838 1.969 2.086 2.171 2.336 2.471 2.595 2.658 2.778 2.896 3.072 3.186 3.295 3.444 3.593 3.745 3.888 4.022 4.201 4.375 4.537 4.745 4.946 5.132 5.365 5.609 5.828 6.083 6.358 6.642 6.948 7.305 7.712 8.099 8.548 9.07 9.644 10.275 10.981 11.754 12.63 13.114 13.269 13.272 13.173 13.055 12.934 12.803 12.654 12.476 12.31 12.155 12.003 11.853 11.721 11.601 11.472 11.369 11.282 11.188 11.074 10.981 10.894 10.794 10.712 10.632 10.551 10.463 10.366 10.3 10.23 10.106 10.026 9.943 9.897 9.805 9.716 9.617 9.56 9.473 9.388 9.325 9.258 9.11 9.019 8.932 8.851 8.757 8.641 8.488 8.211 -5 ,8017 ,TETRA ,17557473,Fri Nov 26 10:12:46 CET,Fri Nov 26 12:04:09 CET,0.0 0.836 1.146 1.35 1.544 1.717 1.855 1.983 2.217 2.326 2.432 2.598 2.721 2.812 2.987 3.146 3.302 3.377 3.522 3.654 3.828 3.943 4.057 4.216 4.37 4.521 4.662 4.794 4.964 5.14 5.31 5.501 5.691 5.88 6.09 6.329 6.569 6.828 7.1 7.389 7.692 8.05 8.478 8.886 9.338 9.864 10.465 11.096 11.829 12.643 13.536 14.164 14.401 14.425 14.348 14.235 14.095 13.944 13.794 13.612 13.441 13.283 13.13 12.961 12.775 12.619 12.455 12.295 12.168 12.037 11.889 11.773 11.649 11.515 11.418 11.313 11.203 11.082 10.947 10.858 10.762 10.61 10.514 10.417 10.367 10.259 10.147 10.028 9.963 9.868 9.734 9.651 9.573 9.368 9.251 9.132 8.994 8.822 8.632 8.396 7.246 -6 ,9601 ,TETRA ,17557474,Fri Nov 26 10:12:47 CET,Fri Nov 26 12:03:54 CET,0.0 0.933 1.187 1.354 1.504 1.645 1.78 1.9 2.099 2.193 2.282 2.409 2.525 2.605 2.769 2.911 3.031 3.094 3.225 3.342 3.511 3.619 3.721 3.885 4.048 4.197 4.339 4.478 4.645 4.804 4.964 5.157 5.339 5.514 5.727 5.971 6.199 6.445 6.719 7.018 7.335 7.687 8.088 8.491 8.939 9.451 10.055 10.696 11.417 12.206 13.077 13.701 13.911 13.957 13.901 13.785 13.644 13.481 13.334 13.166 13.005 12.845 12.675 12.53 12.399 12.276 12.143 12.017 11.909 11.791 11.661 11.559 11.453 11.343 11.259 11.161 11.065 10.97 10.87 10.806 10.734 10.629 10.559 10.483 10.442 10.352 10.255 10.152 10.099 10.019 9.948 9.888 9.817 9.685 9.616 9.534 9.45 9.341 9.212 9.068 8.732 -7 ,3977 ,TETRA ,17557475,Fri Nov 26 10:13:43 CET,Fri Nov 26 12:04:37 CET,0.0 0.464 0.683 0.836 0.989 1.139 1.27 1.395 1.626 1.719 1.808 1.933 2.045 2.122 2.261 2.383 2.505 2.571 2.699 2.817 2.991 3.104 3.21 3.364 3.522 3.673 3.82 3.956 4.132 4.306 4.462 4.664 4.853 5.025 5.248 5.514 5.757 5.999 6.255 6.54 6.843 7.179 7.566 7.955 8.416 8.943 9.549 10.2 10.921 11.697 12.556 13.124 13.342 13.346 13.23 13.078 12.905 12.732 12.573 12.397 12.236 12.09 11.934 11.774 11.617 11.473 11.321 11.18 11.057 10.926 10.797 10.683 10.561 10.452 10.37 10.284 10.201 10.112 10.017 9.948 9.879 9.771 9.696 9.621 9.581 9.49 9.394 9.296 9.248 9.166 9.069 9.005 8.938 8.787 8.708 8.617 8.521 8.427 8.318 8.176 7.833 -8 ,31681 ,TETRA ,17557476,Fri Nov 26 10:13:44 CET,Fri Nov 26 12:04:47 CET,0.0 0.625 0.825 1.003 1.161 1.286 1.407 1.513 1.699 1.792 1.876 1.994 2.114 2.191 2.347 2.499 2.641 2.708 2.836 2.964 3.134 3.236 3.333 3.482 3.632 3.78 3.925 4.063 4.235 4.398 4.563 4.765 4.961 5.155 5.373 5.606 5.84 6.098 6.352 6.624 6.938 7.287 7.674 8.085 8.554 9.073 9.665 10.318 11.065 11.895 12.845 13.445 13.618 13.641 13.582 13.448 13.3 13.165 13.007 12.832 12.695 12.544 12.378 12.212 12.056 11.912 11.738 11.58 11.463 11.344 11.213 11.106 10.99 10.859 10.753 10.642 10.521 10.394 10.258 10.165 10.075 9.928 9.822 9.711 9.656 9.537 9.416 9.299 9.23 9.126 8.996 8.909 8.823 8.652 8.553 8.438 8.31 8.17 7.991 7.702 7.193 -9 ,17045 ,TETRA ,17557477,Fri Nov 26 10:13:43 CET,Fri Nov 26 12:03:40 CET,0.0 0.542 0.692 0.853 1.01 1.136 1.253 1.356 1.549 1.649 1.745 1.89 2.014 2.094 2.241 2.384 2.518 2.584 2.71 2.833 3.017 3.136 3.251 3.414 3.569 3.711 3.857 4.006 4.181 4.352 4.523 4.727 4.917 5.096 5.305 5.547 5.791 6.046 6.327 6.625 6.927 7.283 7.693 8.104 8.602 9.136 9.707 10.345 11.075 11.902 12.817 13.412 13.598 13.599 13.52 13.392 13.226 13.066 12.914 12.727 12.561 12.399 12.245 12.106 11.96 11.832 11.695 11.567 11.462 11.338 11.216 11.126 11.022 10.916 10.837 10.745 10.649 10.559 10.461 10.392 10.315 10.178 10.092 10.016 9.976 9.881 9.78 9.673 9.618 9.534 9.454 9.402 9.346 9.193 9.115 9.049 8.965 8.855 8.723 8.553 8.325 -10 ,1812 ,TETRA ,17557478,Fri Nov 26 10:13:43 CET,Fri Nov 26 12:05:56 CET,0.0 0.838 1.087 1.292 1.446 1.58 1.698 1.791 1.993 2.089 2.177 2.312 2.429 2.511 2.669 2.81 2.934 2.994 3.122 3.243 3.418 3.535 3.642 3.797 3.948 4.094 4.227 4.361 4.54 4.705 4.866 5.051 5.236 5.433 5.653 5.899 6.144 6.396 6.672 6.986 7.301 7.648 8.054 8.438 8.902 9.43 10.022 10.682 11.42 12.279 13.219 13.785 13.948 13.971 13.917 13.786 13.634 13.482 13.337 13.154 12.98 12.833 12.675 12.518 12.371 12.228 12.081 11.936 11.814 11.699 11.573 11.454 11.325 11.184 11.073 10.968 10.857 10.746 10.622 10.528 10.44 10.31 10.221 10.121 10.064 9.955 9.854 9.745 9.679 9.587 9.478 9.391 9.283 9.041 8.928 8.813 8.692 8.54 8.364 8.132 7.544 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt deleted file mode 100644 index 348eeed4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,79 ,TETRA ,17557479,Fri Nov 26 10:13:43 CET,Fri Nov 26 12:05:03 CET,0.0 0.154 0.2 0.25 0.285 0.309 0.317 0.316 0.305 0.297 0.294 0.247 0.271 0.247 0.205 0.167 0.126 0.103 0.045 -0.016 -0.098 -0.15 -0.205 -0.29 -0.367 -0.438 -0.51 -0.585 -0.693 -0.816 -0.943 -1.116 -1.295 -1.479 -1.702 -1.964 -2.25 -2.579 -2.959 -3.403 -3.903 -4.531 -5.313 -6.137 -7.217 -8.555 -10.255 -12.387 -15.244 -19.242 -25.158 -31.391 -36.026 -39.676 -42.613 -45.059 -47.096 -48.862 -50.312 -51.713 -52.872 -53.857 -54.763 -55.598 -56.354 -57.028 -57.73 -58.359 -58.876 -59.386 -59.907 -60.33 -60.758 -61.199 -61.541 -61.877 -62.202 -62.546 -62.9 -63.131 -63.366 -63.733 -63.981 -64.233 -64.365 -64.637 -64.911 -65.192 -65.341 -65.599 -65.819 -65.982 -66.146 -66.48 -66.656 -66.872 -67.103 -67.326 -67.531 -67.762 -68.128 -2 ,10950 ,TETRA ,17557480,Fri Nov 26 10:13:44 CET,Fri Nov 26 12:05:50 CET,0.0 0.294 0.347 0.379 0.404 0.43 0.454 0.466 0.475 0.477 0.462 0.385 0.414 0.398 0.363 0.327 0.285 0.264 0.221 0.168 0.081 0.028 -0.023 -0.098 -0.162 -0.237 -0.325 -0.407 -0.517 -0.631 -0.755 -0.928 -1.104 -1.283 -1.513 -1.783 -2.059 -2.398 -2.78 -3.209 -3.708 -4.316 -5.092 -5.951 -7.035 -8.362 -10.072 -12.229 -15.116 -19.099 -25.011 -31.255 -35.874 -39.512 -42.442 -44.907 -46.938 -48.67 -50.088 -51.445 -52.592 -53.592 -54.504 -55.327 -56.088 -56.781 -57.465 -58.046 -58.534 -59.025 -59.535 -59.963 -60.398 -60.841 -61.168 -61.502 -61.842 -62.182 -62.526 -62.762 -63.002 -63.356 -63.604 -63.86 -63.986 -64.238 -64.494 -64.755 -64.89 -65.134 -65.311 -65.448 -65.575 -65.849 -66.003 -66.16 -66.319 -66.485 -66.664 -66.862 -67.136 -3 ,1337 ,TETRA ,17557481,Fri Nov 26 10:13:47 CET,Fri Nov 26 11:52:59 CET,0.0 0.102 0.137 0.18 0.227 0.255 0.261 0.261 0.235 0.216 0.2 0.144 0.169 0.151 0.126 0.105 0.08 0.062 0.013 -0.045 -0.143 -0.206 -0.269 -0.36 -0.447 -0.534 -0.636 -0.751 -0.891 -1.027 -1.175 -1.364 -1.561 -1.767 -2.03 -2.335 -2.643 -3.008 -3.414 -3.881 -4.42 -5.076 -5.905 -6.801 -7.921 -9.296 -11.038 -13.217 -16.124 -20.128 -26.089 -32.403 -37.076 -40.736 -43.677 -46.121 -48.146 -49.902 -51.345 -52.717 -53.852 -54.823 -55.701 -56.511 -57.235 -57.87 -58.535 -59.107 -59.578 -60.069 -60.569 -60.968 -61.374 -61.785 -62.094 -62.406 -62.716 -63.029 -63.357 -63.579 -63.8 -64.15 -64.397 -64.647 -64.767 -65.0 -65.251 -65.502 -65.631 -65.87 -66.026 -66.162 -66.296 -66.578 -66.72 -66.867 -67.036 -67.215 -67.409 -67.636 -68.014 -4 ,15854 ,TETRA ,17557482,Fri Nov 26 10:14:43 CET,Fri Nov 26 11:48:37 CET,0.0 0.089 0.125 0.146 0.172 0.199 0.225 0.239 0.241 0.236 0.231 0.17 0.197 0.182 0.149 0.132 0.121 0.11 0.079 0.04 -0.008 -0.033 -0.066 -0.123 -0.185 -0.256 -0.33 -0.407 -0.505 -0.612 -0.746 -0.916 -1.085 -1.271 -1.506 -1.774 -2.054 -2.385 -2.763 -3.19 -3.689 -4.299 -5.052 -5.887 -6.966 -8.291 -9.971 -12.121 -14.975 -18.94 -24.973 -31.299 -35.962 -39.569 -42.44 -44.88 -46.911 -48.672 -50.128 -51.538 -52.704 -53.693 -54.624 -55.465 -56.227 -56.906 -57.572 -58.168 -58.682 -59.179 -59.665 -60.056 -60.454 -60.877 -61.206 -61.527 -61.841 -62.16 -62.486 -62.71 -62.944 -63.297 -63.532 -63.77 -63.891 -64.135 -64.385 -64.634 -64.76 -65.0 -65.152 -65.284 -65.43 -65.745 -65.897 -66.046 -66.202 -66.376 -66.567 -66.754 -67.092 -5 ,3974 ,TETRA ,17557483,Fri Nov 26 10:14:42 CET,Fri Nov 26 12:04:42 CET,0.0 0.241 0.304 0.341 0.353 0.369 0.374 0.375 0.368 0.362 0.36 0.306 0.336 0.323 0.286 0.249 0.209 0.189 0.139 0.082 0.002 -0.054 -0.115 -0.208 -0.307 -0.41 -0.511 -0.617 -0.76 -0.902 -1.052 -1.25 -1.456 -1.674 -1.927 -2.217 -2.525 -2.885 -3.296 -3.767 -4.289 -4.927 -5.737 -6.609 -7.709 -9.014 -10.69 -12.872 -15.773 -19.718 -25.609 -31.867 -36.501 -40.161 -43.104 -45.572 -47.617 -49.362 -50.792 -52.169 -53.308 -54.295 -55.21 -56.049 -56.822 -57.502 -58.197 -58.807 -59.319 -59.847 -60.389 -60.816 -61.231 -61.668 -62.011 -62.349 -62.691 -63.047 -63.412 -63.657 -63.914 -64.303 -64.551 -64.796 -64.915 -65.143 -65.385 -65.649 -65.781 -66.013 -66.179 -66.321 -66.457 -66.733 -66.887 -67.051 -67.207 -67.373 -67.545 -67.727 -68.11 -6 ,23860 ,TETRA ,17557484,Fri Nov 26 10:14:42 CET,Fri Nov 26 12:06:17 CET,0.0 0.336 0.39 0.403 0.421 0.434 0.451 0.468 0.466 0.458 0.447 0.379 0.405 0.385 0.348 0.316 0.273 0.249 0.197 0.14 0.05 -0.014 -0.075 -0.164 -0.252 -0.349 -0.454 -0.562 -0.714 -0.87 -1.021 -1.205 -1.403 -1.614 -1.867 -2.175 -2.5 -2.875 -3.301 -3.797 -4.357 -5.016 -5.835 -6.709 -7.807 -9.175 -10.939 -13.117 -15.995 -20.039 -25.977 -32.174 -36.825 -40.465 -43.352 -45.783 -47.826 -49.579 -50.991 -52.338 -53.478 -54.468 -55.379 -56.24 -57.018 -57.682 -58.358 -58.949 -59.449 -59.965 -60.493 -60.906 -61.316 -61.746 -62.073 -62.405 -62.747 -63.091 -63.435 -63.663 -63.891 -64.236 -64.47 -64.714 -64.834 -65.069 -65.312 -65.566 -65.699 -65.938 -66.105 -66.242 -66.382 -66.657 -66.796 -66.953 -67.114 -67.27 -67.431 -67.619 -67.869 -7 ,733 ,TETRA ,17557485,Fri Nov 26 10:14:42 CET,Fri Nov 26 11:54:18 CET,0.0 0.188 0.257 0.295 0.323 0.339 0.333 0.331 0.323 0.318 0.323 0.283 0.312 0.305 0.274 0.238 0.205 0.188 0.149 0.096 0.017 -0.03 -0.077 -0.154 -0.246 -0.356 -0.469 -0.566 -0.689 -0.809 -0.93 -1.103 -1.289 -1.48 -1.713 -1.996 -2.296 -2.637 -3.004 -3.433 -3.928 -4.529 -5.282 -6.123 -7.202 -8.512 -10.201 -12.322 -15.165 -19.145 -25.108 -31.367 -36.034 -39.725 -42.684 -45.14 -47.142 -48.883 -50.346 -51.741 -52.893 -53.88 -54.781 -55.615 -56.386 -57.067 -57.749 -58.343 -58.843 -59.351 -59.871 -60.294 -60.715 -61.148 -61.488 -61.822 -62.153 -62.493 -62.848 -63.096 -63.349 -63.735 -63.988 -64.239 -64.368 -64.613 -64.863 -65.126 -65.263 -65.506 -65.67 -65.806 -65.95 -66.249 -66.396 -66.55 -66.717 -66.912 -67.122 -67.319 -67.586 -8 ,7805 ,TETRA ,17557486,Fri Nov 26 10:15:45 CET,Fri Nov 26 12:04:42 CET,0.0 0.192 0.234 0.248 0.262 0.278 0.287 0.29 0.289 0.278 0.26 0.181 0.204 0.194 0.173 0.138 0.095 0.069 0.016 -0.032 -0.112 -0.175 -0.236 -0.326 -0.427 -0.533 -0.647 -0.759 -0.903 -1.047 -1.189 -1.368 -1.551 -1.738 -1.964 -2.228 -2.513 -2.858 -3.241 -3.673 -4.173 -4.774 -5.534 -6.368 -7.433 -8.759 -10.45 -12.599 -15.493 -19.503 -25.429 -31.689 -36.321 -39.929 -42.815 -45.255 -47.264 -49.011 -50.478 -51.864 -52.993 -53.98 -54.909 -55.755 -56.518 -57.194 -57.865 -58.446 -58.945 -59.453 -59.962 -60.376 -60.804 -61.238 -61.567 -61.895 -62.233 -62.587 -62.937 -63.176 -63.43 -63.818 -64.08 -64.353 -64.484 -64.749 -65.024 -65.301 -65.442 -65.692 -65.88 -66.027 -66.171 -66.45 -66.597 -66.749 -66.916 -67.099 -67.275 -67.463 -67.737 -9 ,27556 ,TETRA ,17557487,Fri Nov 26 10:16:46 CET,Fri Nov 26 12:12:28 CET,0.0 0.091 0.141 0.168 0.186 0.206 0.207 0.199 0.196 0.195 0.185 0.12 0.145 0.133 0.097 0.061 0.028 0.011 -0.03 -0.084 -0.156 -0.209 -0.268 -0.345 -0.433 -0.536 -0.642 -0.749 -0.899 -1.044 -1.178 -1.34 -1.513 -1.694 -1.914 -2.2 -2.506 -2.851 -3.246 -3.691 -4.192 -4.807 -5.575 -6.396 -7.448 -8.765 -10.49 -12.667 -15.506 -19.399 -25.289 -31.619 -36.288 -39.885 -42.776 -45.223 -47.251 -48.997 -50.444 -51.822 -52.946 -53.922 -54.831 -55.659 -56.408 -57.081 -57.762 -58.353 -58.856 -59.349 -59.845 -60.248 -60.652 -61.061 -61.369 -61.686 -62.01 -62.339 -62.667 -62.889 -63.116 -63.461 -63.698 -63.938 -64.06 -64.3 -64.539 -64.788 -64.916 -65.146 -65.281 -65.412 -65.553 -65.829 -65.973 -66.132 -66.288 -66.457 -66.669 -66.894 -67.132 -10 ,1696 ,TETRA ,17557488,Fri Nov 26 10:16:46 CET,Fri Nov 26 12:07:04 CET,0.0 0.19 0.247 0.296 0.328 0.336 0.344 0.353 0.352 0.35 0.342 0.28 0.31 0.292 0.252 0.214 0.166 0.142 0.094 0.036 -0.042 -0.098 -0.157 -0.243 -0.335 -0.428 -0.515 -0.608 -0.739 -0.87 -1.019 -1.217 -1.42 -1.626 -1.868 -2.166 -2.474 -2.83 -3.244 -3.731 -4.291 -4.953 -5.761 -6.629 -7.726 -9.062 -10.756 -12.9 -15.818 -19.868 -25.893 -32.217 -36.822 -40.462 -43.415 -45.901 -47.954 -49.685 -51.108 -52.479 -53.635 -54.631 -55.545 -56.391 -57.154 -57.827 -58.493 -59.059 -59.538 -60.033 -60.532 -60.931 -61.335 -61.737 -62.045 -62.356 -62.663 -62.979 -63.308 -63.534 -63.761 -64.097 -64.325 -64.557 -64.675 -64.909 -65.15 -65.393 -65.515 -65.748 -65.911 -66.047 -66.178 -66.454 -66.593 -66.728 -66.866 -67.026 -67.214 -67.421 -67.652 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt deleted file mode 100644 index 0e44807c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24063 ,TETRA ,17557489,Fri Nov 26 10:16:46 CET,Fri Nov 26 12:06:59 CET,0.0 0.73 1.101 1.378 1.594 1.796 1.978 2.145 2.479 2.633 2.775 2.951 3.189 3.315 3.559 3.819 4.086 4.209 4.436 4.664 4.992 5.2 5.407 5.706 6.01 6.31 6.589 6.859 7.222 7.589 7.955 8.399 8.839 9.275 9.777 10.35 10.92 11.561 12.282 13.069 13.906 14.865 16.031 17.255 18.712 20.402 22.462 24.896 27.946 31.864 37.056 41.867 45.085 47.397 49.059 50.314 51.303 52.12 52.737 53.276 53.698 54.038 54.313 54.542 54.739 54.901 55.052 55.181 55.277 55.362 55.44 55.484 55.521 55.556 55.568 55.571 55.565 55.556 55.554 55.546 55.53 55.495 55.459 55.414 55.393 55.341 55.278 55.207 55.16 55.068 55.029 54.971 54.906 54.755 54.664 54.567 54.445 54.308 54.122 53.866 53.16 -2 ,13006 ,TETRA ,17557490,Fri Nov 26 10:16:46 CET,Fri Nov 26 11:55:20 CET,0.0 0.528 0.776 0.974 1.146 1.318 1.471 1.606 1.877 2.016 2.153 2.31 2.534 2.642 2.856 3.077 3.293 3.395 3.598 3.797 4.084 4.27 4.458 4.746 5.033 5.307 5.574 5.839 6.193 6.552 6.903 7.337 7.767 8.192 8.709 9.319 9.908 10.546 11.251 12.04 12.891 13.866 15.032 16.244 17.731 19.452 21.528 24.026 27.106 30.997 36.258 41.188 44.374 46.63 48.313 49.62 50.611 51.389 51.984 52.521 52.931 53.24 53.506 53.736 53.932 54.089 54.222 54.325 54.411 54.488 54.555 54.606 54.653 54.692 54.709 54.721 54.734 54.738 54.732 54.727 54.72 54.686 54.653 54.624 54.612 54.576 54.525 54.465 54.426 54.333 54.297 54.248 54.186 54.059 53.996 53.883 53.731 53.581 53.396 53.133 51.952 -3 ,10199 ,TETRA ,17557491,Fri Nov 26 10:17:43 CET,Fri Nov 26 12:08:39 CET,0.0 0.616 0.808 0.988 1.16 1.314 1.469 1.619 1.875 1.996 2.118 2.26 2.485 2.6 2.826 3.043 3.258 3.362 3.563 3.765 4.063 4.253 4.447 4.732 5.017 5.303 5.573 5.835 6.187 6.534 6.877 7.294 7.708 8.122 8.609 9.171 9.738 10.388 11.107 11.883 12.727 13.721 14.903 16.11 17.576 19.285 21.328 23.774 26.848 30.765 36.007 40.901 44.094 46.308 47.935 49.202 50.197 50.996 51.583 52.116 52.531 52.86 53.133 53.358 53.554 53.718 53.87 53.985 54.071 54.164 54.251 54.301 54.343 54.378 54.399 54.416 54.422 54.419 54.411 54.405 54.401 54.382 54.358 54.335 54.318 54.28 54.246 54.196 54.164 54.084 54.048 53.995 53.935 53.756 53.658 53.567 53.454 53.325 53.114 52.818 51.54 -4 ,32643 ,TETRA ,17557492,Fri Nov 26 10:17:46 CET,Fri Nov 26 12:06:35 CET,0.0 0.783 1.052 1.3 1.521 1.705 1.881 2.067 2.403 2.557 2.697 2.846 3.078 3.203 3.461 3.709 3.939 4.056 4.285 4.509 4.84 5.048 5.251 5.553 5.846 6.133 6.417 6.71 7.1 7.473 7.838 8.282 8.713 9.138 9.647 10.23 10.802 11.439 12.146 12.919 13.76 14.747 15.936 17.163 18.653 20.38 22.454 24.946 28.035 31.908 37.095 41.944 45.16 47.488 49.175 50.428 51.406 52.211 52.822 53.366 53.797 54.15 54.443 54.685 54.888 55.046 55.19 55.305 55.398 55.483 55.556 55.61 55.658 55.707 55.74 55.76 55.775 55.789 55.802 55.806 55.799 55.759 55.733 55.701 55.683 55.65 55.605 55.546 55.512 55.437 55.417 55.355 55.278 55.128 55.049 54.974 54.88 54.743 54.548 54.296 53.739 -5 ,3664 ,TETRA ,17557493,Fri Nov 26 10:18:44 CET,Fri Nov 26 12:09:52 CET,0.0 0.393 0.577 0.77 0.946 1.105 1.26 1.396 1.668 1.804 1.923 2.05 2.278 2.396 2.618 2.843 3.059 3.167 3.384 3.589 3.888 4.088 4.299 4.607 4.888 5.154 5.42 5.686 6.041 6.39 6.738 7.168 7.582 7.997 8.49 9.047 9.591 10.204 10.889 11.638 12.449 13.405 14.576 15.782 17.242 18.952 21.005 23.417 26.433 30.349 35.655 40.605 43.902 46.251 47.984 49.366 50.427 51.225 51.83 52.388 52.815 53.163 53.474 53.74 53.956 54.133 54.301 54.449 54.554 54.644 54.723 54.773 54.813 54.842 54.873 54.903 54.918 54.919 54.906 54.901 54.9 54.885 54.855 54.827 54.809 54.763 54.701 54.628 54.597 54.508 54.454 54.4 54.342 54.194 54.103 54.004 53.888 53.733 53.561 53.281 51.827 -6 ,24953 ,TETRA ,17557494,Fri Nov 26 10:18:45 CET,Fri Nov 26 12:09:17 CET,0.0 0.896 1.15 1.387 1.607 1.796 1.973 2.141 2.43 2.567 2.71 2.895 3.141 3.282 3.535 3.762 3.993 4.111 4.326 4.544 4.879 5.089 5.288 5.577 5.864 6.156 6.441 6.725 7.095 7.46 7.819 8.254 8.689 9.123 9.629 10.211 10.785 11.43 12.148 12.925 13.776 14.783 15.98 17.205 18.702 20.466 22.572 25.031 28.104 32.033 37.273 42.106 45.228 47.48 49.155 50.451 51.449 52.259 52.879 53.416 53.842 54.183 54.456 54.688 54.869 55.002 55.139 55.263 55.347 55.418 55.492 55.543 55.584 55.606 55.618 55.631 55.634 55.636 55.636 55.632 55.627 55.605 55.583 55.548 55.528 55.493 55.445 55.377 55.329 55.228 55.163 55.099 55.042 54.923 54.852 54.748 54.612 54.458 54.277 54.031 53.016 -7 ,30239 ,TETRA ,17557495,Fri Nov 26 10:18:46 CET,Fri Nov 26 12:09:15 CET,0.0 0.722 1.01 1.23 1.408 1.57 1.731 1.89 2.191 2.33 2.461 2.615 2.847 2.976 3.231 3.47 3.706 3.826 4.063 4.288 4.612 4.835 5.053 5.36 5.65 5.937 6.226 6.509 6.875 7.23 7.591 8.048 8.483 8.907 9.416 9.996 10.561 11.197 11.91 12.691 13.527 14.483 15.652 16.876 18.345 20.05 22.109 24.581 27.662 31.558 36.756 41.608 44.817 47.047 48.695 49.971 50.951 51.737 52.309 52.825 53.24 53.567 53.837 54.064 54.259 54.432 54.606 54.735 54.817 54.9 54.985 55.046 55.098 55.134 55.15 55.16 55.162 55.151 55.148 55.137 55.115 55.08 55.045 55.005 54.982 54.931 54.892 54.841 54.805 54.721 54.683 54.627 54.558 54.41 54.328 54.233 54.113 53.949 53.756 53.498 52.394 -8 ,25976 ,TETRA ,17557496,Fri Nov 26 10:19:43 CET,Fri Nov 26 12:10:12 CET,0.0 0.544 0.766 0.963 1.139 1.304 1.469 1.615 1.874 2.003 2.126 2.249 2.465 2.581 2.82 3.043 3.259 3.366 3.576 3.782 4.079 4.277 4.468 4.738 5.001 5.267 5.54 5.806 6.142 6.482 6.819 7.234 7.646 8.041 8.519 9.077 9.638 10.275 10.962 11.711 12.518 13.458 14.609 15.803 17.237 18.94 21.018 23.468 26.523 30.434 35.643 40.518 43.751 46.068 47.787 49.13 50.14 50.937 51.553 52.096 52.528 52.884 53.213 53.497 53.729 53.926 54.106 54.226 54.306 54.385 54.457 54.503 54.537 54.559 54.57 54.581 54.586 54.589 54.578 54.567 54.552 54.507 54.478 54.453 54.432 54.374 54.312 54.256 54.227 54.148 54.118 54.07 54.007 53.844 53.757 53.632 53.497 53.346 53.116 52.792 51.347 -9 ,1686 ,TETRA ,17557497,Fri Nov 26 10:19:43 CET,Fri Nov 26 12:11:01 CET,0.0 0.568 0.804 1.018 1.191 1.353 1.502 1.635 1.902 2.027 2.152 2.293 2.513 2.631 2.865 3.09 3.306 3.414 3.621 3.82 4.117 4.312 4.513 4.806 5.081 5.355 5.623 5.889 6.246 6.596 6.943 7.371 7.796 8.215 8.698 9.253 9.795 10.421 11.127 11.886 12.71 13.664 14.826 16.064 17.562 19.292 21.388 23.865 26.952 30.891 36.116 40.988 44.173 46.427 48.085 49.346 50.291 51.071 51.667 52.186 52.609 52.945 53.224 53.466 53.682 53.843 53.971 54.078 54.17 54.257 54.328 54.387 54.433 54.465 54.48 54.49 54.496 54.494 54.477 54.457 54.44 54.401 54.36 54.314 54.291 54.238 54.178 54.109 54.082 54.007 53.948 53.89 53.838 53.69 53.597 53.497 53.368 53.204 53.022 52.797 51.608 -10 ,27777 ,TETRA ,17557498,Fri Nov 26 10:19:43 CET,Fri Nov 26 12:10:49 CET,0.0 0.565 0.871 1.116 1.32 1.502 1.686 1.852 2.167 2.322 2.462 2.622 2.851 2.977 3.227 3.473 3.71 3.83 4.07 4.293 4.609 4.82 5.029 5.349 5.667 5.974 6.269 6.551 6.931 7.308 7.67 8.128 8.577 9.007 9.516 10.097 10.663 11.299 12.007 12.79 13.652 14.656 15.853 17.076 18.536 20.238 22.298 24.752 27.845 31.834 37.116 41.911 45.057 47.319 48.987 50.28 51.281 52.088 52.684 53.181 53.56 53.887 54.186 54.433 54.638 54.812 54.962 55.085 55.184 55.255 55.312 55.356 55.406 55.432 55.432 55.439 55.451 55.454 55.455 55.452 55.435 55.405 55.383 55.349 55.324 55.268 55.224 55.174 55.145 55.063 55.032 54.983 54.908 54.753 54.66 54.564 54.444 54.273 54.085 53.853 52.046 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt deleted file mode 100644 index b3bb6a17..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14354 ,TETRA ,17557499,Fri Nov 26 10:19:44 CET,Fri Nov 26 12:10:28 CET,0.0 0.694 1.039 1.31 1.509 1.695 1.882 2.061 2.382 2.536 2.689 2.883 3.131 3.267 3.527 3.775 4.025 4.15 4.396 4.63 4.974 5.2 5.427 5.765 6.084 6.395 6.707 7.013 7.415 7.816 8.212 8.693 9.17 9.638 10.19 10.82 11.434 12.117 12.884 13.736 14.649 15.699 16.959 18.3 19.923 21.79 24.072 26.804 30.209 34.472 40.086 45.314 48.801 51.274 53.094 54.489 55.513 56.354 57.021 57.617 58.08 58.448 58.76 59.036 59.285 59.478 59.653 59.804 59.926 60.032 60.116 60.178 60.242 60.313 60.361 60.406 60.453 60.5 60.53 60.546 60.557 60.562 60.577 60.587 60.584 60.576 60.564 60.52 60.481 60.388 60.346 60.302 60.257 60.118 60.038 59.957 59.86 59.733 59.569 59.357 58.814 -2 ,22337 ,TETRA ,17557500,Fri Nov 26 10:19:46 CET,Fri Nov 26 12:10:44 CET,0.0 0.804 1.093 1.323 1.531 1.721 1.9 2.085 2.426 2.574 2.723 2.923 3.175 3.318 3.582 3.833 4.081 4.204 4.45 4.676 5.0 5.22 5.438 5.784 6.133 6.461 6.779 7.086 7.488 7.895 8.294 8.782 9.255 9.719 10.259 10.891 11.539 12.25 13.026 13.878 14.802 15.878 17.166 18.5 20.127 22.016 24.289 26.961 30.308 34.617 40.359 45.67 49.019 51.387 53.153 54.482 55.488 56.294 56.921 57.499 57.963 58.339 58.645 58.908 59.134 59.318 59.474 59.585 59.683 59.783 59.873 59.931 59.981 60.031 60.065 60.088 60.099 60.108 60.098 60.087 60.079 60.051 60.026 59.999 59.985 59.959 59.917 59.858 59.835 59.756 59.713 59.671 59.625 59.49 59.391 59.271 59.14 58.986 58.834 58.637 58.078 -3 ,18348 ,TETRA ,17557501,Fri Nov 26 10:19:44 CET,Fri Nov 26 12:10:53 CET,0.0 0.721 1.08 1.352 1.56 1.771 1.974 2.15 2.447 2.596 2.748 2.926 3.163 3.297 3.548 3.792 4.05 4.177 4.414 4.641 4.974 5.191 5.414 5.74 6.056 6.371 6.691 7.015 7.433 7.834 8.228 8.72 9.196 9.653 10.206 10.847 11.477 12.175 12.937 13.772 14.677 15.753 17.041 18.371 20.009 21.911 24.193 26.873 30.216 34.438 40.08 45.336 48.683 51.004 52.707 54.036 55.045 55.852 56.493 57.072 57.489 57.822 58.146 58.418 58.635 58.809 58.967 59.107 59.211 59.299 59.384 59.448 59.505 59.545 59.568 59.582 59.581 59.587 59.603 59.61 59.61 59.597 59.571 59.545 59.536 59.498 59.452 59.414 59.388 59.299 59.263 59.211 59.149 59.006 58.909 58.809 58.702 58.556 58.419 58.244 57.663 -4 ,22942 ,TETRA ,17557502,Fri Nov 26 10:19:44 CET,Fri Nov 26 12:10:52 CET,0.0 0.502 0.759 0.994 1.19 1.382 1.557 1.717 2.024 2.181 2.332 2.51 2.75 2.883 3.147 3.41 3.656 3.776 4.025 4.272 4.631 4.854 5.072 5.406 5.731 6.045 6.346 6.648 7.042 7.438 7.825 8.298 8.777 9.247 9.807 10.446 11.09 11.806 12.563 13.384 14.296 15.365 16.657 17.992 19.584 21.481 23.791 26.483 29.815 34.065 39.622 44.732 48.159 50.539 52.304 53.715 54.804 55.679 56.316 56.879 57.324 57.681 57.983 58.254 58.476 58.636 58.799 58.948 59.065 59.169 59.256 59.31 59.363 59.415 59.448 59.472 59.493 59.504 59.51 59.513 59.505 59.473 59.452 59.437 59.426 59.394 59.334 59.259 59.226 59.152 59.136 59.096 59.051 58.93 58.856 58.76 58.644 58.506 58.313 58.065 57.311 -5 ,18744 ,TETRA ,17557503,Fri Nov 26 10:19:44 CET,Fri Nov 26 12:04:24 CET,0.0 0.531 0.815 1.049 1.246 1.427 1.601 1.786 2.135 2.286 2.436 2.62 2.857 2.986 3.231 3.467 3.705 3.826 4.058 4.291 4.639 4.859 5.081 5.41 5.721 6.036 6.355 6.669 7.075 7.454 7.834 8.324 8.792 9.251 9.8 10.421 11.031 11.722 12.488 13.321 14.235 15.293 16.559 17.91 19.522 21.387 23.653 26.332 29.708 33.977 39.666 44.875 48.297 50.774 52.578 53.92 54.928 55.744 56.385 56.965 57.405 57.747 58.041 58.305 58.53 58.714 58.863 58.974 59.083 59.187 59.283 59.356 59.419 59.462 59.491 59.517 59.508 59.502 59.517 59.526 59.529 59.516 59.504 59.479 59.466 59.433 59.385 59.337 59.312 59.237 59.203 59.157 59.115 58.997 58.915 58.847 58.767 58.654 58.504 58.264 57.557 -6 ,32411 ,TETRA ,17557504,Fri Nov 26 10:19:44 CET,Fri Nov 26 12:14:56 CET,0.0 0.779 1.084 1.344 1.584 1.81 1.992 2.155 2.475 2.629 2.775 2.949 3.197 3.35 3.628 3.883 4.13 4.253 4.492 4.728 5.087 5.323 5.553 5.894 6.217 6.541 6.864 7.171 7.571 7.975 8.369 8.859 9.349 9.823 10.374 11.001 11.621 12.328 13.124 13.98 14.891 15.932 17.187 18.528 20.139 21.992 24.271 26.974 30.296 34.528 40.265 45.598 49.082 51.494 53.22 54.581 55.632 56.469 57.101 57.689 58.169 58.531 58.828 59.106 59.331 59.523 59.71 59.841 59.949 60.055 60.135 60.192 60.248 60.281 60.31 60.34 60.357 60.367 60.364 60.36 60.349 60.318 60.295 60.276 60.265 60.221 60.159 60.088 60.05 59.965 59.934 59.898 59.853 59.711 59.616 59.527 59.426 59.308 59.162 58.937 58.418 -7 ,8461 ,TETRA ,17557505,Fri Nov 26 10:19:43 CET,Fri Nov 26 11:59:28 CET,0.0 0.811 1.131 1.4 1.618 1.823 2.027 2.216 2.554 2.709 2.855 3.046 3.292 3.429 3.693 3.947 4.188 4.304 4.545 4.785 5.135 5.369 5.596 5.924 6.25 6.577 6.886 7.18 7.567 7.95 8.343 8.826 9.295 9.759 10.306 10.935 11.572 12.27 13.031 13.882 14.8 15.858 17.132 18.486 20.102 21.942 24.165 26.814 30.114 34.316 40.021 45.298 48.7 51.126 52.905 54.279 55.342 56.188 56.838 57.437 57.923 58.296 58.587 58.837 59.054 59.236 59.407 59.537 59.635 59.728 59.818 59.874 59.922 59.965 59.989 60.008 60.021 60.025 60.022 60.027 60.028 60.017 59.993 59.956 59.941 59.895 59.842 59.787 59.753 59.668 59.635 59.593 59.549 59.449 59.395 59.328 59.237 59.125 58.94 58.615 57.762 -8 ,4612 ,TETRA ,17557506,Fri Nov 26 10:20:43 CET,Fri Nov 26 11:54:15 CET,0.0 0.675 0.977 1.221 1.431 1.635 1.825 1.996 2.328 2.493 2.656 2.843 3.081 3.22 3.481 3.728 3.974 4.098 4.343 4.574 4.911 5.134 5.357 5.691 6.021 6.348 6.67 6.972 7.375 7.782 8.174 8.642 9.1 9.56 10.119 10.772 11.413 12.128 12.906 13.756 14.694 15.793 17.094 18.444 20.052 21.911 24.172 26.852 30.188 34.396 39.976 45.198 48.655 51.076 52.793 54.156 55.234 56.09 56.754 57.345 57.783 58.131 58.43 58.681 58.895 59.06 59.215 59.335 59.428 59.533 59.631 59.689 59.729 59.765 59.79 59.81 59.818 59.829 59.838 59.83 59.827 59.811 59.782 59.757 59.749 59.731 59.697 59.658 59.633 59.552 59.511 59.453 59.394 59.251 59.166 59.073 58.966 58.844 58.683 58.479 57.775 -9 ,24984 ,TETRA ,17557507,Fri Nov 26 10:20:43 CET,Fri Nov 26 12:04:28 CET,0.0 0.638 0.908 1.156 1.38 1.577 1.762 1.942 2.264 2.413 2.564 2.758 3.004 3.142 3.404 3.661 3.908 4.032 4.28 4.511 4.837 5.047 5.255 5.578 5.895 6.205 6.509 6.817 7.244 7.645 8.032 8.517 8.983 9.438 9.99 10.635 11.269 11.962 12.725 13.566 14.468 15.515 16.776 18.081 19.679 21.547 23.766 26.401 29.74 33.987 39.671 44.982 48.509 51.041 52.881 54.254 55.286 56.115 56.767 57.317 57.74 58.108 58.411 58.652 58.856 59.017 59.175 59.304 59.403 59.504 59.588 59.647 59.7 59.75 59.787 59.815 59.831 59.846 59.854 59.849 59.847 59.83 59.81 59.791 59.78 59.747 59.711 59.664 59.633 59.556 59.534 59.485 59.417 59.285 59.228 59.159 59.072 58.955 58.802 58.595 57.971 -10 ,16495 ,TETRA ,17557508,Fri Nov 26 10:20:43 CET,Fri Nov 26 12:11:42 CET,0.0 0.785 1.069 1.319 1.527 1.727 1.911 2.072 2.415 2.574 2.723 2.923 3.171 3.311 3.585 3.856 4.122 4.252 4.498 4.728 5.075 5.307 5.526 5.854 6.179 6.497 6.817 7.129 7.533 7.935 8.33 8.81 9.278 9.728 10.261 10.894 11.521 12.221 13.005 13.875 14.805 15.849 17.111 18.428 20.031 21.938 24.241 26.969 30.353 34.619 40.351 45.739 49.224 51.612 53.347 54.668 55.653 56.463 57.114 57.69 58.123 58.463 58.763 59.026 59.254 59.447 59.63 59.778 59.877 59.976 60.086 60.15 60.202 60.253 60.279 60.298 60.316 60.338 60.36 60.369 60.363 60.333 60.316 60.298 60.283 60.25 60.199 60.14 60.117 60.03 59.971 59.931 59.891 59.769 59.679 59.55 59.393 59.254 59.124 58.889 58.09 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt deleted file mode 100644 index c01bae25..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24471 ,TETRA ,17557509,Fri Nov 26 10:20:44 CET,Fri Nov 26 12:12:40 CET,0.0 0.722 0.989 1.218 1.444 1.64 1.832 2.029 2.374 2.529 2.678 2.872 3.121 3.27 3.568 3.845 4.111 4.238 4.49 4.752 5.128 5.367 5.609 5.971 6.333 6.689 7.031 7.365 7.805 8.237 8.667 9.2 9.727 10.247 10.865 11.577 12.268 13.034 13.889 14.843 15.881 17.093 18.574 20.124 22.008 24.204 26.895 30.126 34.118 39.243 46.225 52.877 57.385 60.667 63.11 65.018 66.536 67.797 68.79 69.699 70.423 71.03 71.572 72.037 72.432 72.777 73.123 73.404 73.629 73.855 74.076 74.251 74.422 74.587 74.71 74.839 74.961 75.077 75.191 75.262 75.339 75.45 75.517 75.586 75.619 75.681 75.737 75.789 75.812 75.805 75.882 75.9 75.913 75.934 75.938 75.934 75.915 75.882 75.835 75.744 75.436 -2 ,11379 ,TETRA ,17557510,Fri Nov 26 10:20:43 CET,Fri Nov 26 12:13:55 CET,0.0 0.597 0.92 1.194 1.418 1.617 1.812 1.998 2.364 2.533 2.691 2.901 3.152 3.304 3.601 3.883 4.158 4.29 4.553 4.811 5.182 5.417 5.657 6.021 6.375 6.731 7.084 7.425 7.869 8.32 8.766 9.312 9.853 10.377 10.991 11.707 12.407 13.191 14.058 14.999 16.036 17.248 18.733 20.317 22.214 24.388 27.034 30.214 34.248 39.428 46.393 53.039 57.55 60.872 63.381 65.348 66.858 68.101 69.101 70.005 70.732 71.343 71.875 72.345 72.745 73.086 73.427 73.703 73.919 74.128 74.333 74.493 74.651 74.799 74.907 75.02 75.125 75.213 75.292 75.345 75.397 75.467 75.505 75.547 75.573 75.621 75.653 75.66 75.654 75.62 75.625 75.615 75.608 75.604 75.601 75.586 75.554 75.482 75.37 75.255 74.868 -3 ,20610 ,TETRA ,17557511,Fri Nov 26 10:20:43 CET,Fri Nov 26 12:09:46 CET,0.0 0.592 0.899 1.147 1.355 1.561 1.752 1.938 2.287 2.453 2.608 2.801 3.057 3.22 3.526 3.804 4.061 4.184 4.445 4.706 5.085 5.334 5.579 5.939 6.297 6.652 7.002 7.341 7.792 8.24 8.668 9.2 9.725 10.231 10.838 11.547 12.251 13.036 13.899 14.86 15.91 17.126 18.592 20.115 21.957 24.11 26.762 29.937 33.933 39.073 46.034 52.72 57.224 60.518 63.003 64.947 66.451 67.677 68.663 69.577 70.292 70.895 71.441 71.899 72.272 72.606 72.94 73.211 73.431 73.642 73.848 74.013 74.171 74.314 74.421 74.528 74.638 74.739 74.825 74.869 74.908 74.978 75.017 75.044 75.058 75.082 75.103 75.133 75.147 75.124 75.132 75.121 75.11 75.085 75.069 75.032 74.972 74.89 74.784 74.635 74.143 -4 ,13353 ,TETRA ,17557512,Fri Nov 26 10:20:43 CET,Fri Nov 26 12:10:37 CET,0.0 0.836 1.123 1.38 1.613 1.821 2.01 2.201 2.553 2.719 2.883 3.097 3.357 3.497 3.761 4.041 4.322 4.456 4.708 4.968 5.353 5.592 5.832 6.189 6.547 6.889 7.223 7.565 8.015 8.447 8.868 9.394 9.918 10.448 11.07 11.78 12.483 13.269 14.14 15.108 16.153 17.356 18.822 20.367 22.26 24.496 27.191 30.366 34.383 39.528 46.467 53.075 57.575 60.875 63.348 65.302 66.841 68.11 69.1 70.012 70.743 71.336 71.861 72.319 72.714 73.06 73.395 73.674 73.905 74.124 74.342 74.512 74.669 74.821 74.923 75.016 75.102 75.187 75.274 75.328 75.369 75.405 75.433 75.464 75.48 75.525 75.565 75.592 75.598 75.569 75.588 75.592 75.592 75.536 75.499 75.476 75.451 75.401 75.321 75.182 74.551 -5 ,2196 ,TETRA ,17557513,Fri Nov 26 10:21:46 CET,Fri Nov 26 12:07:58 CET,0.0 0.599 0.949 1.225 1.463 1.67 1.859 2.039 2.398 2.573 2.735 2.933 3.181 3.328 3.609 3.877 4.143 4.271 4.527 4.777 5.136 5.375 5.613 5.975 6.334 6.677 7.015 7.362 7.805 8.235 8.67 9.205 9.731 10.255 10.876 11.594 12.316 13.128 14.021 15.003 16.054 17.265 18.715 20.231 22.114 24.318 26.972 30.161 34.176 39.318 46.283 52.943 57.492 60.796 63.263 65.232 66.767 68.001 68.974 69.874 70.587 71.18 71.719 72.197 72.59 72.921 73.255 73.53 73.751 73.966 74.171 74.334 74.498 74.666 74.793 74.9 74.987 75.077 75.157 75.206 75.257 75.334 75.379 75.41 75.425 75.465 75.516 75.567 75.595 75.588 75.639 75.648 75.653 75.645 75.633 75.628 75.627 75.599 75.534 75.447 75.233 -6 ,22206 ,TETRA ,17557514,Fri Nov 26 10:21:45 CET,Fri Nov 26 12:13:12 CET,0.0 0.84 1.211 1.492 1.717 1.917 2.091 2.271 2.62 2.78 2.933 3.137 3.398 3.551 3.83 4.102 4.373 4.501 4.752 5.002 5.369 5.615 5.861 6.225 6.581 6.941 7.287 7.612 8.049 8.481 8.896 9.421 9.947 10.462 11.068 11.773 12.472 13.253 14.12 15.08 16.129 17.341 18.796 20.32 22.201 24.417 27.124 30.326 34.305 39.476 46.565 53.326 57.882 61.183 63.665 65.627 67.168 68.427 69.405 70.301 71.014 71.613 72.141 72.602 72.998 73.334 73.667 73.942 74.162 74.377 74.591 74.762 74.929 75.078 75.179 75.28 75.375 75.471 75.565 75.62 75.668 75.741 75.794 75.83 75.842 75.871 75.903 75.924 75.922 75.891 75.921 75.928 75.937 75.947 75.936 75.926 75.928 75.925 75.889 75.797 75.328 -7 ,30668 ,TETRA ,17557515,Fri Nov 26 10:21:45 CET,Fri Nov 26 12:12:00 CET,0.0 0.578 0.848 1.065 1.283 1.481 1.665 1.847 2.181 2.341 2.507 2.706 2.958 3.111 3.403 3.686 3.955 4.088 4.35 4.6 4.979 5.226 5.464 5.83 6.208 6.573 6.914 7.248 7.702 8.156 8.591 9.12 9.664 10.203 10.828 11.541 12.232 13.011 13.901 14.885 15.934 17.162 18.668 20.222 22.076 24.234 26.863 30.055 34.092 39.261 46.269 52.901 57.385 60.686 63.184 65.147 66.673 67.918 68.912 69.828 70.564 71.179 71.721 72.195 72.587 72.924 73.26 73.532 73.745 73.957 74.159 74.312 74.472 74.627 74.736 74.832 74.922 75.023 75.115 75.171 75.228 75.307 75.356 75.406 75.427 75.475 75.529 75.577 75.594 75.58 75.648 75.664 75.678 75.692 75.689 75.684 75.669 75.642 75.605 75.537 75.246 -8 ,25062 ,TETRA ,17557516,Fri Nov 26 10:21:48 CET,Fri Nov 26 12:12:10 CET,0.0 0.613 0.902 1.13 1.362 1.571 1.774 1.967 2.337 2.508 2.66 2.875 3.138 3.29 3.581 3.862 4.131 4.264 4.524 4.78 5.158 5.405 5.645 5.993 6.345 6.691 7.032 7.371 7.812 8.257 8.687 9.212 9.748 10.274 10.889 11.595 12.296 13.085 13.961 14.93 15.971 17.174 18.656 20.229 22.123 24.32 26.952 30.108 34.133 39.298 46.326 53.092 57.656 60.962 63.455 65.421 66.952 68.207 69.201 70.101 70.807 71.398 71.923 72.386 72.792 73.133 73.47 73.747 73.965 74.182 74.396 74.559 74.715 74.871 74.981 75.076 75.171 75.269 75.359 75.409 75.455 75.527 75.569 75.612 75.634 75.67 75.694 75.701 75.694 75.662 75.66 75.64 75.627 75.589 75.562 75.51 75.457 75.399 75.303 75.175 74.926 -9 ,3150 ,TETRA ,17557517,Fri Nov 26 10:21:46 CET,Fri Nov 26 12:10:31 CET,0.0 0.718 1.018 1.295 1.512 1.702 1.895 2.085 2.444 2.615 2.78 2.983 3.234 3.377 3.656 3.932 4.192 4.319 4.587 4.849 5.239 5.495 5.735 6.088 6.442 6.793 7.141 7.481 7.94 8.384 8.811 9.34 9.861 10.369 10.98 11.699 12.394 13.172 14.04 14.989 16.032 17.249 18.721 20.267 22.143 24.337 27.025 30.26 34.249 39.352 46.336 53.008 57.551 60.819 63.279 65.242 66.79 68.049 69.019 69.922 70.657 71.285 71.848 72.344 72.779 73.15 73.512 73.81 74.055 74.3 74.542 74.725 74.897 75.068 75.197 75.319 75.441 75.563 75.675 75.748 75.825 75.935 75.999 76.056 76.081 76.133 76.185 76.233 76.25 76.234 76.29 76.303 76.308 76.295 76.286 76.273 76.25 76.223 76.162 76.057 75.62 -10 ,22486 ,TETRA ,17557518,Fri Nov 26 10:22:43 CET,Fri Nov 26 12:12:56 CET,0.0 0.712 1.02 1.264 1.466 1.674 1.884 2.074 2.397 2.553 2.7 2.885 3.14 3.29 3.566 3.833 4.104 4.244 4.509 4.756 5.122 5.367 5.614 5.998 6.36 6.701 7.048 7.388 7.831 8.271 8.708 9.246 9.779 10.301 10.91 11.617 12.316 13.107 14.007 14.974 16.013 17.25 18.733 20.274 22.16 24.355 26.99 30.141 34.089 39.218 46.249 52.931 57.472 60.779 63.272 65.243 66.778 68.037 69.046 69.978 70.702 71.307 71.848 72.305 72.707 73.059 73.402 73.679 73.894 74.115 74.322 74.478 74.637 74.792 74.914 75.03 75.134 75.223 75.297 75.348 75.408 75.498 75.54 75.573 75.585 75.604 75.631 75.642 75.649 75.631 75.669 75.666 75.66 75.645 75.625 75.593 75.527 75.443 75.347 75.206 74.655 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt deleted file mode 100644 index 902380cf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29787 ,TETRA ,17557520,Fri Nov 26 10:22:43 CET,Fri Nov 26 12:11:59 CET,0.0 0.299 0.431 0.543 0.635 0.721 0.783 0.826 0.898 0.932 0.966 1.017 1.06 1.083 1.116 1.145 1.174 1.184 1.196 1.21 1.231 1.234 1.221 1.182 1.13 1.071 1.006 0.941 0.849 0.742 0.623 0.462 0.288 0.099 -0.145 -0.439 -0.747 -1.123 -1.549 -2.038 -2.608 -3.3 -4.175 -5.135 -6.383 -7.943 -9.939 -12.46 -15.86 -20.644 -27.796 -35.355 -40.98 -45.405 -48.897 -51.845 -54.33 -56.426 -58.155 -59.825 -61.221 -62.434 -63.553 -64.569 -65.48 -66.293 -67.13 -67.877 -68.511 -69.131 -69.752 -70.273 -70.803 -71.338 -71.756 -72.181 -72.592 -73.014 -73.461 -73.756 -74.053 -74.515 -74.839 -75.177 -75.34 -75.672 -76.029 -76.379 -76.552 -76.835 -77.091 -77.275 -77.468 -77.864 -78.075 -78.292 -78.52 -78.772 -79.048 -79.383 -80.308 -2 ,17282 ,TETRA ,17557521,Fri Nov 26 10:23:42 CET,Fri Nov 26 12:13:34 CET,0.0 0.365 0.48 0.581 0.67 0.732 0.783 0.817 0.872 0.898 0.918 0.928 0.959 0.975 0.998 1.003 1.009 1.015 1.021 1.02 1.004 0.989 0.962 0.923 0.886 0.825 0.753 0.68 0.58 0.467 0.332 0.149 -0.027 -0.206 -0.434 -0.719 -1.028 -1.397 -1.823 -2.323 -2.907 -3.612 -4.517 -5.509 -6.765 -8.317 -10.299 -12.838 -16.278 -21.105 -28.315 -35.885 -41.534 -45.973 -49.522 -52.478 -54.889 -56.992 -58.761 -60.45 -61.832 -63.019 -64.13 -65.146 -66.065 -66.886 -67.713 -68.439 -69.058 -69.687 -70.326 -70.835 -71.35 -71.89 -72.301 -72.714 -73.13 -73.535 -73.944 -74.233 -74.53 -74.975 -75.28 -75.592 -75.75 -76.072 -76.391 -76.713 -76.882 -77.156 -77.415 -77.61 -77.815 -78.258 -78.489 -78.715 -78.936 -79.179 -79.468 -79.856 -80.886 -3 ,18230 ,TETRA ,17557522,Fri Nov 26 10:23:45 CET,Fri Nov 26 12:12:25 CET,0.0 0.666 0.886 1.053 1.182 1.297 1.393 1.474 1.598 1.647 1.684 1.737 1.79 1.82 1.867 1.903 1.925 1.929 1.93 1.933 1.921 1.903 1.881 1.838 1.792 1.73 1.663 1.587 1.467 1.347 1.222 1.064 0.895 0.698 0.441 0.14 -0.168 -0.527 -0.957 -1.453 -2.004 -2.692 -3.593 -4.599 -5.866 -7.402 -9.392 -11.949 -15.382 -20.1 -27.147 -34.692 -40.335 -44.751 -48.347 -51.369 -53.816 -55.906 -57.623 -59.313 -60.743 -61.961 -63.086 -64.113 -65.032 -65.844 -66.676 -67.397 -68.007 -68.634 -69.286 -69.808 -70.332 -70.886 -71.305 -71.724 -72.155 -72.588 -73.023 -73.322 -73.627 -74.098 -74.427 -74.768 -74.941 -75.289 -75.649 -76.027 -76.217 -76.51 -76.805 -77.01 -77.225 -77.677 -77.908 -78.137 -78.382 -78.634 -78.937 -79.361 -80.577 -4 ,3047 ,TETRA ,17557523,Fri Nov 26 10:23:45 CET,Fri Nov 26 12:13:46 CET,0.0 0.292 0.454 0.547 0.625 0.698 0.758 0.803 0.859 0.882 0.9 0.902 0.932 0.942 0.958 0.979 0.989 0.989 0.984 0.983 0.985 0.972 0.942 0.898 0.849 0.789 0.718 0.641 0.53 0.406 0.277 0.1 -0.081 -0.261 -0.496 -0.797 -1.097 -1.455 -1.888 -2.389 -2.977 -3.682 -4.558 -5.542 -6.814 -8.382 -10.376 -12.92 -16.406 -21.263 -28.43 -36.038 -41.653 -46.045 -49.616 -52.602 -55.072 -57.211 -58.979 -60.645 -62.033 -63.255 -64.363 -65.388 -66.33 -67.153 -67.998 -68.733 -69.338 -69.962 -70.604 -71.113 -71.626 -72.152 -72.573 -73.025 -73.494 -73.976 -74.461 -74.79 -75.129 -75.657 -76.012 -76.372 -76.556 -76.93 -77.308 -77.682 -77.883 -78.192 -78.501 -78.728 -78.967 -79.475 -79.757 -80.028 -80.313 -80.66 -81.054 -81.509 -82.486 -5 ,16750 ,TETRA ,17557524,Fri Nov 26 10:23:45 CET,Fri Nov 26 12:05:36 CET,0.0 0.273 0.374 0.471 0.55 0.612 0.681 0.739 0.844 0.884 0.918 0.971 1.012 1.035 1.065 1.08 1.098 1.106 1.102 1.096 1.07 1.046 1.023 0.982 0.935 0.886 0.823 0.75 0.639 0.515 0.385 0.215 0.035 -0.151 -0.386 -0.685 -1.001 -1.368 -1.794 -2.281 -2.845 -3.559 -4.468 -5.452 -6.713 -8.264 -10.263 -12.819 -16.244 -20.957 -27.997 -35.518 -41.104 -45.466 -49.003 -51.96 -54.389 -56.515 -58.274 -59.951 -61.354 -62.557 -63.651 -64.676 -65.608 -66.416 -67.248 -67.972 -68.595 -69.233 -69.86 -70.381 -70.916 -71.461 -71.875 -72.29 -72.718 -73.159 -73.603 -73.901 -74.203 -74.654 -74.959 -75.288 -75.453 -75.779 -76.125 -76.48 -76.67 -76.965 -77.249 -77.453 -77.674 -78.143 -78.392 -78.649 -78.924 -79.238 -79.581 -80.02 -81.164 -6 ,22664 ,TETRA ,17557525,Fri Nov 26 10:24:45 CET,Fri Nov 26 12:08:16 CET,0.0 0.353 0.539 0.684 0.81 0.904 0.979 1.051 1.174 1.23 1.293 1.385 1.436 1.467 1.523 1.57 1.603 1.617 1.631 1.64 1.661 1.652 1.626 1.579 1.516 1.45 1.377 1.296 1.187 1.064 0.928 0.757 0.578 0.384 0.132 -0.16 -0.453 -0.804 -1.213 -1.696 -2.262 -2.956 -3.822 -4.781 -6.042 -7.606 -9.603 -12.133 -15.539 -20.275 -27.398 -35.031 -40.748 -45.19 -48.693 -51.637 -54.064 -56.165 -57.916 -59.602 -61.002 -62.225 -63.358 -64.375 -65.298 -66.107 -66.924 -67.661 -68.299 -68.934 -69.569 -70.083 -70.598 -71.135 -71.545 -71.959 -72.391 -72.828 -73.265 -73.563 -73.864 -74.324 -74.638 -74.961 -75.124 -75.456 -75.809 -76.165 -76.344 -76.628 -76.91 -77.125 -77.345 -77.776 -78.002 -78.237 -78.485 -78.725 -78.994 -79.321 -80.108 -7 ,10998 ,TETRA ,17557526,Fri Nov 26 10:24:44 CET,Fri Nov 26 12:14:13 CET,0.0 0.636 0.842 1.006 1.154 1.258 1.342 1.426 1.554 1.605 1.65 1.702 1.748 1.776 1.81 1.824 1.836 1.841 1.849 1.841 1.81 1.788 1.762 1.721 1.671 1.606 1.529 1.455 1.347 1.226 1.099 0.915 0.726 0.54 0.312 0.037 -0.26 -0.62 -1.046 -1.537 -2.122 -2.839 -3.729 -4.71 -5.962 -7.505 -9.497 -12.08 -15.554 -20.379 -27.623 -35.233 -40.893 -45.335 -48.889 -51.877 -54.341 -56.451 -58.199 -59.88 -61.261 -62.452 -63.537 -64.513 -65.398 -66.24 -67.138 -67.903 -68.562 -69.236 -69.919 -70.466 -71.033 -71.627 -72.063 -72.501 -72.951 -73.399 -73.857 -74.167 -74.482 -74.98 -75.311 -75.648 -75.824 -76.181 -76.546 -76.931 -77.131 -77.428 -77.703 -77.912 -78.151 -78.657 -78.918 -79.191 -79.484 -79.822 -80.189 -80.621 -81.523 -8 ,1806 ,TETRA ,17557527,Fri Nov 26 10:24:45 CET,Fri Nov 26 12:10:14 CET,0.0 0.295 0.431 0.555 0.651 0.727 0.794 0.85 0.943 0.983 1.016 1.059 1.099 1.13 1.194 1.243 1.274 1.291 1.332 1.352 1.372 1.379 1.377 1.36 1.329 1.28 1.211 1.129 1.022 0.913 0.795 0.633 0.46 0.279 0.032 -0.269 -0.578 -0.954 -1.403 -1.913 -2.496 -3.207 -4.097 -5.088 -6.365 -7.92 -9.886 -12.396 -15.813 -20.542 -27.585 -35.105 -40.758 -45.179 -48.703 -51.699 -54.171 -56.278 -58.036 -59.736 -61.143 -62.349 -63.462 -64.498 -65.432 -66.253 -67.075 -67.789 -68.395 -69.017 -69.643 -70.152 -70.682 -71.216 -71.622 -72.035 -72.453 -72.895 -73.345 -73.65 -73.969 -74.451 -74.784 -75.122 -75.287 -75.62 -75.962 -76.313 -76.501 -76.798 -77.114 -77.328 -77.551 -78.008 -78.248 -78.517 -78.796 -79.088 -79.412 -79.795 -81.294 -9 ,810 ,TETRA ,17557528,Fri Nov 26 10:24:47 CET,Fri Nov 26 12:06:02 CET,0.0 0.319 0.453 0.56 0.649 0.727 0.8 0.855 0.956 0.997 1.036 1.095 1.148 1.176 1.214 1.246 1.256 1.255 1.249 1.238 1.222 1.21 1.185 1.12 1.052 0.988 0.921 0.846 0.73 0.608 0.479 0.304 0.118 -0.071 -0.315 -0.606 -0.899 -1.269 -1.706 -2.193 -2.743 -3.432 -4.331 -5.324 -6.594 -8.135 -10.116 -12.63 -16.035 -20.861 -28.086 -35.683 -41.31 -45.726 -49.282 -52.293 -54.751 -56.851 -58.638 -60.332 -61.695 -62.888 -63.975 -64.961 -65.877 -66.692 -67.525 -68.251 -68.869 -69.496 -70.123 -70.632 -71.159 -71.711 -72.128 -72.551 -72.995 -73.448 -73.894 -74.192 -74.496 -74.959 -75.279 -75.596 -75.753 -76.077 -76.414 -76.761 -76.937 -77.207 -77.457 -77.646 -77.841 -78.272 -78.499 -78.731 -78.967 -79.205 -79.479 -79.807 -80.44 -10 ,5583 ,TETRA ,17557529,Fri Nov 26 10:24:46 CET,Fri Nov 26 12:09:52 CET,0.0 0.241 0.41 0.532 0.616 0.688 0.749 0.806 0.911 0.955 0.986 1.011 1.046 1.066 1.095 1.112 1.12 1.121 1.107 1.093 1.073 1.047 1.019 0.979 0.93 0.872 0.807 0.732 0.619 0.494 0.36 0.178 -0.014 -0.201 -0.435 -0.734 -1.036 -1.392 -1.806 -2.281 -2.832 -3.527 -4.43 -5.422 -6.682 -8.228 -10.236 -12.804 -16.256 -21.068 -28.261 -35.874 -41.513 -45.924 -49.434 -52.375 -54.827 -56.962 -58.701 -60.345 -61.72 -62.914 -64.031 -65.047 -65.935 -66.723 -67.53 -68.242 -68.852 -69.465 -70.082 -70.579 -71.099 -71.637 -72.03 -72.423 -72.83 -73.248 -73.667 -73.956 -74.251 -74.689 -74.999 -75.327 -75.495 -75.828 -76.152 -76.47 -76.635 -76.911 -77.188 -77.387 -77.588 -78.016 -78.238 -78.462 -78.695 -78.938 -79.219 -79.548 -80.224 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt deleted file mode 100644 index a9e04fbc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28342 ,TETRA ,17557530,Fri Nov 26 10:25:45 CET,Fri Nov 26 12:15:40 CET,0.0 3.182 3.589 3.839 4.033 4.189 4.329 4.433 4.604 4.68 4.75 4.86 4.922 4.969 5.052 5.104 5.147 5.169 5.212 5.242 5.261 5.264 5.256 5.233 5.204 5.167 5.118 5.05 4.94 4.827 4.719 4.569 4.398 4.217 3.986 3.689 3.373 2.998 2.555 2.04 1.446 0.711 -0.219 -1.242 -2.545 -4.171 -6.268 -8.94 -12.564 -17.598 -25.096 -32.971 -38.775 -43.315 -46.986 -50.104 -52.701 -54.898 -56.702 -58.448 -59.885 -61.111 -62.221 -63.249 -64.194 -65.019 -65.842 -66.558 -67.167 -67.778 -68.396 -68.903 -69.422 -69.951 -70.352 -70.752 -71.161 -71.576 -71.988 -72.27 -72.563 -73.011 -73.314 -73.61 -73.761 -74.079 -74.404 -74.736 -74.905 -75.181 -75.432 -75.623 -75.814 -76.204 -76.413 -76.627 -76.869 -77.134 -77.433 -77.841 -79.355 -2 ,5994 ,TETRA ,17557531,Fri Nov 26 10:25:46 CET,Fri Nov 26 12:15:52 CET,0.0 1.814 2.221 2.51 2.701 2.87 3.023 3.151 3.365 3.442 3.501 3.595 3.661 3.705 3.779 3.833 3.871 3.886 3.913 3.928 3.927 3.919 3.907 3.878 3.842 3.796 3.747 3.701 3.62 3.512 3.383 3.209 3.021 2.836 2.619 2.334 2.022 1.644 1.207 0.697 0.11 -0.599 -1.521 -2.533 -3.827 -5.443 -7.511 -10.169 -13.811 -18.855 -26.307 -34.138 -39.953 -44.508 -48.185 -51.288 -53.825 -56.016 -57.842 -59.591 -61.025 -62.255 -63.404 -64.432 -65.353 -66.175 -67.034 -67.789 -68.414 -69.051 -69.69 -70.223 -70.774 -71.328 -71.744 -72.159 -72.57 -72.988 -73.431 -73.73 -74.023 -74.466 -74.782 -75.116 -75.28 -75.618 -75.96 -76.296 -76.465 -76.745 -77.007 -77.195 -77.388 -77.789 -78.004 -78.232 -78.482 -78.758 -79.041 -79.416 -80.959 -3 ,22637 ,TETRA ,17557532,Fri Nov 26 10:25:45 CET,Fri Nov 26 12:14:29 CET,0.0 2.719 3.172 3.48 3.695 3.873 4.014 4.141 4.348 4.423 4.487 4.585 4.651 4.693 4.758 4.806 4.851 4.874 4.902 4.914 4.916 4.919 4.916 4.901 4.888 4.856 4.804 4.751 4.665 4.57 4.467 4.323 4.157 3.966 3.732 3.45 3.156 2.798 2.354 1.824 1.227 0.512 -0.393 -1.396 -2.681 -4.286 -6.379 -9.042 -12.611 -17.576 -25.092 -33.092 -38.971 -43.574 -47.283 -50.338 -52.832 -54.998 -56.795 -58.51 -59.939 -61.178 -62.351 -63.428 -64.371 -65.195 -66.046 -66.809 -67.442 -68.077 -68.727 -69.254 -69.784 -70.334 -70.768 -71.2 -71.62 -72.052 -72.509 -72.817 -73.111 -73.571 -73.895 -74.22 -74.388 -74.732 -75.09 -75.473 -75.671 -75.967 -76.267 -76.478 -76.691 -77.159 -77.396 -77.64 -77.929 -78.283 -78.659 -79.158 -81.036 -4 ,14014 ,TETRA ,17557533,Fri Nov 26 10:25:45 CET,Fri Nov 26 12:06:51 CET,0.0 2.218 2.613 2.882 3.098 3.274 3.408 3.53 3.726 3.799 3.866 3.962 4.021 4.061 4.121 4.178 4.226 4.236 4.246 4.258 4.27 4.27 4.266 4.251 4.218 4.167 4.116 4.059 3.959 3.851 3.739 3.588 3.424 3.241 3.004 2.709 2.394 2.006 1.549 1.049 0.494 -0.2 -1.118 -2.129 -3.408 -4.991 -7.067 -9.757 -13.368 -18.388 -25.931 -33.934 -39.858 -44.474 -48.152 -51.219 -53.733 -55.912 -57.745 -59.49 -60.906 -62.126 -63.261 -64.292 -65.218 -66.045 -66.875 -67.597 -68.231 -68.857 -69.472 -69.986 -70.501 -71.01 -71.41 -71.814 -72.215 -72.624 -73.037 -73.319 -73.617 -74.081 -74.391 -74.699 -74.853 -75.168 -75.495 -75.829 -75.994 -76.266 -76.533 -76.729 -76.926 -77.339 -77.557 -77.79 -78.039 -78.31 -78.619 -78.957 -80.071 -5 ,27977 ,TETRA ,17557534,Fri Nov 26 10:25:45 CET,Fri Nov 26 12:03:00 CET,0.0 3.308 3.738 4.014 4.242 4.442 4.588 4.706 4.906 4.993 5.058 5.143 5.203 5.247 5.323 5.368 5.4 5.414 5.44 5.457 5.459 5.454 5.446 5.428 5.4 5.363 5.316 5.251 5.153 5.056 4.946 4.792 4.639 4.468 4.238 3.954 3.659 3.29 2.843 2.326 1.742 1.017 0.057 -1.02 -2.391 -4.071 -6.254 -8.981 -12.588 -17.66 -25.223 -33.201 -39.062 -43.585 -47.212 -50.27 -52.764 -54.917 -56.713 -58.403 -59.797 -61.018 -62.135 -63.14 -64.068 -64.899 -65.723 -66.45 -67.075 -67.712 -68.365 -68.879 -69.386 -69.91 -70.314 -70.722 -71.131 -71.541 -71.971 -72.266 -72.561 -73.011 -73.314 -73.626 -73.784 -74.103 -74.425 -74.746 -74.918 -75.2 -75.445 -75.632 -75.83 -76.236 -76.461 -76.692 -76.927 -77.185 -77.494 -77.874 -79.587 -6 ,14182 ,TETRA ,17557535,Fri Nov 26 10:25:48 CET,Fri Nov 26 12:16:11 CET,0.0 2.269 2.678 2.98 3.206 3.371 3.511 3.622 3.799 3.871 3.93 4.018 4.081 4.125 4.204 4.26 4.293 4.305 4.323 4.335 4.343 4.348 4.348 4.332 4.293 4.243 4.193 4.137 4.038 3.93 3.819 3.656 3.489 3.306 3.07 2.778 2.464 2.093 1.662 1.166 0.586 -0.141 -1.063 -2.076 -3.394 -5.017 -7.103 -9.791 -13.423 -18.475 -25.979 -33.934 -39.817 -44.389 -48.093 -51.181 -53.699 -55.868 -57.649 -59.356 -60.778 -61.99 -63.096 -64.107 -65.013 -65.829 -66.673 -67.408 -68.02 -68.634 -69.245 -69.743 -70.258 -70.772 -71.168 -71.569 -71.974 -72.393 -72.817 -73.1 -73.386 -73.832 -74.14 -74.444 -74.601 -74.93 -75.273 -75.608 -75.773 -76.049 -76.306 -76.493 -76.689 -77.12 -77.336 -77.551 -77.78 -78.011 -78.304 -78.725 -80.274 -7 ,13254 ,TETRA ,17557536,Fri Nov 26 10:25:49 CET,Fri Nov 26 12:15:44 CET,0.0 2.009 2.495 2.782 2.958 3.106 3.231 3.348 3.511 3.578 3.647 3.74 3.806 3.843 3.903 3.957 3.998 4.018 4.041 4.057 4.075 4.082 4.083 4.061 4.03 3.987 3.932 3.857 3.747 3.641 3.523 3.367 3.193 2.999 2.753 2.466 2.162 1.794 1.375 0.88 0.29 -0.454 -1.396 -2.441 -3.773 -5.428 -7.573 -10.294 -13.973 -19.078 -26.592 -34.469 -40.32 -44.86 -48.466 -51.513 -54.066 -56.268 -58.065 -59.79 -61.193 -62.399 -63.522 -64.543 -65.457 -66.276 -67.128 -67.855 -68.477 -69.131 -69.77 -70.264 -70.778 -71.311 -71.711 -72.111 -72.523 -72.938 -73.366 -73.67 -73.968 -74.407 -74.705 -75.009 -75.165 -75.48 -75.812 -76.154 -76.324 -76.603 -76.845 -77.019 -77.195 -77.585 -77.793 -78.007 -78.226 -78.475 -78.756 -79.09 -79.936 -8 ,12678 ,TETRA ,17557537,Fri Nov 26 10:25:45 CET,Fri Nov 26 12:16:10 CET,0.0 2.133 2.531 2.783 2.998 3.182 3.323 3.455 3.658 3.737 3.805 3.9 3.959 4.002 4.083 4.142 4.173 4.187 4.206 4.206 4.204 4.198 4.184 4.156 4.122 4.083 4.027 3.949 3.835 3.719 3.589 3.414 3.226 3.043 2.81 2.518 2.22 1.851 1.412 0.896 0.298 -0.402 -1.292 -2.306 -3.631 -5.269 -7.359 -10.036 -13.657 -18.661 -26.1 -33.938 -39.734 -44.306 -47.978 -51.021 -53.534 -55.697 -57.522 -59.284 -60.717 -61.949 -63.075 -64.095 -65.021 -65.855 -66.691 -67.408 -68.025 -68.649 -69.277 -69.792 -70.307 -70.819 -71.222 -71.629 -72.03 -72.447 -72.873 -73.153 -73.438 -73.887 -74.189 -74.491 -74.645 -74.951 -75.254 -75.573 -75.737 -76.012 -76.266 -76.459 -76.669 -77.087 -77.296 -77.508 -77.746 -78.01 -78.285 -78.668 -80.186 -9 ,17059 ,TETRA ,17557538,Fri Nov 26 10:25:45 CET,Fri Nov 26 12:16:24 CET,0.0 1.849 2.283 2.576 2.78 2.954 3.12 3.261 3.469 3.55 3.623 3.737 3.815 3.875 3.974 4.062 4.133 4.163 4.222 4.253 4.292 4.318 4.331 4.34 4.351 4.346 4.318 4.269 4.176 4.073 3.955 3.803 3.633 3.441 3.199 2.899 2.578 2.194 1.752 1.25 0.689 -0.006 -0.93 -1.962 -3.291 -4.915 -6.991 -9.646 -13.223 -18.211 -25.66 -33.623 -39.515 -44.089 -47.756 -50.879 -53.46 -55.654 -57.473 -59.214 -60.657 -61.91 -63.05 -64.101 -65.055 -65.894 -66.754 -67.493 -68.116 -68.743 -69.361 -69.865 -70.377 -70.888 -71.295 -71.729 -72.176 -72.633 -73.098 -73.406 -73.719 -74.209 -74.537 -74.861 -75.027 -75.361 -75.709 -76.067 -76.249 -76.548 -76.843 -77.038 -77.239 -77.679 -77.907 -78.141 -78.38 -78.626 -78.943 -79.318 -81.227 -10 ,22147 ,TETRA ,17557539,Fri Nov 26 10:25:45 CET,Fri Nov 26 12:16:17 CET,0.0 2.165 2.586 2.885 3.058 3.203 3.326 3.453 3.683 3.757 3.818 3.914 3.973 4.005 4.058 4.117 4.158 4.171 4.191 4.205 4.21 4.208 4.2 4.181 4.151 4.105 4.048 3.986 3.9 3.8 3.688 3.531 3.362 3.182 2.957 2.675 2.372 2.004 1.56 1.049 0.471 -0.241 -1.157 -2.191 -3.529 -5.185 -7.324 -10.039 -13.685 -18.748 -26.294 -34.245 -40.143 -44.677 -48.276 -51.345 -53.878 -56.027 -57.808 -59.546 -60.977 -62.168 -63.266 -64.289 -65.21 -66.027 -66.848 -67.552 -68.154 -68.784 -69.419 -69.919 -70.43 -70.961 -71.372 -71.792 -72.207 -72.63 -73.053 -73.338 -73.634 -74.091 -74.407 -74.721 -74.877 -75.203 -75.531 -75.883 -76.065 -76.342 -76.6 -76.786 -76.972 -77.37 -77.58 -77.789 -78.035 -78.319 -78.634 -78.997 -80.438 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt deleted file mode 100644 index 949465f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15399 ,TETRA ,17557540,Fri Nov 26 10:25:47 CET,Fri Nov 26 12:16:14 CET,0.0 0.591 0.849 1.032 1.156 1.235 1.286 1.33 1.421 1.465 1.511 1.577 1.628 1.656 1.698 1.745 1.791 1.805 1.833 1.862 1.891 1.912 1.936 1.958 1.966 1.962 1.955 1.951 1.948 1.945 1.933 1.91 1.876 1.826 1.757 1.686 1.619 1.524 1.399 1.252 1.076 0.844 0.55 0.229 -0.212 -0.769 -1.517 -2.556 -4.032 -6.147 -9.391 -12.953 -15.736 -17.962 -19.793 -21.39 -22.687 -23.8 -24.741 -25.664 -26.446 -27.102 -27.707 -28.276 -28.793 -29.256 -29.736 -30.153 -30.508 -30.867 -31.224 -31.525 -31.837 -32.157 -32.409 -32.668 -32.924 -33.19 -33.473 -33.66 -33.847 -34.132 -34.33 -34.534 -34.632 -34.825 -35.03 -35.252 -35.36 -35.517 -35.681 -35.789 -35.9 -36.167 -36.309 -36.456 -36.611 -36.771 -36.977 -37.262 -37.964 -2 ,1272 ,TETRA ,17557541,Fri Nov 26 10:25:45 CET,Fri Nov 26 12:16:49 CET,0.0 0.451 0.575 0.659 0.742 0.835 0.914 0.98 1.098 1.155 1.206 1.285 1.354 1.409 1.49 1.543 1.593 1.624 1.679 1.716 1.754 1.781 1.813 1.849 1.876 1.909 1.935 1.945 1.94 1.932 1.94 1.941 1.918 1.893 1.862 1.819 1.762 1.665 1.545 1.41 1.255 1.039 0.742 0.415 -0.026 -0.599 -1.375 -2.407 -3.827 -5.9 -9.119 -12.624 -15.364 -17.58 -19.415 -20.989 -22.3 -23.438 -24.388 -25.328 -26.107 -26.766 -27.37 -27.93 -28.447 -28.917 -29.396 -29.821 -30.189 -30.564 -30.945 -31.248 -31.555 -31.869 -32.11 -32.357 -32.604 -32.857 -33.115 -33.289 -33.466 -33.744 -33.928 -34.103 -34.194 -34.388 -34.594 -34.805 -34.908 -35.057 -35.224 -35.342 -35.461 -35.724 -35.869 -36.013 -36.174 -36.354 -36.528 -36.717 -37.161 -3 ,23425 ,TETRA ,17557542,Fri Nov 26 10:26:44 CET,Fri Nov 26 12:11:50 CET,0.0 0.537 0.803 0.981 1.103 1.21 1.313 1.398 1.557 1.622 1.678 1.775 1.841 1.885 1.968 2.043 2.099 2.12 2.163 2.205 2.253 2.282 2.312 2.353 2.385 2.415 2.439 2.457 2.482 2.495 2.485 2.473 2.468 2.444 2.398 2.349 2.294 2.209 2.101 1.969 1.821 1.625 1.333 1.008 0.592 0.032 -0.75 -1.779 -3.206 -5.3 -8.538 -12.03 -14.77 -17.015 -18.842 -20.39 -21.69 -22.811 -23.731 -24.628 -25.394 -26.059 -26.669 -27.236 -27.756 -28.215 -28.69 -29.112 -29.48 -29.845 -30.211 -30.519 -30.839 -31.164 -31.402 -31.648 -31.901 -32.174 -32.451 -32.634 -32.824 -33.125 -33.332 -33.542 -33.653 -33.875 -34.097 -34.318 -34.43 -34.598 -34.805 -34.94 -35.081 -35.4 -35.57 -35.74 -35.936 -36.137 -36.354 -36.647 -37.402 -4 ,13868 ,TETRA ,17557543,Fri Nov 26 10:26:43 CET,Fri Nov 26 12:18:04 CET,0.0 0.884 1.156 1.317 1.453 1.572 1.666 1.74 1.867 1.926 1.978 2.063 2.121 2.163 2.246 2.299 2.351 2.377 2.418 2.462 2.527 2.56 2.597 2.643 2.675 2.703 2.727 2.748 2.763 2.768 2.774 2.764 2.743 2.719 2.686 2.641 2.573 2.492 2.396 2.257 2.085 1.878 1.597 1.262 0.814 0.237 -0.542 -1.568 -2.974 -5.048 -8.267 -11.794 -14.559 -16.833 -18.681 -20.247 -21.569 -22.727 -23.688 -24.619 -25.392 -26.057 -26.679 -27.244 -27.754 -28.212 -28.686 -29.114 -29.485 -29.866 -30.246 -30.552 -30.867 -31.185 -31.422 -31.673 -31.936 -32.194 -32.459 -32.637 -32.818 -33.11 -33.311 -33.508 -33.615 -33.84 -34.074 -34.317 -34.44 -34.615 -34.821 -34.957 -35.093 -35.367 -35.517 -35.695 -35.904 -36.118 -36.356 -36.664 -37.305 -5 ,3572 ,TETRA ,17557544,Fri Nov 26 10:26:43 CET,Fri Nov 26 12:17:01 CET,0.0 0.533 0.77 0.949 1.086 1.188 1.275 1.345 1.482 1.544 1.593 1.666 1.726 1.767 1.839 1.913 1.973 2.001 2.061 2.112 2.168 2.198 2.23 2.266 2.287 2.313 2.334 2.342 2.352 2.359 2.347 2.331 2.316 2.285 2.254 2.212 2.154 2.075 1.967 1.834 1.68 1.466 1.171 0.852 0.432 -0.123 -0.875 -1.896 -3.336 -5.377 -8.542 -12.055 -14.81 -17.067 -18.935 -20.533 -21.844 -22.956 -23.889 -24.806 -25.567 -26.235 -26.873 -27.459 -27.993 -28.471 -28.955 -29.38 -29.735 -30.101 -30.48 -30.792 -31.105 -31.418 -31.665 -31.921 -32.178 -32.43 -32.687 -32.874 -33.06 -33.34 -33.544 -33.745 -33.845 -34.062 -34.291 -34.54 -34.664 -34.831 -35.04 -35.169 -35.31 -35.633 -35.798 -35.956 -36.125 -36.317 -36.527 -36.824 -37.447 -6 ,9437 ,TETRA ,17557545,Fri Nov 26 10:26:43 CET,Fri Nov 26 12:02:26 CET,0.0 0.422 0.53 0.62 0.703 0.787 0.853 0.916 1.018 1.056 1.096 1.16 1.207 1.229 1.265 1.297 1.33 1.345 1.36 1.379 1.417 1.438 1.451 1.46 1.474 1.478 1.472 1.467 1.453 1.429 1.405 1.395 1.374 1.33 1.277 1.216 1.155 1.069 0.958 0.833 0.667 0.443 0.157 -0.17 -0.6 -1.148 -1.9 -2.945 -4.427 -6.53 -9.766 -13.299 -16.013 -18.234 -20.054 -21.614 -22.922 -24.042 -24.971 -25.872 -26.63 -27.291 -27.897 -28.456 -28.978 -29.435 -29.904 -30.32 -30.674 -31.044 -31.427 -31.743 -32.05 -32.347 -32.582 -32.824 -33.07 -33.321 -33.589 -33.777 -33.958 -34.241 -34.445 -34.656 -34.762 -34.973 -35.185 -35.406 -35.516 -35.675 -35.875 -36.013 -36.158 -36.467 -36.633 -36.807 -36.988 -37.172 -37.398 -37.696 -38.576 -7 ,13322 ,TETRA ,17557546,Fri Nov 26 10:26:44 CET,Fri Nov 26 12:06:55 CET,0.0 0.873 1.12 1.284 1.397 1.496 1.601 1.688 1.837 1.893 1.937 2.026 2.099 2.145 2.214 2.271 2.314 2.333 2.375 2.408 2.448 2.473 2.499 2.531 2.554 2.577 2.589 2.595 2.6 2.602 2.598 2.59 2.584 2.567 2.533 2.482 2.422 2.346 2.236 2.098 1.928 1.684 1.37 1.029 0.566 -0.035 -0.802 -1.788 -3.196 -5.306 -8.622 -12.224 -14.979 -17.196 -19.001 -20.551 -21.863 -23.01 -23.952 -24.852 -25.609 -26.279 -26.923 -27.511 -28.039 -28.51 -28.993 -29.417 -29.779 -30.156 -30.536 -30.836 -31.139 -31.46 -31.713 -31.973 -32.228 -32.485 -32.757 -32.936 -33.12 -33.397 -33.577 -33.771 -33.879 -34.102 -34.325 -34.552 -34.668 -34.84 -35.056 -35.199 -35.345 -35.661 -35.835 -36.016 -36.209 -36.424 -36.678 -37.024 -37.857 -8 ,8888 ,TETRA ,17557547,Fri Nov 26 10:27:45 CET,Fri Nov 26 12:14:09 CET,0.0 0.724 0.938 1.104 1.213 1.3 1.38 1.452 1.585 1.639 1.698 1.808 1.865 1.903 1.986 2.067 2.134 2.158 2.201 2.245 2.308 2.344 2.377 2.417 2.449 2.477 2.485 2.492 2.502 2.505 2.507 2.505 2.488 2.464 2.415 2.341 2.267 2.171 2.062 1.937 1.785 1.572 1.279 0.95 0.502 -0.089 -0.846 -1.866 -3.336 -5.435 -8.714 -12.341 -15.089 -17.326 -19.16 -20.7 -22.003 -23.136 -24.081 -25.003 -25.76 -26.393 -26.977 -27.518 -28.03 -28.488 -28.932 -29.321 -29.647 -29.983 -30.349 -30.652 -30.943 -31.235 -31.457 -31.68 -31.92 -32.164 -32.414 -32.581 -32.747 -33.014 -33.195 -33.379 -33.472 -33.662 -33.861 -34.066 -34.173 -34.336 -34.513 -34.62 -34.737 -35.003 -35.143 -35.295 -35.454 -35.628 -35.813 -36.036 -36.548 -9 ,24101 ,TETRA ,17557548,Fri Nov 26 10:26:44 CET,Fri Nov 26 12:16:22 CET,0.0 0.585 0.81 0.968 1.101 1.202 1.281 1.34 1.449 1.499 1.548 1.638 1.696 1.742 1.834 1.899 1.96 1.983 2.014 2.052 2.104 2.137 2.173 2.221 2.257 2.275 2.284 2.299 2.315 2.314 2.301 2.286 2.271 2.234 2.189 2.14 2.09 2.018 1.907 1.772 1.607 1.404 1.133 0.814 0.357 -0.237 -1.019 -2.045 -3.479 -5.535 -8.655 -12.171 -14.942 -17.177 -19.027 -20.598 -21.872 -22.984 -23.94 -24.868 -25.638 -26.316 -26.944 -27.518 -28.035 -28.494 -28.961 -29.375 -29.73 -30.091 -30.459 -30.756 -31.062 -31.378 -31.627 -31.893 -32.164 -32.441 -32.725 -32.91 -33.098 -33.402 -33.617 -33.824 -33.928 -34.148 -34.373 -34.617 -34.736 -34.906 -35.128 -35.266 -35.416 -35.732 -35.887 -36.039 -36.202 -36.402 -36.669 -37.003 -37.619 -10 ,11259 ,TETRA ,17557549,Fri Nov 26 10:27:44 CET,Fri Nov 26 12:15:26 CET,0.0 0.444 0.714 0.919 1.048 1.137 1.22 1.293 1.437 1.507 1.564 1.646 1.707 1.744 1.815 1.882 1.936 1.964 2.017 2.061 2.112 2.145 2.179 2.219 2.241 2.261 2.286 2.299 2.312 2.317 2.309 2.296 2.289 2.274 2.238 2.187 2.113 2.02 1.905 1.759 1.595 1.385 1.103 0.782 0.35 -0.226 -1.021 -2.061 -3.51 -5.606 -8.838 -12.47 -15.263 -17.494 -19.334 -20.898 -22.2 -23.335 -24.276 -25.173 -25.929 -26.587 -27.206 -27.793 -28.331 -28.799 -29.285 -29.714 -30.071 -30.434 -30.799 -31.098 -31.401 -31.721 -31.966 -32.211 -32.472 -32.75 -33.029 -33.21 -33.395 -33.685 -33.881 -34.079 -34.182 -34.398 -34.618 -34.856 -34.981 -35.157 -35.361 -35.485 -35.63 -35.936 -36.103 -36.283 -36.474 -36.69 -36.904 -37.163 -37.681 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt deleted file mode 100644 index 70a7feab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12441 ,TETRA ,17557550,Fri Nov 26 10:27:44 CET,Fri Nov 26 12:17:58 CET,0.0 0.474 0.693 0.843 0.992 1.141 1.248 1.328 1.479 1.554 1.632 1.742 1.817 1.883 2.005 2.115 2.211 2.253 2.332 2.399 2.496 2.57 2.64 2.737 2.822 2.892 2.964 3.018 3.07 3.132 3.198 3.276 3.343 3.4 3.46 3.513 3.56 3.597 3.617 3.639 3.654 3.64 3.572 3.492 3.375 3.161 2.825 2.331 1.559 0.32 -1.719 -4.103 -6.033 -7.638 -8.961 -10.12 -11.093 -11.927 -12.633 -13.341 -13.946 -14.467 -14.942 -15.391 -15.8 -16.154 -16.523 -16.862 -17.153 -17.452 -17.758 -18.005 -18.256 -18.518 -18.712 -18.914 -19.128 -19.345 -19.567 -19.707 -19.839 -20.047 -20.188 -20.331 -20.405 -20.554 -20.714 -20.889 -20.98 -21.116 -21.264 -21.357 -21.455 -21.661 -21.77 -21.869 -21.972 -22.12 -22.282 -22.431 -22.726 -2 ,2491 ,TETRA ,17557551,Fri Nov 26 10:27:46 CET,Fri Nov 26 12:18:10 CET,0.0 0.41 0.566 0.682 0.787 0.882 0.958 1.021 1.14 1.19 1.234 1.306 1.373 1.417 1.496 1.576 1.644 1.672 1.727 1.788 1.871 1.916 1.953 2.001 2.046 2.09 2.128 2.175 2.234 2.284 2.331 2.374 2.414 2.452 2.481 2.502 2.516 2.543 2.585 2.607 2.605 2.585 2.541 2.469 2.331 2.107 1.758 1.257 0.49 -0.741 -2.802 -5.188 -7.117 -8.728 -10.052 -11.2 -12.163 -12.998 -13.716 -14.421 -15.015 -15.54 -16.033 -16.498 -16.942 -17.333 -17.705 -18.041 -18.339 -18.636 -18.938 -19.187 -19.445 -19.709 -19.91 -20.119 -20.335 -20.548 -20.759 -20.905 -21.058 -21.298 -21.468 -21.642 -21.729 -21.906 -22.083 -22.274 -22.378 -22.521 -22.675 -22.766 -22.854 -23.048 -23.152 -23.268 -23.397 -23.523 -23.651 -23.817 -24.209 -3 ,12242 ,TETRA ,17557552,Fri Nov 26 10:27:46 CET,Fri Nov 26 12:14:47 CET,0.0 0.395 0.528 0.612 0.695 0.767 0.84 0.91 1.045 1.105 1.158 1.229 1.282 1.321 1.402 1.471 1.535 1.568 1.636 1.696 1.768 1.82 1.872 1.933 1.983 2.024 2.071 2.117 2.166 2.204 2.244 2.295 2.337 2.374 2.413 2.446 2.482 2.515 2.524 2.529 2.519 2.489 2.445 2.374 2.227 1.988 1.628 1.124 0.406 -0.734 -2.784 -5.234 -7.208 -8.806 -10.113 -11.247 -12.199 -13.028 -13.762 -14.494 -15.101 -15.601 -16.051 -16.481 -16.864 -17.206 -17.569 -17.873 -18.133 -18.402 -18.673 -18.891 -19.109 -19.341 -19.523 -19.713 -19.903 -20.098 -20.289 -20.413 -20.541 -20.741 -20.889 -21.049 -21.126 -21.276 -21.428 -21.587 -21.669 -21.798 -21.942 -22.027 -22.11 -22.305 -22.414 -22.524 -22.646 -22.781 -22.946 -23.133 -23.666 -4 ,32490 ,TETRA ,17557553,Fri Nov 26 10:27:46 CET,Fri Nov 26 12:22:16 CET,0.0 0.229 0.357 0.458 0.54 0.615 0.688 0.757 0.889 0.944 1.0 1.086 1.149 1.19 1.257 1.327 1.393 1.421 1.475 1.531 1.611 1.66 1.704 1.77 1.833 1.9 1.969 2.027 2.099 2.165 2.231 2.306 2.365 2.415 2.472 2.54 2.593 2.633 2.657 2.663 2.651 2.611 2.527 2.407 2.236 1.973 1.57 0.999 0.141 -1.13 -3.207 -5.669 -7.632 -9.219 -10.539 -11.637 -12.557 -13.379 -14.063 -14.738 -15.295 -15.769 -16.231 -16.665 -17.037 -17.361 -17.692 -17.989 -18.248 -18.509 -18.788 -19.023 -19.251 -19.48 -19.654 -19.831 -20.019 -20.213 -20.407 -20.536 -20.67 -20.878 -21.021 -21.178 -21.261 -21.415 -21.57 -21.738 -21.823 -21.952 -22.107 -22.205 -22.298 -22.486 -22.591 -22.709 -22.836 -22.964 -23.106 -23.275 -23.561 -5 ,8588 ,TETRA ,17557554,Fri Nov 26 10:27:46 CET,Fri Nov 26 12:18:25 CET,0.0 0.436 0.547 0.643 0.74 0.823 0.892 0.949 1.067 1.126 1.182 1.259 1.326 1.369 1.441 1.504 1.562 1.591 1.664 1.737 1.812 1.856 1.9 1.961 2.018 2.074 2.133 2.188 2.25 2.321 2.392 2.452 2.505 2.555 2.61 2.661 2.69 2.71 2.727 2.72 2.698 2.664 2.61 2.52 2.324 2.073 1.73 1.198 0.423 -0.803 -2.896 -5.284 -7.221 -8.824 -10.127 -11.237 -12.158 -12.978 -13.683 -14.352 -14.907 -15.398 -15.841 -16.251 -16.638 -16.983 -17.343 -17.657 -17.923 -18.203 -18.486 -18.714 -18.948 -19.183 -19.365 -19.552 -19.737 -19.928 -20.124 -20.263 -20.407 -20.635 -20.789 -20.937 -21.01 -21.149 -21.306 -21.478 -21.563 -21.689 -21.825 -21.921 -22.015 -22.195 -22.292 -22.396 -22.514 -22.647 -22.793 -22.943 -23.361 -6 ,29540 ,TETRA ,17557555,Fri Nov 26 10:28:46 CET,Fri Nov 26 12:16:27 CET,0.0 0.298 0.423 0.523 0.597 0.668 0.746 0.818 0.952 1.008 1.054 1.127 1.187 1.225 1.292 1.358 1.43 1.463 1.514 1.565 1.651 1.7 1.74 1.797 1.853 1.915 1.978 2.025 2.072 2.128 2.188 2.256 2.307 2.354 2.407 2.453 2.503 2.543 2.569 2.582 2.581 2.553 2.466 2.355 2.194 1.958 1.611 1.132 0.422 -0.749 -2.786 -5.198 -7.1 -8.634 -9.932 -11.072 -12.05 -12.929 -13.665 -14.369 -14.953 -15.44 -15.907 -16.366 -16.779 -17.146 -17.52 -17.851 -18.14 -18.432 -18.728 -18.97 -19.211 -19.457 -19.641 -19.82 -19.998 -20.183 -20.371 -20.508 -20.657 -20.883 -21.037 -21.184 -21.258 -21.408 -21.548 -21.691 -21.769 -21.891 -22.034 -22.132 -22.236 -22.446 -22.548 -22.66 -22.797 -22.94 -23.076 -23.242 -23.429 -7 ,24635 ,TETRA ,17557556,Fri Nov 26 10:28:46 CET,Fri Nov 26 12:22:22 CET,0.0 0.313 0.48 0.617 0.721 0.815 0.886 0.941 1.062 1.115 1.163 1.249 1.309 1.349 1.42 1.482 1.539 1.566 1.633 1.695 1.769 1.815 1.854 1.908 1.963 2.011 2.054 2.098 2.156 2.222 2.285 2.34 2.397 2.44 2.482 2.536 2.583 2.625 2.656 2.668 2.667 2.643 2.581 2.491 2.327 2.077 1.708 1.203 0.46 -0.755 -2.842 -5.279 -7.222 -8.828 -10.166 -11.301 -12.265 -13.118 -13.852 -14.574 -15.168 -15.686 -16.164 -16.597 -16.997 -17.376 -17.78 -18.136 -18.437 -18.738 -19.033 -19.272 -19.517 -19.766 -19.947 -20.132 -20.327 -20.534 -20.746 -20.884 -21.019 -21.227 -21.365 -21.504 -21.576 -21.736 -21.897 -22.054 -22.136 -22.257 -22.389 -22.475 -22.563 -22.77 -22.879 -22.987 -23.106 -23.229 -23.377 -23.572 -23.884 -8 ,31995 ,TETRA ,17557557,Fri Nov 26 10:29:42 CET,Fri Nov 26 12:19:23 CET,0.0 0.409 0.613 0.699 0.786 0.887 0.986 1.058 1.187 1.245 1.299 1.383 1.442 1.484 1.56 1.634 1.694 1.719 1.777 1.837 1.926 1.987 2.035 2.091 2.138 2.184 2.231 2.277 2.333 2.382 2.434 2.486 2.521 2.546 2.566 2.573 2.586 2.601 2.602 2.594 2.563 2.495 2.389 2.282 2.135 1.915 1.579 1.113 0.34 -0.933 -2.941 -5.359 -7.303 -8.885 -10.239 -11.432 -12.431 -13.311 -14.064 -14.81 -15.424 -15.934 -16.427 -16.885 -17.288 -17.651 -18.034 -18.37 -18.656 -18.955 -19.267 -19.512 -19.751 -20.015 -20.208 -20.385 -20.569 -20.762 -20.964 -21.095 -21.229 -21.45 -21.603 -21.753 -21.826 -21.984 -22.155 -22.329 -22.412 -22.533 -22.671 -22.764 -22.864 -23.074 -23.18 -23.285 -23.391 -23.514 -23.656 -23.837 -24.274 -9 ,4318 ,TETRA ,17557558,Fri Nov 26 10:29:44 CET,Fri Nov 26 12:11:39 CET,0.0 0.192 0.352 0.458 0.551 0.645 0.729 0.807 0.931 0.986 1.041 1.12 1.182 1.226 1.303 1.38 1.453 1.483 1.533 1.581 1.66 1.714 1.768 1.845 1.919 1.998 2.068 2.134 2.221 2.29 2.348 2.418 2.481 2.545 2.626 2.685 2.737 2.795 2.822 2.827 2.816 2.807 2.766 2.664 2.503 2.294 2.012 1.526 0.724 -0.472 -2.513 -4.964 -6.952 -8.593 -9.914 -11.078 -12.073 -12.946 -13.682 -14.386 -14.967 -15.485 -15.998 -16.466 -16.876 -17.248 -17.64 -17.974 -18.249 -18.532 -18.831 -19.083 -19.346 -19.61 -19.808 -20.013 -20.225 -20.425 -20.622 -20.756 -20.89 -21.101 -21.248 -21.398 -21.474 -21.645 -21.82 -21.987 -22.076 -22.209 -22.36 -22.46 -22.557 -22.754 -22.864 -22.978 -23.085 -23.208 -23.378 -23.602 -24.018 -10 ,19478 ,TETRA ,17557559,Fri Nov 26 10:29:44 CET,Fri Nov 26 12:15:11 CET,0.0 0.317 0.47 0.59 0.674 0.75 0.825 0.893 1.005 1.056 1.104 1.186 1.246 1.281 1.358 1.429 1.492 1.526 1.589 1.641 1.711 1.755 1.799 1.875 1.944 1.997 2.043 2.08 2.121 2.163 2.201 2.233 2.264 2.29 2.315 2.347 2.367 2.364 2.36 2.366 2.367 2.349 2.312 2.244 2.089 1.866 1.531 1.02 0.256 -0.96 -3.068 -5.551 -7.471 -9.057 -10.379 -11.511 -12.497 -13.34 -14.047 -14.75 -15.319 -15.811 -16.269 -16.692 -17.071 -17.402 -17.752 -18.064 -18.327 -18.593 -18.858 -19.074 -19.307 -19.553 -19.73 -19.914 -20.105 -20.299 -20.5 -20.636 -20.773 -20.982 -21.119 -21.262 -21.338 -21.488 -21.641 -21.796 -21.874 -21.997 -22.132 -22.222 -22.31 -22.497 -22.601 -22.725 -22.848 -22.98 -23.13 -23.326 -23.891 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index 0727cf4a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21005 ,TETRA ,17557560,Fri Nov 26 10:29:44 CET,Fri Nov 26 12:26:49 CET,0.0 3.224 3.92 4.37 4.745 5.049 5.313 5.576 6.075 6.303 6.515 6.792 7.08 7.248 7.575 7.9 8.2 8.342 8.627 8.899 9.284 9.528 9.757 10.084 10.393 10.693 11.012 11.323 11.692 12.032 12.352 12.707 13.028 13.343 13.714 14.153 14.571 15.023 15.53 16.045 16.567 17.128 17.771 18.403 19.15 19.992 20.851 21.675 22.507 23.194 23.376 22.796 21.944 21.0 20.069 19.059 18.137 17.296 16.481 15.644 14.917 14.26 13.662 13.096 12.545 12.063 11.555 11.112 10.709 10.275 9.832 9.446 9.034 8.631 8.314 7.962 7.613 7.26 6.886 6.621 6.346 5.934 5.65 5.353 5.197 4.864 4.499 4.094 3.879 3.54 3.234 2.999 2.756 2.212 1.874 1.529 1.186 0.757 0.226 -0.56 -6.934 -2 ,28036 ,TETRA ,17557561,Fri Nov 26 10:29:44 CET,Fri Nov 26 12:21:23 CET,0.0 4.129 4.637 5.092 5.477 5.787 6.042 6.263 6.644 6.826 7.004 7.235 7.495 7.647 7.958 8.237 8.499 8.621 8.866 9.13 9.501 9.73 9.956 10.275 10.564 10.837 11.103 11.352 11.652 11.946 12.233 12.559 12.898 13.224 13.559 13.906 14.22 14.57 14.954 15.347 15.742 16.171 16.66 17.128 17.643 18.203 18.775 19.257 19.709 19.993 19.787 18.911 17.782 16.595 15.526 14.574 13.726 12.942 12.213 11.4 10.656 10.005 9.373 8.767 8.2 7.683 7.14 6.642 6.212 5.774 5.331 4.966 4.585 4.177 3.868 3.546 3.204 2.85 2.459 2.176 1.894 1.467 1.163 0.825 0.654 0.317 -0.05 -0.443 -0.651 -0.972 -1.277 -1.521 -1.757 -2.286 -2.606 -2.957 -3.345 -3.75 -4.284 -5.206 -10.399 -3 ,29480 ,TETRA ,17557562,Fri Nov 26 10:29:44 CET,Fri Nov 26 12:25:51 CET,0.0 2.544 3.192 3.655 4.035 4.338 4.626 4.888 5.406 5.67 5.897 6.191 6.485 6.677 7.056 7.378 7.682 7.859 8.217 8.531 8.945 9.202 9.47 9.851 10.178 10.497 10.818 11.114 11.482 11.842 12.193 12.622 13.032 13.421 13.89 14.413 14.877 15.358 15.875 16.429 16.978 17.614 18.325 18.956 19.659 20.391 21.197 21.997 22.812 23.547 23.836 23.236 22.285 21.272 20.126 18.957 17.97 17.105 16.32 15.562 14.891 14.266 13.673 13.11 12.595 12.124 11.614 11.133 10.694 10.246 9.813 9.449 9.071 8.677 8.356 8.02 7.659 7.292 6.934 6.691 6.436 6.043 5.779 5.471 5.298 4.972 4.649 4.283 4.074 3.742 3.427 3.194 2.965 2.485 2.172 1.796 1.365 0.877 0.316 -0.356 -3.314 -4 ,883 ,TETRA ,17557563,Fri Nov 26 10:29:46 CET,Fri Nov 26 12:25:48 CET,0.0 2.792 3.373 3.838 4.234 4.56 4.842 5.09 5.518 5.703 5.89 6.139 6.399 6.554 6.852 7.134 7.4 7.521 7.759 7.995 8.329 8.553 8.776 9.08 9.371 9.625 9.85 10.087 10.424 10.749 11.046 11.392 11.737 12.062 12.435 12.861 13.255 13.666 14.087 14.547 15.021 15.534 16.089 16.607 17.216 17.793 18.358 18.918 19.54 20.279 20.664 20.052 19.054 17.976 16.925 15.893 14.948 14.055 13.265 12.479 11.803 11.191 10.593 9.991 9.405 8.872 8.304 7.802 7.369 6.904 6.41 6.003 5.581 5.132 4.776 4.424 4.06 3.659 3.242 2.949 2.663 2.245 1.948 1.648 1.498 1.187 0.831 0.453 0.263 -0.068 -0.384 -0.617 -0.887 -1.49 -1.838 -2.193 -2.586 -3.049 -3.646 -4.445 -15.821 -5 ,5884 ,TETRA ,17557564,Fri Nov 26 10:29:44 CET,Fri Nov 26 12:25:44 CET,0.0 3.34 3.873 4.345 4.761 5.106 5.398 5.65 6.129 6.353 6.564 6.866 7.146 7.311 7.628 7.922 8.208 8.36 8.67 8.956 9.349 9.61 9.861 10.223 10.585 10.916 11.212 11.501 11.898 12.292 12.659 13.093 13.517 13.916 14.367 14.902 15.403 15.928 16.522 17.146 17.763 18.412 19.119 19.802 20.501 21.205 22.031 22.889 23.641 24.142 24.155 23.321 22.093 20.907 19.909 18.989 18.149 17.34 16.617 15.85 15.167 14.579 14.028 13.45 12.902 12.402 11.865 11.376 10.941 10.517 10.072 9.682 9.268 8.834 8.501 8.144 7.772 7.416 7.045 6.773 6.502 6.105 5.83 5.523 5.362 5.037 4.702 4.367 4.191 3.87 3.563 3.326 3.073 2.518 2.203 1.846 1.437 1.0 0.508 -0.13 -3.128 -6 ,27584 ,TETRA ,17557565,Fri Nov 26 10:29:44 CET,Fri Nov 26 12:26:01 CET,0.0 2.997 3.545 4.007 4.387 4.704 4.988 5.28 5.843 6.08 6.302 6.648 6.987 7.204 7.586 7.972 8.33 8.482 8.759 9.009 9.354 9.595 9.835 10.19 10.54 10.864 11.161 11.452 11.826 12.181 12.525 12.948 13.359 13.741 14.197 14.725 15.211 15.732 16.285 16.897 17.532 18.178 18.922 19.672 20.541 21.449 22.379 23.317 24.192 24.926 25.274 24.697 23.708 22.6 21.516 20.442 19.38 18.355 17.457 16.548 15.742 15.018 14.322 13.735 13.215 12.698 12.163 11.691 11.273 10.859 10.424 10.053 9.676 9.285 8.966 8.595 8.223 7.876 7.497 7.221 6.946 6.494 6.166 5.836 5.669 5.34 4.976 4.575 4.368 4.029 3.701 3.479 3.245 2.7 2.383 2.037 1.671 1.219 0.661 -0.18 -6.955 -7 ,23972 ,TETRA ,17557566,Fri Nov 26 10:29:44 CET,Fri Nov 26 12:18:50 CET,0.0 3.712 4.24 4.626 4.997 5.343 5.629 5.912 6.447 6.667 6.858 7.13 7.437 7.644 8.059 8.428 8.788 8.957 9.252 9.527 9.923 10.186 10.453 10.817 11.142 11.47 11.804 12.105 12.491 12.883 13.237 13.649 14.058 14.451 14.9 15.395 15.872 16.385 16.95 17.562 18.161 18.816 19.596 20.311 21.071 21.916 22.76 23.572 24.371 25.121 25.529 25.083 24.156 23.034 21.894 20.775 19.796 18.869 18.064 17.318 16.672 16.043 15.415 14.817 14.265 13.754 13.2 12.706 12.289 11.866 11.416 11.056 10.697 10.312 10.01 9.682 9.33 8.966 8.591 8.341 8.078 7.654 7.353 7.032 6.866 6.518 6.154 5.784 5.587 5.246 4.849 4.584 4.309 3.678 3.316 2.925 2.526 2.067 1.505 0.772 -4.142 -8 ,19264 ,TETRA ,17557567,Fri Nov 26 10:29:44 CET,Fri Nov 26 12:15:30 CET,0.0 3.803 4.42 4.849 5.225 5.598 5.917 6.204 6.682 6.907 7.133 7.435 7.724 7.887 8.213 8.532 8.808 8.925 9.186 9.477 9.883 10.128 10.356 10.684 10.972 11.228 11.46 11.679 11.979 12.284 12.582 12.952 13.306 13.624 13.977 14.395 14.801 15.2 15.598 15.998 16.395 16.853 17.406 17.946 18.525 19.129 19.706 20.204 20.656 20.953 20.737 19.793 18.727 17.639 16.56 15.411 14.335 13.372 12.538 11.68 10.925 10.277 9.657 9.056 8.492 7.99 7.456 6.963 6.54 6.086 5.606 5.219 4.854 4.465 4.122 3.774 3.428 3.069 2.686 2.415 2.126 1.687 1.399 1.093 0.931 0.581 0.17 -0.28 -0.505 -0.847 -1.207 -1.483 -1.775 -2.449 -2.801 -3.165 -3.567 -4.066 -4.655 -5.402 -11.998 -9 ,25998 ,TETRA ,17557568,Fri Nov 26 10:30:44 CET,Fri Nov 26 12:27:33 CET,0.0 4.466 5.085 5.534 5.926 6.32 6.745 7.139 7.76 7.984 8.185 8.443 8.719 8.892 9.229 9.582 9.919 10.061 10.32 10.56 10.909 11.127 11.341 11.661 11.98 12.311 12.61 12.884 13.257 13.594 13.895 14.267 14.637 15.021 15.464 15.926 16.368 16.862 17.373 17.876 18.41 19.037 19.734 20.43 21.225 22.019 22.907 23.815 24.693 25.438 25.696 25.263 24.425 23.41 22.4 21.431 20.497 19.616 18.851 18.074 17.402 16.78 16.157 15.548 14.969 14.441 13.896 13.402 12.977 12.54 12.092 11.722 11.324 10.905 10.584 10.248 9.894 9.509 9.105 8.841 8.575 8.162 7.869 7.551 7.383 7.041 6.68 6.269 6.057 5.727 5.394 5.155 4.894 4.257 3.922 3.592 3.183 2.713 2.172 1.451 -4.044 -10 ,1905 ,TETRA ,17557569,Fri Nov 26 10:30:44 CET,Fri Nov 26 12:26:54 CET,0.0 2.841 3.654 4.183 4.548 4.893 5.235 5.544 6.095 6.377 6.656 6.996 7.309 7.515 7.896 8.256 8.599 8.753 9.037 9.31 9.744 10.041 10.302 10.676 11.035 11.357 11.661 11.956 12.313 12.643 12.97 13.358 13.747 14.127 14.561 15.041 15.5 15.993 16.494 17.03 17.591 18.224 19.009 19.743 20.488 21.317 22.203 23.093 23.978 24.695 24.975 24.415 23.524 22.496 21.417 20.368 19.464 18.617 17.847 17.051 16.345 15.724 15.125 14.557 14.027 13.541 13.021 12.552 12.148 11.729 11.289 10.908 10.5 10.076 9.727 9.379 9.03 8.661 8.283 8.024 7.767 7.338 7.03 6.7 6.527 6.197 5.839 5.453 5.253 4.919 4.577 4.337 4.085 3.568 3.269 2.903 2.493 2.055 1.547 0.822 -2.759 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index 0e7be3cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24450 ,TETRA ,17557570,Fri Nov 26 10:30:46 CET,Fri Nov 26 12:29:46 CET,0.0 2.369 2.864 3.221 3.48 3.728 3.969 4.195 4.608 4.784 4.956 5.199 5.475 5.645 5.972 6.262 6.528 6.658 6.912 7.166 7.509 7.723 7.927 8.196 8.458 8.723 8.979 9.228 9.531 9.821 10.13 10.499 10.848 11.189 11.591 12.034 12.457 12.967 13.535 14.098 14.663 15.301 16.06 16.85 17.799 18.836 19.967 21.224 22.711 24.424 26.38 27.889 28.699 29.104 29.231 29.211 29.14 29.041 28.938 28.773 28.565 28.363 28.16 27.97 27.794 27.608 27.385 27.159 26.956 26.756 26.524 26.323 26.137 25.945 25.776 25.612 25.461 25.291 25.107 24.959 24.796 24.556 24.384 24.191 24.083 23.87 23.656 23.426 23.306 23.092 22.925 22.79 22.638 22.273 22.067 21.857 21.592 21.263 20.904 20.465 19.059 -2 ,16667 ,TETRA ,17557571,Fri Nov 26 10:30:43 CET,Fri Nov 26 12:21:33 CET,0.0 1.598 2.084 2.472 2.799 3.095 3.344 3.558 3.954 4.131 4.29 4.472 4.727 4.885 5.204 5.486 5.744 5.875 6.123 6.361 6.704 6.917 7.127 7.442 7.739 8.013 8.275 8.541 8.875 9.181 9.489 9.868 10.236 10.589 10.985 11.433 11.868 12.337 12.847 13.398 13.98 14.645 15.426 16.235 17.219 18.298 19.511 20.898 22.5 24.322 26.416 27.978 28.742 29.144 29.336 29.347 29.28 29.197 29.066 28.852 28.666 28.496 28.303 28.091 27.871 27.669 27.493 27.322 27.13 26.924 26.698 26.505 26.312 26.124 25.972 25.807 25.636 25.451 25.238 25.092 24.949 24.722 24.56 24.378 24.278 24.072 23.86 23.653 23.546 23.326 23.111 22.941 22.761 22.405 22.233 22.04 21.784 21.453 21.058 20.546 18.586 -3 ,27978 ,TETRA ,17557572,Fri Nov 26 10:30:43 CET,Fri Nov 26 12:30:24 CET,0.0 1.812 2.269 2.627 2.913 3.176 3.423 3.637 4.006 4.188 4.355 4.554 4.81 4.955 5.243 5.537 5.819 5.957 6.23 6.495 6.854 7.078 7.292 7.592 7.896 8.184 8.458 8.726 9.059 9.386 9.724 10.13 10.512 10.873 11.27 11.722 12.178 12.706 13.285 13.863 14.464 15.163 15.993 16.833 17.841 18.961 20.208 21.625 23.216 24.961 27.006 28.5 29.114 29.285 29.3 29.31 29.265 29.123 28.952 28.767 28.584 28.433 28.268 28.086 27.915 27.745 27.552 27.354 27.181 26.999 26.797 26.612 26.419 26.239 26.1 25.94 25.756 25.572 25.371 25.212 25.058 24.819 24.627 24.422 24.323 24.138 23.956 23.754 23.645 23.436 23.249 23.092 22.942 22.628 22.444 22.245 22.022 21.781 21.499 21.034 18.161 -4 ,18545 ,TETRA ,17557573,Fri Nov 26 10:30:44 CET,Fri Nov 26 12:27:24 CET,0.0 1.357 1.866 2.313 2.621 2.843 3.053 3.263 3.651 3.829 3.995 4.216 4.484 4.647 4.978 5.266 5.529 5.655 5.908 6.151 6.48 6.704 6.918 7.228 7.546 7.849 8.139 8.413 8.754 9.096 9.436 9.837 10.214 10.571 11.004 11.493 11.962 12.495 13.078 13.672 14.248 14.889 15.639 16.399 17.279 18.274 19.451 20.72 22.175 23.938 25.951 27.466 28.226 28.574 28.729 28.775 28.729 28.671 28.573 28.383 28.197 28.016 27.788 27.548 27.333 27.137 26.931 26.749 26.576 26.374 26.149 25.945 25.746 25.543 25.393 25.252 25.102 24.923 24.727 24.591 24.446 24.224 24.06 23.869 23.769 23.575 23.374 23.149 23.032 22.815 22.618 22.484 22.337 22.003 21.829 21.631 21.411 21.151 20.876 20.517 18.775 -5 ,31447 ,TETRA ,17557574,Fri Nov 26 10:30:43 CET,Fri Nov 26 12:27:59 CET,0.0 1.329 1.798 2.194 2.528 2.81 3.072 3.306 3.744 3.959 4.165 4.435 4.728 4.898 5.181 5.437 5.693 5.821 6.059 6.288 6.631 6.852 7.053 7.331 7.595 7.854 8.117 8.376 8.704 9.011 9.325 9.712 10.073 10.421 10.822 11.266 11.692 12.158 12.686 13.246 13.81 14.472 15.243 15.996 16.864 17.823 18.956 20.245 21.726 23.45 25.465 26.985 27.701 28.069 28.276 28.358 28.308 28.194 28.057 27.869 27.711 27.565 27.409 27.26 27.104 26.949 26.773 26.609 26.458 26.277 26.062 25.867 25.659 25.453 25.305 25.146 24.985 24.82 24.645 24.526 24.401 24.192 24.028 23.847 23.751 23.549 23.321 23.075 22.951 22.724 22.527 22.379 22.213 21.824 21.604 21.355 21.063 20.791 20.498 20.011 18.05 -6 ,18340 ,TETRA ,17557575,Fri Nov 26 10:30:45 CET,Fri Nov 26 12:27:21 CET,0.0 1.142 1.637 1.993 2.283 2.563 2.808 3.019 3.42 3.609 3.786 3.998 4.261 4.414 4.702 4.982 5.254 5.38 5.609 5.826 6.146 6.36 6.562 6.843 7.113 7.367 7.603 7.839 8.157 8.458 8.77 9.178 9.558 9.928 10.37 10.848 11.285 11.778 12.315 12.9 13.53 14.246 15.092 15.936 16.922 18.038 19.315 20.735 22.381 24.244 26.306 27.689 28.276 28.524 28.573 28.492 28.354 28.189 27.997 27.78 27.595 27.402 27.186 26.965 26.767 26.586 26.37 26.173 25.997 25.786 25.566 25.396 25.224 25.04 24.894 24.725 24.54 24.359 24.166 24.023 23.877 23.646 23.484 23.322 23.236 23.059 22.867 22.648 22.535 22.337 22.198 22.065 21.926 21.621 21.446 21.223 20.947 20.663 20.328 19.881 18.278 -7 ,1742 ,TETRA ,17557576,Fri Nov 26 10:30:44 CET,Fri Nov 26 12:27:59 CET,0.0 1.913 2.432 2.828 3.146 3.432 3.689 3.956 4.432 4.629 4.811 5.027 5.293 5.455 5.758 6.016 6.249 6.37 6.615 6.853 7.192 7.398 7.606 7.908 8.189 8.461 8.736 9.001 9.339 9.683 10.013 10.397 10.774 11.134 11.552 12.006 12.441 12.931 13.472 14.063 14.664 15.311 16.076 16.853 17.772 18.811 19.972 21.251 22.733 24.439 26.402 27.948 28.73 29.086 29.245 29.265 29.183 29.074 28.94 28.765 28.619 28.472 28.309 28.148 27.961 27.759 27.54 27.346 27.167 26.966 26.764 26.599 26.433 26.238 26.076 25.913 25.742 25.562 25.374 25.236 25.078 24.839 24.673 24.495 24.403 24.218 24.017 23.809 23.704 23.496 23.327 23.182 23.029 22.671 22.444 22.209 21.97 21.741 21.473 21.103 19.71 -8 ,23936 ,TETRA ,17557577,Fri Nov 26 10:30:44 CET,Fri Nov 26 12:28:03 CET,0.0 1.918 2.347 2.725 3.041 3.329 3.613 3.855 4.259 4.436 4.601 4.821 5.092 5.244 5.522 5.786 6.045 6.172 6.435 6.687 6.999 7.198 7.408 7.736 8.063 8.364 8.647 8.927 9.292 9.641 9.977 10.371 10.731 11.09 11.539 12.038 12.493 13.035 13.633 14.241 14.879 15.604 16.447 17.279 18.265 19.356 20.561 21.903 23.476 25.328 27.448 28.97 29.68 29.963 30.029 29.993 29.899 29.748 29.55 29.375 29.252 29.12 28.963 28.785 28.574 28.367 28.15 27.948 27.762 27.568 27.382 27.2 26.981 26.74 26.558 26.393 26.204 25.971 25.728 25.568 25.403 25.14 24.966 24.786 24.69 24.486 24.254 24.009 23.88 23.657 23.511 23.383 23.229 22.911 22.727 22.519 22.315 22.059 21.728 21.303 19.964 -9 ,21833 ,TETRA ,17557578,Fri Nov 26 10:31:45 CET,Fri Nov 26 12:29:03 CET,0.0 1.611 2.025 2.377 2.656 2.908 3.16 3.4 3.832 4.025 4.21 4.453 4.712 4.866 5.189 5.475 5.721 5.84 6.086 6.329 6.67 6.88 7.082 7.372 7.654 7.952 8.246 8.524 8.895 9.233 9.536 9.895 10.237 10.597 11.015 11.448 11.867 12.345 12.87 13.408 13.977 14.621 15.341 16.087 17.0 17.988 19.103 20.353 21.827 23.589 25.642 27.205 27.911 28.193 28.299 28.281 28.188 28.02 27.814 27.604 27.397 27.183 26.975 26.761 26.57 26.402 26.209 26.04 25.882 25.702 25.516 25.368 25.198 24.987 24.818 24.657 24.494 24.313 24.114 23.975 23.818 23.557 23.389 23.214 23.115 22.934 22.74 22.484 22.35 22.116 21.872 21.722 21.579 21.239 21.068 20.888 20.696 20.448 20.119 19.656 16.973 -10 ,2173 ,TETRA ,17557579,Fri Nov 26 10:31:45 CET,Fri Nov 26 12:28:04 CET,0.0 1.82 2.357 2.695 2.959 3.201 3.453 3.679 4.064 4.24 4.409 4.666 4.944 5.101 5.387 5.652 5.907 6.04 6.29 6.517 6.872 7.094 7.292 7.585 7.897 8.234 8.54 8.813 9.18 9.536 9.87 10.27 10.663 11.047 11.485 11.955 12.388 12.866 13.419 14.02 14.615 15.273 16.057 16.856 17.78 18.822 20.037 21.368 22.918 24.672 26.682 28.199 28.904 29.265 29.404 29.386 29.281 29.11 28.911 28.692 28.488 28.281 28.06 27.83 27.624 27.442 27.249 27.084 26.935 26.759 26.558 26.391 26.209 26.004 25.843 25.667 25.47 25.263 25.061 24.923 24.771 24.533 24.372 24.208 24.119 23.93 23.716 23.473 23.357 23.147 22.965 22.822 22.669 22.309 22.091 21.851 21.594 21.29 20.899 20.384 18.626 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index 00d0d77a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13200 ,TETRA ,17557580,Fri Nov 26 10:31:45 CET,Fri Nov 26 12:28:20 CET,0.0 1.063 1.4 1.618 1.774 1.939 2.087 2.217 2.468 2.576 2.682 2.775 2.983 3.084 3.235 3.378 3.525 3.594 3.708 3.807 3.964 4.066 4.164 4.316 4.457 4.583 4.704 4.816 4.959 5.119 5.299 5.503 5.669 5.81 5.96 6.124 6.279 6.426 6.573 6.724 6.87 7.002 7.127 7.248 7.351 7.413 7.405 7.28 6.974 6.282 4.867 2.911 1.211 -0.217 -1.5 -2.689 -3.743 -4.676 -5.439 -6.196 -6.865 -7.457 -8.027 -8.571 -9.076 -9.536 -10.009 -10.446 -10.815 -11.187 -11.576 -11.899 -12.24 -12.593 -12.881 -13.183 -13.484 -13.795 -14.114 -14.333 -14.559 -14.91 -15.151 -15.404 -15.553 -15.865 -16.14 -16.411 -16.562 -16.853 -17.051 -17.209 -17.383 -17.759 -17.965 -18.191 -18.466 -18.788 -19.128 -19.574 -20.746 -2 ,29291 ,TETRA ,17557581,Fri Nov 26 10:31:46 CET,Fri Nov 26 12:29:08 CET,0.0 0.736 0.95 1.105 1.237 1.352 1.464 1.582 1.794 1.886 1.973 2.024 2.211 2.286 2.44 2.583 2.706 2.767 2.881 2.98 3.129 3.229 3.318 3.441 3.56 3.679 3.795 3.91 4.062 4.212 4.363 4.545 4.724 4.886 5.049 5.219 5.372 5.539 5.717 5.879 6.03 6.205 6.367 6.495 6.631 6.742 6.748 6.602 6.291 5.593 4.142 2.164 0.46 -1.017 -2.326 -3.485 -4.505 -5.465 -6.281 -7.076 -7.761 -8.371 -8.958 -9.513 -10.022 -10.48 -10.954 -11.379 -11.752 -12.136 -12.526 -12.856 -13.195 -13.545 -13.823 -14.104 -14.396 -14.704 -15.024 -15.243 -15.466 -15.812 -16.056 -16.316 -16.446 -16.707 -17.001 -17.321 -17.479 -17.764 -17.992 -18.18 -18.37 -18.806 -19.052 -19.313 -19.594 -19.936 -20.368 -20.988 -22.267 -3 ,29387 ,TETRA ,17557582,Fri Nov 26 10:31:49 CET,Fri Nov 26 12:20:36 CET,0.0 0.499 0.828 1.11 1.343 1.505 1.655 1.8 2.061 2.193 2.319 2.44 2.644 2.729 2.933 3.141 3.318 3.401 3.557 3.695 3.891 4.019 4.133 4.271 4.404 4.53 4.652 4.768 4.908 5.04 5.164 5.302 5.442 5.597 5.755 5.908 6.048 6.193 6.336 6.475 6.593 6.705 6.846 6.979 7.095 7.171 7.171 7.038 6.689 5.941 4.468 2.524 0.688 -0.958 -2.336 -3.498 -4.487 -5.421 -6.255 -7.062 -7.757 -8.399 -8.971 -9.495 -9.994 -10.444 -10.912 -11.315 -11.667 -12.047 -12.449 -12.784 -13.113 -13.444 -13.699 -13.953 -14.212 -14.496 -14.808 -15.018 -15.228 -15.554 -15.782 -16.015 -16.129 -16.357 -16.603 -16.866 -16.997 -17.265 -17.413 -17.569 -17.732 -18.06 -18.248 -18.46 -18.698 -18.965 -19.262 -19.612 -20.401 -4 ,24844 ,TETRA ,17557583,Fri Nov 26 10:31:45 CET,Fri Nov 26 12:28:11 CET,0.0 0.835 1.141 1.358 1.527 1.671 1.793 1.922 2.21 2.353 2.487 2.595 2.79 2.885 3.073 3.242 3.401 3.47 3.607 3.745 3.953 4.083 4.19 4.333 4.466 4.591 4.717 4.84 4.986 5.118 5.247 5.404 5.54 5.68 5.84 6.019 6.186 6.351 6.531 6.719 6.893 7.076 7.294 7.488 7.635 7.73 7.749 7.645 7.311 6.551 5.102 3.208 1.533 0.031 -1.286 -2.485 -3.543 -4.477 -5.269 -6.041 -6.694 -7.274 -7.838 -8.368 -8.856 -9.314 -9.781 -10.202 -10.576 -10.962 -11.358 -11.673 -11.992 -12.336 -12.618 -12.902 -13.188 -13.495 -13.81 -14.034 -14.261 -14.607 -14.846 -15.084 -15.211 -15.469 -15.72 -15.996 -16.152 -16.44 -16.661 -16.851 -17.046 -17.478 -17.714 -17.952 -18.217 -18.542 -18.894 -19.33 -20.744 -5 ,7730 ,TETRA ,17557584,Fri Nov 26 10:31:45 CET,Fri Nov 26 12:29:03 CET,0.0 0.448 0.667 0.831 0.979 1.109 1.241 1.364 1.598 1.716 1.821 1.904 2.106 2.2 2.366 2.518 2.662 2.73 2.869 3.011 3.205 3.326 3.445 3.586 3.711 3.852 3.976 4.075 4.212 4.363 4.5 4.656 4.818 4.962 5.099 5.246 5.393 5.544 5.698 5.861 6.004 6.128 6.252 6.365 6.468 6.554 6.585 6.487 6.151 5.419 4.003 2.044 0.265 -1.26 -2.604 -3.795 -4.82 -5.758 -6.552 -7.352 -8.054 -8.649 -9.204 -9.733 -10.224 -10.672 -11.14 -11.566 -11.935 -12.324 -12.725 -13.041 -13.368 -13.725 -14.006 -14.293 -14.587 -14.886 -15.185 -15.386 -15.594 -15.924 -16.167 -16.41 -16.527 -16.774 -17.051 -17.351 -17.506 -17.791 -17.995 -18.189 -18.395 -18.861 -19.106 -19.36 -19.668 -20.023 -20.398 -20.843 -21.982 -6 ,20571 ,TETRA ,17557585,Fri Nov 26 10:31:45 CET,Fri Nov 26 12:28:04 CET,0.0 0.523 0.809 1.03 1.271 1.499 1.663 1.799 2.029 2.134 2.238 2.31 2.497 2.584 2.763 2.927 3.075 3.148 3.291 3.427 3.63 3.757 3.871 4.044 4.221 4.382 4.521 4.644 4.803 4.946 5.087 5.265 5.424 5.562 5.722 5.892 6.035 6.205 6.396 6.567 6.728 6.876 7.019 7.142 7.237 7.296 7.294 7.2 6.876 6.18 4.745 2.824 1.136 -0.368 -1.683 -2.851 -3.882 -4.807 -5.608 -6.402 -7.077 -7.671 -8.232 -8.773 -9.275 -9.719 -10.181 -10.602 -10.975 -11.359 -11.742 -12.063 -12.389 -12.74 -13.021 -13.314 -13.625 -13.936 -14.244 -14.454 -14.669 -14.99 -15.211 -15.469 -15.606 -15.876 -16.148 -16.446 -16.613 -16.915 -17.147 -17.334 -17.515 -17.912 -18.147 -18.385 -18.64 -18.935 -19.349 -19.965 -21.494 -7 ,9198 ,TETRA ,17557586,Fri Nov 26 10:31:46 CET,Fri Nov 26 12:26:11 CET,0.0 0.54 0.871 1.125 1.363 1.558 1.707 1.829 2.063 2.18 2.294 2.372 2.565 2.643 2.788 2.927 3.073 3.148 3.294 3.42 3.59 3.699 3.8 3.952 4.097 4.243 4.383 4.508 4.671 4.825 4.967 5.135 5.287 5.427 5.565 5.687 5.806 5.947 6.088 6.234 6.394 6.537 6.662 6.78 6.852 6.859 6.835 6.7 6.351 5.713 4.345 2.465 0.87 -0.55 -1.826 -2.985 -3.968 -4.844 -5.602 -6.38 -7.126 -7.77 -8.314 -8.84 -9.329 -9.769 -10.233 -10.646 -10.994 -11.34 -11.711 -12.037 -12.369 -12.698 -12.959 -13.226 -13.492 -13.766 -14.061 -14.273 -14.489 -14.831 -15.1 -15.392 -15.537 -15.842 -16.132 -16.411 -16.559 -16.833 -17.018 -17.192 -17.376 -17.792 -18.003 -18.221 -18.448 -18.71 -19.072 -19.627 -21.057 -8 ,23481 ,TETRA ,17557587,Fri Nov 26 10:31:46 CET,Fri Nov 26 12:29:14 CET,0.0 0.887 1.193 1.447 1.696 1.893 2.038 2.187 2.469 2.58 2.685 2.789 2.998 3.09 3.265 3.427 3.571 3.637 3.774 3.914 4.125 4.262 4.392 4.582 4.748 4.894 5.042 5.191 5.382 5.542 5.684 5.859 6.027 6.179 6.335 6.515 6.678 6.837 6.999 7.171 7.339 7.481 7.634 7.777 7.894 7.949 7.939 7.805 7.473 6.777 5.278 3.303 1.61 0.124 -1.227 -2.423 -3.431 -4.357 -5.163 -5.985 -6.676 -7.279 -7.857 -8.393 -8.897 -9.359 -9.834 -10.25 -10.616 -10.997 -11.395 -11.728 -12.06 -12.403 -12.675 -12.944 -13.223 -13.536 -13.864 -14.08 -14.306 -14.655 -14.897 -15.167 -15.306 -15.588 -15.871 -16.164 -16.317 -16.598 -16.768 -16.929 -17.12 -17.503 -17.699 -17.932 -18.184 -18.484 -18.877 -19.355 -20.561 -9 ,23277 ,TETRA ,17557588,Fri Nov 26 10:32:42 CET,Fri Nov 26 12:29:18 CET,0.0 0.893 1.193 1.405 1.626 1.832 2.01 2.172 2.458 2.577 2.681 2.803 3.022 3.115 3.272 3.412 3.551 3.632 3.805 3.948 4.131 4.24 4.339 4.501 4.65 4.784 4.919 5.048 5.204 5.337 5.468 5.635 5.797 5.955 6.123 6.283 6.437 6.608 6.767 6.915 7.069 7.233 7.411 7.554 7.648 7.7 7.677 7.545 7.259 6.611 5.225 3.325 1.628 0.159 -1.14 -2.323 -3.342 -4.253 -5.034 -5.806 -6.49 -7.087 -7.648 -8.185 -8.691 -9.159 -9.633 -10.046 -10.411 -10.79 -11.196 -11.54 -11.884 -12.236 -12.517 -12.797 -13.086 -13.389 -13.701 -13.931 -14.165 -14.515 -14.757 -15.008 -15.134 -15.385 -15.644 -15.937 -16.098 -16.392 -16.579 -16.747 -16.935 -17.375 -17.628 -17.872 -18.122 -18.41 -18.787 -19.282 -20.442 -10 ,25316 ,TETRA ,17557589,Fri Nov 26 10:32:42 CET,Fri Nov 26 12:16:48 CET,0.0 0.662 1.012 1.264 1.491 1.68 1.861 2.013 2.223 2.318 2.413 2.468 2.657 2.732 2.862 2.993 3.114 3.167 3.274 3.389 3.552 3.648 3.747 3.904 4.05 4.194 4.322 4.438 4.59 4.722 4.842 4.976 5.095 5.216 5.35 5.487 5.625 5.77 5.912 6.067 6.242 6.402 6.535 6.638 6.756 6.86 6.872 6.793 6.556 5.942 4.611 2.646 0.882 -0.618 -1.905 -3.111 -4.159 -5.062 -5.841 -6.606 -7.268 -7.876 -8.442 -8.972 -9.466 -9.914 -10.395 -10.818 -11.181 -11.563 -11.967 -12.303 -12.633 -12.984 -13.263 -13.539 -13.819 -14.107 -14.407 -14.617 -14.831 -15.15 -15.377 -15.617 -15.74 -15.992 -16.267 -16.578 -16.745 -17.046 -17.311 -17.524 -17.732 -18.187 -18.462 -18.764 -19.064 -19.382 -19.8 -20.406 -21.611 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index e7e86049..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15650 ,KEBNE ,17132059,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:22:28 CET,0.0 1.535 2.036 2.373 2.638 2.872 3.095 3.294 3.637 3.805 3.968 4.165 4.386 4.526 4.803 5.055 5.276 5.385 5.599 5.792 6.083 6.281 6.471 6.752 7.019 7.252 7.458 7.667 7.91 8.106 8.3 8.541 8.785 9.021 9.27 9.533 9.781 10.041 10.271 10.494 10.733 10.98 11.244 11.479 11.668 11.728 11.703 11.574 11.223 10.362 8.445 5.77 3.32 1.086 -0.87 -2.541 -3.987 -5.3 -6.434 -7.563 -8.497 -9.343 -10.15 -10.891 -11.603 -12.247 -12.908 -13.475 -13.969 -14.522 -15.106 -15.565 -16.038 -16.541 -16.92 -17.293 -17.69 -18.125 -18.567 -18.872 -19.195 -19.701 -20.041 -20.374 -20.543 -20.888 -21.256 -21.658 -21.871 -22.207 -22.573 -22.839 -23.108 -23.682 -24.008 -24.375 -24.783 -25.274 -25.929 -26.8 -29.572 -2 ,1992 ,KEBNE ,17132060,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:23:14 CET,0.0 1.96 2.579 3.001 3.346 3.645 3.925 4.174 4.593 4.808 5.001 5.24 5.493 5.659 5.956 6.222 6.463 6.572 6.792 7.011 7.345 7.558 7.739 7.981 8.23 8.488 8.707 8.897 9.132 9.356 9.583 9.842 10.063 10.268 10.526 10.805 11.049 11.291 11.513 11.724 11.952 12.207 12.428 12.584 12.67 12.673 12.65 12.433 11.864 10.84 8.806 5.989 3.564 1.457 -0.389 -2.04 -3.492 -4.768 -5.859 -6.978 -7.946 -8.802 -9.595 -10.343 -11.039 -11.651 -12.273 -12.831 -13.33 -13.848 -14.392 -14.843 -15.298 -15.758 -16.116 -16.499 -16.902 -17.347 -17.787 -18.064 -18.354 -18.807 -19.136 -19.487 -19.664 -20.025 -20.417 -20.862 -21.099 -21.457 -21.848 -22.115 -22.374 -22.949 -23.27 -23.62 -24.071 -24.598 -25.264 -26.139 -29.651 -3 ,17352 ,KEBNE ,17132061,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:22:06 CET,0.0 2.459 3.11 3.573 3.931 4.218 4.484 4.761 5.244 5.452 5.644 5.891 6.122 6.254 6.525 6.803 7.043 7.149 7.357 7.564 7.864 8.059 8.246 8.49 8.708 8.928 9.148 9.364 9.64 9.893 10.124 10.405 10.68 10.924 11.171 11.409 11.629 11.881 12.151 12.409 12.646 12.874 13.092 13.328 13.602 13.771 13.788 13.616 13.203 12.472 10.749 8.04 5.516 3.299 1.441 -0.234 -1.705 -2.981 -4.11 -5.264 -6.282 -7.171 -7.991 -8.785 -9.515 -10.175 -10.849 -11.438 -11.951 -12.504 -13.104 -13.601 -14.094 -14.563 -14.931 -15.315 -15.699 -16.101 -16.512 -16.806 -17.118 -17.605 -17.948 -18.298 -18.475 -18.856 -19.266 -19.686 -19.892 -20.217 -20.56 -20.806 -21.081 -21.644 -21.941 -22.295 -22.696 -23.179 -23.799 -24.679 -27.532 -4 ,23587 ,KEBNE ,17132062,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:23:21 CET,0.0 1.488 2.171 2.721 3.21 3.6 3.931 4.226 4.723 4.933 5.118 5.375 5.639 5.797 6.099 6.394 6.682 6.824 7.118 7.39 7.764 7.999 8.215 8.507 8.784 9.052 9.321 9.595 9.938 10.258 10.543 10.859 11.16 11.453 11.795 12.168 12.499 12.84 13.21 13.598 13.984 14.386 14.803 15.178 15.552 15.859 16.107 16.238 16.115 15.654 14.269 11.743 9.281 7.018 5.047 3.381 1.935 0.606 -0.54 -1.668 -2.607 -3.484 -4.342 -5.123 -5.84 -6.478 -7.145 -7.756 -8.28 -8.82 -9.38 -9.846 -10.338 -10.839 -11.23 -11.632 -12.027 -12.436 -12.875 -13.188 -13.51 -13.988 -14.319 -14.662 -14.839 -15.22 -15.624 -16.05 -16.271 -16.61 -16.939 -17.188 -17.467 -18.068 -18.411 -18.789 -19.216 -19.71 -20.252 -21.045 -24.659 -5 ,4278 ,KEBNE ,17132063,Sat Jan 1 17:42:22 CET,Sat Jan 1 19:21:49 CET,0.0 2.13 2.73 3.128 3.432 3.695 3.959 4.199 4.616 4.807 4.988 5.222 5.449 5.581 5.83 6.067 6.3 6.417 6.64 6.843 7.126 7.309 7.493 7.75 7.985 8.205 8.412 8.617 8.892 9.152 9.381 9.617 9.811 9.989 10.207 10.478 10.743 11.032 11.329 11.64 11.922 12.185 12.474 12.722 12.92 13.009 13.064 13.035 12.728 11.908 9.997 7.199 4.662 2.489 0.626 -1.046 -2.574 -3.942 -5.091 -6.219 -7.147 -7.973 -8.77 -9.505 -10.192 -10.825 -11.5 -12.102 -12.623 -13.189 -13.765 -14.233 -14.713 -15.202 -15.589 -15.994 -16.402 -16.81 -17.225 -17.521 -17.842 -18.328 -18.672 -19.057 -19.245 -19.609 -19.997 -20.422 -20.649 -21.007 -21.404 -21.684 -21.979 -22.638 -23.009 -23.396 -23.845 -24.366 -24.945 -25.753 -28.921 -6 ,6138 ,KEBNE ,17132064,Sat Jan 1 17:42:22 CET,Sat Jan 1 19:21:46 CET,0.0 1.951 2.603 3.085 3.45 3.756 4.032 4.276 4.705 4.907 5.112 5.396 5.652 5.821 6.164 6.491 6.782 6.909 7.156 7.409 7.797 8.052 8.285 8.608 8.934 9.244 9.517 9.764 10.093 10.413 10.726 11.106 11.44 11.744 12.094 12.494 12.883 13.254 13.584 13.939 14.33 14.755 15.192 15.602 16.105 16.565 16.832 16.935 16.858 16.39 15.089 12.831 10.578 8.513 6.651 4.983 3.491 2.109 0.957 -0.185 -1.14 -1.99 -2.809 -3.615 -4.368 -5.029 -5.714 -6.314 -6.813 -7.331 -7.894 -8.359 -8.816 -9.292 -9.669 -10.058 -10.467 -10.886 -11.306 -11.607 -11.936 -12.442 -12.809 -13.183 -13.362 -13.73 -14.126 -14.572 -14.823 -15.205 -15.621 -15.898 -16.185 -16.791 -17.105 -17.468 -17.878 -18.355 -18.935 -19.737 -22.518 -7 ,31624 ,KEBNE ,17132065,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:22:19 CET,0.0 1.864 2.494 2.924 3.265 3.584 3.853 4.085 4.491 4.663 4.831 5.061 5.304 5.463 5.746 6.004 6.262 6.378 6.596 6.823 7.15 7.349 7.537 7.818 8.096 8.362 8.614 8.847 9.116 9.355 9.596 9.889 10.16 10.42 10.719 11.036 11.316 11.601 11.907 12.226 12.521 12.808 13.099 13.343 13.548 13.731 13.874 14.013 13.946 13.287 11.791 9.549 7.496 5.569 3.799 2.144 0.723 -0.492 -1.568 -2.661 -3.586 -4.409 -5.201 -5.957 -6.669 -7.319 -7.984 -8.557 -9.065 -9.604 -10.157 -10.627 -11.097 -11.563 -11.944 -12.356 -12.775 -13.177 -13.605 -13.927 -14.245 -14.71 -15.039 -15.401 -15.589 -15.96 -16.342 -16.755 -16.987 -17.351 -17.747 -18.047 -18.36 -18.982 -19.314 -19.662 -20.07 -20.564 -21.181 -22.003 -25.058 -8 ,21863 ,KEBNE ,17132066,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:23:13 CET,0.0 1.937 2.484 2.932 3.339 3.667 3.95 4.212 4.676 4.886 5.081 5.376 5.647 5.824 6.175 6.505 6.822 6.968 7.259 7.547 7.957 8.209 8.442 8.75 9.031 9.319 9.588 9.839 10.169 10.491 10.763 11.074 11.378 11.655 11.981 12.362 12.745 13.172 13.577 13.938 14.293 14.664 15.063 15.464 15.857 16.222 16.595 16.764 16.734 16.263 14.628 12.265 10.008 7.879 5.907 4.131 2.63 1.262 0.118 -0.998 -1.987 -2.866 -3.734 -4.549 -5.261 -5.888 -6.551 -7.138 -7.632 -8.144 -8.696 -9.144 -9.617 -10.117 -10.501 -10.906 -11.303 -11.705 -12.135 -12.426 -12.729 -13.221 -13.564 -13.905 -14.086 -14.48 -14.903 -15.354 -15.585 -15.94 -16.316 -16.591 -16.879 -17.524 -17.862 -18.233 -18.681 -19.159 -19.727 -20.498 -23.113 -9 ,27052 ,KEBNE ,17132067,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:22:01 CET,0.0 2.129 2.716 3.128 3.473 3.783 4.037 4.295 4.749 4.943 5.125 5.384 5.634 5.781 6.054 6.308 6.558 6.676 6.897 7.119 7.427 7.614 7.801 8.05 8.28 8.508 8.728 8.955 9.258 9.54 9.802 10.088 10.353 10.598 10.881 11.236 11.561 11.88 12.174 12.431 12.705 12.971 13.167 13.362 13.597 13.764 13.835 13.803 13.419 12.417 10.341 7.39 4.822 2.661 0.783 -0.859 -2.312 -3.671 -4.829 -5.969 -6.925 -7.766 -8.592 -9.384 -10.094 -10.743 -11.439 -12.046 -12.553 -13.108 -13.694 -14.161 -14.639 -15.127 -15.518 -15.924 -16.316 -16.723 -17.172 -17.487 -17.811 -18.313 -18.664 -19.02 -19.197 -19.583 -19.981 -20.391 -20.611 -20.964 -21.379 -21.656 -21.938 -22.526 -22.832 -23.168 -23.547 -23.985 -24.507 -25.269 -31.001 -10 ,17291 ,KEBNE ,17132068,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:22:05 CET,0.0 1.959 2.528 2.977 3.377 3.699 3.967 4.204 4.597 4.767 4.931 5.164 5.413 5.573 5.856 6.112 6.357 6.478 6.707 6.909 7.208 7.393 7.57 7.852 8.118 8.327 8.507 8.694 8.961 9.219 9.457 9.727 9.997 10.257 10.544 10.862 11.163 11.481 11.753 12.007 12.257 12.532 12.837 13.087 13.339 13.547 13.62 13.467 13.075 12.141 10.052 7.18 4.691 2.541 0.707 -0.884 -2.261 -3.538 -4.64 -5.756 -6.731 -7.574 -8.356 -9.1 -9.802 -10.431 -11.086 -11.672 -12.179 -12.705 -13.256 -13.713 -14.179 -14.675 -15.063 -15.465 -15.87 -16.28 -16.715 -17.019 -17.325 -17.792 -18.137 -18.493 -18.67 -19.055 -19.461 -19.878 -20.096 -20.437 -20.759 -20.992 -21.244 -21.857 -22.194 -22.558 -22.971 -23.411 -23.946 -24.769 -28.131 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index ae543fc2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1318 ,TETRA ,17557590,Fri Nov 26 10:32:42 CET,Fri Nov 26 12:28:19 CET,0.0 2.76 3.268 3.629 3.879 4.1 4.268 4.42 4.703 4.821 4.931 5.052 5.236 5.346 5.56 5.742 5.908 5.99 6.146 6.276 6.462 6.582 6.691 6.829 6.94 7.047 7.151 7.234 7.33 7.444 7.558 7.674 7.757 7.848 7.924 7.961 8.005 8.044 8.075 8.105 8.081 7.993 7.882 7.767 7.554 7.197 6.626 5.768 4.514 2.588 -0.584 -4.232 -7.133 -9.6 -11.622 -13.312 -14.737 -16.022 -17.128 -18.216 -19.178 -20.041 -20.835 -21.55 -22.198 -22.794 -23.408 -23.945 -24.414 -24.914 -25.422 -25.823 -26.242 -26.697 -27.065 -27.437 -27.811 -28.195 -28.592 -28.867 -29.148 -29.57 -29.859 -30.178 -30.345 -30.685 -31.024 -31.392 -31.592 -31.921 -32.215 -32.44 -32.669 -33.166 -33.439 -33.763 -34.107 -34.456 -34.845 -35.379 -37.673 -2 ,30363 ,TETRA ,17557591,Fri Nov 26 10:32:42 CET,Fri Nov 26 12:24:17 CET,0.0 1.929 2.412 2.698 2.924 3.11 3.271 3.422 3.693 3.807 3.909 4.021 4.196 4.283 4.47 4.656 4.822 4.891 5.012 5.123 5.302 5.41 5.492 5.597 5.694 5.795 5.896 5.983 6.086 6.179 6.25 6.3 6.338 6.38 6.42 6.482 6.551 6.581 6.562 6.548 6.531 6.474 6.382 6.254 6.065 5.763 5.283 4.603 3.5 1.705 -1.301 -4.833 -7.772 -10.289 -12.398 -14.244 -15.823 -17.205 -18.382 -19.52 -20.477 -21.314 -22.092 -22.82 -23.519 -24.152 -24.792 -25.376 -25.867 -26.355 -26.861 -27.277 -27.69 -28.109 -28.433 -28.782 -29.165 -29.532 -29.899 -30.168 -30.451 -30.894 -31.198 -31.513 -31.677 -32.009 -32.349 -32.707 -32.897 -33.235 -33.537 -33.765 -34.005 -34.521 -34.788 -35.053 -35.355 -35.7 -36.109 -36.75 -39.027 -3 ,14893 ,TETRA ,17557592,Fri Nov 26 10:32:42 CET,Fri Nov 26 12:29:22 CET,0.0 1.53 2.054 2.355 2.625 2.854 3.061 3.263 3.597 3.737 3.856 3.993 4.197 4.303 4.484 4.641 4.798 4.874 5.013 5.135 5.319 5.435 5.542 5.695 5.844 5.97 6.065 6.156 6.265 6.388 6.5 6.599 6.688 6.744 6.805 6.877 6.911 6.953 6.987 6.986 6.972 6.957 6.86 6.618 6.288 5.883 5.319 4.512 3.306 1.435 -1.809 -5.707 -8.8 -11.336 -13.436 -15.197 -16.704 -18.088 -19.284 -20.482 -21.506 -22.368 -23.146 -23.905 -24.625 -25.271 -25.927 -26.5 -26.985 -27.482 -27.984 -28.396 -28.826 -29.262 -29.612 -29.99 -30.378 -30.766 -31.16 -31.427 -31.705 -32.133 -32.42 -32.717 -32.87 -33.175 -33.492 -33.828 -34.0 -34.325 -34.635 -34.849 -35.072 -35.545 -35.805 -36.108 -36.437 -36.818 -37.26 -37.781 -40.009 -4 ,18302 ,TETRA ,17557593,Fri Nov 26 10:32:43 CET,Fri Nov 26 12:29:21 CET,0.0 1.547 1.951 2.202 2.409 2.61 2.768 2.904 3.149 3.267 3.39 3.525 3.707 3.792 3.958 4.115 4.279 4.368 4.52 4.646 4.828 4.94 5.042 5.175 5.3 5.42 5.516 5.605 5.724 5.822 5.901 5.998 6.1 6.196 6.268 6.302 6.325 6.348 6.378 6.409 6.417 6.362 6.259 6.123 5.886 5.533 5.012 4.25 3.002 1.003 -2.335 -6.193 -9.247 -11.721 -13.732 -15.477 -16.994 -18.332 -19.455 -20.59 -21.538 -22.362 -23.16 -23.91 -24.598 -25.219 -25.859 -26.434 -26.926 -27.401 -27.88 -28.292 -28.717 -29.143 -29.467 -29.799 -30.151 -30.54 -30.937 -31.201 -31.478 -31.911 -32.223 -32.54 -32.697 -33.029 -33.383 -33.731 -33.912 -34.244 -34.514 -34.715 -34.949 -35.516 -35.822 -36.149 -36.549 -37.001 -37.491 -38.161 -40.693 -5 ,6847 ,TETRA ,17557594,Fri Nov 26 10:32:42 CET,Fri Nov 26 12:30:01 CET,0.0 1.546 2.039 2.385 2.662 2.891 3.051 3.177 3.387 3.49 3.591 3.685 3.861 3.955 4.151 4.331 4.496 4.588 4.757 4.878 5.023 5.122 5.225 5.37 5.505 5.631 5.728 5.811 5.911 5.993 6.065 6.144 6.219 6.285 6.356 6.418 6.468 6.521 6.547 6.56 6.558 6.486 6.326 6.143 5.886 5.484 4.866 4.045 2.89 1.026 -2.15 -5.807 -8.763 -11.248 -13.27 -15.008 -16.516 -17.849 -18.975 -20.073 -21.015 -21.854 -22.624 -23.33 -23.978 -24.564 -25.177 -25.745 -26.241 -26.749 -27.288 -27.716 -28.137 -28.598 -28.951 -29.286 -29.64 -29.994 -30.338 -30.6 -30.871 -31.256 -31.521 -31.815 -31.974 -32.312 -32.676 -33.044 -33.224 -33.553 -33.864 -34.087 -34.32 -34.825 -35.087 -35.381 -35.734 -36.129 -36.61 -37.344 -39.777 -6 ,27020 ,TETRA ,17557595,Fri Nov 26 10:32:45 CET,Fri Nov 26 12:30:07 CET,0.0 1.714 2.224 2.627 2.904 3.114 3.276 3.412 3.659 3.771 3.879 3.998 4.178 4.261 4.409 4.551 4.708 4.787 4.928 5.056 5.234 5.354 5.466 5.608 5.731 5.826 5.908 6.009 6.145 6.254 6.353 6.476 6.593 6.68 6.765 6.86 6.938 7.014 7.081 7.134 7.162 7.124 6.997 6.793 6.485 6.072 5.502 4.629 3.32 1.386 -1.868 -5.674 -8.701 -11.107 -13.166 -15.028 -16.556 -17.901 -19.085 -20.225 -21.164 -21.994 -22.736 -23.425 -24.068 -24.641 -25.245 -25.802 -26.292 -26.789 -27.282 -27.69 -28.098 -28.52 -28.866 -29.218 -29.577 -29.951 -30.341 -30.618 -30.911 -31.37 -31.688 -32.013 -32.17 -32.513 -32.897 -33.285 -33.485 -33.808 -34.054 -34.256 -34.477 -34.918 -35.131 -35.375 -35.686 -36.073 -36.535 -37.142 -38.968 -7 ,1110 ,TETRA ,17557596,Fri Nov 26 10:32:42 CET,Fri Nov 26 12:22:39 CET,0.0 1.905 2.425 2.766 3.045 3.276 3.466 3.623 3.902 4.019 4.114 4.213 4.396 4.487 4.654 4.817 4.968 5.032 5.156 5.264 5.423 5.523 5.619 5.747 5.858 5.955 6.041 6.113 6.181 6.241 6.299 6.381 6.476 6.559 6.641 6.713 6.776 6.854 6.877 6.836 6.778 6.672 6.496 6.295 6.008 5.59 4.952 4.07 2.867 1.029 -2.012 -5.727 -8.782 -11.266 -13.34 -15.139 -16.638 -17.969 -19.094 -20.18 -21.102 -21.931 -22.732 -23.484 -24.177 -24.814 -25.464 -26.018 -26.512 -27.034 -27.546 -27.951 -28.369 -28.798 -29.137 -29.498 -29.86 -30.235 -30.628 -30.895 -31.178 -31.637 -31.953 -32.278 -32.45 -32.798 -33.146 -33.509 -33.693 -34.013 -34.3 -34.524 -34.758 -35.274 -35.577 -35.902 -36.219 -36.599 -37.113 -37.771 -40.107 -8 ,23042 ,TETRA ,17557597,Fri Nov 26 10:34:42 CET,Fri Nov 26 12:29:34 CET,0.0 1.584 1.993 2.315 2.593 2.812 3.007 3.181 3.451 3.564 3.671 3.81 4.022 4.121 4.282 4.428 4.564 4.625 4.731 4.841 5.013 5.123 5.213 5.373 5.545 5.664 5.754 5.845 5.977 6.11 6.226 6.354 6.466 6.56 6.668 6.788 6.879 6.96 7.028 7.075 7.087 7.097 7.091 6.997 6.77 6.387 5.788 4.931 3.754 2.007 -1.105 -4.92 -7.946 -10.379 -12.366 -14.08 -15.552 -16.83 -17.92 -18.994 -19.936 -20.802 -21.586 -22.314 -22.987 -23.603 -24.251 -24.823 -25.321 -25.829 -26.34 -26.754 -27.198 -27.662 -28.01 -28.366 -28.722 -29.087 -29.478 -29.751 -30.04 -30.504 -30.807 -31.102 -31.251 -31.562 -31.882 -32.207 -32.375 -32.681 -32.965 -33.181 -33.394 -33.845 -34.08 -34.365 -34.723 -35.101 -35.548 -36.113 -37.784 -9 ,25280 ,TETRA ,17557598,Fri Nov 26 10:33:46 CET,Fri Nov 26 12:31:08 CET,0.0 1.476 2.039 2.474 2.761 2.957 3.134 3.281 3.538 3.655 3.771 3.9 4.096 4.203 4.405 4.602 4.779 4.856 4.974 5.078 5.24 5.337 5.423 5.551 5.678 5.797 5.899 5.988 6.099 6.198 6.277 6.366 6.455 6.524 6.588 6.655 6.709 6.753 6.783 6.82 6.855 6.854 6.816 6.722 6.499 6.168 5.672 4.876 3.686 1.836 -1.347 -5.046 -8.028 -10.454 -12.474 -14.293 -15.864 -17.24 -18.391 -19.559 -20.554 -21.392 -22.167 -22.901 -23.593 -24.22 -24.883 -25.462 -25.943 -26.44 -26.965 -27.399 -27.84 -28.299 -28.656 -29.019 -29.388 -29.766 -30.157 -30.431 -30.715 -31.162 -31.486 -31.813 -31.962 -32.263 -32.607 -32.98 -33.174 -33.504 -33.778 -33.99 -34.217 -34.704 -34.965 -35.251 -35.563 -35.928 -36.37 -37.038 -39.736 -10 ,11367 ,TETRA ,17557599,Fri Nov 26 10:32:43 CET,Fri Nov 26 12:28:57 CET,0.0 1.218 1.649 1.978 2.23 2.45 2.64 2.796 3.067 3.189 3.299 3.407 3.598 3.703 3.895 4.064 4.212 4.287 4.43 4.563 4.733 4.827 4.914 5.022 5.128 5.248 5.348 5.446 5.569 5.668 5.749 5.845 5.927 5.974 6.034 6.113 6.184 6.263 6.324 6.365 6.359 6.253 6.055 5.834 5.533 5.108 4.496 3.688 2.523 0.692 -2.489 -6.285 -9.366 -11.952 -14.121 -15.966 -17.534 -18.933 -20.122 -21.286 -22.26 -23.114 -23.935 -24.711 -25.44 -26.091 -26.727 -27.268 -27.742 -28.244 -28.765 -29.199 -29.632 -30.069 -30.401 -30.733 -31.097 -31.492 -31.884 -32.147 -32.404 -32.782 -33.064 -33.369 -33.526 -33.85 -34.157 -34.491 -34.685 -35.005 -35.273 -35.471 -35.673 -36.133 -36.387 -36.663 -36.952 -37.271 -37.668 -38.205 -39.656 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index b981d326..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2425 ,TETRA ,17557600,Fri Nov 26 10:32:43 CET,Fri Nov 26 12:30:19 CET,0.0 1.179 1.688 2.008 2.268 2.52 2.739 2.934 3.297 3.471 3.642 3.87 4.129 4.282 4.577 4.856 5.097 5.205 5.408 5.601 5.892 6.099 6.303 6.583 6.857 7.133 7.4 7.658 7.977 8.292 8.601 8.973 9.346 9.691 10.071 10.5 10.919 11.375 11.863 12.374 12.904 13.499 14.148 14.785 15.575 16.487 17.528 18.672 19.969 21.405 22.907 23.693 23.793 23.621 23.324 23.003 22.646 22.252 21.905 21.5 21.115 20.788 20.471 20.132 19.802 19.518 19.223 18.936 18.686 18.427 18.156 17.929 17.686 17.439 17.237 17.029 16.812 16.563 16.294 16.102 15.91 15.609 15.39 15.165 15.045 14.798 14.528 14.231 14.073 13.806 13.527 13.338 13.125 12.682 12.417 12.125 11.842 11.527 11.144 10.678 9.249 -2 ,26170 ,TETRA ,17557601,Fri Nov 26 10:32:43 CET,Fri Nov 26 12:32:41 CET,0.0 0.999 1.408 1.74 2.016 2.234 2.431 2.626 3.016 3.186 3.338 3.511 3.751 3.88 4.132 4.382 4.621 4.732 4.948 5.158 5.454 5.646 5.832 6.103 6.373 6.622 6.852 7.089 7.402 7.7 7.982 8.328 8.667 8.989 9.37 9.817 10.246 10.713 11.206 11.705 12.221 12.797 13.479 14.199 15.071 16.013 17.038 18.147 19.386 20.723 22.111 22.956 23.094 22.971 22.789 22.557 22.284 21.967 21.647 21.282 20.936 20.61 20.282 19.973 19.679 19.4 19.098 18.815 18.56 18.283 18.006 17.781 17.517 17.217 16.987 16.75 16.497 16.232 15.962 15.774 15.564 15.234 15.003 14.753 14.629 14.383 14.107 13.816 13.666 13.428 13.2 13.024 12.845 12.407 12.138 11.852 11.544 11.198 10.794 10.283 8.933 -3 ,10725 ,TETRA ,17557602,Fri Nov 26 10:32:43 CET,Fri Nov 26 12:30:13 CET,0.0 1.08 1.486 1.797 2.056 2.306 2.56 2.782 3.171 3.35 3.514 3.719 3.968 4.102 4.338 4.565 4.799 4.911 5.132 5.357 5.685 5.891 6.083 6.36 6.621 6.872 7.126 7.374 7.682 7.98 8.277 8.639 8.998 9.326 9.698 10.129 10.531 10.976 11.479 12.005 12.562 13.189 13.905 14.642 15.489 16.429 17.494 18.664 19.979 21.401 22.871 23.642 23.677 23.525 23.32 22.954 22.604 22.305 21.982 21.612 21.281 20.954 20.614 20.299 20.023 19.765 19.489 19.259 19.068 18.862 18.635 18.443 18.227 17.972 17.768 17.564 17.355 17.117 16.853 16.674 16.485 16.19 15.997 15.786 15.671 15.428 15.169 14.882 14.722 14.474 14.2 14.014 13.83 13.403 13.167 12.913 12.604 12.234 11.795 11.259 9.762 -4 ,30380 ,TETRA ,17557603,Fri Nov 26 10:33:46 CET,Fri Nov 26 12:23:17 CET,0.0 1.372 1.804 2.142 2.411 2.663 2.874 3.064 3.432 3.602 3.767 3.975 4.232 4.371 4.633 4.877 5.092 5.196 5.409 5.614 5.914 6.111 6.303 6.589 6.87 7.138 7.393 7.645 7.977 8.295 8.602 8.964 9.301 9.624 9.999 10.441 10.866 11.338 11.828 12.303 12.808 13.39 14.086 14.83 15.706 16.638 17.645 18.728 20.017 21.528 23.018 23.791 23.964 23.805 23.496 23.121 22.747 22.369 22.012 21.632 21.279 20.956 20.641 20.346 20.066 19.804 19.504 19.2 18.938 18.671 18.391 18.147 17.888 17.627 17.425 17.21 16.972 16.729 16.484 16.321 16.147 15.849 15.639 15.419 15.303 15.062 14.8 14.531 14.389 14.146 13.937 13.777 13.593 13.211 13.011 12.781 12.525 12.21 11.806 11.217 8.652 -5 ,9097 ,TETRA ,17557604,Fri Nov 26 10:33:46 CET,Fri Nov 26 12:16:01 CET,0.0 1.441 1.87 2.193 2.511 2.817 3.084 3.304 3.691 3.875 4.047 4.257 4.507 4.65 4.924 5.179 5.426 5.551 5.797 6.029 6.343 6.547 6.746 7.004 7.254 7.516 7.786 8.037 8.337 8.633 8.915 9.26 9.614 9.95 10.312 10.722 11.13 11.574 12.04 12.558 13.119 13.737 14.46 15.176 16.006 16.917 17.932 19.058 20.337 21.772 23.17 23.848 23.959 23.809 23.503 23.113 22.717 22.309 21.938 21.566 21.216 20.862 20.525 20.211 19.879 19.56 19.228 18.915 18.643 18.365 18.072 17.824 17.571 17.314 17.09 16.849 16.609 16.364 16.114 15.936 15.764 15.494 15.285 15.061 14.945 14.681 14.409 14.127 13.975 13.742 13.522 13.359 13.184 12.764 12.526 12.277 12.019 11.703 11.227 10.579 8.764 -6 ,28715 ,TETRA ,17557605,Fri Nov 26 10:33:46 CET,Fri Nov 26 12:32:08 CET,0.0 0.588 0.974 1.281 1.536 1.748 1.961 2.189 2.6 2.784 2.945 3.135 3.379 3.511 3.771 4.009 4.24 4.349 4.562 4.79 5.112 5.31 5.494 5.744 5.996 6.25 6.505 6.748 7.046 7.326 7.6 7.947 8.285 8.612 8.992 9.424 9.851 10.31 10.778 11.255 11.762 12.372 13.122 13.872 14.706 15.593 16.615 17.779 19.088 20.468 21.936 22.87 23.165 23.101 22.89 22.664 22.349 22.001 21.707 21.402 21.139 20.888 20.62 20.331 20.05 19.778 19.447 19.15 18.904 18.632 18.343 18.107 17.838 17.553 17.342 17.119 16.885 16.647 16.393 16.212 16.025 15.718 15.501 15.282 15.164 14.904 14.644 14.386 14.243 13.995 13.761 13.593 13.406 13.032 12.818 12.558 12.265 11.918 11.515 10.981 9.382 -7 ,29141 ,TETRA ,17557606,Fri Nov 26 10:33:58 CET,Fri Nov 26 12:29:51 CET,0.0 1.069 1.431 1.734 1.987 2.221 2.447 2.654 2.997 3.155 3.312 3.492 3.725 3.86 4.13 4.375 4.609 4.725 4.948 5.148 5.439 5.632 5.823 6.11 6.389 6.643 6.88 7.119 7.437 7.75 8.06 8.444 8.803 9.138 9.533 9.978 10.401 10.871 11.394 11.944 12.512 13.168 13.94 14.637 15.412 16.326 17.388 18.537 19.795 21.23 22.7 23.338 23.372 23.205 22.899 22.554 22.191 21.784 21.378 20.956 20.594 20.259 19.932 19.611 19.29 19.004 18.704 18.43 18.183 17.913 17.623 17.379 17.111 16.813 16.593 16.377 16.157 15.937 15.697 15.512 15.303 14.969 14.746 14.507 14.381 14.139 13.882 13.584 13.424 13.167 12.902 12.731 12.541 12.056 11.778 11.525 11.277 10.993 10.617 10.099 8.277 -8 ,7198 ,TETRA ,17557607,Fri Nov 26 10:34:45 CET,Fri Nov 26 12:30:28 CET,0.0 1.292 1.677 2.004 2.278 2.522 2.734 2.931 3.287 3.444 3.599 3.794 4.038 4.175 4.433 4.68 4.913 5.019 5.235 5.454 5.742 5.919 6.098 6.358 6.615 6.86 7.103 7.354 7.677 8.0 8.313 8.681 9.033 9.361 9.744 10.16 10.558 11.015 11.532 12.081 12.649 13.288 14.008 14.731 15.59 16.527 17.566 18.715 20.002 21.394 22.738 23.539 23.777 23.702 23.544 23.351 23.121 22.858 22.583 22.259 21.954 21.656 21.355 21.07 20.81 20.569 20.29 20.005 19.736 19.465 19.182 18.938 18.683 18.414 18.21 17.992 17.754 17.504 17.237 17.039 16.836 16.524 16.305 16.064 15.941 15.69 15.413 15.111 14.947 14.695 14.439 14.252 14.061 13.635 13.396 13.141 12.845 12.494 12.089 11.583 10.198 -9 ,22448 ,TETRA ,17557608,Fri Nov 26 10:34:42 CET,Fri Nov 26 12:23:07 CET,0.0 1.181 1.655 2.008 2.3 2.574 2.829 3.037 3.372 3.541 3.705 3.905 4.159 4.296 4.572 4.833 5.071 5.187 5.411 5.617 5.925 6.127 6.322 6.586 6.827 7.075 7.326 7.574 7.878 8.159 8.437 8.784 9.123 9.447 9.822 10.25 10.672 11.11 11.583 12.106 12.635 13.252 14.004 14.768 15.626 16.574 17.671 18.821 20.059 21.374 22.821 23.623 23.84 23.82 23.618 23.301 22.93 22.549 22.17 21.776 21.425 21.086 20.75 20.424 20.105 19.799 19.487 19.203 18.943 18.655 18.345 18.097 17.842 17.567 17.34 17.11 16.865 16.61 16.35 16.166 15.983 15.705 15.501 15.264 15.131 14.86 14.596 14.319 14.176 13.946 13.716 13.544 13.362 12.975 12.752 12.481 12.165 11.848 11.49 10.996 9.597 -10 ,23831 ,TETRA ,17557609,Fri Nov 26 10:33:46 CET,Fri Nov 26 12:31:42 CET,0.0 1.031 1.506 1.856 2.146 2.406 2.66 2.891 3.278 3.449 3.623 3.83 4.07 4.199 4.439 4.677 4.908 5.014 5.219 5.433 5.747 5.946 6.143 6.437 6.722 6.992 7.256 7.508 7.827 8.128 8.414 8.759 9.096 9.42 9.764 10.159 10.543 10.945 11.376 11.858 12.389 12.989 13.7 14.454 15.345 16.308 17.405 18.622 19.993 21.45 22.961 23.891 24.108 23.95 23.649 23.323 22.973 22.595 22.239 21.857 21.517 21.187 20.876 20.613 20.341 20.079 19.803 19.557 19.327 19.074 18.816 18.585 18.332 18.067 17.862 17.636 17.396 17.176 16.919 16.73 16.551 16.259 16.057 15.848 15.733 15.48 15.193 14.887 14.734 14.496 14.261 14.08 13.878 13.428 13.197 12.957 12.675 12.36 11.946 11.336 9.569 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt deleted file mode 100644 index b95d794e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,26285 ,TETRA ,17557611,Fri Nov 26 10:33:47 CET,Fri Nov 26 12:29:59 CET,0.0 2.717 3.246 3.64 3.922 4.154 4.392 4.611 4.993 5.15 5.299 5.483 5.709 5.819 6.034 6.251 6.459 6.557 6.72 6.863 7.063 7.184 7.294 7.441 7.593 7.766 7.94 8.095 8.271 8.424 8.58 8.772 8.922 9.06 9.225 9.394 9.549 9.691 9.818 9.932 10.031 10.141 10.263 10.32 10.289 10.225 10.049 9.66 8.997 7.897 5.842 3.233 1.058 -0.815 -2.401 -3.791 -5.021 -6.185 -7.196 -8.177 -9.005 -9.743 -10.441 -11.103 -11.719 -12.277 -12.867 -13.409 -13.864 -14.307 -14.772 -15.171 -15.586 -16.019 -16.367 -16.733 -17.102 -17.478 -17.882 -18.171 -18.472 -18.928 -19.257 -19.613 -19.806 -20.197 -20.586 -21.002 -21.223 -21.593 -21.953 -22.193 -22.449 -23.019 -23.347 -23.732 -24.188 -24.716 -25.347 -26.202 -29.845 -3 ,21211 ,TETRA ,17557612,Fri Nov 26 10:34:42 CET,Fri Nov 26 12:29:08 CET,0.0 2.718 3.2 3.548 3.805 4.045 4.282 4.504 4.901 5.079 5.233 5.428 5.704 5.859 6.092 6.282 6.455 6.535 6.692 6.852 7.068 7.193 7.294 7.442 7.595 7.744 7.877 7.98 8.094 8.242 8.431 8.636 8.802 8.951 9.104 9.251 9.427 9.635 9.842 10.022 10.171 10.315 10.402 10.423 10.371 10.242 10.012 9.614 8.901 7.742 5.703 3.066 0.846 -1.055 -2.632 -4.048 -5.286 -6.358 -7.287 -8.233 -9.042 -9.733 -10.405 -11.038 -11.62 -12.142 -12.682 -13.198 -13.678 -14.187 -14.694 -15.097 -15.534 -15.978 -16.304 -16.663 -17.042 -17.418 -17.834 -18.154 -18.49 -19.001 -19.339 -19.677 -19.862 -20.225 -20.597 -20.989 -21.191 -21.552 -21.93 -22.197 -22.471 -23.08 -23.443 -23.846 -24.283 -24.793 -25.43 -26.313 -31.983 -4 ,26843 ,TETRA ,17557613,Fri Nov 26 10:34:43 CET,Fri Nov 26 12:34:04 CET,0.0 1.829 2.226 2.58 2.912 3.189 3.432 3.624 3.923 4.065 4.227 4.395 4.592 4.674 4.86 5.053 5.217 5.286 5.415 5.557 5.795 5.942 6.07 6.242 6.397 6.558 6.718 6.881 7.07 7.211 7.339 7.486 7.624 7.776 7.929 8.077 8.23 8.368 8.474 8.576 8.68 8.772 8.838 8.857 8.839 8.765 8.56 8.177 7.558 6.497 4.447 1.808 -0.416 -2.297 -3.929 -5.362 -6.59 -7.717 -8.724 -9.706 -10.537 -11.289 -12.015 -12.694 -13.303 -13.85 -14.412 -14.928 -15.36 -15.784 -16.28 -16.738 -17.215 -17.695 -18.052 -18.432 -18.855 -19.291 -19.738 -20.038 -20.345 -20.84 -21.164 -21.506 -21.697 -22.081 -22.471 -22.882 -23.09 -23.443 -23.814 -24.089 -24.368 -24.893 -25.188 -25.558 -25.989 -26.527 -27.231 -28.34 -35.572 -5 ,4128 ,TETRA ,17557614,Fri Nov 26 10:34:42 CET,Fri Nov 26 12:34:15 CET,0.0 2.304 2.803 3.187 3.512 3.742 3.955 4.161 4.436 4.561 4.705 4.878 5.095 5.196 5.38 5.544 5.725 5.825 6.019 6.2 6.434 6.577 6.708 6.872 7.036 7.205 7.36 7.505 7.693 7.88 8.056 8.238 8.403 8.57 8.771 8.993 9.184 9.378 9.599 9.835 10.049 10.268 10.47 10.608 10.714 10.735 10.598 10.304 9.743 8.659 6.559 3.798 1.426 -0.59 -2.308 -3.763 -4.985 -6.129 -7.134 -8.192 -9.089 -9.805 -10.462 -11.103 -11.709 -12.271 -12.837 -13.324 -13.76 -14.226 -14.711 -15.127 -15.57 -16.007 -16.342 -16.718 -17.129 -17.544 -17.982 -18.284 -18.591 -19.07 -19.41 -19.768 -19.949 -20.319 -20.711 -21.138 -21.36 -21.695 -22.011 -22.265 -22.533 -23.172 -23.547 -23.95 -24.412 -24.902 -25.478 -26.348 nan -6 ,24819 ,TETRA ,17557615,Fri Nov 26 10:34:44 CET,Fri Nov 26 12:33:39 CET,0.0 2.425 2.828 3.211 3.555 3.801 3.997 4.175 4.463 4.582 4.697 4.832 5.06 5.172 5.382 5.571 5.713 5.776 5.912 6.039 6.231 6.357 6.471 6.62 6.765 6.899 7.015 7.125 7.271 7.445 7.617 7.811 7.968 8.078 8.207 8.346 8.452 8.57 8.701 8.837 8.985 9.123 9.223 9.279 9.302 9.304 9.213 8.914 8.255 7.112 5.031 2.359 0.086 -1.859 -3.489 -4.927 -6.195 -7.335 -8.322 -9.356 -10.256 -11.023 -11.722 -12.374 -13.021 -13.643 -14.254 -14.786 -15.269 -15.78 -16.335 -16.773 -17.196 -17.649 -18.011 -18.397 -18.809 -19.229 -19.644 -19.942 -20.273 -20.81 -21.181 -21.53 -21.719 -22.15 -22.579 -22.993 -23.198 -23.538 -23.893 -24.174 -24.48 -25.162 -25.553 -25.939 -26.294 -26.716 -27.207 -27.961 -33.132 -8 ,5059 ,TETRA ,17557617,Fri Nov 26 10:34:44 CET,Fri Nov 26 12:31:16 CET,0.0 2.775 3.277 3.654 3.976 4.268 4.503 4.702 5.058 5.225 5.39 5.578 5.816 5.941 6.167 6.378 6.564 6.653 6.837 7.019 7.276 7.418 7.552 7.758 7.923 8.039 8.156 8.292 8.45 8.583 8.728 8.919 9.097 9.267 9.468 9.659 9.812 9.978 10.144 10.272 10.39 10.49 10.573 10.654 10.681 10.575 10.354 10.021 9.47 8.43 6.367 3.761 1.551 -0.363 -2.029 -3.481 -4.768 -5.925 -6.906 -7.955 -8.85 -9.605 -10.336 -11.025 -11.664 -12.243 -12.834 -13.376 -13.84 -14.304 -14.782 -15.183 -15.618 -16.088 -16.442 -16.801 -17.175 -17.553 -17.953 -18.24 -18.532 -18.988 -19.333 -19.702 -19.89 -20.278 -20.679 -21.085 -21.287 -21.633 -21.997 -22.259 -22.538 -23.185 -23.566 -23.993 -24.463 -25.031 -25.709 -26.518 -32.508 -10 ,21846 ,TETRA ,17557619,Fri Nov 26 10:36:46 CET,Fri Nov 26 12:19:34 CET,0.0 1.698 2.064 2.415 2.73 2.979 3.175 3.366 3.752 3.917 4.061 4.214 4.44 4.556 4.791 4.976 5.124 5.195 5.329 5.448 5.615 5.734 5.862 6.051 6.216 6.372 6.537 6.696 6.883 7.084 7.29 7.513 7.718 7.894 8.068 8.245 8.394 8.567 8.738 8.859 8.966 9.068 9.131 9.134 9.108 9.019 8.846 8.552 7.97 6.898 4.935 2.324 0.107 -1.794 -3.478 -4.955 -6.221 -7.356 -8.329 -9.302 -10.131 -10.856 -11.534 -12.189 -12.81 -13.349 -13.904 -14.406 -14.843 -15.295 -15.746 -16.118 -16.513 -16.936 -17.29 -17.691 -18.109 -18.508 -18.912 -19.195 -19.487 -19.941 -20.264 -20.607 -20.793 -21.178 -21.563 -21.975 -22.199 -22.558 -22.897 -23.143 -23.426 -24.073 -24.419 -24.774 -25.204 -25.747 -26.457 -27.472 -32.242 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index 76e2d0d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30400 ,TETRA ,17557620,Fri Nov 26 10:35:49 CET,Fri Nov 26 12:35:24 CET,0.0 0.647 1.176 1.592 1.907 2.185 2.448 2.96 3.189 3.405 3.721 4.01 4.208 4.552 4.844 5.138 5.279 5.536 5.788 6.157 6.389 6.612 6.957 7.31 7.634 7.912 8.167 8.478 8.768 9.052 9.382 9.676 9.951 10.279 10.652 11.02 11.41 11.814 12.236 12.677 13.198 13.775 14.379 15.1 15.82 16.658 17.628 18.711 19.729 20.564 20.697 20.361 19.928 19.471 19.003 18.538 18.113 17.715 17.229 16.817 16.445 16.07 15.717 15.377 15.055 14.709 14.39 14.11 13.823 13.536 13.303 13.066 12.803 12.559 12.287 12.007 11.723 11.436 11.257 11.068 10.731 10.499 10.256 10.114 9.813 9.512 9.212 9.039 8.77 8.477 8.244 7.987 7.484 7.233 6.973 6.705 6.361 5.871 5.231 -2 ,4170 ,TETRA ,17557621,Fri Nov 26 10:35:48 CET,Fri Nov 26 12:32:58 CET,0.0 0.606 1.04 1.42 1.762 2.069 2.338 2.815 3.035 3.254 3.556 3.816 3.961 4.238 4.504 4.756 4.874 5.113 5.339 5.644 5.838 6.027 6.315 6.587 6.843 7.099 7.34 7.636 7.911 8.196 8.546 8.845 9.134 9.495 9.907 10.302 10.708 11.129 11.569 12.003 12.492 13.062 13.627 14.25 14.921 15.686 16.509 17.364 18.209 18.888 18.991 18.759 18.389 17.952 17.465 16.968 16.485 16.048 15.616 15.228 14.864 14.521 14.179 13.85 13.546 13.23 12.94 12.681 12.428 12.16 11.916 11.646 11.366 11.168 10.972 10.717 10.401 10.073 9.85 9.615 9.248 8.998 8.717 8.57 8.299 8.017 7.676 7.484 7.205 6.905 6.699 6.481 5.963 5.659 5.321 4.962 4.548 3.963 3.201 -3 ,24957 ,TETRA ,17557622,Fri Nov 26 10:35:48 CET,Fri Nov 26 12:34:28 CET,0.0 0.724 1.172 1.547 1.904 2.224 2.482 2.952 3.183 3.389 3.659 3.926 4.086 4.389 4.685 4.969 5.104 5.377 5.647 6.019 6.257 6.487 6.792 7.087 7.393 7.674 7.938 8.279 8.622 8.971 9.376 9.75 10.1 10.494 10.945 11.372 11.841 12.36 12.894 13.449 14.094 14.865 15.646 16.503 17.344 18.248 19.192 20.187 21.123 21.944 22.214 21.925 21.425 20.856 20.27 19.668 19.113 18.634 18.107 17.648 17.25 16.858 16.481 16.135 15.808 15.455 15.138 14.875 14.595 14.285 14.015 13.724 13.429 13.209 12.972 12.701 12.41 12.124 11.926 11.72 11.416 11.203 10.964 10.831 10.573 10.299 9.997 9.864 9.633 9.416 9.247 9.063 8.643 8.403 8.137 7.818 7.451 7.014 6.231 -4 ,3601 ,TETRA ,17557623,Fri Nov 26 10:35:48 CET,Fri Nov 26 12:34:26 CET,0.0 0.672 1.171 1.583 1.971 2.292 2.548 2.999 3.199 3.401 3.705 3.983 4.144 4.432 4.722 5.015 5.152 5.416 5.657 5.987 6.217 6.44 6.735 7.004 7.263 7.513 7.757 8.091 8.412 8.714 9.09 9.452 9.789 10.151 10.528 10.91 11.345 11.824 12.317 12.841 13.402 13.968 14.554 15.273 16.097 16.953 17.732 18.57 19.497 20.337 20.521 20.219 19.798 19.287 18.757 18.278 17.798 17.344 16.867 16.466 16.123 15.807 15.485 15.155 14.857 14.516 14.174 13.873 13.555 13.216 12.931 12.63 12.305 12.047 11.798 11.556 11.3 10.997 10.773 10.55 10.228 10.01 9.784 9.668 9.383 9.077 8.772 8.617 8.376 8.138 7.965 7.764 7.311 7.046 6.719 6.357 5.929 5.418 4.723 -5 ,23628 ,TETRA ,17557624,Fri Nov 26 10:35:49 CET,Fri Nov 26 12:30:14 CET,0.0 0.703 1.218 1.642 2.008 2.347 2.643 3.136 3.347 3.543 3.809 4.076 4.243 4.568 4.88 5.167 5.288 5.5 5.706 6.006 6.186 6.376 6.681 6.952 7.22 7.487 7.744 8.099 8.449 8.768 9.11 9.422 9.71 10.028 10.377 10.718 11.106 11.518 11.967 12.422 12.903 13.485 14.067 14.732 15.429 16.183 17.005 17.869 18.708 19.432 19.624 19.352 18.913 18.437 17.936 17.455 16.994 16.563 16.102 15.693 15.355 15.045 14.722 14.401 14.089 13.759 13.469 13.213 12.94 12.615 12.318 12.015 11.727 11.511 11.251 10.968 10.693 10.403 10.202 9.996 9.648 9.414 9.202 9.095 8.86 8.569 8.23 8.051 7.789 7.554 7.378 7.163 6.643 6.364 6.068 5.695 5.195 4.593 3.892 -6 ,20452 ,TETRA ,17557625,Fri Nov 26 10:36:46 CET,Fri Nov 26 12:17:53 CET,0.0 0.608 1.044 1.384 1.683 1.941 2.153 2.552 2.741 2.914 3.156 3.421 3.586 3.883 4.132 4.355 4.46 4.67 4.866 5.138 5.326 5.52 5.793 6.072 6.349 6.606 6.842 7.149 7.463 7.759 8.095 8.411 8.704 9.03 9.397 9.746 10.115 10.514 10.931 11.345 11.806 12.346 12.891 13.539 14.255 15.023 15.804 16.618 17.435 18.117 18.251 17.979 17.517 17.044 16.588 16.1 15.599 15.154 14.657 14.2 13.81 13.453 13.125 12.814 12.515 12.196 11.884 11.602 11.31 10.997 10.735 10.469 10.193 9.947 9.671 9.402 9.14 8.85 8.637 8.419 8.081 7.839 7.566 7.421 7.124 6.82 6.501 6.322 6.051 5.726 5.5 5.268 4.792 4.521 4.242 3.925 3.563 3.141 2.501 -7 ,17667 ,TETRA ,17557626,Fri Nov 26 10:36:46 CET,Fri Nov 26 12:18:10 CET,0.0 0.518 0.945 1.315 1.621 1.886 2.136 2.573 2.777 2.98 3.26 3.53 3.69 3.972 4.231 4.5 4.628 4.877 5.138 5.5 5.724 5.953 6.271 6.552 6.825 7.088 7.332 7.653 7.973 8.286 8.666 9.025 9.362 9.728 10.116 10.491 10.922 11.389 11.868 12.356 12.866 13.434 13.992 14.619 15.293 16.042 16.867 17.789 18.644 19.33 19.427 19.073 18.654 18.236 17.77 17.263 16.765 16.327 15.91 15.531 15.177 14.83 14.473 14.126 13.798 13.465 13.171 12.902 12.613 12.309 12.032 11.726 11.423 11.186 10.944 10.696 10.42 10.133 9.944 9.768 9.486 9.264 9.036 8.918 8.649 8.372 8.093 7.937 7.682 7.42 7.219 6.98 6.486 6.236 5.948 5.626 5.285 4.885 4.335 -8 ,26865 ,TETRA ,17557627,Fri Nov 26 10:36:46 CET,Fri Nov 26 12:20:29 CET,0.0 0.523 0.926 1.252 1.574 1.896 2.185 2.65 2.853 3.046 3.302 3.561 3.7 3.942 4.173 4.381 4.484 4.683 4.878 5.166 5.348 5.526 5.794 6.071 6.329 6.565 6.808 7.131 7.427 7.714 8.066 8.406 8.744 9.155 9.629 10.088 10.584 11.094 11.641 12.205 12.773 13.394 14.017 14.734 15.508 16.34 17.196 18.118 19.064 19.902 20.178 20.006 19.612 19.119 18.599 18.089 17.602 17.194 16.763 16.358 15.977 15.597 15.241 14.88 14.522 14.135 13.793 13.5 13.2 12.891 12.638 12.376 12.096 11.884 11.651 11.384 11.092 10.801 10.611 10.42 10.108 9.876 9.589 9.438 9.149 8.828 8.465 8.282 8.005 7.694 7.474 7.229 6.714 6.443 6.14 5.78 5.375 4.888 4.29 -9 ,21569 ,TETRA ,17557629,Fri Nov 26 10:36:46 CET,Fri Nov 26 12:19:09 CET,0.0 0.593 1.115 1.542 1.891 2.213 2.495 2.982 3.195 3.399 3.68 3.948 4.11 4.416 4.698 4.954 5.077 5.329 5.557 5.908 6.149 6.359 6.653 6.938 7.211 7.485 7.756 8.089 8.383 8.658 9.002 9.316 9.605 9.933 10.297 10.637 11.0 11.407 11.833 12.298 12.837 13.417 13.972 14.603 15.277 16.018 16.783 17.571 18.318 18.865 18.999 18.777 18.335 17.834 17.334 16.845 16.361 15.923 15.444 15.016 14.641 14.283 13.925 13.57 13.237 12.882 12.586 12.333 12.045 11.744 11.521 11.289 11.009 10.796 10.585 10.344 10.081 9.799 9.607 9.414 9.104 8.886 8.651 8.522 8.26 8.005 7.738 7.579 7.308 6.976 6.745 6.522 6.043 5.771 5.475 5.132 4.735 4.285 3.72 -10 ,25915 ,TETRA ,17557630,Fri Nov 26 10:36:46 CET,Fri Nov 26 12:17:35 CET,0.0 0.57 1.023 1.391 1.668 1.931 2.187 2.671 2.905 3.108 3.364 3.631 3.774 4.043 4.324 4.577 4.702 4.942 5.167 5.509 5.717 5.916 6.196 6.454 6.725 7.001 7.259 7.565 7.861 8.153 8.52 8.894 9.234 9.604 10.022 10.395 10.781 11.188 11.605 12.043 12.536 13.094 13.647 14.277 14.928 15.676 16.536 17.48 18.432 19.224 19.438 19.131 18.65 18.151 17.603 17.086 16.58 16.089 15.553 15.104 14.704 14.281 13.9 13.532 13.183 12.843 12.511 12.201 11.894 11.58 11.293 10.984 10.678 10.453 10.227 9.989 9.73 9.427 9.212 8.998 8.684 8.464 8.224 8.089 7.792 7.475 7.147 6.972 6.7 6.429 6.209 5.976 5.482 5.183 4.862 4.499 4.039 3.541 2.82 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt deleted file mode 100644 index bef5460e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2955 ,TETRA ,17557631,Fri Nov 26 10:36:46 CET,Fri Nov 26 12:29:35 CET,0.0 0.197 0.35 0.472 0.572 0.667 0.767 0.95 1.039 1.121 1.24 1.346 1.409 1.536 1.658 1.776 1.836 1.958 2.067 2.215 2.301 2.382 2.53 2.685 2.822 2.947 3.053 3.187 3.321 3.449 3.603 3.743 3.878 4.036 4.219 4.406 4.602 4.788 4.983 5.202 5.438 5.679 5.915 6.188 6.454 6.686 6.837 6.855 6.631 5.736 4.178 2.734 1.408 0.148 -1.064 -2.085 -3.015 -3.859 -4.716 -5.448 -6.084 -6.669 -7.228 -7.757 -8.251 -8.774 -9.25 -9.651 -10.053 -10.483 -10.863 -11.259 -11.661 -11.971 -12.298 -12.657 -13.024 -13.413 -13.682 -13.951 -14.372 -14.682 -15.015 -15.176 -15.509 -15.882 -16.278 -16.482 -16.731 -17.174 -17.437 -17.712 -18.301 -18.647 -19.065 -19.585 -20.212 -20.96 -22.0 -2 ,9442 ,TETRA ,17557632,Fri Nov 26 10:36:47 CET,Fri Nov 26 12:28:55 CET,0.0 0.174 0.321 0.426 0.521 0.618 0.715 0.9 0.983 1.06 1.179 1.296 1.374 1.536 1.693 1.837 1.904 2.025 2.14 2.304 2.406 2.505 2.653 2.808 2.963 3.109 3.248 3.433 3.605 3.749 3.916 4.082 4.245 4.435 4.661 4.885 5.112 5.34 5.569 5.797 6.045 6.317 6.585 6.878 7.076 7.217 7.369 7.313 6.882 5.892 4.422 2.935 1.505 0.196 -0.986 -2.023 -2.962 -3.746 -4.525 -5.225 -5.873 -6.492 -7.073 -7.596 -8.051 -8.54 -9.009 -9.428 -9.844 -10.247 -10.583 -10.948 -11.34 -11.663 -12.011 -12.372 -12.746 -13.124 -13.393 -13.683 -14.161 -14.49 -14.832 -15.005 -15.343 -15.718 -16.144 -16.364 -16.646 -17.12 -17.37 -17.657 -18.264 -18.613 -19.021 -19.46 -20.018 -20.829 -21.945 -3 ,13075 ,TETRA ,17557633,Fri Nov 26 10:36:47 CET,Fri Nov 26 12:31:26 CET,0.0 0.213 0.383 0.536 0.675 0.793 0.925 1.174 1.271 1.359 1.47 1.57 1.639 1.769 1.888 1.993 2.048 2.156 2.252 2.405 2.506 2.597 2.729 2.865 3.011 3.151 3.277 3.444 3.605 3.767 3.963 4.145 4.32 4.523 4.747 4.944 5.13 5.338 5.567 5.798 6.066 6.336 6.58 6.853 7.062 7.237 7.38 7.402 7.13 6.08 4.387 2.776 1.233 -0.136 -1.344 -2.403 -3.395 -4.246 -5.073 -5.783 -6.393 -6.964 -7.534 -8.076 -8.567 -9.105 -9.594 -10.009 -10.447 -10.891 -11.242 -11.614 -12.024 -12.358 -12.703 -13.036 -13.413 -13.827 -14.096 -14.382 -14.85 -15.179 -15.509 -15.677 -16.009 -16.359 -16.754 -16.958 -17.215 -17.632 -17.873 -18.158 -18.787 -19.139 -19.557 -20.036 -20.614 -21.328 -22.294 -4 ,13327 ,TETRA ,17557634,Fri Nov 26 10:36:47 CET,Fri Nov 26 12:32:10 CET,0.0 0.199 0.381 0.53 0.66 0.78 0.908 1.142 1.248 1.359 1.511 1.639 1.721 1.876 2.024 2.149 2.203 2.309 2.424 2.603 2.722 2.834 2.988 3.144 3.297 3.451 3.588 3.745 3.888 4.03 4.208 4.369 4.52 4.702 4.902 5.088 5.298 5.545 5.791 6.001 6.189 6.405 6.623 6.869 7.131 7.369 7.552 7.588 7.36 6.563 5.019 3.511 2.247 1.087 -0.03 -1.04 -2.007 -2.83 -3.645 -4.349 -4.969 -5.584 -6.171 -6.718 -7.216 -7.721 -8.178 -8.587 -9.025 -9.49 -9.859 -10.223 -10.62 -10.937 -11.27 -11.637 -12.002 -12.372 -12.625 -12.877 -13.275 -13.57 -13.877 -14.026 -14.339 -14.679 -15.04 -15.235 -15.477 -15.867 -16.097 -16.347 -16.956 -17.296 -17.638 -18.065 -18.654 -19.401 -20.308 -5 ,12736 ,TETRA ,17557635,Fri Nov 26 10:37:46 CET,Fri Nov 26 12:26:33 CET,0.0 0.233 0.374 0.483 0.59 0.705 0.817 1.019 1.115 1.206 1.346 1.481 1.571 1.736 1.899 2.049 2.123 2.269 2.401 2.595 2.73 2.853 3.015 3.182 3.344 3.492 3.643 3.846 4.024 4.197 4.418 4.624 4.806 5.006 5.235 5.45 5.665 5.872 6.058 6.283 6.548 6.782 6.992 7.221 7.438 7.666 7.825 7.833 7.566 6.621 5.101 3.704 2.407 1.23 0.14 -0.892 -1.819 -2.588 -3.355 -4.012 -4.594 -5.157 -5.73 -6.27 -6.736 -7.223 -7.691 -8.092 -8.493 -8.927 -9.301 -9.68 -10.061 -10.386 -10.729 -11.056 -11.404 -11.788 -12.05 -12.314 -12.722 -13.013 -13.311 -13.46 -13.807 -14.203 -14.624 -14.846 -15.111 -15.546 -15.818 -16.127 -16.745 -17.105 -17.516 -17.953 -18.52 -19.263 -20.294 -6 ,32142 ,TETRA ,17557636,Fri Nov 26 10:37:46 CET,Fri Nov 26 12:33:32 CET,0.0 0.136 0.261 0.393 0.526 0.638 0.729 0.897 0.98 1.059 1.179 1.299 1.374 1.514 1.65 1.779 1.837 1.95 2.053 2.199 2.296 2.392 2.537 2.665 2.786 2.905 3.023 3.174 3.319 3.454 3.61 3.763 3.908 4.068 4.256 4.439 4.633 4.826 5.009 5.199 5.427 5.71 5.979 6.23 6.425 6.638 6.907 6.961 6.624 5.748 4.194 2.646 1.303 0.115 -0.988 -1.977 -2.907 -3.727 -4.551 -5.26 -5.908 -6.533 -7.118 -7.657 -8.146 -8.67 -9.135 -9.529 -9.928 -10.355 -10.734 -11.139 -11.546 -11.852 -12.19 -12.538 -12.885 -13.255 -13.494 -13.734 -14.13 -14.412 -14.747 -14.93 -15.29 -15.677 -16.108 -16.327 -16.578 -16.982 -17.212 -17.456 -18.033 -18.397 -18.798 -19.203 -19.73 -20.449 -21.464 -7 ,1900 ,TETRA ,17557637,Fri Nov 26 10:37:46 CET,Fri Nov 26 12:30:30 CET,0.0 0.18 0.375 0.529 0.647 0.773 0.884 1.05 1.129 1.208 1.33 1.434 1.493 1.609 1.731 1.847 1.906 2.014 2.11 2.244 2.339 2.441 2.583 2.712 2.826 2.929 3.033 3.181 3.326 3.46 3.618 3.772 3.914 4.067 4.257 4.448 4.641 4.829 5.027 5.232 5.455 5.705 5.917 6.109 6.303 6.521 6.697 6.732 6.448 5.561 4.091 2.653 1.313 0.069 -1.113 -2.158 -3.073 -3.835 -4.605 -5.283 -5.923 -6.564 -7.138 -7.674 -8.177 -8.696 -9.162 -9.575 -10.015 -10.462 -10.829 -11.217 -11.6 -11.907 -12.24 -12.581 -12.933 -13.291 -13.544 -13.814 -14.245 -14.549 -14.854 -15.001 -15.311 -15.641 -16.006 -16.218 -16.487 -16.923 -17.182 -17.448 -18.027 -18.378 -18.777 -19.229 -19.691 -20.214 -21.046 -8 ,21501 ,TETRA ,17557638,Fri Nov 26 10:37:46 CET,Fri Nov 26 12:32:02 CET,0.0 0.2 0.389 0.52 0.64 0.744 0.841 1.023 1.104 1.178 1.297 1.405 1.475 1.614 1.739 1.86 1.924 2.049 2.163 2.339 2.453 2.546 2.682 2.826 2.956 3.078 3.191 3.328 3.464 3.602 3.766 3.916 4.061 4.233 4.427 4.605 4.79 4.993 5.198 5.386 5.593 5.821 6.003 6.191 6.379 6.515 6.59 6.58 6.256 5.318 3.769 2.183 0.732 -0.535 -1.663 -2.655 -3.522 -4.264 -5.006 -5.629 -6.194 -6.766 -7.33 -7.855 -8.333 -8.86 -9.342 -9.753 -10.172 -10.603 -10.96 -11.336 -11.738 -12.054 -12.387 -12.741 -13.118 -13.51 -13.799 -14.093 -14.519 -14.833 -15.146 -15.308 -15.678 -16.079 -16.512 -16.73 -16.996 -17.47 -17.76 -18.036 -18.587 -18.934 -19.348 -19.816 -20.314 -20.981 -21.951 -9 ,26298 ,TETRA ,17557639,Fri Nov 26 10:37:46 CET,Fri Nov 26 12:20:27 CET,0.0 0.197 0.348 0.481 0.606 0.724 0.82 0.983 1.057 1.139 1.268 1.378 1.452 1.6 1.73 1.85 1.908 2.019 2.134 2.297 2.401 2.512 2.66 2.796 2.933 3.068 3.204 3.369 3.525 3.681 3.855 4.026 4.192 4.371 4.578 4.771 4.983 5.201 5.422 5.659 5.923 6.2 6.436 6.666 6.874 7.103 7.265 7.254 6.869 5.768 4.04 2.45 1.092 -0.099 -1.182 -2.167 -3.098 -3.895 -4.672 -5.357 -6.0 -6.63 -7.214 -7.759 -8.259 -8.779 -9.241 -9.65 -10.087 -10.537 -10.915 -11.311 -11.721 -12.044 -12.389 -12.747 -13.107 -13.496 -13.758 -14.01 -14.43 -14.731 -15.046 -15.208 -15.544 -15.922 -16.329 -16.539 -16.796 -17.235 -17.489 -17.765 -18.42 -18.79 -19.207 -19.711 -20.286 -20.982 -22.036 -10 ,9193 ,TETRA ,17557640,Fri Nov 26 10:37:46 CET,Fri Nov 26 12:33:04 CET,0.0 0.2 0.357 0.485 0.603 0.71 0.806 1.003 1.099 1.183 1.315 1.439 1.516 1.671 1.808 1.921 1.978 2.092 2.202 2.357 2.454 2.55 2.694 2.844 2.986 3.11 3.237 3.403 3.572 3.73 3.907 4.069 4.226 4.423 4.63 4.837 5.054 5.27 5.49 5.698 5.941 6.225 6.48 6.752 7.046 7.319 7.441 7.494 7.353 6.41 4.765 3.171 1.713 0.445 -0.716 -1.782 -2.754 -3.573 -4.419 -5.174 -5.843 -6.45 -7.034 -7.6 -8.109 -8.648 -9.144 -9.569 -10.002 -10.471 -10.875 -11.298 -11.699 -11.981 -12.283 -12.601 -12.938 -13.319 -13.593 -13.872 -14.309 -14.619 -14.937 -15.11 -15.481 -15.86 -16.234 -16.428 -16.684 -17.139 -17.412 -17.695 -18.267 -18.582 -18.969 -19.424 -19.979 -20.665 -21.622 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt deleted file mode 100644 index b08068ef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4735 ,TETRA ,17557641,Fri Nov 26 10:37:46 CET,Fri Nov 26 12:31:52 CET,0.0 0.124 0.202 0.252 0.272 0.293 0.32 0.349 0.354 0.35 0.293 0.325 0.314 0.293 0.271 0.233 0.216 0.188 0.15 0.068 0.011 -0.042 -0.133 -0.229 -0.326 -0.417 -0.516 -0.665 -0.802 -0.947 -1.135 -1.317 -1.516 -1.77 -2.07 -2.374 -2.745 -3.192 -3.709 -4.272 -4.942 -5.793 -6.731 -7.93 -9.407 -11.333 -13.812 -17.117 -21.712 -28.896 -36.822 -42.81 -47.542 -51.327 -54.515 -57.17 -59.466 -61.38 -63.192 -64.73 -66.126 -67.432 -68.594 -69.633 -70.577 -71.545 -72.392 -73.116 -73.857 -74.632 -75.248 -75.866 -76.523 -77.034 -77.56 -78.099 -78.644 -79.208 -79.613 -80.028 -80.646 -81.055 -81.478 -81.699 -82.15 -82.643 -83.15 -83.402 -83.776 -84.268 -84.593 -84.96 -85.777 -86.201 -86.677 -87.184 -87.766 -88.593 -89.594 -2 ,4187 ,TETRA ,17557642,Fri Nov 26 10:38:47 CET,Fri Nov 26 12:18:33 CET,0.0 0.222 0.368 0.471 0.55 0.609 0.665 0.766 0.81 0.848 0.852 0.897 0.908 0.932 0.936 0.926 0.92 0.917 0.904 0.87 0.842 0.816 0.765 0.703 0.636 0.559 0.472 0.345 0.214 0.092 -0.069 -0.252 -0.431 -0.647 -0.926 -1.229 -1.585 -1.993 -2.454 -2.979 -3.628 -4.432 -5.303 -6.428 -7.793 -9.619 -12.117 -15.506 -20.287 -27.63 -35.534 -41.586 -46.356 -50.15 -53.327 -55.977 -58.313 -60.256 -62.135 -63.708 -65.051 -66.291 -67.449 -68.507 -69.461 -70.454 -71.313 -72.033 -72.77 -73.53 -74.151 -74.791 -75.447 -75.951 -76.478 -77.037 -77.601 -78.17 -78.553 -78.935 -79.542 -79.962 -80.395 -80.611 -81.054 -81.519 -82.011 -82.268 -82.644 -83.154 -83.494 -83.842 -84.548 -84.965 -85.419 -85.897 -86.443 -87.084 -88.058 -3 ,13834 ,TETRA ,17557643,Fri Nov 26 10:38:47 CET,Fri Nov 26 12:32:43 CET,0.0 0.089 0.16 0.211 0.25 0.293 0.332 0.358 0.359 0.369 0.345 0.384 0.392 0.422 0.431 0.428 0.42 0.383 0.358 0.332 0.3 0.26 0.189 0.114 0.03 -0.067 -0.17 -0.312 -0.456 -0.601 -0.793 -0.989 -1.176 -1.409 -1.687 -1.995 -2.386 -2.833 -3.333 -3.903 -4.611 -5.503 -6.471 -7.702 -9.202 -11.101 -13.497 -16.769 -21.519 -28.769 -36.682 -42.69 -47.325 -51.086 -54.295 -56.946 -59.266 -61.244 -63.144 -64.709 -66.062 -67.329 -68.498 -69.547 -70.48 -71.417 -72.241 -72.967 -73.719 -74.479 -75.103 -75.728 -76.372 -76.889 -77.405 -77.913 -78.438 -78.992 -79.387 -79.803 -80.468 -80.912 -81.356 -81.586 -82.056 -82.525 -82.995 -83.255 -83.633 -84.083 -84.405 -84.74 -85.434 -85.856 -86.306 -86.8 -87.431 -88.175 -89.254 -4 ,96 ,TETRA ,17557644,Fri Nov 26 10:38:48 CET,Fri Nov 26 12:33:06 CET,0.0 0.093 0.142 0.179 0.208 0.233 0.246 0.267 0.277 0.284 0.247 0.279 0.266 0.238 0.201 0.17 0.155 0.131 0.098 0.036 -0.011 -0.069 -0.167 -0.274 -0.375 -0.46 -0.547 -0.684 -0.82 -0.965 -1.154 -1.35 -1.558 -1.806 -2.1 -2.395 -2.75 -3.186 -3.7 -4.273 -4.955 -5.806 -6.734 -7.925 -9.405 -11.288 -13.713 -17.01 -21.577 -28.602 -36.33 -42.135 -46.744 -50.436 -53.544 -56.174 -58.455 -60.361 -62.185 -63.692 -65.013 -66.262 -67.441 -68.504 -69.434 -70.388 -71.239 -71.974 -72.73 -73.504 -74.135 -74.763 -75.417 -75.939 -76.458 -76.978 -77.509 -78.067 -78.46 -78.881 -79.553 -79.997 -80.415 -80.633 -81.11 -81.631 -82.193 -82.48 -82.894 -83.476 -83.828 -84.156 -84.891 -85.326 -85.748 -86.242 -86.878 -87.612 -88.771 -5 ,11707 ,TETRA ,17557645,Fri Nov 26 10:38:47 CET,Fri Nov 26 12:30:10 CET,0.0 0.068 0.104 0.126 0.15 0.178 0.203 0.219 0.219 0.221 0.195 0.233 0.225 0.202 0.171 0.141 0.125 0.091 0.054 -0.018 -0.068 -0.117 -0.207 -0.307 -0.394 -0.479 -0.558 -0.676 -0.815 -0.956 -1.131 -1.31 -1.497 -1.732 -2.028 -2.325 -2.659 -3.058 -3.526 -4.064 -4.733 -5.59 -6.542 -7.741 -9.212 -11.085 -13.424 -16.646 -21.305 -28.458 -36.123 -41.922 -46.548 -50.264 -53.415 -56.09 -58.444 -60.397 -62.288 -63.87 -65.239 -66.498 -67.647 -68.691 -69.627 -70.597 -71.436 -72.137 -72.853 -73.604 -74.226 -74.858 -75.49 -75.978 -76.49 -77.017 -77.585 -78.174 -78.544 -78.906 -79.484 -79.899 -80.329 -80.554 -81.05 -81.584 -82.156 -82.46 -82.856 -83.337 -83.671 -84.031 -84.751 -85.142 -85.575 -86.082 -86.645 -87.334 -88.324 -6 ,22502 ,TETRA ,17557646,Fri Nov 26 10:38:47 CET,Fri Nov 26 12:29:37 CET,0.0 0.104 0.188 0.245 0.276 0.303 0.335 0.384 0.403 0.42 0.386 0.424 0.413 0.383 0.36 0.335 0.322 0.282 0.233 0.163 0.119 0.07 -0.01 -0.092 -0.193 -0.293 -0.393 -0.524 -0.649 -0.789 -0.978 -1.18 -1.394 -1.647 -1.94 -2.254 -2.619 -3.045 -3.542 -4.114 -4.79 -5.64 -6.609 -7.815 -9.233 -11.114 -13.593 -16.87 -21.478 -28.59 -36.277 -42.011 -46.593 -50.322 -53.451 -56.072 -58.343 -60.239 -62.047 -63.546 -64.85 -66.082 -67.232 -68.284 -69.234 -70.196 -71.025 -71.736 -72.459 -73.22 -73.851 -74.49 -75.138 -75.63 -76.14 -76.668 -77.221 -77.778 -78.152 -78.553 -79.184 -79.629 -80.086 -80.311 -80.755 -81.221 -81.764 -82.045 -82.436 -82.954 -83.27 -83.585 -84.305 -84.704 -85.166 -85.72 -86.321 -87.147 -88.462 -7 ,10820 ,TETRA ,17557647,Fri Nov 26 10:38:47 CET,Fri Nov 26 12:32:50 CET,0.0 0.105 0.18 0.219 0.25 0.285 0.308 0.327 0.325 0.323 0.265 0.298 0.294 0.283 0.256 0.225 0.209 0.179 0.147 0.082 0.022 -0.045 -0.151 -0.25 -0.338 -0.431 -0.53 -0.665 -0.813 -0.97 -1.161 -1.339 -1.513 -1.734 -1.991 -2.267 -2.606 -3.006 -3.474 -4.005 -4.672 -5.519 -6.43 -7.619 -9.138 -11.064 -13.503 -16.773 -21.325 -28.396 -36.053 -41.74 -46.274 -50.045 -53.247 -55.896 -58.168 -60.054 -61.907 -63.465 -64.797 -66.048 -67.237 -68.317 -69.265 -70.225 -71.075 -71.8 -72.533 -73.295 -73.926 -74.564 -75.206 -75.706 -76.227 -76.744 -77.294 -77.896 -78.298 -78.685 -79.297 -79.728 -80.146 -80.362 -80.822 -81.32 -81.847 -82.12 -82.511 -83.016 -83.318 -83.629 -84.403 -84.837 -85.313 -85.886 -86.559 -87.388 -88.587 -8 ,21010 ,TETRA ,17557648,Fri Nov 26 10:38:47 CET,Fri Nov 26 12:32:43 CET,0.0 0.113 0.242 0.339 0.416 0.472 0.511 0.555 0.576 0.59 0.563 0.61 0.624 0.648 0.639 0.617 0.607 0.575 0.539 0.488 0.455 0.412 0.345 0.278 0.21 0.13 0.043 -0.082 -0.218 -0.351 -0.528 -0.718 -0.905 -1.131 -1.402 -1.689 -2.036 -2.454 -2.942 -3.488 -4.148 -4.994 -5.951 -7.187 -8.73 -10.664 -13.114 -16.539 -21.376 -28.691 -36.481 -42.315 -46.965 -50.744 -53.945 -56.639 -58.951 -60.866 -62.744 -64.309 -65.658 -66.929 -68.108 -69.185 -70.157 -71.156 -72.016 -72.751 -73.498 -74.247 -74.867 -75.508 -76.17 -76.665 -77.161 -77.698 -78.235 -78.768 -79.151 -79.554 -80.18 -80.605 -81.042 -81.272 -81.741 -82.214 -82.732 -83.015 -83.402 -83.87 -84.172 -84.496 -85.199 -85.592 -86.031 -86.517 -87.081 -87.895 -88.998 -9 ,12597 ,TETRA ,17557649,Fri Nov 26 10:38:47 CET,Fri Nov 26 12:32:48 CET,0.0 0.078 0.121 0.165 0.197 0.223 0.242 0.253 0.252 0.246 0.197 0.235 0.235 0.215 0.182 0.149 0.127 0.076 0.023 -0.058 -0.113 -0.167 -0.256 -0.342 -0.422 -0.524 -0.633 -0.776 -0.929 -1.085 -1.283 -1.473 -1.648 -1.874 -2.156 -2.439 -2.769 -3.157 -3.606 -4.147 -4.811 -5.613 -6.495 -7.635 -9.072 -11.003 -13.496 -16.877 -21.645 -28.861 -36.659 -42.601 -47.334 -51.152 -54.358 -56.991 -59.312 -61.285 -63.174 -64.739 -66.1 -67.343 -68.512 -69.604 -70.554 -71.518 -72.383 -73.12 -73.863 -74.623 -75.26 -75.899 -76.542 -77.054 -77.568 -78.086 -78.637 -79.193 -79.568 -79.972 -80.619 -81.066 -81.53 -81.774 -82.272 -82.794 -83.315 -83.571 -83.955 -84.461 -84.793 -85.145 -85.812 -86.163 -86.559 -87.052 -87.672 -88.416 -89.471 -10 ,4407 ,TETRA ,17557650,Fri Nov 26 10:38:50 CET,Fri Nov 26 12:28:59 CET,0.0 0.067 0.106 0.131 0.157 0.171 0.181 0.184 0.182 0.186 0.139 0.161 0.149 0.118 0.083 0.05 0.03 -0.018 -0.067 -0.145 -0.199 -0.256 -0.348 -0.449 -0.55 -0.65 -0.757 -0.891 -1.021 -1.163 -1.345 -1.538 -1.731 -1.97 -2.268 -2.575 -2.952 -3.411 -3.925 -4.502 -5.205 -6.094 -7.093 -8.329 -9.797 -11.658 -14.043 -17.263 -21.898 -29.017 -36.64 -42.527 -47.172 -50.859 -53.976 -56.587 -58.824 -60.688 -62.506 -64.039 -65.381 -66.628 -67.778 -68.843 -69.784 -70.729 -71.574 -72.298 -73.042 -73.834 -74.489 -75.148 -75.837 -76.369 -76.911 -77.468 -78.023 -78.578 -78.967 -79.378 -80.028 -80.462 -80.891 -81.119 -81.621 -82.132 -82.652 -82.924 -83.294 -83.823 -84.17 -84.505 -85.281 -85.727 -86.186 -86.676 -87.315 -88.078 -89.141 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt deleted file mode 100644 index d6908de9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5908 ,TETRA ,17557651,Fri Nov 26 10:39:46 CET,Fri Nov 26 12:37:37 CET,0.0 0.921 1.275 1.532 1.77 2.03 2.3 2.547 2.965 3.153 3.348 3.628 3.912 4.08 4.37 4.629 4.875 4.997 5.235 5.458 5.775 5.972 6.165 6.435 6.683 6.95 7.214 7.45 7.753 8.069 8.379 8.739 9.079 9.417 9.838 10.29 10.714 11.192 11.688 12.217 12.786 13.432 14.174 14.924 15.812 16.791 17.903 19.092 20.428 21.935 23.441 24.161 24.198 23.965 23.605 23.202 22.777 22.347 21.943 21.504 21.126 20.756 20.386 20.06 19.74 19.425 19.08 18.768 18.49 18.18 17.851 17.572 17.282 16.99 16.769 16.531 16.283 16.029 15.766 15.582 15.377 15.024 14.773 14.524 14.399 14.124 13.832 13.524 13.356 13.104 12.851 12.669 12.464 11.972 11.716 11.402 11.045 10.629 10.1 9.421 6.553 -2 ,15985 ,TETRA ,17557652,Fri Nov 26 10:39:46 CET,Fri Nov 26 12:39:01 CET,0.0 1.508 1.935 2.268 2.546 2.801 3.025 3.226 3.61 3.809 3.995 4.248 4.512 4.667 4.983 5.284 5.568 5.715 6.001 6.235 6.554 6.768 6.974 7.264 7.53 7.78 8.034 8.296 8.628 8.935 9.236 9.606 9.964 10.316 10.709 11.155 11.596 12.07 12.596 13.177 13.804 14.538 15.361 16.11 16.949 17.871 18.934 20.117 21.445 22.865 24.083 24.535 24.524 24.289 23.908 23.483 23.054 22.628 22.213 21.79 21.421 21.063 20.702 20.333 19.996 19.7 19.371 19.057 18.777 18.501 18.216 17.959 17.684 17.395 17.168 16.922 16.653 16.37 16.073 15.866 15.657 15.319 15.07 14.82 14.69 14.405 14.099 13.772 13.604 13.349 13.058 12.845 12.636 12.193 11.924 11.622 11.312 10.963 10.538 10.024 6.993 -3 ,13386 ,TETRA ,17557653,Fri Nov 26 10:39:46 CET,Fri Nov 26 12:42:19 CET,0.0 1.62 2.053 2.374 2.63 2.853 3.052 3.251 3.619 3.787 3.953 4.192 4.453 4.601 4.882 5.149 5.413 5.545 5.788 6.016 6.375 6.623 6.859 7.198 7.503 7.766 8.015 8.255 8.566 8.882 9.208 9.606 9.973 10.331 10.752 11.208 11.646 12.128 12.642 13.183 13.767 14.436 15.195 15.948 16.879 17.989 19.233 20.606 22.169 23.78 25.349 26.095 26.118 25.897 25.529 25.07 24.586 24.088 23.632 23.151 22.707 22.308 21.951 21.591 21.255 20.954 20.623 20.318 20.034 19.753 19.498 19.26 18.996 18.722 18.494 18.269 18.032 17.773 17.503 17.31 17.102 16.754 16.515 16.288 16.168 15.896 15.603 15.304 15.15 14.894 14.592 14.391 14.19 13.764 13.537 13.259 12.915 12.522 12.061 11.422 9.175 -4 ,2854 ,TETRA ,17557654,Fri Nov 26 10:39:46 CET,Fri Nov 26 12:32:07 CET,0.0 1.535 2.03 2.432 2.78 3.072 3.323 3.55 3.967 4.161 4.345 4.58 4.831 4.977 5.251 5.509 5.775 5.899 6.122 6.339 6.636 6.823 7.014 7.291 7.574 7.872 8.16 8.424 8.754 9.083 9.412 9.798 10.152 10.499 10.911 11.367 11.811 12.313 12.874 13.453 14.04 14.715 15.487 16.268 17.252 18.337 19.466 20.732 22.174 23.648 25.097 25.947 26.091 25.894 25.544 25.118 24.689 24.278 23.911 23.494 23.09 22.677 22.269 21.907 21.561 21.238 20.914 20.617 20.324 20.021 19.703 19.404 19.095 18.795 18.556 18.288 18.013 17.743 17.451 17.24 17.02 16.666 16.401 16.123 15.981 15.693 15.407 15.101 14.928 14.657 14.331 14.106 13.865 13.354 13.072 12.773 12.445 12.041 11.558 10.906 7.451 -5 ,368 ,TETRA ,17557655,Fri Nov 26 10:39:46 CET,Fri Nov 26 12:36:53 CET,0.0 2.435 2.878 3.288 3.611 3.896 4.153 4.375 4.801 5.002 5.177 5.398 5.646 5.802 6.096 6.366 6.619 6.74 6.976 7.206 7.53 7.731 7.937 8.24 8.522 8.795 9.061 9.315 9.653 9.977 10.29 10.667 11.024 11.362 11.73 12.159 12.599 13.062 13.553 14.096 14.673 15.337 16.127 16.908 17.787 18.749 19.858 21.057 22.353 23.76 25.117 25.703 25.672 25.388 25.04 24.649 24.253 23.84 23.406 22.969 22.617 22.273 21.937 21.593 21.257 20.952 20.619 20.327 20.069 19.796 19.508 19.267 19.019 18.736 18.496 18.256 18.002 17.739 17.467 17.271 17.067 16.751 16.523 16.278 16.153 15.884 15.615 15.353 15.211 14.972 14.69 14.485 14.272 13.819 13.574 13.284 12.908 12.478 11.932 11.112 8.112 -6 ,14816 ,TETRA ,17557656,Fri Nov 26 10:39:48 CET,Fri Nov 26 12:39:08 CET,0.0 1.622 2.067 2.349 2.603 2.819 3.03 3.24 3.63 3.8 3.966 4.211 4.472 4.604 4.885 5.178 5.432 5.548 5.768 5.983 6.308 6.513 6.708 7.002 7.278 7.541 7.807 8.065 8.403 8.715 8.994 9.341 9.698 10.027 10.413 10.864 11.283 11.738 12.236 12.785 13.367 13.981 14.7 15.474 16.347 17.284 18.324 19.479 20.814 22.246 23.688 24.539 24.734 24.53 24.125 23.669 23.221 22.753 22.325 21.929 21.578 21.228 20.865 20.513 20.181 19.868 19.528 19.216 18.952 18.681 18.381 18.122 17.83 17.525 17.309 17.071 16.814 16.554 16.28 16.091 15.894 15.579 15.363 15.148 15.038 14.797 14.526 14.221 14.053 13.78 13.507 13.324 13.102 12.623 12.361 12.074 11.756 11.386 10.934 10.343 8.404 -7 ,11619 ,TETRA ,17557657,Fri Nov 26 10:39:46 CET,Fri Nov 26 12:37:01 CET,0.0 0.878 1.119 1.344 1.581 1.796 1.962 2.108 2.401 2.545 2.689 2.883 3.127 3.272 3.54 3.788 4.043 4.167 4.417 4.674 5.036 5.253 5.45 5.746 6.03 6.29 6.54 6.785 7.113 7.435 7.752 8.139 8.515 8.895 9.329 9.827 10.331 10.875 11.449 12.075 12.741 13.426 14.166 14.904 15.776 16.76 17.856 19.053 20.408 21.877 23.327 24.03 24.096 23.835 23.453 22.993 22.473 21.983 21.559 21.112 20.716 20.324 19.921 19.558 19.216 18.891 18.57 18.265 17.983 17.664 17.331 17.084 16.826 16.536 16.309 16.085 15.851 15.595 15.321 15.135 14.933 14.604 14.389 14.165 14.048 13.799 13.516 13.21 13.055 12.812 12.57 12.398 12.221 11.8 11.557 11.296 11.012 10.643 10.2 9.608 7.216 -8 ,26969 ,TETRA ,17557658,Fri Nov 26 10:40:50 CET,Fri Nov 26 12:35:13 CET,0.0 1.013 1.317 1.618 1.906 2.145 2.348 2.534 2.887 3.055 3.214 3.431 3.679 3.816 4.088 4.346 4.596 4.721 4.973 5.211 5.539 5.761 5.987 6.302 6.581 6.838 7.089 7.336 7.65 7.967 8.267 8.612 8.959 9.308 9.719 10.194 10.685 11.215 11.773 12.349 12.915 13.562 14.322 15.066 15.939 16.869 17.877 19.049 20.413 21.899 23.345 24.056 24.168 23.993 23.68 23.278 22.838 22.336 21.869 21.419 21.031 20.676 20.327 19.98 19.627 19.307 18.978 18.665 18.374 18.081 17.783 17.533 17.264 16.968 16.742 16.507 16.257 15.986 15.69 15.489 15.28 14.924 14.664 14.407 14.283 14.0 13.673 13.346 13.175 12.901 12.581 12.382 12.188 11.719 11.441 11.133 10.792 10.395 9.863 9.043 6.004 -9 ,5016 ,TETRA ,17557659,Fri Nov 26 10:40:53 CET,Fri Nov 26 12:41:03 CET,0.0 0.663 1.047 1.422 1.739 1.982 2.2 2.407 2.815 3.008 3.184 3.418 3.688 3.849 4.141 4.42 4.676 4.791 5.011 5.23 5.554 5.757 5.951 6.223 6.493 6.756 7.005 7.248 7.551 7.847 8.128 8.484 8.846 9.184 9.57 10.028 10.471 10.959 11.497 12.035 12.603 13.254 14.009 14.771 15.691 16.756 17.905 19.071 20.44 22.008 23.607 24.418 24.538 24.34 23.955 23.555 23.153 22.675 22.266 21.86 21.472 21.139 20.818 20.474 20.142 19.835 19.511 19.204 18.933 18.667 18.377 18.126 17.866 17.585 17.367 17.136 16.892 16.635 16.367 16.189 16.001 15.685 15.46 15.222 15.092 14.814 14.522 14.189 14.001 13.718 13.398 13.184 12.977 12.538 12.28 11.987 11.66 11.299 10.833 10.189 8.039 -10 ,4420 ,TETRA ,17557660,Fri Nov 26 10:40:50 CET,Fri Nov 26 12:38:58 CET,0.0 1.287 1.736 2.088 2.41 2.695 2.915 3.124 3.523 3.714 3.893 4.11 4.359 4.513 4.842 5.158 5.421 5.535 5.76 5.974 6.29 6.495 6.698 7.023 7.354 7.657 7.94 8.202 8.516 8.826 9.124 9.504 9.889 10.242 10.643 11.086 11.518 11.993 12.497 13.051 13.625 14.259 14.994 15.705 16.559 17.535 18.592 19.727 20.966 22.241 23.543 24.236 24.296 24.1 23.784 23.378 22.959 22.527 22.123 21.713 21.343 20.971 20.577 20.209 19.868 19.537 19.173 18.85 18.58 18.296 17.994 17.73 17.454 17.185 16.982 16.758 16.511 16.26 16.006 15.812 15.604 15.294 15.073 14.824 14.688 14.41 14.135 13.848 13.696 13.444 13.173 12.994 12.801 12.355 12.094 11.8 11.465 11.08 10.651 10.106 8.24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt deleted file mode 100644 index c9ad4adb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26597 ,KEBNE ,17132069,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:25:25 CET,0.0 1.935 2.533 3.0 3.399 3.759 4.082 4.376 4.861 5.065 5.272 5.599 5.898 6.08 6.413 6.726 7.039 7.193 7.505 7.798 8.196 8.456 8.695 9.017 9.317 9.612 9.895 10.159 10.504 10.837 11.164 11.569 11.961 12.32 12.733 13.178 13.583 14.026 14.504 15.006 15.518 16.083 16.748 17.392 18.103 18.846 19.613 20.41 21.292 22.169 22.615 22.169 21.336 20.447 19.586 18.73 17.94 17.171 16.506 15.845 15.246 14.7 14.168 13.673 13.234 12.828 12.379 11.98 11.617 11.216 10.822 10.507 10.162 9.788 9.493 9.209 8.928 8.618 8.295 8.077 7.838 7.463 7.205 6.918 6.767 6.463 6.156 5.812 5.613 5.305 5.031 4.828 4.606 4.075 3.767 3.423 3.051 2.625 2.091 1.355 -1.309 -2 ,5111 ,KEBNE ,17132070,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:24:32 CET,0.0 4.245 5.133 5.643 6.037 6.403 6.745 7.057 7.604 7.849 8.08 8.388 8.674 8.854 9.214 9.54 9.826 9.958 10.225 10.477 10.818 11.063 11.302 11.629 11.948 12.263 12.572 12.86 13.233 13.579 13.896 14.262 14.601 14.937 15.332 15.773 16.208 16.681 17.192 17.731 18.275 18.892 19.614 20.335 21.144 21.955 22.774 23.582 24.453 25.324 25.631 25.154 24.366 23.401 22.503 21.636 20.837 20.078 19.395 18.713 18.116 17.587 17.064 16.562 16.109 15.693 15.263 14.874 14.524 14.156 13.763 13.443 13.117 12.756 12.473 12.174 11.843 11.509 11.167 10.923 10.683 10.317 10.053 9.776 9.628 9.321 9.015 8.671 8.48 8.199 7.915 7.682 7.425 6.86 6.554 6.211 5.788 5.353 4.831 3.994 0.772 -3 ,21946 ,KEBNE ,17132071,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:24:22 CET,0.0 3.515 4.154 4.621 5.012 5.351 5.645 5.909 6.387 6.611 6.829 7.123 7.417 7.605 7.945 8.278 8.586 8.736 9.049 9.333 9.713 9.969 10.213 10.539 10.853 11.155 11.457 11.761 12.128 12.479 12.821 13.235 13.633 14.024 14.483 14.97 15.406 15.851 16.357 16.893 17.421 17.993 18.649 19.271 19.958 20.776 21.65 22.449 23.254 24.015 24.362 23.909 23.121 22.264 21.441 20.61 19.81 19.047 18.387 17.73 17.127 16.593 16.081 15.582 15.115 14.668 14.193 13.773 13.419 13.047 12.652 12.314 11.969 11.61 11.327 11.046 10.752 10.446 10.12 9.885 9.642 9.227 8.909 8.596 8.444 8.124 7.77 7.391 7.203 6.894 6.555 6.335 6.101 5.603 5.321 4.976 4.566 4.043 3.444 2.667 -1.072 -4 ,24203 ,KEBNE ,17132072,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:25:41 CET,0.0 2.859 3.589 4.072 4.514 4.883 5.193 5.522 6.136 6.387 6.607 6.907 7.186 7.345 7.691 8.055 8.377 8.532 8.845 9.123 9.504 9.74 9.97 10.295 10.604 10.908 11.193 11.458 11.801 12.15 12.5 12.911 13.294 13.661 14.082 14.536 14.975 15.49 16.07 16.634 17.172 17.771 18.479 19.173 19.931 20.684 21.449 22.225 23.016 23.682 23.921 23.459 22.703 21.847 20.96 20.053 19.213 18.463 17.838 17.181 16.598 16.066 15.543 15.034 14.557 14.13 13.675 13.275 12.922 12.545 12.129 11.766 11.389 10.994 10.679 10.372 10.048 9.703 9.357 9.107 8.858 8.481 8.225 7.97 7.834 7.543 7.236 6.909 6.742 6.465 6.171 5.949 5.713 5.211 4.938 4.586 4.183 3.736 3.103 2.19 -1.902 -5 ,4745 ,KEBNE ,17132073,Sat Jan 1 17:42:21 CET,Sat Jan 1 19:24:21 CET,0.0 2.924 3.703 4.267 4.696 5.072 5.391 5.668 6.141 6.371 6.6 6.912 7.209 7.39 7.723 8.023 8.296 8.423 8.681 8.951 9.338 9.553 9.765 10.094 10.413 10.707 10.981 11.254 11.606 11.954 12.273 12.627 12.962 13.283 13.685 14.151 14.588 15.045 15.49 15.958 16.503 17.132 17.848 18.532 19.258 20.027 20.813 21.602 22.363 22.964 23.196 22.791 22.078 21.295 20.517 19.728 18.973 18.284 17.676 17.018 16.419 15.871 15.356 14.869 14.389 13.948 13.515 13.116 12.754 12.374 11.968 11.634 11.307 10.947 10.641 10.334 10.022 9.683 9.309 9.049 8.788 8.383 8.081 7.783 7.641 7.329 7.011 6.673 6.494 6.205 5.882 5.657 5.432 4.925 4.639 4.335 3.962 3.527 3.038 2.375 -1.457 -6 ,31615 ,KEBNE ,17132074,Sat Jan 1 17:45:26 CET,Sat Jan 1 19:29:28 CET,0.0 3.606 4.3 4.784 5.196 5.523 5.812 6.074 6.534 6.768 6.989 7.269 7.542 7.711 8.058 8.384 8.667 8.808 9.099 9.363 9.726 9.957 10.165 10.478 10.794 11.105 11.408 11.697 12.079 12.436 12.768 13.162 13.52 13.849 14.231 14.662 15.081 15.529 15.989 16.479 16.973 17.553 18.266 18.965 19.72 20.469 21.246 22.029 22.791 23.418 23.754 23.375 22.667 21.84 20.948 20.125 19.386 18.689 18.051 17.39 16.819 16.313 15.829 15.351 14.902 14.479 14.04 13.646 13.294 12.933 12.55 12.233 11.902 11.543 11.266 10.98 10.675 10.349 10.008 9.772 9.532 9.153 8.896 8.617 8.47 8.163 7.788 7.402 7.227 6.952 6.695 6.491 6.262 5.758 5.458 5.123 4.759 4.343 3.806 3.018 -0.245 -7 ,24688 ,KEBNE ,17132075,Sat Jan 1 17:46:27 CET,Sat Jan 1 19:28:53 CET,0.0 3.677 4.378 4.856 5.294 5.698 6.058 6.386 6.94 7.169 7.399 7.732 8.036 8.219 8.553 8.85 9.115 9.252 9.524 9.789 10.183 10.429 10.645 10.954 11.265 11.572 11.854 12.12 12.477 12.807 13.129 13.524 13.905 14.284 14.709 15.167 15.581 16.033 16.53 17.03 17.568 18.157 18.805 19.417 20.09 20.827 21.602 22.411 23.202 23.865 24.08 23.433 22.592 21.778 20.961 20.112 19.273 18.472 17.793 17.09 16.452 15.881 15.346 14.804 14.286 13.844 13.389 12.98 12.629 12.255 11.848 11.5 11.151 10.79 10.505 10.208 9.885 9.524 9.169 8.936 8.693 8.322 8.056 7.775 7.637 7.348 7.042 6.722 6.548 6.254 5.97 5.771 5.557 5.067 4.773 4.454 4.124 3.747 3.303 2.684 -0.457 -8 ,16325 ,KEBNE ,17132076,Sat Jan 1 17:46:30 CET,Sat Jan 1 19:29:05 CET,0.0 3.303 4.039 4.607 5.108 5.514 5.866 6.142 6.648 6.882 7.092 7.418 7.705 7.869 8.181 8.504 8.822 8.969 9.25 9.51 9.859 10.095 10.333 10.677 11.024 11.356 11.661 11.942 12.279 12.607 12.937 13.342 13.755 14.125 14.54 15.01 15.438 15.901 16.395 16.906 17.423 17.998 18.659 19.327 20.053 20.808 21.659 22.48 23.367 24.219 24.494 23.875 22.928 21.952 21.002 20.114 19.313 18.52 17.832 17.163 16.567 16.006 15.461 14.946 14.458 14.006 13.533 13.126 12.785 12.421 12.039 11.706 11.367 11.02 10.733 10.428 10.131 9.825 9.48 9.239 8.991 8.615 8.362 8.092 7.953 7.669 7.334 6.972 6.799 6.505 6.229 6.017 5.774 5.272 4.986 4.666 4.33 3.962 3.484 2.753 0.367 -9 ,23829 ,KEBNE ,17132077,Sat Jan 1 17:46:30 CET,Sat Jan 1 19:30:03 CET,0.0 3.213 3.882 4.37 4.765 5.118 5.443 5.732 6.267 6.529 6.78 7.12 7.423 7.618 8.004 8.347 8.646 8.793 9.068 9.321 9.697 9.948 10.188 10.517 10.825 11.135 11.423 11.696 12.066 12.426 12.758 13.16 13.538 13.911 14.369 14.863 15.302 15.76 16.256 16.744 17.249 17.846 18.571 19.314 20.128 21.006 21.944 22.833 23.657 24.348 24.591 24.052 23.118 22.118 21.229 20.353 19.537 18.78 18.099 17.406 16.786 16.237 15.73 15.241 14.761 14.32 13.867 13.468 13.118 12.753 12.371 12.041 11.693 11.33 11.049 10.755 10.452 10.141 9.812 9.57 9.316 8.963 8.713 8.424 8.279 7.978 7.643 7.294 7.11 6.816 6.529 6.31 6.073 5.529 5.205 4.873 4.509 4.081 3.521 2.653 -0.565 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt deleted file mode 100644 index 4a2494a7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,674 ,TETRA ,17557661,Fri Nov 26 10:40:51 CET,Fri Nov 26 12:33:27 CET,0.0 1.161 1.621 1.942 2.217 2.489 2.71 2.925 3.316 3.49 3.661 3.853 4.091 4.223 4.476 4.697 4.902 5.01 5.225 5.422 5.701 5.882 6.064 6.335 6.587 6.82 7.042 7.246 7.526 7.815 8.087 8.427 8.749 9.053 9.402 9.796 10.193 10.622 11.078 11.547 12.013 12.534 13.159 13.792 14.48 15.196 16.004 16.871 17.778 18.774 19.797 20.283 20.256 20.017 19.667 19.25 18.843 18.446 18.065 17.656 17.3 16.964 16.617 16.294 15.983 15.672 15.351 15.063 14.809 14.549 14.275 14.06 13.83 13.583 13.389 13.169 12.956 12.738 12.492 12.323 12.138 11.855 11.665 11.449 11.337 11.136 10.925 10.675 10.547 10.323 10.111 9.943 9.777 9.433 9.23 9.006 8.779 8.529 8.179 7.666 5.644 -2 ,25662 ,TETRA ,17557662,Fri Nov 26 10:40:51 CET,Fri Nov 26 12:35:20 CET,0.0 1.39 1.807 2.162 2.462 2.723 2.946 3.139 3.523 3.701 3.861 4.042 4.283 4.417 4.669 4.91 5.144 5.253 5.461 5.669 5.979 6.179 6.37 6.66 6.961 7.238 7.488 7.723 8.003 8.277 8.555 8.895 9.211 9.517 9.863 10.246 10.631 11.053 11.518 12.007 12.507 13.051 13.661 14.277 14.967 15.727 16.59 17.48 18.463 19.584 20.587 20.925 20.833 20.521 20.105 19.63 19.162 18.719 18.329 17.92 17.523 17.139 16.777 16.453 16.148 15.842 15.511 15.203 14.922 14.641 14.359 14.102 13.822 13.543 13.331 13.107 12.874 12.634 12.379 12.194 12.009 11.725 11.518 11.288 11.17 10.921 10.659 10.39 10.239 9.992 9.781 9.6 9.413 9.018 8.807 8.588 8.318 7.996 7.6 7.078 5.151 -3 ,28858 ,TETRA ,17557663,Fri Nov 26 10:40:51 CET,Fri Nov 26 12:39:30 CET,0.0 0.794 1.142 1.443 1.723 1.958 2.162 2.335 2.642 2.801 2.962 3.148 3.377 3.502 3.768 4.028 4.253 4.364 4.604 4.824 5.111 5.306 5.502 5.778 6.033 6.266 6.501 6.729 7.004 7.277 7.542 7.869 8.191 8.483 8.823 9.213 9.577 9.979 10.393 10.824 11.296 11.823 12.401 12.964 13.634 14.396 15.25 16.2 17.199 18.141 19.037 19.403 19.292 18.966 18.587 18.154 17.712 17.286 16.9 16.515 16.185 15.859 15.522 15.203 14.903 14.623 14.306 14.0 13.739 13.48 13.194 12.953 12.705 12.434 12.227 12.025 11.807 11.549 11.29 11.123 10.937 10.646 10.446 10.228 10.112 9.864 9.602 9.325 9.178 8.927 8.716 8.556 8.383 8.004 7.806 7.566 7.262 6.905 6.499 5.979 4.16 -4 ,26588 ,TETRA ,17557664,Fri Nov 26 10:40:51 CET,Fri Nov 26 12:40:42 CET,0.0 1.909 2.355 2.679 2.942 3.172 3.41 3.626 3.969 4.136 4.307 4.525 4.768 4.893 5.127 5.363 5.584 5.687 5.877 6.062 6.363 6.567 6.755 7.026 7.279 7.52 7.754 7.971 8.27 8.575 8.864 9.193 9.501 9.793 10.12 10.496 10.859 11.248 11.662 12.095 12.556 13.079 13.653 14.209 14.862 15.593 16.402 17.263 18.188 19.173 20.138 20.445 20.272 19.945 19.535 19.074 18.644 18.228 17.822 17.396 17.027 16.669 16.312 15.944 15.59 15.299 14.985 14.678 14.421 14.155 13.872 13.633 13.385 13.135 12.93 12.698 12.449 12.187 11.901 11.693 11.486 11.182 10.963 10.72 10.59 10.32 10.059 9.774 9.613 9.355 9.112 8.93 8.747 8.342 8.112 7.855 7.564 7.24 6.814 6.268 4.657 -5 ,11662 ,TETRA ,17557665,Fri Nov 26 10:40:51 CET,Fri Nov 26 12:40:38 CET,0.0 1.364 1.764 2.093 2.363 2.605 2.855 3.082 3.471 3.634 3.779 3.948 4.187 4.318 4.577 4.819 5.036 5.147 5.367 5.576 5.885 6.08 6.262 6.515 6.74 6.952 7.168 7.376 7.63 7.881 8.13 8.458 8.779 9.061 9.381 9.74 10.082 10.468 10.881 11.291 11.714 12.243 12.889 13.495 14.202 14.987 15.853 16.807 17.814 18.816 19.735 20.111 19.935 19.555 19.115 18.66 18.21 17.76 17.358 16.917 16.519 16.172 15.822 15.481 15.15 14.848 14.535 14.239 13.989 13.738 13.462 13.222 12.974 12.708 12.511 12.313 12.091 11.847 11.579 11.383 11.193 10.916 10.718 10.514 10.408 10.183 9.927 9.651 9.507 9.266 9.034 8.853 8.669 8.268 8.067 7.843 7.557 7.251 6.899 6.338 4.077 -6 ,7167 ,TETRA ,17557666,Fri Nov 26 10:40:51 CET,Fri Nov 26 12:38:10 CET,0.0 1.245 1.619 1.953 2.253 2.506 2.721 2.922 3.313 3.488 3.66 3.92 4.185 4.342 4.63 4.868 5.086 5.194 5.413 5.63 5.931 6.116 6.294 6.539 6.773 7.018 7.246 7.457 7.749 8.03 8.292 8.621 8.935 9.221 9.543 9.918 10.289 10.698 11.143 11.602 12.076 12.615 13.238 13.848 14.568 15.345 16.155 17.035 18.058 19.154 20.216 20.665 20.529 20.16 19.723 19.293 18.862 18.421 18.018 17.605 17.228 16.867 16.504 16.16 15.831 15.532 15.229 14.95 14.7 14.433 14.157 13.927 13.684 13.42 13.209 12.998 12.772 12.519 12.248 12.056 11.873 11.603 11.414 11.223 11.12 10.904 10.658 10.387 10.257 10.029 9.832 9.68 9.524 9.185 8.98 8.729 8.45 8.13 7.749 7.28 6.176 -7 ,20402 ,TETRA ,17557667,Fri Nov 26 10:40:51 CET,Fri Nov 26 12:38:45 CET,0.0 1.634 2.127 2.498 2.799 3.047 3.243 3.446 3.852 4.02 4.16 4.328 4.567 4.707 4.956 5.189 5.423 5.544 5.772 5.968 6.229 6.401 6.585 6.859 7.117 7.349 7.567 7.788 8.083 8.36 8.609 8.916 9.212 9.489 9.822 10.203 10.555 10.934 11.346 11.791 12.264 12.796 13.416 14.011 14.675 15.397 16.217 17.086 17.992 18.907 19.753 19.962 19.727 19.359 18.884 18.415 17.989 17.573 17.174 16.721 16.331 15.977 15.64 15.31 14.965 14.637 14.314 14.016 13.738 13.443 13.146 12.894 12.624 12.343 12.129 11.902 11.653 11.4 11.136 10.951 10.754 10.436 10.219 9.987 9.859 9.585 9.306 9.01 8.848 8.579 8.328 8.154 7.981 7.603 7.372 7.109 6.806 6.468 6.106 5.604 3.854 -8 ,24965 ,TETRA ,17557668,Fri Nov 26 10:40:51 CET,Fri Nov 26 12:40:31 CET,0.0 1.844 2.365 2.717 3.024 3.292 3.532 3.766 4.183 4.354 4.503 4.711 4.965 5.105 5.36 5.585 5.799 5.916 6.152 6.36 6.661 6.848 7.026 7.304 7.597 7.869 8.1 8.334 8.643 8.924 9.189 9.506 9.807 10.102 10.456 10.85 11.221 11.631 12.066 12.529 12.996 13.501 14.088 14.692 15.384 16.117 16.962 17.847 18.841 19.917 20.803 21.101 20.966 20.613 20.183 19.766 19.381 18.99 18.606 18.207 17.868 17.553 17.22 16.874 16.558 16.273 15.96 15.678 15.433 15.167 14.899 14.675 14.432 14.175 13.967 13.745 13.521 13.276 13.009 12.84 12.665 12.386 12.179 11.944 11.821 11.579 11.324 11.069 10.935 10.687 10.475 10.307 10.12 9.693 9.444 9.164 8.903 8.626 8.225 7.667 6.134 -9 ,22022 ,TETRA ,17557669,Fri Nov 26 10:40:51 CET,Fri Nov 26 12:40:34 CET,0.0 1.648 2.082 2.386 2.686 2.969 3.186 3.38 3.787 3.965 4.134 4.358 4.6 4.729 4.979 5.232 5.494 5.617 5.829 6.02 6.324 6.528 6.71 6.963 7.214 7.452 7.677 7.899 8.183 8.461 8.729 9.047 9.369 9.675 10.011 10.385 10.747 11.154 11.579 12.022 12.484 12.995 13.613 14.235 14.955 15.743 16.566 17.461 18.494 19.602 20.629 21.057 20.971 20.709 20.363 19.96 19.545 19.133 18.774 18.359 17.932 17.552 17.189 16.846 16.541 16.242 15.914 15.627 15.38 15.126 14.85 14.606 14.361 14.123 13.927 13.702 13.451 13.204 12.952 12.777 12.603 12.29 12.067 11.84 11.723 11.485 11.24 10.981 10.848 10.607 10.383 10.221 10.054 9.691 9.484 9.257 8.989 8.649 8.219 7.682 5.754 -10 ,30395 ,TETRA ,17557670,Fri Nov 26 10:41:47 CET,Fri Nov 26 12:40:50 CET,0.0 0.688 1.034 1.284 1.501 1.724 1.941 2.119 2.434 2.594 2.757 2.992 3.237 3.36 3.601 3.851 4.101 4.219 4.451 4.668 4.964 5.152 5.332 5.592 5.829 6.058 6.284 6.502 6.791 7.064 7.325 7.649 7.963 8.266 8.611 8.983 9.332 9.734 10.176 10.658 11.162 11.707 12.348 12.973 13.673 14.41 15.283 16.227 17.209 18.252 19.22 19.692 19.633 19.3 18.922 18.508 18.066 17.62 17.228 16.798 16.379 16.003 15.65 15.328 15.024 14.734 14.432 14.148 13.884 13.614 13.345 13.114 12.864 12.605 12.402 12.192 11.971 11.731 11.471 11.287 11.099 10.788 10.574 10.356 10.24 9.994 9.739 9.473 9.326 9.069 8.809 8.631 8.451 8.044 7.823 7.559 7.244 6.883 6.411 5.739 3.908 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt deleted file mode 100644 index 678e5cbe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10046 ,TETRA ,17557671,Fri Nov 26 10:41:48 CET,Fri Nov 26 12:39:00 CET,0.0 4.206 4.831 5.314 5.682 6.041 6.374 6.662 7.212 7.478 7.731 8.021 8.354 8.549 8.941 9.303 9.614 9.767 10.079 10.375 10.793 11.049 11.297 11.675 12.041 12.386 12.731 13.056 13.426 13.787 14.166 14.644 15.092 15.51 15.981 16.461 16.917 17.417 17.931 18.477 19.064 19.737 20.495 21.226 22.087 23.039 24.13 25.293 26.559 27.948 29.352 30.086 30.135 29.805 29.316 28.841 28.32 27.746 27.215 26.617 26.02 25.439 24.9 24.389 23.915 23.472 22.974 22.511 22.102 21.677 21.223 20.873 20.524 20.147 19.844 19.526 19.19 18.832 18.435 18.16 17.891 17.455 17.139 16.807 16.631 16.254 15.851 15.407 15.164 14.794 14.41 14.123 13.836 13.241 12.886 12.482 12.042 11.532 10.87 10.045 0.014 -4 ,27035 ,TETRA ,17557674,Fri Nov 26 10:41:48 CET,Fri Nov 26 12:36:08 CET,0.0 8.204 8.964 9.504 9.96 10.351 10.718 11.035 11.611 11.888 12.138 12.423 12.753 12.927 13.282 13.631 13.961 14.127 14.441 14.731 15.152 15.42 15.682 16.06 16.423 16.777 17.131 17.467 17.904 18.331 18.732 19.201 19.627 20.013 20.449 20.924 21.371 21.851 22.364 22.919 23.51 24.164 24.918 25.654 26.511 27.489 28.554 29.717 30.956 32.267 33.608 34.27 34.301 34.012 33.603 33.175 32.709 32.202 31.734 31.257 30.819 30.372 29.945 29.538 29.141 28.758 28.336 27.956 27.624 27.263 26.861 26.51 26.162 25.812 25.527 25.224 24.905 24.579 24.221 23.929 23.626 23.165 22.836 22.512 22.347 21.996 21.602 21.158 20.93 20.564 20.193 19.917 19.614 18.935 18.555 18.154 17.689 17.11 16.306 15.13 9.993 -6 ,32512 ,TETRA ,17557676,Fri Nov 26 10:41:48 CET,Fri Nov 26 12:38:43 CET,0.0 2.283 2.905 3.395 3.842 4.26 4.61 4.905 5.407 5.636 5.852 6.125 6.459 6.674 7.099 7.436 7.722 7.861 8.14 8.422 8.833 9.095 9.356 9.736 10.089 10.421 10.736 11.031 11.438 11.868 12.255 12.679 13.093 13.49 13.963 14.503 15.003 15.535 16.098 16.698 17.31 17.974 18.726 19.459 20.314 21.239 22.297 23.441 24.699 26.037 27.276 27.919 27.956 27.698 27.317 26.873 26.373 25.815 25.283 24.697 24.138 23.615 23.101 22.618 22.159 21.728 21.303 20.897 20.526 20.147 19.722 19.369 19.009 18.64 18.342 18.016 17.676 17.308 16.929 16.676 16.41 15.973 15.668 15.346 15.168 14.799 14.43 14.042 13.833 13.467 13.053 12.757 12.424 11.742 11.368 10.892 10.332 9.775 9.165 8.297 3.542 -7 ,9516 ,TETRA ,17557677,Fri Nov 26 10:41:49 CET,Fri Nov 26 12:38:41 CET,0.0 10.912 11.582 12.021 12.37 12.642 12.897 13.157 13.683 13.939 14.163 14.454 14.804 15.009 15.396 15.733 16.069 16.236 16.523 16.785 17.179 17.43 17.664 18.011 18.369 18.711 19.015 19.305 19.69 20.057 20.393 20.782 21.155 21.535 22.003 22.558 23.085 23.648 24.278 24.94 25.618 26.338 27.125 27.916 28.799 29.754 30.814 31.93 33.205 34.592 35.981 36.797 36.927 36.764 36.421 35.974 35.469 34.93 34.411 33.83 33.307 32.83 32.362 31.922 31.485 31.049 30.575 30.147 29.793 29.427 29.035 28.692 28.325 27.945 27.645 27.335 27.01 26.66 26.297 26.036 25.769 25.343 25.037 24.731 24.566 24.203 23.823 23.413 23.182 22.795 22.399 22.13 21.83 21.188 20.849 20.457 20.0 19.426 18.741 17.967 15.021 -8 ,18396 ,TETRA ,17557678,Fri Nov 26 10:41:48 CET,Fri Nov 26 12:39:12 CET,0.0 2.708 3.327 3.857 4.349 4.749 5.085 5.408 6.042 6.348 6.619 6.973 7.351 7.587 8.051 8.477 8.855 9.034 9.4 9.771 10.316 10.648 10.938 11.379 11.798 12.188 12.591 12.982 13.479 13.949 14.389 14.929 15.439 15.934 16.524 17.158 17.728 18.349 19.036 19.767 20.507 21.314 22.261 23.246 24.427 25.749 27.243 28.823 30.566 32.48 34.523 35.637 35.798 35.579 35.206 34.778 34.336 33.829 33.347 32.819 32.311 31.79 31.222 30.667 30.159 29.7 29.192 28.71 28.297 27.879 27.447 27.078 26.677 26.253 25.926 25.592 25.261 24.924 24.56 24.271 23.968 23.539 23.256 22.951 22.771 22.378 21.967 21.535 21.303 20.929 20.525 20.223 19.908 19.276 18.931 18.574 18.165 17.63 16.942 16.066 11.818 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt deleted file mode 100644 index ef12ab0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9189 ,TETRA ,17557681,Fri Nov 26 10:42:47 CET,Fri Nov 26 12:39:48 CET,0.0 2.283 3.065 3.572 3.946 4.277 4.557 4.81 5.275 5.508 5.718 5.936 6.232 6.393 6.696 6.975 7.228 7.34 7.573 7.824 8.145 8.341 8.545 8.823 9.081 9.348 9.605 9.848 10.175 10.486 10.78 11.132 11.45 11.731 12.05 12.424 12.792 13.206 13.681 14.181 14.663 15.204 15.806 16.387 17.039 17.751 18.557 19.42 20.337 21.204 21.878 21.957 21.616 21.15 20.594 19.962 19.398 18.869 18.383 17.877 17.413 17.002 16.575 16.128 15.708 15.308 14.851 14.415 14.051 13.705 13.348 13.03 12.672 12.303 12.035 11.765 11.493 11.193 10.875 10.664 10.436 10.038 9.742 9.454 9.304 8.994 8.647 8.249 8.054 7.745 7.463 7.253 7.034 6.548 6.289 5.965 5.58 5.097 4.499 3.673 -0.136 -2 ,30244 ,TETRA ,17557682,Fri Nov 26 10:42:47 CET,Fri Nov 26 12:38:40 CET,0.0 3.604 4.278 4.728 5.105 5.412 5.698 5.941 6.34 6.529 6.736 7.005 7.313 7.484 7.793 8.058 8.304 8.439 8.726 8.988 9.341 9.562 9.779 10.098 10.416 10.707 10.967 11.214 11.541 11.844 12.144 12.544 12.916 13.251 13.631 14.07 14.485 14.906 15.32 15.76 16.237 16.759 17.331 17.879 18.567 19.323 20.099 20.94 21.874 22.808 23.543 23.718 23.489 23.06 22.507 21.926 21.359 20.813 20.318 19.795 19.321 18.902 18.49 18.089 17.714 17.334 16.922 16.572 16.261 15.912 15.55 15.251 14.921 14.55 14.264 13.984 13.689 13.386 13.07 12.847 12.617 12.241 11.982 11.709 11.566 11.258 10.905 10.523 10.327 10.007 9.72 9.495 9.253 8.747 8.477 8.179 7.81 7.383 6.883 6.171 3.705 -3 ,10571 ,TETRA ,17557683,Fri Nov 26 10:42:47 CET,Fri Nov 26 12:40:11 CET,0.0 3.062 3.801 4.337 4.806 5.17 5.521 5.848 6.385 6.607 6.797 6.98 7.26 7.433 7.75 8.039 8.306 8.431 8.664 8.883 9.224 9.44 9.661 9.99 10.296 10.593 10.885 11.159 11.505 11.853 12.18 12.547 12.884 13.206 13.587 14.009 14.409 14.839 15.267 15.69 16.138 16.646 17.231 17.815 18.496 19.246 20.069 20.924 21.792 22.615 23.261 23.386 23.153 22.724 22.233 21.751 21.268 20.757 20.291 19.811 19.376 18.974 18.524 18.016 17.578 17.202 16.765 16.355 16.022 15.69 15.331 15.033 14.724 14.399 14.149 13.876 13.589 13.292 12.968 12.718 12.448 12.049 11.776 11.485 11.335 11.023 10.669 10.308 10.125 9.809 9.5 9.261 9.016 8.511 8.193 7.828 7.443 7.006 6.517 5.794 1.872 -4 ,14137 ,TETRA ,17557684,Fri Nov 26 10:42:47 CET,Fri Nov 26 12:39:50 CET,0.0 1.994 2.648 3.095 3.447 3.76 4.044 4.3 4.734 4.928 5.123 5.373 5.682 5.86 6.165 6.42 6.67 6.795 7.037 7.288 7.677 7.927 8.164 8.488 8.782 9.06 9.326 9.583 9.9 10.219 10.552 10.942 11.292 11.617 11.984 12.409 12.816 13.238 13.694 14.191 14.731 15.335 15.973 16.599 17.349 18.15 19.024 19.922 20.898 21.843 22.471 22.455 21.968 21.298 20.59 19.936 19.367 18.847 18.364 17.851 17.386 16.941 16.515 16.128 15.761 15.409 15.049 14.721 14.414 14.095 13.75 13.42 13.077 12.747 12.48 12.201 11.92 11.625 11.28 11.044 10.82 10.446 10.17 9.887 9.743 9.435 9.075 8.667 8.454 8.121 7.795 7.553 7.308 6.789 6.499 6.184 5.859 5.499 4.95 4.218 0.848 -5 ,23824 ,TETRA ,17557685,Fri Nov 26 10:43:48 CET,Fri Nov 26 12:41:08 CET,0.0 1.83 2.415 2.84 3.238 3.594 3.921 4.234 4.718 4.919 5.109 5.325 5.612 5.762 6.056 6.338 6.608 6.737 6.995 7.26 7.642 7.891 8.112 8.403 8.708 9.008 9.275 9.508 9.815 10.114 10.389 10.755 11.171 11.553 11.926 12.323 12.689 13.084 13.509 13.964 14.476 15.054 15.683 16.278 16.924 17.611 18.401 19.297 20.177 21.043 21.837 21.951 21.66 21.176 20.652 20.138 19.625 19.121 18.677 18.219 17.792 17.395 17.018 16.652 16.299 15.962 15.597 15.265 14.974 14.663 14.319 14.009 13.653 13.27 13.002 12.744 12.477 12.177 11.847 11.625 11.392 11.014 10.756 10.476 10.322 9.978 9.615 9.252 9.068 8.759 8.47 8.251 8.021 7.532 7.247 6.913 6.546 6.097 5.444 4.598 1.862 -6 ,15426 ,TETRA ,17557686,Fri Nov 26 10:43:50 CET,Fri Nov 26 12:39:53 CET,0.0 2.329 3.016 3.477 3.853 4.194 4.459 4.684 5.099 5.286 5.479 5.719 6.024 6.206 6.557 6.876 7.154 7.277 7.524 7.763 8.092 8.303 8.51 8.821 9.139 9.44 9.713 9.987 10.318 10.604 10.877 11.206 11.525 11.865 12.266 12.662 13.007 13.398 13.82 14.236 14.686 15.203 15.79 16.355 16.969 17.623 18.4 19.258 20.137 21.061 21.849 21.984 21.556 20.922 20.261 19.518 18.797 18.205 17.752 17.298 16.856 16.433 16.04 15.623 15.206 14.821 14.416 14.063 13.754 13.427 13.079 12.792 12.499 12.178 11.909 11.616 11.298 10.957 10.611 10.394 10.166 9.796 9.546 9.276 9.124 8.8 8.436 8.033 7.828 7.506 7.209 6.999 6.769 6.226 5.926 5.594 5.229 4.83 4.289 3.555 -6.445 -8 ,9584 ,TETRA ,17557688,Fri Nov 26 10:43:50 CET,Fri Nov 26 12:36:50 CET,0.0 2.171 2.734 3.194 3.572 3.91 4.213 4.464 4.918 5.127 5.318 5.56 5.864 6.026 6.341 6.638 6.922 7.058 7.305 7.53 7.858 8.062 8.249 8.509 8.779 9.067 9.358 9.655 10.012 10.329 10.636 10.987 11.323 11.668 12.079 12.535 12.975 13.458 13.965 14.505 15.061 15.66 16.314 16.953 17.687 18.487 19.393 20.378 21.395 22.398 23.251 23.488 23.258 22.796 22.257 21.656 21.072 20.506 19.995 19.461 18.976 18.508 18.042 17.598 17.167 16.766 16.336 15.932 15.581 15.211 14.812 14.483 14.145 13.806 13.553 13.285 12.984 12.663 12.328 12.078 11.823 11.439 11.165 10.891 10.752 10.449 10.105 9.719 9.513 9.179 8.866 8.639 8.378 7.653 7.226 6.797 6.332 5.837 5.299 4.57 0.255 -9 ,10118 ,TETRA ,17557689,Fri Nov 26 10:44:46 CET,Fri Nov 26 12:41:48 CET,0.0 2.591 3.192 3.658 4.03 4.376 4.701 4.976 5.452 5.65 5.834 6.064 6.357 6.514 6.804 7.091 7.378 7.513 7.771 8.01 8.322 8.51 8.691 8.949 9.185 9.424 9.677 9.914 10.21 10.505 10.771 11.082 11.405 11.724 12.103 12.541 12.961 13.422 13.916 14.414 14.916 15.5 16.138 16.715 17.383 18.116 18.887 19.699 20.619 21.508 22.084 22.088 21.849 21.467 20.989 20.431 19.872 19.365 18.902 18.372 17.922 17.509 17.053 16.616 16.244 15.915 15.544 15.173 14.826 14.452 14.052 13.72 13.382 13.036 12.777 12.503 12.217 11.914 11.569 11.33 11.093 10.729 10.485 10.212 10.06 9.763 9.463 9.127 8.945 8.626 8.294 8.066 7.837 7.339 7.072 6.778 6.424 5.981 5.445 4.695 1.243 -10 ,5750 ,TETRA ,17557690,Fri Nov 26 10:44:46 CET,Fri Nov 26 12:41:35 CET,0.0 2.224 2.878 3.325 3.717 4.046 4.33 4.582 5.042 5.255 5.453 5.707 6.021 6.189 6.465 6.753 7.039 7.172 7.426 7.661 7.981 8.188 8.397 8.703 9.013 9.284 9.514 9.754 10.072 10.382 10.683 11.011 11.325 11.664 12.077 12.499 12.866 13.264 13.679 14.134 14.625 15.168 15.786 16.345 16.966 17.665 18.421 19.219 20.091 20.933 21.576 21.673 21.37 20.894 20.377 19.795 19.228 18.699 18.231 17.71 17.235 16.801 16.38 16.004 15.617 15.235 14.804 14.397 14.051 13.686 13.29 12.94 12.58 12.212 11.901 11.57 11.251 10.921 10.543 10.287 10.033 9.613 9.335 9.061 8.915 8.608 8.296 7.979 7.808 7.506 7.23 7.003 6.76 6.258 5.998 5.705 5.354 4.885 4.366 3.698 -3.562 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt deleted file mode 100644 index db1b0bea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/cmet/water/Summary_FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,5800 ,TETRA ,17557692,Fri Nov 26 10:44:46 CET,Fri Nov 26 12:36:42 CET,0.0 1.969 2.476 2.944 3.303 3.593 3.861 4.098 4.534 4.747 4.938 5.162 5.464 5.634 5.956 6.268 6.596 6.758 7.03 7.261 7.605 7.838 8.085 8.466 8.829 9.168 9.479 9.784 10.19 10.592 10.978 11.442 11.868 12.251 12.695 13.198 13.669 14.165 14.684 15.22 15.788 16.426 17.157 17.882 18.729 19.665 20.698 21.792 23.007 24.286 25.522 26.137 26.17 25.952 25.537 24.946 24.382 23.838 23.37 22.928 22.513 22.096 21.689 21.322 20.955 20.612 20.233 19.847 19.482 19.102 18.699 18.356 18.006 17.633 17.346 17.053 16.754 16.457 16.125 15.897 15.667 15.3 15.027 14.715 14.561 14.252 13.917 13.543 13.338 13.013 12.696 12.471 12.213 11.639 11.355 11.028 10.627 10.173 9.641 8.941 5.398 -3 ,32564 ,TETRA ,17557693,Fri Nov 26 10:44:46 CET,Fri Nov 26 12:40:28 CET,0.0 2.348 2.968 3.44 3.785 4.05 4.304 4.542 4.984 5.181 5.344 5.532 5.828 6.003 6.336 6.63 6.938 7.087 7.362 7.625 7.981 8.215 8.453 8.793 9.119 9.426 9.717 9.993 10.333 10.654 10.979 11.375 11.75 12.128 12.586 13.082 13.559 14.12 14.729 15.328 15.911 16.544 17.304 18.082 18.943 19.86 20.883 21.985 23.187 24.443 25.696 26.372 26.398 26.161 25.832 25.404 24.986 24.572 24.143 23.643 23.188 22.823 22.456 22.055 21.669 21.319 20.942 20.598 20.305 19.998 19.67 19.386 19.089 18.762 18.467 18.143 17.815 17.478 17.123 16.869 16.6 16.19 15.9 15.599 15.443 15.115 14.736 14.309 14.096 13.773 13.458 13.232 13.009 12.45 12.089 11.726 11.349 10.886 10.344 9.567 6.124 -4 ,21684 ,TETRA ,17557694,Fri Nov 26 10:44:46 CET,Fri Nov 26 12:40:25 CET,0.0 2.431 3.052 3.486 3.866 4.207 4.506 4.79 5.304 5.532 5.743 6.031 6.349 6.517 6.84 7.176 7.511 7.663 7.945 8.21 8.6 8.845 9.073 9.399 9.696 9.987 10.285 10.574 10.948 11.316 11.667 12.091 12.478 12.853 13.324 13.849 14.345 14.865 15.394 15.942 16.506 17.177 17.955 18.701 19.537 20.432 21.427 22.493 23.661 24.949 26.197 26.722 26.762 26.606 26.298 25.89 25.494 25.097 24.706 24.249 23.792 23.378 22.988 22.621 22.251 21.888 21.517 21.158 20.823 20.452 20.045 19.696 19.327 18.949 18.652 18.338 18.021 17.705 17.36 17.116 16.867 16.468 16.206 15.941 15.791 15.473 15.137 14.774 14.571 14.245 13.937 13.702 13.444 12.921 12.612 12.237 11.847 11.412 10.843 9.979 5.958 -5 ,27455 ,TETRA ,17557695,Fri Nov 26 10:44:46 CET,Fri Nov 26 12:40:41 CET,0.0 3.756 4.449 4.911 5.268 5.556 5.842 6.126 6.644 6.871 7.074 7.306 7.619 7.796 8.109 8.413 8.717 8.869 9.154 9.408 9.78 10.021 10.275 10.642 10.978 11.296 11.601 11.895 12.256 12.599 12.955 13.385 13.815 14.236 14.703 15.225 15.711 16.234 16.772 17.326 17.892 18.524 19.259 19.975 20.793 21.673 22.627 23.672 24.891 26.204 27.508 28.117 28.068 27.827 27.506 27.085 26.623 26.182 25.767 25.33 24.908 24.464 24.035 23.637 23.258 22.884 22.427 21.984 21.622 21.252 20.872 20.578 20.266 19.931 19.679 19.382 19.052 18.729 18.388 18.178 17.978 17.591 17.286 16.967 16.804 16.478 16.13 15.748 15.538 15.21 14.886 14.66 14.434 13.915 13.586 13.226 12.837 12.402 11.839 11.034 6.668 -6 ,8895 ,TETRA ,17557696,Fri Nov 26 10:44:46 CET,Fri Nov 26 12:37:37 CET,0.0 3.651 4.237 4.655 5.0 5.321 5.615 5.891 6.384 6.612 6.831 7.114 7.431 7.612 7.951 8.259 8.55 8.689 8.952 9.213 9.599 9.838 10.05 10.367 10.709 11.042 11.354 11.634 11.972 12.299 12.623 13.019 13.403 13.769 14.189 14.652 15.13 15.682 16.232 16.77 17.325 17.966 18.683 19.372 20.179 21.058 22.049 23.16 24.42 25.736 26.997 27.573 27.598 27.459 27.17 26.713 26.235 25.758 25.315 24.86 24.438 24.046 23.662 23.281 22.923 22.573 22.158 21.782 21.454 21.101 20.738 20.423 20.097 19.764 19.499 19.234 18.957 18.652 18.334 18.113 17.888 17.517 17.238 16.955 16.805 16.487 16.16 15.797 15.6 15.269 14.926 14.68 14.418 13.86 13.554 13.211 12.834 12.353 11.707 10.933 7.914 -7 ,3681 ,TETRA ,17557697,Fri Nov 26 10:45:49 CET,Fri Nov 26 12:39:32 CET,0.0 2.843 3.467 3.898 4.266 4.606 4.908 5.184 5.669 5.875 6.095 6.422 6.753 6.934 7.25 7.534 7.835 7.978 8.252 8.527 8.914 9.149 9.382 9.743 10.093 10.411 10.69 10.972 11.343 11.701 12.067 12.478 12.854 13.225 13.649 14.125 14.571 15.041 15.541 16.054 16.589 17.225 17.978 18.702 19.538 20.468 21.517 22.638 23.87 25.195 26.481 27.097 27.182 26.996 26.649 26.197 25.746 25.336 24.914 24.451 24.042 23.656 23.281 22.895 22.514 22.155 21.768 21.437 21.158 20.832 20.468 20.187 19.903 19.575 19.313 19.033 18.722 18.396 18.061 17.827 17.58 17.186 16.898 16.586 16.438 16.125 15.764 15.357 15.143 14.83 14.508 14.271 14.019 13.462 13.171 12.836 12.434 12.02 11.532 10.86 6.311 -8 ,29767 ,TETRA ,17557698,Fri Nov 26 10:45:49 CET,Fri Nov 26 12:40:36 CET,0.0 2.394 3.028 3.493 3.826 4.106 4.38 4.633 5.083 5.291 5.495 5.8 6.143 6.321 6.622 6.911 7.172 7.304 7.587 7.854 8.243 8.491 8.713 9.023 9.334 9.644 9.945 10.239 10.636 11.011 11.367 11.792 12.186 12.565 12.978 13.426 13.868 14.342 14.848 15.387 15.943 16.579 17.313 18.04 18.858 19.707 20.698 21.806 22.997 24.295 25.673 26.449 26.555 26.308 25.907 25.479 25.053 24.618 24.228 23.822 23.421 23.034 22.664 22.301 21.97 21.651 21.298 20.981 20.687 20.369 20.022 19.725 19.394 19.021 18.733 18.441 18.133 17.796 17.421 17.163 16.89 16.47 16.183 15.891 15.735 15.368 15.009 14.655 14.449 14.115 13.782 13.552 13.311 12.795 12.512 12.211 11.875 11.45 10.874 10.037 5.553 -9 ,12747 ,TETRA ,17557699,Fri Nov 26 10:45:49 CET,Fri Nov 26 12:44:37 CET,0.0 2.445 3.076 3.528 3.895 4.279 4.648 4.935 5.378 5.581 5.783 6.037 6.363 6.548 6.91 7.287 7.628 7.778 8.066 8.336 8.693 8.922 9.165 9.515 9.85 10.164 10.457 10.753 11.142 11.513 11.878 12.333 12.744 13.126 13.562 14.039 14.485 14.967 15.494 16.045 16.643 17.326 18.131 18.94 19.822 20.731 21.712 22.806 24.018 25.303 26.613 27.333 27.356 27.093 26.767 26.382 26.002 25.619 25.252 24.846 24.426 24.002 23.59 23.192 22.806 22.44 22.051 21.709 21.401 21.066 20.711 20.401 20.046 19.66 19.37 19.061 18.727 18.395 18.069 17.832 17.578 17.151 16.832 16.509 16.341 16.011 15.657 15.28 15.094 14.772 14.435 14.219 14.005 13.51 13.21 12.894 12.531 12.091 11.565 10.853 8.021 -10 ,12516 ,TETRA ,17557700,Fri Nov 26 10:46:50 CET,Fri Nov 26 12:40:40 CET,0.0 1.932 2.567 3.117 3.57 3.956 4.224 4.48 4.97 5.19 5.394 5.644 5.962 6.158 6.512 6.824 7.114 7.261 7.553 7.828 8.208 8.457 8.698 9.039 9.373 9.694 10.0 10.304 10.687 11.046 11.384 11.757 12.111 12.45 12.871 13.35 13.784 14.258 14.747 15.262 15.834 16.471 17.182 17.894 18.723 19.686 20.776 21.889 23.105 24.366 25.602 26.216 26.154 25.837 25.435 25.0 24.54 24.056 23.595 23.121 22.691 22.262 21.828 21.432 21.043 20.665 20.285 19.923 19.59 19.249 18.889 18.585 18.272 17.93 17.628 17.298 16.963 16.608 16.237 15.989 15.738 15.338 15.055 14.756 14.593 14.262 13.945 13.573 13.351 13.014 12.67 12.425 12.174 11.645 11.357 11.031 10.622 10.177 9.634 8.938 4.405 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt deleted file mode 100644 index d4012c2d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4566 ,TETRA ,17557766,Fri Nov 26 10:46:51 CET,Fri Nov 26 13:07:40 CET,0.0 0.912 1.251 1.526 1.756 1.956 2.137 2.32 2.658 2.819 2.96 2.956 3.382 3.517 3.767 4.025 4.27 4.397 4.643 4.874 5.229 5.457 5.667 5.963 6.247 6.527 6.798 7.059 7.399 7.718 8.029 8.403 8.756 9.109 9.514 9.971 10.436 10.966 11.531 12.13 12.762 13.494 14.379 15.249 16.238 17.345 18.645 20.113 21.81 23.749 26.045 27.829 28.807 29.394 29.716 29.898 30.006 30.038 30.029 30.004 29.971 29.924 29.848 29.747 29.643 29.556 29.451 29.337 29.235 29.142 29.027 28.925 28.836 28.741 28.657 28.564 28.45 28.274 28.062 27.921 27.795 27.65 27.559 27.446 27.383 27.249 27.122 27.002 26.938 26.612 26.648 26.543 26.456 26.258 26.137 25.983 25.805 25.597 25.333 25.028 23.98 -2 ,1879 ,TETRA ,17557767,Fri Nov 26 10:46:51 CET,Fri Nov 26 13:12:19 CET,0.0 0.84 1.175 1.428 1.65 1.853 2.054 2.277 2.701 2.892 3.065 3.111 3.548 3.688 3.953 4.209 4.456 4.583 4.854 5.129 5.531 5.764 5.96 6.252 6.545 6.831 7.111 7.405 7.81 8.21 8.583 9.025 9.471 9.874 10.3 10.783 11.235 11.746 12.32 12.898 13.505 14.23 15.101 16.015 17.069 18.213 19.551 21.075 22.865 24.975 27.464 29.342 30.38 30.986 31.283 31.43 31.486 31.459 31.456 31.464 31.428 31.347 31.216 31.069 30.923 30.779 30.619 30.489 30.396 30.292 30.177 30.075 29.96 29.838 29.747 29.645 29.532 29.404 29.273 29.184 29.078 28.903 28.773 28.634 28.568 28.44 28.299 28.129 28.034 27.692 27.779 27.695 27.605 27.373 27.206 27.032 26.841 26.612 26.326 25.942 24.676 -3 ,7181 ,TETRA ,17557768,Fri Nov 26 10:46:51 CET,Fri Nov 26 13:11:20 CET,0.0 1.083 1.419 1.705 1.948 2.138 2.326 2.506 2.816 2.967 3.119 3.118 3.537 3.674 3.931 4.187 4.428 4.552 4.797 5.028 5.365 5.584 5.793 6.117 6.427 6.712 6.991 7.256 7.586 7.9 8.177 8.519 8.902 9.274 9.699 10.19 10.664 11.177 11.713 12.278 12.891 13.575 14.381 15.196 16.129 17.197 18.497 20.021 21.882 24.129 26.648 28.781 30.075 30.783 31.17 31.424 31.525 31.562 31.583 31.583 31.572 31.529 31.466 31.41 31.351 31.256 31.153 31.073 31.003 30.933 30.849 30.766 30.668 30.556 30.457 30.333 30.218 30.112 29.969 29.868 29.78 29.653 29.557 29.459 29.406 29.287 29.16 29.016 28.947 28.631 28.727 28.648 28.555 28.354 28.25 28.124 28.0 27.867 27.663 27.413 26.772 -4 ,26270 ,TETRA ,17557769,Fri Nov 26 10:46:51 CET,Fri Nov 26 13:08:39 CET,0.0 3.44 3.907 4.195 4.423 4.656 4.918 5.154 5.516 5.705 5.888 5.938 6.355 6.495 6.756 7.009 7.252 7.364 7.597 7.819 8.121 8.316 8.517 8.827 9.12 9.379 9.622 9.864 10.18 10.505 10.834 11.207 11.572 11.947 12.375 12.839 13.273 13.751 14.273 14.832 15.419 16.076 16.822 17.575 18.477 19.536 20.821 22.233 23.869 25.831 28.249 30.199 31.259 31.898 32.292 32.567 32.723 32.799 32.779 32.673 32.55 32.417 32.285 32.157 32.018 31.858 31.703 31.589 31.504 31.422 31.316 31.227 31.143 31.051 30.972 30.867 30.754 30.647 30.516 30.417 30.319 30.172 30.073 29.976 29.92 29.784 29.642 29.503 29.418 29.07 29.135 29.028 28.915 28.711 28.615 28.492 28.323 28.109 27.858 27.538 26.541 -5 ,10073 ,TETRA ,17557770,Fri Nov 26 10:46:51 CET,Fri Nov 26 13:07:00 CET,0.0 1.481 1.827 2.131 2.383 2.586 2.78 2.973 3.37 3.55 3.724 3.783 4.197 4.342 4.622 4.877 5.133 5.255 5.468 5.675 5.988 6.197 6.4 6.687 6.972 7.254 7.524 7.79 8.128 8.444 8.753 9.128 9.508 9.9 10.354 10.854 11.353 11.931 12.572 13.234 13.864 14.556 15.397 16.245 17.24 18.382 19.683 21.144 22.842 24.907 27.512 29.55 30.678 31.355 31.711 31.896 31.966 31.985 31.999 31.982 31.953 31.911 31.827 31.684 31.529 31.406 31.289 31.186 31.081 30.968 30.859 30.746 30.608 30.491 30.42 30.338 30.24 30.123 30.0 29.922 29.841 29.717 29.618 29.503 29.442 29.331 29.212 29.077 29.016 28.697 28.757 28.655 28.529 28.252 28.105 27.941 27.77 27.606 27.403 27.018 25.501 -6 ,15176 ,TETRA ,17557771,Fri Nov 26 10:47:49 CET,Fri Nov 26 13:11:07 CET,0.0 1.163 1.577 1.878 2.125 2.376 2.628 2.845 3.214 3.378 3.516 3.545 3.985 4.133 4.409 4.652 4.878 4.996 5.234 5.481 5.854 6.089 6.321 6.659 6.975 7.275 7.573 7.842 8.154 8.461 8.769 9.127 9.473 9.807 10.195 10.646 11.077 11.563 12.112 12.696 13.325 14.044 14.873 15.742 16.744 17.881 19.276 20.86 22.711 24.917 27.526 29.551 30.693 31.34 31.687 31.92 32.094 32.14 32.099 32.028 31.948 31.866 31.772 31.682 31.596 31.503 31.387 31.285 31.208 31.134 31.046 30.953 30.846 30.736 30.653 30.546 30.429 30.317 30.201 30.121 30.038 29.895 29.772 29.645 29.583 29.456 29.335 29.204 29.14 28.821 28.896 28.805 28.701 28.449 28.303 28.136 27.955 27.734 27.449 27.089 26.342 -7 ,10811 ,TETRA ,17557772,Fri Nov 26 10:47:47 CET,Fri Nov 26 13:11:37 CET,0.0 1.849 2.284 2.583 2.827 3.029 3.214 3.397 3.73 3.884 4.041 4.044 4.463 4.6 4.869 5.128 5.373 5.487 5.717 5.955 6.275 6.477 6.681 6.971 7.264 7.582 7.889 8.159 8.51 8.847 9.159 9.545 9.931 10.312 10.752 11.237 11.711 12.231 12.778 13.385 14.052 14.794 15.644 16.518 17.534 18.66 19.957 21.374 23.069 25.121 27.551 29.54 30.645 31.277 31.663 31.889 32.02 32.068 32.091 32.102 32.098 32.06 31.988 31.891 31.767 31.68 31.588 31.49 31.405 31.309 31.209 31.105 30.997 30.892 30.798 30.7 30.599 30.464 30.318 30.218 30.099 29.913 29.789 29.68 29.631 29.51 29.357 29.198 29.12 28.788 28.855 28.761 28.646 28.394 28.276 28.121 27.933 27.73 27.551 27.311 25.982 -8 ,15320 ,TETRA ,17557773,Fri Nov 26 10:47:49 CET,Fri Nov 26 13:02:25 CET,0.0 1.602 2.066 2.4 2.686 2.952 3.176 3.382 3.772 3.968 4.166 4.237 4.677 4.826 5.084 5.326 5.558 5.674 5.905 6.127 6.443 6.639 6.827 7.101 7.366 7.624 7.89 8.166 8.537 8.897 9.242 9.659 10.064 10.473 10.957 11.485 11.968 12.492 13.066 13.678 14.321 15.033 15.836 16.635 17.581 18.629 19.826 21.245 22.983 24.972 27.277 29.165 30.26 30.902 31.295 31.528 31.636 31.719 31.751 31.733 31.707 31.617 31.509 31.421 31.337 31.268 31.192 31.099 30.997 30.876 30.745 30.639 30.542 30.443 30.35 30.246 30.14 30.034 29.905 29.809 29.717 29.556 29.44 29.323 29.251 29.076 28.896 28.739 28.668 28.345 28.431 28.34 28.229 27.981 27.856 27.708 27.501 27.269 27.009 26.67 25.729 -9 ,2202 ,TETRA ,17557774,Fri Nov 26 10:47:47 CET,Fri Nov 26 13:07:16 CET,0.0 0.951 1.328 1.622 1.887 2.138 2.358 2.558 2.921 3.093 3.262 3.308 3.705 3.841 4.107 4.361 4.611 4.727 4.963 5.209 5.54 5.74 5.925 6.203 6.472 6.741 7.02 7.283 7.614 7.917 8.216 8.587 8.945 9.279 9.677 10.152 10.604 11.108 11.67 12.276 12.897 13.58 14.391 15.222 16.218 17.383 18.741 20.235 21.968 24.055 26.661 28.714 29.833 30.517 30.878 31.102 31.24 31.288 31.301 31.267 31.233 31.205 31.166 31.11 31.037 30.96 30.887 30.821 30.751 30.673 30.585 30.494 30.394 30.288 30.196 30.099 30.003 29.893 29.763 29.665 29.564 29.427 29.311 29.198 29.145 29.015 28.878 28.735 28.66 28.33 28.378 28.258 28.133 27.868 27.724 27.572 27.378 27.094 26.757 26.405 25.67 -10 ,27107 ,TETRA ,17557775,Fri Nov 26 10:47:47 CET,Fri Nov 26 13:08:52 CET,0.0 1.095 1.486 1.825 2.096 2.314 2.497 2.666 2.993 3.145 3.295 3.307 3.724 3.864 4.124 4.371 4.596 4.707 4.926 5.131 5.439 5.653 5.868 6.183 6.495 6.781 7.06 7.339 7.698 8.022 8.319 8.711 9.108 9.48 9.929 10.435 10.902 11.428 11.997 12.587 13.227 13.984 14.903 15.828 16.893 18.106 19.474 20.937 22.58 24.552 26.972 28.815 29.676 30.074 30.325 30.485 30.525 30.492 30.451 30.376 30.283 30.214 30.136 30.044 29.954 29.877 29.787 29.668 29.559 29.451 29.314 29.183 29.049 28.91 28.804 28.701 28.592 28.471 28.337 28.245 28.145 27.965 27.842 27.717 27.647 27.505 27.363 27.21 27.133 26.802 26.867 26.759 26.639 26.351 26.169 25.97 25.771 25.546 25.248 24.936 24.278 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 686ab074..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6327 ,KEBNE ,17125771,Thu Dec 30 16:52:40 CET,Thu Dec 30 18:52:04 CET,0.0 1.045 1.379 1.562 1.685 1.801 1.88 1.93 2.008 2.025 2.032 1.773 2.046 2.042 2.049 2.059 2.035 2.015 1.972 1.92 1.839 1.793 1.741 1.658 1.564 1.45 1.319 1.172 0.993 0.823 0.622 0.355 0.079 -0.22 -0.603 -1.074 -1.535 -2.058 -2.679 -3.411 -4.246 -5.275 -6.601 -8.051 -9.93 -12.289 -15.32 -19.09 -24.203 -31.559 -42.528 -54.116 -62.753 -69.568 -75.101 -79.728 -83.511 -86.737 -89.403 -92.005 -94.118 -95.926 -97.634 -99.171 -100.573 -101.845 -103.136 -104.249 -105.181 -106.14 -107.106 -107.897 -108.712 -109.559 -110.206 -110.836 -111.467 -112.111 -112.763 -113.206 -113.647 -114.309 -114.771 -115.26 -115.513 -116.018 -116.535 -117.098 -117.397 -118.12 -118.312 -118.62 -118.922 -119.574 -119.957 -120.395 -120.871 -121.359 -121.879 -122.549 -124.698 -2 ,1138 ,KEBNE ,17125772,Thu Dec 30 16:52:40 CET,Thu Dec 30 18:50:46 CET,0.0 1.055 1.338 1.559 1.765 1.947 2.097 2.19 2.308 2.359 2.414 2.234 2.53 2.526 2.513 2.488 2.466 2.461 2.445 2.399 2.309 2.264 2.203 2.094 2.008 1.915 1.807 1.682 1.517 1.361 1.192 0.964 0.712 0.451 0.13 -0.286 -0.744 -1.293 -1.943 -2.707 -3.559 -4.601 -5.891 -7.251 -9.005 -11.168 -13.991 -17.63 -22.568 -29.579 -40.325 -51.744 -60.066 -66.485 -71.66 -76.101 -79.755 -82.893 -85.48 -87.961 -90.046 -91.845 -93.539 -95.102 -96.498 -97.738 -99.003 -100.112 -101.066 -102.062 -103.088 -103.903 -104.747 -105.625 -106.275 -106.922 -107.616 -108.309 -108.976 -109.443 -109.928 -110.679 -111.179 -111.679 -111.939 -112.484 -113.037 -113.605 -113.905 -114.633 -114.847 -115.184 -115.538 -116.279 -116.678 -117.081 -117.525 -118.024 -118.603 -119.286 -121.523 -3 ,14395 ,KEBNE ,17125773,Thu Dec 30 16:52:39 CET,Thu Dec 30 18:51:40 CET,0.0 1.157 1.478 1.736 1.955 2.13 2.265 2.39 2.575 2.639 2.695 2.498 2.798 2.822 2.867 2.879 2.9 2.92 2.951 2.972 2.989 2.985 2.967 2.927 2.885 2.822 2.768 2.713 2.6 2.474 2.342 2.134 1.891 1.662 1.403 1.053 0.657 0.214 -0.3 -0.946 -1.698 -2.598 -3.773 -5.103 -6.836 -9.041 -11.96 -15.726 -20.707 -27.488 -37.788 -48.735 -57.089 -63.92 -69.394 -74.035 -77.949 -81.308 -84.059 -86.726 -88.996 -90.994 -92.827 -94.463 -95.913 -97.2 -98.504 -99.676 -100.686 -101.703 -102.765 -103.628 -104.474 -105.324 -106.003 -106.701 -107.391 -108.094 -108.798 -109.272 -109.759 -110.487 -110.986 -111.502 -111.765 -112.314 -112.875 -113.456 -113.762 -114.495 -114.727 -115.071 -115.435 -116.173 -116.56 -116.945 -117.338 -117.793 -118.311 -119.071 -121.365 -4 ,29904 ,KEBNE ,17125774,Thu Dec 30 16:52:39 CET,Thu Dec 30 18:51:40 CET,0.0 1.425 1.685 1.875 1.972 2.06 2.139 2.203 2.34 2.388 2.418 2.205 2.499 2.51 2.526 2.503 2.459 2.439 2.38 2.331 2.271 2.212 2.148 2.059 1.946 1.811 1.667 1.508 1.293 1.065 0.824 0.519 0.199 -0.131 -0.52 -0.969 -1.447 -2.013 -2.648 -3.342 -4.159 -5.192 -6.463 -7.854 -9.667 -11.891 -14.783 -18.573 -23.696 -30.952 -41.894 -53.214 -61.558 -68.121 -73.372 -77.799 -81.522 -84.768 -87.444 -90.014 -92.137 -93.989 -95.71 -97.29 -98.748 -100.049 -101.37 -102.519 -103.488 -104.459 -105.426 -106.207 -106.989 -107.785 -108.398 -109.056 -109.75 -110.455 -111.148 -111.598 -112.076 -112.835 -113.351 -113.864 -114.121 -114.65 -115.177 -115.719 -116.018 -116.745 -116.985 -117.311 -117.658 -118.382 -118.746 -119.147 -119.552 -119.97 -120.488 -121.176 -123.984 -5 ,7786 ,KEBNE ,17125775,Thu Dec 30 16:52:42 CET,Thu Dec 30 18:50:18 CET,0.0 0.711 1.042 1.296 1.462 1.583 1.676 1.765 1.922 1.969 1.998 1.788 2.077 2.068 2.06 2.061 2.032 2.005 1.958 1.923 1.855 1.799 1.733 1.615 1.47 1.335 1.214 1.088 0.9 0.69 0.481 0.233 -0.021 -0.312 -0.679 -1.117 -1.562 -2.094 -2.749 -3.495 -4.359 -5.422 -6.759 -8.232 -10.083 -12.282 -15.078 -18.688 -23.607 -30.665 -41.374 -52.675 -61.071 -67.647 -72.964 -77.592 -81.43 -84.66 -87.338 -90.028 -92.289 -94.16 -95.859 -97.425 -98.847 -100.1 -101.357 -102.461 -103.407 -104.381 -105.365 -106.169 -106.998 -107.854 -108.512 -109.165 -109.824 -110.495 -111.198 -111.692 -112.18 -112.876 -113.359 -113.868 -114.13 -114.666 -115.218 -115.771 -116.046 -116.738 -116.914 -117.229 -117.566 -118.291 -118.676 -119.11 -119.57 -120.054 -120.701 -121.475 -123.208 -6 ,15258 ,KEBNE ,17125776,Thu Dec 30 16:52:43 CET,Thu Dec 30 18:51:18 CET,0.0 1.304 1.563 1.734 1.862 1.941 2.018 2.089 2.211 2.263 2.302 2.064 2.348 2.36 2.373 2.372 2.357 2.34 2.308 2.288 2.233 2.191 2.159 2.108 2.046 1.995 1.928 1.816 1.654 1.491 1.325 1.111 0.866 0.594 0.275 -0.104 -0.509 -1.022 -1.638 -2.34 -3.168 -4.191 -5.462 -6.842 -8.582 -10.686 -13.453 -17.236 -22.434 -29.605 -40.407 -51.953 -60.622 -67.367 -72.746 -77.392 -81.312 -84.64 -87.366 -90.006 -92.175 -94.0 -95.699 -97.292 -98.745 -100.035 -101.343 -102.476 -103.428 -104.398 -105.387 -106.203 -107.02 -107.829 -108.445 -109.067 -109.705 -110.353 -111.01 -111.462 -111.922 -112.638 -113.151 -113.677 -113.945 -114.49 -115.026 -115.594 -115.887 -116.6 -116.824 -117.137 -117.451 -118.139 -118.481 -118.825 -119.233 -119.698 -120.232 -120.919 -123.214 -8 ,30814 ,KEBNE ,17125780,Thu Dec 30 16:52:46 CET,Thu Dec 30 18:51:15 CET,0.0 1.014 1.36 1.565 1.713 1.815 1.889 1.966 2.051 2.08 2.122 1.897 2.189 2.189 2.189 2.161 2.118 2.091 2.032 1.982 1.892 1.828 1.77 1.662 1.541 1.42 1.275 1.118 0.914 0.682 0.429 0.1 -0.239 -0.577 -0.972 -1.445 -1.976 -2.577 -3.225 -3.966 -4.814 -5.897 -7.278 -8.777 -10.698 -13.034 -16.044 -19.889 -25.037 -32.207 -43.035 -54.576 -63.129 -69.846 -75.222 -79.743 -83.512 -86.715 -89.383 -92.023 -94.197 -96.053 -97.751 -99.279 -100.656 -101.916 -103.222 -104.345 -105.279 -106.214 -107.16 -107.931 -108.719 -109.519 -110.117 -110.734 -111.383 -112.041 -112.715 -113.164 -113.61 -114.309 -114.802 -115.311 -115.568 -116.094 -116.661 -117.261 -117.561 -118.271 -118.487 -118.821 -119.148 -119.847 -120.223 -120.606 -121.013 -121.472 -122.101 -122.857 -124.613 -9 ,23593 ,KEBNE ,17125781,Thu Dec 30 16:52:46 CET,Thu Dec 30 18:51:18 CET,0.0 1.797 2.183 2.41 2.575 2.717 2.8 2.879 3.025 3.072 3.095 2.822 3.105 3.122 3.14 3.157 3.145 3.118 3.083 3.051 2.982 2.941 2.891 2.813 2.718 2.591 2.443 2.269 2.035 1.821 1.611 1.304 0.97 0.653 0.254 -0.235 -0.698 -1.25 -1.901 -2.637 -3.509 -4.574 -5.886 -7.323 -9.158 -11.413 -14.336 -18.161 -23.299 -30.405 -41.325 -53.082 -61.863 -68.834 -74.406 -78.96 -82.7 -85.984 -88.736 -91.366 -93.555 -95.442 -97.15 -98.704 -100.128 -101.391 -102.691 -103.838 -104.779 -105.728 -106.689 -107.46 -108.246 -109.032 -109.627 -110.257 -110.895 -111.535 -112.208 -112.653 -113.094 -113.798 -114.264 -114.72 -114.967 -115.508 -116.088 -116.68 -116.964 -117.659 -117.814 -118.126 -118.451 -119.119 -119.463 -119.829 -120.242 -120.687 -121.181 -121.809 -123.755 -10 ,996 ,KEBNE ,17125782,Thu Dec 30 16:52:46 CET,Thu Dec 30 18:52:28 CET,0.0 1.208 1.49 1.66 1.809 1.92 2.006 2.092 2.222 2.272 2.317 2.07 2.354 2.366 2.395 2.414 2.42 2.415 2.385 2.352 2.256 2.174 2.078 1.933 1.822 1.7 1.56 1.436 1.255 1.04 0.811 0.505 0.157 -0.206 -0.63 -1.131 -1.652 -2.272 -3.002 -3.842 -4.768 -5.866 -7.244 -8.76 -10.71 -13.136 -16.228 -20.17 -25.467 -32.672 -43.358 -54.776 -63.291 -69.952 -75.328 -79.899 -83.674 -86.894 -89.543 -92.084 -94.167 -95.938 -97.619 -99.182 -100.579 -101.821 -103.1 -104.217 -105.158 -106.112 -107.089 -107.888 -108.694 -109.532 -110.161 -110.77 -111.398 -112.06 -112.761 -113.269 -113.76 -114.461 -114.944 -115.407 -115.654 -116.189 -116.719 -117.269 -117.558 -118.267 -118.462 -118.774 -119.093 -119.776 -120.143 -120.553 -120.993 -121.442 -121.947 -122.589 -124.653 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 16b06727..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,10033 ,TETRA ,17557777,Fri Nov 26 10:47:48 CET,Fri Nov 26 13:02:25 CET,0.0 0.271 0.521 0.737 0.924 1.094 1.258 1.419 1.712 1.847 1.992 2.021 2.458 2.607 2.903 3.187 3.47 3.615 3.892 4.143 4.514 4.769 5.016 5.375 5.735 6.096 6.461 6.818 7.265 7.709 8.157 8.693 9.212 9.725 10.321 11.016 11.72 12.476 13.268 14.137 15.118 16.245 17.57 18.914 20.528 22.353 24.453 26.915 29.944 33.587 37.665 40.559 42.077 42.768 42.952 42.937 42.768 42.505 42.223 41.871 41.503 41.144 40.82 40.525 40.21 39.909 39.617 39.31 38.998 38.66 38.308 38.031 37.74 37.421 37.158 36.878 36.574 36.251 35.899 35.641 35.377 34.946 34.612 34.268 34.086 33.719 33.356 32.953 32.717 32.211 31.941 31.677 31.385 30.691 30.214 29.7 29.216 28.708 28.106 27.194 21.302 -10 ,12082 ,TETRA ,17557785,Fri Nov 26 10:47:48 CET,Fri Nov 26 12:57:53 CET,0.0 0.496 0.732 0.918 1.094 1.266 1.442 1.611 1.915 2.053 2.192 2.212 2.63 2.761 3.009 3.261 3.51 3.631 3.873 4.125 4.494 4.723 4.961 5.343 5.714 6.072 6.419 6.762 7.241 7.734 8.237 8.832 9.386 9.946 10.661 11.503 12.282 13.138 14.096 15.133 16.256 17.55 19.002 20.459 22.261 24.365 26.785 29.424 32.488 35.9 39.512 42.097 43.255 43.899 44.13 44.06 43.842 43.562 43.307 42.94 42.55 42.183 41.82 41.451 41.108 40.777 40.389 40.061 39.778 39.459 39.119 38.824 38.449 38.029 37.733 37.407 37.044 36.684 36.331 36.072 35.801 35.376 35.069 34.744 34.573 34.209 33.827 33.4 33.181 32.719 32.482 32.237 32.008 31.426 31.058 30.683 30.263 29.786 29.138 28.138 18.43 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt deleted file mode 100644 index f20ecd7b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20335 ,TETRA ,17557786,Fri Nov 26 10:48:53 CET,Fri Nov 26 13:08:45 CET,0.0 0.746 0.986 1.209 1.384 1.522 1.646 1.757 1.987 2.098 2.21 2.323 2.542 2.632 2.813 3.0 3.179 3.261 3.429 3.599 3.834 3.976 4.115 4.319 4.513 4.705 4.88 5.055 5.297 5.537 5.777 6.07 6.339 6.601 6.926 7.27 7.585 7.93 8.31 8.746 9.224 9.763 10.395 11.057 11.838 12.712 13.756 14.993 16.492 18.25 20.419 22.17 23.055 23.588 23.963 24.202 24.335 24.428 24.466 24.46 24.447 24.421 24.378 24.333 24.28 24.218 24.14 24.067 24.006 23.945 23.871 23.773 23.64 23.512 23.421 23.329 23.249 23.159 23.039 22.96 22.867 22.712 22.614 22.508 22.455 22.354 22.254 22.141 22.076 21.902 21.823 21.739 21.647 21.459 21.345 21.212 21.068 20.904 20.732 20.536 19.752 -2 ,25353 ,TETRA ,17557787,Fri Nov 26 10:48:53 CET,Fri Nov 26 13:11:16 CET,0.0 0.311 0.516 0.638 0.764 0.883 0.997 1.116 1.339 1.449 1.541 1.583 1.778 1.868 2.053 2.222 2.381 2.456 2.598 2.747 2.979 3.123 3.253 3.454 3.657 3.846 4.032 4.215 4.456 4.689 4.917 5.201 5.481 5.749 6.061 6.416 6.761 7.14 7.57 8.038 8.524 9.087 9.74 10.392 11.165 12.068 13.147 14.366 15.874 17.772 20.146 22.072 23.189 23.891 24.411 24.814 25.054 25.189 25.23 25.221 25.18 25.133 25.1 25.053 24.976 24.904 24.836 24.763 24.705 24.65 24.578 24.496 24.4 24.294 24.206 24.11 24.014 23.921 23.821 23.754 23.689 23.558 23.462 23.371 23.323 23.228 23.11 22.989 22.923 22.765 22.724 22.64 22.561 22.397 22.307 22.207 22.09 21.986 21.873 21.678 20.939 -3 ,2689 ,TETRA ,17557788,Fri Nov 26 10:48:53 CET,Fri Nov 26 13:15:04 CET,0.0 0.242 0.387 0.519 0.639 0.748 0.87 0.98 1.161 1.245 1.335 1.415 1.622 1.718 1.914 2.082 2.236 2.319 2.478 2.615 2.831 2.989 3.145 3.371 3.579 3.774 3.971 4.179 4.457 4.708 4.946 5.232 5.509 5.783 6.104 6.472 6.838 7.234 7.653 8.118 8.611 9.186 9.875 10.549 11.368 12.306 13.389 14.655 16.234 18.213 20.68 22.759 23.942 24.68 25.186 25.501 25.72 25.883 25.974 26.036 26.049 26.02 25.983 25.958 25.918 25.86 25.783 25.706 25.649 25.59 25.502 25.425 25.351 25.264 25.194 25.112 25.02 24.943 24.873 24.819 24.75 24.646 24.583 24.505 24.461 24.383 24.283 24.136 24.062 23.913 23.88 23.797 23.709 23.555 23.463 23.361 23.267 23.17 23.054 22.875 22.491 -4 ,18603 ,TETRA ,17557789,Fri Nov 26 10:48:53 CET,Fri Nov 26 13:08:42 CET,0.0 0.709 0.885 1.025 1.172 1.318 1.446 1.56 1.761 1.863 1.964 2.025 2.222 2.305 2.488 2.68 2.876 2.971 3.14 3.293 3.509 3.651 3.793 4.022 4.24 4.438 4.631 4.818 5.061 5.301 5.54 5.838 6.112 6.37 6.683 7.071 7.45 7.855 8.32 8.829 9.372 9.968 10.669 11.411 12.276 13.278 14.48 15.804 17.379 19.323 21.682 23.678 24.846 25.496 25.872 26.143 26.349 26.471 26.536 26.599 26.627 26.626 26.598 26.552 26.493 26.415 26.34 26.269 26.199 26.114 26.008 25.922 25.834 25.74 25.658 25.579 25.496 25.407 25.325 25.259 25.178 25.046 24.956 24.86 24.811 24.708 24.601 24.48 24.409 24.247 24.204 24.122 24.02 23.815 23.708 23.604 23.478 23.305 23.109 22.832 22.274 -5 ,21304 ,TETRA ,17557790,Fri Nov 26 10:48:53 CET,Fri Nov 26 13:11:37 CET,0.0 0.396 0.663 0.837 0.979 1.137 1.296 1.441 1.682 1.785 1.892 1.995 2.213 2.319 2.52 2.684 2.843 2.928 3.091 3.256 3.506 3.662 3.814 4.026 4.23 4.428 4.629 4.833 5.101 5.357 5.595 5.886 6.174 6.456 6.784 7.161 7.539 7.953 8.397 8.864 9.369 9.963 10.649 11.334 12.171 13.154 14.299 15.62 17.161 18.887 20.854 22.475 23.502 24.079 24.4 24.592 24.688 24.722 24.721 24.721 24.715 24.698 24.655 24.593 24.523 24.454 24.377 24.297 24.213 24.125 24.054 23.994 23.921 23.829 23.759 23.692 23.603 23.491 23.378 23.301 23.217 23.086 23.01 22.944 22.903 22.805 22.708 22.608 22.547 22.388 22.367 22.303 22.241 22.121 22.043 21.944 21.829 21.714 21.545 21.288 20.32 -6 ,1736 ,TETRA ,17557791,Fri Nov 26 10:48:53 CET,Fri Nov 26 13:12:27 CET,0.0 0.63 0.815 0.979 1.121 1.244 1.362 1.474 1.692 1.794 1.908 2.009 2.215 2.304 2.488 2.666 2.828 2.906 3.07 3.24 3.459 3.594 3.735 3.948 4.162 4.366 4.564 4.758 4.999 5.24 5.476 5.757 6.039 6.321 6.65 7.041 7.435 7.855 8.306 8.801 9.322 9.923 10.642 11.392 12.278 13.265 14.446 15.826 17.438 19.427 21.996 23.989 25.093 25.798 26.253 26.554 26.712 26.755 26.742 26.71 26.673 26.645 26.623 26.581 26.537 26.49 26.388 26.292 26.201 26.099 25.998 25.902 25.799 25.683 25.591 25.506 25.421 25.323 25.199 25.114 25.033 24.9 24.812 24.737 24.7 24.616 24.514 24.397 24.329 24.164 24.13 24.059 23.976 23.788 23.672 23.537 23.395 23.256 23.098 22.897 22.37 -7 ,30123 ,TETRA ,17557792,Fri Nov 26 10:48:53 CET,Fri Nov 26 13:12:20 CET,0.0 0.246 0.446 0.622 0.766 0.907 1.033 1.138 1.349 1.459 1.556 1.637 1.857 1.955 2.152 2.334 2.502 2.589 2.751 2.905 3.138 3.276 3.404 3.6 3.796 3.988 4.183 4.383 4.65 4.899 5.131 5.411 5.67 5.937 6.25 6.594 6.95 7.35 7.772 8.24 8.746 9.311 9.968 10.649 11.506 12.507 13.654 14.934 16.432 18.278 20.621 22.558 23.677 24.373 24.825 25.128 25.272 25.317 25.334 25.337 25.301 25.227 25.167 25.091 24.976 24.887 24.809 24.726 24.658 24.594 24.515 24.424 24.319 24.215 24.119 24.023 23.936 23.844 23.75 23.677 23.584 23.424 23.31 23.201 23.139 23.0 22.862 22.726 22.656 22.491 22.447 22.373 22.277 22.057 21.929 21.784 21.649 21.508 21.31 21.065 20.582 -8 ,25091 ,TETRA ,17557793,Fri Nov 26 10:49:50 CET,Fri Nov 26 13:11:52 CET,0.0 0.357 0.464 0.561 0.657 0.767 0.882 0.983 1.181 1.277 1.366 1.422 1.627 1.707 1.877 2.044 2.187 2.256 2.39 2.52 2.733 2.879 3.02 3.216 3.415 3.617 3.804 3.986 4.223 4.459 4.696 4.981 5.248 5.509 5.813 6.147 6.479 6.854 7.274 7.744 8.265 8.861 9.558 10.264 11.106 12.105 13.279 14.536 15.928 17.587 19.823 21.755 22.849 23.473 23.816 24.022 24.118 24.179 24.214 24.219 24.182 24.117 24.048 23.976 23.901 23.814 23.706 23.621 23.554 23.476 23.385 23.298 23.215 23.117 23.025 22.932 22.838 22.74 22.629 22.543 22.46 22.325 22.225 22.122 22.064 21.948 21.828 21.707 21.645 21.489 21.436 21.345 21.244 21.027 20.912 20.78 20.623 20.452 20.27 20.03 19.462 -9 ,8381 ,TETRA ,17557794,Fri Nov 26 10:49:51 CET,Fri Nov 26 13:08:40 CET,0.0 0.612 0.812 0.977 1.131 1.282 1.433 1.564 1.783 1.894 1.988 2.034 2.242 2.334 2.523 2.708 2.872 2.952 3.121 3.273 3.47 3.605 3.739 3.928 4.108 4.288 4.466 4.649 4.907 5.15 5.386 5.675 5.939 6.194 6.496 6.869 7.235 7.616 8.026 8.487 8.985 9.559 10.273 10.983 11.812 12.768 13.841 15.03 16.503 18.344 20.573 22.409 23.405 23.807 23.891 23.98 24.113 24.212 24.26 24.307 24.316 24.301 24.278 24.228 24.171 24.112 24.052 23.998 23.938 23.866 23.781 23.698 23.594 23.483 23.398 23.317 23.23 23.11 22.959 22.853 22.749 22.577 22.469 22.364 22.309 22.185 22.028 21.869 21.795 21.636 21.602 21.532 21.445 21.228 21.097 20.983 20.883 20.726 20.467 20.156 19.445 -10 ,24128 ,TETRA ,17557795,Fri Nov 26 10:49:52 CET,Fri Nov 26 13:13:04 CET,0.0 0.308 0.498 0.648 0.817 0.953 1.083 1.208 1.446 1.569 1.683 1.753 1.962 2.055 2.23 2.389 2.537 2.609 2.753 2.893 3.109 3.257 3.405 3.616 3.825 4.041 4.244 4.443 4.709 4.959 5.208 5.52 5.826 6.114 6.457 6.838 7.197 7.613 8.071 8.559 9.078 9.666 10.37 11.085 11.91 12.826 13.886 15.103 16.546 18.269 20.338 22.148 23.269 23.987 24.436 24.727 24.925 24.997 24.977 24.964 24.943 24.882 24.811 24.731 24.644 24.576 24.505 24.42 24.322 24.214 24.102 23.996 23.892 23.794 23.7 23.616 23.539 23.447 23.354 23.287 23.217 23.094 22.998 22.893 22.837 22.716 22.598 22.489 22.43 22.277 22.259 22.194 22.118 21.954 21.869 21.781 21.654 21.532 21.376 21.132 20.713 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index a4fe1390..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18249 ,TETRA ,17557796,Fri Nov 26 10:49:52 CET,Fri Nov 26 13:07:37 CET,0.0 0.376 0.53 0.661 0.812 0.956 1.083 1.219 1.479 1.583 1.679 1.754 1.96 2.054 2.241 2.413 2.584 2.671 2.857 3.033 3.271 3.431 3.595 3.819 4.031 4.239 4.436 4.638 4.906 5.174 5.433 5.74 6.045 6.359 6.727 7.129 7.515 7.937 8.403 8.93 9.51 10.179 10.985 11.809 12.759 13.835 15.172 16.741 18.66 21.068 24.049 26.679 28.319 29.378 30.038 30.474 30.802 31.071 31.26 31.38 31.433 31.453 31.451 31.433 31.425 31.411 31.396 31.38 31.358 31.329 31.276 31.22 31.178 31.131 31.068 31.0 30.94 30.88 30.815 30.763 30.706 30.604 30.538 30.476 30.443 30.368 30.277 30.189 30.143 30.004 29.955 29.898 29.838 29.681 29.591 29.479 29.34 29.208 29.065 28.903 28.676 -2 ,6578 ,TETRA ,17557797,Fri Nov 26 10:49:52 CET,Fri Nov 26 13:15:04 CET,0.0 0.413 0.61 0.77 0.906 1.055 1.198 1.331 1.568 1.681 1.802 1.916 2.14 2.244 2.445 2.626 2.795 2.88 3.044 3.202 3.442 3.603 3.754 3.969 4.19 4.412 4.627 4.844 5.122 5.394 5.661 5.98 6.295 6.606 6.994 7.429 7.819 8.259 8.746 9.29 9.874 10.546 11.351 12.156 13.121 14.252 15.593 17.147 19.076 21.445 24.53 27.336 29.077 30.237 31.005 31.581 32.022 32.327 32.514 32.672 32.781 32.829 32.862 32.891 32.892 32.878 32.84 32.808 32.793 32.764 32.716 32.682 32.645 32.581 32.528 32.482 32.432 32.37 32.295 32.247 32.199 32.124 32.067 31.993 31.954 31.875 31.806 31.731 31.683 31.552 31.526 31.47 31.425 31.341 31.288 31.214 31.117 31.008 30.897 30.763 30.508 -3 ,28812 ,TETRA ,17557798,Fri Nov 26 10:49:52 CET,Fri Nov 26 13:16:10 CET,0.0 0.705 0.911 1.059 1.202 1.355 1.5 1.629 1.887 2.014 2.135 2.245 2.476 2.581 2.776 2.963 3.152 3.247 3.421 3.594 3.856 4.035 4.208 4.444 4.67 4.892 5.103 5.307 5.575 5.845 6.118 6.448 6.774 7.104 7.5 7.956 8.401 8.887 9.399 9.944 10.542 11.246 12.093 12.93 13.916 15.096 16.514 18.092 20.021 22.411 25.424 27.986 29.509 30.468 31.037 31.472 31.786 31.971 32.099 32.206 32.275 32.308 32.307 32.285 32.247 32.219 32.195 32.159 32.131 32.102 32.057 32.013 31.952 31.879 31.827 31.772 31.71 31.642 31.57 31.521 31.467 31.369 31.283 31.187 31.142 31.045 30.932 30.814 30.763 30.632 30.598 30.533 30.446 30.234 30.134 30.045 29.931 29.791 29.624 29.46 29.291 -4 ,27582 ,TETRA ,17557799,Fri Nov 26 10:49:52 CET,Fri Nov 26 13:13:53 CET,0.0 0.209 0.361 0.517 0.688 0.841 0.952 1.062 1.293 1.403 1.501 1.58 1.784 1.868 2.035 2.21 2.38 2.463 2.627 2.794 3.026 3.175 3.328 3.54 3.741 3.944 4.137 4.327 4.587 4.845 5.108 5.433 5.742 6.041 6.384 6.767 7.139 7.555 8.016 8.529 9.088 9.727 10.483 11.245 12.148 13.18 14.44 15.954 17.764 20.008 22.894 25.336 26.813 27.826 28.468 28.9 29.192 29.388 29.574 29.745 29.842 29.901 29.941 29.973 29.997 30.006 29.982 29.943 29.928 29.902 29.846 29.8 29.755 29.707 29.667 29.627 29.57 29.496 29.419 29.367 29.305 29.208 29.146 29.079 29.034 28.926 28.828 28.731 28.681 28.548 28.54 28.476 28.405 28.259 28.179 28.096 28.007 27.906 27.777 27.668 27.481 -5 ,9157 ,TETRA ,17557800,Fri Nov 26 10:49:52 CET,Fri Nov 26 13:03:47 CET,0.0 0.272 0.411 0.555 0.702 0.83 0.945 1.061 1.305 1.415 1.515 1.591 1.791 1.872 2.032 2.198 2.363 2.446 2.621 2.789 3.019 3.164 3.301 3.508 3.716 3.908 4.097 4.299 4.585 4.867 5.13 5.449 5.758 6.051 6.385 6.78 7.183 7.631 8.11 8.625 9.165 9.753 10.48 11.262 12.207 13.267 14.517 15.97 17.692 19.766 22.458 24.806 26.243 27.243 27.929 28.398 28.703 28.933 29.074 29.159 29.226 29.273 29.295 29.3 29.304 29.304 29.294 29.275 29.253 29.225 29.174 29.125 29.073 29.007 28.954 28.91 28.869 28.81 28.741 28.699 28.661 28.599 28.544 28.481 28.452 28.394 28.329 28.255 28.212 28.077 28.082 28.042 27.993 27.881 27.82 27.745 27.648 27.555 27.482 27.375 26.85 -6 ,25106 ,TETRA ,17557801,Fri Nov 26 10:49:52 CET,Fri Nov 26 13:16:25 CET,0.0 0.795 1.03 1.231 1.406 1.575 1.725 1.857 2.105 2.221 2.333 2.425 2.642 2.741 2.94 3.133 3.32 3.405 3.574 3.737 3.952 4.097 4.256 4.508 4.756 4.984 5.2 5.417 5.722 6.014 6.284 6.61 6.933 7.259 7.646 8.079 8.489 8.967 9.504 10.068 10.654 11.304 12.084 12.891 13.812 14.852 16.154 17.726 19.696 22.165 25.264 27.937 29.523 30.587 31.296 31.77 32.128 32.384 32.556 32.685 32.761 32.831 32.882 32.893 32.888 32.883 32.859 32.823 32.791 32.737 32.665 32.606 32.561 32.52 32.474 32.417 32.36 32.308 32.254 32.212 32.161 32.069 32.003 31.941 31.907 31.824 31.757 31.698 31.662 31.535 31.501 31.447 31.4 31.293 31.226 31.137 31.043 30.94 30.814 30.673 30.383 -7 ,5771 ,TETRA ,17557802,Fri Nov 26 10:49:52 CET,Fri Nov 26 13:16:39 CET,0.0 0.307 0.46 0.592 0.759 0.928 1.07 1.189 1.385 1.474 1.567 1.639 1.851 1.936 2.114 2.297 2.469 2.555 2.725 2.887 3.12 3.278 3.446 3.697 3.945 4.186 4.41 4.63 4.922 5.203 5.472 5.806 6.136 6.466 6.85 7.271 7.682 8.146 8.66 9.221 9.818 10.499 11.309 12.157 13.192 14.371 15.768 17.387 19.315 21.653 24.582 27.163 28.74 29.83 30.632 31.151 31.522 31.86 32.114 32.315 32.443 32.525 32.589 32.632 32.653 32.654 32.66 32.669 32.675 32.68 32.671 32.653 32.621 32.58 32.541 32.503 32.474 32.434 32.382 32.347 32.312 32.245 32.19 32.128 32.089 32.006 31.935 31.86 31.824 31.707 31.698 31.649 31.582 31.414 31.326 31.226 31.124 31.031 30.918 30.749 29.934 -8 ,15116 ,TETRA ,17557803,Fri Nov 26 10:49:52 CET,Fri Nov 26 13:13:12 CET,0.0 0.22 0.404 0.58 0.742 0.9 1.044 1.184 1.433 1.546 1.654 1.748 1.978 2.081 2.27 2.453 2.626 2.707 2.868 3.033 3.28 3.446 3.6 3.816 4.028 4.248 4.47 4.689 4.978 5.262 5.534 5.855 6.174 6.488 6.87 7.307 7.721 8.185 8.69 9.234 9.83 10.531 11.374 12.229 13.252 14.391 15.713 17.195 18.926 21.12 23.906 26.35 27.889 28.843 29.463 29.915 30.197 30.401 30.568 30.712 30.781 30.814 30.81 30.765 30.722 30.681 30.634 30.582 30.523 30.447 30.363 30.298 30.218 30.124 30.067 30.015 29.97 29.922 29.851 29.796 29.738 29.66 29.599 29.528 29.496 29.433 29.36 29.271 29.224 29.095 29.08 29.015 28.946 28.789 28.696 28.595 28.493 28.386 28.264 28.124 27.92 -9 ,6646 ,TETRA ,17557804,Fri Nov 26 10:49:52 CET,Fri Nov 26 13:16:30 CET,0.0 0.597 0.772 0.9 1.037 1.166 1.295 1.426 1.656 1.769 1.89 1.996 2.212 2.303 2.496 2.681 2.856 2.949 3.138 3.318 3.58 3.739 3.899 4.146 4.376 4.587 4.806 5.029 5.314 5.598 5.868 6.194 6.522 6.844 7.221 7.672 8.124 8.601 9.106 9.67 10.286 10.994 11.855 12.758 13.828 15.013 16.422 18.124 20.189 22.655 25.808 28.743 30.6 31.813 32.641 33.262 33.73 34.077 34.314 34.503 34.632 34.702 34.714 34.685 34.649 34.601 34.528 34.458 34.397 34.303 34.19 34.094 33.985 33.872 33.785 33.701 33.616 33.54 33.454 33.379 33.298 33.179 33.087 32.973 32.916 32.824 32.731 32.62 32.557 32.402 32.35 32.275 32.205 32.046 31.936 31.821 31.704 31.563 31.402 31.208 30.817 -10 ,2483 ,TETRA ,17557805,Fri Nov 26 10:50:52 CET,Fri Nov 26 13:05:21 CET,0.0 0.565 0.77 0.949 1.078 1.209 1.328 1.437 1.652 1.756 1.857 1.932 2.146 2.237 2.407 2.579 2.759 2.844 3.005 3.159 3.404 3.573 3.737 3.974 4.197 4.407 4.618 4.833 5.113 5.385 5.651 5.985 6.291 6.558 6.866 7.239 7.627 8.051 8.5 8.997 9.533 10.16 10.895 11.636 12.515 13.538 14.824 16.359 18.185 20.437 23.314 25.785 27.403 28.444 29.1 29.551 29.867 30.126 30.302 30.456 30.573 30.641 30.693 30.739 30.77 30.784 30.785 30.775 30.755 30.728 30.694 30.665 30.63 30.587 30.557 30.535 30.493 30.443 30.394 30.36 30.332 30.28 30.237 30.188 30.156 30.082 30.008 29.934 29.897 29.78 29.791 29.739 29.668 29.533 29.466 29.379 29.303 29.213 29.112 29.001 28.815 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt deleted file mode 100644 index fc8d2aa5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10872 ,TETRA ,17557806,Fri Nov 26 10:50:51 CET,Fri Nov 26 13:17:10 CET,0.0 0.248 0.463 0.592 0.7 0.805 0.888 0.966 1.149 1.235 1.316 1.377 1.548 1.606 1.721 1.821 1.914 1.958 2.031 2.112 2.223 2.293 2.352 2.435 2.529 2.62 2.702 2.773 2.858 2.935 2.998 3.066 3.137 3.209 3.293 3.389 3.475 3.557 3.638 3.714 3.755 3.794 3.82 3.776 3.723 3.654 3.448 3.091 2.538 1.688 0.207 -1.719 -3.324 -4.704 -5.892 -6.934 -7.848 -8.649 -9.294 -9.922 -10.461 -10.953 -11.44 -11.885 -12.272 -12.616 -12.987 -13.316 -13.584 -13.859 -14.132 -14.353 -14.59 -14.833 -15.033 -15.238 -15.447 -15.662 -15.866 -16.005 -16.156 -16.381 -16.527 -16.689 -16.775 -16.952 -17.134 -17.325 -17.432 -17.657 -17.757 -17.886 -18.009 -18.25 -18.392 -18.54 -18.684 -18.853 -19.067 -19.28 -19.935 -2 ,31020 ,TETRA ,17557807,Fri Nov 26 10:50:51 CET,Fri Nov 26 13:20:44 CET,0.0 0.264 0.406 0.516 0.63 0.748 0.849 0.931 1.081 1.143 1.203 1.227 1.389 1.444 1.551 1.665 1.779 1.839 1.959 2.072 2.223 2.326 2.43 2.572 2.71 2.844 2.984 3.115 3.257 3.374 3.458 3.55 3.639 3.72 3.816 3.895 3.97 4.051 4.116 4.164 4.189 4.214 4.229 4.218 4.173 4.072 3.846 3.476 2.951 2.075 0.434 -1.575 -3.223 -4.563 -5.703 -6.709 -7.553 -8.276 -8.899 -9.53 -10.08 -10.555 -11.013 -11.467 -11.865 -12.207 -12.588 -12.952 -13.263 -13.559 -13.856 -14.11 -14.37 -14.628 -14.824 -15.024 -15.222 -15.415 -15.626 -15.783 -15.954 -16.227 -16.417 -16.624 -16.73 -16.944 -17.17 -17.399 -17.515 -17.739 -17.86 -17.994 -18.139 -18.43 -18.566 -18.724 -18.897 -19.066 -19.243 -19.459 -19.87 -3 ,4314 ,TETRA ,17557808,Fri Nov 26 10:50:52 CET,Fri Nov 26 13:10:59 CET,0.0 0.367 0.55 0.701 0.789 0.86 0.943 1.041 1.22 1.282 1.342 1.372 1.529 1.578 1.666 1.771 1.862 1.902 1.994 2.074 2.179 2.248 2.304 2.389 2.478 2.571 2.669 2.755 2.866 2.967 3.052 3.15 3.245 3.322 3.423 3.528 3.595 3.659 3.719 3.767 3.82 3.871 3.9 3.903 3.863 3.768 3.586 3.256 2.729 1.784 0.089 -1.881 -3.521 -4.957 -6.181 -7.258 -8.147 -8.907 -9.56 -10.19 -10.693 -11.14 -11.58 -11.985 -12.368 -12.714 -13.073 -13.395 -13.658 -13.925 -14.215 -14.451 -14.694 -14.945 -15.127 -15.31 -15.516 -15.729 -15.939 -16.089 -16.246 -16.49 -16.656 -16.823 -16.914 -17.101 -17.277 -17.446 -17.526 -17.73 -17.82 -17.922 -18.022 -18.258 -18.395 -18.538 -18.675 -18.813 -18.971 -19.164 -19.533 -4 ,3400 ,TETRA ,17557809,Fri Nov 26 10:50:51 CET,Fri Nov 26 13:22:52 CET,0.0 0.296 0.521 0.676 0.806 0.906 0.984 1.074 1.232 1.289 1.345 1.355 1.51 1.561 1.661 1.76 1.851 1.894 1.979 2.069 2.195 2.27 2.341 2.437 2.525 2.606 2.691 2.778 2.889 2.988 3.086 3.219 3.336 3.441 3.543 3.632 3.719 3.811 3.909 4.0 4.063 4.109 4.141 4.154 4.159 4.126 4.067 3.902 3.505 2.807 1.49 -0.212 -1.613 -2.773 -3.793 -4.708 -5.484 -6.178 -6.782 -7.382 -7.896 -8.377 -8.831 -9.243 -9.62 -9.974 -10.348 -10.684 -10.976 -11.251 -11.536 -11.784 -12.043 -12.302 -12.493 -12.691 -12.882 -13.078 -13.294 -13.451 -13.611 -13.85 -14.013 -14.188 -14.278 -14.445 -14.608 -14.784 -14.876 -15.087 -15.161 -15.272 -15.376 -15.554 -15.654 -15.789 -15.932 -16.087 -16.269 -16.466 -16.744 -5 ,9793 ,TETRA ,17557810,Fri Nov 26 10:50:53 CET,Fri Nov 26 13:09:14 CET,0.0 0.479 0.687 0.818 0.962 1.067 1.143 1.219 1.366 1.443 1.521 1.551 1.703 1.761 1.877 1.987 2.083 2.129 2.22 2.29 2.383 2.45 2.517 2.608 2.692 2.772 2.848 2.925 3.03 3.135 3.234 3.339 3.433 3.534 3.657 3.785 3.886 3.969 4.045 4.141 4.237 4.319 4.389 4.413 4.378 4.299 4.153 3.886 3.449 2.687 1.312 -0.528 -2.039 -3.246 -4.332 -5.32 -6.169 -6.923 -7.563 -8.177 -8.686 -9.126 -9.529 -9.909 -10.258 -10.585 -10.946 -11.266 -11.533 -11.797 -12.076 -12.311 -12.535 -12.758 -12.945 -13.138 -13.33 -13.538 -13.748 -13.884 -14.027 -14.257 -14.407 -14.556 -14.637 -14.809 -14.982 -15.16 -15.253 -15.465 -15.559 -15.66 -15.762 -15.965 -16.082 -16.212 -16.345 -16.495 -16.664 -16.885 -17.234 -6 ,30932 ,TETRA ,17557811,Fri Nov 26 10:51:51 CET,Fri Nov 26 13:21:39 CET,0.0 0.279 0.438 0.542 0.646 0.733 0.805 0.869 0.999 1.07 1.132 1.154 1.302 1.354 1.465 1.571 1.66 1.699 1.777 1.857 1.968 2.051 2.129 2.228 2.324 2.422 2.52 2.597 2.693 2.803 2.899 2.987 3.073 3.162 3.269 3.371 3.44 3.516 3.607 3.696 3.781 3.85 3.893 3.93 3.961 4.003 4.005 3.857 3.48 2.81 1.553 -0.101 -1.532 -2.786 -3.889 -4.937 -5.913 -6.772 -7.492 -8.221 -8.78 -9.23 -9.68 -10.094 -10.462 -10.792 -11.129 -11.428 -11.676 -11.936 -12.215 -12.445 -12.682 -12.935 -13.13 -13.314 -13.488 -13.673 -13.877 -14.016 -14.151 -14.363 -14.51 -14.658 -14.731 -14.883 -15.042 -15.201 -15.283 -15.49 -15.568 -15.674 -15.786 -15.988 -16.087 -16.209 -16.344 -16.462 -16.585 -16.746 -16.939 -7 ,14435 ,TETRA ,17557812,Fri Nov 26 10:51:51 CET,Fri Nov 26 13:21:45 CET,0.0 0.645 0.86 1.005 1.133 1.259 1.37 1.473 1.65 1.728 1.816 1.9 2.09 2.168 2.311 2.435 2.547 2.598 2.687 2.771 2.89 2.962 3.024 3.103 3.188 3.27 3.354 3.436 3.548 3.656 3.739 3.843 3.94 4.028 4.117 4.191 4.245 4.304 4.377 4.434 4.477 4.51 4.521 4.505 4.442 4.295 4.052 3.67 3.098 2.187 0.519 -1.488 -3.111 -4.509 -5.683 -6.678 -7.561 -8.36 -9.095 -9.814 -10.371 -10.858 -11.345 -11.83 -12.282 -12.706 -13.118 -13.46 -13.753 -14.056 -14.365 -14.603 -14.835 -15.082 -15.29 -15.508 -15.731 -15.962 -16.187 -16.321 -16.458 -16.694 -16.859 -17.038 -17.13 -17.305 -17.493 -17.705 -17.805 -18.018 -18.125 -18.244 -18.357 -18.586 -18.719 -18.863 -19.023 -19.273 -19.539 -19.838 -20.53 -8 ,21481 ,TETRA ,17557813,Fri Nov 26 11:00:07 CET,Fri Nov 26 13:28:28 CET,0.0 0.263 0.367 0.461 0.565 0.666 0.767 0.853 1.005 1.081 1.143 1.148 1.306 1.365 1.474 1.583 1.671 1.711 1.799 1.881 1.99 2.059 2.122 2.206 2.288 2.36 2.428 2.494 2.572 2.659 2.744 2.822 2.894 2.958 3.014 3.079 3.157 3.253 3.332 3.394 3.457 3.516 3.556 3.528 3.458 3.373 3.187 2.886 2.415 1.555 0.01 -1.884 -3.5 -4.861 -5.957 -6.884 -7.681 -8.41 -9.045 -9.686 -10.246 -10.739 -11.198 -11.626 -12.033 -12.408 -12.799 -13.133 -13.403 -13.677 -13.97 -14.211 -14.462 -14.737 -14.938 -15.128 -15.322 -15.523 -15.727 -15.868 -16.022 -16.256 -16.418 -16.582 -16.665 -16.866 -17.098 -17.308 -17.411 -17.638 -17.747 -17.855 -17.952 -18.148 -18.264 -18.394 -18.544 -18.698 -18.88 -19.168 -19.591 -9 ,31490 ,TETRA ,17557814,Fri Nov 26 11:00:07 CET,Fri Nov 26 13:24:52 CET,0.0 0.291 0.417 0.531 0.621 0.702 0.776 0.847 0.981 1.052 1.113 1.117 1.267 1.315 1.417 1.522 1.612 1.652 1.74 1.821 1.92 1.978 2.038 2.133 2.233 2.327 2.4 2.467 2.557 2.645 2.732 2.836 2.932 3.011 3.105 3.201 3.293 3.397 3.489 3.584 3.687 3.817 3.988 4.077 4.114 4.139 4.108 4.007 3.772 3.265 2.172 0.73 -0.649 -1.884 -2.867 -3.746 -4.63 -5.469 -6.135 -6.763 -7.312 -7.801 -8.243 -8.669 -9.062 -9.407 -9.762 -10.074 -10.349 -10.629 -10.92 -11.161 -11.398 -11.639 -11.829 -12.029 -12.219 -12.424 -12.65 -12.805 -12.957 -13.194 -13.365 -13.538 -13.623 -13.79 -13.956 -14.122 -14.219 -14.441 -14.519 -14.626 -14.733 -14.944 -15.053 -15.191 -15.34 -15.485 -15.646 -15.827 -16.301 -10 ,24798 ,TETRA ,17557815,Fri Nov 26 11:00:07 CET,Fri Nov 26 13:24:29 CET,0.0 0.201 0.344 0.484 0.625 0.738 0.842 0.951 1.135 1.214 1.279 1.299 1.454 1.512 1.634 1.755 1.868 1.918 2.014 2.115 2.264 2.347 2.429 2.544 2.632 2.718 2.804 2.876 2.971 3.074 3.173 3.287 3.393 3.484 3.58 3.66 3.728 3.806 3.88 3.963 4.034 4.084 4.101 4.107 4.107 4.036 3.891 3.608 3.142 2.394 0.896 -1.217 -3.1 -4.68 -5.976 -7.085 -8.047 -8.921 -9.66 -10.365 -10.951 -11.472 -11.955 -12.398 -12.824 -13.217 -13.625 -13.983 -14.282 -14.588 -14.95 -15.278 -15.602 -15.928 -16.161 -16.399 -16.652 -16.918 -17.185 -17.353 -17.527 -17.812 -18.002 -18.185 -18.276 -18.465 -18.685 -18.928 -19.046 -19.279 -19.391 -19.509 -19.645 -19.908 -20.026 -20.163 -20.296 -20.449 -20.628 -20.869 -21.221 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 29e1261c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4752 ,TETRA ,17557816,Fri Nov 26 11:00:07 CET,Fri Nov 26 13:28:03 CET,0.0 0.267 0.412 0.559 0.703 0.835 0.947 1.046 1.25 1.348 1.437 1.506 1.675 1.75 1.922 2.093 2.257 2.331 2.473 2.617 2.81 2.933 3.058 3.235 3.414 3.592 3.77 3.949 4.157 4.345 4.535 4.769 4.998 5.218 5.463 5.725 5.984 6.292 6.625 6.991 7.376 7.825 8.376 8.917 9.541 10.187 10.911 11.759 12.652 13.557 14.498 15.1 15.274 15.219 15.109 14.994 14.86 14.688 14.519 14.358 14.192 13.993 13.795 13.621 13.45 13.275 13.072 12.885 12.731 12.577 12.404 12.26 12.106 11.943 11.822 11.695 11.567 11.441 11.303 11.188 11.071 10.914 10.792 10.662 10.604 10.489 10.358 10.212 10.129 9.957 9.864 9.775 9.686 9.481 9.367 9.249 9.114 8.987 8.828 8.6 8.143 -2 ,31736 ,TETRA ,17557817,Fri Nov 26 11:00:07 CET,Fri Nov 26 13:25:29 CET,0.0 0.27 0.417 0.555 0.682 0.789 0.892 0.995 1.193 1.287 1.379 1.442 1.626 1.715 1.884 2.022 2.153 2.228 2.382 2.527 2.736 2.866 3.002 3.203 3.387 3.562 3.725 3.892 4.127 4.34 4.555 4.831 5.09 5.341 5.627 5.934 6.231 6.565 6.914 7.294 7.685 8.131 8.656 9.177 9.813 10.515 11.304 12.26 13.382 14.618 16.044 17.117 17.62 17.876 17.96 17.931 17.827 17.659 17.489 17.335 17.207 17.06 16.895 16.73 16.571 16.42 16.238 16.069 15.924 15.773 15.63 15.499 15.329 15.155 15.033 14.904 14.781 14.664 14.534 14.442 14.351 14.196 14.076 13.958 13.898 13.78 13.658 13.53 13.474 13.323 13.243 13.166 13.094 12.933 12.829 12.699 12.579 12.444 12.297 12.159 11.876 -3 ,14349 ,TETRA ,17557818,Fri Nov 26 11:00:07 CET,Fri Nov 26 13:20:50 CET,0.0 0.267 0.526 0.723 0.862 0.97 1.073 1.165 1.348 1.445 1.544 1.62 1.808 1.892 2.056 2.23 2.395 2.472 2.621 2.77 2.987 3.12 3.25 3.449 3.653 3.852 4.04 4.219 4.455 4.684 4.887 5.133 5.388 5.64 5.939 6.283 6.601 6.949 7.351 7.781 8.221 8.701 9.264 9.845 10.531 11.342 12.235 13.183 14.293 15.486 16.6 17.335 17.679 17.721 17.612 17.418 17.158 16.891 16.674 16.433 16.199 15.97 15.747 15.55 15.37 15.211 15.032 14.847 14.674 14.504 14.339 14.194 14.019 13.832 13.692 13.554 13.414 13.265 13.111 13.01 12.913 12.745 12.61 12.475 12.414 12.282 12.133 11.987 11.91 11.739 11.648 11.565 11.483 11.278 11.162 11.046 10.937 10.821 10.664 10.487 10.241 -4 ,19261 ,TETRA ,17557819,Fri Nov 26 11:00:08 CET,Fri Nov 26 13:26:02 CET,0.0 0.138 0.26 0.402 0.531 0.637 0.74 0.843 1.03 1.117 1.2 1.257 1.442 1.52 1.673 1.823 1.978 2.055 2.189 2.316 2.499 2.61 2.719 2.87 3.021 3.18 3.347 3.518 3.73 3.929 4.127 4.36 4.59 4.815 5.07 5.375 5.672 5.985 6.32 6.678 7.062 7.484 7.952 8.418 8.931 9.48 10.1 10.849 11.711 12.561 13.446 13.911 14.028 13.991 13.865 13.754 13.636 13.467 13.294 13.123 12.968 12.824 12.685 12.529 12.367 12.227 12.09 11.967 11.847 11.711 11.581 11.479 11.359 11.229 11.134 11.04 10.951 10.863 10.763 10.686 10.602 10.455 10.345 10.25 10.206 10.109 10.011 9.911 9.852 9.708 9.671 9.601 9.527 9.35 9.258 9.169 9.055 8.929 8.764 8.558 8.196 -5 ,7284 ,TETRA ,17557820,Fri Nov 26 11:00:08 CET,Fri Nov 26 13:27:40 CET,0.0 0.268 0.439 0.573 0.72 0.835 0.918 1.012 1.196 1.278 1.37 1.44 1.62 1.702 1.868 2.018 2.167 2.233 2.365 2.511 2.708 2.814 2.919 3.094 3.279 3.458 3.638 3.807 4.002 4.196 4.382 4.61 4.844 5.062 5.309 5.599 5.873 6.176 6.517 6.871 7.262 7.728 8.276 8.819 9.45 10.184 11.034 11.971 13.031 14.257 15.527 16.36 16.816 17.058 17.167 17.185 17.158 17.09 16.982 16.831 16.647 16.493 16.362 16.241 16.132 16.004 15.867 15.764 15.684 15.593 15.471 15.365 15.251 15.125 15.034 14.957 14.884 14.787 14.679 14.594 14.504 14.386 14.297 14.207 14.164 14.07 13.954 13.837 13.772 13.609 13.543 13.473 13.401 13.235 13.148 13.044 12.923 12.823 12.701 12.556 12.252 -6 ,29793 ,TETRA ,17557821,Fri Nov 26 11:00:58 CET,Fri Nov 26 13:27:49 CET,0.0 0.3 0.459 0.604 0.718 0.804 0.896 0.99 1.159 1.238 1.328 1.405 1.592 1.679 1.837 1.987 2.117 2.18 2.317 2.455 2.673 2.802 2.918 3.089 3.259 3.422 3.581 3.736 3.923 4.108 4.293 4.514 4.724 4.932 5.178 5.458 5.729 6.024 6.35 6.713 7.105 7.563 8.111 8.662 9.285 9.948 10.719 11.604 12.642 13.781 14.99 15.938 16.407 16.59 16.62 16.552 16.442 16.324 16.197 16.023 15.848 15.683 15.532 15.399 15.277 15.15 14.984 14.832 14.704 14.57 14.427 14.314 14.198 14.071 13.965 13.848 13.724 13.594 13.463 13.375 13.292 13.161 13.054 12.942 12.889 12.788 12.68 12.549 12.482 12.329 12.268 12.185 12.08 11.882 11.804 11.707 11.571 11.414 11.236 11.017 10.422 -7 ,1401 ,TETRA ,17557822,Fri Nov 26 11:00:08 CET,Fri Nov 26 13:26:14 CET,0.0 0.186 0.305 0.438 0.583 0.7 0.806 0.933 1.155 1.232 1.303 1.347 1.519 1.597 1.749 1.887 2.016 2.079 2.201 2.326 2.515 2.643 2.773 2.96 3.146 3.318 3.481 3.641 3.831 4.017 4.208 4.44 4.676 4.91 5.17 5.461 5.748 6.082 6.456 6.855 7.268 7.722 8.213 8.693 9.26 9.918 10.717 11.566 12.461 13.512 14.702 15.38 15.604 15.635 15.571 15.423 15.22 15.016 14.849 14.687 14.533 14.397 14.249 14.129 14.037 13.925 13.785 13.63 13.482 13.334 13.172 13.029 12.885 12.741 12.634 12.53 12.417 12.307 12.189 12.091 11.981 11.83 11.737 11.649 11.604 11.506 11.384 11.224 11.142 10.981 10.918 10.84 10.752 10.566 10.467 10.363 10.239 10.07 9.895 9.727 9.339 -8 ,10644 ,TETRA ,17557823,Fri Nov 26 11:00:08 CET,Fri Nov 26 13:18:22 CET,0.0 0.228 0.392 0.517 0.619 0.729 0.836 0.937 1.137 1.237 1.318 1.382 1.568 1.649 1.801 1.943 2.088 2.161 2.304 2.44 2.626 2.757 2.893 3.077 3.247 3.412 3.575 3.741 3.964 4.171 4.357 4.602 4.84 5.055 5.317 5.626 5.925 6.26 6.611 6.946 7.297 7.726 8.237 8.738 9.313 9.928 10.635 11.479 12.471 13.596 14.76 15.361 15.489 15.476 15.384 15.244 15.122 14.995 14.818 14.611 14.421 14.229 14.039 13.844 13.668 13.505 13.321 13.161 13.028 12.89 12.743 12.614 12.471 12.327 12.203 12.073 11.937 11.796 11.654 11.554 11.463 11.322 11.214 11.096 11.032 10.892 10.738 10.585 10.512 10.353 10.274 10.193 10.115 9.912 9.8 9.694 9.58 9.468 9.311 9.063 8.546 -9 ,7924 ,TETRA ,17557824,Fri Nov 26 11:00:08 CET,Fri Nov 26 13:13:46 CET,0.0 0.702 0.911 1.113 1.27 1.397 1.509 1.614 1.822 1.91 2.003 2.08 2.269 2.358 2.511 2.659 2.813 2.886 3.033 3.186 3.398 3.529 3.663 3.86 4.047 4.229 4.395 4.56 4.784 4.997 5.199 5.422 5.637 5.856 6.107 6.394 6.672 6.987 7.321 7.671 8.065 8.509 9.049 9.621 10.286 11.023 11.906 12.88 13.9 14.982 16.117 16.741 16.815 16.718 16.587 16.45 16.282 16.076 15.863 15.629 15.428 15.229 15.027 14.827 14.622 14.44 14.25 14.086 13.943 13.786 13.612 13.462 13.316 13.166 13.045 12.914 12.774 12.635 12.486 12.373 12.254 12.079 11.956 11.826 11.762 11.631 11.495 11.327 11.225 11.046 10.939 10.831 10.726 10.507 10.373 10.215 10.047 9.839 9.621 9.416 8.932 -10 ,25446 ,TETRA ,17557825,Fri Nov 26 11:00:08 CET,Fri Nov 26 13:26:38 CET,0.0 0.301 0.463 0.575 0.669 0.762 0.858 0.955 1.14 1.228 1.309 1.364 1.531 1.607 1.763 1.899 2.031 2.094 2.219 2.357 2.564 2.692 2.819 2.996 3.165 3.319 3.467 3.621 3.821 4.01 4.202 4.455 4.692 4.911 5.167 5.463 5.749 6.043 6.356 6.742 7.173 7.612 8.087 8.576 9.119 9.73 10.499 11.369 12.377 13.437 14.525 15.184 15.339 15.281 15.139 14.98 14.798 14.613 14.446 14.284 14.135 13.973 13.795 13.61 13.435 13.27 13.098 12.945 12.802 12.652 12.507 12.385 12.247 12.099 11.977 11.857 11.739 11.614 11.484 11.381 11.27 11.088 10.973 10.865 10.806 10.682 10.545 10.397 10.328 10.182 10.109 10.014 9.917 9.696 9.579 9.463 9.331 9.201 9.043 8.829 8.24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 38c706fe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7180 ,KEBNE ,17125783,Thu Dec 30 16:52:46 CET,Thu Dec 30 18:45:44 CET,0.0 0.268 0.517 0.705 0.891 1.078 1.263 1.442 1.746 1.891 2.043 2.093 2.505 2.655 2.941 3.226 3.504 3.641 3.903 4.156 4.537 4.787 5.041 5.428 5.805 6.167 6.528 6.882 7.335 7.79 8.249 8.818 9.386 9.953 10.636 11.413 12.166 13.024 13.968 14.988 16.084 17.363 18.904 20.515 22.483 24.816 27.673 31.03 35.167 40.371 47.225 53.488 57.558 60.518 62.725 64.271 65.307 66.135 66.756 67.309 67.769 68.125 68.376 68.562 68.722 68.851 68.937 68.948 68.929 68.913 68.88 68.864 68.868 68.836 68.798 68.772 68.745 68.682 68.576 68.493 68.387 68.191 68.067 67.941 67.881 67.746 67.57 67.385 67.283 66.987 66.95 66.81 66.644 66.217 65.968 65.711 65.393 64.937 64.451 63.839 58.111 -2 ,3698 ,KEBNE ,17125784,Thu Dec 30 16:52:46 CET,Thu Dec 30 18:47:09 CET,0.0 0.311 0.567 0.818 1.006 1.174 1.362 1.543 1.884 2.054 2.206 2.229 2.624 2.78 3.093 3.383 3.671 3.821 4.112 4.375 4.752 5.019 5.289 5.671 6.048 6.422 6.784 7.144 7.633 8.108 8.559 9.117 9.676 10.222 10.883 11.659 12.421 13.266 14.215 15.278 16.435 17.783 19.402 21.054 23.006 25.328 28.158 31.489 35.591 40.722 47.488 53.709 57.879 60.901 63.066 64.743 65.964 66.887 67.604 68.233 68.699 69.002 69.245 69.464 69.646 69.794 69.917 69.993 70.017 70.042 70.085 70.097 70.088 70.052 70.002 69.938 69.863 69.781 69.681 69.605 69.525 69.392 69.277 69.144 69.077 68.935 68.795 68.627 68.522 68.211 68.126 67.995 67.86 67.508 67.302 67.061 66.751 66.408 65.927 65.065 62.446 -3 ,14977 ,KEBNE ,17125785,Thu Dec 30 16:52:46 CET,Thu Dec 30 18:47:36 CET,0.0 0.636 0.94 1.176 1.383 1.56 1.704 1.855 2.153 2.305 2.463 2.52 2.93 3.082 3.373 3.655 3.923 4.053 4.318 4.583 4.967 5.213 5.456 5.826 6.206 6.589 6.958 7.317 7.79 8.252 8.711 9.284 9.853 10.425 11.101 11.872 12.624 13.48 14.431 15.451 16.572 17.898 19.509 21.192 23.253 25.597 28.406 31.787 36.026 41.447 48.715 55.345 59.206 61.625 63.381 64.746 65.741 66.546 67.164 67.65 68.0 68.314 68.599 68.822 68.989 69.127 69.261 69.335 69.369 69.391 69.388 69.381 69.363 69.328 69.31 69.274 69.218 69.146 69.06 68.985 68.899 68.787 68.707 68.615 68.552 68.396 68.237 68.073 67.975 67.679 67.678 67.56 67.413 67.1 66.907 66.684 66.446 66.172 65.77 65.264 62.069 -4 ,821 ,KEBNE ,17125786,Thu Dec 30 16:52:46 CET,Thu Dec 30 18:46:13 CET,0.0 0.621 0.829 1.003 1.176 1.334 1.496 1.67 2.001 2.153 2.304 2.348 2.746 2.89 3.166 3.437 3.697 3.824 4.082 4.345 4.723 4.968 5.213 5.57 5.938 6.304 6.656 7.005 7.461 7.913 8.373 8.941 9.505 10.067 10.73 11.497 12.26 13.105 14.038 15.074 16.198 17.508 19.122 20.815 22.814 25.13 27.974 31.406 35.678 41.147 48.477 55.207 59.566 62.605 64.837 66.48 67.658 68.606 69.309 69.876 70.245 70.553 70.824 71.014 71.155 71.257 71.336 71.397 71.441 71.451 71.453 71.454 71.441 71.391 71.338 71.288 71.248 71.218 71.138 71.071 70.991 70.846 70.751 70.664 70.61 70.451 70.289 70.144 70.058 69.767 69.693 69.531 69.368 68.985 68.724 68.466 68.22 67.855 67.374 66.662 60.784 -5 ,32646 ,KEBNE ,17125787,Thu Dec 30 16:52:46 CET,Thu Dec 30 18:46:14 CET,0.0 0.402 0.624 0.859 1.072 1.263 1.445 1.626 1.971 2.125 2.281 2.314 2.738 2.895 3.193 3.48 3.763 3.904 4.182 4.449 4.833 5.092 5.343 5.714 6.091 6.469 6.836 7.188 7.663 8.133 8.603 9.18 9.735 10.286 10.93 11.676 12.415 13.244 14.156 15.129 16.158 17.368 18.838 20.381 22.261 24.406 26.964 30.083 33.961 38.779 45.094 50.849 54.519 57.067 58.915 60.309 61.37 62.215 62.869 63.393 63.727 64.008 64.282 64.515 64.703 64.853 64.947 64.993 65.035 65.088 65.116 65.11 65.098 65.079 65.067 65.025 64.962 64.907 64.826 64.763 64.709 64.6 64.5 64.405 64.35 64.195 64.024 63.848 63.745 63.435 63.327 63.164 62.985 62.624 62.427 62.199 61.937 61.634 61.151 60.267 55.188 -6 ,22924 ,KEBNE ,17125788,Thu Dec 30 16:52:49 CET,Thu Dec 30 18:47:32 CET,0.0 0.314 0.522 0.742 0.972 1.179 1.358 1.532 1.89 2.05 2.194 2.216 2.632 2.779 3.057 3.338 3.612 3.742 4.007 4.27 4.656 4.911 5.166 5.52 5.872 6.239 6.593 6.929 7.368 7.804 8.233 8.765 9.3 9.825 10.453 11.184 11.895 12.698 13.593 14.566 15.602 16.806 18.297 19.86 21.724 23.857 26.385 29.386 33.044 37.681 43.82 49.35 52.872 55.307 57.032 58.335 59.365 60.206 60.907 61.548 62.029 62.41 62.725 62.94 63.084 63.194 63.285 63.32 63.343 63.387 63.447 63.493 63.506 63.499 63.488 63.439 63.349 63.256 63.157 63.082 63.001 62.861 62.736 62.615 62.565 62.46 62.337 62.176 62.074 61.775 61.659 61.494 61.324 60.906 60.662 60.373 60.049 59.628 59.094 58.394 54.199 -7 ,26195 ,KEBNE ,17125789,Thu Dec 30 16:52:49 CET,Thu Dec 30 18:46:28 CET,0.0 0.332 0.593 0.833 1.055 1.248 1.42 1.575 1.906 2.076 2.237 2.311 2.739 2.879 3.148 3.416 3.684 3.814 4.06 4.311 4.696 4.938 5.177 5.528 5.863 6.205 6.559 6.901 7.337 7.767 8.217 8.78 9.313 9.831 10.448 11.173 11.887 12.673 13.546 14.524 15.582 16.785 18.258 19.768 21.579 23.721 26.275 29.297 33.049 37.748 43.989 49.737 53.362 55.842 57.698 59.13 60.146 60.917 61.482 61.992 62.404 62.718 62.981 63.202 63.369 63.497 63.618 63.688 63.74 63.785 63.768 63.714 63.645 63.576 63.531 63.482 63.422 63.349 63.248 63.176 63.109 63.0 62.918 62.82 62.763 62.643 62.501 62.319 62.21 61.913 61.856 61.717 61.581 61.258 61.022 60.745 60.453 60.092 59.633 58.975 55.895 -8 ,10401 ,KEBNE ,17125790,Thu Dec 30 16:52:49 CET,Thu Dec 30 18:46:23 CET,0.0 0.351 0.608 0.841 1.029 1.254 1.472 1.663 2.019 2.185 2.351 2.401 2.798 2.937 3.205 3.478 3.749 3.884 4.154 4.41 4.789 5.045 5.287 5.648 6.027 6.404 6.769 7.126 7.586 8.036 8.495 9.071 9.629 10.182 10.839 11.592 12.337 13.186 14.139 15.177 16.306 17.631 19.231 20.909 22.936 25.291 28.169 31.523 35.71 41.115 48.308 54.932 59.138 62.032 64.224 65.879 67.105 68.124 68.892 69.566 70.08 70.477 70.811 71.059 71.269 71.406 71.485 71.576 71.634 71.662 71.65 71.614 71.586 71.556 71.527 71.498 71.454 71.387 71.322 71.275 71.215 71.094 70.995 70.892 70.838 70.715 70.551 70.351 70.25 69.977 69.991 69.879 69.75 69.4 69.183 68.983 68.716 68.386 67.963 67.214 63.54 -9 ,29352 ,KEBNE ,17125791,Thu Dec 30 16:52:49 CET,Thu Dec 30 18:47:29 CET,0.0 0.354 0.522 0.7 0.931 1.154 1.33 1.505 1.892 2.103 2.303 2.376 2.78 2.925 3.208 3.493 3.769 3.902 4.173 4.445 4.847 5.112 5.376 5.758 6.135 6.506 6.882 7.256 7.738 8.22 8.69 9.257 9.821 10.383 11.055 11.828 12.589 13.465 14.424 15.454 16.582 17.878 19.435 21.058 23.029 25.319 28.077 31.323 35.304 40.326 47.049 53.3 57.321 60.166 62.251 63.786 64.897 65.801 66.444 66.974 67.391 67.686 67.937 68.164 68.338 68.49 68.635 68.699 68.735 68.783 68.818 68.826 68.799 68.777 68.774 68.767 68.747 68.711 68.669 68.615 68.543 68.432 68.337 68.214 68.149 68.024 67.904 67.781 67.708 67.417 67.32 67.156 66.971 66.593 66.376 66.091 65.728 65.391 64.993 64.217 59.386 -10 ,11867 ,KEBNE ,17125792,Thu Dec 30 16:52:49 CET,Thu Dec 30 18:45:41 CET,0.0 0.406 0.605 0.818 1.02 1.196 1.36 1.543 1.908 2.072 2.232 2.292 2.694 2.842 3.149 3.449 3.728 3.858 4.121 4.385 4.774 5.03 5.278 5.643 6.015 6.389 6.745 7.102 7.569 8.027 8.483 9.044 9.611 10.17 10.816 11.555 12.316 13.172 14.104 15.119 16.204 17.476 19.029 20.656 22.66 25.02 27.825 31.125 35.254 40.615 47.873 54.516 58.831 61.915 64.167 65.85 67.078 68.025 68.784 69.421 69.832 70.133 70.386 70.623 70.832 70.977 71.085 71.17 71.244 71.297 71.339 71.353 71.333 71.3 71.268 71.224 71.17 71.129 71.073 71.005 70.925 70.795 70.691 70.574 70.509 70.365 70.216 70.036 69.948 69.67 69.596 69.447 69.304 68.945 68.725 68.473 68.149 67.756 67.138 66.24 59.003 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt deleted file mode 100644 index 03010f9e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16496 ,TETRA ,17557826,Fri Nov 26 11:00:08 CET,Fri Nov 26 13:16:51 CET,0.0 0.68 1.019 1.25 1.47 1.686 1.878 2.077 2.471 2.657 2.836 2.886 3.284 3.434 3.719 4.008 4.296 4.433 4.707 4.984 5.385 5.647 5.917 6.342 6.772 7.176 7.548 7.914 8.42 8.918 9.397 9.978 10.553 11.135 11.829 12.637 13.413 14.271 15.22 16.276 17.441 18.754 20.327 21.966 23.942 26.264 29.092 32.54 36.85 42.163 49.119 55.528 59.75 62.808 65.003 66.642 67.93 68.946 69.712 70.369 70.826 71.146 71.439 71.72 71.926 72.096 72.231 72.323 72.401 72.461 72.499 72.506 72.502 72.49 72.458 72.395 72.336 72.252 72.145 72.07 71.974 71.87 71.812 71.74 71.708 71.648 71.566 71.43 71.338 71.061 71.042 70.92 70.783 70.511 70.375 70.188 69.92 69.564 69.117 68.497 66.343 -2 ,1305 ,TETRA ,17557827,Fri Nov 26 11:02:11 CET,Fri Nov 26 13:07:11 CET,0.0 0.611 0.923 1.171 1.394 1.604 1.817 2.005 2.366 2.548 2.728 2.829 3.266 3.433 3.739 4.027 4.299 4.433 4.7 4.978 5.412 5.705 5.979 6.381 6.801 7.206 7.596 7.977 8.468 8.961 9.455 10.053 10.628 11.193 11.859 12.61 13.356 14.206 15.146 16.185 17.337 18.69 20.373 22.134 24.183 26.591 29.541 33.021 37.352 42.75 49.924 56.683 61.074 64.09 66.306 67.978 69.153 70.028 70.713 71.33 71.806 72.162 72.371 72.525 72.694 72.862 72.979 73.003 73.016 73.01 73.004 73.01 73.016 73.018 72.997 72.961 72.889 72.817 72.747 72.692 72.632 72.516 72.433 72.334 72.277 72.171 72.046 71.852 71.738 71.437 71.393 71.263 71.126 70.837 70.652 70.449 70.183 69.82 69.446 68.992 64.932 -3 ,11509 ,TETRA ,17557828,Fri Nov 26 11:02:14 CET,Fri Nov 26 13:06:13 CET,0.0 0.478 0.766 1.016 1.214 1.408 1.607 1.811 2.166 2.329 2.49 2.546 2.947 3.088 3.383 3.696 3.995 4.142 4.425 4.693 5.093 5.364 5.637 6.038 6.442 6.85 7.247 7.627 8.11 8.594 9.076 9.657 10.235 10.82 11.499 12.259 13.02 13.879 14.81 15.835 16.944 18.243 19.856 21.506 23.457 25.757 28.59 31.994 36.165 41.341 48.18 54.406 58.404 61.189 63.248 64.84 65.985 66.845 67.489 67.999 68.353 68.597 68.794 68.963 69.081 69.169 69.259 69.355 69.428 69.479 69.518 69.535 69.528 69.488 69.444 69.42 69.382 69.321 69.246 69.181 69.124 69.037 68.977 68.912 68.873 68.762 68.621 68.417 68.29 67.998 67.949 67.795 67.631 67.28 67.064 66.819 66.583 66.292 65.926 65.514 63.508 -4 ,3267 ,TETRA ,17557829,Fri Nov 26 11:06:09 CET,Fri Nov 26 13:08:05 CET,0.0 0.902 1.333 1.637 1.91 2.133 2.338 2.546 2.944 3.155 3.361 3.482 3.931 4.093 4.376 4.656 4.961 5.119 5.426 5.716 6.125 6.391 6.65 7.041 7.422 7.793 8.168 8.541 9.033 9.519 9.994 10.578 11.16 11.75 12.442 13.217 13.987 14.841 15.77 16.809 17.953 19.265 20.858 22.521 24.494 26.809 29.658 32.998 37.081 42.238 49.06 55.141 58.878 61.371 63.159 64.553 65.622 66.451 67.054 67.559 67.916 68.182 68.434 68.659 68.838 68.955 69.027 69.093 69.162 69.186 69.168 69.133 69.092 69.046 69.017 68.994 68.944 68.864 68.788 68.756 68.718 68.638 68.556 68.464 68.411 68.265 68.108 67.963 67.888 67.612 67.565 67.437 67.321 67.01 66.813 66.603 66.379 66.125 65.763 65.207 62.578 -5 ,7415 ,TETRA ,17557830,Fri Nov 26 11:19:11 CET,Fri Nov 26 13:29:47 CET,0.0 0.576 0.912 1.186 1.438 1.678 1.902 2.099 2.468 2.663 2.858 2.949 3.392 3.562 3.914 4.261 4.577 4.728 5.045 5.354 5.814 6.111 6.386 6.794 7.209 7.634 8.038 8.436 8.977 9.499 10.002 10.631 11.249 11.844 12.552 13.36 14.173 15.115 16.132 17.228 18.374 19.675 21.237 22.853 24.826 27.144 29.946 33.231 37.315 42.527 49.431 55.689 59.714 62.54 64.607 66.157 67.267 68.13 68.803 69.406 69.812 70.06 70.296 70.516 70.676 70.78 70.85 70.918 70.963 71.008 71.042 71.032 70.965 70.888 70.843 70.802 70.76 70.689 70.599 70.536 70.497 70.455 70.396 70.332 70.304 70.251 70.193 70.101 70.018 69.748 69.756 69.639 69.524 69.235 69.052 68.861 68.651 68.395 68.017 67.479 65.263 -6 ,957 ,TETRA ,17557831,Fri Nov 26 11:19:11 CET,Fri Nov 26 13:32:57 CET,0.0 0.422 0.707 0.959 1.19 1.398 1.585 1.768 2.138 2.319 2.49 2.539 2.936 3.09 3.394 3.681 3.953 4.091 4.365 4.646 5.075 5.355 5.64 6.062 6.472 6.873 7.261 7.642 8.124 8.58 9.032 9.609 10.189 10.764 11.453 12.26 13.032 13.892 14.876 15.925 17.058 18.415 20.042 21.711 23.707 26.06 28.979 32.416 36.698 42.111 49.197 55.81 60.128 63.112 65.284 66.936 68.204 69.091 69.683 70.241 70.66 70.96 71.19 71.39 71.535 71.619 71.682 71.721 71.752 71.777 71.795 71.805 71.784 71.726 71.677 71.631 71.572 71.499 71.412 71.357 71.303 71.19 71.1 71.013 70.972 70.86 70.727 70.564 70.472 70.198 70.224 70.124 70.002 69.733 69.569 69.345 69.033 68.651 68.196 67.538 63.481 -7 ,32021 ,TETRA ,17557832,Fri Nov 26 11:19:12 CET,Fri Nov 26 13:35:17 CET,0.0 0.866 1.176 1.465 1.715 1.935 2.148 2.347 2.772 2.976 3.16 3.25 3.688 3.854 4.215 4.56 4.87 5.018 5.321 5.625 6.061 6.351 6.636 7.055 7.472 7.888 8.284 8.669 9.169 9.657 10.152 10.769 11.357 11.941 12.649 13.436 14.179 15.028 15.99 17.007 18.085 19.365 20.885 22.452 24.383 26.604 29.229 32.307 36.193 41.198 47.846 53.649 57.152 59.447 61.053 62.307 63.295 64.081 64.7 65.27 65.663 65.97 66.224 66.413 66.563 66.687 66.804 66.902 66.975 67.02 67.048 67.013 66.958 66.916 66.858 66.778 66.715 66.673 66.619 66.577 66.501 66.378 66.308 66.203 66.138 65.995 65.846 65.679 65.583 65.291 65.239 65.115 64.993 64.694 64.519 64.304 64.04 63.721 63.328 62.709 59.064 -8 ,196 ,TETRA ,17557833,Fri Nov 26 11:19:11 CET,Fri Nov 26 13:36:52 CET,0.0 0.543 0.905 1.226 1.514 1.779 2.001 2.214 2.67 2.893 3.094 3.181 3.634 3.82 4.186 4.532 4.859 5.018 5.298 5.575 5.996 6.268 6.54 6.949 7.366 7.795 8.223 8.611 9.091 9.597 10.093 10.674 11.249 11.825 12.491 13.229 13.97 14.807 15.733 16.757 17.867 19.157 20.755 22.423 24.47 26.817 29.538 32.755 36.637 41.49 47.976 53.931 57.651 60.205 62.024 63.343 64.352 65.172 65.81 66.339 66.704 66.966 67.169 67.33 67.446 67.546 67.611 67.632 67.642 67.66 67.672 67.675 67.658 67.619 67.587 67.544 67.49 67.422 67.324 67.25 67.172 67.043 66.938 66.818 66.77 66.649 66.529 66.405 66.31 66.024 65.999 65.89 65.754 65.446 65.287 65.095 64.82 64.489 64.052 63.454 61.096 -9 ,9875 ,TETRA ,17557834,Fri Nov 26 11:19:12 CET,Fri Nov 26 13:33:07 CET,0.0 0.65 0.974 1.262 1.507 1.725 1.929 2.159 2.603 2.791 2.967 3.057 3.485 3.648 3.969 4.262 4.54 4.679 4.962 5.244 5.64 5.898 6.157 6.536 6.916 7.29 7.658 8.039 8.533 9.012 9.492 10.079 10.664 11.238 11.901 12.642 13.364 14.182 15.127 16.192 17.338 18.695 20.325 21.981 23.95 26.146 28.828 32.16 36.219 41.219 47.72 53.406 57.047 59.75 61.735 63.182 64.16 64.871 65.434 65.871 66.186 66.475 66.727 66.917 67.044 67.155 67.26 67.326 67.353 67.37 67.376 67.358 67.322 67.301 67.288 67.254 67.208 67.153 67.095 67.036 66.948 66.772 66.632 66.503 66.445 66.302 66.151 66.03 65.961 65.701 65.736 65.639 65.513 65.226 65.063 64.848 64.524 64.159 63.79 63.153 59.963 -10 ,20686 ,TETRA ,17557835,Fri Nov 26 11:19:14 CET,Fri Nov 26 13:33:57 CET,0.0 0.583 0.901 1.17 1.407 1.63 1.841 2.041 2.433 2.621 2.795 2.872 3.285 3.436 3.743 4.046 4.332 4.472 4.747 5.019 5.42 5.696 5.968 6.346 6.723 7.094 7.455 7.812 8.271 8.748 9.237 9.803 10.345 10.887 11.528 12.281 13.058 13.968 14.953 16.009 17.178 18.521 20.106 21.749 23.733 26.041 28.861 32.247 36.474 41.822 48.855 55.322 59.589 62.566 64.738 66.374 67.6 68.532 69.143 69.656 70.0 70.218 70.426 70.629 70.804 70.92 71.02 71.1 71.149 71.182 71.201 71.213 71.195 71.143 71.118 71.09 71.026 70.96 70.876 70.811 70.753 70.652 70.563 70.466 70.417 70.284 70.143 69.966 69.865 69.585 69.545 69.42 69.292 69.045 68.891 68.68 68.434 68.129 67.741 67.231 65.134 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt deleted file mode 100644 index 0c4b8908..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13813 ,TETRA ,17557836,Fri Nov 26 11:19:12 CET,Fri Nov 26 13:18:18 CET,0.0 0.539 0.806 0.992 1.144 1.3 1.452 1.595 1.839 1.95 2.059 2.05 2.416 2.525 2.726 2.93 3.123 3.219 3.41 3.614 3.909 4.086 4.256 4.5 4.742 5.0 5.261 5.506 5.814 6.114 6.428 6.824 7.179 7.501 7.889 8.319 8.741 9.24 9.785 10.356 10.952 11.613 12.375 13.158 14.115 15.22 16.549 18.17 20.111 22.438 25.35 27.705 28.993 29.851 30.486 30.902 31.127 31.297 31.381 31.397 31.423 31.449 31.45 31.443 31.441 31.433 31.422 31.388 31.342 31.306 31.26 31.204 31.131 31.053 31.0 30.944 30.879 30.813 30.741 30.694 30.643 30.554 30.499 30.44 30.404 30.329 30.235 30.123 30.076 29.81 29.905 29.831 29.762 29.643 29.573 29.486 29.393 29.296 29.169 29.023 28.582 -2 ,1038 ,TETRA ,17557837,Fri Nov 26 11:19:12 CET,Fri Nov 26 13:18:23 CET,0.0 0.512 0.733 0.924 1.106 1.262 1.394 1.532 1.791 1.894 1.987 1.962 2.323 2.423 2.608 2.813 3.014 3.106 3.286 3.45 3.687 3.849 4.004 4.238 4.474 4.689 4.898 5.11 5.393 5.675 5.947 6.269 6.582 6.905 7.277 7.697 8.117 8.567 9.069 9.626 10.214 10.865 11.643 12.457 13.419 14.547 15.863 17.334 19.094 21.324 24.127 26.502 28.01 29.008 29.703 30.217 30.549 30.769 30.916 31.052 31.153 31.222 31.249 31.253 31.246 31.233 31.225 31.2 31.172 31.142 31.1 31.052 31.015 30.98 30.938 30.894 30.852 30.8 30.74 30.682 30.612 30.501 30.421 30.345 30.299 30.197 30.109 30.005 29.945 29.676 29.789 29.728 29.662 29.521 29.451 29.377 29.288 29.198 29.11 28.934 28.621 -3 ,20006 ,TETRA ,17557838,Fri Nov 26 11:19:12 CET,Fri Nov 26 13:32:34 CET,0.0 0.348 0.542 0.706 0.867 1.038 1.188 1.323 1.576 1.691 1.805 1.771 2.127 2.246 2.463 2.65 2.82 2.91 3.089 3.249 3.46 3.607 3.77 4.007 4.215 4.421 4.636 4.866 5.18 5.468 5.732 6.045 6.35 6.664 7.025 7.423 7.82 8.264 8.737 9.254 9.818 10.467 11.246 12.024 12.943 14.005 15.241 16.673 18.426 20.534 23.115 25.301 26.584 27.384 27.82 28.051 28.225 28.351 28.415 28.429 28.41 28.392 28.345 28.291 28.252 28.207 28.149 28.087 28.023 27.955 27.877 27.806 27.734 27.652 27.579 27.504 27.436 27.358 27.266 27.203 27.144 27.066 26.993 26.894 26.848 26.777 26.694 26.603 26.566 26.307 26.405 26.34 26.273 26.142 26.074 25.979 25.869 25.752 25.596 25.424 25.112 -4 ,31390 ,TETRA ,17557839,Fri Nov 26 11:19:12 CET,Fri Nov 26 13:38:48 CET,0.0 0.252 0.416 0.569 0.705 0.854 1.02 1.172 1.435 1.547 1.653 1.621 1.972 2.08 2.292 2.478 2.657 2.747 2.914 3.065 3.302 3.459 3.606 3.827 4.045 4.259 4.463 4.658 4.926 5.207 5.468 5.772 6.077 6.384 6.747 7.148 7.541 7.988 8.5 9.047 9.642 10.341 11.146 11.948 12.902 13.999 15.272 16.743 18.507 20.602 23.093 25.169 26.49 27.319 27.822 28.132 28.329 28.487 28.575 28.592 28.577 28.584 28.593 28.559 28.505 28.462 28.411 28.353 28.307 28.264 28.21 28.166 28.113 28.02 27.934 27.847 27.762 27.687 27.605 27.552 27.484 27.371 27.305 27.234 27.197 27.117 27.044 26.959 26.9 26.623 26.731 26.678 26.608 26.457 26.391 26.322 26.21 26.084 25.939 25.755 25.16 -5 ,1685 ,TETRA ,17557840,Fri Nov 26 11:19:12 CET,Fri Nov 26 13:32:48 CET,0.0 0.356 0.586 0.75 0.902 1.052 1.206 1.355 1.647 1.779 1.893 1.862 2.212 2.306 2.48 2.659 2.841 2.929 3.092 3.253 3.491 3.648 3.809 4.045 4.287 4.517 4.736 4.965 5.269 5.569 5.859 6.187 6.501 6.828 7.217 7.643 8.039 8.49 9.009 9.576 10.178 10.884 11.727 12.551 13.539 14.683 16.037 17.654 19.62 21.975 24.968 27.621 29.315 30.473 31.259 31.727 31.928 32.009 32.067 32.114 32.114 32.054 31.999 31.991 31.98 31.947 31.896 31.855 31.826 31.742 31.648 31.607 31.565 31.532 31.507 31.472 31.41 31.321 31.238 31.177 31.12 31.042 30.982 30.918 30.886 30.799 30.71 30.626 30.579 30.31 30.394 30.335 30.281 30.145 30.079 30.01 29.917 29.818 29.732 29.65 29.502 -6 ,4295 ,TETRA ,17557841,Fri Nov 26 11:19:12 CET,Fri Nov 26 13:39:57 CET,0.0 0.394 0.667 0.964 1.178 1.303 1.443 1.577 1.829 1.946 2.052 2.022 2.375 2.47 2.649 2.829 3.006 3.096 3.282 3.466 3.739 3.911 4.076 4.319 4.552 4.773 4.987 5.222 5.52 5.778 6.035 6.343 6.652 6.96 7.322 7.725 8.109 8.559 9.081 9.637 10.201 10.862 11.67 12.487 13.448 14.561 15.864 17.35 19.153 21.407 24.282 26.73 28.285 29.275 29.908 30.333 30.594 30.769 30.895 31.015 31.089 31.142 31.18 31.198 31.2 31.18 31.154 31.132 31.115 31.082 31.026 30.982 30.939 30.891 30.837 30.77 30.707 30.653 30.594 30.54 30.477 30.406 30.364 30.309 30.282 30.224 30.151 30.052 29.998 29.746 29.867 29.815 29.757 29.619 29.545 29.463 29.36 29.25 29.059 28.811 28.27 -7 ,31252 ,TETRA ,17557842,Fri Nov 26 11:19:12 CET,Fri Nov 26 13:43:08 CET,0.0 0.324 0.542 0.773 0.953 1.1 1.246 1.384 1.638 1.75 1.849 1.799 2.145 2.253 2.449 2.629 2.808 2.892 3.057 3.241 3.515 3.68 3.848 4.094 4.332 4.563 4.789 5.015 5.307 5.583 5.845 6.178 6.531 6.881 7.272 7.723 8.152 8.628 9.144 9.683 10.259 10.903 11.678 12.475 13.473 14.583 15.766 17.119 18.799 20.782 23.205 25.335 26.531 27.264 27.732 28.036 28.203 28.31 28.384 28.424 28.44 28.424 28.384 28.339 28.293 28.26 28.208 28.137 28.054 27.951 27.863 27.785 27.703 27.638 27.574 27.496 27.417 27.337 27.255 27.198 27.14 27.026 26.944 26.882 26.85 26.779 26.702 26.611 26.565 26.307 26.432 26.377 26.314 26.148 26.046 25.947 25.83 25.708 25.588 25.435 24.971 -8 ,7107 ,TETRA ,17557843,Fri Nov 26 11:19:13 CET,Fri Nov 26 13:41:01 CET,0.0 0.43 0.688 0.857 1.01 1.158 1.304 1.443 1.659 1.768 1.894 1.883 2.227 2.336 2.548 2.743 2.932 3.017 3.189 3.366 3.618 3.781 3.936 4.167 4.402 4.626 4.855 5.079 5.366 5.66 5.97 6.335 6.646 6.953 7.319 7.752 8.188 8.673 9.196 9.747 10.329 11.002 11.818 12.648 13.656 14.816 16.155 17.719 19.634 22.003 24.998 27.572 29.158 30.145 30.732 31.13 31.364 31.533 31.692 31.807 31.874 31.92 31.941 31.944 31.932 31.901 31.872 31.823 31.766 31.724 31.687 31.649 31.602 31.542 31.493 31.443 31.39 31.329 31.262 31.227 31.187 31.119 31.076 31.02 30.987 30.924 30.85 30.771 30.729 30.466 30.575 30.527 30.477 30.347 30.275 30.18 30.082 29.946 29.758 29.624 29.447 -9 ,29212 ,TETRA ,17557844,Fri Nov 26 11:19:14 CET,Fri Nov 26 13:41:13 CET,0.0 0.455 0.654 0.849 1.032 1.18 1.309 1.436 1.674 1.788 1.901 1.871 2.226 2.331 2.538 2.741 2.932 3.03 3.224 3.405 3.669 3.831 3.993 4.24 4.478 4.713 4.953 5.177 5.462 5.74 6.031 6.396 6.725 7.049 7.45 7.906 8.335 8.797 9.321 9.898 10.485 11.156 11.979 12.855 13.894 15.086 16.479 18.022 19.774 21.78 24.205 26.13 27.292 28.013 28.39 28.573 28.69 28.787 28.851 28.889 28.878 28.846 28.822 28.778 28.738 28.699 28.626 28.56 28.514 28.469 28.411 28.354 28.29 28.211 28.146 28.078 28.009 27.937 27.855 27.801 27.751 27.675 27.623 27.577 27.555 27.497 27.42 27.345 27.297 27.012 27.106 27.046 26.977 26.825 26.758 26.697 26.625 26.532 26.406 26.252 25.847 -10 ,32723 ,TETRA ,17557845,Fri Nov 26 11:19:13 CET,Fri Nov 26 13:33:58 CET,0.0 0.276 0.451 0.617 0.769 0.921 1.058 1.187 1.431 1.548 1.658 1.611 1.955 2.06 2.269 2.457 2.641 2.743 2.94 3.123 3.384 3.554 3.732 3.989 4.232 4.475 4.729 4.97 5.254 5.539 5.813 6.14 6.459 6.776 7.166 7.597 8.005 8.478 8.996 9.564 10.173 10.873 11.754 12.653 13.691 14.862 16.181 17.701 19.556 21.876 24.744 26.925 28.149 28.954 29.517 29.875 30.106 30.288 30.408 30.484 30.511 30.536 30.555 30.54 30.53 30.512 30.469 30.429 30.393 30.357 30.308 30.267 30.211 30.136 30.079 30.022 29.96 29.892 29.822 29.778 29.743 29.667 29.601 29.535 29.506 29.451 29.38 29.277 29.208 28.93 29.02 28.958 28.888 28.731 28.661 28.583 28.478 28.39 28.304 28.208 27.855 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index bd2932a0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22754 ,TETRA ,17557846,Fri Nov 26 11:19:13 CET,Fri Nov 26 13:38:41 CET,0.0 0.986 1.405 1.722 2.008 2.235 2.421 2.601 2.972 3.169 3.35 3.408 3.803 3.948 4.214 4.472 4.738 4.87 5.121 5.367 5.746 5.978 6.205 6.558 6.904 7.236 7.544 7.845 8.262 8.675 9.069 9.545 10.006 10.463 10.983 11.571 12.141 12.769 13.475 14.218 14.984 15.858 16.896 17.984 19.307 20.792 22.583 24.688 27.156 30.116 33.908 37.292 39.37 40.76 41.738 42.423 42.94 43.345 43.63 43.884 44.056 44.167 44.248 44.333 44.41 44.46 44.509 44.517 44.518 44.538 44.531 44.482 44.436 44.406 44.38 44.364 44.347 44.311 44.254 44.213 44.178 44.099 44.034 43.978 43.949 43.867 43.784 43.703 43.659 43.416 43.511 43.449 43.387 43.222 43.13 43.045 42.955 42.851 42.711 42.538 42.235 -2 ,12832 ,TETRA ,17557847,Fri Nov 26 11:19:13 CET,Fri Nov 26 13:43:54 CET,0.0 0.884 1.288 1.615 1.898 2.156 2.383 2.607 3.024 3.2 3.381 3.515 3.928 4.077 4.352 4.627 4.916 5.06 5.339 5.606 5.99 6.237 6.472 6.812 7.148 7.466 7.774 8.107 8.556 8.956 9.324 9.782 10.242 10.688 11.209 11.819 12.422 13.077 13.774 14.548 15.392 16.342 17.462 18.625 20.028 21.633 23.46 25.531 28.109 31.337 35.429 39.017 41.307 42.841 43.917 44.756 45.297 45.65 45.905 46.124 46.279 46.379 46.479 46.587 46.675 46.711 46.723 46.745 46.756 46.747 46.711 46.663 46.619 46.583 46.556 46.518 46.471 46.405 46.325 46.278 46.242 46.185 46.13 46.068 46.035 45.963 45.879 45.8 45.769 45.531 45.66 45.615 45.556 45.408 45.324 45.238 45.156 45.047 44.878 44.667 43.869 -3 ,6068 ,TETRA ,17557848,Fri Nov 26 11:19:13 CET,Fri Nov 26 13:44:46 CET,0.0 1.411 1.764 2.034 2.296 2.544 2.777 2.986 3.381 3.57 3.754 3.865 4.277 4.445 4.774 5.042 5.294 5.424 5.676 5.916 6.263 6.478 6.692 7.005 7.306 7.631 7.95 8.232 8.615 9.016 9.393 9.851 10.305 10.738 11.229 11.793 12.374 13.044 13.766 14.529 15.337 16.264 17.377 18.512 19.829 21.305 23.051 25.124 27.674 30.772 34.783 38.314 40.373 41.745 42.775 43.541 44.078 44.495 44.807 45.025 45.155 45.272 45.372 45.474 45.565 45.623 45.673 45.699 45.713 45.731 45.734 45.729 45.723 45.714 45.705 45.687 45.652 45.601 45.533 45.491 45.45 45.373 45.324 45.263 45.233 45.181 45.1 45.023 44.998 44.766 44.867 44.813 44.747 44.619 44.564 44.511 44.429 44.287 44.143 43.976 43.591 -4 ,9293 ,TETRA ,17557849,Fri Nov 26 11:19:13 CET,Fri Nov 26 13:47:04 CET,0.0 0.783 1.149 1.463 1.755 1.96 2.157 2.354 2.734 2.903 3.049 3.101 3.495 3.639 3.922 4.207 4.502 4.65 4.927 5.185 5.589 5.861 6.109 6.465 6.816 7.149 7.46 7.758 8.167 8.562 8.946 9.428 9.875 10.3 10.809 11.405 12.018 12.726 13.463 14.203 14.972 15.87 16.958 18.063 19.33 20.77 22.477 24.434 26.834 29.828 33.67 36.93 38.887 40.244 41.251 41.933 42.333 42.613 42.83 43.009 43.108 43.175 43.245 43.307 43.351 43.38 43.405 43.404 43.378 43.346 43.307 43.286 43.275 43.262 43.253 43.229 43.19 43.15 43.101 43.071 43.048 42.99 42.93 42.871 42.848 42.792 42.719 42.65 42.614 42.382 42.502 42.454 42.411 42.284 42.207 42.125 42.031 41.929 41.794 41.688 41.517 -5 ,19969 ,TETRA ,17557850,Fri Nov 26 11:19:13 CET,Fri Nov 26 13:44:01 CET,0.0 0.94 1.317 1.602 1.833 2.044 2.23 2.43 2.803 2.968 3.128 3.189 3.587 3.742 4.039 4.305 4.552 4.67 4.896 5.114 5.442 5.673 5.899 6.212 6.514 6.826 7.149 7.465 7.861 8.232 8.586 9.023 9.456 9.882 10.378 10.947 11.5 12.124 12.803 13.538 14.328 15.199 16.222 17.315 18.618 20.077 21.815 23.886 26.384 29.471 33.497 37.056 39.262 40.783 41.88 42.627 43.157 43.59 43.913 44.198 44.389 44.517 44.61 44.686 44.756 44.805 44.826 44.824 44.828 44.824 44.815 44.809 44.789 44.731 44.677 44.635 44.577 44.508 44.441 44.402 44.362 44.301 44.262 44.221 44.193 44.131 44.079 44.028 43.998 43.76 43.862 43.792 43.737 43.643 43.586 43.499 43.394 43.282 43.167 43.03 42.473 -6 ,17334 ,TETRA ,17557851,Fri Nov 26 11:19:13 CET,Fri Nov 26 13:42:18 CET,0.0 1.041 1.479 1.788 2.064 2.272 2.478 2.688 3.04 3.211 3.408 3.524 3.925 4.077 4.403 4.711 4.966 5.099 5.368 5.619 5.991 6.227 6.445 6.779 7.111 7.425 7.746 8.068 8.492 8.905 9.306 9.806 10.274 10.723 11.263 11.87 12.467 13.139 13.876 14.672 15.525 16.508 17.653 18.818 20.204 21.785 23.614 25.755 28.362 31.597 35.764 39.507 41.825 43.325 44.387 45.194 45.766 46.217 46.579 46.801 46.911 47.007 47.072 47.103 47.123 47.137 47.145 47.136 47.11 47.096 47.083 47.049 46.984 46.897 46.843 46.795 46.736 46.683 46.64 46.604 46.561 46.495 46.437 46.372 46.339 46.26 46.178 46.084 46.031 45.779 45.88 45.834 45.783 45.62 45.519 45.431 45.34 45.226 45.069 44.862 44.343 -7 ,25417 ,TETRA ,17557852,Fri Nov 26 11:19:13 CET,Fri Nov 26 13:37:40 CET,0.0 1.428 1.832 2.109 2.336 2.53 2.696 2.884 3.267 3.444 3.629 3.716 4.12 4.287 4.596 4.88 5.17 5.319 5.605 5.86 6.211 6.446 6.686 7.031 7.375 7.735 8.08 8.402 8.82 9.232 9.634 10.155 10.657 11.109 11.635 12.271 12.904 13.589 14.336 15.135 15.968 16.922 18.037 19.163 20.501 22.007 23.756 25.834 28.384 31.411 35.332 38.826 41.04 42.518 43.521 44.277 44.847 45.267 45.56 45.838 46.023 46.158 46.279 46.377 46.454 46.483 46.494 46.51 46.524 46.534 46.528 46.51 46.495 46.473 46.441 46.409 46.382 46.346 46.294 46.269 46.248 46.202 46.168 46.127 46.101 46.045 45.996 45.956 45.931 45.705 45.834 45.798 45.758 45.671 45.613 45.531 45.435 45.327 45.228 45.046 44.333 -8 ,17680 ,TETRA ,17557853,Fri Nov 26 11:31:05 CET,Fri Nov 26 13:55:32 CET,0.0 0.63 1.025 1.395 1.769 2.052 2.285 2.488 2.853 3.043 3.243 3.358 3.763 3.912 4.194 4.465 4.745 4.894 5.197 5.476 5.871 6.13 6.382 6.74 7.099 7.452 7.778 8.101 8.524 8.935 9.331 9.832 10.336 10.81 11.371 12.02 12.631 13.308 14.072 14.929 15.818 16.777 17.949 19.2 20.682 22.338 24.219 26.385 29.016 32.172 36.245 39.797 41.999 43.375 44.262 44.938 45.463 45.868 46.119 46.34 46.529 46.653 46.744 46.801 46.833 46.87 46.9 46.916 46.914 46.898 46.879 46.855 46.828 46.799 46.767 46.721 46.667 46.609 46.555 46.505 46.453 46.393 46.339 46.272 46.245 46.202 46.127 46.031 45.99 45.747 45.831 45.758 45.702 45.609 45.539 45.437 45.335 45.217 45.06 44.875 44.661 -9 ,28844 ,TETRA ,17557854,Fri Nov 26 11:31:05 CET,Fri Nov 26 13:55:06 CET,0.0 0.592 1.052 1.46 1.737 1.977 2.187 2.386 2.826 3.044 3.248 3.372 3.79 3.96 4.292 4.581 4.845 4.986 5.278 5.562 5.962 6.221 6.469 6.812 7.149 7.49 7.823 8.132 8.524 8.909 9.294 9.779 10.276 10.752 11.281 11.903 12.511 13.187 13.93 14.715 15.53 16.479 17.628 18.79 20.198 21.805 23.654 25.726 28.156 31.199 35.147 38.608 40.816 42.349 43.378 44.127 44.689 45.145 45.5 45.79 46.008 46.185 46.321 46.429 46.489 46.516 46.546 46.539 46.504 46.451 46.402 46.372 46.334 46.287 46.247 46.2 46.157 46.099 46.027 45.993 45.95 45.886 45.851 45.807 45.785 45.738 45.664 45.572 45.536 45.295 45.396 45.339 45.292 45.221 45.163 45.088 44.993 44.858 44.706 44.489 44.148 -10 ,7001 ,TETRA ,17557855,Fri Nov 26 11:31:08 CET,Fri Nov 26 13:55:39 CET,0.0 0.809 1.261 1.623 1.908 2.147 2.357 2.558 2.972 3.174 3.349 3.404 3.793 3.922 4.181 4.464 4.756 4.893 5.165 5.424 5.786 6.027 6.262 6.612 6.956 7.289 7.616 7.943 8.387 8.811 9.193 9.662 10.106 10.519 11.036 11.638 12.196 12.819 13.531 14.309 15.152 16.108 17.199 18.317 19.624 21.136 22.986 25.132 27.706 30.923 35.132 38.803 41.053 42.514 43.524 44.292 44.825 45.242 45.56 45.826 46.004 46.136 46.262 46.359 46.436 46.488 46.512 46.519 46.522 46.516 46.488 46.464 46.446 46.426 46.404 46.378 46.345 46.293 46.24 46.211 46.179 46.109 46.058 46.004 45.974 45.915 45.841 45.744 45.697 45.455 45.566 45.518 45.46 45.299 45.19 45.062 44.932 44.821 44.69 44.496 43.91 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 33ee2101..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22147 ,TETRA ,17557856,Fri Nov 26 11:31:05 CET,Fri Nov 26 13:52:52 CET,0.0 0.418 0.658 0.87 1.082 1.243 1.387 1.53 1.785 1.899 2.027 2.078 2.379 2.472 2.66 2.835 3.007 3.089 3.234 3.369 3.557 3.67 3.774 3.939 4.115 4.289 4.455 4.616 4.826 5.017 5.198 5.414 5.613 5.807 6.021 6.274 6.547 6.828 7.138 7.482 7.807 8.159 8.567 8.995 9.506 10.061 10.665 11.354 12.174 13.101 14.116 14.724 14.854 14.796 14.683 14.536 14.354 14.111 13.884 13.63 13.378 13.142 12.904 12.685 12.479 12.271 12.047 11.854 11.681 11.499 11.315 11.164 10.995 10.815 10.678 10.534 10.392 10.232 10.051 9.927 9.804 9.629 9.517 9.39 9.324 9.194 9.044 8.869 8.775 8.486 8.454 8.343 8.228 8.0 7.898 7.765 7.59 7.41 7.164 6.817 5.827 -2 ,30440 ,TETRA ,17557857,Fri Nov 26 11:31:05 CET,Fri Nov 26 13:55:04 CET,0.0 0.59 0.773 0.911 1.047 1.182 1.311 1.428 1.628 1.729 1.831 1.821 2.092 2.173 2.339 2.51 2.669 2.743 2.885 3.023 3.222 3.353 3.478 3.655 3.814 3.958 4.105 4.255 4.451 4.63 4.801 5.013 5.232 5.453 5.697 5.958 6.213 6.503 6.801 7.11 7.456 7.847 8.278 8.719 9.245 9.794 10.427 11.184 12.041 12.949 13.918 14.524 14.693 14.7 14.61 14.438 14.264 14.084 13.912 13.736 13.567 13.409 13.252 13.101 12.935 12.746 12.547 12.401 12.281 12.129 11.966 11.824 11.68 11.538 11.417 11.29 11.162 11.027 10.885 10.782 10.667 10.496 10.388 10.272 10.205 10.053 9.908 9.765 9.685 9.413 9.419 9.322 9.226 9.025 8.913 8.789 8.655 8.505 8.336 8.096 7.254 -3 ,7400 ,TETRA ,17557858,Fri Nov 26 11:31:08 CET,Fri Nov 26 13:54:06 CET,0.0 0.663 0.991 1.171 1.304 1.447 1.601 1.735 1.938 2.042 2.141 2.11 2.385 2.466 2.604 2.746 2.891 2.964 3.108 3.251 3.455 3.586 3.713 3.882 4.051 4.215 4.364 4.525 4.741 4.935 5.123 5.336 5.538 5.744 5.987 6.263 6.512 6.781 7.089 7.426 7.781 8.172 8.601 9.048 9.595 10.16 10.802 11.565 12.415 13.303 14.129 14.557 14.67 14.659 14.53 14.299 14.029 13.74 13.468 13.163 12.879 12.617 12.364 12.095 11.821 11.61 11.426 11.275 11.157 11.017 10.847 10.711 10.555 10.381 10.267 10.149 10.012 9.859 9.703 9.603 9.494 9.304 9.164 9.011 8.928 8.756 8.596 8.434 8.342 8.049 8.008 7.906 7.812 7.603 7.487 7.353 7.207 7.029 6.852 6.623 6.014 -4 ,27483 ,TETRA ,17557859,Fri Nov 26 11:31:05 CET,Fri Nov 26 13:53:02 CET,0.0 0.331 0.623 0.85 1.016 1.168 1.294 1.401 1.587 1.669 1.758 1.754 2.048 2.133 2.285 2.435 2.601 2.678 2.804 2.937 3.151 3.288 3.424 3.626 3.819 4.004 4.192 4.376 4.608 4.826 5.039 5.298 5.543 5.765 6.007 6.277 6.525 6.789 7.089 7.431 7.797 8.215 8.686 9.131 9.645 10.248 10.909 11.568 12.327 13.174 14.127 14.748 14.935 14.919 14.803 14.642 14.459 14.233 13.977 13.714 13.463 13.223 12.983 12.732 12.494 12.297 12.085 11.889 11.728 11.556 11.375 11.218 11.029 10.812 10.659 10.51 10.36 10.211 10.049 9.933 9.81 9.611 9.459 9.3 9.223 9.072 8.913 8.73 8.632 8.346 8.307 8.168 8.029 7.733 7.584 7.422 7.229 7.023 6.791 6.471 5.24 -5 ,17276 ,TETRA ,17557860,Fri Nov 26 11:31:07 CET,Fri Nov 26 13:53:47 CET,0.0 0.442 0.694 0.883 1.059 1.237 1.395 1.53 1.762 1.851 1.94 1.923 2.198 2.284 2.452 2.604 2.76 2.839 2.987 3.128 3.33 3.46 3.593 3.792 3.977 4.142 4.305 4.465 4.68 4.878 5.051 5.257 5.461 5.667 5.9 6.155 6.408 6.701 7.041 7.411 7.779 8.206 8.675 9.121 9.64 10.207 10.873 11.634 12.494 13.455 14.492 15.217 15.57 15.638 15.541 15.389 15.222 15.055 14.856 14.623 14.435 14.235 14.034 13.853 13.66 13.478 13.293 13.116 12.953 12.784 12.617 12.482 12.338 12.178 12.049 11.91 11.744 11.575 11.412 11.304 11.188 10.996 10.873 10.742 10.672 10.519 10.372 10.227 10.138 9.863 9.88 9.777 9.664 9.413 9.253 9.095 8.936 8.776 8.599 8.333 7.668 -6 ,21638 ,TETRA ,17557861,Fri Nov 26 11:31:08 CET,Fri Nov 26 13:53:32 CET,0.0 0.329 0.548 0.733 0.914 1.074 1.208 1.339 1.581 1.686 1.784 1.763 2.033 2.117 2.273 2.422 2.575 2.656 2.807 2.936 3.133 3.261 3.369 3.535 3.708 3.875 4.03 4.176 4.36 4.52 4.683 4.927 5.167 5.366 5.591 5.848 6.107 6.399 6.693 7.026 7.391 7.76 8.186 8.633 9.149 9.708 10.307 10.945 11.662 12.462 13.364 13.872 13.893 13.778 13.652 13.537 13.391 13.196 13.013 12.822 12.641 12.461 12.279 12.086 11.898 11.723 11.554 11.405 11.267 11.113 10.943 10.798 10.65 10.496 10.372 10.253 10.115 9.953 9.791 9.688 9.585 9.423 9.307 9.176 9.101 8.955 8.809 8.632 8.542 8.274 8.273 8.174 8.071 7.831 7.717 7.598 7.445 7.28 7.09 6.823 5.587 -7 ,22825 ,TETRA ,17557862,Fri Nov 26 11:31:06 CET,Fri Nov 26 13:55:14 CET,0.0 0.475 0.633 0.791 0.974 1.142 1.267 1.378 1.614 1.715 1.804 1.793 2.075 2.166 2.34 2.508 2.668 2.74 2.881 3.008 3.19 3.318 3.441 3.611 3.768 3.932 4.088 4.244 4.474 4.694 4.871 5.084 5.297 5.496 5.732 6.002 6.268 6.564 6.901 7.246 7.602 8.006 8.457 8.937 9.527 10.158 10.83 11.561 12.42 13.414 14.542 15.303 15.583 15.685 15.641 15.514 15.375 15.182 14.972 14.772 14.6 14.406 14.205 14.018 13.838 13.672 13.492 13.32 13.169 12.998 12.812 12.664 12.502 12.334 12.207 12.068 11.909 11.748 11.595 11.489 11.39 11.21 11.055 10.899 10.82 10.671 10.528 10.373 10.292 10.017 10.001 9.892 9.774 9.527 9.386 9.213 9.021 8.834 8.582 8.208 7.044 -8 ,5024 ,TETRA ,17557863,Fri Nov 26 11:31:09 CET,Fri Nov 26 13:53:14 CET,0.0 0.28 0.473 0.676 0.839 0.979 1.099 1.191 1.394 1.498 1.589 1.558 1.823 1.897 2.041 2.194 2.337 2.407 2.553 2.701 2.918 3.057 3.178 3.333 3.504 3.677 3.843 3.997 4.198 4.426 4.646 4.89 5.119 5.332 5.569 5.845 6.128 6.436 6.75 7.066 7.402 7.8 8.28 8.753 9.288 9.923 10.689 11.518 12.474 13.621 14.873 15.725 16.105 16.288 16.314 16.259 16.203 16.126 16.022 15.877 15.728 15.578 15.422 15.266 15.113 14.974 14.825 14.691 14.581 14.46 14.319 14.202 14.085 13.978 13.896 13.799 13.691 13.56 13.425 13.332 13.226 13.057 12.938 12.826 12.773 12.662 12.534 12.395 12.324 12.055 12.084 12.006 11.916 11.691 11.563 11.422 11.25 11.075 10.882 10.572 9.715 -9 ,15339 ,TETRA ,17557864,Fri Nov 26 11:31:11 CET,Fri Nov 26 13:49:13 CET,0.0 0.389 0.613 0.782 0.936 1.092 1.236 1.358 1.583 1.675 1.765 1.772 2.077 2.176 2.331 2.467 2.6 2.671 2.814 2.946 3.121 3.228 3.337 3.497 3.665 3.843 4.011 4.169 4.353 4.521 4.72 4.969 5.169 5.38 5.643 5.925 6.198 6.483 6.777 7.086 7.424 7.795 8.235 8.7 9.229 9.807 10.496 11.24 12.063 13.025 14.092 14.757 14.938 14.902 14.774 14.636 14.481 14.297 14.123 13.941 13.77 13.585 13.381 13.187 13.011 12.848 12.679 12.531 12.398 12.244 12.074 11.94 11.787 11.616 11.506 11.403 11.289 11.167 11.016 10.911 10.811 10.653 10.543 10.43 10.369 10.237 10.096 9.934 9.858 9.591 9.57 9.469 9.379 9.193 9.085 8.959 8.824 8.633 8.4 8.133 7.232 -10 ,27514 ,TETRA ,17557865,Fri Nov 26 11:31:06 CET,Fri Nov 26 13:55:03 CET,0.0 0.901 1.163 1.367 1.548 1.694 1.82 1.939 2.141 2.231 2.324 2.322 2.595 2.687 2.872 3.03 3.175 3.249 3.404 3.544 3.722 3.827 3.932 4.087 4.25 4.418 4.578 4.729 4.917 5.1 5.274 5.487 5.689 5.878 6.121 6.424 6.69 6.952 7.258 7.609 7.953 8.315 8.752 9.187 9.704 10.284 10.904 11.553 12.254 13.008 13.779 14.277 14.463 14.459 14.342 14.149 13.937 13.722 13.504 13.265 13.069 12.886 12.692 12.514 12.355 12.191 11.991 11.804 11.65 11.477 11.299 11.165 11.027 10.894 10.772 10.636 10.502 10.364 10.211 10.1 9.979 9.767 9.632 9.503 9.434 9.283 9.113 8.942 8.854 8.558 8.518 8.41 8.301 8.072 7.954 7.839 7.694 7.44 7.097 6.702 5.511 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt deleted file mode 100644 index 3d20abd9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23317 ,TETRA ,17557866,Fri Nov 26 11:31:08 CET,Fri Nov 26 13:57:14 CET,0.0 0.747 0.963 1.133 1.323 1.506 1.659 1.782 2.044 2.173 2.277 2.385 2.557 2.63 2.767 2.887 3.003 3.061 3.173 3.273 3.418 3.511 3.604 3.752 3.884 4.004 4.129 4.255 4.397 4.529 4.667 4.826 4.985 5.142 5.319 5.516 5.713 5.915 6.118 6.346 6.585 6.846 7.117 7.377 7.675 7.964 8.28 8.61 8.892 9.097 9.103 8.826 8.427 7.977 7.521 7.07 6.625 6.208 5.843 5.476 5.156 4.884 4.643 4.396 4.159 3.959 3.749 3.552 3.394 3.232 3.058 2.911 2.741 2.557 2.418 2.276 2.126 1.975 1.804 1.685 1.574 1.394 1.261 1.127 1.061 0.911 0.75 0.586 0.499 0.321 0.246 0.156 0.069 -0.133 -0.246 -0.35 -0.453 -0.608 -0.823 -1.089 -1.35 -2 ,17452 ,TETRA ,17557867,Fri Nov 26 11:31:06 CET,Fri Nov 26 13:52:21 CET,0.0 0.478 0.66 0.83 0.99 1.123 1.223 1.32 1.533 1.633 1.707 1.734 1.885 1.951 2.085 2.206 2.322 2.383 2.495 2.602 2.748 2.842 2.942 3.086 3.219 3.336 3.448 3.572 3.751 3.901 4.032 4.199 4.346 4.478 4.635 4.821 4.986 5.159 5.368 5.601 5.827 6.059 6.303 6.542 6.819 7.123 7.468 7.783 8.068 8.331 8.488 8.332 8.001 7.64 7.293 6.942 6.595 6.281 6.034 5.777 5.552 5.349 5.14 4.937 4.745 4.557 4.361 4.192 4.041 3.898 3.746 3.613 3.491 3.362 3.262 3.16 3.049 2.937 2.818 2.736 2.646 2.496 2.4 2.302 2.25 2.144 2.029 1.897 1.827 1.669 1.622 1.553 1.486 1.324 1.225 1.134 1.06 0.961 0.824 0.637 0.202 -3 ,25612 ,TETRA ,17557868,Fri Nov 26 11:31:06 CET,Fri Nov 26 13:52:07 CET,0.0 0.167 0.29 0.429 0.561 0.682 0.798 0.888 1.035 1.104 1.163 1.193 1.345 1.408 1.541 1.685 1.812 1.869 1.98 2.087 2.229 2.311 2.389 2.506 2.638 2.764 2.874 2.982 3.13 3.282 3.425 3.588 3.738 3.875 4.033 4.211 4.379 4.559 4.762 4.985 5.226 5.486 5.743 6.001 6.29 6.589 6.956 7.306 7.603 7.881 8.041 7.856 7.568 7.228 6.865 6.488 6.117 5.789 5.513 5.229 4.969 4.736 4.497 4.261 4.049 3.858 3.673 3.495 3.33 3.165 3.0 2.864 2.711 2.541 2.414 2.3 2.171 2.029 1.889 1.791 1.693 1.533 1.422 1.312 1.259 1.169 1.057 0.925 0.86 0.703 0.626 0.536 0.455 0.27 0.172 0.082 -0.032 -0.153 -0.305 -0.544 -1.17 -4 ,2248 ,TETRA ,17557869,Fri Nov 26 11:31:06 CET,Fri Nov 26 13:53:35 CET,0.0 0.4 0.62 0.791 0.906 0.997 1.077 1.16 1.32 1.394 1.47 1.517 1.677 1.752 1.897 2.078 2.26 2.33 2.445 2.542 2.681 2.773 2.865 3.012 3.162 3.29 3.388 3.483 3.615 3.743 3.866 4.019 4.182 4.34 4.505 4.672 4.831 5.016 5.213 5.406 5.602 5.831 6.089 6.327 6.615 6.91 7.191 7.503 7.811 8.08 8.218 7.994 7.63 7.227 6.81 6.398 6.033 5.708 5.421 5.121 4.849 4.592 4.358 4.146 3.95 3.781 3.602 3.44 3.299 3.137 2.97 2.837 2.689 2.541 2.434 2.325 2.214 2.095 1.965 1.868 1.758 1.602 1.504 1.4 1.346 1.23 1.113 1.002 0.937 0.767 0.727 0.657 0.581 0.381 0.244 0.118 0.005 -0.119 -0.249 -0.368 -0.715 -5 ,20920 ,TETRA ,17557870,Fri Nov 26 11:31:08 CET,Fri Nov 26 13:53:28 CET,0.0 0.164 0.286 0.407 0.515 0.629 0.747 0.841 1.004 1.087 1.168 1.234 1.389 1.441 1.554 1.676 1.786 1.838 1.941 2.029 2.153 2.236 2.32 2.431 2.534 2.653 2.768 2.869 2.998 3.126 3.253 3.416 3.582 3.742 3.928 4.121 4.304 4.51 4.723 4.918 5.098 5.3 5.535 5.771 5.992 6.226 6.545 6.869 7.193 7.452 7.394 6.922 6.396 5.841 5.304 4.866 4.485 4.117 3.798 3.494 3.211 2.945 2.703 2.472 2.255 2.06 1.872 1.714 1.571 1.421 1.268 1.128 0.971 0.812 0.684 0.55 0.425 0.306 0.182 0.088 -0.01 -0.154 -0.253 -0.367 -0.427 -0.549 -0.686 -0.826 -0.896 -1.065 -1.152 -1.243 -1.343 -1.556 -1.661 -1.782 -1.937 -2.126 -2.373 -2.664 -3.032 -6 ,10827 ,TETRA ,17557871,Fri Nov 26 11:31:07 CET,Fri Nov 26 13:46:44 CET,0.0 1.326 1.674 1.88 2.007 2.115 2.228 2.33 2.51 2.599 2.674 2.722 2.877 2.938 3.065 3.193 3.319 3.378 3.494 3.598 3.733 3.819 3.905 4.033 4.159 4.276 4.392 4.503 4.655 4.815 4.952 5.103 5.246 5.378 5.542 5.719 5.885 6.087 6.298 6.524 6.762 6.986 7.206 7.425 7.713 8.002 8.253 8.498 8.723 8.902 8.974 8.719 8.305 7.823 7.339 6.882 6.48 6.135 5.825 5.491 5.215 4.978 4.735 4.507 4.299 4.112 3.922 3.741 3.574 3.414 3.254 3.106 2.958 2.803 2.677 2.541 2.406 2.27 2.111 2.009 1.904 1.736 1.625 1.511 1.452 1.345 1.241 1.111 1.044 0.887 0.819 0.733 0.65 0.455 0.366 0.272 0.163 0.043 -0.102 -0.297 -1.11 -7 ,25932 ,TETRA ,17557872,Fri Nov 26 11:31:06 CET,Fri Nov 26 13:54:37 CET,0.0 0.494 0.627 0.771 0.922 1.041 1.127 1.215 1.384 1.45 1.522 1.578 1.727 1.789 1.917 2.032 2.134 2.179 2.284 2.406 2.567 2.652 2.735 2.86 2.983 3.101 3.214 3.338 3.485 3.604 3.711 3.855 4.022 4.183 4.346 4.517 4.681 4.852 5.036 5.226 5.424 5.662 5.929 6.171 6.449 6.744 7.066 7.368 7.611 7.775 7.762 7.445 6.908 6.371 5.907 5.492 5.121 4.76 4.417 4.075 3.785 3.533 3.29 3.052 2.841 2.651 2.455 2.276 2.12 1.961 1.785 1.642 1.503 1.347 1.214 1.082 0.953 0.826 0.689 0.591 0.495 0.353 0.248 0.126 0.064 -0.057 -0.204 -0.36 -0.428 -0.591 -0.643 -0.722 -0.804 -0.999 -1.11 -1.225 -1.362 -1.486 -1.613 -1.79 -2.226 -8 ,15065 ,TETRA ,17557873,Fri Nov 26 11:31:08 CET,Fri Nov 26 13:53:01 CET,0.0 0.215 0.401 0.581 0.712 0.834 0.941 1.033 1.197 1.267 1.337 1.37 1.52 1.579 1.702 1.824 1.932 1.987 2.098 2.203 2.36 2.459 2.552 2.684 2.797 2.896 2.998 3.106 3.245 3.37 3.496 3.652 3.803 3.951 4.129 4.32 4.497 4.712 4.945 5.172 5.403 5.648 5.915 6.175 6.454 6.736 7.025 7.294 7.58 7.84 7.994 7.896 7.612 7.297 6.952 6.597 6.249 5.892 5.578 5.255 4.973 4.732 4.495 4.258 4.045 3.859 3.659 3.473 3.305 3.126 2.943 2.788 2.63 2.489 2.39 2.284 2.154 2.016 1.883 1.789 1.687 1.548 1.445 1.324 1.265 1.146 1.029 0.899 0.825 0.664 0.608 0.532 0.458 0.305 0.218 0.121 0.0 -0.156 -0.341 -0.591 -1.23 -9 ,13199 ,TETRA ,17557874,Fri Nov 26 11:31:07 CET,Fri Nov 26 13:53:35 CET,0.0 0.382 0.517 0.626 0.734 0.838 0.923 0.994 1.142 1.219 1.285 1.304 1.453 1.511 1.631 1.752 1.854 1.899 1.998 2.105 2.249 2.336 2.419 2.542 2.679 2.794 2.895 3.007 3.157 3.293 3.428 3.605 3.771 3.919 4.078 4.26 4.437 4.621 4.84 5.079 5.302 5.54 5.796 6.046 6.327 6.61 6.895 7.181 7.484 7.744 7.826 7.604 7.27 6.921 6.591 6.248 5.891 5.571 5.293 5.013 4.786 4.585 4.382 4.192 4.023 3.855 3.685 3.553 3.433 3.298 3.152 3.032 2.908 2.785 2.691 2.59 2.482 2.36 2.241 2.163 2.084 1.956 1.868 1.784 1.741 1.645 1.548 1.454 1.401 1.246 1.205 1.142 1.082 0.925 0.821 0.705 0.577 0.419 0.26 0.113 -0.231 -10 ,17587 ,TETRA ,17557875,Fri Nov 26 11:31:08 CET,Fri Nov 26 13:46:25 CET,0.0 0.172 0.357 0.527 0.642 0.755 0.869 0.964 1.125 1.202 1.273 1.312 1.467 1.532 1.654 1.766 1.897 1.96 2.058 2.157 2.3 2.383 2.465 2.578 2.681 2.783 2.888 2.989 3.107 3.221 3.336 3.485 3.628 3.773 3.951 4.128 4.286 4.459 4.636 4.807 4.991 5.223 5.483 5.739 6.022 6.309 6.606 6.87 7.13 7.296 7.279 7.005 6.6 6.139 5.681 5.267 4.918 4.561 4.218 3.896 3.616 3.359 3.128 2.903 2.682 2.484 2.274 2.091 1.926 1.747 1.575 1.435 1.287 1.136 1.011 0.876 0.736 0.606 0.484 0.387 0.276 0.119 0.026 -0.071 -0.125 -0.248 -0.374 -0.505 -0.574 -0.734 -0.773 -0.852 -0.944 -1.107 -1.18 -1.277 -1.393 -1.512 -1.649 -1.86 -2.582 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 9f6a015b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12946 ,TETRA ,17557876,Fri Nov 26 11:31:08 CET,Fri Nov 26 13:53:48 CET,0.0 0.565 0.788 0.923 1.006 1.095 1.175 1.245 1.387 1.456 1.517 1.269 1.645 1.674 1.736 1.797 1.856 1.874 1.899 1.922 1.932 1.934 1.941 1.959 1.965 1.968 1.968 1.938 1.897 1.859 1.806 1.75 1.694 1.629 1.548 1.423 1.275 1.097 0.882 0.612 0.291 -0.116 -0.644 -1.239 -2.045 -3.049 -4.35 -6.114 -8.58 -12.192 -18.016 -24.474 -29.499 -33.569 -36.948 -39.834 -42.247 -44.381 -46.165 -47.898 -49.366 -50.635 -51.795 -52.884 -53.892 -54.767 -55.696 -56.569 -57.292 -58.005 -58.747 -59.36 -59.992 -60.649 -61.152 -61.667 -62.213 -62.77 -63.328 -63.7 -64.079 -64.671 -65.084 -65.518 -65.742 -66.197 -66.647 -67.09 -67.319 -67.973 -68.072 -68.35 -68.65 -69.325 -69.737 -70.188 -70.667 -71.175 -71.645 -72.285 -74.826 -2 ,12021 ,TETRA ,17557877,Fri Nov 26 11:31:09 CET,Fri Nov 26 13:54:22 CET,0.0 1.03 1.232 1.372 1.532 1.655 1.747 1.817 1.951 2.014 2.066 1.808 2.158 2.192 2.267 2.318 2.356 2.38 2.422 2.455 2.512 2.536 2.54 2.552 2.567 2.581 2.59 2.586 2.571 2.546 2.493 2.416 2.341 2.256 2.162 2.067 1.963 1.805 1.57 1.263 0.941 0.552 0.023 -0.571 -1.394 -2.385 -3.635 -5.363 -7.775 -11.298 -16.832 -23.133 -28.226 -32.387 -35.851 -38.861 -41.344 -43.488 -45.282 -47.049 -48.602 -49.962 -51.219 -52.348 -53.359 -54.278 -55.259 -56.157 -56.935 -57.727 -58.541 -59.223 -59.913 -60.608 -61.141 -61.684 -62.227 -62.817 -63.446 -63.864 -64.311 -64.978 -65.409 -65.865 -66.103 -66.591 -67.089 -67.624 -67.901 -68.594 -68.753 -69.064 -69.387 -70.041 -70.39 -70.76 -71.144 -71.641 -72.29 -73.08 -75.703 -3 ,16000 ,TETRA ,17557878,Fri Nov 26 11:33:05 CET,Fri Nov 26 13:59:02 CET,0.0 0.888 1.173 1.383 1.547 1.705 1.852 1.971 2.16 2.254 2.345 2.124 2.51 2.544 2.595 2.639 2.691 2.723 2.784 2.836 2.909 2.941 2.967 3.009 3.027 3.018 3.012 3.016 2.992 2.955 2.919 2.838 2.745 2.649 2.541 2.413 2.285 2.13 1.898 1.614 1.3 0.937 0.439 -0.18 -0.977 -1.984 -3.352 -5.183 -7.753 -11.509 -17.418 -24.06 -29.258 -33.374 -36.767 -39.705 -42.123 -44.243 -46.083 -47.898 -49.441 -50.797 -52.057 -53.193 -54.184 -55.081 -56.041 -56.904 -57.648 -58.401 -59.14 -59.738 -60.334 -60.934 -61.41 -61.89 -62.389 -62.9 -63.408 -63.762 -64.133 -64.728 -65.155 -65.616 -65.853 -66.34 -66.822 -67.299 -67.557 -68.253 -68.426 -68.736 -69.051 -69.745 -70.109 -70.46 -70.897 -71.478 -72.139 -72.874 -75.222 -4 ,28707 ,TETRA ,17557879,Fri Nov 26 11:33:05 CET,Fri Nov 26 13:37:41 CET,0.0 0.462 0.631 0.799 0.987 1.154 1.279 1.371 1.512 1.574 1.613 1.343 1.733 1.775 1.861 1.923 1.974 2.003 2.058 2.104 2.174 2.213 2.255 2.314 2.355 2.387 2.413 2.419 2.4 2.379 2.335 2.27 2.217 2.164 2.092 1.994 1.873 1.711 1.537 1.355 1.095 0.723 0.217 -0.345 -1.04 -2.013 -3.346 -5.097 -7.566 -11.149 -17.007 -23.504 -28.469 -32.472 -35.753 -38.623 -41.11 -43.283 -45.058 -46.786 -48.262 -49.545 -50.751 -51.897 -52.941 -53.863 -54.83 -55.681 -56.394 -57.129 -57.883 -58.512 -59.141 -59.781 -60.287 -60.78 -61.271 -61.789 -62.316 -62.677 -63.047 -63.63 -64.023 -64.449 -64.67 -65.091 -65.545 -66.006 -66.232 -66.88 -66.983 -67.242 -67.509 -68.16 -68.519 -68.883 -69.283 -69.714 -70.187 -70.841 -73.422 -5 ,9745 ,TETRA ,17557880,Fri Nov 26 11:33:05 CET,Fri Nov 26 13:56:20 CET,0.0 0.647 0.843 0.978 1.08 1.176 1.273 1.354 1.536 1.637 1.719 1.504 1.904 1.945 1.997 2.042 2.07 2.073 2.095 2.127 2.133 2.137 2.166 2.215 2.237 2.245 2.262 2.273 2.257 2.216 2.169 2.101 2.023 1.945 1.84 1.707 1.554 1.374 1.152 0.862 0.521 0.106 -0.433 -1.041 -1.846 -2.876 -4.221 -5.965 -8.488 -12.192 -17.981 -24.454 -29.426 -33.505 -36.892 -39.75 -42.188 -44.275 -45.998 -47.703 -49.126 -50.36 -51.49 -52.569 -53.573 -54.489 -55.432 -56.252 -56.956 -57.675 -58.402 -58.996 -59.615 -60.245 -60.733 -61.22 -61.709 -62.227 -62.762 -63.128 -63.517 -64.126 -64.54 -64.964 -65.178 -65.622 -66.073 -66.527 -66.772 -67.453 -67.581 -67.855 -68.138 -68.746 -69.07 -69.412 -69.818 -70.304 -70.836 -71.558 -74.324 -6 ,17528 ,TETRA ,17557881,Fri Nov 26 11:33:07 CET,Fri Nov 26 13:55:39 CET,0.0 0.579 0.713 0.878 1.04 1.171 1.276 1.369 1.602 1.719 1.811 1.628 2.034 2.09 2.166 2.224 2.29 2.321 2.378 2.415 2.434 2.438 2.451 2.477 2.499 2.525 2.537 2.55 2.558 2.542 2.511 2.456 2.401 2.337 2.226 2.075 1.937 1.762 1.528 1.263 0.968 0.589 0.056 -0.573 -1.391 -2.412 -3.727 -5.434 -7.875 -11.401 -17.039 -23.434 -28.372 -32.394 -35.674 -38.492 -40.905 -43.017 -44.761 -46.44 -47.879 -49.153 -50.345 -51.46 -52.458 -53.359 -54.326 -55.192 -55.931 -56.688 -57.475 -58.119 -58.806 -59.538 -60.11 -60.712 -61.341 -61.989 -62.625 -63.047 -63.487 -64.182 -64.676 -65.182 -65.438 -65.957 -66.489 -67.05 -67.335 -68.053 -68.294 -68.647 -69.015 -69.791 -70.218 -70.66 -71.128 -71.642 -72.303 -73.185 -75.588 -7 ,21046 ,TETRA ,17557882,Fri Nov 26 11:33:05 CET,Fri Nov 26 13:52:49 CET,0.0 0.346 0.512 0.664 0.773 0.855 0.938 1.019 1.171 1.233 1.291 1.05 1.44 1.485 1.548 1.607 1.672 1.705 1.761 1.806 1.906 1.974 2.009 2.046 2.074 2.096 2.105 2.113 2.126 2.1 2.043 1.962 1.882 1.822 1.763 1.66 1.517 1.359 1.186 0.929 0.589 0.176 -0.343 -0.912 -1.641 -2.566 -3.795 -5.518 -7.988 -11.485 -17.125 -23.588 -28.615 -32.623 -35.86 -38.685 -41.172 -43.305 -45.024 -46.761 -48.228 -49.506 -50.733 -51.884 -52.96 -53.915 -54.889 -55.745 -56.45 -57.173 -57.956 -58.61 -59.288 -59.968 -60.481 -61.029 -61.579 -62.127 -62.69 -63.072 -63.456 -64.041 -64.431 -64.843 -65.059 -65.5 -65.966 -66.442 -66.686 -67.369 -67.51 -67.786 -68.066 -68.722 -69.089 -69.525 -70.003 -70.53 -71.17 -72.047 -74.999 -8 ,16570 ,TETRA ,17557883,Fri Nov 26 11:33:05 CET,Fri Nov 26 14:00:34 CET,0.0 1.057 1.253 1.398 1.521 1.612 1.67 1.725 1.836 1.877 1.908 1.616 1.988 2.019 2.082 2.159 2.23 2.259 2.304 2.328 2.355 2.375 2.393 2.401 2.39 2.369 2.349 2.337 2.351 2.39 2.416 2.421 2.415 2.374 2.277 2.171 2.041 1.843 1.606 1.331 1.005 0.578 0.036 -0.534 -1.307 -2.251 -3.507 -5.222 -7.678 -11.287 -16.85 -23.121 -27.915 -31.751 -34.96 -37.752 -40.067 -42.079 -43.801 -45.507 -46.924 -48.163 -49.422 -50.622 -51.713 -52.699 -53.687 -54.548 -55.304 -56.065 -56.841 -57.474 -58.109 -58.762 -59.268 -59.793 -60.333 -60.875 -61.41 -61.77 -62.139 -62.728 -63.136 -63.556 -63.772 -64.219 -64.697 -65.197 -65.444 -66.112 -66.247 -66.521 -66.819 -67.478 -67.823 -68.175 -68.55 -68.973 -69.478 -70.238 -72.192 -9 ,16442 ,TETRA ,17557884,Fri Nov 26 11:33:05 CET,Fri Nov 26 13:58:51 CET,0.0 0.422 0.563 0.697 0.821 0.935 1.035 1.1 1.195 1.243 1.288 1.043 1.413 1.449 1.522 1.57 1.607 1.617 1.638 1.668 1.713 1.729 1.733 1.728 1.726 1.745 1.747 1.726 1.699 1.664 1.619 1.564 1.505 1.427 1.321 1.186 1.03 0.838 0.595 0.305 -0.013 -0.417 -0.981 -1.608 -2.411 -3.416 -4.668 -6.354 -8.794 -12.253 -17.726 -23.944 -28.852 -32.928 -36.332 -39.208 -41.6 -43.713 -45.514 -47.228 -48.645 -49.89 -51.058 -52.12 -53.084 -53.945 -54.828 -55.626 -56.313 -57.01 -57.751 -58.406 -59.108 -59.824 -60.36 -60.906 -61.478 -62.053 -62.647 -63.059 -63.461 -64.078 -64.511 -64.972 -65.218 -65.724 -66.247 -66.803 -67.093 -67.794 -67.93 -68.216 -68.514 -69.166 -69.528 -69.925 -70.358 -70.874 -71.442 -72.163 -74.814 -10 ,13445 ,TETRA ,17557885,Fri Nov 26 11:33:05 CET,Fri Nov 26 14:04:15 CET,0.0 0.774 1.021 1.145 1.259 1.366 1.449 1.505 1.615 1.673 1.724 1.484 1.881 1.937 2.053 2.18 2.295 2.338 2.374 2.384 2.401 2.401 2.4 2.409 2.419 2.423 2.41 2.386 2.353 2.304 2.251 2.174 2.093 2.022 1.907 1.758 1.615 1.437 1.222 0.963 0.64 0.25 -0.253 -0.825 -1.605 -2.645 -4.092 -5.966 -8.439 -12.027 -17.677 -24.14 -29.381 -33.595 -37.036 -40.048 -42.593 -44.82 -46.673 -48.439 -49.938 -51.269 -52.503 -53.655 -54.706 -55.632 -56.598 -57.459 -58.186 -58.917 -59.649 -60.232 -60.822 -61.444 -61.913 -62.387 -62.891 -63.427 -63.976 -64.343 -64.704 -65.247 -65.635 -66.047 -66.253 -66.649 -67.053 -67.498 -67.746 -68.431 -68.581 -68.871 -69.16 -69.778 -70.132 -70.516 -70.907 -71.352 -71.874 -72.428 -75.147 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt deleted file mode 100644 index 03f817b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23264 ,TETRA ,17557886,Fri Nov 26 11:33:09 CET,Fri Nov 26 14:07:57 CET,0.0 1.208 1.56 1.848 2.072 2.278 2.472 2.629 2.904 3.046 3.178 3.068 3.531 3.654 3.899 4.116 4.298 4.38 4.544 4.714 4.956 5.111 5.27 5.502 5.707 5.913 6.122 6.344 6.657 6.941 7.191 7.493 7.779 8.042 8.343 8.705 9.061 9.434 9.84 10.278 10.732 11.217 11.765 12.319 12.915 13.47 14.086 14.727 15.306 15.761 15.859 15.33 14.575 13.797 13.045 12.102 11.126 10.255 9.463 8.666 7.952 7.296 6.693 6.089 5.526 5.035 4.518 4.063 3.675 3.273 2.834 2.443 2.052 1.663 1.346 1.004 0.664 0.327 -0.024 -0.268 -0.521 -0.942 -1.257 -1.581 -1.732 -2.038 -2.383 -2.759 -2.957 -3.493 -3.565 -3.793 -4.039 -4.557 -4.852 -5.174 -5.511 -5.889 -6.292 -6.876 -8.632 -2 ,6959 ,TETRA ,17557887,Fri Nov 26 11:33:07 CET,Fri Nov 26 13:59:17 CET,0.0 1.044 1.408 1.694 1.93 2.137 2.343 2.547 2.873 3.015 3.156 3.093 3.565 3.711 4.011 4.27 4.526 4.655 4.921 5.17 5.501 5.705 5.896 6.188 6.475 6.765 7.049 7.305 7.641 7.973 8.297 8.699 9.07 9.406 9.795 10.217 10.574 10.918 11.268 11.633 12.018 12.442 12.94 13.439 13.985 14.581 15.238 15.821 16.269 16.624 16.683 15.933 15.043 14.164 13.268 12.371 11.542 10.8 10.156 9.46 8.812 8.237 7.713 7.229 6.774 6.357 5.927 5.533 5.188 4.822 4.444 4.131 3.775 3.416 3.15 2.872 2.58 2.292 1.998 1.782 1.539 1.172 0.924 0.633 0.478 0.151 -0.187 -0.524 -0.7 -1.22 -1.271 -1.5 -1.75 -2.336 -2.717 -3.111 -3.5 -3.913 -4.359 -4.935 -6.751 -3 ,20958 ,TETRA ,17557888,Fri Nov 26 11:33:05 CET,Fri Nov 26 13:58:55 CET,0.0 0.941 1.306 1.581 1.842 2.082 2.285 2.452 2.751 2.896 3.03 2.937 3.386 3.488 3.69 3.907 4.112 4.205 4.401 4.609 4.897 5.076 5.257 5.518 5.784 6.068 6.339 6.594 6.906 7.185 7.488 7.888 8.24 8.569 8.922 9.265 9.582 9.909 10.253 10.596 10.924 11.266 11.662 12.074 12.517 12.976 13.549 14.16 14.662 15.01 14.801 13.873 12.85 11.881 11.0 10.085 9.262 8.527 7.868 7.218 6.66 6.156 5.66 5.173 4.709 4.279 3.813 3.388 3.029 2.662 2.262 1.904 1.543 1.172 0.883 0.594 0.278 -0.052 -0.389 -0.628 -0.869 -1.258 -1.539 -1.813 -1.958 -2.279 -2.6 -2.914 -3.083 -3.614 -3.713 -3.96 -4.236 -4.852 -5.184 -5.56 -5.948 -6.321 -6.767 -7.415 -9.556 -4 ,17098 ,TETRA ,17557889,Fri Nov 26 11:33:08 CET,Fri Nov 26 13:58:18 CET,0.0 0.715 1.083 1.403 1.673 1.902 2.114 2.31 2.651 2.8 2.953 2.902 3.373 3.488 3.699 3.91 4.126 4.229 4.411 4.589 4.853 5.016 5.165 5.394 5.614 5.809 6.01 6.21 6.461 6.712 6.956 7.229 7.485 7.735 8.033 8.378 8.715 9.06 9.423 9.816 10.182 10.566 11.012 11.473 11.996 12.557 13.144 13.691 14.176 14.441 14.273 13.55 12.72 11.843 10.942 10.059 9.213 8.386 7.698 7.019 6.408 5.847 5.31 4.8 4.322 3.895 3.455 3.045 2.671 2.272 1.858 1.516 1.164 0.749 0.378 -0.004 -0.391 -0.796 -1.223 -1.516 -1.815 -2.306 -2.663 -3.023 -3.2 -3.579 -3.979 -4.376 -4.572 -5.114 -5.237 -5.479 -5.722 -6.259 -6.56 -6.899 -7.297 -7.749 -8.254 -8.832 -10.479 -5 ,29321 ,TETRA ,17557890,Fri Nov 26 11:33:06 CET,Fri Nov 26 13:58:10 CET,0.0 1.571 2.051 2.448 2.759 2.996 3.213 3.428 3.802 3.984 4.149 4.064 4.523 4.634 4.852 5.056 5.255 5.348 5.521 5.696 5.937 6.076 6.223 6.453 6.673 6.877 7.075 7.273 7.527 7.765 7.99 8.255 8.507 8.738 9.002 9.297 9.59 9.93 10.287 10.678 11.078 11.504 11.987 12.427 12.899 13.428 14.045 14.682 15.402 16.108 16.405 16.09 15.386 14.452 13.549 12.724 12.015 11.354 10.768 10.143 9.578 9.083 8.562 8.047 7.582 7.155 6.718 6.335 6.006 5.676 5.351 5.062 4.737 4.402 4.138 3.857 3.579 3.276 2.941 2.717 2.486 2.124 1.868 1.59 1.45 1.183 0.92 0.643 0.487 -0.013 -0.004 -0.184 -0.391 -0.859 -1.146 -1.438 -1.743 -2.146 -2.641 -3.194 -5.496 -6 ,21513 ,TETRA ,17557891,Fri Nov 26 11:33:07 CET,Fri Nov 26 13:57:33 CET,0.0 0.849 1.201 1.495 1.712 1.9 2.065 2.211 2.497 2.621 2.741 2.641 3.097 3.207 3.411 3.615 3.811 3.896 4.065 4.243 4.504 4.664 4.818 5.056 5.279 5.474 5.655 5.837 6.093 6.353 6.598 6.887 7.158 7.42 7.73 8.041 8.323 8.632 8.972 9.328 9.693 10.113 10.61 11.107 11.644 12.187 12.78 13.324 13.923 14.575 14.877 14.282 13.237 12.145 11.25 10.493 9.77 9.035 8.354 7.659 7.019 6.444 5.916 5.431 4.988 4.58 4.145 3.748 3.406 3.026 2.594 2.245 1.897 1.515 1.214 0.904 0.584 0.246 -0.116 -0.344 -0.581 -0.972 -1.243 -1.566 -1.731 -2.038 -2.379 -2.735 -2.915 -3.438 -3.512 -3.726 -3.943 -4.465 -4.763 -5.103 -5.497 -5.949 -6.465 -7.005 -8.834 -7 ,13974 ,TETRA ,17557892,Fri Nov 26 11:33:05 CET,Fri Nov 26 13:59:35 CET,0.0 1.423 1.71 1.96 2.227 2.454 2.653 2.829 3.165 3.324 3.467 3.385 3.833 3.934 4.148 4.365 4.575 4.673 4.855 5.025 5.259 5.408 5.567 5.806 6.025 6.225 6.412 6.592 6.822 7.063 7.304 7.598 7.866 8.106 8.379 8.657 8.928 9.247 9.597 9.958 10.321 10.719 11.151 11.577 12.07 12.581 13.166 13.746 14.241 14.629 14.714 14.175 13.348 12.433 11.451 10.522 9.69 8.907 8.209 7.461 6.837 6.278 5.717 5.192 4.686 4.222 3.739 3.312 2.954 2.566 2.145 1.804 1.455 1.094 0.822 0.522 0.196 -0.123 -0.447 -0.678 -0.926 -1.328 -1.619 -1.943 -2.118 -2.465 -2.838 -3.244 -3.448 -4.008 -4.159 -4.411 -4.66 -5.271 -5.635 -5.964 -6.338 -6.786 -7.295 -7.941 -10.25 -8 ,6503 ,TETRA ,17557893,Fri Nov 26 11:33:07 CET,Fri Nov 26 14:00:03 CET,0.0 1.092 1.505 1.795 2.035 2.268 2.46 2.629 2.968 3.13 3.269 3.163 3.619 3.733 3.959 4.154 4.359 4.456 4.645 4.86 5.167 5.355 5.516 5.717 5.946 6.173 6.371 6.567 6.823 7.052 7.274 7.549 7.806 8.041 8.3 8.603 8.907 9.223 9.545 9.904 10.296 10.701 11.141 11.581 12.065 12.574 13.099 13.683 14.305 14.72 14.78 14.415 13.798 13.043 12.313 11.558 10.827 10.21 9.706 9.171 8.66 8.204 7.774 7.248 6.666 6.141 5.613 5.138 4.737 4.295 3.777 3.337 2.879 2.413 2.07 1.718 1.331 0.924 0.511 0.235 -0.055 -0.513 -0.841 -1.187 -1.371 -1.758 -2.151 -2.57 -2.782 -3.33 -3.419 -3.653 -3.905 -4.46 -4.75 -5.037 -5.369 -5.765 -6.231 -6.907 -8.849 -9 ,2961 ,TETRA ,17557894,Fri Nov 26 11:33:07 CET,Fri Nov 26 14:02:45 CET,0.0 1.518 1.909 2.212 2.448 2.666 2.888 3.07 3.393 3.561 3.723 3.662 4.136 4.251 4.465 4.66 4.849 4.942 5.115 5.283 5.514 5.662 5.821 6.049 6.25 6.443 6.647 6.841 7.074 7.307 7.548 7.82 8.064 8.308 8.577 8.858 9.119 9.422 9.764 10.13 10.513 10.922 11.357 11.78 12.26 12.766 13.297 13.893 14.466 14.844 14.869 14.265 13.405 12.578 11.785 11.0 10.288 9.594 8.909 8.203 7.612 7.074 6.557 6.061 5.6 5.176 4.732 4.337 3.989 3.618 3.243 2.927 2.6 2.267 1.99 1.692 1.396 1.092 0.765 0.526 0.265 -0.135 -0.394 -0.661 -0.801 -1.094 -1.401 -1.734 -1.906 -2.413 -2.452 -2.655 -2.883 -3.365 -3.621 -3.943 -4.312 -4.734 -5.279 -6.008 -8.376 -10 ,8474 ,TETRA ,17557895,Fri Nov 26 11:33:07 CET,Fri Nov 26 13:54:00 CET,0.0 0.954 1.3 1.551 1.8 2.049 2.289 2.509 2.877 3.064 3.236 3.19 3.67 3.817 4.115 4.372 4.606 4.725 4.958 5.18 5.48 5.659 5.828 6.063 6.291 6.501 6.704 6.926 7.218 7.481 7.717 8.013 8.293 8.541 8.834 9.16 9.465 9.804 10.182 10.576 10.939 11.329 11.81 12.256 12.742 13.253 13.801 14.356 14.878 15.331 15.422 14.817 13.936 13.022 12.099 11.229 10.433 9.683 9.041 8.37 7.794 7.269 6.727 6.212 5.737 5.297 4.82 4.365 3.98 3.595 3.163 2.791 2.418 2.039 1.743 1.438 1.121 0.785 0.444 0.205 -0.052 -0.449 -0.718 -0.996 -1.142 -1.445 -1.776 -2.123 -2.298 -2.815 -2.835 -3.018 -3.219 -3.686 -3.931 -4.229 -4.611 -5.022 -5.525 -6.2 -9.767 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt deleted file mode 100644 index 1e330f6e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,28611 ,TETRA ,17557899,Fri Nov 26 12:24:42 CET,Fri Nov 26 14:48:18 CET,0.0 1.36 1.957 2.352 2.685 2.965 3.204 3.408 3.737 3.866 3.986 3.986 4.353 4.467 4.684 4.888 5.123 5.22 5.321 5.409 5.53 5.6 5.669 5.776 5.864 5.947 6.018 6.074 6.136 6.215 6.308 6.412 6.503 6.559 6.597 6.644 6.683 6.665 6.605 6.513 6.366 6.176 5.921 5.55 4.86 3.816 2.344 0.371 -2.658 -7.47 -15.239 -24.362 -31.925 -38.372 -43.757 -48.355 -52.244 -55.682 -58.587 -61.458 -63.889 -66.043 -68.132 -70.097 -71.827 -73.314 -74.841 -76.158 -77.253 -78.365 -79.534 -80.514 -81.505 -82.531 -83.358 -84.187 -84.986 -85.839 -86.743 -87.341 -87.92 -88.814 -89.468 -90.158 -90.515 -91.284 -92.077 -92.859 -93.274 -94.096 -94.628 -95.128 -95.655 -96.667 -97.268 -97.99 -98.785 -99.816 -101.021 -102.605 -110.091 -7 ,8541 ,TETRA ,17557902,Fri Nov 26 12:24:43 CET,Fri Nov 26 14:55:08 CET,0.0 4.138 4.529 4.775 5.007 5.234 5.414 5.564 5.822 5.931 6.038 5.99 6.36 6.454 6.608 6.762 6.902 6.966 7.095 7.206 7.345 7.431 7.506 7.628 7.758 7.891 8.016 8.113 8.223 8.331 8.432 8.539 8.645 8.752 8.836 8.883 8.926 8.962 8.933 8.851 8.763 8.57 8.188 7.753 7.134 6.253 4.958 3.013 0.197 -4.328 -12.254 -21.899 -29.669 -36.053 -41.401 -46.077 -50.02 -53.467 -56.488 -59.51 -61.974 -64.079 -65.995 -67.728 -69.299 -70.686 -72.147 -73.466 -74.572 -75.696 -76.856 -77.809 -78.789 -79.799 -80.597 -81.407 -82.212 -83.068 -83.985 -84.597 -85.205 -86.144 -86.785 -87.424 -87.75 -88.429 -89.169 -89.973 -90.381 -91.173 -91.716 -92.201 -92.693 -93.705 -94.291 -94.955 -95.653 -96.426 -97.398 -98.722 -106.143 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt deleted file mode 100644 index 53138b00..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,5038 ,TETRA ,17557907,Fri Nov 26 12:24:43 CET,Fri Nov 26 14:55:09 CET,0.0 3.6 4.396 4.95 5.433 5.851 6.232 6.565 7.166 7.447 7.71 7.947 8.436 8.675 9.131 9.556 9.968 10.175 10.594 10.987 11.556 11.917 12.256 12.752 13.227 13.692 14.162 14.611 15.154 15.676 16.198 16.832 17.445 18.078 18.875 19.767 20.557 21.447 22.429 23.366 24.331 25.392 26.522 27.628 28.85 30.125 31.569 33.143 34.843 36.462 37.503 37.238 36.171 34.953 33.845 32.797 31.712 30.597 29.618 28.654 27.857 27.158 26.478 25.795 25.139 24.516 23.842 23.274 22.804 22.315 21.807 21.37 20.894 20.374 19.933 19.48 19.057 18.648 18.2 17.857 17.498 16.952 16.548 16.119 15.911 15.491 15.022 14.472 14.169 13.62 13.297 12.954 12.528 11.544 10.971 10.32 9.574 8.734 7.765 6.34 -2.397 -3 ,14222 ,TETRA ,17557908,Fri Nov 26 12:24:45 CET,Fri Nov 26 14:55:16 CET,0.0 4.08 4.823 5.386 5.895 6.332 6.705 7.061 7.722 8.043 8.337 8.617 9.141 9.377 9.823 10.254 10.686 10.905 11.328 11.762 12.393 12.762 13.125 13.679 14.226 14.756 15.245 15.723 16.343 16.917 17.482 18.167 18.795 19.366 19.996 20.713 21.433 22.244 23.124 24.102 25.137 26.264 27.553 28.801 30.139 31.49 33.06 34.843 36.464 37.824 38.995 38.691 37.726 36.644 35.511 34.4 33.327 32.308 31.375 30.291 29.277 28.375 27.505 26.687 25.943 25.29 24.573 23.896 23.311 22.688 22.047 21.54 21.014 20.463 20.041 19.605 19.15 18.675 18.192 17.868 17.525 16.943 16.535 16.084 15.837 15.346 14.821 14.228 13.906 13.299 12.793 12.42 12.037 11.105 10.616 10.079 9.366 8.573 7.662 6.405 0.152 -4 ,22150 ,TETRA ,17557909,Fri Nov 26 12:24:44 CET,Fri Nov 26 14:54:40 CET,0.0 5.449 6.246 6.769 7.218 7.66 8.085 8.443 9.053 9.37 9.69 9.992 10.52 10.776 11.251 11.739 12.199 12.4 12.796 13.204 13.815 14.217 14.575 15.024 15.45 15.905 16.365 16.821 17.414 17.97 18.497 19.139 19.759 20.35 21.047 21.763 22.422 23.096 23.78 24.554 25.343 26.195 27.142 28.087 29.213 30.485 31.734 32.811 33.78 34.428 34.733 34.031 32.839 31.616 30.43 29.316 28.325 27.295 26.307 25.318 24.39 23.515 22.656 21.8 21.001 20.336 19.695 19.089 18.553 17.993 17.413 16.938 16.451 15.964 15.572 15.139 14.664 14.167 13.665 13.34 12.996 12.39 11.959 11.466 11.199 10.689 10.164 9.632 9.338 8.785 8.421 8.089 7.743 6.889 6.36 5.786 5.154 4.397 3.477 2.272 -3.175 -5 ,8681 ,TETRA ,17557910,Fri Nov 26 12:24:43 CET,Fri Nov 26 14:51:08 CET,0.0 3.075 3.685 4.156 4.581 5.003 5.369 5.688 6.322 6.624 6.919 7.263 7.803 8.071 8.58 9.031 9.452 9.661 10.062 10.434 10.98 11.338 11.674 12.167 12.642 13.126 13.643 14.147 14.72 15.202 15.703 16.351 16.968 17.54 18.199 18.952 19.662 20.405 21.197 22.092 23.064 24.167 25.443 26.638 27.931 29.302 30.876 32.542 34.015 35.393 36.692 36.734 35.946 34.877 33.689 32.543 31.493 30.471 29.592 28.732 27.954 27.154 26.362 25.654 24.973 24.291 23.603 23.028 22.517 21.992 21.398 20.898 20.43 19.908 19.468 19.005 18.531 18.057 17.541 17.165 16.755 16.096 15.655 15.175 14.924 14.397 13.824 13.221 12.901 12.325 11.966 11.646 11.281 10.421 9.924 9.32 8.614 7.806 6.846 5.599 -0.921 -7 ,872 ,TETRA ,17557912,Fri Nov 26 12:24:44 CET,Fri Nov 26 14:57:24 CET,0.0 2.557 3.176 3.713 4.228 4.668 5.067 5.46 6.201 6.524 6.807 7.086 7.612 7.875 8.388 8.855 9.272 9.457 9.802 10.18 10.77 11.116 11.43 11.879 12.295 12.702 13.099 13.484 13.969 14.468 14.981 15.608 16.224 16.8 17.454 18.178 18.86 19.585 20.395 21.332 22.315 23.404 24.72 26.064 27.6 29.151 30.819 32.569 34.123 35.653 36.745 36.273 35.116 33.82 32.594 31.442 30.289 29.214 28.294 27.343 26.465 25.709 25.018 24.302 23.614 22.964 22.265 21.656 21.141 20.597 19.967 19.411 18.848 18.253 17.803 17.359 16.905 16.427 15.904 15.535 15.164 14.596 14.175 13.725 13.491 12.972 12.44 11.902 11.617 11.057 10.662 10.308 9.946 9.09 8.587 8.081 7.507 6.77 5.795 4.274 -2.507 -9 ,9020 ,TETRA ,17557914,Fri Nov 26 12:24:43 CET,Fri Nov 26 14:48:26 CET,0.0 4.016 4.652 5.205 5.688 6.086 6.454 6.794 7.415 7.692 7.969 8.287 8.82 9.076 9.556 10.021 10.48 10.701 11.107 11.506 12.108 12.491 12.855 13.372 13.892 14.446 14.954 15.401 15.962 16.494 17.036 17.698 18.281 18.825 19.496 20.288 21.079 21.95 22.764 23.558 24.432 25.42 26.51 27.567 28.795 30.152 31.633 33.12 34.67 36.03 36.833 36.521 35.561 34.401 33.292 32.15 31.074 30.099 29.13 28.096 27.248 26.507 25.746 24.964 24.27 23.656 22.974 22.319 21.724 21.12 20.517 19.994 19.432 18.87 18.423 17.977 17.545 17.072 16.55 16.198 15.835 15.279 14.881 14.459 14.256 13.836 13.297 12.629 12.278 11.658 11.181 10.819 10.451 9.551 8.982 8.359 7.694 6.879 5.823 4.263 -7.653 -10 ,25334 ,TETRA ,17557915,Fri Nov 26 12:24:44 CET,Fri Nov 26 14:51:07 CET,0.0 4.062 4.847 5.412 5.897 6.349 6.704 7.046 7.729 8.045 8.35 8.685 9.246 9.528 10.026 10.479 10.949 11.185 11.644 12.084 12.73 13.153 13.558 14.132 14.683 15.251 15.813 16.312 16.847 17.325 17.812 18.406 18.931 19.417 19.99 20.6 21.147 21.765 22.46 23.21 23.967 24.724 25.565 26.475 27.552 28.609 29.674 30.743 31.815 32.899 33.78 33.466 32.289 30.848 29.408 28.027 26.811 25.756 24.78 23.724 22.748 21.826 21.0 20.266 19.549 18.872 18.165 17.512 16.944 16.338 15.705 15.161 14.572 13.982 13.529 13.054 12.53 11.949 11.367 11.004 10.612 9.959 9.494 9.003 8.756 8.265 7.742 7.153 6.851 6.297 5.904 5.53 5.088 4.075 3.553 2.987 2.274 1.474 0.536 -0.83 -7.213 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index a2e74102..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9434 ,KEBNE ,17125793,Thu Dec 30 16:52:49 CET,Thu Dec 30 18:50:11 CET,0.0 1.048 1.331 1.557 1.729 1.831 1.953 2.043 2.098 2.112 2.143 1.937 2.182 2.169 2.136 2.112 2.081 2.057 2.015 1.964 1.853 1.772 1.68 1.506 1.34 1.189 1.019 0.832 0.558 0.268 -0.028 -0.415 -0.808 -1.209 -1.698 -2.303 -2.951 -3.694 -4.535 -5.487 -6.526 -7.74 -9.294 -11.018 -13.209 -15.864 -19.235 -23.658 -29.667 -37.963 -50.563 -64.135 -74.277 -82.311 -88.768 -94.193 -98.681 -102.495 -105.666 -108.757 -111.336 -113.522 -115.515 -117.361 -119.033 -120.501 -121.978 -123.286 -124.39 -125.484 -126.605 -127.534 -128.482 -129.444 -130.167 -130.902 -131.652 -132.415 -133.198 -133.713 -134.224 -135.004 -135.551 -136.106 -136.378 -136.925 -137.499 -138.095 -138.383 -139.081 -139.265 -139.574 -139.893 -140.593 -140.967 -141.365 -141.806 -142.283 -142.803 -143.476 -145.217 -2 ,28672 ,KEBNE ,17125794,Thu Dec 30 16:52:49 CET,Thu Dec 30 18:52:33 CET,0.0 0.831 1.032 1.163 1.253 1.349 1.433 1.484 1.497 1.496 1.494 1.229 1.469 1.45 1.422 1.391 1.329 1.294 1.222 1.133 1.001 0.899 0.779 0.601 0.417 0.238 0.068 -0.101 -0.343 -0.582 -0.828 -1.181 -1.565 -1.937 -2.396 -2.983 -3.593 -4.33 -5.186 -6.13 -7.195 -8.486 -10.094 -11.843 -14.081 -16.893 -20.5 -25.032 -31.01 -39.359 -52.156 -65.583 -75.352 -83.038 -89.235 -94.523 -98.978 -102.822 -105.999 -109.053 -111.555 -113.707 -115.775 -117.652 -119.286 -120.709 -122.154 -123.431 -124.515 -125.611 -126.738 -127.665 -128.604 -129.543 -130.251 -130.984 -131.763 -132.561 -133.36 -133.898 -134.428 -135.239 -135.808 -136.386 -136.672 -137.266 -137.898 -138.532 -138.863 -139.626 -139.914 -140.256 -140.606 -141.334 -141.706 -142.108 -142.566 -143.044 -143.567 -144.276 -146.038 -3 ,21165 ,KEBNE ,17125795,Thu Dec 30 16:52:49 CET,Thu Dec 30 18:51:05 CET,0.0 1.159 1.545 1.756 1.868 1.977 2.073 2.149 2.254 2.271 2.287 2.073 2.316 2.323 2.362 2.357 2.314 2.287 2.221 2.137 1.998 1.907 1.825 1.707 1.57 1.422 1.27 1.1 0.839 0.573 0.318 -0.04 -0.443 -0.873 -1.399 -2.014 -2.651 -3.383 -4.233 -5.203 -6.259 -7.545 -9.208 -11.032 -13.356 -16.197 -19.862 -24.564 -30.951 -39.752 -52.576 -66.265 -76.515 -84.552 -91.063 -96.571 -101.112 -104.995 -108.184 -111.251 -113.792 -116.003 -118.048 -119.87 -121.497 -122.957 -124.461 -125.775 -126.891 -128.007 -129.117 -130.036 -130.972 -131.925 -132.662 -133.399 -134.126 -134.862 -135.608 -136.11 -136.622 -137.42 -137.969 -138.536 -138.834 -139.435 -140.03 -140.638 -140.949 -141.68 -141.936 -142.283 -142.638 -143.363 -143.746 -144.154 -144.584 -145.064 -145.614 -146.262 -148.115 -4 ,11411 ,KEBNE ,17125796,Thu Dec 30 16:52:49 CET,Thu Dec 30 18:51:20 CET,0.0 0.571 0.752 0.899 1.043 1.154 1.204 1.24 1.328 1.359 1.402 1.221 1.483 1.486 1.484 1.476 1.45 1.43 1.37 1.292 1.198 1.145 1.072 0.94 0.815 0.687 0.549 0.405 0.208 -0.039 -0.321 -0.682 -1.058 -1.45 -1.943 -2.539 -3.162 -3.86 -4.648 -5.587 -6.681 -8.043 -9.818 -11.802 -14.331 -17.375 -21.281 -26.304 -32.914 -41.816 -54.962 -68.797 -79.004 -87.113 -93.582 -98.943 -103.465 -107.452 -110.755 -113.934 -116.585 -118.874 -120.953 -122.825 -124.498 -125.967 -127.479 -128.815 -129.973 -131.165 -132.388 -133.383 -134.348 -135.357 -136.146 -136.909 -137.685 -138.478 -139.266 -139.787 -140.325 -141.21 -141.827 -142.429 -142.723 -143.346 -144.011 -144.677 -145.006 -145.746 -146.011 -146.353 -146.698 -147.432 -147.824 -148.237 -148.69 -149.189 -149.738 -150.411 -152.153 -5 ,25454 ,KEBNE ,17125797,Thu Dec 30 16:52:49 CET,Thu Dec 30 18:52:41 CET,0.0 0.719 0.916 1.019 1.098 1.176 1.245 1.285 1.32 1.337 1.34 1.057 1.282 1.268 1.236 1.198 1.146 1.111 1.03 0.935 0.776 0.673 0.571 0.411 0.23 0.022 -0.178 -0.385 -0.68 -0.98 -1.275 -1.653 -2.073 -2.515 -3.05 -3.687 -4.337 -5.066 -5.885 -6.818 -7.877 -9.154 -10.774 -12.607 -14.945 -17.743 -21.431 -26.284 -32.724 -41.665 -54.9 -68.696 -78.933 -86.915 -93.285 -98.657 -103.093 -106.908 -110.082 -113.16 -115.721 -117.914 -119.932 -121.754 -123.407 -124.879 -126.368 -127.665 -128.77 -129.903 -131.048 -131.979 -132.915 -133.859 -134.585 -135.321 -136.066 -136.812 -137.574 -138.095 -138.613 -139.399 -139.935 -140.476 -140.751 -141.332 -141.952 -142.596 -142.915 -143.648 -143.932 -144.277 -144.618 -145.358 -145.74 -146.11 -146.488 -146.904 -147.429 -148.101 -149.822 -6 ,3064 ,KEBNE ,17125798,Thu Dec 30 16:52:49 CET,Thu Dec 30 18:51:14 CET,0.0 0.743 1.011 1.209 1.303 1.349 1.397 1.443 1.518 1.539 1.556 1.331 1.578 1.566 1.517 1.441 1.377 1.34 1.25 1.162 0.997 0.877 0.761 0.584 0.406 0.232 0.043 -0.164 -0.437 -0.71 -0.994 -1.374 -1.776 -2.177 -2.665 -3.282 -3.946 -4.722 -5.624 -6.676 -7.837 -9.199 -10.894 -12.781 -15.242 -18.223 -21.915 -26.636 -33.037 -41.678 -54.372 -67.881 -77.985 -85.957 -92.357 -97.702 -102.056 -105.754 -108.831 -111.87 -114.375 -116.476 -118.447 -120.263 -121.873 -123.287 -124.769 -126.127 -127.292 -128.455 -129.63 -130.604 -131.591 -132.545 -133.254 -133.983 -134.737 -135.496 -136.263 -136.776 -137.31 -138.125 -138.664 -139.21 -139.48 -140.056 -140.67 -141.295 -141.611 -142.344 -142.572 -142.923 -143.294 -144.046 -144.461 -144.892 -145.339 -145.852 -146.42 -147.124 -148.89 -7 ,14894 ,KEBNE ,17125799,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:50:21 CET,0.0 0.856 1.079 1.25 1.342 1.409 1.462 1.514 1.591 1.614 1.631 1.391 1.645 1.648 1.628 1.577 1.532 1.512 1.472 1.437 1.354 1.264 1.161 0.986 0.804 0.623 0.452 0.275 0.009 -0.295 -0.63 -1.058 -1.48 -1.881 -2.361 -2.968 -3.583 -4.317 -5.203 -6.239 -7.367 -8.699 -10.451 -12.369 -14.785 -17.736 -21.523 -26.315 -32.686 -41.413 -54.415 -68.276 -78.493 -86.478 -92.927 -98.336 -102.752 -106.501 -109.619 -112.662 -115.159 -117.289 -119.268 -121.083 -122.734 -124.247 -125.798 -127.116 -128.213 -129.32 -130.45 -131.367 -132.304 -133.266 -133.983 -134.693 -135.439 -136.205 -136.956 -137.464 -137.993 -138.797 -139.337 -139.886 -140.165 -140.724 -141.291 -141.879 -142.178 -142.895 -143.12 -143.466 -143.823 -144.573 -144.965 -145.359 -145.789 -146.295 -146.888 -147.628 -150.343 -8 ,653 ,KEBNE ,17125800,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:51:31 CET,0.0 0.575 0.732 0.848 0.948 1.023 1.107 1.183 1.278 1.319 1.36 1.144 1.397 1.387 1.348 1.302 1.235 1.206 1.135 1.046 0.937 0.861 0.764 0.597 0.402 0.205 0.02 -0.157 -0.383 -0.609 -0.849 -1.149 -1.446 -1.775 -2.191 -2.729 -3.317 -4.02 -4.827 -5.743 -6.815 -8.118 -9.761 -11.554 -13.825 -16.604 -20.127 -24.597 -30.568 -38.881 -51.405 -64.589 -74.266 -81.939 -88.074 -93.182 -97.457 -101.158 -104.256 -107.26 -109.758 -111.9 -113.855 -115.61 -117.177 -118.577 -120.008 -121.251 -122.289 -123.331 -124.39 -125.265 -126.166 -127.097 -127.803 -128.513 -129.228 -129.944 -130.669 -131.165 -131.674 -132.481 -133.048 -133.62 -133.905 -134.485 -135.076 -135.68 -135.984 -136.689 -136.919 -137.282 -137.64 -138.34 -138.73 -139.151 -139.59 -140.11 -140.691 -141.329 -143.463 -9 ,11764 ,KEBNE ,17125801,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:50:04 CET,0.0 1.389 1.775 2.004 2.127 2.212 2.29 2.344 2.455 2.519 2.55 2.29 2.549 2.555 2.542 2.518 2.491 2.476 2.435 2.391 2.313 2.244 2.17 2.039 1.886 1.723 1.56 1.399 1.154 0.851 0.523 0.106 -0.327 -0.764 -1.303 -1.957 -2.651 -3.48 -4.44 -5.502 -6.673 -8.111 -9.921 -11.861 -14.287 -17.242 -21.055 -25.911 -32.398 -41.369 -54.565 -68.466 -78.87 -86.983 -93.494 -98.953 -103.485 -107.389 -110.572 -113.617 -116.137 -118.322 -120.325 -122.143 -123.822 -125.313 -126.796 -128.095 -129.201 -130.313 -131.426 -132.322 -133.217 -134.109 -134.791 -135.489 -136.194 -136.921 -137.689 -138.209 -138.726 -139.51 -140.024 -140.532 -140.796 -141.339 -141.892 -142.462 -142.757 -143.478 -143.698 -144.022 -144.352 -145.01 -145.362 -145.769 -146.194 -146.643 -147.162 -147.78 -149.485 -10 ,32240 ,KEBNE ,17125802,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:51:17 CET,0.0 0.58 0.748 0.865 0.951 1.017 1.06 1.084 1.107 1.106 1.09 0.816 1.043 1.015 0.976 0.923 0.835 0.784 0.713 0.678 0.595 0.52 0.435 0.281 0.119 -0.06 -0.247 -0.421 -0.658 -0.912 -1.182 -1.549 -1.934 -2.335 -2.84 -3.443 -4.084 -4.854 -5.755 -6.754 -7.857 -9.209 -10.93 -12.798 -15.165 -18.1 -21.807 -26.438 -32.649 -41.277 -54.313 -68.13 -78.29 -86.368 -92.891 -98.425 -103.002 -106.889 -110.121 -113.216 -115.761 -117.929 -119.933 -121.782 -123.427 -124.895 -126.413 -127.761 -128.916 -130.062 -131.209 -132.143 -133.106 -134.094 -134.835 -135.568 -136.312 -137.07 -137.842 -138.374 -138.91 -139.698 -140.233 -140.784 -141.068 -141.644 -142.222 -142.855 -143.174 -143.899 -144.11 -144.45 -144.813 -145.58 -145.992 -146.419 -146.88 -147.372 -147.937 -148.636 -150.328 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index eea1fe0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,26091 ,TETRA ,17557917,Fri Nov 26 12:24:47 CET,Fri Nov 26 14:39:31 CET,0.0 0.244 0.415 0.561 0.702 0.84 0.977 1.122 1.412 1.54 1.657 1.64 2.0 2.111 2.337 2.545 2.76 2.861 3.065 3.299 3.63 3.821 4.011 4.3 4.584 4.877 5.183 5.484 5.87 6.255 6.633 7.074 7.511 7.939 8.45 9.03 9.552 10.116 10.726 11.375 12.081 12.856 13.734 14.701 15.828 16.997 18.316 19.84 21.618 23.427 24.909 25.334 25.03 24.367 23.565 22.729 21.881 21.001 20.176 19.358 18.653 17.966 17.313 16.698 16.098 15.573 15.037 14.522 14.046 13.562 13.059 12.627 12.213 11.788 11.45 11.099 10.719 10.327 9.927 9.654 9.359 8.873 8.504 8.108 7.92 7.54 7.133 6.719 6.49 5.989 5.697 5.393 5.079 4.358 3.932 3.53 3.099 2.542 1.832 0.748 -9.593 -3 ,4367 ,TETRA ,17557918,Fri Nov 26 12:24:44 CET,Fri Nov 26 14:20:21 CET,0.0 0.789 1.042 1.229 1.392 1.544 1.701 1.857 2.136 2.268 2.409 2.438 2.811 2.938 3.189 3.433 3.681 3.797 4.022 4.243 4.533 4.718 4.905 5.178 5.458 5.75 6.048 6.343 6.727 7.104 7.448 7.819 8.178 8.548 9.035 9.604 10.149 10.816 11.59 12.389 13.191 14.139 15.28 16.379 17.662 19.078 20.641 22.384 24.166 25.883 27.38 27.41 26.616 25.69 24.708 23.763 22.874 21.956 21.125 20.294 19.558 18.913 18.324 17.78 17.256 16.745 16.182 15.669 15.226 14.759 14.257 13.821 13.378 12.888 12.492 12.092 11.69 11.306 10.909 10.612 10.293 9.75 9.343 8.969 8.784 8.38 7.971 7.506 7.26 6.752 6.395 6.068 5.742 4.991 4.494 4.019 3.606 3.069 2.357 1.291 -9.027 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 113bdfe5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,20482 ,TETRA ,17557929,Fri Nov 26 12:33:28 CET,Fri Nov 26 14:52:12 CET,0.0 0.393 0.781 1.125 1.445 1.761 2.058 2.358 2.965 3.25 3.526 3.671 4.357 4.627 5.155 5.694 6.229 6.492 7.017 7.545 8.335 8.854 9.37 10.136 10.908 11.673 12.401 13.098 14.031 15.005 15.983 17.187 18.372 19.534 20.917 22.523 24.134 25.966 28.008 30.223 32.621 35.465 38.903 42.495 46.896 52.045 58.249 65.536 74.576 85.767 100.446 113.692 121.873 127.624 131.935 135.112 137.468 139.472 141.047 142.476 143.576 144.479 145.284 145.933 146.428 146.804 147.149 147.432 147.645 147.806 147.93 148.041 148.147 148.184 148.195 148.197 148.153 148.114 148.111 148.091 148.036 147.921 147.829 147.704 147.642 147.553 147.451 147.333 147.241 146.876 146.812 146.629 146.426 145.981 145.727 145.447 145.11 144.684 144.038 143.077 131.818 -6 ,10476 ,TETRA ,17557931,Fri Nov 26 12:33:30 CET,Fri Nov 26 14:50:14 CET,0.0 0.42 0.827 1.201 1.535 1.863 2.195 2.528 3.163 3.475 3.781 3.954 4.656 4.944 5.527 6.106 6.675 6.956 7.528 8.083 8.895 9.441 9.983 10.797 11.603 12.404 13.197 13.984 15.056 16.115 17.15 18.44 19.727 20.997 22.497 24.22 25.902 27.79 29.868 32.119 34.562 37.42 40.895 44.507 48.817 53.701 59.485 66.407 75.08 86.124 100.785 114.182 123.104 129.657 134.509 138.205 140.98 143.224 145.023 146.644 147.877 148.834 149.601 150.231 150.756 151.209 151.649 151.998 152.274 152.527 152.747 152.906 153.065 153.225 153.319 153.384 153.459 153.541 153.601 153.619 153.632 153.63 153.614 153.546 153.492 153.331 153.125 152.932 152.834 152.493 152.426 152.24 152.075 151.737 151.543 151.296 151.008 150.629 150.027 149.003 141.056 -10 ,2670 ,TETRA ,17557935,Fri Nov 26 12:33:34 CET,Fri Nov 26 14:50:02 CET,0.0 0.488 0.814 1.145 1.476 1.779 2.071 2.373 2.979 3.28 3.587 3.78 4.503 4.803 5.376 5.909 6.427 6.685 7.193 7.711 8.505 9.022 9.524 10.278 11.04 11.788 12.528 13.282 14.282 15.252 16.213 17.422 18.632 19.82 21.219 22.846 24.468 26.294 28.349 30.631 33.074 35.901 39.384 43.084 47.628 52.855 59.022 66.469 75.898 87.744 103.203 116.945 125.591 131.62 136.002 139.335 141.856 143.953 145.698 147.305 148.491 149.437 150.221 150.832 151.386 151.892 152.38 152.754 153.024 153.26 153.445 153.573 153.728 153.883 153.966 154.009 154.028 154.048 154.057 154.065 154.057 153.991 153.955 153.912 153.88 153.805 153.673 153.492 153.394 153.059 153.071 152.925 152.727 152.221 151.971 151.672 151.203 150.626 149.933 148.863 143.826 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index b1a9cb25..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23484 ,TETRA ,17557936,Fri Nov 26 12:33:29 CET,Fri Nov 26 14:53:41 CET,0.0 0.774 1.256 1.709 2.161 2.593 3.009 3.416 4.169 4.542 4.904 5.196 5.949 6.29 6.969 7.621 8.266 8.592 9.239 9.885 10.826 11.424 12.015 12.922 13.821 14.686 15.545 16.409 17.577 18.729 19.861 21.272 22.678 24.064 25.701 27.591 29.453 31.564 33.934 36.524 39.34 42.639 46.628 50.795 55.758 61.456 68.332 76.452 86.476 99.295 116.738 133.016 143.964 151.841 157.65 162.174 165.59 168.271 170.373 172.308 173.828 175.069 176.202 177.243 178.164 178.913 179.655 180.331 180.887 181.39 181.82 182.082 182.326 182.601 182.783 182.94 183.069 183.181 183.302 183.369 183.375 183.316 183.299 183.313 183.309 183.3 183.274 183.211 183.169 182.919 182.978 182.899 182.832 182.683 182.575 182.428 182.296 182.055 181.561 180.624 175.013 -2 ,30564 ,TETRA ,17557937,Fri Nov 26 12:33:31 CET,Fri Nov 26 14:53:08 CET,0.0 1.142 1.799 2.372 2.859 3.324 3.745 4.127 4.875 5.238 5.589 5.873 6.636 6.983 7.651 8.322 9.004 9.336 9.983 10.629 11.599 12.233 12.856 13.797 14.717 15.611 16.511 17.409 18.576 19.734 20.886 22.32 23.782 25.24 26.942 28.921 30.858 33.028 35.455 38.134 41.068 44.425 48.471 52.588 57.41 63.051 69.854 78.028 88.252 101.001 118.325 134.765 145.591 153.422 159.128 163.458 166.803 169.49 171.582 173.479 174.971 176.195 177.295 178.25 179.078 179.789 180.441 180.95 181.364 181.767 182.162 182.476 182.762 183.007 183.171 183.302 183.382 183.452 183.526 183.583 183.651 183.74 183.797 183.849 183.855 183.854 183.844 183.813 183.791 183.552 183.618 183.527 183.415 183.156 182.994 182.769 182.477 182.164 181.732 181.005 176.314 -4 ,18194 ,TETRA ,17557939,Fri Nov 26 12:33:29 CET,Fri Nov 26 15:02:59 CET,0.0 1.307 1.905 2.464 2.954 3.399 3.819 4.247 5.125 5.528 5.894 6.216 7.009 7.378 8.108 8.842 9.536 9.867 10.52 11.143 12.06 12.687 13.32 14.256 15.166 16.057 16.959 17.865 19.04 20.199 21.354 22.779 24.193 25.606 27.3 29.223 31.101 33.255 35.676 38.331 41.214 44.556 48.596 52.834 57.972 63.957 71.248 79.973 90.824 104.311 122.086 138.436 149.01 156.526 162.122 166.435 169.727 172.43 174.546 176.522 178.091 179.353 180.478 181.46 182.276 182.947 183.597 184.082 184.478 184.922 185.351 185.682 185.989 186.279 186.497 186.72 186.909 187.037 187.146 187.213 187.283 187.364 187.369 187.38 187.398 187.405 187.367 187.249 187.149 186.849 186.821 186.671 186.51 186.128 185.944 185.723 185.434 185.008 184.348 183.352 177.355 -5 ,5379 ,TETRA ,17557940,Fri Nov 26 12:33:31 CET,Fri Nov 26 14:52:52 CET,0.0 1.916 2.507 3.01 3.476 3.895 4.302 4.683 5.41 5.783 6.171 6.511 7.302 7.663 8.362 9.023 9.672 10.008 10.683 11.346 12.313 12.937 13.557 14.483 15.414 16.336 17.246 18.156 19.385 20.599 21.77 23.219 24.655 26.078 27.768 29.688 31.593 33.756 36.13 38.74 41.605 44.937 48.997 53.235 58.45 64.579 71.948 80.749 91.656 105.532 124.029 141.187 152.602 160.65 166.407 170.82 174.163 176.903 179.109 181.111 182.698 183.998 185.123 186.07 186.903 187.653 188.412 189.01 189.437 189.829 190.182 190.459 190.735 190.978 191.133 191.272 191.393 191.484 191.563 191.625 191.659 191.631 191.594 191.566 191.549 191.487 191.417 191.317 191.257 191.019 191.094 190.978 190.848 190.57 190.38 190.147 189.885 189.512 189.019 188.21 181.055 -6 ,5678 ,TETRA ,17557941,Fri Nov 26 12:33:31 CET,Fri Nov 26 14:57:51 CET,0.0 0.934 1.442 1.986 2.504 2.947 3.349 3.733 4.508 4.878 5.242 5.553 6.326 6.688 7.428 8.138 8.797 9.12 9.794 10.469 11.449 12.092 12.723 13.661 14.556 15.436 16.332 17.213 18.375 19.543 20.707 22.14 23.543 24.925 26.566 28.435 30.286 32.428 34.816 37.467 40.361 43.64 47.55 51.627 56.557 62.331 69.312 77.443 87.441 100.332 117.529 133.564 144.096 151.649 157.24 161.637 165.035 167.767 169.885 171.768 173.25 174.465 175.527 176.449 177.286 177.978 178.597 179.114 179.532 179.932 180.355 180.691 180.992 181.291 181.493 181.658 181.843 182.012 182.139 182.217 182.273 182.347 182.384 182.4 182.415 182.419 182.355 182.286 182.246 182.005 182.124 182.07 181.981 181.689 181.531 181.356 181.036 180.556 180.006 179.194 175.245 -7 ,6337 ,TETRA ,17557942,Fri Nov 26 12:33:33 CET,Fri Nov 26 14:55:51 CET,0.0 0.882 1.429 1.921 2.379 2.809 3.245 3.661 4.438 4.83 5.213 5.527 6.281 6.618 7.275 7.938 8.608 8.943 9.619 10.284 11.242 11.872 12.5 13.437 14.364 15.28 16.2 17.118 18.32 19.485 20.619 22.036 23.454 24.874 26.562 28.518 30.46 32.605 34.964 37.574 40.409 43.708 47.702 51.908 57.073 63.145 70.521 79.257 89.994 103.543 121.492 137.527 147.882 155.371 160.898 165.179 168.547 171.33 173.49 175.448 176.974 178.227 179.327 180.276 181.098 181.8 182.478 183.043 183.526 184.009 184.482 184.84 185.187 185.519 185.73 185.894 186.038 186.182 186.302 186.361 186.392 186.419 186.458 186.489 186.49 186.45 186.377 186.32 186.28 186.019 186.034 185.928 185.819 185.536 185.372 185.186 184.937 184.671 184.282 183.73 178.042 -8 ,6538 ,TETRA ,17557943,Fri Nov 26 12:33:31 CET,Fri Nov 26 14:58:05 CET,0.0 1.694 2.478 3.055 3.547 3.968 4.365 4.767 5.543 5.909 6.273 6.597 7.381 7.753 8.47 9.153 9.841 10.175 10.83 11.482 12.441 13.083 13.732 14.689 15.612 16.52 17.449 18.367 19.572 20.783 21.982 23.471 24.943 26.398 28.141 30.134 32.088 34.291 36.749 39.455 42.348 45.672 49.665 53.746 58.642 64.354 71.289 79.594 89.802 102.936 121.182 138.397 149.913 158.201 164.34 169.081 172.686 175.571 177.753 179.654 181.166 182.445 183.57 184.569 185.452 186.166 186.782 187.273 187.681 188.074 188.46 188.765 189.057 189.337 189.546 189.755 189.941 190.083 190.201 190.286 190.356 190.406 190.432 190.464 190.469 190.473 190.46 190.38 190.32 190.046 190.066 189.948 189.83 189.582 189.391 189.113 188.808 188.469 188.001 187.281 183.045 -9 ,29556 ,TETRA ,17557944,Fri Nov 26 12:33:33 CET,Fri Nov 26 14:53:57 CET,0.0 2.304 3.034 3.552 4.039 4.509 4.954 5.385 6.202 6.594 6.976 7.285 8.054 8.4 9.093 9.783 10.448 10.775 11.418 12.059 12.993 13.607 14.235 15.159 16.065 16.964 17.852 18.743 19.923 21.064 22.184 23.592 25.007 26.417 28.073 29.98 31.878 33.993 36.331 38.904 41.717 45.033 49.088 53.301 58.216 63.859 70.938 79.601 90.21 103.483 121.538 138.52 149.722 157.715 163.654 168.407 172.129 175.105 177.439 179.566 181.185 182.436 183.463 184.323 185.06 185.695 186.346 186.921 187.368 187.766 188.138 188.421 188.688 188.944 189.118 189.274 189.444 189.601 189.739 189.824 189.895 189.971 189.986 189.976 189.975 189.968 189.945 189.902 189.868 189.618 189.663 189.58 189.487 189.224 189.058 188.902 188.681 188.353 187.977 187.371 184.047 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 338b43a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1072 ,KEBNE ,17125803,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:53:59 CET,0.0 0.864 1.09 1.268 1.455 1.621 1.762 1.889 2.118 2.22 2.311 2.106 2.564 2.641 2.801 2.979 3.16 3.241 3.39 3.541 3.746 3.885 4.021 4.194 4.36 4.526 4.696 4.848 5.022 5.164 5.293 5.484 5.656 5.77 5.887 6.008 6.108 6.205 6.285 6.352 6.41 6.458 6.479 6.467 6.416 6.294 5.904 5.153 4.054 2.452 -0.093 -3.404 -6.432 -9.185 -11.443 -13.274 -14.932 -16.539 -17.934 -19.247 -20.355 -21.304 -22.166 -23.017 -23.831 -24.554 -25.296 -26.01 -26.624 -27.199 -27.77 -28.247 -28.75 -29.289 -29.737 -30.183 -30.617 -31.071 -31.561 -31.896 -32.225 -32.757 -33.117 -33.472 -33.66 -34.073 -34.491 -34.984 -35.261 -35.957 -36.103 -36.402 -36.72 -37.465 -37.91 -38.345 -38.803 -39.33 -39.948 -40.791 -43.209 -2 ,30377 ,KEBNE ,17125804,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:53:27 CET,0.0 0.755 1.056 1.287 1.466 1.612 1.741 1.867 2.106 2.22 2.318 2.102 2.566 2.642 2.787 2.913 3.026 3.087 3.202 3.317 3.488 3.608 3.737 3.931 4.122 4.316 4.479 4.588 4.724 4.843 4.934 5.034 5.126 5.221 5.333 5.445 5.527 5.596 5.69 5.761 5.795 5.835 5.833 5.796 5.678 5.444 5.063 4.45 3.502 1.832 -1.254 -4.94 -7.906 -10.546 -12.94 -15.015 -16.702 -18.19 -19.58 -21.036 -22.228 -23.253 -24.259 -25.179 -25.995 -26.732 -27.504 -28.237 -28.85 -29.455 -30.09 -30.628 -31.171 -31.737 -32.202 -32.673 -33.168 -33.704 -34.249 -34.612 -34.973 -35.523 -35.903 -36.295 -36.497 -36.912 -37.324 -37.752 -37.978 -38.633 -38.747 -39.022 -39.298 -39.944 -40.305 -40.698 -41.13 -41.581 -42.114 -42.793 -46.135 -3 ,7564 ,KEBNE ,17125805,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:53:26 CET,0.0 0.606 0.806 0.996 1.166 1.303 1.445 1.578 1.752 1.838 1.929 1.689 2.135 2.221 2.395 2.553 2.692 2.75 2.865 2.97 3.094 3.176 3.255 3.365 3.469 3.558 3.64 3.722 3.824 3.923 4.013 4.117 4.219 4.307 4.393 4.491 4.611 4.705 4.736 4.797 4.902 5.023 5.13 5.122 5.001 4.739 4.302 3.63 2.507 0.709 -2.4 -6.273 -9.353 -11.862 -14.055 -15.969 -17.617 -19.135 -20.471 -21.822 -22.991 -24.023 -24.96 -25.83 -26.608 -27.277 -27.966 -28.599 -29.167 -29.773 -30.386 -30.865 -31.368 -31.889 -32.287 -32.708 -33.137 -33.571 -34.029 -34.381 -34.746 -35.274 -35.643 -36.033 -36.241 -36.653 -37.064 -37.542 -37.797 -38.447 -38.568 -38.889 -39.232 -39.937 -40.326 -40.773 -41.265 -41.798 -42.473 -43.332 -45.85 -4 ,8184 ,KEBNE ,17125806,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:54:21 CET,0.0 0.724 0.976 1.201 1.429 1.658 1.838 1.981 2.248 2.367 2.468 2.243 2.7 2.77 2.904 3.031 3.147 3.2 3.296 3.378 3.511 3.606 3.696 3.821 3.939 4.061 4.17 4.27 4.412 4.536 4.649 4.791 4.943 5.074 5.181 5.292 5.382 5.45 5.512 5.557 5.594 5.607 5.563 5.487 5.293 4.942 4.436 3.695 2.521 0.557 -2.961 -7.09 -10.557 -13.442 -15.777 -17.8 -19.49 -21.088 -22.522 -23.938 -25.191 -26.293 -27.311 -28.291 -29.2 -30.016 -30.833 -31.538 -32.16 -32.805 -33.46 -34.02 -34.603 -35.227 -35.705 -36.166 -36.627 -37.096 -37.593 -37.93 -38.257 -38.759 -39.122 -39.494 -39.675 -40.043 -40.432 -40.833 -41.039 -41.705 -41.865 -42.159 -42.477 -43.109 -43.471 -43.92 -44.408 -44.917 -45.471 -46.189 -48.967 -5 ,13034 ,KEBNE ,17125807,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:52:41 CET,0.0 0.929 1.309 1.595 1.8 1.992 2.168 2.301 2.52 2.634 2.741 2.534 2.98 3.055 3.205 3.344 3.474 3.544 3.675 3.796 3.967 4.077 4.18 4.319 4.448 4.596 4.74 4.863 5.021 5.172 5.319 5.474 5.585 5.699 5.83 5.957 6.059 6.127 6.171 6.208 6.229 6.235 6.236 6.175 6.017 5.741 5.301 4.685 3.686 2.173 -0.515 -4.207 -7.559 -10.271 -12.388 -14.291 -15.963 -17.541 -19.015 -20.485 -21.709 -22.84 -23.918 -24.846 -25.681 -26.475 -27.316 -28.073 -28.727 -29.383 -30.061 -30.632 -31.2 -31.78 -32.24 -32.709 -33.185 -33.665 -34.166 -34.543 -34.924 -35.466 -35.839 -36.216 -36.4 -36.802 -37.252 -37.729 -37.973 -38.638 -38.761 -39.068 -39.399 -40.109 -40.473 -40.869 -41.318 -41.78 -42.314 -43.02 -45.979 -6 ,26134 ,KEBNE ,17125808,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:54:37 CET,0.0 0.827 1.08 1.261 1.444 1.604 1.732 1.851 2.084 2.189 2.283 2.079 2.532 2.621 2.812 2.977 3.133 3.224 3.419 3.607 3.804 3.895 3.981 4.083 4.177 4.264 4.358 4.443 4.554 4.66 4.76 4.877 4.96 5.02 5.093 5.176 5.237 5.32 5.4 5.466 5.522 5.531 5.507 5.399 5.185 4.924 4.498 3.806 2.706 0.907 -2.342 -6.271 -9.49 -12.202 -14.45 -16.365 -18.01 -19.502 -20.788 -22.094 -23.298 -24.433 -25.509 -26.488 -27.384 -28.197 -29.038 -29.765 -30.39 -31.046 -31.731 -32.308 -32.894 -33.502 -33.984 -34.461 -34.944 -35.453 -35.979 -36.353 -36.733 -37.287 -37.67 -38.075 -38.285 -38.714 -39.127 -39.53 -39.744 -40.415 -40.608 -40.915 -41.202 -41.806 -42.138 -42.487 -42.854 -43.278 -43.763 -44.362 -46.912 -7 ,18984 ,KEBNE ,17125809,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:54:51 CET,0.0 0.488 0.716 0.917 1.081 1.218 1.342 1.464 1.695 1.794 1.872 1.636 2.107 2.191 2.368 2.563 2.718 2.778 2.906 3.022 3.201 3.325 3.429 3.566 3.694 3.798 3.894 3.987 4.094 4.209 4.34 4.495 4.642 4.78 4.93 5.076 5.184 5.283 5.372 5.477 5.61 5.762 5.878 5.894 5.848 5.732 5.359 4.652 3.481 1.555 -1.614 -5.544 -8.791 -11.535 -14.088 -16.351 -18.289 -20.065 -21.575 -23.04 -24.25 -25.302 -26.329 -27.332 -28.236 -29.045 -29.873 -30.613 -31.245 -31.875 -32.526 -33.079 -33.656 -34.209 -34.62 -35.05 -35.495 -35.962 -36.449 -36.77 -37.087 -37.601 -37.963 -38.319 -38.499 -38.88 -39.283 -39.72 -39.941 -40.577 -40.665 -40.914 -41.149 -41.681 -41.962 -42.28 -42.658 -43.067 -43.517 -44.138 -46.498 -8 ,8685 ,KEBNE ,17125810,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:54:18 CET,0.0 0.856 1.112 1.279 1.45 1.617 1.752 1.879 2.14 2.251 2.353 2.149 2.617 2.705 2.854 3.003 3.151 3.209 3.3 3.388 3.538 3.636 3.733 3.859 3.968 4.077 4.17 4.262 4.391 4.512 4.625 4.743 4.846 4.955 5.087 5.246 5.401 5.564 5.695 5.798 5.889 5.959 6.019 6.054 6.037 5.865 5.522 4.971 4.034 2.596 0.052 -3.133 -5.952 -8.526 -10.828 -13.158 -15.334 -17.322 -19.008 -20.582 -21.863 -22.985 -24.046 -25.066 -25.961 -26.705 -27.482 -28.17 -28.77 -29.397 -30.037 -30.562 -31.111 -31.675 -32.104 -32.552 -33.013 -33.48 -33.961 -34.306 -34.665 -35.204 -35.577 -35.971 -36.171 -36.575 -36.989 -37.416 -37.648 -38.315 -38.399 -38.654 -38.923 -39.523 -39.85 -40.19 -40.558 -41.039 -41.648 -42.419 -44.986 -9 ,22117 ,KEBNE ,17125811,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:54:12 CET,0.0 0.748 0.991 1.165 1.335 1.506 1.667 1.809 2.046 2.146 2.236 2.046 2.502 2.575 2.737 2.893 3.038 3.106 3.232 3.339 3.467 3.544 3.619 3.728 3.822 3.889 3.955 4.038 4.156 4.242 4.305 4.388 4.478 4.578 4.672 4.741 4.801 4.868 4.899 4.898 4.933 4.958 4.898 4.776 4.579 4.311 3.893 3.195 2.029 0.25 -2.938 -6.878 -10.02 -12.689 -15.043 -17.131 -18.905 -20.474 -21.846 -23.279 -24.473 -25.505 -26.516 -27.476 -28.359 -29.122 -29.895 -30.603 -31.23 -31.849 -32.464 -32.975 -33.518 -34.089 -34.53 -34.977 -35.42 -35.86 -36.31 -36.616 -36.938 -37.463 -37.827 -38.212 -38.412 -38.823 -39.253 -39.704 -39.943 -40.628 -40.844 -41.183 -41.508 -42.187 -42.576 -42.99 -43.429 -43.932 -44.535 -45.33 -48.591 -10 ,20334 ,KEBNE ,17125812,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:54:21 CET,0.0 1.163 1.577 1.813 2.015 2.184 2.328 2.451 2.656 2.749 2.827 2.615 3.082 3.156 3.288 3.411 3.529 3.579 3.683 3.785 3.922 4.005 4.084 4.217 4.336 4.428 4.523 4.616 4.723 4.851 4.975 5.093 5.206 5.281 5.347 5.459 5.573 5.683 5.781 5.855 5.91 5.923 5.909 5.887 5.739 5.441 5.016 4.329 3.209 1.508 -1.501 -5.376 -8.482 -11.023 -13.185 -15.053 -16.661 -18.224 -19.725 -21.28 -22.571 -23.682 -24.723 -25.681 -26.592 -27.42 -28.237 -28.967 -29.63 -30.33 -31.021 -31.568 -32.132 -32.718 -33.148 -33.578 -34.035 -34.509 -34.985 -35.321 -35.659 -36.164 -36.523 -36.898 -37.1 -37.56 -38.067 -38.556 -38.792 -39.461 -39.588 -39.863 -40.129 -40.74 -41.153 -41.635 -42.15 -42.724 -43.274 -43.862 -45.982 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index c6d2d858..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25886 ,KEBNE ,17125813,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:48:32 CET,0.0 0.284 0.54 0.792 1.047 1.307 1.573 2.117 2.386 2.658 2.805 3.442 3.698 4.204 4.695 5.184 5.421 5.904 6.404 7.12 7.575 8.029 8.697 9.343 9.981 10.625 11.287 12.166 13.033 13.88 14.912 15.926 16.924 18.096 19.472 20.844 22.363 24.063 25.949 27.965 30.298 33.104 36.031 39.65 43.832 48.698 54.253 61.114 69.698 80.753 90.546 96.543 100.493 103.244 105.165 106.388 107.185 107.626 107.94 108.12 108.153 108.155 108.17 108.132 108.041 107.925 107.761 107.599 107.443 107.224 107.004 106.773 106.572 106.413 106.179 105.959 105.775 105.485 105.284 105.118 104.797 104.551 104.293 104.159 103.864 103.525 103.128 102.887 102.373 102.039 101.745 101.413 100.651 100.227 99.79 99.257 98.55 97.67 96.377 -2 ,27854 ,KEBNE ,17125814,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:48:01 CET,0.0 0.337 0.629 0.919 1.214 1.494 1.761 2.275 2.52 2.763 2.886 3.509 3.748 4.234 4.717 5.188 5.423 5.897 6.373 7.071 7.526 7.989 8.668 9.314 9.95 10.578 11.215 12.063 12.891 13.735 14.817 15.865 16.867 18.05 19.427 20.815 22.386 24.091 25.885 27.807 30.082 32.879 35.826 39.368 43.421 48.306 54.024 61.057 69.869 81.093 91.432 98.022 102.372 105.437 107.707 109.383 110.668 111.62 112.369 112.857 113.186 113.437 113.6 113.706 113.768 113.832 113.932 113.978 113.927 113.794 113.698 113.598 113.476 113.406 113.302 113.15 112.988 112.811 112.664 112.497 112.254 112.09 111.877 111.767 111.557 111.26 110.875 110.659 110.186 109.905 109.595 109.199 108.418 108.048 107.633 107.109 106.485 105.774 104.527 -3 ,21633 ,KEBNE ,17125815,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:49:20 CET,0.0 0.352 0.652 0.948 1.249 1.537 1.812 2.368 2.638 2.904 3.033 3.675 3.934 4.456 4.975 5.475 5.722 6.202 6.678 7.377 7.832 8.285 8.971 9.643 10.314 10.994 11.66 12.534 13.394 14.224 15.238 16.252 17.284 18.541 20.017 21.444 22.975 24.666 26.521 28.526 30.917 33.825 36.771 40.36 44.505 49.329 55.158 62.523 71.629 82.992 92.872 98.899 102.776 105.359 107.125 108.358 109.3 109.966 110.488 110.84 111.115 111.343 111.472 111.534 111.548 111.444 111.341 111.277 111.186 111.05 110.873 110.678 110.493 110.312 110.103 109.876 109.63 109.368 109.192 109.017 108.7 108.482 108.248 108.106 107.797 107.446 107.011 106.773 106.293 105.96 105.64 105.345 104.575 104.06 103.541 102.955 102.227 101.297 100.028 -4 ,22047 ,KEBNE ,17125816,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:47:43 CET,0.0 0.334 0.663 0.975 1.26 1.532 1.803 2.36 2.631 2.889 3.028 3.668 3.92 4.428 4.929 5.428 5.678 6.162 6.641 7.38 7.864 8.347 9.066 9.765 10.467 11.17 11.863 12.779 13.657 14.492 15.53 16.592 17.673 18.943 20.37 21.75 23.277 25.013 26.943 29.032 31.483 34.369 37.323 40.913 45.085 49.998 55.688 62.679 71.405 82.509 92.261 98.425 102.559 105.235 107.066 108.405 109.317 109.919 110.386 110.726 111.001 111.166 111.248 111.294 111.291 111.176 111.007 110.844 110.662 110.439 110.217 109.976 109.674 109.431 109.182 108.886 108.588 108.3 108.071 107.771 107.253 106.923 106.584 106.398 106.009 105.593 105.126 104.88 104.428 104.249 104.016 103.759 103.064 102.649 102.119 101.411 100.644 99.715 98.107 -5 ,22296 ,KEBNE ,17125817,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:48:53 CET,0.0 0.314 0.638 0.939 1.218 1.5 1.77 2.27 2.531 2.804 2.945 3.58 3.836 4.331 4.822 5.313 5.549 5.989 6.422 7.079 7.509 7.926 8.554 9.198 9.824 10.437 11.068 11.911 12.741 13.567 14.594 15.608 16.602 17.768 19.132 20.488 22.022 23.711 25.527 27.515 29.872 32.698 35.617 39.186 43.269 48.226 54.139 61.334 70.149 80.971 90.532 96.628 100.723 103.594 105.687 107.193 108.292 109.067 109.691 110.095 110.426 110.752 110.978 111.067 111.095 111.098 111.064 110.996 110.853 110.645 110.488 110.35 110.179 110.045 109.899 109.704 109.462 109.169 108.966 108.756 108.415 108.141 107.847 107.691 107.339 106.943 106.464 106.231 105.776 105.497 105.166 104.786 103.973 103.494 102.903 102.251 101.572 100.748 99.522 -6 ,6332 ,KEBNE ,17125818,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:49:34 CET,0.0 0.299 0.623 0.93 1.212 1.48 1.755 2.324 2.593 2.86 3.006 3.636 3.882 4.389 4.901 5.406 5.652 6.136 6.626 7.362 7.846 8.319 9.016 9.715 10.407 11.094 11.787 12.696 13.6 14.497 15.587 16.652 17.707 18.935 20.336 21.723 23.322 25.133 27.143 29.328 31.841 34.79 37.728 41.27 45.474 50.658 56.798 64.353 73.385 84.705 94.419 100.391 104.494 107.256 109.293 110.82 112.027 112.883 113.531 113.911 114.201 114.449 114.583 114.706 114.812 114.856 114.855 114.828 114.78 114.69 114.6 114.508 114.402 114.294 114.178 114.055 113.916 113.748 113.612 113.455 113.191 112.987 112.771 112.664 112.398 112.09 111.779 111.607 111.171 110.977 110.707 110.372 109.641 109.223 108.692 108.107 107.443 106.651 105.599 -7 ,18401 ,KEBNE ,17125819,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:48:28 CET,0.0 0.286 0.573 0.857 1.112 1.348 1.595 2.097 2.349 2.605 2.727 3.355 3.602 4.091 4.565 5.022 5.26 5.737 6.19 6.856 7.293 7.726 8.377 9.04 9.704 10.369 11.024 11.885 12.726 13.557 14.62 15.665 16.691 17.916 19.345 20.768 22.339 24.058 25.979 28.051 30.386 33.232 36.242 39.896 44.149 49.076 54.817 61.976 70.77 82.016 91.766 97.605 101.385 103.912 105.647 106.859 107.724 108.339 108.884 109.224 109.432 109.614 109.719 109.762 109.793 109.799 109.773 109.71 109.619 109.527 109.433 109.321 109.203 109.09 108.975 108.819 108.603 108.365 108.201 108.045 107.813 107.603 107.335 107.202 106.94 106.632 106.241 106.031 105.594 105.358 105.102 104.813 104.074 103.692 103.28 102.767 102.226 101.662 100.591 -8 ,7591 ,KEBNE ,17125820,Thu Dec 30 16:52:55 CET,Thu Dec 30 18:48:55 CET,0.0 0.314 0.603 0.875 1.159 1.428 1.673 2.146 2.388 2.637 2.762 3.379 3.617 4.086 4.548 5.011 5.241 5.685 6.131 6.804 7.244 7.675 8.31 8.952 9.607 10.255 10.894 11.73 12.553 13.371 14.368 15.337 16.294 17.41 18.686 19.957 21.42 23.073 24.892 26.883 29.249 32.095 35.01 38.536 42.668 47.705 53.604 60.913 69.904 81.298 91.397 97.621 101.978 105.133 107.38 109.026 110.309 111.156 111.777 112.224 112.566 112.849 113.052 113.189 113.283 113.373 113.447 113.489 113.515 113.468 113.387 113.314 113.219 113.158 113.06 112.872 112.63 112.349 112.126 111.873 111.471 111.206 110.911 110.753 110.407 109.99 109.601 109.402 108.907 108.587 108.303 108.004 107.354 106.967 106.536 106.002 105.276 104.398 103.002 -9 ,51 ,KEBNE ,17125821,Thu Dec 30 16:52:55 CET,Thu Dec 30 18:49:30 CET,0.0 0.341 0.66 0.974 1.278 1.576 1.879 2.47 2.747 3.015 3.171 3.803 4.041 4.512 4.975 5.435 5.665 6.125 6.596 7.3 7.755 8.203 8.859 9.538 10.235 10.916 11.599 12.501 13.377 14.242 15.313 16.371 17.427 18.687 20.119 21.496 23.024 24.715 26.55 28.538 30.873 33.653 36.569 40.131 44.152 48.932 54.604 61.616 70.409 81.803 92.061 98.195 102.22 105.11 107.151 108.611 109.663 110.372 110.928 111.257 111.422 111.518 111.583 111.588 111.576 111.515 111.424 111.323 111.198 111.096 111.007 110.91 110.799 110.696 110.576 110.439 110.309 110.169 110.039 109.866 109.578 109.403 109.19 109.06 108.792 108.443 108.009 107.788 107.309 106.985 106.689 106.393 105.679 105.261 104.793 104.224 103.569 102.635 101.165 -10 ,20184 ,KEBNE ,17125822,Thu Dec 30 16:52:55 CET,Thu Dec 30 18:48:18 CET,0.0 0.369 0.714 1.025 1.311 1.595 1.885 2.444 2.712 2.974 3.101 3.733 3.984 4.494 4.984 5.468 5.713 6.188 6.652 7.339 7.8 8.253 8.921 9.604 10.285 10.952 11.609 12.471 13.323 14.151 15.172 16.199 17.219 18.413 19.769 21.125 22.66 24.341 26.162 28.133 30.429 33.223 36.149 39.643 43.7 48.59 54.391 61.52 70.25 81.294 90.72 96.375 100.105 102.666 104.59 106.024 107.075 107.755 108.303 108.701 108.892 108.937 108.935 108.957 108.958 108.902 108.858 108.807 108.732 108.607 108.479 108.381 108.292 108.221 108.125 108.017 107.873 107.7 107.552 107.382 107.092 106.853 106.603 106.468 106.205 105.908 105.573 105.4 104.977 104.781 104.533 104.302 103.734 103.398 102.977 102.311 101.498 100.511 98.972 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 6015f861..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12074 ,TETRA ,17557946,Fri Nov 26 12:35:26 CET,Fri Nov 26 15:06:06 CET,0.0 0.117 0.22 0.316 0.403 0.494 0.585 0.664 0.806 0.873 0.938 0.902 1.157 1.21 1.318 1.404 1.473 1.507 1.574 1.642 1.749 1.813 1.876 1.982 2.082 2.167 2.234 2.293 2.37 2.444 2.513 2.592 2.671 2.744 2.833 2.941 3.038 3.147 3.244 3.317 3.4 3.496 3.595 3.663 3.702 3.761 3.746 3.524 2.974 1.799 -0.297 -3.108 -5.661 -7.945 -9.89 -11.587 -13.134 -14.614 -15.916 -17.288 -18.493 -19.536 -20.534 -21.434 -22.285 -23.088 -23.936 -24.713 -25.356 -26.016 -26.734 -27.361 -27.983 -28.619 -29.141 -29.647 -30.144 -30.664 -31.231 -31.621 -32.028 -32.672 -33.119 -33.651 -33.969 -34.577 -35.139 -35.773 -36.121 -36.732 -37.274 -37.678 -38.109 -39.107 -39.681 -40.286 -40.985 -41.766 -42.733 -44.157 -52.191 -2 ,743 ,TETRA ,17557947,Fri Nov 26 12:35:26 CET,Fri Nov 26 15:04:51 CET,0.0 0.436 0.571 0.691 0.8 0.891 0.986 1.063 1.174 1.247 1.323 1.253 1.521 1.58 1.683 1.757 1.825 1.86 1.934 2.011 2.109 2.167 2.227 2.305 2.386 2.466 2.523 2.578 2.664 2.759 2.856 2.971 3.078 3.189 3.293 3.374 3.452 3.558 3.688 3.836 3.964 4.051 4.116 4.152 4.192 4.202 4.146 3.962 3.528 2.451 0.179 -2.966 -5.875 -8.577 -11.004 -13.09 -14.835 -16.373 -17.648 -18.969 -20.181 -21.286 -22.335 -23.329 -24.217 -24.972 -25.772 -26.49 -27.125 -27.815 -28.556 -29.198 -29.842 -30.478 -30.963 -31.462 -31.976 -32.511 -33.113 -33.535 -33.979 -34.703 -35.202 -35.702 -35.951 -36.479 -37.04 -37.65 -37.986 -38.582 -39.087 -39.467 -39.866 -40.798 -41.346 -41.957 -42.652 -43.443 -44.402 -45.848 -51.076 -3 ,6540 ,TETRA ,17557948,Fri Nov 26 12:35:29 CET,Fri Nov 26 15:07:16 CET,0.0 0.144 0.219 0.299 0.352 0.399 0.469 0.532 0.618 0.655 0.691 0.577 0.808 0.849 0.933 1.013 1.079 1.107 1.161 1.221 1.31 1.378 1.447 1.546 1.635 1.72 1.806 1.87 1.955 2.028 2.084 2.16 2.243 2.315 2.383 2.457 2.532 2.622 2.717 2.809 2.888 2.965 3.035 3.067 3.087 3.096 3.025 2.893 2.562 1.675 -0.086 -2.507 -4.773 -6.881 -8.792 -10.575 -12.151 -13.534 -14.722 -15.985 -17.147 -18.129 -19.063 -19.988 -20.846 -21.645 -22.494 -23.239 -23.874 -24.545 -25.214 -25.776 -26.391 -27.03 -27.549 -28.101 -28.693 -29.328 -29.951 -30.394 -30.862 -31.532 -31.977 -32.424 -32.655 -33.138 -33.631 -34.201 -34.518 -35.11 -35.665 -36.085 -36.548 -37.64 -38.26 -38.953 -39.688 -40.469 -41.514 -42.984 -55.675 -5 ,11810 ,TETRA ,17557950,Fri Nov 26 12:35:26 CET,Fri Nov 26 15:08:36 CET,0.0 0.123 0.236 0.355 0.481 0.557 0.612 0.672 0.77 0.808 0.847 0.74 0.98 1.028 1.123 1.215 1.286 1.318 1.385 1.455 1.555 1.618 1.682 1.772 1.844 1.905 1.974 2.045 2.132 2.216 2.302 2.397 2.48 2.571 2.676 2.782 2.874 2.967 3.073 3.188 3.298 3.396 3.458 3.529 3.63 3.668 3.636 3.474 3.011 2.051 0.228 -2.336 -4.746 -6.799 -8.524 -10.167 -11.781 -13.37 -14.747 -16.103 -17.282 -18.311 -19.276 -20.197 -21.079 -21.882 -22.727 -23.484 -24.168 -24.904 -25.624 -26.217 -26.866 -27.557 -28.11 -28.691 -29.265 -29.832 -30.435 -30.864 -31.309 -32.008 -32.499 -33.025 -33.295 -33.826 -34.37 -34.952 -35.247 -35.827 -36.396 -36.828 -37.293 -38.323 -38.857 -39.442 -40.198 -41.082 -42.195 -43.791 -52.49 -6 ,25355 ,TETRA ,17557951,Fri Nov 26 12:35:26 CET,Fri Nov 26 15:02:24 CET,0.0 0.305 0.386 0.472 0.547 0.614 0.678 0.751 0.879 0.931 0.986 0.893 1.13 1.174 1.255 1.323 1.39 1.419 1.475 1.534 1.62 1.678 1.733 1.814 1.893 1.964 2.034 2.1 2.196 2.292 2.364 2.452 2.55 2.641 2.734 2.83 2.928 3.027 3.135 3.239 3.334 3.46 3.577 3.641 3.67 3.637 3.455 3.1 2.589 1.533 -0.576 -3.49 -6.23 -8.779 -11.075 -13.177 -15.099 -16.803 -18.247 -19.633 -20.809 -21.86 -22.842 -23.791 -24.705 -25.539 -26.376 -27.119 -27.763 -28.42 -29.105 -29.67 -30.278 -30.897 -31.37 -31.873 -32.396 -32.94 -33.49 -33.874 -34.252 -34.829 -35.242 -35.66 -35.884 -36.386 -36.904 -37.417 -37.694 -38.253 -38.715 -39.057 -39.44 -40.437 -41.048 -41.713 -42.403 -43.158 -44.044 -45.343 -50.939 -7 ,14036 ,TETRA ,17557952,Fri Nov 26 12:35:28 CET,Fri Nov 26 14:56:26 CET,0.0 0.257 0.378 0.467 0.531 0.608 0.688 0.753 0.864 0.916 0.972 0.873 1.116 1.163 1.245 1.327 1.401 1.431 1.503 1.575 1.677 1.751 1.815 1.898 1.982 2.064 2.15 2.219 2.303 2.397 2.49 2.599 2.686 2.759 2.835 2.907 2.94 2.968 3.009 3.05 3.094 3.126 3.177 3.213 3.205 3.141 2.974 2.628 2.018 0.91 -1.368 -4.42 -7.086 -9.622 -11.786 -13.6 -15.246 -16.747 -18.138 -19.593 -20.793 -21.825 -22.835 -23.817 -24.707 -25.547 -26.438 -27.214 -27.882 -28.589 -29.348 -29.987 -30.635 -31.293 -31.802 -32.334 -32.886 -33.453 -34.056 -34.465 -34.886 -35.569 -36.033 -36.542 -36.803 -37.321 -37.896 -38.505 -38.831 -39.414 -39.924 -40.384 -40.863 -41.918 -42.548 -43.21 -43.93 -44.799 -45.849 -47.282 -56.769 -9 ,7084 ,TETRA ,17557954,Fri Nov 26 12:35:27 CET,Fri Nov 26 15:05:14 CET,0.0 0.373 0.478 0.556 0.632 0.711 0.791 0.859 0.966 1.023 1.081 0.991 1.22 1.272 1.365 1.446 1.528 1.565 1.635 1.7 1.79 1.854 1.915 2.006 2.091 2.163 2.233 2.316 2.423 2.492 2.555 2.654 2.763 2.878 2.985 3.073 3.168 3.286 3.394 3.485 3.546 3.588 3.574 3.508 3.442 3.314 3.091 2.774 2.212 1.21 -0.63 -3.192 -5.578 -7.655 -9.524 -11.214 -12.599 -13.926 -15.161 -16.408 -17.534 -18.557 -19.496 -20.442 -21.378 -22.227 -23.084 -23.824 -24.44 -25.061 -25.727 -26.297 -26.884 -27.52 -28.052 -28.619 -29.202 -29.822 -30.449 -30.855 -31.275 -31.957 -32.46 -33.012 -33.304 -33.906 -34.53 -35.179 -35.512 -36.101 -36.64 -37.055 -37.512 -38.569 -39.174 -39.831 -40.584 -41.464 -42.528 -43.993 -54.586 -10 ,30755 ,TETRA ,17557955,Fri Nov 26 12:35:29 CET,Fri Nov 26 15:06:12 CET,0.0 0.21 0.287 0.349 0.396 0.435 0.488 0.555 0.678 0.73 0.78 0.69 0.926 0.963 1.047 1.126 1.188 1.208 1.257 1.306 1.367 1.422 1.477 1.544 1.619 1.698 1.772 1.842 1.935 2.018 2.09 2.164 2.227 2.286 2.343 2.416 2.496 2.595 2.696 2.786 2.848 2.893 2.925 2.942 2.945 2.859 2.652 2.335 1.85 1.079 -0.511 -3.04 -5.393 -7.593 -9.697 -11.616 -13.343 -14.936 -16.285 -17.728 -19.009 -20.158 -21.208 -22.151 -23.017 -23.804 -24.634 -25.381 -26.059 -26.796 -27.542 -28.145 -28.791 -29.466 -29.967 -30.459 -30.966 -31.505 -32.092 -32.512 -32.938 -33.593 -34.046 -34.52 -34.76 -35.262 -35.86 -36.483 -36.793 -37.35 -37.759 -38.091 -38.457 -39.428 -40.019 -40.639 -41.253 -41.98 -43.063 -44.624 -54.156 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 7e395f19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23079 ,TETRA ,17557956,Fri Nov 26 12:35:28 CET,Fri Nov 26 15:03:38 CET,0.0 0.289 0.46 0.583 0.706 0.826 0.934 1.046 1.255 1.346 1.445 1.446 1.731 1.804 1.934 2.059 2.206 2.291 2.441 2.568 2.758 2.887 3.011 3.197 3.37 3.522 3.678 3.839 4.055 4.255 4.438 4.665 4.891 5.112 5.377 5.676 5.958 6.265 6.601 6.962 7.344 7.784 8.301 8.812 9.407 10.073 10.819 11.646 12.535 13.356 13.799 13.694 13.364 12.764 12.022 11.298 10.551 9.733 9.05 8.39 7.786 7.23 6.708 6.193 5.666 5.166 4.641 4.187 3.817 3.431 3.001 2.637 2.266 1.882 1.582 1.27 0.938 0.575 0.207 -0.048 -0.328 -0.768 -1.069 -1.371 -1.529 -1.852 -2.184 -2.546 -2.743 -3.159 -3.423 -3.665 -3.916 -4.544 -4.954 -5.378 -5.784 -6.225 -6.759 -7.544 -10.028 -2 ,7790 ,TETRA ,17557957,Fri Nov 26 12:35:29 CET,Fri Nov 26 15:09:54 CET,0.0 0.433 0.717 0.948 1.14 1.298 1.449 1.58 1.806 1.917 2.03 2.068 2.368 2.474 2.686 2.876 3.057 3.139 3.301 3.457 3.665 3.795 3.92 4.103 4.287 4.468 4.657 4.855 5.109 5.331 5.55 5.81 6.046 6.271 6.537 6.837 7.111 7.399 7.717 8.073 8.467 8.94 9.494 10.035 10.66 11.322 12.027 12.792 13.595 14.346 15.023 15.307 15.113 14.738 14.092 13.183 12.343 11.551 10.804 9.994 9.299 8.691 8.082 7.508 6.97 6.417 5.82 5.333 4.934 4.53 4.124 3.755 3.327 2.901 2.593 2.277 1.939 1.564 1.163 0.905 0.654 0.259 -0.016 -0.319 -0.477 -0.809 -1.177 -1.551 -1.745 -2.17 -2.482 -2.749 -3.054 -3.77 -4.182 -4.634 -5.106 -5.708 -6.497 -7.618 -12.16 -3 ,8643 ,TETRA ,17557958,Fri Nov 26 12:35:31 CET,Fri Nov 26 15:08:39 CET,0.0 0.314 0.547 0.719 0.892 1.053 1.192 1.317 1.531 1.619 1.699 1.702 1.991 2.081 2.241 2.389 2.552 2.632 2.777 2.924 3.13 3.268 3.41 3.613 3.793 3.961 4.125 4.296 4.526 4.747 4.972 5.245 5.521 5.784 6.06 6.37 6.664 6.99 7.342 7.724 8.151 8.646 9.237 9.818 10.447 11.143 11.97 12.916 14.002 15.19 16.457 16.984 16.671 15.943 15.098 14.223 13.376 12.596 11.887 11.157 10.487 9.852 9.221 8.6 8.023 7.488 6.925 6.427 5.995 5.542 5.065 4.654 4.228 3.781 3.436 3.107 2.771 2.394 1.996 1.726 1.457 1.03 0.722 0.363 0.184 -0.169 -0.575 -1.005 -1.221 -1.628 -1.846 -2.11 -2.414 -3.008 -3.321 -3.695 -4.094 -4.56 -5.133 -6.037 -9.666 -4 ,25452 ,TETRA ,17557959,Fri Nov 26 12:35:28 CET,Fri Nov 26 15:11:27 CET,0.0 0.54 0.768 0.944 1.104 1.241 1.36 1.475 1.709 1.816 1.906 1.892 2.177 2.261 2.428 2.588 2.743 2.815 2.94 3.064 3.247 3.368 3.489 3.651 3.808 3.963 4.115 4.271 4.469 4.669 4.874 5.126 5.374 5.622 5.923 6.258 6.558 6.861 7.192 7.563 7.964 8.43 8.968 9.509 10.144 10.859 11.727 12.719 13.706 14.531 15.333 15.343 14.722 13.989 13.16 12.348 11.614 10.934 10.349 9.731 9.194 8.698 8.199 7.724 7.282 6.854 6.406 5.984 5.602 5.22 4.748 4.355 3.991 3.601 3.272 2.904 2.516 2.115 1.688 1.389 1.071 0.57 0.262 -0.075 -0.281 -0.69 -1.074 -1.48 -1.698 -2.112 -2.371 -2.633 -2.919 -3.485 -3.783 -4.11 -4.504 -4.984 -5.589 -6.353 -8.859 -5 ,25699 ,TETRA ,17557960,Fri Nov 26 12:35:29 CET,Fri Nov 26 15:08:46 CET,0.0 0.226 0.392 0.55 0.66 0.743 0.825 0.917 1.109 1.205 1.286 1.253 1.541 1.62 1.766 1.906 2.046 2.116 2.252 2.38 2.563 2.678 2.792 2.979 3.172 3.347 3.498 3.642 3.844 4.04 4.232 4.458 4.67 4.876 5.129 5.421 5.698 6.015 6.365 6.715 7.074 7.481 7.976 8.495 9.114 9.756 10.44 11.214 12.083 12.963 13.628 13.515 12.956 12.281 11.514 10.717 9.956 9.196 8.494 7.729 7.04 6.446 5.894 5.371 4.872 4.41 3.902 3.447 3.076 2.688 2.298 1.989 1.635 1.225 0.908 0.567 0.2 -0.175 -0.588 -0.881 -1.158 -1.592 -1.91 -2.217 -2.377 -2.734 -3.128 -3.567 -3.789 -4.203 -4.463 -4.698 -4.948 -5.539 -5.876 -6.267 -6.741 -7.241 -7.808 -8.664 -11.962 -6 ,8142 ,TETRA ,17557961,Fri Nov 26 12:35:28 CET,Fri Nov 26 15:10:33 CET,0.0 0.742 0.952 1.083 1.21 1.335 1.448 1.546 1.753 1.862 1.97 1.985 2.256 2.332 2.49 2.648 2.805 2.88 3.036 3.186 3.401 3.537 3.666 3.848 4.011 4.167 4.32 4.476 4.694 4.929 5.15 5.386 5.606 5.823 6.097 6.425 6.743 7.08 7.436 7.832 8.266 8.75 9.34 9.928 10.591 11.371 12.319 13.343 14.482 15.713 16.905 17.613 17.669 17.273 16.655 15.854 15.079 14.375 13.692 12.984 12.364 11.815 11.283 10.746 10.21 9.71 9.208 8.741 8.323 7.941 7.566 7.244 6.935 6.585 6.267 5.938 5.593 5.239 4.896 4.664 4.413 4.002 3.692 3.333 3.15 2.808 2.463 2.075 1.876 1.464 1.075 0.76 0.46 -0.174 -0.552 -0.994 -1.472 -2.036 -2.684 -3.655 -7.144 -7 ,21143 ,TETRA ,17557962,Fri Nov 26 12:35:28 CET,Fri Nov 26 15:09:23 CET,0.0 0.445 0.639 0.823 0.962 1.062 1.161 1.261 1.456 1.548 1.639 1.632 1.926 2.018 2.184 2.335 2.474 2.546 2.677 2.797 2.994 3.116 3.226 3.396 3.566 3.742 3.924 4.103 4.307 4.496 4.696 4.934 5.156 5.368 5.607 5.886 6.166 6.47 6.811 7.159 7.522 7.93 8.408 8.911 9.496 10.158 10.856 11.611 12.543 13.397 14.079 14.31 14.062 13.577 12.936 12.265 11.624 10.987 10.378 9.712 9.098 8.515 7.914 7.363 6.862 6.376 5.87 5.432 5.034 4.609 4.162 3.787 3.399 2.975 2.649 2.316 1.994 1.662 1.278 1.015 0.751 0.341 0.051 -0.272 -0.45 -0.831 -1.221 -1.631 -1.845 -2.252 -2.587 -2.877 -3.137 -3.673 -3.975 -4.328 -4.789 -5.336 -5.911 -6.792 -10.381 -8 ,25793 ,TETRA ,17557963,Fri Nov 26 12:35:31 CET,Fri Nov 26 15:09:24 CET,0.0 0.238 0.419 0.606 0.744 0.852 0.954 1.058 1.226 1.311 1.408 1.399 1.673 1.756 1.932 2.111 2.287 2.372 2.527 2.659 2.859 2.995 3.11 3.267 3.433 3.606 3.773 3.93 4.146 4.358 4.56 4.794 5.013 5.218 5.456 5.745 6.041 6.361 6.705 7.086 7.467 7.895 8.407 8.902 9.449 10.012 10.644 11.311 12.009 12.728 13.353 13.495 13.155 12.534 11.897 11.316 10.736 10.136 9.594 9.005 8.481 8.008 7.554 7.142 6.717 6.314 5.895 5.487 5.149 4.802 4.416 4.065 3.675 3.29 3.02 2.737 2.422 2.067 1.683 1.433 1.166 0.722 0.415 0.099 -0.062 -0.382 -0.708 -1.048 -1.228 -1.634 -1.937 -2.209 -2.478 -3.029 -3.367 -3.714 -4.098 -4.523 -4.995 -5.738 -9.048 -9 ,27173 ,TETRA ,17557964,Fri Nov 26 12:35:28 CET,Fri Nov 26 15:04:54 CET,0.0 0.306 0.543 0.72 0.85 0.965 1.069 1.175 1.373 1.475 1.569 1.552 1.823 1.903 2.053 2.202 2.357 2.434 2.585 2.736 2.945 3.083 3.227 3.444 3.653 3.856 4.054 4.264 4.533 4.774 5.001 5.269 5.532 5.795 6.111 6.453 6.796 7.18 7.589 8.037 8.499 9.011 9.581 10.125 10.765 11.476 12.301 13.26 14.24 15.046 15.387 15.15 14.564 13.834 13.101 12.35 11.604 10.911 10.318 9.675 9.088 8.525 7.969 7.419 6.878 6.384 5.875 5.416 5.0 4.558 4.107 3.727 3.322 2.89 2.533 2.164 1.792 1.411 1.026 0.768 0.49 0.017 -0.288 -0.588 -0.755 -1.126 -1.496 -1.884 -2.103 -2.53 -2.879 -3.172 -3.483 -4.198 -4.594 -4.99 -5.396 -5.869 -6.495 -7.555 -12.051 -10 ,138 ,TETRA ,17557965,Fri Nov 26 12:35:31 CET,Fri Nov 26 15:04:54 CET,0.0 0.236 0.421 0.571 0.705 0.827 0.94 1.039 1.216 1.322 1.432 1.426 1.72 1.818 1.997 2.168 2.337 2.412 2.559 2.71 2.923 3.07 3.216 3.418 3.614 3.798 3.977 4.162 4.396 4.62 4.841 5.104 5.371 5.645 5.94 6.268 6.587 6.907 7.259 7.642 8.01 8.406 8.855 9.298 9.808 10.358 11.003 11.731 12.402 12.899 13.017 12.579 12.093 11.469 10.811 10.154 9.437 8.722 8.121 7.519 6.967 6.467 5.992 5.538 5.059 4.592 4.125 3.694 3.306 2.907 2.47 2.097 1.711 1.301 0.983 0.65 0.313 -0.031 -0.399 -0.652 -0.942 -1.454 -1.805 -2.191 -2.405 -2.865 -3.326 -3.781 -4.015 -4.461 -4.843 -5.117 -5.394 -6.033 -6.358 -6.703 -7.168 -7.691 -8.271 -9.137 -12.362 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index e8f1bd29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,25885 ,TETRA ,17557969,Fri Nov 26 12:36:23 CET,Fri Nov 26 14:57:11 CET,0.0 0.219 0.436 0.608 0.772 0.935 1.085 1.266 1.628 1.776 1.915 1.968 2.328 2.465 2.721 2.964 3.199 3.313 3.534 3.771 4.109 4.321 4.537 4.857 5.191 5.529 5.85 6.171 6.574 6.963 7.36 7.846 8.313 8.755 9.243 9.786 10.304 10.883 11.553 12.297 13.084 13.966 15.003 16.034 17.243 18.691 20.415 22.336 24.524 26.985 29.945 31.984 32.77 33.016 33.052 32.946 32.655 32.319 31.963 31.6 31.28 30.977 30.652 30.276 29.891 29.538 29.19 28.9 28.612 28.283 27.939 27.646 27.338 27.016 26.774 26.515 26.24 25.973 25.696 25.488 25.26 24.885 24.627 24.374 24.234 23.931 23.633 23.32 23.157 22.771 22.528 22.322 22.079 21.478 21.144 20.769 20.338 19.83 19.119 18.031 8.7 -5 ,5796 ,TETRA ,17557970,Fri Nov 26 12:36:24 CET,Fri Nov 26 14:53:25 CET,0.0 0.307 0.547 0.73 0.913 1.107 1.271 1.429 1.71 1.841 1.993 2.078 2.439 2.575 2.818 3.071 3.326 3.441 3.67 3.899 4.227 4.441 4.653 4.974 5.308 5.643 5.958 6.256 6.648 7.048 7.437 7.934 8.424 8.894 9.456 10.09 10.734 11.459 12.22 13.038 13.914 14.921 16.105 17.307 18.765 20.427 22.401 24.593 26.879 29.322 32.314 34.578 35.622 36.154 36.25 36.106 35.872 35.604 35.351 34.977 34.567 34.197 33.83 33.465 33.11 32.789 32.435 32.089 31.796 31.469 31.125 30.848 30.55 30.242 29.977 29.667 29.352 29.038 28.692 28.426 28.146 27.741 27.459 27.165 27.007 26.682 26.321 25.91 25.721 25.333 25.055 24.832 24.594 24.01 23.682 23.289 22.845 22.384 21.791 20.991 16.975 -6 ,12767 ,TETRA ,17557971,Fri Nov 26 12:36:24 CET,Fri Nov 26 14:48:32 CET,0.0 0.842 1.089 1.263 1.425 1.593 1.764 1.918 2.19 2.321 2.45 2.515 2.872 3.015 3.291 3.537 3.75 3.849 4.049 4.255 4.554 4.745 4.947 5.259 5.552 5.834 6.114 6.393 6.757 7.105 7.464 7.895 8.303 8.721 9.205 9.781 10.332 10.921 11.606 12.313 13.02 13.869 14.874 15.88 17.091 18.47 20.116 22.055 24.371 26.951 29.489 30.897 31.352 31.329 31.111 30.772 30.341 29.891 29.474 29.052 28.704 28.341 27.937 27.552 27.173 26.826 26.464 26.117 25.82 25.494 25.134 24.85 24.549 24.243 24.006 23.724 23.428 23.146 22.853 22.641 22.407 22.035 21.778 21.493 21.347 21.053 20.744 20.408 20.218 19.841 19.649 19.414 19.122 18.395 17.97 17.561 17.109 16.571 15.969 15.065 6.85 -7 ,21814 ,TETRA ,17557972,Fri Nov 26 12:36:24 CET,Fri Nov 26 14:46:27 CET,0.0 0.378 0.645 0.848 1.029 1.204 1.37 1.533 1.825 1.964 2.104 2.151 2.503 2.645 2.937 3.196 3.41 3.525 3.776 4.019 4.388 4.637 4.875 5.219 5.558 5.872 6.158 6.438 6.828 7.217 7.559 7.964 8.374 8.775 9.251 9.799 10.323 10.921 11.595 12.302 13.059 13.957 15.027 16.072 17.298 18.677 20.247 22.078 24.249 26.614 29.164 30.943 31.638 31.833 31.701 31.455 31.154 30.804 30.49 30.111 29.741 29.424 29.054 28.635 28.244 27.86 27.409 27.006 26.684 26.345 25.979 25.654 25.303 24.981 24.739 24.46 24.167 23.858 23.529 23.297 23.053 22.692 22.442 22.133 21.96 21.601 21.253 20.898 20.7 20.314 20.058 19.814 19.554 18.932 18.611 18.301 17.947 17.484 16.874 15.947 11.118 -10 ,29170 ,TETRA ,17557975,Fri Nov 26 12:36:26 CET,Fri Nov 26 14:52:35 CET,0.0 0.705 0.994 1.22 1.408 1.598 1.784 1.956 2.297 2.465 2.622 2.709 3.081 3.217 3.472 3.746 4.017 4.139 4.374 4.612 4.969 5.204 5.437 5.781 6.095 6.385 6.659 6.925 7.292 7.652 7.99 8.398 8.804 9.241 9.751 10.274 10.787 11.395 12.083 12.844 13.651 14.548 15.602 16.712 18.056 19.566 21.326 23.396 25.677 28.09 30.902 32.574 33.109 33.307 33.317 33.174 32.884 32.564 32.202 31.789 31.369 30.911 30.465 30.055 29.677 29.33 28.959 28.591 28.255 27.892 27.523 27.24 26.936 26.623 26.376 26.087 25.782 25.466 25.132 24.905 24.671 24.305 24.041 23.763 23.629 23.342 22.998 22.639 22.457 22.065 21.837 21.625 21.4 20.858 20.553 20.191 19.745 19.243 18.612 17.642 11.026 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt deleted file mode 100644 index 99233667..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32332 ,TETRA ,17557976,Fri Nov 26 12:36:24 CET,Fri Nov 26 14:49:37 CET,0.0 3.159 3.524 3.756 3.936 4.101 4.247 4.377 4.636 4.763 4.884 4.898 5.213 5.294 5.447 5.615 5.78 5.859 6.015 6.156 6.354 6.485 6.599 6.75 6.912 7.071 7.231 7.4 7.604 7.769 7.911 8.068 8.214 8.351 8.484 8.61 8.717 8.811 8.94 9.131 9.291 9.39 9.46 9.445 9.301 9.036 8.721 8.195 7.354 5.771 2.055 -2.645 -6.497 -9.718 -12.366 -14.663 -16.648 -18.45 -19.969 -21.432 -22.667 -23.783 -24.836 -25.754 -26.565 -27.327 -28.172 -28.951 -29.615 -30.312 -31.05 -31.646 -32.228 -32.788 -33.204 -33.629 -34.072 -34.525 -34.989 -35.313 -35.656 -36.179 -36.525 -36.889 -37.073 -37.429 -37.796 -38.179 -38.394 -38.871 -39.089 -39.336 -39.584 -40.167 -40.487 -40.824 -41.249 -41.742 -42.306 -42.982 -52.321 -2 ,1936 ,TETRA ,17557977,Fri Nov 26 12:36:27 CET,Fri Nov 26 14:51:19 CET,0.0 1.297 1.62 1.876 2.098 2.281 2.412 2.509 2.715 2.844 2.969 2.96 3.267 3.357 3.537 3.706 3.869 3.936 4.059 4.202 4.406 4.533 4.659 4.834 4.988 5.126 5.261 5.402 5.562 5.699 5.847 6.018 6.161 6.296 6.472 6.668 6.82 6.959 7.096 7.257 7.419 7.578 7.721 7.826 7.941 7.877 7.512 6.981 5.927 3.901 0.235 -4.437 -8.297 -11.455 -14.159 -16.558 -18.619 -20.391 -21.843 -23.294 -24.513 -25.566 -26.552 -27.487 -28.352 -29.117 -29.894 -30.61 -31.237 -31.883 -32.568 -33.124 -33.716 -34.337 -34.8 -35.273 -35.757 -36.24 -36.731 -37.06 -37.396 -37.927 -38.293 -38.664 -38.851 -39.241 -39.652 -40.098 -40.331 -40.812 -41.032 -41.276 -41.541 -42.152 -42.489 -42.838 -43.226 -43.626 -44.088 -44.836 -52.092 -3 ,26884 ,TETRA ,17557978,Fri Nov 26 12:36:24 CET,Fri Nov 26 15:00:06 CET,0.0 0.923 1.261 1.515 1.705 1.842 1.968 2.103 2.356 2.477 2.59 2.56 2.858 2.94 3.076 3.224 3.397 3.477 3.629 3.78 3.982 4.107 4.234 4.422 4.577 4.714 4.836 4.942 5.096 5.226 5.349 5.513 5.661 5.786 5.941 6.151 6.352 6.545 6.718 6.798 6.769 6.745 6.726 6.662 6.622 6.34 5.707 4.757 3.249 0.959 -2.898 -7.534 -11.502 -14.935 -17.9 -20.429 -22.531 -24.462 -26.108 -27.699 -29.035 -30.199 -31.299 -32.322 -33.254 -34.093 -34.953 -35.728 -36.375 -37.006 -37.673 -38.242 -38.812 -39.392 -39.845 -40.308 -40.768 -41.238 -41.731 -42.079 -42.427 -42.93 -43.29 -43.682 -43.893 -44.321 -44.747 -45.187 -45.412 -45.892 -46.096 -46.339 -46.59 -47.094 -47.354 -47.655 -48.026 -48.463 -48.957 -49.535 nan -4 ,19009 ,TETRA ,17557979,Fri Nov 26 12:36:26 CET,Fri Nov 26 14:55:04 CET,0.0 2.211 2.523 2.728 2.9 3.052 3.192 3.325 3.549 3.657 3.749 3.685 3.983 4.071 4.269 4.473 4.65 4.731 4.879 5.023 5.242 5.376 5.49 5.66 5.832 6.002 6.144 6.252 6.41 6.575 6.717 6.875 7.04 7.192 7.338 7.486 7.652 7.841 8.0 8.129 8.265 8.402 8.408 8.242 7.937 7.495 6.836 5.863 4.321 1.879 -2.019 -6.548 -10.265 -13.361 -16.046 -18.405 -20.45 -22.271 -23.782 -25.277 -26.522 -27.644 -28.706 -29.66 -30.508 -31.292 -32.097 -32.805 -33.45 -34.109 -34.753 -35.263 -35.821 -36.457 -36.954 -37.447 -37.921 -38.379 -38.864 -39.193 -39.516 -40.022 -40.384 -40.749 -40.942 -41.342 -41.747 -42.182 -42.4 -42.868 -43.108 -43.368 -43.629 -44.138 -44.397 -44.699 -45.047 -45.433 -45.908 -46.581 -50.499 -5 ,1941 ,TETRA ,17557980,Fri Nov 26 12:36:24 CET,Fri Nov 26 14:50:09 CET,0.0 0.473 0.759 0.937 1.098 1.292 1.463 1.608 1.873 1.993 2.095 2.075 2.385 2.474 2.674 2.874 3.052 3.137 3.298 3.443 3.638 3.757 3.862 4.033 4.2 4.342 4.484 4.618 4.797 4.977 5.141 5.352 5.56 5.728 5.906 6.121 6.323 6.512 6.693 6.871 7.036 7.236 7.467 7.661 7.717 7.592 7.416 6.796 5.427 3.189 -0.841 -5.507 -9.273 -12.591 -15.446 -17.743 -19.568 -21.234 -22.718 -24.199 -25.435 -26.525 -27.574 -28.502 -29.337 -30.107 -30.878 -31.548 -32.137 -32.746 -33.361 -33.866 -34.422 -35.034 -35.503 -35.997 -36.501 -36.996 -37.49 -37.814 -38.136 -38.659 -39.027 -39.398 -39.594 -39.994 -40.422 -40.868 -41.084 -41.561 -41.79 -42.051 -42.322 -42.873 -43.175 -43.511 -43.884 -44.256 -44.661 -45.252 -47.321 -6 ,17106 ,TETRA ,17557981,Fri Nov 26 12:36:26 CET,Fri Nov 26 14:54:55 CET,0.0 1.661 2.014 2.224 2.439 2.626 2.767 2.894 3.102 3.198 3.311 3.328 3.638 3.738 3.913 4.055 4.183 4.246 4.371 4.506 4.694 4.807 4.929 5.102 5.249 5.398 5.553 5.715 5.91 6.06 6.209 6.415 6.602 6.758 6.915 7.072 7.23 7.392 7.537 7.687 7.836 7.927 7.979 7.986 7.833 7.436 6.73 5.7 4.303 2.158 -1.692 -6.232 -9.894 -12.948 -15.515 -17.799 -19.734 -21.408 -22.848 -24.259 -25.462 -26.516 -27.508 -28.489 -29.383 -30.184 -31.041 -31.794 -32.434 -33.1 -33.783 -34.315 -34.876 -35.496 -35.956 -36.411 -36.876 -37.352 -37.85 -38.189 -38.53 -39.059 -39.424 -39.806 -40.004 -40.409 -40.831 -41.264 -41.481 -41.948 -42.149 -42.384 -42.638 -43.215 -43.517 -43.832 -44.163 -44.521 -44.929 -45.501 -48.135 -7 ,9115 ,TETRA ,17557982,Fri Nov 26 12:36:28 CET,Fri Nov 26 14:54:45 CET,0.0 0.516 0.747 0.95 1.114 1.285 1.448 1.57 1.795 1.914 2.027 2.003 2.316 2.411 2.584 2.736 2.885 2.962 3.114 3.254 3.453 3.583 3.704 3.87 4.021 4.173 4.334 4.49 4.688 4.905 5.104 5.292 5.472 5.646 5.845 6.086 6.305 6.515 6.699 6.851 7.035 7.22 7.362 7.478 7.605 7.623 7.355 6.722 5.543 3.606 0.333 -4.147 -7.966 -11.012 -13.585 -15.845 -17.836 -19.572 -20.987 -22.389 -23.569 -24.645 -25.672 -26.599 -27.425 -28.155 -28.951 -29.676 -30.281 -30.916 -31.572 -32.137 -32.721 -33.305 -33.773 -34.246 -34.718 -35.197 -35.682 -36.011 -36.375 -36.967 -37.355 -37.732 -37.919 -38.3 -38.713 -39.141 -39.359 -39.845 -40.108 -40.381 -40.646 -41.195 -41.497 -41.83 -42.194 -42.618 -43.089 -43.673 -45.463 -8 ,13201 ,TETRA ,17557983,Fri Nov 26 12:36:30 CET,Fri Nov 26 14:51:24 CET,0.0 0.697 0.899 1.104 1.316 1.499 1.664 1.786 2.02 2.132 2.232 2.201 2.502 2.591 2.766 2.937 3.094 3.177 3.355 3.519 3.739 3.881 4.008 4.187 4.386 4.577 4.743 4.895 5.087 5.265 5.436 5.666 5.864 6.021 6.202 6.413 6.598 6.789 7.016 7.265 7.532 7.77 7.963 7.989 7.932 8.001 7.811 7.153 5.878 3.612 -0.189 -4.962 -8.973 -12.236 -14.929 -17.29 -19.383 -21.251 -22.81 -24.342 -25.599 -26.635 -27.603 -28.569 -29.432 -30.18 -30.993 -31.724 -32.364 -33.032 -33.696 -34.23 -34.79 -35.368 -35.818 -36.277 -36.735 -37.211 -37.719 -38.067 -38.409 -38.928 -39.302 -39.705 -39.912 -40.333 -40.772 -41.228 -41.457 -41.941 -42.163 -42.411 -42.685 -43.294 -43.629 -43.968 -44.305 -44.689 -45.206 -45.831 -49.793 -9 ,30958 ,TETRA ,17557984,Fri Nov 26 12:36:26 CET,Fri Nov 26 14:34:09 CET,0.0 1.497 1.783 1.981 2.133 2.283 2.441 2.6 2.921 3.068 3.182 3.194 3.537 3.648 3.866 4.076 4.276 4.357 4.498 4.644 4.842 4.962 5.072 5.237 5.41 5.57 5.718 5.865 6.068 6.236 6.391 6.58 6.771 6.945 7.105 7.282 7.443 7.616 7.767 7.946 8.134 8.28 8.425 8.539 8.544 8.413 8.233 7.832 7.064 5.639 2.63 -1.54 -5.071 -8.012 -10.644 -12.994 -15.018 -16.84 -18.368 -19.902 -21.162 -22.23 -23.26 -24.206 -25.068 -25.875 -26.724 -27.49 -28.122 -28.739 -29.36 -29.874 -30.426 -31.01 -31.481 -31.969 -32.441 -32.916 -33.412 -33.751 -34.089 -34.602 -34.955 -35.328 -35.525 -35.91 -36.315 -36.776 -37.014 -37.495 -37.715 -37.977 -38.232 -38.739 -39.035 -39.38 -39.752 -40.145 -40.627 -41.212 -44.075 -10 ,13464 ,TETRA ,17557985,Fri Nov 26 12:36:26 CET,Fri Nov 26 14:56:52 CET,0.0 1.106 1.406 1.634 1.828 2.007 2.173 2.32 2.603 2.724 2.825 2.791 3.093 3.176 3.339 3.495 3.651 3.733 3.879 4.014 4.219 4.345 4.465 4.645 4.808 4.958 5.108 5.243 5.404 5.551 5.703 5.922 6.153 6.362 6.579 6.824 7.061 7.29 7.479 7.645 7.79 7.9 7.973 8.01 7.984 7.871 7.681 7.249 6.342 4.789 1.734 -2.392 -5.922 -9.05 -11.693 -13.943 -15.92 -17.726 -19.258 -20.771 -22.043 -23.158 -24.227 -25.209 -26.128 -26.959 -27.805 -28.559 -29.209 -29.9 -30.61 -31.175 -31.751 -32.371 -32.843 -33.291 -33.745 -34.232 -34.74 -35.071 -35.424 -35.987 -36.35 -36.741 -36.951 -37.37 -37.807 -38.276 -38.521 -39.009 -39.215 -39.474 -39.755 -40.379 -40.708 -41.023 -41.346 -41.75 -42.198 -42.7 -44.357 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt deleted file mode 100644 index b0e93cc1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7840 ,TETRA ,17557986,Fri Nov 26 12:36:28 CET,Fri Nov 26 14:57:33 CET,0.0 1.766 2.159 2.38 2.534 2.655 2.751 2.843 3.05 3.143 3.21 3.083 3.348 3.399 3.498 3.587 3.664 3.682 3.691 3.711 3.734 3.744 3.747 3.728 3.691 3.634 3.581 3.521 3.407 3.299 3.182 3.005 2.808 2.562 2.238 1.87 1.504 1.059 0.541 -0.032 -0.749 -1.687 -2.844 -4.138 -5.793 -7.798 -10.458 -13.868 -18.375 -24.587 -34.029 -44.224 -51.834 -57.909 -62.841 -66.988 -70.39 -73.298 -75.714 -78.07 -80.05 -81.756 -83.33 -84.759 -86.059 -87.231 -88.395 -89.376 -90.214 -91.065 -91.923 -92.648 -93.382 -94.117 -94.67 -95.23 -95.8 -96.364 -96.943 -97.337 -97.742 -98.377 -98.805 -99.247 -99.478 -99.955 -100.438 -100.943 -101.206 -101.799 -102.0 -102.291 -102.602 -103.25 -103.588 -103.951 -104.337 -104.773 -105.29 -105.971 -107.98 -2 ,13423 ,TETRA ,17557987,Fri Nov 26 12:36:29 CET,Fri Nov 26 14:56:07 CET,0.0 1.535 1.761 1.916 2.041 2.119 2.185 2.244 2.339 2.398 2.464 2.35 2.611 2.656 2.713 2.779 2.834 2.85 2.882 2.9 2.869 2.823 2.785 2.719 2.632 2.537 2.429 2.304 2.167 2.019 1.834 1.58 1.305 1.032 0.681 0.231 -0.241 -0.8 -1.438 -2.155 -2.967 -3.962 -5.235 -6.647 -8.463 -10.701 -13.614 -17.393 -22.323 -29.078 -39.439 -50.389 -58.451 -64.821 -69.962 -74.257 -77.749 -80.731 -83.214 -85.621 -87.612 -89.322 -90.929 -92.418 -93.764 -94.959 -96.169 -97.209 -98.061 -98.919 -99.815 -100.546 -101.283 -102.012 -102.562 -103.136 -103.728 -104.323 -104.938 -105.355 -105.766 -106.381 -106.795 -107.241 -107.471 -107.93 -108.395 -108.878 -109.136 -109.736 -109.94 -110.212 -110.503 -111.155 -111.497 -111.829 -112.179 -112.593 -113.091 -113.655 -115.02 -3 ,5968 ,TETRA ,17557988,Fri Nov 26 12:36:25 CET,Fri Nov 26 14:55:45 CET,0.0 0.943 1.161 1.307 1.426 1.541 1.635 1.682 1.781 1.821 1.842 1.641 1.868 1.872 1.897 1.914 1.914 1.918 1.93 1.935 1.918 1.915 1.926 1.928 1.88 1.787 1.679 1.563 1.388 1.213 1.057 0.849 0.646 0.455 0.19 -0.174 -0.57 -1.049 -1.623 -2.303 -3.097 -4.087 -5.354 -6.737 -8.472 -10.562 -13.199 -16.559 -21.091 -27.362 -36.753 -46.766 -54.231 -60.129 -64.928 -68.98 -72.312 -75.142 -77.53 -79.831 -81.695 -83.318 -84.851 -86.234 -87.461 -88.568 -89.714 -90.702 -91.534 -92.393 -93.249 -93.93 -94.642 -95.383 -95.95 -96.54 -97.153 -97.773 -98.387 -98.807 -99.246 -99.899 -100.341 -100.788 -101.015 -101.475 -101.948 -102.456 -102.719 -103.316 -103.501 -103.767 -104.048 -104.644 -104.97 -105.334 -105.756 -106.292 -106.889 -107.579 -110.183 -4 ,18023 ,TETRA ,17557989,Fri Nov 26 12:36:27 CET,Fri Nov 26 14:55:38 CET,0.0 1.586 1.964 2.222 2.359 2.438 2.514 2.615 2.783 2.829 2.876 2.723 2.972 3.0 3.036 3.04 3.032 3.038 3.036 3.018 2.963 2.914 2.87 2.811 2.742 2.635 2.536 2.452 2.314 2.188 2.066 1.87 1.636 1.377 1.055 0.676 0.292 -0.174 -0.711 -1.359 -2.142 -3.097 -4.277 -5.551 -7.254 -9.381 -12.061 -15.432 -20.061 -26.605 -36.211 -46.411 -54.088 -60.079 -64.903 -68.98 -72.311 -75.127 -77.433 -79.667 -81.548 -83.167 -84.676 -86.041 -87.277 -88.404 -89.517 -90.509 -91.379 -92.241 -93.093 -93.784 -94.476 -95.18 -95.733 -96.275 -96.829 -97.402 -97.966 -98.349 -98.738 -99.342 -99.752 -100.164 -100.378 -100.806 -101.248 -101.763 -102.027 -102.611 -102.771 -103.027 -103.29 -103.851 -104.13 -104.42 -104.765 -105.153 -105.55 -106.131 -108.469 -5 ,14424 ,TETRA ,17557990,Fri Nov 26 12:36:29 CET,Fri Nov 26 14:51:02 CET,0.0 1.425 1.844 2.195 2.547 2.782 2.924 2.999 3.08 3.12 3.16 2.981 3.212 3.226 3.236 3.23 3.225 3.236 3.244 3.21 3.138 3.074 3.01 2.916 2.813 2.727 2.631 2.506 2.318 2.108 1.892 1.619 1.336 1.037 0.683 0.274 -0.162 -0.686 -1.254 -1.905 -2.71 -3.726 -5.003 -6.404 -8.161 -10.258 -12.969 -16.501 -21.297 -27.943 -37.871 -48.349 -56.203 -62.45 -67.396 -71.504 -74.881 -77.81 -80.274 -82.635 -84.585 -86.252 -87.806 -89.222 -90.508 -91.652 -92.811 -93.835 -94.689 -95.538 -96.408 -97.116 -97.833 -98.583 -99.149 -99.707 -100.273 -100.848 -101.435 -101.837 -102.239 -102.835 -103.272 -103.751 -103.988 -104.456 -104.935 -105.408 -105.651 -106.254 -106.43 -106.684 -106.945 -107.541 -107.863 -108.202 -108.545 -108.888 -109.27 -109.725 -111.161 -6 ,25385 ,TETRA ,17557991,Fri Nov 26 12:36:27 CET,Fri Nov 26 14:54:23 CET,0.0 0.845 1.12 1.233 1.283 1.335 1.399 1.475 1.621 1.683 1.73 1.561 1.811 1.833 1.835 1.824 1.794 1.775 1.739 1.704 1.662 1.649 1.641 1.598 1.544 1.483 1.399 1.298 1.14 0.979 0.804 0.552 0.309 0.05 -0.292 -0.685 -1.088 -1.518 -2.0 -2.687 -3.512 -4.455 -5.696 -7.088 -8.824 -11.009 -13.883 -17.504 -22.326 -29.042 -39.11 -49.729 -57.614 -63.795 -68.692 -72.863 -76.34 -79.293 -81.79 -84.179 -86.158 -87.882 -89.454 -90.881 -92.153 -93.274 -94.428 -95.44 -96.287 -97.154 -98.058 -98.782 -99.499 -100.229 -100.802 -101.391 -101.983 -102.598 -103.234 -103.654 -104.081 -104.739 -105.181 -105.625 -105.849 -106.305 -106.77 -107.25 -107.502 -108.095 -108.27 -108.532 -108.82 -109.513 -109.878 -110.24 -110.634 -111.02 -111.437 -112.022 -114.027 -7 ,2364 ,TETRA ,17557992,Fri Nov 26 12:36:29 CET,Fri Nov 26 14:50:26 CET,0.0 1.212 1.54 1.725 1.861 1.979 2.084 2.172 2.346 2.421 2.477 2.336 2.593 2.609 2.629 2.657 2.663 2.66 2.667 2.67 2.639 2.589 2.53 2.441 2.354 2.267 2.176 2.091 1.945 1.763 1.581 1.348 1.09 0.819 0.49 0.073 -0.364 -0.869 -1.44 -2.114 -2.918 -3.865 -5.08 -6.421 -8.093 -10.097 -12.602 -15.873 -20.459 -26.985 -36.814 -47.263 -54.995 -60.996 -65.753 -69.71 -72.981 -75.799 -78.153 -80.417 -82.297 -83.927 -85.421 -86.784 -88.032 -89.134 -90.231 -91.196 -92.014 -92.824 -93.645 -94.33 -95.036 -95.745 -96.26 -96.792 -97.348 -97.905 -98.462 -98.851 -99.27 -99.908 -100.331 -100.754 -100.972 -101.418 -101.856 -102.327 -102.579 -103.174 -103.384 -103.668 -103.951 -104.525 -104.826 -105.157 -105.502 -105.877 -106.333 -106.849 -108.895 -8 ,12649 ,TETRA ,17557993,Fri Nov 26 12:36:27 CET,Fri Nov 26 14:56:25 CET,0.0 1.855 2.193 2.425 2.628 2.827 2.969 3.096 3.32 3.395 3.464 3.377 3.664 3.707 3.738 3.757 3.754 3.746 3.735 3.72 3.668 3.653 3.643 3.578 3.491 3.372 3.253 3.13 2.959 2.782 2.573 2.286 1.987 1.688 1.337 0.894 0.433 -0.074 -0.68 -1.404 -2.228 -3.208 -4.452 -5.831 -7.531 -9.54 -12.199 -15.812 -20.683 -27.322 -37.235 -47.682 -55.278 -61.265 -66.149 -70.402 -73.971 -76.984 -79.483 -81.83 -83.73 -85.368 -86.885 -88.279 -89.54 -90.665 -91.792 -92.755 -93.581 -94.434 -95.31 -96.019 -96.748 -97.494 -98.05 -98.61 -99.188 -99.774 -100.363 -100.77 -101.19 -101.828 -102.266 -102.707 -102.928 -103.408 -103.907 -104.434 -104.698 -105.305 -105.554 -105.874 -106.198 -106.834 -107.143 -107.479 -107.866 -108.245 -108.625 -109.216 -111.056 -9 ,18451 ,TETRA ,17557994,Fri Nov 26 12:40:25 CET,Fri Nov 26 15:03:35 CET,0.0 1.915 2.262 2.471 2.6 2.729 2.865 2.976 3.201 3.311 3.394 3.26 3.518 3.561 3.617 3.665 3.737 3.763 3.791 3.812 3.805 3.791 3.782 3.768 3.725 3.648 3.56 3.479 3.357 3.227 3.101 2.902 2.675 2.441 2.153 1.798 1.38 0.883 0.334 -0.289 -0.98 -1.886 -3.124 -4.536 -6.35 -8.544 -11.399 -14.995 -19.706 -26.298 -36.223 -46.822 -54.875 -61.248 -66.343 -70.596 -74.135 -77.223 -79.758 -82.186 -84.241 -86.014 -87.659 -89.15 -90.467 -91.644 -92.83 -93.818 -94.653 -95.502 -96.376 -97.105 -97.839 -98.582 -99.158 -99.746 -100.331 -100.949 -101.605 -102.044 -102.478 -103.12 -103.567 -104.023 -104.246 -104.701 -105.178 -105.708 -105.993 -106.623 -106.87 -107.177 -107.5 -108.138 -108.499 -108.926 -109.406 -109.916 -110.451 -111.073 -113.16 -10 ,12855 ,TETRA ,17557995,Fri Nov 26 12:40:25 CET,Fri Nov 26 14:59:14 CET,0.0 0.97 1.374 1.583 1.71 1.845 1.962 2.032 2.211 2.292 2.336 2.179 2.445 2.497 2.566 2.592 2.605 2.618 2.643 2.651 2.646 2.643 2.636 2.625 2.602 2.555 2.501 2.437 2.325 2.212 2.102 1.923 1.722 1.526 1.284 0.979 0.648 0.262 -0.217 -0.84 -1.601 -2.555 -3.732 -5.083 -6.879 -9.06 -11.814 -15.257 -19.925 -26.653 -36.853 -47.495 -55.343 -61.535 -66.417 -70.499 -73.983 -77.005 -79.468 -81.825 -83.773 -85.453 -87.027 -88.455 -89.728 -90.866 -92.032 -93.042 -93.91 -94.796 -95.682 -96.398 -97.105 -97.815 -98.376 -98.961 -99.562 -100.182 -100.812 -101.235 -101.649 -102.296 -102.756 -103.222 -103.453 -103.916 -104.389 -104.881 -105.149 -105.758 -105.95 -106.233 -106.538 -107.233 -107.635 -108.073 -108.493 -108.953 -109.485 -110.128 -112.609 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 46900d94..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -6 ,26288 ,TETRA ,17558001,Fri Nov 26 12:40:25 CET,Fri Nov 26 15:02:22 CET,0.0 0.867 1.34 1.704 2.058 2.401 2.702 3.005 3.585 3.847 4.088 4.359 4.79 5.01 5.452 5.877 6.285 6.486 6.874 7.268 7.876 8.274 8.652 9.186 9.712 10.245 10.776 11.303 12.005 12.692 13.381 14.215 15.006 15.791 16.736 17.834 18.898 20.087 21.382 22.796 24.36 26.156 28.309 30.551 33.29 36.471 40.242 44.69 50.14 57.031 66.192 74.57 80.039 83.945 86.806 89.025 90.721 92.074 93.13 94.089 94.859 95.455 95.965 96.405 96.778 97.072 97.331 97.554 97.73 97.89 98.028 98.134 98.227 98.3 98.342 98.371 98.393 98.378 98.325 98.295 98.262 98.194 98.112 97.981 97.935 97.866 97.734 97.552 97.44 97.241 97.053 96.911 96.78 96.451 96.25 95.989 95.7 95.382 94.915 94.081 88.153 -8 ,26381 ,TETRA ,17558003,Fri Nov 26 13:34:01 CET,Fri Nov 26 15:54:40 CET,0.0 0.806 1.263 1.626 1.969 2.305 2.64 2.956 3.493 3.733 3.966 4.219 4.652 4.885 5.319 5.742 6.175 6.381 6.763 7.137 7.7 8.077 8.459 9.022 9.568 10.101 10.62 11.155 11.86 12.513 13.163 13.993 14.828 15.636 16.562 17.644 18.703 19.866 21.161 22.583 24.15 26.006 28.209 30.463 33.159 36.306 40.098 44.523 50.106 57.269 66.503 74.943 80.576 84.565 87.539 89.907 91.698 93.11 94.185 95.148 95.913 96.518 97.032 97.462 97.835 98.156 98.469 98.713 98.869 98.988 99.064 99.123 99.192 99.236 99.276 99.317 99.333 99.328 99.299 99.276 99.263 99.217 99.162 99.092 99.042 98.902 98.745 98.589 98.499 98.325 98.211 98.083 97.915 97.518 97.267 96.925 96.456 95.903 95.364 94.55 87.545 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt deleted file mode 100644 index da58ea0e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15502 ,TETRA ,17558006,Fri Nov 26 13:34:01 CET,Fri Nov 26 15:49:00 CET,0.0 1.332 1.803 2.146 2.439 2.693 2.925 3.148 3.607 3.833 4.037 4.223 4.627 4.838 5.237 5.62 6.006 6.183 6.54 6.905 7.414 7.749 8.084 8.549 8.995 9.433 9.877 10.35 10.985 11.595 12.171 12.872 13.597 14.345 15.203 16.137 17.068 18.12 19.262 20.561 21.954 23.514 25.35 27.204 29.422 31.954 34.921 38.415 42.876 48.487 55.837 62.744 67.386 70.682 72.993 74.74 76.062 77.137 77.972 78.711 79.216 79.595 79.967 80.296 80.575 80.795 80.98 81.092 81.177 81.278 81.385 81.452 81.485 81.49 81.484 81.486 81.464 81.449 81.427 81.375 81.301 81.204 81.158 81.103 81.05 80.916 80.767 80.598 80.509 80.32 80.252 80.148 80.041 79.783 79.642 79.447 79.159 78.84 78.488 77.84 73.417 -3 ,7397 ,TETRA ,17558008,Fri Nov 26 13:34:01 CET,Fri Nov 26 15:50:05 CET,0.0 1.145 1.637 2.007 2.303 2.59 2.864 3.115 3.577 3.797 4.006 4.191 4.579 4.763 5.133 5.523 5.909 6.092 6.43 6.768 7.277 7.604 7.926 8.404 8.877 9.336 9.791 10.243 10.828 11.401 11.98 12.708 13.434 14.142 14.933 15.817 16.696 17.697 18.807 20.027 21.351 22.882 24.713 26.573 28.795 31.351 34.447 38.147 42.714 48.662 56.491 63.543 68.069 71.131 73.324 75.0 76.225 77.192 77.964 78.729 79.337 79.81 80.225 80.573 80.843 81.043 81.217 81.338 81.422 81.467 81.5 81.532 81.537 81.57 81.619 81.624 81.604 81.586 81.564 81.517 81.432 81.276 81.166 81.045 80.972 80.851 80.736 80.604 80.549 80.368 80.239 80.112 79.965 79.533 79.304 79.097 78.853 78.567 78.139 77.539 73.454 -4 ,10301 ,TETRA ,17558009,Fri Nov 26 13:34:01 CET,Fri Nov 26 15:50:27 CET,0.0 2.295 2.777 3.184 3.553 3.882 4.18 4.448 4.945 5.183 5.402 5.637 6.069 6.29 6.713 7.114 7.501 7.692 8.069 8.444 8.99 9.339 9.668 10.147 10.627 11.09 11.548 12.014 12.624 13.202 13.762 14.428 15.087 15.75 16.535 17.438 18.314 19.303 20.394 21.575 22.885 24.455 26.337 28.269 30.574 33.264 36.585 40.531 45.369 51.417 59.272 66.461 71.207 74.54 76.982 78.786 80.116 81.207 82.066 82.825 83.393 83.817 84.164 84.444 84.674 84.858 85.014 85.128 85.207 85.25 85.275 85.272 85.241 85.208 85.163 85.123 85.08 85.018 84.96 84.924 84.884 84.759 84.662 84.572 84.524 84.416 84.264 84.078 83.991 83.794 83.719 83.62 83.47 83.113 82.93 82.732 82.491 82.218 81.843 81.213 77.732 -5 ,13324 ,TETRA ,17558010,Fri Nov 26 13:34:01 CET,Fri Nov 26 15:54:42 CET,0.0 1.789 2.313 2.695 3.02 3.302 3.597 3.894 4.409 4.662 4.896 5.137 5.549 5.749 6.145 6.524 6.884 7.069 7.435 7.784 8.299 8.633 8.959 9.436 9.914 10.401 10.881 11.351 11.937 12.487 13.039 13.726 14.409 15.099 15.91 16.835 17.768 18.859 20.049 21.312 22.658 24.213 26.038 27.898 30.228 32.911 36.092 39.892 44.657 50.701 58.688 66.144 70.873 74.134 76.524 78.367 79.781 80.932 81.818 82.587 83.181 83.615 83.964 84.282 84.514 84.722 84.959 85.117 85.219 85.302 85.351 85.366 85.378 85.399 85.428 85.455 85.439 85.41 85.369 85.327 85.293 85.213 85.148 85.031 84.967 84.852 84.658 84.432 84.32 84.126 84.071 83.97 83.83 83.483 83.304 83.08 82.762 82.406 81.933 81.269 75.273 -7 ,14244 ,TETRA ,17558012,Fri Nov 26 13:34:01 CET,Fri Nov 26 15:49:49 CET,0.0 1.681 2.112 2.468 2.815 3.132 3.405 3.672 4.153 4.361 4.563 4.78 5.172 5.362 5.723 6.067 6.404 6.581 6.94 7.275 7.773 8.09 8.396 8.873 9.342 9.796 10.248 10.695 11.295 11.883 12.443 13.15 13.85 14.556 15.373 16.268 17.169 18.191 19.333 20.577 21.879 23.355 25.159 27.088 29.395 32.055 35.341 39.207 43.92 49.851 57.68 64.848 69.407 72.549 74.824 76.544 77.805 78.81 79.603 80.291 80.796 81.199 81.521 81.774 81.998 82.185 82.332 82.42 82.504 82.586 82.643 82.669 82.677 82.688 82.689 82.692 82.68 82.654 82.621 82.586 82.529 82.446 82.403 82.321 82.277 82.199 82.099 81.969 81.899 81.721 81.622 81.462 81.29 80.903 80.66 80.43 80.184 79.904 79.525 78.866 75.391 -8 ,23865 ,TETRA ,17558013,Fri Nov 26 13:34:03 CET,Fri Nov 26 15:50:03 CET,0.0 1.626 2.056 2.452 2.834 3.169 3.486 3.789 4.288 4.512 4.729 4.946 5.347 5.544 5.937 6.327 6.714 6.907 7.265 7.617 8.144 8.478 8.813 9.328 9.819 10.272 10.711 11.155 11.748 12.345 12.95 13.674 14.382 15.093 15.887 16.799 17.709 18.706 19.782 20.941 22.226 23.748 25.537 27.406 29.63 32.141 35.207 38.884 43.414 49.004 56.416 63.187 67.563 70.718 73.056 74.811 76.141 77.252 78.111 78.846 79.385 79.84 80.249 80.579 80.853 81.077 81.252 81.358 81.464 81.586 81.691 81.753 81.785 81.783 81.772 81.775 81.779 81.759 81.721 81.685 81.626 81.526 81.466 81.393 81.342 81.236 81.121 80.987 80.933 80.776 80.682 80.563 80.43 80.116 79.921 79.665 79.348 78.977 78.46 77.699 73.68 -9 ,2077 ,TETRA ,17558014,Fri Nov 26 13:34:01 CET,Fri Nov 26 15:49:49 CET,0.0 1.143 1.517 1.853 2.209 2.512 2.768 3.001 3.44 3.658 3.87 4.074 4.473 4.681 5.062 5.419 5.786 5.969 6.333 6.688 7.186 7.505 7.832 8.329 8.812 9.309 9.802 10.263 10.865 11.458 12.032 12.739 13.436 14.117 14.911 15.817 16.732 17.766 18.91 20.165 21.506 23.003 24.784 26.671 29.009 31.674 34.753 38.303 42.609 48.076 55.348 62.106 66.558 69.737 72.082 73.894 75.291 76.371 77.17 77.871 78.378 78.783 79.143 79.462 79.693 79.895 80.132 80.288 80.392 80.503 80.598 80.656 80.712 80.773 80.825 80.871 80.889 80.888 80.866 80.829 80.761 80.625 80.554 80.498 80.462 80.384 80.242 80.039 79.957 79.777 79.633 79.498 79.388 79.144 78.971 78.723 78.484 78.224 77.812 77.207 71.645 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt deleted file mode 100644 index 04d2ed3d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31623 ,TETRA ,17558016,Fri Nov 26 13:34:02 CET,Fri Nov 26 16:00:01 CET,0.0 1.109 1.504 1.753 1.971 2.158 2.318 2.483 2.78 2.921 3.061 3.122 3.474 3.619 3.899 4.137 4.34 4.437 4.635 4.809 5.05 5.213 5.371 5.61 5.837 6.042 6.237 6.431 6.689 6.929 7.157 7.441 7.703 7.956 8.263 8.594 8.894 9.236 9.616 10.005 10.406 10.847 11.356 11.858 12.431 13.071 13.738 14.42 15.194 15.982 16.655 16.858 16.788 16.539 16.221 15.886 15.567 15.264 14.981 14.694 14.438 14.208 13.975 13.742 13.524 13.329 13.126 12.958 12.832 12.681 12.489 12.347 12.217 12.079 11.956 11.818 11.679 11.537 11.391 11.29 11.179 11.0 10.882 10.764 10.702 10.567 10.422 10.268 10.193 9.914 9.958 9.874 9.785 9.58 9.472 9.34 9.177 9.009 8.787 8.44 6.952 -2 ,13671 ,TETRA ,17558017,Fri Nov 26 13:34:04 CET,Fri Nov 26 16:00:01 CET,0.0 0.808 1.135 1.407 1.639 1.841 2.04 2.239 2.597 2.744 2.883 2.918 3.251 3.372 3.593 3.794 3.984 4.075 4.265 4.451 4.707 4.873 5.051 5.315 5.545 5.771 5.987 6.185 6.439 6.686 6.914 7.178 7.449 7.709 8.011 8.363 8.679 9.025 9.413 9.859 10.326 10.747 11.204 11.683 12.233 12.803 13.452 14.211 15.008 15.773 16.521 16.811 16.698 16.439 16.141 15.819 15.46 15.124 14.856 14.587 14.346 14.102 13.828 13.571 13.349 13.128 12.894 12.682 12.496 12.328 12.157 12.024 11.89 11.731 11.596 11.464 11.338 11.207 11.052 10.927 10.796 10.612 10.491 10.365 10.298 10.157 9.991 9.781 9.664 9.342 9.302 9.174 9.058 8.796 8.632 8.449 8.246 8.019 7.777 7.462 6.605 -3 ,18500 ,TETRA ,17558018,Fri Nov 26 13:34:06 CET,Fri Nov 26 15:57:30 CET,0.0 1.391 1.652 1.87 2.06 2.243 2.401 2.551 2.845 2.974 3.11 3.178 3.518 3.627 3.832 4.027 4.215 4.309 4.494 4.678 4.953 5.118 5.268 5.494 5.718 5.91 6.112 6.318 6.555 6.783 7.022 7.321 7.614 7.91 8.245 8.596 8.92 9.28 9.67 10.083 10.485 10.932 11.464 11.967 12.492 13.071 13.755 14.496 15.322 16.167 17.012 17.454 17.482 17.37 17.166 16.881 16.607 16.327 16.024 15.721 15.463 15.212 14.966 14.73 14.513 14.319 14.124 13.958 13.803 13.642 13.488 13.347 13.184 13.008 12.88 12.758 12.619 12.481 12.346 12.239 12.13 11.966 11.84 11.706 11.64 11.489 11.296 11.09 11.0 10.713 10.764 10.656 10.541 10.293 10.128 9.952 9.784 9.62 9.436 9.225 8.669 -4 ,18316 ,TETRA ,17558019,Fri Nov 26 13:34:02 CET,Fri Nov 26 15:55:58 CET,0.0 0.632 0.829 0.993 1.16 1.317 1.47 1.657 2.042 2.174 2.304 2.344 2.657 2.757 2.973 3.16 3.332 3.417 3.59 3.764 3.979 4.121 4.269 4.462 4.633 4.806 4.973 5.135 5.345 5.562 5.776 6.012 6.257 6.507 6.777 7.07 7.359 7.68 8.007 8.355 8.76 9.226 9.743 10.237 10.776 11.353 11.991 12.698 13.474 14.196 14.668 14.768 14.665 14.424 14.143 13.834 13.544 13.293 13.074 12.807 12.544 12.341 12.131 11.923 11.734 11.555 11.374 11.211 11.068 10.924 10.767 10.626 10.476 10.325 10.22 10.101 9.965 9.829 9.69 9.591 9.493 9.338 9.209 9.074 9.014 8.897 8.771 8.632 8.552 8.27 8.319 8.236 8.132 7.897 7.789 7.665 7.533 7.394 7.206 6.932 6.443 -5 ,2101 ,TETRA ,17558020,Fri Nov 26 13:34:03 CET,Fri Nov 26 15:54:45 CET,0.0 1.169 1.523 1.786 1.994 2.187 2.388 2.553 2.846 2.982 3.117 3.178 3.526 3.644 3.882 4.094 4.291 4.397 4.596 4.768 5.028 5.207 5.369 5.595 5.833 6.069 6.289 6.503 6.783 7.053 7.31 7.6 7.87 8.148 8.473 8.816 9.146 9.497 9.857 10.278 10.731 11.177 11.676 12.2 12.796 13.441 14.16 14.946 15.803 16.648 17.42 17.649 17.548 17.415 17.223 16.933 16.66 16.404 16.143 15.877 15.632 15.375 15.107 14.843 14.615 14.371 14.098 13.883 13.695 13.474 13.219 13.028 12.858 12.696 12.564 12.407 12.241 12.082 11.922 11.816 11.708 11.53 11.405 11.284 11.224 11.086 10.943 10.804 10.722 10.439 10.472 10.372 10.277 10.064 9.928 9.763 9.605 9.46 9.3 9.116 8.691 -6 ,30015 ,TETRA ,17558021,Fri Nov 26 13:34:02 CET,Fri Nov 26 15:56:16 CET,0.0 0.849 1.16 1.424 1.664 1.883 2.069 2.222 2.491 2.631 2.775 2.828 3.169 3.283 3.493 3.69 3.875 3.972 4.164 4.342 4.6 4.752 4.894 5.108 5.316 5.512 5.699 5.887 6.142 6.405 6.65 6.923 7.194 7.465 7.774 8.101 8.416 8.779 9.181 9.566 9.921 10.325 10.848 11.374 11.908 12.457 13.032 13.622 14.303 15.096 15.851 15.976 15.726 15.349 15.012 14.738 14.431 14.137 13.908 13.64 13.4 13.185 12.964 12.764 12.582 12.383 12.16 11.983 11.812 11.616 11.436 11.296 11.143 10.972 10.828 10.691 10.564 10.422 10.269 10.166 10.061 9.897 9.793 9.672 9.595 9.431 9.263 9.106 9.038 8.77 8.856 8.773 8.668 8.424 8.294 8.186 8.077 7.938 7.758 7.514 7.013 -7 ,4414 ,TETRA ,17558022,Fri Nov 26 13:34:02 CET,Fri Nov 26 15:57:45 CET,0.0 0.875 1.167 1.415 1.644 1.839 2.008 2.178 2.471 2.61 2.751 2.801 3.141 3.264 3.489 3.686 3.877 3.976 4.163 4.331 4.568 4.721 4.888 5.151 5.401 5.622 5.825 6.027 6.299 6.557 6.788 7.073 7.352 7.619 7.942 8.303 8.638 8.995 9.37 9.74 10.11 10.55 11.077 11.579 12.132 12.727 13.401 14.126 14.911 15.631 16.207 16.424 16.372 16.2 15.932 15.639 15.332 15.016 14.722 14.393 14.099 13.875 13.684 13.505 13.329 13.138 12.927 12.735 12.56 12.384 12.214 12.07 11.903 11.729 11.595 11.457 11.331 11.205 11.065 10.983 10.909 10.776 10.681 10.576 10.522 10.414 10.291 10.161 10.084 9.802 9.841 9.745 9.66 9.485 9.385 9.27 9.143 9.035 8.916 8.749 8.116 -8 ,17465 ,TETRA ,17558023,Fri Nov 26 13:34:02 CET,Fri Nov 26 15:57:38 CET,0.0 0.559 0.834 1.063 1.293 1.477 1.61 1.736 2.003 2.131 2.262 2.34 2.699 2.828 3.055 3.271 3.478 3.577 3.765 3.94 4.196 4.357 4.516 4.767 5.006 5.242 5.464 5.668 5.93 6.176 6.408 6.685 6.958 7.233 7.56 7.91 8.232 8.583 8.936 9.31 9.702 10.117 10.62 11.106 11.625 12.21 12.891 13.62 14.377 15.103 15.677 15.827 15.578 15.205 14.835 14.461 14.109 13.722 13.369 13.038 12.76 12.51 12.261 12.024 11.813 11.613 11.377 11.157 10.971 10.766 10.545 10.366 10.167 9.952 9.801 9.639 9.456 9.281 9.108 8.976 8.838 8.638 8.497 8.342 8.26 8.088 7.886 7.669 7.567 7.251 7.219 7.086 6.96 6.705 6.564 6.422 6.279 6.081 5.809 5.492 4.668 -9 ,14739 ,TETRA ,17558024,Fri Nov 26 13:34:02 CET,Fri Nov 26 15:38:37 CET,0.0 0.866 1.139 1.366 1.545 1.716 1.872 2.028 2.316 2.443 2.569 2.613 2.944 3.038 3.219 3.405 3.595 3.673 3.812 3.975 4.224 4.373 4.508 4.706 4.889 5.062 5.239 5.425 5.657 5.872 6.083 6.328 6.561 6.789 7.043 7.315 7.574 7.871 8.22 8.591 8.942 9.315 9.765 10.229 10.758 11.329 11.997 12.687 13.372 14.061 14.75 15.079 14.973 14.725 14.404 14.107 13.831 13.54 13.297 13.034 12.781 12.542 12.327 12.139 11.96 11.785 11.594 11.418 11.268 11.108 10.938 10.798 10.657 10.496 10.363 10.224 10.09 9.972 9.86 9.774 9.666 9.516 9.422 9.322 9.264 9.127 8.989 8.86 8.789 8.51 8.567 8.481 8.382 8.17 8.068 7.944 7.783 7.58 7.369 7.161 6.035 -10 ,12824 ,TETRA ,17558025,Fri Nov 26 13:34:02 CET,Fri Nov 26 15:56:21 CET,0.0 0.917 1.247 1.502 1.721 1.975 2.208 2.387 2.698 2.855 3.002 3.046 3.391 3.515 3.749 3.951 4.125 4.215 4.404 4.588 4.842 5.01 5.181 5.42 5.663 5.889 6.09 6.289 6.558 6.819 7.052 7.324 7.589 7.912 8.278 8.607 8.921 9.283 9.668 10.025 10.396 10.824 11.317 11.82 12.401 13.031 13.718 14.465 15.265 15.986 16.582 16.778 16.659 16.379 15.982 15.576 15.201 14.847 14.567 14.291 14.027 13.782 13.575 13.404 13.226 13.036 12.844 12.663 12.48 12.282 12.092 11.933 11.765 11.595 11.454 11.316 11.167 11.017 10.877 10.776 10.67 10.492 10.37 10.238 10.167 10.028 9.873 9.719 9.651 9.369 9.406 9.314 9.216 8.979 8.855 8.725 8.57 8.386 8.171 7.907 7.161 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 4eddf5fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21844 ,TETRA ,17558026,Fri Nov 26 13:34:02 CET,Fri Nov 26 15:55:06 CET,0.0 0.149 0.265 0.371 0.448 0.531 0.602 0.653 0.764 0.82 0.869 0.744 1.005 1.046 1.123 1.217 1.316 1.355 1.421 1.483 1.569 1.627 1.688 1.779 1.861 1.927 2.004 2.106 2.229 2.329 2.425 2.524 2.599 2.682 2.789 2.894 2.987 3.068 3.13 3.175 3.209 3.24 3.249 3.288 3.301 3.218 3.079 2.827 2.357 1.576 0.021 -2.034 -3.711 -5.112 -6.313 -7.42 -8.382 -9.2 -9.868 -10.558 -11.174 -11.761 -12.346 -12.903 -13.427 -13.894 -14.389 -14.83 -15.215 -15.59 -15.973 -16.316 -16.652 -16.973 -17.243 -17.54 -17.836 -18.126 -18.426 -18.635 -18.853 -19.194 -19.426 -19.677 -19.803 -20.045 -20.291 -20.539 -20.67 -21.07 -21.175 -21.338 -21.495 -21.871 -22.085 -22.323 -22.569 -22.852 -23.202 -23.618 -24.378 -2 ,23048 ,TETRA ,17558027,Fri Nov 26 13:34:05 CET,Fri Nov 26 15:55:29 CET,0.0 0.347 0.537 0.662 0.762 0.847 0.931 1.005 1.131 1.189 1.243 1.13 1.388 1.421 1.487 1.562 1.635 1.672 1.753 1.821 1.908 1.958 2.008 2.091 2.165 2.224 2.279 2.332 2.4 2.471 2.531 2.601 2.658 2.714 2.773 2.811 2.846 2.888 2.925 2.939 2.938 2.937 2.939 2.906 2.824 2.708 2.483 2.154 1.645 0.791 -0.766 -2.803 -4.442 -5.815 -7.035 -8.127 -9.087 -10.043 -10.847 -11.6 -12.278 -12.875 -13.415 -13.908 -14.395 -14.861 -15.347 -15.772 -16.107 -16.456 -16.842 -17.161 -17.483 -17.818 -18.083 -18.345 -18.599 -18.862 -19.137 -19.314 -19.5 -19.826 -20.053 -20.307 -20.439 -20.674 -20.91 -21.18 -21.327 -21.714 -21.774 -21.935 -22.104 -22.478 -22.668 -22.861 -23.076 -23.338 -23.606 -23.919 -25.1 -3 ,32702 ,TETRA ,17558028,Fri Nov 26 13:34:54 CET,Fri Nov 26 15:55:01 CET,0.0 0.344 0.474 0.58 0.657 0.731 0.823 0.917 1.073 1.143 1.199 1.077 1.349 1.408 1.508 1.588 1.664 1.701 1.787 1.867 1.977 2.049 2.118 2.215 2.312 2.41 2.507 2.591 2.682 2.773 2.86 2.982 3.098 3.177 3.265 3.368 3.458 3.559 3.659 3.742 3.827 3.902 3.981 4.106 4.202 4.198 4.137 3.956 3.558 2.825 1.499 -0.31 -1.954 -3.569 -5.042 -6.227 -7.116 -7.915 -8.636 -9.342 -10.007 -10.59 -11.1 -11.601 -12.094 -12.564 -13.056 -13.472 -13.814 -14.169 -14.532 -14.838 -15.145 -15.451 -15.691 -15.935 -16.193 -16.462 -16.726 -16.912 -17.113 -17.408 -17.61 -17.822 -17.926 -18.135 -18.365 -18.621 -18.754 -19.132 -19.197 -19.367 -19.536 -19.902 -20.097 -20.296 -20.514 -20.748 -21.037 -21.452 -22.748 -4 ,2053 ,TETRA ,17558029,Fri Nov 26 13:34:54 CET,Fri Nov 26 15:55:21 CET,0.0 0.537 0.692 0.814 0.921 1.026 1.113 1.201 1.335 1.396 1.465 1.363 1.63 1.681 1.78 1.881 1.978 2.018 2.083 2.152 2.25 2.312 2.373 2.459 2.536 2.595 2.652 2.725 2.809 2.859 2.912 2.985 3.056 3.116 3.173 3.243 3.313 3.376 3.434 3.479 3.519 3.562 3.585 3.577 3.536 3.471 3.357 3.076 2.532 1.639 0.147 -1.845 -3.664 -5.209 -6.51 -7.688 -8.651 -9.484 -10.234 -10.966 -11.649 -12.289 -12.874 -13.455 -13.971 -14.384 -14.82 -15.211 -15.566 -15.941 -16.306 -16.597 -16.913 -17.245 -17.497 -17.781 -18.055 -18.313 -18.597 -18.809 -19.023 -19.346 -19.576 -19.829 -19.963 -20.239 -20.526 -20.809 -20.956 -21.34 -21.368 -21.519 -21.694 -22.072 -22.284 -22.525 -22.79 -23.095 -23.509 -23.987 -25.161 -5 ,30318 ,TETRA ,17558030,Fri Nov 26 13:34:56 CET,Fri Nov 26 16:03:10 CET,0.0 0.501 0.652 0.754 0.88 1.036 1.172 1.276 1.439 1.515 1.569 1.449 1.714 1.752 1.818 1.892 1.957 1.99 2.06 2.124 2.213 2.276 2.335 2.421 2.522 2.608 2.679 2.739 2.807 2.879 2.954 3.049 3.136 3.21 3.28 3.355 3.421 3.466 3.535 3.621 3.696 3.786 3.864 3.893 3.897 3.858 3.771 3.558 3.119 2.367 0.919 -0.969 -2.562 -3.972 -5.294 -6.532 -7.628 -8.59 -9.365 -10.119 -10.768 -11.364 -11.914 -12.445 -12.947 -13.407 -13.909 -14.334 -14.694 -15.065 -15.459 -15.787 -16.121 -16.473 -16.739 -17.008 -17.287 -17.586 -17.901 -18.112 -18.339 -18.694 -18.917 -19.154 -19.279 -19.559 -19.854 -20.13 -20.275 -20.683 -20.782 -20.967 -21.159 -21.589 -21.817 -22.045 -22.305 -22.6 -22.923 -23.293 -24.423 -6 ,6871 ,TETRA ,17558031,Fri Nov 26 13:34:55 CET,Fri Nov 26 15:56:27 CET,0.0 0.223 0.384 0.521 0.634 0.726 0.825 0.925 1.083 1.144 1.21 1.131 1.406 1.463 1.557 1.635 1.712 1.751 1.843 1.93 2.042 2.123 2.195 2.289 2.368 2.45 2.548 2.649 2.766 2.863 2.951 3.05 3.147 3.246 3.344 3.442 3.547 3.655 3.756 3.872 3.996 4.093 4.216 4.38 4.48 4.45 4.341 4.141 3.725 2.95 1.525 -0.326 -1.971 -3.53 -4.982 -6.223 -7.257 -8.162 -8.887 -9.638 -10.353 -11.02 -11.649 -12.231 -12.764 -13.233 -13.733 -14.198 -14.583 -14.96 -15.356 -15.686 -16.019 -16.362 -16.626 -16.893 -17.168 -17.437 -17.697 -17.887 -18.085 -18.417 -18.661 -18.899 -19.019 -19.269 -19.523 -19.782 -19.925 -20.321 -20.384 -20.549 -20.716 -21.086 -21.282 -21.476 -21.69 -21.967 -22.328 -22.797 -24.216 -7 ,24255 ,TETRA ,17558032,Fri Nov 26 13:34:55 CET,Fri Nov 26 15:53:39 CET,0.0 0.312 0.488 0.594 0.703 0.793 0.885 0.985 1.134 1.191 1.245 1.139 1.411 1.468 1.569 1.654 1.738 1.785 1.871 1.936 2.02 2.072 2.129 2.219 2.29 2.357 2.434 2.502 2.58 2.664 2.745 2.844 2.971 3.105 3.234 3.329 3.389 3.46 3.537 3.589 3.643 3.703 3.729 3.733 3.713 3.655 3.483 3.171 2.681 1.838 0.345 -1.489 -3.011 -4.367 -5.636 -6.816 -7.796 -8.652 -9.346 -10.08 -10.728 -11.271 -11.811 -12.355 -12.876 -13.308 -13.769 -14.194 -14.556 -14.949 -15.35 -15.677 -16.022 -16.381 -16.642 -16.893 -17.162 -17.441 -17.741 -17.953 -18.159 -18.459 -18.679 -18.917 -19.042 -19.312 -19.596 -19.884 -20.035 -20.441 -20.53 -20.698 -20.863 -21.26 -21.462 -21.677 -21.943 -22.225 -22.519 -22.933 -24.158 -8 ,16577 ,TETRA ,17558033,Fri Nov 26 13:34:58 CET,Fri Nov 26 15:53:29 CET,0.0 0.253 0.397 0.505 0.609 0.699 0.78 0.87 1.02 1.074 1.123 1.001 1.254 1.289 1.361 1.441 1.524 1.559 1.617 1.673 1.76 1.824 1.889 1.972 2.044 2.12 2.214 2.297 2.372 2.441 2.504 2.562 2.609 2.653 2.702 2.771 2.85 2.931 3.001 3.057 3.109 3.148 3.156 3.134 3.094 3.036 2.902 2.669 2.195 1.288 -0.328 -2.335 -4.02 -5.4 -6.549 -7.602 -8.547 -9.452 -10.262 -11.084 -11.756 -12.365 -12.999 -13.587 -14.123 -14.62 -15.134 -15.574 -15.919 -16.276 -16.654 -16.974 -17.323 -17.669 -17.937 -18.237 -18.547 -18.828 -19.112 -19.316 -19.537 -19.914 -20.164 -20.397 -20.51 -20.753 -21.032 -21.314 -21.451 -21.844 -21.918 -22.09 -22.263 -22.615 -22.805 -23.026 -23.284 -23.565 -23.881 -24.259 -25.414 -9 ,1559 ,TETRA ,17558034,Fri Nov 26 13:34:56 CET,Fri Nov 26 15:55:49 CET,0.0 0.262 0.374 0.475 0.562 0.639 0.719 0.81 0.975 1.047 1.112 1.005 1.274 1.324 1.406 1.473 1.557 1.603 1.668 1.723 1.803 1.86 1.916 1.995 2.075 2.147 2.215 2.29 2.378 2.456 2.531 2.625 2.713 2.77 2.846 2.932 3.01 3.109 3.204 3.313 3.392 3.444 3.542 3.641 3.683 3.671 3.594 3.393 3.003 2.314 0.853 -1.07 -2.678 -4.03 -5.184 -6.348 -7.394 -8.287 -9.109 -9.954 -10.658 -11.291 -11.846 -12.344 -12.847 -13.321 -13.799 -14.2 -14.541 -14.893 -15.254 -15.554 -15.869 -16.177 -16.395 -16.622 -16.87 -17.127 -17.378 -17.559 -17.773 -18.12 -18.34 -18.552 -18.659 -18.879 -19.106 -19.357 -19.493 -19.888 -19.947 -20.091 -20.244 -20.59 -20.773 -20.987 -21.229 -21.464 -21.744 -22.108 -23.597 -10 ,5295 ,TETRA ,17558035,Fri Nov 26 13:34:58 CET,Fri Nov 26 15:53:48 CET,0.0 0.145 0.286 0.386 0.465 0.536 0.607 0.676 0.835 0.911 0.979 0.899 1.181 1.235 1.318 1.411 1.521 1.574 1.658 1.739 1.862 1.935 2.009 2.112 2.202 2.285 2.367 2.448 2.543 2.631 2.713 2.808 2.9 2.998 3.131 3.282 3.398 3.493 3.603 3.712 3.787 3.871 4.016 4.133 4.195 4.233 4.272 4.198 3.847 3.244 1.943 -0.097 -1.753 -3.097 -4.311 -5.459 -6.545 -7.548 -8.428 -9.276 -10.013 -10.69 -11.322 -11.903 -12.416 -12.894 -13.4 -13.845 -14.227 -14.612 -15.016 -15.382 -15.757 -16.114 -16.384 -16.666 -16.956 -17.254 -17.575 -17.787 -17.998 -18.344 -18.57 -18.794 -18.909 -19.149 -19.427 -19.716 -19.861 -20.269 -20.347 -20.507 -20.68 -21.049 -21.248 -21.473 -21.704 -22.002 -22.357 -22.786 -24.24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 2158f368..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26940 ,TETRA ,17558036,Fri Nov 26 13:34:56 CET,Fri Nov 26 15:58:16 CET,0.0 0.631 0.915 1.129 1.326 1.517 1.694 1.857 2.181 2.333 2.464 2.501 2.839 2.958 3.199 3.412 3.6 3.695 3.885 4.065 4.313 4.481 4.642 4.858 5.087 5.316 5.525 5.732 6.001 6.26 6.503 6.81 7.128 7.415 7.734 8.102 8.449 8.826 9.257 9.725 10.196 10.7 11.264 11.814 12.444 13.143 13.96 14.849 15.824 16.92 18.147 18.924 19.154 19.207 19.149 19.039 18.89 18.706 18.548 18.373 18.202 18.045 17.895 17.729 17.563 17.418 17.27 17.126 17.001 16.869 16.728 16.626 16.519 16.409 16.325 16.22 16.086 15.959 15.85 15.768 15.671 15.524 15.424 15.315 15.261 15.142 15.013 14.889 14.823 14.543 14.567 14.48 14.397 14.224 14.134 14.036 13.92 13.805 13.656 13.482 13.178 -2 ,4349 ,TETRA ,17558037,Fri Nov 26 13:34:58 CET,Fri Nov 26 16:04:26 CET,0.0 0.793 1.133 1.389 1.639 1.849 2.008 2.146 2.448 2.606 2.75 2.778 3.115 3.232 3.428 3.611 3.804 3.903 4.095 4.285 4.571 4.771 4.957 5.198 5.425 5.642 5.857 6.058 6.307 6.551 6.785 7.099 7.396 7.652 7.948 8.289 8.644 9.037 9.438 9.853 10.285 10.791 11.394 11.968 12.594 13.283 14.071 14.953 16.037 17.329 18.82 19.893 20.413 20.525 20.464 20.394 20.306 20.186 20.059 19.906 19.738 19.583 19.447 19.324 19.204 19.074 18.944 18.85 18.761 18.67 18.569 18.465 18.362 18.255 18.176 18.087 17.961 17.836 17.721 17.633 17.544 17.424 17.34 17.256 17.208 17.101 17.009 16.927 16.876 16.611 16.674 16.605 16.537 16.411 16.318 16.196 16.078 15.96 15.801 15.535 15.107 -3 ,11214 ,TETRA ,17558038,Fri Nov 26 13:34:57 CET,Fri Nov 26 15:59:49 CET,0.0 0.721 1.041 1.339 1.604 1.843 2.06 2.247 2.572 2.727 2.893 2.989 3.344 3.48 3.746 3.976 4.18 4.288 4.489 4.665 4.926 5.1 5.266 5.499 5.741 5.992 6.23 6.45 6.706 6.965 7.238 7.557 7.849 8.145 8.493 8.869 9.256 9.675 10.089 10.529 11.005 11.551 12.173 12.748 13.413 14.17 14.993 15.904 16.966 18.134 19.401 20.335 20.725 20.862 20.837 20.741 20.666 20.574 20.479 20.332 20.167 20.015 19.868 19.714 19.558 19.437 19.309 19.18 19.082 18.985 18.874 18.785 18.686 18.564 18.466 18.372 18.278 18.176 18.077 18.005 17.916 17.76 17.652 17.558 17.51 17.397 17.279 17.166 17.096 16.812 16.863 16.791 16.72 16.585 16.497 16.407 16.318 16.194 16.063 15.907 15.336 -4 ,23384 ,TETRA ,17558039,Fri Nov 26 13:34:55 CET,Fri Nov 26 16:00:55 CET,0.0 0.649 0.979 1.277 1.537 1.765 1.972 2.145 2.487 2.642 2.794 2.872 3.219 3.342 3.583 3.822 4.037 4.136 4.338 4.528 4.807 5.001 5.194 5.465 5.71 5.953 6.199 6.433 6.734 7.013 7.288 7.628 7.933 8.215 8.526 8.872 9.215 9.592 10.019 10.481 10.952 11.471 12.061 12.634 13.3 14.082 14.977 15.896 16.95 18.13 19.345 20.116 20.359 20.452 20.477 20.449 20.39 20.321 20.236 20.124 20.037 19.944 19.83 19.709 19.59 19.471 19.349 19.248 19.157 19.06 18.942 18.846 18.748 18.627 18.541 18.451 18.362 18.276 18.177 18.107 18.028 17.907 17.83 17.744 17.699 17.605 17.513 17.419 17.365 17.113 17.191 17.128 17.059 16.903 16.829 16.749 16.636 16.493 16.358 16.208 15.915 -5 ,9194 ,TETRA ,17558040,Fri Nov 26 13:34:57 CET,Fri Nov 26 16:03:05 CET,0.0 1.226 1.567 1.849 2.095 2.304 2.504 2.694 3.02 3.165 3.308 3.371 3.708 3.832 4.078 4.315 4.548 4.654 4.857 5.066 5.366 5.557 5.758 6.052 6.312 6.549 6.766 6.982 7.279 7.556 7.834 8.156 8.471 8.785 9.125 9.524 9.916 10.342 10.783 11.226 11.685 12.213 12.845 13.472 14.2 15.006 15.849 16.724 17.745 18.902 20.216 21.1 21.416 21.523 21.518 21.414 21.286 21.177 21.052 20.909 20.77 20.626 20.49 20.355 20.225 20.113 19.995 19.887 19.783 19.659 19.524 19.418 19.309 19.19 19.095 18.988 18.868 18.747 18.628 18.56 18.493 18.364 18.271 18.173 18.13 18.058 17.977 17.887 17.842 17.597 17.674 17.604 17.53 17.351 17.249 17.156 17.06 16.962 16.856 16.707 16.069 -6 ,29910 ,TETRA ,17558041,Fri Nov 26 13:34:56 CET,Fri Nov 26 16:06:22 CET,0.0 0.489 0.754 0.966 1.162 1.33 1.506 1.693 2.034 2.192 2.348 2.417 2.743 2.858 3.084 3.3 3.507 3.602 3.778 3.955 4.197 4.342 4.487 4.692 4.909 5.125 5.341 5.551 5.814 6.072 6.308 6.601 6.907 7.206 7.523 7.876 8.217 8.585 9.006 9.469 9.958 10.491 11.097 11.701 12.397 13.219 14.15 15.057 16.101 17.386 18.795 19.781 20.184 20.263 20.21 20.103 19.93 19.721 19.53 19.329 19.116 18.929 18.783 18.637 18.501 18.385 18.253 18.119 17.999 17.876 17.725 17.598 17.478 17.355 17.261 17.15 17.023 16.9 16.776 16.687 16.591 16.426 16.313 16.213 16.159 16.032 15.89 15.758 15.696 15.44 15.505 15.417 15.332 15.165 15.078 14.998 14.878 14.721 14.529 14.294 13.837 -7 ,18173 ,TETRA ,17558042,Fri Nov 26 13:34:56 CET,Fri Nov 26 15:58:45 CET,0.0 0.901 1.257 1.524 1.762 1.971 2.149 2.32 2.648 2.796 2.961 3.081 3.434 3.559 3.785 4.002 4.228 4.336 4.53 4.705 4.968 5.143 5.322 5.588 5.838 6.067 6.291 6.512 6.793 7.065 7.328 7.654 7.969 8.271 8.604 8.973 9.341 9.742 10.165 10.629 11.139 11.699 12.356 12.98 13.638 14.375 15.184 16.078 17.07 18.121 19.275 19.957 20.205 20.205 20.107 19.957 19.778 19.576 19.374 19.185 19.014 18.857 18.678 18.508 18.345 18.173 18.007 17.858 17.733 17.603 17.472 17.365 17.248 17.113 16.998 16.888 16.763 16.631 16.477 16.375 16.292 16.139 16.03 15.928 15.875 15.762 15.63 15.497 15.428 15.152 15.203 15.123 15.034 14.854 14.754 14.633 14.513 14.368 14.206 14.027 13.429 -8 ,27889 ,TETRA ,17558043,Fri Nov 26 13:34:56 CET,Fri Nov 26 16:03:06 CET,0.0 0.788 1.023 1.225 1.404 1.57 1.71 1.829 2.07 2.185 2.303 2.298 2.604 2.704 2.898 3.077 3.251 3.332 3.498 3.673 3.922 4.082 4.241 4.472 4.687 4.883 5.087 5.302 5.57 5.843 6.097 6.392 6.681 6.964 7.306 7.68 8.058 8.482 8.936 9.444 9.944 10.48 11.13 11.792 12.572 13.425 14.361 15.42 16.656 17.982 19.459 20.517 21.043 21.312 21.427 21.422 21.339 21.18 21.006 20.86 20.72 20.583 20.464 20.315 20.174 20.077 19.961 19.843 19.729 19.59 19.446 19.334 19.223 19.107 19.011 18.91 18.814 18.711 18.597 18.522 18.439 18.316 18.233 18.148 18.106 18.005 17.908 17.803 17.739 17.471 17.546 17.479 17.408 17.237 17.145 17.046 16.914 16.766 16.617 16.428 16.143 -9 ,21723 ,TETRA ,17558044,Fri Nov 26 13:34:56 CET,Fri Nov 26 15:59:17 CET,0.0 1.067 1.417 1.696 1.928 2.136 2.315 2.486 2.825 2.998 3.16 3.244 3.586 3.693 3.907 4.126 4.346 4.454 4.664 4.871 5.172 5.343 5.517 5.785 6.029 6.25 6.462 6.665 6.928 7.193 7.444 7.737 8.033 8.335 8.702 9.116 9.494 9.882 10.288 10.712 11.146 11.655 12.254 12.846 13.549 14.375 15.283 16.246 17.361 18.605 19.885 20.782 21.222 21.367 21.39 21.359 21.278 21.139 20.998 20.848 20.7 20.541 20.366 20.196 20.04 19.918 19.799 19.664 19.532 19.401 19.249 19.106 18.967 18.84 18.739 18.638 18.538 18.427 18.314 18.247 18.173 18.053 17.974 17.878 17.826 17.714 17.596 17.478 17.418 17.143 17.196 17.11 17.015 16.815 16.711 16.62 16.52 16.388 16.222 15.948 15.308 -10 ,4935 ,TETRA ,17558045,Fri Nov 26 13:34:59 CET,Fri Nov 26 15:59:26 CET,0.0 0.669 0.979 1.225 1.436 1.635 1.828 2.003 2.314 2.475 2.621 2.651 2.999 3.129 3.387 3.65 3.89 4.002 4.215 4.41 4.68 4.853 5.036 5.295 5.521 5.748 5.977 6.2 6.485 6.769 7.024 7.3 7.587 7.871 8.176 8.492 8.807 9.176 9.617 10.094 10.527 10.973 11.506 12.056 12.68 13.383 14.198 15.096 16.073 17.195 18.439 19.254 19.626 19.74 19.696 19.609 19.505 19.385 19.251 19.076 18.938 18.836 18.721 18.601 18.501 18.407 18.297 18.19 18.085 17.965 17.85 17.754 17.646 17.521 17.41 17.292 17.178 17.07 16.96 16.88 16.774 16.617 16.526 16.424 16.368 16.252 16.134 16.01 15.942 15.666 15.737 15.673 15.601 15.448 15.365 15.268 15.165 15.038 14.891 14.717 14.411 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt deleted file mode 100644 index 5dba59a4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19232 ,TETRA ,17558046,Fri Nov 26 13:35:01 CET,Fri Nov 26 16:04:47 CET,0.0 0.319 0.461 0.578 0.703 0.831 0.939 1.029 1.189 1.259 1.327 1.269 1.537 1.604 1.729 1.852 1.973 2.029 2.142 2.243 2.381 2.468 2.549 2.674 2.798 2.916 3.034 3.148 3.315 3.477 3.626 3.822 4.002 4.146 4.313 4.504 4.657 4.848 5.07 5.286 5.512 5.752 6.007 6.254 6.519 6.764 7.018 7.255 7.428 7.414 7.064 6.3 5.402 4.599 3.872 3.167 2.544 1.983 1.521 1.082 0.698 0.342 -0.01 -0.338 -0.644 -0.927 -1.237 -1.534 -1.771 -2.01 -2.282 -2.508 -2.731 -2.976 -3.167 -3.34 -3.528 -3.721 -3.905 -4.041 -4.177 -4.391 -4.551 -4.738 -4.831 -5.013 -5.214 -5.424 -5.52 -5.819 -5.842 -5.949 -6.04 -6.288 -6.448 -6.614 -6.789 -6.961 -7.165 -7.461 -7.92 -2 ,12373 ,TETRA ,17558047,Fri Nov 26 13:34:56 CET,Fri Nov 26 16:04:30 CET,0.0 0.369 0.566 0.776 0.922 1.012 1.097 1.186 1.371 1.467 1.558 1.526 1.795 1.855 1.978 2.118 2.266 2.337 2.459 2.562 2.704 2.794 2.88 3.011 3.143 3.258 3.367 3.477 3.605 3.732 3.87 4.035 4.171 4.286 4.436 4.605 4.768 4.94 5.104 5.267 5.451 5.636 5.814 6.021 6.26 6.475 6.698 6.894 6.978 6.818 6.197 5.215 4.33 3.515 2.738 2.083 1.547 1.013 0.54 0.061 -0.348 -0.704 -1.044 -1.386 -1.7 -1.969 -2.237 -2.474 -2.678 -2.912 -3.157 -3.352 -3.544 -3.756 -3.943 -4.139 -4.332 -4.521 -4.711 -4.839 -4.988 -5.217 -5.364 -5.514 -5.592 -5.755 -5.916 -6.087 -6.179 -6.476 -6.468 -6.583 -6.706 -6.965 -7.116 -7.269 -7.404 -7.54 -7.709 -7.925 -8.512 -3 ,9754 ,TETRA ,17558048,Fri Nov 26 13:34:56 CET,Fri Nov 26 16:06:05 CET,0.0 0.512 0.703 0.867 1.002 1.11 1.244 1.381 1.604 1.688 1.765 1.722 2.001 2.081 2.243 2.396 2.525 2.583 2.698 2.809 2.974 3.076 3.176 3.318 3.448 3.575 3.7 3.832 4.01 4.171 4.315 4.482 4.638 4.784 4.95 5.136 5.321 5.498 5.656 5.821 6.009 6.239 6.505 6.744 6.99 7.258 7.475 7.633 7.747 7.685 7.215 6.324 5.433 4.574 3.801 3.081 2.432 1.897 1.454 0.987 0.559 0.177 -0.169 -0.481 -0.788 -1.099 -1.395 -1.653 -1.887 -2.14 -2.41 -2.612 -2.808 -3.027 -3.194 -3.341 -3.496 -3.676 -3.872 -4.012 -4.149 -4.372 -4.532 -4.705 -4.797 -4.993 -5.209 -5.406 -5.508 -5.834 -5.864 -5.983 -6.125 -6.422 -6.562 -6.71 -6.865 -7.039 -7.218 -7.412 -7.65 -4 ,13331 ,TETRA ,17558049,Fri Nov 26 13:34:58 CET,Fri Nov 26 16:07:11 CET,0.0 0.332 0.493 0.628 0.745 0.836 0.929 1.032 1.23 1.328 1.432 1.419 1.703 1.786 1.927 2.056 2.185 2.246 2.357 2.475 2.644 2.745 2.842 2.985 3.124 3.262 3.402 3.518 3.656 3.797 3.927 4.087 4.257 4.439 4.641 4.844 5.021 5.199 5.373 5.576 5.802 6.011 6.235 6.462 6.687 6.904 7.138 7.353 7.495 7.482 7.007 6.077 5.191 4.42 3.759 3.142 2.599 2.075 1.6 1.137 0.743 0.4 0.062 -0.266 -0.566 -0.835 -1.109 -1.349 -1.555 -1.787 -2.041 -2.244 -2.453 -2.678 -2.849 -3.017 -3.195 -3.388 -3.591 -3.725 -3.867 -4.1 -4.264 -4.45 -4.544 -4.721 -4.912 -5.128 -5.236 -5.544 -5.556 -5.669 -5.786 -6.071 -6.241 -6.424 -6.626 -6.866 -7.097 -7.345 -7.767 -5 ,4706 ,TETRA ,17558050,Fri Nov 26 13:40:59 CET,Fri Nov 26 16:00:05 CET,0.0 0.332 0.479 0.63 0.75 0.864 0.965 1.056 1.247 1.328 1.403 1.363 1.635 1.701 1.822 1.931 2.043 2.099 2.206 2.322 2.486 2.59 2.702 2.857 2.989 3.116 3.242 3.379 3.549 3.693 3.838 4.013 4.172 4.337 4.523 4.713 4.91 5.133 5.366 5.596 5.833 6.081 6.346 6.606 6.888 7.165 7.47 7.763 7.952 7.955 7.549 6.75 5.979 5.247 4.548 3.854 3.227 2.646 2.122 1.621 1.21 0.824 0.441 0.083 -0.243 -0.526 -0.819 -1.096 -1.343 -1.607 -1.887 -2.096 -2.312 -2.566 -2.749 -2.923 -3.126 -3.339 -3.559 -3.71 -3.867 -4.112 -4.293 -4.485 -4.576 -4.767 -4.965 -5.164 -5.267 -5.575 -5.59 -5.708 -5.836 -6.116 -6.269 -6.441 -6.618 -6.791 -6.968 -7.185 -7.74 -6 ,32102 ,TETRA ,17558051,Fri Nov 26 13:40:59 CET,Fri Nov 26 16:12:17 CET,0.0 0.308 0.434 0.553 0.719 0.857 0.956 1.056 1.245 1.338 1.427 1.387 1.66 1.715 1.837 1.967 2.093 2.16 2.29 2.401 2.566 2.678 2.79 2.95 3.074 3.179 3.285 3.396 3.551 3.695 3.824 3.968 4.105 4.263 4.455 4.633 4.786 4.963 5.167 5.364 5.56 5.778 5.989 6.209 6.471 6.733 6.989 7.193 7.321 7.223 6.743 5.974 5.15 4.354 3.605 2.888 2.251 1.669 1.154 0.612 0.116 -0.327 -0.729 -1.08 -1.368 -1.631 -1.914 -2.157 -2.373 -2.611 -2.881 -3.093 -3.293 -3.525 -3.724 -3.926 -4.114 -4.301 -4.493 -4.618 -4.758 -4.975 -5.121 -5.276 -5.353 -5.495 -5.665 -5.867 -5.969 -6.28 -6.276 -6.396 -6.52 -6.795 -6.933 -7.07 -7.231 -7.396 -7.561 -7.768 -8.414 -7 ,32060 ,TETRA ,17558052,Fri Nov 26 13:41:00 CET,Fri Nov 26 16:13:56 CET,0.0 0.349 0.523 0.662 0.793 0.913 1.019 1.114 1.296 1.378 1.454 1.405 1.684 1.758 1.89 2.018 2.138 2.197 2.31 2.408 2.542 2.64 2.738 2.861 2.988 3.122 3.248 3.366 3.518 3.679 3.826 4.002 4.172 4.338 4.54 4.752 4.938 5.143 5.349 5.531 5.728 5.936 6.154 6.374 6.602 6.787 6.948 7.078 7.124 7.005 6.468 5.565 4.712 3.88 3.11 2.403 1.792 1.258 0.786 0.288 -0.126 -0.495 -0.878 -1.248 -1.58 -1.861 -2.154 -2.425 -2.671 -2.941 -3.226 -3.46 -3.695 -3.931 -4.098 -4.27 -4.463 -4.66 -4.86 -5.011 -5.17 -5.429 -5.603 -5.77 -5.852 -6.021 -6.217 -6.41 -6.509 -6.823 -6.848 -6.965 -7.092 -7.377 -7.535 -7.683 -7.831 -8.018 -8.271 -8.599 -9.722 -8 ,10907 ,TETRA ,17558053,Fri Nov 26 13:40:59 CET,Fri Nov 26 16:13:25 CET,0.0 0.533 0.707 0.829 0.934 1.04 1.148 1.258 1.478 1.574 1.65 1.582 1.847 1.914 2.042 2.155 2.289 2.352 2.458 2.551 2.678 2.772 2.865 2.999 3.133 3.271 3.389 3.495 3.644 3.78 3.899 4.048 4.2 4.344 4.502 4.663 4.822 4.98 5.147 5.325 5.508 5.74 5.967 6.155 6.374 6.61 6.819 6.951 7.026 6.932 6.429 5.634 4.878 4.15 3.46 2.804 2.173 1.624 1.19 0.742 0.342 -0.007 -0.315 -0.624 -0.928 -1.194 -1.477 -1.744 -1.967 -2.187 -2.423 -2.621 -2.822 -3.035 -3.204 -3.393 -3.604 -3.821 -4.036 -4.174 -4.316 -4.543 -4.692 -4.842 -4.926 -5.1 -5.27 -5.442 -5.534 -5.842 -5.851 -5.964 -6.1 -6.408 -6.571 -6.744 -6.936 -7.132 -7.328 -7.563 -8.369 -9 ,3254 ,TETRA ,17558054,Fri Nov 26 13:40:59 CET,Fri Nov 26 16:10:52 CET,0.0 0.343 0.52 0.655 0.767 0.869 0.971 1.064 1.226 1.305 1.39 1.346 1.617 1.693 1.834 1.957 2.071 2.123 2.219 2.323 2.495 2.617 2.726 2.87 3.011 3.134 3.246 3.347 3.467 3.571 3.683 3.825 3.947 4.074 4.226 4.393 4.558 4.708 4.856 5.031 5.194 5.359 5.544 5.694 5.833 5.966 6.119 6.238 6.221 6.02 5.497 4.613 3.731 2.899 2.171 1.536 1.004 0.511 0.071 -0.373 -0.765 -1.114 -1.453 -1.773 -2.066 -2.331 -2.61 -2.898 -3.164 -3.383 -3.601 -3.814 -4.029 -4.238 -4.405 -4.582 -4.777 -4.981 -5.169 -5.298 -5.437 -5.647 -5.795 -5.942 -6.017 -6.169 -6.324 -6.493 -6.586 -6.896 -6.888 -6.995 -7.115 -7.353 -7.499 -7.662 -7.838 -8.015 -8.202 -8.467 -8.825 -10 ,21832 ,TETRA ,17558055,Fri Nov 26 13:40:59 CET,Fri Nov 26 16:13:29 CET,0.0 0.535 0.853 1.058 1.168 1.274 1.382 1.474 1.643 1.72 1.799 1.755 2.025 2.079 2.185 2.295 2.401 2.456 2.551 2.644 2.801 2.899 2.984 3.126 3.268 3.4 3.513 3.636 3.822 3.983 4.112 4.259 4.413 4.566 4.741 4.925 5.083 5.243 5.415 5.594 5.765 5.944 6.169 6.396 6.653 6.932 7.16 7.354 7.495 7.36 6.686 5.718 4.823 3.992 3.259 2.588 1.988 1.426 0.919 0.393 -0.035 -0.409 -0.781 -1.127 -1.444 -1.739 -2.052 -2.33 -2.564 -2.803 -3.049 -3.255 -3.471 -3.704 -3.875 -4.045 -4.22 -4.415 -4.629 -4.767 -4.905 -5.117 -5.27 -5.426 -5.511 -5.69 -5.866 -6.048 -6.144 -6.446 -6.463 -6.587 -6.697 -6.904 -7.019 -7.163 -7.312 -7.486 -7.756 -8.077 -8.507 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index be5e9040..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14846 ,KEBNE ,17125823,Thu Dec 30 16:52:55 CET,Thu Dec 30 18:57:26 CET,0.0 0.377 0.642 0.824 0.973 1.099 1.218 1.354 1.601 1.703 1.807 1.801 2.086 2.168 2.317 2.459 2.601 2.674 2.819 2.948 3.145 3.28 3.398 3.572 3.749 3.918 4.088 4.26 4.474 4.674 4.868 5.101 5.339 5.577 5.854 6.161 6.456 6.793 7.194 7.611 8.037 8.53 9.113 9.717 10.41 11.187 12.109 13.158 14.389 15.865 17.601 18.938 19.587 19.837 19.974 20.041 19.995 19.899 19.763 19.582 19.389 19.184 18.963 18.742 18.544 18.345 18.139 17.989 17.877 17.734 17.552 17.416 17.273 17.113 16.983 16.834 16.651 16.445 16.239 16.096 15.949 15.731 15.589 15.429 15.337 15.142 14.926 14.702 14.592 14.292 14.2 14.037 13.86 13.501 13.312 13.121 12.901 12.628 12.282 11.796 10.538 -2 ,24678 ,KEBNE ,17125824,Thu Dec 30 16:52:55 CET,Thu Dec 30 18:58:24 CET,0.0 0.414 0.683 0.911 1.077 1.217 1.341 1.456 1.654 1.761 1.879 1.879 2.179 2.267 2.427 2.595 2.75 2.817 2.949 3.088 3.321 3.487 3.646 3.854 4.038 4.214 4.391 4.568 4.78 4.995 5.226 5.487 5.726 5.972 6.254 6.558 6.862 7.21 7.608 8.028 8.457 8.935 9.455 9.984 10.625 11.362 12.23 13.249 14.432 15.749 17.232 18.363 18.869 19.072 19.123 19.022 18.851 18.655 18.465 18.263 18.091 17.914 17.721 17.506 17.284 17.082 16.868 16.667 16.461 16.217 15.975 15.799 15.598 15.362 15.182 14.998 14.806 14.593 14.361 14.203 14.04 13.77 13.575 13.382 13.282 13.059 12.824 12.594 12.473 12.157 12.046 11.889 11.732 11.377 11.159 10.909 10.641 10.337 9.914 9.301 7.381 -3 ,32179 ,KEBNE ,17125825,Thu Dec 30 16:52:55 CET,Thu Dec 30 18:58:04 CET,0.0 0.803 1.044 1.238 1.395 1.529 1.651 1.768 2.009 2.126 2.231 2.227 2.534 2.633 2.824 2.998 3.149 3.227 3.383 3.529 3.742 3.883 4.026 4.245 4.457 4.636 4.804 4.984 5.213 5.419 5.604 5.837 6.068 6.29 6.555 6.841 7.123 7.441 7.795 8.189 8.629 9.129 9.683 10.247 10.891 11.593 12.428 13.37 14.511 15.881 17.405 18.562 19.139 19.327 19.279 19.133 18.971 18.774 18.559 18.32 18.103 17.909 17.714 17.51 17.302 17.082 16.84 16.63 16.455 16.28 16.079 15.882 15.652 15.42 15.252 15.065 14.855 14.657 14.447 14.289 14.129 13.889 13.723 13.538 13.438 13.217 12.977 12.727 12.595 12.278 12.146 11.966 11.784 11.379 11.165 10.924 10.656 10.342 9.953 9.462 7.558 -4 ,29097 ,KEBNE ,17125826,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:58:30 CET,0.0 0.423 0.634 0.83 1.005 1.145 1.257 1.364 1.574 1.683 1.797 1.806 2.109 2.211 2.396 2.559 2.709 2.776 2.91 3.045 3.237 3.37 3.505 3.682 3.853 4.02 4.188 4.357 4.559 4.754 4.95 5.185 5.422 5.67 5.955 6.263 6.554 6.873 7.211 7.594 8.023 8.519 9.093 9.691 10.412 11.18 12.068 13.101 14.345 15.764 17.333 18.535 19.129 19.352 19.414 19.408 19.356 19.276 19.159 18.991 18.824 18.642 18.467 18.326 18.177 18.018 17.861 17.723 17.593 17.442 17.261 17.11 16.965 16.812 16.685 16.558 16.414 16.249 16.084 15.978 15.87 15.689 15.553 15.395 15.32 15.172 15.009 14.819 14.705 14.397 14.347 14.2 14.047 13.781 13.62 13.431 13.226 12.963 12.657 12.268 11.254 -5 ,2930 ,KEBNE ,17125827,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:59:27 CET,0.0 0.338 0.508 0.664 0.811 0.94 1.05 1.165 1.419 1.53 1.629 1.614 1.898 1.989 2.166 2.326 2.473 2.55 2.706 2.859 3.067 3.199 3.335 3.536 3.735 3.936 4.141 4.339 4.58 4.81 5.029 5.293 5.555 5.813 6.121 6.454 6.756 7.095 7.474 7.881 8.297 8.77 9.304 9.85 10.561 11.351 12.268 13.324 14.525 15.891 17.433 18.64 19.249 19.493 19.532 19.473 19.359 19.196 18.992 18.747 18.526 18.318 18.104 17.876 17.634 17.376 17.08 16.808 16.586 16.361 16.119 15.919 15.712 15.481 15.291 15.091 14.877 14.673 14.467 14.32 14.169 13.911 13.722 13.523 13.422 13.217 12.989 12.742 12.611 12.273 12.127 11.957 11.768 11.345 11.098 10.841 10.584 10.269 9.814 9.18 7.391 -6 ,29790 ,KEBNE ,17125828,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:58:03 CET,0.0 0.92 1.218 1.415 1.585 1.731 1.883 2.015 2.204 2.296 2.38 2.348 2.632 2.717 2.907 3.096 3.267 3.353 3.535 3.711 3.955 4.105 4.252 4.461 4.648 4.821 5.008 5.206 5.449 5.677 5.892 6.141 6.38 6.615 6.892 7.224 7.579 7.977 8.36 8.734 9.146 9.626 10.187 10.757 11.413 12.127 12.96 13.914 15.055 16.388 17.898 19.026 19.493 19.624 19.641 19.6 19.512 19.401 19.239 19.013 18.8 18.607 18.404 18.204 18.019 17.832 17.625 17.42 17.219 17.025 16.832 16.676 16.519 16.363 16.231 16.053 15.859 15.662 15.47 15.346 15.215 15.021 14.888 14.725 14.633 14.434 14.229 14.005 13.883 13.569 13.456 13.311 13.17 12.814 12.608 12.378 12.113 11.823 11.472 11.009 9.914 -7 ,32531 ,KEBNE ,17125829,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:59:07 CET,0.0 0.561 0.772 0.96 1.137 1.313 1.472 1.619 1.874 1.987 2.1 2.117 2.426 2.522 2.711 2.907 3.09 3.178 3.347 3.506 3.721 3.875 4.038 4.263 4.462 4.638 4.816 4.985 5.206 5.438 5.666 5.94 6.211 6.469 6.759 7.094 7.427 7.812 8.247 8.681 9.129 9.635 10.221 10.828 11.548 12.395 13.341 14.334 15.455 16.722 18.096 18.987 19.296 19.289 19.161 18.998 18.771 18.52 18.28 18.012 17.787 17.57 17.334 17.06 16.79 16.552 16.315 16.111 15.917 15.716 15.498 15.302 15.095 14.881 14.707 14.512 14.327 14.124 13.891 13.725 13.541 13.237 13.018 12.801 12.696 12.472 12.23 12.008 11.883 11.543 11.401 11.21 11.018 10.625 10.406 10.149 9.839 9.486 9.03 8.416 6.085 -8 ,30839 ,KEBNE ,17125830,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:58:48 CET,0.0 0.354 0.544 0.71 0.867 1.025 1.179 1.306 1.548 1.667 1.799 1.857 2.173 2.278 2.483 2.664 2.831 2.912 3.065 3.21 3.408 3.533 3.656 3.827 4.015 4.201 4.362 4.524 4.746 4.962 5.186 5.479 5.753 5.993 6.263 6.574 6.873 7.219 7.607 8.025 8.469 8.972 9.586 10.192 10.863 11.675 12.645 13.691 14.912 16.376 18.069 19.389 20.044 20.383 20.52 20.581 20.576 20.46 20.329 20.218 20.076 19.927 19.79 19.617 19.443 19.287 19.098 18.915 18.762 18.609 18.447 18.319 18.177 18.017 17.88 17.728 17.561 17.386 17.222 17.108 16.985 16.794 16.664 16.512 16.431 16.254 16.06 15.865 15.763 15.472 15.428 15.305 15.168 14.872 14.702 14.499 14.292 14.082 13.823 13.504 12.795 -9 ,18995 ,KEBNE ,17125831,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:57:41 CET,0.0 0.338 0.535 0.713 0.874 1.035 1.171 1.296 1.526 1.625 1.734 1.741 2.038 2.144 2.331 2.499 2.659 2.729 2.884 3.038 3.231 3.365 3.495 3.673 3.849 4.026 4.204 4.372 4.595 4.821 5.044 5.308 5.576 5.841 6.126 6.439 6.733 7.058 7.432 7.846 8.271 8.746 9.327 9.923 10.601 11.385 12.31 13.318 14.432 15.686 17.147 18.302 18.89 19.137 19.173 19.097 18.956 18.755 18.553 18.345 18.145 17.936 17.7 17.458 17.202 16.973 16.739 16.523 16.338 16.12 15.872 15.649 15.413 15.156 14.967 14.784 14.568 14.333 14.084 13.92 13.745 13.469 13.286 13.083 12.973 12.746 12.516 12.28 12.157 11.846 11.743 11.586 11.427 11.088 10.886 10.638 10.328 9.987 9.628 9.137 8.058 -10 ,20837 ,KEBNE ,17125832,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:58:07 CET,0.0 0.608 0.855 1.063 1.266 1.432 1.576 1.714 1.989 2.1 2.2 2.202 2.51 2.618 2.796 2.972 3.142 3.216 3.36 3.5 3.709 3.854 3.989 4.179 4.369 4.554 4.727 4.892 5.106 5.318 5.523 5.771 6.025 6.269 6.549 6.864 7.163 7.501 7.873 8.255 8.64 9.1 9.664 10.21 10.875 11.617 12.409 13.328 14.41 15.618 16.937 17.835 18.24 18.341 18.281 18.187 18.037 17.803 17.541 17.27 17.047 16.853 16.637 16.401 16.199 16.011 15.778 15.571 15.397 15.2 14.981 14.801 14.611 14.404 14.249 14.092 13.918 13.72 13.506 13.355 13.191 12.923 12.747 12.569 12.466 12.24 12.007 11.776 11.649 11.32 11.222 11.072 10.922 10.604 10.429 10.235 10.001 9.739 9.402 8.931 7.742 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt deleted file mode 100644 index f118ca61..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13733 ,TETRA ,17558056,Fri Nov 26 13:40:59 CET,Fri Nov 26 16:13:33 CET,0.0 0.225 0.4 0.52 0.632 0.757 0.868 0.958 1.147 1.243 1.341 1.33 1.619 1.704 1.857 2.01 2.156 2.22 2.354 2.488 2.686 2.81 2.917 3.07 3.226 3.387 3.553 3.708 3.897 4.086 4.266 4.469 4.678 4.891 5.141 5.412 5.686 5.992 6.299 6.637 6.969 7.32 7.737 8.162 8.646 9.158 9.743 10.364 11.039 11.738 12.378 12.609 12.505 12.268 11.969 11.639 11.32 10.999 10.689 10.362 10.056 9.759 9.472 9.2 8.95 8.706 8.442 8.229 8.052 7.839 7.591 7.377 7.155 6.942 6.79 6.628 6.446 6.237 6.009 5.851 5.684 5.428 5.246 5.06 4.969 4.765 4.533 4.289 4.173 3.866 3.789 3.644 3.49 3.169 3.021 2.853 2.661 2.429 2.152 1.804 1.251 -2 ,7037 ,TETRA ,17558057,Fri Nov 26 13:41:59 CET,Fri Nov 26 16:15:12 CET,0.0 0.7 0.874 1.029 1.168 1.318 1.457 1.584 1.797 1.884 1.977 1.966 2.25 2.335 2.5 2.662 2.822 2.896 3.038 3.176 3.373 3.488 3.598 3.767 3.93 4.084 4.232 4.366 4.536 4.717 4.895 5.111 5.312 5.511 5.753 6.034 6.315 6.603 6.907 7.239 7.59 7.963 8.402 8.846 9.34 9.875 10.464 11.099 11.813 12.531 13.096 13.214 13.038 12.759 12.418 12.054 11.726 11.404 11.13 10.862 10.587 10.31 10.02 9.715 9.445 9.218 8.96 8.719 8.506 8.251 7.988 7.793 7.589 7.378 7.2 7.015 6.824 6.61 6.39 6.236 6.07 5.797 5.593 5.387 5.294 5.099 4.873 4.629 4.506 4.199 4.135 3.972 3.812 3.494 3.314 3.127 2.902 2.651 2.383 2.006 0.962 -3 ,3113 ,TETRA ,17558058,Fri Nov 26 13:42:01 CET,Fri Nov 26 16:16:13 CET,0.0 0.722 0.944 1.107 1.237 1.351 1.46 1.585 1.838 1.954 2.06 2.064 2.358 2.461 2.645 2.8 2.951 3.023 3.173 3.335 3.575 3.719 3.841 4.003 4.178 4.355 4.52 4.685 4.882 5.066 5.242 5.455 5.658 5.851 6.077 6.335 6.579 6.86 7.155 7.466 7.806 8.183 8.634 9.082 9.586 10.126 10.72 11.365 12.058 12.722 13.418 13.807 13.786 13.586 13.325 13.063 12.82 12.539 12.258 11.96 11.691 11.446 11.201 10.964 10.747 10.541 10.302 10.093 9.909 9.707 9.506 9.346 9.162 8.965 8.817 8.66 8.493 8.317 8.109 7.967 7.829 7.583 7.399 7.199 7.094 6.862 6.623 6.38 6.252 5.938 5.89 5.749 5.574 5.184 4.983 4.763 4.501 4.245 3.985 3.658 2.797 -4 ,9437 ,TETRA ,17558059,Fri Nov 26 13:43:59 CET,Fri Nov 26 16:18:57 CET,0.0 0.585 0.828 0.993 1.109 1.221 1.321 1.407 1.572 1.655 1.738 1.697 1.985 2.067 2.217 2.362 2.499 2.564 2.68 2.783 2.951 3.067 3.17 3.304 3.431 3.566 3.704 3.841 4.031 4.223 4.417 4.656 4.879 5.084 5.305 5.541 5.779 6.064 6.373 6.672 6.987 7.364 7.798 8.246 8.746 9.252 9.874 10.555 11.265 12.01 12.659 12.874 12.78 12.583 12.315 12.0 11.724 11.473 11.189 10.827 10.529 10.223 9.906 9.612 9.336 9.107 8.857 8.65 8.481 8.285 8.078 7.916 7.735 7.552 7.414 7.26 7.096 6.933 6.767 6.645 6.502 6.254 6.086 5.913 5.818 5.624 5.422 5.207 5.095 4.789 4.748 4.621 4.484 4.185 4.018 3.852 3.657 3.421 3.17 2.859 2.145 -5 ,3291 ,TETRA ,17558060,Fri Nov 26 13:52:58 CET,Fri Nov 26 16:28:29 CET,0.0 0.855 1.072 1.193 1.299 1.389 1.491 1.595 1.8 1.904 1.993 1.963 2.261 2.357 2.512 2.665 2.817 2.888 3.022 3.142 3.323 3.449 3.572 3.751 3.939 4.108 4.258 4.42 4.622 4.803 4.972 5.175 5.389 5.62 5.872 6.13 6.383 6.652 6.944 7.245 7.57 7.943 8.362 8.796 9.307 9.881 10.527 11.22 12.0 12.856 13.686 14.008 13.915 13.656 13.332 12.994 12.627 12.25 11.928 11.589 11.273 10.969 10.654 10.351 10.059 9.778 9.482 9.22 8.972 8.707 8.418 8.178 7.942 7.688 7.497 7.311 7.105 6.881 6.64 6.483 6.341 6.125 5.971 5.798 5.692 5.458 5.231 5.008 4.89 4.567 4.46 4.306 4.16 3.801 3.607 3.408 3.188 2.975 2.715 2.188 0.611 -6 ,31966 ,TETRA ,17558061,Fri Nov 26 13:52:57 CET,Fri Nov 26 16:24:03 CET,0.0 0.606 0.848 1.008 1.119 1.227 1.341 1.448 1.633 1.728 1.834 1.846 2.14 2.222 2.384 2.55 2.72 2.805 2.951 3.077 3.258 3.369 3.468 3.637 3.809 3.983 4.155 4.314 4.511 4.693 4.866 5.069 5.275 5.477 5.714 5.977 6.22 6.487 6.786 7.106 7.443 7.823 8.242 8.675 9.173 9.676 10.251 10.882 11.59 12.387 13.204 13.759 13.852 13.719 13.551 13.342 13.117 12.882 12.621 12.334 12.096 11.874 11.656 11.45 11.226 10.987 10.727 10.49 10.294 10.101 9.907 9.746 9.574 9.39 9.238 9.086 8.926 8.738 8.539 8.402 8.254 8.016 7.867 7.71 7.62 7.44 7.262 7.055 6.934 6.62 6.577 6.459 6.324 6.013 5.846 5.68 5.512 5.321 5.122 4.836 3.85 -7 ,20292 ,TETRA ,17558062,Fri Nov 26 13:52:57 CET,Fri Nov 26 16:24:04 CET,0.0 0.416 0.579 0.688 0.79 0.886 0.983 1.071 1.24 1.339 1.438 1.398 1.664 1.735 1.869 2.0 2.142 2.208 2.334 2.456 2.628 2.753 2.881 3.059 3.212 3.353 3.503 3.642 3.824 4.01 4.191 4.414 4.621 4.821 5.052 5.295 5.532 5.782 6.052 6.357 6.675 7.034 7.469 7.903 8.381 8.908 9.494 10.108 10.77 11.479 12.186 12.492 12.43 12.219 11.93 11.613 11.324 11.037 10.732 10.385 10.098 9.851 9.609 9.378 9.136 8.892 8.658 8.441 8.235 8.032 7.81 7.613 7.372 7.096 6.92 6.764 6.594 6.41 6.22 6.082 5.92 5.656 5.479 5.301 5.213 5.028 4.837 4.634 4.532 4.249 4.213 4.082 3.956 3.664 3.484 3.285 3.085 2.877 2.597 2.25 1.567 -8 ,17229 ,TETRA ,17558063,Fri Nov 26 13:52:57 CET,Fri Nov 26 16:24:12 CET,0.0 0.473 0.649 0.791 0.947 1.082 1.198 1.324 1.575 1.686 1.788 1.786 2.082 2.178 2.369 2.559 2.734 2.82 3.005 3.174 3.394 3.532 3.671 3.885 4.086 4.274 4.442 4.615 4.846 5.065 5.276 5.521 5.766 6.013 6.292 6.579 6.838 7.128 7.46 7.832 8.223 8.655 9.163 9.652 10.192 10.801 11.515 12.293 13.109 13.849 14.5 14.801 14.706 14.436 14.127 13.81 13.465 13.114 12.771 12.392 12.068 11.796 11.524 11.237 10.955 10.685 10.4 10.143 9.92 9.679 9.408 9.181 8.939 8.7 8.529 8.35 8.136 7.897 7.66 7.501 7.337 7.076 6.898 6.718 6.628 6.431 6.198 5.937 5.804 5.47 5.348 5.179 4.996 4.608 4.382 4.118 3.841 3.561 3.244 2.851 1.678 -9 ,14063 ,TETRA ,17558064,Fri Nov 26 13:52:57 CET,Fri Nov 26 16:25:13 CET,0.0 0.567 0.77 0.911 1.047 1.17 1.271 1.368 1.545 1.632 1.719 1.702 1.986 2.071 2.23 2.381 2.544 2.622 2.762 2.895 3.078 3.208 3.355 3.565 3.748 3.918 4.073 4.22 4.411 4.595 4.782 5.001 5.199 5.402 5.641 5.914 6.197 6.505 6.824 7.168 7.539 7.948 8.403 8.854 9.368 9.892 10.465 11.089 11.809 12.531 13.24 13.544 13.433 13.195 12.869 12.529 12.179 11.843 11.576 11.298 11.032 10.776 10.528 10.292 10.044 9.803 9.568 9.364 9.202 9.023 8.814 8.624 8.422 8.22 8.072 7.929 7.764 7.586 7.407 7.275 7.129 6.904 6.754 6.593 6.513 6.341 6.127 5.905 5.805 5.514 5.458 5.305 5.164 4.871 4.685 4.486 4.259 4.028 3.772 3.41 2.421 -10 ,32008 ,TETRA ,17558065,Fri Nov 26 13:53:55 CET,Fri Nov 26 16:23:55 CET,0.0 0.572 0.774 0.917 1.033 1.149 1.254 1.361 1.583 1.674 1.76 1.738 2.031 2.115 2.26 2.397 2.525 2.588 2.72 2.846 3.023 3.135 3.243 3.41 3.563 3.709 3.856 4.014 4.214 4.383 4.545 4.746 4.953 5.142 5.353 5.604 5.842 6.116 6.414 6.726 7.069 7.441 7.871 8.302 8.793 9.319 9.907 10.59 11.35 12.156 12.892 13.15 13.113 12.955 12.711 12.449 12.18 11.894 11.6 11.281 11.007 10.745 10.472 10.225 10.016 9.798 9.551 9.346 9.153 8.955 8.763 8.614 8.463 8.286 8.15 7.991 7.803 7.62 7.432 7.295 7.156 6.931 6.753 6.567 6.462 6.241 6.024 5.803 5.694 5.389 5.343 5.219 5.093 4.807 4.612 4.379 4.153 3.925 3.648 3.23 2.604 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 58006e2d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24025 ,TETRA ,17558066,Fri Nov 26 13:53:56 CET,Fri Nov 26 16:21:05 CET,0.0 0.264 0.374 0.521 0.645 0.711 0.783 0.84 0.925 0.969 1.008 0.87 1.109 1.153 1.236 1.308 1.371 1.397 1.452 1.501 1.573 1.614 1.653 1.718 1.786 1.846 1.896 1.939 1.989 2.029 2.061 2.097 2.147 2.203 2.236 2.256 2.259 2.254 2.231 2.164 2.085 1.974 1.826 1.621 1.335 1.005 0.506 -0.189 -1.153 -2.647 -5.173 -8.06 -10.445 -12.532 -14.374 -16.033 -17.462 -18.701 -19.747 -20.837 -21.801 -22.618 -23.418 -24.186 -24.852 -25.45 -26.11 -26.677 -27.14 -27.619 -28.132 -28.571 -29.022 -29.502 -29.876 -30.258 -30.648 -31.062 -31.502 -31.792 -32.071 -32.503 -32.82 -33.168 -33.341 -33.691 -34.044 -34.4 -34.608 -35.064 -35.266 -35.492 -35.735 -36.29 -36.587 -36.906 -37.235 -37.567 -37.961 -38.597 -40.164 -2 ,23870 ,TETRA ,17558067,Fri Nov 26 13:53:56 CET,Fri Nov 26 16:22:14 CET,0.0 0.409 0.607 0.712 0.798 0.86 0.923 0.978 1.076 1.129 1.179 1.074 1.329 1.38 1.456 1.511 1.563 1.589 1.646 1.702 1.768 1.804 1.836 1.89 1.949 1.992 2.029 2.073 2.123 2.166 2.197 2.222 2.248 2.265 2.282 2.293 2.286 2.273 2.266 2.254 2.198 2.109 2.0 1.837 1.578 1.263 0.782 0.112 -0.859 -2.438 -5.072 -8.143 -10.624 -12.787 -14.718 -16.431 -17.922 -19.234 -20.375 -21.526 -22.476 -23.303 -24.095 -24.846 -25.522 -26.119 -26.746 -27.296 -27.801 -28.362 -28.939 -29.41 -29.882 -30.359 -30.732 -31.12 -31.531 -31.958 -32.383 -32.675 -32.969 -33.439 -33.767 -34.1 -34.285 -34.663 -35.047 -35.434 -35.623 -36.077 -36.299 -36.538 -36.791 -37.344 -37.65 -38.001 -38.378 -38.779 -39.262 -39.951 -41.886 -3 ,12736 ,TETRA ,17558068,Fri Nov 26 13:53:56 CET,Fri Nov 26 16:21:04 CET,0.0 0.356 0.49 0.576 0.645 0.697 0.744 0.816 0.968 1.031 1.083 0.973 1.21 1.246 1.307 1.373 1.443 1.468 1.504 1.542 1.62 1.673 1.719 1.774 1.818 1.862 1.9 1.931 1.988 2.037 2.069 2.103 2.143 2.171 2.16 2.142 2.132 2.116 2.099 2.075 2.008 1.907 1.766 1.601 1.35 0.994 0.538 -0.1 -1.054 -2.526 -5.013 -7.94 -10.334 -12.586 -14.492 -16.172 -17.7 -19.006 -20.125 -21.271 -22.246 -23.082 -23.861 -24.572 -25.24 -25.878 -26.54 -27.105 -27.581 -28.078 -28.593 -29.006 -29.43 -29.903 -30.281 -30.638 -31.005 -31.415 -31.831 -32.101 -32.381 -32.816 -33.096 -33.404 -33.572 -33.897 -34.224 -34.572 -34.748 -35.179 -35.361 -35.586 -35.817 -36.311 -36.601 -36.931 -37.277 -37.65 -38.115 -38.716 -40.384 -4 ,30997 ,TETRA ,17558069,Fri Nov 26 13:54:59 CET,Fri Nov 26 16:21:01 CET,0.0 0.151 0.259 0.346 0.405 0.471 0.543 0.603 0.699 0.741 0.785 0.68 0.928 0.973 1.041 1.105 1.159 1.184 1.235 1.282 1.36 1.417 1.465 1.506 1.546 1.593 1.628 1.652 1.689 1.72 1.729 1.745 1.772 1.792 1.812 1.814 1.795 1.782 1.758 1.713 1.663 1.606 1.534 1.412 1.193 0.885 0.427 -0.238 -1.165 -2.6 -5.056 -7.997 -10.409 -12.448 -14.267 -15.937 -17.471 -18.86 -20.004 -21.117 -22.02 -22.846 -23.659 -24.391 -25.06 -25.655 -26.233 -26.749 -27.233 -27.76 -28.307 -28.756 -29.217 -29.704 -30.064 -30.431 -30.823 -31.217 -31.639 -31.937 -32.233 -32.695 -33.013 -33.33 -33.487 -33.811 -34.178 -34.584 -34.799 -35.26 -35.452 -35.693 -35.958 -36.485 -36.743 -37.032 -37.381 -37.756 -38.169 -38.703 -40.487 -5 ,28021 ,TETRA ,17558070,Fri Nov 26 13:54:59 CET,Fri Nov 26 16:22:26 CET,0.0 0.311 0.411 0.487 0.577 0.657 0.72 0.774 0.891 0.956 1.003 0.895 1.152 1.199 1.282 1.353 1.421 1.451 1.503 1.547 1.612 1.662 1.712 1.782 1.837 1.889 1.946 1.992 2.031 2.067 2.095 2.135 2.194 2.234 2.248 2.244 2.237 2.234 2.232 2.221 2.19 2.113 2.011 1.892 1.717 1.504 1.128 0.519 -0.404 -1.865 -4.268 -7.133 -9.526 -11.573 -13.311 -14.798 -16.104 -17.424 -18.648 -19.823 -20.763 -21.566 -22.282 -22.928 -23.598 -24.224 -24.843 -25.41 -25.907 -26.419 -26.944 -27.39 -27.842 -28.283 -28.625 -28.995 -29.359 -29.716 -30.12 -30.414 -30.706 -31.148 -31.471 -31.8 -31.967 -32.327 -32.69 -33.064 -33.26 -33.704 -33.89 -34.11 -34.348 -34.841 -35.104 -35.385 -35.691 -36.041 -36.498 -37.076 -38.922 -6 ,1115 ,TETRA ,17558071,Fri Nov 26 13:54:59 CET,Fri Nov 26 16:23:32 CET,0.0 0.403 0.552 0.664 0.737 0.818 0.89 0.934 1.003 1.039 1.09 1.002 1.258 1.309 1.366 1.41 1.456 1.483 1.538 1.586 1.649 1.687 1.714 1.748 1.797 1.834 1.858 1.885 1.914 1.938 1.962 2.014 2.071 2.1 2.11 2.133 2.145 2.154 2.169 2.151 2.097 2.022 1.903 1.718 1.447 1.132 0.722 0.098 -0.859 -2.414 -5.112 -8.238 -10.721 -12.846 -14.65 -16.212 -17.624 -18.941 -20.102 -21.273 -22.274 -23.177 -24.007 -24.764 -25.47 -26.093 -26.732 -27.331 -27.879 -28.425 -28.945 -29.378 -29.84 -30.33 -30.719 -31.105 -31.47 -31.836 -32.229 -32.497 -32.778 -33.212 -33.497 -33.832 -34.002 -34.321 -34.673 -35.062 -35.275 -35.746 -35.995 -36.24 -36.473 -37.022 -37.317 -37.617 -37.988 -38.422 -38.915 -39.529 -41.433 -7 ,25561 ,TETRA ,17558072,Fri Nov 26 13:55:02 CET,Fri Nov 26 16:24:30 CET,0.0 0.235 0.344 0.418 0.494 0.56 0.631 0.702 0.816 0.86 0.904 0.788 1.022 1.06 1.132 1.187 1.242 1.269 1.315 1.361 1.432 1.478 1.522 1.582 1.624 1.667 1.713 1.754 1.819 1.871 1.906 1.948 1.984 2.042 2.105 2.121 2.12 2.111 2.078 2.042 1.983 1.889 1.776 1.643 1.441 1.121 0.606 -0.118 -1.115 -2.604 -5.041 -8.06 -10.534 -12.633 -14.461 -15.986 -17.276 -18.476 -19.567 -20.658 -21.574 -22.389 -23.151 -23.837 -24.491 -25.129 -25.8 -26.394 -26.879 -27.364 -27.883 -28.319 -28.761 -29.225 -29.599 -29.975 -30.365 -30.799 -31.264 -31.581 -31.904 -32.404 -32.741 -33.08 -33.259 -33.649 -34.027 -34.396 -34.617 -35.107 -35.35 -35.599 -35.84 -36.37 -36.687 -37.027 -37.378 -37.771 -38.245 -38.898 -41.34 -8 ,8696 ,TETRA ,17558073,Fri Nov 26 13:55:04 CET,Fri Nov 26 16:24:23 CET,0.0 0.335 0.478 0.607 0.727 0.809 0.861 0.913 1.029 1.08 1.119 1.0 1.24 1.285 1.366 1.438 1.521 1.568 1.648 1.708 1.788 1.821 1.845 1.882 1.926 1.976 2.024 2.075 2.143 2.207 2.249 2.28 2.311 2.333 2.349 2.351 2.345 2.367 2.41 2.413 2.38 2.312 2.197 2.057 1.841 1.506 1.005 0.335 -0.626 -2.122 -4.691 -7.624 -9.972 -12.052 -13.87 -15.51 -16.95 -18.241 -19.326 -20.423 -21.399 -22.24 -23.008 -23.743 -24.454 -25.13 -25.802 -26.375 -26.869 -27.363 -27.875 -28.321 -28.786 -29.24 -29.615 -30.018 -30.411 -30.802 -31.198 -31.474 -31.751 -32.193 -32.521 -32.86 -33.03 -33.362 -33.694 -34.04 -34.236 -34.697 -34.907 -35.138 -35.381 -35.947 -36.275 -36.614 -36.97 -37.356 -37.835 -38.575 -40.73 -9 ,9549 ,TETRA ,17558074,Fri Nov 26 13:54:59 CET,Fri Nov 26 16:24:43 CET,0.0 0.169 0.288 0.395 0.491 0.561 0.616 0.673 0.765 0.814 0.858 0.747 0.99 1.022 1.085 1.144 1.19 1.216 1.273 1.309 1.361 1.396 1.433 1.496 1.545 1.593 1.633 1.66 1.695 1.723 1.746 1.794 1.839 1.865 1.891 1.914 1.939 1.945 1.902 1.85 1.807 1.728 1.588 1.421 1.204 0.912 0.468 -0.212 -1.264 -2.814 -5.393 -8.651 -11.264 -13.329 -15.127 -16.826 -18.247 -19.484 -20.558 -21.602 -22.477 -23.278 -24.068 -24.795 -25.439 -26.035 -26.665 -27.218 -27.723 -28.273 -28.845 -29.306 -29.782 -30.279 -30.673 -31.101 -31.523 -31.938 -32.357 -32.645 -32.935 -33.356 -33.656 -34.002 -34.186 -34.54 -34.91 -35.309 -35.516 -35.987 -36.197 -36.428 -36.695 -37.268 -37.571 -37.891 -38.219 -38.588 -39.001 -39.495 -41.009 -10 ,11849 ,TETRA ,17558075,Fri Nov 26 13:55:01 CET,Fri Nov 26 16:24:51 CET,0.0 0.214 0.338 0.447 0.523 0.612 0.696 0.767 0.896 0.957 1.016 0.907 1.152 1.199 1.3 1.387 1.45 1.477 1.528 1.58 1.637 1.674 1.722 1.783 1.83 1.881 1.94 1.991 2.039 2.082 2.121 2.155 2.169 2.18 2.21 2.24 2.252 2.25 2.221 2.184 2.131 2.062 1.957 1.778 1.527 1.188 0.699 0.025 -1.035 -2.6 -5.144 -8.215 -10.675 -12.805 -14.664 -16.305 -17.698 -18.945 -20.056 -21.112 -21.983 -22.763 -23.472 -24.158 -24.829 -25.467 -26.105 -26.666 -27.161 -27.649 -28.146 -28.562 -28.984 -29.41 -29.742 -30.114 -30.515 -30.909 -31.325 -31.614 -31.908 -32.393 -32.729 -33.057 -33.229 -33.6 -33.974 -34.367 -34.568 -35.016 -35.203 -35.431 -35.674 -36.199 -36.475 -36.791 -37.153 -37.545 -37.995 -38.572 -40.339 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt deleted file mode 100644 index 34e5a0e3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27337 ,TETRA ,17558076,Fri Nov 26 13:54:59 CET,Fri Nov 26 16:05:30 CET,0.0 0.403 0.546 0.636 0.708 0.783 0.845 0.9 0.993 1.043 1.094 1.122 1.253 1.299 1.371 1.462 1.551 1.589 1.661 1.725 1.816 1.882 1.946 2.038 2.126 2.208 2.287 2.36 2.448 2.53 2.625 2.744 2.851 2.942 3.042 3.164 3.283 3.412 3.541 3.672 3.795 3.924 4.095 4.268 4.434 4.586 4.762 4.952 5.137 5.254 5.142 4.837 4.527 4.225 3.935 3.669 3.406 3.155 2.944 2.716 2.518 2.352 2.19 2.021 1.864 1.736 1.598 1.469 1.364 1.249 1.122 1.023 0.918 0.801 0.713 0.62 0.514 0.406 0.31 0.243 0.163 0.045 -0.04 -0.137 -0.187 -0.287 -0.397 -0.509 -0.559 -0.68 -0.706 -0.76 -0.823 -0.965 -1.035 -1.102 -1.192 -1.302 -1.384 -1.454 -1.63 -2 ,990 ,TETRA ,17558077,Fri Nov 26 13:55:00 CET,Fri Nov 26 16:05:34 CET,0.0 0.25 0.339 0.438 0.508 0.563 0.627 0.683 0.782 0.834 0.885 0.913 1.035 1.076 1.163 1.243 1.318 1.357 1.424 1.483 1.576 1.637 1.697 1.781 1.856 1.926 2.002 2.08 2.166 2.24 2.313 2.416 2.521 2.618 2.734 2.867 2.987 3.128 3.267 3.402 3.548 3.708 3.895 4.059 4.23 4.418 4.614 4.808 4.99 5.124 5.116 4.883 4.571 4.223 3.878 3.576 3.322 3.099 2.869 2.612 2.412 2.247 2.086 1.928 1.791 1.66 1.518 1.399 1.285 1.161 1.042 0.934 0.808 0.683 0.594 0.507 0.424 0.331 0.226 0.158 0.079 -0.044 -0.125 -0.209 -0.246 -0.32 -0.407 -0.496 -0.543 -0.667 -0.697 -0.748 -0.807 -0.933 -0.996 -1.081 -1.19 -1.308 -1.415 -1.559 -1.817 -3 ,32188 ,TETRA ,17558078,Fri Nov 26 13:56:00 CET,Fri Nov 26 16:08:48 CET,0.0 0.673 0.79 0.867 0.963 1.062 1.159 1.245 1.376 1.438 1.494 1.528 1.651 1.697 1.776 1.851 1.939 1.982 2.059 2.138 2.235 2.292 2.352 2.452 2.549 2.634 2.707 2.781 2.893 2.988 3.078 3.187 3.284 3.379 3.492 3.612 3.737 3.891 4.045 4.184 4.32 4.483 4.664 4.82 4.99 5.162 5.344 5.535 5.713 5.815 5.777 5.562 5.279 4.936 4.624 4.36 4.091 3.843 3.631 3.414 3.224 3.033 2.856 2.703 2.559 2.416 2.26 2.132 2.027 1.912 1.783 1.675 1.556 1.437 1.348 1.256 1.159 1.045 0.924 0.844 0.753 0.621 0.537 0.445 0.396 0.292 0.188 0.09 0.031 -0.105 -0.133 -0.197 -0.264 -0.42 -0.503 -0.594 -0.692 -0.795 -0.918 -1.109 -1.561 -4 ,32715 ,TETRA ,17558079,Fri Nov 26 13:56:00 CET,Fri Nov 26 16:08:03 CET,0.0 0.395 0.512 0.607 0.693 0.801 0.9 0.988 1.15 1.204 1.245 1.245 1.364 1.408 1.482 1.544 1.602 1.637 1.712 1.782 1.873 1.925 1.981 2.074 2.168 2.251 2.32 2.387 2.477 2.575 2.663 2.763 2.871 2.972 3.096 3.231 3.337 3.451 3.572 3.696 3.822 3.971 4.128 4.286 4.48 4.673 4.869 5.067 5.286 5.435 5.377 5.126 4.847 4.527 4.22 3.95 3.697 3.44 3.209 2.974 2.776 2.604 2.443 2.282 2.126 1.998 1.866 1.733 1.619 1.503 1.38 1.29 1.205 1.111 1.035 0.949 0.864 0.788 0.705 0.64 0.57 0.463 0.39 0.309 0.268 0.19 0.103 0.003 -0.045 -0.172 -0.195 -0.239 -0.297 -0.422 -0.482 -0.549 -0.616 -0.709 -0.817 -0.96 -1.423 -5 ,13488 ,TETRA ,17558080,Fri Nov 26 13:56:00 CET,Fri Nov 26 16:06:25 CET,0.0 0.16 0.26 0.34 0.416 0.489 0.545 0.599 0.709 0.763 0.81 0.798 0.911 0.952 1.029 1.094 1.165 1.203 1.271 1.333 1.419 1.473 1.523 1.607 1.694 1.772 1.848 1.922 2.021 2.117 2.205 2.304 2.392 2.472 2.583 2.713 2.827 2.945 3.066 3.186 3.322 3.492 3.668 3.814 3.973 4.15 4.309 4.455 4.574 4.636 4.566 4.209 3.774 3.353 2.973 2.641 2.344 2.074 1.832 1.582 1.36 1.169 0.982 0.808 0.658 0.51 0.36 0.233 0.119 -0.005 -0.127 -0.229 -0.341 -0.448 -0.53 -0.623 -0.715 -0.806 -0.896 -0.96 -1.026 -1.136 -1.231 -1.331 -1.373 -1.455 -1.538 -1.625 -1.673 -1.801 -1.834 -1.887 -1.949 -2.09 -2.154 -2.236 -2.332 -2.459 -2.604 -2.753 -3.275 -6 ,416 ,TETRA ,17558081,Fri Nov 26 13:56:00 CET,Fri Nov 26 16:07:41 CET,0.0 0.147 0.312 0.454 0.581 0.677 0.748 0.817 0.945 0.997 1.045 1.069 1.184 1.222 1.316 1.421 1.523 1.573 1.661 1.737 1.853 1.928 1.996 2.091 2.177 2.252 2.337 2.425 2.533 2.633 2.729 2.856 2.963 3.054 3.168 3.289 3.394 3.515 3.656 3.802 3.952 4.123 4.318 4.499 4.698 4.896 5.102 5.304 5.466 5.551 5.473 5.212 4.922 4.58 4.236 3.931 3.666 3.417 3.188 2.937 2.726 2.564 2.412 2.262 2.116 1.973 1.811 1.659 1.52 1.377 1.252 1.151 1.035 0.918 0.824 0.719 0.612 0.502 0.384 0.305 0.222 0.088 -0.011 -0.119 -0.165 -0.258 -0.368 -0.479 -0.536 -0.679 -0.747 -0.817 -0.888 -1.012 -1.068 -1.121 -1.167 -1.245 -1.347 -1.462 -1.695 -7 ,30260 ,TETRA ,17558082,Fri Nov 26 13:56:56 CET,Fri Nov 26 16:09:57 CET,0.0 0.172 0.268 0.34 0.412 0.492 0.562 0.617 0.746 0.803 0.857 0.896 1.025 1.074 1.149 1.216 1.28 1.314 1.389 1.463 1.554 1.606 1.661 1.742 1.829 1.919 1.999 2.068 2.148 2.22 2.289 2.375 2.463 2.547 2.646 2.747 2.833 2.943 3.067 3.179 3.301 3.452 3.645 3.823 3.989 4.156 4.344 4.534 4.7 4.758 4.679 4.442 4.133 3.808 3.476 3.173 2.886 2.626 2.423 2.203 2.01 1.843 1.682 1.536 1.401 1.27 1.122 0.997 0.899 0.787 0.668 0.576 0.475 0.369 0.286 0.199 0.102 -0.001 -0.106 -0.182 -0.253 -0.356 -0.434 -0.51 -0.542 -0.613 -0.682 -0.752 -0.798 -0.918 -0.925 -0.974 -1.024 -1.157 -1.229 -1.295 -1.362 -1.42 -1.489 -1.568 -1.644 -8 ,14994 ,TETRA ,17558083,Fri Nov 26 13:56:56 CET,Fri Nov 26 16:08:59 CET,0.0 0.441 0.575 0.679 0.781 0.865 0.928 0.985 1.096 1.154 1.198 1.203 1.323 1.364 1.45 1.534 1.623 1.669 1.749 1.828 1.936 2.01 2.079 2.164 2.251 2.337 2.417 2.492 2.586 2.676 2.766 2.878 2.985 3.077 3.183 3.313 3.432 3.551 3.666 3.79 3.942 4.123 4.316 4.477 4.639 4.803 4.965 5.122 5.26 5.314 5.201 4.884 4.537 4.165 3.818 3.514 3.197 2.884 2.617 2.357 2.129 1.916 1.723 1.557 1.408 1.262 1.094 0.944 0.813 0.679 0.546 0.442 0.335 0.217 0.129 0.035 -0.067 -0.163 -0.26 -0.331 -0.41 -0.549 -0.64 -0.731 -0.778 -0.869 -0.956 -1.044 -1.092 -1.22 -1.265 -1.326 -1.39 -1.526 -1.59 -1.664 -1.743 -1.818 -1.957 -2.176 -2.833 -9 ,28908 ,TETRA ,17558084,Fri Nov 26 13:56:56 CET,Fri Nov 26 16:09:23 CET,0.0 0.151 0.329 0.48 0.574 0.65 0.712 0.775 0.918 0.991 1.059 1.097 1.212 1.252 1.338 1.427 1.52 1.562 1.634 1.701 1.801 1.869 1.928 2.015 2.102 2.18 2.253 2.33 2.425 2.505 2.589 2.689 2.778 2.871 2.975 3.083 3.188 3.301 3.424 3.554 3.68 3.814 3.978 4.152 4.348 4.556 4.745 4.917 5.089 5.215 5.162 4.856 4.53 4.23 3.939 3.619 3.34 3.088 2.856 2.613 2.401 2.224 2.074 1.934 1.778 1.627 1.474 1.333 1.209 1.088 0.965 0.857 0.74 0.614 0.515 0.409 0.294 0.174 0.06 -0.017 -0.091 -0.187 -0.258 -0.345 -0.393 -0.487 -0.58 -0.68 -0.733 -0.871 -0.927 -0.99 -1.069 -1.262 -1.356 -1.463 -1.561 -1.658 -1.801 -1.975 -2.333 -10 ,16697 ,TETRA ,17558085,Fri Nov 26 13:56:58 CET,Fri Nov 26 16:11:16 CET,0.0 0.414 0.557 0.642 0.727 0.797 0.86 0.93 1.069 1.126 1.184 1.21 1.329 1.369 1.464 1.565 1.642 1.676 1.745 1.809 1.901 1.969 2.039 2.142 2.229 2.314 2.395 2.464 2.568 2.682 2.785 2.893 3.005 3.115 3.232 3.368 3.495 3.625 3.767 3.915 4.06 4.212 4.374 4.528 4.712 4.889 5.027 5.151 5.277 5.319 5.149 4.762 4.344 3.95 3.599 3.273 2.985 2.724 2.489 2.227 1.999 1.808 1.634 1.466 1.308 1.176 1.022 0.862 0.714 0.568 0.427 0.318 0.203 0.077 -0.023 -0.126 -0.233 -0.339 -0.455 -0.54 -0.622 -0.743 -0.82 -0.908 -0.952 -1.036 -1.128 -1.218 -1.27 -1.417 -1.481 -1.547 -1.608 -1.726 -1.795 -1.878 -1.974 -2.072 -2.171 -2.364 -3.247 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt deleted file mode 100644 index 21c18b97..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25982 ,TETRA ,17558086,Fri Nov 26 13:56:56 CET,Fri Nov 26 16:22:56 CET,0.0 0.171 0.276 0.358 0.429 0.494 0.558 0.621 0.735 0.789 0.842 0.854 0.978 1.013 1.078 1.152 1.228 1.265 1.332 1.404 1.508 1.559 1.618 1.707 1.776 1.851 1.925 1.989 2.079 2.168 2.244 2.336 2.429 2.518 2.619 2.733 2.827 2.925 3.038 3.138 3.222 3.304 3.396 3.473 3.542 3.61 3.687 3.712 3.629 3.419 2.862 1.945 1.096 0.351 -0.325 -0.929 -1.449 -1.914 -2.316 -2.722 -3.055 -3.338 -3.623 -3.884 -4.12 -4.351 -4.585 -4.79 -4.97 -5.165 -5.371 -5.54 -5.729 -5.942 -6.095 -6.247 -6.409 -6.573 -6.742 -6.857 -6.978 -7.168 -7.294 -7.427 -7.497 -7.64 -7.803 -7.978 -8.065 -8.243 -8.336 -8.436 -8.548 -8.789 -8.925 -9.077 -9.258 -9.438 -9.632 -9.833 -10.259 -2 ,23188 ,TETRA ,17558087,Fri Nov 26 13:56:57 CET,Fri Nov 26 16:22:59 CET,0.0 0.212 0.309 0.402 0.493 0.585 0.713 0.833 1.0 1.076 1.144 1.188 1.327 1.384 1.5 1.595 1.683 1.727 1.802 1.865 1.963 2.034 2.102 2.192 2.284 2.37 2.452 2.534 2.638 2.732 2.828 2.942 3.036 3.131 3.244 3.371 3.496 3.619 3.744 3.865 3.981 4.11 4.253 4.377 4.507 4.633 4.718 4.713 4.578 4.293 3.698 2.816 1.975 1.205 0.511 -0.143 -0.701 -1.188 -1.638 -2.078 -2.442 -2.785 -3.115 -3.409 -3.662 -3.904 -4.162 -4.38 -4.58 -4.784 -4.976 -5.132 -5.306 -5.483 -5.61 -5.745 -5.887 -6.028 -6.172 -6.276 -6.381 -6.555 -6.68 -6.804 -6.867 -7.003 -7.14 -7.291 -7.369 -7.54 -7.621 -7.711 -7.806 -7.986 -8.068 -8.149 -8.254 -8.374 -8.519 -8.701 -9.158 -3 ,26803 ,TETRA ,17558088,Fri Nov 26 13:59:58 CET,Fri Nov 26 16:27:51 CET,0.0 0.109 0.203 0.298 0.395 0.494 0.6 0.69 0.85 0.925 0.981 0.995 1.135 1.185 1.266 1.35 1.443 1.486 1.561 1.649 1.777 1.851 1.921 2.017 2.112 2.212 2.315 2.395 2.488 2.581 2.678 2.784 2.87 2.953 3.056 3.173 3.254 3.353 3.473 3.599 3.727 3.837 3.96 4.078 4.196 4.289 4.355 4.4 4.341 4.111 3.494 2.551 1.708 0.952 0.266 -0.323 -0.857 -1.365 -1.786 -2.224 -2.612 -2.945 -3.261 -3.556 -3.826 -4.081 -4.349 -4.573 -4.763 -4.96 -5.161 -5.331 -5.5 -5.677 -5.835 -6.004 -6.179 -6.365 -6.567 -6.706 -6.832 -7.033 -7.179 -7.326 -7.405 -7.572 -7.731 -7.905 -7.999 -8.191 -8.309 -8.413 -8.519 -8.74 -8.859 -8.976 -9.113 -9.277 -9.45 -9.697 -10.546 -4 ,27477 ,TETRA ,17558089,Fri Nov 26 13:59:58 CET,Fri Nov 26 16:24:14 CET,0.0 0.144 0.277 0.408 0.507 0.581 0.665 0.757 0.905 0.965 1.028 1.067 1.206 1.269 1.402 1.521 1.615 1.657 1.747 1.833 1.949 2.024 2.099 2.2 2.292 2.383 2.461 2.533 2.63 2.731 2.833 2.933 3.027 3.131 3.253 3.376 3.497 3.642 3.774 3.897 4.024 4.148 4.247 4.344 4.462 4.564 4.647 4.687 4.63 4.411 3.856 2.937 2.057 1.277 0.586 -0.066 -0.623 -1.102 -1.513 -1.935 -2.312 -2.629 -2.912 -3.191 -3.455 -3.685 -3.929 -4.148 -4.341 -4.546 -4.755 -4.941 -5.135 -5.314 -5.451 -5.604 -5.77 -5.938 -6.105 -6.223 -6.347 -6.535 -6.669 -6.807 -6.876 -7.027 -7.194 -7.363 -7.437 -7.596 -7.674 -7.77 -7.874 -8.094 -8.214 -8.33 -8.428 -8.55 -8.732 -8.946 -9.405 -5 ,2778 ,TETRA ,17558090,Fri Nov 26 13:59:58 CET,Fri Nov 26 16:24:37 CET,0.0 0.122 0.225 0.32 0.459 0.587 0.667 0.731 0.834 0.889 0.94 0.942 1.069 1.113 1.194 1.271 1.355 1.403 1.488 1.551 1.647 1.712 1.774 1.872 1.963 2.039 2.107 2.176 2.283 2.389 2.48 2.593 2.704 2.811 2.929 3.053 3.165 3.286 3.415 3.536 3.659 3.793 3.94 4.075 4.201 4.323 4.414 4.404 4.264 3.97 3.281 2.274 1.434 0.673 0.002 -0.602 -1.133 -1.625 -2.067 -2.492 -2.828 -3.113 -3.402 -3.679 -3.917 -4.142 -4.39 -4.6 -4.78 -4.977 -5.181 -5.351 -5.524 -5.694 -5.827 -5.967 -6.105 -6.259 -6.436 -6.549 -6.668 -6.857 -7.001 -7.159 -7.231 -7.37 -7.508 -7.654 -7.732 -7.901 -7.962 -8.04 -8.131 -8.315 -8.409 -8.528 -8.66 -8.814 -8.992 -9.199 -9.983 -6 ,12075 ,TETRA ,17558091,Fri Nov 26 13:59:58 CET,Fri Nov 26 16:24:21 CET,0.0 0.873 1.07 1.161 1.236 1.3 1.363 1.431 1.542 1.589 1.637 1.646 1.778 1.824 1.905 1.966 2.028 2.067 2.144 2.213 2.319 2.387 2.446 2.526 2.601 2.679 2.756 2.834 2.937 3.034 3.127 3.223 3.303 3.389 3.49 3.59 3.69 3.795 3.894 3.991 4.089 4.203 4.339 4.454 4.56 4.658 4.766 4.818 4.729 4.443 3.774 2.823 1.941 1.104 0.408 -0.17 -0.661 -1.111 -1.51 -1.93 -2.297 -2.614 -2.917 -3.186 -3.426 -3.656 -3.905 -4.131 -4.327 -4.528 -4.73 -4.889 -5.051 -5.222 -5.359 -5.503 -5.655 -5.805 -5.961 -6.065 -6.164 -6.319 -6.43 -6.544 -6.596 -6.699 -6.809 -6.912 -6.972 -7.132 -7.169 -7.238 -7.309 -7.464 -7.566 -7.669 -7.762 -7.896 -8.032 -8.153 -8.5 -7 ,13390 ,TETRA ,17558092,Fri Nov 26 14:00:00 CET,Fri Nov 26 16:25:21 CET,0.0 0.31 0.412 0.496 0.587 0.676 0.766 0.847 1.008 1.089 1.163 1.21 1.347 1.399 1.491 1.576 1.678 1.729 1.808 1.883 1.998 2.073 2.147 2.258 2.355 2.432 2.507 2.584 2.678 2.763 2.854 2.974 3.076 3.164 3.282 3.414 3.525 3.65 3.782 3.912 4.05 4.184 4.303 4.405 4.512 4.636 4.756 4.82 4.79 4.577 3.951 3.059 2.312 1.607 0.933 0.331 -0.19 -0.662 -1.098 -1.524 -1.861 -2.158 -2.458 -2.76 -3.052 -3.318 -3.562 -3.791 -3.991 -4.177 -4.362 -4.532 -4.73 -4.918 -5.054 -5.211 -5.383 -5.557 -5.73 -5.84 -5.96 -6.176 -6.32 -6.452 -6.515 -6.633 -6.763 -6.913 -6.99 -7.163 -7.246 -7.336 -7.427 -7.633 -7.74 -7.864 -8.02 -8.202 -8.371 -8.56 -8.813 -8 ,20319 ,TETRA ,17558093,Fri Nov 26 13:59:58 CET,Fri Nov 26 16:24:14 CET,0.0 0.114 0.222 0.322 0.414 0.504 0.59 0.677 0.833 0.9 0.968 1.011 1.15 1.211 1.325 1.434 1.559 1.611 1.685 1.754 1.855 1.93 2.0 2.092 2.184 2.273 2.357 2.433 2.534 2.644 2.744 2.85 2.954 3.045 3.138 3.247 3.361 3.468 3.576 3.695 3.815 3.959 4.112 4.239 4.353 4.465 4.565 4.61 4.583 4.36 3.727 2.825 1.987 1.238 0.55 -0.07 -0.597 -1.084 -1.514 -1.962 -2.343 -2.679 -3.017 -3.317 -3.579 -3.83 -4.09 -4.312 -4.505 -4.719 -4.948 -5.134 -5.319 -5.499 -5.646 -5.815 -5.994 -6.176 -6.363 -6.483 -6.61 -6.807 -6.93 -7.051 -7.113 -7.246 -7.39 -7.539 -7.622 -7.802 -7.882 -7.972 -8.07 -8.274 -8.396 -8.527 -8.649 -8.804 -8.975 -9.142 -9.903 -9 ,18444 ,TETRA ,17558094,Fri Nov 26 13:59:59 CET,Fri Nov 26 16:25:00 CET,0.0 0.142 0.233 0.31 0.392 0.484 0.567 0.636 0.784 0.858 0.921 0.946 1.08 1.133 1.239 1.334 1.419 1.459 1.534 1.611 1.737 1.82 1.896 1.993 2.079 2.174 2.269 2.35 2.452 2.565 2.679 2.8 2.903 3.002 3.123 3.237 3.332 3.441 3.556 3.68 3.801 3.919 4.054 4.199 4.345 4.466 4.564 4.569 4.492 4.228 3.526 2.523 1.653 0.844 0.065 -0.627 -1.208 -1.694 -2.112 -2.539 -2.914 -3.272 -3.605 -3.912 -4.224 -4.508 -4.793 -5.054 -5.274 -5.495 -5.73 -5.916 -6.113 -6.315 -6.468 -6.625 -6.784 -6.953 -7.128 -7.25 -7.384 -7.577 -7.698 -7.825 -7.889 -8.015 -8.155 -8.305 -8.374 -8.541 -8.598 -8.674 -8.758 -8.92 -9.012 -9.114 -9.214 -9.322 -9.444 -9.582 -9.803 -10 ,4369 ,TETRA ,17558095,Fri Nov 26 13:59:59 CET,Fri Nov 26 16:25:28 CET,0.0 0.388 0.758 0.949 1.028 1.092 1.165 1.238 1.385 1.455 1.525 1.564 1.697 1.745 1.843 1.945 2.039 2.079 2.153 2.217 2.32 2.393 2.462 2.566 2.666 2.768 2.861 2.936 3.026 3.114 3.193 3.291 3.4 3.503 3.609 3.722 3.838 3.954 4.056 4.157 4.277 4.414 4.571 4.71 4.817 4.895 4.934 4.919 4.817 4.558 3.947 3.011 2.116 1.304 0.633 0.068 -0.432 -0.89 -1.281 -1.662 -2.0 -2.316 -2.622 -2.918 -3.196 -3.444 -3.716 -3.963 -4.168 -4.376 -4.589 -4.781 -4.984 -5.167 -5.304 -5.453 -5.61 -5.781 -5.943 -6.045 -6.161 -6.342 -6.469 -6.612 -6.691 -6.854 -7.017 -7.192 -7.282 -7.46 -7.557 -7.657 -7.76 -7.99 -8.114 -8.249 -8.392 -8.572 -8.767 -8.957 -9.276 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt deleted file mode 100644 index 0ac86c60..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10512 ,TETRA ,17558096,Fri Nov 26 13:59:59 CET,Fri Nov 26 16:27:34 CET,0.0 0.555 0.714 0.841 0.953 1.042 1.114 1.185 1.32 1.373 1.421 1.433 1.565 1.611 1.709 1.803 1.893 1.936 2.007 2.074 2.176 2.245 2.322 2.438 2.529 2.611 2.693 2.768 2.871 2.968 3.046 3.14 3.239 3.337 3.445 3.558 3.665 3.779 3.9 4.006 4.091 4.195 4.334 4.477 4.629 4.772 4.917 4.984 4.906 4.68 4.031 3.047 2.253 1.56 0.949 0.358 -0.221 -0.766 -1.22 -1.649 -2.02 -2.356 -2.672 -2.971 -3.25 -3.505 -3.761 -3.97 -4.15 -4.349 -4.556 -4.723 -4.886 -5.053 -5.192 -5.336 -5.482 -5.637 -5.805 -5.915 -6.02 -6.184 -6.311 -6.446 -6.511 -6.661 -6.818 -6.962 -7.038 -7.209 -7.27 -7.352 -7.439 -7.62 -7.715 -7.82 -7.947 -8.102 -8.29 -8.473 -8.689 -2 ,23387 ,TETRA ,17558097,Fri Nov 26 14:00:58 CET,Fri Nov 26 16:28:58 CET,0.0 0.457 0.572 0.671 0.773 0.876 1.001 1.111 1.285 1.356 1.413 1.449 1.593 1.648 1.746 1.842 1.927 1.965 2.039 2.119 2.25 2.333 2.412 2.546 2.672 2.773 2.86 2.944 3.051 3.138 3.229 3.334 3.425 3.512 3.616 3.745 3.874 4.018 4.153 4.281 4.401 4.518 4.645 4.755 4.864 4.989 5.105 5.128 5.079 4.914 4.414 3.571 2.766 2.048 1.393 0.806 0.278 -0.246 -0.721 -1.158 -1.513 -1.847 -2.17 -2.452 -2.705 -2.952 -3.208 -3.421 -3.613 -3.807 -4.019 -4.196 -4.367 -4.551 -4.69 -4.827 -4.985 -5.161 -5.339 -5.453 -5.561 -5.752 -5.893 -6.025 -6.091 -6.23 -6.375 -6.549 -6.636 -6.803 -6.891 -6.986 -7.074 -7.251 -7.351 -7.464 -7.593 -7.744 -7.886 -8.051 -8.488 -3 ,19040 ,TETRA ,17558098,Fri Nov 26 14:02:32 CET,Fri Nov 26 16:27:57 CET,0.0 0.297 0.439 0.569 0.678 0.779 0.874 0.941 1.084 1.158 1.218 1.25 1.39 1.441 1.545 1.657 1.758 1.81 1.911 1.998 2.122 2.192 2.259 2.365 2.467 2.559 2.65 2.738 2.845 2.944 3.04 3.149 3.253 3.351 3.458 3.582 3.704 3.835 3.98 4.127 4.246 4.378 4.537 4.679 4.832 4.971 5.091 5.166 5.182 5.029 4.459 3.596 2.875 2.241 1.617 0.991 0.433 -0.038 -0.431 -0.818 -1.156 -1.463 -1.755 -2.028 -2.278 -2.509 -2.759 -2.981 -3.165 -3.357 -3.571 -3.747 -3.911 -4.084 -4.224 -4.372 -4.518 -4.663 -4.834 -4.95 -5.061 -5.236 -5.359 -5.491 -5.561 -5.702 -5.839 -5.987 -6.068 -6.239 -6.321 -6.422 -6.521 -6.728 -6.833 -6.932 -7.046 -7.163 -7.333 -7.549 -7.879 -4 ,28747 ,TETRA ,17558099,Fri Nov 26 14:02:32 CET,Fri Nov 26 16:27:53 CET,0.0 0.354 0.538 0.657 0.762 0.842 0.93 1.049 1.256 1.333 1.407 1.452 1.582 1.634 1.745 1.845 1.949 1.994 2.081 2.176 2.308 2.386 2.458 2.565 2.668 2.754 2.833 2.919 3.028 3.122 3.203 3.298 3.403 3.521 3.645 3.77 3.901 4.037 4.165 4.301 4.44 4.576 4.726 4.856 4.987 5.134 5.31 5.437 5.437 5.259 4.676 3.736 2.907 2.119 1.418 0.817 0.281 -0.23 -0.649 -1.07 -1.455 -1.788 -2.096 -2.388 -2.664 -2.933 -3.223 -3.47 -3.668 -3.873 -4.086 -4.261 -4.45 -4.636 -4.771 -4.919 -5.076 -5.235 -5.388 -5.497 -5.623 -5.824 -5.961 -6.102 -6.17 -6.302 -6.447 -6.595 -6.674 -6.852 -6.949 -7.05 -7.154 -7.334 -7.443 -7.576 -7.712 -7.889 -8.11 -8.356 -8.915 -5 ,29583 ,TETRA ,17558100,Fri Nov 26 14:04:52 CET,Fri Nov 26 16:32:20 CET,0.0 0.354 0.529 0.668 0.795 0.914 1.009 1.091 1.23 1.293 1.356 1.385 1.522 1.582 1.682 1.761 1.835 1.876 1.967 2.055 2.18 2.259 2.335 2.447 2.555 2.664 2.76 2.841 2.959 3.08 3.184 3.312 3.423 3.528 3.662 3.811 3.959 4.117 4.272 4.411 4.55 4.723 4.925 5.096 5.265 5.416 5.514 5.536 5.492 5.329 4.835 3.984 3.135 2.369 1.672 1.043 0.505 0.005 -0.43 -0.87 -1.225 -1.529 -1.853 -2.178 -2.499 -2.793 -3.075 -3.319 -3.541 -3.783 -4.024 -4.205 -4.383 -4.568 -4.725 -4.896 -5.064 -5.232 -5.394 -5.503 -5.621 -5.805 -5.937 -6.08 -6.153 -6.297 -6.434 -6.583 -6.665 -6.838 -6.924 -7.022 -7.119 -7.311 -7.418 -7.554 -7.7 -7.844 -7.996 -8.186 -8.635 -6 ,11434 ,TETRA ,17558101,Fri Nov 26 14:04:51 CET,Fri Nov 26 16:35:01 CET,0.0 0.318 0.426 0.529 0.61 0.681 0.758 0.85 1.027 1.087 1.136 1.152 1.282 1.327 1.413 1.492 1.568 1.607 1.692 1.768 1.866 1.931 2.0 2.095 2.168 2.267 2.364 2.438 2.529 2.616 2.711 2.826 2.933 3.039 3.182 3.332 3.441 3.568 3.708 3.857 4.019 4.164 4.289 4.408 4.543 4.673 4.811 4.918 4.899 4.791 4.456 3.744 3.051 2.439 1.878 1.307 0.82 0.418 0.064 -0.31 -0.64 -0.929 -1.207 -1.487 -1.746 -1.983 -2.247 -2.488 -2.687 -2.893 -3.106 -3.27 -3.445 -3.624 -3.757 -3.893 -4.027 -4.173 -4.332 -4.44 -4.548 -4.721 -4.847 -4.988 -5.066 -5.223 -5.377 -5.525 -5.599 -5.773 -5.873 -5.975 -6.079 -6.285 -6.387 -6.502 -6.619 -6.743 -6.922 -7.207 -7.636 -7 ,18928 ,TETRA ,17558102,Fri Nov 26 14:08:52 CET,Fri Nov 26 16:35:48 CET,0.0 0.712 0.839 0.963 1.09 1.199 1.299 1.4 1.545 1.601 1.664 1.731 1.885 1.935 2.036 2.134 2.215 2.255 2.331 2.411 2.52 2.588 2.656 2.75 2.837 2.932 3.032 3.131 3.246 3.339 3.425 3.531 3.634 3.742 3.859 3.984 4.109 4.238 4.379 4.519 4.655 4.812 4.987 5.145 5.309 5.455 5.586 5.653 5.63 5.493 5.08 4.357 3.639 2.983 2.378 1.854 1.412 1.022 0.682 0.31 -0.04 -0.361 -0.669 -0.979 -1.262 -1.512 -1.773 -2.001 -2.195 -2.402 -2.626 -2.809 -3.004 -3.196 -3.332 -3.482 -3.649 -3.816 -3.974 -4.088 -4.207 -4.371 -4.481 -4.606 -4.68 -4.841 -5.008 -5.174 -5.251 -5.422 -5.499 -5.587 -5.677 -5.864 -5.965 -6.082 -6.223 -6.38 -6.548 -6.714 -7.073 -8 ,4588 ,TETRA ,17558103,Fri Nov 26 14:20:55 CET,Fri Nov 26 16:33:31 CET,0.0 0.458 0.594 0.702 0.81 0.932 1.027 1.095 1.259 1.334 1.402 1.451 1.59 1.64 1.735 1.829 1.923 1.971 2.065 2.159 2.304 2.389 2.467 2.584 2.684 2.767 2.856 2.948 3.061 3.171 3.275 3.398 3.523 3.645 3.788 3.945 4.084 4.224 4.382 4.546 4.702 4.854 5.029 5.203 5.369 5.522 5.646 5.724 5.693 5.429 4.716 3.667 2.772 1.914 1.154 0.513 -0.019 -0.473 -0.891 -1.343 -1.728 -2.053 -2.367 -2.667 -2.939 -3.196 -3.46 -3.669 -3.858 -4.067 -4.284 -4.462 -4.636 -4.816 -4.952 -5.091 -5.226 -5.36 -5.516 -5.618 -5.722 -5.897 -6.006 -6.12 -6.185 -6.325 -6.48 -6.641 -6.712 -6.873 -6.949 -7.035 -7.128 -7.347 -7.459 -7.574 -7.693 -7.81 -7.97 -8.153 -8.453 -9 ,24993 ,TETRA ,17558105,Fri Nov 26 14:20:56 CET,Fri Nov 26 16:44:58 CET,0.0 0.233 0.425 0.605 0.754 0.868 0.964 1.073 1.225 1.284 1.347 1.391 1.523 1.57 1.675 1.777 1.873 1.918 1.986 2.05 2.153 2.226 2.3 2.411 2.518 2.619 2.72 2.819 2.936 3.037 3.133 3.245 3.347 3.436 3.531 3.638 3.741 3.856 3.968 4.074 4.178 4.285 4.396 4.529 4.69 4.804 4.865 4.87 4.792 4.528 3.898 3.105 2.343 1.594 0.945 0.32 -0.239 -0.738 -1.182 -1.64 -2.031 -2.366 -2.686 -2.968 -3.235 -3.512 -3.8 -4.039 -4.245 -4.447 -4.667 -4.869 -5.072 -5.275 -5.431 -5.597 -5.757 -5.915 -6.098 -6.227 -6.347 -6.524 -6.653 -6.792 -6.861 -7.009 -7.174 -7.333 -7.416 -7.601 -7.693 -7.78 -7.868 -8.047 -8.164 -8.286 -8.401 -8.526 -8.686 -8.897 -9.772 -10 ,29590 ,TETRA ,17558106,Fri Nov 26 14:20:57 CET,Fri Nov 26 16:44:42 CET,0.0 0.211 0.393 0.514 0.63 0.76 0.869 0.96 1.14 1.214 1.284 1.341 1.477 1.529 1.618 1.712 1.811 1.855 1.942 2.031 2.168 2.249 2.334 2.458 2.571 2.665 2.748 2.836 2.939 3.044 3.157 3.273 3.365 3.449 3.556 3.682 3.797 3.92 4.053 4.19 4.323 4.465 4.594 4.692 4.816 4.932 4.995 4.999 4.916 4.631 4.025 3.145 2.242 1.396 0.682 0.087 -0.432 -0.877 -1.242 -1.63 -1.99 -2.304 -2.582 -2.832 -3.083 -3.348 -3.621 -3.85 -4.046 -4.232 -4.423 -4.595 -4.783 -4.98 -5.128 -5.271 -5.428 -5.594 -5.767 -5.885 -5.996 -6.171 -6.299 -6.427 -6.492 -6.63 -6.786 -6.97 -7.054 -7.228 -7.328 -7.428 -7.548 -7.81 -7.945 -8.096 -8.244 -8.379 -8.556 -8.796 -9.181 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt deleted file mode 100644 index 2d5fdca3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27447 ,TETRA ,17558107,Fri Nov 26 14:24:58 CET,Fri Nov 26 16:42:37 CET,0.0 0.281 0.377 0.459 0.548 0.641 0.719 0.791 0.91 0.967 1.02 1.031 1.162 1.209 1.303 1.393 1.478 1.518 1.601 1.686 1.807 1.893 1.969 2.072 2.185 2.294 2.4 2.502 2.628 2.756 2.873 3.009 3.149 3.281 3.437 3.615 3.788 3.985 4.204 4.442 4.684 4.947 5.259 5.59 5.995 6.466 6.98 7.515 8.131 8.82 9.579 10.05 10.194 10.158 9.981 9.723 9.451 9.166 8.911 8.664 8.446 8.232 8.03 7.836 7.628 7.44 7.233 7.036 6.86 6.679 6.507 6.359 6.194 6.029 5.893 5.739 5.581 5.417 5.23 5.1 4.968 4.773 4.64 4.487 4.403 4.217 4.027 3.829 3.723 3.541 3.393 3.283 3.177 2.952 2.826 2.672 2.491 2.306 2.063 1.714 0.892 -2 ,18631 ,TETRA ,17558108,Fri Nov 26 14:24:58 CET,Fri Nov 26 16:42:49 CET,0.0 0.307 0.443 0.551 0.642 0.727 0.796 0.86 0.988 1.043 1.099 1.142 1.286 1.346 1.466 1.566 1.664 1.716 1.809 1.899 2.044 2.126 2.201 2.312 2.422 2.535 2.644 2.752 2.903 3.047 3.168 3.312 3.453 3.6 3.776 3.961 4.146 4.35 4.563 4.805 5.067 5.354 5.671 5.983 6.381 6.827 7.348 7.922 8.573 9.272 9.953 10.349 10.364 10.276 10.172 9.987 9.766 9.538 9.331 9.106 8.873 8.644 8.422 8.211 8.009 7.838 7.674 7.519 7.37 7.225 7.063 6.914 6.751 6.576 6.436 6.303 6.17 6.008 5.818 5.678 5.537 5.316 5.164 4.999 4.913 4.73 4.538 4.351 4.248 4.062 3.876 3.739 3.595 3.261 3.075 2.866 2.62 2.319 1.955 1.6 0.597 -3 ,13806 ,TETRA ,17558109,Fri Nov 26 14:29:54 CET,Fri Nov 26 16:37:22 CET,0.0 0.251 0.393 0.517 0.635 0.727 0.822 0.917 1.085 1.158 1.227 1.268 1.408 1.462 1.572 1.676 1.773 1.822 1.912 1.995 2.135 2.229 2.322 2.451 2.564 2.673 2.778 2.883 3.019 3.155 3.294 3.45 3.589 3.736 3.918 4.102 4.274 4.474 4.689 4.931 5.185 5.461 5.793 6.122 6.49 6.894 7.387 7.947 8.551 9.203 9.854 10.214 10.286 10.137 9.915 9.68 9.422 9.134 8.873 8.622 8.405 8.184 7.969 7.772 7.563 7.351 7.136 6.955 6.787 6.597 6.382 6.192 5.99 5.786 5.629 5.458 5.283 5.097 4.887 4.746 4.607 4.395 4.24 4.063 3.969 3.782 3.566 3.333 3.215 3.012 2.805 2.661 2.515 2.159 1.968 1.769 1.549 1.295 1.0 0.642 -0.161 -4 ,3787 ,TETRA ,17558110,Fri Nov 26 14:29:54 CET,Fri Nov 26 16:50:22 CET,0.0 0.239 0.454 0.573 0.683 0.784 0.895 1.002 1.173 1.245 1.307 1.348 1.5 1.57 1.688 1.783 1.867 1.909 2.009 2.107 2.246 2.339 2.427 2.543 2.658 2.772 2.876 2.977 3.109 3.229 3.346 3.496 3.639 3.795 3.973 4.149 4.324 4.515 4.729 4.963 5.196 5.465 5.8 6.139 6.521 6.957 7.463 8.006 8.666 9.383 10.071 10.363 10.251 10.034 9.765 9.481 9.244 9.02 8.774 8.482 8.212 7.991 7.769 7.502 7.244 7.021 6.794 6.588 6.395 6.182 5.958 5.768 5.565 5.348 5.177 4.986 4.786 4.584 4.386 4.25 4.086 3.839 3.661 3.457 3.355 3.143 2.921 2.674 2.542 2.33 2.083 1.91 1.738 1.386 1.207 1.007 0.752 0.453 0.086 -0.501 -2.193 -5 ,29094 ,TETRA ,17558111,Fri Nov 26 14:29:57 CET,Fri Nov 26 16:50:22 CET,0.0 0.325 0.436 0.539 0.634 0.71 0.798 0.908 1.086 1.149 1.203 1.23 1.373 1.423 1.504 1.596 1.688 1.727 1.811 1.906 2.042 2.123 2.202 2.32 2.446 2.578 2.697 2.805 2.942 3.078 3.212 3.376 3.531 3.681 3.863 4.058 4.237 4.454 4.686 4.915 5.169 5.446 5.764 6.118 6.544 7.018 7.554 8.135 8.804 9.542 10.325 10.79 10.915 10.889 10.747 10.542 10.309 10.043 9.79 9.511 9.256 9.024 8.802 8.602 8.421 8.259 8.091 7.928 7.779 7.628 7.461 7.298 7.135 6.97 6.827 6.701 6.575 6.42 6.245 6.128 6.015 5.842 5.715 5.577 5.503 5.342 5.17 4.996 4.91 4.75 4.624 4.519 4.421 4.18 3.994 3.752 3.493 3.254 3.026 2.733 1.634 -6 ,22445 ,TETRA ,17558112,Fri Nov 26 14:29:58 CET,Fri Nov 26 16:51:11 CET,0.0 0.286 0.422 0.533 0.643 0.747 0.831 0.905 1.025 1.087 1.146 1.173 1.306 1.352 1.445 1.551 1.644 1.686 1.779 1.871 2.005 2.092 2.173 2.279 2.388 2.502 2.615 2.724 2.857 2.989 3.126 3.287 3.437 3.579 3.756 3.955 4.135 4.344 4.569 4.804 5.05 5.309 5.597 5.897 6.258 6.67 7.134 7.617 8.153 8.742 9.267 9.479 9.385 9.221 9.033 8.779 8.502 8.204 7.926 7.628 7.345 7.082 6.819 6.551 6.269 6.005 5.743 5.501 5.279 5.04 4.784 4.579 4.382 4.164 3.979 3.787 3.591 3.369 3.135 2.984 2.828 2.584 2.425 2.253 2.157 1.96 1.749 1.509 1.369 1.141 0.897 0.72 0.542 0.175 -0.021 -0.255 -0.52 -0.793 -1.149 -1.646 -3.027 -7 ,26007 ,TETRA ,17558113,Fri Nov 26 14:34:58 CET,Fri Nov 26 16:43:29 CET,0.0 0.316 0.505 0.647 0.719 0.785 0.867 0.958 1.106 1.169 1.222 1.234 1.374 1.433 1.545 1.654 1.757 1.808 1.9 1.981 2.094 2.172 2.25 2.365 2.481 2.6 2.719 2.834 2.973 3.1 3.23 3.382 3.531 3.686 3.866 4.058 4.23 4.414 4.612 4.831 5.075 5.349 5.654 5.974 6.351 6.76 7.265 7.83 8.398 9.009 9.683 10.177 10.352 10.316 10.195 10.04 9.891 9.682 9.444 9.176 8.911 8.671 8.427 8.192 8.001 7.827 7.618 7.399 7.188 6.98 6.776 6.602 6.413 6.207 6.053 5.897 5.734 5.556 5.365 5.237 5.107 4.886 4.714 4.527 4.43 4.227 4.007 3.787 3.681 3.508 3.378 3.265 3.137 2.836 2.657 2.439 2.211 1.935 1.589 1.224 0.125 -8 ,11902 ,TETRA ,17558114,Fri Nov 26 14:43:54 CET,Fri Nov 26 17:07:12 CET,0.0 0.246 0.338 0.418 0.478 0.534 0.605 0.679 0.792 0.843 0.897 0.916 1.047 1.09 1.175 1.262 1.347 1.389 1.477 1.564 1.683 1.765 1.848 1.968 2.079 2.182 2.289 2.391 2.526 2.672 2.808 2.954 3.101 3.244 3.402 3.573 3.74 3.933 4.146 4.384 4.635 4.911 5.251 5.603 6.016 6.462 6.941 7.473 8.086 8.759 9.373 9.607 9.608 9.457 9.142 8.806 8.493 8.189 7.916 7.624 7.373 7.11 6.851 6.625 6.41 6.214 5.999 5.798 5.61 5.404 5.208 5.046 4.867 4.679 4.517 4.339 4.154 3.986 3.821 3.702 3.576 3.361 3.21 3.045 2.96 2.793 2.614 2.428 2.322 2.123 1.913 1.775 1.643 1.307 1.118 0.946 0.728 0.436 0.119 -0.324 -1.711 -9 ,20428 ,TETRA ,17558115,Fri Nov 26 14:43:57 CET,Fri Nov 26 17:05:34 CET,0.0 0.364 0.488 0.593 0.687 0.788 0.898 0.996 1.145 1.213 1.285 1.338 1.482 1.536 1.641 1.736 1.833 1.881 1.966 2.047 2.174 2.254 2.333 2.447 2.558 2.662 2.765 2.875 3.02 3.163 3.286 3.438 3.599 3.742 3.906 4.107 4.308 4.521 4.752 4.991 5.24 5.531 5.87 6.206 6.58 6.991 7.474 8.012 8.661 9.448 10.261 10.763 10.92 10.938 10.913 10.799 10.613 10.422 10.246 10.052 9.861 9.669 9.482 9.294 9.094 8.886 8.65 8.436 8.265 8.085 7.888 7.728 7.556 7.366 7.227 7.091 6.941 6.786 6.622 6.506 6.382 6.19 6.071 5.945 5.879 5.729 5.565 5.396 5.304 5.136 4.996 4.887 4.785 4.556 4.424 4.282 4.098 3.887 3.681 3.412 2.793 -10 ,15781 ,TETRA ,17558116,Fri Nov 26 14:43:54 CET,Fri Nov 26 17:02:51 CET,0.0 0.319 0.445 0.531 0.629 0.743 0.824 0.885 1.006 1.069 1.128 1.156 1.292 1.349 1.47 1.581 1.676 1.722 1.813 1.9 2.025 2.107 2.194 2.315 2.427 2.533 2.631 2.726 2.859 2.998 3.134 3.297 3.447 3.592 3.753 3.94 4.13 4.34 4.565 4.814 5.07 5.347 5.687 6.034 6.411 6.828 7.322 7.88 8.545 9.25 9.967 10.368 10.48 10.477 10.348 10.138 9.908 9.682 9.454 9.18 8.915 8.662 8.432 8.212 7.985 7.76 7.516 7.286 7.096 6.912 6.691 6.5 6.303 6.095 5.944 5.794 5.632 5.458 5.282 5.156 5.012 4.787 4.627 4.45 4.358 4.182 3.991 3.776 3.668 3.482 3.332 3.215 3.096 2.846 2.701 2.524 2.302 2.019 1.673 1.124 -0.289 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt deleted file mode 100644 index 3e0a0237..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13794 ,TETRA ,17558117,Fri Nov 26 14:43:54 CET,Fri Nov 26 17:06:18 CET,0.0 0.214 0.369 0.469 0.55 0.623 0.712 0.805 0.967 1.04 1.103 1.137 1.281 1.342 1.451 1.553 1.652 1.698 1.783 1.861 1.974 2.059 2.15 2.274 2.388 2.5 2.611 2.724 2.859 2.986 3.121 3.284 3.434 3.578 3.746 3.936 4.113 4.297 4.509 4.738 4.974 5.241 5.552 5.888 6.279 6.733 7.24 7.734 8.295 8.899 9.418 9.663 9.695 9.605 9.512 9.341 9.05 8.727 8.474 8.237 8.006 7.792 7.558 7.313 7.095 6.914 6.713 6.524 6.364 6.198 6.021 5.866 5.706 5.545 5.42 5.283 5.131 4.97 4.797 4.665 4.522 4.302 4.147 3.988 3.918 3.77 3.608 3.424 3.32 3.135 2.986 2.868 2.719 2.383 2.212 2.008 1.774 1.534 1.239 0.851 0.033 -2 ,31228 ,TETRA ,17558118,Fri Nov 26 14:45:58 CET,Fri Nov 26 16:59:15 CET,0.0 0.234 0.366 0.493 0.608 0.693 0.766 0.842 0.986 1.052 1.123 1.176 1.32 1.372 1.468 1.575 1.681 1.729 1.816 1.901 2.03 2.105 2.183 2.301 2.418 2.535 2.64 2.738 2.866 2.993 3.106 3.238 3.381 3.533 3.718 3.91 4.083 4.281 4.504 4.734 4.968 5.241 5.559 5.888 6.282 6.719 7.205 7.73 8.294 8.87 9.477 9.8 9.849 9.806 9.673 9.454 9.217 8.949 8.706 8.475 8.225 7.969 7.727 7.49 7.249 7.02 6.767 6.517 6.29 6.042 5.755 5.496 5.23 4.967 4.755 4.54 4.327 4.1 3.857 3.69 3.517 3.261 3.094 2.921 2.84 2.68 2.503 2.295 2.187 2.008 1.864 1.73 1.572 1.2 0.989 0.78 0.496 0.174 -0.187 -0.798 -2.944 -3 ,30368 ,TETRA ,17558119,Fri Nov 26 14:41:58 CET,Fri Nov 26 16:57:03 CET,0.0 0.436 0.589 0.645 0.713 0.791 0.869 0.944 1.072 1.133 1.194 1.229 1.379 1.442 1.554 1.666 1.773 1.817 1.893 1.974 2.097 2.175 2.244 2.343 2.456 2.571 2.683 2.789 2.913 3.027 3.133 3.271 3.414 3.555 3.718 3.896 4.07 4.274 4.506 4.729 4.96 5.25 5.61 5.967 6.352 6.758 7.24 7.785 8.362 9.039 9.817 10.29 10.421 10.382 10.26 10.112 9.973 9.826 9.663 9.483 9.318 9.141 8.956 8.8 8.639 8.464 8.298 8.164 8.031 7.881 7.727 7.601 7.461 7.311 7.203 7.085 6.957 6.806 6.617 6.482 6.348 6.138 5.997 5.829 5.736 5.568 5.397 5.208 5.108 4.916 4.745 4.624 4.489 4.211 4.063 3.902 3.735 3.526 3.283 2.859 1.653 -4 ,2159 ,TETRA ,17558120,Fri Nov 26 14:41:59 CET,Fri Nov 26 16:55:08 CET,0.0 0.201 0.304 0.38 0.466 0.544 0.621 0.689 0.809 0.875 0.947 0.986 1.119 1.178 1.292 1.392 1.494 1.545 1.638 1.719 1.83 1.907 1.979 2.103 2.241 2.359 2.472 2.583 2.728 2.865 2.994 3.14 3.283 3.417 3.565 3.739 3.914 4.108 4.31 4.519 4.748 5.007 5.298 5.609 5.985 6.404 6.885 7.394 7.977 8.653 9.351 9.745 9.787 9.609 9.38 9.19 8.987 8.75 8.506 8.198 7.922 7.688 7.442 7.198 6.968 6.761 6.552 6.367 6.199 6.015 5.809 5.639 5.467 5.283 5.125 4.957 4.793 4.617 4.434 4.301 4.157 3.976 3.875 3.748 3.671 3.5 3.341 3.161 3.055 2.886 2.753 2.624 2.497 2.235 2.069 1.891 1.709 1.474 1.174 0.818 -0.727 -5 ,23605 ,TETRA ,17558121,Fri Nov 26 14:42:01 CET,Fri Nov 26 17:02:38 CET,0.0 0.434 0.582 0.701 0.808 0.892 0.951 1.025 1.178 1.234 1.287 1.312 1.452 1.514 1.624 1.736 1.837 1.879 1.966 2.058 2.195 2.286 2.37 2.482 2.59 2.693 2.801 2.912 3.044 3.164 3.287 3.454 3.622 3.776 3.947 4.141 4.334 4.548 4.776 5.033 5.298 5.575 5.911 6.229 6.61 7.039 7.489 7.996 8.575 9.196 9.839 10.171 10.204 10.065 9.839 9.581 9.285 8.979 8.714 8.429 8.149 7.92 7.713 7.509 7.323 7.142 6.933 6.732 6.554 6.371 6.184 6.017 5.825 5.615 5.461 5.308 5.143 4.965 4.774 4.644 4.507 4.277 4.121 3.958 3.873 3.694 3.492 3.279 3.181 2.998 2.811 2.677 2.549 2.23 2.044 1.853 1.616 1.347 1.062 0.71 -0.658 -6 ,23552 ,TETRA ,17558122,Fri Nov 26 14:42:03 CET,Fri Nov 26 17:00:42 CET,0.0 0.092 0.199 0.291 0.389 0.476 0.545 0.617 0.743 0.796 0.842 0.853 0.989 1.036 1.128 1.222 1.312 1.358 1.448 1.529 1.647 1.723 1.792 1.891 1.987 2.091 2.195 2.295 2.42 2.535 2.649 2.788 2.927 3.061 3.207 3.37 3.528 3.7 3.905 4.122 4.348 4.628 4.968 5.299 5.675 6.113 6.598 7.098 7.655 8.267 8.883 9.235 9.269 9.09 8.821 8.521 8.235 7.965 7.703 7.427 7.184 6.926 6.657 6.403 6.143 5.899 5.634 5.385 5.176 4.966 4.758 4.578 4.375 4.164 4.005 3.834 3.654 3.468 3.28 3.153 3.006 2.77 2.605 2.425 2.331 2.144 1.951 1.735 1.614 1.416 1.254 1.126 0.998 0.694 0.524 0.318 0.084 -0.143 -0.41 -0.757 -1.955 -7 ,25100 ,TETRA ,17558123,Fri Nov 26 14:42:00 CET,Fri Nov 26 16:57:38 CET,0.0 0.206 0.301 0.389 0.442 0.52 0.597 0.648 0.751 0.801 0.849 0.857 0.991 1.034 1.116 1.193 1.259 1.295 1.367 1.446 1.569 1.64 1.71 1.812 1.903 2.001 2.1 2.196 2.332 2.46 2.585 2.734 2.868 2.995 3.147 3.33 3.512 3.709 3.91 4.116 4.336 4.584 4.864 5.154 5.505 5.895 6.354 6.871 7.447 8.107 8.781 9.116 9.149 9.066 8.94 8.765 8.569 8.317 8.029 7.734 7.481 7.257 7.025 6.81 6.615 6.436 6.229 6.026 5.853 5.65 5.433 5.256 5.061 4.867 4.728 4.59 4.418 4.234 4.037 3.887 3.753 3.564 3.437 3.293 3.212 3.052 2.888 2.717 2.618 2.426 2.261 2.134 2.011 1.752 1.598 1.434 1.25 1.03 0.789 0.474 -0.556 -8 ,14790 ,TETRA ,17558124,Fri Nov 26 15:02:34 CET,Fri Nov 26 17:13:41 CET,0.0 0.169 0.29 0.402 0.526 0.636 0.723 0.792 0.918 0.982 1.05 1.108 1.263 1.316 1.409 1.498 1.591 1.642 1.734 1.824 1.97 2.056 2.13 2.247 2.373 2.501 2.622 2.734 2.872 3.012 3.145 3.306 3.468 3.606 3.765 3.958 4.155 4.37 4.582 4.803 5.031 5.287 5.609 5.936 6.302 6.707 7.157 7.657 8.19 8.699 9.16 9.235 9.027 8.723 8.357 7.99 7.615 7.234 6.905 6.542 6.181 5.856 5.521 5.166 4.835 4.546 4.241 3.97 3.744 3.519 3.285 3.083 2.846 2.571 2.36 2.147 1.93 1.704 1.454 1.277 1.104 0.835 0.646 0.444 0.332 0.094 -0.147 -0.399 -0.534 -0.748 -0.952 -1.114 -1.306 -1.686 -1.883 -2.115 -2.393 -2.694 -3.071 -3.653 -5.433 -9 ,10431 ,TETRA ,17558125,Fri Nov 26 15:02:34 CET,Fri Nov 26 17:15:37 CET,0.0 0.174 0.27 0.331 0.401 0.48 0.544 0.6 0.73 0.79 0.845 0.877 1.021 1.071 1.172 1.28 1.381 1.425 1.509 1.584 1.697 1.781 1.86 1.97 2.078 2.182 2.282 2.374 2.489 2.602 2.709 2.846 2.987 3.122 3.28 3.454 3.63 3.835 4.044 4.262 4.487 4.728 5.035 5.359 5.724 6.157 6.666 7.194 7.765 8.42 9.103 9.398 9.391 9.289 9.12 8.871 8.586 8.314 8.077 7.843 7.621 7.389 7.128 6.858 6.631 6.452 6.259 6.08 5.919 5.747 5.555 5.401 5.244 5.059 4.903 4.742 4.578 4.397 4.217 4.101 3.979 3.776 3.634 3.49 3.414 3.26 3.091 2.884 2.753 2.544 2.375 2.248 2.128 1.868 1.704 1.516 1.305 1.068 0.788 0.48 0.118 -10 ,7233 ,TETRA ,17558126,Fri Nov 26 15:02:34 CET,Fri Nov 26 17:16:03 CET,0.0 0.333 0.449 0.547 0.629 0.714 0.785 0.846 0.96 1.009 1.058 1.072 1.214 1.276 1.392 1.504 1.601 1.645 1.73 1.813 1.934 2.01 2.091 2.222 2.35 2.47 2.585 2.699 2.849 2.992 3.132 3.283 3.416 3.544 3.704 3.891 4.062 4.254 4.46 4.671 4.888 5.144 5.434 5.709 6.041 6.426 6.879 7.391 7.953 8.527 9.044 9.293 9.265 9.094 8.862 8.6 8.342 8.038 7.705 7.36 7.063 6.789 6.517 6.26 6.007 5.758 5.483 5.223 5.007 4.798 4.591 4.413 4.203 3.976 3.808 3.635 3.452 3.275 3.093 2.962 2.825 2.598 2.456 2.308 2.23 2.066 1.872 1.646 1.531 1.349 1.212 1.11 0.999 0.698 0.525 0.356 0.199 0.024 -0.231 -0.591 -1.615 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt deleted file mode 100644 index 3ce7582f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,2490 ,TETRA ,17558128,Fri Nov 26 15:02:34 CET,Fri Nov 26 17:20:28 CET,0.0 3.375 3.852 4.246 4.519 4.759 4.951 5.108 5.354 5.479 5.598 5.528 5.899 6.006 6.158 6.284 6.411 6.473 6.571 6.668 6.812 6.895 6.954 6.998 7.042 7.108 7.223 7.377 7.614 7.793 7.861 7.856 7.792 7.725 7.615 7.47 7.303 7.071 6.81 6.476 6.022 5.443 4.649 3.724 2.49 0.799 -1.508 -4.478 -8.598 -14.48 -23.49 -33.333 -40.961 -47.249 -52.492 -56.886 -60.511 -63.557 -66.079 -68.632 -70.779 -72.743 -74.643 -76.386 -77.963 -79.378 -80.832 -82.115 -83.191 -84.283 -85.423 -86.342 -87.272 -88.245 -89.007 -89.766 -90.529 -91.302 -92.059 -92.576 -93.119 -93.945 -94.52 -95.138 -95.452 -96.105 -96.799 -97.515 -97.896 -98.674 -99.124 -99.558 -100.011 -100.997 -101.516 -102.026 -102.567 -103.181 -103.89 -104.729 -108.295 -3 ,32358 ,TETRA ,17558129,Fri Nov 26 15:02:35 CET,Fri Nov 26 17:29:40 CET,0.0 3.695 4.284 4.75 5.128 5.465 5.735 5.93 6.292 6.461 6.608 6.599 6.969 7.087 7.308 7.514 7.691 7.762 7.899 8.034 8.213 8.303 8.381 8.506 8.652 8.78 8.877 8.973 9.062 9.129 9.2 9.296 9.392 9.487 9.56 9.605 9.651 9.656 9.553 9.409 9.207 8.874 8.369 7.67 6.76 5.522 3.451 0.46 -3.552 -9.281 -18.452 -28.409 -35.869 -41.984 -47.152 -51.465 -54.873 -57.799 -60.306 -62.861 -64.991 -66.773 -68.434 -69.965 -71.366 -72.623 -73.883 -74.983 -75.963 -77.007 -78.097 -78.96 -79.792 -80.642 -81.324 -82.039 -82.746 -83.465 -84.178 -84.643 -85.117 -85.926 -86.544 -87.202 -87.522 -88.17 -88.856 -89.55 -89.918 -90.678 -91.075 -91.485 -91.911 -92.768 -93.199 -93.706 -94.312 -94.993 -95.78 -96.815 -102.445 -4 ,9062 ,TETRA ,17558130,Fri Nov 26 15:02:36 CET,Fri Nov 26 17:28:53 CET,0.0 2.951 3.872 4.399 4.745 5.031 5.3 5.559 6.058 6.277 6.472 6.583 7.025 7.178 7.465 7.701 7.884 7.962 8.113 8.249 8.422 8.533 8.632 8.78 8.918 9.009 9.086 9.155 9.239 9.329 9.388 9.437 9.483 9.517 9.547 9.52 9.412 9.227 8.97 8.634 8.24 7.807 7.142 6.277 5.167 3.769 1.836 -0.867 -4.764 -10.375 -19.056 -28.741 -36.101 -42.077 -46.953 -51.094 -54.597 -57.602 -60.064 -62.479 -64.519 -66.276 -67.941 -69.499 -70.966 -72.337 -73.718 -74.874 -75.854 -76.856 -77.868 -78.71 -79.575 -80.452 -81.126 -81.804 -82.49 -83.199 -83.933 -84.437 -84.95 -85.733 -86.27 -86.836 -87.121 -87.695 -88.29 -88.906 -89.21 -89.89 -90.114 -90.45 -90.792 -91.516 -91.941 -92.381 -92.866 -93.451 -94.104 -94.829 -97.146 -5 ,17736 ,TETRA ,17558131,Fri Nov 26 15:04:32 CET,Fri Nov 26 17:24:37 CET,0.0 4.145 4.633 4.964 5.212 5.431 5.654 5.84 6.128 6.262 6.372 6.286 6.63 6.724 6.874 7.002 7.132 7.199 7.32 7.401 7.483 7.531 7.592 7.69 7.774 7.842 7.913 7.997 8.104 8.195 8.206 8.139 8.053 7.957 7.804 7.569 7.333 7.069 6.718 6.304 5.899 5.412 4.735 3.885 2.754 1.399 -0.479 -2.979 -6.529 -11.749 -19.869 -28.872 -35.81 -41.338 -45.813 -49.701 -53.017 -55.847 -58.225 -60.602 -62.608 -64.343 -65.988 -67.511 -68.842 -69.991 -71.199 -72.275 -73.159 -74.054 -74.974 -75.756 -76.579 -77.426 -78.086 -78.767 -79.443 -80.113 -80.847 -81.349 -81.812 -82.53 -83.073 -83.617 -83.882 -84.447 -85.075 -85.741 -86.09 -86.842 -87.319 -87.811 -88.318 -89.357 -89.895 -90.448 -91.025 -91.636 -92.341 -93.28 -98.846 -6 ,25168 ,TETRA ,17558132,Fri Nov 26 15:04:34 CET,Fri Nov 26 17:23:32 CET,0.0 3.359 4.1 4.548 4.903 5.259 5.577 5.823 6.246 6.432 6.588 6.617 7.022 7.157 7.436 7.745 8.036 8.176 8.445 8.63 8.765 8.85 8.961 9.118 9.23 9.292 9.319 9.34 9.377 9.391 9.353 9.278 9.207 9.15 9.075 8.923 8.753 8.564 8.28 7.919 7.497 6.952 6.196 5.242 4.005 2.461 0.325 -2.57 -6.57 -12.096 -20.471 -29.685 -36.765 -42.334 -46.838 -50.747 -53.993 -56.795 -59.197 -61.575 -63.617 -65.421 -67.066 -68.518 -69.835 -71.058 -72.376 -73.545 -74.539 -75.577 -76.608 -77.442 -78.294 -79.176 -79.868 -80.603 -81.365 -82.13 -82.903 -83.408 -83.923 -84.705 -85.253 -85.822 -86.105 -86.699 -87.297 -87.894 -88.24 -89.0 -89.386 -89.791 -90.217 -91.097 -91.594 -92.175 -92.752 -93.321 -94.022 -94.943 -101.742 -7 ,14325 ,TETRA ,17558133,Fri Nov 26 15:04:32 CET,Fri Nov 26 17:23:36 CET,0.0 3.113 3.654 4.099 4.437 4.68 4.887 5.052 5.329 5.439 5.543 5.486 5.862 6.011 6.238 6.433 6.645 6.737 6.859 6.97 7.16 7.283 7.407 7.564 7.683 7.783 7.875 7.929 8.007 8.117 8.182 8.185 8.122 8.052 7.946 7.77 7.6 7.363 7.021 6.662 6.229 5.627 4.852 3.964 2.795 1.278 -0.784 -3.488 -7.289 -12.852 -21.363 -30.653 -37.958 -43.925 -48.849 -53.11 -56.754 -59.923 -62.522 -64.991 -67.051 -68.827 -70.482 -72.001 -73.385 -74.658 -75.958 -77.122 -78.144 -79.184 -80.22 -81.032 -81.877 -82.791 -83.492 -84.179 -84.911 -85.703 -86.442 -86.907 -87.43 -88.295 -88.854 -89.406 -89.679 -90.246 -90.845 -91.479 -91.807 -92.522 -92.903 -93.304 -93.728 -94.673 -95.178 -95.814 -96.459 -97.029 -97.787 -98.786 -104.861 -8 ,10268 ,TETRA ,17558134,Fri Nov 26 15:04:31 CET,Fri Nov 26 17:29:41 CET,0.0 2.607 3.23 3.652 3.985 4.225 4.426 4.62 4.93 5.044 5.149 5.112 5.456 5.52 5.658 5.809 5.952 6.015 6.133 6.235 6.366 6.458 6.543 6.643 6.719 6.775 6.841 6.919 6.978 7.013 7.056 7.077 7.082 7.087 7.073 7.009 6.93 6.811 6.608 6.361 6.004 5.492 4.8 3.936 2.722 1.172 -0.834 -3.434 -7.045 -12.282 -20.598 -29.924 -37.133 -42.809 -47.552 -51.814 -55.49 -58.727 -61.423 -64.034 -66.214 -68.111 -69.895 -71.539 -73.02 -74.336 -75.681 -76.92 -77.968 -79.005 -80.097 -80.953 -81.771 -82.637 -83.359 -84.091 -84.81 -85.544 -86.325 -86.885 -87.433 -88.233 -88.787 -89.33 -89.614 -90.21 -90.813 -91.456 -91.788 -92.519 -92.852 -93.211 -93.549 -94.243 -94.649 -95.102 -95.6 -96.162 -96.78 -97.63 -109.148 -10 ,3205 ,TETRA ,17558136,Fri Nov 26 15:04:32 CET,Fri Nov 26 17:23:31 CET,0.0 1.487 1.963 2.343 2.652 2.895 3.113 3.312 3.669 3.858 4.034 4.118 4.545 4.68 4.925 5.139 5.339 5.446 5.665 5.862 6.065 6.176 6.305 6.469 6.598 6.725 6.849 6.957 7.059 7.121 7.182 7.233 7.23 7.172 7.099 7.063 6.987 6.848 6.66 6.446 6.123 5.53 4.692 3.728 2.461 0.894 -1.199 -3.99 -7.834 -13.419 -22.616 -32.847 -40.359 -46.366 -51.268 -55.4 -58.808 -61.733 -64.168 -66.512 -68.445 -70.072 -71.607 -73.07 -74.426 -75.66 -76.96 -78.094 -79.028 -79.989 -81.047 -81.941 -82.812 -83.683 -84.329 -85.013 -85.779 -86.611 -87.467 -88.047 -88.63 -89.479 -90.051 -90.639 -90.937 -91.535 -92.159 -92.846 -93.225 -93.987 -94.433 -94.878 -95.319 -96.224 -96.708 -97.25 -97.892 -98.559 -99.355 -100.476 -104.608 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 6da55add..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4418 ,TETRA ,17558137,Fri Nov 26 15:04:33 CET,Fri Nov 26 17:26:59 CET,0.0 0.159 0.297 0.445 0.584 0.712 0.85 1.122 1.259 1.39 1.361 1.735 1.847 2.067 2.288 2.501 2.608 2.816 3.024 3.354 3.559 3.76 4.051 4.333 4.611 4.883 5.142 5.479 5.808 6.125 6.523 6.906 7.275 7.708 8.209 8.755 9.447 10.175 10.897 11.626 12.434 13.398 14.391 15.536 16.775 18.238 19.88 21.625 23.513 25.524 26.312 26.204 25.763 25.068 24.31 23.623 22.904 22.168 21.315 20.556 19.939 19.349 18.783 18.229 17.706 17.172 16.656 16.151 15.603 15.047 14.57 14.056 13.519 13.085 12.629 12.165 11.645 11.071 10.697 10.303 9.659 9.238 8.813 8.591 8.129 7.624 7.046 6.732 6.168 5.709 5.313 4.883 3.912 3.364 2.686 1.937 1.062 -0.045 -1.601 -2 ,8468 ,TETRA ,17558138,Fri Nov 26 15:04:35 CET,Fri Nov 26 17:26:09 CET,0.0 0.214 0.418 0.602 0.751 0.897 1.032 1.275 1.403 1.521 1.482 1.858 1.97 2.18 2.381 2.58 2.686 2.901 3.118 3.453 3.661 3.851 4.127 4.411 4.685 4.957 5.241 5.611 5.961 6.313 6.751 7.151 7.535 8.013 8.564 9.084 9.651 10.263 10.906 11.624 12.471 13.484 14.569 15.803 17.117 18.744 20.546 22.337 24.269 26.415 27.866 28.24 28.107 27.689 27.082 26.402 25.734 25.095 24.381 23.744 23.104 22.451 21.865 21.318 20.796 20.234 19.736 19.328 18.908 18.464 18.097 17.72 17.321 16.995 16.65 16.312 15.956 15.576 15.285 14.939 14.353 13.929 13.487 13.261 12.769 12.184 11.566 11.261 10.688 10.239 9.863 9.429 8.47 7.948 7.375 6.727 5.97 5.026 3.649 -3 ,5974 ,TETRA ,17558139,Fri Nov 26 15:04:33 CET,Fri Nov 26 17:21:36 CET,0.0 0.137 0.275 0.418 0.55 0.663 0.785 1.023 1.125 1.226 1.18 1.545 1.664 1.883 2.1 2.322 2.431 2.641 2.841 3.135 3.33 3.531 3.83 4.104 4.364 4.626 4.892 5.24 5.578 5.917 6.336 6.757 7.181 7.65 8.163 8.67 9.26 9.902 10.585 11.322 12.135 13.106 14.111 15.329 16.713 18.254 19.965 21.895 24.068 26.223 27.122 27.021 26.545 25.974 25.308 24.574 23.843 23.187 22.457 21.761 21.132 20.507 19.896 19.309 18.755 18.138 17.583 17.113 16.59 16.022 15.554 15.097 14.625 14.226 13.808 13.389 12.922 12.408 12.049 11.689 11.122 10.705 10.247 10.03 9.599 9.117 8.627 8.33 7.75 7.285 6.896 6.483 5.56 5.041 4.453 3.761 2.887 1.753 0.205 -4 ,6011 ,TETRA ,17558140,Fri Nov 26 15:04:35 CET,Fri Nov 26 17:19:34 CET,0.0 0.241 0.452 0.616 0.761 0.922 1.072 1.329 1.449 1.571 1.577 1.979 2.105 2.356 2.608 2.858 2.981 3.212 3.431 3.738 3.944 4.149 4.455 4.766 5.074 5.352 5.6 5.928 6.272 6.637 7.07 7.466 7.871 8.371 8.929 9.467 10.075 10.719 11.39 12.097 12.895 13.837 14.809 16.004 17.339 18.792 20.369 22.018 23.613 25.31 26.242 26.144 25.722 25.275 24.61 23.826 23.038 22.314 21.51 20.76 20.115 19.54 19.015 18.533 18.063 17.519 17.034 16.618 16.195 15.738 15.341 14.944 14.575 14.248 13.844 13.412 12.931 12.398 12.039 11.68 11.131 10.768 10.379 10.161 9.708 9.248 8.738 8.458 7.947 7.528 7.14 6.729 5.869 5.395 4.868 4.269 3.525 2.59 1.06 -5 ,31780 ,TETRA ,17558141,Fri Nov 26 15:04:33 CET,Fri Nov 26 17:23:03 CET,0.0 0.207 0.384 0.544 0.707 0.859 1.004 1.28 1.403 1.529 1.531 1.93 2.059 2.301 2.532 2.773 2.904 3.156 3.399 3.757 3.981 4.201 4.53 4.861 5.196 5.525 5.836 6.242 6.637 6.996 7.435 7.889 8.359 8.896 9.452 9.989 10.612 11.302 12.016 12.763 13.605 14.594 15.587 16.682 17.946 19.475 21.151 22.967 24.835 26.576 27.216 27.086 26.58 25.838 25.126 24.329 23.519 22.893 22.234 21.634 21.102 20.565 20.015 19.465 18.978 18.455 17.957 17.543 17.101 16.609 16.178 15.738 15.261 14.858 14.467 14.084 13.69 13.285 12.989 12.636 12.007 11.582 11.179 10.976 10.53 10.056 9.563 9.282 8.75 8.391 8.045 7.665 6.784 6.271 5.687 5.048 4.277 3.232 1.71 -6 ,4533 ,TETRA ,17558142,Fri Nov 26 15:04:35 CET,Fri Nov 26 17:19:32 CET,0.0 0.184 0.371 0.524 0.667 0.819 0.973 1.257 1.388 1.514 1.531 1.94 2.08 2.334 2.587 2.84 2.958 3.192 3.418 3.737 3.962 4.191 4.515 4.831 5.142 5.453 5.763 6.147 6.513 6.874 7.304 7.743 8.211 8.76 9.354 9.924 10.566 11.273 12.014 12.787 13.718 14.841 15.89 17.067 18.431 19.967 21.546 23.186 25.045 26.779 27.274 27.005 26.446 25.743 24.987 24.3 23.631 22.989 22.292 21.64 21.065 20.536 20.003 19.478 18.998 18.467 17.992 17.618 17.223 16.779 16.417 16.078 15.722 15.419 15.099 14.738 14.287 13.736 13.32 12.888 12.257 11.861 11.408 11.164 10.688 10.189 9.649 9.363 8.819 8.401 8.024 7.609 6.683 6.147 5.52 4.796 3.996 2.905 1.454 -7 ,32000 ,TETRA ,17558143,Fri Nov 26 15:04:33 CET,Fri Nov 26 17:17:54 CET,0.0 0.169 0.326 0.479 0.626 0.774 0.902 1.142 1.267 1.395 1.382 1.756 1.871 2.087 2.303 2.509 2.611 2.832 3.045 3.355 3.559 3.765 4.067 4.357 4.646 4.936 5.21 5.569 5.948 6.334 6.803 7.247 7.67 8.166 8.728 9.256 9.858 10.54 11.253 12.028 12.957 14.051 15.174 16.482 17.961 19.73 21.688 23.711 25.551 27.223 28.008 27.982 27.474 26.818 26.144 25.399 24.607 23.907 23.257 22.678 22.062 21.465 20.903 20.366 19.927 19.494 19.079 18.728 18.356 17.932 17.531 17.083 16.641 16.25 15.821 15.392 14.908 14.401 14.074 13.705 13.075 12.683 12.283 12.057 11.589 11.097 10.563 10.293 9.759 9.321 8.978 8.591 7.644 7.123 6.556 5.813 4.832 3.732 2.282 -8 ,1655 ,TETRA ,17558144,Fri Nov 26 14:41:59 CET,Fri Nov 26 17:03:01 CET,0.0 0.159 0.329 0.506 0.67 0.818 0.969 1.269 1.405 1.528 1.506 1.889 2.01 2.236 2.463 2.695 2.815 3.064 3.303 3.65 3.877 4.087 4.392 4.704 5.018 5.318 5.613 6.006 6.38 6.759 7.236 7.68 8.108 8.624 9.246 9.843 10.465 11.14 11.873 12.638 13.502 14.542 15.58 16.81 18.161 19.639 21.232 23.024 25.086 27.134 28.215 28.526 28.318 27.974 27.565 27.054 26.526 26.031 25.495 24.973 24.475 23.99 23.486 22.967 22.45 21.891 21.348 20.82 20.313 19.773 19.257 18.72 18.195 17.756 17.256 16.753 16.237 15.701 15.315 14.937 14.388 13.998 13.583 13.358 12.848 12.279 11.649 11.286 10.686 10.199 9.798 9.347 8.221 7.611 6.934 6.18 5.329 4.334 2.833 -9 ,986 ,TETRA ,17558145,Fri Nov 26 15:04:33 CET,Fri Nov 26 17:25:43 CET,0.0 0.232 0.439 0.609 0.773 0.952 1.121 1.431 1.562 1.683 1.686 2.088 2.229 2.5 2.752 3.001 3.127 3.38 3.618 3.941 4.154 4.372 4.698 5.01 5.319 5.617 5.885 6.232 6.577 6.908 7.314 7.732 8.14 8.605 9.154 9.705 10.309 10.948 11.632 12.374 13.244 14.263 15.326 16.636 18.066 19.624 21.343 23.194 25.002 26.628 27.038 26.754 26.413 25.893 25.243 24.644 23.987 23.346 22.709 22.12 21.524 20.92 20.332 19.78 19.275 18.756 18.334 17.985 17.603 17.17 16.815 16.458 16.077 15.746 15.404 15.031 14.568 14.043 13.683 13.293 12.676 12.223 11.724 11.49 10.985 10.427 9.841 9.493 8.869 8.328 7.931 7.529 6.649 6.14 5.508 4.808 4.046 2.995 1.477 -10 ,20375 ,TETRA ,17558146,Fri Nov 26 15:04:33 CET,Fri Nov 26 17:24:07 CET,0.0 0.188 0.359 0.511 0.662 0.829 0.999 1.31 1.445 1.57 1.569 1.943 2.056 2.287 2.514 2.728 2.835 3.045 3.253 3.576 3.788 4.002 4.34 4.663 4.968 5.267 5.557 5.95 6.347 6.724 7.187 7.642 8.073 8.583 9.161 9.719 10.344 11.013 11.718 12.459 13.273 14.208 15.174 16.302 17.548 19.01 20.676 22.509 24.465 26.415 27.372 27.441 27.016 26.449 25.798 25.151 24.506 23.821 23.022 22.285 21.646 21.063 20.483 19.922 19.407 18.853 18.339 17.891 17.443 16.965 16.558 16.167 15.694 15.296 14.899 14.437 13.92 13.392 13.031 12.652 12.054 11.614 11.157 10.91 10.402 9.849 9.225 8.916 8.382 7.978 7.573 7.12 6.141 5.548 4.85 4.156 3.453 2.5 1.134 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 5769ce7f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32338 ,TETRA ,17558147,Fri Nov 26 15:04:34 CET,Fri Nov 26 17:15:17 CET,0.0 1.042 1.325 1.525 1.719 1.903 2.058 2.219 2.512 2.64 2.769 2.902 3.123 3.233 3.427 3.614 3.812 3.914 4.107 4.296 4.574 4.748 4.915 5.158 5.398 5.639 5.886 6.128 6.419 6.693 6.958 7.275 7.584 7.877 8.201 8.591 8.973 9.383 9.853 10.34 10.848 11.422 12.106 12.822 13.617 14.508 15.569 16.721 18.043 19.536 21.107 22.092 22.457 22.56 22.549 22.473 22.358 22.218 22.046 21.879 21.719 21.554 21.379 21.18 21.004 20.846 20.673 20.507 20.335 20.149 19.961 19.798 19.638 19.475 19.327 19.174 19.025 18.892 18.75 18.608 18.443 18.212 18.06 17.907 17.823 17.649 17.447 17.187 17.071 16.887 16.758 16.636 16.469 16.032 15.796 15.571 15.321 15.03 14.715 14.206 7.967 -2 ,12851 ,TETRA ,17558148,Fri Nov 26 15:04:33 CET,Fri Nov 26 17:26:21 CET,0.0 0.822 1.107 1.388 1.627 1.825 2.005 2.168 2.465 2.615 2.761 2.949 3.192 3.314 3.549 3.761 3.973 4.081 4.298 4.517 4.82 5.006 5.193 5.473 5.731 5.955 6.155 6.352 6.616 6.877 7.128 7.428 7.725 8.009 8.342 8.742 9.143 9.573 10.056 10.589 11.141 11.761 12.477 13.226 14.134 15.11 16.241 17.47 18.796 20.392 21.968 22.954 23.495 23.735 23.808 23.792 23.731 23.64 23.503 23.308 23.103 22.874 22.643 22.465 22.297 22.115 21.916 21.722 21.523 21.324 21.14 20.946 20.754 20.581 20.422 20.241 20.055 19.883 19.687 19.528 19.38 19.171 18.996 18.789 18.687 18.511 18.321 18.094 17.965 17.732 17.465 17.298 17.116 16.664 16.427 16.135 15.8 15.474 15.056 14.414 10.882 -3 ,14021 ,TETRA ,17558149,Fri Nov 26 15:04:36 CET,Fri Nov 26 17:25:16 CET,0.0 0.574 0.878 1.095 1.307 1.502 1.656 1.8 2.096 2.25 2.391 2.535 2.761 2.876 3.107 3.33 3.537 3.632 3.815 4.0 4.269 4.441 4.602 4.824 5.061 5.295 5.512 5.73 6.009 6.275 6.545 6.851 7.143 7.444 7.774 8.158 8.527 8.922 9.345 9.79 10.289 10.849 11.502 12.148 12.858 13.628 14.542 15.559 16.657 17.937 19.307 20.207 20.534 20.606 20.659 20.648 20.604 20.483 20.333 20.206 20.066 19.907 19.708 19.502 19.31 19.111 18.872 18.651 18.456 18.236 18.025 17.863 17.671 17.465 17.313 17.136 16.958 16.782 16.573 16.423 16.263 16.002 15.811 15.631 15.558 15.409 15.243 15.045 14.933 14.742 14.6 14.461 14.305 13.985 13.772 13.521 13.286 13.042 12.7 12.271 5.21 -4 ,17528 ,TETRA ,17558150,Fri Nov 26 15:04:38 CET,Fri Nov 26 17:25:12 CET,0.0 1.332 1.679 1.92 2.16 2.387 2.583 2.768 3.098 3.237 3.369 3.521 3.749 3.874 4.132 4.377 4.619 4.735 4.965 5.176 5.472 5.68 5.873 6.137 6.385 6.628 6.863 7.102 7.406 7.692 7.98 8.313 8.645 8.976 9.341 9.751 10.151 10.577 11.019 11.514 12.044 12.639 13.353 14.089 14.929 15.842 16.935 18.233 19.721 21.294 23.016 24.374 25.018 25.288 25.397 25.415 25.394 25.294 25.156 25.04 24.921 24.762 24.545 24.311 24.107 23.919 23.696 23.483 23.316 23.154 22.987 22.83 22.638 22.422 22.244 22.055 21.859 21.662 21.471 21.348 21.208 20.948 20.773 20.605 20.517 20.295 19.996 19.68 19.537 19.326 19.114 18.949 18.77 18.387 18.16 17.895 17.57 17.153 16.59 15.797 11.572 -5 ,4483 ,TETRA ,17558151,Fri Nov 26 15:04:33 CET,Fri Nov 26 17:26:55 CET,0.0 0.608 0.868 1.072 1.263 1.456 1.625 1.776 2.092 2.24 2.38 2.552 2.772 2.884 3.107 3.328 3.53 3.622 3.785 3.929 4.168 4.334 4.49 4.729 4.965 5.171 5.367 5.564 5.824 6.082 6.32 6.605 6.891 7.172 7.515 7.903 8.251 8.63 9.044 9.51 10.02 10.587 11.28 11.962 12.73 13.602 14.615 15.754 17.078 18.641 20.449 21.682 22.234 22.532 22.709 22.732 22.653 22.499 22.309 22.134 21.984 21.814 21.622 21.387 21.138 20.921 20.706 20.504 20.319 20.137 19.941 19.761 19.574 19.378 19.224 19.069 18.897 18.713 18.526 18.408 18.281 18.066 17.925 17.778 17.688 17.483 17.268 17.042 16.918 16.708 16.511 16.335 16.161 15.835 15.652 15.457 15.192 14.833 14.41 13.843 10.671 -6 ,5323 ,TETRA ,17558152,Fri Nov 26 15:04:36 CET,Fri Nov 26 17:25:40 CET,0.0 0.582 0.843 1.061 1.256 1.44 1.605 1.772 2.098 2.235 2.371 2.542 2.774 2.898 3.136 3.351 3.569 3.69 3.922 4.14 4.434 4.615 4.791 5.027 5.251 5.487 5.727 5.974 6.305 6.638 6.964 7.344 7.701 8.024 8.399 8.82 9.215 9.654 10.148 10.684 11.236 11.852 12.556 13.276 14.13 15.104 16.198 17.327 18.623 20.191 22.059 23.533 24.222 24.446 24.512 24.499 24.416 24.259 24.065 23.873 23.675 23.482 23.316 23.123 22.923 22.741 22.527 22.321 22.125 21.909 21.699 21.505 21.292 21.098 20.951 20.796 20.619 20.437 20.256 20.117 19.944 19.66 19.471 19.282 19.193 19.008 18.781 18.51 18.357 18.12 17.87 17.682 17.488 17.015 16.766 16.501 16.228 15.895 15.338 14.546 10.577 -7 ,29376 ,TETRA ,17558153,Fri Nov 26 15:04:38 CET,Fri Nov 26 17:15:50 CET,0.0 1.06 1.388 1.632 1.83 2.019 2.208 2.395 2.751 2.904 3.039 3.197 3.425 3.548 3.772 3.999 4.242 4.367 4.599 4.815 5.129 5.322 5.491 5.72 5.966 6.225 6.467 6.696 6.996 7.292 7.594 7.939 8.248 8.536 8.856 9.232 9.589 9.949 10.353 10.813 11.28 11.776 12.363 12.994 13.746 14.607 15.604 16.68 18.005 19.614 21.315 22.572 23.26 23.592 23.677 23.593 23.473 23.298 23.101 22.908 22.691 22.472 22.273 22.084 21.916 21.748 21.526 21.306 21.11 20.912 20.711 20.528 20.331 20.149 20.003 19.848 19.687 19.491 19.296 19.184 19.046 18.802 18.637 18.453 18.347 18.114 17.868 17.611 17.472 17.235 16.975 16.794 16.593 16.152 15.933 15.703 15.437 15.03 14.445 13.82 10.428 -8 ,11087 ,TETRA ,17558154,Fri Nov 26 15:05:33 CET,Fri Nov 26 17:21:04 CET,0.0 1.3 1.574 1.795 1.997 2.197 2.362 2.496 2.768 2.917 3.053 3.197 3.423 3.54 3.785 4.02 4.236 4.34 4.544 4.735 4.993 5.17 5.362 5.628 5.877 6.117 6.344 6.57 6.873 7.155 7.43 7.777 8.121 8.453 8.816 9.23 9.632 10.064 10.539 11.065 11.621 12.256 13.014 13.753 14.621 15.603 16.697 17.91 19.243 20.622 22.074 23.022 23.429 23.592 23.571 23.39 23.156 22.982 22.873 22.76 22.619 22.445 22.273 22.095 21.906 21.706 21.48 21.299 21.156 20.994 20.806 20.643 20.466 20.276 20.114 19.925 19.748 19.583 19.391 19.251 19.109 18.844 18.637 18.426 18.309 18.068 17.837 17.63 17.532 17.33 17.155 17.021 16.859 16.437 16.174 15.908 15.631 15.263 14.817 14.205 10.545 -9 ,19257 ,TETRA ,17558155,Fri Nov 26 15:05:34 CET,Fri Nov 26 17:18:57 CET,0.0 0.604 0.874 1.092 1.299 1.496 1.678 1.849 2.157 2.292 2.417 2.555 2.784 2.904 3.14 3.369 3.571 3.673 3.894 4.098 4.364 4.538 4.714 4.978 5.236 5.484 5.723 5.954 6.251 6.535 6.821 7.189 7.525 7.838 8.19 8.557 8.916 9.338 9.788 10.273 10.782 11.316 11.973 12.659 13.46 14.357 15.397 16.605 18.049 19.731 21.448 22.58 23.075 23.321 23.405 23.316 23.191 23.049 22.89 22.701 22.507 22.324 22.14 21.96 21.792 21.633 21.434 21.234 21.068 20.89 20.712 20.574 20.409 20.198 20.021 19.825 19.646 19.475 19.279 19.124 18.96 18.749 18.594 18.412 18.322 18.123 17.895 17.669 17.554 17.36 17.213 17.09 16.956 16.657 16.482 16.258 15.975 15.651 15.217 14.668 11.104 -10 ,22270 ,TETRA ,17558156,Fri Nov 26 15:05:35 CET,Fri Nov 26 17:19:48 CET,0.0 0.778 1.08 1.3 1.503 1.67 1.822 1.968 2.237 2.37 2.488 2.607 2.819 2.925 3.137 3.334 3.525 3.616 3.793 3.972 4.252 4.428 4.588 4.824 5.07 5.307 5.523 5.738 6.013 6.267 6.514 6.838 7.159 7.458 7.803 8.171 8.514 8.908 9.337 9.782 10.26 10.795 11.404 12.064 12.879 13.753 14.728 15.807 17.009 18.383 20.015 20.983 21.359 21.521 21.5 21.39 21.206 21.009 20.85 20.662 20.474 20.284 20.096 19.916 19.749 19.593 19.382 19.154 18.955 18.774 18.582 18.393 18.197 17.981 17.81 17.639 17.447 17.257 17.083 16.965 16.856 16.659 16.5 16.324 16.231 16.048 15.824 15.588 15.48 15.282 15.127 14.969 14.766 14.371 14.146 13.868 13.559 13.195 12.79 12.222 9.51 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 1fa09071..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/protein/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16739 ,TETRA ,17558157,Fri Nov 26 15:05:33 CET,Fri Nov 26 17:24:35 CET,0.0 0.77 0.942 1.071 1.203 1.317 1.403 1.499 1.696 1.789 1.865 1.82 2.093 2.173 2.295 2.421 2.539 2.592 2.7 2.799 2.939 3.045 3.146 3.282 3.423 3.554 3.677 3.802 3.966 4.127 4.275 4.467 4.671 4.841 5.039 5.279 5.504 5.752 6.018 6.321 6.616 6.902 7.272 7.641 8.01 8.419 8.876 9.36 9.896 10.459 10.968 11.134 10.932 10.425 9.834 9.288 8.793 8.308 7.885 7.496 7.164 6.874 6.587 6.28 5.975 5.691 5.413 5.169 4.919 4.657 4.399 4.177 3.964 3.724 3.516 3.318 3.141 2.975 2.799 2.664 2.501 2.222 2.041 1.875 1.793 1.623 1.434 1.215 1.092 0.787 0.733 0.602 0.461 0.156 -0.007 -0.19 -0.424 -0.693 -0.972 -1.296 -3.102 -2 ,13377 ,TETRA ,17558158,Fri Nov 26 15:07:30 CET,Fri Nov 26 17:23:21 CET,0.0 0.682 0.9 1.087 1.252 1.396 1.523 1.635 1.817 1.899 1.984 1.961 2.22 2.302 2.46 2.604 2.731 2.788 2.895 3.004 3.167 3.288 3.393 3.523 3.651 3.775 3.892 4.007 4.15 4.291 4.433 4.6 4.758 4.904 5.09 5.287 5.478 5.705 5.941 6.186 6.424 6.694 7.022 7.35 7.708 8.11 8.54 8.945 9.309 9.546 9.685 9.407 8.858 8.32 7.794 7.274 6.777 6.293 5.891 5.489 5.08 4.705 4.364 4.039 3.711 3.423 3.15 2.907 2.699 2.452 2.187 1.973 1.76 1.554 1.387 1.202 1.004 0.794 0.578 0.438 0.288 0.032 -0.138 -0.303 -0.391 -0.593 -0.799 -1.022 -1.143 -1.437 -1.533 -1.693 -1.833 -2.135 -2.317 -2.505 -2.729 -2.989 -3.241 -3.608 -4.578 -3 ,29829 ,TETRA ,17558159,Fri Nov 26 15:07:30 CET,Fri Nov 26 17:23:29 CET,0.0 0.322 0.524 0.698 0.821 0.942 1.065 1.17 1.342 1.429 1.509 1.486 1.754 1.822 1.956 2.086 2.216 2.282 2.405 2.523 2.702 2.824 2.932 3.091 3.249 3.385 3.521 3.646 3.801 3.964 4.123 4.296 4.446 4.594 4.781 4.988 5.184 5.401 5.652 5.926 6.203 6.512 6.863 7.174 7.527 7.906 8.305 8.712 9.102 9.468 9.602 9.215 8.698 8.119 7.537 7.015 6.507 6.011 5.587 5.162 4.792 4.481 4.193 3.896 3.578 3.305 3.047 2.791 2.575 2.369 2.15 1.951 1.724 1.483 1.297 1.109 0.923 0.715 0.474 0.311 0.147 -0.107 -0.264 -0.43 -0.525 -0.717 -0.903 -1.107 -1.234 -1.561 -1.666 -1.82 -1.966 -2.249 -2.423 -2.618 -2.809 -3.021 -3.275 -3.611 -4.631 -4 ,30046 ,TETRA ,17558160,Fri Nov 26 15:07:30 CET,Fri Nov 26 17:22:07 CET,0.0 0.674 0.925 1.081 1.217 1.337 1.429 1.511 1.659 1.739 1.818 1.786 2.043 2.111 2.249 2.37 2.483 2.543 2.67 2.784 2.926 3.028 3.137 3.289 3.423 3.558 3.699 3.831 4.013 4.19 4.358 4.565 4.75 4.931 5.133 5.346 5.581 5.844 6.081 6.308 6.529 6.797 7.108 7.396 7.755 8.131 8.521 8.986 9.44 9.746 9.808 9.424 8.784 8.183 7.618 7.042 6.52 6.038 5.626 5.216 4.844 4.465 4.075 3.708 3.399 3.12 2.819 2.571 2.358 2.125 1.888 1.696 1.488 1.268 1.11 0.948 0.776 0.588 0.381 0.24 0.097 -0.124 -0.275 -0.434 -0.522 -0.717 -0.919 -1.144 -1.265 -1.565 -1.614 -1.764 -1.919 -2.231 -2.405 -2.581 -2.804 -3.066 -3.342 -3.661 -4.848 -5 ,2430 ,TETRA ,17558161,Fri Nov 26 15:08:33 CET,Fri Nov 26 17:24:49 CET,0.0 0.498 0.757 0.945 1.114 1.26 1.376 1.481 1.685 1.774 1.842 1.788 2.045 2.117 2.255 2.388 2.508 2.563 2.678 2.781 2.941 3.052 3.161 3.329 3.463 3.581 3.708 3.819 3.95 4.079 4.23 4.447 4.642 4.807 5.007 5.236 5.455 5.703 5.952 6.193 6.432 6.698 6.986 7.283 7.636 8.003 8.368 8.719 9.085 9.421 9.406 8.951 8.45 7.875 7.315 6.819 6.367 5.948 5.553 5.119 4.75 4.405 4.057 3.725 3.399 3.116 2.835 2.571 2.324 2.053 1.792 1.581 1.365 1.165 1.009 0.834 0.656 0.479 0.298 0.165 0.012 -0.229 -0.395 -0.564 -0.662 -0.875 -1.082 -1.298 -1.409 -1.724 -1.845 -2.008 -2.17 -2.502 -2.688 -2.872 -3.08 -3.286 -3.54 -3.912 -4.754 -6 ,11672 ,TETRA ,17558162,Fri Nov 26 15:08:34 CET,Fri Nov 26 17:26:52 CET,0.0 0.397 0.624 0.789 0.923 1.041 1.16 1.287 1.527 1.632 1.715 1.669 1.923 2.004 2.183 2.342 2.487 2.553 2.668 2.773 2.927 3.025 3.119 3.269 3.428 3.575 3.704 3.838 4.018 4.188 4.355 4.557 4.747 4.928 5.135 5.338 5.533 5.763 6.011 6.281 6.564 6.869 7.2 7.528 7.912 8.294 8.73 9.212 9.61 9.887 9.973 9.695 9.2 8.592 8.084 7.603 7.133 6.743 6.394 5.993 5.616 5.267 4.919 4.573 4.27 4.005 3.713 3.455 3.212 2.938 2.683 2.477 2.252 2.005 1.819 1.636 1.446 1.248 1.034 0.887 0.729 0.472 0.287 0.088 -0.018 -0.231 -0.444 -0.665 -0.778 -1.089 -1.18 -1.319 -1.465 -1.765 -1.939 -2.172 -2.43 -2.672 -2.987 -3.491 -4.972 -7 ,14843 ,TETRA ,17558163,Fri Nov 26 15:08:33 CET,Fri Nov 26 17:28:52 CET,0.0 0.292 0.472 0.664 0.836 0.971 1.078 1.167 1.367 1.465 1.55 1.519 1.785 1.874 2.051 2.216 2.356 2.418 2.547 2.674 2.851 2.966 3.074 3.221 3.363 3.515 3.658 3.788 3.953 4.122 4.303 4.504 4.694 4.886 5.112 5.358 5.589 5.84 6.097 6.374 6.672 7.019 7.417 7.738 8.07 8.42 8.772 9.17 9.528 9.757 9.687 9.117 8.432 7.808 7.264 6.789 6.313 5.847 5.437 5.017 4.647 4.295 3.96 3.658 3.391 3.142 2.868 2.608 2.385 2.161 1.922 1.716 1.49 1.239 1.041 0.845 0.641 0.431 0.235 0.106 -0.04 -0.26 -0.407 -0.575 -0.664 -0.878 -1.139 -1.392 -1.501 -1.797 -1.84 -1.973 -2.137 -2.473 -2.658 -2.871 -3.092 -3.325 -3.594 -3.985 -5.265 -8 ,25895 ,TETRA ,17558164,Fri Nov 26 15:08:34 CET,Fri Nov 26 17:27:58 CET,0.0 0.294 0.47 0.631 0.807 0.943 1.042 1.144 1.353 1.442 1.529 1.506 1.761 1.824 1.957 2.085 2.2 2.256 2.381 2.507 2.671 2.775 2.883 3.035 3.171 3.307 3.457 3.615 3.808 3.984 4.156 4.352 4.522 4.696 4.912 5.144 5.356 5.576 5.803 6.062 6.339 6.642 7.018 7.401 7.816 8.234 8.636 9.026 9.482 9.948 10.089 9.775 9.251 8.668 8.136 7.586 7.072 6.642 6.284 5.904 5.522 5.17 4.827 4.478 4.171 3.913 3.65 3.4 3.171 2.935 2.667 2.434 2.191 1.933 1.725 1.522 1.321 1.11 0.899 0.743 0.561 0.259 0.079 -0.085 -0.179 -0.387 -0.614 -0.852 -0.978 -1.296 -1.369 -1.519 -1.682 -2.002 -2.169 -2.338 -2.558 -2.804 -3.077 -3.412 -4.262 -9 ,18160 ,TETRA ,17558165,Fri Nov 26 15:09:26 CET,Fri Nov 26 17:19:49 CET,0.0 0.226 0.369 0.499 0.625 0.734 0.847 0.955 1.145 1.235 1.312 1.286 1.565 1.635 1.753 1.88 2.027 2.097 2.223 2.358 2.551 2.665 2.768 2.917 3.054 3.184 3.316 3.446 3.616 3.789 3.95 4.138 4.32 4.477 4.656 4.875 5.084 5.295 5.514 5.731 5.935 6.171 6.474 6.811 7.187 7.576 8.027 8.439 8.815 9.166 9.345 8.971 8.451 7.903 7.327 6.808 6.326 5.833 5.402 4.984 4.603 4.253 3.926 3.621 3.349 3.109 2.855 2.623 2.419 2.198 1.963 1.766 1.566 1.356 1.175 0.997 0.83 0.649 0.466 0.333 0.176 -0.075 -0.257 -0.451 -0.542 -0.739 -0.959 -1.182 -1.306 -1.618 -1.675 -1.798 -1.921 -2.213 -2.377 -2.579 -2.819 -3.052 -3.317 -3.671 -4.56 -10 ,20090 ,TETRA ,17558166,Fri Nov 26 15:09:26 CET,Fri Nov 26 17:26:34 CET,0.0 0.134 0.292 0.458 0.576 0.679 0.776 0.872 1.048 1.126 1.197 1.154 1.412 1.484 1.617 1.757 1.898 1.96 2.069 2.171 2.325 2.424 2.522 2.669 2.81 2.96 3.11 3.247 3.43 3.6 3.747 3.924 4.097 4.257 4.459 4.697 4.91 5.145 5.399 5.652 5.9 6.162 6.437 6.735 7.12 7.509 7.948 8.395 8.815 9.187 9.259 8.873 8.377 7.873 7.367 6.848 6.39 5.983 5.613 5.228 4.897 4.602 4.31 4.011 3.695 3.401 3.111 2.84 2.599 2.35 2.109 1.909 1.686 1.442 1.248 1.045 0.83 0.608 0.378 0.224 0.076 -0.16 -0.326 -0.528 -0.636 -0.84 -1.081 -1.326 -1.446 -1.762 -1.86 -2.004 -2.142 -2.453 -2.626 -2.817 -3.033 -3.238 -3.491 -3.861 -5.34 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt deleted file mode 100644 index 58db5af8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11357 ,TETRA ,17558167,Fri Nov 26 15:09:26 CET,Fri Nov 26 17:14:55 CET,0.0 0.97 1.471 1.851 2.138 2.395 2.622 2.841 3.277 3.462 3.628 3.771 4.105 4.277 4.618 4.925 5.216 5.365 5.631 5.877 6.279 6.511 6.696 6.98 7.269 7.542 7.809 8.08 8.423 8.745 9.07 9.461 9.841 10.205 10.619 11.102 11.559 12.077 12.665 13.271 13.907 14.626 15.45 16.288 17.256 18.332 19.609 21.089 22.835 24.91 27.419 29.422 30.539 31.164 31.518 31.773 31.895 31.929 31.93 31.874 31.809 31.729 31.631 31.546 31.441 31.304 31.122 30.931 30.797 30.69 30.568 30.455 30.317 30.178 30.08 29.974 29.863 29.739 29.6 29.505 29.399 29.231 29.109 28.974 28.904 28.761 28.603 28.429 28.347 28.118 28.06 27.936 27.807 27.587 27.472 27.322 27.11 26.851 26.551 26.101 24.416 -2 ,5766 ,TETRA ,17558168,Fri Nov 26 15:10:30 CET,Fri Nov 26 17:12:11 CET,0.0 1.436 1.932 2.292 2.595 2.902 3.171 3.395 3.809 4.01 4.174 4.289 4.61 4.748 5.004 5.254 5.487 5.598 5.825 6.052 6.392 6.61 6.81 7.108 7.422 7.735 8.019 8.296 8.672 9.04 9.404 9.842 10.241 10.612 11.025 11.478 11.922 12.427 13.012 13.655 14.318 15.021 15.797 16.608 17.595 18.707 19.991 21.427 23.155 25.261 27.664 29.536 30.57 31.162 31.507 31.696 31.764 31.76 31.729 31.676 31.614 31.519 31.404 31.294 31.195 31.09 30.948 30.818 30.71 30.586 30.437 30.315 30.205 30.083 29.966 29.834 29.705 29.563 29.408 29.301 29.182 29.011 28.887 28.749 28.679 28.524 28.344 28.156 28.057 27.804 27.707 27.576 27.431 27.13 26.983 26.822 26.636 26.415 26.157 25.817 24.404 -3 ,31560 ,TETRA ,17558169,Fri Nov 26 15:10:32 CET,Fri Nov 26 17:12:10 CET,0.0 1.91 2.39 2.711 2.994 3.251 3.505 3.751 4.16 4.345 4.515 4.668 4.973 5.119 5.407 5.699 5.973 6.095 6.322 6.556 6.904 7.127 7.333 7.605 7.891 8.183 8.461 8.737 9.093 9.435 9.761 10.153 10.551 10.937 11.373 11.846 12.294 12.791 13.359 13.982 14.607 15.304 16.103 16.951 17.995 19.151 20.453 21.898 23.617 25.679 28.07 29.96 30.976 31.551 31.885 32.072 32.155 32.159 32.132 32.092 32.046 31.979 31.888 31.792 31.681 31.585 31.488 31.375 31.267 31.147 31.007 30.879 30.736 30.583 30.471 30.367 30.249 30.106 29.965 29.867 29.758 29.596 29.482 29.359 29.297 29.162 29.011 28.864 28.786 28.542 28.454 28.329 28.206 27.956 27.785 27.582 27.372 27.161 26.891 26.499 25.343 -4 ,12809 ,TETRA ,17558170,Fri Nov 26 15:10:30 CET,Fri Nov 26 17:07:15 CET,0.0 1.98 2.467 2.871 3.189 3.448 3.66 3.854 4.246 4.43 4.608 4.749 5.067 5.208 5.479 5.758 6.035 6.169 6.439 6.707 7.048 7.248 7.444 7.716 7.986 8.257 8.52 8.78 9.122 9.447 9.77 10.153 10.512 10.859 11.275 11.804 12.343 12.909 13.492 14.148 14.825 15.549 16.415 17.264 18.227 19.333 20.667 22.2 23.995 26.058 28.501 30.489 31.63 32.272 32.641 32.901 33.059 33.115 33.109 33.058 32.997 32.925 32.841 32.761 32.634 32.501 32.385 32.271 32.16 32.037 31.902 31.77 31.625 31.473 31.321 31.152 30.997 30.834 30.662 30.546 30.432 30.264 30.141 30.003 29.937 29.782 29.618 29.459 29.369 29.125 29.057 28.94 28.832 28.584 28.439 28.29 28.135 27.956 27.719 27.458 25.819 -5 ,7193 ,TETRA ,17558171,Fri Nov 26 15:16:29 CET,Fri Nov 26 17:17:00 CET,0.0 1.361 1.871 2.214 2.507 2.773 3.015 3.222 3.563 3.729 3.893 4.026 4.349 4.499 4.791 5.091 5.381 5.507 5.753 6.016 6.399 6.643 6.874 7.185 7.487 7.799 8.098 8.382 8.765 9.139 9.485 9.865 10.24 10.612 11.039 11.553 12.041 12.549 13.108 13.696 14.343 15.07 15.896 16.758 17.749 18.881 20.207 21.687 23.492 25.653 28.202 30.157 31.179 31.779 32.164 32.392 32.508 32.557 32.557 32.516 32.469 32.41 32.322 32.195 32.046 31.899 31.741 31.595 31.456 31.296 31.09 30.919 30.767 30.637 30.536 30.397 30.242 30.103 29.936 29.8 29.668 29.472 29.347 29.228 29.165 29.043 28.912 28.734 28.62 28.35 28.238 28.099 27.952 27.652 27.465 27.235 27.0 26.745 26.445 26.045 24.774 -6 ,23344 ,TETRA ,17558172,Fri Nov 26 15:16:29 CET,Fri Nov 26 17:14:33 CET,0.0 2.356 2.808 3.091 3.378 3.63 3.863 4.094 4.488 4.675 4.853 4.977 5.297 5.433 5.697 5.962 6.227 6.361 6.61 6.847 7.204 7.435 7.657 7.977 8.285 8.567 8.852 9.155 9.531 9.872 10.204 10.592 10.979 11.365 11.79 12.27 12.746 13.261 13.807 14.391 15.019 15.73 16.557 17.407 18.416 19.529 20.812 22.33 24.156 26.276 28.743 30.677 31.76 32.388 32.738 32.966 33.109 33.171 33.177 33.119 33.039 32.938 32.837 32.755 32.649 32.543 32.419 32.253 32.093 31.949 31.815 31.702 31.586 31.46 31.349 31.224 31.073 30.911 30.741 30.609 30.484 30.314 30.208 30.09 30.017 29.875 29.729 29.557 29.469 29.232 29.135 29.011 28.896 28.609 28.442 28.25 28.028 27.795 27.477 27.019 25.747 -7 ,25422 ,TETRA ,17558173,Fri Nov 26 15:16:32 CET,Fri Nov 26 17:16:32 CET,0.0 1.342 1.747 2.083 2.361 2.597 2.809 3.002 3.359 3.52 3.679 3.811 4.128 4.283 4.57 4.84 5.1 5.219 5.462 5.693 6.012 6.22 6.413 6.696 6.98 7.259 7.526 7.793 8.143 8.469 8.787 9.175 9.56 9.926 10.354 10.847 11.328 11.843 12.383 12.968 13.569 14.235 15.034 15.844 16.803 17.904 19.204 20.631 22.334 24.415 26.856 28.819 29.888 30.527 30.852 31.033 31.128 31.127 31.109 31.033 30.925 30.832 30.736 30.629 30.516 30.394 30.254 30.133 30.01 29.875 29.744 29.635 29.498 29.34 29.227 29.096 28.955 28.837 28.709 28.595 28.473 28.278 28.149 28.012 27.941 27.8 27.663 27.524 27.441 27.206 27.139 27.015 26.879 26.593 26.44 26.275 26.058 25.826 25.587 25.223 24.094 -8 ,32555 ,TETRA ,17558174,Fri Nov 26 15:16:34 CET,Fri Nov 26 17:08:50 CET,0.0 1.367 1.8 2.133 2.419 2.675 2.904 3.118 3.517 3.69 3.864 4.08 4.418 4.569 4.852 5.102 5.35 5.476 5.73 5.967 6.3 6.532 6.752 7.061 7.358 7.659 7.958 8.224 8.554 8.896 9.232 9.623 9.989 10.334 10.744 11.224 11.683 12.187 12.734 13.316 13.931 14.627 15.502 16.388 17.377 18.493 19.776 21.232 22.942 24.995 27.535 29.607 30.767 31.449 31.86 32.116 32.233 32.261 32.245 32.196 32.146 32.086 31.988 31.883 31.75 31.567 31.356 31.187 31.063 30.944 30.818 30.719 30.613 30.481 30.375 30.272 30.155 30.024 29.895 29.803 29.702 29.53 29.389 29.234 29.157 29.0 28.827 28.647 28.558 28.316 28.225 28.108 27.993 27.714 27.57 27.413 27.216 26.983 26.716 26.404 24.971 -9 ,12215 ,TETRA ,17558175,Fri Nov 26 15:16:29 CET,Fri Nov 26 17:10:14 CET,0.0 1.398 1.845 2.202 2.52 2.804 3.061 3.29 3.671 3.833 3.992 4.161 4.496 4.652 4.956 5.257 5.531 5.656 5.907 6.152 6.5 6.726 6.945 7.256 7.543 7.825 8.099 8.367 8.711 9.041 9.371 9.765 10.145 10.512 10.932 11.38 11.826 12.342 12.892 13.523 14.225 14.971 15.838 16.725 17.748 18.873 20.187 21.682 23.433 25.503 27.986 30.031 31.12 31.767 32.155 32.337 32.445 32.499 32.472 32.394 32.296 32.189 32.095 31.971 31.825 31.705 31.575 31.452 31.334 31.207 31.085 30.977 30.856 30.724 30.624 30.518 30.383 30.241 30.099 30.006 29.919 29.776 29.666 29.531 29.448 29.276 29.112 28.949 28.855 28.619 28.597 28.495 28.376 28.073 27.87 27.63 27.362 27.071 26.765 26.39 25.184 -10 ,17781 ,TETRA ,17558176,Fri Nov 26 15:16:29 CET,Fri Nov 26 17:14:15 CET,0.0 1.444 1.962 2.329 2.657 2.95 3.213 3.466 3.944 4.162 4.36 4.516 4.836 4.975 5.225 5.457 5.677 5.793 6.046 6.298 6.637 6.84 7.031 7.31 7.599 7.884 8.165 8.442 8.793 9.125 9.426 9.776 10.13 10.487 10.907 11.377 11.831 12.328 12.864 13.446 14.08 14.811 15.655 16.483 17.477 18.66 20.011 21.505 23.29 25.356 27.774 29.762 30.834 31.438 31.776 31.953 32.015 31.989 31.96 31.894 31.793 31.699 31.589 31.496 31.382 31.24 31.102 30.982 30.881 30.772 30.63 30.495 30.335 30.187 30.091 29.979 29.836 29.674 29.515 29.411 29.292 29.083 28.959 28.843 28.775 28.625 28.463 28.284 28.185 27.924 27.841 27.718 27.578 27.274 27.105 26.889 26.612 26.339 26.062 25.668 24.439 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index ff6f9abd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25351 ,KEBNE ,17125833,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:38:10 CET,0.0 0.703 1.105 1.362 1.511 1.64 1.759 1.865 2.025 2.071 2.118 2.039 2.22 2.22 2.206 2.19 2.19 2.196 2.202 2.189 2.146 2.106 2.061 1.991 1.922 1.843 1.735 1.612 1.438 1.262 1.098 0.897 0.662 0.386 0.024 -0.418 -0.851 -1.374 -2.032 -2.786 -3.62 -4.616 -5.893 -7.288 -9.105 -11.374 -14.246 -17.988 -23.126 -30.294 -40.992 -52.498 -61.051 -67.698 -73.083 -77.621 -81.358 -84.527 -87.148 -89.68 -91.844 -93.757 -95.52 -97.112 -98.582 -99.917 -101.247 -102.395 -103.352 -104.33 -105.308 -106.087 -106.899 -107.711 -108.318 -108.941 -109.576 -110.237 -110.926 -111.377 -111.837 -112.538 -112.99 -113.472 -113.724 -114.219 -114.733 -115.288 -115.582 -116.183 -116.454 -116.782 -117.117 -117.773 -118.129 -118.544 -119.032 -119.545 -120.097 -120.767 -123.297 -2 ,32174 ,KEBNE ,17125834,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:36:01 CET,0.0 2.451 2.859 3.098 3.322 3.481 3.604 3.721 3.853 3.906 3.946 3.826 4.016 4.023 4.033 4.066 4.077 4.07 4.045 4.011 3.962 3.935 3.884 3.783 3.665 3.535 3.416 3.311 3.161 2.998 2.815 2.547 2.254 1.95 1.57 1.12 0.676 0.177 -0.393 -1.099 -1.918 -2.932 -4.264 -5.751 -7.651 -9.973 -12.965 -16.807 -21.989 -29.103 -39.802 -51.272 -59.755 -66.449 -71.863 -76.369 -80.094 -83.29 -85.936 -88.469 -90.589 -92.404 -94.057 -95.595 -97.015 -98.285 -99.571 -100.698 -101.673 -102.678 -103.684 -104.491 -105.314 -106.135 -106.748 -107.354 -107.967 -108.61 -109.265 -109.714 -110.176 -110.89 -111.388 -111.891 -112.146 -112.679 -113.207 -113.747 -114.043 -114.659 -114.981 -115.313 -115.651 -116.332 -116.686 -117.074 -117.529 -118.026 -118.636 -119.542 -122.718 -3 ,16433 ,KEBNE ,17125835,Thu Dec 30 16:52:55 CET,Thu Dec 30 18:36:00 CET,0.0 1.89 2.265 2.572 2.806 2.982 3.106 3.188 3.325 3.371 3.418 3.354 3.562 3.583 3.609 3.626 3.646 3.652 3.643 3.629 3.604 3.584 3.557 3.504 3.44 3.364 3.276 3.175 3.037 2.875 2.709 2.507 2.283 2.03 1.686 1.262 0.846 0.377 -0.205 -0.929 -1.721 -2.695 -3.981 -5.354 -7.143 -9.347 -12.189 -15.954 -21.106 -28.37 -39.282 -50.877 -59.511 -66.318 -71.803 -76.419 -80.242 -83.512 -86.218 -88.804 -90.953 -92.794 -94.485 -96.039 -97.441 -98.68 -99.933 -101.034 -101.968 -102.903 -103.844 -104.604 -105.393 -106.208 -106.823 -107.453 -108.097 -108.758 -109.445 -109.901 -110.363 -111.08 -111.554 -112.037 -112.288 -112.795 -113.293 -113.806 -114.074 -114.66 -114.927 -115.231 -115.537 -116.192 -116.559 -116.943 -117.366 -117.85 -118.392 -119.042 -121.353 -4 ,10557 ,KEBNE ,17125836,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:36:37 CET,0.0 1.821 2.238 2.482 2.656 2.783 2.895 2.976 3.093 3.138 3.172 3.081 3.276 3.297 3.308 3.283 3.253 3.247 3.246 3.236 3.201 3.172 3.138 3.067 2.979 2.889 2.79 2.663 2.473 2.273 2.058 1.776 1.47 1.162 0.776 0.291 -0.198 -0.759 -1.379 -2.069 -2.869 -3.888 -5.207 -6.648 -8.529 -10.867 -13.85 -17.66 -22.837 -29.989 -40.609 -52.141 -60.821 -67.62 -73.105 -77.68 -81.48 -84.708 -87.367 -89.946 -92.062 -93.903 -95.634 -97.208 -98.637 -99.943 -101.304 -102.485 -103.479 -104.485 -105.494 -106.317 -107.151 -108.001 -108.647 -109.29 -109.947 -110.624 -111.3 -111.744 -112.196 -112.91 -113.402 -113.911 -114.182 -114.723 -115.268 -115.824 -116.111 -116.728 -117.007 -117.324 -117.657 -118.368 -118.775 -119.195 -119.615 -120.086 -120.623 -121.276 -123.066 -5 ,15674 ,KEBNE ,17125837,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:36:17 CET,0.0 1.18 1.564 1.872 2.095 2.286 2.439 2.55 2.765 2.855 2.935 2.929 3.151 3.194 3.257 3.303 3.324 3.327 3.33 3.323 3.305 3.278 3.244 3.178 3.098 3.02 2.929 2.824 2.673 2.507 2.334 2.099 1.846 1.572 1.248 0.862 0.424 -0.071 -0.649 -1.342 -2.126 -3.081 -4.313 -5.716 -7.548 -9.8 -12.69 -16.378 -21.359 -28.463 -39.254 -50.817 -59.474 -66.242 -71.599 -76.101 -79.794 -82.926 -85.544 -88.117 -90.254 -92.081 -93.771 -95.331 -96.763 -98.041 -99.326 -100.453 -101.422 -102.415 -103.447 -104.301 -105.145 -105.98 -106.615 -107.263 -107.935 -108.615 -109.325 -109.823 -110.301 -110.99 -111.488 -112.013 -112.294 -112.873 -113.414 -113.967 -114.254 -114.86 -115.201 -115.523 -115.849 -116.56 -116.954 -117.371 -117.782 -118.234 -118.802 -119.514 -122.049 -6 ,12508 ,KEBNE ,17125838,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:36:28 CET,0.0 1.387 1.742 1.994 2.215 2.423 2.582 2.692 2.866 2.941 3.003 2.926 3.107 3.126 3.163 3.193 3.194 3.184 3.167 3.136 3.087 3.059 3.026 2.964 2.889 2.791 2.674 2.562 2.424 2.266 2.106 1.879 1.628 1.354 0.973 0.513 0.078 -0.431 -1.028 -1.743 -2.589 -3.568 -4.817 -6.229 -8.04 -10.204 -12.958 -16.571 -21.631 -28.711 -39.18 -50.455 -58.98 -65.775 -71.206 -75.715 -79.452 -82.713 -85.404 -87.976 -90.161 -92.02 -93.68 -95.21 -96.607 -97.855 -99.129 -100.231 -101.169 -102.097 -103.051 -103.871 -104.681 -105.484 -106.108 -106.745 -107.405 -108.069 -108.722 -109.152 -109.594 -110.305 -110.795 -111.29 -111.554 -112.082 -112.601 -113.145 -113.435 -114.047 -114.352 -114.669 -115.009 -115.746 -116.145 -116.566 -117.008 -117.422 -117.892 -118.589 -120.969 -7 ,25931 ,KEBNE ,17125839,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:38:00 CET,0.0 2.023 2.355 2.622 2.874 3.077 3.225 3.309 3.404 3.466 3.52 3.408 3.605 3.639 3.678 3.72 3.735 3.728 3.721 3.704 3.664 3.637 3.612 3.549 3.477 3.399 3.308 3.204 3.048 2.883 2.703 2.454 2.19 1.916 1.574 1.172 0.751 0.242 -0.347 -1.032 -1.82 -2.766 -3.986 -5.372 -7.168 -9.445 -12.351 -15.982 -20.901 -27.748 -38.106 -49.338 -57.853 -64.544 -69.842 -74.292 -78.023 -81.285 -84.007 -86.631 -88.809 -90.681 -92.402 -93.945 -95.326 -96.588 -97.875 -98.974 -99.922 -100.908 -101.928 -102.767 -103.61 -104.463 -105.092 -105.727 -106.383 -107.047 -107.751 -108.228 -108.701 -109.406 -109.895 -110.404 -110.663 -111.205 -111.766 -112.327 -112.623 -113.245 -113.576 -113.899 -114.221 -114.889 -115.239 -115.616 -116.052 -116.542 -117.099 -117.783 -120.091 -8 ,15394 ,KEBNE ,17125840,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:36:26 CET,0.0 1.047 1.379 1.622 1.802 1.934 2.049 2.145 2.244 2.284 2.327 2.24 2.439 2.455 2.467 2.483 2.494 2.498 2.491 2.483 2.502 2.489 2.44 2.351 2.26 2.164 2.068 1.96 1.785 1.607 1.432 1.199 0.952 0.686 0.35 -0.04 -0.445 -0.946 -1.528 -2.22 -3.022 -4.008 -5.314 -6.75 -8.605 -10.889 -13.77 -17.411 -22.227 -29.035 -39.551 -50.907 -59.34 -65.974 -71.373 -75.98 -79.817 -83.106 -85.837 -88.452 -90.581 -92.426 -94.151 -95.735 -97.144 -98.407 -99.724 -100.882 -101.879 -102.909 -103.974 -104.81 -105.63 -106.468 -107.105 -107.755 -108.421 -109.102 -109.794 -110.269 -110.757 -111.503 -111.984 -112.474 -112.73 -113.23 -113.748 -114.298 -114.579 -115.181 -115.499 -115.832 -116.189 -116.959 -117.352 -117.748 -118.159 -118.627 -119.172 -119.888 -121.737 -9 ,19244 ,KEBNE ,17125841,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:35:23 CET,0.0 1.85 2.325 2.623 2.811 2.978 3.128 3.23 3.429 3.519 3.595 3.525 3.726 3.757 3.784 3.774 3.736 3.721 3.71 3.697 3.677 3.665 3.63 3.537 3.443 3.336 3.22 3.121 3.001 2.879 2.725 2.481 2.25 2.009 1.674 1.288 0.893 0.388 -0.217 -0.902 -1.653 -2.567 -3.758 -5.111 -6.906 -9.196 -12.22 -16.002 -21.017 -28.06 -38.707 -50.147 -58.693 -65.379 -70.734 -75.279 -79.026 -82.222 -84.89 -87.439 -89.528 -91.332 -93.008 -94.545 -95.942 -97.179 -98.438 -99.548 -100.498 -101.492 -102.526 -103.342 -104.17 -105.022 -105.665 -106.317 -106.981 -107.667 -108.351 -108.802 -109.272 -110.005 -110.5 -111.015 -111.275 -111.805 -112.377 -112.986 -113.293 -113.9 -114.228 -114.565 -114.912 -115.667 -116.107 -116.556 -116.996 -117.475 -118.017 -118.699 -121.487 -10 ,15521 ,KEBNE ,17125842,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:36:22 CET,0.0 2.069 2.444 2.692 2.876 3.0 3.09 3.171 3.292 3.334 3.359 3.241 3.433 3.461 3.503 3.524 3.506 3.498 3.486 3.457 3.397 3.342 3.282 3.204 3.115 3.01 2.903 2.812 2.67 2.511 2.352 2.133 1.89 1.625 1.259 0.786 0.321 -0.213 -0.834 -1.537 -2.354 -3.378 -4.693 -6.11 -7.908 -10.177 -13.02 -16.5 -21.168 -27.783 -37.75 -48.379 -56.349 -62.568 -67.61 -72.027 -75.792 -79.093 -81.861 -84.527 -86.745 -88.664 -90.451 -92.098 -93.599 -94.923 -96.228 -97.349 -98.306 -99.287 -100.284 -101.096 -101.915 -102.758 -103.407 -104.066 -104.735 -105.41 -106.093 -106.551 -107.02 -107.748 -108.227 -108.715 -108.971 -109.494 -110.026 -110.613 -110.926 -111.537 -111.89 -112.227 -112.576 -113.315 -113.697 -114.1 -114.559 -115.063 -115.612 -116.325 -118.793 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 49960dfb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,30362 ,TETRA ,17558178,Fri Nov 26 15:11:32 CET,Fri Nov 26 17:06:04 CET,0.0 0.26 0.438 0.609 0.773 0.934 1.093 1.26 1.598 1.776 1.953 2.112 2.453 2.614 2.931 3.218 3.495 3.64 3.93 4.198 4.599 4.881 5.142 5.503 5.848 6.184 6.529 6.865 7.311 7.75 8.174 8.698 9.217 9.729 10.343 11.03 11.695 12.446 13.274 14.157 15.101 16.19 17.43 18.697 20.217 21.97 24.014 26.309 29.124 32.43 36.07 38.597 39.6 39.985 40.132 39.999 39.715 39.418 39.092 38.757 38.454 38.116 37.74 37.356 36.968 36.546 36.051 35.611 35.239 34.864 34.476 34.108 33.722 33.356 33.076 32.792 32.493 32.137 31.804 31.582 31.332 30.932 30.64 30.329 30.147 29.753 29.359 28.986 28.781 28.422 28.101 27.854 27.591 26.956 26.586 26.189 25.767 25.273 24.666 23.634 17.225 -3 ,3434 ,TETRA ,17558179,Fri Nov 26 15:11:34 CET,Fri Nov 26 17:09:05 CET,0.0 0.243 0.426 0.6 0.742 0.89 1.057 1.225 1.529 1.675 1.825 1.942 2.259 2.409 2.703 2.981 3.263 3.403 3.686 3.975 4.396 4.665 4.926 5.308 5.681 6.053 6.407 6.745 7.196 7.642 8.081 8.612 9.136 9.683 10.342 11.034 11.686 12.432 13.229 14.09 15.024 16.101 17.416 18.758 20.346 22.153 24.276 26.742 29.665 33.008 36.801 39.705 40.962 41.371 41.399 41.142 40.71 40.233 39.746 39.214 38.743 38.264 37.769 37.301 36.877 36.508 36.113 35.757 35.405 34.998 34.593 34.264 33.895 33.484 33.182 32.903 32.605 32.265 31.931 31.694 31.42 30.971 30.668 30.366 30.204 29.851 29.486 29.099 28.9 28.555 28.221 27.963 27.674 27.007 26.661 26.295 25.844 25.333 24.752 23.908 18.615 -6 ,1088 ,TETRA ,17558182,Fri Nov 26 15:15:24 CET,Fri Nov 26 17:06:40 CET,0.0 0.428 0.659 0.851 1.029 1.197 1.362 1.522 1.829 1.981 2.143 2.315 2.627 2.768 3.067 3.377 3.679 3.822 4.098 4.367 4.754 5.002 5.243 5.588 5.958 6.34 6.702 7.042 7.473 7.891 8.3 8.835 9.374 9.884 10.474 11.143 11.813 12.565 13.382 14.294 15.263 16.353 17.63 18.918 20.501 22.313 24.44 26.891 29.664 32.826 36.448 39.052 40.243 40.675 40.699 40.442 40.0 39.571 39.193 38.703 38.23 37.797 37.375 36.95 36.529 36.147 35.752 35.361 34.965 34.515 34.021 33.628 33.249 32.858 32.552 32.228 31.895 31.56 31.226 31.003 30.759 30.351 30.071 29.752 29.57 29.195 28.808 28.41 28.203 27.847 27.517 27.275 26.996 26.336 26.012 25.683 25.281 24.78 24.154 23.104 12.659 -7 ,19342 ,TETRA ,17558183,Fri Nov 26 15:15:25 CET,Fri Nov 26 17:07:13 CET,0.0 0.693 0.931 1.13 1.339 1.542 1.72 1.898 2.241 2.406 2.561 2.694 3.025 3.179 3.468 3.752 4.032 4.17 4.441 4.713 5.122 5.396 5.673 6.087 6.504 6.885 7.228 7.562 7.998 8.437 8.874 9.395 9.911 10.434 11.029 11.714 12.423 13.201 14.023 14.928 15.914 17.039 18.366 19.709 21.272 23.05 25.151 27.465 30.244 33.491 37.129 39.76 40.789 41.138 41.293 41.154 40.784 40.301 39.819 39.303 38.755 38.23 37.733 37.243 36.802 36.375 35.892 35.477 35.152 34.811 34.422 34.058 33.646 33.244 32.942 32.602 32.258 31.91 31.562 31.322 31.055 30.622 30.309 29.953 29.772 29.441 29.086 28.692 28.48 28.111 27.729 27.453 27.19 26.621 26.27 25.855 25.365 24.763 24.006 22.785 9.65 -8 ,5157 ,TETRA ,17558184,Fri Nov 26 15:17:29 CET,Fri Nov 26 17:12:50 CET,0.0 0.282 0.462 0.666 0.851 1.012 1.165 1.311 1.599 1.738 1.88 1.994 2.307 2.439 2.706 2.978 3.247 3.37 3.606 3.856 4.237 4.49 4.745 5.116 5.463 5.793 6.122 6.458 6.888 7.303 7.734 8.247 8.749 9.261 9.877 10.576 11.226 11.948 12.743 13.63 14.608 15.708 17.064 18.487 20.099 21.828 23.875 26.308 29.177 32.438 36.099 38.691 39.809 40.056 39.82 39.349 38.667 37.921 37.271 36.63 36.126 35.706 35.307 34.905 34.496 34.113 33.676 33.28 32.945 32.583 32.184 31.838 31.505 31.189 30.939 30.654 30.341 29.989 29.607 29.359 29.111 28.699 28.409 28.116 27.961 27.619 27.231 26.821 26.61 26.257 25.953 25.699 25.384 24.584 24.108 23.601 23.038 22.394 21.53 20.238 12.939 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt deleted file mode 100644 index 1058774c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12413 ,TETRA ,17558187,Fri Nov 26 15:18:20 CET,Fri Nov 26 17:08:26 CET,0.0 0.655 0.913 1.119 1.3 1.471 1.619 1.748 1.995 2.112 2.236 2.378 2.578 2.684 2.903 3.095 3.278 3.368 3.532 3.689 3.935 4.093 4.241 4.452 4.663 4.866 5.057 5.247 5.495 5.735 5.972 6.26 6.535 6.8 7.128 7.5 7.842 8.231 8.66 9.132 9.646 10.218 10.873 11.545 12.38 13.307 14.359 15.527 16.873 18.452 20.359 21.842 22.694 23.203 23.457 23.59 23.652 23.676 23.659 23.599 23.515 23.44 23.369 23.28 23.191 23.097 22.985 22.887 22.798 22.694 22.584 22.498 22.408 22.293 22.199 22.106 22.008 21.908 21.793 21.711 21.631 21.512 21.428 21.331 21.279 21.167 21.042 20.9 20.82 20.672 20.579 20.487 20.393 20.198 20.094 19.956 19.811 19.656 19.467 19.238 18.444 -2 ,3401 ,TETRA ,17558188,Fri Nov 26 15:18:20 CET,Fri Nov 26 17:11:39 CET,0.0 0.621 0.877 1.101 1.278 1.433 1.58 1.74 2.033 2.142 2.257 2.392 2.592 2.69 2.885 3.08 3.261 3.346 3.516 3.676 3.907 4.056 4.196 4.407 4.621 4.82 4.994 5.166 5.4 5.64 5.877 6.168 6.468 6.769 7.107 7.469 7.809 8.189 8.595 9.035 9.515 10.087 10.781 11.463 12.237 13.094 14.134 15.346 16.715 18.32 20.267 21.796 22.596 23.076 23.372 23.512 23.519 23.507 23.506 23.47 23.408 23.346 23.287 23.203 23.113 23.038 22.95 22.861 22.776 22.674 22.569 22.482 22.381 22.277 22.194 22.091 21.974 21.867 21.744 21.647 21.548 21.404 21.306 21.194 21.132 20.988 20.839 20.712 20.637 20.472 20.378 20.282 20.172 19.912 19.763 19.624 19.497 19.374 19.239 19.033 18.456 -3 ,9786 ,TETRA ,17558189,Fri Nov 26 15:19:21 CET,Fri Nov 26 17:11:09 CET,0.0 0.581 0.913 1.151 1.351 1.497 1.643 1.794 2.047 2.17 2.29 2.422 2.624 2.72 2.92 3.104 3.277 3.357 3.521 3.682 3.91 4.064 4.218 4.426 4.629 4.837 5.035 5.228 5.465 5.698 5.933 6.229 6.527 6.815 7.139 7.482 7.829 8.207 8.609 9.056 9.525 10.09 10.79 11.471 12.253 13.135 14.187 15.378 16.765 18.382 20.295 21.84 22.658 23.146 23.405 23.534 23.596 23.598 23.582 23.563 23.509 23.436 23.353 23.269 23.177 23.075 22.974 22.885 22.796 22.687 22.564 22.465 22.361 22.254 22.173 22.077 21.963 21.851 21.755 21.682 21.594 21.451 21.35 21.248 21.197 21.071 20.921 20.772 20.702 20.555 20.477 20.388 20.277 20.037 19.907 19.784 19.656 19.453 19.21 18.938 18.326 -4 ,12923 ,TETRA ,17558190,Fri Nov 26 15:20:26 CET,Fri Nov 26 17:10:48 CET,0.0 0.663 0.911 1.085 1.256 1.411 1.536 1.673 1.971 2.103 2.229 2.365 2.57 2.678 2.911 3.108 3.273 3.358 3.533 3.696 3.911 4.053 4.198 4.406 4.604 4.8 4.99 5.179 5.441 5.702 5.96 6.267 6.555 6.829 7.142 7.509 7.864 8.244 8.655 9.108 9.6 10.16 10.831 11.502 12.288 13.161 14.179 15.32 16.632 18.273 20.258 21.81 22.648 23.143 23.418 23.562 23.604 23.594 23.561 23.479 23.407 23.338 23.244 23.139 23.027 22.932 22.836 22.741 22.648 22.552 22.449 22.355 22.259 22.165 22.082 21.984 21.883 21.773 21.653 21.565 21.471 21.336 21.242 21.14 21.084 20.965 20.847 20.728 20.661 20.518 20.434 20.342 20.231 20.016 19.905 19.764 19.615 19.456 19.211 18.897 18.181 -5 ,24571 ,TETRA ,17558191,Fri Nov 26 15:27:15 CET,Fri Nov 26 17:18:34 CET,0.0 0.776 1.015 1.237 1.432 1.603 1.78 1.929 2.172 2.282 2.396 2.524 2.732 2.83 3.022 3.216 3.401 3.487 3.652 3.818 4.051 4.197 4.337 4.546 4.752 4.954 5.156 5.347 5.593 5.845 6.08 6.354 6.624 6.892 7.21 7.569 7.926 8.314 8.728 9.164 9.639 10.179 10.805 11.458 12.219 13.113 14.179 15.408 16.847 18.519 20.466 21.915 22.714 23.18 23.42 23.556 23.645 23.666 23.663 23.656 23.603 23.522 23.439 23.354 23.258 23.159 23.053 22.962 22.883 22.792 22.684 22.589 22.486 22.377 22.293 22.2 22.097 21.994 21.88 21.797 21.715 21.57 21.466 21.361 21.307 21.199 21.079 20.955 20.888 20.74 20.659 20.571 20.473 20.262 20.133 19.989 19.837 19.656 19.414 19.097 18.202 -6 ,10573 ,TETRA ,17558192,Fri Nov 26 15:29:16 CET,Fri Nov 26 17:24:45 CET,0.0 1.197 1.46 1.699 1.922 2.099 2.254 2.401 2.661 2.792 2.937 3.108 3.333 3.449 3.641 3.833 4.031 4.119 4.279 4.442 4.675 4.823 4.969 5.184 5.396 5.604 5.801 5.991 6.244 6.488 6.722 7.007 7.286 7.559 7.878 8.242 8.588 8.969 9.392 9.838 10.321 10.89 11.551 12.221 13.022 13.901 14.92 16.128 17.572 19.244 21.169 22.72 23.551 24.04 24.358 24.525 24.614 24.666 24.659 24.616 24.556 24.502 24.423 24.318 24.219 24.131 24.025 23.926 23.843 23.75 23.638 23.545 23.458 23.361 23.277 23.183 23.083 22.981 22.877 22.795 22.704 22.561 22.452 22.344 22.293 22.175 22.035 21.886 21.806 21.649 21.567 21.485 21.398 21.194 21.068 20.933 20.777 20.592 20.386 20.13 19.538 -7 ,26257 ,TETRA ,17558193,Fri Nov 26 15:31:18 CET,Fri Nov 26 17:19:05 CET,0.0 0.561 0.865 1.048 1.215 1.377 1.526 1.671 1.941 2.057 2.169 2.303 2.508 2.599 2.776 2.961 3.146 3.227 3.377 3.54 3.778 3.932 4.089 4.313 4.532 4.741 4.945 5.147 5.402 5.649 5.89 6.183 6.457 6.731 7.054 7.421 7.77 8.149 8.583 9.053 9.551 10.113 10.726 11.35 12.14 13.041 14.096 15.298 16.679 18.305 20.266 21.801 22.651 23.158 23.456 23.652 23.737 23.731 23.709 23.662 23.594 23.526 23.44 23.356 23.279 23.197 23.089 22.988 22.9 22.799 22.689 22.599 22.511 22.412 22.322 22.218 22.115 22.006 21.885 21.796 21.699 21.55 21.452 21.35 21.292 21.168 21.035 20.884 20.809 20.654 20.55 20.46 20.351 20.124 20.003 19.887 19.766 19.611 19.422 19.154 18.208 -8 ,19875 ,TETRA ,17558194,Fri Nov 26 23:39:18 CET,Sat Nov 27 01:15:44 CET,0.0 0.498 0.722 0.923 1.076 1.216 1.38 1.542 1.819 1.942 2.052 2.153 2.353 2.452 2.634 2.802 2.961 3.047 3.221 3.393 3.648 3.808 3.969 4.219 4.456 4.659 4.853 5.052 5.3 5.538 5.776 6.071 6.354 6.636 6.963 7.32 7.662 8.046 8.464 8.914 9.395 9.958 10.641 11.332 12.147 13.046 14.085 15.281 16.663 18.329 20.359 21.953 22.799 23.272 23.527 23.678 23.757 23.778 23.761 23.704 23.645 23.573 23.483 23.399 23.302 23.196 23.089 22.975 22.871 22.768 22.656 22.567 22.474 22.371 22.288 22.196 22.09 21.982 21.874 21.795 21.714 21.573 21.469 21.354 21.295 21.179 21.047 20.891 20.813 20.664 20.578 20.501 20.416 20.216 20.103 19.973 19.826 19.654 19.465 19.253 18.597 -9 ,13156 ,TETRA ,17558195,Fri Nov 26 23:39:18 CET,Sat Nov 27 01:15:21 CET,0.0 0.499 0.732 0.922 1.09 1.257 1.424 1.594 1.87 1.983 2.103 2.255 2.465 2.567 2.766 2.95 3.12 3.206 3.39 3.557 3.783 3.932 4.083 4.301 4.497 4.682 4.865 5.059 5.319 5.562 5.804 6.094 6.367 6.642 6.959 7.311 7.645 8.03 8.456 8.906 9.395 9.938 10.569 11.228 12.013 12.886 13.902 15.086 16.439 18.028 20.113 21.771 22.63 23.143 23.444 23.632 23.693 23.683 23.651 23.59 23.521 23.454 23.377 23.283 23.179 23.087 22.995 22.91 22.839 22.745 22.646 22.568 22.475 22.371 22.289 22.203 22.111 22.01 21.904 21.826 21.742 21.589 21.48 21.382 21.331 21.215 21.074 20.919 20.842 20.689 20.583 20.488 20.388 20.188 20.07 19.934 19.786 19.628 19.442 19.169 18.735 -10 ,27833 ,TETRA ,17558196,Fri Nov 26 23:39:18 CET,Sat Nov 27 01:15:01 CET,0.0 0.605 0.886 1.118 1.295 1.447 1.576 1.703 1.948 2.059 2.177 2.318 2.523 2.618 2.802 2.979 3.164 3.254 3.414 3.572 3.818 3.974 4.122 4.346 4.565 4.769 4.968 5.164 5.412 5.65 5.886 6.178 6.472 6.754 7.066 7.428 7.793 8.181 8.578 9.031 9.518 10.072 10.74 11.399 12.161 13.037 14.092 15.296 16.73 18.377 20.319 21.934 22.784 23.224 23.514 23.694 23.765 23.752 23.7 23.633 23.537 23.453 23.387 23.309 23.218 23.143 23.062 22.974 22.882 22.787 22.695 22.62 22.532 22.428 22.34 22.241 22.138 22.038 21.931 21.857 21.775 21.623 21.514 21.409 21.356 21.234 21.103 20.967 20.889 20.738 20.647 20.555 20.468 20.288 20.163 20.021 19.873 19.704 19.516 19.257 18.553 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 23b9708c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17176 ,TETRA ,17558197,Fri Nov 26 23:39:18 CET,Sat Nov 27 01:33:03 CET,0.0 0.735 1.005 1.213 1.43 1.639 1.839 2.012 2.308 2.454 2.591 2.741 2.961 3.079 3.293 3.497 3.72 3.825 4.007 4.184 4.448 4.62 4.785 5.012 5.239 5.471 5.688 5.902 6.178 6.456 6.736 7.075 7.399 7.716 8.094 8.516 8.923 9.372 9.875 10.426 11.002 11.667 12.466 13.279 14.225 15.296 16.594 18.135 19.934 22.108 24.915 27.236 28.592 29.465 30.078 30.523 30.84 31.067 31.216 31.336 31.41 31.452 31.464 31.465 31.457 31.434 31.404 31.363 31.325 31.281 31.237 31.192 31.122 31.05 31.002 30.946 30.888 30.825 30.756 30.703 30.646 30.542 30.457 30.368 30.32 30.234 30.143 30.039 29.986 29.861 29.803 29.733 29.659 29.499 29.402 29.292 29.15 28.976 28.762 28.419 27.847 -2 ,30568 ,TETRA ,17558198,Fri Nov 26 23:39:19 CET,Sat Nov 27 01:15:23 CET,0.0 0.786 1.177 1.469 1.698 1.896 2.058 2.216 2.52 2.654 2.787 2.934 3.148 3.261 3.476 3.673 3.861 3.957 4.148 4.323 4.59 4.769 4.935 5.178 5.418 5.656 5.88 6.096 6.386 6.676 6.949 7.289 7.627 7.944 8.315 8.717 9.108 9.579 10.111 10.679 11.276 11.941 12.712 13.507 14.47 15.576 16.883 18.395 20.188 22.398 25.126 27.396 28.768 29.667 30.272 30.672 30.945 31.144 31.282 31.406 31.474 31.51 31.522 31.505 31.475 31.444 31.416 31.372 31.327 31.284 31.233 31.191 31.145 31.095 31.051 30.999 30.945 30.876 30.792 30.743 30.693 30.601 30.532 30.451 30.406 30.316 30.223 30.116 30.049 29.91 29.85 29.786 29.712 29.51 29.394 29.271 29.125 28.978 28.821 28.575 27.853 -3 ,25903 ,TETRA ,17558199,Fri Nov 26 23:39:19 CET,Sat Nov 27 01:33:11 CET,0.0 0.584 0.875 1.112 1.314 1.475 1.629 1.782 2.076 2.22 2.346 2.499 2.72 2.833 3.045 3.237 3.418 3.509 3.683 3.857 4.122 4.289 4.449 4.686 4.924 5.147 5.353 5.567 5.864 6.136 6.402 6.738 7.069 7.387 7.752 8.162 8.563 9.022 9.53 10.1 10.706 11.369 12.191 13.021 13.959 15.066 16.412 17.957 19.778 21.972 24.723 27.055 28.464 29.336 29.88 30.286 30.583 30.787 30.915 31.014 31.065 31.086 31.104 31.104 31.082 31.051 31.01 30.976 30.945 30.908 30.863 30.807 30.753 30.711 30.664 30.599 30.525 30.454 30.382 30.322 30.259 30.165 30.093 30.02 29.98 29.895 29.796 29.681 29.629 29.511 29.456 29.388 29.313 29.149 29.054 28.931 28.761 28.535 28.247 27.942 27.349 -4 ,4180 ,TETRA ,17558200,Fri Nov 26 23:39:19 CET,Sat Nov 27 01:35:53 CET,0.0 0.899 1.162 1.411 1.614 1.791 1.947 2.103 2.402 2.533 2.662 2.804 3.007 3.112 3.33 3.539 3.731 3.823 4.006 4.187 4.453 4.624 4.798 5.053 5.292 5.523 5.748 5.965 6.246 6.513 6.77 7.092 7.418 7.735 8.095 8.505 8.901 9.341 9.84 10.388 10.962 11.616 12.396 13.209 14.182 15.268 16.525 17.983 19.727 21.808 24.513 26.844 28.225 29.128 29.74 30.176 30.473 30.69 30.838 30.928 30.992 31.047 31.081 31.085 31.059 31.026 30.992 30.959 30.917 30.857 30.796 30.746 30.686 30.62 30.567 30.513 30.449 30.37 30.29 30.235 30.178 30.096 30.036 29.958 29.919 29.832 29.718 29.596 29.539 29.41 29.315 29.243 29.174 29.016 28.911 28.783 28.647 28.493 28.301 28.022 27.343 -5 ,16871 ,TETRA ,17558201,Fri Nov 26 23:39:21 CET,Sat Nov 27 01:33:00 CET,0.0 0.646 0.976 1.215 1.42 1.614 1.785 1.953 2.257 2.39 2.525 2.679 2.893 3.002 3.215 3.417 3.626 3.734 3.926 4.108 4.374 4.555 4.732 4.972 5.207 5.441 5.671 5.891 6.168 6.443 6.718 7.06 7.388 7.703 8.07 8.505 8.919 9.366 9.879 10.434 11.015 11.671 12.46 13.279 14.24 15.276 16.517 18.024 19.86 22.168 25.026 27.324 28.68 29.591 30.209 30.629 30.895 31.071 31.203 31.306 31.366 31.406 31.427 31.435 31.433 31.41 31.374 31.33 31.29 31.24 31.18 31.137 31.083 31.012 30.96 30.911 30.844 30.771 30.691 30.628 30.562 30.453 30.382 30.304 30.259 30.169 30.08 29.982 29.921 29.787 29.725 29.644 29.553 29.393 29.293 29.162 29.018 28.875 28.708 28.402 27.581 -6 ,32378 ,TETRA ,17558202,Fri Nov 26 23:39:19 CET,Sat Nov 27 01:32:29 CET,0.0 0.669 1.001 1.245 1.442 1.627 1.78 1.922 2.194 2.334 2.467 2.605 2.813 2.915 3.126 3.33 3.521 3.614 3.81 3.993 4.25 4.415 4.573 4.812 5.052 5.286 5.507 5.724 6.008 6.278 6.547 6.874 7.184 7.494 7.86 8.263 8.666 9.145 9.669 10.212 10.775 11.415 12.19 12.997 13.942 15.033 16.366 17.908 19.674 21.79 24.521 26.846 28.219 29.076 29.628 30.033 30.342 30.544 30.668 30.758 30.802 30.831 30.852 30.854 30.851 30.838 30.809 30.778 30.746 30.705 30.641 30.586 30.528 30.453 30.401 30.354 30.287 30.209 30.125 30.064 30.003 29.903 29.842 29.774 29.737 29.653 29.562 29.447 29.38 29.257 29.208 29.152 29.093 28.95 28.855 28.739 28.631 28.518 28.366 28.136 27.655 -7 ,5525 ,TETRA ,17558203,Fri Nov 26 23:40:01 CET,Sat Nov 27 01:33:15 CET,0.0 0.722 1.05 1.281 1.472 1.662 1.827 1.971 2.235 2.357 2.475 2.595 2.799 2.906 3.127 3.337 3.543 3.644 3.826 3.997 4.251 4.419 4.582 4.817 5.045 5.265 5.491 5.726 6.011 6.276 6.551 6.885 7.201 7.511 7.883 8.313 8.736 9.201 9.708 10.255 10.845 11.517 12.308 13.105 14.015 15.081 16.372 17.861 19.625 21.727 24.491 26.956 28.412 29.259 29.784 30.174 30.459 30.666 30.806 30.913 30.98 31.012 31.037 31.031 31.001 30.974 30.935 30.907 30.879 30.835 30.779 30.731 30.678 30.613 30.552 30.483 30.423 30.356 30.265 30.204 30.139 30.027 29.943 29.859 29.819 29.724 29.631 29.535 29.475 29.343 29.279 29.203 29.121 28.94 28.833 28.702 28.541 28.371 28.17 27.859 26.644 -8 ,13223 ,TETRA ,17558204,Fri Nov 26 23:40:00 CET,Sat Nov 27 01:16:02 CET,0.0 0.932 1.287 1.539 1.701 1.861 2.021 2.164 2.444 2.574 2.697 2.848 3.067 3.182 3.403 3.618 3.81 3.902 4.085 4.265 4.521 4.679 4.842 5.088 5.313 5.521 5.731 5.945 6.222 6.486 6.742 7.067 7.39 7.705 8.071 8.485 8.898 9.355 9.846 10.371 10.935 11.587 12.346 13.147 14.131 15.259 16.585 18.119 19.982 22.172 24.845 27.203 28.618 29.5 30.086 30.532 30.845 31.038 31.166 31.252 31.298 31.323 31.331 31.337 31.33 31.303 31.26 31.21 31.163 31.134 31.106 31.058 31.001 30.935 30.879 30.827 30.766 30.69 30.613 30.562 30.502 30.395 30.314 30.237 30.198 30.096 29.979 29.862 29.803 29.675 29.619 29.555 29.486 29.304 29.203 29.092 28.962 28.789 28.554 28.289 27.412 -9 ,19018 ,TETRA ,17558205,Fri Nov 26 23:40:01 CET,Sat Nov 27 01:16:22 CET,0.0 1.25 1.609 1.816 2.008 2.171 2.33 2.483 2.746 2.866 2.984 3.123 3.343 3.457 3.665 3.864 4.055 4.148 4.33 4.507 4.751 4.918 5.089 5.332 5.564 5.794 6.016 6.238 6.522 6.787 7.052 7.385 7.723 8.047 8.408 8.835 9.254 9.71 10.22 10.762 11.345 12.028 12.803 13.584 14.545 15.65 16.921 18.376 20.133 22.188 24.746 26.993 28.37 29.269 29.859 30.283 30.593 30.818 30.961 31.061 31.101 31.124 31.14 31.142 31.129 31.104 31.068 31.031 30.991 30.944 30.899 30.86 30.809 30.737 30.68 30.63 30.57 30.502 30.417 30.355 30.298 30.21 30.142 30.062 30.024 29.951 29.855 29.739 29.679 29.547 29.478 29.41 29.328 29.128 29.015 28.903 28.792 28.67 28.507 28.242 27.397 -10 ,31362 ,TETRA ,17558206,Fri Nov 26 23:40:01 CET,Sat Nov 27 01:16:07 CET,0.0 1.213 1.555 1.791 1.971 2.155 2.348 2.502 2.762 2.897 3.029 3.176 3.39 3.501 3.726 3.953 4.167 4.268 4.462 4.644 4.911 5.087 5.255 5.499 5.747 5.984 6.205 6.417 6.693 6.971 7.251 7.581 7.893 8.208 8.571 8.977 9.38 9.837 10.325 10.855 11.427 12.063 12.826 13.619 14.572 15.653 16.933 18.393 20.13 22.305 25.029 27.241 28.565 29.481 30.094 30.517 30.795 30.978 31.094 31.171 31.215 31.233 31.245 31.245 31.227 31.201 31.167 31.136 31.106 31.052 30.992 30.944 30.893 30.834 30.783 30.719 30.654 30.589 30.51 30.455 30.391 30.288 30.223 30.158 30.123 30.038 29.939 29.835 29.779 29.651 29.585 29.518 29.441 29.238 29.132 29.018 28.876 28.697 28.442 28.138 27.686 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt deleted file mode 100644 index d7b9026b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23596 ,TETRA ,17558207,Fri Nov 26 23:40:02 CET,Sat Nov 27 01:16:13 CET,0.0 0.609 0.88 1.069 1.216 1.361 1.49 1.608 1.805 1.894 1.985 2.084 2.251 2.33 2.456 2.586 2.7 2.752 2.851 2.937 3.07 3.151 3.224 3.362 3.496 3.588 3.666 3.745 3.841 3.94 4.051 4.188 4.299 4.384 4.469 4.556 4.643 4.737 4.839 4.93 5.0 5.066 5.112 5.128 5.13 5.085 4.926 4.642 4.174 3.395 1.942 0.094 -1.472 -2.807 -3.928 -4.932 -5.789 -6.534 -7.154 -7.756 -8.285 -8.793 -9.259 -9.681 -10.078 -10.413 -10.753 -11.067 -11.333 -11.606 -11.898 -12.136 -12.395 -12.659 -12.866 -13.096 -13.327 -13.559 -13.795 -13.964 -14.136 -14.404 -14.598 -14.8 -14.902 -15.098 -15.299 -15.509 -15.613 -15.816 -15.962 -16.103 -16.254 -16.587 -16.765 -16.95 -17.134 -17.312 -17.539 -17.86 -18.396 -2 ,27862 ,TETRA ,17558208,Fri Nov 26 23:40:02 CET,Sat Nov 27 01:37:33 CET,0.0 0.468 0.721 0.878 1.052 1.234 1.402 1.54 1.765 1.859 1.931 2.006 2.172 2.25 2.423 2.583 2.717 2.773 2.86 2.942 3.06 3.14 3.221 3.327 3.423 3.512 3.599 3.677 3.758 3.85 3.936 4.034 4.123 4.196 4.293 4.405 4.508 4.591 4.649 4.704 4.765 4.807 4.84 4.874 4.86 4.772 4.609 4.344 3.9 3.146 1.726 -0.172 -1.718 -2.946 -3.997 -4.943 -5.784 -6.553 -7.2 -7.806 -8.314 -8.775 -9.233 -9.68 -10.068 -10.396 -10.752 -11.078 -11.372 -11.668 -11.972 -12.241 -12.519 -12.802 -13.005 -13.2 -13.399 -13.609 -13.831 -13.982 -14.134 -14.369 -14.54 -14.719 -14.814 -15.013 -15.213 -15.422 -15.523 -15.727 -15.87 -16.004 -16.142 -16.421 -16.568 -16.728 -16.922 -17.163 -17.443 -17.805 -18.512 -3 ,9819 ,TETRA ,17558209,Fri Nov 26 23:40:03 CET,Sat Nov 27 01:37:23 CET,0.0 1.01 1.378 1.621 1.77 1.904 2.046 2.173 2.39 2.483 2.564 2.652 2.812 2.881 2.991 3.091 3.188 3.235 3.329 3.417 3.536 3.61 3.687 3.787 3.874 3.96 4.047 4.134 4.236 4.34 4.452 4.575 4.707 4.835 4.952 5.03 5.104 5.186 5.251 5.334 5.416 5.491 5.547 5.568 5.546 5.454 5.278 5.002 4.542 3.709 2.201 0.392 -1.122 -2.446 -3.574 -4.546 -5.368 -6.107 -6.749 -7.404 -7.952 -8.419 -8.855 -9.256 -9.633 -9.984 -10.344 -10.646 -10.925 -11.212 -11.493 -11.728 -11.966 -12.216 -12.406 -12.609 -12.821 -13.032 -13.256 -13.417 -13.577 -13.815 -13.982 -14.158 -14.25 -14.445 -14.641 -14.846 -14.951 -15.157 -15.294 -15.408 -15.521 -15.787 -15.937 -16.09 -16.257 -16.481 -16.736 -17.038 -17.957 -4 ,30510 ,TETRA ,17558210,Fri Nov 26 15:22:21 CET,Fri Nov 26 17:17:58 CET,0.0 0.718 0.932 1.099 1.262 1.404 1.515 1.626 1.84 1.93 2.008 2.076 2.237 2.317 2.453 2.57 2.683 2.737 2.839 2.935 3.063 3.141 3.221 3.334 3.453 3.563 3.644 3.714 3.837 3.96 4.049 4.149 4.241 4.328 4.424 4.519 4.596 4.682 4.779 4.866 4.943 5.014 5.071 5.088 5.059 4.991 4.835 4.542 4.051 3.268 1.79 -0.057 -1.536 -2.822 -3.936 -4.943 -5.788 -6.522 -7.176 -7.861 -8.463 -8.986 -9.452 -9.866 -10.239 -10.577 -10.932 -11.254 -11.522 -11.782 -12.071 -12.302 -12.539 -12.83 -13.071 -13.297 -13.505 -13.727 -13.979 -14.145 -14.302 -14.555 -14.722 -14.892 -14.98 -15.152 -15.339 -15.545 -15.653 -15.867 -16.008 -16.135 -16.274 -16.613 -16.792 -16.962 -17.152 -17.385 -17.661 -17.978 -18.527 -5 ,16157 ,TETRA ,17558211,Fri Nov 26 15:22:21 CET,Fri Nov 26 17:19:36 CET,0.0 0.522 0.786 1.014 1.177 1.299 1.414 1.509 1.676 1.755 1.824 1.877 2.031 2.101 2.227 2.346 2.455 2.506 2.602 2.696 2.849 2.949 3.03 3.133 3.224 3.304 3.398 3.503 3.633 3.733 3.814 3.927 4.028 4.12 4.218 4.328 4.422 4.503 4.606 4.728 4.845 4.911 4.973 5.053 5.07 5.023 4.889 4.615 4.141 3.319 1.871 0.113 -1.376 -2.678 -3.772 -4.753 -5.595 -6.322 -6.956 -7.606 -8.157 -8.639 -9.089 -9.511 -9.901 -10.24 -10.588 -10.894 -11.161 -11.445 -11.743 -11.998 -12.266 -12.553 -12.77 -12.979 -13.189 -13.399 -13.624 -13.782 -13.931 -14.163 -14.328 -14.512 -14.612 -14.818 -15.05 -15.287 -15.39 -15.59 -15.718 -15.846 -15.997 -16.337 -16.511 -16.716 -16.956 -17.214 -17.473 -17.835 -19.089 -6 ,15226 ,TETRA ,17558212,Fri Nov 26 15:22:21 CET,Fri Nov 26 17:19:08 CET,0.0 0.429 0.629 0.772 0.915 1.065 1.197 1.312 1.495 1.582 1.671 1.749 1.895 1.953 2.081 2.193 2.278 2.323 2.416 2.512 2.651 2.723 2.788 2.894 2.995 3.085 3.167 3.239 3.34 3.454 3.562 3.699 3.824 3.902 3.98 4.066 4.141 4.229 4.316 4.385 4.457 4.527 4.561 4.576 4.551 4.451 4.282 3.992 3.482 2.676 1.263 -0.582 -2.138 -3.445 -4.555 -5.484 -6.29 -7.034 -7.649 -8.258 -8.785 -9.246 -9.68 -10.083 -10.456 -10.795 -11.173 -11.518 -11.812 -12.141 -12.478 -12.729 -12.981 -13.241 -13.436 -13.658 -13.912 -14.176 -14.436 -14.604 -14.776 -15.016 -15.181 -15.369 -15.464 -15.644 -15.843 -16.054 -16.167 -16.394 -16.552 -16.689 -16.839 -17.153 -17.32 -17.486 -17.667 -17.869 -18.096 -18.42 -19.275 -7 ,14183 ,TETRA ,17558213,Fri Nov 26 15:23:19 CET,Fri Nov 26 17:17:04 CET,0.0 0.381 0.623 0.852 1.06 1.216 1.36 1.484 1.664 1.743 1.822 1.888 2.036 2.099 2.208 2.305 2.384 2.422 2.512 2.608 2.75 2.837 2.916 3.019 3.109 3.196 3.293 3.382 3.473 3.557 3.633 3.719 3.802 3.879 3.973 4.083 4.166 4.23 4.31 4.399 4.507 4.63 4.706 4.714 4.676 4.578 4.369 4.063 3.584 2.816 1.371 -0.533 -2.108 -3.426 -4.529 -5.505 -6.342 -7.081 -7.699 -8.299 -8.815 -9.293 -9.762 -10.187 -10.573 -10.941 -11.31 -11.608 -11.867 -12.154 -12.458 -12.697 -12.945 -13.202 -13.399 -13.613 -13.838 -14.059 -14.279 -14.435 -14.596 -14.833 -14.997 -15.175 -15.265 -15.449 -15.644 -15.846 -15.951 -16.16 -16.289 -16.415 -16.556 -16.849 -17.016 -17.196 -17.389 -17.585 -17.791 -18.103 -18.77 -8 ,18499 ,TETRA ,17558214,Fri Nov 26 15:24:16 CET,Fri Nov 26 17:15:40 CET,0.0 0.721 0.988 1.206 1.391 1.535 1.644 1.736 1.917 2.009 2.091 2.17 2.325 2.388 2.515 2.644 2.75 2.796 2.886 2.987 3.135 3.225 3.319 3.448 3.555 3.643 3.735 3.833 3.942 4.029 4.105 4.201 4.311 4.415 4.512 4.603 4.698 4.795 4.876 4.973 5.067 5.164 5.246 5.262 5.238 5.194 5.083 4.837 4.39 3.586 2.148 0.392 -1.064 -2.326 -3.4 -4.356 -5.19 -5.936 -6.542 -7.148 -7.725 -8.265 -8.729 -9.152 -9.552 -9.893 -10.248 -10.571 -10.846 -11.118 -11.404 -11.644 -11.89 -12.137 -12.328 -12.528 -12.733 -12.951 -13.177 -13.322 -13.478 -13.733 -13.91 -14.088 -14.172 -14.343 -14.519 -14.722 -14.835 -15.054 -15.184 -15.308 -15.446 -15.75 -15.921 -16.1 -16.298 -16.512 -16.788 -17.185 -18.261 -9 ,4194 ,TETRA ,17558215,Fri Nov 26 15:24:16 CET,Fri Nov 26 17:21:17 CET,0.0 0.796 1.023 1.182 1.341 1.503 1.653 1.766 1.934 2.012 2.098 2.181 2.327 2.397 2.545 2.674 2.782 2.828 2.913 2.998 3.142 3.229 3.308 3.417 3.508 3.599 3.692 3.787 3.9 3.987 4.066 4.173 4.272 4.358 4.459 4.567 4.659 4.757 4.846 4.929 5.001 5.049 5.085 5.11 5.1 5.037 4.896 4.615 4.151 3.342 1.847 -0.042 -1.603 -2.881 -3.945 -4.883 -5.715 -6.449 -7.059 -7.673 -8.203 -8.663 -9.104 -9.518 -9.889 -10.233 -10.608 -10.938 -11.206 -11.478 -11.802 -12.092 -12.368 -12.654 -12.887 -13.133 -13.393 -13.659 -13.933 -14.122 -14.308 -14.584 -14.773 -14.968 -15.065 -15.254 -15.447 -15.662 -15.774 -15.981 -16.11 -16.227 -16.341 -16.615 -16.773 -16.929 -17.093 -17.283 -17.52 -17.839 -18.61 -10 ,31759 ,TETRA ,17558216,Fri Nov 26 15:24:17 CET,Fri Nov 26 17:13:03 CET,0.0 0.619 0.915 1.144 1.331 1.491 1.631 1.749 1.945 2.032 2.112 2.177 2.326 2.406 2.557 2.686 2.799 2.852 2.947 3.039 3.175 3.257 3.342 3.477 3.601 3.704 3.799 3.904 4.044 4.189 4.328 4.474 4.599 4.691 4.783 4.883 4.961 5.035 5.11 5.187 5.244 5.285 5.318 5.336 5.344 5.287 5.166 4.93 4.433 3.627 2.176 0.319 -1.217 -2.547 -3.672 -4.643 -5.479 -6.232 -6.862 -7.479 -7.999 -8.465 -8.924 -9.355 -9.753 -10.112 -10.476 -10.789 -11.056 -11.335 -11.624 -11.865 -12.127 -12.421 -12.659 -12.894 -13.125 -13.364 -13.631 -13.817 -13.985 -14.23 -14.402 -14.577 -14.669 -14.866 -15.056 -15.234 -15.327 -15.529 -15.652 -15.783 -15.935 -16.219 -16.376 -16.571 -16.772 -16.983 -17.236 -17.623 -18.446 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index bf85041d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13947 ,TETRA ,17558217,Fri Nov 26 15:24:17 CET,Fri Nov 26 17:19:07 CET,0.0 0.417 0.632 0.816 0.973 1.111 1.237 1.367 1.61 1.716 1.825 1.96 2.134 2.231 2.401 2.561 2.721 2.798 2.95 3.1 3.312 3.44 3.562 3.738 3.904 4.069 4.232 4.392 4.604 4.807 5.012 5.276 5.529 5.75 5.996 6.279 6.556 6.867 7.203 7.56 7.941 8.368 8.88 9.424 10.041 10.672 11.382 12.181 13.136 14.263 15.348 16.001 16.259 16.321 16.288 16.17 16.008 15.83 15.665 15.483 15.305 15.146 14.991 14.83 14.681 14.535 14.379 14.226 14.085 13.947 13.793 13.663 13.532 13.395 13.28 13.161 13.04 12.918 12.786 12.69 12.589 12.429 12.318 12.203 12.145 12.028 11.888 11.736 11.669 11.531 11.425 11.328 11.221 10.971 10.844 10.713 10.558 10.374 10.133 9.778 9.048 -2 ,2242 ,TETRA ,17558218,Fri Nov 26 15:25:19 CET,Fri Nov 26 17:16:54 CET,0.0 0.548 0.848 1.069 1.253 1.425 1.574 1.712 1.975 2.097 2.212 2.345 2.533 2.632 2.811 2.983 3.157 3.241 3.399 3.558 3.778 3.911 4.045 4.247 4.442 4.614 4.769 4.93 5.139 5.344 5.561 5.826 6.08 6.313 6.567 6.868 7.17 7.5 7.839 8.19 8.558 8.971 9.483 10.006 10.582 11.22 11.968 12.779 13.713 14.785 15.913 16.623 16.916 17.008 16.954 16.818 16.63 16.455 16.3 16.116 15.951 15.801 15.648 15.501 15.357 15.211 15.059 14.931 14.818 14.67 14.501 14.358 14.21 14.052 13.931 13.801 13.655 13.512 13.372 13.269 13.154 12.988 12.868 12.733 12.667 12.527 12.386 12.246 12.168 12.013 11.899 11.803 11.7 11.482 11.36 11.228 11.103 10.955 10.734 10.463 9.621 -3 ,3962 ,TETRA ,17558219,Fri Nov 26 15:25:19 CET,Fri Nov 26 17:20:43 CET,0.0 0.803 1.099 1.345 1.547 1.695 1.832 1.963 2.21 2.325 2.428 2.553 2.743 2.846 3.019 3.182 3.335 3.407 3.557 3.705 3.901 4.027 4.155 4.34 4.526 4.72 4.907 5.091 5.329 5.527 5.716 5.948 6.171 6.396 6.658 6.948 7.216 7.518 7.86 8.212 8.582 9.017 9.55 10.118 10.762 11.455 12.237 13.07 14.034 15.011 15.911 16.602 16.909 17.004 16.946 16.766 16.581 16.39 16.222 16.051 15.89 15.735 15.578 15.419 15.26 15.113 14.97 14.816 14.648 14.468 14.299 14.183 14.07 13.944 13.832 13.716 13.589 13.464 13.341 13.249 13.155 12.996 12.877 12.755 12.692 12.561 12.423 12.263 12.171 12.018 11.892 11.789 11.687 11.468 11.362 11.248 11.1 10.893 10.665 10.418 9.742 -4 ,17015 ,TETRA ,17558220,Fri Nov 26 23:40:01 CET,Sat Nov 27 01:16:08 CET,0.0 0.681 1.029 1.295 1.471 1.63 1.771 1.897 2.138 2.254 2.368 2.506 2.688 2.779 2.94 3.087 3.237 3.314 3.467 3.606 3.805 3.934 4.068 4.272 4.453 4.619 4.787 4.96 5.181 5.389 5.592 5.84 6.085 6.322 6.583 6.869 7.155 7.474 7.818 8.18 8.552 8.955 9.438 9.95 10.536 11.186 11.917 12.708 13.619 14.681 15.802 16.366 16.558 16.589 16.463 16.299 16.123 15.923 15.736 15.551 15.382 15.214 15.047 14.876 14.723 14.591 14.432 14.286 14.15 13.996 13.831 13.68 13.522 13.357 13.226 13.096 12.976 12.848 12.703 12.593 12.477 12.31 12.201 12.084 12.026 11.904 11.768 11.633 11.554 11.403 11.283 11.176 11.062 10.838 10.724 10.592 10.434 10.243 9.987 9.613 8.717 -5 ,1677 ,TETRA ,17558221,Fri Nov 26 23:40:02 CET,Sat Nov 27 01:32:17 CET,0.0 0.624 0.911 1.096 1.251 1.387 1.505 1.635 1.9 2.012 2.11 2.228 2.411 2.504 2.668 2.828 2.985 3.057 3.192 3.328 3.532 3.666 3.801 3.997 4.182 4.366 4.546 4.719 4.923 5.116 5.322 5.579 5.812 6.029 6.293 6.592 6.881 7.199 7.536 7.909 8.304 8.739 9.219 9.681 10.228 10.869 11.609 12.422 13.368 14.402 15.554 16.317 16.551 16.596 16.567 16.45 16.277 16.121 15.956 15.727 15.532 15.366 15.175 14.998 14.849 14.704 14.52 14.347 14.197 14.037 13.864 13.717 13.567 13.42 13.306 13.195 13.089 12.967 12.84 12.757 12.669 12.534 12.435 12.316 12.257 12.133 11.993 11.857 11.785 11.634 11.531 11.437 11.323 11.067 10.923 10.772 10.62 10.451 10.231 9.944 9.385 -6 ,26804 ,TETRA ,17558222,Fri Nov 26 23:40:04 CET,Sat Nov 27 01:32:23 CET,0.0 0.563 0.823 1.008 1.166 1.328 1.479 1.612 1.873 1.998 2.107 2.208 2.372 2.461 2.639 2.809 2.966 3.044 3.184 3.314 3.499 3.615 3.741 3.935 4.107 4.276 4.45 4.614 4.82 5.017 5.209 5.442 5.677 5.899 6.152 6.452 6.748 7.071 7.413 7.76 8.1 8.502 8.972 9.435 10.004 10.688 11.484 12.311 13.202 14.183 15.25 15.971 16.225 16.259 16.206 16.102 15.961 15.809 15.672 15.503 15.339 15.168 14.99 14.818 14.64 14.475 14.295 14.127 13.985 13.847 13.69 13.539 13.383 13.219 13.083 12.951 12.813 12.66 12.505 12.4 12.296 12.132 12.019 11.898 11.835 11.708 11.568 11.429 11.357 11.205 11.087 10.981 10.884 10.666 10.532 10.389 10.216 9.972 9.714 9.418 8.564 -7 ,4113 ,TETRA ,17558223,Fri Nov 26 23:40:02 CET,Sat Nov 27 01:32:09 CET,0.0 0.582 0.817 1.023 1.185 1.327 1.466 1.592 1.811 1.916 2.02 2.135 2.307 2.4 2.588 2.778 2.952 3.03 3.187 3.338 3.544 3.677 3.812 4.006 4.204 4.4 4.582 4.763 4.991 5.202 5.399 5.641 5.87 6.088 6.349 6.646 6.929 7.234 7.58 7.938 8.307 8.735 9.225 9.726 10.366 11.053 11.777 12.645 13.616 14.655 15.794 16.52 16.835 16.913 16.871 16.749 16.581 16.404 16.227 16.04 15.854 15.683 15.525 15.342 15.168 15.006 14.819 14.648 14.503 14.349 14.191 14.063 13.918 13.76 13.641 13.517 13.382 13.232 13.074 12.972 12.873 12.716 12.599 12.475 12.412 12.28 12.138 11.994 11.919 11.771 11.655 11.55 11.452 11.268 11.164 11.045 10.897 10.709 10.508 10.2 9.063 -8 ,20130 ,TETRA ,17558224,Fri Nov 26 23:40:04 CET,Sat Nov 27 01:32:28 CET,0.0 0.899 1.187 1.378 1.54 1.699 1.843 1.975 2.219 2.325 2.426 2.555 2.738 2.834 3.013 3.164 3.315 3.394 3.544 3.69 3.912 4.044 4.158 4.352 4.557 4.748 4.926 5.108 5.336 5.536 5.747 6.017 6.269 6.508 6.781 7.077 7.355 7.637 7.965 8.33 8.698 9.11 9.59 10.081 10.681 11.313 12.024 12.87 13.815 14.831 15.836 16.55 16.854 16.915 16.902 16.801 16.642 16.477 16.315 16.14 15.968 15.802 15.639 15.478 15.324 15.187 15.031 14.878 14.754 14.611 14.457 14.34 14.219 14.084 13.966 13.847 13.719 13.576 13.427 13.332 13.232 13.055 12.933 12.799 12.725 12.598 12.466 12.311 12.229 12.073 11.953 11.856 11.74 11.466 11.327 11.169 10.986 10.804 10.592 10.258 9.661 -9 ,28220 ,TETRA ,17558225,Fri Nov 26 23:40:03 CET,Sat Nov 27 01:32:56 CET,0.0 0.689 0.917 1.071 1.242 1.42 1.57 1.696 1.936 2.042 2.134 2.24 2.414 2.505 2.696 2.876 3.039 3.111 3.254 3.397 3.591 3.724 3.858 4.043 4.226 4.398 4.559 4.722 4.934 5.133 5.329 5.57 5.793 6.014 6.288 6.598 6.898 7.219 7.568 7.956 8.346 8.785 9.308 9.828 10.443 11.121 11.85 12.629 13.567 14.645 15.737 16.428 16.578 16.531 16.435 16.307 16.17 16.019 15.865 15.678 15.499 15.329 15.167 15.007 14.837 14.679 14.515 14.382 14.271 14.136 13.972 13.83 13.697 13.56 13.448 13.325 13.202 13.082 12.948 12.843 12.736 12.57 12.446 12.311 12.25 12.141 11.997 11.834 11.743 11.584 11.473 11.363 11.253 11.034 10.906 10.773 10.644 10.485 10.274 10.019 9.557 -10 ,23349 ,TETRA ,17558226,Fri Nov 26 23:40:04 CET,Sat Nov 27 01:33:06 CET,0.0 0.611 0.884 1.077 1.256 1.417 1.567 1.718 1.992 2.117 2.239 2.357 2.535 2.64 2.825 2.989 3.143 3.218 3.369 3.513 3.711 3.843 3.976 4.177 4.36 4.52 4.681 4.851 5.07 5.264 5.456 5.689 5.916 6.15 6.415 6.718 7.01 7.329 7.675 8.041 8.425 8.858 9.346 9.829 10.406 11.031 11.728 12.502 13.404 14.42 15.555 16.274 16.465 16.47 16.405 16.291 16.098 15.841 15.606 15.362 15.162 15.011 14.863 14.708 14.559 14.41 14.251 14.114 13.989 13.858 13.725 13.608 13.475 13.34 13.236 13.127 13.016 12.897 12.767 12.671 12.562 12.402 12.288 12.152 12.081 11.947 11.811 11.655 11.571 11.414 11.278 11.177 11.077 10.862 10.736 10.592 10.441 10.265 10.028 9.751 8.838 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 4410cbbf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28528 ,KEBNE ,17125843,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:32:14 CET,0.0 0.314 0.556 0.775 0.957 1.106 1.266 1.429 1.726 1.875 2.023 2.155 2.452 2.589 2.86 3.134 3.396 3.52 3.771 4.024 4.391 4.642 4.893 5.269 5.64 5.982 6.306 6.627 7.06 7.497 7.924 8.438 8.969 9.516 10.159 10.865 11.59 12.409 13.295 14.279 15.314 16.489 17.923 19.453 21.285 23.385 25.926 28.903 32.586 37.249 43.404 49.09 52.705 55.215 57.028 58.384 59.446 60.304 60.914 61.431 61.838 62.151 62.412 62.623 62.773 62.89 62.991 63.065 63.113 63.142 63.15 63.128 63.11 63.13 63.136 63.122 63.084 63.002 62.901 62.829 62.755 62.655 62.562 62.452 62.404 62.292 62.143 61.936 61.812 61.595 61.382 61.235 61.072 60.758 60.564 60.307 60.008 59.676 59.229 58.618 55.146 -2 ,24939 ,KEBNE ,17125844,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:32:50 CET,0.0 0.614 0.908 1.123 1.354 1.576 1.754 1.941 2.315 2.496 2.68 2.862 3.156 3.3 3.586 3.858 4.126 4.266 4.536 4.804 5.215 5.481 5.734 6.1 6.468 6.843 7.214 7.58 8.054 8.508 8.959 9.526 10.083 10.626 11.279 12.023 12.781 13.644 14.55 15.514 16.546 17.787 19.278 20.842 22.787 25.008 27.621 30.673 34.448 39.275 45.468 50.98 54.502 56.886 58.634 60.005 61.044 61.857 62.483 63.041 63.454 63.777 64.054 64.264 64.409 64.533 64.64 64.706 64.778 64.817 64.801 64.793 64.777 64.741 64.709 64.676 64.626 64.544 64.45 64.385 64.315 64.194 64.101 63.995 63.937 63.813 63.684 63.516 63.416 63.244 63.106 62.965 62.787 62.41 62.19 61.863 61.501 61.149 60.665 59.872 53.704 -3 ,21760 ,KEBNE ,17125845,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:33:57 CET,0.0 0.439 0.718 0.942 1.143 1.329 1.518 1.704 2.061 2.232 2.394 2.581 2.886 3.033 3.314 3.578 3.848 3.984 4.247 4.508 4.923 5.207 5.471 5.849 6.212 6.56 6.912 7.256 7.718 8.184 8.647 9.197 9.715 10.234 10.869 11.605 12.302 13.08 13.959 14.933 15.956 17.143 18.613 20.121 21.897 23.966 26.481 29.462 33.137 37.702 43.553 48.917 52.533 55.081 56.903 58.232 59.209 59.975 60.566 61.087 61.443 61.687 61.873 62.042 62.201 62.297 62.359 62.406 62.418 62.415 62.395 62.355 62.312 62.275 62.237 62.185 62.117 62.041 61.961 61.904 61.844 61.75 61.682 61.597 61.55 61.447 61.308 61.141 61.041 60.844 60.643 60.489 60.324 59.971 59.781 59.579 59.325 58.99 58.602 57.898 53.402 -4 ,13602 ,KEBNE ,17125846,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:32:52 CET,0.0 0.857 1.204 1.448 1.663 1.848 2.037 2.214 2.558 2.733 2.9 3.049 3.362 3.512 3.805 4.08 4.348 4.488 4.755 5.01 5.394 5.654 5.911 6.291 6.659 7.013 7.361 7.71 8.185 8.648 9.084 9.609 10.142 10.68 11.303 12.018 12.735 13.535 14.418 15.416 16.479 17.695 19.163 20.667 22.501 24.678 27.322 30.443 34.271 39.009 45.196 50.869 54.6 57.179 58.999 60.421 61.471 62.248 62.828 63.321 63.665 63.949 64.196 64.394 64.539 64.649 64.744 64.815 64.88 64.927 64.95 64.953 64.95 64.921 64.866 64.794 64.731 64.664 64.59 64.516 64.424 64.301 64.22 64.135 64.082 63.973 63.839 63.638 63.509 63.308 63.119 62.977 62.84 62.453 62.233 62.021 61.729 61.344 60.816 59.943 51.14 -5 ,15254 ,KEBNE ,17125847,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:32:24 CET,0.0 0.491 0.728 0.957 1.19 1.419 1.613 1.792 2.172 2.363 2.535 2.697 3.005 3.155 3.451 3.741 4.03 4.168 4.446 4.708 5.076 5.321 5.561 5.918 6.276 6.636 6.994 7.354 7.825 8.284 8.723 9.254 9.783 10.315 10.95 11.688 12.416 13.215 14.1 15.103 16.175 17.407 18.897 20.432 22.307 24.46 27.015 30.033 33.84 38.612 44.721 50.19 53.591 55.995 57.732 59.022 60.02 60.772 61.332 61.813 62.17 62.465 62.705 62.933 63.121 63.245 63.354 63.427 63.466 63.496 63.516 63.525 63.507 63.471 63.427 63.37 63.33 63.26 63.164 63.109 63.055 62.941 62.853 62.753 62.691 62.55 62.356 62.138 62.024 61.815 61.62 61.479 61.337 61.001 60.8 60.587 60.301 59.924 59.457 58.558 52.996 -6 ,10178 ,KEBNE ,17125848,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:33:14 CET,0.0 0.455 0.714 0.952 1.17 1.375 1.556 1.729 2.062 2.232 2.406 2.567 2.871 3.024 3.319 3.602 3.871 4.011 4.286 4.554 4.941 5.194 5.448 5.83 6.204 6.562 6.911 7.264 7.731 8.191 8.64 9.197 9.745 10.273 10.904 11.644 12.378 13.188 14.061 15.01 16.053 17.278 18.749 20.255 22.069 24.164 26.689 29.706 33.441 38.17 44.364 49.926 53.515 56.039 57.832 59.225 60.302 61.127 61.738 62.229 62.583 62.879 63.128 63.335 63.496 63.613 63.715 63.789 63.848 63.894 63.888 63.871 63.85 63.814 63.798 63.785 63.741 63.677 63.607 63.56 63.51 63.401 63.305 63.196 63.131 62.983 62.855 62.694 62.582 62.398 62.246 62.117 61.967 61.571 61.34 61.039 60.713 60.393 59.949 59.104 54.967 -7 ,16833 ,KEBNE ,17125849,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:32:24 CET,0.0 0.778 1.134 1.444 1.72 1.947 2.137 2.313 2.657 2.821 2.971 3.137 3.442 3.603 3.916 4.201 4.47 4.607 4.886 5.15 5.529 5.772 6.017 6.386 6.747 7.11 7.477 7.836 8.296 8.747 9.194 9.747 10.293 10.845 11.493 12.222 12.929 13.73 14.651 15.658 16.735 17.993 19.51 21.061 22.933 25.128 27.811 30.943 34.705 39.367 45.403 51.006 54.736 57.299 59.116 60.515 61.588 62.419 63.044 63.599 63.968 64.251 64.501 64.694 64.86 64.997 65.08 65.121 65.16 65.196 65.226 65.22 65.199 65.186 65.163 65.122 65.072 65.003 64.928 64.878 64.812 64.672 64.562 64.453 64.396 64.268 64.129 63.972 63.867 63.675 63.527 63.388 63.242 62.866 62.647 62.429 62.168 61.889 61.493 60.875 56.395 -8 ,23181 ,KEBNE ,17125850,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:32:43 CET,0.0 0.653 0.935 1.192 1.427 1.647 1.858 2.054 2.394 2.566 2.739 2.905 3.222 3.379 3.688 3.991 4.272 4.413 4.707 4.987 5.362 5.619 5.877 6.246 6.616 6.971 7.317 7.678 8.156 8.617 9.07 9.617 10.153 10.69 11.336 12.068 12.776 13.576 14.468 15.432 16.467 17.69 19.168 20.656 22.453 24.516 27.021 30.055 33.778 38.442 44.464 49.926 53.466 55.901 57.61 58.93 59.937 60.713 61.304 61.817 62.196 62.439 62.608 62.773 62.906 62.982 63.054 63.108 63.131 63.152 63.165 63.163 63.137 63.081 63.048 63.036 62.995 62.896 62.772 62.695 62.618 62.453 62.312 62.183 62.121 61.985 61.832 61.649 61.554 61.388 61.278 61.16 61.028 60.703 60.492 60.252 59.966 59.631 59.177 58.477 50.88 -9 ,29723 ,KEBNE ,17125851,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:33:03 CET,0.0 0.676 0.99 1.249 1.506 1.765 2.003 2.203 2.563 2.746 2.926 3.114 3.427 3.583 3.894 4.173 4.444 4.581 4.848 5.11 5.497 5.748 5.999 6.392 6.777 7.134 7.488 7.851 8.326 8.772 9.213 9.758 10.298 10.844 11.493 12.222 12.944 13.767 14.67 15.658 16.726 17.977 19.483 21.004 22.85 25.029 27.675 30.787 34.532 39.185 45.29 50.86 54.502 57.081 58.947 60.328 61.359 62.193 62.794 63.29 63.641 63.917 64.174 64.389 64.553 64.684 64.784 64.824 64.843 64.861 64.862 64.84 64.812 64.784 64.746 64.705 64.669 64.622 64.539 64.485 64.444 64.329 64.223 64.127 64.076 63.951 63.811 63.64 63.545 63.354 63.124 62.976 62.847 62.497 62.278 62.041 61.762 61.366 60.851 60.174 57.016 -10 ,23920 ,KEBNE ,17125852,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:31:58 CET,0.0 0.55 0.808 1.033 1.282 1.492 1.672 1.84 2.167 2.329 2.496 2.659 2.956 3.111 3.388 3.651 3.926 4.062 4.332 4.603 5.003 5.248 5.485 5.85 6.201 6.549 6.902 7.248 7.709 8.169 8.613 9.167 9.717 10.25 10.897 11.635 12.348 13.148 14.033 15.026 16.115 17.361 18.866 20.458 22.384 24.609 27.286 30.4 34.124 38.739 44.762 50.176 53.663 56.127 57.924 59.262 60.239 61.01 61.578 62.08 62.451 62.734 62.983 63.18 63.34 63.466 63.582 63.662 63.707 63.736 63.742 63.737 63.723 63.677 63.649 63.622 63.551 63.484 63.422 63.369 63.303 63.176 63.077 62.949 62.876 62.735 62.583 62.399 62.304 62.133 61.979 61.853 61.746 61.465 61.271 61.041 60.766 60.42 59.965 59.261 53.703 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt deleted file mode 100644 index 4e08e5c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23573 ,TETRA ,17558227,Fri Nov 26 23:40:03 CET,Sat Nov 27 01:35:17 CET,0.0 0.895 1.31 1.606 1.834 2.061 2.283 2.488 2.883 3.073 3.252 3.454 3.79 3.972 4.322 4.673 5.019 5.187 5.512 5.816 6.239 6.503 6.78 7.195 7.585 7.962 8.335 8.703 9.176 9.656 10.141 10.721 11.271 11.832 12.523 13.298 14.047 14.902 15.844 16.838 17.895 19.145 20.661 22.219 24.106 26.331 29.022 32.216 36.242 41.276 47.737 53.767 57.82 60.648 62.636 64.168 65.319 66.201 66.839 67.371 67.772 68.065 68.273 68.443 68.594 68.704 68.804 68.903 68.973 69.014 69.041 69.071 69.097 69.088 69.063 69.035 68.988 68.929 68.877 68.839 68.768 68.627 68.523 68.399 68.346 68.224 68.076 67.929 67.833 67.651 67.491 67.341 67.201 66.882 66.671 66.431 66.151 65.796 65.387 64.849 61.913 -2 ,15481 ,TETRA ,17558228,Fri Nov 26 23:40:04 CET,Sat Nov 27 01:34:43 CET,0.0 1.321 1.657 1.962 2.22 2.455 2.694 2.92 3.353 3.557 3.739 3.951 4.274 4.432 4.748 5.06 5.356 5.505 5.799 6.09 6.517 6.789 7.059 7.471 7.892 8.3 8.694 9.086 9.596 10.087 10.555 11.116 11.685 12.255 12.908 13.657 14.39 15.201 16.128 17.156 18.25 19.496 21.029 22.669 24.605 26.795 29.491 32.733 36.707 41.696 48.12 53.88 57.648 60.247 62.164 63.624 64.684 65.494 66.065 66.536 66.89 67.199 67.461 67.671 67.835 67.944 68.029 68.085 68.118 68.122 68.147 68.147 68.115 68.083 68.054 68.023 67.981 67.921 67.837 67.761 67.678 67.556 67.457 67.351 67.288 67.117 66.949 66.768 66.672 66.496 66.356 66.228 66.09 65.769 65.561 65.356 65.139 64.859 64.469 63.897 60.884 -3 ,26517 ,TETRA ,17558229,Fri Nov 26 23:40:03 CET,Sat Nov 27 01:31:56 CET,0.0 0.828 1.196 1.491 1.744 1.988 2.205 2.415 2.826 3.02 3.202 3.436 3.77 3.941 4.262 4.581 4.884 5.027 5.312 5.614 6.058 6.329 6.601 7.005 7.406 7.802 8.173 8.53 9.001 9.463 9.93 10.507 11.062 11.62 12.294 13.052 13.798 14.654 15.62 16.657 17.747 19.031 20.557 22.178 24.173 26.412 29.056 32.21 36.145 41.035 47.352 52.961 56.554 59.079 60.868 62.197 63.201 63.974 64.54 64.998 65.344 65.639 65.877 66.055 66.201 66.33 66.421 66.477 66.523 66.548 66.53 66.508 66.493 66.458 66.406 66.342 66.281 66.226 66.159 66.095 66.024 65.905 65.815 65.708 65.644 65.504 65.369 65.224 65.136 64.964 64.819 64.667 64.492 64.148 63.96 63.727 63.442 63.148 62.772 62.182 59.064 -4 ,24603 ,TETRA ,17558230,Fri Nov 26 23:40:03 CET,Sat Nov 27 01:45:47 CET,0.0 0.641 1.001 1.309 1.577 1.818 2.054 2.275 2.672 2.852 3.031 3.24 3.556 3.721 4.033 4.355 4.675 4.832 5.152 5.453 5.89 6.176 6.447 6.849 7.25 7.63 7.999 8.37 8.863 9.35 9.82 10.402 10.974 11.533 12.208 12.968 13.705 14.531 15.432 16.433 17.53 18.78 20.287 21.862 23.793 26.059 28.736 31.88 35.795 40.783 47.446 53.537 57.509 60.218 62.082 63.491 64.504 65.278 65.859 66.361 66.744 67.024 67.273 67.491 67.637 67.733 67.825 67.903 67.942 67.953 67.949 67.937 67.902 67.845 67.792 67.737 67.683 67.607 67.498 67.427 67.353 67.21 67.134 67.053 67.004 66.895 66.772 66.638 66.551 66.372 66.227 66.105 65.961 65.545 65.318 65.09 64.805 64.483 64.026 63.339 59.62 -5 ,31087 ,TETRA ,17558231,Fri Nov 26 23:40:04 CET,Sat Nov 27 01:36:17 CET,0.0 1.113 1.494 1.821 2.089 2.347 2.575 2.765 3.134 3.337 3.537 3.738 4.061 4.227 4.564 4.891 5.211 5.366 5.652 5.927 6.329 6.59 6.847 7.217 7.59 7.981 8.356 8.722 9.2 9.646 10.106 10.704 11.272 11.838 12.51 13.265 14.019 14.873 15.804 16.806 17.913 19.193 20.721 22.3 24.189 26.407 29.094 32.313 36.253 41.195 47.762 53.755 57.775 60.597 62.583 64.057 65.122 65.97 66.584 67.086 67.465 67.737 67.92 68.08 68.214 68.302 68.358 68.365 68.349 68.342 68.334 68.317 68.297 68.253 68.208 68.16 68.114 68.046 67.971 67.929 67.859 67.714 67.615 67.509 67.451 67.346 67.22 67.071 66.989 66.812 66.677 66.544 66.406 66.129 65.936 65.689 65.413 65.122 64.744 64.099 61.684 -6 ,7336 ,TETRA ,17558232,Fri Nov 26 23:40:02 CET,Sat Nov 27 01:34:32 CET,0.0 0.843 1.143 1.399 1.649 1.865 2.053 2.229 2.589 2.769 2.952 3.175 3.484 3.634 3.935 4.238 4.523 4.663 4.953 5.229 5.63 5.9 6.172 6.59 6.997 7.375 7.757 8.128 8.624 9.146 9.653 10.255 10.848 11.435 12.122 12.909 13.653 14.47 15.387 16.407 17.529 18.813 20.348 21.974 23.952 26.238 28.986 32.209 36.182 41.165 47.824 53.999 57.922 60.539 62.36 63.76 64.828 65.621 66.202 66.714 67.075 67.369 67.62 67.812 67.964 68.082 68.186 68.24 68.258 68.258 68.244 68.219 68.173 68.111 68.061 68.021 67.983 67.939 67.855 67.794 67.749 67.607 67.5 67.397 67.337 67.21 67.06 66.922 66.847 66.668 66.531 66.42 66.283 65.92 65.709 65.473 65.214 64.888 64.431 63.832 60.466 -7 ,28464 ,TETRA ,17558233,Fri Nov 26 23:40:05 CET,Sat Nov 27 01:33:48 CET,0.0 0.726 1.112 1.446 1.704 1.913 2.137 2.36 2.738 2.912 3.09 3.264 3.592 3.775 4.14 4.471 4.786 4.95 5.27 5.554 5.959 6.238 6.504 6.898 7.301 7.697 8.087 8.462 8.956 9.457 9.969 10.584 11.174 11.757 12.436 13.22 14.001 14.868 15.791 16.786 17.894 19.201 20.743 22.349 24.296 26.564 29.302 32.515 36.52 41.543 48.102 54.058 57.948 60.654 62.566 64.027 65.11 65.882 66.478 67.018 67.459 67.792 68.024 68.203 68.328 68.426 68.517 68.58 68.615 68.624 68.619 68.598 68.559 68.535 68.517 68.498 68.466 68.393 68.302 68.237 68.169 68.06 67.971 67.869 67.809 67.666 67.504 67.326 67.233 67.065 66.92 66.785 66.636 66.278 66.068 65.836 65.578 65.249 64.799 64.175 61.128 -8 ,21116 ,TETRA ,17558234,Fri Nov 26 23:40:03 CET,Sat Nov 27 01:17:07 CET,0.0 1.435 1.81 2.102 2.328 2.532 2.744 2.945 3.314 3.483 3.651 3.846 4.18 4.353 4.676 4.989 5.289 5.438 5.73 6.009 6.409 6.665 6.918 7.3 7.678 8.056 8.441 8.823 9.316 9.798 10.266 10.833 11.39 11.949 12.624 13.395 14.164 15.037 15.971 16.991 18.105 19.37 20.906 22.507 24.445 26.74 29.475 32.64 36.593 41.582 48.027 53.805 57.626 60.391 62.36 63.832 64.934 65.836 66.495 67.021 67.416 67.7 67.952 68.168 68.314 68.425 68.495 68.533 68.566 68.585 68.577 68.55 68.535 68.514 68.482 68.421 68.341 68.277 68.203 68.133 68.05 67.903 67.776 67.642 67.581 67.472 67.346 67.191 67.109 66.944 66.824 66.7 66.568 66.277 66.062 65.818 65.581 65.25 64.836 64.251 61.101 -9 ,19850 ,TETRA ,17558235,Fri Nov 26 23:40:03 CET,Sat Nov 27 01:17:11 CET,0.0 0.93 1.304 1.625 1.863 2.115 2.362 2.591 3.037 3.227 3.392 3.584 3.894 4.059 4.388 4.706 5.021 5.183 5.492 5.78 6.196 6.459 6.736 7.151 7.532 7.906 8.285 8.66 9.15 9.621 10.084 10.662 11.234 11.803 12.487 13.25 13.969 14.794 15.73 16.755 17.858 19.144 20.653 22.211 24.131 26.341 28.952 32.097 35.966 40.706 46.798 52.268 55.828 58.345 60.167 61.567 62.624 63.409 63.998 64.502 64.872 65.173 65.424 65.623 65.763 65.869 65.982 66.052 66.082 66.113 66.131 66.131 66.128 66.106 66.067 66.027 65.98 65.922 65.847 65.786 65.735 65.625 65.524 65.418 65.362 65.234 65.095 64.946 64.857 64.684 64.51 64.371 64.221 63.844 63.63 63.398 63.138 62.817 62.359 61.713 58.612 -10 ,25147 ,TETRA ,17558236,Fri Nov 26 23:40:04 CET,Sat Nov 27 01:17:06 CET,0.0 0.699 1.008 1.296 1.554 1.8 2.027 2.234 2.611 2.782 2.951 3.154 3.493 3.665 3.986 4.297 4.616 4.769 5.068 5.376 5.808 6.089 6.365 6.768 7.166 7.556 7.947 8.328 8.822 9.31 9.787 10.374 10.961 11.519 12.153 12.907 13.662 14.528 15.507 16.541 17.649 18.959 20.543 22.165 24.057 26.226 28.818 31.937 35.83 40.729 47.242 53.283 57.11 59.642 61.416 62.748 63.729 64.447 64.998 65.503 65.861 66.14 66.396 66.615 66.777 66.903 66.989 67.027 67.042 67.048 67.039 67.022 67.01 66.984 66.937 66.855 66.767 66.687 66.594 66.53 66.445 66.304 66.214 66.098 66.037 65.905 65.715 65.514 65.429 65.262 65.133 65.009 64.871 64.555 64.345 64.116 63.848 63.501 63.085 62.474 59.04 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt deleted file mode 100644 index 4022bbd7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20333 ,TETRA ,17558237,Fri Nov 26 23:40:04 CET,Sat Nov 27 01:16:00 CET,0.0 0.91 1.205 1.443 1.626 1.789 1.952 2.107 2.395 2.527 2.659 2.787 3.045 3.159 3.376 3.597 3.798 3.891 4.076 4.25 4.517 4.687 4.85 5.098 5.326 5.552 5.769 5.969 6.233 6.501 6.761 7.072 7.382 7.706 8.12 8.555 8.945 9.391 9.887 10.425 10.983 11.62 12.353 13.107 14.038 15.072 16.29 17.677 19.274 21.288 23.786 25.809 26.979 27.74 28.253 28.598 28.773 28.864 28.963 29.042 29.082 29.088 29.076 29.041 29.006 28.992 28.949 28.896 28.86 28.822 28.763 28.705 28.642 28.564 28.503 28.445 28.378 28.299 28.22 28.173 28.125 28.045 27.992 27.939 27.903 27.804 27.704 27.604 27.555 27.405 27.43 27.381 27.33 27.19 27.114 27.037 26.945 26.85 26.756 26.589 26.145 -2 ,29949 ,TETRA ,17558238,Fri Nov 26 23:40:03 CET,Sat Nov 27 01:16:00 CET,0.0 0.958 1.219 1.423 1.609 1.818 2.004 2.142 2.424 2.57 2.711 2.827 3.079 3.184 3.399 3.612 3.808 3.903 4.093 4.277 4.538 4.707 4.889 5.165 5.417 5.643 5.862 6.097 6.389 6.66 6.929 7.243 7.553 7.857 8.208 8.626 9.038 9.489 9.982 10.508 11.067 11.72 12.516 13.303 14.228 15.279 16.457 17.86 19.592 21.669 24.174 26.201 27.405 28.154 28.588 28.875 29.086 29.214 29.276 29.327 29.348 29.347 29.338 29.294 29.246 29.205 29.144 29.086 29.035 28.981 28.921 28.857 28.795 28.721 28.655 28.602 28.537 28.462 28.38 28.313 28.246 28.132 28.048 27.969 27.927 27.827 27.719 27.607 27.536 27.356 27.345 27.281 27.203 27.024 26.905 26.769 26.641 26.5 26.313 26.085 25.489 -3 ,27511 ,TETRA ,17558239,Fri Nov 26 23:40:03 CET,Sat Nov 27 01:15:45 CET,0.0 1.077 1.394 1.651 1.866 2.042 2.214 2.374 2.655 2.771 2.881 2.964 3.214 3.324 3.536 3.743 3.933 4.023 4.211 4.398 4.657 4.823 4.985 5.232 5.482 5.714 5.931 6.143 6.421 6.698 6.978 7.314 7.631 7.946 8.325 8.741 9.125 9.544 10.017 10.553 11.118 11.762 12.516 13.278 14.159 15.165 16.396 17.818 19.513 21.539 23.995 26.009 27.189 27.934 28.387 28.693 28.894 29.039 29.137 29.186 29.206 29.223 29.234 29.222 29.181 29.135 29.088 29.036 28.978 28.904 28.82 28.763 28.703 28.622 28.555 28.478 28.398 28.313 28.22 28.16 28.093 27.987 27.915 27.832 27.795 27.729 27.639 27.52 27.457 27.28 27.245 27.181 27.119 26.951 26.847 26.731 26.596 26.439 26.245 26.027 25.515 -4 ,9467 ,TETRA ,17558240,Fri Nov 26 23:40:05 CET,Sat Nov 27 01:27:26 CET,0.0 1.048 1.389 1.653 1.857 2.031 2.188 2.324 2.567 2.697 2.828 2.925 3.166 3.263 3.46 3.674 3.888 3.983 4.156 4.338 4.609 4.777 4.949 5.197 5.425 5.651 5.887 6.116 6.403 6.677 6.957 7.311 7.644 7.968 8.358 8.787 9.189 9.619 10.084 10.608 11.184 11.848 12.613 13.407 14.363 15.412 16.626 18.02 19.732 21.769 24.217 26.325 27.526 28.247 28.701 28.998 29.22 29.372 29.442 29.472 29.469 29.453 29.42 29.373 29.326 29.269 29.195 29.134 29.087 29.037 28.981 28.923 28.85 28.763 28.691 28.612 28.528 28.454 28.374 28.312 28.256 28.168 28.102 28.027 27.982 27.884 27.794 27.69 27.634 27.454 27.405 27.333 27.262 27.106 27.0 26.891 26.788 26.663 26.462 26.209 25.539 -5 ,23192 ,TETRA ,17558241,Fri Nov 26 23:40:07 CET,Sat Nov 27 01:23:25 CET,0.0 0.513 0.797 1.079 1.304 1.483 1.649 1.793 2.068 2.195 2.311 2.41 2.666 2.774 2.993 3.21 3.406 3.505 3.708 3.895 4.146 4.306 4.469 4.701 4.924 5.161 5.389 5.615 5.92 6.202 6.462 6.78 7.104 7.427 7.786 8.176 8.546 8.958 9.422 9.93 10.481 11.113 11.847 12.583 13.476 14.528 15.782 17.226 18.928 20.933 23.314 25.245 26.363 27.048 27.532 27.886 28.113 28.282 28.399 28.463 28.485 28.492 28.485 28.461 28.431 28.403 28.343 28.275 28.217 28.147 28.084 28.025 27.956 27.888 27.837 27.784 27.709 27.621 27.537 27.474 27.404 27.309 27.24 27.148 27.085 26.969 26.855 26.724 26.656 26.476 26.447 26.373 26.29 26.107 26.007 25.91 25.802 25.633 25.407 25.171 24.705 -6 ,21640 ,TETRA ,17558242,Fri Nov 26 23:40:45 CET,Sat Nov 27 01:36:34 CET,0.0 0.356 0.529 0.679 0.82 0.961 1.091 1.197 1.419 1.533 1.632 1.681 1.925 2.023 2.213 2.411 2.605 2.701 2.896 3.092 3.357 3.519 3.678 3.919 4.143 4.364 4.587 4.799 5.073 5.331 5.587 5.91 6.223 6.53 6.894 7.301 7.718 8.19 8.687 9.218 9.77 10.396 11.157 11.957 12.899 13.926 15.106 16.501 18.153 20.017 22.34 24.355 25.6 26.432 26.904 27.205 27.426 27.573 27.66 27.727 27.763 27.76 27.748 27.719 27.673 27.639 27.588 27.511 27.425 27.334 27.248 27.186 27.132 27.079 27.024 26.966 26.907 26.844 26.777 26.723 26.671 26.594 26.543 26.481 26.443 26.356 26.269 26.183 26.137 25.982 26.005 25.953 25.899 25.775 25.701 25.603 25.51 25.412 25.275 25.122 24.816 -7 ,10776 ,TETRA ,17558243,Fri Nov 26 23:40:45 CET,Sat Nov 27 01:34:41 CET,0.0 0.795 1.129 1.382 1.568 1.749 1.926 2.091 2.366 2.477 2.593 2.695 2.95 3.06 3.271 3.486 3.695 3.794 3.973 4.15 4.42 4.605 4.779 5.012 5.249 5.489 5.706 5.915 6.193 6.472 6.759 7.106 7.442 7.753 8.101 8.519 8.94 9.428 9.956 10.485 11.055 11.695 12.429 13.197 14.111 15.135 16.354 17.762 19.492 21.619 24.262 26.333 27.476 28.2 28.619 28.908 29.112 29.266 29.354 29.354 29.347 29.363 29.361 29.35 29.33 29.285 29.23 29.188 29.132 29.073 29.019 28.943 28.837 28.742 28.676 28.599 28.504 28.394 28.294 28.234 28.165 28.031 27.936 27.853 27.81 27.71 27.607 27.498 27.442 27.273 27.254 27.182 27.107 26.938 26.84 26.717 26.587 26.426 26.184 25.851 25.369 -8 ,24301 ,TETRA ,17558244,Fri Nov 26 23:40:48 CET,Sat Nov 27 01:34:27 CET,0.0 0.575 0.88 1.139 1.372 1.564 1.724 1.869 2.126 2.252 2.37 2.444 2.692 2.802 3.019 3.222 3.427 3.532 3.713 3.89 4.146 4.319 4.501 4.755 4.993 5.223 5.466 5.693 5.977 6.275 6.569 6.918 7.252 7.563 7.909 8.292 8.685 9.142 9.629 10.164 10.726 11.349 12.125 12.941 13.895 14.971 16.2 17.559 19.238 21.313 23.781 25.751 26.827 27.486 27.975 28.303 28.512 28.667 28.738 28.765 28.782 28.792 28.794 28.778 28.727 28.685 28.648 28.596 28.531 28.45 28.365 28.309 28.256 28.194 28.149 28.095 28.021 27.934 27.845 27.789 27.72 27.614 27.545 27.461 27.417 27.34 27.266 27.158 27.089 26.915 26.897 26.83 26.759 26.555 26.419 26.288 26.166 26.042 25.873 25.651 24.961 -9 ,5712 ,TETRA ,17558245,Fri Nov 26 23:40:46 CET,Sat Nov 27 01:33:38 CET,0.0 0.97 1.275 1.496 1.671 1.849 2.033 2.212 2.509 2.639 2.758 2.852 3.106 3.221 3.458 3.68 3.889 3.988 4.187 4.376 4.656 4.834 4.994 5.232 5.483 5.736 5.981 6.215 6.488 6.744 7.004 7.328 7.655 7.977 8.33 8.719 9.111 9.551 10.021 10.519 11.066 11.707 12.471 13.249 14.165 15.183 16.377 17.804 19.534 21.577 24.045 26.069 27.207 27.931 28.428 28.73 28.923 29.053 29.143 29.194 29.208 29.204 29.181 29.157 29.125 29.081 29.038 28.996 28.944 28.896 28.848 28.796 28.73 28.648 28.588 28.522 28.447 28.361 28.27 28.208 28.142 28.035 27.962 27.883 27.841 27.757 27.661 27.557 27.507 27.344 27.36 27.316 27.261 27.103 27.007 26.902 26.769 26.635 26.505 26.268 25.807 -10 ,32091 ,TETRA ,17558246,Fri Nov 26 23:40:45 CET,Sat Nov 27 01:33:45 CET,0.0 0.682 0.92 1.13 1.34 1.525 1.712 1.878 2.162 2.298 2.424 2.523 2.782 2.903 3.15 3.375 3.573 3.673 3.874 4.061 4.325 4.494 4.658 4.907 5.153 5.402 5.645 5.87 6.157 6.431 6.705 7.043 7.353 7.655 8.012 8.42 8.83 9.267 9.726 10.237 10.779 11.417 12.209 13.002 13.929 14.988 16.187 17.584 19.291 21.229 23.587 25.561 26.706 27.454 27.909 28.193 28.404 28.553 28.638 28.681 28.697 28.703 28.699 28.677 28.632 28.592 28.551 28.52 28.486 28.419 28.344 28.288 28.227 28.159 28.102 28.036 27.951 27.87 27.798 27.746 27.69 27.591 27.517 27.443 27.402 27.307 27.215 27.115 27.054 26.885 26.868 26.79 26.713 26.534 26.433 26.32 26.162 25.979 25.777 25.539 25.008 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 2ce084b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24112 ,TETRA ,17558247,Fri Nov 26 23:40:47 CET,Sat Nov 27 01:35:42 CET,0.0 1.51 1.984 2.309 2.623 2.898 3.128 3.369 3.838 4.043 4.232 4.436 4.741 4.9 5.208 5.513 5.793 5.931 6.209 6.473 6.856 7.091 7.31 7.64 7.969 8.288 8.613 8.922 9.304 9.687 10.08 10.563 11.015 11.439 11.939 12.526 13.121 13.774 14.47 15.212 15.985 16.86 17.911 18.991 20.265 21.731 23.476 25.49 27.898 30.814 34.343 37.321 39.23 40.485 41.305 41.919 42.38 42.72 42.939 43.07 43.164 43.256 43.315 43.341 43.353 43.356 43.352 43.344 43.327 43.309 43.296 43.287 43.268 43.239 43.218 43.188 43.147 43.103 43.07 43.047 43.018 42.966 42.908 42.853 42.832 42.775 42.71 42.654 42.622 42.489 42.529 42.489 42.437 42.321 42.268 42.223 42.171 42.082 41.97 41.853 41.612 -2 ,25991 ,TETRA ,17558248,Fri Nov 26 23:40:45 CET,Sat Nov 27 01:36:11 CET,0.0 0.843 1.248 1.563 1.864 2.13 2.37 2.59 3.015 3.219 3.404 3.594 3.888 4.044 4.352 4.65 4.932 5.06 5.312 5.561 5.935 6.177 6.413 6.767 7.1 7.418 7.728 8.024 8.421 8.82 9.209 9.681 10.127 10.576 11.135 11.751 12.321 12.958 13.635 14.348 15.152 16.054 17.091 18.154 19.425 20.913 22.632 24.59 26.981 29.866 33.375 36.472 38.403 39.681 40.559 41.166 41.608 41.942 42.178 42.394 42.543 42.65 42.737 42.784 42.806 42.828 42.857 42.869 42.872 42.874 42.871 42.855 42.826 42.783 42.749 42.716 42.677 42.633 42.589 42.564 42.533 42.482 42.449 42.408 42.385 42.326 42.269 42.214 42.176 42.043 42.057 42.01 41.963 41.858 41.788 41.721 41.672 41.621 41.555 41.448 41.213 -3 ,7541 ,TETRA ,17558249,Fri Nov 26 23:40:48 CET,Sat Nov 27 01:36:04 CET,0.0 0.978 1.367 1.694 2.022 2.294 2.532 2.743 3.107 3.3 3.485 3.683 3.994 4.162 4.494 4.805 5.084 5.223 5.49 5.743 6.119 6.376 6.622 6.966 7.288 7.598 7.908 8.198 8.574 8.945 9.313 9.771 10.2 10.619 11.124 11.693 12.231 12.835 13.51 14.227 14.999 15.88 16.902 17.951 19.203 20.644 22.343 24.309 26.696 29.643 33.281 36.409 38.337 39.58 40.416 41.062 41.553 41.91 42.144 42.317 42.448 42.562 42.66 42.737 42.78 42.791 42.809 42.836 42.855 42.868 42.873 42.873 42.866 42.848 42.83 42.803 42.764 42.724 42.679 42.65 42.623 42.58 42.544 42.493 42.465 42.427 42.388 42.336 42.307 42.179 42.201 42.165 42.121 42.019 41.959 41.889 41.824 41.765 41.712 41.618 41.428 -4 ,19295 ,TETRA ,17558250,Fri Nov 26 23:40:49 CET,Sat Nov 27 01:37:53 CET,0.0 1.148 1.596 1.955 2.258 2.53 2.785 3.011 3.424 3.617 3.8 4.005 4.297 4.448 4.736 5.017 5.299 5.429 5.662 5.893 6.252 6.474 6.69 7.026 7.339 7.628 7.931 8.232 8.598 8.948 9.295 9.721 10.133 10.547 11.044 11.614 12.169 12.785 13.468 14.21 14.99 15.853 16.875 17.92 19.188 20.658 22.368 24.329 26.649 29.502 33.151 36.265 38.142 39.337 40.148 40.763 41.239 41.597 41.818 41.986 42.116 42.206 42.274 42.352 42.413 42.453 42.485 42.499 42.514 42.533 42.534 42.526 42.513 42.495 42.476 42.457 42.438 42.407 42.369 42.341 42.307 42.246 42.208 42.168 42.144 42.102 42.057 42.012 41.983 41.847 41.867 41.832 41.803 41.712 41.66 41.594 41.521 41.447 41.343 41.214 40.632 -5 ,19327 ,TETRA ,17558251,Fri Nov 26 23:40:46 CET,Sat Nov 27 01:38:20 CET,0.0 1.301 1.745 2.081 2.367 2.622 2.842 3.044 3.441 3.641 3.841 4.086 4.391 4.547 4.865 5.168 5.443 5.578 5.841 6.096 6.479 6.718 6.947 7.271 7.574 7.872 8.177 8.484 8.882 9.288 9.694 10.164 10.607 11.039 11.554 12.153 12.725 13.343 14.001 14.728 15.524 16.436 17.519 18.603 19.894 21.357 23.047 25.007 27.362 30.157 33.687 36.697 38.529 39.782 40.643 41.264 41.681 42.014 42.25 42.451 42.593 42.668 42.732 42.787 42.821 42.848 42.854 42.845 42.851 42.851 42.837 42.827 42.817 42.804 42.79 42.768 42.735 42.704 42.674 42.641 42.608 42.558 42.519 42.465 42.434 42.382 42.321 42.251 42.218 42.091 42.139 42.111 42.073 41.963 41.907 41.863 41.808 41.752 41.677 41.565 41.424 -6 ,12885 ,TETRA ,17558252,Fri Nov 26 23:40:48 CET,Sat Nov 27 01:35:44 CET,0.0 1.468 1.925 2.308 2.627 2.892 3.136 3.378 3.826 4.023 4.208 4.448 4.773 4.941 5.234 5.528 5.807 5.941 6.212 6.46 6.822 7.062 7.297 7.642 7.972 8.292 8.606 8.919 9.309 9.694 10.086 10.559 11.016 11.443 11.944 12.532 13.104 13.719 14.389 15.129 15.929 16.836 17.876 18.958 20.247 21.724 23.471 25.429 27.838 30.754 34.287 37.456 39.408 40.638 41.499 42.116 42.546 42.889 43.134 43.352 43.504 43.613 43.707 43.757 43.8 43.836 43.864 43.882 43.884 43.873 43.854 43.851 43.85 43.845 43.837 43.816 43.788 43.756 43.716 43.686 43.654 43.589 43.54 43.497 43.471 43.41 43.355 43.299 43.269 43.143 43.175 43.135 43.08 42.947 42.896 42.854 42.788 42.691 42.573 42.445 42.255 -7 ,9099 ,TETRA ,17558253,Fri Nov 26 23:40:49 CET,Sat Nov 27 01:35:35 CET,0.0 1.099 1.541 1.902 2.197 2.46 2.696 2.925 3.373 3.57 3.755 3.957 4.264 4.434 4.764 5.074 5.364 5.504 5.781 6.05 6.432 6.679 6.92 7.261 7.583 7.902 8.218 8.527 8.941 9.342 9.732 10.2 10.642 11.08 11.58 12.126 12.664 13.288 13.991 14.737 15.537 16.433 17.458 18.525 19.834 21.311 23.026 25.024 27.42 30.18 33.666 36.865 38.797 40.052 40.904 41.514 41.96 42.306 42.548 42.731 42.865 42.975 43.062 43.136 43.202 43.227 43.237 43.249 43.244 43.229 43.212 43.198 43.176 43.147 43.121 43.093 43.048 43.0 42.958 42.931 42.901 42.845 42.791 42.703 42.663 42.593 42.518 42.455 42.424 42.285 42.3 42.264 42.228 42.154 42.11 42.051 41.988 41.92 41.842 41.736 41.544 -8 ,19283 ,TETRA ,17558254,Fri Nov 26 23:40:45 CET,Sat Nov 27 01:35:44 CET,0.0 1.149 1.659 2.017 2.287 2.541 2.806 3.041 3.478 3.674 3.854 4.065 4.37 4.528 4.824 5.107 5.394 5.535 5.802 6.061 6.425 6.669 6.916 7.263 7.594 7.908 8.229 8.548 8.946 9.327 9.708 10.166 10.599 11.048 11.575 12.15 12.728 13.352 14.031 14.799 15.585 16.458 17.489 18.527 19.787 21.209 22.854 24.786 27.154 29.983 33.539 36.661 38.571 39.884 40.747 41.379 41.841 42.158 42.392 42.59 42.726 42.818 42.881 42.93 42.96 42.983 43.002 43.002 43.006 43.013 43.001 42.981 42.959 42.941 42.931 42.916 42.887 42.828 42.752 42.695 42.637 42.577 42.536 42.476 42.447 42.395 42.323 42.232 42.191 42.052 42.075 42.046 42.007 41.892 41.822 41.76 41.697 41.631 41.56 41.456 41.131 -9 ,14269 ,TETRA ,17558255,Fri Nov 26 23:40:47 CET,Sat Nov 27 01:24:31 CET,0.0 0.951 1.435 1.845 2.156 2.418 2.65 2.865 3.284 3.48 3.663 3.873 4.186 4.352 4.68 4.982 5.264 5.411 5.69 5.962 6.342 6.561 6.775 7.106 7.452 7.784 8.101 8.412 8.806 9.195 9.59 10.057 10.501 10.936 11.453 12.04 12.607 13.257 13.949 14.664 15.447 16.325 17.35 18.417 19.702 21.191 22.906 24.851 27.211 30.047 33.559 36.606 38.449 39.645 40.5 41.123 41.574 41.913 42.133 42.345 42.498 42.595 42.68 42.746 42.796 42.836 42.863 42.875 42.88 42.883 42.879 42.864 42.848 42.836 42.825 42.81 42.794 42.774 42.745 42.717 42.689 42.63 42.585 42.542 42.513 42.449 42.38 42.295 42.251 42.117 42.134 42.089 42.047 41.945 41.886 41.82 41.738 41.666 41.558 41.413 41.131 -10 ,15351 ,TETRA ,17558256,Fri Nov 26 23:40:47 CET,Sat Nov 27 01:38:09 CET,0.0 1.016 1.465 1.82 2.108 2.35 2.563 2.762 3.115 3.301 3.486 3.664 3.956 4.114 4.424 4.717 4.985 5.118 5.387 5.633 5.981 6.211 6.442 6.786 7.114 7.427 7.732 8.025 8.412 8.79 9.149 9.592 10.01 10.411 10.91 11.465 11.984 12.568 13.233 13.973 14.736 15.596 16.634 17.694 18.967 20.437 22.148 24.119 26.519 29.446 33.079 36.222 38.074 39.272 40.097 40.689 41.124 41.471 41.732 41.926 42.056 42.163 42.245 42.257 42.255 42.281 42.29 42.283 42.273 42.264 42.253 42.24 42.232 42.218 42.189 42.151 42.106 42.07 42.044 42.025 41.997 41.957 41.923 41.874 41.849 41.795 41.738 41.662 41.628 41.504 41.537 41.497 41.457 41.386 41.339 41.275 41.199 41.109 40.969 40.78 40.513 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 9fb2f2a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25735 ,TETRA ,17558257,Fri Nov 26 23:40:47 CET,Sat Nov 27 01:33:39 CET,0.0 0.388 0.616 0.806 0.988 1.17 1.333 1.48 1.776 1.899 2.003 2.11 2.302 2.402 2.575 2.736 2.898 2.984 3.165 3.33 3.55 3.692 3.827 4.013 4.197 4.368 4.519 4.676 4.894 5.112 5.315 5.549 5.789 6.013 6.289 6.62 6.902 7.197 7.522 7.872 8.243 8.645 9.117 9.613 10.183 10.813 11.524 12.315 13.222 14.158 15.135 15.764 15.955 15.935 15.801 15.625 15.422 15.21 15.014 14.78 14.553 14.371 14.198 14.009 13.821 13.652 13.462 13.278 13.12 12.953 12.788 12.646 12.483 12.32 12.183 12.023 11.86 11.704 11.55 11.426 11.283 11.086 10.956 10.811 10.732 10.561 10.39 10.213 10.124 9.948 9.818 9.699 9.573 9.31 9.149 8.977 8.788 8.553 8.295 7.937 6.851 -2 ,14717 ,TETRA ,17558258,Fri Nov 26 23:40:49 CET,Sat Nov 27 01:33:28 CET,0.0 0.978 1.312 1.574 1.773 1.928 2.074 2.229 2.494 2.609 2.713 2.82 3.013 3.119 3.303 3.463 3.63 3.707 3.853 4.001 4.193 4.302 4.421 4.615 4.801 4.995 5.178 5.347 5.581 5.791 5.978 6.21 6.444 6.68 6.952 7.25 7.534 7.845 8.175 8.503 8.845 9.26 9.748 10.231 10.786 11.389 12.064 12.815 13.678 14.662 15.717 16.379 16.611 16.624 16.526 16.349 16.168 15.999 15.823 15.618 15.399 15.197 15.029 14.873 14.696 14.507 14.312 14.137 13.993 13.853 13.695 13.553 13.402 13.247 13.107 12.956 12.804 12.639 12.459 12.349 12.235 12.027 11.899 11.777 11.707 11.552 11.396 11.239 11.161 10.999 10.886 10.773 10.653 10.392 10.247 10.082 9.883 9.673 9.472 9.194 7.549 -3 ,19202 ,TETRA ,17558259,Fri Nov 26 23:40:50 CET,Sat Nov 27 01:33:42 CET,0.0 0.643 0.895 1.09 1.226 1.367 1.511 1.653 1.924 2.043 2.155 2.27 2.462 2.561 2.752 2.938 3.105 3.185 3.344 3.488 3.686 3.814 3.944 4.136 4.312 4.486 4.662 4.841 5.064 5.253 5.434 5.681 5.917 6.137 6.389 6.66 6.932 7.233 7.541 7.882 8.263 8.682 9.155 9.617 10.155 10.758 11.415 12.139 13.002 13.952 14.888 15.414 15.572 15.558 15.444 15.286 15.094 14.907 14.737 14.528 14.332 14.169 14.008 13.807 13.618 13.458 13.286 13.126 12.974 12.81 12.642 12.491 12.319 12.144 12.016 11.885 11.737 11.586 11.425 11.309 11.191 11.01 10.892 10.78 10.718 10.568 10.416 10.266 10.181 10.006 9.867 9.755 9.646 9.377 9.231 9.064 8.874 8.66 8.401 8.08 6.983 -4 ,4644 ,TETRA ,17558260,Fri Nov 26 23:40:47 CET,Sat Nov 27 01:33:54 CET,0.0 0.774 1.039 1.271 1.473 1.645 1.806 1.961 2.232 2.349 2.466 2.585 2.779 2.882 3.077 3.268 3.431 3.504 3.657 3.811 4.023 4.165 4.31 4.51 4.692 4.878 5.063 5.238 5.467 5.669 5.864 6.11 6.331 6.543 6.783 7.068 7.349 7.642 7.962 8.299 8.671 9.104 9.599 10.092 10.657 11.291 11.983 12.716 13.591 14.604 15.648 16.268 16.508 16.559 16.52 16.425 16.262 16.067 15.872 15.656 15.456 15.268 15.071 14.879 14.704 14.54 14.376 14.222 14.068 13.904 13.732 13.587 13.428 13.269 13.141 13.006 12.845 12.664 12.491 12.36 12.233 12.048 11.918 11.785 11.712 11.551 11.382 11.206 11.106 10.913 10.793 10.683 10.566 10.293 10.115 9.934 9.753 9.54 9.271 8.851 7.535 -5 ,4409 ,TETRA ,17558261,Fri Nov 26 23:40:50 CET,Sat Nov 27 01:33:45 CET,0.0 0.949 1.263 1.512 1.731 1.885 2.043 2.202 2.468 2.582 2.695 2.832 3.03 3.127 3.32 3.507 3.668 3.743 3.88 4.03 4.268 4.417 4.552 4.746 4.922 5.091 5.259 5.414 5.625 5.823 6.015 6.259 6.493 6.725 6.994 7.294 7.572 7.872 8.205 8.54 8.885 9.275 9.74 10.194 10.711 11.323 12.03 12.785 13.607 14.513 15.491 16.13 16.291 16.246 16.139 16.009 15.861 15.675 15.479 15.268 15.071 14.897 14.726 14.554 14.38 14.224 14.07 13.888 13.719 13.553 13.368 13.221 13.068 12.882 12.736 12.59 12.438 12.282 12.118 11.991 11.864 11.68 11.543 11.397 11.324 11.171 10.987 10.798 10.69 10.487 10.306 10.18 10.061 9.783 9.629 9.482 9.313 9.111 8.814 8.333 7.016 -6 ,10019 ,TETRA ,17558262,Fri Nov 26 23:40:47 CET,Sat Nov 27 01:34:12 CET,0.0 0.694 0.969 1.233 1.45 1.646 1.819 1.953 2.214 2.349 2.47 2.579 2.765 2.87 3.066 3.231 3.39 3.469 3.632 3.8 4.019 4.155 4.299 4.51 4.693 4.864 5.032 5.195 5.383 5.583 5.779 6.013 6.253 6.458 6.69 6.978 7.245 7.523 7.836 8.169 8.522 8.923 9.412 9.89 10.438 11.058 11.749 12.521 13.326 14.273 15.325 15.863 16.046 16.113 16.073 15.929 15.745 15.562 15.361 15.142 14.979 14.823 14.646 14.468 14.304 14.15 13.974 13.797 13.638 13.462 13.272 13.13 12.995 12.847 12.717 12.573 12.408 12.251 12.108 12.01 11.909 11.757 11.645 11.521 11.469 11.37 11.247 11.11 11.036 10.854 10.727 10.62 10.496 10.24 10.089 9.921 9.74 9.526 9.267 8.964 7.971 -7 ,21598 ,TETRA ,17558263,Fri Nov 26 23:40:47 CET,Sat Nov 27 01:34:05 CET,0.0 0.699 1.053 1.283 1.475 1.655 1.815 1.957 2.215 2.343 2.461 2.573 2.767 2.862 3.047 3.231 3.397 3.483 3.652 3.809 4.047 4.205 4.342 4.512 4.69 4.869 5.04 5.214 5.433 5.641 5.853 6.112 6.345 6.56 6.802 7.088 7.368 7.679 8.019 8.363 8.725 9.148 9.62 10.074 10.598 11.183 11.866 12.622 13.472 14.427 15.419 16.025 16.183 16.142 16.051 15.891 15.692 15.5 15.322 15.099 14.891 14.689 14.491 14.32 14.152 14.006 13.832 13.672 13.538 13.373 13.187 13.035 12.868 12.7 12.576 12.438 12.282 12.138 11.994 11.877 11.753 11.567 11.438 11.289 11.216 11.076 10.899 10.689 10.584 10.407 10.258 10.138 10.021 9.753 9.604 9.447 9.287 9.093 8.836 8.537 7.395 -8 ,22386 ,TETRA ,17558264,Fri Nov 26 23:40:49 CET,Sat Nov 27 01:35:11 CET,0.0 0.672 0.968 1.177 1.365 1.547 1.719 1.857 2.106 2.228 2.343 2.461 2.659 2.768 2.968 3.14 3.297 3.371 3.516 3.651 3.849 3.983 4.118 4.314 4.505 4.69 4.867 5.034 5.226 5.42 5.616 5.842 6.056 6.275 6.539 6.821 7.081 7.377 7.699 8.041 8.398 8.79 9.255 9.738 10.318 10.968 11.686 12.459 13.335 14.304 15.306 15.987 16.223 16.218 16.137 16.027 15.885 15.706 15.529 15.319 15.118 14.943 14.759 14.567 14.389 14.223 14.047 13.887 13.736 13.567 13.384 13.242 13.099 12.926 12.788 12.646 12.497 12.349 12.203 12.108 12.007 11.817 11.663 11.498 11.423 11.275 11.104 10.939 10.844 10.657 10.535 10.43 10.316 10.061 9.917 9.757 9.554 9.303 9.021 8.676 7.937 -9 ,30824 ,TETRA ,17558265,Fri Nov 26 23:40:51 CET,Sat Nov 27 01:34:19 CET,0.0 1.399 1.745 2.01 2.219 2.385 2.56 2.711 2.977 3.102 3.211 3.322 3.503 3.588 3.754 3.936 4.117 4.195 4.347 4.488 4.688 4.837 4.986 5.175 5.343 5.517 5.685 5.855 6.082 6.291 6.489 6.724 6.948 7.18 7.459 7.755 8.04 8.383 8.745 9.093 9.434 9.809 10.27 10.751 11.306 11.912 12.577 13.325 14.232 15.235 16.27 16.907 17.118 17.141 17.065 16.928 16.751 16.55 16.381 16.221 16.031 15.84 15.679 15.522 15.368 15.22 15.061 14.911 14.781 14.64 14.465 14.33 14.216 14.096 13.985 13.851 13.711 13.57 13.426 13.328 13.228 13.083 12.973 12.84 12.769 12.607 12.44 12.287 12.199 12.016 11.889 11.782 11.647 11.357 11.206 11.028 10.823 10.603 10.355 10.016 8.728 -10 ,7583 ,TETRA ,17558266,Fri Nov 26 23:40:47 CET,Sat Nov 27 01:33:36 CET,0.0 0.894 1.196 1.422 1.616 1.778 1.926 2.073 2.337 2.443 2.537 2.674 2.881 2.983 3.155 3.308 3.46 3.535 3.681 3.82 4.011 4.142 4.275 4.456 4.625 4.789 4.941 5.094 5.292 5.486 5.674 5.896 6.124 6.339 6.584 6.873 7.156 7.468 7.788 8.126 8.504 8.911 9.382 9.877 10.448 11.073 11.801 12.627 13.512 14.473 15.502 16.077 16.278 16.299 16.198 16.04 15.85 15.643 15.407 15.142 14.947 14.774 14.586 14.395 14.212 14.04 13.856 13.706 13.567 13.385 13.192 13.051 12.898 12.72 12.582 12.449 12.314 12.157 11.981 11.864 11.742 11.541 11.39 11.222 11.14 10.984 10.832 10.66 10.563 10.384 10.274 10.168 10.053 9.785 9.62 9.444 9.267 9.061 8.818 8.459 6.649 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt deleted file mode 100644 index 96261ed4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24993 ,TETRA ,17558267,Fri Nov 26 23:40:49 CET,Sat Nov 27 01:32:24 CET,0.0 0.29 0.498 0.716 0.91 1.055 1.17 1.28 1.488 1.591 1.689 1.764 1.899 1.971 2.116 2.251 2.396 2.459 2.583 2.705 2.842 2.94 3.045 3.194 3.338 3.466 3.584 3.695 3.825 3.951 4.079 4.228 4.378 4.533 4.696 4.864 5.036 5.219 5.422 5.64 5.859 6.112 6.382 6.633 6.932 7.239 7.559 7.885 8.21 8.476 8.575 8.452 8.17 7.815 7.405 7.011 6.681 6.359 6.085 5.803 5.54 5.302 5.079 4.87 4.65 4.447 4.245 4.061 3.903 3.734 3.553 3.403 3.244 3.078 2.962 2.852 2.736 2.592 2.433 2.331 2.225 2.061 1.947 1.832 1.773 1.641 1.509 1.361 1.275 1.117 1.01 0.923 0.823 0.551 0.411 0.293 0.163 -0.04 -0.302 -0.612 -1.23 -2 ,2303 ,TETRA ,17558268,Fri Nov 26 23:40:52 CET,Sat Nov 27 01:32:29 CET,0.0 0.803 1.063 1.208 1.324 1.421 1.528 1.634 1.818 1.901 1.982 2.064 2.209 2.28 2.429 2.569 2.689 2.753 2.874 2.971 3.113 3.215 3.313 3.441 3.568 3.716 3.855 3.972 4.123 4.278 4.438 4.622 4.795 4.958 5.136 5.333 5.517 5.7 5.878 6.073 6.299 6.535 6.78 7.019 7.295 7.603 7.925 8.287 8.674 8.94 8.985 8.756 8.444 8.097 7.729 7.383 7.072 6.784 6.526 6.243 5.98 5.752 5.534 5.321 5.126 4.949 4.748 4.565 4.411 4.246 4.063 3.914 3.76 3.598 3.473 3.34 3.21 3.073 2.93 2.834 2.738 2.586 2.482 2.377 2.321 2.202 2.064 1.912 1.833 1.681 1.594 1.496 1.387 1.157 1.037 0.9 0.762 0.637 0.499 0.291 -0.516 -3 ,2796 ,TETRA ,17558269,Fri Nov 26 23:40:48 CET,Sat Nov 27 01:32:37 CET,0.0 0.573 0.845 1.073 1.2 1.293 1.387 1.479 1.7 1.829 1.938 2.016 2.161 2.237 2.382 2.52 2.674 2.744 2.853 2.957 3.1 3.199 3.302 3.461 3.605 3.728 3.838 3.954 4.116 4.26 4.388 4.529 4.676 4.829 4.993 5.17 5.349 5.553 5.773 5.99 6.196 6.438 6.717 6.98 7.263 7.56 7.887 8.192 8.488 8.748 8.841 8.639 8.304 7.968 7.612 7.255 6.92 6.616 6.364 6.086 5.835 5.605 5.378 5.151 4.941 4.759 4.562 4.377 4.213 4.043 3.862 3.711 3.55 3.395 3.285 3.168 3.041 2.902 2.75 2.634 2.52 2.358 2.239 2.117 2.057 1.938 1.793 1.636 1.562 1.406 1.307 1.221 1.137 0.934 0.815 0.684 0.531 0.344 0.095 -0.155 -0.598 -4 ,3322 ,TETRA ,17558270,Fri Nov 26 23:40:49 CET,Sat Nov 27 01:32:59 CET,0.0 0.464 0.697 0.898 1.025 1.139 1.265 1.378 1.562 1.66 1.776 1.914 2.065 2.155 2.355 2.506 2.628 2.689 2.801 2.929 3.114 3.215 3.312 3.446 3.572 3.706 3.845 3.968 4.118 4.261 4.398 4.564 4.715 4.854 5.01 5.193 5.37 5.558 5.756 5.959 6.177 6.418 6.686 6.94 7.223 7.533 7.85 8.165 8.515 8.822 8.948 8.751 8.454 8.093 7.693 7.342 7.022 6.687 6.383 6.075 5.806 5.57 5.333 5.096 4.885 4.699 4.502 4.332 4.186 4.031 3.878 3.743 3.592 3.44 3.332 3.218 3.092 2.959 2.817 2.721 2.622 2.457 2.342 2.223 2.153 2.008 1.854 1.698 1.626 1.48 1.379 1.279 1.184 0.982 0.862 0.728 0.588 0.442 0.265 0.02 -0.475 -5 ,20855 ,TETRA ,17558271,Fri Nov 26 23:40:49 CET,Sat Nov 27 01:34:56 CET,0.0 0.916 1.291 1.558 1.749 1.887 2.0 2.097 2.277 2.357 2.446 2.549 2.697 2.757 2.868 2.984 3.101 3.155 3.274 3.397 3.559 3.666 3.774 3.939 4.108 4.263 4.391 4.503 4.641 4.774 4.904 5.071 5.237 5.394 5.562 5.748 5.924 6.104 6.294 6.49 6.698 6.935 7.211 7.473 7.753 8.03 8.325 8.661 8.978 9.221 9.317 9.068 8.705 8.339 7.969 7.616 7.323 7.043 6.775 6.483 6.215 5.981 5.744 5.526 5.328 5.133 4.93 4.755 4.599 4.431 4.259 4.105 3.952 3.808 3.685 3.549 3.414 3.275 3.127 3.026 2.913 2.733 2.609 2.476 2.415 2.297 2.148 1.999 1.925 1.771 1.657 1.551 1.44 1.211 1.096 0.977 0.847 0.672 0.471 0.253 -0.329 -6 ,26751 ,TETRA ,17558272,Fri Nov 26 23:40:49 CET,Sat Nov 27 01:21:15 CET,0.0 0.506 0.77 0.994 1.159 1.313 1.478 1.615 1.873 2.006 2.101 2.167 2.312 2.382 2.515 2.636 2.748 2.804 2.917 3.042 3.229 3.336 3.431 3.595 3.755 3.879 3.997 4.119 4.271 4.426 4.583 4.759 4.921 5.074 5.244 5.427 5.601 5.796 6.024 6.256 6.475 6.729 7.012 7.264 7.555 7.864 8.193 8.521 8.818 9.077 9.234 9.074 8.722 8.329 7.965 7.614 7.274 6.95 6.659 6.353 6.081 5.86 5.636 5.408 5.21 5.035 4.848 4.673 4.515 4.348 4.178 4.035 3.888 3.737 3.618 3.49 3.35 3.21 3.068 2.97 2.866 2.692 2.574 2.456 2.396 2.264 2.12 1.979 1.905 1.748 1.627 1.531 1.427 1.171 1.018 0.857 0.697 0.546 0.367 0.098 -0.474 -7 ,2414 ,TETRA ,17558273,Fri Nov 26 23:41:30 CET,Sat Nov 27 01:32:53 CET,0.0 0.8 1.084 1.315 1.465 1.613 1.77 1.908 2.11 2.199 2.287 2.378 2.532 2.609 2.769 2.91 3.029 3.099 3.223 3.321 3.478 3.583 3.68 3.822 3.953 4.079 4.196 4.312 4.475 4.619 4.745 4.897 5.047 5.2 5.371 5.554 5.725 5.91 6.106 6.315 6.531 6.764 7.027 7.273 7.569 7.891 8.224 8.574 8.924 9.214 9.351 9.164 8.811 8.428 8.056 7.672 7.343 7.057 6.786 6.515 6.288 6.069 5.838 5.617 5.42 5.234 5.034 4.848 4.689 4.533 4.36 4.209 4.052 3.878 3.75 3.621 3.476 3.33 3.177 3.067 2.961 2.799 2.688 2.58 2.522 2.392 2.246 2.074 1.989 1.84 1.745 1.653 1.562 1.376 1.266 1.14 0.999 0.817 0.56 0.27 -0.328 -8 ,23613 ,TETRA ,17558274,Fri Nov 26 23:41:32 CET,Sat Nov 27 01:32:59 CET,0.0 0.836 1.079 1.265 1.449 1.599 1.718 1.837 2.044 2.134 2.218 2.272 2.408 2.475 2.627 2.766 2.875 2.934 3.044 3.146 3.298 3.399 3.509 3.666 3.791 3.914 4.036 4.151 4.304 4.442 4.57 4.733 4.884 5.032 5.206 5.39 5.574 5.79 6.001 6.205 6.443 6.691 6.946 7.205 7.482 7.765 8.099 8.458 8.805 9.075 9.211 9.055 8.714 8.344 7.989 7.664 7.353 7.063 6.816 6.546 6.282 6.048 5.825 5.604 5.409 5.232 5.035 4.847 4.686 4.536 4.376 4.233 4.091 3.938 3.816 3.695 3.564 3.418 3.258 3.153 3.044 2.878 2.762 2.634 2.571 2.438 2.296 2.144 2.06 1.902 1.788 1.679 1.581 1.385 1.266 1.134 0.974 0.823 0.632 0.373 -0.467 -9 ,16855 ,TETRA ,17558275,Fri Nov 26 23:41:34 CET,Sat Nov 27 01:34:36 CET,0.0 0.671 1.016 1.207 1.372 1.544 1.697 1.821 2.057 2.165 2.257 2.355 2.504 2.579 2.72 2.851 2.98 3.041 3.184 3.323 3.493 3.594 3.685 3.828 3.968 4.092 4.213 4.329 4.469 4.613 4.753 4.912 5.065 5.209 5.377 5.566 5.739 5.934 6.148 6.357 6.576 6.826 7.093 7.362 7.669 7.966 8.296 8.621 8.897 9.136 9.212 8.947 8.614 8.246 7.86 7.487 7.15 6.84 6.553 6.257 5.995 5.768 5.538 5.308 5.107 4.921 4.722 4.54 4.383 4.218 4.035 3.887 3.735 3.558 3.411 3.263 3.125 2.986 2.833 2.725 2.612 2.426 2.297 2.168 2.105 1.974 1.837 1.703 1.631 1.474 1.365 1.283 1.2 0.996 0.867 0.718 0.569 0.4 0.184 -0.044 -0.715 -10 ,22974 ,TETRA ,17558276,Fri Nov 26 23:41:30 CET,Sat Nov 27 01:33:04 CET,0.0 0.283 0.516 0.681 0.816 0.945 1.081 1.21 1.425 1.52 1.619 1.761 1.945 2.052 2.248 2.425 2.596 2.668 2.784 2.887 3.047 3.148 3.239 3.371 3.489 3.599 3.708 3.81 3.95 4.11 4.254 4.406 4.556 4.705 4.866 5.049 5.232 5.423 5.621 5.831 6.048 6.279 6.571 6.851 7.116 7.418 7.773 8.133 8.445 8.655 8.752 8.574 8.26 7.886 7.506 7.138 6.808 6.516 6.256 5.966 5.681 5.443 5.213 4.979 4.782 4.606 4.408 4.227 4.077 3.912 3.727 3.573 3.415 3.237 3.089 2.941 2.788 2.622 2.453 2.344 2.237 2.066 1.933 1.792 1.718 1.568 1.424 1.273 1.203 1.05 0.933 0.837 0.747 0.571 0.466 0.344 0.197 0.036 -0.158 -0.433 -1.203 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index 896b9839..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24418 ,TETRA ,17558277,Fri Nov 26 23:41:33 CET,Sat Nov 27 01:42:01 CET,0.0 0.607 0.77 0.941 1.088 1.179 1.255 1.33 1.461 1.514 1.556 1.396 1.672 1.701 1.745 1.777 1.812 1.827 1.855 1.892 1.929 1.934 1.944 1.977 2.008 2.023 2.018 2.014 2.032 2.056 2.073 2.083 2.085 2.077 2.034 1.932 1.8 1.631 1.449 1.242 0.966 0.583 0.084 -0.48 -1.157 -1.987 -3.204 -4.921 -7.389 -11.009 -16.701 -23.201 -28.385 -32.656 -36.137 -39.046 -41.523 -43.697 -45.494 -47.24 -48.707 -49.985 -51.189 -52.314 -53.338 -54.282 -55.261 -56.107 -56.843 -57.6 -58.365 -58.977 -59.612 -60.262 -60.762 -61.279 -61.814 -62.364 -62.937 -63.337 -63.756 -64.439 -64.906 -65.392 -65.641 -66.136 -66.632 -67.137 -67.41 -67.987 -68.245 -68.535 -68.827 -69.506 -69.882 -70.289 -70.725 -71.255 -71.873 -72.659 -75.769 -2 ,25065 ,TETRA ,17558278,Fri Nov 26 23:41:35 CET,Sat Nov 27 01:41:59 CET,0.0 1.653 1.825 1.916 2.017 2.106 2.172 2.238 2.36 2.406 2.451 2.307 2.572 2.586 2.601 2.616 2.63 2.636 2.649 2.679 2.754 2.795 2.823 2.855 2.869 2.875 2.888 2.888 2.909 2.941 2.944 2.912 2.852 2.791 2.699 2.609 2.528 2.374 2.182 1.981 1.722 1.376 0.925 0.377 -0.375 -1.406 -2.791 -4.553 -7.003 -10.586 -16.311 -22.785 -27.843 -32.011 -35.424 -38.316 -40.74 -42.866 -44.673 -46.414 -47.871 -49.156 -50.345 -51.45 -52.462 -53.371 -54.316 -55.142 -55.836 -56.545 -57.275 -57.858 -58.467 -59.114 -59.605 -60.122 -60.675 -61.246 -61.861 -62.295 -62.715 -63.349 -63.78 -64.225 -64.459 -64.933 -65.438 -65.981 -66.248 -66.831 -67.111 -67.416 -67.734 -68.448 -68.831 -69.217 -69.631 -70.119 -70.679 -71.391 -75.118 -3 ,15699 ,TETRA ,17558279,Fri Nov 26 23:41:30 CET,Sat Nov 27 01:40:13 CET,0.0 1.003 1.277 1.44 1.55 1.628 1.69 1.751 1.875 1.946 2.017 1.897 2.186 2.228 2.293 2.348 2.407 2.434 2.493 2.535 2.55 2.556 2.571 2.607 2.631 2.648 2.666 2.684 2.705 2.71 2.687 2.631 2.575 2.518 2.441 2.344 2.225 2.033 1.822 1.594 1.304 0.927 0.401 -0.191 -0.978 -1.952 -3.296 -5.13 -7.651 -11.219 -16.848 -23.265 -28.226 -32.268 -35.598 -38.515 -40.999 -43.117 -44.881 -46.612 -48.094 -49.368 -50.528 -51.61 -52.6 -53.498 -54.415 -55.208 -55.894 -56.623 -57.371 -57.975 -58.585 -59.216 -59.705 -60.196 -60.727 -61.287 -61.822 -62.185 -62.577 -63.197 -63.621 -64.062 -64.282 -64.716 -65.184 -65.695 -65.959 -66.523 -66.763 -67.056 -67.359 -68.015 -68.395 -68.808 -69.224 -69.667 -70.162 -70.831 -73.671 -4 ,22297 ,TETRA ,17558280,Fri Nov 26 23:41:32 CET,Sat Nov 27 01:40:27 CET,0.0 0.411 0.599 0.763 0.885 0.983 1.093 1.193 1.31 1.369 1.434 1.28 1.562 1.6 1.679 1.749 1.8 1.813 1.835 1.855 1.888 1.915 1.936 1.955 1.965 1.956 1.949 1.934 1.919 1.918 1.905 1.86 1.785 1.7 1.62 1.532 1.414 1.258 1.04 0.789 0.508 0.13 -0.37 -0.911 -1.629 -2.589 -3.917 -5.695 -8.092 -11.572 -17.269 -23.729 -28.768 -32.811 -36.19 -39.081 -41.478 -43.585 -45.356 -47.108 -48.586 -49.885 -51.072 -52.145 -53.162 -54.077 -55.015 -55.866 -56.581 -57.294 -58.021 -58.619 -59.244 -59.878 -60.368 -60.894 -61.42 -61.953 -62.504 -62.865 -63.243 -63.842 -64.26 -64.675 -64.889 -65.374 -65.896 -66.435 -66.708 -67.305 -67.56 -67.855 -68.139 -68.772 -69.125 -69.5 -69.965 -70.469 -71.034 -71.777 -74.403 -5 ,13375 ,TETRA ,17558281,Fri Nov 26 23:41:34 CET,Sat Nov 27 01:29:05 CET,0.0 0.348 0.49 0.609 0.726 0.818 0.897 0.981 1.146 1.219 1.284 1.176 1.472 1.524 1.604 1.704 1.798 1.84 1.923 1.981 2.048 2.092 2.141 2.221 2.296 2.364 2.446 2.525 2.602 2.65 2.667 2.668 2.655 2.615 2.526 2.421 2.337 2.247 2.138 1.975 1.726 1.366 0.875 0.298 -0.473 -1.448 -2.764 -4.503 -6.946 -10.578 -16.283 -22.771 -27.76 -31.772 -35.183 -38.161 -40.65 -42.789 -44.574 -46.322 -47.787 -49.067 -50.304 -51.454 -52.507 -53.482 -54.495 -55.363 -56.077 -56.795 -57.523 -58.111 -58.711 -59.325 -59.818 -60.341 -60.859 -61.379 -61.914 -62.284 -62.668 -63.273 -63.686 -64.131 -64.362 -64.8 -65.258 -65.762 -66.01 -66.576 -66.886 -67.217 -67.56 -68.256 -68.598 -68.975 -69.417 -69.918 -70.5 -71.229 -74.626 -6 ,18276 ,TETRA ,17558282,Fri Nov 26 23:41:32 CET,Sat Nov 27 01:42:50 CET,0.0 0.393 0.554 0.705 0.86 0.969 1.042 1.137 1.315 1.373 1.421 1.276 1.558 1.599 1.664 1.729 1.798 1.836 1.908 1.966 2.023 2.06 2.085 2.114 2.127 2.143 2.164 2.167 2.161 2.159 2.133 2.062 2.017 1.976 1.899 1.782 1.633 1.453 1.229 0.953 0.646 0.282 -0.201 -0.792 -1.577 -2.589 -3.949 -5.758 -8.284 -11.904 -17.721 -24.348 -29.445 -33.525 -36.863 -39.691 -42.091 -44.222 -46.011 -47.752 -49.236 -50.564 -51.807 -52.936 -53.95 -54.861 -55.821 -56.658 -57.346 -58.04 -58.759 -59.381 -60.039 -60.695 -61.183 -61.682 -62.19 -62.714 -63.252 -63.632 -64.037 -64.671 -65.1 -65.522 -65.743 -66.197 -66.644 -67.114 -67.367 -67.929 -68.16 -68.458 -68.759 -69.369 -69.735 -70.138 -70.569 -71.059 -71.646 -72.384 -74.919 -7 ,6595 ,TETRA ,17558283,Fri Nov 26 23:41:34 CET,Sat Nov 27 01:43:22 CET,0.0 1.022 1.275 1.465 1.624 1.753 1.849 1.916 2.003 2.053 2.121 2.014 2.289 2.318 2.38 2.442 2.5 2.529 2.572 2.606 2.669 2.706 2.73 2.765 2.795 2.812 2.83 2.852 2.87 2.878 2.869 2.823 2.75 2.683 2.608 2.507 2.399 2.256 2.06 1.818 1.532 1.187 0.698 0.092 -0.693 -1.692 -2.996 -4.701 -7.082 -10.575 -16.31 -22.965 -28.074 -32.244 -35.674 -38.578 -41.03 -43.16 -44.953 -46.681 -48.115 -49.377 -50.574 -51.672 -52.651 -53.523 -54.443 -55.273 -55.973 -56.676 -57.402 -58.002 -58.635 -59.293 -59.797 -60.303 -60.806 -61.318 -61.848 -62.218 -62.595 -63.161 -63.57 -63.995 -64.21 -64.67 -65.153 -65.668 -65.925 -66.479 -66.686 -66.968 -67.258 -67.913 -68.304 -68.723 -69.206 -69.719 -70.257 -70.983 -73.661 -8 ,15045 ,TETRA ,17558284,Fri Nov 26 23:41:35 CET,Sat Nov 27 01:28:53 CET,0.0 0.493 0.683 0.824 0.947 1.029 1.086 1.147 1.27 1.312 1.346 1.179 1.456 1.481 1.521 1.573 1.611 1.63 1.667 1.693 1.722 1.736 1.752 1.782 1.808 1.816 1.814 1.815 1.815 1.797 1.786 1.779 1.735 1.676 1.6 1.49 1.377 1.221 1.003 0.748 0.446 0.054 -0.448 -1.03 -1.811 -2.822 -4.17 -5.917 -8.361 -11.934 -17.707 -24.24 -29.335 -33.434 -36.786 -39.683 -42.132 -44.272 -46.079 -47.861 -49.344 -50.611 -51.839 -52.994 -54.022 -54.974 -55.918 -56.703 -57.4 -58.135 -58.892 -59.511 -60.123 -60.735 -61.219 -61.72 -62.247 -62.78 -63.318 -63.691 -64.082 -64.687 -65.092 -65.524 -65.746 -66.216 -66.717 -67.215 -67.474 -68.044 -68.279 -68.556 -68.834 -69.496 -69.881 -70.288 -70.686 -71.151 -71.813 -72.727 -75.176 -9 ,22177 ,TETRA ,17558285,Fri Nov 26 23:41:32 CET,Sat Nov 27 01:34:19 CET,0.0 0.709 0.898 1.027 1.134 1.212 1.28 1.335 1.435 1.484 1.549 1.454 1.749 1.816 1.948 2.029 2.069 2.099 2.18 2.249 2.33 2.37 2.404 2.44 2.469 2.493 2.512 2.529 2.559 2.56 2.525 2.476 2.424 2.356 2.283 2.194 2.068 1.924 1.756 1.531 1.254 0.921 0.434 -0.16 -0.93 -1.878 -3.121 -4.85 -7.357 -11.072 -16.973 -23.627 -28.832 -33.039 -36.497 -39.509 -41.995 -44.139 -45.971 -47.73 -49.204 -50.506 -51.709 -52.817 -53.837 -54.771 -55.74 -56.565 -57.281 -58.047 -58.862 -59.534 -60.189 -60.864 -61.398 -61.943 -62.502 -63.077 -63.651 -64.03 -64.425 -65.059 -65.509 -65.951 -66.176 -66.641 -67.101 -67.615 -67.893 -68.467 -68.766 -69.117 -69.48 -70.144 -70.482 -70.874 -71.348 -71.888 -72.522 -73.471 -77.014 -10 ,7088 ,TETRA ,17558286,Fri Nov 26 23:41:34 CET,Sat Nov 27 01:30:36 CET,0.0 0.968 1.142 1.237 1.34 1.441 1.513 1.596 1.733 1.777 1.824 1.672 1.957 2.001 2.068 2.125 2.179 2.219 2.323 2.412 2.501 2.542 2.58 2.642 2.684 2.696 2.713 2.736 2.768 2.805 2.83 2.827 2.81 2.767 2.706 2.647 2.559 2.416 2.243 2.032 1.764 1.425 1.01 0.504 -0.233 -1.197 -2.474 -4.11 -6.449 -10.177 -16.201 -22.743 -27.85 -31.98 -35.369 -38.308 -40.771 -42.885 -44.692 -46.493 -48.011 -49.339 -50.557 -51.679 -52.709 -53.609 -54.551 -55.397 -56.095 -56.807 -57.526 -58.117 -58.726 -59.354 -59.833 -60.32 -60.828 -61.351 -61.91 -62.298 -62.679 -63.259 -63.659 -64.067 -64.282 -64.731 -65.198 -65.69 -65.938 -66.516 -66.803 -67.09 -67.387 -68.035 -68.396 -68.781 -69.203 -69.722 -70.366 -71.155 -75.103 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt deleted file mode 100644 index c94f3dec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11808 ,TETRA ,17558287,Fri Nov 26 23:45:28 CET,Sat Nov 27 01:47:12 CET,0.0 1.483 1.906 2.215 2.46 2.662 2.858 3.062 3.425 3.592 3.751 3.791 4.175 4.309 4.57 4.794 4.991 5.09 5.286 5.492 5.785 5.952 6.108 6.341 6.572 6.785 6.977 7.179 7.482 7.782 8.047 8.355 8.623 8.859 9.161 9.52 9.858 10.201 10.554 10.924 11.309 11.748 12.261 12.767 13.345 13.936 14.552 15.194 15.796 16.277 16.463 16.014 15.218 14.324 13.432 12.603 11.842 11.114 10.47 9.823 9.276 8.776 8.278 7.798 7.337 6.923 6.499 6.085 5.72 5.341 4.936 4.61 4.282 3.943 3.678 3.406 3.115 2.79 2.451 2.207 1.945 1.538 1.244 0.947 0.799 0.495 0.163 -0.173 -0.345 -0.774 -0.943 -1.167 -1.386 -1.864 -2.171 -2.534 -2.914 -3.339 -3.877 -4.575 -6.679 -2 ,16425 ,TETRA ,17558288,Fri Nov 26 23:51:26 CET,Sat Nov 27 01:52:09 CET,0.0 0.91 1.349 1.747 2.011 2.217 2.418 2.624 2.974 3.126 3.261 3.279 3.669 3.808 4.077 4.332 4.571 4.686 4.922 5.146 5.442 5.613 5.784 6.045 6.285 6.507 6.726 6.936 7.185 7.438 7.693 7.982 8.244 8.509 8.837 9.179 9.492 9.826 10.187 10.597 11.013 11.439 11.899 12.369 12.914 13.426 13.956 14.567 15.152 15.605 15.721 15.28 14.604 13.737 12.848 12.034 11.325 10.662 10.039 9.38 8.8 8.282 7.791 7.316 6.843 6.397 5.939 5.541 5.202 4.827 4.421 4.108 3.788 3.438 3.167 2.878 2.568 2.227 1.859 1.597 1.329 0.93 0.639 0.328 0.182 -0.129 -0.485 -0.878 -1.075 -1.503 -1.695 -1.938 -2.178 -2.67 -2.956 -3.313 -3.733 -4.203 -4.714 -5.473 -9.029 -3 ,4588 ,TETRA ,17558289,Fri Nov 26 23:51:29 CET,Sat Nov 27 01:51:39 CET,0.0 1.876 2.357 2.77 3.075 3.335 3.582 3.811 4.154 4.311 4.469 4.522 4.891 5.024 5.278 5.544 5.82 5.946 6.168 6.349 6.632 6.835 7.03 7.296 7.545 7.794 8.043 8.268 8.508 8.733 8.96 9.222 9.482 9.756 10.064 10.372 10.678 11.019 11.35 11.698 12.066 12.48 12.965 13.414 13.962 14.575 15.22 15.911 16.613 17.155 17.317 16.85 16.116 15.315 14.502 13.711 12.952 12.192 11.512 10.837 10.229 9.647 9.036 8.417 7.847 7.345 6.824 6.366 5.98 5.559 5.113 4.746 4.39 4.016 3.694 3.345 2.984 2.629 2.281 2.031 1.753 1.343 1.084 0.807 0.657 0.333 -0.028 -0.43 -0.639 -1.084 -1.324 -1.585 -1.851 -2.436 -2.774 -3.142 -3.553 -3.984 -4.486 -5.227 -8.15 -4 ,11592 ,TETRA ,17558290,Fri Nov 26 23:52:26 CET,Sat Nov 27 01:52:50 CET,0.0 1.292 1.753 2.1 2.42 2.68 2.903 3.109 3.465 3.631 3.792 3.878 4.26 4.397 4.631 4.853 5.09 5.208 5.42 5.607 5.883 6.074 6.258 6.536 6.828 7.117 7.377 7.607 7.902 8.183 8.493 8.903 9.271 9.592 9.923 10.241 10.522 10.854 11.212 11.585 11.962 12.393 12.878 13.308 13.855 14.459 15.04 15.584 16.146 16.61 16.693 16.196 15.397 14.539 13.743 12.947 12.174 11.459 10.796 10.147 9.621 9.121 8.627 8.152 7.669 7.231 6.804 6.404 6.063 5.706 5.294 4.936 4.548 4.137 3.815 3.452 3.043 2.638 2.25 1.993 1.735 1.334 1.044 0.769 0.625 0.279 -0.095 -0.469 -0.652 -1.068 -1.256 -1.492 -1.75 -2.324 -2.626 -2.932 -3.313 -3.82 -4.356 -4.988 -7.541 -5 ,12541 ,TETRA ,17558291,Fri Nov 26 23:52:26 CET,Sat Nov 27 01:56:11 CET,0.0 1.474 1.859 2.231 2.537 2.79 3.013 3.202 3.548 3.711 3.879 3.96 4.321 4.442 4.673 4.901 5.123 5.233 5.46 5.715 6.107 6.333 6.547 6.864 7.16 7.435 7.668 7.878 8.179 8.488 8.78 9.145 9.48 9.769 10.111 10.485 10.832 11.219 11.631 12.05 12.459 12.918 13.437 13.941 14.513 15.055 15.577 16.146 16.715 17.198 17.412 17.062 16.442 15.606 14.777 13.988 13.238 12.543 11.912 11.252 10.666 10.132 9.618 9.114 8.67 8.26 7.774 7.325 6.956 6.593 6.214 5.885 5.528 5.149 4.859 4.565 4.246 3.92 3.588 3.344 3.094 2.716 2.455 2.176 2.033 1.733 1.404 1.029 0.832 0.397 0.188 -0.061 -0.316 -0.834 -1.119 -1.448 -1.816 -2.219 -2.776 -3.579 -7.141 -6 ,5818 ,TETRA ,17558292,Fri Nov 26 23:54:25 CET,Sat Nov 27 01:54:02 CET,0.0 2.677 3.19 3.504 3.813 4.063 4.275 4.457 4.768 4.913 5.049 5.065 5.432 5.554 5.783 6.009 6.254 6.372 6.571 6.759 7.032 7.195 7.342 7.589 7.83 8.049 8.26 8.463 8.736 8.981 9.211 9.51 9.792 10.057 10.36 10.721 11.073 11.421 11.765 12.141 12.548 12.984 13.456 13.893 14.347 14.854 15.443 16.092 16.755 17.336 17.489 16.968 16.186 15.32 14.485 13.602 12.785 12.055 11.426 10.801 10.247 9.719 9.203 8.74 8.311 7.896 7.443 7.034 6.693 6.336 5.925 5.563 5.2 4.828 4.525 4.221 3.908 3.573 3.24 3.015 2.771 2.351 2.051 1.729 1.557 1.231 0.926 0.608 0.426 -0.012 -0.208 -0.458 -0.72 -1.252 -1.54 -1.903 -2.333 -2.829 -3.47 -4.374 -7.365 -7 ,29037 ,TETRA ,17558293,Fri Nov 26 23:54:28 CET,Sat Nov 27 01:54:21 CET,0.0 2.065 2.485 2.799 3.073 3.319 3.525 3.704 4.043 4.203 4.356 4.404 4.764 4.89 5.14 5.37 5.593 5.71 5.933 6.143 6.444 6.624 6.795 7.05 7.312 7.582 7.853 8.107 8.416 8.723 9.02 9.36 9.655 9.904 10.188 10.497 10.762 11.047 11.432 11.857 12.251 12.671 13.13 13.591 14.073 14.618 15.273 15.904 16.506 17.006 17.207 16.779 16.056 15.22 14.345 13.512 12.789 12.119 11.478 10.782 10.166 9.62 9.075 8.493 7.928 7.424 6.889 6.394 5.971 5.558 5.121 4.761 4.384 3.973 3.652 3.32 2.967 2.603 2.234 1.995 1.738 1.307 1.015 0.701 0.543 0.224 -0.141 -0.546 -0.752 -1.191 -1.395 -1.623 -1.866 -2.398 -2.721 -3.06 -3.425 -3.872 -4.436 -5.178 -9.254 -8 ,32237 ,TETRA ,17558294,Fri Nov 26 23:54:30 CET,Sat Nov 27 01:53:51 CET,0.0 2.415 2.938 3.277 3.562 3.812 4.032 4.234 4.593 4.761 4.916 4.975 5.34 5.471 5.735 5.957 6.156 6.251 6.443 6.659 7.005 7.217 7.405 7.656 7.881 8.095 8.301 8.509 8.787 9.046 9.287 9.563 9.831 10.105 10.437 10.811 11.146 11.488 11.83 12.195 12.581 12.982 13.449 13.95 14.51 15.068 15.68 16.326 16.886 17.305 17.477 16.906 15.989 15.152 14.359 13.569 12.914 12.279 11.667 11.02 10.424 9.898 9.407 8.914 8.45 8.019 7.559 7.151 6.788 6.417 6.026 5.707 5.37 5.005 4.723 4.429 4.141 3.848 3.529 3.299 3.052 2.655 2.379 2.105 1.96 1.649 1.34 1.018 0.83 0.407 0.239 0.023 -0.225 -0.785 -1.091 -1.439 -1.825 -2.264 -2.802 -3.443 -6.501 -9 ,9373 ,TETRA ,17558295,Fri Nov 26 23:54:26 CET,Sat Nov 27 01:55:18 CET,0.0 2.071 2.546 2.882 3.108 3.326 3.535 3.709 4.012 4.163 4.309 4.339 4.705 4.813 5.027 5.233 5.467 5.589 5.796 5.972 6.215 6.378 6.547 6.818 7.067 7.294 7.524 7.739 8.04 8.328 8.579 8.873 9.146 9.403 9.715 10.073 10.4 10.767 11.156 11.547 11.938 12.345 12.808 13.288 13.839 14.405 14.979 15.514 16.033 16.473 16.589 16.054 15.247 14.363 13.519 12.722 11.96 11.214 10.568 9.907 9.315 8.803 8.317 7.829 7.367 6.948 6.492 6.087 5.738 5.358 4.964 4.624 4.251 3.872 3.589 3.291 2.993 2.69 2.337 2.077 1.816 1.391 1.094 0.815 0.666 0.337 0.002 -0.356 -0.543 -0.971 -1.162 -1.403 -1.682 -2.297 -2.62 -2.99 -3.426 -3.933 -4.503 -5.246 -7.539 -10 ,21914 ,TETRA ,17558296,Fri Nov 26 23:55:25 CET,Sat Nov 27 01:54:21 CET,0.0 1.999 2.439 2.791 3.099 3.374 3.613 3.808 4.184 4.363 4.543 4.633 5.004 5.137 5.361 5.586 5.816 5.941 6.173 6.366 6.678 6.879 7.048 7.302 7.586 7.877 8.145 8.378 8.676 8.975 9.245 9.552 9.849 10.143 10.483 10.858 11.195 11.545 11.911 12.28 12.659 13.076 13.545 14.005 14.508 15.079 15.741 16.425 17.03 17.426 17.515 16.907 16.025 15.187 14.365 13.567 12.8 11.979 11.198 10.371 9.655 9.021 8.39 7.802 7.237 6.708 6.148 5.634 5.197 4.754 4.306 3.923 3.535 3.138 2.834 2.529 2.173 1.79 1.418 1.154 0.868 0.419 0.122 -0.18 -0.347 -0.704 -1.053 -1.409 -1.595 -2.026 -2.219 -2.427 -2.656 -3.192 -3.479 -3.798 -4.149 -4.553 -5.099 -5.898 -9.863 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt deleted file mode 100644 index d12e4024..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,11039 ,TETRA ,17558298,Sat Nov 27 00:00:29 CET,Sat Nov 27 02:04:51 CET,0.0 3.214 3.846 4.257 4.596 4.931 5.221 5.474 5.927 6.107 6.258 6.382 6.654 6.764 6.983 7.165 7.321 7.398 7.543 7.681 7.885 8.006 8.137 8.338 8.512 8.708 8.913 9.071 9.214 9.317 9.399 9.505 9.587 9.668 9.787 9.919 9.955 9.945 9.969 9.883 9.681 9.309 8.652 7.866 6.791 5.326 3.356 0.75 -2.92 -8.193 -16.421 -25.657 -32.784 -38.45 -43.157 -47.188 -50.659 -53.69 -56.133 -58.559 -60.676 -62.599 -64.429 -66.111 -67.645 -69.0 -70.381 -71.583 -72.599 -73.661 -74.782 -75.687 -76.574 -77.479 -78.194 -78.92 -79.672 -80.475 -81.281 -81.832 -82.433 -83.365 -83.974 -84.563 -84.867 -85.564 -86.322 -87.097 -87.523 -88.233 -88.861 -89.323 -89.802 -90.894 -91.474 -92.101 -92.763 -93.506 -94.504 -95.962 -102.485 -3 ,9259 ,TETRA ,17558299,Sat Nov 27 00:00:27 CET,Sat Nov 27 01:59:08 CET,0.0 3.525 4.17 4.57 4.91 5.193 5.425 5.642 6.023 6.165 6.308 6.439 6.734 6.88 7.137 7.363 7.57 7.674 7.889 8.093 8.375 8.544 8.701 8.906 9.082 9.225 9.326 9.439 9.576 9.682 9.802 9.919 9.999 10.051 10.03 9.945 9.858 9.708 9.447 9.117 8.749 8.271 7.569 6.731 5.595 4.109 2.108 -0.438 -3.97 -9.3 -17.644 -26.846 -34.192 -40.481 -45.77 -50.167 -53.762 -56.935 -59.653 -62.336 -64.554 -66.509 -68.36 -70.041 -71.602 -73.015 -74.53 -75.908 -77.024 -78.109 -79.223 -80.142 -81.088 -82.072 -82.833 -83.652 -84.546 -85.481 -86.418 -87.049 -87.681 -88.654 -89.325 -90.037 -90.42 -91.213 -92.031 -92.89 -93.323 -94.017 -94.691 -95.23 -95.771 -96.888 -97.484 -98.158 -98.945 -99.838 -100.933 -102.35 -110.451 -5 ,2333 ,TETRA ,17558301,Sat Nov 27 00:07:22 CET,Sat Nov 27 02:10:06 CET,0.0 2.827 3.286 3.673 3.97 4.208 4.388 4.549 4.864 5.005 5.14 5.264 5.523 5.634 5.887 6.096 6.251 6.318 6.442 6.558 6.714 6.812 6.904 7.014 7.083 7.133 7.208 7.287 7.358 7.399 7.414 7.414 7.394 7.339 7.236 7.092 6.922 6.706 6.451 6.117 5.661 5.082 4.282 3.328 2.083 0.499 -1.55 -4.101 -7.765 -13.335 -22.012 -31.682 -39.104 -45.095 -50.055 -54.449 -58.349 -61.758 -64.519 -67.091 -69.163 -70.951 -72.639 -74.219 -75.659 -76.972 -78.331 -79.533 -80.557 -81.564 -82.604 -83.483 -84.364 -85.293 -86.009 -86.715 -87.449 -88.2 -88.951 -89.479 -90.032 -90.85 -91.426 -92.022 -92.323 -92.932 -93.573 -94.261 -94.614 -95.244 -95.756 -96.167 -96.622 -97.641 -98.206 -98.823 -99.504 -100.241 -101.09 -102.304 -112.215 -7 ,11399 ,TETRA ,17558303,Sat Nov 27 00:10:21 CET,Sat Nov 27 02:08:25 CET,0.0 5.743 6.462 6.944 7.26 7.487 7.695 7.881 8.206 8.373 8.519 8.623 8.911 9.018 9.187 9.375 9.558 9.623 9.744 9.882 10.074 10.177 10.267 10.399 10.53 10.649 10.751 10.852 10.972 11.067 11.154 11.259 11.338 11.393 11.471 11.549 11.604 11.56 11.4 11.279 11.07 10.654 10.064 9.401 8.41 6.971 5.001 2.335 -1.346 -6.722 -15.253 -24.7 -32.006 -38.092 -43.136 -47.41 -50.978 -54.186 -56.933 -59.566 -61.779 -63.775 -65.78 -67.681 -69.341 -70.809 -72.325 -73.665 -74.806 -75.97 -77.149 -78.14 -79.191 -80.251 -81.077 -81.938 -82.827 -83.717 -84.609 -85.198 -85.787 -86.732 -87.398 -88.094 -88.444 -89.157 -89.914 -90.731 -91.156 -91.862 -92.505 -92.987 -93.513 -94.683 -95.348 -96.106 -96.918 -97.776 -98.872 -100.376 -108.644 -8 ,19970 ,TETRA ,17558304,Sat Nov 27 00:10:21 CET,Sat Nov 27 02:00:34 CET,0.0 2.855 3.449 3.833 4.164 4.446 4.688 4.894 5.211 5.358 5.488 5.547 5.819 5.923 6.105 6.273 6.431 6.499 6.603 6.698 6.827 6.9 6.976 7.071 7.115 7.14 7.153 7.162 7.19 7.212 7.214 7.194 7.143 7.092 7.012 6.855 6.68 6.445 6.139 5.74 5.259 4.664 3.874 2.996 1.852 0.409 -1.547 -4.214 -7.953 -13.406 -22.01 -31.619 -39.039 -45.038 -50.025 -54.356 -57.987 -61.113 -63.717 -66.246 -68.39 -70.151 -71.726 -73.235 -74.658 -75.989 -77.385 -78.609 -79.617 -80.614 -81.665 -82.543 -83.44 -84.377 -85.083 -85.793 -86.529 -87.339 -88.156 -88.681 -89.261 -90.146 -90.737 -91.348 -91.652 -92.284 -92.941 -93.648 -94.03 -94.686 -95.28 -95.741 -96.216 -97.246 -97.8 -98.407 -99.054 -99.786 -100.703 -102.09 -107.223 -10 ,18330 ,TETRA ,17558306,Sat Nov 27 00:16:21 CET,Sat Nov 27 02:07:39 CET,0.0 2.976 3.497 3.891 4.24 4.507 4.742 4.96 5.335 5.511 5.693 5.864 6.143 6.263 6.477 6.692 6.891 6.974 7.137 7.289 7.518 7.678 7.831 8.016 8.16 8.283 8.39 8.469 8.561 8.671 8.773 8.851 8.907 8.955 8.981 9.005 9.042 9.04 8.984 8.829 8.54 8.16 7.631 6.998 6.112 4.975 3.485 1.483 -1.426 -6.266 -15.069 -25.317 -33.305 -39.778 -44.86 -49.072 -52.659 -55.756 -58.321 -60.842 -62.933 -64.779 -66.5 -68.118 -69.643 -70.948 -72.277 -73.465 -74.457 -75.472 -76.527 -77.396 -78.303 -79.243 -79.968 -80.7 -81.419 -82.12 -82.876 -83.424 -84.006 -84.905 -85.521 -86.123 -86.422 -87.102 -87.791 -88.481 -88.847 -89.49 -90.021 -90.438 -90.905 -91.911 -92.434 -93.004 -93.625 -94.375 -95.351 -96.685 -100.96 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt deleted file mode 100644 index 9b2e70d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,12390 ,TETRA ,17558308,Sat Nov 27 00:18:20 CET,Sat Nov 27 02:18:51 CET,0.0 5.122 5.955 6.533 6.968 7.374 7.736 8.062 8.683 8.964 9.226 9.568 9.966 10.216 10.698 11.139 11.577 11.796 12.201 12.585 13.136 13.491 13.844 14.353 14.851 15.328 15.782 16.245 16.862 17.404 17.883 18.443 19.003 19.586 20.252 20.976 21.654 22.38 23.226 24.139 24.975 25.896 26.962 27.894 28.876 29.892 30.993 32.012 32.933 33.7 33.772 32.877 31.663 30.378 29.108 27.993 26.964 25.937 25.02 24.091 23.283 22.492 21.705 21.035 20.407 19.8 19.168 18.599 18.089 17.501 16.866 16.332 15.771 15.174 14.682 14.19 13.701 13.195 12.666 12.275 11.858 11.219 10.808 10.384 10.152 9.681 9.187 8.633 8.33 7.855 7.26 6.872 6.487 5.67 5.233 4.735 4.177 3.466 2.527 1.233 -12.175 -3 ,24162 ,TETRA ,17558309,Sat Nov 27 00:18:22 CET,Sat Nov 27 02:18:51 CET,0.0 3.087 3.795 4.348 4.802 5.146 5.456 5.752 6.302 6.566 6.818 7.154 7.532 7.751 8.178 8.564 8.907 9.087 9.466 9.849 10.419 10.769 11.094 11.606 12.129 12.613 13.066 13.505 14.046 14.558 15.066 15.672 16.256 16.869 17.634 18.517 19.283 20.018 20.826 21.643 22.463 23.351 24.298 25.21 26.3 27.472 28.686 29.751 30.741 31.609 31.789 31.028 29.908 28.675 27.364 26.113 25.059 24.102 23.215 22.191 21.289 20.571 19.884 19.191 18.506 17.898 17.295 16.713 16.211 15.72 15.187 14.719 14.215 13.663 13.229 12.79 12.337 11.878 11.362 10.957 10.547 9.958 9.538 9.07 8.841 8.339 7.813 7.257 6.962 6.525 6.041 5.712 5.359 4.58 4.115 3.592 2.961 2.155 1.179 -0.061 -5.111 -4 ,27685 ,TETRA ,17558310,Sat Nov 27 00:18:23 CET,Sat Nov 27 02:06:08 CET,0.0 2.747 3.413 3.919 4.34 4.704 5.024 5.324 5.892 6.165 6.432 6.77 7.164 7.394 7.845 8.285 8.714 8.92 9.32 9.696 10.226 10.555 10.89 11.42 11.915 12.376 12.806 13.22 13.767 14.303 14.801 15.386 15.949 16.497 17.136 17.819 18.463 19.19 19.922 20.69 21.616 22.568 23.461 24.293 25.222 26.243 27.355 28.496 29.62 30.367 30.33 29.596 28.49 27.298 26.213 25.155 24.102 23.084 22.172 21.207 20.312 19.542 18.821 18.085 17.332 16.664 15.964 15.306 14.783 14.217 13.632 13.158 12.654 12.097 11.613 11.11 10.619 10.161 9.707 9.349 8.97 8.401 7.98 7.535 7.309 6.822 6.337 5.833 5.543 5.098 4.583 4.223 3.833 3.011 2.586 2.108 1.511 0.837 -0.071 -1.478 -10.964 -5 ,27065 ,TETRA ,17558311,Sat Nov 27 00:18:21 CET,Sat Nov 27 02:16:55 CET,0.0 3.389 4.194 4.739 5.152 5.515 5.865 6.194 6.79 7.064 7.33 7.662 8.043 8.279 8.736 9.154 9.525 9.715 10.117 10.504 11.042 11.38 11.709 12.201 12.678 13.131 13.557 13.959 14.499 15.07 15.659 16.371 16.993 17.554 18.24 19.05 19.82 20.643 21.496 22.338 23.205 24.128 25.114 26.011 27.014 28.18 29.365 30.475 31.595 32.452 32.65 31.619 30.298 29.082 27.963 26.903 25.844 24.803 23.958 23.167 22.421 21.675 20.92 20.206 19.554 18.945 18.278 17.653 17.119 16.591 16.015 15.484 14.931 14.369 13.938 13.509 13.046 12.558 12.083 11.751 11.415 10.86 10.446 9.995 9.772 9.329 8.852 8.316 8.011 7.554 7.054 6.702 6.333 5.485 5.002 4.469 3.852 3.136 2.25 0.976 -5.432 -6 ,27539 ,TETRA ,17558312,Sat Nov 27 00:18:23 CET,Sat Nov 27 02:17:10 CET,0.0 1.994 2.641 3.159 3.528 3.841 4.171 4.473 5.052 5.324 5.568 5.873 6.267 6.475 6.859 7.245 7.637 7.82 8.146 8.465 8.931 9.254 9.575 10.001 10.427 10.859 11.263 11.697 12.299 12.856 13.428 14.115 14.684 15.224 15.875 16.534 17.122 17.769 18.481 19.226 20.015 20.903 21.839 22.768 23.926 25.144 26.304 27.515 28.644 29.367 29.5 28.612 27.505 26.359 25.254 24.292 23.4 22.477 21.625 20.739 19.96 19.219 18.35 17.537 16.881 16.295 15.672 15.104 14.626 14.093 13.488 12.982 12.452 11.938 11.532 11.089 10.633 10.159 9.653 9.28 8.899 8.299 7.858 7.413 7.174 6.643 6.111 5.58 5.304 4.849 4.337 3.996 3.62 2.697 2.164 1.627 1.045 0.289 -0.712 -2.085 -8.594 -7 ,663 ,TETRA ,17558313,Sat Nov 27 00:18:25 CET,Sat Nov 27 02:13:42 CET,0.0 2.728 3.429 4.0 4.497 4.897 5.266 5.604 6.198 6.482 6.739 7.094 7.499 7.746 8.196 8.609 9.009 9.2 9.571 9.926 10.46 10.818 11.17 11.662 12.112 12.576 13.02 13.423 13.954 14.469 14.953 15.533 16.116 16.702 17.334 17.999 18.65 19.357 20.103 20.926 21.791 22.687 23.716 24.681 25.704 26.8 27.97 29.152 30.169 30.935 31.071 30.24 29.073 27.888 26.774 25.671 24.612 23.594 22.679 21.798 21.084 20.367 19.59 18.828 18.111 17.413 16.646 15.986 15.419 14.792 14.119 13.572 13.028 12.457 11.991 11.497 10.975 10.436 9.917 9.593 9.257 8.708 8.282 7.798 7.558 7.053 6.481 5.872 5.581 5.153 4.696 4.356 3.978 3.13 2.634 2.085 1.435 0.639 -0.283 -1.455 -10.257 -8 ,17566 ,TETRA ,17558314,Sat Nov 27 00:18:21 CET,Sat Nov 27 02:17:49 CET,0.0 3.396 4.096 4.622 5.089 5.497 5.831 6.138 6.726 7.002 7.256 7.571 7.942 8.172 8.639 9.08 9.473 9.66 10.038 10.391 10.901 11.244 11.57 12.046 12.517 12.968 13.4 13.806 14.326 14.84 15.322 15.878 16.454 17.041 17.698 18.422 19.099 19.838 20.649 21.49 22.327 23.242 24.244 25.175 26.14 27.077 28.211 29.413 30.335 30.953 30.994 30.076 28.897 27.635 26.38 25.218 24.168 23.167 22.196 21.219 20.434 19.685 18.917 18.202 17.567 16.953 16.296 15.735 15.234 14.682 14.097 13.624 13.14 12.612 12.177 11.68 11.122 10.565 10.017 9.651 9.276 8.669 8.246 7.812 7.579 7.039 6.412 5.773 5.451 4.989 4.438 4.039 3.655 2.83 2.345 1.822 1.24 0.521 -0.402 -1.8 -10.54 -9 ,1921 ,TETRA ,17558315,Sat Nov 27 00:18:23 CET,Sat Nov 27 02:17:42 CET,0.0 2.981 3.854 4.435 4.797 5.117 5.444 5.73 6.247 6.513 6.778 7.115 7.518 7.768 8.241 8.677 9.086 9.274 9.635 9.997 10.53 10.86 11.169 11.636 12.099 12.579 13.076 13.56 14.135 14.634 15.097 15.681 16.285 16.868 17.517 18.233 18.928 19.617 20.296 21.07 21.979 22.977 23.97 24.971 26.006 26.977 28.207 29.435 30.494 31.352 31.721 31.165 30.132 28.924 27.797 26.806 25.843 24.832 23.937 23.065 22.218 21.416 20.679 19.944 19.318 18.761 18.065 17.433 16.872 16.276 15.688 15.188 14.677 14.122 13.677 13.266 12.838 12.353 11.831 11.46 11.064 10.44 10.051 9.655 9.439 9.009 8.533 7.994 7.718 7.289 6.881 6.563 6.171 5.389 4.981 4.49 3.893 3.177 2.266 0.953 -4.754 -10 ,24257 ,TETRA ,17558316,Sat Nov 27 00:18:22 CET,Sat Nov 27 02:16:51 CET,0.0 2.56 3.15 3.616 3.961 4.276 4.581 4.901 5.508 5.78 6.031 6.345 6.734 6.95 7.369 7.796 8.189 8.374 8.75 9.116 9.626 9.974 10.323 10.842 11.361 11.827 12.255 12.665 13.181 13.678 14.167 14.762 15.345 15.907 16.537 17.244 17.93 18.676 19.477 20.333 21.111 21.921 22.89 23.81 25.003 26.313 27.504 28.531 29.406 30.116 30.166 29.442 28.491 27.282 26.068 24.981 24.033 23.137 22.314 21.481 20.732 19.988 19.217 18.471 17.768 17.163 16.534 15.968 15.493 14.962 14.409 13.961 13.432 12.807 12.335 11.885 11.416 10.892 10.326 9.938 9.53 8.863 8.395 7.919 7.671 7.125 6.531 5.929 5.625 5.16 4.633 4.284 3.9 3.013 2.531 1.999 1.325 0.558 -0.293 -1.59 -8.75 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index b01e84c2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23853 ,KEBNE ,17125853,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:35:47 CET,0.0 1.636 1.915 2.118 2.259 2.358 2.45 2.516 2.602 2.638 2.659 2.542 2.679 2.689 2.705 2.682 2.637 2.606 2.521 2.427 2.294 2.209 2.115 1.935 1.747 1.567 1.392 1.196 0.905 0.614 0.32 -0.036 -0.406 -0.795 -1.271 -1.856 -2.479 -3.204 -4.047 -5.02 -6.092 -7.388 -8.992 -10.771 -13.142 -16.004 -19.541 -24.081 -30.31 -38.997 -51.839 -65.211 -75.166 -83.094 -89.413 -94.76 -99.248 -103.098 -106.249 -109.255 -111.722 -113.809 -115.743 -117.526 -119.125 -120.532 -121.975 -123.231 -124.279 -125.337 -126.412 -127.3 -128.214 -129.124 -129.816 -130.519 -131.224 -131.947 -132.716 -133.238 -133.754 -134.531 -135.063 -135.618 -135.902 -136.476 -137.046 -137.615 -137.915 -138.54 -138.909 -139.264 -139.629 -140.354 -140.73 -141.129 -141.562 -142.077 -142.686 -143.449 -145.464 -2 ,12032 ,KEBNE ,17125854,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:36:37 CET,0.0 1.261 1.581 1.77 1.861 1.947 2.009 2.07 2.186 2.22 2.238 2.109 2.252 2.251 2.236 2.222 2.195 2.164 2.095 2.011 1.868 1.779 1.706 1.586 1.439 1.274 1.097 0.919 0.677 0.41 0.133 -0.228 -0.593 -0.97 -1.45 -2.025 -2.637 -3.365 -4.199 -5.183 -6.341 -7.76 -9.505 -11.361 -13.705 -16.516 -20.029 -24.49 -30.563 -39.11 -51.94 -65.566 -75.633 -83.566 -89.862 -95.099 -99.409 -103.122 -106.207 -109.171 -111.689 -113.855 -115.829 -117.648 -119.319 -120.821 -122.326 -123.62 -124.712 -125.828 -126.969 -127.887 -128.817 -129.767 -130.483 -131.206 -131.938 -132.667 -133.402 -133.898 -134.398 -135.171 -135.717 -136.283 -136.57 -137.162 -137.758 -138.368 -138.676 -139.287 -139.632 -139.966 -140.328 -141.117 -141.517 -141.929 -142.406 -142.931 -143.504 -144.286 -147.445 -3 ,10592 ,KEBNE ,17125855,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:35:35 CET,0.0 2.081 2.484 2.683 2.813 2.921 3.01 3.08 3.159 3.195 3.223 3.077 3.213 3.219 3.2 3.155 3.094 3.069 3.011 2.933 2.814 2.727 2.623 2.454 2.306 2.142 1.943 1.733 1.448 1.154 0.848 0.423 -0.017 -0.427 -0.912 -1.516 -2.135 -2.858 -3.712 -4.673 -5.767 -7.125 -8.783 -10.567 -12.869 -15.68 -19.262 -23.94 -30.241 -38.788 -51.562 -65.12 -75.121 -82.884 -89.079 -94.303 -98.627 -102.324 -105.351 -108.219 -110.61 -112.669 -114.556 -116.284 -117.879 -119.331 -120.834 -122.156 -123.261 -124.367 -125.474 -126.364 -127.271 -128.18 -128.874 -129.576 -130.267 -130.984 -131.739 -132.249 -132.761 -133.543 -134.09 -134.657 -134.942 -135.524 -136.122 -136.744 -137.063 -137.695 -138.052 -138.384 -138.742 -139.509 -139.925 -140.387 -140.866 -141.364 -141.961 -142.696 -145.026 -4 ,19384 ,KEBNE ,17125856,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:36:48 CET,0.0 1.245 1.581 1.854 2.027 2.132 2.217 2.274 2.334 2.369 2.397 2.281 2.421 2.401 2.355 2.309 2.249 2.213 2.151 2.099 2.002 1.919 1.819 1.663 1.498 1.331 1.161 0.967 0.686 0.397 0.1 -0.285 -0.672 -1.062 -1.552 -2.153 -2.739 -3.413 -4.221 -5.173 -6.3 -7.662 -9.374 -11.286 -13.695 -16.588 -20.34 -25.094 -31.37 -40.11 -53.021 -66.626 -76.754 -84.656 -90.995 -96.355 -100.818 -104.626 -107.683 -110.614 -113.06 -115.14 -117.076 -118.859 -120.451 -121.852 -123.286 -124.554 -125.621 -126.684 -127.751 -128.614 -129.492 -130.404 -131.104 -131.8 -132.503 -133.233 -133.999 -134.51 -135.021 -135.804 -136.324 -136.847 -137.121 -137.706 -138.303 -138.921 -139.239 -139.867 -140.239 -140.587 -140.929 -141.652 -142.049 -142.481 -142.936 -143.425 -143.95 -144.648 -146.939 -5 ,5870 ,KEBNE ,17125857,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:35:55 CET,0.0 0.634 0.947 1.163 1.258 1.322 1.381 1.443 1.518 1.526 1.547 1.426 1.558 1.543 1.5 1.455 1.396 1.369 1.303 1.23 1.106 1.001 0.894 0.741 0.579 0.404 0.235 0.063 -0.165 -0.399 -0.673 -1.031 -1.394 -1.785 -2.266 -2.855 -3.484 -4.222 -5.056 -6.002 -7.08 -8.392 -10.079 -11.959 -14.348 -17.279 -21.011 -25.672 -31.881 -40.62 -53.553 -67.069 -77.041 -84.804 -91.091 -96.358 -100.647 -104.333 -107.383 -110.295 -112.691 -114.792 -116.757 -118.542 -120.15 -121.579 -123.04 -124.311 -125.396 -126.521 -127.634 -128.518 -129.435 -130.346 -131.031 -131.741 -132.475 -133.237 -134.026 -134.556 -135.069 -135.865 -136.424 -136.975 -137.253 -137.822 -138.42 -139.032 -139.337 -139.96 -140.33 -140.682 -141.043 -141.829 -142.27 -142.736 -143.214 -143.71 -144.216 -144.858 -147.037 -6 ,5471 ,KEBNE ,17125858,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:35:10 CET,0.0 1.266 1.606 1.777 1.919 2.039 2.113 2.144 2.198 2.225 2.23 2.076 2.213 2.206 2.189 2.171 2.135 2.111 2.064 1.99 1.864 1.801 1.706 1.519 1.339 1.149 0.953 0.758 0.483 0.192 -0.096 -0.44 -0.795 -1.172 -1.643 -2.2 -2.786 -3.497 -4.322 -5.307 -6.42 -7.709 -9.348 -11.179 -13.508 -16.342 -19.977 -24.562 -30.599 -39.002 -51.713 -65.209 -75.227 -82.998 -89.315 -94.693 -99.093 -102.871 -106.009 -109.048 -111.587 -113.765 -115.765 -117.604 -119.25 -120.694 -122.168 -123.449 -124.539 -125.649 -126.763 -127.688 -128.634 -129.581 -130.307 -131.033 -131.766 -132.527 -133.312 -133.851 -134.392 -135.201 -135.759 -136.334 -136.617 -137.192 -137.792 -138.404 -138.709 -139.333 -139.7 -140.035 -140.375 -141.095 -141.479 -141.881 -142.346 -142.893 -143.54 -144.332 -146.618 -7 ,3608 ,KEBNE ,17125859,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:36:55 CET,0.0 1.338 1.679 1.873 2.037 2.167 2.233 2.293 2.427 2.459 2.471 2.367 2.513 2.508 2.498 2.476 2.443 2.415 2.339 2.251 2.104 2.008 1.914 1.757 1.571 1.378 1.185 0.983 0.722 0.432 0.118 -0.246 -0.627 -1.048 -1.552 -2.165 -2.794 -3.521 -4.366 -5.312 -6.372 -7.681 -9.386 -11.244 -13.611 -16.536 -20.251 -24.908 -31.014 -39.513 -52.233 -65.576 -75.468 -83.259 -89.498 -94.674 -98.92 -102.618 -105.722 -108.663 -111.088 -113.165 -115.078 -116.825 -118.414 -119.836 -121.293 -122.576 -123.671 -124.81 -125.959 -126.861 -127.761 -128.685 -129.381 -130.085 -130.829 -131.575 -132.309 -132.806 -133.318 -134.111 -134.65 -135.222 -135.53 -136.149 -136.746 -137.34 -137.641 -138.253 -138.615 -138.977 -139.339 -140.158 -140.608 -141.043 -141.481 -141.962 -142.485 -143.171 -145.797 -8 ,8290 ,KEBNE ,17125860,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:35:08 CET,0.0 1.117 1.356 1.515 1.643 1.729 1.79 1.859 1.965 1.992 2.01 1.898 2.041 2.027 2.005 1.975 1.928 1.902 1.866 1.831 1.749 1.67 1.586 1.426 1.253 1.09 0.916 0.728 0.493 0.249 -0.034 -0.399 -0.789 -1.201 -1.699 -2.291 -2.907 -3.624 -4.44 -5.397 -6.489 -7.78 -9.378 -11.179 -13.514 -16.29 -19.89 -24.606 -30.902 -39.541 -52.374 -65.896 -75.978 -84.032 -90.469 -95.762 -100.133 -103.906 -107.007 -109.997 -112.499 -114.667 -116.655 -118.454 -120.046 -121.467 -122.95 -124.219 -125.309 -126.427 -127.538 -128.442 -129.331 -130.23 -130.919 -131.611 -132.315 -133.026 -133.767 -134.265 -134.763 -135.545 -136.069 -136.6 -136.877 -137.461 -138.076 -138.699 -139.004 -139.625 -140.025 -140.369 -140.704 -141.4 -141.802 -142.245 -142.726 -143.274 -143.879 -144.649 -146.972 -9 ,10170 ,KEBNE ,17125861,Thu Dec 30 16:52:52 CET,Thu Dec 30 18:35:22 CET,0.0 1.294 1.601 1.811 1.962 2.074 2.151 2.222 2.347 2.388 2.423 2.326 2.487 2.496 2.487 2.471 2.433 2.399 2.322 2.244 2.129 2.051 1.965 1.838 1.703 1.545 1.376 1.192 0.909 0.603 0.301 -0.081 -0.484 -0.882 -1.363 -1.946 -2.542 -3.249 -4.092 -5.055 -6.13 -7.442 -9.109 -10.938 -13.287 -16.156 -19.767 -24.363 -30.495 -38.925 -51.539 -64.875 -74.912 -82.943 -89.327 -94.648 -99.067 -102.839 -106.011 -109.078 -111.591 -113.712 -115.674 -117.488 -119.142 -120.61 -122.086 -123.38 -124.482 -125.599 -126.752 -127.702 -128.64 -129.576 -130.291 -131.011 -131.74 -132.503 -133.283 -133.796 -134.309 -135.102 -135.654 -136.229 -136.528 -137.149 -137.772 -138.38 -138.697 -139.343 -139.764 -140.121 -140.483 -141.237 -141.642 -142.073 -142.526 -143.062 -143.716 -144.425 -146.959 -10 ,17498 ,KEBNE ,17125862,Thu Dec 30 16:52:51 CET,Thu Dec 30 18:37:22 CET,0.0 1.057 1.295 1.486 1.653 1.762 1.835 1.901 1.992 2.019 2.048 1.922 2.068 2.066 2.027 1.99 1.942 1.907 1.845 1.773 1.64 1.563 1.491 1.362 1.213 1.052 0.889 0.703 0.427 0.154 -0.124 -0.49 -0.88 -1.275 -1.759 -2.375 -3.013 -3.732 -4.566 -5.513 -6.592 -7.96 -9.65 -11.498 -13.879 -16.804 -20.594 -25.349 -31.689 -40.459 -53.418 -67.034 -77.124 -85.056 -91.476 -96.881 -101.38 -105.272 -108.461 -111.485 -114.003 -116.202 -118.189 -120.005 -121.697 -123.195 -124.704 -126.017 -127.118 -128.212 -129.304 -130.197 -131.121 -132.061 -132.772 -133.501 -134.238 -134.963 -135.697 -136.213 -136.736 -137.525 -138.068 -138.613 -138.889 -139.472 -140.065 -140.645 -140.937 -141.546 -141.877 -142.223 -142.583 -143.322 -143.737 -144.18 -144.653 -145.145 -145.668 -146.323 -148.714 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 6eaecbad..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29363 ,TETRA ,17558317,Sat Nov 27 00:18:20 CET,Sat Nov 27 02:03:13 CET,0.0 0.247 0.405 0.546 0.679 0.817 0.952 1.082 1.352 1.478 1.588 1.662 1.919 2.021 2.22 2.426 2.643 2.742 2.927 3.121 3.405 3.59 3.778 4.062 4.332 4.597 4.858 5.113 5.468 5.826 6.171 6.59 7.011 7.452 7.985 8.571 9.147 9.771 10.389 11.027 11.7 12.501 13.473 14.474 15.651 16.935 18.329 19.801 21.394 23.015 24.429 24.669 24.124 23.135 22.109 21.124 20.066 19.012 18.067 17.082 16.255 15.54 14.837 14.135 13.476 12.893 12.275 11.722 11.264 10.764 10.205 9.748 9.282 8.79 8.431 8.064 7.659 7.217 6.767 6.474 6.168 5.672 5.315 4.965 4.788 4.4 3.981 3.524 3.298 2.939 2.541 2.252 1.971 1.329 0.947 0.559 0.121 -0.423 -1.12 -2.264 -12.388 -2 ,17219 ,TETRA ,17558318,Sat Nov 27 00:18:22 CET,Sat Nov 27 02:13:14 CET,0.0 0.239 0.455 0.666 0.849 1.017 1.176 1.312 1.551 1.666 1.79 1.891 2.146 2.257 2.469 2.673 2.879 2.98 3.168 3.356 3.646 3.84 4.031 4.314 4.593 4.848 5.088 5.338 5.7 6.068 6.412 6.813 7.199 7.594 8.066 8.595 9.111 9.678 10.33 11.045 11.794 12.63 13.578 14.585 15.752 16.91 18.159 19.554 21.146 22.742 24.036 24.239 23.57 22.628 21.691 20.719 19.716 18.702 17.806 16.904 16.119 15.408 14.742 14.157 13.621 13.073 12.477 11.971 11.519 11.031 10.552 10.166 9.755 9.287 8.896 8.465 8.001 7.541 7.076 6.753 6.403 5.849 5.485 5.141 4.961 4.587 4.19 3.702 3.452 3.071 2.687 2.416 2.146 1.561 1.236 0.79 0.281 -0.234 -0.949 -2.127 -14.474 -5 ,22586 ,TETRA ,17558321,Sat Nov 27 00:19:21 CET,Sat Nov 27 02:13:59 CET,0.0 0.243 0.397 0.535 0.668 0.798 0.932 1.059 1.305 1.427 1.553 1.655 1.922 2.045 2.277 2.478 2.686 2.787 2.979 3.176 3.475 3.673 3.87 4.158 4.436 4.716 4.993 5.259 5.615 5.969 6.307 6.708 7.1 7.499 7.978 8.506 9.017 9.595 10.248 10.946 11.66 12.48 13.462 14.483 15.631 16.801 18.125 19.57 21.094 22.678 23.975 24.047 23.381 22.514 21.605 20.652 19.712 18.81 17.997 17.147 16.389 15.708 15.04 14.404 13.802 13.234 12.652 12.139 11.675 11.171 10.637 10.204 9.741 9.267 8.922 8.556 8.178 7.764 7.3 7.002 6.713 6.246 5.902 5.535 5.348 4.963 4.566 4.151 3.936 3.559 3.179 2.904 2.598 1.895 1.465 0.957 0.382 -0.306 -1.178 -2.464 -8.487 -6 ,5311 ,TETRA ,17558322,Sat Nov 27 00:19:21 CET,Sat Nov 27 02:13:40 CET,0.0 0.198 0.338 0.482 0.632 0.759 0.878 0.997 1.253 1.377 1.496 1.596 1.856 1.959 2.167 2.373 2.569 2.669 2.873 3.069 3.352 3.545 3.757 4.071 4.353 4.629 4.899 5.166 5.522 5.88 6.244 6.678 7.09 7.483 7.941 8.463 8.983 9.579 10.231 10.934 11.684 12.515 13.444 14.397 15.517 16.731 18.1 19.611 21.168 22.681 24.086 24.383 23.863 23.01 21.93 20.697 19.532 18.468 17.517 16.522 15.643 14.847 14.048 13.308 12.67 12.042 11.363 10.766 10.252 9.748 9.217 8.77 8.317 7.852 7.498 7.124 6.709 6.257 5.784 5.465 5.142 4.633 4.284 3.931 3.75 3.351 2.94 2.513 2.275 1.9 1.516 1.24 0.949 0.217 -0.215 -0.623 -1.074 -1.662 -2.37 -3.386 -14.545 -7 ,7448 ,TETRA ,17558323,Sat Nov 27 00:19:23 CET,Sat Nov 27 02:14:21 CET,0.0 0.283 0.461 0.619 0.778 0.943 1.102 1.26 1.582 1.736 1.882 2.005 2.277 2.408 2.655 2.888 3.122 3.237 3.461 3.686 4.034 4.259 4.465 4.759 5.052 5.339 5.627 5.906 6.275 6.651 6.996 7.396 7.805 8.222 8.704 9.244 9.757 10.315 10.925 11.598 12.343 13.164 14.081 15.016 16.134 17.373 18.711 20.18 21.828 23.355 24.668 24.969 24.257 23.22 22.125 21.033 20.023 19.089 18.23 17.342 16.605 15.908 15.242 14.627 14.038 13.495 12.875 12.281 11.777 11.259 10.728 10.295 9.828 9.334 8.948 8.527 8.1 7.688 7.279 6.961 6.608 6.076 5.699 5.316 5.118 4.687 4.253 3.835 3.612 3.219 2.812 2.539 2.24 1.606 1.257 0.872 0.345 -0.303 -1.092 -2.367 -10.613 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index c5334be6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15900 ,TETRA ,17558327,Sat Nov 27 00:26:21 CET,Sat Nov 27 02:20:24 CET,0.0 0.369 0.696 1.01 1.322 1.636 1.932 2.225 2.819 3.125 3.434 3.719 4.311 4.605 5.207 5.789 6.355 6.64 7.207 7.76 8.562 9.104 9.66 10.483 11.28 12.067 12.852 13.617 14.628 15.622 16.593 17.793 18.982 20.17 21.593 23.233 24.852 26.658 28.68 30.931 33.358 36.207 39.709 43.369 47.778 52.924 59.152 66.375 75.124 86.202 100.825 114.212 123.059 129.339 133.905 137.498 140.065 141.936 143.443 144.953 146.099 146.856 147.522 148.159 148.68 149.091 149.493 149.815 150.014 150.193 150.387 150.524 150.639 150.736 150.788 150.806 150.793 150.761 150.731 150.724 150.716 150.675 150.637 150.601 150.575 150.516 150.408 150.266 150.199 149.97 149.894 149.757 149.599 149.218 148.943 148.62 148.296 147.905 147.316 146.351 140.156 -2 ,4774 ,TETRA ,17558328,Sat Nov 27 00:20:21 CET,Sat Nov 27 02:14:27 CET,0.0 0.556 0.998 1.395 1.769 2.105 2.411 2.707 3.302 3.598 3.882 4.131 4.732 5.016 5.575 6.114 6.635 6.901 7.432 7.96 8.742 9.255 9.765 10.527 11.285 12.047 12.816 13.569 14.538 15.496 16.457 17.656 18.84 20.024 21.431 23.041 24.631 26.445 28.472 30.691 33.11 35.953 39.417 43.026 47.362 52.452 58.616 65.799 74.702 85.988 100.831 114.498 123.251 129.22 133.524 136.915 139.618 141.817 143.331 144.573 145.622 146.485 147.204 147.823 148.363 148.814 149.234 149.551 149.744 149.903 150.042 150.133 150.237 150.31 150.333 150.355 150.361 150.359 150.365 150.363 150.345 150.291 150.247 150.18 150.132 150.007 149.837 149.692 149.633 149.397 149.272 149.14 148.992 148.647 148.456 148.194 147.824 147.388 146.791 145.638 138.774 -3 ,22348 ,TETRA ,17558329,Sat Nov 27 00:20:23 CET,Sat Nov 27 02:14:40 CET,0.0 0.695 1.082 1.456 1.803 2.144 2.478 2.802 3.422 3.723 4.023 4.312 4.908 5.182 5.733 6.278 6.81 7.077 7.603 8.119 8.867 9.372 9.883 10.639 11.397 12.148 12.883 13.599 14.554 15.516 16.472 17.669 18.851 20.004 21.366 22.948 24.512 26.224 28.082 30.127 32.364 34.932 38.007 41.262 45.271 49.982 55.752 62.656 71.25 82.239 96.866 110.709 120.111 126.624 131.111 134.584 137.215 139.244 140.803 142.231 143.301 144.108 144.831 145.473 146.032 146.461 146.82 147.14 147.421 147.673 147.915 148.06 148.143 148.193 148.216 148.233 148.25 148.255 148.231 148.204 148.161 148.108 148.076 148.008 147.961 147.858 147.709 147.524 147.425 147.167 147.059 146.936 146.758 146.189 145.864 145.477 144.995 144.465 143.708 142.341 136.39 -5 ,10006 ,TETRA ,17558332,Sat Nov 27 00:20:21 CET,Sat Nov 27 02:14:38 CET,0.0 0.334 0.672 0.975 1.273 1.567 1.85 2.13 2.69 2.967 3.245 3.476 4.053 4.318 4.861 5.396 5.919 6.181 6.697 7.199 7.939 8.429 8.917 9.653 10.399 11.132 11.849 12.571 13.541 14.517 15.494 16.688 17.872 19.047 20.436 22.045 23.644 25.457 27.473 29.675 32.087 34.877 38.224 41.771 46.091 51.075 57.09 64.218 72.778 83.435 97.583 110.76 119.375 125.367 129.748 133.012 135.441 137.445 139.026 140.515 141.751 142.696 143.392 143.988 144.514 144.94 145.29 145.559 145.769 145.936 146.061 146.146 146.222 146.28 146.313 146.346 146.379 146.366 146.332 146.301 146.26 146.217 146.175 146.105 146.056 145.932 145.804 145.663 145.578 145.332 145.186 145.019 144.853 144.489 144.23 143.937 143.599 143.162 142.584 141.525 134.66 -7 ,4380 ,TETRA ,17558334,Fri Nov 26 23:46:29 CET,Sat Nov 27 01:40:36 CET,0.0 0.458 0.75 1.061 1.377 1.692 1.988 2.26 2.82 3.095 3.36 3.586 4.148 4.407 4.919 5.429 5.945 6.203 6.717 7.236 8.01 8.518 9.029 9.794 10.548 11.305 12.043 12.764 13.724 14.676 15.628 16.815 17.997 19.17 20.54 22.103 23.634 25.381 27.361 29.527 31.878 34.64 37.994 41.454 45.625 50.482 56.241 62.908 71.187 81.646 95.559 108.79 117.591 124.081 129.049 132.774 135.615 137.939 139.721 141.348 142.569 143.473 144.193 144.787 145.327 145.765 146.121 146.371 146.549 146.716 146.846 146.924 147.018 147.096 147.13 147.156 147.177 147.188 147.183 147.174 147.161 147.1 147.038 146.971 146.936 146.835 146.695 146.541 146.448 146.21 146.121 145.991 145.86 145.506 145.267 145.004 144.671 144.25 143.682 142.599 137.095 -9 ,12190 ,TETRA ,17558336,Fri Nov 26 23:48:31 CET,Sat Nov 27 01:43:01 CET,0.0 0.342 0.669 0.977 1.269 1.555 1.836 2.123 2.683 2.949 3.211 3.43 3.986 4.247 4.774 5.291 5.795 6.046 6.548 7.039 7.778 8.274 8.767 9.505 10.242 10.971 11.683 12.386 13.313 14.247 15.204 16.392 17.57 18.722 20.084 21.693 23.248 24.925 26.779 28.837 31.097 33.718 36.935 40.3 44.349 49.15 54.981 61.877 70.46 81.331 96.011 109.912 119.108 125.572 130.252 133.913 136.792 139.135 141.007 142.708 143.901 144.745 145.415 145.973 146.468 146.891 147.29 147.608 147.86 148.089 148.316 148.467 148.559 148.627 148.679 148.73 148.757 148.741 148.726 148.719 148.683 148.607 148.539 148.444 148.386 148.282 148.162 147.988 147.891 147.662 147.616 147.482 147.299 146.914 146.689 146.387 145.996 145.518 144.871 143.852 135.652 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index ee28779b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22684 ,TETRA ,17558338,Sat Nov 27 00:20:23 CET,Sat Nov 27 02:09:55 CET,0.0 1.402 2.093 2.665 3.127 3.551 3.983 4.413 5.228 5.603 5.959 6.369 7.015 7.359 8.026 8.678 9.338 9.667 10.307 10.936 11.884 12.513 13.119 14.018 14.924 15.826 16.714 17.587 18.751 19.909 21.052 22.46 23.852 25.21 26.814 28.686 30.54 32.655 35.028 37.622 40.418 43.643 47.58 51.738 56.701 62.462 69.552 77.97 88.338 101.486 118.857 134.95 145.764 153.597 159.293 163.649 167.091 169.973 172.221 174.229 175.828 177.122 178.267 179.267 180.119 180.872 181.574 182.114 182.542 182.957 183.358 183.668 183.973 184.253 184.441 184.625 184.798 184.972 185.132 185.217 185.282 185.308 185.315 185.319 185.304 185.27 185.23 185.136 185.08 184.938 184.904 184.823 184.72 184.414 184.239 184.071 183.828 183.49 183.105 182.406 179.282 -2 ,28648 ,TETRA ,17558339,Sat Nov 27 00:27:20 CET,Sat Nov 27 02:23:31 CET,0.0 1.55 2.27 2.886 3.42 3.892 4.307 4.718 5.55 5.952 6.333 6.743 7.412 7.767 8.46 9.129 9.812 10.155 10.809 11.471 12.468 13.132 13.775 14.697 15.611 16.525 17.431 18.322 19.488 20.64 21.798 23.215 24.612 26.017 27.678 29.572 31.45 33.573 35.935 38.532 41.366 44.689 48.678 52.792 57.804 63.656 70.794 79.392 90.092 103.562 121.266 137.576 148.41 156.139 161.8 166.149 169.494 172.222 174.39 176.375 177.928 179.191 180.251 181.156 181.964 182.656 183.32 183.882 184.34 184.763 185.135 185.401 185.655 185.903 186.09 186.256 186.42 186.582 186.704 186.773 186.844 186.937 186.971 186.982 186.994 187.014 187.001 186.957 186.926 186.805 186.837 186.794 186.707 186.45 186.282 186.083 185.841 185.469 184.946 184.226 180.671 -4 ,7231 ,TETRA ,17558341,Sat Nov 27 00:29:21 CET,Sat Nov 27 02:08:38 CET,0.0 1.213 1.858 2.411 2.943 3.421 3.868 4.283 5.1 5.507 5.901 6.336 7.009 7.368 8.082 8.773 9.423 9.746 10.4 11.059 12.028 12.654 13.269 14.192 15.121 16.027 16.911 17.787 18.947 20.1 21.249 22.678 24.095 25.493 27.155 29.076 30.953 33.075 35.463 38.088 40.915 44.188 48.149 52.334 57.402 63.267 70.407 78.902 89.289 102.273 119.643 135.857 146.56 154.295 159.954 164.346 167.794 170.575 172.783 174.749 176.238 177.492 178.649 179.711 180.657 181.446 182.212 182.862 183.387 183.896 184.369 184.726 185.071 185.409 185.661 185.849 185.977 186.1 186.203 186.263 186.334 186.437 186.49 186.538 186.554 186.549 186.524 186.483 186.466 186.343 186.325 186.257 186.158 185.902 185.738 185.559 185.342 185.008 184.499 183.855 172.981 -5 ,28107 ,TETRA ,17558342,Sat Nov 27 00:51:57 CET,Sat Nov 27 02:48:06 CET,0.0 2.097 2.838 3.407 3.919 4.401 4.83 5.226 6.051 6.477 6.906 7.42 8.114 8.482 9.173 9.875 10.569 10.908 11.581 12.247 13.237 13.898 14.56 15.531 16.474 17.395 18.321 19.239 20.434 21.62 22.788 24.234 25.687 27.134 28.83 30.757 32.652 34.787 37.168 39.794 42.627 45.908 49.849 53.974 59.019 64.837 71.848 80.194 90.449 103.536 121.268 137.48 148.186 156.099 161.914 166.393 169.928 172.79 175.001 176.994 178.588 179.905 181.051 182.008 182.777 183.389 184.008 184.529 184.897 185.266 185.685 186.038 186.351 186.603 186.782 186.943 187.083 187.212 187.323 187.393 187.463 187.602 187.686 187.697 187.691 187.691 187.67 187.643 187.636 187.526 187.553 187.486 187.383 187.162 187.052 186.915 186.748 186.432 185.979 185.299 174.343 -6 ,20512 ,TETRA ,17558343,Sat Nov 27 00:52:55 CET,Sat Nov 27 02:48:58 CET,0.0 1.589 2.26 2.795 3.292 3.791 4.249 4.678 5.508 5.915 6.324 6.794 7.469 7.824 8.539 9.25 9.943 10.285 10.969 11.645 12.639 13.285 13.918 14.851 15.788 16.718 17.629 18.533 19.699 20.847 21.999 23.425 24.83 26.234 27.914 29.849 31.734 33.858 36.262 38.895 41.715 44.961 48.883 52.957 57.875 63.566 70.459 78.715 88.903 101.866 119.091 134.986 145.744 153.561 159.369 163.918 167.46 170.413 172.751 174.903 176.582 177.851 178.934 179.91 180.781 181.528 182.243 182.842 183.344 183.842 184.33 184.699 185.001 185.256 185.405 185.534 185.686 185.823 185.918 185.955 186.003 186.095 186.137 186.176 186.199 186.245 186.268 186.244 186.224 186.095 186.093 186.015 185.917 185.702 185.575 185.382 185.123 184.818 184.346 183.538 179.661 -7 ,31927 ,TETRA ,17558344,Sat Nov 27 00:53:55 CET,Sat Nov 27 02:55:05 CET,0.0 1.315 1.94 2.56 3.125 3.646 4.138 4.591 5.41 5.805 6.2 6.656 7.346 7.717 8.444 9.176 9.898 10.247 10.921 11.593 12.592 13.245 13.893 14.842 15.782 16.726 17.654 18.557 19.72 20.885 22.056 23.489 24.903 26.296 27.929 29.789 31.644 33.791 36.137 38.693 41.509 44.808 48.754 52.795 57.722 63.446 70.4 78.665 88.974 102.139 119.519 135.73 146.465 154.116 159.829 164.353 167.862 170.648 172.831 174.767 176.254 177.508 178.607 179.546 180.33 180.993 181.652 182.187 182.648 183.114 183.541 183.866 184.154 184.41 184.59 184.763 184.929 185.099 185.261 185.353 185.45 185.531 185.559 185.613 185.625 185.611 185.602 185.568 185.539 185.414 185.388 185.31 185.229 184.961 184.795 184.627 184.391 184.082 183.613 182.794 177.722 -8 ,30629 ,TETRA ,17558345,Sat Nov 27 00:53:55 CET,Sat Nov 27 02:50:02 CET,0.0 1.529 2.135 2.708 3.216 3.692 4.137 4.574 5.412 5.807 6.19 6.628 7.308 7.673 8.39 9.102 9.794 10.14 10.828 11.498 12.493 13.148 13.805 14.778 15.707 16.622 17.539 18.444 19.638 20.808 21.954 23.406 24.863 26.283 27.952 29.868 31.752 33.893 36.271 38.853 41.673 44.957 48.928 53.099 58.157 63.987 70.957 79.32 89.806 103.126 120.528 136.335 146.781 154.391 160.076 164.549 168.085 170.949 173.151 175.057 176.487 177.675 178.702 179.615 180.413 181.064 181.692 182.228 182.683 183.106 183.499 183.806 184.117 184.415 184.604 184.78 184.952 185.11 185.258 185.348 185.414 185.505 185.564 185.609 185.611 185.606 185.625 185.623 185.598 185.449 185.462 185.409 185.325 185.143 184.999 184.798 184.516 184.169 183.813 183.263 173.749 -9 ,19691 ,TETRA ,17558346,Sat Nov 27 00:01:28 CET,Sat Nov 27 01:57:37 CET,0.0 0.998 1.602 2.167 2.683 3.15 3.611 4.034 4.813 5.197 5.565 6.016 6.695 7.05 7.735 8.396 9.049 9.379 10.024 10.65 11.572 12.184 12.805 13.716 14.595 15.467 16.346 17.218 18.37 19.516 20.642 22.051 23.466 24.877 26.526 28.412 30.295 32.385 34.709 37.282 40.02 43.1 46.797 50.704 55.432 60.968 67.745 75.841 85.999 99.072 116.634 133.059 144.156 152.232 158.314 163.078 166.771 169.632 171.798 173.768 175.207 176.355 177.389 178.295 179.12 179.853 180.541 181.102 181.574 182.04 182.46 182.774 183.094 183.419 183.644 183.844 184.025 184.183 184.324 184.411 184.486 184.558 184.57 184.589 184.607 184.606 184.58 184.54 184.496 184.33 184.271 184.194 184.112 183.881 183.717 183.557 183.392 183.181 182.845 182.113 176.973 -10 ,26186 ,TETRA ,17558347,Sat Nov 27 00:02:23 CET,Sat Nov 27 01:59:05 CET,0.0 1.322 1.947 2.454 2.882 3.31 3.714 4.124 4.913 5.279 5.65 6.081 6.738 7.092 7.78 8.453 9.108 9.424 10.056 10.687 11.643 12.277 12.9 13.814 14.703 15.574 16.441 17.314 18.467 19.605 20.736 22.142 23.526 24.893 26.515 28.392 30.237 32.34 34.694 37.273 40.075 43.323 47.238 51.225 56.01 61.597 68.282 76.363 86.525 99.258 116.492 132.671 143.318 151.056 156.826 161.323 164.816 167.643 169.866 171.904 173.5 174.807 175.897 176.822 177.663 178.397 179.131 179.76 180.252 180.735 181.217 181.581 181.917 182.188 182.338 182.46 182.582 182.724 182.873 182.946 183.007 183.072 183.091 183.109 183.109 183.099 183.071 183.007 182.969 182.842 182.868 182.805 182.722 182.548 182.404 182.17 181.899 181.514 181.008 180.403 176.274 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt deleted file mode 100644 index fea1a073..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18842 ,KEBNE ,17125863,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:36:00 CET,0.0 1.329 1.725 2.036 2.289 2.507 2.662 2.777 3.004 3.112 3.209 3.116 3.475 3.554 3.687 3.806 3.924 3.98 4.076 4.164 4.301 4.392 4.494 4.657 4.806 4.939 5.053 5.158 5.296 5.426 5.566 5.718 5.823 5.938 6.073 6.2 6.285 6.35 6.436 6.516 6.571 6.576 6.555 6.546 6.43 6.132 5.697 5.058 4.019 2.342 -0.636 -4.392 -7.645 -10.431 -12.773 -14.825 -16.56 -18.14 -19.57 -20.879 -21.918 -22.858 -23.779 -24.637 -25.393 -26.084 -26.792 -27.413 -27.961 -28.532 -29.104 -29.575 -30.085 -30.62 -31.014 -31.395 -31.794 -32.223 -32.652 -32.943 -33.258 -33.782 -34.148 -34.525 -34.716 -35.105 -35.532 -36.007 -36.239 -36.771 -36.965 -37.246 -37.534 -38.112 -38.434 -38.787 -39.164 -39.646 -40.261 -41.057 -43.609 -2 ,14838 ,KEBNE ,17125864,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:37:12 CET,0.0 1.291 1.715 2.016 2.272 2.507 2.699 2.856 3.157 3.314 3.452 3.405 3.793 3.895 4.065 4.219 4.376 4.454 4.592 4.716 4.877 4.98 5.083 5.231 5.368 5.487 5.605 5.721 5.868 6.009 6.132 6.307 6.473 6.587 6.69 6.824 6.967 7.087 7.169 7.187 7.231 7.333 7.401 7.391 7.291 6.968 6.436 5.726 4.572 2.708 -0.612 -4.522 -7.896 -10.966 -13.53 -15.74 -17.675 -19.401 -20.845 -22.227 -23.398 -24.452 -25.441 -26.32 -27.11 -27.845 -28.617 -29.306 -29.909 -30.518 -31.104 -31.61 -32.154 -32.677 -33.065 -33.46 -33.87 -34.28 -34.681 -34.965 -35.271 -35.746 -36.065 -36.394 -36.567 -36.914 -37.26 -37.659 -37.869 -38.38 -38.507 -38.73 -38.964 -39.437 -39.694 -40.0 -40.367 -40.79 -41.261 -41.864 -43.865 -3 ,7505 ,KEBNE ,17125865,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:35:17 CET,0.0 1.559 1.955 2.227 2.453 2.667 2.865 3.043 3.346 3.477 3.588 3.496 3.858 3.94 4.112 4.277 4.404 4.474 4.625 4.764 4.952 5.062 5.157 5.301 5.431 5.538 5.641 5.743 5.897 6.056 6.195 6.353 6.502 6.603 6.699 6.809 6.902 6.995 7.061 7.11 7.133 7.151 7.14 7.067 6.931 6.709 6.364 5.669 4.436 2.603 -0.442 -4.24 -7.676 -10.728 -13.359 -15.578 -17.462 -19.15 -20.566 -21.967 -23.124 -24.148 -25.091 -25.959 -26.821 -27.615 -28.408 -29.09 -29.677 -30.298 -30.944 -31.471 -32.029 -32.612 -33.047 -33.476 -33.932 -34.406 -34.865 -35.184 -35.513 -35.997 -36.338 -36.682 -36.858 -37.233 -37.615 -38.001 -38.202 -38.729 -38.88 -39.163 -39.48 -40.084 -40.411 -40.786 -41.211 -41.692 -42.234 -42.924 -45.561 -4 ,22156 ,KEBNE ,17125866,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:36:05 CET,0.0 1.101 1.483 1.747 1.995 2.203 2.375 2.519 2.795 2.925 3.018 2.888 3.229 3.304 3.46 3.584 3.7 3.756 3.863 3.973 4.133 4.228 4.331 4.486 4.609 4.714 4.81 4.918 5.084 5.229 5.347 5.512 5.698 5.859 5.996 6.111 6.21 6.358 6.536 6.644 6.67 6.676 6.653 6.557 6.35 6.042 5.544 4.711 3.474 1.581 -1.636 -5.687 -9.334 -12.426 -15.029 -17.358 -19.339 -21.056 -22.501 -23.887 -25.047 -26.11 -27.169 -28.13 -28.96 -29.718 -30.539 -31.255 -31.841 -32.438 -33.058 -33.568 -34.074 -34.614 -35.046 -35.509 -35.989 -36.453 -36.936 -37.27 -37.617 -38.155 -38.532 -38.944 -39.157 -39.567 -39.965 -40.382 -40.614 -41.173 -41.416 -41.686 -41.952 -42.517 -42.833 -43.202 -43.607 -44.084 -44.707 -45.524 -48.933 -5 ,32027 ,KEBNE ,17125867,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:37:22 CET,0.0 0.85 1.162 1.402 1.62 1.817 1.977 2.131 2.426 2.558 2.679 2.646 3.031 3.11 3.278 3.462 3.622 3.689 3.835 3.96 4.112 4.225 4.326 4.454 4.569 4.665 4.756 4.853 4.973 5.058 5.142 5.256 5.351 5.428 5.51 5.607 5.728 5.848 5.93 5.974 6.007 6.003 5.98 5.93 5.756 5.457 5.018 4.335 3.131 1.11 -2.632 -7.03 -10.448 -13.353 -15.852 -18.105 -19.998 -21.61 -22.964 -24.289 -25.391 -26.35 -27.259 -28.131 -28.958 -29.686 -30.451 -31.115 -31.662 -32.236 -32.822 -33.286 -33.77 -34.3 -34.701 -35.094 -35.496 -35.92 -36.364 -36.652 -36.945 -37.42 -37.748 -38.101 -38.289 -38.673 -39.05 -39.447 -39.665 -40.186 -40.312 -40.532 -40.79 -41.329 -41.586 -41.88 -42.266 -42.713 -43.183 -43.851 -46.452 -6 ,23968 ,KEBNE ,17125868,Thu Dec 30 16:52:55 CET,Thu Dec 30 18:35:54 CET,0.0 1.027 1.391 1.654 1.841 1.977 2.115 2.252 2.534 2.675 2.799 2.701 3.066 3.155 3.32 3.451 3.588 3.666 3.804 3.933 4.099 4.2 4.298 4.447 4.576 4.695 4.833 4.956 5.106 5.247 5.376 5.541 5.676 5.783 5.914 6.052 6.15 6.231 6.303 6.359 6.396 6.432 6.426 6.363 6.2 5.919 5.453 4.731 3.546 1.601 -1.633 -5.519 -8.835 -11.818 -14.429 -16.721 -18.683 -20.384 -21.838 -23.335 -24.59 -25.651 -26.641 -27.586 -28.463 -29.257 -30.089 -30.805 -31.392 -32.013 -32.668 -33.19 -33.699 -34.216 -34.622 -35.042 -35.482 -35.943 -36.428 -36.759 -37.106 -37.641 -37.998 -38.363 -38.556 -38.969 -39.391 -39.869 -40.134 -40.713 -40.964 -41.247 -41.546 -42.251 -42.63 -43.02 -43.442 -43.881 -44.392 -45.102 -47.102 -7 ,25620 ,KEBNE ,17125869,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:36:33 CET,0.0 1.012 1.348 1.64 1.905 2.123 2.334 2.534 2.865 2.999 3.118 3.066 3.431 3.519 3.654 3.765 3.883 3.942 4.045 4.148 4.313 4.417 4.508 4.631 4.747 4.855 4.952 5.046 5.16 5.26 5.348 5.441 5.539 5.64 5.753 5.902 6.027 6.115 6.199 6.271 6.304 6.318 6.32 6.246 6.142 5.954 5.464 4.565 3.208 1.268 -1.821 -5.481 -8.557 -11.23 -13.488 -15.449 -17.201 -18.824 -20.168 -21.436 -22.47 -23.369 -24.246 -25.061 -25.814 -26.54 -27.291 -27.926 -28.471 -29.044 -29.661 -30.175 -30.687 -31.222 -31.623 -32.022 -32.448 -32.908 -33.389 -33.71 -34.052 -34.607 -34.988 -35.362 -35.547 -35.918 -36.349 -36.782 -36.99 -37.532 -37.747 -38.023 -38.319 -38.957 -39.303 -39.651 -40.019 -40.439 -40.959 -41.696 -44.872 -8 ,27648 ,KEBNE ,17125870,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:38:25 CET,0.0 1.195 1.539 1.841 2.078 2.266 2.433 2.57 2.82 2.942 3.034 2.922 3.3 3.392 3.564 3.741 3.905 3.968 4.085 4.196 4.355 4.444 4.521 4.637 4.765 4.882 4.977 5.065 5.157 5.256 5.395 5.552 5.68 5.793 5.894 5.996 6.099 6.197 6.281 6.355 6.454 6.513 6.45 6.332 6.203 6.003 5.542 4.809 3.517 1.287 -2.578 -7.231 -10.901 -13.869 -16.379 -18.68 -20.613 -22.217 -23.582 -24.963 -26.141 -27.176 -28.137 -29.05 -29.883 -30.602 -31.327 -31.963 -32.509 -33.096 -33.708 -34.202 -34.728 -35.293 -35.73 -36.162 -36.591 -37.012 -37.455 -37.773 -38.084 -38.534 -38.834 -39.157 -39.336 -39.715 -40.094 -40.495 -40.702 -41.229 -41.391 -41.628 -41.893 -42.454 -42.744 -43.08 -43.469 -43.912 -44.465 -45.251 -47.962 -9 ,10954 ,KEBNE ,17125871,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:37:01 CET,0.0 1.428 1.797 2.028 2.219 2.428 2.638 2.806 3.117 3.244 3.349 3.287 3.655 3.758 3.95 4.109 4.244 4.305 4.448 4.597 4.782 4.885 4.986 5.121 5.23 5.33 5.426 5.549 5.744 5.896 5.989 6.081 6.208 6.322 6.406 6.506 6.615 6.724 6.816 6.918 6.998 7.023 7.021 6.968 6.81 6.561 6.1 5.362 4.191 2.283 -1.056 -5.243 -8.891 -12.016 -14.491 -16.631 -18.561 -20.279 -21.707 -23.12 -24.312 -25.409 -26.488 -27.503 -28.455 -29.302 -30.146 -30.887 -31.538 -32.211 -32.902 -33.463 -34.014 -34.568 -34.998 -35.435 -35.896 -36.378 -36.861 -37.181 -37.523 -38.059 -38.433 -38.82 -39.017 -39.42 -39.838 -40.28 -40.512 -41.071 -41.287 -41.59 -41.915 -42.564 -42.891 -43.288 -43.76 -44.25 -44.833 -45.622 -48.912 -10 ,6084 ,KEBNE ,17125872,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:35:48 CET,0.0 1.028 1.318 1.579 1.797 1.961 2.108 2.247 2.472 2.577 2.696 2.667 3.05 3.165 3.356 3.526 3.706 3.798 3.973 4.124 4.303 4.421 4.536 4.671 4.775 4.868 4.977 5.085 5.207 5.351 5.51 5.677 5.814 5.93 6.057 6.183 6.285 6.389 6.487 6.566 6.572 6.515 6.418 6.274 6.095 5.898 5.494 4.737 3.526 1.599 -1.737 -5.636 -9.013 -12.15 -14.77 -17.035 -19.014 -20.778 -22.312 -23.816 -25.062 -26.137 -27.118 -28.016 -28.859 -29.62 -30.393 -31.063 -31.636 -32.258 -32.907 -33.43 -33.967 -34.549 -35.009 -35.465 -35.931 -36.418 -36.918 -37.269 -37.643 -38.194 -38.571 -38.99 -39.207 -39.634 -40.076 -40.538 -40.782 -41.354 -41.562 -41.837 -42.133 -42.765 -43.111 -43.469 -43.883 -44.371 -44.987 -45.865 -48.733 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 8fceb681..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32533 ,KEBNE ,17125873,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:34:39 CET,0.0 0.34 0.686 1.01 1.31 1.609 1.896 2.443 2.718 2.991 3.244 3.777 4.031 4.534 5.038 5.532 5.777 6.271 6.752 7.46 7.937 8.416 9.13 9.808 10.454 11.089 11.709 12.547 13.41 14.271 15.37 16.46 17.514 18.771 20.238 21.696 23.325 25.011 26.719 28.533 30.63 33.186 35.895 39.226 43.14 47.936 53.565 60.46 69.141 80.216 89.627 95.069 98.696 101.269 103.121 104.542 105.579 106.218 106.787 107.212 107.483 107.689 107.856 107.906 107.906 107.928 107.911 107.836 107.722 107.572 107.434 107.305 107.145 107.009 106.9 106.793 106.628 106.46 106.343 106.171 105.833 105.589 105.375 105.265 105.018 104.753 104.448 104.289 103.983 103.663 103.396 103.129 102.517 102.132 101.681 101.178 100.555 99.822 98.688 -2 ,24684 ,KEBNE ,17125874,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:33:29 CET,0.0 0.289 0.584 0.862 1.126 1.395 1.65 2.142 2.396 2.647 2.881 3.395 3.639 4.127 4.619 5.104 5.341 5.816 6.299 7.037 7.527 8.007 8.708 9.411 10.101 10.779 11.464 12.38 13.288 14.167 15.207 16.222 17.217 18.394 19.762 21.124 22.65 24.344 26.201 28.215 30.536 33.305 36.247 39.806 43.882 48.809 54.676 61.862 70.681 82.131 92.306 98.423 102.422 105.044 107.003 108.356 109.269 109.997 110.564 110.959 111.269 111.475 111.623 111.71 111.703 111.66 111.631 111.614 111.586 111.516 111.379 111.195 111.043 110.928 110.783 110.587 110.366 110.153 109.985 109.795 109.522 109.354 109.156 109.033 108.757 108.458 108.157 107.976 107.624 107.35 107.132 106.87 106.232 105.858 105.424 104.921 104.351 103.655 102.495 -3 ,28974 ,KEBNE ,17125875,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:32:47 CET,0.0 0.331 0.623 0.889 1.152 1.397 1.651 2.146 2.382 2.625 2.848 3.347 3.587 4.06 4.524 4.981 5.216 5.696 6.166 6.844 7.294 7.749 8.419 9.086 9.755 10.413 11.059 11.898 12.723 13.56 14.606 15.627 16.655 17.892 19.29 20.67 22.23 23.937 25.8 27.853 30.253 33.119 36.109 39.63 43.626 48.431 54.095 61.03 69.589 80.749 90.715 96.595 100.358 103.114 105.005 106.17 106.902 107.353 107.766 108.005 108.135 108.205 108.245 108.282 108.283 108.278 108.215 108.103 107.981 107.827 107.696 107.529 107.342 107.214 107.066 106.895 106.708 106.488 106.322 106.156 105.875 105.649 105.372 105.238 104.994 104.697 104.344 104.124 103.76 103.492 103.257 102.979 102.295 101.888 101.433 100.932 100.258 99.267 97.846 -4 ,17866 ,KEBNE ,17125876,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:34:16 CET,0.0 0.27 0.521 0.754 0.988 1.224 1.467 1.957 2.19 2.421 2.626 3.103 3.331 3.781 4.222 4.642 4.848 5.264 5.674 6.287 6.703 7.116 7.715 8.304 8.901 9.497 10.076 10.837 11.614 12.403 13.39 14.369 15.346 16.507 17.84 19.193 20.734 22.387 24.135 26.019 28.205 30.843 33.707 37.165 41.015 45.62 51.059 57.804 66.355 77.426 87.277 93.38 97.437 100.237 102.285 103.695 104.559 105.057 105.416 105.72 106.017 106.236 106.394 106.525 106.584 106.606 106.607 106.592 106.542 106.386 106.216 106.06 105.869 105.715 105.546 105.353 105.146 104.915 104.752 104.571 104.267 104.048 103.812 103.681 103.405 103.097 102.742 102.549 102.217 101.889 101.629 101.372 100.736 100.304 99.851 99.312 98.503 97.333 95.601 -5 ,20743 ,KEBNE ,17125877,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:33:06 CET,0.0 0.284 0.567 0.869 1.162 1.434 1.699 2.236 2.509 2.783 3.034 3.576 3.84 4.363 4.876 5.368 5.611 6.1 6.586 7.321 7.803 8.283 8.999 9.675 10.345 11.025 11.7 12.593 13.477 14.343 15.409 16.478 17.505 18.675 20.028 21.374 22.898 24.596 26.453 28.427 30.718 33.524 36.453 39.981 43.991 48.759 54.436 61.415 69.961 80.944 90.564 96.292 99.851 102.282 104.117 105.415 106.35 107.002 107.538 107.84 108.035 108.202 108.294 108.298 108.265 108.218 108.123 108.03 107.959 107.845 107.713 107.571 107.396 107.252 107.092 106.894 106.669 106.458 106.315 106.136 105.803 105.591 105.377 105.258 105.038 104.77 104.451 104.283 103.951 103.63 103.391 103.14 102.563 102.184 101.731 101.171 100.493 99.705 98.477 -6 ,7591 ,KEBNE ,17125878,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:32:49 CET,0.0 0.276 0.543 0.807 1.071 1.335 1.594 2.107 2.345 2.569 2.758 3.232 3.447 3.877 4.304 4.728 4.939 5.353 5.765 6.389 6.806 7.221 7.834 8.423 9.017 9.631 10.244 11.048 11.832 12.594 13.538 14.483 15.429 16.538 17.83 19.121 20.557 22.146 23.911 25.858 28.111 30.831 33.621 36.934 40.825 45.577 51.165 57.954 66.442 77.436 87.306 93.497 97.607 100.226 101.948 103.203 104.137 104.764 105.269 105.589 105.79 105.978 106.121 106.181 106.194 106.21 106.184 106.14 106.114 106.057 105.942 105.803 105.692 105.59 105.434 105.245 105.078 104.917 104.793 104.638 104.306 104.042 103.788 103.67 103.437 103.205 102.956 102.81 102.508 102.266 102.058 101.842 101.325 101.022 100.638 100.16 99.609 98.955 97.979 -7 ,18418 ,KEBNE ,17125879,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:34:32 CET,0.0 0.348 0.673 0.967 1.263 1.568 1.861 2.42 2.694 2.961 3.221 3.74 3.99 4.494 4.981 5.448 5.676 6.135 6.589 7.269 7.722 8.175 8.852 9.51 10.158 10.808 11.468 12.349 13.193 14.017 15.072 16.106 17.079 18.222 19.563 20.9 22.42 24.102 25.88 27.857 30.258 33.162 36.197 39.789 43.807 48.483 53.91 60.745 69.17 79.533 88.627 94.126 97.747 100.217 102.072 103.494 104.458 105.132 105.754 106.205 106.552 106.815 106.965 107.006 107.036 107.098 107.101 107.067 106.989 106.888 106.804 106.702 106.598 106.497 106.368 106.24 106.077 105.884 105.752 105.592 105.349 105.179 104.976 104.88 104.68 104.438 104.12 103.921 103.578 103.261 103.003 102.695 101.925 101.54 101.149 100.65 100.049 99.27 97.862 -8 ,30940 ,KEBNE ,17125880,Thu Dec 30 16:52:54 CET,Thu Dec 30 18:33:27 CET,0.0 0.336 0.642 0.942 1.241 1.536 1.818 2.374 2.645 2.907 3.159 3.687 3.95 4.469 4.976 5.482 5.735 6.22 6.694 7.408 7.892 8.369 9.082 9.782 10.438 11.058 11.683 12.537 13.372 14.227 15.323 16.384 17.402 18.625 20.074 21.518 23.128 24.882 26.718 28.647 30.924 33.744 36.73 40.276 44.353 49.222 54.857 61.753 70.312 81.537 91.181 96.837 100.709 103.615 105.789 107.197 108.125 108.81 109.391 109.778 110.057 110.285 110.478 110.585 110.583 110.513 110.419 110.298 110.116 109.925 109.771 109.579 109.377 109.207 109.005 108.781 108.538 108.304 108.151 107.992 107.729 107.532 107.318 107.211 106.961 106.661 106.336 106.167 105.87 105.584 105.322 105.063 104.507 104.161 103.763 103.296 102.776 102.018 100.705 -9 ,7580 ,KEBNE ,17125881,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:33:32 CET,0.0 0.331 0.638 0.956 1.257 1.542 1.817 2.352 2.622 2.898 3.148 3.681 3.951 4.489 5.012 5.527 5.781 6.295 6.805 7.543 8.028 8.503 9.207 9.916 10.611 11.292 11.972 12.868 13.762 14.634 15.683 16.717 17.751 18.989 20.418 21.875 23.515 25.282 27.233 29.362 31.82 34.775 37.848 41.497 45.582 50.402 56.044 62.793 70.902 81.311 90.67 96.501 100.487 103.183 105.019 106.368 107.405 108.145 108.764 109.183 109.471 109.717 109.89 109.982 110.034 110.077 110.089 110.051 109.998 109.945 109.872 109.796 109.718 109.636 109.543 109.408 109.255 109.076 108.916 108.716 108.376 108.143 107.94 107.851 107.608 107.331 107.051 106.873 106.56 106.349 106.146 105.911 105.334 104.985 104.592 104.118 103.495 102.714 101.494 -10 ,8933 ,KEBNE ,17125882,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:35:02 CET,0.0 0.299 0.591 0.864 1.129 1.389 1.65 2.169 2.421 2.669 2.884 3.403 3.646 4.128 4.602 5.059 5.285 5.741 6.198 6.873 7.322 7.767 8.428 9.092 9.754 10.419 11.078 11.959 12.84 13.723 14.814 15.892 16.97 18.255 19.659 20.965 22.443 24.103 25.919 27.891 30.162 32.83 35.631 39.049 43.076 47.959 53.665 60.594 69.0 79.692 88.815 94.299 97.841 100.106 101.723 102.963 103.904 104.551 105.04 105.379 105.636 105.778 105.819 105.832 105.867 105.897 105.877 105.799 105.695 105.572 105.435 105.275 105.101 104.986 104.848 104.657 104.41 104.119 103.923 103.732 103.458 103.246 103.005 102.886 102.611 102.263 101.902 101.732 101.412 101.142 100.887 100.602 99.986 99.604 99.128 98.522 97.743 96.737 95.286 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index b0722992..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16610 ,TETRA ,17558348,Sat Nov 27 00:02:23 CET,Sat Nov 27 01:58:00 CET,0.0 0.185 0.297 0.364 0.42 0.47 0.519 0.562 0.635 0.672 0.713 0.706 0.843 0.884 0.965 1.051 1.128 1.162 1.224 1.277 1.35 1.408 1.462 1.518 1.579 1.652 1.718 1.777 1.859 1.921 1.971 2.049 2.123 2.186 2.267 2.36 2.438 2.515 2.6 2.677 2.75 2.858 2.966 2.987 2.956 2.882 2.647 2.237 1.619 0.468 -1.795 -4.874 -7.628 -9.872 -11.782 -13.659 -15.402 -17.006 -18.441 -19.935 -21.234 -22.353 -23.393 -24.357 -25.247 -26.034 -26.853 -27.588 -28.216 -28.857 -29.54 -30.117 -30.689 -31.309 -31.784 -32.271 -32.797 -33.328 -33.896 -34.272 -34.655 -35.285 -35.702 -36.133 -36.378 -36.906 -37.479 -38.122 -38.469 -38.954 -39.507 -39.878 -40.257 -41.055 -41.586 -42.209 -42.859 -43.662 -44.667 -46.017 -53.04 -2 ,14049 ,TETRA ,17558349,Sat Nov 27 00:04:21 CET,Sat Nov 27 02:00:21 CET,0.0 0.218 0.294 0.346 0.403 0.469 0.524 0.574 0.683 0.732 0.783 0.785 0.917 0.956 1.043 1.118 1.175 1.204 1.272 1.334 1.422 1.482 1.53 1.61 1.686 1.746 1.804 1.854 1.912 1.979 2.046 2.103 2.15 2.206 2.275 2.345 2.403 2.457 2.507 2.548 2.577 2.607 2.619 2.571 2.445 2.268 2.011 1.591 0.912 -0.33 -2.721 -5.748 -8.43 -10.732 -12.889 -15.008 -16.825 -18.479 -19.877 -21.204 -22.333 -23.376 -24.4 -25.362 -26.246 -27.033 -27.862 -28.617 -29.282 -29.966 -30.638 -31.18 -31.767 -32.391 -32.852 -33.321 -33.834 -34.377 -34.937 -35.32 -35.71 -36.289 -36.697 -37.138 -37.38 -37.885 -38.382 -38.946 -39.242 -39.67 -40.132 -40.44 -40.774 -41.586 -42.054 -42.583 -43.227 -44.021 -45.099 -46.548 -52.99 -3 ,16225 ,TETRA ,17558350,Sat Nov 27 00:04:24 CET,Sat Nov 27 02:00:44 CET,0.0 0.164 0.272 0.36 0.437 0.5 0.55 0.599 0.697 0.74 0.779 0.759 0.896 0.932 1.001 1.072 1.134 1.166 1.225 1.287 1.379 1.43 1.476 1.549 1.626 1.706 1.778 1.845 1.932 2.005 2.074 2.159 2.24 2.311 2.366 2.423 2.48 2.505 2.545 2.594 2.583 2.551 2.507 2.466 2.431 2.376 2.239 1.899 1.159 -0.154 -2.414 -5.468 -8.204 -10.796 -13.19 -15.36 -17.324 -19.102 -20.578 -22.013 -23.251 -24.363 -25.406 -26.368 -27.255 -28.068 -28.906 -29.658 -30.307 -30.951 -31.617 -32.196 -32.786 -33.411 -33.915 -34.414 -34.912 -35.442 -36.022 -36.446 -36.907 -37.634 -38.103 -38.593 -38.864 -39.421 -40.015 -40.661 -40.991 -41.448 -41.989 -42.358 -42.771 -43.722 -44.23 -44.798 -45.453 -46.228 -47.247 -48.721 -55.328 -4 ,19002 ,TETRA ,17558351,Sat Nov 27 00:05:27 CET,Sat Nov 27 02:03:10 CET,0.0 0.121 0.215 0.281 0.34 0.386 0.432 0.481 0.572 0.605 0.647 0.643 0.773 0.803 0.86 0.915 0.972 0.999 1.051 1.105 1.176 1.222 1.267 1.335 1.409 1.477 1.533 1.591 1.668 1.723 1.768 1.832 1.907 1.978 2.035 2.071 2.107 2.156 2.197 2.231 2.261 2.264 2.297 2.353 2.36 2.311 2.144 1.808 1.139 -0.039 -2.256 -5.17 -7.803 -10.282 -12.434 -14.263 -15.898 -17.397 -18.682 -20.012 -21.174 -22.269 -23.338 -24.349 -25.283 -26.105 -26.948 -27.679 -28.3 -28.955 -29.653 -30.237 -30.857 -31.493 -31.967 -32.449 -32.954 -33.5 -34.072 -34.476 -34.883 -35.498 -35.96 -36.433 -36.669 -37.173 -37.687 -38.257 -38.569 -39.02 -39.564 -39.941 -40.359 -41.315 -41.826 -42.351 -42.986 -43.81 -44.858 -46.282 -58.18 -5 ,20889 ,TETRA ,17558352,Sat Nov 27 00:05:27 CET,Sat Nov 27 02:03:59 CET,0.0 0.28 0.373 0.428 0.482 0.54 0.597 0.645 0.719 0.756 0.788 0.753 0.881 0.927 0.995 1.055 1.123 1.154 1.215 1.275 1.373 1.436 1.494 1.575 1.651 1.719 1.778 1.831 1.884 1.933 1.996 2.075 2.158 2.25 2.342 2.433 2.519 2.604 2.679 2.753 2.832 2.888 2.907 2.902 2.885 2.852 2.671 2.251 1.504 0.227 -2.329 -5.932 -8.829 -11.24 -13.395 -15.396 -17.097 -18.701 -20.128 -21.483 -22.671 -23.758 -24.766 -25.698 -26.573 -27.39 -28.221 -28.925 -29.542 -30.179 -30.828 -31.379 -31.955 -32.534 -32.99 -33.468 -33.989 -34.521 -35.062 -35.443 -35.825 -36.442 -36.892 -37.348 -37.581 -38.102 -38.64 -39.188 -39.477 -39.903 -40.422 -40.793 -41.184 -42.01 -42.461 -42.959 -43.523 -44.242 -45.154 -46.433 -52.03 -6 ,3818 ,TETRA ,17558353,Sat Nov 27 00:54:56 CET,Sat Nov 27 02:50:45 CET,0.0 0.119 0.192 0.26 0.329 0.384 0.43 0.472 0.547 0.588 0.632 0.626 0.758 0.798 0.877 0.949 1.009 1.037 1.083 1.139 1.233 1.283 1.328 1.396 1.455 1.509 1.559 1.608 1.682 1.75 1.824 1.909 1.976 2.044 2.129 2.214 2.28 2.352 2.425 2.504 2.598 2.688 2.73 2.7 2.601 2.432 2.153 1.744 0.994 -0.272 -2.518 -5.488 -8.095 -10.535 -12.665 -14.441 -16.023 -17.593 -18.982 -20.394 -21.635 -22.694 -23.678 -24.624 -25.531 -26.361 -27.2 -27.954 -28.626 -29.314 -30.032 -30.628 -31.232 -31.859 -32.359 -32.87 -33.392 -33.947 -34.546 -34.96 -35.349 -35.932 -36.362 -36.82 -37.045 -37.515 -38.037 -38.584 -38.855 -39.272 -39.761 -40.102 -40.476 -41.387 -41.923 -42.502 -43.154 -43.884 -44.759 -46.049 -51.392 -8 ,2704 ,TETRA ,17558355,Sat Nov 27 00:54:58 CET,Sat Nov 27 02:50:48 CET,0.0 0.13 0.218 0.322 0.39 0.442 0.488 0.531 0.615 0.662 0.705 0.673 0.787 0.812 0.867 0.917 0.961 0.983 1.033 1.084 1.148 1.189 1.238 1.319 1.378 1.413 1.452 1.502 1.583 1.658 1.709 1.771 1.829 1.869 1.898 1.931 1.985 2.045 2.106 2.156 2.171 2.184 2.2 2.17 2.063 1.862 1.531 0.987 0.075 -1.41 -4.02 -7.349 -10.383 -13.02 -15.214 -17.262 -19.182 -20.903 -22.354 -23.845 -25.144 -26.285 -27.301 -28.202 -29.06 -29.855 -30.69 -31.431 -32.067 -32.716 -33.405 -33.991 -34.601 -35.222 -35.701 -36.204 -36.706 -37.239 -37.831 -38.245 -38.649 -39.237 -39.66 -40.118 -40.359 -40.867 -41.373 -41.909 -42.196 -42.625 -43.147 -43.495 -43.884 -44.711 -45.171 -45.707 -46.323 -47.075 -47.997 -49.334 -54.668 -9 ,12525 ,TETRA ,17558356,Sat Nov 27 00:54:56 CET,Sat Nov 27 02:51:00 CET,0.0 0.242 0.347 0.447 0.523 0.584 0.634 0.679 0.771 0.807 0.847 0.837 0.97 1.0 1.054 1.119 1.18 1.207 1.258 1.305 1.366 1.41 1.457 1.511 1.571 1.637 1.698 1.756 1.825 1.886 1.943 2.015 2.087 2.145 2.212 2.284 2.343 2.407 2.478 2.563 2.639 2.716 2.785 2.816 2.795 2.724 2.618 2.286 1.545 0.249 -2.144 -5.25 -8.141 -10.69 -12.896 -15.01 -16.814 -18.302 -19.587 -20.895 -22.071 -23.141 -24.156 -25.103 -25.955 -26.747 -27.58 -28.315 -28.956 -29.62 -30.293 -30.851 -31.428 -32.029 -32.494 -32.958 -33.451 -33.985 -34.552 -34.954 -35.37 -36.016 -36.449 -36.895 -37.142 -37.668 -38.25 -38.892 -39.218 -39.692 -40.299 -40.706 -41.138 -42.078 -42.542 -43.037 -43.675 -44.383 -45.292 -46.624 -51.371 -10 ,22934 ,TETRA ,17558357,Sat Nov 27 00:57:58 CET,Sat Nov 27 02:53:58 CET,0.0 0.285 0.365 0.425 0.479 0.543 0.598 0.655 0.774 0.816 0.855 0.844 0.965 0.991 1.04 1.093 1.142 1.172 1.231 1.285 1.358 1.4 1.442 1.504 1.559 1.612 1.677 1.748 1.831 1.903 1.972 2.045 2.117 2.191 2.26 2.338 2.416 2.489 2.549 2.604 2.676 2.771 2.828 2.819 2.752 2.556 2.284 1.891 1.087 -0.218 -2.483 -5.516 -8.119 -10.387 -12.38 -14.171 -15.885 -17.557 -19.028 -20.505 -21.763 -22.876 -23.92 -24.896 -25.794 -26.582 -27.368 -28.086 -28.717 -29.384 -30.091 -30.688 -31.283 -31.853 -32.302 -32.775 -33.256 -33.75 -34.284 -34.646 -35.012 -35.623 -36.036 -36.47 -36.718 -37.222 -37.743 -38.329 -38.651 -39.118 -39.628 -39.948 -40.298 -41.085 -41.519 -41.995 -42.562 -43.352 -44.347 -45.717 -53.177 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 04be06a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27277 ,TETRA ,17558358,Sat Nov 27 00:57:57 CET,Sat Nov 27 02:57:06 CET,0.0 0.461 0.731 0.941 1.119 1.273 1.407 1.521 1.722 1.826 1.936 2.066 2.26 2.359 2.554 2.73 2.896 2.979 3.143 3.3 3.514 3.654 3.796 4.005 4.213 4.399 4.57 4.752 4.993 5.219 5.424 5.662 5.901 6.133 6.385 6.649 6.926 7.261 7.62 7.985 8.337 8.722 9.152 9.562 10.045 10.593 11.235 11.977 12.754 13.533 14.033 13.632 12.852 12.031 11.182 10.372 9.718 9.103 8.528 7.887 7.28 6.777 6.316 5.849 5.426 5.042 4.635 4.262 3.927 3.58 3.176 2.81 2.452 2.095 1.822 1.542 1.244 0.904 0.54 0.278 -0.006 -0.435 -0.729 -1.058 -1.229 -1.561 -1.906 -2.28 -2.475 -2.766 -3.114 -3.36 -3.644 -4.299 -4.624 -4.985 -5.41 -5.896 -6.526 -7.347 -10.073 -2 ,19898 ,TETRA ,17558359,Sat Nov 27 00:57:57 CET,Sat Nov 27 02:56:42 CET,0.0 0.482 0.726 0.917 1.09 1.27 1.416 1.548 1.816 1.937 2.048 2.165 2.351 2.437 2.606 2.777 2.945 3.026 3.188 3.343 3.544 3.68 3.823 4.023 4.214 4.398 4.562 4.728 4.947 5.152 5.365 5.608 5.835 6.055 6.32 6.64 6.938 7.252 7.58 7.945 8.318 8.716 9.222 9.735 10.3 10.888 11.498 12.207 13.044 13.836 14.362 13.993 13.214 12.322 11.455 10.726 10.052 9.362 8.725 8.109 7.594 7.09 6.583 6.091 5.631 5.215 4.757 4.334 3.985 3.624 3.241 2.921 2.56 2.177 1.899 1.62 1.329 1.018 0.695 0.467 0.208 -0.251 -0.575 -0.884 -1.041 -1.385 -1.752 -2.171 -2.405 -2.714 -3.069 -3.328 -3.604 -4.214 -4.546 -4.876 -5.297 -5.858 -6.537 -7.49 -11.487 -3 ,9383 ,TETRA ,17558360,Sat Nov 27 00:58:56 CET,Sat Nov 27 02:57:21 CET,0.0 0.434 0.692 0.898 1.069 1.22 1.354 1.473 1.705 1.807 1.92 2.052 2.234 2.32 2.497 2.682 2.848 2.926 3.082 3.233 3.457 3.6 3.734 3.922 4.106 4.28 4.445 4.601 4.804 5.015 5.212 5.446 5.683 5.919 6.198 6.506 6.805 7.142 7.489 7.848 8.209 8.612 9.068 9.511 10.046 10.594 11.145 11.759 12.383 12.92 13.359 13.035 12.204 11.299 10.454 9.65 8.882 8.168 7.522 6.862 6.304 5.797 5.287 4.822 4.411 4.047 3.616 3.192 2.865 2.514 2.093 1.732 1.379 1.017 0.732 0.421 0.064 -0.296 -0.672 -0.942 -1.209 -1.63 -1.936 -2.239 -2.397 -2.801 -3.244 -3.659 -3.864 -4.171 -4.562 -4.823 -5.093 -5.699 -6.071 -6.491 -6.957 -7.479 -8.123 -8.972 -12.253 -4 ,9996 ,TETRA ,17558361,Sat Nov 27 00:59:56 CET,Sat Nov 27 02:59:30 CET,0.0 0.477 0.77 0.974 1.163 1.339 1.482 1.604 1.83 1.943 2.048 2.153 2.338 2.435 2.625 2.798 2.976 3.062 3.227 3.386 3.607 3.743 3.877 4.08 4.266 4.436 4.597 4.762 4.989 5.208 5.416 5.66 5.9 6.128 6.401 6.722 7.031 7.371 7.706 8.051 8.43 8.879 9.39 9.839 10.344 10.875 11.452 12.075 12.683 13.241 13.443 12.98 12.304 11.531 10.76 10.045 9.377 8.702 8.106 7.48 6.898 6.364 5.816 5.31 4.867 4.442 3.98 3.577 3.21 2.821 2.424 2.073 1.693 1.303 1.01 0.699 0.36 0.005 -0.368 -0.627 -0.893 -1.315 -1.594 -1.898 -2.069 -2.428 -2.799 -3.177 -3.386 -3.7 -4.081 -4.34 -4.621 -5.277 -5.646 -6.027 -6.437 -6.949 -7.581 -8.386 -12.722 -5 ,20722 ,TETRA ,17558362,Sat Nov 27 01:02:56 CET,Sat Nov 27 03:01:53 CET,0.0 0.743 1.012 1.235 1.42 1.579 1.728 1.867 2.1 2.204 2.307 2.409 2.588 2.679 2.851 3.015 3.179 3.257 3.407 3.557 3.765 3.884 4.004 4.198 4.394 4.584 4.775 4.955 5.173 5.386 5.6 5.851 6.082 6.304 6.572 6.892 7.204 7.52 7.849 8.222 8.631 9.072 9.544 10.017 10.552 11.122 11.785 12.532 13.29 13.917 14.263 14.158 13.728 13.045 12.282 11.552 10.849 10.179 9.606 9.037 8.473 7.918 7.396 6.896 6.407 5.951 5.472 5.037 4.66 4.266 3.839 3.481 3.102 2.703 2.406 2.087 1.749 1.421 1.087 0.846 0.582 0.163 -0.125 -0.447 -0.618 -0.968 -1.349 -1.757 -1.966 -2.278 -2.687 -2.954 -3.218 -3.771 -4.101 -4.502 -4.948 -5.442 -6.038 -6.932 -10.546 -6 ,22004 ,TETRA ,17558363,Sat Nov 27 01:02:57 CET,Sat Nov 27 03:01:34 CET,0.0 0.589 0.836 1.045 1.227 1.371 1.488 1.61 1.84 1.945 2.049 2.172 2.365 2.46 2.624 2.782 2.949 3.026 3.17 3.317 3.532 3.67 3.807 3.998 4.167 4.337 4.511 4.679 4.886 5.082 5.273 5.516 5.759 5.973 6.218 6.508 6.799 7.125 7.464 7.823 8.224 8.691 9.233 9.737 10.281 10.864 11.526 12.225 12.897 13.527 13.844 13.561 13.035 12.38 11.632 10.909 10.217 9.507 8.869 8.214 7.604 7.068 6.567 6.095 5.664 5.253 4.823 4.426 4.063 3.684 3.281 2.944 2.588 2.199 1.89 1.565 1.235 0.895 0.541 0.306 0.056 -0.352 -0.624 -0.912 -1.064 -1.384 -1.748 -2.14 -2.353 -2.667 -2.997 -3.231 -3.489 -4.052 -4.352 -4.674 -5.066 -5.545 -6.133 -7.034 -10.367 -7 ,12420 ,TETRA ,17558364,Sat Nov 27 01:04:58 CET,Sat Nov 27 03:04:31 CET,0.0 0.917 1.181 1.391 1.566 1.709 1.844 1.967 2.195 2.309 2.426 2.544 2.732 2.83 3.013 3.175 3.329 3.404 3.559 3.706 3.91 4.041 4.173 4.379 4.58 4.761 4.929 5.1 5.326 5.543 5.754 5.998 6.228 6.456 6.728 7.041 7.344 7.689 8.041 8.378 8.744 9.174 9.672 10.187 10.79 11.424 12.07 12.645 13.258 13.95 14.365 14.186 13.628 12.81 11.882 10.953 10.131 9.377 8.699 8.039 7.478 6.95 6.431 5.941 5.456 5.017 4.569 4.163 3.809 3.438 3.013 2.646 2.268 1.874 1.574 1.265 0.958 0.632 0.283 0.039 -0.226 -0.638 -0.922 -1.219 -1.38 -1.695 -2.002 -2.362 -2.553 -2.838 -3.197 -3.429 -3.668 -4.263 -4.606 -4.972 -5.398 -5.882 -6.425 -7.28 -10.57 -8 ,16521 ,TETRA ,17558365,Sat Nov 27 01:05:56 CET,Sat Nov 27 03:04:32 CET,0.0 0.294 0.55 0.746 0.916 1.089 1.219 1.34 1.597 1.719 1.829 1.942 2.121 2.211 2.397 2.569 2.734 2.812 2.956 3.098 3.313 3.46 3.6 3.808 4.004 4.184 4.352 4.505 4.729 4.955 5.15 5.379 5.602 5.809 6.057 6.33 6.612 6.945 7.269 7.611 7.992 8.423 8.917 9.429 10.043 10.716 11.433 12.186 12.984 13.809 14.271 13.896 13.282 12.5 11.713 10.996 10.301 9.609 8.979 8.341 7.783 7.284 6.758 6.242 5.746 5.271 4.768 4.322 3.951 3.563 3.125 2.75 2.363 1.976 1.702 1.398 1.06 0.719 0.354 0.084 -0.2 -0.664 -0.977 -1.28 -1.441 -1.82 -2.232 -2.648 -2.885 -3.22 -3.608 -3.869 -4.15 -4.795 -5.159 -5.576 -6.045 -6.557 -7.171 -8.092 -12.373 -9 ,1889 ,TETRA ,17558366,Fri Nov 26 23:56:25 CET,Sat Nov 27 01:54:51 CET,0.0 0.178 0.303 0.426 0.54 0.655 0.78 0.901 1.098 1.194 1.31 1.43 1.603 1.684 1.855 2.019 2.163 2.234 2.375 2.506 2.687 2.814 2.951 3.151 3.334 3.507 3.678 3.852 4.075 4.28 4.481 4.708 4.913 5.122 5.38 5.695 6.005 6.334 6.698 7.074 7.455 7.894 8.392 8.834 9.308 9.862 10.545 11.348 12.069 12.584 12.842 12.632 12.263 11.693 10.911 10.117 9.43 8.839 8.35 7.818 7.289 6.808 6.323 5.822 5.352 4.917 4.438 4.007 3.644 3.249 2.817 2.462 2.098 1.708 1.406 1.104 0.803 0.488 0.123 -0.142 -0.419 -0.849 -1.144 -1.457 -1.616 -1.969 -2.349 -2.723 -2.916 -3.206 -3.52 -3.749 -4.002 -4.612 -4.989 -5.381 -5.791 -6.285 -6.948 -7.914 -11.438 -10 ,22482 ,TETRA ,17558367,Fri Nov 26 23:56:28 CET,Sat Nov 27 01:54:54 CET,0.0 0.58 0.851 1.096 1.325 1.491 1.625 1.748 1.963 2.071 2.178 2.291 2.472 2.561 2.746 2.936 3.107 3.188 3.35 3.514 3.741 3.876 4.014 4.231 4.439 4.62 4.795 4.979 5.217 5.44 5.656 5.916 6.159 6.385 6.649 6.949 7.226 7.517 7.866 8.25 8.637 9.086 9.562 9.981 10.456 10.961 11.498 12.152 12.781 13.227 13.62 13.538 13.018 12.361 11.65 10.972 10.298 9.568 8.904 8.228 7.681 7.171 6.642 6.14 5.662 5.22 4.728 4.284 3.907 3.519 3.106 2.743 2.396 2.023 1.707 1.386 1.055 0.709 0.352 0.096 -0.17 -0.575 -0.868 -1.179 -1.341 -1.683 -2.051 -2.463 -2.683 -3.001 -3.402 -3.673 -3.965 -4.613 -4.969 -5.357 -5.765 -6.259 -6.949 -7.901 -11.475 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 3c6d910d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,11905 ,TETRA ,17558369,Fri Nov 26 23:57:27 CET,Sat Nov 27 01:51:56 CET,0.0 0.602 0.869 1.094 1.299 1.477 1.633 1.781 2.06 2.187 2.322 2.485 2.723 2.846 3.087 3.328 3.567 3.683 3.926 4.156 4.483 4.704 4.924 5.246 5.571 5.89 6.204 6.52 6.937 7.335 7.714 8.175 8.622 9.08 9.641 10.261 10.827 11.438 12.093 12.786 13.541 14.373 15.353 16.383 17.611 19.015 20.707 22.678 24.961 27.579 30.517 32.76 33.888 34.459 34.734 34.775 34.714 34.533 34.204 33.772 33.377 32.989 32.563 32.14 31.738 31.373 31.002 30.631 30.287 29.981 29.665 29.375 29.084 28.779 28.523 28.236 27.937 27.639 27.322 27.108 26.881 26.526 26.259 25.961 25.81 25.501 25.164 24.799 24.601 24.312 23.946 23.686 23.401 22.805 22.484 22.141 21.728 21.209 20.587 19.723 12.957 -3 ,7014 ,TETRA ,17558370,Fri Nov 26 23:57:25 CET,Sat Nov 27 01:51:58 CET,0.0 0.327 0.496 0.672 0.837 0.993 1.154 1.309 1.587 1.716 1.839 1.999 2.253 2.394 2.678 2.923 3.159 3.275 3.495 3.709 4.032 4.254 4.474 4.789 5.108 5.426 5.738 6.043 6.445 6.846 7.245 7.73 8.197 8.659 9.206 9.83 10.424 11.044 11.692 12.384 13.134 13.989 15.029 16.139 17.391 18.757 20.313 22.046 24.108 26.415 28.873 30.532 31.199 31.289 31.16 30.837 30.435 30.012 29.572 29.076 28.629 28.199 27.789 27.423 27.073 26.707 26.291 25.943 25.643 25.335 25.002 24.692 24.374 24.055 23.79 23.503 23.21 22.9 22.581 22.367 22.131 21.747 21.471 21.167 21.011 20.69 20.367 20.024 19.835 19.56 19.217 18.998 18.769 18.225 17.94 17.612 17.236 16.76 16.094 15.195 8.107 -4 ,6193 ,TETRA ,17558371,Fri Nov 26 23:58:25 CET,Sat Nov 27 01:53:48 CET,0.0 0.978 1.263 1.515 1.762 1.986 2.177 2.355 2.723 2.899 3.071 3.286 3.552 3.701 3.996 4.285 4.561 4.689 4.939 5.189 5.548 5.78 6.016 6.372 6.715 7.038 7.338 7.632 8.024 8.411 8.802 9.305 9.804 10.283 10.84 11.45 12.013 12.632 13.309 14.018 14.763 15.642 16.704 17.759 18.964 20.333 21.896 23.696 25.822 28.211 30.876 32.515 33.013 33.096 32.97 32.697 32.347 31.977 31.611 31.118 30.576 30.091 29.658 29.221 28.798 28.427 28.054 27.709 27.376 27.017 26.654 26.361 26.041 25.695 25.425 25.135 24.812 24.471 24.134 23.907 23.655 23.264 23.016 22.755 22.629 22.369 22.065 21.728 21.537 21.239 20.791 20.512 20.239 19.655 19.3 18.931 18.509 17.971 17.343 16.484 10.868 -6 ,19938 ,TETRA ,17558374,Fri Nov 26 23:59:28 CET,Sat Nov 27 01:55:41 CET,0.0 0.612 0.935 1.179 1.362 1.545 1.735 1.901 2.224 2.385 2.54 2.736 2.989 3.128 3.408 3.677 3.938 4.07 4.313 4.569 4.983 5.232 5.463 5.817 6.175 6.518 6.847 7.168 7.578 7.984 8.393 8.905 9.406 9.881 10.419 11.032 11.635 12.32 13.07 13.872 14.761 15.761 16.939 18.177 19.587 21.156 22.974 24.955 27.216 29.653 32.217 33.96 34.639 34.758 34.571 34.181 33.694 33.184 32.683 32.117 31.639 31.25 30.86 30.481 30.141 29.798 29.417 29.091 28.79 28.446 28.062 27.743 27.429 27.084 26.807 26.543 26.27 25.967 25.639 25.408 25.173 24.807 24.552 24.301 24.161 23.852 23.562 23.243 23.048 22.765 22.413 22.186 21.95 21.315 20.949 20.529 20.055 19.509 18.833 17.922 11.242 -8 ,10427 ,TETRA ,17558376,Fri Nov 26 23:59:26 CET,Sat Nov 27 01:54:36 CET,0.0 0.614 0.927 1.17 1.365 1.551 1.727 1.902 2.238 2.407 2.563 2.741 3.001 3.154 3.443 3.702 3.958 4.089 4.348 4.599 4.967 5.213 5.462 5.825 6.167 6.489 6.814 7.133 7.54 7.954 8.358 8.853 9.367 9.871 10.448 11.104 11.748 12.495 13.309 14.159 15.054 16.066 17.245 18.454 19.861 21.367 23.056 24.927 27.111 29.483 31.979 33.573 34.077 34.078 33.817 33.412 32.878 32.288 31.751 31.208 30.716 30.275 29.876 29.499 29.149 28.811 28.441 28.087 27.743 27.408 27.079 26.788 26.475 26.124 25.843 25.572 25.304 25.003 24.664 24.428 24.186 23.81 23.545 23.27 23.133 22.833 22.496 22.162 21.983 21.709 21.37 21.13 20.883 20.322 20.012 19.697 19.304 18.771 18.096 17.022 10.627 -10 ,31425 ,TETRA ,17558378,Fri Nov 26 23:59:30 CET,Sat Nov 27 01:42:55 CET,0.0 1.11 1.403 1.625 1.83 2.017 2.222 2.418 2.756 2.915 3.064 3.243 3.502 3.654 3.966 4.253 4.523 4.666 4.936 5.187 5.546 5.782 6.014 6.357 6.7 7.031 7.35 7.651 8.043 8.46 8.87 9.359 9.825 10.277 10.83 11.441 12.016 12.668 13.388 14.169 14.985 15.898 17.044 18.216 19.555 20.99 22.688 24.72 27.01 29.625 32.539 34.374 35.068 35.285 35.232 35.04 34.764 34.423 34.043 33.572 33.111 32.687 32.253 31.802 31.373 30.982 30.568 30.196 29.873 29.528 29.16 28.839 28.506 28.178 27.921 27.642 27.365 27.074 26.748 26.525 26.304 25.948 25.68 25.394 25.251 24.947 24.62 24.27 24.085 23.822 23.508 23.281 23.032 22.438 22.076 21.678 21.275 20.797 20.125 19.031 13.615 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt deleted file mode 100644 index cf28c441..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29833 ,TETRA ,17558379,Fri Nov 26 23:59:26 CET,Sat Nov 27 01:55:31 CET,0.0 2.704 3.148 3.427 3.64 3.846 4.036 4.195 4.483 4.623 4.765 4.915 5.135 5.237 5.419 5.602 5.771 5.842 5.996 6.168 6.432 6.6 6.75 6.942 7.125 7.306 7.484 7.661 7.87 8.057 8.233 8.462 8.657 8.805 8.991 9.218 9.427 9.623 9.818 10.051 10.289 10.484 10.657 10.814 10.954 10.919 10.713 10.332 9.494 7.992 5.026 1.178 -2.029 -4.838 -7.355 -9.658 -11.616 -13.333 -14.772 -16.187 -17.421 -18.524 -19.556 -20.522 -21.427 -22.247 -23.087 -23.819 -24.433 -25.066 -25.73 -26.277 -26.836 -27.409 -27.848 -28.286 -28.738 -29.193 -29.658 -29.997 -30.333 -30.839 -31.193 -31.554 -31.744 -32.145 -32.562 -32.976 -33.196 -33.566 -33.898 -34.154 -34.411 -35.014 -35.344 -35.712 -36.125 -36.564 -37.1 -37.865 -40.783 -2 ,6243 ,TETRA ,17558380,Fri Nov 26 23:59:28 CET,Sat Nov 27 01:55:17 CET,0.0 2.249 2.587 2.862 3.142 3.384 3.588 3.779 4.115 4.263 4.398 4.532 4.765 4.884 5.123 5.342 5.531 5.631 5.847 6.077 6.381 6.544 6.681 6.878 7.066 7.227 7.367 7.498 7.669 7.836 7.98 8.138 8.293 8.439 8.592 8.77 8.962 9.151 9.301 9.433 9.578 9.69 9.737 9.788 9.813 9.764 9.64 9.074 7.897 6.072 2.759 -1.56 -5.095 -7.958 -10.385 -12.562 -14.416 -16.04 -17.422 -18.797 -19.934 -20.934 -21.921 -22.861 -23.732 -24.533 -25.346 -26.041 -26.631 -27.249 -27.892 -28.423 -29.004 -29.599 -30.021 -30.464 -30.938 -31.416 -31.892 -32.205 -32.533 -33.06 -33.42 -33.773 -33.951 -34.339 -34.737 -35.134 -35.343 -35.71 -36.068 -36.33 -36.585 -37.13 -37.466 -37.87 -38.311 -38.747 -39.192 -39.866 -44.16 -3 ,22756 ,TETRA ,17558381,Fri Nov 26 23:59:30 CET,Sat Nov 27 01:44:12 CET,0.0 2.257 2.627 2.927 3.147 3.324 3.52 3.703 4.012 4.147 4.263 4.398 4.637 4.74 4.933 5.142 5.349 5.442 5.603 5.764 6.019 6.178 6.324 6.545 6.777 6.963 7.094 7.233 7.403 7.566 7.73 7.907 8.068 8.228 8.441 8.662 8.847 9.056 9.259 9.452 9.602 9.733 9.899 10.006 10.031 9.923 9.678 9.239 8.381 6.793 3.808 -0.077 -3.293 -5.964 -8.368 -10.473 -12.253 -13.846 -15.163 -16.458 -17.633 -18.735 -19.784 -20.767 -21.648 -22.471 -23.331 -24.034 -24.644 -25.312 -26.03 -26.601 -27.157 -27.727 -28.17 -28.629 -29.098 -29.597 -30.109 -30.454 -30.801 -31.339 -31.7 -32.056 -32.243 -32.633 -33.053 -33.51 -33.746 -34.165 -34.561 -34.824 -35.086 -35.684 -35.996 -36.307 -36.661 -37.057 -37.557 -38.275 -41.442 -4 ,17396 ,TETRA ,17558382,Fri Nov 26 23:59:27 CET,Sat Nov 27 01:56:14 CET,0.0 3.257 3.689 4.02 4.291 4.531 4.728 4.891 5.178 5.318 5.44 5.517 5.703 5.796 5.977 6.16 6.339 6.428 6.59 6.735 6.947 7.08 7.188 7.337 7.482 7.625 7.772 7.914 8.093 8.28 8.467 8.687 8.878 9.028 9.179 9.343 9.493 9.613 9.71 9.816 9.892 9.953 10.058 10.11 10.024 9.769 9.313 8.58 7.339 5.397 1.934 -2.41 -5.879 -8.824 -11.337 -13.518 -15.468 -17.19 -18.639 -20.046 -21.18 -22.204 -23.226 -24.202 -25.071 -25.843 -26.659 -27.399 -28.021 -28.668 -29.349 -29.904 -30.473 -31.038 -31.47 -31.92 -32.376 -32.834 -33.304 -33.622 -33.946 -34.459 -34.826 -35.208 -35.411 -35.822 -36.237 -36.669 -36.89 -37.271 -37.601 -37.856 -38.145 -38.744 -39.075 -39.431 -39.835 -40.343 -40.965 -41.717 -44.77 -5 ,32246 ,TETRA ,17558383,Fri Nov 26 23:59:29 CET,Sat Nov 27 01:56:13 CET,0.0 3.265 3.66 3.955 4.201 4.398 4.53 4.648 4.843 4.939 5.033 5.103 5.299 5.377 5.532 5.685 5.833 5.907 6.068 6.214 6.404 6.532 6.647 6.795 6.938 7.074 7.221 7.383 7.559 7.714 7.868 8.071 8.255 8.401 8.549 8.687 8.813 8.927 9.039 9.212 9.386 9.523 9.701 9.83 9.891 9.814 9.463 8.74 7.574 5.677 2.258 -1.789 -5.008 -7.802 -10.21 -12.418 -14.446 -16.263 -17.808 -19.297 -20.546 -21.642 -22.687 -23.682 -24.607 -25.421 -26.231 -26.96 -27.578 -28.204 -28.855 -29.395 -29.931 -30.465 -30.901 -31.345 -31.788 -32.249 -32.729 -33.067 -33.439 -34.031 -34.432 -34.85 -35.062 -35.488 -35.901 -36.322 -36.538 -36.901 -37.196 -37.459 -37.738 -38.331 -38.663 -39.005 -39.4 -39.848 -40.39 -41.036 -42.835 -6 ,17229 ,TETRA ,17558384,Fri Nov 26 23:59:31 CET,Sat Nov 27 01:44:21 CET,0.0 1.941 2.24 2.488 2.681 2.867 3.029 3.175 3.419 3.53 3.648 3.779 4.02 4.132 4.33 4.527 4.712 4.798 4.971 5.134 5.34 5.466 5.6 5.795 5.969 6.146 6.308 6.445 6.601 6.748 6.892 7.054 7.199 7.35 7.518 7.676 7.837 8.0 8.142 8.288 8.368 8.378 8.399 8.389 8.254 7.955 7.444 6.669 5.503 3.675 0.272 -4.054 -7.619 -10.531 -13.02 -15.264 -17.137 -18.746 -20.072 -21.429 -22.651 -23.766 -24.856 -25.86 -26.744 -27.501 -28.288 -29.0 -29.616 -30.258 -30.918 -31.458 -32.015 -32.578 -32.998 -33.442 -33.935 -34.485 -35.072 -35.45 -35.792 -36.326 -36.693 -37.052 -37.237 -37.617 -38.02 -38.453 -38.679 -39.041 -39.366 -39.618 -39.86 -40.382 -40.697 -41.076 -41.497 -41.965 -42.578 -43.537 -47.27 -7 ,12477 ,TETRA ,17558385,Fri Nov 26 23:59:27 CET,Sat Nov 27 01:55:51 CET,0.0 2.488 2.91 3.266 3.52 3.747 3.964 4.14 4.45 4.585 4.711 4.836 5.056 5.163 5.372 5.558 5.725 5.814 5.972 6.101 6.314 6.453 6.578 6.767 6.948 7.115 7.284 7.455 7.654 7.836 8.018 8.246 8.467 8.656 8.828 8.999 9.15 9.301 9.452 9.595 9.742 9.927 10.131 10.188 10.09 9.87 9.467 8.809 7.63 5.653 2.303 -1.735 -5.094 -7.979 -10.554 -12.834 -14.705 -16.333 -17.7 -19.081 -20.266 -21.336 -22.377 -23.303 -24.14 -24.941 -25.802 -26.582 -27.232 -27.864 -28.512 -29.038 -29.592 -30.16 -30.603 -31.06 -31.528 -32.021 -32.506 -32.844 -33.189 -33.717 -34.074 -34.423 -34.602 -34.989 -35.403 -35.823 -36.041 -36.412 -36.745 -36.998 -37.252 -37.803 -38.122 -38.466 -38.836 -39.237 -39.689 -40.26 -43.85 -8 ,4471 ,TETRA ,17558386,Fri Nov 26 23:59:30 CET,Sat Nov 27 01:55:58 CET,0.0 3.017 3.487 3.756 3.981 4.197 4.385 4.544 4.91 5.1 5.265 5.452 5.694 5.815 6.046 6.245 6.425 6.503 6.63 6.762 6.966 7.098 7.217 7.386 7.572 7.743 7.891 8.028 8.185 8.332 8.478 8.617 8.741 8.861 8.949 9.046 9.165 9.316 9.466 9.581 9.695 9.835 9.934 9.969 9.874 9.546 9.037 8.286 7.09 5.185 1.867 -2.227 -5.561 -8.371 -10.791 -12.887 -14.628 -16.149 -17.479 -18.839 -20.005 -21.014 -21.942 -22.81 -23.643 -24.446 -25.252 -25.973 -26.622 -27.256 -27.876 -28.389 -28.935 -29.509 -29.957 -30.414 -30.874 -31.343 -31.818 -32.148 -32.489 -33.004 -33.366 -33.744 -33.936 -34.325 -34.72 -35.151 -35.379 -35.743 -36.086 -36.347 -36.605 -37.195 -37.569 -37.956 -38.375 -38.819 -39.304 -40.036 -45.011 -9 ,2714 ,TETRA ,17558387,Fri Nov 26 23:59:28 CET,Sat Nov 27 01:44:23 CET,0.0 0.83 1.107 1.309 1.463 1.6 1.737 1.878 2.114 2.22 2.333 2.436 2.636 2.717 2.884 3.024 3.148 3.217 3.348 3.479 3.673 3.792 3.904 4.062 4.23 4.395 4.521 4.648 4.852 5.035 5.187 5.361 5.522 5.699 5.906 6.112 6.271 6.406 6.544 6.662 6.738 6.794 6.835 6.806 6.743 6.669 6.507 6.055 4.995 3.182 -0.099 -4.31 -7.695 -10.566 -13.043 -15.144 -16.894 -18.467 -19.893 -21.334 -22.528 -23.613 -24.64 -25.569 -26.476 -27.282 -28.078 -28.832 -29.475 -30.108 -30.801 -31.353 -31.881 -32.464 -32.919 -33.363 -33.824 -34.311 -34.801 -35.123 -35.463 -36.012 -36.399 -36.831 -37.051 -37.488 -37.941 -38.375 -38.6 -39.017 -39.411 -39.691 -39.973 -40.592 -40.935 -41.295 -41.705 -42.204 -42.745 -43.415 -46.368 -10 ,4243 ,TETRA ,17558388,Fri Nov 26 23:59:28 CET,Sat Nov 27 01:55:50 CET,0.0 1.092 1.326 1.517 1.658 1.79 1.931 2.08 2.367 2.481 2.57 2.637 2.845 2.937 3.108 3.253 3.396 3.467 3.602 3.736 3.924 4.034 4.147 4.327 4.492 4.637 4.777 4.917 5.098 5.256 5.393 5.599 5.836 6.011 6.167 6.304 6.402 6.502 6.604 6.719 6.848 6.999 7.062 7.002 6.898 6.74 6.337 5.539 4.285 2.308 -1.071 -5.203 -8.565 -11.393 -13.907 -16.103 -17.913 -19.599 -21.083 -22.517 -23.725 -24.775 -25.757 -26.74 -27.681 -28.467 -29.246 -29.964 -30.595 -31.239 -31.926 -32.494 -33.043 -33.609 -34.049 -34.5 -34.97 -35.453 -35.951 -36.301 -36.663 -37.212 -37.574 -37.948 -38.141 -38.526 -38.915 -39.329 -39.549 -39.918 -40.253 -40.499 -40.765 -41.322 -41.628 -41.963 -42.329 -42.76 -43.283 -43.975 -47.962 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt deleted file mode 100644 index 113bd819..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7960 ,TETRA ,17558389,Fri Nov 26 23:59:30 CET,Sat Nov 27 01:56:14 CET,0.0 1.739 2.112 2.395 2.621 2.762 2.869 2.976 3.137 3.191 3.231 3.185 3.318 3.346 3.397 3.404 3.393 3.398 3.402 3.39 3.349 3.325 3.283 3.19 3.11 3.022 2.912 2.791 2.617 2.433 2.252 2.021 1.781 1.517 1.169 0.739 0.292 -0.236 -0.857 -1.538 -2.296 -3.258 -4.459 -5.744 -7.42 -9.536 -12.309 -15.848 -20.561 -27.065 -36.843 -47.255 -54.997 -61.156 -66.069 -70.196 -73.637 -76.573 -79.001 -81.322 -83.252 -84.94 -86.515 -87.926 -89.141 -90.216 -91.35 -92.374 -93.225 -94.065 -94.908 -95.595 -96.303 -97.034 -97.594 -98.169 -98.76 -99.352 -99.959 -100.372 -100.796 -101.446 -101.895 -102.361 -102.597 -103.093 -103.606 -104.111 -104.372 -104.873 -105.216 -105.514 -105.801 -106.446 -106.818 -107.221 -107.652 -108.103 -108.627 -109.272 -112.645 -2 ,11141 ,TETRA ,17558390,Fri Nov 26 23:59:32 CET,Sat Nov 27 01:45:21 CET,0.0 2.058 2.55 2.824 2.984 3.151 3.338 3.499 3.739 3.833 3.921 3.965 4.125 4.158 4.209 4.255 4.298 4.311 4.326 4.33 4.328 4.319 4.289 4.209 4.119 4.01 3.887 3.768 3.596 3.4 3.207 2.967 2.744 2.537 2.253 1.884 1.505 1.03 0.473 -0.178 -0.951 -1.869 -3.035 -4.307 -5.962 -8.1 -10.926 -14.522 -19.314 -25.924 -35.768 -46.268 -54.029 -60.08 -64.939 -68.992 -72.336 -75.228 -77.642 -79.975 -81.933 -83.646 -85.249 -86.717 -88.027 -89.184 -90.361 -91.412 -92.307 -93.211 -94.143 -94.899 -95.656 -96.417 -96.997 -97.586 -98.166 -98.754 -99.356 -99.764 -100.181 -100.809 -101.239 -101.685 -101.915 -102.386 -102.852 -103.319 -103.562 -104.051 -104.393 -104.669 -104.969 -105.655 -106.017 -106.412 -106.827 -107.304 -107.856 -108.516 -110.908 -3 ,9061 ,TETRA ,17558391,Fri Nov 26 23:59:27 CET,Sat Nov 27 01:57:39 CET,0.0 1.545 1.912 2.167 2.367 2.525 2.644 2.727 2.851 2.907 2.954 2.888 3.013 3.034 3.085 3.144 3.195 3.219 3.241 3.222 3.164 3.116 3.059 2.954 2.865 2.766 2.633 2.504 2.339 2.202 2.043 1.809 1.573 1.312 1.003 0.624 0.22 -0.252 -0.803 -1.46 -2.226 -3.167 -4.382 -5.744 -7.488 -9.643 -12.455 -15.977 -20.671 -27.364 -37.288 -47.645 -55.341 -61.428 -66.385 -70.592 -74.058 -76.981 -79.371 -81.693 -83.62 -85.241 -86.739 -88.115 -89.365 -90.488 -91.617 -92.597 -93.431 -94.269 -95.118 -95.81 -96.508 -97.241 -97.819 -98.392 -98.959 -99.541 -100.135 -100.54 -100.961 -101.607 -102.052 -102.516 -102.758 -103.254 -103.747 -104.281 -104.569 -105.082 -105.443 -105.75 -106.066 -106.717 -107.08 -107.45 -107.861 -108.342 -108.827 -109.456 -111.805 -4 ,31036 ,TETRA ,17558392,Fri Nov 26 23:59:30 CET,Sat Nov 27 01:57:55 CET,0.0 2.273 2.693 2.949 3.126 3.284 3.418 3.52 3.68 3.758 3.825 3.822 3.972 4.009 4.07 4.093 4.093 4.091 4.078 4.052 4.036 4.014 3.988 3.966 3.93 3.878 3.822 3.77 3.673 3.529 3.357 3.136 2.911 2.681 2.387 1.99 1.558 1.064 0.526 -0.085 -0.834 -1.741 -2.896 -4.218 -5.927 -8.036 -10.718 -14.161 -18.9 -25.423 -35.174 -45.68 -53.411 -59.47 -64.32 -68.389 -71.81 -74.793 -77.247 -79.592 -81.556 -83.242 -84.785 -86.191 -87.471 -88.605 -89.727 -90.71 -91.55 -92.393 -93.243 -93.941 -94.677 -95.432 -95.994 -96.558 -97.133 -97.724 -98.329 -98.735 -99.149 -99.795 -100.238 -100.696 -100.932 -101.404 -101.883 -102.37 -102.618 -103.113 -103.457 -103.741 -104.035 -104.666 -105.005 -105.384 -105.788 -106.201 -106.664 -107.352 -110.004 -5 ,11734 ,TETRA ,17558393,Fri Nov 26 23:59:32 CET,Sat Nov 27 01:45:15 CET,0.0 1.745 2.214 2.605 2.868 3.042 3.19 3.34 3.629 3.75 3.841 3.846 3.997 4.034 4.083 4.142 4.196 4.195 4.197 4.203 4.185 4.167 4.131 4.059 4.011 3.96 3.887 3.811 3.696 3.565 3.406 3.187 2.951 2.692 2.369 1.966 1.529 1.029 0.456 -0.176 -0.888 -1.807 -3.026 -4.395 -6.122 -8.212 -10.954 -14.465 -19.137 -25.696 -35.54 -45.999 -53.718 -59.707 -64.51 -68.601 -72.037 -74.972 -77.339 -79.616 -81.585 -83.3 -84.879 -86.322 -87.603 -88.711 -89.816 -90.789 -91.629 -92.473 -93.344 -94.087 -94.829 -95.594 -96.175 -96.754 -97.362 -97.983 -98.616 -99.03 -99.453 -100.126 -100.571 -101.014 -101.244 -101.711 -102.187 -102.69 -102.963 -103.472 -103.805 -104.109 -104.429 -105.082 -105.446 -105.827 -106.237 -106.727 -107.303 -107.954 -110.314 -6 ,8457 ,TETRA ,17558394,Sat Nov 27 01:05:58 CET,Sat Nov 27 03:03:11 CET,0.0 1.594 1.898 2.131 2.311 2.448 2.556 2.639 2.798 2.866 2.921 2.89 3.015 3.027 3.086 3.161 3.206 3.21 3.188 3.161 3.111 3.084 3.056 2.971 2.869 2.758 2.649 2.551 2.409 2.277 2.151 1.943 1.713 1.476 1.145 0.744 0.354 -0.125 -0.709 -1.381 -2.128 -3.06 -4.308 -5.629 -7.288 -9.414 -12.124 -15.502 -20.093 -26.625 -36.589 -47.152 -54.948 -61.055 -65.914 -70.017 -73.432 -76.387 -78.865 -81.252 -83.223 -84.941 -86.525 -87.957 -89.227 -90.338 -91.472 -92.468 -93.321 -94.191 -95.062 -95.765 -96.492 -97.229 -97.791 -98.381 -98.985 -99.609 -100.244 -100.663 -101.093 -101.751 -102.197 -102.654 -102.902 -103.416 -103.921 -104.439 -104.694 -105.18 -105.523 -105.83 -106.123 -106.77 -107.121 -107.484 -107.883 -108.332 -108.903 -109.581 -112.035 -7 ,12513 ,TETRA ,17558395,Sat Nov 27 01:07:56 CET,Sat Nov 27 02:58:07 CET,0.0 2.338 2.731 3.053 3.32 3.514 3.646 3.748 3.873 3.931 3.975 3.937 4.067 4.085 4.122 4.141 4.172 4.19 4.187 4.16 4.114 4.08 4.049 3.994 3.924 3.853 3.75 3.619 3.439 3.269 3.084 2.8 2.528 2.275 1.975 1.606 1.217 0.746 0.17 -0.5 -1.285 -2.26 -3.503 -4.851 -6.52 -8.55 -11.226 -14.669 -19.312 -25.781 -35.364 -45.618 -53.374 -59.542 -64.507 -68.67 -72.108 -75.063 -77.508 -79.859 -81.793 -83.453 -85.016 -86.477 -87.801 -88.952 -90.121 -91.153 -92.011 -92.887 -93.795 -94.526 -95.264 -96.024 -96.608 -97.196 -97.772 -98.34 -98.934 -99.344 -99.758 -100.41 -100.858 -101.298 -101.519 -102.0 -102.506 -103.013 -103.293 -103.824 -104.142 -104.411 -104.693 -105.294 -105.659 -106.067 -106.482 -106.931 -107.425 -108.035 -110.764 -8 ,20658 ,TETRA ,17558396,Sat Nov 27 01:10:55 CET,Sat Nov 27 03:09:24 CET,0.0 2.397 2.735 2.967 3.19 3.35 3.497 3.626 3.782 3.857 3.925 3.896 4.035 4.073 4.127 4.161 4.18 4.178 4.14 4.108 4.082 4.061 4.033 3.972 3.885 3.77 3.649 3.539 3.406 3.286 3.131 2.875 2.608 2.325 1.954 1.52 1.1 0.592 -0.017 -0.725 -1.52 -2.495 -3.728 -5.053 -6.733 -8.8 -11.518 -15.074 -19.919 -26.603 -36.406 -46.884 -54.62 -60.606 -65.446 -69.546 -72.987 -75.96 -78.394 -80.687 -82.569 -84.221 -85.754 -87.138 -88.363 -89.457 -90.589 -91.564 -92.392 -93.234 -94.113 -94.847 -95.598 -96.376 -96.958 -97.519 -98.098 -98.712 -99.32 -99.732 -100.155 -100.807 -101.258 -101.733 -101.981 -102.465 -102.947 -103.457 -103.725 -104.229 -104.575 -104.866 -105.16 -105.763 -106.08 -106.458 -106.91 -107.369 -107.84 -108.418 -110.112 -9 ,899 ,TETRA ,17558397,Sat Nov 27 01:10:56 CET,Sat Nov 27 03:09:09 CET,0.0 1.594 1.955 2.184 2.367 2.504 2.643 2.767 2.947 3.02 3.081 3.089 3.256 3.297 3.347 3.392 3.448 3.467 3.485 3.485 3.455 3.437 3.407 3.343 3.271 3.195 3.103 3.007 2.858 2.676 2.5 2.279 2.04 1.783 1.463 1.076 0.699 0.282 -0.216 -0.823 -1.531 -2.384 -3.484 -4.739 -6.395 -8.375 -11.005 -14.503 -19.196 -25.774 -35.702 -46.148 -53.911 -60.101 -64.988 -69.098 -72.491 -75.343 -77.731 -80.033 -81.912 -83.563 -85.113 -86.496 -87.743 -88.845 -89.956 -90.938 -91.786 -92.665 -93.541 -94.236 -94.939 -95.648 -96.192 -96.76 -97.351 -97.953 -98.555 -98.949 -99.346 -99.994 -100.448 -100.888 -101.112 -101.587 -102.078 -102.571 -102.829 -103.316 -103.613 -103.876 -104.155 -104.816 -105.173 -105.559 -105.978 -106.399 -106.861 -107.435 -109.684 -10 ,10110 ,TETRA ,17558398,Sat Nov 27 01:13:55 CET,Sat Nov 27 03:12:26 CET,0.0 1.758 2.21 2.519 2.733 2.89 3.017 3.108 3.227 3.278 3.328 3.326 3.484 3.516 3.543 3.554 3.564 3.563 3.549 3.528 3.488 3.46 3.427 3.363 3.281 3.188 3.078 2.963 2.798 2.616 2.418 2.155 1.894 1.612 1.243 0.799 0.334 -0.225 -0.878 -1.617 -2.421 -3.391 -4.614 -5.966 -7.715 -9.845 -12.585 -16.079 -20.807 -27.416 -37.263 -47.757 -55.509 -61.629 -66.593 -70.788 -74.233 -77.167 -79.602 -81.942 -83.872 -85.526 -87.08 -88.521 -89.784 -90.888 -92.034 -93.05 -93.906 -94.787 -95.714 -96.458 -97.194 -97.931 -98.495 -99.092 -99.702 -100.306 -100.905 -101.318 -101.747 -102.405 -102.853 -103.306 -103.546 -104.037 -104.531 -105.033 -105.286 -105.765 -106.048 -106.33 -106.619 -107.203 -107.548 -107.921 -108.287 -108.669 -109.129 -109.762 -112.53 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 5167db5e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28412 ,TETRA ,17558399,Sat Nov 27 01:15:57 CET,Sat Nov 27 02:53:44 CET,0.0 1.256 1.735 2.065 2.351 2.62 2.875 3.125 3.63 3.863 4.087 4.345 4.736 4.945 5.343 5.739 6.127 6.319 6.696 7.063 7.601 7.954 8.307 8.834 9.349 9.853 10.349 10.841 11.493 12.13 12.755 13.522 14.263 14.991 15.886 16.934 17.951 19.062 20.291 21.66 23.131 24.848 26.922 29.067 31.671 34.7 38.371 42.725 48.061 54.724 63.611 71.802 77.045 80.72 83.372 85.393 86.988 88.268 89.237 90.125 90.823 91.39 91.899 92.331 92.696 92.996 93.264 93.467 93.628 93.781 93.913 94.01 94.105 94.168 94.196 94.221 94.243 94.269 94.267 94.258 94.255 94.216 94.172 94.122 94.081 93.989 93.894 93.767 93.696 93.529 93.342 93.203 93.027 92.612 92.396 92.188 91.975 91.69 91.209 90.062 81.36 -7 ,24424 ,TETRA ,17558405,Sat Nov 27 01:16:57 CET,Sat Nov 27 02:53:59 CET,0.0 0.86 1.305 1.648 1.981 2.288 2.574 2.848 3.327 3.562 3.794 4.068 4.469 4.674 5.063 5.45 5.831 6.02 6.391 6.757 7.28 7.62 7.955 8.447 8.947 9.438 9.921 10.395 11.019 11.649 12.27 13.038 13.795 14.536 15.421 16.442 17.449 18.592 19.842 21.197 22.666 24.367 26.432 28.614 31.276 34.267 37.862 42.188 47.463 54.152 63.101 71.379 76.658 80.305 83.027 85.157 86.761 88.046 89.008 89.854 90.536 91.091 91.56 91.986 92.359 92.654 92.933 93.157 93.332 93.504 93.657 93.769 93.865 93.948 93.992 94.004 94.009 93.999 93.998 94.001 93.989 93.965 93.926 93.837 93.777 93.653 93.543 93.462 93.413 93.282 93.221 93.132 93.019 92.673 92.446 92.231 91.991 91.655 91.124 90.247 83.528 -9 ,5518 ,TETRA ,17558407,Sat Nov 27 01:16:57 CET,Sat Nov 27 02:54:25 CET,0.0 0.793 1.206 1.555 1.888 2.179 2.439 2.693 3.183 3.422 3.651 3.917 4.307 4.52 4.946 5.34 5.725 5.919 6.296 6.667 7.223 7.58 7.932 8.453 8.958 9.458 9.962 10.459 11.099 11.722 12.341 13.11 13.88 14.642 15.532 16.564 17.579 18.704 19.942 21.305 22.778 24.486 26.563 28.734 31.352 34.352 38.006 42.374 47.706 54.401 63.076 71.045 76.341 80.031 82.684 84.71 86.255 87.494 88.477 89.379 90.061 90.595 91.064 91.474 91.849 92.175 92.471 92.678 92.839 93.011 93.168 93.286 93.364 93.431 93.495 93.54 93.556 93.568 93.586 93.572 93.547 93.512 93.489 93.45 93.423 93.361 93.281 93.179 93.117 92.972 92.861 92.746 92.587 92.3 92.136 91.889 91.621 91.264 90.698 89.901 77.031 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt deleted file mode 100644 index b8ac28f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4154 ,TETRA ,17558409,Sat Nov 27 01:16:57 CET,Sat Nov 27 02:53:55 CET,0.0 1.365 1.746 2.087 2.418 2.713 2.98 3.212 3.646 3.866 4.073 4.275 4.652 4.85 5.229 5.601 5.95 6.121 6.469 6.815 7.308 7.622 7.942 8.442 8.932 9.394 9.843 10.288 10.861 11.414 11.953 12.615 13.296 13.965 14.736 15.644 16.53 17.499 18.564 19.735 20.984 22.417 24.185 26.036 28.251 30.862 34.069 37.782 42.284 48.02 55.729 62.682 67.043 70.122 72.361 74.08 75.407 76.464 77.268 77.949 78.459 78.883 79.253 79.578 79.847 80.05 80.226 80.36 80.451 80.517 80.553 80.569 80.591 80.589 80.572 80.572 80.561 80.519 80.455 80.408 80.35 80.232 80.151 80.067 80.021 79.917 79.812 79.675 79.578 79.382 79.205 79.084 78.965 78.627 78.454 78.269 78.013 77.651 77.163 76.482 72.984 -2 ,15315 ,TETRA ,17558410,Sat Nov 27 01:16:57 CET,Sat Nov 27 02:53:50 CET,0.0 0.976 1.407 1.75 2.045 2.352 2.635 2.889 3.39 3.62 3.839 4.118 4.512 4.716 5.109 5.487 5.853 6.037 6.405 6.741 7.208 7.523 7.838 8.307 8.768 9.239 9.701 10.146 10.746 11.336 11.913 12.633 13.328 13.993 14.787 15.709 16.623 17.626 18.737 19.942 21.209 22.715 24.522 26.445 28.792 31.42 34.539 38.211 42.801 48.661 56.254 63.123 67.63 70.82 73.159 74.944 76.257 77.243 77.984 78.628 79.122 79.545 79.904 80.186 80.416 80.589 80.736 80.812 80.856 80.909 80.972 81.013 81.024 81.033 81.031 81.017 81.01 80.989 80.939 80.875 80.79 80.644 80.528 80.419 80.35 80.23 80.121 79.935 79.822 79.625 79.447 79.295 79.159 78.856 78.635 78.379 78.061 77.693 77.262 76.635 72.916 -3 ,2787 ,TETRA ,17558411,Sat Nov 27 01:17:56 CET,Sat Nov 27 02:54:47 CET,0.0 0.848 1.299 1.68 2.034 2.357 2.644 2.904 3.388 3.615 3.829 4.069 4.461 4.667 5.055 5.436 5.806 5.983 6.321 6.651 7.147 7.474 7.792 8.253 8.689 9.128 9.576 9.999 10.561 11.139 11.706 12.379 13.023 13.661 14.431 15.311 16.171 17.148 18.243 19.43 20.705 22.17 23.927 25.781 28.012 30.595 33.742 37.497 42.158 47.951 55.48 62.367 66.793 69.867 72.127 73.928 75.288 76.316 77.056 77.739 78.262 78.671 79.032 79.326 79.541 79.711 79.881 79.972 80.035 80.092 80.146 80.218 80.253 80.271 80.285 80.265 80.232 80.193 80.126 80.071 80.001 79.851 79.761 79.683 79.64 79.556 79.447 79.28 79.172 78.974 78.856 78.751 78.621 78.303 78.091 77.827 77.502 77.173 76.806 76.185 73.003 -4 ,17165 ,TETRA ,17558412,Sat Nov 27 01:17:56 CET,Sat Nov 27 02:55:04 CET,0.0 1.795 2.238 2.586 2.916 3.214 3.459 3.698 4.157 4.371 4.595 4.847 5.206 5.385 5.742 6.091 6.437 6.609 6.934 7.26 7.761 8.085 8.398 8.858 9.33 9.789 10.228 10.66 11.209 11.759 12.312 12.989 13.658 14.332 15.132 16.025 16.883 17.828 18.872 20.015 21.272 22.741 24.51 26.342 28.578 31.255 34.431 38.148 42.716 48.428 56.049 62.876 67.244 70.391 72.673 74.409 75.758 76.83 77.62 78.316 78.856 79.239 79.556 79.84 80.089 80.298 80.492 80.632 80.716 80.794 80.827 80.825 80.839 80.85 80.85 80.849 80.846 80.846 80.817 80.77 80.705 80.569 80.467 80.362 80.303 80.186 80.062 79.916 79.84 79.677 79.575 79.453 79.298 78.983 78.797 78.551 78.22 77.868 77.477 76.864 71.667 -5 ,2272 ,TETRA ,17558413,Sat Nov 27 01:17:56 CET,Sat Nov 27 03:06:43 CET,0.0 2.439 2.976 3.402 3.787 4.095 4.368 4.62 5.073 5.286 5.49 5.729 6.102 6.283 6.658 7.021 7.374 7.554 7.909 8.26 8.755 9.073 9.393 9.86 10.312 10.749 11.18 11.593 12.153 12.723 13.265 13.94 14.63 15.292 16.045 16.913 17.776 18.765 19.881 21.115 22.41 23.844 25.636 27.56 29.849 32.498 35.632 39.285 43.882 49.743 57.433 64.324 68.664 71.684 73.887 75.599 76.868 77.87 78.621 79.252 79.737 80.142 80.503 80.788 80.998 81.179 81.361 81.511 81.592 81.634 81.693 81.739 81.769 81.783 81.775 81.754 81.727 81.686 81.653 81.623 81.57 81.49 81.424 81.338 81.281 81.147 80.974 80.763 80.672 80.513 80.412 80.3 80.18 79.876 79.656 79.447 79.245 78.964 78.546 77.845 67.562 -6 ,14180 ,TETRA ,17558414,Sat Nov 27 01:22:57 CET,Sat Nov 27 03:07:51 CET,0.0 1.726 2.162 2.506 2.816 3.066 3.305 3.542 3.992 4.207 4.418 4.661 5.044 5.233 5.614 5.992 6.342 6.518 6.884 7.245 7.762 8.09 8.428 8.926 9.389 9.844 10.289 10.72 11.278 11.838 12.402 13.085 13.751 14.402 15.164 16.039 16.907 17.903 18.989 20.156 21.42 22.849 24.587 26.437 28.625 31.141 34.215 37.856 42.35 48.06 55.548 62.411 66.949 70.153 72.468 74.197 75.461 76.42 77.184 77.903 78.439 78.863 79.229 79.521 79.75 79.928 80.086 80.192 80.262 80.332 80.377 80.402 80.445 80.472 80.474 80.478 80.463 80.433 80.395 80.353 80.301 80.223 80.158 80.086 80.047 79.925 79.755 79.578 79.486 79.307 79.18 79.058 78.92 78.56 78.36 78.159 77.898 77.599 77.206 76.594 72.969 -7 ,15060 ,TETRA ,17558415,Sat Nov 27 01:23:56 CET,Sat Nov 27 03:08:19 CET,0.0 1.856 2.358 2.72 3.041 3.324 3.581 3.827 4.274 4.49 4.704 4.929 5.292 5.484 5.89 6.282 6.655 6.835 7.176 7.506 8.008 8.331 8.645 9.12 9.586 10.046 10.503 10.959 11.545 12.116 12.672 13.37 14.094 14.778 15.564 16.455 17.298 18.243 19.29 20.442 21.7 23.149 24.897 26.736 28.963 31.559 34.716 38.488 43.122 48.969 56.57 63.302 67.726 70.842 73.071 74.776 76.059 77.027 77.777 78.484 79.009 79.426 79.781 80.063 80.3 80.491 80.65 80.77 80.866 80.963 81.052 81.09 81.112 81.136 81.137 81.123 81.104 81.079 81.053 81.02 80.963 80.85 80.759 80.661 80.605 80.473 80.308 80.16 80.096 79.935 79.825 79.701 79.542 79.164 78.952 78.731 78.48 78.195 77.78 77.132 72.695 -8 ,12195 ,TETRA ,17558416,Sat Nov 27 01:24:56 CET,Sat Nov 27 03:09:42 CET,0.0 1.757 2.24 2.602 2.92 3.21 3.475 3.728 4.224 4.448 4.66 4.892 5.258 5.458 5.836 6.203 6.57 6.751 7.113 7.458 7.94 8.257 8.565 9.023 9.483 9.937 10.375 10.787 11.361 11.945 12.499 13.161 13.811 14.474 15.25 16.114 16.984 17.979 19.052 20.217 21.482 22.965 24.758 26.576 28.722 31.216 34.282 37.88 42.318 48.04 55.699 62.732 67.248 70.467 72.811 74.551 75.894 76.93 77.726 78.43 78.947 79.39 79.763 80.084 80.358 80.566 80.738 80.871 80.975 81.054 81.127 81.192 81.245 81.275 81.271 81.239 81.208 81.165 81.114 81.085 81.037 80.942 80.848 80.731 80.674 80.545 80.395 80.23 80.134 79.942 79.811 79.697 79.574 79.25 79.05 78.831 78.593 78.306 77.874 77.26 73.313 -9 ,21116 ,TETRA ,17558417,Sat Nov 27 01:27:01 CET,Sat Nov 27 03:22:41 CET,0.0 1.96 2.409 2.75 3.047 3.339 3.608 3.852 4.316 4.535 4.745 4.98 5.353 5.552 5.956 6.324 6.677 6.853 7.195 7.533 8.045 8.375 8.692 9.175 9.649 10.091 10.511 10.933 11.512 12.096 12.674 13.39 14.077 14.747 15.552 16.47 17.376 18.38 19.454 20.627 21.913 23.374 25.112 26.932 29.125 31.684 34.785 38.485 43.035 48.74 56.39 63.373 67.833 70.955 73.174 74.874 76.217 77.27 78.056 78.705 79.145 79.507 79.849 80.155 80.372 80.549 80.695 80.776 80.856 80.932 80.972 80.99 80.994 80.991 81.0 81.002 80.994 80.982 80.937 80.897 80.852 80.743 80.66 80.604 80.564 80.443 80.315 80.161 80.077 79.896 79.755 79.621 79.472 79.165 78.964 78.72 78.441 78.048 77.565 77.018 73.263 -10 ,1017 ,TETRA ,17558418,Sat Nov 27 01:28:54 CET,Sat Nov 27 03:17:26 CET,0.0 2.634 3.159 3.535 3.853 4.136 4.394 4.653 5.138 5.357 5.563 5.791 6.167 6.362 6.729 7.094 7.454 7.628 7.964 8.294 8.796 9.12 9.436 9.914 10.385 10.825 11.257 11.696 12.289 12.866 13.43 14.126 14.801 15.461 16.229 17.118 18.006 18.973 20.025 21.169 22.398 23.844 25.603 27.446 29.648 32.214 35.28 38.869 43.348 49.041 56.757 63.827 68.353 71.539 73.876 75.584 76.806 77.799 78.589 79.27 79.756 80.158 80.536 80.826 81.045 81.235 81.387 81.49 81.572 81.659 81.733 81.74 81.738 81.76 81.763 81.763 81.759 81.73 81.666 81.61 81.559 81.484 81.421 81.339 81.285 81.178 81.07 80.947 80.875 80.705 80.562 80.432 80.309 79.999 79.793 79.559 79.3 79.024 78.548 77.83 74.201 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt deleted file mode 100644 index 07a9358b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24330 ,TETRA ,17558419,Sat Nov 27 01:29:43 CET,Sat Nov 27 03:26:13 CET,0.0 0.793 1.189 1.491 1.758 1.954 2.128 2.294 2.592 2.732 2.867 3.011 3.237 3.349 3.56 3.77 3.974 4.073 4.256 4.426 4.68 4.841 4.993 5.212 5.431 5.647 5.87 6.077 6.318 6.554 6.785 7.064 7.334 7.605 7.902 8.209 8.506 8.827 9.172 9.548 9.937 10.375 10.88 11.357 11.916 12.56 13.259 13.966 14.702 15.425 15.996 16.133 15.967 15.652 15.276 14.909 14.555 14.204 13.892 13.555 13.268 13.016 12.781 12.548 12.325 12.132 11.911 11.714 11.552 11.379 11.205 11.072 10.933 10.78 10.657 10.521 10.384 10.251 10.097 9.973 9.852 9.692 9.588 9.472 9.408 9.265 9.109 8.954 8.878 8.696 8.666 8.587 8.503 8.316 8.207 8.091 7.971 7.825 7.618 7.376 6.614 -2 ,2360 ,TETRA ,17558420,Sat Nov 27 01:29:44 CET,Sat Nov 27 03:12:11 CET,0.0 1.215 1.595 1.86 2.081 2.313 2.518 2.677 2.954 3.087 3.236 3.417 3.651 3.772 4.008 4.234 4.432 4.517 4.686 4.855 5.108 5.271 5.428 5.656 5.88 6.097 6.309 6.499 6.736 6.982 7.225 7.514 7.78 8.016 8.285 8.625 8.943 9.263 9.644 10.052 10.437 10.864 11.358 11.835 12.383 12.995 13.668 14.327 15.054 15.799 16.423 16.584 16.427 16.154 15.836 15.499 15.167 14.818 14.498 14.185 13.913 13.66 13.393 13.129 12.893 12.679 12.449 12.256 12.096 11.924 11.745 11.597 11.446 11.288 11.157 11.016 10.863 10.719 10.58 10.47 10.353 10.2 10.105 9.992 9.927 9.783 9.625 9.468 9.399 9.221 9.178 9.105 9.028 8.862 8.76 8.644 8.525 8.401 8.256 8.099 7.762 -3 ,27112 ,TETRA ,17558421,Sat Nov 27 01:29:44 CET,Sat Nov 27 03:12:01 CET,0.0 0.774 1.151 1.506 1.78 1.975 2.169 2.351 2.645 2.782 2.916 3.062 3.304 3.429 3.647 3.858 4.065 4.174 4.383 4.564 4.833 4.998 5.152 5.376 5.592 5.814 6.021 6.219 6.461 6.697 6.931 7.203 7.468 7.719 7.997 8.299 8.59 8.914 9.262 9.632 10.011 10.447 10.972 11.461 12.026 12.662 13.323 13.951 14.614 15.288 15.831 15.965 15.798 15.469 15.099 14.736 14.405 14.052 13.707 13.342 13.051 12.81 12.571 12.334 12.118 11.922 11.703 11.512 11.357 11.201 11.038 10.906 10.742 10.566 10.438 10.302 10.167 10.022 9.871 9.775 9.677 9.51 9.388 9.253 9.183 9.043 8.911 8.773 8.693 8.508 8.439 8.351 8.274 8.104 8.0 7.885 7.76 7.63 7.462 7.259 6.981 -4 ,14664 ,TETRA ,17558422,Sat Nov 27 01:30:47 CET,Sat Nov 27 03:26:54 CET,0.0 0.958 1.329 1.627 1.874 2.081 2.287 2.49 2.824 2.974 3.116 3.266 3.501 3.618 3.848 4.074 4.284 4.383 4.58 4.757 5.004 5.174 5.353 5.617 5.842 6.047 6.251 6.451 6.696 6.921 7.144 7.43 7.702 7.972 8.292 8.615 8.914 9.269 9.646 10.036 10.456 10.913 11.417 11.921 12.49 13.076 13.699 14.413 15.214 15.955 16.576 16.737 16.54 16.233 15.933 15.61 15.291 14.967 14.646 14.29 13.978 13.685 13.387 13.129 12.902 12.703 12.492 12.309 12.152 11.979 11.797 11.647 11.498 11.334 11.204 11.077 10.951 10.819 10.675 10.575 10.475 10.324 10.217 10.101 10.04 9.915 9.8 9.682 9.604 9.415 9.373 9.292 9.208 9.041 8.952 8.837 8.698 8.523 8.336 8.164 7.899 -5 ,27025 ,TETRA ,17558423,Sat Nov 27 01:30:49 CET,Sat Nov 27 03:26:35 CET,0.0 1.121 1.516 1.787 1.99 2.19 2.394 2.582 2.908 3.041 3.173 3.345 3.593 3.718 3.946 4.182 4.409 4.513 4.717 4.91 5.197 5.384 5.553 5.805 6.029 6.222 6.419 6.612 6.854 7.088 7.307 7.573 7.84 8.099 8.4 8.705 8.997 9.348 9.72 10.097 10.482 10.908 11.427 11.954 12.543 13.182 13.855 14.52 15.232 16.011 16.607 16.713 16.538 16.231 15.867 15.49 15.127 14.778 14.482 14.157 13.872 13.636 13.375 13.105 12.879 12.679 12.478 12.289 12.12 11.944 11.766 11.618 11.466 11.317 11.196 11.076 10.957 10.827 10.689 10.59 10.485 10.327 10.215 10.103 10.044 9.918 9.777 9.629 9.562 9.393 9.382 9.308 9.216 9.043 8.957 8.864 8.764 8.62 8.458 8.284 7.957 -6 ,32047 ,TETRA ,17558424,Sat Nov 27 01:31:50 CET,Sat Nov 27 03:16:02 CET,0.0 1.223 1.7 2.007 2.242 2.464 2.712 2.966 3.411 3.585 3.713 3.84 4.064 4.173 4.376 4.584 4.789 4.882 5.061 5.237 5.492 5.649 5.793 6.011 6.23 6.437 6.639 6.84 7.108 7.365 7.592 7.857 8.118 8.357 8.638 8.961 9.275 9.625 9.977 10.344 10.75 11.183 11.679 12.188 12.74 13.316 13.967 14.658 15.335 15.973 16.59 16.824 16.677 16.411 16.093 15.715 15.329 14.965 14.649 14.326 14.045 13.803 13.569 13.341 13.126 12.921 12.702 12.511 12.338 12.166 11.997 11.857 11.727 11.593 11.481 11.35 11.204 11.061 10.923 10.819 10.713 10.556 10.443 10.318 10.252 10.129 10.003 9.867 9.799 9.614 9.566 9.49 9.395 9.172 9.038 8.899 8.762 8.63 8.466 8.248 7.821 -7 ,1009 ,TETRA ,17558425,Sat Nov 27 01:32:46 CET,Sat Nov 27 03:25:41 CET,0.0 1.415 1.764 2.041 2.282 2.488 2.702 2.909 3.255 3.397 3.517 3.66 3.919 4.054 4.28 4.512 4.733 4.836 5.025 5.196 5.453 5.62 5.772 6.001 6.247 6.473 6.682 6.894 7.16 7.402 7.62 7.885 8.139 8.386 8.67 8.994 9.321 9.652 9.991 10.347 10.708 11.105 11.594 12.069 12.581 13.159 13.832 14.515 15.184 15.894 16.538 16.696 16.508 16.191 15.852 15.504 15.159 14.815 14.499 14.177 13.908 13.662 13.416 13.202 13.001 12.809 12.612 12.432 12.269 12.104 11.946 11.806 11.646 11.477 11.354 11.224 11.083 10.939 10.781 10.669 10.556 10.379 10.267 10.158 10.1 9.972 9.833 9.709 9.639 9.454 9.4 9.318 9.234 9.036 8.927 8.803 8.663 8.536 8.372 8.143 7.867 -8 ,16457 ,TETRA ,17558426,Sat Nov 27 01:32:48 CET,Sat Nov 27 03:25:38 CET,0.0 0.971 1.391 1.679 1.93 2.131 2.332 2.5 2.765 2.898 3.027 3.142 3.357 3.459 3.661 3.85 4.025 4.12 4.312 4.503 4.766 4.913 5.047 5.247 5.463 5.67 5.847 6.001 6.21 6.428 6.646 6.893 7.126 7.352 7.612 7.926 8.235 8.576 8.943 9.319 9.7 10.115 10.601 11.089 11.66 12.265 12.943 13.665 14.373 15.095 15.808 16.031 15.814 15.48 15.119 14.745 14.386 14.052 13.737 13.403 13.126 12.882 12.627 12.37 12.134 11.937 11.745 11.565 11.398 11.216 11.014 10.844 10.696 10.54 10.41 10.29 10.169 10.04 9.896 9.795 9.69 9.515 9.391 9.256 9.191 9.072 8.951 8.803 8.726 8.541 8.459 8.369 8.293 8.128 8.038 7.933 7.798 7.641 7.461 7.229 6.667 -9 ,3152 ,TETRA ,17558427,Sat Nov 27 01:32:45 CET,Sat Nov 27 03:27:55 CET,0.0 1.521 1.879 2.189 2.426 2.629 2.808 2.98 3.319 3.483 3.637 3.804 4.04 4.15 4.35 4.569 4.795 4.9 5.093 5.266 5.515 5.675 5.819 6.027 6.222 6.421 6.622 6.802 7.044 7.298 7.542 7.83 8.1 8.357 8.653 8.972 9.271 9.6 9.953 10.324 10.723 11.18 11.701 12.212 12.81 13.48 14.194 14.934 15.721 16.433 16.969 17.107 16.885 16.519 16.138 15.748 15.391 15.047 14.758 14.461 14.177 13.929 13.711 13.499 13.279 13.079 12.851 12.631 12.454 12.275 12.077 11.913 11.756 11.606 11.484 11.355 11.213 11.049 10.878 10.762 10.651 10.499 10.389 10.261 10.191 10.047 9.906 9.781 9.71 9.524 9.489 9.416 9.331 9.149 9.049 8.922 8.791 8.666 8.499 8.292 7.983 -10 ,13598 ,TETRA ,17558428,Sat Nov 27 01:32:46 CET,Sat Nov 27 03:26:54 CET,0.0 1.189 1.626 1.963 2.242 2.462 2.645 2.807 3.085 3.207 3.351 3.535 3.771 3.891 4.12 4.335 4.549 4.654 4.849 5.04 5.317 5.482 5.643 5.875 6.094 6.309 6.519 6.713 6.953 7.19 7.421 7.714 7.996 8.246 8.52 8.847 9.186 9.526 9.876 10.261 10.632 11.033 11.497 11.966 12.494 13.055 13.701 14.365 15.05 15.771 16.494 16.676 16.398 16.039 15.629 15.147 14.704 14.354 14.046 13.713 13.435 13.197 12.953 12.714 12.491 12.291 12.102 11.933 11.775 11.601 11.433 11.296 11.149 11.0 10.881 10.754 10.617 10.474 10.343 10.256 10.152 9.975 9.846 9.714 9.646 9.507 9.365 9.225 9.153 8.966 8.904 8.818 8.728 8.532 8.43 8.33 8.221 8.111 8.0 7.813 7.231 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 54a69521..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12923 ,TETRA ,17558429,Sat Nov 27 01:33:43 CET,Sat Nov 27 03:25:44 CET,0.0 0.533 0.774 0.938 1.077 1.191 1.293 1.402 1.566 1.643 1.729 1.762 1.934 1.994 2.105 2.203 2.293 2.334 2.407 2.483 2.58 2.635 2.689 2.782 2.863 2.922 2.983 3.047 3.134 3.205 3.265 3.352 3.42 3.47 3.517 3.568 3.625 3.695 3.763 3.805 3.838 3.867 3.879 3.86 3.788 3.654 3.431 3.13 2.633 1.78 0.197 -1.888 -3.605 -5.099 -6.455 -7.639 -8.612 -9.451 -10.2 -11.029 -11.727 -12.312 -12.917 -13.494 -14.002 -14.444 -14.878 -15.277 -15.637 -16.011 -16.414 -16.751 -17.079 -17.422 -17.678 -17.94 -18.211 -18.481 -18.774 -18.973 -19.174 -19.514 -19.749 -19.981 -20.108 -20.357 -20.59 -20.837 -20.98 -21.271 -21.445 -21.617 -21.794 -22.151 -22.339 -22.552 -22.787 -23.05 -23.4 -23.885 -25.257 -2 ,13236 ,TETRA ,17558430,Sat Nov 27 01:33:43 CET,Sat Nov 27 03:25:03 CET,0.0 0.67 0.955 1.143 1.286 1.385 1.486 1.586 1.746 1.823 1.886 1.887 2.062 2.119 2.222 2.329 2.426 2.469 2.55 2.63 2.734 2.795 2.854 2.934 3.01 3.083 3.154 3.228 3.325 3.416 3.494 3.568 3.665 3.799 3.912 3.99 4.051 4.113 4.188 4.259 4.293 4.317 4.34 4.321 4.282 4.23 4.082 3.753 3.218 2.378 0.776 -1.476 -3.369 -4.907 -6.275 -7.463 -8.478 -9.368 -10.118 -10.886 -11.556 -12.151 -12.71 -13.244 -13.721 -14.132 -14.567 -14.977 -15.344 -15.714 -16.103 -16.431 -16.764 -17.108 -17.366 -17.635 -17.934 -18.234 -18.517 -18.706 -18.912 -19.246 -19.466 -19.69 -19.806 -20.048 -20.296 -20.565 -20.698 -20.976 -21.153 -21.325 -21.496 -21.835 -22.035 -22.262 -22.501 -22.765 -23.101 -23.561 -25.315 -3 ,25963 ,TETRA ,17558431,Sat Nov 27 01:33:45 CET,Sat Nov 27 03:24:28 CET,0.0 0.908 1.136 1.293 1.438 1.58 1.704 1.808 1.945 1.995 2.048 2.063 2.238 2.301 2.416 2.528 2.618 2.658 2.737 2.817 2.921 2.988 3.057 3.138 3.207 3.275 3.343 3.413 3.5 3.578 3.647 3.732 3.801 3.855 3.933 4.032 4.109 4.17 4.228 4.274 4.292 4.304 4.316 4.304 4.263 4.146 3.912 3.548 2.958 2.079 0.519 -1.494 -3.187 -4.689 -6.022 -7.215 -8.191 -9.056 -9.834 -10.624 -11.305 -11.888 -12.447 -12.99 -13.485 -13.931 -14.374 -14.77 -15.128 -15.498 -15.882 -16.191 -16.507 -16.844 -17.107 -17.361 -17.622 -17.897 -18.165 -18.335 -18.514 -18.812 -19.019 -19.254 -19.376 -19.619 -19.868 -20.131 -20.277 -20.563 -20.727 -20.894 -21.061 -21.422 -21.614 -21.809 -22.055 -22.343 -22.663 -23.068 -24.458 -4 ,10639 ,TETRA ,17558432,Sat Nov 27 01:33:44 CET,Sat Nov 27 03:22:00 CET,0.0 0.316 0.49 0.603 0.707 0.798 0.867 0.939 1.068 1.114 1.16 1.148 1.309 1.345 1.417 1.486 1.542 1.568 1.616 1.661 1.729 1.77 1.823 1.907 1.964 2.014 2.062 2.108 2.168 2.226 2.277 2.342 2.407 2.462 2.532 2.622 2.711 2.783 2.826 2.863 2.899 2.948 2.98 2.948 2.877 2.767 2.564 2.284 1.834 0.964 -0.724 -2.833 -4.526 -5.987 -7.349 -8.608 -9.679 -10.605 -11.403 -12.214 -12.888 -13.474 -14.052 -14.61 -15.117 -15.574 -16.029 -16.429 -16.789 -17.152 -17.511 -17.816 -18.139 -18.48 -18.745 -19.008 -19.276 -19.557 -19.843 -20.046 -20.261 -20.561 -20.768 -20.991 -21.11 -21.349 -21.593 -21.865 -22.007 -22.294 -22.462 -22.626 -22.795 -23.16 -23.377 -23.616 -23.859 -24.127 -24.454 -24.849 -25.852 -5 ,30432 ,TETRA ,17558433,Sat Nov 27 01:33:44 CET,Sat Nov 27 03:25:47 CET,0.0 0.298 0.471 0.667 0.852 0.992 1.111 1.206 1.377 1.452 1.522 1.548 1.717 1.771 1.889 1.985 2.065 2.106 2.18 2.248 2.353 2.419 2.484 2.583 2.671 2.756 2.839 2.912 2.988 3.039 3.102 3.186 3.252 3.315 3.382 3.465 3.536 3.585 3.64 3.719 3.779 3.812 3.836 3.828 3.758 3.638 3.46 3.174 2.716 1.907 0.383 -1.64 -3.432 -4.94 -6.196 -7.345 -8.369 -9.287 -10.059 -10.833 -11.52 -12.121 -12.658 -13.158 -13.633 -14.063 -14.5 -14.911 -15.272 -15.635 -16.011 -16.316 -16.626 -16.964 -17.237 -17.503 -17.767 -18.044 -18.334 -18.539 -18.75 -19.1 -19.346 -19.592 -19.727 -20.001 -20.263 -20.529 -20.672 -20.967 -21.15 -21.315 -21.486 -21.829 -22.025 -22.244 -22.488 -22.767 -23.104 -23.525 -24.956 -6 ,14902 ,TETRA ,17558434,Sat Nov 27 01:33:46 CET,Sat Nov 27 03:25:39 CET,0.0 0.382 0.589 0.708 0.807 0.921 1.014 1.093 1.266 1.357 1.443 1.476 1.635 1.686 1.788 1.882 1.98 2.028 2.119 2.203 2.312 2.393 2.49 2.615 2.702 2.772 2.831 2.893 2.977 3.044 3.103 3.171 3.247 3.317 3.383 3.454 3.531 3.606 3.646 3.672 3.711 3.742 3.735 3.697 3.635 3.525 3.332 3.003 2.454 1.588 -0.007 -2.106 -3.86 -5.319 -6.629 -7.754 -8.69 -9.598 -10.392 -11.175 -11.843 -12.436 -13.005 -13.539 -14.029 -14.489 -14.978 -15.417 -15.807 -16.199 -16.598 -16.931 -17.257 -17.6 -17.868 -18.128 -18.389 -18.649 -18.923 -19.12 -19.333 -19.655 -19.861 -20.095 -20.222 -20.468 -20.729 -21.013 -21.156 -21.444 -21.653 -21.834 -22.013 -22.416 -22.641 -22.873 -23.144 -23.455 -23.833 -24.3 -25.616 -7 ,9054 ,TETRA ,17558435,Sat Nov 27 01:33:44 CET,Sat Nov 27 03:27:19 CET,0.0 0.693 0.927 1.068 1.196 1.321 1.431 1.528 1.694 1.76 1.821 1.831 2.01 2.076 2.192 2.304 2.399 2.438 2.508 2.567 2.656 2.716 2.774 2.862 2.945 3.015 3.076 3.137 3.224 3.316 3.395 3.472 3.537 3.599 3.664 3.715 3.766 3.827 3.877 3.91 3.939 3.968 3.978 3.93 3.847 3.739 3.553 3.246 2.714 1.865 0.326 -1.683 -3.359 -4.815 -6.132 -7.296 -8.32 -9.248 -10.025 -10.782 -11.428 -12.016 -12.608 -13.158 -13.663 -14.12 -14.546 -14.935 -15.291 -15.658 -16.036 -16.349 -16.672 -17.013 -17.273 -17.537 -17.799 -18.068 -18.356 -18.559 -18.766 -19.088 -19.317 -19.549 -19.659 -19.88 -20.125 -20.388 -20.535 -20.824 -20.994 -21.16 -21.323 -21.667 -21.864 -22.079 -22.311 -22.578 -22.882 -23.287 -24.762 -8 ,30046 ,TETRA ,17558436,Sat Nov 27 01:33:44 CET,Sat Nov 27 03:25:52 CET,0.0 0.088 0.176 0.258 0.336 0.404 0.463 0.517 0.599 0.628 0.661 0.629 0.779 0.815 0.894 0.978 1.07 1.118 1.2 1.28 1.392 1.459 1.528 1.625 1.726 1.814 1.894 1.973 2.058 2.149 2.239 2.315 2.39 2.473 2.555 2.651 2.735 2.794 2.853 2.921 2.988 3.03 3.035 3.017 2.978 2.882 2.69 2.352 1.823 0.951 -0.585 -2.47 -4.107 -5.69 -7.073 -8.242 -9.313 -10.225 -11.003 -11.805 -12.476 -13.077 -13.641 -14.188 -14.691 -15.127 -15.589 -16.005 -16.351 -16.698 -17.06 -17.348 -17.646 -17.969 -18.224 -18.487 -18.756 -19.032 -19.309 -19.503 -19.711 -20.024 -20.251 -20.492 -20.609 -20.846 -21.098 -21.37 -21.51 -21.799 -21.979 -22.136 -22.307 -22.685 -22.894 -23.11 -23.345 -23.607 -23.94 -24.393 -25.977 -9 ,3571 ,TETRA ,17558437,Sat Nov 27 01:33:44 CET,Sat Nov 27 03:25:31 CET,0.0 0.47 0.676 0.836 0.985 1.11 1.229 1.332 1.498 1.576 1.64 1.647 1.804 1.848 1.938 2.027 2.129 2.18 2.252 2.318 2.424 2.494 2.57 2.694 2.816 2.919 2.995 3.059 3.147 3.235 3.314 3.404 3.49 3.563 3.65 3.747 3.831 3.918 3.982 4.039 4.077 4.095 4.11 4.082 4.037 3.958 3.782 3.469 2.944 2.116 0.59 -1.3 -2.915 -4.402 -5.724 -6.837 -7.762 -8.606 -9.361 -10.127 -10.795 -11.4 -11.967 -12.486 -12.98 -13.438 -13.906 -14.318 -14.667 -15.032 -15.42 -15.74 -16.069 -16.383 -16.623 -16.874 -17.128 -17.409 -17.692 -17.881 -18.09 -18.424 -18.642 -18.86 -18.979 -19.226 -19.485 -19.777 -19.924 -20.195 -20.348 -20.517 -20.684 -21.043 -21.238 -21.451 -21.696 -21.975 -22.299 -22.739 -23.809 -10 ,9259 ,TETRA ,17558438,Sat Nov 27 01:33:45 CET,Sat Nov 27 03:25:20 CET,0.0 0.533 0.746 0.938 1.078 1.196 1.306 1.406 1.581 1.655 1.719 1.716 1.873 1.923 2.028 2.131 2.215 2.247 2.306 2.368 2.468 2.534 2.596 2.676 2.761 2.849 2.919 2.983 3.086 3.188 3.276 3.374 3.452 3.514 3.578 3.635 3.679 3.723 3.764 3.813 3.869 3.904 3.916 3.896 3.822 3.691 3.486 3.157 2.609 1.722 0.234 -1.764 -3.508 -5.078 -6.427 -7.532 -8.498 -9.411 -10.184 -10.976 -11.684 -12.279 -12.853 -13.424 -13.944 -14.4 -14.884 -15.336 -15.712 -16.081 -16.456 -16.755 -17.081 -17.429 -17.687 -17.947 -18.212 -18.481 -18.762 -18.96 -19.173 -19.501 -19.728 -19.965 -20.085 -20.327 -20.591 -20.881 -21.023 -21.314 -21.492 -21.665 -21.84 -22.2 -22.414 -22.642 -22.884 -23.169 -23.501 -23.882 -25.465 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt deleted file mode 100644 index 28dfd08d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5016 ,TETRA ,17558439,Sat Nov 27 01:34:44 CET,Sat Nov 27 03:29:38 CET,0.0 1.82 2.247 2.576 2.872 3.117 3.323 3.523 3.872 4.032 4.194 4.386 4.63 4.745 4.961 5.183 5.398 5.508 5.741 5.947 6.218 6.382 6.545 6.807 7.068 7.332 7.576 7.803 8.084 8.355 8.631 8.962 9.265 9.543 9.864 10.225 10.582 10.963 11.358 11.779 12.216 12.702 13.251 13.81 14.465 15.206 16.097 17.101 18.177 19.316 20.491 21.293 21.566 21.618 21.575 21.466 21.362 21.231 21.079 20.91 20.757 20.608 20.459 20.319 20.169 20.031 19.899 19.781 19.684 19.577 19.461 19.368 19.267 19.151 19.06 18.962 18.864 18.764 18.653 18.578 18.504 18.401 18.33 18.251 18.212 18.125 18.031 17.936 17.883 17.72 17.686 17.627 17.574 17.443 17.372 17.301 17.225 17.134 17.018 16.892 16.631 -2 ,4871 ,TETRA ,17558440,Sat Nov 27 01:33:43 CET,Sat Nov 27 03:28:48 CET,0.0 0.662 1.105 1.476 1.723 1.913 2.097 2.29 2.653 2.805 2.953 3.121 3.366 3.499 3.745 3.98 4.21 4.319 4.524 4.731 5.032 5.217 5.394 5.648 5.895 6.132 6.356 6.575 6.85 7.111 7.364 7.665 7.955 8.235 8.558 8.911 9.237 9.597 9.998 10.429 10.881 11.392 11.986 12.572 13.251 13.991 14.818 15.76 16.879 18.098 19.372 20.149 20.448 20.567 20.539 20.446 20.341 20.213 20.076 19.925 19.777 19.643 19.524 19.393 19.256 19.126 18.991 18.857 18.748 18.66 18.556 18.462 18.371 18.264 18.171 18.08 17.983 17.885 17.793 17.726 17.655 17.545 17.467 17.388 17.344 17.251 17.165 17.055 16.994 16.845 16.835 16.775 16.705 16.568 16.506 16.421 16.331 16.242 16.147 16.04 15.827 -3 ,21994 ,TETRA ,17558441,Sat Nov 27 01:33:46 CET,Sat Nov 27 03:28:36 CET,0.0 1.138 1.55 1.901 2.188 2.43 2.655 2.85 3.204 3.367 3.516 3.684 3.924 4.056 4.303 4.529 4.745 4.856 5.074 5.281 5.565 5.737 5.908 6.174 6.441 6.687 6.916 7.129 7.407 7.692 7.955 8.252 8.539 8.811 9.118 9.465 9.815 10.21 10.632 11.075 11.531 12.03 12.595 13.181 13.886 14.647 15.495 16.47 17.543 18.714 20.078 21.06 21.432 21.548 21.561 21.46 21.297 21.152 21.033 20.877 20.708 20.568 20.438 20.308 20.171 20.044 19.919 19.806 19.698 19.591 19.499 19.408 19.306 19.21 19.141 19.057 18.959 18.857 18.75 18.674 18.6 18.499 18.428 18.344 18.304 18.225 18.117 18.002 17.951 17.798 17.759 17.682 17.611 17.454 17.364 17.267 17.158 17.04 16.927 16.799 16.411 -4 ,21211 ,TETRA ,17558442,Sat Nov 27 01:33:45 CET,Sat Nov 27 03:28:06 CET,0.0 1.19 1.568 1.837 2.065 2.287 2.493 2.678 3.019 3.173 3.322 3.483 3.714 3.834 4.081 4.336 4.547 4.633 4.814 4.999 5.251 5.421 5.602 5.85 6.087 6.321 6.543 6.762 7.047 7.327 7.597 7.91 8.196 8.471 8.805 9.185 9.53 9.89 10.293 10.732 11.19 11.706 12.275 12.842 13.516 14.269 15.118 16.072 17.178 18.35 19.611 20.474 20.832 20.936 20.931 20.869 20.764 20.642 20.505 20.329 20.18 20.04 19.879 19.736 19.598 19.456 19.312 19.185 19.075 18.965 18.833 18.709 18.592 18.481 18.387 18.281 18.179 18.082 17.991 17.929 17.856 17.742 17.655 17.555 17.505 17.42 17.342 17.255 17.203 17.032 16.981 16.919 16.854 16.707 16.631 16.544 16.437 16.337 16.233 16.088 15.853 -5 ,3054 ,TETRA ,17558443,Sat Nov 27 01:33:46 CET,Sat Nov 27 03:27:43 CET,0.0 0.994 1.431 1.744 2.004 2.247 2.454 2.626 2.949 3.099 3.244 3.45 3.698 3.817 4.064 4.305 4.545 4.661 4.866 5.052 5.311 5.492 5.685 5.957 6.209 6.45 6.671 6.882 7.176 7.454 7.703 8.002 8.302 8.601 8.952 9.339 9.688 10.07 10.474 10.888 11.328 11.835 12.437 13.038 13.709 14.456 15.334 16.276 17.29 18.445 19.791 20.702 21.095 21.274 21.297 21.227 21.123 20.99 20.827 20.636 20.482 20.34 20.198 20.067 19.947 19.831 19.697 19.563 19.428 19.301 19.193 19.094 18.976 18.865 18.791 18.714 18.63 18.539 18.438 18.365 18.291 18.182 18.102 18.02 17.981 17.907 17.813 17.719 17.679 17.535 17.531 17.482 17.428 17.299 17.228 17.161 17.081 16.986 16.873 16.68 16.39 -6 ,2161 ,TETRA ,17558444,Sat Nov 27 01:33:45 CET,Sat Nov 27 03:29:00 CET,0.0 1.15 1.539 1.828 2.081 2.34 2.585 2.807 3.179 3.333 3.486 3.669 3.917 4.042 4.282 4.528 4.744 4.849 5.078 5.282 5.552 5.74 5.927 6.209 6.477 6.71 6.93 7.142 7.403 7.646 7.882 8.178 8.472 8.753 9.083 9.443 9.782 10.171 10.607 11.074 11.557 12.092 12.69 13.282 13.979 14.767 15.661 16.579 17.664 18.966 20.32 21.243 21.635 21.74 21.719 21.607 21.453 21.302 21.137 20.972 20.824 20.638 20.457 20.317 20.205 20.103 19.97 19.843 19.741 19.632 19.517 19.41 19.302 19.187 19.081 18.976 18.886 18.795 18.7 18.644 18.576 18.464 18.396 18.311 18.257 18.151 18.064 17.977 17.928 17.782 17.773 17.712 17.642 17.508 17.432 17.342 17.256 17.171 17.071 16.95 16.73 -7 ,7865 ,TETRA ,17558445,Sat Nov 27 01:34:45 CET,Sat Nov 27 03:29:06 CET,0.0 1.139 1.602 1.909 2.162 2.382 2.572 2.751 3.105 3.269 3.411 3.572 3.803 3.921 4.17 4.401 4.605 4.705 4.905 5.101 5.389 5.575 5.749 5.984 6.198 6.412 6.63 6.835 7.11 7.383 7.638 7.958 8.273 8.561 8.895 9.252 9.588 9.978 10.402 10.856 11.334 11.888 12.531 13.138 13.839 14.576 15.389 16.325 17.327 18.404 19.616 20.458 20.814 20.929 20.908 20.826 20.711 20.572 20.429 20.267 20.127 19.986 19.823 19.678 19.564 19.455 19.338 19.226 19.112 18.996 18.883 18.789 18.678 18.556 18.469 18.368 18.267 18.173 18.068 17.991 17.909 17.784 17.687 17.591 17.546 17.449 17.364 17.277 17.229 17.077 17.068 17.007 16.938 16.802 16.727 16.634 16.542 16.441 16.313 16.183 15.985 -8 ,25284 ,TETRA ,17558446,Sat Nov 27 01:34:48 CET,Sat Nov 27 03:29:27 CET,0.0 1.252 1.612 1.938 2.25 2.497 2.701 2.88 3.201 3.363 3.529 3.719 3.955 4.067 4.277 4.495 4.733 4.856 5.071 5.265 5.554 5.729 5.897 6.133 6.348 6.56 6.777 6.999 7.288 7.558 7.803 8.109 8.41 8.694 9.011 9.357 9.692 10.065 10.494 10.948 11.411 11.917 12.495 13.079 13.793 14.571 15.427 16.36 17.401 18.559 19.784 20.572 20.934 21.074 21.045 20.918 20.787 20.657 20.51 20.371 20.224 20.06 19.907 19.762 19.622 19.508 19.391 19.288 19.195 19.08 18.948 18.845 18.74 18.639 18.557 18.459 18.355 18.251 18.141 18.062 17.984 17.866 17.773 17.677 17.631 17.538 17.434 17.332 17.278 17.116 17.106 17.056 17.0 16.868 16.791 16.718 16.64 16.549 16.446 16.334 16.085 -9 ,31778 ,TETRA ,17558447,Sat Nov 27 00:21:21 CET,Sat Nov 27 02:15:20 CET,0.0 1.269 1.647 1.913 2.135 2.356 2.565 2.76 3.107 3.26 3.408 3.599 3.848 3.975 4.22 4.46 4.696 4.808 4.996 5.18 5.468 5.649 5.823 6.079 6.326 6.558 6.774 6.99 7.272 7.53 7.787 8.129 8.464 8.762 9.083 9.456 9.808 10.173 10.575 11.022 11.489 12.03 12.647 13.242 13.985 14.793 15.628 16.519 17.546 18.742 20.0 20.855 21.211 21.274 21.234 21.141 21.004 20.867 20.758 20.629 20.49 20.35 20.201 20.059 19.938 19.838 19.735 19.639 19.547 19.435 19.311 19.212 19.113 19.009 18.925 18.834 18.732 18.627 18.535 18.474 18.405 18.3 18.216 18.117 18.069 17.987 17.913 17.83 17.785 17.633 17.605 17.538 17.469 17.348 17.277 17.193 17.106 17.018 16.915 16.791 16.551 -10 ,25417 ,TETRA ,17558448,Sat Nov 27 00:21:24 CET,Sat Nov 27 02:15:25 CET,0.0 1.298 1.654 1.93 2.168 2.406 2.621 2.819 3.203 3.358 3.492 3.642 3.872 4.004 4.259 4.491 4.706 4.813 5.03 5.23 5.502 5.669 5.832 6.07 6.313 6.566 6.801 7.014 7.278 7.539 7.79 8.083 8.379 8.669 8.989 9.363 9.725 10.122 10.558 10.983 11.426 11.934 12.518 13.135 13.842 14.587 15.425 16.357 17.431 18.593 19.825 20.652 20.98 21.076 21.064 21.012 20.892 20.697 20.523 20.369 20.24 20.124 19.999 19.882 19.772 19.658 19.535 19.423 19.324 19.213 19.107 19.025 18.929 18.829 18.753 18.669 18.577 18.468 18.355 18.289 18.225 18.108 18.029 17.956 17.919 17.842 17.747 17.638 17.583 17.421 17.372 17.3 17.235 17.081 16.994 16.918 16.834 16.747 16.652 16.516 16.337 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt deleted file mode 100644 index da1612bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10392 ,TETRA ,17558449,Sat Nov 27 00:21:26 CET,Sat Nov 27 02:17:42 CET,0.0 0.407 0.622 0.802 0.967 1.128 1.269 1.39 1.601 1.702 1.807 1.907 2.082 2.16 2.322 2.484 2.624 2.681 2.775 2.886 3.083 3.203 3.311 3.461 3.58 3.696 3.817 3.93 4.073 4.233 4.398 4.569 4.717 4.855 5.022 5.203 5.37 5.551 5.738 5.934 6.147 6.376 6.618 6.878 7.142 7.353 7.557 7.708 7.765 7.681 7.154 6.198 5.263 4.431 3.707 3.011 2.364 1.779 1.25 0.713 0.269 -0.126 -0.488 -0.845 -1.169 -1.438 -1.717 -1.974 -2.219 -2.496 -2.776 -2.996 -3.226 -3.458 -3.641 -3.828 -4.032 -4.239 -4.421 -4.547 -4.693 -4.92 -5.081 -5.268 -5.361 -5.551 -5.75 -5.954 -6.061 -6.268 -6.394 -6.525 -6.667 -6.984 -7.157 -7.332 -7.506 -7.678 -7.882 -8.169 -8.867 -2 ,6522 ,TETRA ,17558450,Sat Nov 27 00:21:21 CET,Sat Nov 27 02:17:50 CET,0.0 0.815 1.111 1.331 1.497 1.648 1.781 1.908 2.142 2.242 2.332 2.424 2.608 2.685 2.816 2.944 3.073 3.135 3.255 3.358 3.526 3.649 3.756 3.886 4.006 4.14 4.287 4.437 4.608 4.749 4.887 5.054 5.2 5.339 5.505 5.689 5.862 6.058 6.291 6.511 6.717 6.951 7.192 7.419 7.645 7.859 8.091 8.295 8.35 8.149 7.638 6.726 5.799 4.971 4.178 3.478 2.908 2.393 1.923 1.426 1.007 0.641 0.302 -0.023 -0.324 -0.581 -0.847 -1.098 -1.311 -1.527 -1.759 -1.953 -2.148 -2.348 -2.504 -2.668 -2.84 -3.017 -3.197 -3.333 -3.476 -3.675 -3.804 -3.935 -4.004 -4.145 -4.312 -4.495 -4.583 -4.782 -4.875 -4.98 -5.097 -5.382 -5.537 -5.697 -5.877 -6.077 -6.329 -6.659 -7.657 -3 ,23311 ,TETRA ,17558451,Sat Nov 27 00:21:22 CET,Sat Nov 27 02:18:19 CET,0.0 0.581 0.901 1.153 1.326 1.481 1.626 1.755 1.958 2.042 2.124 2.212 2.401 2.483 2.632 2.778 2.912 2.978 3.107 3.232 3.416 3.543 3.657 3.809 3.962 4.108 4.248 4.375 4.509 4.635 4.759 4.914 5.083 5.237 5.405 5.597 5.782 5.973 6.154 6.337 6.538 6.781 7.017 7.21 7.417 7.609 7.845 8.011 8.033 7.951 7.531 6.729 5.867 5.013 4.23 3.542 2.945 2.398 1.909 1.408 0.975 0.587 0.218 -0.131 -0.459 -0.766 -1.087 -1.379 -1.637 -1.901 -2.154 -2.355 -2.565 -2.787 -2.964 -3.148 -3.34 -3.536 -3.735 -3.88 -4.029 -4.254 -4.425 -4.603 -4.693 -4.875 -5.062 -5.27 -5.387 -5.607 -5.736 -5.86 -5.994 -6.259 -6.391 -6.543 -6.743 -7.007 -7.334 -7.695 -8.443 -4 ,11790 ,TETRA ,17558452,Sat Nov 27 00:22:22 CET,Sat Nov 27 02:19:21 CET,0.0 0.653 0.973 1.204 1.42 1.573 1.721 1.835 2.006 2.113 2.23 2.322 2.501 2.584 2.739 2.878 3.003 3.066 3.183 3.295 3.474 3.59 3.699 3.855 3.998 4.132 4.256 4.381 4.547 4.687 4.811 4.975 5.136 5.277 5.441 5.636 5.83 6.02 6.214 6.406 6.592 6.822 7.077 7.282 7.462 7.655 7.851 7.96 7.971 7.84 7.41 6.527 5.623 4.803 4.051 3.372 2.779 2.248 1.768 1.266 0.842 0.464 0.075 -0.293 -0.613 -0.902 -1.207 -1.478 -1.711 -1.954 -2.215 -2.434 -2.654 -2.878 -3.067 -3.266 -3.453 -3.654 -3.864 -4.004 -4.16 -4.402 -4.57 -4.74 -4.823 -4.995 -5.18 -5.393 -5.517 -5.738 -5.872 -6.008 -6.153 -6.448 -6.597 -6.757 -6.928 -7.143 -7.412 -7.709 -8.356 -5 ,4283 ,TETRA ,17558453,Sat Nov 27 01:34:44 CET,Sat Nov 27 03:30:46 CET,0.0 0.59 0.883 1.103 1.274 1.399 1.52 1.641 1.841 1.921 2.005 2.084 2.253 2.324 2.463 2.59 2.7 2.754 2.867 2.979 3.16 3.279 3.388 3.547 3.701 3.839 3.956 4.062 4.196 4.34 4.489 4.658 4.825 4.976 5.134 5.317 5.481 5.653 5.848 6.057 6.262 6.471 6.718 6.941 7.138 7.338 7.547 7.676 7.717 7.576 6.991 6.092 5.245 4.44 3.683 2.98 2.375 1.815 1.328 0.836 0.396 -0.003 -0.372 -0.71 -1.042 -1.345 -1.661 -1.951 -2.204 -2.452 -2.69 -2.886 -3.112 -3.369 -3.556 -3.74 -3.941 -4.148 -4.343 -4.473 -4.609 -4.833 -4.996 -5.174 -5.265 -5.433 -5.607 -5.808 -5.918 -6.131 -6.282 -6.419 -6.555 -6.865 -7.052 -7.25 -7.438 -7.646 -7.976 -8.368 -9.13 -6 ,18882 ,TETRA ,17558454,Sat Nov 27 01:34:44 CET,Sat Nov 27 03:31:18 CET,0.0 0.669 0.841 1.026 1.252 1.437 1.558 1.664 1.872 1.974 2.064 2.136 2.332 2.429 2.571 2.688 2.792 2.845 2.948 3.052 3.203 3.294 3.387 3.528 3.651 3.762 3.872 3.977 4.116 4.244 4.361 4.506 4.637 4.754 4.89 5.04 5.181 5.337 5.498 5.663 5.824 5.987 6.2 6.413 6.628 6.851 7.082 7.245 7.312 7.285 6.855 5.965 5.094 4.249 3.522 2.841 2.215 1.674 1.204 0.72 0.312 -0.056 -0.411 -0.751 -1.076 -1.35 -1.642 -1.923 -2.166 -2.421 -2.691 -2.903 -3.113 -3.341 -3.507 -3.68 -3.868 -4.07 -4.294 -4.445 -4.596 -4.825 -4.98 -5.135 -5.218 -5.394 -5.571 -5.752 -5.858 -6.078 -6.222 -6.362 -6.506 -6.805 -6.953 -7.103 -7.285 -7.535 -7.838 -8.185 -9.492 -7 ,20097 ,TETRA ,17558455,Sat Nov 27 01:34:47 CET,Sat Nov 27 03:31:21 CET,0.0 0.389 0.559 0.726 0.883 1.01 1.104 1.193 1.356 1.424 1.494 1.539 1.696 1.763 1.883 1.99 2.097 2.144 2.245 2.343 2.473 2.564 2.657 2.794 2.92 3.033 3.138 3.241 3.375 3.497 3.62 3.792 3.946 4.08 4.229 4.385 4.536 4.692 4.854 5.035 5.216 5.4 5.613 5.81 6.004 6.194 6.388 6.549 6.626 6.498 5.977 5.081 4.161 3.327 2.607 1.929 1.277 0.699 0.188 -0.339 -0.784 -1.176 -1.56 -1.923 -2.251 -2.552 -2.856 -3.142 -3.392 -3.638 -3.901 -4.122 -4.342 -4.576 -4.757 -4.943 -5.144 -5.359 -5.594 -5.752 -5.902 -6.136 -6.311 -6.497 -6.586 -6.767 -6.957 -7.154 -7.255 -7.465 -7.592 -7.714 -7.847 -8.157 -8.326 -8.501 -8.685 -8.885 -9.133 -9.497 -10.287 -8 ,19694 ,TETRA ,17558456,Sat Nov 27 01:34:44 CET,Sat Nov 27 03:31:29 CET,0.0 1.054 1.287 1.464 1.645 1.807 1.943 2.073 2.3 2.394 2.484 2.557 2.726 2.797 2.943 3.079 3.224 3.296 3.417 3.54 3.712 3.811 3.904 4.058 4.21 4.337 4.453 4.565 4.714 4.861 4.999 5.159 5.326 5.488 5.651 5.837 6.031 6.246 6.453 6.663 6.887 7.096 7.3 7.497 7.703 7.896 8.053 8.206 8.291 8.154 7.682 6.823 5.955 5.13 4.385 3.722 3.131 2.566 2.081 1.592 1.173 0.809 0.448 0.105 -0.221 -0.516 -0.817 -1.096 -1.332 -1.57 -1.827 -2.028 -2.224 -2.449 -2.63 -2.813 -3.004 -3.211 -3.424 -3.572 -3.729 -3.971 -4.13 -4.292 -4.373 -4.556 -4.763 -4.975 -5.084 -5.303 -5.451 -5.585 -5.726 -6.036 -6.21 -6.394 -6.599 -6.827 -7.08 -7.425 -8.281 -9 ,21523 ,TETRA ,17558457,Sat Nov 27 01:34:44 CET,Sat Nov 27 03:31:24 CET,0.0 0.551 0.883 1.094 1.259 1.418 1.558 1.686 1.908 2.002 2.094 2.176 2.347 2.418 2.563 2.698 2.824 2.885 3.022 3.16 3.342 3.452 3.551 3.691 3.833 3.973 4.101 4.236 4.409 4.544 4.666 4.823 4.985 5.135 5.291 5.478 5.655 5.839 6.039 6.239 6.453 6.694 6.913 7.121 7.352 7.528 7.712 7.864 7.966 7.887 7.385 6.527 5.622 4.748 3.931 3.205 2.613 2.071 1.567 1.05 0.593 0.194 -0.168 -0.497 -0.8 -1.092 -1.408 -1.688 -1.948 -2.202 -2.434 -2.64 -2.858 -3.106 -3.298 -3.484 -3.696 -3.918 -4.134 -4.285 -4.455 -4.721 -4.887 -5.052 -5.137 -5.323 -5.512 -5.712 -5.814 -6.013 -6.14 -6.275 -6.41 -6.682 -6.83 -6.998 -7.193 -7.439 -7.721 -8.053 -9.003 -10 ,12275 ,TETRA ,17558458,Sat Nov 27 01:34:47 CET,Sat Nov 27 03:31:22 CET,0.0 0.787 1.086 1.286 1.462 1.605 1.75 1.89 2.151 2.289 2.404 2.48 2.648 2.727 2.902 3.057 3.183 3.25 3.377 3.497 3.691 3.815 3.924 4.073 4.2 4.316 4.439 4.566 4.725 4.876 5.019 5.189 5.353 5.525 5.705 5.891 6.081 6.266 6.445 6.645 6.86 7.078 7.318 7.542 7.784 8.021 8.25 8.439 8.588 8.541 8.024 7.081 6.164 5.337 4.576 3.899 3.295 2.734 2.281 1.812 1.399 1.037 0.688 0.347 0.027 -0.273 -0.605 -0.888 -1.128 -1.374 -1.623 -1.843 -2.076 -2.318 -2.497 -2.67 -2.857 -3.06 -3.268 -3.412 -3.565 -3.79 -3.95 -4.119 -4.199 -4.363 -4.541 -4.737 -4.84 -5.043 -5.154 -5.285 -5.435 -5.732 -5.889 -6.07 -6.276 -6.481 -6.733 -7.142 -8.287 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index 6a553412..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14083 ,KEBNE ,17125883,Thu Dec 30 16:52:53 CET,Thu Dec 30 18:32:47 CET,0.0 0.616 0.901 1.152 1.368 1.532 1.683 1.841 2.079 2.179 2.284 2.387 2.574 2.669 2.863 3.041 3.213 3.302 3.463 3.613 3.841 3.991 4.126 4.323 4.525 4.713 4.896 5.07 5.295 5.519 5.73 5.987 6.231 6.47 6.756 7.076 7.382 7.728 8.107 8.502 8.908 9.383 9.958 10.524 11.174 11.881 12.695 13.652 14.781 16.1 17.589 18.77 19.398 19.691 19.762 19.776 19.741 19.608 19.496 19.36 19.178 18.995 18.828 18.675 18.517 18.354 18.172 18.0 17.852 17.684 17.503 17.351 17.183 17.007 16.863 16.714 16.56 16.39 16.215 16.085 15.95 15.734 15.573 15.41 15.328 15.155 14.953 14.719 14.599 14.396 14.213 14.079 13.936 13.609 13.439 13.252 13.006 12.726 12.39 11.914 10.577 -2 ,12924 ,KEBNE ,17125884,Thu Dec 30 16:52:57 CET,Thu Dec 30 18:32:43 CET,0.0 0.769 1.026 1.214 1.397 1.543 1.668 1.78 2.007 2.12 2.24 2.372 2.571 2.675 2.864 3.032 3.171 3.237 3.387 3.538 3.77 3.922 4.058 4.256 4.458 4.662 4.853 5.026 5.235 5.445 5.656 5.919 6.184 6.429 6.691 6.98 7.27 7.605 7.966 8.353 8.783 9.251 9.765 10.308 10.958 11.696 12.579 13.599 14.757 15.996 17.466 18.657 19.182 19.374 19.427 19.429 19.347 19.214 19.049 18.837 18.637 18.451 18.267 18.057 17.863 17.705 17.537 17.362 17.176 16.996 16.814 16.662 16.505 16.331 16.186 16.022 15.853 15.686 15.51 15.384 15.252 15.026 14.864 14.701 14.621 14.447 14.239 14.032 13.927 13.734 13.541 13.388 13.251 12.909 12.708 12.479 12.224 11.968 11.657 11.146 9.153 -3 ,1587 ,KEBNE ,17125885,Thu Dec 30 16:52:57 CET,Thu Dec 30 18:34:19 CET,0.0 0.868 1.187 1.461 1.664 1.853 2.033 2.185 2.444 2.559 2.679 2.808 3.0 3.097 3.283 3.459 3.618 3.697 3.857 4.021 4.251 4.386 4.517 4.715 4.919 5.123 5.306 5.477 5.703 5.922 6.129 6.387 6.632 6.873 7.176 7.51 7.805 8.138 8.519 8.916 9.337 9.828 10.382 10.918 11.554 12.283 13.138 14.097 15.173 16.384 17.842 18.931 19.453 19.752 19.886 19.859 19.751 19.633 19.513 19.353 19.19 19.019 18.832 18.645 18.435 18.235 18.028 17.842 17.688 17.507 17.3 17.145 16.992 16.828 16.689 16.545 16.408 16.244 16.071 15.953 15.817 15.622 15.502 15.365 15.291 15.143 14.975 14.799 14.705 14.517 14.377 14.259 14.138 13.905 13.777 13.597 13.379 13.152 12.866 12.427 10.932 -4 ,5307 ,KEBNE ,17125886,Thu Dec 30 16:52:57 CET,Thu Dec 30 18:32:51 CET,0.0 0.69 1.008 1.246 1.434 1.618 1.802 1.951 2.195 2.301 2.399 2.478 2.658 2.74 2.888 3.031 3.174 3.25 3.405 3.553 3.764 3.893 4.018 4.212 4.399 4.564 4.722 4.888 5.108 5.303 5.491 5.718 5.941 6.186 6.47 6.775 7.071 7.403 7.747 8.111 8.528 9.014 9.575 10.131 10.769 11.475 12.293 13.224 14.352 15.687 17.165 18.279 18.817 19.082 19.179 19.133 19.014 18.875 18.752 18.582 18.412 18.269 18.107 17.916 17.736 17.578 17.397 17.218 17.043 16.859 16.653 16.465 16.289 16.12 15.981 15.836 15.695 15.546 15.349 15.2 15.068 14.864 14.718 14.56 14.472 14.284 14.069 13.845 13.726 13.518 13.346 13.202 13.04 12.692 12.505 12.267 12.01 11.736 11.369 10.868 8.905 -5 ,4848 ,KEBNE ,17125887,Thu Dec 30 16:52:57 CET,Thu Dec 30 18:32:45 CET,0.0 0.601 0.923 1.139 1.334 1.513 1.696 1.846 2.105 2.246 2.356 2.471 2.672 2.77 2.955 3.13 3.303 3.395 3.581 3.756 3.993 4.138 4.27 4.455 4.645 4.837 5.028 5.196 5.395 5.603 5.825 6.086 6.342 6.591 6.872 7.213 7.55 7.901 8.285 8.705 9.13 9.599 10.174 10.734 11.384 12.133 12.955 13.865 14.929 16.197 17.703 18.78 19.303 19.538 19.565 19.513 19.443 19.328 19.164 18.957 18.776 18.613 18.436 18.248 18.075 17.937 17.781 17.604 17.451 17.291 17.118 16.976 16.815 16.642 16.507 16.366 16.22 16.059 15.884 15.752 15.619 15.409 15.24 15.063 14.975 14.788 14.601 14.412 14.312 14.12 13.948 13.804 13.644 13.307 13.113 12.907 12.68 12.412 12.043 11.571 9.859 -6 ,19133 ,KEBNE ,17125888,Thu Dec 30 16:52:57 CET,Thu Dec 30 18:33:46 CET,0.0 0.821 1.211 1.48 1.684 1.851 2.019 2.178 2.467 2.591 2.695 2.814 3.015 3.114 3.304 3.474 3.629 3.705 3.865 4.017 4.225 4.366 4.505 4.708 4.895 5.07 5.251 5.433 5.662 5.881 6.09 6.337 6.591 6.844 7.139 7.455 7.753 8.086 8.447 8.848 9.26 9.712 10.244 10.772 11.407 12.149 13.025 13.982 15.029 16.29 17.826 18.972 19.46 19.619 19.712 19.752 19.673 19.539 19.402 19.247 19.116 18.984 18.825 18.641 18.454 18.277 18.089 17.925 17.776 17.616 17.44 17.298 17.145 16.967 16.825 16.656 16.49 16.344 16.167 16.036 15.898 15.681 15.522 15.374 15.296 15.095 14.893 14.681 14.567 14.373 14.209 14.066 13.918 13.572 13.355 13.124 12.889 12.591 12.185 11.674 9.87 -7 ,7799 ,KEBNE ,17125889,Thu Dec 30 16:52:57 CET,Thu Dec 30 18:32:47 CET,0.0 0.584 0.82 1.044 1.249 1.427 1.572 1.711 1.954 2.068 2.176 2.284 2.475 2.573 2.774 2.963 3.147 3.235 3.403 3.566 3.809 3.965 4.095 4.274 4.452 4.645 4.838 5.014 5.248 5.475 5.693 5.95 6.2 6.443 6.716 7.029 7.325 7.649 8.013 8.41 8.809 9.261 9.812 10.358 10.974 11.68 12.512 13.408 14.494 15.797 17.298 18.455 19.068 19.331 19.369 19.32 19.23 19.123 19.002 18.857 18.711 18.539 18.373 18.221 18.059 17.894 17.709 17.542 17.38 17.198 17.014 16.853 16.676 16.482 16.343 16.203 16.036 15.851 15.661 15.524 15.374 15.161 15.018 14.851 14.754 14.561 14.367 14.156 14.048 13.863 13.72 13.59 13.455 13.157 12.984 12.781 12.554 12.263 11.865 11.307 9.216 -8 ,12558 ,KEBNE ,17125890,Thu Dec 30 16:52:57 CET,Thu Dec 30 18:33:01 CET,0.0 0.891 1.21 1.441 1.648 1.848 2.0 2.153 2.435 2.553 2.665 2.779 2.971 3.07 3.268 3.457 3.633 3.723 3.879 4.018 4.22 4.352 4.504 4.731 4.927 5.114 5.298 5.485 5.729 5.947 6.15 6.4 6.639 6.877 7.154 7.458 7.752 8.074 8.426 8.821 9.248 9.709 10.268 10.847 11.507 12.228 13.058 14.017 15.144 16.483 18.018 19.151 19.696 19.951 20.02 19.977 19.927 19.82 19.678 19.524 19.325 19.131 18.968 18.786 18.573 18.394 18.225 18.069 17.923 17.755 17.576 17.417 17.251 17.079 16.938 16.779 16.613 16.438 16.241 16.104 15.966 15.742 15.577 15.393 15.306 15.114 14.88 14.644 14.528 14.327 14.142 13.994 13.843 13.556 13.382 13.147 12.891 12.598 12.237 11.724 10.339 -9 ,8554 ,KEBNE ,17125891,Thu Dec 30 16:52:57 CET,Thu Dec 30 18:33:43 CET,0.0 0.856 1.238 1.542 1.77 1.945 2.118 2.277 2.539 2.657 2.775 2.906 3.098 3.193 3.379 3.559 3.73 3.807 3.964 4.12 4.336 4.47 4.6 4.785 4.974 5.164 5.357 5.54 5.769 5.993 6.209 6.478 6.739 6.986 7.269 7.589 7.899 8.265 8.663 9.065 9.489 9.953 10.497 11.045 11.681 12.391 13.214 14.165 15.26 16.53 18.01 19.134 19.627 19.793 19.802 19.74 19.652 19.513 19.351 19.179 19.023 18.849 18.659 18.495 18.333 18.175 18.005 17.827 17.666 17.494 17.301 17.132 16.941 16.741 16.607 16.474 16.314 16.146 15.98 15.865 15.732 15.505 15.347 15.186 15.103 14.918 14.703 14.48 14.362 14.16 13.978 13.827 13.66 13.243 12.998 12.765 12.508 12.2 11.837 11.403 9.714 -10 ,22090 ,KEBNE ,17125892,Thu Dec 30 16:52:57 CET,Thu Dec 30 18:32:43 CET,0.0 0.983 1.294 1.53 1.75 1.944 2.106 2.252 2.5 2.612 2.727 2.848 3.05 3.159 3.357 3.554 3.733 3.815 3.981 4.13 4.325 4.446 4.585 4.805 5.007 5.189 5.361 5.54 5.772 5.993 6.203 6.445 6.699 6.959 7.245 7.554 7.846 8.165 8.516 8.909 9.315 9.771 10.301 10.833 11.468 12.192 13.059 14.01 15.111 16.388 17.878 18.982 19.466 19.665 19.74 19.734 19.657 19.537 19.356 19.176 19.057 18.911 18.749 18.592 18.429 18.267 18.071 17.867 17.704 17.557 17.379 17.218 17.051 16.86 16.705 16.559 16.405 16.222 16.028 15.901 15.767 15.541 15.381 15.208 15.114 14.929 14.732 14.511 14.399 14.206 14.034 13.892 13.74 13.441 13.272 13.054 12.782 12.44 12.05 11.546 9.853 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt deleted file mode 100644 index 3fee8052..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12801 ,TETRA ,17558459,Sat Nov 27 01:34:48 CET,Sat Nov 27 03:31:28 CET,0.0 1.139 1.475 1.754 1.949 2.084 2.228 2.357 2.591 2.708 2.825 2.949 3.137 3.218 3.375 3.526 3.67 3.74 3.869 4.002 4.185 4.291 4.399 4.574 4.742 4.889 5.041 5.197 5.394 5.582 5.748 5.955 6.156 6.343 6.562 6.802 7.046 7.307 7.568 7.853 8.154 8.503 8.907 9.308 9.771 10.262 10.819 11.448 12.117 12.777 13.432 13.731 13.642 13.45 13.217 12.912 12.588 12.297 12.047 11.778 11.526 11.281 11.046 10.824 10.602 10.389 10.158 9.946 9.778 9.599 9.388 9.209 9.025 8.833 8.687 8.541 8.4 8.263 8.119 8.023 7.915 7.728 7.597 7.47 7.408 7.257 7.089 6.909 6.819 6.637 6.542 6.445 6.332 6.091 5.966 5.829 5.689 5.535 5.36 5.138 4.338 -2 ,22123 ,TETRA ,17558460,Sat Nov 27 01:35:43 CET,Sat Nov 27 03:27:45 CET,0.0 0.784 1.131 1.358 1.535 1.695 1.821 1.934 2.174 2.289 2.395 2.5 2.69 2.779 2.953 3.118 3.278 3.352 3.491 3.626 3.805 3.928 4.057 4.234 4.391 4.542 4.692 4.841 5.033 5.225 5.407 5.605 5.793 5.981 6.209 6.48 6.729 6.986 7.254 7.53 7.824 8.156 8.539 8.949 9.424 9.918 10.47 11.056 11.664 12.332 13.019 13.293 13.246 13.059 12.781 12.448 12.125 11.818 11.528 11.178 10.876 10.634 10.382 10.119 9.866 9.639 9.398 9.169 8.983 8.785 8.562 8.385 8.19 7.986 7.828 7.652 7.479 7.309 7.131 7.0 6.855 6.618 6.451 6.289 6.211 6.056 5.877 5.682 5.581 5.388 5.249 5.12 4.987 4.694 4.538 4.374 4.181 3.953 3.711 3.35 2.119 -3 ,13999 ,TETRA ,17558461,Sat Nov 27 01:34:44 CET,Sat Nov 27 03:30:53 CET,0.0 0.919 1.161 1.35 1.541 1.697 1.833 1.963 2.188 2.299 2.415 2.529 2.718 2.812 2.996 3.155 3.291 3.362 3.497 3.626 3.807 3.917 4.037 4.217 4.383 4.53 4.673 4.826 5.017 5.189 5.359 5.568 5.771 5.963 6.186 6.428 6.671 6.936 7.211 7.507 7.798 8.131 8.54 8.956 9.423 9.918 10.488 11.112 11.82 12.556 13.187 13.427 13.334 13.13 12.87 12.577 12.293 11.976 11.693 11.4 11.129 10.885 10.639 10.384 10.158 9.953 9.724 9.525 9.351 9.15 8.943 8.777 8.608 8.433 8.284 8.127 7.968 7.799 7.621 7.495 7.362 7.16 7.025 6.865 6.773 6.587 6.409 6.244 6.141 5.938 5.809 5.674 5.542 5.256 5.091 4.918 4.723 4.518 4.248 3.894 3.101 -4 ,26585 ,TETRA ,17558462,Sat Nov 27 01:34:47 CET,Sat Nov 27 03:30:41 CET,0.0 0.48 0.659 0.828 0.988 1.103 1.193 1.287 1.48 1.563 1.64 1.7 1.876 1.963 2.132 2.279 2.416 2.483 2.632 2.784 2.982 3.105 3.226 3.394 3.554 3.715 3.875 4.024 4.204 4.378 4.557 4.778 4.983 5.185 5.422 5.671 5.915 6.171 6.431 6.708 7.01 7.363 7.761 8.14 8.577 9.094 9.652 10.265 10.996 11.729 12.344 12.536 12.501 12.314 12.059 11.773 11.487 11.223 10.963 10.651 10.355 10.099 9.874 9.661 9.422 9.196 8.951 8.726 8.541 8.353 8.15 7.964 7.78 7.588 7.432 7.269 7.101 6.938 6.769 6.645 6.52 6.317 6.166 6.015 5.933 5.75 5.551 5.35 5.241 5.036 4.876 4.739 4.615 4.347 4.167 3.964 3.747 3.526 3.282 2.886 1.393 -5 ,2870 ,TETRA ,17558463,Sat Nov 27 01:34:45 CET,Sat Nov 27 03:24:15 CET,0.0 1.103 1.453 1.682 1.884 2.045 2.191 2.333 2.564 2.671 2.781 2.891 3.09 3.192 3.384 3.539 3.678 3.75 3.875 3.99 4.164 4.266 4.354 4.495 4.639 4.78 4.94 5.098 5.29 5.47 5.639 5.843 6.035 6.222 6.442 6.679 6.91 7.158 7.425 7.711 8.006 8.355 8.791 9.203 9.666 10.183 10.721 11.328 12.013 12.712 13.318 13.527 13.421 13.191 12.922 12.621 12.34 12.091 11.847 11.557 11.3 11.062 10.79 10.526 10.302 10.091 9.856 9.65 9.465 9.27 9.054 8.87 8.692 8.501 8.351 8.196 8.041 7.876 7.685 7.558 7.421 7.202 7.043 6.864 6.776 6.597 6.405 6.209 6.11 5.913 5.781 5.667 5.538 5.239 5.063 4.858 4.667 4.479 4.246 3.877 2.872 -6 ,19303 ,TETRA ,17558464,Sat Nov 27 01:35:42 CET,Sat Nov 27 03:33:41 CET,0.0 1.035 1.339 1.532 1.672 1.807 1.949 2.088 2.299 2.394 2.494 2.59 2.771 2.855 3.014 3.176 3.332 3.399 3.533 3.663 3.861 3.981 4.088 4.264 4.435 4.581 4.725 4.867 5.036 5.192 5.351 5.548 5.745 5.939 6.163 6.417 6.661 6.934 7.226 7.512 7.806 8.136 8.538 8.96 9.435 9.915 10.438 11.012 11.633 12.28 12.959 13.26 13.194 12.991 12.7 12.414 12.136 11.865 11.607 11.277 10.974 10.72 10.485 10.248 10.019 9.811 9.577 9.359 9.171 8.963 8.752 8.573 8.371 8.174 8.02 7.869 7.723 7.547 7.349 7.214 7.075 6.863 6.705 6.527 6.436 6.251 6.041 5.819 5.711 5.499 5.317 5.192 5.054 4.732 4.572 4.4 4.211 3.988 3.68 3.282 2.477 -7 ,15720 ,TETRA ,17558465,Sat Nov 27 01:35:44 CET,Sat Nov 27 03:32:35 CET,0.0 0.502 0.673 0.807 0.924 1.034 1.117 1.201 1.376 1.453 1.52 1.554 1.72 1.787 1.94 2.096 2.23 2.3 2.444 2.585 2.781 2.909 3.04 3.211 3.367 3.53 3.695 3.848 4.04 4.231 4.409 4.616 4.817 5.009 5.228 5.475 5.715 5.973 6.246 6.529 6.829 7.166 7.54 7.921 8.371 8.853 9.42 10.053 10.712 11.39 11.979 12.224 12.192 12.046 11.841 11.587 11.298 10.981 10.698 10.425 10.186 9.943 9.696 9.464 9.226 9.006 8.789 8.579 8.396 8.198 7.994 7.824 7.623 7.425 7.278 7.118 6.954 6.784 6.607 6.473 6.327 6.102 5.936 5.759 5.672 5.485 5.278 5.075 4.968 4.762 4.62 4.498 4.367 4.068 3.896 3.72 3.549 3.362 3.11 2.751 2.174 -8 ,16265 ,TETRA ,17558466,Sat Nov 27 01:35:44 CET,Sat Nov 27 03:31:00 CET,0.0 1.073 1.372 1.598 1.793 1.976 2.118 2.244 2.5 2.604 2.7 2.787 2.96 3.052 3.233 3.39 3.534 3.605 3.751 3.886 4.073 4.201 4.327 4.492 4.646 4.802 4.951 5.096 5.284 5.465 5.635 5.835 6.031 6.229 6.444 6.677 6.913 7.186 7.474 7.768 8.092 8.459 8.852 9.238 9.688 10.169 10.724 11.354 12.029 12.682 13.302 13.525 13.445 13.234 12.928 12.65 12.39 12.126 11.875 11.602 11.352 11.123 10.902 10.673 10.45 10.248 10.022 9.809 9.638 9.456 9.259 9.096 8.928 8.734 8.578 8.423 8.253 8.068 7.884 7.755 7.613 7.405 7.252 7.084 7.002 6.84 6.662 6.464 6.36 6.161 6.025 5.906 5.784 5.492 5.327 5.138 4.907 4.695 4.49 4.174 3.342 -9 ,9120 ,TETRA ,17558467,Sat Nov 27 01:35:46 CET,Sat Nov 27 03:31:10 CET,0.0 0.905 1.162 1.324 1.444 1.547 1.653 1.754 1.924 2.011 2.092 2.159 2.331 2.397 2.529 2.668 2.798 2.858 2.978 3.096 3.27 3.388 3.504 3.679 3.854 4.019 4.174 4.331 4.531 4.727 4.919 5.136 5.325 5.511 5.735 5.969 6.192 6.455 6.761 7.098 7.433 7.779 8.191 8.6 9.084 9.605 10.151 10.739 11.401 12.102 12.698 12.973 12.919 12.682 12.422 12.124 11.82 11.525 11.25 10.997 10.774 10.543 10.289 10.025 9.791 9.594 9.369 9.162 8.988 8.784 8.558 8.378 8.195 8.014 7.871 7.709 7.534 7.347 7.164 7.044 6.912 6.704 6.563 6.41 6.33 6.154 5.957 5.743 5.623 5.407 5.241 5.121 4.999 4.701 4.538 4.349 4.126 3.889 3.615 3.214 1.912 -10 ,12005 ,TETRA ,17558468,Sat Nov 27 01:35:44 CET,Sat Nov 27 03:32:02 CET,0.0 0.794 1.073 1.263 1.414 1.546 1.686 1.833 2.038 2.132 2.243 2.357 2.55 2.643 2.803 2.952 3.105 3.184 3.336 3.479 3.688 3.818 3.934 4.093 4.253 4.418 4.584 4.735 4.913 5.101 5.296 5.511 5.7 5.878 6.099 6.358 6.597 6.86 7.133 7.413 7.729 8.093 8.489 8.882 9.359 9.868 10.395 10.993 11.687 12.371 12.982 13.231 13.158 12.922 12.66 12.394 12.097 11.795 11.541 11.264 11.003 10.758 10.507 10.263 10.03 9.784 9.506 9.272 9.083 8.88 8.654 8.47 8.278 8.085 7.937 7.766 7.579 7.391 7.205 7.086 6.961 6.761 6.616 6.458 6.379 6.214 6.043 5.848 5.745 5.549 5.401 5.288 5.155 4.832 4.663 4.49 4.292 4.059 3.78 3.37 2.185 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 854cc1ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10568 ,TETRA ,17558469,Sat Nov 27 01:35:46 CET,Sat Nov 27 03:30:55 CET,0.0 0.198 0.283 0.345 0.395 0.433 0.471 0.507 0.575 0.616 0.655 0.621 0.755 0.785 0.829 0.878 0.932 0.957 0.988 1.015 1.077 1.105 1.117 1.142 1.166 1.184 1.203 1.223 1.25 1.279 1.294 1.3 1.311 1.312 1.306 1.304 1.283 1.252 1.222 1.175 1.101 0.992 0.871 0.697 0.436 0.106 -0.378 -1.036 -2.049 -3.641 -6.275 -9.461 -12.096 -14.267 -16.106 -17.713 -19.074 -20.322 -21.414 -22.48 -23.377 -24.167 -24.927 -25.645 -26.315 -26.909 -27.508 -28.055 -28.527 -28.997 -29.49 -29.896 -30.32 -30.762 -31.104 -31.466 -31.829 -32.213 -32.624 -32.888 -33.157 -33.587 -33.88 -34.19 -34.354 -34.703 -35.08 -35.461 -35.644 -35.981 -36.265 -36.471 -36.688 -37.184 -37.467 -37.774 -38.116 -38.495 -38.919 -39.491 -41.464 -2 ,662 ,TETRA ,17558470,Sat Nov 27 01:35:48 CET,Sat Nov 27 03:29:57 CET,0.0 0.166 0.276 0.35 0.404 0.453 0.503 0.557 0.657 0.698 0.736 0.702 0.834 0.862 0.905 0.94 0.976 0.998 1.04 1.074 1.113 1.131 1.156 1.202 1.253 1.297 1.318 1.339 1.367 1.406 1.449 1.495 1.52 1.52 1.511 1.499 1.471 1.423 1.378 1.324 1.252 1.181 1.068 0.889 0.629 0.27 -0.237 -0.926 -1.951 -3.51 -6.134 -9.236 -11.737 -13.852 -15.647 -17.29 -18.728 -19.983 -21.055 -22.148 -23.095 -23.907 -24.639 -25.334 -26.001 -26.586 -27.185 -27.739 -28.215 -28.7 -29.208 -29.622 -30.04 -30.479 -30.838 -31.214 -31.584 -31.947 -32.312 -32.576 -32.854 -33.278 -33.573 -33.88 -34.03 -34.327 -34.665 -35.036 -35.228 -35.56 -35.829 -36.052 -36.287 -36.786 -37.061 -37.362 -37.708 -38.078 -38.534 -39.146 -40.664 -3 ,17519 ,TETRA ,17558471,Sat Nov 27 01:35:44 CET,Sat Nov 27 03:32:10 CET,0.0 0.247 0.346 0.427 0.494 0.547 0.587 0.625 0.703 0.744 0.789 0.773 0.901 0.927 0.972 1.01 1.051 1.076 1.114 1.149 1.196 1.217 1.235 1.266 1.297 1.32 1.337 1.366 1.394 1.416 1.446 1.468 1.473 1.463 1.446 1.435 1.409 1.366 1.339 1.296 1.224 1.128 0.99 0.811 0.522 0.13 -0.38 -1.101 -2.214 -3.862 -6.569 -9.703 -12.186 -14.381 -16.256 -17.875 -19.25 -20.458 -21.491 -22.518 -23.397 -24.192 -24.95 -25.644 -26.284 -26.875 -27.484 -28.04 -28.522 -29.022 -29.543 -29.966 -30.398 -30.851 -31.206 -31.558 -31.917 -32.296 -32.699 -32.98 -33.266 -33.687 -33.98 -34.297 -34.458 -34.771 -35.087 -35.434 -35.621 -35.941 -36.184 -36.388 -36.594 -37.099 -37.394 -37.721 -38.089 -38.455 -38.871 -39.427 -41.071 -4 ,22222 ,TETRA ,17558472,Sat Nov 27 01:35:44 CET,Sat Nov 27 03:30:20 CET,0.0 0.191 0.272 0.341 0.406 0.472 0.531 0.584 0.684 0.726 0.762 0.729 0.859 0.885 0.934 0.975 1.018 1.04 1.081 1.112 1.151 1.18 1.22 1.271 1.293 1.319 1.345 1.368 1.4 1.433 1.463 1.482 1.496 1.517 1.539 1.552 1.562 1.557 1.523 1.479 1.421 1.338 1.216 1.059 0.842 0.512 -0.003 -0.684 -1.693 -3.32 -5.942 -9.02 -11.553 -13.671 -15.513 -17.178 -18.553 -19.778 -20.887 -21.961 -22.846 -23.663 -24.448 -25.156 -25.791 -26.385 -27.009 -27.553 -28.037 -28.553 -29.073 -29.491 -29.913 -30.358 -30.702 -31.041 -31.392 -31.749 -32.125 -32.389 -32.666 -33.094 -33.377 -33.683 -33.839 -34.155 -34.505 -34.871 -35.063 -35.4 -35.663 -35.871 -36.1 -36.634 -36.926 -37.235 -37.571 -37.958 -38.41 -38.955 -40.684 -5 ,19717 ,TETRA ,17558473,Sat Nov 27 01:35:44 CET,Sat Nov 27 03:31:11 CET,0.0 0.355 0.462 0.53 0.584 0.634 0.679 0.732 0.827 0.859 0.895 0.865 0.987 1.01 1.071 1.13 1.181 1.206 1.248 1.277 1.32 1.348 1.375 1.422 1.462 1.483 1.505 1.52 1.532 1.555 1.571 1.57 1.567 1.566 1.562 1.543 1.515 1.465 1.399 1.327 1.246 1.141 0.992 0.805 0.54 0.19 -0.319 -1.016 -2.015 -3.562 -6.125 -9.177 -11.734 -13.865 -15.651 -17.286 -18.692 -19.926 -20.994 -22.047 -22.946 -23.757 -24.537 -25.263 -25.905 -26.491 -27.116 -27.666 -28.14 -28.62 -29.127 -29.557 -29.984 -30.41 -30.745 -31.096 -31.449 -31.817 -32.211 -32.473 -32.747 -33.194 -33.496 -33.801 -33.96 -34.305 -34.671 -35.055 -35.253 -35.592 -35.872 -36.103 -36.351 -36.84 -37.09 -37.359 -37.658 -38.016 -38.428 -38.931 -40.527 -6 ,7242 ,TETRA ,17558474,Sat Nov 27 01:36:45 CET,Sat Nov 27 03:34:13 CET,0.0 0.333 0.48 0.576 0.636 0.694 0.745 0.784 0.854 0.89 0.935 0.922 1.058 1.091 1.131 1.177 1.223 1.241 1.273 1.306 1.35 1.369 1.388 1.432 1.465 1.494 1.521 1.555 1.603 1.635 1.669 1.723 1.767 1.782 1.792 1.795 1.791 1.79 1.779 1.76 1.731 1.664 1.556 1.406 1.157 0.793 0.289 -0.409 -1.458 -3.071 -5.783 -8.912 -11.375 -13.387 -15.183 -16.76 -18.107 -19.374 -20.436 -21.506 -22.46 -23.3 -24.063 -24.777 -25.433 -26.003 -26.627 -27.199 -27.653 -28.118 -28.608 -29.025 -29.456 -29.873 -30.211 -30.575 -30.948 -31.316 -31.677 -31.937 -32.225 -32.644 -32.925 -33.233 -33.387 -33.697 -34.032 -34.402 -34.597 -34.923 -35.183 -35.411 -35.645 -36.13 -36.39 -36.661 -36.967 -37.365 -37.878 -38.539 -40.701 -7 ,6973 ,TETRA ,17558475,Sat Nov 27 01:36:46 CET,Sat Nov 27 03:30:13 CET,0.0 0.281 0.366 0.442 0.499 0.55 0.602 0.644 0.728 0.768 0.813 0.817 0.949 0.978 1.027 1.074 1.113 1.134 1.168 1.185 1.214 1.234 1.261 1.303 1.343 1.384 1.415 1.448 1.489 1.514 1.535 1.564 1.575 1.566 1.559 1.563 1.566 1.566 1.548 1.512 1.45 1.363 1.237 1.062 0.82 0.472 -0.037 -0.722 -1.762 -3.394 -6.014 -9.139 -11.793 -13.971 -15.807 -17.421 -18.791 -20.022 -21.083 -22.161 -23.069 -23.871 -24.638 -25.331 -25.985 -26.592 -27.221 -27.775 -28.26 -28.756 -29.247 -29.655 -30.078 -30.517 -30.862 -31.229 -31.596 -31.964 -32.369 -32.646 -32.92 -33.349 -33.651 -33.974 -34.145 -34.484 -34.833 -35.205 -35.394 -35.723 -35.982 -36.2 -36.428 -36.938 -37.226 -37.527 -37.844 -38.21 -38.653 -39.246 -40.853 -8 ,24715 ,TETRA ,17558476,Sat Nov 27 01:36:48 CET,Sat Nov 27 03:31:34 CET,0.0 0.291 0.394 0.474 0.535 0.578 0.616 0.658 0.76 0.804 0.837 0.794 0.915 0.944 1.005 1.046 1.088 1.113 1.149 1.176 1.228 1.264 1.294 1.326 1.357 1.38 1.396 1.416 1.441 1.457 1.461 1.472 1.482 1.483 1.473 1.447 1.428 1.408 1.367 1.323 1.285 1.199 1.054 0.908 0.685 0.331 -0.179 -0.882 -1.9 -3.508 -6.208 -9.399 -11.942 -14.02 -15.841 -17.484 -18.913 -20.167 -21.231 -22.32 -23.264 -24.074 -24.818 -25.53 -26.204 -26.817 -27.447 -27.994 -28.477 -28.992 -29.504 -29.911 -30.332 -30.756 -31.073 -31.422 -31.802 -32.19 -32.59 -32.86 -33.133 -33.553 -33.849 -34.163 -34.326 -34.644 -34.977 -35.343 -35.544 -35.885 -36.152 -36.366 -36.585 -37.053 -37.315 -37.602 -37.921 -38.291 -38.74 -39.36 -41.121 -9 ,21424 ,TETRA ,17558477,Sat Nov 27 01:36:45 CET,Sat Nov 27 03:32:53 CET,0.0 0.391 0.522 0.587 0.645 0.715 0.772 0.811 0.895 0.942 0.977 0.934 1.068 1.112 1.187 1.245 1.297 1.32 1.369 1.415 1.473 1.502 1.527 1.563 1.59 1.609 1.634 1.649 1.681 1.717 1.735 1.75 1.747 1.731 1.713 1.694 1.676 1.653 1.607 1.55 1.491 1.393 1.252 1.065 0.777 0.416 -0.092 -0.849 -1.92 -3.556 -6.283 -9.413 -11.941 -14.143 -16.029 -17.633 -18.986 -20.225 -21.33 -22.414 -23.329 -24.147 -24.916 -25.629 -26.275 -26.852 -27.457 -27.998 -28.465 -28.958 -29.467 -29.875 -30.307 -30.763 -31.097 -31.438 -31.797 -32.165 -32.552 -32.801 -33.055 -33.473 -33.765 -34.073 -34.242 -34.589 -34.925 -35.292 -35.481 -35.797 -36.051 -36.269 -36.491 -36.976 -37.252 -37.522 -37.818 -38.173 -38.59 -39.191 -41.302 -10 ,25139 ,TETRA ,17558478,Sat Nov 27 01:36:45 CET,Sat Nov 27 03:30:38 CET,0.0 0.227 0.313 0.375 0.414 0.449 0.494 0.54 0.619 0.655 0.68 0.632 0.759 0.783 0.83 0.871 0.909 0.932 0.97 1.001 1.038 1.06 1.08 1.103 1.116 1.138 1.169 1.197 1.219 1.224 1.22 1.225 1.237 1.235 1.228 1.223 1.218 1.191 1.147 1.095 1.031 0.941 0.807 0.635 0.371 0.023 -0.458 -1.166 -2.225 -3.791 -6.356 -9.348 -11.892 -14.111 -15.88 -17.395 -18.78 -20.012 -21.002 -22.005 -22.882 -23.695 -24.481 -25.198 -25.858 -26.428 -27.02 -27.557 -28.005 -28.466 -28.958 -29.375 -29.8 -30.222 -30.55 -30.897 -31.245 -31.614 -32.016 -32.284 -32.553 -32.982 -33.276 -33.579 -33.741 -34.068 -34.406 -34.765 -34.956 -35.299 -35.561 -35.783 -36.032 -36.539 -36.804 -37.102 -37.408 -37.743 -38.148 -38.703 -40.428 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt deleted file mode 100644 index e57e0c0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12449 ,TETRA ,17558479,Sat Nov 27 01:36:46 CET,Sat Nov 27 03:25:15 CET,0.0 0.756 1.04 1.233 1.363 1.5 1.618 1.723 1.92 2.011 2.097 2.17 2.289 2.343 2.45 2.552 2.647 2.692 2.785 2.88 3.012 3.098 3.168 3.261 3.355 3.447 3.537 3.621 3.737 3.846 3.942 4.064 4.182 4.301 4.438 4.58 4.704 4.835 4.978 5.136 5.288 5.445 5.623 5.784 5.967 6.18 6.398 6.625 6.865 7.069 7.124 6.911 6.637 6.321 6.019 5.754 5.484 5.207 4.972 4.742 4.541 4.361 4.184 4.026 3.876 3.731 3.587 3.459 3.34 3.211 3.079 2.962 2.849 2.745 2.663 2.583 2.507 2.423 2.335 2.279 2.219 2.105 2.026 1.951 1.917 1.848 1.766 1.682 1.636 1.523 1.486 1.434 1.381 1.281 1.224 1.153 1.089 1.017 0.936 0.833 0.485 -2 ,28359 ,TETRA ,17558480,Sat Nov 27 01:36:49 CET,Sat Nov 27 03:25:29 CET,0.0 0.461 0.668 0.866 1.036 1.166 1.269 1.35 1.521 1.603 1.682 1.771 1.893 1.944 2.049 2.165 2.277 2.326 2.416 2.503 2.629 2.702 2.766 2.86 2.961 3.063 3.159 3.252 3.365 3.459 3.556 3.683 3.805 3.91 4.021 4.164 4.318 4.478 4.631 4.799 4.973 5.158 5.362 5.535 5.728 5.941 6.154 6.373 6.612 6.813 6.911 6.753 6.458 6.139 5.842 5.551 5.281 5.037 4.82 4.588 4.386 4.201 4.024 3.863 3.709 3.562 3.399 3.246 3.111 2.978 2.838 2.735 2.638 2.532 2.458 2.372 2.282 2.201 2.112 2.053 1.99 1.895 1.824 1.739 1.702 1.619 1.524 1.43 1.384 1.276 1.249 1.194 1.139 1.03 0.931 0.794 0.656 0.515 0.331 0.048 -0.452 -3 ,26712 ,TETRA ,17558481,Sat Nov 27 01:36:47 CET,Sat Nov 27 03:25:00 CET,0.0 0.608 0.762 0.911 1.028 1.125 1.216 1.312 1.511 1.593 1.662 1.734 1.859 1.921 2.038 2.149 2.253 2.305 2.407 2.503 2.634 2.718 2.791 2.897 2.999 3.091 3.177 3.261 3.364 3.462 3.566 3.69 3.801 3.906 4.03 4.153 4.266 4.406 4.569 4.73 4.882 5.053 5.254 5.465 5.689 5.917 6.158 6.369 6.561 6.745 6.806 6.651 6.43 6.152 5.885 5.605 5.328 5.077 4.876 4.664 4.453 4.271 4.101 3.934 3.775 3.627 3.469 3.322 3.193 3.054 2.912 2.812 2.709 2.608 2.53 2.448 2.37 2.272 2.174 2.115 2.05 1.946 1.864 1.777 1.74 1.667 1.587 1.51 1.47 1.363 1.342 1.292 1.235 1.116 1.047 0.967 0.894 0.797 0.665 0.52 0.169 -4 ,31143 ,TETRA ,17558482,Sat Nov 27 00:33:20 CET,Sat Nov 27 02:27:59 CET,0.0 0.865 1.178 1.385 1.526 1.655 1.775 1.886 2.079 2.161 2.23 2.303 2.427 2.489 2.608 2.701 2.795 2.842 2.929 3.016 3.14 3.216 3.288 3.386 3.495 3.603 3.709 3.803 3.909 4.012 4.117 4.249 4.375 4.489 4.612 4.746 4.866 5.006 5.152 5.301 5.454 5.621 5.812 5.988 6.19 6.423 6.672 6.917 7.164 7.341 7.345 7.103 6.81 6.525 6.217 5.899 5.634 5.398 5.166 4.929 4.719 4.528 4.351 4.177 4.008 3.862 3.713 3.571 3.448 3.314 3.179 3.077 2.959 2.812 2.707 2.617 2.509 2.397 2.282 2.196 2.105 1.975 1.888 1.786 1.736 1.643 1.559 1.465 1.415 1.304 1.266 1.209 1.153 1.05 0.998 0.92 0.811 0.702 0.607 0.51 0.285 -5 ,28624 ,TETRA ,17558483,Sat Nov 27 00:33:22 CET,Sat Nov 27 02:28:27 CET,0.0 0.771 1.01 1.174 1.303 1.412 1.52 1.627 1.819 1.899 1.964 2.021 2.145 2.199 2.305 2.418 2.516 2.561 2.652 2.746 2.874 2.949 3.025 3.139 3.251 3.36 3.453 3.548 3.676 3.782 3.885 4.021 4.152 4.266 4.384 4.518 4.654 4.802 4.944 5.073 5.211 5.379 5.588 5.785 5.983 6.179 6.387 6.606 6.825 7.017 7.091 6.889 6.603 6.291 5.988 5.696 5.443 5.205 4.981 4.751 4.556 4.37 4.184 4.007 3.851 3.711 3.559 3.414 3.279 3.142 2.999 2.88 2.766 2.658 2.578 2.503 2.431 2.344 2.236 2.162 2.096 2.004 1.937 1.851 1.809 1.742 1.663 1.571 1.528 1.413 1.368 1.323 1.269 1.15 1.079 0.997 0.903 0.785 0.668 0.557 0.296 -6 ,2146 ,TETRA ,17558484,Sat Nov 27 00:33:23 CET,Sat Nov 27 02:22:37 CET,0.0 0.464 0.686 0.842 0.978 1.095 1.2 1.293 1.462 1.536 1.597 1.649 1.772 1.841 1.968 2.067 2.16 2.211 2.302 2.382 2.496 2.569 2.644 2.754 2.858 2.955 3.048 3.14 3.263 3.38 3.484 3.606 3.717 3.822 3.951 4.097 4.236 4.386 4.531 4.676 4.831 5.0 5.206 5.391 5.58 5.798 6.007 6.185 6.381 6.58 6.65 6.453 6.178 5.877 5.589 5.321 5.056 4.817 4.609 4.375 4.168 3.993 3.818 3.645 3.493 3.348 3.184 3.034 2.906 2.772 2.629 2.512 2.39 2.265 2.169 2.075 1.983 1.874 1.754 1.672 1.582 1.441 1.348 1.259 1.209 1.095 0.965 0.823 0.747 0.61 0.514 0.42 0.324 0.138 0.033 -0.089 -0.218 -0.371 -0.543 -0.812 -1.483 -7 ,4506 ,TETRA ,17558485,Sat Nov 27 00:33:20 CET,Sat Nov 27 02:05:50 CET,0.0 0.943 1.217 1.438 1.586 1.714 1.829 1.936 2.124 2.203 2.27 2.334 2.46 2.524 2.644 2.761 2.87 2.921 3.012 3.106 3.238 3.322 3.406 3.527 3.635 3.732 3.825 3.916 4.041 4.16 4.264 4.383 4.499 4.608 4.726 4.86 4.975 5.094 5.23 5.373 5.527 5.706 5.898 6.076 6.286 6.51 6.721 6.935 7.161 7.347 7.427 7.257 6.987 6.685 6.391 6.082 5.791 5.542 5.302 5.035 4.82 4.649 4.473 4.297 4.132 3.983 3.837 3.703 3.579 3.445 3.308 3.188 3.048 2.913 2.822 2.72 2.613 2.504 2.389 2.317 2.237 2.095 1.997 1.888 1.828 1.719 1.613 1.495 1.431 1.299 1.208 1.128 1.049 0.89 0.786 0.658 0.519 0.38 0.218 0.002 -0.435 -8 ,32111 ,TETRA ,17558486,Sat Nov 27 00:36:20 CET,Sat Nov 27 02:17:05 CET,0.0 0.484 0.751 0.936 1.093 1.234 1.349 1.439 1.598 1.673 1.743 1.822 1.951 2.013 2.124 2.23 2.326 2.375 2.478 2.569 2.694 2.778 2.861 2.974 3.089 3.197 3.289 3.379 3.498 3.615 3.729 3.862 3.984 4.103 4.234 4.365 4.505 4.662 4.809 4.959 5.122 5.302 5.491 5.685 5.915 6.129 6.342 6.569 6.806 7.003 7.083 6.904 6.619 6.359 6.092 5.815 5.562 5.327 5.114 4.899 4.694 4.506 4.332 4.166 4.021 3.88 3.719 3.572 3.453 3.332 3.206 3.117 3.025 2.923 2.845 2.764 2.683 2.598 2.507 2.439 2.375 2.286 2.207 2.121 2.086 2.019 1.944 1.865 1.825 1.712 1.662 1.612 1.564 1.446 1.371 1.286 1.202 1.118 0.991 0.823 0.19 -9 ,22912 ,TETRA ,17558487,Sat Nov 27 00:37:20 CET,Sat Nov 27 02:28:25 CET,0.0 0.437 0.644 0.797 0.937 1.088 1.213 1.304 1.464 1.547 1.625 1.695 1.819 1.886 2.007 2.123 2.225 2.278 2.377 2.458 2.584 2.663 2.73 2.837 2.955 3.072 3.183 3.289 3.413 3.514 3.612 3.735 3.851 3.959 4.083 4.208 4.33 4.472 4.622 4.784 4.943 5.109 5.302 5.471 5.653 5.878 6.136 6.396 6.636 6.825 6.882 6.663 6.344 6.038 5.76 5.493 5.244 4.998 4.761 4.533 4.337 4.155 3.979 3.808 3.642 3.489 3.337 3.204 3.08 2.951 2.815 2.698 2.594 2.483 2.391 2.298 2.2 2.105 2.015 1.957 1.9 1.792 1.711 1.633 1.596 1.525 1.442 1.346 1.298 1.187 1.144 1.09 1.038 0.93 0.877 0.811 0.741 0.659 0.524 0.366 0.116 -10 ,21665 ,TETRA ,17558488,Sat Nov 27 00:40:21 CET,Sat Nov 27 02:29:41 CET,0.0 0.807 1.002 1.147 1.27 1.379 1.466 1.549 1.711 1.784 1.855 1.931 2.055 2.116 2.237 2.352 2.458 2.507 2.598 2.681 2.805 2.89 2.969 3.087 3.191 3.277 3.361 3.441 3.548 3.653 3.75 3.862 3.981 4.096 4.227 4.364 4.478 4.614 4.757 4.905 5.057 5.226 5.425 5.612 5.813 6.023 6.261 6.506 6.731 6.913 6.988 6.818 6.545 6.267 5.989 5.731 5.473 5.217 5.0 4.776 4.584 4.408 4.235 4.069 3.908 3.763 3.62 3.49 3.374 3.256 3.133 3.022 2.908 2.792 2.698 2.592 2.479 2.366 2.261 2.186 2.103 1.963 1.859 1.749 1.696 1.596 1.473 1.336 1.271 1.146 1.057 0.974 0.891 0.721 0.636 0.549 0.457 0.371 0.268 0.112 -0.114 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt deleted file mode 100644 index 8bed4c22..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15898 ,TETRA ,17558489,Sat Nov 27 00:40:20 CET,Sat Nov 27 02:27:01 CET,0.0 0.561 0.905 1.076 1.194 1.294 1.401 1.522 1.712 1.785 1.861 1.943 2.073 2.133 2.247 2.336 2.424 2.467 2.556 2.652 2.792 2.882 2.961 3.074 3.18 3.272 3.357 3.433 3.539 3.65 3.756 3.877 3.982 4.076 4.191 4.318 4.424 4.529 4.642 4.759 4.873 4.991 5.123 5.242 5.353 5.436 5.452 5.424 5.328 5.039 4.401 3.42 2.526 1.753 1.069 0.434 -0.127 -0.638 -1.083 -1.528 -1.881 -2.186 -2.501 -2.794 -3.063 -3.314 -3.588 -3.821 -4.023 -4.246 -4.463 -4.64 -4.831 -5.039 -5.185 -5.322 -5.475 -5.643 -5.813 -5.926 -6.043 -6.234 -6.381 -6.531 -6.598 -6.732 -6.877 -7.036 -7.126 -7.292 -7.423 -7.537 -7.648 -7.902 -8.049 -8.201 -8.365 -8.531 -8.738 -9.052 -9.941 -2 ,21783 ,TETRA ,17558490,Sat Nov 27 00:42:21 CET,Sat Nov 27 02:34:28 CET,0.0 0.65 1.007 1.269 1.441 1.55 1.665 1.773 1.946 2.027 2.117 2.206 2.33 2.386 2.511 2.643 2.751 2.794 2.889 2.985 3.108 3.18 3.252 3.36 3.471 3.57 3.651 3.73 3.841 3.947 4.044 4.161 4.265 4.361 4.471 4.595 4.705 4.817 4.933 5.051 5.177 5.299 5.412 5.521 5.619 5.708 5.778 5.766 5.644 5.348 4.716 3.809 2.923 2.144 1.493 0.873 0.311 -0.169 -0.57 -0.982 -1.371 -1.702 -1.995 -2.295 -2.575 -2.817 -3.073 -3.314 -3.522 -3.734 -3.955 -4.14 -4.33 -4.524 -4.67 -4.819 -4.975 -5.13 -5.298 -5.415 -5.532 -5.717 -5.858 -6.006 -6.079 -6.238 -6.404 -6.574 -6.663 -6.821 -6.917 -7.018 -7.124 -7.361 -7.514 -7.698 -7.875 -8.058 -8.288 -8.558 -9.237 -3 ,2144 ,TETRA ,17558491,Sat Nov 27 00:43:21 CET,Sat Nov 27 02:36:24 CET,0.0 0.327 0.558 0.788 0.974 1.096 1.219 1.372 1.671 1.778 1.862 1.95 2.086 2.144 2.246 2.346 2.444 2.491 2.589 2.686 2.817 2.897 2.979 3.104 3.214 3.316 3.409 3.519 3.67 3.793 3.905 4.03 4.149 4.26 4.372 4.498 4.619 4.743 4.874 4.998 5.118 5.237 5.368 5.494 5.589 5.653 5.697 5.724 5.683 5.439 4.793 3.84 2.983 2.204 1.496 0.85 0.308 -0.183 -0.632 -1.061 -1.42 -1.74 -2.042 -2.331 -2.609 -2.859 -3.111 -3.34 -3.54 -3.745 -3.951 -4.127 -4.307 -4.486 -4.631 -4.787 -4.952 -5.123 -5.301 -5.429 -5.562 -5.747 -5.88 -6.021 -6.093 -6.242 -6.396 -6.558 -6.646 -6.821 -6.946 -7.051 -7.165 -7.382 -7.516 -7.663 -7.821 -8.014 -8.235 -8.498 -9.139 -4 ,28043 ,TETRA ,17558492,Sat Nov 27 00:43:21 CET,Sat Nov 27 02:35:34 CET,0.0 1.065 1.322 1.533 1.724 1.864 1.992 2.106 2.291 2.375 2.443 2.509 2.646 2.712 2.846 2.985 3.096 3.142 3.24 3.337 3.461 3.54 3.627 3.755 3.87 3.962 4.044 4.126 4.248 4.359 4.449 4.563 4.672 4.765 4.873 5.018 5.143 5.251 5.365 5.478 5.593 5.718 5.859 5.983 6.087 6.173 6.243 6.247 6.131 5.796 5.078 4.142 3.304 2.54 1.85 1.238 0.686 0.165 -0.259 -0.657 -1.012 -1.341 -1.644 -1.933 -2.204 -2.454 -2.722 -2.959 -3.17 -3.385 -3.602 -3.784 -3.956 -4.14 -4.289 -4.435 -4.593 -4.759 -4.927 -5.043 -5.17 -5.37 -5.502 -5.637 -5.709 -5.862 -6.034 -6.216 -6.304 -6.468 -6.577 -6.679 -6.789 -7.007 -7.129 -7.252 -7.383 -7.542 -7.708 -7.937 -8.477 -5 ,32058 ,TETRA ,17558493,Sat Nov 27 00:43:22 CET,Sat Nov 27 02:36:45 CET,0.0 0.522 0.765 0.95 1.129 1.284 1.439 1.573 1.818 1.927 2.01 2.107 2.247 2.309 2.424 2.542 2.651 2.707 2.819 2.92 3.056 3.142 3.222 3.337 3.449 3.552 3.649 3.741 3.858 3.973 4.087 4.223 4.334 4.425 4.54 4.673 4.789 4.904 5.026 5.153 5.278 5.394 5.52 5.642 5.749 5.836 5.885 5.88 5.739 5.39 4.715 3.774 2.851 2.017 1.319 0.693 0.147 -0.352 -0.768 -1.181 -1.558 -1.882 -2.198 -2.498 -2.76 -3.016 -3.292 -3.528 -3.727 -3.936 -4.171 -4.366 -4.556 -4.757 -4.909 -5.059 -5.218 -5.383 -5.549 -5.66 -5.778 -5.965 -6.095 -6.227 -6.301 -6.477 -6.657 -6.819 -6.899 -7.06 -7.183 -7.295 -7.403 -7.628 -7.74 -7.86 -8.007 -8.184 -8.448 -8.773 -9.341 -6 ,29185 ,TETRA ,17558494,Sat Nov 27 00:45:22 CET,Sat Nov 27 02:37:23 CET,0.0 0.84 1.143 1.45 1.65 1.8 1.917 2.016 2.193 2.271 2.342 2.409 2.54 2.6 2.729 2.855 2.957 3.004 3.107 3.212 3.345 3.428 3.511 3.616 3.707 3.803 3.891 3.97 4.081 4.189 4.295 4.418 4.529 4.634 4.756 4.88 5.002 5.13 5.243 5.373 5.495 5.6 5.717 5.84 5.98 6.093 6.178 6.22 6.163 5.947 5.33 4.355 3.499 2.747 2.067 1.449 0.888 0.386 -0.051 -0.497 -0.87 -1.201 -1.519 -1.82 -2.108 -2.369 -2.652 -2.903 -3.104 -3.308 -3.512 -3.697 -3.898 -4.094 -4.254 -4.424 -4.591 -4.757 -4.923 -5.038 -5.166 -5.376 -5.524 -5.678 -5.759 -5.932 -6.095 -6.268 -6.367 -6.535 -6.659 -6.764 -6.871 -7.113 -7.238 -7.366 -7.522 -7.719 -7.929 -8.187 -9.093 -7 ,24800 ,TETRA ,17558495,Sat Nov 27 00:46:55 CET,Sat Nov 27 02:38:43 CET,0.0 0.462 0.702 0.911 1.047 1.173 1.279 1.379 1.565 1.655 1.738 1.823 1.955 2.016 2.138 2.252 2.351 2.398 2.492 2.58 2.698 2.775 2.845 2.932 3.019 3.112 3.21 3.297 3.396 3.496 3.589 3.692 3.797 3.903 4.019 4.131 4.24 4.359 4.485 4.614 4.738 4.867 4.983 5.081 5.186 5.295 5.388 5.392 5.273 4.985 4.342 3.422 2.542 1.751 1.049 0.419 -0.108 -0.599 -1.031 -1.459 -1.803 -2.116 -2.444 -2.746 -3.028 -3.3 -3.573 -3.803 -4.01 -4.231 -4.454 -4.641 -4.841 -5.044 -5.204 -5.371 -5.53 -5.686 -5.848 -5.966 -6.085 -6.267 -6.409 -6.555 -6.629 -6.778 -6.925 -7.095 -7.184 -7.345 -7.459 -7.557 -7.658 -7.877 -8.0 -8.14 -8.298 -8.461 -8.672 -8.964 -9.973 -8 ,30629 ,TETRA ,17558496,Sat Nov 27 00:47:55 CET,Sat Nov 27 02:41:24 CET,0.0 0.724 0.906 1.069 1.22 1.361 1.5 1.618 1.77 1.846 1.924 2.01 2.154 2.226 2.336 2.426 2.519 2.567 2.656 2.758 2.902 2.972 3.035 3.124 3.209 3.296 3.382 3.466 3.574 3.682 3.791 3.912 4.029 4.133 4.24 4.363 4.484 4.618 4.76 4.892 5.019 5.165 5.297 5.407 5.53 5.627 5.699 5.738 5.647 5.345 4.681 3.669 2.742 1.959 1.273 0.639 0.079 -0.433 -0.842 -1.242 -1.607 -1.937 -2.267 -2.572 -2.849 -3.094 -3.344 -3.571 -3.775 -3.999 -4.22 -4.398 -4.583 -4.769 -4.909 -5.06 -5.216 -5.373 -5.543 -5.669 -5.808 -6.008 -6.14 -6.289 -6.366 -6.497 -6.63 -6.798 -6.89 -7.067 -7.195 -7.302 -7.416 -7.662 -7.811 -7.993 -8.182 -8.376 -8.609 -8.944 -9.861 -9 ,18934 ,TETRA ,17558497,Sat Nov 27 00:47:55 CET,Sat Nov 27 02:42:16 CET,0.0 0.71 0.955 1.137 1.319 1.468 1.623 1.772 1.984 2.073 2.156 2.272 2.41 2.469 2.59 2.705 2.816 2.87 2.977 3.07 3.195 3.275 3.349 3.467 3.578 3.678 3.769 3.852 3.975 4.093 4.192 4.306 4.406 4.5 4.607 4.714 4.812 4.926 5.047 5.164 5.266 5.376 5.502 5.612 5.722 5.823 5.873 5.84 5.694 5.383 4.742 3.734 2.788 1.981 1.299 0.689 0.138 -0.357 -0.772 -1.201 -1.578 -1.896 -2.202 -2.516 -2.794 -3.028 -3.273 -3.496 -3.699 -3.905 -4.125 -4.315 -4.508 -4.701 -4.857 -5.026 -5.201 -5.381 -5.556 -5.672 -5.798 -5.998 -6.135 -6.273 -6.339 -6.479 -6.632 -6.79 -6.877 -7.05 -7.187 -7.286 -7.394 -7.647 -7.786 -7.936 -8.096 -8.271 -8.481 -8.847 -9.713 -10 ,25076 ,TETRA ,17558498,Sat Nov 27 00:47:54 CET,Sat Nov 27 02:40:10 CET,0.0 0.621 0.871 1.105 1.317 1.461 1.598 1.733 1.936 2.027 2.112 2.199 2.334 2.401 2.519 2.622 2.733 2.781 2.869 2.962 3.095 3.181 3.26 3.366 3.464 3.548 3.637 3.726 3.829 3.93 4.033 4.15 4.242 4.326 4.418 4.538 4.66 4.779 4.907 5.046 5.178 5.304 5.43 5.527 5.635 5.748 5.825 5.826 5.736 5.512 4.941 3.95 3.067 2.298 1.575 0.929 0.376 -0.127 -0.556 -1.009 -1.399 -1.729 -2.039 -2.334 -2.614 -2.865 -3.127 -3.367 -3.571 -3.787 -4.014 -4.202 -4.383 -4.565 -4.717 -4.877 -5.035 -5.196 -5.367 -5.493 -5.631 -5.831 -5.971 -6.127 -6.205 -6.36 -6.536 -6.728 -6.815 -6.974 -7.088 -7.188 -7.283 -7.482 -7.597 -7.739 -7.889 -8.06 -8.268 -8.526 -9.098 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt deleted file mode 100644 index c840ec62..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14846 ,TETRA ,17558499,Sat Nov 27 00:47:55 CET,Sat Nov 27 02:30:27 CET,0.0 0.503 0.78 0.976 1.14 1.286 1.423 1.531 1.718 1.81 1.891 1.976 2.109 2.173 2.289 2.394 2.492 2.543 2.651 2.752 2.875 2.952 3.039 3.163 3.266 3.359 3.454 3.543 3.659 3.776 3.888 4.019 4.139 4.245 4.363 4.495 4.625 4.77 4.908 5.041 5.186 5.339 5.488 5.629 5.761 5.849 5.918 5.956 5.915 5.684 5.075 4.174 3.336 2.566 1.896 1.302 0.75 0.244 -0.179 -0.59 -0.938 -1.278 -1.606 -1.885 -2.146 -2.396 -2.661 -2.897 -3.102 -3.317 -3.534 -3.707 -3.891 -4.09 -4.236 -4.388 -4.551 -4.722 -4.898 -5.015 -5.141 -5.345 -5.478 -5.6 -5.667 -5.825 -5.986 -6.143 -6.222 -6.391 -6.534 -6.641 -6.746 -6.956 -7.071 -7.205 -7.375 -7.578 -7.797 -8.097 -9.059 -2 ,28053 ,TETRA ,17558500,Sat Nov 27 00:48:54 CET,Sat Nov 27 02:44:55 CET,0.0 0.688 0.905 1.098 1.288 1.435 1.533 1.646 1.864 1.954 2.04 2.115 2.255 2.318 2.42 2.53 2.64 2.687 2.783 2.885 3.023 3.107 3.183 3.294 3.418 3.534 3.632 3.72 3.827 3.935 4.045 4.18 4.31 4.417 4.528 4.666 4.795 4.923 5.055 5.198 5.342 5.475 5.601 5.733 5.885 6.014 6.107 6.145 6.118 5.916 5.317 4.452 3.64 2.855 2.128 1.483 0.942 0.452 0.036 -0.377 -0.75 -1.074 -1.386 -1.683 -1.951 -2.192 -2.443 -2.682 -2.879 -3.068 -3.273 -3.455 -3.637 -3.821 -3.979 -4.144 -4.305 -4.471 -4.642 -4.765 -4.891 -5.076 -5.203 -5.334 -5.407 -5.568 -5.734 -5.905 -5.991 -6.151 -6.26 -6.358 -6.463 -6.702 -6.839 -7.006 -7.201 -7.387 -7.617 -7.92 -8.708 -3 ,25136 ,TETRA ,17558501,Sat Nov 27 00:48:57 CET,Sat Nov 27 02:42:36 CET,0.0 0.715 0.933 1.09 1.229 1.361 1.496 1.609 1.795 1.887 1.968 2.042 2.18 2.247 2.36 2.462 2.573 2.628 2.732 2.823 2.939 3.02 3.108 3.221 3.327 3.433 3.53 3.607 3.711 3.82 3.924 4.058 4.187 4.302 4.429 4.58 4.719 4.861 5.004 5.135 5.273 5.429 5.574 5.703 5.837 5.936 6.019 6.035 5.978 5.76 5.168 4.281 3.416 2.687 2.048 1.438 0.894 0.412 -0.015 -0.459 -0.837 -1.154 -1.452 -1.745 -2.005 -2.239 -2.506 -2.747 -2.95 -3.169 -3.394 -3.577 -3.757 -3.941 -4.091 -4.243 -4.393 -4.558 -4.733 -4.848 -4.969 -5.169 -5.311 -5.45 -5.526 -5.684 -5.831 -5.985 -6.08 -6.263 -6.404 -6.504 -6.612 -6.832 -6.941 -7.082 -7.241 -7.416 -7.67 -8.005 -8.716 -4 ,2126 ,TETRA ,17558502,Sat Nov 27 00:49:56 CET,Sat Nov 27 02:36:17 CET,0.0 0.743 1.043 1.241 1.404 1.551 1.672 1.803 2.037 2.114 2.187 2.262 2.398 2.479 2.635 2.766 2.877 2.933 3.043 3.135 3.269 3.351 3.427 3.548 3.67 3.793 3.917 4.016 4.125 4.238 4.347 4.466 4.566 4.673 4.798 4.921 5.043 5.183 5.325 5.457 5.586 5.709 5.833 5.952 6.067 6.164 6.247 6.293 6.241 5.988 5.394 4.542 3.719 2.949 2.275 1.664 1.119 0.616 0.187 -0.224 -0.601 -0.929 -1.219 -1.507 -1.777 -2.03 -2.303 -2.53 -2.732 -2.946 -3.154 -3.329 -3.517 -3.714 -3.866 -4.032 -4.204 -4.375 -4.559 -4.687 -4.816 -5.019 -5.156 -5.298 -5.37 -5.509 -5.663 -5.825 -5.907 -6.069 -6.196 -6.302 -6.414 -6.655 -6.798 -6.961 -7.118 -7.297 -7.582 -7.95 -8.736 -5 ,2568 ,TETRA ,17558503,Sat Nov 27 00:49:57 CET,Sat Nov 27 02:42:48 CET,0.0 0.57 0.84 1.041 1.216 1.36 1.472 1.573 1.782 1.875 1.949 2.032 2.183 2.252 2.355 2.447 2.545 2.595 2.69 2.783 2.918 3.005 3.075 3.179 3.299 3.418 3.517 3.604 3.73 3.851 3.954 4.082 4.201 4.306 4.428 4.558 4.674 4.794 4.923 5.059 5.188 5.326 5.476 5.609 5.737 5.843 5.915 5.933 5.919 5.688 4.995 4.046 3.177 2.428 1.775 1.169 0.649 0.171 -0.252 -0.671 -1.024 -1.342 -1.659 -1.952 -2.211 -2.457 -2.724 -2.961 -3.158 -3.361 -3.584 -3.774 -3.953 -4.132 -4.289 -4.445 -4.599 -4.775 -4.954 -5.07 -5.192 -5.392 -5.533 -5.68 -5.757 -5.905 -6.068 -6.245 -6.342 -6.51 -6.615 -6.724 -6.836 -7.077 -7.217 -7.363 -7.529 -7.737 -8.005 -8.352 -9.101 -6 ,26164 ,TETRA ,17558504,Sat Nov 27 00:50:00 CET,Sat Nov 27 02:41:55 CET,0.0 0.598 0.9 1.079 1.209 1.318 1.431 1.534 1.716 1.8 1.879 1.949 2.075 2.138 2.283 2.406 2.518 2.572 2.67 2.76 2.897 2.991 3.084 3.215 3.344 3.465 3.563 3.655 3.773 3.882 3.986 4.116 4.223 4.319 4.439 4.563 4.676 4.799 4.945 5.101 5.243 5.397 5.541 5.677 5.835 5.956 6.016 6.032 6.016 5.852 5.292 4.337 3.533 2.822 2.122 1.471 0.905 0.398 -0.024 -0.433 -0.779 -1.082 -1.384 -1.683 -1.951 -2.185 -2.429 -2.659 -2.872 -3.083 -3.302 -3.489 -3.678 -3.877 -4.033 -4.19 -4.358 -4.529 -4.701 -4.818 -4.934 -5.124 -5.258 -5.407 -5.483 -5.637 -5.804 -5.979 -6.071 -6.239 -6.377 -6.488 -6.598 -6.832 -6.955 -7.088 -7.236 -7.422 -7.656 -7.949 -8.821 -7 ,1359 ,TETRA ,17558505,Sat Nov 27 00:49:57 CET,Sat Nov 27 02:41:35 CET,0.0 0.831 1.096 1.283 1.405 1.518 1.63 1.736 1.92 2.009 2.088 2.179 2.317 2.384 2.523 2.638 2.738 2.788 2.889 2.991 3.112 3.182 3.262 3.377 3.477 3.568 3.662 3.755 3.877 3.993 4.09 4.197 4.3 4.404 4.521 4.647 4.763 4.882 5.003 5.132 5.265 5.399 5.535 5.65 5.761 5.862 5.944 5.976 5.934 5.752 5.173 4.215 3.329 2.552 1.845 1.2 0.646 0.152 -0.283 -0.737 -1.109 -1.438 -1.752 -2.053 -2.329 -2.576 -2.834 -3.06 -3.259 -3.466 -3.688 -3.877 -4.065 -4.255 -4.408 -4.578 -4.756 -4.93 -5.108 -5.228 -5.357 -5.563 -5.698 -5.837 -5.907 -6.058 -6.23 -6.407 -6.494 -6.652 -6.765 -6.869 -6.977 -7.21 -7.336 -7.483 -7.639 -7.817 -8.044 -8.327 -9.372 -8 ,13254 ,TETRA ,17558506,Sat Nov 27 01:36:48 CET,Sat Nov 27 03:28:37 CET,0.0 0.901 1.216 1.401 1.544 1.688 1.824 1.938 2.131 2.212 2.288 2.384 2.533 2.608 2.743 2.872 3.003 3.059 3.157 3.259 3.402 3.489 3.568 3.672 3.772 3.879 3.977 4.074 4.199 4.303 4.4 4.52 4.631 4.736 4.853 4.995 5.124 5.239 5.362 5.482 5.598 5.732 5.884 6.024 6.168 6.287 6.353 6.367 6.291 6.043 5.385 4.409 3.585 2.851 2.198 1.585 1.04 0.544 0.124 -0.293 -0.661 -0.981 -1.282 -1.573 -1.853 -2.089 -2.341 -2.583 -2.785 -2.999 -3.218 -3.391 -3.571 -3.762 -3.908 -4.06 -4.223 -4.389 -4.556 -4.676 -4.806 -4.999 -5.138 -5.28 -5.352 -5.519 -5.688 -5.854 -5.947 -6.119 -6.242 -6.351 -6.47 -6.715 -6.852 -6.988 -7.133 -7.321 -7.532 -7.84 -8.497 -9 ,32019 ,TETRA ,17558507,Sat Nov 27 01:36:47 CET,Sat Nov 27 03:30:24 CET,0.0 0.526 0.838 1.029 1.168 1.305 1.444 1.564 1.782 1.878 1.972 2.059 2.188 2.254 2.382 2.5 2.611 2.666 2.78 2.879 3.0 3.081 3.166 3.28 3.385 3.497 3.602 3.686 3.795 3.901 4.001 4.137 4.269 4.375 4.489 4.623 4.743 4.868 4.992 5.117 5.242 5.369 5.506 5.631 5.765 5.904 6.008 6.057 6.032 5.83 5.25 4.375 3.546 2.787 2.102 1.48 0.949 0.465 0.026 -0.413 -0.788 -1.126 -1.454 -1.771 -2.038 -2.27 -2.524 -2.759 -2.959 -3.159 -3.368 -3.548 -3.733 -3.924 -4.089 -4.263 -4.431 -4.599 -4.779 -4.91 -5.038 -5.22 -5.352 -5.492 -5.565 -5.731 -5.903 -6.085 -6.189 -6.361 -6.479 -6.581 -6.686 -6.9 -7.023 -7.164 -7.326 -7.508 -7.725 -8.017 -8.926 -10 ,3854 ,TETRA ,17558508,Sat Nov 27 01:37:41 CET,Sat Nov 27 03:29:33 CET,0.0 0.375 0.644 0.863 1.032 1.168 1.279 1.375 1.547 1.618 1.696 1.81 1.951 2.018 2.169 2.315 2.429 2.482 2.587 2.683 2.806 2.876 2.951 3.074 3.19 3.291 3.386 3.482 3.605 3.725 3.841 3.976 4.099 4.214 4.339 4.469 4.594 4.717 4.84 4.959 5.098 5.25 5.39 5.523 5.647 5.758 5.845 5.868 5.802 5.585 5.031 4.059 3.169 2.423 1.775 1.184 0.637 0.14 -0.273 -0.679 -1.018 -1.33 -1.643 -1.934 -2.222 -2.496 -2.759 -2.984 -3.181 -3.384 -3.612 -3.799 -3.978 -4.174 -4.336 -4.495 -4.654 -4.825 -4.998 -5.112 -5.242 -5.467 -5.615 -5.756 -5.829 -5.982 -6.153 -6.326 -6.411 -6.569 -6.664 -6.754 -6.859 -7.092 -7.207 -7.342 -7.498 -7.665 -7.86 -8.108 -8.752 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt deleted file mode 100644 index e483e310..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24431 ,TETRA ,17558509,Sat Nov 27 01:37:41 CET,Sat Nov 27 03:32:24 CET,0.0 0.314 0.406 0.499 0.564 0.622 0.686 0.749 0.862 0.909 0.95 0.963 1.077 1.12 1.196 1.276 1.36 1.402 1.478 1.55 1.655 1.717 1.778 1.876 1.973 2.064 2.158 2.248 2.358 2.459 2.555 2.668 2.782 2.899 3.039 3.192 3.322 3.468 3.632 3.798 3.979 4.191 4.437 4.69 4.976 5.289 5.66 6.087 6.544 7.015 7.522 7.833 7.897 7.812 7.666 7.487 7.306 7.105 6.894 6.673 6.467 6.283 6.123 5.967 5.793 5.624 5.458 5.308 5.174 5.026 4.863 4.719 4.57 4.409 4.272 4.127 3.972 3.806 3.638 3.527 3.406 3.209 3.078 2.943 2.874 2.731 2.572 2.404 2.314 2.16 2.022 1.892 1.729 1.408 1.228 1.011 0.787 0.56 0.238 -0.255 -1.534 -2 ,9327 ,TETRA ,17558510,Sat Nov 27 01:38:44 CET,Sat Nov 27 03:33:55 CET,0.0 0.184 0.248 0.306 0.363 0.418 0.463 0.506 0.607 0.656 0.7 0.712 0.82 0.859 0.93 0.994 1.059 1.094 1.166 1.238 1.335 1.395 1.455 1.539 1.618 1.701 1.783 1.864 1.981 2.084 2.176 2.297 2.414 2.525 2.651 2.794 2.931 3.087 3.256 3.441 3.634 3.841 4.09 4.329 4.609 4.923 5.28 5.701 6.177 6.67 7.13 7.359 7.376 7.287 7.15 6.984 6.778 6.565 6.38 6.155 5.94 5.77 5.598 5.418 5.23 5.049 4.881 4.73 4.579 4.409 4.244 4.104 3.955 3.8 3.686 3.562 3.424 3.289 3.127 3.02 2.915 2.717 2.581 2.439 2.359 2.198 2.013 1.809 1.71 1.539 1.339 1.193 1.045 0.726 0.529 0.312 0.08 -0.168 -0.468 -0.945 -2.361 -3 ,22103 ,TETRA ,17558511,Sat Nov 27 01:38:44 CET,Sat Nov 27 03:31:43 CET,0.0 0.094 0.161 0.222 0.281 0.349 0.417 0.468 0.577 0.641 0.702 0.737 0.856 0.902 0.98 1.06 1.139 1.18 1.263 1.34 1.446 1.514 1.582 1.677 1.763 1.848 1.928 2.011 2.121 2.215 2.308 2.423 2.537 2.654 2.781 2.912 3.052 3.211 3.371 3.552 3.746 3.95 4.18 4.423 4.711 5.029 5.384 5.774 6.235 6.751 7.321 7.644 7.698 7.632 7.512 7.347 7.145 6.943 6.751 6.531 6.329 6.156 5.998 5.831 5.648 5.486 5.32 5.172 5.036 4.886 4.726 4.572 4.412 4.261 4.14 4.002 3.846 3.69 3.542 3.433 3.31 3.106 2.981 2.853 2.777 2.614 2.441 2.273 2.169 1.996 1.838 1.701 1.548 1.228 1.065 0.891 0.663 0.412 0.153 -0.211 -1.514 -4 ,8503 ,TETRA ,17558512,Sat Nov 27 01:38:44 CET,Sat Nov 27 03:30:29 CET,0.0 0.199 0.29 0.371 0.457 0.529 0.594 0.649 0.742 0.784 0.827 0.842 0.954 1.001 1.092 1.166 1.238 1.273 1.349 1.424 1.522 1.583 1.639 1.734 1.831 1.926 2.017 2.097 2.207 2.306 2.399 2.528 2.648 2.766 2.9 3.049 3.202 3.364 3.532 3.707 3.877 4.08 4.321 4.57 4.88 5.203 5.555 5.955 6.425 6.979 7.536 7.82 7.798 7.682 7.544 7.363 7.181 6.993 6.824 6.633 6.434 6.261 6.077 5.866 5.674 5.507 5.332 5.177 5.04 4.911 4.773 4.648 4.518 4.37 4.252 4.136 4.006 3.861 3.71 3.605 3.499 3.31 3.18 3.047 2.975 2.816 2.644 2.466 2.366 2.194 2.04 1.924 1.803 1.516 1.357 1.179 0.984 0.768 0.475 -0.009 -1.486 -5 ,18150 ,TETRA ,17558513,Sat Nov 27 01:38:44 CET,Sat Nov 27 03:33:09 CET,0.0 0.111 0.19 0.266 0.33 0.391 0.455 0.518 0.629 0.69 0.749 0.777 0.891 0.937 1.022 1.101 1.17 1.203 1.274 1.347 1.446 1.509 1.575 1.666 1.745 1.826 1.906 1.984 2.081 2.171 2.264 2.388 2.507 2.616 2.745 2.892 3.038 3.192 3.348 3.518 3.697 3.905 4.16 4.407 4.701 5.029 5.402 5.815 6.274 6.791 7.364 7.677 7.727 7.671 7.54 7.394 7.229 7.045 6.857 6.656 6.479 6.304 6.127 5.941 5.755 5.596 5.421 5.249 5.088 4.915 4.745 4.596 4.433 4.254 4.118 3.993 3.85 3.694 3.521 3.398 3.276 3.086 2.951 2.8 2.725 2.554 2.35 2.154 2.056 1.879 1.683 1.541 1.377 1.03 0.855 0.674 0.472 0.246 -0.008 -0.384 -1.946 -6 ,29004 ,TETRA ,17558514,Sat Nov 27 01:39:47 CET,Sat Nov 27 03:31:04 CET,0.0 0.168 0.252 0.321 0.385 0.466 0.534 0.597 0.717 0.763 0.804 0.821 0.937 0.98 1.058 1.125 1.191 1.226 1.294 1.361 1.457 1.52 1.581 1.669 1.755 1.844 1.931 2.018 2.132 2.231 2.326 2.443 2.558 2.679 2.822 2.983 3.127 3.287 3.464 3.642 3.84 4.069 4.313 4.554 4.834 5.147 5.521 5.945 6.42 6.92 7.444 7.743 7.783 7.699 7.558 7.386 7.19 6.971 6.751 6.514 6.295 6.078 5.874 5.686 5.503 5.344 5.167 4.994 4.838 4.667 4.489 4.344 4.194 4.034 3.907 3.772 3.619 3.459 3.299 3.18 3.062 2.898 2.769 2.62 2.546 2.391 2.221 2.033 1.925 1.746 1.557 1.43 1.298 0.98 0.794 0.603 0.37 0.105 -0.237 -0.734 -1.959 -7 ,23449 ,TETRA ,17558515,Sat Nov 27 01:39:47 CET,Sat Nov 27 03:34:35 CET,0.0 0.119 0.197 0.272 0.34 0.413 0.479 0.535 0.647 0.701 0.748 0.766 0.881 0.923 1.002 1.084 1.163 1.2 1.278 1.357 1.452 1.506 1.569 1.668 1.761 1.857 1.947 2.024 2.111 2.211 2.306 2.411 2.527 2.638 2.771 2.926 3.067 3.226 3.403 3.579 3.766 3.987 4.233 4.47 4.753 5.063 5.404 5.793 6.257 6.816 7.408 7.729 7.782 7.723 7.584 7.371 7.185 7.019 6.832 6.612 6.425 6.239 6.058 5.898 5.728 5.571 5.408 5.243 5.091 4.941 4.774 4.632 4.487 4.334 4.218 4.093 3.952 3.799 3.634 3.524 3.411 3.24 3.124 2.989 2.918 2.769 2.6 2.42 2.339 2.191 2.035 1.901 1.746 1.419 1.233 1.033 0.782 0.492 0.179 -0.292 -2.073 -8 ,7550 ,TETRA ,17558516,Sat Nov 27 01:39:47 CET,Sat Nov 27 03:29:59 CET,0.0 0.108 0.179 0.25 0.319 0.374 0.421 0.468 0.559 0.602 0.643 0.647 0.755 0.804 0.895 0.97 1.06 1.109 1.189 1.25 1.343 1.401 1.455 1.542 1.63 1.717 1.803 1.882 1.981 2.078 2.171 2.29 2.4 2.502 2.627 2.766 2.899 3.051 3.229 3.422 3.617 3.837 4.086 4.34 4.626 4.917 5.277 5.712 6.197 6.715 7.256 7.525 7.562 7.499 7.381 7.206 7.005 6.81 6.605 6.372 6.159 5.967 5.782 5.609 5.446 5.284 5.118 4.962 4.816 4.664 4.523 4.399 4.257 4.095 3.967 3.834 3.683 3.524 3.36 3.253 3.144 2.963 2.828 2.674 2.584 2.387 2.19 1.988 1.875 1.695 1.504 1.366 1.226 0.904 0.709 0.493 0.264 0.03 -0.262 -0.684 -1.728 -9 ,20060 ,TETRA ,17558517,Sat Nov 27 01:40:46 CET,Sat Nov 27 03:34:40 CET,0.0 0.213 0.301 0.39 0.468 0.525 0.583 0.644 0.742 0.784 0.83 0.846 0.955 0.996 1.081 1.168 1.241 1.275 1.349 1.423 1.523 1.588 1.659 1.76 1.848 1.927 2.005 2.082 2.185 2.289 2.386 2.499 2.602 2.705 2.834 2.976 3.108 3.26 3.434 3.626 3.824 4.029 4.258 4.491 4.786 5.119 5.49 5.911 6.401 6.923 7.47 7.75 7.764 7.671 7.506 7.322 7.131 6.925 6.741 6.54 6.348 6.176 6.011 5.849 5.68 5.531 5.383 5.226 5.072 4.912 4.74 4.588 4.43 4.267 4.14 4.011 3.874 3.724 3.56 3.436 3.31 3.123 2.986 2.844 2.772 2.611 2.429 2.244 2.145 1.983 1.823 1.683 1.543 1.273 1.129 0.955 0.747 0.497 0.183 -0.312 -1.818 -10 ,17051 ,TETRA ,17558518,Sat Nov 27 01:41:45 CET,Sat Nov 27 03:32:05 CET,0.0 0.154 0.277 0.367 0.447 0.515 0.577 0.635 0.714 0.751 0.793 0.81 0.926 0.971 1.052 1.133 1.213 1.252 1.326 1.388 1.484 1.547 1.612 1.705 1.788 1.868 1.945 2.028 2.144 2.25 2.347 2.468 2.584 2.687 2.811 2.958 3.098 3.255 3.422 3.589 3.758 3.968 4.21 4.451 4.745 5.058 5.411 5.816 6.274 6.799 7.34 7.597 7.634 7.587 7.479 7.315 7.146 6.962 6.759 6.547 6.357 6.179 5.999 5.796 5.615 5.465 5.272 5.096 4.967 4.824 4.666 4.539 4.39 4.218 4.088 3.952 3.809 3.654 3.481 3.361 3.224 3.004 2.849 2.677 2.594 2.426 2.236 2.008 1.892 1.72 1.538 1.398 1.256 0.947 0.757 0.553 0.33 0.086 -0.201 -0.58 -1.811 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt deleted file mode 100644 index e29b84c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18841 ,TETRA ,17558519,Sat Nov 27 01:41:46 CET,Sat Nov 27 03:32:50 CET,0.0 0.5 0.698 0.866 0.977 1.086 1.193 1.287 1.442 1.505 1.572 1.646 1.772 1.831 1.954 2.064 2.161 2.212 2.314 2.403 2.544 2.643 2.734 2.864 2.987 3.101 3.207 3.302 3.415 3.532 3.654 3.79 3.919 4.056 4.209 4.364 4.523 4.703 4.886 5.082 5.296 5.526 5.786 6.055 6.368 6.717 7.111 7.529 7.97 8.427 8.863 8.988 8.838 8.569 8.296 8.018 7.711 7.41 7.135 6.85 6.615 6.401 6.178 5.969 5.779 5.583 5.371 5.182 5.023 4.85 4.641 4.466 4.289 4.106 3.965 3.801 3.645 3.5 3.32 3.17 3.014 2.793 2.633 2.466 2.374 2.176 1.989 1.759 1.641 1.475 1.297 1.17 1.035 0.747 0.557 0.322 0.075 -0.282 -0.725 -1.21 -3.412 -2 ,18604 ,TETRA ,17558520,Sat Nov 27 01:41:46 CET,Sat Nov 27 03:31:32 CET,0.0 0.414 0.546 0.683 0.809 0.896 0.985 1.086 1.265 1.34 1.404 1.464 1.594 1.662 1.784 1.896 2.014 2.066 2.165 2.257 2.375 2.452 2.536 2.658 2.776 2.894 3.003 3.11 3.246 3.372 3.496 3.644 3.78 3.905 4.054 4.222 4.378 4.545 4.727 4.922 5.136 5.381 5.656 5.914 6.226 6.584 6.979 7.428 7.898 8.353 8.762 8.884 8.764 8.558 8.355 8.127 7.863 7.58 7.301 7.005 6.746 6.521 6.32 6.117 5.898 5.689 5.481 5.283 5.102 4.92 4.722 4.559 4.399 4.216 4.07 3.915 3.746 3.569 3.375 3.241 3.089 2.837 2.665 2.483 2.39 2.217 2.028 1.822 1.716 1.545 1.36 1.21 1.063 0.776 0.595 0.367 0.117 -0.141 -0.469 -0.899 -2.766 -3 ,865 ,TETRA ,17558521,Sat Nov 27 01:41:48 CET,Sat Nov 27 03:31:46 CET,0.0 0.434 0.619 0.74 0.854 0.959 1.052 1.138 1.303 1.385 1.463 1.538 1.674 1.746 1.886 2.007 2.105 2.155 2.261 2.365 2.51 2.598 2.68 2.805 2.925 3.034 3.141 3.245 3.378 3.5 3.621 3.769 3.909 4.048 4.215 4.403 4.585 4.784 4.994 5.209 5.438 5.699 5.978 6.243 6.55 6.906 7.304 7.742 8.244 8.739 9.153 9.337 9.247 8.992 8.689 8.405 8.139 7.85 7.583 7.319 7.088 6.864 6.634 6.411 6.194 5.986 5.755 5.542 5.36 5.175 4.97 4.784 4.599 4.416 4.266 4.097 3.928 3.749 3.551 3.421 3.288 3.062 2.886 2.714 2.632 2.452 2.251 2.02 1.888 1.693 1.501 1.362 1.21 0.901 0.712 0.499 0.282 0.05 -0.214 -0.625 -2.048 -4 ,30714 ,TETRA ,17558522,Sat Nov 27 01:42:45 CET,Sat Nov 27 03:35:03 CET,0.0 0.404 0.513 0.623 0.747 0.873 0.994 1.091 1.262 1.34 1.418 1.492 1.624 1.689 1.808 1.917 2.031 2.086 2.18 2.266 2.403 2.493 2.575 2.712 2.847 2.962 3.069 3.164 3.288 3.409 3.527 3.669 3.807 3.955 4.128 4.307 4.479 4.669 4.871 5.085 5.295 5.529 5.805 6.085 6.407 6.753 7.133 7.538 7.964 8.437 8.919 9.066 8.984 8.835 8.606 8.319 8.053 7.778 7.52 7.282 7.032 6.786 6.568 6.365 6.166 5.956 5.716 5.5 5.33 5.166 4.969 4.798 4.618 4.427 4.276 4.119 3.956 3.777 3.574 3.435 3.295 3.07 2.926 2.765 2.674 2.489 2.301 2.091 1.976 1.8 1.626 1.488 1.343 1.064 0.898 0.69 0.447 0.166 -0.167 -0.64 -2.365 -5 ,25970 ,TETRA ,17558523,Sat Nov 27 01:42:48 CET,Sat Nov 27 03:34:59 CET,0.0 0.393 0.607 0.787 0.918 1.025 1.133 1.235 1.397 1.469 1.528 1.584 1.709 1.768 1.882 1.981 2.081 2.132 2.23 2.328 2.464 2.553 2.639 2.752 2.855 2.954 3.062 3.175 3.312 3.443 3.565 3.704 3.842 3.98 4.149 4.337 4.496 4.674 4.877 5.081 5.282 5.514 5.812 6.117 6.446 6.793 7.189 7.615 8.074 8.555 8.985 9.13 9.06 8.849 8.614 8.361 8.084 7.819 7.581 7.325 7.096 6.88 6.658 6.453 6.255 6.047 5.823 5.626 5.451 5.255 5.039 4.87 4.695 4.499 4.348 4.189 4.01 3.828 3.646 3.522 3.389 3.158 2.989 2.839 2.76 2.571 2.376 2.153 2.04 1.865 1.662 1.521 1.377 1.086 0.92 0.736 0.491 0.19 -0.135 -0.597 -2.303 -6 ,16658 ,TETRA ,17558524,Sat Nov 27 01:43:43 CET,Sat Nov 27 03:34:42 CET,0.0 0.494 0.662 0.847 0.996 1.1 1.198 1.29 1.478 1.563 1.64 1.718 1.844 1.904 2.014 2.121 2.229 2.28 2.373 2.459 2.582 2.661 2.744 2.868 2.981 3.091 3.188 3.279 3.406 3.524 3.641 3.787 3.931 4.069 4.228 4.406 4.571 4.766 4.979 5.182 5.388 5.62 5.888 6.161 6.479 6.825 7.218 7.63 8.066 8.536 8.938 9.033 8.925 8.75 8.496 8.221 7.941 7.656 7.399 7.127 6.881 6.641 6.421 6.219 6.011 5.806 5.59 5.395 5.22 5.04 4.85 4.683 4.506 4.317 4.174 4.035 3.881 3.698 3.488 3.349 3.21 2.975 2.81 2.65 2.568 2.385 2.184 1.986 1.87 1.668 1.449 1.308 1.169 0.844 0.633 0.41 0.186 -0.1 -0.47 -0.955 -2.877 -7 ,17682 ,TETRA ,17558525,Sat Nov 27 01:43:43 CET,Sat Nov 27 03:22:52 CET,0.0 0.484 0.754 0.906 1.061 1.202 1.303 1.397 1.565 1.634 1.698 1.763 1.891 1.954 2.072 2.176 2.275 2.326 2.424 2.519 2.652 2.736 2.824 2.941 3.049 3.165 3.271 3.37 3.503 3.625 3.749 3.913 4.057 4.182 4.343 4.517 4.677 4.861 5.052 5.249 5.463 5.711 5.985 6.247 6.554 6.901 7.284 7.664 8.103 8.575 8.97 9.079 9.011 8.871 8.627 8.355 8.09 7.816 7.545 7.256 7.012 6.775 6.531 6.314 6.116 5.918 5.705 5.512 5.323 5.105 4.879 4.686 4.502 4.326 4.181 4.023 3.857 3.678 3.494 3.37 3.24 3.04 2.886 2.716 2.629 2.454 2.285 2.081 1.955 1.759 1.548 1.406 1.264 0.945 0.764 0.565 0.325 0.036 -0.307 -0.781 -2.559 -8 ,4889 ,TETRA ,17558526,Sat Nov 27 01:43:43 CET,Sat Nov 27 03:23:10 CET,0.0 0.312 0.493 0.635 0.763 0.874 0.98 1.079 1.246 1.324 1.394 1.438 1.557 1.617 1.749 1.87 1.979 2.031 2.123 2.21 2.343 2.429 2.509 2.627 2.742 2.85 2.957 3.069 3.198 3.316 3.437 3.583 3.725 3.867 4.023 4.186 4.34 4.515 4.715 4.922 5.131 5.368 5.635 5.904 6.229 6.579 6.956 7.395 7.894 8.41 8.882 9.054 9.001 8.76 8.456 8.179 7.898 7.631 7.399 7.14 6.889 6.65 6.413 6.179 5.964 5.766 5.526 5.307 5.139 4.954 4.764 4.613 4.427 4.214 4.048 3.885 3.718 3.549 3.386 3.265 3.123 2.907 2.755 2.6 2.524 2.327 2.122 1.92 1.8 1.606 1.402 1.267 1.122 0.785 0.587 0.374 0.147 -0.136 -0.486 -0.919 -3.104 -9 ,12763 ,TETRA ,17558527,Sat Nov 27 01:43:43 CET,Sat Nov 27 03:36:25 CET,0.0 0.237 0.454 0.637 0.754 0.847 0.927 1.011 1.175 1.245 1.321 1.41 1.542 1.604 1.716 1.829 1.942 1.991 2.089 2.184 2.321 2.406 2.494 2.615 2.721 2.821 2.92 3.027 3.164 3.294 3.418 3.559 3.701 3.837 3.991 4.169 4.327 4.499 4.692 4.901 5.117 5.352 5.637 5.914 6.225 6.574 6.937 7.349 7.858 8.371 8.768 8.817 8.649 8.408 8.148 7.89 7.628 7.348 7.066 6.772 6.523 6.274 6.031 5.809 5.584 5.373 5.148 4.934 4.758 4.593 4.401 4.222 4.02 3.798 3.633 3.473 3.311 3.141 2.967 2.84 2.706 2.489 2.323 2.157 2.075 1.895 1.695 1.485 1.375 1.198 1.002 0.859 0.714 0.384 0.212 0.022 -0.217 -0.506 -0.836 -1.3 -2.994 -10 ,32041 ,TETRA ,17558528,Sat Nov 27 01:43:46 CET,Sat Nov 27 03:37:23 CET,0.0 0.65 0.882 1.061 1.196 1.3 1.388 1.475 1.626 1.689 1.745 1.821 1.961 2.024 2.144 2.252 2.342 2.394 2.496 2.586 2.718 2.805 2.888 3.014 3.138 3.245 3.345 3.438 3.571 3.715 3.837 3.97 4.102 4.23 4.393 4.595 4.773 4.951 5.155 5.384 5.614 5.857 6.148 6.433 6.733 7.074 7.44 7.847 8.326 8.831 9.275 9.389 9.328 9.19 8.978 8.719 8.455 8.197 7.962 7.711 7.483 7.243 6.998 6.77 6.539 6.329 6.104 5.91 5.741 5.552 5.345 5.166 4.986 4.802 4.649 4.484 4.325 4.155 3.964 3.825 3.677 3.455 3.289 3.109 3.021 2.836 2.638 2.43 2.321 2.149 1.935 1.773 1.613 1.31 1.136 0.905 0.629 0.3 -0.032 -0.533 -2.567 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt deleted file mode 100644 index f4b68b37..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28349 ,TETRA ,17558529,Sat Nov 27 01:44:42 CET,Sat Nov 27 03:30:56 CET,0.0 3.004 3.778 4.33 4.776 5.106 5.383 5.635 6.098 6.292 6.452 6.607 6.886 7.001 7.233 7.445 7.631 7.726 7.952 8.177 8.468 8.629 8.764 8.966 9.186 9.396 9.569 9.717 9.885 10.007 10.088 10.201 10.292 10.341 10.372 10.363 10.344 10.361 10.408 10.266 9.881 9.344 8.578 7.699 6.515 4.986 2.984 0.321 -3.306 -8.475 -16.757 -26.05 -33.231 -39.202 -44.107 -48.34 -51.914 -55.03 -57.666 -60.221 -62.402 -64.324 -66.089 -67.685 -69.12 -70.367 -71.588 -72.667 -73.617 -74.581 -75.596 -76.445 -77.321 -78.245 -78.953 -79.646 -80.355 -81.087 -81.835 -82.351 -82.859 -83.667 -84.227 -84.791 -85.085 -85.688 -86.331 -87.009 -87.356 -87.995 -88.517 -88.914 -89.303 -90.085 -90.512 -90.995 -91.507 -92.066 -92.771 -93.634 -101.236 -2 ,5011 ,TETRA ,17558530,Sat Nov 27 01:44:43 CET,Sat Nov 27 03:31:04 CET,0.0 3.433 3.969 4.394 4.724 4.993 5.262 5.506 5.945 6.121 6.27 6.431 6.733 6.886 7.138 7.344 7.546 7.655 7.872 8.041 8.278 8.412 8.521 8.685 8.804 8.913 9.036 9.143 9.246 9.311 9.352 9.379 9.403 9.41 9.446 9.482 9.443 9.4 9.291 9.108 8.834 8.362 7.659 6.86 5.795 4.421 2.517 -0.165 -4.035 -9.745 -18.807 -28.842 -36.565 -42.695 -47.604 -51.73 -55.27 -58.413 -60.997 -63.52 -65.598 -67.375 -69.038 -70.527 -71.876 -73.104 -74.343 -75.412 -76.333 -77.298 -78.356 -79.223 -80.064 -80.906 -81.555 -82.215 -82.87 -83.533 -84.185 -84.616 -85.065 -85.776 -86.281 -86.798 -87.064 -87.638 -88.23 -88.847 -89.164 -89.754 -90.219 -90.614 -90.986 -91.785 -92.233 -92.702 -93.235 -93.8 -94.417 -95.251 -99.529 -3 ,27947 ,TETRA ,17558531,Sat Nov 27 01:44:43 CET,Sat Nov 27 03:31:41 CET,0.0 2.317 2.842 3.207 3.438 3.646 3.861 4.067 4.41 4.564 4.736 4.878 5.148 5.266 5.462 5.609 5.719 5.782 5.927 6.066 6.258 6.382 6.502 6.661 6.8 6.911 7.025 7.135 7.246 7.331 7.408 7.511 7.595 7.636 7.634 7.641 7.591 7.416 7.191 6.916 6.58 6.128 5.487 4.683 3.527 2.012 -0.065 -2.839 -6.739 -12.443 -21.214 -30.893 -38.518 -44.701 -49.723 -53.975 -57.512 -60.629 -63.312 -65.881 -67.991 -69.795 -71.415 -72.893 -74.273 -75.543 -76.819 -77.962 -78.958 -79.985 -81.056 -81.918 -82.797 -83.71 -84.401 -85.059 -85.695 -86.353 -87.047 -87.543 -88.056 -88.8 -89.304 -89.814 -90.081 -90.664 -91.273 -91.885 -92.205 -92.811 -93.293 -93.667 -94.041 -94.865 -95.32 -95.813 -96.369 -96.985 -97.605 -98.427 -101.405 -5 ,2771 ,TETRA ,17558533,Sat Nov 27 01:45:47 CET,Sat Nov 27 03:32:11 CET,0.0 2.111 2.596 2.915 3.207 3.506 3.747 3.95 4.294 4.449 4.607 4.699 4.931 5.024 5.214 5.355 5.487 5.572 5.731 5.85 6.021 6.128 6.233 6.385 6.528 6.667 6.807 6.942 7.056 7.107 7.14 7.155 7.137 7.108 7.11 7.073 6.974 6.984 6.97 6.814 6.619 6.329 5.838 5.2 4.372 3.247 1.66 -0.581 -4.005 -9.098 -17.026 -26.112 -33.523 -39.719 -44.799 -49.115 -52.796 -56.014 -58.685 -61.306 -63.526 -65.414 -67.192 -68.905 -70.479 -71.856 -73.229 -74.481 -75.583 -76.705 -77.854 -78.78 -79.731 -80.727 -81.471 -82.202 -82.965 -83.778 -84.588 -85.127 -85.678 -86.531 -87.115 -87.733 -88.057 -88.695 -89.377 -90.079 -90.428 -91.075 -91.544 -91.902 -92.265 -93.092 -93.568 -94.091 -94.671 -95.32 -96.118 -97.058 -100.795 -6 ,18085 ,TETRA ,17558534,Sat Nov 27 01:46:44 CET,Sat Nov 27 03:48:14 CET,0.0 2.807 3.684 4.314 4.788 5.171 5.447 5.658 5.974 6.11 6.236 6.333 6.631 6.765 6.946 7.091 7.223 7.286 7.401 7.514 7.675 7.764 7.838 7.941 8.035 8.117 8.179 8.22 8.26 8.279 8.288 8.3 8.265 8.217 8.193 8.126 7.984 7.739 7.418 7.023 6.567 6.032 5.327 4.497 3.355 1.879 -0.156 -2.86 -6.679 -12.052 -20.109 -29.35 -36.83 -42.986 -47.995 -52.321 -55.966 -59.177 -62.019 -64.838 -67.136 -69.045 -70.788 -72.396 -73.851 -75.224 -76.715 -77.977 -79.046 -80.166 -81.288 -82.234 -83.228 -84.234 -84.981 -85.723 -86.489 -87.262 -88.037 -88.585 -89.15 -89.995 -90.56 -91.127 -91.414 -91.983 -92.585 -93.23 -93.548 -94.145 -94.565 -94.92 -95.279 -96.021 -96.439 -96.9 -97.408 -97.958 -98.639 -99.475 -103.649 -7 ,28336 ,TETRA ,17558535,Sat Nov 27 01:46:45 CET,Sat Nov 27 03:45:16 CET,0.0 1.848 2.344 2.697 2.959 3.163 3.344 3.501 3.795 3.921 4.03 4.134 4.412 4.516 4.705 4.866 5.007 5.066 5.17 5.27 5.424 5.563 5.714 5.858 5.921 5.964 6.01 6.079 6.188 6.268 6.317 6.374 6.407 6.415 6.382 6.319 6.247 6.129 5.945 5.676 5.361 5.019 4.589 3.916 2.844 1.457 -0.408 -2.821 -6.232 -11.316 -19.518 -28.799 -35.845 -41.657 -46.502 -50.687 -54.353 -57.538 -60.155 -62.706 -64.903 -66.947 -68.84 -70.534 -72.088 -73.494 -74.912 -76.143 -77.197 -78.288 -79.444 -80.403 -81.379 -82.384 -83.147 -83.891 -84.637 -85.399 -86.154 -86.644 -87.163 -88.008 -88.574 -89.147 -89.448 -90.067 -90.697 -91.36 -91.696 -92.305 -92.717 -93.069 -93.433 -94.262 -94.703 -95.124 -95.625 -96.2 -96.845 -97.796 -101.163 -8 ,7408 ,TETRA ,17558536,Sat Nov 27 01:46:45 CET,Sat Nov 27 03:54:05 CET,0.0 2.53 3.137 3.527 3.803 4.061 4.295 4.496 4.861 5.029 5.196 5.349 5.61 5.721 5.929 6.119 6.323 6.422 6.591 6.743 6.937 7.052 7.153 7.267 7.392 7.529 7.627 7.728 7.869 7.977 8.046 8.092 8.126 8.136 8.137 8.124 8.065 7.959 7.787 7.545 7.271 6.908 6.358 5.662 4.684 3.331 1.335 -1.492 -5.592 -11.537 -20.569 -30.618 -38.52 -44.881 -50.101 -54.57 -58.297 -61.496 -64.122 -66.652 -68.776 -70.631 -72.419 -74.099 -75.556 -76.819 -78.153 -79.394 -80.496 -81.62 -82.717 -83.572 -84.471 -85.368 -86.011 -86.658 -87.336 -88.041 -88.752 -89.246 -89.753 -90.516 -91.056 -91.632 -91.922 -92.501 -93.098 -93.728 -94.05 -94.653 -95.168 -95.568 -95.948 -96.75 -97.193 -97.677 -98.181 -98.736 -99.393 -100.184 -103.409 -9 ,6697 ,TETRA ,17558537,Sat Nov 27 01:47:41 CET,Sat Nov 27 03:45:19 CET,0.0 3.267 3.709 4.085 4.402 4.664 4.92 5.125 5.428 5.599 5.759 5.875 6.146 6.261 6.437 6.591 6.742 6.81 6.91 7.008 7.175 7.239 7.289 7.376 7.477 7.57 7.646 7.69 7.722 7.746 7.741 7.751 7.809 7.804 7.7 7.561 7.42 7.219 6.924 6.561 6.127 5.595 4.822 3.88 2.701 1.192 -0.988 -3.952 -7.902 -13.576 -22.61 -32.497 -40.033 -46.157 -51.23 -55.572 -59.165 -62.211 -64.727 -67.157 -69.192 -70.944 -72.619 -74.241 -75.782 -77.246 -78.767 -80.029 -81.039 -82.086 -83.175 -84.063 -84.958 -85.852 -86.54 -87.253 -87.996 -88.775 -89.556 -90.059 -90.572 -91.372 -91.917 -92.482 -92.768 -93.332 -93.917 -94.551 -94.88 -95.476 -95.922 -96.298 -96.667 -97.439 -97.871 -98.349 -98.866 -99.428 -100.045 -100.846 -104.428 -10 ,8709 ,TETRA ,17558538,Sat Nov 27 01:47:44 CET,Sat Nov 27 03:45:13 CET,0.0 3.182 3.801 4.24 4.571 4.839 5.081 5.353 5.867 6.048 6.184 6.283 6.548 6.648 6.805 6.977 7.166 7.232 7.349 7.455 7.603 7.694 7.774 7.898 8.001 8.088 8.156 8.206 8.26 8.354 8.504 8.671 8.807 8.894 8.874 8.723 8.507 8.249 7.956 7.566 7.063 6.426 5.551 4.568 3.325 1.739 -0.432 -3.245 -7.184 -12.962 -22.14 -32.283 -39.928 -46.072 -51.009 -55.131 -58.596 -61.572 -64.023 -66.431 -68.486 -70.309 -72.006 -73.549 -74.947 -76.192 -77.464 -78.607 -79.566 -80.522 -81.528 -82.369 -83.217 -84.086 -84.762 -85.453 -86.197 -86.96 -87.696 -88.198 -88.711 -89.518 -90.117 -90.74 -91.05 -91.704 -92.363 -93.01 -93.355 -93.991 -94.466 -94.846 -95.223 -95.954 -96.351 -96.793 -97.267 -97.866 -98.6 -99.38 -103.232 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt deleted file mode 100644 index 18eb39b1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32377 ,TETRA ,17558540,Sat Nov 27 01:47:43 CET,Sat Nov 27 03:42:44 CET,0.0 0.28 0.459 0.626 0.796 0.946 1.086 1.357 1.484 1.61 1.702 1.961 2.087 2.33 2.56 2.78 2.884 3.089 3.296 3.602 3.806 4.001 4.274 4.538 4.804 5.081 5.349 5.683 6.015 6.341 6.734 7.123 7.497 7.924 8.41 8.898 9.451 10.07 10.736 11.453 12.291 13.238 14.212 15.344 16.571 18.009 19.573 21.304 23.324 25.208 25.661 25.324 24.701 23.893 22.994 22.188 21.462 20.833 20.162 19.505 18.939 18.412 17.847 17.222 16.617 15.961 15.392 14.941 14.436 13.898 13.486 13.028 12.516 12.129 11.763 11.405 11.001 10.531 10.191 9.87 9.399 9.073 8.699 8.462 7.944 7.417 6.863 6.552 6.087 5.481 5.058 4.611 3.627 3.056 2.454 1.738 0.778 -0.309 -1.711 -2 ,9897 ,TETRA ,17558541,Sat Nov 27 01:47:42 CET,Sat Nov 27 03:42:42 CET,0.0 0.16 0.298 0.423 0.541 0.648 0.762 1.005 1.118 1.23 1.294 1.546 1.65 1.853 2.053 2.248 2.344 2.538 2.728 3.023 3.218 3.415 3.71 4.002 4.288 4.551 4.806 5.154 5.492 5.811 6.2 6.583 6.973 7.432 7.949 8.488 9.082 9.695 10.361 11.051 11.833 12.748 13.653 14.732 15.965 17.434 19.085 20.901 22.84 24.513 25.083 24.962 24.52 23.929 23.223 22.571 21.968 21.316 20.593 19.911 19.274 18.713 18.179 17.668 17.199 16.708 16.256 15.848 15.442 14.986 14.573 14.146 13.685 13.345 13.002 12.617 12.221 11.799 11.498 11.187 10.607 10.208 9.845 9.66 9.248 8.772 8.265 7.997 7.608 7.177 6.821 6.438 5.678 5.269 4.765 4.164 3.427 2.546 1.204 -3 ,21367 ,TETRA ,17558542,Sat Nov 27 01:50:44 CET,Sat Nov 27 03:45:20 CET,0.0 0.153 0.275 0.401 0.535 0.659 0.773 0.995 1.105 1.221 1.293 1.552 1.654 1.862 2.073 2.267 2.363 2.559 2.742 3.001 3.166 3.332 3.592 3.851 4.098 4.337 4.571 4.888 5.211 5.532 5.932 6.321 6.697 7.14 7.642 8.131 8.691 9.294 9.924 10.593 11.371 12.288 13.21 14.303 15.527 16.947 18.631 20.524 22.348 24.083 24.755 24.552 24.048 23.398 22.689 21.921 21.095 20.318 19.513 18.788 18.095 17.43 16.824 16.255 15.732 15.18 14.675 14.227 13.719 13.161 12.695 12.214 11.742 11.408 11.083 10.74 10.326 9.868 9.562 9.225 8.703 8.34 7.956 7.738 7.25 6.779 6.262 5.965 5.508 4.951 4.574 4.134 3.171 2.64 2.079 1.396 0.544 -0.475 -2.08 -4 ,24500 ,TETRA ,17558543,Sat Nov 27 01:50:46 CET,Sat Nov 27 03:45:29 CET,0.0 0.207 0.398 0.582 0.737 0.878 1.008 1.271 1.398 1.519 1.618 1.89 2.011 2.244 2.473 2.693 2.804 3.038 3.255 3.566 3.776 3.972 4.26 4.543 4.815 5.104 5.389 5.746 6.088 6.425 6.822 7.194 7.558 7.992 8.479 8.955 9.481 10.069 10.706 11.352 12.127 13.055 13.97 15.087 16.299 17.659 19.189 20.86 22.588 24.109 24.778 24.61 24.098 23.401 22.669 21.962 21.26 20.643 19.967 19.341 18.763 18.207 17.69 17.208 16.737 16.231 15.761 15.345 14.946 14.508 14.123 13.724 13.278 12.931 12.586 12.205 11.813 11.419 11.127 10.805 10.289 9.953 9.604 9.419 8.999 8.496 7.989 7.719 7.296 6.835 6.489 6.121 5.343 4.906 4.427 3.87 3.216 2.405 1.072 -5 ,7614 ,TETRA ,17558544,Sat Nov 27 01:50:48 CET,Sat Nov 27 03:45:34 CET,0.0 0.161 0.296 0.42 0.534 0.65 0.774 1.005 1.119 1.235 1.293 1.542 1.647 1.862 2.056 2.246 2.344 2.527 2.695 2.954 3.136 3.322 3.594 3.848 4.089 4.339 4.599 4.937 5.266 5.589 5.968 6.348 6.721 7.164 7.679 8.171 8.729 9.33 9.961 10.645 11.438 12.361 13.344 14.508 15.695 17.051 18.678 20.598 22.655 24.492 25.243 25.138 24.65 24.003 23.283 22.522 21.791 21.148 20.444 19.753 19.078 18.385 17.684 17.069 16.529 15.92 15.348 14.884 14.415 13.926 13.484 13.01 12.554 12.189 11.811 11.441 11.048 10.609 10.321 10.027 9.553 9.215 8.82 8.615 8.209 7.759 7.285 7.04 6.62 6.102 5.761 5.424 4.727 4.321 3.867 3.293 2.59 1.765 0.592 -6 ,877 ,TETRA ,17558545,Sat Nov 27 01:52:45 CET,Sat Nov 27 03:47:56 CET,0.0 0.143 0.278 0.394 0.506 0.615 0.73 0.957 1.054 1.158 1.226 1.488 1.591 1.792 1.994 2.191 2.288 2.482 2.671 2.94 3.114 3.289 3.552 3.808 4.067 4.332 4.588 4.915 5.237 5.557 5.959 6.347 6.733 7.189 7.709 8.219 8.784 9.406 10.05 10.716 11.483 12.396 13.359 14.474 15.681 17.007 18.454 20.235 22.146 23.98 24.672 24.534 24.002 23.356 22.609 21.848 21.168 20.53 19.855 19.157 18.475 17.864 17.332 16.855 16.399 15.877 15.404 14.998 14.524 14.005 13.612 13.236 12.832 12.508 12.175 11.832 11.457 11.047 10.731 10.368 9.787 9.354 8.863 8.601 8.117 7.638 7.158 6.904 6.489 6.08 5.784 5.429 4.604 4.124 3.632 3.071 2.437 1.538 0.106 -7 ,29784 ,TETRA ,17558546,Sat Nov 27 01:52:47 CET,Sat Nov 27 03:47:29 CET,0.0 0.145 0.291 0.412 0.534 0.659 0.772 1.003 1.11 1.214 1.273 1.535 1.647 1.856 2.054 2.249 2.34 2.516 2.689 2.942 3.12 3.304 3.573 3.828 4.073 4.319 4.57 4.893 5.207 5.515 5.893 6.268 6.637 7.071 7.572 8.057 8.593 9.203 9.878 10.585 11.381 12.306 13.215 14.268 15.422 16.704 18.216 19.996 21.886 23.916 24.855 24.632 23.959 23.082 22.117 21.209 20.337 19.563 18.755 18.037 17.354 16.724 16.197 15.702 15.233 14.652 14.063 13.56 13.05 12.495 12.016 11.554 11.077 10.687 10.275 9.864 9.454 8.975 8.622 8.271 7.749 7.381 7.009 6.831 6.443 5.997 5.528 5.289 4.883 4.445 4.141 3.794 3.056 2.583 2.065 1.515 0.702 -0.403 -2.01 -8 ,5915 ,TETRA ,17558547,Sat Nov 27 01:52:47 CET,Sat Nov 27 03:49:33 CET,0.0 0.154 0.319 0.479 0.611 0.732 0.855 1.084 1.19 1.31 1.422 1.701 1.812 2.025 2.248 2.472 2.579 2.787 2.99 3.289 3.481 3.679 3.969 4.249 4.536 4.812 5.08 5.426 5.761 6.088 6.482 6.881 7.263 7.692 8.196 8.679 9.234 9.86 10.506 11.194 11.984 12.921 13.871 14.953 16.17 17.604 19.209 20.987 22.856 24.69 25.555 25.439 24.852 24.115 23.345 22.606 21.865 21.206 20.555 19.953 19.403 18.876 18.353 17.839 17.366 16.871 16.409 15.991 15.518 15.02 14.652 14.277 13.859 13.536 13.197 12.842 12.457 12.066 11.788 11.469 10.973 10.604 10.207 10.013 9.613 9.152 8.673 8.419 8.011 7.566 7.239 6.903 6.19 5.765 5.282 4.743 4.162 3.311 1.945 -9 ,12704 ,TETRA ,17558548,Sat Nov 27 01:52:48 CET,Sat Nov 27 03:49:18 CET,0.0 0.165 0.315 0.452 0.564 0.686 0.81 1.043 1.159 1.279 1.347 1.6 1.702 1.908 2.116 2.329 2.432 2.637 2.845 3.158 3.358 3.548 3.813 4.082 4.358 4.62 4.872 5.208 5.543 5.866 6.258 6.654 7.043 7.484 7.988 8.478 9.02 9.607 10.242 10.938 11.739 12.675 13.629 14.754 15.993 17.459 19.08 20.85 22.845 24.672 25.326 25.111 24.509 23.722 22.827 22.033 21.316 20.667 19.975 19.314 18.684 18.108 17.561 17.018 16.484 15.907 15.426 15.015 14.571 14.088 13.677 13.226 12.725 12.343 11.963 11.569 11.118 10.619 10.288 9.967 9.459 9.105 8.737 8.538 8.147 7.71 7.198 6.945 6.534 6.004 5.604 5.167 4.206 3.641 3.073 2.422 1.554 0.465 -1.022 -10 ,28125 ,TETRA ,17558549,Sat Nov 27 01:52:47 CET,Sat Nov 27 03:49:01 CET,0.0 0.151 0.304 0.442 0.584 0.725 0.857 1.118 1.239 1.35 1.424 1.695 1.81 2.035 2.258 2.483 2.592 2.797 3.004 3.313 3.518 3.719 4.012 4.293 4.571 4.84 5.1 5.458 5.819 6.161 6.566 6.955 7.333 7.799 8.334 8.839 9.387 10.0 10.683 11.403 12.203 13.14 14.103 15.241 16.512 17.874 19.359 21.095 22.926 24.653 25.271 25.175 24.654 23.981 23.263 22.536 21.817 21.137 20.43 19.787 19.168 18.536 17.95 17.431 16.954 16.441 15.991 15.549 15.055 14.564 14.101 13.549 12.998 12.595 12.196 11.797 11.358 10.898 10.586 10.243 9.637 9.201 8.782 8.598 8.209 7.721 7.171 6.895 6.488 6.058 5.703 5.261 4.28 3.731 3.098 2.379 1.481 0.231 -1.531 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt deleted file mode 100644 index 81d888f2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5189 ,TETRA ,17558550,Sat Nov 27 01:53:51 CET,Sat Nov 27 03:47:06 CET,0.0 0.96 1.286 1.584 1.828 2.018 2.194 2.369 2.689 2.836 2.977 3.149 3.361 3.483 3.703 3.912 4.129 4.236 4.434 4.639 4.931 5.108 5.279 5.539 5.788 6.017 6.235 6.455 6.751 7.04 7.321 7.64 7.945 8.252 8.621 9.018 9.38 9.808 10.27 10.748 11.271 11.881 12.592 13.277 14.072 14.968 16.004 17.162 18.452 19.859 21.414 22.497 22.995 23.155 23.109 23.024 22.919 22.778 22.613 22.416 22.226 22.058 21.892 21.716 21.55 21.407 21.259 21.097 20.946 20.796 20.617 20.461 20.306 20.149 20.026 19.91 19.78 19.625 19.452 19.317 19.185 19.008 18.89 18.756 18.674 18.515 18.367 18.197 18.107 17.941 17.752 17.615 17.471 17.119 16.942 16.765 16.527 16.276 15.948 15.348 11.71 -2 ,29256 ,TETRA ,17558551,Sat Nov 27 01:54:50 CET,Sat Nov 27 03:49:05 CET,0.0 0.916 1.282 1.551 1.766 1.961 2.138 2.313 2.612 2.75 2.886 3.053 3.265 3.391 3.634 3.856 4.088 4.199 4.394 4.583 4.856 5.04 5.211 5.453 5.686 5.917 6.151 6.377 6.671 6.952 7.222 7.556 7.883 8.195 8.544 8.943 9.324 9.738 10.191 10.675 11.193 11.769 12.44 13.14 13.978 14.874 15.85 16.956 18.236 19.663 21.229 22.279 22.723 22.866 22.867 22.79 22.646 22.509 22.378 22.201 22.015 21.852 21.696 21.515 21.341 21.193 21.017 20.825 20.678 20.539 20.383 20.239 20.079 19.933 19.815 19.678 19.539 19.382 19.199 19.081 18.975 18.808 18.678 18.512 18.42 18.253 18.09 17.902 17.802 17.624 17.422 17.277 17.141 16.83 16.637 16.421 16.167 15.868 15.452 14.85 11.581 -3 ,30862 ,TETRA ,17558552,Sat Nov 27 01:54:53 CET,Sat Nov 27 03:48:48 CET,0.0 1.588 1.903 2.185 2.45 2.667 2.864 3.039 3.351 3.5 3.645 3.854 4.073 4.19 4.4 4.609 4.822 4.93 5.136 5.33 5.621 5.81 5.985 6.233 6.48 6.713 6.937 7.159 7.443 7.721 7.988 8.311 8.629 8.943 9.309 9.723 10.124 10.564 11.058 11.569 12.096 12.688 13.363 14.082 14.931 15.842 16.879 18.064 19.375 20.799 22.288 23.181 23.588 23.742 23.726 23.657 23.539 23.387 23.231 23.025 22.803 22.603 22.431 22.27 22.115 21.961 21.795 21.652 21.515 21.359 21.187 21.016 20.832 20.662 20.535 20.393 20.24 20.08 19.888 19.756 19.636 19.434 19.3 19.16 19.081 18.908 18.706 18.479 18.366 18.195 18.03 17.896 17.754 17.434 17.235 17.016 16.829 16.593 16.272 15.796 12.574 -4 ,12664 ,TETRA ,17558553,Sat Nov 27 01:54:55 CET,Sat Nov 27 03:47:52 CET,0.0 1.234 1.585 1.867 2.117 2.318 2.493 2.674 2.986 3.128 3.266 3.438 3.65 3.769 4.007 4.244 4.466 4.571 4.777 4.965 5.229 5.407 5.585 5.837 6.082 6.327 6.56 6.777 7.062 7.347 7.624 7.951 8.25 8.545 8.908 9.335 9.739 10.16 10.598 11.067 11.591 12.172 12.84 13.536 14.37 15.296 16.316 17.425 18.705 20.19 21.856 23.026 23.516 23.672 23.678 23.614 23.507 23.359 23.231 23.061 22.876 22.721 22.568 22.421 22.293 22.157 21.992 21.844 21.7 21.54 21.4 21.276 21.131 20.987 20.869 20.723 20.557 20.406 20.259 20.157 20.048 19.859 19.731 19.581 19.495 19.327 19.136 18.923 18.818 18.65 18.478 18.336 18.179 17.854 17.682 17.497 17.265 16.945 16.524 15.974 10.44 -6 ,3986 ,TETRA ,17558555,Sat Nov 27 01:55:42 CET,Sat Nov 27 03:48:19 CET,0.0 0.879 1.27 1.604 1.862 2.087 2.294 2.472 2.781 2.929 3.073 3.257 3.476 3.609 3.848 4.073 4.288 4.394 4.592 4.768 5.022 5.194 5.368 5.61 5.839 6.064 6.292 6.531 6.823 7.085 7.355 7.682 7.985 8.29 8.657 9.048 9.416 9.833 10.303 10.814 11.341 11.911 12.578 13.291 14.122 15.016 16.047 17.191 18.442 19.815 21.339 22.333 22.709 22.743 22.599 22.386 22.16 21.928 21.718 21.513 21.314 21.114 20.919 20.75 20.596 20.418 20.227 20.08 19.941 19.772 19.58 19.419 19.253 19.072 18.934 18.803 18.661 18.508 18.339 18.207 18.069 17.874 17.725 17.576 17.502 17.337 17.159 16.991 16.907 16.727 16.544 16.419 16.29 15.975 15.817 15.626 15.397 15.15 14.75 14.19 11.701 -7 ,11774 ,TETRA ,17558556,Sat Nov 27 01:55:41 CET,Sat Nov 27 03:48:24 CET,0.0 1.176 1.517 1.791 2.025 2.24 2.438 2.633 2.97 3.11 3.251 3.434 3.644 3.759 3.975 4.196 4.42 4.524 4.722 4.921 5.199 5.377 5.557 5.822 6.07 6.29 6.508 6.735 7.028 7.314 7.597 7.932 8.248 8.561 8.931 9.35 9.767 10.215 10.673 11.133 11.63 12.224 12.89 13.564 14.372 15.279 16.304 17.431 18.725 20.202 21.871 22.991 23.477 23.668 23.638 23.501 23.335 23.18 23.056 22.891 22.697 22.513 22.334 22.137 21.937 21.772 21.593 21.43 21.281 21.122 20.957 20.822 20.692 20.551 20.42 20.274 20.142 20.007 19.854 19.756 19.649 19.474 19.341 19.192 19.114 18.936 18.743 18.539 18.442 18.267 18.105 18.002 17.887 17.587 17.403 17.205 16.981 16.688 16.341 15.853 13.196 -8 ,31013 ,TETRA ,17558557,Sat Nov 27 01:55:40 CET,Sat Nov 27 03:48:17 CET,0.0 0.883 1.242 1.54 1.771 1.957 2.136 2.322 2.672 2.828 2.964 3.122 3.328 3.449 3.69 3.91 4.104 4.201 4.4 4.585 4.849 5.034 5.223 5.47 5.7 5.93 6.138 6.354 6.65 6.926 7.191 7.512 7.828 8.137 8.482 8.863 9.231 9.648 10.115 10.626 11.172 11.782 12.473 13.177 14.03 14.96 15.982 17.134 18.458 19.844 21.494 22.744 23.123 23.174 23.134 23.049 22.912 22.726 22.545 22.352 22.168 21.974 21.783 21.618 21.438 21.258 21.052 20.88 20.758 20.629 20.482 20.358 20.202 20.03 19.894 19.746 19.607 19.458 19.288 19.159 19.019 18.818 18.689 18.554 18.484 18.335 18.181 18.007 17.904 17.725 17.542 17.401 17.265 16.954 16.746 16.534 16.322 16.071 15.734 15.271 12.412 -9 ,18871 ,TETRA ,17558558,Sat Nov 27 01:55:41 CET,Sat Nov 27 03:48:49 CET,0.0 1.046 1.433 1.671 1.912 2.136 2.326 2.507 2.82 2.956 3.089 3.263 3.477 3.605 3.859 4.08 4.275 4.369 4.564 4.761 5.038 5.211 5.375 5.612 5.855 6.102 6.342 6.563 6.84 7.114 7.377 7.695 8.003 8.305 8.649 9.048 9.442 9.864 10.325 10.825 11.335 11.901 12.569 13.205 13.942 14.789 15.758 16.806 18.016 19.385 20.839 21.759 22.106 22.219 22.177 21.994 21.783 21.589 21.399 21.169 20.963 20.772 20.585 20.438 20.279 20.108 19.921 19.755 19.621 19.487 19.356 19.238 19.119 18.996 18.856 18.687 18.528 18.375 18.216 18.095 17.968 17.757 17.609 17.46 17.382 17.23 17.067 16.881 16.792 16.624 16.477 16.352 16.215 15.939 15.763 15.564 15.344 15.083 14.743 14.205 11.698 -10 ,17272 ,TETRA ,17558559,Sat Nov 27 01:55:42 CET,Sat Nov 27 03:48:57 CET,0.0 1.355 1.703 2.011 2.252 2.451 2.62 2.782 3.093 3.24 3.381 3.572 3.792 3.913 4.152 4.397 4.614 4.719 4.922 5.115 5.397 5.573 5.757 6.029 6.278 6.52 6.757 6.978 7.256 7.53 7.803 8.136 8.454 8.75 9.098 9.497 9.876 10.3 10.774 11.277 11.794 12.375 13.062 13.765 14.609 15.556 16.617 17.802 19.1 20.592 22.254 23.33 23.795 23.964 23.978 23.897 23.74 23.568 23.398 23.171 22.956 22.764 22.57 22.403 22.229 22.054 21.855 21.673 21.532 21.396 21.257 21.126 20.969 20.8 20.676 20.539 20.395 20.249 20.096 19.983 19.858 19.659 19.523 19.397 19.329 19.187 19.018 18.81 18.698 18.504 18.321 18.198 18.065 17.739 17.553 17.359 17.132 16.879 16.527 15.962 12.538 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt deleted file mode 100644 index ffb5fa11..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/eg5/water/Summary_FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6652 ,TETRA ,17558560,Sat Nov 27 01:55:41 CET,Sat Nov 27 03:48:07 CET,0.0 1.253 1.581 1.836 2.016 2.187 2.361 2.495 2.716 2.816 2.918 3.026 3.191 3.263 3.418 3.575 3.724 3.804 3.95 4.083 4.278 4.399 4.516 4.677 4.814 4.95 5.084 5.209 5.373 5.545 5.712 5.887 6.077 6.27 6.476 6.699 6.913 7.143 7.403 7.687 7.968 8.282 8.638 8.965 9.302 9.666 10.081 10.493 10.853 11.094 11.035 10.661 10.139 9.522 8.884 8.301 7.813 7.355 6.921 6.469 6.096 5.754 5.406 5.084 4.789 4.52 4.248 3.986 3.755 3.523 3.272 3.069 2.851 2.622 2.441 2.247 2.049 1.829 1.598 1.441 1.288 1.051 0.864 0.674 0.588 0.412 0.211 -0.016 -0.132 -0.331 -0.511 -0.648 -0.798 -1.122 -1.279 -1.497 -1.769 -2.033 -2.387 -2.88 -4.618 -2 ,11351 ,TETRA ,17558561,Sat Nov 27 01:55:42 CET,Sat Nov 27 03:48:09 CET,0.0 0.362 0.541 0.703 0.843 0.955 1.073 1.183 1.366 1.457 1.546 1.631 1.793 1.866 1.992 2.098 2.204 2.259 2.365 2.475 2.632 2.731 2.833 2.968 3.098 3.23 3.351 3.476 3.647 3.82 3.993 4.196 4.369 4.517 4.713 4.943 5.151 5.39 5.64 5.913 6.22 6.539 6.867 7.156 7.522 7.92 8.308 8.689 9.061 9.373 9.393 8.921 8.346 7.736 7.122 6.537 6.028 5.581 5.176 4.744 4.358 4.023 3.711 3.385 3.09 2.842 2.569 2.315 2.083 1.839 1.589 1.387 1.166 0.922 0.737 0.541 0.341 0.141 -0.077 -0.223 -0.358 -0.579 -0.758 -0.954 -1.047 -1.246 -1.452 -1.651 -1.757 -1.966 -2.169 -2.319 -2.466 -2.743 -2.892 -3.072 -3.287 -3.54 -3.867 -4.312 -6.264 -3 ,5489 ,TETRA ,17558562,Sat Nov 27 01:55:41 CET,Sat Nov 27 03:49:15 CET,0.0 0.425 0.664 0.864 1.07 1.243 1.367 1.487 1.71 1.825 1.939 2.072 2.254 2.344 2.517 2.684 2.835 2.9 3.033 3.185 3.403 3.528 3.64 3.793 3.936 4.082 4.23 4.369 4.53 4.707 4.885 5.084 5.267 5.435 5.645 5.884 6.11 6.364 6.618 6.872 7.128 7.408 7.739 8.044 8.385 8.763 9.192 9.652 10.069 10.376 10.437 10.09 9.637 9.106 8.577 8.097 7.648 7.18 6.756 6.33 5.947 5.605 5.267 4.934 4.63 4.351 4.054 3.791 3.555 3.299 3.028 2.817 2.605 2.38 2.207 2.006 1.795 1.585 1.379 1.244 1.085 0.823 0.635 0.448 0.357 0.172 -0.028 -0.273 -0.405 -0.618 -0.809 -0.948 -1.094 -1.409 -1.581 -1.798 -2.038 -2.274 -2.593 -3.058 -4.968 -4 ,13376 ,TETRA ,17558563,Sat Nov 27 01:56:42 CET,Sat Nov 27 03:48:38 CET,0.0 0.92 1.215 1.44 1.614 1.8 1.963 2.076 2.295 2.41 2.519 2.622 2.782 2.859 3.018 3.18 3.331 3.396 3.531 3.668 3.85 3.973 4.097 4.284 4.468 4.632 4.773 4.909 5.089 5.258 5.426 5.638 5.846 6.032 6.234 6.455 6.644 6.858 7.122 7.389 7.656 7.954 8.279 8.596 8.937 9.278 9.65 10.013 10.373 10.655 10.608 10.192 9.662 9.074 8.462 7.889 7.386 6.926 6.514 6.069 5.683 5.338 5.019 4.703 4.395 4.113 3.813 3.559 3.344 3.124 2.885 2.659 2.422 2.19 2.016 1.831 1.63 1.421 1.208 1.056 0.881 0.616 0.436 0.263 0.177 -0.007 -0.199 -0.428 -0.549 -0.771 -1.007 -1.155 -1.305 -1.618 -1.799 -2.008 -2.249 -2.535 -2.9 -3.399 -5.663 -5 ,30300 ,TETRA ,17558564,Sat Nov 27 01:56:43 CET,Sat Nov 27 03:49:02 CET,0.0 0.85 1.1 1.293 1.477 1.648 1.803 1.933 2.153 2.255 2.361 2.485 2.658 2.743 2.905 3.058 3.193 3.263 3.402 3.522 3.703 3.817 3.931 4.108 4.274 4.433 4.589 4.733 4.92 5.097 5.258 5.454 5.631 5.799 6.019 6.261 6.478 6.722 6.969 7.225 7.485 7.78 8.107 8.433 8.828 9.208 9.624 10.051 10.427 10.72 10.792 10.484 9.947 9.36 8.808 8.258 7.739 7.277 6.874 6.441 6.053 5.697 5.379 5.098 4.818 4.545 4.263 4.012 3.776 3.533 3.296 3.097 2.882 2.645 2.463 2.29 2.102 1.886 1.645 1.482 1.32 1.076 0.913 0.735 0.645 0.465 0.27 0.06 -0.05 -0.255 -0.469 -0.628 -0.766 -1.041 -1.223 -1.428 -1.656 -1.937 -2.249 -2.596 -4.185 -6 ,6641 ,TETRA ,17558565,Sat Nov 27 01:56:42 CET,Sat Nov 27 03:51:07 CET,0.0 1.236 1.634 1.907 2.118 2.297 2.454 2.587 2.824 2.927 3.021 3.109 3.275 3.359 3.51 3.663 3.824 3.9 4.05 4.195 4.396 4.516 4.631 4.816 4.996 5.149 5.278 5.414 5.594 5.751 5.901 6.083 6.257 6.428 6.627 6.862 7.094 7.332 7.58 7.852 8.14 8.468 8.844 9.176 9.519 9.899 10.278 10.627 11.048 11.392 11.415 11.09 10.513 9.914 9.411 8.901 8.388 7.904 7.5 7.068 6.654 6.284 5.939 5.621 5.309 5.002 4.68 4.399 4.159 3.912 3.664 3.456 3.228 2.977 2.789 2.589 2.388 2.18 1.934 1.765 1.598 1.348 1.169 0.976 0.866 0.633 0.399 0.187 0.088 -0.1 -0.251 -0.378 -0.504 -0.778 -0.951 -1.155 -1.385 -1.614 -1.903 -2.343 -3.531 -7 ,27244 ,TETRA ,17558566,Sat Nov 27 01:56:42 CET,Sat Nov 27 03:50:28 CET,0.0 0.544 0.81 1.015 1.14 1.242 1.329 1.423 1.613 1.694 1.766 1.831 1.988 2.061 2.199 2.321 2.447 2.502 2.618 2.74 2.908 3.017 3.117 3.262 3.396 3.525 3.651 3.771 3.943 4.118 4.277 4.456 4.648 4.829 5.01 5.23 5.452 5.685 5.915 6.173 6.461 6.782 7.132 7.457 7.797 8.174 8.609 9.066 9.489 9.735 9.793 9.429 8.857 8.275 7.745 7.212 6.678 6.198 5.788 5.355 4.955 4.571 4.22 3.924 3.662 3.403 3.104 2.839 2.613 2.373 2.115 1.911 1.699 1.464 1.279 1.087 0.9 0.708 0.497 0.346 0.181 -0.061 -0.224 -0.406 -0.497 -0.69 -0.903 -1.145 -1.268 -1.478 -1.668 -1.816 -1.97 -2.298 -2.484 -2.684 -2.923 -3.236 -3.629 -4.073 -5.816 -8 ,23180 ,TETRA ,17558567,Sat Nov 27 01:56:43 CET,Sat Nov 27 03:50:31 CET,0.0 1.049 1.363 1.557 1.731 1.905 2.076 2.223 2.463 2.577 2.688 2.786 2.946 3.019 3.16 3.31 3.476 3.553 3.689 3.824 4.019 4.146 4.274 4.452 4.614 4.765 4.926 5.079 5.247 5.419 5.599 5.802 5.991 6.172 6.356 6.563 6.781 7.026 7.274 7.558 7.86 8.171 8.523 8.849 9.18 9.535 9.964 10.393 10.735 11.038 11.043 10.524 9.963 9.363 8.781 8.22 7.694 7.229 6.819 6.387 6.011 5.683 5.358 5.052 4.771 4.477 4.172 3.915 3.684 3.431 3.167 2.956 2.741 2.519 2.337 2.146 1.947 1.731 1.509 1.363 1.223 1.0 0.824 0.626 0.529 0.341 0.133 -0.079 -0.194 -0.401 -0.606 -0.752 -0.899 -1.212 -1.381 -1.581 -1.806 -2.047 -2.34 -2.76 -4.457 -9 ,17588 ,TETRA ,17558568,Sat Nov 27 01:56:42 CET,Sat Nov 27 03:48:52 CET,0.0 0.868 1.158 1.39 1.573 1.723 1.849 1.967 2.173 2.261 2.346 2.446 2.617 2.703 2.868 3.009 3.131 3.196 3.325 3.458 3.655 3.771 3.883 4.048 4.197 4.345 4.501 4.64 4.812 4.982 5.146 5.349 5.533 5.69 5.881 6.113 6.333 6.564 6.811 7.057 7.305 7.608 7.975 8.324 8.736 9.185 9.623 10.042 10.454 10.802 10.828 10.393 9.805 9.171 8.566 8.013 7.514 7.041 6.626 6.228 5.877 5.541 5.223 4.915 4.607 4.333 4.041 3.773 3.552 3.324 3.083 2.884 2.673 2.441 2.262 2.081 1.887 1.686 1.466 1.309 1.15 0.896 0.722 0.548 0.46 0.274 0.078 -0.137 -0.26 -0.458 -0.626 -0.769 -0.941 -1.299 -1.48 -1.688 -1.931 -2.164 -2.442 -2.834 -4.459 -10 ,27434 ,TETRA ,17558569,Sat Nov 27 01:56:44 CET,Sat Nov 27 03:49:07 CET,0.0 0.755 1.009 1.211 1.383 1.549 1.699 1.816 2.034 2.128 2.215 2.31 2.49 2.577 2.735 2.883 3.03 3.106 3.251 3.393 3.596 3.713 3.818 3.96 4.107 4.269 4.437 4.598 4.786 4.965 5.119 5.306 5.501 5.672 5.853 6.072 6.293 6.519 6.766 7.043 7.32 7.627 7.984 8.344 8.753 9.155 9.562 9.941 10.293 10.556 10.575 10.222 9.684 9.092 8.533 7.962 7.413 6.889 6.465 6.054 5.674 5.326 4.975 4.636 4.334 4.048 3.743 3.466 3.221 2.991 2.754 2.557 2.352 2.14 1.958 1.759 1.565 1.365 1.147 0.991 0.822 0.559 0.38 0.184 0.094 -0.079 -0.298 -0.531 -0.657 -0.875 -1.084 -1.225 -1.368 -1.722 -1.927 -2.15 -2.394 -2.622 -2.893 -3.365 -4.684 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/get_summary_files.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/get_summary_files.py deleted file mode 100644 index 797e26f2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/get_summary_files.py +++ /dev/null @@ -1,15 +0,0 @@ -import glob -import os -import shlex -import subprocess - -wd = os.getcwd() -for target in glob.glob('*/'): - os.chdir(os.path.join(wd, target)) - for leg in glob.glob('*/'): - os.chdir(os.path.join(wd, target, leg)) - executable = 'rsync -av kebne:/proj/nobackup/uucompbiochem/diazalej/qligfep-benchmarking/openFF2/{}*{}*/analysis/*.txt .'.format(target, leg) - #print(executable) - #print(os.getcwd()) - run = subprocess.run(shlex.split(executable)) - os.chdir(wd) diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_124_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_124_41.txt deleted file mode 100644 index 01ff34b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_124_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26658 ,KEBNE ,16748437,Mon Nov 29 19:52:08 CET,Mon Nov 29 21:23:01 CET,0.0 1.244 1.699 2.02 2.266 2.48 2.659 2.815 3.095 3.21 3.327 3.548 3.66 3.747 3.92 4.096 4.251 4.324 4.481 4.63 4.823 4.936 5.039 5.194 5.352 5.5 5.623 5.739 5.9 6.04 6.169 6.325 6.448 6.552 6.681 6.817 6.929 7.045 7.147 7.259 7.403 7.497 7.539 7.542 7.47 7.31 6.924 6.265 5.247 3.649 1.04 -1.892 -4.132 -5.963 -7.456 -8.746 -9.836 -10.773 -11.596 -12.414 -13.092 -13.681 -14.232 -14.743 -15.231 -15.666 -16.094 -16.464 -16.775 -17.11 -17.462 -17.767 -18.08 -18.377 -18.613 -18.874 -19.138 -19.409 -19.678 -19.856 -20.043 -20.334 -20.549 -20.759 -20.869 -21.095 -21.325 -21.574 -21.708 -21.902 -22.18 -22.335 -22.493 -22.87 -23.063 -23.269 -23.524 -23.803 -24.101 -24.507 -25.719 -2 ,21354 ,KEBNE ,16748438,Mon Nov 29 21:00:16 CET,Mon Nov 29 22:30:17 CET,0.0 1.055 1.406 1.646 1.831 2.005 2.171 2.328 2.593 2.706 2.818 3.019 3.124 3.215 3.398 3.562 3.706 3.771 3.889 4.013 4.197 4.302 4.406 4.571 4.708 4.812 4.912 5.021 5.15 5.26 5.357 5.459 5.541 5.612 5.699 5.775 5.853 5.919 5.929 5.962 6.003 5.95 5.831 5.683 5.455 5.171 4.747 4.056 2.968 1.323 -1.248 -4.201 -6.483 -8.374 -9.955 -11.34 -12.496 -13.498 -14.377 -15.236 -15.958 -16.584 -17.182 -17.734 -18.215 -18.658 -19.131 -19.542 -19.89 -20.25 -20.629 -20.932 -21.237 -21.559 -21.799 -22.054 -22.324 -22.586 -22.859 -23.06 -23.26 -23.565 -23.777 -23.979 -24.095 -24.343 -24.594 -24.835 -24.951 -25.126 -25.369 -25.527 -25.693 -26.039 -26.226 -26.429 -26.666 -26.953 -27.317 -27.757 -28.943 -3 ,678 ,KEBNE ,16748439,Mon Nov 29 21:02:23 CET,Mon Nov 29 22:32:19 CET,0.0 1.289 1.734 2.065 2.324 2.531 2.705 2.869 3.167 3.309 3.441 3.652 3.774 3.875 4.047 4.211 4.375 4.453 4.6 4.733 4.932 5.064 5.188 5.346 5.491 5.631 5.771 5.907 6.071 6.214 6.329 6.438 6.523 6.608 6.709 6.814 6.907 6.973 7.006 7.036 7.057 7.042 6.98 6.868 6.656 6.388 6.053 5.47 4.553 3.248 0.973 -1.772 -3.992 -5.828 -7.325 -8.634 -9.769 -10.766 -11.61 -12.452 -13.141 -13.719 -14.259 -14.769 -15.261 -15.701 -16.149 -16.561 -16.907 -17.248 -17.608 -17.912 -18.218 -18.523 -18.749 -18.985 -19.227 -19.474 -19.75 -19.949 -20.147 -20.452 -20.667 -20.881 -20.987 -21.214 -21.457 -21.698 -21.824 -22.005 -22.238 -22.393 -22.557 -22.887 -23.075 -23.302 -23.541 -23.787 -24.049 -24.426 -25.404 -4 ,89 ,KEBNE ,16748440,Mon Nov 29 21:02:22 CET,Mon Nov 29 22:32:46 CET,0.0 1.417 1.897 2.231 2.538 2.807 3.009 3.203 3.526 3.647 3.771 3.982 4.099 4.196 4.362 4.522 4.675 4.742 4.879 5.023 5.215 5.329 5.438 5.59 5.733 5.863 5.995 6.125 6.285 6.435 6.583 6.743 6.844 6.915 6.987 7.042 7.086 7.151 7.262 7.4 7.517 7.604 7.654 7.62 7.446 7.147 6.717 6.046 5.035 3.532 1.014 -1.882 -4.089 -5.868 -7.372 -8.682 -9.762 -10.696 -11.499 -12.28 -12.952 -13.56 -14.107 -14.619 -15.103 -15.566 -16.034 -16.418 -16.749 -17.094 -17.478 -17.803 -18.118 -18.426 -18.658 -18.903 -19.162 -19.436 -19.733 -19.926 -20.117 -20.404 -20.617 -20.842 -20.951 -21.174 -21.415 -21.686 -21.827 -22.016 -22.276 -22.43 -22.594 -22.945 -23.137 -23.357 -23.589 -23.852 -24.162 -24.584 -25.846 -5 ,28740 ,KEBNE ,16748441,Mon Nov 29 21:02:23 CET,Mon Nov 29 22:32:33 CET,0.0 1.545 1.954 2.238 2.49 2.722 2.933 3.122 3.467 3.626 3.759 3.987 4.111 4.218 4.409 4.59 4.772 4.847 4.983 5.109 5.299 5.418 5.521 5.665 5.787 5.906 6.012 6.119 6.281 6.44 6.599 6.771 6.891 6.98 7.1 7.216 7.274 7.335 7.38 7.413 7.475 7.477 7.384 7.246 7.038 6.737 6.272 5.617 4.607 3.006 0.362 -2.548 -4.871 -6.811 -8.406 -9.774 -10.944 -11.936 -12.714 -13.462 -14.089 -14.651 -15.211 -15.727 -16.184 -16.621 -17.074 -17.447 -17.759 -18.108 -18.491 -18.813 -19.137 -19.456 -19.693 -19.93 -20.17 -20.425 -20.684 -20.857 -21.043 -21.35 -21.553 -21.752 -21.861 -22.104 -22.362 -22.601 -22.726 -22.917 -23.176 -23.338 -23.507 -23.863 -24.053 -24.239 -24.458 -24.699 -25.01 -25.468 -26.915 -6 ,27295 ,KEBNE ,16748442,Mon Nov 29 21:04:29 CET,Mon Nov 29 22:35:44 CET,0.0 1.61 2.106 2.456 2.718 2.958 3.175 3.378 3.7 3.83 3.967 4.217 4.354 4.468 4.66 4.863 5.059 5.148 5.316 5.474 5.701 5.828 5.948 6.12 6.266 6.4 6.511 6.615 6.757 6.888 7.003 7.129 7.234 7.328 7.43 7.509 7.563 7.611 7.651 7.666 7.677 7.655 7.572 7.448 7.247 6.969 6.542 5.936 5.019 3.587 1.045 -1.923 -4.278 -6.234 -7.873 -9.301 -10.471 -11.453 -12.268 -13.095 -13.821 -14.457 -15.045 -15.572 -16.061 -16.541 -17.022 -17.435 -17.791 -18.149 -18.528 -18.842 -19.164 -19.479 -19.712 -19.974 -20.243 -20.527 -20.827 -21.02 -21.205 -21.514 -21.734 -21.945 -22.061 -22.306 -22.561 -22.825 -22.96 -23.144 -23.381 -23.539 -23.713 -24.082 -24.29 -24.526 -24.78 -25.062 -25.379 -25.819 -27.208 -7 ,6754 ,KEBNE ,16748443,Mon Nov 29 21:04:29 CET,Mon Nov 29 22:35:27 CET,0.0 0.995 1.405 1.697 1.921 2.109 2.295 2.473 2.794 2.925 3.047 3.273 3.402 3.512 3.709 3.884 4.048 4.133 4.283 4.41 4.584 4.68 4.774 4.917 5.046 5.181 5.31 5.42 5.563 5.688 5.772 5.861 5.948 6.015 6.088 6.215 6.326 6.368 6.4 6.411 6.384 6.371 6.362 6.283 6.15 5.891 5.403 4.697 3.697 2.308 0.167 -2.438 -4.637 -6.485 -7.984 -9.265 -10.406 -11.398 -12.219 -13.035 -13.725 -14.327 -14.875 -15.389 -15.869 -16.329 -16.809 -17.218 -17.56 -17.898 -18.241 -18.53 -18.832 -19.157 -19.412 -19.67 -19.942 -20.212 -20.482 -20.667 -20.88 -21.198 -21.396 -21.618 -21.725 -21.946 -22.191 -22.438 -22.572 -22.753 -22.998 -23.152 -23.296 -23.626 -23.825 -24.04 -24.268 -24.506 -24.786 -25.201 -26.178 -8 ,9629 ,KEBNE ,16748444,Mon Nov 29 21:06:35 CET,Mon Nov 29 22:39:47 CET,0.0 1.437 1.882 2.217 2.46 2.677 2.878 3.036 3.276 3.388 3.509 3.723 3.841 3.941 4.129 4.289 4.422 4.485 4.613 4.731 4.888 4.986 5.082 5.236 5.37 5.483 5.601 5.723 5.865 5.974 6.082 6.199 6.299 6.386 6.492 6.623 6.7 6.728 6.731 6.715 6.688 6.63 6.522 6.369 6.116 5.782 5.377 4.784 3.874 2.486 -0.027 -3.082 -5.413 -7.285 -8.833 -10.125 -11.266 -12.307 -13.19 -14.057 -14.758 -15.363 -15.97 -16.538 -17.029 -17.465 -17.907 -18.309 -18.672 -19.057 -19.434 -19.745 -20.087 -20.436 -20.7 -20.969 -21.249 -21.529 -21.818 -22.024 -22.233 -22.544 -22.759 -22.985 -23.1 -23.334 -23.597 -23.876 -24.013 -24.207 -24.467 -24.622 -24.796 -25.166 -25.356 -25.552 -25.776 -26.028 -26.308 -26.677 -27.724 -9 ,10576 ,KEBNE ,16748445,Mon Nov 29 21:06:35 CET,Mon Nov 29 22:39:00 CET,0.0 1.188 1.624 1.985 2.248 2.448 2.646 2.829 3.114 3.237 3.357 3.597 3.724 3.826 4.03 4.203 4.366 4.442 4.588 4.729 4.915 5.032 5.141 5.298 5.439 5.571 5.695 5.8 5.918 6.015 6.117 6.227 6.331 6.436 6.528 6.615 6.676 6.738 6.809 6.859 6.895 6.893 6.809 6.695 6.479 6.158 5.709 5.047 4.056 2.529 0.043 -2.89 -5.183 -7.041 -8.541 -9.819 -10.9 -11.843 -12.67 -13.481 -14.161 -14.766 -15.346 -15.905 -16.403 -16.827 -17.27 -17.67 -18.009 -18.361 -18.736 -19.054 -19.358 -19.658 -19.907 -20.154 -20.404 -20.681 -20.966 -21.164 -21.384 -21.718 -21.94 -22.166 -22.277 -22.512 -22.757 -23.012 -23.146 -23.326 -23.559 -23.708 -23.861 -24.203 -24.393 -24.608 -24.842 -25.096 -25.382 -25.775 -27.136 -10 ,32502 ,KEBNE ,16748446,Mon Nov 29 21:06:39 CET,Mon Nov 29 22:28:57 CET,0.0 1.213 1.621 1.947 2.211 2.419 2.602 2.779 3.073 3.196 3.311 3.487 3.596 3.693 3.873 4.043 4.189 4.256 4.386 4.516 4.699 4.805 4.906 5.055 5.209 5.342 5.445 5.535 5.651 5.774 5.893 6.06 6.229 6.346 6.428 6.514 6.593 6.667 6.735 6.767 6.775 6.758 6.656 6.488 6.291 6.051 5.622 5.023 4.235 2.903 0.466 -2.383 -4.608 -6.49 -8.081 -9.422 -10.574 -11.642 -12.525 -13.348 -14.034 -14.642 -15.227 -15.775 -16.252 -16.659 -17.117 -17.527 -17.86 -18.189 -18.542 -18.836 -19.123 -19.427 -19.666 -19.907 -20.135 -20.375 -20.642 -20.83 -21.027 -21.34 -21.563 -21.791 -21.914 -22.178 -22.432 -22.695 -22.837 -23.028 -23.3 -23.457 -23.625 -24.019 -24.224 -24.429 -24.668 -24.945 -25.254 -25.66 -26.772 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_124_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_124_54.txt deleted file mode 100644 index db01ca8b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_124_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16201 ,KEBNE ,16748481,Tue Nov 30 03:37:36 CET,Tue Nov 30 05:09:29 CET,0.0 1.291 1.666 1.933 2.124 2.247 2.347 2.449 2.628 2.697 2.758 2.826 2.845 2.84 2.834 2.835 2.838 2.836 2.799 2.726 2.604 2.503 2.391 2.195 1.996 1.814 1.615 1.383 1.052 0.727 0.384 -0.056 -0.523 -1.019 -1.593 -2.27 -2.979 -3.81 -4.782 -5.888 -7.129 -8.613 -10.443 -12.436 -14.948 -18.043 -21.998 -27.022 -33.703 -42.726 -55.813 -69.274 -79.129 -86.762 -92.725 -97.602 -101.57 -104.949 -107.742 -110.409 -112.597 -114.467 -116.192 -117.76 -119.166 -120.424 -121.713 -122.829 -123.753 -124.686 -125.649 -126.453 -127.264 -128.051 -128.653 -129.277 -129.903 -130.541 -131.186 -131.613 -132.044 -132.704 -133.153 -133.623 -133.869 -134.376 -134.898 -135.437 -135.707 -136.137 -136.503 -136.782 -137.08 -137.692 -138.008 -138.34 -138.692 -139.075 -139.512 -140.045 -141.666 -2 ,11004 ,KEBNE ,16748482,Tue Nov 30 03:38:38 CET,Tue Nov 30 05:08:37 CET,0.0 1.355 1.754 2.008 2.193 2.336 2.447 2.545 2.695 2.743 2.779 2.792 2.812 2.823 2.816 2.802 2.782 2.757 2.687 2.599 2.428 2.302 2.182 2.005 1.813 1.628 1.453 1.263 0.99 0.686 0.376 -0.024 -0.466 -0.945 -1.495 -2.097 -2.768 -3.618 -4.599 -5.688 -6.892 -8.326 -10.116 -12.048 -14.51 -17.593 -21.525 -26.429 -33.002 -42.02 -55.162 -68.789 -78.73 -86.41 -92.475 -97.454 -101.556 -105.064 -107.883 -110.556 -112.769 -114.666 -116.398 -117.962 -119.361 -120.603 -121.855 -122.948 -123.881 -124.814 -125.757 -126.514 -127.261 -128.016 -128.583 -129.157 -129.749 -130.353 -130.97 -131.375 -131.785 -132.413 -132.842 -133.301 -133.532 -133.985 -134.447 -134.92 -135.156 -135.558 -135.918 -136.194 -136.476 -137.068 -137.372 -137.679 -138.004 -138.37 -138.765 -139.217 -140.299 -3 ,15768 ,KEBNE ,16748483,Tue Nov 30 04:24:38 CET,Tue Nov 30 05:55:03 CET,0.0 1.47 1.878 2.138 2.318 2.462 2.57 2.659 2.803 2.85 2.866 2.845 2.856 2.858 2.866 2.842 2.79 2.773 2.729 2.639 2.474 2.369 2.251 2.065 1.871 1.661 1.445 1.219 0.915 0.605 0.28 -0.15 -0.598 -1.06 -1.642 -2.348 -3.077 -3.928 -4.896 -5.984 -7.195 -8.697 -10.603 -12.668 -15.28 -18.439 -22.389 -27.313 -33.861 -42.838 -55.905 -69.468 -79.367 -86.974 -93.004 -97.987 -102.098 -105.632 -108.53 -111.318 -113.637 -115.624 -117.463 -119.151 -120.675 -122.027 -123.355 -124.483 -125.438 -126.411 -127.414 -128.227 -129.047 -129.88 -130.507 -131.135 -131.767 -132.403 -133.053 -133.499 -133.954 -134.661 -135.136 -135.609 -135.853 -136.346 -136.848 -137.37 -137.642 -138.087 -138.474 -138.771 -139.076 -139.718 -140.062 -140.425 -140.817 -141.251 -141.74 -142.36 -143.874 -4 ,26606 ,KEBNE ,16748484,Tue Nov 30 04:24:38 CET,Tue Nov 30 05:54:18 CET,0.0 1.331 1.761 2.063 2.261 2.414 2.582 2.724 2.94 3.025 3.076 3.118 3.147 3.148 3.159 3.148 3.096 3.074 3.009 2.909 2.747 2.66 2.569 2.369 2.145 1.929 1.703 1.472 1.151 0.806 0.477 0.088 -0.344 -0.845 -1.451 -2.125 -2.824 -3.668 -4.645 -5.762 -7.015 -8.517 -10.404 -12.458 -15.042 -18.191 -22.196 -27.234 -33.926 -42.985 -56.146 -69.79 -79.689 -87.203 -93.08 -98.008 -102.062 -105.518 -108.363 -111.096 -113.372 -115.319 -117.098 -118.731 -120.182 -121.446 -122.719 -123.797 -124.724 -125.675 -126.632 -127.417 -128.213 -129.009 -129.588 -130.163 -130.747 -131.339 -131.939 -132.345 -132.754 -133.388 -133.839 -134.317 -134.569 -135.08 -135.603 -136.14 -136.416 -136.86 -137.243 -137.534 -137.848 -138.515 -138.862 -139.22 -139.623 -140.068 -140.569 -141.204 -142.786 -5 ,22389 ,KEBNE ,16748485,Tue Nov 30 04:24:38 CET,Tue Nov 30 05:55:19 CET,0.0 1.289 1.723 1.961 2.159 2.339 2.458 2.515 2.601 2.636 2.665 2.674 2.686 2.683 2.662 2.63 2.601 2.58 2.508 2.43 2.288 2.183 2.08 1.895 1.698 1.491 1.263 1.018 0.69 0.376 0.052 -0.382 -0.828 -1.283 -1.845 -2.502 -3.145 -3.876 -4.764 -5.833 -7.042 -8.53 -10.449 -12.509 -15.07 -18.253 -22.291 -27.26 -33.875 -42.969 -56.171 -69.797 -79.736 -87.409 -93.519 -98.697 -102.95 -106.539 -109.472 -112.258 -114.548 -116.521 -118.335 -119.981 -121.448 -122.729 -124.03 -125.168 -126.123 -127.074 -128.027 -128.799 -129.593 -130.405 -131.024 -131.655 -132.284 -132.936 -133.608 -134.049 -134.496 -135.171 -135.625 -136.106 -136.353 -136.847 -137.359 -137.893 -138.162 -138.605 -139.041 -139.348 -139.653 -140.284 -140.626 -140.976 -141.346 -141.746 -142.186 -142.795 -144.453 -6 ,20005 ,KEBNE ,16748486,Tue Nov 30 04:25:40 CET,Tue Nov 30 05:56:16 CET,0.0 1.499 1.91 2.099 2.212 2.316 2.41 2.478 2.57 2.606 2.642 2.687 2.706 2.696 2.646 2.6 2.563 2.537 2.46 2.374 2.221 2.104 2.001 1.832 1.622 1.401 1.19 0.961 0.628 0.272 -0.106 -0.583 -1.06 -1.541 -2.134 -2.844 -3.562 -4.383 -5.332 -6.415 -7.595 -9.013 -10.891 -12.975 -15.565 -18.639 -22.597 -27.675 -34.26 -43.062 -55.786 -69.146 -78.963 -86.501 -92.473 -97.424 -101.426 -104.801 -107.597 -110.287 -112.497 -114.388 -116.121 -117.678 -119.073 -120.32 -121.565 -122.632 -123.532 -124.434 -125.352 -126.1 -126.861 -127.624 -128.196 -128.772 -129.359 -129.968 -130.58 -130.994 -131.417 -132.061 -132.493 -132.937 -133.165 -133.625 -134.105 -134.605 -134.851 -135.263 -135.62 -135.886 -136.163 -136.774 -137.091 -137.417 -137.78 -138.185 -138.65 -139.231 -140.776 -7 ,11362 ,KEBNE ,16748487,Tue Nov 30 04:31:49 CET,Tue Nov 30 06:02:21 CET,0.0 1.5 1.923 2.233 2.45 2.58 2.663 2.75 2.916 2.977 3.026 3.058 3.071 3.062 3.021 2.97 2.904 2.863 2.776 2.681 2.527 2.413 2.291 2.076 1.85 1.617 1.366 1.109 0.764 0.42 0.066 -0.4 -0.881 -1.349 -1.934 -2.642 -3.343 -4.196 -5.166 -6.251 -7.495 -9.012 -10.908 -12.973 -15.617 -18.816 -22.858 -27.865 -34.401 -43.273 -56.309 -69.927 -79.799 -87.376 -93.381 -98.342 -102.349 -105.74 -108.529 -111.189 -113.393 -115.27 -116.974 -118.527 -119.92 -121.149 -122.391 -123.459 -124.378 -125.327 -126.255 -126.992 -127.745 -128.505 -129.076 -129.655 -130.243 -130.832 -131.425 -131.848 -132.294 -132.959 -133.411 -133.878 -134.123 -134.635 -135.171 -135.704 -135.969 -136.398 -136.783 -137.073 -137.368 -138.005 -138.343 -138.698 -139.079 -139.499 -140.003 -140.636 -142.164 -8 ,15004 ,KEBNE ,16748488,Tue Nov 30 04:31:49 CET,Tue Nov 30 06:03:35 CET,0.0 1.697 2.108 2.413 2.655 2.805 2.881 2.946 3.094 3.151 3.187 3.193 3.194 3.178 3.151 3.117 3.054 3.017 2.949 2.869 2.717 2.61 2.509 2.339 2.145 1.936 1.732 1.52 1.214 0.914 0.602 0.171 -0.322 -0.839 -1.433 -2.138 -2.86 -3.721 -4.747 -5.881 -7.132 -8.657 -10.557 -12.601 -15.178 -18.323 -22.304 -27.319 -34.002 -43.061 -56.343 -70.034 -79.875 -87.463 -93.42 -98.383 -102.502 -105.976 -108.829 -111.58 -113.838 -115.759 -117.496 -119.102 -120.571 -121.865 -123.164 -124.293 -125.26 -126.242 -127.253 -128.068 -128.886 -129.745 -130.395 -131.036 -131.677 -132.321 -132.985 -133.429 -133.877 -134.587 -135.072 -135.555 -135.792 -136.278 -136.779 -137.301 -137.571 -138.014 -138.424 -138.714 -139.016 -139.674 -140.038 -140.403 -140.784 -141.233 -141.75 -142.386 -144.185 -9 ,29639 ,KEBNE ,16748489,Tue Nov 30 04:34:52 CET,Tue Nov 30 06:04:17 CET,0.0 1.591 1.949 2.208 2.412 2.547 2.647 2.721 2.807 2.831 2.838 2.851 2.886 2.894 2.885 2.875 2.847 2.825 2.761 2.686 2.552 2.436 2.306 2.094 1.884 1.682 1.47 1.23 0.906 0.577 0.228 -0.225 -0.699 -1.171 -1.738 -2.418 -3.099 -3.916 -4.87 -5.964 -7.217 -8.724 -10.635 -12.714 -15.343 -18.531 -22.517 -27.486 -33.997 -42.922 -55.946 -69.371 -79.186 -86.706 -92.729 -97.81 -101.974 -105.559 -108.492 -111.231 -113.451 -115.334 -117.049 -118.605 -120.019 -121.285 -122.539 -123.621 -124.534 -125.444 -126.379 -127.149 -127.941 -128.764 -129.395 -130.028 -130.662 -131.304 -131.949 -132.381 -132.826 -133.528 -134.005 -134.475 -134.708 -135.187 -135.687 -136.196 -136.452 -136.869 -137.269 -137.574 -137.896 -138.545 -138.894 -139.265 -139.641 -140.037 -140.477 -141.032 -142.731 -10 ,4078 ,KEBNE ,16748490,Tue Nov 30 04:35:53 CET,Tue Nov 30 06:05:11 CET,0.0 1.717 2.141 2.375 2.536 2.645 2.749 2.849 3.0 3.056 3.083 3.09 3.107 3.097 3.088 3.082 3.026 2.977 2.865 2.774 2.638 2.523 2.413 2.247 2.072 1.898 1.706 1.481 1.161 0.836 0.504 0.077 -0.373 -0.832 -1.389 -2.081 -2.811 -3.682 -4.664 -5.76 -6.992 -8.437 -10.269 -12.279 -14.763 -17.783 -21.711 -26.701 -33.243 -42.208 -55.37 -68.932 -78.801 -86.361 -92.277 -97.264 -101.365 -104.788 -107.571 -110.235 -112.444 -114.341 -116.087 -117.647 -119.034 -120.268 -121.518 -122.613 -123.535 -124.471 -125.428 -126.198 -126.96 -127.727 -128.313 -128.913 -129.536 -130.172 -130.806 -131.236 -131.68 -132.336 -132.774 -133.229 -133.463 -133.945 -134.439 -134.945 -135.211 -135.649 -136.045 -136.336 -136.641 -137.265 -137.599 -137.966 -138.35 -138.744 -139.219 -139.859 -141.395 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_1.txt deleted file mode 100644 index 120dff1b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14633 ,KEBNE ,16748449,Mon Nov 29 21:26:28 CET,Mon Nov 29 22:58:51 CET,0.0 1.529 1.936 2.19 2.409 2.606 2.777 2.941 3.257 3.395 3.521 3.701 3.856 3.958 4.154 4.328 4.485 4.566 4.718 4.863 5.086 5.224 5.353 5.522 5.651 5.774 5.913 6.039 6.185 6.326 6.46 6.614 6.737 6.852 7.038 7.242 7.409 7.587 7.736 7.881 8.019 8.16 8.325 8.481 8.613 8.705 8.808 8.873 8.773 8.473 7.833 6.955 6.178 5.505 4.911 4.353 3.839 3.359 2.925 2.483 2.117 1.759 1.414 1.116 0.855 0.61 0.331 0.095 -0.096 -0.292 -0.54 -0.782 -1.019 -1.247 -1.417 -1.588 -1.756 -1.924 -2.118 -2.271 -2.439 -2.703 -2.885 -3.079 -3.18 -3.381 -3.602 -3.844 -3.972 -4.162 -4.401 -4.548 -4.696 -5.05 -5.248 -5.465 -5.708 -5.99 -6.315 -6.871 -8.749 -2 ,17940 ,KEBNE ,16748450,Mon Nov 29 21:26:29 CET,Mon Nov 29 22:57:57 CET,0.0 2.041 2.383 2.634 2.827 2.999 3.179 3.35 3.615 3.745 3.875 4.055 4.218 4.315 4.47 4.625 4.783 4.862 5.023 5.181 5.383 5.503 5.611 5.738 5.875 6.024 6.178 6.327 6.478 6.612 6.758 6.945 7.111 7.237 7.381 7.529 7.645 7.78 7.938 8.097 8.247 8.386 8.515 8.657 8.824 8.993 9.166 9.262 9.226 9.015 8.444 7.557 6.734 5.946 5.257 4.604 4.023 3.544 3.121 2.664 2.257 1.916 1.604 1.3 1.019 0.78 0.525 0.298 0.098 -0.124 -0.399 -0.659 -0.887 -1.087 -1.248 -1.424 -1.603 -1.795 -2.021 -2.179 -2.331 -2.574 -2.765 -2.948 -3.031 -3.213 -3.41 -3.63 -3.759 -3.957 -4.177 -4.318 -4.461 -4.779 -4.969 -5.193 -5.427 -5.67 -6.002 -6.438 -8.238 -3 ,649 ,KEBNE ,16748451,Mon Nov 29 21:28:34 CET,Mon Nov 29 23:02:07 CET,0.0 1.272 1.711 2.028 2.273 2.489 2.687 2.858 3.16 3.309 3.445 3.614 3.771 3.877 4.056 4.206 4.35 4.422 4.556 4.701 4.922 5.041 5.154 5.32 5.465 5.596 5.722 5.851 6.012 6.15 6.288 6.478 6.654 6.798 6.969 7.168 7.317 7.445 7.575 7.75 7.929 8.074 8.247 8.404 8.557 8.695 8.792 8.795 8.685 8.448 7.844 6.898 6.023 5.266 4.614 4.001 3.483 2.96 2.486 2.041 1.654 1.297 0.956 0.638 0.357 0.113 -0.192 -0.507 -0.746 -0.971 -1.222 -1.428 -1.628 -1.856 -2.037 -2.226 -2.439 -2.652 -2.856 -3.001 -3.159 -3.4 -3.559 -3.73 -3.824 -4.032 -4.263 -4.478 -4.581 -4.755 -4.971 -5.121 -5.264 -5.584 -5.766 -5.964 -6.191 -6.453 -6.753 -7.209 -9.189 -4 ,15549 ,KEBNE ,16748452,Mon Nov 29 21:57:51 CET,Mon Nov 29 23:29:20 CET,0.0 1.268 1.582 1.828 2.046 2.242 2.405 2.54 2.809 2.935 3.049 3.224 3.372 3.467 3.661 3.841 3.995 4.063 4.195 4.328 4.498 4.597 4.69 4.822 4.941 5.058 5.178 5.286 5.429 5.571 5.694 5.839 5.983 6.115 6.283 6.468 6.605 6.76 6.938 7.128 7.318 7.502 7.698 7.86 8.006 8.115 8.193 8.216 8.142 7.867 7.255 6.39 5.58 4.776 4.07 3.45 2.906 2.403 1.935 1.47 1.081 0.742 0.431 0.138 -0.139 -0.401 -0.665 -0.931 -1.202 -1.456 -1.697 -1.904 -2.126 -2.341 -2.501 -2.675 -2.866 -3.08 -3.298 -3.45 -3.604 -3.85 -4.023 -4.202 -4.299 -4.505 -4.719 -4.945 -5.069 -5.247 -5.43 -5.571 -5.714 -6.015 -6.199 -6.414 -6.643 -6.91 -7.265 -7.767 -9.61 -5 ,29640 ,KEBNE ,16748453,Mon Nov 29 22:29:19 CET,Mon Nov 29 23:53:41 CET,0.0 1.231 1.636 1.891 2.11 2.305 2.487 2.65 2.915 3.039 3.168 3.359 3.512 3.619 3.826 4.007 4.171 4.239 4.367 4.507 4.724 4.847 4.947 5.108 5.283 5.433 5.573 5.716 5.883 6.043 6.218 6.421 6.565 6.674 6.801 6.975 7.153 7.301 7.437 7.592 7.741 7.893 8.047 8.163 8.262 8.344 8.409 8.396 8.289 8.033 7.437 6.61 5.817 5.078 4.409 3.769 3.22 2.739 2.328 1.901 1.518 1.198 0.894 0.605 0.348 0.112 -0.145 -0.388 -0.588 -0.792 -1.053 -1.29 -1.507 -1.706 -1.867 -2.065 -2.28 -2.504 -2.72 -2.863 -3.006 -3.212 -3.364 -3.536 -3.641 -3.854 -4.06 -4.277 -4.38 -4.53 -4.682 -4.806 -4.942 -5.275 -5.485 -5.711 -5.939 -6.189 -6.509 -6.955 -8.657 -6 ,7837 ,KEBNE ,16748454,Mon Nov 29 22:31:20 CET,Tue Nov 30 00:03:01 CET,0.0 1.412 1.755 2.023 2.264 2.477 2.649 2.787 3.047 3.173 3.282 3.423 3.553 3.628 3.77 3.911 4.032 4.085 4.208 4.315 4.446 4.534 4.614 4.749 4.871 4.989 5.116 5.225 5.348 5.478 5.621 5.781 5.934 6.082 6.222 6.355 6.495 6.637 6.76 6.894 7.011 7.131 7.292 7.445 7.59 7.685 7.713 7.698 7.586 7.303 6.659 5.79 4.996 4.266 3.632 3.028 2.484 2.006 1.595 1.173 0.812 0.489 0.157 -0.146 -0.444 -0.722 -0.984 -1.208 -1.393 -1.602 -1.843 -2.047 -2.246 -2.47 -2.67 -2.872 -3.07 -3.259 -3.452 -3.586 -3.726 -3.965 -4.137 -4.307 -4.393 -4.583 -4.801 -5.043 -5.156 -5.313 -5.479 -5.602 -5.745 -6.093 -6.275 -6.46 -6.674 -6.921 -7.19 -7.652 -9.957 -7 ,22575 ,KEBNE ,16748455,Mon Nov 29 22:33:25 CET,Tue Nov 30 00:05:29 CET,0.0 1.426 1.758 2.021 2.272 2.483 2.674 2.837 3.121 3.256 3.383 3.558 3.714 3.811 3.976 4.143 4.311 4.38 4.51 4.65 4.859 4.991 5.116 5.276 5.427 5.59 5.735 5.853 6.013 6.149 6.265 6.407 6.528 6.628 6.755 6.91 7.048 7.184 7.343 7.508 7.661 7.811 7.955 8.066 8.163 8.282 8.433 8.512 8.452 8.179 7.504 6.552 5.673 4.903 4.228 3.634 3.129 2.652 2.234 1.83 1.479 1.164 0.848 0.549 0.285 0.03 -0.23 -0.493 -0.77 -1.028 -1.297 -1.53 -1.775 -2.042 -2.224 -2.412 -2.621 -2.821 -3.027 -3.178 -3.334 -3.551 -3.712 -3.909 -4.006 -4.196 -4.392 -4.625 -4.76 -4.948 -5.134 -5.273 -5.426 -5.755 -5.965 -6.186 -6.409 -6.686 -7.048 -7.57 -9.474 -8 ,4359 ,KEBNE ,16748456,Mon Nov 29 22:33:26 CET,Tue Nov 30 00:04:25 CET,0.0 1.358 1.778 2.07 2.304 2.499 2.658 2.801 3.075 3.191 3.298 3.454 3.606 3.704 3.898 4.069 4.21 4.28 4.415 4.539 4.729 4.856 4.974 5.121 5.235 5.343 5.451 5.575 5.738 5.882 6.037 6.248 6.457 6.616 6.769 6.935 7.086 7.244 7.401 7.562 7.697 7.806 7.947 8.063 8.161 8.265 8.369 8.434 8.398 8.202 7.652 6.742 5.86 5.1 4.411 3.776 3.242 2.767 2.373 1.965 1.59 1.255 0.94 0.659 0.4 0.112 -0.202 -0.443 -0.642 -0.866 -1.112 -1.333 -1.565 -1.785 -1.959 -2.134 -2.31 -2.502 -2.726 -2.879 -3.034 -3.286 -3.449 -3.609 -3.698 -3.879 -4.066 -4.279 -4.402 -4.591 -4.807 -4.955 -5.113 -5.456 -5.662 -5.899 -6.148 -6.446 -6.822 -7.326 -9.91 -9 ,19839 ,KEBNE ,16748457,Mon Nov 29 22:40:44 CET,Tue Nov 30 00:15:12 CET,0.0 1.246 1.628 1.86 2.059 2.246 2.426 2.587 2.869 3.007 3.133 3.31 3.461 3.545 3.727 3.908 4.073 4.159 4.329 4.483 4.671 4.769 4.878 5.055 5.222 5.357 5.477 5.617 5.803 5.961 6.086 6.231 6.393 6.529 6.668 6.818 6.95 7.086 7.214 7.345 7.47 7.597 7.734 7.858 7.974 8.09 8.24 8.337 8.287 8.057 7.512 6.649 5.849 5.15 4.52 3.939 3.44 2.971 2.544 2.108 1.741 1.433 1.135 0.826 0.501 0.157 -0.197 -0.462 -0.662 -0.87 -1.1 -1.294 -1.511 -1.738 -1.897 -2.057 -2.24 -2.462 -2.701 -2.843 -2.992 -3.245 -3.422 -3.61 -3.705 -3.899 -4.114 -4.332 -4.447 -4.635 -4.841 -4.979 -5.123 -5.491 -5.692 -5.911 -6.19 -6.499 -6.867 -7.317 -8.857 -10 ,9976 ,KEBNE ,16748458,Mon Nov 29 22:59:21 CET,Tue Nov 30 00:31:25 CET,0.0 1.062 1.42 1.706 1.936 2.115 2.262 2.407 2.696 2.829 2.947 3.094 3.231 3.32 3.505 3.68 3.854 3.93 4.058 4.167 4.305 4.4 4.495 4.659 4.838 4.985 5.094 5.18 5.303 5.437 5.554 5.684 5.805 5.914 6.032 6.16 6.275 6.413 6.605 6.806 6.964 7.153 7.355 7.515 7.681 7.819 7.899 7.897 7.821 7.556 6.938 6.094 5.286 4.527 3.88 3.277 2.722 2.236 1.839 1.417 1.042 0.722 0.41 0.111 -0.214 -0.519 -0.805 -1.086 -1.352 -1.594 -1.817 -2.008 -2.213 -2.467 -2.678 -2.884 -3.072 -3.269 -3.483 -3.627 -3.768 -4.016 -4.212 -4.404 -4.5 -4.693 -4.891 -5.103 -5.206 -5.367 -5.534 -5.653 -5.783 -6.098 -6.286 -6.495 -6.733 -7.025 -7.409 -7.931 -9.726 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_156.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_156.txt deleted file mode 100644 index cdd161ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_156.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2692 ,KEBNE ,16748492,Tue Nov 30 04:35:53 CET,Tue Nov 30 06:07:06 CET,0.0 1.239 1.615 1.932 2.189 2.395 2.593 2.778 3.129 3.291 3.435 3.644 3.82 3.945 4.187 4.41 4.62 4.718 4.916 5.113 5.363 5.528 5.693 5.917 6.129 6.323 6.516 6.707 6.948 7.174 7.386 7.657 7.925 8.174 8.497 8.887 9.261 9.676 10.078 10.477 10.904 11.403 11.981 12.559 13.265 14.08 15.022 16.094 17.424 19.024 20.96 22.579 23.501 24.101 24.495 24.744 24.904 25.002 25.019 25.012 24.974 24.922 24.899 24.824 24.727 24.657 24.586 24.52 24.455 24.37 24.264 24.176 24.092 23.983 23.883 23.787 23.666 23.522 23.386 23.288 23.182 23.013 22.898 22.787 22.724 22.579 22.421 22.261 22.174 22.044 21.855 21.737 21.619 21.368 21.218 21.044 20.862 20.66 20.404 20.033 18.799 -2 ,1458 ,KEBNE ,16748493,Tue Nov 30 04:36:55 CET,Tue Nov 30 06:08:16 CET,0.0 1.149 1.553 1.822 2.083 2.307 2.487 2.655 2.964 3.101 3.231 3.432 3.604 3.727 3.969 4.196 4.403 4.504 4.706 4.901 5.174 5.341 5.516 5.782 6.039 6.295 6.52 6.724 7.002 7.287 7.558 7.858 8.128 8.386 8.688 9.028 9.368 9.768 10.196 10.633 11.09 11.614 12.242 12.87 13.59 14.405 15.379 16.494 17.846 19.474 21.426 23.077 24.046 24.571 24.853 25.085 25.262 25.334 25.359 25.284 25.207 25.195 25.163 25.124 25.03 24.918 24.84 24.751 24.645 24.549 24.47 24.403 24.311 24.165 24.038 23.92 23.797 23.666 23.535 23.437 23.345 23.221 23.132 23.027 22.968 22.84 22.679 22.522 22.451 22.341 22.197 22.087 21.967 21.718 21.576 21.42 21.228 21.004 20.736 20.382 18.97 -3 ,20800 ,KEBNE ,16748494,Tue Nov 30 04:39:58 CET,Tue Nov 30 06:11:30 CET,0.0 1.003 1.376 1.67 1.929 2.151 2.339 2.507 2.856 3.025 3.165 3.348 3.509 3.621 3.843 4.049 4.252 4.348 4.524 4.707 4.996 5.184 5.355 5.579 5.784 5.999 6.224 6.434 6.701 6.978 7.234 7.517 7.797 8.057 8.346 8.693 9.025 9.37 9.762 10.182 10.611 11.095 11.701 12.323 13.014 13.788 14.714 15.792 17.056 18.566 20.495 22.123 23.033 23.599 23.961 24.199 24.35 24.46 24.529 24.497 24.423 24.34 24.27 24.213 24.124 24.043 23.964 23.882 23.804 23.726 23.646 23.576 23.496 23.409 23.334 23.23 23.1 22.969 22.848 22.754 22.639 22.462 22.352 22.237 22.17 22.02 21.847 21.662 21.572 21.452 21.316 21.226 21.107 20.809 20.645 20.475 20.277 20.051 19.787 19.442 18.296 -4 ,8336 ,KEBNE ,16748495,Tue Nov 30 04:39:58 CET,Tue Nov 30 06:12:16 CET,0.0 1.228 1.617 1.884 2.113 2.324 2.503 2.676 3.012 3.151 3.272 3.452 3.619 3.734 3.945 4.149 4.352 4.441 4.607 4.768 4.998 5.169 5.347 5.599 5.846 6.08 6.289 6.48 6.728 6.955 7.182 7.463 7.722 7.975 8.268 8.634 8.997 9.358 9.752 10.183 10.61 11.104 11.688 12.274 13.073 13.983 14.923 16.004 17.331 18.946 20.889 22.488 23.424 24.023 24.355 24.578 24.76 24.876 24.938 24.962 24.946 24.908 24.872 24.846 24.808 24.747 24.663 24.578 24.506 24.406 24.266 24.155 24.035 23.891 23.78 23.665 23.551 23.44 23.318 23.229 23.124 22.948 22.842 22.732 22.662 22.51 22.363 22.218 22.146 22.033 21.884 21.777 21.66 21.412 21.26 21.091 20.903 20.673 20.399 20.037 18.701 -5 ,18094 ,KEBNE ,16748496,Tue Nov 30 04:39:58 CET,Tue Nov 30 06:10:52 CET,0.0 1.594 1.992 2.261 2.487 2.681 2.849 3.012 3.321 3.471 3.609 3.803 3.958 4.056 4.258 4.459 4.661 4.762 4.954 5.143 5.408 5.587 5.772 6.026 6.255 6.484 6.713 6.912 7.144 7.385 7.643 7.931 8.189 8.453 8.767 9.161 9.567 9.948 10.323 10.721 11.148 11.656 12.252 12.827 13.5 14.3 15.242 16.331 17.67 19.281 21.263 22.943 23.89 24.484 24.887 25.121 25.275 25.378 25.448 25.506 25.503 25.46 25.416 25.338 25.265 25.212 25.149 25.092 25.015 24.932 24.858 24.791 24.702 24.59 24.487 24.379 24.292 24.197 24.085 24.009 23.924 23.776 23.66 23.53 23.465 23.337 23.203 23.062 22.988 22.871 22.684 22.571 22.452 22.173 22.028 21.869 21.693 21.493 21.256 20.916 19.622 -6 ,32556 ,KEBNE ,16748497,Tue Nov 30 04:39:59 CET,Tue Nov 30 06:11:13 CET,0.0 1.384 1.781 2.056 2.27 2.472 2.663 2.844 3.156 3.3 3.447 3.664 3.834 3.954 4.194 4.431 4.649 4.747 4.942 5.111 5.342 5.506 5.662 5.871 6.091 6.333 6.552 6.766 7.052 7.308 7.54 7.807 8.074 8.359 8.672 9.006 9.375 9.808 10.232 10.673 11.178 11.765 12.423 13.086 13.846 14.668 15.6 16.691 18.023 19.575 21.542 23.227 24.18 24.754 25.121 25.333 25.448 25.51 25.54 25.557 25.509 25.451 25.416 25.384 25.339 25.272 25.168 25.067 24.994 24.909 24.811 24.735 24.65 24.57 24.513 24.442 24.359 24.269 24.169 24.095 24.018 23.885 23.775 23.657 23.592 23.452 23.3 23.129 23.039 22.913 22.744 22.638 22.54 22.32 22.182 22.031 21.854 21.65 21.403 21.063 19.884 -7 ,17067 ,KEBNE ,16748498,Tue Nov 30 04:42:01 CET,Tue Nov 30 06:14:26 CET,0.0 0.984 1.345 1.615 1.833 2.028 2.212 2.395 2.702 2.826 2.951 3.152 3.323 3.425 3.623 3.829 4.01 4.093 4.26 4.418 4.657 4.827 4.996 5.243 5.468 5.672 5.863 6.062 6.338 6.611 6.852 7.126 7.431 7.742 8.087 8.497 8.907 9.317 9.715 10.132 10.567 11.062 11.683 12.32 13.033 13.841 14.782 15.88 17.178 18.696 20.639 22.305 23.248 23.801 24.139 24.341 24.469 24.547 24.508 24.447 24.418 24.369 24.325 24.245 24.128 24.039 23.965 23.879 23.77 23.651 23.557 23.494 23.411 23.282 23.168 23.055 22.959 22.866 22.761 22.686 22.607 22.463 22.353 22.262 22.219 22.112 21.972 21.843 21.78 21.663 21.485 21.369 21.244 20.977 20.833 20.67 20.503 20.315 20.068 19.7 18.056 -8 ,4330 ,KEBNE ,16748499,Tue Nov 30 04:45:05 CET,Tue Nov 30 06:16:16 CET,0.0 1.163 1.525 1.812 2.044 2.245 2.434 2.603 2.919 3.069 3.206 3.393 3.555 3.662 3.876 4.079 4.264 4.35 4.532 4.716 4.986 5.169 5.333 5.546 5.753 5.953 6.156 6.367 6.644 6.924 7.167 7.469 7.762 8.017 8.325 8.661 8.971 9.311 9.727 10.242 10.761 11.285 11.869 12.45 13.164 13.98 14.943 16.06 17.378 18.943 20.882 22.551 23.509 24.103 24.493 24.742 24.886 24.998 25.071 25.107 25.121 25.113 25.083 25.022 24.948 24.896 24.834 24.766 24.7 24.624 24.54 24.449 24.332 24.184 24.071 23.972 23.86 23.71 23.542 23.44 23.346 23.208 23.104 22.989 22.93 22.812 22.668 22.503 22.428 22.323 22.189 22.104 22.003 21.755 21.622 21.481 21.303 21.083 20.813 20.434 19.322 -9 ,823 ,KEBNE ,16748500,Tue Nov 30 04:47:07 CET,Tue Nov 30 06:18:39 CET,0.0 1.494 1.873 2.147 2.374 2.566 2.755 2.934 3.224 3.369 3.522 3.741 3.91 4.024 4.242 4.449 4.635 4.72 4.888 5.053 5.294 5.455 5.614 5.845 6.082 6.313 6.522 6.705 6.936 7.177 7.425 7.722 7.994 8.247 8.553 8.898 9.21 9.572 9.976 10.387 10.812 11.281 11.843 12.44 13.147 13.959 14.923 16.06 17.411 18.977 20.893 22.453 23.352 23.95 24.313 24.549 24.733 24.823 24.861 24.882 24.867 24.815 24.735 24.659 24.596 24.536 24.478 24.424 24.355 24.275 24.189 24.121 24.037 23.925 23.835 23.723 23.597 23.466 23.335 23.252 23.16 22.987 22.863 22.741 22.681 22.564 22.428 22.267 22.188 22.077 21.927 21.821 21.711 21.482 21.341 21.175 21.005 20.828 20.591 20.203 18.776 -10 ,19501 ,KEBNE ,16748501,Tue Nov 30 04:47:07 CET,Tue Nov 30 06:18:38 CET,0.0 1.194 1.564 1.854 2.069 2.285 2.488 2.658 2.973 3.116 3.253 3.454 3.627 3.746 3.978 4.183 4.361 4.447 4.615 4.775 5.013 5.19 5.364 5.609 5.839 6.044 6.235 6.415 6.659 6.889 7.118 7.429 7.72 7.981 8.277 8.604 8.922 9.279 9.674 10.091 10.523 11.02 11.598 12.182 12.899 13.724 14.7 15.817 17.075 18.576 20.463 22.052 23.05 23.719 24.146 24.434 24.599 24.663 24.685 24.696 24.685 24.65 24.606 24.566 24.497 24.41 24.336 24.26 24.158 24.029 23.911 23.829 23.735 23.611 23.505 23.411 23.299 23.175 23.058 22.962 22.853 22.671 22.557 22.453 22.387 22.257 22.13 21.981 21.899 21.78 21.615 21.508 21.394 21.138 20.986 20.815 20.631 20.429 20.182 19.778 18.434 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_23.txt deleted file mode 100644 index 75533961..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24943 ,KEBNE ,16748470,Tue Nov 30 01:43:55 CET,Tue Nov 30 03:14:43 CET,0.0 1.73 2.114 2.381 2.603 2.811 2.994 3.148 3.394 3.507 3.623 3.777 3.922 4.017 4.19 4.354 4.507 4.584 4.736 4.874 5.074 5.202 5.327 5.478 5.601 5.726 5.85 5.979 6.145 6.305 6.449 6.592 6.735 6.889 7.055 7.253 7.463 7.676 7.88 8.053 8.183 8.361 8.542 8.659 8.792 8.892 8.956 8.965 8.896 8.634 7.947 6.886 5.918 5.092 4.346 3.654 3.043 2.518 2.052 1.561 1.152 0.807 0.477 0.137 -0.182 -0.455 -0.749 -1.023 -1.282 -1.573 -1.836 -2.025 -2.215 -2.428 -2.61 -2.79 -2.983 -3.21 -3.441 -3.591 -3.748 -3.998 -4.18 -4.376 -4.473 -4.654 -4.866 -5.114 -5.241 -5.43 -5.643 -5.786 -5.946 -6.296 -6.488 -6.723 -6.986 -7.285 -7.659 -8.177 -9.762 -2 ,15631 ,KEBNE ,16748471,Tue Nov 30 01:51:05 CET,Tue Nov 30 03:26:02 CET,0.0 1.707 2.12 2.384 2.633 2.872 3.06 3.222 3.513 3.645 3.772 3.949 4.098 4.188 4.369 4.548 4.732 4.817 4.967 5.126 5.369 5.519 5.66 5.847 6.013 6.157 6.294 6.442 6.648 6.844 7.026 7.213 7.353 7.502 7.679 7.852 7.995 8.141 8.334 8.555 8.748 8.964 9.212 9.368 9.509 9.666 9.794 9.889 9.956 9.823 9.26 8.314 7.381 6.508 5.723 5.029 4.436 3.895 3.426 2.942 2.488 2.081 1.697 1.35 1.032 0.737 0.416 0.128 -0.116 -0.436 -0.772 -0.996 -1.221 -1.483 -1.697 -1.914 -2.153 -2.418 -2.698 -2.882 -3.06 -3.357 -3.555 -3.743 -3.842 -4.043 -4.274 -4.533 -4.667 -4.865 -5.08 -5.24 -5.418 -5.784 -5.988 -6.23 -6.52 -6.85 -7.25 -7.785 -9.816 -3 ,28381 ,KEBNE ,16748472,Tue Nov 30 02:03:23 CET,Tue Nov 30 03:36:57 CET,0.0 1.275 1.663 1.912 2.118 2.317 2.508 2.674 2.956 3.085 3.204 3.378 3.528 3.628 3.841 4.053 4.248 4.33 4.473 4.621 4.859 5.005 5.133 5.317 5.471 5.608 5.768 5.911 6.065 6.264 6.452 6.682 6.924 7.108 7.271 7.434 7.623 7.888 8.116 8.255 8.401 8.579 8.763 8.925 9.094 9.246 9.332 9.331 9.266 9.039 8.427 7.462 6.468 5.551 4.798 4.128 3.524 2.957 2.461 1.967 1.512 1.118 0.759 0.386 0.041 -0.291 -0.642 -0.939 -1.205 -1.484 -1.784 -2.028 -2.261 -2.501 -2.699 -2.904 -3.106 -3.317 -3.527 -3.668 -3.827 -4.089 -4.274 -4.462 -4.552 -4.737 -4.958 -5.207 -5.334 -5.526 -5.742 -5.877 -6.022 -6.365 -6.565 -6.791 -7.071 -7.406 -7.786 -8.336 -10.669 -4 ,21704 ,KEBNE ,16748473,Tue Nov 30 02:06:28 CET,Tue Nov 30 03:38:29 CET,0.0 1.291 1.651 1.966 2.22 2.44 2.633 2.796 3.076 3.208 3.341 3.515 3.653 3.729 3.881 4.038 4.193 4.266 4.435 4.593 4.768 4.875 4.979 5.149 5.328 5.49 5.643 5.773 5.913 6.051 6.197 6.37 6.539 6.723 6.9 7.063 7.236 7.403 7.535 7.686 7.848 7.99 8.132 8.275 8.398 8.475 8.519 8.529 8.442 8.177 7.538 6.516 5.583 4.728 3.939 3.225 2.593 2.029 1.552 1.066 0.651 0.293 -0.044 -0.374 -0.724 -1.062 -1.385 -1.651 -1.9 -2.168 -2.415 -2.603 -2.807 -3.027 -3.197 -3.375 -3.562 -3.783 -4.015 -4.161 -4.32 -4.565 -4.726 -4.901 -4.995 -5.21 -5.449 -5.69 -5.815 -6.004 -6.267 -6.451 -6.621 -6.968 -7.171 -7.425 -7.72 -8.036 -8.395 -8.896 -10.822 -5 ,21940 ,KEBNE ,16748474,Tue Nov 30 02:32:06 CET,Tue Nov 30 04:04:47 CET,0.0 1.266 1.639 1.91 2.131 2.319 2.471 2.615 2.88 3.008 3.134 3.304 3.455 3.556 3.759 3.934 4.103 4.187 4.337 4.47 4.639 4.754 4.868 5.009 5.151 5.3 5.442 5.576 5.737 5.901 6.054 6.216 6.379 6.538 6.706 6.884 7.045 7.219 7.43 7.635 7.818 8.0 8.189 8.363 8.54 8.724 8.844 8.909 8.87 8.583 7.895 6.897 6.003 5.114 4.303 3.619 3.036 2.493 1.991 1.486 1.077 0.713 0.368 0.043 -0.288 -0.576 -0.868 -1.144 -1.376 -1.642 -1.956 -2.218 -2.459 -2.704 -2.917 -3.14 -3.359 -3.582 -3.84 -4.034 -4.227 -4.522 -4.714 -4.911 -5.013 -5.24 -5.492 -5.744 -5.871 -6.073 -6.311 -6.467 -6.639 -7.034 -7.25 -7.476 -7.737 -8.05 -8.416 -8.9 -10.854 -6 ,8951 ,KEBNE ,16748475,Tue Nov 30 02:33:06 CET,Tue Nov 30 04:06:06 CET,0.0 1.063 1.397 1.664 1.917 2.138 2.33 2.498 2.783 2.912 3.024 3.16 3.307 3.4 3.569 3.722 3.874 3.95 4.098 4.244 4.451 4.589 4.729 4.931 5.11 5.273 5.44 5.611 5.82 6.013 6.198 6.412 6.616 6.793 6.963 7.16 7.359 7.569 7.807 8.026 8.183 8.338 8.551 8.781 9.018 9.233 9.363 9.376 9.321 9.063 8.306 7.235 6.234 5.301 4.497 3.786 3.106 2.443 1.893 1.378 0.898 0.496 0.163 -0.172 -0.538 -0.892 -1.228 -1.538 -1.811 -2.085 -2.392 -2.642 -2.882 -3.135 -3.324 -3.501 -3.69 -3.886 -4.112 -4.292 -4.478 -4.767 -4.976 -5.183 -5.284 -5.523 -5.794 -6.056 -6.178 -6.367 -6.628 -6.801 -6.959 -7.327 -7.557 -7.789 -8.034 -8.323 -8.676 -9.141 -10.439 -7 ,8047 ,KEBNE ,16748476,Tue Nov 30 03:04:51 CET,Tue Nov 30 04:36:16 CET,0.0 1.265 1.603 1.874 2.112 2.326 2.519 2.679 2.972 3.106 3.223 3.377 3.515 3.612 3.83 4.022 4.171 4.241 4.374 4.501 4.7 4.83 4.953 5.129 5.283 5.418 5.55 5.685 5.876 6.057 6.203 6.375 6.562 6.745 6.92 7.074 7.2 7.369 7.558 7.704 7.857 8.042 8.254 8.449 8.623 8.757 8.905 9.015 8.956 8.678 8.069 7.073 6.093 5.265 4.503 3.833 3.283 2.775 2.302 1.798 1.369 0.97 0.557 0.167 -0.181 -0.474 -0.756 -0.991 -1.186 -1.421 -1.683 -1.886 -2.104 -2.347 -2.544 -2.745 -2.945 -3.147 -3.387 -3.559 -3.74 -4.022 -4.219 -4.434 -4.541 -4.732 -4.897 -5.11 -5.243 -5.442 -5.665 -5.824 -5.99 -6.36 -6.575 -6.82 -7.105 -7.426 -7.816 -8.332 -10.69 -8 ,27078 ,KEBNE ,16748477,Tue Nov 30 03:07:55 CET,Tue Nov 30 04:39:29 CET,0.0 1.43 1.908 2.196 2.439 2.646 2.812 2.961 3.222 3.35 3.479 3.644 3.799 3.908 4.102 4.269 4.434 4.522 4.688 4.835 5.02 5.136 5.254 5.432 5.624 5.795 5.921 6.035 6.201 6.369 6.522 6.694 6.855 7.005 7.207 7.418 7.566 7.716 7.887 8.063 8.204 8.345 8.498 8.683 8.939 9.126 9.227 9.297 9.215 8.941 8.295 7.289 6.366 5.522 4.789 4.137 3.569 3.019 2.522 2.038 1.589 1.206 0.856 0.512 0.207 -0.077 -0.392 -0.697 -0.945 -1.165 -1.387 -1.583 -1.827 -2.105 -2.296 -2.514 -2.724 -2.931 -3.186 -3.355 -3.558 -3.878 -4.075 -4.262 -4.346 -4.521 -4.701 -4.92 -5.055 -5.256 -5.483 -5.637 -5.808 -6.157 -6.348 -6.566 -6.8 -7.069 -7.432 -7.96 -9.875 -9 ,26364 ,KEBNE ,16748478,Tue Nov 30 03:26:20 CET,Tue Nov 30 05:01:15 CET,0.0 1.1 1.442 1.715 1.946 2.144 2.315 2.459 2.735 2.874 2.998 3.181 3.352 3.458 3.651 3.839 4.025 4.117 4.294 4.461 4.693 4.833 4.946 5.095 5.252 5.427 5.582 5.704 5.887 6.071 6.204 6.366 6.529 6.698 6.913 7.112 7.263 7.412 7.591 7.774 7.939 8.164 8.404 8.566 8.729 8.876 8.972 8.986 8.914 8.632 7.905 6.877 5.899 5.032 4.332 3.694 3.126 2.577 2.089 1.601 1.173 0.812 0.463 0.128 -0.19 -0.495 -0.845 -1.17 -1.44 -1.729 -2.014 -2.244 -2.496 -2.748 -2.96 -3.196 -3.43 -3.671 -3.927 -4.106 -4.294 -4.551 -4.706 -4.895 -5.003 -5.232 -5.476 -5.724 -5.846 -6.028 -6.221 -6.377 -6.554 -6.945 -7.157 -7.394 -7.651 -7.925 -8.26 -8.749 -10.935 -10 ,31256 ,KEBNE ,16748479,Tue Nov 30 03:33:33 CET,Tue Nov 30 04:58:11 CET,0.0 1.463 1.853 2.118 2.349 2.56 2.737 2.891 3.147 3.26 3.361 3.517 3.678 3.782 3.966 4.133 4.299 4.381 4.538 4.689 4.904 5.035 5.149 5.338 5.523 5.681 5.818 5.95 6.129 6.284 6.424 6.613 6.803 6.977 7.177 7.374 7.564 7.752 7.956 8.163 8.392 8.695 8.969 9.143 9.297 9.464 9.585 9.602 9.504 9.242 8.521 7.378 6.448 5.663 4.926 4.231 3.634 3.107 2.66 2.218 1.794 1.37 0.934 0.539 0.22 -0.044 -0.317 -0.591 -0.837 -1.089 -1.355 -1.571 -1.805 -2.081 -2.31 -2.53 -2.745 -2.973 -3.23 -3.412 -3.598 -3.87 -4.048 -4.266 -4.38 -4.592 -4.82 -5.069 -5.202 -5.412 -5.648 -5.794 -5.965 -6.355 -6.554 -6.78 -7.05 -7.34 -7.703 -8.281 -10.043 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_30.txt deleted file mode 100644 index b467f572..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18058 ,KEBNE ,16748426,Mon Nov 29 19:29:05 CET,Mon Nov 29 21:00:02 CET,0.0 0.775 1.096 1.368 1.579 1.733 1.871 1.991 2.224 2.333 2.423 2.539 2.682 2.766 2.902 3.023 3.144 3.206 3.334 3.448 3.591 3.675 3.762 3.891 4.006 4.118 4.225 4.321 4.441 4.552 4.653 4.777 4.903 5.014 5.117 5.227 5.323 5.411 5.503 5.587 5.674 5.744 5.782 5.807 5.796 5.701 5.538 5.267 4.812 4.094 2.735 0.836 -0.706 -2.07 -3.266 -4.223 -5.043 -5.807 -6.488 -7.147 -7.706 -8.244 -8.764 -9.227 -9.633 -9.988 -10.365 -10.712 -11.011 -11.325 -11.637 -11.882 -12.142 -12.416 -12.639 -12.882 -13.124 -13.36 -13.609 -13.782 -13.959 -14.241 -14.438 -14.635 -14.73 -14.934 -15.156 -15.383 -15.503 -15.7 -15.912 -16.058 -16.208 -16.551 -16.753 -16.977 -17.222 -17.499 -17.792 -18.19 -19.387 -2 ,20489 ,KEBNE ,16748427,Mon Nov 29 19:29:06 CET,Mon Nov 29 21:00:24 CET,0.0 0.745 1.021 1.206 1.351 1.502 1.648 1.759 1.952 2.048 2.139 2.271 2.413 2.497 2.643 2.768 2.888 2.945 3.043 3.13 3.254 3.339 3.422 3.527 3.618 3.714 3.8 3.874 3.963 4.05 4.138 4.232 4.319 4.397 4.487 4.604 4.705 4.784 4.859 4.918 4.951 4.991 5.026 5.014 4.984 4.935 4.755 4.445 3.957 3.037 1.363 -0.71 -2.554 -4.101 -5.323 -6.408 -7.336 -8.198 -8.998 -9.763 -10.356 -10.851 -11.351 -11.837 -12.264 -12.652 -13.052 -13.396 -13.685 -13.978 -14.309 -14.611 -14.917 -15.215 -15.446 -15.678 -15.898 -16.133 -16.392 -16.576 -16.779 -17.081 -17.283 -17.501 -17.616 -17.852 -18.101 -18.353 -18.475 -18.671 -18.87 -19.017 -19.195 -19.572 -19.753 -19.96 -20.203 -20.484 -20.88 -21.349 -22.596 -3 ,20391 ,KEBNE ,16748428,Mon Nov 29 19:31:11 CET,Mon Nov 29 21:03:33 CET,0.0 0.971 1.229 1.444 1.612 1.748 1.878 2.002 2.223 2.32 2.412 2.524 2.647 2.724 2.883 3.026 3.151 3.202 3.287 3.38 3.527 3.615 3.692 3.802 3.913 4.016 4.107 4.188 4.277 4.366 4.456 4.559 4.651 4.731 4.804 4.889 4.976 5.059 5.145 5.231 5.325 5.407 5.443 5.449 5.407 5.295 5.106 4.759 4.243 3.5 2.129 0.356 -1.173 -2.52 -3.701 -4.733 -5.621 -6.412 -7.05 -7.705 -8.317 -8.856 -9.35 -9.821 -10.272 -10.667 -11.038 -11.387 -11.712 -12.02 -12.331 -12.595 -12.871 -13.168 -13.387 -13.595 -13.808 -14.044 -14.297 -14.473 -14.652 -14.935 -15.139 -15.347 -15.456 -15.691 -15.926 -16.161 -16.288 -16.484 -16.681 -16.819 -16.957 -17.268 -17.455 -17.662 -17.881 -18.117 -18.404 -18.759 -19.77 -4 ,25818 ,KEBNE ,16748429,Mon Nov 29 19:31:11 CET,Mon Nov 29 21:03:37 CET,0.0 0.684 0.948 1.118 1.267 1.421 1.556 1.684 1.892 1.986 2.084 2.213 2.346 2.435 2.592 2.713 2.813 2.861 2.965 3.062 3.192 3.274 3.35 3.464 3.569 3.659 3.757 3.851 3.953 4.048 4.146 4.258 4.347 4.423 4.512 4.614 4.713 4.825 4.931 5.019 5.103 5.159 5.192 5.21 5.208 5.199 5.122 5.003 4.746 4.128 2.804 1.07 -0.348 -1.528 -2.539 -3.452 -4.254 -5.017 -5.66 -6.252 -6.755 -7.226 -7.683 -8.098 -8.487 -8.846 -9.209 -9.528 -9.823 -10.123 -10.413 -10.649 -10.918 -11.202 -11.407 -11.624 -11.842 -12.062 -12.31 -12.487 -12.672 -12.955 -13.139 -13.332 -13.428 -13.622 -13.848 -14.074 -14.191 -14.39 -14.589 -14.729 -14.884 -15.217 -15.391 -15.576 -15.794 -16.085 -16.439 -16.845 -17.847 -5 ,7301 ,KEBNE ,16748430,Mon Nov 29 19:31:10 CET,Mon Nov 29 21:01:37 CET,0.0 0.677 0.974 1.172 1.342 1.488 1.61 1.721 1.931 2.038 2.131 2.237 2.368 2.442 2.566 2.687 2.815 2.878 2.991 3.084 3.216 3.311 3.399 3.521 3.651 3.773 3.871 3.961 4.067 4.161 4.259 4.381 4.481 4.577 4.684 4.781 4.868 4.973 5.075 5.162 5.238 5.313 5.381 5.417 5.423 5.368 5.266 5.06 4.649 3.928 2.573 0.901 -0.509 -1.771 -2.844 -3.764 -4.568 -5.332 -6.003 -6.643 -7.229 -7.755 -8.237 -8.711 -9.141 -9.501 -9.89 -10.256 -10.563 -10.88 -11.181 -11.432 -11.703 -11.96 -12.163 -12.397 -12.645 -12.885 -13.141 -13.313 -13.476 -13.721 -13.886 -14.073 -14.174 -14.378 -14.575 -14.792 -14.92 -15.114 -15.334 -15.49 -15.633 -15.939 -16.119 -16.312 -16.547 -16.828 -17.128 -17.5 -18.375 -6 ,177 ,KEBNE ,16748431,Mon Nov 29 19:31:11 CET,Mon Nov 29 21:01:51 CET,0.0 0.71 0.978 1.176 1.365 1.537 1.675 1.788 1.978 2.059 2.136 2.235 2.359 2.429 2.556 2.695 2.83 2.889 2.99 3.075 3.202 3.291 3.372 3.479 3.592 3.715 3.83 3.933 4.052 4.16 4.247 4.334 4.445 4.556 4.666 4.771 4.867 4.981 5.091 5.181 5.236 5.283 5.31 5.279 5.222 5.128 4.956 4.71 4.297 3.503 1.974 -0.212 -2.125 -3.716 -5.059 -6.219 -7.237 -8.124 -8.87 -9.604 -10.185 -10.67 -11.131 -11.575 -12.006 -12.412 -12.832 -13.204 -13.531 -13.856 -14.182 -14.448 -14.736 -15.027 -15.242 -15.475 -15.708 -15.931 -16.156 -16.329 -16.522 -16.816 -17.003 -17.182 -17.277 -17.482 -17.691 -17.924 -18.056 -18.258 -18.476 -18.628 -18.784 -19.116 -19.302 -19.505 -19.721 -19.971 -20.262 -20.639 -21.803 -7 ,20972 ,KEBNE ,16748432,Mon Nov 29 19:32:15 CET,Mon Nov 29 21:06:16 CET,0.0 0.94 1.22 1.459 1.636 1.76 1.874 1.99 2.218 2.32 2.406 2.514 2.654 2.738 2.863 2.975 3.071 3.107 3.19 3.286 3.41 3.49 3.566 3.659 3.755 3.845 3.929 4.004 4.091 4.181 4.269 4.365 4.466 4.575 4.683 4.786 4.888 5.001 5.103 5.176 5.218 5.265 5.308 5.329 5.334 5.286 5.133 4.767 4.189 3.378 1.961 0.168 -1.353 -2.643 -3.744 -4.746 -5.647 -6.469 -7.187 -7.892 -8.46 -8.961 -9.431 -9.87 -10.273 -10.632 -11.002 -11.315 -11.572 -11.846 -12.125 -12.346 -12.587 -12.848 -13.054 -13.266 -13.485 -13.719 -13.967 -14.133 -14.297 -14.56 -14.755 -14.963 -15.07 -15.271 -15.487 -15.746 -15.878 -16.084 -16.307 -16.445 -16.582 -16.89 -17.082 -17.288 -17.497 -17.756 -18.079 -18.512 -19.471 -8 ,11527 ,KEBNE ,16748433,Mon Nov 29 19:32:14 CET,Mon Nov 29 21:05:52 CET,0.0 0.815 1.088 1.315 1.493 1.624 1.745 1.854 2.043 2.137 2.218 2.311 2.433 2.497 2.631 2.772 2.882 2.936 3.047 3.142 3.261 3.343 3.427 3.529 3.62 3.714 3.809 3.906 4.029 4.124 4.205 4.299 4.38 4.457 4.545 4.653 4.747 4.828 4.932 5.025 5.1 5.184 5.233 5.249 5.21 5.04 4.832 4.624 4.287 3.664 2.436 0.836 -0.592 -1.954 -3.129 -4.141 -5.027 -5.884 -6.629 -7.291 -7.864 -8.391 -8.86 -9.323 -9.779 -10.174 -10.584 -10.975 -11.33 -11.697 -12.064 -12.339 -12.607 -12.867 -13.077 -13.325 -13.583 -13.843 -14.096 -14.26 -14.44 -14.728 -14.921 -15.12 -15.227 -15.435 -15.654 -15.9 -16.025 -16.231 -16.461 -16.61 -16.755 -17.055 -17.229 -17.458 -17.733 -18.016 -18.306 -18.747 -20.255 -9 ,30081 ,KEBNE ,16748434,Mon Nov 29 19:34:20 CET,Mon Nov 29 21:06:33 CET,0.0 0.9 1.248 1.48 1.66 1.803 1.926 2.037 2.23 2.314 2.395 2.508 2.646 2.735 2.879 3.008 3.138 3.191 3.288 3.396 3.548 3.636 3.722 3.835 3.946 4.044 4.127 4.209 4.313 4.413 4.52 4.647 4.74 4.825 4.917 5.003 5.083 5.169 5.258 5.35 5.422 5.451 5.456 5.45 5.422 5.34 5.174 4.87 4.39 3.632 2.233 0.519 -1.043 -2.467 -3.628 -4.603 -5.458 -6.262 -6.935 -7.6 -8.218 -8.759 -9.21 -9.608 -9.992 -10.355 -10.743 -11.079 -11.36 -11.654 -11.953 -12.216 -12.508 -12.791 -12.991 -13.21 -13.44 -13.686 -13.953 -14.138 -14.338 -14.673 -14.905 -15.126 -15.245 -15.497 -15.749 -16.003 -16.132 -16.344 -16.588 -16.755 -16.931 -17.317 -17.516 -17.725 -17.953 -18.177 -18.433 -18.816 -19.903 -10 ,24146 ,KEBNE ,16748435,Mon Nov 29 19:37:33 CET,Mon Nov 29 21:17:48 CET,0.0 0.937 1.251 1.442 1.593 1.725 1.861 1.992 2.222 2.321 2.41 2.519 2.627 2.69 2.821 2.921 3.014 3.069 3.177 3.267 3.385 3.466 3.54 3.638 3.73 3.814 3.895 3.979 4.071 4.15 4.235 4.328 4.403 4.493 4.597 4.68 4.747 4.826 4.937 5.041 5.118 5.204 5.28 5.291 5.279 5.236 5.096 4.837 4.414 3.687 2.309 0.653 -0.694 -1.846 -2.85 -3.773 -4.563 -5.317 -5.996 -6.647 -7.197 -7.689 -8.119 -8.506 -8.873 -9.217 -9.596 -9.94 -10.225 -10.518 -10.811 -11.037 -11.286 -11.561 -11.776 -11.99 -12.221 -12.465 -12.717 -12.902 -13.093 -13.386 -13.595 -13.807 -13.914 -14.144 -14.396 -14.66 -14.799 -15.001 -15.224 -15.379 -15.545 -15.895 -16.073 -16.279 -16.515 -16.762 -17.042 -17.436 -18.514 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_42.txt deleted file mode 100644 index b31d1ac4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15541 ,KEBNE ,17125903,Thu Dec 30 17:02:37 CET,Thu Dec 30 18:36:18 CET,0.0 1.063 1.435 1.709 1.956 2.182 2.384 2.584 2.932 3.07 3.198 3.39 3.559 3.676 3.889 4.084 4.27 4.361 4.544 4.715 4.975 5.153 5.322 5.526 5.703 5.893 6.083 6.286 6.546 6.781 7.029 7.304 7.539 7.779 8.037 8.307 8.595 8.919 9.261 9.622 9.974 10.376 10.856 11.325 11.832 12.375 12.987 13.649 14.38 15.191 16.063 16.576 16.729 16.737 16.661 16.533 16.392 16.19 15.998 15.84 15.674 15.498 15.335 15.167 14.989 14.835 14.642 14.426 14.226 14.044 13.889 13.76 13.621 13.456 13.31 13.166 13.011 12.827 12.637 12.508 12.387 12.188 12.043 11.905 11.832 11.686 11.528 11.333 11.232 11.086 10.915 10.803 10.667 10.365 10.209 10.049 9.866 9.639 9.367 9.003 7.729 -2 ,22340 ,KEBNE ,17125904,Thu Dec 30 17:02:37 CET,Thu Dec 30 18:36:47 CET,0.0 0.922 1.268 1.559 1.82 2.042 2.253 2.447 2.785 2.954 3.102 3.292 3.458 3.576 3.805 4.016 4.21 4.308 4.5 4.682 4.96 5.14 5.317 5.581 5.822 6.024 6.224 6.426 6.676 6.935 7.193 7.502 7.783 8.031 8.309 8.604 8.878 9.165 9.475 9.801 10.148 10.546 11.017 11.488 12.012 12.592 13.256 13.942 14.696 15.528 16.395 16.995 17.217 17.268 17.207 17.073 16.908 16.746 16.593 16.414 16.249 16.078 15.913 15.753 15.574 15.397 15.22 15.06 14.919 14.776 14.622 14.49 14.346 14.185 14.064 13.941 13.793 13.652 13.484 13.347 13.217 13.031 12.906 12.778 12.711 12.553 12.382 12.209 12.114 11.963 11.791 11.665 11.532 11.254 11.088 10.908 10.719 10.508 10.274 9.955 9.067 -3 ,11517 ,KEBNE ,17125905,Thu Dec 30 17:02:37 CET,Thu Dec 30 18:35:39 CET,0.0 1.014 1.415 1.724 1.981 2.202 2.39 2.558 2.878 3.032 3.167 3.338 3.503 3.619 3.849 4.062 4.264 4.361 4.526 4.694 4.97 5.154 5.312 5.511 5.705 5.89 6.066 6.228 6.447 6.661 6.848 7.076 7.31 7.533 7.777 8.05 8.327 8.695 9.124 9.491 9.827 10.21 10.675 11.158 11.712 12.287 12.901 13.553 14.276 15.149 16.116 16.66 16.825 16.847 16.791 16.698 16.581 16.385 16.191 16.004 15.823 15.657 15.489 15.338 15.173 14.999 14.816 14.625 14.439 14.247 14.047 13.891 13.742 13.607 13.515 13.416 13.294 13.139 12.977 12.881 12.782 12.607 12.492 12.38 12.315 12.18 12.032 11.876 11.793 11.652 11.499 11.387 11.281 11.053 10.912 10.758 10.581 10.367 10.115 9.781 8.746 -4 ,17718 ,KEBNE ,17125906,Thu Dec 30 17:02:37 CET,Thu Dec 30 18:36:21 CET,0.0 1.1 1.496 1.8 2.085 2.313 2.501 2.688 3.006 3.164 3.327 3.553 3.729 3.85 4.057 4.231 4.408 4.498 4.656 4.803 5.03 5.179 5.331 5.574 5.803 6.001 6.195 6.39 6.643 6.889 7.127 7.398 7.653 7.914 8.218 8.547 8.842 9.21 9.651 10.093 10.553 11.026 11.491 11.952 12.488 13.092 13.795 14.551 15.421 16.393 17.478 18.164 18.46 18.539 18.512 18.434 18.296 18.126 17.955 17.687 17.425 17.261 17.117 16.961 16.795 16.618 16.408 16.245 16.122 15.989 15.857 15.717 15.556 15.402 15.275 15.132 14.98 14.822 14.664 14.568 14.466 14.285 14.153 14.022 13.945 13.779 13.636 13.484 13.404 13.285 13.143 13.035 12.919 12.639 12.477 12.306 12.119 11.913 11.628 11.254 10.311 -5 ,9298 ,KEBNE ,17125907,Thu Dec 30 17:02:37 CET,Thu Dec 30 18:37:09 CET,0.0 0.923 1.275 1.556 1.79 2.011 2.228 2.424 2.77 2.923 3.061 3.246 3.408 3.517 3.71 3.892 4.067 4.162 4.366 4.552 4.813 4.969 5.114 5.342 5.57 5.802 6.034 6.237 6.481 6.721 6.948 7.223 7.474 7.693 7.94 8.228 8.506 8.807 9.117 9.44 9.794 10.196 10.669 11.14 11.677 12.232 12.831 13.515 14.296 15.14 16.016 16.542 16.736 16.809 16.72 16.571 16.343 16.103 15.934 15.729 15.504 15.289 15.102 14.923 14.756 14.6 14.43 14.288 14.161 14.017 13.869 13.745 13.61 13.439 13.296 13.16 13.041 12.905 12.722 12.587 12.461 12.281 12.164 12.04 11.963 11.78 11.603 11.429 11.343 11.214 11.07 10.973 10.848 10.553 10.407 10.226 10.024 9.819 9.582 9.231 8.359 -6 ,12350 ,KEBNE ,17125908,Thu Dec 30 17:02:37 CET,Thu Dec 30 18:36:13 CET,0.0 1.107 1.501 1.77 2.018 2.227 2.39 2.551 2.865 3.015 3.158 3.365 3.536 3.655 3.895 4.109 4.308 4.406 4.576 4.726 4.964 5.117 5.253 5.449 5.664 5.892 6.096 6.263 6.485 6.727 6.952 7.193 7.42 7.673 8.013 8.391 8.701 8.986 9.312 9.684 10.05 10.437 10.867 11.3 11.801 12.371 13.006 13.671 14.426 15.241 16.117 16.674 16.821 16.823 16.755 16.624 16.469 16.309 16.119 15.893 15.708 15.536 15.358 15.164 14.979 14.828 14.671 14.525 14.385 14.228 14.068 13.91 13.714 13.523 13.373 13.207 13.035 12.864 12.691 12.571 12.44 12.224 12.075 11.924 11.845 11.681 11.521 11.365 11.291 11.167 11.042 10.952 10.852 10.615 10.466 10.298 10.111 9.893 9.636 9.287 8.097 -7 ,130 ,KEBNE ,17125909,Thu Dec 30 17:02:37 CET,Thu Dec 30 18:35:58 CET,0.0 0.97 1.344 1.624 1.858 2.038 2.211 2.386 2.709 2.863 3.009 3.235 3.414 3.527 3.746 3.955 4.15 4.236 4.41 4.596 4.822 4.961 5.116 5.349 5.569 5.773 5.966 6.144 6.364 6.573 6.79 7.09 7.377 7.623 7.878 8.164 8.466 8.787 9.111 9.464 9.83 10.231 10.683 11.161 11.734 12.305 12.91 13.567 14.318 15.168 16.059 16.603 16.753 16.764 16.687 16.526 16.322 16.069 15.864 15.674 15.482 15.285 15.074 14.877 14.703 14.51 14.279 14.11 13.993 13.856 13.703 13.562 13.412 13.255 13.122 12.98 12.82 12.669 12.532 12.429 12.311 12.115 11.977 11.844 11.782 11.657 11.503 11.328 11.237 11.097 10.957 10.863 10.748 10.462 10.306 10.159 10.002 9.792 9.55 9.197 8.003 -8 ,22294 ,KEBNE ,17125910,Thu Dec 30 17:02:37 CET,Thu Dec 30 18:36:14 CET,0.0 1.2 1.596 1.91 2.154 2.347 2.516 2.693 3.042 3.182 3.317 3.535 3.716 3.844 4.094 4.327 4.542 4.635 4.801 4.968 5.203 5.36 5.506 5.707 5.902 6.099 6.318 6.533 6.788 7.041 7.292 7.563 7.818 8.084 8.394 8.706 8.974 9.257 9.56 9.889 10.244 10.685 11.206 11.667 12.183 12.772 13.406 14.087 14.892 15.786 16.695 17.258 17.456 17.482 17.386 17.238 17.101 16.972 16.835 16.653 16.482 16.312 16.134 15.963 15.795 15.637 15.46 15.294 15.147 14.985 14.829 14.686 14.505 14.323 14.193 14.044 13.892 13.74 13.583 13.466 13.323 13.094 12.957 12.821 12.735 12.549 12.387 12.222 12.132 11.996 11.806 11.673 11.537 11.222 11.055 10.88 10.692 10.455 10.188 9.866 8.961 -9 ,2329 ,KEBNE ,17125911,Thu Dec 30 17:02:37 CET,Thu Dec 30 18:35:32 CET,0.0 1.101 1.495 1.794 2.033 2.232 2.412 2.573 2.847 2.984 3.125 3.329 3.496 3.607 3.829 4.054 4.274 4.378 4.565 4.728 4.956 5.112 5.248 5.433 5.638 5.857 6.065 6.259 6.507 6.757 6.987 7.217 7.436 7.659 7.909 8.182 8.441 8.714 9.036 9.412 9.788 10.179 10.646 11.093 11.593 12.162 12.777 13.46 14.258 15.159 16.124 16.685 16.889 16.911 16.742 16.544 16.387 16.226 16.066 15.879 15.687 15.475 15.275 15.098 14.921 14.764 14.614 14.467 14.333 14.194 14.042 13.881 13.691 13.497 13.359 13.234 13.095 12.926 12.75 12.625 12.495 12.298 12.151 12.015 11.94 11.765 11.592 11.413 11.324 11.19 11.022 10.91 10.801 10.562 10.426 10.244 10.033 9.819 9.547 9.168 7.952 -10 ,4134 ,KEBNE ,17125912,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:20 CET,0.0 0.881 1.284 1.578 1.815 2.062 2.283 2.449 2.771 2.915 3.054 3.263 3.436 3.553 3.762 3.954 4.136 4.231 4.435 4.639 4.933 5.115 5.288 5.526 5.734 5.935 6.135 6.318 6.549 6.778 7.021 7.313 7.567 7.812 8.089 8.38 8.665 8.986 9.315 9.671 10.047 10.443 10.9 11.355 11.889 12.485 13.117 13.8 14.579 15.437 16.357 17.001 17.26 17.284 17.241 17.131 16.936 16.741 16.58 16.393 16.22 16.058 15.902 15.744 15.574 15.4 15.2 15.036 14.905 14.77 14.626 14.492 14.346 14.177 14.043 13.917 13.786 13.644 13.479 13.365 13.247 13.044 12.9 12.741 12.656 12.484 12.3 12.105 12.003 11.852 11.67 11.556 11.431 11.175 11.033 10.854 10.628 10.358 10.085 9.778 9.06 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_61.txt deleted file mode 100644 index 7ad64a0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_155_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24044 ,KEBNE ,16748459,Mon Nov 29 23:57:01 CET,Tue Nov 30 01:20:56 CET,0.0 1.212 1.513 1.743 1.912 2.041 2.154 2.261 2.459 2.542 2.612 2.665 2.747 2.792 2.894 2.973 3.037 3.068 3.128 3.18 3.221 3.228 3.23 3.235 3.232 3.195 3.159 3.127 3.076 3.031 2.992 2.922 2.824 2.708 2.557 2.366 2.183 2.021 1.803 1.501 1.151 0.728 0.178 -0.401 -1.148 -2.168 -3.545 -5.314 -7.607 -10.766 -15.488 -20.566 -24.397 -27.471 -29.921 -31.975 -33.754 -35.365 -36.693 -37.943 -38.979 -39.871 -40.69 -41.438 -42.12 -42.713 -43.323 -43.855 -44.296 -44.753 -45.273 -45.734 -46.168 -46.607 -46.969 -47.327 -47.702 -48.088 -48.455 -48.693 -48.943 -49.342 -49.616 -49.89 -50.028 -50.312 -50.627 -50.964 -51.134 -51.423 -51.704 -51.912 -52.135 -52.579 -52.82 -53.112 -53.425 -53.757 -54.163 -54.704 -57.103 -2 ,29510 ,KEBNE ,16748460,Tue Nov 30 00:05:16 CET,Tue Nov 30 01:36:29 CET,0.0 1.279 1.646 1.892 2.069 2.203 2.324 2.428 2.585 2.656 2.724 2.803 2.91 2.952 3.014 3.055 3.086 3.105 3.16 3.198 3.215 3.219 3.228 3.245 3.258 3.277 3.304 3.298 3.254 3.205 3.147 3.057 2.954 2.845 2.716 2.581 2.423 2.183 1.906 1.603 1.251 0.816 0.269 -0.3 -1.036 -2.043 -3.37 -5.047 -7.312 -10.491 -15.286 -20.39 -24.204 -27.211 -29.615 -31.649 -33.388 -34.889 -36.093 -37.276 -38.314 -39.228 -40.06 -40.778 -41.406 -42.006 -42.625 -43.151 -43.597 -44.049 -44.532 -44.947 -45.372 -45.792 -46.11 -46.443 -46.782 -47.116 -47.454 -47.698 -47.956 -48.355 -48.623 -48.887 -49.018 -49.293 -49.588 -49.891 -50.051 -50.324 -50.564 -50.752 -50.962 -51.429 -51.679 -51.932 -52.234 -52.597 -53.004 -53.583 -55.322 -3 ,9877 ,KEBNE ,16748461,Tue Nov 30 00:15:45 CET,Tue Nov 30 01:49:59 CET,0.0 1.237 1.563 1.752 1.895 2.044 2.172 2.262 2.398 2.452 2.51 2.566 2.649 2.677 2.747 2.808 2.844 2.857 2.883 2.912 2.942 2.95 2.963 2.976 2.96 2.934 2.913 2.888 2.836 2.782 2.726 2.654 2.567 2.463 2.318 2.135 1.971 1.782 1.567 1.311 0.972 0.547 0.079 -0.486 -1.245 -2.157 -3.459 -5.179 -7.577 -10.9 -15.791 -21.217 -25.467 -28.781 -31.317 -33.444 -35.24 -36.793 -38.097 -39.337 -40.374 -41.297 -42.151 -42.922 -43.652 -44.298 -44.926 -45.503 -46.005 -46.515 -47.037 -47.446 -47.843 -48.243 -48.57 -48.904 -49.226 -49.582 -49.968 -50.232 -50.5 -50.904 -51.178 -51.461 -51.61 -51.903 -52.202 -52.531 -52.7 -52.974 -53.232 -53.422 -53.626 -54.085 -54.323 -54.553 -54.829 -55.19 -55.607 -56.183 -58.891 -4 ,5790 ,KEBNE ,16748462,Tue Nov 30 00:33:34 CET,Tue Nov 30 02:05:24 CET,0.0 1.106 1.442 1.693 1.873 2.016 2.158 2.28 2.476 2.543 2.601 2.671 2.78 2.831 2.918 3.002 3.072 3.102 3.163 3.205 3.264 3.295 3.312 3.342 3.358 3.376 3.384 3.362 3.299 3.225 3.148 3.026 2.926 2.849 2.717 2.544 2.351 2.108 1.826 1.493 1.148 0.741 0.175 -0.465 -1.274 -2.299 -3.632 -5.345 -7.663 -10.863 -15.686 -20.834 -24.631 -27.589 -29.957 -32.027 -33.783 -35.279 -36.551 -37.775 -38.784 -39.654 -40.445 -41.198 -41.902 -42.521 -43.158 -43.745 -44.267 -44.806 -45.328 -45.747 -46.183 -46.61 -46.92 -47.233 -47.568 -47.92 -48.284 -48.538 -48.808 -49.202 -49.466 -49.751 -49.899 -50.205 -50.531 -50.893 -51.067 -51.339 -51.586 -51.763 -51.939 -52.362 -52.61 -52.864 -53.15 -53.514 -53.914 -54.449 -56.717 -5 ,26125 ,KEBNE ,16748463,Tue Nov 30 00:59:30 CET,Tue Nov 30 02:32:42 CET,0.0 1.095 1.416 1.652 1.816 1.959 2.085 2.184 2.368 2.449 2.511 2.557 2.65 2.693 2.78 2.829 2.851 2.869 2.898 2.926 2.978 3.011 3.036 3.046 3.043 3.034 3.027 3.007 2.974 2.949 2.901 2.831 2.755 2.671 2.557 2.404 2.222 1.98 1.698 1.376 1.03 0.617 0.098 -0.505 -1.353 -2.387 -3.714 -5.44 -7.758 -10.979 -15.83 -20.968 -24.77 -27.744 -30.097 -32.094 -33.769 -35.206 -36.41 -37.574 -38.539 -39.394 -40.186 -40.912 -41.571 -42.151 -42.761 -43.352 -43.877 -44.401 -44.925 -45.337 -45.743 -46.178 -46.525 -46.862 -47.195 -47.53 -47.879 -48.135 -48.398 -48.814 -49.114 -49.405 -49.558 -49.877 -50.187 -50.497 -50.662 -50.952 -51.226 -51.421 -51.628 -52.067 -52.306 -52.572 -52.857 -53.16 -53.539 -54.109 -55.731 -6 ,20429 ,KEBNE ,16748464,Tue Nov 30 00:59:30 CET,Tue Nov 30 02:31:57 CET,0.0 1.153 1.512 1.751 1.963 2.135 2.267 2.385 2.571 2.65 2.717 2.746 2.828 2.868 2.95 3.018 3.073 3.099 3.156 3.19 3.211 3.239 3.285 3.324 3.323 3.317 3.32 3.322 3.312 3.279 3.224 3.151 3.062 2.974 2.855 2.692 2.518 2.289 2.019 1.702 1.341 0.907 0.352 -0.291 -1.126 -2.139 -3.5 -5.26 -7.577 -10.902 -15.872 -21.071 -24.882 -27.835 -30.29 -32.433 -34.228 -35.753 -36.997 -38.182 -39.156 -40.054 -40.94 -41.742 -42.443 -43.091 -43.741 -44.272 -44.755 -45.27 -45.776 -46.17 -46.587 -47.008 -47.316 -47.645 -47.976 -48.313 -48.686 -48.96 -49.239 -49.663 -49.949 -50.255 -50.412 -50.713 -51.036 -51.391 -51.569 -51.85 -52.132 -52.329 -52.526 -52.973 -53.219 -53.507 -53.819 -54.171 -54.605 -55.198 -57.903 -7 ,12542 ,KEBNE ,16748465,Tue Nov 30 01:21:20 CET,Tue Nov 30 02:45:35 CET,0.0 1.229 1.529 1.745 1.932 2.07 2.195 2.301 2.437 2.512 2.594 2.674 2.78 2.834 2.932 3.011 3.059 3.079 3.121 3.153 3.197 3.228 3.259 3.284 3.288 3.28 3.263 3.247 3.215 3.163 3.102 3.028 2.947 2.835 2.685 2.509 2.327 2.15 1.957 1.681 1.331 0.881 0.282 -0.358 -1.165 -2.168 -3.427 -5.038 -7.274 -10.429 -15.192 -20.338 -24.285 -27.356 -29.776 -31.823 -33.504 -34.938 -36.135 -37.313 -38.296 -39.139 -39.98 -40.776 -41.446 -42.021 -42.635 -43.216 -43.683 -44.122 -44.593 -44.98 -45.37 -45.77 -46.079 -46.402 -46.75 -47.125 -47.504 -47.757 -48.032 -48.47 -48.767 -49.059 -49.209 -49.522 -49.847 -50.189 -50.366 -50.654 -50.909 -51.097 -51.311 -51.764 -52.015 -52.288 -52.584 -52.948 -53.376 -53.895 -55.649 -8 ,31242 ,KEBNE ,16748466,Tue Nov 30 01:33:38 CET,Tue Nov 30 03:04:30 CET,0.0 1.351 1.665 1.879 2.048 2.191 2.307 2.399 2.559 2.631 2.696 2.773 2.879 2.928 3.014 3.072 3.113 3.138 3.188 3.205 3.215 3.227 3.242 3.254 3.249 3.232 3.202 3.167 3.126 3.095 3.075 3.032 2.948 2.847 2.724 2.561 2.372 2.146 1.866 1.554 1.2 0.731 0.161 -0.48 -1.313 -2.303 -3.589 -5.267 -7.526 -10.695 -15.62 -20.805 -24.553 -27.568 -30.035 -32.135 -33.861 -35.375 -36.654 -37.864 -38.881 -39.783 -40.618 -41.375 -42.062 -42.694 -43.357 -43.927 -44.432 -44.969 -45.51 -45.957 -46.423 -46.892 -47.241 -47.582 -47.912 -48.258 -48.637 -48.902 -49.175 -49.587 -49.859 -50.136 -50.272 -50.555 -50.863 -51.188 -51.358 -51.636 -51.892 -52.074 -52.266 -52.739 -52.987 -53.229 -53.515 -53.894 -54.313 -54.861 -56.825 -9 ,8202 ,KEBNE ,16748467,Tue Nov 30 01:36:45 CET,Tue Nov 30 03:07:40 CET,0.0 1.261 1.583 1.799 1.986 2.135 2.252 2.366 2.556 2.631 2.701 2.789 2.909 2.97 3.084 3.175 3.262 3.297 3.346 3.381 3.419 3.444 3.453 3.484 3.527 3.541 3.539 3.538 3.516 3.485 3.46 3.402 3.325 3.23 3.085 2.889 2.679 2.453 2.167 1.83 1.453 1.002 0.436 -0.228 -1.075 -2.082 -3.383 -5.099 -7.422 -10.64 -15.407 -20.469 -24.324 -27.369 -29.783 -31.814 -33.569 -35.103 -36.363 -37.575 -38.582 -39.438 -40.218 -40.948 -41.607 -42.21 -42.852 -43.403 -43.895 -44.426 -44.943 -45.352 -45.8 -46.25 -46.587 -46.944 -47.311 -47.685 -48.064 -48.328 -48.583 -48.984 -49.278 -49.572 -49.725 -50.051 -50.377 -50.699 -50.862 -51.129 -51.371 -51.559 -51.758 -52.189 -52.428 -52.7 -53.006 -53.343 -53.768 -54.353 -55.889 -10 ,19409 ,KEBNE ,16748468,Tue Nov 30 01:43:55 CET,Tue Nov 30 03:16:07 CET,0.0 2.097 2.49 2.728 2.904 3.053 3.178 3.289 3.491 3.576 3.644 3.704 3.808 3.863 3.953 4.01 4.055 4.082 4.13 4.165 4.209 4.225 4.239 4.256 4.243 4.221 4.201 4.166 4.107 4.038 3.979 3.911 3.832 3.747 3.629 3.466 3.299 3.078 2.817 2.526 2.169 1.712 1.127 0.494 -0.35 -1.411 -2.776 -4.524 -6.858 -10.046 -14.776 -19.86 -23.619 -26.603 -29.108 -31.206 -32.982 -34.575 -35.896 -37.141 -38.144 -38.99 -39.757 -40.471 -41.144 -41.764 -42.399 -42.967 -43.452 -43.959 -44.469 -44.847 -45.23 -45.619 -45.945 -46.315 -46.69 -47.084 -47.473 -47.722 -47.985 -48.394 -48.675 -48.963 -49.101 -49.394 -49.715 -50.052 -50.229 -50.519 -50.813 -51.021 -51.238 -51.723 -51.984 -52.264 -52.559 -52.883 -53.275 -53.808 -55.355 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_156_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_156_1.txt deleted file mode 100644 index 7d083772..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_156_1.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8541 ,KEBNE ,16707770,Fri Nov 26 12:25:24 CET,Fri Nov 26 15:00:49 CET,0.0 2.104 2.525 2.826 3.063 3.261 3.452 3.612 3.88 4.007 4.117 4.293 4.419 4.513 4.685 4.838 4.974 5.036 5.162 5.267 5.405 5.502 5.598 5.742 5.878 5.973 6.048 6.131 6.214 6.271 6.341 6.434 6.501 6.54 6.566 6.588 6.629 6.666 6.641 6.604 6.559 6.507 6.413 6.238 6.007 5.709 5.297 4.705 3.79 2.355 0.074 -2.488 -4.567 -6.284 -7.691 -8.9 -9.921 -10.817 -11.577 -12.335 -12.967 -13.534 -14.056 -14.517 -14.95 -15.332 -15.77 -16.174 -16.488 -16.806 -17.139 -17.414 -17.705 -18.008 -18.255 -18.52 -18.785 -19.075 -19.38 -19.57 -19.76 -20.055 -20.259 -20.489 -20.606 -20.844 -21.109 -21.386 -21.53 -21.743 -22.018 -22.204 -22.396 -22.814 -23.057 -23.3 -23.549 -23.833 -24.188 -24.711 -26.767 -4 ,11462 ,KEBNE ,16707773,Fri Nov 26 12:26:27 CET,Fri Nov 26 15:00:32 CET,0.0 3.684 4.131 4.42 4.673 4.874 5.041 5.184 5.438 5.568 5.688 5.854 5.978 6.072 6.254 6.412 6.54 6.601 6.7 6.779 6.906 7.005 7.106 7.223 7.314 7.407 7.517 7.631 7.739 7.794 7.85 7.919 7.954 7.985 8.03 8.063 8.084 8.079 8.036 7.977 7.918 7.843 7.715 7.555 7.32 6.994 6.523 5.851 4.879 3.444 1.098 -1.594 -3.689 -5.388 -6.788 -7.996 -9.026 -9.933 -10.694 -11.482 -12.142 -12.696 -13.226 -13.756 -14.222 -14.606 -15.041 -15.434 -15.754 -16.078 -16.428 -16.72 -17.01 -17.297 -17.511 -17.753 -18.008 -18.256 -18.528 -18.722 -18.927 -19.249 -19.465 -19.688 -19.801 -20.04 -20.3 -20.563 -20.695 -20.889 -21.135 -21.309 -21.497 -21.889 -22.114 -22.35 -22.601 -22.919 -23.304 -23.845 -26.207 -8 ,22656 ,KEBNE ,16707777,Fri Nov 26 12:28:31 CET,Fri Nov 26 15:02:18 CET,0.0 2.492 2.976 3.311 3.563 3.779 3.961 4.116 4.351 4.446 4.542 4.701 4.819 4.902 5.051 5.178 5.304 5.365 5.482 5.584 5.699 5.766 5.835 5.934 6.021 6.114 6.222 6.314 6.398 6.479 6.551 6.639 6.73 6.813 6.912 6.974 7.014 7.043 7.041 7.009 6.945 6.838 6.669 6.481 6.223 5.855 5.365 4.69 3.715 2.278 -0.021 -2.676 -4.748 -6.378 -7.753 -8.946 -9.944 -10.826 -11.573 -12.308 -12.937 -13.491 -14.051 -14.553 -14.983 -15.381 -15.793 -16.15 -16.452 -16.76 -17.087 -17.361 -17.654 -17.974 -18.226 -18.477 -18.718 -18.962 -19.23 -19.41 -19.606 -19.939 -20.151 -20.376 -20.502 -20.752 -21.018 -21.318 -21.469 -21.679 -21.947 -22.106 -22.268 -22.653 -22.866 -23.089 -23.348 -23.685 -24.075 -24.609 -26.857 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_156_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_156_31.txt deleted file mode 100644 index f1c62d05..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_156_31.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -5 ,14970 ,KEBNE ,16707784,Fri Nov 26 13:55:31 CET,Fri Nov 26 15:26:22 CET,0.0 1.406 1.764 2.029 2.257 2.46 2.647 2.807 3.077 3.202 3.321 3.492 3.614 3.701 3.859 4.009 4.154 4.223 4.356 4.482 4.649 4.752 4.854 5.009 5.154 5.276 5.38 5.482 5.626 5.767 5.892 6.035 6.168 6.29 6.409 6.521 6.618 6.728 6.827 6.906 6.986 7.049 7.137 7.242 7.313 7.319 7.273 7.146 6.765 5.982 4.548 2.753 1.27 -0.122 -1.298 -2.293 -3.189 -3.965 -4.59 -5.213 -5.756 -6.251 -6.74 -7.184 -7.565 -7.908 -8.28 -8.637 -8.966 -9.304 -9.641 -9.925 -10.215 -10.494 -10.716 -10.941 -11.173 -11.428 -11.699 -11.894 -12.087 -12.392 -12.61 -12.832 -12.943 -13.162 -13.397 -13.629 -13.744 -13.921 -14.162 -14.325 -14.496 -14.869 -15.084 -15.315 -15.568 -15.861 -16.237 -16.734 -18.206 -6 ,17358 ,KEBNE ,16707785,Fri Nov 26 13:55:31 CET,Fri Nov 26 15:26:51 CET,0.0 1.048 1.392 1.664 1.878 2.065 2.242 2.397 2.658 2.786 2.901 3.065 3.192 3.29 3.465 3.619 3.763 3.826 3.94 4.049 4.206 4.308 4.406 4.549 4.687 4.811 4.919 5.023 5.165 5.296 5.408 5.534 5.645 5.759 5.889 6.019 6.148 6.273 6.392 6.522 6.64 6.757 6.88 6.974 7.021 7.005 6.9 6.706 6.333 5.621 4.361 2.74 1.333 0.069 -1.021 -1.951 -2.753 -3.492 -4.151 -4.804 -5.311 -5.766 -6.219 -6.64 -7.057 -7.436 -7.836 -8.185 -8.47 -8.787 -9.125 -9.39 -9.637 -9.903 -10.115 -10.316 -10.535 -10.777 -11.02 -11.188 -11.366 -11.641 -11.833 -12.027 -12.128 -12.328 -12.551 -12.8 -12.925 -13.099 -13.308 -13.448 -13.609 -13.969 -14.17 -14.399 -14.646 -14.904 -15.224 -15.656 -16.826 -7 ,26252 ,KEBNE ,16707786,Fri Nov 26 13:55:32 CET,Fri Nov 26 15:27:39 CET,0.0 1.428 1.791 2.049 2.27 2.46 2.613 2.761 3.055 3.193 3.31 3.461 3.582 3.676 3.842 3.979 4.105 4.164 4.284 4.406 4.559 4.658 4.757 4.892 5.014 5.132 5.244 5.35 5.489 5.613 5.723 5.855 5.971 6.075 6.212 6.358 6.47 6.591 6.706 6.826 6.956 7.066 7.169 7.249 7.29 7.288 7.227 7.044 6.664 6.064 4.876 3.251 1.836 0.6 -0.429 -1.352 -2.158 -2.876 -3.495 -4.127 -4.7 -5.236 -5.757 -6.229 -6.633 -6.995 -7.377 -7.726 -8.047 -8.359 -8.688 -8.958 -9.217 -9.498 -9.708 -9.91 -10.132 -10.367 -10.607 -10.773 -10.935 -11.182 -11.36 -11.556 -11.659 -11.865 -12.067 -12.296 -12.427 -12.602 -12.82 -12.963 -13.113 -13.428 -13.604 -13.803 -14.013 -14.254 -14.592 -15.06 -16.299 -8 ,26874 ,KEBNE ,16707787,Fri Nov 26 13:55:31 CET,Fri Nov 26 15:26:36 CET,0.0 1.314 1.699 1.992 2.22 2.409 2.581 2.73 3.003 3.136 3.255 3.434 3.559 3.643 3.799 3.942 4.086 4.16 4.305 4.433 4.592 4.691 4.787 4.924 5.053 5.173 5.28 5.391 5.541 5.67 5.78 5.901 6.019 6.134 6.26 6.402 6.527 6.641 6.754 6.862 6.954 7.029 7.08 7.107 7.095 7.032 6.895 6.645 6.261 5.655 4.384 2.6 1.142 -0.089 -1.179 -2.119 -2.951 -3.734 -4.409 -5.065 -5.6 -6.076 -6.531 -6.944 -7.342 -7.713 -8.106 -8.465 -8.78 -9.105 -9.433 -9.697 -9.959 -10.221 -10.434 -10.667 -10.903 -11.13 -11.354 -11.518 -11.68 -11.936 -12.133 -12.334 -12.441 -12.672 -12.908 -13.171 -13.309 -13.495 -13.725 -13.873 -14.037 -14.38 -14.567 -14.784 -15.03 -15.315 -15.628 -16.049 -17.534 -9 ,11230 ,KEBNE ,16707788,Fri Nov 26 13:55:32 CET,Fri Nov 26 15:25:30 CET,0.0 1.095 1.43 1.679 1.893 2.07 2.232 2.377 2.595 2.697 2.794 2.938 3.05 3.128 3.271 3.404 3.532 3.593 3.715 3.831 3.974 4.059 4.14 4.255 4.361 4.453 4.551 4.664 4.802 4.91 5.01 5.143 5.269 5.371 5.477 5.604 5.719 5.837 5.96 6.062 6.145 6.236 6.344 6.422 6.464 6.449 6.328 6.114 5.759 5.089 3.801 2.151 0.724 -0.548 -1.599 -2.518 -3.293 -3.958 -4.609 -5.308 -5.868 -6.342 -6.792 -7.233 -7.657 -8.035 -8.429 -8.788 -9.082 -9.383 -9.696 -9.965 -10.235 -10.503 -10.726 -10.966 -11.212 -11.469 -11.738 -11.914 -12.092 -12.384 -12.593 -12.807 -12.915 -13.128 -13.354 -13.598 -13.722 -13.899 -14.135 -14.287 -14.449 -14.802 -14.991 -15.195 -15.443 -15.717 -16.033 -16.47 -17.919 -10 ,27550 ,KEBNE ,16707789,Fri Nov 26 13:55:32 CET,Fri Nov 26 15:26:41 CET,0.0 1.446 1.833 2.102 2.34 2.544 2.723 2.89 3.195 3.32 3.441 3.639 3.767 3.85 4.016 4.163 4.284 4.345 4.471 4.595 4.762 4.859 4.957 5.113 5.261 5.388 5.482 5.578 5.718 5.848 5.969 6.112 6.245 6.36 6.479 6.606 6.73 6.856 6.966 7.061 7.16 7.261 7.357 7.422 7.46 7.492 7.444 7.303 7.009 6.422 5.302 3.729 2.311 1.096 0.041 -0.91 -1.737 -2.511 -3.195 -3.852 -4.401 -4.886 -5.35 -5.802 -6.221 -6.617 -7.032 -7.397 -7.693 -7.974 -8.273 -8.525 -8.789 -9.076 -9.29 -9.5 -9.728 -9.962 -10.207 -10.386 -10.57 -10.864 -11.074 -11.301 -11.419 -11.659 -11.9 -12.157 -12.292 -12.481 -12.733 -12.893 -13.06 -13.413 -13.622 -13.84 -14.075 -14.361 -14.688 -15.094 -16.853 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_15_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_15_163.txt deleted file mode 100644 index b3a16a57..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_15_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26875 ,KEBNE ,16707790,Fri Nov 26 13:55:32 CET,Fri Nov 26 15:28:00 CET,0.0 0.693 0.896 1.039 1.148 1.232 1.283 1.322 1.383 1.413 1.439 1.417 1.475 1.488 1.499 1.499 1.486 1.471 1.425 1.394 1.361 1.332 1.29 1.198 1.113 1.051 0.966 0.861 0.726 0.56 0.366 0.121 -0.124 -0.375 -0.708 -1.12 -1.533 -2.016 -2.567 -3.198 -3.912 -4.791 -5.853 -6.968 -8.436 -10.3 -12.672 -15.659 -19.608 -24.976 -32.904 -41.32 -47.515 -52.277 -56.036 -59.196 -61.827 -64.057 -65.891 -67.666 -69.128 -70.363 -71.507 -72.571 -73.527 -74.372 -75.23 -76.019 -76.698 -77.346 -77.988 -78.532 -79.096 -79.674 -80.117 -80.575 -81.043 -81.539 -82.045 -82.351 -82.648 -83.121 -83.443 -83.777 -83.952 -84.3 -84.663 -85.051 -85.25 -85.591 -85.911 -86.131 -86.337 -86.807 -87.06 -87.316 -87.581 -87.871 -88.197 -88.576 -89.464 -2 ,17948 ,KEBNE ,16707791,Fri Nov 26 13:55:32 CET,Fri Nov 26 15:27:35 CET,0.0 0.779 1.013 1.169 1.279 1.354 1.423 1.488 1.551 1.565 1.586 1.56 1.606 1.61 1.605 1.581 1.566 1.563 1.557 1.537 1.488 1.453 1.413 1.317 1.188 1.061 0.928 0.781 0.592 0.411 0.221 -0.015 -0.234 -0.457 -0.766 -1.157 -1.573 -2.074 -2.633 -3.272 -3.995 -4.85 -5.944 -7.138 -8.654 -10.497 -12.843 -15.835 -19.801 -25.218 -33.141 -41.377 -47.398 -52.107 -55.877 -58.94 -61.463 -63.654 -65.489 -67.29 -68.733 -69.94 -71.109 -72.171 -73.071 -73.899 -74.785 -75.543 -76.164 -76.804 -77.467 -78.009 -78.573 -79.164 -79.624 -80.067 -80.487 -80.942 -81.424 -81.75 -82.089 -82.606 -82.946 -83.31 -83.496 -83.844 -84.19 -84.545 -84.723 -85.032 -85.286 -85.497 -85.731 -86.207 -86.451 -86.716 -86.998 -87.331 -87.725 -88.217 -89.457 -3 ,14655 ,KEBNE ,16707792,Fri Nov 26 13:55:36 CET,Fri Nov 26 15:21:09 CET,0.0 0.665 0.846 0.944 0.999 1.05 1.098 1.129 1.197 1.227 1.248 1.232 1.283 1.283 1.285 1.29 1.28 1.271 1.245 1.219 1.161 1.107 1.056 0.967 0.878 0.795 0.703 0.596 0.434 0.248 0.045 -0.19 -0.416 -0.69 -1.054 -1.429 -1.787 -2.255 -2.808 -3.41 -4.108 -4.987 -6.081 -7.26 -8.759 -10.602 -12.969 -15.896 -19.758 -25.049 -32.811 -40.923 -46.808 -51.447 -55.205 -58.276 -60.831 -63.056 -64.864 -66.597 -68.044 -69.287 -70.431 -71.521 -72.521 -73.356 -74.185 -74.933 -75.563 -76.181 -76.801 -77.315 -77.845 -78.39 -78.804 -79.234 -79.693 -80.159 -80.628 -80.946 -81.253 -81.718 -82.046 -82.379 -82.549 -82.911 -83.274 -83.645 -83.843 -84.169 -84.465 -84.698 -84.942 -85.471 -85.743 -86.028 -86.308 -86.594 -86.931 -87.376 -88.462 -4 ,5343 ,KEBNE ,16707793,Fri Nov 26 13:55:32 CET,Fri Nov 26 15:27:05 CET,0.0 0.725 0.943 1.09 1.213 1.318 1.397 1.47 1.586 1.634 1.665 1.656 1.714 1.718 1.712 1.7 1.689 1.687 1.669 1.628 1.563 1.514 1.459 1.363 1.248 1.135 1.011 0.879 0.713 0.574 0.425 0.2 -0.042 -0.297 -0.625 -1.036 -1.429 -1.883 -2.4 -2.96 -3.619 -4.472 -5.568 -6.75 -8.246 -10.074 -12.401 -15.323 -19.206 -24.51 -32.463 -40.754 -46.814 -51.514 -55.222 -58.313 -60.87 -63.095 -64.911 -66.65 -68.096 -69.335 -70.486 -71.559 -72.557 -73.418 -74.288 -75.062 -75.69 -76.312 -76.967 -77.512 -78.07 -78.641 -79.062 -79.493 -79.925 -80.352 -80.793 -81.104 -81.418 -81.899 -82.251 -82.599 -82.766 -83.13 -83.509 -83.871 -84.053 -84.374 -84.636 -84.845 -85.082 -85.592 -85.853 -86.127 -86.42 -86.716 -87.047 -87.482 -88.268 -5 ,19012 ,KEBNE ,16707794,Fri Nov 26 13:55:32 CET,Fri Nov 26 15:27:13 CET,0.0 0.663 0.879 1.051 1.161 1.237 1.29 1.335 1.429 1.464 1.489 1.483 1.536 1.541 1.532 1.516 1.503 1.494 1.47 1.433 1.349 1.286 1.217 1.117 1.016 0.901 0.771 0.656 0.51 0.342 0.156 -0.101 -0.365 -0.619 -0.939 -1.349 -1.763 -2.253 -2.806 -3.419 -4.111 -4.951 -6.034 -7.23 -8.755 -10.594 -12.917 -15.879 -19.799 -25.147 -32.997 -41.165 -47.183 -51.861 -55.583 -58.643 -61.168 -63.34 -65.092 -66.788 -68.215 -69.433 -70.573 -71.619 -72.537 -73.363 -74.228 -74.96 -75.559 -76.185 -76.854 -77.406 -77.953 -78.492 -78.897 -79.328 -79.806 -80.298 -80.782 -81.122 -81.471 -82.004 -82.361 -82.734 -82.926 -83.293 -83.668 -84.091 -84.308 -84.649 -84.954 -85.181 -85.418 -85.878 -86.123 -86.426 -86.779 -87.169 -87.624 -88.191 -89.361 -6 ,30182 ,KEBNE ,16707795,Fri Nov 26 13:55:32 CET,Fri Nov 26 15:27:24 CET,0.0 0.861 1.082 1.261 1.385 1.487 1.566 1.621 1.724 1.763 1.783 1.767 1.819 1.831 1.845 1.85 1.828 1.807 1.765 1.723 1.665 1.62 1.58 1.51 1.414 1.3 1.184 1.068 0.902 0.744 0.573 0.342 0.107 -0.141 -0.47 -0.861 -1.218 -1.616 -2.097 -2.692 -3.393 -4.176 -5.161 -6.34 -7.854 -9.695 -12.044 -14.997 -18.887 -24.178 -31.91 -39.954 -45.872 -50.478 -54.114 -57.143 -59.711 -61.943 -63.75 -65.456 -66.882 -68.123 -69.252 -70.287 -71.212 -72.035 -72.922 -73.699 -74.341 -74.983 -75.614 -76.129 -76.67 -77.232 -77.665 -78.118 -78.601 -79.104 -79.614 -79.953 -80.283 -80.743 -81.058 -81.405 -81.587 -81.973 -82.371 -82.773 -82.973 -83.298 -83.576 -83.788 -84.02 -84.531 -84.806 -85.105 -85.424 -85.783 -86.188 -86.642 -87.85 -7 ,22977 ,KEBNE ,16707796,Fri Nov 26 13:55:32 CET,Fri Nov 26 15:27:06 CET,0.0 0.8 0.995 1.144 1.269 1.354 1.42 1.48 1.571 1.607 1.637 1.624 1.674 1.671 1.658 1.645 1.628 1.622 1.599 1.561 1.492 1.448 1.405 1.34 1.254 1.159 1.071 0.98 0.852 0.712 0.556 0.344 0.092 -0.185 -0.525 -0.939 -1.353 -1.784 -2.249 -2.838 -3.552 -4.39 -5.442 -6.574 -8.009 -9.862 -12.211 -15.133 -19.007 -24.326 -32.155 -40.288 -46.186 -50.729 -54.348 -57.406 -59.94 -62.109 -63.891 -65.601 -67.013 -68.221 -69.352 -70.423 -71.392 -72.23 -73.089 -73.824 -74.456 -75.122 -75.813 -76.364 -76.927 -77.522 -77.969 -78.399 -78.82 -79.246 -79.679 -79.993 -80.327 -80.844 -81.193 -81.545 -81.719 -82.055 -82.384 -82.719 -82.915 -83.264 -83.561 -83.769 -83.981 -84.431 -84.679 -84.944 -85.209 -85.495 -85.823 -86.228 -87.134 -8 ,10543 ,KEBNE ,16707797,Fri Nov 26 13:56:32 CET,Fri Nov 26 15:27:51 CET,0.0 0.787 1.011 1.149 1.254 1.343 1.396 1.439 1.514 1.531 1.542 1.521 1.571 1.583 1.606 1.615 1.616 1.613 1.595 1.576 1.527 1.472 1.402 1.307 1.231 1.144 1.057 0.961 0.812 0.663 0.512 0.287 0.023 -0.254 -0.587 -1.007 -1.435 -1.93 -2.514 -3.155 -3.867 -4.718 -5.803 -7.0 -8.467 -10.276 -12.654 -15.629 -19.547 -24.896 -32.61 -40.588 -46.484 -51.075 -54.706 -57.755 -60.337 -62.589 -64.403 -66.125 -67.575 -68.835 -69.983 -71.012 -71.94 -72.768 -73.658 -74.444 -75.071 -75.694 -76.375 -76.964 -77.543 -78.116 -78.561 -79.025 -79.472 -79.918 -80.399 -80.73 -81.07 -81.586 -81.928 -82.263 -82.435 -82.8 -83.173 -83.536 -83.715 -84.055 -84.404 -84.625 -84.836 -85.297 -85.556 -85.831 -86.122 -86.448 -86.852 -87.386 -88.494 -9 ,16055 ,KEBNE ,16707798,Fri Nov 26 13:56:32 CET,Fri Nov 26 15:28:02 CET,0.0 0.784 1.003 1.151 1.279 1.377 1.441 1.506 1.611 1.643 1.675 1.684 1.74 1.748 1.75 1.733 1.707 1.696 1.683 1.66 1.604 1.565 1.52 1.445 1.361 1.269 1.155 1.017 0.849 0.708 0.571 0.394 0.173 -0.101 -0.444 -0.84 -1.259 -1.756 -2.296 -2.887 -3.588 -4.467 -5.522 -6.666 -8.173 -10.013 -12.349 -15.283 -19.14 -24.554 -32.538 -40.772 -46.809 -51.46 -55.193 -58.363 -60.962 -63.147 -64.985 -66.778 -68.275 -69.533 -70.678 -71.779 -72.77 -73.603 -74.455 -75.217 -75.865 -76.516 -77.164 -77.703 -78.276 -78.849 -79.269 -79.695 -80.136 -80.581 -81.036 -81.356 -81.681 -82.189 -82.558 -82.94 -83.131 -83.517 -83.928 -84.356 -84.57 -84.924 -85.243 -85.474 -85.7 -86.182 -86.438 -86.704 -87.022 -87.377 -87.77 -88.295 -89.545 -10 ,24332 ,KEBNE ,16707799,Fri Nov 26 13:56:33 CET,Fri Nov 26 15:28:21 CET,0.0 0.659 0.85 1.014 1.111 1.181 1.238 1.273 1.337 1.377 1.413 1.41 1.461 1.465 1.468 1.458 1.433 1.422 1.385 1.324 1.245 1.194 1.146 1.077 0.996 0.886 0.755 0.622 0.42 0.214 0.013 -0.239 -0.493 -0.755 -1.08 -1.439 -1.78 -2.175 -2.676 -3.303 -3.985 -4.793 -5.87 -7.06 -8.547 -10.386 -12.75 -15.682 -19.526 -24.77 -32.45 -40.538 -46.542 -51.185 -54.891 -57.985 -60.502 -62.654 -64.428 -66.165 -67.595 -68.802 -69.919 -70.969 -71.942 -72.799 -73.664 -74.436 -75.059 -75.677 -76.331 -76.864 -77.421 -78.002 -78.423 -78.842 -79.28 -79.736 -80.218 -80.536 -80.848 -81.354 -81.715 -82.066 -82.233 -82.567 -82.928 -83.329 -83.526 -83.848 -84.133 -84.345 -84.566 -85.02 -85.25 -85.514 -85.8 -86.099 -86.461 -86.897 -87.703 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_15_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_15_25.txt deleted file mode 100644 index 83925478..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_15_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27362 ,KEBNE ,16707800,Fri Nov 26 13:56:37 CET,Fri Nov 26 15:24:40 CET,0.0 2.886 3.474 3.859 4.192 4.487 4.738 4.96 5.361 5.536 5.71 6.005 6.204 6.36 6.676 6.96 7.204 7.32 7.552 7.776 8.095 8.291 8.489 8.79 9.073 9.352 9.632 9.898 10.227 10.57 10.905 11.285 11.647 11.998 12.44 12.955 13.464 14.011 14.567 15.16 15.796 16.54 17.444 18.368 19.437 20.637 22.09 23.784 25.814 28.361 31.735 34.767 36.619 37.873 38.76 39.383 39.823 40.162 40.418 40.625 40.724 40.78 40.807 40.815 40.834 40.843 40.794 40.714 40.665 40.62 40.562 40.508 40.432 40.323 40.223 40.108 39.994 39.873 39.745 39.649 39.548 39.391 39.26 39.137 39.071 38.912 38.742 38.545 38.442 38.327 38.071 37.941 37.813 37.484 37.274 37.028 36.771 36.496 36.142 35.567 32.459 -2 ,2794 ,KEBNE ,16707801,Fri Nov 26 13:56:36 CET,Fri Nov 26 15:24:17 CET,0.0 1.528 2.011 2.344 2.612 2.848 3.066 3.276 3.652 3.818 3.98 4.272 4.474 4.627 4.928 5.197 5.474 5.612 5.86 6.091 6.442 6.694 6.936 7.261 7.572 7.881 8.184 8.477 8.822 9.161 9.503 9.92 10.338 10.715 11.126 11.592 12.064 12.605 13.196 13.832 14.512 15.27 16.144 17.042 18.172 19.478 20.978 22.734 24.811 27.346 30.664 33.661 35.555 36.846 37.728 38.378 38.846 39.149 39.365 39.551 39.674 39.763 39.816 39.845 39.856 39.848 39.838 39.82 39.764 39.671 39.588 39.55 39.49 39.387 39.308 39.227 39.129 39.03 38.948 38.88 38.778 38.599 38.461 38.322 38.259 38.091 37.896 37.69 37.583 37.483 37.266 37.144 37.022 36.673 36.478 36.253 35.99 35.666 35.246 34.712 31.388 -3 ,11287 ,KEBNE ,16707802,Fri Nov 26 13:56:36 CET,Fri Nov 26 15:21:19 CET,0.0 2.239 2.758 3.156 3.49 3.796 4.052 4.276 4.667 4.848 5.023 5.306 5.502 5.65 5.935 6.205 6.467 6.596 6.846 7.103 7.457 7.672 7.901 8.25 8.577 8.883 9.157 9.403 9.71 10.012 10.329 10.719 11.094 11.461 11.902 12.404 12.861 13.383 13.963 14.588 15.273 16.004 16.826 17.695 18.731 19.919 21.351 23.026 25.099 27.647 30.917 33.87 35.706 36.924 37.805 38.438 38.872 39.192 39.426 39.616 39.735 39.789 39.813 39.797 39.769 39.771 39.753 39.72 39.695 39.648 39.586 39.54 39.495 39.443 39.387 39.303 39.205 39.106 38.956 38.847 38.767 38.634 38.529 38.397 38.319 38.162 37.984 37.769 37.669 37.563 37.33 37.212 37.06 36.695 36.504 36.299 36.065 35.797 35.485 35.003 30.827 -4 ,15174 ,KEBNE ,16707803,Fri Nov 26 13:56:32 CET,Fri Nov 26 15:27:19 CET,0.0 1.781 2.236 2.573 2.831 3.071 3.304 3.518 3.895 4.056 4.211 4.457 4.655 4.819 5.121 5.409 5.686 5.807 6.054 6.305 6.625 6.82 7.016 7.304 7.578 7.872 8.16 8.416 8.768 9.103 9.415 9.802 10.168 10.539 11.023 11.612 12.144 12.689 13.292 13.929 14.59 15.347 16.235 17.128 18.196 19.443 20.902 22.563 24.61 27.149 30.383 33.317 35.179 36.483 37.404 38.004 38.433 38.785 39.053 39.266 39.378 39.418 39.443 39.476 39.475 39.473 39.466 39.436 39.401 39.338 39.261 39.211 39.162 39.07 38.963 38.874 38.803 38.703 38.597 38.535 38.454 38.281 38.161 38.045 37.978 37.813 37.629 37.44 37.337 37.21 36.963 36.839 36.703 36.375 36.193 35.986 35.742 35.457 35.108 34.574 31.614 -5 ,10071 ,KEBNE ,16707804,Fri Nov 26 13:56:32 CET,Fri Nov 26 15:27:55 CET,0.0 1.489 1.969 2.319 2.583 2.819 3.038 3.246 3.622 3.791 3.963 4.253 4.453 4.61 4.911 5.194 5.465 5.59 5.82 6.034 6.334 6.539 6.749 7.039 7.32 7.63 7.924 8.175 8.482 8.798 9.117 9.514 9.913 10.283 10.704 11.199 11.669 12.181 12.743 13.349 14.031 14.807 15.686 16.571 17.621 18.834 20.267 21.93 23.98 26.547 29.921 32.932 34.763 35.996 36.898 37.6 38.097 38.47 38.729 38.936 39.029 39.056 39.086 39.076 39.017 38.988 38.956 38.862 38.761 38.668 38.594 38.548 38.505 38.412 38.305 38.218 38.142 38.024 37.883 37.787 37.683 37.528 37.427 37.326 37.263 37.11 36.959 36.825 36.739 36.624 36.414 36.297 36.171 35.836 35.627 35.399 35.153 34.875 34.526 33.994 31.048 -6 ,127 ,KEBNE ,16707805,Fri Nov 26 13:56:32 CET,Fri Nov 26 15:27:54 CET,0.0 1.807 2.325 2.697 3.003 3.255 3.479 3.702 4.125 4.316 4.495 4.799 5.005 5.157 5.446 5.722 5.968 6.079 6.297 6.511 6.815 7.031 7.257 7.579 7.887 8.193 8.499 8.773 9.105 9.441 9.78 10.175 10.548 10.91 11.338 11.822 12.315 12.893 13.49 14.1 14.755 15.511 16.393 17.314 18.427 19.677 21.184 22.939 25.025 27.579 30.865 33.765 35.597 36.897 37.819 38.484 38.962 39.329 39.567 39.768 39.929 40.029 40.11 40.168 40.185 40.175 40.111 40.043 40.012 39.976 39.929 39.839 39.722 39.657 39.625 39.577 39.506 39.426 39.338 39.26 39.155 38.969 38.84 38.714 38.65 38.511 38.34 38.116 38.006 37.9 37.695 37.562 37.426 37.142 36.957 36.75 36.505 36.206 35.846 35.357 31.587 -7 ,20219 ,KEBNE ,16707806,Fri Nov 26 13:56:32 CET,Fri Nov 26 15:27:19 CET,0.0 1.911 2.412 2.76 3.048 3.312 3.549 3.766 4.147 4.331 4.507 4.786 4.988 5.143 5.432 5.699 5.96 6.087 6.324 6.548 6.868 7.089 7.306 7.588 7.873 8.175 8.476 8.747 9.095 9.444 9.758 10.13 10.49 10.855 11.291 11.781 12.296 12.861 13.439 14.069 14.736 15.488 16.341 17.207 18.268 19.484 20.916 22.587 24.645 27.195 30.534 33.444 35.247 36.516 37.371 37.988 38.439 38.716 38.889 39.07 39.197 39.278 39.311 39.316 39.33 39.337 39.299 39.25 39.204 39.16 39.131 39.078 38.977 38.856 38.782 38.718 38.66 38.598 38.515 38.426 38.334 38.206 38.095 37.99 37.932 37.804 37.668 37.508 37.422 37.315 37.08 36.958 36.836 36.515 36.327 36.112 35.854 35.535 35.125 34.554 31.426 -8 ,6302 ,KEBNE ,16707807,Fri Nov 26 13:56:32 CET,Fri Nov 26 15:27:47 CET,0.0 1.914 2.393 2.768 3.055 3.309 3.532 3.737 4.143 4.331 4.509 4.789 4.986 5.144 5.427 5.688 5.934 6.053 6.301 6.545 6.911 7.15 7.363 7.662 7.984 8.298 8.594 8.895 9.259 9.581 9.885 10.268 10.642 10.997 11.416 11.892 12.338 12.834 13.398 13.998 14.638 15.4 16.315 17.242 18.331 19.531 20.967 22.664 24.68 27.205 30.507 33.463 35.345 36.589 37.508 38.236 38.738 39.118 39.41 39.636 39.776 39.885 39.97 40.016 40.05 40.079 40.087 40.071 40.062 40.045 40.01 39.969 39.915 39.856 39.805 39.738 39.644 39.539 39.417 39.326 39.23 39.049 38.928 38.817 38.726 38.507 38.325 38.168 38.078 37.959 37.677 37.503 37.33 36.999 36.799 36.56 36.305 35.987 35.595 35.024 30.404 -9 ,19565 ,KEBNE ,16707808,Fri Nov 26 13:56:32 CET,Fri Nov 26 15:26:51 CET,0.0 2.045 2.496 2.847 3.144 3.406 3.634 3.841 4.211 4.38 4.55 4.85 5.051 5.205 5.493 5.73 5.962 6.08 6.303 6.514 6.828 7.031 7.235 7.547 7.831 8.113 8.412 8.705 9.068 9.415 9.785 10.211 10.568 10.928 11.362 11.842 12.293 12.822 13.421 14.031 14.676 15.42 16.285 17.178 18.257 19.495 20.975 22.698 24.802 27.368 30.637 33.592 35.459 36.72 37.624 38.332 38.833 39.197 39.474 39.697 39.861 39.988 40.057 40.072 40.06 40.065 40.079 40.072 40.05 40.009 39.955 39.903 39.842 39.772 39.707 39.635 39.56 39.444 39.288 39.177 39.064 38.897 38.772 38.639 38.562 38.392 38.233 38.057 37.947 37.813 37.562 37.427 37.262 36.918 36.742 36.526 36.287 36.014 35.679 35.194 32.304 -10 ,29711 ,KEBNE ,16707809,Fri Nov 26 13:57:33 CET,Fri Nov 26 15:28:19 CET,0.0 1.536 2.016 2.382 2.709 2.974 3.214 3.457 3.89 4.065 4.247 4.547 4.732 4.875 5.15 5.398 5.635 5.757 6.001 6.232 6.57 6.784 6.998 7.299 7.565 7.82 8.074 8.323 8.661 8.99 9.298 9.7 10.103 10.477 10.937 11.462 11.929 12.444 13.011 13.625 14.269 15.003 15.87 16.754 17.815 19.064 20.581 22.331 24.442 26.994 30.279 33.249 35.142 36.39 37.258 37.872 38.299 38.626 38.822 38.984 39.12 39.215 39.269 39.301 39.328 39.339 39.319 39.296 39.26 39.192 39.127 39.088 39.045 38.982 38.907 38.806 38.706 38.615 38.537 38.467 38.362 38.155 38.018 37.916 37.858 37.728 37.583 37.395 37.292 37.16 36.888 36.744 36.578 36.212 36.034 35.854 35.598 35.316 35.002 34.459 32.199 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_15_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_15_252.txt deleted file mode 100644 index c16817a4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_15_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14391 ,KEBNE ,16707810,Fri Nov 26 13:57:33 CET,Fri Nov 26 15:28:57 CET,0.0 0.947 1.115 1.215 1.263 1.273 1.281 1.267 1.172 1.103 1.034 0.86 0.839 0.765 0.581 0.384 0.17 0.062 -0.167 -0.394 -0.719 -0.943 -1.168 -1.514 -1.87 -2.23 -2.593 -2.95 -3.437 -3.941 -4.448 -5.1 -5.765 -6.427 -7.268 -8.3 -9.319 -10.471 -11.776 -13.29 -15.033 -17.096 -19.62 -22.34 -25.761 -29.891 -35.063 -41.481 -49.872 -61.196 -77.539 -94.288 -106.449 -115.795 -123.234 -129.422 -134.465 -138.748 -142.237 -145.543 -148.253 -150.645 -152.913 -154.943 -156.77 -158.394 -160.024 -161.452 -162.661 -163.891 -165.159 -166.19 -167.229 -168.262 -169.055 -169.865 -170.691 -171.534 -172.375 -172.952 -173.533 -174.398 -174.983 -175.598 -175.91 -176.529 -177.166 -177.818 -178.148 -178.711 -179.2 -179.58 -179.987 -180.875 -181.309 -181.739 -182.223 -182.78 -183.464 -184.364 -186.555 -2 ,6892 ,KEBNE ,16707811,Fri Nov 26 13:57:41 CET,Fri Nov 26 15:26:14 CET,0.0 0.632 0.813 0.888 0.894 0.894 0.884 0.845 0.728 0.654 0.574 0.4 0.373 0.291 0.138 -0.019 -0.203 -0.294 -0.479 -0.685 -0.97 -1.171 -1.388 -1.72 -2.07 -2.435 -2.818 -3.213 -3.762 -4.319 -4.879 -5.6 -6.327 -7.054 -7.934 -8.983 -10.049 -11.263 -12.645 -14.202 -15.933 -17.952 -20.476 -23.235 -26.669 -30.788 -35.947 -42.364 -50.754 -62.068 -78.445 -95.321 -107.53 -116.869 -124.267 -130.403 -135.444 -139.772 -143.279 -146.597 -149.448 -151.986 -154.32 -156.452 -158.347 -159.976 -161.633 -163.093 -164.314 -165.539 -166.754 -167.751 -168.78 -169.827 -170.64 -171.469 -172.313 -173.159 -174.018 -174.596 -175.152 -175.994 -176.596 -177.213 -177.515 -178.121 -178.751 -179.406 -179.746 -180.333 -180.812 -181.176 -181.563 -182.371 -182.784 -183.228 -183.712 -184.234 -184.833 -185.625 -187.575 -3 ,5594 ,KEBNE ,16707812,Fri Nov 26 13:57:41 CET,Fri Nov 26 15:22:29 CET,0.0 0.629 0.789 0.831 0.831 0.83 0.81 0.763 0.653 0.597 0.531 0.325 0.28 0.189 0.03 -0.133 -0.296 -0.389 -0.602 -0.815 -1.14 -1.384 -1.641 -2.006 -2.354 -2.713 -3.09 -3.471 -3.996 -4.551 -5.115 -5.8 -6.502 -7.232 -8.103 -9.123 -10.155 -11.339 -12.674 -14.191 -15.908 -17.964 -20.501 -23.2 -26.581 -30.714 -35.882 -42.226 -50.576 -61.932 -78.34 -95.192 -107.543 -117.085 -124.45 -130.44 -135.364 -139.61 -143.077 -146.338 -149.013 -151.281 -153.354 -155.292 -157.092 -158.705 -160.328 -161.728 -162.928 -164.129 -165.361 -166.394 -167.435 -168.498 -169.299 -170.085 -170.894 -171.743 -172.631 -173.235 -173.85 -174.792 -175.421 -176.054 -176.376 -177.024 -177.695 -178.381 -178.724 -179.311 -179.807 -180.193 -180.578 -181.365 -181.787 -182.221 -182.652 -183.113 -183.656 -184.311 -185.939 -4 ,25671 ,KEBNE ,16707813,Fri Nov 26 13:57:33 CET,Fri Nov 26 15:28:29 CET,0.0 0.743 0.896 0.981 1.03 1.044 1.03 1.009 0.925 0.875 0.822 0.651 0.637 0.568 0.414 0.245 0.048 -0.045 -0.238 -0.445 -0.756 -0.988 -1.232 -1.597 -1.995 -2.406 -2.808 -3.2 -3.709 -4.225 -4.765 -5.463 -6.185 -6.913 -7.798 -8.855 -9.925 -11.118 -12.453 -13.989 -15.692 -17.707 -20.231 -22.958 -26.381 -30.518 -35.689 -42.126 -50.602 -61.983 -78.36 -95.225 -107.391 -116.745 -124.159 -130.276 -135.279 -139.517 -143.007 -146.366 -149.147 -151.505 -153.668 -155.657 -157.402 -158.919 -160.449 -161.773 -162.905 -164.059 -165.21 -166.148 -167.129 -168.106 -168.835 -169.592 -170.359 -171.145 -171.942 -172.472 -173.006 -173.807 -174.365 -174.941 -175.234 -175.838 -176.454 -177.09 -177.417 -177.984 -178.453 -178.824 -179.224 -180.039 -180.464 -180.924 -181.408 -181.934 -182.532 -183.296 -185.358 -5 ,12435 ,KEBNE ,16707814,Fri Nov 26 13:57:33 CET,Fri Nov 26 15:29:14 CET,0.0 0.801 0.948 1.038 1.069 1.072 1.045 1.012 0.938 0.886 0.82 0.594 0.556 0.485 0.337 0.169 -0.014 -0.1 -0.277 -0.497 -0.86 -1.095 -1.323 -1.664 -2.039 -2.442 -2.845 -3.255 -3.791 -4.302 -4.82 -5.495 -6.211 -6.953 -7.841 -8.872 -9.917 -11.127 -12.509 -14.037 -15.712 -17.75 -20.316 -23.046 -26.454 -30.601 -35.817 -42.264 -50.695 -62.082 -78.452 -95.153 -107.279 -116.624 -123.981 -130.106 -135.156 -139.481 -143.063 -146.527 -149.417 -151.895 -154.153 -156.22 -158.073 -159.707 -161.395 -162.844 -164.026 -165.229 -166.469 -167.483 -168.487 -169.505 -170.28 -171.058 -171.89 -172.735 -173.561 -174.119 -174.7 -175.595 -176.184 -176.792 -177.098 -177.704 -178.333 -178.979 -179.307 -179.868 -180.349 -180.718 -181.1 -181.91 -182.336 -182.803 -183.314 -183.86 -184.471 -185.22 -187.608 -6 ,26640 ,KEBNE ,16707815,Fri Nov 26 13:57:32 CET,Fri Nov 26 15:29:01 CET,0.0 0.713 0.893 0.992 1.043 1.042 1.033 1.009 0.919 0.853 0.79 0.62 0.59 0.502 0.303 0.12 -0.071 -0.169 -0.366 -0.568 -0.897 -1.132 -1.364 -1.728 -2.117 -2.517 -2.924 -3.325 -3.871 -4.426 -4.959 -5.596 -6.276 -6.983 -7.795 -8.736 -9.742 -10.961 -12.329 -13.864 -15.591 -17.636 -20.182 -22.934 -26.354 -30.432 -35.555 -41.958 -50.34 -61.717 -78.094 -94.885 -107.514 -117.462 -125.291 -131.814 -137.172 -141.745 -145.569 -149.197 -152.111 -154.599 -156.869 -158.905 -160.76 -162.411 -164.067 -165.536 -166.78 -168.018 -169.276 -170.297 -171.338 -172.411 -173.231 -174.051 -174.869 -175.711 -176.567 -177.148 -177.743 -178.63 -179.216 -179.824 -180.142 -180.799 -181.475 -182.156 -182.505 -183.086 -183.548 -183.921 -184.309 -185.092 -185.498 -185.923 -186.371 -186.861 -187.406 -188.061 -189.824 -7 ,15619 ,KEBNE ,16707816,Fri Nov 26 13:57:32 CET,Fri Nov 26 15:28:02 CET,0.0 0.884 1.064 1.141 1.193 1.191 1.174 1.163 1.082 1.023 0.97 0.791 0.759 0.675 0.472 0.276 0.08 -0.03 -0.261 -0.493 -0.845 -1.07 -1.317 -1.723 -2.116 -2.488 -2.857 -3.236 -3.737 -4.233 -4.744 -5.429 -6.145 -6.849 -7.713 -8.753 -9.805 -11.025 -12.399 -13.942 -15.655 -17.697 -20.251 -23.024 -26.468 -30.597 -35.8 -42.208 -50.529 -61.831 -78.301 -95.14 -107.246 -116.534 -123.868 -129.941 -134.962 -139.281 -142.799 -146.149 -148.945 -151.337 -153.57 -155.653 -157.482 -159.064 -160.661 -162.054 -163.267 -164.518 -165.745 -166.726 -167.766 -168.821 -169.604 -170.394 -171.203 -172.049 -172.895 -173.462 -174.028 -174.893 -175.471 -176.035 -176.329 -176.94 -177.571 -178.243 -178.579 -179.149 -179.629 -179.997 -180.358 -181.113 -181.531 -181.981 -182.443 -182.959 -183.575 -184.311 -186.027 -8 ,14928 ,KEBNE ,16707817,Fri Nov 26 13:57:33 CET,Fri Nov 26 15:28:20 CET,0.0 0.683 0.816 0.868 0.904 0.911 0.915 0.898 0.823 0.777 0.73 0.58 0.552 0.472 0.296 0.12 -0.051 -0.14 -0.333 -0.557 -0.928 -1.182 -1.432 -1.813 -2.192 -2.561 -2.943 -3.345 -3.905 -4.471 -5.036 -5.743 -6.445 -7.156 -8.044 -9.1 -10.16 -11.364 -12.722 -14.261 -15.989 -18.028 -20.546 -23.274 -26.704 -30.852 -36.027 -42.453 -50.86 -62.225 -78.618 -95.438 -107.702 -117.107 -124.48 -130.565 -135.531 -139.757 -143.319 -146.836 -149.739 -152.213 -154.488 -156.546 -158.37 -159.949 -161.561 -162.942 -164.085 -165.273 -166.502 -167.501 -168.511 -169.554 -170.344 -171.108 -171.888 -172.711 -173.537 -174.099 -174.682 -175.559 -176.154 -176.777 -177.1 -177.743 -178.391 -179.061 -179.396 -179.961 -180.419 -180.77 -181.138 -181.919 -182.332 -182.761 -183.226 -183.756 -184.37 -185.152 -187.31 -9 ,6242 ,KEBNE ,16707818,Fri Nov 26 13:57:33 CET,Fri Nov 26 15:28:12 CET,0.0 0.799 0.964 1.061 1.106 1.117 1.094 1.056 0.96 0.908 0.854 0.661 0.616 0.528 0.359 0.176 -0.023 -0.121 -0.33 -0.553 -0.902 -1.128 -1.352 -1.686 -2.007 -2.322 -2.652 -3.027 -3.547 -4.043 -4.561 -5.25 -5.949 -6.667 -7.535 -8.543 -9.571 -10.77 -12.121 -13.635 -15.339 -17.394 -19.942 -22.659 -26.049 -30.139 -35.272 -41.642 -50.008 -61.334 -77.687 -94.461 -106.573 -115.847 -123.165 -129.278 -134.339 -138.632 -142.087 -145.338 -148.015 -150.321 -152.451 -154.402 -156.165 -157.731 -159.338 -160.718 -161.89 -163.073 -164.237 -165.184 -166.149 -167.125 -167.867 -168.613 -169.367 -170.146 -170.942 -171.475 -172.019 -172.847 -173.416 -174.008 -174.299 -174.873 -175.447 -176.045 -176.356 -176.903 -177.353 -177.702 -178.054 -178.767 -179.126 -179.519 -179.94 -180.402 -180.933 -181.631 -183.389 -10 ,4873 ,KEBNE ,16707819,Fri Nov 26 13:57:33 CET,Fri Nov 26 15:28:20 CET,0.0 0.648 0.804 0.868 0.919 0.967 0.965 0.948 0.888 0.841 0.79 0.613 0.572 0.486 0.308 0.123 -0.067 -0.166 -0.364 -0.569 -0.931 -1.189 -1.451 -1.857 -2.262 -2.665 -3.063 -3.466 -4.018 -4.551 -5.074 -5.767 -6.461 -7.175 -8.087 -9.154 -10.219 -11.456 -12.861 -14.41 -16.134 -18.231 -20.816 -23.523 -26.902 -31.02 -36.18 -42.608 -51.043 -62.447 -78.914 -95.704 -107.87 -117.222 -124.611 -130.722 -135.679 -139.91 -143.376 -146.715 -149.568 -152.045 -154.279 -156.285 -158.111 -159.748 -161.397 -162.85 -164.085 -165.326 -166.583 -167.603 -168.612 -169.624 -170.411 -171.21 -172.031 -172.877 -173.735 -174.309 -174.886 -175.771 -176.369 -176.968 -177.265 -177.856 -178.465 -179.114 -179.449 -180.02 -180.519 -180.895 -181.279 -182.095 -182.521 -182.996 -183.512 -184.058 -184.679 -185.401 -187.09 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_164.txt deleted file mode 100644 index d8ee4d08..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9317 ,KEBNE ,16707820,Fri Nov 26 13:57:33 CET,Fri Nov 26 15:29:51 CET,0.0 0.675 0.996 1.27 1.498 1.698 1.886 2.067 2.395 2.545 2.684 2.793 3.053 3.176 3.405 3.634 3.855 3.958 4.149 4.338 4.626 4.813 4.992 5.245 5.483 5.72 5.949 6.17 6.442 6.706 6.992 7.345 7.674 7.983 8.334 8.723 9.104 9.545 10.024 10.505 11.013 11.603 12.301 13.009 13.844 14.8 15.958 17.331 18.85 20.512 22.56 24.374 25.414 26.007 26.404 26.666 26.83 26.915 26.926 26.867 26.763 26.662 26.598 26.529 26.418 26.293 26.174 26.077 26.002 25.915 25.805 25.723 25.633 25.531 25.438 25.327 25.207 25.08 24.93 24.814 24.696 24.518 24.396 24.253 24.175 24.03 23.862 23.674 23.589 23.388 23.309 23.202 23.078 22.81 22.666 22.491 22.287 22.066 21.81 21.483 20.336 -2 ,22010 ,KEBNE ,16707821,Fri Nov 26 13:57:33 CET,Fri Nov 26 15:27:47 CET,0.0 1.042 1.417 1.728 1.976 2.192 2.395 2.58 2.915 3.07 3.222 3.38 3.642 3.764 3.995 4.218 4.435 4.548 4.765 4.954 5.223 5.398 5.576 5.843 6.096 6.323 6.546 6.77 7.059 7.326 7.559 7.833 8.098 8.376 8.712 9.072 9.43 9.842 10.284 10.754 11.284 11.918 12.649 13.344 14.109 14.985 16.0 17.121 18.458 19.999 21.877 23.447 24.315 24.797 25.074 25.21 25.291 25.32 25.303 25.262 25.173 25.079 24.977 24.855 24.744 24.642 24.509 24.359 24.223 24.104 23.977 23.851 23.71 23.573 23.461 23.335 23.204 23.062 22.907 22.81 22.721 22.574 22.473 22.37 22.308 22.172 22.028 21.874 21.796 21.599 21.526 21.43 21.324 21.08 20.939 20.777 20.591 20.391 20.15 19.797 18.752 -3 ,18314 ,KEBNE ,16707822,Fri Nov 26 13:57:33 CET,Fri Nov 26 15:28:20 CET,0.0 0.898 1.271 1.567 1.82 1.992 2.163 2.322 2.592 2.726 2.866 3.012 3.281 3.412 3.649 3.867 4.079 4.177 4.368 4.553 4.834 5.025 5.203 5.449 5.693 5.92 6.141 6.364 6.648 6.918 7.177 7.51 7.83 8.128 8.478 8.851 9.192 9.567 9.985 10.454 10.97 11.579 12.278 12.979 13.829 14.781 15.861 17.07 18.531 20.291 22.442 24.226 25.27 25.849 26.133 26.285 26.381 26.438 26.437 26.383 26.305 26.227 26.137 26.016 25.879 25.755 25.621 25.481 25.342 25.202 25.061 24.942 24.824 24.681 24.556 24.425 24.286 24.151 24.016 23.916 23.821 23.674 23.549 23.412 23.343 23.198 23.043 22.869 22.774 22.567 22.491 22.39 22.282 22.04 21.909 21.746 21.545 21.33 21.082 20.735 19.718 -4 ,4769 ,KEBNE ,16707823,Fri Nov 26 13:58:34 CET,Fri Nov 26 15:29:05 CET,0.0 0.949 1.251 1.502 1.728 1.93 2.104 2.269 2.586 2.729 2.868 3.003 3.264 3.386 3.61 3.816 4.026 4.133 4.344 4.546 4.825 4.996 5.165 5.412 5.638 5.848 6.054 6.266 6.548 6.82 7.085 7.408 7.69 7.965 8.307 8.682 9.028 9.401 9.82 10.277 10.763 11.308 11.976 12.65 13.471 14.458 15.593 16.81 18.179 19.794 21.591 23.023 23.931 24.493 24.775 24.901 24.957 24.975 24.912 24.797 24.717 24.642 24.552 24.476 24.389 24.287 24.182 24.056 23.914 23.776 23.646 23.536 23.409 23.265 23.153 23.03 22.889 22.733 22.583 22.496 22.399 22.235 22.111 21.984 21.925 21.807 21.683 21.52 21.426 21.23 21.158 21.048 20.929 20.672 20.525 20.367 20.184 19.953 19.686 19.353 18.178 -5 ,1386 ,KEBNE ,16707824,Fri Nov 26 13:58:34 CET,Fri Nov 26 15:29:00 CET,0.0 1.074 1.455 1.765 2.048 2.274 2.471 2.653 2.987 3.15 3.292 3.426 3.684 3.809 4.057 4.286 4.492 4.594 4.791 4.987 5.289 5.472 5.642 5.901 6.152 6.391 6.627 6.862 7.173 7.451 7.701 8.019 8.336 8.637 8.98 9.377 9.774 10.212 10.692 11.196 11.729 12.367 13.125 13.872 14.718 15.654 16.756 18.017 19.472 21.255 23.489 25.19 26.084 26.652 27.017 27.238 27.353 27.414 27.457 27.488 27.477 27.427 27.364 27.291 27.21 27.127 27.031 26.932 26.854 26.777 26.696 26.626 26.525 26.394 26.299 26.205 26.11 25.995 25.855 25.765 25.682 25.541 25.442 25.358 25.306 25.172 25.022 24.868 24.791 24.6 24.533 24.427 24.33 24.117 23.966 23.784 23.569 23.337 23.096 22.734 21.586 -6 ,12132 ,KEBNE ,16707825,Fri Nov 26 13:58:34 CET,Fri Nov 26 15:29:43 CET,0.0 0.92 1.282 1.566 1.804 1.997 2.161 2.322 2.633 2.776 2.909 3.038 3.289 3.402 3.616 3.822 4.031 4.131 4.312 4.498 4.774 4.94 5.106 5.354 5.579 5.802 6.015 6.225 6.507 6.767 7.016 7.326 7.631 7.927 8.275 8.668 9.042 9.444 9.871 10.329 10.836 11.455 12.178 12.871 13.676 14.592 15.69 16.916 18.25 19.785 21.659 23.116 23.912 24.411 24.706 24.823 24.808 24.777 24.75 24.676 24.566 24.462 24.346 24.21 24.085 23.97 23.843 23.73 23.613 23.47 23.319 23.192 23.044 22.877 22.753 22.625 22.508 22.404 22.293 22.211 22.11 21.936 21.808 21.68 21.624 21.499 21.362 21.215 21.132 20.927 20.836 20.725 20.616 20.38 20.244 20.097 19.923 19.727 19.491 19.136 17.976 -7 ,4124 ,KEBNE ,16707826,Fri Nov 26 13:58:34 CET,Fri Nov 26 15:29:38 CET,0.0 0.983 1.408 1.708 1.93 2.132 2.326 2.517 2.865 3.017 3.161 3.316 3.572 3.697 3.936 4.154 4.363 4.461 4.653 4.837 5.088 5.255 5.424 5.654 5.88 6.114 6.344 6.575 6.868 7.14 7.394 7.715 8.035 8.356 8.74 9.128 9.475 9.885 10.345 10.798 11.256 11.766 12.362 12.986 13.731 14.578 15.598 16.743 18.046 19.615 21.47 22.893 23.745 24.246 24.58 24.819 24.926 24.921 24.907 24.903 24.854 24.764 24.673 24.598 24.528 24.443 24.339 24.246 24.115 23.979 23.861 23.763 23.652 23.539 23.45 23.341 23.225 23.102 22.96 22.861 22.758 22.591 22.484 22.376 22.307 22.168 22.029 21.872 21.798 21.612 21.535 21.427 21.313 21.065 20.917 20.759 20.586 20.37 20.116 19.779 18.944 -8 ,29154 ,KEBNE ,16707827,Fri Nov 26 13:58:34 CET,Fri Nov 26 15:29:53 CET,0.0 0.935 1.283 1.543 1.777 1.996 2.195 2.384 2.737 2.897 3.049 3.197 3.461 3.587 3.835 4.07 4.288 4.392 4.591 4.779 5.048 5.206 5.362 5.604 5.832 6.055 6.271 6.482 6.769 7.049 7.315 7.647 7.967 8.281 8.648 9.054 9.455 9.922 10.441 10.945 11.44 12.022 12.714 13.384 14.118 14.954 15.924 17.086 18.514 20.077 21.92 23.429 24.254 24.757 25.037 25.148 25.2 25.184 25.128 25.076 24.993 24.887 24.779 24.679 24.572 24.442 24.311 24.219 24.124 24.008 23.889 23.791 23.679 23.556 23.465 23.368 23.262 23.161 23.031 22.925 22.814 22.639 22.529 22.411 22.346 22.209 22.061 21.895 21.801 21.596 21.519 21.411 21.293 21.028 20.881 20.728 20.553 20.346 20.066 19.695 18.606 -9 ,27462 ,KEBNE ,16707828,Fri Nov 26 13:58:34 CET,Fri Nov 26 15:29:18 CET,0.0 0.965 1.362 1.669 1.93 2.156 2.347 2.52 2.828 2.97 3.099 3.209 3.465 3.587 3.826 4.06 4.279 4.383 4.596 4.799 5.076 5.236 5.38 5.579 5.784 6.01 6.226 6.44 6.715 6.971 7.224 7.538 7.84 8.127 8.45 8.82 9.185 9.58 10.008 10.452 10.926 11.514 12.22 12.866 13.591 14.467 15.492 16.64 17.983 19.673 21.83 23.516 24.432 24.945 25.263 25.464 25.536 25.533 25.486 25.405 25.285 25.163 25.073 24.971 24.855 24.749 24.643 24.557 24.471 24.368 24.267 24.185 24.083 23.963 23.863 23.762 23.652 23.517 23.361 23.256 23.148 22.979 22.866 22.75 22.686 22.55 22.402 22.238 22.159 21.96 21.871 21.767 21.656 21.407 21.265 21.093 20.905 20.707 20.45 20.11 19.035 -10 ,14891 ,KEBNE ,16707829,Fri Nov 26 13:58:34 CET,Fri Nov 26 15:30:13 CET,0.0 1.092 1.511 1.78 2.003 2.21 2.404 2.586 2.918 3.069 3.209 3.337 3.577 3.689 3.9 4.102 4.291 4.387 4.577 4.753 5.009 5.175 5.339 5.567 5.793 6.033 6.267 6.482 6.747 6.997 7.242 7.545 7.847 8.149 8.504 8.906 9.286 9.69 10.137 10.635 11.168 11.76 12.464 13.156 13.94 14.795 15.733 16.814 18.125 19.726 21.631 23.146 23.963 24.432 24.692 24.829 24.888 24.893 24.861 24.798 24.73 24.66 24.571 24.47 24.368 24.268 24.156 24.054 23.965 23.855 23.736 23.64 23.545 23.439 23.342 23.228 23.1 22.976 22.851 22.755 22.655 22.498 22.382 22.257 22.198 22.078 21.945 21.802 21.722 21.522 21.426 21.316 21.201 20.944 20.798 20.632 20.423 20.206 19.968 19.635 18.434 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_165.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_165.txt deleted file mode 100644 index 0cad81ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_165.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6680 ,KEBNE ,16707830,Fri Nov 26 13:58:38 CET,Fri Nov 26 15:26:32 CET,0.0 0.987 1.34 1.608 1.855 2.091 2.311 2.513 2.863 3.014 3.156 3.287 3.548 3.682 3.919 4.113 4.305 4.4 4.583 4.758 5.019 5.185 5.336 5.556 5.771 5.979 6.177 6.383 6.652 6.914 7.172 7.46 7.737 8.014 8.327 8.67 8.997 9.364 9.764 10.176 10.602 11.095 11.681 12.286 13.006 13.808 14.743 15.772 16.922 18.252 19.792 20.989 21.661 22.0 22.135 22.16 22.136 22.114 22.113 22.087 22.039 21.987 21.905 21.814 21.73 21.65 21.549 21.418 21.31 21.219 21.117 21.022 20.925 20.831 20.752 20.658 20.548 20.42 20.293 20.204 20.107 19.958 19.86 19.742 19.674 19.543 19.419 19.286 19.218 19.036 18.998 18.908 18.801 18.553 18.414 18.267 18.106 17.95 17.77 17.468 16.808 -2 ,22479 ,KEBNE ,16707831,Fri Nov 26 13:58:33 CET,Fri Nov 26 15:29:42 CET,0.0 0.835 1.201 1.472 1.711 1.915 2.102 2.277 2.617 2.773 2.918 3.068 3.347 3.48 3.717 3.934 4.148 4.247 4.431 4.612 4.887 5.063 5.221 5.439 5.664 5.887 6.09 6.289 6.553 6.797 7.018 7.296 7.573 7.844 8.156 8.502 8.852 9.238 9.639 10.071 10.539 11.053 11.622 12.203 12.912 13.666 14.525 15.525 16.679 18.076 19.754 21.006 21.713 22.135 22.4 22.532 22.537 22.455 22.348 22.27 22.198 22.102 21.982 21.849 21.714 21.595 21.483 21.379 21.276 21.159 21.008 20.877 20.773 20.656 20.535 20.397 20.264 20.151 20.041 19.956 19.871 19.733 19.637 19.545 19.494 19.379 19.257 19.131 19.064 18.871 18.812 18.712 18.605 18.387 18.265 18.127 17.984 17.816 17.586 17.309 16.65 -3 ,1454 ,KEBNE ,16707832,Fri Nov 26 13:58:33 CET,Fri Nov 26 15:30:03 CET,0.0 0.968 1.282 1.515 1.714 1.894 2.063 2.22 2.505 2.643 2.766 2.871 3.118 3.226 3.423 3.613 3.788 3.881 4.071 4.244 4.476 4.635 4.802 5.038 5.251 5.448 5.647 5.846 6.097 6.328 6.572 6.905 7.231 7.549 7.902 8.251 8.573 8.929 9.281 9.667 10.107 10.594 11.161 11.738 12.395 13.103 13.923 14.87 15.956 17.195 18.66 19.742 20.289 20.599 20.794 20.846 20.812 20.775 20.726 20.659 20.59 20.518 20.415 20.295 20.177 20.066 19.923 19.78 19.675 19.564 19.445 19.352 19.244 19.107 18.986 18.857 18.729 18.585 18.437 18.34 18.233 18.066 17.954 17.834 17.77 17.637 17.496 17.354 17.277 17.08 17.02 16.926 16.829 16.607 16.48 16.338 16.18 15.997 15.777 15.467 14.476 -4 ,21182 ,KEBNE ,16707833,Fri Nov 26 13:58:34 CET,Fri Nov 26 15:29:32 CET,0.0 0.745 1.085 1.36 1.589 1.795 1.993 2.171 2.462 2.599 2.729 2.832 3.064 3.16 3.364 3.572 3.769 3.864 4.056 4.249 4.54 4.712 4.87 5.095 5.324 5.544 5.745 5.939 6.186 6.433 6.674 6.969 7.251 7.511 7.813 8.164 8.514 8.904 9.311 9.734 10.201 10.708 11.245 11.79 12.443 13.196 14.057 15.028 16.177 17.541 19.094 20.269 20.917 21.26 21.417 21.491 21.517 21.429 21.26 21.096 20.948 20.782 20.623 20.502 20.392 20.263 20.128 20.023 19.921 19.808 19.694 19.605 19.518 19.407 19.318 19.233 19.144 19.045 18.917 18.822 18.732 18.6 18.51 18.4 18.338 18.229 18.12 17.993 17.918 17.725 17.667 17.572 17.478 17.266 17.129 16.978 16.829 16.66 16.45 16.116 15.056 -5 ,11238 ,KEBNE ,16707834,Fri Nov 26 13:58:33 CET,Fri Nov 26 15:30:51 CET,0.0 1.108 1.449 1.682 1.867 2.031 2.194 2.356 2.635 2.767 2.898 3.006 3.239 3.339 3.545 3.762 3.974 4.07 4.266 4.455 4.722 4.892 5.051 5.283 5.517 5.74 5.956 6.173 6.444 6.697 6.945 7.246 7.539 7.846 8.227 8.617 8.943 9.28 9.655 10.07 10.494 10.97 11.553 12.161 12.873 13.627 14.453 15.359 16.445 17.762 19.25 20.396 20.972 21.287 21.419 21.426 21.432 21.405 21.344 21.222 21.067 20.954 20.85 20.727 20.609 20.505 20.382 20.255 20.15 20.037 19.924 19.829 19.728 19.626 19.527 19.403 19.274 19.147 19.024 18.933 18.834 18.676 18.565 18.443 18.373 18.232 18.075 17.897 17.81 17.614 17.546 17.448 17.347 17.109 16.978 16.841 16.674 16.47 16.246 15.961 15.228 -6 ,13517 ,KEBNE ,16707835,Fri Nov 26 13:58:33 CET,Fri Nov 26 15:29:30 CET,0.0 0.857 1.164 1.399 1.614 1.819 1.982 2.128 2.403 2.539 2.668 2.745 2.978 3.089 3.29 3.472 3.643 3.726 3.891 4.051 4.284 4.441 4.584 4.805 5.057 5.288 5.49 5.675 5.908 6.156 6.413 6.695 6.966 7.232 7.509 7.83 8.149 8.495 8.868 9.261 9.68 10.16 10.712 11.276 11.946 12.69 13.571 14.577 15.762 17.096 18.622 19.888 20.509 20.823 21.022 21.109 21.109 21.058 20.961 20.829 20.723 20.64 20.552 20.462 20.38 20.282 20.164 20.053 19.937 19.807 19.677 19.577 19.469 19.331 19.221 19.126 19.025 18.914 18.797 18.705 18.599 18.429 18.309 18.188 18.132 18.016 17.876 17.715 17.635 17.437 17.373 17.279 17.177 16.945 16.818 16.677 16.53 16.376 16.156 15.867 14.993 -7 ,25447 ,KEBNE ,16707836,Fri Nov 26 13:59:35 CET,Fri Nov 26 15:31:27 CET,0.0 1.098 1.508 1.798 2.022 2.229 2.423 2.612 2.961 3.112 3.247 3.364 3.612 3.729 3.956 4.161 4.344 4.433 4.612 4.779 5.012 5.165 5.319 5.552 5.768 5.979 6.179 6.356 6.58 6.807 7.034 7.31 7.575 7.821 8.105 8.439 8.755 9.155 9.673 10.161 10.59 11.09 11.667 12.245 12.972 13.789 14.682 15.672 16.86 18.335 20.091 21.307 21.901 22.223 22.383 22.469 22.49 22.475 22.424 22.311 22.191 22.078 21.93 21.788 21.673 21.546 21.4 21.268 21.148 21.014 20.897 20.813 20.69 20.558 20.464 20.374 20.29 20.188 20.064 19.968 19.864 19.718 19.618 19.494 19.426 19.289 19.136 18.96 18.87 18.667 18.595 18.504 18.41 18.172 18.021 17.86 17.707 17.535 17.306 17.0 16.025 -8 ,10700 ,KEBNE ,16707837,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:31:06 CET,0.0 0.825 1.149 1.417 1.623 1.8 1.969 2.128 2.42 2.55 2.682 2.822 3.077 3.193 3.411 3.608 3.789 3.885 4.073 4.252 4.517 4.689 4.858 5.093 5.31 5.518 5.729 5.935 6.199 6.446 6.689 7.009 7.321 7.59 7.892 8.249 8.562 8.883 9.252 9.679 10.156 10.678 11.25 11.825 12.532 13.343 14.263 15.283 16.482 17.839 19.372 20.538 21.162 21.529 21.747 21.867 21.889 21.847 21.805 21.758 21.656 21.511 21.353 21.225 21.129 21.015 20.877 20.753 20.632 20.524 20.428 20.332 20.232 20.125 20.047 19.965 19.874 19.756 19.612 19.519 19.425 19.288 19.194 19.072 19.001 18.876 18.745 18.604 18.54 18.358 18.327 18.239 18.14 17.931 17.809 17.681 17.536 17.354 17.155 16.84 15.794 -9 ,6958 ,KEBNE ,16707838,Fri Nov 26 13:59:38 CET,Fri Nov 26 15:27:03 CET,0.0 0.686 0.991 1.233 1.446 1.637 1.813 1.969 2.247 2.383 2.52 2.644 2.886 2.987 3.187 3.38 3.556 3.646 3.827 3.996 4.253 4.429 4.602 4.837 5.045 5.248 5.455 5.649 5.896 6.145 6.386 6.665 6.922 7.173 7.478 7.83 8.161 8.54 8.964 9.393 9.85 10.387 10.993 11.568 12.242 13.016 13.895 14.875 16.007 17.343 18.926 20.161 20.826 21.155 21.313 21.41 21.435 21.385 21.292 21.18 21.081 20.987 20.903 20.821 20.705 20.577 20.471 20.391 20.311 20.201 20.094 20.009 19.902 19.795 19.702 19.585 19.463 19.34 19.203 19.104 19.001 18.838 18.715 18.598 18.543 18.418 18.27 18.107 18.021 17.825 17.764 17.666 17.558 17.317 17.188 17.047 16.899 16.702 16.461 16.151 15.351 -10 ,16534 ,KEBNE ,16707839,Fri Nov 26 13:59:42 CET,Fri Nov 26 15:27:10 CET,0.0 0.742 1.046 1.293 1.504 1.671 1.831 1.982 2.254 2.391 2.515 2.607 2.846 2.954 3.171 3.392 3.595 3.689 3.868 4.032 4.28 4.44 4.594 4.825 5.037 5.246 5.45 5.64 5.887 6.121 6.35 6.629 6.895 7.153 7.463 7.805 8.115 8.466 8.87 9.291 9.714 10.187 10.761 11.351 12.051 12.851 13.701 14.604 15.684 16.948 18.406 19.54 20.131 20.472 20.661 20.734 20.736 20.683 20.605 20.515 20.409 20.277 20.15 20.028 19.887 19.748 19.58 19.459 19.386 19.296 19.19 19.093 18.997 18.889 18.779 18.65 18.534 18.429 18.326 18.251 18.169 18.044 17.947 17.839 17.783 17.674 17.547 17.396 17.319 17.135 17.09 17.004 16.91 16.686 16.561 16.426 16.285 16.136 15.943 15.642 14.977 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_231.txt deleted file mode 100644 index ac1c78f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14964 ,KEBNE ,17125913,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:37:32 CET,0.0 0.756 1.083 1.324 1.518 1.688 1.842 1.962 2.199 2.313 2.414 2.469 2.691 2.775 2.946 3.097 3.251 3.329 3.47 3.595 3.763 3.868 3.967 4.121 4.275 4.4 4.526 4.65 4.799 4.947 5.075 5.233 5.385 5.527 5.702 5.873 6.043 6.261 6.457 6.617 6.761 6.899 7.056 7.18 7.293 7.401 7.459 7.43 7.283 6.939 6.135 4.957 3.852 2.865 2.013 1.276 0.617 0.007 -0.528 -1.07 -1.536 -1.958 -2.366 -2.751 -3.097 -3.436 -3.811 -4.107 -4.347 -4.625 -4.919 -5.143 -5.366 -5.622 -5.818 -6.009 -6.229 -6.449 -6.694 -6.865 -7.013 -7.243 -7.415 -7.594 -7.684 -7.886 -8.116 -8.366 -8.494 -8.771 -8.88 -9.011 -9.134 -9.408 -9.571 -9.753 -9.964 -10.217 -10.492 -10.858 -11.921 -2 ,5902 ,KEBNE ,17125914,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:20 CET,0.0 1.078 1.4 1.652 1.868 2.032 2.177 2.312 2.568 2.69 2.784 2.811 3.013 3.089 3.251 3.383 3.496 3.55 3.663 3.778 3.933 4.034 4.135 4.285 4.416 4.526 4.629 4.74 4.885 4.994 5.096 5.222 5.323 5.426 5.553 5.677 5.793 5.914 6.051 6.188 6.313 6.437 6.542 6.621 6.685 6.706 6.674 6.583 6.384 5.95 5.08 3.956 2.956 2.097 1.372 0.684 0.074 -0.461 -0.933 -1.412 -1.804 -2.181 -2.549 -2.872 -3.17 -3.426 -3.687 -3.911 -4.108 -4.339 -4.607 -4.844 -5.061 -5.265 -5.447 -5.641 -5.839 -6.045 -6.243 -6.375 -6.514 -6.751 -6.922 -7.087 -7.175 -7.358 -7.558 -7.788 -7.897 -8.143 -8.243 -8.369 -8.5 -8.803 -8.974 -9.145 -9.346 -9.574 -9.859 -10.24 -11.324 -3 ,18514 ,KEBNE ,17125915,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:39 CET,0.0 0.819 1.084 1.262 1.437 1.599 1.729 1.837 2.025 2.114 2.216 2.272 2.48 2.562 2.736 2.901 3.063 3.141 3.265 3.383 3.552 3.663 3.77 3.891 3.992 4.096 4.197 4.292 4.407 4.51 4.627 4.769 4.884 4.99 5.107 5.218 5.319 5.433 5.557 5.68 5.79 5.915 6.038 6.125 6.21 6.257 6.244 6.187 6.022 5.603 4.722 3.589 2.578 1.628 0.808 0.084 -0.532 -1.06 -1.532 -2.001 -2.413 -2.784 -3.157 -3.51 -3.808 -4.073 -4.395 -4.688 -4.93 -5.205 -5.511 -5.77 -6.013 -6.25 -6.456 -6.657 -6.838 -7.041 -7.271 -7.424 -7.576 -7.804 -7.945 -8.099 -8.192 -8.393 -8.611 -8.843 -8.962 -9.227 -9.346 -9.48 -9.607 -9.889 -10.05 -10.238 -10.477 -10.728 -11.017 -11.458 -12.323 -4 ,4923 ,KEBNE ,17125916,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:37 CET,0.0 0.901 1.186 1.408 1.587 1.738 1.888 2.031 2.278 2.381 2.479 2.535 2.747 2.831 2.981 3.118 3.251 3.318 3.457 3.581 3.739 3.834 3.928 4.073 4.221 4.384 4.531 4.646 4.813 4.986 5.126 5.277 5.413 5.551 5.712 5.863 6.014 6.206 6.393 6.545 6.679 6.82 6.979 7.111 7.229 7.334 7.446 7.489 7.366 7.023 6.236 5.118 4.073 3.099 2.264 1.525 0.875 0.299 -0.177 -0.662 -1.089 -1.462 -1.824 -2.173 -2.498 -2.794 -3.1 -3.39 -3.658 -3.933 -4.219 -4.461 -4.703 -4.944 -5.133 -5.337 -5.543 -5.751 -5.974 -6.139 -6.306 -6.551 -6.729 -6.919 -7.015 -7.221 -7.447 -7.685 -7.811 -8.098 -8.258 -8.406 -8.553 -8.889 -9.078 -9.288 -9.517 -9.753 -10.023 -10.416 -11.542 -5 ,13551 ,KEBNE ,17125917,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:35:28 CET,0.0 0.771 1.015 1.223 1.42 1.578 1.72 1.854 2.116 2.241 2.358 2.434 2.656 2.735 2.897 3.059 3.21 3.291 3.445 3.591 3.778 3.886 3.997 4.143 4.266 4.391 4.514 4.637 4.784 4.908 5.014 5.154 5.31 5.441 5.564 5.7 5.86 6.047 6.229 6.399 6.549 6.679 6.8 6.938 7.092 7.191 7.249 7.21 7.034 6.681 5.936 4.825 3.795 2.857 2.072 1.372 0.712 0.085 -0.471 -0.979 -1.384 -1.748 -2.121 -2.492 -2.821 -3.11 -3.413 -3.688 -3.938 -4.226 -4.514 -4.74 -5.001 -5.278 -5.479 -5.688 -5.896 -6.125 -6.383 -6.547 -6.707 -6.958 -7.135 -7.331 -7.428 -7.622 -7.834 -8.071 -8.197 -8.465 -8.556 -8.685 -8.832 -9.187 -9.378 -9.575 -9.798 -10.052 -10.352 -10.757 -11.795 -6 ,28506 ,KEBNE ,17125918,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:52 CET,0.0 1.35 1.686 1.941 2.142 2.305 2.442 2.573 2.813 2.925 3.04 3.117 3.351 3.45 3.622 3.769 3.914 3.98 4.107 4.243 4.455 4.594 4.706 4.854 5.021 5.16 5.281 5.401 5.552 5.696 5.837 6.018 6.206 6.378 6.516 6.664 6.806 6.955 7.107 7.227 7.346 7.487 7.648 7.792 7.906 7.984 8.037 8.034 7.902 7.553 6.722 5.523 4.474 3.561 2.73 1.989 1.387 0.835 0.335 -0.162 -0.605 -1.019 -1.389 -1.712 -2.048 -2.39 -2.749 -3.059 -3.316 -3.573 -3.832 -4.053 -4.285 -4.509 -4.679 -4.895 -5.154 -5.407 -5.662 -5.834 -6.005 -6.282 -6.471 -6.661 -6.757 -6.952 -7.17 -7.409 -7.534 -7.816 -7.929 -8.062 -8.205 -8.494 -8.668 -8.876 -9.094 -9.336 -9.619 -9.994 -11.255 -7 ,23317 ,KEBNE ,17125919,Thu Dec 30 17:02:41 CET,Thu Dec 30 18:37:39 CET,0.0 0.714 0.965 1.163 1.357 1.519 1.651 1.782 2.01 2.103 2.192 2.244 2.465 2.558 2.745 2.917 3.072 3.151 3.297 3.419 3.616 3.752 3.866 4.003 4.147 4.288 4.405 4.526 4.695 4.846 4.984 5.137 5.264 5.39 5.544 5.7 5.839 5.992 6.141 6.265 6.387 6.52 6.665 6.785 6.87 6.943 6.997 6.981 6.843 6.448 5.562 4.358 3.325 2.397 1.602 0.873 0.201 -0.4 -0.913 -1.408 -1.815 -2.182 -2.55 -2.898 -3.212 -3.511 -3.857 -4.181 -4.467 -4.758 -5.019 -5.224 -5.45 -5.671 -5.86 -6.073 -6.276 -6.495 -6.721 -6.862 -7.005 -7.264 -7.472 -7.67 -7.763 -7.962 -8.192 -8.448 -8.574 -8.841 -8.948 -9.084 -9.231 -9.563 -9.743 -9.935 -10.132 -10.35 -10.616 -10.968 -12.068 -8 ,19933 ,KEBNE ,17125920,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:37:10 CET,0.0 1.011 1.328 1.588 1.807 1.984 2.144 2.286 2.537 2.648 2.759 2.833 3.051 3.141 3.295 3.442 3.596 3.665 3.788 3.912 4.103 4.223 4.333 4.489 4.639 4.788 4.933 5.05 5.168 5.305 5.447 5.577 5.69 5.801 5.918 6.051 6.171 6.267 6.364 6.453 6.54 6.678 6.829 6.924 6.991 7.042 7.042 6.947 6.753 6.372 5.518 4.342 3.318 2.39 1.585 0.902 0.311 -0.257 -0.735 -1.222 -1.641 -1.997 -2.373 -2.733 -3.042 -3.336 -3.638 -3.895 -4.116 -4.344 -4.591 -4.795 -5.002 -5.213 -5.369 -5.532 -5.702 -5.885 -6.079 -6.213 -6.357 -6.595 -6.766 -6.927 -7.005 -7.185 -7.375 -7.569 -7.675 -7.935 -8.036 -8.165 -8.323 -8.648 -8.812 -8.99 -9.18 -9.425 -9.751 -10.115 -11.173 -9 ,28645 ,KEBNE ,17125921,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:37 CET,0.0 0.771 1.077 1.309 1.505 1.671 1.801 1.916 2.146 2.261 2.362 2.426 2.638 2.719 2.888 3.061 3.22 3.293 3.443 3.585 3.781 3.905 4.014 4.175 4.341 4.489 4.617 4.745 4.925 5.092 5.234 5.365 5.487 5.593 5.714 5.839 5.95 6.08 6.189 6.306 6.432 6.524 6.641 6.774 6.908 7.03 7.07 7.012 6.819 6.428 5.635 4.497 3.497 2.599 1.816 1.098 0.477 -0.073 -0.555 -1.05 -1.477 -1.869 -2.263 -2.651 -3.005 -3.314 -3.629 -3.913 -4.172 -4.432 -4.696 -4.929 -5.159 -5.396 -5.59 -5.8 -6.026 -6.248 -6.487 -6.67 -6.86 -7.137 -7.324 -7.518 -7.612 -7.787 -7.988 -8.218 -8.333 -8.592 -8.694 -8.83 -8.979 -9.282 -9.447 -9.631 -9.84 -10.071 -10.352 -10.736 -12.043 -10 ,10543 ,KEBNE ,17125922,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:37:10 CET,0.0 0.85 1.135 1.348 1.537 1.709 1.862 1.998 2.259 2.38 2.494 2.599 2.842 2.94 3.132 3.33 3.511 3.593 3.748 3.9 4.097 4.211 4.327 4.492 4.648 4.802 4.932 5.037 5.18 5.314 5.423 5.559 5.7 5.827 5.965 6.123 6.265 6.435 6.617 6.797 6.989 7.152 7.312 7.457 7.584 7.695 7.749 7.719 7.605 7.276 6.52 5.419 4.41 3.491 2.658 1.944 1.343 0.774 0.253 -0.266 -0.709 -1.11 -1.471 -1.821 -2.16 -2.466 -2.791 -3.071 -3.299 -3.555 -3.843 -4.069 -4.278 -4.511 -4.709 -4.902 -5.093 -5.306 -5.541 -5.692 -5.838 -6.064 -6.226 -6.408 -6.5 -6.665 -6.853 -7.076 -7.183 -7.424 -7.49 -7.602 -7.737 -8.084 -8.257 -8.431 -8.649 -8.899 -9.18 -9.596 -10.849 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_234.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_234.txt deleted file mode 100644 index 01d49f2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_234.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1262 ,KEBNE ,16707840,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:52 CET,0.0 1.053 1.405 1.669 1.906 2.134 2.331 2.497 2.788 2.93 3.058 3.166 3.417 3.521 3.706 3.9 4.089 4.171 4.323 4.476 4.723 4.891 5.037 5.22 5.379 5.563 5.771 5.954 6.166 6.359 6.556 6.819 7.078 7.305 7.559 7.888 8.2 8.523 8.831 9.128 9.522 9.942 10.322 10.712 11.184 11.669 12.195 12.777 13.409 14.063 14.692 15.064 15.137 15.061 14.911 14.707 14.51 14.283 14.063 13.851 13.651 13.467 13.28 13.098 12.919 12.746 12.55 12.355 12.192 12.026 11.822 11.646 11.49 11.335 11.207 11.081 10.963 10.836 10.698 10.581 10.458 10.304 10.191 10.064 10.003 9.874 9.725 9.559 9.472 9.258 9.176 9.063 8.948 8.717 8.584 8.42 8.237 8.026 7.769 7.404 6.248 -2 ,17110 ,KEBNE ,16707841,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:31:07 CET,0.0 1.062 1.399 1.639 1.85 2.06 2.261 2.445 2.763 2.907 3.034 3.111 3.346 3.454 3.659 3.871 4.093 4.199 4.393 4.581 4.859 5.036 5.189 5.392 5.581 5.776 5.974 6.157 6.383 6.588 6.78 7.005 7.226 7.444 7.7 7.969 8.241 8.574 8.908 9.199 9.477 9.808 10.212 10.613 11.083 11.626 12.228 12.852 13.501 14.12 14.766 15.135 15.159 15.014 14.827 14.597 14.345 14.112 13.902 13.692 13.53 13.394 13.243 13.084 12.934 12.798 12.632 12.45 12.281 12.121 11.957 11.827 11.706 11.578 11.465 11.333 11.214 11.089 10.926 10.82 10.718 10.558 10.448 10.326 10.254 10.095 9.932 9.757 9.665 9.448 9.358 9.247 9.134 8.862 8.706 8.538 8.356 8.162 7.929 7.564 6.311 -3 ,12047 ,KEBNE ,16707842,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:31:41 CET,0.0 1.383 1.777 2.075 2.33 2.539 2.727 2.895 3.178 3.316 3.453 3.576 3.821 3.941 4.182 4.414 4.609 4.698 4.879 5.06 5.308 5.459 5.598 5.771 5.948 6.145 6.325 6.485 6.725 6.954 7.136 7.342 7.53 7.721 7.955 8.201 8.438 8.688 8.953 9.241 9.548 9.895 10.286 10.658 11.093 11.56 12.065 12.643 13.295 13.973 14.591 14.858 14.894 14.84 14.72 14.542 14.363 14.136 13.918 13.729 13.557 13.38 13.172 12.961 12.779 12.628 12.468 12.284 12.136 11.988 11.804 11.668 11.543 11.411 11.286 11.14 10.985 10.815 10.652 10.549 10.432 10.217 10.061 9.896 9.809 9.657 9.504 9.331 9.249 9.041 8.962 8.841 8.711 8.443 8.299 8.137 7.951 7.722 7.451 7.102 5.777 -4 ,12218 ,KEBNE ,16707843,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:53 CET,0.0 1.624 1.959 2.242 2.482 2.678 2.853 3.022 3.316 3.449 3.573 3.663 3.895 3.997 4.216 4.416 4.566 4.639 4.797 4.95 5.175 5.333 5.495 5.721 5.937 6.156 6.349 6.51 6.739 6.972 7.16 7.401 7.636 7.862 8.149 8.442 8.711 9.014 9.3 9.585 9.922 10.303 10.703 11.091 11.543 12.005 12.49 13.027 13.65 14.372 15.087 15.435 15.506 15.437 15.301 15.123 14.931 14.746 14.56 14.365 14.193 13.999 13.801 13.609 13.411 13.199 12.974 12.803 12.673 12.531 12.359 12.192 11.995 11.799 11.65 11.494 11.338 11.167 10.966 10.837 10.7 10.477 10.336 10.183 10.103 9.937 9.763 9.583 9.485 9.257 9.177 9.064 8.939 8.656 8.502 8.337 8.152 7.938 7.646 7.264 6.204 -5 ,29463 ,KEBNE ,16707844,Fri Nov 26 13:59:33 CET,Fri Nov 26 15:31:13 CET,0.0 0.991 1.338 1.623 1.862 2.066 2.243 2.4 2.679 2.808 2.928 3.027 3.268 3.374 3.586 3.78 3.965 4.065 4.241 4.382 4.58 4.71 4.839 5.033 5.217 5.412 5.625 5.823 6.066 6.289 6.488 6.714 6.936 7.157 7.407 7.689 7.961 8.252 8.552 8.874 9.224 9.609 10.045 10.484 10.996 11.548 12.15 12.802 13.481 14.168 14.877 15.284 15.362 15.276 15.105 14.906 14.695 14.461 14.269 14.094 13.887 13.686 13.512 13.334 13.175 13.03 12.851 12.673 12.52 12.372 12.191 12.029 11.858 11.658 11.484 11.302 11.135 10.985 10.842 10.733 10.6 10.416 10.308 10.181 10.107 9.95 9.786 9.609 9.51 9.281 9.199 9.087 8.963 8.684 8.54 8.382 8.21 8.029 7.81 7.521 6.619 -6 ,11627 ,KEBNE ,16707845,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:42 CET,0.0 1.218 1.654 1.958 2.208 2.426 2.601 2.745 3.052 3.193 3.312 3.399 3.64 3.752 3.948 4.145 4.336 4.424 4.609 4.798 5.072 5.242 5.394 5.605 5.797 5.972 6.135 6.303 6.531 6.75 6.979 7.233 7.45 7.667 7.926 8.223 8.474 8.755 9.076 9.37 9.677 10.041 10.46 10.865 11.323 11.828 12.409 13.015 13.631 14.268 14.973 15.398 15.467 15.384 15.257 15.082 14.911 14.726 14.527 14.314 14.133 13.987 13.809 13.609 13.441 13.287 13.106 12.935 12.793 12.658 12.516 12.389 12.265 12.133 12.016 11.893 11.748 11.579 11.405 11.284 11.168 10.984 10.845 10.699 10.618 10.441 10.272 10.106 10.015 9.796 9.706 9.596 9.48 9.192 9.035 8.878 8.707 8.511 8.26 7.901 6.859 -7 ,9153 ,KEBNE ,16707846,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:25 CET,0.0 1.102 1.463 1.713 1.923 2.135 2.322 2.48 2.764 2.895 3.013 3.098 3.335 3.452 3.653 3.841 4.035 4.127 4.322 4.51 4.777 4.935 5.071 5.264 5.463 5.67 5.871 6.063 6.298 6.527 6.766 7.054 7.299 7.516 7.761 8.038 8.314 8.627 8.979 9.312 9.635 9.992 10.442 10.881 11.328 11.805 12.353 12.93 13.528 14.177 14.782 15.101 15.176 15.106 14.959 14.79 14.623 14.438 14.257 14.074 13.87 13.672 13.508 13.344 13.177 13.02 12.864 12.728 12.603 12.473 12.321 12.192 12.059 11.905 11.78 11.648 11.519 11.374 11.197 11.074 10.954 10.775 10.656 10.526 10.451 10.297 10.135 9.979 9.91 9.703 9.65 9.561 9.461 9.221 9.078 8.916 8.718 8.491 8.243 7.93 6.438 -8 ,4414 ,KEBNE ,16707847,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:54 CET,0.0 1.462 1.866 2.119 2.338 2.55 2.752 2.937 3.283 3.431 3.562 3.684 3.943 4.058 4.278 4.476 4.658 4.757 4.947 5.123 5.382 5.548 5.711 5.96 6.204 6.421 6.632 6.851 7.135 7.395 7.616 7.877 8.139 8.375 8.64 8.935 9.201 9.5 9.808 10.112 10.423 10.762 11.163 11.574 12.036 12.571 13.182 13.811 14.477 15.155 15.824 16.209 16.248 16.13 15.953 15.743 15.554 15.392 15.234 15.038 14.842 14.659 14.483 14.309 14.155 14.016 13.86 13.71 13.575 13.42 13.239 13.073 12.913 12.772 12.659 12.528 12.372 12.219 12.025 11.873 11.736 11.525 11.385 11.232 11.154 11.013 10.863 10.688 10.582 10.342 10.247 10.123 9.997 9.724 9.568 9.395 9.208 8.999 8.758 8.413 7.216 -9 ,25905 ,KEBNE ,16707848,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:31:06 CET,0.0 1.231 1.585 1.86 2.094 2.286 2.455 2.628 2.943 3.078 3.202 3.313 3.553 3.663 3.885 4.094 4.294 4.389 4.558 4.72 4.941 5.069 5.191 5.367 5.535 5.693 5.85 6.008 6.208 6.387 6.57 6.793 6.996 7.192 7.425 7.695 7.95 8.229 8.52 8.809 9.11 9.475 9.932 10.332 10.754 11.234 11.764 12.317 12.911 13.536 14.087 14.369 14.396 14.322 14.206 14.057 13.891 13.715 13.542 13.332 13.12 12.936 12.768 12.608 12.459 12.327 12.182 12.042 11.912 11.771 11.615 11.472 11.308 11.152 11.021 10.879 10.755 10.626 10.468 10.342 10.224 10.052 9.92 9.782 9.712 9.572 9.432 9.278 9.188 8.964 8.871 8.763 8.639 8.36 8.219 8.068 7.887 7.673 7.401 7.013 6.002 -10 ,3957 ,KEBNE ,16707849,Fri Nov 26 13:59:33 CET,Fri Nov 26 15:31:44 CET,0.0 1.232 1.604 1.869 2.073 2.264 2.432 2.589 2.875 3.003 3.127 3.238 3.483 3.597 3.808 4.014 4.221 4.316 4.491 4.649 4.851 4.984 5.127 5.344 5.554 5.751 5.929 6.091 6.301 6.509 6.733 7.015 7.254 7.453 7.68 7.948 8.221 8.492 8.758 9.114 9.493 9.858 10.249 10.617 11.048 11.502 11.995 12.532 13.137 13.81 14.539 14.901 14.915 14.84 14.698 14.515 14.332 14.133 13.957 13.774 13.589 13.406 13.217 13.022 12.838 12.681 12.512 12.333 12.18 12.053 11.913 11.781 11.642 11.478 11.341 11.2 11.046 10.898 10.756 10.642 10.524 10.366 10.254 10.134 10.069 9.911 9.743 9.563 9.461 9.239 9.158 9.045 8.928 8.662 8.51 8.359 8.214 8.022 7.793 7.515 6.347 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_252.txt deleted file mode 100644 index d952d2ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27360 ,KEBNE ,16707850,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:25 CET,0.0 0.784 1.039 1.229 1.333 1.397 1.447 1.485 1.531 1.535 1.534 1.4 1.538 1.548 1.536 1.508 1.475 1.452 1.404 1.363 1.276 1.211 1.149 1.033 0.901 0.759 0.606 0.457 0.282 0.086 -0.115 -0.337 -0.592 -0.875 -1.221 -1.642 -2.087 -2.61 -3.219 -3.891 -4.645 -5.564 -6.765 -8.107 -9.753 -11.712 -14.231 -17.452 -21.768 -27.703 -36.403 -45.734 -52.672 -58.042 -62.329 -65.871 -68.811 -71.325 -73.359 -75.315 -76.943 -78.309 -79.575 -80.765 -81.86 -82.82 -83.788 -84.666 -85.417 -86.187 -86.969 -87.59 -88.218 -88.874 -89.388 -89.916 -90.447 -90.984 -91.532 -91.905 -92.281 -92.843 -93.233 -93.631 -93.837 -94.253 -94.686 -95.12 -95.337 -95.806 -96.059 -96.321 -96.587 -97.151 -97.462 -97.755 -98.062 -98.403 -98.782 -99.316 -100.764 -2 ,23037 ,KEBNE ,16707851,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:31:05 CET,0.0 0.662 0.883 1.038 1.137 1.222 1.294 1.342 1.412 1.436 1.462 1.386 1.528 1.531 1.521 1.502 1.478 1.462 1.409 1.34 1.245 1.179 1.105 1.0 0.9 0.8 0.691 0.569 0.384 0.196 0.013 -0.245 -0.534 -0.831 -1.179 -1.604 -2.072 -2.621 -3.251 -3.976 -4.781 -5.75 -6.962 -8.266 -9.914 -11.929 -14.466 -17.637 -21.838 -27.598 -36.106 -45.002 -51.599 -56.732 -60.838 -64.33 -67.231 -69.674 -71.666 -73.603 -75.215 -76.591 -77.862 -79.032 -80.081 -81.008 -81.965 -82.819 -83.531 -84.252 -85.007 -85.615 -86.213 -86.815 -87.278 -87.766 -88.267 -88.766 -89.279 -89.625 -89.981 -90.554 -90.926 -91.287 -91.477 -91.849 -92.219 -92.625 -92.845 -93.29 -93.495 -93.72 -93.959 -94.472 -94.761 -95.06 -95.373 -95.73 -96.144 -96.663 -97.814 -3 ,11555 ,KEBNE ,16707852,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:43 CET,0.0 0.757 0.977 1.113 1.211 1.28 1.341 1.391 1.437 1.453 1.467 1.344 1.478 1.489 1.471 1.431 1.394 1.372 1.336 1.312 1.267 1.207 1.134 1.031 0.926 0.803 0.684 0.568 0.401 0.235 0.021 -0.281 -0.576 -0.886 -1.271 -1.715 -2.173 -2.717 -3.334 -4.02 -4.781 -5.725 -6.931 -8.229 -9.876 -11.904 -14.466 -17.645 -21.849 -27.612 -36.163 -45.117 -51.652 -56.778 -60.874 -64.306 -67.122 -69.517 -71.496 -73.421 -75.032 -76.384 -77.626 -78.774 -79.803 -80.7 -81.627 -82.448 -83.135 -83.844 -84.549 -85.121 -85.705 -86.282 -86.715 -87.159 -87.642 -88.132 -88.619 -88.953 -89.279 -89.779 -90.117 -90.454 -90.629 -91.005 -91.415 -91.845 -92.055 -92.492 -92.691 -92.915 -93.135 -93.598 -93.865 -94.152 -94.47 -94.804 -95.181 -95.702 -97.366 -4 ,29937 ,KEBNE ,16707853,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:31:05 CET,0.0 0.708 0.906 1.052 1.159 1.253 1.335 1.393 1.469 1.48 1.488 1.39 1.525 1.532 1.527 1.497 1.463 1.447 1.421 1.395 1.344 1.273 1.189 1.077 0.972 0.866 0.749 0.612 0.408 0.205 -0.002 -0.289 -0.578 -0.872 -1.226 -1.647 -2.095 -2.614 -3.186 -3.86 -4.652 -5.594 -6.799 -8.133 -9.827 -11.885 -14.514 -17.794 -22.118 -28.074 -36.868 -46.058 -52.715 -57.82 -61.882 -65.356 -68.243 -70.723 -72.772 -74.71 -76.289 -77.651 -78.961 -80.168 -81.227 -82.145 -83.084 -83.907 -84.613 -85.357 -86.13 -86.764 -87.399 -88.008 -88.462 -88.925 -89.404 -89.914 -90.421 -90.756 -91.09 -91.592 -91.929 -92.269 -92.454 -92.847 -93.252 -93.664 -93.871 -94.318 -94.533 -94.765 -95.002 -95.512 -95.79 -96.07 -96.359 -96.677 -97.058 -97.564 -98.703 -5 ,32412 ,KEBNE ,16707854,Fri Nov 26 13:59:35 CET,Fri Nov 26 15:35:00 CET,0.0 0.589 0.805 0.958 1.082 1.182 1.252 1.291 1.328 1.341 1.344 1.21 1.337 1.334 1.338 1.319 1.285 1.269 1.239 1.211 1.149 1.097 1.035 0.935 0.829 0.72 0.604 0.469 0.307 0.152 -0.039 -0.307 -0.555 -0.825 -1.198 -1.631 -2.081 -2.59 -3.161 -3.838 -4.622 -5.562 -6.763 -8.059 -9.671 -11.651 -14.176 -17.356 -21.603 -27.53 -36.227 -45.25 -51.971 -57.177 -61.302 -64.765 -67.623 -70.101 -72.134 -74.07 -75.714 -77.178 -78.543 -79.754 -80.808 -81.751 -82.708 -83.535 -84.264 -84.989 -85.718 -86.329 -86.953 -87.591 -88.079 -88.579 -89.092 -89.611 -90.12 -90.463 -90.815 -91.351 -91.72 -92.086 -92.272 -92.667 -93.07 -93.475 -93.676 -94.115 -94.308 -94.531 -94.762 -95.261 -95.522 -95.793 -96.09 -96.43 -96.837 -97.323 -98.356 -6 ,1165 ,KEBNE ,16707855,Fri Nov 26 13:59:35 CET,Fri Nov 26 15:31:56 CET,0.0 0.744 0.975 1.126 1.214 1.28 1.327 1.35 1.389 1.402 1.406 1.277 1.392 1.378 1.343 1.304 1.25 1.223 1.181 1.143 1.092 1.03 0.959 0.87 0.778 0.683 0.555 0.413 0.214 -0.009 -0.233 -0.521 -0.792 -1.063 -1.432 -1.88 -2.34 -2.874 -3.495 -4.223 -5.034 -6.002 -7.213 -8.505 -10.082 -12.033 -14.592 -17.811 -22.12 -28.005 -36.65 -45.638 -52.233 -57.437 -61.612 -65.089 -67.965 -70.441 -72.462 -74.422 -76.12 -77.587 -78.934 -80.178 -81.249 -82.204 -83.233 -84.092 -84.796 -85.544 -86.333 -86.966 -87.592 -88.243 -88.732 -89.195 -89.653 -90.144 -90.669 -91.014 -91.351 -91.858 -92.216 -92.6 -92.792 -93.188 -93.61 -94.056 -94.288 -94.753 -95.016 -95.271 -95.519 -96.053 -96.339 -96.631 -96.926 -97.268 -97.702 -98.292 -99.768 -7 ,30100 ,KEBNE ,16707856,Fri Nov 26 13:59:35 CET,Fri Nov 26 15:31:37 CET,0.0 0.834 1.081 1.263 1.391 1.478 1.561 1.632 1.715 1.745 1.782 1.719 1.878 1.895 1.919 1.938 1.936 1.922 1.899 1.877 1.825 1.769 1.698 1.587 1.473 1.337 1.191 1.051 0.849 0.63 0.407 0.142 -0.129 -0.433 -0.792 -1.207 -1.641 -2.17 -2.789 -3.481 -4.219 -5.092 -6.252 -7.553 -9.182 -11.154 -13.686 -16.857 -21.028 -26.735 -35.175 -44.08 -50.606 -55.665 -59.736 -63.15 -65.933 -68.339 -70.393 -72.372 -73.958 -75.309 -76.563 -77.71 -78.769 -79.71 -80.65 -81.471 -82.181 -82.909 -83.627 -84.19 -84.752 -85.344 -85.815 -86.298 -86.79 -87.294 -87.8 -88.14 -88.5 -89.056 -89.413 -89.771 -89.961 -90.35 -90.749 -91.174 -91.398 -91.855 -92.114 -92.361 -92.614 -93.156 -93.43 -93.714 -94.03 -94.373 -94.752 -95.243 -96.601 -8 ,7371 ,KEBNE ,16707857,Fri Nov 26 13:59:35 CET,Fri Nov 26 15:32:36 CET,0.0 1.148 1.439 1.594 1.681 1.749 1.822 1.887 1.974 2.0 2.013 1.908 2.044 2.043 2.024 1.99 1.952 1.93 1.879 1.817 1.739 1.676 1.614 1.557 1.489 1.392 1.274 1.146 0.999 0.848 0.68 0.45 0.179 -0.114 -0.489 -0.929 -1.38 -1.91 -2.519 -3.213 -3.978 -4.899 -6.073 -7.364 -9.005 -11.016 -13.617 -16.933 -21.261 -27.107 -35.731 -44.716 -51.311 -56.451 -60.608 -64.092 -66.953 -69.435 -71.498 -73.519 -75.203 -76.621 -77.938 -79.123 -80.165 -81.129 -82.125 -82.992 -83.75 -84.494 -85.226 -85.812 -86.404 -87.02 -87.484 -87.969 -88.466 -88.94 -89.427 -89.764 -90.096 -90.61 -90.969 -91.359 -91.561 -91.969 -92.388 -92.807 -93.02 -93.477 -93.662 -93.891 -94.137 -94.638 -94.916 -95.219 -95.544 -95.921 -96.32 -96.759 -97.917 -9 ,26943 ,KEBNE ,16707858,Fri Nov 26 13:59:42 CET,Fri Nov 26 15:31:04 CET,0.0 0.8 0.996 1.095 1.163 1.228 1.284 1.329 1.404 1.432 1.443 1.303 1.439 1.443 1.447 1.434 1.386 1.359 1.311 1.28 1.234 1.184 1.132 1.04 0.922 0.799 0.674 0.534 0.335 0.139 -0.054 -0.293 -0.55 -0.829 -1.182 -1.601 -2.034 -2.576 -3.184 -3.858 -4.636 -5.609 -6.829 -8.128 -9.783 -11.821 -14.357 -17.568 -21.908 -27.84 -36.627 -45.788 -52.555 -57.873 -62.089 -65.583 -68.473 -70.966 -73.017 -74.979 -76.595 -77.99 -79.302 -80.521 -81.609 -82.559 -83.552 -84.436 -85.177 -85.937 -86.735 -87.39 -88.045 -88.685 -89.151 -89.632 -90.119 -90.605 -91.117 -91.473 -91.834 -92.376 -92.751 -93.148 -93.357 -93.759 -94.148 -94.548 -94.745 -95.2 -95.428 -95.667 -95.906 -96.406 -96.677 -96.964 -97.256 -97.558 -97.922 -98.418 -99.901 -10 ,3435 ,KEBNE ,16707859,Fri Nov 26 13:59:38 CET,Fri Nov 26 15:30:18 CET,0.0 0.742 0.959 1.099 1.203 1.292 1.384 1.435 1.491 1.517 1.542 1.46 1.612 1.623 1.618 1.604 1.587 1.566 1.513 1.474 1.39 1.32 1.269 1.196 1.081 0.956 0.85 0.737 0.563 0.361 0.167 -0.034 -0.252 -0.5 -0.83 -1.265 -1.719 -2.267 -2.905 -3.617 -4.41 -5.379 -6.621 -7.958 -9.644 -11.706 -14.329 -17.606 -21.943 -27.852 -36.538 -45.71 -52.373 -57.508 -61.65 -65.162 -68.06 -70.537 -72.567 -74.481 -76.069 -77.456 -78.734 -79.878 -80.916 -81.848 -82.79 -83.606 -84.316 -85.046 -85.787 -86.405 -87.026 -87.646 -88.114 -88.576 -89.046 -89.549 -90.079 -90.429 -90.785 -91.33 -91.705 -92.099 -92.304 -92.709 -93.111 -93.535 -93.756 -94.222 -94.467 -94.7 -94.945 -95.457 -95.739 -96.056 -96.391 -96.728 -97.135 -97.647 -99.12 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_54.txt deleted file mode 100644 index be072039..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_163_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16016 ,KEBNE ,17025669,Wed Dec 22 13:01:18 CET,Wed Dec 22 14:32:51 CET,0.0 2.053 2.597 2.947 3.247 3.526 3.75 3.935 4.221 4.359 4.502 4.637 4.897 5.021 5.249 5.448 5.617 5.701 5.857 5.978 6.144 6.259 6.358 6.472 6.607 6.753 6.903 7.055 7.221 7.343 7.469 7.624 7.756 7.892 8.038 8.173 8.231 8.266 8.296 8.315 8.322 8.271 8.135 7.99 7.8 7.477 6.973 6.262 5.191 3.501 0.753 -2.361 -4.751 -6.695 -8.346 -9.772 -10.967 -12.022 -12.892 -13.719 -14.421 -15.046 -15.633 -16.174 -16.675 -17.129 -17.645 -18.135 -18.548 -18.955 -19.362 -19.676 -19.985 -20.327 -20.611 -20.91 -21.213 -21.528 -21.856 -22.086 -22.331 -22.697 -22.946 -23.208 -23.342 -23.618 -23.9 -24.219 -24.384 -24.701 -24.878 -25.066 -25.278 -25.737 -25.992 -26.292 -26.629 -27.031 -27.484 -28.061 -31.891 -2 ,10433 ,KEBNE ,17025670,Wed Dec 22 13:01:18 CET,Wed Dec 22 14:33:28 CET,0.0 2.416 2.965 3.349 3.68 3.956 4.2 4.4 4.747 4.908 5.066 5.248 5.511 5.637 5.908 6.152 6.356 6.441 6.608 6.759 6.956 7.079 7.202 7.402 7.584 7.724 7.828 7.93 8.062 8.186 8.288 8.39 8.508 8.636 8.774 8.929 9.061 9.144 9.227 9.291 9.275 9.206 9.111 8.928 8.603 8.215 7.689 6.902 5.733 3.954 0.966 -2.436 -5.067 -7.177 -8.868 -10.36 -11.652 -12.812 -13.806 -14.759 -15.549 -16.262 -16.931 -17.555 -18.117 -18.607 -19.118 -19.577 -19.979 -20.397 -20.825 -21.193 -21.57 -21.932 -22.213 -22.53 -22.855 -23.156 -23.477 -23.725 -23.988 -24.367 -24.604 -24.849 -24.983 -25.272 -25.577 -25.893 -26.057 -26.384 -26.553 -26.744 -26.945 -27.402 -27.631 -27.866 -28.152 -28.5 -28.927 -29.485 -32.31 -3 ,6122 ,KEBNE ,17025671,Wed Dec 22 13:01:18 CET,Wed Dec 22 14:32:25 CET,0.0 2.847 3.359 3.742 4.065 4.34 4.578 4.773 5.132 5.296 5.448 5.591 5.843 5.967 6.204 6.404 6.597 6.69 6.861 7.033 7.26 7.394 7.521 7.725 7.925 8.079 8.218 8.354 8.53 8.703 8.84 8.972 9.076 9.178 9.287 9.368 9.465 9.535 9.539 9.527 9.483 9.411 9.294 9.181 8.968 8.644 8.2 7.509 6.472 4.893 2.319 -0.729 -3.138 -5.066 -6.64 -8.0 -9.189 -10.266 -11.16 -12.035 -12.775 -13.402 -14.009 -14.62 -15.176 -15.673 -16.22 -16.69 -17.067 -17.447 -17.846 -18.2 -18.56 -18.925 -19.239 -19.544 -19.826 -20.138 -20.479 -20.722 -20.967 -21.334 -21.583 -21.82 -21.949 -22.232 -22.543 -22.873 -23.038 -23.371 -23.564 -23.763 -23.97 -24.413 -24.654 -24.915 -25.216 -25.538 -25.912 -26.488 -28.575 -4 ,19206 ,KEBNE ,17025672,Wed Dec 22 13:01:18 CET,Wed Dec 22 14:32:09 CET,0.0 1.831 2.293 2.638 2.941 3.221 3.479 3.703 4.114 4.301 4.481 4.669 4.933 5.076 5.354 5.575 5.776 5.879 6.089 6.264 6.484 6.622 6.754 6.922 7.064 7.195 7.326 7.453 7.586 7.701 7.817 7.942 8.035 8.109 8.193 8.282 8.333 8.378 8.418 8.417 8.396 8.385 8.363 8.26 8.041 7.685 7.117 6.351 5.209 3.404 0.484 -2.829 -5.401 -7.536 -9.297 -10.78 -12.059 -13.267 -14.263 -15.174 -15.994 -16.711 -17.365 -17.993 -18.566 -19.091 -19.632 -20.081 -20.462 -20.871 -21.3 -21.652 -22.013 -22.389 -22.682 -22.979 -23.279 -23.617 -23.971 -24.202 -24.436 -24.786 -25.057 -25.358 -25.505 -25.796 -26.09 -26.384 -26.539 -26.885 -27.084 -27.285 -27.49 -27.941 -28.196 -28.445 -28.71 -29.041 -29.487 -30.121 -32.857 -5 ,15009 ,KEBNE ,17025673,Wed Dec 22 13:01:18 CET,Wed Dec 22 14:32:50 CET,0.0 2.095 2.688 3.101 3.443 3.736 3.99 4.219 4.595 4.763 4.94 5.12 5.386 5.499 5.703 5.894 6.08 6.178 6.369 6.529 6.727 6.844 6.934 7.047 7.151 7.248 7.334 7.415 7.554 7.709 7.859 8.033 8.162 8.241 8.326 8.418 8.469 8.502 8.528 8.553 8.534 8.447 8.304 8.099 7.791 7.388 6.815 6.006 4.852 3.167 0.503 -2.518 -4.869 -6.764 -8.337 -9.736 -10.935 -11.967 -12.855 -13.722 -14.426 -15.045 -15.665 -16.271 -16.823 -17.349 -17.879 -18.329 -18.748 -19.171 -19.597 -19.96 -20.33 -20.698 -20.968 -21.255 -21.556 -21.859 -22.157 -22.365 -22.599 -22.99 -23.267 -23.54 -23.68 -23.982 -24.292 -24.611 -24.775 -25.106 -25.291 -25.477 -25.691 -26.175 -26.431 -26.697 -26.988 -27.31 -27.68 -28.223 -30.643 -6 ,25274 ,KEBNE ,17025674,Wed Dec 22 13:01:18 CET,Wed Dec 22 14:33:11 CET,0.0 1.967 2.482 2.837 3.143 3.412 3.662 3.887 4.244 4.409 4.565 4.705 4.958 5.093 5.371 5.573 5.722 5.801 5.97 6.108 6.284 6.395 6.512 6.692 6.859 7.015 7.153 7.297 7.478 7.594 7.681 7.781 7.893 7.991 8.074 8.159 8.223 8.283 8.318 8.311 8.303 8.288 8.207 8.093 7.937 7.684 7.226 6.539 5.536 3.997 1.369 -1.736 -4.159 -6.123 -7.769 -9.257 -10.515 -11.601 -12.511 -13.372 -14.077 -14.69 -15.272 -15.827 -16.334 -16.783 -17.244 -17.651 -18.002 -18.383 -18.813 -19.146 -19.451 -19.77 -20.034 -20.324 -20.637 -20.943 -21.227 -21.42 -21.616 -21.952 -22.189 -22.416 -22.537 -22.786 -23.056 -23.346 -23.5 -23.828 -24.006 -24.182 -24.355 -24.752 -24.995 -25.246 -25.517 -25.806 -26.186 -26.739 -29.333 -7 ,717 ,KEBNE ,17025675,Wed Dec 22 13:01:18 CET,Wed Dec 22 14:33:10 CET,0.0 2.269 2.796 3.165 3.482 3.764 4.018 4.257 4.625 4.779 4.932 5.079 5.324 5.433 5.654 5.856 6.036 6.12 6.277 6.421 6.626 6.745 6.854 7.005 7.156 7.305 7.447 7.568 7.702 7.853 7.994 8.128 8.234 8.335 8.439 8.53 8.613 8.688 8.739 8.745 8.732 8.723 8.637 8.484 8.247 7.908 7.438 6.711 5.564 3.93 1.358 -1.604 -3.93 -5.839 -7.502 -8.968 -10.162 -11.228 -12.148 -13.041 -13.804 -14.49 -15.149 -15.743 -16.274 -16.76 -17.24 -17.64 -17.975 -18.323 -18.711 -19.065 -19.419 -19.757 -20.008 -20.253 -20.517 -20.808 -21.131 -21.364 -21.592 -21.919 -22.142 -22.382 -22.515 -22.777 -23.051 -23.353 -23.51 -23.84 -24.044 -24.245 -24.454 -24.882 -25.13 -25.419 -25.743 -26.102 -26.514 -27.126 -30.448 -8 ,20874 ,KEBNE ,17025676,Wed Dec 22 13:01:18 CET,Wed Dec 22 14:33:09 CET,0.0 2.464 3.024 3.41 3.735 4.006 4.252 4.467 4.835 5.004 5.165 5.333 5.581 5.675 5.878 6.089 6.263 6.346 6.509 6.664 6.877 7.004 7.127 7.31 7.466 7.609 7.754 7.887 8.05 8.2 8.337 8.476 8.602 8.72 8.8 8.893 8.996 9.064 9.084 9.133 9.202 9.226 9.201 9.087 8.839 8.487 7.994 7.276 6.221 4.615 1.894 -1.313 -3.851 -5.922 -7.635 -9.117 -10.381 -11.462 -12.349 -13.244 -14.019 -14.676 -15.331 -15.992 -16.557 -17.036 -17.53 -17.965 -18.348 -18.752 -19.174 -19.514 -19.861 -20.242 -20.553 -20.87 -21.189 -21.531 -21.882 -22.11 -22.341 -22.689 -22.933 -23.19 -23.32 -23.583 -23.868 -24.189 -24.357 -24.682 -24.87 -25.065 -25.27 -25.72 -25.972 -26.223 -26.494 -26.815 -27.198 -27.724 -30.417 -9 ,13850 ,KEBNE ,17025677,Wed Dec 22 13:01:17 CET,Wed Dec 22 14:32:52 CET,0.0 2.386 2.946 3.352 3.663 3.954 4.219 4.452 4.838 5.001 5.165 5.328 5.593 5.714 5.93 6.124 6.277 6.36 6.541 6.69 6.871 6.973 7.086 7.263 7.39 7.486 7.607 7.75 7.902 8.026 8.117 8.197 8.266 8.326 8.404 8.535 8.702 8.873 9.032 9.112 9.087 9.024 8.93 8.763 8.537 8.23 7.722 6.981 5.862 4.199 1.391 -1.808 -4.335 -6.534 -8.39 -9.965 -11.299 -12.455 -13.423 -14.369 -15.165 -15.889 -16.574 -17.186 -17.746 -18.272 -18.82 -19.296 -19.703 -20.111 -20.53 -20.878 -21.231 -21.588 -21.86 -22.138 -22.427 -22.735 -23.06 -23.292 -23.535 -23.904 -24.17 -24.448 -24.583 -24.861 -25.163 -25.488 -25.659 -26.002 -26.198 -26.385 -26.589 -27.031 -27.274 -27.562 -27.882 -28.251 -28.685 -29.204 -31.214 -10 ,1381 ,KEBNE ,17025678,Wed Dec 22 13:01:17 CET,Wed Dec 22 14:33:22 CET,0.0 1.956 2.479 2.847 3.132 3.386 3.615 3.812 4.157 4.318 4.461 4.563 4.804 4.911 5.128 5.334 5.512 5.594 5.755 5.91 6.122 6.269 6.407 6.572 6.711 6.83 6.947 7.068 7.219 7.353 7.469 7.596 7.718 7.811 7.878 7.951 8.0 8.056 8.116 8.129 8.109 8.066 7.975 7.844 7.603 7.226 6.69 5.909 4.797 3.086 0.176 -3.178 -5.825 -7.986 -9.743 -11.244 -12.505 -13.619 -14.545 -15.449 -16.219 -16.893 -17.527 -18.132 -18.722 -19.269 -19.8 -20.26 -20.655 -21.067 -21.494 -21.83 -22.185 -22.546 -22.817 -23.111 -23.413 -23.726 -24.069 -24.307 -24.54 -24.895 -25.142 -25.383 -25.506 -25.776 -26.075 -26.381 -26.538 -26.879 -27.077 -27.265 -27.453 -27.876 -28.11 -28.356 -28.646 -28.983 -29.375 -29.965 -32.405 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_164_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_164_231.txt deleted file mode 100644 index 8994e7a4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_164_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1274 ,KEBNE ,17125923,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:15 CET,0.0 0.805 1.081 1.297 1.476 1.611 1.727 1.849 2.071 2.166 2.253 2.294 2.478 2.56 2.718 2.852 2.971 3.028 3.139 3.235 3.352 3.426 3.493 3.573 3.647 3.729 3.809 3.874 3.965 4.047 4.119 4.207 4.287 4.352 4.417 4.496 4.57 4.62 4.634 4.62 4.572 4.479 4.363 4.26 4.101 3.82 3.326 2.599 1.576 -0.044 -2.714 -5.843 -8.368 -10.489 -12.259 -13.783 -15.071 -16.167 -17.078 -17.977 -18.744 -19.419 -20.053 -20.639 -21.175 -21.66 -22.155 -22.588 -22.958 -23.34 -23.747 -24.092 -24.433 -24.778 -25.047 -25.326 -25.607 -25.88 -26.171 -26.379 -26.588 -26.914 -27.142 -27.385 -27.512 -27.774 -28.051 -28.35 -28.513 -28.822 -29.001 -29.173 -29.356 -29.761 -29.969 -30.18 -30.438 -30.763 -31.154 -31.627 -32.946 -2 ,5625 ,KEBNE ,17125924,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:37:00 CET,0.0 0.964 1.231 1.432 1.605 1.732 1.84 1.938 2.117 2.208 2.292 2.326 2.499 2.563 2.69 2.808 2.923 2.977 3.071 3.155 3.28 3.351 3.426 3.546 3.647 3.735 3.809 3.875 3.945 4.002 4.046 4.081 4.118 4.171 4.245 4.301 4.324 4.329 4.327 4.32 4.287 4.224 4.127 3.977 3.695 3.302 2.792 2.07 1.0 -0.612 -3.323 -6.42 -8.862 -10.886 -12.603 -14.152 -15.468 -16.595 -17.548 -18.498 -19.286 -19.976 -20.619 -21.21 -21.764 -22.262 -22.767 -23.21 -23.591 -23.99 -24.396 -24.719 -25.039 -25.369 -25.632 -25.912 -26.204 -26.504 -26.811 -27.017 -27.227 -27.551 -27.778 -28.014 -28.129 -28.364 -28.606 -28.863 -28.999 -29.281 -29.445 -29.619 -29.811 -30.2 -30.411 -30.638 -30.876 -31.15 -31.474 -31.879 -33.225 -3 ,18818 ,KEBNE ,17125925,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:35:38 CET,0.0 0.668 0.9 1.081 1.227 1.351 1.479 1.606 1.804 1.894 1.981 2.015 2.197 2.257 2.369 2.481 2.579 2.625 2.717 2.808 2.932 3.005 3.073 3.159 3.243 3.339 3.43 3.507 3.604 3.688 3.768 3.849 3.897 3.958 4.04 4.093 4.13 4.174 4.197 4.213 4.229 4.212 4.169 4.069 3.857 3.52 3.026 2.339 1.37 -0.075 -2.428 -5.125 -7.355 -9.179 -10.665 -12.019 -13.187 -14.186 -15.071 -15.971 -16.713 -17.37 -18.037 -18.677 -19.247 -19.747 -20.266 -20.739 -21.124 -21.487 -21.872 -22.195 -22.524 -22.873 -23.14 -23.419 -23.715 -24.015 -24.311 -24.51 -24.725 -25.071 -25.303 -25.534 -25.652 -25.899 -26.165 -26.452 -26.604 -26.907 -27.085 -27.265 -27.448 -27.837 -28.07 -28.323 -28.589 -28.882 -29.251 -29.713 -30.858 -4 ,24465 ,KEBNE ,17125926,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:51 CET,0.0 0.83 1.108 1.313 1.469 1.61 1.749 1.886 2.086 2.16 2.246 2.325 2.525 2.593 2.709 2.813 2.889 2.928 3.021 3.118 3.245 3.314 3.382 3.487 3.582 3.661 3.735 3.8 3.872 3.96 4.039 4.096 4.134 4.183 4.246 4.316 4.383 4.447 4.479 4.462 4.428 4.342 4.196 4.048 3.803 3.41 2.888 2.19 1.136 -0.454 -2.999 -5.904 -8.219 -10.122 -11.687 -13.077 -14.274 -15.344 -16.271 -17.182 -17.951 -18.64 -19.281 -19.872 -20.411 -20.893 -21.38 -21.804 -22.168 -22.548 -22.944 -23.264 -23.605 -23.957 -24.215 -24.477 -24.749 -25.043 -25.344 -25.548 -25.766 -26.103 -26.338 -26.586 -26.712 -26.969 -27.242 -27.533 -27.68 -27.966 -28.147 -28.329 -28.522 -28.947 -29.179 -29.434 -29.704 -30.01 -30.355 -30.793 -31.994 -5 ,2782 ,KEBNE ,17125927,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:35 CET,0.0 1.004 1.303 1.518 1.687 1.841 1.985 2.119 2.312 2.389 2.465 2.495 2.67 2.735 2.838 2.923 2.997 3.03 3.098 3.169 3.302 3.397 3.458 3.526 3.589 3.645 3.694 3.761 3.879 3.974 4.043 4.13 4.221 4.265 4.268 4.262 4.277 4.294 4.293 4.267 4.197 4.118 3.987 3.826 3.594 3.237 2.721 1.983 0.928 -0.705 -3.371 -6.457 -9.016 -11.138 -12.82 -14.224 -15.44 -16.558 -17.527 -18.486 -19.26 -19.914 -20.55 -21.137 -21.681 -22.178 -22.69 -23.131 -23.497 -23.888 -24.298 -24.637 -24.993 -25.373 -25.675 -25.981 -26.289 -26.606 -26.934 -27.152 -27.375 -27.736 -27.974 -28.21 -28.333 -28.585 -28.849 -29.116 -29.252 -29.54 -29.697 -29.856 -30.028 -30.393 -30.587 -30.804 -31.054 -31.332 -31.679 -32.173 -33.363 -6 ,20438 ,KEBNE ,17125928,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:46 CET,0.0 0.792 1.055 1.288 1.466 1.6 1.724 1.845 2.052 2.138 2.215 2.239 2.42 2.493 2.617 2.73 2.843 2.897 3.0 3.093 3.224 3.301 3.374 3.477 3.571 3.658 3.727 3.799 3.898 3.99 4.069 4.148 4.22 4.302 4.384 4.443 4.489 4.525 4.548 4.562 4.534 4.462 4.379 4.248 4.008 3.694 3.253 2.59 1.617 0.076 -2.32 -5.003 -7.247 -9.104 -10.694 -12.108 -13.359 -14.474 -15.356 -16.197 -16.976 -17.727 -18.413 -19.009 -19.532 -19.997 -20.509 -20.983 -21.386 -21.796 -22.217 -22.568 -22.923 -23.282 -23.556 -23.847 -24.155 -24.456 -24.764 -24.98 -25.199 -25.54 -25.787 -26.037 -26.159 -26.405 -26.664 -26.938 -27.083 -27.384 -27.563 -27.733 -27.91 -28.29 -28.5 -28.728 -28.981 -29.265 -29.583 -29.991 -31.059 -7 ,1773 ,KEBNE ,17125929,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:55 CET,0.0 0.924 1.231 1.43 1.603 1.755 1.88 1.998 2.207 2.299 2.384 2.444 2.641 2.718 2.85 2.96 3.073 3.12 3.204 3.277 3.378 3.447 3.508 3.596 3.682 3.774 3.864 3.942 4.025 4.099 4.164 4.227 4.282 4.344 4.409 4.476 4.546 4.569 4.546 4.569 4.592 4.518 4.361 4.147 3.842 3.453 2.928 2.184 1.039 -0.647 -3.44 -6.659 -9.082 -11.154 -12.872 -14.363 -15.679 -16.768 -17.64 -18.51 -19.261 -19.931 -20.557 -21.122 -21.652 -22.153 -22.673 -23.124 -23.521 -23.934 -24.352 -24.701 -25.062 -25.435 -25.721 -26.013 -26.323 -26.643 -26.955 -27.161 -27.381 -27.734 -27.972 -28.215 -28.341 -28.594 -28.848 -29.123 -29.272 -29.573 -29.752 -29.93 -30.105 -30.489 -30.718 -30.963 -31.226 -31.521 -31.836 -32.214 -33.382 -8 ,10966 ,KEBNE ,17125930,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:37:39 CET,0.0 0.943 1.234 1.436 1.597 1.74 1.871 1.985 2.19 2.283 2.371 2.416 2.596 2.665 2.798 2.91 3.008 3.055 3.14 3.211 3.312 3.386 3.462 3.554 3.647 3.758 3.86 3.936 4.009 4.079 4.151 4.222 4.279 4.322 4.376 4.462 4.513 4.524 4.53 4.522 4.497 4.427 4.336 4.268 4.107 3.83 3.425 2.832 1.909 0.409 -2.146 -5.098 -7.413 -9.358 -10.963 -12.355 -13.549 -14.58 -15.458 -16.322 -17.019 -17.664 -18.302 -18.866 -19.386 -19.864 -20.359 -20.807 -21.205 -21.62 -22.041 -22.4 -22.776 -23.157 -23.438 -23.726 -24.027 -24.329 -24.659 -24.893 -25.129 -25.477 -25.715 -25.964 -26.092 -26.358 -26.647 -26.945 -27.098 -27.402 -27.591 -27.767 -27.954 -28.368 -28.607 -28.867 -29.14 -29.459 -29.842 -30.33 -31.429 -9 ,29465 ,KEBNE ,17125931,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:35 CET,0.0 0.841 1.099 1.318 1.511 1.667 1.807 1.931 2.158 2.253 2.334 2.384 2.572 2.642 2.769 2.876 2.974 3.018 3.096 3.168 3.282 3.36 3.434 3.524 3.597 3.679 3.755 3.834 3.932 4.011 4.088 4.171 4.231 4.276 4.321 4.384 4.434 4.46 4.471 4.456 4.419 4.39 4.307 4.12 3.905 3.638 3.183 2.538 1.566 0.008 -2.603 -5.707 -8.208 -10.194 -11.895 -13.445 -14.769 -15.919 -16.859 -17.788 -18.596 -19.289 -19.938 -20.557 -21.113 -21.614 -22.138 -22.597 -23.002 -23.415 -23.837 -24.187 -24.548 -24.918 -25.196 -25.482 -25.779 -26.082 -26.399 -26.618 -26.849 -27.196 -27.417 -27.649 -27.771 -28.027 -28.288 -28.561 -28.713 -29.012 -29.179 -29.338 -29.513 -29.923 -30.153 -30.389 -30.646 -30.923 -31.218 -31.617 -32.708 -10 ,21655 ,KEBNE ,17125932,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:37:02 CET,0.0 0.823 1.119 1.339 1.51 1.647 1.755 1.857 2.054 2.153 2.241 2.277 2.449 2.51 2.636 2.768 2.884 2.933 3.029 3.12 3.232 3.295 3.351 3.421 3.493 3.574 3.654 3.734 3.832 3.912 3.984 4.06 4.113 4.151 4.21 4.265 4.307 4.354 4.391 4.428 4.428 4.379 4.275 4.1 3.817 3.421 2.919 2.212 1.126 -0.505 -3.198 -6.226 -8.588 -10.505 -12.054 -13.439 -14.649 -15.697 -16.592 -17.466 -18.203 -18.863 -19.49 -20.082 -20.639 -21.142 -21.66 -22.119 -22.506 -22.891 -23.297 -23.638 -23.978 -24.331 -24.613 -24.893 -25.17 -25.471 -25.781 -25.982 -26.192 -26.53 -26.766 -27.014 -27.142 -27.408 -27.685 -27.968 -28.119 -28.418 -28.604 -28.774 -28.956 -29.376 -29.61 -29.849 -30.102 -30.398 -30.746 -31.184 -32.561 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_167_234.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_167_234.txt deleted file mode 100644 index 15517617..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_167_234.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30314 ,KEBNE ,16707860,Fri Nov 26 13:59:33 CET,Fri Nov 26 15:30:53 CET,0.0 0.8 1.069 1.265 1.377 1.476 1.567 1.65 1.828 1.898 1.963 2.025 2.168 2.22 2.3 2.36 2.405 2.42 2.452 2.482 2.516 2.537 2.546 2.557 2.586 2.603 2.609 2.609 2.581 2.548 2.5 2.436 2.376 2.311 2.219 2.084 1.942 1.77 1.543 1.281 0.985 0.623 0.148 -0.383 -1.051 -1.871 -2.962 -4.382 -6.297 -9.012 -13.174 -17.608 -20.906 -23.597 -25.802 -27.591 -29.116 -30.43 -31.499 -32.553 -33.428 -34.205 -34.931 -35.59 -36.182 -36.714 -37.304 -37.847 -38.313 -38.778 -39.233 -39.585 -39.935 -40.299 -40.574 -40.857 -41.153 -41.476 -41.82 -42.05 -42.275 -42.618 -42.862 -43.127 -43.267 -43.571 -43.879 -44.198 -44.36 -44.64 -44.838 -45.017 -45.205 -45.606 -45.822 -46.047 -46.276 -46.524 -46.818 -47.202 -48.029 -2 ,20059 ,KEBNE ,16707861,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:43 CET,0.0 0.719 0.98 1.219 1.393 1.506 1.603 1.7 1.874 1.942 2.004 2.027 2.146 2.183 2.261 2.328 2.388 2.418 2.474 2.524 2.594 2.632 2.666 2.692 2.698 2.711 2.726 2.747 2.746 2.735 2.736 2.717 2.676 2.606 2.514 2.4 2.266 2.103 1.927 1.752 1.558 1.302 0.902 0.381 -0.319 -1.179 -2.277 -3.692 -5.6 -8.246 -12.271 -16.762 -20.093 -22.683 -24.787 -26.589 -28.086 -29.336 -30.352 -31.35 -32.197 -32.951 -33.662 -34.303 -34.896 -35.461 -36.023 -36.509 -36.935 -37.371 -37.81 -38.172 -38.544 -38.918 -39.219 -39.544 -39.881 -40.244 -40.609 -40.853 -41.112 -41.495 -41.738 -41.987 -42.123 -42.399 -42.688 -43.008 -43.166 -43.439 -43.645 -43.815 -43.977 -44.325 -44.512 -44.714 -44.933 -45.174 -45.447 -45.864 -46.971 -3 ,30331 ,KEBNE ,16707862,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:31:38 CET,0.0 0.535 0.847 1.049 1.18 1.313 1.449 1.554 1.699 1.765 1.824 1.842 1.965 2.007 2.097 2.206 2.296 2.326 2.375 2.43 2.508 2.537 2.576 2.654 2.722 2.762 2.788 2.82 2.824 2.807 2.796 2.767 2.711 2.64 2.533 2.4 2.27 2.105 1.913 1.694 1.437 1.118 0.686 0.197 -0.462 -1.306 -2.414 -3.806 -5.693 -8.451 -12.57 -16.978 -20.384 -23.107 -25.333 -27.208 -28.711 -29.955 -31.015 -32.077 -32.945 -33.684 -34.362 -35.006 -35.618 -36.172 -36.749 -37.233 -37.623 -38.032 -38.483 -38.871 -39.268 -39.649 -39.929 -40.23 -40.566 -40.895 -41.205 -41.418 -41.637 -41.981 -42.211 -42.445 -42.565 -42.831 -43.11 -43.391 -43.534 -43.808 -43.999 -44.154 -44.311 -44.658 -44.848 -45.046 -45.257 -45.506 -45.81 -46.191 -47.428 -4 ,13708 ,KEBNE ,16707863,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:32 CET,0.0 0.714 1.001 1.167 1.3 1.413 1.508 1.591 1.72 1.771 1.829 1.854 1.979 2.029 2.122 2.192 2.244 2.264 2.31 2.369 2.454 2.492 2.524 2.564 2.592 2.605 2.6 2.596 2.598 2.602 2.616 2.623 2.604 2.556 2.462 2.33 2.21 2.068 1.866 1.668 1.499 1.227 0.774 0.243 -0.458 -1.287 -2.368 -3.79 -5.706 -8.406 -12.51 -16.908 -20.306 -22.962 -25.09 -26.894 -28.378 -29.677 -30.807 -31.919 -32.833 -33.609 -34.296 -34.94 -35.554 -36.132 -36.706 -37.233 -37.733 -38.201 -38.64 -39.036 -39.464 -39.887 -40.208 -40.533 -40.859 -41.197 -41.53 -41.755 -41.999 -42.385 -42.653 -42.915 -43.044 -43.302 -43.57 -43.845 -43.993 -44.278 -44.479 -44.641 -44.809 -45.179 -45.371 -45.596 -45.85 -46.123 -46.413 -46.796 -47.966 -5 ,27985 ,KEBNE ,16707864,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:41 CET,0.0 0.577 0.792 0.948 1.092 1.206 1.298 1.38 1.5 1.561 1.627 1.674 1.822 1.879 1.96 2.018 2.063 2.087 2.129 2.155 2.189 2.217 2.238 2.273 2.307 2.317 2.308 2.292 2.264 2.227 2.183 2.154 2.154 2.126 2.037 1.902 1.758 1.599 1.411 1.201 0.981 0.67 0.203 -0.319 -0.973 -1.813 -2.925 -4.365 -6.333 -9.028 -13.051 -17.373 -20.621 -23.226 -25.379 -27.2 -28.697 -29.981 -31.065 -32.133 -33.028 -33.833 -34.552 -35.19 -35.793 -36.34 -36.913 -37.434 -37.897 -38.353 -38.793 -39.149 -39.5 -39.867 -40.165 -40.478 -40.792 -41.098 -41.402 -41.614 -41.857 -42.261 -42.537 -42.814 -42.952 -43.241 -43.537 -43.83 -43.989 -44.285 -44.51 -44.692 -44.862 -45.204 -45.386 -45.581 -45.813 -46.066 -46.349 -46.712 -47.424 -6 ,15423 ,KEBNE ,16707865,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:31:43 CET,0.0 0.814 1.069 1.258 1.425 1.556 1.655 1.741 1.932 2.014 2.079 2.106 2.231 2.269 2.326 2.395 2.468 2.499 2.553 2.616 2.685 2.709 2.743 2.785 2.8 2.802 2.805 2.795 2.771 2.774 2.762 2.703 2.625 2.542 2.436 2.296 2.192 2.075 1.902 1.674 1.403 1.057 0.593 0.077 -0.594 -1.41 -2.493 -3.905 -5.821 -8.527 -12.684 -17.163 -20.601 -23.282 -25.392 -27.189 -28.692 -30.064 -31.273 -32.431 -33.361 -34.136 -34.849 -35.53 -36.142 -36.67 -37.214 -37.751 -38.225 -38.695 -39.178 -39.572 -39.957 -40.332 -40.638 -40.955 -41.268 -41.594 -41.932 -42.154 -42.38 -42.742 -43.007 -43.28 -43.42 -43.705 -43.982 -44.275 -44.426 -44.701 -44.901 -45.076 -45.263 -45.66 -45.865 -46.095 -46.347 -46.607 -46.935 -47.352 -48.443 -7 ,11912 ,KEBNE ,16707866,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:31:39 CET,0.0 0.778 1.024 1.196 1.341 1.473 1.58 1.659 1.783 1.841 1.901 1.93 2.049 2.079 2.121 2.166 2.216 2.244 2.298 2.344 2.408 2.444 2.479 2.532 2.557 2.572 2.578 2.575 2.589 2.587 2.584 2.561 2.523 2.496 2.459 2.381 2.283 2.166 1.978 1.741 1.463 1.107 0.644 0.159 -0.504 -1.407 -2.564 -4.054 -6.02 -8.704 -12.838 -17.25 -20.575 -23.23 -25.401 -27.365 -29.076 -30.509 -31.696 -32.849 -33.775 -34.564 -35.311 -35.989 -36.585 -37.118 -37.671 -38.155 -38.593 -39.068 -39.556 -39.956 -40.34 -40.736 -41.058 -41.386 -41.722 -42.051 -42.383 -42.605 -42.84 -43.237 -43.508 -43.789 -43.936 -44.24 -44.554 -44.867 -45.028 -45.322 -45.555 -45.733 -45.914 -46.315 -46.539 -46.787 -47.046 -47.34 -47.674 -48.085 -49.196 -8 ,13830 ,KEBNE ,16707867,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:35 CET,0.0 0.651 0.879 1.06 1.2 1.336 1.471 1.573 1.731 1.805 1.884 1.946 2.081 2.133 2.219 2.292 2.362 2.396 2.45 2.49 2.578 2.646 2.685 2.716 2.774 2.834 2.882 2.928 2.982 3.001 2.962 2.897 2.834 2.755 2.649 2.522 2.379 2.213 2.022 1.796 1.535 1.188 0.736 0.234 -0.441 -1.316 -2.464 -3.888 -5.803 -8.524 -12.697 -17.192 -20.517 -23.132 -25.285 -27.101 -28.627 -29.949 -31.054 -32.11 -32.971 -33.741 -34.467 -35.111 -35.71 -36.298 -36.906 -37.404 -37.83 -38.287 -38.759 -39.148 -39.517 -39.874 -40.151 -40.44 -40.755 -41.084 -41.406 -41.633 -41.868 -42.225 -42.461 -42.688 -42.814 -43.085 -43.344 -43.61 -43.749 -44.014 -44.192 -44.36 -44.532 -44.898 -45.107 -45.333 -45.565 -45.813 -46.107 -46.473 -47.362 -9 ,1728 ,KEBNE ,16707868,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:44 CET,0.0 0.801 1.049 1.236 1.368 1.492 1.602 1.699 1.872 1.949 2.025 2.057 2.177 2.224 2.315 2.378 2.428 2.45 2.478 2.501 2.555 2.599 2.641 2.696 2.741 2.776 2.81 2.826 2.809 2.786 2.755 2.719 2.707 2.669 2.581 2.472 2.361 2.214 2.034 1.808 1.56 1.251 0.809 0.339 -0.291 -1.12 -2.2 -3.588 -5.523 -8.268 -12.43 -16.876 -20.228 -22.871 -24.971 -26.745 -28.201 -29.447 -30.502 -31.529 -32.382 -33.126 -33.809 -34.464 -35.072 -35.579 -36.15 -36.697 -37.164 -37.641 -38.089 -38.443 -38.806 -39.192 -39.498 -39.794 -40.098 -40.418 -40.742 -40.962 -41.194 -41.556 -41.808 -42.081 -42.227 -42.504 -42.769 -43.062 -43.221 -43.508 -43.726 -43.903 -44.086 -44.494 -44.721 -44.954 -45.196 -45.482 -45.807 -46.205 -47.164 -10 ,3013 ,KEBNE ,16707869,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:10 CET,0.0 0.779 1.054 1.232 1.383 1.541 1.675 1.764 1.903 1.969 2.044 2.101 2.232 2.282 2.375 2.443 2.506 2.545 2.614 2.668 2.748 2.785 2.817 2.879 2.919 2.946 2.964 2.979 2.997 2.978 2.963 2.95 2.902 2.851 2.791 2.673 2.556 2.434 2.254 2.038 1.831 1.565 1.096 0.553 -0.118 -0.98 -2.12 -3.555 -5.476 -8.221 -12.503 -17.087 -20.419 -23.012 -25.06 -26.817 -28.337 -29.635 -30.699 -31.753 -32.636 -33.448 -34.286 -35.012 -35.608 -36.169 -36.751 -37.264 -37.716 -38.16 -38.618 -39.011 -39.43 -39.864 -40.178 -40.489 -40.792 -41.096 -41.407 -41.618 -41.848 -42.199 -42.449 -42.711 -42.835 -43.085 -43.355 -43.653 -43.804 -44.076 -44.26 -44.427 -44.596 -44.933 -45.108 -45.312 -45.545 -45.801 -46.117 -46.519 -47.542 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_1_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_1_61.txt deleted file mode 100644 index 0a609463..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_1_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4911 ,KEBNE ,16707870,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:29 CET,0.0 1.104 1.431 1.655 1.809 1.933 2.043 2.145 2.325 2.403 2.464 2.513 2.624 2.685 2.801 2.866 2.906 2.927 2.98 3.032 3.074 3.086 3.104 3.136 3.15 3.152 3.156 3.161 3.151 3.14 3.124 3.082 3.02 2.941 2.866 2.777 2.652 2.479 2.267 2.026 1.735 1.385 0.929 0.431 -0.201 -1.053 -2.154 -3.572 -5.538 -8.313 -12.366 -16.7 -20.019 -22.629 -24.777 -26.677 -28.24 -29.568 -30.709 -31.83 -32.751 -33.592 -34.41 -35.129 -35.776 -36.338 -36.893 -37.38 -37.8 -38.264 -38.758 -39.162 -39.586 -39.994 -40.292 -40.614 -40.939 -41.261 -41.59 -41.819 -42.059 -42.406 -42.653 -42.925 -43.063 -43.336 -43.616 -43.912 -44.062 -44.336 -44.577 -44.744 -44.921 -45.297 -45.527 -45.786 -46.042 -46.323 -46.661 -47.091 -48.427 -2 ,8182 ,KEBNE ,16707871,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:44 CET,0.0 0.979 1.275 1.487 1.631 1.754 1.864 1.96 2.123 2.195 2.266 2.33 2.432 2.485 2.59 2.673 2.755 2.793 2.849 2.898 2.969 3.0 3.026 3.059 3.08 3.122 3.166 3.168 3.128 3.085 3.037 2.992 2.968 2.944 2.901 2.837 2.73 2.562 2.377 2.177 1.922 1.566 1.106 0.591 -0.096 -0.958 -2.058 -3.444 -5.341 -8.044 -12.199 -16.608 -19.881 -22.553 -24.761 -26.576 -28.076 -29.4 -30.535 -31.621 -32.525 -33.347 -34.124 -34.807 -35.401 -35.965 -36.567 -37.094 -37.538 -37.995 -38.473 -38.862 -39.259 -39.658 -39.96 -40.276 -40.599 -40.92 -41.25 -41.492 -41.738 -42.079 -42.308 -42.573 -42.71 -42.963 -43.225 -43.513 -43.664 -43.917 -44.155 -44.337 -44.531 -44.976 -45.203 -45.44 -45.708 -45.994 -46.329 -46.839 -48.618 -3 ,21733 ,KEBNE ,16707872,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:43 CET,0.0 0.736 1.004 1.191 1.343 1.47 1.579 1.68 1.866 1.945 2.006 2.042 2.139 2.184 2.264 2.325 2.392 2.418 2.465 2.519 2.581 2.62 2.665 2.719 2.762 2.805 2.839 2.873 2.895 2.879 2.857 2.795 2.713 2.629 2.529 2.404 2.284 2.172 2.013 1.813 1.574 1.297 0.926 0.446 -0.175 -1.005 -2.1 -3.487 -5.386 -8.051 -12.043 -16.388 -19.662 -22.18 -24.207 -25.984 -27.517 -28.88 -30.09 -31.228 -32.102 -32.856 -33.552 -34.203 -34.806 -35.397 -36.045 -36.609 -37.087 -37.549 -37.996 -38.37 -38.776 -39.194 -39.503 -39.816 -40.149 -40.482 -40.798 -41.004 -41.219 -41.55 -41.781 -42.038 -42.17 -42.43 -42.713 -43.02 -43.17 -43.424 -43.661 -43.845 -44.026 -44.403 -44.609 -44.825 -45.051 -45.307 -45.594 -45.96 -46.909 -4 ,31378 ,KEBNE ,16707873,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:36 CET,0.0 0.714 0.972 1.163 1.319 1.439 1.542 1.636 1.806 1.884 1.963 2.061 2.165 2.2 2.268 2.342 2.423 2.459 2.517 2.564 2.625 2.65 2.671 2.696 2.711 2.744 2.782 2.807 2.816 2.797 2.763 2.729 2.724 2.69 2.612 2.517 2.427 2.324 2.144 1.892 1.64 1.339 0.92 0.439 -0.22 -1.073 -2.134 -3.482 -5.282 -7.82 -11.756 -16.002 -19.175 -21.706 -23.756 -25.481 -26.996 -28.366 -29.465 -30.511 -31.386 -32.142 -32.838 -33.465 -34.064 -34.602 -35.133 -35.611 -36.032 -36.466 -36.917 -37.299 -37.69 -38.087 -38.389 -38.705 -39.031 -39.351 -39.684 -39.918 -40.16 -40.529 -40.775 -41.036 -41.168 -41.422 -41.672 -41.931 -42.072 -42.329 -42.553 -42.729 -42.911 -43.299 -43.514 -43.738 -43.971 -44.236 -44.553 -44.978 -46.185 -5 ,21616 ,KEBNE ,16707874,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:22 CET,0.0 0.94 1.238 1.432 1.582 1.715 1.835 1.941 2.136 2.208 2.261 2.317 2.429 2.474 2.571 2.669 2.753 2.79 2.862 2.922 2.999 3.056 3.101 3.136 3.161 3.174 3.168 3.157 3.131 3.094 3.054 3.009 2.961 2.898 2.81 2.689 2.548 2.412 2.298 2.104 1.8 1.433 0.967 0.454 -0.201 -1.012 -2.066 -3.466 -5.41 -8.105 -12.184 -16.581 -19.862 -22.475 -24.584 -26.377 -27.889 -29.25 -30.4 -31.471 -32.328 -33.051 -33.729 -34.342 -34.894 -35.398 -35.933 -36.433 -36.866 -37.316 -37.76 -38.098 -38.44 -38.797 -39.085 -39.393 -39.708 -40.028 -40.344 -40.549 -40.767 -41.115 -41.366 -41.627 -41.76 -42.031 -42.301 -42.566 -42.704 -42.959 -43.178 -43.351 -43.527 -43.917 -44.125 -44.354 -44.618 -44.907 -45.256 -45.691 -46.674 -6 ,30184 ,KEBNE ,16707875,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:31:12 CET,0.0 1.065 1.334 1.518 1.663 1.78 1.881 1.976 2.143 2.214 2.271 2.297 2.404 2.453 2.549 2.639 2.71 2.742 2.798 2.847 2.898 2.919 2.936 2.969 2.99 3.023 3.073 3.101 3.133 3.144 3.13 3.112 3.085 3.037 2.952 2.839 2.701 2.525 2.318 2.081 1.802 1.454 1.057 0.61 -0.03 -0.84 -1.912 -3.269 -5.146 -7.799 -11.853 -16.248 -19.508 -22.061 -24.088 -25.789 -27.212 -28.53 -29.697 -30.818 -31.701 -32.443 -33.134 -33.777 -34.357 -34.863 -35.382 -35.862 -36.302 -36.769 -37.241 -37.6 -37.958 -38.316 -38.617 -38.952 -39.269 -39.584 -39.933 -40.185 -40.44 -40.814 -41.066 -41.323 -41.459 -41.745 -42.045 -42.358 -42.517 -42.797 -43.067 -43.256 -43.445 -43.836 -44.051 -44.283 -44.528 -44.813 -45.145 -45.539 -46.76 -7 ,12581 ,KEBNE ,16707876,Fri Nov 26 13:59:33 CET,Fri Nov 26 15:30:05 CET,0.0 0.775 1.053 1.236 1.388 1.528 1.654 1.763 1.962 2.048 2.112 2.161 2.273 2.323 2.416 2.49 2.564 2.598 2.655 2.708 2.762 2.784 2.808 2.831 2.851 2.878 2.892 2.902 2.91 2.925 2.93 2.895 2.86 2.823 2.755 2.646 2.52 2.367 2.173 1.935 1.668 1.334 0.904 0.407 -0.247 -1.084 -2.197 -3.604 -5.527 -8.193 -12.27 -16.674 -19.961 -22.57 -24.654 -26.397 -27.847 -29.088 -30.146 -31.227 -32.11 -32.844 -33.522 -34.145 -34.74 -35.284 -35.853 -36.357 -36.789 -37.224 -37.664 -38.036 -38.403 -38.777 -39.08 -39.389 -39.692 -40.014 -40.342 -40.567 -40.804 -41.173 -41.425 -41.684 -41.821 -42.095 -42.368 -42.644 -42.788 -43.05 -43.293 -43.473 -43.654 -44.039 -44.247 -44.46 -44.693 -44.93 -45.205 -45.598 -46.569 -8 ,295 ,KEBNE ,16707877,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:47 CET,0.0 0.931 1.19 1.394 1.562 1.693 1.805 1.902 2.084 2.166 2.234 2.29 2.415 2.48 2.579 2.661 2.728 2.764 2.851 2.917 2.98 3.005 3.03 3.055 3.055 3.066 3.1 3.147 3.193 3.231 3.268 3.265 3.223 3.178 3.103 2.978 2.83 2.65 2.438 2.193 1.912 1.569 1.128 0.627 -0.029 -0.847 -1.952 -3.39 -5.314 -8.033 -12.127 -16.576 -19.979 -22.642 -24.765 -26.567 -28.027 -29.277 -30.377 -31.538 -32.567 -33.414 -34.14 -34.807 -35.425 -35.98 -36.568 -37.105 -37.572 -38.039 -38.514 -38.9 -39.272 -39.627 -39.901 -40.211 -40.541 -40.866 -41.207 -41.45 -41.678 -42.012 -42.249 -42.49 -42.621 -42.897 -43.175 -43.465 -43.617 -43.877 -44.086 -44.253 -44.426 -44.75 -44.92 -45.117 -45.344 -45.628 -45.97 -46.403 -47.709 -9 ,31376 ,KEBNE ,16707878,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:31 CET,0.0 0.828 1.102 1.307 1.472 1.615 1.724 1.812 1.969 2.046 2.126 2.183 2.298 2.35 2.423 2.498 2.584 2.621 2.673 2.71 2.773 2.823 2.868 2.908 2.913 2.908 2.925 2.953 2.963 2.952 2.962 2.97 2.925 2.867 2.79 2.689 2.576 2.435 2.251 2.013 1.742 1.421 1.02 0.52 -0.159 -1.004 -2.105 -3.535 -5.412 -8.03 -12.057 -16.445 -19.837 -22.588 -24.772 -26.559 -28.046 -29.327 -30.472 -31.634 -32.544 -33.315 -34.033 -34.736 -35.4 -35.977 -36.569 -37.073 -37.49 -37.923 -38.371 -38.732 -39.098 -39.473 -39.771 -40.063 -40.347 -40.644 -40.963 -41.186 -41.411 -41.777 -42.019 -42.256 -42.377 -42.627 -42.891 -43.175 -43.327 -43.588 -43.825 -44.009 -44.189 -44.564 -44.767 -44.99 -45.24 -45.515 -45.824 -46.189 -47.32 -10 ,5683 ,KEBNE ,16707879,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:30:26 CET,0.0 1.057 1.356 1.528 1.681 1.801 1.926 2.042 2.225 2.304 2.367 2.425 2.536 2.592 2.705 2.8 2.881 2.918 2.988 3.051 3.108 3.136 3.171 3.223 3.275 3.327 3.353 3.348 3.331 3.34 3.355 3.352 3.329 3.284 3.219 3.102 2.954 2.779 2.567 2.32 2.046 1.689 1.245 0.773 0.164 -0.634 -1.731 -3.151 -5.129 -7.943 -12.096 -16.674 -20.155 -22.828 -24.944 -26.709 -28.255 -29.597 -30.74 -31.868 -32.771 -33.541 -34.259 -34.915 -35.513 -36.064 -36.614 -37.111 -37.552 -38.008 -38.486 -38.867 -39.238 -39.625 -39.95 -40.287 -40.621 -40.959 -41.297 -41.519 -41.738 -42.083 -42.334 -42.591 -42.723 -43.003 -43.311 -43.631 -43.795 -44.076 -44.322 -44.49 -44.66 -45.053 -45.268 -45.507 -45.786 -46.067 -46.36 -46.749 -47.904 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_1_84.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_1_84.txt deleted file mode 100644 index ce557c67..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_1_84.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32601 ,KEBNE ,16707880,Fri Nov 26 13:59:35 CET,Fri Nov 26 15:29:57 CET,0.0 0.781 1.101 1.333 1.501 1.643 1.771 1.889 2.09 2.176 2.267 2.379 2.514 2.586 2.703 2.821 2.942 2.996 3.096 3.186 3.312 3.394 3.479 3.59 3.681 3.771 3.852 3.926 4.024 4.115 4.2 4.307 4.396 4.475 4.572 4.673 4.75 4.819 4.885 4.942 4.996 5.033 5.04 5.022 4.989 4.925 4.77 4.477 3.952 3.055 1.525 -0.494 -2.333 -3.787 -4.94 -5.941 -6.788 -7.555 -8.219 -8.912 -9.549 -10.148 -10.7 -11.223 -11.738 -12.199 -12.648 -13.024 -13.367 -13.733 -14.092 -14.39 -14.697 -15.004 -15.246 -15.498 -15.755 -16.026 -16.318 -16.521 -16.728 -17.044 -17.256 -17.47 -17.581 -17.802 -18.021 -18.273 -18.412 -18.644 -18.889 -19.052 -19.221 -19.592 -19.778 -19.983 -20.204 -20.437 -20.728 -21.113 -22.104 -2 ,2032 ,KEBNE ,16707881,Fri Nov 26 13:59:35 CET,Fri Nov 26 15:30:17 CET,0.0 0.813 1.118 1.343 1.511 1.65 1.784 1.909 2.111 2.201 2.292 2.392 2.531 2.605 2.746 2.876 2.987 3.035 3.124 3.225 3.359 3.439 3.523 3.635 3.737 3.823 3.9 3.985 4.092 4.179 4.271 4.376 4.459 4.532 4.606 4.692 4.777 4.868 4.95 5.02 5.072 5.111 5.157 5.184 5.187 5.151 4.984 4.646 4.131 3.308 1.895 0.055 -1.576 -2.94 -4.083 -5.147 -6.09 -6.939 -7.702 -8.431 -9.012 -9.52 -10.006 -10.48 -10.908 -11.283 -11.666 -12.044 -12.386 -12.74 -13.101 -13.383 -13.684 -14.01 -14.27 -14.538 -14.804 -15.075 -15.36 -15.557 -15.755 -16.062 -16.28 -16.503 -16.619 -16.863 -17.111 -17.361 -17.496 -17.712 -17.939 -18.108 -18.283 -18.655 -18.852 -19.066 -19.298 -19.541 -19.836 -20.275 -21.508 -3 ,3309 ,KEBNE ,16707882,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:29:30 CET,0.0 0.615 0.891 1.114 1.305 1.464 1.604 1.722 1.922 2.007 2.09 2.189 2.325 2.397 2.528 2.639 2.737 2.794 2.901 2.995 3.128 3.208 3.288 3.392 3.489 3.591 3.694 3.788 3.888 3.973 4.057 4.148 4.226 4.302 4.396 4.486 4.536 4.59 4.668 4.739 4.788 4.83 4.842 4.832 4.771 4.682 4.496 4.053 3.401 2.406 0.651 -1.538 -3.32 -4.76 -5.99 -7.066 -7.998 -8.873 -9.612 -10.295 -10.884 -11.417 -11.937 -12.432 -12.897 -13.353 -13.845 -14.258 -14.618 -14.994 -15.383 -15.711 -16.031 -16.353 -16.609 -16.893 -17.208 -17.521 -17.809 -18.016 -18.232 -18.56 -18.793 -19.028 -19.143 -19.376 -19.633 -19.897 -20.037 -20.276 -20.521 -20.687 -20.855 -21.233 -21.44 -21.656 -21.905 -22.191 -22.504 -22.886 -24.286 -4 ,18876 ,KEBNE ,16707883,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:29:31 CET,0.0 0.793 1.087 1.293 1.454 1.602 1.73 1.849 2.059 2.16 2.257 2.373 2.504 2.573 2.712 2.83 2.932 2.984 3.092 3.197 3.351 3.439 3.517 3.626 3.721 3.812 3.901 3.993 4.108 4.199 4.282 4.384 4.473 4.543 4.619 4.705 4.777 4.841 4.914 5.007 5.082 5.126 5.141 5.137 5.097 4.971 4.752 4.416 3.88 3.011 1.511 -0.468 -2.195 -3.637 -4.848 -5.946 -6.913 -7.793 -8.498 -9.166 -9.779 -10.334 -10.867 -11.401 -11.894 -12.297 -12.674 -13.002 -13.3 -13.625 -13.97 -14.263 -14.566 -14.858 -15.083 -15.33 -15.577 -15.82 -16.09 -16.278 -16.468 -16.763 -16.979 -17.203 -17.31 -17.532 -17.771 -18.037 -18.178 -18.397 -18.602 -18.75 -18.919 -19.281 -19.478 -19.683 -19.914 -20.167 -20.454 -20.816 -21.97 -5 ,11117 ,KEBNE ,16707884,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:29:54 CET,0.0 1.089 1.389 1.627 1.806 1.957 2.103 2.23 2.433 2.53 2.62 2.711 2.84 2.911 3.048 3.169 3.283 3.332 3.416 3.5 3.624 3.695 3.76 3.856 3.942 4.03 4.12 4.2 4.293 4.37 4.448 4.547 4.613 4.676 4.751 4.816 4.859 4.891 4.919 4.949 4.966 4.946 4.903 4.837 4.694 4.457 4.117 3.619 2.788 1.582 -0.338 -2.842 -4.953 -6.8 -8.489 -9.854 -10.909 -11.879 -12.745 -13.619 -14.329 -14.96 -15.57 -16.121 -16.614 -17.069 -17.552 -17.964 -18.302 -18.649 -19.019 -19.33 -19.655 -19.992 -20.244 -20.504 -20.774 -21.044 -21.317 -21.514 -21.72 -22.018 -22.221 -22.434 -22.545 -22.786 -23.046 -23.329 -23.469 -23.688 -23.895 -24.045 -24.211 -24.588 -24.789 -24.99 -25.201 -25.439 -25.714 -26.063 -27.21 -6 ,14556 ,KEBNE ,16707885,Fri Nov 26 13:59:34 CET,Fri Nov 26 15:29:39 CET,0.0 0.863 1.159 1.372 1.549 1.711 1.851 1.972 2.161 2.244 2.332 2.432 2.554 2.622 2.746 2.846 2.944 2.988 3.072 3.157 3.276 3.352 3.421 3.523 3.626 3.711 3.788 3.869 3.976 4.071 4.156 4.261 4.352 4.437 4.527 4.609 4.686 4.777 4.855 4.902 4.945 5.008 5.06 5.073 5.03 4.91 4.695 4.328 3.751 2.737 0.876 -1.309 -3.083 -4.616 -5.9 -7.007 -7.988 -8.876 -9.644 -10.424 -11.108 -11.7 -12.24 -12.741 -13.205 -13.619 -14.054 -14.462 -14.804 -15.147 -15.496 -15.79 -16.097 -16.411 -16.643 -16.887 -17.151 -17.414 -17.679 -17.871 -18.066 -18.355 -18.554 -18.761 -18.878 -19.114 -19.335 -19.583 -19.712 -19.926 -20.13 -20.279 -20.447 -20.831 -21.023 -21.231 -21.465 -21.734 -22.063 -22.558 -23.901 -7 ,8249 ,KEBNE ,16707886,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:30:44 CET,0.0 0.79 1.042 1.27 1.465 1.611 1.724 1.84 2.06 2.155 2.248 2.354 2.488 2.56 2.692 2.811 2.917 2.964 3.05 3.134 3.252 3.329 3.413 3.532 3.634 3.726 3.816 3.912 4.025 4.123 4.214 4.307 4.383 4.458 4.558 4.678 4.777 4.863 4.936 4.997 5.071 5.124 5.139 5.107 5.049 4.973 4.831 4.575 4.063 3.185 1.602 -0.474 -2.249 -3.702 -4.912 -6.004 -6.945 -7.761 -8.454 -9.233 -9.954 -10.571 -11.118 -11.581 -12.013 -12.398 -12.756 -13.063 -13.35 -13.684 -14.033 -14.33 -14.648 -14.956 -15.179 -15.413 -15.663 -15.926 -16.208 -16.403 -16.602 -16.907 -17.122 -17.344 -17.455 -17.679 -17.907 -18.141 -18.266 -18.471 -18.664 -18.814 -18.974 -19.329 -19.528 -19.734 -19.957 -20.228 -20.572 -21.021 -22.257 -8 ,14374 ,KEBNE ,16707887,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:32:17 CET,0.0 0.945 1.22 1.424 1.59 1.731 1.863 1.986 2.186 2.274 2.363 2.471 2.596 2.659 2.784 2.902 3.018 3.071 3.169 3.262 3.383 3.457 3.528 3.629 3.715 3.793 3.871 3.945 4.051 4.161 4.263 4.37 4.46 4.544 4.639 4.721 4.796 4.872 4.937 5.005 5.049 5.072 5.092 5.081 5.007 4.873 4.637 4.298 3.785 2.89 1.238 -0.795 -2.517 -4.029 -5.33 -6.532 -7.571 -8.442 -9.137 -9.832 -10.453 -11.008 -11.55 -12.052 -12.52 -12.966 -13.428 -13.82 -14.173 -14.548 -14.908 -15.206 -15.518 -15.829 -16.067 -16.33 -16.617 -16.913 -17.224 -17.438 -17.644 -17.953 -18.169 -18.391 -18.508 -18.739 -18.966 -19.212 -19.35 -19.574 -19.787 -19.946 -20.12 -20.491 -20.686 -20.889 -21.123 -21.428 -21.791 -22.226 -23.557 -9 ,22593 ,KEBNE ,16707888,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:33:01 CET,0.0 0.986 1.31 1.543 1.727 1.884 2.021 2.142 2.351 2.444 2.531 2.639 2.773 2.849 2.979 3.086 3.183 3.227 3.325 3.429 3.566 3.648 3.718 3.804 3.895 3.983 4.054 4.122 4.212 4.302 4.392 4.49 4.569 4.64 4.727 4.842 4.941 5.013 5.08 5.14 5.191 5.248 5.271 5.257 5.246 5.189 5.029 4.719 4.15 3.22 1.613 -0.443 -2.202 -3.718 -5.071 -6.303 -7.32 -8.17 -8.902 -9.649 -10.278 -10.821 -11.33 -11.819 -12.277 -12.693 -13.129 -13.511 -13.832 -14.144 -14.475 -14.764 -15.048 -15.34 -15.589 -15.837 -16.078 -16.337 -16.611 -16.805 -17.003 -17.304 -17.504 -17.709 -17.819 -18.04 -18.266 -18.506 -18.637 -18.854 -19.058 -19.2 -19.346 -19.688 -19.885 -20.097 -20.319 -20.589 -20.913 -21.309 -22.219 -10 ,28764 ,KEBNE ,16707889,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:30:32 CET,0.0 1.103 1.475 1.72 1.914 2.08 2.225 2.347 2.561 2.658 2.749 2.85 2.982 3.054 3.181 3.292 3.393 3.442 3.539 3.637 3.769 3.844 3.916 4.022 4.134 4.239 4.33 4.418 4.514 4.6 4.689 4.785 4.875 4.957 5.04 5.128 5.209 5.282 5.335 5.387 5.434 5.456 5.465 5.442 5.364 5.222 4.973 4.607 4.071 3.139 1.23 -1.111 -3.041 -4.8 -6.257 -7.456 -8.51 -9.512 -10.384 -11.24 -11.949 -12.549 -13.115 -13.641 -14.113 -14.546 -14.994 -15.379 -15.703 -16.043 -16.402 -16.708 -17.04 -17.38 -17.619 -17.851 -18.108 -18.379 -18.65 -18.843 -19.042 -19.341 -19.557 -19.781 -19.889 -20.109 -20.366 -20.639 -20.778 -21.006 -21.242 -21.398 -21.549 -21.867 -22.052 -22.271 -22.499 -22.763 -23.093 -23.549 -24.653 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_206_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_206_163.txt deleted file mode 100644 index 7f6cafbb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_206_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12133 ,KEBNE ,16707890,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:04 CET,0.0 0.693 0.997 1.207 1.35 1.48 1.608 1.727 1.923 2.018 2.111 2.161 2.354 2.426 2.531 2.627 2.726 2.778 2.868 2.932 3.007 3.074 3.146 3.239 3.349 3.454 3.523 3.592 3.68 3.732 3.793 3.879 3.949 4.006 4.064 4.126 4.171 4.236 4.297 4.313 4.326 4.314 4.272 4.21 4.109 3.942 3.642 3.225 2.665 1.746 0.057 -1.895 -3.492 -4.881 -6.064 -7.163 -8.13 -8.947 -9.619 -10.269 -10.838 -11.383 -11.9 -12.408 -12.911 -13.374 -13.847 -14.238 -14.593 -14.962 -15.366 -15.72 -16.062 -16.389 -16.647 -16.925 -17.19 -17.463 -17.732 -17.909 -18.103 -18.434 -18.659 -18.884 -18.998 -19.233 -19.478 -19.758 -19.911 -20.191 -20.35 -20.517 -20.721 -21.191 -21.448 -21.718 -22.002 -22.316 -22.724 -23.251 -24.809 -2 ,7364 ,KEBNE ,16707891,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:33:45 CET,0.0 0.685 0.934 1.106 1.248 1.395 1.522 1.618 1.78 1.863 1.946 1.987 2.161 2.22 2.337 2.44 2.537 2.583 2.662 2.737 2.849 2.93 2.997 3.067 3.162 3.277 3.387 3.471 3.562 3.659 3.761 3.874 3.95 4.02 4.111 4.182 4.224 4.262 4.294 4.335 4.365 4.363 4.32 4.234 4.112 3.931 3.64 3.216 2.548 1.453 -0.365 -2.478 -4.245 -5.828 -7.176 -8.279 -9.232 -10.095 -10.8 -11.552 -12.282 -12.979 -13.638 -14.219 -14.729 -15.183 -15.66 -16.108 -16.531 -16.978 -17.421 -17.757 -18.1 -18.459 -18.755 -19.064 -19.367 -19.685 -20.014 -20.237 -20.453 -20.792 -21.032 -21.29 -21.428 -21.701 -21.981 -22.272 -22.423 -22.702 -22.884 -23.054 -23.234 -23.623 -23.836 -24.075 -24.331 -24.631 -25.012 -25.474 -26.763 -3 ,16569 ,KEBNE ,16707892,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:34:08 CET,0.0 0.828 1.118 1.362 1.577 1.743 1.885 2.006 2.208 2.296 2.381 2.433 2.62 2.698 2.845 2.964 3.075 3.128 3.232 3.346 3.493 3.568 3.64 3.748 3.863 3.969 4.051 4.115 4.212 4.333 4.426 4.503 4.597 4.699 4.816 4.943 5.065 5.177 5.244 5.277 5.287 5.292 5.283 5.233 5.127 4.943 4.654 4.247 3.658 2.683 0.898 -1.179 -2.851 -4.257 -5.453 -6.515 -7.451 -8.284 -8.973 -9.655 -10.244 -10.825 -11.416 -11.953 -12.431 -12.873 -13.338 -13.724 -14.061 -14.421 -14.799 -15.134 -15.479 -15.798 -16.041 -16.321 -16.608 -16.874 -17.146 -17.331 -17.519 -17.79 -17.982 -18.2 -18.31 -18.559 -18.823 -19.099 -19.252 -19.549 -19.748 -19.921 -20.127 -20.586 -20.803 -21.03 -21.311 -21.616 -21.971 -22.428 -24.197 -4 ,7882 ,KEBNE ,16707893,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:41 CET,0.0 0.618 0.914 1.117 1.282 1.429 1.553 1.645 1.809 1.888 1.958 1.968 2.139 2.209 2.36 2.503 2.626 2.674 2.75 2.828 2.94 3.007 3.08 3.191 3.288 3.369 3.442 3.512 3.589 3.657 3.731 3.84 3.949 4.042 4.131 4.218 4.285 4.318 4.332 4.339 4.338 4.329 4.357 4.333 4.2 4.013 3.743 3.342 2.754 1.841 0.182 -1.852 -3.515 -4.927 -6.198 -7.332 -8.266 -9.146 -9.902 -10.625 -11.259 -11.792 -12.29 -12.771 -13.198 -13.616 -14.036 -14.375 -14.699 -15.034 -15.359 -15.636 -15.947 -16.258 -16.483 -16.723 -16.977 -17.262 -17.548 -17.727 -17.926 -18.241 -18.445 -18.654 -18.763 -19.004 -19.276 -19.542 -19.663 -19.918 -20.095 -20.26 -20.424 -20.799 -20.995 -21.211 -21.464 -21.777 -22.13 -22.56 -23.959 -5 ,2524 ,KEBNE ,16707894,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:33:47 CET,0.0 0.698 0.943 1.173 1.352 1.495 1.627 1.737 1.935 2.023 2.104 2.123 2.298 2.372 2.501 2.628 2.755 2.809 2.898 2.989 3.127 3.21 3.285 3.387 3.497 3.604 3.701 3.785 3.874 3.966 4.048 4.118 4.183 4.255 4.317 4.385 4.432 4.456 4.495 4.512 4.506 4.497 4.486 4.441 4.339 4.187 3.955 3.578 2.953 2.004 0.394 -1.543 -3.17 -4.61 -5.857 -6.941 -7.875 -8.721 -9.467 -10.201 -10.791 -11.308 -11.821 -12.286 -12.696 -13.075 -13.467 -13.839 -14.165 -14.489 -14.82 -15.101 -15.406 -15.719 -15.976 -16.234 -16.48 -16.744 -17.024 -17.223 -17.423 -17.746 -17.981 -18.206 -18.326 -18.586 -18.854 -19.141 -19.284 -19.562 -19.77 -19.94 -20.119 -20.509 -20.718 -20.943 -21.181 -21.46 -21.799 -22.239 -23.32 -6 ,24477 ,KEBNE ,16707895,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:32:52 CET,0.0 0.695 0.979 1.195 1.35 1.495 1.62 1.73 1.928 2.013 2.102 2.168 2.366 2.445 2.583 2.698 2.813 2.873 2.973 3.065 3.202 3.279 3.35 3.453 3.557 3.672 3.768 3.835 3.921 4.038 4.147 4.242 4.32 4.374 4.443 4.527 4.588 4.636 4.661 4.676 4.71 4.746 4.775 4.791 4.728 4.56 4.28 3.877 3.205 2.169 0.473 -1.606 -3.299 -4.735 -5.957 -7.029 -7.952 -8.784 -9.482 -10.157 -10.752 -11.29 -11.804 -12.295 -12.759 -13.163 -13.541 -13.904 -14.234 -14.562 -14.914 -15.2 -15.489 -15.796 -16.048 -16.315 -16.581 -16.848 -17.125 -17.314 -17.52 -17.865 -18.125 -18.377 -18.484 -18.693 -18.955 -19.251 -19.405 -19.707 -19.921 -20.11 -20.307 -20.689 -20.888 -21.094 -21.323 -21.591 -21.951 -22.513 -24.279 -7 ,29696 ,KEBNE ,16707896,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:33:25 CET,0.0 0.621 0.928 1.127 1.268 1.413 1.545 1.66 1.846 1.937 2.039 2.112 2.311 2.387 2.519 2.646 2.774 2.839 2.969 3.092 3.249 3.338 3.432 3.545 3.639 3.755 3.869 3.959 4.06 4.174 4.29 4.4 4.477 4.547 4.63 4.692 4.744 4.797 4.832 4.857 4.864 4.848 4.808 4.746 4.629 4.461 4.216 3.836 3.221 2.215 0.489 -1.64 -3.408 -4.874 -6.082 -7.117 -8.014 -8.883 -9.636 -10.394 -11.048 -11.601 -12.135 -12.626 -13.08 -13.488 -13.889 -14.289 -14.66 -15.025 -15.403 -15.714 -16.071 -16.472 -16.763 -17.049 -17.362 -17.696 -18.034 -18.261 -18.487 -18.844 -19.1 -19.368 -19.505 -19.804 -20.124 -20.464 -20.647 -20.963 -21.206 -21.425 -21.677 -22.183 -22.421 -22.69 -23.003 -23.364 -23.865 -24.548 -26.839 -8 ,7898 ,KEBNE ,16707897,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:27 CET,0.0 0.76 1.041 1.241 1.419 1.566 1.698 1.829 2.06 2.148 2.226 2.274 2.462 2.537 2.683 2.807 2.923 2.974 3.066 3.163 3.303 3.384 3.458 3.566 3.652 3.735 3.812 3.897 4.037 4.169 4.3 4.444 4.539 4.626 4.742 4.825 4.866 4.926 4.996 5.047 5.066 5.051 5.017 4.958 4.85 4.679 4.406 4.021 3.42 2.39 0.643 -1.518 -3.345 -4.849 -6.068 -7.155 -8.103 -8.941 -9.641 -10.319 -10.914 -11.471 -12.048 -12.57 -13.022 -13.43 -13.833 -14.231 -14.575 -14.927 -15.319 -15.628 -15.951 -16.273 -16.508 -16.757 -17.032 -17.329 -17.637 -17.85 -18.066 -18.404 -18.614 -18.822 -18.936 -19.183 -19.443 -19.719 -19.868 -20.15 -20.346 -20.521 -20.704 -21.07 -21.282 -21.541 -21.827 -22.132 -22.437 -22.823 -24.604 -9 ,4127 ,KEBNE ,16707898,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:33:30 CET,0.0 0.856 1.126 1.333 1.51 1.663 1.801 1.93 2.151 2.235 2.307 2.324 2.503 2.567 2.69 2.829 2.965 3.019 3.123 3.235 3.392 3.501 3.599 3.726 3.833 3.917 4.001 4.074 4.161 4.236 4.3 4.368 4.433 4.498 4.605 4.723 4.796 4.878 4.95 4.989 4.992 4.989 4.989 4.958 4.848 4.684 4.43 4.011 3.345 2.269 0.469 -1.632 -3.322 -4.835 -6.155 -7.312 -8.286 -9.112 -9.81 -10.556 -11.169 -11.673 -12.167 -12.682 -13.196 -13.624 -14.034 -14.401 -14.742 -15.124 -15.505 -15.813 -16.159 -16.534 -16.81 -17.061 -17.333 -17.607 -17.887 -18.103 -18.313 -18.61 -18.825 -19.062 -19.179 -19.398 -19.612 -19.847 -19.976 -20.249 -20.465 -20.647 -20.832 -21.244 -21.459 -21.68 -21.91 -22.187 -22.54 -22.991 -24.121 -10 ,26765 ,KEBNE ,16707899,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:32:30 CET,0.0 1.038 1.405 1.668 1.901 2.107 2.291 2.449 2.732 2.86 2.978 3.099 3.304 3.386 3.554 3.712 3.839 3.891 3.989 4.088 4.233 4.338 4.444 4.592 4.744 4.882 4.997 5.11 5.25 5.37 5.497 5.632 5.715 5.778 5.881 6.046 6.169 6.239 6.296 6.357 6.431 6.481 6.453 6.396 6.322 6.169 5.886 5.412 4.757 3.769 1.952 -0.219 -2.022 -3.545 -4.828 -5.917 -6.843 -7.733 -8.536 -9.314 -9.927 -10.485 -11.022 -11.505 -11.968 -12.391 -12.836 -13.268 -13.64 -13.997 -14.339 -14.611 -14.927 -15.271 -15.525 -15.775 -16.055 -16.371 -16.702 -16.931 -17.149 -17.481 -17.72 -17.952 -18.056 -18.282 -18.547 -18.841 -18.997 -19.282 -19.479 -19.644 -19.798 -20.141 -20.33 -20.526 -20.751 -20.999 -21.322 -21.783 -23.162 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_206_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_206_252.txt deleted file mode 100644 index 05af8485..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_206_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24926 ,KEBNE ,17125933,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:37:44 CET,0.0 0.696 0.95 1.135 1.273 1.379 1.462 1.536 1.628 1.655 1.673 1.552 1.645 1.642 1.621 1.555 1.496 1.461 1.366 1.286 1.157 1.049 0.94 0.793 0.638 0.476 0.304 0.099 -0.197 -0.503 -0.815 -1.191 -1.566 -1.961 -2.438 -3.002 -3.581 -4.229 -4.947 -5.791 -6.781 -7.956 -9.446 -11.098 -13.148 -15.616 -18.759 -22.713 -27.924 -35.018 -45.424 -56.304 -64.246 -70.48 -75.524 -79.729 -83.356 -86.591 -89.213 -91.702 -93.799 -95.608 -97.239 -98.755 -100.136 -101.356 -102.62 -103.709 -104.588 -105.449 -106.364 -107.146 -107.933 -108.734 -109.351 -109.976 -110.614 -111.259 -111.914 -112.376 -112.859 -113.584 -114.065 -114.565 -114.821 -115.344 -115.881 -116.432 -116.721 -117.241 -117.627 -117.94 -118.252 -118.964 -119.358 -119.761 -120.233 -120.824 -121.465 -122.199 -124.715 -2 ,15908 ,KEBNE ,17125934,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:37 CET,0.0 0.752 0.961 1.072 1.175 1.227 1.251 1.284 1.326 1.327 1.33 1.198 1.277 1.255 1.217 1.161 1.099 1.064 0.983 0.891 0.736 0.622 0.496 0.311 0.14 -0.046 -0.248 -0.457 -0.747 -1.034 -1.334 -1.723 -2.101 -2.48 -2.938 -3.505 -4.107 -4.791 -5.565 -6.446 -7.416 -8.581 -10.068 -11.681 -13.726 -16.217 -19.326 -23.175 -28.282 -35.428 -45.967 -56.802 -64.636 -70.679 -75.459 -79.464 -82.757 -85.555 -87.917 -90.309 -92.378 -94.174 -95.839 -97.355 -98.734 -99.976 -101.213 -102.283 -103.214 -104.169 -105.15 -105.953 -106.76 -107.577 -108.201 -108.842 -109.514 -110.202 -110.901 -111.375 -111.859 -112.605 -113.1 -113.619 -113.888 -114.415 -114.97 -115.569 -115.87 -116.408 -116.814 -117.166 -117.56 -118.371 -118.789 -119.249 -119.744 -120.297 -120.945 -121.822 -125.16 -3 ,11515 ,KEBNE ,17125935,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:38:06 CET,0.0 1.022 1.332 1.512 1.621 1.701 1.768 1.826 1.893 1.911 1.908 1.789 1.89 1.882 1.859 1.826 1.797 1.773 1.704 1.638 1.515 1.414 1.311 1.154 0.985 0.821 0.668 0.499 0.224 -0.053 -0.301 -0.627 -0.968 -1.327 -1.762 -2.298 -2.878 -3.549 -4.333 -5.199 -6.181 -7.385 -8.883 -10.433 -12.352 -14.77 -17.857 -21.766 -26.976 -34.039 -44.387 -55.269 -63.286 -69.448 -74.354 -78.521 -81.998 -84.927 -87.295 -89.59 -91.506 -93.184 -94.794 -96.297 -97.7 -98.976 -100.24 -101.313 -102.191 -103.062 -103.946 -104.675 -105.427 -106.2 -106.795 -107.416 -108.062 -108.71 -109.357 -109.785 -110.228 -110.915 -111.396 -111.881 -112.126 -112.669 -113.237 -113.815 -114.118 -114.668 -115.076 -115.406 -115.758 -116.485 -116.882 -117.332 -117.801 -118.315 -118.977 -119.81 -122.605 -4 ,4037 ,KEBNE ,17125936,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:37 CET,0.0 0.818 1.116 1.272 1.376 1.487 1.548 1.546 1.55 1.564 1.577 1.5 1.61 1.603 1.576 1.532 1.485 1.455 1.386 1.32 1.21 1.123 1.029 0.869 0.684 0.5 0.334 0.17 -0.085 -0.353 -0.626 -0.981 -1.337 -1.721 -2.21 -2.784 -3.371 -4.064 -4.84 -5.721 -6.724 -7.941 -9.454 -11.088 -13.142 -15.625 -18.756 -22.615 -27.706 -34.757 -45.158 -55.941 -63.888 -70.093 -75.036 -79.244 -82.674 -85.528 -87.877 -90.146 -92.089 -93.822 -95.444 -96.951 -98.348 -99.554 -100.727 -101.784 -102.701 -103.602 -104.527 -105.293 -106.085 -106.919 -107.567 -108.217 -108.846 -109.485 -110.155 -110.596 -111.051 -111.796 -112.295 -112.799 -113.059 -113.591 -114.146 -114.713 -115.016 -115.572 -116.006 -116.355 -116.709 -117.477 -117.901 -118.38 -118.89 -119.457 -120.123 -120.922 -123.401 -5 ,15614 ,KEBNE ,17125937,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:37 CET,0.0 0.868 1.136 1.315 1.42 1.499 1.585 1.647 1.705 1.713 1.704 1.57 1.666 1.652 1.603 1.524 1.441 1.411 1.359 1.307 1.218 1.13 1.022 0.874 0.751 0.605 0.423 0.222 -0.061 -0.353 -0.635 -0.989 -1.38 -1.787 -2.264 -2.824 -3.405 -4.097 -4.89 -5.77 -6.744 -7.911 -9.384 -10.984 -13.004 -15.498 -18.675 -22.619 -27.812 -34.909 -45.483 -56.559 -64.573 -70.744 -75.642 -79.782 -83.277 -86.306 -88.78 -91.151 -93.13 -94.847 -96.444 -97.919 -99.246 -100.415 -101.611 -102.67 -103.558 -104.465 -105.395 -106.124 -106.849 -107.591 -108.168 -108.761 -109.383 -110.017 -110.632 -111.073 -111.553 -112.292 -112.791 -113.309 -113.586 -114.148 -114.716 -115.294 -115.583 -116.108 -116.509 -116.847 -117.201 -117.964 -118.379 -118.86 -119.386 -119.939 -120.562 -121.331 -123.512 -6 ,18039 ,KEBNE ,17125938,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:25 CET,0.0 0.813 1.022 1.209 1.347 1.425 1.471 1.516 1.595 1.613 1.635 1.556 1.657 1.631 1.593 1.558 1.499 1.464 1.388 1.309 1.197 1.133 1.055 0.909 0.743 0.57 0.395 0.2 -0.035 -0.269 -0.542 -0.916 -1.287 -1.655 -2.106 -2.657 -3.222 -3.876 -4.625 -5.448 -6.38 -7.543 -8.999 -10.561 -12.561 -14.972 -17.953 -21.733 -26.766 -33.657 -43.772 -54.375 -62.19 -68.456 -73.687 -78.113 -81.814 -85.031 -87.675 -90.153 -92.167 -93.92 -95.563 -97.05 -98.397 -99.611 -100.863 -101.959 -102.884 -103.82 -104.756 -105.503 -106.263 -107.074 -107.71 -108.367 -109.025 -109.669 -110.324 -110.784 -111.268 -111.996 -112.465 -112.942 -113.193 -113.726 -114.299 -114.888 -115.175 -115.699 -116.076 -116.407 -116.748 -117.467 -117.857 -118.278 -118.74 -119.275 -119.907 -120.706 -122.968 -7 ,20916 ,KEBNE ,17125939,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:36 CET,0.0 0.978 1.212 1.364 1.473 1.539 1.578 1.615 1.668 1.67 1.66 1.521 1.617 1.606 1.598 1.571 1.502 1.465 1.406 1.353 1.252 1.165 1.074 0.928 0.776 0.639 0.488 0.304 0.063 -0.179 -0.449 -0.809 -1.165 -1.529 -2.001 -2.565 -3.149 -3.84 -4.61 -5.495 -6.497 -7.693 -9.194 -10.827 -12.885 -15.343 -18.458 -22.361 -27.495 -34.517 -44.935 -55.793 -63.731 -69.907 -74.896 -79.162 -82.708 -85.803 -88.371 -90.85 -92.972 -94.798 -96.454 -97.96 -99.35 -100.606 -101.874 -102.979 -103.926 -104.878 -105.854 -106.657 -107.462 -108.3 -108.957 -109.613 -110.265 -110.929 -111.601 -112.065 -112.533 -113.241 -113.732 -114.231 -114.491 -115.044 -115.627 -116.217 -116.513 -117.06 -117.475 -117.783 -118.086 -118.806 -119.212 -119.649 -120.158 -120.711 -121.333 -122.149 -125.864 -8 ,20438 ,KEBNE ,17125940,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:45 CET,0.0 0.78 1.002 1.154 1.267 1.348 1.407 1.447 1.481 1.498 1.515 1.403 1.478 1.445 1.397 1.321 1.237 1.196 1.107 1.007 0.852 0.746 0.635 0.479 0.34 0.194 0.024 -0.156 -0.414 -0.7 -1.0 -1.4 -1.81 -2.199 -2.644 -3.184 -3.743 -4.395 -5.175 -6.057 -7.027 -8.199 -9.664 -11.255 -13.309 -15.79 -18.916 -22.854 -28.018 -35.107 -45.583 -56.502 -64.486 -70.587 -75.458 -79.543 -82.893 -85.793 -88.185 -90.464 -92.365 -94.045 -95.615 -97.02 -98.295 -99.433 -100.556 -101.545 -102.42 -103.326 -104.244 -104.994 -105.751 -106.516 -107.11 -107.7 -108.282 -108.872 -109.481 -109.906 -110.346 -111.012 -111.469 -111.93 -112.16 -112.634 -113.116 -113.635 -113.895 -114.376 -114.734 -115.06 -115.374 -116.016 -116.371 -116.767 -117.213 -117.688 -118.258 -119.026 -121.471 -9 ,15588 ,KEBNE ,17125941,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:37:12 CET,0.0 0.648 0.868 1.006 1.096 1.166 1.22 1.252 1.282 1.293 1.304 1.185 1.28 1.246 1.193 1.155 1.09 1.051 0.97 0.873 0.719 0.614 0.507 0.381 0.228 0.036 -0.144 -0.332 -0.602 -0.882 -1.179 -1.554 -1.936 -2.331 -2.787 -3.354 -3.955 -4.641 -5.433 -6.337 -7.345 -8.544 -10.055 -11.688 -13.747 -16.222 -19.342 -23.273 -28.524 -35.698 -46.168 -57.183 -65.33 -71.641 -76.726 -80.992 -84.382 -87.221 -89.635 -92.012 -93.972 -95.65 -97.239 -98.735 -100.08 -101.291 -102.544 -103.647 -104.553 -105.46 -106.387 -107.115 -107.865 -108.652 -109.27 -109.902 -110.543 -111.193 -111.847 -112.3 -112.765 -113.456 -113.928 -114.441 -114.703 -115.227 -115.786 -116.373 -116.673 -117.21 -117.609 -117.939 -118.285 -119.01 -119.378 -119.775 -120.241 -120.745 -121.296 -122.018 -124.307 -10 ,22023 ,KEBNE ,17125942,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:20 CET,0.0 0.698 0.899 1.054 1.172 1.26 1.349 1.411 1.447 1.459 1.484 1.405 1.518 1.505 1.445 1.394 1.356 1.336 1.279 1.198 1.059 0.959 0.864 0.731 0.581 0.415 0.231 0.028 -0.252 -0.521 -0.801 -1.184 -1.588 -1.988 -2.446 -2.998 -3.575 -4.243 -5.027 -5.899 -6.864 -8.073 -9.578 -11.174 -13.188 -15.647 -18.764 -22.646 -27.779 -34.824 -45.142 -55.836 -63.67 -69.802 -74.701 -78.756 -82.099 -84.994 -87.353 -89.603 -91.554 -93.228 -94.751 -96.186 -97.491 -98.614 -99.77 -100.842 -101.735 -102.594 -103.481 -104.237 -105.013 -105.778 -106.347 -106.944 -107.577 -108.24 -108.923 -109.369 -109.822 -110.551 -111.058 -111.58 -111.845 -112.383 -112.953 -113.553 -113.844 -114.361 -114.741 -115.059 -115.405 -116.174 -116.576 -116.953 -117.399 -117.951 -118.576 -119.374 -122.164 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_215_167.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_215_167.txt deleted file mode 100644 index acddd9e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_215_167.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7533 ,KEBNE ,16707900,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:32:35 CET,0.0 1.576 2.052 2.384 2.661 2.916 3.159 3.382 3.777 3.95 4.117 4.344 4.613 4.755 5.036 5.304 5.541 5.649 5.866 6.085 6.401 6.61 6.827 7.134 7.407 7.66 7.899 8.12 8.405 8.705 9.015 9.4 9.789 10.175 10.63 11.128 11.597 12.113 12.661 13.231 13.828 14.519 15.354 16.201 17.184 18.311 19.66 21.26 23.181 25.533 28.606 31.3 32.928 34.003 34.755 35.305 35.682 35.906 36.025 36.129 36.186 36.227 36.28 36.311 36.313 36.261 36.186 36.142 36.107 36.035 35.944 35.886 35.794 35.677 35.601 35.534 35.463 35.386 35.314 35.257 35.181 35.042 34.932 34.82 34.766 34.666 34.553 34.405 34.324 34.156 34.039 33.94 33.825 33.541 33.383 33.215 33.026 32.794 32.512 32.108 30.417 -2 ,27244 ,KEBNE ,16707901,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:31:52 CET,0.0 1.61 2.098 2.491 2.803 3.067 3.285 3.49 3.853 4.014 4.185 4.391 4.631 4.773 5.065 5.313 5.554 5.682 5.931 6.173 6.529 6.74 6.936 7.232 7.501 7.754 8.013 8.267 8.578 8.866 9.154 9.497 9.835 10.183 10.587 11.023 11.452 11.947 12.472 13.047 13.672 14.36 15.155 15.971 16.953 18.072 19.418 21.002 22.877 25.169 28.153 30.762 32.376 33.416 34.11 34.643 35.004 35.28 35.488 35.65 35.732 35.784 35.835 35.868 35.868 35.828 35.78 35.737 35.706 35.65 35.563 35.467 35.348 35.247 35.185 35.123 35.034 34.909 34.783 34.704 34.617 34.464 34.347 34.231 34.173 34.058 33.937 33.809 33.744 33.587 33.468 33.36 33.249 33.009 32.87 32.693 32.496 32.274 31.972 31.565 30.22 -3 ,10905 ,KEBNE ,16707902,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:31:51 CET,0.0 1.269 1.7 2.038 2.309 2.546 2.777 2.992 3.374 3.531 3.664 3.823 4.074 4.212 4.47 4.723 4.96 5.074 5.313 5.563 5.902 6.096 6.275 6.56 6.85 7.113 7.365 7.606 7.926 8.239 8.53 8.873 9.202 9.537 9.943 10.416 10.874 11.363 11.952 12.604 13.249 13.96 14.808 15.679 16.689 17.811 19.084 20.587 22.44 24.73 27.712 30.365 32.005 33.067 33.808 34.392 34.8 35.037 35.174 35.314 35.403 35.422 35.382 35.329 35.298 35.266 35.172 35.082 35.003 34.889 34.785 34.708 34.623 34.542 34.47 34.379 34.292 34.206 34.098 34.011 33.92 33.76 33.635 33.494 33.424 33.283 33.14 32.996 32.911 32.742 32.626 32.529 32.433 32.209 32.069 31.91 31.719 31.475 31.177 30.799 29.413 -4 ,17951 ,KEBNE ,16707903,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:40 CET,0.0 1.53 1.983 2.337 2.651 2.914 3.139 3.362 3.781 3.969 4.13 4.324 4.581 4.717 4.995 5.262 5.492 5.601 5.826 6.034 6.319 6.52 6.724 7.015 7.284 7.532 7.774 8.013 8.327 8.649 8.974 9.372 9.768 10.166 10.616 11.117 11.599 12.101 12.628 13.183 13.803 14.542 15.399 16.233 17.193 18.271 19.572 21.114 22.959 25.21 28.15 30.785 32.433 33.5 34.237 34.814 35.214 35.49 35.648 35.774 35.877 35.939 35.978 36.004 35.998 35.97 35.944 35.925 35.897 35.861 35.82 35.77 35.679 35.587 35.538 35.478 35.404 35.316 35.211 35.116 35.023 34.885 34.769 34.652 34.59 34.462 34.337 34.195 34.114 33.95 33.836 33.736 33.627 33.37 33.234 33.081 32.911 32.715 32.468 32.108 30.823 -5 ,6067 ,KEBNE ,16707904,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:07 CET,0.0 1.784 2.275 2.617 2.913 3.18 3.43 3.663 4.049 4.227 4.402 4.612 4.862 4.986 5.26 5.541 5.803 5.926 6.158 6.405 6.76 6.973 7.194 7.509 7.789 8.072 8.349 8.601 8.936 9.264 9.609 10.029 10.396 10.741 11.128 11.569 12.0 12.478 13.037 13.651 14.277 14.96 15.751 16.573 17.559 18.685 20.014 21.569 23.473 25.827 28.865 31.557 33.22 34.34 35.131 35.732 36.171 36.483 36.7 36.88 36.982 37.048 37.104 37.131 37.115 37.079 37.013 36.957 36.905 36.822 36.759 36.737 36.674 36.567 36.496 36.436 36.357 36.259 36.162 36.095 36.018 35.853 35.728 35.605 35.538 35.405 35.258 35.074 34.978 34.801 34.684 34.593 34.481 34.185 33.998 33.804 33.599 33.347 33.056 32.647 30.942 -6 ,20472 ,KEBNE ,16707905,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:55 CET,0.0 1.77 2.216 2.538 2.839 3.111 3.365 3.599 3.988 4.162 4.33 4.511 4.755 4.895 5.161 5.404 5.649 5.763 5.98 6.191 6.477 6.663 6.852 7.13 7.389 7.634 7.875 8.121 8.461 8.783 9.078 9.466 9.835 10.17 10.56 11.021 11.501 12.023 12.548 13.159 13.84 14.563 15.41 16.266 17.259 18.356 19.684 21.244 23.124 25.468 28.438 31.126 32.913 34.143 34.927 35.469 35.877 36.187 36.39 36.537 36.641 36.71 36.707 36.683 36.69 36.671 36.637 36.594 36.546 36.497 36.437 36.392 36.347 36.282 36.217 36.154 36.073 35.969 35.857 35.78 35.708 35.578 35.468 35.34 35.266 35.113 34.963 34.808 34.728 34.571 34.5 34.419 34.316 34.068 33.913 33.749 33.571 33.362 33.1 32.786 31.56 -7 ,10252 ,KEBNE ,16707906,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:37:03 CET,0.0 1.355 1.786 2.117 2.402 2.653 2.861 3.039 3.382 3.547 3.708 3.928 4.194 4.345 4.649 4.924 5.179 5.306 5.543 5.765 6.087 6.286 6.475 6.755 7.023 7.287 7.566 7.84 8.198 8.556 8.874 9.226 9.586 9.943 10.377 10.887 11.391 11.931 12.504 13.144 13.786 14.493 15.304 16.137 17.14 18.248 19.548 21.108 23.065 25.452 28.377 30.945 32.579 33.67 34.465 35.07 35.464 35.612 35.697 35.844 35.951 35.979 35.98 35.999 35.99 35.962 35.947 35.921 35.863 35.778 35.682 35.592 35.512 35.436 35.346 35.252 35.176 35.079 34.951 34.863 34.76 34.572 34.451 34.324 34.251 34.114 33.976 33.823 33.751 33.598 33.481 33.368 33.266 33.056 32.931 32.766 32.539 32.299 32.032 31.632 30.286 -8 ,9012 ,KEBNE ,16707907,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:32:03 CET,0.0 1.689 2.187 2.558 2.825 3.04 3.26 3.473 3.872 4.036 4.179 4.35 4.597 4.733 4.978 5.222 5.466 5.589 5.817 6.007 6.281 6.472 6.671 6.98 7.259 7.505 7.751 7.998 8.344 8.687 8.997 9.354 9.697 10.04 10.453 10.927 11.387 11.891 12.423 12.974 13.58 14.274 15.087 15.907 16.9 18.041 19.375 20.973 22.924 25.331 28.466 31.265 33.016 34.206 35.009 35.568 35.869 36.037 36.209 36.397 36.503 36.538 36.572 36.612 36.632 36.6 36.516 36.482 36.463 36.406 36.356 36.296 36.191 36.089 36.013 35.923 35.834 35.725 35.58 35.474 35.361 35.192 35.078 34.951 34.886 34.762 34.641 34.507 34.418 34.245 34.142 34.033 33.915 33.689 33.553 33.39 33.207 32.984 32.699 32.307 31.06 -9 ,16094 ,KEBNE ,16707908,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:18 CET,0.0 1.577 2.095 2.463 2.775 3.039 3.25 3.445 3.804 3.967 4.125 4.311 4.557 4.703 5.001 5.284 5.533 5.656 5.888 6.091 6.385 6.59 6.79 7.058 7.328 7.594 7.843 8.084 8.391 8.679 8.952 9.291 9.622 9.95 10.351 10.809 11.253 11.722 12.223 12.774 13.351 14.035 14.866 15.692 16.693 17.86 19.211 20.764 22.651 25.001 28.086 30.838 32.588 33.774 34.58 35.15 35.547 35.83 36.047 36.188 36.275 36.354 36.404 36.431 36.426 36.41 36.395 36.376 36.349 36.308 36.262 36.214 36.156 36.065 35.963 35.88 35.816 35.719 35.585 35.489 35.393 35.26 35.17 35.066 35.015 34.905 34.766 34.599 34.501 34.325 34.218 34.11 33.988 33.736 33.589 33.427 33.243 33.017 32.733 32.373 30.86 -10 ,26264 ,KEBNE ,16707909,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:42 CET,0.0 1.655 2.123 2.479 2.772 3.012 3.233 3.441 3.806 3.97 4.129 4.356 4.625 4.775 5.054 5.313 5.554 5.671 5.918 6.166 6.494 6.703 6.913 7.232 7.561 7.881 8.159 8.404 8.727 9.042 9.345 9.72 10.128 10.546 11.001 11.47 11.895 12.365 12.876 13.43 14.031 14.759 15.663 16.561 17.564 18.71 20.099 21.675 23.567 25.905 28.91 31.613 33.29 34.416 35.208 35.803 36.214 36.49 36.687 36.838 36.934 36.992 37.018 37.014 37.006 36.99 36.954 36.907 36.863 36.786 36.66 36.561 36.455 36.31 36.213 36.14 36.065 35.963 35.837 35.748 35.649 35.509 35.422 35.308 35.239 35.095 34.93 34.743 34.641 34.459 34.327 34.221 34.108 33.828 33.678 33.513 33.309 33.059 32.758 32.367 31.202 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_215_206.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_215_206.txt deleted file mode 100644 index 3209e0a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_215_206.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25679 ,KEBNE ,16707910,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:32:21 CET,0.0 1.148 1.538 1.81 2.036 2.249 2.453 2.635 2.963 3.119 3.262 3.423 3.662 3.788 4.047 4.281 4.475 4.572 4.758 4.918 5.153 5.309 5.452 5.688 5.932 6.152 6.361 6.577 6.829 7.022 7.239 7.523 7.762 7.974 8.215 8.462 8.687 8.906 9.183 9.505 9.802 10.129 10.484 10.808 11.152 11.537 11.929 12.273 12.569 12.8 12.881 12.66 12.299 11.868 11.438 11.04 10.678 10.342 10.021 9.676 9.387 9.089 8.811 8.575 8.353 8.148 7.895 7.608 7.337 7.08 6.86 6.701 6.52 6.294 6.104 5.891 5.673 5.476 5.273 5.13 4.968 4.721 4.56 4.4 4.322 4.141 3.932 3.719 3.599 3.354 3.205 3.083 2.965 2.683 2.53 2.351 2.109 1.835 1.526 1.12 -0.208 -2 ,3567 ,KEBNE ,16707911,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:33:15 CET,0.0 0.896 1.294 1.619 1.872 2.109 2.335 2.545 2.905 3.059 3.207 3.372 3.603 3.727 3.99 4.234 4.46 4.564 4.764 4.943 5.173 5.322 5.466 5.68 5.871 6.03 6.193 6.366 6.579 6.765 6.951 7.191 7.433 7.664 7.92 8.22 8.481 8.757 9.029 9.29 9.558 9.842 10.17 10.479 10.834 11.192 11.555 11.931 12.32 12.664 12.833 12.663 12.254 11.819 11.424 11.011 10.639 10.191 9.719 9.315 8.993 8.677 8.364 8.072 7.792 7.554 7.282 6.996 6.781 6.579 6.351 6.153 5.958 5.764 5.581 5.39 5.197 4.97 4.723 4.566 4.419 4.19 4.039 3.878 3.795 3.639 3.463 3.257 3.144 2.908 2.736 2.598 2.475 2.186 2.024 1.844 1.656 1.46 1.212 0.874 -0.206 -3 ,17018 ,KEBNE ,16707912,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:33:31 CET,0.0 1.277 1.667 1.955 2.199 2.435 2.639 2.805 3.095 3.235 3.359 3.452 3.657 3.747 3.912 4.081 4.267 4.357 4.521 4.67 4.912 5.086 5.247 5.464 5.649 5.817 5.981 6.123 6.331 6.555 6.772 6.999 7.174 7.356 7.605 7.873 8.086 8.359 8.685 8.986 9.243 9.5 9.821 10.139 10.464 10.841 11.291 11.712 12.087 12.436 12.63 12.389 12.023 11.635 11.245 10.896 10.552 10.201 9.88 9.528 9.21 8.932 8.684 8.442 8.185 7.941 7.717 7.509 7.308 7.116 6.922 6.76 6.596 6.406 6.259 6.098 5.911 5.711 5.511 5.387 5.266 5.096 4.965 4.814 4.743 4.588 4.403 4.2 4.091 3.873 3.758 3.633 3.509 3.258 3.13 2.982 2.793 2.591 2.33 1.964 0.965 -4 ,14817 ,KEBNE ,16707913,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:33:41 CET,0.0 1.099 1.395 1.649 1.9 2.106 2.268 2.416 2.684 2.816 2.935 3.023 3.23 3.338 3.544 3.728 3.893 3.972 4.116 4.241 4.425 4.551 4.673 4.843 5.002 5.18 5.387 5.587 5.814 6.006 6.184 6.386 6.564 6.724 6.91 7.162 7.411 7.646 7.872 8.121 8.401 8.707 9.076 9.427 9.797 10.161 10.518 10.92 11.354 11.711 11.851 11.67 11.389 10.989 10.527 10.122 9.767 9.417 9.068 8.7 8.417 8.13 7.854 7.624 7.404 7.179 6.917 6.658 6.42 6.186 5.955 5.755 5.537 5.315 5.132 4.942 4.738 4.516 4.309 4.176 4.05 3.846 3.676 3.5 3.417 3.253 3.077 2.879 2.781 2.572 2.452 2.308 2.141 1.811 1.657 1.492 1.3 1.086 0.817 0.419 -0.562 -5 ,30112 ,KEBNE ,16707914,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:33:36 CET,0.0 1.61 2.067 2.391 2.65 2.865 3.052 3.236 3.571 3.714 3.851 4.0 4.224 4.335 4.567 4.775 4.962 5.057 5.236 5.406 5.654 5.818 5.982 6.229 6.47 6.669 6.855 7.036 7.243 7.461 7.67 7.917 8.159 8.375 8.607 8.86 9.107 9.366 9.661 9.969 10.263 10.601 11.006 11.378 11.738 12.095 12.447 12.765 13.088 13.407 13.564 13.403 13.092 12.689 12.281 11.906 11.548 11.232 10.963 10.671 10.418 10.181 9.932 9.657 9.379 9.157 8.945 8.75 8.579 8.395 8.197 8.01 7.781 7.533 7.362 7.199 7.012 6.81 6.591 6.443 6.309 6.108 5.975 5.847 5.774 5.607 5.435 5.222 5.105 4.877 4.71 4.567 4.412 4.058 3.864 3.656 3.438 3.215 2.958 2.599 1.413 -6 ,17175 ,KEBNE ,16707915,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:33:07 CET,0.0 1.305 1.728 1.999 2.225 2.447 2.648 2.839 3.177 3.322 3.464 3.611 3.836 3.954 4.18 4.377 4.567 4.663 4.851 5.015 5.235 5.363 5.474 5.65 5.848 6.049 6.254 6.455 6.716 6.965 7.164 7.383 7.604 7.796 8.013 8.269 8.542 8.845 9.137 9.441 9.78 10.172 10.616 11.012 11.357 11.706 12.131 12.551 12.947 13.32 13.615 13.544 13.239 12.911 12.548 12.167 11.834 11.545 11.27 10.946 10.64 10.365 10.107 9.847 9.588 9.342 9.102 8.884 8.684 8.474 8.243 8.038 7.802 7.569 7.402 7.232 7.057 6.863 6.666 6.543 6.418 6.225 6.075 5.9 5.82 5.662 5.488 5.288 5.172 4.937 4.79 4.66 4.532 4.242 4.078 3.887 3.662 3.426 3.163 2.817 1.655 -7 ,1374 ,KEBNE ,16707916,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:33:08 CET,0.0 1.236 1.615 1.916 2.181 2.417 2.638 2.839 3.157 3.303 3.462 3.644 3.877 3.992 4.205 4.405 4.609 4.703 4.859 5.026 5.309 5.487 5.641 5.844 6.051 6.258 6.452 6.641 6.888 7.106 7.29 7.508 7.742 7.963 8.196 8.446 8.674 8.905 9.138 9.396 9.654 9.965 10.34 10.679 11.034 11.408 11.811 12.221 12.604 12.93 13.147 13.003 12.652 12.276 11.867 11.416 11.003 10.624 10.305 9.959 9.646 9.371 9.089 8.812 8.558 8.319 8.068 7.848 7.644 7.422 7.195 6.99 6.765 6.536 6.361 6.185 6.006 5.832 5.653 5.526 5.374 5.131 4.971 4.812 4.73 4.546 4.357 4.162 4.061 3.856 3.764 3.649 3.525 3.231 3.071 2.895 2.678 2.417 2.106 1.713 0.702 -8 ,26571 ,KEBNE ,16707917,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:42 CET,0.0 0.982 1.502 1.814 2.048 2.28 2.511 2.696 2.992 3.14 3.294 3.476 3.716 3.838 4.073 4.299 4.505 4.609 4.795 4.965 5.234 5.391 5.531 5.74 5.936 6.117 6.307 6.502 6.744 6.977 7.2 7.466 7.698 7.912 8.161 8.413 8.664 8.943 9.224 9.502 9.768 10.06 10.405 10.725 11.043 11.424 11.918 12.339 12.665 12.899 12.948 12.7 12.317 11.796 11.24 10.748 10.327 9.896 9.517 9.182 8.91 8.669 8.44 8.229 8.018 7.803 7.54 7.288 7.077 6.871 6.641 6.419 6.191 5.977 5.833 5.684 5.509 5.316 5.12 4.975 4.812 4.58 4.429 4.271 4.184 3.996 3.805 3.576 3.453 3.241 3.15 3.037 2.906 2.643 2.511 2.36 2.172 1.944 1.671 1.28 0.168 -9 ,2119 ,KEBNE ,16707918,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:53 CET,0.0 0.911 1.255 1.567 1.842 2.071 2.278 2.459 2.765 2.899 3.03 3.165 3.391 3.512 3.73 3.93 4.119 4.204 4.377 4.545 4.748 4.877 5.024 5.25 5.469 5.667 5.855 6.04 6.274 6.499 6.716 6.986 7.236 7.472 7.74 7.977 8.181 8.431 8.681 8.929 9.244 9.619 9.974 10.307 10.724 11.163 11.619 12.048 12.443 12.827 13.074 12.927 12.61 12.25 11.841 11.416 11.09 10.728 10.389 10.08 9.798 9.544 9.301 9.074 8.813 8.546 8.297 8.106 7.946 7.766 7.543 7.36 7.213 7.024 6.849 6.655 6.434 6.212 6.014 5.894 5.771 5.56 5.392 5.233 5.158 4.986 4.798 4.616 4.519 4.3 4.182 4.058 3.916 3.619 3.464 3.301 3.122 2.889 2.613 2.29 1.489 -10 ,26656 ,KEBNE ,16707919,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:34:11 CET,0.0 1.146 1.553 1.884 2.146 2.36 2.547 2.7 2.987 3.122 3.262 3.417 3.65 3.767 3.975 4.174 4.367 4.463 4.631 4.793 5.031 5.182 5.332 5.549 5.757 5.952 6.141 6.333 6.567 6.798 7.03 7.274 7.503 7.741 8.01 8.288 8.528 8.806 9.115 9.438 9.749 10.087 10.495 10.863 11.226 11.596 12.003 12.448 12.885 13.221 13.346 13.061 12.627 12.203 11.812 11.419 11.031 10.66 10.34 9.983 9.604 9.222 8.884 8.593 8.336 8.115 7.862 7.616 7.431 7.251 7.036 6.86 6.676 6.479 6.314 6.13 5.951 5.75 5.55 5.436 5.321 5.12 4.971 4.817 4.735 4.559 4.371 4.191 4.104 3.895 3.774 3.654 3.52 3.234 3.078 2.9 2.715 2.513 2.253 1.883 0.357 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_215_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_215_252.txt deleted file mode 100644 index 8b735bb0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_215_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6110 ,KEBNE ,16707920,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:20 CET,0.0 0.749 1.027 1.204 1.296 1.363 1.414 1.443 1.489 1.5 1.5 1.391 1.502 1.489 1.417 1.334 1.253 1.216 1.14 1.061 0.923 0.813 0.694 0.512 0.335 0.154 -0.039 -0.243 -0.508 -0.772 -1.059 -1.443 -1.844 -2.233 -2.713 -3.296 -3.879 -4.538 -5.297 -6.18 -7.153 -8.321 -9.79 -11.403 -13.428 -15.879 -19.051 -22.984 -28.158 -35.299 -45.826 -56.62 -64.41 -70.516 -75.47 -79.678 -83.205 -86.278 -88.82 -91.288 -93.362 -95.123 -96.72 -98.136 -99.433 -100.629 -101.838 -102.887 -103.747 -104.613 -105.48 -106.182 -106.963 -107.778 -108.391 -109.032 -109.657 -110.266 -110.894 -111.332 -111.775 -112.449 -112.915 -113.372 -113.609 -114.1 -114.603 -115.14 -115.415 -115.914 -116.22 -116.505 -116.806 -117.434 -117.778 -118.154 -118.549 -119.051 -119.68 -120.448 -122.382 -2 ,8591 ,KEBNE ,16707921,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:31:20 CET,0.0 0.923 1.135 1.227 1.303 1.346 1.372 1.392 1.406 1.419 1.426 1.308 1.412 1.387 1.333 1.267 1.172 1.123 1.055 0.991 0.85 0.741 0.631 0.449 0.277 0.123 -0.062 -0.279 -0.567 -0.855 -1.165 -1.57 -1.976 -2.389 -2.896 -3.497 -4.114 -4.838 -5.656 -6.556 -7.557 -8.756 -10.277 -11.935 -13.996 -16.527 -19.729 -23.74 -29.015 -36.221 -46.866 -57.979 -66.032 -72.225 -77.195 -81.415 -84.877 -87.821 -90.302 -92.722 -94.681 -96.361 -97.94 -99.432 -100.781 -101.94 -103.102 -104.105 -104.952 -105.818 -106.727 -107.472 -108.219 -108.993 -109.594 -110.179 -110.782 -111.406 -112.002 -112.392 -112.79 -113.406 -113.825 -114.266 -114.497 -114.953 -115.407 -115.894 -116.155 -116.663 -117.004 -117.308 -117.62 -118.268 -118.607 -118.961 -119.34 -119.768 -120.271 -120.843 -122.165 -3 ,6914 ,KEBNE ,16707922,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:10 CET,0.0 0.579 0.754 0.872 0.953 1.024 1.084 1.131 1.183 1.194 1.2 1.11 1.221 1.214 1.199 1.184 1.121 1.074 0.985 0.886 0.73 0.627 0.516 0.329 0.135 -0.06 -0.236 -0.418 -0.718 -1.026 -1.332 -1.721 -2.118 -2.514 -2.953 -3.475 -4.028 -4.673 -5.462 -6.367 -7.364 -8.584 -10.11 -11.75 -13.811 -16.293 -19.394 -23.255 -28.393 -35.367 -45.587 -56.324 -64.203 -70.318 -75.26 -79.462 -82.972 -85.979 -88.439 -90.854 -92.895 -94.659 -96.311 -97.788 -99.08 -100.243 -101.42 -102.452 -103.363 -104.311 -105.257 -106.003 -106.754 -107.518 -108.094 -108.679 -109.272 -109.86 -110.463 -110.882 -111.311 -111.968 -112.423 -112.887 -113.129 -113.643 -114.156 -114.67 -114.94 -115.449 -115.807 -116.113 -116.426 -117.064 -117.432 -117.85 -118.258 -118.693 -119.231 -119.961 -122.049 -4 ,16896 ,KEBNE ,16707923,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:31:33 CET,0.0 0.439 0.651 0.786 0.874 0.922 0.954 0.986 1.005 1.004 0.996 0.876 0.979 0.953 0.879 0.812 0.743 0.7 0.614 0.523 0.37 0.292 0.222 0.062 -0.145 -0.349 -0.537 -0.717 -0.981 -1.26 -1.545 -1.915 -2.302 -2.701 -3.194 -3.773 -4.365 -5.06 -5.833 -6.709 -7.706 -8.915 -10.44 -12.085 -14.133 -16.607 -19.713 -23.645 -28.88 -36.024 -46.573 -57.426 -65.362 -71.571 -76.535 -80.669 -84.035 -86.934 -89.32 -91.583 -93.447 -95.05 -96.597 -98.08 -99.4 -100.549 -101.741 -102.778 -103.652 -104.54 -105.429 -106.149 -106.862 -107.619 -108.192 -108.748 -109.324 -109.913 -110.52 -110.946 -111.386 -112.041 -112.486 -112.966 -113.219 -113.717 -114.228 -114.769 -115.043 -115.546 -115.878 -116.173 -116.487 -117.176 -117.545 -117.924 -118.341 -118.819 -119.381 -120.25 -123.196 -5 ,16723 ,KEBNE ,16707924,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:32:27 CET,0.0 0.667 0.895 1.027 1.126 1.198 1.236 1.259 1.273 1.279 1.289 1.187 1.303 1.308 1.285 1.256 1.222 1.193 1.134 1.067 0.944 0.874 0.801 0.679 0.567 0.421 0.235 0.058 -0.168 -0.396 -0.653 -1.005 -1.372 -1.76 -2.224 -2.772 -3.364 -4.056 -4.836 -5.71 -6.686 -7.876 -9.375 -11.002 -13.058 -15.527 -18.638 -22.524 -27.678 -34.791 -45.248 -56.046 -63.9 -70.02 -74.918 -79.048 -82.446 -85.339 -87.711 -90.033 -91.947 -93.563 -95.062 -96.429 -97.661 -98.764 -99.898 -100.888 -101.716 -102.539 -103.383 -104.088 -104.79 -105.518 -106.097 -106.668 -107.246 -107.827 -108.418 -108.827 -109.245 -109.878 -110.288 -110.704 -110.914 -111.348 -111.813 -112.278 -112.519 -112.989 -113.246 -113.497 -113.77 -114.412 -114.768 -115.138 -115.559 -116.048 -116.627 -117.354 -120.615 -6 ,3810 ,KEBNE ,16707925,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:32:11 CET,0.0 0.641 0.845 1.005 1.116 1.191 1.252 1.304 1.372 1.383 1.389 1.262 1.338 1.303 1.235 1.151 1.071 1.03 0.949 0.863 0.713 0.623 0.536 0.38 0.225 0.079 -0.095 -0.272 -0.499 -0.747 -1.015 -1.393 -1.784 -2.18 -2.654 -3.202 -3.768 -4.428 -5.19 -6.054 -6.984 -8.106 -9.566 -11.158 -13.161 -15.59 -18.685 -22.575 -27.744 -34.903 -45.411 -56.23 -64.128 -70.279 -75.17 -79.24 -82.564 -85.467 -87.867 -90.128 -92.042 -93.742 -95.298 -96.717 -98.039 -99.222 -100.389 -101.384 -102.21 -103.029 -103.851 -104.541 -105.261 -106.003 -106.594 -107.196 -107.795 -108.398 -109.018 -109.438 -109.843 -110.42 -110.817 -111.243 -111.461 -111.906 -112.369 -112.862 -113.133 -113.648 -114.002 -114.298 -114.605 -115.285 -115.671 -116.071 -116.495 -116.968 -117.482 -118.166 -120.137 -7 ,4982 ,KEBNE ,16707926,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:32:04 CET,0.0 0.788 1.008 1.112 1.184 1.236 1.287 1.353 1.448 1.473 1.495 1.409 1.522 1.527 1.514 1.481 1.445 1.425 1.368 1.308 1.208 1.129 1.034 0.856 0.668 0.481 0.289 0.104 -0.134 -0.383 -0.643 -0.985 -1.356 -1.737 -2.193 -2.721 -3.265 -3.925 -4.697 -5.584 -6.59 -7.805 -9.314 -10.933 -12.954 -15.453 -18.671 -22.663 -27.903 -35.002 -45.341 -56.05 -63.929 -70.048 -74.903 -78.986 -82.367 -85.261 -87.653 -89.937 -91.841 -93.536 -95.131 -96.557 -97.838 -98.979 -100.11 -101.095 -101.955 -102.811 -103.685 -104.421 -105.156 -105.896 -106.456 -107.024 -107.624 -108.252 -108.889 -109.321 -109.762 -110.412 -110.856 -111.323 -111.561 -112.045 -112.554 -113.079 -113.352 -113.875 -114.233 -114.525 -114.837 -115.523 -115.874 -116.24 -116.658 -117.122 -117.665 -118.397 -120.845 -8 ,32729 ,KEBNE ,16707927,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:32:02 CET,0.0 0.781 1.037 1.237 1.352 1.409 1.49 1.56 1.626 1.645 1.646 1.517 1.61 1.599 1.578 1.534 1.48 1.452 1.39 1.32 1.195 1.103 1.01 0.858 0.686 0.485 0.304 0.154 -0.071 -0.315 -0.577 -0.93 -1.286 -1.669 -2.141 -2.69 -3.271 -3.937 -4.711 -5.63 -6.653 -7.858 -9.376 -11.05 -13.13 -15.596 -18.731 -22.7 -27.986 -35.169 -45.648 -56.606 -64.595 -70.721 -75.597 -79.74 -83.113 -85.967 -88.337 -90.604 -92.488 -94.13 -95.655 -97.024 -98.292 -99.456 -100.649 -101.713 -102.618 -103.5 -104.388 -105.136 -105.912 -106.702 -107.294 -107.888 -108.497 -109.124 -109.757 -110.186 -110.625 -111.266 -111.683 -112.125 -112.358 -112.832 -113.328 -113.855 -114.127 -114.637 -115.019 -115.335 -115.644 -116.318 -116.685 -117.084 -117.509 -117.954 -118.488 -119.222 -121.181 -9 ,10878 ,KEBNE ,16707928,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:32:02 CET,0.0 0.741 0.986 1.132 1.228 1.298 1.341 1.365 1.409 1.419 1.418 1.321 1.427 1.403 1.356 1.295 1.229 1.199 1.126 1.029 0.872 0.778 0.675 0.492 0.311 0.128 -0.077 -0.29 -0.559 -0.82 -1.103 -1.481 -1.871 -2.24 -2.69 -3.243 -3.803 -4.477 -5.247 -6.098 -7.045 -8.234 -9.782 -11.453 -13.532 -16.078 -19.294 -23.28 -28.566 -35.809 -46.432 -57.451 -65.45 -71.66 -76.607 -80.743 -84.18 -87.087 -89.441 -91.739 -93.641 -95.284 -96.837 -98.291 -99.619 -100.773 -101.947 -102.974 -103.847 -104.743 -105.658 -106.416 -107.198 -107.988 -108.586 -109.197 -109.827 -110.478 -111.115 -111.543 -111.988 -112.677 -113.153 -113.613 -113.848 -114.342 -114.836 -115.353 -115.633 -116.145 -116.477 -116.772 -117.074 -117.699 -118.038 -118.418 -118.841 -119.307 -119.866 -120.6 -123.081 -10 ,22533 ,KEBNE ,16707929,Fri Nov 26 14:00:35 CET,Fri Nov 26 15:32:57 CET,0.0 0.855 1.065 1.197 1.284 1.359 1.417 1.447 1.481 1.504 1.511 1.369 1.456 1.428 1.387 1.369 1.335 1.307 1.242 1.161 1.021 0.943 0.865 0.734 0.598 0.453 0.276 0.069 -0.221 -0.501 -0.782 -1.142 -1.502 -1.895 -2.372 -2.929 -3.508 -4.196 -4.979 -5.857 -6.859 -8.055 -9.538 -11.154 -13.193 -15.688 -18.85 -22.785 -27.916 -34.928 -45.306 -56.02 -63.857 -70.017 -74.955 -79.179 -82.747 -85.773 -88.224 -90.544 -92.452 -94.094 -95.618 -97.046 -98.377 -99.55 -100.724 -101.768 -102.663 -103.553 -104.443 -105.179 -105.933 -106.686 -107.24 -107.793 -108.351 -108.916 -109.491 -109.89 -110.31 -110.95 -111.38 -111.821 -112.048 -112.507 -112.987 -113.5 -113.768 -114.264 -114.598 -114.89 -115.185 -115.81 -116.145 -116.529 -116.949 -117.428 -118.001 -118.72 -120.549 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_227_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_227_231.txt deleted file mode 100644 index 834b39d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_227_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1997 ,KEBNE ,16707930,Fri Nov 26 14:00:34 CET,Fri Nov 26 15:31:54 CET,0.0 0.519 0.646 0.738 0.79 0.806 0.809 0.791 0.74 0.714 0.676 0.597 0.539 0.487 0.379 0.241 0.085 0.011 -0.12 -0.256 -0.494 -0.674 -0.852 -1.123 -1.387 -1.641 -1.925 -2.226 -2.632 -3.049 -3.459 -3.969 -4.476 -4.995 -5.667 -6.487 -7.315 -8.275 -9.363 -10.556 -11.91 -13.53 -15.503 -17.599 -20.228 -23.476 -27.568 -32.656 -39.34 -48.348 -61.424 -74.899 -84.613 -92.067 -97.956 -102.949 -107.078 -110.605 -113.472 -116.169 -118.412 -120.321 -122.054 -123.679 -125.179 -126.488 -127.815 -128.961 -129.924 -130.896 -131.88 -132.672 -133.444 -134.212 -134.791 -135.382 -135.983 -136.589 -137.229 -137.667 -138.099 -138.777 -139.259 -139.739 -139.979 -140.474 -140.994 -141.556 -141.84 -142.246 -142.632 -142.909 -143.212 -143.893 -144.251 -144.635 -145.064 -145.516 -146.044 -146.726 -148.299 -2 ,22562 ,KEBNE ,16707931,Fri Nov 26 14:01:34 CET,Fri Nov 26 15:33:14 CET,0.0 0.905 1.086 1.186 1.235 1.246 1.26 1.273 1.26 1.241 1.212 1.146 1.107 1.065 0.96 0.833 0.684 0.612 0.47 0.319 0.095 -0.053 -0.205 -0.47 -0.751 -1.011 -1.268 -1.537 -1.9 -2.259 -2.627 -3.14 -3.698 -4.26 -4.936 -5.731 -6.529 -7.436 -8.423 -9.548 -10.867 -12.449 -14.417 -16.557 -19.262 -22.554 -26.647 -31.713 -38.396 -47.403 -60.517 -74.028 -83.81 -91.282 -97.143 -102.056 -106.072 -109.559 -112.398 -115.052 -117.253 -119.155 -120.941 -122.581 -124.028 -125.288 -126.562 -127.709 -128.703 -129.687 -130.706 -131.57 -132.421 -133.232 -133.843 -134.474 -135.124 -135.784 -136.433 -136.86 -137.302 -137.993 -138.464 -138.95 -139.205 -139.723 -140.237 -140.738 -140.997 -141.405 -141.819 -142.111 -142.412 -143.048 -143.37 -143.709 -144.104 -144.532 -145.003 -145.644 -147.184 -3 ,9012 ,KEBNE ,16707932,Fri Nov 26 14:01:34 CET,Fri Nov 26 15:33:18 CET,0.0 0.91 1.145 1.24 1.282 1.313 1.329 1.322 1.272 1.26 1.244 1.177 1.128 1.087 1.001 0.904 0.794 0.733 0.609 0.47 0.238 0.072 -0.095 -0.346 -0.593 -0.834 -1.091 -1.361 -1.732 -2.119 -2.521 -3.035 -3.561 -4.099 -4.736 -5.477 -6.261 -7.17 -8.204 -9.361 -10.61 -12.142 -14.117 -16.243 -18.936 -22.184 -26.253 -31.293 -37.891 -46.862 -59.911 -73.288 -82.926 -90.386 -96.281 -101.158 -105.209 -108.668 -111.495 -114.196 -116.472 -118.479 -120.287 -121.901 -123.35 -124.612 -125.879 -126.985 -127.921 -128.867 -129.819 -130.592 -131.367 -132.163 -132.763 -133.35 -133.953 -134.573 -135.209 -135.634 -136.054 -136.71 -137.164 -137.626 -137.869 -138.37 -138.874 -139.376 -139.634 -140.029 -140.396 -140.659 -140.93 -141.515 -141.839 -142.19 -142.559 -142.953 -143.364 -143.858 -144.78 -4 ,6840 ,KEBNE ,16707933,Fri Nov 26 14:01:34 CET,Fri Nov 26 15:32:43 CET,0.0 0.463 0.621 0.715 0.781 0.819 0.816 0.802 0.767 0.738 0.709 0.651 0.605 0.561 0.48 0.384 0.26 0.189 0.036 -0.13 -0.393 -0.58 -0.771 -1.049 -1.337 -1.633 -1.923 -2.215 -2.619 -3.043 -3.473 -3.979 -4.463 -4.953 -5.584 -6.37 -7.184 -8.114 -9.164 -10.373 -11.719 -13.319 -15.314 -17.474 -20.165 -23.418 -27.507 -32.559 -39.221 -48.247 -61.247 -74.632 -84.338 -91.776 -97.66 -102.56 -106.581 -110.009 -112.821 -115.478 -117.655 -119.541 -121.296 -122.874 -124.303 -125.582 -126.871 -128.027 -129.009 -129.975 -130.94 -131.728 -132.533 -133.347 -133.963 -134.603 -135.243 -135.896 -136.573 -137.015 -137.455 -138.119 -138.566 -139.029 -139.266 -139.729 -140.216 -140.726 -140.985 -141.385 -141.784 -142.076 -142.393 -143.023 -143.363 -143.748 -144.166 -144.605 -145.081 -145.627 -147.344 -5 ,10009 ,KEBNE ,16707934,Fri Nov 26 14:02:35 CET,Fri Nov 26 15:33:45 CET,0.0 0.486 0.638 0.732 0.783 0.815 0.826 0.828 0.814 0.801 0.782 0.714 0.65 0.583 0.463 0.352 0.239 0.177 0.041 -0.097 -0.313 -0.473 -0.643 -0.909 -1.183 -1.473 -1.761 -2.025 -2.382 -2.772 -3.175 -3.692 -4.226 -4.76 -5.422 -6.189 -6.959 -7.883 -8.894 -10.038 -11.385 -12.97 -14.923 -17.063 -19.744 -22.974 -27.022 -32.075 -38.745 -47.759 -60.825 -74.241 -83.909 -91.359 -97.271 -102.205 -106.272 -109.745 -112.611 -115.347 -117.593 -119.518 -121.26 -122.838 -124.283 -125.58 -126.857 -127.948 -128.926 -129.919 -130.883 -131.648 -132.409 -133.186 -133.78 -134.392 -135.031 -135.672 -136.301 -136.731 -137.173 -137.829 -138.276 -138.74 -138.987 -139.505 -140.034 -140.59 -140.889 -141.33 -141.795 -142.122 -142.466 -143.162 -143.526 -143.913 -144.332 -144.799 -145.364 -146.008 -147.542 -6 ,20216 ,KEBNE ,16707935,Fri Nov 26 14:02:35 CET,Fri Nov 26 15:33:18 CET,0.0 0.461 0.612 0.687 0.741 0.78 0.814 0.835 0.849 0.837 0.799 0.699 0.642 0.588 0.469 0.344 0.214 0.153 0.022 -0.127 -0.372 -0.541 -0.706 -0.957 -1.208 -1.456 -1.731 -2.034 -2.43 -2.822 -3.223 -3.749 -4.295 -4.815 -5.407 -6.114 -6.854 -7.75 -8.79 -9.966 -11.303 -12.926 -14.91 -17.05 -19.783 -23.062 -27.153 -32.253 -38.955 -47.969 -61.012 -74.347 -83.976 -91.386 -97.204 -102.018 -106.025 -109.519 -112.342 -115.015 -117.199 -119.045 -120.768 -122.389 -123.889 -125.186 -126.481 -127.644 -128.658 -129.698 -130.698 -131.484 -132.3 -133.126 -133.736 -134.344 -134.967 -135.597 -136.257 -136.724 -137.197 -137.916 -138.418 -138.929 -139.182 -139.692 -140.217 -140.761 -141.03 -141.44 -141.861 -142.161 -142.492 -143.195 -143.574 -143.982 -144.397 -144.825 -145.352 -146.025 -147.387 -7 ,22437 ,KEBNE ,16707936,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:34:25 CET,0.0 0.551 0.672 0.723 0.769 0.802 0.804 0.798 0.762 0.728 0.68 0.576 0.518 0.477 0.367 0.224 0.088 0.017 -0.121 -0.261 -0.488 -0.632 -0.763 -0.968 -1.197 -1.432 -1.672 -1.921 -2.281 -2.663 -3.046 -3.533 -4.038 -4.558 -5.162 -5.892 -6.673 -7.54 -8.486 -9.56 -10.824 -12.372 -14.308 -16.44 -19.135 -22.424 -26.544 -31.623 -38.282 -47.287 -60.413 -73.927 -83.652 -91.13 -97.046 -101.972 -105.99 -109.387 -112.164 -114.814 -117.018 -118.901 -120.6 -122.151 -123.554 -124.806 -126.084 -127.187 -128.123 -129.08 -130.049 -130.832 -131.639 -132.429 -133.008 -133.597 -134.2 -134.83 -135.471 -135.896 -136.322 -136.97 -137.405 -137.857 -138.082 -138.539 -139.015 -139.468 -139.703 -140.095 -140.529 -140.823 -141.124 -141.81 -142.198 -142.637 -143.093 -143.537 -144.076 -144.766 -146.571 -8 ,2180 ,KEBNE ,16707937,Fri Nov 26 14:02:35 CET,Fri Nov 26 15:34:16 CET,0.0 0.61 0.807 0.937 0.998 1.03 1.058 1.078 1.086 1.074 1.053 1.016 0.978 0.937 0.86 0.767 0.649 0.585 0.44 0.278 0.041 -0.11 -0.259 -0.497 -0.739 -0.976 -1.23 -1.504 -1.875 -2.271 -2.678 -3.185 -3.708 -4.236 -4.856 -5.604 -6.371 -7.281 -8.324 -9.464 -10.753 -12.338 -14.33 -16.463 -19.151 -22.387 -26.456 -31.53 -38.201 -47.218 -60.235 -73.612 -83.276 -90.712 -96.576 -101.427 -105.372 -108.761 -111.558 -114.196 -116.409 -118.326 -120.116 -121.742 -123.183 -124.492 -125.834 -126.976 -127.925 -128.866 -129.811 -130.597 -131.396 -132.213 -132.841 -133.465 -134.089 -134.743 -135.412 -135.859 -136.299 -136.963 -137.411 -137.861 -138.093 -138.584 -139.12 -139.678 -139.959 -140.382 -140.858 -141.168 -141.469 -142.113 -142.46 -142.807 -143.153 -143.543 -144.001 -144.628 -146.267 -9 ,19964 ,KEBNE ,16707938,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:46 CET,0.0 0.537 0.712 0.831 0.898 0.917 0.924 0.916 0.893 0.879 0.849 0.783 0.748 0.711 0.616 0.514 0.395 0.328 0.2 0.063 -0.159 -0.304 -0.46 -0.709 -0.972 -1.262 -1.567 -1.862 -2.231 -2.604 -2.995 -3.505 -4.028 -4.567 -5.223 -6.014 -6.824 -7.75 -8.762 -9.854 -11.135 -12.729 -14.688 -16.786 -19.45 -22.683 -26.762 -31.868 -38.561 -47.639 -60.813 -74.259 -84.036 -91.573 -97.534 -102.493 -106.484 -109.857 -112.634 -115.267 -117.429 -119.296 -121.024 -122.6 -124.014 -125.269 -126.55 -127.672 -128.627 -129.597 -130.577 -131.376 -132.184 -132.994 -133.61 -134.229 -134.862 -135.513 -136.171 -136.603 -137.03 -137.696 -138.152 -138.624 -138.859 -139.318 -139.793 -140.301 -140.571 -140.972 -141.375 -141.667 -141.968 -142.595 -142.934 -143.29 -143.652 -144.031 -144.479 -145.058 -146.173 -10 ,17448 ,KEBNE ,16707939,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:58 CET,0.0 0.798 0.923 1.008 1.067 1.098 1.117 1.135 1.141 1.12 1.084 1.015 0.971 0.92 0.807 0.678 0.528 0.455 0.321 0.177 -0.067 -0.234 -0.385 -0.633 -0.907 -1.177 -1.464 -1.761 -2.161 -2.568 -2.961 -3.446 -3.967 -4.517 -5.192 -5.98 -6.757 -7.682 -8.767 -9.973 -11.309 -12.903 -14.877 -17.015 -19.714 -22.963 -27.043 -32.118 -38.767 -47.873 -61.277 -75.081 -85.092 -92.762 -98.78 -103.791 -107.933 -111.428 -114.315 -117.22 -119.589 -121.523 -123.357 -125.059 -126.601 -127.992 -129.394 -130.583 -131.555 -132.518 -133.47 -134.247 -135.037 -135.837 -136.476 -137.137 -137.786 -138.456 -139.168 -139.654 -140.125 -140.828 -141.332 -141.852 -142.114 -142.625 -143.122 -143.639 -143.898 -144.292 -144.667 -144.946 -145.243 -145.857 -146.18 -146.525 -146.901 -147.32 -147.75 -148.289 -149.582 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_227_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_227_57.txt deleted file mode 100644 index d135fdec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_227_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13826 ,KEBNE ,16707940,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:53 CET,0.0 0.937 1.297 1.549 1.748 1.922 2.061 2.188 2.449 2.57 2.677 2.876 2.964 3.055 3.231 3.383 3.518 3.59 3.738 3.882 4.1 4.242 4.369 4.538 4.696 4.859 5.011 5.155 5.349 5.515 5.647 5.8 5.938 6.088 6.282 6.477 6.676 6.929 7.17 7.385 7.626 7.893 8.161 8.373 8.602 8.842 9.054 9.228 9.334 9.238 8.791 8.082 7.32 6.53 5.8 5.193 4.69 4.232 3.782 3.286 2.86 2.491 2.158 1.845 1.529 1.187 0.803 0.496 0.26 -0.024 -0.345 -0.576 -0.798 -1.033 -1.217 -1.415 -1.625 -1.843 -2.064 -2.223 -2.393 -2.662 -2.849 -3.042 -3.145 -3.353 -3.56 -3.776 -3.891 -4.019 -4.283 -4.417 -4.552 -4.883 -5.097 -5.317 -5.525 -5.753 -6.044 -6.404 -7.226 -2 ,17338 ,KEBNE ,16707941,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:34:26 CET,0.0 0.962 1.284 1.539 1.758 1.938 2.104 2.244 2.477 2.59 2.703 2.912 3.006 3.104 3.28 3.444 3.604 3.683 3.834 3.97 4.144 4.254 4.366 4.524 4.68 4.834 4.989 5.129 5.301 5.468 5.621 5.823 6.036 6.236 6.45 6.682 6.887 7.098 7.316 7.52 7.723 7.938 8.164 8.422 8.764 9.088 9.346 9.519 9.626 9.596 9.162 8.394 7.646 6.924 6.249 5.616 5.004 4.405 3.942 3.506 3.116 2.777 2.448 2.122 1.822 1.551 1.256 0.978 0.733 0.487 0.216 -0.024 -0.28 -0.547 -0.743 -0.938 -1.138 -1.356 -1.6 -1.764 -1.929 -2.185 -2.365 -2.552 -2.641 -2.821 -3.027 -3.244 -3.352 -3.468 -3.725 -3.868 -4.021 -4.362 -4.544 -4.733 -4.939 -5.174 -5.469 -5.853 -6.859 -3 ,12140 ,KEBNE ,16707942,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:54 CET,0.0 0.846 1.223 1.502 1.731 1.917 2.088 2.253 2.551 2.691 2.813 3.037 3.135 3.221 3.38 3.534 3.686 3.765 3.904 4.034 4.232 4.366 4.494 4.675 4.849 5.01 5.169 5.32 5.51 5.682 5.846 6.031 6.204 6.389 6.618 6.87 7.087 7.296 7.55 7.82 8.071 8.331 8.591 8.871 9.257 9.622 9.865 10.073 10.224 10.231 9.893 9.164 8.408 7.642 6.956 6.344 5.765 5.209 4.709 4.207 3.781 3.414 3.067 2.73 2.417 2.125 1.81 1.521 1.256 0.978 0.677 0.433 0.186 -0.067 -0.271 -0.499 -0.709 -0.911 -1.157 -1.329 -1.489 -1.771 -1.977 -2.174 -2.277 -2.5 -2.728 -2.967 -3.094 -3.223 -3.488 -3.627 -3.782 -4.143 -4.346 -4.544 -4.752 -5.009 -5.315 -5.687 -6.801 -4 ,13071 ,KEBNE ,16707943,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:34:41 CET,0.0 0.886 1.237 1.539 1.77 1.947 2.102 2.24 2.534 2.667 2.773 2.979 3.074 3.174 3.36 3.525 3.675 3.747 3.881 3.995 4.155 4.266 4.381 4.554 4.722 4.876 5.042 5.21 5.389 5.549 5.714 5.897 6.05 6.19 6.359 6.574 6.795 7.03 7.25 7.447 7.633 7.83 8.05 8.271 8.521 8.761 8.963 9.122 9.244 9.228 8.86 8.211 7.514 6.82 6.144 5.451 4.823 4.278 3.845 3.407 3.045 2.724 2.383 2.031 1.704 1.383 1.024 0.752 0.541 0.303 0.031 -0.2 -0.422 -0.643 -0.818 -0.993 -1.18 -1.39 -1.618 -1.779 -1.942 -2.197 -2.373 -2.562 -2.66 -2.87 -3.101 -3.347 -3.471 -3.596 -3.859 -3.99 -4.131 -4.477 -4.674 -4.872 -5.085 -5.326 -5.598 -5.982 -6.971 -5 ,16134 ,KEBNE ,16707944,Fri Nov 26 14:02:40 CET,Fri Nov 26 15:29:31 CET,0.0 0.944 1.25 1.496 1.697 1.863 2.022 2.17 2.398 2.512 2.632 2.851 2.936 3.016 3.195 3.363 3.503 3.578 3.724 3.855 4.044 4.148 4.237 4.372 4.528 4.678 4.817 4.948 5.099 5.254 5.401 5.576 5.74 5.893 6.066 6.268 6.48 6.687 6.882 7.116 7.381 7.655 7.891 8.109 8.37 8.607 8.796 8.936 9.022 8.941 8.55 7.803 7.012 6.25 5.577 4.989 4.444 3.947 3.512 3.045 2.656 2.335 2.01 1.669 1.328 1.007 0.693 0.424 0.193 -0.028 -0.261 -0.467 -0.68 -0.891 -1.053 -1.227 -1.418 -1.632 -1.865 -2.023 -2.171 -2.402 -2.569 -2.738 -2.82 -2.982 -3.153 -3.333 -3.439 -3.561 -3.795 -3.912 -4.039 -4.332 -4.485 -4.662 -4.87 -5.08 -5.334 -5.749 -6.798 -6 ,21171 ,KEBNE ,16707945,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:34:47 CET,0.0 0.991 1.361 1.589 1.797 1.982 2.134 2.255 2.491 2.613 2.733 2.954 3.048 3.141 3.303 3.471 3.626 3.692 3.817 3.934 4.116 4.227 4.319 4.457 4.592 4.708 4.819 4.932 5.08 5.227 5.376 5.579 5.771 5.938 6.138 6.349 6.532 6.752 7.021 7.27 7.469 7.69 7.944 8.232 8.542 8.773 9.015 9.2 9.273 9.251 8.956 8.287 7.537 6.769 6.098 5.464 4.874 4.346 3.872 3.392 2.998 2.645 2.284 1.899 1.53 1.237 0.97 0.721 0.485 0.235 -0.029 -0.241 -0.475 -0.721 -0.889 -1.07 -1.26 -1.448 -1.655 -1.803 -1.954 -2.214 -2.394 -2.567 -2.656 -2.834 -3.021 -3.232 -3.348 -3.471 -3.723 -3.849 -3.971 -4.262 -4.442 -4.648 -4.886 -5.15 -5.434 -5.793 -6.904 -7 ,30737 ,KEBNE ,16707946,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:34:37 CET,0.0 0.903 1.255 1.536 1.758 1.943 2.108 2.266 2.543 2.669 2.786 2.996 3.093 3.189 3.374 3.554 3.717 3.793 3.94 4.089 4.301 4.429 4.547 4.705 4.865 5.037 5.2 5.349 5.519 5.665 5.808 5.981 6.143 6.305 6.492 6.688 6.862 7.044 7.247 7.484 7.723 7.955 8.196 8.417 8.647 8.9 9.157 9.364 9.511 9.56 9.278 8.575 7.83 7.108 6.439 5.822 5.258 4.745 4.278 3.82 3.433 3.07 2.728 2.377 2.057 1.789 1.508 1.229 0.961 0.671 0.375 0.151 -0.079 -0.332 -0.522 -0.722 -0.932 -1.135 -1.362 -1.53 -1.698 -1.969 -2.174 -2.381 -2.489 -2.711 -2.933 -3.166 -3.279 -3.406 -3.685 -3.829 -3.976 -4.31 -4.522 -4.746 -4.96 -5.204 -5.51 -5.905 -6.849 -8 ,11334 ,KEBNE ,16707947,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:52 CET,0.0 1.012 1.346 1.562 1.751 1.915 2.056 2.203 2.461 2.582 2.704 2.915 3.0 3.091 3.273 3.433 3.585 3.659 3.801 3.932 4.11 4.224 4.333 4.507 4.678 4.827 4.964 5.101 5.26 5.415 5.562 5.717 5.878 6.036 6.231 6.455 6.636 6.853 7.122 7.394 7.65 7.898 8.175 8.438 8.716 8.982 9.2 9.366 9.448 9.365 8.993 8.248 7.442 6.718 6.046 5.433 4.86 4.331 3.849 3.345 2.945 2.596 2.242 1.897 1.571 1.229 0.86 0.561 0.311 0.036 -0.235 -0.443 -0.653 -0.887 -1.085 -1.287 -1.5 -1.719 -1.949 -2.115 -2.279 -2.534 -2.716 -2.89 -2.976 -3.161 -3.353 -3.546 -3.651 -3.77 -4.021 -4.146 -4.278 -4.617 -4.804 -5.003 -5.213 -5.434 -5.713 -6.102 -7.13 -9 ,1490 ,KEBNE ,16707948,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:53 CET,0.0 1.014 1.391 1.648 1.854 2.046 2.211 2.358 2.613 2.725 2.837 3.055 3.146 3.25 3.444 3.62 3.793 3.872 4.018 4.168 4.367 4.477 4.59 4.761 4.92 5.065 5.199 5.328 5.491 5.654 5.825 6.029 6.215 6.378 6.543 6.729 6.888 7.053 7.243 7.438 7.637 7.853 8.084 8.309 8.55 8.784 9.016 9.197 9.289 9.207 8.809 8.118 7.399 6.712 6.067 5.468 4.963 4.496 4.073 3.649 3.217 2.806 2.474 2.185 1.903 1.632 1.343 1.073 0.824 0.577 0.327 0.109 -0.116 -0.364 -0.57 -0.787 -1.011 -1.235 -1.454 -1.603 -1.76 -2.015 -2.196 -2.381 -2.467 -2.659 -2.869 -3.082 -3.195 -3.308 -3.547 -3.692 -3.843 -4.154 -4.339 -4.533 -4.738 -4.991 -5.275 -5.63 -6.486 -10 ,31100 ,KEBNE ,16707949,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:34:37 CET,0.0 0.791 1.09 1.32 1.515 1.692 1.88 2.045 2.299 2.424 2.547 2.759 2.858 2.944 3.106 3.28 3.456 3.537 3.676 3.805 4.006 4.139 4.27 4.457 4.627 4.768 4.912 5.048 5.209 5.363 5.498 5.662 5.814 5.958 6.154 6.381 6.571 6.775 6.969 7.156 7.377 7.623 7.883 8.124 8.353 8.558 8.765 8.942 9.057 9.002 8.643 7.924 7.155 6.441 5.775 5.157 4.614 4.138 3.726 3.31 2.96 2.615 2.283 1.972 1.66 1.384 1.085 0.768 0.486 0.223 -0.027 -0.246 -0.469 -0.69 -0.868 -1.037 -1.209 -1.39 -1.584 -1.728 -1.883 -2.122 -2.281 -2.459 -2.558 -2.758 -2.963 -3.19 -3.314 -3.437 -3.669 -3.806 -3.957 -4.292 -4.47 -4.662 -4.886 -5.118 -5.402 -5.795 -6.701 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_235_167.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_235_167.txt deleted file mode 100644 index 4af59b50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_235_167.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3525 ,KEBNE ,16707950,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:44 CET,0.0 1.55 1.972 2.249 2.461 2.611 2.74 2.854 3.019 3.098 3.163 3.305 3.344 3.383 3.443 3.481 3.489 3.48 3.458 3.438 3.404 3.38 3.361 3.334 3.255 3.133 3.004 2.878 2.715 2.542 2.359 2.141 1.915 1.656 1.342 0.959 0.56 0.114 -0.415 -1.06 -1.808 -2.736 -3.906 -5.198 -6.858 -8.882 -11.481 -14.74 -19.016 -24.881 -33.644 -42.892 -49.653 -54.893 -59.011 -62.414 -65.318 -67.819 -69.827 -71.747 -73.348 -74.726 -76.01 -77.22 -78.313 -79.256 -80.196 -81.01 -81.717 -82.424 -83.109 -83.695 -84.327 -84.966 -85.449 -85.943 -86.455 -86.975 -87.507 -87.869 -88.228 -88.771 -89.136 -89.499 -89.685 -90.079 -90.484 -90.901 -91.11 -91.403 -91.791 -92.03 -92.276 -92.798 -93.079 -93.385 -93.722 -94.085 -94.502 -95.043 -96.387 -2 ,14074 ,KEBNE ,16707951,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:14 CET,0.0 1.575 1.937 2.177 2.399 2.585 2.737 2.858 3.008 3.082 3.153 3.285 3.325 3.378 3.453 3.488 3.5 3.504 3.526 3.553 3.575 3.568 3.551 3.521 3.471 3.409 3.345 3.275 3.157 3.044 2.923 2.723 2.51 2.272 1.958 1.573 1.174 0.709 0.137 -0.545 -1.274 -2.139 -3.278 -4.525 -6.104 -8.063 -10.55 -13.795 -18.172 -24.126 -32.938 -42.008 -48.679 -53.903 -58.034 -61.514 -64.369 -66.796 -68.817 -70.749 -72.354 -73.757 -75.09 -76.308 -77.387 -78.347 -79.306 -80.119 -80.784 -81.464 -82.169 -82.745 -83.339 -83.95 -84.407 -84.891 -85.391 -85.877 -86.382 -86.736 -87.095 -87.644 -88.011 -88.376 -88.562 -88.943 -89.34 -89.756 -89.963 -90.255 -90.644 -90.88 -91.129 -91.679 -91.969 -92.279 -92.618 -92.993 -93.392 -93.896 -95.699 -3 ,4833 ,KEBNE ,16707952,Fri Nov 26 14:02:35 CET,Fri Nov 26 15:33:05 CET,0.0 2.124 2.559 2.86 3.055 3.231 3.387 3.51 3.703 3.777 3.841 3.949 3.961 3.98 4.033 4.081 4.091 4.083 4.05 4.018 3.965 3.92 3.881 3.824 3.749 3.666 3.574 3.479 3.35 3.178 2.984 2.722 2.449 2.185 1.857 1.477 1.08 0.577 -0.032 -0.729 -1.512 -2.467 -3.661 -4.952 -6.611 -8.663 -11.275 -14.53 -18.781 -24.598 -33.135 -42.081 -48.756 -53.94 -58.035 -61.542 -64.465 -66.924 -68.953 -70.881 -72.478 -73.898 -75.196 -76.353 -77.407 -78.361 -79.324 -80.138 -80.826 -81.526 -82.24 -82.835 -83.452 -84.108 -84.609 -85.099 -85.602 -86.103 -86.6 -86.944 -87.3 -87.845 -88.216 -88.604 -88.799 -89.194 -89.613 -90.052 -90.276 -90.569 -90.929 -91.165 -91.402 -91.9 -92.168 -92.45 -92.777 -93.162 -93.604 -94.107 -95.806 -4 ,12168 ,KEBNE ,16707953,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:30 CET,0.0 1.895 2.246 2.517 2.738 2.908 3.017 3.106 3.254 3.302 3.346 3.466 3.504 3.552 3.613 3.656 3.681 3.683 3.672 3.668 3.66 3.635 3.605 3.575 3.541 3.484 3.418 3.314 3.159 3.011 2.836 2.635 2.417 2.138 1.789 1.366 0.95 0.472 -0.108 -0.783 -1.529 -2.445 -3.638 -4.932 -6.548 -8.521 -11.059 -14.271 -18.601 -24.557 -33.293 -42.374 -48.918 -53.974 -58.073 -61.554 -64.403 -66.839 -68.865 -70.804 -72.417 -73.796 -75.067 -76.235 -77.298 -78.242 -79.223 -80.087 -80.782 -81.487 -82.235 -82.832 -83.444 -84.073 -84.542 -85.021 -85.523 -86.043 -86.576 -86.935 -87.286 -87.816 -88.181 -88.552 -88.743 -89.13 -89.527 -89.948 -90.16 -90.459 -90.843 -91.083 -91.332 -91.856 -92.138 -92.455 -92.797 -93.157 -93.591 -94.124 -95.941 -5 ,29775 ,KEBNE ,16707954,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:34:06 CET,0.0 1.561 1.953 2.219 2.423 2.574 2.688 2.794 2.943 2.993 3.03 3.113 3.136 3.175 3.233 3.237 3.212 3.208 3.211 3.209 3.169 3.131 3.108 3.052 2.957 2.854 2.742 2.613 2.434 2.285 2.108 1.838 1.559 1.272 0.936 0.563 0.176 -0.32 -0.909 -1.58 -2.33 -3.253 -4.467 -5.794 -7.427 -9.446 -12.06 -15.336 -19.654 -25.553 -34.222 -43.34 -50.115 -55.376 -59.49 -62.933 -65.819 -68.272 -70.283 -72.219 -73.817 -75.199 -76.477 -77.635 -78.712 -79.673 -80.615 -81.45 -82.149 -82.856 -83.603 -84.216 -84.842 -85.47 -85.955 -86.434 -86.907 -87.405 -87.926 -88.277 -88.628 -89.146 -89.505 -89.887 -90.09 -90.515 -90.946 -91.383 -91.607 -91.911 -92.297 -92.538 -92.787 -93.322 -93.628 -93.947 -94.281 -94.675 -95.1 -95.646 -97.154 -6 ,31595 ,KEBNE ,16707955,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:49 CET,0.0 1.277 1.693 1.971 2.173 2.333 2.458 2.569 2.763 2.833 2.902 3.037 3.072 3.119 3.162 3.173 3.197 3.214 3.234 3.242 3.209 3.178 3.157 3.122 3.067 2.995 2.921 2.824 2.681 2.541 2.363 2.113 1.862 1.597 1.263 0.909 0.566 0.142 -0.404 -1.077 -1.802 -2.683 -3.8 -5.017 -6.595 -8.575 -11.154 -14.41 -18.712 -24.559 -33.17 -42.184 -48.8 -53.969 -58.115 -61.586 -64.435 -66.865 -68.88 -70.865 -72.497 -73.871 -75.143 -76.321 -77.388 -78.331 -79.284 -80.118 -80.818 -81.529 -82.282 -82.887 -83.485 -84.106 -84.598 -85.103 -85.599 -86.088 -86.602 -86.958 -87.315 -87.846 -88.205 -88.583 -88.779 -89.176 -89.561 -89.977 -90.199 -90.495 -90.864 -91.1 -91.34 -91.845 -92.128 -92.427 -92.746 -93.134 -93.604 -94.143 -95.992 -7 ,31196 ,KEBNE ,16707956,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:02 CET,0.0 1.696 2.098 2.343 2.517 2.679 2.816 2.929 3.09 3.149 3.214 3.35 3.378 3.41 3.449 3.473 3.487 3.5 3.519 3.516 3.484 3.46 3.443 3.421 3.385 3.335 3.264 3.171 3.023 2.841 2.648 2.404 2.164 1.93 1.638 1.256 0.86 0.393 -0.17 -0.814 -1.548 -2.463 -3.622 -4.911 -6.573 -8.578 -11.133 -14.302 -18.519 -24.412 -33.062 -42.143 -48.806 -53.968 -58.1 -61.553 -64.397 -66.824 -68.796 -70.718 -72.338 -73.748 -75.024 -76.154 -77.206 -78.153 -79.111 -79.967 -80.681 -81.383 -82.098 -82.687 -83.306 -83.956 -84.448 -84.934 -85.417 -85.909 -86.424 -86.777 -87.137 -87.702 -88.088 -88.474 -88.672 -89.078 -89.503 -89.92 -90.12 -90.406 -90.78 -91.013 -91.255 -91.785 -92.092 -92.426 -92.778 -93.143 -93.568 -94.112 -95.502 -8 ,18609 ,KEBNE ,16707957,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:34:10 CET,0.0 2.311 2.75 3.019 3.203 3.353 3.471 3.562 3.734 3.809 3.872 3.978 3.997 4.028 4.082 4.118 4.129 4.13 4.131 4.119 4.092 4.082 4.053 3.978 3.911 3.826 3.746 3.672 3.527 3.383 3.243 3.05 2.835 2.587 2.261 1.847 1.413 0.901 0.308 -0.347 -1.084 -1.99 -3.181 -4.45 -6.039 -8.018 -10.51 -13.712 -18.026 -23.954 -32.705 -41.883 -48.69 -53.965 -58.107 -61.545 -64.367 -66.81 -68.829 -70.75 -72.34 -73.765 -75.098 -76.322 -77.428 -78.391 -79.345 -80.159 -80.872 -81.607 -82.347 -82.935 -83.537 -84.156 -84.627 -85.113 -85.608 -86.108 -86.619 -86.973 -87.327 -87.866 -88.242 -88.621 -88.806 -89.177 -89.569 -89.976 -90.183 -90.482 -90.874 -91.122 -91.368 -91.876 -92.164 -92.484 -92.807 -93.141 -93.527 -94.067 -96.077 -9 ,10013 ,KEBNE ,16707958,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:32 CET,0.0 2.394 2.838 3.127 3.311 3.449 3.586 3.697 3.859 3.93 3.991 4.094 4.114 4.145 4.179 4.188 4.201 4.215 4.238 4.253 4.277 4.278 4.249 4.199 4.117 4.003 3.92 3.844 3.705 3.545 3.365 3.117 2.869 2.618 2.306 1.912 1.48 0.973 0.412 -0.216 -0.95 -1.867 -3.062 -4.355 -5.973 -7.977 -10.557 -13.794 -18.069 -23.94 -32.576 -41.677 -48.414 -53.647 -57.839 -61.364 -64.257 -66.722 -68.736 -70.653 -72.263 -73.667 -74.97 -76.14 -77.209 -78.184 -79.141 -79.95 -80.638 -81.33 -82.037 -82.629 -83.256 -83.883 -84.337 -84.818 -85.327 -85.83 -86.332 -86.677 -87.037 -87.577 -87.942 -88.326 -88.524 -88.936 -89.364 -89.798 -90.016 -90.318 -90.718 -90.969 -91.23 -91.779 -92.069 -92.37 -92.692 -93.05 -93.467 -94.035 -95.858 -10 ,14294 ,KEBNE ,16707959,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:34:22 CET,0.0 1.752 2.153 2.426 2.652 2.811 2.936 3.038 3.208 3.278 3.326 3.415 3.44 3.478 3.518 3.535 3.547 3.551 3.546 3.518 3.466 3.436 3.393 3.301 3.189 3.086 2.98 2.852 2.702 2.541 2.348 2.087 1.828 1.572 1.245 0.821 0.386 -0.111 -0.712 -1.406 -2.195 -3.148 -4.339 -5.645 -7.288 -9.297 -11.818 -15.003 -19.259 -24.957 -33.397 -42.339 -48.913 -54.069 -58.176 -61.558 -64.335 -66.733 -68.748 -70.687 -72.266 -73.608 -74.849 -75.992 -77.025 -77.962 -78.956 -79.808 -80.518 -81.242 -81.941 -82.524 -83.131 -83.721 -84.172 -84.657 -85.153 -85.656 -86.188 -86.538 -86.879 -87.42 -87.793 -88.152 -88.331 -88.718 -89.117 -89.512 -89.718 -90.008 -90.375 -90.615 -90.862 -91.373 -91.649 -91.947 -92.289 -92.65 -93.063 -93.581 -94.93 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_235_224.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_235_224.txt deleted file mode 100644 index ee077fea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_235_224.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9054 ,KEBNE ,16707960,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:32:50 CET,0.0 1.945 2.431 2.752 2.986 3.206 3.411 3.598 3.935 4.086 4.237 4.55 4.657 4.775 4.998 5.187 5.378 5.473 5.655 5.828 6.088 6.268 6.434 6.653 6.882 7.111 7.329 7.547 7.83 8.103 8.373 8.723 9.024 9.279 9.601 9.975 10.294 10.645 11.03 11.462 11.942 12.432 12.945 13.426 13.961 14.543 15.195 15.905 16.672 17.427 18.106 18.403 18.374 18.136 17.811 17.43 17.053 16.742 16.404 16.029 15.722 15.373 14.994 14.624 14.28 14.0 13.714 13.462 13.232 12.972 12.699 12.457 12.198 11.92 11.709 11.508 11.298 11.085 10.834 10.638 10.45 10.15 9.922 9.7 9.593 9.35 9.075 8.76 8.595 8.451 8.048 7.849 7.638 7.18 6.942 6.692 6.401 6.075 5.688 5.158 1.969 -2 ,19954 ,KEBNE ,16707961,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:15 CET,0.0 1.554 1.958 2.259 2.517 2.74 2.958 3.166 3.524 3.681 3.838 4.164 4.285 4.42 4.664 4.885 5.106 5.208 5.386 5.561 5.839 6.024 6.192 6.44 6.669 6.87 7.07 7.276 7.536 7.766 7.99 8.289 8.604 8.893 9.221 9.569 9.92 10.311 10.667 11.071 11.493 11.901 12.383 12.916 13.545 14.222 14.931 15.652 16.468 17.284 17.996 18.24 18.128 17.908 17.621 17.305 16.961 16.61 16.313 15.992 15.678 15.35 15.034 14.717 14.375 14.055 13.737 13.47 13.241 13.003 12.762 12.555 12.308 12.049 11.862 11.657 11.457 11.273 11.056 10.876 10.683 10.394 10.185 9.971 9.868 9.634 9.348 9.049 8.91 8.809 8.545 8.419 8.281 7.94 7.728 7.476 7.216 6.911 6.492 5.911 4.037 -3 ,7424 ,KEBNE ,16707962,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:44 CET,0.0 1.789 2.292 2.702 3.029 3.29 3.513 3.697 4.023 4.189 4.344 4.631 4.738 4.864 5.107 5.325 5.544 5.652 5.847 6.028 6.294 6.476 6.64 6.872 7.131 7.378 7.593 7.81 8.104 8.377 8.613 8.865 9.123 9.394 9.749 10.127 10.441 10.779 11.135 11.507 11.91 12.354 12.834 13.331 13.923 14.548 15.206 15.879 16.618 17.426 18.162 18.511 18.455 18.222 17.905 17.565 17.221 16.87 16.573 16.26 15.949 15.603 15.231 14.895 14.585 14.294 13.982 13.703 13.453 13.141 12.809 12.565 12.293 12.002 11.811 11.606 11.371 11.12 10.848 10.655 10.467 10.198 9.995 9.779 9.66 9.413 9.164 8.883 8.733 8.609 8.291 8.123 7.929 7.471 7.215 6.938 6.609 6.235 5.795 5.173 2.535 -4 ,13204 ,KEBNE ,16707963,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:51 CET,0.0 1.434 1.851 2.16 2.42 2.653 2.867 3.062 3.412 3.572 3.726 4.031 4.143 4.275 4.55 4.823 5.077 5.195 5.412 5.629 5.95 6.139 6.319 6.589 6.861 7.128 7.374 7.608 7.907 8.195 8.472 8.777 9.044 9.295 9.583 9.947 10.31 10.68 11.07 11.47 11.899 12.395 12.932 13.458 14.064 14.687 15.334 16.014 16.749 17.502 18.172 18.36 18.215 17.973 17.627 17.225 16.847 16.491 16.179 15.842 15.527 15.246 14.978 14.706 14.455 14.222 13.949 13.67 13.422 13.165 12.879 12.62 12.351 12.089 11.876 11.66 11.443 11.207 10.945 10.761 10.577 10.297 10.086 9.855 9.736 9.488 9.249 8.994 8.851 8.724 8.344 8.157 7.964 7.561 7.355 7.137 6.862 6.521 6.126 5.589 3.762 -5 ,12288 ,KEBNE ,16707964,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:32:28 CET,0.0 2.026 2.545 2.912 3.231 3.499 3.703 3.892 4.268 4.444 4.597 4.904 5.017 5.123 5.35 5.596 5.825 5.928 6.13 6.322 6.579 6.742 6.9 7.141 7.381 7.617 7.838 8.042 8.323 8.598 8.849 9.155 9.468 9.788 10.115 10.457 10.813 11.194 11.575 11.954 12.356 12.81 13.311 13.802 14.383 15.0 15.645 16.307 17.02 17.849 18.654 18.988 19.008 18.819 18.519 18.186 17.875 17.562 17.257 16.949 16.652 16.325 15.981 15.602 15.227 14.933 14.68 14.404 14.122 13.847 13.532 13.259 12.979 12.67 12.422 12.17 11.907 11.645 11.403 11.228 11.017 10.66 10.413 10.18 10.072 9.84 9.559 9.24 9.078 8.949 8.608 8.423 8.21 7.804 7.601 7.353 7.049 6.693 6.248 5.641 3.432 -6 ,26024 ,KEBNE ,16707965,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:34 CET,0.0 1.116 1.511 1.797 2.035 2.24 2.445 2.624 2.936 3.093 3.24 3.53 3.639 3.76 3.998 4.233 4.454 4.552 4.716 4.869 5.11 5.284 5.452 5.668 5.887 6.129 6.366 6.597 6.899 7.197 7.476 7.798 8.104 8.374 8.663 9.023 9.371 9.705 10.072 10.459 10.864 11.321 11.831 12.339 12.899 13.472 14.101 14.828 15.637 16.471 17.187 17.462 17.444 17.237 16.94 16.585 16.251 15.865 15.429 14.978 14.586 14.232 13.886 13.53 13.213 12.939 12.61 12.292 12.046 11.808 11.562 11.353 11.117 10.869 10.669 10.471 10.265 10.045 9.812 9.638 9.457 9.175 8.963 8.74 8.626 8.364 8.099 7.838 7.704 7.596 7.288 7.123 6.933 6.515 6.294 6.061 5.789 5.483 5.117 4.615 2.457 -7 ,11253 ,KEBNE ,16707966,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:01 CET,0.0 1.796 2.225 2.531 2.784 3.002 3.191 3.365 3.674 3.818 3.967 4.277 4.381 4.497 4.741 4.971 5.177 5.268 5.456 5.653 5.943 6.145 6.346 6.624 6.874 7.094 7.31 7.532 7.809 8.056 8.294 8.59 8.869 9.13 9.429 9.756 10.061 10.391 10.75 11.17 11.615 12.079 12.573 13.035 13.562 14.128 14.785 15.501 16.227 16.881 17.391 17.587 17.493 17.221 16.884 16.552 16.226 15.755 15.248 14.791 14.455 14.151 13.809 13.434 13.08 12.765 12.428 12.101 11.816 11.518 11.173 10.887 10.639 10.389 10.162 9.927 9.69 9.456 9.222 9.063 8.893 8.602 8.389 8.166 8.058 7.832 7.589 7.326 7.185 7.066 6.731 6.551 6.355 5.938 5.693 5.426 5.172 4.883 4.506 3.998 2.159 -8 ,30540 ,KEBNE ,16707967,Fri Nov 26 14:02:36 CET,Fri Nov 26 15:33:33 CET,0.0 1.686 2.074 2.364 2.6 2.811 3.004 3.2 3.565 3.727 3.88 4.171 4.293 4.429 4.673 4.907 5.144 5.259 5.472 5.68 5.986 6.178 6.362 6.635 6.904 7.136 7.35 7.581 7.881 8.177 8.467 8.789 9.077 9.345 9.655 9.988 10.297 10.633 10.977 11.336 11.729 12.181 12.692 13.189 13.752 14.368 15.044 15.736 16.476 17.251 17.924 18.144 18.045 17.817 17.482 17.136 16.822 16.511 16.22 15.902 15.6 15.327 15.059 14.766 14.502 14.233 13.908 13.591 13.32 13.048 12.736 12.469 12.204 11.953 11.764 11.577 11.379 11.144 10.865 10.674 10.483 10.184 9.978 9.771 9.66 9.419 9.17 8.887 8.741 8.614 8.279 8.111 7.914 7.492 7.255 6.969 6.651 6.306 5.865 5.286 2.919 -9 ,23730 ,KEBNE ,16707968,Fri Nov 26 14:03:36 CET,Fri Nov 26 15:34:42 CET,0.0 2.145 2.568 2.865 3.106 3.33 3.531 3.723 4.096 4.276 4.441 4.771 4.901 5.033 5.3 5.548 5.766 5.87 6.086 6.304 6.604 6.796 6.978 7.246 7.498 7.723 7.93 8.13 8.392 8.657 8.907 9.191 9.462 9.721 10.018 10.346 10.658 11.011 11.384 11.762 12.156 12.64 13.242 13.811 14.421 15.05 15.702 16.412 17.191 17.972 18.744 19.07 18.995 18.759 18.467 18.109 17.767 17.458 17.097 16.731 16.39 16.033 15.725 15.411 15.115 14.852 14.556 14.303 14.031 13.739 13.448 13.191 12.949 12.7 12.493 12.268 12.025 11.773 11.508 11.322 11.136 10.841 10.635 10.405 10.279 10.03 9.765 9.483 9.335 9.202 8.861 8.698 8.528 8.177 7.968 7.715 7.453 7.153 6.768 6.195 3.656 -10 ,30295 ,KEBNE ,16707969,Fri Nov 26 14:03:36 CET,Fri Nov 26 15:33:40 CET,0.0 1.373 1.739 2.03 2.28 2.51 2.727 2.913 3.24 3.401 3.548 3.813 3.908 4.027 4.268 4.497 4.725 4.833 5.034 5.229 5.496 5.646 5.796 6.053 6.324 6.577 6.803 6.994 7.242 7.488 7.706 7.98 8.243 8.477 8.748 9.049 9.338 9.655 10.003 10.37 10.752 11.186 11.669 12.139 12.688 13.288 13.981 14.758 15.56 16.324 16.954 17.131 16.959 16.571 16.124 15.754 15.404 15.042 14.673 14.188 13.787 13.465 13.129 12.813 12.515 12.242 11.96 11.717 11.505 11.265 10.998 10.744 10.456 10.171 9.962 9.758 9.556 9.339 9.103 8.939 8.769 8.488 8.284 8.065 7.96 7.741 7.503 7.242 7.099 6.978 6.648 6.49 6.317 5.957 5.767 5.534 5.235 4.907 4.522 4.041 2.319 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_155.txt deleted file mode 100644 index d131715e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12404 ,KEBNE ,16707970,Fri Nov 26 14:03:36 CET,Fri Nov 26 15:34:36 CET,0.0 0.924 1.217 1.441 1.605 1.752 1.885 2.012 2.242 2.34 2.435 2.595 2.704 2.77 2.892 3.013 3.131 3.183 3.266 3.353 3.513 3.611 3.69 3.788 3.876 3.957 4.034 4.1 4.2 4.305 4.393 4.499 4.593 4.667 4.738 4.839 4.941 5.038 5.141 5.214 5.251 5.281 5.317 5.291 5.169 4.995 4.726 4.289 3.593 2.545 0.771 -1.52 -3.5 -5.155 -6.521 -7.736 -8.805 -9.775 -10.589 -11.379 -12.079 -12.708 -13.298 -13.838 -14.331 -14.778 -15.231 -15.624 -15.954 -16.303 -16.667 -16.969 -17.29 -17.612 -17.859 -18.116 -18.391 -18.673 -18.97 -19.189 -19.397 -19.704 -19.923 -20.157 -20.278 -20.523 -20.782 -21.061 -21.21 -21.414 -21.663 -21.813 -21.981 -22.339 -22.529 -22.746 -22.991 -23.274 -23.609 -24.012 -24.921 -2 ,3288 ,KEBNE ,16707971,Fri Nov 26 14:03:36 CET,Fri Nov 26 15:35:02 CET,0.0 0.972 1.333 1.59 1.769 1.924 2.065 2.201 2.432 2.547 2.658 2.805 2.919 2.998 3.132 3.263 3.384 3.433 3.521 3.605 3.737 3.811 3.881 4.001 4.104 4.199 4.281 4.359 4.489 4.616 4.722 4.823 4.897 4.957 5.021 5.105 5.172 5.21 5.245 5.276 5.305 5.345 5.414 5.441 5.406 5.331 5.111 4.74 4.175 3.199 1.498 -0.743 -2.673 -4.311 -5.672 -6.847 -7.865 -8.768 -9.559 -10.368 -11.072 -11.683 -12.251 -12.78 -13.25 -13.666 -14.095 -14.484 -14.845 -15.21 -15.568 -15.872 -16.176 -16.47 -16.699 -16.952 -17.214 -17.481 -17.761 -17.95 -18.147 -18.461 -18.679 -18.911 -19.031 -19.27 -19.524 -19.785 -19.922 -20.121 -20.4 -20.574 -20.748 -21.132 -21.346 -21.567 -21.802 -22.065 -22.371 -22.853 -24.108 -3 ,13163 ,KEBNE ,16707972,Fri Nov 26 14:03:40 CET,Fri Nov 26 15:31:10 CET,0.0 1.013 1.371 1.634 1.87 2.052 2.179 2.292 2.501 2.605 2.699 2.826 2.934 3.014 3.168 3.31 3.44 3.507 3.638 3.762 3.919 4.011 4.108 4.227 4.314 4.409 4.506 4.6 4.707 4.798 4.893 5.014 5.124 5.224 5.324 5.41 5.483 5.548 5.604 5.674 5.778 5.863 5.926 5.971 5.969 5.892 5.688 5.357 4.816 3.887 2.269 0.318 -1.287 -2.583 -3.793 -4.912 -5.888 -6.847 -7.666 -8.44 -9.082 -9.666 -10.234 -10.734 -11.192 -11.612 -12.031 -12.391 -12.699 -13.026 -13.374 -13.68 -14.004 -14.334 -14.595 -14.847 -15.108 -15.405 -15.696 -15.884 -16.079 -16.39 -16.603 -16.829 -16.95 -17.204 -17.457 -17.707 -17.851 -18.052 -18.305 -18.471 -18.645 -19.006 -19.199 -19.422 -19.683 -19.988 -20.344 -20.847 -21.944 -4 ,24057 ,KEBNE ,16707973,Fri Nov 26 14:04:37 CET,Fri Nov 26 15:35:23 CET,0.0 1.062 1.368 1.624 1.826 2.0 2.145 2.272 2.498 2.612 2.722 2.867 2.966 3.039 3.18 3.31 3.433 3.494 3.616 3.721 3.849 3.94 4.029 4.143 4.263 4.395 4.519 4.613 4.71 4.788 4.869 4.981 5.075 5.151 5.223 5.278 5.339 5.438 5.548 5.652 5.755 5.808 5.775 5.727 5.635 5.471 5.213 4.796 4.15 3.116 1.35 -0.832 -2.65 -4.259 -5.659 -6.791 -7.718 -8.549 -9.307 -10.095 -10.752 -11.344 -11.915 -12.419 -12.855 -13.259 -13.686 -14.062 -14.386 -14.71 -15.048 -15.339 -15.649 -15.971 -16.209 -16.452 -16.706 -16.954 -17.203 -17.383 -17.565 -17.83 -18.018 -18.22 -18.327 -18.563 -18.79 -19.009 -19.137 -19.323 -19.549 -19.69 -19.84 -20.163 -20.363 -20.588 -20.811 -21.051 -21.31 -21.667 -22.437 -5 ,21905 ,KEBNE ,16707974,Fri Nov 26 14:04:39 CET,Fri Nov 26 15:30:53 CET,0.0 0.829 1.151 1.381 1.554 1.686 1.821 1.944 2.156 2.255 2.347 2.478 2.578 2.65 2.789 2.917 3.04 3.106 3.226 3.332 3.462 3.556 3.665 3.821 3.951 4.05 4.153 4.249 4.37 4.48 4.566 4.666 4.767 4.857 4.949 5.052 5.152 5.245 5.326 5.405 5.464 5.476 5.426 5.352 5.251 5.105 4.864 4.453 3.823 2.858 1.08 -1.297 -3.283 -4.878 -6.237 -7.463 -8.512 -9.448 -10.249 -11.054 -11.747 -12.324 -12.838 -13.342 -13.824 -14.252 -14.688 -15.093 -15.446 -15.795 -16.148 -16.442 -16.756 -17.089 -17.354 -17.629 -17.907 -18.177 -18.464 -18.672 -18.884 -19.198 -19.408 -19.643 -19.766 -20.011 -20.261 -20.532 -20.686 -20.891 -21.151 -21.313 -21.48 -21.852 -22.045 -22.246 -22.479 -22.75 -23.082 -23.485 -24.446 -6 ,9239 ,KEBNE ,16707975,Fri Nov 26 14:06:39 CET,Fri Nov 26 15:38:16 CET,0.0 0.923 1.234 1.464 1.632 1.802 1.96 2.084 2.293 2.391 2.491 2.633 2.73 2.791 2.911 3.026 3.14 3.195 3.294 3.41 3.604 3.72 3.821 3.947 4.055 4.156 4.251 4.337 4.417 4.497 4.587 4.683 4.757 4.809 4.861 4.905 4.946 5.003 5.053 5.084 5.103 5.101 5.04 4.938 4.8 4.594 4.307 3.912 3.245 2.073 0.058 -2.33 -4.3 -5.95 -7.275 -8.388 -9.362 -10.228 -11.012 -11.839 -12.522 -13.112 -13.667 -14.183 -14.647 -15.062 -15.507 -15.912 -16.247 -16.587 -16.942 -17.23 -17.529 -17.856 -18.111 -18.359 -18.611 -18.874 -19.147 -19.345 -19.559 -19.874 -20.081 -20.303 -20.417 -20.648 -20.902 -21.183 -21.326 -21.521 -21.786 -21.933 -22.086 -22.437 -22.631 -22.848 -23.069 -23.325 -23.619 -23.906 -24.789 -7 ,9664 ,KEBNE ,16707976,Fri Nov 26 14:06:39 CET,Fri Nov 26 15:37:36 CET,0.0 0.965 1.293 1.522 1.696 1.836 1.971 2.098 2.293 2.381 2.473 2.616 2.735 2.814 2.936 3.05 3.161 3.216 3.311 3.385 3.499 3.584 3.683 3.816 3.913 3.997 4.098 4.186 4.279 4.374 4.482 4.614 4.722 4.813 4.908 5.023 5.105 5.198 5.318 5.393 5.471 5.557 5.594 5.563 5.443 5.365 5.25 4.98 4.501 3.497 1.726 -0.37 -2.131 -3.594 -4.821 -5.99 -7.045 -7.991 -8.792 -9.568 -10.23 -10.804 -11.357 -11.887 -12.378 -12.83 -13.308 -13.736 -14.107 -14.485 -14.865 -15.177 -15.503 -15.849 -16.111 -16.38 -16.655 -16.92 -17.203 -17.413 -17.629 -17.947 -18.166 -18.391 -18.51 -18.76 -19.003 -19.261 -19.402 -19.585 -19.811 -19.963 -20.127 -20.51 -20.719 -20.945 -21.197 -21.5 -21.863 -22.291 -23.05 -8 ,5662 ,KEBNE ,16707977,Fri Nov 26 14:06:39 CET,Fri Nov 26 15:38:14 CET,0.0 0.869 1.193 1.443 1.652 1.828 1.989 2.117 2.328 2.437 2.532 2.669 2.767 2.83 2.967 3.114 3.242 3.295 3.397 3.493 3.632 3.709 3.777 3.881 3.989 4.097 4.201 4.291 4.413 4.518 4.601 4.708 4.814 4.918 5.012 5.097 5.188 5.287 5.39 5.482 5.548 5.597 5.621 5.622 5.598 5.553 5.479 5.185 4.561 3.515 1.625 -0.623 -2.342 -3.787 -5.046 -6.153 -7.135 -8.01 -8.762 -9.523 -10.174 -10.753 -11.311 -11.824 -12.279 -12.693 -13.131 -13.523 -13.841 -14.171 -14.544 -14.855 -15.17 -15.488 -15.735 -16.007 -16.291 -16.562 -16.835 -17.017 -17.203 -17.496 -17.696 -17.91 -18.022 -18.244 -18.472 -18.708 -18.84 -19.039 -19.301 -19.47 -19.648 -20.033 -20.237 -20.468 -20.735 -21.008 -21.32 -21.747 -23.053 -9 ,145 ,KEBNE ,16707978,Fri Nov 26 14:06:43 CET,Fri Nov 26 15:34:29 CET,0.0 1.053 1.361 1.586 1.747 1.867 1.99 2.123 2.366 2.469 2.562 2.696 2.805 2.875 2.991 3.092 3.21 3.27 3.373 3.459 3.577 3.658 3.729 3.844 3.958 4.044 4.12 4.199 4.305 4.413 4.51 4.6 4.672 4.764 4.881 4.981 5.062 5.172 5.269 5.339 5.452 5.563 5.587 5.533 5.442 5.302 5.083 4.72 4.052 2.853 0.939 -1.28 -3.299 -4.977 -6.365 -7.62 -8.679 -9.615 -10.403 -11.134 -11.732 -12.279 -12.819 -13.3 -13.748 -14.167 -14.59 -14.978 -15.312 -15.653 -15.989 -16.271 -16.566 -16.862 -17.092 -17.328 -17.586 -17.862 -18.151 -18.34 -18.534 -18.85 -19.067 -19.287 -19.398 -19.649 -19.914 -20.18 -20.331 -20.542 -20.8 -20.961 -21.132 -21.494 -21.686 -21.901 -22.122 -22.395 -22.74 -23.148 -24.18 -10 ,11142 ,KEBNE ,16707979,Fri Nov 26 14:07:40 CET,Fri Nov 26 15:38:56 CET,0.0 0.963 1.298 1.507 1.673 1.818 1.945 2.07 2.289 2.387 2.472 2.609 2.721 2.796 2.946 3.092 3.219 3.273 3.368 3.467 3.601 3.673 3.75 3.864 3.973 4.076 4.173 4.27 4.373 4.455 4.539 4.643 4.744 4.834 4.925 5.01 5.086 5.149 5.208 5.242 5.251 5.264 5.256 5.201 5.181 5.127 4.901 4.53 3.93 3.04 1.207 -1.093 -2.963 -4.635 -6.055 -7.275 -8.318 -9.233 -10.013 -10.836 -11.542 -12.137 -12.678 -13.182 -13.662 -14.105 -14.563 -14.946 -15.268 -15.624 -16.005 -16.31 -16.615 -16.946 -17.198 -17.452 -17.729 -18.013 -18.295 -18.485 -18.676 -18.967 -19.175 -19.39 -19.499 -19.726 -19.969 -20.244 -20.382 -20.572 -20.819 -20.965 -21.118 -21.481 -21.68 -21.895 -22.125 -22.405 -22.728 -23.157 -24.593 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_163.txt deleted file mode 100644 index 699245d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27071 ,KEBNE ,16707980,Fri Nov 26 14:08:41 CET,Fri Nov 26 15:39:48 CET,0.0 0.842 1.098 1.264 1.371 1.461 1.54 1.607 1.708 1.747 1.768 1.739 1.764 1.765 1.759 1.73 1.704 1.687 1.631 1.572 1.489 1.417 1.332 1.21 1.09 0.974 0.866 0.746 0.541 0.318 0.09 -0.207 -0.508 -0.783 -1.088 -1.488 -1.939 -2.523 -3.206 -3.969 -4.851 -5.932 -7.267 -8.69 -10.496 -12.701 -15.478 -18.89 -23.394 -29.602 -38.726 -48.32 -55.485 -61.026 -65.422 -69.104 -72.124 -74.737 -76.902 -78.946 -80.618 -82.083 -83.424 -84.629 -85.726 -86.697 -87.668 -88.511 -89.224 -89.948 -90.687 -91.283 -91.884 -92.5 -92.981 -93.48 -93.989 -94.495 -95.006 -95.354 -95.71 -96.265 -96.638 -97.013 -97.204 -97.58 -97.968 -98.397 -98.62 -98.977 -99.328 -99.573 -99.82 -100.325 -100.604 -100.908 -101.218 -101.56 -101.954 -102.403 -103.816 -2 ,3028 ,KEBNE ,16707981,Fri Nov 26 14:08:41 CET,Fri Nov 26 15:39:28 CET,0.0 0.746 1.055 1.242 1.393 1.508 1.597 1.669 1.779 1.811 1.844 1.868 1.916 1.933 1.95 1.944 1.927 1.917 1.889 1.856 1.784 1.717 1.645 1.536 1.425 1.284 1.139 1.015 0.858 0.692 0.501 0.231 -0.062 -0.359 -0.679 -1.056 -1.478 -2.001 -2.588 -3.258 -3.988 -4.865 -6.037 -7.34 -9.032 -11.091 -13.709 -16.994 -21.395 -27.543 -36.691 -46.322 -53.44 -58.959 -63.283 -66.895 -69.908 -72.511 -74.63 -76.655 -78.345 -79.795 -81.126 -82.326 -83.402 -84.367 -85.352 -86.212 -86.945 -87.693 -88.456 -89.068 -89.686 -90.337 -90.833 -91.331 -91.851 -92.382 -92.902 -93.257 -93.619 -94.167 -94.536 -94.901 -95.091 -95.482 -95.891 -96.327 -96.553 -96.913 -97.259 -97.506 -97.759 -98.309 -98.602 -98.902 -99.213 -99.542 -99.91 -100.403 -102.129 -3 ,21378 ,KEBNE ,16707982,Fri Nov 26 14:08:41 CET,Fri Nov 26 15:39:32 CET,0.0 0.741 0.935 1.084 1.207 1.317 1.407 1.466 1.553 1.587 1.605 1.575 1.606 1.611 1.603 1.587 1.554 1.536 1.505 1.459 1.366 1.308 1.248 1.146 1.038 0.918 0.781 0.634 0.445 0.253 0.047 -0.229 -0.505 -0.761 -1.077 -1.499 -1.943 -2.45 -3.078 -3.818 -4.645 -5.625 -6.868 -8.258 -10.035 -12.239 -15.007 -18.493 -23.118 -29.374 -38.677 -48.359 -55.457 -60.96 -65.384 -69.052 -72.013 -74.547 -76.65 -78.679 -80.334 -81.742 -83.036 -84.239 -85.349 -86.319 -87.29 -88.142 -88.855 -89.566 -90.287 -90.879 -91.48 -92.116 -92.604 -93.084 -93.572 -94.063 -94.554 -94.892 -95.231 -95.733 -96.081 -96.44 -96.622 -97.001 -97.396 -97.8 -98.007 -98.359 -98.695 -98.919 -99.15 -99.636 -99.901 -100.186 -100.487 -100.796 -101.149 -101.58 -102.634 -4 ,13926 ,KEBNE ,16707983,Fri Nov 26 14:08:41 CET,Fri Nov 26 15:39:43 CET,0.0 1.267 1.54 1.702 1.824 1.941 2.048 2.116 2.188 2.215 2.238 2.24 2.29 2.304 2.309 2.302 2.269 2.245 2.187 2.122 2.009 1.936 1.87 1.766 1.666 1.563 1.435 1.284 1.086 0.887 0.667 0.376 0.071 -0.23 -0.592 -1.051 -1.526 -2.086 -2.72 -3.436 -4.268 -5.27 -6.541 -7.894 -9.601 -11.726 -14.482 -17.998 -22.661 -28.927 -37.88 -47.329 -54.384 -59.881 -64.327 -68.022 -71.019 -73.584 -75.671 -77.633 -79.266 -80.682 -81.995 -83.217 -84.318 -85.278 -86.243 -87.102 -87.844 -88.569 -89.305 -89.92 -90.528 -91.138 -91.609 -92.091 -92.569 -93.051 -93.548 -93.891 -94.24 -94.774 -95.135 -95.489 -95.669 -96.04 -96.423 -96.826 -97.042 -97.391 -97.708 -97.945 -98.189 -98.687 -98.951 -99.25 -99.569 -99.941 -100.385 -100.876 -101.951 -5 ,31456 ,KEBNE ,16707984,Fri Nov 26 14:08:41 CET,Fri Nov 26 15:39:45 CET,0.0 0.863 1.09 1.242 1.348 1.439 1.521 1.585 1.663 1.685 1.707 1.689 1.715 1.715 1.705 1.688 1.675 1.661 1.614 1.572 1.502 1.441 1.37 1.267 1.157 1.038 0.932 0.821 0.635 0.436 0.245 -0.018 -0.313 -0.603 -0.953 -1.408 -1.897 -2.492 -3.168 -3.878 -4.696 -5.749 -7.064 -8.488 -10.29 -12.489 -15.201 -18.58 -23.162 -29.431 -38.625 -48.199 -55.189 -60.677 -65.087 -68.731 -71.713 -74.298 -76.433 -78.458 -80.136 -81.545 -82.825 -84.019 -85.104 -86.064 -87.045 -87.913 -88.657 -89.401 -90.146 -90.756 -91.372 -92.004 -92.471 -92.932 -93.409 -93.89 -94.379 -94.718 -95.07 -95.599 -95.953 -96.324 -96.517 -96.909 -97.306 -97.724 -97.941 -98.293 -98.613 -98.839 -99.074 -99.587 -99.86 -100.144 -100.455 -100.793 -101.165 -101.628 -102.828 -6 ,24454 ,KEBNE ,16707985,Fri Nov 26 14:08:41 CET,Fri Nov 26 15:41:03 CET,0.0 0.729 0.958 1.1 1.201 1.255 1.303 1.346 1.425 1.451 1.462 1.434 1.461 1.459 1.445 1.415 1.359 1.324 1.261 1.195 1.081 1.012 0.936 0.797 0.664 0.538 0.4 0.251 0.045 -0.163 -0.383 -0.684 -0.967 -1.268 -1.683 -2.162 -2.643 -3.234 -3.934 -4.72 -5.586 -6.624 -7.93 -9.351 -11.138 -13.313 -16.111 -19.629 -24.242 -30.43 -39.585 -49.327 -56.519 -62.113 -66.536 -70.158 -73.158 -75.736 -77.818 -79.856 -81.574 -83.004 -84.302 -85.505 -86.615 -87.628 -88.636 -89.484 -90.219 -90.968 -91.724 -92.343 -92.946 -93.541 -94.0 -94.485 -94.973 -95.457 -95.968 -96.32 -96.675 -97.211 -97.581 -97.966 -98.161 -98.543 -98.924 -99.338 -99.549 -99.888 -100.192 -100.43 -100.689 -101.221 -101.507 -101.821 -102.141 -102.492 -102.905 -103.377 -104.462 -7 ,23982 ,KEBNE ,16707986,Fri Nov 26 14:08:41 CET,Fri Nov 26 15:39:55 CET,0.0 1.0 1.226 1.354 1.48 1.579 1.652 1.714 1.807 1.839 1.865 1.883 1.924 1.929 1.921 1.883 1.827 1.804 1.774 1.731 1.649 1.596 1.537 1.425 1.303 1.18 1.043 0.882 0.672 0.475 0.281 0.011 -0.295 -0.61 -0.995 -1.462 -1.935 -2.466 -3.054 -3.757 -4.581 -5.601 -6.918 -8.293 -9.951 -12.006 -14.767 -18.328 -22.99 -29.354 -38.762 -48.656 -55.994 -61.717 -66.244 -69.973 -73.045 -75.685 -77.848 -79.922 -81.647 -83.136 -84.502 -85.703 -86.799 -87.823 -88.867 -89.754 -90.485 -91.227 -91.986 -92.604 -93.239 -93.871 -94.332 -94.801 -95.288 -95.774 -96.271 -96.615 -96.955 -97.471 -97.838 -98.23 -98.433 -98.836 -99.242 -99.64 -99.842 -100.188 -100.484 -100.714 -100.946 -101.44 -101.713 -101.993 -102.29 -102.627 -103.018 -103.503 -104.531 -8 ,2556 ,KEBNE ,16707987,Fri Nov 26 14:09:42 CET,Fri Nov 26 15:40:16 CET,0.0 1.492 1.801 2.016 2.172 2.263 2.315 2.368 2.462 2.489 2.5 2.496 2.526 2.521 2.522 2.503 2.458 2.431 2.369 2.309 2.228 2.161 2.087 1.976 1.869 1.748 1.602 1.454 1.257 1.05 0.84 0.589 0.317 0.018 -0.333 -0.756 -1.226 -1.794 -2.445 -3.189 -4.028 -5.027 -6.271 -7.619 -9.344 -11.505 -14.254 -17.678 -22.143 -28.336 -37.628 -47.365 -54.483 -59.939 -64.325 -68.031 -71.085 -73.697 -75.821 -77.859 -79.584 -81.082 -82.466 -83.73 -84.872 -85.888 -86.914 -87.796 -88.54 -89.28 -90.013 -90.614 -91.229 -91.853 -92.32 -92.792 -93.285 -93.773 -94.262 -94.605 -94.953 -95.477 -95.831 -96.203 -96.393 -96.778 -97.171 -97.604 -97.832 -98.177 -98.508 -98.745 -98.987 -99.511 -99.799 -100.104 -100.408 -100.772 -101.197 -101.679 -102.857 -9 ,8473 ,KEBNE ,16707988,Fri Nov 26 14:09:42 CET,Fri Nov 26 15:40:12 CET,0.0 1.14 1.442 1.668 1.826 1.926 1.999 2.053 2.146 2.184 2.206 2.209 2.246 2.25 2.242 2.221 2.2 2.183 2.131 2.08 1.992 1.935 1.892 1.821 1.719 1.588 1.443 1.289 1.092 0.903 0.68 0.366 0.038 -0.29 -0.676 -1.138 -1.605 -2.175 -2.861 -3.633 -4.497 -5.556 -6.888 -8.334 -10.171 -12.376 -15.173 -18.702 -23.294 -29.484 -38.49 -48.02 -55.129 -60.677 -65.147 -68.87 -71.952 -74.638 -76.837 -78.939 -80.69 -82.174 -83.531 -84.787 -85.923 -86.937 -87.961 -88.837 -89.582 -90.333 -91.083 -91.685 -92.294 -92.926 -93.416 -93.902 -94.387 -94.889 -95.389 -95.731 -96.083 -96.619 -96.989 -97.37 -97.569 -97.973 -98.39 -98.813 -99.022 -99.363 -99.674 -99.902 -100.13 -100.608 -100.874 -101.179 -101.479 -101.788 -102.172 -102.677 -104.146 -10 ,32490 ,KEBNE ,16707989,Fri Nov 26 14:09:42 CET,Fri Nov 26 15:40:28 CET,0.0 1.12 1.401 1.579 1.719 1.822 1.92 1.999 2.081 2.1 2.102 2.071 2.105 2.103 2.083 2.063 2.047 2.042 2.034 2.015 1.963 1.897 1.821 1.718 1.624 1.511 1.368 1.215 1.019 0.82 0.615 0.349 0.054 -0.243 -0.604 -1.032 -1.483 -2.029 -2.672 -3.396 -4.189 -5.197 -6.551 -8.016 -9.839 -11.991 -14.668 -18.073 -22.633 -28.953 -38.232 -47.835 -54.879 -60.292 -64.606 -68.288 -71.35 -73.96 -76.068 -78.067 -79.731 -81.159 -82.493 -83.722 -84.816 -85.788 -86.776 -87.64 -88.368 -89.094 -89.837 -90.455 -91.075 -91.696 -92.17 -92.648 -93.139 -93.64 -94.142 -94.496 -94.862 -95.405 -95.776 -96.144 -96.331 -96.721 -97.131 -97.573 -97.793 -98.139 -98.448 -98.667 -98.903 -99.433 -99.708 -99.984 -100.275 -100.607 -101.02 -101.559 -102.731 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_164.txt deleted file mode 100644 index bc422c8c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5361 ,KEBNE ,17125943,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:20 CET,0.0 0.817 1.04 1.212 1.382 1.494 1.584 1.666 1.791 1.846 1.885 1.895 1.941 1.957 1.983 2.0 2.008 2.002 2.003 2.02 2.014 1.987 1.943 1.88 1.815 1.744 1.668 1.585 1.461 1.32 1.179 0.995 0.796 0.581 0.324 0.034 -0.268 -0.629 -1.062 -1.559 -2.128 -2.833 -3.731 -4.715 -5.993 -7.597 -9.646 -12.252 -15.777 -20.666 -27.981 -35.746 -41.424 -45.874 -49.49 -52.55 -55.101 -57.26 -59.021 -60.704 -62.085 -63.3 -64.444 -65.466 -66.375 -67.21 -68.084 -68.849 -69.497 -70.138 -70.775 -71.295 -71.812 -72.329 -72.74 -73.171 -73.608 -74.049 -74.5 -74.809 -75.116 -75.566 -75.862 -76.172 -76.338 -76.692 -77.051 -77.409 -77.595 -77.898 -78.209 -78.421 -78.639 -79.096 -79.361 -79.635 -79.915 -80.216 -80.558 -81.02 -82.189 -2 ,13899 ,KEBNE ,17125944,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:37 CET,0.0 0.824 1.069 1.23 1.37 1.492 1.573 1.631 1.723 1.755 1.779 1.804 1.856 1.869 1.893 1.904 1.897 1.889 1.861 1.828 1.779 1.742 1.709 1.658 1.592 1.514 1.432 1.346 1.219 1.08 0.939 0.723 0.474 0.219 -0.092 -0.455 -0.833 -1.278 -1.782 -2.373 -3.034 -3.836 -4.854 -5.963 -7.364 -9.058 -11.174 -13.831 -17.394 -22.216 -29.468 -37.091 -42.68 -47.1 -50.62 -53.5 -55.89 -58.02 -59.811 -61.509 -62.929 -64.183 -65.343 -66.416 -67.381 -68.212 -69.067 -69.819 -70.457 -71.106 -71.764 -72.302 -72.862 -73.447 -73.896 -74.345 -74.789 -75.22 -75.637 -75.924 -76.214 -76.645 -76.955 -77.276 -77.439 -77.773 -78.122 -78.484 -78.674 -78.998 -79.289 -79.513 -79.753 -80.231 -80.481 -80.753 -81.038 -81.352 -81.714 -82.153 -83.515 -3 ,14441 ,KEBNE ,17125945,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:03 CET,0.0 0.982 1.246 1.391 1.511 1.613 1.668 1.721 1.837 1.877 1.914 1.953 2.013 2.044 2.077 2.093 2.102 2.1 2.089 2.079 2.046 2.016 1.993 1.948 1.888 1.821 1.759 1.693 1.572 1.442 1.3 1.101 0.892 0.67 0.398 0.083 -0.243 -0.635 -1.085 -1.59 -2.165 -2.873 -3.792 -4.813 -6.101 -7.719 -9.73 -12.2 -15.563 -20.237 -27.23 -34.717 -40.21 -44.429 -47.855 -50.76 -53.21 -55.344 -57.069 -58.701 -60.05 -61.215 -62.308 -63.319 -64.232 -65.043 -65.878 -66.61 -67.211 -67.819 -68.452 -68.952 -69.443 -69.955 -70.35 -70.751 -71.148 -71.557 -71.994 -72.289 -72.574 -73.01 -73.312 -73.623 -73.789 -74.131 -74.472 -74.822 -75.003 -75.296 -75.568 -75.773 -75.992 -76.445 -76.688 -76.955 -77.242 -77.536 -77.857 -78.281 -79.77 -4 ,2379 ,KEBNE ,17125946,Thu Dec 30 17:02:39 CET,Thu Dec 30 18:37:08 CET,0.0 1.171 1.44 1.623 1.751 1.826 1.902 1.983 2.11 2.156 2.197 2.229 2.273 2.283 2.303 2.314 2.323 2.323 2.301 2.28 2.239 2.2 2.166 2.107 2.037 1.965 1.879 1.781 1.647 1.5 1.353 1.166 0.958 0.746 0.496 0.177 -0.17 -0.572 -1.029 -1.545 -2.124 -2.834 -3.773 -4.785 -6.008 -7.552 -9.641 -12.282 -15.724 -20.603 -27.908 -35.349 -40.761 -45.022 -48.455 -51.326 -53.701 -55.742 -57.447 -59.117 -60.49 -61.634 -62.706 -63.698 -64.585 -65.378 -66.183 -66.893 -67.496 -68.109 -68.751 -69.275 -69.784 -70.3 -70.699 -71.106 -71.513 -71.917 -72.334 -72.625 -72.918 -73.351 -73.645 -73.938 -74.093 -74.416 -74.724 -75.044 -75.219 -75.5 -75.723 -75.902 -76.098 -76.52 -76.747 -76.999 -77.264 -77.546 -77.909 -78.368 -79.49 -5 ,23282 ,KEBNE ,17125947,Thu Dec 30 17:02:39 CET,Thu Dec 30 18:38:20 CET,0.0 0.653 0.9 1.061 1.173 1.275 1.357 1.412 1.501 1.537 1.571 1.578 1.609 1.626 1.632 1.618 1.601 1.595 1.579 1.552 1.492 1.435 1.384 1.309 1.224 1.134 1.047 0.966 0.838 0.683 0.53 0.34 0.127 -0.1 -0.375 -0.719 -1.057 -1.432 -1.891 -2.423 -3.011 -3.701 -4.564 -5.528 -6.848 -8.553 -10.683 -13.336 -16.897 -21.82 -29.145 -36.863 -42.559 -46.966 -50.501 -53.515 -55.98 -58.072 -59.816 -61.461 -62.796 -63.962 -65.026 -66.02 -66.944 -67.731 -68.507 -69.174 -69.744 -70.336 -70.937 -71.433 -71.948 -72.471 -72.866 -73.274 -73.695 -74.132 -74.576 -74.872 -75.179 -75.637 -75.942 -76.258 -76.419 -76.751 -77.097 -77.442 -77.616 -77.909 -78.214 -78.425 -78.626 -79.048 -79.272 -79.514 -79.77 -80.027 -80.319 -80.714 -82.023 -6 ,3300 ,KEBNE ,17125948,Thu Dec 30 17:02:39 CET,Thu Dec 30 18:36:43 CET,0.0 0.919 1.229 1.427 1.563 1.659 1.745 1.809 1.89 1.919 1.95 1.981 2.03 2.04 2.06 2.07 2.073 2.076 2.076 2.066 2.047 2.013 1.962 1.89 1.808 1.705 1.602 1.516 1.403 1.274 1.126 0.938 0.743 0.528 0.269 -0.042 -0.37 -0.759 -1.21 -1.726 -2.296 -3.003 -3.934 -4.941 -6.228 -7.817 -9.871 -12.555 -16.122 -20.932 -28.147 -35.891 -41.588 -46.007 -49.531 -52.486 -54.936 -57.012 -58.73 -60.41 -61.82 -63.034 -64.147 -65.163 -66.088 -66.916 -67.749 -68.469 -69.061 -69.665 -70.294 -70.808 -71.326 -71.852 -72.249 -72.643 -73.07 -73.511 -73.948 -74.254 -74.574 -75.044 -75.353 -75.674 -75.838 -76.173 -76.51 -76.85 -77.029 -77.327 -77.612 -77.815 -78.021 -78.466 -78.705 -78.951 -79.215 -79.508 -79.866 -80.337 -81.346 -7 ,20816 ,KEBNE ,17125949,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:36:57 CET,0.0 0.777 1.024 1.19 1.308 1.399 1.475 1.548 1.656 1.69 1.729 1.772 1.815 1.821 1.84 1.857 1.859 1.85 1.842 1.839 1.804 1.765 1.712 1.614 1.508 1.401 1.286 1.161 0.99 0.816 0.637 0.407 0.162 -0.094 -0.407 -0.768 -1.14 -1.588 -2.11 -2.7 -3.362 -4.162 -5.15 -6.209 -7.586 -9.301 -11.421 -14.081 -17.674 -22.583 -29.773 -37.328 -43.033 -47.511 -51.075 -54.097 -56.631 -58.778 -60.51 -62.179 -63.557 -64.737 -65.856 -66.886 -67.806 -68.62 -69.457 -70.19 -70.792 -71.4 -72.024 -72.549 -73.083 -73.625 -74.032 -74.439 -74.861 -75.287 -75.73 -76.029 -76.318 -76.779 -77.098 -77.414 -77.573 -77.902 -78.258 -78.624 -78.804 -79.093 -79.351 -79.545 -79.763 -80.219 -80.471 -80.741 -81.019 -81.33 -81.697 -82.145 -83.491 -8 ,21312 ,KEBNE ,17125950,Thu Dec 30 17:02:40 CET,Thu Dec 30 18:37:48 CET,0.0 0.905 1.15 1.322 1.453 1.573 1.674 1.747 1.832 1.867 1.901 1.902 1.942 1.96 1.982 1.984 1.983 1.982 1.977 1.968 1.941 1.917 1.88 1.808 1.73 1.657 1.572 1.481 1.356 1.218 1.071 0.884 0.686 0.48 0.221 -0.097 -0.417 -0.803 -1.253 -1.774 -2.349 -3.045 -3.963 -4.983 -6.281 -7.828 -9.844 -12.478 -16.05 -21.035 -28.487 -36.411 -42.199 -46.683 -50.264 -53.246 -55.723 -57.838 -59.599 -61.321 -62.761 -63.986 -65.109 -66.142 -67.06 -67.875 -68.716 -69.438 -70.037 -70.649 -71.268 -71.775 -72.317 -72.875 -73.288 -73.694 -74.11 -74.555 -75.01 -75.312 -75.624 -76.108 -76.435 -76.761 -76.924 -77.25 -77.577 -77.919 -78.103 -78.405 -78.695 -78.905 -79.112 -79.557 -79.784 -80.03 -80.299 -80.586 -80.918 -81.3 -82.126 -9 ,5919 ,KEBNE ,17125951,Thu Dec 30 17:02:42 CET,Thu Dec 30 18:36:17 CET,0.0 0.992 1.236 1.374 1.502 1.624 1.699 1.762 1.866 1.894 1.912 1.909 1.948 1.957 1.976 1.992 1.989 1.985 1.961 1.932 1.903 1.881 1.847 1.78 1.703 1.622 1.536 1.442 1.303 1.168 1.03 0.84 0.627 0.406 0.149 -0.163 -0.492 -0.882 -1.33 -1.852 -2.459 -3.169 -4.044 -5.001 -6.245 -7.853 -9.997 -12.73 -16.372 -21.417 -28.738 -36.275 -41.874 -46.198 -49.641 -52.551 -54.966 -57.037 -58.754 -60.423 -61.81 -62.979 -64.058 -65.061 -65.958 -66.754 -67.556 -68.269 -68.898 -69.539 -70.182 -70.694 -71.214 -71.745 -72.146 -72.549 -72.951 -73.371 -73.818 -74.111 -74.394 -74.842 -75.157 -75.478 -75.637 -75.961 -76.298 -76.653 -76.84 -77.13 -77.383 -77.572 -77.766 -78.208 -78.455 -78.707 -78.972 -79.265 -79.611 -80.078 -81.392 -10 ,7819 ,KEBNE ,17125952,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:37:20 CET,0.0 0.614 0.861 1.024 1.136 1.24 1.325 1.385 1.467 1.493 1.524 1.551 1.6 1.623 1.637 1.642 1.654 1.656 1.654 1.64 1.603 1.565 1.527 1.468 1.399 1.315 1.23 1.14 0.993 0.828 0.669 0.485 0.285 0.074 -0.193 -0.515 -0.845 -1.238 -1.693 -2.221 -2.805 -3.505 -4.422 -5.441 -6.725 -8.299 -10.33 -12.94 -16.423 -21.205 -28.324 -36.032 -41.798 -46.263 -49.811 -52.78 -55.229 -57.313 -59.039 -60.665 -61.991 -63.163 -64.239 -65.21 -66.096 -66.904 -67.736 -68.445 -69.038 -69.639 -70.262 -70.785 -71.322 -71.866 -72.265 -72.661 -73.078 -73.51 -73.966 -74.279 -74.583 -75.045 -75.369 -75.698 -75.867 -76.216 -76.583 -76.962 -77.152 -77.46 -77.75 -77.955 -78.18 -78.679 -78.936 -79.217 -79.521 -79.847 -80.214 -80.669 -82.0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_215.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_215.txt deleted file mode 100644 index 4560fb2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_215.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27901 ,TETRA ,17667946,Fri Dec 3 06:09:15 CET,Fri Dec 3 07:56:51 CET,0.0 1.123 1.462 1.687 1.883 2.031 2.151 2.272 2.454 2.514 2.564 2.623 2.698 2.737 2.788 2.83 2.866 2.882 2.909 2.924 2.939 2.937 2.925 2.92 2.909 2.877 2.832 2.787 2.729 2.644 2.551 2.403 2.197 1.978 1.711 1.397 1.086 0.724 0.269 -0.268 -0.843 -1.55 -2.515 -3.601 -4.952 -6.579 -8.66 -11.331 -14.957 -19.947 -27.334 -35.047 -40.797 -45.38 -48.997 -51.965 -54.43 -56.523 -58.246 -59.941 -61.366 -62.602 -63.741 -64.788 -65.732 -66.561 -67.388 -68.119 -68.754 -69.392 -70.022 -70.529 -71.036 -71.554 -71.952 -72.356 -72.776 -73.198 -73.625 -73.91 -74.188 -74.626 -74.928 -75.235 -75.394 -75.726 -76.081 -76.459 -76.651 -76.958 -77.269 -77.488 -77.704 -78.156 -78.411 -78.678 -78.981 -79.31 -79.687 -80.198 -81.42 -2 ,3148 ,TETRA ,17667947,Fri Dec 3 06:09:16 CET,Fri Dec 3 07:56:56 CET,0.0 0.748 1.035 1.253 1.423 1.559 1.674 1.755 1.903 1.969 2.018 2.072 2.138 2.185 2.292 2.353 2.377 2.373 2.361 2.366 2.363 2.338 2.305 2.252 2.185 2.128 2.068 1.992 1.914 1.834 1.714 1.547 1.391 1.211 0.953 0.655 0.349 -0.026 -0.458 -0.959 -1.558 -2.297 -3.208 -4.2 -5.487 -7.082 -9.047 -11.573 -15.059 -19.819 -26.922 -34.433 -40.005 -44.337 -47.801 -50.783 -53.245 -55.306 -57.006 -58.631 -59.987 -61.211 -62.348 -63.367 -64.299 -65.15 -66.03 -66.781 -67.405 -68.045 -68.702 -69.231 -69.761 -70.291 -70.699 -71.119 -71.562 -72.002 -72.434 -72.738 -73.05 -73.538 -73.867 -74.204 -74.382 -74.74 -75.11 -75.485 -75.678 -75.985 -76.277 -76.494 -76.721 -77.186 -77.444 -77.717 -78.011 -78.346 -78.736 -79.24 -80.58 -3 ,9367 ,TETRA ,17667948,Fri Dec 3 06:09:19 CET,Fri Dec 3 07:56:48 CET,0.0 0.852 1.159 1.379 1.53 1.656 1.761 1.868 2.061 2.127 2.172 2.206 2.26 2.283 2.323 2.352 2.37 2.384 2.409 2.425 2.435 2.44 2.431 2.381 2.341 2.295 2.225 2.133 1.992 1.842 1.698 1.527 1.336 1.129 0.869 0.549 0.254 -0.097 -0.541 -1.063 -1.665 -2.405 -3.356 -4.384 -5.651 -7.2 -9.165 -11.636 -14.961 -19.54 -26.455 -33.803 -39.299 -43.593 -47.066 -50.037 -52.51 -54.654 -56.409 -58.049 -59.389 -60.547 -61.618 -62.617 -63.525 -64.324 -65.145 -65.88 -66.498 -67.106 -67.737 -68.253 -68.771 -69.311 -69.728 -70.144 -70.555 -70.965 -71.383 -71.668 -71.96 -72.407 -72.705 -73.005 -73.168 -73.523 -73.881 -74.239 -74.427 -74.736 -75.018 -75.206 -75.395 -75.791 -76.017 -76.28 -76.564 -76.85 -77.191 -77.636 -78.787 -4 ,12831 ,TETRA ,17667949,Fri Dec 3 06:09:20 CET,Fri Dec 3 07:56:10 CET,0.0 0.922 1.215 1.435 1.623 1.786 1.902 1.993 2.154 2.221 2.286 2.398 2.486 2.521 2.566 2.602 2.625 2.633 2.639 2.635 2.638 2.633 2.603 2.547 2.5 2.47 2.434 2.379 2.283 2.172 2.078 1.936 1.771 1.596 1.369 1.1 0.829 0.495 0.06 -0.463 -1.068 -1.818 -2.781 -3.847 -5.198 -6.848 -8.963 -11.623 -15.227 -20.198 -27.448 -35.021 -40.709 -45.252 -48.886 -51.832 -54.231 -56.328 -58.078 -59.764 -61.163 -62.358 -63.459 -64.475 -65.386 -66.184 -66.986 -67.686 -68.287 -68.911 -69.566 -70.106 -70.638 -71.17 -71.572 -71.976 -72.387 -72.806 -73.237 -73.531 -73.827 -74.291 -74.614 -74.936 -75.096 -75.428 -75.781 -76.158 -76.356 -76.665 -76.955 -77.159 -77.374 -77.84 -78.097 -78.373 -78.665 -78.99 -79.367 -79.829 -81.062 -5 ,18861 ,TETRA ,17667950,Fri Dec 3 06:09:15 CET,Fri Dec 3 07:58:28 CET,0.0 1.597 1.917 2.16 2.345 2.486 2.592 2.691 2.841 2.894 2.953 3.025 3.095 3.127 3.186 3.238 3.28 3.3 3.32 3.333 3.351 3.35 3.341 3.297 3.244 3.19 3.126 3.064 2.961 2.831 2.687 2.502 2.325 2.149 1.93 1.673 1.391 1.022 0.551 -0.017 -0.654 -1.403 -2.365 -3.433 -4.759 -6.387 -8.495 -11.185 -14.777 -19.741 -27.109 -34.838 -40.672 -45.261 -48.864 -51.857 -54.308 -56.412 -58.168 -59.879 -61.304 -62.534 -63.669 -64.681 -65.605 -66.436 -67.272 -67.999 -68.596 -69.211 -69.852 -70.381 -70.919 -71.465 -71.882 -72.287 -72.697 -73.13 -73.557 -73.84 -74.135 -74.587 -74.895 -75.218 -75.389 -75.734 -76.09 -76.467 -76.657 -76.963 -77.257 -77.457 -77.669 -78.136 -78.389 -78.663 -78.958 -79.27 -79.645 -80.086 -80.98 -6 ,6679 ,TETRA ,17667951,Fri Dec 3 06:09:16 CET,Fri Dec 3 07:58:15 CET,0.0 1.592 1.99 2.229 2.411 2.549 2.676 2.773 2.904 2.956 3.009 3.081 3.148 3.181 3.231 3.27 3.28 3.276 3.274 3.276 3.288 3.289 3.279 3.251 3.218 3.17 3.088 3.007 2.921 2.832 2.731 2.576 2.385 2.174 1.959 1.734 1.453 1.089 0.671 0.182 -0.404 -1.133 -2.075 -3.116 -4.402 -6.006 -8.103 -10.733 -14.227 -19.084 -26.322 -33.931 -39.627 -44.122 -47.735 -50.781 -53.254 -55.305 -57.011 -58.696 -60.124 -61.333 -62.424 -63.443 -64.401 -65.253 -66.097 -66.847 -67.489 -68.141 -68.79 -69.307 -69.841 -70.386 -70.802 -71.218 -71.642 -72.079 -72.53 -72.831 -73.136 -73.615 -73.934 -74.262 -74.439 -74.788 -75.143 -75.519 -75.706 -76.024 -76.359 -76.572 -76.801 -77.301 -77.551 -77.811 -78.095 -78.407 -78.788 -79.307 -80.305 -7 ,19663 ,TETRA ,17667952,Fri Dec 3 06:09:47 CET,Fri Dec 3 07:58:44 CET,0.0 0.658 0.964 1.182 1.342 1.49 1.621 1.709 1.852 1.91 1.969 2.053 2.113 2.137 2.181 2.22 2.273 2.29 2.302 2.321 2.334 2.33 2.315 2.281 2.242 2.202 2.175 2.128 2.042 1.964 1.878 1.742 1.588 1.405 1.168 0.925 0.686 0.372 -0.029 -0.531 -1.118 -1.853 -2.824 -3.831 -5.085 -6.658 -8.676 -11.296 -14.846 -19.769 -27.034 -34.657 -40.392 -44.879 -48.4 -51.337 -53.771 -55.888 -57.654 -59.343 -60.736 -61.943 -63.057 -64.076 -64.996 -65.803 -66.626 -67.345 -67.941 -68.541 -69.162 -69.677 -70.203 -70.733 -71.134 -71.532 -71.932 -72.35 -72.782 -73.073 -73.377 -73.867 -74.195 -74.523 -74.689 -75.04 -75.418 -75.794 -75.982 -76.284 -76.586 -76.792 -76.994 -77.454 -77.715 -77.992 -78.303 -78.67 -79.078 -79.527 -80.552 -8 ,31064 ,TETRA ,17667953,Fri Dec 3 06:09:47 CET,Fri Dec 3 07:57:37 CET,0.0 0.927 1.253 1.477 1.674 1.857 1.991 2.107 2.319 2.402 2.475 2.558 2.637 2.675 2.719 2.748 2.789 2.816 2.838 2.845 2.857 2.851 2.834 2.787 2.721 2.656 2.597 2.532 2.435 2.341 2.236 2.087 1.949 1.796 1.563 1.279 1.005 0.667 0.264 -0.204 -0.743 -1.366 -2.214 -3.236 -4.536 -6.117 -8.074 -10.546 -13.949 -18.731 -25.847 -33.413 -38.951 -43.17 -46.548 -49.414 -51.87 -54.006 -55.716 -57.371 -58.749 -59.929 -61.024 -62.016 -62.914 -63.704 -64.513 -65.218 -65.807 -66.416 -67.041 -67.542 -68.045 -68.553 -68.932 -69.308 -69.693 -70.101 -70.52 -70.803 -71.105 -71.597 -71.928 -72.255 -72.421 -72.757 -73.105 -73.462 -73.648 -73.937 -74.22 -74.432 -74.64 -75.078 -75.33 -75.594 -75.869 -76.178 -76.568 -77.121 -78.341 -9 ,12619 ,TETRA ,17667954,Fri Dec 3 06:09:50 CET,Fri Dec 3 07:57:25 CET,0.0 1.664 2.023 2.214 2.392 2.572 2.724 2.814 2.956 3.023 3.074 3.14 3.2 3.234 3.288 3.312 3.333 3.344 3.368 3.385 3.384 3.374 3.349 3.32 3.302 3.243 3.164 3.096 2.98 2.848 2.724 2.543 2.328 2.093 1.803 1.458 1.093 0.696 0.28 -0.219 -0.814 -1.568 -2.538 -3.628 -5.005 -6.655 -8.725 -11.332 -14.91 -19.805 -27.012 -34.606 -40.264 -44.703 -48.3 -51.279 -53.634 -55.666 -57.386 -59.029 -60.415 -61.628 -62.713 -63.705 -64.611 -65.42 -66.242 -66.966 -67.58 -68.191 -68.82 -69.343 -69.872 -70.399 -70.782 -71.178 -71.589 -72.004 -72.44 -72.736 -73.027 -73.469 -73.773 -74.073 -74.234 -74.581 -74.928 -75.274 -75.455 -75.747 -76.022 -76.227 -76.433 -76.877 -77.113 -77.375 -77.671 -77.984 -78.351 -78.833 -79.9 -10 ,1472 ,TETRA ,17667955,Fri Dec 3 06:09:43 CET,Fri Dec 3 07:56:42 CET,0.0 1.613 2.039 2.259 2.405 2.529 2.649 2.779 3.014 3.091 3.165 3.273 3.354 3.396 3.463 3.517 3.546 3.555 3.568 3.586 3.611 3.604 3.58 3.544 3.504 3.468 3.418 3.337 3.239 3.159 3.061 2.926 2.779 2.628 2.438 2.158 1.865 1.5 1.025 0.475 -0.145 -0.843 -1.729 -2.785 -4.131 -5.767 -7.855 -10.504 -14.046 -18.924 -26.202 -33.892 -39.531 -43.973 -47.552 -50.535 -53.038 -55.199 -56.941 -58.611 -60.024 -61.247 -62.372 -63.406 -64.319 -65.118 -65.945 -66.666 -67.282 -67.92 -68.562 -69.067 -69.579 -70.096 -70.485 -70.889 -71.306 -71.735 -72.158 -72.446 -72.75 -73.229 -73.556 -73.892 -74.066 -74.417 -74.777 -75.143 -75.329 -75.625 -75.903 -76.103 -76.3 -76.755 -77.017 -77.299 -77.622 -77.963 -78.352 -78.835 -80.055 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_235.txt deleted file mode 100644 index 01920166..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26590 ,KEBNE ,17125953,Thu Dec 30 17:02:44 CET,Thu Dec 30 18:37:49 CET,0.0 1.726 2.26 2.693 3.061 3.371 3.659 3.921 4.385 4.598 4.789 5.117 5.311 5.489 5.827 6.135 6.441 6.586 6.86 7.115 7.484 7.728 7.963 8.314 8.677 9.037 9.378 9.7 10.131 10.567 11.02 11.573 12.057 12.496 13.019 13.619 14.182 14.806 15.508 16.275 17.112 18.073 19.19 20.384 21.814 23.401 25.255 27.363 30.054 33.464 37.702 41.602 44.086 45.759 46.95 47.874 48.533 49.028 49.368 49.639 49.849 50.021 50.161 50.264 50.329 50.363 50.395 50.404 50.406 50.403 50.37 50.323 50.28 50.244 50.21 50.148 50.074 50.013 49.94 49.883 49.824 49.72 49.643 49.565 49.521 49.403 49.267 49.14 49.069 48.997 48.796 48.71 48.6 48.342 48.198 48.032 47.827 47.567 47.252 46.848 45.401 -2 ,5788 ,KEBNE ,17125954,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:38:04 CET,0.0 2.037 2.608 3.015 3.375 3.686 3.969 4.243 4.722 4.935 5.142 5.52 5.732 5.907 6.246 6.563 6.864 7.015 7.319 7.609 8.022 8.292 8.565 8.97 9.359 9.725 10.076 10.425 10.886 11.318 11.73 12.233 12.732 13.232 13.799 14.42 15.029 15.717 16.497 17.318 18.193 19.191 20.357 21.607 23.081 24.714 26.654 28.951 31.724 35.12 39.465 43.307 45.712 47.372 48.528 49.379 50.007 50.47 50.765 50.994 51.194 51.37 51.517 51.63 51.735 51.798 51.839 51.88 51.894 51.888 51.889 51.886 51.868 51.831 51.796 51.771 51.745 51.681 51.58 51.518 51.462 51.357 51.275 51.191 51.149 51.054 50.95 50.824 50.754 50.689 50.47 50.375 50.264 49.991 49.836 49.665 49.487 49.273 48.976 48.573 46.789 -3 ,11777 ,KEBNE ,17125955,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:56 CET,0.0 1.807 2.438 2.864 3.217 3.523 3.793 4.043 4.498 4.704 4.9 5.256 5.467 5.643 5.998 6.35 6.672 6.826 7.13 7.424 7.857 8.13 8.381 8.748 9.119 9.483 9.83 10.171 10.608 11.029 11.443 11.957 12.452 12.926 13.483 14.115 14.731 15.41 16.147 16.927 17.766 18.73 19.866 21.04 22.39 23.907 25.737 27.877 30.536 33.966 38.51 42.555 45.126 46.912 48.172 49.117 49.84 50.392 50.777 51.111 51.364 51.551 51.693 51.811 51.889 51.929 51.958 51.976 51.974 51.954 51.921 51.894 51.848 51.779 51.735 51.698 51.649 51.582 51.503 51.433 51.348 51.232 51.147 51.064 51.021 50.909 50.779 50.635 50.549 50.477 50.265 50.15 50.03 49.747 49.588 49.435 49.238 49.005 48.699 48.197 46.626 -4 ,21578 ,KEBNE ,17125956,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:37:58 CET,0.0 1.704 2.256 2.669 3.029 3.331 3.609 3.889 4.387 4.621 4.851 5.226 5.448 5.634 5.983 6.314 6.623 6.776 7.08 7.364 7.776 8.052 8.32 8.687 9.044 9.401 9.776 10.145 10.583 11.005 11.424 11.962 12.49 12.98 13.547 14.198 14.841 15.532 16.302 17.177 18.097 19.133 20.399 21.683 23.152 24.799 26.729 28.946 31.686 35.125 39.561 43.568 46.166 47.859 48.968 49.835 50.519 51.027 51.381 51.727 51.996 52.173 52.294 52.388 52.454 52.506 52.559 52.57 52.57 52.573 52.56 52.556 52.542 52.513 52.477 52.418 52.346 52.264 52.167 52.105 52.047 51.941 51.863 51.768 51.716 51.595 51.454 51.307 51.227 51.154 50.95 50.86 50.761 50.505 50.353 50.201 50.02 49.773 49.483 49.031 47.201 -5 ,14064 ,KEBNE ,17125957,Thu Dec 30 17:02:44 CET,Thu Dec 30 18:36:32 CET,0.0 2.036 2.62 3.025 3.388 3.711 3.987 4.237 4.714 4.941 5.153 5.517 5.731 5.918 6.26 6.571 6.875 7.029 7.355 7.663 8.065 8.318 8.573 8.956 9.314 9.643 9.959 10.284 10.735 11.175 11.595 12.124 12.637 13.107 13.638 14.254 14.839 15.463 16.152 16.894 17.701 18.664 19.825 21.022 22.464 24.142 26.125 28.408 31.267 34.817 39.194 43.122 45.678 47.393 48.634 49.57 50.265 50.815 51.197 51.489 51.683 51.821 51.913 51.992 52.068 52.12 52.16 52.191 52.19 52.171 52.164 52.158 52.135 52.096 52.06 52.005 51.943 51.867 51.78 51.726 51.671 51.568 51.485 51.398 51.35 51.241 51.116 50.983 50.906 50.843 50.674 50.589 50.496 50.283 50.161 50.008 49.812 49.564 49.284 48.887 47.436 -6 ,22884 ,KEBNE ,17125958,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:37:10 CET,0.0 2.319 2.904 3.326 3.658 3.961 4.256 4.53 5.001 5.206 5.409 5.787 6.001 6.18 6.53 6.871 7.205 7.367 7.677 7.966 8.38 8.631 8.865 9.227 9.589 9.924 10.267 10.622 11.067 11.507 11.948 12.463 12.947 13.424 13.992 14.647 15.266 15.919 16.649 17.469 18.372 19.44 20.71 21.964 23.421 25.059 26.969 29.252 31.983 35.261 39.588 43.567 46.155 47.93 49.14 50.035 50.697 51.195 51.599 51.961 52.201 52.344 52.454 52.564 52.635 52.679 52.721 52.748 52.766 52.771 52.75 52.714 52.676 52.634 52.595 52.541 52.477 52.409 52.333 52.286 52.23 52.135 52.063 51.99 51.953 51.862 51.759 51.647 51.586 51.541 51.368 51.271 51.175 50.959 50.828 50.659 50.475 50.287 50.045 49.734 48.236 -7 ,16736 ,KEBNE ,17125959,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:37:20 CET,0.0 1.834 2.408 2.812 3.152 3.456 3.731 3.982 4.421 4.616 4.807 5.147 5.347 5.519 5.871 6.195 6.475 6.606 6.866 7.119 7.504 7.762 8.012 8.382 8.752 9.107 9.449 9.78 10.213 10.639 11.041 11.516 11.979 12.446 13.023 13.686 14.33 15.036 15.778 16.559 17.371 18.296 19.44 20.599 21.946 23.541 25.463 27.683 30.396 33.769 38.067 41.897 44.317 45.926 47.085 47.931 48.518 48.958 49.304 49.598 49.786 49.946 50.098 50.204 50.274 50.323 50.349 50.34 50.314 50.296 50.267 50.22 50.164 50.12 50.077 50.009 49.942 49.875 49.791 49.728 49.666 49.56 49.478 49.389 49.341 49.239 49.129 49.013 48.949 48.888 48.681 48.577 48.469 48.23 48.103 47.952 47.773 47.581 47.321 46.909 45.543 -8 ,29073 ,KEBNE ,17125960,Thu Dec 30 17:02:44 CET,Thu Dec 30 18:36:15 CET,0.0 2.319 2.934 3.374 3.723 4.02 4.282 4.548 5.051 5.26 5.454 5.808 6.019 6.2 6.548 6.869 7.176 7.323 7.612 7.893 8.304 8.577 8.836 9.206 9.569 9.933 10.299 10.649 11.092 11.529 11.964 12.491 12.998 13.498 14.08 14.755 15.425 16.16 16.969 17.861 18.808 19.885 21.11 22.312 23.697 25.251 27.1 29.25 31.908 35.13 39.305 43.175 45.648 47.348 48.498 49.367 50.026 50.511 50.873 51.171 51.386 51.536 51.644 51.725 51.771 51.782 51.783 51.795 51.795 51.764 51.714 51.683 51.651 51.603 51.566 51.516 51.444 51.353 51.251 51.184 51.107 50.981 50.901 50.811 50.764 50.665 50.53 50.379 50.301 50.223 50.006 49.899 49.779 49.507 49.342 49.163 48.956 48.695 48.347 47.826 45.877 -9 ,9511 ,KEBNE ,17125961,Thu Dec 30 17:02:44 CET,Thu Dec 30 18:36:47 CET,0.0 1.556 2.045 2.405 2.727 3.045 3.323 3.569 4.04 4.242 4.44 4.788 4.982 5.147 5.478 5.788 6.101 6.258 6.552 6.845 7.279 7.53 7.758 8.114 8.478 8.843 9.202 9.544 9.985 10.43 10.872 11.414 11.924 12.394 12.956 13.631 14.313 15.071 15.853 16.669 17.545 18.552 19.744 20.946 22.41 24.113 26.113 28.473 31.453 35.156 39.776 43.882 46.486 48.34 49.613 50.453 51.03 51.47 51.77 51.984 52.169 52.319 52.415 52.485 52.549 52.595 52.599 52.576 52.558 52.537 52.516 52.503 52.473 52.408 52.349 52.309 52.266 52.197 52.114 52.055 51.986 51.856 51.777 51.691 51.635 51.522 51.402 51.253 51.169 51.09 50.874 50.776 50.666 50.416 50.27 50.114 49.94 49.686 49.365 48.904 47.187 -10 ,15378 ,KEBNE ,17125962,Thu Dec 30 17:02:44 CET,Thu Dec 30 18:37:08 CET,0.0 1.785 2.302 2.703 3.065 3.402 3.699 3.975 4.485 4.716 4.932 5.291 5.513 5.701 6.053 6.393 6.728 6.885 7.188 7.487 7.908 8.174 8.438 8.822 9.191 9.548 9.9 10.253 10.727 11.183 11.614 12.129 12.636 13.14 13.751 14.449 15.109 15.814 16.555 17.36 18.286 19.376 20.666 21.943 23.404 25.1 27.07 29.405 32.215 35.503 39.742 43.616 46.15 47.893 49.127 50.045 50.724 51.253 51.643 51.964 52.173 52.309 52.391 52.45 52.504 52.511 52.505 52.519 52.52 52.511 52.506 52.489 52.437 52.365 52.325 52.272 52.196 52.131 52.058 51.993 51.919 51.805 51.726 51.63 51.573 51.449 51.308 51.16 51.084 51.018 50.812 50.712 50.607 50.388 50.263 50.105 49.924 49.686 49.421 48.998 47.095 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_25.txt deleted file mode 100644 index bc897f58..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16841 ,KEBNE ,16707990,Fri Nov 26 14:09:42 CET,Fri Nov 26 15:40:00 CET,0.0 1.479 1.972 2.354 2.683 2.97 3.243 3.496 3.928 4.137 4.335 4.658 4.847 5.004 5.308 5.603 5.885 6.018 6.28 6.511 6.814 7.007 7.186 7.456 7.732 7.991 8.232 8.486 8.817 9.131 9.43 9.767 10.08 10.384 10.757 11.191 11.61 12.081 12.572 13.097 13.683 14.307 15.014 15.756 16.639 17.654 18.853 20.262 21.92 23.684 25.713 27.239 28.039 28.53 28.741 28.805 28.787 28.705 28.606 28.516 28.41 28.293 28.172 28.066 27.968 27.867 27.751 27.638 27.536 27.412 27.266 27.138 27.001 26.844 26.7 26.541 26.378 26.21 26.021 25.885 25.747 25.527 25.382 25.219 25.132 24.955 24.766 24.584 24.481 24.365 24.143 23.984 23.798 23.405 23.202 22.976 22.757 22.491 22.085 21.504 15.053 -2 ,16892 ,KEBNE ,16707991,Fri Nov 26 14:09:46 CET,Fri Nov 26 15:36:31 CET,0.0 2.264 2.724 3.08 3.383 3.651 3.912 4.163 4.609 4.806 4.98 5.257 5.439 5.588 5.862 6.122 6.386 6.511 6.743 6.96 7.261 7.455 7.663 7.976 8.273 8.548 8.796 9.033 9.357 9.685 9.997 10.377 10.735 11.065 11.455 11.911 12.335 12.781 13.261 13.798 14.369 14.983 15.702 16.435 17.275 18.213 19.341 20.563 21.92 23.565 25.694 27.388 28.239 28.695 28.942 29.068 29.071 29.038 28.973 28.841 28.723 28.619 28.494 28.353 28.222 28.089 27.923 27.786 27.666 27.519 27.364 27.221 27.079 26.936 26.814 26.683 26.533 26.375 26.213 26.097 25.98 25.782 25.643 25.509 25.436 25.279 25.093 24.88 24.765 24.648 24.436 24.315 24.165 23.801 23.595 23.364 23.1 22.814 22.42 21.829 17.841 -3 ,23123 ,KEBNE ,16707992,Fri Nov 26 14:10:44 CET,Fri Nov 26 15:41:49 CET,0.0 1.685 2.18 2.567 2.894 3.144 3.357 3.558 3.955 4.137 4.306 4.617 4.805 4.95 5.241 5.514 5.749 5.862 6.097 6.324 6.647 6.847 7.043 7.329 7.597 7.856 8.102 8.337 8.668 9.015 9.33 9.687 10.009 10.301 10.658 11.078 11.487 11.939 12.438 12.97 13.531 14.215 15.01 15.715 16.456 17.255 18.244 19.403 20.792 22.481 24.499 26.21 27.211 27.793 28.084 28.246 28.305 28.247 28.169 28.095 27.995 27.85 27.693 27.551 27.424 27.291 27.065 26.849 26.671 26.491 26.325 26.177 26.019 25.858 25.719 25.566 25.424 25.275 25.112 24.982 24.841 24.644 24.505 24.342 24.25 24.071 23.885 23.672 23.559 23.431 23.149 22.977 22.809 22.45 22.235 21.98 21.691 21.364 20.942 20.275 16.72 -4 ,26178 ,KEBNE ,16707993,Fri Nov 26 14:10:48 CET,Fri Nov 26 15:41:26 CET,0.0 2.462 3.006 3.401 3.679 3.945 4.206 4.436 4.852 5.046 5.226 5.53 5.721 5.877 6.163 6.414 6.656 6.78 7.037 7.268 7.572 7.763 7.946 8.211 8.472 8.739 8.991 9.245 9.569 9.862 10.18 10.563 10.929 11.275 11.65 12.067 12.462 12.934 13.457 13.966 14.493 15.097 15.803 16.552 17.441 18.43 19.645 21.021 22.53 24.118 25.959 27.525 28.327 28.762 29.03 29.157 29.16 29.067 28.953 28.808 28.644 28.483 28.321 28.172 28.029 27.882 27.701 27.522 27.356 27.185 27.008 26.847 26.676 26.521 26.399 26.265 26.114 25.945 25.78 25.662 25.523 25.275 25.085 24.911 24.829 24.636 24.432 24.213 24.096 23.962 23.691 23.525 23.344 22.971 22.736 22.461 22.181 21.86 21.411 20.757 18.139 -5 ,8784 ,KEBNE ,16707994,Fri Nov 26 14:10:43 CET,Fri Nov 26 15:40:53 CET,0.0 1.728 2.319 2.783 3.12 3.401 3.652 3.884 4.316 4.514 4.696 5.001 5.184 5.329 5.612 5.888 6.135 6.252 6.481 6.703 7.049 7.28 7.492 7.783 8.05 8.324 8.596 8.848 9.159 9.452 9.733 10.067 10.394 10.701 11.057 11.46 11.834 12.248 12.713 13.227 13.715 14.216 14.85 15.527 16.391 17.379 18.489 19.698 21.096 22.736 24.451 25.687 26.308 26.615 26.758 26.794 26.766 26.704 26.59 26.416 26.249 26.111 25.978 25.837 25.684 25.53 25.372 25.202 25.033 24.876 24.724 24.579 24.421 24.267 24.137 24.01 23.878 23.712 23.507 23.367 23.235 23.031 22.872 22.709 22.621 22.437 22.262 22.064 21.958 21.84 21.6 21.445 21.269 20.875 20.655 20.411 20.125 19.793 19.379 18.789 15.568 -6 ,7740 ,KEBNE ,16707995,Fri Nov 26 14:10:43 CET,Fri Nov 26 15:42:06 CET,0.0 2.076 2.586 2.985 3.323 3.623 3.895 4.136 4.559 4.751 4.928 5.218 5.402 5.555 5.84 6.104 6.369 6.499 6.743 6.984 7.299 7.502 7.721 8.053 8.361 8.637 8.884 9.105 9.381 9.677 9.985 10.349 10.676 10.992 11.375 11.785 12.149 12.574 13.055 13.61 14.214 14.841 15.568 16.292 17.159 18.158 19.312 20.651 22.15 23.803 25.811 27.341 28.127 28.566 28.811 28.952 28.994 28.998 28.96 28.844 28.684 28.523 28.382 28.238 28.082 27.932 27.755 27.603 27.491 27.366 27.214 27.085 26.95 26.803 26.688 26.568 26.431 26.283 26.132 26.012 25.887 25.706 25.576 25.435 25.364 25.22 25.045 24.838 24.725 24.61 24.393 24.251 24.084 23.71 23.499 23.256 22.969 22.641 22.189 21.498 18.425 -7 ,12801 ,KEBNE ,16707996,Fri Nov 26 14:11:45 CET,Fri Nov 26 15:43:02 CET,0.0 2.092 2.61 3.059 3.424 3.719 3.979 4.233 4.672 4.857 5.037 5.364 5.557 5.703 5.997 6.28 6.529 6.644 6.874 7.084 7.381 7.599 7.822 8.135 8.419 8.682 8.937 9.179 9.485 9.791 10.111 10.477 10.805 11.138 11.525 11.959 12.38 12.826 13.321 13.87 14.407 15.014 15.752 16.499 17.399 18.363 19.434 20.618 21.916 23.386 25.168 26.659 27.449 27.884 28.075 28.107 28.068 27.966 27.843 27.714 27.578 27.465 27.351 27.209 27.063 26.934 26.799 26.66 26.535 26.401 26.25 26.118 25.973 25.825 25.714 25.598 25.464 25.321 25.176 25.063 24.936 24.738 24.605 24.454 24.378 24.216 24.022 23.824 23.715 23.577 23.307 23.138 22.962 22.625 22.445 22.232 21.983 21.691 21.322 20.738 17.851 -8 ,12769 ,KEBNE ,16707997,Fri Nov 26 14:11:45 CET,Fri Nov 26 15:41:43 CET,0.0 1.819 2.319 2.708 3.075 3.391 3.648 3.884 4.312 4.506 4.716 5.062 5.258 5.419 5.701 5.971 6.231 6.35 6.577 6.813 7.145 7.348 7.543 7.823 8.091 8.35 8.595 8.831 9.133 9.419 9.693 10.015 10.319 10.631 11.009 11.439 11.852 12.316 12.849 13.403 13.973 14.629 15.4 16.161 17.011 17.959 19.056 20.377 21.925 23.615 25.57 27.012 27.689 28.008 28.152 28.238 28.244 28.176 28.093 28.003 27.904 27.801 27.679 27.554 27.438 27.326 27.193 27.036 26.892 26.722 26.536 26.387 26.224 26.06 25.934 25.794 25.637 25.483 25.315 25.191 25.068 24.855 24.7 24.528 24.433 24.26 24.087 23.893 23.782 23.632 23.335 23.183 23.02 22.656 22.453 22.209 21.894 21.543 21.095 20.425 14.15 -9 ,32346 ,KEBNE ,16707998,Fri Nov 26 14:11:45 CET,Fri Nov 26 15:42:29 CET,0.0 3.284 3.913 4.354 4.685 4.956 5.214 5.45 5.852 6.045 6.231 6.553 6.752 6.907 7.196 7.464 7.706 7.821 8.036 8.245 8.553 8.757 8.956 9.226 9.493 9.75 9.988 10.225 10.535 10.834 11.117 11.449 11.798 12.161 12.573 13.015 13.441 13.897 14.368 14.894 15.478 16.159 16.912 17.626 18.449 19.37 20.463 21.74 23.226 24.939 27.029 28.669 29.575 30.034 30.254 30.35 30.351 30.295 30.201 30.081 29.973 29.872 29.76 29.646 29.534 29.419 29.281 29.141 29.017 28.899 28.758 28.61 28.462 28.32 28.196 28.056 27.918 27.776 27.614 27.499 27.378 27.172 27.03 26.868 26.78 26.589 26.383 26.172 26.07 25.955 25.699 25.555 25.401 25.069 24.891 24.667 24.368 24.043 23.621 22.987 19.762 -10 ,25217 ,KEBNE ,16707999,Fri Nov 26 14:11:45 CET,Fri Nov 26 15:43:02 CET,0.0 3.159 3.744 4.167 4.518 4.792 5.025 5.239 5.652 5.856 6.045 6.334 6.508 6.657 6.947 7.231 7.516 7.654 7.911 8.14 8.472 8.687 8.895 9.211 9.497 9.753 10.008 10.262 10.573 10.86 11.138 11.48 11.808 12.133 12.52 12.935 13.339 13.803 14.292 14.78 15.281 15.851 16.492 17.162 17.952 18.838 19.91 21.106 22.517 24.244 26.311 27.809 28.509 28.906 29.125 29.172 29.136 29.067 28.987 28.868 28.732 28.61 28.489 28.355 28.21 28.066 27.9 27.739 27.615 27.493 27.35 27.188 27.0 26.832 26.691 26.519 26.335 26.157 25.986 25.866 25.734 25.54 25.383 25.216 25.13 24.939 24.73 24.502 24.381 24.234 23.949 23.796 23.634 23.291 23.062 22.785 22.524 22.208 21.783 21.128 17.047 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_252.txt deleted file mode 100644 index 996364a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_237_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27991 ,KEBNE ,16708000,Fri Nov 26 14:11:45 CET,Fri Nov 26 15:42:38 CET,0.0 1.004 1.171 1.246 1.264 1.242 1.21 1.181 1.079 1.011 0.941 0.779 0.728 0.638 0.448 0.24 0.009 -0.104 -0.319 -0.55 -0.905 -1.152 -1.424 -1.846 -2.249 -2.628 -3.022 -3.439 -4.019 -4.615 -5.191 -5.926 -6.694 -7.488 -8.449 -9.559 -10.709 -12.05 -13.557 -15.236 -17.087 -19.323 -22.095 -25.083 -28.831 -33.315 -38.979 -46.078 -55.408 -67.937 -86.208 -105.0 -118.507 -128.869 -137.074 -143.878 -149.435 -154.221 -158.169 -161.927 -165.038 -167.717 -170.197 -172.461 -174.479 -176.263 -178.059 -179.597 -180.886 -182.189 -183.539 -184.642 -185.741 -186.844 -187.683 -188.534 -189.383 -190.246 -191.13 -191.72 -192.318 -193.223 -193.848 -194.493 -194.818 -195.467 -196.145 -196.852 -197.207 -197.795 -198.315 -198.712 -199.11 -199.923 -200.373 -200.87 -201.404 -202.018 -202.704 -203.532 -205.407 -2 ,6717 ,KEBNE ,16708001,Fri Nov 26 14:11:45 CET,Fri Nov 26 15:42:16 CET,0.0 0.966 1.156 1.264 1.315 1.319 1.285 1.223 1.092 1.032 0.967 0.784 0.735 0.648 0.455 0.255 0.04 -0.075 -0.307 -0.541 -0.906 -1.161 -1.417 -1.818 -2.214 -2.587 -2.987 -3.417 -4.0 -4.591 -5.181 -5.916 -6.684 -7.452 -8.369 -9.469 -10.556 -11.812 -13.254 -14.856 -16.619 -18.776 -21.53 -24.468 -28.118 -32.509 -37.996 -44.79 -53.707 -65.743 -83.324 -101.414 -114.563 -124.721 -132.623 -139.181 -144.676 -149.481 -153.443 -157.171 -160.211 -162.821 -165.243 -167.44 -169.42 -171.17 -172.904 -174.383 -175.626 -176.879 -178.149 -179.187 -180.234 -181.27 -182.05 -182.858 -183.678 -184.509 -185.375 -185.953 -186.528 -187.424 -188.036 -188.652 -188.957 -189.565 -190.183 -190.829 -191.173 -191.769 -192.308 -192.706 -193.112 -193.977 -194.425 -194.861 -195.303 -195.807 -196.429 -197.189 -199.003 -3 ,20070 ,KEBNE ,16708002,Fri Nov 26 14:12:46 CET,Fri Nov 26 15:43:47 CET,0.0 1.178 1.337 1.414 1.454 1.444 1.421 1.39 1.28 1.202 1.124 0.943 0.884 0.792 0.583 0.364 0.147 0.035 -0.174 -0.387 -0.726 -0.959 -1.202 -1.579 -1.975 -2.37 -2.753 -3.149 -3.708 -4.266 -4.83 -5.555 -6.29 -7.036 -7.931 -9.014 -10.11 -11.368 -12.8 -14.402 -16.199 -18.386 -21.149 -24.098 -27.745 -32.142 -37.708 -44.668 -53.807 -66.139 -84.035 -102.549 -115.935 -126.155 -134.288 -141.052 -146.584 -151.301 -155.18 -158.932 -162.007 -164.6 -166.991 -169.162 -171.072 -172.788 -174.546 -176.076 -177.401 -178.756 -180.1 -181.174 -182.294 -183.435 -184.277 -185.107 -185.943 -186.791 -187.663 -188.263 -188.876 -189.808 -190.442 -191.084 -191.405 -192.061 -192.723 -193.381 -193.71 -194.26 -194.711 -195.088 -195.513 -196.41 -196.891 -197.384 -197.897 -198.48 -199.155 -200.007 -202.065 -4 ,8257 ,KEBNE ,16708003,Fri Nov 26 14:12:50 CET,Fri Nov 26 15:39:44 CET,0.0 1.009 1.171 1.208 1.227 1.254 1.249 1.207 1.09 1.033 0.97 0.767 0.706 0.608 0.408 0.214 0.005 -0.113 -0.357 -0.603 -0.977 -1.233 -1.501 -1.895 -2.271 -2.645 -3.035 -3.427 -3.977 -4.555 -5.119 -5.837 -6.615 -7.401 -8.338 -9.454 -10.572 -11.861 -13.332 -14.994 -16.829 -19.024 -21.798 -24.808 -28.57 -33.087 -38.79 -45.891 -55.118 -67.548 -85.522 -103.995 -117.392 -127.776 -136.005 -142.82 -148.392 -153.102 -156.971 -160.684 -163.737 -166.326 -168.704 -170.894 -172.878 -174.606 -176.329 -177.848 -179.13 -180.413 -181.705 -182.734 -183.779 -184.837 -185.635 -186.451 -187.284 -188.117 -188.952 -189.517 -190.091 -190.976 -191.582 -192.2 -192.518 -193.183 -193.852 -194.532 -194.887 -195.461 -195.958 -196.368 -196.791 -197.633 -198.063 -198.519 -199.0 -199.523 -200.151 -200.938 -203.175 -5 ,31861 ,KEBNE ,16708004,Fri Nov 26 14:12:50 CET,Fri Nov 26 15:38:01 CET,0.0 0.768 0.913 0.975 1.007 1.002 0.984 0.96 0.845 0.773 0.713 0.537 0.485 0.395 0.185 -0.019 -0.207 -0.298 -0.5 -0.732 -1.106 -1.369 -1.632 -2.03 -2.445 -2.854 -3.26 -3.684 -4.241 -4.81 -5.406 -6.162 -6.935 -7.693 -8.586 -9.677 -10.811 -12.103 -13.572 -15.215 -17.02 -19.188 -21.904 -24.813 -28.431 -32.832 -38.324 -45.115 -54.118 -66.365 -84.069 -102.303 -115.579 -125.791 -133.894 -140.605 -146.054 -150.699 -154.574 -158.29 -161.313 -163.879 -166.248 -168.412 -170.329 -172.026 -173.775 -175.275 -176.515 -177.778 -179.055 -180.073 -181.11 -182.173 -182.973 -183.773 -184.575 -185.397 -186.234 -186.798 -187.383 -188.265 -188.861 -189.463 -189.762 -190.383 -191.049 -191.747 -192.1 -192.693 -193.224 -193.628 -194.036 -194.885 -195.335 -195.794 -196.314 -196.9 -197.511 -198.267 -200.517 -6 ,25809 ,KEBNE ,16708005,Fri Nov 26 14:13:47 CET,Fri Nov 26 15:44:31 CET,0.0 1.13 1.302 1.377 1.414 1.392 1.343 1.327 1.3 1.256 1.185 0.985 0.925 0.824 0.614 0.392 0.159 0.046 -0.163 -0.377 -0.705 -0.939 -1.176 -1.513 -1.885 -2.292 -2.713 -3.143 -3.703 -4.263 -4.833 -5.576 -6.357 -7.146 -8.102 -9.234 -10.364 -11.648 -13.129 -14.803 -16.631 -18.809 -21.551 -24.485 -28.138 -32.552 -38.135 -45.145 -54.295 -66.676 -84.783 -103.358 -116.748 -127.067 -135.173 -141.867 -147.283 -151.812 -155.551 -159.134 -162.068 -164.563 -166.843 -168.937 -170.839 -172.526 -174.241 -175.71 -176.915 -178.161 -179.421 -180.415 -181.416 -182.441 -183.22 -184.017 -184.828 -185.653 -186.519 -187.111 -187.71 -188.648 -189.28 -189.909 -190.23 -190.863 -191.482 -192.094 -192.428 -193.01 -193.498 -193.877 -194.287 -195.194 -195.649 -196.091 -196.581 -197.151 -197.849 -198.763 -201.174 -7 ,670 ,KEBNE ,16708006,Fri Nov 26 14:13:47 CET,Fri Nov 26 15:44:24 CET,0.0 0.989 1.165 1.234 1.256 1.263 1.257 1.224 1.139 1.091 1.029 0.855 0.802 0.719 0.529 0.312 0.101 -0.009 -0.246 -0.479 -0.817 -1.051 -1.289 -1.64 -1.991 -2.361 -2.752 -3.148 -3.706 -4.293 -4.882 -5.633 -6.404 -7.181 -8.102 -9.191 -10.321 -11.616 -13.059 -14.656 -16.456 -18.654 -21.377 -24.304 -28.004 -32.532 -38.251 -45.362 -54.685 -67.268 -85.393 -103.871 -117.168 -127.351 -135.355 -141.959 -147.413 -152.129 -156.017 -159.712 -162.763 -165.343 -167.711 -169.89 -171.823 -173.541 -175.305 -176.802 -178.057 -179.351 -180.639 -181.658 -182.7 -183.771 -184.573 -185.378 -186.196 -187.027 -187.861 -188.425 -189.004 -189.877 -190.472 -191.087 -191.399 -192.032 -192.674 -193.318 -193.645 -194.206 -194.673 -195.04 -195.413 -196.17 -196.582 -197.037 -197.512 -198.015 -198.607 -199.358 -201.294 -8 ,6073 ,KEBNE ,16708007,Fri Nov 26 14:13:47 CET,Fri Nov 26 15:44:19 CET,0.0 0.738 0.912 0.971 0.99 0.995 0.964 0.913 0.825 0.775 0.707 0.531 0.481 0.396 0.209 0.005 -0.217 -0.334 -0.572 -0.814 -1.203 -1.473 -1.73 -2.12 -2.518 -2.929 -3.339 -3.755 -4.309 -4.861 -5.437 -6.185 -6.958 -7.741 -8.701 -9.819 -10.927 -12.229 -13.706 -15.328 -17.151 -19.347 -22.082 -25.053 -28.76 -33.222 -38.844 -45.805 -54.859 -67.115 -85.039 -103.3 -116.467 -126.733 -134.943 -141.695 -147.152 -151.818 -155.67 -159.357 -162.396 -164.985 -167.334 -169.455 -171.377 -173.093 -174.827 -176.314 -177.56 -178.821 -180.115 -181.162 -182.209 -183.283 -184.102 -184.935 -185.792 -186.65 -187.513 -188.097 -188.683 -189.576 -190.167 -190.758 -191.059 -191.674 -192.315 -192.967 -193.298 -193.867 -194.342 -194.717 -195.107 -195.909 -196.345 -196.811 -197.311 -197.868 -198.505 -199.285 -201.412 -9 ,12424 ,KEBNE ,16708008,Fri Nov 26 14:13:47 CET,Fri Nov 26 15:44:35 CET,0.0 1.194 1.378 1.484 1.522 1.524 1.513 1.468 1.35 1.29 1.22 1.041 0.985 0.893 0.694 0.489 0.292 0.187 -0.041 -0.272 -0.633 -0.888 -1.14 -1.511 -1.895 -2.288 -2.677 -3.081 -3.648 -4.215 -4.79 -5.525 -6.24 -6.952 -7.852 -8.964 -10.091 -11.349 -12.778 -14.416 -16.255 -18.447 -21.155 -24.101 -27.796 -32.25 -37.821 -44.71 -53.783 -66.163 -84.06 -102.368 -115.827 -126.237 -134.404 -141.15 -146.646 -151.304 -155.112 -158.757 -161.746 -164.286 -166.593 -168.687 -170.576 -172.25 -173.969 -175.477 -176.732 -177.983 -179.233 -180.235 -181.253 -182.287 -183.071 -183.86 -184.661 -185.478 -186.305 -186.87 -187.451 -188.327 -188.904 -189.487 -189.786 -190.397 -191.035 -191.673 -191.99 -192.538 -192.996 -193.365 -193.734 -194.492 -194.877 -195.276 -195.732 -196.26 -196.835 -197.494 -199.482 -10 ,26111 ,KEBNE ,16708009,Fri Nov 26 14:13:49 CET,Fri Nov 26 15:40:47 CET,0.0 0.717 0.832 0.873 0.876 0.86 0.82 0.766 0.628 0.543 0.456 0.246 0.18 0.075 -0.147 -0.38 -0.606 -0.721 -0.973 -1.229 -1.598 -1.848 -2.109 -2.512 -2.915 -3.331 -3.767 -4.206 -4.804 -5.401 -5.993 -6.74 -7.49 -8.24 -9.154 -10.266 -11.393 -12.686 -14.13 -15.746 -17.572 -19.769 -22.53 -25.549 -29.276 -33.661 -39.152 -46.076 -55.329 -67.933 -86.143 -104.821 -118.3 -128.619 -136.782 -143.514 -148.986 -153.659 -157.531 -161.227 -164.254 -166.855 -169.238 -171.398 -173.329 -175.014 -176.727 -178.207 -179.451 -180.733 -182.032 -183.087 -184.156 -185.198 -185.979 -186.785 -187.61 -188.454 -189.302 -189.872 -190.453 -191.351 -191.968 -192.598 -192.91 -193.529 -194.166 -194.816 -195.145 -195.727 -196.245 -196.634 -197.032 -197.841 -198.263 -198.722 -199.227 -199.773 -200.37 -201.158 -202.962 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_23_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_23_1.txt deleted file mode 100644 index 93b499d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_23_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23938 ,KEBNE ,16708010,Fri Nov 26 14:14:48 CET,Fri Nov 26 15:45:21 CET,0.0 1.097 1.552 1.887 2.156 2.37 2.551 2.723 3.027 3.161 3.296 3.501 3.688 3.804 4.038 4.246 4.42 4.503 4.668 4.825 5.044 5.183 5.326 5.525 5.7 5.858 6.005 6.152 6.347 6.562 6.788 7.027 7.23 7.426 7.642 7.89 8.128 8.379 8.627 8.886 9.14 9.441 9.798 10.124 10.472 10.823 11.181 11.557 11.987 12.373 12.656 12.578 12.274 11.957 11.613 11.277 10.944 10.598 10.303 10.005 9.736 9.497 9.28 9.073 8.833 8.586 8.356 8.138 7.924 7.713 7.472 7.238 7.032 6.855 6.702 6.54 6.383 6.215 6.017 5.879 5.744 5.544 5.409 5.262 5.184 4.997 4.793 4.597 4.5 4.331 4.143 4.015 3.887 3.6 3.432 3.26 3.052 2.813 2.54 2.179 0.962 -2 ,13185 ,KEBNE ,16708011,Fri Nov 26 14:14:49 CET,Fri Nov 26 15:45:53 CET,0.0 1.233 1.601 1.873 2.101 2.299 2.469 2.631 2.933 3.066 3.198 3.393 3.573 3.687 3.881 4.06 4.255 4.358 4.542 4.696 4.911 5.066 5.226 5.434 5.608 5.788 5.973 6.137 6.347 6.534 6.719 6.95 7.16 7.346 7.546 7.772 7.979 8.217 8.508 8.835 9.13 9.418 9.747 10.125 10.643 11.122 11.515 11.907 12.316 12.653 12.822 12.666 12.33 11.979 11.605 11.217 10.891 10.538 10.228 9.884 9.551 9.259 8.986 8.754 8.535 8.318 8.081 7.861 7.661 7.449 7.233 7.062 6.884 6.695 6.531 6.36 6.174 5.951 5.722 5.573 5.418 5.169 4.991 4.8 4.7 4.495 4.283 4.053 3.932 3.752 3.553 3.403 3.241 2.908 2.727 2.527 2.301 2.05 1.748 1.377 0.133 -3 ,28743 ,KEBNE ,16708012,Fri Nov 26 14:14:49 CET,Fri Nov 26 15:45:37 CET,0.0 1.084 1.427 1.691 1.914 2.136 2.352 2.547 2.89 3.039 3.173 3.364 3.546 3.661 3.868 4.068 4.26 4.352 4.521 4.674 4.916 5.083 5.246 5.48 5.686 5.854 6.022 6.197 6.417 6.635 6.829 7.042 7.245 7.431 7.635 7.871 8.103 8.357 8.619 8.861 9.162 9.53 9.932 10.295 10.645 10.982 11.329 11.734 12.14 12.519 12.767 12.682 12.409 12.064 11.709 11.358 11.024 10.689 10.38 10.077 9.815 9.577 9.351 9.131 8.92 8.726 8.517 8.316 8.128 7.938 7.705 7.506 7.328 7.109 6.924 6.738 6.549 6.361 6.178 6.058 5.934 5.739 5.595 5.427 5.333 5.141 4.937 4.7 4.583 4.414 4.217 4.083 3.95 3.651 3.486 3.303 3.095 2.865 2.601 2.256 1.333 -4 ,6525 ,KEBNE ,16708013,Fri Nov 26 14:14:49 CET,Fri Nov 26 15:46:49 CET,0.0 1.379 1.852 2.198 2.461 2.665 2.851 3.003 3.297 3.453 3.596 3.791 3.97 4.079 4.273 4.467 4.64 4.721 4.887 5.044 5.252 5.376 5.498 5.672 5.851 6.02 6.174 6.329 6.547 6.775 6.988 7.256 7.507 7.723 7.954 8.175 8.38 8.611 8.871 9.174 9.462 9.726 10.036 10.376 10.758 11.113 11.483 11.872 12.247 12.555 12.803 12.679 12.301 11.892 11.443 11.024 10.661 10.342 10.084 9.804 9.547 9.298 9.056 8.83 8.62 8.379 8.108 7.916 7.752 7.543 7.331 7.18 6.999 6.803 6.646 6.468 6.29 6.11 5.933 5.817 5.689 5.469 5.316 5.174 5.092 4.885 4.667 4.44 4.325 4.156 3.97 3.839 3.699 3.387 3.213 3.018 2.811 2.586 2.315 1.902 0.763 -5 ,14011 ,KEBNE ,16708014,Fri Nov 26 14:14:48 CET,Fri Nov 26 15:45:27 CET,0.0 1.24 1.621 1.906 2.135 2.349 2.546 2.711 2.99 3.116 3.23 3.389 3.548 3.652 3.86 4.057 4.245 4.332 4.497 4.651 4.853 4.979 5.1 5.269 5.443 5.639 5.829 6.004 6.22 6.439 6.656 6.878 7.077 7.28 7.518 7.764 7.989 8.228 8.486 8.753 8.998 9.298 9.663 9.975 10.322 10.695 11.107 11.526 11.938 12.317 12.582 12.535 12.303 11.981 11.663 11.353 11.035 10.699 10.385 10.071 9.783 9.518 9.278 9.049 8.829 8.616 8.391 8.195 7.993 7.788 7.602 7.435 7.256 7.064 6.891 6.694 6.491 6.295 6.107 5.977 5.838 5.635 5.49 5.321 5.229 5.04 4.856 4.65 4.535 4.363 4.185 4.061 3.925 3.6 3.418 3.228 3.028 2.783 2.495 2.144 0.925 -6 ,2908 ,KEBNE ,16708015,Fri Nov 26 14:14:52 CET,Fri Nov 26 15:41:59 CET,0.0 1.434 1.802 2.111 2.364 2.573 2.758 2.937 3.251 3.399 3.551 3.768 3.952 4.062 4.249 4.43 4.611 4.695 4.871 5.038 5.275 5.429 5.571 5.758 5.936 6.127 6.316 6.481 6.687 6.893 7.1 7.35 7.565 7.761 7.991 8.247 8.473 8.696 8.926 9.179 9.451 9.718 10.031 10.353 10.704 11.061 11.429 11.836 12.274 12.691 13.004 12.944 12.69 12.371 11.972 11.597 11.28 10.926 10.592 10.288 9.986 9.702 9.451 9.197 8.958 8.74 8.518 8.319 8.109 7.882 7.667 7.48 7.257 7.038 6.89 6.713 6.507 6.289 6.066 5.912 5.768 5.563 5.424 5.273 5.188 5.016 4.835 4.642 4.538 4.37 4.175 4.038 3.896 3.612 3.446 3.248 3.044 2.828 2.568 2.201 1.176 -7 ,14935 ,KEBNE ,16708016,Fri Nov 26 14:15:49 CET,Fri Nov 26 15:46:58 CET,0.0 1.277 1.693 1.986 2.233 2.451 2.632 2.789 3.065 3.194 3.312 3.501 3.691 3.806 4.011 4.208 4.398 4.49 4.646 4.789 5.023 5.175 5.31 5.516 5.724 5.909 6.086 6.268 6.471 6.638 6.797 7.013 7.254 7.462 7.694 7.965 8.214 8.479 8.726 8.979 9.239 9.544 9.922 10.264 10.592 10.968 11.38 11.751 12.157 12.572 12.876 12.776 12.409 11.993 11.595 11.222 10.873 10.551 10.229 9.863 9.529 9.268 9.034 8.769 8.523 8.318 8.1 7.89 7.7 7.491 7.272 7.09 6.899 6.711 6.576 6.424 6.26 6.081 5.88 5.749 5.617 5.409 5.259 5.093 5.009 4.843 4.683 4.51 4.408 4.241 4.071 3.954 3.815 3.502 3.329 3.144 2.943 2.723 2.483 2.177 0.936 -8 ,8326 ,KEBNE ,16708017,Fri Nov 26 14:15:49 CET,Fri Nov 26 15:46:15 CET,0.0 1.317 1.733 2.032 2.265 2.446 2.612 2.771 3.066 3.198 3.327 3.518 3.693 3.817 4.049 4.251 4.429 4.511 4.678 4.849 5.077 5.219 5.371 5.589 5.786 5.953 6.096 6.249 6.459 6.652 6.845 7.094 7.338 7.561 7.804 8.065 8.314 8.594 8.853 9.093 9.344 9.633 9.945 10.259 10.658 11.13 11.676 12.212 12.684 13.098 13.323 13.195 12.941 12.631 12.302 11.941 11.589 11.29 11.025 10.726 10.442 10.184 9.932 9.67 9.426 9.207 8.982 8.77 8.576 8.353 8.099 7.898 7.721 7.535 7.363 7.167 6.965 6.786 6.606 6.46 6.306 6.082 5.935 5.786 5.703 5.531 5.354 5.149 5.043 4.876 4.691 4.553 4.422 4.143 3.968 3.769 3.557 3.32 3.006 2.567 1.448 -9 ,26524 ,KEBNE ,16708018,Fri Nov 26 14:15:49 CET,Fri Nov 26 15:46:53 CET,0.0 1.182 1.597 1.924 2.196 2.429 2.627 2.803 3.093 3.217 3.332 3.495 3.668 3.774 3.96 4.126 4.289 4.374 4.538 4.682 4.883 5.014 5.145 5.326 5.492 5.648 5.797 5.958 6.171 6.36 6.535 6.766 6.992 7.181 7.374 7.636 7.916 8.166 8.401 8.638 8.881 9.146 9.461 9.788 10.145 10.504 10.912 11.403 11.868 12.221 12.466 12.315 12.015 11.718 11.407 11.077 10.779 10.476 10.177 9.889 9.64 9.387 9.145 8.931 8.705 8.476 8.251 8.025 7.817 7.609 7.389 7.205 7.014 6.836 6.694 6.536 6.361 6.155 5.938 5.793 5.653 5.441 5.287 5.123 5.039 4.856 4.646 4.417 4.298 4.114 3.906 3.77 3.628 3.312 3.143 2.961 2.759 2.506 2.18 1.774 0.329 -10 ,21840 ,KEBNE ,16708019,Fri Nov 26 14:16:50 CET,Fri Nov 26 15:48:07 CET,0.0 1.34 1.815 2.14 2.384 2.598 2.783 2.947 3.233 3.371 3.511 3.708 3.893 4.015 4.237 4.434 4.625 4.715 4.878 5.034 5.268 5.426 5.571 5.76 5.943 6.126 6.314 6.498 6.716 6.915 7.124 7.395 7.617 7.8 8.032 8.293 8.522 8.783 9.057 9.342 9.649 9.993 10.367 10.673 11.009 11.386 11.843 12.309 12.711 13.089 13.38 13.287 12.975 12.603 12.238 11.887 11.58 11.303 11.018 10.682 10.376 10.083 9.827 9.602 9.362 9.118 8.865 8.656 8.464 8.256 8.044 7.868 7.678 7.463 7.289 7.112 6.945 6.775 6.596 6.464 6.315 6.087 5.935 5.779 5.694 5.511 5.325 5.14 5.041 4.879 4.699 4.571 4.436 4.132 3.961 3.783 3.585 3.354 3.066 2.668 1.21 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_251_256.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_251_256.txt deleted file mode 100644 index adb59de3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_251_256.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28690 ,KEBNE ,16708020,Fri Nov 26 14:16:50 CET,Fri Nov 26 15:46:59 CET,0.0 0.899 1.164 1.366 1.542 1.675 1.778 1.872 2.048 2.126 2.195 2.156 2.412 2.47 2.576 2.691 2.787 2.829 2.916 2.985 3.083 3.148 3.199 3.285 3.349 3.373 3.377 3.379 3.382 3.374 3.35 3.31 3.264 3.214 3.132 3.013 2.879 2.719 2.553 2.355 2.1 1.767 1.351 0.903 0.273 -0.551 -1.635 -3.051 -5.108 -8.112 -12.744 -17.9 -21.896 -25.135 -27.743 -29.932 -31.767 -33.364 -34.713 -36.023 -37.093 -38.018 -38.865 -39.634 -40.327 -40.952 -41.619 -42.24 -42.777 -43.313 -43.845 -44.277 -44.733 -45.218 -45.587 -45.967 -46.361 -46.787 -47.212 -47.485 -47.775 -48.218 -48.524 -48.862 -49.04 -49.382 -49.741 -50.13 -50.329 -50.773 -50.965 -51.181 -51.411 -51.933 -52.218 -52.515 -52.839 -53.218 -53.657 -54.211 -56.186 -2 ,24326 ,KEBNE ,16708021,Fri Nov 26 14:16:54 CET,Fri Nov 26 15:43:49 CET,0.0 0.666 0.926 1.135 1.312 1.447 1.564 1.666 1.858 1.946 2.014 1.955 2.202 2.257 2.332 2.372 2.403 2.421 2.449 2.469 2.517 2.553 2.577 2.595 2.613 2.63 2.643 2.649 2.64 2.622 2.608 2.584 2.54 2.478 2.393 2.311 2.207 2.049 1.842 1.599 1.317 0.96 0.5 -0.029 -0.731 -1.626 -2.775 -4.272 -6.353 -9.253 -13.766 -18.654 -22.252 -25.148 -27.516 -29.542 -31.296 -32.856 -34.221 -35.551 -36.603 -37.502 -38.344 -39.109 -39.788 -40.393 -41.025 -41.576 -42.041 -42.519 -43.012 -43.429 -43.844 -44.269 -44.61 -44.974 -45.339 -45.693 -46.069 -46.336 -46.611 -47.041 -47.344 -47.635 -47.779 -48.12 -48.505 -48.892 -49.092 -49.542 -49.736 -49.962 -50.211 -50.759 -51.063 -51.395 -51.731 -52.11 -52.579 -53.203 -55.289 -3 ,1438 ,KEBNE ,16708022,Fri Nov 26 14:17:52 CET,Fri Nov 26 15:47:46 CET,0.0 0.847 1.129 1.329 1.478 1.598 1.701 1.783 1.941 2.027 2.109 2.062 2.295 2.351 2.457 2.54 2.604 2.625 2.671 2.706 2.724 2.739 2.76 2.786 2.796 2.795 2.78 2.753 2.729 2.723 2.701 2.638 2.568 2.511 2.421 2.271 2.125 1.932 1.688 1.456 1.203 0.87 0.415 -0.131 -0.848 -1.745 -2.91 -4.415 -6.475 -9.36 -13.768 -18.737 -22.557 -25.67 -28.258 -30.44 -32.261 -33.848 -35.134 -36.37 -37.436 -38.342 -39.179 -39.991 -40.75 -41.432 -42.136 -42.769 -43.32 -43.866 -44.417 -44.867 -45.353 -45.859 -46.237 -46.635 -47.024 -47.422 -47.863 -48.156 -48.441 -48.881 -49.184 -49.514 -49.697 -50.061 -50.394 -50.742 -50.944 -51.397 -51.613 -51.847 -52.082 -52.588 -52.881 -53.199 -53.55 -53.956 -54.444 -55.064 -57.433 -4 ,18492 ,KEBNE ,16708023,Fri Nov 26 14:17:56 CET,Fri Nov 26 15:44:48 CET,0.0 0.821 1.079 1.279 1.438 1.544 1.63 1.717 1.875 1.953 2.035 1.979 2.198 2.235 2.302 2.354 2.403 2.43 2.485 2.532 2.605 2.661 2.699 2.714 2.718 2.729 2.723 2.698 2.667 2.63 2.617 2.59 2.537 2.472 2.391 2.306 2.198 2.064 1.888 1.648 1.365 1.002 0.51 -0.032 -0.717 -1.614 -2.823 -4.339 -6.39 -9.356 -13.872 -18.705 -22.39 -25.429 -27.931 -29.991 -31.693 -33.156 -34.383 -35.59 -36.641 -37.568 -38.426 -39.215 -39.913 -40.544 -41.204 -41.788 -42.305 -42.85 -43.427 -43.899 -44.374 -44.887 -45.278 -45.673 -46.096 -46.545 -47.008 -47.328 -47.666 -48.176 -48.509 -48.828 -48.988 -49.339 -49.708 -50.092 -50.291 -50.726 -50.933 -51.172 -51.413 -51.943 -52.245 -52.577 -52.945 -53.345 -53.818 -54.454 -56.305 -5 ,22690 ,KEBNE ,16708024,Fri Nov 26 14:18:53 CET,Fri Nov 26 15:49:30 CET,0.0 0.956 1.219 1.401 1.561 1.678 1.763 1.851 1.999 2.051 2.101 2.038 2.27 2.309 2.389 2.453 2.502 2.52 2.575 2.633 2.682 2.712 2.746 2.789 2.816 2.833 2.826 2.799 2.764 2.755 2.744 2.697 2.648 2.612 2.545 2.424 2.332 2.215 1.999 1.702 1.386 1.007 0.534 0.027 -0.669 -1.568 -2.745 -4.279 -6.329 -9.221 -13.711 -18.651 -22.466 -25.505 -27.987 -30.09 -31.831 -33.374 -34.683 -35.938 -36.984 -37.904 -38.757 -39.548 -40.288 -40.941 -41.61 -42.23 -42.743 -43.293 -43.862 -44.284 -44.731 -45.211 -45.578 -45.935 -46.294 -46.67 -47.057 -47.323 -47.612 -48.072 -48.392 -48.751 -48.93 -49.267 -49.619 -49.967 -50.153 -50.584 -50.742 -50.949 -51.183 -51.722 -52.027 -52.361 -52.714 -53.102 -53.582 -54.198 -56.671 -6 ,27185 ,KEBNE ,16708025,Fri Nov 26 14:18:53 CET,Fri Nov 26 15:49:10 CET,0.0 0.878 1.12 1.289 1.438 1.581 1.703 1.813 1.999 2.078 2.152 2.095 2.342 2.411 2.538 2.637 2.734 2.78 2.859 2.936 3.042 3.097 3.15 3.213 3.246 3.266 3.282 3.298 3.316 3.337 3.35 3.37 3.382 3.376 3.363 3.36 3.32 3.231 3.095 2.912 2.717 2.416 1.986 1.554 1.021 0.28 -0.722 -1.959 -3.779 -6.579 -10.963 -15.807 -19.492 -22.453 -24.842 -26.84 -28.523 -29.996 -31.215 -32.399 -33.4 -34.278 -35.094 -35.857 -36.573 -37.25 -37.952 -38.539 -39.046 -39.564 -40.088 -40.518 -40.961 -41.408 -41.749 -42.109 -42.467 -42.809 -43.166 -43.416 -43.684 -44.115 -44.408 -44.707 -44.855 -45.155 -45.474 -45.825 -46.009 -46.421 -46.55 -46.741 -46.941 -47.363 -47.599 -47.859 -48.126 -48.425 -48.788 -49.286 -50.774 -7 ,7201 ,KEBNE ,16708026,Fri Nov 26 14:18:57 CET,Fri Nov 26 15:46:13 CET,0.0 0.776 1.001 1.173 1.313 1.434 1.556 1.665 1.828 1.904 1.973 1.886 2.109 2.145 2.2 2.261 2.319 2.344 2.389 2.431 2.499 2.543 2.571 2.588 2.612 2.655 2.682 2.69 2.687 2.664 2.642 2.618 2.598 2.579 2.509 2.391 2.295 2.19 2.016 1.822 1.573 1.213 0.791 0.317 -0.346 -1.183 -2.252 -3.677 -5.687 -8.504 -12.839 -17.627 -21.245 -24.15 -26.515 -28.55 -30.334 -31.983 -33.366 -34.646 -35.712 -36.655 -37.566 -38.434 -39.271 -40.011 -40.72 -41.334 -41.843 -42.367 -42.914 -43.368 -43.855 -44.343 -44.707 -45.086 -45.472 -45.87 -46.302 -46.621 -46.953 -47.462 -47.804 -48.142 -48.317 -48.686 -49.05 -49.417 -49.616 -50.062 -50.246 -50.464 -50.7 -51.173 -51.423 -51.697 -51.994 -52.326 -52.728 -53.239 -54.996 -8 ,2767 ,KEBNE ,16708027,Fri Nov 26 14:19:54 CET,Fri Nov 26 15:50:02 CET,0.0 0.867 1.113 1.304 1.459 1.579 1.679 1.773 1.935 1.992 2.042 1.967 2.204 2.262 2.349 2.408 2.459 2.48 2.519 2.554 2.591 2.622 2.665 2.721 2.747 2.763 2.777 2.786 2.8 2.787 2.74 2.675 2.604 2.536 2.461 2.354 2.213 2.029 1.831 1.591 1.287 0.907 0.403 -0.14 -0.832 -1.749 -2.931 -4.42 -6.458 -9.32 -13.786 -18.725 -22.496 -25.524 -27.957 -30.039 -31.796 -33.345 -34.633 -35.886 -36.944 -37.872 -38.752 -39.549 -40.279 -40.966 -41.672 -42.245 -42.725 -43.252 -43.812 -44.248 -44.696 -45.176 -45.556 -45.943 -46.354 -46.801 -47.237 -47.512 -47.793 -48.242 -48.54 -48.857 -49.042 -49.413 -49.761 -50.129 -50.324 -50.766 -50.994 -51.222 -51.46 -51.988 -52.271 -52.598 -52.979 -53.388 -53.843 -54.407 -56.726 -9 ,16310 ,KEBNE ,16708028,Fri Nov 26 14:19:54 CET,Fri Nov 26 15:49:56 CET,0.0 0.737 0.995 1.179 1.332 1.469 1.592 1.723 1.938 2.029 2.118 2.068 2.298 2.347 2.439 2.514 2.589 2.634 2.716 2.764 2.792 2.801 2.821 2.853 2.893 2.952 2.994 3.001 2.984 2.954 2.905 2.842 2.78 2.713 2.632 2.549 2.455 2.293 2.094 1.879 1.628 1.268 0.756 0.216 -0.444 -1.288 -2.454 -3.97 -6.021 -8.923 -13.318 -18.087 -21.77 -24.757 -27.235 -29.366 -31.154 -32.738 -34.013 -35.261 -36.339 -37.251 -38.111 -38.909 -39.615 -40.258 -40.947 -41.558 -42.09 -42.62 -43.142 -43.587 -44.067 -44.544 -44.883 -45.221 -45.573 -45.954 -46.358 -46.631 -46.905 -47.301 -47.571 -47.875 -48.034 -48.365 -48.719 -49.097 -49.297 -49.744 -49.934 -50.158 -50.391 -50.93 -51.245 -51.588 -51.97 -52.367 -52.818 -53.418 -55.599 -10 ,16055 ,KEBNE ,16708029,Fri Nov 26 14:19:54 CET,Fri Nov 26 15:49:37 CET,0.0 0.92 1.191 1.353 1.489 1.594 1.68 1.768 1.937 2.017 2.094 2.056 2.283 2.315 2.38 2.452 2.514 2.536 2.57 2.606 2.673 2.72 2.752 2.765 2.78 2.782 2.767 2.762 2.764 2.763 2.74 2.709 2.692 2.653 2.586 2.509 2.415 2.257 2.065 1.821 1.531 1.199 0.759 0.235 -0.455 -1.318 -2.447 -3.943 -5.994 -8.915 -13.487 -18.456 -22.204 -25.284 -27.895 -30.114 -31.881 -33.36 -34.581 -35.761 -36.735 -37.6 -38.439 -39.187 -39.848 -40.45 -41.095 -41.695 -42.227 -42.798 -43.366 -43.808 -44.272 -44.749 -45.122 -45.494 -45.876 -46.272 -46.686 -46.99 -47.291 -47.72 -48.015 -48.325 -48.481 -48.799 -49.149 -49.521 -49.714 -50.157 -50.34 -50.566 -50.803 -51.327 -51.631 -51.942 -52.289 -52.696 -53.17 -53.79 -56.155 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_155.txt deleted file mode 100644 index 7d4e4b22..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27797 ,KEBNE ,16708030,Fri Nov 26 14:19:58 CET,Fri Nov 26 15:47:02 CET,0.0 2.331 3.145 3.779 4.296 4.756 5.189 5.602 6.41 6.788 7.138 7.564 8.112 8.441 9.08 9.695 10.283 10.567 11.143 11.707 12.517 13.054 13.595 14.387 15.155 15.923 16.689 17.453 18.453 19.433 20.408 21.586 22.769 23.959 25.367 27.036 28.681 30.484 32.448 34.556 36.82 39.486 42.664 46.001 50.08 54.792 60.607 67.678 76.642 88.298 104.505 120.317 131.242 139.288 145.366 150.234 154.14 157.378 159.929 162.326 164.218 165.792 167.269 168.592 169.718 170.675 171.598 172.382 173.051 173.689 174.293 174.781 175.268 175.769 176.147 176.502 176.838 177.184 177.504 177.691 177.894 178.181 178.349 178.512 178.599 178.77 178.902 179.014 179.076 179.088 179.254 179.309 179.347 179.389 179.393 179.375 179.346 179.296 179.186 178.925 177.95 -2 ,7743 ,KEBNE ,16708031,Fri Nov 26 14:20:55 CET,Fri Nov 26 15:51:25 CET,0.0 2.338 3.018 3.592 4.075 4.477 4.857 5.245 5.985 6.332 6.68 7.156 7.736 8.072 8.721 9.346 9.952 10.253 10.854 11.446 12.317 12.888 13.442 14.242 15.057 15.87 16.66 17.437 18.44 19.397 20.334 21.507 22.642 23.76 25.1 26.606 28.104 29.831 31.755 33.842 36.119 38.804 41.981 45.291 49.407 54.35 60.299 67.442 76.531 88.208 104.219 119.859 130.691 138.674 144.773 149.658 153.576 156.861 159.476 161.875 163.787 165.408 166.872 168.162 169.306 170.305 171.272 172.095 172.763 173.39 174.025 174.512 174.985 175.47 175.811 176.13 176.463 176.779 177.053 177.231 177.407 177.648 177.807 177.958 178.032 178.191 178.327 178.445 178.504 178.519 178.709 178.759 178.792 178.84 178.851 178.831 178.809 178.77 178.635 178.453 177.695 -3 ,20115 ,KEBNE ,16708032,Fri Nov 26 14:20:55 CET,Fri Nov 26 15:51:57 CET,0.0 1.749 2.459 3.081 3.637 4.131 4.584 5.01 5.801 6.174 6.536 6.997 7.578 7.922 8.603 9.249 9.877 10.195 10.813 11.402 12.275 12.852 13.415 14.247 15.073 15.883 16.681 17.466 18.486 19.501 20.495 21.673 22.845 24.057 25.538 27.206 28.803 30.626 32.649 34.856 37.274 40.097 43.535 47.112 51.421 56.54 62.797 70.278 79.659 91.614 107.819 123.633 134.738 143.045 149.325 154.324 158.322 161.626 164.248 166.708 168.689 170.33 171.814 173.157 174.317 175.305 176.282 177.122 177.812 178.481 179.154 179.693 180.226 180.751 181.116 181.471 181.807 182.13 182.478 182.707 182.914 183.193 183.369 183.542 183.626 183.77 183.896 184.033 184.096 184.097 184.237 184.277 184.321 184.371 184.377 184.362 184.331 184.275 184.178 183.945 183.038 -4 ,30147 ,KEBNE ,16708033,Fri Nov 26 14:20:55 CET,Fri Nov 26 15:51:46 CET,0.0 1.669 2.389 2.963 3.444 3.902 4.362 4.796 5.576 5.938 6.298 6.792 7.35 7.658 8.27 8.898 9.531 9.832 10.413 10.988 11.81 12.354 12.91 13.725 14.511 15.29 16.05 16.792 17.778 18.745 19.724 20.934 22.091 23.233 24.613 26.178 27.68 29.366 31.252 33.345 35.665 38.475 41.96 45.583 49.836 54.654 60.537 67.634 76.614 88.279 104.398 120.081 130.899 138.858 144.899 149.734 153.577 156.769 159.319 161.699 163.588 165.167 166.574 167.79 168.87 169.829 170.783 171.583 172.228 172.874 173.539 174.062 174.568 175.066 175.408 175.716 176.029 176.36 176.685 176.894 177.106 177.436 177.658 177.862 177.956 178.144 178.308 178.471 178.541 178.535 178.662 178.705 178.743 178.816 178.834 178.79 178.742 178.693 178.603 178.439 177.613 -5 ,18609 ,KEBNE ,16708034,Fri Nov 26 14:20:55 CET,Fri Nov 26 15:51:39 CET,0.0 2.175 2.97 3.54 3.999 4.441 4.871 5.28 6.051 6.413 6.764 7.204 7.758 8.09 8.725 9.326 9.907 10.182 10.72 11.261 12.06 12.578 13.094 13.889 14.698 15.489 16.25 16.996 17.981 18.955 19.931 21.135 22.318 23.501 24.917 26.491 27.989 29.728 31.685 33.802 36.082 38.734 41.98 45.382 49.506 54.384 60.305 67.314 76.132 87.662 103.85 119.58 130.423 138.478 144.569 149.416 153.263 156.466 159.015 161.384 163.276 164.879 166.333 167.609 168.728 169.688 170.637 171.442 172.101 172.736 173.363 173.851 174.338 174.823 175.155 175.464 175.772 176.098 176.426 176.631 176.83 177.127 177.324 177.517 177.597 177.729 177.826 177.887 177.939 177.953 178.072 178.095 178.126 178.145 178.127 178.083 178.014 177.926 177.786 177.57 176.715 -6 ,9543 ,KEBNE ,16708035,Fri Nov 26 14:20:55 CET,Fri Nov 26 15:51:24 CET,0.0 2.036 2.847 3.505 4.049 4.543 5.01 5.445 6.226 6.582 6.931 7.376 7.924 8.237 8.85 9.448 10.03 10.32 10.879 11.413 12.19 12.687 13.184 13.947 14.708 15.45 16.186 16.924 17.884 18.823 19.744 20.882 22.034 23.164 24.471 25.992 27.525 29.266 31.197 33.295 35.567 38.231 41.411 44.725 48.808 53.632 59.527 66.658 75.654 87.287 103.375 119.04 129.951 138.045 144.186 149.121 153.052 156.306 158.87 161.23 163.133 164.758 166.251 167.577 168.709 169.686 170.649 171.444 172.102 172.761 173.38 173.851 174.325 174.766 175.095 175.453 175.824 176.181 176.526 176.753 176.981 177.315 177.524 177.726 177.816 177.982 178.146 178.311 178.39 178.412 178.574 178.619 178.663 178.713 178.728 178.72 178.663 178.577 178.433 178.217 177.513 -7 ,32270 ,KEBNE ,16708036,Fri Nov 26 14:21:56 CET,Fri Nov 26 15:53:15 CET,0.0 1.773 2.43 2.982 3.48 3.926 4.358 4.778 5.554 5.903 6.246 6.701 7.275 7.609 8.259 8.873 9.482 9.785 10.377 10.954 11.805 12.364 12.919 13.72 14.507 15.294 16.074 16.846 17.847 18.843 19.812 20.966 22.122 23.273 24.591 26.084 27.571 29.265 31.173 33.269 35.545 38.197 41.361 44.708 48.822 53.624 59.501 66.584 75.492 87.119 103.31 119.057 129.911 137.93 144.037 148.92 152.795 156.034 158.623 161.016 162.944 164.572 166.034 167.314 168.424 169.407 170.367 171.146 171.764 172.352 172.93 173.415 173.893 174.339 174.686 175.026 175.338 175.643 175.944 176.131 176.325 176.637 176.822 176.97 177.048 177.235 177.418 177.578 177.65 177.659 177.786 177.819 177.853 177.923 177.949 177.944 177.908 177.837 177.707 177.484 176.258 -8 ,13542 ,KEBNE ,16708037,Fri Nov 26 14:21:56 CET,Fri Nov 26 15:53:02 CET,0.0 1.795 2.532 3.12 3.623 4.088 4.504 4.904 5.651 6.015 6.385 6.858 7.419 7.734 8.352 8.959 9.562 9.86 10.452 11.036 11.908 12.48 13.024 13.82 14.629 15.443 16.235 17.007 18.025 19.006 19.96 21.171 22.376 23.555 24.937 26.573 28.203 30.006 32.004 34.172 36.532 39.276 42.564 46.053 50.271 55.103 60.99 68.077 77.008 88.628 104.693 120.317 131.138 139.117 145.184 150.091 154.007 157.262 159.853 162.275 164.238 165.858 167.294 168.569 169.709 170.689 171.651 172.46 173.111 173.758 174.378 174.857 175.346 175.818 176.149 176.482 176.837 177.202 177.542 177.743 177.938 178.237 178.43 178.612 178.704 178.881 179.052 179.218 179.289 179.301 179.45 179.482 179.509 179.525 179.512 179.486 179.422 179.325 179.2 179.023 178.149 -9 ,24287 ,KEBNE ,16708038,Fri Nov 26 14:21:56 CET,Fri Nov 26 15:52:20 CET,0.0 1.782 2.517 3.125 3.668 4.18 4.645 5.089 5.941 6.325 6.684 7.164 7.759 8.115 8.783 9.406 10.016 10.32 10.916 11.514 12.393 12.959 13.512 14.342 15.161 15.951 16.739 17.521 18.546 19.544 20.511 21.744 22.975 24.159 25.535 27.068 28.585 30.392 32.472 34.766 37.178 39.873 43.106 46.475 50.495 55.166 60.92 67.956 76.956 88.738 105.098 120.964 131.882 140.023 146.291 151.272 155.17 158.331 160.845 163.239 165.163 166.76 168.163 169.378 170.458 171.42 172.361 173.115 173.727 174.333 174.951 175.451 175.959 176.468 176.825 177.182 177.528 177.847 178.158 178.365 178.569 178.857 179.049 179.22 179.286 179.427 179.578 179.733 179.814 179.833 180.017 180.075 180.12 180.201 180.221 180.209 180.168 180.105 180.022 179.807 179.029 -10 ,15589 ,KEBNE ,16708039,Fri Nov 26 14:22:57 CET,Fri Nov 26 15:54:24 CET,0.0 1.851 2.593 3.179 3.698 4.184 4.641 5.058 5.851 6.234 6.604 7.093 7.663 7.999 8.653 9.278 9.889 10.19 10.772 11.331 12.146 12.693 13.244 14.041 14.848 15.643 16.419 17.203 18.229 19.222 20.214 21.446 22.636 23.784 25.171 26.776 28.341 30.105 32.056 34.248 36.644 39.396 42.676 46.131 50.349 55.243 61.224 68.415 77.405 89.112 105.345 121.134 132.001 139.978 146.048 150.897 154.726 157.924 160.506 162.893 164.808 166.407 167.827 169.093 170.22 171.206 172.177 172.997 173.67 174.33 174.986 175.501 175.987 176.47 176.832 177.184 177.525 177.852 178.162 178.351 178.541 178.834 179.009 179.166 179.246 179.408 179.547 179.689 179.764 179.782 179.959 180.015 180.054 180.083 180.09 180.092 180.08 180.022 179.903 179.678 178.616 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_164.txt deleted file mode 100644 index f45c9a8d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10018 ,KEBNE ,17125963,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:26 CET,0.0 1.288 1.879 2.325 2.737 3.117 3.468 3.802 4.4 4.673 4.949 5.266 5.756 6.008 6.498 6.985 7.457 7.674 8.093 8.515 9.138 9.547 9.958 10.577 11.181 11.759 12.329 12.884 13.624 14.37 15.087 15.974 16.843 17.68 18.664 19.779 20.851 22.059 23.404 24.884 26.504 28.375 30.663 33.032 35.849 39.182 43.273 48.172 54.324 62.259 73.096 83.555 90.768 96.065 100.043 103.193 105.676 107.661 109.205 110.67 111.84 112.801 113.677 114.457 115.108 115.649 116.197 116.662 117.028 117.375 117.728 118.004 118.26 118.512 118.711 118.909 119.089 119.268 119.439 119.544 119.647 119.77 119.839 119.915 119.946 119.997 120.04 120.077 120.089 119.982 120.073 120.065 120.057 120.007 119.946 119.871 119.797 119.71 119.601 119.432 118.648 -2 ,13335 ,KEBNE ,17125964,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:04 CET,0.0 1.355 1.916 2.388 2.779 3.108 3.402 3.68 4.245 4.519 4.782 5.052 5.519 5.748 6.208 6.649 7.082 7.296 7.711 8.129 8.735 9.125 9.516 10.088 10.643 11.185 11.728 12.263 12.95 13.631 14.319 15.185 16.039 16.852 17.804 18.889 19.943 21.142 22.503 24.008 25.634 27.532 29.819 32.206 35.089 38.447 42.591 47.592 53.81 61.805 72.831 83.241 90.262 95.458 99.376 102.514 104.961 106.974 108.571 110.039 111.224 112.21 113.076 113.814 114.439 114.977 115.515 115.961 116.318 116.677 117.016 117.268 117.513 117.739 117.908 118.092 118.275 118.445 118.606 118.713 118.814 118.929 118.994 119.06 119.091 119.147 119.175 119.174 119.175 119.074 119.221 119.23 119.228 119.157 119.095 119.027 118.955 118.854 118.683 118.45 117.583 -3 ,11674 ,KEBNE ,17125965,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:26 CET,0.0 0.904 1.403 1.826 2.163 2.491 2.808 3.093 3.647 3.919 4.173 4.414 4.871 5.091 5.526 5.966 6.394 6.6 7.01 7.412 7.98 8.354 8.725 9.26 9.782 10.295 10.797 11.295 11.939 12.576 13.222 14.037 14.839 15.631 16.572 17.666 18.734 19.951 21.347 22.861 24.485 26.344 28.622 31.066 34.007 37.398 41.53 46.518 52.793 60.864 71.816 82.326 89.484 94.727 98.626 101.699 104.173 106.167 107.732 109.22 110.398 111.36 112.171 112.867 113.501 114.07 114.635 115.1 115.47 115.807 116.122 116.391 116.657 116.924 117.119 117.3 117.473 117.636 117.796 117.892 117.978 118.113 118.196 118.275 118.317 118.393 118.457 118.512 118.532 118.434 118.558 118.56 118.558 118.532 118.504 118.461 118.402 118.304 118.153 117.935 117.097 -4 ,22737 ,KEBNE ,17125966,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:01 CET,0.0 1.282 1.827 2.266 2.664 3.048 3.415 3.735 4.28 4.542 4.798 5.056 5.527 5.759 6.21 6.67 7.113 7.325 7.744 8.149 8.734 9.115 9.491 10.038 10.583 11.12 11.656 12.176 12.858 13.544 14.209 15.033 15.855 16.667 17.628 18.731 19.817 21.055 22.44 23.929 25.524 27.401 29.695 32.071 34.999 38.469 42.594 47.508 53.693 61.655 72.522 82.94 90.081 95.329 99.235 102.228 104.591 106.601 108.206 109.648 110.784 111.741 112.607 113.396 114.091 114.68 115.254 115.696 116.046 116.406 116.771 117.072 117.348 117.584 117.757 117.941 118.134 118.31 118.45 118.554 118.664 118.809 118.898 118.983 119.018 119.088 119.152 119.201 119.213 119.113 119.253 119.243 119.217 119.181 119.164 119.13 119.081 118.992 118.825 118.567 117.708 -5 ,21053 ,KEBNE ,17125967,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:35:59 CET,0.0 1.327 1.874 2.315 2.687 3.019 3.336 3.644 4.238 4.522 4.804 5.12 5.597 5.834 6.297 6.743 7.175 7.387 7.804 8.193 8.748 9.117 9.499 10.062 10.603 11.142 11.665 12.187 12.885 13.556 14.22 15.043 15.848 16.638 17.591 18.701 19.813 21.054 22.401 23.884 25.487 27.35 29.643 32.05 34.948 38.363 42.59 47.66 53.955 62.054 73.127 83.74 90.965 96.214 100.17 103.321 105.774 107.767 109.358 110.842 112.044 113.03 113.862 114.595 115.255 115.82 116.346 116.749 117.105 117.469 117.791 118.039 118.284 118.531 118.715 118.883 119.043 119.193 119.317 119.396 119.485 119.606 119.671 119.733 119.756 119.808 119.867 119.913 119.93 119.831 119.958 119.946 119.932 119.901 119.871 119.827 119.777 119.692 119.559 119.31 118.519 -6 ,4585 ,KEBNE ,17125968,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:47 CET,0.0 1.416 1.931 2.393 2.802 3.135 3.439 3.744 4.304 4.581 4.849 5.114 5.59 5.836 6.327 6.799 7.242 7.454 7.869 8.277 8.878 9.268 9.652 10.221 10.793 11.36 11.9 12.424 13.122 13.818 14.515 15.359 16.174 17.002 17.991 19.119 20.215 21.445 22.799 24.257 25.858 27.733 29.994 32.341 35.175 38.525 42.625 47.552 53.674 61.566 72.38 82.77 89.787 94.9 98.818 101.945 104.4 106.423 108.067 109.524 110.629 111.586 112.443 113.173 113.845 114.427 114.98 115.446 115.833 116.199 116.534 116.797 117.044 117.272 117.449 117.598 117.7 117.82 117.958 118.033 118.107 118.235 118.306 118.358 118.38 118.421 118.451 118.467 118.48 118.379 118.472 118.447 118.432 118.369 118.322 118.269 118.167 118.02 117.847 117.577 116.616 -7 ,11940 ,KEBNE ,17125969,Thu Dec 30 17:02:44 CET,Thu Dec 30 18:36:16 CET,0.0 1.344 1.881 2.281 2.631 2.953 3.265 3.561 4.11 4.367 4.614 4.867 5.34 5.573 6.013 6.456 6.894 7.108 7.531 7.948 8.577 8.98 9.373 9.949 10.517 11.084 11.628 12.16 12.867 13.564 14.258 15.132 15.997 16.83 17.803 18.921 20.029 21.282 22.664 24.187 25.848 27.761 30.03 32.379 35.274 38.734 43.011 48.107 54.361 62.378 73.528 84.308 91.691 97.098 101.067 104.205 106.658 108.648 110.237 111.691 112.85 113.812 114.637 115.367 116.006 116.53 117.057 117.516 117.898 118.285 118.654 118.937 119.191 119.414 119.593 119.782 119.972 120.157 120.324 120.411 120.493 120.628 120.715 120.797 120.829 120.881 120.922 120.946 120.963 120.873 121.018 121.019 120.995 120.925 120.877 120.814 120.742 120.633 120.444 120.174 119.19 -8 ,11017 ,KEBNE ,17125970,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:18 CET,0.0 1.359 1.91 2.366 2.749 3.111 3.46 3.783 4.361 4.629 4.894 5.15 5.618 5.854 6.308 6.758 7.191 7.398 7.816 8.24 8.86 9.257 9.65 10.223 10.783 11.328 11.85 12.363 13.045 13.739 14.429 15.264 16.08 16.892 17.874 19.007 20.128 21.408 22.799 24.325 25.983 27.878 30.144 32.544 35.471 38.857 42.977 47.943 54.18 62.055 72.693 83.064 90.267 95.538 99.451 102.568 105.035 107.019 108.6 110.089 111.277 112.264 113.146 113.922 114.584 115.156 115.732 116.187 116.536 116.901 117.28 117.574 117.85 118.106 118.295 118.463 118.606 118.756 118.91 119.01 119.112 119.231 119.286 119.351 119.381 119.435 119.49 119.513 119.517 119.413 119.529 119.522 119.516 119.492 119.474 119.431 119.352 119.259 119.129 118.919 118.161 -9 ,27972 ,KEBNE ,17125971,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:37:22 CET,0.0 1.382 1.891 2.344 2.74 3.116 3.477 3.808 4.372 4.628 4.899 5.179 5.654 5.902 6.387 6.838 7.257 7.464 7.883 8.294 8.882 9.266 9.648 10.224 10.8 11.372 11.946 12.506 13.228 13.945 14.645 15.489 16.335 17.176 18.141 19.261 20.379 21.622 22.976 24.448 26.043 27.884 30.167 32.597 35.524 38.914 42.967 47.801 53.996 62.045 73.011 83.582 90.812 96.069 100.024 103.14 105.573 107.575 109.13 110.586 111.76 112.7 113.546 114.285 114.937 115.51 116.053 116.513 116.883 117.242 117.6 117.874 118.133 118.379 118.552 118.718 118.877 119.008 119.134 119.222 119.299 119.411 119.483 119.542 119.564 119.609 119.643 119.669 119.679 119.566 119.671 119.665 119.663 119.627 119.586 119.529 119.443 119.331 119.192 118.972 118.04 -10 ,23178 ,KEBNE ,17125972,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:14 CET,0.0 1.595 2.203 2.671 3.094 3.478 3.804 4.114 4.732 5.026 5.306 5.615 6.127 6.394 6.873 7.334 7.794 8.006 8.421 8.83 9.412 9.808 10.207 10.783 11.344 11.893 12.435 12.973 13.7 14.418 15.089 15.931 16.794 17.633 18.616 19.739 20.853 22.126 23.524 25.046 26.722 28.653 30.96 33.387 36.319 39.738 43.893 48.886 55.112 63.029 73.879 84.311 91.456 96.707 100.681 103.865 106.267 108.205 109.792 111.278 112.47 113.46 114.366 115.163 115.837 116.415 116.975 117.429 117.782 118.104 118.412 118.653 118.885 119.131 119.326 119.526 119.712 119.868 119.995 120.08 120.176 120.288 120.355 120.424 120.456 120.507 120.546 120.583 120.604 120.504 120.622 120.62 120.614 120.56 120.519 120.473 120.421 120.346 120.208 119.996 119.148 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_256.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_256.txt deleted file mode 100644 index a8638e6d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_256.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17226 ,KEBNE ,16708040,Fri Nov 26 14:22:57 CET,Fri Nov 26 15:52:42 CET,0.0 1.142 1.468 1.73 1.964 2.156 2.323 2.474 2.732 2.846 2.961 2.943 3.278 3.384 3.583 3.758 3.896 3.964 4.1 4.219 4.391 4.504 4.618 4.798 4.979 5.135 5.265 5.389 5.538 5.665 5.811 5.986 6.162 6.328 6.488 6.658 6.801 6.965 7.156 7.355 7.545 7.791 8.07 8.268 8.463 8.649 8.807 8.899 8.899 8.709 8.016 6.894 5.883 4.961 4.13 3.397 2.724 2.028 1.424 0.843 0.336 -0.127 -0.579 -0.981 -1.392 -1.773 -2.11 -2.413 -2.687 -2.987 -3.309 -3.571 -3.841 -4.124 -4.341 -4.571 -4.801 -5.026 -5.261 -5.424 -5.596 -5.869 -6.071 -6.301 -6.422 -6.671 -6.919 -7.168 -7.291 -7.647 -7.678 -7.818 -7.959 -8.281 -8.467 -8.665 -8.88 -9.136 -9.466 -9.879 -11.93 -2 ,17398 ,KEBNE ,16708041,Fri Nov 26 14:22:57 CET,Fri Nov 26 15:52:44 CET,0.0 1.63 2.006 2.248 2.458 2.633 2.791 2.945 3.192 3.306 3.424 3.407 3.743 3.842 4.014 4.168 4.327 4.407 4.571 4.73 4.932 5.039 5.157 5.349 5.521 5.668 5.788 5.928 6.136 6.298 6.428 6.575 6.715 6.844 6.991 7.149 7.299 7.478 7.662 7.859 8.064 8.268 8.472 8.638 8.81 9.009 9.23 9.4 9.416 9.189 8.487 7.356 6.291 5.338 4.473 3.683 2.982 2.305 1.674 1.06 0.592 0.189 -0.187 -0.534 -0.863 -1.157 -1.457 -1.727 -1.994 -2.295 -2.575 -2.796 -3.048 -3.331 -3.555 -3.777 -4.006 -4.256 -4.515 -4.683 -4.843 -5.12 -5.315 -5.504 -5.61 -5.835 -6.077 -6.317 -6.441 -6.817 -6.833 -6.973 -7.124 -7.475 -7.671 -7.889 -8.132 -8.38 -8.691 -9.093 -11.615 -3 ,25262 ,KEBNE ,16708042,Fri Nov 26 14:23:58 CET,Fri Nov 26 15:54:36 CET,0.0 1.517 1.88 2.158 2.395 2.602 2.765 2.919 3.225 3.354 3.484 3.508 3.849 3.95 4.15 4.336 4.523 4.611 4.792 4.96 5.194 5.344 5.474 5.656 5.843 6.004 6.127 6.278 6.494 6.658 6.801 6.99 7.179 7.338 7.487 7.64 7.791 7.976 8.168 8.34 8.499 8.67 8.863 9.042 9.231 9.48 9.693 9.808 9.855 9.672 9.077 8.096 7.095 6.193 5.393 4.618 3.861 3.162 2.614 2.07 1.586 1.122 0.685 0.277 -0.11 -0.444 -0.804 -1.112 -1.389 -1.69 -1.978 -2.223 -2.485 -2.761 -2.978 -3.184 -3.378 -3.592 -3.825 -3.992 -4.175 -4.455 -4.643 -4.839 -4.933 -5.115 -5.315 -5.553 -5.686 -6.057 -6.08 -6.225 -6.369 -6.688 -6.877 -7.086 -7.309 -7.568 -7.871 -8.346 -10.565 -4 ,5016 ,KEBNE ,16708043,Fri Nov 26 14:23:58 CET,Fri Nov 26 15:53:58 CET,0.0 1.309 1.698 1.961 2.198 2.388 2.55 2.696 2.952 3.072 3.183 3.139 3.463 3.559 3.757 3.953 4.126 4.201 4.355 4.502 4.678 4.796 4.922 5.088 5.237 5.391 5.546 5.689 5.857 6.01 6.149 6.312 6.465 6.64 6.865 7.095 7.31 7.542 7.798 8.016 8.19 8.366 8.561 8.743 8.92 9.081 9.195 9.255 9.258 9.04 8.379 7.319 6.328 5.452 4.656 3.935 3.299 2.694 2.18 1.672 1.221 0.814 0.415 0.049 -0.287 -0.6 -0.94 -1.233 -1.488 -1.786 -2.13 -2.406 -2.648 -2.896 -3.109 -3.332 -3.563 -3.811 -4.07 -4.245 -4.424 -4.701 -4.888 -5.068 -5.159 -5.374 -5.629 -5.91 -6.044 -6.413 -6.425 -6.556 -6.701 -7.024 -7.209 -7.411 -7.641 -7.912 -8.234 -8.64 -10.66 -5 ,15643 ,KEBNE ,16708044,Fri Nov 26 14:25:00 CET,Fri Nov 26 15:55:01 CET,0.0 1.752 2.156 2.424 2.65 2.832 2.987 3.141 3.401 3.515 3.638 3.658 4.003 4.103 4.312 4.524 4.727 4.825 4.997 5.157 5.356 5.465 5.574 5.73 5.86 5.981 6.112 6.24 6.393 6.523 6.659 6.828 6.969 7.1 7.253 7.411 7.549 7.707 7.862 8.012 8.175 8.363 8.567 8.748 8.945 9.109 9.252 9.382 9.38 9.099 8.339 7.18 6.129 5.143 4.283 3.521 2.85 2.289 1.781 1.234 0.782 0.393 0.019 -0.366 -0.718 -1.016 -1.336 -1.625 -1.872 -2.123 -2.377 -2.586 -2.845 -3.14 -3.364 -3.596 -3.82 -4.06 -4.329 -4.5 -4.659 -4.919 -5.11 -5.313 -5.421 -5.624 -5.828 -6.058 -6.172 -6.521 -6.541 -6.689 -6.847 -7.212 -7.415 -7.642 -7.913 -8.208 -8.546 -9.008 -11.735 -6 ,17518 ,KEBNE ,16708045,Fri Nov 26 14:25:02 CET,Fri Nov 26 15:49:23 CET,0.0 1.334 1.701 1.971 2.189 2.372 2.538 2.689 2.96 3.085 3.194 3.149 3.462 3.551 3.727 3.896 4.045 4.12 4.277 4.424 4.615 4.723 4.826 4.979 5.104 5.225 5.353 5.473 5.636 5.805 5.993 6.223 6.429 6.614 6.805 6.971 7.111 7.272 7.458 7.686 7.926 8.143 8.361 8.541 8.685 8.818 8.955 9.032 8.985 8.766 8.099 6.987 5.904 4.928 4.091 3.314 2.617 2.002 1.491 0.953 0.486 0.094 -0.281 -0.647 -0.982 -1.289 -1.612 -1.903 -2.158 -2.42 -2.708 -2.932 -3.145 -3.39 -3.603 -3.819 -4.029 -4.237 -4.474 -4.641 -4.799 -5.057 -5.245 -5.442 -5.544 -5.747 -5.946 -6.158 -6.279 -6.636 -6.66 -6.807 -6.959 -7.298 -7.486 -7.681 -7.901 -8.154 -8.46 -8.894 -11.156 -7 ,1132 ,KEBNE ,16708046,Fri Nov 26 14:26:01 CET,Fri Nov 26 15:57:05 CET,0.0 1.344 1.735 1.998 2.213 2.415 2.58 2.704 2.935 3.051 3.179 3.194 3.52 3.612 3.8 3.981 4.142 4.216 4.365 4.51 4.691 4.81 4.945 5.134 5.277 5.398 5.528 5.658 5.826 6.003 6.152 6.302 6.464 6.624 6.785 6.951 7.128 7.315 7.483 7.663 7.839 8.023 8.225 8.408 8.598 8.772 8.933 9.015 8.977 8.716 7.874 6.655 5.54 4.552 3.686 2.903 2.228 1.641 1.138 0.636 0.194 -0.211 -0.592 -0.94 -1.309 -1.689 -2.072 -2.391 -2.654 -2.963 -3.319 -3.58 -3.822 -4.065 -4.261 -4.488 -4.733 -4.995 -5.246 -5.414 -5.6 -5.881 -6.071 -6.278 -6.393 -6.621 -6.843 -7.057 -7.164 -7.529 -7.57 -7.712 -7.852 -8.153 -8.342 -8.548 -8.747 -8.981 -9.295 -9.758 -13.653 -8 ,4238 ,KEBNE ,16708047,Fri Nov 26 14:26:01 CET,Fri Nov 26 15:56:25 CET,0.0 1.583 1.934 2.21 2.462 2.694 2.878 3.033 3.321 3.459 3.576 3.555 3.889 3.991 4.19 4.378 4.578 4.673 4.827 4.965 5.174 5.317 5.447 5.613 5.768 5.913 6.051 6.184 6.343 6.49 6.636 6.808 6.986 7.173 7.368 7.557 7.731 7.926 8.136 8.333 8.534 8.747 8.944 9.152 9.433 9.7 9.912 10.058 10.089 9.877 9.18 8.13 7.158 6.266 5.469 4.711 4.051 3.486 2.963 2.405 1.931 1.514 1.123 0.765 0.435 0.134 -0.181 -0.481 -0.746 -1.036 -1.335 -1.575 -1.856 -2.173 -2.408 -2.625 -2.832 -3.044 -3.261 -3.405 -3.556 -3.807 -3.988 -4.176 -4.275 -4.486 -4.708 -4.951 -5.075 -5.431 -5.422 -5.558 -5.701 -6.029 -6.22 -6.423 -6.654 -6.926 -7.245 -7.675 -9.525 -9 ,14220 ,KEBNE ,16708048,Fri Nov 26 14:27:03 CET,Fri Nov 26 15:57:46 CET,0.0 2.069 2.452 2.7 2.888 3.071 3.257 3.409 3.642 3.758 3.875 3.864 4.198 4.304 4.494 4.656 4.794 4.856 4.975 5.089 5.252 5.354 5.448 5.594 5.761 5.915 6.047 6.181 6.366 6.548 6.716 6.897 7.056 7.203 7.361 7.524 7.671 7.822 7.982 8.143 8.3 8.495 8.712 8.886 9.068 9.235 9.406 9.536 9.533 9.283 8.578 7.348 6.164 5.239 4.435 3.702 3.071 2.482 1.986 1.484 1.032 0.623 0.241 -0.098 -0.416 -0.707 -0.997 -1.256 -1.49 -1.743 -1.996 -2.205 -2.432 -2.659 -2.832 -3.028 -3.246 -3.488 -3.729 -3.876 -4.036 -4.281 -4.432 -4.6 -4.7 -4.916 -5.13 -5.349 -5.463 -5.823 -5.843 -5.974 -6.132 -6.501 -6.689 -6.884 -7.106 -7.36 -7.671 -8.096 -10.025 -10 ,13622 ,KEBNE ,16708049,Fri Nov 26 14:27:06 CET,Fri Nov 26 15:54:37 CET,0.0 1.432 1.806 2.073 2.304 2.506 2.674 2.823 3.111 3.248 3.375 3.386 3.734 3.847 4.035 4.202 4.369 4.454 4.601 4.727 4.92 5.045 5.165 5.342 5.501 5.638 5.78 5.923 6.127 6.33 6.504 6.7 6.855 6.999 7.183 7.386 7.591 7.825 8.06 8.273 8.472 8.673 8.928 9.2 9.467 9.716 9.994 10.229 10.283 10.06 9.323 8.18 7.159 6.201 5.337 4.615 3.951 3.328 2.793 2.246 1.775 1.368 0.98 0.62 0.309 0.019 -0.296 -0.574 -0.826 -1.114 -1.416 -1.643 -1.874 -2.133 -2.354 -2.567 -2.762 -2.986 -3.239 -3.412 -3.589 -3.851 -4.029 -4.232 -4.339 -4.544 -4.745 -4.948 -5.063 -5.427 -5.441 -5.585 -5.741 -6.075 -6.28 -6.518 -6.755 -7.017 -7.336 -7.775 -11.949 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_336.txt deleted file mode 100644 index 4ed7d395..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6486 ,KEBNE ,16708050,Fri Nov 26 14:29:06 CET,Fri Nov 26 15:59:55 CET,0.0 0.865 1.231 1.503 1.719 1.907 2.063 2.2 2.459 2.585 2.708 2.682 3.009 3.095 3.258 3.416 3.571 3.649 3.813 3.977 4.208 4.342 4.458 4.626 4.784 4.924 5.053 5.173 5.345 5.513 5.648 5.813 6.01 6.185 6.353 6.556 6.744 6.936 7.128 7.342 7.607 7.88 8.113 8.329 8.56 8.789 9.009 9.153 9.178 9.005 8.389 7.314 6.288 5.382 4.552 3.793 3.133 2.516 1.975 1.435 0.989 0.623 0.266 -0.08 -0.404 -0.711 -1.07 -1.402 -1.668 -1.92 -2.184 -2.412 -2.649 -2.896 -3.102 -3.338 -3.559 -3.782 -4.033 -4.199 -4.379 -4.652 -4.84 -5.06 -5.178 -5.411 -5.621 -5.851 -5.991 -6.379 -6.435 -6.587 -6.745 -7.09 -7.268 -7.446 -7.674 -7.95 -8.236 -8.575 -9.597 -2 ,10424 ,KEBNE ,16708051,Fri Nov 26 14:29:06 CET,Fri Nov 26 15:59:50 CET,0.0 0.932 1.226 1.425 1.594 1.75 1.908 2.06 2.317 2.429 2.534 2.515 2.849 2.95 3.145 3.317 3.454 3.519 3.663 3.802 4.008 4.134 4.244 4.401 4.558 4.731 4.888 5.014 5.176 5.333 5.474 5.656 5.868 6.08 6.287 6.477 6.653 6.836 7.025 7.233 7.439 7.645 7.868 8.071 8.313 8.537 8.71 8.816 8.768 8.523 7.863 6.744 5.659 4.691 3.825 3.056 2.402 1.817 1.317 0.806 0.34 -0.079 -0.461 -0.819 -1.153 -1.451 -1.76 -2.042 -2.291 -2.546 -2.813 -3.034 -3.271 -3.514 -3.687 -3.879 -4.09 -4.328 -4.588 -4.752 -4.928 -5.207 -5.379 -5.578 -5.688 -5.908 -6.142 -6.381 -6.504 -6.881 -6.929 -7.073 -7.208 -7.523 -7.712 -7.916 -8.158 -8.448 -8.758 -9.145 -10.297 -3 ,6420 ,KEBNE ,16708052,Fri Nov 26 14:29:06 CET,Fri Nov 26 15:59:13 CET,0.0 0.895 1.247 1.492 1.713 1.898 2.05 2.203 2.496 2.617 2.733 2.729 3.071 3.175 3.353 3.514 3.66 3.723 3.872 4.041 4.275 4.417 4.555 4.756 4.917 5.075 5.241 5.38 5.553 5.739 5.929 6.151 6.346 6.525 6.753 6.984 7.173 7.381 7.576 7.794 8.037 8.259 8.486 8.718 8.974 9.216 9.391 9.549 9.682 9.573 8.951 7.943 6.966 6.035 5.166 4.336 3.608 2.999 2.502 1.987 1.538 1.136 0.744 0.376 0.023 -0.303 -0.661 -0.974 -1.227 -1.488 -1.749 -1.977 -2.216 -2.454 -2.639 -2.838 -3.045 -3.263 -3.493 -3.665 -3.851 -4.169 -4.375 -4.583 -4.699 -4.911 -5.115 -5.345 -5.466 -5.845 -5.91 -6.076 -6.249 -6.559 -6.728 -6.916 -7.106 -7.362 -7.691 -8.1 -9.223 -4 ,21488 ,KEBNE ,16708053,Fri Nov 26 14:30:09 CET,Fri Nov 26 15:59:56 CET,0.0 0.837 1.183 1.432 1.632 1.805 1.98 2.16 2.466 2.604 2.737 2.747 3.084 3.174 3.357 3.564 3.769 3.859 4.026 4.168 4.368 4.51 4.653 4.846 5.007 5.139 5.26 5.38 5.54 5.697 5.864 6.065 6.255 6.448 6.655 6.84 7.005 7.21 7.444 7.677 7.901 8.128 8.352 8.566 8.83 9.091 9.286 9.427 9.512 9.499 9.107 8.256 7.369 6.488 5.67 4.938 4.316 3.753 3.259 2.756 2.304 1.882 1.458 1.068 0.705 0.348 -0.016 -0.325 -0.621 -0.945 -1.245 -1.467 -1.72 -2.015 -2.232 -2.452 -2.693 -2.946 -3.189 -3.345 -3.51 -3.794 -4.001 -4.2 -4.297 -4.497 -4.71 -4.947 -5.083 -5.469 -5.482 -5.629 -5.803 -6.175 -6.373 -6.585 -6.796 -7.042 -7.356 -7.759 -8.878 -5 ,13429 ,KEBNE ,16708054,Fri Nov 26 14:31:10 CET,Fri Nov 26 16:02:42 CET,0.0 0.897 1.184 1.412 1.602 1.763 1.926 2.083 2.354 2.472 2.571 2.519 2.858 2.957 3.125 3.274 3.425 3.51 3.685 3.832 4.014 4.123 4.221 4.37 4.524 4.685 4.851 5.005 5.179 5.334 5.484 5.652 5.797 5.944 6.115 6.313 6.502 6.7 6.941 7.184 7.401 7.641 7.879 8.077 8.293 8.529 8.765 8.916 8.957 8.745 8.089 7.108 6.13 5.219 4.409 3.67 3.009 2.409 1.884 1.331 0.811 0.363 -0.066 -0.507 -0.9 -1.242 -1.574 -1.861 -2.111 -2.38 -2.666 -2.902 -3.176 -3.495 -3.729 -3.951 -4.197 -4.437 -4.677 -4.856 -5.037 -5.322 -5.518 -5.731 -5.842 -6.066 -6.295 -6.513 -6.621 -6.996 -7.056 -7.209 -7.359 -7.705 -7.901 -8.121 -8.365 -8.625 -8.94 -9.334 -10.35 -6 ,24717 ,KEBNE ,16708055,Fri Nov 26 14:32:11 CET,Fri Nov 26 16:02:24 CET,0.0 0.977 1.294 1.53 1.741 1.948 2.133 2.29 2.571 2.702 2.812 2.796 3.146 3.253 3.463 3.668 3.828 3.903 4.061 4.21 4.433 4.56 4.672 4.84 4.994 5.138 5.276 5.404 5.57 5.73 5.877 6.06 6.233 6.407 6.608 6.842 7.081 7.301 7.509 7.717 7.929 8.161 8.401 8.625 8.872 9.126 9.347 9.509 9.611 9.488 8.999 8.116 7.137 6.233 5.352 4.537 3.884 3.298 2.785 2.259 1.799 1.352 0.907 0.491 0.109 -0.222 -0.579 -0.894 -1.164 -1.437 -1.723 -1.972 -2.251 -2.54 -2.752 -2.967 -3.202 -3.465 -3.706 -3.864 -4.04 -4.31 -4.489 -4.67 -4.769 -4.985 -5.205 -5.437 -5.56 -5.94 -5.984 -6.131 -6.299 -6.703 -6.915 -7.121 -7.339 -7.595 -7.884 -8.239 -9.176 -7 ,2466 ,KEBNE ,16708056,Fri Nov 26 14:32:11 CET,Fri Nov 26 16:03:13 CET,0.0 1.195 1.567 1.852 2.078 2.251 2.398 2.539 2.799 2.904 3.018 3.031 3.37 3.47 3.673 3.857 4.022 4.092 4.227 4.358 4.537 4.652 4.77 4.944 5.094 5.232 5.373 5.507 5.665 5.848 6.05 6.268 6.452 6.617 6.786 6.987 7.192 7.383 7.572 7.774 7.973 8.206 8.465 8.68 8.907 9.124 9.326 9.488 9.528 9.371 8.795 7.793 6.808 5.851 4.995 4.239 3.572 2.938 2.386 1.831 1.354 0.949 0.551 0.167 -0.191 -0.549 -0.943 -1.259 -1.516 -1.803 -2.094 -2.326 -2.584 -2.85 -3.037 -3.233 -3.441 -3.675 -3.941 -4.115 -4.281 -4.531 -4.711 -4.899 -5.001 -5.233 -5.466 -5.683 -5.804 -6.196 -6.235 -6.367 -6.52 -6.878 -7.072 -7.273 -7.484 -7.735 -8.059 -8.522 -9.741 -8 ,18896 ,KEBNE ,16708057,Fri Nov 26 14:32:11 CET,Fri Nov 26 16:02:12 CET,0.0 0.912 1.227 1.498 1.737 1.94 2.121 2.282 2.557 2.684 2.805 2.797 3.144 3.247 3.449 3.669 3.868 3.95 4.092 4.238 4.461 4.61 4.755 4.956 5.155 5.345 5.514 5.686 5.904 6.081 6.256 6.454 6.629 6.845 7.122 7.361 7.545 7.764 8.039 8.37 8.735 9.124 9.475 9.782 10.159 10.522 10.816 11.006 11.117 11.042 10.487 9.466 8.544 7.607 6.742 6.032 5.405 4.844 4.306 3.74 3.26 2.813 2.375 1.94 1.543 1.205 0.863 0.553 0.279 -0.032 -0.339 -0.56 -0.798 -1.034 -1.208 -1.401 -1.624 -1.867 -2.128 -2.31 -2.481 -2.738 -2.925 -3.13 -3.234 -3.45 -3.698 -3.962 -4.094 -4.469 -4.494 -4.645 -4.805 -5.157 -5.35 -5.557 -5.81 -6.106 -6.464 -6.894 -7.957 -9 ,22809 ,KEBNE ,16708058,Fri Nov 26 14:32:11 CET,Fri Nov 26 16:02:06 CET,0.0 1.006 1.322 1.579 1.792 1.964 2.108 2.231 2.462 2.573 2.678 2.658 2.996 3.091 3.274 3.441 3.594 3.676 3.843 3.984 4.176 4.313 4.446 4.64 4.815 4.961 5.122 5.294 5.52 5.718 5.891 6.116 6.331 6.539 6.76 6.978 7.169 7.351 7.539 7.747 7.971 8.195 8.412 8.627 8.877 9.133 9.344 9.436 9.439 9.249 8.597 7.538 6.582 5.74 4.97 4.259 3.59 2.965 2.43 1.897 1.441 1.029 0.643 0.27 -0.095 -0.447 -0.803 -1.114 -1.4 -1.684 -1.967 -2.209 -2.497 -2.825 -3.055 -3.282 -3.518 -3.763 -4.031 -4.216 -4.4 -4.667 -4.835 -5.026 -5.128 -5.345 -5.57 -5.799 -5.921 -6.29 -6.303 -6.44 -6.591 -6.915 -7.088 -7.273 -7.503 -7.778 -8.09 -8.522 -9.713 -10 ,28290 ,KEBNE ,16708059,Fri Nov 26 14:33:13 CET,Fri Nov 26 16:03:11 CET,0.0 0.983 1.323 1.597 1.83 2.032 2.215 2.375 2.679 2.819 2.945 2.952 3.29 3.396 3.602 3.784 3.952 4.037 4.214 4.386 4.625 4.773 4.901 5.065 5.216 5.363 5.501 5.625 5.789 5.971 6.149 6.373 6.601 6.806 7.047 7.308 7.521 7.746 7.986 8.235 8.521 8.823 9.107 9.36 9.604 9.814 10.016 10.219 10.319 10.143 9.511 8.403 7.283 6.354 5.541 4.773 4.101 3.491 2.967 2.447 2.011 1.609 1.205 0.827 0.457 0.094 -0.247 -0.548 -0.823 -1.122 -1.443 -1.679 -1.917 -2.167 -2.373 -2.598 -2.818 -3.057 -3.32 -3.504 -3.705 -4.018 -4.243 -4.463 -4.575 -4.825 -5.082 -5.354 -5.502 -5.888 -5.94 -6.099 -6.269 -6.631 -6.828 -7.05 -7.291 -7.556 -7.877 -8.279 -9.376 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_67.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_67.txt deleted file mode 100644 index 44b4115c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_252_67.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3149 ,KEBNE ,16708060,Fri Nov 26 14:34:16 CET,Fri Nov 26 16:04:03 CET,0.0 1.537 2.025 2.425 2.767 3.089 3.398 3.688 4.24 4.506 4.773 5.064 5.547 5.793 6.281 6.755 7.216 7.442 7.89 8.336 8.995 9.424 9.851 10.494 11.131 11.754 12.366 12.974 13.774 14.563 15.351 16.337 17.308 18.263 19.402 20.726 22.049 23.56 25.248 27.112 29.146 31.511 34.337 37.279 40.877 45.027 50.098 56.322 64.252 74.57 88.709 102.305 111.504 118.205 123.301 127.31 130.423 132.978 135.001 136.847 138.279 139.453 140.525 141.497 142.351 143.049 143.706 144.268 144.72 145.136 145.534 145.82 146.113 146.423 146.642 146.872 147.081 147.265 147.443 147.548 147.658 147.834 147.936 148.015 148.038 148.071 148.095 148.086 148.071 147.98 148.009 147.972 147.91 147.739 147.652 147.557 147.402 147.171 146.857 146.419 143.983 -2 ,17046 ,KEBNE ,16708061,Fri Nov 26 14:35:17 CET,Fri Nov 26 16:05:24 CET,0.0 1.875 2.362 2.766 3.102 3.413 3.732 4.037 4.607 4.882 5.152 5.435 5.912 6.148 6.614 7.075 7.525 7.744 8.178 8.612 9.258 9.686 10.111 10.73 11.325 11.904 12.481 13.07 13.846 14.598 15.347 16.275 17.204 18.15 19.27 20.545 21.798 23.214 24.832 26.611 28.519 30.762 33.531 36.432 39.961 44.169 49.277 55.458 63.401 73.752 87.882 101.564 110.99 117.955 123.277 127.435 130.658 133.309 135.41 137.3 138.794 140.085 141.253 142.228 143.041 143.744 144.427 145.007 145.462 145.891 146.326 146.667 147.012 147.343 147.575 147.808 148.018 148.198 148.376 148.497 148.608 148.741 148.805 148.87 148.895 148.935 148.966 148.968 148.953 148.855 148.927 148.916 148.889 148.786 148.711 148.621 148.489 148.32 148.088 147.702 145.539 -3 ,17789 ,KEBNE ,16708062,Fri Nov 26 14:40:24 CET,Fri Nov 26 16:10:52 CET,0.0 1.523 2.021 2.438 2.797 3.116 3.406 3.689 4.241 4.508 4.77 5.054 5.531 5.77 6.251 6.727 7.191 7.419 7.874 8.315 8.96 9.385 9.807 10.42 11.018 11.614 12.2 12.782 13.544 14.292 15.035 15.962 16.88 17.797 18.913 20.229 21.531 22.991 24.589 26.357 28.322 30.596 33.404 36.338 39.82 43.918 48.943 55.004 62.689 72.788 86.721 100.149 109.34 116.055 121.182 125.297 128.582 131.25 133.383 135.386 136.933 138.192 139.303 140.272 141.11 141.834 142.544 143.148 143.653 144.141 144.614 144.969 145.302 145.625 145.848 146.043 146.244 146.446 146.633 146.757 146.873 147.022 147.111 147.182 147.212 147.267 147.323 147.369 147.383 147.321 147.424 147.418 147.392 147.308 147.248 147.149 146.996 146.795 146.563 146.208 144.316 -4 ,27498 ,KEBNE ,16708063,Fri Nov 26 14:56:45 CET,Fri Nov 26 16:27:01 CET,0.0 1.293 1.803 2.216 2.557 2.884 3.198 3.496 4.054 4.311 4.565 4.84 5.318 5.567 6.048 6.519 6.976 7.201 7.646 8.083 8.73 9.15 9.57 10.205 10.825 11.429 12.021 12.609 13.388 14.163 14.931 15.877 16.816 17.754 18.874 20.158 21.439 22.907 24.528 26.321 28.305 30.635 33.466 36.375 39.882 44.007 49.111 55.305 63.021 73.011 86.862 100.32 109.496 116.22 121.305 125.325 128.466 131.039 133.098 134.987 136.479 137.72 138.818 139.784 140.613 141.317 141.995 142.536 142.981 143.431 143.868 144.197 144.532 144.878 145.14 145.383 145.588 145.767 145.938 146.045 146.156 146.323 146.41 146.475 146.508 146.567 146.605 146.61 146.602 146.518 146.57 146.549 146.521 146.432 146.355 146.242 146.118 145.94 145.653 145.174 142.6 -5 ,32494 ,KEBNE ,16708064,Fri Nov 26 14:56:45 CET,Fri Nov 26 16:26:23 CET,0.0 1.409 1.878 2.282 2.65 2.98 3.271 3.555 4.109 4.366 4.617 4.892 5.371 5.616 6.102 6.581 7.049 7.271 7.704 8.147 8.789 9.203 9.62 10.243 10.868 11.476 12.071 12.67 13.455 14.227 15.012 15.985 16.932 17.868 18.974 20.255 21.549 23.038 24.684 26.504 28.503 30.802 33.567 36.464 40.026 44.254 49.436 55.614 63.395 73.541 87.518 101.095 110.501 117.413 122.564 126.619 129.712 132.22 134.26 136.145 137.637 138.873 139.968 140.897 141.687 142.389 143.091 143.679 144.154 144.63 145.103 145.444 145.747 146.064 146.3 146.52 146.741 146.956 147.167 147.291 147.405 147.553 147.636 147.719 147.759 147.829 147.87 147.901 147.923 147.867 147.948 147.933 147.892 147.766 147.681 147.57 147.441 147.268 147.01 146.562 143.867 -6 ,29041 ,KEBNE ,16708065,Fri Nov 26 14:58:47 CET,Fri Nov 26 16:28:52 CET,0.0 1.635 2.104 2.493 2.867 3.206 3.513 3.813 4.378 4.651 4.913 5.181 5.652 5.902 6.388 6.86 7.316 7.537 7.976 8.4 9.017 9.427 9.838 10.45 11.047 11.633 12.217 12.807 13.581 14.354 15.137 16.1 17.043 17.962 19.046 20.32 21.603 23.064 24.678 26.427 28.348 30.64 33.469 36.439 40.011 44.164 49.253 55.392 63.211 73.37 87.12 100.381 109.423 115.966 120.888 124.908 128.113 130.68 132.692 134.587 136.099 137.36 138.48 139.455 140.326 141.051 141.743 142.337 142.778 143.183 143.592 143.905 144.207 144.499 144.718 144.944 145.174 145.4 145.615 145.759 145.877 146.008 146.092 146.171 146.206 146.262 146.301 146.326 146.339 146.278 146.341 146.324 146.309 146.259 146.203 146.119 146.018 145.857 145.565 145.107 142.04 -7 ,17803 ,KEBNE ,16708066,Fri Nov 26 15:00:50 CET,Fri Nov 26 16:30:48 CET,0.0 1.547 2.043 2.452 2.816 3.161 3.476 3.765 4.323 4.585 4.836 5.102 5.583 5.831 6.321 6.805 7.269 7.494 7.938 8.374 9.008 9.421 9.836 10.465 11.09 11.709 12.323 12.935 13.749 14.555 15.345 16.324 17.294 18.243 19.38 20.71 22.027 23.517 25.194 27.046 29.03 31.348 34.175 37.142 40.766 45.045 50.332 56.701 64.685 74.991 89.303 103.353 112.828 119.647 124.915 129.161 132.466 135.14 137.167 138.981 140.465 141.691 142.75 143.678 144.511 145.229 145.9 146.456 146.914 147.357 147.761 148.061 148.356 148.644 148.849 149.044 149.223 149.403 149.581 149.698 149.822 149.986 150.084 150.173 150.197 150.221 150.254 150.265 150.251 150.157 150.189 150.146 150.093 149.96 149.86 149.725 149.552 149.312 148.995 148.477 144.869 -8 ,17964 ,KEBNE ,16708067,Fri Nov 26 15:01:51 CET,Fri Nov 26 16:32:22 CET,0.0 1.855 2.377 2.805 3.169 3.49 3.802 4.092 4.669 4.948 5.205 5.478 5.961 6.205 6.676 7.144 7.598 7.824 8.276 8.716 9.356 9.783 10.208 10.838 11.458 12.062 12.671 13.27 14.046 14.831 15.62 16.58 17.505 18.405 19.471 20.727 21.977 23.393 24.988 26.74 28.641 30.892 33.633 36.482 39.962 44.103 49.209 55.313 62.98 72.931 86.664 99.977 109.061 115.632 120.55 124.422 127.555 130.211 132.3 134.176 135.627 136.829 137.905 138.873 139.74 140.474 141.185 141.777 142.256 142.704 143.138 143.487 143.832 144.17 144.397 144.615 144.815 145.003 145.195 145.302 145.412 145.6 145.708 145.806 145.849 145.924 146.001 146.06 146.079 146.006 146.06 146.038 146.008 145.936 145.858 145.74 145.582 145.353 145.061 144.653 142.038 -9 ,27794 ,KEBNE ,16708068,Fri Nov 26 15:02:52 CET,Fri Nov 26 16:32:14 CET,0.0 1.99 2.48 2.886 3.247 3.582 3.883 4.18 4.752 5.026 5.297 5.577 6.045 6.276 6.728 7.197 7.669 7.901 8.356 8.798 9.455 9.883 10.302 10.919 11.526 12.13 12.736 13.329 14.109 14.89 15.668 16.623 17.55 18.468 19.587 20.902 22.199 23.644 25.243 27.008 28.92 31.151 33.887 36.78 40.274 44.333 49.315 55.359 63.04 73.062 86.963 100.5 109.724 116.478 121.514 125.565 128.847 131.563 133.706 135.666 137.272 138.62 139.789 140.796 141.652 142.37 143.077 143.626 144.071 144.524 144.974 145.336 145.667 145.982 146.206 146.425 146.661 146.891 147.105 147.227 147.336 147.473 147.536 147.612 147.645 147.678 147.704 147.735 147.745 147.668 147.704 147.662 147.623 147.524 147.453 147.364 147.236 147.053 146.815 146.421 143.354 -10 ,21359 ,KEBNE ,16708069,Fri Nov 26 15:10:03 CET,Fri Nov 26 16:40:00 CET,0.0 1.276 1.727 2.124 2.494 2.834 3.15 3.443 4.004 4.275 4.533 4.8 5.271 5.511 5.974 6.433 6.886 7.107 7.548 7.969 8.582 8.999 9.425 10.067 10.693 11.296 11.9 12.512 13.309 14.095 14.888 15.863 16.819 17.759 18.88 20.169 21.427 22.854 24.452 26.236 28.188 30.461 33.237 36.135 39.69 43.956 49.178 55.36 63.056 73.046 86.766 99.931 108.924 115.435 120.423 124.434 127.573 130.151 132.163 134.064 135.589 136.83 137.944 138.925 139.755 140.479 141.148 141.705 142.198 142.672 143.12 143.46 143.792 144.104 144.335 144.571 144.794 144.979 145.128 145.237 145.362 145.515 145.591 145.663 145.698 145.762 145.806 145.837 145.847 145.782 145.856 145.834 145.796 145.688 145.622 145.517 145.359 145.181 144.941 144.481 142.092 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_254_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_254_163.txt deleted file mode 100644 index e923cb02..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_254_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13405 ,KEBNE ,16708070,Fri Nov 26 15:21:16 CET,Fri Nov 26 16:52:27 CET,0.0 0.743 1.073 1.352 1.598 1.811 2.008 2.202 2.558 2.708 2.858 2.983 3.295 3.419 3.659 3.907 4.154 4.278 4.53 4.76 5.09 5.293 5.483 5.773 6.056 6.339 6.616 6.895 7.263 7.634 8.019 8.479 8.918 9.348 9.833 10.38 10.921 11.509 12.157 12.853 13.6 14.465 15.508 16.593 17.88 19.372 21.172 23.289 25.882 29.169 33.498 37.437 40.027 41.8 43.075 44.085 44.839 45.408 45.84 46.219 46.512 46.719 46.877 47.015 47.118 47.195 47.244 47.278 47.285 47.255 47.225 47.201 47.167 47.124 47.082 47.029 46.975 46.916 46.83 46.76 46.675 46.554 46.474 46.367 46.309 46.181 46.044 45.884 45.789 45.572 45.53 45.44 45.346 45.143 45.018 44.866 44.658 44.387 44.046 43.595 41.514 -2 ,25023 ,KEBNE ,16708071,Fri Nov 26 15:21:16 CET,Fri Nov 26 16:51:54 CET,0.0 0.948 1.268 1.532 1.784 2.008 2.203 2.381 2.705 2.855 2.994 3.092 3.395 3.517 3.753 3.977 4.196 4.311 4.529 4.727 5.034 5.249 5.479 5.824 6.159 6.467 6.757 7.056 7.453 7.833 8.201 8.644 9.096 9.548 10.04 10.583 11.118 11.705 12.363 13.078 13.818 14.7 15.748 16.795 18.052 19.501 21.235 23.297 25.841 28.963 33.039 36.794 39.243 40.933 42.129 43.057 43.748 44.243 44.62 44.944 45.178 45.342 45.41 45.458 45.514 45.552 45.578 45.582 45.545 45.503 45.454 45.416 45.399 45.384 45.361 45.316 45.266 45.185 45.085 45.02 44.943 44.809 44.724 44.624 44.569 44.454 44.316 44.161 44.078 43.861 43.78 43.674 43.573 43.333 43.19 43.047 42.876 42.661 42.418 42.048 40.488 -3 ,25161 ,KEBNE ,16708072,Fri Nov 26 15:22:21 CET,Fri Nov 26 16:48:25 CET,0.0 0.957 1.28 1.545 1.781 2.012 2.195 2.346 2.66 2.821 2.982 3.096 3.414 3.573 3.852 4.105 4.365 4.486 4.729 4.967 5.307 5.518 5.714 5.995 6.26 6.525 6.789 7.068 7.45 7.836 8.208 8.629 9.035 9.445 9.921 10.442 10.97 11.589 12.25 12.929 13.66 14.516 15.546 16.62 17.905 19.398 21.239 23.392 25.996 29.253 33.566 37.476 39.963 41.69 42.953 43.891 44.575 45.123 45.538 45.88 46.11 46.293 46.441 46.585 46.722 46.816 46.89 46.93 46.954 46.98 47.005 47.019 47.006 46.968 46.935 46.886 46.846 46.813 46.765 46.727 46.663 46.542 46.478 46.396 46.345 46.251 46.134 45.99 45.912 45.714 45.681 45.56 45.449 45.224 45.071 44.897 44.705 44.488 44.27 43.982 43.105 -4 ,22814 ,KEBNE ,16708073,Fri Nov 26 15:22:21 CET,Fri Nov 26 16:48:29 CET,0.0 0.93 1.266 1.537 1.792 2.02 2.224 2.43 2.808 2.978 3.139 3.266 3.581 3.719 3.994 4.247 4.499 4.624 4.869 5.111 5.475 5.713 5.948 6.295 6.614 6.908 7.172 7.445 7.838 8.195 8.519 8.917 9.318 9.709 10.159 10.671 11.167 11.717 12.335 13.031 13.778 14.626 15.619 16.643 17.893 19.323 21.003 22.999 25.441 28.571 32.724 36.366 38.686 40.26 41.379 42.223 42.83 43.262 43.593 43.905 44.097 44.232 44.356 44.441 44.488 44.534 44.594 44.628 44.612 44.574 44.531 44.481 44.421 44.371 44.344 44.31 44.26 44.187 44.101 44.04 43.971 43.838 43.737 43.641 43.591 43.482 43.363 43.236 43.173 42.966 42.924 42.85 42.765 42.543 42.432 42.298 42.126 41.912 41.59 41.12 39.365 -5 ,3973 ,KEBNE ,16708074,Fri Nov 26 15:23:23 CET,Fri Nov 26 16:49:08 CET,0.0 0.829 1.14 1.401 1.644 1.865 2.061 2.247 2.583 2.721 2.861 2.988 3.3 3.426 3.673 3.922 4.178 4.303 4.533 4.759 5.101 5.318 5.538 5.879 6.207 6.52 6.828 7.131 7.495 7.841 8.173 8.564 8.951 9.332 9.777 10.297 10.816 11.397 12.043 12.761 13.537 14.447 15.502 16.547 17.82 19.294 21.065 23.148 25.724 29.0 33.275 37.208 39.772 41.535 42.836 43.845 44.591 45.142 45.544 45.897 46.146 46.329 46.485 46.595 46.662 46.726 46.77 46.769 46.771 46.771 46.753 46.715 46.659 46.61 46.578 46.543 46.505 46.459 46.409 46.375 46.324 46.195 46.1 45.987 45.914 45.776 45.645 45.531 45.469 45.252 45.201 45.107 44.99 44.77 44.65 44.489 44.301 44.085 43.826 43.452 42.23 -6 ,9700 ,KEBNE ,16708075,Fri Nov 26 15:25:20 CET,Fri Nov 26 16:56:15 CET,0.0 1.236 1.608 1.867 2.089 2.292 2.479 2.658 2.986 3.151 3.321 3.457 3.777 3.914 4.165 4.431 4.681 4.792 4.999 5.204 5.519 5.728 5.933 6.221 6.504 6.799 7.103 7.404 7.793 8.165 8.505 8.912 9.299 9.667 10.092 10.587 11.113 11.702 12.323 12.997 13.7 14.509 15.496 16.519 17.733 19.106 20.779 22.777 25.207 28.223 32.244 35.861 38.135 39.748 40.908 41.789 42.437 42.934 43.295 43.59 43.815 43.987 44.106 44.177 44.235 44.283 44.326 44.348 44.339 44.316 44.294 44.267 44.228 44.163 44.086 44.011 43.937 43.864 43.793 43.734 43.668 43.562 43.487 43.388 43.333 43.223 43.116 42.985 42.904 42.69 42.627 42.52 42.406 42.158 42.007 41.836 41.655 41.462 41.232 40.91 39.275 -7 ,4203 ,KEBNE ,16708076,Fri Nov 26 15:25:25 CET,Fri Nov 26 16:53:54 CET,0.0 0.958 1.323 1.618 1.871 2.105 2.298 2.48 2.818 2.97 3.125 3.258 3.586 3.736 4.017 4.276 4.519 4.635 4.865 5.105 5.458 5.669 5.88 6.215 6.546 6.865 7.177 7.473 7.822 8.173 8.528 8.945 9.352 9.765 10.256 10.796 11.307 11.885 12.536 13.245 13.994 14.864 15.915 16.988 18.301 19.804 21.562 23.654 26.267 29.511 33.763 37.719 40.333 42.174 43.47 44.448 45.188 45.752 46.179 46.56 46.866 47.069 47.172 47.264 47.36 47.435 47.481 47.511 47.549 47.581 47.588 47.588 47.604 47.595 47.568 47.536 47.471 47.374 47.302 47.274 47.236 47.169 47.109 47.041 47.011 46.928 46.801 46.643 46.567 46.363 46.33 46.239 46.13 45.892 45.745 45.57 45.381 45.189 44.97 44.665 43.312 -8 ,6334 ,KEBNE ,16708077,Fri Nov 26 15:25:25 CET,Fri Nov 26 16:51:36 CET,0.0 0.962 1.375 1.733 2.055 2.33 2.567 2.772 3.154 3.336 3.517 3.692 4.036 4.19 4.469 4.73 4.987 5.122 5.383 5.604 5.939 6.171 6.384 6.692 6.986 7.293 7.601 7.886 8.256 8.62 8.985 9.444 9.878 10.273 10.737 11.299 11.857 12.487 13.176 13.899 14.661 15.524 16.564 17.622 18.858 20.326 22.118 24.187 26.762 30.033 34.289 38.238 40.829 42.619 43.879 44.808 45.525 46.103 46.545 46.932 47.199 47.409 47.607 47.788 47.921 48.004 48.086 48.155 48.192 48.233 48.289 48.309 48.307 48.276 48.227 48.156 48.094 48.045 47.965 47.902 47.848 47.73 47.621 47.536 47.49 47.398 47.328 47.245 47.193 46.999 46.956 46.863 46.778 46.581 46.448 46.295 46.14 45.922 45.614 45.198 43.471 -9 ,2255 ,KEBNE ,16708078,Fri Nov 26 15:27:23 CET,Fri Nov 26 16:58:39 CET,0.0 0.995 1.377 1.649 1.899 2.151 2.367 2.564 2.955 3.139 3.308 3.452 3.794 3.945 4.224 4.496 4.762 4.887 5.124 5.371 5.74 5.98 6.216 6.571 6.903 7.19 7.466 7.763 8.195 8.627 9.033 9.507 9.945 10.363 10.848 11.394 11.93 12.53 13.183 13.881 14.63 15.504 16.561 17.631 18.909 20.381 22.125 24.199 26.848 30.158 34.359 38.211 40.807 42.636 43.837 44.692 45.408 45.98 46.343 46.617 46.791 46.92 47.059 47.129 47.103 47.068 47.064 47.066 47.039 46.983 46.921 46.881 46.826 46.738 46.674 46.618 46.536 46.447 46.368 46.308 46.24 46.117 46.022 45.908 45.846 45.72 45.563 45.376 45.28 45.036 44.963 44.844 44.706 44.41 44.244 44.048 43.825 43.569 43.277 42.901 41.229 -10 ,31928 ,KEBNE ,16708079,Fri Nov 26 15:27:23 CET,Fri Nov 26 16:58:32 CET,0.0 0.805 1.127 1.392 1.617 1.821 2.015 2.2 2.527 2.678 2.825 2.939 3.258 3.386 3.613 3.831 4.052 4.171 4.416 4.633 4.95 5.166 5.383 5.697 6.002 6.292 6.578 6.85 7.185 7.518 7.849 8.26 8.673 9.078 9.536 10.055 10.596 11.218 11.905 12.665 13.46 14.348 15.39 16.469 17.773 19.271 21.055 23.12 25.658 28.931 33.211 37.109 39.681 41.462 42.764 43.768 44.5 45.07 45.512 45.858 46.08 46.236 46.34 46.394 46.436 46.474 46.487 46.456 46.406 46.371 46.336 46.299 46.256 46.183 46.113 46.017 45.916 45.833 45.758 45.703 45.637 45.501 45.404 45.315 45.264 45.161 45.041 44.887 44.8 44.589 44.56 44.464 44.358 44.14 44.008 43.852 43.641 43.361 43.054 42.678 41.117 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_254_251.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_254_251.txt deleted file mode 100644 index 93b224ea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_254_251.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32047 ,KEBNE ,16708080,Fri Nov 26 15:27:23 CET,Fri Nov 26 16:59:28 CET,0.0 1.104 1.485 1.769 1.998 2.178 2.341 2.491 2.76 2.887 3.01 3.074 3.36 3.461 3.662 3.853 4.028 4.116 4.302 4.481 4.746 4.896 5.015 5.216 5.424 5.616 5.814 6.0 6.203 6.4 6.605 6.852 7.093 7.321 7.602 7.937 8.237 8.506 8.722 8.889 9.114 9.376 9.649 9.917 10.131 10.325 10.519 10.679 10.73 10.535 9.893 8.895 7.951 7.074 6.259 5.469 4.758 4.129 3.604 3.033 2.5 2.02 1.501 0.974 0.529 0.141 -0.27 -0.626 -0.922 -1.23 -1.56 -1.82 -2.098 -2.435 -2.695 -2.942 -3.17 -3.398 -3.652 -3.831 -4.003 -4.323 -4.553 -4.759 -4.88 -5.156 -5.427 -5.709 -5.86 -6.209 -6.348 -6.503 -6.666 -7.038 -7.266 -7.531 -7.824 -8.14 -8.566 -9.163 -11.537 -2 ,10375 ,KEBNE ,16708081,Fri Nov 26 15:27:23 CET,Fri Nov 26 16:59:00 CET,0.0 1.113 1.483 1.749 1.958 2.135 2.293 2.443 2.726 2.855 2.972 2.998 3.269 3.372 3.573 3.745 3.886 3.957 4.111 4.268 4.476 4.6 4.718 4.891 5.057 5.218 5.371 5.493 5.658 5.822 5.955 6.097 6.226 6.368 6.526 6.688 6.85 7.016 7.182 7.359 7.546 7.739 7.932 8.108 8.297 8.453 8.548 8.615 8.583 8.333 7.751 6.734 5.713 4.811 4.0 3.221 2.546 1.95 1.439 0.933 0.483 0.034 -0.424 -0.825 -1.194 -1.571 -1.984 -2.353 -2.662 -2.971 -3.298 -3.574 -3.862 -4.172 -4.408 -4.642 -4.887 -5.136 -5.417 -5.634 -5.867 -6.251 -6.501 -6.724 -6.835 -7.055 -7.286 -7.557 -7.714 -8.062 -8.207 -8.378 -8.558 -8.91 -9.103 -9.335 -9.615 -9.949 -10.359 -10.884 -12.966 -3 ,31809 ,KEBNE ,16708082,Fri Nov 26 15:27:23 CET,Fri Nov 26 16:58:55 CET,0.0 2.176 2.637 2.943 3.178 3.389 3.582 3.765 4.106 4.252 4.383 4.445 4.731 4.826 5.027 5.233 5.422 5.514 5.683 5.822 6.006 6.132 6.273 6.48 6.672 6.851 6.998 7.126 7.283 7.448 7.615 7.788 7.947 8.099 8.26 8.442 8.621 8.797 8.986 9.236 9.52 9.746 9.939 10.132 10.339 10.509 10.632 10.751 10.783 10.633 10.065 9.12 8.258 7.41 6.653 5.983 5.39 4.847 4.362 3.827 3.362 2.98 2.624 2.293 1.977 1.686 1.371 1.055 0.786 0.534 0.275 0.059 -0.185 -0.442 -0.642 -0.855 -1.057 -1.252 -1.465 -1.623 -1.787 -2.055 -2.249 -2.439 -2.535 -2.734 -2.953 -3.19 -3.305 -3.604 -3.69 -3.851 -4.026 -4.383 -4.563 -4.78 -5.055 -5.382 -5.783 -6.388 -8.644 -4 ,18159 ,KEBNE ,16708083,Fri Nov 26 15:27:31 CET,Fri Nov 26 16:55:17 CET,0.0 1.178 1.546 1.833 2.071 2.279 2.481 2.658 2.938 3.057 3.164 3.183 3.468 3.578 3.763 3.931 4.079 4.156 4.312 4.452 4.66 4.795 4.934 5.149 5.345 5.535 5.719 5.881 6.07 6.261 6.442 6.636 6.821 6.993 7.166 7.343 7.515 7.722 7.934 8.141 8.383 8.62 8.847 9.068 9.27 9.451 9.623 9.722 9.737 9.568 9.071 8.16 7.251 6.42 5.656 4.946 4.321 3.769 3.295 2.807 2.385 2.013 1.67 1.323 0.983 0.681 0.335 -0.006 -0.302 -0.6 -0.895 -1.14 -1.4 -1.684 -1.907 -2.108 -2.307 -2.517 -2.758 -2.93 -3.096 -3.373 -3.57 -3.757 -3.873 -4.12 -4.332 -4.548 -4.663 -4.985 -5.079 -5.222 -5.375 -5.731 -5.964 -6.228 -6.497 -6.819 -7.224 -7.757 -9.363 -5 ,14943 ,KEBNE ,16708084,Fri Nov 26 15:27:31 CET,Fri Nov 26 16:54:54 CET,0.0 1.791 2.203 2.525 2.789 3.023 3.234 3.409 3.735 3.883 4.03 4.117 4.414 4.534 4.763 4.969 5.15 5.242 5.428 5.601 5.837 5.978 6.1 6.25 6.399 6.553 6.701 6.84 7.016 7.204 7.398 7.627 7.839 8.022 8.208 8.399 8.584 8.784 8.973 9.184 9.397 9.594 9.821 10.039 10.25 10.454 10.648 10.787 10.825 10.76 10.361 9.54 8.683 7.861 7.126 6.459 5.852 5.321 4.853 4.352 3.889 3.447 3.034 2.621 2.253 1.937 1.601 1.304 1.005 0.666 0.316 0.027 -0.272 -0.584 -0.834 -1.102 -1.376 -1.649 -1.903 -2.062 -2.242 -2.541 -2.75 -2.969 -3.09 -3.349 -3.596 -3.841 -3.979 -4.324 -4.499 -4.674 -4.838 -5.215 -5.467 -5.758 -6.03 -6.311 -6.635 -7.12 -8.984 -6 ,23564 ,KEBNE ,16708085,Fri Nov 26 15:28:24 CET,Fri Nov 26 17:00:15 CET,0.0 1.384 1.835 2.191 2.492 2.749 2.985 3.174 3.489 3.636 3.767 3.836 4.131 4.241 4.47 4.689 4.888 4.98 5.138 5.276 5.472 5.595 5.703 5.843 6.001 6.163 6.314 6.468 6.651 6.828 6.983 7.155 7.334 7.512 7.703 7.885 8.064 8.257 8.46 8.676 8.89 9.097 9.311 9.524 9.754 9.946 10.104 10.22 10.309 10.246 9.704 8.735 7.794 6.95 6.164 5.447 4.845 4.304 3.832 3.306 2.834 2.415 2.036 1.672 1.299 0.972 0.639 0.344 0.09 -0.178 -0.458 -0.678 -0.914 -1.156 -1.331 -1.526 -1.777 -2.086 -2.357 -2.525 -2.708 -2.975 -3.144 -3.331 -3.436 -3.656 -3.915 -4.182 -4.32 -4.64 -4.702 -4.85 -5.01 -5.345 -5.557 -5.79 -6.035 -6.344 -6.719 -7.253 -10.621 -7 ,20209 ,KEBNE ,16708086,Fri Nov 26 15:28:24 CET,Fri Nov 26 17:01:53 CET,0.0 1.033 1.387 1.639 1.857 2.053 2.228 2.375 2.62 2.734 2.857 2.913 3.202 3.309 3.49 3.663 3.824 3.893 4.024 4.151 4.339 4.466 4.584 4.746 4.907 5.053 5.198 5.345 5.515 5.691 5.864 6.05 6.209 6.351 6.502 6.7 6.879 7.032 7.202 7.364 7.528 7.733 7.962 8.17 8.4 8.612 8.782 8.899 8.946 8.83 8.333 7.436 6.518 5.704 4.992 4.328 3.729 3.122 2.574 2.083 1.676 1.275 0.885 0.527 0.188 -0.121 -0.464 -0.778 -1.037 -1.319 -1.598 -1.835 -2.107 -2.373 -2.568 -2.766 -2.986 -3.236 -3.493 -3.681 -3.87 -4.151 -4.352 -4.551 -4.644 -4.839 -5.069 -5.308 -5.425 -5.744 -5.861 -6.015 -6.19 -6.586 -6.82 -7.065 -7.337 -7.651 -8.012 -8.496 -10.331 -8 ,31395 ,KEBNE ,16708087,Fri Nov 26 15:28:24 CET,Fri Nov 26 17:00:14 CET,0.0 1.524 1.89 2.141 2.336 2.514 2.684 2.839 3.109 3.247 3.387 3.47 3.762 3.865 4.055 4.232 4.406 4.497 4.669 4.825 5.062 5.197 5.3 5.433 5.58 5.737 5.873 5.996 6.166 6.357 6.539 6.727 6.893 7.024 7.167 7.356 7.556 7.762 7.971 8.176 8.365 8.556 8.755 8.925 9.095 9.279 9.439 9.518 9.499 9.31 8.681 7.659 6.668 5.797 5.076 4.379 3.747 3.177 2.7 2.252 1.849 1.48 1.133 0.793 0.452 0.15 -0.144 -0.405 -0.627 -0.882 -1.155 -1.368 -1.614 -1.879 -2.074 -2.272 -2.48 -2.691 -2.896 -3.06 -3.23 -3.449 -3.604 -3.778 -3.875 -4.1 -4.333 -4.563 -4.688 -5.005 -5.089 -5.225 -5.394 -5.793 -6.022 -6.296 -6.603 -6.899 -7.229 -7.732 -9.492 -9 ,48 ,KEBNE ,16708088,Fri Nov 26 15:28:24 CET,Fri Nov 26 17:00:27 CET,0.0 0.994 1.284 1.526 1.731 1.891 2.041 2.179 2.431 2.551 2.652 2.66 2.922 3.011 3.185 3.354 3.514 3.587 3.735 3.871 4.065 4.195 4.315 4.478 4.623 4.744 4.852 4.959 5.101 5.24 5.39 5.568 5.743 5.927 6.097 6.289 6.5 6.724 6.981 7.267 7.534 7.812 8.123 8.433 8.782 9.129 9.476 9.741 9.826 9.67 9.127 8.066 6.886 5.8 4.894 4.071 3.373 2.8 2.316 1.838 1.434 1.082 0.724 0.358 0.02 -0.297 -0.622 -0.883 -1.113 -1.375 -1.645 -1.862 -2.087 -2.309 -2.503 -2.75 -3.002 -3.221 -3.432 -3.583 -3.733 -3.984 -4.176 -4.393 -4.511 -4.746 -4.998 -5.273 -5.411 -5.732 -5.87 -6.046 -6.217 -6.591 -6.811 -7.072 -7.356 -7.657 -8.04 -8.598 -11.024 -10 ,541 ,KEBNE ,16708089,Fri Nov 26 15:29:25 CET,Fri Nov 26 17:01:33 CET,0.0 2.0 2.41 2.691 2.913 3.102 3.276 3.45 3.757 3.886 4.001 4.054 4.341 4.446 4.632 4.793 4.963 5.054 5.231 5.394 5.612 5.745 5.879 6.094 6.295 6.472 6.638 6.781 6.951 7.129 7.331 7.589 7.802 7.979 8.215 8.497 8.789 9.096 9.343 9.589 9.836 10.15 10.525 10.867 11.222 11.549 11.82 11.934 11.952 11.761 11.102 10.106 9.133 8.231 7.413 6.663 5.989 5.387 4.894 4.378 3.906 3.505 3.143 2.74 2.312 1.93 1.506 1.114 0.795 0.466 0.121 -0.177 -0.485 -0.806 -1.066 -1.334 -1.604 -1.885 -2.172 -2.373 -2.583 -2.904 -3.13 -3.35 -3.454 -3.673 -3.917 -4.186 -4.329 -4.659 -4.779 -4.932 -5.111 -5.522 -5.741 -5.988 -6.293 -6.613 -7.013 -7.668 -9.766 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_254_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_254_252.txt deleted file mode 100644 index dd0c3ca0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_254_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12069 ,KEBNE ,17125973,Thu Dec 30 17:02:47 CET,Thu Dec 30 18:37:10 CET,0.0 0.668 0.905 1.106 1.25 1.363 1.474 1.567 1.706 1.756 1.802 1.724 1.954 1.998 2.045 2.086 2.125 2.145 2.195 2.25 2.313 2.336 2.358 2.414 2.444 2.435 2.422 2.396 2.365 2.327 2.266 2.191 2.129 2.075 1.992 1.856 1.696 1.505 1.284 1.045 0.779 0.44 -0.006 -0.533 -1.245 -2.14 -3.324 -4.816 -6.827 -9.715 -14.107 -18.912 -22.634 -25.782 -28.396 -30.637 -32.566 -34.18 -35.467 -36.747 -37.84 -38.789 -39.689 -40.492 -41.207 -41.866 -42.552 -43.168 -43.707 -44.246 -44.82 -45.283 -45.722 -46.179 -46.519 -46.886 -47.312 -47.769 -48.268 -48.601 -48.907 -49.371 -49.682 -50.018 -50.198 -50.531 -50.899 -51.348 -51.584 -52.051 -52.314 -52.561 -52.805 -53.313 -53.613 -53.974 -54.358 -54.774 -55.229 -55.83 -57.942 -2 ,22423 ,KEBNE ,17125974,Thu Dec 30 17:02:45 CET,Thu Dec 30 18:37:10 CET,0.0 0.722 0.965 1.122 1.251 1.36 1.459 1.541 1.688 1.762 1.826 1.749 1.966 1.996 2.03 2.067 2.111 2.126 2.148 2.173 2.208 2.232 2.247 2.254 2.259 2.259 2.262 2.267 2.266 2.258 2.231 2.211 2.199 2.144 2.062 1.977 1.885 1.739 1.536 1.286 1.014 0.707 0.294 -0.2 -0.875 -1.748 -2.917 -4.45 -6.439 -9.15 -13.462 -18.282 -21.899 -24.832 -27.228 -29.23 -30.975 -32.536 -33.83 -35.085 -36.128 -37.035 -37.857 -38.62 -39.377 -40.041 -40.689 -41.275 -41.778 -42.315 -42.904 -43.406 -43.961 -44.547 -44.958 -45.362 -45.779 -46.205 -46.652 -46.953 -47.249 -47.715 -48.043 -48.403 -48.588 -48.964 -49.354 -49.736 -49.932 -50.378 -50.616 -50.868 -51.128 -51.679 -51.985 -52.299 -52.65 -53.032 -53.453 -54.038 -56.602 -3 ,29914 ,KEBNE ,17125975,Thu Dec 30 17:02:44 CET,Thu Dec 30 18:36:25 CET,0.0 0.72 0.969 1.126 1.262 1.397 1.498 1.567 1.692 1.755 1.826 1.791 2.023 2.066 2.125 2.184 2.245 2.264 2.293 2.318 2.334 2.353 2.369 2.391 2.415 2.414 2.397 2.385 2.357 2.309 2.279 2.27 2.221 2.127 2.012 1.888 1.762 1.591 1.374 1.13 0.875 0.542 0.124 -0.321 -0.961 -1.78 -2.89 -4.399 -6.468 -9.36 -13.842 -18.782 -22.616 -25.887 -28.647 -30.962 -32.858 -34.497 -35.896 -37.272 -38.455 -39.491 -40.439 -41.337 -42.151 -42.851 -43.62 -44.322 -44.9 -45.494 -46.109 -46.615 -47.14 -47.686 -48.086 -48.506 -48.965 -49.432 -49.887 -50.188 -50.498 -51.015 -51.397 -51.782 -51.976 -52.378 -52.771 -53.157 -53.359 -53.791 -53.997 -54.24 -54.487 -55.044 -55.364 -55.706 -56.066 -56.434 -56.882 -57.493 -59.524 -4 ,14998 ,KEBNE ,17125976,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:56 CET,0.0 0.685 0.918 1.093 1.232 1.356 1.455 1.543 1.712 1.781 1.839 1.781 2.015 2.062 2.144 2.217 2.304 2.346 2.402 2.431 2.475 2.5 2.509 2.521 2.533 2.538 2.529 2.516 2.491 2.454 2.427 2.383 2.323 2.267 2.194 2.098 1.987 1.869 1.706 1.458 1.203 0.912 0.51 0.008 -0.696 -1.59 -2.752 -4.223 -6.192 -9.041 -13.47 -18.29 -22.102 -25.169 -27.656 -29.865 -31.716 -33.293 -34.605 -35.879 -36.945 -37.863 -38.756 -39.59 -40.327 -40.994 -41.71 -42.356 -42.932 -43.518 -44.102 -44.591 -45.097 -45.642 -46.07 -46.507 -46.936 -47.334 -47.749 -48.047 -48.351 -48.822 -49.156 -49.507 -49.684 -50.04 -50.416 -50.819 -51.023 -51.46 -51.685 -51.922 -52.162 -52.717 -53.013 -53.313 -53.632 -53.997 -54.421 -54.944 -56.27 -5 ,27575 ,KEBNE ,17125977,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:37:06 CET,0.0 0.734 0.994 1.181 1.339 1.469 1.581 1.67 1.834 1.908 1.955 1.863 2.085 2.127 2.205 2.267 2.329 2.353 2.388 2.407 2.439 2.465 2.477 2.484 2.498 2.502 2.498 2.489 2.461 2.429 2.402 2.374 2.323 2.264 2.191 2.08 1.955 1.804 1.65 1.457 1.179 0.813 0.374 -0.112 -0.785 -1.621 -2.708 -4.128 -6.075 -8.836 -13.096 -17.718 -21.253 -24.152 -26.604 -28.715 -30.481 -32.047 -33.352 -34.578 -35.61 -36.564 -37.468 -38.29 -39.03 -39.684 -40.34 -40.91 -41.423 -41.975 -42.54 -42.995 -43.441 -43.888 -44.245 -44.613 -44.99 -45.397 -45.819 -46.093 -46.367 -46.809 -47.122 -47.441 -47.607 -47.956 -48.309 -48.674 -48.869 -49.303 -49.492 -49.708 -49.95 -50.491 -50.792 -51.136 -51.511 -51.904 -52.35 -52.975 -55.153 -6 ,7045 ,KEBNE ,17125978,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:02 CET,0.0 0.78 1.029 1.194 1.325 1.424 1.514 1.607 1.771 1.837 1.903 1.86 2.097 2.15 2.227 2.303 2.383 2.423 2.493 2.552 2.64 2.693 2.736 2.76 2.752 2.747 2.741 2.729 2.715 2.691 2.681 2.679 2.676 2.632 2.526 2.392 2.244 2.061 1.849 1.605 1.295 0.933 0.488 -0.011 -0.671 -1.529 -2.623 -4.091 -6.14 -8.976 -13.297 -18.059 -21.79 -24.826 -27.294 -29.474 -31.353 -32.97 -34.385 -35.769 -36.871 -37.808 -38.727 -39.615 -40.436 -41.173 -41.921 -42.587 -43.165 -43.748 -44.326 -44.789 -45.281 -45.801 -46.215 -46.637 -47.065 -47.528 -47.997 -48.304 -48.62 -49.109 -49.444 -49.793 -49.978 -50.351 -50.727 -51.144 -51.355 -51.795 -52.012 -52.247 -52.491 -53.008 -53.296 -53.592 -53.925 -54.329 -54.803 -55.463 -57.717 -7 ,23766 ,KEBNE ,17125979,Thu Dec 30 17:02:44 CET,Thu Dec 30 18:36:05 CET,0.0 0.896 1.149 1.292 1.387 1.475 1.561 1.644 1.798 1.861 1.921 1.843 2.062 2.105 2.174 2.255 2.32 2.346 2.401 2.431 2.462 2.486 2.513 2.563 2.598 2.617 2.643 2.68 2.705 2.697 2.661 2.608 2.55 2.468 2.358 2.227 2.086 1.912 1.695 1.435 1.136 0.757 0.271 -0.244 -0.894 -1.758 -2.915 -4.426 -6.473 -9.324 -13.81 -18.707 -22.286 -25.135 -27.573 -29.655 -31.425 -32.991 -34.258 -35.539 -36.677 -37.643 -38.525 -39.366 -40.145 -40.791 -41.432 -42.021 -42.521 -43.038 -43.598 -44.068 -44.558 -45.037 -45.365 -45.695 -46.053 -46.446 -46.858 -47.136 -47.411 -47.832 -48.134 -48.45 -48.617 -48.961 -49.296 -49.657 -49.86 -50.302 -50.502 -50.715 -50.954 -51.47 -51.748 -52.051 -52.37 -52.734 -53.15 -53.749 -54.933 -8 ,18003 ,KEBNE ,17125980,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:37:11 CET,0.0 0.723 0.964 1.125 1.249 1.352 1.453 1.537 1.645 1.707 1.778 1.681 1.889 1.929 2.0 2.051 2.096 2.125 2.199 2.255 2.297 2.311 2.336 2.379 2.394 2.42 2.44 2.45 2.469 2.494 2.488 2.421 2.347 2.302 2.263 2.221 2.138 1.999 1.823 1.578 1.3 0.955 0.5 -0.02 -0.707 -1.554 -2.646 -4.068 -6.022 -8.779 -13.043 -17.696 -21.313 -24.204 -26.578 -28.681 -30.438 -31.947 -33.209 -34.462 -35.545 -36.521 -37.401 -38.158 -38.864 -39.495 -40.124 -40.699 -41.193 -41.702 -42.247 -42.683 -43.118 -43.589 -43.955 -44.313 -44.683 -45.054 -45.442 -45.729 -46.023 -46.469 -46.79 -47.112 -47.28 -47.647 -48.018 -48.387 -48.589 -49.028 -49.244 -49.476 -49.711 -50.215 -50.489 -50.781 -51.12 -51.514 -51.974 -52.598 -54.682 -9 ,30339 ,KEBNE ,17125981,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:35:37 CET,0.0 0.707 0.911 1.065 1.198 1.31 1.412 1.499 1.651 1.713 1.763 1.678 1.896 1.937 1.997 2.045 2.106 2.14 2.189 2.224 2.271 2.308 2.343 2.385 2.427 2.457 2.465 2.476 2.475 2.457 2.456 2.425 2.369 2.305 2.207 2.077 1.929 1.783 1.635 1.463 1.259 0.961 0.52 -0.023 -0.71 -1.554 -2.685 -4.16 -6.205 -9.196 -13.958 -19.101 -22.957 -26.054 -28.678 -30.939 -32.856 -34.563 -35.974 -37.333 -38.478 -39.484 -40.424 -41.297 -42.072 -42.742 -43.417 -44.027 -44.561 -45.1 -45.66 -46.13 -46.62 -47.138 -47.52 -47.88 -48.247 -48.646 -49.065 -49.346 -49.635 -50.09 -50.411 -50.735 -50.895 -51.217 -51.561 -51.924 -52.106 -52.544 -52.755 -52.973 -53.2 -53.702 -53.971 -54.278 -54.633 -55.033 -55.517 -56.159 -58.473 -10 ,23747 ,KEBNE ,17125982,Thu Dec 30 17:02:43 CET,Thu Dec 30 18:36:33 CET,0.0 0.722 0.99 1.168 1.301 1.418 1.523 1.609 1.757 1.829 1.89 1.814 2.044 2.107 2.206 2.269 2.33 2.368 2.436 2.484 2.53 2.546 2.584 2.644 2.685 2.736 2.767 2.764 2.755 2.761 2.753 2.704 2.682 2.663 2.583 2.476 2.37 2.246 2.096 1.902 1.652 1.334 0.94 0.505 -0.086 -0.887 -2.001 -3.501 -5.587 -8.557 -13.226 -18.401 -22.301 -25.363 -27.925 -30.182 -32.084 -33.801 -35.252 -36.579 -37.64 -38.574 -39.453 -40.278 -41.031 -41.713 -42.43 -43.038 -43.575 -44.149 -44.727 -45.179 -45.631 -46.065 -46.4 -46.769 -47.168 -47.594 -48.028 -48.33 -48.663 -49.173 -49.509 -49.865 -50.046 -50.412 -50.813 -51.218 -51.42 -51.867 -52.08 -52.329 -52.601 -53.12 -53.382 -53.686 -54.034 -54.435 -54.905 -55.562 -58.561 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_256_67.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_256_67.txt deleted file mode 100644 index 5db6a89e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_256_67.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8117 ,KEBNE ,16708090,Fri Nov 26 15:29:28 CET,Fri Nov 26 16:58:53 CET,0.0 1.073 1.557 1.958 2.317 2.659 2.975 3.268 3.826 4.095 4.361 4.638 5.126 5.375 5.863 6.333 6.803 7.036 7.479 7.917 8.573 9.007 9.441 10.101 10.759 11.399 12.031 12.664 13.505 14.339 15.143 16.118 17.095 18.06 19.242 20.637 21.978 23.477 25.174 27.036 29.049 31.445 34.34 37.346 41.038 45.414 50.777 57.26 65.424 75.904 90.46 104.62 114.293 121.408 126.793 131.11 134.555 137.446 139.767 141.892 143.59 144.99 146.221 147.311 148.275 149.066 149.787 150.434 151.003 151.532 152.014 152.388 152.76 153.139 153.417 153.674 153.919 154.177 154.433 154.587 154.726 154.908 155.032 155.154 155.207 155.303 155.369 155.421 155.445 155.381 155.473 155.471 155.465 155.392 155.336 155.255 155.138 155.006 154.806 154.496 153.0 -2 ,12586 ,KEBNE ,16708091,Fri Nov 26 15:30:25 CET,Fri Nov 26 17:00:50 CET,0.0 1.444 1.95 2.351 2.688 3.002 3.3 3.587 4.142 4.409 4.671 4.953 5.447 5.697 6.191 6.677 7.146 7.374 7.824 8.274 8.941 9.372 9.796 10.428 11.053 11.669 12.275 12.869 13.669 14.462 15.253 16.253 17.232 18.214 19.396 20.758 22.086 23.588 25.292 27.139 29.128 31.477 34.39 37.464 41.16 45.514 50.86 57.3 65.418 75.936 90.546 104.813 114.635 121.82 127.178 131.444 134.792 137.561 139.794 141.873 143.54 144.934 146.171 147.255 148.202 149.021 149.826 150.461 150.985 151.525 152.03 152.424 152.819 153.197 153.466 153.737 153.993 154.219 154.445 154.599 154.753 154.982 155.121 155.251 155.314 155.428 155.52 155.584 155.605 155.548 155.643 155.649 155.654 155.582 155.51 155.443 155.369 155.267 155.115 154.85 153.375 -3 ,15713 ,KEBNE ,16708092,Fri Nov 26 15:30:29 CET,Fri Nov 26 17:00:16 CET,0.0 1.149 1.59 1.964 2.304 2.618 2.917 3.207 3.773 4.053 4.326 4.601 5.098 5.351 5.843 6.326 6.8 7.035 7.492 7.936 8.612 9.058 9.493 10.151 10.798 11.43 12.05 12.668 13.494 14.305 15.12 16.133 17.126 18.111 19.305 20.688 22.041 23.592 25.342 27.277 29.394 31.858 34.866 38.022 41.839 46.334 51.829 58.429 66.791 77.618 92.585 107.19 117.209 124.559 130.082 134.483 137.941 140.746 142.936 144.944 146.534 147.803 148.906 149.918 150.798 151.528 152.232 152.812 153.281 153.748 154.236 154.634 155.018 155.392 155.675 155.945 156.196 156.434 156.656 156.803 156.962 157.187 157.308 157.412 157.449 157.492 157.548 157.588 157.583 157.502 157.568 157.552 157.533 157.441 157.374 157.271 157.117 156.942 156.701 156.265 154.442 -4 ,24675 ,KEBNE ,16708093,Fri Nov 26 15:30:30 CET,Fri Nov 26 16:55:59 CET,0.0 1.387 1.823 2.192 2.537 2.86 3.163 3.446 3.978 4.243 4.5 4.752 5.235 5.481 5.961 6.43 6.883 7.104 7.547 7.991 8.664 9.114 9.549 10.186 10.831 11.464 12.08 12.68 13.464 14.245 15.026 16.003 16.978 17.958 19.136 20.477 21.819 23.372 25.106 26.996 29.055 31.482 34.459 37.584 41.335 45.694 51.046 57.561 65.832 76.623 91.417 105.559 115.242 122.393 127.763 131.983 135.316 138.094 140.231 142.219 143.862 145.201 146.391 147.483 148.495 149.369 150.197 150.867 151.406 151.932 152.463 152.86 153.232 153.601 153.859 154.114 154.348 154.555 154.761 154.906 155.044 155.238 155.354 155.464 155.52 155.605 155.687 155.783 155.832 155.804 155.948 155.959 155.954 155.911 155.865 155.782 155.677 155.574 155.423 155.13 153.575 -5 ,29642 ,KEBNE ,16708094,Fri Nov 26 15:30:29 CET,Fri Nov 26 17:01:07 CET,0.0 1.201 1.67 2.054 2.399 2.73 3.034 3.31 3.847 4.116 4.386 4.672 5.166 5.408 5.874 6.344 6.815 7.049 7.513 7.969 8.652 9.092 9.528 10.184 10.838 11.485 12.126 12.753 13.576 14.385 15.178 16.176 17.173 18.147 19.289 20.608 21.937 23.447 25.102 26.928 28.929 31.278 34.154 37.232 40.99 45.314 50.685 57.204 65.35 75.9 90.555 104.777 114.522 121.694 127.133 131.486 134.802 137.506 139.725 141.842 143.531 144.886 146.102 147.184 148.111 148.928 149.762 150.411 150.903 151.424 151.955 152.366 152.767 153.158 153.447 153.704 153.946 154.199 154.45 154.598 154.731 154.946 155.09 155.219 155.279 155.387 155.473 155.529 155.545 155.479 155.537 155.52 155.51 155.471 155.427 155.371 155.276 155.153 155.011 154.726 153.39 -6 ,8290 ,KEBNE ,16708095,Fri Nov 26 15:30:26 CET,Fri Nov 26 17:01:03 CET,0.0 1.281 1.783 2.19 2.557 2.899 3.211 3.509 4.073 4.339 4.598 4.868 5.363 5.617 6.104 6.581 7.055 7.29 7.758 8.215 8.875 9.3 9.726 10.362 10.985 11.6 12.212 12.822 13.646 14.476 15.293 16.299 17.287 18.253 19.408 20.771 22.157 23.732 25.483 27.39 29.448 31.864 34.807 37.925 41.721 46.108 51.47 57.95 66.087 76.631 91.256 105.374 115.087 122.327 127.837 132.229 135.715 138.587 140.876 143.0 144.681 146.054 147.262 148.326 149.24 149.99 150.729 151.383 151.938 152.475 152.993 153.427 153.855 154.251 154.547 154.818 155.057 155.286 155.494 155.638 155.79 155.992 156.113 156.243 156.305 156.4 156.481 156.558 156.59 156.546 156.678 156.688 156.693 156.675 156.628 156.556 156.471 156.342 156.147 155.84 154.493 -7 ,11830 ,KEBNE ,16708096,Fri Nov 26 15:30:26 CET,Fri Nov 26 17:00:11 CET,0.0 1.028 1.468 1.852 2.208 2.534 2.828 3.105 3.658 3.928 4.185 4.448 4.934 5.175 5.651 6.125 6.582 6.805 7.247 7.688 8.333 8.759 9.19 9.841 10.483 11.119 11.753 12.379 13.202 14.017 14.823 15.817 16.805 17.805 19.005 20.375 21.731 23.259 24.957 26.832 28.866 31.229 34.089 37.134 40.854 45.208 50.494 56.842 64.997 75.668 90.382 104.685 114.558 121.815 127.355 131.786 135.278 138.224 140.595 142.756 144.469 145.887 147.104 148.211 149.219 150.049 150.852 151.556 152.131 152.662 153.195 153.632 154.04 154.401 154.656 154.922 155.198 155.462 155.703 155.849 155.995 156.216 156.351 156.477 156.543 156.688 156.817 156.906 156.941 156.888 156.969 156.979 156.974 156.93 156.906 156.872 156.804 156.692 156.536 156.29 155.015 -8 ,10739 ,KEBNE ,16708097,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:01:08 CET,0.0 1.309 1.791 2.171 2.523 2.862 3.182 3.472 4.029 4.306 4.581 4.867 5.355 5.595 6.072 6.558 7.038 7.269 7.713 8.15 8.814 9.263 9.702 10.363 11.029 11.672 12.309 12.948 13.774 14.581 15.383 16.365 17.349 18.333 19.511 20.883 22.232 23.742 25.456 27.354 29.398 31.784 34.672 37.736 41.483 45.876 51.271 57.711 65.808 76.44 91.386 106.036 116.068 123.396 128.868 133.17 136.642 139.492 141.706 143.757 145.39 146.758 147.964 149.024 149.972 150.762 151.541 152.204 152.757 153.319 153.834 154.24 154.652 155.015 155.269 155.528 155.797 156.039 156.256 156.404 156.531 156.712 156.841 156.952 157.0 157.117 157.24 157.325 157.36 157.326 157.455 157.459 157.45 157.411 157.374 157.299 157.197 157.076 156.881 156.566 154.869 -9 ,17281 ,KEBNE ,16708098,Fri Nov 26 15:30:26 CET,Fri Nov 26 17:01:14 CET,0.0 1.107 1.634 2.043 2.396 2.713 3.014 3.301 3.856 4.136 4.41 4.691 5.192 5.445 5.94 6.428 6.922 7.168 7.65 8.116 8.806 9.259 9.698 10.357 11.001 11.624 12.242 12.859 13.674 14.47 15.254 16.232 17.201 18.152 19.291 20.621 21.952 23.477 25.181 27.073 29.138 31.534 34.464 37.546 41.326 45.766 51.148 57.671 65.903 76.588 91.427 105.899 115.909 123.232 128.67 133.003 136.448 139.26 141.485 143.562 145.225 146.601 147.815 148.872 149.794 150.581 151.352 152.021 152.574 153.093 153.574 153.962 154.356 154.719 154.966 155.202 155.417 155.621 155.845 155.991 156.132 156.35 156.476 156.581 156.63 156.743 156.853 156.941 156.975 156.926 157.03 157.024 157.008 156.93 156.877 156.806 156.694 156.553 156.349 156.019 154.14 -10 ,29601 ,KEBNE ,16708099,Fri Nov 26 15:30:26 CET,Fri Nov 26 17:00:05 CET,0.0 1.146 1.601 1.983 2.322 2.649 2.972 3.287 3.861 4.132 4.406 4.674 5.162 5.42 5.933 6.418 6.878 7.104 7.557 8.001 8.664 9.108 9.554 10.219 10.876 11.527 12.163 12.792 13.63 14.454 15.268 16.278 17.282 18.292 19.488 20.863 22.216 23.732 25.452 27.353 29.403 31.779 34.68 37.788 41.65 46.129 51.506 58.015 66.287 77.148 92.15 106.648 116.608 123.944 129.475 133.782 137.139 139.91 142.103 144.119 145.73 147.069 148.251 149.294 150.185 150.923 151.653 152.283 152.805 153.323 153.812 154.184 154.561 154.928 155.184 155.42 155.646 155.862 156.051 156.164 156.282 156.471 156.573 156.655 156.691 156.764 156.825 156.852 156.848 156.767 156.836 156.807 156.774 156.7 156.647 156.564 156.419 156.244 156.028 155.663 153.871 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_266_224.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_266_224.txt deleted file mode 100644 index 46438d82..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_266_224.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29094 ,KEBNE ,16708100,Fri Nov 26 15:30:26 CET,Fri Nov 26 17:02:31 CET,0.0 1.472 1.824 2.091 2.301 2.486 2.664 2.829 3.133 3.28 3.429 3.709 3.793 3.89 4.095 4.31 4.517 4.617 4.784 4.939 5.198 5.361 5.507 5.724 5.935 6.132 6.314 6.497 6.748 6.969 7.189 7.448 7.679 7.91 8.158 8.423 8.715 9.028 9.343 9.682 10.034 10.426 10.861 11.275 11.8 12.376 12.917 13.544 14.141 14.619 15.1 15.125 14.877 14.546 14.143 13.734 13.328 12.93 12.586 12.175 11.788 11.458 11.128 10.783 10.429 10.075 9.738 9.465 9.227 8.986 8.701 8.447 8.19 7.905 7.668 7.428 7.179 6.905 6.636 6.452 6.244 5.914 5.689 5.46 5.346 5.132 4.91 4.643 4.502 4.387 4.047 3.867 3.681 3.25 3.001 2.75 2.485 2.135 1.662 0.986 -1.878 -2 ,14049 ,KEBNE ,16708101,Fri Nov 26 15:30:26 CET,Fri Nov 26 17:01:47 CET,0.0 1.406 1.764 2.036 2.26 2.449 2.638 2.815 3.142 3.296 3.433 3.696 3.785 3.903 4.126 4.33 4.527 4.614 4.783 4.974 5.249 5.413 5.56 5.751 5.941 6.115 6.275 6.462 6.701 6.888 7.067 7.317 7.548 7.751 8.005 8.327 8.621 8.902 9.225 9.577 9.942 10.319 10.736 11.159 11.65 12.15 12.658 13.215 13.819 14.361 14.737 14.771 14.471 14.04 13.578 13.12 12.694 12.276 11.868 11.384 10.871 10.451 10.132 9.777 9.421 9.127 8.825 8.535 8.272 7.989 7.684 7.414 7.134 6.856 6.624 6.366 6.105 5.853 5.599 5.407 5.204 4.893 4.672 4.444 4.328 4.075 3.794 3.481 3.313 3.177 2.819 2.629 2.426 1.986 1.733 1.448 1.134 0.763 0.332 -0.262 -3.927 -3 ,30622 ,KEBNE ,16708102,Fri Nov 26 15:30:29 CET,Fri Nov 26 17:02:03 CET,0.0 1.626 1.986 2.265 2.496 2.695 2.872 3.03 3.317 3.451 3.58 3.864 3.959 4.065 4.259 4.444 4.619 4.706 4.889 5.064 5.319 5.486 5.644 5.874 6.069 6.235 6.405 6.574 6.791 6.996 7.19 7.433 7.662 7.883 8.185 8.534 8.831 9.15 9.502 9.889 10.237 10.584 11.014 11.455 11.955 12.435 12.935 13.499 14.056 14.559 14.923 14.871 14.596 14.205 13.724 13.206 12.723 12.316 11.926 11.463 11.046 10.682 10.317 9.966 9.664 9.385 9.088 8.816 8.578 8.323 8.038 7.806 7.557 7.29 7.079 6.853 6.614 6.37 6.114 5.927 5.738 5.444 5.227 4.982 4.856 4.582 4.291 4.013 3.873 3.75 3.369 3.171 2.957 2.514 2.278 2.026 1.741 1.359 0.913 0.318 -3.317 -4 ,31675 ,KEBNE ,16708103,Fri Nov 26 15:30:26 CET,Fri Nov 26 17:02:15 CET,0.0 1.533 1.862 2.104 2.319 2.528 2.711 2.855 3.128 3.259 3.391 3.668 3.765 3.873 4.075 4.272 4.462 4.551 4.722 4.884 5.127 5.294 5.454 5.682 5.881 6.048 6.239 6.439 6.682 6.893 7.068 7.283 7.503 7.727 7.987 8.277 8.555 8.851 9.165 9.518 9.874 10.207 10.586 10.955 11.418 11.931 12.453 13.001 13.556 14.075 14.414 14.284 13.902 13.471 13.012 12.532 12.087 11.644 11.18 10.683 10.303 9.967 9.592 9.213 8.882 8.583 8.276 7.987 7.725 7.455 7.135 6.846 6.531 6.184 5.925 5.661 5.396 5.126 4.811 4.582 4.357 4.031 3.809 3.572 3.449 3.164 2.843 2.492 2.304 2.144 1.76 1.571 1.365 0.88 0.61 0.32 -0.042 -0.452 -0.942 -1.655 -4.576 -5 ,22482 ,KEBNE ,16708104,Fri Nov 26 15:30:26 CET,Fri Nov 26 17:01:13 CET,0.0 1.685 1.999 2.245 2.485 2.69 2.861 3.025 3.331 3.462 3.583 3.854 3.955 4.072 4.313 4.527 4.725 4.821 4.99 5.159 5.423 5.586 5.736 5.936 6.114 6.294 6.464 6.618 6.824 7.011 7.205 7.446 7.662 7.882 8.127 8.432 8.741 9.039 9.339 9.668 10.036 10.421 10.912 11.398 11.856 12.33 12.817 13.292 13.807 14.32 14.669 14.593 14.243 13.812 13.373 12.936 12.5 12.055 11.663 11.267 10.908 10.54 10.167 9.84 9.544 9.25 8.93 8.666 8.409 8.124 7.852 7.613 7.342 7.069 6.871 6.643 6.39 6.122 5.823 5.627 5.424 5.111 4.9 4.665 4.548 4.322 4.066 3.784 3.637 3.509 3.181 3.015 2.843 2.484 2.264 1.996 1.7 1.353 0.86 0.166 -2.962 -6 ,24827 ,KEBNE ,16708105,Fri Nov 26 15:30:26 CET,Fri Nov 26 17:02:11 CET,0.0 1.259 1.636 1.947 2.195 2.384 2.575 2.755 3.054 3.191 3.318 3.572 3.656 3.757 3.951 4.146 4.326 4.41 4.594 4.77 4.995 5.133 5.277 5.497 5.715 5.918 6.111 6.308 6.576 6.824 7.058 7.367 7.647 7.875 8.151 8.462 8.737 9.026 9.324 9.648 10.006 10.4 10.819 11.215 11.684 12.181 12.709 13.317 13.961 14.497 14.918 14.998 14.747 14.345 13.889 13.478 13.13 12.75 12.373 11.969 11.61 11.3 10.992 10.68 10.396 10.117 9.792 9.474 9.188 8.91 8.64 8.4 8.15 7.887 7.663 7.441 7.204 6.951 6.692 6.513 6.335 6.05 5.849 5.632 5.514 5.276 5.016 4.74 4.603 4.477 4.105 3.923 3.743 3.337 3.095 2.831 2.521 2.145 1.715 1.095 -1.54 -7 ,25287 ,KEBNE ,16708106,Fri Nov 26 15:30:26 CET,Fri Nov 26 17:01:31 CET,0.0 1.44 1.789 2.064 2.3 2.505 2.704 2.883 3.184 3.326 3.456 3.725 3.827 3.939 4.155 4.361 4.549 4.639 4.801 4.958 5.187 5.335 5.477 5.667 5.849 6.054 6.269 6.463 6.711 6.947 7.153 7.387 7.617 7.859 8.162 8.494 8.768 9.061 9.389 9.703 10.033 10.4 10.798 11.234 11.733 12.215 12.786 13.385 13.981 14.577 14.977 14.959 14.647 14.178 13.699 13.206 12.72 12.289 11.918 11.501 11.119 10.768 10.41 10.083 9.787 9.497 9.188 8.881 8.582 8.307 8.058 7.822 7.567 7.292 7.051 6.79 6.537 6.29 6.03 5.848 5.66 5.355 5.138 4.927 4.82 4.596 4.339 4.035 3.88 3.743 3.381 3.205 3.008 2.559 2.314 2.023 1.696 1.312 0.825 0.15 -3.999 -8 ,31085 ,KEBNE ,16708107,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:02:17 CET,0.0 1.475 1.827 2.103 2.334 2.531 2.709 2.863 3.173 3.319 3.439 3.682 3.779 3.887 4.072 4.261 4.451 4.543 4.728 4.903 5.127 5.263 5.397 5.59 5.785 5.975 6.16 6.331 6.533 6.725 6.917 7.145 7.38 7.642 7.969 8.338 8.664 8.991 9.311 9.631 9.99 10.392 10.802 11.183 11.639 12.167 12.744 13.323 13.894 14.42 14.812 14.747 14.351 13.895 13.417 12.846 12.368 11.951 11.526 11.114 10.758 10.415 10.079 9.776 9.493 9.213 8.916 8.662 8.412 8.109 7.795 7.535 7.272 6.997 6.763 6.52 6.295 6.064 5.81 5.638 5.467 5.186 4.97 4.736 4.615 4.366 4.103 3.819 3.657 3.517 3.154 2.965 2.773 2.325 2.073 1.813 1.552 1.254 0.868 0.219 -2.442 -9 ,4972 ,KEBNE ,16708108,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:02:47 CET,0.0 1.519 1.834 2.081 2.304 2.51 2.696 2.864 3.174 3.319 3.465 3.75 3.838 3.938 4.128 4.307 4.487 4.58 4.751 4.912 5.133 5.267 5.396 5.587 5.767 5.947 6.136 6.332 6.579 6.799 7.021 7.278 7.51 7.756 8.042 8.359 8.65 8.937 9.217 9.495 9.808 10.179 10.619 11.034 11.484 11.979 12.535 13.113 13.72 14.33 14.814 14.853 14.632 14.292 13.92 13.549 13.178 12.783 12.429 12.079 11.766 11.459 11.143 10.835 10.555 10.285 9.99 9.714 9.481 9.244 8.981 8.766 8.545 8.284 8.07 7.847 7.599 7.348 7.104 6.934 6.753 6.475 6.285 6.092 5.991 5.777 5.556 5.314 5.174 5.046 4.704 4.534 4.35 3.951 3.725 3.483 3.218 2.897 2.533 2.009 -1.201 -10 ,16875 ,KEBNE ,16708109,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:02:51 CET,0.0 1.975 2.367 2.636 2.872 3.093 3.289 3.461 3.78 3.931 4.063 4.325 4.427 4.539 4.742 4.943 5.139 5.225 5.382 5.535 5.769 5.936 6.1 6.312 6.502 6.695 6.879 7.049 7.265 7.474 7.669 7.897 8.12 8.323 8.577 8.881 9.142 9.421 9.712 10.037 10.386 10.757 11.16 11.532 11.963 12.446 12.972 13.514 14.105 14.667 15.092 15.079 14.747 14.315 13.88 13.424 12.955 12.515 12.13 11.681 11.278 10.927 10.575 10.259 9.976 9.715 9.43 9.131 8.862 8.565 8.233 7.977 7.709 7.409 7.151 6.914 6.715 6.486 6.238 6.056 5.843 5.524 5.3 5.045 4.921 4.673 4.382 4.069 3.911 3.776 3.415 3.229 3.026 2.594 2.339 2.053 1.744 1.366 0.929 0.347 -2.532 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_266_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_266_235.txt deleted file mode 100644 index ed8c170e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_266_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17033 ,KEBNE ,16708110,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:02:57 CET,0.0 2.132 2.712 3.152 3.486 3.785 4.069 4.328 4.783 4.982 5.161 5.499 5.627 5.77 6.059 6.32 6.546 6.665 6.912 7.118 7.357 7.53 7.729 8.004 8.257 8.472 8.667 8.862 9.124 9.368 9.579 9.835 10.071 10.313 10.573 10.88 11.221 11.553 11.89 12.219 12.509 12.805 13.146 13.479 13.859 14.277 14.703 15.06 15.336 15.492 15.39 14.844 14.185 13.524 12.859 12.227 11.648 11.131 10.682 10.192 9.747 9.366 9.012 8.662 8.336 8.017 7.632 7.256 6.921 6.579 6.249 5.971 5.675 5.386 5.171 4.947 4.708 4.469 4.231 4.06 3.876 3.553 3.316 3.077 2.952 2.697 2.433 2.15 2.006 1.875 1.517 1.325 1.119 0.67 0.42 0.154 -0.145 -0.473 -0.842 -1.417 -4.006 -2 ,13142 ,KEBNE ,16708111,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:03:31 CET,0.0 2.37 2.854 3.224 3.542 3.791 4.018 4.228 4.61 4.788 4.96 5.298 5.416 5.551 5.784 5.997 6.23 6.358 6.6 6.816 7.104 7.283 7.458 7.707 7.956 8.181 8.377 8.568 8.817 9.06 9.309 9.613 9.883 10.119 10.375 10.663 10.919 11.204 11.495 11.764 12.049 12.355 12.67 12.958 13.261 13.567 13.884 14.17 14.433 14.556 14.357 13.735 13.069 12.346 11.614 10.937 10.337 9.773 9.293 8.818 8.391 8.009 7.635 7.258 6.919 6.634 6.319 6.034 5.789 5.525 5.228 4.952 4.676 4.409 4.201 3.977 3.711 3.448 3.192 2.984 2.775 2.471 2.254 2.019 1.894 1.639 1.37 1.09 0.954 0.82 0.46 0.281 0.097 -0.311 -0.548 -0.806 -1.09 -1.415 -1.82 -2.375 -4.476 -3 ,24112 ,KEBNE ,16708112,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:02:19 CET,0.0 1.692 2.212 2.598 2.898 3.137 3.353 3.571 3.977 4.175 4.364 4.723 4.864 5.026 5.307 5.551 5.788 5.904 6.135 6.343 6.626 6.811 6.985 7.256 7.516 7.762 8.001 8.219 8.48 8.699 8.915 9.181 9.423 9.645 9.877 10.174 10.477 10.773 11.083 11.417 11.724 12.001 12.388 12.756 13.056 13.401 13.782 14.113 14.363 14.42 14.164 13.568 12.831 12.117 11.447 10.817 10.22 9.691 9.246 8.727 8.255 7.853 7.465 7.094 6.69 6.287 5.9 5.582 5.295 4.977 4.666 4.417 4.153 3.87 3.647 3.426 3.184 2.925 2.66 2.456 2.236 1.903 1.689 1.481 1.364 1.091 0.791 0.462 0.291 0.135 -0.25 -0.441 -0.641 -1.079 -1.325 -1.619 -1.944 -2.285 -2.693 -3.229 -5.167 -4 ,22272 ,KEBNE ,16708113,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:02:41 CET,0.0 2.614 3.169 3.581 3.946 4.271 4.546 4.783 5.212 5.419 5.612 5.951 6.076 6.225 6.507 6.767 7.015 7.129 7.344 7.56 7.852 8.015 8.18 8.436 8.714 8.972 9.166 9.345 9.592 9.819 10.023 10.263 10.467 10.663 10.903 11.184 11.444 11.725 12.012 12.269 12.522 12.805 13.103 13.367 13.668 14.009 14.378 14.733 15.029 15.176 14.925 14.252 13.51 12.756 12.012 11.296 10.671 10.109 9.619 9.105 8.669 8.293 7.915 7.559 7.227 6.891 6.524 6.191 5.906 5.608 5.285 5.009 4.716 4.4 4.138 3.864 3.59 3.317 3.027 2.824 2.618 2.323 2.124 1.909 1.791 1.54 1.29 1.013 0.861 0.713 0.344 0.169 -0.006 -0.427 -0.674 -0.943 -1.258 -1.604 -2.018 -2.584 -5.033 -5 ,11828 ,KEBNE ,16708114,Fri Nov 26 15:31:29 CET,Fri Nov 26 16:58:38 CET,0.0 1.616 2.151 2.552 2.874 3.155 3.418 3.656 4.077 4.26 4.421 4.772 4.909 5.049 5.311 5.559 5.805 5.923 6.131 6.325 6.646 6.861 7.055 7.326 7.588 7.844 8.064 8.268 8.52 8.755 8.998 9.262 9.481 9.679 9.939 10.241 10.501 10.767 11.03 11.316 11.605 11.896 12.231 12.552 12.891 13.246 13.602 13.977 14.316 14.471 14.329 13.753 13.11 12.452 11.797 11.173 10.571 10.005 9.532 9.076 8.681 8.297 7.919 7.576 7.269 6.977 6.646 6.348 6.082 5.787 5.473 5.224 4.974 4.71 4.51 4.3 4.079 3.847 3.578 3.384 3.196 2.911 2.702 2.467 2.352 2.118 1.844 1.552 1.415 1.286 0.94 0.755 0.548 0.109 -0.124 -0.379 -0.674 -1.018 -1.443 -2.045 -3.951 -6 ,6014 ,KEBNE ,16708115,Fri Nov 26 15:31:31 CET,Fri Nov 26 16:59:33 CET,0.0 2.402 2.931 3.291 3.564 3.832 4.103 4.352 4.765 4.957 5.13 5.456 5.59 5.737 6.02 6.276 6.501 6.619 6.858 7.08 7.4 7.617 7.83 8.114 8.363 8.586 8.799 9.0 9.225 9.472 9.725 9.976 10.184 10.382 10.625 10.923 11.197 11.433 11.669 11.942 12.214 12.48 12.78 13.083 13.425 13.752 14.076 14.367 14.61 14.785 14.624 14.007 13.324 12.619 11.965 11.372 10.793 10.236 9.731 9.201 8.735 8.283 7.855 7.495 7.149 6.823 6.481 6.144 5.864 5.605 5.306 5.019 4.719 4.425 4.183 3.919 3.652 3.376 3.095 2.895 2.683 2.379 2.164 1.926 1.798 1.536 1.269 0.973 0.819 0.678 0.306 0.106 -0.108 -0.565 -0.805 -1.06 -1.356 -1.685 -2.106 -2.76 -5.916 -7 ,30959 ,KEBNE ,16708116,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:02:44 CET,0.0 2.34 2.901 3.319 3.643 3.931 4.201 4.451 4.874 5.061 5.24 5.597 5.735 5.883 6.172 6.431 6.673 6.793 7.005 7.186 7.436 7.6 7.76 8.016 8.271 8.509 8.732 8.905 9.122 9.338 9.575 9.872 10.091 10.278 10.483 10.719 10.964 11.257 11.545 11.854 12.158 12.407 12.712 13.048 13.395 13.697 13.99 14.276 14.485 14.563 14.43 13.863 13.141 12.494 11.861 11.243 10.711 10.193 9.746 9.299 8.899 8.543 8.184 7.813 7.457 7.1 6.711 6.38 6.112 5.839 5.552 5.3 5.025 4.749 4.531 4.289 4.044 3.805 3.55 3.356 3.151 2.839 2.625 2.422 2.322 2.072 1.793 1.514 1.362 1.232 0.921 0.761 0.599 0.25 0.037 -0.203 -0.478 -0.804 -1.217 -1.758 -4.25 -8 ,31411 ,KEBNE ,16708117,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:02:43 CET,0.0 2.67 3.243 3.674 4.014 4.296 4.548 4.763 5.153 5.342 5.524 5.894 6.037 6.2 6.495 6.763 7.016 7.126 7.336 7.558 7.874 8.063 8.249 8.516 8.754 8.982 9.179 9.339 9.554 9.792 10.018 10.271 10.508 10.743 11.022 11.323 11.597 11.885 12.172 12.447 12.736 13.06 13.419 13.747 14.112 14.482 14.824 15.124 15.399 15.569 15.407 14.824 14.157 13.511 12.87 12.273 11.727 11.196 10.738 10.268 9.853 9.48 9.13 8.791 8.434 8.09 7.74 7.431 7.172 6.905 6.618 6.365 6.088 5.82 5.623 5.409 5.181 4.934 4.66 4.476 4.293 4.001 3.787 3.561 3.446 3.218 2.96 2.667 2.521 2.389 2.034 1.853 1.675 1.286 1.06 0.804 0.516 0.176 -0.23 -0.796 -2.9 -9 ,17761 ,KEBNE ,16708118,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:02:45 CET,0.0 2.642 3.198 3.592 3.933 4.252 4.508 4.739 5.157 5.34 5.515 5.875 6.014 6.159 6.432 6.69 6.943 7.054 7.24 7.46 7.814 8.011 8.192 8.434 8.651 8.863 9.044 9.205 9.427 9.659 9.886 10.152 10.398 10.631 10.923 11.246 11.552 11.901 12.218 12.491 12.79 13.134 13.488 13.801 14.118 14.432 14.739 15.016 15.333 15.587 15.479 14.966 14.342 13.673 12.972 12.265 11.648 11.109 10.625 10.115 9.632 9.191 8.789 8.408 8.034 7.668 7.306 6.97 6.667 6.352 5.991 5.668 5.337 5.002 4.746 4.497 4.251 3.982 3.689 3.493 3.285 2.923 2.67 2.428 2.296 2.017 1.733 1.418 1.253 1.106 0.746 0.559 0.366 -0.063 -0.302 -0.572 -0.876 -1.213 -1.702 -2.331 -4.782 -10 ,7062 ,KEBNE ,16708119,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:03:01 CET,0.0 2.166 2.748 3.155 3.484 3.772 4.03 4.242 4.644 4.839 5.024 5.391 5.52 5.666 5.946 6.198 6.434 6.557 6.788 6.983 7.252 7.423 7.594 7.848 8.116 8.364 8.571 8.771 9.026 9.26 9.513 9.798 10.014 10.237 10.507 10.821 11.105 11.363 11.625 11.895 12.193 12.525 12.842 13.14 13.441 13.724 14.043 14.338 14.548 14.665 14.5 13.952 13.315 12.643 11.985 11.404 10.904 10.354 9.85 9.393 8.983 8.606 8.27 7.921 7.54 7.181 6.846 6.57 6.318 6.04 5.746 5.501 5.242 4.969 4.768 4.555 4.332 4.107 3.871 3.701 3.509 3.214 2.997 2.741 2.605 2.346 2.085 1.792 1.642 1.505 1.14 0.956 0.764 0.303 0.058 -0.194 -0.495 -0.84 -1.232 -1.738 -4.257 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_289_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_289_231.txt deleted file mode 100644 index 593c5ed5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_289_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6949 ,KEBNE ,16708120,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:02:54 CET,0.0 0.787 1.1 1.328 1.528 1.714 1.889 2.05 2.333 2.451 2.568 2.659 2.916 3.019 3.201 3.367 3.536 3.622 3.795 3.961 4.194 4.343 4.481 4.678 4.869 5.049 5.225 5.397 5.604 5.788 5.975 6.198 6.418 6.658 6.933 7.19 7.431 7.699 7.989 8.333 8.677 9.018 9.415 9.836 10.314 10.833 11.448 12.082 12.741 13.504 14.304 14.804 15.006 15.025 14.951 14.777 14.6 14.474 14.313 14.111 13.946 13.789 13.638 13.491 13.349 13.211 13.046 12.892 12.765 12.634 12.472 12.33 12.175 11.993 11.862 11.715 11.535 11.346 11.158 11.05 10.956 10.805 10.688 10.557 10.492 10.365 10.23 10.093 10.013 9.778 9.732 9.634 9.511 9.246 9.122 8.975 8.794 8.581 8.339 8.019 7.106 -2 ,18505 ,KEBNE ,16708121,Fri Nov 26 15:31:27 CET,Fri Nov 26 17:02:00 CET,0.0 0.985 1.305 1.567 1.807 2.007 2.201 2.382 2.685 2.831 2.97 3.067 3.349 3.467 3.699 3.931 4.133 4.22 4.38 4.554 4.815 4.972 5.122 5.314 5.513 5.73 5.934 6.125 6.38 6.625 6.833 7.069 7.312 7.556 7.812 8.065 8.316 8.623 8.972 9.329 9.671 10.076 10.545 10.958 11.427 11.935 12.514 13.152 13.873 14.599 15.312 15.701 15.746 15.659 15.514 15.352 15.195 14.998 14.786 14.558 14.334 14.129 13.941 13.768 13.601 13.444 13.275 13.12 12.979 12.829 12.676 12.525 12.338 12.147 11.991 11.836 11.663 11.481 11.325 11.216 11.088 10.88 10.75 10.608 10.537 10.404 10.242 10.06 9.964 9.715 9.649 9.536 9.415 9.154 9.001 8.835 8.642 8.408 8.127 7.729 6.871 -3 ,16949 ,KEBNE ,16708122,Fri Nov 26 15:31:26 CET,Fri Nov 26 17:02:53 CET,0.0 0.796 1.13 1.379 1.578 1.758 1.922 2.062 2.308 2.43 2.551 2.63 2.893 3.009 3.226 3.43 3.622 3.704 3.846 3.991 4.23 4.385 4.53 4.728 4.916 5.101 5.282 5.47 5.704 5.911 6.098 6.303 6.509 6.732 6.978 7.223 7.46 7.733 8.068 8.417 8.718 9.061 9.5 9.919 10.343 10.806 11.371 12.029 12.735 13.504 14.328 14.822 14.969 14.931 14.81 14.681 14.527 14.349 14.138 13.897 13.694 13.525 13.381 13.241 13.091 12.929 12.728 12.546 12.417 12.278 12.134 12.008 11.837 11.626 11.473 11.338 11.218 11.099 10.969 10.874 10.767 10.593 10.463 10.313 10.232 10.066 9.921 9.782 9.701 9.474 9.442 9.346 9.239 8.992 8.84 8.677 8.507 8.295 8.044 7.715 6.941 -4 ,14130 ,KEBNE ,16708123,Fri Nov 26 15:31:26 CET,Fri Nov 26 17:02:17 CET,0.0 1.077 1.438 1.679 1.896 2.096 2.286 2.458 2.76 2.898 3.025 3.117 3.387 3.502 3.711 3.913 4.119 4.213 4.372 4.534 4.768 4.91 5.061 5.303 5.529 5.747 5.949 6.126 6.352 6.57 6.769 7.003 7.23 7.433 7.651 7.888 8.117 8.372 8.646 8.941 9.242 9.573 9.967 10.363 10.807 11.278 11.83 12.493 13.2 13.925 14.689 15.133 15.286 15.274 15.178 15.061 14.945 14.78 14.592 14.307 14.012 13.8 13.618 13.454 13.309 13.137 12.931 12.767 12.633 12.495 12.345 12.208 12.053 11.892 11.769 11.645 11.521 11.386 11.243 11.143 11.042 10.862 10.707 10.556 10.483 10.318 10.161 9.988 9.895 9.664 9.607 9.498 9.38 9.127 8.981 8.811 8.64 8.456 8.206 7.837 6.748 -5 ,4451 ,KEBNE ,16708124,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:04:30 CET,0.0 0.934 1.267 1.542 1.78 1.987 2.172 2.342 2.639 2.788 2.943 3.056 3.329 3.435 3.632 3.822 4.018 4.112 4.266 4.43 4.687 4.846 5.003 5.233 5.447 5.642 5.842 6.023 6.222 6.399 6.567 6.774 6.985 7.201 7.452 7.72 7.999 8.329 8.691 9.049 9.387 9.799 10.251 10.653 11.16 11.734 12.3 12.876 13.549 14.325 15.177 15.703 15.834 15.771 15.626 15.435 15.219 15.011 14.814 14.603 14.42 14.249 14.054 13.875 13.693 13.518 13.346 13.136 12.93 12.727 12.515 12.332 12.155 11.962 11.806 11.661 11.512 11.332 11.129 10.998 10.865 10.667 10.528 10.379 10.303 10.154 10.011 9.84 9.746 9.501 9.409 9.284 9.154 8.866 8.704 8.52 8.319 8.106 7.847 7.479 6.61 -6 ,23199 ,KEBNE ,16708125,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:03:54 CET,0.0 0.757 1.093 1.334 1.539 1.708 1.86 2.002 2.242 2.349 2.452 2.504 2.749 2.849 3.06 3.255 3.426 3.503 3.651 3.789 3.979 4.105 4.229 4.417 4.611 4.813 5.01 5.191 5.401 5.576 5.746 5.949 6.163 6.382 6.63 6.904 7.144 7.417 7.706 8.012 8.348 8.695 9.114 9.538 9.952 10.395 10.916 11.489 12.169 12.904 13.675 14.198 14.338 14.329 14.261 14.102 13.891 13.701 13.546 13.346 13.157 12.968 12.782 12.621 12.471 12.329 12.174 11.996 11.821 11.664 11.505 11.362 11.189 11.001 10.855 10.701 10.573 10.452 10.291 10.163 10.041 9.868 9.743 9.596 9.521 9.371 9.207 9.054 8.983 8.76 8.715 8.613 8.504 8.27 8.131 7.979 7.812 7.619 7.402 7.084 6.301 -7 ,24375 ,KEBNE ,16708126,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:03:36 CET,0.0 1.1 1.445 1.713 1.926 2.119 2.307 2.472 2.754 2.895 3.017 3.104 3.371 3.485 3.715 3.923 4.108 4.198 4.381 4.562 4.806 4.95 5.097 5.327 5.552 5.766 5.975 6.182 6.454 6.703 6.927 7.194 7.467 7.733 8.007 8.311 8.601 8.904 9.219 9.546 9.922 10.395 10.919 11.363 11.858 12.42 13.054 13.718 14.419 15.194 16.065 16.605 16.78 16.783 16.653 16.496 16.325 16.121 15.914 15.686 15.459 15.263 15.095 14.931 14.745 14.558 14.375 14.21 14.046 13.859 13.662 13.506 13.342 13.154 13.021 12.896 12.752 12.595 12.43 12.313 12.179 11.972 11.838 11.688 11.605 11.442 11.279 11.098 10.994 10.739 10.647 10.533 10.415 10.145 9.984 9.814 9.638 9.429 9.167 8.839 7.914 -8 ,24292 ,KEBNE ,16708127,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:03:12 CET,0.0 0.873 1.168 1.412 1.626 1.819 2.001 2.159 2.432 2.558 2.679 2.756 3.006 3.109 3.309 3.497 3.667 3.748 3.91 4.062 4.296 4.466 4.623 4.838 5.036 5.22 5.409 5.593 5.802 5.979 6.157 6.378 6.589 6.78 6.992 7.234 7.462 7.708 7.985 8.288 8.619 9.031 9.517 9.96 10.44 10.982 11.601 12.241 12.914 13.648 14.465 15.012 15.212 15.242 15.168 15.04 14.89 14.68 14.488 14.307 14.135 13.97 13.784 13.561 13.341 13.127 12.86 12.626 12.427 12.207 11.996 11.833 11.675 11.525 11.406 11.268 11.106 10.932 10.748 10.617 10.484 10.278 10.132 9.979 9.898 9.716 9.526 9.34 9.247 9.009 8.923 8.79 8.66 8.373 8.211 8.052 7.875 7.666 7.381 6.968 5.89 -9 ,19223 ,KEBNE ,16708128,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:04:28 CET,0.0 1.02 1.36 1.606 1.839 2.04 2.218 2.391 2.723 2.878 3.016 3.117 3.385 3.488 3.674 3.852 4.027 4.109 4.278 4.458 4.713 4.87 5.028 5.251 5.454 5.636 5.805 5.989 6.238 6.482 6.695 6.938 7.216 7.492 7.775 8.076 8.368 8.663 9.005 9.365 9.702 10.084 10.521 10.96 11.461 12.003 12.62 13.297 14.022 14.81 15.566 15.972 16.051 15.978 15.841 15.669 15.49 15.309 15.121 14.887 14.662 14.476 14.296 14.106 13.876 13.662 13.477 13.29 13.108 12.918 12.715 12.554 12.392 12.227 12.103 11.962 11.802 11.627 11.429 11.294 11.167 10.961 10.804 10.635 10.558 10.406 10.245 10.073 9.971 9.706 9.6 9.472 9.337 9.069 8.92 8.73 8.539 8.321 8.043 7.666 6.805 -10 ,28264 ,KEBNE ,16708129,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:04:25 CET,0.0 0.929 1.269 1.51 1.729 1.923 2.102 2.262 2.531 2.656 2.779 2.858 3.104 3.213 3.436 3.637 3.816 3.899 4.046 4.185 4.407 4.549 4.696 4.917 5.126 5.328 5.518 5.69 5.912 6.124 6.338 6.59 6.802 7.019 7.278 7.547 7.831 8.155 8.452 8.754 9.081 9.433 9.846 10.271 10.747 11.263 11.841 12.455 13.124 13.905 14.796 15.284 15.43 15.46 15.412 15.308 15.129 14.95 14.788 14.585 14.391 14.209 14.037 13.871 13.685 13.508 13.338 13.176 13.026 12.872 12.708 12.557 12.406 12.251 12.096 11.911 11.736 11.558 11.384 11.278 11.149 10.932 10.787 10.64 10.567 10.41 10.254 10.101 10.013 9.769 9.704 9.587 9.462 9.187 9.046 8.9 8.738 8.552 8.283 7.912 6.689 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_289_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_289_336.txt deleted file mode 100644 index f8d81e43..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_289_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3106 ,KEBNE ,16708130,Fri Nov 26 15:32:32 CET,Fri Nov 26 17:01:00 CET,0.0 0.594 0.808 0.951 1.055 1.133 1.192 1.242 1.32 1.34 1.354 1.248 1.418 1.434 1.485 1.521 1.517 1.504 1.48 1.465 1.458 1.432 1.378 1.316 1.243 1.129 1.025 0.933 0.819 0.686 0.545 0.408 0.207 -0.059 -0.379 -0.735 -1.081 -1.508 -2.041 -2.661 -3.354 -4.178 -5.21 -6.342 -7.795 -9.592 -11.895 -14.776 -18.603 -23.89 -31.68 -39.887 -45.93 -50.631 -54.394 -57.517 -60.117 -62.394 -64.271 -66.023 -67.472 -68.766 -69.933 -70.986 -71.937 -72.773 -73.637 -74.409 -75.076 -75.742 -76.4 -76.946 -77.504 -78.079 -78.515 -78.955 -79.43 -79.905 -80.37 -80.677 -81.001 -81.52 -81.869 -82.224 -82.401 -82.764 -83.156 -83.576 -83.789 -84.245 -84.449 -84.676 -84.907 -85.393 -85.666 -85.958 -86.258 -86.58 -87.002 -87.545 -88.89 -2 ,14926 ,KEBNE ,16708131,Fri Nov 26 15:32:32 CET,Fri Nov 26 16:59:58 CET,0.0 0.74 0.972 1.154 1.271 1.354 1.44 1.509 1.577 1.595 1.612 1.498 1.659 1.662 1.665 1.672 1.695 1.698 1.676 1.661 1.641 1.609 1.564 1.486 1.409 1.332 1.241 1.148 1.013 0.843 0.671 0.448 0.216 -0.025 -0.326 -0.679 -1.057 -1.499 -1.979 -2.511 -3.121 -3.911 -4.946 -6.07 -7.505 -9.272 -11.553 -14.43 -18.194 -23.456 -31.363 -39.666 -45.832 -50.687 -54.587 -57.821 -60.459 -62.71 -64.575 -66.37 -67.865 -69.162 -70.341 -71.446 -72.48 -73.383 -74.293 -75.085 -75.756 -76.443 -77.132 -77.691 -78.27 -78.865 -79.318 -79.768 -80.216 -80.7 -81.233 -81.592 -81.949 -82.51 -82.886 -83.257 -83.448 -83.836 -84.221 -84.631 -84.846 -85.306 -85.505 -85.742 -85.992 -86.54 -86.836 -87.137 -87.45 -87.784 -88.167 -88.658 -89.796 -3 ,1401 ,KEBNE ,16708132,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:03:59 CET,0.0 0.916 1.172 1.339 1.455 1.55 1.628 1.706 1.818 1.86 1.908 1.858 2.054 2.074 2.083 2.089 2.095 2.097 2.108 2.1 2.057 2.029 1.996 1.917 1.826 1.732 1.633 1.531 1.374 1.216 1.059 0.85 0.635 0.417 0.157 -0.166 -0.507 -0.937 -1.466 -2.053 -2.687 -3.478 -4.546 -5.711 -7.133 -8.888 -11.185 -14.106 -17.94 -23.172 -30.908 -39.075 -45.19 -49.952 -53.748 -56.897 -59.535 -61.819 -63.683 -65.473 -66.964 -68.28 -69.494 -70.588 -71.613 -72.521 -73.419 -74.189 -74.847 -75.556 -76.289 -76.874 -77.487 -78.102 -78.555 -79.035 -79.553 -80.066 -80.579 -80.936 -81.276 -81.794 -82.157 -82.532 -82.723 -83.103 -83.495 -83.894 -84.098 -84.56 -84.771 -85.01 -85.26 -85.791 -86.067 -86.35 -86.663 -87.028 -87.455 -87.99 -89.409 -4 ,31858 ,KEBNE ,16708133,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:03:31 CET,0.0 0.683 0.862 0.993 1.128 1.216 1.276 1.335 1.408 1.431 1.464 1.378 1.57 1.601 1.641 1.662 1.676 1.684 1.693 1.683 1.637 1.59 1.535 1.436 1.338 1.247 1.143 1.03 0.863 0.676 0.487 0.253 0.005 -0.25 -0.572 -0.946 -1.312 -1.768 -2.298 -2.889 -3.557 -4.382 -5.419 -6.519 -7.926 -9.721 -12.002 -14.86 -18.68 -23.905 -31.645 -39.882 -45.919 -50.554 -54.355 -57.569 -60.228 -62.552 -64.491 -66.362 -67.946 -69.3 -70.514 -71.61 -72.605 -73.505 -74.421 -75.206 -75.883 -76.604 -77.358 -77.952 -78.527 -79.128 -79.599 -80.074 -80.552 -81.02 -81.487 -81.81 -82.137 -82.627 -82.982 -83.352 -83.538 -83.933 -84.336 -84.733 -84.948 -85.41 -85.578 -85.798 -86.034 -86.568 -86.872 -87.178 -87.483 -87.812 -88.18 -88.654 -89.809 -5 ,22271 ,KEBNE ,16708134,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:02:38 CET,0.0 0.657 0.869 1.013 1.135 1.247 1.359 1.451 1.573 1.627 1.667 1.574 1.748 1.78 1.815 1.791 1.752 1.746 1.744 1.713 1.641 1.593 1.542 1.459 1.39 1.329 1.263 1.19 1.059 0.894 0.723 0.486 0.243 0.0 -0.302 -0.661 -1.012 -1.409 -1.908 -2.499 -3.142 -3.936 -4.963 -6.064 -7.492 -9.248 -11.49 -14.347 -18.162 -23.535 -31.515 -39.903 -46.126 -50.936 -54.786 -58.031 -60.691 -62.975 -64.872 -66.708 -68.215 -69.552 -70.8 -71.917 -72.918 -73.791 -74.696 -75.499 -76.18 -76.869 -77.566 -78.114 -78.667 -79.274 -79.761 -80.239 -80.683 -81.136 -81.61 -81.926 -82.245 -82.734 -83.074 -83.428 -83.615 -84.019 -84.445 -84.884 -85.113 -85.584 -85.796 -86.035 -86.271 -86.773 -87.045 -87.359 -87.719 -88.091 -88.509 -89.017 -90.596 -6 ,5978 ,KEBNE ,16708135,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:03:17 CET,0.0 0.868 1.133 1.312 1.424 1.518 1.615 1.7 1.815 1.858 1.897 1.816 1.985 1.994 1.997 1.997 2.001 2.004 1.986 1.95 1.876 1.816 1.752 1.667 1.581 1.491 1.389 1.275 1.122 0.96 0.785 0.547 0.29 0.04 -0.251 -0.613 -1.014 -1.48 -2.0 -2.596 -3.267 -4.085 -5.132 -6.274 -7.702 -9.471 -11.757 -14.654 -18.482 -23.701 -31.538 -39.729 -45.781 -50.54 -54.342 -57.518 -60.14 -62.522 -64.509 -66.347 -67.853 -69.158 -70.414 -71.557 -72.576 -73.496 -74.433 -75.267 -75.987 -76.708 -77.44 -78.042 -78.655 -79.289 -79.761 -80.22 -80.695 -81.191 -81.707 -82.063 -82.418 -82.95 -83.305 -83.675 -83.882 -84.31 -84.73 -85.185 -85.422 -85.901 -86.165 -86.43 -86.694 -87.23 -87.533 -87.869 -88.215 -88.595 -89.045 -89.58 -90.897 -7 ,1121 ,KEBNE ,16708136,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:03:23 CET,0.0 0.801 1.05 1.234 1.356 1.435 1.511 1.583 1.685 1.723 1.762 1.65 1.818 1.826 1.837 1.835 1.813 1.802 1.791 1.792 1.811 1.818 1.785 1.703 1.618 1.51 1.383 1.263 1.1 0.931 0.769 0.564 0.329 0.075 -0.232 -0.606 -1.001 -1.463 -1.985 -2.578 -3.247 -4.043 -5.049 -6.163 -7.593 -9.355 -11.613 -14.493 -18.347 -23.657 -31.545 -39.753 -45.765 -50.505 -54.296 -57.407 -59.998 -62.259 -64.102 -65.84 -67.301 -68.571 -69.768 -70.869 -71.84 -72.732 -73.689 -74.519 -75.193 -75.898 -76.624 -77.205 -77.806 -78.418 -78.87 -79.315 -79.787 -80.276 -80.751 -81.064 -81.393 -81.923 -82.296 -82.68 -82.874 -83.257 -83.642 -84.062 -84.285 -84.748 -84.954 -85.188 -85.433 -85.946 -86.217 -86.515 -86.832 -87.158 -87.535 -88.068 -89.361 -8 ,29320 ,KEBNE ,16708137,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:03:39 CET,0.0 0.963 1.242 1.441 1.601 1.713 1.799 1.859 1.929 1.954 1.97 1.868 2.043 2.058 2.101 2.153 2.198 2.208 2.188 2.147 2.088 2.038 1.99 1.922 1.856 1.787 1.68 1.568 1.407 1.216 1.06 0.874 0.639 0.402 0.111 -0.244 -0.612 -1.057 -1.579 -2.175 -2.827 -3.64 -4.701 -5.867 -7.349 -9.156 -11.446 -14.38 -18.317 -23.695 -31.606 -39.876 -46.011 -50.79 -54.593 -57.779 -60.406 -62.683 -64.582 -66.385 -67.862 -69.116 -70.283 -71.365 -72.338 -73.216 -74.117 -74.907 -75.565 -76.225 -76.898 -77.451 -78.042 -78.659 -79.12 -79.571 -80.057 -80.559 -81.039 -81.372 -81.718 -82.237 -82.597 -82.961 -83.144 -83.523 -83.918 -84.339 -84.548 -85.002 -85.215 -85.449 -85.688 -86.216 -86.505 -86.802 -87.101 -87.46 -87.881 -88.409 -89.737 -9 ,19078 ,KEBNE ,16708138,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:03:28 CET,0.0 0.739 0.941 1.08 1.178 1.252 1.33 1.397 1.487 1.525 1.554 1.453 1.626 1.653 1.694 1.711 1.721 1.717 1.702 1.67 1.593 1.544 1.504 1.445 1.367 1.264 1.162 1.09 0.96 0.787 0.608 0.382 0.145 -0.097 -0.374 -0.721 -1.107 -1.507 -1.977 -2.571 -3.231 -4.035 -5.049 -6.162 -7.592 -9.359 -11.649 -14.532 -18.352 -23.614 -31.4 -39.588 -45.648 -50.38 -54.193 -57.386 -60.043 -62.347 -64.252 -66.054 -67.525 -68.805 -69.993 -71.093 -72.11 -73.05 -74.046 -74.878 -75.551 -76.241 -76.954 -77.529 -78.105 -78.698 -79.167 -79.653 -80.127 -80.625 -81.143 -81.467 -81.799 -82.331 -82.69 -83.057 -83.248 -83.626 -84.014 -84.433 -84.641 -85.091 -85.297 -85.537 -85.774 -86.277 -86.558 -86.854 -87.161 -87.512 -87.942 -88.441 -89.777 -10 ,3179 ,KEBNE ,16708139,Fri Nov 26 15:32:28 CET,Fri Nov 26 17:03:14 CET,0.0 1.124 1.345 1.49 1.6 1.68 1.755 1.838 1.96 1.995 2.026 1.926 2.102 2.122 2.141 2.144 2.145 2.144 2.142 2.126 2.061 2.008 1.958 1.863 1.765 1.662 1.546 1.433 1.279 1.114 0.929 0.686 0.448 0.21 -0.092 -0.444 -0.803 -1.252 -1.776 -2.377 -3.056 -3.893 -4.952 -6.111 -7.599 -9.402 -11.718 -14.61 -18.453 -23.781 -31.679 -39.919 -46.026 -50.905 -54.8 -58.052 -60.709 -62.99 -64.881 -66.654 -68.142 -69.448 -70.643 -71.738 -72.734 -73.639 -74.603 -75.445 -76.129 -76.803 -77.486 -78.041 -78.6 -79.168 -79.616 -80.075 -80.556 -81.059 -81.555 -81.879 -82.209 -82.746 -83.119 -83.504 -83.709 -84.128 -84.531 -84.92 -85.121 -85.579 -85.785 -86.029 -86.274 -86.774 -87.049 -87.347 -87.673 -88.033 -88.469 -89.048 -90.546 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_164.txt deleted file mode 100644 index 9f50f51e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9748 ,KEBNE ,16708140,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:05:53 CET,0.0 0.637 0.835 0.948 1.034 1.086 1.123 1.15 1.135 1.117 1.111 1.112 1.072 1.04 0.978 0.91 0.815 0.763 0.663 0.558 0.371 0.238 0.11 -0.079 -0.296 -0.536 -0.781 -1.029 -1.372 -1.734 -2.091 -2.533 -2.977 -3.422 -3.957 -4.6 -5.274 -6.067 -6.985 -8.035 -9.2 -10.583 -12.335 -14.23 -16.57 -19.388 -22.97 -27.453 -33.368 -41.508 -53.328 -65.587 -74.525 -81.458 -86.969 -91.566 -95.402 -98.677 -101.354 -103.88 -105.967 -107.765 -109.448 -110.978 -112.352 -113.584 -114.832 -115.927 -116.847 -117.792 -118.771 -119.564 -120.381 -121.229 -121.876 -122.535 -123.211 -123.9 -124.583 -125.032 -125.485 -126.184 -126.66 -127.149 -127.4 -127.913 -128.443 -128.989 -129.267 -129.651 -130.117 -130.422 -130.743 -131.445 -131.824 -132.223 -132.654 -133.142 -133.714 -134.418 -136.221 -2 ,9821 ,KEBNE ,16708141,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:07:30 CET,0.0 1.011 1.236 1.367 1.468 1.543 1.593 1.632 1.679 1.687 1.701 1.716 1.68 1.667 1.617 1.547 1.477 1.436 1.356 1.28 1.146 1.043 0.939 0.757 0.556 0.356 0.147 -0.072 -0.372 -0.687 -1.004 -1.41 -1.839 -2.267 -2.79 -3.435 -4.099 -4.881 -5.771 -6.761 -7.856 -9.188 -10.896 -12.744 -15.058 -17.875 -21.44 -25.887 -31.836 -39.984 -51.787 -64.026 -72.999 -79.867 -85.384 -89.974 -93.67 -96.825 -99.454 -101.955 -104.059 -105.938 -107.657 -109.202 -110.575 -111.784 -113.013 -114.09 -114.996 -115.913 -116.883 -117.695 -118.522 -119.359 -120.002 -120.664 -121.318 -121.968 -122.624 -123.069 -123.522 -124.225 -124.707 -125.197 -125.451 -125.966 -126.495 -127.041 -127.323 -127.714 -128.169 -128.475 -128.807 -129.496 -129.858 -130.256 -130.672 -131.123 -131.672 -132.465 -134.475 -3 ,12244 ,KEBNE ,16708142,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:07:10 CET,0.0 0.883 1.175 1.308 1.392 1.463 1.506 1.528 1.552 1.551 1.54 1.519 1.465 1.436 1.374 1.283 1.176 1.116 1.005 0.897 0.702 0.556 0.407 0.176 -0.057 -0.295 -0.545 -0.789 -1.118 -1.455 -1.796 -2.244 -2.687 -3.125 -3.69 -4.367 -5.058 -5.866 -6.783 -7.817 -8.986 -10.41 -12.178 -14.076 -16.461 -19.317 -22.9 -27.388 -33.344 -41.453 -53.237 -65.506 -74.474 -81.38 -86.878 -91.485 -95.299 -98.575 -101.254 -103.843 -106.065 -108.031 -109.855 -111.529 -113.014 -114.274 -115.535 -116.614 -117.5 -118.407 -119.354 -120.126 -120.905 -121.711 -122.311 -122.901 -123.515 -124.165 -124.821 -125.261 -125.703 -126.358 -126.81 -127.279 -127.521 -128.015 -128.511 -129.015 -129.271 -129.638 -130.086 -130.378 -130.663 -131.277 -131.613 -131.977 -132.386 -132.861 -133.401 -134.07 -135.987 -4 ,7192 ,KEBNE ,16708143,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:05:24 CET,0.0 1.082 1.352 1.501 1.601 1.666 1.72 1.758 1.796 1.803 1.813 1.829 1.794 1.773 1.719 1.662 1.589 1.549 1.47 1.383 1.222 1.094 0.961 0.758 0.549 0.338 0.127 -0.095 -0.427 -0.763 -1.097 -1.517 -1.937 -2.367 -2.906 -3.56 -4.22 -4.986 -5.888 -6.929 -8.076 -9.42 -11.107 -12.963 -15.297 -18.12 -21.685 -26.171 -32.102 -40.116 -51.772 -63.955 -72.892 -79.791 -85.281 -89.857 -93.568 -96.735 -99.458 -102.15 -104.339 -106.183 -107.865 -109.374 -110.729 -111.933 -113.137 -114.185 -115.082 -115.993 -116.923 -117.686 -118.467 -119.245 -119.827 -120.418 -121.018 -121.632 -122.268 -122.697 -123.135 -123.82 -124.287 -124.762 -125.01 -125.515 -126.046 -126.611 -126.909 -127.309 -127.794 -128.114 -128.436 -129.137 -129.527 -129.937 -130.364 -130.847 -131.391 -132.083 -134.102 -5 ,8598 ,KEBNE ,16708144,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:05:43 CET,0.0 1.014 1.243 1.382 1.48 1.545 1.605 1.628 1.64 1.654 1.656 1.65 1.614 1.596 1.54 1.461 1.368 1.317 1.213 1.105 0.959 0.845 0.713 0.514 0.303 0.1 -0.104 -0.318 -0.599 -0.894 -1.218 -1.648 -2.094 -2.547 -3.103 -3.769 -4.44 -5.216 -6.124 -7.158 -8.322 -9.719 -11.435 -13.299 -15.677 -18.534 -22.108 -26.599 -32.538 -40.607 -52.401 -64.696 -73.767 -80.837 -86.407 -91.014 -94.802 -98.048 -100.698 -103.212 -105.276 -107.065 -108.723 -110.24 -111.616 -112.827 -114.048 -115.092 -115.994 -116.941 -117.883 -118.622 -119.371 -120.133 -120.724 -121.322 -121.934 -122.556 -123.167 -123.602 -124.06 -124.774 -125.264 -125.753 -126.002 -126.509 -127.034 -127.574 -127.848 -128.241 -128.709 -128.99 -129.284 -129.933 -130.291 -130.676 -131.109 -131.585 -132.101 -132.816 -135.374 -6 ,14181 ,KEBNE ,16708145,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:04:36 CET,0.0 0.785 1.035 1.177 1.269 1.32 1.351 1.375 1.36 1.335 1.318 1.303 1.258 1.224 1.147 1.059 0.96 0.915 0.821 0.724 0.551 0.413 0.273 0.05 -0.167 -0.383 -0.615 -0.852 -1.159 -1.48 -1.818 -2.243 -2.681 -3.133 -3.704 -4.395 -5.099 -5.912 -6.831 -7.839 -8.951 -10.306 -12.012 -13.846 -16.165 -19.014 -22.611 -27.115 -33.072 -41.201 -53.122 -65.519 -74.611 -81.702 -87.37 -92.06 -95.887 -99.133 -101.769 -104.306 -106.429 -108.268 -109.96 -111.472 -112.828 -114.04 -115.28 -116.374 -117.301 -118.224 -119.138 -119.89 -120.65 -121.418 -122.008 -122.599 -123.21 -123.839 -124.503 -124.975 -125.458 -126.182 -126.666 -127.168 -127.428 -127.961 -128.512 -129.067 -129.352 -129.762 -130.265 -130.573 -130.892 -131.561 -131.916 -132.314 -132.75 -133.207 -133.726 -134.406 -136.251 -7 ,24252 ,KEBNE ,16708146,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:05:14 CET,0.0 0.651 0.853 0.992 1.1 1.153 1.175 1.192 1.207 1.197 1.179 1.16 1.111 1.074 0.992 0.906 0.794 0.74 0.642 0.526 0.345 0.216 0.094 -0.09 -0.301 -0.522 -0.748 -0.985 -1.316 -1.644 -1.975 -2.403 -2.849 -3.316 -3.883 -4.54 -5.198 -5.969 -6.864 -7.862 -8.97 -10.319 -12.023 -13.876 -16.207 -19.024 -22.609 -27.113 -33.11 -41.304 -53.126 -65.294 -74.259 -81.25 -86.753 -91.386 -95.21 -98.446 -101.106 -103.676 -105.824 -107.675 -109.385 -110.942 -112.346 -113.608 -114.915 -116.073 -117.058 -118.043 -119.002 -119.758 -120.533 -121.343 -121.967 -122.583 -123.206 -123.838 -124.475 -124.913 -125.376 -126.108 -126.602 -127.102 -127.355 -127.865 -128.387 -128.932 -129.219 -129.619 -130.122 -130.438 -130.757 -131.417 -131.765 -132.128 -132.535 -132.999 -133.558 -134.343 -136.607 -8 ,15274 ,KEBNE ,16708147,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:05:03 CET,0.0 0.632 0.89 1.04 1.134 1.218 1.275 1.317 1.335 1.321 1.314 1.311 1.269 1.242 1.181 1.115 1.039 0.99 0.88 0.767 0.589 0.457 0.328 0.146 -0.036 -0.241 -0.462 -0.685 -0.999 -1.324 -1.645 -2.064 -2.487 -2.909 -3.443 -4.073 -4.717 -5.478 -6.348 -7.327 -8.417 -9.75 -11.419 -13.225 -15.556 -18.395 -21.976 -26.514 -32.497 -40.64 -52.643 -65.089 -74.079 -81.059 -86.624 -91.239 -95.033 -98.263 -100.913 -103.461 -105.571 -107.377 -109.05 -110.569 -111.952 -113.194 -114.431 -115.475 -116.349 -117.24 -118.134 -118.866 -119.631 -120.424 -121.023 -121.629 -122.275 -122.947 -123.631 -124.094 -124.571 -125.318 -125.814 -126.318 -126.573 -127.084 -127.609 -128.143 -128.422 -128.819 -129.326 -129.644 -129.962 -130.638 -131.019 -131.432 -131.878 -132.371 -132.951 -133.707 -135.459 -9 ,5348 ,KEBNE ,16708148,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:05:45 CET,0.0 1.117 1.384 1.534 1.608 1.674 1.736 1.781 1.831 1.842 1.843 1.851 1.818 1.807 1.781 1.731 1.656 1.622 1.56 1.485 1.349 1.245 1.139 0.963 0.778 0.594 0.407 0.206 -0.081 -0.367 -0.66 -1.059 -1.482 -1.912 -2.444 -3.083 -3.729 -4.474 -5.331 -6.302 -7.396 -8.725 -10.416 -12.28 -14.607 -17.409 -20.916 -25.325 -31.278 -39.437 -51.381 -63.733 -72.668 -79.616 -85.245 -89.912 -93.683 -96.908 -99.626 -102.247 -104.396 -106.213 -107.864 -109.409 -110.809 -112.026 -113.257 -114.341 -115.247 -116.166 -117.102 -117.853 -118.613 -119.386 -119.988 -120.601 -121.21 -121.815 -122.443 -122.88 -123.313 -123.982 -124.451 -124.917 -125.147 -125.633 -126.145 -126.658 -126.925 -127.307 -127.757 -128.048 -128.343 -128.966 -129.305 -129.66 -130.031 -130.447 -130.905 -131.446 -132.81 -10 ,27183 ,KEBNE ,16708149,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:05:29 CET,0.0 1.035 1.345 1.494 1.585 1.643 1.671 1.686 1.693 1.68 1.669 1.661 1.611 1.58 1.517 1.444 1.363 1.318 1.216 1.115 0.966 0.849 0.726 0.52 0.288 0.074 -0.146 -0.38 -0.71 -1.052 -1.396 -1.837 -2.268 -2.71 -3.256 -3.89 -4.559 -5.357 -6.276 -7.309 -8.448 -9.815 -11.527 -13.343 -15.586 -18.392 -21.998 -26.505 -32.463 -40.556 -52.378 -64.632 -73.572 -80.496 -86.037 -90.654 -94.443 -97.7 -100.412 -103.025 -105.221 -107.136 -108.9 -110.519 -111.967 -113.238 -114.53 -115.66 -116.595 -117.5 -118.413 -119.175 -119.939 -120.717 -121.312 -121.919 -122.556 -123.2 -123.86 -124.307 -124.758 -125.459 -125.954 -126.453 -126.698 -127.191 -127.684 -128.197 -128.476 -128.873 -129.376 -129.686 -129.998 -130.695 -131.058 -131.442 -131.874 -132.36 -132.914 -133.645 -135.71 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_165.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_165.txt deleted file mode 100644 index 70e73598..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_165.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30964 ,KEBNE ,16708150,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:05:47 CET,0.0 0.81 0.967 1.052 1.105 1.129 1.146 1.15 1.125 1.11 1.088 1.047 0.985 0.936 0.824 0.704 0.571 0.501 0.356 0.201 -0.026 -0.178 -0.33 -0.56 -0.805 -1.046 -1.284 -1.529 -1.866 -2.218 -2.577 -3.054 -3.565 -4.09 -4.727 -5.48 -6.228 -7.089 -8.079 -9.181 -10.382 -11.852 -13.744 -15.785 -18.348 -21.408 -25.215 -30.01 -36.354 -44.932 -57.366 -70.235 -79.619 -86.839 -92.616 -97.488 -101.466 -104.848 -107.625 -110.254 -112.392 -114.262 -116.008 -117.589 -119.038 -120.361 -121.69 -122.814 -123.775 -124.758 -125.732 -126.517 -127.337 -128.151 -128.759 -129.378 -130.001 -130.627 -131.279 -131.73 -132.182 -132.84 -133.285 -133.76 -133.998 -134.459 -134.916 -135.414 -135.667 -136.029 -136.448 -136.722 -137.007 -137.628 -137.952 -138.274 -138.63 -139.057 -139.546 -140.135 -141.099 -2 ,10962 ,KEBNE ,16708151,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:05:38 CET,0.0 0.687 0.854 0.954 1.02 1.057 1.061 1.05 1.016 1.001 0.982 0.936 0.871 0.828 0.737 0.641 0.518 0.447 0.31 0.163 -0.055 -0.19 -0.326 -0.543 -0.791 -1.059 -1.32 -1.581 -1.962 -2.361 -2.757 -3.261 -3.768 -4.275 -4.896 -5.623 -6.382 -7.275 -8.289 -9.387 -10.598 -12.104 -13.99 -16.018 -18.53 -21.559 -25.408 -30.198 -36.481 -44.949 -57.31 -70.158 -79.45 -86.603 -92.294 -97.019 -100.881 -104.164 -106.866 -109.496 -111.667 -113.51 -115.216 -116.76 -118.128 -119.342 -120.616 -121.737 -122.662 -123.602 -124.568 -125.353 -126.13 -126.901 -127.486 -128.073 -128.688 -129.321 -129.958 -130.388 -130.82 -131.493 -131.955 -132.422 -132.661 -133.136 -133.603 -134.066 -134.295 -134.657 -135.064 -135.327 -135.611 -136.201 -136.504 -136.826 -137.186 -137.586 -138.061 -138.638 -139.846 -3 ,10330 ,KEBNE ,16708152,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:04:58 CET,0.0 0.654 0.806 0.897 0.975 1.035 1.059 1.062 1.043 1.025 0.989 0.918 0.85 0.808 0.742 0.662 0.572 0.523 0.407 0.28 0.08 -0.065 -0.222 -0.473 -0.729 -0.984 -1.253 -1.517 -1.867 -2.238 -2.624 -3.123 -3.618 -4.11 -4.715 -5.442 -6.184 -7.054 -8.051 -9.161 -10.397 -11.883 -13.728 -15.672 -18.102 -21.124 -24.971 -29.747 -36.051 -44.645 -57.089 -69.898 -79.227 -86.404 -92.08 -96.815 -100.761 -104.104 -106.776 -109.318 -111.416 -113.26 -114.976 -116.504 -117.863 -119.064 -120.304 -121.379 -122.264 -123.17 -124.097 -124.851 -125.616 -126.379 -126.953 -127.534 -128.131 -128.733 -129.336 -129.745 -130.159 -130.8 -131.251 -131.721 -131.951 -132.415 -132.905 -133.419 -133.678 -134.052 -134.484 -134.758 -135.039 -135.626 -135.941 -136.285 -136.651 -137.042 -137.479 -138.05 -139.5 -4 ,1476 ,KEBNE ,16708153,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:05:47 CET,0.0 0.554 0.658 0.747 0.797 0.81 0.8 0.795 0.798 0.792 0.771 0.729 0.673 0.633 0.528 0.401 0.268 0.201 0.069 -0.073 -0.327 -0.491 -0.641 -0.875 -1.115 -1.363 -1.627 -1.903 -2.263 -2.641 -3.032 -3.513 -3.999 -4.479 -5.076 -5.794 -6.515 -7.361 -8.309 -9.343 -10.539 -12.038 -13.912 -15.914 -18.437 -21.486 -25.294 -30.038 -36.337 -44.885 -57.309 -70.165 -79.475 -86.674 -92.374 -97.068 -100.918 -104.179 -106.827 -109.359 -111.444 -113.244 -114.936 -116.463 -117.812 -118.999 -120.209 -121.264 -122.154 -123.047 -123.947 -124.675 -125.394 -126.12 -126.68 -127.243 -127.811 -128.374 -128.934 -129.324 -129.726 -130.337 -130.747 -131.19 -131.422 -131.879 -132.343 -132.817 -133.06 -133.418 -133.796 -134.052 -134.321 -134.889 -135.203 -135.534 -135.871 -136.24 -136.685 -137.283 -138.9 -5 ,23304 ,KEBNE ,16708154,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:05:22 CET,0.0 0.595 0.754 0.847 0.903 0.923 0.939 0.958 0.965 0.952 0.928 0.895 0.835 0.791 0.708 0.607 0.494 0.437 0.314 0.176 -0.037 -0.179 -0.325 -0.542 -0.765 -1.005 -1.262 -1.528 -1.87 -2.217 -2.581 -3.032 -3.494 -3.973 -4.581 -5.332 -6.092 -6.948 -7.89 -8.986 -10.251 -11.737 -13.604 -15.634 -18.192 -21.295 -25.158 -29.979 -36.376 -44.98 -57.473 -70.442 -79.954 -87.446 -93.434 -98.38 -102.476 -105.995 -108.895 -111.718 -114.048 -116.013 -117.82 -119.473 -120.954 -122.282 -123.617 -124.753 -125.723 -126.698 -127.703 -128.551 -129.403 -130.261 -130.896 -131.521 -132.156 -132.824 -133.533 -134.005 -134.467 -135.187 -135.675 -136.173 -136.426 -136.952 -137.492 -138.038 -138.316 -138.726 -139.204 -139.517 -139.847 -140.514 -140.86 -141.246 -141.665 -142.113 -142.598 -143.152 -144.283 -6 ,27702 ,KEBNE ,16708155,Fri Nov 26 15:33:29 CET,Fri Nov 26 17:05:08 CET,0.0 0.824 1.014 1.13 1.193 1.224 1.235 1.239 1.226 1.207 1.17 1.103 1.04 1.002 0.934 0.852 0.761 0.713 0.603 0.478 0.291 0.156 0.006 -0.232 -0.492 -0.762 -1.035 -1.306 -1.666 -2.03 -2.391 -2.86 -3.37 -3.886 -4.505 -5.251 -6.005 -6.864 -7.843 -8.965 -10.198 -11.676 -13.543 -15.518 -18.004 -21.061 -24.941 -29.793 -36.143 -44.682 -57.107 -70.002 -79.391 -86.598 -92.282 -97.005 -100.87 -104.17 -106.878 -109.44 -111.544 -113.357 -115.047 -116.59 -117.991 -119.257 -120.555 -121.705 -122.66 -123.583 -124.498 -125.244 -126.014 -126.802 -127.395 -127.989 -128.585 -129.191 -129.826 -130.253 -130.671 -131.309 -131.757 -132.216 -132.445 -132.914 -133.383 -133.863 -134.109 -134.477 -134.879 -135.147 -135.417 -135.98 -136.291 -136.61 -136.944 -137.314 -137.755 -138.363 -139.795 -7 ,15907 ,KEBNE ,16708156,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:01 CET,0.0 0.491 0.622 0.688 0.727 0.746 0.757 0.766 0.77 0.765 0.738 0.68 0.613 0.556 0.443 0.339 0.214 0.143 -0.001 -0.141 -0.357 -0.519 -0.694 -0.948 -1.183 -1.429 -1.694 -1.976 -2.365 -2.756 -3.148 -3.641 -4.141 -4.635 -5.233 -5.967 -6.687 -7.482 -8.447 -9.574 -10.81 -12.302 -14.171 -16.183 -18.693 -21.737 -25.602 -30.458 -36.801 -45.383 -57.893 -70.757 -80.08 -87.225 -92.864 -97.553 -101.429 -104.774 -107.49 -110.048 -112.136 -113.919 -115.587 -117.118 -118.49 -119.693 -120.915 -121.983 -122.885 -123.802 -124.727 -125.487 -126.269 -127.056 -127.656 -128.256 -128.846 -129.438 -130.051 -130.477 -130.907 -131.562 -131.999 -132.436 -132.663 -133.135 -133.59 -134.046 -134.293 -134.659 -135.059 -135.323 -135.595 -136.193 -136.54 -136.908 -137.269 -137.647 -138.088 -138.676 -139.945 -8 ,10061 ,KEBNE ,16708157,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:23 CET,0.0 0.596 0.766 0.865 0.911 0.937 0.939 0.928 0.873 0.836 0.798 0.723 0.645 0.583 0.461 0.333 0.196 0.133 0.013 -0.124 -0.355 -0.515 -0.671 -0.919 -1.191 -1.461 -1.74 -2.027 -2.404 -2.782 -3.173 -3.663 -4.145 -4.628 -5.22 -5.929 -6.649 -7.491 -8.461 -9.567 -10.815 -12.319 -14.208 -16.237 -18.762 -21.829 -25.717 -30.549 -36.88 -45.45 -57.882 -70.619 -79.851 -86.993 -92.652 -97.421 -101.371 -104.683 -107.367 -109.94 -112.069 -113.891 -115.558 -117.064 -118.415 -119.634 -120.869 -121.917 -122.814 -123.716 -124.617 -125.356 -126.108 -126.87 -127.447 -128.026 -128.617 -129.223 -129.84 -130.254 -130.691 -131.383 -131.863 -132.352 -132.598 -133.11 -133.599 -134.074 -134.327 -134.694 -135.099 -135.372 -135.657 -136.263 -136.577 -136.903 -137.255 -137.664 -138.136 -138.751 -140.124 -9 ,1443 ,KEBNE ,16708158,Fri Nov 26 15:34:29 CET,Fri Nov 26 17:06:27 CET,0.0 0.569 0.72 0.783 0.824 0.848 0.866 0.872 0.84 0.816 0.781 0.704 0.63 0.58 0.477 0.367 0.257 0.204 0.09 -0.046 -0.25 -0.388 -0.536 -0.775 -1.026 -1.266 -1.523 -1.805 -2.203 -2.606 -3.0 -3.509 -4.029 -4.556 -5.166 -5.852 -6.572 -7.446 -8.451 -9.569 -10.834 -12.357 -14.241 -16.291 -18.878 -21.992 -25.879 -30.718 -37.112 -45.806 -58.543 -71.665 -81.129 -88.442 -94.201 -98.949 -102.822 -106.121 -108.826 -111.458 -113.634 -115.45 -117.103 -118.595 -119.984 -121.236 -122.466 -123.514 -124.376 -125.27 -126.181 -126.907 -127.652 -128.409 -128.984 -129.562 -130.156 -130.766 -131.38 -131.801 -132.228 -132.87 -133.317 -133.772 -134.003 -134.487 -134.974 -135.47 -135.721 -136.083 -136.5 -136.777 -137.065 -137.64 -137.935 -138.288 -138.669 -139.032 -139.408 -139.877 -141.192 -10 ,30458 ,KEBNE ,16708159,Fri Nov 26 15:34:29 CET,Fri Nov 26 17:05:38 CET,0.0 0.873 1.017 1.084 1.118 1.126 1.131 1.123 1.062 1.025 0.992 0.95 0.887 0.84 0.749 0.64 0.514 0.449 0.301 0.147 -0.077 -0.238 -0.412 -0.677 -0.944 -1.214 -1.485 -1.762 -2.141 -2.525 -2.915 -3.413 -3.923 -4.433 -5.05 -5.8 -6.57 -7.427 -8.342 -9.38 -10.578 -12.024 -13.866 -15.881 -18.427 -21.522 -25.417 -30.277 -36.63 -45.138 -57.53 -70.356 -79.683 -86.865 -92.524 -97.25 -101.124 -104.389 -107.061 -109.603 -111.709 -113.53 -115.249 -116.824 -118.186 -119.384 -120.601 -121.641 -122.525 -123.432 -124.342 -125.078 -125.834 -126.602 -127.168 -127.75 -128.351 -128.939 -129.535 -129.948 -130.363 -131.002 -131.449 -131.9 -132.127 -132.603 -133.09 -133.584 -133.84 -134.205 -134.635 -134.952 -135.271 -135.891 -136.213 -136.541 -136.889 -137.268 -137.71 -138.267 -139.397 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_227.txt deleted file mode 100644 index aca49e9c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5437 ,TETRA ,17667956,Fri Dec 3 06:09:46 CET,Fri Dec 3 07:57:22 CET,0.0 0.979 1.255 1.458 1.638 1.792 1.935 2.068 2.283 2.377 2.464 2.638 2.685 2.758 2.898 3.031 3.157 3.219 3.336 3.453 3.611 3.703 3.8 3.958 4.083 4.179 4.272 4.368 4.499 4.621 4.73 4.851 4.982 5.11 5.237 5.355 5.463 5.588 5.694 5.786 5.853 5.925 6.03 6.05 5.97 5.81 5.557 5.227 4.679 3.766 2.16 0.183 -1.544 -3.032 -4.272 -5.377 -6.303 -7.14 -7.893 -8.663 -9.32 -9.867 -10.374 -10.846 -11.285 -11.701 -12.138 -12.548 -12.919 -13.286 -13.651 -13.952 -14.264 -14.588 -14.838 -15.087 -15.336 -15.581 -15.824 -16.001 -16.194 -16.504 -16.717 -16.941 -17.061 -17.308 -17.572 -17.841 -17.966 -18.088 -18.385 -18.541 -18.696 -19.035 -19.23 -19.455 -19.7 -19.945 -20.233 -20.632 -21.803 -2 ,18687 ,TETRA ,17667957,Fri Dec 3 06:10:44 CET,Fri Dec 3 07:59:43 CET,0.0 0.794 1.136 1.389 1.596 1.758 1.889 2.014 2.247 2.348 2.443 2.629 2.683 2.758 2.886 3.019 3.153 3.215 3.342 3.462 3.623 3.727 3.83 3.97 4.086 4.183 4.28 4.384 4.516 4.628 4.721 4.824 4.923 5.019 5.14 5.268 5.361 5.448 5.522 5.589 5.652 5.706 5.751 5.762 5.732 5.616 5.402 5.123 4.589 3.576 1.785 -0.337 -2.036 -3.472 -4.706 -5.801 -6.749 -7.613 -8.357 -9.046 -9.636 -10.177 -10.681 -11.165 -11.611 -12.016 -12.435 -12.775 -13.059 -13.368 -13.7 -14.001 -14.32 -14.628 -14.863 -15.099 -15.343 -15.587 -15.824 -15.989 -16.178 -16.489 -16.69 -16.897 -17.004 -17.215 -17.428 -17.653 -17.78 -17.919 -18.23 -18.387 -18.537 -18.871 -19.057 -19.254 -19.465 -19.716 -20.047 -20.47 -21.442 -3 ,18502 ,TETRA ,17667958,Fri Dec 3 06:10:46 CET,Fri Dec 3 08:02:35 CET,0.0 1.043 1.357 1.596 1.762 1.909 2.048 2.175 2.382 2.476 2.572 2.776 2.832 2.902 3.035 3.166 3.281 3.338 3.465 3.578 3.729 3.833 3.923 4.036 4.159 4.301 4.424 4.526 4.651 4.747 4.826 4.926 5.038 5.149 5.281 5.414 5.535 5.67 5.785 5.879 5.982 6.082 6.126 6.154 6.193 6.128 5.914 5.571 4.999 3.997 2.227 0.151 -1.574 -3.0 -4.226 -5.32 -6.259 -7.121 -7.852 -8.548 -9.163 -9.734 -10.269 -10.753 -11.165 -11.536 -11.939 -12.292 -12.584 -12.896 -13.212 -13.472 -13.77 -14.061 -14.279 -14.512 -14.73 -14.962 -15.223 -15.414 -15.607 -15.886 -16.075 -16.266 -16.367 -16.58 -16.809 -17.085 -17.225 -17.346 -17.624 -17.772 -17.912 -18.202 -18.364 -18.574 -18.822 -19.112 -19.45 -19.854 -21.065 -4 ,2260 ,TETRA ,17667959,Fri Dec 3 06:10:46 CET,Fri Dec 3 08:02:44 CET,0.0 1.07 1.408 1.684 1.887 2.021 2.149 2.281 2.519 2.622 2.718 2.92 2.977 3.059 3.215 3.365 3.502 3.56 3.669 3.783 3.954 4.056 4.15 4.265 4.37 4.495 4.619 4.73 4.866 4.982 5.075 5.19 5.311 5.417 5.564 5.733 5.836 5.941 6.068 6.169 6.282 6.443 6.556 6.601 6.574 6.44 6.238 5.894 5.376 4.47 2.747 0.637 -1.09 -2.563 -3.833 -4.955 -5.947 -6.852 -7.623 -8.386 -9.044 -9.642 -10.188 -10.693 -11.158 -11.551 -11.967 -12.335 -12.643 -12.985 -13.347 -13.626 -13.922 -14.237 -14.471 -14.711 -14.962 -15.222 -15.489 -15.669 -15.858 -16.158 -16.362 -16.581 -16.693 -16.924 -17.172 -17.425 -17.556 -17.69 -17.968 -18.112 -18.275 -18.641 -18.834 -19.045 -19.3 -19.586 -19.904 -20.34 -21.401 -5 ,18940 ,TETRA ,17667960,Fri Dec 3 06:10:46 CET,Fri Dec 3 07:57:52 CET,0.0 0.986 1.228 1.419 1.585 1.735 1.867 1.985 2.196 2.293 2.385 2.581 2.637 2.725 2.893 3.028 3.158 3.221 3.344 3.469 3.638 3.738 3.84 3.99 4.129 4.267 4.396 4.504 4.62 4.736 4.868 5.019 5.13 5.225 5.346 5.519 5.671 5.813 5.96 6.114 6.258 6.393 6.528 6.589 6.584 6.5 6.312 6.003 5.414 4.405 2.507 0.123 -1.729 -3.261 -4.581 -5.784 -6.815 -7.707 -8.476 -9.222 -9.846 -10.405 -10.927 -11.411 -11.865 -12.278 -12.725 -13.143 -13.515 -13.911 -14.319 -14.656 -15.003 -15.351 -15.609 -15.871 -16.125 -16.382 -16.656 -16.852 -17.046 -17.332 -17.541 -17.766 -17.881 -18.107 -18.342 -18.594 -18.731 -18.877 -19.196 -19.36 -19.538 -19.9 -20.083 -20.296 -20.529 -20.797 -21.109 -21.539 -22.885 -6 ,14318 ,TETRA ,17667961,Fri Dec 3 06:10:49 CET,Fri Dec 3 07:58:12 CET,0.0 0.875 1.212 1.474 1.661 1.826 1.983 2.124 2.387 2.501 2.605 2.811 2.872 2.956 3.109 3.248 3.385 3.453 3.568 3.686 3.862 3.962 4.056 4.191 4.326 4.469 4.591 4.699 4.834 4.941 5.051 5.165 5.255 5.35 5.443 5.537 5.633 5.741 5.837 5.888 5.927 6.001 6.064 6.071 6.031 5.891 5.665 5.313 4.74 3.825 2.139 -0.066 -1.831 -3.351 -4.659 -5.778 -6.728 -7.566 -8.293 -9.03 -9.642 -10.173 -10.697 -11.179 -11.623 -12.027 -12.451 -12.833 -13.151 -13.485 -13.834 -14.109 -14.391 -14.688 -14.915 -15.159 -15.417 -15.681 -15.958 -16.149 -16.338 -16.657 -16.891 -17.132 -17.251 -17.483 -17.733 -18.0 -18.146 -18.295 -18.624 -18.794 -18.971 -19.367 -19.587 -19.815 -20.063 -20.359 -20.714 -21.113 -21.938 -7 ,31950 ,TETRA ,17667962,Fri Dec 3 06:11:42 CET,Fri Dec 3 08:01:36 CET,0.0 0.912 1.276 1.544 1.778 1.959 2.104 2.244 2.522 2.636 2.736 2.93 2.979 3.064 3.228 3.368 3.498 3.564 3.695 3.807 3.967 4.065 4.151 4.294 4.445 4.569 4.662 4.751 4.891 5.028 5.152 5.305 5.427 5.536 5.675 5.839 5.993 6.148 6.257 6.302 6.346 6.412 6.452 6.436 6.375 6.25 6.06 5.753 5.173 4.169 2.388 0.139 -1.736 -3.302 -4.607 -5.727 -6.699 -7.586 -8.327 -9.029 -9.621 -10.158 -10.666 -11.146 -11.588 -11.98 -12.387 -12.744 -13.055 -13.378 -13.717 -14.021 -14.343 -14.657 -14.888 -15.14 -15.422 -15.706 -15.982 -16.166 -16.346 -16.634 -16.843 -17.071 -17.192 -17.426 -17.66 -17.921 -18.061 -18.189 -18.478 -18.631 -18.789 -19.141 -19.34 -19.538 -19.755 -20.02 -20.362 -20.828 -22.202 -8 ,30192 ,TETRA ,17667963,Fri Dec 3 06:12:44 CET,Fri Dec 3 08:00:43 CET,0.0 1.04 1.42 1.67 1.852 2.007 2.159 2.312 2.578 2.683 2.775 2.996 3.065 3.143 3.276 3.42 3.563 3.625 3.741 3.855 4.012 4.104 4.196 4.332 4.445 4.541 4.631 4.725 4.864 4.995 5.1 5.217 5.331 5.433 5.534 5.63 5.702 5.775 5.874 5.959 6.052 6.162 6.218 6.221 6.161 6.036 5.807 5.383 4.752 3.803 2.095 -0.046 -1.801 -3.291 -4.546 -5.661 -6.643 -7.525 -8.274 -9.005 -9.699 -10.322 -10.875 -11.391 -11.86 -12.29 -12.713 -13.06 -13.374 -13.712 -14.06 -14.341 -14.638 -14.959 -15.203 -15.44 -15.681 -15.934 -16.224 -16.427 -16.619 -16.914 -17.118 -17.331 -17.439 -17.67 -17.914 -18.163 -18.297 -18.427 -18.704 -18.858 -19.022 -19.383 -19.584 -19.8 -20.039 -20.308 -20.648 -21.128 -22.322 -9 ,26161 ,TETRA ,17667964,Fri Dec 3 06:11:42 CET,Fri Dec 3 07:59:07 CET,0.0 0.868 1.178 1.425 1.629 1.831 2.019 2.179 2.428 2.541 2.66 2.903 2.977 3.077 3.268 3.46 3.624 3.687 3.813 3.944 4.128 4.238 4.354 4.517 4.652 4.778 4.894 5.002 5.154 5.308 5.447 5.605 5.758 5.88 5.997 6.148 6.28 6.383 6.466 6.567 6.67 6.752 6.807 6.83 6.855 6.819 6.632 6.309 5.829 4.967 3.261 1.179 -0.583 -2.118 -3.412 -4.519 -5.514 -6.428 -7.221 -8.008 -8.662 -9.245 -9.795 -10.294 -10.748 -11.166 -11.607 -12.012 -12.363 -12.713 -13.081 -13.383 -13.684 -13.997 -14.256 -14.525 -14.792 -15.075 -15.364 -15.561 -15.762 -16.084 -16.316 -16.543 -16.658 -16.889 -17.134 -17.4 -17.535 -17.669 -17.971 -18.129 -18.293 -18.646 -18.849 -19.061 -19.278 -19.533 -19.849 -20.265 -21.518 -10 ,32352 ,TETRA ,17667965,Fri Dec 3 06:12:43 CET,Fri Dec 3 07:59:47 CET,0.0 0.705 1.058 1.324 1.517 1.698 1.866 2.003 2.237 2.346 2.445 2.662 2.731 2.809 2.938 3.074 3.209 3.272 3.398 3.518 3.672 3.76 3.84 3.958 4.07 4.179 4.272 4.344 4.448 4.551 4.653 4.79 4.917 5.034 5.169 5.306 5.436 5.563 5.67 5.801 5.901 5.955 6.019 6.057 6.122 6.188 6.06 5.75 5.272 4.369 2.671 0.598 -1.085 -2.483 -3.679 -4.782 -5.753 -6.631 -7.384 -8.191 -8.861 -9.376 -9.86 -10.326 -10.764 -11.175 -11.599 -11.959 -12.259 -12.558 -12.867 -13.13 -13.408 -13.685 -13.892 -14.109 -14.342 -14.588 -14.83 -14.996 -15.174 -15.459 -15.652 -15.841 -15.938 -16.157 -16.391 -16.626 -16.745 -16.858 -17.088 -17.216 -17.36 -17.659 -17.828 -18.002 -18.196 -18.443 -18.702 -19.043 -19.993 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_235.txt deleted file mode 100644 index cf7e2623..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24861 ,KEBNE ,16708160,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:58 CET,0.0 1.043 1.469 1.783 2.022 2.234 2.434 2.606 2.875 3.005 3.128 3.363 3.444 3.539 3.719 3.888 4.061 4.143 4.287 4.431 4.649 4.79 4.916 5.1 5.298 5.478 5.643 5.819 6.029 6.206 6.375 6.587 6.805 7.02 7.272 7.548 7.807 8.056 8.289 8.553 8.822 9.136 9.497 9.798 10.116 10.434 10.752 11.098 11.376 11.43 11.068 10.318 9.525 8.702 7.948 7.261 6.657 6.078 5.55 5.049 4.645 4.272 3.888 3.532 3.217 2.935 2.619 2.297 2.008 1.714 1.424 1.198 0.963 0.718 0.506 0.258 -0.005 -0.253 -0.495 -0.674 -0.851 -1.111 -1.291 -1.475 -1.577 -1.792 -2.019 -2.274 -2.411 -2.538 -2.843 -2.988 -3.152 -3.538 -3.751 -3.994 -4.262 -4.559 -4.903 -5.35 -6.956 -2 ,14899 ,KEBNE ,16708161,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:07:32 CET,0.0 1.642 2.074 2.377 2.617 2.826 3.001 3.147 3.436 3.569 3.68 3.917 4.0 4.11 4.323 4.502 4.671 4.757 4.932 5.097 5.321 5.466 5.616 5.827 6.015 6.2 6.381 6.541 6.727 6.904 7.09 7.337 7.578 7.785 7.997 8.221 8.433 8.664 8.899 9.144 9.397 9.66 9.927 10.199 10.488 10.789 11.079 11.272 11.411 11.402 11.049 10.311 9.525 8.749 8.04 7.373 6.782 6.231 5.742 5.225 4.755 4.35 3.961 3.594 3.255 2.945 2.635 2.363 2.124 1.874 1.606 1.369 1.126 0.879 0.684 0.468 0.252 0.036 -0.188 -0.344 -0.515 -0.778 -0.962 -1.157 -1.256 -1.469 -1.694 -1.944 -2.079 -2.21 -2.534 -2.695 -2.867 -3.222 -3.431 -3.656 -3.904 -4.175 -4.472 -4.932 -6.633 -3 ,502 ,KEBNE ,16708162,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:25 CET,0.0 1.173 1.63 1.947 2.201 2.41 2.607 2.784 3.062 3.187 3.307 3.562 3.649 3.755 3.968 4.185 4.389 4.478 4.642 4.8 5.028 5.157 5.272 5.45 5.625 5.803 5.982 6.155 6.361 6.545 6.733 6.954 7.174 7.387 7.64 7.962 8.266 8.541 8.791 9.074 9.409 9.758 10.102 10.441 10.816 11.201 11.583 11.933 12.302 12.485 12.178 11.395 10.588 9.891 9.253 8.615 8.032 7.485 6.993 6.48 6.05 5.649 5.232 4.841 4.502 4.188 3.824 3.493 3.204 2.913 2.61 2.358 2.1 1.841 1.657 1.461 1.263 1.071 0.84 0.671 0.508 0.254 0.065 -0.137 -0.237 -0.455 -0.692 -0.926 -1.054 -1.175 -1.504 -1.666 -1.815 -2.143 -2.346 -2.584 -2.848 -3.162 -3.565 -4.069 -5.759 -4 ,19122 ,KEBNE ,16708163,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:05:33 CET,0.0 1.629 2.033 2.291 2.505 2.711 2.893 3.053 3.346 3.479 3.616 3.897 3.986 4.089 4.295 4.496 4.681 4.769 4.922 5.061 5.271 5.403 5.534 5.735 5.941 6.139 6.313 6.464 6.643 6.822 6.996 7.192 7.378 7.571 7.815 8.055 8.269 8.513 8.779 9.095 9.42 9.719 10.059 10.378 10.668 10.976 11.328 11.704 11.973 12.018 11.724 10.949 10.151 9.427 8.746 8.087 7.486 6.943 6.472 6.003 5.578 5.173 4.791 4.437 4.103 3.8 3.48 3.208 2.972 2.729 2.47 2.237 1.987 1.729 1.536 1.334 1.128 0.912 0.679 0.526 0.372 0.116 -0.07 -0.28 -0.387 -0.588 -0.792 -1.019 -1.14 -1.252 -1.545 -1.689 -1.838 -2.172 -2.366 -2.586 -2.819 -3.075 -3.419 -3.906 -5.737 -5 ,16095 ,KEBNE ,16708164,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:05:41 CET,0.0 1.382 1.807 2.098 2.346 2.566 2.762 2.949 3.273 3.403 3.529 3.78 3.863 3.965 4.178 4.38 4.562 4.65 4.825 4.986 5.21 5.355 5.495 5.69 5.869 6.04 6.207 6.368 6.574 6.76 6.936 7.173 7.417 7.628 7.846 8.097 8.345 8.643 8.96 9.286 9.627 9.956 10.271 10.573 10.949 11.317 11.636 11.877 12.048 12.028 11.562 10.657 9.731 8.873 8.123 7.415 6.773 6.188 5.648 5.065 4.561 4.138 3.727 3.32 2.951 2.622 2.284 1.959 1.669 1.38 1.086 0.838 0.554 0.235 -0.011 -0.248 -0.484 -0.728 -0.969 -1.129 -1.287 -1.543 -1.721 -1.898 -1.994 -2.201 -2.419 -2.669 -2.791 -2.893 -3.189 -3.353 -3.524 -3.884 -4.089 -4.305 -4.541 -4.838 -5.206 -5.697 -7.482 -6 ,15849 ,KEBNE ,16708165,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:49 CET,0.0 1.697 2.094 2.394 2.645 2.856 3.055 3.244 3.577 3.717 3.835 4.081 4.168 4.275 4.496 4.704 4.893 4.979 5.152 5.312 5.525 5.658 5.786 5.963 6.145 6.333 6.514 6.695 6.921 7.14 7.347 7.591 7.821 8.01 8.217 8.454 8.702 8.984 9.253 9.528 9.803 10.074 10.367 10.655 10.99 11.338 11.679 11.981 12.16 12.167 11.891 11.164 10.321 9.455 8.644 7.904 7.277 6.703 6.193 5.667 5.203 4.782 4.378 3.995 3.645 3.342 3.001 2.664 2.355 2.033 1.698 1.425 1.186 0.958 0.765 0.549 0.328 0.113 -0.12 -0.286 -0.452 -0.703 -0.884 -1.071 -1.164 -1.358 -1.564 -1.771 -1.877 -1.979 -2.272 -2.415 -2.558 -2.892 -3.09 -3.308 -3.559 -3.865 -4.204 -4.662 -6.076 -7 ,30246 ,KEBNE ,16708166,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:34 CET,0.0 1.405 1.854 2.186 2.429 2.644 2.844 3.02 3.338 3.474 3.59 3.849 3.936 4.034 4.224 4.412 4.607 4.699 4.857 4.999 5.207 5.341 5.47 5.668 5.872 6.075 6.251 6.409 6.626 6.819 6.994 7.2 7.396 7.586 7.802 8.025 8.236 8.481 8.72 8.979 9.238 9.516 9.855 10.172 10.528 10.885 11.188 11.468 11.811 12.053 11.915 11.267 10.459 9.684 8.977 8.319 7.769 7.25 6.77 6.269 5.816 5.411 5.018 4.642 4.262 3.865 3.458 3.128 2.862 2.59 2.313 2.081 1.826 1.563 1.361 1.152 0.934 0.69 0.432 0.27 0.109 -0.153 -0.334 -0.53 -0.633 -0.854 -1.106 -1.361 -1.496 -1.626 -1.942 -2.097 -2.254 -2.603 -2.81 -3.043 -3.296 -3.562 -3.875 -4.337 -6.294 -8 ,32595 ,KEBNE ,16708167,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:22 CET,0.0 2.059 2.507 2.81 3.048 3.267 3.458 3.621 3.913 4.053 4.188 4.45 4.53 4.644 4.866 5.056 5.237 5.325 5.494 5.654 5.877 6.007 6.124 6.314 6.502 6.663 6.822 6.999 7.21 7.39 7.558 7.746 7.938 8.116 8.32 8.56 8.776 9.021 9.316 9.632 9.94 10.229 10.5 10.787 11.131 11.44 11.713 11.941 12.108 12.148 11.861 11.191 10.505 9.801 9.13 8.505 7.934 7.412 6.965 6.51 6.111 5.752 5.382 5.023 4.714 4.445 4.153 3.892 3.675 3.439 3.175 2.949 2.718 2.488 2.307 2.098 1.883 1.66 1.43 1.29 1.132 0.865 0.682 0.482 0.373 0.167 -0.042 -0.261 -0.373 -0.483 -0.777 -0.925 -1.091 -1.421 -1.589 -1.789 -2.034 -2.305 -2.628 -3.114 -4.802 -9 ,3944 ,KEBNE ,16708168,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:41 CET,0.0 1.106 1.57 1.91 2.17 2.378 2.554 2.738 3.066 3.202 3.329 3.585 3.671 3.774 3.959 4.128 4.293 4.377 4.531 4.664 4.861 4.991 5.133 5.357 5.556 5.742 5.923 6.095 6.331 6.561 6.778 7.037 7.275 7.496 7.738 7.991 8.266 8.607 8.939 9.224 9.488 9.785 10.101 10.403 10.72 11.005 11.361 11.705 11.881 11.972 11.722 10.965 10.102 9.252 8.466 7.737 7.102 6.537 6.037 5.514 5.052 4.642 4.273 3.92 3.589 3.295 2.973 2.674 2.429 2.174 1.897 1.673 1.444 1.207 1.02 0.821 0.613 0.383 0.109 -0.075 -0.241 -0.489 -0.673 -0.864 -0.957 -1.17 -1.419 -1.686 -1.819 -1.93 -2.212 -2.362 -2.526 -2.89 -3.104 -3.352 -3.599 -3.859 -4.193 -4.667 -6.423 -10 ,15788 ,KEBNE ,16708169,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:23 CET,0.0 1.783 2.178 2.49 2.741 2.947 3.139 3.313 3.608 3.758 3.9 4.163 4.259 4.37 4.578 4.769 4.938 5.016 5.163 5.308 5.526 5.665 5.806 5.999 6.163 6.307 6.451 6.598 6.782 6.961 7.145 7.381 7.585 7.752 7.954 8.197 8.42 8.641 8.887 9.142 9.379 9.641 9.946 10.224 10.508 10.765 11.06 11.375 11.67 11.804 11.399 10.573 9.772 9.01 8.322 7.707 7.129 6.574 6.087 5.553 5.063 4.644 4.253 3.886 3.552 3.239 2.907 2.592 2.305 1.994 1.651 1.355 1.043 0.726 0.496 0.259 0.02 -0.208 -0.447 -0.609 -0.775 -1.027 -1.215 -1.429 -1.536 -1.772 -2.032 -2.285 -2.414 -2.527 -2.821 -2.975 -3.134 -3.492 -3.693 -3.903 -4.134 -4.43 -4.808 -5.284 -7.344 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_252.txt deleted file mode 100644 index 641b64e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23262 ,KEBNE ,16708170,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:07:19 CET,0.0 0.563 0.647 0.678 0.663 0.62 0.553 0.469 0.275 0.154 0.014 -0.273 -0.458 -0.607 -0.891 -1.211 -1.533 -1.693 -2.029 -2.383 -2.937 -3.304 -3.654 -4.189 -4.74 -5.302 -5.864 -6.434 -7.217 -8.0 -8.786 -9.781 -10.79 -11.805 -13.042 -14.514 -15.977 -17.67 -19.605 -21.757 -24.14 -26.983 -30.499 -34.272 -38.973 -44.606 -51.745 -60.603 -72.129 -87.683 -110.125 -133.308 -150.116 -162.972 -173.068 -181.384 -188.167 -193.916 -198.591 -203.084 -206.781 -209.893 -212.738 -215.339 -217.758 -219.95 -222.181 -224.116 -225.719 -227.308 -228.906 -230.203 -231.514 -232.835 -233.845 -234.854 -235.868 -236.918 -237.992 -238.711 -239.42 -240.499 -241.246 -242.006 -242.393 -243.177 -243.964 -244.777 -245.192 -245.841 -246.509 -246.975 -247.441 -248.419 -248.96 -249.543 -250.176 -250.879 -251.692 -252.676 -255.361 -2 ,114 ,KEBNE ,16708171,Fri Nov 26 15:34:37 CET,Fri Nov 26 17:06:27 CET,0.0 0.854 0.929 0.899 0.843 0.752 0.637 0.529 0.308 0.187 0.058 -0.198 -0.36 -0.498 -0.779 -1.085 -1.404 -1.575 -1.927 -2.267 -2.762 -3.088 -3.435 -3.975 -4.52 -5.078 -5.634 -6.202 -6.99 -7.784 -8.579 -9.555 -10.552 -11.603 -12.866 -14.33 -15.824 -17.551 -19.487 -21.637 -24.036 -26.901 -30.457 -34.226 -38.871 -44.484 -51.56 -60.377 -71.864 -87.256 -109.601 -132.759 -149.568 -162.378 -172.421 -180.654 -187.327 -193.024 -197.707 -202.185 -205.868 -209.072 -212.068 -214.731 -217.049 -219.085 -221.172 -222.974 -224.469 -226.003 -227.545 -228.783 -230.041 -231.315 -232.312 -233.348 -234.393 -235.44 -236.491 -237.187 -237.893 -238.987 -239.735 -240.494 -240.889 -241.703 -242.54 -243.395 -243.828 -244.499 -245.175 -245.65 -246.14 -247.15 -247.673 -248.208 -248.802 -249.488 -250.289 -251.235 -253.63 -3 ,19530 ,KEBNE ,16708172,Fri Nov 26 15:34:37 CET,Fri Nov 26 17:05:49 CET,0.0 0.73 0.857 0.871 0.838 0.791 0.712 0.626 0.42 0.297 0.173 -0.08 -0.253 -0.398 -0.672 -0.968 -1.287 -1.452 -1.794 -2.143 -2.677 -3.033 -3.377 -3.906 -4.457 -5.033 -5.628 -6.224 -7.013 -7.814 -8.628 -9.643 -10.656 -11.658 -12.847 -14.297 -15.804 -17.526 -19.473 -21.655 -24.064 -26.952 -30.56 -34.399 -39.154 -44.856 -51.965 -60.802 -72.396 -87.984 -110.531 -133.564 -150.072 -162.761 -172.763 -181.074 -187.837 -193.545 -198.211 -202.645 -206.29 -209.405 -212.302 -214.98 -217.381 -219.541 -221.769 -223.695 -225.282 -226.861 -228.48 -229.778 -231.09 -232.432 -233.445 -234.485 -235.574 -236.663 -237.733 -238.454 -239.18 -240.262 -240.985 -241.707 -242.072 -242.825 -243.624 -244.447 -244.866 -245.509 -246.109 -246.541 -247.008 -248.032 -248.577 -249.156 -249.784 -250.469 -251.23 -252.196 -255.06 -4 ,6201 ,KEBNE ,16708173,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:02 CET,0.0 0.488 0.61 0.647 0.595 0.491 0.39 0.299 0.098 -0.029 -0.162 -0.401 -0.559 -0.707 -1.013 -1.317 -1.625 -1.789 -2.123 -2.457 -2.983 -3.351 -3.727 -4.293 -4.871 -5.452 -6.017 -6.568 -7.324 -8.096 -8.869 -9.848 -10.837 -11.852 -13.096 -14.562 -16.032 -17.718 -19.659 -21.844 -24.244 -27.102 -30.669 -34.494 -39.22 -44.89 -51.98 -60.82 -72.478 -88.124 -110.78 -133.96 -150.54 -163.221 -173.256 -181.585 -188.335 -194.045 -198.712 -203.158 -206.829 -209.977 -212.827 -215.425 -217.808 -219.929 -222.086 -223.963 -225.556 -227.181 -228.826 -230.149 -231.479 -232.814 -233.815 -234.827 -235.855 -236.879 -237.934 -238.647 -239.367 -240.475 -241.212 -241.96 -242.341 -243.119 -243.929 -244.769 -245.2 -245.868 -246.532 -246.983 -247.442 -248.431 -248.972 -249.552 -250.15 -250.818 -251.581 -252.449 -255.356 -5 ,30055 ,KEBNE ,16708174,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:13 CET,0.0 0.552 0.68 0.683 0.623 0.556 0.485 0.381 0.137 0.018 -0.105 -0.344 -0.499 -0.642 -0.952 -1.279 -1.611 -1.775 -2.113 -2.473 -3.037 -3.391 -3.729 -4.257 -4.807 -5.376 -5.954 -6.55 -7.356 -8.139 -8.924 -9.929 -10.954 -11.991 -13.244 -14.729 -16.21 -17.909 -19.832 -21.972 -24.359 -27.197 -30.71 -34.516 -39.286 -44.999 -52.15 -60.998 -72.526 -88.106 -110.643 -133.801 -150.47 -163.15 -173.154 -181.41 -188.13 -193.86 -198.561 -203.082 -206.785 -209.897 -212.749 -215.362 -217.718 -219.826 -221.976 -223.815 -225.355 -226.95 -228.587 -229.901 -231.22 -232.522 -233.496 -234.472 -235.477 -236.544 -237.643 -238.368 -239.091 -240.215 -240.981 -241.747 -242.137 -242.914 -243.708 -244.546 -244.981 -245.652 -246.337 -246.797 -247.269 -248.303 -248.855 -249.439 -250.057 -250.701 -251.401 -252.287 -254.562 -6 ,30725 ,KEBNE ,16708175,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:16 CET,0.0 0.635 0.698 0.676 0.592 0.5 0.387 0.253 -0.013 -0.146 -0.282 -0.559 -0.738 -0.901 -1.209 -1.525 -1.857 -2.022 -2.355 -2.705 -3.249 -3.611 -3.981 -4.541 -5.104 -5.696 -6.288 -6.867 -7.633 -8.397 -9.182 -10.175 -11.163 -12.16 -13.359 -14.799 -16.276 -17.968 -19.903 -22.084 -24.47 -27.335 -30.953 -34.797 -39.565 -45.27 -52.395 -61.255 -72.813 -88.323 -110.756 -133.755 -150.314 -162.999 -173.021 -181.25 -187.914 -193.628 -198.31 -202.729 -206.357 -209.45 -212.277 -214.863 -217.199 -219.275 -221.416 -223.303 -224.84 -226.353 -227.908 -229.196 -230.51 -231.814 -232.834 -233.892 -234.916 -235.929 -236.962 -237.661 -238.37 -239.454 -240.198 -240.987 -241.383 -242.161 -242.963 -243.789 -244.209 -244.877 -245.581 -246.047 -246.505 -247.481 -248.0 -248.552 -249.169 -249.852 -250.649 -251.651 -253.962 -7 ,11334 ,KEBNE ,16708176,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:05:56 CET,0.0 0.634 0.726 0.697 0.637 0.548 0.44 0.329 0.093 -0.035 -0.171 -0.413 -0.573 -0.72 -1.023 -1.319 -1.633 -1.797 -2.141 -2.501 -3.05 -3.424 -3.794 -4.375 -4.979 -5.56 -6.137 -6.729 -7.517 -8.305 -9.095 -10.095 -11.126 -12.164 -13.394 -14.855 -16.324 -18.001 -19.932 -22.122 -24.546 -27.403 -30.946 -34.771 -39.584 -45.376 -52.61 -61.574 -73.251 -88.965 -111.622 -134.743 -151.415 -164.274 -174.444 -182.82 -189.627 -195.444 -200.248 -204.859 -208.675 -211.918 -214.893 -217.625 -220.086 -222.271 -224.491 -226.351 -227.89 -229.465 -231.069 -232.394 -233.737 -235.091 -236.124 -237.168 -238.211 -239.257 -240.337 -241.076 -241.818 -242.94 -243.696 -244.464 -244.86 -245.665 -246.476 -247.315 -247.748 -248.418 -249.11 -249.581 -250.051 -251.03 -251.543 -252.088 -252.684 -253.33 -254.013 -254.857 -256.729 -8 ,10153 ,KEBNE ,16708177,Fri Nov 26 15:34:29 CET,Fri Nov 26 17:05:16 CET,0.0 0.682 0.805 0.82 0.77 0.705 0.631 0.543 0.301 0.167 0.038 -0.222 -0.398 -0.554 -0.866 -1.187 -1.522 -1.685 -2.009 -2.35 -2.886 -3.26 -3.635 -4.198 -4.736 -5.259 -5.81 -6.375 -7.139 -7.935 -8.751 -9.783 -10.789 -11.799 -13.018 -14.437 -15.908 -17.616 -19.545 -21.709 -24.124 -27.012 -30.594 -34.374 -39.087 -44.786 -51.915 -60.795 -72.375 -88.042 -110.692 -133.752 -150.426 -163.216 -173.227 -181.501 -188.287 -194.156 -198.981 -203.475 -207.168 -210.374 -213.299 -215.897 -218.264 -220.408 -222.597 -224.477 -226.043 -227.677 -229.341 -230.666 -232.011 -233.352 -234.354 -235.359 -236.365 -237.402 -238.458 -239.168 -239.911 -241.083 -241.879 -242.67 -243.066 -243.88 -244.746 -245.632 -246.063 -246.723 -247.382 -247.856 -248.353 -249.384 -249.927 -250.489 -251.114 -251.805 -252.604 -253.642 -256.622 -9 ,13094 ,KEBNE ,16708178,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:05:29 CET,0.0 1.012 1.125 1.168 1.173 1.121 1.023 0.926 0.733 0.622 0.495 0.246 0.082 -0.074 -0.383 -0.687 -1.013 -1.179 -1.506 -1.847 -2.378 -2.747 -3.11 -3.645 -4.191 -4.758 -5.358 -5.956 -6.746 -7.559 -8.383 -9.419 -10.481 -11.543 -12.808 -14.297 -15.784 -17.453 -19.344 -21.524 -23.932 -26.805 -30.389 -34.242 -39.059 -44.825 -52.022 -60.914 -72.462 -88.041 -110.687 -133.823 -150.492 -163.246 -173.281 -181.549 -188.293 -194.026 -198.751 -203.23 -206.885 -209.996 -212.835 -215.441 -217.841 -220.011 -222.195 -224.035 -225.539 -227.067 -228.675 -230.018 -231.368 -232.712 -233.733 -234.764 -235.812 -236.904 -238.027 -238.778 -239.529 -240.679 -241.444 -242.209 -242.608 -243.433 -244.258 -245.094 -245.527 -246.194 -246.866 -247.33 -247.8 -248.813 -249.383 -249.973 -250.592 -251.27 -252.047 -253.033 -255.693 -10 ,19553 ,KEBNE ,16708179,Fri Nov 26 15:34:30 CET,Fri Nov 26 17:06:13 CET,0.0 0.562 0.688 0.714 0.662 0.575 0.484 0.391 0.173 0.065 -0.048 -0.278 -0.447 -0.605 -0.921 -1.241 -1.571 -1.741 -2.08 -2.43 -2.975 -3.348 -3.732 -4.296 -4.841 -5.393 -5.963 -6.542 -7.334 -8.133 -8.934 -9.932 -10.94 -11.948 -13.141 -14.55 -15.978 -17.64 -19.572 -21.754 -24.172 -27.025 -30.543 -34.35 -39.097 -44.813 -51.975 -60.816 -72.415 -88.09 -110.687 -133.783 -150.474 -163.287 -173.42 -181.742 -188.468 -194.155 -198.802 -203.245 -206.916 -210.074 -212.977 -215.6 -217.932 -219.999 -222.132 -224.008 -225.576 -227.159 -228.762 -230.054 -231.365 -232.698 -233.721 -234.75 -235.777 -236.823 -237.884 -238.602 -239.351 -240.466 -241.199 -241.963 -242.36 -243.162 -243.962 -244.78 -245.208 -245.882 -246.556 -247.022 -247.497 -248.466 -248.992 -249.555 -250.15 -250.77 -251.497 -252.446 -254.772 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_57.txt deleted file mode 100644 index 730c6a89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_290_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12256 ,KEBNE ,16708180,Fri Nov 26 15:35:31 CET,Fri Nov 26 17:07:30 CET,0.0 0.8 1.095 1.319 1.497 1.649 1.786 1.899 2.095 2.185 2.27 2.446 2.496 2.562 2.693 2.817 2.928 2.98 3.081 3.175 3.309 3.385 3.456 3.571 3.671 3.759 3.851 3.937 4.036 4.127 4.21 4.298 4.364 4.439 4.537 4.62 4.707 4.788 4.839 4.85 4.816 4.765 4.669 4.578 4.49 4.313 4.009 3.548 2.755 1.384 -0.868 -3.58 -5.904 -7.773 -9.293 -10.625 -11.74 -12.727 -13.596 -14.447 -15.167 -15.794 -16.377 -16.929 -17.443 -17.905 -18.379 -18.797 -19.153 -19.516 -19.886 -20.187 -20.513 -20.863 -21.112 -21.358 -21.626 -21.913 -22.2 -22.394 -22.592 -22.913 -23.141 -23.377 -23.506 -23.766 -24.015 -24.275 -24.413 -24.557 -24.858 -25.013 -25.176 -25.556 -25.778 -26.015 -26.276 -26.575 -26.923 -27.333 -28.289 -2 ,16583 ,KEBNE ,16708181,Fri Nov 26 15:35:31 CET,Fri Nov 26 17:11:11 CET,0.0 0.829 1.141 1.345 1.518 1.671 1.821 1.946 2.161 2.253 2.336 2.531 2.593 2.669 2.795 2.889 2.974 3.017 3.098 3.175 3.292 3.368 3.443 3.556 3.663 3.756 3.838 3.921 4.023 4.116 4.196 4.275 4.345 4.414 4.487 4.556 4.61 4.641 4.65 4.656 4.657 4.618 4.517 4.423 4.318 4.129 3.815 3.327 2.579 1.384 -0.791 -3.32 -5.289 -6.985 -8.391 -9.649 -10.798 -11.809 -12.648 -13.478 -14.193 -14.83 -15.425 -15.968 -16.454 -16.923 -17.425 -17.849 -18.207 -18.588 -18.985 -19.31 -19.644 -19.976 -20.228 -20.491 -20.751 -21.02 -21.321 -21.548 -21.783 -22.122 -22.341 -22.565 -22.683 -22.932 -23.195 -23.467 -23.606 -23.754 -24.052 -24.206 -24.374 -24.759 -24.95 -25.147 -25.369 -25.626 -25.933 -26.328 -27.465 -3 ,26369 ,KEBNE ,16708182,Fri Nov 26 15:35:31 CET,Fri Nov 26 17:07:03 CET,0.0 0.851 1.148 1.359 1.527 1.669 1.788 1.905 2.121 2.222 2.315 2.464 2.499 2.563 2.664 2.756 2.855 2.907 3.006 3.107 3.254 3.335 3.409 3.519 3.621 3.713 3.801 3.884 3.972 4.035 4.101 4.181 4.25 4.32 4.394 4.465 4.516 4.544 4.563 4.593 4.612 4.587 4.509 4.399 4.228 3.941 3.544 3.132 2.44 1.168 -1.043 -3.772 -5.975 -7.814 -9.365 -10.725 -11.896 -12.922 -13.788 -14.638 -15.355 -15.984 -16.594 -17.158 -17.668 -18.127 -18.602 -19.025 -19.389 -19.757 -20.135 -20.451 -20.779 -21.132 -21.42 -21.713 -21.984 -22.242 -22.508 -22.697 -22.896 -23.23 -23.479 -23.742 -23.878 -24.147 -24.432 -24.733 -24.882 -25.03 -25.328 -25.496 -25.677 -26.077 -26.281 -26.488 -26.756 -27.048 -27.371 -27.807 -29.036 -4 ,22704 ,KEBNE ,16708183,Fri Nov 26 15:35:31 CET,Fri Nov 26 17:07:25 CET,0.0 0.859 1.17 1.38 1.551 1.694 1.826 1.948 2.166 2.251 2.327 2.492 2.537 2.605 2.728 2.829 2.933 2.986 3.083 3.168 3.272 3.339 3.404 3.501 3.591 3.667 3.745 3.83 3.924 3.997 4.072 4.151 4.211 4.26 4.306 4.377 4.448 4.499 4.559 4.612 4.652 4.676 4.652 4.576 4.458 4.281 3.929 3.35 2.549 1.253 -1.04 -3.754 -6.023 -7.9 -9.441 -10.777 -11.936 -12.979 -13.86 -14.715 -15.459 -16.102 -16.691 -17.255 -17.786 -18.304 -18.85 -19.305 -19.676 -20.056 -20.454 -20.781 -21.116 -21.456 -21.717 -21.997 -22.304 -22.621 -22.925 -23.126 -23.336 -23.698 -23.951 -24.185 -24.302 -24.556 -24.814 -25.077 -25.218 -25.368 -25.673 -25.833 -26.009 -26.411 -26.639 -26.879 -27.123 -27.392 -27.707 -28.125 -29.4 -5 ,5934 ,KEBNE ,16708184,Fri Nov 26 15:35:31 CET,Fri Nov 26 17:07:23 CET,0.0 0.749 0.98 1.156 1.304 1.43 1.546 1.642 1.798 1.876 1.964 2.141 2.182 2.237 2.335 2.433 2.536 2.587 2.677 2.759 2.883 2.97 3.052 3.165 3.275 3.376 3.465 3.545 3.66 3.756 3.835 3.932 4.008 4.076 4.148 4.231 4.316 4.38 4.411 4.425 4.41 4.373 4.318 4.197 3.95 3.615 3.199 2.61 1.688 0.26 -2.187 -5.079 -7.327 -9.226 -10.807 -12.159 -13.327 -14.378 -15.262 -16.136 -16.893 -17.543 -18.151 -18.745 -19.279 -19.797 -20.378 -20.856 -21.233 -21.603 -21.992 -22.322 -22.649 -22.99 -23.26 -23.538 -23.827 -24.124 -24.428 -24.63 -24.841 -25.175 -25.409 -25.676 -25.816 -26.088 -26.358 -26.659 -26.818 -26.985 -27.326 -27.507 -27.683 -28.058 -28.267 -28.486 -28.718 -28.983 -29.312 -29.713 -30.711 -6 ,24645 ,KEBNE ,16708185,Fri Nov 26 15:35:31 CET,Fri Nov 26 17:07:15 CET,0.0 0.823 1.13 1.325 1.46 1.574 1.692 1.811 2.002 2.078 2.159 2.357 2.418 2.484 2.602 2.728 2.833 2.881 2.971 3.056 3.193 3.275 3.351 3.45 3.537 3.634 3.724 3.801 3.898 3.989 4.074 4.164 4.236 4.304 4.366 4.405 4.448 4.503 4.573 4.641 4.685 4.666 4.574 4.477 4.327 4.08 3.752 3.23 2.343 0.979 -1.324 -4.043 -6.277 -8.149 -9.72 -11.07 -12.205 -13.191 -14.015 -14.928 -15.704 -16.317 -16.883 -17.425 -17.941 -18.41 -18.889 -19.314 -19.686 -20.06 -20.435 -20.759 -21.124 -21.526 -21.834 -22.136 -22.438 -22.73 -23.01 -23.21 -23.423 -23.744 -23.969 -24.214 -24.342 -24.602 -24.888 -25.204 -25.365 -25.526 -25.855 -26.02 -26.174 -26.524 -26.73 -26.948 -27.2 -27.476 -27.796 -28.221 -29.16 -7 ,29721 ,KEBNE ,16708186,Fri Nov 26 15:35:31 CET,Fri Nov 26 17:07:19 CET,0.0 0.818 1.123 1.344 1.522 1.677 1.805 1.919 2.134 2.232 2.318 2.471 2.508 2.571 2.7 2.811 2.902 2.952 3.062 3.161 3.282 3.362 3.447 3.558 3.652 3.737 3.814 3.901 4.02 4.114 4.199 4.299 4.378 4.444 4.516 4.572 4.599 4.617 4.653 4.688 4.713 4.711 4.663 4.605 4.494 4.3 3.936 3.355 2.501 1.095 -1.166 -3.586 -5.667 -7.489 -9.016 -10.34 -11.486 -12.5 -13.359 -14.223 -14.954 -15.585 -16.154 -16.686 -17.183 -17.626 -18.109 -18.54 -18.895 -19.268 -19.665 -19.974 -20.293 -20.635 -20.902 -21.202 -21.514 -21.832 -22.171 -22.392 -22.6 -22.925 -23.153 -23.385 -23.503 -23.757 -24.018 -24.285 -24.43 -24.581 -24.888 -25.048 -25.213 -25.547 -25.727 -25.938 -26.163 -26.433 -26.758 -27.165 -28.131 -8 ,9328 ,KEBNE ,16708187,Fri Nov 26 15:35:31 CET,Fri Nov 26 17:07:17 CET,0.0 0.849 1.112 1.31 1.464 1.602 1.722 1.835 2.017 2.108 2.196 2.368 2.425 2.502 2.619 2.72 2.833 2.889 2.992 3.087 3.213 3.294 3.371 3.464 3.544 3.619 3.703 3.79 3.875 3.949 4.021 4.1 4.177 4.254 4.35 4.433 4.504 4.59 4.65 4.669 4.671 4.694 4.714 4.688 4.608 4.48 4.214 3.792 3.05 1.696 -0.601 -3.339 -5.545 -7.407 -8.927 -10.244 -11.398 -12.417 -13.273 -14.112 -14.832 -15.46 -16.051 -16.615 -17.129 -17.581 -18.063 -18.488 -18.867 -19.267 -19.661 -19.985 -20.309 -20.651 -20.924 -21.196 -21.476 -21.76 -22.063 -22.277 -22.493 -22.846 -23.084 -23.317 -23.438 -23.672 -23.915 -24.169 -24.3 -24.449 -24.762 -24.933 -25.1 -25.471 -25.681 -25.899 -26.125 -26.389 -26.728 -27.16 -28.259 -9 ,5132 ,KEBNE ,16708188,Fri Nov 26 15:35:31 CET,Fri Nov 26 17:06:21 CET,0.0 0.856 1.104 1.288 1.456 1.604 1.725 1.844 2.066 2.163 2.255 2.435 2.486 2.551 2.675 2.802 2.916 2.965 3.064 3.151 3.259 3.328 3.396 3.498 3.594 3.688 3.778 3.844 3.93 4.02 4.094 4.183 4.282 4.367 4.446 4.523 4.579 4.623 4.638 4.641 4.651 4.659 4.633 4.542 4.345 4.065 3.643 2.961 1.995 0.654 -1.609 -4.327 -6.479 -8.263 -9.816 -11.181 -12.338 -13.353 -14.196 -15.012 -15.708 -16.33 -16.939 -17.518 -18.018 -18.457 -18.932 -19.353 -19.696 -20.055 -20.436 -20.742 -21.079 -21.46 -21.732 -21.997 -22.282 -22.57 -22.876 -23.094 -23.324 -23.69 -23.923 -24.144 -24.259 -24.493 -24.732 -24.989 -25.132 -25.283 -25.567 -25.717 -25.891 -26.261 -26.44 -26.666 -26.933 -27.198 -27.557 -28.043 -29.001 -10 ,16368 ,KEBNE ,16708189,Fri Nov 26 15:36:31 CET,Fri Nov 26 17:07:20 CET,0.0 1.022 1.33 1.552 1.717 1.857 1.985 2.106 2.313 2.405 2.491 2.658 2.7 2.765 2.887 3.01 3.116 3.162 3.257 3.346 3.451 3.51 3.57 3.662 3.756 3.864 3.965 4.042 4.14 4.228 4.305 4.393 4.477 4.55 4.609 4.679 4.77 4.86 4.9 4.915 4.918 4.88 4.821 4.77 4.623 4.358 4.04 3.586 2.779 1.431 -0.898 -3.708 -5.935 -7.747 -9.262 -10.605 -11.772 -12.786 -13.624 -14.475 -15.2 -15.803 -16.355 -16.877 -17.39 -17.847 -18.306 -18.728 -19.077 -19.424 -19.793 -20.099 -20.412 -20.744 -20.997 -21.26 -21.523 -21.779 -22.063 -22.266 -22.469 -22.771 -22.984 -23.206 -23.322 -23.564 -23.801 -24.063 -24.206 -24.351 -24.654 -24.82 -24.999 -25.397 -25.62 -25.864 -26.113 -26.381 -26.726 -27.158 -28.593 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_30_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_30_42.txt deleted file mode 100644 index 34d40892..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_30_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18985 ,KEBNE ,16708190,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:05:14 CET,0.0 1.239 1.668 2.027 2.355 2.609 2.828 3.039 3.408 3.57 3.722 3.944 4.154 4.295 4.584 4.873 5.145 5.267 5.5 5.725 6.037 6.244 6.457 6.767 7.058 7.335 7.614 7.884 8.239 8.594 8.926 9.306 9.651 9.976 10.381 10.872 11.342 11.862 12.428 13.047 13.719 14.499 15.424 16.288 17.229 18.308 19.531 20.881 22.484 24.437 26.922 29.068 30.404 31.255 31.835 32.259 32.534 32.701 32.802 32.887 32.927 32.948 32.949 32.919 32.863 32.805 32.767 32.719 32.674 32.632 32.574 32.524 32.468 32.403 32.347 32.279 32.205 32.121 32.025 31.958 31.884 31.754 31.666 31.569 31.515 31.421 31.322 31.206 31.152 31.047 30.942 30.866 30.776 30.564 30.447 30.312 30.164 29.999 29.788 29.475 28.28 -2 ,5727 ,KEBNE ,16708191,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:04:41 CET,0.0 0.959 1.332 1.639 1.901 2.134 2.376 2.598 2.973 3.151 3.318 3.559 3.767 3.914 4.195 4.46 4.754 4.89 5.116 5.332 5.624 5.817 6.032 6.335 6.61 6.887 7.165 7.434 7.775 8.104 8.409 8.802 9.199 9.567 9.999 10.5 10.985 11.513 12.069 12.618 13.194 13.866 14.642 15.456 16.471 17.586 18.826 20.36 22.262 24.416 26.986 29.045 30.276 31.122 31.687 32.096 32.419 32.62 32.72 32.822 32.885 32.922 32.96 32.991 33.016 33.033 33.041 33.019 32.985 32.952 32.905 32.859 32.81 32.749 32.7 32.646 32.586 32.515 32.426 32.369 32.32 32.238 32.18 32.097 32.047 31.956 31.86 31.761 31.714 31.618 31.535 31.464 31.377 31.195 31.093 30.965 30.831 30.678 30.465 30.163 29.138 -3 ,23302 ,KEBNE ,16708192,Fri Nov 26 15:36:31 CET,Fri Nov 26 17:04:41 CET,0.0 1.443 1.847 2.161 2.439 2.685 2.916 3.13 3.501 3.669 3.834 4.061 4.264 4.398 4.663 4.921 5.162 5.28 5.507 5.73 6.052 6.259 6.461 6.754 7.037 7.311 7.586 7.837 8.158 8.476 8.774 9.128 9.475 9.813 10.234 10.74 11.222 11.745 12.31 12.898 13.521 14.193 14.937 15.714 16.649 17.693 18.934 20.388 22.128 24.221 26.851 28.989 30.287 31.178 31.743 32.112 32.332 32.472 32.572 32.654 32.686 32.697 32.704 32.697 32.67 32.631 32.581 32.536 32.498 32.442 32.368 32.297 32.222 32.151 32.094 32.037 31.975 31.901 31.826 31.773 31.719 31.638 31.575 31.5 31.455 31.359 31.259 31.152 31.097 30.993 30.919 30.855 30.774 30.57 30.457 30.332 30.197 30.024 29.752 29.401 28.398 -4 ,19380 ,KEBNE ,16708193,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:05:15 CET,0.0 1.503 2.0 2.326 2.564 2.78 2.992 3.198 3.565 3.738 3.9 4.121 4.329 4.467 4.738 5.001 5.263 5.385 5.617 5.836 6.166 6.369 6.557 6.843 7.127 7.412 7.674 7.917 8.242 8.563 8.878 9.264 9.643 10.011 10.419 10.892 11.368 11.856 12.379 12.971 13.605 14.31 15.107 15.925 16.944 18.076 19.346 20.79 22.508 24.585 27.028 29.037 30.213 30.991 31.506 31.861 32.111 32.258 32.348 32.404 32.422 32.437 32.445 32.431 32.396 32.351 32.293 32.223 32.162 32.113 32.049 31.986 31.922 31.853 31.794 31.717 31.631 31.553 31.485 31.44 31.378 31.257 31.169 31.07 31.016 30.918 30.828 30.733 30.679 30.58 30.496 30.42 30.351 30.19 30.08 29.953 29.809 29.624 29.366 29.083 28.3 -5 ,12596 ,KEBNE ,16708194,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:04:24 CET,0.0 1.557 2.0 2.34 2.656 2.91 3.112 3.298 3.664 3.833 3.982 4.194 4.404 4.545 4.805 5.053 5.296 5.425 5.676 5.91 6.231 6.434 6.64 6.931 7.215 7.493 7.756 8.013 8.347 8.671 8.993 9.38 9.753 10.113 10.531 11.024 11.513 12.058 12.65 13.281 13.935 14.68 15.545 16.397 17.433 18.618 19.987 21.489 23.18 25.233 27.783 29.894 31.155 31.943 32.471 32.85 33.119 33.298 33.405 33.486 33.544 33.593 33.641 33.669 33.674 33.674 33.656 33.624 33.589 33.539 33.475 33.426 33.373 33.301 33.246 33.197 33.145 33.099 33.032 32.975 32.915 32.814 32.755 32.701 32.669 32.598 32.502 32.394 32.338 32.233 32.143 32.068 31.981 31.786 31.672 31.544 31.415 31.262 31.059 30.742 29.66 -6 ,14437 ,KEBNE ,16708195,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:05:05 CET,0.0 1.144 1.582 1.911 2.2 2.46 2.683 2.872 3.242 3.422 3.586 3.845 4.059 4.202 4.482 4.741 4.998 5.127 5.38 5.613 5.93 6.141 6.346 6.634 6.918 7.206 7.49 7.763 8.123 8.476 8.826 9.202 9.543 9.911 10.335 10.819 11.297 11.822 12.42 13.069 13.766 14.564 15.428 16.194 17.079 18.162 19.441 20.902 22.646 24.633 27.055 29.093 30.284 31.032 31.564 31.916 32.12 32.286 32.388 32.434 32.461 32.477 32.478 32.452 32.407 32.367 32.321 32.267 32.213 32.148 32.082 32.033 31.976 31.9 31.827 31.748 31.674 31.591 31.506 31.451 31.394 31.283 31.202 31.121 31.075 30.967 30.851 30.742 30.685 30.584 30.5 30.422 30.35 30.166 30.037 29.905 29.754 29.563 29.326 29.028 28.094 -7 ,2706 ,KEBNE ,16708196,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:04:13 CET,0.0 1.128 1.499 1.826 2.112 2.362 2.581 2.773 3.133 3.319 3.488 3.722 3.943 4.088 4.353 4.592 4.822 4.933 5.156 5.384 5.709 5.9 6.097 6.392 6.666 6.929 7.187 7.443 7.783 8.098 8.408 8.803 9.172 9.531 9.943 10.402 10.859 11.348 11.843 12.402 13.035 13.735 14.532 15.373 16.364 17.391 18.588 20.003 21.697 23.723 26.251 28.42 29.745 30.623 31.198 31.632 31.982 32.246 32.41 32.519 32.568 32.591 32.606 32.595 32.57 32.554 32.511 32.462 32.427 32.371 32.292 32.233 32.183 32.126 32.073 31.998 31.912 31.827 31.741 31.673 31.594 31.454 31.356 31.246 31.188 31.088 30.978 30.848 30.78 30.667 30.554 30.457 30.362 30.182 30.062 29.922 29.771 29.598 29.392 29.104 28.161 -8 ,5737 ,KEBNE ,16708197,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:05:08 CET,0.0 0.986 1.4 1.726 2.006 2.265 2.496 2.714 3.14 3.333 3.506 3.759 3.987 4.136 4.414 4.69 4.956 5.078 5.318 5.56 5.909 6.124 6.322 6.62 6.903 7.178 7.461 7.73 8.073 8.412 8.744 9.13 9.487 9.841 10.277 10.777 11.242 11.773 12.362 12.996 13.667 14.417 15.299 16.157 17.158 18.349 19.794 21.434 23.371 25.566 28.11 30.392 31.804 32.683 33.322 33.777 34.068 34.289 34.419 34.511 34.592 34.643 34.655 34.663 34.673 34.65 34.603 34.552 34.509 34.478 34.41 34.333 34.256 34.177 34.11 34.029 33.964 33.912 33.837 33.778 33.721 33.625 33.552 33.479 33.443 33.364 33.273 33.166 33.102 32.987 32.878 32.794 32.714 32.522 32.419 32.318 32.171 31.988 31.804 31.553 30.863 -9 ,12786 ,KEBNE ,16708198,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:05:21 CET,0.0 1.128 1.522 1.829 2.082 2.308 2.53 2.73 3.078 3.234 3.392 3.648 3.87 4.015 4.277 4.534 4.785 4.905 5.135 5.349 5.654 5.853 6.052 6.348 6.654 6.945 7.22 7.484 7.811 8.133 8.421 8.754 9.104 9.462 9.878 10.332 10.771 11.261 11.808 12.433 13.099 13.836 14.715 15.584 16.529 17.582 18.82 20.243 21.96 24.005 26.474 28.499 29.693 30.449 30.993 31.397 31.658 31.839 31.953 32.034 32.076 32.074 32.065 32.055 32.025 31.972 31.927 31.889 31.848 31.799 31.735 31.684 31.623 31.551 31.49 31.423 31.358 31.276 31.183 31.131 31.064 30.944 30.866 30.79 30.747 30.649 30.547 30.433 30.372 30.262 30.148 30.061 29.969 29.756 29.643 29.516 29.381 29.228 29.023 28.768 27.89 -10 ,25657 ,KEBNE ,16708199,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:04:53 CET,0.0 1.414 1.865 2.206 2.516 2.787 3.012 3.207 3.572 3.752 3.928 4.174 4.396 4.545 4.824 5.097 5.38 5.516 5.766 6.0 6.342 6.556 6.755 7.045 7.345 7.636 7.917 8.201 8.56 8.899 9.243 9.665 10.071 10.452 10.883 11.386 11.866 12.431 13.052 13.659 14.277 14.974 15.802 16.66 17.671 18.829 20.123 21.5 23.142 25.148 27.617 29.71 30.948 31.725 32.232 32.596 32.861 33.058 33.179 33.233 33.253 33.266 33.247 33.218 33.206 33.185 33.154 33.105 33.057 33.006 32.932 32.86 32.782 32.702 32.637 32.565 32.483 32.388 32.286 32.22 32.154 32.022 31.927 31.842 31.802 31.712 31.594 31.461 31.388 31.265 31.147 31.051 30.952 30.778 30.676 30.534 30.361 30.176 29.977 29.717 28.702 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_338_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_338_252.txt deleted file mode 100644 index 7fad3941..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_338_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13416 ,KEBNE ,16708200,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:07:30 CET,0.0 0.901 1.238 1.469 1.665 1.841 2.024 2.197 2.506 2.639 2.758 2.774 3.115 3.221 3.43 3.617 3.785 3.873 4.032 4.192 4.453 4.603 4.725 4.901 5.07 5.207 5.334 5.453 5.605 5.762 5.918 6.086 6.243 6.435 6.687 6.946 7.151 7.349 7.565 7.784 7.996 8.221 8.468 8.694 8.913 9.12 9.35 9.544 9.673 9.613 9.091 8.242 7.391 6.548 5.717 4.968 4.306 3.713 3.233 2.749 2.334 1.985 1.654 1.31 0.978 0.689 0.393 0.122 -0.115 -0.354 -0.6 -0.81 -1.033 -1.296 -1.511 -1.707 -1.887 -2.091 -2.327 -2.475 -2.627 -2.886 -3.072 -3.273 -3.374 -3.567 -3.78 -4.005 -4.108 -4.437 -4.442 -4.58 -4.724 -5.034 -5.2 -5.374 -5.555 -5.785 -6.076 -6.435 -7.321 -2 ,12704 ,KEBNE ,16708201,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:07:27 CET,0.0 0.795 1.101 1.346 1.544 1.718 1.899 2.067 2.357 2.496 2.624 2.637 2.985 3.093 3.282 3.438 3.589 3.659 3.785 3.919 4.133 4.268 4.396 4.584 4.752 4.907 5.051 5.182 5.368 5.556 5.724 5.903 6.078 6.25 6.457 6.686 6.881 7.073 7.262 7.456 7.685 7.941 8.177 8.388 8.636 8.904 9.149 9.338 9.494 9.523 9.213 8.414 7.521 6.711 5.957 5.243 4.633 4.049 3.526 3.017 2.59 2.214 1.818 1.449 1.105 0.773 0.452 0.179 -0.055 -0.295 -0.574 -0.806 -1.043 -1.283 -1.458 -1.642 -1.824 -2.033 -2.256 -2.403 -2.569 -2.817 -2.994 -3.2 -3.309 -3.533 -3.746 -3.968 -4.101 -4.474 -4.513 -4.652 -4.796 -5.085 -5.233 -5.403 -5.607 -5.826 -6.09 -6.41 -7.211 -3 ,16154 ,KEBNE ,16708202,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:07:35 CET,0.0 0.914 1.224 1.458 1.661 1.838 1.996 2.143 2.416 2.538 2.646 2.635 2.962 3.048 3.23 3.397 3.541 3.618 3.78 3.927 4.133 4.247 4.366 4.563 4.738 4.874 4.989 5.134 5.323 5.474 5.619 5.811 5.994 6.144 6.304 6.512 6.749 6.993 7.194 7.408 7.657 7.894 8.131 8.361 8.614 8.828 9.025 9.204 9.316 9.268 8.68 7.576 6.641 5.85 5.115 4.435 3.782 3.193 2.696 2.176 1.718 1.332 0.947 0.531 0.16 -0.165 -0.488 -0.794 -1.073 -1.327 -1.573 -1.774 -1.981 -2.216 -2.416 -2.621 -2.821 -3.018 -3.215 -3.353 -3.495 -3.739 -3.914 -4.089 -4.177 -4.337 -4.5 -4.679 -4.773 -5.118 -5.134 -5.26 -5.381 -5.653 -5.795 -5.959 -6.151 -6.352 -6.596 -6.946 -7.889 -4 ,6043 ,KEBNE ,16708203,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:07:38 CET,0.0 0.913 1.245 1.544 1.808 2.033 2.245 2.446 2.81 2.981 3.128 3.134 3.489 3.617 3.852 4.088 4.305 4.399 4.574 4.728 4.958 5.128 5.293 5.51 5.718 5.924 6.124 6.327 6.612 6.848 7.036 7.254 7.441 7.631 7.841 8.061 8.284 8.516 8.754 8.972 9.187 9.43 9.692 9.913 10.183 10.495 10.767 10.993 11.114 11.058 10.542 9.586 8.771 7.962 7.18 6.501 5.926 5.382 4.898 4.347 3.845 3.446 3.1 2.782 2.481 2.204 1.894 1.613 1.385 1.153 0.908 0.705 0.479 0.217 0.018 -0.193 -0.409 -0.62 -0.837 -0.984 -1.15 -1.424 -1.591 -1.763 -1.873 -2.122 -2.365 -2.592 -2.705 -3.05 -3.054 -3.19 -3.335 -3.638 -3.804 -3.973 -4.155 -4.369 -4.618 -4.963 -5.673 -5 ,31142 ,KEBNE ,16708204,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:06:43 CET,0.0 0.922 1.252 1.506 1.708 1.907 2.098 2.271 2.571 2.698 2.823 2.814 3.146 3.252 3.443 3.61 3.767 3.842 3.98 4.102 4.302 4.449 4.592 4.774 4.916 5.067 5.213 5.349 5.53 5.703 5.877 6.101 6.32 6.516 6.736 6.964 7.175 7.457 7.736 7.938 8.125 8.328 8.542 8.778 9.041 9.26 9.469 9.641 9.694 9.538 8.983 7.976 7.015 6.147 5.344 4.637 4.004 3.398 2.882 2.359 1.912 1.542 1.204 0.863 0.527 0.218 -0.099 -0.375 -0.625 -0.886 -1.148 -1.366 -1.593 -1.829 -2.025 -2.231 -2.452 -2.696 -2.918 -3.063 -3.24 -3.529 -3.718 -3.914 -4.019 -4.245 -4.48 -4.72 -4.841 -5.206 -5.222 -5.365 -5.522 -5.845 -6.01 -6.167 -6.339 -6.583 -6.871 -7.232 -8.185 -6 ,3373 ,KEBNE ,16708205,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:07:08 CET,0.0 1.065 1.392 1.635 1.827 2.007 2.175 2.328 2.584 2.689 2.788 2.769 3.092 3.181 3.343 3.492 3.631 3.702 3.858 4.006 4.206 4.323 4.444 4.635 4.804 4.967 5.137 5.282 5.452 5.637 5.8 5.97 6.134 6.293 6.502 6.734 6.921 7.12 7.342 7.591 7.821 8.032 8.276 8.538 8.837 9.196 9.558 9.837 9.983 9.841 9.271 8.214 7.185 6.322 5.561 4.837 4.201 3.634 3.126 2.614 2.195 1.806 1.417 1.054 0.707 0.405 0.076 -0.233 -0.465 -0.694 -0.938 -1.148 -1.371 -1.608 -1.817 -2.018 -2.225 -2.467 -2.712 -2.883 -3.074 -3.369 -3.573 -3.78 -3.885 -4.099 -4.299 -4.508 -4.617 -4.953 -4.957 -5.091 -5.228 -5.515 -5.689 -5.889 -6.126 -6.384 -6.667 -7.057 -8.131 -7 ,16118 ,KEBNE ,16708206,Fri Nov 26 15:36:32 CET,Fri Nov 26 17:06:40 CET,0.0 1.12 1.456 1.698 1.92 2.121 2.298 2.462 2.742 2.86 2.966 2.923 3.251 3.353 3.544 3.735 3.922 4.014 4.202 4.379 4.619 4.77 4.914 5.088 5.23 5.388 5.551 5.688 5.852 6.033 6.199 6.369 6.552 6.727 6.911 7.132 7.308 7.463 7.634 7.846 8.081 8.321 8.606 8.854 9.117 9.4 9.62 9.774 9.817 9.646 9.107 8.214 7.297 6.487 5.773 5.057 4.382 3.768 3.207 2.664 2.222 1.816 1.447 1.088 0.75 0.441 0.113 -0.186 -0.436 -0.675 -0.917 -1.147 -1.406 -1.648 -1.831 -2.019 -2.217 -2.437 -2.676 -2.849 -3.025 -3.3 -3.476 -3.644 -3.732 -3.912 -4.109 -4.308 -4.411 -4.755 -4.749 -4.892 -5.038 -5.301 -5.451 -5.623 -5.797 -5.999 -6.281 -6.662 -7.488 -8 ,32556 ,KEBNE ,16708207,Fri Nov 26 15:37:33 CET,Fri Nov 26 17:12:43 CET,0.0 1.09 1.445 1.719 1.932 2.116 2.28 2.435 2.701 2.813 2.92 2.907 3.245 3.345 3.524 3.7 3.874 3.958 4.111 4.261 4.504 4.649 4.755 4.905 5.057 5.2 5.33 5.449 5.596 5.743 5.899 6.09 6.264 6.427 6.629 6.844 7.028 7.218 7.397 7.565 7.754 7.957 8.174 8.376 8.565 8.746 8.919 9.039 9.076 8.927 8.372 7.501 6.661 5.898 5.225 4.562 3.964 3.423 2.958 2.487 2.087 1.728 1.373 1.024 0.666 0.333 0.021 -0.247 -0.487 -0.731 -1.015 -1.279 -1.538 -1.797 -1.984 -2.157 -2.335 -2.536 -2.763 -2.922 -3.087 -3.315 -3.477 -3.653 -3.74 -3.924 -4.12 -4.33 -4.445 -4.795 -4.788 -4.916 -5.059 -5.336 -5.492 -5.671 -5.851 -6.061 -6.33 -6.652 -7.535 -9 ,23361 ,KEBNE ,16708208,Fri Nov 26 15:37:37 CET,Fri Nov 26 17:04:08 CET,0.0 0.842 1.127 1.354 1.541 1.731 1.916 2.079 2.369 2.497 2.614 2.605 2.942 3.048 3.231 3.397 3.556 3.638 3.811 3.974 4.194 4.322 4.433 4.591 4.753 4.91 5.082 5.249 5.426 5.591 5.754 5.952 6.151 6.334 6.531 6.757 6.964 7.181 7.401 7.599 7.791 8.006 8.235 8.445 8.697 8.955 9.177 9.308 9.327 9.224 8.658 7.731 6.837 5.992 5.221 4.489 3.822 3.141 2.589 2.048 1.568 1.142 0.739 0.363 0.032 -0.24 -0.546 -0.838 -1.098 -1.384 -1.688 -1.933 -2.197 -2.476 -2.678 -2.886 -3.108 -3.318 -3.517 -3.668 -3.838 -4.082 -4.247 -4.424 -4.522 -4.732 -4.932 -5.153 -5.274 -5.621 -5.61 -5.747 -5.889 -6.185 -6.342 -6.496 -6.671 -6.897 -7.171 -7.539 -8.646 -10 ,30024 ,KEBNE ,16708209,Fri Nov 26 15:38:34 CET,Fri Nov 26 17:08:36 CET,0.0 0.956 1.328 1.601 1.817 1.998 2.14 2.276 2.557 2.693 2.815 2.806 3.15 3.261 3.481 3.687 3.863 3.939 4.089 4.239 4.432 4.551 4.681 4.874 5.036 5.182 5.33 5.476 5.676 5.87 6.051 6.25 6.433 6.61 6.804 7.012 7.201 7.421 7.665 7.889 8.109 8.347 8.612 8.863 9.078 9.23 9.389 9.536 9.58 9.427 8.843 7.818 6.866 5.995 5.187 4.462 3.829 3.275 2.792 2.297 1.854 1.445 1.06 0.7 0.367 0.065 -0.243 -0.532 -0.813 -1.131 -1.45 -1.693 -1.946 -2.217 -2.426 -2.642 -2.883 -3.155 -3.426 -3.602 -3.782 -4.044 -4.252 -4.497 -4.626 -4.871 -5.1 -5.359 -5.503 -5.881 -5.96 -6.127 -6.306 -6.675 -6.86 -7.068 -7.307 -7.557 -7.833 -8.212 -9.258 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_338_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_338_336.txt deleted file mode 100644 index 6af6249f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_338_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9774 ,KEBNE ,16708210,Fri Nov 26 15:39:35 CET,Fri Nov 26 17:10:29 CET,0.0 0.878 1.182 1.421 1.649 1.858 2.025 2.179 2.461 2.58 2.688 2.671 2.996 3.083 3.246 3.399 3.536 3.6 3.739 3.868 4.035 4.147 4.257 4.393 4.522 4.653 4.779 4.908 5.049 5.158 5.266 5.386 5.539 5.694 5.839 5.999 6.134 6.27 6.396 6.502 6.596 6.674 6.75 6.851 6.936 6.928 6.835 6.68 6.494 5.942 4.539 2.78 1.315 0.03 -1.077 -2.081 -2.959 -3.711 -4.358 -5.027 -5.593 -6.09 -6.553 -6.991 -7.424 -7.812 -8.209 -8.577 -8.899 -9.266 -9.622 -9.882 -10.17 -10.47 -10.703 -10.955 -11.208 -11.442 -11.69 -11.875 -12.056 -12.343 -12.551 -12.757 -12.864 -13.08 -13.305 -13.553 -13.685 -14.061 -14.09 -14.249 -14.43 -14.836 -15.056 -15.296 -15.544 -15.813 -16.134 -16.519 -17.684 -2 ,32371 ,KEBNE ,16708211,Fri Nov 26 15:39:35 CET,Fri Nov 26 17:10:31 CET,0.0 0.939 1.291 1.539 1.747 1.924 2.093 2.238 2.5 2.622 2.743 2.74 3.065 3.16 3.344 3.522 3.685 3.769 3.933 4.077 4.272 4.382 4.497 4.655 4.782 4.908 5.053 5.198 5.369 5.526 5.647 5.786 5.933 6.093 6.298 6.511 6.666 6.798 6.926 7.058 7.175 7.329 7.48 7.575 7.668 7.716 7.678 7.504 7.181 6.588 5.332 3.614 2.128 0.845 -0.281 -1.294 -2.16 -2.912 -3.562 -4.212 -4.793 -5.307 -5.78 -6.219 -6.619 -7.002 -7.406 -7.754 -8.08 -8.407 -8.731 -9.006 -9.274 -9.556 -9.779 -9.998 -10.233 -10.499 -10.78 -10.987 -11.205 -11.505 -11.713 -11.933 -12.036 -12.255 -12.492 -12.743 -12.87 -13.241 -13.301 -13.469 -13.653 -14.034 -14.226 -14.431 -14.655 -14.912 -15.215 -15.644 -16.772 -3 ,26233 ,KEBNE ,16708212,Fri Nov 26 15:39:35 CET,Fri Nov 26 17:09:47 CET,0.0 1.186 1.486 1.726 1.949 2.134 2.291 2.435 2.704 2.836 2.961 2.977 3.311 3.402 3.557 3.71 3.868 3.954 4.122 4.273 4.482 4.625 4.773 4.955 5.096 5.248 5.402 5.542 5.704 5.845 5.982 6.15 6.293 6.414 6.56 6.725 6.888 7.051 7.203 7.313 7.425 7.577 7.732 7.846 7.989 8.142 8.261 8.305 8.166 7.599 6.193 4.385 2.865 1.596 0.507 -0.525 -1.429 -2.188 -2.833 -3.496 -4.074 -4.588 -5.08 -5.543 -5.964 -6.356 -6.768 -7.116 -7.424 -7.748 -8.073 -8.344 -8.635 -8.926 -9.155 -9.408 -9.687 -9.973 -10.25 -10.446 -10.659 -10.976 -11.172 -11.372 -11.477 -11.688 -11.905 -12.153 -12.282 -12.652 -12.708 -12.872 -13.055 -13.44 -13.628 -13.856 -14.129 -14.413 -14.72 -15.1 -16.091 -4 ,17066 ,KEBNE ,16708213,Fri Nov 26 15:40:36 CET,Fri Nov 26 17:10:56 CET,0.0 0.826 1.165 1.404 1.602 1.777 1.934 2.083 2.34 2.449 2.547 2.51 2.839 2.943 3.117 3.273 3.43 3.507 3.64 3.746 3.913 4.017 4.114 4.282 4.445 4.572 4.677 4.783 4.911 5.016 5.132 5.293 5.432 5.564 5.727 5.883 6.019 6.16 6.287 6.415 6.528 6.626 6.728 6.814 6.874 6.893 6.864 6.748 6.483 5.905 4.577 2.821 1.353 0.044 -1.057 -2.004 -2.878 -3.701 -4.42 -5.116 -5.679 -6.165 -6.63 -7.065 -7.486 -7.875 -8.254 -8.594 -8.893 -9.202 -9.51 -9.754 -10.017 -10.285 -10.514 -10.768 -11.009 -11.258 -11.53 -11.733 -11.948 -12.27 -12.493 -12.728 -12.846 -13.076 -13.303 -13.541 -13.666 -14.031 -14.091 -14.268 -14.444 -14.818 -15.012 -15.241 -15.518 -15.799 -16.109 -16.527 -17.428 -5 ,13338 ,KEBNE ,16708214,Fri Nov 26 15:40:36 CET,Fri Nov 26 17:11:04 CET,0.0 0.994 1.334 1.609 1.837 2.039 2.212 2.35 2.59 2.714 2.835 2.82 3.152 3.248 3.443 3.609 3.745 3.811 3.956 4.086 4.248 4.367 4.499 4.686 4.853 5.027 5.212 5.381 5.57 5.754 5.928 6.129 6.287 6.41 6.572 6.714 6.807 6.946 7.104 7.305 7.527 7.679 7.793 7.888 7.997 8.054 7.986 7.819 7.479 6.839 5.533 3.711 2.152 0.825 -0.289 -1.257 -2.125 -2.915 -3.611 -4.31 -4.905 -5.41 -5.858 -6.297 -6.713 -7.083 -7.514 -7.9 -8.185 -8.5 -8.847 -9.131 -9.418 -9.717 -9.941 -10.173 -10.444 -10.735 -11.041 -11.257 -11.471 -11.799 -12.039 -12.265 -12.383 -12.636 -12.887 -13.156 -13.283 -13.655 -13.707 -13.862 -14.014 -14.361 -14.564 -14.789 -15.042 -15.352 -15.703 -16.11 -17.138 -6 ,27481 ,KEBNE ,16708215,Fri Nov 26 15:40:36 CET,Fri Nov 26 17:10:54 CET,0.0 1.1 1.448 1.705 1.93 2.109 2.27 2.42 2.684 2.806 2.924 2.916 3.247 3.348 3.543 3.722 3.896 3.976 4.124 4.272 4.486 4.622 4.755 4.938 5.103 5.246 5.376 5.497 5.638 5.771 5.91 6.064 6.198 6.343 6.489 6.622 6.771 6.943 7.096 7.248 7.435 7.603 7.74 7.861 7.973 8.028 8.006 7.935 7.641 6.96 5.628 3.895 2.408 1.108 -0.035 -1.039 -1.869 -2.621 -3.275 -3.921 -4.473 -4.949 -5.409 -5.857 -6.293 -6.696 -7.13 -7.535 -7.857 -8.155 -8.461 -8.742 -9.032 -9.332 -9.589 -9.88 -10.173 -10.427 -10.664 -10.835 -11.016 -11.297 -11.486 -11.701 -11.826 -12.076 -12.326 -12.599 -12.745 -13.135 -13.184 -13.345 -13.513 -13.876 -14.09 -14.312 -14.533 -14.778 -15.08 -15.461 -16.603 -7 ,1984 ,KEBNE ,16708216,Fri Nov 26 15:40:36 CET,Fri Nov 26 17:11:05 CET,0.0 0.941 1.297 1.565 1.781 1.966 2.139 2.281 2.518 2.635 2.746 2.733 3.061 3.149 3.318 3.49 3.654 3.734 3.883 4.024 4.232 4.358 4.473 4.649 4.809 4.946 5.083 5.202 5.342 5.503 5.655 5.82 5.985 6.117 6.253 6.439 6.636 6.805 6.942 7.051 7.183 7.39 7.576 7.68 7.747 7.775 7.726 7.576 7.273 6.624 5.295 3.555 2.034 0.746 -0.311 -1.269 -2.155 -2.968 -3.641 -4.312 -4.893 -5.402 -5.862 -6.29 -6.687 -7.048 -7.452 -7.811 -8.111 -8.413 -8.716 -8.966 -9.227 -9.524 -9.768 -10.021 -10.272 -10.519 -10.782 -10.981 -11.192 -11.525 -11.757 -12.002 -12.13 -12.373 -12.632 -12.905 -13.045 -13.444 -13.511 -13.684 -13.868 -14.239 -14.439 -14.648 -14.883 -15.153 -15.47 -15.908 -17.193 -8 ,1761 ,KEBNE ,16708217,Fri Nov 26 15:40:35 CET,Fri Nov 26 17:11:22 CET,0.0 0.902 1.269 1.567 1.806 2.025 2.214 2.374 2.689 2.815 2.926 2.943 3.28 3.387 3.601 3.804 4.002 4.096 4.27 4.419 4.602 4.718 4.841 5.024 5.194 5.345 5.482 5.604 5.74 5.875 6.02 6.207 6.369 6.499 6.649 6.824 7.004 7.208 7.402 7.594 7.769 7.93 8.109 8.239 8.316 8.335 8.289 8.13 7.784 7.077 5.669 3.849 2.274 0.92 -0.242 -1.272 -2.133 -2.907 -3.586 -4.269 -4.859 -5.378 -5.854 -6.299 -6.713 -7.108 -7.542 -7.916 -8.244 -8.558 -8.853 -9.122 -9.409 -9.734 -10.003 -10.28 -10.573 -10.859 -11.128 -11.311 -11.5 -11.775 -11.956 -12.172 -12.301 -12.564 -12.836 -13.128 -13.281 -13.677 -13.746 -13.891 -14.045 -14.427 -14.642 -14.867 -15.108 -15.379 -15.708 -16.153 -17.268 -9 ,24573 ,KEBNE ,16708218,Fri Nov 26 15:40:36 CET,Fri Nov 26 17:11:10 CET,0.0 0.866 1.254 1.556 1.771 1.951 2.109 2.247 2.476 2.591 2.706 2.697 3.026 3.11 3.282 3.439 3.599 3.674 3.793 3.919 4.115 4.247 4.379 4.551 4.711 4.863 4.989 5.093 5.228 5.365 5.516 5.702 5.867 6.002 6.142 6.306 6.446 6.594 6.725 6.843 6.953 7.099 7.277 7.426 7.596 7.687 7.659 7.522 7.213 6.642 5.441 3.789 2.307 1.035 -0.05 -1.023 -1.877 -2.655 -3.327 -3.981 -4.556 -5.057 -5.505 -5.932 -6.336 -6.73 -7.148 -7.493 -7.773 -8.062 -8.394 -8.668 -8.929 -9.208 -9.428 -9.665 -9.913 -10.162 -10.415 -10.597 -10.798 -11.111 -11.328 -11.555 -11.67 -11.912 -12.166 -12.418 -12.548 -12.931 -12.989 -13.152 -13.314 -13.667 -13.864 -14.068 -14.279 -14.55 -14.902 -15.316 -16.208 -10 ,10672 ,KEBNE ,16708219,Fri Nov 26 15:41:41 CET,Fri Nov 26 17:12:31 CET,0.0 1.067 1.461 1.718 1.916 2.091 2.237 2.375 2.644 2.779 2.906 2.915 3.261 3.362 3.546 3.736 3.924 4.014 4.184 4.34 4.57 4.733 4.873 5.055 5.262 5.457 5.603 5.727 5.912 6.119 6.298 6.463 6.619 6.771 6.956 7.151 7.34 7.545 7.724 7.897 8.054 8.199 8.358 8.49 8.604 8.625 8.548 8.449 8.192 7.526 6.191 4.405 2.901 1.65 0.55 -0.445 -1.331 -2.124 -2.785 -3.449 -4.041 -4.59 -5.098 -5.551 -5.948 -6.306 -6.717 -7.097 -7.409 -7.715 -8.041 -8.33 -8.642 -8.945 -9.17 -9.42 -9.681 -9.954 -10.256 -10.468 -10.675 -10.993 -11.213 -11.445 -11.559 -11.795 -12.064 -12.328 -12.459 -12.842 -12.875 -13.014 -13.158 -13.504 -13.711 -13.939 -14.193 -14.493 -14.857 -15.276 -16.326 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_35_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_35_41.txt deleted file mode 100644 index 525b0731..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_35_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23392 ,KEBNE ,16708220,Fri Nov 26 15:41:37 CET,Fri Nov 26 17:11:49 CET,0.0 0.899 1.237 1.515 1.766 1.974 2.155 2.317 2.63 2.778 2.914 3.127 3.311 3.433 3.651 3.84 4.028 4.123 4.312 4.508 4.772 4.94 5.095 5.306 5.531 5.753 5.962 6.172 6.451 6.704 6.945 7.218 7.45 7.671 7.949 8.266 8.549 8.856 9.185 9.534 9.902 10.293 10.776 11.249 11.758 12.329 12.948 13.609 14.326 15.089 15.894 16.349 16.404 16.305 16.163 15.959 15.73 15.493 15.268 15.05 14.826 14.589 14.383 14.19 13.996 13.775 13.512 13.279 13.054 12.818 12.553 12.337 12.138 11.939 11.804 11.672 11.524 11.335 11.118 10.979 10.84 10.626 10.479 10.317 10.237 10.069 9.888 9.704 9.599 9.444 9.251 9.125 8.999 8.698 8.513 8.326 8.13 7.894 7.614 7.221 5.915 -2 ,15235 ,KEBNE ,16708221,Fri Nov 26 15:42:38 CET,Fri Nov 26 17:11:41 CET,0.0 1.252 1.715 2.032 2.284 2.509 2.69 2.869 3.226 3.388 3.534 3.726 3.896 4.028 4.287 4.527 4.754 4.858 5.06 5.26 5.523 5.683 5.848 6.072 6.284 6.506 6.734 6.96 7.245 7.508 7.748 8.027 8.305 8.59 8.926 9.258 9.539 9.866 10.208 10.597 11.035 11.476 11.96 12.46 13.016 13.604 14.301 15.061 15.812 16.543 17.31 17.723 17.703 17.536 17.364 17.138 16.871 16.633 16.444 16.227 16.006 15.781 15.579 15.394 15.207 15.042 14.83 14.609 14.405 14.172 13.922 13.706 13.479 13.252 13.089 12.924 12.76 12.594 12.41 12.28 12.14 11.902 11.722 11.538 11.456 11.302 11.127 10.936 10.828 10.666 10.459 10.317 10.184 9.897 9.73 9.546 9.344 9.13 8.849 8.431 6.982 -3 ,27911 ,KEBNE ,16708222,Fri Nov 26 15:42:37 CET,Fri Nov 26 17:12:17 CET,0.0 1.246 1.651 1.935 2.179 2.401 2.603 2.779 3.067 3.216 3.374 3.606 3.771 3.872 4.113 4.354 4.585 4.693 4.893 5.078 5.345 5.526 5.684 5.9 6.108 6.302 6.488 6.673 6.906 7.116 7.325 7.584 7.836 8.093 8.379 8.665 8.928 9.229 9.559 9.916 10.295 10.701 11.172 11.651 12.183 12.756 13.403 14.093 14.863 15.672 16.426 16.894 16.987 16.852 16.673 16.49 16.283 16.073 15.876 15.618 15.334 15.079 14.838 14.566 14.313 14.105 13.891 13.705 13.524 13.317 13.087 12.891 12.677 12.452 12.298 12.143 11.975 11.791 11.601 11.482 11.346 11.12 10.961 10.79 10.707 10.544 10.357 10.139 10.022 9.873 9.684 9.549 9.413 9.112 8.934 8.749 8.533 8.283 7.98 7.521 6.074 -4 ,9067 ,KEBNE ,16708223,Fri Nov 26 15:42:38 CET,Fri Nov 26 17:12:41 CET,0.0 1.419 1.817 2.124 2.402 2.626 2.831 3.021 3.349 3.498 3.644 3.873 4.055 4.179 4.404 4.603 4.816 4.92 5.106 5.291 5.54 5.69 5.834 6.034 6.23 6.42 6.6 6.779 7.018 7.241 7.458 7.725 7.985 8.236 8.507 8.803 9.079 9.37 9.695 10.062 10.44 10.836 11.323 11.85 12.423 13.043 13.772 14.516 15.321 16.207 17.047 17.527 17.643 17.533 17.332 17.051 16.783 16.582 16.38 16.142 15.934 15.75 15.582 15.389 15.171 14.978 14.781 14.585 14.41 14.23 14.053 13.909 13.767 13.623 13.5 13.366 13.203 13.011 12.8 12.65 12.487 12.224 12.054 11.884 11.8 11.631 11.442 11.239 11.137 10.989 10.824 10.701 10.558 10.251 10.076 9.876 9.667 9.439 9.134 8.618 6.899 -5 ,29088 ,KEBNE ,16708224,Fri Nov 26 15:42:37 CET,Fri Nov 26 17:12:18 CET,0.0 1.503 1.936 2.252 2.502 2.731 2.94 3.12 3.458 3.608 3.75 3.972 4.144 4.261 4.481 4.69 4.889 4.992 5.199 5.378 5.63 5.779 5.916 6.128 6.34 6.548 6.739 6.919 7.145 7.351 7.563 7.838 8.107 8.351 8.601 8.877 9.154 9.45 9.754 10.066 10.401 10.777 11.183 11.584 12.086 12.665 13.321 13.991 14.674 15.403 16.194 16.674 16.846 16.817 16.654 16.417 16.179 15.964 15.767 15.526 15.272 15.021 14.785 14.58 14.393 14.211 14.009 13.808 13.618 13.428 13.213 13.015 12.816 12.607 12.435 12.284 12.143 11.953 11.751 11.624 11.493 11.293 11.153 11.012 10.935 10.767 10.592 10.394 10.29 10.131 9.934 9.802 9.657 9.342 9.157 8.942 8.683 8.38 8.02 7.524 6.088 -6 ,30499 ,KEBNE ,16708225,Fri Nov 26 15:42:37 CET,Fri Nov 26 17:11:41 CET,0.0 1.157 1.559 1.826 2.063 2.284 2.472 2.632 2.909 3.042 3.165 3.349 3.521 3.639 3.857 4.051 4.233 4.313 4.464 4.625 4.868 5.016 5.168 5.385 5.576 5.772 5.969 6.16 6.388 6.603 6.826 7.078 7.311 7.558 7.834 8.129 8.423 8.736 9.092 9.449 9.782 10.155 10.593 11.067 11.579 12.08 12.653 13.274 14.081 15.003 15.84 16.332 16.431 16.383 16.248 16.064 15.892 15.676 15.454 15.251 15.033 14.818 14.615 14.403 14.205 14.019 13.813 13.626 13.461 13.266 13.07 12.934 12.779 12.614 12.488 12.334 12.168 12.007 11.84 11.706 11.55 11.335 11.181 10.994 10.899 10.71 10.515 10.315 10.21 10.051 9.834 9.69 9.539 9.235 9.056 8.838 8.622 8.393 8.113 7.684 6.418 -7 ,21182 ,KEBNE ,16708226,Fri Nov 26 15:42:37 CET,Fri Nov 26 17:11:46 CET,0.0 1.286 1.679 1.997 2.254 2.458 2.657 2.842 3.171 3.316 3.45 3.659 3.839 3.957 4.161 4.36 4.562 4.666 4.865 5.04 5.277 5.417 5.557 5.77 5.972 6.151 6.325 6.536 6.815 7.051 7.271 7.54 7.801 8.048 8.319 8.609 8.896 9.205 9.518 9.846 10.218 10.686 11.245 11.738 12.231 12.772 13.382 14.032 14.725 15.522 16.412 16.874 17.013 16.961 16.785 16.578 16.345 16.114 15.914 15.682 15.451 15.234 15.009 14.766 14.505 14.263 14.038 13.842 13.643 13.41 13.174 12.989 12.792 12.56 12.377 12.2 12.018 11.84 11.655 11.522 11.369 11.12 10.956 10.776 10.681 10.49 10.283 10.046 9.921 9.756 9.549 9.42 9.283 8.941 8.755 8.553 8.321 8.053 7.702 7.242 6.012 -8 ,22060 ,KEBNE ,16708227,Fri Nov 26 15:42:38 CET,Fri Nov 26 17:12:37 CET,0.0 1.057 1.49 1.804 2.082 2.314 2.505 2.67 2.969 3.124 3.277 3.475 3.634 3.74 3.945 4.123 4.303 4.405 4.597 4.763 4.993 5.146 5.301 5.517 5.724 5.941 6.166 6.386 6.671 6.932 7.168 7.456 7.712 7.972 8.288 8.622 8.925 9.222 9.524 9.834 10.204 10.632 11.091 11.533 12.033 12.636 13.364 14.104 14.834 15.63 16.48 16.934 17.028 16.959 16.779 16.524 16.264 15.985 15.735 15.465 15.22 15.011 14.808 14.634 14.466 14.285 14.085 13.916 13.763 13.583 13.391 13.237 13.046 12.808 12.628 12.449 12.262 12.07 11.877 11.74 11.591 11.347 11.181 11.018 10.936 10.76 10.561 10.352 10.241 10.076 9.85 9.712 9.559 9.216 9.032 8.826 8.606 8.366 8.061 7.594 6.422 -9 ,25734 ,KEBNE ,16708228,Fri Nov 26 15:42:38 CET,Fri Nov 26 17:11:56 CET,0.0 1.068 1.45 1.765 2.025 2.233 2.427 2.618 2.953 3.101 3.248 3.492 3.671 3.796 4.049 4.275 4.473 4.563 4.73 4.913 5.207 5.385 5.553 5.79 6.014 6.227 6.439 6.639 6.893 7.126 7.341 7.647 7.93 8.178 8.467 8.763 9.039 9.331 9.648 9.992 10.347 10.761 11.24 11.703 12.209 12.753 13.385 14.073 14.843 15.677 16.445 16.852 16.922 16.82 16.645 16.428 16.206 15.938 15.687 15.473 15.28 15.071 14.821 14.582 14.371 14.148 13.9 13.654 13.427 13.218 12.983 12.775 12.565 12.352 12.178 11.985 11.804 11.619 11.407 11.261 11.111 10.888 10.733 10.56 10.463 10.256 10.063 9.878 9.776 9.627 9.444 9.306 9.164 8.841 8.665 8.492 8.295 8.075 7.756 7.322 6.054 -10 ,11633 ,KEBNE ,16708229,Fri Nov 26 15:42:38 CET,Fri Nov 26 17:12:29 CET,0.0 0.934 1.303 1.588 1.834 2.047 2.242 2.429 2.787 2.939 3.084 3.327 3.504 3.622 3.845 4.053 4.26 4.365 4.572 4.762 5.019 5.174 5.317 5.526 5.737 5.943 6.142 6.334 6.571 6.823 7.076 7.336 7.567 7.799 8.082 8.416 8.746 9.086 9.407 9.738 10.138 10.606 11.097 11.583 12.184 12.805 13.411 14.065 14.805 15.653 16.527 17.06 17.21 17.088 16.877 16.639 16.373 16.116 15.877 15.613 15.36 15.125 14.918 14.701 14.467 14.266 14.046 13.802 13.575 13.35 13.14 12.965 12.751 12.519 12.337 12.139 11.944 11.747 11.545 11.415 11.277 11.032 10.862 10.688 10.604 10.442 10.252 10.04 9.932 9.776 9.593 9.463 9.314 8.99 8.8 8.605 8.391 8.132 7.816 7.355 5.955 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_35_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_35_50.txt deleted file mode 100644 index d5a9aad3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_35_50.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17680 ,KEBNE ,16708230,Fri Nov 26 15:43:38 CET,Fri Nov 26 17:13:57 CET,0.0 0.829 1.078 1.234 1.348 1.424 1.458 1.481 1.504 1.518 1.528 1.466 1.504 1.49 1.449 1.403 1.345 1.306 1.222 1.133 0.987 0.884 0.783 0.625 0.46 0.292 0.104 -0.093 -0.35 -0.606 -0.873 -1.231 -1.588 -1.938 -2.372 -2.913 -3.474 -4.115 -4.849 -5.688 -6.644 -7.78 -9.205 -10.749 -12.695 -15.091 -18.102 -21.827 -26.801 -33.608 -43.562 -53.853 -61.368 -67.213 -71.808 -75.624 -78.839 -81.631 -83.89 -86.049 -87.842 -89.397 -90.833 -92.143 -93.348 -94.406 -95.455 -96.372 -97.162 -97.996 -98.874 -99.582 -100.299 -101.025 -101.582 -102.152 -102.727 -103.304 -103.859 -104.243 -104.66 -105.292 -105.712 -106.155 -106.385 -106.844 -107.304 -107.77 -108.018 -108.432 -108.772 -109.033 -109.324 -109.965 -110.302 -110.683 -111.097 -111.488 -111.904 -112.515 -114.534 -2 ,5514 ,KEBNE ,16708231,Fri Nov 26 15:43:39 CET,Fri Nov 26 17:13:22 CET,0.0 0.988 1.295 1.486 1.592 1.667 1.713 1.744 1.783 1.793 1.801 1.755 1.798 1.786 1.757 1.713 1.653 1.62 1.549 1.483 1.367 1.275 1.181 1.021 0.851 0.683 0.511 0.329 0.084 -0.184 -0.463 -0.825 -1.199 -1.578 -2.056 -2.611 -3.152 -3.794 -4.553 -5.416 -6.372 -7.526 -8.981 -10.543 -12.502 -14.879 -17.856 -21.611 -26.581 -33.286 -43.209 -53.534 -61.072 -66.964 -71.62 -75.506 -78.755 -81.519 -83.749 -85.902 -87.699 -89.224 -90.633 -91.939 -93.113 -94.149 -95.225 -96.194 -97.003 -97.83 -98.687 -99.365 -100.036 -100.721 -101.251 -101.8 -102.361 -102.918 -103.481 -103.855 -104.246 -104.856 -105.267 -105.692 -105.904 -106.342 -106.798 -107.271 -107.516 -107.922 -108.27 -108.538 -108.814 -109.408 -109.735 -110.072 -110.422 -110.779 -111.165 -111.683 -113.117 -3 ,29309 ,KEBNE ,16708232,Fri Nov 26 15:43:39 CET,Fri Nov 26 17:13:08 CET,0.0 0.948 1.2 1.346 1.448 1.524 1.572 1.607 1.64 1.648 1.66 1.6 1.635 1.617 1.586 1.531 1.458 1.422 1.36 1.293 1.172 1.097 1.017 0.872 0.716 0.549 0.386 0.209 -0.051 -0.303 -0.57 -0.92 -1.265 -1.62 -2.064 -2.601 -3.145 -3.773 -4.5 -5.338 -6.277 -7.394 -8.812 -10.364 -12.321 -14.674 -17.656 -21.418 -26.367 -33.111 -43.051 -53.373 -60.913 -66.847 -71.578 -75.564 -78.85 -81.632 -83.933 -86.133 -87.968 -89.553 -91.019 -92.387 -93.664 -94.788 -95.893 -96.854 -97.65 -98.44 -99.263 -99.938 -100.629 -101.346 -101.888 -102.44 -102.989 -103.532 -104.092 -104.483 -104.898 -105.516 -105.921 -106.344 -106.561 -107.009 -107.474 -107.964 -108.216 -108.621 -108.935 -109.183 -109.432 -109.993 -110.302 -110.611 -110.94 -111.313 -111.736 -112.273 -113.886 -4 ,10191 ,KEBNE ,16708233,Fri Nov 26 15:44:39 CET,Fri Nov 26 17:13:52 CET,0.0 0.9 1.127 1.263 1.358 1.43 1.483 1.531 1.599 1.611 1.618 1.576 1.627 1.617 1.577 1.532 1.482 1.453 1.389 1.314 1.184 1.092 0.994 0.836 0.681 0.518 0.342 0.162 -0.086 -0.351 -0.619 -0.962 -1.324 -1.684 -2.13 -2.673 -3.22 -3.864 -4.616 -5.44 -6.353 -7.505 -8.969 -10.546 -12.529 -14.917 -17.938 -21.71 -26.661 -33.4 -43.221 -53.446 -60.967 -67.007 -71.862 -75.811 -79.006 -81.766 -84.072 -86.284 -88.117 -89.677 -91.127 -92.446 -93.619 -94.677 -95.75 -96.697 -97.51 -98.329 -99.166 -99.854 -100.543 -101.237 -101.774 -102.32 -102.875 -103.421 -103.977 -104.377 -104.781 -105.39 -105.805 -106.237 -106.46 -106.903 -107.36 -107.809 -108.03 -108.437 -108.8 -109.06 -109.327 -109.895 -110.204 -110.544 -110.894 -111.257 -111.692 -112.304 -113.84 -5 ,14804 ,KEBNE ,16708234,Fri Nov 26 15:44:39 CET,Fri Nov 26 17:14:32 CET,0.0 0.854 1.072 1.193 1.275 1.351 1.418 1.469 1.522 1.531 1.538 1.479 1.512 1.493 1.445 1.381 1.303 1.26 1.176 1.088 0.947 0.845 0.735 0.561 0.38 0.192 0.002 -0.189 -0.467 -0.768 -1.068 -1.433 -1.803 -2.175 -2.641 -3.221 -3.802 -4.474 -5.26 -6.129 -7.077 -8.236 -9.687 -11.252 -13.252 -15.674 -18.758 -22.635 -27.704 -34.596 -44.717 -55.205 -62.847 -68.861 -73.695 -77.656 -80.906 -83.719 -86.051 -88.276 -90.092 -91.622 -93.02 -94.315 -95.488 -96.523 -97.586 -98.506 -99.277 -100.07 -100.896 -101.571 -102.259 -102.964 -103.495 -104.02 -104.557 -105.104 -105.657 -106.042 -106.432 -107.044 -107.47 -107.894 -108.1 -108.525 -108.975 -109.43 -109.668 -110.071 -110.414 -110.684 -110.958 -111.528 -111.823 -112.143 -112.494 -112.859 -113.27 -113.774 -115.066 -6 ,25991 ,KEBNE ,16708235,Fri Nov 26 15:44:39 CET,Fri Nov 26 17:13:52 CET,0.0 0.862 1.111 1.252 1.347 1.415 1.46 1.502 1.582 1.611 1.62 1.563 1.61 1.588 1.543 1.494 1.446 1.415 1.331 1.241 1.094 0.99 0.891 0.735 0.568 0.392 0.2 0.004 -0.264 -0.541 -0.81 -1.148 -1.51 -1.898 -2.381 -2.937 -3.5 -4.15 -4.881 -5.717 -6.653 -7.778 -9.194 -10.748 -12.725 -15.091 -18.066 -21.816 -26.784 -33.537 -43.354 -53.599 -61.17 -67.05 -71.814 -75.838 -79.133 -81.981 -84.302 -86.494 -88.309 -89.877 -91.329 -92.656 -93.858 -94.914 -95.98 -96.926 -97.737 -98.562 -99.396 -100.073 -100.755 -101.432 -101.947 -102.489 -103.043 -103.603 -104.165 -104.551 -104.953 -105.585 -106.019 -106.45 -106.665 -107.083 -107.521 -107.989 -108.231 -108.641 -108.979 -109.241 -109.515 -110.099 -110.427 -110.788 -111.173 -111.578 -112.042 -112.581 -113.974 -7 ,17154 ,KEBNE ,16708236,Fri Nov 26 15:44:39 CET,Fri Nov 26 17:14:29 CET,0.0 1.232 1.494 1.656 1.765 1.849 1.908 1.963 2.025 2.038 2.044 1.968 2.002 1.987 1.939 1.888 1.826 1.8 1.753 1.686 1.558 1.473 1.385 1.228 1.064 0.888 0.703 0.517 0.258 -0.016 -0.295 -0.657 -1.025 -1.396 -1.858 -2.408 -2.964 -3.599 -4.328 -5.172 -6.125 -7.28 -8.722 -10.284 -12.253 -14.637 -17.641 -21.423 -26.387 -33.087 -42.93 -53.164 -60.663 -66.504 -71.238 -75.173 -78.346 -81.045 -83.301 -85.529 -87.367 -88.955 -90.436 -91.77 -92.983 -94.08 -95.191 -96.145 -96.952 -97.782 -98.617 -99.287 -99.961 -100.656 -101.202 -101.745 -102.284 -102.833 -103.402 -103.784 -104.163 -104.742 -105.154 -105.597 -105.822 -106.259 -106.704 -107.165 -107.399 -107.812 -108.164 -108.423 -108.703 -109.319 -109.645 -109.977 -110.331 -110.734 -111.178 -111.737 -113.03 -9 ,29541 ,KEBNE ,16708238,Fri Nov 26 15:45:41 CET,Fri Nov 26 17:15:50 CET,0.0 1.093 1.358 1.531 1.677 1.791 1.845 1.876 1.913 1.923 1.931 1.878 1.923 1.917 1.882 1.826 1.756 1.719 1.649 1.577 1.45 1.355 1.253 1.108 0.948 0.769 0.589 0.406 0.145 -0.121 -0.393 -0.754 -1.122 -1.495 -1.958 -2.509 -3.075 -3.737 -4.507 -5.371 -6.318 -7.473 -8.925 -10.485 -12.458 -14.86 -17.926 -21.791 -26.828 -33.646 -43.704 -54.099 -61.633 -67.517 -72.24 -76.192 -79.439 -82.216 -84.484 -86.729 -88.632 -90.218 -91.651 -92.968 -94.154 -95.19 -96.264 -97.214 -98.017 -98.828 -99.658 -100.323 -100.974 -101.642 -102.169 -102.709 -103.253 -103.803 -104.371 -104.747 -105.129 -105.723 -106.123 -106.534 -106.737 -107.155 -107.594 -108.044 -108.274 -108.678 -109.014 -109.268 -109.553 -110.14 -110.429 -110.741 -111.064 -111.406 -111.803 -112.31 -113.622 -10 ,29960 ,KEBNE ,16708239,Fri Nov 26 15:45:41 CET,Fri Nov 26 17:15:22 CET,0.0 1.072 1.327 1.46 1.55 1.615 1.67 1.717 1.761 1.767 1.767 1.699 1.745 1.732 1.695 1.642 1.579 1.551 1.481 1.406 1.283 1.186 1.083 0.916 0.754 0.583 0.39 0.199 -0.051 -0.323 -0.601 -0.942 -1.302 -1.685 -2.157 -2.697 -3.233 -3.878 -4.627 -5.466 -6.425 -7.579 -9.009 -10.547 -12.502 -14.904 -17.945 -21.769 -26.835 -33.731 -43.765 -54.223 -62.007 -68.052 -72.817 -76.761 -79.973 -82.77 -85.099 -87.341 -89.194 -90.769 -92.2 -93.475 -94.629 -95.664 -96.703 -97.6 -98.359 -99.117 -99.883 -100.522 -101.181 -101.856 -102.387 -102.919 -103.443 -103.979 -104.528 -104.899 -105.281 -105.87 -106.266 -106.668 -106.877 -107.313 -107.739 -108.169 -108.4 -108.8 -109.118 -109.365 -109.617 -110.174 -110.475 -110.776 -111.085 -111.413 -111.806 -112.322 -113.584 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_35_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_35_54.txt deleted file mode 100644 index 8d6fd42c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_35_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15250 ,KEBNE ,17125983,Thu Dec 30 17:02:47 CET,Thu Dec 30 18:35:37 CET,0.0 1.614 2.04 2.3 2.511 2.694 2.845 2.952 3.122 3.202 3.267 3.29 3.369 3.39 3.436 3.481 3.506 3.522 3.532 3.516 3.478 3.434 3.385 3.306 3.222 3.121 3.016 2.909 2.754 2.587 2.403 2.16 1.914 1.67 1.323 0.879 0.42 -0.133 -0.763 -1.501 -2.313 -3.249 -4.497 -5.975 -7.831 -10.052 -12.875 -16.486 -21.356 -28.051 -37.926 -48.378 -56.05 -61.944 -66.563 -70.394 -73.551 -76.253 -78.506 -80.681 -82.504 -84.093 -85.586 -86.997 -88.264 -89.367 -90.438 -91.35 -92.165 -93.017 -93.884 -94.563 -95.263 -96.031 -96.625 -97.23 -97.849 -98.478 -99.116 -99.544 -99.976 -100.641 -101.104 -101.584 -101.832 -102.342 -102.859 -103.378 -103.644 -104.079 -104.449 -104.734 -105.048 -105.705 -106.043 -106.403 -106.816 -107.296 -107.828 -108.504 -110.306 -2 ,221 ,KEBNE ,17125984,Thu Dec 30 17:02:45 CET,Thu Dec 30 18:35:13 CET,0.0 1.316 1.672 1.938 2.136 2.297 2.419 2.512 2.667 2.739 2.79 2.81 2.902 2.934 2.982 3.003 3.014 3.021 3.013 2.967 2.911 2.886 2.852 2.807 2.752 2.674 2.576 2.463 2.345 2.24 2.076 1.831 1.582 1.295 0.947 0.536 0.089 -0.447 -1.075 -1.797 -2.608 -3.599 -4.904 -6.368 -8.215 -10.442 -13.273 -16.91 -21.825 -28.528 -38.334 -48.608 -56.169 -62.021 -66.693 -70.621 -73.8 -76.493 -78.74 -80.893 -82.671 -84.216 -85.654 -86.98 -88.172 -89.245 -90.363 -91.338 -92.177 -93.024 -93.889 -94.609 -95.351 -96.113 -96.695 -97.271 -97.854 -98.457 -99.071 -99.502 -99.949 -100.639 -101.107 -101.569 -101.8 -102.265 -102.75 -103.272 -103.546 -104.003 -104.408 -104.703 -105.001 -105.633 -105.973 -106.321 -106.7 -107.129 -107.624 -108.262 -109.943 -3 ,13243 ,KEBNE ,17125985,Thu Dec 30 17:02:46 CET,Thu Dec 30 18:35:24 CET,0.0 1.202 1.608 1.871 2.066 2.208 2.32 2.436 2.628 2.705 2.762 2.8 2.903 2.948 2.998 3.051 3.106 3.126 3.157 3.174 3.189 3.178 3.144 3.086 3.023 2.943 2.846 2.731 2.551 2.373 2.18 1.891 1.577 1.268 0.913 0.477 -0.025 -0.626 -1.27 -1.992 -2.837 -3.889 -5.243 -6.72 -8.599 -10.889 -13.787 -17.443 -22.293 -28.951 -38.934 -49.364 -56.931 -62.948 -67.781 -71.722 -74.996 -77.881 -80.302 -82.65 -84.601 -86.293 -87.837 -89.26 -90.568 -91.72 -92.885 -93.897 -94.748 -95.598 -96.459 -97.172 -97.893 -98.605 -99.152 -99.724 -100.315 -100.934 -101.544 -101.945 -102.368 -103.008 -103.439 -103.893 -104.126 -104.597 -105.071 -105.567 -105.824 -106.259 -106.65 -106.943 -107.255 -107.902 -108.227 -108.577 -108.965 -109.38 -109.864 -110.507 -112.271 -4 ,5629 ,KEBNE ,17125986,Thu Dec 30 17:02:46 CET,Thu Dec 30 18:36:09 CET,0.0 1.444 1.843 2.085 2.29 2.479 2.644 2.792 3.044 3.14 3.23 3.311 3.427 3.481 3.54 3.557 3.552 3.547 3.544 3.559 3.55 3.531 3.524 3.476 3.414 3.379 3.327 3.253 3.135 2.958 2.746 2.487 2.212 1.957 1.668 1.313 0.944 0.495 -0.068 -0.76 -1.581 -2.6 -3.886 -5.315 -7.13 -9.324 -12.148 -15.693 -20.4 -26.999 -36.935 -47.455 -55.079 -60.988 -65.702 -69.647 -72.89 -75.699 -78.076 -80.382 -82.28 -83.876 -85.353 -86.704 -87.957 -89.079 -90.209 -91.195 -92.015 -92.847 -93.688 -94.378 -95.086 -95.777 -96.294 -96.817 -97.347 -97.898 -98.462 -98.843 -99.231 -99.851 -100.28 -100.716 -100.93 -101.363 -101.808 -102.252 -102.492 -102.896 -103.243 -103.521 -103.803 -104.391 -104.721 -105.069 -105.432 -105.816 -106.283 -106.956 -108.48 -5 ,24522 ,KEBNE ,17125987,Thu Dec 30 17:02:46 CET,Thu Dec 30 18:34:57 CET,0.0 1.46 1.867 2.128 2.326 2.483 2.621 2.743 2.937 2.997 3.039 3.071 3.165 3.19 3.219 3.277 3.328 3.347 3.37 3.383 3.387 3.368 3.328 3.272 3.225 3.176 3.124 3.049 2.92 2.763 2.608 2.385 2.117 1.84 1.498 1.078 0.619 0.054 -0.584 -1.318 -2.208 -3.295 -4.643 -6.129 -7.966 -10.201 -13.092 -16.732 -21.643 -28.373 -38.249 -48.54 -56.111 -62.005 -66.672 -70.637 -73.912 -76.741 -79.122 -81.42 -83.352 -85.006 -86.489 -87.857 -89.111 -90.238 -91.395 -92.374 -93.201 -94.062 -94.948 -95.677 -96.391 -97.103 -97.662 -98.237 -98.826 -99.424 -100.027 -100.433 -100.841 -101.462 -101.896 -102.343 -102.563 -103.021 -103.497 -103.986 -104.236 -104.657 -105.058 -105.345 -105.643 -106.27 -106.596 -106.966 -107.379 -107.822 -108.333 -109.025 -110.69 -6 ,10322 ,KEBNE ,17125988,Thu Dec 30 17:02:46 CET,Thu Dec 30 18:34:25 CET,0.0 1.255 1.667 1.977 2.18 2.342 2.499 2.627 2.798 2.876 2.941 2.989 3.093 3.137 3.216 3.279 3.304 3.303 3.291 3.285 3.28 3.265 3.222 3.148 3.089 3.029 2.96 2.873 2.722 2.546 2.371 2.127 1.867 1.607 1.266 0.822 0.35 -0.168 -0.769 -1.512 -2.33 -3.325 -4.599 -6.008 -7.811 -9.996 -12.82 -16.342 -21.029 -27.558 -37.223 -47.419 -54.905 -60.716 -65.376 -69.24 -72.41 -75.145 -77.402 -79.582 -81.377 -82.903 -84.347 -85.698 -86.874 -87.924 -89.006 -89.944 -90.761 -91.581 -92.412 -93.087 -93.763 -94.463 -94.994 -95.538 -96.098 -96.649 -97.213 -97.593 -97.96 -98.531 -98.95 -99.384 -99.599 -100.023 -100.464 -100.945 -101.186 -101.594 -101.963 -102.247 -102.54 -103.136 -103.461 -103.825 -104.218 -104.682 -105.227 -105.857 -107.449 -7 ,7897 ,KEBNE ,17125989,Thu Dec 30 17:02:46 CET,Thu Dec 30 18:35:14 CET,0.0 1.404 1.787 2.056 2.274 2.452 2.599 2.718 2.921 2.997 3.063 3.127 3.223 3.273 3.378 3.45 3.48 3.487 3.524 3.545 3.524 3.496 3.46 3.394 3.339 3.282 3.213 3.148 3.045 2.912 2.751 2.517 2.293 2.074 1.788 1.426 1.008 0.476 -0.166 -0.906 -1.755 -2.806 -4.131 -5.584 -7.433 -9.713 -12.661 -16.362 -21.193 -27.742 -37.524 -47.847 -55.367 -61.233 -65.954 -69.868 -73.046 -75.755 -78.006 -80.207 -82.036 -83.577 -84.969 -86.241 -87.419 -88.463 -89.487 -90.412 -91.234 -92.051 -92.886 -93.559 -94.209 -94.868 -95.379 -95.92 -96.493 -97.098 -97.728 -98.153 -98.585 -99.232 -99.67 -100.122 -100.351 -100.814 -101.292 -101.787 -102.042 -102.478 -102.88 -103.168 -103.469 -104.107 -104.439 -104.81 -105.21 -105.631 -106.125 -106.749 -108.434 -8 ,22045 ,KEBNE ,17125990,Thu Dec 30 17:02:46 CET,Thu Dec 30 18:35:21 CET,0.0 1.321 1.743 1.979 2.156 2.316 2.446 2.558 2.738 2.801 2.861 2.923 3.02 3.07 3.145 3.193 3.225 3.234 3.245 3.253 3.233 3.2 3.172 3.127 3.055 2.992 2.944 2.873 2.76 2.63 2.488 2.292 2.064 1.824 1.519 1.125 0.705 0.208 -0.379 -1.097 -1.935 -2.951 -4.266 -5.677 -7.474 -9.743 -12.633 -16.286 -21.117 -27.72 -37.543 -47.937 -55.613 -61.554 -66.271 -70.161 -73.375 -76.299 -78.781 -81.095 -82.911 -84.432 -85.882 -87.212 -88.408 -89.488 -90.585 -91.562 -92.435 -93.327 -94.26 -95.0 -95.71 -96.454 -97.028 -97.616 -98.225 -98.837 -99.43 -99.839 -100.265 -100.916 -101.362 -101.825 -102.068 -102.549 -103.047 -103.58 -103.85 -104.289 -104.69 -104.982 -105.282 -105.933 -106.279 -106.625 -107.012 -107.451 -107.966 -108.61 -110.015 -9 ,14607 ,KEBNE ,17125991,Thu Dec 30 17:02:49 CET,Thu Dec 30 18:35:06 CET,0.0 1.459 1.817 2.072 2.251 2.374 2.487 2.588 2.726 2.782 2.832 2.857 2.947 2.996 3.08 3.136 3.19 3.206 3.216 3.215 3.183 3.152 3.121 3.074 3.016 2.942 2.857 2.769 2.606 2.399 2.179 1.882 1.566 1.233 0.818 0.348 -0.092 -0.629 -1.28 -2.03 -2.895 -3.969 -5.321 -6.77 -8.602 -10.849 -13.735 -17.347 -22.099 -28.697 -38.512 -48.836 -56.41 -62.278 -67.029 -70.975 -74.19 -76.92 -79.179 -81.373 -83.17 -84.704 -86.117 -87.411 -88.565 -89.619 -90.75 -91.741 -92.558 -93.379 -94.25 -94.985 -95.741 -96.499 -97.077 -97.687 -98.307 -98.907 -99.502 -99.909 -100.338 -101.004 -101.459 -101.927 -102.162 -102.646 -103.142 -103.651 -103.918 -104.358 -104.765 -105.058 -105.362 -106.018 -106.386 -106.774 -107.172 -107.624 -108.128 -108.746 -110.578 -10 ,9079 ,KEBNE ,17125992,Thu Dec 30 17:02:49 CET,Thu Dec 30 18:36:04 CET,0.0 1.158 1.531 1.823 2.076 2.263 2.416 2.54 2.744 2.835 2.919 2.982 3.062 3.079 3.133 3.187 3.237 3.264 3.303 3.322 3.339 3.351 3.334 3.255 3.171 3.108 3.047 2.957 2.802 2.625 2.443 2.19 1.902 1.591 1.222 0.8 0.348 -0.195 -0.813 -1.521 -2.344 -3.354 -4.614 -6.011 -7.772 -9.879 -12.623 -16.114 -20.768 -27.163 -36.521 -46.424 -53.85 -59.614 -64.209 -68.075 -71.26 -73.949 -76.161 -78.275 -80.018 -81.55 -82.992 -84.3 -85.473 -86.53 -87.595 -88.506 -89.289 -90.117 -90.961 -91.625 -92.305 -93.027 -93.57 -94.103 -94.642 -95.175 -95.723 -96.103 -96.498 -97.122 -97.535 -97.942 -98.156 -98.59 -99.043 -99.511 -99.742 -100.156 -100.567 -100.853 -101.156 -101.823 -102.166 -102.523 -102.923 -103.345 -103.816 -104.413 -105.986 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_41_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_41_54.txt deleted file mode 100644 index 5c1d2443..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_41_54.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25505 ,KEBNE ,16708240,Fri Nov 26 15:45:41 CET,Fri Nov 26 17:15:27 CET,0.0 1.422 1.839 2.124 2.334 2.469 2.614 2.758 2.954 3.029 3.106 3.189 3.278 3.315 3.366 3.398 3.411 3.411 3.415 3.399 3.349 3.309 3.249 3.16 3.08 2.965 2.829 2.703 2.505 2.307 2.116 1.846 1.541 1.228 0.865 0.456 0.02 -0.532 -1.153 -1.85 -2.667 -3.696 -5.057 -6.588 -8.552 -10.919 -13.977 -17.926 -23.206 -30.443 -41.055 -52.132 -60.153 -66.313 -71.219 -75.355 -78.789 -81.665 -83.98 -86.205 -88.069 -89.698 -91.187 -92.517 -93.779 -94.948 -96.14 -97.199 -98.092 -98.991 -99.931 -100.693 -101.445 -102.209 -102.806 -103.416 -104.021 -104.625 -105.233 -105.655 -106.089 -106.749 -107.215 -107.711 -107.968 -108.476 -108.996 -109.549 -109.827 -110.278 -110.7 -111.003 -111.317 -111.969 -112.321 -112.706 -113.111 -113.533 -114.001 -114.567 -116.224 -3 ,23516 ,KEBNE ,16708242,Fri Nov 26 15:45:45 CET,Fri Nov 26 17:12:20 CET,0.0 1.189 1.604 1.839 2.04 2.21 2.367 2.518 2.734 2.83 2.92 2.987 3.063 3.088 3.131 3.162 3.182 3.182 3.188 3.194 3.181 3.166 3.137 3.088 3.026 2.941 2.821 2.694 2.54 2.36 2.158 1.885 1.606 1.311 0.928 0.43 -0.096 -0.686 -1.395 -2.242 -3.155 -4.206 -5.56 -7.108 -9.095 -11.524 -14.641 -18.541 -23.705 -30.782 -41.211 -52.137 -60.217 -66.513 -71.465 -75.543 -78.887 -81.802 -84.288 -86.621 -88.474 -90.116 -91.666 -93.028 -94.21 -95.26 -96.334 -97.285 -98.105 -98.929 -99.755 -100.438 -101.135 -101.831 -102.351 -102.863 -103.412 -104.021 -104.66 -105.089 -105.517 -106.175 -106.624 -107.088 -107.33 -107.83 -108.343 -108.868 -109.145 -109.596 -110.007 -110.31 -110.628 -111.285 -111.628 -111.999 -112.408 -112.867 -113.424 -114.077 -116.147 -4 ,2948 ,KEBNE ,16708243,Fri Nov 26 15:46:41 CET,Fri Nov 26 17:16:48 CET,0.0 1.726 2.102 2.346 2.526 2.684 2.812 2.92 3.089 3.152 3.199 3.221 3.303 3.342 3.381 3.391 3.41 3.423 3.447 3.45 3.433 3.422 3.401 3.347 3.268 3.14 2.996 2.858 2.648 2.45 2.271 2.001 1.681 1.338 0.934 0.465 -0.019 -0.6 -1.305 -2.125 -3.049 -4.164 -5.577 -7.135 -9.109 -11.509 -14.552 -18.399 -23.581 -30.679 -41.072 -51.909 -59.829 -65.985 -71.003 -75.292 -78.859 -81.862 -84.265 -86.616 -88.57 -90.251 -91.81 -93.206 -94.487 -95.659 -96.849 -97.885 -98.748 -99.64 -100.573 -101.307 -102.033 -102.759 -103.304 -103.878 -104.48 -105.109 -105.758 -106.199 -106.646 -107.306 -107.757 -108.211 -108.439 -108.907 -109.395 -109.927 -110.205 -110.639 -111.052 -111.356 -111.667 -112.325 -112.68 -113.047 -113.42 -113.833 -114.323 -114.923 -116.519 -5 ,30175 ,KEBNE ,16708244,Fri Nov 26 15:46:41 CET,Fri Nov 26 17:16:28 CET,0.0 1.336 1.732 2.022 2.257 2.43 2.574 2.686 2.868 2.943 2.989 3.019 3.089 3.109 3.157 3.203 3.249 3.265 3.261 3.247 3.239 3.214 3.169 3.083 2.981 2.864 2.742 2.615 2.432 2.246 2.053 1.815 1.579 1.319 0.961 0.473 -0.051 -0.642 -1.317 -2.105 -2.982 -4.033 -5.401 -6.915 -8.846 -11.232 -14.262 -18.114 -23.283 -30.379 -40.724 -51.498 -59.531 -65.844 -70.819 -75.053 -78.557 -81.457 -83.84 -86.115 -88.053 -89.773 -91.324 -92.747 -94.064 -95.244 -96.459 -97.466 -98.315 -99.191 -100.061 -100.796 -101.575 -102.356 -102.937 -103.539 -104.152 -104.751 -105.37 -105.799 -106.233 -106.902 -107.349 -107.803 -108.042 -108.538 -109.042 -109.56 -109.826 -110.26 -110.672 -110.981 -111.287 -111.924 -112.277 -112.653 -113.064 -113.532 -114.079 -114.839 -116.673 -7 ,11157 ,KEBNE ,16708246,Fri Nov 26 15:46:45 CET,Fri Nov 26 17:12:49 CET,0.0 1.314 1.672 1.918 2.143 2.35 2.506 2.638 2.853 2.926 2.979 3.031 3.118 3.155 3.224 3.255 3.267 3.274 3.281 3.282 3.276 3.261 3.232 3.151 3.037 2.932 2.847 2.749 2.607 2.457 2.295 2.076 1.824 1.553 1.234 0.828 0.361 -0.204 -0.875 -1.627 -2.492 -3.568 -4.925 -6.426 -8.374 -10.766 -13.778 -17.567 -22.564 -29.488 -39.831 -50.613 -58.455 -64.563 -69.363 -73.349 -76.722 -79.59 -81.896 -84.166 -86.145 -87.83 -89.319 -90.674 -91.926 -93.069 -94.217 -95.165 -95.965 -96.815 -97.701 -98.41 -99.131 -99.881 -100.437 -100.975 -101.514 -102.077 -102.657 -103.05 -103.458 -104.073 -104.483 -104.916 -105.13 -105.56 -106.046 -106.56 -106.819 -107.243 -107.623 -107.9 -108.183 -108.824 -109.151 -109.482 -109.842 -110.247 -110.717 -111.3 -113.167 -8 ,32356 ,KEBNE ,16708247,Fri Nov 26 15:47:43 CET,Fri Nov 26 17:18:06 CET,0.0 1.621 2.08 2.348 2.554 2.731 2.862 2.97 3.167 3.246 3.322 3.396 3.483 3.529 3.6 3.632 3.647 3.654 3.647 3.642 3.653 3.64 3.611 3.554 3.476 3.362 3.233 3.101 2.921 2.744 2.53 2.219 1.895 1.571 1.186 0.707 0.173 -0.462 -1.172 -2.001 -2.937 -4.052 -5.427 -6.948 -8.953 -11.415 -14.536 -18.457 -23.671 -30.861 -41.393 -52.32 -60.294 -66.471 -71.341 -75.444 -78.872 -81.86 -84.316 -86.601 -88.5 -90.151 -91.644 -93.005 -94.268 -95.409 -96.575 -97.607 -98.493 -99.38 -100.279 -101.014 -101.747 -102.494 -103.067 -103.648 -104.222 -104.809 -105.419 -105.841 -106.271 -106.914 -107.359 -107.823 -108.063 -108.556 -109.04 -109.527 -109.789 -110.215 -110.581 -110.852 -111.132 -111.741 -112.085 -112.459 -112.869 -113.303 -113.79 -114.438 -116.356 -9 ,27115 ,KEBNE ,16708248,Fri Nov 26 15:47:43 CET,Fri Nov 26 17:18:06 CET,0.0 1.743 2.184 2.481 2.697 2.861 3.005 3.133 3.314 3.386 3.444 3.475 3.544 3.559 3.621 3.677 3.715 3.722 3.728 3.736 3.732 3.721 3.694 3.653 3.613 3.533 3.424 3.316 3.166 2.973 2.759 2.5 2.237 1.967 1.6 1.097 0.582 -0.006 -0.702 -1.511 -2.435 -3.578 -5.043 -6.624 -8.628 -11.078 -14.154 -18.014 -23.218 -30.437 -41.099 -52.167 -60.128 -66.252 -71.149 -75.291 -78.635 -81.47 -83.863 -86.18 -88.122 -89.87 -91.505 -92.927 -94.211 -95.36 -96.516 -97.541 -98.413 -99.329 -100.26 -100.978 -101.696 -102.439 -103.039 -103.659 -104.28 -104.922 -105.567 -105.988 -106.419 -107.074 -107.513 -107.954 -108.18 -108.66 -109.161 -109.681 -109.94 -110.367 -110.771 -111.056 -111.344 -111.975 -112.317 -112.672 -113.056 -113.486 -113.995 -114.599 -115.957 -10 ,13604 ,KEBNE ,16708249,Fri Nov 26 15:48:44 CET,Fri Nov 26 17:19:10 CET,0.0 1.572 1.962 2.222 2.455 2.685 2.888 3.038 3.252 3.334 3.397 3.439 3.518 3.554 3.626 3.674 3.694 3.706 3.723 3.712 3.676 3.637 3.584 3.476 3.353 3.236 3.109 2.972 2.797 2.627 2.449 2.177 1.899 1.62 1.247 0.801 0.342 -0.201 -0.823 -1.505 -2.284 -3.288 -4.577 -6.037 -8.031 -10.519 -13.652 -17.579 -22.749 -29.837 -40.326 -51.213 -59.167 -65.32 -70.207 -74.304 -77.643 -80.467 -82.795 -85.054 -86.94 -88.581 -90.11 -91.489 -92.716 -93.816 -94.947 -95.954 -96.792 -97.614 -98.449 -99.149 -99.9 -100.662 -101.242 -101.821 -102.394 -102.995 -103.628 -104.066 -104.522 -105.2 -105.643 -106.097 -106.329 -106.827 -107.349 -107.876 -108.141 -108.571 -108.965 -109.259 -109.561 -110.213 -110.57 -110.94 -111.317 -111.736 -112.266 -112.979 -115.067 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_42_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_42_35.txt deleted file mode 100644 index 3c1d8bd1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_42_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12697 ,KEBNE ,16708250,Fri Nov 26 15:49:45 CET,Fri Nov 26 17:19:15 CET,0.0 2.094 2.574 2.948 3.215 3.43 3.651 3.868 4.237 4.402 4.561 4.785 4.955 5.074 5.294 5.495 5.672 5.761 5.942 6.095 6.294 6.42 6.555 6.771 6.982 7.182 7.368 7.535 7.737 7.911 8.083 8.28 8.434 8.568 8.726 8.91 9.072 9.263 9.488 9.715 9.961 10.23 10.491 10.719 10.915 11.062 11.233 11.375 11.395 11.19 10.551 9.573 8.647 7.757 6.937 6.185 5.527 4.926 4.414 3.92 3.469 3.03 2.622 2.258 1.91 1.607 1.303 1.02 0.761 0.446 0.101 -0.16 -0.414 -0.656 -0.844 -1.064 -1.312 -1.554 -1.795 -1.977 -2.17 -2.46 -2.653 -2.858 -2.958 -3.168 -3.438 -3.731 -3.874 -4.073 -4.332 -4.492 -4.664 -5.067 -5.296 -5.536 -5.8 -6.108 -6.491 -7.035 -9.202 -2 ,25037 ,KEBNE ,16708251,Fri Nov 26 15:49:45 CET,Fri Nov 26 17:19:00 CET,0.0 1.741 2.171 2.491 2.775 3.009 3.187 3.343 3.644 3.793 3.938 4.169 4.341 4.469 4.7 4.901 5.081 5.166 5.327 5.466 5.666 5.796 5.934 6.145 6.345 6.519 6.662 6.795 6.977 7.152 7.311 7.495 7.647 7.775 7.932 8.123 8.323 8.552 8.825 9.15 9.425 9.648 9.871 10.073 10.288 10.495 10.667 10.728 10.673 10.428 9.738 8.619 7.582 6.729 5.989 5.291 4.674 4.076 3.532 2.983 2.506 2.074 1.654 1.297 0.976 0.666 0.331 0.011 -0.272 -0.56 -0.855 -1.104 -1.356 -1.624 -1.825 -2.014 -2.216 -2.427 -2.662 -2.836 -3.004 -3.283 -3.492 -3.699 -3.81 -4.04 -4.284 -4.572 -4.721 -4.913 -5.174 -5.34 -5.522 -5.923 -6.145 -6.392 -6.642 -6.981 -7.418 -7.993 -9.632 -3 ,11934 ,KEBNE ,16708252,Fri Nov 26 15:49:45 CET,Fri Nov 26 17:19:24 CET,0.0 1.966 2.42 2.772 3.054 3.294 3.502 3.686 4.002 4.154 4.31 4.541 4.707 4.828 5.059 5.275 5.46 5.543 5.7 5.859 6.068 6.197 6.34 6.53 6.691 6.855 7.026 7.183 7.401 7.629 7.825 8.014 8.184 8.371 8.593 8.828 9.017 9.192 9.361 9.524 9.697 9.911 10.146 10.34 10.536 10.733 10.87 10.972 11.004 10.789 10.146 9.12 8.129 7.249 6.459 5.745 5.124 4.553 4.017 3.495 3.048 2.644 2.254 1.886 1.556 1.246 0.899 0.57 0.291 0.015 -0.27 -0.519 -0.761 -1.0 -1.191 -1.382 -1.589 -1.815 -2.044 -2.207 -2.39 -2.687 -2.889 -3.074 -3.176 -3.4 -3.628 -3.915 -4.065 -4.254 -4.475 -4.63 -4.814 -5.224 -5.464 -5.744 -6.061 -6.418 -6.843 -7.435 -9.726 -4 ,29361 ,KEBNE ,16708253,Fri Nov 26 15:49:45 CET,Fri Nov 26 17:19:59 CET,0.0 2.247 2.736 3.069 3.364 3.641 3.898 4.115 4.474 4.643 4.791 5.034 5.214 5.337 5.561 5.759 5.962 6.054 6.221 6.384 6.612 6.758 6.901 7.113 7.301 7.473 7.631 7.791 8.015 8.224 8.398 8.584 8.762 8.916 9.094 9.311 9.498 9.672 9.855 10.064 10.277 10.479 10.702 10.901 11.085 11.243 11.356 11.4 11.338 11.09 10.376 9.264 8.252 7.336 6.521 5.736 5.012 4.378 3.856 3.347 2.901 2.502 2.088 1.681 1.331 0.982 0.618 0.317 0.061 -0.214 -0.497 -0.724 -0.995 -1.302 -1.531 -1.759 -1.994 -2.238 -2.492 -2.665 -2.848 -3.128 -3.334 -3.545 -3.647 -3.867 -4.114 -4.376 -4.507 -4.698 -4.958 -5.133 -5.312 -5.697 -5.914 -6.179 -6.475 -6.842 -7.283 -7.889 -10.266 -5 ,18582 ,KEBNE ,16708254,Fri Nov 26 15:49:45 CET,Fri Nov 26 17:19:49 CET,0.0 1.48 1.968 2.302 2.547 2.768 2.973 3.158 3.508 3.651 3.779 4.014 4.189 4.306 4.52 4.715 4.885 4.968 5.147 5.308 5.509 5.628 5.758 5.967 6.159 6.339 6.508 6.666 6.85 7.005 7.171 7.375 7.55 7.707 7.888 8.09 8.257 8.433 8.648 8.927 9.202 9.435 9.701 9.927 10.113 10.278 10.404 10.485 10.456 10.204 9.533 8.46 7.421 6.489 5.685 4.955 4.321 3.766 3.295 2.807 2.387 2.022 1.647 1.288 0.967 0.634 0.281 -0.039 -0.315 -0.571 -0.823 -1.032 -1.26 -1.513 -1.703 -1.911 -2.151 -2.383 -2.615 -2.777 -2.952 -3.243 -3.443 -3.644 -3.748 -3.985 -4.246 -4.507 -4.643 -4.843 -5.131 -5.3 -5.466 -5.851 -6.082 -6.333 -6.598 -6.91 -7.311 -7.895 -10.526 -6 ,27381 ,KEBNE ,16708255,Fri Nov 26 15:49:45 CET,Fri Nov 26 17:19:26 CET,0.0 1.67 2.138 2.495 2.764 2.98 3.191 3.399 3.744 3.889 4.03 4.275 4.451 4.562 4.774 4.986 5.2 5.302 5.465 5.601 5.789 5.919 6.071 6.313 6.533 6.721 6.906 7.071 7.254 7.438 7.638 7.903 8.149 8.341 8.552 8.81 9.029 9.232 9.42 9.595 9.769 9.986 10.225 10.408 10.593 10.748 10.905 11.028 10.955 10.594 9.825 8.695 7.653 6.714 5.862 5.106 4.485 3.925 3.401 2.823 2.319 1.893 1.464 1.069 0.71 0.359 -0.018 -0.364 -0.643 -0.898 -1.174 -1.43 -1.698 -1.945 -2.132 -2.354 -2.615 -2.89 -3.138 -3.298 -3.46 -3.716 -3.908 -4.128 -4.238 -4.435 -4.639 -4.89 -5.043 -5.257 -5.511 -5.674 -5.843 -6.183 -6.378 -6.607 -6.885 -7.207 -7.571 -8.076 -9.964 -7 ,13031 ,KEBNE ,16708256,Fri Nov 26 15:49:45 CET,Fri Nov 26 17:19:50 CET,0.0 1.982 2.484 2.801 3.072 3.322 3.531 3.748 4.133 4.284 4.422 4.635 4.801 4.93 5.16 5.369 5.583 5.683 5.857 6.004 6.224 6.379 6.533 6.749 6.952 7.148 7.332 7.514 7.738 7.932 8.119 8.374 8.636 8.869 9.107 9.381 9.616 9.82 10.051 10.281 10.478 10.697 10.962 11.195 11.406 11.559 11.633 11.616 11.462 11.187 10.635 9.718 8.722 7.761 6.932 6.2 5.55 4.957 4.45 3.918 3.454 3.072 2.724 2.328 1.935 1.598 1.213 0.861 0.582 0.315 0.043 -0.219 -0.504 -0.791 -1.027 -1.256 -1.494 -1.759 -2.033 -2.241 -2.457 -2.77 -2.988 -3.203 -3.306 -3.528 -3.759 -4.012 -4.158 -4.367 -4.641 -4.823 -5.018 -5.41 -5.621 -5.859 -6.128 -6.411 -6.75 -7.317 -8.983 -8 ,13954 ,KEBNE ,16708257,Fri Nov 26 15:49:45 CET,Fri Nov 26 17:19:22 CET,0.0 1.646 2.118 2.456 2.741 3.014 3.253 3.44 3.753 3.9 4.04 4.238 4.393 4.508 4.71 4.893 5.091 5.185 5.344 5.501 5.758 5.921 6.075 6.28 6.447 6.601 6.743 6.871 7.042 7.204 7.367 7.566 7.755 7.921 8.082 8.255 8.422 8.631 8.852 9.077 9.314 9.547 9.779 9.965 10.157 10.347 10.491 10.59 10.597 10.404 9.701 8.567 7.548 6.648 5.851 5.115 4.394 3.741 3.23 2.736 2.291 1.824 1.331 0.88 0.468 0.087 -0.31 -0.662 -0.947 -1.22 -1.503 -1.751 -2.007 -2.255 -2.446 -2.648 -2.876 -3.122 -3.377 -3.561 -3.754 -4.061 -4.272 -4.49 -4.609 -4.854 -5.09 -5.347 -5.488 -5.692 -5.977 -6.161 -6.345 -6.708 -6.911 -7.146 -7.42 -7.753 -8.11 -8.565 -10.488 -9 ,532 ,KEBNE ,16708258,Fri Nov 26 15:50:46 CET,Fri Nov 26 17:20:26 CET,0.0 1.473 1.91 2.25 2.501 2.703 2.894 3.073 3.408 3.571 3.72 3.938 4.105 4.231 4.473 4.675 4.853 4.942 5.125 5.306 5.543 5.668 5.795 6.003 6.2 6.37 6.517 6.652 6.824 7.03 7.225 7.412 7.612 7.825 8.055 8.283 8.487 8.682 8.886 9.101 9.299 9.544 9.828 10.061 10.264 10.455 10.681 10.848 10.846 10.6 9.907 8.874 7.943 7.072 6.271 5.556 4.962 4.422 3.929 3.427 2.997 2.611 2.234 1.864 1.504 1.166 0.827 0.547 0.286 0.0 -0.285 -0.544 -0.825 -1.114 -1.342 -1.562 -1.811 -2.088 -2.361 -2.56 -2.766 -3.063 -3.27 -3.497 -3.618 -3.855 -4.132 -4.442 -4.597 -4.802 -5.073 -5.252 -5.446 -5.874 -6.097 -6.325 -6.589 -6.913 -7.283 -7.853 -9.658 -10 ,5294 ,KEBNE ,16708259,Fri Nov 26 15:50:46 CET,Fri Nov 26 17:19:52 CET,0.0 1.537 2.011 2.313 2.581 2.834 3.054 3.254 3.592 3.747 3.896 4.116 4.267 4.371 4.585 4.788 4.969 5.056 5.221 5.365 5.575 5.718 5.861 6.084 6.293 6.471 6.629 6.777 6.949 7.105 7.27 7.461 7.611 7.763 7.96 8.174 8.374 8.584 8.788 8.963 9.133 9.367 9.629 9.8 9.956 10.109 10.254 10.356 10.33 10.099 9.463 8.403 7.412 6.551 5.772 5.07 4.435 3.832 3.322 2.806 2.332 1.926 1.574 1.24 0.883 0.535 0.207 -0.063 -0.302 -0.544 -0.819 -1.086 -1.38 -1.686 -1.896 -2.095 -2.301 -2.521 -2.772 -2.96 -3.147 -3.447 -3.674 -3.89 -3.995 -4.208 -4.419 -4.649 -4.775 -4.958 -5.21 -5.378 -5.556 -5.944 -6.162 -6.398 -6.656 -6.959 -7.374 -7.89 -10.834 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_42_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_42_41.txt deleted file mode 100644 index 564f1d55..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_42_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10021 ,KEBNE ,16708260,Fri Nov 26 15:51:48 CET,Fri Nov 26 17:21:18 CET,0.0 1.313 1.734 2.061 2.333 2.567 2.776 2.959 3.273 3.412 3.544 3.747 3.908 4.022 4.238 4.453 4.644 4.727 4.892 5.063 5.311 5.466 5.616 5.819 5.988 6.169 6.357 6.522 6.73 6.932 7.126 7.325 7.508 7.71 7.953 8.203 8.419 8.667 8.905 9.13 9.378 9.644 9.951 10.271 10.645 11.014 11.393 11.73 11.981 12.164 12.215 11.854 11.32 10.781 10.281 9.835 9.444 9.048 8.664 8.255 7.891 7.577 7.284 6.995 6.695 6.437 6.187 5.931 5.706 5.46 5.207 5.012 4.787 4.552 4.375 4.171 3.957 3.734 3.499 3.352 3.203 2.958 2.801 2.635 2.536 2.314 2.082 1.833 1.7 1.523 1.268 1.106 0.933 0.582 0.384 0.155 -0.126 -0.468 -0.814 -1.307 -3.309 -2 ,29055 ,KEBNE ,16708261,Fri Nov 26 15:52:48 CET,Fri Nov 26 17:22:04 CET,0.0 1.65 2.081 2.395 2.637 2.828 2.999 3.168 3.476 3.628 3.77 3.981 4.158 4.292 4.526 4.736 4.937 5.025 5.185 5.342 5.544 5.662 5.783 5.959 6.13 6.301 6.474 6.642 6.855 7.043 7.213 7.429 7.634 7.824 8.03 8.276 8.571 8.881 9.153 9.417 9.714 10.062 10.42 10.725 11.019 11.332 11.667 11.981 12.268 12.498 12.545 12.258 11.787 11.278 10.817 10.36 9.917 9.522 9.163 8.773 8.441 8.15 7.841 7.533 7.266 7.023 6.759 6.526 6.332 6.12 5.893 5.692 5.477 5.264 5.079 4.865 4.639 4.436 4.244 4.11 3.964 3.713 3.532 3.34 3.246 3.048 2.835 2.6 2.481 2.309 2.055 1.898 1.724 1.355 1.141 0.903 0.668 0.361 0.01 -0.477 -2.835 -3 ,13555 ,KEBNE ,16708262,Fri Nov 26 15:52:48 CET,Fri Nov 26 17:21:58 CET,0.0 1.4 1.888 2.229 2.492 2.713 2.917 3.112 3.473 3.627 3.776 4.022 4.208 4.339 4.554 4.751 4.939 5.037 5.23 5.405 5.655 5.823 5.982 6.198 6.409 6.611 6.79 6.951 7.161 7.361 7.548 7.763 7.955 8.159 8.429 8.718 8.948 9.177 9.443 9.748 10.033 10.323 10.675 11.004 11.316 11.652 12.011 12.331 12.636 12.838 12.814 12.467 11.949 11.426 10.932 10.44 10.008 9.593 9.171 8.737 8.375 8.038 7.721 7.442 7.172 6.889 6.558 6.272 6.036 5.773 5.51 5.286 5.021 4.737 4.523 4.296 4.074 3.865 3.641 3.477 3.294 3.015 2.834 2.644 2.543 2.344 2.142 1.91 1.78 1.598 1.348 1.182 0.994 0.573 0.345 0.097 -0.176 -0.469 -0.833 -1.357 -3.503 -4 ,21780 ,KEBNE ,16708263,Fri Nov 26 15:53:50 CET,Fri Nov 26 17:23:17 CET,0.0 1.943 2.376 2.696 2.959 3.193 3.403 3.589 3.921 4.07 4.206 4.42 4.577 4.691 4.93 5.127 5.316 5.415 5.593 5.776 6.022 6.166 6.326 6.57 6.796 7.008 7.199 7.378 7.593 7.782 7.96 8.163 8.358 8.552 8.772 9.004 9.246 9.526 9.856 10.238 10.597 10.936 11.264 11.562 11.898 12.237 12.566 12.838 13.109 13.306 13.329 13.028 12.571 12.064 11.525 11.044 10.62 10.206 9.85 9.472 9.151 8.856 8.551 8.262 7.98 7.722 7.443 7.203 6.983 6.736 6.469 6.244 6.005 5.742 5.547 5.361 5.182 4.985 4.752 4.587 4.415 4.136 3.936 3.739 3.643 3.425 3.189 2.95 2.826 2.651 2.395 2.239 2.074 1.691 1.483 1.258 0.99 0.669 0.271 -0.274 -1.993 -5 ,12306 ,KEBNE ,16708264,Fri Nov 26 15:53:50 CET,Fri Nov 26 17:23:44 CET,0.0 2.839 3.287 3.597 3.861 4.087 4.27 4.444 4.783 4.945 5.089 5.277 5.438 5.561 5.804 6.02 6.213 6.307 6.487 6.665 6.925 7.082 7.207 7.375 7.544 7.695 7.841 8.011 8.226 8.435 8.647 8.913 9.143 9.32 9.515 9.761 10.0 10.247 10.513 10.78 11.027 11.306 11.625 11.893 12.249 12.672 13.061 13.47 13.852 14.022 13.994 13.652 13.198 12.713 12.255 11.771 11.325 10.912 10.5 10.099 9.754 9.442 9.126 8.791 8.49 8.246 7.953 7.648 7.413 7.194 6.952 6.735 6.5 6.254 6.068 5.898 5.719 5.506 5.278 5.111 4.933 4.676 4.499 4.304 4.198 3.973 3.738 3.478 3.337 3.146 2.873 2.705 2.537 2.18 1.992 1.802 1.562 1.286 0.996 0.461 -2.233 -6 ,14922 ,KEBNE ,16708265,Fri Nov 26 15:53:49 CET,Fri Nov 26 17:23:35 CET,0.0 1.688 2.118 2.443 2.739 2.979 3.18 3.346 3.634 3.776 3.924 4.182 4.367 4.497 4.731 4.941 5.142 5.239 5.411 5.571 5.793 5.927 6.056 6.243 6.42 6.593 6.758 6.914 7.102 7.296 7.506 7.751 7.979 8.181 8.407 8.661 8.881 9.104 9.34 9.598 9.88 10.156 10.418 10.678 10.968 11.278 11.582 11.856 12.101 12.29 12.249 11.859 11.382 10.923 10.5 10.017 9.551 9.132 8.755 8.367 8.009 7.687 7.38 7.071 6.781 6.496 6.151 5.821 5.547 5.31 5.086 4.888 4.671 4.441 4.269 4.072 3.839 3.608 3.38 3.224 3.074 2.845 2.665 2.466 2.37 2.157 1.906 1.637 1.5 1.326 1.098 0.949 0.798 0.476 0.278 0.054 -0.197 -0.515 -0.906 -1.442 -3.291 -7 ,27670 ,KEBNE ,16708266,Fri Nov 26 15:53:49 CET,Fri Nov 26 17:23:08 CET,0.0 2.337 2.842 3.175 3.421 3.634 3.842 4.032 4.343 4.487 4.632 4.85 5.006 5.112 5.32 5.522 5.708 5.788 5.945 6.097 6.318 6.467 6.615 6.834 7.027 7.22 7.401 7.553 7.746 7.929 8.099 8.298 8.503 8.701 8.894 9.105 9.303 9.513 9.745 9.967 10.192 10.474 10.785 11.077 11.396 11.74 12.128 12.476 12.775 12.914 12.844 12.525 12.064 11.573 11.123 10.701 10.291 9.917 9.579 9.205 8.869 8.567 8.268 7.97 7.671 7.367 7.036 6.739 6.486 6.243 5.978 5.768 5.593 5.422 5.277 5.111 4.902 4.675 4.456 4.301 4.14 3.895 3.714 3.508 3.407 3.215 2.993 2.759 2.646 2.479 2.25 2.108 1.954 1.613 1.401 1.163 0.93 0.66 0.329 -0.177 -1.862 -8 ,25891 ,KEBNE ,16708267,Fri Nov 26 15:54:54 CET,Fri Nov 26 17:21:56 CET,0.0 1.413 1.849 2.172 2.421 2.64 2.847 3.046 3.393 3.538 3.669 3.875 4.03 4.128 4.316 4.513 4.699 4.785 4.95 5.115 5.351 5.496 5.638 5.832 6.019 6.194 6.368 6.544 6.764 6.99 7.192 7.411 7.626 7.814 8.017 8.231 8.439 8.695 8.95 9.186 9.449 9.72 10.003 10.302 10.629 10.938 11.26 11.61 11.935 12.131 12.083 11.667 11.166 10.683 10.214 9.768 9.36 8.93 8.509 8.088 7.754 7.451 7.143 6.867 6.61 6.335 6.056 5.83 5.624 5.379 5.112 4.911 4.693 4.452 4.258 4.041 3.827 3.633 3.433 3.288 3.125 2.863 2.686 2.509 2.415 2.209 1.976 1.733 1.609 1.434 1.205 1.026 0.847 0.507 0.304 0.063 -0.207 -0.515 -0.901 -1.432 -3.741 -9 ,27895 ,KEBNE ,16708268,Fri Nov 26 15:55:52 CET,Fri Nov 26 17:25:09 CET,0.0 2.0 2.484 2.866 3.149 3.379 3.571 3.746 4.057 4.2 4.339 4.553 4.714 4.828 5.028 5.201 5.387 5.473 5.631 5.778 6.001 6.153 6.291 6.486 6.667 6.831 6.983 7.146 7.379 7.601 7.804 8.019 8.209 8.4 8.602 8.804 9.004 9.219 9.458 9.726 9.979 10.228 10.559 10.882 11.168 11.459 11.768 12.065 12.321 12.514 12.494 12.117 11.643 11.113 10.608 10.152 9.742 9.346 8.977 8.6 8.268 7.953 7.639 7.357 7.099 6.846 6.594 6.363 6.143 5.922 5.669 5.456 5.249 5.063 4.931 4.786 4.617 4.413 4.199 4.047 3.89 3.657 3.486 3.293 3.198 3.004 2.786 2.541 2.414 2.25 2.027 1.866 1.693 1.359 1.178 0.968 0.743 0.469 0.103 -0.4 -2.246 -10 ,5628 ,KEBNE ,16708269,Fri Nov 26 15:57:54 CET,Fri Nov 26 17:28:27 CET,0.0 1.77 2.208 2.517 2.765 2.969 3.159 3.332 3.661 3.814 3.959 4.2 4.368 4.481 4.684 4.864 5.04 5.129 5.292 5.445 5.69 5.853 5.999 6.199 6.408 6.604 6.764 6.911 7.107 7.296 7.48 7.68 7.872 8.072 8.292 8.546 8.791 9.056 9.328 9.585 9.868 10.186 10.496 10.762 11.041 11.339 11.667 11.962 12.232 12.455 12.426 12.046 11.527 11.005 10.518 10.056 9.64 9.221 8.831 8.405 8.039 7.722 7.406 7.118 6.843 6.604 6.374 6.156 5.955 5.74 5.483 5.229 4.989 4.759 4.572 4.371 4.134 3.894 3.683 3.532 3.366 3.113 2.934 2.727 2.613 2.39 2.158 1.897 1.75 1.562 1.327 1.175 1.002 0.603 0.393 0.159 -0.117 -0.383 -0.694 -1.209 -3.419 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_42_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_42_43.txt deleted file mode 100644 index 622e976f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_42_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5182 ,KEBNE ,16708270,Fri Nov 26 15:59:55 CET,Fri Nov 26 17:29:56 CET,0.0 1.153 1.588 1.883 2.145 2.381 2.585 2.803 3.204 3.367 3.509 3.74 3.919 4.036 4.255 4.49 4.728 4.839 5.054 5.273 5.584 5.774 5.962 6.246 6.523 6.774 7.03 7.269 7.542 7.81 8.099 8.47 8.801 9.102 9.482 9.923 10.302 10.71 11.149 11.621 12.125 12.732 13.456 14.135 14.943 15.898 17.0 18.255 19.712 21.414 23.501 25.258 26.32 26.98 27.378 27.641 27.8 27.867 27.873 27.836 27.795 27.717 27.603 27.514 27.446 27.375 27.281 27.176 27.071 26.958 26.824 26.689 26.575 26.465 26.356 26.224 26.082 25.956 25.847 25.759 25.663 25.529 25.413 25.263 25.179 25.009 24.846 24.679 24.589 24.466 24.266 24.149 24.027 23.734 23.562 23.376 23.157 22.902 22.598 22.136 20.658 -2 ,9299 ,KEBNE ,16708271,Fri Nov 26 15:59:55 CET,Fri Nov 26 17:29:13 CET,0.0 1.385 1.842 2.2 2.472 2.696 2.92 3.121 3.457 3.611 3.773 4.048 4.229 4.355 4.615 4.873 5.128 5.241 5.435 5.635 5.935 6.123 6.299 6.581 6.842 7.067 7.285 7.501 7.789 8.06 8.324 8.645 8.947 9.233 9.569 9.966 10.356 10.794 11.27 11.742 12.235 12.808 13.485 14.162 14.942 15.827 16.833 17.972 19.382 21.104 23.15 24.891 25.904 26.462 26.813 27.062 27.207 27.276 27.288 27.266 27.224 27.169 27.114 27.059 27.001 26.913 26.748 26.556 26.389 26.263 26.157 26.027 25.868 25.722 25.614 25.489 25.353 25.193 25.004 24.886 24.76 24.543 24.401 24.26 24.183 24.033 23.856 23.637 23.536 23.418 23.234 23.121 22.996 22.699 22.538 22.359 22.167 21.942 21.642 21.208 19.541 -3 ,2820 ,KEBNE ,16708272,Fri Nov 26 16:00:56 CET,Fri Nov 26 17:30:01 CET,0.0 1.328 1.759 2.092 2.382 2.636 2.841 3.031 3.399 3.553 3.696 3.91 4.075 4.19 4.415 4.637 4.854 4.967 5.181 5.38 5.666 5.838 6.016 6.283 6.524 6.752 6.987 7.206 7.485 7.771 8.063 8.433 8.784 9.126 9.528 9.951 10.373 10.824 11.267 11.752 12.249 12.816 13.477 14.138 14.925 15.815 16.878 18.088 19.525 21.226 23.267 25.01 26.002 26.585 26.914 27.113 27.203 27.148 27.107 27.084 27.032 26.972 26.905 26.835 26.754 26.669 26.542 26.387 26.244 26.121 26.0 25.873 25.741 25.6 25.484 25.362 25.226 25.097 24.969 24.879 24.774 24.607 24.484 24.35 24.286 24.128 23.948 23.757 23.648 23.517 23.34 23.211 23.066 22.768 22.591 22.417 22.229 21.984 21.671 21.238 19.667 -4 ,4020 ,KEBNE ,16708273,Fri Nov 26 16:00:56 CET,Fri Nov 26 17:30:25 CET,0.0 1.514 1.981 2.331 2.634 2.902 3.144 3.348 3.713 3.899 4.084 4.341 4.508 4.624 4.87 5.119 5.352 5.469 5.689 5.887 6.187 6.385 6.559 6.807 7.042 7.271 7.511 7.743 8.034 8.333 8.632 8.95 9.263 9.593 9.985 10.46 10.898 11.323 11.77 12.26 12.768 13.33 14.025 14.72 15.504 16.413 17.491 18.705 20.141 21.896 24.006 25.73 26.721 27.319 27.693 27.92 28.063 28.12 28.097 28.056 28.008 27.914 27.778 27.638 27.483 27.361 27.258 27.139 27.027 26.898 26.75 26.616 26.485 26.352 26.22 26.072 25.924 25.796 25.666 25.55 25.43 25.24 25.103 24.98 24.91 24.739 24.567 24.385 24.274 24.13 23.895 23.748 23.593 23.293 23.135 22.962 22.755 22.509 22.214 21.768 20.114 -5 ,1088 ,KEBNE ,16708274,Fri Nov 26 16:00:56 CET,Fri Nov 26 17:30:56 CET,0.0 1.395 1.79 2.071 2.32 2.552 2.765 2.961 3.311 3.469 3.626 3.904 4.098 4.241 4.511 4.759 4.989 5.095 5.285 5.482 5.803 6.009 6.194 6.454 6.712 6.957 7.191 7.429 7.725 7.999 8.261 8.571 8.878 9.183 9.572 10.016 10.425 10.892 11.376 11.849 12.342 12.939 13.655 14.353 15.196 16.154 17.242 18.486 19.932 21.695 23.843 25.616 26.66 27.309 27.73 27.988 28.146 28.253 28.301 28.304 28.281 28.242 28.177 28.088 27.986 27.882 27.752 27.621 27.511 27.399 27.256 27.096 26.947 26.829 26.729 26.619 26.474 26.29 26.099 25.982 25.877 25.691 25.54 25.395 25.32 25.15 24.973 24.783 24.676 24.551 24.36 24.23 24.092 23.771 23.593 23.396 23.182 22.928 22.612 22.208 20.555 -6 ,26191 ,KEBNE ,16708275,Fri Nov 26 16:03:00 CET,Fri Nov 26 17:33:10 CET,0.0 1.29 1.7 1.999 2.256 2.49 2.699 2.91 3.307 3.465 3.618 3.86 4.031 4.161 4.416 4.654 4.869 4.975 5.178 5.362 5.648 5.841 6.032 6.322 6.58 6.826 7.074 7.309 7.627 7.95 8.262 8.61 8.928 9.252 9.62 10.004 10.372 10.783 11.234 11.723 12.234 12.844 13.586 14.31 15.111 16.011 17.065 18.231 19.632 21.29 23.335 25.137 26.167 26.785 27.233 27.529 27.687 27.768 27.813 27.817 27.763 27.698 27.642 27.554 27.443 27.346 27.231 27.12 27.032 26.928 26.786 26.679 26.578 26.45 26.334 26.225 26.11 25.958 25.806 25.712 25.612 25.419 25.26 25.081 24.994 24.822 24.638 24.462 24.363 24.222 24.004 23.887 23.751 23.442 23.283 23.109 22.907 22.656 22.325 21.892 20.238 -7 ,9004 ,KEBNE ,16708276,Fri Nov 26 16:03:00 CET,Fri Nov 26 17:33:31 CET,0.0 1.149 1.544 1.848 2.116 2.374 2.604 2.809 3.199 3.369 3.522 3.755 3.933 4.061 4.303 4.54 4.766 4.876 5.092 5.292 5.591 5.791 5.986 6.262 6.527 6.784 7.01 7.221 7.504 7.771 8.03 8.34 8.635 8.924 9.266 9.671 10.09 10.555 11.026 11.523 12.067 12.667 13.362 14.054 14.846 15.723 16.742 17.947 19.399 21.148 23.274 25.015 26.045 26.648 27.002 27.226 27.366 27.442 27.437 27.402 27.339 27.253 27.162 27.078 27.002 26.902 26.769 26.663 26.564 26.45 26.343 26.241 26.134 25.999 25.873 25.735 25.59 25.433 25.256 25.137 25.018 24.841 24.732 24.62 24.559 24.402 24.208 24.01 23.901 23.765 23.571 23.467 23.351 23.082 22.937 22.758 22.553 22.324 22.044 21.619 20.287 -8 ,11371 ,KEBNE ,16708277,Fri Nov 26 16:04:01 CET,Fri Nov 26 17:33:31 CET,0.0 1.528 1.983 2.312 2.595 2.859 3.096 3.304 3.671 3.842 4.001 4.233 4.398 4.517 4.738 4.964 5.195 5.3 5.506 5.717 6.026 6.228 6.414 6.678 6.939 7.182 7.431 7.679 7.997 8.306 8.611 8.968 9.276 9.572 9.928 10.317 10.689 11.109 11.575 12.073 12.582 13.191 13.937 14.679 15.539 16.454 17.485 18.672 20.103 21.768 23.768 25.442 26.393 26.985 27.341 27.527 27.655 27.747 27.762 27.74 27.711 27.65 27.573 27.488 27.394 27.295 27.192 27.092 26.976 26.823 26.664 26.55 26.428 26.3 26.217 26.128 26.003 25.839 25.648 25.521 25.401 25.203 25.058 24.904 24.822 24.651 24.477 24.282 24.179 24.062 23.88 23.772 23.651 23.348 23.179 22.995 22.809 22.614 22.345 21.907 20.386 -9 ,20112 ,KEBNE ,16708278,Fri Nov 26 16:04:01 CET,Fri Nov 26 17:34:07 CET,0.0 1.291 1.688 1.992 2.251 2.469 2.672 2.869 3.21 3.359 3.507 3.758 3.94 4.073 4.329 4.572 4.799 4.912 5.138 5.35 5.662 5.869 6.068 6.349 6.605 6.835 7.045 7.254 7.54 7.825 8.085 8.4 8.718 9.012 9.338 9.702 10.067 10.464 10.892 11.362 11.863 12.447 13.163 13.862 14.656 15.589 16.683 17.88 19.296 21.008 23.092 24.783 25.713 26.269 26.599 26.827 26.957 26.993 26.973 26.927 26.861 26.771 26.653 26.522 26.4 26.29 26.176 26.059 25.933 25.801 25.678 25.577 25.474 25.353 25.225 25.085 24.965 24.832 24.662 24.548 24.443 24.278 24.152 23.991 23.903 23.73 23.543 23.348 23.252 23.129 22.926 22.8 22.653 22.332 22.16 21.962 21.742 21.483 21.124 20.639 19.062 -10 ,1674 ,KEBNE ,16708279,Fri Nov 26 16:04:01 CET,Fri Nov 26 17:33:03 CET,0.0 1.646 2.031 2.339 2.617 2.888 3.138 3.338 3.702 3.878 4.056 4.35 4.547 4.686 4.942 5.197 5.44 5.552 5.794 6.038 6.365 6.566 6.765 7.061 7.324 7.579 7.846 8.103 8.417 8.732 9.051 9.433 9.816 10.175 10.566 10.985 11.365 11.784 12.231 12.711 13.23 13.841 14.558 15.278 16.161 17.141 18.234 19.484 20.979 22.738 24.818 26.538 27.473 28.003 28.303 28.488 28.622 28.711 28.736 28.714 28.656 28.583 28.502 28.397 28.258 28.125 27.986 27.858 27.741 27.617 27.482 27.347 27.209 27.049 26.923 26.808 26.688 26.556 26.415 26.31 26.182 25.973 25.818 25.651 25.569 25.393 25.207 25.004 24.892 24.747 24.525 24.401 24.274 23.966 23.779 23.565 23.321 23.029 22.668 22.192 20.627 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_43_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_43_31.txt deleted file mode 100644 index 4b1e53b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_43_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2105 ,KEBNE ,16708280,Fri Nov 26 16:04:01 CET,Fri Nov 26 17:34:22 CET,0.0 1.228 1.61 1.87 2.066 2.241 2.4 2.543 2.798 2.913 3.008 3.151 3.249 3.326 3.483 3.619 3.743 3.804 3.895 3.976 4.114 4.198 4.268 4.368 4.471 4.57 4.659 4.743 4.836 4.911 4.992 5.084 5.157 5.231 5.312 5.393 5.463 5.531 5.583 5.629 5.648 5.637 5.608 5.53 5.402 5.21 4.882 4.351 3.482 2.117 -0.108 -2.66 -4.81 -6.677 -8.236 -9.596 -10.745 -11.769 -12.665 -13.576 -14.34 -15.009 -15.616 -16.134 -16.622 -17.109 -17.617 -18.051 -18.426 -18.812 -19.216 -19.547 -19.883 -20.222 -20.472 -20.74 -21.025 -21.314 -21.61 -21.815 -22.03 -22.359 -22.578 -22.813 -22.943 -23.213 -23.502 -23.815 -23.974 -24.179 -24.46 -24.636 -24.816 -25.209 -25.431 -25.674 -25.943 -26.255 -26.64 -27.153 -28.581 -2 ,25334 ,KEBNE ,16708281,Fri Nov 26 16:05:03 CET,Fri Nov 26 17:35:05 CET,0.0 1.314 1.712 2.002 2.22 2.393 2.555 2.688 2.902 3.004 3.104 3.25 3.342 3.417 3.579 3.727 3.863 3.926 4.042 4.147 4.284 4.37 4.455 4.564 4.648 4.737 4.827 4.916 5.016 5.1 5.179 5.25 5.323 5.404 5.473 5.527 5.578 5.636 5.682 5.708 5.68 5.623 5.564 5.468 5.273 5.015 4.673 4.104 3.237 1.844 -0.476 -3.072 -5.247 -7.06 -8.608 -9.963 -11.078 -12.039 -12.83 -13.64 -14.362 -15.003 -15.64 -16.249 -16.807 -17.321 -17.843 -18.298 -18.696 -19.09 -19.489 -19.828 -20.185 -20.543 -20.811 -21.095 -21.392 -21.71 -22.032 -22.247 -22.468 -22.793 -23.014 -23.252 -23.374 -23.622 -23.879 -24.149 -24.288 -24.482 -24.756 -24.918 -25.083 -25.446 -25.654 -25.885 -26.153 -26.456 -26.778 -27.174 -28.489 -3 ,14749 ,KEBNE ,16708282,Fri Nov 26 16:05:02 CET,Fri Nov 26 17:34:08 CET,0.0 1.661 2.094 2.384 2.613 2.79 2.939 3.072 3.305 3.41 3.511 3.669 3.774 3.85 3.994 4.119 4.232 4.286 4.396 4.499 4.63 4.704 4.765 4.861 4.96 5.046 5.128 5.197 5.289 5.384 5.466 5.563 5.651 5.726 5.8 5.876 5.941 5.999 6.043 6.054 6.049 6.03 5.971 5.879 5.726 5.475 5.112 4.582 3.709 2.231 -0.271 -2.971 -5.062 -6.764 -8.206 -9.489 -10.575 -11.558 -12.41 -13.225 -13.903 -14.514 -15.108 -15.651 -16.136 -16.564 -17.003 -17.423 -17.812 -18.2 -18.591 -18.925 -19.259 -19.59 -19.847 -20.111 -20.388 -20.669 -20.949 -21.145 -21.349 -21.664 -21.887 -22.131 -22.256 -22.508 -22.765 -23.03 -23.171 -23.366 -23.632 -23.805 -23.983 -24.357 -24.573 -24.82 -25.106 -25.414 -25.757 -26.275 -27.782 -4 ,8997 ,KEBNE ,16708283,Fri Nov 26 16:06:04 CET,Fri Nov 26 17:36:02 CET,0.0 1.28 1.661 1.98 2.218 2.409 2.581 2.728 2.974 3.088 3.196 3.365 3.476 3.564 3.715 3.839 3.963 4.019 4.132 4.237 4.381 4.475 4.558 4.668 4.766 4.856 4.94 5.016 5.113 5.204 5.283 5.362 5.43 5.494 5.568 5.637 5.699 5.752 5.789 5.818 5.811 5.786 5.734 5.629 5.475 5.242 4.835 4.26 3.391 2.009 -0.261 -2.888 -4.967 -6.648 -8.054 -9.286 -10.335 -11.288 -12.115 -12.945 -13.666 -14.307 -14.886 -15.452 -16.004 -16.499 -17.007 -17.446 -17.795 -18.128 -18.476 -18.771 -19.104 -19.459 -19.723 -19.988 -20.262 -20.566 -20.895 -21.111 -21.328 -21.667 -21.917 -22.175 -22.305 -22.578 -22.861 -23.154 -23.306 -23.512 -23.803 -23.987 -24.183 -24.617 -24.846 -25.086 -25.369 -25.686 -26.054 -26.532 -28.105 -5 ,4202 ,KEBNE ,16708284,Fri Nov 26 16:08:07 CET,Fri Nov 26 17:37:14 CET,0.0 1.149 1.545 1.829 2.055 2.244 2.415 2.565 2.818 2.934 3.035 3.225 3.349 3.438 3.588 3.719 3.847 3.915 4.053 4.173 4.328 4.427 4.514 4.62 4.722 4.818 4.912 5.005 5.112 5.213 5.303 5.403 5.495 5.555 5.609 5.666 5.699 5.732 5.756 5.765 5.756 5.7 5.581 5.422 5.235 4.983 4.571 3.998 3.182 1.894 -0.374 -3.07 -5.347 -7.281 -8.816 -10.122 -11.224 -12.241 -13.129 -13.98 -14.687 -15.298 -15.893 -16.473 -17.004 -17.477 -17.97 -18.406 -18.781 -19.173 -19.567 -19.886 -20.219 -20.564 -20.836 -21.127 -21.422 -21.735 -22.061 -22.261 -22.475 -22.828 -23.069 -23.313 -23.439 -23.683 -23.945 -24.263 -24.429 -24.638 -24.935 -25.117 -25.303 -25.698 -25.904 -26.139 -26.413 -26.716 -27.064 -27.488 -28.751 -6 ,30330 ,KEBNE ,16708285,Fri Nov 26 16:09:08 CET,Fri Nov 26 17:38:36 CET,0.0 1.546 1.96 2.251 2.473 2.642 2.79 2.94 3.198 3.302 3.402 3.585 3.704 3.792 3.963 4.111 4.224 4.28 4.391 4.489 4.624 4.711 4.794 4.913 5.031 5.13 5.212 5.282 5.365 5.448 5.528 5.619 5.701 5.769 5.837 5.906 5.965 6.003 6.039 6.071 6.075 6.064 6.015 5.921 5.748 5.489 5.144 4.632 3.834 2.581 0.419 -2.093 -4.037 -5.704 -7.307 -8.804 -9.996 -11.014 -11.895 -12.811 -13.611 -14.271 -14.897 -15.498 -16.032 -16.5 -16.968 -17.373 -17.73 -18.105 -18.494 -18.809 -19.131 -19.476 -19.736 -19.987 -20.257 -20.559 -20.88 -21.091 -21.296 -21.628 -21.861 -22.097 -22.22 -22.459 -22.714 -22.998 -23.133 -23.322 -23.59 -23.744 -23.903 -24.277 -24.492 -24.741 -25.029 -25.37 -25.748 -26.249 -27.779 -7 ,29142 ,KEBNE ,16708286,Fri Nov 26 16:09:12 CET,Fri Nov 26 17:34:42 CET,0.0 1.998 2.458 2.771 2.991 3.17 3.326 3.467 3.702 3.798 3.895 4.082 4.196 4.279 4.435 4.562 4.673 4.729 4.851 4.961 5.108 5.206 5.3 5.415 5.515 5.617 5.711 5.795 5.888 5.979 6.073 6.173 6.253 6.312 6.387 6.472 6.528 6.581 6.627 6.661 6.673 6.642 6.553 6.428 6.264 6.027 5.651 5.113 4.255 2.88 0.707 -1.842 -4.06 -5.921 -7.399 -8.76 -9.94 -10.962 -11.861 -12.725 -13.431 -14.029 -14.605 -15.185 -15.74 -16.218 -16.688 -17.092 -17.455 -17.837 -18.216 -18.545 -18.887 -19.209 -19.454 -19.72 -20.01 -20.312 -20.616 -20.827 -21.04 -21.361 -21.6 -21.857 -21.988 -22.252 -22.518 -22.815 -22.98 -23.195 -23.487 -23.654 -23.829 -24.23 -24.442 -24.67 -24.93 -25.237 -25.578 -26.014 -27.645 -8 ,27728 ,KEBNE ,16708287,Fri Nov 26 16:09:12 CET,Fri Nov 26 17:34:47 CET,0.0 1.488 1.901 2.179 2.409 2.6 2.777 2.928 3.176 3.283 3.381 3.534 3.636 3.718 3.883 4.03 4.154 4.207 4.305 4.401 4.536 4.613 4.692 4.823 4.949 5.077 5.196 5.287 5.397 5.501 5.579 5.67 5.763 5.84 5.917 5.995 6.073 6.139 6.17 6.191 6.215 6.218 6.175 6.083 5.934 5.721 5.354 4.83 4.105 2.888 0.689 -1.912 -4.165 -6.108 -7.672 -8.991 -10.077 -11.03 -11.852 -12.671 -13.374 -13.952 -14.471 -14.987 -15.479 -15.939 -16.417 -16.834 -17.198 -17.579 -17.96 -18.277 -18.626 -18.983 -19.256 -19.554 -19.86 -20.16 -20.465 -20.661 -20.861 -21.188 -21.414 -21.646 -21.771 -22.035 -22.322 -22.622 -22.77 -22.967 -23.246 -23.411 -23.59 -23.989 -24.206 -24.44 -24.688 -24.98 -25.32 -25.768 -27.078 -9 ,22447 ,KEBNE ,16708288,Fri Nov 26 16:10:09 CET,Fri Nov 26 17:40:10 CET,0.0 1.246 1.642 1.944 2.196 2.409 2.563 2.696 2.937 3.04 3.139 3.314 3.425 3.503 3.642 3.761 3.878 3.934 4.028 4.123 4.276 4.362 4.434 4.54 4.629 4.71 4.798 4.883 4.986 5.078 5.156 5.24 5.308 5.376 5.448 5.508 5.558 5.612 5.669 5.699 5.712 5.691 5.628 5.545 5.413 5.202 4.871 4.375 3.544 2.206 -0.032 -2.639 -4.778 -6.518 -8.018 -9.317 -10.41 -11.452 -12.351 -13.227 -13.972 -14.637 -15.239 -15.773 -16.298 -16.798 -17.299 -17.736 -18.114 -18.49 -18.877 -19.2 -19.537 -19.897 -20.185 -20.493 -20.797 -21.099 -21.408 -21.605 -21.798 -22.122 -22.369 -22.62 -22.741 -22.988 -23.252 -23.532 -23.681 -23.893 -24.214 -24.397 -24.584 -24.987 -25.201 -25.429 -25.677 -25.962 -26.306 -26.765 -28.272 -10 ,32599 ,KEBNE ,16708289,Fri Nov 26 16:10:09 CET,Fri Nov 26 17:39:48 CET,0.0 1.048 1.433 1.695 1.903 2.082 2.245 2.387 2.643 2.765 2.878 3.057 3.168 3.247 3.372 3.489 3.609 3.668 3.779 3.877 4.007 4.093 4.167 4.278 4.386 4.474 4.546 4.614 4.691 4.767 4.852 4.948 5.028 5.075 5.112 5.164 5.223 5.266 5.296 5.336 5.36 5.368 5.347 5.267 5.116 4.888 4.534 4.027 3.174 1.735 -0.528 -3.042 -5.059 -6.774 -8.242 -9.54 -10.661 -11.642 -12.484 -13.345 -14.044 -14.641 -15.226 -15.765 -16.281 -16.771 -17.27 -17.713 -18.111 -18.517 -18.902 -19.212 -19.541 -19.87 -20.144 -20.448 -20.748 -21.053 -21.371 -21.584 -21.803 -22.157 -22.404 -22.652 -22.776 -23.03 -23.293 -23.569 -23.717 -23.922 -24.202 -24.382 -24.567 -24.954 -25.179 -25.416 -25.662 -25.933 -26.27 -26.766 -28.411 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_54_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_54_50.txt deleted file mode 100644 index a6abff44..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_54_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32257 ,KEBNE ,16708290,Fri Nov 26 16:11:10 CET,Fri Nov 26 17:41:16 CET,0.0 1.064 1.438 1.713 1.957 2.175 2.377 2.543 2.825 2.968 3.1 3.164 3.444 3.545 3.739 3.93 4.116 4.2 4.358 4.509 4.726 4.869 5.014 5.221 5.409 5.596 5.774 5.941 6.157 6.369 6.574 6.815 7.04 7.258 7.507 7.773 8.041 8.344 8.654 8.975 9.31 9.682 10.108 10.544 11.055 11.593 12.139 12.663 13.167 13.58 13.783 13.402 12.725 12.082 11.529 10.93 10.358 9.839 9.366 8.885 8.42 7.999 7.611 7.23 6.872 6.555 6.222 5.865 5.547 5.251 4.938 4.666 4.398 4.126 3.899 3.672 3.41 3.095 2.788 2.59 2.388 2.095 1.891 1.658 1.535 1.282 1.005 0.708 0.549 0.224 0.067 -0.114 -0.309 -0.72 -0.955 -1.23 -1.527 -1.846 -2.249 -2.811 -4.525 -2 ,4688 ,KEBNE ,16708291,Fri Nov 26 16:12:11 CET,Fri Nov 26 17:41:38 CET,0.0 1.293 1.686 1.968 2.196 2.399 2.605 2.79 3.088 3.224 3.349 3.415 3.707 3.819 4.037 4.246 4.435 4.524 4.699 4.869 5.113 5.269 5.419 5.632 5.835 6.041 6.23 6.398 6.622 6.84 7.047 7.293 7.521 7.736 7.985 8.262 8.52 8.797 9.113 9.47 9.828 10.221 10.673 11.085 11.521 11.991 12.514 12.979 13.344 13.695 13.862 13.548 12.963 12.305 11.746 11.224 10.677 10.126 9.642 9.173 8.752 8.378 8.036 7.706 7.371 7.057 6.743 6.443 6.169 5.891 5.583 5.304 4.994 4.68 4.458 4.23 3.98 3.716 3.457 3.279 3.067 2.718 2.489 2.255 2.131 1.867 1.586 1.293 1.129 0.791 0.59 0.395 0.21 -0.21 -0.448 -0.711 -0.993 -1.3 -1.674 -2.257 -3.961 -3 ,17659 ,KEBNE ,16708292,Fri Nov 26 16:12:11 CET,Fri Nov 26 17:42:16 CET,0.0 1.105 1.577 1.901 2.146 2.358 2.549 2.71 2.979 3.098 3.214 3.274 3.539 3.636 3.822 3.995 4.167 4.252 4.421 4.583 4.811 4.952 5.085 5.282 5.463 5.63 5.798 5.962 6.17 6.375 6.568 6.789 6.992 7.184 7.396 7.611 7.816 8.055 8.31 8.568 8.85 9.164 9.493 9.822 10.218 10.614 10.994 11.4 11.84 12.11 12.007 11.464 10.819 10.149 9.498 8.828 8.203 7.661 7.141 6.582 6.133 5.765 5.405 5.048 4.732 4.405 4.0 3.633 3.328 3.036 2.736 2.479 2.207 1.924 1.715 1.474 1.194 0.919 0.64 0.453 0.277 -0.014 -0.235 -0.466 -0.581 -0.819 -1.091 -1.371 -1.51 -1.824 -2.015 -2.193 -2.377 -2.795 -3.019 -3.261 -3.531 -3.854 -4.238 -4.726 -6.142 -4 ,32715 ,KEBNE ,16708293,Fri Nov 26 16:12:12 CET,Fri Nov 26 17:41:06 CET,0.0 1.379 1.811 2.11 2.349 2.552 2.732 2.896 3.177 3.31 3.441 3.512 3.79 3.891 4.086 4.273 4.46 4.549 4.715 4.868 5.084 5.226 5.37 5.572 5.753 5.929 6.096 6.252 6.46 6.665 6.862 7.091 7.32 7.547 7.802 8.071 8.32 8.595 8.892 9.209 9.552 9.952 10.414 10.83 11.245 11.66 12.037 12.38 12.707 13.011 13.18 12.902 12.419 11.858 11.32 10.801 10.244 9.664 9.163 8.675 8.25 7.887 7.49 7.061 6.684 6.354 6.013 5.711 5.442 5.156 4.841 4.569 4.295 4.017 3.806 3.587 3.374 3.131 2.868 2.704 2.541 2.283 2.094 1.907 1.806 1.584 1.349 1.077 0.916 0.59 0.418 0.233 0.039 -0.375 -0.632 -0.912 -1.195 -1.527 -1.955 -2.534 -3.857 -5 ,15125 ,KEBNE ,16708294,Fri Nov 26 16:12:12 CET,Fri Nov 26 17:41:43 CET,0.0 1.227 1.614 1.889 2.116 2.323 2.533 2.735 3.064 3.205 3.343 3.417 3.701 3.819 4.037 4.232 4.421 4.513 4.684 4.839 5.057 5.201 5.339 5.543 5.75 5.945 6.131 6.316 6.554 6.773 6.98 7.222 7.456 7.672 7.919 8.204 8.483 8.798 9.118 9.462 9.836 10.233 10.695 11.142 11.56 11.949 12.36 12.779 13.213 13.549 13.587 13.111 12.438 11.787 11.206 10.636 10.118 9.632 9.199 8.735 8.271 7.847 7.454 7.085 6.75 6.425 6.074 5.761 5.466 5.144 4.806 4.525 4.24 3.945 3.727 3.504 3.269 3.031 2.759 2.56 2.372 2.077 1.856 1.621 1.503 1.264 0.998 0.707 0.55 0.231 0.069 -0.111 -0.29 -0.688 -0.899 -1.124 -1.401 -1.699 -2.059 -2.573 -3.984 -6 ,20418 ,KEBNE ,16708295,Fri Nov 26 16:12:11 CET,Fri Nov 26 17:41:52 CET,0.0 1.273 1.676 1.96 2.189 2.39 2.566 2.728 3.057 3.198 3.325 3.401 3.679 3.779 3.964 4.145 4.333 4.422 4.589 4.759 5.01 5.173 5.333 5.542 5.739 5.93 6.1 6.263 6.478 6.693 6.902 7.153 7.394 7.605 7.824 8.068 8.299 8.538 8.784 9.072 9.38 9.696 10.047 10.374 10.766 11.187 11.628 12.083 12.476 12.783 12.907 12.641 12.215 11.569 10.903 10.384 9.899 9.427 9.015 8.544 8.105 7.748 7.407 7.04 6.687 6.366 5.996 5.631 5.295 4.964 4.657 4.382 4.095 3.824 3.591 3.349 3.112 2.851 2.567 2.36 2.151 1.837 1.614 1.376 1.244 0.964 0.682 0.389 0.236 -0.085 -0.226 -0.395 -0.586 -1.016 -1.259 -1.505 -1.779 -2.107 -2.508 -3.086 -4.638 -7 ,30475 ,KEBNE ,16708296,Fri Nov 26 16:14:14 CET,Fri Nov 26 17:43:41 CET,0.0 1.301 1.686 1.971 2.227 2.433 2.596 2.754 3.06 3.199 3.325 3.407 3.688 3.795 3.994 4.183 4.359 4.441 4.609 4.781 5.022 5.17 5.302 5.49 5.67 5.845 6.01 6.164 6.363 6.556 6.747 6.978 7.192 7.404 7.647 7.907 8.169 8.449 8.733 9.025 9.332 9.675 10.049 10.387 10.769 11.187 11.634 12.078 12.504 12.855 12.939 12.369 11.701 11.097 10.485 9.925 9.43 8.979 8.563 8.094 7.668 7.283 6.923 6.598 6.257 5.919 5.596 5.306 5.029 4.742 4.449 4.21 3.958 3.697 3.487 3.278 3.077 2.85 2.593 2.398 2.202 1.898 1.704 1.507 1.394 1.152 0.888 0.606 0.46 0.157 -0.003 -0.186 -0.374 -0.774 -0.976 -1.204 -1.496 -1.831 -2.206 -2.657 -4.23 -8 ,23598 ,KEBNE ,16708297,Fri Nov 26 16:15:16 CET,Fri Nov 26 17:45:21 CET,0.0 1.105 1.486 1.753 1.966 2.171 2.359 2.521 2.807 2.949 3.084 3.153 3.425 3.525 3.718 3.9 4.061 4.138 4.29 4.432 4.641 4.775 4.9 5.085 5.267 5.438 5.591 5.735 5.925 6.107 6.279 6.486 6.681 6.886 7.134 7.407 7.661 7.919 8.18 8.437 8.706 9.014 9.355 9.691 10.068 10.472 10.9 11.306 11.689 12.005 12.005 11.513 10.894 10.224 9.517 8.847 8.286 7.769 7.313 6.842 6.388 5.949 5.524 5.108 4.718 4.339 3.914 3.523 3.192 2.86 2.513 2.224 1.924 1.605 1.351 1.093 0.837 0.572 0.29 0.101 -0.078 -0.365 -0.583 -0.794 -0.905 -1.15 -1.392 -1.652 -1.793 -2.109 -2.265 -2.44 -2.624 -2.983 -3.179 -3.4 -3.661 -3.982 -4.349 -4.854 -6.488 -9 ,22225 ,KEBNE ,16708298,Fri Nov 26 16:16:17 CET,Fri Nov 26 17:46:21 CET,0.0 1.144 1.499 1.762 2.007 2.224 2.398 2.554 2.836 2.972 3.106 3.177 3.45 3.555 3.759 3.943 4.115 4.201 4.366 4.524 4.763 4.911 5.05 5.255 5.44 5.616 5.792 5.96 6.163 6.345 6.512 6.728 6.948 7.155 7.381 7.632 7.873 8.129 8.394 8.673 8.963 9.27 9.631 9.996 10.388 10.806 11.283 11.784 12.306 12.774 12.98 12.779 12.343 11.831 11.326 10.829 10.353 9.875 9.443 9.029 8.671 8.327 7.968 7.605 7.292 7.023 6.725 6.447 6.19 5.931 5.651 5.387 5.115 4.829 4.598 4.366 4.132 3.891 3.633 3.435 3.221 2.879 2.653 2.438 2.324 2.071 1.785 1.481 1.318 0.988 0.801 0.608 0.395 -0.054 -0.287 -0.567 -0.879 -1.207 -1.613 -2.16 -4.203 -10 ,15700 ,KEBNE ,16708299,Fri Nov 26 16:17:26 CET,Fri Nov 26 17:44:25 CET,0.0 1.56 1.94 2.237 2.501 2.726 2.915 3.081 3.365 3.495 3.623 3.685 3.948 4.048 4.238 4.409 4.575 4.649 4.789 4.927 5.13 5.273 5.402 5.578 5.755 5.936 6.11 6.273 6.473 6.662 6.845 7.038 7.214 7.397 7.608 7.853 8.108 8.395 8.708 9.046 9.403 9.795 10.162 10.465 10.816 11.193 11.673 12.196 12.665 12.973 12.924 12.533 12.06 11.546 10.964 10.355 9.791 9.26 8.786 8.298 7.877 7.511 7.132 6.765 6.383 6.006 5.644 5.283 4.952 4.633 4.298 4.049 3.805 3.517 3.287 3.046 2.815 2.582 2.322 2.13 1.923 1.601 1.36 1.096 0.975 0.728 0.45 0.176 0.04 -0.268 -0.41 -0.56 -0.724 -1.104 -1.315 -1.534 -1.806 -2.128 -2.504 -3.048 -4.799 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_57_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_57_155.txt deleted file mode 100644 index 565143a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_57_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,359 ,KEBNE ,16708300,Fri Nov 26 16:17:27 CET,Fri Nov 26 17:42:57 CET,0.0 0.79 1.067 1.245 1.407 1.554 1.68 1.79 1.963 2.035 2.102 2.204 2.265 2.325 2.44 2.55 2.636 2.673 2.746 2.808 2.885 2.921 2.942 2.974 2.992 2.982 2.967 2.959 2.96 2.958 2.926 2.894 2.886 2.868 2.821 2.716 2.589 2.474 2.383 2.233 1.983 1.634 1.167 0.678 0.044 -0.785 -1.88 -3.305 -5.278 -8.046 -12.29 -16.817 -20.164 -22.847 -25.009 -26.841 -28.366 -29.735 -30.871 -31.926 -32.804 -33.565 -34.269 -34.917 -35.553 -36.14 -36.697 -37.201 -37.646 -38.099 -38.581 -38.979 -39.365 -39.751 -40.046 -40.334 -40.634 -40.947 -41.27 -41.499 -41.737 -42.1 -42.348 -42.595 -42.717 -42.969 -43.239 -43.504 -43.635 -43.835 -44.127 -44.298 -44.469 -44.858 -45.064 -45.279 -45.514 -45.769 -46.083 -46.486 -47.504 -2 ,5169 ,KEBNE ,16708301,Fri Nov 26 16:19:21 CET,Fri Nov 26 17:51:45 CET,0.0 0.631 0.853 1.03 1.175 1.323 1.436 1.517 1.653 1.719 1.785 1.905 1.964 2.017 2.106 2.183 2.264 2.304 2.374 2.435 2.512 2.547 2.581 2.639 2.672 2.674 2.69 2.722 2.73 2.7 2.652 2.581 2.52 2.459 2.36 2.282 2.249 2.136 1.929 1.686 1.386 1.008 0.538 0.014 -0.659 -1.481 -2.583 -4.006 -5.983 -8.824 -13.054 -17.551 -20.971 -23.659 -25.832 -27.786 -29.421 -30.778 -31.9 -32.991 -33.896 -34.66 -35.38 -36.073 -36.696 -37.239 -37.808 -38.338 -38.801 -39.261 -39.7 -40.046 -40.405 -40.806 -41.118 -41.418 -41.717 -42.022 -42.332 -42.544 -42.771 -43.122 -43.361 -43.622 -43.755 -44.01 -44.27 -44.548 -44.693 -44.897 -45.165 -45.333 -45.498 -45.87 -46.083 -46.302 -46.524 -46.791 -47.095 -47.445 -48.239 -3 ,8085 ,KEBNE ,16708302,Fri Nov 26 16:29:34 CET,Fri Nov 26 18:00:23 CET,0.0 0.994 1.362 1.613 1.796 1.939 2.068 2.181 2.366 2.455 2.539 2.672 2.738 2.793 2.89 2.984 3.077 3.123 3.2 3.265 3.341 3.378 3.412 3.455 3.501 3.561 3.604 3.625 3.65 3.654 3.635 3.585 3.521 3.485 3.464 3.424 3.374 3.269 3.087 2.86 2.624 2.356 2.039 1.642 1.05 0.32 -0.671 -1.998 -3.885 -6.628 -10.833 -15.375 -18.779 -21.442 -23.597 -25.449 -27.056 -28.512 -29.732 -30.878 -31.848 -32.699 -33.476 -34.194 -34.849 -35.439 -36.032 -36.558 -36.998 -37.442 -37.916 -38.296 -38.674 -39.05 -39.337 -39.631 -39.946 -40.289 -40.627 -40.855 -41.091 -41.447 -41.69 -41.948 -42.085 -42.372 -42.657 -42.938 -43.087 -43.296 -43.578 -43.747 -43.922 -44.297 -44.509 -44.74 -44.96 -45.196 -45.506 -45.935 -46.827 -4 ,17449 ,KEBNE ,16708303,Fri Nov 26 16:31:37 CET,Fri Nov 26 18:03:00 CET,0.0 0.762 1.057 1.27 1.421 1.548 1.664 1.761 1.932 2.005 2.072 2.199 2.256 2.297 2.373 2.445 2.522 2.563 2.617 2.652 2.697 2.721 2.742 2.792 2.851 2.905 2.934 2.945 2.945 2.936 2.935 2.929 2.897 2.826 2.719 2.573 2.433 2.278 2.092 1.908 1.711 1.407 0.943 0.435 -0.206 -1.023 -2.123 -3.569 -5.56 -8.345 -12.534 -17.097 -20.554 -23.271 -25.47 -27.368 -28.956 -30.331 -31.472 -32.563 -33.471 -34.264 -35.007 -35.718 -36.36 -36.92 -37.511 -38.014 -38.429 -38.856 -39.321 -39.732 -40.148 -40.538 -40.813 -41.091 -41.383 -41.685 -41.993 -42.213 -42.433 -42.78 -43.025 -43.275 -43.408 -43.674 -43.953 -44.247 -44.397 -44.599 -44.86 -45.027 -45.201 -45.57 -45.774 -46.003 -46.245 -46.495 -46.792 -47.172 -48.249 -5 ,4531 ,KEBNE ,16708304,Fri Nov 26 16:31:37 CET,Fri Nov 26 18:03:18 CET,0.0 0.929 1.206 1.414 1.58 1.721 1.856 1.969 2.148 2.216 2.274 2.382 2.443 2.496 2.607 2.689 2.735 2.754 2.809 2.869 2.935 2.967 2.99 3.006 3.014 3.015 3.005 2.997 3.004 3.017 3.029 3.033 3.014 2.955 2.851 2.733 2.625 2.495 2.303 2.038 1.725 1.361 0.906 0.356 -0.367 -1.22 -2.36 -3.85 -5.853 -8.695 -13.063 -17.758 -21.363 -24.171 -26.384 -28.288 -29.858 -31.222 -32.362 -33.458 -34.392 -35.2 -35.934 -36.606 -37.24 -37.81 -38.401 -38.947 -39.387 -39.815 -40.251 -40.601 -40.974 -41.357 -41.653 -41.958 -42.265 -42.576 -42.9 -43.117 -43.345 -43.721 -43.99 -44.27 -44.406 -44.669 -44.943 -45.23 -45.381 -45.591 -45.863 -46.025 -46.19 -46.562 -46.762 -46.967 -47.205 -47.485 -47.805 -48.236 -49.131 -6 ,22866 ,KEBNE ,16708305,Fri Nov 26 16:31:37 CET,Fri Nov 26 18:03:02 CET,0.0 0.788 1.021 1.189 1.332 1.46 1.581 1.681 1.851 1.92 1.995 2.14 2.201 2.256 2.345 2.414 2.481 2.514 2.563 2.599 2.663 2.712 2.751 2.791 2.832 2.869 2.902 2.923 2.923 2.896 2.869 2.837 2.797 2.755 2.685 2.577 2.458 2.305 2.105 1.862 1.576 1.231 0.772 0.237 -0.452 -1.294 -2.428 -3.93 -5.941 -8.745 -12.991 -17.541 -20.966 -23.72 -25.951 -27.845 -29.436 -30.787 -31.902 -32.986 -33.886 -34.727 -35.52 -36.216 -36.831 -37.397 -38.019 -38.568 -39.016 -39.457 -39.926 -40.297 -40.653 -41.021 -41.316 -41.625 -41.937 -42.274 -42.626 -42.858 -43.093 -43.453 -43.692 -43.939 -44.066 -44.327 -44.597 -44.868 -45.014 -45.216 -45.469 -45.632 -45.806 -46.165 -46.366 -46.585 -46.805 -47.069 -47.426 -47.858 -49.172 -7 ,7497 ,KEBNE ,16708306,Fri Nov 26 16:32:38 CET,Fri Nov 26 18:04:09 CET,0.0 0.612 0.848 1.024 1.148 1.242 1.32 1.409 1.579 1.651 1.73 1.871 1.93 1.976 2.06 2.132 2.188 2.221 2.284 2.344 2.429 2.476 2.519 2.566 2.603 2.628 2.644 2.662 2.688 2.709 2.715 2.701 2.635 2.548 2.457 2.354 2.245 2.117 1.941 1.703 1.419 1.057 0.588 0.072 -0.579 -1.379 -2.463 -3.872 -5.782 -8.525 -12.727 -17.283 -20.677 -23.31 -25.443 -27.337 -28.94 -30.293 -31.41 -32.491 -33.39 -34.148 -34.86 -35.543 -36.192 -36.769 -37.359 -37.907 -38.39 -38.883 -39.355 -39.733 -40.115 -40.5 -40.816 -41.155 -41.503 -41.832 -42.157 -42.389 -42.625 -42.984 -43.242 -43.513 -43.645 -43.917 -44.207 -44.502 -44.659 -44.877 -45.153 -45.32 -45.491 -45.842 -46.037 -46.249 -46.491 -46.768 -47.074 -47.456 -48.22 -8 ,23943 ,KEBNE ,16708307,Fri Nov 26 16:32:38 CET,Fri Nov 26 18:03:51 CET,0.0 0.659 0.902 1.092 1.267 1.418 1.534 1.636 1.819 1.882 1.947 2.068 2.123 2.166 2.239 2.316 2.397 2.43 2.495 2.548 2.6 2.63 2.662 2.723 2.78 2.804 2.799 2.785 2.77 2.764 2.742 2.696 2.666 2.65 2.591 2.459 2.353 2.275 2.173 2.032 1.789 1.442 0.997 0.46 -0.253 -1.131 -2.26 -3.687 -5.623 -8.342 -12.436 -16.956 -20.449 -23.201 -25.378 -27.22 -28.771 -30.116 -31.224 -32.298 -33.202 -33.978 -34.685 -35.336 -35.947 -36.524 -37.108 -37.61 -38.048 -38.475 -38.896 -39.235 -39.604 -39.988 -40.279 -40.605 -40.932 -41.247 -41.574 -41.808 -42.048 -42.395 -42.627 -42.855 -42.984 -43.267 -43.542 -43.827 -43.969 -44.18 -44.473 -44.638 -44.816 -45.204 -45.419 -45.641 -45.875 -46.128 -46.428 -46.801 -47.718 -9 ,31463 ,KEBNE ,16708308,Fri Nov 26 16:32:38 CET,Fri Nov 26 18:04:36 CET,0.0 0.7 0.975 1.162 1.323 1.451 1.544 1.633 1.803 1.883 1.965 2.09 2.136 2.183 2.278 2.357 2.428 2.466 2.526 2.569 2.652 2.701 2.741 2.799 2.861 2.919 2.962 2.99 3.028 3.057 3.045 3.02 2.995 2.938 2.846 2.708 2.564 2.397 2.195 2.012 1.791 1.443 1.009 0.502 -0.196 -1.026 -2.089 -3.51 -5.466 -8.196 -12.385 -16.992 -20.384 -23.064 -25.251 -27.113 -28.664 -29.991 -31.128 -32.238 -33.132 -33.9 -34.641 -35.352 -36.007 -36.595 -37.214 -37.752 -38.171 -38.588 -39.053 -39.428 -39.803 -40.203 -40.516 -40.829 -41.144 -41.465 -41.793 -42.024 -42.258 -42.609 -42.862 -43.118 -43.247 -43.511 -43.785 -44.067 -44.214 -44.422 -44.679 -44.851 -45.037 -45.41 -45.618 -45.853 -46.117 -46.386 -46.663 -47.042 -47.923 -10 ,29761 ,KEBNE ,16708309,Fri Nov 26 16:32:38 CET,Fri Nov 26 18:03:23 CET,0.0 0.737 0.985 1.177 1.345 1.509 1.657 1.777 1.954 2.022 2.089 2.204 2.269 2.33 2.447 2.552 2.639 2.677 2.748 2.804 2.855 2.896 2.948 3.012 3.047 3.065 3.08 3.083 3.071 3.047 3.044 3.034 2.993 2.935 2.864 2.813 2.724 2.555 2.352 2.096 1.799 1.456 1.07 0.671 0.078 -0.738 -1.822 -3.266 -5.302 -8.147 -12.45 -17.039 -20.482 -23.218 -25.444 -27.308 -28.86 -30.196 -31.297 -32.378 -33.262 -34.041 -34.823 -35.531 -36.139 -36.678 -37.248 -37.752 -38.169 -38.621 -39.115 -39.504 -39.899 -40.314 -40.629 -40.949 -41.276 -41.613 -41.963 -42.203 -42.455 -42.835 -43.088 -43.346 -43.478 -43.757 -44.04 -44.338 -44.491 -44.696 -44.988 -45.175 -45.364 -45.765 -45.989 -46.246 -46.511 -46.785 -47.107 -47.51 -48.68 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_1.txt deleted file mode 100644 index 4725cbc4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16709 ,KEBNE ,16708310,Fri Nov 26 16:38:46 CET,Fri Nov 26 18:09:51 CET,0.0 0.797 1.128 1.386 1.573 1.728 1.888 2.048 2.33 2.461 2.582 2.745 2.92 3.025 3.225 3.414 3.59 3.671 3.83 3.987 4.218 4.366 4.498 4.693 4.88 5.035 5.182 5.331 5.523 5.706 5.886 6.095 6.283 6.461 6.676 6.917 7.148 7.404 7.676 7.959 8.26 8.6 8.975 9.354 9.765 10.208 10.727 11.263 11.876 12.609 13.431 13.893 13.997 13.934 13.82 13.62 13.356 13.127 12.907 12.64 12.376 12.123 11.878 11.636 11.381 11.132 10.89 10.67 10.474 10.271 10.062 9.879 9.658 9.404 9.222 9.025 8.795 8.59 8.423 8.309 8.175 7.948 7.78 7.593 7.486 7.263 7.031 6.795 6.676 6.484 6.252 6.112 5.97 5.655 5.485 5.301 5.071 4.795 4.481 4.034 2.753 -2 ,17583 ,KEBNE ,16708311,Fri Nov 26 16:38:46 CET,Fri Nov 26 18:10:32 CET,0.0 0.895 1.222 1.458 1.666 1.856 2.033 2.198 2.484 2.606 2.727 2.888 3.052 3.156 3.356 3.547 3.736 3.82 3.974 4.124 4.358 4.507 4.648 4.837 5.012 5.192 5.369 5.549 5.791 6.022 6.243 6.482 6.692 6.907 7.173 7.449 7.68 7.936 8.235 8.555 8.887 9.257 9.662 10.117 10.638 11.173 11.765 12.358 13.039 13.775 14.522 14.976 14.993 14.865 14.686 14.504 14.321 14.098 13.864 13.615 13.401 13.2 12.98 12.725 12.489 12.3 12.086 11.869 11.673 11.46 11.228 11.037 10.834 10.612 10.444 10.274 10.099 9.916 9.718 9.577 9.433 9.217 9.059 8.888 8.8 8.616 8.424 8.201 8.078 7.907 7.726 7.59 7.444 7.121 6.945 6.751 6.517 6.246 5.908 5.457 3.963 -3 ,8931 ,KEBNE ,16708312,Fri Nov 26 16:46:56 CET,Fri Nov 26 18:17:55 CET,0.0 0.858 1.233 1.528 1.741 1.914 2.078 2.242 2.529 2.655 2.767 2.896 3.047 3.135 3.32 3.492 3.666 3.748 3.899 4.063 4.316 4.472 4.619 4.806 4.962 5.117 5.272 5.446 5.675 5.892 6.104 6.34 6.544 6.725 6.951 7.213 7.45 7.693 7.955 8.24 8.538 8.875 9.27 9.655 10.093 10.581 11.122 11.718 12.398 13.136 13.859 14.191 14.159 13.941 13.677 13.354 12.984 12.676 12.427 12.146 11.886 11.648 11.434 11.215 10.973 10.734 10.488 10.263 10.059 9.855 9.61 9.393 9.177 8.952 8.787 8.635 8.469 8.269 8.05 7.895 7.741 7.525 7.378 7.22 7.137 6.967 6.785 6.577 6.45 6.254 6.047 5.91 5.768 5.452 5.273 5.071 4.842 4.573 4.232 3.779 2.59 -4 ,29264 ,KEBNE ,16708313,Fri Nov 26 16:49:04 CET,Fri Nov 26 18:14:47 CET,0.0 0.837 1.212 1.447 1.631 1.819 2.003 2.158 2.431 2.555 2.667 2.802 2.972 3.078 3.254 3.415 3.571 3.648 3.803 3.969 4.224 4.386 4.539 4.736 4.908 5.082 5.265 5.435 5.637 5.823 5.99 6.196 6.394 6.582 6.799 7.043 7.275 7.523 7.79 8.093 8.424 8.774 9.164 9.532 9.953 10.409 10.931 11.523 12.163 12.883 13.608 13.908 13.835 13.616 13.372 13.103 12.789 12.457 12.185 11.919 11.674 11.431 11.173 10.917 10.693 10.466 10.211 10.003 9.833 9.652 9.43 9.224 9.005 8.766 8.569 8.376 8.189 7.994 7.797 7.658 7.509 7.241 7.04 6.841 6.744 6.559 6.345 6.106 5.988 5.809 5.601 5.442 5.271 4.878 4.651 4.422 4.178 3.869 3.488 3.001 1.763 -5 ,7373 ,KEBNE ,16708314,Fri Nov 26 16:49:04 CET,Fri Nov 26 18:14:02 CET,0.0 1.073 1.354 1.588 1.796 1.957 2.101 2.237 2.521 2.665 2.792 2.961 3.135 3.247 3.441 3.606 3.763 3.839 3.983 4.127 4.341 4.472 4.593 4.777 4.964 5.146 5.328 5.509 5.73 5.939 6.153 6.422 6.671 6.892 7.134 7.388 7.654 7.967 8.279 8.585 8.885 9.216 9.612 10.022 10.533 11.071 11.625 12.226 12.887 13.604 14.259 14.609 14.697 14.632 14.498 14.302 14.054 13.786 13.504 13.208 12.968 12.738 12.476 12.166 11.915 11.727 11.525 11.31 11.094 10.854 10.589 10.389 10.203 9.971 9.774 9.595 9.403 9.194 8.982 8.838 8.683 8.426 8.259 8.098 8.02 7.857 7.676 7.479 7.361 7.182 6.994 6.851 6.687 6.334 6.138 5.912 5.662 5.36 4.994 4.553 3.114 -6 ,16383 ,KEBNE ,16708315,Fri Nov 26 16:50:05 CET,Fri Nov 26 18:14:54 CET,0.0 1.213 1.541 1.794 2.026 2.219 2.381 2.534 2.811 2.93 3.041 3.167 3.325 3.428 3.629 3.826 4.006 4.081 4.231 4.377 4.568 4.695 4.823 5.012 5.199 5.397 5.601 5.795 6.02 6.213 6.407 6.667 6.92 7.13 7.343 7.583 7.819 8.082 8.36 8.66 8.973 9.291 9.652 10.011 10.43 10.905 11.421 11.973 12.613 13.284 13.923 14.239 14.227 14.072 13.818 13.541 13.302 13.078 12.875 12.644 12.43 12.22 12.01 11.792 11.571 11.392 11.189 10.959 10.758 10.561 10.348 10.157 9.931 9.699 9.542 9.386 9.208 9.015 8.824 8.696 8.551 8.302 8.136 7.958 7.867 7.689 7.486 7.267 7.146 6.943 6.711 6.558 6.392 6.05 5.863 5.659 5.415 5.138 4.82 4.364 2.701 -7 ,25820 ,KEBNE ,16708316,Fri Nov 26 16:51:03 CET,Fri Nov 26 18:21:45 CET,0.0 1.135 1.466 1.702 1.92 2.09 2.24 2.386 2.644 2.763 2.886 3.068 3.239 3.346 3.547 3.71 3.882 3.973 4.13 4.26 4.453 4.58 4.713 4.929 5.127 5.299 5.475 5.649 5.839 6.026 6.244 6.523 6.75 6.951 7.182 7.419 7.671 7.963 8.237 8.507 8.805 9.15 9.537 9.927 10.376 10.869 11.429 12.038 12.728 13.471 14.169 14.46 14.443 14.23 13.97 13.709 13.424 13.106 12.795 12.486 12.172 11.889 11.657 11.432 11.216 11.009 10.797 10.618 10.454 10.26 10.04 9.874 9.72 9.537 9.364 9.165 8.987 8.815 8.612 8.469 8.328 8.114 7.945 7.753 7.655 7.447 7.217 6.989 6.863 6.659 6.433 6.289 6.136 5.82 5.649 5.443 5.188 4.889 4.524 4.107 2.885 -8 ,7714 ,KEBNE ,16708317,Fri Nov 26 16:51:03 CET,Fri Nov 26 18:22:36 CET,0.0 0.903 1.231 1.455 1.646 1.826 1.99 2.149 2.427 2.553 2.673 2.83 2.998 3.089 3.262 3.419 3.564 3.646 3.808 3.972 4.221 4.359 4.482 4.667 4.837 4.992 5.149 5.305 5.501 5.683 5.877 6.118 6.343 6.581 6.849 7.117 7.359 7.611 7.889 8.193 8.51 8.872 9.295 9.717 10.182 10.682 11.233 11.803 12.511 13.34 14.098 14.521 14.675 14.65 14.539 14.343 14.113 13.905 13.678 13.4 13.145 12.899 12.639 12.406 12.187 11.959 11.716 11.482 11.268 11.051 10.822 10.634 10.443 10.238 10.079 9.919 9.736 9.528 9.307 9.169 9.035 8.794 8.624 8.442 8.348 8.184 8.013 7.811 7.694 7.51 7.329 7.202 7.064 6.749 6.565 6.383 6.166 5.895 5.583 5.133 3.62 -9 ,31228 ,KEBNE ,16708318,Fri Nov 26 16:52:04 CET,Fri Nov 26 18:22:33 CET,0.0 0.92 1.25 1.492 1.68 1.841 1.994 2.128 2.373 2.485 2.592 2.741 2.899 2.987 3.168 3.35 3.52 3.594 3.736 3.881 4.088 4.225 4.361 4.55 4.723 4.905 5.097 5.272 5.47 5.677 5.907 6.17 6.4 6.593 6.807 7.05 7.28 7.551 7.838 8.12 8.415 8.76 9.154 9.546 10.02 10.538 11.121 11.768 12.53 13.38 14.262 14.782 14.954 14.967 14.89 14.734 14.554 14.342 14.127 13.894 13.598 13.334 13.155 12.98 12.808 12.633 12.431 12.196 11.974 11.749 11.52 11.336 11.132 10.919 10.75 10.578 10.399 10.191 9.955 9.788 9.641 9.413 9.222 9.02 8.917 8.693 8.461 8.247 8.137 7.967 7.79 7.654 7.501 7.172 6.978 6.756 6.494 6.169 5.799 5.372 4.132 -10 ,14277 ,KEBNE ,16708319,Fri Nov 26 16:52:08 CET,Fri Nov 26 18:20:47 CET,0.0 0.862 1.164 1.435 1.675 1.853 2.003 2.152 2.439 2.578 2.713 2.888 3.058 3.158 3.345 3.525 3.705 3.792 3.96 4.14 4.396 4.53 4.659 4.878 5.065 5.228 5.414 5.597 5.814 6.026 6.215 6.422 6.636 6.857 7.121 7.413 7.697 8.002 8.32 8.678 9.036 9.382 9.795 10.242 10.731 11.244 11.771 12.336 13.007 13.774 14.591 14.907 14.858 14.701 14.487 14.229 13.98 13.711 13.434 13.115 12.818 12.562 12.31 12.04 11.77 11.532 11.287 11.055 10.865 10.683 10.475 10.261 10.044 9.832 9.648 9.464 9.281 9.077 8.852 8.688 8.516 8.239 8.05 7.869 7.784 7.614 7.434 7.23 7.107 6.926 6.718 6.571 6.422 6.11 5.936 5.714 5.47 5.227 4.895 4.412 3.109 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_41.txt deleted file mode 100644 index 11ac547d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_7a_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10536 ,KEBNE ,16708320,Fri Nov 26 16:53:06 CET,Fri Nov 26 18:23:44 CET,0.0 1.151 1.544 1.857 2.116 2.317 2.515 2.724 3.105 3.273 3.428 3.647 3.866 4.017 4.282 4.523 4.752 4.858 5.085 5.31 5.622 5.836 6.026 6.282 6.542 6.786 7.024 7.257 7.552 7.869 8.166 8.497 8.831 9.156 9.527 9.933 10.33 10.787 11.283 11.804 12.354 12.951 13.634 14.314 15.088 15.991 17.062 18.26 19.688 21.332 23.337 25.021 25.914 26.394 26.627 26.744 26.805 26.849 26.851 26.766 26.656 26.563 26.488 26.418 26.337 26.244 26.119 25.976 25.861 25.735 25.577 25.461 25.354 25.228 25.124 25.008 24.889 24.758 24.601 24.483 24.347 24.134 23.996 23.837 23.757 23.61 23.452 23.271 23.168 23.015 22.808 22.672 22.527 22.204 22.004 21.791 21.567 21.285 20.94 20.422 18.749 -2 ,25834 ,KEBNE ,16708321,Fri Nov 26 16:54:11 CET,Fri Nov 26 18:21:43 CET,0.0 1.248 1.679 1.994 2.257 2.501 2.697 2.867 3.206 3.368 3.518 3.73 3.924 4.044 4.293 4.551 4.797 4.909 5.112 5.307 5.575 5.76 5.948 6.215 6.488 6.77 7.035 7.285 7.611 7.92 8.209 8.551 8.89 9.202 9.573 10.001 10.403 10.83 11.292 11.793 12.298 12.881 13.556 14.246 15.091 16.039 17.124 18.339 19.806 21.477 23.46 25.12 26.092 26.73 27.099 27.293 27.394 27.407 27.353 27.282 27.199 27.089 26.972 26.891 26.81 26.713 26.593 26.454 26.327 26.207 26.088 25.986 25.87 25.731 25.605 25.45 25.275 25.077 24.873 24.744 24.618 24.417 24.255 24.09 24.002 23.805 23.605 23.391 23.276 23.108 22.898 22.776 22.64 22.302 22.119 21.899 21.648 21.387 21.048 20.612 18.998 -3 ,5827 ,KEBNE ,16708322,Fri Nov 26 16:55:12 CET,Fri Nov 26 18:21:42 CET,0.0 1.028 1.442 1.773 2.048 2.293 2.518 2.712 3.055 3.215 3.369 3.609 3.812 3.932 4.163 4.402 4.641 4.743 4.936 5.149 5.477 5.679 5.87 6.156 6.431 6.687 6.926 7.147 7.435 7.738 8.037 8.378 8.691 9.002 9.417 9.866 10.253 10.682 11.151 11.646 12.165 12.764 13.471 14.171 14.997 15.905 16.946 18.151 19.621 21.411 23.543 25.285 26.258 26.678 26.838 26.949 27.017 27.005 26.929 26.872 26.843 26.797 26.682 26.561 26.464 26.342 26.194 26.067 25.952 25.825 25.678 25.537 25.39 25.235 25.108 24.963 24.789 24.587 24.401 24.294 24.187 24.008 23.882 23.744 23.664 23.475 23.264 23.067 22.975 22.817 22.594 22.463 22.305 21.923 21.732 21.531 21.306 21.046 20.711 20.218 18.14 -4 ,18544 ,KEBNE ,16708323,Fri Nov 26 16:56:13 CET,Fri Nov 26 18:22:42 CET,0.0 1.387 1.808 2.067 2.307 2.551 2.773 2.973 3.34 3.517 3.673 3.872 4.068 4.198 4.446 4.671 4.875 4.973 5.192 5.414 5.713 5.898 6.057 6.308 6.595 6.866 7.111 7.341 7.642 7.936 8.208 8.546 8.893 9.22 9.604 10.031 10.419 10.86 11.354 11.875 12.4 12.99 13.669 14.342 15.15 16.049 17.076 18.225 19.598 21.235 23.157 24.74 25.645 26.169 26.458 26.582 26.618 26.597 26.519 26.428 26.365 26.255 26.081 25.903 25.732 25.585 25.441 25.293 25.166 25.023 24.836 24.671 24.524 24.36 24.227 24.103 23.966 23.825 23.659 23.52 23.364 23.116 22.932 22.733 22.633 22.435 22.227 22.002 21.896 21.743 21.54 21.405 21.27 20.971 20.796 20.594 20.358 20.072 19.734 19.258 17.431 -5 ,16161 ,KEBNE ,16708324,Fri Nov 26 16:56:13 CET,Fri Nov 26 18:21:51 CET,0.0 1.063 1.477 1.781 2.023 2.226 2.402 2.578 2.898 3.042 3.194 3.445 3.655 3.786 4.027 4.271 4.536 4.656 4.869 5.067 5.353 5.545 5.735 6.014 6.264 6.494 6.741 6.99 7.284 7.58 7.89 8.254 8.605 8.943 9.331 9.734 10.093 10.521 10.985 11.47 11.978 12.586 13.322 14.033 14.859 15.784 16.854 18.08 19.534 21.195 23.2 24.772 25.599 26.138 26.495 26.72 26.827 26.852 26.829 26.788 26.75 26.698 26.622 26.515 26.379 26.264 26.142 26.009 25.874 25.74 25.609 25.472 25.325 25.143 24.988 24.838 24.699 24.56 24.412 24.316 24.205 24.019 23.883 23.723 23.636 23.443 23.22 22.975 22.849 22.684 22.48 22.343 22.186 21.841 21.632 21.399 21.155 20.873 20.549 20.099 18.768 -6 ,2444 ,KEBNE ,16708325,Fri Nov 26 16:57:10 CET,Fri Nov 26 18:27:51 CET,0.0 0.949 1.339 1.62 1.887 2.123 2.313 2.483 2.805 2.971 3.127 3.346 3.542 3.665 3.892 4.107 4.345 4.473 4.716 4.936 5.24 5.43 5.605 5.867 6.126 6.37 6.602 6.828 7.133 7.426 7.707 8.048 8.375 8.677 9.036 9.468 9.878 10.33 10.817 11.333 11.853 12.455 13.2 13.922 14.726 15.642 16.73 17.976 19.458 21.243 23.444 25.206 26.184 26.724 27.025 27.205 27.315 27.374 27.392 27.352 27.276 27.162 27.001 26.827 26.662 26.514 26.346 26.199 26.042 25.878 25.744 25.603 25.444 25.293 25.163 25.014 24.847 24.663 24.455 24.307 24.165 23.948 23.797 23.64 23.559 23.375 23.172 22.957 22.836 22.671 22.476 22.336 22.181 21.848 21.646 21.417 21.17 20.886 20.554 20.06 18.348 -7 ,29368 ,KEBNE ,16708326,Fri Nov 26 16:59:13 CET,Fri Nov 26 18:29:12 CET,0.0 1.055 1.39 1.68 1.97 2.204 2.384 2.559 2.885 3.03 3.183 3.431 3.634 3.766 4.009 4.237 4.467 4.581 4.783 4.97 5.242 5.408 5.569 5.832 6.1 6.349 6.587 6.819 7.117 7.385 7.622 7.927 8.241 8.538 8.887 9.294 9.68 10.099 10.547 11.025 11.526 12.085 12.76 13.442 14.239 15.142 16.164 17.327 18.721 20.387 22.297 23.787 24.64 25.164 25.417 25.527 25.542 25.477 25.429 25.329 25.184 25.046 24.931 24.786 24.619 24.484 24.33 24.189 24.081 23.98 23.843 23.695 23.527 23.34 23.187 23.034 22.862 22.678 22.503 22.372 22.22 21.967 21.799 21.64 21.56 21.39 21.215 21.027 20.92 20.746 20.512 20.368 20.22 19.91 19.733 19.546 19.306 19.018 18.703 18.267 16.955 -8 ,526 ,KEBNE ,16708327,Fri Nov 26 16:59:13 CET,Fri Nov 26 18:29:31 CET,0.0 1.209 1.568 1.837 2.102 2.331 2.533 2.734 3.098 3.259 3.421 3.657 3.857 3.993 4.267 4.53 4.77 4.883 5.091 5.285 5.574 5.762 5.933 6.176 6.421 6.667 6.888 7.104 7.401 7.677 7.933 8.252 8.569 8.881 9.245 9.643 9.997 10.381 10.82 11.307 11.803 12.362 13.026 13.67 14.445 15.324 16.31 17.461 18.832 20.485 22.488 23.963 24.806 25.352 25.651 25.799 25.88 25.914 25.901 25.856 25.792 25.719 25.641 25.537 25.407 25.237 25.007 24.807 24.643 24.474 24.285 24.119 23.967 23.822 23.692 23.527 23.331 23.113 22.887 22.741 22.593 22.35 22.198 22.055 21.97 21.778 21.581 21.375 21.26 21.086 20.867 20.729 20.575 20.23 20.035 19.83 19.591 19.294 18.934 18.361 16.633 -9 ,21762 ,KEBNE ,16708328,Fri Nov 26 16:59:13 CET,Fri Nov 26 18:29:52 CET,0.0 1.045 1.448 1.738 1.993 2.216 2.416 2.598 2.931 3.095 3.258 3.498 3.705 3.839 4.097 4.352 4.576 4.685 4.92 5.143 5.449 5.652 5.845 6.108 6.363 6.618 6.868 7.109 7.413 7.691 7.959 8.312 8.653 8.971 9.356 9.777 10.161 10.585 11.065 11.571 12.097 12.705 13.4 14.115 14.966 15.886 16.949 18.204 19.68 21.393 23.408 24.992 25.901 26.425 26.724 26.86 26.874 26.841 26.785 26.699 26.584 26.463 26.343 26.211 26.082 25.951 25.799 25.632 25.467 25.259 25.035 24.888 24.715 24.51 24.377 24.256 24.116 23.955 23.781 23.659 23.532 23.335 23.178 22.991 22.895 22.701 22.508 22.295 22.172 21.999 21.774 21.629 21.474 21.155 20.983 20.782 20.53 20.235 19.907 19.48 17.867 -10 ,5252 ,KEBNE ,16708329,Fri Nov 26 16:59:13 CET,Fri Nov 26 18:29:26 CET,0.0 1.174 1.587 1.906 2.162 2.389 2.602 2.798 3.142 3.297 3.444 3.664 3.87 4.002 4.232 4.45 4.671 4.786 5.0 5.202 5.493 5.685 5.864 6.116 6.387 6.656 6.902 7.132 7.414 7.695 7.979 8.321 8.643 8.946 9.3 9.704 10.102 10.536 10.991 11.503 12.042 12.633 13.395 14.129 14.911 15.817 16.923 18.169 19.577 21.249 23.244 24.853 25.684 26.117 26.42 26.624 26.709 26.73 26.719 26.625 26.513 26.434 26.342 26.226 26.103 25.962 25.782 25.623 25.475 25.321 25.183 25.07 24.943 24.802 24.686 24.568 24.439 24.286 24.125 24.016 23.895 23.663 23.496 23.344 23.268 23.118 22.956 22.752 22.644 22.498 22.321 22.179 22.026 21.694 21.502 21.297 21.055 20.753 20.418 19.892 18.115 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_1.txt deleted file mode 100644 index 5d21b71a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19553 ,KEBNE ,16708330,Fri Nov 26 16:59:13 CET,Fri Nov 26 18:29:56 CET,0.0 0.838 1.158 1.399 1.569 1.729 1.906 2.072 2.345 2.457 2.567 2.724 2.881 2.985 3.181 3.362 3.539 3.612 3.743 3.879 4.08 4.225 4.367 4.551 4.713 4.862 5.007 5.146 5.339 5.528 5.699 5.936 6.164 6.359 6.579 6.836 7.091 7.354 7.639 7.938 8.224 8.516 8.827 9.166 9.563 9.924 10.352 10.842 11.192 11.237 10.996 10.341 9.566 8.818 8.118 7.487 6.908 6.334 5.849 5.383 4.969 4.566 4.164 3.808 3.459 3.132 2.821 2.532 2.257 1.972 1.689 1.452 1.198 0.929 0.718 0.489 0.242 -0.012 -0.282 -0.47 -0.665 -0.982 -1.202 -1.434 -1.557 -1.817 -2.089 -2.362 -2.509 -2.724 -2.983 -3.15 -3.323 -3.704 -3.909 -4.119 -4.373 -4.692 -5.086 -5.642 -7.329 -2 ,8290 ,KEBNE ,16708331,Fri Nov 26 16:59:15 CET,Fri Nov 26 18:25:32 CET,0.0 1.568 1.927 2.194 2.428 2.635 2.808 2.952 3.205 3.334 3.454 3.615 3.766 3.855 4.016 4.17 4.328 4.408 4.567 4.731 4.967 5.1 5.229 5.421 5.604 5.793 5.975 6.144 6.367 6.582 6.777 6.982 7.154 7.321 7.514 7.72 7.923 8.141 8.365 8.603 8.857 9.158 9.49 9.796 10.119 10.494 10.903 11.321 11.758 11.994 11.829 11.245 10.541 9.876 9.199 8.537 7.921 7.364 6.898 6.41 5.985 5.571 5.171 4.772 4.363 4.001 3.653 3.361 3.1 2.814 2.526 2.3 2.065 1.824 1.638 1.434 1.221 1.005 0.777 0.607 0.424 0.148 -0.05 -0.258 -0.369 -0.625 -0.879 -1.114 -1.241 -1.44 -1.659 -1.801 -1.957 -2.336 -2.578 -2.856 -3.149 -3.466 -3.894 -4.531 -6.328 -3 ,8697 ,KEBNE ,16708332,Fri Nov 26 17:00:14 CET,Fri Nov 26 18:31:15 CET,0.0 0.848 1.206 1.492 1.732 1.933 2.11 2.263 2.534 2.662 2.794 2.972 3.143 3.237 3.44 3.645 3.852 3.955 4.142 4.312 4.555 4.699 4.827 5.026 5.213 5.382 5.555 5.727 5.943 6.142 6.321 6.538 6.75 6.946 7.171 7.433 7.681 7.937 8.194 8.46 8.73 9.03 9.398 9.787 10.218 10.644 11.069 11.478 11.88 12.169 12.289 11.906 11.272 10.586 9.901 9.256 8.675 8.164 7.701 7.211 6.802 6.436 6.085 5.76 5.443 5.132 4.822 4.544 4.283 4.012 3.713 3.481 3.243 2.966 2.761 2.575 2.373 2.14 1.891 1.707 1.502 1.174 0.955 0.733 0.611 0.353 0.099 -0.192 -0.366 -0.586 -0.816 -0.97 -1.128 -1.463 -1.664 -1.885 -2.132 -2.426 -2.786 -3.216 -4.584 -4 ,19047 ,KEBNE ,16708333,Fri Nov 26 17:00:14 CET,Fri Nov 26 18:31:37 CET,0.0 0.95 1.301 1.574 1.77 1.936 2.101 2.254 2.522 2.656 2.782 2.937 3.09 3.187 3.394 3.597 3.771 3.848 3.994 4.135 4.332 4.461 4.589 4.769 4.94 5.105 5.263 5.415 5.602 5.792 5.989 6.22 6.462 6.703 6.966 7.258 7.531 7.777 8.004 8.257 8.492 8.744 9.07 9.416 9.813 10.228 10.674 11.114 11.526 11.851 11.871 11.401 10.823 10.211 9.548 8.922 8.352 7.848 7.446 7.017 6.625 6.268 5.906 5.567 5.253 4.945 4.614 4.322 4.087 3.85 3.602 3.39 3.165 2.951 2.799 2.63 2.444 2.245 2.025 1.867 1.71 1.461 1.29 1.114 1.017 0.825 0.632 0.426 0.32 0.152 -0.042 -0.192 -0.359 -0.717 -0.905 -1.093 -1.302 -1.581 -1.926 -2.387 -3.661 -5 ,22632 ,KEBNE ,16708334,Fri Nov 26 17:00:18 CET,Fri Nov 26 18:28:10 CET,0.0 0.848 1.157 1.396 1.603 1.792 1.96 2.1 2.381 2.523 2.652 2.824 2.984 3.083 3.261 3.423 3.576 3.651 3.797 3.936 4.137 4.263 4.379 4.547 4.719 4.891 5.051 5.212 5.419 5.598 5.758 5.939 6.125 6.306 6.509 6.749 6.99 7.254 7.53 7.802 8.067 8.377 8.733 9.044 9.396 9.781 10.133 10.406 10.637 10.804 10.793 10.344 9.685 8.983 8.315 7.66 7.035 6.463 5.992 5.538 5.122 4.729 4.356 4.019 3.689 3.379 3.068 2.778 2.498 2.2 1.914 1.689 1.455 1.212 1.018 0.81 0.588 0.355 0.113 -0.053 -0.232 -0.519 -0.718 -0.927 -1.032 -1.252 -1.484 -1.75 -1.898 -2.105 -2.365 -2.53 -2.701 -3.11 -3.355 -3.627 -3.925 -4.243 -4.629 -5.157 -6.597 -6 ,18686 ,KEBNE ,16708335,Fri Nov 26 17:00:18 CET,Fri Nov 26 18:27:47 CET,0.0 0.831 1.115 1.328 1.509 1.665 1.81 1.957 2.229 2.342 2.456 2.62 2.771 2.864 3.059 3.251 3.419 3.507 3.687 3.849 4.073 4.207 4.346 4.543 4.709 4.86 5.005 5.142 5.302 5.456 5.628 5.852 6.059 6.261 6.488 6.718 6.903 7.09 7.294 7.518 7.764 8.027 8.324 8.611 8.971 9.329 9.672 10.08 10.482 10.746 10.649 10.01 9.279 8.538 7.809 7.146 6.544 5.935 5.359 4.793 4.336 3.908 3.474 3.071 2.713 2.391 2.056 1.761 1.493 1.2 0.888 0.617 0.338 0.024 -0.222 -0.45 -0.691 -0.953 -1.223 -1.413 -1.615 -1.939 -2.166 -2.394 -2.514 -2.761 -3.003 -3.247 -3.388 -3.602 -3.838 -3.976 -4.133 -4.517 -4.736 -4.97 -5.234 -5.562 -5.934 -6.449 -7.792 -7 ,10770 ,KEBNE ,16708336,Fri Nov 26 17:01:15 CET,Fri Nov 26 18:32:20 CET,0.0 0.842 1.162 1.432 1.636 1.808 1.974 2.127 2.416 2.55 2.665 2.812 2.975 3.07 3.245 3.423 3.596 3.673 3.823 3.964 4.15 4.272 4.391 4.57 4.753 4.921 5.087 5.255 5.479 5.678 5.839 6.033 6.22 6.409 6.646 6.906 7.163 7.444 7.719 8.005 8.277 8.61 9.019 9.381 9.778 10.186 10.633 10.973 11.248 11.522 11.548 11.048 10.349 9.69 9.068 8.474 7.893 7.351 6.883 6.377 5.935 5.523 5.116 4.751 4.406 4.079 3.75 3.444 3.168 2.889 2.588 2.333 2.059 1.782 1.586 1.374 1.135 0.865 0.588 0.417 0.237 -0.052 -0.249 -0.458 -0.569 -0.814 -1.077 -1.335 -1.47 -1.678 -1.95 -2.124 -2.315 -2.736 -2.961 -3.205 -3.48 -3.803 -4.184 -4.72 -6.136 -8 ,392 ,KEBNE ,16708337,Fri Nov 26 17:01:15 CET,Fri Nov 26 18:32:50 CET,0.0 1.216 1.608 1.87 2.07 2.23 2.373 2.52 2.788 2.907 3.025 3.221 3.4 3.506 3.708 3.892 4.081 4.174 4.332 4.475 4.672 4.797 4.927 5.113 5.284 5.458 5.613 5.758 5.97 6.173 6.369 6.579 6.75 6.922 7.144 7.425 7.67 7.902 8.157 8.407 8.649 8.927 9.283 9.642 10.004 10.301 10.536 10.748 10.922 10.975 10.837 10.288 9.564 8.909 8.201 7.493 6.912 6.374 5.853 5.314 4.843 4.373 3.931 3.544 3.176 2.837 2.468 2.134 1.865 1.581 1.285 1.041 0.781 0.513 0.302 0.075 -0.165 -0.399 -0.631 -0.802 -0.985 -1.281 -1.483 -1.705 -1.82 -2.04 -2.288 -2.54 -2.671 -2.858 -3.084 -3.242 -3.415 -3.821 -4.039 -4.279 -4.565 -4.878 -5.233 -5.702 -6.98 -9 ,3759 ,KEBNE ,16708338,Fri Nov 26 17:01:15 CET,Fri Nov 26 18:32:09 CET,0.0 0.853 1.139 1.352 1.543 1.719 1.881 2.018 2.278 2.407 2.533 2.712 2.875 2.978 3.186 3.376 3.544 3.621 3.761 3.895 4.09 4.224 4.355 4.521 4.68 4.835 4.977 5.108 5.277 5.439 5.592 5.781 5.972 6.16 6.374 6.607 6.823 7.06 7.311 7.552 7.796 8.084 8.406 8.717 9.072 9.494 9.923 10.319 10.733 11.061 11.235 11.031 10.524 9.881 9.335 8.822 8.331 7.878 7.428 6.935 6.492 6.085 5.672 5.277 4.923 4.582 4.204 3.862 3.562 3.248 2.927 2.681 2.435 2.162 1.946 1.734 1.508 1.264 1.019 0.844 0.648 0.349 0.14 -0.081 -0.188 -0.404 -0.635 -0.869 -0.997 -1.2 -1.447 -1.601 -1.752 -2.065 -2.243 -2.453 -2.726 -3.052 -3.431 -3.918 -5.576 -10 ,20309 ,KEBNE ,16708339,Fri Nov 26 17:01:15 CET,Fri Nov 26 18:33:06 CET,0.0 0.831 1.149 1.402 1.596 1.776 1.944 2.104 2.375 2.491 2.606 2.773 2.929 3.027 3.235 3.415 3.565 3.639 3.79 3.924 4.106 4.236 4.362 4.53 4.698 4.868 5.045 5.216 5.408 5.582 5.744 5.944 6.141 6.329 6.538 6.75 6.944 7.182 7.463 7.744 8.018 8.324 8.669 8.993 9.363 9.768 10.169 10.581 10.951 11.191 11.142 10.759 10.194 9.597 9.023 8.437 7.863 7.307 6.855 6.402 5.994 5.615 5.262 4.954 4.68 4.424 4.142 3.873 3.617 3.344 3.062 2.837 2.614 2.384 2.198 1.987 1.764 1.538 1.309 1.148 0.982 0.726 0.532 0.309 0.193 -0.023 -0.236 -0.466 -0.592 -0.778 -0.994 -1.158 -1.329 -1.686 -1.872 -2.08 -2.346 -2.662 -3.037 -3.561 -5.232 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_41.txt deleted file mode 100644 index 109c14df..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_7b_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11025 ,KEBNE ,16708340,Fri Nov 26 17:01:16 CET,Fri Nov 26 18:32:00 CET,0.0 1.778 2.241 2.59 2.865 3.098 3.285 3.452 3.759 3.905 4.063 4.301 4.484 4.613 4.851 5.063 5.263 5.359 5.556 5.754 6.038 6.212 6.368 6.593 6.836 7.077 7.294 7.508 7.804 8.088 8.358 8.678 8.975 9.258 9.576 9.922 10.24 10.585 10.997 11.472 11.971 12.528 13.17 13.829 14.588 15.385 16.303 17.376 18.561 19.764 21.199 22.302 22.707 22.815 22.718 22.51 22.324 22.098 21.846 21.548 21.26 20.987 20.733 20.497 20.249 19.991 19.715 19.468 19.239 18.993 18.729 18.514 18.307 18.091 17.909 17.711 17.5 17.274 17.042 16.873 16.682 16.381 16.179 15.966 15.854 15.619 15.382 15.132 14.989 14.813 14.586 14.418 14.231 13.83 13.613 13.357 13.084 12.761 12.333 11.732 9.419 -2 ,19198 ,KEBNE ,16708341,Fri Nov 26 17:01:15 CET,Fri Nov 26 18:31:31 CET,0.0 1.414 1.838 2.123 2.374 2.61 2.817 2.99 3.301 3.452 3.597 3.815 3.999 4.117 4.346 4.575 4.804 4.908 5.101 5.291 5.566 5.743 5.916 6.163 6.398 6.631 6.849 7.059 7.344 7.605 7.854 8.185 8.5 8.802 9.16 9.554 9.931 10.328 10.766 11.237 11.739 12.334 13.033 13.753 14.563 15.391 16.364 17.507 18.76 20.111 21.751 22.75 23.042 23.075 22.987 22.886 22.737 22.499 22.235 21.976 21.735 21.512 21.311 21.104 20.857 20.611 20.355 20.129 19.93 19.71 19.472 19.268 19.071 18.873 18.707 18.514 18.308 18.101 17.866 17.708 17.548 17.29 17.112 16.915 16.813 16.608 16.391 16.165 16.04 15.857 15.592 15.433 15.259 14.848 14.62 14.37 14.098 13.808 13.411 12.825 11.113 -3 ,8901 ,KEBNE ,16708342,Fri Nov 26 17:01:15 CET,Fri Nov 26 18:31:48 CET,0.0 1.07 1.491 1.819 2.071 2.279 2.483 2.674 2.992 3.14 3.288 3.503 3.683 3.808 4.036 4.248 4.462 4.571 4.783 4.979 5.242 5.407 5.563 5.8 6.031 6.26 6.504 6.731 7.002 7.26 7.516 7.84 8.149 8.458 8.823 9.216 9.558 9.95 10.402 10.87 11.327 11.825 12.409 13.009 13.751 14.557 15.482 16.573 17.76 18.892 19.965 20.6 20.764 20.728 20.653 20.503 20.303 20.074 19.801 19.517 19.254 18.966 18.663 18.358 18.079 17.844 17.581 17.32 17.108 16.899 16.667 16.462 16.245 16.013 15.825 15.642 15.468 15.272 15.065 14.919 14.751 14.468 14.255 14.049 13.95 13.743 13.523 13.278 13.148 12.979 12.741 12.581 12.414 12.051 11.842 11.607 11.358 11.038 10.602 10.081 8.482 -4 ,31251 ,KEBNE ,16708343,Fri Nov 26 17:01:19 CET,Fri Nov 26 18:28:53 CET,0.0 1.07 1.517 1.849 2.116 2.324 2.512 2.694 2.999 3.147 3.291 3.494 3.679 3.802 4.064 4.303 4.512 4.617 4.831 5.03 5.294 5.473 5.648 5.893 6.153 6.409 6.636 6.853 7.142 7.437 7.728 8.068 8.385 8.697 9.07 9.479 9.867 10.312 10.773 11.237 11.725 12.302 13.033 13.745 14.482 15.259 16.178 17.226 18.384 19.6 20.906 21.645 21.749 21.684 21.582 21.382 21.123 20.864 20.606 20.317 20.032 19.754 19.472 19.198 18.957 18.743 18.494 18.258 18.07 17.876 17.665 17.48 17.277 17.056 16.887 16.708 16.538 16.344 16.101 15.95 15.811 15.593 15.434 15.255 15.154 14.928 14.699 14.478 14.354 14.174 13.953 13.818 13.654 13.275 13.082 12.87 12.597 12.293 11.939 11.442 9.894 -5 ,30391 ,KEBNE ,16708344,Fri Nov 26 17:01:15 CET,Fri Nov 26 18:31:44 CET,0.0 1.26 1.651 1.933 2.162 2.369 2.582 2.789 3.146 3.306 3.451 3.67 3.862 3.988 4.237 4.48 4.713 4.822 5.011 5.188 5.456 5.639 5.82 6.09 6.338 6.574 6.805 7.007 7.265 7.536 7.809 8.139 8.457 8.761 9.104 9.481 9.864 10.279 10.681 11.114 11.627 12.182 12.745 13.339 14.052 14.863 15.81 16.821 17.91 19.172 20.678 21.711 22.058 22.05 21.817 21.55 21.296 21.053 20.829 20.556 20.311 20.086 19.865 19.629 19.394 19.19 18.955 18.73 18.537 18.328 18.083 17.893 17.705 17.487 17.3 17.087 16.879 16.688 16.484 16.34 16.184 15.932 15.765 15.595 15.51 15.313 15.078 14.844 14.723 14.548 14.313 14.157 13.998 13.668 13.471 13.245 12.997 12.734 12.409 11.975 10.586 -6 ,30326 ,KEBNE ,16708345,Fri Nov 26 17:01:15 CET,Fri Nov 26 18:31:52 CET,0.0 1.069 1.443 1.698 1.932 2.164 2.364 2.533 2.858 3.005 3.14 3.348 3.537 3.662 3.905 4.149 4.389 4.497 4.695 4.878 5.142 5.33 5.519 5.776 6.015 6.251 6.485 6.705 6.983 7.255 7.515 7.815 8.098 8.383 8.731 9.096 9.431 9.809 10.244 10.745 11.252 11.816 12.499 13.181 13.947 14.803 15.802 16.925 18.23 19.718 21.408 22.563 22.793 22.567 22.301 21.993 21.645 21.308 20.988 20.642 20.314 19.995 19.689 19.404 19.148 18.918 18.656 18.412 18.192 17.953 17.729 17.541 17.332 17.116 16.941 16.757 16.554 16.335 16.12 15.981 15.816 15.537 15.344 15.154 15.063 14.853 14.624 14.4 14.276 14.093 13.849 13.695 13.529 13.116 12.884 12.638 12.367 12.033 11.565 11.014 9.447 -7 ,21764 ,KEBNE ,16708346,Fri Nov 26 17:02:16 CET,Fri Nov 26 18:32:15 CET,0.0 1.237 1.646 1.963 2.221 2.444 2.652 2.847 3.18 3.327 3.466 3.669 3.852 3.98 4.221 4.44 4.631 4.731 4.921 5.089 5.342 5.514 5.687 5.944 6.179 6.391 6.604 6.812 7.083 7.35 7.603 7.906 8.199 8.493 8.818 9.157 9.493 9.874 10.317 10.818 11.331 11.884 12.48 13.043 13.721 14.519 15.42 16.354 17.403 18.583 19.801 20.606 20.89 20.886 20.766 20.545 20.31 20.074 19.794 19.496 19.249 18.993 18.708 18.432 18.157 17.894 17.627 17.376 17.163 16.927 16.668 16.452 16.221 15.985 15.793 15.604 15.409 15.202 14.995 14.848 14.693 14.447 14.281 14.087 13.981 13.761 13.506 13.237 13.111 12.94 12.708 12.564 12.4 12.031 11.819 11.582 11.317 11.004 10.628 10.098 6.837 -8 ,16798 ,KEBNE ,16708347,Fri Nov 26 17:02:17 CET,Fri Nov 26 18:34:10 CET,0.0 1.484 1.877 2.177 2.431 2.662 2.886 3.082 3.442 3.594 3.737 3.94 4.116 4.232 4.481 4.72 4.938 5.044 5.264 5.479 5.761 5.944 6.133 6.389 6.628 6.871 7.112 7.339 7.624 7.899 8.186 8.544 8.87 9.172 9.519 9.898 10.245 10.638 11.07 11.519 11.976 12.495 13.16 13.819 14.555 15.408 16.363 17.394 18.584 19.999 21.578 22.607 22.927 22.911 22.737 22.464 22.189 21.936 21.709 21.469 21.21 20.973 20.768 20.556 20.335 20.117 19.871 19.651 19.469 19.275 19.056 18.868 18.674 18.462 18.296 18.114 17.914 17.703 17.485 17.343 17.196 16.954 16.771 16.568 16.46 16.24 16.018 15.762 15.625 15.445 15.202 15.062 14.906 14.523 14.309 14.072 13.782 13.469 13.139 12.69 10.524 -9 ,32608 ,KEBNE ,16708348,Fri Nov 26 17:02:17 CET,Fri Nov 26 18:32:37 CET,0.0 1.098 1.477 1.794 2.059 2.292 2.488 2.651 2.977 3.134 3.273 3.479 3.673 3.792 4.019 4.248 4.475 4.586 4.789 4.975 5.259 5.443 5.616 5.867 6.12 6.364 6.58 6.788 7.065 7.334 7.591 7.896 8.202 8.49 8.838 9.234 9.594 9.994 10.436 10.896 11.346 11.846 12.45 13.075 13.86 14.797 15.777 16.748 17.809 18.88 19.944 20.624 20.812 20.794 20.68 20.49 20.27 19.99 19.728 19.463 19.208 18.961 18.717 18.489 18.254 18.022 17.758 17.52 17.317 17.106 16.887 16.713 16.536 16.328 16.166 15.994 15.81 15.625 15.426 15.274 15.113 14.875 14.702 14.511 14.424 14.24 14.02 13.79 13.662 13.49 13.261 13.102 12.934 12.562 12.341 12.079 11.775 11.424 11.005 10.458 8.282 -10 ,25647 ,KEBNE ,16708349,Fri Nov 26 17:02:17 CET,Fri Nov 26 18:33:09 CET,0.0 1.34 1.712 2.001 2.266 2.495 2.674 2.853 3.196 3.347 3.502 3.75 3.944 4.069 4.312 4.554 4.786 4.897 5.099 5.283 5.557 5.739 5.908 6.139 6.37 6.609 6.851 7.095 7.376 7.627 7.878 8.173 8.456 8.74 9.086 9.478 9.835 10.207 10.634 11.128 11.646 12.203 12.847 13.468 14.214 15.072 15.998 16.986 18.038 19.204 20.615 21.546 21.752 21.691 21.54 21.34 21.118 20.897 20.659 20.357 20.095 19.876 19.642 19.376 19.132 18.906 18.658 18.425 18.219 17.995 17.765 17.589 17.406 17.213 17.047 16.875 16.688 16.492 16.295 16.164 16.008 15.742 15.578 15.413 15.327 15.135 14.919 14.68 14.557 14.394 14.176 14.016 13.843 13.498 13.307 13.104 12.864 12.582 12.253 11.786 10.308 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_84_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_84_41.txt deleted file mode 100644 index aade7f15..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/protein/Summary_FEP_84_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26684 ,KEBNE ,16708350,Fri Nov 26 17:02:16 CET,Fri Nov 26 18:31:45 CET,0.0 1.088 1.516 1.876 2.175 2.437 2.665 2.875 3.272 3.46 3.647 3.917 4.164 4.325 4.635 4.932 5.201 5.331 5.591 5.846 6.222 6.463 6.691 7.027 7.358 7.683 8.006 8.316 8.704 9.057 9.397 9.831 10.263 10.687 11.168 11.689 12.207 12.792 13.438 14.133 14.873 15.741 16.774 17.804 19.013 20.468 22.27 24.337 26.719 29.597 33.263 36.556 38.66 40.084 41.093 41.826 42.346 42.772 43.082 43.301 43.472 43.616 43.723 43.791 43.83 43.855 43.866 43.873 43.876 43.87 43.846 43.821 43.786 43.739 43.705 43.673 43.637 43.59 43.532 43.491 43.438 43.335 43.261 43.193 43.159 43.078 42.988 42.885 42.832 42.735 42.655 42.587 42.511 42.324 42.21 42.082 41.95 41.795 41.601 41.343 40.581 -2 ,7012 ,KEBNE ,16708351,Fri Nov 26 17:02:16 CET,Fri Nov 26 18:31:56 CET,0.0 1.348 1.789 2.129 2.438 2.725 2.962 3.179 3.572 3.765 3.961 4.233 4.463 4.617 4.911 5.174 5.436 5.564 5.798 6.031 6.393 6.628 6.857 7.201 7.515 7.821 8.135 8.429 8.812 9.188 9.542 9.961 10.365 10.782 11.273 11.794 12.29 12.866 13.511 14.188 14.923 15.793 16.825 17.828 18.963 20.292 21.856 23.638 25.864 28.591 31.983 34.928 36.773 38.03 38.931 39.582 40.022 40.355 40.609 40.8 40.928 41.044 41.132 41.187 41.226 41.247 41.257 41.244 41.216 41.197 41.173 41.143 41.115 41.082 41.042 40.987 40.926 40.867 40.804 40.758 40.715 40.645 40.58 40.51 40.474 40.39 40.295 40.196 40.143 40.035 39.943 39.87 39.786 39.593 39.487 39.361 39.205 39.023 38.822 38.545 37.451 -3 ,11567 ,KEBNE ,16708352,Fri Nov 26 17:02:16 CET,Fri Nov 26 18:31:32 CET,0.0 1.153 1.62 1.962 2.277 2.546 2.78 3.006 3.419 3.601 3.783 4.074 4.323 4.475 4.769 5.039 5.312 5.453 5.73 5.998 6.399 6.653 6.886 7.228 7.562 7.881 8.191 8.497 8.899 9.276 9.652 10.129 10.586 11.029 11.543 12.114 12.65 13.241 13.909 14.625 15.362 16.196 17.177 18.158 19.416 20.888 22.52 24.395 26.707 29.716 33.555 36.739 38.75 40.099 41.032 41.747 42.289 42.686 42.95 43.186 43.367 43.478 43.563 43.643 43.697 43.723 43.732 43.72 43.693 43.661 43.62 43.581 43.525 43.465 43.42 43.366 43.309 43.249 43.191 43.146 43.088 42.999 42.932 42.855 42.811 42.724 42.641 42.545 42.493 42.384 42.292 42.198 42.085 41.856 41.748 41.623 41.461 41.267 41.066 40.814 39.978 -4 ,12862 ,KEBNE ,16708353,Fri Nov 26 17:02:16 CET,Fri Nov 26 18:31:44 CET,0.0 1.126 1.543 1.886 2.186 2.456 2.687 2.915 3.346 3.556 3.755 4.022 4.266 4.426 4.73 5.014 5.283 5.418 5.7 5.961 6.317 6.546 6.772 7.107 7.415 7.709 8.009 8.315 8.698 9.062 9.423 9.84 10.254 10.682 11.172 11.722 12.272 12.883 13.526 14.199 14.902 15.711 16.709 17.751 18.946 20.256 21.781 23.527 25.652 28.282 31.599 34.529 36.363 37.667 38.596 39.227 39.667 40.009 40.264 40.475 40.6 40.675 40.757 40.83 40.872 40.893 40.909 40.917 40.913 40.891 40.856 40.828 40.798 40.754 40.712 40.662 40.614 40.561 40.487 40.432 40.369 40.268 40.205 40.137 40.1 40.023 39.933 39.824 39.765 39.663 39.588 39.518 39.433 39.211 39.086 38.943 38.77 38.582 38.368 38.029 36.756 -5 ,22378 ,KEBNE ,16708354,Fri Nov 26 17:02:16 CET,Fri Nov 26 18:31:17 CET,0.0 1.148 1.616 1.978 2.261 2.504 2.732 2.94 3.34 3.541 3.738 4.025 4.272 4.42 4.712 5.009 5.294 5.432 5.71 5.971 6.327 6.562 6.786 7.085 7.371 7.653 7.935 8.225 8.606 8.973 9.333 9.765 10.189 10.626 11.147 11.728 12.296 12.94 13.615 14.315 15.058 15.925 16.999 18.075 19.323 20.667 22.287 24.259 26.555 29.276 32.661 35.678 37.578 38.856 39.779 40.465 40.956 41.342 41.621 41.849 42.018 42.137 42.234 42.315 42.364 42.393 42.416 42.43 42.428 42.407 42.377 42.36 42.331 42.281 42.248 42.212 42.161 42.104 42.04 41.984 41.922 41.822 41.753 41.683 41.645 41.55 41.434 41.305 41.247 41.149 41.06 40.985 40.908 40.72 40.599 40.455 40.309 40.146 39.918 39.614 38.726 -6 ,24542 ,KEBNE ,16708355,Fri Nov 26 17:03:17 CET,Fri Nov 26 18:32:37 CET,0.0 1.19 1.645 1.996 2.309 2.599 2.858 3.09 3.512 3.709 3.89 4.154 4.4 4.56 4.863 5.146 5.418 5.55 5.811 6.065 6.43 6.661 6.89 7.235 7.569 7.9 8.227 8.55 8.958 9.338 9.703 10.162 10.602 11.005 11.472 12.013 12.545 13.143 13.823 14.56 15.354 16.242 17.231 18.266 19.499 20.919 22.701 24.781 27.151 29.924 33.2 36.032 37.772 38.933 39.753 40.345 40.812 41.184 41.456 41.694 41.872 42.001 42.102 42.168 42.221 42.256 42.256 42.252 42.245 42.232 42.207 42.174 42.125 42.065 42.016 41.969 41.927 41.877 41.815 41.769 41.713 41.614 41.542 41.467 41.428 41.347 41.257 41.154 41.085 40.972 40.901 40.823 40.736 40.544 40.436 40.308 40.165 40.018 39.81 39.48 38.482 -7 ,5173 ,KEBNE ,16708356,Fri Nov 26 17:03:17 CET,Fri Nov 26 18:31:57 CET,0.0 1.097 1.511 1.85 2.124 2.368 2.61 2.828 3.227 3.418 3.6 3.851 4.092 4.251 4.545 4.808 5.071 5.195 5.438 5.676 6.016 6.241 6.464 6.78 7.077 7.378 7.676 7.959 8.317 8.663 8.998 9.416 9.828 10.247 10.754 11.304 11.814 12.378 13.014 13.705 14.438 15.261 16.243 17.254 18.389 19.681 21.223 22.966 25.032 27.515 30.683 33.614 35.517 36.83 37.761 38.421 38.855 39.155 39.405 39.659 39.846 39.968 40.053 40.127 40.18 40.219 40.232 40.222 40.21 40.184 40.152 40.129 40.098 40.052 40.017 39.982 39.936 39.872 39.796 39.745 39.696 39.619 39.551 39.479 39.445 39.368 39.271 39.166 39.111 39.007 38.919 38.835 38.741 38.521 38.39 38.24 38.063 37.89 37.674 37.362 36.434 -8 ,10136 ,KEBNE ,16708357,Fri Nov 26 17:03:18 CET,Fri Nov 26 18:32:49 CET,0.0 1.24 1.682 2.009 2.292 2.555 2.792 3.0 3.387 3.564 3.727 3.956 4.182 4.331 4.619 4.907 5.207 5.344 5.594 5.842 6.195 6.422 6.643 6.953 7.243 7.534 7.83 8.123 8.499 8.85 9.197 9.629 10.056 10.461 10.931 11.478 11.992 12.547 13.161 13.851 14.618 15.452 16.369 17.331 18.498 19.82 21.369 23.154 25.275 27.947 31.257 34.094 35.919 37.22 38.112 38.727 39.175 39.508 39.755 39.966 40.122 40.239 40.337 40.421 40.464 40.487 40.506 40.502 40.498 40.494 40.484 40.464 40.441 40.416 40.381 40.336 40.29 40.235 40.173 40.125 40.072 39.988 39.925 39.862 39.829 39.739 39.636 39.519 39.462 39.363 39.272 39.199 39.129 38.956 38.836 38.703 38.573 38.411 38.206 37.899 36.972 -9 ,5549 ,KEBNE ,16708358,Fri Nov 26 17:03:17 CET,Fri Nov 26 18:32:44 CET,0.0 1.883 2.352 2.71 3.004 3.234 3.435 3.642 4.035 4.223 4.404 4.668 4.914 5.066 5.344 5.613 5.88 6.008 6.249 6.482 6.823 7.046 7.268 7.592 7.901 8.204 8.495 8.776 9.139 9.499 9.858 10.299 10.721 11.107 11.569 12.106 12.636 13.235 13.894 14.609 15.335 16.14 17.113 18.103 19.286 20.641 22.206 24.027 26.276 29.059 32.569 35.74 37.749 39.061 39.961 40.585 41.053 41.439 41.712 41.933 42.112 42.248 42.338 42.4 42.445 42.481 42.502 42.511 42.523 42.525 42.512 42.491 42.464 42.434 42.401 42.363 42.33 42.288 42.224 42.171 42.117 42.042 41.986 41.915 41.876 41.78 41.666 41.547 41.488 41.38 41.28 41.193 41.094 40.898 40.785 40.634 40.473 40.302 40.062 39.742 38.94 -10 ,6414 ,KEBNE ,16708359,Fri Nov 26 17:03:17 CET,Fri Nov 26 18:32:15 CET,0.0 1.312 1.758 2.125 2.432 2.695 2.947 3.187 3.609 3.812 4.005 4.278 4.521 4.678 4.98 5.259 5.527 5.649 5.884 6.122 6.473 6.707 6.939 7.276 7.597 7.903 8.2 8.492 8.866 9.229 9.586 10.01 10.421 10.829 11.29 11.808 12.324 12.897 13.51 14.191 14.958 15.846 16.874 17.881 19.095 20.551 22.285 24.243 26.557 29.398 32.861 35.89 37.77 39.054 39.993 40.706 41.234 41.623 41.899 42.117 42.259 42.371 42.45 42.489 42.505 42.506 42.493 42.469 42.436 42.41 42.385 42.347 42.297 42.247 42.207 42.166 42.118 42.065 41.999 41.952 41.91 41.835 41.785 41.723 41.684 41.605 41.524 41.427 41.365 41.258 41.178 41.108 41.027 40.81 40.678 40.528 40.387 40.185 39.927 39.638 38.819 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_124_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_124_41.txt deleted file mode 100644 index 5313a3d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_124_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31133 ,KEBNE ,16708360,Fri Nov 26 17:03:18 CET,Fri Nov 26 18:35:05 CET,0.0 1.632 2.159 2.505 2.776 3.004 3.211 3.391 3.703 3.86 4.002 4.252 4.36 4.464 4.656 4.82 4.973 5.053 5.199 5.328 5.505 5.614 5.722 5.863 5.987 6.112 6.24 6.362 6.503 6.612 6.706 6.832 6.955 7.067 7.181 7.293 7.39 7.485 7.572 7.619 7.659 7.72 7.757 7.76 7.7 7.487 7.101 6.577 5.747 4.309 1.771 -1.412 -4.029 -6.107 -7.85 -9.378 -10.672 -11.801 -12.776 -13.734 -14.514 -15.199 -15.85 -16.453 -16.995 -17.488 -17.979 -18.411 -18.799 -19.203 -19.623 -19.956 -20.285 -20.638 -20.907 -21.187 -21.48 -21.771 -22.066 -22.27 -22.484 -22.818 -23.047 -23.279 -23.398 -23.646 -23.893 -24.141 -24.271 -24.443 -24.707 -24.87 -25.036 -25.389 -25.593 -25.822 -26.071 -26.338 -26.629 -27.07 -28.578 -2 ,8180 ,KEBNE ,16708361,Fri Nov 26 17:03:17 CET,Fri Nov 26 18:34:36 CET,0.0 1.958 2.454 2.816 3.102 3.326 3.527 3.711 4.017 4.155 4.284 4.532 4.638 4.742 4.924 5.089 5.235 5.304 5.455 5.604 5.807 5.93 6.033 6.191 6.344 6.464 6.58 6.693 6.833 6.958 7.066 7.208 7.343 7.442 7.558 7.693 7.797 7.909 8.007 8.051 8.082 8.14 8.143 8.067 7.906 7.581 7.062 6.374 5.354 3.845 1.384 -1.667 -4.15 -6.214 -7.93 -9.45 -10.727 -11.846 -12.799 -13.725 -14.515 -15.182 -15.804 -16.415 -16.97 -17.453 -17.96 -18.406 -18.777 -19.149 -19.539 -19.866 -20.199 -20.539 -20.802 -21.078 -21.355 -21.637 -21.943 -22.157 -22.369 -22.699 -22.933 -23.176 -23.294 -23.525 -23.78 -24.058 -24.196 -24.382 -24.669 -24.831 -24.999 -25.354 -25.543 -25.75 -25.985 -26.261 -26.571 -26.952 -28.705 -3 ,23295 ,KEBNE ,16708362,Fri Nov 26 17:03:17 CET,Fri Nov 26 18:33:28 CET,0.0 1.793 2.244 2.586 2.877 3.119 3.331 3.524 3.851 3.995 4.137 4.407 4.512 4.613 4.817 5.001 5.168 5.249 5.404 5.539 5.731 5.848 5.951 6.105 6.25 6.376 6.501 6.627 6.778 6.904 7.018 7.151 7.27 7.367 7.459 7.564 7.66 7.754 7.841 7.887 7.896 7.895 7.888 7.866 7.742 7.456 7.05 6.442 5.54 4.217 1.782 -1.327 -3.896 -5.993 -7.709 -9.197 -10.463 -11.566 -12.49 -13.407 -14.196 -14.897 -15.559 -16.15 -16.691 -17.179 -17.671 -18.094 -18.47 -18.873 -19.281 -19.614 -19.952 -20.296 -20.56 -20.829 -21.107 -21.399 -21.694 -21.896 -22.112 -22.452 -22.677 -22.904 -23.023 -23.27 -23.532 -23.814 -23.96 -24.14 -24.402 -24.561 -24.726 -25.087 -25.289 -25.518 -25.784 -26.059 -26.392 -26.832 -28.473 -4 ,6207 ,KEBNE ,16708363,Fri Nov 26 17:03:18 CET,Fri Nov 26 18:35:14 CET,0.0 2.129 2.622 2.981 3.288 3.536 3.746 3.935 4.294 4.458 4.603 4.86 4.974 5.084 5.271 5.446 5.606 5.681 5.834 5.982 6.189 6.319 6.425 6.572 6.724 6.854 6.962 7.069 7.199 7.317 7.436 7.583 7.712 7.825 7.959 8.094 8.21 8.308 8.379 8.429 8.478 8.522 8.531 8.49 8.353 8.083 7.702 7.171 6.282 4.846 2.347 -0.676 -3.147 -5.164 -6.847 -8.361 -9.635 -10.732 -11.66 -12.578 -13.368 -14.06 -14.716 -15.328 -15.882 -16.376 -16.877 -17.311 -17.699 -18.108 -18.527 -18.865 -19.211 -19.562 -19.829 -20.107 -20.397 -20.699 -21.0 -21.2 -21.402 -21.713 -21.936 -22.163 -22.279 -22.521 -22.779 -23.074 -23.222 -23.403 -23.674 -23.843 -24.019 -24.38 -24.578 -24.784 -25.024 -25.301 -25.622 -26.106 -27.511 -5 ,21378 ,KEBNE ,16708364,Fri Nov 26 17:03:18 CET,Fri Nov 26 18:34:54 CET,0.0 2.165 2.655 3.02 3.29 3.525 3.746 3.944 4.265 4.406 4.54 4.775 4.869 4.967 5.176 5.38 5.563 5.645 5.797 5.931 6.098 6.211 6.33 6.491 6.63 6.755 6.867 6.971 7.106 7.247 7.373 7.51 7.629 7.73 7.837 7.947 8.057 8.158 8.234 8.301 8.349 8.381 8.383 8.293 8.13 7.926 7.553 6.909 5.902 4.418 1.973 -1.151 -3.716 -5.816 -7.598 -9.128 -10.401 -11.525 -12.484 -13.423 -14.212 -14.901 -15.564 -16.179 -16.735 -17.223 -17.724 -18.174 -18.557 -18.943 -19.335 -19.664 -20.009 -20.366 -20.639 -20.906 -21.175 -21.451 -21.748 -21.956 -22.169 -22.496 -22.724 -22.959 -23.079 -23.327 -23.581 -23.847 -23.987 -24.173 -24.454 -24.621 -24.797 -25.154 -25.356 -25.585 -25.828 -26.1 -26.421 -26.836 -28.638 -6 ,280 ,KEBNE ,16708365,Fri Nov 26 17:03:18 CET,Fri Nov 26 18:33:02 CET,0.0 2.264 2.782 3.122 3.387 3.624 3.836 4.013 4.339 4.491 4.629 4.887 4.998 5.11 5.336 5.541 5.714 5.79 5.933 6.07 6.253 6.359 6.462 6.61 6.747 6.876 6.989 7.088 7.226 7.362 7.488 7.625 7.727 7.822 7.925 8.03 8.123 8.19 8.24 8.281 8.301 8.31 8.308 8.217 8.055 7.828 7.465 6.934 6.057 4.601 2.064 -0.95 -3.396 -5.492 -7.262 -8.794 -10.085 -11.215 -12.196 -13.152 -13.929 -14.607 -15.247 -15.837 -16.379 -16.864 -17.381 -17.84 -18.216 -18.599 -19.002 -19.328 -19.671 -20.022 -20.284 -20.556 -20.843 -21.136 -21.432 -21.642 -21.855 -22.193 -22.426 -22.661 -22.779 -23.009 -23.256 -23.54 -23.691 -23.871 -24.143 -24.308 -24.466 -24.816 -25.007 -25.223 -25.472 -25.759 -26.086 -26.459 -27.947 -7 ,16891 ,KEBNE ,16708366,Fri Nov 26 17:03:17 CET,Fri Nov 26 18:33:19 CET,0.0 1.405 1.92 2.285 2.571 2.832 3.048 3.241 3.599 3.744 3.873 4.126 4.238 4.349 4.555 4.73 4.873 4.949 5.101 5.223 5.388 5.509 5.637 5.804 5.949 6.081 6.202 6.312 6.446 6.57 6.686 6.82 6.953 7.06 7.164 7.289 7.408 7.5 7.563 7.622 7.651 7.662 7.666 7.588 7.417 7.201 6.844 6.252 5.329 3.856 1.375 -1.64 -4.05 -6.056 -7.783 -9.283 -10.562 -11.686 -12.639 -13.58 -14.366 -15.051 -15.692 -16.292 -16.852 -17.354 -17.862 -18.303 -18.69 -19.108 -19.535 -19.873 -20.204 -20.543 -20.813 -21.095 -21.376 -21.672 -21.981 -22.183 -22.388 -22.708 -22.929 -23.154 -23.276 -23.534 -23.792 -24.051 -24.187 -24.366 -24.646 -24.822 -25.005 -25.386 -25.586 -25.797 -26.049 -26.328 -26.645 -27.074 -28.516 -8 ,22731 ,KEBNE ,16708367,Fri Nov 26 17:03:18 CET,Fri Nov 26 18:33:32 CET,0.0 1.678 2.177 2.557 2.852 3.102 3.307 3.484 3.803 3.945 4.086 4.354 4.465 4.57 4.752 4.92 5.074 5.144 5.288 5.429 5.63 5.759 5.88 6.033 6.165 6.305 6.433 6.535 6.667 6.797 6.908 7.04 7.155 7.256 7.361 7.473 7.583 7.693 7.795 7.89 7.96 7.991 7.99 7.939 7.854 7.737 7.475 7.002 6.217 4.811 2.297 -0.765 -3.297 -5.415 -7.168 -8.678 -9.936 -11.001 -11.923 -12.857 -13.634 -14.317 -14.965 -15.567 -16.121 -16.613 -17.113 -17.549 -17.912 -18.289 -18.688 -19.016 -19.358 -19.708 -19.978 -20.256 -20.55 -20.852 -21.152 -21.355 -21.566 -21.903 -22.13 -22.36 -22.482 -22.73 -22.976 -23.238 -23.386 -23.57 -23.828 -23.991 -24.162 -24.53 -24.73 -24.944 -25.177 -25.443 -25.815 -26.261 -27.58 -9 ,5643 ,KEBNE ,16708368,Fri Nov 26 17:03:18 CET,Fri Nov 26 18:33:14 CET,0.0 1.555 2.097 2.487 2.812 3.064 3.28 3.474 3.804 3.942 4.068 4.313 4.415 4.524 4.74 4.927 5.088 5.161 5.311 5.455 5.644 5.763 5.874 6.035 6.181 6.315 6.436 6.555 6.704 6.831 6.938 7.052 7.161 7.263 7.375 7.489 7.59 7.693 7.787 7.871 7.934 7.959 7.923 7.846 7.677 7.386 6.999 6.382 5.289 3.609 0.855 -2.354 -4.857 -6.941 -8.7 -10.203 -11.495 -12.649 -13.607 -14.505 -15.271 -15.97 -16.623 -17.222 -17.767 -18.258 -18.76 -19.214 -19.618 -20.022 -20.425 -20.754 -21.094 -21.448 -21.722 -21.998 -22.271 -22.547 -22.837 -23.04 -23.248 -23.572 -23.796 -24.023 -24.137 -24.373 -24.624 -24.888 -25.026 -25.208 -25.476 -25.635 -25.802 -26.159 -26.348 -26.567 -26.811 -27.07 -27.385 -27.832 -29.403 -10 ,19021 ,KEBNE ,16708369,Fri Nov 26 17:03:18 CET,Fri Nov 26 18:33:17 CET,0.0 1.847 2.288 2.602 2.877 3.11 3.322 3.524 3.869 4.014 4.155 4.401 4.512 4.627 4.842 5.015 5.154 5.22 5.349 5.485 5.68 5.789 5.896 6.057 6.196 6.323 6.448 6.565 6.695 6.819 6.929 7.05 7.179 7.295 7.411 7.527 7.631 7.72 7.789 7.86 7.916 7.962 7.949 7.829 7.683 7.501 7.181 6.651 5.728 4.225 1.798 -1.13 -3.58 -5.624 -7.356 -8.891 -10.19 -11.313 -12.299 -13.277 -14.063 -14.735 -15.373 -15.983 -16.554 -17.072 -17.588 -18.031 -18.419 -18.813 -19.208 -19.529 -19.854 -20.193 -20.464 -20.738 -21.007 -21.289 -21.598 -21.812 -22.022 -22.337 -22.553 -22.783 -22.903 -23.149 -23.41 -23.681 -23.817 -23.989 -24.244 -24.401 -24.576 -24.964 -25.169 -25.383 -25.615 -25.881 -26.216 -26.681 -28.119 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_124_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_124_54.txt deleted file mode 100644 index ff10928b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_124_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20776 ,KEBNE ,16708370,Fri Nov 26 17:03:18 CET,Fri Nov 26 18:34:03 CET,0.0 1.781 2.145 2.357 2.497 2.612 2.72 2.806 2.953 3.005 3.034 3.071 3.071 3.075 3.062 3.022 2.968 2.938 2.866 2.794 2.665 2.552 2.441 2.259 2.061 1.871 1.665 1.439 1.141 0.835 0.504 0.072 -0.378 -0.807 -1.329 -2.013 -2.74 -3.581 -4.521 -5.584 -6.821 -8.317 -10.192 -12.252 -14.836 -17.986 -21.961 -26.933 -33.576 -42.688 -56.062 -69.849 -79.896 -87.696 -93.867 -98.954 -103.128 -106.709 -109.637 -112.439 -114.747 -116.705 -118.497 -120.133 -121.61 -122.929 -124.252 -125.409 -126.385 -127.358 -128.338 -129.122 -129.912 -130.71 -131.321 -131.948 -132.58 -133.213 -133.879 -134.336 -134.79 -135.476 -135.947 -136.43 -136.673 -137.15 -137.623 -138.136 -138.405 -138.831 -139.23 -139.517 -139.805 -140.408 -140.723 -141.062 -141.439 -141.835 -142.26 -142.764 -143.916 -2 ,19956 ,KEBNE ,16708371,Fri Nov 26 17:03:18 CET,Fri Nov 26 18:33:51 CET,0.0 1.511 1.987 2.32 2.525 2.646 2.759 2.866 3.008 3.032 3.054 3.088 3.086 3.094 3.101 3.063 3.007 2.974 2.908 2.841 2.702 2.601 2.482 2.282 2.087 1.893 1.691 1.45 1.112 0.787 0.459 0.037 -0.419 -0.906 -1.488 -2.165 -2.888 -3.755 -4.741 -5.848 -7.063 -8.527 -10.404 -12.45 -15.052 -18.186 -22.148 -27.197 -33.869 -42.961 -56.201 -69.987 -80.042 -87.79 -94.017 -99.179 -103.386 -106.997 -109.915 -112.678 -114.979 -116.961 -118.792 -120.443 -121.918 -123.234 -124.568 -125.725 -126.701 -127.667 -128.639 -129.437 -130.232 -131.047 -131.67 -132.286 -132.912 -133.559 -134.215 -134.657 -135.112 -135.8 -136.266 -136.743 -136.977 -137.441 -137.93 -138.43 -138.684 -139.101 -139.486 -139.772 -140.067 -140.657 -140.967 -141.3 -141.65 -142.032 -142.487 -143.043 -144.295 -3 ,15737 ,KEBNE ,16708372,Fri Nov 26 17:04:19 CET,Fri Nov 26 18:36:19 CET,0.0 1.507 1.931 2.241 2.457 2.601 2.706 2.817 2.967 3.004 3.039 3.073 3.068 3.071 3.073 3.04 2.993 2.965 2.89 2.803 2.667 2.573 2.467 2.296 2.111 1.915 1.699 1.466 1.153 0.832 0.494 0.061 -0.389 -0.867 -1.45 -2.136 -2.845 -3.671 -4.631 -5.727 -6.952 -8.443 -10.319 -12.38 -15.011 -18.163 -22.118 -27.138 -33.811 -42.916 -56.233 -70.013 -80.116 -87.978 -94.175 -99.267 -103.418 -106.963 -109.867 -112.639 -114.958 -116.922 -118.728 -120.382 -121.858 -123.164 -124.482 -125.644 -126.624 -127.615 -128.628 -129.444 -130.266 -131.08 -131.692 -132.324 -132.962 -133.601 -134.254 -134.699 -135.148 -135.829 -136.286 -136.756 -136.996 -137.477 -137.954 -138.445 -138.707 -139.133 -139.543 -139.835 -140.126 -140.716 -141.034 -141.364 -141.703 -142.085 -142.531 -143.101 -144.413 -4 ,10310 ,KEBNE ,16708373,Fri Nov 26 17:04:19 CET,Fri Nov 26 18:34:43 CET,0.0 1.531 1.964 2.237 2.418 2.53 2.619 2.697 2.794 2.814 2.825 2.865 2.876 2.875 2.855 2.84 2.813 2.79 2.731 2.65 2.49 2.38 2.262 2.064 1.856 1.648 1.432 1.19 0.872 0.564 0.242 -0.188 -0.636 -1.106 -1.694 -2.388 -3.093 -3.924 -4.891 -5.986 -7.241 -8.758 -10.635 -12.648 -15.209 -18.333 -22.3 -27.331 -33.984 -43.067 -56.34 -70.053 -80.04 -87.818 -93.999 -99.129 -103.317 -106.913 -109.894 -112.724 -115.041 -117.02 -118.838 -120.491 -121.994 -123.312 -124.633 -125.773 -126.717 -127.69 -128.681 -129.475 -130.272 -131.081 -131.698 -132.319 -132.968 -133.638 -134.302 -134.738 -135.187 -135.881 -136.344 -136.822 -137.063 -137.552 -138.067 -138.594 -138.858 -139.277 -139.65 -139.92 -140.205 -140.802 -141.122 -141.458 -141.823 -142.215 -142.644 -143.186 -144.371 -5 ,3747 ,KEBNE ,16708374,Fri Nov 26 17:04:19 CET,Fri Nov 26 18:36:54 CET,0.0 2.229 2.719 3.025 3.252 3.446 3.595 3.702 3.852 3.9 3.943 3.996 4.0 4.008 4.012 3.986 3.947 3.921 3.854 3.784 3.656 3.557 3.45 3.274 3.074 2.868 2.654 2.417 2.095 1.769 1.426 0.984 0.52 0.036 -0.542 -1.228 -1.934 -2.764 -3.723 -4.812 -6.051 -7.543 -9.41 -11.445 -14.046 -17.221 -21.208 -26.243 -32.887 -41.914 -55.099 -68.782 -78.881 -86.764 -92.986 -98.079 -102.254 -105.844 -108.78 -111.588 -113.902 -115.864 -117.674 -119.346 -120.861 -122.194 -123.511 -124.634 -125.597 -126.582 -127.562 -128.357 -129.17 -129.975 -130.584 -131.207 -131.842 -132.483 -133.124 -133.555 -133.997 -134.672 -135.136 -135.613 -135.855 -136.345 -136.834 -137.327 -137.576 -137.991 -138.383 -138.663 -138.948 -139.517 -139.823 -140.159 -140.504 -140.898 -141.355 -141.907 -142.991 -6 ,6506 ,KEBNE ,16708375,Fri Nov 26 17:04:19 CET,Fri Nov 26 18:34:49 CET,0.0 1.362 1.812 2.082 2.261 2.423 2.57 2.69 2.826 2.862 2.895 2.933 2.937 2.94 2.921 2.89 2.85 2.828 2.76 2.665 2.532 2.441 2.341 2.202 2.035 1.852 1.648 1.432 1.151 0.826 0.485 0.047 -0.414 -0.872 -1.42 -2.09 -2.786 -3.604 -4.546 -5.632 -6.89 -8.424 -10.319 -12.36 -14.95 -18.107 -22.1 -27.103 -33.748 -42.828 -56.131 -70.03 -80.155 -87.984 -94.201 -99.32 -103.495 -107.076 -110.032 -112.844 -115.17 -117.15 -118.95 -120.595 -122.074 -123.385 -124.738 -125.917 -126.901 -127.885 -128.884 -129.69 -130.491 -131.309 -131.932 -132.557 -133.198 -133.855 -134.511 -134.953 -135.403 -136.085 -136.555 -137.031 -137.271 -137.769 -138.281 -138.787 -139.04 -139.455 -139.837 -140.114 -140.396 -140.995 -141.318 -141.668 -142.029 -142.409 -142.843 -143.377 -144.916 -7 ,24286 ,KEBNE ,16708376,Fri Nov 26 17:04:23 CET,Fri Nov 26 18:32:49 CET,0.0 1.641 2.076 2.306 2.482 2.656 2.803 2.938 3.116 3.162 3.195 3.247 3.243 3.246 3.262 3.245 3.189 3.16 3.117 3.053 2.929 2.841 2.732 2.561 2.372 2.16 1.946 1.721 1.405 1.094 0.765 0.3 -0.176 -0.636 -1.207 -1.901 -2.614 -3.457 -4.413 -5.477 -6.689 -8.159 -9.955 -11.911 -14.415 -17.552 -21.563 -26.561 -33.2 -42.285 -55.569 -69.308 -79.304 -87.085 -93.323 -98.45 -102.586 -106.14 -109.076 -111.88 -114.175 -116.135 -117.959 -119.607 -121.083 -122.387 -123.694 -124.834 -125.794 -126.774 -127.778 -128.59 -129.402 -130.228 -130.868 -131.512 -132.157 -132.798 -133.449 -133.893 -134.347 -135.04 -135.494 -135.955 -136.189 -136.657 -137.146 -137.665 -137.928 -138.345 -138.745 -139.028 -139.318 -139.923 -140.234 -140.564 -140.932 -141.336 -141.777 -142.287 -143.675 -8 ,4084 ,KEBNE ,16708377,Fri Nov 26 17:04:19 CET,Fri Nov 26 18:36:15 CET,0.0 2.037 2.433 2.698 2.876 3.02 3.122 3.187 3.331 3.383 3.407 3.425 3.417 3.397 3.36 3.317 3.249 3.212 3.156 3.098 2.983 2.888 2.786 2.624 2.431 2.221 2.018 1.8 1.48 1.155 0.828 0.412 -0.044 -0.532 -1.125 -1.833 -2.562 -3.404 -4.371 -5.479 -6.71 -8.17 -10.023 -12.054 -14.617 -17.717 -21.647 -26.617 -33.217 -42.282 -55.55 -69.315 -79.35 -87.159 -93.426 -98.593 -102.786 -106.35 -109.27 -112.073 -114.393 -116.367 -118.185 -119.849 -121.355 -122.679 -123.997 -125.136 -126.104 -127.094 -128.086 -128.875 -129.67 -130.47 -131.079 -131.709 -132.344 -132.994 -133.658 -134.101 -134.55 -135.227 -135.677 -136.141 -136.383 -136.872 -137.37 -137.872 -138.128 -138.544 -138.913 -139.192 -139.494 -140.12 -140.451 -140.798 -141.175 -141.555 -141.964 -142.514 -143.668 -9 ,10209 ,KEBNE ,16708378,Fri Nov 26 17:04:19 CET,Fri Nov 26 18:36:00 CET,0.0 1.641 2.118 2.403 2.591 2.746 2.872 2.964 3.087 3.139 3.19 3.249 3.26 3.269 3.262 3.232 3.183 3.149 3.085 3.007 2.841 2.736 2.64 2.448 2.238 2.034 1.816 1.597 1.283 0.929 0.56 0.11 -0.339 -0.791 -1.354 -2.048 -2.764 -3.606 -4.591 -5.699 -6.926 -8.414 -10.24 -12.234 -14.822 -17.978 -21.976 -26.966 -33.57 -42.627 -55.94 -69.871 -80.046 -87.831 -93.971 -99.119 -103.365 -106.969 -109.88 -112.655 -114.95 -116.901 -118.696 -120.333 -121.799 -123.096 -124.427 -125.574 -126.542 -127.538 -128.531 -129.325 -130.127 -130.941 -131.56 -132.179 -132.803 -133.452 -134.117 -134.558 -135.003 -135.69 -136.157 -136.617 -136.847 -137.323 -137.82 -138.337 -138.607 -139.033 -139.421 -139.698 -139.984 -140.589 -140.902 -141.233 -141.576 -141.944 -142.377 -142.932 -144.103 -10 ,4458 ,KEBNE ,16708379,Fri Nov 26 17:04:20 CET,Fri Nov 26 18:35:05 CET,0.0 1.681 2.067 2.301 2.468 2.587 2.666 2.762 2.963 3.018 3.048 3.083 3.084 3.09 3.082 3.038 3.003 2.985 2.92 2.834 2.697 2.605 2.508 2.345 2.16 1.958 1.737 1.498 1.162 0.815 0.48 0.091 -0.294 -0.719 -1.291 -1.975 -2.677 -3.515 -4.487 -5.62 -6.86 -8.329 -10.206 -12.258 -14.842 -17.964 -21.961 -26.989 -33.616 -42.642 -55.832 -69.643 -79.708 -87.483 -93.702 -98.901 -103.16 -106.778 -109.745 -112.55 -114.814 -116.765 -118.595 -120.244 -121.715 -123.032 -124.359 -125.493 -126.448 -127.426 -128.428 -129.246 -130.062 -130.882 -131.497 -132.107 -132.731 -133.369 -134.018 -134.455 -134.905 -135.605 -136.079 -136.547 -136.781 -137.268 -137.769 -138.294 -138.566 -138.996 -139.385 -139.665 -139.959 -140.58 -140.894 -141.23 -141.583 -141.971 -142.417 -142.945 -143.967 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_1.txt deleted file mode 100644 index a3996205..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8367 ,KEBNE ,16708380,Fri Nov 26 17:04:19 CET,Fri Nov 26 18:36:14 CET,0.0 1.231 1.613 1.885 2.116 2.318 2.49 2.665 3.001 3.147 3.281 3.476 3.621 3.727 3.911 4.072 4.24 4.323 4.465 4.587 4.782 4.907 5.025 5.19 5.344 5.498 5.631 5.744 5.915 6.076 6.234 6.436 6.604 6.767 6.954 7.143 7.322 7.561 7.8 8.005 8.189 8.341 8.518 8.701 8.866 9.003 9.087 9.089 8.999 8.746 8.057 6.988 6.021 5.16 4.422 3.747 3.16 2.613 2.12 1.643 1.226 0.802 0.384 0.018 -0.313 -0.614 -0.914 -1.196 -1.461 -1.718 -1.973 -2.193 -2.42 -2.666 -2.877 -3.092 -3.297 -3.511 -3.737 -3.887 -4.048 -4.297 -4.469 -4.647 -4.738 -4.935 -5.145 -5.373 -5.498 -5.67 -5.887 -6.033 -6.182 -6.514 -6.701 -6.921 -7.151 -7.401 -7.719 -8.163 -9.929 -2 ,2949 ,KEBNE ,16708381,Fri Nov 26 17:04:19 CET,Fri Nov 26 18:37:23 CET,0.0 1.309 1.711 2.012 2.26 2.474 2.657 2.821 3.136 3.276 3.392 3.557 3.706 3.809 3.998 4.174 4.354 4.438 4.593 4.741 4.926 5.034 5.147 5.32 5.489 5.654 5.815 5.951 6.12 6.293 6.457 6.63 6.785 6.923 7.083 7.289 7.482 7.652 7.853 8.061 8.228 8.43 8.623 8.769 8.95 9.111 9.215 9.265 9.222 9.001 8.375 7.391 6.479 5.662 4.924 4.246 3.638 3.084 2.618 2.153 1.707 1.276 0.885 0.533 0.216 -0.098 -0.43 -0.72 -0.967 -1.219 -1.492 -1.742 -1.99 -2.228 -2.426 -2.639 -2.862 -3.07 -3.293 -3.454 -3.609 -3.841 -3.995 -4.163 -4.258 -4.465 -4.688 -4.914 -5.031 -5.199 -5.414 -5.556 -5.72 -6.097 -6.289 -6.496 -6.74 -7.019 -7.325 -7.721 -9.18 -3 ,4468 ,KEBNE ,16708382,Fri Nov 26 17:04:19 CET,Fri Nov 26 18:36:30 CET,0.0 1.484 1.91 2.236 2.483 2.67 2.833 2.978 3.259 3.386 3.507 3.687 3.824 3.917 4.112 4.303 4.465 4.545 4.703 4.847 5.069 5.215 5.34 5.5 5.641 5.786 5.935 6.08 6.259 6.437 6.604 6.772 6.926 7.07 7.244 7.441 7.607 7.782 7.975 8.147 8.34 8.531 8.668 8.806 8.994 9.214 9.383 9.467 9.439 9.171 8.461 7.416 6.435 5.542 4.761 4.073 3.485 2.936 2.454 1.964 1.487 1.047 0.64 0.236 -0.114 -0.404 -0.719 -1.016 -1.269 -1.525 -1.794 -2.018 -2.253 -2.499 -2.681 -2.87 -3.067 -3.258 -3.488 -3.662 -3.823 -4.081 -4.269 -4.443 -4.534 -4.748 -4.981 -5.228 -5.347 -5.505 -5.689 -5.818 -5.968 -6.327 -6.521 -6.725 -6.957 -7.212 -7.545 -7.996 -9.296 -4 ,23023 ,KEBNE ,16708383,Fri Nov 26 17:04:19 CET,Fri Nov 26 18:36:29 CET,0.0 0.894 1.262 1.546 1.77 1.943 2.113 2.272 2.532 2.665 2.791 2.969 3.115 3.228 3.434 3.616 3.793 3.872 4.022 4.173 4.379 4.506 4.625 4.787 4.956 5.121 5.273 5.412 5.585 5.761 5.912 6.095 6.293 6.457 6.624 6.82 7.0 7.183 7.36 7.54 7.704 7.867 8.046 8.185 8.312 8.469 8.62 8.656 8.564 8.289 7.56 6.469 5.511 4.654 3.88 3.171 2.528 1.94 1.446 0.926 0.49 0.093 -0.323 -0.682 -0.983 -1.268 -1.565 -1.831 -2.1 -2.378 -2.663 -2.918 -3.18 -3.459 -3.661 -3.863 -4.065 -4.264 -4.504 -4.673 -4.828 -5.066 -5.251 -5.451 -5.548 -5.751 -5.968 -6.179 -6.29 -6.464 -6.701 -6.85 -6.997 -7.273 -7.421 -7.605 -7.825 -8.082 -8.382 -8.763 -9.893 -5 ,25742 ,KEBNE ,16708384,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:39:12 CET,0.0 1.601 1.99 2.253 2.461 2.67 2.878 3.061 3.353 3.484 3.613 3.797 3.942 4.038 4.222 4.404 4.57 4.646 4.784 4.918 5.135 5.268 5.396 5.567 5.693 5.815 5.95 6.087 6.251 6.406 6.563 6.762 6.935 7.108 7.316 7.505 7.69 7.868 8.025 8.212 8.411 8.612 8.817 9.024 9.241 9.397 9.501 9.562 9.561 9.379 8.739 7.687 6.705 5.85 5.065 4.344 3.735 3.174 2.692 2.216 1.805 1.44 1.102 0.769 0.446 0.152 -0.154 -0.423 -0.652 -0.899 -1.16 -1.388 -1.628 -1.862 -2.046 -2.24 -2.447 -2.654 -2.86 -3.013 -3.187 -3.466 -3.657 -3.854 -3.95 -4.142 -4.353 -4.594 -4.722 -4.901 -5.123 -5.26 -5.4 -5.709 -5.89 -6.088 -6.297 -6.525 -6.797 -7.173 -8.69 -6 ,21203 ,KEBNE ,16708385,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:37:20 CET,0.0 1.253 1.639 1.941 2.156 2.357 2.551 2.725 3.017 3.138 3.244 3.411 3.559 3.666 3.86 4.026 4.163 4.232 4.377 4.516 4.724 4.858 4.986 5.164 5.332 5.496 5.646 5.789 5.972 6.152 6.338 6.54 6.702 6.843 7.026 7.227 7.407 7.606 7.793 7.955 8.122 8.322 8.516 8.673 8.868 9.071 9.222 9.35 9.382 9.141 8.449 7.371 6.385 5.52 4.76 4.077 3.499 2.951 2.464 1.99 1.577 1.194 0.816 0.454 0.123 -0.169 -0.496 -0.787 -1.051 -1.316 -1.597 -1.863 -2.127 -2.383 -2.568 -2.749 -2.932 -3.13 -3.353 -3.515 -3.682 -3.941 -4.127 -4.314 -4.418 -4.636 -4.852 -5.092 -5.212 -5.384 -5.617 -5.763 -5.914 -6.213 -6.382 -6.578 -6.79 -7.056 -7.401 -7.883 -9.46 -7 ,32355 ,KEBNE ,16708386,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:37:09 CET,0.0 0.997 1.342 1.613 1.858 2.049 2.216 2.387 2.677 2.805 2.928 3.109 3.258 3.363 3.55 3.725 3.896 3.976 4.125 4.278 4.493 4.619 4.748 4.943 5.114 5.265 5.412 5.537 5.706 5.903 6.068 6.243 6.421 6.58 6.768 6.982 7.177 7.383 7.577 7.735 7.89 8.056 8.228 8.4 8.564 8.683 8.766 8.802 8.754 8.485 7.762 6.758 5.836 4.944 4.137 3.428 2.8 2.236 1.745 1.247 0.837 0.476 0.12 -0.223 -0.544 -0.832 -1.123 -1.401 -1.676 -1.95 -2.241 -2.479 -2.705 -2.964 -3.175 -3.378 -3.567 -3.761 -3.987 -4.161 -4.334 -4.595 -4.775 -4.948 -5.03 -5.21 -5.419 -5.635 -5.752 -5.932 -6.17 -6.314 -6.467 -6.795 -6.969 -7.164 -7.391 -7.64 -7.925 -8.354 -9.695 -8 ,24761 ,KEBNE ,16708387,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:39:36 CET,0.0 1.742 2.122 2.383 2.605 2.81 2.999 3.18 3.493 3.625 3.75 3.945 4.092 4.192 4.389 4.566 4.732 4.814 4.958 5.081 5.255 5.36 5.465 5.633 5.788 5.929 6.061 6.186 6.351 6.514 6.664 6.824 6.97 7.127 7.333 7.532 7.694 7.887 8.079 8.272 8.478 8.666 8.846 9.013 9.195 9.385 9.528 9.558 9.486 9.262 8.661 7.673 6.741 5.892 5.161 4.475 3.865 3.325 2.84 2.372 1.962 1.578 1.199 0.835 0.501 0.183 -0.148 -0.442 -0.697 -0.961 -1.258 -1.496 -1.721 -1.966 -2.156 -2.352 -2.57 -2.801 -3.05 -3.215 -3.369 -3.615 -3.801 -4.002 -4.099 -4.288 -4.488 -4.707 -4.82 -4.98 -5.194 -5.332 -5.473 -5.774 -5.934 -6.127 -6.365 -6.617 -6.955 -7.415 -9.09 -9 ,10614 ,KEBNE ,16708388,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:39:39 CET,0.0 1.293 1.725 2.039 2.278 2.455 2.617 2.778 3.078 3.206 3.321 3.507 3.651 3.75 3.936 4.108 4.265 4.331 4.469 4.615 4.806 4.923 5.039 5.214 5.364 5.512 5.664 5.789 5.947 6.108 6.268 6.45 6.633 6.824 7.013 7.205 7.377 7.546 7.718 7.896 8.074 8.261 8.445 8.613 8.813 8.971 9.082 9.163 9.178 9.002 8.394 7.447 6.53 5.689 4.934 4.247 3.648 3.088 2.594 2.109 1.668 1.27 0.906 0.557 0.217 -0.095 -0.412 -0.688 -0.946 -1.216 -1.483 -1.738 -1.994 -2.233 -2.436 -2.639 -2.832 -3.041 -3.265 -3.422 -3.598 -3.856 -4.035 -4.227 -4.324 -4.542 -4.772 -4.99 -5.102 -5.274 -5.485 -5.615 -5.75 -6.064 -6.25 -6.454 -6.691 -6.968 -7.268 -7.726 -8.999 -10 ,27219 ,KEBNE ,16708389,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:37:28 CET,0.0 1.528 1.973 2.31 2.575 2.788 2.973 3.145 3.446 3.586 3.717 3.88 4.02 4.125 4.313 4.481 4.641 4.723 4.878 5.022 5.22 5.329 5.441 5.603 5.751 5.905 6.035 6.166 6.344 6.505 6.66 6.83 6.999 7.176 7.403 7.641 7.81 7.974 8.138 8.331 8.552 8.812 9.072 9.253 9.437 9.607 9.727 9.767 9.743 9.544 8.967 7.978 7.043 6.239 5.508 4.816 4.205 3.667 3.2 2.72 2.302 1.919 1.541 1.193 0.863 0.547 0.221 -0.066 -0.317 -0.601 -0.919 -1.158 -1.39 -1.625 -1.8 -2.003 -2.215 -2.415 -2.653 -2.825 -2.988 -3.266 -3.458 -3.652 -3.761 -3.984 -4.204 -4.418 -4.536 -4.716 -4.962 -5.127 -5.296 -5.631 -5.809 -6.013 -6.251 -6.526 -6.844 -7.265 -8.793 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_156.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_156.txt deleted file mode 100644 index 93b989fe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_156.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21618 ,KEBNE ,16708390,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:37:30 CET,0.0 0.936 1.303 1.574 1.816 2.048 2.253 2.443 2.79 2.946 3.097 3.362 3.538 3.661 3.902 4.131 4.347 4.451 4.638 4.825 5.11 5.295 5.48 5.737 5.963 6.176 6.409 6.653 6.947 7.231 7.504 7.837 8.143 8.44 8.81 9.2 9.564 9.96 10.381 10.846 11.35 11.89 12.505 13.137 13.895 14.754 15.754 16.897 18.214 19.79 21.758 23.342 24.23 24.796 25.14 25.356 25.46 25.497 25.492 25.448 25.381 25.271 25.159 25.076 24.962 24.84 24.725 24.625 24.539 24.426 24.313 24.21 24.064 23.926 23.84 23.726 23.598 23.479 23.345 23.234 23.119 22.961 22.836 22.688 22.615 22.474 22.326 22.147 22.05 21.941 21.749 21.63 21.499 21.195 21.023 20.837 20.623 20.344 20.002 19.613 18.395 -2 ,31391 ,KEBNE ,16708391,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:38:44 CET,0.0 1.105 1.54 1.867 2.132 2.355 2.554 2.736 3.089 3.246 3.388 3.613 3.79 3.917 4.139 4.35 4.56 4.666 4.869 5.066 5.353 5.535 5.702 5.941 6.201 6.444 6.658 6.869 7.161 7.456 7.736 8.076 8.405 8.699 9.019 9.368 9.716 10.116 10.525 10.96 11.435 11.98 12.625 13.252 13.998 14.84 15.816 16.952 18.275 19.867 21.846 23.401 24.311 24.911 25.279 25.428 25.466 25.504 25.508 25.46 25.348 25.231 25.143 25.071 25.01 24.932 24.812 24.695 24.595 24.493 24.366 24.241 24.115 23.978 23.867 23.744 23.62 23.503 23.388 23.3 23.197 23.04 22.923 22.789 22.729 22.615 22.473 22.32 22.245 22.145 21.959 21.835 21.705 21.437 21.278 21.106 20.897 20.66 20.374 19.948 18.386 -3 ,16276 ,KEBNE ,16708392,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:37:16 CET,0.0 1.186 1.509 1.765 1.987 2.218 2.431 2.608 2.914 3.055 3.198 3.426 3.586 3.708 3.951 4.183 4.409 4.517 4.72 4.902 5.146 5.314 5.489 5.735 5.964 6.186 6.406 6.634 6.929 7.2 7.459 7.772 8.062 8.354 8.709 9.076 9.414 9.803 10.229 10.678 11.153 11.693 12.339 12.993 13.742 14.581 15.563 16.69 18.051 19.71 21.693 23.283 24.22 24.8 25.172 25.398 25.491 25.534 25.548 25.521 25.437 25.361 25.309 25.232 25.111 24.965 24.844 24.729 24.61 24.486 24.35 24.233 24.119 24.006 23.906 23.796 23.673 23.53 23.381 23.287 23.189 23.018 22.908 22.807 22.747 22.617 22.476 22.302 22.197 22.072 21.887 21.789 21.68 21.436 21.311 21.149 20.972 20.78 20.533 20.228 19.384 -4 ,13078 ,KEBNE ,16708393,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:37:25 CET,0.0 0.9 1.29 1.575 1.813 2.029 2.22 2.401 2.758 2.927 3.087 3.34 3.512 3.644 3.896 4.121 4.329 4.432 4.628 4.799 5.062 5.253 5.443 5.699 5.924 6.125 6.333 6.545 6.817 7.105 7.374 7.672 7.947 8.224 8.562 8.943 9.314 9.72 10.171 10.681 11.198 11.746 12.38 13.01 13.749 14.593 15.613 16.759 18.104 19.701 21.633 23.253 24.161 24.735 25.081 25.275 25.381 25.427 25.433 25.413 25.358 25.281 25.2 25.13 25.063 24.988 24.903 24.796 24.693 24.588 24.449 24.334 24.208 24.062 23.942 23.814 23.702 23.596 23.476 23.381 23.278 23.126 23.015 22.897 22.839 22.697 22.529 22.361 22.264 22.143 21.961 21.846 21.715 21.426 21.267 21.106 20.903 20.665 20.4 20.004 18.631 -5 ,7862 ,KEBNE ,16708394,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:37:30 CET,0.0 0.836 1.178 1.454 1.684 1.88 2.07 2.253 2.596 2.747 2.886 3.116 3.281 3.409 3.671 3.899 4.113 4.229 4.459 4.664 4.932 5.101 5.266 5.509 5.762 6.019 6.257 6.467 6.751 7.025 7.261 7.579 7.911 8.205 8.541 8.945 9.329 9.721 10.109 10.539 11.003 11.531 12.182 12.872 13.662 14.508 15.503 16.649 17.992 19.589 21.579 23.235 24.166 24.709 25.048 25.265 25.351 25.375 25.368 25.333 25.257 25.185 25.143 25.055 24.929 24.817 24.672 24.538 24.445 24.348 24.245 24.152 24.048 23.912 23.798 23.69 23.585 23.46 23.31 23.2 23.083 22.911 22.788 22.65 22.581 22.437 22.279 22.119 22.035 21.923 21.718 21.59 21.458 21.17 21.012 20.838 20.638 20.414 20.114 19.698 18.243 -6 ,21249 ,KEBNE ,16708395,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:37:48 CET,0.0 1.333 1.712 1.981 2.193 2.395 2.598 2.788 3.142 3.312 3.473 3.737 3.911 4.034 4.278 4.511 4.731 4.836 5.04 5.222 5.487 5.666 5.848 6.105 6.343 6.561 6.782 7.017 7.318 7.595 7.857 8.169 8.466 8.758 9.084 9.458 9.838 10.253 10.699 11.187 11.684 12.221 12.865 13.503 14.236 15.076 16.102 17.323 18.728 20.35 22.325 23.98 24.951 25.528 25.888 26.113 26.246 26.325 26.35 26.337 26.302 26.262 26.193 26.115 26.038 25.948 25.855 25.744 25.641 25.532 25.4 25.297 25.19 25.057 24.942 24.833 24.715 24.595 24.474 24.382 24.28 24.109 23.993 23.883 23.824 23.666 23.476 23.271 23.172 23.053 22.838 22.732 22.634 22.388 22.231 22.058 21.885 21.693 21.412 20.967 19.637 -7 ,4889 ,KEBNE ,16708396,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:38:35 CET,0.0 1.177 1.584 1.862 2.1 2.315 2.501 2.674 3.004 3.17 3.327 3.544 3.702 3.817 4.038 4.233 4.427 4.534 4.737 4.916 5.158 5.32 5.481 5.726 5.971 6.193 6.399 6.592 6.851 7.103 7.349 7.655 7.957 8.254 8.597 8.981 9.355 9.76 10.193 10.696 11.278 11.897 12.539 13.197 13.973 14.817 15.786 16.912 18.266 19.904 21.888 23.475 24.406 24.986 25.337 25.547 25.665 25.737 25.769 25.727 25.614 25.53 25.449 25.349 25.272 25.189 25.086 24.972 24.845 24.733 24.639 24.551 24.452 24.322 24.203 24.086 23.968 23.83 23.677 23.571 23.457 23.26 23.13 23.01 22.943 22.79 22.629 22.473 22.386 22.266 22.075 21.967 21.853 21.586 21.425 21.253 21.064 20.849 20.593 20.213 19.203 -8 ,7844 ,KEBNE ,16708397,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:37:26 CET,0.0 0.975 1.38 1.672 1.922 2.163 2.383 2.577 2.916 3.074 3.228 3.475 3.645 3.769 3.98 4.175 4.379 4.48 4.675 4.863 5.123 5.285 5.451 5.7 5.937 6.178 6.406 6.613 6.889 7.155 7.411 7.725 8.056 8.393 8.739 9.106 9.459 9.831 10.257 10.74 11.225 11.797 12.47 13.11 13.868 14.752 15.772 16.95 18.36 20.0 21.982 23.604 24.526 25.107 25.464 25.656 25.779 25.808 25.758 25.733 25.677 25.58 25.471 25.366 25.274 25.182 25.053 24.924 24.817 24.715 24.616 24.515 24.386 24.244 24.137 24.022 23.89 23.765 23.624 23.504 23.398 23.25 23.146 23.035 22.97 22.826 22.649 22.462 22.376 22.265 22.082 21.973 21.859 21.589 21.433 21.273 21.087 20.87 20.651 20.319 19.274 -9 ,15791 ,KEBNE ,16708398,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:37:26 CET,0.0 1.405 1.828 2.128 2.385 2.631 2.856 3.055 3.39 3.541 3.696 3.952 4.123 4.255 4.517 4.738 4.961 5.076 5.284 5.496 5.808 5.989 6.156 6.398 6.652 6.914 7.159 7.383 7.681 7.978 8.265 8.605 8.929 9.217 9.529 9.885 10.261 10.684 11.12 11.586 12.053 12.586 13.243 13.928 14.705 15.549 16.536 17.665 19.04 20.684 22.675 24.307 25.23 25.785 26.146 26.373 26.483 26.522 26.477 26.382 26.335 26.244 26.14 26.051 25.927 25.805 25.689 25.604 25.518 25.403 25.295 25.209 25.111 24.97 24.852 24.749 24.637 24.531 24.402 24.304 24.217 24.069 23.945 23.811 23.74 23.591 23.429 23.248 23.147 23.029 22.853 22.751 22.641 22.38 22.231 22.073 21.904 21.702 21.415 21.026 19.777 -10 ,7930 ,KEBNE ,16708399,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:37:28 CET,0.0 1.511 1.926 2.207 2.442 2.634 2.811 2.989 3.321 3.486 3.651 3.907 4.078 4.2 4.436 4.661 4.885 4.995 5.192 5.379 5.669 5.861 6.032 6.265 6.506 6.738 6.961 7.181 7.456 7.708 7.943 8.251 8.556 8.875 9.239 9.599 9.971 10.389 10.843 11.348 11.857 12.423 13.072 13.716 14.476 15.313 16.302 17.465 18.782 20.371 22.369 24.004 24.919 25.503 25.874 26.077 26.174 26.218 26.22 26.203 26.144 26.062 25.952 25.839 25.747 25.656 25.571 25.48 25.363 25.233 25.101 24.971 24.83 24.697 24.596 24.496 24.37 24.226 24.095 23.999 23.899 23.737 23.609 23.482 23.417 23.269 23.113 22.949 22.857 22.745 22.562 22.445 22.33 22.086 21.931 21.758 21.57 21.349 21.07 20.674 19.6 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_23.txt deleted file mode 100644 index f1459c33..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20481 ,KEBNE ,16708400,Fri Nov 26 17:05:21 CET,Fri Nov 26 18:37:27 CET,0.0 1.114 1.52 1.825 2.074 2.291 2.484 2.655 2.965 3.108 3.241 3.456 3.621 3.735 3.953 4.157 4.344 4.422 4.56 4.705 4.916 5.056 5.201 5.402 5.587 5.752 5.909 6.056 6.225 6.392 6.547 6.721 6.912 7.106 7.3 7.492 7.662 7.846 8.036 8.226 8.428 8.667 8.914 9.11 9.292 9.43 9.54 9.579 9.478 9.074 8.173 6.834 5.583 4.5 3.556 2.697 1.942 1.214 0.584 -0.005 -0.509 -0.976 -1.442 -1.86 -2.258 -2.636 -3.005 -3.335 -3.633 -3.942 -4.282 -4.561 -4.829 -5.115 -5.355 -5.623 -5.878 -6.116 -6.376 -6.566 -6.765 -7.073 -7.296 -7.537 -7.655 -7.881 -8.122 -8.389 -8.525 -8.719 -8.96 -9.123 -9.299 -9.68 -9.878 -10.087 -10.31 -10.557 -10.896 -11.398 -13.049 -2 ,691 ,KEBNE ,16708401,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:39:25 CET,0.0 1.471 1.893 2.19 2.442 2.664 2.852 3.021 3.337 3.48 3.618 3.824 3.98 4.094 4.299 4.494 4.683 4.776 4.964 5.127 5.332 5.469 5.606 5.785 5.951 6.106 6.25 6.381 6.54 6.7 6.859 7.05 7.217 7.375 7.547 7.719 7.925 8.152 8.34 8.531 8.725 8.916 9.129 9.345 9.553 9.745 9.886 9.934 9.893 9.621 8.837 7.522 6.281 5.177 4.194 3.295 2.472 1.735 1.119 0.508 -0.008 -0.498 -0.975 -1.424 -1.846 -2.229 -2.616 -2.962 -3.286 -3.624 -3.96 -4.219 -4.493 -4.801 -5.033 -5.273 -5.522 -5.777 -6.061 -6.255 -6.447 -6.758 -6.971 -7.2 -7.318 -7.553 -7.815 -8.089 -8.224 -8.422 -8.681 -8.85 -9.023 -9.387 -9.584 -9.801 -10.025 -10.293 -10.657 -11.1 -12.625 -3 ,2017 ,KEBNE ,16708402,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:38:24 CET,0.0 1.183 1.56 1.836 2.071 2.301 2.514 2.7 3.021 3.148 3.268 3.461 3.612 3.723 3.933 4.113 4.283 4.362 4.52 4.669 4.856 4.981 5.117 5.314 5.491 5.642 5.798 5.977 6.199 6.404 6.601 6.801 6.966 7.12 7.29 7.458 7.615 7.787 7.982 8.209 8.453 8.708 8.952 9.156 9.36 9.549 9.719 9.804 9.756 9.448 8.53 7.227 6.023 4.85 3.809 2.885 2.081 1.401 0.809 0.197 -0.343 -0.825 -1.275 -1.726 -2.148 -2.505 -2.873 -3.228 -3.55 -3.887 -4.236 -4.514 -4.79 -5.098 -5.339 -5.575 -5.842 -6.112 -6.369 -6.551 -6.739 -7.034 -7.253 -7.484 -7.597 -7.829 -8.07 -8.336 -8.484 -8.69 -8.951 -9.11 -9.282 -9.664 -9.88 -10.128 -10.402 -10.687 -11.033 -11.497 -12.918 -4 ,16842 ,KEBNE ,16708403,Fri Nov 26 17:06:23 CET,Fri Nov 26 18:38:37 CET,0.0 1.252 1.661 1.935 2.177 2.382 2.549 2.704 3.003 3.143 3.27 3.466 3.624 3.74 3.951 4.139 4.309 4.394 4.564 4.725 4.938 5.08 5.223 5.419 5.607 5.77 5.931 6.094 6.287 6.484 6.664 6.87 7.068 7.255 7.449 7.629 7.82 8.037 8.262 8.48 8.687 8.91 9.136 9.325 9.521 9.687 9.805 9.881 9.841 9.6 8.804 7.507 6.319 5.188 4.126 3.198 2.394 1.655 0.986 0.34 -0.19 -0.701 -1.181 -1.606 -2.012 -2.389 -2.774 -3.127 -3.447 -3.767 -4.103 -4.37 -4.628 -4.899 -5.112 -5.343 -5.579 -5.813 -6.056 -6.24 -6.439 -6.727 -6.928 -7.156 -7.275 -7.515 -7.759 -8.005 -8.138 -8.329 -8.567 -8.732 -8.912 -9.29 -9.478 -9.681 -9.921 -10.189 -10.51 -10.924 -12.391 -5 ,22558 ,KEBNE ,16708404,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:39:41 CET,0.0 1.824 2.271 2.576 2.814 3.017 3.208 3.381 3.703 3.863 4.003 4.189 4.343 4.451 4.635 4.809 4.98 5.062 5.222 5.382 5.593 5.722 5.861 6.051 6.221 6.38 6.519 6.656 6.841 7.007 7.153 7.328 7.495 7.641 7.806 8.0 8.168 8.345 8.527 8.723 8.924 9.129 9.332 9.515 9.726 9.922 10.094 10.187 10.1 9.737 8.92 7.618 6.368 5.266 4.277 3.342 2.561 1.886 1.29 0.691 0.161 -0.316 -0.761 -1.204 -1.637 -2.005 -2.394 -2.772 -3.087 -3.379 -3.676 -3.924 -4.177 -4.451 -4.686 -4.922 -5.16 -5.428 -5.682 -5.857 -6.06 -6.368 -6.566 -6.778 -6.887 -7.103 -7.328 -7.591 -7.728 -7.925 -8.175 -8.326 -8.484 -8.847 -9.053 -9.276 -9.516 -9.796 -10.152 -10.691 -12.449 -6 ,28104 ,KEBNE ,16708405,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:38:22 CET,0.0 1.241 1.664 1.987 2.259 2.488 2.703 2.884 3.144 3.264 3.394 3.611 3.761 3.856 4.035 4.217 4.392 4.479 4.652 4.811 5.043 5.182 5.294 5.453 5.634 5.843 6.037 6.216 6.463 6.654 6.802 6.985 7.157 7.312 7.494 7.718 7.93 8.133 8.329 8.529 8.728 8.937 9.189 9.436 9.645 9.85 10.034 10.128 10.134 9.882 9.019 7.674 6.354 5.125 4.051 3.111 2.313 1.557 0.915 0.311 -0.212 -0.674 -1.108 -1.534 -1.942 -2.306 -2.677 -3.01 -3.304 -3.613 -3.944 -4.235 -4.525 -4.826 -5.063 -5.286 -5.524 -5.779 -6.031 -6.205 -6.382 -6.659 -6.857 -7.065 -7.183 -7.434 -7.701 -7.986 -8.123 -8.313 -8.552 -8.716 -8.883 -9.232 -9.429 -9.641 -9.879 -10.181 -10.542 -10.958 -12.136 -7 ,28269 ,KEBNE ,16708406,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:39:39 CET,0.0 1.56 2.014 2.336 2.595 2.814 3.004 3.177 3.515 3.673 3.808 4.022 4.179 4.278 4.471 4.656 4.84 4.929 5.095 5.245 5.447 5.573 5.697 5.898 6.085 6.243 6.384 6.517 6.698 6.868 7.021 7.212 7.42 7.632 7.865 8.086 8.279 8.495 8.729 8.947 9.134 9.356 9.617 9.828 10.022 10.169 10.277 10.318 10.238 9.943 9.174 7.926 6.762 5.663 4.671 3.782 2.996 2.309 1.752 1.163 0.634 0.185 -0.279 -0.74 -1.162 -1.524 -1.887 -2.217 -2.494 -2.774 -3.097 -3.384 -3.673 -3.972 -4.196 -4.424 -4.663 -4.938 -5.215 -5.388 -5.585 -5.893 -6.09 -6.296 -6.402 -6.622 -6.867 -7.129 -7.255 -7.432 -7.648 -7.809 -7.982 -8.345 -8.545 -8.762 -9.018 -9.313 -9.659 -10.11 -12.086 -8 ,4193 ,KEBNE ,16708407,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:39:10 CET,0.0 1.45 1.825 2.077 2.309 2.526 2.703 2.862 3.163 3.305 3.442 3.657 3.802 3.906 4.116 4.318 4.501 4.582 4.74 4.895 5.12 5.258 5.393 5.604 5.787 5.943 6.099 6.259 6.454 6.627 6.815 7.04 7.239 7.428 7.634 7.833 8.032 8.278 8.499 8.713 8.933 9.161 9.407 9.619 9.843 10.006 10.145 10.221 10.146 9.847 9.081 7.83 6.568 5.38 4.311 3.4 2.569 1.758 1.107 0.525 0.013 -0.491 -0.968 -1.422 -1.846 -2.208 -2.588 -2.938 -3.247 -3.561 -3.892 -4.16 -4.42 -4.695 -4.925 -5.177 -5.428 -5.67 -5.927 -6.105 -6.281 -6.578 -6.782 -6.984 -7.098 -7.335 -7.58 -7.852 -7.994 -8.188 -8.423 -8.575 -8.732 -9.082 -9.273 -9.478 -9.721 -10.004 -10.375 -10.898 -13.023 -9 ,32642 ,KEBNE ,16708408,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:40:56 CET,0.0 1.323 1.751 2.023 2.251 2.464 2.643 2.808 3.11 3.235 3.358 3.565 3.724 3.842 4.064 4.264 4.437 4.516 4.669 4.811 5.014 5.151 5.284 5.482 5.664 5.815 5.976 6.159 6.382 6.552 6.699 6.881 7.058 7.221 7.428 7.691 7.929 8.151 8.348 8.543 8.736 8.945 9.182 9.385 9.607 9.816 10.002 10.099 10.025 9.722 8.952 7.652 6.36 5.237 4.248 3.336 2.525 1.746 1.09 0.484 -0.037 -0.511 -0.99 -1.454 -1.872 -2.241 -2.591 -2.905 -3.211 -3.535 -3.859 -4.131 -4.433 -4.744 -4.975 -5.217 -5.469 -5.744 -6.034 -6.228 -6.427 -6.724 -6.93 -7.158 -7.28 -7.526 -7.77 -8.008 -8.14 -8.334 -8.573 -8.732 -8.898 -9.257 -9.452 -9.672 -9.927 -10.228 -10.576 -11.023 -12.764 -10 ,24462 ,KEBNE ,16708409,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:38:19 CET,0.0 1.009 1.392 1.657 1.885 2.107 2.31 2.478 2.783 2.933 3.071 3.262 3.407 3.518 3.729 3.932 4.12 4.204 4.37 4.536 4.769 4.911 5.04 5.238 5.427 5.605 5.763 5.902 6.104 6.299 6.471 6.678 6.858 7.033 7.273 7.498 7.678 7.878 8.078 8.337 8.61 8.824 9.041 9.255 9.469 9.656 9.815 9.885 9.837 9.561 8.71 7.3 5.994 4.852 3.858 2.976 2.205 1.498 0.87 0.265 -0.257 -0.781 -1.279 -1.699 -2.096 -2.466 -2.882 -3.283 -3.603 -3.919 -4.268 -4.544 -4.829 -5.116 -5.335 -5.577 -5.823 -6.084 -6.366 -6.55 -6.737 -7.021 -7.231 -7.469 -7.582 -7.825 -8.088 -8.355 -8.494 -8.696 -8.943 -9.107 -9.287 -9.675 -9.885 -10.098 -10.349 -10.676 -11.062 -11.528 -13.11 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_30.txt deleted file mode 100644 index 77fa0e36..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8988 ,KEBNE ,16708410,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:37:18 CET,0.0 1.132 1.48 1.76 1.981 2.163 2.328 2.476 2.736 2.854 2.962 3.124 3.267 3.367 3.546 3.702 3.847 3.921 4.058 4.181 4.355 4.468 4.57 4.71 4.84 4.952 5.066 5.185 5.33 5.458 5.575 5.711 5.84 5.952 6.083 6.228 6.371 6.525 6.658 6.762 6.869 6.998 7.117 7.221 7.34 7.425 7.388 7.223 6.908 6.27 4.907 2.97 1.257 -0.227 -1.502 -2.621 -3.611 -4.51 -5.294 -6.073 -6.719 -7.296 -7.84 -8.35 -8.813 -9.233 -9.644 -10.008 -10.331 -10.654 -10.984 -11.247 -11.537 -11.843 -12.075 -12.323 -12.583 -12.848 -13.123 -13.313 -13.499 -13.779 -13.985 -14.204 -14.32 -14.56 -14.805 -15.069 -15.202 -15.392 -15.638 -15.807 -15.978 -16.346 -16.55 -16.759 -17.009 -17.301 -17.637 -18.082 -19.678 -2 ,19676 ,KEBNE ,16708411,Fri Nov 26 17:06:23 CET,Fri Nov 26 18:38:35 CET,0.0 1.117 1.461 1.687 1.863 2.007 2.158 2.289 2.514 2.621 2.725 2.866 2.991 3.075 3.242 3.395 3.532 3.598 3.727 3.852 4.032 4.146 4.248 4.388 4.52 4.643 4.761 4.873 5.019 5.157 5.274 5.422 5.566 5.696 5.837 5.977 6.121 6.268 6.396 6.536 6.67 6.787 6.907 6.993 7.044 7.058 6.955 6.764 6.485 5.868 4.482 2.481 0.651 -0.975 -2.34 -3.569 -4.61 -5.512 -6.305 -7.092 -7.739 -8.323 -8.867 -9.358 -9.833 -10.262 -10.705 -11.096 -11.43 -11.772 -12.122 -12.411 -12.713 -13.031 -13.268 -13.513 -13.774 -14.04 -14.312 -14.503 -14.702 -14.998 -15.205 -15.43 -15.543 -15.779 -16.046 -16.311 -16.444 -16.64 -16.887 -17.059 -17.241 -17.628 -17.835 -18.056 -18.303 -18.565 -18.899 -19.354 -20.742 -3 ,23518 ,KEBNE ,16708412,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:38:29 CET,0.0 1.052 1.407 1.668 1.874 2.046 2.213 2.361 2.607 2.724 2.839 3.016 3.16 3.256 3.418 3.574 3.723 3.79 3.922 4.044 4.204 4.302 4.391 4.515 4.64 4.768 4.891 5.006 5.142 5.26 5.367 5.501 5.631 5.749 5.889 6.043 6.169 6.287 6.419 6.581 6.765 6.915 7.038 7.153 7.241 7.273 7.197 7.045 6.742 6.042 4.695 2.856 1.214 -0.214 -1.525 -2.753 -3.823 -4.764 -5.556 -6.326 -6.977 -7.541 -8.086 -8.601 -9.07 -9.497 -9.931 -10.306 -10.632 -10.976 -11.336 -11.632 -11.916 -12.215 -12.458 -12.712 -12.978 -13.247 -13.522 -13.712 -13.906 -14.202 -14.407 -14.62 -14.731 -14.962 -15.206 -15.465 -15.599 -15.786 -16.018 -16.181 -16.358 -16.738 -16.951 -17.177 -17.416 -17.702 -18.042 -18.499 -19.985 -4 ,2426 ,KEBNE ,16708413,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:37:28 CET,0.0 1.397 1.749 2.009 2.221 2.407 2.565 2.699 2.962 3.082 3.19 3.346 3.478 3.563 3.719 3.869 4.018 4.087 4.21 4.337 4.515 4.629 4.738 4.89 5.038 5.173 5.3 5.417 5.569 5.713 5.842 5.989 6.135 6.281 6.447 6.617 6.77 6.927 7.073 7.206 7.334 7.475 7.631 7.747 7.83 7.872 7.833 7.665 7.261 6.44 4.952 3.051 1.403 -0.034 -1.291 -2.403 -3.392 -4.328 -5.121 -5.867 -6.505 -7.08 -7.617 -8.118 -8.585 -9.013 -9.437 -9.805 -10.132 -10.473 -10.818 -11.107 -11.411 -11.72 -11.96 -12.21 -12.47 -12.743 -13.015 -13.204 -13.397 -13.692 -13.901 -14.114 -14.227 -14.46 -14.699 -14.953 -15.088 -15.285 -15.521 -15.671 -15.832 -16.176 -16.376 -16.603 -16.852 -17.129 -17.452 -17.919 -19.856 -5 ,7594 ,KEBNE ,16708414,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:38:13 CET,0.0 0.998 1.271 1.482 1.666 1.83 1.986 2.13 2.398 2.516 2.619 2.758 2.877 2.957 3.112 3.253 3.399 3.472 3.593 3.706 3.876 3.975 4.069 4.209 4.339 4.461 4.571 4.686 4.838 4.97 5.104 5.267 5.41 5.534 5.672 5.833 5.978 6.141 6.298 6.419 6.522 6.644 6.78 6.873 6.916 6.904 6.826 6.653 6.328 5.597 4.001 1.805 -0.069 -1.706 -3.123 -4.321 -5.335 -6.24 -7.005 -7.766 -8.416 -8.986 -9.518 -10.01 -10.485 -10.915 -11.352 -11.743 -12.078 -12.42 -12.765 -13.059 -13.364 -13.689 -13.937 -14.191 -14.461 -14.743 -15.035 -15.226 -15.415 -15.715 -15.928 -16.149 -16.262 -16.496 -16.749 -17.018 -17.154 -17.355 -17.623 -17.79 -17.965 -18.338 -18.542 -18.781 -19.043 -19.321 -19.64 -20.092 -21.79 -6 ,13374 ,KEBNE ,16708415,Fri Nov 26 17:06:26 CET,Fri Nov 26 18:37:08 CET,0.0 0.953 1.274 1.557 1.812 2.013 2.18 2.325 2.567 2.669 2.765 2.902 3.023 3.097 3.242 3.383 3.511 3.575 3.713 3.844 4.007 4.114 4.222 4.367 4.509 4.635 4.743 4.85 4.997 5.143 5.277 5.44 5.587 5.713 5.854 6.0 6.143 6.296 6.446 6.598 6.724 6.84 6.948 7.024 7.119 7.216 7.196 7.08 6.753 5.967 4.433 2.28 0.382 -1.278 -2.655 -3.845 -4.922 -5.863 -6.606 -7.323 -7.965 -8.556 -9.09 -9.569 -10.042 -10.477 -10.907 -11.281 -11.605 -11.946 -12.303 -12.592 -12.88 -13.184 -13.426 -13.675 -13.914 -14.16 -14.432 -14.619 -14.803 -15.109 -15.325 -15.54 -15.655 -15.892 -16.14 -16.394 -16.525 -16.718 -16.968 -17.131 -17.292 -17.649 -17.847 -18.073 -18.328 -18.598 -18.928 -19.428 -20.982 -7 ,7662 ,KEBNE ,16708416,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:37:15 CET,0.0 0.9 1.22 1.465 1.666 1.835 2.005 2.165 2.448 2.565 2.678 2.831 2.952 3.036 3.205 3.369 3.507 3.57 3.693 3.818 3.999 4.105 4.212 4.376 4.527 4.65 4.76 4.874 5.019 5.146 5.267 5.406 5.517 5.63 5.764 5.901 6.025 6.163 6.301 6.43 6.558 6.67 6.807 6.937 7.018 7.036 7.003 6.873 6.533 5.83 4.315 2.251 0.456 -1.105 -2.443 -3.597 -4.605 -5.505 -6.27 -7.032 -7.681 -8.257 -8.811 -9.335 -9.8 -10.217 -10.665 -11.074 -11.42 -11.77 -12.131 -12.424 -12.717 -13.024 -13.271 -13.529 -13.785 -14.045 -14.316 -14.503 -14.693 -14.993 -15.203 -15.414 -15.525 -15.766 -16.023 -16.289 -16.419 -16.612 -16.872 -17.048 -17.214 -17.573 -17.773 -17.999 -18.263 -18.563 -18.933 -19.386 -20.643 -8 ,404 ,KEBNE ,16708417,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:37:14 CET,0.0 0.952 1.274 1.515 1.727 1.915 2.074 2.206 2.432 2.544 2.661 2.82 2.951 3.034 3.177 3.321 3.457 3.521 3.639 3.751 3.902 3.993 4.095 4.232 4.347 4.462 4.57 4.669 4.809 4.949 5.066 5.209 5.345 5.462 5.596 5.723 5.842 5.991 6.134 6.257 6.374 6.485 6.613 6.746 6.877 6.953 6.9 6.715 6.369 5.658 4.199 2.217 0.415 -1.124 -2.371 -3.437 -4.379 -5.251 -6.002 -6.734 -7.351 -7.901 -8.435 -8.931 -9.386 -9.804 -10.239 -10.621 -10.945 -11.283 -11.635 -11.931 -12.237 -12.555 -12.8 -13.036 -13.282 -13.546 -13.814 -13.999 -14.201 -14.505 -14.709 -14.928 -15.041 -15.273 -15.51 -15.776 -15.917 -16.112 -16.344 -16.499 -16.661 -17.024 -17.238 -17.472 -17.732 -18.028 -18.365 -18.782 -20.278 -9 ,19841 ,KEBNE ,16708418,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:38:40 CET,0.0 1.174 1.497 1.731 1.929 2.103 2.245 2.377 2.637 2.756 2.868 3.038 3.18 3.271 3.437 3.599 3.74 3.806 3.935 4.052 4.21 4.309 4.408 4.544 4.67 4.799 4.929 5.043 5.178 5.312 5.43 5.568 5.692 5.802 5.934 6.082 6.218 6.35 6.485 6.63 6.765 6.872 6.972 7.055 7.113 7.152 7.117 6.979 6.651 5.969 4.639 2.747 1.125 -0.279 -1.528 -2.606 -3.546 -4.443 -5.231 -6.003 -6.645 -7.213 -7.758 -8.285 -8.762 -9.194 -9.655 -10.053 -10.388 -10.721 -11.065 -11.357 -11.66 -11.972 -12.211 -12.453 -12.705 -12.968 -13.242 -13.437 -13.628 -13.917 -14.119 -14.326 -14.435 -14.664 -14.911 -15.169 -15.305 -15.508 -15.743 -15.894 -16.054 -16.415 -16.617 -16.841 -17.097 -17.403 -17.754 -18.22 -20.06 -10 ,11410 ,KEBNE ,16708419,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:38:34 CET,0.0 1.044 1.386 1.634 1.845 2.029 2.194 2.34 2.594 2.697 2.787 2.922 3.055 3.14 3.287 3.425 3.565 3.625 3.733 3.859 4.047 4.168 4.283 4.429 4.563 4.697 4.82 4.925 5.066 5.196 5.309 5.439 5.551 5.669 5.815 5.98 6.126 6.268 6.397 6.522 6.661 6.796 6.933 7.045 7.14 7.179 7.126 6.978 6.654 5.939 4.301 2.08 0.204 -1.35 -2.665 -3.843 -4.848 -5.75 -6.523 -7.3 -7.949 -8.507 -9.033 -9.523 -9.98 -10.407 -10.837 -11.216 -11.556 -11.902 -12.248 -12.537 -12.837 -13.127 -13.355 -13.604 -13.869 -14.144 -14.424 -14.618 -14.817 -15.129 -15.349 -15.572 -15.685 -15.921 -16.177 -16.441 -16.59 -16.808 -17.076 -17.237 -17.408 -17.777 -17.984 -18.206 -18.45 -18.739 -19.09 -19.554 -20.98 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_42.txt deleted file mode 100644 index 15b39600..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4305 ,KEBNE ,17125993,Thu Dec 30 17:02:52 CET,Thu Dec 30 18:37:45 CET,0.0 1.234 1.719 2.053 2.327 2.587 2.823 3.029 3.387 3.56 3.728 3.997 4.184 4.331 4.595 4.819 5.031 5.135 5.336 5.527 5.823 6.013 6.183 6.422 6.657 6.904 7.155 7.371 7.623 7.868 8.119 8.407 8.677 8.953 9.24 9.56 9.902 10.272 10.649 11.026 11.411 11.844 12.328 12.845 13.458 14.087 14.754 15.45 16.261 17.138 17.976 18.411 18.523 18.477 18.299 18.027 17.737 17.472 17.254 17.021 16.796 16.591 16.364 16.136 15.933 15.731 15.493 15.276 15.076 14.861 14.639 14.441 14.232 14.036 13.889 13.723 13.537 13.362 13.197 13.058 12.91 12.691 12.526 12.358 12.276 12.107 11.923 11.709 11.588 11.441 11.256 11.127 10.987 10.693 10.524 10.338 10.131 9.879 9.56 9.118 7.9 -2 ,25913 ,KEBNE ,17125994,Thu Dec 30 17:02:52 CET,Thu Dec 30 18:39:19 CET,0.0 1.373 1.847 2.181 2.492 2.761 3.0 3.222 3.609 3.786 3.961 4.25 4.439 4.577 4.84 5.094 5.321 5.429 5.658 5.887 6.19 6.381 6.574 6.848 7.113 7.36 7.589 7.79 8.029 8.276 8.547 8.878 9.165 9.446 9.759 10.096 10.429 10.784 11.148 11.55 11.989 12.453 12.964 13.455 14.008 14.615 15.279 16.009 16.816 17.663 18.518 18.938 19.002 18.945 18.751 18.484 18.207 17.901 17.638 17.4 17.162 16.907 16.674 16.455 16.235 16.031 15.807 15.589 15.387 15.175 14.963 14.775 14.573 14.363 14.186 14.022 13.863 13.68 13.481 13.349 13.217 13.006 12.855 12.695 12.607 12.41 12.216 12.005 11.89 11.742 11.538 11.406 11.255 10.924 10.755 10.569 10.34 10.084 9.789 9.443 8.424 -3 ,26516 ,KEBNE ,17125995,Thu Dec 30 17:02:52 CET,Thu Dec 30 18:38:46 CET,0.0 1.311 1.799 2.106 2.361 2.615 2.862 3.075 3.417 3.566 3.712 3.978 4.164 4.299 4.56 4.798 5.025 5.14 5.355 5.552 5.836 6.014 6.182 6.44 6.717 6.965 7.182 7.413 7.729 8.024 8.3 8.635 8.935 9.194 9.526 9.954 10.336 10.679 11.027 11.399 11.799 12.255 12.745 13.218 13.794 14.437 15.108 15.777 16.54 17.371 18.22 18.69 18.743 18.633 18.483 18.291 18.052 17.824 17.606 17.338 17.09 16.879 16.689 16.496 16.287 16.043 15.8 15.605 15.42 15.2 14.946 14.734 14.509 14.268 14.092 13.92 13.733 13.541 13.332 13.193 13.058 12.851 12.721 12.563 12.466 12.282 12.107 11.911 11.797 11.644 11.441 11.314 11.185 10.893 10.723 10.537 10.329 10.098 9.796 9.363 7.838 -4 ,25896 ,KEBNE ,17125996,Thu Dec 30 17:02:52 CET,Thu Dec 30 18:39:36 CET,0.0 1.881 2.379 2.719 2.986 3.234 3.448 3.642 3.998 4.16 4.325 4.584 4.767 4.909 5.173 5.404 5.631 5.747 5.955 6.146 6.428 6.596 6.751 7.003 7.271 7.526 7.762 7.975 8.248 8.526 8.807 9.159 9.49 9.779 10.065 10.384 10.745 11.156 11.564 11.99 12.378 12.774 13.253 13.717 14.236 14.808 15.457 16.166 16.982 17.875 18.719 19.121 19.18 19.084 18.922 18.74 18.507 18.267 18.051 17.792 17.565 17.355 17.128 16.904 16.683 16.454 16.206 16.005 15.824 15.64 15.452 15.275 15.077 14.87 14.702 14.531 14.362 14.188 14.016 13.892 13.75 13.539 13.389 13.224 13.142 12.96 12.757 12.532 12.424 12.289 12.09 11.959 11.821 11.53 11.362 11.175 10.965 10.719 10.42 10.039 8.405 -5 ,13826 ,KEBNE ,17125997,Thu Dec 30 17:02:52 CET,Thu Dec 30 18:38:32 CET,0.0 1.44 1.884 2.244 2.545 2.815 3.051 3.268 3.644 3.817 3.979 4.239 4.424 4.562 4.821 5.063 5.292 5.405 5.621 5.805 6.062 6.243 6.422 6.664 6.879 7.101 7.329 7.546 7.829 8.091 8.333 8.599 8.869 9.133 9.416 9.727 10.027 10.376 10.75 11.128 11.511 11.934 12.419 12.922 13.503 14.11 14.78 15.502 16.343 17.264 18.136 18.577 18.633 18.519 18.347 18.102 17.827 17.571 17.342 17.088 16.861 16.651 16.434 16.22 16.001 15.802 15.583 15.385 15.222 15.051 14.849 14.664 14.465 14.249 14.084 13.906 13.726 13.545 13.366 13.242 13.102 12.871 12.698 12.519 12.424 12.23 12.029 11.811 11.693 11.537 11.337 11.218 11.093 10.79 10.604 10.385 10.153 9.904 9.616 9.258 8.221 -6 ,25625 ,KEBNE ,17125998,Thu Dec 30 17:02:51 CET,Thu Dec 30 18:38:28 CET,0.0 1.41 1.922 2.249 2.523 2.768 2.982 3.163 3.494 3.653 3.81 4.085 4.28 4.42 4.678 4.929 5.16 5.269 5.471 5.679 6.0 6.192 6.365 6.617 6.852 7.078 7.299 7.513 7.787 8.029 8.26 8.562 8.883 9.179 9.474 9.822 10.16 10.501 10.865 11.279 11.745 12.239 12.754 13.223 13.764 14.342 14.998 15.736 16.542 17.368 18.156 18.587 18.644 18.503 18.304 18.071 17.822 17.572 17.352 17.109 16.874 16.655 16.43 16.203 15.974 15.739 15.503 15.277 15.063 14.859 14.666 14.515 14.334 14.137 13.985 13.812 13.64 13.473 13.291 13.164 13.033 12.812 12.65 12.476 12.396 12.233 12.026 11.814 11.708 11.551 11.317 11.172 11.025 10.735 10.573 10.398 10.206 9.975 9.684 9.251 7.931 -7 ,18066 ,KEBNE ,17125999,Thu Dec 30 17:02:53 CET,Thu Dec 30 18:38:34 CET,0.0 1.373 1.84 2.153 2.431 2.701 2.934 3.143 3.527 3.697 3.855 4.128 4.304 4.428 4.674 4.897 5.107 5.211 5.408 5.601 5.909 6.107 6.285 6.555 6.809 7.041 7.257 7.467 7.759 8.038 8.29 8.604 8.912 9.185 9.481 9.795 10.096 10.438 10.798 11.16 11.565 12.076 12.625 13.091 13.625 14.208 14.863 15.565 16.346 17.204 18.044 18.567 18.677 18.541 18.311 18.049 17.78 17.514 17.288 17.034 16.757 16.498 16.273 16.029 15.784 15.566 15.337 15.143 14.985 14.825 14.628 14.448 14.272 14.073 13.898 13.709 13.52 13.341 13.173 13.047 12.914 12.728 12.568 12.389 12.306 12.126 11.94 11.743 11.635 11.484 11.274 11.141 10.992 10.658 10.476 10.268 10.046 9.813 9.52 9.097 7.997 -8 ,21211 ,KEBNE ,17126000,Thu Dec 30 17:02:53 CET,Thu Dec 30 18:38:28 CET,0.0 1.175 1.558 1.862 2.144 2.377 2.594 2.809 3.208 3.396 3.563 3.814 3.993 4.133 4.395 4.638 4.872 4.986 5.201 5.398 5.669 5.852 6.034 6.279 6.504 6.738 6.972 7.184 7.454 7.718 7.951 8.251 8.557 8.837 9.159 9.499 9.833 10.19 10.553 10.938 11.341 11.791 12.276 12.747 13.301 13.923 14.584 15.266 16.064 16.938 17.818 18.326 18.404 18.265 18.077 17.818 17.535 17.291 17.068 16.838 16.623 16.406 16.189 15.976 15.748 15.528 15.303 15.076 14.874 14.65 14.409 14.231 14.056 13.854 13.677 13.499 13.313 13.124 12.935 12.795 12.649 12.42 12.263 12.096 12.004 11.819 11.633 11.43 11.322 11.181 10.981 10.852 10.713 10.412 10.251 10.06 9.843 9.586 9.256 8.795 6.97 -9 ,22883 ,KEBNE ,17126001,Thu Dec 30 17:02:54 CET,Thu Dec 30 18:37:44 CET,0.0 1.166 1.605 1.952 2.241 2.469 2.671 2.89 3.292 3.463 3.631 3.91 4.091 4.227 4.49 4.728 4.953 5.062 5.264 5.462 5.759 5.945 6.126 6.385 6.64 6.886 7.123 7.352 7.62 7.871 8.11 8.379 8.657 8.946 9.255 9.575 9.899 10.259 10.618 11.035 11.486 11.913 12.395 12.939 13.575 14.199 14.868 15.605 16.397 17.226 18.049 18.492 18.539 18.455 18.272 17.974 17.678 17.4 17.158 16.9 16.654 16.427 16.212 16.006 15.766 15.531 15.316 15.112 14.91 14.702 14.494 14.331 14.175 13.987 13.833 13.677 13.519 13.343 13.131 12.997 12.871 12.657 12.495 12.333 12.25 12.072 11.875 11.649 11.531 11.379 11.165 11.026 10.879 10.566 10.389 10.202 9.985 9.717 9.377 8.917 7.62 -10 ,21417 ,KEBNE ,17126002,Thu Dec 30 17:02:54 CET,Thu Dec 30 18:39:35 CET,0.0 1.245 1.696 2.045 2.32 2.555 2.78 2.994 3.397 3.573 3.727 3.988 4.17 4.312 4.581 4.819 5.044 5.163 5.395 5.605 5.908 6.088 6.244 6.477 6.71 6.932 7.149 7.364 7.627 7.868 8.115 8.424 8.714 8.971 9.279 9.657 9.972 10.294 10.678 11.066 11.495 11.998 12.494 12.955 13.5 14.116 14.834 15.593 16.383 17.217 18.082 18.534 18.629 18.549 18.338 18.092 17.806 17.524 17.29 17.056 16.853 16.645 16.423 16.19 15.973 15.784 15.573 15.358 15.147 14.941 14.722 14.533 14.351 14.172 14.026 13.839 13.654 13.485 13.301 13.177 13.046 12.841 12.709 12.559 12.471 12.286 12.088 11.88 11.773 11.622 11.381 11.237 11.1 10.777 10.591 10.398 10.195 9.959 9.686 9.328 8.258 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_61.txt deleted file mode 100644 index 5ac018a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_155_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29755 ,KEBNE ,16708420,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:38:29 CET,0.0 1.32 1.641 1.888 2.096 2.251 2.361 2.455 2.631 2.699 2.752 2.815 2.905 2.952 3.062 3.172 3.254 3.287 3.352 3.409 3.473 3.505 3.535 3.576 3.588 3.596 3.606 3.605 3.585 3.56 3.542 3.474 3.377 3.298 3.199 3.048 2.871 2.641 2.379 2.084 1.749 1.38 0.875 0.234 -0.604 -1.661 -3.002 -4.728 -7.11 -10.463 -15.544 -21.065 -25.235 -28.538 -31.221 -33.451 -35.279 -36.853 -38.178 -39.466 -40.533 -41.452 -42.306 -43.104 -43.874 -44.579 -45.29 -45.898 -46.403 -46.931 -47.46 -47.894 -48.349 -48.801 -49.146 -49.512 -49.884 -50.254 -50.633 -50.884 -51.139 -51.547 -51.833 -52.13 -52.279 -52.591 -52.923 -53.26 -53.436 -53.716 -54.008 -54.207 -54.403 -54.846 -55.094 -55.358 -55.656 -55.994 -56.39 -56.881 -58.245 -2 ,18198 ,KEBNE ,16708421,Fri Nov 26 17:06:22 CET,Fri Nov 26 18:39:35 CET,0.0 1.139 1.416 1.611 1.785 1.942 2.061 2.16 2.317 2.395 2.466 2.53 2.62 2.67 2.766 2.841 2.907 2.94 2.986 3.025 3.06 3.074 3.104 3.157 3.186 3.183 3.191 3.194 3.16 3.118 3.076 3.019 2.939 2.841 2.737 2.606 2.449 2.242 1.986 1.689 1.343 0.932 0.373 -0.281 -1.126 -2.172 -3.506 -5.264 -7.693 -11.135 -16.326 -21.858 -26.022 -29.331 -32.031 -34.315 -36.214 -37.847 -39.193 -40.503 -41.583 -42.499 -43.345 -44.143 -44.885 -45.555 -46.235 -46.832 -47.35 -47.853 -48.348 -48.767 -49.197 -49.664 -50.041 -50.412 -50.774 -51.15 -51.554 -51.844 -52.142 -52.589 -52.888 -53.188 -53.344 -53.666 -53.981 -54.314 -54.499 -54.786 -55.078 -55.278 -55.484 -55.961 -56.24 -56.53 -56.827 -57.167 -57.579 -58.058 -59.483 -3 ,17988 ,KEBNE ,16708422,Fri Nov 26 17:07:27 CET,Fri Nov 26 18:40:38 CET,0.0 1.505 1.878 2.132 2.296 2.43 2.543 2.655 2.852 2.937 3.007 3.079 3.172 3.225 3.322 3.396 3.462 3.494 3.55 3.596 3.638 3.665 3.694 3.721 3.742 3.74 3.722 3.713 3.697 3.66 3.618 3.576 3.53 3.461 3.34 3.197 3.044 2.819 2.562 2.265 1.902 1.445 0.877 0.25 -0.586 -1.633 -2.99 -4.752 -7.182 -10.578 -15.647 -21.156 -25.329 -28.627 -31.248 -33.483 -35.384 -37.034 -38.389 -39.717 -40.836 -41.775 -42.667 -43.486 -44.221 -44.882 -45.54 -46.142 -46.66 -47.177 -47.697 -48.129 -48.582 -49.04 -49.408 -49.781 -50.157 -50.555 -50.959 -51.234 -51.522 -51.967 -52.268 -52.57 -52.72 -53.028 -53.355 -53.711 -53.892 -54.165 -54.45 -54.658 -54.87 -55.321 -55.572 -55.83 -56.122 -56.467 -56.853 -57.356 -58.95 -4 ,25488 ,KEBNE ,16708423,Fri Nov 26 17:07:23 CET,Fri Nov 26 18:39:37 CET,0.0 1.18 1.479 1.698 1.874 2.033 2.155 2.256 2.431 2.503 2.576 2.66 2.742 2.788 2.878 2.936 2.986 3.014 3.067 3.103 3.14 3.156 3.168 3.201 3.241 3.251 3.237 3.241 3.258 3.251 3.221 3.153 3.081 2.998 2.868 2.706 2.528 2.327 2.09 1.78 1.418 0.974 0.404 -0.237 -1.076 -2.131 -3.496 -5.237 -7.581 -10.909 -16.003 -21.543 -25.748 -29.028 -31.684 -33.929 -35.799 -37.426 -38.756 -40.056 -41.173 -42.131 -43.011 -43.833 -44.574 -45.229 -45.915 -46.536 -47.074 -47.609 -48.158 -48.606 -49.071 -49.542 -49.895 -50.276 -50.669 -51.06 -51.465 -51.74 -52.017 -52.447 -52.737 -53.027 -53.176 -53.486 -53.805 -54.14 -54.307 -54.573 -54.856 -55.063 -55.279 -55.734 -55.992 -56.261 -56.541 -56.875 -57.272 -57.778 -59.668 -5 ,5554 ,KEBNE ,16708424,Fri Nov 26 17:07:24 CET,Fri Nov 26 18:41:04 CET,0.0 1.21 1.584 1.834 2.0 2.13 2.252 2.361 2.541 2.613 2.685 2.756 2.846 2.903 2.995 3.072 3.154 3.19 3.259 3.31 3.37 3.412 3.444 3.476 3.496 3.51 3.512 3.518 3.509 3.462 3.404 3.341 3.263 3.157 3.013 2.869 2.744 2.57 2.327 2.051 1.723 1.266 0.726 0.14 -0.693 -1.72 -3.037 -4.789 -7.18 -10.556 -15.66 -21.133 -25.282 -28.631 -31.399 -33.704 -35.579 -37.174 -38.497 -39.798 -40.888 -41.824 -42.697 -43.509 -44.274 -44.956 -45.649 -46.261 -46.791 -47.347 -47.904 -48.333 -48.763 -49.232 -49.586 -49.939 -50.313 -50.697 -51.104 -51.387 -51.664 -52.085 -52.392 -52.703 -52.853 -53.16 -53.501 -53.86 -54.04 -54.323 -54.617 -54.825 -55.045 -55.504 -55.754 -56.042 -56.346 -56.655 -57.011 -57.542 -58.789 -6 ,28200 ,KEBNE ,16708425,Fri Nov 26 17:07:24 CET,Fri Nov 26 18:44:10 CET,0.0 1.404 1.732 1.939 2.118 2.259 2.371 2.472 2.644 2.714 2.782 2.88 2.97 3.01 3.096 3.175 3.249 3.286 3.348 3.402 3.471 3.507 3.529 3.558 3.563 3.552 3.559 3.57 3.568 3.536 3.493 3.441 3.375 3.295 3.191 3.082 2.963 2.761 2.523 2.254 1.93 1.505 0.928 0.279 -0.566 -1.597 -2.947 -4.677 -7.038 -10.393 -15.445 -20.928 -25.029 -28.233 -30.877 -33.184 -35.147 -36.794 -38.116 -39.464 -40.594 -41.532 -42.413 -43.251 -44.014 -44.666 -45.327 -45.916 -46.41 -46.928 -47.453 -47.891 -48.363 -48.858 -49.23 -49.59 -49.962 -50.358 -50.753 -51.019 -51.293 -51.693 -51.969 -52.275 -52.439 -52.75 -53.064 -53.399 -53.569 -53.844 -54.129 -54.336 -54.552 -54.99 -55.226 -55.476 -55.732 -56.041 -56.454 -56.958 -58.753 -7 ,28064 ,KEBNE ,16708426,Fri Nov 26 17:07:23 CET,Fri Nov 26 18:39:20 CET,0.0 1.207 1.518 1.727 1.902 2.046 2.165 2.286 2.481 2.565 2.644 2.74 2.846 2.91 3.031 3.141 3.226 3.266 3.335 3.386 3.448 3.475 3.5 3.517 3.508 3.501 3.49 3.492 3.496 3.467 3.424 3.355 3.276 3.202 3.098 2.939 2.771 2.564 2.312 2.021 1.691 1.259 0.685 0.05 -0.782 -1.837 -3.191 -4.924 -7.229 -10.495 -15.592 -21.083 -25.248 -28.589 -31.234 -33.418 -35.234 -36.811 -38.135 -39.446 -40.553 -41.499 -42.353 -43.153 -43.883 -44.517 -45.176 -45.762 -46.271 -46.787 -47.315 -47.738 -48.181 -48.651 -49.009 -49.37 -49.749 -50.151 -50.55 -50.82 -51.099 -51.538 -51.836 -52.135 -52.283 -52.586 -52.916 -53.265 -53.44 -53.713 -54.001 -54.195 -54.412 -54.919 -55.176 -55.438 -55.706 -56.013 -56.406 -56.902 -58.223 -8 ,5864 ,KEBNE ,16708427,Fri Nov 26 17:07:23 CET,Fri Nov 26 18:40:44 CET,0.0 1.68 2.068 2.292 2.447 2.579 2.692 2.782 2.951 3.032 3.108 3.194 3.275 3.318 3.411 3.492 3.558 3.591 3.647 3.681 3.724 3.754 3.772 3.804 3.846 3.861 3.866 3.874 3.845 3.803 3.769 3.688 3.585 3.489 3.368 3.242 3.088 2.864 2.607 2.315 1.967 1.514 0.942 0.312 -0.512 -1.543 -2.894 -4.66 -7.047 -10.348 -15.326 -20.759 -24.943 -28.262 -30.912 -33.153 -35.047 -36.685 -38.023 -39.325 -40.419 -41.366 -42.271 -43.115 -43.862 -44.53 -45.208 -45.784 -46.274 -46.783 -47.307 -47.731 -48.171 -48.641 -48.998 -49.357 -49.723 -50.098 -50.472 -50.729 -51.002 -51.429 -51.724 -52.013 -52.162 -52.471 -52.795 -53.146 -53.327 -53.616 -53.896 -54.091 -54.298 -54.733 -54.975 -55.235 -55.532 -55.862 -56.221 -56.693 -58.477 -9 ,23836 ,KEBNE ,16708428,Fri Nov 26 17:07:23 CET,Fri Nov 26 18:39:14 CET,0.0 1.228 1.637 1.927 2.108 2.265 2.417 2.546 2.746 2.82 2.891 2.982 3.086 3.133 3.203 3.266 3.331 3.367 3.43 3.489 3.553 3.593 3.63 3.652 3.666 3.672 3.664 3.664 3.663 3.637 3.588 3.514 3.464 3.408 3.292 3.134 2.98 2.798 2.537 2.211 1.864 1.458 0.903 0.258 -0.562 -1.575 -2.913 -4.663 -7.033 -10.359 -15.386 -20.835 -24.988 -28.287 -30.929 -33.123 -34.983 -36.625 -37.956 -39.265 -40.38 -41.364 -42.274 -43.074 -43.795 -44.431 -45.079 -45.674 -46.197 -46.721 -47.263 -47.708 -48.159 -48.629 -48.996 -49.368 -49.741 -50.125 -50.503 -50.753 -51.019 -51.441 -51.735 -52.039 -52.192 -52.499 -52.825 -53.175 -53.348 -53.622 -53.915 -54.12 -54.33 -54.822 -55.082 -55.337 -55.617 -55.94 -56.34 -56.846 -58.794 -10 ,3923 ,KEBNE ,16708429,Fri Nov 26 17:07:23 CET,Fri Nov 26 18:40:29 CET,0.0 1.392 1.678 1.879 2.064 2.227 2.348 2.456 2.657 2.73 2.785 2.842 2.923 2.959 3.034 3.113 3.188 3.216 3.251 3.278 3.319 3.348 3.368 3.379 3.384 3.387 3.4 3.414 3.42 3.395 3.355 3.317 3.253 3.186 3.086 2.93 2.772 2.56 2.331 2.063 1.711 1.321 0.848 0.244 -0.584 -1.616 -2.975 -4.702 -7.055 -10.382 -15.493 -21.005 -25.171 -28.489 -31.151 -33.356 -35.163 -36.751 -38.096 -39.442 -40.567 -41.52 -42.409 -43.231 -44.002 -44.706 -45.413 -46.042 -46.567 -47.104 -47.671 -48.135 -48.608 -49.059 -49.38 -49.729 -50.101 -50.476 -50.861 -51.129 -51.402 -51.815 -52.104 -52.407 -52.554 -52.855 -53.184 -53.511 -53.674 -53.946 -54.231 -54.439 -54.651 -55.095 -55.329 -55.58 -55.872 -56.204 -56.565 -57.061 -59.335 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_156_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_156_1.txt deleted file mode 100644 index 17682da1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_156_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17171 ,KEBNE ,16708430,Fri Nov 26 17:07:23 CET,Fri Nov 26 18:39:10 CET,0.0 1.522 1.912 2.181 2.414 2.602 2.76 2.922 3.209 3.334 3.44 3.598 3.701 3.782 3.941 4.092 4.228 4.293 4.42 4.537 4.678 4.77 4.866 4.979 5.086 5.205 5.316 5.4 5.485 5.572 5.649 5.746 5.839 5.903 5.951 5.998 6.043 6.079 6.079 6.057 6.028 5.984 5.874 5.72 5.529 5.221 4.725 4.035 3.049 1.561 -0.914 -3.733 -5.963 -7.793 -9.314 -10.678 -11.831 -12.797 -13.631 -14.44 -15.1 -15.688 -16.251 -16.767 -17.24 -17.674 -18.12 -18.531 -18.889 -19.235 -19.592 -19.881 -20.165 -20.463 -20.704 -20.949 -21.2 -21.46 -21.72 -21.92 -22.137 -22.472 -22.704 -22.932 -23.052 -23.305 -23.567 -23.864 -24.022 -24.214 -24.47 -24.637 -24.811 -25.188 -25.382 -25.59 -25.834 -26.132 -26.496 -26.986 -28.534 -2 ,30811 ,KEBNE ,16708431,Fri Nov 26 17:07:23 CET,Fri Nov 26 18:39:13 CET,0.0 1.665 2.043 2.329 2.609 2.841 3.011 3.17 3.46 3.58 3.681 3.86 3.972 4.06 4.209 4.342 4.478 4.549 4.684 4.797 4.959 5.05 5.126 5.248 5.357 5.44 5.512 5.584 5.673 5.756 5.842 5.95 6.038 6.117 6.195 6.275 6.344 6.383 6.395 6.373 6.337 6.292 6.194 6.04 5.81 5.505 5.083 4.45 3.509 2.038 -0.397 -3.191 -5.413 -7.239 -8.727 -9.998 -11.105 -12.086 -12.914 -13.745 -14.447 -15.052 -15.66 -16.224 -16.71 -17.143 -17.598 -18.046 -18.433 -18.796 -19.161 -19.468 -19.811 -20.177 -20.445 -20.721 -21.013 -21.308 -21.604 -21.804 -22.006 -22.332 -22.56 -22.793 -22.911 -23.142 -23.391 -23.665 -23.799 -23.986 -24.254 -24.426 -24.618 -25.048 -25.268 -25.497 -25.769 -26.057 -26.385 -26.833 -28.105 -3 ,6259 ,KEBNE ,16708432,Fri Nov 26 17:07:23 CET,Fri Nov 26 18:39:06 CET,0.0 1.738 2.121 2.425 2.677 2.868 3.038 3.191 3.469 3.598 3.712 3.879 3.983 4.066 4.222 4.373 4.513 4.582 4.707 4.803 4.926 5.016 5.106 5.23 5.328 5.419 5.525 5.633 5.741 5.817 5.889 5.966 6.021 6.07 6.155 6.25 6.353 6.435 6.442 6.442 6.42 6.381 6.313 6.173 5.933 5.612 5.19 4.612 3.723 2.312 -0.127 -3.043 -5.304 -7.116 -8.616 -9.916 -11.026 -12.035 -12.892 -13.713 -14.44 -15.066 -15.611 -16.132 -16.652 -17.122 -17.573 -17.979 -18.326 -18.691 -19.065 -19.358 -19.664 -19.99 -20.239 -20.479 -20.73 -20.999 -21.296 -21.5 -21.711 -22.038 -22.276 -22.538 -22.663 -22.902 -23.153 -23.436 -23.582 -23.779 -24.045 -24.206 -24.371 -24.723 -24.924 -25.157 -25.418 -25.715 -26.073 -26.581 -28.137 -4 ,21261 ,KEBNE ,16708433,Fri Nov 26 17:07:23 CET,Fri Nov 26 18:39:07 CET,0.0 1.534 1.907 2.195 2.421 2.632 2.816 2.957 3.215 3.332 3.442 3.626 3.737 3.831 4.003 4.153 4.285 4.353 4.491 4.608 4.755 4.853 4.951 5.083 5.197 5.293 5.389 5.495 5.603 5.683 5.775 5.889 5.971 6.055 6.161 6.245 6.337 6.434 6.48 6.495 6.51 6.485 6.357 6.205 5.977 5.655 5.233 4.611 3.648 2.213 -0.182 -2.98 -5.193 -7.042 -8.593 -9.931 -11.089 -12.134 -12.996 -13.793 -14.472 -15.1 -15.699 -16.24 -16.733 -17.176 -17.613 -17.994 -18.335 -18.7 -19.068 -19.367 -19.675 -19.991 -20.243 -20.497 -20.764 -21.06 -21.356 -21.555 -21.758 -22.087 -22.328 -22.572 -22.69 -22.925 -23.168 -23.426 -23.564 -23.762 -24.032 -24.199 -24.376 -24.768 -24.978 -25.196 -25.44 -25.715 -26.069 -26.492 -28.012 -5 ,6589 ,KEBNE ,16708434,Fri Nov 26 17:07:24 CET,Fri Nov 26 18:42:42 CET,0.0 1.62 2.048 2.354 2.594 2.793 2.958 3.117 3.429 3.553 3.667 3.865 3.984 4.084 4.268 4.419 4.55 4.607 4.722 4.83 4.97 5.056 5.145 5.272 5.374 5.468 5.559 5.647 5.749 5.838 5.923 6.021 6.104 6.164 6.215 6.288 6.339 6.372 6.402 6.399 6.367 6.295 6.178 6.009 5.751 5.404 4.946 4.291 3.277 1.769 -0.675 -3.537 -5.768 -7.594 -9.133 -10.476 -11.597 -12.55 -13.35 -14.147 -14.826 -15.418 -15.972 -16.516 -17.077 -17.564 -18.013 -18.433 -18.801 -19.168 -19.558 -19.867 -20.179 -20.531 -20.806 -21.076 -21.335 -21.595 -21.871 -22.07 -22.276 -22.587 -22.803 -23.048 -23.171 -23.413 -23.688 -23.968 -24.118 -24.325 -24.588 -24.757 -24.942 -25.325 -25.53 -25.761 -26.033 -26.333 -26.677 -27.149 -29.371 -6 ,22798 ,KEBNE ,16708435,Fri Nov 26 17:07:23 CET,Fri Nov 26 18:41:01 CET,0.0 2.198 2.62 2.899 3.096 3.297 3.482 3.626 3.878 3.999 4.119 4.319 4.429 4.517 4.704 4.867 5.014 5.082 5.202 5.324 5.483 5.573 5.66 5.77 5.862 5.946 6.027 6.1 6.203 6.284 6.354 6.449 6.521 6.577 6.63 6.69 6.757 6.82 6.884 6.928 6.925 6.885 6.803 6.645 6.396 6.078 5.622 5.001 4.033 2.503 0.03 -2.791 -5.024 -6.857 -8.376 -9.701 -10.82 -11.805 -12.648 -13.473 -14.156 -14.742 -15.305 -15.834 -16.347 -16.832 -17.332 -17.741 -18.078 -18.436 -18.802 -19.124 -19.464 -19.818 -20.094 -20.348 -20.592 -20.851 -21.132 -21.33 -21.523 -21.821 -22.028 -22.24 -22.354 -22.598 -22.84 -23.1 -23.239 -23.423 -23.664 -23.822 -23.985 -24.357 -24.572 -24.794 -25.049 -25.334 -25.703 -26.207 -27.641 -7 ,7804 ,KEBNE ,16708436,Fri Nov 26 17:08:30 CET,Fri Nov 26 18:44:03 CET,0.0 1.522 1.895 2.199 2.452 2.645 2.812 2.96 3.221 3.34 3.451 3.638 3.751 3.837 4.002 4.149 4.282 4.35 4.472 4.585 4.743 4.832 4.923 5.049 5.167 5.273 5.374 5.468 5.556 5.644 5.751 5.871 5.988 6.078 6.123 6.158 6.18 6.196 6.206 6.198 6.207 6.201 6.132 6.008 5.777 5.44 4.949 4.295 3.34 1.847 -0.596 -3.445 -5.665 -7.482 -9.007 -10.333 -11.468 -12.461 -13.286 -14.106 -14.805 -15.434 -16.039 -16.583 -17.073 -17.51 -17.991 -18.417 -18.752 -19.107 -19.48 -19.778 -20.079 -20.394 -20.65 -20.903 -21.146 -21.401 -21.676 -21.875 -22.083 -22.411 -22.649 -22.901 -23.02 -23.25 -23.507 -23.778 -23.92 -24.119 -24.412 -24.59 -24.768 -25.18 -25.397 -25.614 -25.863 -26.155 -26.511 -26.963 -28.4 -8 ,6450 ,KEBNE ,16708437,Fri Nov 26 17:08:29 CET,Fri Nov 26 18:44:01 CET,0.0 2.032 2.489 2.793 3.016 3.218 3.406 3.573 3.861 3.979 4.088 4.275 4.385 4.475 4.648 4.786 4.914 4.975 5.091 5.212 5.365 5.453 5.548 5.679 5.792 5.889 5.983 6.075 6.184 6.265 6.341 6.442 6.514 6.576 6.658 6.738 6.79 6.833 6.854 6.854 6.826 6.753 6.657 6.571 6.413 6.117 5.664 5.024 4.053 2.562 0.081 -2.757 -4.96 -6.791 -8.296 -9.584 -10.726 -11.735 -12.581 -13.435 -14.138 -14.739 -15.344 -15.89 -16.374 -16.827 -17.287 -17.682 -18.051 -18.449 -18.835 -19.153 -19.488 -19.836 -20.091 -20.346 -20.626 -20.9 -21.186 -21.403 -21.628 -21.948 -22.162 -22.384 -22.5 -22.753 -23.008 -23.272 -23.416 -23.614 -23.855 -23.997 -24.161 -24.542 -24.762 -24.998 -25.236 -25.485 -25.781 -26.2 -27.633 -9 ,26789 ,KEBNE ,16708438,Fri Nov 26 17:08:24 CET,Fri Nov 26 18:41:25 CET,0.0 1.26 1.619 1.9 2.122 2.327 2.506 2.641 2.894 3.007 3.116 3.324 3.442 3.539 3.711 3.854 3.989 4.054 4.169 4.285 4.458 4.556 4.644 4.777 4.913 5.027 5.126 5.221 5.341 5.429 5.505 5.601 5.691 5.771 5.852 5.926 5.967 5.991 6.03 6.062 6.035 5.971 5.859 5.706 5.488 5.177 4.76 4.149 3.17 1.656 -0.834 -3.635 -5.837 -7.642 -9.158 -10.521 -11.687 -12.677 -13.494 -14.299 -15.009 -15.642 -16.2 -16.701 -17.168 -17.593 -18.043 -18.432 -18.756 -19.11 -19.487 -19.797 -20.109 -20.433 -20.673 -20.932 -21.224 -21.507 -21.782 -21.964 -22.166 -22.479 -22.69 -22.923 -23.034 -23.269 -23.53 -23.799 -23.938 -24.132 -24.388 -24.55 -24.718 -25.081 -25.281 -25.502 -25.759 -26.027 -26.342 -26.777 -28.237 -10 ,11365 ,KEBNE ,16708439,Fri Nov 26 17:08:29 CET,Fri Nov 26 18:41:43 CET,0.0 1.551 1.951 2.243 2.458 2.648 2.812 2.946 3.173 3.268 3.369 3.547 3.656 3.748 3.919 4.067 4.197 4.252 4.348 4.442 4.568 4.648 4.731 4.858 4.985 5.105 5.204 5.296 5.42 5.507 5.588 5.684 5.743 5.784 5.832 5.9 5.954 5.997 6.05 6.07 6.048 6.008 5.914 5.783 5.568 5.266 4.816 4.137 3.162 1.678 -0.685 -3.457 -5.705 -7.539 -9.093 -10.442 -11.58 -12.563 -13.387 -14.219 -14.907 -15.489 -16.041 -16.552 -17.02 -17.452 -17.891 -18.278 -18.632 -19.001 -19.398 -19.736 -20.084 -20.433 -20.683 -20.939 -21.202 -21.466 -21.761 -21.96 -22.164 -22.504 -22.725 -22.948 -23.068 -23.297 -23.537 -23.814 -23.967 -24.176 -24.443 -24.602 -24.774 -25.168 -25.377 -25.594 -25.832 -26.118 -26.489 -26.946 -28.461 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_156_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_156_31.txt deleted file mode 100644 index 5fb95f2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_156_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23577 ,KEBNE ,16708440,Fri Nov 26 17:08:28 CET,Fri Nov 26 18:40:54 CET,0.0 0.828 1.18 1.437 1.656 1.858 2.025 2.171 2.442 2.581 2.711 2.894 3.002 3.089 3.263 3.428 3.582 3.66 3.797 3.913 4.082 4.19 4.291 4.424 4.548 4.67 4.796 4.911 5.046 5.183 5.309 5.465 5.626 5.778 5.935 6.095 6.227 6.363 6.521 6.67 6.788 6.886 7.006 7.121 7.19 7.193 7.113 6.876 6.428 5.648 4.213 2.307 0.568 -0.887 -2.078 -3.13 -4.085 -4.979 -5.737 -6.473 -7.1 -7.663 -8.186 -8.667 -9.112 -9.536 -9.965 -10.33 -10.642 -10.961 -11.308 -11.597 -11.879 -12.174 -12.413 -12.651 -12.896 -13.155 -13.421 -13.603 -13.785 -14.075 -14.286 -14.511 -14.626 -14.866 -15.119 -15.381 -15.521 -15.702 -15.97 -16.129 -16.298 -16.67 -16.884 -17.121 -17.387 -17.685 -18.033 -18.522 -20.152 -2 ,18462 ,KEBNE ,16708441,Fri Nov 26 17:08:25 CET,Fri Nov 26 18:43:16 CET,0.0 1.154 1.518 1.785 1.999 2.181 2.345 2.5 2.781 2.916 3.041 3.232 3.339 3.42 3.595 3.764 3.915 3.986 4.113 4.233 4.413 4.525 4.626 4.772 4.916 5.067 5.212 5.345 5.504 5.641 5.77 5.918 6.055 6.192 6.345 6.496 6.633 6.785 6.934 7.071 7.216 7.353 7.478 7.574 7.64 7.674 7.646 7.468 7.063 6.404 5.003 3.057 1.358 -0.069 -1.279 -2.45 -3.504 -4.43 -5.196 -5.939 -6.583 -7.154 -7.658 -8.121 -8.558 -8.949 -9.362 -9.743 -10.078 -10.415 -10.756 -11.038 -11.321 -11.62 -11.858 -12.102 -12.346 -12.598 -12.868 -13.055 -13.246 -13.536 -13.731 -13.933 -14.039 -14.259 -14.505 -14.765 -14.896 -15.069 -15.333 -15.493 -15.662 -16.056 -16.264 -16.483 -16.744 -17.027 -17.346 -17.797 -18.865 -3 ,13712 ,KEBNE ,16708442,Fri Nov 26 17:08:24 CET,Fri Nov 26 18:39:49 CET,0.0 1.636 2.097 2.41 2.656 2.853 3.018 3.173 3.452 3.575 3.696 3.894 4.007 4.094 4.259 4.417 4.564 4.631 4.76 4.881 5.041 5.151 5.272 5.44 5.593 5.748 5.887 6.006 6.169 6.321 6.451 6.593 6.717 6.841 6.987 7.138 7.273 7.409 7.548 7.689 7.832 7.979 8.118 8.219 8.313 8.376 8.316 8.148 7.836 7.118 5.636 3.766 2.054 0.536 -0.752 -1.883 -2.882 -3.77 -4.508 -5.266 -5.93 -6.522 -7.067 -7.561 -8.025 -8.441 -8.86 -9.236 -9.567 -9.908 -10.257 -10.543 -10.845 -11.16 -11.398 -11.653 -11.927 -12.193 -12.448 -12.626 -12.814 -13.111 -13.317 -13.523 -13.638 -13.878 -14.123 -14.377 -14.513 -14.692 -14.951 -15.103 -15.258 -15.595 -15.774 -15.973 -16.206 -16.474 -16.821 -17.259 -18.703 -4 ,1707 ,KEBNE ,16708443,Fri Nov 26 17:08:24 CET,Fri Nov 26 18:40:56 CET,0.0 0.94 1.255 1.491 1.707 1.908 2.088 2.252 2.53 2.66 2.777 2.974 3.093 3.187 3.358 3.514 3.671 3.751 3.904 4.035 4.206 4.319 4.429 4.575 4.719 4.858 4.986 5.102 5.246 5.383 5.518 5.675 5.818 5.947 6.076 6.227 6.37 6.523 6.68 6.835 6.972 7.082 7.197 7.312 7.424 7.469 7.421 7.274 6.955 6.224 4.629 2.428 0.597 -0.951 -2.315 -3.512 -4.492 -5.339 -6.074 -6.799 -7.415 -7.966 -8.48 -8.954 -9.394 -9.797 -10.222 -10.589 -10.894 -11.221 -11.572 -11.853 -12.137 -12.43 -12.672 -12.93 -13.196 -13.467 -13.75 -13.941 -14.129 -14.42 -14.633 -14.864 -14.98 -15.221 -15.475 -15.738 -15.873 -16.053 -16.312 -16.466 -16.622 -16.954 -17.157 -17.383 -17.628 -17.922 -18.275 -18.759 -20.292 -5 ,25544 ,KEBNE ,16708444,Fri Nov 26 17:08:24 CET,Fri Nov 26 18:41:04 CET,0.0 0.983 1.387 1.665 1.879 2.062 2.229 2.39 2.667 2.781 2.889 3.072 3.191 3.284 3.452 3.608 3.759 3.83 3.962 4.099 4.29 4.401 4.503 4.659 4.812 4.951 5.079 5.208 5.366 5.496 5.626 5.777 5.914 6.044 6.182 6.332 6.462 6.602 6.743 6.868 6.991 7.107 7.192 7.257 7.323 7.323 7.223 7.044 6.672 5.868 4.386 2.402 0.56 -1.02 -2.358 -3.523 -4.525 -5.424 -6.194 -6.971 -7.629 -8.202 -8.74 -9.226 -9.676 -10.09 -10.508 -10.874 -11.189 -11.512 -11.849 -12.135 -12.426 -12.725 -12.958 -13.203 -13.456 -13.712 -13.975 -14.158 -14.339 -14.619 -14.832 -15.051 -15.162 -15.404 -15.653 -15.915 -16.052 -16.224 -16.476 -16.63 -16.791 -17.176 -17.404 -17.633 -17.867 -18.164 -18.531 -18.996 -20.631 -6 ,28586 ,KEBNE ,16708445,Fri Nov 26 17:08:29 CET,Fri Nov 26 18:39:55 CET,0.0 1.374 1.752 2.069 2.321 2.533 2.719 2.883 3.181 3.316 3.441 3.632 3.745 3.844 4.034 4.204 4.37 4.446 4.583 4.716 4.906 5.019 5.125 5.268 5.402 5.534 5.659 5.787 5.954 6.11 6.256 6.424 6.563 6.676 6.816 6.975 7.111 7.254 7.4 7.549 7.704 7.83 7.937 8.016 8.059 8.049 7.969 7.79 7.362 6.533 4.936 2.709 0.775 -0.779 -2.016 -3.089 -4.034 -4.928 -5.723 -6.492 -7.125 -7.666 -8.175 -8.672 -9.146 -9.556 -9.972 -10.337 -10.661 -11.005 -11.368 -11.671 -11.97 -12.278 -12.515 -12.758 -13.008 -13.274 -13.541 -13.726 -13.92 -14.225 -14.442 -14.662 -14.774 -14.995 -15.231 -15.494 -15.634 -15.823 -16.108 -16.267 -16.433 -16.809 -17.018 -17.243 -17.49 -17.79 -18.152 -18.577 -19.879 -7 ,10087 ,KEBNE ,16708446,Fri Nov 26 17:08:29 CET,Fri Nov 26 18:40:58 CET,0.0 1.211 1.61 1.912 2.156 2.375 2.574 2.744 3.03 3.156 3.275 3.471 3.593 3.694 3.884 4.062 4.218 4.294 4.44 4.569 4.743 4.857 4.971 5.135 5.283 5.409 5.524 5.635 5.781 5.934 6.075 6.219 6.351 6.481 6.625 6.776 6.923 7.085 7.242 7.369 7.486 7.616 7.755 7.858 7.922 7.947 7.909 7.773 7.426 6.667 5.052 3.058 1.43 0.002 -1.231 -2.293 -3.211 -4.031 -4.722 -5.44 -6.08 -6.668 -7.225 -7.735 -8.198 -8.606 -9.027 -9.403 -9.71 -10.031 -10.389 -10.674 -10.955 -11.256 -11.498 -11.75 -12.004 -12.264 -12.535 -12.714 -12.899 -13.191 -13.397 -13.615 -13.726 -13.955 -14.192 -14.452 -14.59 -14.767 -15.016 -15.169 -15.336 -15.723 -15.936 -16.156 -16.396 -16.682 -17.025 -17.477 -19.148 -8 ,1824 ,KEBNE ,16708447,Fri Nov 26 17:08:29 CET,Fri Nov 26 18:41:10 CET,0.0 1.24 1.62 1.899 2.132 2.344 2.512 2.667 2.956 3.081 3.207 3.417 3.539 3.639 3.819 3.996 4.16 4.234 4.378 4.513 4.69 4.798 4.903 5.053 5.188 5.312 5.432 5.557 5.714 5.858 5.994 6.146 6.297 6.442 6.6 6.759 6.898 7.049 7.21 7.353 7.491 7.62 7.737 7.862 7.958 7.969 7.911 7.745 7.365 6.622 5.146 3.168 1.465 -0.023 -1.314 -2.48 -3.486 -4.372 -5.136 -5.886 -6.509 -7.067 -7.597 -8.088 -8.545 -8.951 -9.373 -9.763 -10.094 -10.428 -10.783 -11.079 -11.382 -11.696 -11.94 -12.2 -12.472 -12.746 -13.007 -13.187 -13.389 -13.696 -13.909 -14.141 -14.257 -14.494 -14.752 -15.028 -15.174 -15.358 -15.628 -15.784 -15.947 -16.306 -16.495 -16.697 -16.939 -17.235 -17.564 -17.93 -18.966 -9 ,12976 ,KEBNE ,16708448,Fri Nov 26 17:09:25 CET,Fri Nov 26 18:41:23 CET,0.0 1.293 1.65 1.924 2.171 2.374 2.552 2.728 3.026 3.145 3.26 3.45 3.563 3.653 3.825 3.99 4.142 4.209 4.337 4.471 4.671 4.793 4.908 5.076 5.248 5.414 5.562 5.684 5.827 5.963 6.09 6.252 6.399 6.525 6.679 6.837 6.969 7.115 7.263 7.391 7.497 7.626 7.761 7.874 7.989 8.037 7.966 7.796 7.452 6.618 5.076 3.247 1.598 0.083 -1.232 -2.389 -3.386 -4.3 -5.099 -5.884 -6.541 -7.123 -7.662 -8.148 -8.574 -8.949 -9.347 -9.709 -10.036 -10.379 -10.723 -11.003 -11.291 -11.591 -11.822 -12.065 -12.315 -12.58 -12.85 -13.034 -13.234 -13.543 -13.745 -13.955 -14.065 -14.292 -14.529 -14.786 -14.918 -15.092 -15.35 -15.5 -15.658 -16.024 -16.245 -16.49 -16.758 -17.034 -17.367 -17.88 -19.514 -10 ,18769 ,KEBNE ,16708449,Fri Nov 26 17:09:26 CET,Fri Nov 26 18:40:28 CET,0.0 0.989 1.378 1.661 1.878 2.052 2.21 2.365 2.647 2.777 2.898 3.111 3.234 3.336 3.535 3.701 3.848 3.919 4.056 4.191 4.399 4.529 4.641 4.79 4.924 5.05 5.172 5.287 5.443 5.589 5.721 5.887 6.057 6.204 6.35 6.497 6.625 6.751 6.875 6.994 7.122 7.277 7.435 7.591 7.718 7.749 7.694 7.532 7.151 6.375 4.891 2.934 1.194 -0.31 -1.573 -2.656 -3.568 -4.432 -5.18 -5.89 -6.519 -7.106 -7.621 -8.07 -8.514 -8.92 -9.331 -9.697 -10.014 -10.352 -10.72 -11.023 -11.327 -11.627 -11.857 -12.089 -12.328 -12.588 -12.862 -13.048 -13.23 -13.535 -13.758 -13.974 -14.083 -14.313 -14.536 -14.775 -14.919 -15.106 -15.382 -15.548 -15.717 -16.087 -16.298 -16.525 -16.773 -17.06 -17.411 -17.873 -19.38 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_15_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_15_163.txt deleted file mode 100644 index 9df66ea1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_15_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11337 ,KEBNE ,16708450,Fri Nov 26 17:10:27 CET,Fri Nov 26 18:42:29 CET,0.0 0.606 0.83 0.994 1.115 1.203 1.274 1.321 1.379 1.415 1.449 1.444 1.483 1.492 1.503 1.501 1.493 1.483 1.456 1.435 1.38 1.327 1.279 1.191 1.07 0.941 0.828 0.727 0.582 0.417 0.249 0.042 -0.178 -0.414 -0.724 -1.111 -1.506 -1.968 -2.504 -3.128 -3.838 -4.72 -5.833 -6.985 -8.417 -10.201 -12.55 -15.531 -19.509 -24.999 -33.119 -41.572 -47.765 -52.68 -56.61 -59.871 -62.565 -64.878 -66.801 -68.685 -70.224 -71.52 -72.719 -73.807 -74.789 -75.675 -76.602 -77.41 -78.06 -78.717 -79.396 -79.942 -80.522 -81.12 -81.563 -82.009 -82.461 -82.922 -83.401 -83.741 -84.09 -84.62 -84.985 -85.37 -85.57 -85.971 -86.369 -86.769 -86.975 -87.31 -87.63 -87.853 -88.076 -88.562 -88.824 -89.101 -89.413 -89.771 -90.21 -90.778 -92.265 -2 ,16723 ,KEBNE ,16708451,Fri Nov 26 17:10:32 CET,Fri Nov 26 18:39:02 CET,0.0 0.663 0.819 0.92 1.005 1.071 1.14 1.209 1.313 1.359 1.389 1.385 1.424 1.422 1.402 1.388 1.382 1.371 1.344 1.318 1.262 1.208 1.142 1.044 0.936 0.82 0.698 0.576 0.404 0.219 0.034 -0.197 -0.44 -0.698 -1.024 -1.402 -1.767 -2.206 -2.717 -3.314 -4.023 -4.895 -5.994 -7.19 -8.684 -10.539 -12.882 -15.802 -19.75 -25.212 -33.187 -41.523 -47.738 -52.56 -56.393 -59.607 -62.27 -64.573 -66.469 -68.262 -69.744 -71.024 -72.223 -73.344 -74.352 -75.242 -76.145 -76.922 -77.578 -78.254 -78.97 -79.568 -80.156 -80.742 -81.182 -81.617 -82.069 -82.527 -83.0 -83.328 -83.663 -84.191 -84.564 -84.945 -85.131 -85.496 -85.868 -86.267 -86.471 -86.8 -87.103 -87.33 -87.566 -88.082 -88.347 -88.603 -88.895 -89.24 -89.658 -90.166 -91.392 -3 ,21631 ,KEBNE ,16708452,Fri Nov 26 17:10:31 CET,Fri Nov 26 18:36:14 CET,0.0 0.668 0.896 1.032 1.104 1.152 1.192 1.229 1.308 1.34 1.364 1.367 1.412 1.418 1.423 1.421 1.416 1.41 1.382 1.338 1.279 1.237 1.19 1.128 1.057 0.969 0.868 0.762 0.626 0.462 0.267 0.008 -0.265 -0.52 -0.798 -1.125 -1.48 -1.95 -2.517 -3.15 -3.859 -4.686 -5.732 -6.897 -8.383 -10.232 -12.599 -15.622 -19.623 -25.086 -33.175 -41.659 -47.91 -52.798 -56.692 -59.911 -62.593 -64.923 -66.82 -68.615 -70.102 -71.395 -72.597 -73.697 -74.741 -75.705 -76.621 -77.392 -78.057 -78.728 -79.415 -79.967 -80.512 -81.083 -81.538 -82.002 -82.466 -82.938 -83.413 -83.737 -84.078 -84.589 -84.931 -85.292 -85.471 -85.83 -86.23 -86.638 -86.842 -87.175 -87.509 -87.735 -87.963 -88.455 -88.717 -89.011 -89.362 -89.758 -90.185 -90.706 -91.793 -4 ,6427 ,KEBNE ,16708453,Fri Nov 26 17:11:28 CET,Fri Nov 26 18:43:34 CET,0.0 0.691 0.878 0.994 1.08 1.156 1.212 1.257 1.325 1.361 1.39 1.396 1.441 1.445 1.444 1.436 1.419 1.409 1.378 1.345 1.296 1.253 1.205 1.124 1.019 0.888 0.746 0.614 0.436 0.23 0.015 -0.248 -0.52 -0.805 -1.146 -1.557 -2.001 -2.507 -3.069 -3.726 -4.458 -5.309 -6.385 -7.571 -9.071 -10.904 -13.262 -16.214 -20.138 -25.612 -33.74 -42.28 -48.578 -53.497 -57.453 -60.718 -63.391 -65.711 -67.633 -69.457 -70.965 -72.258 -73.447 -74.547 -75.541 -76.455 -77.389 -78.195 -78.865 -79.54 -80.235 -80.806 -81.382 -81.969 -82.434 -82.894 -83.348 -83.8 -84.26 -84.583 -84.909 -85.417 -85.774 -86.15 -86.346 -86.732 -87.132 -87.542 -87.76 -88.102 -88.433 -88.671 -88.923 -89.449 -89.726 -90.021 -90.33 -90.679 -91.065 -91.537 -92.58 -5 ,14977 ,KEBNE ,16708454,Fri Nov 26 17:11:28 CET,Fri Nov 26 18:43:10 CET,0.0 0.642 0.812 0.931 1.027 1.113 1.182 1.22 1.268 1.288 1.301 1.282 1.319 1.31 1.293 1.282 1.264 1.255 1.233 1.199 1.13 1.086 1.043 0.956 0.856 0.758 0.657 0.552 0.385 0.214 0.051 -0.16 -0.393 -0.646 -0.955 -1.332 -1.733 -2.198 -2.729 -3.356 -4.044 -4.879 -5.958 -7.124 -8.629 -10.512 -12.885 -15.833 -19.783 -25.279 -33.367 -41.74 -47.934 -52.755 -56.558 -59.754 -62.433 -64.729 -66.612 -68.419 -69.952 -71.264 -72.449 -73.53 -74.495 -75.384 -76.332 -77.158 -77.837 -78.506 -79.187 -79.76 -80.334 -80.909 -81.368 -81.836 -82.299 -82.777 -83.25 -83.569 -83.906 -84.447 -84.821 -85.179 -85.353 -85.713 -86.078 -86.465 -86.679 -87.019 -87.351 -87.591 -87.834 -88.356 -88.632 -88.92 -89.237 -89.576 -89.941 -90.374 -91.582 -6 ,12780 ,KEBNE ,16708455,Fri Nov 26 17:11:29 CET,Fri Nov 26 18:50:41 CET,0.0 0.742 0.94 1.068 1.149 1.202 1.242 1.274 1.309 1.323 1.35 1.355 1.397 1.41 1.438 1.444 1.423 1.41 1.388 1.366 1.304 1.254 1.202 1.11 1.016 0.918 0.825 0.719 0.547 0.395 0.249 0.066 -0.137 -0.362 -0.661 -1.064 -1.462 -1.879 -2.356 -2.967 -3.671 -4.503 -5.569 -6.745 -8.241 -10.107 -12.483 -15.497 -19.493 -24.967 -33.063 -41.486 -47.659 -52.497 -56.367 -59.61 -62.293 -64.583 -66.483 -68.342 -69.861 -71.153 -72.365 -73.474 -74.462 -75.371 -76.333 -77.147 -77.839 -78.551 -79.262 -79.83 -80.395 -80.973 -81.423 -81.868 -82.332 -82.82 -83.316 -83.65 -83.988 -84.514 -84.867 -85.217 -85.403 -85.797 -86.209 -86.623 -86.823 -87.158 -87.476 -87.703 -87.941 -88.439 -88.706 -89.002 -89.323 -89.689 -90.115 -90.655 -91.816 -7 ,1862 ,KEBNE ,16708456,Fri Nov 26 17:11:28 CET,Fri Nov 26 18:43:18 CET,0.0 0.642 0.892 1.079 1.199 1.28 1.345 1.387 1.435 1.451 1.456 1.437 1.466 1.455 1.438 1.403 1.37 1.36 1.345 1.327 1.287 1.261 1.232 1.173 1.082 0.979 0.891 0.784 0.606 0.445 0.279 0.04 -0.218 -0.5 -0.853 -1.281 -1.709 -2.209 -2.753 -3.349 -4.053 -4.913 -6.021 -7.225 -8.717 -10.546 -12.922 -15.937 -19.931 -25.428 -33.516 -41.969 -48.205 -53.11 -57.021 -60.281 -62.953 -65.223 -67.107 -68.925 -70.422 -71.696 -72.88 -73.967 -74.962 -75.86 -76.764 -77.561 -78.236 -78.927 -79.624 -80.197 -80.777 -81.342 -81.784 -82.239 -82.69 -83.147 -83.618 -83.942 -84.271 -84.761 -85.099 -85.471 -85.662 -86.028 -86.422 -86.832 -87.03 -87.358 -87.668 -87.905 -88.155 -88.667 -88.94 -89.243 -89.564 -89.902 -90.311 -90.794 -92.045 -8 ,12395 ,KEBNE ,16708457,Fri Nov 26 17:11:28 CET,Fri Nov 26 18:43:38 CET,0.0 0.954 1.172 1.296 1.365 1.439 1.521 1.582 1.651 1.671 1.685 1.653 1.68 1.679 1.688 1.686 1.664 1.649 1.645 1.635 1.586 1.543 1.5 1.436 1.349 1.255 1.167 1.084 0.965 0.822 0.646 0.411 0.166 -0.074 -0.347 -0.714 -1.123 -1.584 -2.071 -2.646 -3.313 -4.131 -5.207 -6.375 -7.854 -9.683 -12.029 -14.966 -18.916 -24.376 -32.402 -40.821 -47.006 -51.881 -55.78 -58.963 -61.58 -63.864 -65.761 -67.614 -69.176 -70.482 -71.702 -72.841 -73.824 -74.726 -75.662 -76.438 -77.099 -77.788 -78.512 -79.087 -79.653 -80.23 -80.669 -81.115 -81.579 -82.061 -82.558 -82.909 -83.267 -83.811 -84.183 -84.564 -84.757 -85.145 -85.557 -85.977 -86.187 -86.527 -86.853 -87.091 -87.34 -87.869 -88.165 -88.484 -88.823 -89.169 -89.511 -89.928 -91.126 -9 ,31143 ,KEBNE ,16708458,Fri Nov 26 17:11:28 CET,Fri Nov 26 18:43:28 CET,0.0 0.637 0.826 0.947 1.049 1.131 1.191 1.243 1.34 1.37 1.383 1.378 1.43 1.45 1.486 1.5 1.487 1.479 1.456 1.417 1.33 1.263 1.207 1.12 1.025 0.919 0.807 0.713 0.566 0.382 0.206 -0.003 -0.234 -0.481 -0.784 -1.161 -1.559 -2.029 -2.582 -3.218 -3.928 -4.788 -5.875 -7.052 -8.561 -10.416 -12.769 -15.753 -19.754 -25.197 -33.193 -41.612 -47.859 -52.71 -56.56 -59.792 -62.445 -64.771 -66.699 -68.556 -70.106 -71.429 -72.651 -73.754 -74.746 -75.629 -76.533 -77.32 -77.996 -78.679 -79.362 -79.921 -80.496 -81.093 -81.561 -82.036 -82.511 -82.999 -83.475 -83.792 -84.119 -84.611 -84.97 -85.347 -85.534 -85.915 -86.317 -86.741 -86.95 -87.291 -87.62 -87.848 -88.078 -88.572 -88.852 -89.15 -89.455 -89.773 -90.157 -90.698 -91.729 -10 ,13359 ,KEBNE ,16708459,Fri Nov 26 17:11:28 CET,Fri Nov 26 18:43:27 CET,0.0 0.641 0.803 0.926 1.036 1.124 1.189 1.256 1.353 1.377 1.391 1.364 1.402 1.417 1.445 1.468 1.482 1.485 1.478 1.463 1.425 1.385 1.331 1.257 1.184 1.099 1.005 0.904 0.779 0.632 0.44 0.191 -0.056 -0.32 -0.659 -1.07 -1.49 -1.984 -2.547 -3.172 -3.862 -4.719 -5.824 -7.004 -8.504 -10.343 -12.691 -15.692 -19.666 -25.088 -33.089 -41.504 -47.675 -52.462 -56.305 -59.543 -62.204 -64.5 -66.396 -68.204 -69.686 -70.964 -72.154 -73.254 -74.257 -75.126 -76.02 -76.818 -77.516 -78.239 -78.978 -79.57 -80.141 -80.715 -81.145 -81.575 -82.016 -82.491 -82.991 -83.318 -83.635 -84.131 -84.483 -84.85 -85.033 -85.393 -85.76 -86.154 -86.361 -86.689 -87.004 -87.236 -87.474 -87.973 -88.253 -88.567 -88.908 -89.301 -89.747 -90.26 -91.522 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_15_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_15_25.txt deleted file mode 100644 index 44820c90..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_15_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30458 ,KEBNE ,16708460,Fri Nov 26 17:11:28 CET,Fri Nov 26 18:43:19 CET,0.0 1.641 2.043 2.393 2.707 2.968 3.2 3.416 3.797 3.969 4.139 4.433 4.618 4.762 5.049 5.318 5.566 5.688 5.919 6.151 6.479 6.696 6.908 7.222 7.549 7.861 8.149 8.429 8.807 9.175 9.512 9.9 10.258 10.604 11.021 11.538 12.059 12.596 13.164 13.783 14.469 15.245 16.159 17.111 18.219 19.453 20.926 22.664 24.739 27.281 30.514 33.298 35.048 36.188 36.938 37.5 37.85 38.078 38.255 38.383 38.449 38.506 38.541 38.535 38.507 38.444 38.346 38.244 38.159 38.079 37.974 37.858 37.749 37.649 37.563 37.464 37.329 37.176 37.013 36.907 36.816 36.66 36.517 36.371 36.307 36.146 35.956 35.782 35.692 35.595 35.37 35.246 35.105 34.794 34.626 34.429 34.176 33.883 33.552 33.1 31.187 -2 ,11526 ,KEBNE ,16708461,Fri Nov 26 17:11:28 CET,Fri Nov 26 18:43:16 CET,0.0 1.794 2.226 2.553 2.831 3.067 3.285 3.496 3.9 4.093 4.272 4.57 4.765 4.921 5.193 5.444 5.702 5.828 6.08 6.323 6.679 6.917 7.142 7.451 7.757 8.057 8.336 8.618 8.999 9.359 9.712 10.127 10.512 10.913 11.399 11.947 12.469 13.058 13.685 14.31 14.979 15.738 16.624 17.561 18.703 19.979 21.466 23.176 25.257 27.865 31.158 34.026 35.789 36.931 37.688 38.234 38.627 38.907 39.085 39.218 39.292 39.325 39.324 39.289 39.26 39.224 39.122 39.004 38.915 38.826 38.721 38.628 38.539 38.437 38.338 38.227 38.098 37.969 37.853 37.76 37.65 37.496 37.385 37.26 37.194 37.031 36.855 36.682 36.589 36.483 36.225 36.083 35.93 35.605 35.43 35.229 35.003 34.738 34.419 33.984 32.121 -3 ,12235 ,KEBNE ,16708462,Fri Nov 26 17:12:29 CET,Fri Nov 26 18:44:26 CET,0.0 1.872 2.576 3.068 3.405 3.657 3.889 4.092 4.472 4.648 4.813 5.095 5.275 5.413 5.683 5.945 6.203 6.324 6.559 6.797 7.149 7.372 7.579 7.878 8.177 8.473 8.747 9.006 9.328 9.639 9.977 10.403 10.775 11.125 11.538 12.008 12.46 12.979 13.564 14.219 14.908 15.658 16.551 17.467 18.553 19.785 21.257 22.973 25.05 27.584 30.826 33.653 35.399 36.539 37.301 37.853 38.244 38.521 38.687 38.806 38.855 38.846 38.807 38.773 38.72 38.656 38.598 38.522 38.447 38.367 38.259 38.14 38.003 37.864 37.756 37.636 37.522 37.419 37.318 37.23 37.131 36.966 36.826 36.676 36.599 36.428 36.241 36.031 35.917 35.809 35.568 35.432 35.278 34.935 34.746 34.533 34.292 34.017 33.673 33.249 31.52 -4 ,6924 ,KEBNE ,16708463,Fri Nov 26 17:12:29 CET,Fri Nov 26 18:44:07 CET,0.0 1.866 2.338 2.685 2.992 3.255 3.484 3.682 4.032 4.206 4.381 4.669 4.842 4.987 5.261 5.508 5.749 5.876 6.137 6.38 6.72 6.932 7.121 7.405 7.695 7.977 8.268 8.564 8.944 9.309 9.667 10.078 10.458 10.85 11.319 11.849 12.368 12.89 13.446 14.08 14.742 15.516 16.445 17.361 18.473 19.74 21.218 22.943 25.033 27.563 30.791 33.65 35.394 36.486 37.193 37.728 38.109 38.368 38.56 38.701 38.781 38.843 38.851 38.834 38.817 38.783 38.74 38.688 38.584 38.472 38.396 38.303 38.183 38.059 37.968 37.861 37.739 37.611 37.475 37.393 37.296 37.136 37.029 36.903 36.824 36.662 36.503 36.323 36.235 36.151 35.936 35.82 35.698 35.413 35.233 35.045 34.843 34.579 34.207 33.672 30.929 -5 ,9572 ,KEBNE ,16708464,Fri Nov 26 17:12:30 CET,Fri Nov 26 18:45:05 CET,0.0 1.724 2.136 2.462 2.757 3.019 3.239 3.444 3.829 4.001 4.165 4.454 4.646 4.8 5.098 5.381 5.658 5.794 6.06 6.299 6.61 6.806 7.012 7.32 7.613 7.892 8.182 8.491 8.856 9.177 9.488 9.885 10.306 10.733 11.199 11.726 12.233 12.759 13.337 13.955 14.605 15.356 16.257 17.189 18.309 19.571 21.041 22.722 24.767 27.281 30.472 33.324 35.036 36.161 36.944 37.494 37.858 38.062 38.193 38.309 38.392 38.424 38.437 38.422 38.366 38.308 38.218 38.134 38.065 37.981 37.885 37.792 37.693 37.575 37.481 37.379 37.256 37.106 36.961 36.873 36.777 36.622 36.491 36.349 36.278 36.133 35.997 35.832 35.728 35.629 35.414 35.295 35.154 34.846 34.67 34.469 34.237 33.977 33.651 33.098 30.848 -6 ,25031 ,KEBNE ,16708465,Fri Nov 26 17:12:33 CET,Fri Nov 26 18:40:29 CET,0.0 1.234 1.682 2.007 2.268 2.504 2.711 2.913 3.304 3.488 3.657 3.941 4.124 4.266 4.543 4.801 5.038 5.152 5.385 5.618 5.963 6.193 6.421 6.731 7.013 7.288 7.563 7.838 8.185 8.515 8.839 9.245 9.635 10.021 10.465 10.953 11.447 11.982 12.538 13.135 13.808 14.575 15.449 16.349 17.411 18.648 20.131 21.844 23.909 26.473 29.771 32.64 34.389 35.556 36.353 36.882 37.252 37.524 37.693 37.824 37.897 37.925 37.94 37.944 37.908 37.863 37.78 37.678 37.575 37.459 37.354 37.269 37.183 37.084 36.988 36.885 36.767 36.632 36.51 36.418 36.304 36.111 35.973 35.831 35.764 35.642 35.498 35.308 35.211 35.118 34.879 34.741 34.589 34.25 34.069 33.873 33.647 33.373 33.016 32.528 30.483 -7 ,19803 ,KEBNE ,16708466,Fri Nov 26 17:12:29 CET,Fri Nov 26 18:45:24 CET,0.0 2.306 2.765 3.079 3.361 3.621 3.873 4.094 4.47 4.653 4.833 5.124 5.302 5.449 5.739 6.015 6.276 6.401 6.651 6.894 7.242 7.469 7.681 7.99 8.288 8.576 8.856 9.122 9.462 9.802 10.135 10.522 10.894 11.259 11.701 12.232 12.757 13.31 13.882 14.486 15.147 15.914 16.794 17.697 18.776 20.025 21.493 23.192 25.248 27.782 31.028 33.855 35.595 36.779 37.613 38.209 38.587 38.842 39.021 39.15 39.218 39.227 39.218 39.2 39.167 39.129 39.059 38.973 38.874 38.763 38.649 38.515 38.377 38.252 38.161 38.058 37.936 37.808 37.67 37.572 37.468 37.312 37.185 37.026 36.948 36.799 36.619 36.412 36.307 36.202 35.966 35.839 35.698 35.362 35.166 34.979 34.762 34.497 34.193 33.706 31.338 -8 ,8637 ,KEBNE ,16708467,Fri Nov 26 17:12:29 CET,Fri Nov 26 18:44:12 CET,0.0 1.714 2.193 2.533 2.832 3.096 3.33 3.559 3.989 4.184 4.351 4.629 4.812 4.957 5.23 5.5 5.756 5.869 6.104 6.345 6.705 6.932 7.148 7.471 7.796 8.113 8.394 8.655 9.025 9.372 9.715 10.143 10.516 10.872 11.297 11.779 12.254 12.762 13.306 13.894 14.538 15.302 16.212 17.124 18.193 19.45 20.958 22.665 24.687 27.198 30.469 33.335 35.099 36.277 37.084 37.643 38.044 38.343 38.546 38.687 38.775 38.823 38.805 38.773 38.747 38.703 38.632 38.555 38.459 38.34 38.228 38.133 38.039 37.94 37.838 37.726 37.623 37.485 37.308 37.184 37.062 36.876 36.749 36.615 36.535 36.369 36.216 36.055 35.961 35.863 35.644 35.52 35.379 35.056 34.874 34.671 34.435 34.166 33.857 33.376 30.279 -9 ,12664 ,KEBNE ,16708468,Fri Nov 26 17:12:29 CET,Fri Nov 26 18:44:21 CET,0.0 1.406 1.861 2.194 2.462 2.714 2.957 3.181 3.558 3.726 3.905 4.221 4.412 4.569 4.858 5.13 5.398 5.535 5.799 6.033 6.378 6.606 6.816 7.116 7.412 7.705 7.995 8.275 8.631 8.992 9.347 9.765 10.144 10.505 10.938 11.453 11.965 12.51 13.101 13.743 14.419 15.169 16.053 16.972 18.075 19.339 20.818 22.521 24.588 27.156 30.432 33.25 34.95 36.066 36.831 37.355 37.749 38.045 38.194 38.285 38.324 38.332 38.333 38.312 38.284 38.238 38.143 38.052 37.977 37.875 37.738 37.625 37.506 37.392 37.31 37.201 37.067 36.942 36.827 36.732 36.631 36.454 36.318 36.179 36.101 35.938 35.776 35.591 35.493 35.392 35.145 35.006 34.869 34.6 34.44 34.256 34.048 33.805 33.469 32.963 31.184 -10 ,21860 ,KEBNE ,16708469,Fri Nov 26 17:12:29 CET,Fri Nov 26 18:44:16 CET,0.0 1.261 1.686 2.026 2.334 2.603 2.835 3.047 3.449 3.634 3.827 4.138 4.322 4.473 4.762 5.028 5.272 5.398 5.634 5.86 6.197 6.414 6.638 6.954 7.233 7.503 7.779 8.059 8.408 8.751 9.116 9.562 9.98 10.386 10.86 11.375 11.882 12.431 12.996 13.622 14.293 15.03 15.901 16.802 17.87 19.086 20.539 22.253 24.347 26.901 30.128 32.888 34.579 35.712 36.485 37.045 37.421 37.659 37.833 37.959 38.045 38.107 38.118 38.109 38.084 38.047 37.986 37.909 37.832 37.74 37.645 37.544 37.439 37.329 37.237 37.137 36.999 36.85 36.701 36.58 36.453 36.266 36.134 35.998 35.923 35.762 35.572 35.373 35.269 35.163 34.924 34.794 34.662 34.361 34.187 33.973 33.721 33.44 33.117 32.659 29.973 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_15_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_15_252.txt deleted file mode 100644 index 2d7e197c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_15_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19822 ,KEBNE ,16708470,Fri Nov 26 17:13:34 CET,Fri Nov 26 18:45:33 CET,0.0 0.809 1.01 1.114 1.159 1.168 1.166 1.16 1.129 1.104 1.056 0.9 0.864 0.784 0.616 0.437 0.227 0.119 -0.107 -0.318 -0.611 -0.83 -1.063 -1.4 -1.739 -2.092 -2.458 -2.829 -3.322 -3.84 -4.375 -5.052 -5.727 -6.425 -7.29 -8.302 -9.302 -10.438 -11.755 -13.243 -14.935 -17.004 -19.566 -22.316 -25.753 -29.87 -35.069 -41.6 -50.145 -61.651 -78.345 -95.492 -107.867 -117.384 -124.927 -131.219 -136.366 -140.757 -144.404 -147.859 -150.667 -153.065 -155.263 -157.277 -159.091 -160.739 -162.425 -163.877 -165.111 -166.336 -167.579 -168.601 -169.627 -170.664 -171.443 -172.237 -173.057 -173.89 -174.743 -175.331 -175.907 -176.763 -177.358 -177.977 -178.288 -178.905 -179.541 -180.216 -180.57 -181.158 -181.667 -182.046 -182.433 -183.246 -183.682 -184.132 -184.629 -185.199 -185.842 -186.628 -188.348 -2 ,11763 ,KEBNE ,16708471,Fri Nov 26 17:13:30 CET,Fri Nov 26 18:46:11 CET,0.0 0.986 1.177 1.312 1.4 1.432 1.43 1.415 1.358 1.326 1.291 1.155 1.127 1.06 0.902 0.741 0.577 0.49 0.311 0.118 -0.225 -0.457 -0.674 -1.0 -1.341 -1.679 -2.022 -2.373 -2.853 -3.384 -3.893 -4.525 -5.19 -5.847 -6.679 -7.677 -8.669 -9.852 -11.217 -12.731 -14.41 -16.441 -19.008 -21.739 -25.151 -29.296 -34.489 -40.968 -49.471 -60.96 -77.584 -94.636 -107.021 -116.609 -124.209 -130.504 -135.754 -140.247 -143.866 -147.301 -150.133 -152.576 -154.838 -156.87 -158.709 -160.364 -162.056 -163.558 -164.818 -166.09 -167.376 -168.417 -169.48 -170.544 -171.341 -172.141 -172.949 -173.778 -174.637 -175.211 -175.787 -176.68 -177.288 -177.908 -178.218 -178.848 -179.491 -180.135 -180.489 -181.083 -181.574 -181.952 -182.332 -183.125 -183.562 -184.035 -184.53 -185.054 -185.665 -186.428 -188.109 -3 ,20456 ,KEBNE ,16708472,Fri Nov 26 17:13:30 CET,Fri Nov 26 18:45:23 CET,0.0 1.266 1.495 1.585 1.64 1.667 1.667 1.648 1.601 1.565 1.513 1.367 1.338 1.275 1.127 0.96 0.776 0.682 0.498 0.299 -0.006 -0.215 -0.437 -0.787 -1.112 -1.435 -1.774 -2.119 -2.609 -3.126 -3.648 -4.321 -5.022 -5.739 -6.593 -7.575 -8.573 -9.729 -11.092 -12.636 -14.314 -16.322 -18.837 -21.557 -24.994 -29.156 -34.333 -40.73 -49.175 -60.628 -77.264 -94.463 -106.914 -116.529 -124.107 -130.383 -135.596 -140.045 -143.709 -147.193 -150.009 -152.45 -154.695 -156.7 -158.518 -160.158 -161.836 -163.3 -164.545 -165.798 -167.074 -168.134 -169.205 -170.268 -171.05 -171.831 -172.647 -173.502 -174.387 -174.974 -175.553 -176.452 -177.075 -177.697 -178.002 -178.627 -179.261 -179.919 -180.263 -180.828 -181.313 -181.693 -182.08 -182.905 -183.349 -183.808 -184.279 -184.782 -185.387 -186.191 -188.128 -4 ,7553 ,KEBNE ,16708473,Fri Nov 26 17:13:30 CET,Fri Nov 26 18:46:37 CET,0.0 0.844 0.98 1.057 1.127 1.178 1.189 1.164 1.1 1.059 1.006 0.837 0.793 0.726 0.609 0.455 0.274 0.187 0.014 -0.176 -0.466 -0.654 -0.864 -1.201 -1.551 -1.89 -2.239 -2.632 -3.165 -3.702 -4.234 -4.893 -5.597 -6.317 -7.176 -8.2 -9.237 -10.376 -11.656 -13.156 -14.855 -16.897 -19.431 -22.165 -25.602 -29.736 -34.935 -41.404 -49.877 -61.443 -78.222 -95.358 -107.733 -117.237 -124.782 -131.118 -136.328 -140.802 -144.454 -147.904 -150.779 -153.245 -155.519 -157.599 -159.498 -161.161 -162.817 -164.254 -165.456 -166.683 -167.92 -168.944 -169.988 -171.019 -171.796 -172.606 -173.447 -174.279 -175.134 -175.721 -176.312 -177.218 -177.825 -178.455 -178.777 -179.407 -180.055 -180.712 -181.047 -181.626 -182.129 -182.523 -182.921 -183.715 -184.139 -184.589 -185.06 -185.603 -186.206 -186.905 -188.831 -5 ,6584 ,KEBNE ,16708474,Fri Nov 26 17:13:31 CET,Fri Nov 26 18:53:34 CET,0.0 1.02 1.233 1.348 1.388 1.418 1.429 1.404 1.335 1.286 1.224 1.065 1.033 0.964 0.818 0.65 0.467 0.372 0.183 -0.024 -0.36 -0.581 -0.802 -1.141 -1.484 -1.83 -2.182 -2.551 -3.077 -3.618 -4.16 -4.855 -5.555 -6.244 -7.086 -8.071 -9.076 -10.26 -11.586 -13.09 -14.796 -16.867 -19.441 -22.178 -25.617 -29.762 -34.929 -41.348 -49.824 -61.328 -78.043 -95.275 -107.679 -117.221 -124.813 -131.16 -136.332 -140.696 -144.259 -147.669 -150.494 -152.928 -155.202 -157.28 -159.119 -160.741 -162.383 -163.827 -165.074 -166.326 -167.578 -168.626 -169.705 -170.795 -171.62 -172.457 -173.293 -174.127 -174.967 -175.521 -176.098 -176.991 -177.601 -178.23 -178.549 -179.183 -179.817 -180.486 -180.828 -181.403 -181.895 -182.262 -182.646 -183.476 -183.928 -184.415 -184.941 -185.535 -186.218 -186.995 -188.982 -6 ,9747 ,KEBNE ,16708475,Fri Nov 26 17:13:34 CET,Fri Nov 26 18:41:25 CET,0.0 0.648 0.828 0.913 0.964 0.977 0.966 0.95 0.882 0.837 0.772 0.601 0.575 0.501 0.327 0.149 -0.042 -0.128 -0.308 -0.516 -0.829 -1.02 -1.22 -1.568 -1.917 -2.257 -2.61 -2.979 -3.491 -4.002 -4.512 -5.186 -5.869 -6.539 -7.389 -8.414 -9.408 -10.572 -11.953 -13.498 -15.199 -17.218 -19.733 -22.458 -25.889 -30.021 -35.212 -41.692 -50.195 -61.659 -78.347 -95.543 -108.06 -117.73 -125.389 -131.741 -136.936 -141.425 -145.121 -148.574 -151.421 -153.902 -156.188 -158.276 -160.136 -161.784 -163.447 -164.876 -166.1 -167.346 -168.638 -169.681 -170.701 -171.739 -172.561 -173.392 -174.221 -175.054 -175.883 -176.454 -177.048 -177.934 -178.526 -179.142 -179.446 -180.068 -180.716 -181.375 -181.716 -182.279 -182.752 -183.12 -183.496 -184.271 -184.688 -185.138 -185.621 -186.138 -186.733 -187.507 -189.612 -7 ,16450 ,KEBNE ,16708476,Fri Nov 26 17:13:30 CET,Fri Nov 26 18:47:06 CET,0.0 0.658 0.804 0.888 0.938 0.974 0.978 0.96 0.894 0.849 0.801 0.65 0.608 0.534 0.374 0.197 0.023 -0.069 -0.254 -0.446 -0.735 -0.927 -1.128 -1.436 -1.767 -2.119 -2.471 -2.847 -3.37 -3.863 -4.366 -5.052 -5.754 -6.449 -7.305 -8.334 -9.365 -10.519 -11.811 -13.311 -15.009 -17.023 -19.546 -22.3 -25.739 -29.867 -35.044 -41.477 -49.961 -61.502 -78.268 -95.569 -108.108 -117.712 -125.317 -131.637 -136.793 -141.219 -144.89 -148.37 -151.184 -153.567 -155.789 -157.829 -159.659 -161.306 -163.005 -164.455 -165.659 -166.904 -168.202 -169.245 -170.294 -171.375 -172.194 -172.996 -173.791 -174.61 -175.451 -176.027 -176.618 -177.502 -178.097 -178.7 -179.007 -179.634 -180.264 -180.91 -181.242 -181.812 -182.293 -182.649 -183.029 -183.89 -184.348 -184.823 -185.315 -185.833 -186.481 -187.274 -189.259 -8 ,16847 ,KEBNE ,16708477,Fri Nov 26 17:13:30 CET,Fri Nov 26 18:46:26 CET,0.0 0.809 1.017 1.122 1.167 1.192 1.194 1.175 1.12 1.076 1.031 0.907 0.878 0.806 0.65 0.496 0.329 0.243 0.085 -0.101 -0.41 -0.618 -0.836 -1.168 -1.498 -1.828 -2.171 -2.539 -3.046 -3.544 -4.041 -4.676 -5.327 -6.024 -6.894 -7.91 -8.943 -10.146 -11.52 -13.068 -14.787 -16.833 -19.395 -22.133 -25.525 -29.665 -34.859 -41.342 -49.898 -61.447 -78.21 -95.333 -107.729 -117.369 -124.965 -131.224 -136.358 -140.774 -144.39 -147.798 -150.652 -153.103 -155.346 -157.392 -159.213 -160.85 -162.528 -163.968 -165.176 -166.408 -167.645 -168.625 -169.638 -170.688 -171.493 -172.305 -173.116 -173.957 -174.81 -175.371 -175.951 -176.823 -177.415 -178.036 -178.35 -178.988 -179.645 -180.324 -180.664 -181.228 -181.732 -182.117 -182.503 -183.327 -183.752 -184.183 -184.648 -185.168 -185.768 -186.507 -188.37 -9 ,24491 ,KEBNE ,16708478,Fri Nov 26 17:14:31 CET,Fri Nov 26 18:47:29 CET,0.0 0.831 1.027 1.111 1.151 1.18 1.202 1.212 1.155 1.111 1.07 0.949 0.936 0.886 0.758 0.605 0.443 0.362 0.187 -0.006 -0.314 -0.52 -0.73 -1.057 -1.386 -1.715 -2.067 -2.444 -2.953 -3.452 -3.94 -4.557 -5.205 -5.874 -6.718 -7.734 -8.722 -9.873 -11.224 -12.77 -14.485 -16.522 -19.059 -21.802 -25.233 -29.363 -34.578 -41.027 -49.485 -60.953 -77.57 -94.628 -107.023 -116.647 -124.301 -130.559 -135.7 -140.085 -143.657 -147.076 -149.897 -152.32 -154.582 -156.666 -158.501 -160.149 -161.836 -163.283 -164.495 -165.709 -166.97 -167.998 -169.057 -170.13 -170.911 -171.69 -172.506 -173.347 -174.201 -174.78 -175.349 -176.219 -176.834 -177.47 -177.789 -178.421 -179.074 -179.737 -180.069 -180.641 -181.124 -181.493 -181.886 -182.681 -183.096 -183.568 -184.048 -184.538 -185.141 -185.892 -187.488 -10 ,19415 ,KEBNE ,16708479,Fri Nov 26 17:14:31 CET,Fri Nov 26 18:46:25 CET,0.0 0.944 1.103 1.176 1.209 1.227 1.226 1.203 1.121 1.08 1.034 0.877 0.841 0.775 0.636 0.486 0.319 0.233 0.059 -0.131 -0.448 -0.657 -0.867 -1.192 -1.519 -1.882 -2.25 -2.613 -3.113 -3.623 -4.127 -4.783 -5.468 -6.137 -6.968 -7.972 -8.966 -10.107 -11.438 -12.96 -14.658 -16.694 -19.239 -21.993 -25.455 -29.6 -34.789 -41.218 -49.661 -61.098 -77.675 -94.791 -107.229 -116.755 -124.291 -130.591 -135.783 -140.224 -143.844 -147.256 -150.059 -152.488 -154.737 -156.769 -158.606 -160.276 -161.952 -163.399 -164.621 -165.815 -167.056 -168.08 -169.098 -170.166 -170.978 -171.775 -172.604 -173.442 -174.288 -174.874 -175.464 -176.338 -176.923 -177.514 -177.817 -178.458 -179.093 -179.762 -180.116 -180.693 -181.181 -181.543 -181.918 -182.725 -183.163 -183.624 -184.114 -184.651 -185.313 -186.153 -188.346 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_164.txt deleted file mode 100644 index 8df6016b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_164.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,25325 ,KEBNE ,16708482,Fri Nov 26 17:17:35 CET,Fri Nov 26 18:49:42 CET,0.0 1.344 1.731 2.017 2.265 2.491 2.69 2.866 3.181 3.319 3.458 3.613 3.866 3.983 4.203 4.423 4.638 4.744 4.951 5.153 5.443 5.62 5.788 6.042 6.278 6.498 6.706 6.903 7.163 7.423 7.679 7.984 8.278 8.559 8.887 9.269 9.633 10.035 10.484 10.97 11.481 12.063 12.749 13.42 14.225 15.141 16.205 17.403 18.741 20.298 22.229 23.724 24.467 24.802 24.921 24.932 24.882 24.743 24.583 24.436 24.29 24.143 23.982 23.817 23.662 23.52 23.368 23.235 23.106 22.949 22.785 22.66 22.527 22.384 22.269 22.149 22.028 21.896 21.745 21.646 21.547 21.381 21.261 21.133 21.066 20.929 20.781 20.63 20.555 20.365 20.286 20.188 20.085 19.864 19.736 19.583 19.422 19.24 18.987 18.648 17.687 -4 ,3576 ,KEBNE ,16708483,Fri Nov 26 17:17:34 CET,Fri Nov 26 18:50:41 CET,0.0 1.261 1.647 1.926 2.162 2.378 2.584 2.772 3.107 3.266 3.42 3.567 3.815 3.939 4.184 4.422 4.651 4.761 4.967 5.162 5.44 5.618 5.792 6.04 6.271 6.502 6.725 6.942 7.227 7.503 7.774 8.096 8.403 8.701 9.041 9.431 9.823 10.271 10.749 11.247 11.78 12.366 13.049 13.749 14.61 15.583 16.705 17.977 19.368 21.027 22.887 24.176 24.843 25.178 25.27 25.269 25.215 25.076 24.915 24.756 24.622 24.497 24.349 24.178 24.005 23.836 23.666 23.525 23.399 23.262 23.111 22.983 22.839 22.674 22.554 22.431 22.297 22.159 22.014 21.904 21.791 21.616 21.492 21.358 21.285 21.127 20.963 20.789 20.693 20.501 20.405 20.293 20.181 19.924 19.772 19.607 19.427 19.228 19.002 18.698 17.831 -5 ,2111 ,KEBNE ,16708484,Fri Nov 26 17:18:36 CET,Fri Nov 26 18:51:56 CET,0.0 1.337 1.712 1.986 2.225 2.436 2.615 2.78 3.052 3.179 3.306 3.425 3.666 3.777 3.998 4.213 4.415 4.511 4.698 4.882 5.144 5.312 5.482 5.733 5.963 6.183 6.405 6.617 6.897 7.179 7.456 7.801 8.128 8.432 8.795 9.208 9.6 10.028 10.483 10.955 11.468 12.072 12.782 13.515 14.359 15.259 16.308 17.496 18.895 20.558 22.479 23.847 24.466 24.736 24.812 24.776 24.672 24.532 24.389 24.206 24.024 23.851 23.679 23.51 23.348 23.21 23.058 22.922 22.788 22.625 22.465 22.327 22.181 22.039 21.936 21.817 21.681 21.539 21.39 21.29 21.186 21.027 20.911 20.784 20.716 20.577 20.441 20.29 20.209 20.019 19.93 19.829 19.73 19.511 19.383 19.251 19.103 18.933 18.719 18.414 17.685 -6 ,32375 ,KEBNE ,16708485,Fri Nov 26 17:18:36 CET,Fri Nov 26 18:52:08 CET,0.0 0.75 1.059 1.298 1.509 1.702 1.89 2.079 2.399 2.538 2.668 2.791 3.029 3.143 3.358 3.565 3.764 3.86 4.049 4.238 4.513 4.693 4.867 5.122 5.377 5.625 5.851 6.059 6.332 6.606 6.881 7.214 7.52 7.815 8.176 8.585 8.97 9.383 9.822 10.297 10.815 11.377 12.029 12.742 13.544 14.437 15.501 16.654 18.033 19.705 21.681 23.243 23.987 24.248 24.257 24.21 24.135 24.021 23.888 23.724 23.571 23.407 23.241 23.097 22.954 22.808 22.654 22.522 22.402 22.277 22.148 22.031 21.912 21.78 21.664 21.545 21.425 21.303 21.158 21.058 20.968 20.822 20.699 20.562 20.496 20.356 20.204 20.043 19.964 19.778 19.707 19.61 19.501 19.255 19.12 18.966 18.794 18.612 18.376 18.054 17.031 -7 ,20985 ,KEBNE ,16708486,Fri Nov 26 17:19:38 CET,Fri Nov 26 18:51:30 CET,0.0 1.1 1.472 1.755 1.992 2.196 2.384 2.57 2.91 3.062 3.208 3.343 3.583 3.699 3.915 4.128 4.332 4.431 4.635 4.824 5.081 5.254 5.422 5.644 5.855 6.078 6.304 6.525 6.801 7.074 7.342 7.645 7.936 8.228 8.579 8.98 9.351 9.768 10.235 10.735 11.278 11.884 12.585 13.287 14.093 14.984 15.987 17.095 18.413 20.081 21.978 23.249 23.893 24.201 24.269 24.227 24.139 24.024 23.899 23.743 23.597 23.447 23.289 23.108 22.934 22.79 22.624 22.462 22.318 22.158 21.987 21.849 21.713 21.57 21.459 21.345 21.217 21.086 20.946 20.847 20.742 20.591 20.485 20.377 20.318 20.172 20.024 19.876 19.797 19.607 19.534 19.442 19.336 19.122 19.017 18.895 18.762 18.606 18.396 18.079 17.09 -8 ,22960 ,KEBNE ,16708487,Fri Nov 26 17:19:38 CET,Fri Nov 26 18:52:51 CET,0.0 1.644 2.046 2.361 2.624 2.861 3.072 3.252 3.561 3.708 3.852 3.989 4.238 4.362 4.608 4.829 5.03 5.127 5.308 5.491 5.774 5.953 6.122 6.359 6.591 6.817 7.039 7.259 7.542 7.812 8.085 8.412 8.72 9.029 9.374 9.76 10.145 10.571 11.033 11.542 12.077 12.68 13.386 14.062 14.87 15.789 16.813 17.964 19.293 20.742 22.461 23.877 24.617 24.985 25.128 25.122 25.031 24.91 24.803 24.661 24.493 24.324 24.163 24.018 23.862 23.719 23.581 23.451 23.326 23.187 23.039 22.916 22.793 22.658 22.541 22.423 22.302 22.169 22.021 21.912 21.806 21.632 21.502 21.364 21.286 21.121 20.955 20.79 20.705 20.498 20.391 20.29 20.196 19.97 19.81 19.628 19.449 19.268 19.002 18.618 17.703 -10 ,21709 ,KEBNE ,16708489,Fri Nov 26 17:19:38 CET,Fri Nov 26 18:51:51 CET,0.0 1.224 1.56 1.808 2.007 2.199 2.388 2.548 2.849 3.004 3.144 3.267 3.507 3.629 3.86 4.062 4.251 4.345 4.532 4.716 4.971 5.138 5.313 5.562 5.792 6.009 6.214 6.418 6.691 6.972 7.247 7.58 7.918 8.239 8.602 9.001 9.381 9.818 10.292 10.787 11.316 11.92 12.665 13.435 14.251 15.151 16.27 17.494 18.868 20.499 22.366 23.772 24.525 24.877 24.993 25.012 24.953 24.832 24.697 24.53 24.358 24.195 24.046 23.892 23.709 23.537 23.359 23.182 23.026 22.869 22.712 22.585 22.434 22.278 22.16 22.036 21.899 21.763 21.633 21.538 21.437 21.261 21.121 20.978 20.908 20.765 20.613 20.435 20.339 20.145 20.059 19.946 19.819 19.542 19.384 19.208 19.013 18.769 18.476 18.095 17.011 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_165.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_165.txt deleted file mode 100644 index 005e3b28..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_165.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20352 ,KEBNE ,16708490,Fri Nov 26 17:19:38 CET,Fri Nov 26 18:51:38 CET,0.0 1.109 1.545 1.883 2.161 2.395 2.602 2.8 3.143 3.297 3.442 3.586 3.831 3.949 4.173 4.369 4.549 4.643 4.838 5.018 5.27 5.435 5.597 5.828 6.049 6.253 6.45 6.652 6.903 7.137 7.381 7.683 7.964 8.259 8.61 8.969 9.309 9.68 10.08 10.516 10.966 11.473 12.05 12.654 13.417 14.289 15.252 16.285 17.44 18.758 20.29 21.405 21.911 22.101 22.148 22.15 22.12 22.055 21.97 21.826 21.686 21.581 21.449 21.297 21.151 21.003 20.849 20.727 20.621 20.484 20.346 20.244 20.119 19.993 19.904 19.814 19.714 19.595 19.455 19.358 19.263 19.108 19.0 18.894 18.84 18.725 18.593 18.43 18.348 18.162 18.11 18.018 17.921 17.727 17.604 17.466 17.325 17.166 16.972 16.677 15.842 -2 ,18958 ,KEBNE ,16708491,Fri Nov 26 17:19:38 CET,Fri Nov 26 18:51:46 CET,0.0 0.875 1.262 1.525 1.749 1.944 2.115 2.285 2.62 2.773 2.915 3.042 3.281 3.392 3.596 3.786 3.972 4.062 4.246 4.432 4.696 4.855 5.009 5.247 5.479 5.707 5.93 6.15 6.423 6.679 6.935 7.234 7.52 7.797 8.115 8.47 8.829 9.253 9.695 10.149 10.64 11.205 11.867 12.498 13.21 14.046 14.991 16.043 17.248 18.582 20.117 21.283 21.839 22.095 22.172 22.168 22.136 22.045 21.939 21.813 21.685 21.563 21.438 21.305 21.159 21.012 20.868 20.732 20.607 20.48 20.344 20.227 20.099 19.965 19.852 19.729 19.605 19.469 19.32 19.211 19.107 18.957 18.833 18.687 18.614 18.476 18.327 18.176 18.102 17.913 17.835 17.741 17.641 17.414 17.291 17.157 17.005 16.826 16.596 16.278 15.333 -3 ,24 ,KEBNE ,16708492,Fri Nov 26 17:19:38 CET,Fri Nov 26 18:51:57 CET,0.0 1.032 1.346 1.621 1.855 2.06 2.247 2.413 2.72 2.87 3.018 3.187 3.44 3.559 3.78 3.996 4.206 4.306 4.502 4.704 5.019 5.214 5.379 5.619 5.854 6.068 6.279 6.483 6.753 7.006 7.253 7.568 7.871 8.186 8.539 8.9 9.237 9.602 10.01 10.47 10.943 11.438 12.03 12.646 13.363 14.149 15.059 16.16 17.437 18.79 20.24 21.345 21.921 22.128 22.183 22.187 22.126 22.021 21.909 21.787 21.659 21.515 21.356 21.204 21.069 20.952 20.821 20.68 20.541 20.386 20.217 20.089 19.973 19.852 19.763 19.678 19.589 19.485 19.359 19.275 19.191 19.05 18.951 18.84 18.784 18.661 18.525 18.393 18.324 18.141 18.077 17.989 17.891 17.683 17.558 17.402 17.234 17.034 16.789 16.52 15.699 -4 ,6620 ,KEBNE ,16708493,Fri Nov 26 17:19:38 CET,Fri Nov 26 18:51:43 CET,0.0 1.045 1.386 1.648 1.87 2.064 2.242 2.413 2.728 2.879 3.029 3.168 3.423 3.544 3.757 3.961 4.166 4.26 4.445 4.629 4.881 5.046 5.208 5.444 5.67 5.884 6.083 6.283 6.552 6.811 7.059 7.351 7.647 7.94 8.26 8.621 8.984 9.375 9.776 10.195 10.647 11.162 11.733 12.306 12.987 13.751 14.652 15.628 16.738 18.069 19.594 20.675 21.228 21.522 21.619 21.63 21.593 21.489 21.369 21.254 21.135 21.013 20.888 20.748 20.603 20.476 20.339 20.213 20.112 19.993 19.859 19.747 19.62 19.496 19.396 19.291 19.185 19.072 18.958 18.869 18.771 18.619 18.515 18.401 18.344 18.246 18.129 17.977 17.892 17.699 17.618 17.516 17.411 17.204 17.085 16.947 16.791 16.603 16.403 16.154 15.463 -5 ,17044 ,KEBNE ,16708494,Fri Nov 26 17:20:39 CET,Fri Nov 26 18:52:49 CET,0.0 1.005 1.485 1.8 2.033 2.223 2.396 2.56 2.859 2.992 3.108 3.209 3.449 3.549 3.733 3.918 4.092 4.183 4.365 4.533 4.765 4.916 5.07 5.294 5.519 5.736 5.938 6.143 6.407 6.661 6.916 7.21 7.48 7.743 8.029 8.355 8.699 9.08 9.462 9.876 10.344 10.888 11.537 12.149 12.825 13.57 14.434 15.387 16.511 17.866 19.405 20.525 21.038 21.301 21.426 21.461 21.433 21.357 21.263 21.14 21.017 20.872 20.717 20.572 20.435 20.31 20.173 20.034 19.907 19.776 19.631 19.516 19.384 19.245 19.151 19.049 18.941 18.836 18.729 18.651 18.559 18.411 18.299 18.182 18.124 17.994 17.859 17.71 17.628 17.435 17.35 17.243 17.143 16.944 16.819 16.667 16.509 16.329 16.107 15.812 14.987 -6 ,4710 ,KEBNE ,16708495,Fri Nov 26 17:20:39 CET,Fri Nov 26 18:52:36 CET,0.0 1.114 1.526 1.834 2.111 2.361 2.581 2.768 3.083 3.231 3.366 3.491 3.736 3.852 4.067 4.254 4.432 4.524 4.71 4.887 5.13 5.283 5.442 5.699 5.941 6.167 6.385 6.586 6.847 7.108 7.353 7.635 7.908 8.207 8.575 8.957 9.323 9.734 10.168 10.616 11.094 11.616 12.211 12.844 13.6 14.414 15.285 16.241 17.365 18.645 20.041 21.117 21.675 21.954 22.086 22.111 22.063 21.987 21.89 21.759 21.63 21.516 21.405 21.287 21.16 21.016 20.864 20.713 20.578 20.452 20.31 20.181 20.052 19.913 19.801 19.675 19.525 19.363 19.217 19.116 19.007 18.831 18.7 18.566 18.5 18.363 18.213 18.058 17.979 17.792 17.707 17.607 17.51 17.299 17.177 17.045 16.891 16.708 16.511 16.24 15.298 -7 ,9629 ,KEBNE ,16708496,Fri Nov 26 17:20:39 CET,Fri Nov 26 18:54:08 CET,0.0 0.881 1.298 1.579 1.818 2.03 2.235 2.418 2.719 2.859 2.991 3.135 3.387 3.522 3.777 4.014 4.24 4.346 4.546 4.743 5.033 5.216 5.398 5.656 5.9 6.137 6.359 6.572 6.831 7.075 7.314 7.611 7.903 8.175 8.509 8.904 9.289 9.678 10.076 10.52 10.979 11.497 12.118 12.767 13.483 14.245 15.139 16.149 17.332 18.677 20.17 21.274 21.783 22.021 22.132 22.123 22.065 22.0 21.895 21.754 21.625 21.512 21.384 21.25 21.104 20.949 20.798 20.668 20.555 20.432 20.298 20.193 20.083 19.953 19.847 19.735 19.617 19.5 19.379 19.294 19.206 19.063 18.954 18.838 18.773 18.621 18.461 18.314 18.238 18.046 17.982 17.899 17.813 17.599 17.465 17.322 17.174 17.022 16.844 16.597 15.642 -8 ,16948 ,KEBNE ,16708497,Fri Nov 26 17:20:38 CET,Fri Nov 26 18:52:45 CET,0.0 1.141 1.54 1.858 2.098 2.303 2.498 2.684 3.032 3.182 3.319 3.476 3.721 3.828 4.035 4.227 4.424 4.52 4.695 4.865 5.125 5.293 5.458 5.698 5.919 6.13 6.338 6.536 6.789 7.036 7.271 7.561 7.846 8.114 8.416 8.767 9.118 9.51 9.931 10.38 10.847 11.383 11.996 12.567 13.232 14.007 14.931 15.961 17.076 18.301 19.742 20.825 21.314 21.536 21.644 21.661 21.602 21.488 21.37 21.267 21.155 21.031 20.864 20.701 20.572 20.414 20.243 20.108 19.982 19.861 19.749 19.644 19.526 19.4 19.298 19.202 19.105 18.98 18.843 18.754 18.661 18.501 18.387 18.267 18.201 18.069 17.934 17.788 17.716 17.535 17.465 17.375 17.279 17.067 16.953 16.813 16.65 16.475 16.258 15.938 15.111 -9 ,6668 ,KEBNE ,16708498,Fri Nov 26 17:20:38 CET,Fri Nov 26 18:54:01 CET,0.0 1.002 1.401 1.702 1.935 2.151 2.367 2.565 2.902 3.064 3.223 3.388 3.637 3.756 3.995 4.224 4.431 4.525 4.71 4.893 5.152 5.326 5.487 5.706 5.923 6.132 6.336 6.537 6.805 7.063 7.326 7.646 7.934 8.213 8.516 8.848 9.182 9.557 9.973 10.411 10.857 11.377 11.966 12.527 13.212 14.003 14.877 15.806 16.868 18.189 19.722 20.832 21.379 21.629 21.724 21.713 21.622 21.512 21.391 21.267 21.148 21.025 20.898 20.758 20.625 20.499 20.362 20.229 20.108 19.987 19.842 19.704 19.556 19.409 19.302 19.185 19.067 18.96 18.827 18.731 18.634 18.458 18.323 18.181 18.11 17.977 17.84 17.681 17.593 17.398 17.31 17.216 17.117 16.868 16.736 16.599 16.433 16.239 15.967 15.632 14.978 -10 ,708 ,KEBNE ,16708499,Fri Nov 26 17:20:39 CET,Fri Nov 26 18:53:58 CET,0.0 0.876 1.196 1.431 1.64 1.857 2.049 2.213 2.519 2.65 2.773 2.894 3.129 3.23 3.434 3.626 3.811 3.906 4.088 4.258 4.505 4.663 4.816 5.05 5.284 5.501 5.703 5.91 6.181 6.441 6.699 6.999 7.289 7.573 7.897 8.266 8.619 9.002 9.423 9.878 10.336 10.845 11.476 12.097 12.781 13.525 14.446 15.535 16.718 18.02 19.445 20.528 21.075 21.345 21.467 21.471 21.385 21.268 21.159 21.046 20.935 20.79 20.635 20.497 20.355 20.223 20.058 19.892 19.756 19.615 19.476 19.355 19.224 19.098 18.999 18.887 18.756 18.608 18.469 18.372 18.271 18.117 17.993 17.856 17.792 17.649 17.48 17.325 17.249 17.061 16.985 16.886 16.79 16.58 16.456 16.322 16.162 15.965 15.724 15.416 14.513 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_231.txt deleted file mode 100644 index 9f79f30b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13224 ,KEBNE ,17126003,Thu Dec 30 17:02:54 CET,Thu Dec 30 18:38:46 CET,0.0 1.149 1.457 1.677 1.864 2.03 2.184 2.334 2.631 2.754 2.858 2.922 3.142 3.235 3.404 3.552 3.71 3.786 3.911 4.015 4.159 4.252 4.346 4.496 4.634 4.761 4.901 5.036 5.179 5.299 5.42 5.552 5.669 5.788 5.922 6.079 6.224 6.367 6.514 6.652 6.788 6.937 7.08 7.184 7.309 7.437 7.484 7.446 7.313 6.98 6.174 5.028 3.97 3.013 2.179 1.453 0.82 0.229 -0.294 -0.806 -1.244 -1.655 -2.052 -2.404 -2.721 -3.032 -3.371 -3.663 -3.937 -4.219 -4.48 -4.711 -4.96 -5.215 -5.418 -5.624 -5.838 -6.08 -6.332 -6.498 -6.673 -6.942 -7.129 -7.318 -7.415 -7.639 -7.864 -8.094 -8.22 -8.486 -8.62 -8.754 -8.885 -9.203 -9.393 -9.594 -9.813 -10.062 -10.348 -10.683 -11.71 -2 ,9446 ,KEBNE ,17126004,Thu Dec 30 17:02:54 CET,Thu Dec 30 18:39:56 CET,0.0 0.923 1.223 1.462 1.651 1.81 1.953 2.08 2.319 2.427 2.515 2.561 2.779 2.867 3.025 3.175 3.326 3.394 3.525 3.666 3.859 3.959 4.048 4.19 4.326 4.451 4.565 4.681 4.832 4.976 5.121 5.29 5.445 5.581 5.724 5.886 6.042 6.189 6.31 6.433 6.57 6.714 6.85 6.947 7.056 7.17 7.229 7.203 7.066 6.744 5.933 4.694 3.618 2.676 1.85 1.089 0.426 -0.179 -0.709 -1.217 -1.649 -2.05 -2.433 -2.77 -3.082 -3.364 -3.66 -3.951 -4.224 -4.497 -4.78 -5.031 -5.3 -5.57 -5.767 -5.976 -6.213 -6.463 -6.711 -6.881 -7.06 -7.341 -7.532 -7.736 -7.839 -8.046 -8.27 -8.508 -8.628 -8.885 -9.009 -9.139 -9.273 -9.579 -9.747 -9.933 -10.138 -10.354 -10.616 -10.983 -11.95 -3 ,31103 ,KEBNE ,17126005,Thu Dec 30 17:02:54 CET,Thu Dec 30 18:38:47 CET,0.0 1.262 1.606 1.849 2.043 2.223 2.382 2.52 2.741 2.836 2.926 2.964 3.166 3.239 3.379 3.513 3.642 3.705 3.82 3.929 4.106 4.223 4.332 4.474 4.593 4.713 4.826 4.93 5.056 5.181 5.296 5.414 5.539 5.666 5.803 5.975 6.145 6.317 6.48 6.647 6.809 6.974 7.145 7.272 7.397 7.494 7.542 7.5 7.331 6.95 6.128 4.962 3.919 2.994 2.2 1.481 0.827 0.222 -0.282 -0.781 -1.245 -1.699 -2.133 -2.517 -2.853 -3.154 -3.496 -3.829 -4.118 -4.391 -4.651 -4.877 -5.113 -5.376 -5.595 -5.799 -6.01 -6.242 -6.484 -6.633 -6.772 -7.011 -7.2 -7.395 -7.489 -7.702 -7.948 -8.195 -8.314 -8.572 -8.706 -8.845 -8.988 -9.287 -9.455 -9.644 -9.857 -10.094 -10.366 -10.691 -11.572 -4 ,31162 ,KEBNE ,17126006,Thu Dec 30 17:02:54 CET,Thu Dec 30 18:38:36 CET,0.0 1.009 1.359 1.6 1.79 1.958 2.117 2.274 2.547 2.669 2.786 2.869 3.087 3.183 3.37 3.539 3.697 3.772 3.912 4.053 4.257 4.372 4.478 4.619 4.734 4.848 4.995 5.159 5.338 5.477 5.603 5.752 5.903 6.059 6.221 6.398 6.579 6.75 6.88 7.008 7.182 7.371 7.506 7.612 7.707 7.788 7.825 7.8 7.661 7.289 6.442 5.24 4.188 3.264 2.431 1.681 1.039 0.464 -0.062 -0.599 -1.034 -1.411 -1.792 -2.15 -2.512 -2.854 -3.179 -3.46 -3.705 -3.954 -4.21 -4.432 -4.667 -4.906 -5.082 -5.271 -5.465 -5.681 -5.924 -6.076 -6.213 -6.43 -6.608 -6.8 -6.897 -7.096 -7.301 -7.526 -7.647 -7.897 -7.977 -8.09 -8.218 -8.48 -8.625 -8.806 -8.985 -9.182 -9.449 -9.795 -10.622 -5 ,22476 ,KEBNE ,17126007,Thu Dec 30 17:02:54 CET,Thu Dec 30 18:39:34 CET,0.0 0.674 0.937 1.155 1.334 1.484 1.623 1.755 1.983 2.082 2.177 2.232 2.444 2.525 2.678 2.836 2.993 3.069 3.227 3.371 3.556 3.671 3.792 3.966 4.101 4.225 4.347 4.464 4.6 4.725 4.842 4.987 5.13 5.24 5.351 5.498 5.656 5.811 5.968 6.134 6.287 6.483 6.718 6.868 6.971 7.056 7.108 7.092 6.923 6.485 5.578 4.364 3.326 2.408 1.608 0.899 0.251 -0.334 -0.813 -1.31 -1.75 -2.136 -2.535 -2.908 -3.241 -3.567 -3.905 -4.193 -4.44 -4.698 -4.986 -5.23 -5.457 -5.698 -5.903 -6.126 -6.348 -6.564 -6.801 -6.974 -7.157 -7.447 -7.653 -7.845 -7.941 -8.149 -8.355 -8.583 -8.705 -8.97 -9.102 -9.246 -9.397 -9.722 -9.914 -10.115 -10.34 -10.603 -10.908 -11.286 -12.428 -6 ,27308 ,KEBNE ,17126008,Thu Dec 30 17:02:54 CET,Thu Dec 30 18:38:47 CET,0.0 1.017 1.344 1.62 1.846 2.028 2.185 2.33 2.601 2.714 2.815 2.888 3.109 3.193 3.337 3.47 3.62 3.692 3.807 3.929 4.124 4.241 4.35 4.484 4.602 4.721 4.826 4.924 5.049 5.172 5.301 5.446 5.569 5.7 5.882 6.087 6.244 6.391 6.538 6.674 6.821 6.978 7.124 7.265 7.394 7.467 7.541 7.538 7.322 6.926 6.134 4.949 3.871 2.936 2.114 1.39 0.764 0.194 -0.298 -0.821 -1.287 -1.683 -2.056 -2.444 -2.807 -3.116 -3.434 -3.719 -3.982 -4.25 -4.509 -4.716 -4.957 -5.215 -5.403 -5.595 -5.778 -5.961 -6.15 -6.285 -6.43 -6.662 -6.824 -6.999 -7.092 -7.288 -7.494 -7.705 -7.813 -8.064 -8.155 -8.271 -8.405 -8.749 -8.948 -9.163 -9.409 -9.661 -9.951 -10.343 -11.391 -7 ,16973 ,KEBNE ,17126009,Thu Dec 30 17:02:54 CET,Thu Dec 30 18:38:39 CET,0.0 0.674 0.962 1.168 1.35 1.539 1.697 1.821 2.051 2.162 2.265 2.326 2.531 2.604 2.755 2.889 3.007 3.068 3.184 3.303 3.493 3.617 3.736 3.896 4.056 4.194 4.313 4.447 4.644 4.828 4.996 5.202 5.392 5.557 5.726 5.904 6.046 6.177 6.3 6.44 6.58 6.701 6.803 6.885 6.964 7.004 7.023 6.959 6.794 6.432 5.602 4.438 3.398 2.483 1.674 0.914 0.257 -0.31 -0.811 -1.325 -1.757 -2.157 -2.564 -2.976 -3.347 -3.647 -3.973 -4.264 -4.503 -4.785 -5.076 -5.281 -5.509 -5.751 -5.927 -6.107 -6.29 -6.477 -6.681 -6.821 -6.962 -7.21 -7.394 -7.577 -7.668 -7.851 -8.033 -8.236 -8.346 -8.592 -8.691 -8.827 -8.971 -9.256 -9.415 -9.586 -9.774 -9.998 -10.266 -10.634 -11.623 -8 ,5581 ,KEBNE ,17126010,Thu Dec 30 17:02:54 CET,Thu Dec 30 18:39:46 CET,0.0 0.928 1.253 1.494 1.687 1.842 1.979 2.113 2.364 2.481 2.59 2.664 2.881 2.975 3.146 3.315 3.465 3.527 3.639 3.741 3.893 4.001 4.099 4.233 4.363 4.483 4.602 4.726 4.902 5.072 5.225 5.384 5.51 5.636 5.783 5.94 6.075 6.216 6.376 6.575 6.758 6.913 7.076 7.232 7.383 7.474 7.533 7.554 7.437 7.06 6.19 4.938 3.896 2.967 2.141 1.404 0.775 0.211 -0.268 -0.794 -1.259 -1.686 -2.101 -2.457 -2.805 -3.132 -3.459 -3.743 -3.995 -4.275 -4.582 -4.834 -5.071 -5.293 -5.473 -5.672 -5.868 -6.08 -6.308 -6.469 -6.619 -6.836 -7.009 -7.196 -7.289 -7.471 -7.662 -7.872 -7.986 -8.243 -8.351 -8.48 -8.616 -8.901 -9.064 -9.257 -9.471 -9.694 -9.95 -10.303 -11.376 -9 ,8006 ,KEBNE ,17126011,Thu Dec 30 17:02:54 CET,Thu Dec 30 18:38:47 CET,0.0 0.915 1.249 1.492 1.694 1.857 2.023 2.173 2.42 2.531 2.634 2.72 2.945 3.037 3.196 3.333 3.482 3.556 3.691 3.828 4.035 4.149 4.249 4.416 4.59 4.763 4.922 5.059 5.199 5.308 5.413 5.536 5.681 5.823 5.968 6.145 6.308 6.478 6.652 6.8 6.958 7.13 7.28 7.41 7.532 7.627 7.679 7.647 7.506 7.136 6.314 5.153 4.064 3.075 2.249 1.523 0.881 0.285 -0.251 -0.769 -1.209 -1.62 -2.009 -2.389 -2.763 -3.083 -3.392 -3.687 -3.98 -4.285 -4.593 -4.863 -5.142 -5.428 -5.633 -5.823 -6.023 -6.246 -6.484 -6.638 -6.784 -7.001 -7.154 -7.313 -7.399 -7.582 -7.774 -7.994 -8.115 -8.368 -8.481 -8.615 -8.756 -9.072 -9.242 -9.417 -9.62 -9.853 -10.126 -10.467 -11.471 -10 ,11322 ,KEBNE ,17126012,Thu Dec 30 17:02:57 CET,Thu Dec 30 18:38:46 CET,0.0 0.97 1.253 1.478 1.675 1.858 2.025 2.173 2.415 2.533 2.648 2.723 2.94 3.032 3.204 3.383 3.569 3.654 3.797 3.923 4.097 4.208 4.318 4.485 4.62 4.723 4.836 4.961 5.111 5.237 5.356 5.524 5.717 5.9 6.094 6.279 6.438 6.647 6.874 7.035 7.172 7.316 7.457 7.603 7.752 7.861 7.938 7.937 7.812 7.486 6.691 5.54 4.484 3.53 2.72 1.984 1.329 0.749 0.245 -0.271 -0.714 -1.107 -1.479 -1.843 -2.208 -2.522 -2.84 -3.136 -3.387 -3.629 -3.874 -4.086 -4.309 -4.547 -4.755 -4.967 -5.182 -5.427 -5.67 -5.83 -5.998 -6.258 -6.428 -6.606 -6.703 -6.909 -7.119 -7.318 -7.425 -7.685 -7.824 -7.965 -8.113 -8.436 -8.612 -8.798 -9.004 -9.249 -9.539 -9.906 -11.004 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_234.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_234.txt deleted file mode 100644 index 78194da3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_234.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16235 ,KEBNE ,16708500,Fri Nov 26 17:20:39 CET,Fri Nov 26 18:52:41 CET,0.0 1.738 2.146 2.47 2.738 2.965 3.172 3.354 3.662 3.811 3.95 4.072 4.313 4.417 4.627 4.84 5.046 5.147 5.342 5.507 5.706 5.828 5.95 6.162 6.402 6.616 6.79 6.961 7.198 7.421 7.615 7.835 8.043 8.241 8.46 8.702 8.965 9.271 9.565 9.89 10.242 10.63 11.06 11.457 11.921 12.441 13.022 13.628 14.297 14.988 15.65 15.976 15.999 15.886 15.72 15.503 15.271 15.068 14.871 14.624 14.396 14.197 14.005 13.783 13.561 13.378 13.162 12.952 12.781 12.613 12.451 12.315 12.18 12.035 11.918 11.803 11.676 11.546 11.403 11.301 11.204 11.049 10.937 10.818 10.755 10.613 10.462 10.294 10.204 9.993 9.905 9.797 9.691 9.451 9.326 9.186 9.016 8.824 8.611 8.315 7.496 -2 ,26475 ,KEBNE ,16708501,Fri Nov 26 17:20:39 CET,Fri Nov 26 18:53:47 CET,0.0 0.932 1.287 1.553 1.77 1.95 2.102 2.251 2.522 2.654 2.789 2.931 3.187 3.307 3.516 3.692 3.869 3.962 4.15 4.332 4.57 4.704 4.833 5.023 5.208 5.375 5.53 5.688 5.909 6.13 6.332 6.589 6.843 7.065 7.304 7.566 7.827 8.103 8.373 8.666 8.993 9.354 9.772 10.165 10.613 11.101 11.653 12.258 12.881 13.523 14.187 14.532 14.53 14.394 14.203 13.952 13.653 13.401 13.174 12.885 12.643 12.435 12.224 12.003 11.794 11.637 11.475 11.282 11.12 10.979 10.826 10.692 10.555 10.396 10.271 10.157 10.028 9.884 9.724 9.596 9.464 9.258 9.112 8.962 8.889 8.748 8.597 8.424 8.323 8.099 8.013 7.915 7.806 7.541 7.394 7.216 7.012 6.797 6.53 6.162 4.977 -3 ,23157 ,KEBNE ,16708502,Fri Nov 26 17:21:41 CET,Fri Nov 26 18:53:55 CET,0.0 1.383 1.811 2.131 2.361 2.545 2.721 2.896 3.209 3.357 3.506 3.645 3.891 3.997 4.186 4.366 4.536 4.622 4.783 4.935 5.159 5.3 5.429 5.628 5.841 6.034 6.217 6.4 6.625 6.853 7.067 7.304 7.536 7.771 8.04 8.313 8.554 8.821 9.114 9.41 9.737 10.108 10.518 10.92 11.358 11.855 12.468 13.108 13.776 14.493 15.182 15.497 15.497 15.403 15.259 15.046 14.803 14.576 14.367 14.157 13.95 13.735 13.524 13.312 13.1 12.916 12.73 12.563 12.395 12.194 12.019 11.889 11.738 11.565 11.432 11.299 11.155 11.009 10.845 10.731 10.629 10.471 10.361 10.241 10.177 10.036 9.866 9.681 9.589 9.371 9.279 9.168 9.056 8.807 8.656 8.483 8.299 8.106 7.891 7.598 6.759 -4 ,6253 ,KEBNE ,16708503,Fri Nov 26 17:21:41 CET,Fri Nov 26 18:53:24 CET,0.0 1.631 2.0 2.298 2.559 2.797 3.012 3.202 3.515 3.658 3.795 3.915 4.148 4.252 4.431 4.605 4.773 4.852 5.001 5.137 5.327 5.457 5.599 5.81 5.999 6.174 6.348 6.517 6.727 6.927 7.132 7.402 7.663 7.9 8.167 8.477 8.764 9.044 9.334 9.635 9.955 10.315 10.715 11.103 11.572 12.084 12.623 13.225 13.922 14.631 15.243 15.547 15.588 15.481 15.308 15.099 14.881 14.636 14.409 14.195 13.991 13.793 13.596 13.395 13.197 13.011 12.82 12.627 12.449 12.285 12.098 11.928 11.769 11.609 11.458 11.304 11.155 10.975 10.777 10.643 10.508 10.313 10.18 10.049 9.981 9.816 9.629 9.437 9.343 9.127 9.038 8.923 8.788 8.496 8.344 8.186 8.021 7.831 7.602 7.263 6.25 -5 ,24205 ,KEBNE ,16708504,Fri Nov 26 17:21:41 CET,Fri Nov 26 18:53:34 CET,0.0 1.52 1.961 2.255 2.484 2.665 2.823 2.972 3.241 3.375 3.509 3.639 3.892 4.001 4.2 4.392 4.58 4.681 4.859 5.028 5.286 5.455 5.62 5.846 6.053 6.23 6.385 6.536 6.727 6.915 7.116 7.363 7.581 7.818 8.127 8.444 8.739 9.063 9.38 9.713 10.052 10.429 10.882 11.282 11.719 12.209 12.735 13.303 13.966 14.67 15.352 15.724 15.784 15.724 15.54 15.279 15.059 14.829 14.612 14.38 14.162 13.975 13.778 13.569 13.368 13.185 12.983 12.789 12.633 12.469 12.281 12.125 11.962 11.775 11.633 11.507 11.37 11.2 11.009 10.883 10.763 10.564 10.419 10.27 10.201 10.065 9.923 9.773 9.687 9.469 9.368 9.259 9.15 8.905 8.774 8.623 8.462 8.271 8.03 7.72 6.861 -6 ,3724 ,KEBNE ,16708505,Fri Nov 26 17:22:42 CET,Fri Nov 26 18:54:44 CET,0.0 1.068 1.438 1.723 1.96 2.171 2.359 2.535 2.846 2.972 3.077 3.155 3.386 3.484 3.686 3.89 4.076 4.165 4.343 4.509 4.736 4.878 5.023 5.238 5.452 5.671 5.881 6.088 6.342 6.559 6.755 6.986 7.206 7.41 7.655 7.937 8.206 8.508 8.812 9.133 9.484 9.862 10.29 10.717 11.197 11.716 12.297 12.898 13.536 14.214 14.861 15.146 15.157 15.04 14.855 14.659 14.448 14.219 13.984 13.728 13.497 13.295 13.131 12.975 12.808 12.627 12.418 12.233 12.071 11.905 11.719 11.56 11.404 11.24 11.113 10.964 10.787 10.616 10.459 10.349 10.221 10.016 9.883 9.735 9.658 9.491 9.298 9.098 8.998 8.771 8.652 8.522 8.383 8.101 7.955 7.783 7.591 7.395 7.172 6.881 5.778 -7 ,14256 ,KEBNE ,16708506,Fri Nov 26 17:22:42 CET,Fri Nov 26 18:54:26 CET,0.0 1.532 1.927 2.221 2.454 2.65 2.826 2.982 3.261 3.394 3.519 3.617 3.843 3.937 4.118 4.295 4.466 4.545 4.692 4.831 5.037 5.167 5.289 5.465 5.636 5.806 5.971 6.127 6.322 6.517 6.73 6.996 7.239 7.479 7.745 8.022 8.286 8.576 8.878 9.178 9.49 9.841 10.27 10.727 11.216 11.703 12.266 12.925 13.614 14.271 14.92 15.256 15.289 15.149 14.924 14.673 14.446 14.22 14.014 13.78 13.565 13.39 13.209 13.019 12.831 12.647 12.42 12.187 11.999 11.825 11.631 11.442 11.268 11.104 10.95 10.781 10.608 10.436 10.26 10.13 9.993 9.795 9.664 9.542 9.485 9.361 9.219 9.065 8.974 8.754 8.653 8.535 8.407 8.13 7.975 7.803 7.627 7.432 7.168 6.808 5.407 -8 ,2374 ,KEBNE ,16708507,Fri Nov 26 17:22:46 CET,Fri Nov 26 18:51:34 CET,0.0 0.901 1.267 1.562 1.795 1.976 2.133 2.278 2.543 2.664 2.784 2.905 3.139 3.238 3.427 3.61 3.784 3.867 4.017 4.159 4.366 4.503 4.636 4.818 4.986 5.148 5.326 5.515 5.764 6.009 6.23 6.475 6.714 6.949 7.224 7.494 7.733 8.043 8.38 8.697 9.037 9.413 9.814 10.203 10.671 11.182 11.733 12.321 12.983 13.702 14.414 14.816 14.841 14.711 14.531 14.329 14.114 13.881 13.683 13.45 13.226 13.03 12.842 12.614 12.398 12.206 11.97 11.779 11.593 11.362 11.159 10.996 10.798 10.593 10.452 10.311 10.171 10.01 9.817 9.682 9.537 9.339 9.221 9.102 9.044 8.917 8.777 8.625 8.54 8.332 8.246 8.131 8.008 7.73 7.568 7.394 7.205 6.998 6.761 6.417 5.091 -9 ,13550 ,KEBNE ,16708508,Fri Nov 26 17:23:44 CET,Fri Nov 26 18:55:39 CET,0.0 0.802 1.127 1.386 1.586 1.769 1.96 2.134 2.411 2.538 2.666 2.762 2.975 3.063 3.241 3.41 3.584 3.671 3.829 3.984 4.216 4.362 4.516 4.742 4.943 5.135 5.306 5.45 5.648 5.851 6.036 6.263 6.491 6.697 6.955 7.24 7.491 7.812 8.161 8.494 8.815 9.183 9.621 10.06 10.571 11.092 11.632 12.214 12.857 13.522 14.193 14.515 14.537 14.46 14.293 14.054 13.808 13.597 13.394 13.148 12.945 12.789 12.639 12.473 12.298 12.149 12.006 11.846 11.698 11.556 11.403 11.264 11.088 10.886 10.73 10.573 10.416 10.27 10.131 10.006 9.86 9.652 9.514 9.377 9.299 9.13 8.966 8.795 8.708 8.503 8.434 8.33 8.212 7.93 7.772 7.609 7.429 7.223 6.974 6.611 5.387 -10 ,1212 ,KEBNE ,16708509,Fri Nov 26 17:23:44 CET,Fri Nov 26 18:55:46 CET,0.0 0.957 1.294 1.552 1.802 2.015 2.195 2.352 2.64 2.773 2.896 3.025 3.269 3.38 3.579 3.772 3.949 4.03 4.184 4.324 4.537 4.67 4.797 5.01 5.206 5.367 5.523 5.673 5.896 6.136 6.353 6.626 6.889 7.137 7.417 7.722 8.037 8.367 8.696 9.032 9.374 9.752 10.183 10.569 11.002 11.488 12.029 12.585 13.183 13.888 14.62 14.973 15.001 14.909 14.764 14.58 14.375 14.161 13.961 13.742 13.527 13.306 13.11 12.944 12.779 12.617 12.433 12.262 12.105 11.911 11.699 11.538 11.393 11.245 11.135 11.016 10.882 10.752 10.589 10.463 10.337 10.142 10.008 9.849 9.769 9.636 9.512 9.374 9.29 9.079 8.976 8.852 8.738 8.517 8.375 8.198 8.011 7.792 7.526 7.161 6.014 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_252.txt deleted file mode 100644 index e9363212..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31949 ,KEBNE ,16708510,Fri Nov 26 17:23:44 CET,Fri Nov 26 18:55:42 CET,0.0 0.706 0.951 1.11 1.231 1.336 1.423 1.504 1.649 1.7 1.738 1.701 1.86 1.885 1.939 1.97 1.948 1.934 1.929 1.927 1.913 1.897 1.855 1.757 1.646 1.538 1.426 1.321 1.177 1.002 0.831 0.623 0.387 0.134 -0.159 -0.528 -0.946 -1.444 -2.013 -2.653 -3.372 -4.239 -5.348 -6.578 -8.106 -9.994 -12.475 -15.597 -19.78 -25.543 -34.017 -42.925 -49.558 -54.709 -58.853 -62.35 -65.237 -67.725 -69.79 -71.818 -73.485 -74.882 -76.205 -77.474 -78.609 -79.582 -80.57 -81.456 -82.213 -82.969 -83.726 -84.35 -85.013 -85.702 -86.22 -86.741 -87.261 -87.786 -88.333 -88.727 -89.133 -89.741 -90.145 -90.561 -90.777 -91.217 -91.661 -92.116 -92.356 -92.83 -93.082 -93.323 -93.57 -94.133 -94.452 -94.791 -95.147 -95.525 -95.98 -96.57 -98.203 -2 ,28817 ,KEBNE ,16708511,Fri Nov 26 17:24:46 CET,Fri Nov 26 18:57:42 CET,0.0 0.753 1.064 1.303 1.483 1.617 1.716 1.787 1.903 1.955 2.0 1.944 2.111 2.149 2.185 2.198 2.186 2.182 2.191 2.191 2.167 2.141 2.107 2.048 1.986 1.912 1.818 1.687 1.512 1.341 1.151 0.91 0.645 0.365 0.03 -0.366 -0.749 -1.21 -1.769 -2.39 -3.101 -3.989 -5.109 -6.305 -7.859 -9.839 -12.339 -15.466 -19.571 -25.173 -33.532 -42.38 -49.023 -54.249 -58.479 -62.025 -64.986 -67.517 -69.569 -71.587 -73.255 -74.677 -75.989 -77.194 -78.292 -79.273 -80.297 -81.2 -81.961 -82.724 -83.476 -84.113 -84.817 -85.519 -86.031 -86.56 -87.093 -87.615 -88.157 -88.538 -88.921 -89.513 -89.918 -90.331 -90.538 -90.946 -91.378 -91.839 -92.073 -92.543 -92.834 -93.096 -93.36 -93.92 -94.214 -94.517 -94.854 -95.274 -95.801 -96.434 -97.953 -3 ,30757 ,KEBNE ,16708512,Fri Nov 26 17:25:47 CET,Fri Nov 26 18:57:43 CET,0.0 1.089 1.408 1.621 1.792 1.923 2.017 2.095 2.234 2.306 2.362 2.305 2.444 2.467 2.507 2.52 2.502 2.487 2.478 2.472 2.446 2.432 2.395 2.3 2.197 2.084 1.983 1.893 1.761 1.598 1.418 1.174 0.914 0.669 0.374 -0.022 -0.437 -0.921 -1.482 -2.11 -2.808 -3.669 -4.808 -6.051 -7.623 -9.552 -12.038 -15.217 -19.385 -25.07 -33.507 -42.422 -49.07 -54.242 -58.383 -61.885 -64.755 -67.248 -69.315 -71.324 -72.989 -74.43 -75.771 -76.99 -78.102 -79.104 -80.13 -81.026 -81.791 -82.569 -83.346 -83.973 -84.621 -85.265 -85.76 -86.27 -86.774 -87.286 -87.816 -88.19 -88.568 -89.134 -89.524 -89.929 -90.139 -90.565 -91.018 -91.485 -91.72 -92.183 -92.44 -92.694 -92.96 -93.539 -93.85 -94.185 -94.542 -94.923 -95.351 -95.89 -97.186 -4 ,15266 ,KEBNE ,16708513,Fri Nov 26 17:28:50 CET,Fri Nov 26 19:02:06 CET,0.0 0.968 1.259 1.448 1.591 1.71 1.822 1.909 2.03 2.084 2.12 2.044 2.191 2.209 2.237 2.256 2.262 2.266 2.259 2.238 2.191 2.142 2.084 2.013 1.95 1.854 1.742 1.632 1.489 1.336 1.185 0.977 0.727 0.472 0.152 -0.23 -0.626 -1.096 -1.651 -2.294 -3.008 -3.896 -5.026 -6.252 -7.816 -9.733 -12.189 -15.305 -19.436 -25.101 -33.58 -42.494 -49.089 -54.256 -58.433 -61.955 -64.855 -67.349 -69.421 -71.373 -72.978 -74.39 -75.707 -76.943 -78.063 -79.042 -80.06 -80.959 -81.724 -82.503 -83.286 -83.919 -84.562 -85.219 -85.719 -86.218 -86.725 -87.244 -87.783 -88.154 -88.523 -89.09 -89.488 -89.883 -90.086 -90.532 -90.99 -91.458 -91.694 -92.158 -92.424 -92.688 -92.962 -93.519 -93.806 -94.128 -94.495 -94.883 -95.31 -95.9 -97.663 -5 ,27565 ,KEBNE ,16708514,Fri Nov 26 17:29:50 CET,Fri Nov 26 19:01:26 CET,0.0 0.997 1.269 1.436 1.562 1.678 1.778 1.847 1.932 1.963 1.988 1.903 2.039 2.058 2.104 2.118 2.117 2.117 2.106 2.095 2.085 2.066 2.023 1.924 1.799 1.671 1.558 1.446 1.284 1.11 0.923 0.692 0.476 0.231 -0.113 -0.536 -0.966 -1.453 -1.991 -2.617 -3.362 -4.267 -5.402 -6.641 -8.227 -10.175 -12.672 -15.824 -19.999 -25.738 -34.175 -43.07 -49.707 -54.914 -59.091 -62.545 -65.376 -67.871 -69.947 -71.945 -73.605 -75.036 -76.365 -77.575 -78.684 -79.662 -80.681 -81.593 -82.34 -83.11 -83.906 -84.571 -85.278 -85.967 -86.488 -87.023 -87.537 -88.049 -88.588 -88.949 -89.318 -89.916 -90.308 -90.709 -90.919 -91.357 -91.83 -92.301 -92.537 -93.014 -93.273 -93.523 -93.809 -94.394 -94.692 -95.005 -95.347 -95.763 -96.266 -96.892 -98.512 -6 ,22608 ,KEBNE ,16708515,Fri Nov 26 17:30:51 CET,Fri Nov 26 19:02:29 CET,0.0 0.642 0.903 1.069 1.204 1.328 1.429 1.518 1.65 1.696 1.73 1.654 1.793 1.811 1.861 1.889 1.904 1.903 1.898 1.872 1.812 1.778 1.746 1.71 1.641 1.538 1.427 1.322 1.166 0.981 0.801 0.576 0.336 0.072 -0.222 -0.525 -0.888 -1.338 -1.85 -2.487 -3.175 -3.997 -5.039 -6.174 -7.718 -9.629 -12.071 -15.149 -19.221 -24.844 -33.229 -42.091 -48.631 -53.742 -57.856 -61.29 -64.164 -66.661 -68.773 -70.812 -72.478 -73.925 -75.26 -76.49 -77.626 -78.632 -79.648 -80.526 -81.282 -82.067 -82.866 -83.521 -84.196 -84.878 -85.386 -85.907 -86.425 -86.942 -87.468 -87.829 -88.197 -88.766 -89.158 -89.568 -89.779 -90.187 -90.611 -91.057 -91.283 -91.751 -92.04 -92.312 -92.585 -93.15 -93.461 -93.787 -94.156 -94.572 -95.043 -95.64 -97.103 -7 ,20975 ,KEBNE ,16708516,Fri Nov 26 17:30:51 CET,Fri Nov 26 19:02:42 CET,0.0 0.725 0.975 1.161 1.331 1.471 1.583 1.663 1.783 1.841 1.894 1.851 1.998 2.016 2.042 2.063 2.066 2.06 2.073 2.08 2.049 2.016 1.975 1.891 1.806 1.712 1.6 1.494 1.338 1.181 1.04 0.827 0.602 0.363 0.035 -0.376 -0.797 -1.248 -1.794 -2.469 -3.221 -4.132 -5.263 -6.457 -8.009 -9.93 -12.368 -15.477 -19.617 -25.334 -33.875 -42.865 -49.493 -54.698 -58.889 -62.372 -65.226 -67.694 -69.767 -71.775 -73.434 -74.864 -76.211 -77.446 -78.523 -79.46 -80.425 -81.281 -82.038 -82.816 -83.591 -84.226 -84.867 -85.53 -86.047 -86.573 -87.114 -87.666 -88.207 -88.567 -88.938 -89.53 -89.938 -90.361 -90.568 -90.981 -91.431 -91.902 -92.139 -92.612 -92.891 -93.147 -93.41 -93.988 -94.296 -94.628 -95.007 -95.417 -95.845 -96.387 -97.794 -8 ,3103 ,KEBNE ,16708517,Fri Nov 26 17:30:51 CET,Fri Nov 26 19:04:20 CET,0.0 1.124 1.363 1.579 1.758 1.871 1.984 2.087 2.245 2.303 2.352 2.331 2.496 2.522 2.567 2.599 2.603 2.591 2.576 2.57 2.527 2.485 2.442 2.374 2.284 2.181 2.068 1.957 1.805 1.634 1.471 1.253 0.996 0.722 0.401 0.018 -0.383 -0.857 -1.389 -2.002 -2.711 -3.58 -4.708 -5.941 -7.493 -9.399 -11.838 -14.946 -19.122 -24.845 -33.279 -42.195 -48.807 -53.92 -58.044 -61.565 -64.455 -66.927 -69.018 -71.016 -72.665 -74.095 -75.455 -76.718 -77.812 -78.809 -79.847 -80.724 -81.459 -82.211 -82.989 -83.631 -84.299 -84.986 -85.501 -86.003 -86.506 -87.036 -87.602 -87.995 -88.388 -88.959 -89.349 -89.775 -89.993 -90.412 -90.847 -91.302 -91.539 -92.013 -92.287 -92.546 -92.812 -93.401 -93.717 -94.045 -94.411 -94.8 -95.213 -95.739 -97.139 -9 ,4245 ,KEBNE ,16708518,Fri Nov 26 17:31:52 CET,Fri Nov 26 19:03:33 CET,0.0 0.586 0.818 0.964 1.096 1.218 1.317 1.405 1.528 1.587 1.634 1.561 1.713 1.742 1.782 1.817 1.844 1.846 1.851 1.849 1.804 1.76 1.716 1.645 1.569 1.465 1.356 1.264 1.111 0.941 0.789 0.574 0.316 0.035 -0.303 -0.669 -1.064 -1.578 -2.152 -2.786 -3.529 -4.43 -5.564 -6.822 -8.433 -10.388 -12.868 -15.988 -20.159 -25.903 -34.365 -43.267 -49.896 -55.071 -59.219 -62.712 -65.656 -68.219 -70.296 -72.271 -73.928 -75.352 -76.669 -77.882 -79.008 -80.026 -81.067 -81.98 -82.717 -83.452 -84.235 -84.902 -85.56 -86.218 -86.739 -87.261 -87.781 -88.317 -88.882 -89.266 -89.651 -90.23 -90.615 -91.011 -91.219 -91.665 -92.134 -92.598 -92.834 -93.3 -93.597 -93.876 -94.154 -94.73 -95.051 -95.383 -95.732 -96.126 -96.585 -97.157 -98.422 -10 ,11700 ,KEBNE ,16708519,Fri Nov 26 17:33:55 CET,Fri Nov 26 19:06:07 CET,0.0 1.18 1.433 1.614 1.772 1.894 2.01 2.096 2.207 2.259 2.318 2.294 2.445 2.466 2.498 2.516 2.524 2.525 2.509 2.486 2.462 2.426 2.367 2.28 2.186 2.076 1.967 1.863 1.729 1.599 1.439 1.224 0.986 0.71 0.381 -0.036 -0.461 -0.942 -1.506 -2.145 -2.869 -3.722 -4.806 -6.045 -7.598 -9.499 -11.929 -15.023 -19.152 -24.788 -33.146 -41.934 -48.512 -53.704 -57.853 -61.326 -64.232 -66.776 -68.873 -70.858 -72.483 -73.888 -75.206 -76.424 -77.548 -78.562 -79.603 -80.513 -81.261 -82.006 -82.783 -83.437 -84.099 -84.75 -85.265 -85.8 -86.332 -86.882 -87.434 -87.795 -88.167 -88.763 -89.168 -89.58 -89.795 -90.238 -90.675 -91.115 -91.35 -91.83 -92.13 -92.4 -92.675 -93.248 -93.55 -93.883 -94.245 -94.614 -95.035 -95.59 -97.225 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_54.txt deleted file mode 100644 index f1e6600a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_163_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3772 ,KEBNE ,17025709,Wed Dec 22 13:01:22 CET,Wed Dec 22 14:33:54 CET,0.0 1.379 1.869 2.246 2.563 2.816 3.04 3.257 3.62 3.794 3.955 4.117 4.376 4.499 4.739 4.96 5.171 5.269 5.45 5.626 5.871 6.028 6.169 6.356 6.527 6.688 6.834 6.962 7.1 7.211 7.316 7.417 7.524 7.641 7.751 7.859 7.95 8.059 8.14 8.16 8.166 8.128 8.038 7.907 7.674 7.317 6.803 6.046 4.935 3.23 0.346 -2.969 -5.601 -7.77 -9.576 -11.1 -12.411 -13.58 -14.569 -15.581 -16.428 -17.137 -17.805 -18.469 -19.073 -19.583 -20.122 -20.613 -21.039 -21.475 -21.895 -22.242 -22.617 -23.008 -23.314 -23.611 -23.905 -24.228 -24.562 -24.793 -25.024 -25.366 -25.603 -25.853 -25.977 -26.242 -26.538 -26.835 -26.993 -27.32 -27.486 -27.656 -27.834 -28.224 -28.451 -28.698 -28.978 -29.295 -29.66 -30.1 -32.671 -2 ,32643 ,KEBNE ,17025710,Wed Dec 22 13:01:22 CET,Wed Dec 22 14:34:01 CET,0.0 2.188 2.767 3.148 3.451 3.722 3.968 4.194 4.592 4.759 4.905 5.059 5.319 5.448 5.676 5.877 6.052 6.141 6.304 6.459 6.664 6.793 6.938 7.146 7.331 7.495 7.645 7.782 7.947 8.098 8.224 8.371 8.533 8.696 8.865 9.043 9.185 9.307 9.42 9.498 9.524 9.491 9.438 9.351 9.175 8.864 8.356 7.634 6.527 4.834 2.038 -1.262 -3.893 -6.018 -7.793 -9.342 -10.659 -11.807 -12.782 -13.731 -14.522 -15.206 -15.843 -16.446 -17.005 -17.522 -18.067 -18.53 -18.915 -19.311 -19.718 -20.053 -20.391 -20.737 -21.02 -21.326 -21.644 -21.966 -22.275 -22.477 -22.703 -23.074 -23.324 -23.58 -23.711 -23.988 -24.263 -24.531 -24.684 -24.996 -25.158 -25.327 -25.5 -25.882 -26.078 -26.304 -26.58 -26.879 -27.241 -27.773 -29.305 -3 ,22397 ,KEBNE ,17025711,Wed Dec 22 13:01:23 CET,Wed Dec 22 14:35:13 CET,0.0 1.658 2.139 2.545 2.892 3.165 3.4 3.615 4.006 4.178 4.341 4.509 4.758 4.883 5.123 5.319 5.508 5.604 5.775 5.925 6.131 6.264 6.401 6.598 6.777 6.947 7.103 7.242 7.424 7.583 7.726 7.906 8.077 8.205 8.317 8.441 8.573 8.704 8.8 8.851 8.861 8.851 8.808 8.707 8.512 8.253 7.85 7.175 6.079 4.344 1.506 -1.805 -4.449 -6.611 -8.441 -10.031 -11.342 -12.482 -13.459 -14.398 -15.172 -15.847 -16.52 -17.156 -17.714 -18.216 -18.73 -19.208 -19.62 -20.015 -20.439 -20.819 -21.204 -21.575 -21.848 -22.137 -22.445 -22.762 -23.071 -23.277 -23.506 -23.856 -24.102 -24.359 -24.486 -24.738 -24.989 -25.256 -25.402 -25.721 -25.93 -26.114 -26.298 -26.677 -26.892 -27.154 -27.458 -27.791 -28.174 -28.657 -29.958 -4 ,24338 ,KEBNE ,17025712,Wed Dec 22 13:01:22 CET,Wed Dec 22 14:33:33 CET,0.0 1.67 2.2 2.605 2.92 3.196 3.435 3.654 4.031 4.201 4.358 4.516 4.79 4.929 5.171 5.394 5.594 5.691 5.884 6.055 6.278 6.408 6.541 6.721 6.878 7.023 7.16 7.298 7.448 7.583 7.728 7.882 8.009 8.151 8.279 8.394 8.51 8.602 8.653 8.67 8.64 8.591 8.516 8.37 8.14 7.836 7.352 6.606 5.48 3.742 0.888 -2.411 -5.044 -7.208 -8.975 -10.517 -11.83 -13.014 -14.022 -14.976 -15.78 -16.475 -17.128 -17.752 -18.337 -18.845 -19.364 -19.82 -20.207 -20.608 -21.038 -21.399 -21.747 -22.108 -22.401 -22.706 -23.018 -23.351 -23.704 -23.944 -24.177 -24.528 -24.76 -24.994 -25.111 -25.354 -25.611 -25.876 -26.028 -26.344 -26.511 -26.682 -26.866 -27.274 -27.486 -27.728 -28.006 -28.31 -28.661 -29.122 -30.537 -5 ,10328 ,KEBNE ,17025713,Wed Dec 22 13:01:22 CET,Wed Dec 22 14:34:46 CET,0.0 1.868 2.375 2.723 3.019 3.264 3.484 3.674 4.015 4.177 4.33 4.514 4.769 4.884 5.083 5.278 5.476 5.563 5.737 5.914 6.143 6.288 6.437 6.632 6.814 6.992 7.156 7.294 7.447 7.602 7.752 7.894 8.003 8.104 8.208 8.328 8.415 8.465 8.52 8.56 8.559 8.514 8.412 8.265 8.035 7.687 7.161 6.427 5.321 3.577 0.732 -2.595 -5.256 -7.416 -9.235 -10.796 -12.082 -13.218 -14.233 -15.202 -15.979 -16.672 -17.331 -17.944 -18.495 -18.976 -19.474 -19.929 -20.333 -20.75 -21.173 -21.53 -21.911 -22.3 -22.595 -22.898 -23.192 -23.48 -23.768 -23.974 -24.193 -24.522 -24.765 -25.025 -25.156 -25.428 -25.725 -26.031 -26.183 -26.492 -26.641 -26.817 -27.01 -27.407 -27.617 -27.861 -28.146 -28.467 -28.814 -29.285 -30.957 -6 ,18029 ,KEBNE ,17025714,Wed Dec 22 13:01:22 CET,Wed Dec 22 14:35:54 CET,0.0 1.855 2.381 2.778 3.106 3.344 3.537 3.73 4.111 4.282 4.434 4.584 4.837 4.968 5.189 5.376 5.577 5.68 5.861 6.022 6.257 6.419 6.562 6.746 6.916 7.081 7.254 7.403 7.558 7.679 7.813 7.993 8.139 8.253 8.374 8.495 8.615 8.763 8.897 9.005 9.065 9.075 9.068 9.006 8.811 8.449 7.946 7.268 6.234 4.532 1.625 -1.686 -4.337 -6.487 -8.24 -9.783 -11.108 -12.254 -13.205 -14.115 -14.891 -15.595 -16.248 -16.839 -17.393 -17.89 -18.4 -18.877 -19.295 -19.736 -20.208 -20.575 -20.927 -21.3 -21.585 -21.868 -22.181 -22.519 -22.852 -23.071 -23.296 -23.643 -23.877 -24.11 -24.229 -24.485 -24.772 -25.077 -25.228 -25.545 -25.732 -25.922 -26.109 -26.502 -26.72 -26.958 -27.233 -27.534 -27.892 -28.391 -30.475 -7 ,11577 ,KEBNE ,17025715,Wed Dec 22 13:01:23 CET,Wed Dec 22 14:35:18 CET,0.0 2.199 2.808 3.214 3.528 3.816 4.068 4.285 4.651 4.813 4.962 5.095 5.332 5.443 5.669 5.879 6.049 6.13 6.307 6.486 6.719 6.842 6.952 7.116 7.286 7.466 7.634 7.797 7.998 8.165 8.3 8.43 8.548 8.675 8.8 8.902 8.977 9.026 9.051 9.061 9.075 9.071 9.041 8.964 8.745 8.38 7.861 7.157 6.085 4.369 1.524 -1.764 -4.384 -6.521 -8.294 -9.824 -11.123 -12.257 -13.211 -14.174 -14.98 -15.677 -16.343 -16.954 -17.512 -18.019 -18.546 -19.019 -19.439 -19.883 -20.335 -20.686 -21.036 -21.412 -21.693 -21.978 -22.289 -22.599 -22.897 -23.107 -23.33 -23.671 -23.911 -24.157 -24.285 -24.555 -24.839 -25.139 -25.286 -25.598 -25.763 -25.941 -26.13 -26.506 -26.726 -26.97 -27.242 -27.552 -27.894 -28.352 -30.086 -8 ,18290 ,KEBNE ,17025716,Wed Dec 22 13:01:23 CET,Wed Dec 22 14:33:54 CET,0.0 1.802 2.367 2.839 3.181 3.469 3.715 3.948 4.341 4.499 4.653 4.835 5.102 5.234 5.46 5.643 5.806 5.884 6.05 6.219 6.453 6.596 6.714 6.871 7.029 7.192 7.348 7.479 7.624 7.742 7.846 7.984 8.098 8.184 8.291 8.392 8.449 8.491 8.527 8.543 8.547 8.521 8.427 8.274 8.043 7.686 7.2 6.553 5.479 3.756 0.915 -2.396 -5.031 -7.223 -9.05 -10.63 -11.96 -13.118 -14.077 -15.017 -15.823 -16.534 -17.226 -17.844 -18.382 -18.872 -19.367 -19.809 -20.213 -20.644 -21.071 -21.401 -21.739 -22.094 -22.361 -22.656 -22.962 -23.282 -23.614 -23.824 -24.03 -24.36 -24.609 -24.871 -24.999 -25.268 -25.56 -25.868 -26.028 -26.349 -26.553 -26.74 -26.918 -27.292 -27.504 -27.735 -27.985 -28.267 -28.594 -29.004 -30.42 -9 ,8806 ,KEBNE ,17025717,Wed Dec 22 13:01:22 CET,Wed Dec 22 14:34:56 CET,0.0 1.701 2.215 2.606 2.917 3.18 3.399 3.599 3.963 4.121 4.265 4.42 4.674 4.793 5.009 5.214 5.406 5.5 5.673 5.827 6.038 6.167 6.289 6.457 6.635 6.804 6.95 7.074 7.187 7.321 7.454 7.567 7.693 7.817 7.92 8.009 8.087 8.168 8.215 8.22 8.23 8.236 8.169 8.07 7.906 7.618 7.163 6.434 5.346 3.636 0.752 -2.507 -5.137 -7.298 -9.054 -10.542 -11.81 -12.972 -13.954 -14.881 -15.67 -16.371 -17.065 -17.716 -18.289 -18.808 -19.32 -19.78 -20.204 -20.646 -21.095 -21.463 -21.846 -22.246 -22.554 -22.857 -23.17 -23.496 -23.822 -24.043 -24.27 -24.619 -24.866 -25.137 -25.275 -25.556 -25.844 -26.132 -26.283 -26.59 -26.746 -26.925 -27.109 -27.495 -27.715 -27.956 -28.206 -28.48 -28.833 -29.314 -31.407 -10 ,25925 ,KEBNE ,17025718,Wed Dec 22 13:01:22 CET,Wed Dec 22 14:33:57 CET,0.0 1.658 2.176 2.548 2.869 3.141 3.383 3.61 4.032 4.219 4.384 4.536 4.78 4.902 5.137 5.333 5.517 5.61 5.79 5.95 6.171 6.316 6.447 6.625 6.806 6.987 7.141 7.275 7.451 7.628 7.785 7.962 8.139 8.295 8.46 8.601 8.679 8.736 8.798 8.858 8.888 8.874 8.791 8.656 8.471 8.204 7.74 7.029 5.92 4.183 1.267 -2.126 -4.767 -6.881 -8.65 -10.198 -11.506 -12.663 -13.644 -14.608 -15.423 -16.13 -16.807 -17.443 -18.029 -18.547 -19.092 -19.587 -19.993 -20.413 -20.856 -21.22 -21.594 -21.955 -22.211 -22.498 -22.806 -23.113 -23.427 -23.645 -23.881 -24.236 -24.462 -24.706 -24.84 -25.097 -25.379 -25.685 -25.838 -26.158 -26.32 -26.498 -26.691 -27.095 -27.323 -27.567 -27.841 -28.139 -28.475 -28.959 -30.856 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_164_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_164_231.txt deleted file mode 100644 index 02037165..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_164_231.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18203 ,KEBNE ,17126013,Thu Dec 30 17:02:57 CET,Thu Dec 30 18:39:42 CET,0.0 0.793 1.068 1.266 1.436 1.581 1.708 1.829 2.064 2.172 2.268 2.32 2.505 2.577 2.71 2.834 2.949 3.005 3.103 3.183 3.307 3.384 3.456 3.567 3.672 3.767 3.86 3.942 4.035 4.121 4.207 4.31 4.396 4.474 4.579 4.689 4.779 4.85 4.877 4.904 4.921 4.922 4.923 4.91 4.86 4.711 4.384 3.845 3.001 1.681 -0.624 -3.456 -5.796 -7.738 -9.38 -10.827 -12.089 -13.227 -14.155 -15.029 -15.777 -16.407 -16.985 -17.557 -18.1 -18.584 -19.092 -19.551 -19.937 -20.326 -20.724 -21.049 -21.38 -21.721 -21.98 -22.255 -22.537 -22.815 -23.103 -23.309 -23.521 -23.838 -24.056 -24.282 -24.402 -24.64 -24.874 -25.137 -25.28 -25.565 -25.75 -25.909 -26.07 -26.42 -26.621 -26.834 -27.054 -27.317 -27.615 -27.998 -28.875 -2 ,19443 ,KEBNE ,17126014,Thu Dec 30 17:02:57 CET,Thu Dec 30 18:38:49 CET,0.0 1.299 1.628 1.844 2.046 2.215 2.344 2.471 2.696 2.79 2.878 2.945 3.121 3.192 3.333 3.463 3.596 3.663 3.782 3.882 4.02 4.11 4.192 4.311 4.429 4.53 4.614 4.698 4.808 4.91 4.999 5.107 5.206 5.28 5.365 5.484 5.582 5.646 5.696 5.738 5.772 5.806 5.804 5.796 5.711 5.489 5.162 4.669 3.85 2.422 0.093 -2.707 -5.016 -6.956 -8.637 -10.095 -11.318 -12.397 -13.32 -14.237 -14.99 -15.644 -16.283 -16.871 -17.402 -17.876 -18.354 -18.779 -19.146 -19.508 -19.881 -20.198 -20.527 -20.861 -21.118 -21.383 -21.65 -21.936 -22.244 -22.446 -22.645 -22.956 -23.177 -23.402 -23.514 -23.748 -23.99 -24.243 -24.38 -24.661 -24.833 -24.992 -25.155 -25.491 -25.669 -25.873 -26.105 -26.367 -26.67 -27.079 -28.135 -4 ,25659 ,KEBNE ,17126016,Thu Dec 30 17:03:45 CET,Thu Dec 30 18:39:31 CET,0.0 1.18 1.51 1.736 1.912 2.064 2.203 2.326 2.535 2.635 2.73 2.798 2.984 3.061 3.204 3.34 3.466 3.52 3.635 3.744 3.881 3.969 4.053 4.167 4.278 4.385 4.486 4.589 4.709 4.807 4.898 4.996 5.084 5.176 5.279 5.392 5.477 5.517 5.557 5.604 5.631 5.66 5.666 5.619 5.536 5.393 5.076 4.499 3.648 2.374 0.067 -2.741 -5.027 -6.986 -8.655 -10.12 -11.376 -12.457 -13.342 -14.216 -14.979 -15.652 -16.273 -16.851 -17.359 -17.819 -18.303 -18.726 -19.1 -19.482 -19.874 -20.196 -20.522 -20.867 -21.132 -21.403 -21.671 -21.939 -22.227 -22.43 -22.641 -22.965 -23.202 -23.447 -23.573 -23.83 -24.087 -24.369 -24.516 -24.801 -24.955 -25.103 -25.27 -25.653 -25.855 -26.058 -26.285 -26.55 -26.864 -27.261 -28.425 -5 ,27690 ,KEBNE ,17126017,Thu Dec 30 17:03:45 CET,Thu Dec 30 18:41:14 CET,0.0 0.594 0.852 1.023 1.177 1.328 1.462 1.578 1.759 1.846 1.935 2.004 2.19 2.268 2.409 2.531 2.645 2.699 2.806 2.91 3.057 3.151 3.245 3.368 3.467 3.549 3.631 3.714 3.82 3.914 4.001 4.108 4.197 4.275 4.359 4.446 4.531 4.621 4.708 4.794 4.87 4.911 4.924 4.911 4.802 4.57 4.19 3.604 2.745 1.417 -0.987 -3.788 -6.095 -8.109 -9.749 -11.157 -12.364 -13.424 -14.335 -15.243 -16.004 -16.658 -17.287 -17.896 -18.466 -18.96 -19.449 -19.893 -20.278 -20.662 -21.052 -21.379 -21.705 -22.031 -22.284 -22.552 -22.825 -23.106 -23.397 -23.585 -23.778 -24.09 -24.315 -24.547 -24.665 -24.91 -25.165 -25.435 -25.578 -25.856 -26.004 -26.161 -26.336 -26.687 -26.877 -27.09 -27.323 -27.593 -27.904 -28.297 -29.2 -6 ,6630 ,KEBNE ,17126018,Thu Dec 30 17:09:33 CET,Thu Dec 30 18:45:18 CET,0.0 1.152 1.554 1.78 1.954 2.105 2.247 2.383 2.613 2.715 2.803 2.852 3.028 3.092 3.233 3.367 3.481 3.536 3.64 3.732 3.863 3.95 4.024 4.13 4.233 4.323 4.408 4.501 4.623 4.739 4.835 4.919 4.995 5.07 5.158 5.247 5.342 5.453 5.526 5.562 5.562 5.532 5.472 5.361 5.184 4.967 4.653 4.134 3.324 2.044 -0.295 -3.179 -5.449 -7.405 -9.058 -10.462 -11.683 -12.778 -13.706 -14.617 -15.393 -16.053 -16.681 -17.281 -17.824 -18.315 -18.806 -19.228 -19.601 -19.995 -20.387 -20.693 -21.009 -21.336 -21.59 -21.86 -22.143 -22.442 -22.735 -22.931 -23.145 -23.478 -23.707 -23.948 -24.069 -24.317 -24.566 -24.822 -24.956 -25.234 -25.406 -25.566 -25.731 -26.081 -26.264 -26.463 -26.682 -26.945 -27.255 -27.667 -28.87 -7 ,8096 ,KEBNE ,17126019,Thu Dec 30 17:09:33 CET,Thu Dec 30 18:46:54 CET,0.0 1.178 1.555 1.799 2.002 2.179 2.331 2.466 2.704 2.821 2.924 2.979 3.152 3.223 3.369 3.499 3.614 3.676 3.794 3.896 4.032 4.117 4.2 4.309 4.415 4.512 4.601 4.691 4.802 4.892 4.98 5.088 5.191 5.29 5.39 5.479 5.533 5.582 5.66 5.763 5.833 5.851 5.805 5.738 5.654 5.485 5.153 4.603 3.835 2.662 0.328 -2.583 -4.945 -6.958 -8.698 -10.193 -11.427 -12.524 -13.455 -14.334 -15.067 -15.738 -16.373 -16.965 -17.504 -17.989 -18.489 -18.924 -19.301 -19.695 -20.089 -20.406 -20.733 -21.072 -21.342 -21.625 -21.904 -22.187 -22.484 -22.681 -22.881 -23.193 -23.401 -23.609 -23.719 -23.958 -24.207 -24.475 -24.616 -24.894 -25.053 -25.205 -25.37 -25.712 -25.897 -26.104 -26.332 -26.586 -26.866 -27.222 -28.178 -8 ,30865 ,KEBNE ,17126020,Thu Dec 30 17:30:17 CET,Thu Dec 30 19:06:56 CET,0.0 0.912 1.212 1.402 1.579 1.738 1.868 1.998 2.247 2.361 2.461 2.52 2.703 2.782 2.921 3.045 3.166 3.226 3.345 3.455 3.593 3.685 3.777 3.887 3.974 4.06 4.156 4.245 4.346 4.445 4.544 4.66 4.745 4.821 4.924 5.032 5.116 5.191 5.252 5.307 5.361 5.405 5.397 5.338 5.238 5.056 4.803 4.37 3.549 2.258 -0.103 -3.131 -5.544 -7.447 -9.044 -10.444 -11.636 -12.726 -13.673 -14.598 -15.351 -16.015 -16.636 -17.208 -17.742 -18.235 -18.742 -19.183 -19.561 -19.935 -20.312 -20.636 -20.966 -21.295 -21.56 -21.833 -22.107 -22.388 -22.672 -22.874 -23.089 -23.421 -23.645 -23.867 -23.989 -24.247 -24.512 -24.78 -24.914 -25.187 -25.339 -25.5 -25.676 -26.048 -26.241 -26.451 -26.697 -26.969 -27.289 -27.697 -28.623 -9 ,30090 ,KEBNE ,17126021,Thu Dec 30 17:30:17 CET,Thu Dec 30 19:06:18 CET,0.0 1.004 1.35 1.598 1.798 1.982 2.134 2.265 2.512 2.622 2.726 2.819 3.015 3.099 3.243 3.373 3.495 3.553 3.668 3.783 3.945 4.039 4.129 4.246 4.349 4.453 4.55 4.634 4.729 4.825 4.91 5.001 5.087 5.163 5.228 5.307 5.392 5.457 5.527 5.585 5.603 5.624 5.61 5.527 5.401 5.19 4.843 4.347 3.533 2.263 0.051 -2.725 -5.008 -6.892 -8.462 -9.861 -11.092 -12.143 -13.018 -13.878 -14.61 -15.264 -15.879 -16.452 -16.966 -17.432 -17.925 -18.364 -18.739 -19.11 -19.484 -19.806 -20.135 -20.469 -20.726 -20.984 -21.257 -21.545 -21.842 -22.045 -22.253 -22.576 -22.791 -23.009 -23.119 -23.338 -23.56 -23.811 -23.945 -24.223 -24.396 -24.556 -24.72 -25.071 -25.264 -25.486 -25.732 -26.008 -26.365 -26.818 -27.856 -10 ,31250 ,KEBNE ,17126022,Thu Dec 30 17:30:17 CET,Thu Dec 30 19:05:59 CET,0.0 1.264 1.635 1.892 2.105 2.277 2.42 2.561 2.809 2.912 3.006 3.075 3.257 3.329 3.46 3.575 3.688 3.748 3.867 3.977 4.117 4.193 4.273 4.397 4.506 4.601 4.688 4.775 4.892 4.997 5.082 5.205 5.327 5.424 5.533 5.659 5.764 5.859 5.947 6.039 6.097 6.097 6.088 6.066 5.978 5.843 5.617 5.109 4.231 2.891 0.594 -2.245 -4.533 -6.476 -8.149 -9.597 -10.836 -11.945 -12.862 -13.73 -14.48 -15.136 -15.746 -16.312 -16.841 -17.317 -17.803 -18.233 -18.593 -18.97 -19.37 -19.696 -20.026 -20.367 -20.627 -20.898 -21.186 -21.478 -21.775 -21.982 -22.195 -22.533 -22.765 -23.001 -23.125 -23.377 -23.637 -23.908 -24.042 -24.322 -24.496 -24.655 -24.821 -25.177 -25.38 -25.597 -25.832 -26.106 -26.435 -26.87 -27.951 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_167_234.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_167_234.txt deleted file mode 100644 index cdd7d23b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_167_234.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31650 ,KEBNE ,16708520,Fri Nov 26 17:33:55 CET,Fri Nov 26 19:05:54 CET,0.0 0.687 0.91 1.09 1.238 1.352 1.463 1.567 1.735 1.799 1.868 1.928 2.045 2.09 2.158 2.23 2.304 2.329 2.364 2.394 2.459 2.512 2.551 2.578 2.58 2.572 2.564 2.561 2.566 2.569 2.561 2.52 2.453 2.372 2.267 2.13 1.992 1.832 1.649 1.435 1.185 0.865 0.436 -0.063 -0.743 -1.594 -2.642 -3.999 -5.95 -8.726 -12.982 -17.584 -21.044 -23.816 -26.097 -28.021 -29.642 -31.064 -32.244 -33.397 -34.353 -35.181 -35.97 -36.708 -37.357 -37.927 -38.54 -39.112 -39.575 -40.042 -40.545 -40.935 -41.319 -41.739 -42.067 -42.4 -42.733 -43.066 -43.414 -43.662 -43.924 -44.322 -44.6 -44.879 -45.021 -45.31 -45.622 -45.943 -46.095 -46.381 -46.638 -46.825 -47.014 -47.42 -47.638 -47.869 -48.116 -48.387 -48.721 -49.111 -49.98 -2 ,30267 ,KEBNE ,16708521,Fri Nov 26 17:33:55 CET,Fri Nov 26 19:06:55 CET,0.0 0.857 1.119 1.313 1.487 1.616 1.713 1.801 1.929 1.983 2.034 2.07 2.189 2.232 2.304 2.362 2.417 2.446 2.492 2.53 2.578 2.596 2.609 2.625 2.63 2.626 2.636 2.653 2.662 2.655 2.646 2.635 2.64 2.637 2.577 2.465 2.347 2.184 1.964 1.738 1.498 1.169 0.724 0.23 -0.424 -1.23 -2.268 -3.674 -5.651 -8.445 -12.723 -17.302 -20.778 -23.552 -25.799 -27.713 -29.335 -30.729 -31.87 -32.981 -33.914 -34.722 -35.471 -36.176 -36.844 -37.439 -38.069 -38.665 -39.169 -39.665 -40.137 -40.51 -40.909 -41.308 -41.626 -41.968 -42.309 -42.657 -43.025 -43.273 -43.521 -43.879 -44.116 -44.386 -44.534 -44.82 -45.098 -45.414 -45.582 -45.867 -46.089 -46.27 -46.459 -46.849 -47.081 -47.358 -47.645 -47.939 -48.269 -48.706 -49.797 -3 ,3984 ,KEBNE ,16708522,Fri Nov 26 17:33:55 CET,Fri Nov 26 19:07:24 CET,0.0 1.038 1.282 1.457 1.606 1.76 1.882 1.973 2.123 2.183 2.235 2.262 2.376 2.423 2.533 2.626 2.686 2.717 2.784 2.837 2.905 2.952 2.991 3.037 3.069 3.092 3.101 3.089 3.094 3.129 3.148 3.149 3.149 3.12 3.052 2.972 2.873 2.723 2.55 2.345 2.081 1.745 1.315 0.883 0.301 -0.513 -1.572 -2.963 -4.913 -7.658 -11.813 -16.387 -19.832 -22.595 -24.861 -26.825 -28.508 -29.943 -31.097 -32.206 -33.147 -33.959 -34.717 -35.417 -36.058 -36.625 -37.207 -37.755 -38.246 -38.714 -39.163 -39.534 -39.924 -40.312 -40.617 -40.944 -41.272 -41.621 -41.975 -42.204 -42.44 -42.818 -43.082 -43.356 -43.494 -43.79 -44.107 -44.415 -44.565 -44.84 -45.069 -45.242 -45.415 -45.802 -46.023 -46.263 -46.519 -46.805 -47.164 -47.57 -48.565 -4 ,12634 ,KEBNE ,16708523,Fri Nov 26 17:34:57 CET,Fri Nov 26 19:07:53 CET,0.0 0.722 0.973 1.18 1.324 1.439 1.536 1.621 1.788 1.862 1.927 1.982 2.109 2.158 2.25 2.336 2.406 2.433 2.489 2.551 2.637 2.683 2.718 2.774 2.842 2.898 2.937 2.96 2.988 3.031 3.035 3.01 2.986 2.943 2.876 2.783 2.712 2.62 2.464 2.248 1.983 1.667 1.233 0.731 0.08 -0.725 -1.803 -3.222 -5.148 -7.923 -12.191 -16.749 -20.217 -22.996 -25.239 -27.135 -28.717 -30.072 -31.222 -32.367 -33.308 -34.108 -34.87 -35.566 -36.194 -36.777 -37.397 -37.961 -38.424 -38.909 -39.412 -39.8 -40.2 -40.612 -40.943 -41.293 -41.626 -41.959 -42.308 -42.55 -42.8 -43.195 -43.473 -43.746 -43.881 -44.182 -44.512 -44.86 -45.027 -45.304 -45.516 -45.699 -45.88 -46.252 -46.472 -46.699 -46.931 -47.205 -47.525 -47.927 -48.863 -5 ,16344 ,KEBNE ,16708524,Fri Nov 26 17:34:56 CET,Fri Nov 26 19:08:15 CET,0.0 0.826 1.044 1.205 1.337 1.456 1.56 1.649 1.823 1.9 1.966 2.01 2.123 2.162 2.219 2.289 2.378 2.413 2.478 2.538 2.6 2.642 2.675 2.694 2.711 2.722 2.725 2.72 2.69 2.666 2.646 2.61 2.572 2.524 2.456 2.36 2.239 2.083 1.893 1.668 1.41 1.105 0.687 0.187 -0.463 -1.285 -2.357 -3.751 -5.668 -8.459 -12.71 -17.315 -20.873 -23.677 -25.899 -27.78 -29.354 -30.747 -31.984 -33.145 -34.065 -34.9 -35.674 -36.404 -37.079 -37.653 -38.256 -38.799 -39.26 -39.723 -40.215 -40.622 -41.011 -41.395 -41.689 -41.995 -42.332 -42.682 -43.029 -43.265 -43.512 -43.898 -44.144 -44.398 -44.539 -44.829 -45.116 -45.409 -45.571 -45.855 -46.078 -46.26 -46.467 -46.889 -47.109 -47.351 -47.621 -47.936 -48.299 -48.7 -49.653 -6 ,18292 ,KEBNE ,16708525,Fri Nov 26 17:34:57 CET,Fri Nov 26 19:06:40 CET,0.0 0.899 1.158 1.331 1.488 1.644 1.772 1.871 2.043 2.126 2.205 2.249 2.366 2.41 2.468 2.512 2.559 2.578 2.606 2.638 2.675 2.691 2.711 2.741 2.759 2.767 2.761 2.757 2.755 2.739 2.73 2.741 2.756 2.753 2.723 2.689 2.638 2.528 2.372 2.162 1.893 1.556 1.12 0.631 -0.009 -0.798 -1.836 -3.215 -5.135 -7.895 -12.144 -16.75 -20.209 -22.973 -25.244 -27.201 -28.83 -30.217 -31.382 -32.537 -33.485 -34.295 -35.074 -35.846 -36.538 -37.12 -37.702 -38.222 -38.702 -39.182 -39.654 -40.031 -40.407 -40.799 -41.114 -41.424 -41.742 -42.094 -42.445 -42.69 -42.959 -43.368 -43.641 -43.914 -44.044 -44.306 -44.595 -44.913 -45.07 -45.356 -45.593 -45.78 -45.977 -46.39 -46.622 -46.876 -47.136 -47.407 -47.721 -48.129 -49.089 -7 ,13348 ,KEBNE ,16708526,Fri Nov 26 17:35:01 CET,Fri Nov 26 19:02:33 CET,0.0 0.838 1.087 1.251 1.391 1.523 1.625 1.728 1.919 1.993 2.069 2.134 2.255 2.305 2.401 2.481 2.543 2.564 2.588 2.604 2.627 2.66 2.704 2.749 2.774 2.771 2.773 2.796 2.829 2.834 2.799 2.747 2.685 2.62 2.543 2.448 2.345 2.254 2.121 1.891 1.623 1.307 0.948 0.552 -0.041 -0.822 -1.869 -3.282 -5.217 -7.987 -12.283 -16.885 -20.348 -23.088 -25.315 -27.237 -28.856 -30.249 -31.4 -32.534 -33.481 -34.292 -35.044 -35.725 -36.343 -36.906 -37.474 -38.008 -38.477 -38.93 -39.404 -39.792 -40.169 -40.553 -40.86 -41.185 -41.513 -41.837 -42.16 -42.385 -42.633 -43.025 -43.29 -43.546 -43.67 -43.948 -44.259 -44.577 -44.741 -45.021 -45.227 -45.404 -45.597 -45.981 -46.204 -46.462 -46.714 -47.0 -47.351 -47.799 -48.884 -8 ,291 ,KEBNE ,16708527,Fri Nov 26 17:35:01 CET,Fri Nov 26 19:03:30 CET,0.0 0.656 0.876 1.061 1.211 1.337 1.439 1.531 1.707 1.772 1.826 1.858 1.982 2.032 2.109 2.173 2.22 2.246 2.322 2.395 2.483 2.528 2.577 2.645 2.677 2.706 2.73 2.749 2.766 2.746 2.715 2.669 2.62 2.562 2.474 2.376 2.289 2.177 2.018 1.815 1.573 1.257 0.83 0.341 -0.307 -1.113 -2.179 -3.604 -5.563 -8.331 -12.583 -17.182 -20.7 -23.472 -25.704 -27.637 -29.244 -30.634 -31.782 -32.875 -33.79 -34.592 -35.37 -36.092 -36.754 -37.338 -37.895 -38.387 -38.831 -39.287 -39.772 -40.17 -40.574 -40.976 -41.274 -41.594 -41.907 -42.217 -42.558 -42.804 -43.056 -43.443 -43.712 -43.986 -44.126 -44.419 -44.731 -45.058 -45.228 -45.512 -45.717 -45.897 -46.09 -46.49 -46.703 -46.923 -47.171 -47.454 -47.774 -48.225 -49.432 -9 ,27359 ,KEBNE ,16708528,Fri Nov 26 17:35:58 CET,Fri Nov 26 19:09:03 CET,0.0 0.85 1.103 1.296 1.473 1.625 1.745 1.834 1.987 2.056 2.124 2.187 2.313 2.365 2.457 2.528 2.593 2.622 2.68 2.727 2.778 2.807 2.842 2.886 2.927 2.968 2.985 3.001 3.009 3.001 3.017 3.031 3.025 3.033 3.023 2.974 2.897 2.778 2.648 2.47 2.197 1.866 1.502 1.066 0.42 -0.386 -1.436 -2.815 -4.747 -7.508 -11.675 -16.149 -19.584 -22.342 -24.611 -26.545 -28.128 -29.521 -30.687 -31.784 -32.715 -33.534 -34.286 -34.994 -35.655 -36.258 -36.892 -37.442 -37.909 -38.412 -38.931 -39.356 -39.761 -40.172 -40.497 -40.826 -41.19 -41.558 -41.91 -42.145 -42.392 -42.761 -43.005 -43.284 -43.433 -43.72 -43.998 -44.28 -44.449 -44.747 -44.984 -45.165 -45.347 -45.766 -45.998 -46.256 -46.542 -46.845 -47.17 -47.606 -48.833 -10 ,30460 ,KEBNE ,16708529,Fri Nov 26 17:36:59 CET,Fri Nov 26 19:10:02 CET,0.0 0.938 1.155 1.311 1.425 1.522 1.614 1.702 1.874 1.938 1.995 2.028 2.134 2.183 2.297 2.381 2.439 2.468 2.533 2.599 2.675 2.72 2.76 2.802 2.825 2.837 2.856 2.869 2.868 2.871 2.884 2.879 2.85 2.807 2.738 2.645 2.541 2.417 2.268 2.088 1.858 1.539 1.105 0.602 -0.04 -0.832 -1.892 -3.312 -5.28 -8.056 -12.303 -16.932 -20.453 -23.244 -25.505 -27.391 -28.948 -30.328 -31.504 -32.641 -33.584 -34.387 -35.135 -35.843 -36.5 -37.101 -37.72 -38.251 -38.694 -39.146 -39.627 -40.019 -40.389 -40.773 -41.075 -41.382 -41.7 -42.041 -42.412 -42.666 -42.925 -43.31 -43.57 -43.846 -43.985 -44.267 -44.577 -44.893 -45.047 -45.332 -45.581 -45.769 -45.962 -46.415 -46.665 -46.9 -47.163 -47.461 -47.82 -48.277 -49.28 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_1_61.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_1_61.txt deleted file mode 100644 index dc552f05..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_1_61.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25157 ,KEBNE ,16708530,Fri Nov 26 17:37:06 CET,Fri Nov 26 19:08:52 CET,0.0 1.053 1.38 1.588 1.756 1.922 2.072 2.199 2.399 2.477 2.562 2.661 2.777 2.836 2.933 3.019 3.109 3.151 3.201 3.246 3.32 3.361 3.398 3.452 3.492 3.515 3.536 3.558 3.572 3.559 3.534 3.499 3.452 3.403 3.325 3.217 3.103 2.966 2.807 2.589 2.336 2.039 1.628 1.123 0.441 -0.414 -1.556 -3.033 -5.041 -7.908 -12.257 -16.952 -20.446 -23.197 -25.476 -27.403 -29.026 -30.478 -31.689 -32.841 -33.82 -34.676 -35.452 -36.154 -36.787 -37.368 -37.986 -38.521 -38.962 -39.43 -39.907 -40.282 -40.679 -41.092 -41.399 -41.724 -42.052 -42.374 -42.709 -42.937 -43.177 -43.55 -43.796 -44.067 -44.213 -44.507 -44.807 -45.112 -45.272 -45.519 -45.747 -45.937 -46.127 -46.544 -46.767 -46.971 -47.19 -47.466 -47.82 -48.297 -49.417 -2 ,10888 ,KEBNE ,16708531,Fri Nov 26 17:37:05 CET,Fri Nov 26 19:10:06 CET,0.0 0.942 1.26 1.505 1.663 1.795 1.924 2.033 2.22 2.31 2.387 2.449 2.54 2.584 2.668 2.743 2.803 2.832 2.897 2.959 3.031 3.065 3.088 3.106 3.119 3.131 3.147 3.159 3.162 3.137 3.121 3.101 3.07 3.042 2.964 2.844 2.717 2.563 2.394 2.171 1.881 1.547 1.123 0.612 -0.069 -0.915 -2.014 -3.464 -5.446 -8.221 -12.466 -17.04 -20.553 -23.386 -25.69 -27.681 -29.344 -30.8 -31.995 -33.121 -34.07 -34.924 -35.722 -36.447 -37.103 -37.691 -38.283 -38.801 -39.27 -39.756 -40.235 -40.64 -41.052 -41.462 -41.777 -42.096 -42.414 -42.741 -43.085 -43.319 -43.571 -43.959 -44.216 -44.483 -44.619 -44.918 -45.22 -45.512 -45.674 -45.935 -46.193 -46.385 -46.572 -46.957 -47.174 -47.395 -47.656 -47.969 -48.31 -48.762 -49.991 -3 ,11960 ,KEBNE ,16708532,Fri Nov 26 17:37:05 CET,Fri Nov 26 19:09:39 CET,0.0 1.193 1.559 1.793 1.966 2.095 2.2 2.287 2.442 2.519 2.605 2.706 2.814 2.871 2.978 3.067 3.14 3.175 3.25 3.317 3.388 3.431 3.464 3.485 3.514 3.559 3.604 3.644 3.656 3.633 3.602 3.551 3.491 3.438 3.402 3.343 3.229 3.066 2.876 2.653 2.397 2.101 1.674 1.152 0.498 -0.273 -1.304 -2.75 -4.745 -7.591 -11.907 -16.544 -20.023 -22.838 -25.154 -27.103 -28.732 -30.143 -31.319 -32.478 -33.44 -34.253 -35.011 -35.713 -36.346 -36.914 -37.498 -38.02 -38.472 -38.953 -39.459 -39.859 -40.255 -40.652 -40.953 -41.26 -41.584 -41.93 -42.282 -42.519 -42.768 -43.154 -43.409 -43.669 -43.807 -44.104 -44.406 -44.702 -44.861 -45.127 -45.385 -45.566 -45.741 -46.123 -46.327 -46.556 -46.837 -47.146 -47.495 -47.97 -49.358 -4 ,4695 ,KEBNE ,16708533,Fri Nov 26 17:38:00 CET,Fri Nov 26 19:09:19 CET,0.0 0.944 1.269 1.476 1.625 1.765 1.895 1.989 2.129 2.203 2.282 2.37 2.476 2.533 2.645 2.745 2.824 2.86 2.939 2.998 3.056 3.089 3.125 3.179 3.218 3.263 3.309 3.334 3.344 3.342 3.324 3.297 3.255 3.203 3.153 3.089 2.996 2.852 2.667 2.481 2.26 1.945 1.51 1.012 0.349 -0.517 -1.644 -3.094 -5.053 -7.848 -12.079 -16.626 -20.111 -22.872 -25.084 -26.967 -28.535 -29.878 -31.024 -32.168 -33.126 -33.928 -34.682 -35.384 -36.013 -36.594 -37.217 -37.779 -38.251 -38.729 -39.21 -39.618 -40.031 -40.427 -40.734 -41.053 -41.379 -41.722 -42.078 -42.322 -42.578 -42.979 -43.259 -43.544 -43.689 -43.981 -44.269 -44.562 -44.716 -44.969 -45.204 -45.384 -45.575 -45.988 -46.198 -46.443 -46.714 -47.007 -47.391 -47.875 -49.091 -5 ,30403 ,KEBNE ,16708534,Fri Nov 26 17:39:01 CET,Fri Nov 26 19:10:32 CET,0.0 0.871 1.171 1.389 1.55 1.68 1.804 1.922 2.108 2.181 2.249 2.326 2.425 2.474 2.581 2.666 2.728 2.758 2.811 2.844 2.892 2.932 2.96 2.989 3.035 3.087 3.135 3.158 3.151 3.135 3.127 3.138 3.13 3.089 3.019 2.931 2.827 2.669 2.458 2.205 1.952 1.655 1.238 0.758 0.124 -0.694 -1.807 -3.21 -5.152 -7.992 -12.336 -17.033 -20.584 -23.357 -25.59 -27.487 -29.07 -30.474 -31.618 -32.702 -33.633 -34.449 -35.242 -36.0 -36.694 -37.294 -37.88 -38.385 -38.819 -39.267 -39.716 -40.075 -40.45 -40.846 -41.158 -41.49 -41.835 -42.178 -42.51 -42.747 -42.994 -43.353 -43.592 -43.838 -43.972 -44.257 -44.563 -44.876 -45.033 -45.289 -45.524 -45.703 -45.879 -46.271 -46.496 -46.727 -46.966 -47.247 -47.594 -48.096 -49.452 -6 ,15003 ,KEBNE ,16708535,Fri Nov 26 17:40:03 CET,Fri Nov 26 19:11:35 CET,0.0 1.114 1.401 1.614 1.803 1.961 2.101 2.214 2.375 2.45 2.52 2.595 2.7 2.76 2.856 2.927 2.999 3.034 3.088 3.137 3.204 3.245 3.294 3.37 3.442 3.484 3.493 3.486 3.463 3.456 3.461 3.432 3.386 3.357 3.32 3.23 3.137 3.025 2.833 2.593 2.344 2.036 1.606 1.091 0.426 -0.391 -1.486 -2.936 -4.951 -7.799 -12.102 -16.799 -20.349 -23.151 -25.395 -27.271 -28.854 -30.277 -31.462 -32.598 -33.547 -34.361 -35.093 -35.775 -36.411 -36.971 -37.552 -38.058 -38.489 -38.924 -39.375 -39.748 -40.118 -40.509 -40.821 -41.139 -41.456 -41.801 -42.177 -42.428 -42.671 -43.041 -43.302 -43.564 -43.695 -43.969 -44.27 -44.601 -44.771 -45.025 -45.253 -45.433 -45.624 -46.029 -46.24 -46.479 -46.758 -47.066 -47.425 -47.864 -49.011 -7 ,8740 ,KEBNE ,16708536,Fri Nov 26 17:41:04 CET,Fri Nov 26 19:13:50 CET,0.0 1.065 1.406 1.619 1.814 1.987 2.127 2.257 2.468 2.548 2.616 2.693 2.801 2.854 2.955 3.061 3.157 3.199 3.278 3.34 3.394 3.426 3.461 3.506 3.547 3.589 3.613 3.622 3.645 3.67 3.678 3.646 3.605 3.559 3.487 3.392 3.274 3.115 2.922 2.688 2.406 2.059 1.599 1.08 0.424 -0.404 -1.512 -2.95 -4.97 -7.851 -12.258 -16.966 -20.441 -23.173 -25.359 -27.215 -28.824 -30.262 -31.424 -32.526 -33.44 -34.233 -34.996 -35.695 -36.324 -36.888 -37.46 -37.971 -38.417 -38.878 -39.347 -39.725 -40.119 -40.513 -40.827 -41.181 -41.545 -41.909 -42.275 -42.514 -42.751 -43.099 -43.351 -43.638 -43.779 -44.056 -44.35 -44.651 -44.807 -45.065 -45.308 -45.495 -45.691 -46.088 -46.302 -46.539 -46.782 -47.063 -47.42 -47.895 -49.071 -8 ,18736 ,KEBNE ,16708537,Fri Nov 26 17:42:05 CET,Fri Nov 26 19:13:38 CET,0.0 1.116 1.421 1.625 1.804 1.947 2.068 2.186 2.388 2.472 2.556 2.661 2.765 2.816 2.925 3.018 3.095 3.126 3.171 3.21 3.271 3.312 3.343 3.372 3.405 3.42 3.43 3.454 3.478 3.485 3.487 3.487 3.489 3.489 3.462 3.377 3.243 3.072 2.874 2.632 2.352 2.003 1.568 1.083 0.406 -0.446 -1.566 -3.043 -5.044 -7.86 -12.265 -16.981 -20.439 -23.229 -25.525 -27.474 -29.132 -30.563 -31.767 -32.925 -33.892 -34.725 -35.474 -36.165 -36.826 -37.439 -38.036 -38.574 -39.042 -39.499 -39.955 -40.324 -40.704 -41.096 -41.399 -41.714 -42.039 -42.37 -42.718 -42.966 -43.22 -43.597 -43.852 -44.124 -44.263 -44.541 -44.817 -45.105 -45.267 -45.53 -45.762 -45.943 -46.14 -46.555 -46.783 -47.03 -47.292 -47.589 -47.953 -48.394 -49.555 -9 ,24764 ,KEBNE ,16708538,Fri Nov 26 17:42:06 CET,Fri Nov 26 19:13:44 CET,0.0 1.011 1.336 1.564 1.732 1.881 2.013 2.131 2.34 2.427 2.496 2.577 2.695 2.753 2.858 2.961 3.045 3.082 3.14 3.188 3.259 3.305 3.344 3.389 3.423 3.439 3.435 3.423 3.413 3.391 3.346 3.297 3.262 3.211 3.134 3.014 2.881 2.727 2.527 2.284 2.006 1.644 1.162 0.652 -0.026 -0.896 -2.024 -3.524 -5.569 -8.386 -12.632 -17.215 -20.675 -23.445 -25.721 -27.644 -29.238 -30.629 -31.804 -32.939 -33.898 -34.75 -35.55 -36.272 -36.92 -37.51 -38.123 -38.665 -39.121 -39.596 -40.08 -40.455 -40.841 -41.241 -41.547 -41.864 -42.198 -42.552 -42.919 -43.172 -43.434 -43.815 -44.068 -44.335 -44.471 -44.757 -45.054 -45.361 -45.511 -45.757 -45.992 -46.161 -46.34 -46.754 -46.983 -47.22 -47.499 -47.797 -48.139 -48.599 -49.654 -10 ,24003 ,KEBNE ,16708539,Fri Nov 26 17:42:06 CET,Fri Nov 26 19:13:38 CET,0.0 1.01 1.306 1.565 1.776 1.908 2.02 2.127 2.334 2.424 2.494 2.59 2.713 2.781 2.883 2.956 3.022 3.06 3.124 3.167 3.23 3.275 3.305 3.348 3.405 3.437 3.45 3.478 3.515 3.513 3.491 3.472 3.433 3.371 3.318 3.26 3.151 3.0 2.811 2.604 2.39 2.094 1.644 1.126 0.451 -0.389 -1.473 -2.895 -4.851 -7.663 -11.976 -16.604 -20.149 -22.994 -25.245 -27.182 -28.825 -30.2 -31.321 -32.424 -33.361 -34.203 -34.994 -35.719 -36.389 -36.963 -37.526 -38.018 -38.448 -38.916 -39.427 -39.846 -40.246 -40.658 -40.993 -41.322 -41.643 -41.964 -42.308 -42.559 -42.811 -43.192 -43.458 -43.742 -43.888 -44.178 -44.474 -44.779 -44.942 -45.212 -45.496 -45.693 -45.889 -46.292 -46.506 -46.745 -47.019 -47.325 -47.65 -48.035 -49.039 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_1_84.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_1_84.txt deleted file mode 100644 index 4ca8ad97..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_1_84.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18141 ,KEBNE ,16708540,Fri Nov 26 17:42:05 CET,Fri Nov 26 19:13:55 CET,0.0 0.88 1.174 1.401 1.605 1.772 1.917 2.057 2.278 2.37 2.461 2.586 2.708 2.782 2.945 3.09 3.217 3.274 3.374 3.475 3.613 3.695 3.779 3.905 4.031 4.148 4.256 4.363 4.486 4.599 4.699 4.804 4.912 5.019 5.133 5.251 5.357 5.466 5.569 5.669 5.758 5.837 5.896 5.923 5.905 5.816 5.638 5.325 4.772 3.715 1.706 -0.796 -2.871 -4.654 -6.204 -7.578 -8.771 -9.857 -10.789 -11.745 -12.547 -13.224 -13.862 -14.443 -14.995 -15.479 -15.961 -16.396 -16.779 -17.179 -17.585 -17.918 -18.26 -18.612 -18.873 -19.138 -19.408 -19.693 -19.993 -20.201 -20.423 -20.767 -20.999 -21.242 -21.368 -21.623 -21.885 -22.153 -22.292 -22.508 -22.744 -22.903 -23.078 -23.454 -23.665 -23.921 -24.185 -24.465 -24.796 -25.213 -26.533 -2 ,23994 ,KEBNE ,16708541,Fri Nov 26 17:42:06 CET,Fri Nov 26 19:14:51 CET,0.0 0.993 1.32 1.538 1.715 1.874 2.022 2.149 2.358 2.45 2.54 2.671 2.803 2.883 3.034 3.18 3.306 3.359 3.476 3.589 3.744 3.84 3.93 4.053 4.164 4.281 4.388 4.477 4.591 4.702 4.805 4.913 5.016 5.116 5.221 5.34 5.448 5.536 5.621 5.726 5.831 5.922 5.993 6.033 6.025 5.955 5.827 5.529 4.926 3.783 1.485 -1.427 -3.745 -5.66 -7.28 -8.707 -9.965 -11.097 -12.057 -12.986 -13.761 -14.444 -15.077 -15.661 -16.202 -16.69 -17.196 -17.645 -18.027 -18.41 -18.82 -19.168 -19.509 -19.852 -20.113 -20.378 -20.67 -20.976 -21.282 -21.501 -21.724 -22.054 -22.282 -22.529 -22.655 -22.906 -23.166 -23.441 -23.586 -23.806 -24.054 -24.225 -24.404 -24.805 -25.025 -25.274 -25.548 -25.86 -26.211 -26.669 -27.986 -3 ,13202 ,KEBNE ,16708542,Fri Nov 26 17:43:06 CET,Fri Nov 26 19:14:57 CET,0.0 0.985 1.312 1.556 1.771 1.947 2.091 2.224 2.45 2.56 2.663 2.776 2.9 2.975 3.112 3.245 3.375 3.44 3.552 3.656 3.813 3.909 3.995 4.115 4.231 4.336 4.434 4.532 4.657 4.775 4.885 5.018 5.136 5.231 5.346 5.476 5.585 5.694 5.796 5.888 5.959 6.037 6.118 6.129 6.09 6.042 5.947 5.706 5.14 4.157 2.249 -0.386 -2.623 -4.487 -6.091 -7.552 -8.784 -9.864 -10.782 -11.686 -12.436 -13.082 -13.711 -14.305 -14.848 -15.338 -15.842 -16.288 -16.659 -17.037 -17.433 -17.76 -18.104 -18.465 -18.737 -19.021 -19.305 -19.587 -19.887 -20.095 -20.311 -20.638 -20.872 -21.117 -21.237 -21.504 -21.779 -22.057 -22.201 -22.421 -22.685 -22.864 -23.047 -23.435 -23.652 -23.897 -24.161 -24.449 -24.771 -25.202 -26.502 -4 ,18014 ,KEBNE ,16708543,Fri Nov 26 17:43:11 CET,Fri Nov 26 19:07:12 CET,0.0 1.391 1.675 1.914 2.154 2.382 2.57 2.73 2.952 3.047 3.148 3.282 3.417 3.493 3.621 3.754 3.878 3.935 4.046 4.166 4.342 4.45 4.55 4.68 4.798 4.907 5.008 5.102 5.217 5.329 5.441 5.573 5.686 5.792 5.923 6.05 6.164 6.295 6.417 6.524 6.617 6.718 6.804 6.832 6.816 6.783 6.66 6.35 5.788 4.76 2.863 0.321 -1.883 -3.75 -5.386 -6.862 -8.117 -9.234 -10.184 -11.082 -11.828 -12.485 -13.096 -13.656 -14.194 -14.697 -15.203 -15.638 -16.018 -16.412 -16.806 -17.13 -17.482 -17.838 -18.102 -18.378 -18.666 -18.961 -19.269 -19.481 -19.694 -20.021 -20.248 -20.49 -20.612 -20.855 -21.115 -21.391 -21.538 -21.762 -21.993 -22.148 -22.319 -22.69 -22.907 -23.155 -23.419 -23.708 -24.05 -24.5 -25.721 -5 ,29355 ,KEBNE ,16708544,Fri Nov 26 17:44:08 CET,Fri Nov 26 19:15:00 CET,0.0 1.0 1.289 1.512 1.72 1.891 2.032 2.163 2.378 2.486 2.597 2.747 2.879 2.956 3.091 3.214 3.326 3.379 3.488 3.601 3.746 3.826 3.907 4.027 4.143 4.258 4.367 4.468 4.586 4.698 4.804 4.918 5.017 5.117 5.23 5.336 5.441 5.559 5.672 5.755 5.858 5.983 6.082 6.138 6.152 6.114 5.983 5.732 5.224 4.33 2.37 -0.323 -2.479 -4.314 -5.873 -7.216 -8.406 -9.505 -10.445 -11.338 -12.098 -12.791 -13.428 -14.017 -14.559 -15.043 -15.553 -15.991 -16.358 -16.752 -17.151 -17.457 -17.786 -18.138 -18.408 -18.697 -18.981 -19.271 -19.563 -19.766 -19.98 -20.308 -20.536 -20.767 -20.883 -21.131 -21.399 -21.673 -21.817 -22.044 -22.325 -22.505 -22.678 -23.049 -23.274 -23.518 -23.764 -24.033 -24.391 -24.839 -25.943 -6 ,13672 ,KEBNE ,16708545,Fri Nov 26 17:45:14 CET,Fri Nov 26 19:13:35 CET,0.0 0.901 1.228 1.459 1.649 1.831 1.99 2.114 2.339 2.448 2.56 2.709 2.832 2.907 3.058 3.194 3.329 3.399 3.519 3.625 3.775 3.874 3.965 4.077 4.19 4.307 4.416 4.515 4.634 4.746 4.852 4.967 5.068 5.162 5.267 5.38 5.49 5.602 5.707 5.826 5.926 6.02 6.105 6.121 6.099 6.04 5.923 5.687 5.191 4.121 1.947 -0.751 -3.005 -4.929 -6.593 -7.975 -9.089 -10.106 -10.999 -11.88 -12.638 -13.302 -13.921 -14.513 -15.05 -15.536 -16.044 -16.492 -16.867 -17.24 -17.64 -17.974 -18.315 -18.666 -18.937 -19.217 -19.509 -19.814 -20.116 -20.323 -20.543 -20.884 -21.117 -21.352 -21.474 -21.722 -21.988 -22.271 -22.402 -22.616 -22.87 -23.052 -23.235 -23.618 -23.834 -24.077 -24.343 -24.621 -24.937 -25.372 -26.704 -7 ,19683 ,KEBNE ,16708546,Fri Nov 26 17:46:12 CET,Fri Nov 26 19:18:03 CET,0.0 1.099 1.457 1.702 1.888 2.054 2.199 2.322 2.548 2.65 2.74 2.859 2.984 3.057 3.198 3.337 3.481 3.546 3.651 3.746 3.884 3.97 4.049 4.163 4.274 4.378 4.478 4.568 4.673 4.786 4.896 4.996 5.084 5.19 5.314 5.442 5.553 5.652 5.762 5.855 5.933 6.032 6.114 6.145 6.11 6.011 5.795 5.384 4.717 3.536 1.386 -1.325 -3.664 -5.696 -7.382 -8.823 -10.061 -11.128 -12.021 -12.916 -13.698 -14.379 -15.019 -15.604 -16.126 -16.597 -17.085 -17.527 -17.923 -18.325 -18.719 -19.043 -19.379 -19.734 -20.007 -20.29 -20.576 -20.863 -21.169 -21.382 -21.594 -21.919 -22.15 -22.391 -22.51 -22.751 -23.014 -23.304 -23.451 -23.676 -23.942 -24.105 -24.273 -24.65 -24.862 -25.097 -25.364 -25.659 -25.987 -26.396 -27.816 -8 ,16271 ,KEBNE ,16708547,Fri Nov 26 17:52:19 CET,Fri Nov 26 19:24:38 CET,0.0 0.932 1.223 1.45 1.635 1.79 1.932 2.07 2.298 2.4 2.495 2.611 2.737 2.818 2.961 3.085 3.204 3.264 3.392 3.509 3.654 3.736 3.811 3.926 4.037 4.147 4.256 4.362 4.498 4.614 4.705 4.822 4.947 5.056 5.171 5.294 5.397 5.505 5.623 5.731 5.832 5.911 5.981 6.039 6.022 5.95 5.8 5.489 4.945 4.029 2.223 -0.3 -2.495 -4.439 -6.093 -7.505 -8.706 -9.796 -10.696 -11.566 -12.311 -12.959 -13.583 -14.171 -14.719 -15.225 -15.733 -16.151 -16.506 -16.889 -17.286 -17.607 -17.933 -18.276 -18.548 -18.828 -19.112 -19.407 -19.7 -19.896 -20.099 -20.426 -20.655 -20.89 -21.012 -21.268 -21.534 -21.814 -21.962 -22.181 -22.412 -22.582 -22.768 -23.172 -23.384 -23.618 -23.88 -24.179 -24.545 -25.017 -26.384 -9 ,13149 ,KEBNE ,16708548,Fri Nov 26 17:53:20 CET,Fri Nov 26 19:24:59 CET,0.0 0.968 1.3 1.513 1.676 1.84 1.99 2.118 2.34 2.444 2.543 2.673 2.803 2.883 3.035 3.173 3.295 3.352 3.455 3.552 3.696 3.789 3.877 4.008 4.133 4.244 4.353 4.456 4.564 4.664 4.769 4.879 4.973 5.072 5.18 5.283 5.373 5.479 5.6 5.715 5.802 5.867 5.907 5.923 5.915 5.845 5.671 5.307 4.708 3.637 1.464 -1.298 -3.657 -5.713 -7.431 -8.912 -10.139 -11.196 -12.102 -13.009 -13.779 -14.444 -15.074 -15.669 -16.216 -16.705 -17.195 -17.624 -18.0 -18.383 -18.77 -19.105 -19.452 -19.798 -20.061 -20.35 -20.646 -20.937 -21.242 -21.446 -21.666 -22.009 -22.235 -22.47 -22.593 -22.842 -23.1 -23.385 -23.527 -23.739 -23.974 -24.145 -24.326 -24.711 -24.938 -25.164 -25.394 -25.671 -25.994 -26.438 -27.728 -10 ,14921 ,KEBNE ,16708549,Fri Nov 26 17:54:21 CET,Fri Nov 26 19:26:10 CET,0.0 0.927 1.249 1.496 1.727 1.915 2.055 2.175 2.403 2.511 2.614 2.734 2.846 2.918 3.063 3.197 3.326 3.382 3.487 3.593 3.739 3.833 3.921 4.04 4.153 4.263 4.373 4.476 4.603 4.709 4.807 4.925 5.02 5.104 5.205 5.303 5.389 5.495 5.613 5.728 5.836 5.937 6.011 6.048 6.051 5.994 5.804 5.42 4.701 3.531 1.481 -1.351 -3.754 -5.735 -7.381 -8.822 -10.054 -11.15 -12.078 -12.973 -13.74 -14.423 -15.071 -15.666 -16.183 -16.646 -17.145 -17.6 -17.987 -18.369 -18.763 -19.091 -19.423 -19.763 -20.033 -20.31 -20.588 -20.867 -21.152 -21.351 -21.562 -21.896 -22.126 -22.365 -22.482 -22.721 -22.982 -23.263 -23.407 -23.628 -23.883 -24.052 -24.233 -24.616 -24.82 -25.045 -25.295 -25.573 -25.882 -26.281 -27.545 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_206_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_206_163.txt deleted file mode 100644 index 871f4a34..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_206_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,765 ,KEBNE ,16708550,Fri Nov 26 17:55:22 CET,Fri Nov 26 19:28:46 CET,0.0 0.804 1.064 1.251 1.396 1.517 1.642 1.77 1.985 2.086 2.184 2.245 2.428 2.505 2.658 2.779 2.891 2.951 3.063 3.173 3.33 3.417 3.483 3.573 3.678 3.798 3.9 3.973 4.085 4.207 4.309 4.403 4.47 4.529 4.598 4.693 4.767 4.812 4.844 4.87 4.899 4.954 4.997 4.979 4.921 4.78 4.525 4.127 3.488 2.486 0.797 -1.259 -2.985 -4.466 -5.715 -6.801 -7.83 -8.748 -9.478 -10.197 -10.799 -11.33 -11.876 -12.394 -12.839 -13.252 -13.677 -14.057 -14.386 -14.73 -15.107 -15.442 -15.767 -16.091 -16.345 -16.585 -16.827 -17.079 -17.355 -17.553 -17.749 -18.077 -18.313 -18.539 -18.657 -18.913 -19.17 -19.421 -19.559 -19.832 -20.005 -20.162 -20.335 -20.724 -20.941 -21.178 -21.426 -21.691 -21.992 -22.402 -23.626 -2 ,14640 ,KEBNE ,16708551,Fri Nov 26 17:55:22 CET,Fri Nov 26 19:27:36 CET,0.0 0.773 1.02 1.195 1.342 1.476 1.599 1.718 1.94 2.033 2.111 2.154 2.327 2.39 2.501 2.607 2.733 2.793 2.908 3.014 3.141 3.22 3.306 3.442 3.552 3.633 3.696 3.77 3.901 4.023 4.117 4.236 4.338 4.422 4.521 4.598 4.649 4.711 4.786 4.839 4.864 4.873 4.871 4.838 4.738 4.58 4.307 3.879 3.231 2.183 0.424 -1.644 -3.321 -4.742 -5.965 -6.996 -7.88 -8.703 -9.415 -10.172 -10.798 -11.314 -11.801 -12.285 -12.74 -13.181 -13.665 -14.075 -14.432 -14.793 -15.15 -15.429 -15.732 -16.08 -16.342 -16.59 -16.849 -17.117 -17.398 -17.609 -17.831 -18.15 -18.373 -18.613 -18.737 -18.99 -19.257 -19.538 -19.687 -19.972 -20.187 -20.367 -20.553 -20.92 -21.125 -21.358 -21.611 -21.879 -22.178 -22.548 -23.931 -3 ,11981 ,KEBNE ,16708552,Fri Nov 26 18:01:30 CET,Fri Nov 26 19:33:44 CET,0.0 1.013 1.278 1.471 1.631 1.783 1.928 2.062 2.291 2.384 2.471 2.524 2.706 2.779 2.907 3.018 3.122 3.169 3.26 3.359 3.514 3.616 3.696 3.811 3.926 4.016 4.094 4.17 4.274 4.355 4.418 4.505 4.578 4.638 4.742 4.861 4.954 5.028 5.058 5.086 5.108 5.105 5.101 5.104 5.057 4.906 4.639 4.229 3.589 2.557 0.784 -1.32 -3.025 -4.507 -5.796 -6.903 -7.845 -8.692 -9.405 -10.114 -10.749 -11.319 -11.83 -12.289 -12.713 -13.099 -13.519 -13.909 -14.238 -14.574 -14.947 -15.257 -15.56 -15.887 -16.141 -16.387 -16.645 -16.92 -17.242 -17.464 -17.666 -17.97 -18.185 -18.418 -18.539 -18.79 -19.042 -19.303 -19.44 -19.69 -19.85 -20.02 -20.188 -20.55 -20.763 -20.995 -21.247 -21.527 -21.872 -22.377 -23.742 -4 ,16710 ,KEBNE ,16708553,Fri Nov 26 18:03:32 CET,Fri Nov 26 19:35:50 CET,0.0 1.207 1.508 1.737 1.917 2.068 2.198 2.308 2.499 2.586 2.667 2.714 2.904 2.985 3.127 3.265 3.398 3.46 3.568 3.672 3.818 3.898 3.979 4.116 4.259 4.386 4.496 4.6 4.74 4.872 4.985 5.116 5.225 5.296 5.355 5.422 5.479 5.523 5.556 5.588 5.594 5.586 5.573 5.531 5.42 5.263 5.022 4.573 3.886 2.851 1.083 -1.124 -2.874 -4.288 -5.499 -6.57 -7.5 -8.363 -9.1 -9.817 -10.437 -10.982 -11.499 -11.984 -12.417 -12.811 -13.22 -13.6 -13.942 -14.289 -14.667 -14.977 -15.286 -15.601 -15.839 -16.093 -16.351 -16.605 -16.867 -17.062 -17.281 -17.613 -17.841 -18.079 -18.201 -18.448 -18.698 -18.968 -19.103 -19.365 -19.544 -19.714 -19.898 -20.302 -20.526 -20.76 -21.002 -21.258 -21.552 -21.931 -23.309 -5 ,26462 ,KEBNE ,16708554,Fri Nov 26 18:03:32 CET,Fri Nov 26 19:36:54 CET,0.0 0.902 1.199 1.397 1.558 1.717 1.865 1.995 2.233 2.336 2.437 2.518 2.706 2.786 2.937 3.081 3.207 3.266 3.365 3.446 3.558 3.638 3.726 3.85 3.947 4.019 4.084 4.145 4.22 4.282 4.342 4.42 4.487 4.538 4.586 4.641 4.727 4.839 4.926 4.987 5.031 5.051 5.052 5.025 4.968 4.853 4.614 4.241 3.631 2.568 0.77 -1.33 -3.053 -4.488 -5.683 -6.73 -7.65 -8.484 -9.189 -9.882 -10.467 -10.988 -11.496 -11.998 -12.453 -12.86 -13.295 -13.683 -14.022 -14.373 -14.753 -15.065 -15.357 -15.662 -15.903 -16.148 -16.414 -16.685 -16.976 -17.174 -17.368 -17.669 -17.875 -18.104 -18.223 -18.465 -18.724 -19.009 -19.153 -19.415 -19.582 -19.74 -19.918 -20.32 -20.533 -20.766 -21.029 -21.31 -21.634 -22.044 -23.384 -6 ,14128 ,KEBNE ,16708555,Fri Nov 26 18:03:32 CET,Fri Nov 26 19:37:02 CET,0.0 0.921 1.192 1.376 1.524 1.658 1.772 1.869 2.055 2.152 2.248 2.305 2.491 2.574 2.719 2.841 2.957 3.016 3.122 3.208 3.333 3.416 3.497 3.619 3.718 3.798 3.87 3.935 4.03 4.112 4.188 4.284 4.361 4.426 4.496 4.563 4.629 4.704 4.763 4.803 4.848 4.885 4.881 4.853 4.767 4.603 4.391 4.045 3.421 2.408 0.614 -1.536 -3.244 -4.664 -5.893 -7.001 -7.979 -8.838 -9.563 -10.289 -10.88 -11.395 -11.893 -12.373 -12.828 -13.242 -13.686 -14.069 -14.373 -14.682 -15.041 -15.356 -15.649 -15.956 -16.189 -16.421 -16.685 -16.95 -17.199 -17.368 -17.561 -17.883 -18.101 -18.32 -18.437 -18.683 -18.936 -19.207 -19.351 -19.626 -19.804 -19.956 -20.119 -20.491 -20.712 -20.943 -21.162 -21.416 -21.773 -22.212 -23.295 -7 ,21666 ,KEBNE ,16708556,Fri Nov 26 18:03:32 CET,Fri Nov 26 19:35:49 CET,0.0 0.777 1.058 1.281 1.451 1.602 1.744 1.869 2.099 2.197 2.279 2.321 2.491 2.555 2.667 2.766 2.857 2.898 2.978 3.059 3.169 3.237 3.306 3.419 3.527 3.622 3.724 3.818 3.939 4.056 4.152 4.24 4.309 4.393 4.493 4.572 4.673 4.79 4.876 4.938 4.961 4.969 4.947 4.884 4.783 4.627 4.347 3.924 3.288 2.266 0.501 -1.615 -3.336 -4.795 -6.026 -7.091 -7.985 -8.789 -9.488 -10.18 -10.771 -11.29 -11.786 -12.295 -12.8 -13.258 -13.7 -14.067 -14.373 -14.704 -15.062 -15.337 -15.612 -15.908 -16.14 -16.385 -16.656 -16.943 -17.232 -17.436 -17.656 -17.992 -18.219 -18.449 -18.567 -18.817 -19.096 -19.394 -19.546 -19.826 -20.013 -20.178 -20.357 -20.767 -20.997 -21.229 -21.456 -21.731 -22.137 -22.66 -24.117 -8 ,27137 ,KEBNE ,16708557,Fri Nov 26 18:04:33 CET,Fri Nov 26 19:37:49 CET,0.0 0.637 0.869 1.07 1.241 1.387 1.508 1.623 1.812 1.893 1.967 2.011 2.189 2.253 2.378 2.491 2.601 2.647 2.728 2.81 2.924 2.996 3.061 3.153 3.237 3.3 3.361 3.424 3.504 3.576 3.653 3.767 3.854 3.901 3.962 4.03 4.074 4.112 4.151 4.185 4.215 4.246 4.256 4.226 4.142 3.985 3.739 3.348 2.726 1.705 -0.109 -2.319 -4.121 -5.565 -6.766 -7.835 -8.756 -9.553 -10.263 -10.99 -11.603 -12.142 -12.624 -13.069 -13.479 -13.862 -14.272 -14.653 -14.973 -15.308 -15.673 -15.967 -16.276 -16.6 -16.844 -17.105 -17.373 -17.652 -17.957 -18.16 -18.36 -18.67 -18.893 -19.135 -19.266 -19.521 -19.771 -20.048 -20.196 -20.47 -20.657 -20.826 -21.004 -21.382 -21.597 -21.846 -22.101 -22.381 -22.709 -23.108 -24.53 -9 ,2716 ,KEBNE ,16708558,Fri Nov 26 18:04:33 CET,Fri Nov 26 19:36:39 CET,0.0 0.719 0.975 1.171 1.34 1.509 1.65 1.773 2.012 2.124 2.238 2.344 2.534 2.614 2.77 2.909 3.037 3.097 3.206 3.31 3.465 3.569 3.669 3.805 3.907 3.982 4.05 4.113 4.195 4.271 4.347 4.43 4.505 4.566 4.62 4.702 4.77 4.813 4.861 4.92 4.96 4.961 4.938 4.89 4.799 4.639 4.369 3.973 3.361 2.376 0.675 -1.393 -3.109 -4.579 -5.812 -6.878 -7.818 -8.68 -9.404 -10.185 -10.886 -11.458 -11.956 -12.424 -12.855 -13.252 -13.688 -14.092 -14.429 -14.76 -15.108 -15.414 -15.715 -16.001 -16.248 -16.51 -16.762 -17.027 -17.319 -17.525 -17.735 -18.063 -18.298 -18.54 -18.665 -18.916 -19.168 -19.425 -19.57 -19.853 -20.092 -20.274 -20.445 -20.797 -21.003 -21.241 -21.515 -21.829 -22.177 -22.642 -23.741 -10 ,19091 ,KEBNE ,16708559,Fri Nov 26 18:05:34 CET,Fri Nov 26 19:38:55 CET,0.0 0.684 0.94 1.123 1.264 1.4 1.537 1.669 1.913 2.008 2.097 2.163 2.338 2.397 2.513 2.621 2.724 2.771 2.845 2.911 3.017 3.079 3.148 3.28 3.4 3.489 3.564 3.648 3.745 3.825 3.901 3.975 4.049 4.117 4.183 4.269 4.367 4.455 4.518 4.589 4.626 4.632 4.626 4.585 4.494 4.343 4.085 3.689 3.035 2.02 0.304 -1.813 -3.537 -4.952 -6.176 -7.286 -8.237 -9.087 -9.82 -10.538 -11.142 -11.671 -12.181 -12.647 -13.075 -13.472 -13.888 -14.263 -14.589 -14.951 -15.297 -15.577 -15.9 -16.22 -16.454 -16.683 -16.939 -17.222 -17.5 -17.704 -17.906 -18.225 -18.447 -18.672 -18.79 -19.036 -19.3 -19.579 -19.727 -19.999 -20.175 -20.334 -20.514 -20.896 -21.1 -21.345 -21.594 -21.845 -22.171 -22.634 -24.112 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_206_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_206_252.txt deleted file mode 100644 index 579ec8cc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_206_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18846 ,KEBNE ,17126023,Thu Dec 30 17:34:24 CET,Thu Dec 30 19:11:52 CET,0.0 1.28 1.568 1.736 1.843 1.921 1.975 2.022 2.1 2.134 2.154 2.061 2.164 2.165 2.154 2.13 2.094 2.072 2.013 1.953 1.872 1.813 1.731 1.592 1.472 1.345 1.182 1.005 0.784 0.568 0.354 0.056 -0.292 -0.639 -1.066 -1.604 -2.157 -2.788 -3.515 -4.349 -5.279 -6.424 -7.872 -9.432 -11.376 -13.724 -16.789 -20.684 -25.808 -32.817 -43.099 -53.797 -61.656 -67.782 -72.676 -76.795 -80.197 -83.145 -85.622 -88.019 -89.953 -91.562 -93.102 -94.568 -95.872 -97.006 -98.16 -99.172 -100.019 -100.902 -101.848 -102.615 -103.376 -104.149 -104.732 -105.331 -105.968 -106.609 -107.23 -107.667 -108.117 -108.794 -109.26 -109.741 -109.995 -110.509 -111.036 -111.6 -111.892 -112.407 -112.757 -113.074 -113.413 -114.142 -114.532 -114.933 -115.358 -115.839 -116.388 -117.107 -118.967 -2 ,13993 ,KEBNE ,17126024,Thu Dec 30 17:43:34 CET,Thu Dec 30 19:21:00 CET,0.0 1.081 1.364 1.545 1.677 1.78 1.873 1.949 2.055 2.097 2.113 2.029 2.136 2.142 2.138 2.1 2.033 2.003 1.959 1.917 1.817 1.729 1.642 1.51 1.364 1.206 1.041 0.864 0.623 0.414 0.188 -0.156 -0.528 -0.901 -1.322 -1.836 -2.385 -3.022 -3.764 -4.601 -5.526 -6.64 -8.075 -9.642 -11.63 -14.083 -17.162 -21.024 -26.173 -33.214 -43.491 -54.242 -62.213 -68.472 -73.461 -77.604 -81.036 -83.958 -86.375 -88.73 -90.651 -92.314 -93.878 -95.316 -96.637 -97.829 -99.061 -100.132 -101.012 -101.919 -102.86 -103.61 -104.386 -105.198 -105.812 -106.423 -107.048 -107.691 -108.349 -108.806 -109.283 -110.007 -110.475 -110.955 -111.204 -111.712 -112.248 -112.778 -113.046 -113.561 -113.954 -114.278 -114.609 -115.366 -115.766 -116.174 -116.62 -117.121 -117.726 -118.504 -120.981 -3 ,11876 ,KEBNE ,17126025,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:49:57 CET,0.0 0.901 1.143 1.295 1.406 1.495 1.567 1.624 1.714 1.758 1.79 1.713 1.823 1.832 1.834 1.817 1.777 1.75 1.701 1.655 1.582 1.524 1.465 1.343 1.185 1.034 0.886 0.712 0.45 0.19 -0.073 -0.391 -0.704 -1.023 -1.432 -1.947 -2.467 -3.108 -3.858 -4.679 -5.608 -6.745 -8.131 -9.657 -11.636 -14.042 -17.105 -20.943 -26.046 -33.087 -43.404 -54.229 -62.291 -68.519 -73.443 -77.577 -80.967 -83.84 -86.268 -88.592 -90.493 -92.223 -93.868 -95.324 -96.612 -97.753 -98.973 -100.04 -100.91 -101.808 -102.733 -103.497 -104.268 -105.03 -105.622 -106.231 -106.868 -107.526 -108.197 -108.664 -109.138 -109.835 -110.303 -110.802 -111.051 -111.543 -112.054 -112.603 -112.884 -113.404 -113.81 -114.128 -114.457 -115.194 -115.587 -116.0 -116.471 -117.016 -117.635 -118.372 -120.729 -4 ,13666 ,KEBNE ,17126026,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:48:33 CET,0.0 1.396 1.68 1.895 2.035 2.125 2.204 2.268 2.334 2.366 2.406 2.368 2.486 2.49 2.489 2.498 2.502 2.48 2.398 2.333 2.257 2.192 2.121 2.005 1.869 1.716 1.543 1.383 1.196 0.981 0.738 0.441 0.135 -0.209 -0.652 -1.151 -1.672 -2.32 -3.078 -3.961 -4.952 -6.126 -7.573 -9.131 -11.112 -13.535 -16.626 -20.476 -25.554 -32.497 -42.717 -53.423 -61.298 -67.473 -72.445 -76.588 -79.993 -82.971 -85.475 -87.866 -89.805 -91.501 -93.103 -94.555 -95.849 -97.033 -98.246 -99.262 -100.128 -101.018 -101.921 -102.662 -103.416 -104.171 -104.728 -105.31 -105.933 -106.578 -107.233 -107.691 -108.168 -108.858 -109.318 -109.789 -110.03 -110.512 -111.027 -111.594 -111.891 -112.423 -112.798 -113.111 -113.432 -114.106 -114.474 -114.88 -115.315 -115.817 -116.448 -117.298 -119.885 -5 ,1874 ,KEBNE ,17126027,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:48:52 CET,0.0 0.847 1.131 1.299 1.401 1.486 1.561 1.618 1.702 1.736 1.761 1.699 1.817 1.822 1.841 1.825 1.784 1.758 1.698 1.644 1.528 1.444 1.363 1.229 1.073 0.905 0.76 0.626 0.414 0.173 -0.063 -0.384 -0.737 -1.072 -1.486 -2.007 -2.548 -3.202 -3.945 -4.788 -5.731 -6.881 -8.359 -9.929 -11.885 -14.254 -17.292 -21.109 -26.174 -33.179 -43.517 -54.373 -62.288 -68.468 -73.473 -77.638 -81.062 -84.002 -86.418 -88.766 -90.736 -92.452 -94.021 -95.463 -96.801 -97.999 -99.225 -100.288 -101.179 -102.103 -103.064 -103.815 -104.562 -105.335 -105.909 -106.5 -107.124 -107.765 -108.418 -108.862 -109.323 -110.043 -110.524 -111.012 -111.264 -111.775 -112.31 -112.874 -113.182 -113.726 -114.11 -114.421 -114.754 -115.493 -115.887 -116.31 -116.777 -117.292 -117.861 -118.605 -121.071 -6 ,25497 ,KEBNE ,17126028,Thu Dec 30 18:13:16 CET,Thu Dec 30 19:48:45 CET,0.0 0.659 0.848 0.979 1.089 1.167 1.225 1.287 1.377 1.409 1.423 1.328 1.443 1.454 1.453 1.434 1.403 1.394 1.377 1.343 1.232 1.151 1.075 0.966 0.836 0.681 0.534 0.375 0.159 -0.071 -0.333 -0.676 -1.026 -1.369 -1.78 -2.317 -2.86 -3.479 -4.226 -5.087 -6.042 -7.203 -8.644 -10.207 -12.216 -14.662 -17.747 -21.606 -26.737 -33.801 -44.224 -55.114 -63.049 -69.193 -74.155 -78.296 -81.718 -84.672 -87.141 -89.525 -91.472 -93.132 -94.67 -96.079 -97.372 -98.517 -99.643 -100.633 -101.489 -102.352 -103.228 -103.961 -104.718 -105.489 -106.082 -106.677 -107.269 -107.887 -108.531 -108.958 -109.4 -110.087 -110.555 -111.027 -111.272 -111.786 -112.314 -112.868 -113.155 -113.682 -114.083 -114.415 -114.758 -115.452 -115.838 -116.256 -116.698 -117.217 -117.8 -118.527 -120.708 -7 ,11993 ,KEBNE ,17126029,Thu Dec 30 18:13:16 CET,Thu Dec 30 19:48:37 CET,0.0 1.126 1.419 1.595 1.723 1.825 1.911 1.972 2.016 2.034 2.057 1.981 2.101 2.112 2.103 2.088 2.065 2.05 1.994 1.913 1.78 1.691 1.603 1.493 1.38 1.247 1.11 0.948 0.724 0.521 0.299 -0.008 -0.321 -0.657 -1.095 -1.626 -2.172 -2.82 -3.569 -4.43 -5.42 -6.613 -8.07 -9.637 -11.603 -14.018 -17.11 -20.973 -26.062 -33.063 -43.333 -54.031 -61.892 -68.009 -72.951 -77.117 -80.538 -83.477 -85.871 -88.156 -90.186 -92.01 -93.698 -95.199 -96.522 -97.735 -98.952 -99.982 -100.856 -101.796 -102.739 -103.479 -104.255 -105.066 -105.689 -106.291 -106.887 -107.506 -108.172 -108.637 -109.103 -109.834 -110.344 -110.84 -111.089 -111.613 -112.153 -112.702 -112.982 -113.503 -113.895 -114.211 -114.557 -115.255 -115.606 -116.015 -116.463 -116.986 -117.608 -118.368 -121.147 -8 ,25377 ,KEBNE ,17126030,Thu Dec 30 18:13:16 CET,Thu Dec 30 19:48:34 CET,0.0 1.472 1.747 1.906 2.023 2.129 2.214 2.294 2.384 2.413 2.445 2.364 2.466 2.462 2.472 2.479 2.448 2.427 2.382 2.346 2.269 2.207 2.152 2.023 1.868 1.74 1.621 1.491 1.316 1.121 0.885 0.55 0.216 -0.124 -0.556 -1.058 -1.586 -2.208 -2.921 -3.763 -4.709 -5.838 -7.26 -8.821 -10.797 -13.203 -16.293 -20.169 -25.236 -32.163 -42.4 -53.139 -61.076 -67.273 -72.211 -76.352 -79.797 -82.769 -85.203 -87.509 -89.425 -91.067 -92.627 -94.093 -95.431 -96.614 -97.779 -98.792 -99.654 -100.535 -101.452 -102.212 -102.966 -103.751 -104.359 -104.957 -105.559 -106.185 -106.823 -107.268 -107.729 -108.419 -108.907 -109.416 -109.676 -110.21 -110.772 -111.342 -111.64 -112.184 -112.546 -112.848 -113.171 -113.844 -114.222 -114.646 -115.114 -115.615 -116.189 -117.001 -119.498 -9 ,29691 ,KEBNE ,17126031,Thu Dec 30 18:13:17 CET,Thu Dec 30 19:48:37 CET,0.0 1.164 1.42 1.548 1.669 1.774 1.844 1.889 1.96 2.0 2.035 1.953 2.056 2.048 2.019 1.994 1.952 1.921 1.853 1.793 1.718 1.672 1.604 1.472 1.332 1.19 1.04 0.887 0.665 0.403 0.147 -0.176 -0.533 -0.882 -1.303 -1.825 -2.374 -3.015 -3.73 -4.557 -5.5 -6.646 -8.089 -9.63 -11.602 -14.005 -17.062 -20.923 -26.041 -33.086 -43.422 -54.19 -62.095 -68.297 -73.261 -77.39 -80.797 -83.719 -86.168 -88.556 -90.484 -92.146 -93.736 -95.172 -96.459 -97.587 -98.725 -99.733 -100.6 -101.474 -102.371 -103.114 -103.869 -104.654 -105.27 -105.882 -106.497 -107.114 -107.742 -108.19 -108.658 -109.374 -109.854 -110.34 -110.591 -111.109 -111.646 -112.182 -112.46 -112.98 -113.371 -113.686 -113.996 -114.671 -115.053 -115.487 -115.961 -116.419 -116.965 -117.768 -120.223 -10 ,29899 ,KEBNE ,17126032,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:48:30 CET,0.0 0.954 1.205 1.388 1.532 1.632 1.701 1.753 1.821 1.843 1.869 1.795 1.904 1.912 1.913 1.895 1.877 1.857 1.798 1.739 1.632 1.559 1.486 1.368 1.235 1.076 0.904 0.736 0.506 0.258 0.015 -0.312 -0.668 -1.025 -1.475 -2.028 -2.57 -3.187 -3.936 -4.799 -5.744 -6.862 -8.275 -9.82 -11.792 -14.212 -17.315 -21.194 -26.306 -33.305 -43.633 -54.449 -62.391 -68.554 -73.471 -77.625 -81.09 -84.056 -86.511 -88.837 -90.755 -92.443 -93.982 -95.4 -96.719 -97.885 -99.059 -100.099 -101.021 -101.97 -102.916 -103.667 -104.405 -105.174 -105.789 -106.411 -107.027 -107.662 -108.311 -108.746 -109.192 -109.894 -110.369 -110.838 -111.088 -111.622 -112.166 -112.727 -113.017 -113.546 -113.985 -114.32 -114.651 -115.377 -115.784 -116.218 -116.686 -117.19 -117.744 -118.49 -121.678 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_215_167.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_215_167.txt deleted file mode 100644 index 11009198..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_215_167.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,162 ,KEBNE ,16708560,Fri Nov 26 18:10:42 CET,Fri Nov 26 19:42:43 CET,0.0 1.555 1.974 2.316 2.6 2.853 3.084 3.288 3.673 3.856 4.027 4.229 4.471 4.606 4.847 5.099 5.355 5.473 5.711 5.944 6.281 6.502 6.717 7.046 7.343 7.609 7.856 8.09 8.42 8.769 9.116 9.544 9.936 10.301 10.737 11.246 11.711 12.22 12.786 13.363 13.972 14.675 15.531 16.396 17.418 18.599 19.942 21.496 23.433 25.799 28.816 31.526 33.198 34.304 35.035 35.566 35.943 36.246 36.471 36.613 36.706 36.762 36.791 36.802 36.789 36.754 36.692 36.637 36.577 36.513 36.453 36.373 36.253 36.12 36.031 35.931 35.814 35.691 35.565 35.475 35.371 35.198 35.07 34.943 34.883 34.748 34.601 34.441 34.361 34.199 34.031 33.927 33.823 33.578 33.441 33.294 33.121 32.916 32.651 32.248 30.708 -2 ,14919 ,KEBNE ,16708561,Fri Nov 26 18:10:42 CET,Fri Nov 26 19:43:47 CET,0.0 1.136 1.515 1.814 2.093 2.33 2.55 2.779 3.2 3.395 3.584 3.818 4.074 4.224 4.508 4.782 5.063 5.19 5.422 5.659 5.996 6.206 6.413 6.729 7.031 7.322 7.628 7.932 8.311 8.672 9.012 9.396 9.764 10.134 10.574 11.045 11.496 12.026 12.595 13.188 13.82 14.53 15.359 16.197 17.186 18.337 19.738 21.344 23.227 25.575 28.598 31.201 32.812 33.889 34.623 35.146 35.538 35.802 35.933 35.988 36.035 36.104 36.134 36.117 36.066 36.018 35.971 35.909 35.823 35.713 35.62 35.541 35.455 35.377 35.307 35.206 35.097 34.964 34.81 34.722 34.631 34.467 34.346 34.22 34.149 34.009 33.866 33.716 33.63 33.455 33.285 33.167 33.047 32.749 32.564 32.371 32.178 31.952 31.663 31.231 29.838 -3 ,11089 ,KEBNE ,16708562,Fri Nov 26 18:14:52 CET,Fri Nov 26 19:39:57 CET,0.0 1.74 2.189 2.516 2.783 3.021 3.252 3.462 3.855 4.041 4.216 4.443 4.693 4.837 5.113 5.378 5.618 5.734 5.977 6.226 6.609 6.842 7.054 7.35 7.621 7.875 8.138 8.42 8.79 9.127 9.438 9.808 10.152 10.488 10.881 11.327 11.785 12.301 12.855 13.457 14.113 14.918 15.862 16.745 17.773 18.923 20.241 21.817 23.785 26.168 29.169 31.772 33.378 34.484 35.255 35.795 36.186 36.497 36.698 36.809 36.856 36.897 36.878 36.795 36.711 36.655 36.626 36.595 36.547 36.48 36.38 36.277 36.172 36.085 36.017 35.941 35.849 35.716 35.56 35.461 35.359 35.184 35.071 34.952 34.89 34.76 34.619 34.465 34.38 34.215 34.087 33.991 33.873 33.593 33.447 33.28 33.082 32.872 32.593 32.212 31.056 -4 ,19110 ,KEBNE ,16708563,Fri Nov 26 18:16:51 CET,Fri Nov 26 19:48:34 CET,0.0 1.008 1.413 1.721 1.976 2.199 2.407 2.607 3.001 3.18 3.345 3.568 3.822 3.974 4.257 4.533 4.8 4.918 5.148 5.386 5.747 5.964 6.168 6.483 6.781 7.052 7.312 7.558 7.883 8.19 8.493 8.905 9.291 9.638 10.049 10.52 10.985 11.506 12.068 12.694 13.347 14.068 14.949 15.849 16.895 18.059 19.417 21.012 22.941 25.325 28.334 30.974 32.603 33.654 34.361 34.855 35.186 35.398 35.493 35.581 35.676 35.731 35.75 35.721 35.686 35.675 35.66 35.631 35.567 35.477 35.391 35.312 35.205 35.1 35.031 34.95 34.861 34.763 34.64 34.544 34.454 34.316 34.196 34.062 33.998 33.862 33.708 33.544 33.461 33.3 33.163 33.063 32.954 32.707 32.565 32.411 32.246 32.027 31.774 31.374 30.44 -5 ,3597 ,KEBNE ,16708564,Fri Nov 26 18:16:55 CET,Fri Nov 26 19:42:09 CET,0.0 0.985 1.381 1.705 1.983 2.236 2.465 2.679 3.057 3.237 3.392 3.577 3.823 3.965 4.235 4.506 4.777 4.901 5.142 5.385 5.743 5.955 6.152 6.46 6.765 7.073 7.37 7.647 7.979 8.286 8.607 9.003 9.386 9.782 10.247 10.774 11.293 11.851 12.421 13.006 13.653 14.392 15.231 16.084 17.091 18.237 19.599 21.173 23.091 25.425 28.37 30.989 32.649 33.748 34.498 35.025 35.392 35.692 35.909 36.078 36.171 36.186 36.185 36.208 36.23 36.21 36.158 36.085 36.02 35.962 35.884 35.804 35.715 35.606 35.509 35.418 35.334 35.222 35.053 34.933 34.818 34.641 34.513 34.386 34.32 34.189 34.064 33.903 33.808 33.647 33.521 33.402 33.277 33.004 32.848 32.674 32.453 32.174 31.843 31.428 29.89 -6 ,7780 ,KEBNE ,16708565,Fri Nov 26 18:21:00 CET,Fri Nov 26 19:46:00 CET,0.0 1.714 2.216 2.547 2.822 3.074 3.298 3.505 3.906 4.087 4.261 4.503 4.749 4.891 5.187 5.487 5.767 5.895 6.14 6.385 6.764 6.996 7.205 7.495 7.777 8.045 8.311 8.602 8.959 9.29 9.624 10.014 10.389 10.74 11.163 11.651 12.119 12.649 13.259 13.92 14.585 15.302 16.138 17.009 17.997 19.133 20.514 22.088 23.982 26.318 29.338 32.03 33.743 34.868 35.622 36.188 36.562 36.791 36.955 37.068 37.135 37.16 37.133 37.088 37.038 37.002 36.958 36.876 36.782 36.709 36.626 36.538 36.444 36.338 36.263 36.179 36.081 36.0 35.894 35.789 35.679 35.521 35.408 35.295 35.246 35.124 34.971 34.812 34.735 34.581 34.439 34.327 34.199 33.915 33.764 33.589 33.372 33.112 32.776 32.222 30.318 -7 ,20283 ,KEBNE ,16708566,Fri Nov 26 18:22:58 CET,Fri Nov 26 19:56:05 CET,0.0 1.552 2.002 2.351 2.64 2.888 3.121 3.345 3.766 3.951 4.115 4.326 4.576 4.727 5.026 5.325 5.612 5.75 5.994 6.211 6.52 6.735 6.954 7.255 7.549 7.839 8.124 8.41 8.758 9.08 9.385 9.744 10.111 10.463 10.863 11.324 11.773 12.281 12.865 13.514 14.167 14.902 15.78 16.657 17.674 18.821 20.2 21.805 23.72 26.066 29.064 31.708 33.363 34.459 35.193 35.731 36.121 36.403 36.608 36.793 36.885 36.908 36.932 36.958 36.947 36.916 36.874 36.81 36.741 36.682 36.608 36.533 36.464 36.383 36.303 36.199 36.068 35.935 35.788 35.68 35.591 35.444 35.325 35.201 35.139 35.008 34.853 34.679 34.6 34.45 34.306 34.2 34.091 33.842 33.691 33.519 33.321 33.075 32.779 32.385 30.811 -8 ,22909 ,KEBNE ,16708567,Fri Nov 26 18:22:01 CET,Fri Nov 26 19:50:13 CET,0.0 1.425 1.887 2.265 2.574 2.829 3.04 3.253 3.66 3.839 4.008 4.23 4.488 4.641 4.921 5.183 5.431 5.551 5.786 6.025 6.368 6.581 6.78 7.044 7.3 7.564 7.838 8.105 8.459 8.799 9.11 9.498 9.898 10.295 10.732 11.198 11.627 12.122 12.676 13.266 13.9 14.605 15.436 16.296 17.336 18.551 20.0 21.635 23.561 25.967 29.04 31.681 33.33 34.398 35.151 35.746 36.165 36.44 36.612 36.738 36.825 36.861 36.858 36.823 36.789 36.781 36.743 36.651 36.567 36.49 36.393 36.322 36.237 36.12 36.044 35.973 35.87 35.762 35.651 35.571 35.487 35.354 35.257 35.144 35.077 34.928 34.774 34.616 34.537 34.386 34.272 34.15 34.002 33.691 33.529 33.354 33.153 32.928 32.667 32.319 31.214 -9 ,8559 ,KEBNE ,16708568,Fri Nov 26 18:22:58 CET,Fri Nov 26 19:54:42 CET,0.0 1.523 2.021 2.368 2.649 2.897 3.142 3.363 3.763 3.941 4.099 4.3 4.548 4.686 4.953 5.211 5.441 5.555 5.785 6.013 6.338 6.547 6.758 7.068 7.379 7.674 7.948 8.227 8.585 8.91 9.24 9.642 10.039 10.424 10.845 11.32 11.786 12.298 12.864 13.471 14.101 14.897 15.845 16.719 17.722 18.848 20.205 21.8 23.738 26.12 29.133 31.725 33.355 34.447 35.196 35.742 36.128 36.397 36.586 36.73 36.796 36.844 36.889 36.916 36.904 36.854 36.803 36.77 36.714 36.652 36.606 36.545 36.444 36.313 36.22 36.112 35.99 35.86 35.722 35.622 35.517 35.386 35.288 35.173 35.12 34.996 34.841 34.683 34.602 34.448 34.318 34.208 34.102 33.852 33.709 33.56 33.363 33.124 32.856 32.511 31.489 -10 ,25730 ,KEBNE ,16708569,Fri Nov 26 18:23:02 CET,Fri Nov 26 19:50:24 CET,0.0 1.267 1.706 2.044 2.314 2.544 2.758 2.964 3.352 3.531 3.7 3.91 4.156 4.305 4.578 4.83 5.081 5.206 5.468 5.707 6.032 6.248 6.457 6.754 7.038 7.325 7.611 7.899 8.267 8.601 8.911 9.279 9.665 10.06 10.504 10.991 11.47 12.023 12.652 13.325 13.984 14.757 15.701 16.595 17.604 18.744 20.137 21.745 23.662 26.06 29.082 31.673 33.268 34.397 35.178 35.68 36.004 36.236 36.412 36.568 36.673 36.738 36.759 36.744 36.711 36.693 36.657 36.609 36.562 36.489 36.408 36.329 36.222 36.12 36.026 35.914 35.806 35.681 35.555 35.471 35.38 35.253 35.158 35.036 34.973 34.843 34.706 34.552 34.469 34.309 34.179 34.074 33.961 33.731 33.59 33.417 33.243 33.047 32.791 32.421 31.114 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_215_206.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_215_206.txt deleted file mode 100644 index 2b17cd03..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_215_206.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23574 ,KEBNE ,16708570,Fri Nov 26 18:23:02 CET,Fri Nov 26 19:54:21 CET,0.0 1.451 1.913 2.248 2.526 2.769 2.975 3.153 3.478 3.622 3.751 3.907 4.119 4.229 4.44 4.628 4.815 4.902 5.065 5.234 5.476 5.647 5.819 6.039 6.244 6.445 6.642 6.817 7.005 7.184 7.364 7.579 7.801 8.025 8.261 8.507 8.743 8.985 9.268 9.596 9.877 10.162 10.494 10.809 11.156 11.502 11.862 12.182 12.475 12.744 12.76 12.369 11.848 11.34 10.862 10.383 9.962 9.579 9.215 8.783 8.371 8.024 7.72 7.431 7.167 6.946 6.71 6.476 6.277 6.058 5.815 5.617 5.413 5.203 5.021 4.816 4.609 4.405 4.202 4.053 3.884 3.631 3.469 3.296 3.201 2.996 2.79 2.575 2.457 2.232 2.088 1.958 1.821 1.543 1.395 1.212 0.988 0.758 0.453 0.054 -0.997 -2 ,24887 ,KEBNE ,16708571,Fri Nov 26 18:23:59 CET,Fri Nov 26 19:56:17 CET,0.0 1.034 1.424 1.748 2.024 2.251 2.445 2.633 2.982 3.135 3.278 3.44 3.661 3.771 3.979 4.2 4.406 4.499 4.683 4.868 5.115 5.266 5.422 5.642 5.84 6.024 6.194 6.358 6.572 6.794 7.011 7.237 7.438 7.656 7.934 8.207 8.463 8.738 8.977 9.23 9.506 9.793 10.117 10.433 10.764 11.114 11.469 11.837 12.195 12.447 12.502 12.15 11.684 11.227 10.759 10.296 9.88 9.498 9.132 8.719 8.315 7.938 7.587 7.247 6.955 6.704 6.421 6.161 5.935 5.696 5.428 5.207 4.978 4.755 4.589 4.419 4.23 4.003 3.77 3.607 3.444 3.203 3.036 2.866 2.775 2.571 2.337 2.085 1.967 1.751 1.615 1.477 1.332 1.042 0.869 0.671 0.443 0.186 -0.141 -0.618 -2.016 -3 ,9050 ,KEBNE ,16708572,Fri Nov 26 18:26:03 CET,Fri Nov 26 19:54:12 CET,0.0 1.219 1.638 1.911 2.161 2.403 2.601 2.778 3.089 3.218 3.343 3.506 3.729 3.847 4.094 4.32 4.516 4.607 4.774 4.935 5.182 5.341 5.485 5.698 5.914 6.124 6.32 6.491 6.705 6.909 7.098 7.324 7.544 7.756 8.002 8.278 8.517 8.749 9.008 9.296 9.607 9.94 10.287 10.631 10.985 11.368 11.777 12.122 12.423 12.631 12.609 12.206 11.73 11.241 10.742 10.278 9.87 9.468 9.117 8.738 8.39 8.104 7.819 7.51 7.181 6.905 6.663 6.435 6.204 5.952 5.716 5.516 5.304 5.09 4.925 4.748 4.57 4.379 4.171 4.036 3.885 3.636 3.459 3.274 3.18 2.984 2.774 2.575 2.469 2.239 2.076 1.942 1.801 1.482 1.291 1.079 0.861 0.625 0.323 -0.078 -1.531 -4 ,16167 ,KEBNE ,16708573,Fri Nov 26 18:27:02 CET,Fri Nov 26 19:59:04 CET,0.0 1.257 1.717 2.03 2.27 2.477 2.659 2.829 3.148 3.3 3.438 3.594 3.816 3.938 4.151 4.318 4.49 4.586 4.766 4.934 5.178 5.329 5.472 5.688 5.905 6.103 6.284 6.443 6.634 6.849 7.087 7.35 7.586 7.802 8.014 8.275 8.573 8.878 9.144 9.387 9.648 9.946 10.34 10.72 11.067 11.433 11.814 12.218 12.611 12.872 12.946 12.655 12.196 11.726 11.276 10.798 10.311 9.855 9.437 8.992 8.631 8.341 8.076 7.806 7.55 7.287 7.017 6.794 6.572 6.344 6.108 5.89 5.661 5.431 5.242 5.039 4.833 4.61 4.372 4.21 4.043 3.791 3.624 3.459 3.369 3.182 2.979 2.749 2.631 2.407 2.247 2.105 1.967 1.647 1.468 1.282 1.074 0.843 0.561 0.185 -1.105 -5 ,17177 ,KEBNE ,16708574,Fri Nov 26 18:27:02 CET,Fri Nov 26 20:00:16 CET,0.0 1.252 1.631 1.933 2.193 2.396 2.572 2.742 3.061 3.206 3.341 3.522 3.746 3.855 4.076 4.301 4.512 4.605 4.783 4.944 5.169 5.327 5.473 5.673 5.882 6.072 6.22 6.386 6.646 6.869 7.05 7.269 7.475 7.683 7.937 8.196 8.417 8.697 9.021 9.344 9.651 9.947 10.275 10.576 10.921 11.291 11.674 12.025 12.34 12.604 12.625 12.223 11.672 11.141 10.675 10.221 9.789 9.391 9.037 8.652 8.333 8.043 7.712 7.358 7.016 6.734 6.474 6.239 6.023 5.801 5.57 5.379 5.184 4.972 4.806 4.635 4.461 4.268 4.07 3.937 3.78 3.541 3.372 3.173 3.068 2.873 2.679 2.455 2.329 2.091 1.92 1.777 1.629 1.327 1.153 0.951 0.715 0.442 0.113 -0.317 -1.926 -6 ,14587 ,KEBNE ,16708575,Fri Nov 26 18:27:06 CET,Fri Nov 26 19:56:25 CET,0.0 1.103 1.475 1.802 2.084 2.314 2.511 2.699 3.048 3.211 3.353 3.48 3.694 3.81 4.013 4.214 4.412 4.511 4.707 4.89 5.132 5.284 5.437 5.66 5.867 6.066 6.271 6.473 6.718 6.95 7.185 7.468 7.723 7.95 8.184 8.414 8.65 8.922 9.195 9.494 9.794 10.098 10.435 10.771 11.153 11.522 11.897 12.259 12.613 12.877 12.837 12.41 11.914 11.377 10.832 10.359 9.921 9.497 9.12 8.712 8.345 8.029 7.71 7.395 7.109 6.838 6.555 6.266 6.008 5.76 5.497 5.276 5.073 4.877 4.714 4.523 4.335 4.15 3.935 3.789 3.645 3.395 3.2 3.002 2.909 2.714 2.493 2.251 2.131 1.915 1.776 1.636 1.48 1.151 0.982 0.813 0.635 0.403 0.135 -0.215 -1.019 -7 ,496 ,KEBNE ,16708576,Fri Nov 26 18:27:06 CET,Fri Nov 26 19:56:36 CET,0.0 1.171 1.576 1.892 2.166 2.41 2.616 2.808 3.125 3.262 3.395 3.544 3.754 3.857 4.076 4.289 4.479 4.571 4.739 4.894 5.109 5.256 5.401 5.584 5.77 5.965 6.153 6.328 6.533 6.735 6.935 7.152 7.373 7.585 7.802 8.041 8.259 8.54 8.862 9.155 9.425 9.729 10.079 10.379 10.755 11.143 11.521 11.898 12.264 12.559 12.603 12.275 11.817 11.345 10.905 10.458 10.025 9.62 9.251 8.885 8.568 8.271 7.98 7.663 7.358 7.096 6.801 6.528 6.301 6.082 5.865 5.675 5.454 5.204 5.005 4.817 4.636 4.445 4.241 4.097 3.936 3.669 3.489 3.312 3.22 3.014 2.807 2.599 2.496 2.284 2.145 2.021 1.892 1.575 1.397 1.229 1.031 0.789 0.486 0.152 -0.91 -8 ,7101 ,KEBNE ,16708577,Fri Nov 26 18:28:03 CET,Fri Nov 26 20:01:58 CET,0.0 1.307 1.732 2.045 2.292 2.49 2.66 2.827 3.136 3.276 3.406 3.546 3.766 3.879 4.079 4.257 4.439 4.531 4.698 4.861 5.111 5.265 5.418 5.653 5.863 6.038 6.197 6.346 6.542 6.757 6.974 7.202 7.414 7.644 7.891 8.139 8.384 8.65 8.944 9.255 9.544 9.856 10.224 10.559 10.902 11.285 11.691 12.036 12.318 12.531 12.564 12.27 11.861 11.392 10.922 10.406 9.876 9.408 9.026 8.647 8.277 7.9 7.569 7.283 7.012 6.761 6.502 6.285 6.092 5.882 5.663 5.472 5.264 5.042 4.856 4.662 4.481 4.263 4.022 3.872 3.705 3.436 3.265 3.075 2.973 2.761 2.526 2.302 2.198 1.976 1.804 1.663 1.518 1.177 0.968 0.755 0.535 0.282 0.013 -0.35 -1.563 -9 ,11975 ,KEBNE ,16708578,Fri Nov 26 18:28:07 CET,Fri Nov 26 19:57:07 CET,0.0 1.712 2.072 2.352 2.618 2.84 3.04 3.219 3.52 3.674 3.833 4.025 4.241 4.341 4.53 4.716 4.912 5.007 5.2 5.382 5.62 5.77 5.919 6.141 6.354 6.568 6.767 6.925 7.139 7.344 7.539 7.797 8.05 8.296 8.568 8.88 9.149 9.378 9.613 9.856 10.112 10.406 10.783 11.162 11.521 11.878 12.25 12.593 12.912 13.213 13.276 12.898 12.378 11.83 11.316 10.853 10.459 10.058 9.677 9.265 8.901 8.582 8.278 7.98 7.687 7.432 7.174 6.912 6.661 6.416 6.17 5.95 5.722 5.49 5.315 5.143 4.946 4.736 4.523 4.386 4.243 3.985 3.796 3.603 3.508 3.329 3.137 2.916 2.785 2.551 2.376 2.233 2.088 1.768 1.587 1.395 1.197 0.949 0.657 0.249 -0.986 -10 ,19169 ,KEBNE ,16708579,Fri Nov 26 18:29:08 CET,Fri Nov 26 19:59:00 CET,0.0 1.113 1.492 1.77 2.014 2.232 2.43 2.618 2.967 3.124 3.266 3.442 3.659 3.77 3.978 4.176 4.366 4.455 4.614 4.762 5.007 5.184 5.345 5.556 5.735 5.9 6.056 6.208 6.402 6.582 6.76 6.975 7.183 7.389 7.63 7.922 8.216 8.505 8.774 9.04 9.343 9.692 10.025 10.315 10.655 11.014 11.353 11.666 11.972 12.172 12.129 11.744 11.265 10.773 10.307 9.82 9.379 8.98 8.613 8.207 7.843 7.556 7.273 6.985 6.731 6.497 6.205 5.941 5.714 5.47 5.226 5.034 4.843 4.618 4.449 4.288 4.115 3.935 3.726 3.576 3.426 3.183 2.993 2.794 2.7 2.514 2.32 2.099 1.982 1.76 1.59 1.455 1.32 1.021 0.852 0.659 0.437 0.159 -0.152 -0.529 -2.187 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_215_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_215_252.txt deleted file mode 100644 index a5e461f9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_215_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21681 ,KEBNE ,16708580,Fri Nov 26 18:29:08 CET,Fri Nov 26 19:57:43 CET,0.0 0.787 1.056 1.247 1.39 1.49 1.549 1.604 1.698 1.726 1.756 1.695 1.804 1.808 1.779 1.748 1.731 1.713 1.656 1.599 1.503 1.417 1.334 1.237 1.11 0.938 0.754 0.585 0.36 0.1 -0.17 -0.507 -0.839 -1.185 -1.648 -2.189 -2.734 -3.382 -4.145 -5.038 -6.011 -7.166 -8.665 -10.312 -12.378 -14.884 -18.061 -22.061 -27.3 -34.465 -45.098 -56.122 -64.18 -70.387 -75.334 -79.501 -82.938 -85.879 -88.3 -90.638 -92.565 -94.232 -95.801 -97.212 -98.485 -99.622 -100.784 -101.819 -102.689 -103.553 -104.418 -105.152 -105.913 -106.653 -107.224 -107.805 -108.406 -109.041 -109.686 -110.123 -110.589 -111.312 -111.805 -112.314 -112.573 -113.108 -113.652 -114.199 -114.472 -114.98 -115.325 -115.624 -115.947 -116.635 -117.001 -117.401 -117.848 -118.332 -118.914 -119.669 -121.655 -2 ,2794 ,KEBNE ,16708581,Fri Nov 26 18:30:06 CET,Fri Nov 26 20:01:45 CET,0.0 0.73 0.979 1.148 1.265 1.357 1.434 1.491 1.567 1.599 1.629 1.555 1.656 1.659 1.663 1.652 1.619 1.59 1.522 1.468 1.375 1.301 1.216 1.081 0.943 0.782 0.618 0.464 0.233 -0.02 -0.289 -0.631 -0.956 -1.293 -1.701 -2.201 -2.762 -3.409 -4.164 -5.006 -5.943 -7.119 -8.599 -10.238 -12.323 -14.858 -18.095 -22.15 -27.441 -34.613 -45.234 -56.292 -64.343 -70.634 -75.654 -79.864 -83.363 -86.344 -88.787 -91.117 -93.064 -94.76 -96.314 -97.751 -99.096 -100.301 -101.489 -102.517 -103.382 -104.249 -105.131 -105.84 -106.602 -107.412 -108.023 -108.639 -109.273 -109.928 -110.587 -111.033 -111.487 -112.181 -112.649 -113.123 -113.365 -113.861 -114.371 -114.89 -115.161 -115.671 -116.028 -116.331 -116.652 -117.345 -117.722 -118.123 -118.543 -119.015 -119.544 -120.221 -122.268 -3 ,575 ,KEBNE ,16708582,Fri Nov 26 18:30:06 CET,Fri Nov 26 20:01:59 CET,0.0 1.033 1.314 1.482 1.61 1.714 1.804 1.869 1.954 1.98 1.992 1.896 1.985 1.97 1.952 1.94 1.901 1.869 1.808 1.754 1.643 1.552 1.462 1.339 1.212 1.054 0.888 0.739 0.508 0.267 0.038 -0.289 -0.635 -0.979 -1.427 -1.981 -2.554 -3.24 -3.98 -4.797 -5.731 -6.883 -8.394 -10.028 -12.076 -14.598 -17.768 -21.728 -27.013 -34.189 -44.606 -55.547 -63.594 -69.811 -74.785 -79.014 -82.536 -85.524 -87.99 -90.379 -92.331 -93.997 -95.553 -96.976 -98.274 -99.432 -100.617 -101.654 -102.53 -103.4 -104.261 -104.99 -105.757 -106.519 -107.099 -107.697 -108.302 -108.891 -109.508 -109.962 -110.421 -111.119 -111.599 -112.09 -112.35 -112.871 -113.395 -113.953 -114.246 -114.768 -115.133 -115.454 -115.795 -116.475 -116.823 -117.201 -117.621 -118.109 -118.757 -119.544 -121.911 -4 ,16518 ,KEBNE ,16708583,Fri Nov 26 18:30:07 CET,Fri Nov 26 20:02:11 CET,0.0 1.091 1.359 1.55 1.67 1.76 1.823 1.867 1.934 1.967 1.996 1.933 2.039 2.048 2.053 2.034 2.011 2.002 1.959 1.881 1.747 1.653 1.559 1.405 1.229 1.052 0.874 0.686 0.429 0.173 -0.088 -0.425 -0.765 -1.127 -1.581 -2.123 -2.698 -3.37 -4.148 -5.02 -5.991 -7.199 -8.697 -10.306 -12.34 -14.808 -17.967 -21.967 -27.283 -34.535 -45.14 -56.217 -64.276 -70.523 -75.601 -79.833 -83.267 -86.24 -88.687 -91.023 -92.974 -94.639 -96.202 -97.652 -98.916 -100.03 -101.2 -102.264 -103.165 -104.077 -105.02 -105.772 -106.502 -107.249 -107.841 -108.446 -109.063 -109.699 -110.337 -110.762 -111.213 -111.921 -112.399 -112.886 -113.127 -113.627 -114.146 -114.672 -114.956 -115.469 -115.802 -116.102 -116.415 -117.092 -117.464 -117.866 -118.298 -118.793 -119.365 -120.121 -122.008 -5 ,16504 ,KEBNE ,16708584,Fri Nov 26 18:30:06 CET,Fri Nov 26 20:02:06 CET,0.0 1.09 1.408 1.595 1.728 1.84 1.928 1.979 2.03 2.047 2.073 2.012 2.115 2.122 2.137 2.129 2.101 2.083 2.037 1.986 1.907 1.85 1.794 1.692 1.575 1.435 1.279 1.123 0.902 0.668 0.405 0.047 -0.317 -0.678 -1.111 -1.651 -2.21 -2.864 -3.633 -4.515 -5.527 -6.706 -8.155 -9.733 -11.725 -14.162 -17.293 -21.277 -26.503 -33.646 -44.2 -55.23 -63.3 -69.552 -74.51 -78.673 -82.12 -85.092 -87.55 -89.882 -91.826 -93.545 -95.154 -96.6 -97.891 -99.05 -100.232 -101.25 -102.112 -103.005 -103.921 -104.663 -105.418 -106.195 -106.809 -107.426 -108.041 -108.686 -109.352 -109.805 -110.26 -110.94 -111.408 -111.881 -112.11 -112.592 -113.129 -113.702 -113.994 -114.505 -114.887 -115.217 -115.552 -116.253 -116.628 -117.003 -117.415 -117.888 -118.459 -119.188 -121.277 -6 ,5882 ,KEBNE ,16708585,Fri Nov 26 18:30:05 CET,Fri Nov 26 20:01:42 CET,0.0 0.874 1.118 1.264 1.387 1.48 1.552 1.608 1.68 1.705 1.729 1.66 1.751 1.74 1.71 1.675 1.646 1.627 1.569 1.521 1.472 1.423 1.338 1.187 1.033 0.866 0.703 0.535 0.312 0.06 -0.222 -0.556 -0.894 -1.266 -1.746 -2.321 -2.897 -3.578 -4.36 -5.237 -6.211 -7.401 -8.93 -10.551 -12.578 -15.078 -18.26 -22.281 -27.566 -34.786 -45.481 -56.551 -64.586 -70.891 -75.947 -80.161 -83.619 -86.587 -89.052 -91.41 -93.325 -94.983 -96.543 -97.99 -99.311 -100.455 -101.584 -102.584 -103.456 -104.363 -105.304 -106.062 -106.817 -107.577 -108.163 -108.781 -109.428 -110.075 -110.707 -111.14 -111.608 -112.328 -112.809 -113.309 -113.56 -114.078 -114.636 -115.177 -115.442 -115.938 -116.257 -116.555 -116.88 -117.576 -117.932 -118.306 -118.733 -119.245 -119.843 -120.558 -122.572 -7 ,5384 ,KEBNE ,16708586,Fri Nov 26 18:31:07 CET,Fri Nov 26 20:02:39 CET,0.0 0.626 0.839 1.004 1.104 1.184 1.246 1.276 1.318 1.342 1.366 1.3 1.41 1.409 1.384 1.355 1.309 1.275 1.211 1.165 1.076 0.997 0.913 0.787 0.66 0.523 0.373 0.206 -0.034 -0.274 -0.507 -0.807 -1.138 -1.483 -1.91 -2.435 -2.98 -3.638 -4.407 -5.283 -6.246 -7.389 -8.86 -10.456 -12.492 -15.02 -18.21 -22.19 -27.465 -34.693 -45.257 -56.225 -64.268 -70.543 -75.553 -79.776 -83.243 -86.171 -88.589 -90.925 -92.864 -94.618 -96.288 -97.747 -99.056 -100.235 -101.409 -102.422 -103.292 -104.218 -105.189 -105.963 -106.725 -107.475 -108.028 -108.581 -109.18 -109.823 -110.464 -110.898 -111.345 -112.031 -112.479 -112.943 -113.189 -113.692 -114.219 -114.759 -115.037 -115.551 -115.926 -116.231 -116.548 -117.195 -117.55 -117.946 -118.39 -118.906 -119.462 -120.151 -122.047 -8 ,6914 ,KEBNE ,16708587,Fri Nov 26 18:32:08 CET,Fri Nov 26 20:03:53 CET,0.0 0.742 0.97 1.142 1.266 1.375 1.463 1.503 1.553 1.577 1.599 1.528 1.631 1.625 1.617 1.604 1.574 1.554 1.49 1.411 1.278 1.197 1.128 0.995 0.842 0.7 0.569 0.427 0.195 -0.074 -0.37 -0.709 -1.023 -1.36 -1.805 -2.325 -2.859 -3.54 -4.309 -5.154 -6.112 -7.281 -8.77 -10.379 -12.377 -14.794 -17.917 -21.944 -27.302 -34.57 -45.209 -56.174 -64.203 -70.471 -75.445 -79.597 -83.014 -85.96 -88.382 -90.763 -92.771 -94.469 -96.013 -97.409 -98.679 -99.826 -101.025 -102.101 -103.023 -103.947 -104.853 -105.598 -106.373 -107.146 -107.728 -108.32 -108.945 -109.577 -110.204 -110.646 -111.08 -111.723 -112.197 -112.713 -112.973 -113.49 -114.018 -114.544 -114.819 -115.333 -115.696 -116.017 -116.346 -117.014 -117.369 -117.767 -118.219 -118.696 -119.234 -119.95 -122.435 -9 ,12814 ,KEBNE ,16708588,Fri Nov 26 18:32:08 CET,Fri Nov 26 20:03:58 CET,0.0 0.787 0.981 1.092 1.192 1.271 1.331 1.375 1.463 1.484 1.49 1.408 1.518 1.533 1.546 1.54 1.527 1.51 1.43 1.338 1.235 1.168 1.102 0.987 0.846 0.697 0.534 0.354 0.092 -0.18 -0.424 -0.745 -1.128 -1.519 -1.994 -2.566 -3.142 -3.805 -4.544 -5.392 -6.377 -7.553 -9.01 -10.593 -12.581 -15.003 -18.174 -22.193 -27.491 -34.72 -45.276 -56.292 -64.38 -70.674 -75.669 -79.803 -83.208 -86.174 -88.62 -90.961 -92.997 -94.766 -96.38 -97.889 -99.202 -100.327 -101.511 -102.578 -103.483 -104.387 -105.293 -106.023 -106.798 -107.604 -108.193 -108.809 -109.462 -110.116 -110.778 -111.21 -111.659 -112.368 -112.837 -113.313 -113.555 -114.042 -114.532 -115.043 -115.318 -115.836 -116.208 -116.514 -116.822 -117.476 -117.838 -118.221 -118.636 -119.079 -119.613 -120.322 -122.116 -10 ,3670 ,KEBNE ,16708589,Fri Nov 26 18:32:08 CET,Fri Nov 26 20:04:53 CET,0.0 0.777 0.98 1.089 1.183 1.278 1.353 1.399 1.447 1.464 1.491 1.424 1.521 1.529 1.532 1.487 1.436 1.418 1.382 1.323 1.172 1.083 1.01 0.877 0.728 0.574 0.404 0.211 -0.034 -0.284 -0.552 -0.904 -1.275 -1.665 -2.122 -2.655 -3.202 -3.838 -4.606 -5.466 -6.417 -7.563 -9.02 -10.654 -12.735 -15.251 -18.424 -22.416 -27.718 -34.923 -45.409 -56.385 -64.474 -70.76 -75.779 -79.936 -83.389 -86.387 -88.882 -91.254 -93.167 -94.803 -96.328 -97.74 -99.015 -100.147 -101.329 -102.362 -103.222 -104.12 -105.025 -105.757 -106.506 -107.26 -107.831 -108.411 -109.027 -109.653 -110.294 -110.749 -111.203 -111.889 -112.36 -112.82 -113.055 -113.537 -114.043 -114.581 -114.854 -115.352 -115.708 -116.025 -116.344 -117.004 -117.364 -117.76 -118.182 -118.658 -119.255 -119.995 -122.202 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_227_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_227_231.txt deleted file mode 100644 index 5c5db4e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_227_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13273 ,KEBNE ,16708590,Fri Nov 26 18:32:08 CET,Fri Nov 26 20:04:49 CET,0.0 0.672 0.825 0.939 0.992 1.012 1.033 1.041 1.01 0.982 0.944 0.872 0.806 0.75 0.634 0.516 0.39 0.318 0.157 -0.016 -0.295 -0.464 -0.615 -0.875 -1.176 -1.491 -1.794 -2.098 -2.527 -2.958 -3.391 -3.946 -4.509 -5.081 -5.779 -6.601 -7.428 -8.387 -9.471 -10.692 -12.05 -13.665 -15.711 -17.934 -20.711 -24.054 -28.254 -33.452 -40.24 -49.453 -62.882 -76.725 -86.804 -94.576 -100.691 -105.77 -109.937 -113.506 -116.443 -119.202 -121.455 -123.435 -125.268 -126.906 -128.401 -129.752 -131.092 -132.241 -133.214 -134.2 -135.21 -136.051 -136.884 -137.687 -138.308 -138.951 -139.598 -140.257 -140.934 -141.386 -141.858 -142.592 -143.07 -143.546 -143.794 -144.286 -144.787 -145.334 -145.617 -146.03 -146.478 -146.782 -147.092 -147.756 -148.108 -148.46 -148.829 -149.261 -149.747 -150.388 -151.919 -2 ,2069 ,KEBNE ,16708591,Fri Nov 26 18:32:08 CET,Fri Nov 26 20:04:05 CET,0.0 0.621 0.754 0.833 0.877 0.884 0.878 0.871 0.817 0.781 0.746 0.679 0.623 0.574 0.453 0.33 0.209 0.141 -0.019 -0.2 -0.454 -0.613 -0.782 -1.059 -1.337 -1.627 -1.938 -2.251 -2.672 -3.1 -3.538 -4.099 -4.662 -5.22 -5.894 -6.698 -7.52 -8.47 -9.51 -10.673 -11.997 -13.597 -15.623 -17.799 -20.499 -23.756 -27.93 -33.143 -39.939 -49.135 -62.485 -76.25 -86.258 -93.993 -100.111 -105.168 -109.313 -112.855 -115.752 -118.523 -120.796 -122.751 -124.584 -126.236 -127.704 -129.008 -130.335 -131.5 -132.481 -133.459 -134.434 -135.245 -136.098 -136.949 -137.58 -138.22 -138.875 -139.528 -140.208 -140.679 -141.148 -141.854 -142.34 -142.841 -143.09 -143.592 -144.1 -144.625 -144.9 -145.321 -145.778 -146.082 -146.383 -147.026 -147.368 -147.715 -148.093 -148.501 -148.957 -149.511 -150.976 -3 ,21477 ,KEBNE ,16708592,Fri Nov 26 18:32:08 CET,Fri Nov 26 20:05:01 CET,0.0 0.612 0.797 0.902 0.948 0.964 0.956 0.935 0.874 0.841 0.805 0.718 0.639 0.58 0.455 0.304 0.147 0.069 -0.092 -0.26 -0.523 -0.701 -0.882 -1.177 -1.487 -1.795 -2.108 -2.426 -2.855 -3.287 -3.714 -4.262 -4.827 -5.396 -6.083 -6.892 -7.717 -8.681 -9.755 -10.958 -12.316 -13.91 -15.907 -18.077 -20.774 -24.055 -28.221 -33.405 -40.233 -49.513 -62.987 -76.796 -86.768 -94.462 -100.574 -105.692 -109.889 -113.459 -116.419 -119.226 -121.512 -123.472 -125.285 -126.977 -128.507 -129.826 -131.132 -132.265 -133.232 -134.206 -135.195 -136.019 -136.844 -137.66 -138.272 -138.904 -139.556 -140.209 -140.894 -141.364 -141.836 -142.56 -143.045 -143.542 -143.795 -144.305 -144.824 -145.347 -145.621 -146.043 -146.477 -146.775 -147.083 -147.703 -148.029 -148.387 -148.807 -149.253 -149.698 -150.243 -151.509 -4 ,31838 ,KEBNE ,16708593,Fri Nov 26 18:32:08 CET,Fri Nov 26 20:03:57 CET,0.0 0.791 0.939 1.013 1.049 1.076 1.095 1.106 1.08 1.053 1.025 0.962 0.894 0.838 0.737 0.628 0.498 0.43 0.287 0.132 -0.114 -0.291 -0.479 -0.752 -1.011 -1.264 -1.551 -1.862 -2.283 -2.722 -3.172 -3.729 -4.285 -4.854 -5.546 -6.351 -7.163 -8.087 -9.143 -10.346 -11.707 -13.355 -15.407 -17.623 -20.363 -23.636 -27.798 -33.015 -39.808 -49.02 -62.48 -76.332 -86.404 -94.187 -100.329 -105.399 -109.518 -113.051 -115.96 -118.722 -121.022 -122.986 -124.801 -126.482 -127.979 -129.282 -130.596 -131.75 -132.739 -133.727 -134.7 -135.49 -136.299 -137.133 -137.768 -138.396 -139.039 -139.705 -140.395 -140.856 -141.31 -142.019 -142.508 -143.002 -143.253 -143.759 -144.288 -144.832 -145.104 -145.516 -145.97 -146.279 -146.585 -147.241 -147.603 -147.979 -148.38 -148.808 -149.281 -149.912 -151.322 -5 ,5667 ,KEBNE ,16708594,Fri Nov 26 18:32:08 CET,Fri Nov 26 20:05:00 CET,0.0 0.567 0.703 0.772 0.809 0.831 0.829 0.811 0.742 0.701 0.649 0.53 0.451 0.387 0.262 0.135 0.001 -0.07 -0.228 -0.391 -0.656 -0.836 -1.012 -1.265 -1.505 -1.763 -2.053 -2.368 -2.801 -3.237 -3.671 -4.225 -4.792 -5.365 -6.073 -6.904 -7.731 -8.683 -9.759 -10.957 -12.283 -13.875 -15.846 -17.991 -20.712 -23.99 -28.136 -33.315 -40.101 -49.287 -62.654 -76.496 -86.553 -94.307 -100.443 -105.524 -109.693 -113.258 -116.167 -118.948 -121.236 -123.191 -124.978 -126.578 -128.032 -129.341 -130.683 -131.86 -132.86 -133.861 -134.877 -135.697 -136.531 -137.382 -138.019 -138.674 -139.345 -140.006 -140.682 -141.145 -141.611 -142.329 -142.811 -143.299 -143.539 -144.03 -144.552 -145.085 -145.365 -145.777 -146.215 -146.518 -146.82 -147.442 -147.785 -148.15 -148.531 -148.952 -149.416 -149.993 -151.332 -6 ,29641 ,KEBNE ,16708595,Fri Nov 26 18:32:08 CET,Fri Nov 26 20:03:55 CET,0.0 0.64 0.771 0.854 0.903 0.921 0.922 0.92 0.863 0.826 0.787 0.708 0.651 0.605 0.497 0.372 0.238 0.171 0.014 -0.165 -0.442 -0.626 -0.812 -1.1 -1.389 -1.675 -1.966 -2.261 -2.666 -3.094 -3.532 -4.089 -4.627 -5.13 -5.774 -6.587 -7.418 -8.381 -9.474 -10.694 -12.049 -13.666 -15.687 -17.858 -20.51 -23.743 -27.886 -33.011 -39.767 -49.005 -62.43 -76.292 -86.363 -94.125 -100.279 -105.38 -109.541 -113.105 -116.024 -118.781 -121.043 -123.027 -124.858 -126.514 -128.008 -129.335 -130.679 -131.842 -132.844 -133.843 -134.856 -135.695 -136.534 -137.359 -137.992 -138.658 -139.316 -139.958 -140.629 -141.09 -141.55 -142.265 -142.75 -143.231 -143.474 -143.971 -144.487 -145.027 -145.303 -145.712 -146.139 -146.426 -146.722 -147.365 -147.703 -148.053 -148.421 -148.829 -149.301 -149.828 -151.012 -7 ,9494 ,KEBNE ,16708596,Fri Nov 26 18:32:08 CET,Fri Nov 26 20:05:03 CET,0.0 0.603 0.721 0.811 0.884 0.921 0.939 0.926 0.844 0.8 0.75 0.648 0.574 0.511 0.392 0.256 0.096 0.015 -0.141 -0.306 -0.569 -0.744 -0.925 -1.207 -1.494 -1.791 -2.103 -2.418 -2.834 -3.266 -3.703 -4.255 -4.828 -5.397 -6.081 -6.888 -7.704 -8.656 -9.735 -10.963 -12.329 -13.931 -15.936 -18.111 -20.837 -24.161 -28.312 -33.453 -40.233 -49.453 -62.9 -76.797 -86.861 -94.615 -100.746 -105.854 -110.062 -113.621 -116.524 -119.3 -121.58 -123.528 -125.325 -126.957 -128.45 -129.768 -131.07 -132.207 -133.183 -134.173 -135.163 -135.977 -136.81 -137.657 -138.295 -138.93 -139.587 -140.261 -140.952 -141.417 -141.878 -142.579 -143.064 -143.557 -143.807 -144.313 -144.837 -145.388 -145.669 -146.087 -146.523 -146.814 -147.12 -147.808 -148.185 -148.568 -148.986 -149.428 -149.874 -150.427 -151.736 -8 ,26906 ,KEBNE ,16708597,Fri Nov 26 18:32:08 CET,Fri Nov 26 20:04:07 CET,0.0 0.7 0.808 0.874 0.921 0.95 0.959 0.951 0.912 0.881 0.841 0.764 0.695 0.631 0.518 0.407 0.278 0.21 0.063 -0.083 -0.305 -0.468 -0.65 -0.942 -1.231 -1.522 -1.798 -2.066 -2.466 -2.899 -3.344 -3.899 -4.46 -5.031 -5.712 -6.512 -7.337 -8.308 -9.405 -10.625 -11.993 -13.627 -15.647 -17.827 -20.58 -23.906 -28.073 -33.241 -40.043 -49.263 -62.671 -76.478 -86.507 -94.251 -100.363 -105.424 -109.592 -113.157 -116.067 -118.824 -121.118 -123.095 -124.918 -126.588 -128.099 -129.431 -130.777 -131.96 -132.946 -133.926 -134.911 -135.714 -136.531 -137.357 -138.001 -138.665 -139.323 -139.996 -140.673 -141.118 -141.569 -142.269 -142.76 -143.266 -143.523 -144.025 -144.532 -145.052 -145.326 -145.755 -146.223 -146.529 -146.83 -147.472 -147.846 -148.239 -148.633 -149.06 -149.56 -150.182 -151.429 -9 ,15541 ,KEBNE ,16708598,Fri Nov 26 18:33:11 CET,Fri Nov 26 20:06:08 CET,0.0 0.562 0.704 0.794 0.847 0.885 0.901 0.888 0.832 0.795 0.759 0.695 0.635 0.587 0.485 0.361 0.217 0.143 -0.01 -0.177 -0.452 -0.647 -0.842 -1.128 -1.421 -1.715 -2.012 -2.316 -2.729 -3.151 -3.578 -4.112 -4.659 -5.223 -5.909 -6.716 -7.528 -8.472 -9.563 -10.8 -12.172 -13.797 -15.814 -17.99 -20.73 -24.049 -28.204 -33.372 -40.185 -49.407 -62.787 -76.558 -86.611 -94.348 -100.474 -105.562 -109.722 -113.265 -116.179 -118.947 -121.2 -123.141 -124.952 -126.611 -128.097 -129.397 -130.719 -131.864 -132.823 -133.809 -134.817 -135.638 -136.456 -137.271 -137.905 -138.566 -139.249 -139.929 -140.609 -141.067 -141.528 -142.249 -142.731 -143.211 -143.457 -143.968 -144.492 -145.031 -145.31 -145.72 -146.154 -146.442 -146.737 -147.381 -147.723 -148.071 -148.453 -148.891 -149.366 -149.93 -151.427 -10 ,27409 ,KEBNE ,16708599,Fri Nov 26 18:33:11 CET,Fri Nov 26 20:05:06 CET,0.0 0.579 0.716 0.809 0.85 0.862 0.866 0.865 0.838 0.805 0.757 0.664 0.589 0.528 0.397 0.25 0.095 0.015 -0.152 -0.322 -0.583 -0.764 -0.954 -1.249 -1.526 -1.785 -2.06 -2.357 -2.774 -3.204 -3.649 -4.209 -4.766 -5.327 -6.007 -6.81 -7.624 -8.573 -9.653 -10.876 -12.228 -13.813 -15.81 -17.977 -20.688 -23.993 -28.16 -33.328 -40.091 -49.319 -62.761 -76.609 -86.711 -94.463 -100.585 -105.698 -109.858 -113.392 -116.284 -119.055 -121.335 -123.29 -125.093 -126.718 -128.174 -129.471 -130.799 -131.946 -132.897 -133.855 -134.841 -135.676 -136.536 -137.39 -138.022 -138.663 -139.328 -140.01 -140.707 -141.175 -141.642 -142.342 -142.828 -143.34 -143.602 -144.114 -144.61 -145.115 -145.38 -145.786 -146.227 -146.532 -146.853 -147.504 -147.855 -148.233 -148.615 -149.036 -149.539 -150.111 -151.329 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_227_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_227_57.txt deleted file mode 100644 index ad3bc6be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_227_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16621 ,KEBNE ,16708600,Fri Nov 26 18:33:11 CET,Fri Nov 26 20:04:40 CET,0.0 1.154 1.525 1.784 2.003 2.197 2.378 2.536 2.805 2.932 3.048 3.275 3.365 3.467 3.656 3.844 4.017 4.097 4.242 4.384 4.586 4.72 4.849 5.024 5.19 5.333 5.471 5.612 5.814 6.011 6.169 6.356 6.536 6.716 6.93 7.163 7.384 7.592 7.808 8.013 8.2 8.407 8.688 8.968 9.224 9.49 9.741 9.901 9.987 9.928 9.389 8.452 7.608 6.839 6.12 5.45 4.878 4.33 3.806 3.282 2.873 2.502 2.116 1.741 1.412 1.112 0.781 0.501 0.268 0.012 -0.267 -0.491 -0.735 -1.004 -1.22 -1.434 -1.634 -1.843 -2.083 -2.248 -2.407 -2.647 -2.824 -3.024 -3.127 -3.332 -3.549 -3.784 -3.905 -4.014 -4.29 -4.438 -4.589 -4.914 -5.09 -5.272 -5.48 -5.72 -6.008 -6.405 -7.359 -2 ,26852 ,KEBNE ,16708601,Fri Nov 26 18:33:11 CET,Fri Nov 26 20:05:57 CET,0.0 0.939 1.313 1.597 1.831 2.027 2.21 2.365 2.638 2.765 2.891 3.135 3.214 3.309 3.49 3.66 3.835 3.914 4.054 4.196 4.4 4.525 4.65 4.843 5.019 5.173 5.31 5.437 5.612 5.772 5.924 6.119 6.297 6.476 6.701 6.953 7.171 7.386 7.614 7.829 8.026 8.24 8.49 8.728 8.961 9.184 9.49 9.773 9.863 9.792 9.348 8.464 7.575 6.762 6.034 5.357 4.726 4.174 3.711 3.224 2.789 2.389 2.016 1.677 1.357 1.048 0.695 0.395 0.169 -0.082 -0.354 -0.569 -0.797 -1.053 -1.266 -1.478 -1.701 -1.927 -2.139 -2.297 -2.475 -2.753 -2.935 -3.122 -3.224 -3.44 -3.669 -3.913 -4.033 -4.146 -4.426 -4.566 -4.711 -5.02 -5.199 -5.398 -5.605 -5.871 -6.188 -6.584 -7.801 -3 ,2174 ,KEBNE ,16708602,Fri Nov 26 18:34:12 CET,Fri Nov 26 20:05:32 CET,0.0 1.043 1.416 1.686 1.893 2.081 2.248 2.394 2.654 2.78 2.9 3.126 3.203 3.3 3.491 3.677 3.858 3.938 4.079 4.215 4.405 4.527 4.653 4.847 5.03 5.201 5.357 5.49 5.655 5.824 5.986 6.172 6.347 6.511 6.712 6.935 7.144 7.364 7.577 7.792 8.018 8.272 8.542 8.778 9.038 9.275 9.488 9.647 9.717 9.671 9.245 8.337 7.412 6.551 5.778 5.092 4.495 3.905 3.378 2.888 2.486 2.121 1.76 1.425 1.108 0.816 0.48 0.18 -0.059 -0.305 -0.566 -0.784 -1.015 -1.252 -1.427 -1.615 -1.815 -2.027 -2.267 -2.433 -2.6 -2.873 -3.066 -3.259 -3.355 -3.546 -3.754 -3.992 -4.119 -4.234 -4.5 -4.634 -4.767 -5.062 -5.242 -5.434 -5.63 -5.86 -6.147 -6.51 -7.532 -4 ,23251 ,KEBNE ,16708603,Fri Nov 26 18:33:11 CET,Fri Nov 26 20:04:48 CET,0.0 1.121 1.507 1.764 1.986 2.189 2.357 2.518 2.838 2.976 3.099 3.356 3.447 3.543 3.713 3.874 4.048 4.124 4.254 4.384 4.575 4.704 4.844 5.032 5.185 5.336 5.471 5.608 5.794 5.976 6.169 6.387 6.565 6.735 6.951 7.175 7.355 7.559 7.785 7.995 8.19 8.417 8.662 8.916 9.224 9.533 9.802 9.966 10.03 9.918 9.41 8.488 7.596 6.757 6.022 5.359 4.755 4.205 3.737 3.278 2.847 2.46 2.117 1.773 1.441 1.146 0.836 0.561 0.306 0.038 -0.237 -0.474 -0.703 -0.918 -1.094 -1.291 -1.499 -1.715 -1.931 -2.076 -2.235 -2.486 -2.661 -2.851 -2.952 -3.156 -3.354 -3.576 -3.695 -3.806 -4.081 -4.229 -4.39 -4.708 -4.88 -5.07 -5.286 -5.544 -5.845 -6.261 -7.552 -5 ,15576 ,KEBNE ,16708604,Fri Nov 26 18:33:11 CET,Fri Nov 26 20:04:45 CET,0.0 0.909 1.266 1.539 1.755 1.942 2.104 2.244 2.519 2.648 2.769 2.994 3.066 3.153 3.327 3.494 3.666 3.748 3.895 4.041 4.229 4.344 4.475 4.65 4.81 4.966 5.106 5.243 5.415 5.585 5.736 5.912 6.091 6.274 6.473 6.652 6.836 7.042 7.277 7.524 7.742 7.971 8.214 8.458 8.708 8.91 9.126 9.362 9.481 9.392 8.919 7.996 7.121 6.318 5.582 4.885 4.241 3.655 3.163 2.629 2.164 1.771 1.373 1.012 0.676 0.36 0.034 -0.278 -0.534 -0.785 -1.07 -1.299 -1.525 -1.781 -1.976 -2.174 -2.392 -2.614 -2.828 -2.977 -3.141 -3.4 -3.572 -3.755 -3.856 -4.069 -4.286 -4.511 -4.63 -4.735 -4.976 -5.101 -5.25 -5.57 -5.726 -5.898 -6.115 -6.37 -6.676 -7.067 -8.14 -6 ,14535 ,KEBNE ,16708605,Fri Nov 26 18:33:11 CET,Fri Nov 26 20:05:54 CET,0.0 1.141 1.469 1.694 1.895 2.084 2.243 2.378 2.631 2.757 2.875 3.11 3.193 3.295 3.506 3.69 3.858 3.939 4.099 4.267 4.483 4.615 4.744 4.912 5.083 5.266 5.446 5.6 5.776 5.94 6.094 6.272 6.441 6.616 6.814 7.031 7.238 7.461 7.676 7.866 8.089 8.324 8.537 8.733 8.951 9.148 9.343 9.491 9.519 9.403 8.908 7.999 7.127 6.28 5.49 4.782 4.178 3.623 3.126 2.558 2.056 1.654 1.274 0.932 0.617 0.305 -0.017 -0.298 -0.549 -0.82 -1.093 -1.305 -1.523 -1.761 -1.954 -2.151 -2.363 -2.589 -2.825 -2.99 -3.164 -3.433 -3.616 -3.798 -3.889 -4.084 -4.286 -4.501 -4.621 -4.742 -5.05 -5.198 -5.343 -5.676 -5.85 -6.006 -6.197 -6.43 -6.698 -7.056 -7.782 -7 ,12698 ,KEBNE ,16708606,Fri Nov 26 18:33:15 CET,Fri Nov 26 20:02:19 CET,0.0 1.213 1.589 1.883 2.107 2.291 2.462 2.615 2.865 2.979 3.092 3.334 3.425 3.521 3.695 3.865 4.023 4.101 4.268 4.425 4.636 4.769 4.893 5.067 5.229 5.382 5.529 5.666 5.848 6.02 6.163 6.343 6.526 6.7 6.888 7.076 7.276 7.493 7.712 7.938 8.151 8.377 8.611 8.823 9.04 9.257 9.482 9.649 9.691 9.592 9.16 8.311 7.439 6.605 5.857 5.185 4.593 4.064 3.604 3.119 2.667 2.27 1.888 1.52 1.178 0.848 0.516 0.238 -0.022 -0.284 -0.572 -0.81 -1.037 -1.29 -1.482 -1.671 -1.878 -2.108 -2.345 -2.513 -2.678 -2.922 -3.111 -3.31 -3.407 -3.614 -3.838 -4.074 -4.192 -4.297 -4.568 -4.711 -4.863 -5.196 -5.377 -5.566 -5.764 -6.004 -6.295 -6.72 -7.92 -8 ,32654 ,KEBNE ,16708607,Fri Nov 26 18:33:11 CET,Fri Nov 26 20:05:41 CET,0.0 1.12 1.469 1.762 1.987 2.167 2.325 2.475 2.752 2.874 3.001 3.253 3.344 3.45 3.647 3.83 3.999 4.08 4.225 4.354 4.527 4.649 4.772 4.953 5.118 5.252 5.386 5.529 5.712 5.885 6.04 6.217 6.405 6.582 6.767 6.98 7.173 7.384 7.616 7.811 8.003 8.232 8.536 8.809 9.04 9.266 9.468 9.618 9.665 9.528 9.033 8.152 7.338 6.612 5.918 5.293 4.734 4.203 3.745 3.295 2.88 2.492 2.111 1.711 1.364 1.089 0.785 0.506 0.256 -0.01 -0.277 -0.511 -0.766 -1.032 -1.224 -1.425 -1.661 -1.907 -2.132 -2.284 -2.45 -2.712 -2.888 -3.064 -3.164 -3.381 -3.595 -3.829 -3.957 -4.071 -4.331 -4.453 -4.585 -4.894 -5.064 -5.245 -5.448 -5.683 -5.989 -6.409 -7.566 -9 ,21263 ,KEBNE ,16708608,Fri Nov 26 18:33:10 CET,Fri Nov 26 20:06:01 CET,0.0 0.947 1.274 1.541 1.749 1.928 2.088 2.237 2.526 2.657 2.78 3.025 3.114 3.214 3.404 3.571 3.729 3.809 3.971 4.132 4.348 4.477 4.599 4.769 4.932 5.092 5.245 5.38 5.548 5.702 5.863 6.083 6.268 6.418 6.587 6.807 7.005 7.195 7.403 7.629 7.874 8.13 8.372 8.582 8.829 9.066 9.289 9.471 9.56 9.462 8.972 8.125 7.258 6.446 5.715 5.029 4.415 3.86 3.39 2.904 2.485 2.119 1.763 1.409 1.063 0.756 0.445 0.14 -0.134 -0.402 -0.689 -0.945 -1.187 -1.41 -1.578 -1.753 -1.968 -2.197 -2.405 -2.542 -2.688 -2.934 -3.114 -3.297 -3.39 -3.581 -3.783 -4.001 -4.126 -4.244 -4.532 -4.677 -4.821 -5.136 -5.314 -5.507 -5.701 -5.901 -6.171 -6.535 -7.435 -10 ,22912 ,KEBNE ,16708609,Fri Nov 26 18:34:12 CET,Fri Nov 26 20:05:47 CET,0.0 1.04 1.376 1.632 1.843 2.021 2.193 2.34 2.586 2.711 2.833 3.078 3.177 3.287 3.485 3.663 3.82 3.899 4.062 4.211 4.42 4.547 4.669 4.853 5.024 5.177 5.337 5.498 5.683 5.852 6.015 6.192 6.365 6.519 6.699 6.926 7.115 7.295 7.477 7.696 7.956 8.213 8.459 8.678 8.911 9.154 9.373 9.508 9.585 9.536 9.082 8.214 7.373 6.569 5.825 5.103 4.478 3.943 3.478 3.002 2.551 2.158 1.809 1.477 1.17 0.88 0.56 0.265 0.016 -0.257 -0.559 -0.816 -1.057 -1.295 -1.496 -1.704 -1.912 -2.121 -2.363 -2.551 -2.733 -3.002 -3.184 -3.365 -3.46 -3.67 -3.881 -4.108 -4.231 -4.343 -4.624 -4.77 -4.929 -5.25 -5.427 -5.64 -5.866 -6.121 -6.43 -6.814 -8.083 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_235_167.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_235_167.txt deleted file mode 100644 index 5bf0d6eb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_235_167.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23580 ,KEBNE ,16708610,Fri Nov 26 18:34:12 CET,Fri Nov 26 20:06:10 CET,0.0 2.268 2.645 2.909 3.082 3.252 3.396 3.487 3.642 3.712 3.774 3.929 3.942 3.988 4.074 4.126 4.148 4.157 4.185 4.189 4.168 4.147 4.101 4.028 3.957 3.873 3.791 3.689 3.545 3.406 3.263 3.067 2.831 2.581 2.276 1.918 1.56 1.105 0.519 -0.145 -0.892 -1.806 -2.935 -4.188 -5.853 -7.893 -10.475 -13.784 -18.202 -24.177 -33.026 -42.413 -49.352 -54.733 -58.985 -62.554 -65.503 -68.028 -70.12 -72.129 -73.773 -75.158 -76.443 -77.656 -78.766 -79.739 -80.739 -81.618 -82.365 -83.133 -83.91 -84.546 -85.184 -85.823 -86.315 -86.797 -87.294 -87.825 -88.367 -88.732 -89.098 -89.659 -90.03 -90.42 -90.624 -91.026 -91.445 -91.885 -92.112 -92.417 -92.83 -93.069 -93.316 -93.864 -94.178 -94.526 -94.895 -95.264 -95.639 -96.094 -97.443 -2 ,17953 ,KEBNE ,16708611,Fri Nov 26 18:34:12 CET,Fri Nov 26 20:06:00 CET,0.0 2.31 2.724 3.016 3.226 3.397 3.552 3.678 3.875 3.943 3.993 4.133 4.15 4.182 4.219 4.263 4.288 4.294 4.307 4.309 4.309 4.288 4.238 4.176 4.132 4.068 4.001 3.928 3.782 3.615 3.435 3.201 2.965 2.713 2.389 1.983 1.567 1.095 0.558 -0.074 -0.811 -1.727 -2.871 -4.1 -5.677 -7.634 -10.169 -13.442 -17.813 -23.778 -32.613 -42.019 -48.928 -54.243 -58.464 -61.991 -64.926 -67.427 -69.483 -71.457 -73.078 -74.518 -75.878 -77.1 -78.191 -79.166 -80.183 -81.092 -81.853 -82.616 -83.395 -84.013 -84.642 -85.275 -85.743 -86.225 -86.731 -87.247 -87.761 -88.118 -88.488 -89.05 -89.43 -89.814 -90.006 -90.391 -90.769 -91.173 -91.39 -91.681 -92.078 -92.324 -92.585 -93.18 -93.495 -93.808 -94.148 -94.523 -94.952 -95.5 -97.01 -3 ,10168 ,KEBNE ,16708612,Fri Nov 26 18:34:12 CET,Fri Nov 26 20:06:25 CET,0.0 1.9 2.296 2.57 2.786 2.988 3.163 3.279 3.462 3.539 3.609 3.773 3.797 3.834 3.883 3.93 3.954 3.966 3.978 3.96 3.94 3.922 3.885 3.827 3.77 3.695 3.621 3.538 3.396 3.241 3.086 2.896 2.677 2.452 2.177 1.811 1.41 0.906 0.318 -0.35 -1.099 -1.975 -3.076 -4.318 -5.905 -7.881 -10.444 -13.663 -17.951 -23.887 -32.783 -42.082 -48.964 -54.408 -58.718 -62.302 -65.255 -67.769 -69.833 -71.815 -73.456 -74.887 -76.246 -77.484 -78.581 -79.586 -80.63 -81.515 -82.237 -82.97 -83.74 -84.362 -84.985 -85.628 -86.119 -86.631 -87.158 -87.677 -88.196 -88.539 -88.895 -89.468 -89.85 -90.241 -90.449 -90.862 -91.276 -91.705 -91.925 -92.222 -92.632 -92.88 -93.137 -93.708 -94.032 -94.361 -94.692 -95.098 -95.563 -96.064 -97.132 -4 ,16735 ,KEBNE ,16708613,Fri Nov 26 18:34:12 CET,Fri Nov 26 20:06:44 CET,0.0 2.417 2.857 3.127 3.327 3.496 3.649 3.767 3.948 4.027 4.097 4.233 4.246 4.276 4.302 4.337 4.369 4.372 4.366 4.353 4.339 4.334 4.31 4.272 4.227 4.17 4.112 4.016 3.852 3.682 3.506 3.263 3.033 2.801 2.472 2.102 1.771 1.337 0.752 0.063 -0.696 -1.601 -2.753 -4.039 -5.656 -7.577 -10.094 -13.355 -17.667 -23.58 -32.319 -41.513 -48.344 -53.728 -58.041 -61.627 -64.559 -67.062 -69.151 -71.163 -72.829 -74.259 -75.586 -76.801 -77.902 -78.901 -79.929 -80.849 -81.615 -82.369 -83.129 -83.724 -84.327 -84.954 -85.452 -85.962 -86.46 -86.972 -87.513 -87.875 -88.232 -88.797 -89.198 -89.592 -89.785 -90.184 -90.591 -91.006 -91.22 -91.515 -91.95 -92.202 -92.458 -92.997 -93.275 -93.566 -93.877 -94.225 -94.662 -95.191 -97.083 -5 ,10679 ,KEBNE ,16708614,Fri Nov 26 18:34:12 CET,Fri Nov 26 20:06:03 CET,0.0 1.242 1.598 1.871 2.064 2.231 2.376 2.497 2.693 2.771 2.843 2.973 2.979 3.011 3.06 3.091 3.097 3.099 3.124 3.132 3.11 3.095 3.072 3.034 2.974 2.891 2.806 2.709 2.558 2.4 2.225 1.994 1.751 1.482 1.167 0.789 0.372 -0.075 -0.554 -1.156 -1.848 -2.673 -3.757 -4.951 -6.51 -8.52 -11.094 -14.318 -18.639 -24.623 -33.454 -42.696 -49.509 -54.913 -59.232 -62.822 -65.803 -68.332 -70.425 -72.466 -74.136 -75.551 -76.865 -78.09 -79.205 -80.184 -81.165 -82.01 -82.742 -83.523 -84.293 -84.891 -85.51 -86.138 -86.611 -87.103 -87.613 -88.116 -88.627 -88.972 -89.329 -89.898 -90.272 -90.647 -90.843 -91.243 -91.657 -92.1 -92.327 -92.624 -93.046 -93.306 -93.58 -94.144 -94.43 -94.728 -95.059 -95.428 -95.857 -96.414 -98.214 -6 ,4418 ,KEBNE ,16708615,Fri Nov 26 18:34:12 CET,Fri Nov 26 20:06:02 CET,0.0 1.256 1.64 1.863 2.007 2.13 2.24 2.344 2.507 2.571 2.623 2.722 2.724 2.754 2.796 2.822 2.834 2.843 2.86 2.866 2.861 2.857 2.833 2.762 2.691 2.597 2.486 2.391 2.268 2.112 1.93 1.693 1.461 1.244 0.954 0.569 0.161 -0.332 -0.915 -1.556 -2.276 -3.175 -4.303 -5.539 -7.152 -9.147 -11.704 -14.987 -19.363 -25.34 -34.202 -43.582 -50.504 -55.881 -60.17 -63.781 -66.762 -69.297 -71.377 -73.356 -74.987 -76.401 -77.742 -78.97 -80.053 -81.008 -82.009 -82.898 -83.629 -84.371 -85.128 -85.745 -86.38 -87.024 -87.51 -88.005 -88.51 -89.025 -89.56 -89.929 -90.298 -90.858 -91.248 -91.642 -91.842 -92.251 -92.656 -93.072 -93.289 -93.577 -93.972 -94.217 -94.47 -95.017 -95.312 -95.636 -95.982 -96.353 -96.772 -97.314 -99.18 -7 ,3467 ,KEBNE ,16708616,Fri Nov 26 18:34:12 CET,Fri Nov 26 20:05:49 CET,0.0 1.387 1.831 2.102 2.28 2.42 2.543 2.656 2.819 2.872 2.923 3.048 3.06 3.104 3.164 3.188 3.192 3.194 3.199 3.199 3.179 3.152 3.121 3.05 2.966 2.874 2.791 2.711 2.562 2.394 2.213 2.001 1.778 1.512 1.181 0.783 0.356 -0.137 -0.672 -1.304 -2.048 -2.961 -4.145 -5.459 -7.109 -9.105 -11.652 -14.9 -19.24 -25.187 -33.978 -43.212 -50.045 -55.394 -59.653 -63.221 -66.134 -68.636 -70.739 -72.753 -74.395 -75.83 -77.16 -78.357 -79.463 -80.442 -81.422 -82.286 -83.028 -83.808 -84.6 -85.217 -85.839 -86.472 -86.954 -87.455 -87.971 -88.498 -89.028 -89.388 -89.763 -90.328 -90.699 -91.071 -91.261 -91.656 -92.068 -92.491 -92.711 -93.005 -93.389 -93.625 -93.874 -94.402 -94.683 -94.988 -95.311 -95.652 -96.073 -96.583 -97.502 -8 ,17272 ,KEBNE ,16708617,Fri Nov 26 18:34:12 CET,Fri Nov 26 20:05:58 CET,0.0 2.362 2.795 3.063 3.262 3.407 3.526 3.633 3.825 3.905 3.963 4.075 4.07 4.109 4.184 4.217 4.243 4.257 4.268 4.258 4.223 4.178 4.131 4.076 4.02 3.945 3.857 3.754 3.595 3.429 3.263 3.072 2.839 2.577 2.268 1.892 1.503 1.016 0.419 -0.227 -0.933 -1.829 -2.984 -4.246 -5.87 -7.882 -10.454 -13.693 -17.984 -23.941 -32.83 -42.151 -48.991 -54.31 -58.563 -62.148 -65.107 -67.642 -69.731 -71.722 -73.36 -74.775 -76.081 -77.274 -78.355 -79.31 -80.297 -81.193 -81.93 -82.655 -83.424 -84.064 -84.695 -85.325 -85.818 -86.312 -86.813 -87.345 -87.886 -88.249 -88.622 -89.183 -89.559 -89.961 -90.169 -90.577 -91.003 -91.451 -91.677 -91.983 -92.418 -92.674 -92.933 -93.505 -93.831 -94.177 -94.532 -94.917 -95.398 -95.973 -97.918 -9 ,1699 ,KEBNE ,16708618,Fri Nov 26 18:34:12 CET,Fri Nov 26 20:06:34 CET,0.0 2.333 2.831 3.119 3.332 3.494 3.607 3.705 3.873 3.952 4.029 4.18 4.189 4.225 4.276 4.309 4.347 4.363 4.372 4.367 4.348 4.326 4.292 4.248 4.197 4.127 4.056 3.97 3.819 3.65 3.487 3.286 3.059 2.8 2.459 2.064 1.652 1.162 0.606 -0.037 -0.768 -1.646 -2.8 -4.094 -5.749 -7.8 -10.366 -13.577 -17.916 -23.909 -32.781 -42.09 -48.947 -54.291 -58.575 -62.189 -65.142 -67.65 -69.72 -71.726 -73.383 -74.8 -76.135 -77.354 -78.447 -79.409 -80.384 -81.242 -81.959 -82.683 -83.431 -84.035 -84.641 -85.27 -85.74 -86.219 -86.73 -87.265 -87.799 -88.149 -88.509 -89.061 -89.434 -89.827 -90.027 -90.414 -90.82 -91.251 -91.461 -91.739 -92.121 -92.374 -92.647 -93.202 -93.491 -93.806 -94.148 -94.532 -95.005 -95.567 -96.884 -10 ,15891 ,KEBNE ,16708619,Fri Nov 26 18:35:14 CET,Fri Nov 26 20:06:55 CET,0.0 1.402 1.772 2.002 2.172 2.322 2.455 2.583 2.786 2.854 2.917 3.051 3.051 3.079 3.129 3.145 3.14 3.137 3.117 3.103 3.091 3.075 3.041 2.98 2.918 2.849 2.767 2.653 2.504 2.384 2.239 2.028 1.831 1.598 1.269 0.869 0.457 -0.01 -0.539 -1.166 -1.908 -2.803 -3.884 -5.096 -6.714 -8.708 -11.27 -14.51 -18.827 -24.773 -33.634 -42.988 -49.856 -55.213 -59.48 -63.019 -65.933 -68.461 -70.56 -72.562 -74.201 -75.598 -76.917 -78.144 -79.248 -80.229 -81.219 -82.082 -82.817 -83.553 -84.304 -84.922 -85.55 -86.18 -86.659 -87.15 -87.649 -88.154 -88.678 -89.038 -89.4 -89.951 -90.318 -90.686 -90.884 -91.291 -91.695 -92.117 -92.342 -92.642 -93.045 -93.283 -93.531 -94.065 -94.351 -94.655 -94.985 -95.32 -95.727 -96.304 -97.511 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_235_224.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_235_224.txt deleted file mode 100644 index 39bfeca5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_235_224.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28232 ,KEBNE ,16708620,Fri Nov 26 18:35:14 CET,Fri Nov 26 20:07:48 CET,0.0 1.775 2.285 2.659 2.968 3.181 3.357 3.514 3.793 3.921 4.04 4.279 4.354 4.457 4.659 4.867 5.066 5.153 5.311 5.46 5.68 5.827 5.969 6.154 6.318 6.47 6.618 6.766 6.938 7.096 7.258 7.45 7.64 7.841 8.056 8.285 8.521 8.767 9.015 9.277 9.551 9.865 10.233 10.59 10.986 11.47 12.02 12.526 13.053 13.528 13.687 13.362 12.84 12.24 11.65 11.08 10.566 10.072 9.616 9.145 8.743 8.379 8.014 7.66 7.336 7.038 6.721 6.452 6.226 5.968 5.654 5.395 5.132 4.858 4.649 4.411 4.157 3.901 3.632 3.445 3.256 2.966 2.761 2.54 2.425 2.185 1.938 1.705 1.579 1.458 1.095 0.922 0.74 0.367 0.154 -0.094 -0.354 -0.666 -1.072 -1.647 -3.893 -2 ,15610 ,KEBNE ,16708621,Fri Nov 26 18:35:15 CET,Fri Nov 26 20:10:18 CET,0.0 1.654 1.993 2.267 2.505 2.706 2.885 3.054 3.379 3.521 3.647 3.924 4.008 4.117 4.322 4.511 4.697 4.786 4.96 5.128 5.37 5.52 5.658 5.865 6.074 6.278 6.471 6.661 6.894 7.094 7.319 7.613 7.891 8.144 8.426 8.72 8.956 9.226 9.527 9.853 10.203 10.577 10.97 11.37 11.846 12.33 12.848 13.347 13.819 14.262 14.477 14.193 13.701 13.171 12.579 11.971 11.457 10.992 10.581 10.157 9.771 9.403 9.017 8.624 8.273 7.979 7.687 7.422 7.151 6.869 6.608 6.388 6.138 5.868 5.673 5.464 5.24 5.008 4.76 4.584 4.404 4.135 3.934 3.732 3.632 3.414 3.177 2.928 2.791 2.684 2.358 2.189 1.98 1.465 1.211 0.932 0.598 0.201 -0.298 -0.96 -3.604 -3 ,31076 ,KEBNE ,16708622,Fri Nov 26 18:35:15 CET,Fri Nov 26 20:06:51 CET,0.0 2.058 2.397 2.648 2.858 3.056 3.238 3.395 3.679 3.8 3.907 4.143 4.218 4.33 4.547 4.738 4.93 5.028 5.221 5.402 5.648 5.799 5.936 6.132 6.338 6.535 6.726 6.919 7.162 7.379 7.587 7.855 8.101 8.329 8.609 8.919 9.199 9.501 9.809 10.135 10.459 10.811 11.201 11.583 12.046 12.543 13.061 13.553 14.085 14.554 14.716 14.436 13.887 13.332 12.793 12.26 11.753 11.242 10.809 10.369 9.97 9.61 9.251 8.899 8.552 8.245 7.938 7.66 7.404 7.114 6.822 6.576 6.314 6.058 5.872 5.677 5.45 5.204 4.963 4.802 4.639 4.392 4.202 3.982 3.865 3.633 3.413 3.152 3.008 2.891 2.533 2.374 2.204 1.807 1.603 1.389 1.125 0.8 0.447 -0.075 -2.655 -4 ,13789 ,KEBNE ,16708623,Fri Nov 26 18:35:14 CET,Fri Nov 26 20:06:34 CET,0.0 1.533 1.844 2.097 2.297 2.472 2.63 2.771 3.043 3.162 3.27 3.501 3.566 3.663 3.86 4.051 4.238 4.329 4.496 4.654 4.886 5.04 5.19 5.408 5.593 5.743 5.89 6.032 6.216 6.4 6.57 6.766 6.967 7.165 7.384 7.624 7.838 8.068 8.35 8.68 9.022 9.381 9.791 10.196 10.643 11.11 11.613 12.173 12.739 13.216 13.456 13.171 12.721 12.215 11.673 11.128 10.634 10.181 9.77 9.321 8.854 8.45 8.109 7.784 7.474 7.166 6.826 6.526 6.275 5.986 5.679 5.441 5.186 4.916 4.688 4.45 4.225 4.005 3.756 3.566 3.382 3.108 2.909 2.692 2.578 2.344 2.11 1.877 1.749 1.633 1.285 1.116 0.94 0.577 0.373 0.136 -0.125 -0.435 -0.856 -1.379 -3.154 -5 ,11055 ,KEBNE ,16708624,Fri Nov 26 18:35:14 CET,Fri Nov 26 20:08:08 CET,0.0 1.257 1.697 2.033 2.352 2.6 2.793 2.957 3.279 3.435 3.576 3.873 3.976 4.102 4.31 4.499 4.683 4.771 4.949 5.135 5.397 5.553 5.72 5.973 6.184 6.386 6.593 6.774 6.997 7.205 7.387 7.604 7.84 8.065 8.301 8.583 8.866 9.145 9.455 9.802 10.119 10.469 10.862 11.294 11.8 12.291 12.838 13.334 13.805 14.214 14.368 14.064 13.486 12.84 12.227 11.651 11.091 10.545 10.1 9.675 9.291 8.934 8.579 8.239 7.884 7.536 7.213 6.924 6.66 6.382 6.085 5.824 5.545 5.26 5.042 4.835 4.62 4.365 4.088 3.907 3.712 3.42 3.223 2.996 2.88 2.639 2.373 2.105 1.966 1.854 1.537 1.362 1.172 0.717 0.449 0.165 -0.147 -0.539 -1.04 -1.724 -4.731 -6 ,16233 ,KEBNE ,16708625,Fri Nov 26 18:35:14 CET,Fri Nov 26 20:07:57 CET,0.0 1.489 1.882 2.182 2.462 2.7 2.898 3.071 3.377 3.518 3.65 3.922 3.999 4.106 4.316 4.504 4.683 4.771 4.95 5.129 5.364 5.51 5.652 5.852 6.037 6.225 6.428 6.619 6.847 7.073 7.289 7.544 7.796 8.02 8.271 8.573 8.847 9.128 9.436 9.747 10.095 10.49 10.9 11.285 11.713 12.176 12.662 13.182 13.723 14.168 14.36 14.1 13.591 12.995 12.383 11.778 11.262 10.808 10.361 9.871 9.433 9.044 8.667 8.304 7.966 7.64 7.274 6.957 6.671 6.37 6.084 5.848 5.604 5.343 5.148 4.927 4.673 4.418 4.155 3.983 3.81 3.543 3.348 3.135 3.026 2.79 2.532 2.257 2.112 1.998 1.658 1.498 1.349 0.988 0.76 0.513 0.247 -0.085 -0.474 -0.952 -2.406 -7 ,24690 ,KEBNE ,16708626,Fri Nov 26 18:36:16 CET,Fri Nov 26 20:08:53 CET,0.0 1.407 1.871 2.169 2.385 2.576 2.759 2.924 3.211 3.348 3.485 3.769 3.856 3.965 4.172 4.362 4.545 4.637 4.792 4.945 5.185 5.332 5.474 5.691 5.911 6.123 6.321 6.507 6.75 6.985 7.196 7.467 7.717 7.954 8.232 8.516 8.81 9.128 9.431 9.732 10.041 10.409 10.828 11.208 11.647 12.156 12.683 13.167 13.629 14.033 14.274 14.069 13.57 12.956 12.364 11.825 11.325 10.846 10.415 9.965 9.557 9.179 8.805 8.421 8.069 7.763 7.424 7.121 6.855 6.541 6.218 5.961 5.697 5.431 5.213 4.987 4.76 4.519 4.268 4.093 3.916 3.657 3.456 3.234 3.116 2.874 2.634 2.353 2.21 2.104 1.767 1.596 1.408 1.003 0.758 0.497 0.201 -0.149 -0.52 -1.055 -3.738 -8 ,27401 ,KEBNE ,16708627,Fri Nov 26 18:36:16 CET,Fri Nov 26 20:08:46 CET,0.0 1.683 2.156 2.477 2.709 2.931 3.139 3.32 3.64 3.784 3.915 4.193 4.279 4.397 4.635 4.841 5.023 5.114 5.284 5.434 5.668 5.829 5.986 6.215 6.431 6.635 6.81 6.979 7.227 7.467 7.681 7.921 8.164 8.409 8.709 9.036 9.3 9.582 9.879 10.197 10.54 10.919 11.344 11.76 12.218 12.682 13.156 13.643 14.147 14.573 14.797 14.564 14.079 13.529 12.962 12.392 11.838 11.277 10.799 10.343 9.925 9.543 9.179 8.816 8.441 8.068 7.7 7.389 7.106 6.828 6.568 6.35 6.089 5.815 5.603 5.367 5.143 4.91 4.641 4.458 4.269 3.985 3.795 3.582 3.47 3.244 3.004 2.757 2.628 2.526 2.203 2.045 1.875 1.491 1.278 1.03 0.757 0.457 0.091 -0.441 -2.508 -9 ,2176 ,KEBNE ,16708628,Fri Nov 26 18:38:18 CET,Fri Nov 26 20:11:15 CET,0.0 1.044 1.366 1.609 1.818 2.007 2.198 2.38 2.72 2.876 3.01 3.292 3.389 3.504 3.717 3.926 4.12 4.214 4.399 4.576 4.824 4.983 5.145 5.386 5.597 5.794 5.989 6.168 6.399 6.614 6.829 7.125 7.41 7.659 7.916 8.207 8.481 8.765 9.078 9.412 9.746 10.092 10.491 10.876 11.305 11.759 12.244 12.781 13.316 13.701 13.832 13.533 13.068 12.523 11.967 11.424 10.907 10.421 10.007 9.596 9.2 8.825 8.467 8.132 7.819 7.51 7.152 6.809 6.527 6.23 5.928 5.701 5.465 5.222 5.026 4.794 4.532 4.275 4.018 3.837 3.654 3.366 3.161 2.941 2.826 2.607 2.364 2.088 1.948 1.825 1.455 1.29 1.111 0.681 0.441 0.18 -0.104 -0.424 -0.809 -1.325 -3.929 -10 ,31892 ,KEBNE ,16708629,Fri Nov 26 18:38:18 CET,Fri Nov 26 20:11:12 CET,0.0 1.237 1.639 1.909 2.143 2.355 2.54 2.703 3.006 3.154 3.298 3.62 3.728 3.848 4.062 4.277 4.478 4.568 4.731 4.89 5.144 5.316 5.475 5.682 5.876 6.07 6.258 6.435 6.65 6.862 7.085 7.365 7.626 7.869 8.129 8.405 8.691 9.008 9.312 9.635 9.958 10.326 10.746 11.134 11.601 12.086 12.574 13.083 13.577 13.996 14.225 13.984 13.514 12.974 12.411 11.836 11.272 10.764 10.324 9.863 9.46 9.1 8.765 8.416 8.047 7.703 7.347 7.05 6.804 6.546 6.245 5.98 5.717 5.426 5.208 4.997 4.765 4.495 4.217 4.042 3.858 3.572 3.369 3.156 3.049 2.809 2.553 2.289 2.149 2.023 1.685 1.524 1.337 0.925 0.709 0.483 0.235 -0.069 -0.434 -0.949 -2.916 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_155.txt deleted file mode 100644 index 983eea4f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1726 ,KEBNE ,16708630,Fri Nov 26 18:38:18 CET,Fri Nov 26 20:09:51 CET,0.0 1.05 1.438 1.74 1.953 2.119 2.259 2.399 2.657 2.767 2.866 3.044 3.153 3.242 3.418 3.577 3.712 3.782 3.916 4.029 4.182 4.289 4.396 4.533 4.657 4.779 4.904 5.027 5.177 5.311 5.44 5.605 5.749 5.872 6.022 6.186 6.333 6.466 6.601 6.753 6.896 7.032 7.175 7.283 7.374 7.418 7.399 7.277 6.969 6.318 4.927 3.07 1.249 -0.447 -1.885 -3.137 -4.224 -5.217 -6.049 -6.848 -7.507 -8.085 -8.654 -9.181 -9.651 -10.095 -10.561 -10.966 -11.322 -11.683 -12.043 -12.354 -12.669 -12.987 -13.246 -13.515 -13.782 -14.057 -14.335 -14.523 -14.72 -15.033 -15.26 -15.507 -15.63 -15.871 -16.13 -16.408 -16.551 -16.736 -16.988 -17.145 -17.311 -17.681 -17.89 -18.109 -18.357 -18.626 -18.94 -19.371 -20.771 -2 ,10910 ,KEBNE ,16708631,Fri Nov 26 18:38:20 CET,Fri Nov 26 20:07:25 CET,0.0 1.091 1.411 1.643 1.856 2.044 2.207 2.35 2.597 2.71 2.82 3.006 3.123 3.213 3.365 3.51 3.654 3.724 3.856 3.982 4.156 4.265 4.369 4.513 4.652 4.789 4.912 5.024 5.179 5.327 5.453 5.597 5.736 5.861 5.995 6.151 6.307 6.462 6.61 6.722 6.818 6.938 7.026 7.074 7.081 7.032 6.946 6.706 6.227 5.36 3.564 1.304 -0.603 -2.286 -3.724 -4.943 -5.993 -6.969 -7.781 -8.558 -9.255 -9.874 -10.453 -10.979 -11.438 -11.876 -12.324 -12.723 -13.082 -13.444 -13.818 -14.127 -14.443 -14.764 -15.018 -15.283 -15.559 -15.853 -16.147 -16.347 -16.55 -16.877 -17.106 -17.343 -17.464 -17.709 -17.957 -18.225 -18.37 -18.558 -18.833 -19.003 -19.18 -19.551 -19.758 -20.001 -20.266 -20.546 -20.872 -21.325 -22.736 -3 ,12746 ,KEBNE ,16708632,Fri Nov 26 18:38:19 CET,Fri Nov 26 20:10:24 CET,0.0 0.86 1.155 1.4 1.612 1.788 1.93 2.057 2.31 2.431 2.541 2.724 2.841 2.931 3.096 3.248 3.386 3.457 3.588 3.704 3.864 3.97 4.083 4.239 4.374 4.5 4.623 4.745 4.886 5.009 5.13 5.265 5.38 5.514 5.671 5.833 5.988 6.137 6.278 6.389 6.483 6.617 6.742 6.82 6.893 6.943 6.963 6.863 6.53 5.646 3.834 1.546 -0.258 -1.733 -3.01 -4.153 -5.181 -6.138 -6.947 -7.736 -8.427 -9.03 -9.593 -10.124 -10.608 -11.043 -11.485 -11.883 -12.233 -12.594 -12.967 -13.269 -13.576 -13.906 -14.159 -14.412 -14.677 -14.954 -15.228 -15.414 -15.615 -15.925 -16.136 -16.356 -16.477 -16.739 -17.003 -17.272 -17.413 -17.593 -17.86 -18.039 -18.225 -18.623 -18.846 -19.095 -19.365 -19.647 -19.963 -20.419 -21.981 -4 ,6446 ,KEBNE ,16708633,Fri Nov 26 18:38:19 CET,Fri Nov 26 20:10:11 CET,0.0 1.13 1.476 1.72 1.942 2.125 2.291 2.449 2.724 2.856 2.979 3.177 3.292 3.383 3.553 3.7 3.843 3.912 4.032 4.14 4.299 4.407 4.506 4.644 4.79 4.926 5.044 5.158 5.314 5.448 5.564 5.715 5.863 5.999 6.151 6.313 6.458 6.604 6.727 6.845 6.969 7.086 7.241 7.388 7.503 7.593 7.595 7.486 7.19 6.362 4.584 2.33 0.411 -1.256 -2.694 -3.974 -5.033 -5.94 -6.74 -7.555 -8.257 -8.876 -9.455 -10.0 -10.499 -10.959 -11.434 -11.851 -12.218 -12.58 -12.942 -13.251 -13.574 -13.894 -14.141 -14.412 -14.688 -14.964 -15.255 -15.45 -15.647 -15.964 -16.188 -16.413 -16.531 -16.775 -17.019 -17.283 -17.421 -17.61 -17.877 -18.04 -18.21 -18.578 -18.781 -19.004 -19.254 -19.529 -19.843 -20.267 -21.381 -5 ,22972 ,KEBNE ,16708634,Fri Nov 26 18:38:19 CET,Fri Nov 26 20:10:03 CET,0.0 1.271 1.612 1.86 2.069 2.246 2.41 2.557 2.82 2.933 3.042 3.252 3.378 3.479 3.666 3.829 3.974 4.044 4.181 4.31 4.483 4.592 4.694 4.831 4.96 5.092 5.219 5.337 5.499 5.644 5.771 5.926 6.076 6.211 6.347 6.498 6.649 6.806 6.935 7.038 7.154 7.278 7.405 7.523 7.636 7.691 7.666 7.577 7.18 6.238 4.698 2.818 0.998 -0.64 -2.019 -3.249 -4.328 -5.298 -6.11 -6.905 -7.58 -8.175 -8.729 -9.239 -9.721 -10.178 -10.664 -11.082 -11.433 -11.802 -12.163 -12.46 -12.769 -13.083 -13.33 -13.599 -13.868 -14.141 -14.448 -14.657 -14.859 -15.176 -15.402 -15.623 -15.731 -15.972 -16.244 -16.523 -16.668 -16.858 -17.128 -17.297 -17.484 -17.899 -18.118 -18.335 -18.573 -18.855 -19.21 -19.678 -20.856 -6 ,32180 ,KEBNE ,16708635,Fri Nov 26 18:38:18 CET,Fri Nov 26 20:10:16 CET,0.0 1.119 1.527 1.828 2.027 2.182 2.337 2.475 2.702 2.807 2.905 3.081 3.196 3.282 3.447 3.591 3.732 3.803 3.937 4.059 4.215 4.313 4.419 4.569 4.702 4.83 4.949 5.06 5.2 5.335 5.455 5.604 5.756 5.89 6.044 6.213 6.368 6.52 6.651 6.796 6.949 7.08 7.212 7.319 7.37 7.373 7.292 7.078 6.647 5.756 3.963 1.622 -0.336 -1.963 -3.382 -4.668 -5.75 -6.695 -7.516 -8.357 -9.069 -9.686 -10.265 -10.788 -11.259 -11.684 -12.13 -12.543 -12.894 -13.247 -13.635 -13.95 -14.266 -14.6 -14.853 -15.107 -15.371 -15.647 -15.938 -16.14 -16.34 -16.654 -16.885 -17.112 -17.222 -17.459 -17.717 -17.992 -18.132 -18.322 -18.606 -18.781 -18.959 -19.326 -19.532 -19.748 -19.968 -20.217 -20.517 -20.939 -22.262 -7 ,20023 ,KEBNE ,16708636,Fri Nov 26 18:38:18 CET,Fri Nov 26 20:10:11 CET,0.0 0.866 1.199 1.449 1.655 1.844 2.026 2.196 2.467 2.578 2.68 2.853 2.964 3.056 3.234 3.393 3.523 3.587 3.713 3.829 4.0 4.112 4.215 4.347 4.48 4.611 4.724 4.828 4.962 5.089 5.212 5.355 5.485 5.619 5.769 5.936 6.09 6.226 6.362 6.488 6.586 6.698 6.826 6.927 7.001 7.005 6.923 6.71 6.302 5.509 3.873 1.668 -0.317 -2.003 -3.34 -4.529 -5.605 -6.54 -7.35 -8.176 -8.859 -9.461 -10.053 -10.606 -11.094 -11.538 -12.006 -12.413 -12.759 -13.115 -13.485 -13.794 -14.113 -14.436 -14.686 -14.95 -15.219 -15.496 -15.782 -15.984 -16.198 -16.536 -16.763 -17.007 -17.138 -17.391 -17.648 -17.935 -18.082 -18.269 -18.54 -18.7 -18.873 -19.26 -19.466 -19.681 -19.926 -20.232 -20.568 -20.952 -22.251 -8 ,11588 ,KEBNE ,16708637,Fri Nov 26 18:38:18 CET,Fri Nov 26 20:11:21 CET,0.0 1.17 1.501 1.761 1.964 2.149 2.308 2.435 2.676 2.8 2.918 3.101 3.214 3.304 3.471 3.631 3.772 3.837 3.964 4.092 4.272 4.382 4.486 4.64 4.781 4.9 5.015 5.128 5.275 5.416 5.558 5.727 5.865 5.984 6.135 6.302 6.442 6.57 6.693 6.846 7.01 7.159 7.317 7.448 7.54 7.608 7.609 7.495 7.244 6.681 5.316 3.359 1.527 -0.094 -1.47 -2.723 -3.787 -4.72 -5.521 -6.297 -6.967 -7.575 -8.138 -8.66 -9.135 -9.566 -10.013 -10.416 -10.76 -11.117 -11.501 -11.803 -12.112 -12.44 -12.69 -12.943 -13.205 -13.482 -13.773 -13.973 -14.175 -14.48 -14.696 -14.928 -15.049 -15.293 -15.53 -15.78 -15.921 -16.118 -16.409 -16.573 -16.749 -17.132 -17.338 -17.557 -17.797 -18.072 -18.401 -18.818 -19.966 -9 ,13657 ,KEBNE ,16708638,Fri Nov 26 18:38:18 CET,Fri Nov 26 20:10:13 CET,0.0 1.023 1.379 1.673 1.91 2.107 2.281 2.425 2.667 2.787 2.902 3.102 3.224 3.319 3.516 3.678 3.806 3.874 4.009 4.121 4.29 4.4 4.507 4.652 4.775 4.906 5.032 5.153 5.298 5.429 5.552 5.684 5.812 5.943 6.087 6.242 6.388 6.526 6.666 6.811 6.955 7.113 7.277 7.412 7.5 7.551 7.558 7.433 7.115 6.545 5.318 3.377 1.684 0.234 -1.068 -2.257 -3.291 -4.208 -4.999 -5.793 -6.472 -7.068 -7.633 -8.149 -8.626 -9.066 -9.522 -9.928 -10.277 -10.647 -11.015 -11.316 -11.643 -11.981 -12.233 -12.474 -12.732 -13.012 -13.296 -13.49 -13.69 -14.01 -14.227 -14.442 -14.56 -14.812 -15.073 -15.359 -15.506 -15.698 -15.947 -16.098 -16.268 -16.631 -16.839 -17.075 -17.31 -17.582 -17.909 -18.293 -19.767 -10 ,12476 ,KEBNE ,16708639,Fri Nov 26 18:38:23 CET,Fri Nov 26 20:10:07 CET,0.0 1.346 1.68 1.906 2.1 2.278 2.434 2.584 2.834 2.94 3.042 3.211 3.313 3.397 3.551 3.69 3.823 3.885 4.006 4.118 4.294 4.412 4.514 4.67 4.814 4.943 5.068 5.188 5.338 5.477 5.608 5.758 5.904 6.043 6.188 6.337 6.48 6.637 6.781 6.914 7.054 7.183 7.317 7.438 7.515 7.535 7.462 7.296 6.858 5.968 4.318 2.104 0.183 -1.482 -2.865 -4.074 -5.118 -6.069 -6.894 -7.686 -8.356 -8.973 -9.562 -10.09 -10.573 -11.025 -11.5 -11.918 -12.264 -12.629 -13.017 -13.318 -13.63 -13.954 -14.199 -14.45 -14.713 -14.996 -15.283 -15.475 -15.679 -16.01 -16.225 -16.45 -16.572 -16.824 -17.093 -17.37 -17.507 -17.695 -17.981 -18.149 -18.321 -18.694 -18.891 -19.102 -19.356 -19.655 -19.975 -20.385 -21.686 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_163.txt deleted file mode 100644 index cfd4fe13..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_163.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16178 ,KEBNE ,16708640,Fri Nov 26 18:38:19 CET,Fri Nov 26 20:10:13 CET,0.0 1.021 1.299 1.455 1.576 1.673 1.738 1.777 1.836 1.874 1.901 1.909 1.936 1.944 1.943 1.912 1.883 1.867 1.831 1.79 1.719 1.66 1.604 1.523 1.424 1.316 1.201 1.067 0.873 0.674 0.491 0.254 -0.016 -0.288 -0.615 -1.014 -1.419 -1.896 -2.473 -3.133 -3.872 -4.787 -5.957 -7.219 -8.82 -10.788 -13.378 -16.685 -21.037 -27.107 -36.218 -45.899 -53.106 -58.687 -63.092 -66.765 -69.826 -72.462 -74.623 -76.671 -78.388 -79.89 -81.276 -82.519 -83.619 -84.603 -85.605 -86.477 -87.22 -87.977 -88.744 -89.37 -89.996 -90.632 -91.113 -91.609 -92.125 -92.64 -93.16 -93.511 -93.878 -94.443 -94.828 -95.218 -95.414 -95.818 -96.229 -96.654 -96.88 -97.225 -97.563 -97.806 -98.044 -98.549 -98.814 -99.092 -99.415 -99.798 -100.218 -100.753 -102.366 -2 ,5458 ,KEBNE ,16708641,Fri Nov 26 18:38:19 CET,Fri Nov 26 20:10:13 CET,0.0 0.889 1.129 1.281 1.386 1.48 1.549 1.605 1.698 1.726 1.737 1.733 1.761 1.774 1.768 1.737 1.704 1.686 1.642 1.582 1.47 1.393 1.323 1.224 1.113 0.992 0.863 0.724 0.528 0.318 0.101 -0.158 -0.412 -0.677 -1.015 -1.421 -1.841 -2.35 -2.952 -3.655 -4.424 -5.326 -6.486 -7.739 -9.35 -11.355 -13.914 -17.185 -21.506 -27.481 -36.535 -46.135 -53.232 -58.765 -63.142 -66.795 -69.845 -72.479 -74.626 -76.663 -78.376 -79.862 -81.203 -82.428 -83.543 -84.529 -85.533 -86.413 -87.164 -87.928 -88.706 -89.342 -89.987 -90.631 -91.117 -91.614 -92.118 -92.641 -93.177 -93.536 -93.908 -94.488 -94.877 -95.263 -95.46 -95.867 -96.284 -96.716 -96.947 -97.306 -97.66 -97.91 -98.178 -98.735 -99.02 -99.325 -99.664 -100.029 -100.448 -101.014 -102.4 -3 ,13314 ,KEBNE ,16708642,Fri Nov 26 18:38:18 CET,Fri Nov 26 20:09:57 CET,0.0 0.57 0.765 0.927 1.051 1.143 1.224 1.279 1.353 1.378 1.391 1.39 1.417 1.412 1.403 1.38 1.34 1.321 1.283 1.243 1.17 1.109 1.041 0.934 0.821 0.705 0.58 0.457 0.276 0.064 -0.162 -0.446 -0.737 -1.033 -1.386 -1.799 -2.211 -2.703 -3.291 -3.964 -4.724 -5.653 -6.836 -8.119 -9.759 -11.805 -14.379 -17.614 -22.002 -28.105 -37.113 -46.67 -53.813 -59.338 -63.709 -67.391 -70.426 -73.052 -75.222 -77.292 -78.999 -80.451 -81.787 -83.031 -84.176 -85.186 -86.198 -87.068 -87.811 -88.573 -89.345 -89.976 -90.618 -91.26 -91.744 -92.24 -92.744 -93.265 -93.796 -94.159 -94.527 -95.085 -95.462 -95.846 -96.044 -96.448 -96.872 -97.3 -97.513 -97.858 -98.186 -98.42 -98.677 -99.248 -99.552 -99.876 -100.24 -100.631 -101.116 -101.773 -103.722 -4 ,21633 ,KEBNE ,16708643,Fri Nov 26 18:38:18 CET,Fri Nov 26 20:10:02 CET,0.0 0.913 1.177 1.346 1.447 1.534 1.604 1.655 1.733 1.764 1.786 1.779 1.8 1.807 1.81 1.793 1.77 1.758 1.726 1.697 1.639 1.571 1.504 1.417 1.316 1.196 1.061 0.914 0.704 0.499 0.288 0.013 -0.244 -0.499 -0.835 -1.245 -1.68 -2.196 -2.789 -3.459 -4.204 -5.081 -6.195 -7.455 -9.072 -11.081 -13.669 -16.901 -21.269 -27.425 -36.544 -46.19 -53.276 -58.75 -63.126 -66.815 -69.893 -72.53 -74.709 -76.807 -78.536 -80.032 -81.418 -82.655 -83.758 -84.758 -85.771 -86.641 -87.378 -88.116 -88.869 -89.495 -90.131 -90.785 -91.285 -91.794 -92.309 -92.823 -93.352 -93.712 -94.081 -94.662 -95.054 -95.443 -95.643 -96.059 -96.489 -96.929 -97.156 -97.517 -97.86 -98.094 -98.352 -98.889 -99.178 -99.492 -99.826 -100.198 -100.665 -101.256 -102.943 -5 ,15735 ,KEBNE ,16708644,Fri Nov 26 18:38:18 CET,Fri Nov 26 20:10:03 CET,0.0 1.303 1.537 1.695 1.802 1.873 1.923 1.973 2.049 2.072 2.088 2.078 2.094 2.094 2.088 2.069 2.044 2.03 1.992 1.941 1.853 1.788 1.722 1.612 1.486 1.364 1.244 1.116 0.949 0.771 0.572 0.308 0.034 -0.242 -0.581 -0.986 -1.398 -1.904 -2.49 -3.166 -3.938 -4.871 -6.058 -7.328 -8.944 -10.955 -13.548 -16.812 -21.128 -27.185 -36.217 -45.662 -52.732 -58.226 -62.6 -66.274 -69.321 -71.986 -74.17 -76.257 -77.991 -79.46 -80.817 -82.06 -83.176 -84.162 -85.176 -86.07 -86.821 -87.576 -88.348 -88.982 -89.612 -90.248 -90.736 -91.241 -91.752 -92.272 -92.796 -93.15 -93.52 -94.087 -94.474 -94.851 -95.039 -95.421 -95.828 -96.258 -96.478 -96.826 -97.17 -97.411 -97.658 -98.198 -98.487 -98.775 -99.087 -99.43 -99.828 -100.351 -102.117 -6 ,11778 ,KEBNE ,16708645,Fri Nov 26 18:38:19 CET,Fri Nov 26 20:09:54 CET,0.0 1.018 1.238 1.392 1.508 1.593 1.647 1.688 1.781 1.822 1.853 1.875 1.908 1.905 1.887 1.867 1.835 1.814 1.767 1.71 1.615 1.549 1.484 1.379 1.259 1.132 1.007 0.88 0.693 0.506 0.311 0.062 -0.186 -0.466 -0.824 -1.238 -1.64 -2.109 -2.668 -3.308 -4.071 -5.01 -6.171 -7.441 -9.049 -11.011 -13.557 -16.832 -21.207 -27.267 -36.214 -45.568 -52.503 -57.928 -62.26 -65.916 -68.948 -71.585 -73.761 -75.823 -77.533 -78.99 -80.329 -81.57 -82.697 -83.687 -84.69 -85.576 -86.329 -87.103 -87.894 -88.526 -89.168 -89.82 -90.314 -90.819 -91.336 -91.865 -92.405 -92.77 -93.14 -93.713 -94.098 -94.486 -94.682 -95.083 -95.504 -95.929 -96.148 -96.49 -96.809 -97.055 -97.303 -97.801 -98.077 -98.376 -98.698 -99.05 -99.495 -100.05 -101.469 -7 ,26057 ,KEBNE ,16708646,Fri Nov 26 18:38:18 CET,Fri Nov 26 20:10:09 CET,0.0 0.962 1.184 1.348 1.483 1.587 1.666 1.722 1.796 1.812 1.819 1.804 1.827 1.828 1.814 1.799 1.779 1.762 1.714 1.663 1.617 1.578 1.521 1.417 1.287 1.157 1.017 0.878 0.684 0.472 0.245 -0.049 -0.349 -0.649 -1.0 -1.416 -1.833 -2.314 -2.894 -3.551 -4.255 -5.114 -6.238 -7.491 -9.109 -11.094 -13.667 -16.892 -21.165 -27.203 -36.273 -45.829 -52.849 -58.281 -62.615 -66.328 -69.435 -72.085 -74.252 -76.304 -78.002 -79.475 -80.836 -82.076 -83.186 -84.18 -85.205 -86.102 -86.855 -87.605 -88.372 -89.002 -89.646 -90.288 -90.769 -91.271 -91.776 -92.296 -92.841 -93.194 -93.549 -94.105 -94.473 -94.864 -95.071 -95.487 -95.915 -96.352 -96.578 -96.924 -97.26 -97.514 -97.774 -98.319 -98.62 -98.94 -99.277 -99.638 -100.062 -100.663 -102.498 -8 ,2093 ,KEBNE ,16708647,Fri Nov 26 18:38:19 CET,Fri Nov 26 20:10:21 CET,0.0 0.97 1.198 1.343 1.445 1.521 1.581 1.634 1.697 1.716 1.727 1.711 1.741 1.745 1.73 1.701 1.672 1.656 1.619 1.57 1.476 1.411 1.351 1.264 1.161 1.049 0.917 0.767 0.559 0.356 0.153 -0.093 -0.351 -0.65 -0.993 -1.387 -1.82 -2.332 -2.921 -3.59 -4.353 -5.283 -6.44 -7.719 -9.339 -11.384 -14.046 -17.315 -21.629 -27.56 -36.473 -46.082 -53.245 -58.807 -63.239 -66.952 -70.029 -72.696 -74.899 -77.001 -78.75 -80.268 -81.638 -82.869 -83.988 -84.98 -85.984 -86.866 -87.621 -88.386 -89.164 -89.795 -90.435 -91.096 -91.599 -92.1 -92.601 -93.116 -93.647 -94.012 -94.381 -94.942 -95.32 -95.701 -95.895 -96.295 -96.711 -97.143 -97.362 -97.704 -98.021 -98.246 -98.498 -99.005 -99.278 -99.588 -99.913 -100.294 -100.701 -101.158 -102.343 -9 ,17611 ,KEBNE ,16708648,Fri Nov 26 18:38:19 CET,Fri Nov 26 20:10:05 CET,0.0 1.007 1.282 1.446 1.589 1.693 1.774 1.85 1.937 1.961 1.98 1.987 2.016 2.018 2.007 1.99 1.96 1.942 1.911 1.869 1.779 1.715 1.65 1.548 1.445 1.331 1.204 1.086 0.927 0.753 0.569 0.315 0.042 -0.234 -0.566 -0.963 -1.377 -1.892 -2.511 -3.197 -3.962 -4.902 -6.084 -7.362 -8.98 -11.001 -13.581 -16.887 -21.35 -27.476 -36.515 -45.909 -52.872 -58.404 -62.828 -66.502 -69.546 -72.198 -74.369 -76.412 -78.109 -79.601 -80.991 -82.252 -83.372 -84.375 -85.401 -86.286 -87.04 -87.805 -88.58 -89.209 -89.846 -90.487 -90.979 -91.487 -91.998 -92.525 -93.071 -93.437 -93.806 -94.375 -94.762 -95.155 -95.357 -95.766 -96.184 -96.618 -96.841 -97.198 -97.557 -97.804 -98.062 -98.625 -98.923 -99.232 -99.543 -99.889 -100.334 -100.896 -102.455 -10 ,15980 ,KEBNE ,16708649,Fri Nov 26 18:38:19 CET,Fri Nov 26 20:11:18 CET,0.0 0.864 1.136 1.297 1.4 1.474 1.545 1.615 1.712 1.736 1.76 1.774 1.807 1.815 1.814 1.797 1.767 1.748 1.707 1.673 1.613 1.558 1.497 1.4 1.297 1.185 1.059 0.932 0.768 0.581 0.377 0.115 -0.161 -0.441 -0.778 -1.171 -1.57 -2.058 -2.622 -3.267 -4.011 -4.907 -6.058 -7.326 -8.902 -10.847 -13.389 -16.615 -20.892 -26.9 -35.886 -45.33 -52.334 -57.796 -62.209 -65.92 -68.946 -71.515 -73.638 -75.704 -77.438 -78.905 -80.255 -81.515 -82.644 -83.651 -84.679 -85.564 -86.314 -87.081 -87.857 -88.484 -89.125 -89.776 -90.274 -90.787 -91.3 -91.818 -92.343 -92.695 -93.055 -93.614 -93.997 -94.384 -94.58 -94.993 -95.418 -95.851 -96.081 -96.441 -96.796 -97.047 -97.313 -97.852 -98.141 -98.46 -98.806 -99.184 -99.62 -100.198 -101.924 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_164.txt deleted file mode 100644 index cd4d926b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19352 ,KEBNE ,17126033,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:48:22 CET,0.0 0.868 1.124 1.342 1.474 1.56 1.635 1.698 1.794 1.832 1.858 1.875 1.908 1.919 1.941 1.954 1.941 1.93 1.899 1.874 1.856 1.835 1.812 1.776 1.715 1.632 1.55 1.469 1.368 1.241 1.08 0.884 0.681 0.459 0.18 -0.154 -0.495 -0.906 -1.381 -1.904 -2.496 -3.196 -4.098 -5.13 -6.443 -8.083 -10.233 -12.95 -16.583 -21.65 -29.216 -37.237 -43.153 -47.718 -51.383 -54.492 -57.063 -59.287 -61.125 -62.892 -64.365 -65.632 -66.797 -67.858 -68.815 -69.677 -70.567 -71.342 -71.985 -72.639 -73.306 -73.835 -74.363 -74.905 -75.33 -75.763 -76.206 -76.665 -77.115 -77.415 -77.733 -78.223 -78.559 -78.909 -79.086 -79.438 -79.806 -80.204 -80.413 -80.73 -81.06 -81.277 -81.499 -81.973 -82.228 -82.497 -82.779 -83.089 -83.463 -83.947 -85.191 -2 ,30083 ,KEBNE ,17126034,Thu Dec 30 18:13:16 CET,Thu Dec 30 19:47:52 CET,0.0 0.956 1.214 1.404 1.539 1.615 1.676 1.737 1.831 1.864 1.894 1.911 1.942 1.949 1.945 1.926 1.905 1.896 1.88 1.85 1.793 1.748 1.696 1.609 1.518 1.431 1.344 1.249 1.114 0.977 0.836 0.653 0.455 0.238 -0.024 -0.326 -0.642 -1.02 -1.476 -2.027 -2.659 -3.41 -4.368 -5.408 -6.743 -8.407 -10.52 -13.228 -16.887 -21.982 -29.574 -37.597 -43.524 -48.138 -51.82 -54.936 -57.504 -59.686 -61.486 -63.21 -64.63 -65.86 -67.006 -68.059 -69.02 -69.892 -70.772 -71.522 -72.165 -72.815 -73.464 -73.997 -74.568 -75.158 -75.589 -76.014 -76.451 -76.895 -77.348 -77.661 -77.969 -78.438 -78.77 -79.12 -79.295 -79.641 -80.01 -80.392 -80.579 -80.87 -81.16 -81.371 -81.599 -82.099 -82.36 -82.648 -82.979 -83.317 -83.685 -84.142 -85.189 -3 ,18228 ,KEBNE ,17126035,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:48:32 CET,0.0 0.789 1.026 1.215 1.357 1.474 1.575 1.657 1.775 1.82 1.858 1.89 1.922 1.941 1.96 1.961 1.964 1.96 1.939 1.912 1.862 1.823 1.775 1.694 1.613 1.532 1.456 1.381 1.287 1.185 1.059 0.872 0.662 0.46 0.217 -0.114 -0.485 -0.921 -1.42 -2.003 -2.651 -3.428 -4.373 -5.401 -6.745 -8.355 -10.475 -13.216 -16.892 -21.948 -29.452 -37.458 -43.388 -48.003 -51.692 -54.76 -57.286 -59.488 -61.315 -63.035 -64.457 -65.697 -66.832 -67.863 -68.804 -69.642 -70.496 -71.246 -71.863 -72.501 -73.178 -73.73 -74.288 -74.842 -75.258 -75.675 -76.103 -76.546 -77.002 -77.314 -77.639 -78.122 -78.438 -78.768 -78.939 -79.308 -79.686 -80.075 -80.284 -80.595 -80.931 -81.158 -81.383 -81.876 -82.156 -82.463 -82.788 -83.134 -83.544 -84.096 -85.309 -4 ,8116 ,KEBNE ,17126036,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:48:00 CET,0.0 0.801 1.047 1.222 1.356 1.472 1.569 1.639 1.767 1.822 1.865 1.909 1.955 1.982 2.028 2.063 2.086 2.092 2.104 2.096 2.055 2.022 1.985 1.921 1.857 1.791 1.704 1.599 1.452 1.298 1.136 0.933 0.719 0.498 0.238 -0.073 -0.396 -0.778 -1.196 -1.682 -2.278 -3.031 -3.948 -4.951 -6.294 -7.913 -10.011 -12.712 -16.316 -21.358 -28.925 -36.889 -42.83 -47.48 -51.167 -54.266 -56.815 -59.009 -60.833 -62.581 -64.008 -65.238 -66.403 -67.458 -68.391 -69.256 -70.154 -70.924 -71.571 -72.217 -72.871 -73.405 -73.95 -74.507 -74.944 -75.399 -75.859 -76.31 -76.752 -77.064 -77.382 -77.858 -78.188 -78.521 -78.697 -79.067 -79.438 -79.831 -80.036 -80.339 -80.642 -80.848 -81.058 -81.493 -81.729 -81.983 -82.259 -82.59 -82.947 -83.376 -84.168 -5 ,17309 ,KEBNE ,17126037,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:49:30 CET,0.0 0.615 0.822 0.937 1.015 1.088 1.171 1.233 1.327 1.372 1.412 1.452 1.5 1.521 1.538 1.548 1.553 1.548 1.531 1.506 1.453 1.417 1.377 1.314 1.247 1.169 1.08 0.973 0.825 0.681 0.528 0.317 0.095 -0.121 -0.377 -0.683 -1.027 -1.452 -1.943 -2.502 -3.132 -3.884 -4.837 -5.89 -7.239 -8.893 -10.965 -13.668 -17.376 -22.461 -29.969 -37.939 -43.868 -48.492 -52.183 -55.284 -57.823 -60.013 -61.843 -63.593 -65.044 -66.298 -67.433 -68.469 -69.421 -70.283 -71.158 -71.914 -72.559 -73.199 -73.841 -74.368 -74.899 -75.441 -75.861 -76.304 -76.758 -77.208 -77.663 -77.976 -78.297 -78.78 -79.099 -79.426 -79.601 -79.95 -80.306 -80.673 -80.86 -81.157 -81.477 -81.709 -81.944 -82.433 -82.69 -82.971 -83.296 -83.647 -84.064 -84.541 -85.61 -6 ,12459 ,KEBNE ,17126038,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:48:42 CET,0.0 0.801 0.998 1.152 1.276 1.371 1.451 1.509 1.598 1.634 1.658 1.694 1.735 1.744 1.777 1.802 1.809 1.812 1.807 1.786 1.751 1.726 1.693 1.64 1.582 1.52 1.45 1.363 1.232 1.095 0.94 0.746 0.546 0.329 0.062 -0.248 -0.574 -0.963 -1.405 -1.927 -2.535 -3.279 -4.221 -5.276 -6.588 -8.221 -10.361 -13.076 -16.715 -21.815 -29.48 -37.483 -43.359 -47.956 -51.621 -54.719 -57.296 -59.475 -61.28 -63.029 -64.47 -65.707 -66.854 -67.916 -68.864 -69.707 -70.568 -71.319 -71.949 -72.586 -73.248 -73.8 -74.356 -74.916 -75.355 -75.798 -76.239 -76.691 -77.155 -77.46 -77.771 -78.269 -78.608 -78.96 -79.145 -79.507 -79.874 -80.261 -80.457 -80.753 -81.078 -81.319 -81.571 -82.084 -82.339 -82.615 -82.919 -83.237 -83.609 -84.073 -85.145 -7 ,3059 ,KEBNE ,17126039,Thu Dec 30 18:13:16 CET,Thu Dec 30 19:48:41 CET,0.0 0.845 1.113 1.275 1.411 1.51 1.573 1.636 1.757 1.789 1.819 1.859 1.897 1.913 1.944 1.96 1.959 1.956 1.954 1.929 1.867 1.825 1.782 1.718 1.642 1.565 1.49 1.405 1.263 1.105 0.952 0.752 0.527 0.3 0.014 -0.35 -0.716 -1.116 -1.586 -2.137 -2.734 -3.481 -4.427 -5.463 -6.795 -8.449 -10.625 -13.356 -16.949 -21.945 -29.501 -37.456 -43.331 -47.92 -51.589 -54.675 -57.219 -59.394 -61.208 -62.951 -64.403 -65.666 -66.826 -67.897 -68.856 -69.689 -70.535 -71.276 -71.89 -72.51 -73.154 -73.679 -74.221 -74.788 -75.214 -75.639 -76.08 -76.525 -76.969 -77.274 -77.583 -78.062 -78.393 -78.736 -78.913 -79.277 -79.653 -80.035 -80.229 -80.532 -80.855 -81.086 -81.318 -81.807 -82.07 -82.346 -82.64 -82.968 -83.37 -83.891 -85.137 -8 ,19020 ,KEBNE ,17126040,Thu Dec 30 18:13:16 CET,Thu Dec 30 19:49:53 CET,0.0 0.568 0.805 0.969 1.109 1.211 1.284 1.348 1.445 1.486 1.511 1.522 1.558 1.571 1.597 1.607 1.599 1.596 1.589 1.573 1.521 1.48 1.448 1.393 1.335 1.264 1.157 1.039 0.893 0.741 0.574 0.356 0.136 -0.073 -0.339 -0.691 -1.028 -1.411 -1.886 -2.449 -3.098 -3.842 -4.751 -5.753 -7.087 -8.755 -10.881 -13.644 -17.342 -22.447 -30.068 -38.154 -44.125 -48.783 -52.533 -55.657 -58.219 -60.423 -62.25 -64.007 -65.435 -66.637 -67.767 -68.828 -69.781 -70.631 -71.495 -72.226 -72.838 -73.47 -74.126 -74.672 -75.223 -75.777 -76.199 -76.618 -77.051 -77.505 -77.967 -78.273 -78.577 -79.054 -79.387 -79.745 -79.923 -80.262 -80.622 -81.012 -81.219 -81.528 -81.851 -82.066 -82.28 -82.737 -82.99 -83.264 -83.559 -83.912 -84.304 -84.806 -86.081 -9 ,8103 ,KEBNE ,17126041,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:48:09 CET,0.0 0.754 0.99 1.164 1.287 1.377 1.459 1.534 1.65 1.687 1.714 1.731 1.768 1.777 1.817 1.862 1.881 1.882 1.876 1.849 1.793 1.753 1.704 1.62 1.539 1.459 1.377 1.297 1.194 1.081 0.949 0.758 0.549 0.334 0.06 -0.276 -0.634 -1.057 -1.526 -2.045 -2.631 -3.388 -4.382 -5.444 -6.772 -8.452 -10.656 -13.414 -17.017 -22.042 -29.546 -37.429 -43.346 -47.936 -51.593 -54.668 -57.179 -59.346 -61.154 -62.894 -64.329 -65.556 -66.711 -67.775 -68.734 -69.58 -70.426 -71.157 -71.78 -72.414 -73.063 -73.599 -74.145 -74.716 -75.15 -75.579 -76.013 -76.454 -76.902 -77.214 -77.526 -77.998 -78.337 -78.693 -78.873 -79.227 -79.582 -79.97 -80.177 -80.491 -80.814 -81.03 -81.264 -81.765 -82.02 -82.289 -82.596 -82.934 -83.325 -83.849 -85.051 -10 ,14500 ,KEBNE ,17126042,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:48:32 CET,0.0 0.813 1.095 1.271 1.38 1.466 1.541 1.599 1.682 1.714 1.741 1.766 1.809 1.824 1.831 1.824 1.804 1.79 1.758 1.718 1.655 1.61 1.569 1.519 1.454 1.366 1.268 1.165 1.021 0.88 0.756 0.589 0.386 0.178 -0.079 -0.392 -0.717 -1.097 -1.566 -2.133 -2.773 -3.55 -4.508 -5.559 -6.917 -8.589 -10.693 -13.383 -17.091 -22.219 -29.833 -37.83 -43.714 -48.315 -51.999 -55.106 -57.717 -59.973 -61.805 -63.544 -64.997 -66.257 -67.412 -68.476 -69.455 -70.321 -71.208 -71.972 -72.609 -73.262 -73.941 -74.498 -75.052 -75.589 -75.997 -76.426 -76.859 -77.307 -77.771 -78.089 -78.406 -78.889 -79.231 -79.578 -79.753 -80.118 -80.493 -80.883 -81.089 -81.398 -81.704 -81.919 -82.14 -82.595 -82.841 -83.102 -83.395 -83.744 -84.134 -84.571 -85.516 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_215.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_215.txt deleted file mode 100644 index 626996fe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_215.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27736 ,TETRA ,17667966,Fri Dec 3 06:12:44 CET,Fri Dec 3 07:59:23 CET,0.0 1.412 1.801 2.052 2.264 2.408 2.537 2.665 2.861 2.946 3.026 3.121 3.184 3.233 3.319 3.38 3.415 3.426 3.455 3.48 3.501 3.512 3.522 3.515 3.487 3.444 3.394 3.34 3.266 3.201 3.122 2.999 2.862 2.704 2.512 2.298 2.067 1.764 1.39 0.968 0.477 -0.122 -0.887 -1.756 -2.858 -4.266 -6.132 -8.547 -11.874 -16.418 -23.262 -30.652 -36.28 -40.815 -44.36 -47.31 -49.77 -51.86 -53.61 -55.302 -56.687 -57.898 -59.042 -60.079 -60.999 -61.818 -62.665 -63.388 -63.998 -64.646 -65.295 -65.813 -66.339 -66.869 -67.274 -67.685 -68.113 -68.554 -69.01 -69.317 -69.63 -70.122 -70.454 -70.796 -70.971 -71.326 -71.689 -72.072 -72.261 -72.548 -72.844 -73.053 -73.273 -73.716 -73.938 -74.184 -74.452 -74.76 -75.158 -75.705 -77.128 -2 ,24888 ,TETRA ,17667967,Fri Dec 3 06:12:47 CET,Fri Dec 3 07:59:08 CET,0.0 1.134 1.44 1.665 1.84 2.007 2.145 2.24 2.413 2.484 2.527 2.592 2.647 2.682 2.749 2.816 2.863 2.882 2.91 2.918 2.929 2.922 2.9 2.891 2.891 2.855 2.803 2.765 2.705 2.622 2.527 2.393 2.259 2.114 1.915 1.661 1.406 1.105 0.746 0.341 -0.126 -0.72 -1.483 -2.363 -3.483 -4.888 -6.757 -9.17 -12.465 -17.042 -23.904 -31.287 -36.93 -41.382 -44.941 -47.922 -50.402 -52.526 -54.311 -56.058 -57.505 -58.752 -59.896 -60.915 -61.823 -62.657 -63.514 -64.248 -64.879 -65.539 -66.197 -66.722 -67.264 -67.821 -68.244 -68.67 -69.097 -69.521 -69.962 -70.277 -70.595 -71.063 -71.388 -71.728 -71.897 -72.235 -72.588 -72.95 -73.142 -73.45 -73.771 -73.983 -74.202 -74.641 -74.876 -75.135 -75.432 -75.748 -76.077 -76.506 -77.879 -3 ,11482 ,TETRA ,17667968,Fri Dec 3 06:12:49 CET,Fri Dec 3 07:58:50 CET,0.0 1.033 1.35 1.584 1.759 1.898 2.021 2.124 2.284 2.356 2.437 2.554 2.621 2.665 2.732 2.789 2.84 2.866 2.906 2.919 2.918 2.923 2.929 2.926 2.907 2.879 2.86 2.831 2.772 2.7 2.618 2.512 2.386 2.235 2.021 1.759 1.492 1.185 0.832 0.415 -0.058 -0.65 -1.438 -2.311 -3.46 -4.921 -6.797 -9.224 -12.48 -16.993 -23.9 -31.351 -36.884 -41.217 -44.736 -47.734 -50.214 -52.362 -54.157 -55.888 -57.339 -58.579 -59.707 -60.732 -61.64 -62.44 -63.267 -63.998 -64.614 -65.255 -65.919 -66.453 -66.985 -67.517 -67.923 -68.338 -68.773 -69.225 -69.694 -70.012 -70.333 -70.83 -71.173 -71.525 -71.701 -72.058 -72.43 -72.819 -73.007 -73.299 -73.636 -73.855 -74.079 -74.568 -74.821 -75.079 -75.347 -75.644 -75.982 -76.39 -77.144 -4 ,6424 ,TETRA ,17667969,Fri Dec 3 06:12:43 CET,Fri Dec 3 08:02:35 CET,0.0 1.657 2.058 2.306 2.493 2.649 2.794 2.936 3.163 3.247 3.311 3.399 3.481 3.537 3.624 3.686 3.722 3.736 3.763 3.784 3.798 3.81 3.817 3.808 3.787 3.748 3.7 3.665 3.596 3.489 3.372 3.239 3.106 2.95 2.765 2.558 2.332 2.029 1.676 1.257 0.77 0.151 -0.656 -1.552 -2.719 -4.127 -5.93 -8.248 -11.462 -15.968 -22.75 -30.174 -35.769 -40.206 -43.753 -46.715 -49.237 -51.394 -53.159 -54.86 -56.278 -57.512 -58.659 -59.702 -60.63 -61.462 -62.311 -63.067 -63.701 -64.345 -65.008 -65.543 -66.076 -66.627 -67.061 -67.495 -67.925 -68.358 -68.808 -69.116 -69.423 -69.918 -70.267 -70.614 -70.782 -71.124 -71.476 -71.827 -72.012 -72.304 -72.599 -72.798 -73.016 -73.481 -73.745 -74.038 -74.331 -74.652 -75.038 -75.558 -76.925 -5 ,27662 ,TETRA ,17667970,Fri Dec 3 06:12:44 CET,Fri Dec 3 08:02:32 CET,0.0 1.343 1.693 1.946 2.146 2.304 2.443 2.569 2.762 2.838 2.906 3.002 3.064 3.101 3.173 3.229 3.284 3.309 3.34 3.363 3.38 3.377 3.371 3.357 3.335 3.305 3.271 3.226 3.156 3.092 3.01 2.891 2.757 2.61 2.446 2.24 1.976 1.63 1.244 0.818 0.353 -0.204 -0.986 -1.864 -2.926 -4.307 -6.173 -8.514 -11.699 -16.227 -23.168 -30.616 -36.22 -40.717 -44.288 -47.239 -49.71 -51.858 -53.632 -55.348 -56.782 -58.039 -59.208 -60.254 -61.188 -62.039 -62.902 -63.651 -64.291 -64.946 -65.603 -66.134 -66.684 -67.232 -67.637 -68.05 -68.487 -68.937 -69.384 -69.683 -69.994 -70.474 -70.8 -71.144 -71.319 -71.689 -72.072 -72.467 -72.663 -72.958 -73.263 -73.476 -73.703 -74.188 -74.444 -74.707 -75.009 -75.354 -75.754 -76.261 -77.585 -6 ,16760 ,TETRA ,17667971,Fri Dec 3 06:12:43 CET,Fri Dec 3 08:00:29 CET,0.0 1.099 1.457 1.684 1.863 2.008 2.125 2.219 2.364 2.437 2.506 2.597 2.661 2.702 2.777 2.834 2.881 2.896 2.925 2.953 2.975 2.978 2.967 2.953 2.941 2.905 2.852 2.8 2.754 2.702 2.615 2.479 2.348 2.208 2.022 1.794 1.543 1.229 0.863 0.44 -0.05 -0.684 -1.516 -2.4 -3.5 -4.898 -6.765 -9.076 -12.178 -16.666 -23.668 -31.179 -36.724 -41.15 -44.739 -47.772 -50.242 -52.324 -54.071 -55.735 -57.106 -58.332 -59.482 -60.552 -61.517 -62.335 -63.159 -63.895 -64.53 -65.169 -65.815 -66.329 -66.856 -67.404 -67.815 -68.226 -68.64 -69.074 -69.52 -69.82 -70.13 -70.595 -70.913 -71.246 -71.413 -71.75 -72.092 -72.465 -72.662 -72.962 -73.267 -73.481 -73.707 -74.183 -74.436 -74.715 -75.004 -75.308 -75.658 -76.064 -77.074 -7 ,15476 ,TETRA ,17667972,Fri Dec 3 06:12:44 CET,Fri Dec 3 07:59:21 CET,0.0 1.04 1.35 1.6 1.798 1.925 2.042 2.14 2.287 2.342 2.391 2.46 2.518 2.558 2.611 2.652 2.683 2.697 2.718 2.725 2.729 2.737 2.749 2.738 2.718 2.69 2.652 2.624 2.574 2.498 2.42 2.306 2.161 2.023 1.853 1.633 1.392 1.068 0.713 0.318 -0.153 -0.726 -1.497 -2.358 -3.477 -4.88 -6.765 -9.221 -12.48 -16.949 -23.778 -31.219 -36.818 -41.245 -44.798 -47.779 -50.244 -52.377 -54.14 -55.857 -57.282 -58.505 -59.645 -60.683 -61.62 -62.448 -63.292 -64.029 -64.645 -65.267 -65.902 -66.427 -66.967 -67.525 -67.962 -68.416 -68.871 -69.323 -69.79 -70.111 -70.434 -70.943 -71.289 -71.628 -71.803 -72.155 -72.512 -72.891 -73.087 -73.377 -73.649 -73.857 -74.087 -74.564 -74.815 -75.086 -75.387 -75.748 -76.177 -76.635 -77.492 -8 ,31293 ,TETRA ,17667973,Fri Dec 3 06:12:46 CET,Fri Dec 3 07:59:04 CET,0.0 1.42 1.754 1.995 2.229 2.395 2.516 2.631 2.829 2.898 2.954 3.056 3.124 3.176 3.272 3.335 3.379 3.391 3.405 3.428 3.458 3.467 3.46 3.45 3.439 3.409 3.363 3.32 3.256 3.185 3.113 2.991 2.867 2.741 2.552 2.302 2.033 1.732 1.383 0.967 0.495 -0.1 -0.854 -1.717 -2.871 -4.3 -6.152 -8.519 -11.732 -16.223 -23.016 -30.363 -35.929 -40.364 -43.898 -46.88 -49.375 -51.475 -53.208 -54.89 -56.285 -57.489 -58.594 -59.591 -60.507 -61.344 -62.206 -62.958 -63.59 -64.24 -64.905 -65.429 -65.965 -66.534 -66.961 -67.384 -67.82 -68.263 -68.71 -69.01 -69.316 -69.779 -70.09 -70.405 -70.579 -70.937 -71.286 -71.645 -71.827 -72.103 -72.39 -72.59 -72.805 -73.298 -73.552 -73.817 -74.136 -74.493 -74.876 -75.36 -76.986 -9 ,3736 ,TETRA ,17667974,Fri Dec 3 06:12:43 CET,Fri Dec 3 07:59:18 CET,0.0 1.502 1.877 2.111 2.281 2.446 2.579 2.679 2.878 2.97 3.045 3.171 3.259 3.316 3.389 3.439 3.486 3.506 3.541 3.569 3.605 3.62 3.628 3.627 3.604 3.563 3.507 3.45 3.379 3.306 3.223 3.118 2.998 2.853 2.657 2.406 2.157 1.873 1.53 1.1 0.589 -0.039 -0.829 -1.713 -2.871 -4.27 -6.043 -8.335 -11.567 -16.242 -23.238 -30.551 -36.061 -40.505 -44.081 -47.047 -49.489 -51.622 -53.393 -55.1 -56.525 -57.751 -58.9 -59.944 -60.882 -61.733 -62.598 -63.332 -63.949 -64.589 -65.247 -65.788 -66.337 -66.897 -67.32 -67.747 -68.179 -68.628 -69.091 -69.405 -69.732 -70.225 -70.571 -70.929 -71.104 -71.457 -71.815 -72.179 -72.368 -72.669 -73.01 -73.234 -73.453 -73.957 -74.241 -74.514 -74.799 -75.142 -75.523 -76.034 -77.594 -10 ,20401 ,TETRA ,17667975,Fri Dec 3 06:12:43 CET,Fri Dec 3 07:59:41 CET,0.0 1.636 1.997 2.237 2.444 2.601 2.715 2.826 3.016 3.1 3.174 3.278 3.354 3.409 3.493 3.566 3.623 3.64 3.675 3.705 3.733 3.738 3.723 3.697 3.681 3.654 3.615 3.568 3.492 3.415 3.334 3.215 3.078 2.933 2.745 2.5 2.246 1.912 1.549 1.159 0.655 0.026 -0.752 -1.596 -2.689 -4.089 -5.885 -8.155 -11.359 -15.916 -22.83 -30.359 -36.002 -40.424 -43.95 -46.883 -49.281 -51.346 -53.085 -54.791 -56.226 -57.48 -58.647 -59.708 -60.655 -61.501 -62.36 -63.098 -63.722 -64.359 -65.02 -65.555 -66.086 -66.634 -67.061 -67.485 -67.911 -68.34 -68.78 -69.084 -69.389 -69.854 -70.181 -70.514 -70.677 -71.016 -71.371 -71.737 -71.923 -72.207 -72.504 -72.726 -72.949 -73.413 -73.668 -73.94 -74.239 -74.584 -74.973 -75.442 -77.005 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_235.txt deleted file mode 100644 index 4d26b2c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21363 ,KEBNE ,17126043,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:49:35 CET,0.0 1.304 1.813 2.179 2.477 2.761 3.021 3.249 3.677 3.882 4.076 4.429 4.621 4.796 5.139 5.451 5.76 5.917 6.214 6.492 6.909 7.182 7.445 7.849 8.249 8.622 8.986 9.338 9.796 10.248 10.684 11.22 11.76 12.287 12.884 13.56 14.214 14.979 15.826 16.741 17.745 18.874 20.193 21.557 23.196 25.057 27.297 29.914 32.989 36.762 41.686 46.148 48.951 50.819 52.101 53.067 53.817 54.401 54.793 55.081 55.283 55.412 55.513 55.595 55.638 55.674 55.705 55.703 55.677 55.645 55.608 55.573 55.527 55.467 55.408 55.347 55.277 55.188 55.086 55.006 54.925 54.775 54.672 54.58 54.528 54.403 54.264 54.126 54.051 53.98 53.736 53.629 53.518 53.276 53.137 52.991 52.809 52.58 52.306 51.876 50.894 -2 ,30965 ,KEBNE ,17126044,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:47:51 CET,0.0 1.81 2.284 2.69 3.043 3.328 3.581 3.828 4.284 4.489 4.685 5.047 5.248 5.423 5.754 6.078 6.395 6.547 6.834 7.115 7.514 7.775 8.043 8.436 8.812 9.182 9.539 9.891 10.368 10.835 11.275 11.796 12.322 12.846 13.445 14.107 14.77 15.532 16.375 17.274 18.208 19.297 20.63 21.969 23.541 25.366 27.537 30.078 33.162 36.97 41.772 45.916 48.511 50.275 51.511 52.426 53.119 53.632 53.988 54.291 54.531 54.709 54.816 54.876 54.927 54.951 54.954 54.956 54.951 54.941 54.914 54.88 54.833 54.769 54.705 54.629 54.557 54.469 54.365 54.297 54.227 54.095 53.981 53.869 53.819 53.695 53.543 53.391 53.318 53.274 53.042 52.929 52.813 52.578 52.446 52.281 52.087 51.864 51.576 51.166 49.271 -3 ,28764 ,KEBNE ,17126045,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:47:50 CET,0.0 1.521 2.066 2.447 2.751 3.03 3.279 3.521 3.978 4.176 4.376 4.743 4.949 5.126 5.437 5.738 6.044 6.2 6.492 6.769 7.184 7.46 7.725 8.103 8.479 8.84 9.191 9.545 10.01 10.453 10.897 11.449 11.971 12.478 13.064 13.731 14.389 15.14 15.978 16.87 17.84 18.946 20.213 21.516 23.117 24.964 27.117 29.613 32.753 36.707 41.549 45.785 48.579 50.467 51.807 52.814 53.525 54.053 54.438 54.753 54.978 55.132 55.254 55.354 55.428 55.474 55.486 55.5 55.51 55.488 55.446 55.402 55.354 55.305 55.259 55.199 55.143 55.074 54.982 54.917 54.848 54.743 54.67 54.58 54.525 54.412 54.299 54.171 54.096 54.045 53.822 53.723 53.622 53.393 53.266 53.123 52.956 52.754 52.488 52.113 50.888 -4 ,9715 ,KEBNE ,17126046,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:49:16 CET,0.0 1.915 2.398 2.767 3.078 3.357 3.616 3.859 4.291 4.506 4.706 5.043 5.236 5.409 5.726 6.029 6.329 6.484 6.794 7.085 7.509 7.78 8.043 8.427 8.803 9.175 9.537 9.896 10.36 10.81 11.25 11.779 12.288 12.777 13.382 14.098 14.794 15.556 16.392 17.305 18.259 19.344 20.652 21.963 23.519 25.329 27.48 30.072 33.253 37.221 42.395 46.819 49.557 51.494 52.892 53.918 54.621 55.112 55.447 55.77 56.027 56.186 56.308 56.402 56.449 56.488 56.532 56.548 56.54 56.508 56.467 56.433 56.393 56.34 56.279 56.218 56.143 56.044 55.955 55.89 55.828 55.734 55.656 55.562 55.509 55.406 55.291 55.166 55.088 55.034 54.839 54.749 54.637 54.325 54.16 53.998 53.798 53.542 53.229 52.786 50.93 -5 ,19134 ,KEBNE ,17126047,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:47:36 CET,0.0 1.586 2.03 2.371 2.681 2.966 3.223 3.464 3.916 4.122 4.321 4.682 4.879 5.052 5.397 5.728 6.04 6.186 6.482 6.776 7.194 7.466 7.732 8.123 8.514 8.893 9.269 9.64 10.107 10.555 10.986 11.514 12.035 12.531 13.126 13.827 14.483 15.202 16.029 16.92 17.867 18.963 20.27 21.62 23.212 25.032 27.215 29.792 33.009 37.062 42.249 46.817 49.593 51.439 52.768 53.766 54.467 54.992 55.386 55.721 55.955 56.127 56.255 56.343 56.395 56.438 56.481 56.488 56.487 56.484 56.46 56.428 56.382 56.329 56.284 56.222 56.142 56.06 55.968 55.892 55.816 55.69 55.601 55.506 55.445 55.306 55.172 55.016 54.925 54.869 54.641 54.527 54.395 54.091 53.919 53.717 53.49 53.232 52.926 52.478 51.181 -6 ,15535 ,KEBNE ,17126048,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:48:08 CET,0.0 1.083 1.589 1.977 2.298 2.578 2.817 3.043 3.481 3.682 3.883 4.247 4.44 4.621 4.968 5.292 5.606 5.759 6.046 6.324 6.745 7.016 7.273 7.644 8.009 8.389 8.76 9.119 9.59 10.038 10.466 10.997 11.505 12.001 12.609 13.316 14.006 14.76 15.582 16.479 17.431 18.504 19.793 21.114 22.704 24.571 26.802 29.366 32.43 36.273 41.32 45.792 48.554 50.373 51.629 52.54 53.195 53.707 54.097 54.433 54.639 54.761 54.868 54.958 55.025 55.073 55.1 55.094 55.084 55.077 55.047 55.0 54.947 54.898 54.849 54.784 54.718 54.64 54.549 54.484 54.411 54.292 54.214 54.126 54.072 53.95 53.812 53.65 53.56 53.502 53.269 53.161 53.047 52.769 52.606 52.425 52.224 51.962 51.656 51.215 49.489 -7 ,11363 ,KEBNE ,17126049,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:49:30 CET,0.0 1.458 1.91 2.279 2.599 2.863 3.119 3.367 3.796 4.001 4.201 4.567 4.769 4.946 5.283 5.599 5.922 6.079 6.371 6.656 7.082 7.368 7.639 8.023 8.397 8.768 9.141 9.501 9.963 10.414 10.844 11.376 11.905 12.422 13.014 13.687 14.356 15.079 15.859 16.738 17.693 18.78 20.093 21.433 23.015 24.837 27.002 29.607 32.786 36.716 41.768 46.104 48.771 50.604 51.957 52.952 53.665 54.173 54.516 54.808 55.016 55.161 55.283 55.387 55.45 55.495 55.523 55.524 55.523 55.515 55.483 55.437 55.384 55.323 55.271 55.22 55.161 55.081 54.992 54.921 54.851 54.745 54.663 54.562 54.504 54.397 54.286 54.163 54.087 54.042 53.833 53.724 53.608 53.315 53.136 52.944 52.732 52.47 52.126 51.68 49.421 -8 ,4088 ,KEBNE ,17126050,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:47:36 CET,0.0 1.566 2.071 2.444 2.798 3.107 3.365 3.601 4.032 4.235 4.432 4.783 4.977 5.152 5.49 5.823 6.145 6.304 6.615 6.903 7.309 7.58 7.846 8.231 8.603 8.956 9.304 9.642 10.096 10.545 10.969 11.505 12.042 12.554 13.141 13.804 14.48 15.259 16.094 16.991 17.951 19.035 20.325 21.658 23.26 25.116 27.34 29.975 33.18 37.106 42.131 46.574 49.347 51.165 52.389 53.313 53.992 54.473 54.82 55.141 55.401 55.59 55.717 55.799 55.841 55.862 55.881 55.895 55.902 55.884 55.844 55.811 55.774 55.726 55.675 55.619 55.555 55.485 55.413 55.357 55.286 55.152 55.054 54.944 54.892 54.787 54.651 54.5 54.421 54.366 54.15 54.041 53.923 53.657 53.489 53.298 53.092 52.84 52.538 52.108 50.065 -9 ,13506 ,KEBNE ,17126051,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:47:48 CET,0.0 1.434 1.96 2.345 2.67 2.965 3.22 3.462 3.906 4.109 4.312 4.684 4.885 5.062 5.406 5.734 6.05 6.203 6.493 6.769 7.19 7.47 7.733 8.122 8.511 8.883 9.244 9.596 10.055 10.501 10.937 11.466 11.989 12.507 13.114 13.791 14.464 15.221 16.034 16.91 17.843 18.926 20.276 21.66 23.216 24.997 27.158 29.7 32.774 36.544 41.455 45.695 48.274 50.08 51.363 52.301 53.01 53.569 53.944 54.23 54.42 54.586 54.717 54.806 54.885 54.934 54.973 54.996 54.99 54.967 54.937 54.904 54.864 54.807 54.752 54.699 54.64 54.569 54.48 54.411 54.341 54.229 54.139 54.043 53.995 53.886 53.777 53.65 53.579 53.535 53.329 53.233 53.122 52.868 52.72 52.549 52.371 52.174 51.903 51.504 50.02 -10 ,5385 ,KEBNE ,17126052,Thu Dec 30 18:13:18 CET,Thu Dec 30 19:48:59 CET,0.0 1.471 1.959 2.349 2.668 2.968 3.234 3.463 3.882 4.079 4.254 4.559 4.733 4.895 5.217 5.518 5.812 5.96 6.256 6.54 6.967 7.25 7.518 7.917 8.306 8.693 9.076 9.436 9.884 10.317 10.74 11.248 11.758 12.266 12.85 13.518 14.176 14.914 15.742 16.644 17.62 18.734 20.06 21.437 23.065 24.933 27.108 29.669 32.9 36.848 41.87 46.222 48.962 50.786 52.013 52.948 53.657 54.202 54.565 54.841 55.043 55.23 55.378 55.473 55.543 55.595 55.636 55.654 55.651 55.644 55.641 55.629 55.583 55.529 55.495 55.445 55.395 55.33 55.242 55.188 55.125 55.007 54.932 54.845 54.799 54.701 54.592 54.474 54.405 54.367 54.17 54.075 53.974 53.759 53.631 53.48 53.311 53.107 52.847 52.505 51.49 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_25.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_25.txt deleted file mode 100644 index 789e3251..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_25.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22487 ,KEBNE ,16708650,Fri Nov 26 18:38:19 CET,Fri Nov 26 20:09:46 CET,0.0 1.421 1.931 2.297 2.595 2.846 3.076 3.292 3.686 3.879 4.057 4.34 4.498 4.638 4.897 5.154 5.404 5.526 5.764 5.989 6.32 6.528 6.729 7.023 7.306 7.575 7.842 8.098 8.426 8.738 9.04 9.422 9.798 10.172 10.596 11.055 11.505 12.005 12.535 13.105 13.745 14.468 15.266 16.072 17.035 18.146 19.495 21.024 22.685 24.474 26.654 28.482 29.368 29.855 30.096 30.148 30.158 30.111 30.006 29.854 29.685 29.522 29.373 29.222 29.039 28.863 28.681 28.51 28.355 28.183 27.993 27.829 27.654 27.461 27.311 27.157 26.981 26.789 26.584 26.437 26.288 26.059 25.893 25.729 25.649 25.485 25.305 25.099 24.991 24.882 24.607 24.456 24.301 23.951 23.753 23.535 23.273 22.959 22.577 22.0 19.997 -2 ,18144 ,KEBNE ,16708651,Fri Nov 26 18:38:19 CET,Fri Nov 26 20:09:49 CET,0.0 1.776 2.331 2.713 3.007 3.274 3.5 3.718 4.128 4.312 4.476 4.768 4.943 5.093 5.379 5.653 5.911 6.034 6.26 6.477 6.791 6.987 7.183 7.47 7.763 8.063 8.336 8.6 8.948 9.278 9.603 9.993 10.368 10.734 11.151 11.611 12.047 12.551 13.102 13.695 14.34 15.054 15.894 16.761 17.754 18.787 20.0 21.396 22.969 24.867 27.087 28.711 29.562 29.968 30.122 30.215 30.217 30.135 30.01 29.84 29.702 29.566 29.428 29.281 29.109 28.948 28.762 28.583 28.435 28.279 28.111 27.967 27.808 27.617 27.462 27.314 27.148 26.963 26.771 26.638 26.5 26.281 26.125 25.964 25.877 25.677 25.465 25.246 25.13 25.005 24.728 24.586 24.439 24.132 23.94 23.716 23.479 23.204 22.86 22.387 19.755 -3 ,20714 ,KEBNE ,16708652,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:10:58 CET,0.0 1.54 2.074 2.473 2.763 3.028 3.287 3.518 3.909 4.085 4.261 4.575 4.747 4.897 5.18 5.433 5.678 5.799 6.037 6.274 6.606 6.824 7.042 7.352 7.64 7.918 8.189 8.457 8.797 9.113 9.417 9.785 10.15 10.5 10.911 11.397 11.865 12.345 12.865 13.434 14.059 14.774 15.582 16.409 17.402 18.542 19.836 21.241 22.901 24.848 27.152 28.944 29.941 30.448 30.591 30.635 30.602 30.546 30.446 30.278 30.116 29.941 29.758 29.591 29.427 29.262 29.069 28.892 28.73 28.533 28.325 28.155 27.971 27.788 27.645 27.492 27.332 27.173 27.001 26.881 26.764 26.572 26.422 26.259 26.172 25.986 25.774 25.522 25.4 25.287 25.036 24.907 24.755 24.403 24.195 23.962 23.705 23.413 23.045 22.475 19.638 -4 ,17439 ,KEBNE ,16708653,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:12:40 CET,0.0 1.247 1.682 2.025 2.315 2.554 2.763 2.974 3.363 3.54 3.703 3.994 4.167 4.313 4.6 4.874 5.127 5.254 5.503 5.727 6.05 6.262 6.466 6.765 7.056 7.336 7.604 7.853 8.167 8.474 8.773 9.141 9.514 9.87 10.27 10.739 11.192 11.675 12.224 12.841 13.476 14.193 15.034 15.844 16.81 17.898 19.169 20.666 22.385 24.372 26.817 28.71 29.658 30.139 30.333 30.415 30.399 30.286 30.152 29.994 29.862 29.739 29.578 29.411 29.252 29.103 28.936 28.769 28.606 28.443 28.271 28.111 27.95 27.785 27.643 27.483 27.317 27.144 26.963 26.836 26.696 26.464 26.304 26.139 26.04 25.821 25.608 25.388 25.278 25.17 24.93 24.798 24.647 24.294 24.09 23.856 23.606 23.341 23.007 22.503 20.933 -5 ,20940 ,KEBNE ,16708654,Fri Nov 26 18:39:19 CET,Fri Nov 26 20:10:43 CET,0.0 1.523 2.011 2.368 2.66 2.895 3.109 3.312 3.677 3.853 4.03 4.342 4.512 4.657 4.933 5.212 5.472 5.595 5.826 6.044 6.359 6.569 6.774 7.058 7.347 7.629 7.899 8.178 8.532 8.846 9.155 9.552 9.947 10.32 10.737 11.211 11.669 12.157 12.688 13.254 13.869 14.598 15.456 16.326 17.347 18.529 19.909 21.436 23.213 25.231 27.56 29.268 30.074 30.477 30.666 30.736 30.744 30.698 30.583 30.442 30.293 30.129 29.963 29.794 29.63 29.445 29.242 29.063 28.9 28.732 28.548 28.383 28.222 28.059 27.916 27.761 27.6 27.431 27.248 27.109 26.962 26.751 26.607 26.435 26.339 26.143 25.952 25.756 25.645 25.524 25.238 25.082 24.919 24.56 24.342 24.102 23.829 23.534 23.198 22.688 20.884 -6 ,21368 ,KEBNE ,16708655,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:10:57 CET,0.0 2.281 2.754 3.125 3.398 3.635 3.853 4.055 4.418 4.586 4.744 5.027 5.193 5.331 5.595 5.848 6.093 6.215 6.468 6.709 7.037 7.242 7.44 7.73 8.013 8.283 8.542 8.796 9.135 9.474 9.805 10.189 10.549 10.91 11.319 11.776 12.228 12.721 13.264 13.869 14.497 15.16 15.961 16.772 17.729 18.811 20.018 21.406 23.02 25.045 27.713 29.699 30.601 31.055 31.241 31.302 31.25 31.155 31.063 30.935 30.809 30.665 30.502 30.337 30.176 30.017 29.84 29.66 29.501 29.344 29.173 29.033 28.879 28.701 28.558 28.412 28.251 28.082 27.906 27.766 27.617 27.396 27.246 27.071 26.976 26.78 26.558 26.34 26.225 26.106 25.84 25.703 25.568 25.253 25.078 24.875 24.625 24.332 23.964 23.462 21.581 -7 ,21258 ,KEBNE ,16708656,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:10:48 CET,0.0 2.845 3.293 3.6 3.89 4.159 4.386 4.597 4.985 5.173 5.357 5.663 5.823 5.953 6.205 6.449 6.69 6.806 7.031 7.254 7.585 7.806 8.016 8.313 8.597 8.877 9.144 9.391 9.726 10.056 10.369 10.765 11.162 11.546 11.987 12.452 12.883 13.37 13.913 14.506 15.145 15.872 16.736 17.62 18.616 19.693 20.928 22.321 24.053 26.037 28.193 29.934 30.868 31.285 31.446 31.539 31.537 31.453 31.337 31.193 31.062 30.921 30.769 30.617 30.472 30.332 30.164 29.993 29.836 29.675 29.487 29.335 29.177 28.993 28.852 28.702 28.548 28.384 28.197 28.066 27.936 27.736 27.587 27.414 27.328 27.161 26.96 26.746 26.634 26.529 26.285 26.144 25.988 25.641 25.446 25.222 24.968 24.694 24.389 23.937 21.561 -8 ,3964 ,KEBNE ,16708657,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:10:48 CET,0.0 1.858 2.331 2.678 2.971 3.249 3.497 3.701 4.073 4.242 4.415 4.747 4.92 5.06 5.313 5.553 5.799 5.921 6.153 6.371 6.689 6.902 7.106 7.398 7.684 7.965 8.23 8.474 8.789 9.092 9.382 9.739 10.096 10.454 10.857 11.303 11.752 12.255 12.789 13.375 14.013 14.682 15.49 16.326 17.294 18.377 19.576 20.923 22.566 24.594 27.019 28.812 29.716 30.113 30.291 30.382 30.405 30.383 30.267 30.107 29.973 29.826 29.671 29.489 29.312 29.151 28.971 28.808 28.653 28.476 28.3 28.157 27.999 27.836 27.702 27.561 27.414 27.243 27.054 26.926 26.795 26.585 26.438 26.276 26.188 26.004 25.802 25.572 25.443 25.321 25.056 24.903 24.732 24.346 24.126 23.908 23.658 23.346 22.968 22.479 20.741 -9 ,19707 ,KEBNE ,16708658,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:11:15 CET,0.0 1.664 2.221 2.606 2.902 3.196 3.466 3.707 4.121 4.309 4.482 4.775 4.947 5.102 5.389 5.663 5.916 6.034 6.263 6.486 6.82 7.023 7.214 7.501 7.78 8.052 8.316 8.569 8.907 9.237 9.554 9.946 10.324 10.674 11.087 11.573 12.037 12.552 13.128 13.732 14.365 15.093 15.923 16.739 17.672 18.753 20.056 21.576 23.424 25.481 27.797 29.655 30.675 31.222 31.505 31.607 31.563 31.459 31.329 31.172 31.015 30.854 30.682 30.508 30.327 30.148 29.954 29.774 29.624 29.461 29.276 29.13 28.985 28.829 28.705 28.565 28.408 28.24 28.046 27.91 27.773 27.564 27.421 27.261 27.175 27.006 26.831 26.626 26.52 26.411 26.169 26.04 25.888 25.533 25.342 25.129 24.883 24.602 24.248 23.77 22.015 -10 ,310 ,KEBNE ,16708659,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:10:33 CET,0.0 2.091 2.606 2.976 3.288 3.576 3.82 4.025 4.432 4.619 4.791 5.089 5.255 5.4 5.669 5.916 6.165 6.287 6.518 6.736 7.046 7.255 7.459 7.754 8.05 8.341 8.611 8.87 9.202 9.516 9.826 10.207 10.578 10.946 11.375 11.853 12.312 12.822 13.393 14.009 14.651 15.353 16.167 16.997 17.974 19.073 20.314 21.664 23.198 25.049 27.266 28.975 29.915 30.423 30.637 30.707 30.701 30.617 30.512 30.365 30.196 30.039 29.899 29.746 29.562 29.39 29.231 29.082 28.928 28.748 28.543 28.377 28.206 28.016 27.859 27.686 27.511 27.338 27.152 27.017 26.877 26.648 26.487 26.326 26.239 26.042 25.826 25.58 25.452 25.332 25.068 24.926 24.768 24.414 24.21 23.995 23.765 23.488 23.121 22.608 20.62 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_252.txt deleted file mode 100644 index 2274587d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_237_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,97 ,KEBNE ,16708660,Fri Nov 26 18:39:22 CET,Fri Nov 26 20:08:10 CET,0.0 0.857 1.04 1.124 1.159 1.174 1.172 1.15 1.071 1.022 0.956 0.801 0.748 0.678 0.537 0.379 0.192 0.09 -0.125 -0.348 -0.677 -0.905 -1.141 -1.488 -1.83 -2.174 -2.537 -2.919 -3.455 -4.002 -4.548 -5.235 -5.947 -6.68 -7.552 -8.564 -9.613 -10.839 -12.236 -13.809 -15.516 -17.543 -20.126 -22.968 -26.542 -30.811 -36.217 -43.002 -51.902 -63.979 -81.603 -99.802 -113.051 -123.354 -131.528 -138.305 -143.85 -148.56 -152.422 -156.106 -159.126 -161.706 -164.101 -166.287 -168.243 -169.976 -171.747 -173.313 -174.605 -175.884 -177.191 -178.259 -179.359 -180.474 -181.315 -182.158 -183.004 -183.874 -184.762 -185.378 -186.004 -186.931 -187.568 -188.212 -188.534 -189.197 -189.861 -190.522 -190.869 -191.464 -191.983 -192.355 -192.746 -193.594 -194.041 -194.498 -194.982 -195.508 -196.098 -196.829 -198.367 -2 ,9853 ,KEBNE ,16708661,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:12:25 CET,0.0 1.282 1.452 1.542 1.595 1.599 1.576 1.562 1.515 1.466 1.416 1.28 1.218 1.135 0.954 0.745 0.537 0.436 0.226 0.01 -0.329 -0.558 -0.794 -1.162 -1.541 -1.917 -2.296 -2.688 -3.215 -3.753 -4.287 -4.969 -5.663 -6.362 -7.229 -8.269 -9.317 -10.521 -11.927 -13.509 -15.248 -17.336 -19.944 -22.77 -26.335 -30.583 -35.956 -42.74 -51.675 -63.831 -81.491 -99.893 -113.272 -123.595 -131.765 -138.514 -144.05 -148.741 -152.597 -156.334 -159.41 -162.033 -164.428 -166.624 -168.616 -170.365 -172.131 -173.673 -174.981 -176.31 -177.659 -178.76 -179.873 -180.969 -181.802 -182.645 -183.502 -184.377 -185.273 -185.885 -186.501 -187.424 -188.045 -188.69 -189.017 -189.675 -190.342 -191.03 -191.381 -191.962 -192.485 -192.872 -193.264 -194.12 -194.573 -195.062 -195.593 -196.14 -196.747 -197.542 -200.54 -3 ,18281 ,KEBNE ,16708662,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:10:53 CET,0.0 1.388 1.613 1.707 1.771 1.818 1.833 1.831 1.775 1.736 1.686 1.549 1.509 1.442 1.299 1.135 0.969 0.892 0.722 0.539 0.235 0.017 -0.205 -0.539 -0.896 -1.284 -1.67 -2.062 -2.6 -3.154 -3.742 -4.473 -5.208 -5.927 -6.8 -7.867 -8.942 -10.164 -11.534 -13.057 -14.768 -16.829 -19.413 -22.26 -25.813 -30.099 -35.582 -42.465 -51.478 -63.604 -81.441 -99.975 -113.378 -123.685 -131.81 -138.569 -144.07 -148.75 -152.644 -156.378 -159.413 -161.99 -164.387 -166.583 -168.567 -170.34 -172.133 -173.653 -174.927 -176.238 -177.586 -178.667 -179.774 -180.914 -181.76 -182.598 -183.446 -184.31 -185.188 -185.779 -186.39 -187.328 -187.962 -188.613 -188.94 -189.605 -190.292 -190.993 -191.351 -191.947 -192.466 -192.856 -193.255 -194.077 -194.518 -195.002 -195.538 -196.136 -196.805 -197.614 -199.95 -4 ,27700 ,KEBNE ,16708663,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:12:10 CET,0.0 0.888 1.14 1.281 1.356 1.407 1.422 1.416 1.371 1.325 1.268 1.112 1.056 0.974 0.786 0.599 0.406 0.309 0.123 -0.08 -0.402 -0.619 -0.847 -1.202 -1.562 -1.931 -2.3 -2.677 -3.186 -3.7 -4.229 -4.89 -5.569 -6.288 -7.179 -8.198 -9.225 -10.443 -11.815 -13.368 -15.116 -17.189 -19.792 -22.605 -26.111 -30.297 -35.632 -42.316 -51.049 -63.073 -80.806 -99.196 -112.544 -122.817 -130.942 -137.707 -143.246 -147.951 -151.812 -155.494 -158.507 -161.083 -163.498 -165.722 -167.696 -169.434 -171.174 -172.661 -173.94 -175.237 -176.536 -177.597 -178.679 -179.766 -180.595 -181.438 -182.276 -183.135 -184.019 -184.609 -185.205 -186.108 -186.728 -187.373 -187.692 -188.331 -189.006 -189.716 -190.076 -190.678 -191.229 -191.615 -192.007 -192.833 -193.279 -193.739 -194.214 -194.738 -195.322 -196.011 -197.798 -5 ,9393 ,KEBNE ,16708664,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:12:25 CET,0.0 1.163 1.376 1.46 1.496 1.508 1.5 1.488 1.445 1.411 1.363 1.197 1.138 1.06 0.886 0.709 0.522 0.425 0.214 -0.015 -0.347 -0.566 -0.796 -1.157 -1.536 -1.925 -2.33 -2.732 -3.263 -3.815 -4.37 -5.057 -5.755 -6.486 -7.381 -8.425 -9.472 -10.672 -12.033 -13.579 -15.326 -17.442 -20.05 -22.861 -26.43 -30.784 -36.31 -43.088 -51.92 -63.999 -81.649 -100.094 -113.554 -123.875 -132.005 -138.774 -144.314 -149.006 -152.854 -156.554 -159.606 -162.247 -164.656 -166.801 -168.757 -170.52 -172.332 -173.902 -175.198 -176.508 -177.845 -178.931 -180.029 -181.138 -181.99 -182.85 -183.723 -184.628 -185.523 -186.114 -186.722 -187.649 -188.274 -188.928 -189.268 -189.944 -190.621 -191.298 -191.649 -192.25 -192.802 -193.199 -193.592 -194.414 -194.863 -195.343 -195.85 -196.428 -197.074 -197.884 -199.928 -6 ,20244 ,KEBNE ,16708665,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:12:05 CET,0.0 1.313 1.557 1.668 1.724 1.739 1.728 1.708 1.62 1.56 1.496 1.336 1.281 1.21 1.052 0.877 0.693 0.595 0.378 0.15 -0.175 -0.4 -0.639 -0.982 -1.343 -1.73 -2.111 -2.504 -3.05 -3.606 -4.152 -4.836 -5.537 -6.242 -7.096 -8.089 -9.104 -10.311 -11.693 -13.287 -15.069 -17.167 -19.793 -22.634 -26.219 -30.477 -35.795 -42.521 -51.358 -63.345 -81.032 -99.452 -112.861 -123.167 -131.286 -138.061 -143.609 -148.326 -152.198 -155.855 -158.872 -161.468 -163.847 -166.042 -168.005 -169.722 -171.464 -172.973 -174.257 -175.556 -176.846 -177.904 -178.985 -180.068 -180.894 -181.728 -182.585 -183.46 -184.353 -184.964 -185.591 -186.529 -187.153 -187.784 -188.104 -188.772 -189.454 -190.147 -190.511 -191.113 -191.63 -191.997 -192.37 -193.189 -193.635 -194.109 -194.639 -195.24 -195.937 -196.803 -199.17 -7 ,13522 ,KEBNE ,16708666,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:12:17 CET,0.0 0.85 1.045 1.138 1.21 1.26 1.263 1.235 1.16 1.127 1.082 0.958 0.921 0.852 0.684 0.51 0.336 0.244 0.055 -0.159 -0.502 -0.719 -0.949 -1.31 -1.661 -2.025 -2.396 -2.773 -3.287 -3.814 -4.356 -5.044 -5.745 -6.462 -7.342 -8.363 -9.399 -10.609 -12.007 -13.603 -15.33 -17.389 -20.045 -22.931 -26.519 -30.83 -36.223 -42.92 -51.767 -63.827 -81.54 -99.91 -113.232 -123.471 -131.574 -138.366 -143.923 -148.623 -152.543 -156.28 -159.324 -161.968 -164.403 -166.6 -168.562 -170.331 -172.121 -173.648 -174.941 -176.253 -177.579 -178.639 -179.708 -180.807 -181.651 -182.493 -183.342 -184.214 -185.098 -185.697 -186.309 -187.241 -187.875 -188.512 -188.837 -189.512 -190.185 -190.86 -191.217 -191.818 -192.337 -192.735 -193.159 -194.036 -194.493 -194.973 -195.477 -195.996 -196.626 -197.504 -200.302 -8 ,5481 ,KEBNE ,16708667,Fri Nov 26 18:39:20 CET,Fri Nov 26 20:10:49 CET,0.0 0.781 0.965 1.053 1.085 1.085 1.08 1.066 1.019 0.987 0.94 0.804 0.745 0.659 0.482 0.294 0.105 0.008 -0.199 -0.415 -0.721 -0.921 -1.145 -1.519 -1.901 -2.289 -2.686 -3.085 -3.633 -4.201 -4.768 -5.464 -6.165 -6.876 -7.761 -8.855 -9.927 -11.12 -12.475 -14.007 -15.73 -17.82 -20.482 -23.358 -26.946 -31.279 -36.723 -43.489 -52.364 -64.384 -82.122 -100.549 -113.826 -124.015 -132.106 -138.851 -144.37 -149.078 -152.96 -156.694 -159.78 -162.397 -164.782 -166.951 -168.903 -170.647 -172.419 -173.943 -175.224 -176.516 -177.81 -178.858 -179.925 -181.032 -181.886 -182.744 -183.607 -184.482 -185.377 -185.988 -186.606 -187.525 -188.156 -188.816 -189.148 -189.813 -190.505 -191.224 -191.595 -192.203 -192.752 -193.143 -193.537 -194.376 -194.829 -195.32 -195.838 -196.435 -197.117 -197.948 -199.97 -9 ,27252 ,KEBNE ,16708668,Fri Nov 26 18:40:21 CET,Fri Nov 26 20:11:47 CET,0.0 1.491 1.756 1.887 1.985 2.044 2.06 2.07 2.039 1.992 1.932 1.784 1.735 1.666 1.518 1.344 1.161 1.069 0.874 0.657 0.326 0.109 -0.109 -0.459 -0.829 -1.216 -1.604 -1.986 -2.509 -3.045 -3.592 -4.301 -5.029 -5.75 -6.633 -7.682 -8.729 -9.939 -11.336 -12.925 -14.676 -16.765 -19.359 -22.122 -25.649 -30.001 -35.442 -42.176 -51.142 -63.354 -81.065 -99.28 -112.563 -122.836 -130.981 -137.802 -143.334 -148.034 -151.906 -155.593 -158.612 -161.192 -163.553 -165.688 -167.638 -169.373 -171.114 -172.63 -173.909 -175.195 -176.526 -177.604 -178.672 -179.755 -180.568 -181.387 -182.223 -183.081 -183.954 -184.542 -185.14 -186.039 -186.648 -187.266 -187.58 -188.23 -188.911 -189.601 -189.958 -190.558 -191.097 -191.495 -191.894 -192.712 -193.141 -193.605 -194.127 -194.706 -195.368 -196.237 -199.071 -10 ,21957 ,KEBNE ,16708669,Fri Nov 26 18:40:21 CET,Fri Nov 26 20:12:59 CET,0.0 1.067 1.268 1.343 1.367 1.377 1.369 1.346 1.285 1.24 1.191 1.065 1.014 0.944 0.799 0.638 0.457 0.361 0.156 -0.065 -0.393 -0.619 -0.854 -1.213 -1.566 -1.93 -2.312 -2.7 -3.242 -3.797 -4.35 -5.062 -5.776 -6.489 -7.36 -8.39 -9.418 -10.62 -12.014 -13.581 -15.314 -17.399 -20.031 -22.848 -26.432 -30.761 -36.19 -43.027 -51.953 -63.941 -81.437 -99.661 -112.997 -123.323 -131.475 -138.211 -143.77 -148.515 -152.371 -156.062 -159.11 -161.714 -164.114 -166.29 -168.268 -170.042 -171.823 -173.348 -174.633 -175.951 -177.281 -178.357 -179.446 -180.542 -181.371 -182.214 -183.069 -183.935 -184.823 -185.416 -186.011 -186.935 -187.574 -188.233 -188.563 -189.223 -189.902 -190.598 -190.953 -191.536 -192.04 -192.437 -192.841 -193.687 -194.15 -194.635 -195.157 -195.683 -196.26 -197.017 -199.287 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_23_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_23_1.txt deleted file mode 100644 index da753fd0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_23_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3502 ,KEBNE ,16708670,Fri Nov 26 18:40:20 CET,Fri Nov 26 20:12:15 CET,0.0 1.531 1.953 2.281 2.523 2.739 2.931 3.098 3.4 3.548 3.695 3.908 4.091 4.212 4.434 4.64 4.835 4.926 5.116 5.308 5.572 5.732 5.876 6.089 6.31 6.537 6.744 6.941 7.223 7.488 7.72 7.991 8.251 8.505 8.803 9.114 9.404 9.734 10.092 10.451 10.819 11.236 11.756 12.267 12.802 13.378 13.969 14.601 15.3 15.994 16.522 16.567 16.308 15.942 15.565 15.169 14.784 14.416 14.058 13.704 13.383 13.063 12.737 12.419 12.151 11.936 11.711 11.495 11.288 11.065 10.837 10.623 10.404 10.193 10.024 9.848 9.665 9.478 9.298 9.172 9.024 8.793 8.641 8.466 8.368 8.172 7.972 7.768 7.658 7.496 7.304 7.187 7.064 6.776 6.613 6.433 6.226 5.989 5.69 5.293 3.982 -2 ,13564 ,KEBNE ,16708671,Fri Nov 26 18:40:21 CET,Fri Nov 26 20:12:16 CET,0.0 1.163 1.542 1.849 2.103 2.324 2.525 2.715 3.018 3.152 3.3 3.54 3.729 3.845 4.065 4.286 4.495 4.588 4.778 4.97 5.224 5.399 5.582 5.834 6.069 6.285 6.484 6.682 6.952 7.188 7.379 7.624 7.874 8.112 8.402 8.724 9.021 9.328 9.652 9.99 10.332 10.724 11.18 11.643 12.17 12.722 13.362 14.023 14.713 15.409 15.943 16.061 15.853 15.528 15.16 14.773 14.397 14.063 13.758 13.428 13.125 12.856 12.585 12.296 12.023 11.793 11.556 11.334 11.141 10.935 10.696 10.512 10.345 10.127 9.93 9.734 9.538 9.343 9.141 8.998 8.84 8.598 8.453 8.314 8.243 8.083 7.903 7.706 7.598 7.427 7.218 7.085 6.955 6.66 6.493 6.323 6.14 5.924 5.629 5.229 4.081 -3 ,22504 ,KEBNE ,16708672,Fri Nov 26 18:40:21 CET,Fri Nov 26 20:13:26 CET,0.0 1.479 1.883 2.155 2.4 2.636 2.831 3.014 3.351 3.502 3.648 3.853 4.028 4.159 4.401 4.618 4.82 4.91 5.08 5.249 5.509 5.665 5.81 6.03 6.257 6.486 6.701 6.893 7.134 7.363 7.603 7.893 8.13 8.385 8.69 9.008 9.315 9.629 9.996 10.373 10.737 11.16 11.623 12.047 12.526 13.032 13.636 14.26 14.849 15.449 15.929 16.012 15.796 15.455 15.028 14.586 14.171 13.785 13.454 13.115 12.819 12.541 12.228 11.928 11.658 11.4 11.135 10.886 10.659 10.442 10.232 10.045 9.847 9.64 9.482 9.32 9.132 8.938 8.752 8.618 8.482 8.269 8.11 7.927 7.832 7.651 7.453 7.235 7.12 6.951 6.758 6.633 6.483 6.155 5.985 5.791 5.576 5.338 5.059 4.685 3.209 -4 ,12573 ,KEBNE ,16708673,Fri Nov 26 18:40:21 CET,Fri Nov 26 20:13:30 CET,0.0 1.56 2.039 2.348 2.594 2.811 3.032 3.226 3.572 3.726 3.866 4.073 4.256 4.391 4.634 4.852 5.054 5.149 5.342 5.519 5.761 5.925 6.086 6.307 6.515 6.722 6.929 7.133 7.394 7.65 7.889 8.152 8.393 8.629 8.908 9.203 9.482 9.811 10.147 10.466 10.807 11.179 11.611 12.055 12.576 13.134 13.766 14.406 15.007 15.649 16.224 16.3 16.081 15.768 15.399 15.044 14.683 14.3 13.942 13.558 13.207 12.916 12.632 12.334 12.073 11.855 11.633 11.432 11.207 10.97 10.74 10.543 10.337 10.121 9.95 9.771 9.6 9.402 9.193 9.058 8.898 8.64 8.487 8.33 8.238 8.039 7.816 7.591 7.486 7.328 7.14 7.021 6.889 6.601 6.44 6.242 6.012 5.764 5.464 5.074 3.771 -5 ,2371 ,KEBNE ,16708674,Fri Nov 26 18:40:21 CET,Fri Nov 26 20:13:03 CET,0.0 1.116 1.458 1.755 2.026 2.254 2.465 2.66 2.995 3.144 3.284 3.491 3.683 3.82 4.05 4.254 4.457 4.555 4.743 4.927 5.191 5.351 5.504 5.719 5.914 6.123 6.33 6.519 6.767 7.024 7.283 7.558 7.81 8.058 8.33 8.622 8.897 9.2 9.525 9.859 10.202 10.642 11.164 11.618 12.124 12.667 13.265 13.961 14.665 15.252 15.681 15.607 15.306 14.964 14.556 14.122 13.718 13.321 12.938 12.555 12.249 11.888 11.537 11.266 10.988 10.726 10.45 10.207 10.008 9.751 9.461 9.255 9.053 8.833 8.678 8.524 8.337 8.141 7.941 7.786 7.631 7.417 7.254 7.076 6.989 6.78 6.556 6.342 6.23 6.071 5.878 5.744 5.607 5.322 5.148 4.947 4.733 4.518 4.256 3.892 2.689 -6 ,15042 ,KEBNE ,16708675,Fri Nov 26 18:40:21 CET,Fri Nov 26 20:12:12 CET,0.0 1.435 1.855 2.131 2.367 2.595 2.811 3.005 3.323 3.467 3.603 3.795 3.974 4.095 4.309 4.517 4.728 4.826 5.013 5.187 5.442 5.617 5.787 6.021 6.23 6.436 6.635 6.815 7.072 7.33 7.577 7.854 8.105 8.364 8.635 8.931 9.236 9.566 9.907 10.244 10.599 11.017 11.464 11.896 12.399 12.95 13.584 14.252 14.889 15.539 16.094 16.173 15.946 15.611 15.263 14.892 14.532 14.184 13.866 13.542 13.258 12.964 12.675 12.4 12.14 11.888 11.597 11.363 11.167 10.954 10.711 10.491 10.267 10.03 9.842 9.65 9.451 9.251 9.057 8.915 8.769 8.545 8.37 8.188 8.095 7.895 7.673 7.439 7.32 7.155 6.968 6.834 6.698 6.404 6.224 6.022 5.812 5.592 5.31 4.923 3.486 -7 ,25716 ,KEBNE ,16708676,Fri Nov 26 18:40:21 CET,Fri Nov 26 20:14:11 CET,0.0 1.438 1.787 2.092 2.342 2.563 2.766 2.959 3.317 3.477 3.627 3.849 4.027 4.144 4.379 4.612 4.824 4.928 5.127 5.307 5.57 5.743 5.904 6.133 6.351 6.546 6.73 6.913 7.169 7.408 7.645 7.951 8.234 8.491 8.797 9.126 9.386 9.699 10.049 10.398 10.755 11.154 11.652 12.149 12.679 13.218 13.787 14.412 15.064 15.701 16.213 16.257 16.033 15.673 15.245 14.826 14.442 14.054 13.707 13.383 13.09 12.793 12.506 12.239 11.986 11.733 11.45 11.181 10.959 10.752 10.512 10.286 10.06 9.834 9.64 9.444 9.274 9.1 8.899 8.758 8.606 8.366 8.214 8.054 7.96 7.775 7.58 7.357 7.239 7.066 6.871 6.742 6.604 6.332 6.16 5.958 5.757 5.54 5.253 4.845 3.724 -8 ,20165 ,KEBNE ,16708677,Fri Nov 26 18:40:21 CET,Fri Nov 26 20:14:45 CET,0.0 1.728 2.106 2.384 2.621 2.825 3.002 3.176 3.508 3.664 3.814 4.035 4.216 4.343 4.603 4.857 5.084 5.181 5.362 5.544 5.804 5.979 6.154 6.39 6.609 6.809 7.0 7.181 7.433 7.69 7.908 8.172 8.44 8.673 8.915 9.183 9.444 9.737 10.083 10.443 10.812 11.224 11.672 12.133 12.67 13.26 13.851 14.441 15.12 15.742 16.211 16.277 15.989 15.637 15.269 14.797 14.374 14.036 13.716 13.383 13.098 12.835 12.577 12.324 12.077 11.833 11.559 11.318 11.108 10.881 10.644 10.424 10.2 9.991 9.82 9.642 9.457 9.274 9.082 8.946 8.806 8.579 8.418 8.243 8.152 7.961 7.744 7.504 7.384 7.216 6.995 6.856 6.718 6.428 6.263 6.065 5.833 5.596 5.319 4.912 3.325 -9 ,21792 ,KEBNE ,16708678,Fri Nov 26 18:41:26 CET,Fri Nov 26 20:14:30 CET,0.0 1.713 2.18 2.494 2.769 3.011 3.213 3.393 3.699 3.839 3.984 4.198 4.389 4.526 4.781 4.997 5.179 5.271 5.455 5.623 5.857 6.019 6.175 6.395 6.618 6.826 7.034 7.254 7.529 7.769 7.991 8.269 8.563 8.823 9.092 9.407 9.723 10.076 10.413 10.745 11.105 11.52 11.984 12.427 12.944 13.484 14.083 14.734 15.381 15.954 16.411 16.479 16.247 15.953 15.615 15.249 14.87 14.521 14.227 13.867 13.558 13.303 13.04 12.8 12.569 12.345 12.098 11.87 11.675 11.469 11.256 11.068 10.87 10.657 10.494 10.339 10.161 9.96 9.739 9.589 9.447 9.212 9.034 8.85 8.758 8.563 8.344 8.122 8.016 7.852 7.643 7.505 7.358 7.045 6.874 6.675 6.442 6.178 5.856 5.437 4.18 -10 ,20068 ,KEBNE ,16708679,Fri Nov 26 18:41:23 CET,Fri Nov 26 20:14:50 CET,0.0 2.027 2.431 2.728 2.971 3.19 3.391 3.562 3.851 3.976 4.097 4.286 4.467 4.593 4.815 5.025 5.236 5.337 5.52 5.692 5.935 6.097 6.265 6.511 6.738 6.956 7.186 7.39 7.645 7.893 8.121 8.421 8.697 8.957 9.236 9.515 9.792 10.097 10.431 10.787 11.172 11.593 12.04 12.463 12.935 13.474 14.068 14.646 15.275 15.884 16.377 16.374 16.104 15.769 15.391 15.023 14.665 14.314 13.982 13.644 13.373 13.102 12.814 12.533 12.25 11.999 11.76 11.541 11.332 11.086 10.824 10.621 10.425 10.243 10.092 9.908 9.715 9.527 9.311 9.156 9.014 8.8 8.634 8.455 8.364 8.179 7.985 7.769 7.652 7.49 7.308 7.175 7.029 6.705 6.527 6.344 6.138 5.908 5.648 5.273 4.142 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_251_256.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_251_256.txt deleted file mode 100644 index e0efa1d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_251_256.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23532 ,KEBNE ,16708680,Fri Nov 26 18:41:22 CET,Fri Nov 26 20:14:34 CET,0.0 0.938 1.248 1.464 1.64 1.806 1.949 2.062 2.27 2.359 2.431 2.395 2.65 2.715 2.837 2.954 3.055 3.096 3.168 3.235 3.321 3.379 3.44 3.511 3.573 3.64 3.684 3.701 3.732 3.763 3.771 3.766 3.765 3.756 3.729 3.699 3.624 3.462 3.264 3.023 2.726 2.353 1.888 1.358 0.662 -0.195 -1.308 -2.768 -4.877 -7.9 -12.439 -17.55 -21.523 -24.655 -27.274 -29.516 -31.369 -32.99 -34.399 -35.795 -36.931 -37.924 -38.873 -39.765 -40.6 -41.328 -42.057 -42.699 -43.234 -43.794 -44.363 -44.817 -45.292 -45.795 -46.189 -46.586 -46.981 -47.397 -47.828 -48.121 -48.415 -48.855 -49.165 -49.492 -49.663 -50.012 -50.397 -50.813 -51.014 -51.456 -51.663 -51.892 -52.133 -52.653 -52.954 -53.276 -53.614 -54.012 -54.506 -55.124 -56.852 -2 ,14169 ,KEBNE ,16708681,Fri Nov 26 18:41:22 CET,Fri Nov 26 20:14:56 CET,0.0 0.88 1.175 1.39 1.597 1.76 1.883 1.988 2.181 2.272 2.351 2.309 2.544 2.608 2.726 2.831 2.929 2.974 3.059 3.132 3.23 3.288 3.339 3.414 3.464 3.499 3.539 3.554 3.566 3.576 3.562 3.521 3.49 3.448 3.363 3.254 3.146 3.045 2.915 2.726 2.505 2.184 1.715 1.216 0.579 -0.252 -1.372 -2.824 -4.834 -7.726 -12.18 -17.03 -20.729 -23.666 -26.069 -28.163 -29.941 -31.467 -32.763 -34.054 -35.162 -36.137 -37.037 -37.877 -38.629 -39.322 -40.057 -40.697 -41.227 -41.78 -42.36 -42.82 -43.287 -43.78 -44.168 -44.558 -44.973 -45.421 -45.865 -46.164 -46.467 -46.936 -47.263 -47.592 -47.76 -48.117 -48.489 -48.875 -49.083 -49.538 -49.771 -50.02 -50.274 -50.826 -51.137 -51.466 -51.831 -52.269 -52.764 -53.402 -55.231 -3 ,28205 ,KEBNE ,16708682,Fri Nov 26 18:41:22 CET,Fri Nov 26 20:14:27 CET,0.0 1.193 1.5 1.721 1.93 2.11 2.235 2.344 2.577 2.684 2.779 2.759 3.013 3.089 3.232 3.332 3.414 3.461 3.544 3.604 3.683 3.722 3.75 3.796 3.835 3.853 3.872 3.902 3.935 3.96 3.95 3.909 3.871 3.838 3.786 3.689 3.573 3.432 3.246 3.027 2.78 2.463 2.04 1.529 0.806 -0.11 -1.241 -2.691 -4.743 -7.664 -12.228 -17.284 -21.198 -24.367 -26.973 -29.179 -31.046 -32.704 -34.114 -35.496 -36.64 -37.612 -38.517 -39.372 -40.144 -40.849 -41.58 -42.222 -42.786 -43.367 -43.949 -44.405 -44.882 -45.395 -45.79 -46.188 -46.585 -47.0 -47.441 -47.735 -48.036 -48.515 -48.864 -49.237 -49.416 -49.764 -50.131 -50.52 -50.717 -51.145 -51.326 -51.561 -51.813 -52.375 -52.672 -52.975 -53.304 -53.682 -54.128 -54.709 -57.185 -4 ,19632 ,KEBNE ,16708683,Fri Nov 26 18:41:22 CET,Fri Nov 26 20:13:02 CET,0.0 0.924 1.227 1.411 1.594 1.767 1.904 2.042 2.306 2.418 2.517 2.508 2.749 2.803 2.897 2.978 3.07 3.109 3.174 3.233 3.313 3.371 3.418 3.467 3.518 3.554 3.588 3.637 3.673 3.691 3.696 3.698 3.698 3.679 3.636 3.551 3.46 3.351 3.199 2.991 2.721 2.361 1.906 1.384 0.719 -0.105 -1.236 -2.746 -4.86 -7.851 -12.408 -17.435 -21.331 -24.493 -27.091 -29.308 -31.179 -32.838 -34.226 -35.571 -36.719 -37.728 -38.639 -39.467 -40.257 -40.98 -41.737 -42.4 -42.96 -43.523 -44.092 -44.555 -45.037 -45.563 -45.953 -46.347 -46.766 -47.192 -47.619 -47.919 -48.224 -48.676 -48.992 -49.326 -49.499 -49.849 -50.205 -50.584 -50.797 -51.246 -51.426 -51.652 -51.894 -52.404 -52.689 -52.999 -53.36 -53.769 -54.184 -54.788 -57.186 -5 ,8998 ,KEBNE ,16708684,Fri Nov 26 18:41:22 CET,Fri Nov 26 20:14:13 CET,0.0 1.015 1.353 1.609 1.81 1.977 2.11 2.232 2.43 2.512 2.589 2.546 2.792 2.856 2.973 3.071 3.151 3.189 3.277 3.367 3.471 3.523 3.576 3.628 3.66 3.689 3.723 3.757 3.765 3.764 3.764 3.741 3.73 3.735 3.72 3.635 3.532 3.421 3.265 3.051 2.791 2.477 2.03 1.543 0.944 0.147 -0.933 -2.414 -4.491 -7.423 -11.914 -16.982 -20.872 -23.981 -26.522 -28.689 -30.502 -32.07 -33.451 -34.842 -36.009 -37.021 -37.935 -38.789 -39.598 -40.323 -41.042 -41.66 -42.212 -42.798 -43.377 -43.85 -44.346 -44.833 -45.203 -45.613 -46.039 -46.435 -46.841 -47.145 -47.459 -47.941 -48.27 -48.621 -48.809 -49.187 -49.563 -49.958 -50.161 -50.614 -50.855 -51.087 -51.333 -51.887 -52.199 -52.53 -52.889 -53.286 -53.76 -54.401 -56.185 -6 ,30445 ,KEBNE ,16708685,Fri Nov 26 18:41:26 CET,Fri Nov 26 20:08:53 CET,0.0 0.969 1.297 1.549 1.753 1.932 2.085 2.201 2.405 2.497 2.575 2.528 2.771 2.83 2.941 3.055 3.157 3.196 3.269 3.328 3.414 3.468 3.506 3.568 3.637 3.687 3.733 3.786 3.816 3.809 3.798 3.783 3.761 3.723 3.668 3.583 3.485 3.369 3.213 2.982 2.704 2.376 1.945 1.431 0.715 -0.184 -1.325 -2.81 -4.891 -7.851 -12.47 -17.574 -21.498 -24.662 -27.27 -29.482 -31.359 -33.022 -34.42 -35.77 -36.921 -37.919 -38.822 -39.66 -40.436 -41.146 -41.863 -42.499 -43.081 -43.687 -44.275 -44.762 -45.255 -45.74 -46.133 -46.539 -46.953 -47.381 -47.809 -48.094 -48.391 -48.859 -49.184 -49.525 -49.704 -50.061 -50.411 -50.798 -51.004 -51.445 -51.632 -51.859 -52.117 -52.687 -52.999 -53.337 -53.694 -54.09 -54.589 -55.305 -57.417 -7 ,10156 ,KEBNE ,16708686,Fri Nov 26 18:41:22 CET,Fri Nov 26 20:15:43 CET,0.0 1.067 1.404 1.638 1.831 1.991 2.135 2.259 2.448 2.528 2.607 2.585 2.829 2.889 3.005 3.117 3.219 3.268 3.362 3.439 3.511 3.549 3.596 3.656 3.699 3.727 3.759 3.805 3.861 3.894 3.898 3.885 3.863 3.813 3.747 3.677 3.593 3.457 3.275 3.062 2.806 2.489 2.07 1.588 0.92 0.054 -1.088 -2.61 -4.684 -7.654 -12.223 -17.229 -21.112 -24.29 -26.883 -29.066 -30.958 -32.614 -34.051 -35.477 -36.603 -37.583 -38.532 -39.419 -40.233 -40.955 -41.685 -42.316 -42.864 -43.451 -44.043 -44.534 -45.022 -45.51 -45.898 -46.297 -46.7 -47.118 -47.556 -47.852 -48.171 -48.685 -49.034 -49.394 -49.579 -49.939 -50.301 -50.694 -50.908 -51.366 -51.607 -51.856 -52.105 -52.635 -52.938 -53.261 -53.61 -54.025 -54.519 -55.182 -57.468 -8 ,7204 ,KEBNE ,16708687,Fri Nov 26 18:41:22 CET,Fri Nov 26 20:14:22 CET,0.0 1.047 1.38 1.583 1.774 1.961 2.13 2.286 2.511 2.609 2.703 2.661 2.89 2.937 3.026 3.129 3.21 3.249 3.323 3.377 3.467 3.518 3.555 3.612 3.686 3.743 3.772 3.797 3.807 3.8 3.79 3.769 3.748 3.719 3.651 3.557 3.443 3.316 3.162 2.958 2.714 2.353 1.876 1.368 0.697 -0.127 -1.246 -2.754 -4.813 -7.709 -12.212 -17.335 -21.371 -24.57 -27.11 -29.315 -31.179 -32.777 -34.124 -35.427 -36.534 -37.521 -38.453 -39.336 -40.124 -40.809 -41.508 -42.128 -42.675 -43.225 -43.784 -44.258 -44.749 -45.256 -45.647 -46.044 -46.445 -46.857 -47.294 -47.601 -47.922 -48.394 -48.697 -49.032 -49.211 -49.588 -49.979 -50.367 -50.569 -51.018 -51.228 -51.459 -51.705 -52.256 -52.553 -52.865 -53.219 -53.636 -54.116 -54.803 -57.292 -9 ,13309 ,KEBNE ,16708688,Fri Nov 26 18:41:22 CET,Fri Nov 26 20:14:30 CET,0.0 1.085 1.446 1.706 1.905 2.066 2.223 2.36 2.585 2.676 2.771 2.771 3.018 3.079 3.184 3.279 3.367 3.407 3.506 3.59 3.66 3.7 3.74 3.808 3.872 3.909 3.948 3.999 4.033 4.037 4.037 4.042 4.032 3.988 3.918 3.814 3.683 3.533 3.361 3.179 2.954 2.628 2.189 1.683 1.029 0.196 -0.94 -2.425 -4.473 -7.402 -11.92 -16.925 -20.809 -23.976 -26.55 -28.721 -30.523 -32.104 -33.456 -34.831 -35.962 -36.925 -37.839 -38.677 -39.499 -40.251 -40.999 -41.655 -42.209 -42.794 -43.385 -43.845 -44.322 -44.837 -45.239 -45.639 -46.06 -46.485 -46.915 -47.219 -47.52 -47.973 -48.303 -48.657 -48.834 -49.186 -49.541 -49.909 -50.112 -50.567 -50.777 -51.004 -51.244 -51.776 -52.078 -52.413 -52.76 -53.129 -53.57 -54.162 -56.125 -10 ,25639 ,KEBNE ,16708689,Fri Nov 26 18:41:22 CET,Fri Nov 26 20:14:24 CET,0.0 0.917 1.204 1.43 1.624 1.781 1.92 2.062 2.321 2.42 2.499 2.458 2.694 2.749 2.868 2.977 3.071 3.11 3.171 3.224 3.308 3.351 3.388 3.45 3.495 3.541 3.576 3.587 3.595 3.616 3.654 3.673 3.628 3.579 3.529 3.464 3.387 3.257 3.105 2.917 2.649 2.311 1.873 1.37 0.697 -0.183 -1.355 -2.872 -4.969 -7.957 -12.541 -17.514 -21.349 -24.512 -27.114 -29.353 -31.242 -32.874 -34.281 -35.641 -36.733 -37.682 -38.591 -39.469 -40.275 -40.984 -41.718 -42.384 -42.945 -43.503 -44.064 -44.535 -45.014 -45.5 -45.889 -46.28 -46.68 -47.102 -47.533 -47.826 -48.132 -48.613 -48.94 -49.266 -49.439 -49.804 -50.174 -50.55 -50.75 -51.205 -51.429 -51.665 -51.905 -52.445 -52.728 -53.034 -53.359 -53.71 -54.155 -54.77 -57.473 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_155.txt deleted file mode 100644 index db4cc274..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21781 ,KEBNE ,16708690,Fri Nov 26 18:41:22 CET,Fri Nov 26 20:14:22 CET,0.0 1.783 2.53 3.146 3.68 4.16 4.59 4.999 5.781 6.156 6.51 6.958 7.51 7.835 8.491 9.12 9.74 10.047 10.635 11.214 12.089 12.656 13.201 14.003 14.805 15.584 16.348 17.113 18.121 19.135 20.14 21.342 22.514 23.7 25.117 26.734 28.33 30.121 32.146 34.402 36.804 39.583 42.934 46.433 50.689 55.643 61.71 69.045 78.212 89.98 106.184 121.921 132.754 140.732 146.782 151.642 155.501 158.716 161.211 163.475 165.329 166.917 168.327 169.56 170.648 171.571 172.438 173.169 173.788 174.398 174.998 175.458 175.899 176.346 176.679 176.99 177.3 177.604 177.902 178.081 178.259 178.532 178.71 178.874 178.944 179.088 179.216 179.318 179.366 179.37 179.495 179.538 179.559 179.566 179.568 179.538 179.478 179.41 179.308 179.061 177.914 -2 ,29364 ,KEBNE ,16708691,Fri Nov 26 18:42:23 CET,Fri Nov 26 20:14:36 CET,0.0 1.775 2.481 3.014 3.513 3.977 4.406 4.817 5.574 5.945 6.305 6.749 7.301 7.628 8.272 8.888 9.483 9.775 10.361 10.949 11.822 12.391 12.936 13.744 14.552 15.355 16.147 16.914 17.923 18.937 19.946 21.167 22.357 23.542 24.951 26.561 28.14 29.937 31.923 34.088 36.454 39.209 42.552 46.031 50.198 55.03 60.985 68.281 77.507 89.448 105.845 121.651 132.443 140.381 146.446 151.325 155.17 158.346 160.893 163.209 165.06 166.625 168.02 169.258 170.324 171.252 172.184 172.966 173.604 174.205 174.777 175.237 175.696 176.153 176.497 176.827 177.14 177.45 177.757 177.953 178.141 178.402 178.564 178.713 178.782 178.923 179.058 179.168 179.221 179.226 179.345 179.376 179.405 179.44 179.414 179.362 179.287 179.183 179.052 178.801 177.752 -3 ,11046 ,KEBNE ,16708692,Fri Nov 26 18:42:23 CET,Fri Nov 26 20:15:29 CET,0.0 1.834 2.576 3.175 3.683 4.132 4.56 4.972 5.753 6.124 6.481 6.918 7.483 7.828 8.486 9.11 9.715 10.014 10.618 11.208 12.073 12.654 13.211 14.019 14.812 15.585 16.36 17.145 18.184 19.174 20.125 21.315 22.486 23.64 25.025 26.601 28.184 30.01 32.001 34.184 36.579 39.346 42.634 46.083 50.342 55.301 61.321 68.597 77.715 89.505 105.858 121.738 132.643 140.667 146.736 151.6 155.496 158.726 161.297 163.655 165.522 167.103 168.53 169.768 170.855 171.776 172.694 173.486 174.11 174.727 175.326 175.796 176.277 176.733 177.053 177.388 177.733 178.042 178.327 178.518 178.718 179.005 179.164 179.323 179.391 179.515 179.664 179.775 179.809 179.802 179.937 179.979 180.011 180.029 180.006 179.95 179.883 179.786 179.635 179.433 178.651 -4 ,9222 ,KEBNE ,16708693,Fri Nov 26 18:42:27 CET,Fri Nov 26 20:09:43 CET,0.0 1.718 2.432 3.007 3.517 3.974 4.413 4.836 5.612 5.987 6.344 6.783 7.342 7.675 8.313 8.937 9.528 9.82 10.404 10.981 11.822 12.372 12.929 13.75 14.539 15.322 16.097 16.854 17.868 18.866 19.844 21.055 22.232 23.396 24.792 26.408 28.009 29.787 31.764 33.97 36.322 39.013 42.32 45.851 50.146 55.104 61.158 68.47 77.623 89.501 105.917 121.762 132.616 140.576 146.604 151.461 155.326 158.532 161.096 163.437 165.319 166.878 168.289 169.564 170.65 171.576 172.493 173.268 173.9 174.514 175.107 175.56 175.981 176.411 176.746 177.091 177.426 177.73 178.016 178.201 178.387 178.652 178.814 178.962 179.033 179.167 179.286 179.382 179.428 179.437 179.566 179.586 179.598 179.629 179.625 179.6 179.56 179.501 179.364 179.132 178.592 -5 ,13791 ,KEBNE ,16708694,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:20:01 CET,0.0 2.262 2.969 3.53 4.045 4.514 4.936 5.332 6.077 6.443 6.812 7.301 7.857 8.185 8.844 9.464 10.065 10.367 10.965 11.563 12.438 12.993 13.545 14.362 15.158 15.939 16.732 17.517 18.522 19.517 20.508 21.724 22.914 24.071 25.465 27.098 28.723 30.567 32.546 34.701 37.046 39.761 43.073 46.557 50.817 55.763 61.743 68.976 78.143 90.027 106.378 122.223 133.074 141.082 147.163 152.017 155.914 159.131 161.659 163.992 165.884 167.454 168.83 170.07 171.161 172.069 172.985 173.773 174.413 175.019 175.606 176.085 176.563 177.026 177.347 177.65 177.943 178.242 178.548 178.744 178.935 179.206 179.374 179.522 179.588 179.709 179.816 179.902 179.948 179.959 180.084 180.111 180.133 180.155 180.155 180.132 180.07 179.998 179.861 179.584 178.344 -6 ,1067 ,KEBNE ,16708695,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:16:14 CET,0.0 1.658 2.361 2.916 3.415 3.861 4.301 4.729 5.507 5.873 6.235 6.71 7.275 7.61 8.259 8.874 9.486 9.789 10.379 10.955 11.805 12.366 12.909 13.708 14.497 15.286 16.07 16.844 17.856 18.851 19.826 21.01 22.219 23.427 24.846 26.477 28.069 29.847 31.802 33.964 36.313 39.05 42.408 45.965 50.289 55.276 61.283 68.519 77.723 89.7 106.156 122.014 132.872 140.844 146.942 151.847 155.721 158.926 161.481 163.847 165.737 167.33 168.768 170.03 171.118 172.051 172.993 173.801 174.454 175.087 175.713 176.197 176.671 177.113 177.44 177.769 178.089 178.391 178.691 178.883 179.052 179.298 179.46 179.62 179.704 179.854 179.971 180.062 180.093 180.09 180.22 180.262 180.291 180.305 180.285 180.256 180.224 180.169 180.022 179.688 178.699 -7 ,23841 ,KEBNE ,16708696,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:15:49 CET,0.0 1.835 2.62 3.222 3.724 4.186 4.622 5.038 5.816 6.167 6.523 7.01 7.587 7.926 8.581 9.203 9.801 10.103 10.696 11.257 12.087 12.66 13.233 14.062 14.88 15.668 16.437 17.202 18.215 19.211 20.204 21.446 22.675 23.852 25.21 26.824 28.423 30.188 32.157 34.359 36.755 39.525 42.88 46.353 50.569 55.516 61.469 68.618 77.718 89.552 105.899 121.698 132.512 140.53 146.609 151.473 155.359 158.567 161.134 163.491 165.386 166.992 168.396 169.634 170.713 171.65 172.577 173.355 173.966 174.558 175.171 175.619 176.066 176.549 176.902 177.237 177.546 177.818 178.083 178.269 178.456 178.723 178.885 179.04 179.113 179.24 179.347 179.461 179.52 179.52 179.651 179.688 179.717 179.767 179.766 179.756 179.714 179.649 179.555 179.35 178.117 -8 ,18721 ,KEBNE ,16708697,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:19:52 CET,0.0 2.355 3.182 3.808 4.32 4.795 5.222 5.629 6.412 6.786 7.147 7.594 8.148 8.478 9.138 9.776 10.389 10.694 11.294 11.879 12.741 13.311 13.868 14.701 15.514 16.301 17.098 17.883 18.904 19.911 20.898 22.117 23.314 24.49 25.877 27.477 29.079 30.909 32.953 35.14 37.504 40.277 43.597 47.045 51.278 56.296 62.372 69.631 78.817 90.709 107.028 122.783 133.599 141.627 147.752 152.635 156.506 159.725 162.309 164.724 166.652 168.235 169.644 170.894 171.991 172.934 173.858 174.642 175.267 175.848 176.424 176.897 177.355 177.809 178.131 178.434 178.757 179.089 179.39 179.576 179.745 179.97 180.114 180.261 180.339 180.463 180.579 180.693 180.738 180.739 180.877 180.909 180.916 180.934 180.939 180.908 180.825 180.715 180.571 180.321 179.207 -9 ,5012 ,KEBNE ,16708698,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:21:04 CET,0.0 2.352 3.034 3.616 4.137 4.596 5.038 5.462 6.235 6.602 6.962 7.415 7.987 8.327 8.98 9.605 10.205 10.499 11.089 11.656 12.474 13.029 13.578 14.379 15.159 15.934 16.73 17.516 18.535 19.54 20.518 21.741 22.956 24.13 25.51 27.086 28.658 30.483 32.495 34.621 36.912 39.656 43.024 46.56 50.852 55.793 61.755 68.947 78.094 89.947 106.233 121.996 132.857 140.849 146.921 151.798 155.652 158.859 161.407 163.781 165.678 167.228 168.601 169.819 170.889 171.801 172.69 173.44 174.077 174.724 175.351 175.829 176.281 176.729 177.05 177.36 177.689 178.014 178.319 178.508 178.695 178.96 179.114 179.255 179.323 179.453 179.581 179.713 179.772 179.78 179.912 179.948 179.977 180.02 180.017 179.985 179.923 179.83 179.664 179.418 178.716 -10 ,3636 ,KEBNE ,16708699,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:17:16 CET,0.0 1.982 2.797 3.397 3.94 4.438 4.897 5.319 6.086 6.459 6.819 7.278 7.851 8.175 8.809 9.447 10.067 10.371 10.966 11.55 12.413 12.965 13.516 14.337 15.135 15.927 16.722 17.507 18.513 19.49 20.47 21.675 22.85 24.024 25.435 27.048 28.619 30.431 32.444 34.623 36.961 39.661 42.958 46.416 50.664 55.668 61.7 68.917 78.09 89.926 106.107 121.81 132.638 140.589 146.643 151.511 155.367 158.591 161.145 163.486 165.351 166.9 168.308 169.581 170.69 171.627 172.55 173.328 173.939 174.555 175.143 175.583 176.042 176.508 176.827 177.124 177.432 177.742 178.043 178.231 178.419 178.704 178.868 179.01 179.087 179.234 179.356 179.468 179.525 179.536 179.632 179.659 179.677 179.684 179.678 179.652 179.609 179.535 179.4 179.144 178.421 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_164.txt deleted file mode 100644 index 0949b058..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19792 ,KEBNE ,17126053,Thu Dec 30 18:13:16 CET,Thu Dec 30 19:47:50 CET,0.0 1.826 2.54 3.061 3.513 3.904 4.258 4.616 5.269 5.561 5.851 6.181 6.686 6.969 7.488 7.966 8.445 8.678 9.123 9.573 10.222 10.643 11.058 11.654 12.25 12.839 13.409 13.971 14.708 15.442 16.172 17.055 17.92 18.789 19.798 20.944 22.104 23.417 24.864 26.433 28.104 30.03 32.394 34.893 37.873 41.281 45.387 50.299 56.491 64.369 75.03 85.164 91.929 96.792 100.438 103.378 105.683 107.535 108.981 110.286 111.314 112.16 112.902 113.543 114.108 114.587 115.023 115.375 115.669 115.981 116.275 116.487 116.704 116.923 117.081 117.229 117.366 117.49 117.595 117.653 117.714 117.797 117.843 117.891 117.906 117.916 117.93 117.917 117.897 117.783 117.87 117.849 117.814 117.716 117.651 117.568 117.486 117.372 117.197 116.926 115.766 -2 ,28135 ,KEBNE ,17126054,Thu Dec 30 18:13:21 CET,Thu Dec 30 19:48:20 CET,0.0 1.767 2.427 2.919 3.338 3.719 4.078 4.418 5.051 5.35 5.626 5.921 6.403 6.65 7.131 7.607 8.083 8.32 8.774 9.213 9.86 10.285 10.708 11.322 11.918 12.512 13.096 13.666 14.411 15.148 15.871 16.738 17.608 18.492 19.532 20.713 21.863 23.144 24.546 26.099 27.793 29.72 32.033 34.465 37.424 40.851 44.975 49.921 56.078 63.908 74.585 84.715 91.503 96.379 99.959 102.759 104.994 106.859 108.339 109.686 110.723 111.552 112.267 112.902 113.47 113.967 114.454 114.845 115.147 115.44 115.714 115.931 116.144 116.333 116.473 116.609 116.733 116.846 116.962 117.025 117.066 117.121 117.153 117.199 117.225 117.258 117.287 117.308 117.311 117.201 117.272 117.234 117.194 117.112 117.042 116.944 116.841 116.711 116.534 116.233 115.295 -3 ,31179 ,KEBNE ,17126055,Thu Dec 30 18:13:33 CET,Thu Dec 30 19:48:33 CET,0.0 1.669 2.294 2.785 3.216 3.616 3.985 4.32 4.952 5.263 5.551 5.839 6.31 6.553 7.031 7.505 7.983 8.219 8.672 9.095 9.706 10.123 10.541 11.152 11.752 12.339 12.905 13.464 14.211 14.958 15.698 16.594 17.477 18.342 19.362 20.531 21.675 22.957 24.37 25.912 27.594 29.544 31.883 34.345 37.353 40.792 44.918 49.844 55.983 63.85 74.483 84.647 91.5 96.399 99.978 102.788 104.98 106.779 108.22 109.545 110.587 111.43 112.182 112.848 113.42 113.895 114.322 114.677 114.99 115.299 115.592 115.816 116.009 116.195 116.327 116.447 116.585 116.721 116.841 116.901 116.952 117.029 117.072 117.108 117.118 117.141 117.158 117.156 117.148 117.024 117.078 117.046 117.006 116.909 116.85 116.781 116.685 116.546 116.358 116.092 115.168 -4 ,24688 ,KEBNE ,17126056,Thu Dec 30 18:13:36 CET,Thu Dec 30 19:47:52 CET,0.0 1.527 2.142 2.612 3.0 3.354 3.691 4.011 4.625 4.919 5.196 5.494 5.979 6.236 6.719 7.185 7.639 7.872 8.335 8.774 9.407 9.812 10.221 10.846 11.452 12.038 12.607 13.173 13.92 14.641 15.355 16.252 17.142 18.016 19.056 20.22 21.335 22.581 23.983 25.57 27.279 29.229 31.591 34.057 37.044 40.521 44.663 49.556 55.691 63.567 74.224 84.164 90.773 95.612 99.303 102.18 104.372 106.144 107.551 108.858 109.85 110.654 111.396 112.052 112.613 113.089 113.519 113.877 114.194 114.497 114.778 114.992 115.196 115.384 115.524 115.665 115.799 115.925 116.038 116.104 116.161 116.24 116.283 116.313 116.327 116.358 116.382 116.388 116.381 116.275 116.375 116.369 116.347 116.254 116.194 116.109 115.999 115.878 115.708 115.442 114.548 -5 ,20694 ,KEBNE ,17126057,Thu Dec 30 18:13:44 CET,Thu Dec 30 19:48:43 CET,0.0 1.355 1.961 2.456 2.874 3.263 3.625 3.94 4.521 4.803 5.084 5.397 5.873 6.12 6.61 7.089 7.557 7.781 8.231 8.682 9.315 9.721 10.123 10.732 11.332 11.905 12.469 13.039 13.794 14.53 15.256 16.136 16.994 17.834 18.815 19.963 21.069 22.299 23.696 25.255 26.933 28.877 31.248 33.704 36.646 40.025 44.181 49.193 55.404 63.261 73.825 84.045 90.923 95.8 99.442 102.303 104.51 106.318 107.775 109.077 110.088 110.946 111.697 112.353 112.919 113.388 113.839 114.217 114.534 114.849 115.142 115.37 115.591 115.784 115.924 116.06 116.18 116.281 116.38 116.447 116.508 116.592 116.644 116.687 116.7 116.73 116.764 116.779 116.775 116.664 116.746 116.722 116.693 116.598 116.537 116.459 116.348 116.226 116.087 115.839 114.943 -6 ,3755 ,KEBNE ,17126058,Thu Dec 30 18:13:44 CET,Thu Dec 30 19:47:52 CET,0.0 1.958 2.62 3.122 3.559 3.947 4.335 4.692 5.33 5.629 5.922 6.277 6.789 7.055 7.567 8.072 8.561 8.796 9.254 9.725 10.429 10.87 11.299 11.912 12.507 13.103 13.696 14.288 15.05 15.776 16.5 17.399 18.285 19.164 20.224 21.468 22.649 23.927 25.359 26.931 28.587 30.52 32.899 35.352 38.266 41.665 45.832 50.812 57.046 64.942 75.638 85.968 92.779 97.53 101.095 103.908 106.111 107.901 109.288 110.598 111.642 112.461 113.203 113.887 114.474 114.948 115.408 115.794 116.105 116.423 116.72 116.926 117.125 117.335 117.493 117.629 117.752 117.867 117.961 118.023 118.079 118.151 118.199 118.246 118.267 118.298 118.307 118.3 118.294 118.184 118.258 118.234 118.212 118.139 118.082 118.009 117.906 117.766 117.609 117.372 116.389 -7 ,29450 ,KEBNE ,17126059,Thu Dec 30 18:13:53 CET,Thu Dec 30 19:48:31 CET,0.0 1.451 2.094 2.591 3.027 3.405 3.717 4.02 4.623 4.912 5.183 5.473 5.957 6.207 6.68 7.15 7.609 7.829 8.266 8.696 9.327 9.728 10.115 10.705 11.293 11.864 12.434 12.999 13.747 14.482 15.197 16.075 16.939 17.8 18.804 19.958 21.103 22.375 23.791 25.332 26.998 28.942 31.242 33.624 36.549 40.012 44.225 49.156 55.281 63.189 73.818 83.871 90.66 95.421 99.005 101.892 104.141 106.033 107.49 108.785 109.814 110.663 111.428 112.09 112.664 113.152 113.619 114.004 114.306 114.602 114.885 115.089 115.3 115.501 115.642 115.772 115.891 116.023 116.145 116.216 116.289 116.386 116.429 116.473 116.492 116.495 116.487 116.491 116.494 116.386 116.448 116.416 116.381 116.286 116.218 116.133 116.04 115.924 115.749 115.459 114.523 -8 ,11382 ,KEBNE ,17126060,Thu Dec 30 18:14:01 CET,Thu Dec 30 19:48:43 CET,0.0 1.37 1.965 2.382 2.747 3.093 3.433 3.762 4.368 4.662 4.954 5.254 5.732 5.984 6.471 6.953 7.402 7.615 8.049 8.485 9.145 9.566 9.973 10.575 11.154 11.718 12.268 12.814 13.547 14.283 14.993 15.851 16.707 17.543 18.537 19.714 20.878 22.169 23.595 25.154 26.842 28.8 31.133 33.543 36.518 39.989 44.117 49.029 55.221 63.123 73.868 83.993 90.68 95.546 99.207 102.099 104.341 106.152 107.561 108.856 109.891 110.744 111.492 112.151 112.732 113.222 113.676 114.057 114.368 114.659 114.944 115.165 115.382 115.588 115.729 115.859 116.0 116.131 116.23 116.291 116.35 116.436 116.477 116.508 116.529 116.552 116.556 116.564 116.56 116.44 116.502 116.47 116.431 116.328 116.261 116.196 116.128 116.03 115.846 115.54 114.506 -9 ,28902 ,KEBNE ,17126061,Thu Dec 30 18:14:14 CET,Thu Dec 30 19:48:41 CET,0.0 1.507 2.043 2.502 2.921 3.31 3.654 3.963 4.561 4.841 5.118 5.427 5.908 6.156 6.664 7.155 7.621 7.852 8.299 8.72 9.34 9.75 10.16 10.771 11.37 11.958 12.531 13.089 13.823 14.543 15.248 16.112 16.957 17.783 18.79 19.97 21.119 22.408 23.845 25.4 27.05 28.973 31.306 33.747 36.7 40.143 44.301 49.219 55.385 63.255 73.912 84.039 90.711 95.553 99.143 101.929 104.151 105.95 107.366 108.692 109.726 110.558 111.308 111.957 112.512 113.006 113.483 113.854 114.147 114.429 114.706 114.926 115.129 115.303 115.448 115.604 115.748 115.893 116.027 116.102 116.173 116.264 116.314 116.347 116.356 116.373 116.385 116.365 116.344 116.223 116.286 116.267 116.235 116.105 116.022 115.927 115.833 115.71 115.511 115.232 114.347 -10 ,21514 ,KEBNE ,17126062,Thu Dec 30 18:14:27 CET,Thu Dec 30 19:48:50 CET,0.0 1.56 2.167 2.657 3.064 3.434 3.793 4.133 4.747 5.045 5.342 5.649 6.135 6.391 6.888 7.372 7.833 8.059 8.507 8.955 9.612 10.029 10.435 11.037 11.623 12.193 12.765 13.332 14.069 14.802 15.526 16.405 17.264 18.111 19.125 20.29 21.441 22.755 24.218 25.776 27.435 29.381 31.708 34.115 37.071 40.566 44.796 49.761 55.882 63.722 74.376 84.589 91.446 96.359 99.984 102.779 105.024 106.87 108.299 109.575 110.601 111.48 112.217 112.852 113.403 113.864 114.323 114.712 115.028 115.306 115.578 115.807 116.022 116.227 116.369 116.5 116.617 116.717 116.82 116.886 116.952 117.045 117.084 117.125 117.147 117.166 117.173 117.171 117.171 117.061 117.137 117.11 117.065 116.961 116.898 116.814 116.692 116.557 116.383 116.086 114.954 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_256.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_256.txt deleted file mode 100644 index 36e80d92..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_256.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12926 ,KEBNE ,16708700,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:18:49 CET,0.0 1.061 1.495 1.785 2.017 2.238 2.442 2.625 2.938 3.081 3.218 3.255 3.614 3.74 3.953 4.148 4.346 4.442 4.628 4.814 5.068 5.205 5.328 5.5 5.676 5.867 6.046 6.209 6.411 6.614 6.811 7.027 7.217 7.381 7.584 7.814 8.021 8.247 8.492 8.742 8.974 9.233 9.497 9.699 9.893 10.074 10.254 10.384 10.394 10.151 9.362 8.143 6.972 5.89 4.93 4.032 3.247 2.537 1.915 1.299 0.755 0.288 -0.154 -0.579 -0.954 -1.286 -1.631 -1.987 -2.332 -2.658 -2.997 -3.291 -3.567 -3.851 -4.083 -4.316 -4.558 -4.804 -5.055 -5.233 -5.422 -5.723 -5.928 -6.14 -6.264 -6.537 -6.802 -7.098 -7.257 -7.652 -7.734 -7.909 -8.083 -8.477 -8.713 -8.95 -9.215 -9.549 -9.935 -10.448 -12.431 -2 ,27642 ,KEBNE ,16708701,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:15:39 CET,0.0 1.78 2.145 2.41 2.679 2.941 3.148 3.32 3.651 3.808 3.959 3.992 4.342 4.464 4.716 4.928 5.119 5.217 5.391 5.547 5.777 5.919 6.056 6.261 6.44 6.589 6.745 6.916 7.128 7.323 7.506 7.726 7.918 8.089 8.267 8.464 8.679 8.939 9.187 9.396 9.599 9.817 10.034 10.215 10.42 10.624 10.828 10.978 10.957 10.672 9.879 8.592 7.432 6.396 5.446 4.587 3.841 3.173 2.582 1.955 1.42 0.888 0.385 -0.023 -0.428 -0.808 -1.238 -1.61 -1.895 -2.204 -2.539 -2.818 -3.088 -3.378 -3.623 -3.871 -4.139 -4.419 -4.693 -4.885 -5.077 -5.391 -5.625 -5.868 -5.994 -6.269 -6.541 -6.8 -6.938 -7.321 -7.385 -7.544 -7.715 -8.066 -8.273 -8.526 -8.799 -9.129 -9.558 -10.103 -12.083 -3 ,26179 ,KEBNE ,16708702,Fri Nov 26 18:44:27 CET,Fri Nov 26 20:19:28 CET,0.0 1.076 1.468 1.737 1.988 2.218 2.41 2.57 2.86 3.004 3.141 3.165 3.517 3.649 3.876 4.096 4.309 4.402 4.576 4.744 4.982 5.137 5.284 5.494 5.692 5.858 6.025 6.199 6.412 6.592 6.752 6.967 7.179 7.352 7.548 7.78 7.995 8.232 8.497 8.736 8.93 9.142 9.38 9.594 9.8 10.008 10.2 10.308 10.337 10.052 9.239 8.017 6.846 5.81 4.888 4.037 3.271 2.556 1.951 1.358 0.836 0.369 -0.083 -0.506 -0.898 -1.26 -1.653 -2.019 -2.34 -2.664 -2.981 -3.249 -3.562 -3.874 -4.108 -4.378 -4.646 -4.901 -5.181 -5.379 -5.565 -5.846 -6.047 -6.262 -6.37 -6.604 -6.869 -7.153 -7.293 -7.668 -7.717 -7.87 -8.032 -8.406 -8.617 -8.845 -9.098 -9.393 -9.721 -10.231 -11.823 -4 ,12863 ,KEBNE ,16708703,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:15:57 CET,0.0 1.62 2.024 2.329 2.606 2.843 3.047 3.231 3.569 3.712 3.848 3.89 4.245 4.365 4.575 4.753 4.917 5.001 5.188 5.379 5.627 5.776 5.917 6.114 6.3 6.475 6.634 6.781 6.977 7.178 7.379 7.608 7.797 7.956 8.133 8.342 8.562 8.794 9.023 9.24 9.444 9.673 9.919 10.13 10.347 10.559 10.796 10.961 10.951 10.699 9.889 8.657 7.502 6.417 5.49 4.653 3.901 3.231 2.633 2.008 1.485 1.03 0.603 0.18 -0.226 -0.587 -0.978 -1.355 -1.662 -1.96 -2.3 -2.572 -2.832 -3.132 -3.364 -3.601 -3.855 -4.138 -4.443 -4.638 -4.829 -5.124 -5.34 -5.567 -5.682 -5.916 -6.192 -6.482 -6.613 -6.986 -7.05 -7.222 -7.404 -7.811 -8.041 -8.287 -8.572 -8.908 -9.277 -9.777 -11.645 -5 ,30910 ,KEBNE ,16708704,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:16:08 CET,0.0 1.126 1.503 1.79 2.019 2.224 2.433 2.614 2.901 3.043 3.193 3.236 3.59 3.704 3.919 4.139 4.353 4.453 4.63 4.781 4.997 5.148 5.289 5.508 5.723 5.912 6.102 6.285 6.503 6.676 6.838 7.039 7.225 7.406 7.602 7.815 8.001 8.191 8.411 8.639 8.866 9.104 9.34 9.559 9.796 9.996 10.138 10.19 10.162 9.934 9.144 7.858 6.706 5.645 4.699 3.862 3.126 2.454 1.872 1.246 0.7 0.184 -0.338 -0.785 -1.168 -1.528 -1.929 -2.293 -2.617 -2.958 -3.282 -3.544 -3.846 -4.186 -4.434 -4.655 -4.89 -5.159 -5.43 -5.622 -5.828 -6.146 -6.372 -6.587 -6.702 -6.945 -7.189 -7.47 -7.617 -8.005 -8.093 -8.261 -8.445 -8.851 -9.071 -9.29 -9.531 -9.848 -10.221 -10.694 -12.466 -6 ,24359 ,KEBNE ,16708705,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:15:49 CET,0.0 1.531 1.964 2.256 2.495 2.723 2.952 3.165 3.482 3.614 3.757 3.8 4.152 4.272 4.513 4.724 4.91 4.999 5.17 5.319 5.52 5.658 5.8 5.999 6.195 6.373 6.515 6.648 6.832 7.022 7.202 7.401 7.619 7.83 8.037 8.263 8.455 8.655 8.857 9.065 9.292 9.531 9.762 9.965 10.192 10.403 10.584 10.7 10.713 10.513 9.771 8.563 7.462 6.45 5.531 4.692 3.942 3.26 2.653 2.043 1.525 1.08 0.635 0.189 -0.199 -0.557 -0.925 -1.243 -1.535 -1.865 -2.206 -2.466 -2.758 -3.079 -3.323 -3.581 -3.853 -4.124 -4.403 -4.599 -4.783 -5.053 -5.239 -5.436 -5.551 -5.807 -6.075 -6.357 -6.513 -6.909 -6.996 -7.167 -7.346 -7.721 -7.918 -8.152 -8.443 -8.763 -9.145 -9.678 -11.101 -7 ,3842 ,KEBNE ,16708706,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:15:43 CET,0.0 1.713 2.142 2.453 2.708 2.945 3.156 3.337 3.672 3.829 3.979 4.013 4.361 4.469 4.669 4.885 5.082 5.178 5.374 5.546 5.789 5.938 6.08 6.291 6.473 6.632 6.806 6.995 7.234 7.441 7.594 7.766 7.94 8.105 8.301 8.527 8.724 8.946 9.179 9.409 9.653 9.878 10.133 10.357 10.554 10.75 10.887 10.944 10.915 10.615 9.812 8.628 7.506 6.493 5.583 4.706 3.95 3.257 2.635 2.044 1.53 1.048 0.563 0.114 -0.304 -0.691 -1.082 -1.444 -1.76 -2.089 -2.412 -2.677 -2.968 -3.278 -3.519 -3.778 -4.062 -4.319 -4.575 -4.758 -4.947 -5.272 -5.511 -5.739 -5.854 -6.105 -6.354 -6.61 -6.753 -7.133 -7.202 -7.373 -7.564 -7.971 -8.207 -8.465 -8.731 -9.052 -9.429 -9.987 -11.919 -8 ,30336 ,KEBNE ,16708707,Fri Nov 26 18:46:28 CET,Fri Nov 26 20:18:07 CET,0.0 1.521 1.962 2.278 2.51 2.719 2.936 3.138 3.475 3.623 3.754 3.782 4.143 4.256 4.453 4.662 4.852 4.933 5.08 5.236 5.465 5.6 5.741 5.942 6.137 6.34 6.506 6.637 6.824 7.006 7.196 7.429 7.625 7.816 8.035 8.255 8.447 8.68 8.922 9.136 9.33 9.552 9.813 10.055 10.3 10.512 10.71 10.796 10.766 10.554 9.801 8.585 7.459 6.395 5.447 4.6 3.801 3.068 2.471 1.875 1.354 0.892 0.443 -0.026 -0.484 -0.855 -1.237 -1.608 -1.91 -2.204 -2.53 -2.814 -3.096 -3.377 -3.596 -3.825 -4.069 -4.32 -4.584 -4.781 -4.995 -5.296 -5.502 -5.719 -5.828 -6.079 -6.336 -6.621 -6.781 -7.174 -7.241 -7.412 -7.603 -8.009 -8.227 -8.459 -8.721 -9.016 -9.36 -9.845 -11.967 -9 ,80 ,KEBNE ,16708708,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:15:56 CET,0.0 1.317 1.738 2.064 2.337 2.572 2.77 2.932 3.217 3.356 3.499 3.544 3.892 4.002 4.213 4.429 4.633 4.727 4.893 5.061 5.314 5.457 5.593 5.8 6.007 6.19 6.358 6.521 6.714 6.911 7.119 7.342 7.525 7.713 7.942 8.174 8.377 8.563 8.748 8.965 9.193 9.436 9.683 9.903 10.116 10.278 10.442 10.538 10.506 10.255 9.486 8.247 7.075 6.029 5.132 4.324 3.58 2.88 2.276 1.684 1.164 0.664 0.165 -0.274 -0.651 -1.027 -1.457 -1.851 -2.173 -2.496 -2.838 -3.098 -3.389 -3.704 -3.932 -4.163 -4.395 -4.652 -4.929 -5.121 -5.311 -5.574 -5.765 -5.991 -6.107 -6.332 -6.585 -6.859 -6.997 -7.379 -7.431 -7.584 -7.765 -8.171 -8.392 -8.648 -8.934 -9.249 -9.633 -10.161 -11.639 -10 ,29832 ,KEBNE ,16708709,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:17:00 CET,0.0 1.332 1.81 2.167 2.442 2.676 2.885 3.078 3.416 3.561 3.688 3.707 4.06 4.176 4.397 4.601 4.782 4.875 5.061 5.215 5.434 5.59 5.738 5.942 6.117 6.264 6.414 6.584 6.803 6.966 7.106 7.299 7.515 7.707 7.898 8.117 8.316 8.522 8.731 8.941 9.176 9.414 9.646 9.854 10.058 10.253 10.41 10.508 10.488 10.245 9.508 8.294 7.133 6.09 5.142 4.273 3.522 2.824 2.223 1.649 1.141 0.674 0.226 -0.207 -0.62 -0.989 -1.377 -1.719 -1.998 -2.288 -2.613 -2.883 -3.163 -3.467 -3.703 -3.941 -4.187 -4.47 -4.773 -4.978 -5.198 -5.533 -5.745 -5.964 -6.083 -6.338 -6.604 -6.859 -6.988 -7.364 -7.425 -7.592 -7.767 -8.15 -8.368 -8.607 -8.866 -9.189 -9.535 -9.952 -11.889 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_336.txt deleted file mode 100644 index a93cbb78..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11333 ,KEBNE ,16708710,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:15:34 CET,0.0 1.456 1.865 2.189 2.487 2.736 2.945 3.146 3.498 3.651 3.795 3.831 4.177 4.294 4.511 4.706 4.895 4.987 5.18 5.367 5.591 5.728 5.881 6.116 6.314 6.507 6.697 6.87 7.086 7.281 7.461 7.675 7.888 8.099 8.323 8.565 8.811 9.072 9.325 9.564 9.785 10.041 10.372 10.678 10.969 11.21 11.436 11.653 11.757 11.619 10.989 9.937 8.923 7.92 7.0 6.171 5.417 4.738 4.152 3.573 3.076 2.619 2.191 1.777 1.407 1.063 0.701 0.378 0.085 -0.213 -0.532 -0.808 -1.107 -1.405 -1.623 -1.847 -2.084 -2.346 -2.614 -2.802 -3.009 -3.311 -3.532 -3.778 -3.896 -4.127 -4.37 -4.63 -4.763 -5.139 -5.228 -5.4 -5.578 -5.971 -6.176 -6.397 -6.645 -6.923 -7.254 -7.688 -8.964 -2 ,9158 ,KEBNE ,16708711,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:15:55 CET,0.0 1.055 1.441 1.746 1.994 2.231 2.448 2.628 2.922 3.063 3.2 3.212 3.551 3.665 3.869 4.057 4.268 4.36 4.518 4.665 4.902 5.064 5.196 5.39 5.603 5.815 6.02 6.208 6.435 6.657 6.875 7.131 7.342 7.531 7.766 8.021 8.268 8.513 8.743 9.009 9.279 9.538 9.834 10.14 10.471 10.779 11.064 11.304 11.475 11.433 10.919 9.861 8.781 7.755 6.794 5.94 5.194 4.514 3.944 3.354 2.836 2.374 1.934 1.535 1.156 0.795 0.423 0.094 -0.235 -0.597 -0.926 -1.187 -1.493 -1.822 -2.062 -2.304 -2.558 -2.823 -3.086 -3.262 -3.445 -3.745 -3.943 -4.158 -4.277 -4.511 -4.762 -5.03 -5.17 -5.557 -5.631 -5.795 -5.966 -6.359 -6.596 -6.842 -7.082 -7.358 -7.679 -8.116 -9.595 -3 ,8769 ,KEBNE ,16708712,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:16:17 CET,0.0 1.017 1.476 1.824 2.101 2.324 2.516 2.699 3.044 3.195 3.344 3.392 3.736 3.84 4.066 4.291 4.496 4.594 4.783 4.99 5.274 5.434 5.595 5.809 5.997 6.196 6.377 6.551 6.779 6.977 7.156 7.376 7.617 7.833 8.051 8.303 8.551 8.796 9.026 9.268 9.525 9.834 10.156 10.428 10.732 11.039 11.335 11.568 11.701 11.662 11.146 10.082 9.001 7.994 7.114 6.316 5.617 4.969 4.358 3.759 3.237 2.746 2.283 1.84 1.428 1.049 0.657 0.314 0.038 -0.262 -0.592 -0.856 -1.121 -1.398 -1.622 -1.861 -2.123 -2.402 -2.689 -2.886 -3.07 -3.35 -3.588 -3.837 -3.947 -4.182 -4.436 -4.714 -4.864 -5.25 -5.347 -5.536 -5.726 -6.111 -6.323 -6.557 -6.812 -7.076 -7.36 -7.795 -8.838 -4 ,31685 ,KEBNE ,16708713,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:15:57 CET,0.0 1.001 1.37 1.644 1.875 2.084 2.292 2.476 2.784 2.946 3.098 3.11 3.448 3.562 3.797 4.024 4.239 4.331 4.5 4.662 4.891 5.035 5.182 5.393 5.592 5.787 5.981 6.177 6.401 6.596 6.777 6.997 7.221 7.438 7.696 7.96 8.204 8.496 8.774 9.031 9.298 9.569 9.846 10.116 10.402 10.686 10.995 11.256 11.379 11.284 10.711 9.687 8.676 7.709 6.794 5.963 5.245 4.575 3.974 3.393 2.894 2.431 1.979 1.562 1.178 0.824 0.461 0.134 -0.149 -0.451 -0.795 -1.082 -1.381 -1.683 -1.919 -2.173 -2.414 -2.658 -2.916 -3.105 -3.312 -3.614 -3.827 -4.048 -4.168 -4.409 -4.639 -4.895 -5.022 -5.395 -5.461 -5.63 -5.799 -6.157 -6.36 -6.589 -6.835 -7.105 -7.43 -7.829 -8.866 -5 ,2721 ,KEBNE ,16708714,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:15:49 CET,0.0 1.271 1.654 1.942 2.208 2.433 2.625 2.8 3.093 3.231 3.369 3.397 3.747 3.867 4.096 4.299 4.492 4.591 4.792 4.965 5.217 5.383 5.534 5.732 5.928 6.125 6.304 6.48 6.713 6.918 7.103 7.331 7.539 7.738 7.982 8.246 8.472 8.694 8.928 9.182 9.459 9.774 10.106 10.387 10.667 10.941 11.21 11.421 11.549 11.476 10.878 9.735 8.646 7.689 6.828 6.002 5.275 4.637 4.078 3.495 2.982 2.525 2.08 1.657 1.222 0.818 0.416 0.058 -0.24 -0.55 -0.879 -1.142 -1.4 -1.689 -1.923 -2.161 -2.43 -2.7 -2.953 -3.125 -3.303 -3.586 -3.779 -3.979 -4.091 -4.34 -4.593 -4.854 -4.985 -5.356 -5.433 -5.605 -5.774 -6.145 -6.352 -6.576 -6.81 -7.063 -7.359 -7.768 -9.189 -6 ,10795 ,KEBNE ,16708715,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:16:04 CET,0.0 1.293 1.722 2.048 2.32 2.555 2.762 2.951 3.308 3.453 3.59 3.648 4.01 4.132 4.334 4.513 4.689 4.775 4.949 5.124 5.358 5.503 5.653 5.875 6.081 6.267 6.456 6.626 6.816 7.008 7.2 7.433 7.64 7.839 8.073 8.326 8.563 8.809 9.059 9.338 9.621 9.893 10.197 10.451 10.716 10.991 11.266 11.499 11.609 11.507 10.941 9.958 8.978 8.022 7.096 6.253 5.488 4.783 4.211 3.627 3.118 2.644 2.108 1.622 1.241 0.901 0.532 0.196 -0.11 -0.422 -0.712 -0.96 -1.219 -1.47 -1.668 -1.896 -2.134 -2.387 -2.666 -2.852 -3.051 -3.357 -3.558 -3.754 -3.865 -4.103 -4.348 -4.616 -4.761 -5.152 -5.219 -5.378 -5.543 -5.881 -6.079 -6.319 -6.576 -6.846 -7.17 -7.639 -8.977 -7 ,11363 ,KEBNE ,16708716,Fri Nov 26 18:44:26 CET,Fri Nov 26 20:16:04 CET,0.0 1.267 1.639 1.937 2.187 2.407 2.625 2.811 3.111 3.254 3.393 3.425 3.778 3.896 4.107 4.31 4.517 4.614 4.783 4.94 5.15 5.292 5.443 5.656 5.865 6.066 6.257 6.426 6.622 6.823 7.019 7.233 7.442 7.656 7.895 8.162 8.441 8.725 8.986 9.247 9.508 9.79 10.075 10.376 10.734 11.055 11.336 11.541 11.652 11.53 10.907 9.795 8.723 7.722 6.818 5.999 5.259 4.593 4.024 3.443 2.913 2.437 2.002 1.593 1.21 0.865 0.499 0.14 -0.211 -0.567 -0.9 -1.167 -1.455 -1.751 -1.969 -2.199 -2.452 -2.721 -2.991 -3.162 -3.332 -3.613 -3.827 -4.056 -4.167 -4.397 -4.633 -4.882 -5.018 -5.394 -5.447 -5.606 -5.778 -6.145 -6.343 -6.554 -6.79 -7.056 -7.378 -7.791 -9.021 -8 ,4463 ,KEBNE ,16708717,Fri Nov 26 18:46:32 CET,Fri Nov 26 20:18:13 CET,0.0 1.096 1.448 1.737 1.989 2.229 2.438 2.616 2.926 3.062 3.192 3.214 3.57 3.687 3.893 4.11 4.33 4.426 4.598 4.783 5.05 5.21 5.365 5.585 5.813 6.015 6.197 6.379 6.609 6.843 7.051 7.304 7.531 7.732 7.977 8.217 8.445 8.716 8.982 9.24 9.512 9.805 10.103 10.363 10.645 10.916 11.168 11.371 11.444 11.345 10.797 9.726 8.632 7.593 6.695 5.906 5.16 4.496 3.934 3.35 2.843 2.395 1.956 1.529 1.13 0.763 0.378 0.007 -0.299 -0.589 -0.918 -1.219 -1.52 -1.825 -2.057 -2.301 -2.567 -2.843 -3.111 -3.288 -3.484 -3.791 -3.995 -4.209 -4.327 -4.563 -4.819 -5.096 -5.23 -5.602 -5.643 -5.798 -5.971 -6.345 -6.54 -6.74 -6.98 -7.255 -7.551 -7.963 -9.173 -9 ,22040 ,KEBNE ,16708718,Fri Nov 26 18:46:28 CET,Fri Nov 26 20:18:03 CET,0.0 1.027 1.403 1.711 1.979 2.196 2.406 2.591 2.919 3.068 3.206 3.236 3.582 3.695 3.921 4.124 4.304 4.398 4.599 4.797 5.054 5.21 5.347 5.547 5.772 6.009 6.214 6.376 6.568 6.751 6.927 7.145 7.369 7.577 7.813 8.069 8.305 8.547 8.807 9.092 9.362 9.623 9.926 10.243 10.541 10.799 11.05 11.244 11.372 11.322 10.755 9.643 8.551 7.546 6.67 5.874 5.145 4.499 3.927 3.34 2.847 2.404 1.946 1.509 1.085 0.685 0.311 -0.022 -0.316 -0.602 -0.902 -1.175 -1.463 -1.746 -1.978 -2.24 -2.516 -2.78 -3.035 -3.223 -3.424 -3.723 -3.928 -4.131 -4.242 -4.49 -4.746 -5.01 -5.144 -5.523 -5.592 -5.762 -5.934 -6.307 -6.527 -6.768 -7.014 -7.28 -7.586 -7.991 -9.162 -10 ,24844 ,KEBNE ,16708719,Fri Nov 26 18:46:28 CET,Fri Nov 26 20:19:03 CET,0.0 1.024 1.403 1.736 1.98 2.161 2.359 2.569 2.909 3.048 3.175 3.212 3.566 3.672 3.858 4.056 4.265 4.352 4.524 4.691 4.92 5.072 5.225 5.457 5.665 5.852 6.021 6.185 6.419 6.64 6.837 7.082 7.316 7.518 7.759 8.037 8.29 8.551 8.794 9.063 9.365 9.658 9.958 10.276 10.59 10.895 11.216 11.46 11.582 11.5 11.022 10.045 8.974 7.947 7.017 6.184 5.447 4.792 4.242 3.651 3.122 2.659 2.226 1.827 1.448 1.093 0.734 0.415 0.112 -0.223 -0.547 -0.801 -1.095 -1.397 -1.619 -1.867 -2.134 -2.407 -2.688 -2.877 -3.063 -3.366 -3.565 -3.784 -3.911 -4.16 -4.398 -4.639 -4.773 -5.165 -5.263 -5.433 -5.611 -5.998 -6.21 -6.436 -6.69 -7.01 -7.378 -7.789 -8.816 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_67.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_67.txt deleted file mode 100644 index ba24fd8b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_252_67.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16908 ,KEBNE ,16708720,Fri Nov 26 18:46:28 CET,Fri Nov 26 20:17:06 CET,0.0 1.688 2.208 2.612 2.968 3.309 3.64 3.95 4.513 4.781 5.052 5.375 5.888 6.159 6.682 7.201 7.702 7.946 8.421 8.889 9.586 10.052 10.506 11.168 11.837 12.498 13.158 13.824 14.694 15.551 16.391 17.403 18.425 19.444 20.642 22.031 23.413 24.98 26.719 28.616 30.695 33.102 36.033 39.119 42.863 47.31 52.693 59.122 67.223 77.623 91.73 105.046 113.954 120.494 125.521 129.508 132.59 135.09 137.082 138.907 140.336 141.558 142.649 143.582 144.388 145.075 145.749 146.31 146.752 147.167 147.577 147.901 148.224 148.543 148.762 148.965 149.162 149.354 149.538 149.653 149.752 149.871 149.937 150.008 150.041 150.093 150.123 150.113 150.103 150.039 150.073 150.044 149.997 149.89 149.79 149.65 149.484 149.275 148.995 148.566 146.067 -2 ,14738 ,KEBNE ,16708721,Fri Nov 26 18:46:29 CET,Fri Nov 26 20:18:01 CET,0.0 1.547 2.028 2.428 2.801 3.15 3.477 3.789 4.386 4.679 4.959 5.261 5.754 6.019 6.547 7.053 7.543 7.79 8.286 8.774 9.486 9.954 10.418 11.087 11.74 12.397 13.053 13.699 14.545 15.38 16.216 17.259 18.282 19.287 20.472 21.839 23.211 24.778 26.528 28.459 30.52 32.895 35.798 38.84 42.553 46.962 52.365 58.785 66.862 77.329 91.589 105.298 114.547 121.19 126.201 130.177 133.238 135.731 137.749 139.582 141.011 142.21 143.269 144.201 145.018 145.719 146.396 146.958 147.432 147.9 148.317 148.621 148.917 149.208 149.419 149.624 149.809 149.988 150.174 150.28 150.38 150.513 150.572 150.626 150.655 150.693 150.713 150.725 150.723 150.656 150.67 150.626 150.562 150.396 150.293 150.177 150.028 149.823 149.553 149.12 147.292 -3 ,29998 ,KEBNE ,16708722,Fri Nov 26 18:46:28 CET,Fri Nov 26 20:18:03 CET,0.0 1.443 1.927 2.331 2.698 3.044 3.369 3.669 4.268 4.555 4.832 5.151 5.648 5.907 6.419 6.915 7.391 7.633 8.121 8.598 9.296 9.754 10.207 10.882 11.548 12.209 12.869 13.514 14.342 15.181 16.03 17.068 18.099 19.13 20.347 21.738 23.113 24.689 26.451 28.374 30.417 32.772 35.675 38.726 42.444 46.816 52.138 58.603 66.741 77.183 91.466 105.07 114.197 120.857 125.895 129.87 132.97 135.498 137.507 139.339 140.784 141.969 143.006 143.913 144.71 145.39 146.046 146.595 147.037 147.462 147.884 148.225 148.533 148.821 149.046 149.252 149.435 149.619 149.799 149.894 149.986 150.111 150.173 150.233 150.257 150.308 150.329 150.322 150.321 150.261 150.284 150.242 150.199 150.111 150.034 149.935 149.812 149.656 149.371 148.834 146.782 -4 ,16576 ,KEBNE ,16708723,Fri Nov 26 18:47:29 CET,Fri Nov 26 20:18:08 CET,0.0 1.229 1.702 2.102 2.484 2.835 3.181 3.511 4.091 4.365 4.635 4.945 5.45 5.716 6.221 6.703 7.196 7.445 7.93 8.404 9.098 9.548 9.999 10.674 11.322 11.958 12.587 13.217 14.058 14.891 15.724 16.745 17.739 18.732 19.942 21.34 22.716 24.266 25.962 27.833 29.925 32.367 35.289 38.36 42.13 46.568 51.941 58.343 66.367 76.763 90.909 104.421 113.678 120.338 125.278 129.239 132.365 134.904 136.937 138.813 140.272 141.465 142.555 143.511 144.326 145.021 145.698 146.257 146.68 147.09 147.513 147.837 148.144 148.449 148.671 148.883 149.078 149.26 149.446 149.552 149.655 149.815 149.893 149.938 149.96 150.013 150.043 150.058 150.053 149.989 150.013 149.98 149.943 149.804 149.715 149.609 149.466 149.284 149.014 148.571 146.172 -5 ,11145 ,KEBNE ,16708724,Fri Nov 26 18:47:29 CET,Fri Nov 26 20:19:37 CET,0.0 1.216 1.738 2.162 2.524 2.862 3.191 3.507 4.112 4.392 4.672 4.998 5.503 5.768 6.272 6.769 7.26 7.504 7.996 8.49 9.199 9.661 10.128 10.813 11.482 12.148 12.81 13.454 14.31 15.152 15.996 17.055 18.06 19.047 20.227 21.578 22.913 24.463 26.186 28.048 30.065 32.418 35.336 38.379 42.083 46.434 51.704 58.001 65.992 76.418 90.537 103.928 112.938 119.473 124.387 128.304 131.393 133.92 135.914 137.696 139.106 140.294 141.36 142.291 143.094 143.793 144.465 145.01 145.447 145.866 146.279 146.596 146.905 147.204 147.422 147.623 147.802 147.976 148.137 148.233 148.311 148.412 148.483 148.555 148.584 148.628 148.657 148.662 148.664 148.605 148.621 148.59 148.548 148.444 148.363 148.262 148.105 147.868 147.612 147.273 145.577 -6 ,4259 ,KEBNE ,16708725,Fri Nov 26 18:47:29 CET,Fri Nov 26 20:19:22 CET,0.0 0.879 1.365 1.8 2.162 2.487 2.804 3.106 3.663 3.941 4.22 4.535 5.034 5.295 5.801 6.309 6.805 7.049 7.541 8.019 8.714 9.172 9.615 10.274 10.948 11.619 12.275 12.928 13.804 14.657 15.491 16.518 17.523 18.521 19.727 21.127 22.494 24.043 25.775 27.661 29.71 32.124 35.087 38.192 41.905 46.304 51.678 58.02 66.009 76.319 90.34 103.67 112.673 119.345 124.381 128.332 131.428 133.928 135.914 137.751 139.2 140.409 141.451 142.353 143.15 143.844 144.524 145.074 145.532 145.986 146.413 146.743 147.06 147.358 147.571 147.77 147.956 148.129 148.294 148.401 148.503 148.65 148.744 148.836 148.871 148.918 148.937 148.939 148.943 148.882 148.89 148.848 148.79 148.644 148.567 148.458 148.305 148.131 147.892 147.467 144.717 -7 ,15888 ,KEBNE ,16708726,Fri Nov 26 18:48:31 CET,Fri Nov 26 20:20:28 CET,0.0 1.144 1.669 2.117 2.489 2.831 3.161 3.477 4.039 4.302 4.573 4.892 5.38 5.633 6.137 6.639 7.135 7.377 7.85 8.324 9.022 9.478 9.92 10.559 11.211 11.861 12.501 13.143 13.989 14.825 15.653 16.687 17.695 18.683 19.868 21.259 22.653 24.203 25.888 27.74 29.816 32.28 35.261 38.365 42.13 46.542 51.916 58.447 66.661 77.129 91.254 104.728 113.904 120.551 125.553 129.539 132.669 135.213 137.212 139.056 140.522 141.729 142.801 143.737 144.548 145.24 145.9 146.453 146.902 147.335 147.758 148.091 148.421 148.739 148.95 149.161 149.381 149.594 149.783 149.885 149.969 150.083 150.161 150.242 150.278 150.337 150.367 150.364 150.358 150.289 150.287 150.244 150.198 150.062 149.944 149.81 149.67 149.472 149.176 148.709 146.72 -9 ,7704 ,KEBNE ,16708728,Fri Nov 26 18:51:37 CET,Fri Nov 26 20:29:27 CET,0.0 1.599 2.152 2.609 2.986 3.346 3.684 4.009 4.628 4.917 5.197 5.503 6.0 6.265 6.783 7.29 7.8 8.054 8.55 9.027 9.721 10.17 10.617 11.274 11.911 12.557 13.212 13.866 14.707 15.528 16.342 17.368 18.4 19.417 20.62 21.988 23.349 24.909 26.63 28.514 30.6 33.051 35.977 39.01 42.74 47.111 52.429 58.849 66.861 77.191 91.312 104.785 113.905 120.509 125.489 129.417 132.469 134.997 136.99 138.839 140.31 141.516 142.573 143.493 144.285 144.944 145.595 146.142 146.585 147.03 147.462 147.787 148.104 148.399 148.603 148.793 148.968 149.142 149.318 149.423 149.515 149.649 149.73 149.797 149.826 149.875 149.913 149.931 149.924 149.853 149.854 149.814 149.772 149.645 149.567 149.453 149.301 149.113 148.863 148.459 146.503 -10 ,31409 ,KEBNE ,16708729,Fri Nov 26 18:51:37 CET,Fri Nov 26 20:22:01 CET,0.0 1.229 1.752 2.199 2.604 2.982 3.316 3.633 4.238 4.522 4.796 5.108 5.6 5.853 6.364 6.874 7.374 7.617 8.087 8.548 9.241 9.7 10.153 10.823 11.482 12.13 12.78 13.423 14.261 15.107 15.959 17.0 18.011 19.003 20.202 21.606 22.987 24.54 26.251 28.133 30.188 32.592 35.519 38.565 42.276 46.655 51.986 58.38 66.44 76.871 91.155 104.762 113.952 120.558 125.501 129.454 132.586 135.143 137.161 139.036 140.518 141.737 142.815 143.76 144.568 145.249 145.918 146.469 146.912 147.349 147.792 148.149 148.488 148.793 149.004 149.213 149.415 149.618 149.81 149.924 150.026 150.156 150.239 150.3 150.32 150.364 150.383 150.372 150.361 150.288 150.313 150.279 150.234 150.109 150.012 149.896 149.752 149.577 149.353 148.94 146.903 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_254_163.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_254_163.txt deleted file mode 100644 index ed766da3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_254_163.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7940 ,KEBNE ,16708730,Fri Nov 26 18:52:38 CET,Fri Nov 26 20:24:48 CET,0.0 1.075 1.499 1.814 2.086 2.33 2.55 2.76 3.124 3.293 3.466 3.62 3.946 4.121 4.485 4.787 5.054 5.19 5.461 5.709 6.053 6.269 6.473 6.785 7.117 7.458 7.787 8.111 8.534 8.93 9.327 9.79 10.224 10.671 11.187 11.765 12.364 13.065 13.813 14.606 15.447 16.401 17.539 18.681 20.021 21.582 23.456 25.656 28.362 31.669 35.926 39.921 42.532 44.305 45.537 46.437 47.124 47.68 48.109 48.481 48.76 48.98 49.11 49.192 49.283 49.358 49.402 49.392 49.356 49.3 49.254 49.213 49.137 49.066 49.029 48.973 48.897 48.814 48.719 48.66 48.606 48.506 48.417 48.309 48.253 48.14 48.01 47.868 47.793 47.585 47.535 47.439 47.335 47.093 46.949 46.786 46.59 46.376 46.124 45.762 44.393 -3 ,15299 ,KEBNE ,16708732,Fri Nov 26 18:52:42 CET,Fri Nov 26 20:21:27 CET,0.0 1.051 1.527 1.88 2.171 2.423 2.641 2.852 3.27 3.471 3.657 3.826 4.165 4.316 4.618 4.926 5.23 5.376 5.657 5.927 6.316 6.563 6.804 7.174 7.522 7.865 8.194 8.502 8.932 9.368 9.77 10.242 10.723 11.195 11.742 12.368 12.957 13.607 14.328 15.078 15.889 16.814 17.909 19.056 20.402 21.937 23.798 25.98 28.642 31.95 36.238 40.037 42.393 43.992 45.142 46.02 46.674 47.169 47.44 47.614 47.769 47.872 47.961 48.044 48.094 48.123 48.106 48.043 47.994 47.955 47.921 47.88 47.805 47.729 47.681 47.632 47.554 47.441 47.329 47.267 47.21 47.097 46.994 46.882 46.821 46.689 46.549 46.386 46.299 46.09 46.016 45.909 45.793 45.534 45.378 45.191 45.0 44.769 44.487 44.077 42.883 -4 ,741 ,KEBNE ,16708733,Fri Nov 26 18:52:38 CET,Fri Nov 26 20:26:18 CET,0.0 0.961 1.342 1.658 1.931 2.171 2.402 2.612 2.99 3.172 3.345 3.503 3.838 4.002 4.324 4.606 4.869 4.999 5.265 5.537 5.928 6.172 6.413 6.761 7.074 7.38 7.687 7.989 8.399 8.796 9.179 9.655 10.106 10.543 11.084 11.707 12.288 12.929 13.617 14.395 15.265 16.25 17.429 18.619 19.997 21.584 23.464 25.667 28.36 31.724 36.156 40.065 42.56 44.297 45.498 46.403 47.098 47.646 48.055 48.416 48.681 48.893 49.041 49.119 49.197 49.249 49.28 49.319 49.325 49.309 49.277 49.223 49.149 49.078 49.018 48.93 48.831 48.742 48.667 48.605 48.523 48.399 48.315 48.216 48.162 48.037 47.886 47.728 47.642 47.428 47.372 47.276 47.166 46.894 46.745 46.581 46.397 46.196 45.948 45.619 44.504 -5 ,22465 ,KEBNE ,16708734,Fri Nov 26 18:52:38 CET,Fri Nov 26 20:24:40 CET,0.0 1.182 1.565 1.908 2.243 2.532 2.761 2.964 3.334 3.5 3.651 3.781 4.105 4.251 4.542 4.841 5.14 5.285 5.566 5.835 6.201 6.428 6.664 7.01 7.33 7.641 7.952 8.252 8.642 9.04 9.424 9.889 10.352 10.799 11.324 11.926 12.509 13.164 13.876 14.619 15.462 16.441 17.55 18.716 20.097 21.68 23.542 25.657 28.328 31.694 36.042 40.0 42.547 44.303 45.537 46.488 47.205 47.749 48.155 48.504 48.767 48.958 49.107 49.237 49.331 49.381 49.402 49.403 49.42 49.441 49.445 49.421 49.363 49.316 49.288 49.249 49.208 49.169 49.105 49.035 48.947 48.811 48.719 48.625 48.566 48.432 48.31 48.164 48.078 47.869 47.822 47.718 47.585 47.302 47.168 46.996 46.79 46.568 46.298 45.929 44.557 -6 ,24974 ,KEBNE ,16708735,Fri Nov 26 18:52:38 CET,Fri Nov 26 20:24:50 CET,0.0 1.055 1.531 1.925 2.215 2.48 2.727 2.951 3.358 3.535 3.712 3.916 4.272 4.44 4.749 5.036 5.317 5.459 5.741 6.015 6.387 6.607 6.822 7.15 7.48 7.817 8.153 8.489 8.915 9.314 9.711 10.18 10.642 11.117 11.665 12.267 12.86 13.521 14.223 14.994 15.843 16.818 17.968 19.131 20.471 22.013 23.888 26.073 28.694 31.99 36.281 40.006 42.344 43.998 45.187 46.014 46.599 47.062 47.411 47.683 47.862 48.036 48.217 48.348 48.417 48.463 48.479 48.455 48.431 48.423 48.413 48.377 48.307 48.227 48.181 48.141 48.098 48.017 47.942 47.903 47.828 47.695 47.599 47.506 47.462 47.361 47.236 47.092 47.013 46.806 46.756 46.653 46.54 46.279 46.137 45.964 45.756 45.52 45.211 44.796 43.217 -7 ,32763 ,KEBNE ,16708736,Fri Nov 26 18:52:38 CET,Fri Nov 26 20:24:56 CET,0.0 1.012 1.394 1.727 2.032 2.289 2.498 2.713 3.115 3.293 3.465 3.63 3.961 4.11 4.385 4.644 4.908 5.045 5.289 5.507 5.856 6.086 6.309 6.654 6.99 7.312 7.621 7.944 8.377 8.78 9.176 9.639 10.078 10.519 11.052 11.651 12.214 12.843 13.549 14.331 15.143 16.055 17.17 18.344 19.711 21.297 23.259 25.49 28.196 31.593 35.95 39.849 42.392 44.134 45.371 46.331 47.011 47.535 47.944 48.284 48.513 48.671 48.83 48.965 49.05 49.098 49.136 49.167 49.184 49.189 49.168 49.113 49.044 48.969 48.897 48.828 48.772 48.696 48.614 48.564 48.495 48.382 48.298 48.202 48.149 48.024 47.88 47.717 47.626 47.412 47.362 47.26 47.148 46.892 46.727 46.549 46.356 46.125 45.763 45.225 43.304 -8 ,14064 ,KEBNE ,16708737,Fri Nov 26 18:52:38 CET,Fri Nov 26 20:24:51 CET,0.0 1.014 1.379 1.676 1.935 2.151 2.352 2.554 2.934 3.101 3.259 3.393 3.728 3.888 4.203 4.497 4.772 4.909 5.179 5.421 5.767 6.0 6.23 6.567 6.91 7.246 7.553 7.851 8.266 8.691 9.115 9.625 10.088 10.526 11.072 11.691 12.262 12.906 13.603 14.388 15.241 16.196 17.351 18.494 19.829 21.385 23.324 25.586 28.228 31.498 35.769 39.567 41.915 43.5 44.644 45.531 46.197 46.677 46.995 47.258 47.436 47.558 47.665 47.755 47.794 47.805 47.814 47.825 47.82 47.804 47.794 47.778 47.754 47.69 47.632 47.58 47.512 47.434 47.346 47.273 47.195 47.072 46.969 46.869 46.819 46.697 46.565 46.409 46.324 46.102 45.993 45.887 45.76 45.466 45.318 45.142 44.942 44.711 44.426 44.056 42.688 -9 ,4061 ,KEBNE ,16708738,Fri Nov 26 18:53:40 CET,Fri Nov 26 20:25:56 CET,0.0 1.223 1.731 2.118 2.418 2.672 2.918 3.145 3.568 3.763 3.952 4.151 4.517 4.692 5.017 5.329 5.627 5.767 6.032 6.308 6.711 6.946 7.161 7.477 7.797 8.118 8.425 8.711 9.107 9.513 9.917 10.393 10.856 11.333 11.864 12.474 13.073 13.755 14.54 15.342 16.173 17.132 18.255 19.459 20.88 22.463 24.311 26.404 28.993 32.25 36.495 40.318 42.7 44.291 45.452 46.345 46.97 47.426 47.793 48.111 48.317 48.453 48.528 48.546 48.561 48.573 48.569 48.574 48.56 48.519 48.462 48.423 48.374 48.296 48.226 48.137 48.026 47.919 47.816 47.742 47.662 47.534 47.438 47.328 47.276 47.171 47.029 46.86 46.778 46.57 46.517 46.418 46.311 46.055 45.906 45.703 45.478 45.246 44.948 44.549 43.243 -10 ,19070 ,KEBNE ,16708739,Fri Nov 26 18:53:39 CET,Fri Nov 26 20:26:38 CET,0.0 0.823 1.183 1.472 1.713 1.932 2.139 2.325 2.666 2.829 2.987 3.124 3.455 3.626 3.95 4.237 4.533 4.686 4.973 5.238 5.606 5.831 6.058 6.416 6.776 7.102 7.405 7.708 8.094 8.48 8.882 9.382 9.859 10.308 10.817 11.409 12.006 12.655 13.357 14.129 14.939 15.866 17.008 18.176 19.516 21.078 22.971 25.189 27.869 31.182 35.522 39.484 42.055 43.832 45.102 46.045 46.717 47.243 47.65 47.981 48.213 48.377 48.51 48.639 48.736 48.804 48.846 48.837 48.816 48.783 48.723 48.695 48.69 48.667 48.617 48.563 48.509 48.444 48.371 48.3 48.226 48.107 48.017 47.915 47.86 47.751 47.636 47.492 47.409 47.189 47.088 46.976 46.865 46.598 46.449 46.294 46.106 45.87 45.492 44.974 43.626 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_254_251.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_254_251.txt deleted file mode 100644 index 2814384b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_254_251.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20117 ,KEBNE ,16708740,Fri Nov 26 18:53:40 CET,Fri Nov 26 20:26:00 CET,0.0 1.465 1.899 2.232 2.48 2.681 2.859 3.026 3.311 3.443 3.58 3.657 3.961 4.068 4.237 4.415 4.612 4.705 4.862 5.001 5.21 5.339 5.477 5.704 5.909 6.104 6.3 6.5 6.752 6.987 7.216 7.488 7.749 8.014 8.309 8.616 8.894 9.21 9.565 9.902 10.247 10.608 10.967 11.26 11.526 11.774 11.98 12.168 12.271 12.153 11.619 10.594 9.595 8.735 7.951 7.227 6.566 5.967 5.42 4.805 4.283 3.856 3.468 3.107 2.757 2.392 1.995 1.646 1.339 1.029 0.723 0.469 0.205 -0.054 -0.246 -0.466 -0.714 -0.96 -1.209 -1.38 -1.564 -1.862 -2.069 -2.302 -2.427 -2.691 -2.962 -3.226 -3.358 -3.676 -3.811 -3.98 -4.153 -4.533 -4.756 -4.994 -5.244 -5.545 -5.92 -6.408 -8.188 -2 ,15172 ,KEBNE ,16708741,Fri Nov 26 18:53:40 CET,Fri Nov 26 20:27:19 CET,0.0 1.709 2.103 2.4 2.622 2.834 3.032 3.211 3.53 3.676 3.82 3.895 4.174 4.279 4.501 4.705 4.883 4.968 5.14 5.28 5.464 5.59 5.712 5.884 6.043 6.192 6.329 6.463 6.635 6.797 6.963 7.151 7.32 7.528 7.82 8.137 8.405 8.671 8.941 9.232 9.545 9.888 10.256 10.597 10.918 11.156 11.35 11.503 11.585 11.44 10.872 9.923 8.977 8.085 7.313 6.611 5.943 5.333 4.805 4.262 3.784 3.374 2.974 2.585 2.23 1.866 1.473 1.151 0.886 0.619 0.319 0.047 -0.235 -0.524 -0.757 -0.995 -1.238 -1.482 -1.736 -1.915 -2.088 -2.363 -2.568 -2.78 -2.893 -3.131 -3.386 -3.662 -3.799 -4.123 -4.262 -4.421 -4.583 -4.945 -5.147 -5.367 -5.644 -5.981 -6.33 -6.797 -8.101 -3 ,14253 ,KEBNE ,16708742,Fri Nov 26 18:53:40 CET,Fri Nov 26 20:34:21 CET,0.0 1.545 1.96 2.252 2.495 2.7 2.882 3.043 3.331 3.458 3.579 3.627 3.906 4.016 4.222 4.401 4.575 4.667 4.843 4.999 5.234 5.387 5.543 5.78 6.005 6.229 6.423 6.588 6.798 6.985 7.148 7.358 7.58 7.783 8.011 8.283 8.514 8.73 8.965 9.187 9.416 9.651 9.908 10.151 10.388 10.618 10.867 11.063 11.114 10.954 10.319 9.334 8.382 7.502 6.716 5.984 5.358 4.778 4.242 3.687 3.208 2.795 2.403 2.024 1.65 1.27 0.871 0.543 0.246 -0.056 -0.37 -0.653 -0.938 -1.207 -1.406 -1.616 -1.843 -2.093 -2.362 -2.559 -2.766 -3.064 -3.264 -3.479 -3.589 -3.825 -4.073 -4.334 -4.477 -4.804 -4.922 -5.073 -5.233 -5.594 -5.798 -6.026 -6.304 -6.63 -6.987 -7.468 -9.189 -4 ,1798 ,KEBNE ,16708743,Fri Nov 26 18:53:40 CET,Fri Nov 26 20:26:01 CET,0.0 1.706 2.177 2.523 2.792 3.003 3.189 3.375 3.731 3.903 4.059 4.135 4.425 4.534 4.753 4.961 5.159 5.254 5.425 5.588 5.828 5.976 6.107 6.285 6.449 6.627 6.828 7.028 7.264 7.492 7.714 7.977 8.247 8.496 8.786 9.119 9.408 9.691 9.976 10.241 10.477 10.738 11.042 11.33 11.622 11.884 12.126 12.329 12.404 12.299 11.802 10.859 9.862 8.924 8.051 7.252 6.542 5.894 5.351 4.822 4.345 3.894 3.44 2.992 2.552 2.141 1.735 1.368 1.026 0.645 0.254 -0.037 -0.334 -0.649 -0.905 -1.177 -1.447 -1.731 -2.027 -2.232 -2.457 -2.813 -3.059 -3.316 -3.448 -3.715 -3.981 -4.252 -4.394 -4.72 -4.873 -5.053 -5.239 -5.642 -5.865 -6.112 -6.369 -6.686 -7.086 -7.578 -9.879 -5 ,30872 ,KEBNE ,16708744,Fri Nov 26 18:53:39 CET,Fri Nov 26 20:26:10 CET,0.0 1.646 2.096 2.415 2.655 2.853 3.022 3.206 3.535 3.668 3.801 3.878 4.177 4.29 4.505 4.722 4.932 5.029 5.195 5.354 5.604 5.758 5.906 6.117 6.317 6.499 6.67 6.848 7.063 7.259 7.438 7.641 7.844 8.046 8.272 8.501 8.73 8.978 9.234 9.535 9.87 10.213 10.601 10.94 11.231 11.48 11.708 11.903 11.976 11.825 11.243 10.099 9.037 8.13 7.287 6.503 5.774 5.098 4.537 3.96 3.433 2.992 2.589 2.219 1.872 1.519 1.109 0.706 0.343 -0.019 -0.385 -0.705 -1.042 -1.373 -1.628 -1.895 -2.162 -2.434 -2.717 -2.914 -3.127 -3.455 -3.679 -3.902 -4.019 -4.279 -4.544 -4.8 -4.933 -5.255 -5.395 -5.552 -5.707 -6.041 -6.222 -6.434 -6.681 -6.953 -7.309 -7.773 -9.143 -6 ,17906 ,KEBNE ,16708745,Fri Nov 26 18:53:40 CET,Fri Nov 26 20:25:57 CET,0.0 1.752 2.253 2.56 2.796 3.017 3.216 3.386 3.7 3.846 3.981 4.059 4.349 4.45 4.666 4.864 5.032 5.119 5.293 5.457 5.676 5.801 5.924 6.107 6.273 6.451 6.619 6.776 6.985 7.19 7.387 7.61 7.819 7.997 8.189 8.415 8.637 8.878 9.119 9.36 9.589 9.848 10.136 10.391 10.646 10.876 11.098 11.269 11.348 11.249 10.719 9.73 8.751 7.87 7.077 6.33 5.672 5.052 4.507 3.959 3.473 3.035 2.613 2.22 1.846 1.479 1.109 0.796 0.506 0.195 -0.139 -0.42 -0.692 -0.977 -1.202 -1.428 -1.663 -1.908 -2.161 -2.342 -2.527 -2.809 -3.012 -3.233 -3.346 -3.567 -3.795 -4.057 -4.2 -4.523 -4.643 -4.8 -4.972 -5.356 -5.568 -5.792 -6.049 -6.346 -6.714 -7.202 -8.467 -7 ,22678 ,KEBNE ,16708746,Fri Nov 26 18:54:41 CET,Fri Nov 26 20:28:31 CET,0.0 1.494 1.944 2.289 2.53 2.738 2.936 3.108 3.386 3.52 3.655 3.746 4.038 4.15 4.397 4.635 4.839 4.93 5.101 5.279 5.543 5.705 5.864 6.095 6.322 6.549 6.762 6.955 7.203 7.454 7.676 7.923 8.154 8.368 8.597 8.842 9.101 9.379 9.68 10.014 10.36 10.731 11.096 11.435 11.783 12.04 12.273 12.472 12.57 12.484 11.937 10.895 9.865 8.941 8.08 7.285 6.569 5.928 5.352 4.741 4.237 3.781 3.302 2.848 2.404 1.987 1.57 1.195 0.867 0.512 0.171 -0.087 -0.373 -0.691 -0.931 -1.173 -1.427 -1.679 -1.935 -2.11 -2.287 -2.577 -2.782 -2.99 -3.088 -3.285 -3.522 -3.793 -3.927 -4.241 -4.375 -4.537 -4.695 -5.036 -5.239 -5.479 -5.743 -6.018 -6.32 -6.752 -8.453 -8 ,26673 ,KEBNE ,16708747,Fri Nov 26 18:54:41 CET,Fri Nov 26 20:26:50 CET,0.0 1.289 1.703 2.051 2.348 2.584 2.78 2.948 3.24 3.364 3.477 3.53 3.814 3.928 4.148 4.337 4.516 4.599 4.745 4.882 5.093 5.22 5.332 5.517 5.704 5.855 5.99 6.115 6.279 6.453 6.63 6.83 6.99 7.14 7.321 7.509 7.678 7.874 8.082 8.299 8.525 8.759 8.994 9.221 9.453 9.66 9.873 10.014 10.055 9.936 9.386 8.44 7.5 6.642 5.898 5.208 4.563 3.928 3.378 2.818 2.351 1.966 1.598 1.232 0.886 0.557 0.176 -0.15 -0.398 -0.645 -0.932 -1.181 -1.449 -1.74 -1.97 -2.2 -2.431 -2.669 -2.894 -3.057 -3.226 -3.477 -3.663 -3.871 -3.984 -4.219 -4.469 -4.731 -4.863 -5.174 -5.289 -5.444 -5.596 -5.943 -6.151 -6.383 -6.653 -6.974 -7.36 -7.844 -9.014 -9 ,124 ,KEBNE ,16708748,Fri Nov 26 18:54:41 CET,Fri Nov 26 20:28:17 CET,0.0 1.343 1.773 2.018 2.228 2.47 2.702 2.897 3.225 3.369 3.51 3.603 3.9 4.022 4.254 4.463 4.654 4.741 4.894 5.03 5.226 5.352 5.47 5.666 5.852 6.015 6.186 6.363 6.597 6.817 7.026 7.268 7.504 7.746 8.013 8.325 8.611 8.915 9.263 9.562 9.806 10.05 10.323 10.568 10.795 11.009 11.226 11.395 11.464 11.332 10.781 9.809 8.807 7.892 7.079 6.308 5.601 4.89 4.215 3.549 2.989 2.458 1.979 1.593 1.227 0.856 0.462 0.086 -0.275 -0.672 -1.066 -1.376 -1.713 -2.071 -2.347 -2.636 -2.917 -3.196 -3.5 -3.707 -3.912 -4.229 -4.453 -4.684 -4.809 -5.078 -5.352 -5.639 -5.79 -6.112 -6.231 -6.389 -6.553 -6.918 -7.124 -7.35 -7.591 -7.852 -8.178 -8.601 -9.828 -10 ,24249 ,KEBNE ,16708749,Fri Nov 26 18:54:41 CET,Fri Nov 26 20:28:20 CET,0.0 1.419 1.864 2.183 2.417 2.629 2.835 3.014 3.358 3.518 3.663 3.744 4.024 4.123 4.342 4.55 4.73 4.82 4.996 5.161 5.429 5.6 5.745 5.961 6.161 6.331 6.491 6.649 6.866 7.081 7.269 7.472 7.655 7.829 8.036 8.285 8.511 8.751 9.025 9.278 9.504 9.749 10.021 10.267 10.534 10.787 11.016 11.218 11.322 11.244 10.736 9.798 8.845 7.924 7.131 6.382 5.659 4.967 4.398 3.829 3.32 2.866 2.427 2.005 1.625 1.265 0.887 0.565 0.284 -0.01 -0.334 -0.605 -0.875 -1.152 -1.372 -1.596 -1.816 -2.053 -2.317 -2.501 -2.694 -2.997 -3.205 -3.414 -3.522 -3.744 -3.982 -4.259 -4.405 -4.724 -4.825 -4.992 -5.171 -5.552 -5.758 -5.976 -6.212 -6.5 -6.848 -7.313 -8.69 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_254_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_254_252.txt deleted file mode 100644 index 771f1455..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_254_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2336 ,KEBNE ,17126063,Thu Dec 30 18:14:33 CET,Thu Dec 30 19:50:52 CET,0.0 1.182 1.519 1.779 2.004 2.21 2.375 2.502 2.695 2.787 2.884 2.887 3.141 3.2 3.322 3.446 3.551 3.607 3.703 3.78 3.879 3.934 3.98 4.035 4.085 4.147 4.216 4.252 4.263 4.28 4.313 4.332 4.315 4.277 4.23 4.175 4.096 3.962 3.78 3.577 3.355 3.078 2.684 2.207 1.559 0.731 -0.341 -1.694 -3.557 -6.302 -10.638 -15.541 -19.375 -22.46 -24.974 -27.078 -28.832 -30.387 -31.76 -33.115 -34.257 -35.245 -36.18 -37.056 -37.85 -38.586 -39.348 -40.019 -40.603 -41.168 -41.71 -42.186 -42.687 -43.17 -43.555 -43.948 -44.315 -44.711 -45.154 -45.463 -45.792 -46.285 -46.619 -46.963 -47.131 -47.466 -47.824 -48.23 -48.437 -48.874 -49.086 -49.319 -49.572 -50.142 -50.442 -50.79 -51.169 -51.558 -52.011 -52.62 -54.503 -2 ,27652 ,KEBNE ,17126064,Thu Dec 30 18:14:34 CET,Thu Dec 30 19:50:52 CET,0.0 1.148 1.456 1.683 1.882 2.06 2.207 2.329 2.523 2.622 2.716 2.699 2.938 2.999 3.113 3.223 3.308 3.354 3.458 3.542 3.641 3.71 3.77 3.829 3.881 3.954 4.022 4.073 4.13 4.167 4.18 4.183 4.177 4.152 4.119 4.072 3.988 3.871 3.736 3.574 3.374 3.095 2.699 2.227 1.603 0.812 -0.251 -1.682 -3.677 -6.551 -10.991 -15.89 -19.736 -22.794 -25.25 -27.424 -29.312 -30.938 -32.255 -33.536 -34.636 -35.607 -36.526 -37.372 -38.171 -38.933 -39.701 -40.366 -40.928 -41.488 -42.068 -42.539 -43.024 -43.523 -43.898 -44.301 -44.726 -45.152 -45.588 -45.876 -46.161 -46.623 -46.956 -47.305 -47.481 -47.841 -48.214 -48.622 -48.836 -49.278 -49.513 -49.756 -49.998 -50.519 -50.808 -51.124 -51.503 -51.912 -52.365 -52.936 -54.684 -3 ,24962 ,KEBNE ,17126065,Thu Dec 30 18:14:40 CET,Thu Dec 30 19:49:52 CET,0.0 0.866 1.144 1.37 1.58 1.725 1.85 1.974 2.187 2.273 2.353 2.32 2.555 2.606 2.726 2.828 2.918 2.962 3.038 3.104 3.179 3.223 3.264 3.335 3.413 3.483 3.545 3.603 3.64 3.654 3.677 3.697 3.703 3.688 3.654 3.582 3.497 3.428 3.337 3.17 2.946 2.653 2.295 1.914 1.346 0.559 -0.493 -1.863 -3.827 -6.742 -11.288 -16.231 -20.045 -23.129 -25.637 -27.787 -29.623 -31.224 -32.57 -33.883 -35.012 -36.016 -36.936 -37.783 -38.569 -39.307 -40.049 -40.671 -41.223 -41.818 -42.429 -42.916 -43.417 -43.946 -44.342 -44.743 -45.151 -45.572 -46.022 -46.328 -46.641 -47.121 -47.458 -47.805 -47.981 -48.356 -48.772 -49.218 -49.434 -49.877 -50.093 -50.327 -50.579 -51.135 -51.448 -51.792 -52.152 -52.566 -53.05 -53.655 -55.821 -4 ,12478 ,KEBNE ,17126066,Thu Dec 30 18:14:41 CET,Thu Dec 30 19:50:04 CET,0.0 0.974 1.326 1.554 1.741 1.899 2.04 2.167 2.384 2.495 2.605 2.615 2.872 2.942 3.067 3.174 3.259 3.303 3.404 3.496 3.613 3.69 3.744 3.808 3.864 3.894 3.919 3.963 4.04 4.079 4.094 4.118 4.121 4.095 4.07 4.017 3.936 3.835 3.704 3.542 3.337 3.073 2.691 2.251 1.646 0.816 -0.282 -1.685 -3.594 -6.334 -10.693 -15.56 -19.249 -22.251 -24.678 -26.662 -28.366 -29.89 -31.159 -32.398 -33.48 -34.439 -35.298 -36.1 -36.845 -37.532 -38.257 -38.872 -39.376 -39.884 -40.418 -40.874 -41.342 -41.808 -42.167 -42.543 -42.959 -43.397 -43.83 -44.13 -44.435 -44.915 -45.25 -45.585 -45.762 -46.114 -46.447 -46.802 -46.999 -47.446 -47.691 -47.939 -48.204 -48.766 -49.069 -49.404 -49.791 -50.213 -50.686 -51.233 -52.604 -5 ,7898 ,KEBNE ,17126067,Thu Dec 30 18:14:51 CET,Thu Dec 30 19:50:36 CET,0.0 1.025 1.395 1.654 1.858 2.039 2.202 2.342 2.554 2.65 2.762 2.788 3.046 3.111 3.256 3.389 3.482 3.522 3.608 3.688 3.799 3.865 3.93 4.014 4.081 4.157 4.204 4.219 4.244 4.291 4.339 4.351 4.328 4.316 4.32 4.291 4.246 4.169 4.018 3.805 3.566 3.304 2.945 2.496 1.844 1.023 -0.066 -1.525 -3.547 -6.441 -10.914 -15.835 -19.663 -22.793 -25.351 -27.508 -29.321 -30.916 -32.254 -33.56 -34.659 -35.621 -36.532 -37.398 -38.184 -38.874 -39.611 -40.273 -40.837 -41.424 -42.006 -42.468 -42.942 -43.444 -43.841 -44.232 -44.629 -45.046 -45.484 -45.799 -46.138 -46.648 -46.988 -47.345 -47.525 -47.891 -48.272 -48.676 -48.882 -49.32 -49.529 -49.753 -49.999 -50.529 -50.804 -51.116 -51.495 -51.933 -52.408 -53.017 -54.972 -6 ,31241 ,KEBNE ,17126068,Thu Dec 30 18:15:03 CET,Thu Dec 30 19:51:27 CET,0.0 0.782 1.079 1.292 1.487 1.643 1.775 1.902 2.116 2.225 2.331 2.322 2.557 2.606 2.71 2.819 2.908 2.953 3.046 3.122 3.211 3.263 3.312 3.397 3.481 3.553 3.607 3.635 3.675 3.707 3.702 3.693 3.692 3.653 3.594 3.51 3.4 3.298 3.19 3.005 2.774 2.5 2.118 1.692 1.101 0.299 -0.772 -2.195 -4.184 -7.041 -11.474 -16.463 -20.35 -23.425 -25.921 -28.053 -29.859 -31.454 -32.788 -34.094 -35.187 -36.12 -36.955 -37.747 -38.501 -39.183 -39.901 -40.507 -41.017 -41.536 -42.067 -42.533 -43.011 -43.503 -43.889 -44.268 -44.663 -45.086 -45.501 -45.791 -46.108 -46.571 -46.892 -47.238 -47.409 -47.759 -48.148 -48.56 -48.771 -49.218 -49.439 -49.663 -49.907 -50.435 -50.722 -51.046 -51.41 -51.827 -52.333 -52.977 -54.858 -7 ,32307 ,KEBNE ,17126069,Thu Dec 30 18:15:09 CET,Thu Dec 30 19:51:14 CET,0.0 1.164 1.56 1.847 2.059 2.218 2.357 2.479 2.691 2.802 2.906 2.86 3.083 3.137 3.243 3.338 3.444 3.499 3.59 3.682 3.791 3.854 3.925 3.992 4.044 4.093 4.109 4.134 4.169 4.179 4.205 4.217 4.199 4.164 4.124 4.067 3.972 3.86 3.704 3.5 3.254 2.934 2.529 2.089 1.487 0.711 -0.318 -1.671 -3.569 -6.39 -10.871 -15.754 -19.454 -22.494 -25.019 -27.141 -28.929 -30.491 -31.791 -33.077 -34.174 -35.141 -36.059 -36.889 -37.666 -38.377 -39.098 -39.745 -40.287 -40.816 -41.352 -41.805 -42.267 -42.729 -43.115 -43.517 -43.911 -44.348 -44.792 -45.081 -45.384 -45.865 -46.202 -46.564 -46.752 -47.117 -47.494 -47.904 -48.121 -48.573 -48.821 -49.064 -49.308 -49.868 -50.179 -50.516 -50.885 -51.293 -51.785 -52.412 -54.56 -8 ,32310 ,KEBNE ,17126070,Thu Dec 30 18:15:36 CET,Thu Dec 30 19:52:14 CET,0.0 0.714 1.026 1.269 1.439 1.575 1.708 1.829 2.041 2.149 2.243 2.223 2.461 2.53 2.661 2.772 2.881 2.927 2.997 3.054 3.13 3.19 3.253 3.359 3.439 3.481 3.509 3.538 3.583 3.625 3.667 3.69 3.681 3.654 3.592 3.532 3.494 3.415 3.275 3.103 2.881 2.584 2.165 1.705 1.128 0.34 -0.721 -2.074 -3.965 -6.703 -10.933 -15.607 -19.162 -22.043 -24.438 -26.494 -28.247 -29.796 -31.094 -32.331 -33.409 -34.393 -35.269 -36.073 -36.83 -37.502 -38.181 -38.788 -39.313 -39.873 -40.454 -40.917 -41.426 -41.965 -42.35 -42.745 -43.143 -43.544 -43.969 -44.255 -44.554 -45.041 -45.364 -45.681 -45.843 -46.186 -46.549 -46.923 -47.124 -47.56 -47.77 -48.0 -48.235 -48.747 -49.049 -49.365 -49.696 -50.057 -50.497 -51.118 -53.024 -9 ,681 ,KEBNE ,17126071,Thu Dec 30 18:15:52 CET,Thu Dec 30 19:50:28 CET,0.0 0.943 1.301 1.529 1.72 1.902 2.049 2.176 2.407 2.505 2.59 2.563 2.805 2.879 2.998 3.093 3.198 3.25 3.344 3.41 3.513 3.589 3.643 3.723 3.788 3.819 3.865 3.908 3.948 3.979 3.992 3.979 3.963 3.94 3.885 3.832 3.769 3.636 3.447 3.24 2.989 2.684 2.321 1.877 1.262 0.479 -0.563 -1.933 -3.815 -6.545 -10.785 -15.419 -18.984 -21.853 -24.2 -26.203 -27.924 -29.454 -30.724 -32.005 -33.113 -34.061 -34.961 -35.786 -36.544 -37.24 -37.927 -38.526 -39.037 -39.567 -40.134 -40.597 -41.095 -41.626 -42.005 -42.376 -42.77 -43.175 -43.578 -43.862 -44.153 -44.628 -44.964 -45.306 -45.477 -45.827 -46.203 -46.586 -46.789 -47.228 -47.41 -47.635 -47.885 -48.428 -48.717 -49.018 -49.346 -49.729 -50.201 -50.818 -52.877 -10 ,17039 ,KEBNE ,17126072,Thu Dec 30 18:15:59 CET,Thu Dec 30 19:50:50 CET,0.0 0.981 1.293 1.534 1.743 1.947 2.105 2.227 2.431 2.518 2.591 2.534 2.771 2.833 2.958 3.06 3.164 3.22 3.319 3.404 3.527 3.6 3.67 3.763 3.834 3.891 3.932 3.967 4.015 4.066 4.082 4.089 4.083 4.052 4.039 3.999 3.927 3.84 3.707 3.534 3.358 3.124 2.725 2.265 1.662 0.851 -0.2 -1.556 -3.518 -6.374 -10.773 -15.696 -19.517 -22.532 -25.018 -27.151 -28.936 -30.481 -31.848 -33.214 -34.307 -35.266 -36.161 -37.018 -37.832 -38.534 -39.233 -39.859 -40.425 -41.019 -41.629 -42.11 -42.585 -43.059 -43.426 -43.823 -44.23 -44.631 -45.051 -45.341 -45.651 -46.153 -46.48 -46.818 -46.987 -47.336 -47.714 -48.096 -48.29 -48.73 -48.972 -49.215 -49.461 -49.983 -50.274 -50.597 -50.951 -51.352 -51.813 -52.44 -54.52 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_256_67.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_256_67.txt deleted file mode 100644 index e0f2ee8f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_256_67.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20059 ,KEBNE ,16708750,Fri Nov 26 18:54:41 CET,Fri Nov 26 20:26:19 CET,0.0 1.183 1.682 2.081 2.43 2.764 3.099 3.417 4.002 4.287 4.574 4.905 5.414 5.681 6.211 6.736 7.242 7.485 7.963 8.439 9.15 9.63 10.106 10.807 11.506 12.198 12.864 13.516 14.372 15.22 16.076 17.16 18.245 19.294 20.536 22.007 23.467 25.108 26.923 28.892 31.068 33.625 36.693 39.896 43.788 48.362 54.049 60.951 69.545 80.636 95.859 110.448 120.425 127.693 133.108 137.42 140.834 143.64 145.887 147.968 149.634 150.995 152.178 153.237 154.184 154.983 155.747 156.396 156.936 157.454 157.938 158.313 158.686 159.048 159.3 159.552 159.8 160.026 160.237 160.373 160.496 160.67 160.794 160.919 160.977 161.072 161.15 161.224 161.258 161.23 161.313 161.299 161.286 161.237 161.181 161.101 160.987 160.833 160.63 160.293 158.876 -2 ,8866 ,KEBNE ,16708751,Fri Nov 26 18:55:41 CET,Fri Nov 26 20:26:07 CET,0.0 1.189 1.679 2.114 2.511 2.871 3.207 3.532 4.155 4.454 4.745 5.07 5.574 5.835 6.349 6.863 7.366 7.607 8.078 8.547 9.249 9.714 10.184 10.885 11.56 12.233 12.912 13.582 14.449 15.307 16.169 17.235 18.295 19.348 20.604 22.053 23.474 25.075 26.856 28.837 31.0 33.546 36.615 39.741 43.596 48.19 53.785 60.525 69.02 80.029 95.182 109.553 119.237 126.38 131.758 136.024 139.409 142.226 144.473 146.543 148.172 149.511 150.699 151.76 152.713 153.51 154.269 154.905 155.428 155.965 156.466 156.856 157.266 157.66 157.925 158.152 158.378 158.621 158.853 158.999 159.131 159.317 159.437 159.54 159.583 159.664 159.746 159.812 159.838 159.806 159.863 159.85 159.833 159.762 159.709 159.631 159.535 159.396 159.169 158.809 157.141 -3 ,22740 ,KEBNE ,16708752,Fri Nov 26 18:58:46 CET,Fri Nov 26 20:29:14 CET,0.0 1.145 1.651 2.068 2.443 2.797 3.122 3.43 4.032 4.321 4.596 4.895 5.399 5.655 6.17 6.691 7.196 7.442 7.931 8.415 9.132 9.599 10.065 10.752 11.426 12.104 12.788 13.475 14.372 15.241 16.107 17.182 18.242 19.291 20.531 21.978 23.416 25.041 26.845 28.815 30.959 33.483 36.534 39.765 43.704 48.308 53.985 60.785 69.362 80.403 95.677 110.504 120.457 127.646 133.087 137.424 140.815 143.602 145.814 147.839 149.453 150.808 152.008 153.06 153.977 154.754 155.504 156.141 156.677 157.199 157.713 158.112 158.473 158.83 159.097 159.353 159.594 159.84 160.075 160.207 160.348 160.563 160.687 160.81 160.869 160.965 161.051 161.106 161.124 161.086 161.164 161.159 161.136 161.069 161.01 160.935 160.837 160.692 160.518 160.13 158.349 -4 ,6129 ,KEBNE ,16708753,Fri Nov 26 19:00:51 CET,Fri Nov 26 20:31:23 CET,0.0 1.238 1.745 2.181 2.57 2.924 3.245 3.54 4.12 4.403 4.674 4.968 5.467 5.724 6.229 6.732 7.228 7.472 7.963 8.446 9.165 9.636 10.094 10.785 11.475 12.165 12.839 13.497 14.373 15.237 16.084 17.141 18.197 19.244 20.49 21.92 23.337 24.985 26.811 28.777 30.926 33.473 36.582 39.819 43.787 48.417 54.034 60.846 69.463 80.546 95.615 110.082 119.936 127.136 132.605 136.981 140.452 143.326 145.581 147.666 149.347 150.737 151.95 152.995 153.917 154.706 155.461 156.103 156.64 157.154 157.647 158.021 158.377 158.741 159.011 159.277 159.532 159.776 160.001 160.131 160.262 160.472 160.598 160.7 160.743 160.815 160.884 160.955 160.98 160.935 161.002 160.995 160.967 160.872 160.813 160.745 160.643 160.5 160.296 159.944 158.158 -5 ,21244 ,KEBNE ,16708754,Fri Nov 26 19:00:51 CET,Fri Nov 26 20:32:30 CET,0.0 1.397 1.918 2.352 2.715 3.055 3.382 3.698 4.303 4.585 4.863 5.171 5.669 5.932 6.455 6.983 7.504 7.761 8.264 8.75 9.465 9.932 10.395 11.092 11.782 12.462 13.142 13.816 14.684 15.541 16.406 17.472 18.505 19.536 20.801 22.281 23.744 25.373 27.149 29.105 31.264 33.813 36.883 40.08 44.01 48.66 54.336 61.159 69.848 81.047 96.228 110.814 120.727 127.963 133.456 137.87 141.343 144.205 146.466 148.541 150.187 151.573 152.811 153.875 154.786 155.573 156.338 156.979 157.493 157.987 158.48 158.851 159.206 159.57 159.832 160.078 160.33 160.57 160.79 160.946 161.097 161.267 161.376 161.491 161.542 161.628 161.704 161.77 161.79 161.749 161.803 161.798 161.794 161.703 161.64 161.569 161.475 161.31 161.064 160.729 158.83 -6 ,20692 ,KEBNE ,16708755,Fri Nov 26 19:01:52 CET,Fri Nov 26 20:32:06 CET,0.0 1.388 1.861 2.26 2.629 2.968 3.287 3.594 4.188 4.48 4.77 5.098 5.604 5.876 6.407 6.92 7.419 7.663 8.153 8.644 9.356 9.826 10.295 10.977 11.642 12.314 12.99 13.656 14.534 15.395 16.256 17.332 18.404 19.461 20.694 22.125 23.546 25.141 26.913 28.887 31.067 33.606 36.706 39.948 43.895 48.565 54.235 61.003 69.575 80.698 95.943 110.582 120.463 127.677 133.176 137.586 141.056 143.911 146.184 148.284 149.92 151.264 152.465 153.499 154.399 155.193 155.972 156.626 157.166 157.687 158.18 158.557 158.923 159.291 159.556 159.801 160.046 160.278 160.486 160.621 160.762 160.944 161.035 161.127 161.176 161.267 161.353 161.423 161.448 161.413 161.521 161.533 161.527 161.471 161.404 161.33 161.252 161.116 160.906 160.601 158.931 -7 ,32180 ,KEBNE ,16708756,Fri Nov 26 19:01:52 CET,Fri Nov 26 20:32:05 CET,0.0 1.217 1.703 2.119 2.485 2.808 3.126 3.439 4.038 4.332 4.629 4.963 5.474 5.746 6.266 6.773 7.273 7.523 8.015 8.498 9.216 9.689 10.159 10.859 11.552 12.236 12.912 13.582 14.459 15.322 16.183 17.235 18.285 19.341 20.585 22.017 23.432 25.041 26.843 28.813 30.949 33.44 36.467 39.642 43.521 48.076 53.667 60.431 69.019 80.275 95.585 110.167 120.086 127.328 132.839 137.242 140.746 143.642 145.923 147.973 149.572 150.934 152.152 153.207 154.116 154.877 155.639 156.304 156.846 157.355 157.835 158.217 158.602 158.965 159.216 159.473 159.725 159.954 160.176 160.316 160.435 160.607 160.717 160.828 160.878 160.96 161.048 161.127 161.165 161.131 161.197 161.192 161.175 161.098 161.04 160.972 160.867 160.709 160.517 160.189 158.806 -8 ,14703 ,KEBNE ,16708757,Fri Nov 26 19:02:55 CET,Fri Nov 26 20:33:16 CET,0.0 1.061 1.543 1.942 2.294 2.628 2.954 3.281 3.902 4.193 4.474 4.775 5.282 5.553 6.077 6.6 7.113 7.355 7.837 8.32 9.038 9.509 9.973 10.668 11.366 12.05 12.717 13.37 14.214 15.072 15.953 17.038 18.083 19.113 20.343 21.787 23.244 24.876 26.665 28.633 30.81 33.361 36.429 39.646 43.559 48.189 53.83 60.532 69.089 80.241 95.371 109.83 119.701 126.956 132.419 136.742 140.156 142.965 145.163 147.164 148.772 150.1 151.29 152.401 153.348 154.135 154.905 155.536 156.065 156.575 157.072 157.467 157.833 158.181 158.449 158.72 158.979 159.207 159.429 159.577 159.708 159.88 159.991 160.093 160.137 160.211 160.256 160.286 160.312 160.279 160.348 160.342 160.326 160.282 160.237 160.173 160.067 159.89 159.637 159.277 157.732 -9 ,31354 ,KEBNE ,16708758,Fri Nov 26 19:02:54 CET,Fri Nov 26 20:34:11 CET,0.0 1.118 1.581 2.002 2.388 2.734 3.055 3.365 3.951 4.241 4.534 4.855 5.359 5.625 6.138 6.633 7.131 7.379 7.866 8.358 9.087 9.552 10.006 10.701 11.402 12.094 12.775 13.438 14.298 15.149 16.007 17.07 18.108 19.136 20.391 21.855 23.293 24.928 26.744 28.716 30.841 33.323 36.39 39.659 43.65 48.292 53.902 60.674 69.27 80.287 95.23 109.678 119.536 126.813 132.318 136.692 140.16 143.003 145.217 147.246 148.878 150.209 151.351 152.386 153.316 154.096 154.864 155.506 156.034 156.561 157.061 157.452 157.836 158.194 158.442 158.696 158.959 159.209 159.445 159.596 159.743 159.942 160.054 160.148 160.191 160.268 160.334 160.389 160.406 160.355 160.409 160.401 160.379 160.309 160.27 160.197 160.093 159.932 159.689 159.369 158.065 -10 ,8460 ,KEBNE ,16708759,Fri Nov 26 19:02:55 CET,Fri Nov 26 20:34:39 CET,0.0 1.13 1.628 2.072 2.475 2.834 3.172 3.501 4.126 4.425 4.718 5.047 5.56 5.829 6.352 6.867 7.369 7.621 8.123 8.62 9.366 9.841 10.305 11.011 11.706 12.384 13.057 13.726 14.597 15.469 16.34 17.389 18.444 19.503 20.75 22.219 23.67 25.316 27.145 29.13 31.3 33.815 36.889 40.166 44.175 48.818 54.448 61.24 69.806 80.798 95.761 110.08 119.804 126.924 132.316 136.624 140.063 142.909 145.1 147.061 148.626 149.919 151.106 152.178 153.096 153.884 154.66 155.311 155.828 156.329 156.843 157.241 157.608 157.956 158.222 158.476 158.718 158.958 159.187 159.323 159.444 159.636 159.755 159.854 159.898 159.98 160.05 160.096 160.114 160.073 160.126 160.127 160.123 160.076 160.048 159.986 159.872 159.707 159.48 159.105 157.624 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_266_224.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_266_224.txt deleted file mode 100644 index 33d8a03e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_266_224.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22671 ,KEBNE ,16708760,Fri Nov 26 19:02:55 CET,Fri Nov 26 20:34:39 CET,0.0 1.772 2.279 2.634 2.903 3.121 3.331 3.522 3.821 3.947 4.071 4.329 4.398 4.497 4.676 4.833 4.989 5.065 5.212 5.368 5.582 5.704 5.828 6.0 6.154 6.309 6.457 6.6 6.785 6.967 7.152 7.4 7.652 7.892 8.153 8.415 8.654 8.917 9.233 9.588 9.916 10.228 10.571 10.914 11.317 11.755 12.2 12.597 12.93 13.179 13.091 12.463 11.703 10.868 10.066 9.33 8.672 8.064 7.517 6.927 6.386 5.91 5.461 5.029 4.622 4.227 3.77 3.357 3.015 2.668 2.303 2.014 1.721 1.406 1.154 0.893 0.598 0.286 -0.013 -0.223 -0.45 -0.819 -1.068 -1.31 -1.433 -1.702 -1.998 -2.325 -2.5 -2.645 -3.03 -3.214 -3.413 -3.876 -4.132 -4.42 -4.748 -5.095 -5.524 -6.203 -8.934 -3 ,31764 ,KEBNE ,16708762,Fri Nov 26 19:02:57 CET,Fri Nov 26 20:30:15 CET,0.0 1.749 2.104 2.374 2.591 2.793 2.97 3.124 3.407 3.545 3.68 3.954 4.024 4.127 4.317 4.494 4.679 4.778 4.959 5.121 5.357 5.513 5.663 5.874 6.077 6.25 6.41 6.566 6.747 6.921 7.099 7.313 7.515 7.71 7.945 8.207 8.438 8.659 8.887 9.16 9.461 9.796 10.156 10.498 10.906 11.298 11.667 12.066 12.468 12.767 12.682 12.09 11.355 10.51 9.71 8.976 8.303 7.618 7.008 6.438 5.929 5.467 4.995 4.546 4.148 3.743 3.32 2.972 2.652 2.295 1.95 1.672 1.373 1.071 0.837 0.583 0.31 0.019 -0.293 -0.519 -0.757 -1.105 -1.34 -1.598 -1.741 -2.022 -2.296 -2.595 -2.757 -2.901 -3.322 -3.533 -3.769 -4.301 -4.566 -4.84 -5.154 -5.571 -6.113 -6.761 -10.316 -4 ,19916 ,KEBNE ,16708763,Fri Nov 26 19:03:59 CET,Fri Nov 26 20:32:26 CET,0.0 1.418 1.743 1.985 2.187 2.357 2.504 2.648 2.901 3.022 3.149 3.409 3.478 3.583 3.795 3.988 4.15 4.229 4.399 4.554 4.761 4.907 5.061 5.276 5.489 5.712 5.921 6.113 6.364 6.603 6.819 7.07 7.325 7.565 7.799 8.08 8.381 8.704 9.053 9.391 9.707 10.044 10.458 10.864 11.287 11.727 12.179 12.631 13.047 13.302 13.119 12.361 11.528 10.697 9.863 9.083 8.391 7.726 7.141 6.518 5.973 5.493 4.997 4.554 4.155 3.763 3.372 3.033 2.716 2.38 2.049 1.745 1.425 1.118 0.868 0.615 0.348 0.065 -0.221 -0.42 -0.624 -0.953 -1.193 -1.453 -1.588 -1.849 -2.119 -2.426 -2.587 -2.729 -3.141 -3.338 -3.542 -3.999 -4.27 -4.582 -4.92 -5.29 -5.757 -6.41 -9.531 -5 ,19504 ,KEBNE ,16708764,Fri Nov 26 19:06:00 CET,Fri Nov 26 20:37:45 CET,0.0 1.696 2.126 2.482 2.757 2.974 3.169 3.351 3.702 3.854 3.995 4.303 4.4 4.535 4.769 4.962 5.145 5.232 5.407 5.573 5.8 5.948 6.096 6.304 6.492 6.677 6.849 7.021 7.256 7.468 7.683 7.967 8.217 8.454 8.762 9.09 9.392 9.717 10.022 10.329 10.662 11.031 11.426 11.811 12.214 12.645 13.146 13.618 14.059 14.352 14.236 13.559 12.72 11.807 10.992 10.257 9.528 8.883 8.341 7.775 7.263 6.772 6.268 5.793 5.368 4.987 4.595 4.238 3.901 3.544 3.215 2.941 2.628 2.286 2.029 1.774 1.505 1.228 0.927 0.706 0.48 0.125 -0.11 -0.343 -0.474 -0.746 -1.023 -1.329 -1.498 -1.634 -2.014 -2.219 -2.442 -2.912 -3.175 -3.46 -3.777 -4.183 -4.732 -5.451 -8.11 -6 ,20086 ,KEBNE ,16708765,Fri Nov 26 19:07:01 CET,Fri Nov 26 20:38:57 CET,0.0 1.285 1.646 1.885 2.086 2.253 2.418 2.568 2.809 2.916 3.015 3.234 3.295 3.388 3.558 3.721 3.872 3.947 4.09 4.22 4.405 4.525 4.646 4.818 4.982 5.145 5.297 5.44 5.623 5.811 5.995 6.198 6.383 6.558 6.764 6.989 7.21 7.475 7.76 8.045 8.344 8.676 9.035 9.371 9.747 10.186 10.621 11.0 11.359 11.543 11.381 10.676 9.885 9.14 8.407 7.726 7.104 6.515 5.984 5.446 4.989 4.558 4.113 3.682 3.267 2.849 2.404 2.049 1.745 1.406 1.049 0.765 0.45 0.107 -0.144 -0.433 -0.718 -0.992 -1.301 -1.508 -1.721 -2.062 -2.307 -2.571 -2.7 -2.959 -3.25 -3.586 -3.759 -3.905 -4.319 -4.515 -4.723 -5.184 -5.439 -5.738 -6.122 -6.56 -7.099 -7.868 -12.054 -7 ,22191 ,KEBNE ,16708766,Fri Nov 26 19:07:01 CET,Fri Nov 26 20:39:00 CET,0.0 1.483 1.818 2.101 2.353 2.591 2.786 2.954 3.263 3.398 3.528 3.812 3.899 4.018 4.243 4.452 4.652 4.745 4.925 5.099 5.343 5.501 5.644 5.838 6.025 6.208 6.406 6.611 6.854 7.075 7.29 7.56 7.813 8.022 8.269 8.567 8.871 9.228 9.582 9.904 10.246 10.632 11.083 11.532 12.02 12.516 12.996 13.477 13.949 14.245 14.149 13.488 12.61 11.762 11.042 10.364 9.694 9.033 8.462 7.904 7.42 6.949 6.432 5.97 5.566 5.203 4.823 4.433 4.09 3.757 3.433 3.145 2.819 2.491 2.238 1.982 1.706 1.41 1.112 0.899 0.68 0.352 0.12 -0.136 -0.276 -0.555 -0.855 -1.187 -1.343 -1.471 -1.859 -2.036 -2.212 -2.606 -2.86 -3.155 -3.478 -3.876 -4.376 -5.057 -7.731 -8 ,17680 ,KEBNE ,16708767,Fri Nov 26 19:07:01 CET,Fri Nov 26 20:40:01 CET,0.0 1.39 1.719 1.959 2.155 2.336 2.507 2.66 2.929 3.05 3.169 3.44 3.515 3.615 3.807 4.003 4.193 4.272 4.408 4.542 4.738 4.859 4.979 5.161 5.347 5.525 5.682 5.826 6.013 6.192 6.362 6.576 6.781 6.975 7.194 7.432 7.651 7.878 8.124 8.392 8.675 8.982 9.315 9.64 10.032 10.45 10.842 11.207 11.547 11.778 11.664 10.964 10.166 9.296 8.449 7.673 6.991 6.362 5.795 5.201 4.662 4.151 3.681 3.242 2.838 2.503 2.095 1.729 1.417 1.045 0.682 0.377 0.026 -0.299 -0.541 -0.814 -1.088 -1.374 -1.69 -1.911 -2.13 -2.489 -2.728 -2.969 -3.096 -3.357 -3.643 -3.955 -4.129 -4.274 -4.671 -4.862 -5.075 -5.572 -5.837 -6.127 -6.463 -6.848 -7.315 -7.976 -9.792 -9 ,18075 ,KEBNE ,16708768,Fri Nov 26 19:08:04 CET,Fri Nov 26 20:39:49 CET,0.0 1.992 2.325 2.569 2.783 2.975 3.151 3.311 3.602 3.745 3.881 4.155 4.238 4.345 4.547 4.748 4.939 5.033 5.215 5.385 5.62 5.759 5.886 6.063 6.223 6.366 6.508 6.657 6.856 7.032 7.191 7.41 7.627 7.822 8.04 8.271 8.491 8.73 8.996 9.282 9.568 9.888 10.245 10.589 10.974 11.367 11.797 12.234 12.608 12.829 12.718 12.132 11.389 10.595 9.826 9.064 8.347 7.714 7.176 6.605 6.099 5.617 5.121 4.668 4.264 3.902 3.528 3.176 2.882 2.567 2.224 1.936 1.62 1.299 1.06 0.807 0.538 0.265 -0.024 -0.241 -0.456 -0.8 -1.064 -1.338 -1.474 -1.736 -2.019 -2.318 -2.463 -2.592 -2.986 -3.179 -3.396 -3.894 -4.147 -4.441 -4.789 -5.16 -5.624 -6.271 -8.728 -10 ,8215 ,KEBNE ,16708769,Fri Nov 26 19:08:04 CET,Fri Nov 26 20:39:55 CET,0.0 2.107 2.437 2.679 2.879 3.061 3.222 3.375 3.658 3.789 3.91 4.167 4.244 4.355 4.579 4.79 4.986 5.074 5.232 5.378 5.578 5.72 5.874 6.091 6.285 6.451 6.599 6.741 6.928 7.103 7.275 7.479 7.686 7.929 8.204 8.442 8.642 8.878 9.14 9.423 9.723 10.036 10.388 10.742 11.151 11.575 12.003 12.409 12.797 13.084 13.028 12.403 11.553 10.714 9.965 9.299 8.682 8.063 7.52 7.01 6.557 6.121 5.722 5.324 4.926 4.555 4.146 3.789 3.488 3.155 2.79 2.478 2.162 1.858 1.623 1.381 1.119 0.821 0.503 0.287 0.081 -0.238 -0.486 -0.741 -0.864 -1.134 -1.413 -1.704 -1.871 -2.014 -2.407 -2.602 -2.811 -3.249 -3.524 -3.834 -4.136 -4.509 -4.987 -5.661 -8.865 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_266_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_266_235.txt deleted file mode 100644 index a623cc73..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_266_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15368 ,KEBNE ,16708770,Fri Nov 26 19:08:04 CET,Fri Nov 26 20:41:01 CET,0.0 1.488 1.99 2.366 2.66 2.914 3.155 3.355 3.688 3.838 3.967 4.258 4.345 4.461 4.698 4.922 5.119 5.202 5.37 5.555 5.807 5.968 6.135 6.365 6.576 6.787 7.014 7.24 7.496 7.736 7.966 8.237 8.489 8.719 9.013 9.337 9.605 9.879 10.177 10.502 10.838 11.204 11.612 11.99 12.433 12.905 13.385 13.895 14.398 14.705 14.547 13.741 12.963 12.213 11.472 10.778 10.065 9.369 8.788 8.185 7.642 7.186 6.746 6.306 5.883 5.486 5.08 4.745 4.457 4.116 3.758 3.475 3.19 2.908 2.69 2.444 2.166 1.885 1.594 1.385 1.16 0.812 0.565 0.313 0.186 -0.078 -0.331 -0.611 -0.755 -0.88 -1.277 -1.475 -1.674 -2.131 -2.384 -2.637 -2.92 -3.257 -3.656 -4.182 -6.206 -2 ,158 ,KEBNE ,16708771,Fri Nov 26 19:08:04 CET,Fri Nov 26 20:41:32 CET,0.0 1.976 2.457 2.828 3.126 3.376 3.594 3.794 4.159 4.324 4.472 4.795 4.903 5.031 5.273 5.523 5.762 5.869 6.072 6.276 6.567 6.738 6.901 7.122 7.318 7.518 7.718 7.909 8.167 8.418 8.647 8.911 9.171 9.416 9.694 10.031 10.342 10.652 10.952 11.274 11.64 12.049 12.502 12.912 13.358 13.885 14.442 14.941 15.342 15.53 15.344 14.525 13.615 12.742 11.91 11.121 10.369 9.706 9.143 8.58 8.078 7.599 7.152 6.768 6.401 6.035 5.646 5.279 4.946 4.605 4.232 3.919 3.608 3.3 3.056 2.795 2.544 2.292 2.009 1.805 1.602 1.266 1.034 0.801 0.677 0.419 0.143 -0.172 -0.348 -0.495 -0.852 -1.022 -1.212 -1.64 -1.888 -2.152 -2.42 -2.729 -3.132 -3.699 -6.113 -3 ,8431 ,KEBNE ,16708772,Fri Nov 26 19:09:05 CET,Fri Nov 26 20:41:58 CET,0.0 2.545 3.041 3.38 3.667 3.95 4.208 4.411 4.777 4.949 5.102 5.44 5.553 5.69 5.946 6.189 6.423 6.538 6.752 6.942 7.199 7.354 7.508 7.733 7.94 8.156 8.366 8.557 8.822 9.078 9.33 9.641 9.896 10.124 10.395 10.731 11.083 11.437 11.76 12.09 12.452 12.817 13.204 13.596 14.024 14.44 14.852 15.278 15.743 16.105 16.05 15.395 14.487 13.563 12.699 11.882 11.202 10.59 10.052 9.465 8.911 8.434 7.99 7.519 7.085 6.704 6.303 5.949 5.626 5.277 4.92 4.636 4.318 3.979 3.738 3.508 3.26 2.979 2.693 2.496 2.285 1.937 1.696 1.461 1.34 1.076 0.784 0.485 0.328 0.201 -0.14 -0.311 -0.507 -0.948 -1.192 -1.452 -1.755 -2.096 -2.503 -3.133 -4.996 -4 ,26954 ,KEBNE ,16708773,Fri Nov 26 19:09:05 CET,Fri Nov 26 20:41:05 CET,0.0 1.741 2.244 2.632 2.948 3.205 3.431 3.635 3.986 4.147 4.309 4.653 4.764 4.905 5.162 5.404 5.637 5.752 5.963 6.164 6.45 6.618 6.767 7.004 7.243 7.48 7.715 7.924 8.188 8.432 8.635 8.881 9.145 9.402 9.681 9.959 10.223 10.554 10.901 11.228 11.555 11.892 12.262 12.66 13.109 13.583 14.087 14.499 14.888 15.209 15.132 14.514 13.729 12.845 11.991 11.246 10.577 9.929 9.329 8.719 8.225 7.784 7.331 6.899 6.513 6.158 5.783 5.436 5.138 4.847 4.555 4.295 4.005 3.693 3.431 3.167 2.902 2.607 2.312 2.126 1.934 1.619 1.396 1.164 1.034 0.767 0.512 0.225 0.071 -0.05 -0.429 -0.617 -0.802 -1.235 -1.487 -1.749 -2.054 -2.395 -2.823 -3.378 -5.545 -5 ,5863 ,KEBNE ,16708774,Fri Nov 26 19:11:09 CET,Fri Nov 26 20:44:15 CET,0.0 2.039 2.526 2.869 3.131 3.376 3.597 3.798 4.179 4.353 4.509 4.834 4.937 5.069 5.325 5.551 5.765 5.871 6.069 6.252 6.509 6.679 6.836 7.067 7.299 7.512 7.722 7.937 8.218 8.457 8.671 8.937 9.191 9.432 9.714 10.047 10.375 10.694 10.983 11.312 11.686 12.071 12.49 12.92 13.409 13.87 14.328 14.788 15.173 15.43 15.391 14.731 13.842 12.949 12.134 11.411 10.801 10.219 9.674 9.124 8.653 8.222 7.764 7.348 6.974 6.615 6.26 5.942 5.66 5.364 5.043 4.774 4.49 4.176 3.934 3.687 3.411 3.124 2.824 2.622 2.426 2.107 1.875 1.641 1.521 1.261 0.98 0.675 0.517 0.398 0.059 -0.112 -0.296 -0.734 -0.978 -1.232 -1.507 -1.825 -2.217 -2.758 -4.773 -6 ,20291 ,KEBNE ,16708775,Fri Nov 26 19:11:10 CET,Fri Nov 26 20:42:48 CET,0.0 2.242 2.715 3.042 3.32 3.571 3.806 4.017 4.369 4.537 4.704 5.039 5.132 5.256 5.515 5.772 5.989 6.09 6.291 6.487 6.767 6.935 7.107 7.363 7.603 7.832 8.042 8.236 8.481 8.753 9.03 9.317 9.577 9.833 10.14 10.475 10.808 11.199 11.568 11.913 12.239 12.598 13.007 13.378 13.829 14.326 14.845 15.343 15.755 15.944 15.771 15.128 14.278 13.42 12.586 11.785 11.061 10.377 9.782 9.169 8.634 8.168 7.718 7.306 6.907 6.516 6.13 5.801 5.509 5.201 4.86 4.565 4.254 3.92 3.674 3.437 3.18 2.896 2.59 2.376 2.161 1.832 1.609 1.375 1.252 1.005 0.734 0.429 0.276 0.148 -0.205 -0.365 -0.558 -0.999 -1.236 -1.488 -1.757 -2.076 -2.461 -3.005 -6.328 -7 ,30696 ,KEBNE ,16708776,Fri Nov 26 19:11:10 CET,Fri Nov 26 20:44:22 CET,0.0 1.836 2.306 2.676 2.964 3.224 3.465 3.67 4.049 4.229 4.396 4.717 4.818 4.963 5.222 5.459 5.689 5.797 6.009 6.214 6.491 6.658 6.814 7.041 7.262 7.475 7.697 7.91 8.168 8.414 8.637 8.904 9.172 9.433 9.745 10.093 10.427 10.77 11.1 11.432 11.747 12.117 12.56 12.952 13.382 13.827 14.273 14.671 15.049 15.335 15.272 14.667 13.881 13.022 12.178 11.41 10.685 9.992 9.368 8.727 8.206 7.744 7.289 6.868 6.482 6.136 5.751 5.367 5.042 4.708 4.346 4.053 3.768 3.481 3.232 2.974 2.719 2.452 2.172 1.969 1.752 1.411 1.179 0.951 0.829 0.573 0.315 0.043 -0.103 -0.231 -0.602 -0.779 -0.97 -1.373 -1.606 -1.869 -2.141 -2.457 -2.843 -3.433 -5.525 -8 ,26586 ,KEBNE ,16708777,Fri Nov 26 19:11:10 CET,Fri Nov 26 20:43:58 CET,0.0 2.054 2.502 2.826 3.107 3.364 3.59 3.808 4.188 4.345 4.498 4.814 4.903 5.029 5.264 5.481 5.701 5.809 6.009 6.191 6.457 6.632 6.791 7.018 7.256 7.479 7.681 7.888 8.152 8.386 8.601 8.869 9.151 9.412 9.713 10.054 10.356 10.69 11.043 11.385 11.744 12.122 12.525 12.898 13.306 13.747 14.247 14.78 15.264 15.577 15.489 14.785 13.839 12.896 12.084 11.374 10.711 10.072 9.512 8.932 8.435 7.952 7.446 6.975 6.544 6.162 5.797 5.482 5.194 4.89 4.576 4.299 4.007 3.702 3.449 3.195 2.929 2.64 2.354 2.16 1.949 1.616 1.384 1.146 1.025 0.779 0.501 0.181 0.013 -0.128 -0.498 -0.669 -0.865 -1.314 -1.557 -1.827 -2.129 -2.464 -2.854 -3.39 -6.033 -9 ,2489 ,KEBNE ,16708778,Fri Nov 26 19:11:09 CET,Fri Nov 26 20:42:54 CET,0.0 1.926 2.428 2.767 3.055 3.321 3.547 3.74 4.101 4.267 4.427 4.759 4.86 4.992 5.24 5.491 5.74 5.851 6.04 6.226 6.506 6.679 6.848 7.099 7.331 7.557 7.775 7.972 8.221 8.467 8.701 8.977 9.249 9.494 9.757 10.052 10.355 10.674 10.994 11.33 11.695 12.11 12.59 13.034 13.475 13.929 14.405 14.879 15.285 15.539 15.436 14.754 13.879 12.984 12.157 11.396 10.706 10.046 9.467 8.895 8.391 7.917 7.438 6.996 6.608 6.27 5.889 5.529 5.204 4.837 4.469 4.192 3.903 3.584 3.345 3.089 2.813 2.545 2.266 2.073 1.882 1.551 1.31 1.067 0.942 0.681 0.403 0.122 -0.027 -0.154 -0.515 -0.686 -0.878 -1.303 -1.523 -1.767 -2.052 -2.396 -2.801 -3.332 -5.337 -10 ,11334 ,KEBNE ,16708779,Fri Nov 26 19:11:10 CET,Fri Nov 26 20:44:04 CET,0.0 1.599 2.134 2.504 2.811 3.067 3.29 3.508 3.895 4.069 4.229 4.562 4.669 4.81 5.085 5.315 5.54 5.654 5.855 6.039 6.309 6.466 6.605 6.821 7.057 7.285 7.48 7.656 7.89 8.121 8.351 8.625 8.885 9.147 9.44 9.751 10.045 10.356 10.712 11.085 11.421 11.811 12.249 12.663 13.172 13.649 14.062 14.489 14.887 15.154 15.046 14.355 13.559 12.75 11.976 11.244 10.545 9.864 9.29 8.72 8.187 7.725 7.297 6.892 6.507 6.155 5.772 5.413 5.092 4.775 4.479 4.216 3.919 3.594 3.334 3.076 2.822 2.552 2.257 2.056 1.846 1.498 1.261 1.022 0.9 0.645 0.38 0.108 -0.047 -0.189 -0.551 -0.722 -0.919 -1.358 -1.591 -1.852 -2.142 -2.461 -2.85 -3.405 -5.21 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_289_231.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_289_231.txt deleted file mode 100644 index cae1e374..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_289_231.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18333 ,KEBNE ,16708780,Fri Nov 26 19:12:11 CET,Fri Nov 26 20:43:56 CET,0.0 0.753 1.056 1.292 1.512 1.717 1.886 2.042 2.336 2.475 2.601 2.714 2.987 3.103 3.312 3.509 3.699 3.793 3.962 4.116 4.326 4.469 4.607 4.785 4.948 5.106 5.285 5.467 5.674 5.877 6.068 6.29 6.501 6.711 6.955 7.241 7.552 7.862 8.175 8.505 8.819 9.173 9.592 10.018 10.491 11.003 11.605 12.248 12.939 13.702 14.444 14.819 14.858 14.753 14.582 14.311 14.024 13.795 13.596 13.368 13.139 12.913 12.693 12.494 12.286 12.051 11.832 11.669 11.524 11.373 11.21 11.065 10.899 10.726 10.602 10.471 10.339 10.203 10.049 9.938 9.822 9.636 9.51 9.377 9.298 9.123 8.962 8.814 8.725 8.493 8.423 8.305 8.174 7.879 7.713 7.538 7.322 7.099 6.88 6.566 5.57 -2 ,2243 ,KEBNE ,16708781,Fri Nov 26 19:12:15 CET,Fri Nov 26 20:37:16 CET,0.0 0.806 1.143 1.386 1.604 1.799 1.961 2.108 2.371 2.501 2.631 2.724 2.977 3.08 3.272 3.463 3.652 3.742 3.918 4.077 4.294 4.44 4.576 4.768 4.964 5.16 5.351 5.514 5.698 5.879 6.072 6.339 6.595 6.805 7.036 7.3 7.562 7.839 8.112 8.416 8.738 9.083 9.501 9.938 10.435 10.967 11.535 12.149 12.843 13.593 14.347 14.745 14.807 14.71 14.525 14.314 14.105 13.878 13.635 13.379 13.178 12.983 12.771 12.575 12.396 12.227 12.042 11.856 11.686 11.495 11.272 11.081 10.898 10.726 10.595 10.464 10.337 10.189 10.006 9.887 9.774 9.572 9.435 9.313 9.248 9.113 8.968 8.792 8.693 8.456 8.359 8.239 8.119 7.867 7.73 7.581 7.41 7.219 6.999 6.691 5.623 -3 ,14964 ,KEBNE ,16708782,Fri Nov 26 19:14:15 CET,Fri Nov 26 20:45:55 CET,0.0 0.913 1.245 1.483 1.687 1.887 2.055 2.206 2.47 2.58 2.689 2.762 3.013 3.123 3.349 3.551 3.728 3.812 3.972 4.132 4.379 4.539 4.685 4.869 5.047 5.238 5.434 5.63 5.864 6.064 6.274 6.536 6.762 6.963 7.192 7.474 7.742 8.028 8.334 8.634 8.95 9.317 9.744 10.152 10.613 11.131 11.693 12.31 13.006 13.741 14.498 14.901 14.992 14.931 14.79 14.6 14.376 14.163 13.952 13.704 13.495 13.298 13.087 12.869 12.646 12.468 12.311 12.155 12.01 11.851 11.68 11.529 11.383 11.236 11.108 10.975 10.84 10.699 10.552 10.453 10.356 10.19 10.055 9.898 9.816 9.65 9.466 9.279 9.178 8.944 8.862 8.745 8.633 8.356 8.207 8.055 7.885 7.693 7.463 7.166 6.313 -4 ,13496 ,KEBNE ,16708783,Fri Nov 26 19:14:16 CET,Fri Nov 26 20:46:04 CET,0.0 1.074 1.399 1.621 1.813 1.995 2.161 2.309 2.571 2.693 2.806 2.878 3.124 3.227 3.435 3.63 3.812 3.898 4.063 4.216 4.433 4.576 4.722 4.933 5.134 5.336 5.532 5.711 5.941 6.163 6.377 6.623 6.864 7.097 7.329 7.576 7.84 8.149 8.467 8.807 9.158 9.55 9.999 10.409 10.878 11.417 12.015 12.652 13.375 14.122 14.901 15.326 15.405 15.341 15.185 14.946 14.681 14.416 14.163 13.894 13.668 13.456 13.261 13.081 12.909 12.75 12.565 12.388 12.204 12.008 11.83 11.692 11.529 11.324 11.174 11.034 10.89 10.729 10.54 10.4 10.258 10.046 9.889 9.719 9.643 9.492 9.317 9.147 9.065 8.829 8.722 8.596 8.464 8.181 8.021 7.835 7.617 7.381 7.106 6.73 6.02 -5 ,10830 ,KEBNE ,16708784,Fri Nov 26 19:14:16 CET,Fri Nov 26 20:47:07 CET,0.0 0.854 1.19 1.433 1.626 1.815 1.996 2.148 2.408 2.532 2.649 2.72 2.966 3.067 3.241 3.396 3.546 3.619 3.759 3.889 4.072 4.189 4.31 4.514 4.723 4.913 5.106 5.298 5.519 5.728 5.941 6.196 6.42 6.629 6.865 7.149 7.432 7.722 8.014 8.327 8.662 9.041 9.467 9.899 10.408 10.923 11.486 12.068 12.722 13.485 14.209 14.592 14.639 14.493 14.316 14.126 13.903 13.67 13.467 13.257 13.066 12.89 12.697 12.488 12.313 12.154 11.94 11.757 11.623 11.473 11.312 11.176 11.021 10.851 10.722 10.597 10.465 10.313 10.157 10.057 9.934 9.716 9.577 9.448 9.384 9.245 9.094 8.916 8.813 8.575 8.507 8.402 8.293 8.061 7.922 7.764 7.589 7.381 7.133 6.831 6.113 -6 ,24636 ,KEBNE ,16708785,Fri Nov 26 19:14:20 CET,Fri Nov 26 20:43:43 CET,0.0 0.906 1.267 1.576 1.84 2.067 2.253 2.413 2.706 2.835 2.959 3.05 3.3 3.402 3.587 3.76 3.933 4.02 4.198 4.383 4.648 4.801 4.933 5.139 5.364 5.565 5.737 5.906 6.126 6.348 6.566 6.806 7.056 7.306 7.578 7.869 8.135 8.46 8.82 9.18 9.539 9.909 10.329 10.735 11.182 11.674 12.243 12.856 13.53 14.285 15.059 15.462 15.498 15.417 15.284 15.081 14.849 14.616 14.342 14.048 13.81 13.589 13.379 13.183 13.009 12.825 12.627 12.457 12.288 12.088 11.87 11.703 11.515 11.31 11.168 11.01 10.862 10.729 10.584 10.484 10.375 10.203 10.089 9.955 9.879 9.722 9.535 9.319 9.211 8.975 8.895 8.771 8.635 8.362 8.221 8.061 7.895 7.708 7.487 7.216 6.492 -7 ,13147 ,KEBNE ,16708786,Fri Nov 26 19:15:17 CET,Fri Nov 26 20:47:05 CET,0.0 0.749 1.064 1.296 1.492 1.669 1.813 1.955 2.21 2.324 2.438 2.519 2.769 2.869 3.06 3.25 3.436 3.527 3.705 3.866 4.107 4.276 4.435 4.649 4.845 5.028 5.209 5.399 5.642 5.853 6.03 6.24 6.436 6.622 6.858 7.127 7.375 7.667 8.013 8.394 8.776 9.156 9.565 9.986 10.472 11.005 11.597 12.214 12.891 13.62 14.351 14.73 14.783 14.741 14.611 14.373 14.142 13.913 13.685 13.476 13.283 13.098 12.938 12.773 12.599 12.432 12.246 12.064 11.865 11.684 11.535 11.397 11.234 11.016 10.859 10.709 10.531 10.361 10.2 10.067 9.921 9.707 9.559 9.405 9.327 9.175 9.03 8.885 8.801 8.571 8.508 8.399 8.281 8.025 7.877 7.712 7.522 7.281 6.983 6.627 5.735 -8 ,6938 ,KEBNE ,16708787,Fri Nov 26 19:15:17 CET,Fri Nov 26 20:48:16 CET,0.0 0.839 1.134 1.374 1.586 1.783 1.963 2.129 2.417 2.544 2.666 2.758 3.013 3.124 3.33 3.523 3.718 3.813 3.984 4.135 4.354 4.503 4.647 4.851 5.037 5.209 5.378 5.549 5.783 6.004 6.22 6.475 6.689 6.904 7.158 7.446 7.736 8.046 8.366 8.713 9.07 9.445 9.859 10.266 10.75 11.258 11.8 12.401 13.076 13.847 14.662 15.084 15.158 15.058 14.869 14.655 14.436 14.196 13.97 13.728 13.497 13.294 13.099 12.877 12.627 12.423 12.227 12.042 11.876 11.7 11.532 11.399 11.245 11.059 10.909 10.756 10.59 10.434 10.282 10.167 10.055 9.867 9.717 9.577 9.513 9.365 9.189 9.013 8.92 8.679 8.586 8.472 8.354 8.098 7.95 7.779 7.597 7.393 7.151 6.829 5.979 -9 ,16267 ,KEBNE ,16708788,Fri Nov 26 19:15:17 CET,Fri Nov 26 20:48:19 CET,0.0 0.723 1.094 1.377 1.584 1.78 1.948 2.093 2.36 2.482 2.59 2.637 2.872 2.969 3.159 3.353 3.552 3.648 3.828 4.0 4.241 4.392 4.548 4.763 4.951 5.13 5.301 5.483 5.729 5.95 6.151 6.378 6.585 6.813 7.061 7.306 7.564 7.845 8.135 8.456 8.783 9.175 9.671 10.107 10.58 11.087 11.665 12.3 13.017 13.817 14.548 14.938 15.016 14.936 14.769 14.547 14.348 14.152 13.894 13.625 13.411 13.194 12.93 12.658 12.438 12.227 12.003 11.805 11.644 11.481 11.284 11.094 10.892 10.687 10.524 10.374 10.215 10.039 9.867 9.739 9.612 9.438 9.302 9.147 9.07 8.913 8.742 8.554 8.453 8.22 8.167 8.07 7.974 7.756 7.623 7.459 7.283 7.111 6.903 6.582 5.661 -10 ,28260 ,KEBNE ,16708789,Fri Nov 26 19:15:17 CET,Fri Nov 26 20:49:21 CET,0.0 0.976 1.339 1.605 1.802 1.981 2.144 2.299 2.577 2.696 2.813 2.905 3.157 3.262 3.467 3.658 3.843 3.929 4.099 4.265 4.5 4.651 4.802 5.027 5.232 5.421 5.606 5.787 5.998 6.177 6.364 6.61 6.859 7.094 7.337 7.596 7.846 8.136 8.453 8.78 9.108 9.462 9.87 10.29 10.739 11.232 11.823 12.481 13.223 14.005 14.741 15.145 15.224 15.107 14.933 14.744 14.525 14.308 14.123 13.926 13.7 13.478 13.267 13.058 12.856 12.674 12.515 12.358 12.205 12.046 11.849 11.671 11.499 11.339 11.222 11.097 10.972 10.837 10.689 10.591 10.481 10.286 10.148 9.996 9.915 9.764 9.613 9.439 9.347 9.125 9.073 8.968 8.862 8.63 8.491 8.327 8.153 7.956 7.725 7.414 6.6 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_289_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_289_336.txt deleted file mode 100644 index a6601b4e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_289_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22895 ,KEBNE ,16708790,Fri Nov 26 19:18:24 CET,Fri Nov 26 20:51:20 CET,0.0 0.918 1.258 1.453 1.583 1.709 1.817 1.915 2.076 2.149 2.209 2.129 2.299 2.341 2.388 2.416 2.451 2.466 2.494 2.513 2.528 2.529 2.522 2.49 2.415 2.339 2.275 2.215 2.139 2.032 1.898 1.713 1.51 1.308 1.042 0.688 0.332 -0.111 -0.636 -1.213 -1.857 -2.643 -3.651 -4.752 -6.132 -7.855 -10.057 -12.827 -16.528 -21.636 -29.382 -37.665 -43.745 -48.507 -52.355 -55.592 -58.296 -60.612 -62.553 -64.456 -66.013 -67.376 -68.659 -69.82 -70.871 -71.796 -72.734 -73.567 -74.251 -74.958 -75.725 -76.351 -76.979 -77.609 -78.09 -78.577 -79.075 -79.578 -80.101 -80.467 -80.821 -81.347 -81.713 -82.093 -82.292 -82.697 -83.12 -83.582 -83.816 -84.283 -84.544 -84.813 -85.077 -85.605 -85.886 -86.195 -86.55 -86.955 -87.407 -87.988 -89.353 -2 ,32407 ,KEBNE ,16708791,Fri Nov 26 19:20:28 CET,Fri Nov 26 20:57:06 CET,0.0 0.795 1.062 1.257 1.408 1.526 1.623 1.709 1.839 1.895 1.94 1.867 2.045 2.09 2.179 2.249 2.289 2.299 2.308 2.301 2.284 2.269 2.264 2.263 2.215 2.155 2.096 2.02 1.925 1.824 1.677 1.483 1.289 1.071 0.779 0.427 0.061 -0.375 -0.839 -1.37 -1.974 -2.716 -3.713 -4.814 -6.22 -7.944 -10.159 -12.962 -16.707 -21.896 -29.607 -37.689 -43.678 -48.423 -52.253 -55.514 -58.214 -60.55 -62.521 -64.424 -65.968 -67.29 -68.567 -69.803 -70.901 -71.836 -72.773 -73.588 -74.299 -75.03 -75.772 -76.376 -76.975 -77.594 -78.09 -78.607 -79.118 -79.631 -80.19 -80.567 -80.939 -81.508 -81.892 -82.279 -82.473 -82.883 -83.311 -83.757 -83.992 -84.46 -84.684 -84.927 -85.191 -85.735 -86.011 -86.32 -86.68 -87.077 -87.519 -88.115 -89.896 -3 ,22368 ,KEBNE ,16708792,Fri Nov 26 19:20:28 CET,Fri Nov 26 20:53:02 CET,0.0 1.053 1.416 1.629 1.8 1.953 2.07 2.17 2.33 2.379 2.421 2.372 2.554 2.582 2.611 2.61 2.614 2.622 2.632 2.624 2.62 2.63 2.616 2.582 2.555 2.496 2.405 2.298 2.179 2.069 1.933 1.76 1.574 1.386 1.16 0.856 0.541 0.153 -0.351 -0.931 -1.509 -2.242 -3.227 -4.291 -5.693 -7.406 -9.597 -12.4 -16.115 -21.187 -28.794 -36.899 -42.954 -47.704 -51.509 -54.707 -57.362 -59.689 -61.668 -63.563 -65.128 -66.499 -67.798 -69.008 -70.096 -71.018 -71.975 -72.835 -73.546 -74.291 -75.05 -75.656 -76.265 -76.883 -77.366 -77.862 -78.363 -78.86 -79.376 -79.72 -80.068 -80.608 -80.971 -81.37 -81.581 -81.986 -82.386 -82.797 -83.01 -83.477 -83.736 -83.988 -84.239 -84.749 -85.052 -85.388 -85.737 -86.139 -86.586 -87.14 -88.506 -4 ,13219 ,KEBNE ,16708793,Fri Nov 26 19:25:38 CET,Fri Nov 26 20:58:55 CET,0.0 0.615 0.842 1.05 1.201 1.301 1.391 1.49 1.658 1.706 1.741 1.687 1.869 1.899 1.938 1.984 2.03 2.042 2.041 2.027 2.003 1.985 1.96 1.91 1.874 1.829 1.775 1.713 1.606 1.467 1.305 1.125 0.93 0.709 0.444 0.12 -0.226 -0.636 -1.124 -1.691 -2.329 -3.09 -4.049 -5.124 -6.507 -8.226 -10.411 -13.161 -16.891 -22.07 -29.713 -37.806 -43.842 -48.68 -52.606 -55.843 -58.514 -60.831 -62.748 -64.614 -66.149 -67.444 -68.654 -69.786 -70.83 -71.758 -72.689 -73.511 -74.221 -74.939 -75.661 -76.256 -76.856 -77.468 -77.962 -78.468 -78.969 -79.482 -80.026 -80.398 -80.759 -81.318 -81.717 -82.115 -82.315 -82.735 -83.167 -83.614 -83.849 -84.324 -84.553 -84.794 -85.067 -85.697 -86.016 -86.335 -86.673 -87.031 -87.484 -88.088 -89.633 -5 ,29 ,KEBNE ,16708794,Fri Nov 26 19:25:38 CET,Fri Nov 26 20:58:18 CET,0.0 0.894 1.215 1.421 1.565 1.688 1.792 1.868 1.969 2.008 2.048 2.001 2.189 2.228 2.273 2.31 2.355 2.368 2.373 2.375 2.364 2.339 2.303 2.26 2.209 2.137 2.065 1.973 1.836 1.699 1.543 1.344 1.143 0.922 0.642 0.303 -0.022 -0.409 -0.898 -1.455 -2.096 -2.879 -3.865 -4.948 -6.355 -8.072 -10.239 -13.027 -16.775 -21.981 -29.734 -37.892 -44.005 -48.805 -52.654 -55.896 -58.571 -60.878 -62.818 -64.73 -66.356 -67.742 -68.99 -70.17 -71.267 -72.226 -73.19 -74.024 -74.741 -75.463 -76.215 -76.844 -77.47 -78.124 -78.63 -79.14 -79.66 -80.167 -80.661 -81.011 -81.364 -81.896 -82.276 -82.674 -82.873 -83.27 -83.674 -84.116 -84.341 -84.8 -85.041 -85.3 -85.563 -86.075 -86.364 -86.693 -87.038 -87.414 -87.836 -88.385 -89.702 -6 ,10478 ,KEBNE ,16708795,Fri Nov 26 19:29:49 CET,Fri Nov 26 21:01:26 CET,0.0 1.054 1.399 1.602 1.733 1.844 1.947 2.024 2.144 2.2 2.246 2.201 2.387 2.425 2.471 2.497 2.511 2.518 2.538 2.547 2.547 2.53 2.505 2.471 2.431 2.407 2.38 2.299 2.142 2.008 1.87 1.657 1.447 1.253 1.001 0.679 0.389 0.03 -0.457 -1.028 -1.67 -2.449 -3.433 -4.493 -5.846 -7.563 -9.758 -12.525 -16.23 -21.353 -28.983 -37.041 -43.066 -47.86 -51.728 -54.994 -57.714 -60.051 -61.998 -63.858 -65.431 -66.853 -68.156 -69.305 -70.338 -71.258 -72.185 -73.004 -73.702 -74.411 -75.131 -75.723 -76.352 -76.997 -77.491 -77.997 -78.512 -79.026 -79.534 -79.886 -80.251 -80.798 -81.177 -81.556 -81.745 -82.151 -82.57 -83.009 -83.243 -83.711 -83.953 -84.21 -84.471 -85.025 -85.323 -85.642 -85.987 -86.376 -86.847 -87.431 -88.724 -7 ,25663 ,KEBNE ,16708796,Fri Nov 26 19:29:49 CET,Fri Nov 26 21:01:26 CET,0.0 1.387 1.764 2.034 2.229 2.368 2.472 2.562 2.73 2.803 2.86 2.81 2.991 3.025 3.072 3.108 3.167 3.185 3.192 3.194 3.191 3.18 3.163 3.124 3.049 2.969 2.901 2.834 2.714 2.57 2.409 2.185 1.983 1.768 1.517 1.248 0.912 0.497 0.04 -0.5 -1.142 -1.931 -2.947 -4.033 -5.416 -7.115 -9.268 -12.035 -15.775 -20.968 -28.717 -36.82 -42.859 -47.603 -51.426 -54.648 -57.318 -59.657 -61.589 -63.434 -65.006 -66.37 -67.601 -68.751 -69.835 -70.785 -71.735 -72.597 -73.345 -74.076 -74.818 -75.444 -76.062 -76.68 -77.153 -77.648 -78.164 -78.676 -79.202 -79.564 -79.917 -80.449 -80.827 -81.217 -81.413 -81.817 -82.232 -82.652 -82.878 -83.348 -83.575 -83.828 -84.096 -84.632 -84.934 -85.254 -85.58 -85.981 -86.447 -86.983 -88.482 -8 ,13822 ,KEBNE ,16708797,Fri Nov 26 19:36:02 CET,Fri Nov 26 21:08:03 CET,0.0 0.676 0.902 1.067 1.179 1.281 1.39 1.483 1.655 1.733 1.792 1.742 1.91 1.93 1.976 2.016 2.035 2.043 2.063 2.069 2.055 2.029 1.993 1.936 1.885 1.816 1.721 1.637 1.522 1.388 1.254 1.078 0.898 0.689 0.388 0.032 -0.326 -0.749 -1.237 -1.773 -2.383 -3.174 -4.181 -5.27 -6.687 -8.425 -10.635 -13.439 -17.109 -22.187 -29.828 -37.956 -44.06 -48.869 -52.761 -56.007 -58.708 -61.087 -63.025 -64.846 -66.39 -67.743 -68.983 -70.11 -71.134 -72.089 -73.095 -73.957 -74.652 -75.339 -76.05 -76.631 -77.234 -77.848 -78.317 -78.804 -79.289 -79.788 -80.303 -80.642 -80.981 -81.519 -81.903 -82.31 -82.518 -82.94 -83.38 -83.828 -84.052 -84.527 -84.788 -85.059 -85.341 -85.904 -86.212 -86.557 -86.906 -87.278 -87.719 -88.273 -89.839 -9 ,27304 ,KEBNE ,16708798,Fri Nov 26 19:38:05 CET,Fri Nov 26 21:11:16 CET,0.0 0.666 0.988 1.237 1.41 1.55 1.646 1.711 1.839 1.902 1.956 1.903 2.071 2.1 2.167 2.212 2.244 2.259 2.254 2.246 2.247 2.231 2.201 2.17 2.136 2.078 2.004 1.901 1.77 1.648 1.526 1.384 1.199 0.984 0.723 0.381 0.025 -0.384 -0.879 -1.453 -2.069 -2.809 -3.807 -4.925 -6.323 -8.028 -10.206 -12.987 -16.739 -21.928 -29.68 -37.879 -43.958 -48.709 -52.556 -55.85 -58.569 -60.901 -62.81 -64.651 -66.222 -67.637 -68.924 -70.062 -71.103 -72.029 -72.968 -73.782 -74.481 -75.193 -75.94 -76.571 -77.219 -77.877 -78.361 -78.845 -79.352 -79.863 -80.373 -80.711 -81.057 -81.605 -81.992 -82.395 -82.595 -82.995 -83.4 -83.844 -84.076 -84.55 -84.809 -85.063 -85.319 -85.878 -86.186 -86.512 -86.876 -87.27 -87.685 -88.226 -89.879 -10 ,19370 ,KEBNE ,16708799,Fri Nov 26 19:38:05 CET,Fri Nov 26 21:10:58 CET,0.0 0.756 1.042 1.231 1.383 1.519 1.624 1.709 1.839 1.901 1.965 1.904 2.087 2.123 2.159 2.197 2.234 2.238 2.227 2.223 2.213 2.185 2.17 2.151 2.1 2.041 1.965 1.887 1.781 1.647 1.498 1.303 1.121 0.939 0.671 0.343 0.001 -0.415 -0.878 -1.383 -1.99 -2.781 -3.769 -4.865 -6.279 -7.98 -10.154 -12.913 -16.566 -21.644 -29.248 -37.35 -43.444 -48.175 -51.973 -55.239 -57.955 -60.328 -62.313 -64.189 -65.74 -67.084 -68.339 -69.469 -70.485 -71.396 -72.33 -73.2 -73.932 -74.646 -75.407 -76.02 -76.624 -77.232 -77.699 -78.189 -78.679 -79.197 -79.755 -80.113 -80.464 -81.025 -81.418 -81.834 -82.048 -82.471 -82.902 -83.342 -83.558 -84.017 -84.239 -84.481 -84.727 -85.264 -85.549 -85.839 -86.176 -86.564 -87.038 -87.663 -89.275 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_164.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_164.txt deleted file mode 100644 index 9c4900d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_164.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7335 ,KEBNE ,16708800,Fri Nov 26 19:38:05 CET,Fri Nov 26 21:11:25 CET,0.0 1.066 1.293 1.423 1.502 1.56 1.597 1.609 1.609 1.6 1.575 1.532 1.444 1.393 1.275 1.151 1.033 0.97 0.835 0.707 0.505 0.36 0.211 -0.016 -0.252 -0.502 -0.762 -1.027 -1.384 -1.752 -2.121 -2.589 -3.073 -3.544 -4.108 -4.807 -5.525 -6.357 -7.308 -8.386 -9.596 -11.026 -12.819 -14.79 -17.266 -20.255 -24.048 -28.772 -35.059 -43.724 -56.3 -69.539 -79.305 -86.813 -92.806 -97.843 -102.007 -105.582 -108.509 -111.296 -113.571 -115.523 -117.332 -118.983 -120.483 -121.81 -123.143 -124.308 -125.297 -126.288 -127.292 -128.1 -128.927 -129.766 -130.397 -131.035 -131.678 -132.33 -132.992 -133.442 -133.909 -134.62 -135.102 -135.591 -135.832 -136.318 -136.811 -137.326 -137.592 -137.975 -138.472 -138.778 -139.08 -139.713 -140.059 -140.418 -140.796 -141.203 -141.682 -142.264 -144.176 -2 ,5927 ,KEBNE ,16708801,Fri Nov 26 19:38:05 CET,Fri Nov 26 21:10:08 CET,0.0 0.523 0.658 0.738 0.801 0.829 0.846 0.853 0.837 0.813 0.775 0.712 0.621 0.577 0.467 0.34 0.219 0.159 0.033 -0.112 -0.349 -0.5 -0.654 -0.895 -1.141 -1.391 -1.65 -1.919 -2.276 -2.632 -3.0 -3.471 -3.958 -4.458 -5.055 -5.772 -6.494 -7.33 -8.3 -9.399 -10.608 -12.055 -13.874 -15.844 -18.326 -21.365 -25.226 -30.057 -36.475 -45.174 -57.773 -71.036 -80.779 -88.265 -94.244 -99.238 -103.347 -106.883 -109.778 -112.536 -114.826 -116.785 -118.574 -120.196 -121.661 -122.961 -124.288 -125.452 -126.429 -127.408 -128.395 -129.192 -129.993 -130.826 -131.469 -132.103 -132.74 -133.388 -134.038 -134.476 -134.922 -135.622 -136.107 -136.594 -136.839 -137.336 -137.853 -138.386 -138.658 -139.03 -139.506 -139.81 -140.111 -140.727 -141.06 -141.427 -141.824 -142.26 -142.733 -143.308 -144.407 -3 ,28847 ,KEBNE ,16708802,Fri Nov 26 19:50:34 CET,Fri Nov 26 21:19:18 CET,0.0 0.972 1.19 1.303 1.369 1.408 1.428 1.438 1.436 1.421 1.402 1.386 1.315 1.275 1.185 1.081 0.971 0.917 0.805 0.673 0.457 0.311 0.155 -0.081 -0.318 -0.555 -0.803 -1.065 -1.42 -1.784 -2.149 -2.608 -3.081 -3.564 -4.161 -4.873 -5.602 -6.45 -7.405 -8.497 -9.72 -11.166 -12.962 -14.935 -17.411 -20.405 -24.19 -28.927 -35.211 -43.81 -56.499 -69.733 -79.537 -87.18 -93.231 -98.261 -102.361 -105.865 -108.804 -111.655 -113.98 -115.933 -117.718 -119.356 -120.829 -122.131 -123.46 -124.595 -125.548 -126.525 -127.527 -128.363 -129.198 -130.02 -130.651 -131.294 -131.935 -132.581 -133.237 -133.695 -134.169 -134.888 -135.376 -135.867 -136.118 -136.63 -137.164 -137.707 -137.977 -138.356 -138.818 -139.107 -139.41 -140.05 -140.381 -140.741 -141.14 -141.586 -142.103 -142.711 -144.31 -4 ,25012 ,KEBNE ,16708803,Fri Nov 26 19:50:35 CET,Fri Nov 26 21:16:07 CET,0.0 0.632 0.757 0.837 0.892 0.924 0.929 0.926 0.889 0.855 0.816 0.792 0.716 0.668 0.553 0.426 0.299 0.234 0.112 -0.011 -0.22 -0.372 -0.53 -0.772 -1.014 -1.258 -1.516 -1.788 -2.154 -2.521 -2.896 -3.371 -3.863 -4.371 -4.978 -5.688 -6.417 -7.274 -8.251 -9.341 -10.559 -12.046 -13.907 -15.894 -18.345 -21.309 -25.11 -29.856 -36.13 -44.79 -57.471 -70.686 -80.41 -88.003 -94.036 -99.056 -103.173 -106.685 -109.572 -112.331 -114.636 -116.603 -118.388 -120.027 -121.496 -122.783 -124.104 -125.265 -126.241 -127.237 -128.252 -129.066 -129.889 -130.729 -131.367 -132.016 -132.661 -133.297 -133.952 -134.408 -134.871 -135.576 -136.042 -136.508 -136.753 -137.259 -137.782 -138.326 -138.605 -138.989 -139.466 -139.761 -140.061 -140.701 -141.05 -141.434 -141.854 -142.291 -142.766 -143.379 -144.784 -5 ,18971 ,KEBNE ,16708804,Fri Nov 26 19:51:33 CET,Fri Nov 26 21:23:39 CET,0.0 1.072 1.296 1.42 1.504 1.546 1.565 1.587 1.612 1.609 1.592 1.573 1.499 1.458 1.379 1.288 1.182 1.129 1.02 0.892 0.686 0.548 0.398 0.166 -0.068 -0.31 -0.561 -0.816 -1.153 -1.508 -1.875 -2.339 -2.822 -3.318 -3.909 -4.607 -5.326 -6.164 -7.122 -8.21 -9.417 -10.862 -12.674 -14.622 -17.111 -20.141 -23.94 -28.715 -35.008 -43.595 -56.234 -69.37 -78.986 -86.546 -92.621 -97.669 -101.84 -105.413 -108.295 -111.041 -113.318 -115.265 -117.052 -118.687 -120.178 -121.529 -122.895 -124.038 -124.998 -125.978 -126.97 -127.776 -128.599 -129.436 -130.067 -130.705 -131.356 -132.022 -132.686 -133.124 -133.582 -134.292 -134.77 -135.261 -135.512 -136.024 -136.538 -137.054 -137.322 -137.716 -138.212 -138.516 -138.833 -139.514 -139.865 -140.221 -140.628 -141.059 -141.528 -142.192 -143.798 -6 ,7260 ,KEBNE ,16708805,Fri Nov 26 19:50:35 CET,Fri Nov 26 21:16:12 CET,0.0 1.054 1.245 1.374 1.467 1.523 1.57 1.602 1.611 1.598 1.579 1.568 1.493 1.448 1.355 1.263 1.154 1.093 0.974 0.84 0.625 0.485 0.341 0.117 -0.109 -0.338 -0.579 -0.83 -1.174 -1.532 -1.909 -2.385 -2.856 -3.338 -3.94 -4.652 -5.373 -6.208 -7.163 -8.249 -9.481 -10.953 -12.763 -14.734 -17.238 -20.264 -24.05 -28.803 -35.118 -43.749 -56.472 -69.773 -79.564 -87.21 -93.302 -98.347 -102.486 -106.028 -108.959 -111.739 -114.006 -115.955 -117.756 -119.409 -120.884 -122.182 -123.502 -124.652 -125.627 -126.611 -127.623 -128.445 -129.258 -130.082 -130.707 -131.339 -131.979 -132.634 -133.327 -133.794 -134.253 -134.956 -135.438 -135.927 -136.176 -136.688 -137.209 -137.75 -138.025 -138.406 -138.899 -139.205 -139.508 -140.133 -140.476 -140.85 -141.224 -141.643 -142.149 -142.747 -144.104 -7 ,8522 ,KEBNE ,16708806,Fri Nov 26 19:51:33 CET,Fri Nov 26 21:24:57 CET,0.0 0.786 0.914 0.977 1.012 1.034 1.053 1.058 1.032 1.002 0.962 0.912 0.83 0.786 0.692 0.582 0.456 0.389 0.251 0.11 -0.115 -0.271 -0.43 -0.664 -0.907 -1.166 -1.429 -1.688 -2.04 -2.409 -2.776 -3.242 -3.72 -4.198 -4.799 -5.54 -6.274 -7.118 -8.094 -9.181 -10.395 -11.845 -13.656 -15.617 -18.068 -21.079 -24.918 -29.741 -36.087 -44.728 -57.568 -70.944 -80.667 -88.239 -94.246 -99.283 -103.473 -107.019 -109.903 -112.692 -114.993 -116.976 -118.828 -120.506 -121.991 -123.289 -124.604 -125.743 -126.708 -127.683 -128.672 -129.482 -130.303 -131.143 -131.775 -132.417 -133.079 -133.741 -134.406 -134.857 -135.316 -136.003 -136.464 -136.946 -137.19 -137.689 -138.203 -138.725 -138.995 -139.372 -139.841 -140.141 -140.462 -141.139 -141.478 -141.828 -142.213 -142.626 -143.097 -143.664 -144.983 -8 ,29930 ,KEBNE ,16708807,Fri Nov 26 19:51:37 CET,Fri Nov 26 21:19:29 CET,0.0 1.113 1.348 1.492 1.58 1.629 1.656 1.672 1.66 1.643 1.625 1.625 1.556 1.521 1.446 1.355 1.246 1.19 1.072 0.938 0.733 0.594 0.438 0.193 -0.058 -0.315 -0.575 -0.834 -1.187 -1.561 -1.941 -2.427 -2.914 -3.405 -4.009 -4.724 -5.455 -6.306 -7.287 -8.395 -9.609 -11.073 -12.896 -14.872 -17.38 -20.415 -24.286 -29.112 -35.393 -43.93 -56.605 -69.919 -79.773 -87.35 -93.362 -98.394 -102.607 -106.229 -109.117 -111.873 -114.152 -116.103 -117.908 -119.549 -121.005 -122.303 -123.652 -124.824 -125.805 -126.792 -127.792 -128.616 -129.447 -130.282 -130.917 -131.562 -132.215 -132.878 -133.552 -134.005 -134.463 -135.166 -135.645 -136.134 -136.382 -136.885 -137.393 -137.916 -138.193 -138.58 -139.037 -139.326 -139.631 -140.3 -140.631 -140.97 -141.344 -141.734 -142.197 -142.768 -144.316 -9 ,16382 ,KEBNE ,16708808,Fri Nov 26 19:51:37 CET,Fri Nov 26 21:17:03 CET,0.0 1.154 1.347 1.48 1.564 1.609 1.634 1.642 1.628 1.615 1.597 1.58 1.505 1.469 1.391 1.299 1.195 1.138 1.013 0.888 0.696 0.56 0.415 0.189 -0.037 -0.275 -0.526 -0.78 -1.139 -1.518 -1.882 -2.337 -2.816 -3.3 -3.883 -4.589 -5.321 -6.176 -7.143 -8.227 -9.464 -10.933 -12.747 -14.712 -17.171 -20.165 -23.986 -28.757 -35.031 -43.684 -56.372 -69.714 -79.569 -87.171 -93.113 -98.125 -102.286 -105.805 -108.717 -111.502 -113.763 -115.698 -117.497 -119.137 -120.633 -121.951 -123.28 -124.433 -125.395 -126.378 -127.393 -128.211 -129.034 -129.876 -130.507 -131.139 -131.794 -132.469 -133.161 -133.621 -134.081 -134.786 -135.26 -135.744 -135.988 -136.484 -136.986 -137.52 -137.8 -138.174 -138.633 -138.927 -139.228 -139.878 -140.219 -140.568 -140.975 -141.413 -141.858 -142.447 -144.251 -10 ,28182 ,KEBNE ,16708809,Fri Nov 26 19:51:33 CET,Fri Nov 26 21:24:43 CET,0.0 0.732 0.885 0.969 1.029 1.069 1.105 1.124 1.123 1.11 1.087 1.057 0.979 0.939 0.854 0.756 0.651 0.597 0.476 0.342 0.135 -0.005 -0.157 -0.389 -0.628 -0.882 -1.142 -1.404 -1.745 -2.103 -2.47 -2.931 -3.411 -3.9 -4.493 -5.194 -5.912 -6.741 -7.696 -8.783 -10.007 -11.482 -13.295 -15.242 -17.697 -20.678 -24.461 -29.207 -35.491 -44.139 -56.894 -70.222 -80.119 -87.789 -93.79 -98.789 -102.929 -106.477 -109.38 -112.123 -114.385 -116.333 -118.118 -119.747 -121.226 -122.533 -123.855 -125.017 -126.005 -126.994 -127.988 -128.786 -129.581 -130.4 -131.036 -131.677 -132.324 -132.978 -133.629 -134.077 -134.537 -135.239 -135.71 -136.197 -136.451 -136.952 -137.464 -138.001 -138.272 -138.655 -139.136 -139.439 -139.742 -140.373 -140.709 -141.075 -141.462 -141.873 -142.355 -142.96 -144.392 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_165.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_165.txt deleted file mode 100644 index 10866cd2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_165.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24685 ,KEBNE ,16708810,Fri Nov 26 19:51:33 CET,Fri Nov 26 21:23:49 CET,0.0 0.588 0.758 0.842 0.894 0.938 0.97 0.985 0.976 0.969 0.947 0.9 0.808 0.756 0.662 0.565 0.447 0.385 0.25 0.103 -0.119 -0.275 -0.434 -0.665 -0.908 -1.162 -1.431 -1.705 -2.086 -2.499 -2.915 -3.433 -3.953 -4.479 -5.108 -5.854 -6.629 -7.519 -8.537 -9.703 -11.007 -12.571 -14.52 -16.612 -19.239 -22.388 -26.314 -31.265 -37.872 -46.837 -59.906 -73.403 -83.186 -90.766 -96.78 -101.745 -105.786 -109.241 -112.087 -114.796 -117.023 -118.942 -120.709 -122.299 -123.738 -125.037 -126.355 -127.489 -128.441 -129.4 -130.383 -131.189 -132.015 -132.831 -133.436 -134.059 -134.694 -135.344 -136.012 -136.468 -136.929 -137.615 -138.082 -138.557 -138.798 -139.291 -139.79 -140.311 -140.576 -140.947 -141.395 -141.684 -141.989 -142.621 -142.94 -143.268 -143.63 -144.039 -144.489 -145.014 -146.207 -2 ,5925 ,KEBNE ,16708811,Fri Nov 26 19:51:33 CET,Fri Nov 26 21:24:51 CET,0.0 0.843 0.982 1.043 1.069 1.087 1.097 1.087 1.032 1.001 0.962 0.914 0.827 0.777 0.669 0.558 0.436 0.366 0.209 0.031 -0.231 -0.396 -0.565 -0.832 -1.107 -1.382 -1.658 -1.95 -2.361 -2.763 -3.17 -3.698 -4.232 -4.763 -5.389 -6.153 -6.951 -7.867 -8.905 -10.083 -11.392 -12.937 -14.824 -16.848 -19.399 -22.518 -26.523 -31.552 -38.153 -47.048 -60.067 -73.513 -83.284 -90.839 -96.868 -101.874 -105.954 -109.41 -112.243 -114.976 -117.234 -119.165 -120.932 -122.548 -124.015 -125.329 -126.635 -127.746 -128.687 -129.648 -130.607 -131.379 -132.182 -133.0 -133.616 -134.24 -134.877 -135.523 -136.173 -136.615 -137.055 -137.714 -138.17 -138.639 -138.882 -139.374 -139.862 -140.372 -140.635 -141.013 -141.454 -141.735 -142.038 -142.686 -143.024 -143.382 -143.769 -144.198 -144.681 -145.219 -146.618 -3 ,18203 ,KEBNE ,16708812,Fri Nov 26 19:55:41 CET,Fri Nov 26 21:27:48 CET,0.0 0.73 0.866 0.927 0.952 0.953 0.947 0.937 0.91 0.888 0.853 0.811 0.73 0.689 0.597 0.488 0.374 0.317 0.185 0.041 -0.186 -0.346 -0.508 -0.758 -1.032 -1.321 -1.612 -1.907 -2.3 -2.693 -3.099 -3.585 -4.071 -4.597 -5.256 -6.042 -6.84 -7.75 -8.745 -9.88 -11.193 -12.762 -14.701 -16.804 -19.461 -22.656 -26.673 -31.669 -38.207 -47.116 -60.141 -73.572 -83.363 -90.876 -96.794 -101.72 -105.785 -109.258 -112.096 -114.795 -116.999 -118.894 -120.644 -122.255 -123.697 -124.964 -126.257 -127.402 -128.36 -129.303 -130.262 -131.032 -131.823 -132.627 -133.234 -133.861 -134.494 -135.133 -135.787 -136.236 -136.689 -137.365 -137.819 -138.279 -138.515 -139.008 -139.518 -140.03 -140.289 -140.661 -141.09 -141.364 -141.654 -142.271 -142.605 -142.968 -143.356 -143.766 -144.231 -144.799 -146.345 -4 ,6166 ,KEBNE ,16708813,Fri Nov 26 19:55:45 CET,Fri Nov 26 21:27:03 CET,0.0 0.729 0.855 0.926 0.978 1.012 1.031 1.028 0.994 0.968 0.939 0.909 0.828 0.783 0.675 0.552 0.426 0.36 0.222 0.072 -0.153 -0.297 -0.45 -0.702 -0.979 -1.267 -1.562 -1.867 -2.272 -2.68 -3.088 -3.609 -4.149 -4.7 -5.374 -6.163 -6.955 -7.863 -8.88 -10.034 -11.329 -12.867 -14.796 -16.857 -19.428 -22.589 -26.589 -31.586 -38.136 -47.086 -60.139 -73.56 -83.354 -90.915 -96.892 -101.911 -106.017 -109.466 -112.291 -114.982 -117.182 -119.07 -120.822 -122.401 -123.841 -125.149 -126.483 -127.623 -128.574 -129.545 -130.519 -131.3 -132.091 -132.911 -133.544 -134.167 -134.784 -135.417 -136.064 -136.496 -136.937 -137.627 -138.09 -138.556 -138.795 -139.289 -139.794 -140.305 -140.562 -140.933 -141.372 -141.657 -141.951 -142.554 -142.874 -143.199 -143.578 -144.001 -144.466 -144.991 -146.341 -5 ,17887 ,KEBNE ,16708814,Fri Nov 26 19:56:42 CET,Fri Nov 26 21:30:13 CET,0.0 0.783 0.881 0.951 1.003 1.018 1.0 0.969 0.893 0.854 0.814 0.752 0.654 0.591 0.453 0.306 0.154 0.079 -0.063 -0.21 -0.447 -0.612 -0.792 -1.064 -1.325 -1.601 -1.89 -2.178 -2.564 -2.947 -3.326 -3.807 -4.307 -4.839 -5.497 -6.273 -7.057 -7.971 -8.98 -10.059 -11.274 -12.79 -14.725 -16.78 -19.373 -22.564 -26.594 -31.595 -38.166 -47.055 -59.952 -73.378 -83.174 -90.705 -96.629 -101.564 -105.64 -109.098 -111.929 -114.678 -116.939 -118.872 -120.677 -122.311 -123.756 -125.032 -126.344 -127.497 -128.457 -129.425 -130.407 -131.213 -132.033 -132.854 -133.466 -134.077 -134.706 -135.334 -135.961 -136.399 -136.844 -137.491 -137.936 -138.413 -138.655 -139.149 -139.658 -140.172 -140.436 -140.813 -141.273 -141.563 -141.855 -142.463 -142.797 -143.157 -143.533 -143.91 -144.307 -144.802 -145.876 -6 ,26934 ,KEBNE ,16708815,Fri Nov 26 19:56:42 CET,Fri Nov 26 21:29:03 CET,0.0 0.582 0.711 0.766 0.781 0.786 0.77 0.745 0.692 0.657 0.614 0.568 0.481 0.438 0.358 0.259 0.146 0.088 -0.039 -0.177 -0.401 -0.569 -0.75 -1.027 -1.313 -1.609 -1.908 -2.207 -2.609 -3.007 -3.391 -3.879 -4.393 -4.922 -5.578 -6.356 -7.141 -8.054 -9.087 -10.252 -11.529 -13.03 -14.939 -17.043 -19.673 -22.857 -26.899 -31.942 -38.539 -47.465 -60.475 -73.864 -83.65 -91.256 -97.244 -102.192 -106.251 -109.709 -112.567 -115.281 -117.532 -119.489 -121.292 -122.922 -124.372 -125.649 -126.947 -128.065 -129.002 -129.955 -130.917 -131.693 -132.477 -133.276 -133.886 -134.504 -135.131 -135.776 -136.433 -136.872 -137.316 -137.98 -138.425 -138.883 -139.118 -139.608 -140.113 -140.623 -140.886 -141.258 -141.696 -141.985 -142.284 -142.904 -143.241 -143.593 -143.971 -144.398 -144.857 -145.422 -146.736 -7 ,7088 ,KEBNE ,16708816,Fri Nov 26 19:56:46 CET,Fri Nov 26 21:26:24 CET,0.0 0.833 0.991 1.093 1.158 1.195 1.23 1.252 1.237 1.207 1.171 1.135 1.047 0.999 0.905 0.798 0.666 0.589 0.426 0.26 0.008 -0.166 -0.336 -0.593 -0.875 -1.176 -1.479 -1.776 -2.176 -2.573 -2.986 -3.53 -4.069 -4.615 -5.277 -6.055 -6.843 -7.759 -8.805 -9.98 -11.289 -12.853 -14.815 -16.934 -19.541 -22.703 -26.759 -31.815 -38.463 -47.406 -60.413 -73.874 -83.679 -91.31 -97.399 -102.425 -106.554 -110.078 -112.931 -115.633 -117.895 -119.842 -121.62 -123.261 -124.717 -125.982 -127.266 -128.397 -129.362 -130.334 -131.289 -132.049 -132.833 -133.64 -134.261 -134.898 -135.522 -136.149 -136.814 -137.257 -137.689 -138.349 -138.801 -139.259 -139.492 -139.973 -140.466 -140.986 -141.256 -141.637 -142.111 -142.405 -142.708 -143.352 -143.702 -144.068 -144.436 -144.83 -145.283 -145.885 -147.129 -8 ,6166 ,KEBNE ,16708817,Fri Nov 26 19:57:48 CET,Fri Nov 26 21:27:05 CET,0.0 0.729 0.855 0.926 0.978 1.012 1.031 1.028 0.994 0.968 0.939 0.909 0.828 0.783 0.675 0.552 0.426 0.36 0.222 0.072 -0.153 -0.297 -0.45 -0.702 -0.979 -1.267 -1.562 -1.867 -2.272 -2.68 -3.088 -3.609 -4.149 -4.7 -5.374 -6.163 -6.955 -7.863 -8.88 -10.034 -11.329 -12.867 -14.796 -16.857 -19.428 -22.589 -26.589 -31.586 -38.136 -47.086 -60.139 -73.56 -83.354 -90.915 -96.892 -101.911 -106.017 -109.466 -112.291 -114.982 -117.182 -119.07 -120.822 -122.401 -123.841 -125.149 -126.483 -127.623 -128.574 -129.545 -130.519 -131.3 -132.091 -132.911 -133.544 -134.167 -134.784 -135.417 -136.064 -136.496 -136.937 -137.627 -138.09 -138.556 -138.795 -139.289 -139.794 -140.305 -140.562 -140.933 -141.372 -141.657 -141.951 -142.554 -142.874 -143.199 -143.578 -144.001 -144.466 -144.991 -146.341 -9 ,22100 ,KEBNE ,16708818,Fri Nov 26 19:57:47 CET,Fri Nov 26 21:26:18 CET,0.0 0.814 0.987 1.07 1.124 1.138 1.121 1.102 1.051 1.013 0.973 0.911 0.813 0.745 0.609 0.465 0.306 0.226 0.071 -0.076 -0.298 -0.458 -0.624 -0.876 -1.125 -1.402 -1.701 -1.999 -2.403 -2.815 -3.227 -3.75 -4.26 -4.779 -5.421 -6.176 -6.945 -7.838 -8.854 -10.007 -11.317 -12.878 -14.794 -16.838 -19.431 -22.586 -26.548 -31.493 -38.05 -47.053 -60.244 -73.784 -83.616 -91.198 -97.144 -102.073 -106.111 -109.553 -112.398 -115.163 -117.458 -119.419 -121.217 -122.874 -124.371 -125.695 -127.01 -128.133 -129.091 -130.065 -131.044 -131.826 -132.622 -133.428 -134.032 -134.65 -135.283 -135.923 -136.579 -137.023 -137.486 -138.205 -138.682 -139.162 -139.398 -139.852 -140.316 -140.812 -141.071 -141.445 -141.899 -142.171 -142.464 -143.148 -143.502 -143.854 -144.217 -144.607 -145.046 -145.649 -147.114 -10 ,22301 ,KEBNE ,16708819,Fri Nov 26 19:58:49 CET,Fri Nov 26 21:27:20 CET,0.0 0.589 0.696 0.745 0.75 0.74 0.728 0.703 0.634 0.591 0.548 0.487 0.388 0.326 0.201 0.078 -0.055 -0.123 -0.262 -0.407 -0.631 -0.794 -0.949 -1.181 -1.43 -1.684 -1.951 -2.228 -2.604 -2.984 -3.377 -3.891 -4.424 -4.955 -5.586 -6.336 -7.114 -8.023 -9.052 -10.2 -11.472 -13.016 -14.945 -17.012 -19.62 -22.781 -26.778 -31.745 -38.25 -47.139 -60.206 -73.747 -83.578 -91.135 -97.139 -102.144 -106.227 -109.676 -112.484 -115.213 -117.506 -119.44 -121.189 -122.78 -124.216 -125.512 -126.84 -127.981 -128.922 -129.869 -130.823 -131.608 -132.426 -133.268 -133.908 -134.542 -135.176 -135.826 -136.479 -136.905 -137.342 -138.017 -138.468 -138.926 -139.159 -139.645 -140.155 -140.683 -140.947 -141.314 -141.77 -142.079 -142.386 -142.996 -143.326 -143.674 -144.029 -144.408 -144.865 -145.457 -146.772 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_227.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_227.txt deleted file mode 100644 index 5dc5d43b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_227.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28649 ,TETRA ,17667976,Fri Dec 3 06:12:46 CET,Fri Dec 3 08:00:38 CET,0.0 1.429 1.779 2.047 2.267 2.452 2.606 2.741 2.964 3.061 3.157 3.384 3.438 3.525 3.668 3.813 3.964 4.03 4.136 4.243 4.407 4.514 4.622 4.773 4.91 5.046 5.18 5.297 5.434 5.563 5.68 5.829 5.966 6.073 6.192 6.326 6.438 6.551 6.661 6.768 6.905 7.02 7.071 7.119 7.14 7.05 6.933 6.743 6.27 5.368 3.706 1.609 -0.196 -1.762 -3.055 -4.202 -5.231 -6.161 -6.923 -7.685 -8.363 -8.964 -9.537 -10.078 -10.571 -10.985 -11.407 -11.789 -12.127 -12.498 -12.908 -13.263 -13.63 -13.984 -14.228 -14.478 -14.747 -15.029 -15.325 -15.52 -15.713 -16.028 -16.254 -16.485 -16.609 -16.867 -17.127 -17.397 -17.53 -17.649 -17.96 -18.119 -18.284 -18.66 -18.864 -19.083 -19.345 -19.635 -19.946 -20.383 -21.542 -2 ,10127 ,TETRA ,17667977,Fri Dec 3 06:13:44 CET,Fri Dec 3 07:59:56 CET,0.0 0.85 1.227 1.508 1.708 1.872 2.019 2.159 2.398 2.495 2.587 2.809 2.863 2.955 3.132 3.281 3.419 3.485 3.607 3.728 3.882 3.98 4.081 4.226 4.365 4.493 4.608 4.723 4.855 4.974 5.091 5.233 5.374 5.495 5.617 5.741 5.863 5.99 6.107 6.206 6.322 6.414 6.451 6.479 6.501 6.466 6.332 6.074 5.602 4.83 3.176 0.948 -0.888 -2.449 -3.769 -4.969 -6.007 -6.937 -7.758 -8.561 -9.236 -9.838 -10.41 -10.942 -11.424 -11.865 -12.319 -12.727 -13.077 -13.443 -13.828 -14.133 -14.461 -14.802 -15.046 -15.292 -15.558 -15.835 -16.106 -16.311 -16.539 -16.869 -17.086 -17.3 -17.412 -17.661 -17.918 -18.182 -18.322 -18.447 -18.741 -18.894 -19.072 -19.458 -19.655 -19.88 -20.136 -20.419 -20.769 -21.207 -22.5 -3 ,14890 ,TETRA ,17667978,Fri Dec 3 06:13:46 CET,Fri Dec 3 08:00:49 CET,0.0 0.97 1.308 1.556 1.764 1.94 2.092 2.232 2.501 2.623 2.735 2.964 3.019 3.109 3.284 3.442 3.58 3.647 3.771 3.889 4.047 4.139 4.23 4.361 4.475 4.601 4.728 4.823 4.946 5.073 5.179 5.304 5.433 5.553 5.676 5.804 5.908 6.024 6.152 6.258 6.345 6.423 6.488 6.538 6.534 6.462 6.328 6.066 5.571 4.654 2.98 0.853 -0.984 -2.584 -3.985 -5.201 -6.208 -7.131 -7.945 -8.728 -9.395 -9.99 -10.56 -11.092 -11.578 -12.021 -12.505 -12.929 -13.293 -13.697 -14.124 -14.455 -14.783 -15.101 -15.341 -15.617 -15.891 -16.151 -16.428 -16.623 -16.822 -17.139 -17.359 -17.591 -17.708 -17.945 -18.204 -18.47 -18.612 -18.755 -19.101 -19.266 -19.426 -19.771 -19.965 -20.175 -20.417 -20.688 -21.007 -21.393 -22.744 -4 ,10275 ,TETRA ,17667979,Fri Dec 3 06:13:48 CET,Fri Dec 3 07:59:40 CET,0.0 1.01 1.308 1.518 1.703 1.879 2.033 2.181 2.445 2.557 2.649 2.882 2.94 3.03 3.201 3.373 3.521 3.583 3.709 3.833 3.998 4.104 4.208 4.356 4.486 4.598 4.693 4.785 4.918 5.053 5.197 5.353 5.475 5.578 5.699 5.836 5.952 6.056 6.155 6.291 6.447 6.554 6.6 6.637 6.649 6.606 6.493 6.225 5.696 4.769 3.076 0.957 -0.862 -2.472 -3.856 -5.061 -6.105 -7.079 -7.904 -8.656 -9.313 -9.91 -10.475 -11.014 -11.509 -11.947 -12.395 -12.792 -13.152 -13.525 -13.886 -14.202 -14.544 -14.874 -15.117 -15.366 -15.625 -15.907 -16.203 -16.407 -16.611 -16.919 -17.138 -17.373 -17.499 -17.758 -18.017 -18.295 -18.434 -18.554 -18.873 -19.034 -19.195 -19.555 -19.758 -19.99 -20.267 -20.57 -20.873 -21.276 -22.776 -5 ,5695 ,TETRA ,17667980,Fri Dec 3 06:13:46 CET,Fri Dec 3 08:00:49 CET,0.0 1.458 1.817 2.05 2.247 2.425 2.589 2.736 2.985 3.1 3.204 3.44 3.5 3.593 3.75 3.895 4.037 4.104 4.245 4.37 4.524 4.627 4.729 4.869 4.992 5.11 5.223 5.33 5.486 5.628 5.756 5.929 6.071 6.18 6.302 6.437 6.572 6.727 6.908 7.057 7.133 7.204 7.272 7.312 7.327 7.289 7.172 6.87 6.29 5.254 3.474 1.297 -0.683 -2.273 -3.653 -4.942 -5.999 -6.925 -7.731 -8.514 -9.177 -9.788 -10.349 -10.864 -11.358 -11.82 -12.284 -12.68 -13.024 -13.376 -13.745 -14.047 -14.355 -14.68 -14.937 -15.219 -15.506 -15.785 -16.097 -16.31 -16.52 -16.844 -17.067 -17.296 -17.409 -17.642 -17.893 -18.154 -18.289 -18.41 -18.725 -18.894 -19.063 -19.433 -19.652 -19.885 -20.116 -20.374 -20.713 -21.155 -22.239 -6 ,7201 ,TETRA ,17667981,Fri Dec 3 06:13:48 CET,Fri Dec 3 08:00:43 CET,0.0 0.735 1.087 1.335 1.533 1.722 1.887 2.025 2.26 2.376 2.493 2.74 2.793 2.88 3.036 3.175 3.305 3.385 3.529 3.641 3.805 3.91 4.014 4.172 4.303 4.413 4.531 4.639 4.765 4.881 4.994 5.126 5.244 5.364 5.499 5.623 5.728 5.828 5.938 6.044 6.147 6.28 6.426 6.524 6.531 6.492 6.395 6.143 5.654 4.784 3.116 0.918 -0.963 -2.547 -3.901 -5.083 -6.101 -7.039 -7.834 -8.62 -9.3 -9.915 -10.494 -11.02 -11.506 -11.941 -12.394 -12.805 -13.162 -13.532 -13.928 -14.27 -14.616 -14.952 -15.202 -15.454 -15.71 -15.982 -16.263 -16.458 -16.653 -16.97 -17.209 -17.442 -17.557 -17.786 -18.017 -18.29 -18.433 -18.562 -18.898 -19.07 -19.248 -19.623 -19.837 -20.064 -20.313 -20.593 -20.912 -21.332 -22.689 -7 ,4002 ,TETRA ,17667982,Fri Dec 3 06:13:43 CET,Fri Dec 3 08:01:18 CET,0.0 1.121 1.443 1.694 1.914 2.088 2.239 2.376 2.622 2.727 2.824 3.055 3.109 3.196 3.356 3.515 3.667 3.734 3.854 3.974 4.139 4.238 4.338 4.485 4.624 4.752 4.875 4.995 5.146 5.285 5.423 5.571 5.692 5.807 5.932 6.069 6.195 6.314 6.416 6.505 6.599 6.671 6.731 6.793 6.831 6.823 6.7 6.395 5.84 4.923 3.21 1.052 -0.754 -2.342 -3.722 -4.912 -5.914 -6.799 -7.568 -8.345 -9.036 -9.664 -10.224 -10.729 -11.199 -11.62 -12.055 -12.443 -12.781 -13.147 -13.526 -13.822 -14.127 -14.453 -14.711 -14.979 -15.25 -15.528 -15.817 -16.018 -16.232 -16.553 -16.766 -16.989 -17.105 -17.359 -17.624 -17.889 -18.029 -18.159 -18.503 -18.672 -18.845 -19.236 -19.434 -19.635 -19.878 -20.16 -20.521 -20.984 -22.388 -8 ,15814 ,TETRA ,17667983,Fri Dec 3 06:13:44 CET,Fri Dec 3 08:00:56 CET,0.0 1.099 1.467 1.73 1.919 2.086 2.247 2.393 2.661 2.783 2.885 3.109 3.158 3.239 3.393 3.539 3.682 3.754 3.877 3.99 4.149 4.252 4.358 4.502 4.622 4.728 4.835 4.949 5.09 5.213 5.335 5.473 5.599 5.719 5.853 5.984 6.098 6.235 6.36 6.476 6.592 6.685 6.764 6.811 6.811 6.725 6.544 6.286 5.81 4.866 3.037 0.75 -1.083 -2.633 -4.016 -5.25 -6.288 -7.216 -8.01 -8.782 -9.423 -10.001 -10.572 -11.09 -11.567 -11.993 -12.431 -12.832 -13.178 -13.538 -13.907 -14.2 -14.511 -14.842 -15.083 -15.313 -15.565 -15.844 -16.13 -16.321 -16.519 -16.837 -17.059 -17.289 -17.408 -17.655 -17.922 -18.2 -18.339 -18.457 -18.76 -18.919 -19.085 -19.446 -19.648 -19.868 -20.108 -20.392 -20.757 -21.183 -22.553 -9 ,3551 ,TETRA ,17667984,Fri Dec 3 06:13:43 CET,Fri Dec 3 08:00:23 CET,0.0 0.877 1.148 1.374 1.56 1.726 1.905 2.057 2.293 2.396 2.498 2.734 2.79 2.877 3.027 3.171 3.3 3.366 3.5 3.617 3.775 3.874 3.966 4.107 4.258 4.397 4.53 4.652 4.783 4.904 5.02 5.148 5.283 5.417 5.541 5.673 5.798 5.925 6.044 6.166 6.297 6.406 6.483 6.515 6.531 6.494 6.358 6.118 5.671 4.835 3.186 1.043 -0.799 -2.377 -3.763 -5.007 -6.058 -6.976 -7.754 -8.529 -9.21 -9.816 -10.372 -10.895 -11.416 -11.899 -12.362 -12.749 -13.081 -13.45 -13.826 -14.109 -14.422 -14.765 -15.029 -15.289 -15.54 -15.808 -16.101 -16.302 -16.506 -16.834 -17.057 -17.286 -17.404 -17.636 -17.879 -18.144 -18.278 -18.398 -18.713 -18.872 -19.033 -19.373 -19.564 -19.774 -20.016 -20.305 -20.658 -21.079 -21.997 -10 ,10209 ,TETRA ,17667985,Fri Dec 3 06:13:46 CET,Fri Dec 3 08:00:23 CET,0.0 1.103 1.45 1.68 1.881 2.056 2.22 2.366 2.624 2.745 2.856 3.102 3.143 3.224 3.374 3.521 3.654 3.716 3.85 3.977 4.148 4.259 4.362 4.497 4.622 4.739 4.843 4.936 5.056 5.16 5.258 5.395 5.527 5.654 5.803 5.958 6.079 6.205 6.323 6.424 6.505 6.581 6.679 6.74 6.707 6.627 6.508 6.241 5.733 4.837 3.163 0.988 -0.866 -2.483 -3.856 -5.038 -6.087 -7.047 -7.863 -8.649 -9.306 -9.899 -10.484 -11.028 -11.511 -11.955 -12.435 -12.87 -13.236 -13.59 -13.948 -14.252 -14.571 -14.894 -15.139 -15.395 -15.656 -15.927 -16.207 -16.398 -16.608 -16.943 -17.174 -17.408 -17.524 -17.776 -18.036 -18.304 -18.45 -18.588 -18.944 -19.116 -19.285 -19.68 -19.899 -20.117 -20.361 -20.65 -20.993 -21.493 -23.143 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_235.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_235.txt deleted file mode 100644 index 818af77f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_235.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,341 ,KEBNE ,16708820,Fri Nov 26 19:59:46 CET,Fri Nov 26 21:33:06 CET,0.0 1.224 1.587 1.879 2.123 2.329 2.513 2.677 2.964 3.094 3.217 3.472 3.531 3.638 3.832 4.004 4.166 4.246 4.414 4.572 4.777 4.91 5.043 5.213 5.369 5.516 5.661 5.811 6.005 6.187 6.364 6.573 6.76 6.939 7.149 7.372 7.568 7.787 8.024 8.29 8.567 8.852 9.156 9.443 9.763 10.064 10.343 10.583 10.694 10.655 10.321 9.505 8.654 7.816 7.002 6.24 5.551 4.897 4.363 3.819 3.332 2.917 2.51 2.103 1.732 1.402 1.04 0.709 0.439 0.166 -0.133 -0.387 -0.648 -0.927 -1.141 -1.356 -1.58 -1.819 -2.065 -2.24 -2.439 -2.726 -2.916 -3.132 -3.247 -3.483 -3.73 -3.996 -4.139 -4.255 -4.591 -4.756 -4.916 -5.252 -5.456 -5.676 -5.921 -6.22 -6.545 -6.936 -8.063 -2 ,9865 ,KEBNE ,16708821,Fri Nov 26 19:59:50 CET,Fri Nov 26 21:29:13 CET,0.0 0.898 1.202 1.458 1.658 1.827 1.984 2.125 2.395 2.513 2.627 2.9 2.967 3.071 3.266 3.447 3.612 3.685 3.823 3.964 4.164 4.29 4.415 4.596 4.765 4.919 5.08 5.246 5.441 5.617 5.792 5.996 6.187 6.36 6.569 6.807 7.012 7.245 7.497 7.756 8.036 8.347 8.678 8.961 9.262 9.555 9.835 10.151 10.392 10.36 9.928 9.036 8.135 7.28 6.478 5.753 5.086 4.472 3.946 3.389 2.89 2.442 2.019 1.612 1.23 0.881 0.529 0.222 -0.067 -0.364 -0.668 -0.932 -1.206 -1.486 -1.702 -1.922 -2.159 -2.417 -2.681 -2.857 -3.028 -3.302 -3.491 -3.703 -3.821 -4.045 -4.277 -4.518 -4.652 -4.762 -5.069 -5.212 -5.364 -5.71 -5.905 -6.124 -6.378 -6.671 -7.012 -7.498 -9.318 -3 ,14665 ,KEBNE ,16708822,Fri Nov 26 20:00:48 CET,Fri Nov 26 21:33:39 CET,0.0 0.728 1.059 1.293 1.487 1.66 1.812 1.956 2.223 2.345 2.462 2.718 2.777 2.868 3.042 3.214 3.377 3.454 3.599 3.736 3.929 4.063 4.196 4.367 4.516 4.659 4.803 4.949 5.119 5.287 5.458 5.674 5.881 6.061 6.272 6.506 6.727 6.971 7.223 7.488 7.754 8.044 8.376 8.66 8.958 9.302 9.617 9.848 10.038 10.119 9.888 9.028 8.085 7.284 6.578 5.894 5.245 4.643 4.112 3.572 3.096 2.643 2.212 1.813 1.439 1.106 0.76 0.451 0.181 -0.104 -0.396 -0.64 -0.909 -1.205 -1.426 -1.65 -1.888 -2.14 -2.39 -2.559 -2.761 -3.071 -3.27 -3.482 -3.592 -3.819 -4.071 -4.33 -4.456 -4.565 -4.895 -5.06 -5.228 -5.598 -5.819 -6.039 -6.304 -6.613 -6.95 -7.434 -9.132 -4 ,29851 ,KEBNE ,16708823,Fri Nov 26 20:02:51 CET,Fri Nov 26 21:34:37 CET,0.0 0.951 1.296 1.553 1.773 1.966 2.135 2.309 2.616 2.743 2.863 3.104 3.158 3.255 3.438 3.602 3.753 3.836 3.988 4.118 4.323 4.466 4.588 4.76 4.948 5.118 5.289 5.468 5.686 5.889 6.074 6.284 6.478 6.646 6.832 7.043 7.258 7.494 7.726 7.972 8.219 8.482 8.783 9.051 9.329 9.606 9.926 10.26 10.408 10.314 9.88 8.984 8.085 7.225 6.442 5.723 5.048 4.422 3.893 3.342 2.864 2.459 2.073 1.688 1.318 0.979 0.62 0.296 0.018 -0.265 -0.557 -0.804 -1.054 -1.312 -1.521 -1.756 -2.006 -2.253 -2.506 -2.685 -2.871 -3.162 -3.369 -3.577 -3.676 -3.885 -4.119 -4.376 -4.507 -4.611 -4.916 -5.057 -5.208 -5.566 -5.77 -5.991 -6.241 -6.525 -6.876 -7.321 -8.486 -5 ,29249 ,KEBNE ,16708824,Fri Nov 26 20:02:52 CET,Fri Nov 26 21:35:07 CET,0.0 1.47 1.86 2.138 2.366 2.557 2.748 2.934 3.241 3.378 3.501 3.76 3.829 3.936 4.122 4.287 4.449 4.537 4.714 4.867 5.077 5.212 5.339 5.525 5.702 5.865 6.028 6.175 6.361 6.549 6.728 6.94 7.135 7.319 7.532 7.753 7.972 8.211 8.436 8.666 8.894 9.15 9.471 9.802 10.128 10.405 10.702 10.968 11.159 11.266 10.961 10.182 9.259 8.411 7.696 6.993 6.317 5.701 5.173 4.649 4.222 3.806 3.372 2.974 2.608 2.284 1.909 1.531 1.202 0.861 0.536 0.285 0.024 -0.243 -0.458 -0.675 -0.891 -1.102 -1.315 -1.497 -1.696 -1.987 -2.197 -2.408 -2.513 -2.733 -2.966 -3.222 -3.351 -3.455 -3.798 -3.949 -4.102 -4.444 -4.647 -4.874 -5.134 -5.451 -5.82 -6.335 -8.329 -6 ,25024 ,KEBNE ,16708825,Fri Nov 26 20:02:51 CET,Fri Nov 26 21:34:53 CET,0.0 1.349 1.708 1.977 2.208 2.405 2.575 2.722 2.985 3.119 3.242 3.502 3.563 3.663 3.86 4.04 4.214 4.293 4.436 4.588 4.809 4.943 5.066 5.235 5.408 5.571 5.725 5.874 6.058 6.228 6.393 6.595 6.777 6.946 7.143 7.367 7.596 7.835 8.072 8.333 8.604 8.884 9.201 9.492 9.791 10.125 10.457 10.722 10.927 10.983 10.599 9.727 8.802 7.85 7.004 6.235 5.55 4.934 4.388 3.839 3.352 2.921 2.513 2.103 1.708 1.35 0.962 0.624 0.363 0.064 -0.277 -0.545 -0.808 -1.076 -1.285 -1.506 -1.739 -1.981 -2.231 -2.394 -2.568 -2.852 -3.044 -3.238 -3.342 -3.558 -3.78 -4.037 -4.177 -4.28 -4.596 -4.753 -4.915 -5.271 -5.478 -5.694 -5.918 -6.18 -6.482 -6.876 -7.992 -7 ,30419 ,KEBNE ,16708826,Fri Nov 26 20:02:55 CET,Fri Nov 26 21:32:14 CET,0.0 1.612 2.02 2.302 2.531 2.732 2.908 3.071 3.33 3.436 3.551 3.834 3.904 4.009 4.211 4.397 4.565 4.645 4.81 4.966 5.194 5.334 5.467 5.652 5.801 5.944 6.097 6.249 6.428 6.594 6.76 6.979 7.185 7.352 7.529 7.732 7.938 8.164 8.397 8.671 8.969 9.259 9.538 9.791 10.082 10.377 10.632 10.87 11.042 11.032 10.73 10.015 9.193 8.368 7.574 6.795 6.096 5.45 4.892 4.327 3.816 3.379 2.969 2.541 2.14 1.801 1.447 1.127 0.848 0.555 0.238 -0.033 -0.302 -0.576 -0.798 -1.023 -1.26 -1.507 -1.752 -1.92 -2.091 -2.377 -2.585 -2.792 -2.899 -3.134 -3.385 -3.651 -3.788 -3.895 -4.244 -4.417 -4.596 -4.99 -5.194 -5.423 -5.682 -5.977 -6.335 -6.811 -8.345 -8 ,10482 ,KEBNE ,16708827,Fri Nov 26 20:04:53 CET,Fri Nov 26 21:36:36 CET,0.0 1.349 1.715 1.999 2.227 2.413 2.577 2.725 2.986 3.112 3.23 3.505 3.576 3.674 3.859 4.042 4.213 4.296 4.451 4.595 4.81 4.946 5.081 5.27 5.433 5.589 5.744 5.894 6.083 6.263 6.443 6.66 6.856 7.042 7.24 7.442 7.635 7.854 8.091 8.332 8.598 8.894 9.173 9.399 9.675 9.983 10.255 10.46 10.589 10.49 10.003 9.179 8.296 7.461 6.682 5.928 5.27 4.679 4.173 3.672 3.21 2.764 2.354 1.975 1.612 1.287 0.932 0.617 0.329 0.022 -0.274 -0.53 -0.798 -1.069 -1.284 -1.517 -1.756 -2.011 -2.288 -2.467 -2.646 -2.924 -3.129 -3.341 -3.45 -3.675 -3.903 -4.146 -4.266 -4.352 -4.639 -4.785 -4.942 -5.298 -5.52 -5.756 -5.989 -6.237 -6.541 -6.998 -8.165 -9 ,17892 ,KEBNE ,16708828,Fri Nov 26 20:04:53 CET,Fri Nov 26 21:36:54 CET,0.0 1.681 2.035 2.295 2.521 2.722 2.912 3.075 3.345 3.482 3.61 3.884 3.957 4.06 4.259 4.423 4.562 4.641 4.803 4.954 5.161 5.29 5.415 5.589 5.753 5.908 6.051 6.204 6.409 6.604 6.785 7.002 7.196 7.369 7.567 7.775 7.98 8.196 8.42 8.655 8.904 9.175 9.494 9.793 10.106 10.455 10.789 11.063 11.288 11.328 10.951 10.045 9.108 8.272 7.513 6.812 6.183 5.591 5.032 4.473 3.985 3.546 3.141 2.741 2.356 2.015 1.65 1.312 1.029 0.751 0.464 0.205 -0.089 -0.389 -0.602 -0.812 -1.04 -1.273 -1.519 -1.697 -1.876 -2.152 -2.347 -2.563 -2.675 -2.899 -3.127 -3.374 -3.51 -3.619 -3.95 -4.11 -4.284 -4.68 -4.895 -5.132 -5.401 -5.721 -6.089 -6.52 -8.523 -10 ,27376 ,KEBNE ,16708829,Fri Nov 26 20:05:55 CET,Fri Nov 26 21:37:46 CET,0.0 0.73 1.073 1.34 1.546 1.715 1.874 2.024 2.281 2.398 2.511 2.778 2.838 2.927 3.122 3.331 3.524 3.609 3.77 3.924 4.112 4.229 4.36 4.557 4.743 4.906 5.058 5.209 5.403 5.589 5.756 5.953 6.145 6.319 6.519 6.757 6.981 7.215 7.47 7.718 7.959 8.233 8.545 8.833 9.163 9.527 9.864 10.137 10.324 10.367 9.928 9.015 8.163 7.338 6.476 5.637 4.935 4.309 3.713 3.115 2.662 2.247 1.828 1.455 1.121 0.809 0.472 0.176 -0.086 -0.382 -0.697 -0.965 -1.222 -1.495 -1.735 -1.969 -2.194 -2.43 -2.694 -2.892 -3.088 -3.377 -3.583 -3.793 -3.9 -4.135 -4.396 -4.665 -4.805 -4.916 -5.239 -5.4 -5.568 -5.939 -6.137 -6.362 -6.613 -6.918 -7.275 -7.728 -8.887 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_252.txt deleted file mode 100644 index 9080a46d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19620 ,KEBNE ,16708830,Fri Nov 26 20:04:53 CET,Fri Nov 26 21:36:56 CET,0.0 0.734 0.833 0.847 0.807 0.743 0.686 0.613 0.402 0.287 0.164 -0.076 -0.259 -0.4 -0.687 -0.99 -1.3 -1.459 -1.779 -2.111 -2.625 -2.974 -3.327 -3.874 -4.439 -5.014 -5.592 -6.153 -6.917 -7.712 -8.519 -9.51 -10.488 -11.499 -12.747 -14.208 -15.678 -17.404 -19.368 -21.551 -23.938 -26.777 -30.34 -34.153 -38.888 -44.594 -51.781 -60.726 -72.473 -88.366 -111.333 -134.808 -151.757 -164.815 -175.069 -183.553 -190.503 -196.442 -201.335 -205.956 -209.74 -212.979 -215.962 -218.694 -221.135 -223.274 -225.443 -227.335 -228.927 -230.519 -232.118 -233.421 -234.749 -236.112 -237.142 -238.182 -239.241 -240.297 -241.38 -242.116 -242.853 -243.97 -244.723 -245.478 -245.864 -246.677 -247.504 -248.327 -248.741 -249.393 -250.036 -250.506 -250.992 -251.984 -252.512 -253.084 -253.699 -254.346 -255.059 -255.99 -258.278 -2 ,13571 ,KEBNE ,16708831,Fri Nov 26 20:04:54 CET,Fri Nov 26 21:37:06 CET,0.0 0.834 0.958 0.989 0.949 0.881 0.808 0.722 0.515 0.39 0.257 0.03 -0.138 -0.275 -0.565 -0.871 -1.191 -1.356 -1.68 -2.007 -2.516 -2.853 -3.2 -3.752 -4.321 -4.883 -5.45 -6.034 -6.814 -7.598 -8.39 -9.388 -10.403 -11.425 -12.659 -14.121 -15.613 -17.329 -19.27 -21.444 -23.836 -26.699 -30.274 -34.095 -38.837 -44.546 -51.759 -60.724 -72.417 -88.214 -111.09 -134.568 -151.59 -164.653 -174.896 -183.426 -190.425 -196.369 -201.22 -205.85 -209.661 -212.921 -215.96 -218.719 -221.196 -223.379 -225.562 -227.466 -229.069 -230.718 -232.402 -233.73 -235.056 -236.4 -237.428 -238.467 -239.51 -240.572 -241.653 -242.378 -243.1 -244.178 -244.928 -245.703 -246.094 -246.898 -247.714 -248.554 -248.984 -249.642 -250.303 -250.76 -251.236 -252.215 -252.731 -253.296 -253.883 -254.502 -255.196 -256.065 -258.379 -3 ,32178 ,KEBNE ,16708832,Fri Nov 26 20:05:56 CET,Fri Nov 26 21:38:28 CET,0.0 0.788 0.835 0.814 0.772 0.698 0.613 0.529 0.304 0.18 0.055 -0.172 -0.347 -0.491 -0.796 -1.108 -1.423 -1.576 -1.898 -2.24 -2.753 -3.103 -3.464 -4.014 -4.567 -5.135 -5.71 -6.29 -7.057 -7.83 -8.616 -9.599 -10.613 -11.639 -12.852 -14.295 -15.788 -17.501 -19.437 -21.599 -23.987 -26.839 -30.389 -34.199 -38.975 -44.718 -51.854 -60.758 -72.475 -88.286 -111.165 -134.572 -151.563 -164.63 -174.918 -183.415 -190.353 -196.28 -201.152 -205.782 -209.597 -212.902 -215.933 -218.7 -221.186 -223.343 -225.519 -227.411 -229.0 -230.617 -232.243 -233.544 -234.853 -236.186 -237.219 -238.256 -239.294 -240.354 -241.452 -242.187 -242.924 -244.053 -244.823 -245.615 -246.009 -246.804 -247.63 -248.497 -248.936 -249.604 -250.262 -250.719 -251.199 -252.164 -252.673 -253.236 -253.841 -254.481 -255.23 -256.143 -258.401 -4 ,25111 ,KEBNE ,16708833,Fri Nov 26 20:05:56 CET,Fri Nov 26 21:38:50 CET,0.0 0.85 0.898 0.873 0.842 0.786 0.718 0.638 0.426 0.306 0.178 -0.07 -0.259 -0.41 -0.726 -1.043 -1.37 -1.538 -1.87 -2.2 -2.707 -3.062 -3.425 -3.969 -4.521 -5.077 -5.635 -6.21 -6.986 -7.772 -8.575 -9.578 -10.587 -11.606 -12.839 -14.316 -15.783 -17.464 -19.364 -21.488 -23.896 -26.787 -30.36 -34.173 -38.944 -44.709 -51.919 -60.855 -72.607 -88.46 -111.345 -134.765 -151.727 -164.82 -175.152 -183.722 -190.774 -196.818 -201.738 -206.356 -210.142 -213.407 -216.4 -219.107 -221.568 -223.751 -225.945 -227.855 -229.48 -231.105 -232.707 -234.011 -235.322 -236.631 -237.636 -238.667 -239.728 -240.799 -241.875 -242.595 -243.314 -244.444 -245.225 -246.011 -246.4 -247.182 -247.98 -248.804 -249.23 -249.887 -250.581 -251.068 -251.566 -252.603 -253.123 -253.652 -254.224 -254.861 -255.634 -256.481 -258.475 -5 ,194 ,KEBNE ,16708834,Fri Nov 26 20:05:56 CET,Fri Nov 26 21:37:34 CET,0.0 0.5 0.572 0.568 0.537 0.475 0.393 0.305 0.064 -0.07 -0.2 -0.42 -0.599 -0.736 -1.019 -1.328 -1.659 -1.824 -2.149 -2.476 -2.994 -3.353 -3.709 -4.24 -4.79 -5.365 -5.949 -6.531 -7.293 -8.059 -8.846 -9.84 -10.834 -11.851 -13.082 -14.523 -15.981 -17.669 -19.576 -21.667 -24.021 -26.889 -30.463 -34.29 -39.019 -44.718 -51.915 -60.89 -72.6 -88.337 -111.168 -134.717 -151.786 -164.938 -175.293 -183.829 -190.822 -196.738 -201.588 -206.23 -210.036 -213.287 -216.264 -218.972 -221.406 -223.576 -225.786 -227.677 -229.263 -230.89 -232.541 -233.862 -235.188 -236.516 -237.528 -238.566 -239.624 -240.7 -241.78 -242.493 -243.215 -244.341 -245.099 -245.848 -246.235 -247.027 -247.829 -248.664 -249.088 -249.751 -250.419 -250.871 -251.345 -252.344 -252.864 -253.412 -253.996 -254.635 -255.416 -256.399 -258.621 -6 ,2499 ,KEBNE ,16708835,Fri Nov 26 20:06:56 CET,Fri Nov 26 21:38:56 CET,0.0 0.667 0.75 0.759 0.726 0.668 0.584 0.477 0.247 0.13 -0.003 -0.251 -0.435 -0.573 -0.871 -1.177 -1.482 -1.64 -1.962 -2.296 -2.802 -3.142 -3.49 -4.03 -4.578 -5.133 -5.703 -6.291 -7.086 -7.865 -8.64 -9.645 -10.67 -11.687 -12.9 -14.315 -15.774 -17.484 -19.427 -21.611 -24.025 -26.882 -30.444 -34.287 -39.036 -44.757 -51.924 -60.811 -72.474 -88.253 -111.19 -134.702 -151.686 -164.712 -175.023 -183.602 -190.574 -196.537 -201.421 -206.037 -209.812 -213.02 -215.969 -218.65 -221.061 -223.205 -225.414 -227.32 -228.895 -230.511 -232.154 -233.469 -234.794 -236.142 -237.163 -238.198 -239.255 -240.326 -241.41 -242.148 -242.876 -243.976 -244.736 -245.499 -245.89 -246.689 -247.502 -248.369 -248.808 -249.474 -250.157 -250.626 -251.104 -252.082 -252.604 -253.146 -253.723 -254.358 -255.069 -255.948 -258.25 -7 ,31115 ,KEBNE ,16708836,Fri Nov 26 20:06:57 CET,Fri Nov 26 21:39:18 CET,0.0 0.448 0.538 0.525 0.474 0.408 0.322 0.226 0.013 -0.099 -0.216 -0.421 -0.599 -0.747 -1.03 -1.306 -1.599 -1.75 -2.058 -2.4 -2.942 -3.297 -3.654 -4.199 -4.747 -5.286 -5.843 -6.423 -7.183 -7.936 -8.709 -9.718 -10.742 -11.774 -13.035 -14.52 -16.006 -17.7 -19.626 -21.8 -24.224 -27.124 -30.719 -34.553 -39.337 -45.096 -52.313 -61.279 -72.991 -88.778 -111.588 -135.027 -151.999 -165.045 -175.388 -184.033 -191.125 -197.098 -201.964 -206.604 -210.448 -213.738 -216.745 -219.511 -221.986 -224.16 -226.388 -228.328 -229.957 -231.601 -233.248 -234.583 -235.945 -237.318 -238.363 -239.41 -240.465 -241.536 -242.62 -243.358 -244.109 -245.244 -245.996 -246.775 -247.174 -247.966 -248.774 -249.598 -250.021 -250.685 -251.372 -251.841 -252.317 -253.318 -253.849 -254.415 -255.013 -255.653 -256.397 -257.33 -259.798 -8 ,22222 ,KEBNE ,16708837,Fri Nov 26 20:06:57 CET,Fri Nov 26 21:38:53 CET,0.0 0.995 1.101 1.12 1.114 1.072 1.005 0.913 0.696 0.577 0.447 0.222 0.046 -0.087 -0.37 -0.67 -0.971 -1.126 -1.45 -1.784 -2.292 -2.64 -3.0 -3.539 -4.076 -4.633 -5.199 -5.76 -6.518 -7.301 -8.098 -9.105 -10.114 -11.119 -12.345 -13.801 -15.26 -16.952 -18.883 -21.037 -23.437 -26.308 -29.893 -33.72 -38.461 -44.204 -51.434 -60.394 -72.129 -87.942 -110.789 -134.252 -151.29 -164.372 -174.648 -183.168 -190.121 -196.106 -201.007 -205.654 -209.539 -212.846 -215.838 -218.553 -221.002 -223.166 -225.375 -227.294 -228.894 -230.497 -232.113 -233.444 -234.823 -236.227 -237.263 -238.31 -239.382 -240.471 -241.571 -242.29 -243.011 -244.135 -244.903 -245.691 -246.089 -246.887 -247.709 -248.548 -248.976 -249.654 -250.337 -250.794 -251.264 -252.263 -252.786 -253.326 -253.915 -254.544 -255.234 -256.094 -258.543 -9 ,2079 ,KEBNE ,16708838,Fri Nov 26 20:06:57 CET,Fri Nov 26 21:38:59 CET,0.0 0.591 0.65 0.657 0.633 0.562 0.474 0.375 0.132 0.01 -0.116 -0.339 -0.512 -0.649 -0.951 -1.263 -1.57 -1.73 -2.054 -2.388 -2.922 -3.288 -3.647 -4.188 -4.736 -5.286 -5.852 -6.438 -7.205 -7.971 -8.755 -9.746 -10.765 -11.793 -13.018 -14.48 -15.968 -17.683 -19.61 -21.729 -24.102 -26.95 -30.48 -34.323 -39.166 -44.927 -52.1 -61.053 -72.766 -88.597 -111.56 -135.066 -151.997 -165.002 -175.26 -183.733 -190.725 -196.727 -201.691 -206.397 -210.264 -213.607 -216.693 -219.454 -221.912 -224.109 -226.306 -228.216 -229.831 -231.465 -233.135 -234.469 -235.805 -237.165 -238.2 -239.255 -240.313 -241.369 -242.44 -243.166 -243.896 -245.006 -245.744 -246.484 -246.869 -247.662 -248.461 -249.268 -249.684 -250.338 -250.991 -251.459 -251.943 -252.943 -253.476 -254.018 -254.611 -255.262 -255.985 -256.843 -259.524 -10 ,14278 ,KEBNE ,16708839,Fri Nov 26 20:06:57 CET,Fri Nov 26 21:38:54 CET,0.0 0.911 0.996 0.99 0.964 0.91 0.826 0.732 0.525 0.408 0.275 0.034 -0.155 -0.306 -0.619 -0.943 -1.268 -1.431 -1.765 -2.119 -2.671 -3.037 -3.398 -3.944 -4.506 -5.069 -5.615 -6.172 -6.945 -7.733 -8.541 -9.563 -10.578 -11.579 -12.789 -14.232 -15.705 -17.399 -19.325 -21.513 -23.917 -26.74 -30.248 -34.029 -38.756 -44.482 -51.714 -60.672 -72.345 -88.15 -111.101 -134.642 -151.589 -164.564 -174.844 -183.325 -190.236 -196.187 -201.092 -205.748 -209.548 -212.803 -215.801 -218.509 -220.946 -223.164 -225.434 -227.362 -228.972 -230.606 -232.25 -233.566 -234.909 -236.257 -237.26 -238.264 -239.286 -240.34 -241.417 -242.149 -242.876 -243.949 -244.695 -245.474 -245.868 -246.666 -247.47 -248.284 -248.709 -249.384 -250.057 -250.52 -251.007 -252.034 -252.577 -253.123 -253.7 -254.346 -255.112 -256.095 -258.315 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_57.txt deleted file mode 100644 index 906280d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_290_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5979 ,KEBNE ,16708840,Fri Nov 26 20:06:57 CET,Fri Nov 26 21:38:57 CET,0.0 1.0 1.316 1.529 1.687 1.814 1.928 2.045 2.259 2.349 2.428 2.628 2.66 2.725 2.854 2.974 3.071 3.118 3.218 3.304 3.423 3.507 3.596 3.711 3.795 3.868 3.94 4.023 4.131 4.212 4.279 4.354 4.418 4.482 4.553 4.617 4.659 4.707 4.752 4.759 4.744 4.716 4.673 4.622 4.483 4.227 3.878 3.339 2.437 1.039 -1.298 -4.117 -6.418 -8.357 -10.009 -11.437 -12.608 -13.617 -14.503 -15.373 -16.096 -16.757 -17.38 -17.953 -18.482 -18.954 -19.447 -19.891 -20.265 -20.662 -21.072 -21.395 -21.73 -22.076 -22.338 -22.613 -22.899 -23.194 -23.511 -23.735 -23.964 -24.31 -24.541 -24.773 -24.895 -25.15 -25.429 -25.74 -25.903 -26.055 -26.392 -26.557 -26.724 -27.108 -27.326 -27.556 -27.779 -28.026 -28.367 -28.807 -30.116 -2 ,6415 ,KEBNE ,16708841,Fri Nov 26 20:07:58 CET,Fri Nov 26 21:41:32 CET,0.0 0.798 1.062 1.264 1.424 1.564 1.682 1.799 2.02 2.123 2.217 2.421 2.462 2.537 2.673 2.793 2.895 2.951 3.057 3.148 3.278 3.348 3.417 3.524 3.62 3.708 3.784 3.858 3.965 4.059 4.134 4.21 4.271 4.33 4.407 4.46 4.482 4.524 4.571 4.589 4.577 4.535 4.461 4.357 4.187 3.921 3.523 2.939 2.064 0.682 -1.706 -4.563 -6.818 -8.665 -10.235 -11.618 -12.807 -13.879 -14.804 -15.721 -16.498 -17.173 -17.805 -18.395 -18.925 -19.402 -19.904 -20.327 -20.69 -21.077 -21.477 -21.809 -22.157 -22.514 -22.789 -23.081 -23.386 -23.715 -24.052 -24.261 -24.463 -24.811 -25.053 -25.291 -25.416 -25.661 -25.933 -26.225 -26.37 -26.519 -26.878 -27.042 -27.211 -27.597 -27.805 -28.037 -28.299 -28.593 -28.943 -29.391 -30.614 -3 ,23676 ,KEBNE ,16708842,Fri Nov 26 20:07:58 CET,Fri Nov 26 21:41:23 CET,0.0 0.792 1.08 1.278 1.431 1.573 1.704 1.826 2.014 2.1 2.189 2.383 2.422 2.496 2.618 2.728 2.83 2.876 2.964 3.053 3.186 3.27 3.346 3.445 3.538 3.622 3.7 3.776 3.866 3.952 4.024 4.097 4.169 4.24 4.298 4.334 4.364 4.384 4.387 4.405 4.432 4.418 4.365 4.277 4.106 3.84 3.446 2.85 1.942 0.499 -1.975 -4.84 -7.114 -8.982 -10.539 -11.931 -13.139 -14.193 -15.097 -15.977 -16.715 -17.371 -18.008 -18.607 -19.13 -19.598 -20.089 -20.517 -20.904 -21.345 -21.779 -22.124 -22.482 -22.836 -23.111 -23.389 -23.672 -23.956 -24.244 -24.45 -24.669 -25.006 -25.244 -25.5 -25.632 -25.892 -26.144 -26.406 -26.537 -26.659 -26.967 -27.126 -27.299 -27.693 -27.891 -28.111 -28.372 -28.657 -28.982 -29.407 -30.507 -4 ,3489 ,KEBNE ,16708843,Fri Nov 26 20:09:00 CET,Fri Nov 26 21:42:23 CET,0.0 0.856 1.149 1.378 1.551 1.698 1.824 1.936 2.157 2.257 2.344 2.541 2.571 2.638 2.767 2.889 3.006 3.063 3.165 3.266 3.403 3.477 3.546 3.655 3.762 3.861 3.95 4.018 4.098 4.183 4.262 4.346 4.417 4.473 4.531 4.596 4.667 4.739 4.78 4.781 4.762 4.71 4.627 4.526 4.348 4.085 3.678 3.111 2.219 0.802 -1.581 -4.494 -6.836 -8.787 -10.448 -11.879 -13.08 -14.141 -15.079 -16.014 -16.793 -17.479 -18.124 -18.721 -19.298 -19.826 -20.335 -20.763 -21.146 -21.547 -21.945 -22.271 -22.602 -22.951 -23.228 -23.509 -23.803 -24.1 -24.397 -24.606 -24.826 -25.175 -25.407 -25.648 -25.779 -26.047 -26.322 -26.588 -26.724 -26.862 -27.193 -27.352 -27.516 -27.901 -28.118 -28.341 -28.574 -28.854 -29.197 -29.637 -31.144 -5 ,10275 ,KEBNE ,16708844,Fri Nov 26 20:09:00 CET,Fri Nov 26 21:42:13 CET,0.0 0.922 1.218 1.429 1.614 1.76 1.88 2.004 2.235 2.329 2.415 2.615 2.64 2.7 2.82 2.928 3.031 3.083 3.187 3.287 3.411 3.483 3.556 3.664 3.761 3.843 3.911 3.979 4.064 4.139 4.207 4.27 4.319 4.376 4.44 4.514 4.581 4.633 4.669 4.682 4.685 4.696 4.692 4.617 4.445 4.211 3.816 3.188 2.184 0.552 -1.905 -4.744 -7.082 -8.996 -10.635 -12.056 -13.267 -14.371 -15.286 -16.175 -16.942 -17.606 -18.222 -18.81 -19.353 -19.84 -20.348 -20.817 -21.231 -21.661 -22.086 -22.411 -22.747 -23.109 -23.385 -23.662 -23.945 -24.236 -24.548 -24.761 -24.972 -25.3 -25.527 -25.763 -25.885 -26.146 -26.429 -26.722 -26.873 -27.017 -27.361 -27.525 -27.695 -28.091 -28.299 -28.52 -28.776 -29.051 -29.343 -29.757 -30.863 -6 ,4747 ,KEBNE ,16708845,Fri Nov 26 20:09:00 CET,Fri Nov 26 21:42:15 CET,0.0 0.792 1.05 1.226 1.394 1.564 1.701 1.807 2.015 2.11 2.197 2.408 2.443 2.509 2.633 2.755 2.867 2.917 3.008 3.101 3.238 3.32 3.396 3.493 3.586 3.68 3.763 3.841 3.947 4.028 4.087 4.177 4.268 4.344 4.41 4.461 4.498 4.53 4.561 4.578 4.579 4.559 4.485 4.384 4.21 3.938 3.521 2.948 2.108 0.746 -1.704 -4.72 -7.025 -8.874 -10.469 -11.879 -13.108 -14.201 -15.092 -15.98 -16.797 -17.496 -18.101 -18.665 -19.188 -19.657 -20.138 -20.591 -20.999 -21.403 -21.803 -22.135 -22.468 -22.818 -23.101 -23.389 -23.673 -23.949 -24.237 -24.448 -24.688 -25.054 -25.301 -25.567 -25.695 -25.949 -26.22 -26.497 -26.64 -26.786 -27.123 -27.297 -27.473 -27.826 -28.028 -28.243 -28.485 -28.76 -29.074 -29.482 -30.986 -7 ,8785 ,KEBNE ,16708846,Fri Nov 26 20:09:00 CET,Fri Nov 26 21:40:59 CET,0.0 0.793 1.104 1.365 1.568 1.73 1.869 1.989 2.186 2.281 2.369 2.571 2.605 2.675 2.79 2.893 2.996 3.046 3.149 3.253 3.397 3.479 3.552 3.646 3.722 3.791 3.873 3.955 4.039 4.114 4.196 4.285 4.363 4.435 4.504 4.566 4.613 4.645 4.655 4.667 4.666 4.639 4.574 4.474 4.301 4.039 3.677 3.141 2.278 0.833 -1.628 -4.576 -6.919 -8.848 -10.509 -11.982 -13.234 -14.324 -15.232 -16.123 -16.887 -17.539 -18.146 -18.713 -19.236 -19.719 -20.228 -20.674 -21.043 -21.43 -21.844 -22.177 -22.52 -22.895 -23.177 -23.46 -23.752 -24.058 -24.381 -24.599 -24.823 -25.165 -25.397 -25.645 -25.776 -26.044 -26.317 -26.603 -26.755 -26.903 -27.28 -27.474 -27.667 -28.065 -28.277 -28.49 -28.733 -29.026 -29.356 -29.786 -30.88 -8 ,6431 ,KEBNE ,16708847,Fri Nov 26 20:09:00 CET,Fri Nov 26 21:40:57 CET,0.0 1.047 1.401 1.648 1.829 1.986 2.137 2.263 2.469 2.567 2.657 2.868 2.903 2.97 3.098 3.22 3.325 3.377 3.473 3.558 3.682 3.759 3.829 3.927 4.033 4.123 4.201 4.273 4.359 4.449 4.531 4.608 4.673 4.735 4.803 4.895 4.971 5.01 5.026 5.025 4.996 4.952 4.896 4.798 4.647 4.418 4.056 3.456 2.522 1.102 -1.378 -4.326 -6.72 -8.734 -10.368 -11.769 -12.949 -13.996 -14.876 -15.746 -16.522 -17.182 -17.789 -18.356 -18.88 -19.372 -19.878 -20.308 -20.682 -21.064 -21.454 -21.779 -22.104 -22.453 -22.726 -23.0 -23.295 -23.615 -23.946 -24.162 -24.386 -24.73 -24.958 -25.193 -25.315 -25.571 -25.829 -26.102 -26.245 -26.378 -26.693 -26.852 -27.023 -27.412 -27.63 -27.851 -28.101 -28.393 -28.692 -29.054 -30.108 -9 ,30904 ,KEBNE ,16708848,Fri Nov 26 20:09:00 CET,Fri Nov 26 21:42:07 CET,0.0 0.874 1.108 1.294 1.447 1.589 1.709 1.812 1.995 2.083 2.168 2.374 2.409 2.479 2.608 2.733 2.857 2.911 3.0 3.086 3.212 3.297 3.383 3.486 3.575 3.665 3.749 3.826 3.92 4.016 4.104 4.192 4.264 4.32 4.389 4.466 4.514 4.545 4.566 4.591 4.615 4.587 4.502 4.397 4.243 4.009 3.645 3.067 2.161 0.78 -1.588 -4.436 -6.737 -8.7 -10.339 -11.777 -13.02 -14.098 -14.992 -15.83 -16.552 -17.205 -17.823 -18.398 -18.923 -19.407 -19.905 -20.346 -20.72 -21.095 -21.488 -21.819 -22.161 -22.513 -22.783 -23.056 -23.341 -23.632 -23.936 -24.152 -24.383 -24.752 -24.995 -25.237 -25.365 -25.629 -25.889 -26.166 -26.308 -26.441 -26.765 -26.943 -27.125 -27.483 -27.697 -27.93 -28.188 -28.473 -28.825 -29.314 -30.508 -10 ,10302 ,KEBNE ,16708849,Fri Nov 26 20:09:00 CET,Fri Nov 26 21:42:21 CET,0.0 0.847 1.132 1.346 1.526 1.684 1.843 1.979 2.201 2.303 2.397 2.595 2.626 2.698 2.833 2.958 3.067 3.12 3.214 3.3 3.434 3.522 3.608 3.713 3.8 3.878 3.949 4.02 4.096 4.167 4.248 4.34 4.411 4.479 4.549 4.602 4.66 4.736 4.786 4.806 4.803 4.777 4.73 4.64 4.482 4.243 3.888 3.346 2.449 0.99 -1.419 -4.184 -6.44 -8.388 -10.044 -11.487 -12.741 -13.826 -14.746 -15.654 -16.412 -17.07 -17.691 -18.281 -18.819 -19.288 -19.768 -20.216 -20.593 -20.959 -21.341 -21.664 -21.999 -22.342 -22.606 -22.878 -23.153 -23.437 -23.74 -23.946 -24.154 -24.489 -24.721 -24.961 -25.084 -25.329 -25.599 -25.895 -26.047 -26.194 -26.541 -26.718 -26.899 -27.293 -27.508 -27.734 -27.996 -28.285 -28.616 -29.1 -30.326 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_30_42.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_30_42.txt deleted file mode 100644 index 13a4c6e2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_30_42.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18591 ,KEBNE ,16708850,Fri Nov 26 20:09:00 CET,Fri Nov 26 21:38:59 CET,0.0 1.275 1.754 2.158 2.499 2.789 3.041 3.268 3.689 3.885 4.064 4.331 4.541 4.689 4.961 5.222 5.47 5.597 5.854 6.098 6.449 6.664 6.875 7.196 7.498 7.797 8.091 8.377 8.749 9.115 9.467 9.878 10.267 10.644 11.074 11.544 12.018 12.547 13.115 13.744 14.422 15.173 16.031 16.891 17.96 19.193 20.626 22.22 24.029 26.138 28.774 30.947 32.169 32.971 33.525 33.869 34.053 34.136 34.119 34.075 34.024 33.96 33.887 33.811 33.738 33.663 33.566 33.48 33.395 33.294 33.186 33.083 32.973 32.859 32.769 32.671 32.565 32.461 32.354 32.274 32.192 32.062 31.957 31.839 31.781 31.664 31.531 31.38 31.29 31.158 31.005 30.909 30.805 30.563 30.416 30.243 30.066 29.877 29.619 29.199 27.17 -2 ,2345 ,KEBNE ,16708851,Fri Nov 26 20:09:00 CET,Fri Nov 26 21:40:13 CET,0.0 2.049 2.538 2.902 3.212 3.499 3.755 3.982 4.385 4.561 4.724 4.998 5.215 5.374 5.683 5.967 6.238 6.376 6.644 6.894 7.248 7.476 7.696 8.017 8.338 8.635 8.915 9.203 9.566 9.904 10.24 10.646 11.035 11.423 11.881 12.38 12.853 13.389 13.991 14.622 15.284 16.044 16.943 17.85 18.889 20.015 21.302 22.837 24.71 26.96 29.588 31.628 32.734 33.413 33.843 34.123 34.295 34.362 34.365 34.343 34.314 34.289 34.254 34.193 34.118 34.032 33.94 33.855 33.765 33.672 33.59 33.519 33.424 33.322 33.241 33.146 33.045 32.927 32.809 32.722 32.626 32.487 32.386 32.268 32.202 32.079 31.941 31.789 31.721 31.617 31.475 31.376 31.277 31.047 30.924 30.788 30.609 30.381 30.122 29.752 28.455 -3 ,17460 ,KEBNE ,16708852,Fri Nov 26 20:09:00 CET,Fri Nov 26 21:38:40 CET,0.0 2.053 2.559 2.971 3.295 3.569 3.811 4.022 4.441 4.647 4.835 5.127 5.351 5.51 5.796 6.068 6.337 6.466 6.714 6.956 7.3 7.523 7.74 8.06 8.363 8.65 8.935 9.231 9.615 9.969 10.305 10.705 11.092 11.48 11.943 12.462 12.943 13.459 14.035 14.657 15.313 16.078 16.981 17.884 18.95 20.15 21.532 23.094 24.927 27.035 29.634 31.747 32.991 33.803 34.251 34.491 34.608 34.666 34.685 34.671 34.661 34.638 34.578 34.493 34.391 34.285 34.169 34.075 34.004 33.92 33.795 33.692 33.602 33.496 33.409 33.311 33.204 33.1 32.988 32.911 32.827 32.682 32.568 32.448 32.39 32.265 32.134 31.991 31.914 31.792 31.622 31.519 31.405 31.106 30.939 30.787 30.619 30.405 30.16 29.869 28.359 -4 ,4787 ,KEBNE ,16708853,Fri Nov 26 20:09:00 CET,Fri Nov 26 21:38:50 CET,0.0 1.936 2.431 2.819 3.117 3.39 3.644 3.876 4.306 4.508 4.695 4.977 5.184 5.328 5.617 5.889 6.151 6.282 6.525 6.754 7.112 7.341 7.552 7.853 8.148 8.439 8.729 9.007 9.357 9.697 10.023 10.409 10.79 11.18 11.643 12.172 12.67 13.201 13.784 14.414 15.081 15.841 16.744 17.623 18.62 19.773 21.114 22.652 24.474 26.549 29.093 31.19 32.352 33.075 33.475 33.731 33.893 33.978 34.012 34.008 33.964 33.904 33.83 33.756 33.688 33.611 33.522 33.427 33.335 33.246 33.149 33.052 32.941 32.818 32.728 32.635 32.527 32.413 32.294 32.209 32.121 31.979 31.877 31.772 31.717 31.6 31.474 31.333 31.258 31.15 31.02 30.921 30.806 30.54 30.406 30.264 30.082 29.875 29.641 29.288 27.769 -5 ,13278 ,KEBNE ,16708854,Fri Nov 26 20:10:01 CET,Fri Nov 26 21:39:57 CET,0.0 1.985 2.477 2.835 3.159 3.444 3.695 3.935 4.37 4.566 4.752 5.03 5.244 5.399 5.702 5.986 6.26 6.388 6.635 6.878 7.224 7.436 7.642 7.955 8.252 8.548 8.84 9.115 9.481 9.83 10.169 10.595 11.007 11.397 11.853 12.379 12.875 13.422 14.008 14.645 15.314 16.036 16.898 17.779 18.83 20.072 21.5 23.084 24.899 26.991 29.611 31.724 32.891 33.607 34.054 34.346 34.482 34.523 34.543 34.541 34.513 34.475 34.411 34.326 34.24 34.161 34.059 33.959 33.878 33.79 33.681 33.578 33.476 33.373 33.285 33.197 33.101 32.988 32.865 32.783 32.697 32.549 32.436 32.319 32.259 32.131 31.993 31.838 31.756 31.635 31.486 31.383 31.266 30.992 30.841 30.687 30.51 30.305 30.059 29.688 28.45 -6 ,25576 ,KEBNE ,16708855,Fri Nov 26 20:10:01 CET,Fri Nov 26 21:40:04 CET,0.0 1.391 1.89 2.251 2.549 2.802 3.047 3.271 3.661 3.856 4.039 4.301 4.515 4.674 4.969 5.255 5.522 5.649 5.901 6.141 6.494 6.729 6.959 7.282 7.577 7.869 8.154 8.431 8.8 9.154 9.486 9.893 10.288 10.669 11.12 11.643 12.152 12.691 13.264 13.88 14.52 15.25 16.11 16.992 18.086 19.323 20.771 22.379 24.155 26.273 28.973 31.106 32.211 32.895 33.302 33.514 33.65 33.745 33.758 33.743 33.729 33.693 33.62 33.508 33.407 33.325 33.23 33.142 33.06 32.966 32.858 32.771 32.672 32.551 32.454 32.364 32.278 32.169 32.036 31.949 31.861 31.719 31.609 31.494 31.439 31.317 31.185 31.047 30.97 30.851 30.705 30.606 30.503 30.257 30.117 29.967 29.789 29.592 29.358 28.974 27.066 -7 ,16796 ,KEBNE ,16708856,Fri Nov 26 20:10:01 CET,Fri Nov 26 21:39:59 CET,0.0 1.491 1.946 2.315 2.64 2.914 3.16 3.376 3.757 3.942 4.121 4.41 4.637 4.798 5.097 5.371 5.637 5.764 5.997 6.231 6.591 6.826 7.045 7.355 7.656 7.956 8.255 8.533 8.88 9.221 9.558 9.959 10.352 10.744 11.197 11.707 12.194 12.709 13.26 13.874 14.532 15.266 16.147 17.039 18.11 19.35 20.762 22.355 24.281 26.456 28.939 30.982 32.141 32.876 33.313 33.531 33.642 33.718 33.761 33.769 33.736 33.685 33.615 33.514 33.414 33.337 33.253 33.167 33.087 32.992 32.883 32.787 32.692 32.581 32.487 32.396 32.3 32.192 32.078 32.0 31.913 31.786 31.681 31.557 31.499 31.378 31.239 31.082 31.004 30.887 30.74 30.642 30.544 30.324 30.191 30.041 29.871 29.657 29.398 29.05 27.797 -8 ,4456 ,KEBNE ,16708857,Fri Nov 26 20:12:04 CET,Fri Nov 26 21:43:16 CET,0.0 1.659 2.199 2.612 2.947 3.229 3.485 3.7 4.044 4.211 4.388 4.686 4.907 5.059 5.355 5.635 5.907 6.037 6.281 6.51 6.832 7.058 7.284 7.597 7.919 8.226 8.507 8.774 9.12 9.452 9.789 10.207 10.615 11.015 11.464 11.973 12.47 13.029 13.641 14.273 14.921 15.655 16.533 17.423 18.474 19.682 21.067 22.619 24.459 26.584 29.114 31.157 32.28 32.931 33.354 33.659 33.824 33.88 33.901 33.886 33.844 33.788 33.701 33.624 33.547 33.464 33.384 33.292 33.185 33.074 32.958 32.847 32.733 32.616 32.529 32.44 32.329 32.212 32.093 32.002 31.909 31.757 31.645 31.53 31.47 31.348 31.227 31.101 31.026 30.904 30.763 30.671 30.573 30.345 30.204 30.041 29.862 29.626 29.316 28.941 27.385 -9 ,26083 ,KEBNE ,16708858,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:12 CET,0.0 1.502 2.009 2.401 2.731 3.021 3.281 3.517 3.927 4.118 4.301 4.575 4.8 4.958 5.25 5.537 5.825 5.957 6.205 6.458 6.819 7.038 7.257 7.586 7.898 8.198 8.486 8.765 9.121 9.45 9.766 10.16 10.547 10.922 11.371 11.898 12.395 12.929 13.498 14.102 14.759 15.537 16.463 17.395 18.484 19.692 21.069 22.632 24.557 26.913 29.893 32.408 33.731 34.397 34.812 35.096 35.23 35.297 35.318 35.291 35.251 35.224 35.177 35.113 35.028 34.925 34.835 34.748 34.661 34.579 34.481 34.379 34.272 34.159 34.062 33.961 33.871 33.781 33.67 33.587 33.505 33.361 33.251 33.141 33.083 32.961 32.83 32.69 32.612 32.494 32.351 32.253 32.137 31.88 31.748 31.609 31.431 31.222 30.977 30.671 29.308 -10 ,29653 ,KEBNE ,16708859,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:40:55 CET,0.0 1.432 1.977 2.391 2.714 3.02 3.286 3.513 3.939 4.136 4.32 4.606 4.827 4.986 5.287 5.574 5.847 5.977 6.232 6.473 6.804 7.028 7.247 7.555 7.852 8.144 8.428 8.705 9.057 9.405 9.752 10.178 10.598 10.988 11.414 11.893 12.384 12.93 13.522 14.175 14.863 15.645 16.563 17.472 18.537 19.771 21.202 22.783 24.712 26.998 29.639 31.726 32.882 33.558 33.951 34.212 34.374 34.433 34.449 34.449 34.422 34.393 34.348 34.283 34.22 34.152 34.058 33.965 33.877 33.788 33.697 33.617 33.525 33.416 33.325 33.215 33.103 32.99 32.872 32.786 32.7 32.557 32.451 32.352 32.296 32.165 32.03 31.886 31.804 31.679 31.51 31.405 31.298 31.067 30.931 30.765 30.589 30.415 30.217 29.931 28.814 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_338_252.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_338_252.txt deleted file mode 100644 index 4550c345..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_338_252.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,611 ,KEBNE ,16708860,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:36 CET,0.0 1.034 1.36 1.608 1.835 2.022 2.201 2.384 2.693 2.828 2.962 2.985 3.31 3.423 3.654 3.861 4.048 4.13 4.314 4.497 4.754 4.913 5.053 5.263 5.447 5.63 5.817 5.991 6.215 6.415 6.579 6.813 7.063 7.283 7.517 7.772 8.001 8.212 8.43 8.648 8.866 9.115 9.448 9.761 10.054 10.334 10.567 10.768 10.927 10.944 10.49 9.462 8.447 7.521 6.727 6.011 5.336 4.701 4.181 3.64 3.159 2.73 2.313 1.915 1.5 1.115 0.754 0.432 0.146 -0.145 -0.458 -0.716 -0.977 -1.269 -1.492 -1.702 -1.914 -2.139 -2.39 -2.572 -2.773 -3.073 -3.27 -3.472 -3.578 -3.8 -4.03 -4.274 -4.408 -4.789 -4.863 -5.023 -5.196 -5.561 -5.757 -5.977 -6.245 -6.54 -6.874 -7.328 -8.699 -2 ,24751 ,KEBNE ,16708861,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:44:03 CET,0.0 0.963 1.363 1.658 1.896 2.12 2.32 2.501 2.84 3.0 3.143 3.162 3.492 3.603 3.815 4.023 4.218 4.308 4.48 4.64 4.871 5.025 5.169 5.363 5.538 5.71 5.889 6.071 6.282 6.453 6.615 6.826 7.028 7.235 7.469 7.702 7.913 8.131 8.363 8.599 8.832 9.073 9.343 9.62 9.902 10.163 10.44 10.674 10.805 10.762 10.294 9.346 8.358 7.416 6.559 5.79 5.12 4.49 3.955 3.425 2.932 2.484 2.088 1.714 1.359 1.017 0.635 0.315 0.056 -0.223 -0.508 -0.748 -1.006 -1.27 -1.492 -1.716 -1.946 -2.213 -2.483 -2.663 -2.859 -3.151 -3.333 -3.522 -3.629 -3.873 -4.121 -4.377 -4.52 -4.907 -4.994 -5.15 -5.317 -5.679 -5.883 -6.11 -6.353 -6.61 -6.898 -7.327 -8.478 -3 ,8595 ,KEBNE ,16708862,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:43:41 CET,0.0 1.233 1.651 1.959 2.207 2.436 2.652 2.869 3.242 3.398 3.554 3.637 4.0 4.125 4.353 4.585 4.791 4.88 5.051 5.229 5.499 5.643 5.785 6.015 6.244 6.454 6.632 6.794 7.002 7.193 7.372 7.601 7.812 8.007 8.232 8.483 8.707 8.967 9.232 9.48 9.746 10.02 10.312 10.578 10.848 11.099 11.327 11.51 11.623 11.576 11.107 10.153 9.149 8.198 7.35 6.588 5.883 5.239 4.677 4.112 3.634 3.186 2.77 2.399 2.04 1.696 1.338 1.013 0.728 0.423 0.107 -0.165 -0.451 -0.734 -0.948 -1.175 -1.407 -1.645 -1.89 -2.06 -2.253 -2.542 -2.724 -2.916 -3.026 -3.257 -3.493 -3.741 -3.871 -4.25 -4.335 -4.494 -4.66 -5.022 -5.222 -5.432 -5.655 -5.888 -6.178 -6.58 -7.536 -4 ,28599 ,KEBNE ,16708863,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:46:19 CET,0.0 0.982 1.33 1.61 1.874 2.097 2.267 2.427 2.72 2.867 3.014 3.052 3.392 3.509 3.73 3.924 4.108 4.209 4.419 4.595 4.83 4.992 5.141 5.328 5.497 5.658 5.827 6.013 6.246 6.458 6.643 6.845 7.042 7.257 7.511 7.775 8.011 8.264 8.516 8.736 8.956 9.207 9.491 9.764 10.061 10.351 10.646 10.882 11.018 10.933 10.392 9.383 8.361 7.43 6.62 5.856 5.152 4.508 3.934 3.36 2.872 2.453 2.062 1.687 1.337 0.987 0.62 0.279 -0.022 -0.296 -0.605 -0.877 -1.142 -1.422 -1.662 -1.91 -2.152 -2.396 -2.652 -2.829 -3.013 -3.311 -3.519 -3.735 -3.842 -4.049 -4.274 -4.533 -4.664 -5.025 -5.064 -5.207 -5.367 -5.763 -5.973 -6.201 -6.472 -6.746 -7.048 -7.471 -8.728 -5 ,29130 ,KEBNE ,16708864,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:43 CET,0.0 1.086 1.485 1.78 2.011 2.212 2.399 2.583 2.947 3.101 3.232 3.269 3.621 3.737 3.944 4.153 4.342 4.431 4.596 4.74 4.942 5.08 5.211 5.416 5.639 5.838 6.002 6.148 6.344 6.551 6.75 6.988 7.22 7.41 7.615 7.844 8.058 8.295 8.543 8.813 9.103 9.368 9.627 9.877 10.162 10.451 10.725 10.953 11.108 11.093 10.56 9.605 8.669 7.741 6.884 6.121 5.453 4.823 4.29 3.756 3.252 2.798 2.389 2.021 1.659 1.308 0.931 0.615 0.36 0.066 -0.243 -0.478 -0.737 -1.037 -1.259 -1.467 -1.678 -1.929 -2.206 -2.394 -2.594 -2.884 -3.071 -3.263 -3.364 -3.578 -3.809 -4.062 -4.196 -4.569 -4.644 -4.797 -4.952 -5.277 -5.488 -5.737 -5.998 -6.3 -6.655 -7.127 -8.505 -6 ,16740 ,KEBNE ,16708865,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:33 CET,0.0 0.87 1.242 1.494 1.681 1.857 2.023 2.194 2.522 2.661 2.808 2.878 3.228 3.351 3.568 3.758 3.948 4.04 4.22 4.397 4.612 4.747 4.881 5.084 5.286 5.471 5.642 5.801 6.041 6.27 6.453 6.676 6.881 7.068 7.315 7.617 7.881 8.119 8.368 8.618 8.843 9.07 9.338 9.589 9.843 10.141 10.445 10.671 10.812 10.785 10.297 9.342 8.386 7.501 6.673 5.922 5.264 4.655 4.135 3.605 3.111 2.664 2.217 1.783 1.398 1.054 0.67 0.316 0.024 -0.26 -0.552 -0.806 -1.086 -1.374 -1.577 -1.78 -2.002 -2.255 -2.525 -2.715 -2.893 -3.171 -3.376 -3.583 -3.692 -3.928 -4.181 -4.42 -4.534 -4.889 -4.924 -5.09 -5.262 -5.606 -5.804 -6.016 -6.25 -6.51 -6.816 -7.215 -8.345 -7 ,5128 ,KEBNE ,16708866,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:49 CET,0.0 0.948 1.307 1.6 1.835 2.058 2.246 2.398 2.706 2.861 3.006 3.046 3.395 3.514 3.722 3.919 4.11 4.205 4.395 4.561 4.776 4.918 5.069 5.273 5.463 5.646 5.802 5.962 6.179 6.371 6.556 6.789 6.988 7.196 7.442 7.68 7.918 8.149 8.357 8.602 8.868 9.19 9.525 9.798 10.087 10.368 10.659 10.886 11.019 10.972 10.493 9.569 8.642 7.742 6.89 6.07 5.354 4.726 4.191 3.65 3.176 2.748 2.317 1.892 1.507 1.166 0.805 0.466 0.18 -0.108 -0.427 -0.705 -0.973 -1.24 -1.465 -1.705 -1.945 -2.193 -2.447 -2.608 -2.785 -3.081 -3.294 -3.517 -3.629 -3.868 -4.125 -4.396 -4.534 -4.899 -4.942 -5.095 -5.266 -5.641 -5.831 -6.038 -6.306 -6.597 -6.925 -7.351 -8.531 -8 ,17484 ,KEBNE ,16708867,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:50 CET,0.0 0.911 1.277 1.569 1.801 2.023 2.227 2.402 2.71 2.849 2.985 3.023 3.36 3.468 3.691 3.891 4.062 4.145 4.319 4.476 4.703 4.86 5.004 5.202 5.392 5.582 5.778 5.948 6.156 6.371 6.584 6.823 7.032 7.245 7.464 7.702 7.949 8.205 8.456 8.694 8.913 9.185 9.521 9.803 10.114 10.402 10.62 10.818 10.999 10.996 10.49 9.516 8.57 7.709 6.911 6.164 5.508 4.895 4.338 3.773 3.31 2.905 2.49 2.086 1.709 1.375 1.029 0.726 0.459 0.165 -0.143 -0.425 -0.704 -0.967 -1.17 -1.396 -1.656 -1.925 -2.174 -2.349 -2.555 -2.88 -3.093 -3.303 -3.41 -3.646 -3.905 -4.169 -4.303 -4.668 -4.717 -4.861 -5.003 -5.323 -5.506 -5.707 -5.954 -6.257 -6.61 -7.066 -8.328 -9 ,15008 ,KEBNE ,16708868,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:40 CET,0.0 1.229 1.633 1.936 2.237 2.484 2.685 2.883 3.234 3.388 3.52 3.534 3.865 3.976 4.172 4.349 4.528 4.613 4.798 4.992 5.275 5.427 5.558 5.756 5.928 6.08 6.225 6.38 6.595 6.794 6.961 7.162 7.355 7.557 7.793 8.018 8.23 8.48 8.737 8.975 9.238 9.508 9.807 10.085 10.36 10.639 10.896 11.135 11.253 11.116 10.568 9.574 8.63 7.747 6.931 6.162 5.461 4.829 4.26 3.678 3.133 2.659 2.243 1.843 1.47 1.104 0.715 0.39 0.088 -0.226 -0.516 -0.763 -1.011 -1.273 -1.486 -1.717 -1.972 -2.239 -2.518 -2.691 -2.863 -3.171 -3.39 -3.613 -3.721 -3.937 -4.181 -4.439 -4.574 -4.945 -5.032 -5.204 -5.366 -5.713 -5.924 -6.172 -6.431 -6.713 -7.077 -7.519 -8.428 -10 ,7894 ,KEBNE ,16708869,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:41 CET,0.0 1.11 1.569 1.885 2.15 2.391 2.603 2.795 3.14 3.299 3.439 3.462 3.798 3.902 4.089 4.273 4.456 4.543 4.713 4.901 5.169 5.329 5.474 5.686 5.892 6.068 6.243 6.418 6.619 6.79 6.957 7.173 7.378 7.566 7.773 8.02 8.258 8.482 8.712 8.95 9.195 9.483 9.805 10.079 10.369 10.648 10.921 11.148 11.247 11.185 10.725 9.75 8.786 7.878 7.074 6.332 5.671 5.051 4.512 3.988 3.523 3.106 2.709 2.334 1.974 1.644 1.295 0.977 0.709 0.411 0.064 -0.201 -0.47 -0.762 -0.973 -1.21 -1.465 -1.71 -1.976 -2.17 -2.373 -2.659 -2.862 -3.081 -3.189 -3.419 -3.657 -3.91 -4.052 -4.424 -4.511 -4.682 -4.858 -5.248 -5.459 -5.69 -5.958 -6.258 -6.65 -7.17 -8.394 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_338_336.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_338_336.txt deleted file mode 100644 index 30df9a07..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_338_336.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30158 ,KEBNE ,16708870,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:43 CET,0.0 0.927 1.282 1.559 1.794 2.009 2.195 2.346 2.615 2.741 2.866 2.9 3.244 3.358 3.564 3.759 3.949 4.035 4.198 4.362 4.617 4.763 4.874 5.015 5.169 5.327 5.484 5.646 5.85 6.029 6.189 6.369 6.53 6.706 6.907 7.109 7.272 7.422 7.598 7.789 7.948 8.105 8.268 8.419 8.54 8.587 8.605 8.537 8.236 7.607 6.323 4.543 3.021 1.676 0.429 -0.687 -1.62 -2.425 -3.115 -3.794 -4.383 -4.947 -5.48 -5.99 -6.444 -6.839 -7.254 -7.6 -7.895 -8.223 -8.589 -8.877 -9.162 -9.471 -9.715 -9.988 -10.288 -10.57 -10.832 -11.022 -11.233 -11.581 -11.824 -12.082 -12.215 -12.48 -12.741 -12.997 -13.138 -13.526 -13.593 -13.758 -13.954 -14.339 -14.544 -14.782 -15.024 -15.276 -15.594 -16.017 -17.37 -2 ,21913 ,KEBNE ,16708871,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:26 CET,0.0 1.119 1.493 1.763 2.005 2.235 2.438 2.616 2.938 3.09 3.216 3.215 3.536 3.642 3.853 4.05 4.218 4.298 4.467 4.62 4.828 4.95 5.063 5.229 5.389 5.536 5.67 5.819 6.027 6.212 6.376 6.576 6.753 6.913 7.095 7.301 7.515 7.714 7.887 8.053 8.221 8.388 8.565 8.727 8.852 8.93 8.918 8.8 8.511 7.902 6.641 4.904 3.383 2.071 0.956 -0.067 -0.978 -1.777 -2.449 -3.132 -3.735 -4.265 -4.761 -5.222 -5.657 -6.083 -6.516 -6.878 -7.183 -7.507 -7.857 -8.145 -8.468 -8.791 -9.013 -9.246 -9.495 -9.763 -10.056 -10.264 -10.481 -10.822 -11.057 -11.318 -11.448 -11.696 -11.969 -12.25 -12.395 -12.784 -12.868 -13.042 -13.226 -13.613 -13.829 -14.072 -14.337 -14.635 -14.964 -15.396 -16.718 -3 ,5893 ,KEBNE ,16708872,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:28 CET,0.0 1.283 1.701 1.956 2.157 2.334 2.478 2.628 2.892 3.004 3.125 3.132 3.466 3.569 3.755 3.938 4.12 4.21 4.388 4.54 4.743 4.879 5.021 5.244 5.453 5.622 5.763 5.914 6.094 6.248 6.426 6.647 6.821 6.964 7.15 7.348 7.506 7.671 7.829 7.993 8.158 8.331 8.503 8.651 8.782 8.843 8.835 8.741 8.484 7.873 6.581 4.783 3.221 1.884 0.687 -0.379 -1.291 -2.169 -2.899 -3.578 -4.185 -4.73 -5.224 -5.681 -6.125 -6.534 -6.942 -7.329 -7.678 -8.027 -8.4 -8.713 -9.041 -9.38 -9.625 -9.867 -10.12 -10.368 -10.64 -10.861 -11.094 -11.459 -11.724 -11.993 -12.133 -12.42 -12.692 -12.942 -13.081 -13.477 -13.547 -13.702 -13.876 -14.289 -14.512 -14.745 -14.997 -15.282 -15.633 -16.087 -17.564 -4 ,21376 ,KEBNE ,16708873,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:31 CET,0.0 1.008 1.403 1.689 1.913 2.132 2.346 2.519 2.787 2.916 3.033 3.03 3.362 3.467 3.673 3.886 4.077 4.157 4.313 4.46 4.648 4.758 4.867 5.038 5.196 5.351 5.522 5.676 5.852 6.025 6.177 6.357 6.561 6.778 7.01 7.249 7.444 7.611 7.768 7.91 8.045 8.195 8.363 8.481 8.592 8.688 8.696 8.624 8.379 7.734 6.475 4.75 3.185 1.837 0.682 -0.357 -1.269 -2.111 -2.902 -3.667 -4.258 -4.785 -5.296 -5.783 -6.247 -6.654 -7.067 -7.439 -7.795 -8.19 -8.599 -8.902 -9.18 -9.49 -9.747 -10.01 -10.289 -10.563 -10.826 -11.015 -11.209 -11.533 -11.757 -11.99 -12.11 -12.351 -12.618 -12.894 -13.039 -13.434 -13.56 -13.743 -13.939 -14.372 -14.592 -14.84 -15.107 -15.375 -15.67 -16.087 -17.096 -5 ,30966 ,KEBNE ,16708874,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:31 CET,0.0 0.841 1.191 1.485 1.737 1.952 2.141 2.32 2.614 2.749 2.892 2.914 3.248 3.352 3.56 3.752 3.927 4.012 4.176 4.322 4.507 4.623 4.747 4.946 5.113 5.267 5.428 5.587 5.798 5.956 6.103 6.309 6.517 6.745 6.966 7.15 7.315 7.469 7.608 7.767 7.946 8.125 8.276 8.38 8.489 8.597 8.648 8.561 8.258 7.602 6.298 4.533 2.997 1.686 0.538 -0.494 -1.395 -2.198 -2.892 -3.582 -4.177 -4.729 -5.262 -5.744 -6.2 -6.638 -7.074 -7.471 -7.818 -8.176 -8.556 -8.851 -9.154 -9.476 -9.721 -9.97 -10.218 -10.484 -10.792 -11.032 -11.27 -11.603 -11.83 -12.07 -12.198 -12.456 -12.723 -13.0 -13.149 -13.533 -13.581 -13.758 -13.948 -14.338 -14.558 -14.795 -15.059 -15.35 -15.694 -16.173 -17.696 -6 ,16202 ,KEBNE ,16708875,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:39 CET,0.0 1.274 1.656 1.938 2.185 2.394 2.587 2.772 3.095 3.227 3.367 3.408 3.754 3.868 4.076 4.266 4.44 4.525 4.661 4.785 4.97 5.079 5.192 5.379 5.56 5.735 5.898 6.062 6.269 6.444 6.612 6.806 6.995 7.172 7.35 7.542 7.724 7.898 8.065 8.254 8.426 8.585 8.768 8.918 9.039 9.086 9.064 8.973 8.715 8.107 6.809 5.004 3.463 2.139 0.99 -0.038 -0.944 -1.736 -2.414 -3.105 -3.717 -4.262 -4.774 -5.275 -5.757 -6.181 -6.604 -6.967 -7.279 -7.625 -7.977 -8.275 -8.588 -8.913 -9.174 -9.448 -9.736 -10.038 -10.334 -10.513 -10.699 -11.018 -11.256 -11.503 -11.624 -11.868 -12.124 -12.408 -12.568 -12.967 -13.053 -13.217 -13.381 -13.777 -14.005 -14.248 -14.512 -14.822 -15.178 -15.592 -16.714 -7 ,16709 ,KEBNE ,16708876,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:43:38 CET,0.0 1.103 1.495 1.77 2.005 2.21 2.388 2.544 2.821 2.961 3.104 3.141 3.479 3.585 3.779 3.959 4.104 4.176 4.354 4.505 4.691 4.825 4.953 5.114 5.275 5.45 5.614 5.757 5.927 6.086 6.227 6.39 6.546 6.699 6.889 7.069 7.229 7.41 7.585 7.775 7.926 8.06 8.222 8.349 8.457 8.545 8.547 8.44 8.149 7.547 6.272 4.476 2.929 1.598 0.44 -0.65 -1.585 -2.413 -3.111 -3.815 -4.447 -4.983 -5.493 -6.0 -6.478 -6.934 -7.398 -7.775 -8.091 -8.436 -8.805 -9.126 -9.437 -9.744 -9.989 -10.241 -10.511 -10.798 -11.101 -11.306 -11.506 -11.806 -12.034 -12.287 -12.413 -12.658 -12.914 -13.198 -13.342 -13.724 -13.804 -13.98 -14.162 -14.549 -14.775 -15.042 -15.313 -15.613 -16.006 -16.502 -17.701 -8 ,11150 ,KEBNE ,16708877,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:24 CET,0.0 1.182 1.614 1.955 2.216 2.405 2.588 2.768 3.063 3.198 3.326 3.346 3.688 3.793 3.998 4.204 4.391 4.469 4.632 4.794 5.003 5.131 5.255 5.423 5.588 5.77 5.934 6.067 6.267 6.474 6.648 6.823 6.988 7.176 7.364 7.543 7.719 7.882 8.066 8.25 8.426 8.618 8.798 8.924 9.004 9.041 9.028 8.941 8.645 8.04 6.779 5.009 3.447 2.084 0.925 -0.072 -0.96 -1.776 -2.492 -3.247 -3.871 -4.393 -4.915 -5.408 -5.865 -6.302 -6.748 -7.135 -7.464 -7.805 -8.152 -8.423 -8.717 -9.023 -9.261 -9.51 -9.755 -10.024 -10.331 -10.533 -10.734 -11.077 -11.312 -11.537 -11.647 -11.882 -12.137 -12.407 -12.539 -12.922 -13.022 -13.187 -13.356 -13.716 -13.928 -14.17 -14.445 -14.761 -15.144 -15.613 -16.837 -9 ,3468 ,KEBNE ,16708878,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:32 CET,0.0 1.037 1.396 1.673 1.914 2.121 2.29 2.429 2.674 2.804 2.935 2.954 3.294 3.417 3.629 3.806 3.961 4.039 4.203 4.354 4.561 4.694 4.826 5.019 5.2 5.362 5.487 5.608 5.799 5.989 6.138 6.3 6.447 6.584 6.771 6.976 7.134 7.314 7.513 7.697 7.876 8.056 8.231 8.37 8.493 8.573 8.588 8.484 8.18 7.57 6.266 4.458 2.908 1.535 0.365 -0.669 -1.627 -2.474 -3.162 -3.874 -4.494 -5.024 -5.525 -5.996 -6.435 -6.828 -7.25 -7.634 -7.954 -8.277 -8.612 -8.891 -9.221 -9.58 -9.834 -10.098 -10.382 -10.676 -10.975 -11.174 -11.38 -11.715 -11.941 -12.179 -12.309 -12.581 -12.866 -13.152 -13.299 -13.693 -13.793 -13.963 -14.126 -14.476 -14.675 -14.89 -15.133 -15.412 -15.733 -16.164 -17.415 -10 ,25099 ,KEBNE ,16708879,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:42:19 CET,0.0 1.109 1.469 1.746 1.996 2.212 2.415 2.601 2.925 3.069 3.198 3.214 3.544 3.649 3.853 4.06 4.247 4.33 4.496 4.649 4.838 4.965 5.119 5.346 5.537 5.686 5.81 5.938 6.122 6.292 6.427 6.612 6.815 7.017 7.249 7.448 7.618 7.786 7.946 8.133 8.329 8.493 8.653 8.813 8.958 9.065 9.086 8.956 8.651 8.027 6.709 4.87 3.295 1.941 0.769 -0.266 -1.153 -1.953 -2.64 -3.321 -3.92 -4.422 -4.921 -5.455 -5.93 -6.33 -6.754 -7.142 -7.469 -7.796 -8.123 -8.405 -8.712 -9.027 -9.261 -9.503 -9.769 -10.037 -10.307 -10.499 -10.696 -11.004 -11.218 -11.451 -11.575 -11.853 -12.152 -12.43 -12.57 -12.959 -13.059 -13.231 -13.403 -13.759 -13.961 -14.184 -14.403 -14.63 -14.931 -15.351 -16.525 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_35_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_35_41.txt deleted file mode 100644 index b14c5f2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_35_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13668 ,KEBNE ,16708880,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:41:30 CET,0.0 1.017 1.468 1.804 2.065 2.301 2.534 2.735 3.093 3.26 3.419 3.697 3.884 4.014 4.278 4.525 4.743 4.845 5.026 5.193 5.449 5.628 5.803 6.049 6.292 6.499 6.691 6.907 7.197 7.466 7.697 7.962 8.231 8.503 8.84 9.228 9.57 9.91 10.267 10.631 11.023 11.451 11.943 12.433 12.966 13.531 14.178 14.89 15.628 16.4 17.109 17.364 17.272 16.99 16.659 16.308 15.941 15.573 15.227 14.88 14.591 14.303 13.97 13.669 13.422 13.175 12.89 12.624 12.392 12.156 11.889 11.642 11.407 11.185 11.017 10.844 10.656 10.445 10.208 10.044 9.874 9.614 9.437 9.26 9.168 8.959 8.726 8.479 8.347 8.173 7.923 7.761 7.585 7.22 7.02 6.793 6.53 6.261 5.963 5.499 3.567 -2 ,4224 ,KEBNE ,16708881,Fri Nov 26 20:11:03 CET,Fri Nov 26 21:41:30 CET,0.0 1.212 1.657 1.985 2.281 2.529 2.751 2.953 3.34 3.518 3.68 3.933 4.112 4.249 4.506 4.741 4.955 5.059 5.255 5.45 5.736 5.915 6.091 6.342 6.584 6.813 7.03 7.239 7.504 7.754 7.996 8.287 8.555 8.802 9.093 9.424 9.709 10.007 10.347 10.745 11.161 11.588 12.057 12.524 13.067 13.63 14.245 14.88 15.561 16.284 16.919 17.15 17.011 16.722 16.391 16.037 15.693 15.36 15.036 14.69 14.388 14.093 13.789 13.474 13.202 12.972 12.703 12.447 12.228 11.986 11.734 11.548 11.337 11.096 10.907 10.704 10.488 10.257 10.016 9.856 9.691 9.417 9.222 9.015 8.906 8.677 8.44 8.213 8.095 7.928 7.666 7.503 7.34 6.988 6.776 6.556 6.306 6.005 5.646 5.148 3.668 -3 ,21593 ,KEBNE ,16708882,Fri Nov 26 20:12:04 CET,Fri Nov 26 21:43:41 CET,0.0 1.288 1.663 1.956 2.215 2.444 2.661 2.867 3.261 3.442 3.6 3.858 4.048 4.195 4.456 4.693 4.92 5.034 5.259 5.474 5.753 5.902 6.058 6.309 6.546 6.784 7.005 7.209 7.475 7.734 7.992 8.284 8.547 8.793 9.072 9.425 9.759 10.083 10.442 10.813 11.194 11.615 12.081 12.559 13.086 13.623 14.256 14.93 15.62 16.319 16.975 17.234 17.144 16.912 16.612 16.28 15.945 15.599 15.208 14.746 14.344 13.983 13.637 13.311 12.978 12.679 12.423 12.195 11.983 11.749 11.467 11.227 10.983 10.73 10.531 10.324 10.128 9.903 9.649 9.483 9.311 9.041 8.842 8.627 8.524 8.316 8.081 7.842 7.714 7.528 7.268 7.114 6.956 6.603 6.387 6.152 5.897 5.598 5.236 4.736 3.214 -4 ,30631 ,KEBNE ,16708883,Fri Nov 26 20:12:04 CET,Fri Nov 26 21:43:05 CET,0.0 1.434 1.845 2.168 2.45 2.683 2.896 3.102 3.455 3.609 3.762 4.025 4.2 4.326 4.582 4.819 5.047 5.156 5.35 5.536 5.813 5.991 6.166 6.428 6.668 6.885 7.094 7.299 7.569 7.827 8.058 8.322 8.588 8.861 9.184 9.523 9.819 10.128 10.452 10.803 11.181 11.598 12.081 12.58 13.14 13.717 14.365 15.065 15.807 16.582 17.225 17.39 17.228 16.936 16.589 16.262 15.949 15.597 15.281 14.96 14.631 14.333 14.03 13.719 13.402 13.109 12.807 12.531 12.279 12.006 11.746 11.529 11.306 11.071 10.893 10.705 10.511 10.315 10.098 9.948 9.776 9.503 9.315 9.093 8.98 8.753 8.511 8.263 8.137 7.978 7.707 7.534 7.367 7.0 6.799 6.576 6.329 6.065 5.733 5.258 4.077 -5 ,25055 ,KEBNE ,16708884,Fri Nov 26 20:12:04 CET,Fri Nov 26 21:43:30 CET,0.0 1.332 1.773 2.106 2.386 2.624 2.836 3.049 3.45 3.623 3.772 4.006 4.196 4.344 4.613 4.845 5.059 5.168 5.381 5.585 5.867 6.05 6.236 6.494 6.727 6.95 7.174 7.392 7.668 7.919 8.152 8.459 8.757 9.037 9.376 9.779 10.136 10.478 10.822 11.2 11.622 12.057 12.545 13.019 13.554 14.108 14.714 15.396 16.093 16.763 17.334 17.527 17.455 17.187 16.849 16.487 16.129 15.739 15.376 15.045 14.76 14.486 14.184 13.887 13.623 13.377 13.085 12.828 12.605 12.337 12.04 11.804 11.558 11.285 11.075 10.856 10.64 10.411 10.163 9.999 9.831 9.567 9.373 9.167 9.063 8.848 8.628 8.362 8.209 8.023 7.751 7.588 7.418 7.051 6.847 6.629 6.376 6.064 5.701 5.214 3.551 -6 ,19481 ,KEBNE ,16708885,Fri Nov 26 20:12:04 CET,Fri Nov 26 21:42:16 CET,0.0 1.365 1.82 2.166 2.447 2.684 2.896 3.088 3.425 3.583 3.743 3.997 4.177 4.31 4.556 4.809 5.049 5.149 5.343 5.556 5.864 6.06 6.245 6.499 6.736 6.949 7.161 7.378 7.65 7.919 8.16 8.418 8.68 8.942 9.246 9.581 9.897 10.235 10.592 10.958 11.339 11.772 12.262 12.756 13.346 13.966 14.614 15.274 16.013 16.789 17.45 17.687 17.612 17.364 17.021 16.615 16.24 15.892 15.586 15.27 14.974 14.684 14.388 14.094 13.81 13.56 13.296 13.025 12.769 12.528 12.274 12.043 11.799 11.551 11.368 11.185 10.991 10.769 10.517 10.338 10.17 9.918 9.746 9.576 9.472 9.24 9.005 8.755 8.628 8.461 8.219 8.07 7.902 7.538 7.348 7.147 6.912 6.619 6.253 5.798 4.389 -7 ,17617 ,KEBNE ,16708886,Fri Nov 26 20:12:04 CET,Fri Nov 26 21:42:13 CET,0.0 1.346 1.844 2.192 2.449 2.677 2.902 3.113 3.474 3.638 3.79 4.043 4.222 4.354 4.615 4.867 5.1 5.207 5.401 5.587 5.849 6.021 6.207 6.479 6.728 6.965 7.185 7.389 7.644 7.906 8.167 8.462 8.74 9.002 9.309 9.659 9.972 10.312 10.694 11.074 11.434 11.839 12.319 12.797 13.32 13.892 14.552 15.268 16.052 16.803 17.403 17.614 17.483 17.205 16.869 16.529 16.213 15.869 15.532 15.178 14.837 14.499 14.176 13.871 13.582 13.32 13.022 12.731 12.481 12.217 11.943 11.739 11.533 11.286 11.09 10.88 10.644 10.417 10.192 10.034 9.869 9.594 9.388 9.188 9.091 8.895 8.672 8.413 8.292 8.137 7.898 7.721 7.54 7.169 6.956 6.737 6.49 6.201 5.86 5.433 4.139 -8 ,23292 ,KEBNE ,16708887,Fri Nov 26 20:13:06 CET,Fri Nov 26 21:45:07 CET,0.0 1.951 2.438 2.791 3.077 3.339 3.583 3.807 4.185 4.35 4.509 4.765 4.937 5.065 5.315 5.553 5.778 5.885 6.09 6.292 6.585 6.765 6.939 7.191 7.43 7.661 7.881 8.098 8.361 8.604 8.848 9.132 9.381 9.636 9.961 10.325 10.651 10.997 11.403 11.817 12.208 12.639 13.129 13.603 14.154 14.756 15.415 16.102 16.832 17.588 18.26 18.495 18.343 18.016 17.695 17.362 17.017 16.624 16.231 15.859 15.539 15.249 14.951 14.626 14.299 14.011 13.715 13.445 13.226 12.982 12.707 12.482 12.243 11.986 11.79 11.589 11.374 11.157 10.939 10.784 10.619 10.352 10.171 9.981 9.881 9.675 9.447 9.194 9.069 8.898 8.657 8.522 8.37 8.009 7.808 7.592 7.347 7.058 6.731 6.272 4.913 -9 ,28944 ,KEBNE ,16708888,Fri Nov 26 20:13:06 CET,Fri Nov 26 21:44:43 CET,0.0 1.897 2.412 2.739 3.006 3.254 3.488 3.694 4.05 4.206 4.354 4.599 4.783 4.915 5.147 5.373 5.582 5.689 5.91 6.105 6.374 6.549 6.725 6.978 7.212 7.436 7.645 7.85 8.108 8.345 8.572 8.839 9.096 9.341 9.632 9.964 10.261 10.589 10.947 11.312 11.678 12.083 12.583 13.1 13.635 14.194 14.806 15.473 16.214 16.96 17.646 17.91 17.783 17.49 17.146 16.762 16.388 16.032 15.69 15.332 14.985 14.655 14.378 14.113 13.838 13.562 13.279 13.038 12.811 12.554 12.274 12.049 11.82 11.571 11.383 11.169 10.93 10.713 10.501 10.354 10.187 9.921 9.745 9.556 9.453 9.225 8.985 8.74 8.615 8.452 8.204 8.05 7.887 7.535 7.344 7.122 6.876 6.618 6.329 5.876 4.402 -10 ,26475 ,KEBNE ,16708889,Fri Nov 26 20:13:06 CET,Fri Nov 26 21:44:36 CET,0.0 1.219 1.686 1.997 2.242 2.469 2.674 2.863 3.217 3.371 3.516 3.759 3.931 4.062 4.315 4.547 4.765 4.868 5.065 5.267 5.566 5.756 5.947 6.207 6.448 6.678 6.882 7.086 7.335 7.576 7.828 8.119 8.378 8.628 8.916 9.221 9.52 9.872 10.255 10.633 11.024 11.448 11.936 12.424 12.944 13.511 14.157 14.847 15.591 16.348 17.034 17.305 17.17 16.885 16.51 16.123 15.782 15.465 15.151 14.796 14.475 14.173 13.863 13.556 13.285 13.033 12.741 12.482 12.233 11.985 11.751 11.538 11.302 11.067 10.902 10.716 10.511 10.302 10.091 9.938 9.774 9.501 9.293 9.094 8.998 8.784 8.556 8.313 8.183 8.024 7.787 7.638 7.483 7.11 6.893 6.658 6.41 6.131 5.796 5.36 4.161 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_35_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_35_50.txt deleted file mode 100644 index 6565f38e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_35_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15390 ,KEBNE ,16708890,Fri Nov 26 20:13:06 CET,Fri Nov 26 21:43:33 CET,0.0 0.858 1.126 1.279 1.376 1.444 1.499 1.541 1.593 1.603 1.605 1.576 1.608 1.591 1.56 1.521 1.471 1.44 1.367 1.282 1.147 1.053 0.95 0.787 0.622 0.451 0.262 0.071 -0.172 -0.425 -0.691 -1.045 -1.419 -1.797 -2.263 -2.812 -3.37 -4.023 -4.768 -5.618 -6.575 -7.741 -9.204 -10.781 -12.812 -15.29 -18.406 -22.251 -27.352 -34.418 -44.878 -55.828 -63.88 -70.2 -75.194 -79.324 -82.759 -85.73 -88.206 -90.58 -92.512 -94.164 -95.684 -97.077 -98.34 -99.453 -100.596 -101.609 -102.454 -103.283 -104.125 -104.813 -105.523 -106.257 -106.811 -107.383 -107.967 -108.55 -109.145 -109.548 -109.948 -110.561 -110.991 -111.428 -111.652 -112.118 -112.593 -113.087 -113.341 -113.753 -114.142 -114.432 -114.729 -115.349 -115.679 -116.015 -116.387 -116.823 -117.364 -118.034 -119.377 -2 ,27690 ,KEBNE ,16708891,Fri Nov 26 20:13:06 CET,Fri Nov 26 21:44:46 CET,0.0 0.919 1.157 1.308 1.409 1.482 1.548 1.594 1.624 1.628 1.636 1.594 1.622 1.605 1.57 1.523 1.465 1.432 1.357 1.277 1.14 1.046 0.956 0.823 0.663 0.487 0.312 0.13 -0.126 -0.399 -0.676 -1.025 -1.394 -1.78 -2.244 -2.79 -3.354 -4.015 -4.78 -5.656 -6.637 -7.811 -9.268 -10.857 -12.865 -15.33 -18.445 -22.321 -27.484 -34.594 -45.251 -56.387 -64.528 -70.826 -75.75 -79.853 -83.269 -86.207 -88.611 -90.921 -92.833 -94.467 -95.968 -97.333 -98.588 -99.726 -100.884 -101.905 -102.754 -103.587 -104.432 -105.121 -105.836 -106.571 -107.125 -107.69 -108.266 -108.849 -109.45 -109.852 -110.253 -110.865 -111.293 -111.742 -111.97 -112.43 -112.902 -113.394 -113.649 -114.064 -114.448 -114.715 -114.99 -115.586 -115.907 -116.263 -116.666 -117.121 -117.618 -118.233 -119.783 -3 ,9667 ,KEBNE ,16708892,Fri Nov 26 20:13:06 CET,Fri Nov 26 21:44:43 CET,0.0 1.171 1.411 1.562 1.649 1.714 1.775 1.822 1.866 1.879 1.895 1.86 1.891 1.878 1.841 1.788 1.73 1.699 1.627 1.544 1.419 1.335 1.25 1.108 0.936 0.761 0.587 0.406 0.158 -0.092 -0.364 -0.732 -1.104 -1.475 -1.933 -2.496 -3.073 -3.74 -4.488 -5.336 -6.309 -7.468 -8.923 -10.519 -12.524 -14.963 -18.05 -21.922 -27.112 -34.271 -44.762 -55.753 -63.92 -70.263 -75.297 -79.518 -82.943 -85.879 -88.291 -90.575 -92.486 -94.15 -95.691 -97.106 -98.382 -99.507 -100.665 -101.675 -102.514 -103.365 -104.23 -104.937 -105.653 -106.378 -106.927 -107.491 -108.061 -108.631 -109.213 -109.615 -110.025 -110.655 -111.09 -111.535 -111.763 -112.233 -112.71 -113.198 -113.449 -113.851 -114.235 -114.517 -114.812 -115.456 -115.808 -116.174 -116.543 -116.939 -117.411 -118.005 -119.662 -4 ,14916 ,KEBNE ,16708893,Fri Nov 26 20:14:08 CET,Fri Nov 26 21:45:18 CET,0.0 0.923 1.169 1.324 1.416 1.477 1.535 1.583 1.651 1.667 1.674 1.627 1.659 1.647 1.608 1.559 1.495 1.463 1.4 1.324 1.185 1.089 0.986 0.818 0.646 0.472 0.29 0.098 -0.157 -0.425 -0.719 -1.092 -1.462 -1.837 -2.29 -2.823 -3.373 -4.035 -4.802 -5.655 -6.614 -7.777 -9.229 -10.812 -12.807 -15.237 -18.367 -22.265 -27.417 -34.516 -44.99 -55.954 -63.996 -70.306 -75.337 -79.481 -82.85 -85.753 -88.194 -90.566 -92.516 -94.182 -95.727 -97.129 -98.372 -99.465 -100.576 -101.553 -102.377 -103.212 -104.066 -104.762 -105.463 -106.176 -106.731 -107.296 -107.872 -108.465 -109.076 -109.484 -109.889 -110.506 -110.93 -111.373 -111.601 -112.057 -112.51 -112.992 -113.252 -113.679 -114.101 -114.392 -114.671 -115.257 -115.597 -115.955 -116.327 -116.734 -117.215 -117.837 -119.804 -5 ,26708 ,KEBNE ,16708894,Fri Nov 26 20:14:08 CET,Fri Nov 26 21:45:39 CET,0.0 0.858 1.064 1.201 1.298 1.373 1.444 1.491 1.547 1.566 1.574 1.55 1.592 1.588 1.578 1.551 1.497 1.467 1.399 1.324 1.197 1.1 0.998 0.824 0.647 0.471 0.284 0.088 -0.175 -0.44 -0.721 -1.08 -1.447 -1.824 -2.281 -2.821 -3.393 -4.078 -4.866 -5.747 -6.725 -7.903 -9.389 -10.992 -12.995 -15.445 -18.554 -22.455 -27.663 -34.809 -45.362 -56.32 -64.293 -70.592 -75.65 -79.848 -83.274 -86.211 -88.644 -90.947 -92.85 -94.487 -95.997 -97.385 -98.64 -99.744 -100.879 -101.873 -102.704 -103.557 -104.429 -105.124 -105.818 -106.528 -107.08 -107.641 -108.194 -108.758 -109.354 -109.763 -110.183 -110.798 -111.208 -111.648 -111.873 -112.33 -112.802 -113.29 -113.545 -113.969 -114.365 -114.644 -114.945 -115.58 -115.909 -116.256 -116.638 -117.062 -117.554 -118.205 -119.673 -6 ,28754 ,KEBNE ,16708895,Fri Nov 26 20:14:08 CET,Fri Nov 26 21:45:36 CET,0.0 0.885 1.109 1.268 1.369 1.438 1.493 1.533 1.581 1.598 1.607 1.552 1.582 1.564 1.523 1.473 1.408 1.378 1.302 1.216 1.079 0.98 0.876 0.718 0.559 0.383 0.203 0.02 -0.24 -0.503 -0.776 -1.143 -1.515 -1.891 -2.351 -2.896 -3.449 -4.103 -4.855 -5.694 -6.643 -7.794 -9.259 -10.852 -12.841 -15.253 -18.347 -22.275 -27.471 -34.566 -45.163 -56.335 -64.424 -70.619 -75.536 -79.658 -83.095 -86.024 -88.449 -90.795 -92.735 -94.409 -95.945 -97.349 -98.611 -99.718 -100.829 -101.801 -102.629 -103.454 -104.3 -104.993 -105.694 -106.407 -106.943 -107.481 -108.034 -108.606 -109.188 -109.574 -109.973 -110.585 -111.0 -111.438 -111.664 -112.129 -112.606 -113.092 -113.345 -113.757 -114.131 -114.406 -114.686 -115.285 -115.614 -115.957 -116.322 -116.71 -117.18 -117.797 -118.893 -7 ,21301 ,KEBNE ,16708896,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:46:53 CET,0.0 0.975 1.212 1.338 1.423 1.489 1.545 1.583 1.634 1.65 1.653 1.606 1.638 1.623 1.578 1.519 1.461 1.428 1.348 1.261 1.117 1.021 0.922 0.763 0.603 0.432 0.25 0.066 -0.183 -0.446 -0.716 -1.064 -1.426 -1.793 -2.244 -2.787 -3.334 -3.961 -4.691 -5.543 -6.503 -7.666 -9.14 -10.748 -12.753 -15.162 -18.279 -22.269 -27.474 -34.55 -44.996 -56.012 -64.108 -70.367 -75.327 -79.478 -82.941 -85.918 -88.375 -90.716 -92.628 -94.301 -95.859 -97.27 -98.546 -99.66 -100.782 -101.763 -102.601 -103.455 -104.311 -105.009 -105.717 -106.43 -106.985 -107.558 -108.133 -108.739 -109.362 -109.782 -110.203 -110.825 -111.249 -111.693 -111.921 -112.381 -112.857 -113.339 -113.582 -113.991 -114.386 -114.669 -114.955 -115.561 -115.881 -116.219 -116.598 -117.032 -117.495 -118.04 -119.44 -8 ,16456 ,KEBNE ,16708897,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:48:14 CET,0.0 0.897 1.156 1.31 1.437 1.518 1.572 1.612 1.669 1.69 1.701 1.666 1.703 1.692 1.647 1.595 1.534 1.496 1.418 1.35 1.238 1.146 1.047 0.883 0.714 0.546 0.377 0.201 -0.056 -0.328 -0.602 -0.956 -1.325 -1.689 -2.136 -2.68 -3.235 -3.898 -4.672 -5.546 -6.534 -7.719 -9.182 -10.749 -12.733 -15.181 -18.329 -22.302 -27.551 -34.735 -45.229 -56.251 -64.309 -70.532 -75.509 -79.679 -83.109 -86.002 -88.373 -90.676 -92.597 -94.252 -95.775 -97.182 -98.451 -99.556 -100.684 -101.682 -102.524 -103.38 -104.238 -104.93 -105.645 -106.376 -106.929 -107.487 -108.07 -108.665 -109.267 -109.671 -110.087 -110.74 -111.181 -111.629 -111.857 -112.323 -112.798 -113.283 -113.535 -113.953 -114.344 -114.615 -114.899 -115.527 -115.863 -116.206 -116.575 -116.978 -117.426 -118.026 -119.269 -9 ,5840 ,KEBNE ,16708898,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:47:46 CET,0.0 0.879 1.122 1.27 1.394 1.487 1.543 1.586 1.653 1.67 1.673 1.614 1.648 1.634 1.593 1.546 1.484 1.452 1.381 1.297 1.171 1.074 0.966 0.804 0.638 0.469 0.293 0.104 -0.152 -0.419 -0.688 -1.026 -1.393 -1.769 -2.227 -2.777 -3.337 -3.989 -4.738 -5.591 -6.563 -7.732 -9.19 -10.775 -12.769 -15.216 -18.33 -22.229 -27.428 -34.531 -44.947 -55.862 -63.867 -70.108 -75.135 -79.301 -82.739 -85.71 -88.116 -90.418 -92.349 -94.02 -95.556 -96.953 -98.199 -99.297 -100.426 -101.425 -102.269 -103.112 -103.975 -104.692 -105.421 -106.143 -106.696 -107.253 -107.805 -108.374 -108.96 -109.354 -109.756 -110.38 -110.807 -111.248 -111.472 -111.921 -112.376 -112.856 -113.112 -113.525 -113.893 -114.163 -114.444 -115.067 -115.402 -115.778 -116.187 -116.601 -117.088 -117.715 -119.212 -10 ,28074 ,KEBNE ,16708899,Fri Nov 26 20:16:11 CET,Fri Nov 26 21:46:18 CET,0.0 1.012 1.282 1.428 1.525 1.609 1.667 1.703 1.746 1.758 1.755 1.704 1.738 1.726 1.695 1.645 1.592 1.563 1.493 1.419 1.286 1.189 1.091 0.941 0.776 0.603 0.427 0.243 -0.018 -0.289 -0.563 -0.921 -1.285 -1.653 -2.098 -2.64 -3.215 -3.88 -4.643 -5.505 -6.477 -7.663 -9.138 -10.728 -12.736 -15.183 -18.299 -22.236 -27.463 -34.617 -45.164 -56.15 -64.286 -70.653 -75.692 -79.858 -83.254 -86.202 -88.676 -91.048 -92.969 -94.606 -96.132 -97.53 -98.781 -99.886 -101.01 -101.988 -102.818 -103.676 -104.543 -105.24 -105.955 -106.685 -107.243 -107.803 -108.367 -108.952 -109.548 -109.949 -110.366 -111.008 -111.436 -111.865 -112.084 -112.538 -113.007 -113.476 -113.719 -114.129 -114.496 -114.769 -115.058 -115.686 -116.021 -116.372 -116.743 -117.168 -117.678 -118.302 -119.848 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_35_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_35_54.txt deleted file mode 100644 index c82ab74c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_35_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12725 ,KEBNE ,17126073,Thu Dec 30 18:16:16 CET,Thu Dec 30 19:49:08 CET,0.0 1.154 1.571 1.864 2.101 2.277 2.436 2.585 2.806 2.898 2.979 3.075 3.165 3.206 3.272 3.324 3.364 3.373 3.385 3.386 3.356 3.318 3.283 3.243 3.184 3.089 2.985 2.89 2.755 2.615 2.449 2.219 1.975 1.719 1.385 0.983 0.566 0.032 -0.622 -1.385 -2.236 -3.252 -4.525 -5.949 -7.758 -9.974 -12.846 -16.54 -21.456 -28.271 -38.55 -49.398 -57.403 -63.664 -68.63 -72.768 -76.183 -79.111 -81.534 -83.857 -85.761 -87.411 -88.96 -90.359 -91.617 -92.762 -93.923 -94.936 -95.802 -96.681 -97.548 -98.237 -98.958 -99.703 -100.268 -100.861 -101.471 -102.067 -102.684 -103.106 -103.525 -104.186 -104.645 -105.093 -105.319 -105.799 -106.282 -106.769 -107.025 -107.447 -107.851 -108.138 -108.437 -109.09 -109.421 -109.79 -110.213 -110.653 -111.18 -111.799 -113.412 -2 ,15392 ,KEBNE ,17126074,Thu Dec 30 18:16:16 CET,Thu Dec 30 19:50:29 CET,0.0 1.403 1.801 2.086 2.323 2.53 2.707 2.834 3.026 3.117 3.19 3.256 3.342 3.383 3.453 3.498 3.527 3.538 3.553 3.565 3.553 3.529 3.504 3.446 3.381 3.319 3.24 3.139 2.992 2.825 2.642 2.425 2.188 1.935 1.617 1.212 0.801 0.289 -0.333 -1.051 -1.876 -2.889 -4.189 -5.617 -7.425 -9.662 -12.539 -16.189 -21.08 -27.86 -37.936 -48.483 -56.276 -62.48 -67.45 -71.562 -74.922 -77.798 -80.19 -82.469 -84.38 -86.054 -87.591 -88.986 -90.246 -91.364 -92.523 -93.539 -94.381 -95.239 -96.125 -96.828 -97.529 -98.251 -98.815 -99.393 -99.969 -100.553 -101.15 -101.563 -101.989 -102.638 -103.071 -103.516 -103.741 -104.204 -104.699 -105.2 -105.45 -105.854 -106.265 -106.56 -106.849 -107.483 -107.832 -108.191 -108.55 -108.95 -109.453 -110.071 -111.629 -3 ,16523 ,KEBNE ,17126075,Thu Dec 30 18:16:28 CET,Thu Dec 30 19:51:04 CET,0.0 1.485 1.867 2.159 2.397 2.57 2.719 2.855 3.058 3.152 3.232 3.288 3.369 3.406 3.466 3.513 3.532 3.54 3.557 3.552 3.549 3.54 3.508 3.445 3.366 3.27 3.178 3.082 2.936 2.767 2.587 2.37 2.107 1.8 1.453 1.058 0.634 0.105 -0.536 -1.263 -2.082 -3.089 -4.393 -5.822 -7.654 -9.935 -12.842 -16.541 -21.461 -28.251 -38.478 -49.234 -57.114 -63.282 -68.186 -72.272 -75.632 -78.515 -80.945 -83.297 -85.248 -86.916 -88.425 -89.813 -91.059 -92.173 -93.327 -94.336 -95.194 -96.079 -96.972 -97.685 -98.398 -99.124 -99.698 -100.279 -100.868 -101.472 -102.082 -102.494 -102.911 -103.539 -103.966 -104.405 -104.632 -105.098 -105.577 -106.08 -106.334 -106.739 -107.103 -107.376 -107.661 -108.282 -108.606 -108.954 -109.337 -109.761 -110.272 -110.883 -112.39 -4 ,13170 ,KEBNE ,17126076,Thu Dec 30 18:16:31 CET,Thu Dec 30 19:49:57 CET,0.0 1.39 1.82 2.116 2.34 2.524 2.648 2.751 2.931 2.995 3.053 3.135 3.229 3.278 3.348 3.397 3.431 3.436 3.445 3.439 3.403 3.389 3.374 3.316 3.255 3.193 3.116 3.025 2.883 2.727 2.55 2.311 2.064 1.786 1.421 1.004 0.576 0.061 -0.556 -1.279 -2.1 -3.108 -4.391 -5.78 -7.577 -9.803 -12.655 -16.336 -21.195 -27.928 -38.033 -48.695 -56.552 -62.643 -67.552 -71.648 -74.985 -77.847 -80.247 -82.594 -84.547 -86.206 -87.725 -89.118 -90.402 -91.546 -92.7 -93.719 -94.584 -95.442 -96.298 -97.012 -97.752 -98.502 -99.072 -99.641 -100.206 -100.772 -101.368 -101.786 -102.207 -102.853 -103.305 -103.766 -103.991 -104.449 -104.928 -105.411 -105.662 -106.075 -106.447 -106.73 -107.015 -107.612 -107.952 -108.307 -108.677 -109.101 -109.597 -110.202 -111.755 -5 ,31139 ,KEBNE ,17126077,Thu Dec 30 18:16:36 CET,Thu Dec 30 19:50:11 CET,0.0 1.41 1.869 2.168 2.405 2.607 2.781 2.907 3.103 3.194 3.262 3.339 3.429 3.471 3.533 3.573 3.607 3.617 3.637 3.645 3.636 3.627 3.604 3.549 3.488 3.406 3.316 3.227 3.096 2.953 2.792 2.567 2.323 2.067 1.753 1.356 0.907 0.386 -0.238 -0.985 -1.816 -2.788 -3.986 -5.337 -7.11 -9.299 -12.132 -15.84 -20.823 -27.634 -37.713 -48.373 -56.298 -62.475 -67.415 -71.552 -74.946 -77.848 -80.252 -82.572 -84.516 -86.164 -87.688 -89.09 -90.35 -91.488 -92.667 -93.705 -94.563 -95.418 -96.296 -97.012 -97.725 -98.456 -99.023 -99.605 -100.192 -100.785 -101.399 -101.81 -102.22 -102.86 -103.296 -103.741 -103.974 -104.442 -104.891 -105.375 -105.641 -106.06 -106.451 -106.737 -107.036 -107.666 -108.009 -108.376 -108.758 -109.186 -109.704 -110.353 -111.723 -6 ,21361 ,KEBNE ,17126078,Thu Dec 30 18:16:48 CET,Thu Dec 30 19:49:56 CET,0.0 1.663 2.106 2.408 2.61 2.767 2.893 3.004 3.196 3.281 3.363 3.463 3.557 3.599 3.65 3.698 3.726 3.733 3.742 3.747 3.731 3.711 3.685 3.637 3.567 3.466 3.361 3.253 3.106 2.96 2.8 2.569 2.332 2.083 1.764 1.381 0.988 0.506 -0.088 -0.776 -1.555 -2.497 -3.672 -5.021 -6.819 -9.083 -11.978 -15.572 -20.422 -27.156 -37.301 -48.035 -55.961 -62.157 -67.052 -71.155 -74.535 -77.41 -79.814 -82.117 -84.0 -85.681 -87.247 -88.659 -89.944 -91.088 -92.254 -93.25 -94.079 -94.938 -95.805 -96.495 -97.223 -97.975 -98.535 -99.112 -99.703 -100.298 -100.915 -101.349 -101.783 -102.426 -102.859 -103.304 -103.536 -104.006 -104.496 -104.998 -105.252 -105.674 -106.053 -106.335 -106.633 -107.236 -107.546 -107.885 -108.269 -108.694 -109.16 -109.76 -111.414 -7 ,30600 ,KEBNE ,17126079,Thu Dec 30 18:16:55 CET,Thu Dec 30 19:51:55 CET,0.0 1.806 2.209 2.469 2.71 2.921 3.071 3.21 3.428 3.506 3.575 3.655 3.748 3.796 3.873 3.933 3.976 3.986 3.995 3.995 3.972 3.941 3.896 3.829 3.762 3.688 3.605 3.517 3.39 3.226 3.039 2.805 2.555 2.289 1.933 1.47 1.019 0.511 -0.101 -0.812 -1.588 -2.531 -3.799 -5.217 -7.002 -9.211 -12.116 -15.848 -20.753 -27.583 -37.795 -48.476 -56.327 -62.412 -67.259 -71.355 -74.736 -77.599 -79.975 -82.302 -84.251 -85.904 -87.414 -88.825 -90.104 -91.226 -92.38 -93.381 -94.234 -95.101 -95.971 -96.681 -97.41 -98.159 -98.73 -99.309 -99.896 -100.493 -101.089 -101.495 -101.913 -102.555 -102.995 -103.454 -103.688 -104.163 -104.651 -105.163 -105.423 -105.84 -106.234 -106.517 -106.809 -107.429 -107.777 -108.14 -108.493 -108.885 -109.343 -109.972 -111.662 -8 ,24096 ,KEBNE ,17126080,Thu Dec 30 18:17:45 CET,Thu Dec 30 19:52:47 CET,0.0 1.862 2.361 2.658 2.881 3.062 3.209 3.332 3.53 3.614 3.69 3.757 3.834 3.872 3.93 3.977 4.006 4.008 4.016 4.025 4.019 4.005 3.986 3.947 3.869 3.777 3.676 3.552 3.394 3.229 3.057 2.836 2.572 2.284 1.937 1.514 1.067 0.55 -0.073 -0.822 -1.675 -2.707 -4.013 -5.437 -7.27 -9.518 -12.381 -15.995 -20.885 -27.709 -37.82 -48.475 -56.333 -62.462 -67.343 -71.42 -74.798 -77.733 -80.162 -82.467 -84.394 -86.084 -87.608 -88.973 -90.238 -91.358 -92.479 -93.454 -94.306 -95.169 -96.032 -96.752 -97.469 -98.2 -98.763 -99.322 -99.889 -100.482 -101.096 -101.498 -101.903 -102.541 -102.973 -103.424 -103.657 -104.117 -104.597 -105.11 -105.37 -105.785 -106.178 -106.468 -106.759 -107.386 -107.722 -108.084 -108.484 -108.93 -109.442 -110.065 -111.81 -9 ,31337 ,KEBNE ,17126081,Thu Dec 30 18:17:55 CET,Thu Dec 30 19:52:42 CET,0.0 1.54 1.997 2.325 2.578 2.77 2.912 3.03 3.212 3.276 3.329 3.392 3.478 3.518 3.572 3.597 3.61 3.614 3.634 3.648 3.639 3.62 3.589 3.537 3.471 3.384 3.289 3.193 3.044 2.88 2.702 2.45 2.188 1.925 1.591 1.194 0.774 0.249 -0.395 -1.146 -1.995 -2.99 -4.213 -5.598 -7.414 -9.693 -12.613 -16.265 -21.192 -28.04 -38.091 -48.751 -56.742 -62.948 -67.898 -72.022 -75.419 -78.342 -80.743 -83.035 -84.95 -86.626 -88.181 -89.59 -90.863 -92.006 -93.16 -94.179 -95.051 -95.915 -96.803 -97.537 -98.271 -99.001 -99.559 -100.123 -100.702 -101.295 -101.894 -102.317 -102.751 -103.409 -103.866 -104.34 -104.577 -105.054 -105.546 -106.052 -106.308 -106.725 -107.112 -107.395 -107.698 -108.332 -108.662 -109.005 -109.376 -109.791 -110.302 -110.943 -112.648 -10 ,25921 ,KEBNE ,17126082,Thu Dec 30 18:20:50 CET,Thu Dec 30 19:54:34 CET,0.0 1.557 2.02 2.338 2.544 2.726 2.894 3.02 3.199 3.268 3.332 3.409 3.491 3.53 3.595 3.655 3.695 3.705 3.736 3.756 3.732 3.712 3.693 3.641 3.573 3.489 3.391 3.281 3.111 2.927 2.735 2.486 2.237 1.978 1.672 1.304 0.863 0.316 -0.291 -0.992 -1.795 -2.776 -4.053 -5.448 -7.232 -9.411 -12.194 -15.836 -20.776 -27.597 -37.804 -48.71 -56.804 -62.988 -67.862 -71.934 -75.291 -78.209 -80.619 -82.91 -84.779 -86.379 -87.906 -89.358 -90.689 -91.827 -92.954 -93.94 -94.786 -95.663 -96.558 -97.27 -97.965 -98.693 -99.261 -99.823 -100.405 -101.008 -101.621 -102.035 -102.452 -103.088 -103.521 -103.97 -104.202 -104.675 -105.163 -105.655 -105.899 -106.311 -106.711 -106.995 -107.293 -107.933 -108.268 -108.614 -108.985 -109.402 -109.869 -110.463 -111.785 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_41_54.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_41_54.txt deleted file mode 100644 index c39461a0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_41_54.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6081 ,KEBNE ,16708900,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:46:49 CET,0.0 1.977 2.411 2.691 2.906 3.085 3.246 3.373 3.565 3.641 3.705 3.773 3.852 3.883 3.937 3.974 3.991 3.995 4.003 4.009 4.003 3.975 3.94 3.899 3.841 3.743 3.644 3.562 3.422 3.247 3.073 2.816 2.523 2.232 1.88 1.471 1.031 0.457 -0.227 -0.986 -1.839 -2.902 -4.266 -5.769 -7.673 -9.982 -12.953 -16.786 -21.987 -29.094 -39.655 -50.805 -58.976 -65.354 -70.403 -74.6 -78.068 -81.023 -83.503 -85.91 -87.873 -89.535 -91.045 -92.478 -93.825 -95.008 -96.202 -97.242 -98.104 -98.974 -99.846 -100.561 -101.312 -102.064 -102.62 -103.188 -103.773 -104.373 -104.983 -105.402 -105.836 -106.498 -106.951 -107.411 -107.637 -108.096 -108.573 -109.058 -109.315 -109.741 -110.136 -110.423 -110.723 -111.351 -111.682 -112.037 -112.419 -112.855 -113.342 -113.956 -115.938 -2 ,16532 ,KEBNE ,16708901,Fri Nov 26 20:16:11 CET,Fri Nov 26 21:46:51 CET,0.0 1.306 1.775 2.064 2.289 2.478 2.64 2.762 2.934 3.008 3.075 3.154 3.235 3.263 3.301 3.331 3.344 3.35 3.372 3.382 3.352 3.32 3.299 3.239 3.153 3.071 2.969 2.841 2.635 2.416 2.2 1.926 1.653 1.378 1.017 0.569 0.086 -0.51 -1.195 -1.985 -2.859 -3.92 -5.289 -6.78 -8.705 -11.068 -14.104 -18.001 -23.198 -30.34 -40.944 -52.057 -60.222 -66.602 -71.673 -75.883 -79.373 -82.4 -84.876 -87.243 -89.185 -90.863 -92.429 -93.853 -95.157 -96.296 -97.44 -98.449 -99.312 -100.192 -101.07 -101.784 -102.536 -103.32 -103.911 -104.497 -105.093 -105.705 -106.316 -106.725 -107.142 -107.8 -108.251 -108.713 -108.947 -109.412 -109.888 -110.377 -110.62 -111.037 -111.425 -111.703 -111.994 -112.599 -112.934 -113.297 -113.659 -114.077 -114.616 -115.24 -116.886 -3 ,16295 ,KEBNE ,16708902,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:48:52 CET,0.0 1.327 1.759 2.083 2.329 2.515 2.664 2.797 3.008 3.098 3.185 3.281 3.357 3.392 3.465 3.502 3.504 3.504 3.509 3.499 3.483 3.464 3.425 3.367 3.283 3.182 3.082 2.965 2.798 2.601 2.383 2.1 1.815 1.53 1.158 0.688 0.195 -0.377 -1.033 -1.785 -2.659 -3.738 -5.073 -6.54 -8.464 -10.851 -13.919 -17.775 -22.932 -30.121 -40.72 -51.814 -60.005 -66.342 -71.372 -75.559 -78.988 -81.951 -84.382 -86.685 -88.604 -90.265 -91.827 -93.262 -94.533 -95.675 -96.844 -97.864 -98.732 -99.611 -100.514 -101.252 -101.996 -102.753 -103.334 -103.912 -104.483 -105.077 -105.69 -106.106 -106.521 -107.145 -107.578 -108.028 -108.263 -108.753 -109.256 -109.767 -110.022 -110.433 -110.811 -111.092 -111.393 -112.001 -112.314 -112.66 -113.028 -113.439 -113.903 -114.501 -115.964 -4 ,9625 ,KEBNE ,16708903,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:49:08 CET,0.0 1.475 1.935 2.189 2.406 2.605 2.755 2.874 3.063 3.158 3.248 3.336 3.415 3.458 3.546 3.588 3.595 3.604 3.629 3.627 3.576 3.537 3.508 3.45 3.366 3.266 3.163 3.058 2.899 2.727 2.537 2.29 2.033 1.75 1.379 0.914 0.444 -0.127 -0.798 -1.575 -2.437 -3.487 -4.897 -6.43 -8.343 -10.706 -13.776 -17.661 -22.824 -30.025 -40.63 -51.755 -59.965 -66.316 -71.421 -75.75 -79.282 -82.218 -84.625 -86.993 -88.987 -90.688 -92.256 -93.683 -94.95 -96.098 -97.291 -98.328 -99.202 -100.075 -100.933 -101.642 -102.373 -103.129 -103.716 -104.312 -104.922 -105.544 -106.172 -106.593 -107.01 -107.643 -108.088 -108.545 -108.772 -109.234 -109.725 -110.223 -110.475 -110.896 -111.292 -111.578 -111.874 -112.516 -112.86 -113.225 -113.603 -114.018 -114.529 -115.153 -116.946 -5 ,882 ,KEBNE ,16708904,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:48:15 CET,0.0 1.486 1.92 2.25 2.494 2.674 2.815 2.932 3.118 3.201 3.274 3.367 3.451 3.493 3.568 3.614 3.651 3.668 3.686 3.676 3.651 3.625 3.579 3.502 3.431 3.351 3.254 3.146 2.981 2.802 2.605 2.365 2.123 1.848 1.483 1.063 0.632 0.067 -0.585 -1.306 -2.153 -3.213 -4.548 -6.025 -7.958 -10.359 -13.418 -17.332 -22.575 -29.731 -40.325 -51.388 -59.623 -66.138 -71.223 -75.391 -78.83 -81.799 -84.254 -86.59 -88.515 -90.174 -91.745 -93.194 -94.469 -95.578 -96.706 -97.704 -98.568 -99.449 -100.337 -101.064 -101.806 -102.573 -103.161 -103.745 -104.339 -104.945 -105.57 -106.001 -106.437 -107.095 -107.544 -107.996 -108.226 -108.704 -109.197 -109.711 -109.971 -110.392 -110.803 -111.094 -111.376 -111.999 -112.343 -112.694 -113.066 -113.483 -113.971 -114.623 -116.08 -6 ,32563 ,KEBNE ,16708905,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:48:21 CET,0.0 1.417 1.875 2.167 2.387 2.571 2.724 2.859 3.057 3.12 3.181 3.266 3.352 3.388 3.442 3.471 3.477 3.48 3.493 3.488 3.452 3.427 3.385 3.293 3.21 3.148 3.067 2.943 2.749 2.577 2.406 2.154 1.889 1.609 1.25 0.807 0.332 -0.245 -0.918 -1.716 -2.623 -3.724 -5.136 -6.677 -8.633 -11.035 -14.116 -18.014 -23.207 -30.376 -40.977 -52.087 -60.278 -66.619 -71.629 -75.819 -79.255 -82.27 -84.76 -87.108 -89.091 -90.807 -92.359 -93.777 -95.078 -96.26 -97.463 -98.491 -99.346 -100.205 -101.094 -101.828 -102.573 -103.327 -103.888 -104.454 -105.035 -105.636 -106.259 -106.677 -107.102 -107.753 -108.186 -108.634 -108.871 -109.349 -109.818 -110.305 -110.557 -110.967 -111.333 -111.613 -111.904 -112.542 -112.882 -113.243 -113.634 -114.029 -114.494 -115.164 -116.832 -7 ,6631 ,KEBNE ,16708906,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:46:43 CET,0.0 1.427 1.899 2.236 2.481 2.667 2.825 2.971 3.198 3.293 3.368 3.454 3.536 3.584 3.67 3.721 3.765 3.782 3.795 3.801 3.766 3.717 3.679 3.629 3.56 3.473 3.369 3.251 3.1 2.941 2.743 2.461 2.144 1.821 1.463 1.026 0.537 -0.026 -0.661 -1.415 -2.3 -3.373 -4.726 -6.22 -8.135 -10.505 -13.583 -17.559 -22.824 -29.96 -40.448 -51.459 -59.577 -65.92 -70.984 -75.213 -78.714 -81.694 -84.126 -86.46 -88.417 -90.099 -91.665 -93.121 -94.421 -95.553 -96.693 -97.67 -98.493 -99.369 -100.293 -101.043 -101.792 -102.544 -103.114 -103.678 -104.263 -104.869 -105.457 -105.87 -106.31 -106.959 -107.398 -107.843 -108.073 -108.554 -109.033 -109.526 -109.776 -110.185 -110.579 -110.87 -111.168 -111.77 -112.088 -112.446 -112.841 -113.245 -113.705 -114.287 -116.13 -8 ,26716 ,KEBNE ,16708907,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:49:33 CET,0.0 1.658 2.098 2.418 2.651 2.841 2.998 3.123 3.367 3.459 3.525 3.594 3.659 3.683 3.754 3.8 3.814 3.828 3.843 3.834 3.811 3.795 3.776 3.739 3.679 3.585 3.478 3.367 3.189 3.006 2.833 2.573 2.289 1.998 1.638 1.2 0.729 0.161 -0.475 -1.173 -1.949 -2.953 -4.318 -5.814 -7.738 -10.111 -13.149 -17.047 -22.289 -29.523 -40.232 -51.388 -59.545 -65.856 -70.876 -75.074 -78.509 -81.481 -83.973 -86.34 -88.267 -89.923 -91.486 -92.925 -94.206 -95.347 -96.528 -97.57 -98.454 -99.337 -100.235 -100.979 -101.708 -102.423 -102.991 -103.578 -104.172 -104.76 -105.349 -105.756 -106.182 -106.847 -107.29 -107.745 -107.979 -108.447 -108.922 -109.423 -109.686 -110.111 -110.492 -110.769 -111.069 -111.696 -112.018 -112.358 -112.728 -113.138 -113.615 -114.241 -115.949 -9 ,9955 ,KEBNE ,16708908,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:48:13 CET,0.0 1.769 2.189 2.499 2.762 2.953 3.084 3.215 3.429 3.513 3.588 3.675 3.755 3.798 3.869 3.92 3.94 3.945 3.959 3.954 3.925 3.899 3.87 3.819 3.744 3.657 3.552 3.436 3.287 3.112 2.924 2.656 2.358 2.044 1.647 1.186 0.707 0.138 -0.548 -1.344 -2.213 -3.259 -4.598 -6.097 -8.015 -10.361 -13.398 -17.265 -22.439 -29.622 -40.248 -51.388 -59.629 -66.097 -71.23 -75.469 -78.941 -81.973 -84.471 -86.785 -88.688 -90.343 -91.882 -93.294 -94.581 -95.731 -96.899 -97.911 -98.762 -99.612 -100.47 -101.184 -101.919 -102.678 -103.265 -103.865 -104.467 -105.077 -105.703 -106.109 -106.513 -107.156 -107.605 -108.054 -108.28 -108.739 -109.217 -109.728 -109.998 -110.424 -110.83 -111.122 -111.419 -112.047 -112.379 -112.739 -113.135 -113.543 -114.016 -114.64 -116.375 -10 ,28957 ,KEBNE ,16708909,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:48:07 CET,0.0 2.665 3.12 3.415 3.644 3.831 3.978 4.103 4.322 4.415 4.484 4.565 4.654 4.697 4.753 4.797 4.838 4.857 4.884 4.874 4.833 4.805 4.776 4.737 4.661 4.558 4.446 4.311 4.122 3.91 3.685 3.398 3.101 2.822 2.491 2.057 1.593 1.04 0.401 -0.337 -1.227 -2.309 -3.65 -5.152 -7.086 -9.45 -12.518 -16.423 -21.612 -28.787 -39.363 -50.404 -58.542 -64.854 -69.922 -74.228 -77.743 -80.763 -83.294 -85.692 -87.647 -89.339 -90.906 -92.339 -93.622 -94.753 -95.943 -96.983 -97.854 -98.753 -99.638 -100.338 -101.062 -101.811 -102.382 -102.967 -103.571 -104.171 -104.758 -105.158 -105.578 -106.235 -106.676 -107.121 -107.352 -107.824 -108.306 -108.803 -109.062 -109.485 -109.863 -110.143 -110.449 -111.107 -111.447 -111.801 -112.178 -112.598 -113.091 -113.731 -115.771 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_42_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_42_35.txt deleted file mode 100644 index 693f49d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_42_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27546 ,KEBNE ,16708910,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:46:34 CET,0.0 1.752 2.242 2.606 2.95 3.239 3.473 3.692 4.076 4.242 4.407 4.688 4.874 5.016 5.27 5.496 5.72 5.822 6.01 6.201 6.467 6.637 6.795 7.007 7.211 7.412 7.597 7.765 7.987 8.225 8.448 8.695 8.952 9.188 9.426 9.686 9.933 10.204 10.483 10.766 11.093 11.456 11.791 12.07 12.357 12.641 12.919 13.179 13.324 13.232 12.777 11.829 10.859 9.966 9.133 8.376 7.721 7.108 6.542 5.951 5.458 5.018 4.583 4.191 3.802 3.403 2.991 2.657 2.375 2.055 1.71 1.419 1.11 0.793 0.548 0.299 0.062 -0.188 -0.466 -0.653 -0.847 -1.143 -1.343 -1.545 -1.661 -1.916 -2.167 -2.433 -2.576 -2.772 -3.063 -3.237 -3.423 -3.832 -4.046 -4.277 -4.536 -4.84 -5.201 -5.672 -7.212 -2 ,25647 ,KEBNE ,16708911,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:47:49 CET,0.0 1.839 2.354 2.723 3.03 3.272 3.508 3.738 4.115 4.283 4.459 4.74 4.909 5.038 5.275 5.485 5.682 5.782 5.976 6.169 6.442 6.601 6.759 6.994 7.203 7.401 7.597 7.802 8.06 8.274 8.469 8.691 8.885 9.091 9.356 9.619 9.845 10.083 10.329 10.608 10.89 11.188 11.498 11.793 12.094 12.363 12.661 12.931 13.098 13.068 12.622 11.706 10.692 9.725 8.86 8.122 7.476 6.87 6.351 5.785 5.287 4.853 4.391 3.923 3.52 3.173 2.784 2.407 2.092 1.775 1.446 1.169 0.891 0.616 0.384 0.128 -0.125 -0.398 -0.691 -0.882 -1.077 -1.387 -1.61 -1.847 -1.968 -2.208 -2.471 -2.757 -2.902 -3.088 -3.381 -3.554 -3.746 -4.174 -4.403 -4.656 -4.925 -5.221 -5.567 -6.022 -7.518 -3 ,4265 ,KEBNE ,16708912,Fri Nov 26 20:16:12 CET,Fri Nov 26 21:46:38 CET,0.0 1.513 1.966 2.345 2.663 2.915 3.15 3.35 3.68 3.851 4.01 4.263 4.44 4.572 4.816 5.038 5.253 5.359 5.56 5.752 6.023 6.195 6.364 6.606 6.82 7.003 7.2 7.397 7.649 7.884 8.09 8.351 8.588 8.794 9.037 9.318 9.555 9.792 10.039 10.312 10.626 10.933 11.24 11.53 11.856 12.181 12.46 12.688 12.834 12.797 12.282 11.279 10.245 9.281 8.435 7.67 6.995 6.364 5.805 5.181 4.582 4.035 3.514 3.058 2.675 2.325 1.961 1.624 1.321 1.003 0.665 0.392 0.106 -0.207 -0.442 -0.678 -0.924 -1.17 -1.434 -1.616 -1.807 -2.121 -2.345 -2.573 -2.69 -2.931 -3.178 -3.442 -3.582 -3.77 -4.055 -4.225 -4.407 -4.82 -5.044 -5.288 -5.585 -5.935 -6.306 -6.797 -8.584 -4 ,5258 ,KEBNE ,16708913,Fri Nov 26 20:16:11 CET,Fri Nov 26 21:47:59 CET,0.0 1.739 2.226 2.573 2.883 3.146 3.387 3.601 3.962 4.135 4.301 4.572 4.746 4.877 5.116 5.339 5.552 5.658 5.873 6.063 6.331 6.518 6.694 6.947 7.177 7.381 7.568 7.756 7.998 8.212 8.4 8.638 8.878 9.08 9.322 9.583 9.81 10.056 10.321 10.596 10.854 11.148 11.475 11.743 12.049 12.373 12.638 12.862 13.058 13.007 12.489 11.592 10.653 9.75 8.885 8.056 7.347 6.707 6.158 5.603 5.103 4.652 4.233 3.837 3.444 3.061 2.663 2.325 2.012 1.696 1.367 1.1 0.84 0.546 0.311 0.068 -0.182 -0.447 -0.726 -0.915 -1.117 -1.437 -1.667 -1.905 -2.021 -2.274 -2.556 -2.854 -3.009 -3.212 -3.488 -3.656 -3.842 -4.246 -4.462 -4.694 -4.963 -5.272 -5.64 -6.142 -8.219 -5 ,25745 ,KEBNE ,16708914,Fri Nov 26 20:16:11 CET,Fri Nov 26 21:46:48 CET,0.0 1.666 2.175 2.552 2.87 3.142 3.362 3.571 3.979 4.156 4.309 4.551 4.723 4.857 5.104 5.329 5.544 5.642 5.827 6.014 6.274 6.441 6.608 6.846 7.07 7.282 7.476 7.646 7.879 8.115 8.331 8.581 8.819 9.075 9.368 9.67 9.964 10.273 10.556 10.84 11.108 11.372 11.672 11.936 12.214 12.483 12.737 12.96 13.101 13.017 12.496 11.536 10.561 9.635 8.805 8.014 7.275 6.609 6.031 5.485 5.028 4.584 4.145 3.74 3.341 2.977 2.616 2.286 1.995 1.674 1.336 1.067 0.772 0.45 0.217 -0.011 -0.25 -0.507 -0.781 -0.959 -1.135 -1.418 -1.633 -1.877 -1.993 -2.214 -2.472 -2.745 -2.884 -3.071 -3.337 -3.498 -3.671 -4.05 -4.243 -4.47 -4.742 -5.066 -5.429 -5.897 -7.378 -6 ,19361 ,KEBNE ,16708915,Fri Nov 26 20:16:11 CET,Fri Nov 26 21:46:46 CET,0.0 1.738 2.216 2.567 2.86 3.116 3.348 3.554 3.921 4.087 4.253 4.524 4.69 4.809 5.04 5.268 5.493 5.598 5.781 5.968 6.254 6.419 6.578 6.807 7.024 7.244 7.454 7.636 7.878 8.119 8.347 8.644 8.901 9.136 9.418 9.706 9.973 10.262 10.546 10.822 11.097 11.397 11.724 12.007 12.291 12.558 12.827 13.082 13.226 13.157 12.656 11.667 10.688 9.802 8.968 8.17 7.445 6.786 6.225 5.649 5.159 4.703 4.217 3.797 3.444 3.091 2.719 2.385 2.099 1.8 1.463 1.173 0.897 0.611 0.375 0.135 -0.119 -0.38 -0.654 -0.844 -1.042 -1.359 -1.58 -1.811 -1.926 -2.148 -2.397 -2.684 -2.832 -3.015 -3.258 -3.414 -3.59 -3.969 -4.171 -4.41 -4.672 -4.956 -5.282 -5.756 -7.404 -7 ,24519 ,KEBNE ,16708916,Fri Nov 26 20:17:13 CET,Fri Nov 26 21:47:44 CET,0.0 2.089 2.629 2.991 3.304 3.562 3.792 4.009 4.387 4.568 4.729 4.975 5.152 5.291 5.547 5.795 6.013 6.119 6.339 6.539 6.823 7.0 7.159 7.389 7.624 7.846 8.049 8.237 8.47 8.697 8.904 9.136 9.374 9.621 9.891 10.176 10.432 10.673 10.904 11.151 11.421 11.694 11.98 12.256 12.537 12.839 13.14 13.37 13.508 13.477 13.018 12.095 11.132 10.204 9.347 8.566 7.844 7.115 6.5 5.903 5.403 4.96 4.532 4.122 3.718 3.329 2.912 2.54 2.215 1.906 1.603 1.33 1.028 0.718 0.48 0.227 -0.024 -0.276 -0.555 -0.745 -0.931 -1.235 -1.454 -1.691 -1.804 -2.028 -2.284 -2.562 -2.709 -2.9 -3.165 -3.327 -3.5 -3.896 -4.115 -4.347 -4.612 -4.913 -5.286 -5.872 -7.847 -8 ,15096 ,KEBNE ,16708917,Fri Nov 26 20:17:13 CET,Fri Nov 26 21:47:41 CET,0.0 1.803 2.306 2.662 2.967 3.239 3.456 3.661 4.03 4.192 4.345 4.597 4.764 4.895 5.147 5.373 5.576 5.667 5.854 6.039 6.302 6.467 6.622 6.849 7.063 7.282 7.493 7.68 7.923 8.151 8.369 8.634 8.878 9.113 9.388 9.653 9.888 10.139 10.422 10.763 11.105 11.471 11.897 12.268 12.58 12.868 13.158 13.386 13.513 13.416 12.922 11.964 10.942 10.016 9.175 8.39 7.647 6.954 6.355 5.763 5.228 4.697 4.188 3.732 3.325 2.982 2.628 2.301 1.992 1.648 1.287 0.999 0.702 0.399 0.172 -0.075 -0.325 -0.583 -0.847 -1.022 -1.202 -1.48 -1.695 -1.927 -2.045 -2.287 -2.54 -2.803 -2.942 -3.136 -3.422 -3.589 -3.773 -4.195 -4.422 -4.661 -4.941 -5.263 -5.63 -6.137 -8.01 -9 ,4662 ,KEBNE ,16708918,Fri Nov 26 20:17:12 CET,Fri Nov 26 21:47:39 CET,0.0 2.107 2.579 2.914 3.21 3.494 3.747 3.975 4.373 4.541 4.7 4.946 5.107 5.232 5.472 5.704 5.925 6.032 6.221 6.402 6.675 6.851 7.022 7.273 7.483 7.671 7.865 8.049 8.286 8.515 8.734 8.987 9.204 9.4 9.653 9.921 10.142 10.39 10.652 10.927 11.223 11.524 11.832 12.106 12.378 12.627 12.852 13.082 13.234 13.132 12.572 11.496 10.452 9.538 8.694 7.916 7.209 6.568 5.99 5.398 4.908 4.412 3.935 3.533 3.16 2.825 2.474 2.141 1.861 1.563 1.259 1.02 0.753 0.457 0.219 -0.03 -0.279 -0.525 -0.797 -0.997 -1.2 -1.508 -1.726 -1.952 -2.065 -2.303 -2.552 -2.8 -2.938 -3.131 -3.402 -3.558 -3.717 -4.092 -4.298 -4.525 -4.791 -5.086 -5.409 -5.861 -7.635 -10 ,3554 ,KEBNE ,16708919,Fri Nov 26 20:18:14 CET,Fri Nov 26 21:48:46 CET,0.0 1.684 2.182 2.543 2.858 3.112 3.342 3.561 3.948 4.117 4.272 4.521 4.686 4.82 5.074 5.299 5.52 5.629 5.833 6.027 6.283 6.444 6.594 6.82 7.032 7.232 7.448 7.637 7.877 8.11 8.309 8.546 8.78 9.014 9.278 9.551 9.831 10.15 10.452 10.756 11.08 11.387 11.685 11.966 12.251 12.514 12.741 12.929 13.052 12.983 12.46 11.406 10.426 9.554 8.739 8.007 7.348 6.715 6.167 5.552 5.03 4.603 4.182 3.778 3.408 3.075 2.707 2.358 2.034 1.708 1.371 1.065 0.758 0.48 0.263 0.017 -0.237 -0.506 -0.806 -1.007 -1.202 -1.512 -1.729 -1.957 -2.072 -2.299 -2.56 -2.852 -2.997 -3.183 -3.452 -3.613 -3.79 -4.209 -4.429 -4.662 -4.924 -5.215 -5.559 -6.064 -7.818 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_42_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_42_41.txt deleted file mode 100644 index fdd4975b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_42_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15303 ,KEBNE ,16708920,Fri Nov 26 20:18:14 CET,Fri Nov 26 21:48:28 CET,0.0 1.522 1.946 2.264 2.544 2.799 3.034 3.248 3.62 3.795 3.956 4.214 4.389 4.52 4.758 4.968 5.18 5.286 5.48 5.656 5.912 6.085 6.26 6.505 6.731 6.951 7.155 7.35 7.601 7.826 8.023 8.276 8.541 8.781 9.049 9.34 9.601 9.866 10.138 10.433 10.743 11.059 11.4 11.738 12.121 12.524 12.884 13.195 13.485 13.685 13.606 13.077 12.416 11.799 11.202 10.597 10.063 9.571 9.125 8.676 8.288 7.923 7.563 7.234 6.91 6.611 6.327 6.023 5.721 5.441 5.177 4.959 4.724 4.462 4.259 4.048 3.831 3.599 3.337 3.166 2.993 2.707 2.512 2.302 2.197 1.979 1.727 1.448 1.306 1.121 0.831 0.662 0.492 0.142 -0.073 -0.321 -0.58 -0.872 -1.246 -1.757 -3.661 -2 ,14528 ,KEBNE ,16708921,Fri Nov 26 20:18:14 CET,Fri Nov 26 21:48:32 CET,0.0 1.544 2.033 2.341 2.586 2.819 3.044 3.237 3.572 3.73 3.895 4.169 4.341 4.476 4.719 4.933 5.152 5.259 5.468 5.654 5.889 6.045 6.192 6.408 6.62 6.827 7.048 7.245 7.484 7.727 7.949 8.187 8.399 8.62 8.892 9.191 9.457 9.73 10.03 10.326 10.592 10.888 11.215 11.521 11.888 12.28 12.689 13.073 13.38 13.544 13.401 12.849 12.202 11.543 10.937 10.37 9.817 9.318 8.889 8.428 8.03 7.655 7.284 6.932 6.593 6.282 5.964 5.66 5.404 5.122 4.784 4.538 4.298 4.01 3.768 3.528 3.29 3.027 2.751 2.572 2.395 2.115 1.921 1.712 1.592 1.348 1.097 0.813 0.667 0.486 0.216 0.049 -0.134 -0.531 -0.741 -0.97 -1.237 -1.548 -1.907 -2.387 -3.886 -3 ,333 ,KEBNE ,16708922,Fri Nov 26 20:18:14 CET,Fri Nov 26 21:49:18 CET,0.0 1.677 2.166 2.532 2.818 3.076 3.324 3.537 3.878 4.03 4.185 4.446 4.615 4.743 4.967 5.172 5.38 5.479 5.669 5.85 6.123 6.295 6.45 6.667 6.875 7.075 7.271 7.456 7.691 7.934 8.165 8.451 8.724 8.974 9.251 9.539 9.817 10.144 10.49 10.778 11.036 11.341 11.701 12.03 12.391 12.768 13.172 13.523 13.795 13.998 13.95 13.437 12.775 12.097 11.462 10.877 10.354 9.858 9.41 8.896 8.439 8.06 7.71 7.377 7.066 6.77 6.432 6.109 5.826 5.529 5.223 4.963 4.695 4.425 4.195 3.959 3.708 3.443 3.17 2.977 2.792 2.505 2.3 2.086 1.972 1.733 1.496 1.26 1.132 0.95 0.67 0.517 0.344 -0.054 -0.27 -0.535 -0.832 -1.12 -1.445 -1.899 -3.29 -4 ,29371 ,KEBNE ,16708923,Fri Nov 26 20:18:14 CET,Fri Nov 26 21:49:19 CET,0.0 1.418 1.838 2.157 2.421 2.67 2.908 3.1 3.426 3.586 3.745 4.016 4.189 4.317 4.546 4.751 4.946 5.04 5.23 5.418 5.691 5.861 6.021 6.247 6.467 6.665 6.86 7.054 7.28 7.477 7.685 7.962 8.209 8.429 8.676 8.943 9.199 9.473 9.722 9.982 10.257 10.565 10.926 11.264 11.623 11.982 12.355 12.729 13.035 13.194 13.064 12.514 11.849 11.221 10.603 10.015 9.513 9.045 8.62 8.151 7.731 7.351 6.986 6.59 6.17 5.792 5.426 5.122 4.874 4.623 4.328 4.075 3.822 3.538 3.309 3.077 2.843 2.615 2.375 2.202 2.024 1.756 1.563 1.365 1.257 1.016 0.774 0.519 0.378 0.19 -0.075 -0.227 -0.389 -0.775 -0.998 -1.251 -1.522 -1.809 -2.183 -2.675 -4.474 -5 ,4131 ,KEBNE ,16708924,Fri Nov 26 20:19:15 CET,Fri Nov 26 21:50:45 CET,0.0 1.306 1.781 2.097 2.358 2.586 2.794 2.99 3.359 3.526 3.689 3.977 4.147 4.27 4.516 4.752 4.966 5.067 5.264 5.451 5.726 5.904 6.066 6.282 6.489 6.7 6.893 7.08 7.326 7.561 7.79 8.041 8.265 8.497 8.774 9.058 9.311 9.608 9.964 10.283 10.585 10.949 11.346 11.7 12.067 12.454 12.831 13.169 13.483 13.69 13.595 13.12 12.521 11.875 11.25 10.648 10.118 9.625 9.177 8.728 8.358 8.016 7.671 7.336 7.011 6.684 6.362 6.066 5.794 5.519 5.192 4.917 4.663 4.421 4.235 4.032 3.789 3.539 3.287 3.104 2.917 2.635 2.445 2.238 2.125 1.891 1.643 1.367 1.223 1.038 0.765 0.606 0.434 0.048 -0.17 -0.392 -0.638 -0.921 -1.274 -1.749 -3.463 -6 ,29140 ,KEBNE ,16708925,Fri Nov 26 20:19:16 CET,Fri Nov 26 21:52:16 CET,0.0 1.383 1.877 2.223 2.489 2.734 2.977 3.193 3.549 3.715 3.868 4.102 4.263 4.388 4.628 4.858 5.086 5.202 5.4 5.573 5.84 6.011 6.168 6.391 6.615 6.835 7.038 7.224 7.466 7.697 7.9 8.157 8.424 8.66 8.909 9.17 9.404 9.667 9.958 10.237 10.537 10.887 11.241 11.568 11.932 12.316 12.685 13.006 13.307 13.538 13.449 12.91 12.306 11.686 11.051 10.457 9.944 9.426 8.969 8.536 8.116 7.725 7.371 7.039 6.711 6.412 6.086 5.789 5.543 5.274 4.963 4.706 4.47 4.228 4.038 3.81 3.561 3.32 3.083 2.914 2.73 2.445 2.251 2.042 1.926 1.698 1.462 1.196 1.055 0.873 0.599 0.443 0.286 -0.071 -0.29 -0.542 -0.811 -1.123 -1.511 -1.998 -3.331 -7 ,28245 ,KEBNE ,16708926,Fri Nov 26 20:20:17 CET,Fri Nov 26 21:54:02 CET,0.0 1.36 1.825 2.194 2.495 2.724 2.936 3.134 3.508 3.691 3.855 4.105 4.266 4.389 4.638 4.869 5.088 5.193 5.397 5.604 5.893 6.058 6.214 6.447 6.66 6.847 7.049 7.252 7.495 7.73 7.948 8.208 8.467 8.709 8.97 9.259 9.522 9.792 10.086 10.374 10.648 10.942 11.31 11.66 11.978 12.317 12.659 13.015 13.355 13.548 13.47 12.92 12.254 11.606 10.993 10.381 9.79 9.26 8.774 8.269 7.856 7.482 7.115 6.758 6.42 6.121 5.826 5.542 5.264 4.959 4.655 4.421 4.161 3.897 3.696 3.464 3.227 3.0 2.765 2.602 2.428 2.125 1.91 1.695 1.582 1.341 1.092 0.818 0.673 0.485 0.199 0.035 -0.151 -0.528 -0.727 -0.957 -1.206 -1.488 -1.833 -2.299 -3.854 -8 ,15573 ,KEBNE ,16708927,Fri Nov 26 20:20:17 CET,Fri Nov 26 21:53:52 CET,0.0 1.088 1.556 1.909 2.193 2.437 2.663 2.873 3.231 3.387 3.538 3.797 3.967 4.091 4.323 4.559 4.787 4.893 5.096 5.293 5.556 5.722 5.88 6.101 6.316 6.511 6.693 6.882 7.116 7.326 7.55 7.838 8.087 8.294 8.527 8.789 9.048 9.354 9.726 10.116 10.474 10.833 11.188 11.491 11.828 12.172 12.513 12.861 13.166 13.322 13.178 12.662 12.049 11.393 10.732 10.053 9.462 8.962 8.527 8.094 7.709 7.345 6.988 6.628 6.294 5.998 5.671 5.351 5.067 4.793 4.526 4.283 3.999 3.714 3.514 3.306 3.066 2.836 2.61 2.429 2.228 1.918 1.716 1.518 1.413 1.186 0.933 0.673 0.544 0.363 0.082 -0.09 -0.28 -0.724 -0.974 -1.224 -1.478 -1.781 -2.152 -2.63 -4.1 -9 ,26031 ,KEBNE ,16708928,Fri Nov 26 20:20:17 CET,Fri Nov 26 21:53:57 CET,0.0 1.686 2.156 2.507 2.773 3.007 3.223 3.409 3.738 3.898 4.047 4.295 4.471 4.614 4.878 5.107 5.306 5.4 5.595 5.768 6.028 6.213 6.392 6.636 6.853 7.062 7.255 7.422 7.64 7.856 8.065 8.332 8.588 8.816 9.056 9.328 9.615 9.907 10.2 10.509 10.819 11.146 11.5 11.837 12.214 12.608 12.992 13.365 13.678 13.876 13.815 13.322 12.736 12.103 11.478 10.878 10.353 9.882 9.431 8.948 8.531 8.119 7.72 7.371 7.035 6.718 6.404 6.135 5.882 5.599 5.312 5.062 4.787 4.509 4.286 4.056 3.826 3.577 3.312 3.129 2.941 2.642 2.427 2.206 2.095 1.854 1.602 1.346 1.213 1.026 0.745 0.573 0.389 -0.003 -0.208 -0.423 -0.683 -0.983 -1.326 -1.809 -3.443 -10 ,5237 ,KEBNE ,16708929,Fri Nov 26 20:20:16 CET,Fri Nov 26 21:51:50 CET,0.0 1.765 2.236 2.559 2.81 3.04 3.265 3.479 3.853 4.021 4.175 4.406 4.557 4.673 4.905 5.125 5.341 5.434 5.604 5.792 6.074 6.251 6.421 6.663 6.9 7.125 7.326 7.514 7.763 8.003 8.212 8.454 8.703 8.93 9.189 9.502 9.78 10.068 10.374 10.669 10.963 11.276 11.594 11.921 12.295 12.652 13.025 13.384 13.715 13.921 13.776 13.245 12.656 12.029 11.404 10.817 10.286 9.767 9.279 8.798 8.398 7.976 7.517 7.094 6.701 6.36 6.004 5.67 5.393 5.101 4.784 4.517 4.255 3.978 3.745 3.518 3.292 3.043 2.777 2.613 2.452 2.17 1.959 1.734 1.622 1.398 1.158 0.904 0.768 0.586 0.305 0.151 -0.013 -0.398 -0.622 -0.86 -1.096 -1.375 -1.761 -2.276 -3.882 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_42_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_42_43.txt deleted file mode 100644 index 1585a1dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_42_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32088 ,KEBNE ,16708930,Fri Nov 26 20:20:16 CET,Fri Nov 26 21:51:51 CET,0.0 0.916 1.378 1.744 2.073 2.358 2.585 2.801 3.215 3.407 3.576 3.857 4.052 4.201 4.491 4.763 5.03 5.166 5.408 5.643 5.972 6.179 6.384 6.68 6.978 7.266 7.521 7.767 8.088 8.393 8.704 9.069 9.409 9.745 10.163 10.647 11.086 11.561 12.058 12.595 13.188 13.837 14.57 15.306 16.185 17.174 18.293 19.574 21.09 22.886 25.025 26.725 27.667 28.254 28.575 28.694 28.75 28.769 28.737 28.656 28.547 28.408 28.274 28.116 27.972 27.848 27.67 27.508 27.342 27.154 26.979 26.833 26.651 26.445 26.302 26.153 25.985 25.811 25.625 25.494 25.353 25.119 24.962 24.799 24.709 24.517 24.319 24.108 23.999 23.879 23.649 23.506 23.353 23.012 22.819 22.62 22.399 22.145 21.815 21.382 19.659 -2 ,139 ,KEBNE ,16708931,Fri Nov 26 20:21:18 CET,Fri Nov 26 21:52:44 CET,0.0 1.498 1.981 2.33 2.635 2.919 3.18 3.428 3.87 4.055 4.224 4.519 4.72 4.877 5.171 5.451 5.721 5.862 6.136 6.361 6.668 6.886 7.103 7.415 7.698 7.975 8.256 8.531 8.876 9.185 9.484 9.846 10.188 10.535 10.932 11.358 11.772 12.229 12.718 13.25 13.822 14.433 15.15 15.909 16.783 17.75 18.91 20.222 21.717 23.497 25.699 27.481 28.432 28.96 29.295 29.5 29.598 29.626 29.598 29.52 29.42 29.312 29.196 29.091 28.967 28.796 28.59 28.428 28.309 28.156 27.966 27.827 27.676 27.5 27.354 27.202 27.041 26.856 26.672 26.55 26.423 26.219 26.066 25.885 25.791 25.593 25.4 25.192 25.076 24.945 24.667 24.506 24.342 23.973 23.765 23.532 23.284 22.996 22.655 22.203 20.683 -3 ,13150 ,KEBNE ,16708932,Fri Nov 26 20:21:18 CET,Fri Nov 26 21:56:30 CET,0.0 1.402 1.808 2.135 2.443 2.715 2.977 3.213 3.592 3.769 3.935 4.216 4.408 4.563 4.873 5.156 5.412 5.529 5.76 5.997 6.352 6.588 6.793 7.088 7.404 7.694 7.979 8.258 8.603 8.938 9.261 9.651 10.007 10.345 10.731 11.154 11.574 12.052 12.587 13.164 13.745 14.378 15.1 15.816 16.668 17.652 18.782 20.043 21.543 23.333 25.514 27.26 28.239 28.8 29.104 29.296 29.386 29.39 29.353 29.293 29.212 29.097 28.978 28.853 28.721 28.586 28.414 28.231 28.095 27.974 27.806 27.646 27.49 27.324 27.185 27.038 26.875 26.709 26.547 26.426 26.293 26.063 25.896 25.737 25.646 25.463 25.284 25.086 24.984 24.865 24.589 24.429 24.273 23.927 23.739 23.536 23.288 22.994 22.617 22.107 20.768 -4 ,163 ,KEBNE ,16708933,Fri Nov 26 20:26:25 CET,Fri Nov 26 21:56:38 CET,0.0 1.911 2.409 2.808 3.125 3.386 3.633 3.863 4.276 4.466 4.648 4.957 5.151 5.309 5.622 5.915 6.171 6.299 6.562 6.817 7.183 7.406 7.619 7.919 8.194 8.475 8.752 9.015 9.369 9.703 10.026 10.405 10.784 11.177 11.587 12.007 12.413 12.873 13.366 13.877 14.46 15.138 15.901 16.659 17.518 18.483 19.574 20.827 22.345 24.175 26.409 28.189 29.174 29.719 30.048 30.194 30.232 30.27 30.229 30.133 30.069 29.969 29.807 29.62 29.459 29.35 29.222 29.051 28.883 28.725 28.561 28.423 28.27 28.076 27.932 27.793 27.623 27.457 27.303 27.184 27.048 26.819 26.645 26.463 26.373 26.189 25.989 25.769 25.66 25.533 25.278 25.13 24.969 24.617 24.419 24.189 23.954 23.688 23.369 22.979 21.948 -5 ,17793 ,KEBNE ,16708934,Fri Nov 26 20:26:24 CET,Fri Nov 26 21:56:33 CET,0.0 1.064 1.502 1.839 2.135 2.388 2.609 2.823 3.22 3.408 3.589 3.892 4.095 4.262 4.563 4.845 5.111 5.239 5.477 5.698 6.02 6.222 6.421 6.725 7.022 7.31 7.6 7.878 8.236 8.578 8.873 9.218 9.573 9.914 10.295 10.736 11.182 11.676 12.193 12.73 13.301 13.933 14.674 15.422 16.294 17.297 18.442 19.733 21.269 23.072 25.244 26.999 27.947 28.474 28.805 29.016 29.1 29.064 29.009 28.966 28.891 28.797 28.649 28.464 28.301 28.16 28.014 27.867 27.731 27.59 27.438 27.293 27.122 26.942 26.793 26.645 26.504 26.348 26.156 26.024 25.895 25.664 25.493 25.318 25.233 25.067 24.875 24.654 24.543 24.412 24.173 24.033 23.891 23.589 23.401 23.194 22.974 22.708 22.344 21.823 20.337 -6 ,16300 ,KEBNE ,16708935,Fri Nov 26 20:26:25 CET,Fri Nov 26 21:57:01 CET,0.0 1.184 1.723 2.126 2.43 2.691 2.916 3.122 3.515 3.701 3.877 4.165 4.35 4.496 4.76 4.999 5.233 5.345 5.569 5.794 6.123 6.336 6.535 6.83 7.114 7.382 7.654 7.924 8.257 8.586 8.921 9.325 9.678 10.002 10.402 10.86 11.294 11.767 12.305 12.869 13.449 14.09 14.815 15.564 16.442 17.451 18.62 19.891 21.37 23.1 25.242 27.087 28.126 28.708 29.04 29.231 29.306 29.337 29.322 29.232 29.115 29.004 28.885 28.725 28.536 28.389 28.243 28.09 27.958 27.805 27.641 27.512 27.37 27.205 27.057 26.899 26.719 26.522 26.313 26.163 26.017 25.762 25.582 25.403 25.314 25.136 24.932 24.707 24.584 24.449 24.223 24.103 23.973 23.674 23.512 23.322 23.086 22.816 22.51 22.117 20.957 -7 ,18707 ,KEBNE ,16708936,Fri Nov 26 20:26:24 CET,Fri Nov 26 21:56:46 CET,0.0 1.42 1.873 2.266 2.605 2.878 3.119 3.331 3.724 3.916 4.102 4.401 4.583 4.728 5.013 5.283 5.544 5.678 5.937 6.173 6.5 6.717 6.932 7.23 7.515 7.802 8.083 8.338 8.665 8.978 9.281 9.677 10.063 10.415 10.8 11.229 11.649 12.104 12.575 13.107 13.703 14.347 15.12 15.912 16.794 17.766 18.894 20.199 21.768 23.611 25.812 27.58 28.535 29.115 29.476 29.672 29.766 29.792 29.758 29.699 29.628 29.547 29.465 29.369 29.273 29.167 28.997 28.839 28.716 28.58 28.433 28.302 28.153 27.998 27.864 27.71 27.558 27.384 27.191 27.059 26.907 26.659 26.514 26.362 26.275 26.088 25.87 25.654 25.541 25.404 25.164 25.029 24.889 24.571 24.387 24.188 23.965 23.718 23.416 23.007 21.91 -8 ,24625 ,KEBNE ,16708937,Fri Nov 26 20:26:25 CET,Fri Nov 26 21:56:53 CET,0.0 1.41 1.911 2.33 2.657 2.915 3.171 3.409 3.802 3.981 4.16 4.456 4.64 4.784 5.072 5.36 5.621 5.738 5.981 6.224 6.55 6.766 6.973 7.259 7.531 7.789 8.064 8.328 8.66 8.986 9.297 9.684 10.052 10.419 10.878 11.372 11.788 12.268 12.812 13.347 13.913 14.579 15.35 16.095 16.949 17.922 19.063 20.378 21.969 23.813 25.998 27.76 28.722 29.295 29.601 29.8 29.902 29.929 29.932 29.905 29.854 29.773 29.662 29.549 29.42 29.24 29.025 28.846 28.689 28.501 28.304 28.168 28.029 27.847 27.701 27.557 27.399 27.25 27.101 26.981 26.837 26.623 26.478 26.312 26.227 26.039 25.849 25.65 25.535 25.402 25.176 25.045 24.899 24.603 24.442 24.248 24.028 23.751 23.402 22.983 22.002 -9 ,14707 ,KEBNE ,16708938,Fri Nov 26 20:26:25 CET,Fri Nov 26 21:57:50 CET,0.0 1.609 2.12 2.532 2.873 3.153 3.405 3.626 4.027 4.216 4.39 4.693 4.886 5.037 5.334 5.609 5.867 5.993 6.242 6.487 6.842 7.068 7.284 7.607 7.91 8.193 8.462 8.726 9.063 9.394 9.734 10.124 10.507 10.864 11.257 11.727 12.156 12.627 13.137 13.667 14.289 14.993 15.746 16.494 17.351 18.318 19.458 20.717 22.211 23.981 26.108 27.852 28.761 29.26 29.565 29.742 29.837 29.857 29.814 29.739 29.672 29.584 29.474 29.329 29.161 29.021 28.886 28.749 28.592 28.398 28.213 28.066 27.896 27.699 27.548 27.402 27.248 27.065 26.863 26.734 26.615 26.43 26.281 26.111 26.026 25.84 25.639 25.421 25.299 25.166 24.914 24.774 24.613 24.248 24.062 23.855 23.626 23.355 22.993 22.483 20.806 -10 ,21613 ,KEBNE ,16708939,Fri Nov 26 20:26:28 CET,Fri Nov 26 21:52:27 CET,0.0 1.333 1.808 2.163 2.472 2.735 2.965 3.176 3.554 3.726 3.899 4.214 4.41 4.557 4.835 5.118 5.408 5.535 5.767 5.994 6.329 6.541 6.747 7.036 7.297 7.573 7.839 8.084 8.427 8.789 9.133 9.56 9.962 10.311 10.712 11.167 11.597 12.067 12.573 13.114 13.691 14.354 15.101 15.805 16.658 17.641 18.766 20.057 21.558 23.306 25.429 27.137 28.117 28.722 29.043 29.22 29.333 29.372 29.375 29.333 29.228 29.142 29.046 28.889 28.732 28.613 28.455 28.305 28.175 27.997 27.812 27.671 27.526 27.362 27.218 27.065 26.885 26.699 26.516 26.388 26.263 26.071 25.922 25.755 25.668 25.483 25.287 25.084 24.977 24.845 24.604 24.473 24.337 24.015 23.813 23.602 23.378 23.114 22.793 22.35 21.293 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_43_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_43_31.txt deleted file mode 100644 index 327cff24..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_43_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12764 ,KEBNE ,16708940,Fri Nov 26 20:26:25 CET,Fri Nov 26 21:56:47 CET,0.0 1.155 1.542 1.816 2.031 2.222 2.4 2.564 2.856 2.985 3.102 3.3 3.41 3.51 3.695 3.866 4.026 4.096 4.225 4.35 4.535 4.651 4.754 4.897 5.026 5.142 5.246 5.352 5.492 5.602 5.701 5.823 5.929 6.013 6.102 6.213 6.322 6.415 6.5 6.579 6.626 6.651 6.638 6.575 6.464 6.265 5.968 5.533 4.77 3.439 0.92 -2.261 -4.778 -6.852 -8.551 -10.017 -11.302 -12.428 -13.383 -14.302 -15.068 -15.74 -16.368 -16.976 -17.545 -18.046 -18.572 -19.049 -19.459 -19.889 -20.329 -20.665 -21.013 -21.397 -21.689 -21.977 -22.271 -22.579 -22.905 -23.122 -23.34 -23.682 -23.92 -24.174 -24.303 -24.567 -24.847 -25.142 -25.302 -25.506 -25.81 -25.991 -26.197 -26.633 -26.865 -27.123 -27.416 -27.733 -28.083 -28.569 -30.485 -2 ,1627 ,KEBNE ,16708941,Fri Nov 26 20:26:24 CET,Fri Nov 26 21:56:41 CET,0.0 1.044 1.455 1.774 2.015 2.235 2.419 2.568 2.829 2.946 3.06 3.265 3.376 3.455 3.615 3.774 3.912 3.973 4.096 4.212 4.374 4.487 4.589 4.732 4.874 4.99 5.098 5.201 5.325 5.448 5.555 5.665 5.774 5.877 5.983 6.09 6.176 6.248 6.319 6.393 6.46 6.498 6.487 6.443 6.34 6.126 5.808 5.366 4.626 3.405 1.178 -1.551 -3.894 -5.943 -7.663 -9.159 -10.455 -11.558 -12.483 -13.421 -14.224 -14.897 -15.502 -16.083 -16.625 -17.114 -17.62 -18.062 -18.44 -18.835 -19.248 -19.589 -19.947 -20.317 -20.598 -20.897 -21.201 -21.512 -21.84 -22.069 -22.308 -22.669 -22.912 -23.152 -23.276 -23.543 -23.824 -24.125 -24.287 -24.488 -24.792 -24.978 -25.167 -25.572 -25.807 -26.054 -26.329 -26.658 -27.027 -27.505 -29.078 -3 ,13593 ,KEBNE ,16708942,Fri Nov 26 20:26:25 CET,Fri Nov 26 21:57:57 CET,0.0 1.128 1.485 1.775 2.018 2.212 2.372 2.516 2.786 2.904 3.007 3.195 3.303 3.396 3.566 3.72 3.853 3.915 4.037 4.151 4.321 4.428 4.528 4.666 4.784 4.894 4.994 5.09 5.224 5.347 5.451 5.575 5.681 5.764 5.849 5.938 6.019 6.106 6.185 6.243 6.298 6.315 6.286 6.225 6.082 5.895 5.637 5.177 4.425 3.267 1.106 -1.612 -3.802 -5.693 -7.347 -8.79 -10.036 -11.167 -12.126 -13.09 -13.908 -14.615 -15.281 -15.909 -16.486 -16.999 -17.505 -17.947 -18.338 -18.74 -19.158 -19.49 -19.826 -20.189 -20.475 -20.768 -21.065 -21.379 -21.712 -21.938 -22.174 -22.533 -22.774 -23.029 -23.163 -23.444 -23.726 -24.016 -24.169 -24.362 -24.677 -24.865 -25.058 -25.499 -25.74 -25.996 -26.292 -26.618 -27.023 -27.596 -29.189 -4 ,11421 ,KEBNE ,16708943,Fri Nov 26 20:26:24 CET,Fri Nov 26 21:56:39 CET,0.0 1.221 1.582 1.847 2.061 2.272 2.458 2.622 2.929 3.075 3.208 3.419 3.528 3.615 3.784 3.945 4.106 4.185 4.32 4.431 4.574 4.671 4.765 4.888 5.008 5.118 5.214 5.321 5.448 5.545 5.653 5.777 5.88 5.977 6.074 6.176 6.267 6.347 6.422 6.486 6.53 6.553 6.535 6.483 6.401 6.246 5.969 5.554 4.82 3.531 1.363 -1.245 -3.446 -5.334 -6.92 -8.307 -9.515 -10.573 -11.47 -12.36 -13.114 -13.792 -14.442 -15.045 -15.593 -16.094 -16.613 -17.067 -17.455 -17.87 -18.31 -18.66 -19.013 -19.394 -19.697 -19.994 -20.301 -20.633 -20.957 -21.18 -21.418 -21.77 -22.005 -22.249 -22.375 -22.645 -22.925 -23.217 -23.378 -23.586 -23.895 -24.081 -24.279 -24.712 -24.963 -25.232 -25.512 -25.848 -26.237 -26.756 -28.169 -5 ,9569 ,KEBNE ,16708944,Fri Nov 26 20:26:29 CET,Fri Nov 26 21:53:46 CET,0.0 1.447 1.876 2.175 2.431 2.639 2.817 2.967 3.218 3.335 3.446 3.627 3.729 3.824 4.005 4.165 4.318 4.388 4.505 4.61 4.772 4.875 4.97 5.117 5.253 5.368 5.478 5.587 5.719 5.845 5.96 6.089 6.2 6.3 6.413 6.518 6.622 6.713 6.782 6.855 6.901 6.944 6.983 6.963 6.889 6.752 6.426 5.903 5.142 3.858 1.571 -1.203 -3.49 -5.425 -7.066 -8.483 -9.67 -10.737 -11.613 -12.476 -13.257 -13.943 -14.592 -15.216 -15.759 -16.251 -16.778 -17.238 -17.633 -18.038 -18.466 -18.828 -19.208 -19.584 -19.869 -20.176 -20.495 -20.81 -21.125 -21.35 -21.591 -21.972 -22.23 -22.483 -22.613 -22.885 -23.168 -23.466 -23.63 -23.842 -24.145 -24.32 -24.511 -24.942 -25.199 -25.476 -25.761 -26.078 -26.448 -26.958 -28.554 -6 ,27014 ,KEBNE ,16708945,Fri Nov 26 20:26:29 CET,Fri Nov 26 21:52:47 CET,0.0 1.272 1.723 2.042 2.278 2.474 2.65 2.813 3.114 3.249 3.371 3.573 3.687 3.783 3.967 4.134 4.287 4.355 4.475 4.595 4.762 4.864 4.964 5.107 5.238 5.361 5.475 5.579 5.698 5.793 5.891 6.007 6.111 6.209 6.319 6.428 6.525 6.626 6.703 6.759 6.801 6.849 6.868 6.811 6.71 6.536 6.235 5.775 5.018 3.724 1.291 -1.74 -4.251 -6.322 -8.023 -9.531 -10.801 -11.94 -12.884 -13.779 -14.562 -15.233 -15.862 -16.476 -17.036 -17.537 -18.057 -18.507 -18.902 -19.312 -19.728 -20.069 -20.425 -20.805 -21.098 -21.395 -21.704 -22.027 -22.352 -22.58 -22.811 -23.155 -23.401 -23.662 -23.792 -24.057 -24.346 -24.638 -24.785 -24.983 -25.313 -25.501 -25.693 -26.11 -26.34 -26.595 -26.869 -27.166 -27.536 -28.048 -29.931 -7 ,14032 ,KEBNE ,16708946,Fri Nov 26 20:26:25 CET,Fri Nov 26 21:58:02 CET,0.0 1.476 1.853 2.108 2.323 2.51 2.689 2.854 3.125 3.247 3.36 3.54 3.638 3.72 3.876 4.013 4.139 4.198 4.308 4.419 4.575 4.673 4.767 4.894 5.005 5.112 5.216 5.318 5.438 5.534 5.628 5.749 5.864 5.958 6.06 6.156 6.236 6.317 6.392 6.454 6.511 6.577 6.593 6.578 6.496 6.318 5.998 5.476 4.701 3.443 1.189 -1.566 -3.753 -5.584 -7.177 -8.671 -9.98 -11.109 -12.066 -12.997 -13.801 -14.515 -15.172 -15.785 -16.345 -16.837 -17.355 -17.825 -18.229 -18.638 -19.057 -19.41 -19.76 -20.12 -20.407 -20.709 -21.009 -21.322 -21.659 -21.88 -22.095 -22.416 -22.657 -22.913 -23.041 -23.304 -23.591 -23.894 -24.043 -24.244 -24.541 -24.709 -24.894 -25.304 -25.539 -25.803 -26.095 -26.443 -26.843 -27.296 -28.841 -8 ,8086 ,KEBNE ,16708947,Fri Nov 26 20:26:25 CET,Fri Nov 26 21:56:33 CET,0.0 2.036 2.47 2.762 3.003 3.221 3.406 3.557 3.845 3.978 4.089 4.271 4.374 4.455 4.617 4.77 4.909 4.976 5.099 5.213 5.37 5.468 5.566 5.701 5.826 5.944 6.036 6.127 6.256 6.369 6.471 6.591 6.713 6.827 6.932 7.025 7.107 7.183 7.246 7.305 7.349 7.377 7.389 7.341 7.215 7.037 6.798 6.364 5.533 4.209 1.961 -0.76 -3.007 -4.929 -6.576 -7.975 -9.138 -10.203 -11.128 -12.045 -12.827 -13.519 -14.169 -14.77 -15.351 -15.881 -16.399 -16.855 -17.242 -17.649 -18.075 -18.407 -18.74 -19.085 -19.36 -19.656 -19.965 -20.266 -20.577 -20.795 -21.021 -21.381 -21.634 -21.888 -22.016 -22.292 -22.582 -22.887 -23.043 -23.241 -23.554 -23.744 -23.948 -24.374 -24.617 -24.895 -25.192 -25.511 -25.882 -26.403 -28.281 -9 ,20853 ,KEBNE ,16708948,Fri Nov 26 20:26:25 CET,Fri Nov 26 21:56:47 CET,0.0 1.147 1.503 1.767 1.986 2.166 2.332 2.491 2.735 2.852 2.971 3.156 3.27 3.364 3.533 3.684 3.823 3.89 4.016 4.144 4.307 4.403 4.5 4.635 4.76 4.879 4.988 5.085 5.206 5.318 5.418 5.527 5.621 5.718 5.831 5.946 6.041 6.12 6.186 6.232 6.267 6.299 6.306 6.257 6.149 5.963 5.65 5.19 4.421 3.134 0.939 -1.749 -4.183 -6.334 -8.131 -9.606 -10.779 -11.815 -12.708 -13.598 -14.381 -15.085 -15.736 -16.345 -16.903 -17.408 -17.913 -18.368 -18.772 -19.175 -19.59 -19.927 -20.275 -20.639 -20.914 -21.206 -21.517 -21.831 -22.161 -22.377 -22.593 -22.928 -23.151 -23.396 -23.526 -23.792 -24.074 -24.37 -24.526 -24.728 -25.04 -25.222 -25.408 -25.842 -26.089 -26.348 -26.63 -26.968 -27.385 -27.928 -29.393 -10 ,3921 ,KEBNE ,16708949,Fri Nov 26 20:26:25 CET,Fri Nov 26 21:57:52 CET,0.0 1.672 2.072 2.347 2.573 2.775 2.946 3.11 3.409 3.537 3.656 3.848 3.952 4.043 4.208 4.345 4.474 4.541 4.667 4.773 4.923 5.014 5.105 5.241 5.359 5.474 5.58 5.668 5.787 5.898 5.994 6.117 6.215 6.29 6.382 6.484 6.56 6.618 6.702 6.797 6.853 6.872 6.86 6.812 6.714 6.533 6.242 5.797 5.043 3.769 1.526 -1.314 -3.772 -5.757 -7.39 -8.797 -10.016 -11.135 -12.077 -12.998 -13.792 -14.512 -15.196 -15.801 -16.337 -16.799 -17.287 -17.735 -18.121 -18.518 -18.929 -19.26 -19.594 -19.958 -20.246 -20.536 -20.83 -21.134 -21.455 -21.675 -21.9 -22.258 -22.498 -22.733 -22.854 -23.119 -23.398 -23.693 -23.85 -24.056 -24.379 -24.564 -24.757 -25.177 -25.413 -25.679 -25.973 -26.312 -26.713 -27.227 -29.063 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_54_50.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_54_50.txt deleted file mode 100644 index 38cadb55..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_54_50.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5894 ,KEBNE ,16708950,Fri Nov 26 20:26:25 CET,Fri Nov 26 21:57:06 CET,0.0 1.359 1.763 2.075 2.319 2.518 2.691 2.847 3.124 3.25 3.379 3.471 3.739 3.842 4.036 4.208 4.381 4.469 4.638 4.795 5.021 5.166 5.304 5.503 5.69 5.877 6.051 6.216 6.429 6.63 6.829 7.07 7.295 7.508 7.742 7.987 8.211 8.464 8.742 9.033 9.339 9.672 10.061 10.446 10.865 11.306 11.757 12.164 12.548 12.85 12.696 11.991 11.192 10.369 9.665 8.997 8.333 7.726 7.207 6.667 6.176 5.727 5.268 4.804 4.386 4.03 3.662 3.317 3.006 2.687 2.355 2.064 1.755 1.445 1.21 0.969 0.719 0.446 0.156 -0.047 -0.277 -0.627 -0.854 -1.109 -1.235 -1.478 -1.746 -2.033 -2.183 -2.495 -2.694 -2.897 -3.107 -3.525 -3.751 -4.024 -4.33 -4.676 -5.106 -5.711 -7.394 -2 ,19928 ,KEBNE ,16708951,Fri Nov 26 20:27:25 CET,Fri Nov 26 21:59:15 CET,0.0 1.375 1.8 2.131 2.405 2.624 2.812 2.98 3.272 3.405 3.531 3.614 3.888 4.0 4.198 4.381 4.555 4.64 4.803 4.97 5.2 5.343 5.484 5.679 5.866 6.034 6.203 6.365 6.561 6.753 6.935 7.167 7.392 7.589 7.824 8.094 8.342 8.62 8.911 9.212 9.535 9.905 10.314 10.687 11.123 11.58 12.03 12.474 12.867 13.057 12.953 12.389 11.614 10.833 10.107 9.394 8.715 8.091 7.56 7.008 6.504 6.029 5.577 5.168 4.77 4.408 4.034 3.683 3.369 3.053 2.734 2.463 2.171 1.87 1.645 1.407 1.17 0.926 0.667 0.479 0.272 -0.055 -0.275 -0.516 -0.647 -0.902 -1.165 -1.461 -1.619 -1.932 -2.119 -2.312 -2.51 -2.911 -3.138 -3.404 -3.734 -4.127 -4.601 -5.209 -6.827 -3 ,20189 ,KEBNE ,16708952,Fri Nov 26 20:27:26 CET,Fri Nov 26 21:59:10 CET,0.0 1.08 1.481 1.781 2.028 2.238 2.429 2.599 2.869 2.987 3.109 3.17 3.433 3.537 3.747 3.95 4.134 4.222 4.39 4.546 4.765 4.907 5.042 5.238 5.443 5.631 5.802 5.964 6.17 6.381 6.583 6.82 7.052 7.266 7.497 7.754 8.01 8.305 8.606 8.895 9.199 9.516 9.878 10.26 10.669 11.091 11.531 11.92 12.266 12.518 12.396 11.727 10.956 10.147 9.368 8.64 7.99 7.407 6.898 6.339 5.844 5.413 4.978 4.562 4.16 3.78 3.395 3.057 2.763 2.446 2.11 1.829 1.527 1.217 0.982 0.745 0.498 0.229 -0.044 -0.243 -0.456 -0.778 -1.006 -1.258 -1.391 -1.651 -1.929 -2.221 -2.363 -2.667 -2.84 -3.016 -3.207 -3.646 -3.906 -4.192 -4.518 -4.878 -5.286 -5.915 -7.877 -4 ,11250 ,KEBNE ,16708953,Fri Nov 26 20:27:26 CET,Fri Nov 26 21:57:56 CET,0.0 0.967 1.334 1.633 1.874 2.067 2.244 2.41 2.716 2.853 2.981 3.062 3.326 3.431 3.624 3.814 4.007 4.098 4.265 4.414 4.63 4.774 4.918 5.132 5.326 5.506 5.682 5.849 6.055 6.26 6.46 6.693 6.915 7.128 7.359 7.607 7.854 8.136 8.423 8.714 9.018 9.347 9.716 10.064 10.439 10.86 11.265 11.631 12.052 12.33 12.131 11.534 10.835 10.032 9.25 8.52 7.873 7.256 6.695 6.114 5.58 5.105 4.647 4.212 3.825 3.474 3.084 2.719 2.4 2.062 1.705 1.421 1.132 0.818 0.562 0.297 0.031 -0.246 -0.542 -0.742 -0.941 -1.256 -1.478 -1.726 -1.856 -2.099 -2.361 -2.666 -2.829 -3.149 -3.324 -3.504 -3.705 -4.153 -4.393 -4.66 -4.97 -5.31 -5.71 -6.225 -8.016 -5 ,29092 ,KEBNE ,16708954,Fri Nov 26 20:28:27 CET,Fri Nov 26 22:00:13 CET,0.0 1.298 1.741 2.035 2.252 2.44 2.628 2.798 3.083 3.218 3.349 3.453 3.73 3.833 4.03 4.211 4.389 4.478 4.642 4.8 5.016 5.153 5.291 5.483 5.671 5.856 6.033 6.2 6.409 6.614 6.816 7.04 7.253 7.472 7.716 7.977 8.223 8.486 8.755 9.046 9.363 9.699 10.092 10.489 10.913 11.363 11.919 12.459 12.874 13.177 13.056 12.324 11.515 10.733 9.961 9.234 8.573 7.931 7.396 6.847 6.324 5.833 5.352 4.908 4.49 4.088 3.669 3.301 2.985 2.678 2.364 2.097 1.821 1.519 1.281 1.053 0.812 0.554 0.269 0.061 -0.147 -0.471 -0.702 -0.949 -1.076 -1.339 -1.609 -1.885 -2.044 -2.376 -2.58 -2.783 -2.995 -3.399 -3.625 -3.878 -4.163 -4.497 -4.919 -5.527 -7.538 -6 ,17678 ,KEBNE ,16708955,Fri Nov 26 20:29:28 CET,Fri Nov 26 22:01:20 CET,0.0 1.209 1.612 1.913 2.156 2.366 2.559 2.734 3.052 3.194 3.322 3.409 3.686 3.798 4.002 4.182 4.361 4.45 4.605 4.756 4.972 5.099 5.232 5.436 5.634 5.825 5.994 6.152 6.36 6.558 6.76 7.008 7.237 7.454 7.697 7.958 8.201 8.465 8.75 9.059 9.383 9.725 10.136 10.533 10.96 11.423 11.908 12.433 12.903 13.14 12.987 12.299 11.444 10.606 9.87 9.088 8.32 7.654 7.061 6.432 5.922 5.472 5.031 4.604 4.182 3.815 3.447 3.097 2.807 2.518 2.17 1.868 1.573 1.275 1.046 0.791 0.523 0.241 -0.049 -0.241 -0.443 -0.778 -1.003 -1.227 -1.346 -1.605 -1.885 -2.163 -2.319 -2.65 -2.845 -3.017 -3.199 -3.644 -3.888 -4.148 -4.472 -4.846 -5.295 -5.881 -7.908 -7 ,15322 ,KEBNE ,16708956,Fri Nov 26 20:29:28 CET,Fri Nov 26 22:00:11 CET,0.0 1.42 1.817 2.104 2.326 2.527 2.713 2.879 3.202 3.354 3.481 3.56 3.835 3.938 4.133 4.334 4.509 4.589 4.754 4.918 5.151 5.297 5.432 5.622 5.807 5.985 6.156 6.322 6.535 6.738 6.939 7.184 7.415 7.626 7.867 8.147 8.412 8.684 8.967 9.274 9.61 9.966 10.323 10.667 11.065 11.492 11.957 12.425 12.862 13.16 13.126 12.52 11.746 10.896 10.111 9.4 8.7 8.046 7.486 6.916 6.408 5.949 5.511 5.074 4.658 4.293 3.929 3.591 3.272 2.938 2.618 2.359 2.075 1.771 1.528 1.283 1.03 0.745 0.458 0.26 0.045 -0.274 -0.49 -0.723 -0.841 -1.08 -1.352 -1.657 -1.809 -2.115 -2.302 -2.502 -2.714 -3.138 -3.39 -3.669 -3.956 -4.307 -4.748 -5.365 -7.057 -8 ,11006 ,KEBNE ,16708957,Fri Nov 26 20:30:30 CET,Fri Nov 26 22:08:39 CET,0.0 1.186 1.583 1.861 2.09 2.279 2.449 2.621 2.934 3.07 3.202 3.287 3.557 3.666 3.868 4.055 4.236 4.322 4.484 4.638 4.866 5.018 5.159 5.349 5.531 5.712 5.889 6.047 6.237 6.432 6.629 6.857 7.067 7.27 7.512 7.755 7.978 8.243 8.533 8.831 9.139 9.496 9.893 10.274 10.667 11.086 11.517 11.872 12.203 12.487 12.442 11.78 10.949 10.169 9.429 8.7 8.081 7.485 6.941 6.368 5.852 5.38 4.908 4.473 4.1 3.759 3.392 3.051 2.764 2.464 2.131 1.855 1.562 1.269 1.032 0.768 0.495 0.214 -0.094 -0.31 -0.509 -0.823 -1.064 -1.3 -1.42 -1.678 -1.959 -2.25 -2.397 -2.71 -2.877 -3.061 -3.268 -3.69 -3.923 -4.185 -4.486 -4.83 -5.267 -5.888 -7.46 -9 ,3677 ,KEBNE ,16708958,Fri Nov 26 20:30:31 CET,Fri Nov 26 21:56:40 CET,0.0 1.099 1.46 1.74 1.976 2.167 2.336 2.496 2.783 2.914 3.037 3.108 3.371 3.484 3.696 3.89 4.074 4.158 4.32 4.467 4.68 4.814 4.941 5.135 5.327 5.514 5.689 5.862 6.082 6.282 6.467 6.69 6.905 7.121 7.357 7.608 7.857 8.114 8.393 8.687 9.008 9.373 9.761 10.142 10.549 10.939 11.342 11.749 12.111 12.352 12.214 11.509 10.688 9.855 9.104 8.381 7.72 7.126 6.601 6.05 5.536 5.049 4.597 4.179 3.796 3.439 3.054 2.717 2.404 2.067 1.729 1.469 1.197 0.886 0.637 0.385 0.128 -0.152 -0.45 -0.659 -0.883 -1.218 -1.46 -1.72 -1.849 -2.114 -2.387 -2.66 -2.803 -3.124 -3.332 -3.515 -3.703 -4.123 -4.374 -4.641 -4.944 -5.304 -5.717 -6.294 -8.196 -10 ,23723 ,KEBNE ,16708959,Fri Nov 26 20:32:33 CET,Fri Nov 26 22:03:22 CET,0.0 1.084 1.53 1.866 2.136 2.353 2.547 2.713 3.008 3.143 3.271 3.367 3.644 3.751 3.951 4.147 4.336 4.422 4.591 4.758 4.99 5.124 5.236 5.405 5.569 5.722 5.878 6.035 6.233 6.424 6.614 6.845 7.056 7.258 7.509 7.804 8.07 8.347 8.637 8.93 9.236 9.588 9.983 10.335 10.741 11.19 11.674 12.144 12.56 12.809 12.668 12.11 11.368 10.549 9.774 9.012 8.346 7.734 7.188 6.677 6.215 5.785 5.357 4.924 4.53 4.174 3.792 3.453 3.169 2.852 2.484 2.193 1.911 1.603 1.345 1.074 0.802 0.526 0.239 0.047 -0.159 -0.499 -0.726 -0.951 -1.062 -1.31 -1.583 -1.884 -2.053 -2.376 -2.567 -2.745 -2.938 -3.372 -3.602 -3.862 -4.173 -4.523 -4.97 -5.577 -7.398 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_57_155.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_57_155.txt deleted file mode 100644 index d6d33eaf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_57_155.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6121 ,KEBNE ,16708960,Fri Nov 26 20:32:32 CET,Fri Nov 26 22:04:24 CET,0.0 0.818 1.073 1.236 1.377 1.508 1.609 1.711 1.916 1.991 2.052 2.183 2.228 2.281 2.381 2.466 2.53 2.558 2.612 2.67 2.759 2.804 2.842 2.883 2.9 2.93 2.953 2.951 2.953 2.955 2.934 2.894 2.859 2.817 2.75 2.659 2.548 2.423 2.274 2.061 1.811 1.503 1.072 0.56 -0.075 -0.893 -2.04 -3.528 -5.554 -8.398 -12.774 -17.54 -21.092 -23.879 -26.131 -28.054 -29.656 -31.064 -32.249 -33.388 -34.336 -35.159 -35.922 -36.632 -37.285 -37.866 -38.456 -38.969 -39.412 -39.862 -40.331 -40.717 -41.118 -41.523 -41.829 -42.15 -42.496 -42.861 -43.225 -43.463 -43.705 -44.079 -44.338 -44.608 -44.743 -45.018 -45.3 -45.583 -45.733 -45.93 -46.226 -46.413 -46.602 -46.986 -47.202 -47.433 -47.692 -47.981 -48.323 -48.761 -49.8 -2 ,14916 ,KEBNE ,16708961,Fri Nov 26 20:33:37 CET,Fri Nov 26 22:01:56 CET,0.0 0.937 1.218 1.4 1.534 1.654 1.769 1.873 2.058 2.149 2.228 2.382 2.432 2.484 2.569 2.63 2.684 2.715 2.78 2.843 2.928 2.962 2.986 3.038 3.082 3.107 3.126 3.145 3.152 3.144 3.139 3.099 3.047 2.994 2.916 2.828 2.719 2.563 2.359 2.125 1.864 1.531 1.074 0.537 -0.133 -0.942 -2.022 -3.447 -5.457 -8.295 -12.566 -17.252 -20.815 -23.64 -25.921 -27.857 -29.487 -30.943 -32.152 -33.3 -34.314 -35.219 -36.02 -36.744 -37.439 -38.059 -38.679 -39.222 -39.672 -40.132 -40.614 -41.018 -41.436 -41.852 -42.172 -42.507 -42.844 -43.192 -43.538 -43.769 -44.012 -44.392 -44.661 -44.93 -45.063 -45.331 -45.605 -45.908 -46.07 -46.275 -46.599 -46.797 -46.99 -47.388 -47.616 -47.881 -48.148 -48.426 -48.762 -49.191 -50.014 -3 ,7795 ,KEBNE ,16708962,Fri Nov 26 20:34:37 CET,Fri Nov 26 22:06:44 CET,0.0 0.98 1.309 1.528 1.682 1.83 1.959 2.078 2.285 2.37 2.44 2.563 2.609 2.668 2.756 2.817 2.883 2.92 2.987 3.045 3.103 3.141 3.181 3.227 3.272 3.312 3.329 3.347 3.388 3.402 3.393 3.361 3.303 3.225 3.123 3.023 2.922 2.776 2.583 2.343 2.083 1.753 1.309 0.813 0.165 -0.639 -1.722 -3.143 -5.029 -7.734 -12.045 -16.723 -20.244 -23.062 -25.377 -27.389 -29.047 -30.456 -31.64 -32.794 -33.795 -34.704 -35.543 -36.278 -36.939 -37.549 -38.159 -38.681 -39.146 -39.645 -40.165 -40.566 -40.965 -41.383 -41.71 -42.048 -42.398 -42.745 -43.1 -43.359 -43.628 -44.027 -44.279 -44.537 -44.672 -44.947 -45.247 -45.57 -45.731 -45.938 -46.249 -46.429 -46.622 -47.066 -47.303 -47.552 -47.832 -48.146 -48.487 -48.919 -49.955 -4 ,9035 ,KEBNE ,16708963,Fri Nov 26 20:34:37 CET,Fri Nov 26 22:07:47 CET,0.0 0.686 0.959 1.17 1.333 1.458 1.582 1.69 1.863 1.934 1.999 2.125 2.172 2.231 2.33 2.414 2.483 2.517 2.581 2.639 2.701 2.725 2.757 2.799 2.838 2.883 2.909 2.94 2.993 3.002 3.0 3.021 3.018 2.973 2.912 2.825 2.715 2.588 2.419 2.221 1.967 1.595 1.103 0.598 -0.059 -0.905 -2.03 -3.497 -5.488 -8.333 -12.698 -17.405 -20.919 -23.721 -26.017 -27.995 -29.663 -31.092 -32.269 -33.416 -34.42 -35.3 -36.084 -36.8 -37.456 -38.053 -38.652 -39.169 -39.633 -40.111 -40.592 -40.985 -41.399 -41.827 -42.129 -42.433 -42.76 -43.107 -43.464 -43.69 -43.918 -44.293 -44.568 -44.844 -44.98 -45.254 -45.541 -45.845 -46.006 -46.211 -46.511 -46.689 -46.877 -47.275 -47.5 -47.751 -48.022 -48.331 -48.69 -49.153 -50.409 -5 ,25332 ,KEBNE ,16708964,Fri Nov 26 20:34:37 CET,Fri Nov 26 22:07:31 CET,0.0 0.951 1.289 1.516 1.686 1.823 1.944 2.055 2.23 2.308 2.382 2.508 2.546 2.598 2.673 2.733 2.81 2.847 2.908 2.968 3.051 3.09 3.122 3.151 3.16 3.181 3.214 3.227 3.232 3.232 3.221 3.208 3.173 3.118 3.039 2.939 2.859 2.743 2.553 2.331 2.072 1.721 1.266 0.759 0.095 -0.726 -1.766 -3.153 -5.149 -8.009 -12.436 -17.236 -20.849 -23.68 -25.996 -27.945 -29.563 -30.972 -32.153 -33.285 -34.241 -35.131 -35.944 -36.682 -37.347 -37.937 -38.59 -39.144 -39.586 -40.069 -40.587 -40.998 -41.412 -41.84 -42.179 -42.525 -42.87 -43.219 -43.568 -43.806 -44.04 -44.397 -44.656 -44.921 -45.049 -45.298 -45.565 -45.873 -46.043 -46.258 -46.573 -46.754 -46.947 -47.361 -47.575 -47.807 -48.081 -48.386 -48.73 -49.174 -50.294 -6 ,11540 ,KEBNE ,16708965,Fri Nov 26 20:34:38 CET,Fri Nov 26 22:14:47 CET,0.0 0.963 1.232 1.423 1.597 1.761 1.89 2.0 2.193 2.266 2.326 2.464 2.516 2.567 2.663 2.761 2.839 2.868 2.931 2.993 3.072 3.119 3.161 3.214 3.247 3.287 3.317 3.323 3.334 3.354 3.368 3.346 3.309 3.283 3.243 3.191 3.102 2.958 2.777 2.532 2.243 1.922 1.492 0.967 0.304 -0.517 -1.586 -2.981 -4.93 -7.723 -12.036 -16.745 -20.326 -23.181 -25.477 -27.443 -29.101 -30.522 -31.693 -32.826 -33.769 -34.605 -35.41 -36.144 -36.796 -37.397 -38.017 -38.552 -39.005 -39.468 -39.939 -40.335 -40.745 -41.149 -41.458 -41.776 -42.09 -42.422 -42.775 -43.003 -43.239 -43.618 -43.883 -44.163 -44.305 -44.585 -44.878 -45.19 -45.363 -45.576 -45.882 -46.071 -46.272 -46.694 -46.917 -47.163 -47.419 -47.72 -48.076 -48.529 -49.537 -7 ,5592 ,KEBNE ,16708966,Fri Nov 26 20:38:51 CET,Fri Nov 26 22:03:55 CET,0.0 0.899 1.206 1.394 1.559 1.717 1.854 1.974 2.171 2.25 2.324 2.488 2.547 2.607 2.705 2.779 2.85 2.888 2.958 3.019 3.096 3.133 3.161 3.216 3.263 3.289 3.322 3.339 3.345 3.357 3.349 3.305 3.264 3.223 3.156 3.063 2.957 2.835 2.671 2.453 2.195 1.865 1.434 0.918 0.246 -0.614 -1.755 -3.229 -5.254 -8.061 -12.376 -17.154 -20.747 -23.627 -26.001 -27.987 -29.623 -31.037 -32.211 -33.335 -34.28 -35.114 -35.897 -36.61 -37.246 -37.84 -38.477 -39.02 -39.459 -39.908 -40.395 -40.795 -41.191 -41.6 -41.911 -42.229 -42.563 -42.896 -43.239 -43.474 -43.71 -44.079 -44.352 -44.65 -44.798 -45.093 -45.383 -45.675 -45.834 -46.03 -46.315 -46.491 -46.676 -47.073 -47.289 -47.534 -47.805 -48.114 -48.488 -48.994 -50.326 -8 ,11747 ,KEBNE ,16708967,Fri Nov 26 20:41:55 CET,Fri Nov 26 22:14:09 CET,0.0 1.011 1.314 1.506 1.653 1.779 1.903 2.013 2.172 2.239 2.31 2.455 2.505 2.562 2.657 2.732 2.787 2.816 2.88 2.946 3.042 3.101 3.143 3.174 3.186 3.217 3.257 3.279 3.298 3.302 3.286 3.25 3.195 3.126 3.063 2.984 2.904 2.801 2.624 2.391 2.113 1.763 1.313 0.814 0.137 -0.744 -1.893 -3.331 -5.242 -7.995 -12.317 -17.074 -20.667 -23.536 -25.871 -27.819 -29.462 -30.919 -32.123 -33.264 -34.221 -35.071 -35.862 -36.626 -37.348 -37.986 -38.619 -39.163 -39.644 -40.123 -40.604 -41.019 -41.451 -41.879 -42.206 -42.542 -42.889 -43.25 -43.617 -43.861 -44.112 -44.507 -44.788 -45.075 -45.216 -45.499 -45.799 -46.113 -46.269 -46.471 -46.791 -46.992 -47.186 -47.584 -47.81 -48.061 -48.347 -48.662 -49.007 -49.428 -50.694 -9 ,1679 ,KEBNE ,16708968,Fri Nov 26 20:41:55 CET,Fri Nov 26 22:15:16 CET,0.0 0.841 1.131 1.345 1.507 1.633 1.74 1.839 2.004 2.083 2.166 2.307 2.349 2.401 2.505 2.6 2.683 2.722 2.781 2.819 2.877 2.911 2.931 2.959 2.982 2.992 2.999 2.993 2.971 2.961 2.95 2.923 2.89 2.84 2.756 2.651 2.542 2.413 2.233 1.998 1.723 1.375 0.952 0.464 -0.191 -1.017 -2.128 -3.547 -5.478 -8.273 -12.621 -17.322 -20.907 -23.809 -26.132 -28.052 -29.659 -31.055 -32.207 -33.325 -34.273 -35.104 -35.904 -36.647 -37.348 -37.99 -38.631 -39.201 -39.672 -40.125 -40.589 -40.98 -41.394 -41.825 -42.141 -42.454 -42.778 -43.098 -43.427 -43.667 -43.917 -44.296 -44.563 -44.842 -44.986 -45.282 -45.569 -45.869 -46.028 -46.23 -46.546 -46.739 -46.937 -47.4 -47.653 -47.916 -48.205 -48.517 -48.874 -49.321 -50.4 -10 ,18997 ,KEBNE ,16708969,Fri Nov 26 20:44:01 CET,Fri Nov 26 22:13:34 CET,0.0 0.959 1.288 1.506 1.659 1.777 1.899 2.006 2.156 2.219 2.287 2.425 2.472 2.523 2.6 2.666 2.734 2.765 2.823 2.88 2.966 3.006 3.035 3.08 3.111 3.138 3.163 3.169 3.165 3.164 3.145 3.113 3.071 3.012 2.941 2.856 2.736 2.588 2.44 2.253 2.01 1.704 1.278 0.749 0.059 -0.815 -1.929 -3.352 -5.359 -8.275 -12.707 -17.459 -21.057 -23.903 -26.21 -28.191 -29.837 -31.267 -32.463 -33.616 -34.577 -35.426 -36.215 -36.913 -37.55 -38.148 -38.764 -39.29 -39.748 -40.223 -40.702 -41.106 -41.522 -41.928 -42.252 -42.598 -42.932 -43.261 -43.605 -43.848 -44.101 -44.494 -44.757 -45.015 -45.144 -45.428 -45.745 -46.074 -46.243 -46.451 -46.748 -46.93 -47.122 -47.544 -47.776 -48.024 -48.305 -48.614 -48.954 -49.391 -50.521 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_7a_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_7a_1.txt deleted file mode 100644 index 91b84e03..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_7a_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18158 ,KEBNE ,16708970,Fri Nov 26 20:44:59 CET,Fri Nov 26 22:18:23 CET,0.0 1.182 1.538 1.803 2.03 2.236 2.419 2.583 2.872 3.013 3.142 3.329 3.499 3.608 3.812 3.999 4.179 4.271 4.459 4.639 4.87 5.025 5.184 5.393 5.588 5.775 5.963 6.16 6.399 6.602 6.8 7.043 7.263 7.475 7.736 8.022 8.29 8.589 8.908 9.224 9.549 9.928 10.353 10.764 11.255 11.821 12.46 13.133 13.865 14.641 15.444 15.881 15.944 15.843 15.662 15.439 15.189 14.932 14.712 14.448 14.188 13.956 13.669 13.387 13.129 12.896 12.683 12.498 12.332 12.114 11.877 11.689 11.465 11.252 11.114 10.967 10.807 10.62 10.426 10.303 10.164 9.937 9.776 9.596 9.506 9.32 9.114 8.884 8.761 8.591 8.381 8.245 8.106 7.786 7.595 7.394 7.172 6.915 6.576 6.147 4.902 -2 ,8965 ,KEBNE ,16708971,Fri Nov 26 20:44:59 CET,Fri Nov 26 22:18:10 CET,0.0 1.038 1.406 1.709 1.955 2.157 2.344 2.516 2.808 2.944 3.067 3.241 3.401 3.501 3.69 3.877 4.046 4.123 4.294 4.463 4.678 4.817 4.973 5.188 5.37 5.553 5.747 5.94 6.194 6.418 6.62 6.88 7.138 7.386 7.645 7.927 8.194 8.477 8.771 9.083 9.423 9.79 10.203 10.607 11.084 11.598 12.121 12.733 13.475 14.299 15.129 15.545 15.585 15.511 15.378 15.191 14.975 14.752 14.533 14.274 14.043 13.824 13.604 13.363 13.135 12.957 12.769 12.592 12.436 12.265 12.08 11.91 11.727 11.55 11.403 11.223 11.007 10.787 10.588 10.469 10.345 10.112 9.926 9.747 9.661 9.463 9.247 9.006 8.882 8.715 8.516 8.383 8.218 7.867 7.686 7.502 7.295 7.038 6.753 6.383 5.244 -3 ,21813 ,KEBNE ,16708972,Fri Nov 26 20:45:59 CET,Fri Nov 26 22:17:54 CET,0.0 0.843 1.164 1.426 1.634 1.81 1.994 2.172 2.473 2.615 2.749 2.954 3.13 3.236 3.44 3.638 3.815 3.898 4.066 4.215 4.437 4.601 4.767 4.99 5.186 5.372 5.564 5.748 5.946 6.13 6.33 6.598 6.86 7.091 7.342 7.614 7.909 8.25 8.593 8.936 9.269 9.648 10.071 10.529 11.068 11.587 12.169 12.832 13.579 14.396 15.196 15.669 15.725 15.557 15.376 15.198 14.978 14.711 14.428 14.12 13.87 13.662 13.464 13.259 13.041 12.808 12.57 12.378 12.183 11.963 11.727 11.515 11.304 11.08 10.917 10.767 10.604 10.42 10.231 10.11 9.967 9.743 9.577 9.399 9.316 9.13 8.926 8.693 8.571 8.401 8.2 8.054 7.887 7.562 7.382 7.184 6.94 6.654 6.371 5.953 4.665 -4 ,13593 ,KEBNE ,16708973,Fri Nov 26 20:47:01 CET,Fri Nov 26 22:18:49 CET,0.0 0.803 1.124 1.402 1.628 1.823 2.0 2.151 2.433 2.56 2.681 2.864 3.032 3.148 3.353 3.539 3.716 3.792 3.94 4.092 4.303 4.446 4.6 4.819 5.02 5.215 5.398 5.566 5.792 5.995 6.193 6.428 6.652 6.902 7.195 7.517 7.821 8.136 8.447 8.771 9.118 9.489 9.897 10.3 10.798 11.353 11.971 12.629 13.349 14.108 14.867 15.32 15.418 15.304 15.112 14.84 14.558 14.318 14.068 13.774 13.516 13.289 13.087 12.899 12.707 12.528 12.333 12.121 11.933 11.761 11.567 11.367 11.162 10.977 10.833 10.66 10.471 10.292 10.106 9.962 9.814 9.597 9.443 9.285 9.209 9.029 8.829 8.644 8.542 8.391 8.213 8.071 7.918 7.581 7.392 7.201 7.001 6.751 6.427 6.013 4.529 -5 ,31646 ,KEBNE ,16708974,Fri Nov 26 20:49:03 CET,Fri Nov 26 22:22:11 CET,0.0 0.919 1.28 1.529 1.751 1.948 2.131 2.302 2.591 2.712 2.828 3.017 3.181 3.283 3.485 3.691 3.9 3.996 4.179 4.351 4.577 4.734 4.886 5.084 5.283 5.487 5.67 5.834 6.03 6.223 6.438 6.673 6.883 7.119 7.408 7.728 8.04 8.358 8.65 8.958 9.297 9.673 10.096 10.513 11.011 11.529 12.087 12.728 13.429 14.158 14.919 15.349 15.49 15.453 15.321 15.102 14.859 14.627 14.388 14.124 13.896 13.693 13.483 13.271 13.05 12.858 12.672 12.479 12.308 12.124 11.92 11.763 11.598 11.415 11.274 11.119 10.944 10.768 10.58 10.44 10.289 10.066 9.908 9.736 9.654 9.471 9.259 9.033 8.914 8.739 8.504 8.35 8.188 7.847 7.665 7.482 7.264 6.996 6.685 6.251 5.022 -6 ,17684 ,KEBNE ,16708975,Fri Nov 26 20:50:06 CET,Fri Nov 26 22:24:27 CET,0.0 0.963 1.322 1.615 1.849 2.033 2.206 2.379 2.676 2.806 2.93 3.117 3.284 3.391 3.596 3.782 3.954 4.037 4.198 4.359 4.613 4.774 4.912 5.123 5.337 5.528 5.703 5.858 6.057 6.272 6.472 6.715 6.957 7.174 7.419 7.686 7.951 8.241 8.541 8.851 9.174 9.544 9.975 10.435 10.962 11.468 12.046 12.712 13.466 14.251 14.942 15.304 15.343 15.215 15.0 14.77 14.492 14.207 13.936 13.618 13.343 13.08 12.842 12.643 12.444 12.254 12.02 11.793 11.592 11.372 11.154 10.967 10.749 10.505 10.324 10.138 9.953 9.776 9.601 9.474 9.333 9.094 8.925 8.756 8.667 8.485 8.304 8.104 7.985 7.819 7.603 7.461 7.322 7.01 6.819 6.599 6.372 6.138 5.843 5.42 4.043 -7 ,15915 ,KEBNE ,16708976,Fri Nov 26 20:52:09 CET,Fri Nov 26 22:24:12 CET,0.0 1.062 1.42 1.73 1.971 2.156 2.32 2.47 2.743 2.86 2.965 3.12 3.281 3.385 3.575 3.759 3.932 4.014 4.193 4.355 4.586 4.747 4.899 5.116 5.326 5.516 5.683 5.855 6.085 6.311 6.537 6.796 7.044 7.3 7.568 7.827 8.078 8.382 8.701 9.036 9.384 9.748 10.178 10.606 11.076 11.579 12.165 12.788 13.46 14.188 14.921 15.285 15.379 15.364 15.225 15.007 14.777 14.563 14.325 14.079 13.883 13.686 13.487 13.278 13.026 12.772 12.548 12.37 12.213 12.054 11.879 11.713 11.516 11.305 11.154 11.002 10.807 10.584 10.381 10.25 10.11 9.876 9.712 9.553 9.466 9.267 9.058 8.833 8.721 8.555 8.342 8.204 8.056 7.762 7.601 7.412 7.201 6.961 6.642 6.192 4.691 -8 ,24998 ,KEBNE ,16708977,Fri Nov 26 20:52:09 CET,Fri Nov 26 22:25:23 CET,0.0 0.919 1.25 1.531 1.784 2.012 2.2 2.35 2.618 2.744 2.863 3.035 3.193 3.299 3.503 3.696 3.887 3.979 4.158 4.337 4.6 4.759 4.911 5.147 5.366 5.555 5.73 5.903 6.138 6.373 6.601 6.865 7.099 7.323 7.579 7.877 8.18 8.507 8.866 9.241 9.597 9.984 10.415 10.827 11.289 11.789 12.35 12.947 13.621 14.385 15.15 15.539 15.586 15.488 15.259 14.979 14.748 14.52 14.299 14.054 13.808 13.573 13.338 13.103 12.894 12.698 12.48 12.272 12.089 11.896 11.69 11.51 11.306 11.119 10.967 10.785 10.607 10.42 10.235 10.115 9.991 9.78 9.619 9.442 9.348 9.161 8.961 8.751 8.642 8.467 8.254 8.123 7.98 7.672 7.488 7.277 7.038 6.771 6.464 6.056 4.743 -9 ,15243 ,KEBNE ,16708978,Fri Nov 26 20:52:09 CET,Fri Nov 26 22:24:24 CET,0.0 1.23 1.615 1.873 2.102 2.311 2.499 2.656 2.919 3.049 3.184 3.392 3.561 3.67 3.884 4.087 4.272 4.352 4.504 4.659 4.901 5.068 5.226 5.449 5.66 5.864 6.045 6.221 6.448 6.671 6.878 7.098 7.347 7.612 7.88 8.15 8.415 8.691 8.975 9.282 9.618 10.011 10.468 10.921 11.424 11.933 12.507 13.162 13.894 14.701 15.517 15.971 16.059 15.983 15.817 15.627 15.436 15.218 14.985 14.714 14.477 14.262 14.05 13.847 13.643 13.444 13.224 13.034 12.851 12.63 12.411 12.235 12.055 11.878 11.741 11.573 11.384 11.19 11.002 10.871 10.717 10.476 10.323 10.159 10.071 9.875 9.678 9.486 9.375 9.208 8.999 8.854 8.705 8.375 8.18 7.978 7.759 7.49 7.098 6.567 5.238 -10 ,27212 ,KEBNE ,16708979,Fri Nov 26 20:52:09 CET,Fri Nov 26 22:25:25 CET,0.0 0.984 1.343 1.622 1.861 2.075 2.25 2.409 2.723 2.87 3.008 3.204 3.372 3.477 3.696 3.904 4.096 4.188 4.352 4.51 4.738 4.877 5.011 5.218 5.423 5.629 5.83 6.008 6.225 6.427 6.626 6.876 7.115 7.355 7.644 7.947 8.213 8.502 8.803 9.102 9.432 9.807 10.234 10.672 11.171 11.701 12.262 12.869 13.545 14.263 15.01 15.455 15.549 15.481 15.367 15.191 15.001 14.811 14.601 14.369 14.158 13.968 13.751 13.522 13.316 13.121 12.874 12.632 12.43 12.201 11.95 11.746 11.536 11.312 11.14 10.95 10.767 10.596 10.401 10.26 10.103 9.868 9.706 9.531 9.445 9.277 9.1 8.898 8.785 8.622 8.415 8.28 8.138 7.806 7.612 7.408 7.192 6.956 6.676 6.28 5.131 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_7a_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_7a_41.txt deleted file mode 100644 index d1dbfc4f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_7a_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14117 ,KEBNE ,16708980,Fri Nov 26 20:54:12 CET,Fri Nov 26 22:26:29 CET,0.0 1.244 1.702 2.042 2.311 2.544 2.773 2.979 3.334 3.497 3.667 3.943 4.143 4.291 4.576 4.845 5.103 5.221 5.453 5.685 6.014 6.217 6.408 6.684 6.953 7.23 7.49 7.738 8.055 8.353 8.641 8.992 9.344 9.691 10.07 10.494 10.934 11.431 11.939 12.445 12.986 13.592 14.273 14.954 15.779 16.725 17.787 18.992 20.392 22.006 23.933 25.458 26.29 26.746 26.955 27.073 27.089 27.034 26.982 26.896 26.774 26.623 26.459 26.305 26.131 25.984 25.851 25.697 25.546 25.374 25.211 25.079 24.931 24.76 24.616 24.479 24.332 24.173 24.017 23.901 23.774 23.561 23.386 23.21 23.119 22.924 22.733 22.528 22.411 22.247 22.018 21.88 21.725 21.395 21.224 21.018 20.78 20.497 20.175 19.71 18.135 -2 ,20546 ,KEBNE ,16708981,Fri Nov 26 20:57:16 CET,Fri Nov 26 22:29:32 CET,0.0 1.239 1.645 1.957 2.224 2.487 2.73 2.951 3.385 3.582 3.742 3.978 4.173 4.318 4.612 4.888 5.146 5.271 5.513 5.752 6.09 6.299 6.495 6.787 7.083 7.354 7.61 7.87 8.186 8.466 8.76 9.12 9.431 9.75 10.158 10.601 11.034 11.501 11.973 12.494 13.072 13.748 14.489 15.213 16.077 17.026 18.111 19.319 20.741 22.422 24.441 26.065 26.91 27.382 27.665 27.817 27.873 27.867 27.821 27.724 27.612 27.476 27.311 27.156 26.969 26.799 26.645 26.487 26.339 26.195 26.035 25.868 25.698 25.534 25.403 25.25 25.072 24.889 24.696 24.56 24.433 24.247 24.095 23.909 23.815 23.614 23.385 23.158 23.048 22.891 22.661 22.528 22.38 22.037 21.853 21.661 21.444 21.199 20.903 20.484 18.939 -3 ,32344 ,KEBNE ,16708982,Fri Nov 26 20:57:16 CET,Fri Nov 26 22:33:20 CET,0.0 1.018 1.399 1.724 2.018 2.274 2.521 2.744 3.113 3.284 3.447 3.706 3.91 4.056 4.329 4.579 4.815 4.934 5.176 5.404 5.724 5.941 6.155 6.459 6.737 6.994 7.24 7.491 7.837 8.152 8.455 8.822 9.164 9.507 9.904 10.344 10.765 11.23 11.712 12.241 12.815 13.435 14.209 14.984 15.811 16.734 17.802 18.987 20.342 21.928 23.835 25.41 26.336 26.859 27.125 27.253 27.274 27.257 27.21 27.122 26.993 26.859 26.726 26.598 26.473 26.351 26.189 26.031 25.907 25.746 25.542 25.383 25.24 25.084 24.952 24.806 24.658 24.5 24.326 24.193 24.037 23.776 23.603 23.448 23.371 23.195 22.996 22.782 22.662 22.494 22.257 22.116 21.967 21.642 21.453 21.22 20.964 20.674 20.314 19.838 18.338 -4 ,14178 ,KEBNE ,16708983,Fri Nov 26 20:59:19 CET,Fri Nov 26 22:30:42 CET,0.0 1.093 1.516 1.852 2.144 2.398 2.618 2.829 3.219 3.389 3.548 3.794 3.987 4.126 4.394 4.65 4.894 5.013 5.25 5.461 5.762 5.973 6.181 6.469 6.738 7.008 7.278 7.538 7.862 8.155 8.439 8.804 9.146 9.486 9.888 10.337 10.771 11.234 11.732 12.262 12.81 13.433 14.137 14.823 15.623 16.51 17.592 18.826 20.191 21.8 23.747 25.263 26.1 26.591 26.878 26.992 26.979 26.951 26.914 26.836 26.742 26.636 26.489 26.316 26.171 26.026 25.858 25.681 25.508 25.329 25.128 24.953 24.76 24.568 24.436 24.307 24.148 23.96 23.766 23.626 23.479 23.254 23.094 22.925 22.837 22.655 22.467 22.264 22.151 22.001 21.801 21.659 21.502 21.143 20.947 20.733 20.496 20.244 19.925 19.438 17.985 -5 ,29968 ,KEBNE ,16708984,Fri Nov 26 20:59:19 CET,Fri Nov 26 22:32:11 CET,0.0 1.512 1.924 2.23 2.493 2.74 2.963 3.168 3.574 3.752 3.91 4.177 4.389 4.533 4.803 5.063 5.299 5.418 5.657 5.886 6.199 6.396 6.6 6.906 7.179 7.441 7.706 7.949 8.254 8.555 8.848 9.206 9.554 9.901 10.309 10.721 11.125 11.576 12.07 12.584 13.083 13.663 14.372 15.106 15.955 16.886 17.997 19.202 20.561 22.198 24.189 25.771 26.63 27.117 27.403 27.531 27.518 27.455 27.333 27.178 27.066 26.948 26.8 26.637 26.46 26.291 26.111 25.955 25.813 25.636 25.433 25.25 25.05 24.858 24.733 24.604 24.472 24.322 24.137 24.009 23.863 23.636 23.496 23.355 23.282 23.111 22.919 22.712 22.6 22.446 22.241 22.097 21.938 21.605 21.429 21.245 21.0 20.679 20.279 19.795 17.81 -6 ,22789 ,KEBNE ,16708985,Fri Nov 26 21:11:34 CET,Fri Nov 26 22:42:57 CET,0.0 1.375 1.818 2.15 2.43 2.675 2.888 3.097 3.511 3.703 3.883 4.16 4.367 4.511 4.771 5.025 5.287 5.409 5.64 5.862 6.172 6.371 6.578 6.89 7.17 7.439 7.702 7.946 8.276 8.599 8.898 9.24 9.556 9.876 10.263 10.691 11.091 11.531 12.02 12.55 13.096 13.699 14.457 15.283 16.146 17.031 18.052 19.205 20.601 22.243 24.216 25.749 26.554 27.002 27.25 27.398 27.469 27.477 27.444 27.339 27.232 27.153 27.06 26.918 26.767 26.635 26.47 26.326 26.201 26.068 25.926 25.793 25.639 25.47 25.333 25.183 25.011 24.826 24.64 24.515 24.383 24.167 24.014 23.843 23.757 23.583 23.378 23.176 23.061 22.898 22.668 22.518 22.362 22.025 21.822 21.613 21.375 21.043 20.677 20.238 18.431 -7 ,14873 ,KEBNE ,16708986,Fri Nov 26 21:11:34 CET,Fri Nov 26 22:44:16 CET,0.0 1.429 1.91 2.249 2.551 2.801 3.022 3.229 3.623 3.819 4.01 4.295 4.495 4.631 4.892 5.152 5.403 5.519 5.734 5.95 6.265 6.47 6.686 6.995 7.288 7.567 7.811 8.045 8.362 8.667 8.967 9.348 9.715 10.062 10.457 10.87 11.256 11.69 12.148 12.631 13.158 13.752 14.433 15.138 15.962 16.879 17.972 19.189 20.613 22.248 24.141 25.705 26.599 27.081 27.318 27.447 27.429 27.362 27.294 27.198 27.11 27.015 26.874 26.708 26.548 26.394 26.25 26.111 25.966 25.813 25.646 25.488 25.298 25.114 25.003 24.886 24.74 24.562 24.374 24.245 24.097 23.874 23.717 23.543 23.461 23.291 23.101 22.883 22.762 22.61 22.381 22.236 22.088 21.779 21.605 21.396 21.151 20.87 20.493 20.003 18.481 -8 ,24281 ,KEBNE ,16708987,Fri Nov 26 21:11:34 CET,Fri Nov 26 22:44:07 CET,0.0 1.041 1.466 1.799 2.077 2.334 2.578 2.809 3.198 3.368 3.53 3.797 4.006 4.151 4.427 4.69 4.948 5.074 5.321 5.561 5.888 6.09 6.283 6.564 6.826 7.08 7.339 7.594 7.943 8.25 8.515 8.859 9.218 9.588 10.012 10.453 10.866 11.309 11.775 12.269 12.784 13.381 14.075 14.753 15.544 16.401 17.403 18.576 19.987 21.644 23.635 25.211 26.057 26.546 26.79 26.941 26.997 26.955 26.908 26.828 26.677 26.518 26.394 26.274 26.109 25.918 25.724 25.539 25.373 25.199 25.018 24.888 24.746 24.565 24.411 24.244 24.061 23.875 23.703 23.587 23.45 23.219 23.047 22.867 22.78 22.596 22.384 22.158 22.049 21.906 21.672 21.514 21.366 21.035 20.847 20.658 20.434 20.163 19.839 19.399 17.821 -9 ,21759 ,KEBNE ,16708988,Fri Nov 26 21:11:34 CET,Fri Nov 26 22:42:43 CET,0.0 1.103 1.551 1.894 2.17 2.44 2.702 2.918 3.281 3.459 3.636 3.923 4.137 4.279 4.552 4.817 5.064 5.183 5.413 5.63 5.931 6.123 6.318 6.611 6.891 7.144 7.39 7.645 7.976 8.28 8.566 8.924 9.265 9.601 10.039 10.499 10.924 11.423 11.941 12.464 12.987 13.603 14.321 15.017 15.881 16.849 17.903 19.107 20.506 22.12 24.08 25.654 26.521 27.03 27.308 27.442 27.467 27.431 27.355 27.229 27.107 27.003 26.891 26.786 26.637 26.486 26.359 26.216 26.072 25.942 25.777 25.587 25.392 25.217 25.069 24.893 24.728 24.559 24.357 24.217 24.089 23.888 23.742 23.578 23.495 23.331 23.146 22.95 22.843 22.682 22.459 22.336 22.198 21.876 21.688 21.466 21.219 20.953 20.615 20.155 18.258 -10 ,9367 ,KEBNE ,16708989,Fri Nov 26 21:12:36 CET,Fri Nov 26 22:44:04 CET,0.0 1.295 1.707 2.019 2.316 2.577 2.825 3.057 3.43 3.603 3.777 4.062 4.28 4.433 4.717 4.996 5.266 5.396 5.643 5.886 6.215 6.416 6.618 6.898 7.16 7.428 7.696 7.957 8.278 8.603 8.91 9.26 9.6 9.915 10.298 10.731 11.135 11.57 12.037 12.541 13.064 13.669 14.385 15.083 15.9 16.79 17.846 19.076 20.497 22.156 24.115 25.678 26.489 26.92 27.148 27.255 27.286 27.25 27.159 27.052 26.929 26.771 26.603 26.471 26.363 26.226 26.065 25.903 25.732 25.565 25.402 25.254 25.099 24.946 24.805 24.627 24.445 24.282 24.123 24.001 23.87 23.645 23.475 23.311 23.235 23.067 22.886 22.699 22.596 22.444 22.235 22.108 21.962 21.639 21.452 21.228 20.99 20.721 20.394 19.915 18.394 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_7b_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_7b_1.txt deleted file mode 100644 index d14520bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_7b_1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17008 ,KEBNE ,16708990,Fri Nov 26 21:16:48 CET,Fri Nov 26 22:41:46 CET,0.0 0.934 1.286 1.533 1.75 1.951 2.128 2.291 2.595 2.733 2.864 3.065 3.237 3.351 3.558 3.756 3.941 4.031 4.202 4.364 4.616 4.772 4.915 5.122 5.317 5.512 5.697 5.871 6.092 6.319 6.545 6.805 7.052 7.285 7.553 7.862 8.159 8.508 8.883 9.26 9.64 10.072 10.574 11.065 11.627 12.217 12.889 13.604 14.344 15.099 15.808 15.97 15.619 15.128 14.583 14.025 13.542 13.072 12.639 12.222 11.861 11.519 11.166 10.842 10.555 10.288 9.986 9.705 9.458 9.199 8.942 8.728 8.498 8.261 8.076 7.883 7.689 7.485 7.27 7.114 6.951 6.695 6.511 6.323 6.223 6.007 5.784 5.557 5.438 5.266 5.033 4.87 4.697 4.349 4.155 3.941 3.709 3.453 3.123 2.641 1.302 -2 ,27145 ,KEBNE ,16708991,Fri Nov 26 21:16:48 CET,Fri Nov 26 22:41:48 CET,0.0 1.244 1.632 1.918 2.152 2.353 2.531 2.687 2.973 3.109 3.241 3.427 3.6 3.725 3.951 4.159 4.352 4.446 4.632 4.807 5.038 5.179 5.328 5.544 5.746 5.929 6.107 6.294 6.533 6.75 6.962 7.211 7.45 7.688 7.946 8.243 8.526 8.812 9.134 9.496 9.89 10.313 10.775 11.261 11.797 12.301 12.86 13.458 14.034 14.556 14.965 14.981 14.616 14.069 13.512 12.971 12.506 12.079 11.686 11.271 10.878 10.516 10.173 9.849 9.551 9.275 8.979 8.717 8.484 8.227 7.97 7.755 7.527 7.289 7.106 6.912 6.71 6.501 6.27 6.113 5.955 5.693 5.513 5.325 5.226 5.026 4.8 4.569 4.454 4.284 4.07 3.933 3.788 3.455 3.268 3.055 2.809 2.525 2.191 1.77 0.627 -3 ,27927 ,KEBNE ,16708992,Fri Nov 26 21:18:51 CET,Fri Nov 26 22:43:50 CET,0.0 0.888 1.219 1.513 1.757 1.945 2.117 2.277 2.539 2.658 2.782 2.968 3.137 3.253 3.447 3.635 3.823 3.918 4.106 4.279 4.517 4.657 4.793 5.009 5.222 5.422 5.61 5.791 6.011 6.215 6.417 6.668 6.907 7.15 7.433 7.731 8.03 8.351 8.682 9.043 9.411 9.825 10.321 10.817 11.39 11.992 12.642 13.359 14.151 14.955 15.477 15.344 14.937 14.419 13.887 13.39 12.938 12.512 12.082 11.638 11.276 10.935 10.596 10.267 9.962 9.68 9.362 9.084 8.857 8.61 8.347 8.133 7.906 7.677 7.499 7.306 7.104 6.895 6.687 6.537 6.382 6.146 5.974 5.789 5.688 5.484 5.285 5.064 4.931 4.755 4.561 4.432 4.276 3.919 3.731 3.531 3.297 3.015 2.681 2.235 0.971 -4 ,7126 ,KEBNE ,16708993,Fri Nov 26 21:19:53 CET,Fri Nov 26 22:47:39 CET,0.0 1.256 1.687 2.008 2.252 2.465 2.653 2.823 3.143 3.287 3.426 3.644 3.818 3.936 4.184 4.387 4.563 4.654 4.822 4.972 5.202 5.352 5.496 5.715 5.929 6.13 6.315 6.497 6.733 6.959 7.177 7.43 7.664 7.894 8.164 8.467 8.751 9.067 9.411 9.766 10.142 10.539 10.987 11.422 11.918 12.463 13.108 13.736 14.297 14.877 15.235 15.013 14.513 13.916 13.341 12.791 12.291 11.812 11.393 10.966 10.569 10.208 9.869 9.548 9.232 8.943 8.654 8.379 8.139 7.898 7.628 7.398 7.166 6.925 6.724 6.517 6.305 6.082 5.862 5.701 5.534 5.286 5.103 4.915 4.817 4.605 4.387 4.162 4.045 3.871 3.656 3.522 3.374 3.017 2.816 2.612 2.39 2.138 1.829 1.422 0.255 -5 ,1861 ,KEBNE ,16708994,Fri Nov 26 21:19:53 CET,Fri Nov 26 22:46:51 CET,0.0 1.097 1.428 1.687 1.922 2.152 2.358 2.545 2.873 3.019 3.156 3.376 3.554 3.674 3.878 4.067 4.249 4.334 4.512 4.681 4.915 5.07 5.216 5.418 5.611 5.798 5.981 6.163 6.401 6.629 6.847 7.105 7.342 7.571 7.845 8.14 8.426 8.724 9.033 9.382 9.752 10.165 10.637 11.092 11.619 12.203 12.807 13.431 14.107 14.797 15.303 15.111 14.608 14.062 13.546 13.068 12.609 12.145 11.724 11.278 10.885 10.546 10.204 9.869 9.57 9.312 9.045 8.793 8.564 8.332 8.084 7.864 7.639 7.407 7.215 7.017 6.83 6.625 6.4 6.238 6.068 5.82 5.635 5.435 5.337 5.132 4.919 4.703 4.587 4.412 4.168 4.015 3.853 3.491 3.293 3.073 2.839 2.585 2.274 1.84 0.506 -6 ,17605 ,KEBNE ,16708995,Fri Nov 26 21:23:56 CET,Fri Nov 26 22:55:54 CET,0.0 1.251 1.69 1.948 2.177 2.394 2.6 2.779 3.074 3.197 3.324 3.529 3.694 3.809 4.023 4.235 4.434 4.529 4.711 4.886 5.145 5.299 5.45 5.665 5.858 6.048 6.236 6.415 6.639 6.843 7.043 7.308 7.554 7.775 8.035 8.337 8.616 8.916 9.254 9.612 9.978 10.415 10.911 11.366 11.875 12.435 13.045 13.644 14.325 14.902 15.077 14.901 14.436 13.928 13.459 12.935 12.439 11.956 11.535 11.119 10.757 10.41 10.068 9.728 9.414 9.145 8.84 8.569 8.336 8.083 7.814 7.59 7.365 7.133 6.942 6.743 6.537 6.312 6.068 5.906 5.743 5.492 5.306 5.113 5.02 4.822 4.607 4.375 4.264 4.102 3.887 3.751 3.6 3.271 3.083 2.867 2.611 2.324 1.979 1.536 0.122 -7 ,22969 ,KEBNE ,16708996,Fri Nov 26 21:23:56 CET,Fri Nov 26 22:55:37 CET,0.0 1.008 1.332 1.6 1.846 2.064 2.251 2.42 2.719 2.859 2.999 3.213 3.382 3.493 3.698 3.893 4.086 4.173 4.341 4.508 4.752 4.916 5.076 5.308 5.519 5.703 5.886 6.07 6.299 6.513 6.713 6.959 7.207 7.441 7.705 8.001 8.302 8.623 8.947 9.312 9.72 10.167 10.652 11.138 11.675 12.243 12.886 13.532 14.126 14.666 15.252 15.434 15.156 14.621 14.047 13.515 12.994 12.497 12.097 11.681 11.301 10.95 10.584 10.253 9.957 9.658 9.35 9.087 8.853 8.602 8.325 8.105 7.891 7.662 7.483 7.29 7.096 6.893 6.662 6.503 6.343 6.1 5.926 5.746 5.655 5.44 5.216 4.993 4.871 4.694 4.482 4.344 4.197 3.861 3.672 3.479 3.255 2.997 2.683 2.284 1.234 -8 ,30560 ,KEBNE ,16708997,Fri Nov 26 21:24:59 CET,Fri Nov 26 22:58:04 CET,0.0 1.254 1.622 1.901 2.14 2.356 2.547 2.716 3.02 3.159 3.3 3.515 3.68 3.783 3.983 4.172 4.355 4.444 4.627 4.8 5.025 5.17 5.316 5.523 5.721 5.91 6.086 6.255 6.488 6.722 6.938 7.19 7.441 7.688 7.978 8.299 8.604 8.939 9.284 9.661 10.05 10.479 10.99 11.451 11.979 12.608 13.31 14.044 14.832 15.576 15.904 15.697 15.269 14.774 14.29 13.732 13.221 12.785 12.426 12.056 11.697 11.357 11.002 10.666 10.349 10.053 9.742 9.446 9.206 8.952 8.687 8.475 8.234 7.982 7.792 7.597 7.396 7.185 6.962 6.8 6.636 6.383 6.212 6.03 5.928 5.702 5.471 5.245 5.13 4.965 4.728 4.569 4.402 4.032 3.827 3.603 3.36 3.067 2.711 2.209 0.497 -9 ,11726 ,KEBNE ,16708998,Fri Nov 26 21:24:59 CET,Fri Nov 26 22:58:02 CET,0.0 1.016 1.413 1.726 1.964 2.161 2.341 2.5 2.779 2.907 3.04 3.244 3.398 3.506 3.712 3.914 4.105 4.197 4.374 4.537 4.783 4.948 5.105 5.319 5.512 5.705 5.907 6.099 6.339 6.569 6.79 7.06 7.32 7.568 7.847 8.15 8.429 8.727 9.058 9.424 9.798 10.215 10.703 11.2 11.759 12.362 13.003 13.587 14.131 14.68 15.036 14.846 14.442 13.956 13.412 12.858 12.364 11.871 11.44 11.018 10.626 10.261 9.897 9.544 9.237 8.953 8.633 8.355 8.134 7.906 7.653 7.435 7.203 6.965 6.779 6.582 6.385 6.195 5.986 5.84 5.698 5.474 5.308 5.131 5.037 4.832 4.62 4.406 4.284 4.104 3.867 3.717 3.565 3.232 3.042 2.838 2.612 2.338 2.011 1.501 -0.04 -10 ,18604 ,KEBNE ,16708999,Fri Nov 26 21:26:01 CET,Fri Nov 26 22:59:17 CET,0.0 1.126 1.479 1.732 1.974 2.193 2.385 2.569 2.901 3.053 3.197 3.4 3.57 3.682 3.907 4.121 4.301 4.384 4.563 4.743 4.992 5.141 5.294 5.511 5.698 5.893 6.08 6.251 6.49 6.737 6.964 7.212 7.453 7.683 7.95 8.247 8.53 8.842 9.167 9.519 9.897 10.309 10.806 11.322 11.898 12.509 13.17 13.842 14.573 15.371 15.797 15.619 15.22 14.686 14.177 13.644 13.14 12.683 12.287 11.889 11.504 11.121 10.745 10.384 10.064 9.798 9.513 9.254 9.018 8.764 8.507 8.283 8.044 7.798 7.615 7.431 7.24 7.028 6.787 6.622 6.466 6.223 6.046 5.861 5.764 5.561 5.35 5.115 4.99 4.813 4.569 4.413 4.254 3.894 3.701 3.498 3.278 3.023 2.692 2.237 0.873 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_7b_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_7b_41.txt deleted file mode 100644 index 4031ac7c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_7b_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3078 ,KEBNE ,16709000,Fri Nov 26 21:27:07 CET,Fri Nov 26 22:55:25 CET,0.0 1.428 1.924 2.319 2.612 2.856 3.065 3.267 3.654 3.829 3.992 4.246 4.434 4.571 4.847 5.115 5.361 5.48 5.713 5.919 6.219 6.438 6.646 6.946 7.237 7.494 7.739 7.991 8.326 8.644 8.942 9.314 9.67 10.018 10.418 10.836 11.259 11.757 12.276 12.792 13.299 13.864 14.531 15.228 16.045 16.973 18.001 19.091 20.393 21.902 23.652 24.756 25.108 25.181 25.062 24.871 24.678 24.425 24.175 23.908 23.647 23.394 23.144 22.887 22.648 22.443 22.223 22.009 21.815 21.613 21.391 21.19 20.976 20.759 20.592 20.415 20.232 20.05 19.859 19.723 19.594 19.372 19.2 19.028 18.94 18.754 18.543 18.316 18.196 18.035 17.778 17.614 17.442 17.068 16.871 16.661 16.417 16.101 15.711 15.144 13.374 -2 ,22342 ,KEBNE ,16709001,Fri Nov 26 21:27:06 CET,Fri Nov 26 22:53:32 CET,0.0 1.643 2.139 2.477 2.746 2.98 3.202 3.415 3.779 3.943 4.107 4.396 4.606 4.761 5.047 5.317 5.588 5.716 5.95 6.164 6.464 6.656 6.849 7.128 7.399 7.661 7.929 8.192 8.505 8.81 9.11 9.474 9.818 10.146 10.541 10.985 11.413 11.895 12.418 12.938 13.471 14.114 14.878 15.607 16.41 17.318 18.401 19.624 20.9 22.234 23.711 24.756 25.243 25.388 25.344 25.202 25.019 24.825 24.606 24.319 24.04 23.791 23.561 23.349 23.137 22.926 22.671 22.427 22.224 22.03 21.831 21.643 21.44 21.229 21.069 20.902 20.721 20.522 20.31 20.168 20.017 19.778 19.604 19.425 19.332 19.133 18.934 18.718 18.595 18.433 18.187 18.04 17.889 17.526 17.329 17.113 16.853 16.555 16.164 15.617 13.751 -3 ,19827 ,KEBNE ,16709002,Fri Nov 26 21:28:04 CET,Fri Nov 26 22:59:09 CET,0.0 1.352 1.796 2.146 2.459 2.726 2.961 3.177 3.565 3.744 3.916 4.175 4.377 4.519 4.78 5.027 5.278 5.403 5.643 5.871 6.194 6.409 6.616 6.907 7.183 7.442 7.696 7.953 8.287 8.599 8.885 9.224 9.54 9.844 10.216 10.653 11.088 11.554 12.029 12.526 13.067 13.67 14.379 15.125 16.0 16.977 18.072 19.217 20.521 21.944 23.317 24.274 24.626 24.68 24.59 24.404 24.224 24.007 23.788 23.556 23.31 23.068 22.827 22.577 22.308 22.073 21.835 21.612 21.438 21.254 21.046 20.867 20.664 20.461 20.306 20.13 19.947 19.756 19.566 19.434 19.283 19.036 18.866 18.685 18.593 18.406 18.198 17.972 17.851 17.688 17.431 17.271 17.107 16.754 16.567 16.358 16.105 15.815 15.453 14.951 13.503 -4 ,16910 ,KEBNE ,16709003,Fri Nov 26 21:28:08 CET,Fri Nov 26 22:54:09 CET,0.0 1.336 1.777 2.118 2.414 2.663 2.879 3.093 3.48 3.648 3.806 4.059 4.26 4.397 4.639 4.881 5.133 5.253 5.482 5.716 6.041 6.245 6.448 6.722 6.987 7.257 7.518 7.768 8.075 8.369 8.676 9.049 9.399 9.726 10.105 10.53 10.938 11.41 11.922 12.445 12.978 13.621 14.426 15.22 16.144 17.197 18.39 19.744 21.312 23.06 24.934 26.069 26.363 26.399 26.379 26.245 26.013 25.75 25.495 25.214 24.955 24.718 24.475 24.222 23.99 23.775 23.546 23.35 23.175 22.97 22.75 22.563 22.357 22.132 21.965 21.8 21.622 21.431 21.222 21.075 20.919 20.669 20.501 20.333 20.242 20.039 19.827 19.593 19.468 19.313 19.105 18.965 18.806 18.435 18.213 17.975 17.703 17.382 17.022 16.533 14.647 -5 ,31778 ,KEBNE ,16709004,Fri Nov 26 21:28:08 CET,Fri Nov 26 22:56:40 CET,0.0 1.498 1.927 2.239 2.501 2.73 2.948 3.166 3.553 3.732 3.904 4.173 4.365 4.501 4.778 5.044 5.289 5.412 5.649 5.87 6.193 6.401 6.595 6.875 7.149 7.411 7.669 7.901 8.193 8.481 8.755 9.086 9.404 9.72 10.087 10.485 10.877 11.325 11.84 12.376 12.9 13.487 14.15 14.858 15.751 16.7 17.737 18.91 20.329 22.0 23.741 24.669 25.017 25.182 25.142 24.968 24.737 24.478 24.206 23.903 23.657 23.433 23.192 22.961 22.72 22.483 22.251 22.039 21.842 21.639 21.418 21.223 21.015 20.797 20.623 20.437 20.243 20.041 19.849 19.715 19.564 19.32 19.143 18.957 18.86 18.658 18.446 18.214 18.097 17.938 17.69 17.539 17.378 17.036 16.845 16.62 16.372 16.084 15.725 15.252 13.818 -6 ,1172 ,KEBNE ,16709005,Fri Nov 26 21:28:08 CET,Fri Nov 26 22:53:05 CET,0.0 1.73 2.252 2.643 2.959 3.24 3.485 3.705 4.107 4.287 4.456 4.722 4.927 5.072 5.348 5.621 5.874 5.997 6.236 6.454 6.763 6.963 7.157 7.444 7.72 7.968 8.203 8.445 8.745 9.035 9.331 9.697 10.044 10.365 10.739 11.177 11.58 12.026 12.544 13.106 13.7 14.373 15.141 15.899 16.759 17.694 18.805 20.099 21.616 23.381 25.411 26.661 27.077 27.158 27.054 26.864 26.611 26.349 26.104 25.797 25.509 25.274 25.02 24.76 24.554 24.359 24.126 23.92 23.733 23.529 23.309 23.112 22.911 22.709 22.548 22.364 22.167 21.974 21.768 21.61 21.443 21.174 20.99 20.815 20.723 20.518 20.301 20.063 19.939 19.783 19.558 19.418 19.261 18.865 18.657 18.44 18.191 17.888 17.495 17.015 15.637 -7 ,14247 ,KEBNE ,16709006,Fri Nov 26 21:30:07 CET,Fri Nov 26 23:01:14 CET,0.0 1.676 2.185 2.535 2.838 3.118 3.383 3.609 3.99 4.17 4.338 4.605 4.816 4.963 5.23 5.484 5.725 5.843 6.071 6.284 6.583 6.782 6.979 7.267 7.547 7.8 8.035 8.264 8.567 8.869 9.15 9.494 9.828 10.152 10.538 10.945 11.338 11.788 12.25 12.74 13.267 13.868 14.575 15.294 16.176 17.16 18.237 19.429 20.856 22.392 23.994 25.024 25.297 25.312 25.199 25.02 24.81 24.565 24.318 24.053 23.815 23.59 23.349 23.111 22.879 22.664 22.446 22.234 22.031 21.829 21.604 21.403 21.214 21.016 20.853 20.678 20.49 20.285 20.069 19.917 19.758 19.515 19.343 19.162 19.068 18.867 18.65 18.409 18.278 18.115 17.866 17.697 17.534 17.209 17.006 16.786 16.541 16.237 15.871 15.386 13.591 -8 ,15265 ,KEBNE ,16709007,Fri Nov 26 21:30:11 CET,Fri Nov 26 22:56:39 CET,0.0 1.446 1.959 2.319 2.613 2.875 3.115 3.329 3.709 3.887 4.061 4.327 4.531 4.673 4.943 5.216 5.482 5.596 5.82 6.052 6.386 6.592 6.782 7.061 7.317 7.559 7.805 8.06 8.384 8.69 8.995 9.361 9.709 10.036 10.417 10.862 11.289 11.747 12.231 12.748 13.312 13.95 14.706 15.491 16.374 17.323 18.447 19.695 21.105 22.722 24.654 26.035 26.619 26.76 26.685 26.508 26.294 26.046 25.776 25.481 25.231 25.012 24.761 24.516 24.291 24.07 23.841 23.633 23.449 23.249 23.031 22.846 22.666 22.469 22.298 22.116 21.938 21.753 21.539 21.391 21.247 21.016 20.847 20.662 20.564 20.37 20.155 19.924 19.804 19.643 19.423 19.282 19.121 18.747 18.534 18.298 18.055 17.814 17.476 16.976 13.644 -9 ,30034 ,KEBNE ,16709008,Fri Nov 26 21:31:09 CET,Fri Nov 26 23:03:21 CET,0.0 1.755 2.275 2.623 2.903 3.152 3.378 3.587 3.977 4.158 4.335 4.61 4.81 4.954 5.216 5.467 5.719 5.841 6.065 6.28 6.597 6.803 7.002 7.28 7.555 7.834 8.098 8.347 8.656 8.948 9.236 9.592 9.945 10.277 10.649 11.066 11.465 11.916 12.432 12.989 13.567 14.226 14.963 15.663 16.52 17.513 18.638 19.86 21.344 23.073 24.872 25.939 26.357 26.485 26.433 26.256 26.022 25.77 25.539 25.288 25.021 24.769 24.534 24.309 24.075 23.841 23.595 23.379 23.207 23.033 22.83 22.649 22.462 22.256 22.084 21.917 21.738 21.554 21.365 21.223 21.075 20.828 20.646 20.468 20.377 20.168 19.944 19.732 19.621 19.452 19.2 19.054 18.904 18.553 18.359 18.142 17.875 17.573 17.213 16.732 14.688 -10 ,8041 ,KEBNE ,16709009,Fri Nov 26 21:33:12 CET,Fri Nov 26 23:06:06 CET,0.0 1.495 2.029 2.406 2.719 2.984 3.223 3.434 3.821 4.011 4.188 4.46 4.655 4.799 5.061 5.294 5.52 5.63 5.851 6.081 6.405 6.601 6.798 7.081 7.352 7.613 7.868 8.116 8.424 8.727 9.014 9.367 9.719 10.052 10.449 10.899 11.299 11.717 12.186 12.734 13.322 13.982 14.762 15.516 16.368 17.304 18.33 19.485 20.893 22.494 24.054 24.977 25.368 25.456 25.352 25.103 24.822 24.569 24.359 24.114 23.861 23.614 23.342 23.06 22.796 22.569 22.338 22.121 21.927 21.725 21.5 21.317 21.135 20.937 20.772 20.593 20.404 20.195 19.969 19.819 19.682 19.465 19.297 19.13 19.046 18.849 18.633 18.414 18.29 18.115 17.866 17.716 17.562 17.205 17.0 16.774 16.518 16.223 15.871 15.36 13.273 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_84_41.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_84_41.txt deleted file mode 100644 index 13a2ee00..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/hif2a/water/Summary_FEP_84_41.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12308 ,KEBNE ,16709010,Fri Nov 26 21:33:16 CET,Fri Nov 26 23:00:25 CET,0.0 1.486 2.009 2.416 2.735 3.007 3.269 3.525 3.969 4.172 4.372 4.683 4.932 5.103 5.434 5.74 6.03 6.167 6.441 6.712 7.101 7.352 7.598 7.977 8.345 8.686 9.014 9.341 9.776 10.193 10.582 11.043 11.505 11.967 12.51 13.125 13.718 14.367 15.063 15.815 16.612 17.539 18.669 19.812 21.124 22.58 24.329 26.368 28.784 31.84 35.729 39.117 41.141 42.354 43.148 43.713 44.121 44.421 44.659 44.859 44.961 45.014 45.045 45.065 45.059 45.038 45.016 44.983 44.941 44.897 44.841 44.785 44.73 44.662 44.602 44.539 44.465 44.395 44.311 44.247 44.176 44.062 43.98 43.887 43.844 43.751 43.643 43.532 43.469 43.36 43.241 43.157 43.063 42.857 42.736 42.622 42.476 42.283 42.032 41.653 40.497 -2 ,569 ,KEBNE ,16709011,Fri Nov 26 21:34:13 CET,Fri Nov 26 23:05:25 CET,0.0 1.664 2.145 2.51 2.856 3.164 3.427 3.671 4.119 4.334 4.544 4.86 5.109 5.273 5.591 5.905 6.2 6.339 6.607 6.877 7.27 7.509 7.746 8.102 8.44 8.776 9.116 9.452 9.883 10.289 10.679 11.15 11.607 12.043 12.568 13.184 13.788 14.455 15.183 15.97 16.798 17.741 18.867 20.043 21.427 22.943 24.71 26.747 29.133 31.975 35.554 38.614 40.409 41.679 42.59 43.195 43.624 43.948 44.159 44.326 44.441 44.511 44.569 44.608 44.614 44.605 44.575 44.538 44.505 44.459 44.414 44.378 44.326 44.264 44.217 44.16 44.094 44.018 43.932 43.868 43.793 43.668 43.587 43.498 43.449 43.339 43.206 43.065 42.998 42.893 42.76 42.668 42.571 42.35 42.232 42.091 41.922 41.735 41.498 41.185 39.911 -3 ,11795 ,KEBNE ,16709012,Fri Nov 26 21:35:15 CET,Fri Nov 26 23:04:49 CET,0.0 1.458 1.955 2.341 2.687 2.993 3.249 3.48 3.917 4.116 4.305 4.591 4.831 4.993 5.298 5.599 5.893 6.034 6.31 6.58 6.988 7.241 7.479 7.85 8.217 8.56 8.887 9.21 9.628 10.027 10.416 10.88 11.317 11.748 12.276 12.875 13.442 14.057 14.757 15.541 16.368 17.321 18.456 19.613 20.992 22.522 24.265 26.293 28.721 31.556 35.058 38.091 39.943 41.146 41.993 42.569 42.976 43.27 43.451 43.621 43.744 43.817 43.872 43.916 43.93 43.921 43.896 43.861 43.824 43.773 43.709 43.653 43.58 43.5 43.442 43.378 43.304 43.227 43.151 43.094 43.027 42.92 42.843 42.757 42.715 42.628 42.524 42.408 42.351 42.251 42.118 42.024 41.935 41.747 41.628 41.491 41.34 41.168 40.949 40.645 39.69 -4 ,19152 ,KEBNE ,16709013,Fri Nov 26 21:35:16 CET,Fri Nov 26 23:05:50 CET,0.0 1.52 2.057 2.476 2.842 3.156 3.428 3.681 4.15 4.362 4.557 4.858 5.104 5.271 5.603 5.908 6.197 6.339 6.612 6.881 7.272 7.522 7.774 8.141 8.485 8.824 9.157 9.482 9.901 10.299 10.689 11.171 11.655 12.128 12.677 13.288 13.868 14.519 15.23 15.978 16.765 17.652 18.713 19.836 21.197 22.7 24.441 26.545 29.111 32.21 36.198 39.549 41.443 42.68 43.533 44.138 44.582 44.911 45.125 45.297 45.408 45.465 45.487 45.492 45.49 45.484 45.469 45.444 45.407 45.366 45.335 45.291 45.233 45.175 45.134 45.083 45.015 44.939 44.855 44.798 44.738 44.648 44.581 44.494 44.445 44.348 44.243 44.105 44.037 43.932 43.816 43.736 43.654 43.472 43.361 43.233 43.074 42.885 42.654 42.287 40.82 -5 ,16105 ,KEBNE ,16709014,Fri Nov 26 21:35:15 CET,Fri Nov 26 23:05:26 CET,0.0 1.349 1.847 2.215 2.538 2.824 3.093 3.348 3.803 4.018 4.221 4.532 4.777 4.941 5.266 5.581 5.878 6.02 6.285 6.536 6.919 7.165 7.403 7.751 8.091 8.436 8.774 9.099 9.516 9.914 10.301 10.782 11.261 11.718 12.258 12.896 13.506 14.161 14.868 15.641 16.485 17.445 18.566 19.712 21.106 22.716 24.584 26.711 29.221 32.217 36.014 39.162 40.969 42.136 42.918 43.505 43.928 44.225 44.446 44.62 44.727 44.796 44.837 44.858 44.849 44.836 44.823 44.805 44.787 44.752 44.697 44.636 44.562 44.478 44.416 44.354 44.28 44.207 44.127 44.064 43.995 43.875 43.794 43.702 43.65 43.552 43.439 43.297 43.229 43.121 43.002 42.924 42.84 42.642 42.521 42.375 42.218 42.02 41.759 41.425 40.302 -6 ,32346 ,KEBNE ,16709015,Fri Nov 26 21:37:17 CET,Fri Nov 26 23:07:24 CET,0.0 1.605 2.175 2.564 2.884 3.172 3.44 3.698 4.162 4.37 4.57 4.873 5.112 5.27 5.585 5.894 6.19 6.33 6.591 6.852 7.231 7.478 7.729 8.085 8.422 8.758 9.089 9.418 9.839 10.235 10.642 11.14 11.614 12.067 12.583 13.193 13.803 14.462 15.151 15.89 16.705 17.655 18.75 19.848 21.157 22.658 24.425 26.53 29.135 32.276 36.126 39.362 41.323 42.535 43.3 43.855 44.287 44.581 44.781 44.96 45.06 45.124 45.178 45.192 45.18 45.154 45.122 45.085 45.043 45.0 44.952 44.908 44.853 44.789 44.73 44.673 44.619 44.546 44.469 44.412 44.336 44.213 44.127 44.026 43.975 43.872 43.757 43.636 43.575 43.471 43.363 43.284 43.197 43.001 42.872 42.717 42.549 42.364 42.141 41.825 40.71 -7 ,5071 ,KEBNE ,16709016,Fri Nov 26 21:37:18 CET,Fri Nov 26 23:07:13 CET,0.0 1.361 1.811 2.181 2.51 2.791 3.045 3.285 3.725 3.932 4.135 4.428 4.669 4.838 5.149 5.441 5.738 5.884 6.147 6.41 6.809 7.061 7.305 7.655 7.999 8.34 8.659 8.971 9.382 9.775 10.162 10.629 11.085 11.538 12.064 12.646 13.223 13.871 14.576 15.329 16.137 17.065 18.134 19.237 20.6 22.162 24.003 26.109 28.57 31.632 35.457 38.548 40.481 41.763 42.568 43.147 43.575 43.886 44.096 44.252 44.363 44.436 44.487 44.519 44.515 44.504 44.487 44.462 44.438 44.415 44.378 44.328 44.262 44.191 44.141 44.093 44.032 43.963 43.9 43.852 43.784 43.673 43.597 43.515 43.469 43.36 43.246 43.131 43.064 42.956 42.83 42.742 42.657 42.483 42.372 42.243 42.109 41.933 41.685 41.323 40.12 -8 ,5674 ,KEBNE ,16709017,Fri Nov 26 21:37:17 CET,Fri Nov 26 23:07:14 CET,0.0 1.914 2.415 2.793 3.114 3.399 3.653 3.89 4.329 4.542 4.737 5.031 5.281 5.455 5.792 6.109 6.418 6.566 6.856 7.128 7.524 7.784 8.031 8.398 8.747 9.082 9.412 9.726 10.134 10.542 10.934 11.4 11.853 12.284 12.796 13.425 14.047 14.714 15.43 16.197 17.033 17.97 19.087 20.267 21.589 23.033 24.768 26.763 29.208 32.174 35.861 38.901 40.671 41.936 42.824 43.412 43.822 44.149 44.369 44.523 44.626 44.693 44.737 44.773 44.782 44.761 44.737 44.716 44.685 44.65 44.616 44.577 44.52 44.465 44.419 44.356 44.29 44.219 44.143 44.083 44.014 43.921 43.855 43.773 43.722 43.621 43.523 43.408 43.344 43.246 43.14 43.057 42.966 42.775 42.663 42.531 42.381 42.218 42.015 41.705 40.241 -9 ,18614 ,KEBNE ,16709018,Fri Nov 26 21:37:18 CET,Fri Nov 26 23:07:13 CET,0.0 1.457 1.926 2.307 2.663 2.973 3.24 3.478 3.905 4.107 4.283 4.525 4.761 4.936 5.28 5.589 5.888 6.036 6.315 6.581 6.977 7.237 7.493 7.864 8.218 8.563 8.896 9.217 9.63 10.036 10.434 10.922 11.386 11.831 12.351 12.938 13.508 14.144 14.862 15.664 16.504 17.45 18.593 19.757 21.108 22.68 24.567 26.702 29.206 32.107 35.699 38.932 40.781 41.963 42.761 43.334 43.771 44.092 44.298 44.448 44.544 44.606 44.648 44.663 44.663 44.654 44.633 44.622 44.602 44.552 44.481 44.424 44.368 44.301 44.248 44.194 44.137 44.069 43.988 43.93 43.868 43.75 43.663 43.589 43.546 43.441 43.325 43.196 43.129 43.026 42.911 42.82 42.728 42.544 42.427 42.286 42.111 41.909 41.677 41.353 40.161 -10 ,13709 ,KEBNE ,16709019,Fri Nov 26 21:38:19 CET,Fri Nov 26 23:08:09 CET,0.0 1.564 2.107 2.5 2.82 3.121 3.391 3.644 4.083 4.282 4.483 4.789 5.043 5.221 5.554 5.866 6.16 6.301 6.582 6.872 7.275 7.514 7.752 8.111 8.459 8.804 9.135 9.452 9.881 10.288 10.66 11.124 11.591 12.035 12.561 13.171 13.763 14.412 15.125 15.884 16.682 17.591 18.671 19.777 21.1 22.639 24.463 26.556 29.041 31.975 35.483 38.618 40.642 42.014 42.896 43.505 43.963 44.32 44.567 44.754 44.849 44.901 44.956 45.0 45.022 45.02 45.004 44.975 44.948 44.906 44.85 44.801 44.734 44.661 44.607 44.549 44.47 44.38 44.294 44.227 44.158 44.048 43.968 43.895 43.856 43.758 43.635 43.501 43.436 43.335 43.22 43.136 43.038 42.797 42.676 42.542 42.397 42.237 42.008 41.702 40.702 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt deleted file mode 100644 index e82c06d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19433 ,KEBNE ,16692266,Thu Nov 25 18:02:48 CET,Thu Nov 25 19:56:09 CET,0.0 1.716 2.225 2.592 2.891 3.168 3.395 3.594 3.967 4.122 4.262 4.191 4.679 4.821 5.083 5.291 5.479 5.57 5.74 5.898 6.105 6.224 6.335 6.517 6.695 6.846 6.994 7.128 7.294 7.462 7.617 7.779 7.902 8.013 8.14 8.262 8.404 8.555 8.647 8.742 8.856 8.947 9.016 9.038 8.978 8.863 8.657 8.282 7.634 6.488 4.473 1.952 -0.131 -1.788 -3.21 -4.541 -5.775 -6.92 -7.842 -8.688 -9.399 -10.034 -10.638 -11.22 -11.757 -12.237 -12.753 -13.201 -13.574 -13.948 -14.335 -14.662 -14.991 -15.317 -15.554 -15.811 -16.089 -16.376 -16.671 -16.865 -17.065 -17.382 -17.605 -17.836 -17.953 -18.172 -18.393 -18.632 -18.759 -19.266 -19.2 -19.353 -19.521 -19.874 -20.067 -20.292 -20.548 -20.847 -21.197 -21.684 -23.223 -2 ,26344 ,KEBNE ,16692267,Thu Nov 25 18:02:47 CET,Thu Nov 25 19:55:10 CET,0.0 2.459 3.067 3.496 3.823 4.091 4.346 4.572 4.942 5.112 5.27 5.201 5.672 5.782 5.987 6.179 6.372 6.467 6.633 6.775 6.979 7.121 7.269 7.477 7.673 7.838 7.958 8.081 8.253 8.41 8.551 8.713 8.859 8.977 9.113 9.246 9.352 9.471 9.576 9.67 9.768 9.888 10.003 10.099 10.167 10.136 10.004 9.644 8.957 7.809 5.658 2.908 0.676 -1.238 -2.923 -4.344 -5.553 -6.641 -7.53 -8.394 -9.123 -9.762 -10.388 -11.0 -11.568 -12.072 -12.593 -13.041 -13.41 -13.801 -14.208 -14.537 -14.881 -15.249 -15.521 -15.788 -16.06 -16.343 -16.646 -16.854 -17.057 -17.374 -17.604 -17.838 -17.957 -18.202 -18.447 -18.707 -18.854 -19.372 -19.308 -19.47 -19.635 -20.007 -20.207 -20.432 -20.68 -20.937 -21.251 -21.666 -23.155 -3 ,27181 ,KEBNE ,16692268,Thu Nov 25 18:02:47 CET,Thu Nov 25 19:55:37 CET,0.0 1.425 1.876 2.193 2.478 2.74 2.956 3.145 3.478 3.615 3.746 3.634 4.088 4.193 4.391 4.587 4.775 4.859 5.022 5.171 5.38 5.509 5.635 5.804 5.937 6.053 6.165 6.287 6.448 6.598 6.737 6.904 7.053 7.167 7.297 7.468 7.62 7.749 7.895 8.032 8.137 8.228 8.265 8.332 8.383 8.376 8.319 8.077 7.578 6.488 4.403 1.9 -0.163 -1.961 -3.585 -5.033 -6.22 -7.271 -8.178 -9.029 -9.748 -10.407 -11.046 -11.64 -12.179 -12.646 -13.113 -13.518 -13.875 -14.268 -14.673 -15.0 -15.317 -15.624 -15.871 -16.146 -16.435 -16.726 -17.022 -17.225 -17.438 -17.764 -17.99 -18.225 -18.339 -18.582 -18.846 -19.125 -19.275 -19.796 -19.725 -19.882 -20.048 -20.407 -20.622 -20.86 -21.118 -21.405 -21.736 -22.171 -23.85 -4 ,19913 ,KEBNE ,16692269,Thu Nov 25 18:02:48 CET,Thu Nov 25 19:55:00 CET,0.0 1.894 2.354 2.689 2.952 3.183 3.382 3.569 3.924 4.068 4.194 4.09 4.551 4.654 4.845 5.044 5.25 5.346 5.515 5.673 5.899 6.036 6.166 6.354 6.522 6.675 6.815 6.935 7.077 7.209 7.351 7.508 7.657 7.818 7.973 8.111 8.225 8.352 8.481 8.578 8.652 8.726 8.794 8.87 8.917 8.861 8.695 8.337 7.77 6.889 5.086 2.654 0.542 -1.299 -2.87 -4.284 -5.484 -6.513 -7.414 -8.317 -9.043 -9.687 -10.303 -10.857 -11.399 -11.901 -12.408 -12.85 -13.214 -13.574 -13.948 -14.266 -14.603 -14.947 -15.219 -15.496 -15.774 -16.06 -16.359 -16.573 -16.793 -17.13 -17.363 -17.6 -17.726 -18.001 -18.276 -18.553 -18.696 -19.212 -19.138 -19.308 -19.501 -19.916 -20.13 -20.366 -20.621 -20.899 -21.251 -21.705 -23.05 -5 ,9642 ,KEBNE ,16692270,Thu Nov 25 18:02:48 CET,Thu Nov 25 19:55:26 CET,0.0 1.495 1.936 2.276 2.542 2.791 3.018 3.197 3.504 3.635 3.771 3.689 4.135 4.231 4.402 4.553 4.707 4.789 4.954 5.11 5.321 5.435 5.547 5.723 5.867 6.003 6.132 6.244 6.374 6.497 6.621 6.751 6.86 6.981 7.128 7.274 7.395 7.509 7.62 7.742 7.866 7.972 8.047 8.084 8.099 8.07 7.958 7.623 6.957 5.878 3.918 1.541 -0.555 -2.482 -4.112 -5.544 -6.759 -7.821 -8.741 -9.583 -10.271 -10.95 -11.611 -12.191 -12.706 -13.196 -13.715 -14.149 -14.524 -14.91 -15.316 -15.675 -16.047 -16.406 -16.676 -16.95 -17.225 -17.528 -17.836 -18.035 -18.243 -18.566 -18.782 -19.004 -19.121 -19.362 -19.605 -19.862 -20.003 -20.522 -20.476 -20.648 -20.831 -21.218 -21.418 -21.635 -21.883 -22.173 -22.514 -22.949 -24.24 -6 ,24726 ,KEBNE ,16692271,Thu Nov 25 18:02:48 CET,Thu Nov 25 19:55:13 CET,0.0 2.435 3.076 3.605 4.023 4.383 4.708 4.973 5.392 5.58 5.756 5.724 6.228 6.368 6.642 6.9 7.121 7.23 7.449 7.663 7.971 8.144 8.291 8.502 8.703 8.902 9.096 9.28 9.51 9.708 9.897 10.11 10.326 10.54 10.779 11.044 11.264 11.486 11.715 11.964 12.225 12.381 12.442 12.517 12.536 12.5 12.39 12.026 11.294 9.991 7.651 4.829 2.498 0.563 -0.929 -2.207 -3.328 -4.351 -5.235 -6.126 -6.92 -7.594 -8.222 -8.821 -9.368 -9.864 -10.369 -10.824 -11.195 -11.573 -11.982 -12.319 -12.653 -12.991 -13.277 -13.578 -13.87 -14.172 -14.474 -14.675 -14.887 -15.226 -15.461 -15.691 -15.81 -16.064 -16.336 -16.614 -16.756 -17.276 -17.195 -17.359 -17.538 -17.939 -18.163 -18.397 -18.651 -18.941 -19.297 -19.756 -21.867 -7 ,16346 ,KEBNE ,16692272,Thu Nov 25 18:03:51 CET,Thu Nov 25 19:57:48 CET,0.0 1.315 1.764 2.086 2.374 2.63 2.856 3.059 3.389 3.539 3.686 3.607 4.071 4.184 4.384 4.546 4.706 4.795 4.972 5.112 5.301 5.445 5.583 5.762 5.931 6.082 6.225 6.377 6.569 6.739 6.914 7.115 7.255 7.374 7.5 7.607 7.703 7.794 7.891 8.008 8.136 8.312 8.468 8.53 8.553 8.551 8.532 8.286 7.712 6.724 4.836 2.297 0.093 -1.715 -3.18 -4.512 -5.7 -6.769 -7.675 -8.584 -9.353 -10.005 -10.636 -11.21 -11.73 -12.209 -12.689 -13.116 -13.49 -13.864 -14.243 -14.568 -14.91 -15.253 -15.507 -15.768 -16.042 -16.33 -16.621 -16.808 -17.0 -17.291 -17.495 -17.718 -17.832 -18.08 -18.345 -18.613 -18.751 -19.256 -19.171 -19.32 -19.476 -19.827 -20.032 -20.245 -20.489 -20.776 -21.119 -21.554 -22.862 -8 ,21805 ,KEBNE ,16692273,Thu Nov 25 18:03:51 CET,Thu Nov 25 19:58:01 CET,0.0 1.575 2.083 2.418 2.695 2.945 3.157 3.355 3.706 3.853 3.992 3.903 4.363 4.494 4.739 4.954 5.152 5.243 5.389 5.509 5.692 5.822 5.955 6.162 6.355 6.546 6.733 6.883 7.046 7.19 7.324 7.487 7.654 7.809 7.965 8.136 8.274 8.383 8.493 8.599 8.689 8.762 8.847 8.874 8.801 8.683 8.517 8.182 7.49 6.387 4.506 2.151 0.161 -1.579 -3.147 -4.543 -5.715 -6.747 -7.63 -8.517 -9.274 -9.936 -10.546 -11.13 -11.684 -12.183 -12.687 -13.137 -13.539 -13.945 -14.381 -14.736 -15.075 -15.447 -15.74 -16.032 -16.327 -16.617 -16.909 -17.112 -17.33 -17.683 -17.926 -18.169 -18.297 -18.569 -18.841 -19.12 -19.268 -19.798 -19.784 -19.97 -20.158 -20.564 -20.776 -20.996 -21.232 -21.5 -21.822 -22.262 -23.773 -9 ,16511 ,KEBNE ,16692274,Thu Nov 25 18:03:51 CET,Thu Nov 25 19:58:13 CET,0.0 1.418 1.951 2.337 2.643 2.915 3.161 3.378 3.764 3.934 4.087 4.012 4.502 4.637 4.872 5.065 5.252 5.346 5.511 5.661 5.896 6.057 6.214 6.436 6.628 6.788 6.936 7.085 7.302 7.511 7.665 7.824 7.973 8.108 8.253 8.396 8.542 8.696 8.798 8.926 9.098 9.243 9.355 9.412 9.405 9.302 9.174 8.93 8.395 7.429 5.512 2.991 0.747 -1.17 -2.776 -4.124 -5.226 -6.214 -7.098 -8.005 -8.765 -9.416 -10.043 -10.652 -11.233 -11.755 -12.259 -12.697 -13.088 -13.491 -13.893 -14.228 -14.576 -14.928 -15.205 -15.483 -15.751 -16.033 -16.339 -16.546 -16.759 -17.094 -17.33 -17.58 -17.716 -17.988 -18.259 -18.543 -18.685 -19.203 -19.132 -19.286 -19.451 -19.816 -20.015 -20.229 -20.472 -20.745 -21.054 -21.5 -22.907 -10 ,32484 ,KEBNE ,16692275,Thu Nov 25 18:03:51 CET,Thu Nov 25 19:57:09 CET,0.0 1.644 2.141 2.495 2.797 3.067 3.306 3.5 3.785 3.917 4.054 3.983 4.46 4.578 4.802 4.996 5.165 5.244 5.392 5.542 5.763 5.901 6.029 6.205 6.385 6.559 6.719 6.854 7.034 7.231 7.387 7.556 7.726 7.883 8.049 8.205 8.329 8.491 8.689 8.874 9.07 9.279 9.483 9.645 9.743 9.719 9.551 9.301 8.872 7.987 6.125 3.726 1.695 -0.191 -1.735 -3.051 -4.221 -5.242 -6.102 -6.961 -7.733 -8.426 -9.06 -9.621 -10.112 -10.545 -11.013 -11.433 -11.798 -12.198 -12.616 -12.953 -13.276 -13.608 -13.869 -14.132 -14.411 -14.719 -15.04 -15.257 -15.472 -15.794 -16.025 -16.278 -16.404 -16.672 -16.948 -17.225 -17.372 -17.89 -17.821 -17.976 -18.146 -18.508 -18.706 -18.93 -19.178 -19.444 -19.755 -20.168 -21.683 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index ad4a32d6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18686 ,KEBNE ,16692276,Thu Nov 25 18:03:51 CET,Thu Nov 25 19:56:02 CET,0.0 1.557 2.054 2.407 2.702 2.946 3.155 3.341 3.689 3.84 3.98 3.902 4.362 4.46 4.659 4.856 5.038 5.113 5.258 5.412 5.631 5.762 5.867 6.008 6.15 6.302 6.458 6.586 6.73 6.868 7.031 7.215 7.33 7.432 7.553 7.681 7.775 7.853 7.923 7.996 8.072 8.153 8.221 8.247 8.235 8.123 7.918 7.692 7.223 6.135 4.024 1.427 -0.705 -2.514 -4.083 -5.531 -6.798 -7.922 -8.868 -9.763 -10.478 -11.1 -11.688 -12.237 -12.766 -13.274 -13.794 -14.247 -14.637 -15.023 -15.414 -15.747 -16.1 -16.461 -16.725 -16.994 -17.288 -17.599 -17.918 -18.14 -18.362 -18.694 -18.926 -19.181 -19.316 -19.579 -19.848 -20.136 -20.283 -20.813 -20.84 -21.049 -21.273 -21.745 -21.996 -22.255 -22.517 -22.808 -23.209 -23.791 -25.722 -2 ,18421 ,KEBNE ,16692277,Thu Nov 25 18:03:51 CET,Thu Nov 25 19:56:51 CET,0.0 1.867 2.342 2.679 2.966 3.211 3.418 3.593 3.878 4.005 4.113 3.993 4.46 4.556 4.73 4.899 5.049 5.114 5.238 5.373 5.574 5.698 5.807 5.939 6.054 6.16 6.247 6.322 6.427 6.537 6.646 6.764 6.852 6.921 7.01 7.111 7.184 7.252 7.321 7.386 7.435 7.444 7.391 7.303 7.158 6.934 6.589 6.085 5.299 4.0 1.672 -1.114 -3.35 -5.217 -6.81 -8.191 -9.329 -10.357 -11.268 -12.131 -12.827 -13.436 -14.01 -14.544 -15.043 -15.51 -16.012 -16.47 -16.853 -17.23 -17.638 -17.989 -18.335 -18.696 -18.984 -19.278 -19.592 -19.925 -20.258 -20.482 -20.712 -21.069 -21.321 -21.58 -21.716 -21.995 -22.279 -22.588 -22.758 -23.288 -23.249 -23.424 -23.605 -23.99 -24.224 -24.494 -24.812 -25.159 -25.526 -26.051 -28.02 -3 ,24967 ,KEBNE ,16692278,Thu Nov 25 18:03:51 CET,Thu Nov 25 19:56:26 CET,0.0 1.712 2.122 2.403 2.626 2.83 3.011 3.175 3.457 3.594 3.716 3.557 3.99 4.076 4.228 4.365 4.506 4.568 4.672 4.771 4.916 5.013 5.109 5.242 5.366 5.473 5.56 5.655 5.8 5.941 6.055 6.177 6.299 6.398 6.479 6.546 6.602 6.685 6.79 6.86 6.893 6.921 6.902 6.856 6.758 6.543 6.203 5.721 4.943 3.806 1.95 -0.4 -2.472 -4.328 -5.872 -7.276 -8.436 -9.404 -10.292 -11.19 -11.897 -12.508 -13.117 -13.701 -14.228 -14.702 -15.185 -15.607 -15.983 -16.368 -16.758 -17.089 -17.431 -17.771 -18.029 -18.289 -18.548 -18.815 -19.085 -19.268 -19.464 -19.783 -20.002 -20.224 -20.346 -20.617 -20.905 -21.226 -21.402 -21.942 -21.917 -22.104 -22.3 -22.742 -23.016 -23.309 -23.616 -23.969 -24.417 -25.065 -27.058 -4 ,23732 ,KEBNE ,16692279,Thu Nov 25 18:03:52 CET,Thu Nov 25 19:55:55 CET,0.0 1.412 1.865 2.218 2.48 2.701 2.901 3.08 3.395 3.527 3.652 3.552 4.005 4.109 4.313 4.49 4.643 4.718 4.862 4.989 5.165 5.272 5.369 5.51 5.643 5.756 5.843 5.943 6.075 6.176 6.27 6.373 6.465 6.551 6.669 6.794 6.892 6.997 7.088 7.197 7.303 7.377 7.447 7.464 7.428 7.319 7.073 6.709 6.138 5.095 3.144 0.582 -1.644 -3.56 -5.158 -6.518 -7.732 -8.759 -9.607 -10.463 -11.206 -11.878 -12.493 -13.063 -13.588 -14.074 -14.568 -14.989 -15.377 -15.778 -16.191 -16.524 -16.843 -17.176 -17.446 -17.732 -18.03 -18.339 -18.668 -18.889 -19.099 -19.409 -19.63 -19.857 -19.97 -20.202 -20.447 -20.715 -20.861 -21.387 -21.357 -21.538 -21.732 -22.169 -22.404 -22.624 -22.86 -23.18 -23.584 -24.094 -25.769 -5 ,26435 ,KEBNE ,16692280,Thu Nov 25 18:03:50 CET,Thu Nov 25 19:55:32 CET,0.0 1.817 2.251 2.543 2.777 2.983 3.176 3.353 3.646 3.787 3.935 3.839 4.308 4.417 4.595 4.754 4.914 4.992 5.157 5.312 5.505 5.612 5.718 5.869 6.008 6.14 6.247 6.348 6.483 6.614 6.761 6.918 7.028 7.128 7.232 7.332 7.416 7.5 7.573 7.635 7.671 7.688 7.709 7.724 7.64 7.4 7.006 6.352 5.352 4.014 1.837 -1.072 -3.395 -5.196 -6.667 -7.972 -9.144 -10.198 -11.082 -11.946 -12.69 -13.367 -13.977 -14.505 -14.999 -15.466 -15.943 -16.359 -16.719 -17.079 -17.45 -17.758 -18.075 -18.424 -18.697 -18.969 -19.253 -19.553 -19.866 -20.075 -20.282 -20.588 -20.791 -21.009 -21.126 -21.374 -21.651 -21.935 -22.075 -22.586 -22.537 -22.709 -22.905 -23.323 -23.55 -23.813 -24.092 -24.448 -24.903 -25.459 -27.153 -6 ,31489 ,KEBNE ,16692281,Thu Nov 25 18:03:50 CET,Thu Nov 25 19:55:54 CET,0.0 1.686 2.125 2.43 2.667 2.888 3.084 3.227 3.491 3.626 3.757 3.62 4.068 4.166 4.345 4.49 4.625 4.689 4.808 4.929 5.105 5.215 5.318 5.471 5.631 5.779 5.913 6.045 6.189 6.314 6.429 6.582 6.743 6.893 7.052 7.199 7.318 7.424 7.525 7.622 7.713 7.785 7.83 7.814 7.733 7.55 7.182 6.667 5.931 4.793 2.779 0.134 -2.192 -4.204 -5.832 -7.228 -8.415 -9.427 -10.311 -11.229 -11.997 -12.672 -13.296 -13.855 -14.385 -14.864 -15.33 -15.751 -16.13 -16.519 -16.914 -17.237 -17.583 -17.946 -18.206 -18.455 -18.711 -18.985 -19.279 -19.486 -19.704 -20.029 -20.254 -20.498 -20.625 -20.889 -21.17 -21.469 -21.627 -22.151 -22.116 -22.29 -22.477 -22.926 -23.19 -23.461 -23.755 -24.095 -24.499 -25.03 -26.56 -7 ,25706 ,KEBNE ,16692282,Thu Nov 25 18:03:51 CET,Thu Nov 25 19:55:55 CET,0.0 2.813 3.321 3.609 3.853 4.096 4.316 4.531 4.884 5.023 5.141 4.982 5.427 5.533 5.749 5.932 6.077 6.143 6.271 6.412 6.62 6.744 6.85 6.979 7.103 7.229 7.354 7.463 7.61 7.748 7.862 7.989 8.097 8.205 8.322 8.451 8.567 8.662 8.763 8.848 8.902 8.927 8.917 8.864 8.738 8.557 8.273 7.708 6.791 5.379 2.81 -0.172 -2.485 -4.344 -5.875 -7.244 -8.41 -9.456 -10.377 -11.311 -12.094 -12.779 -13.45 -14.066 -14.615 -15.107 -15.634 -16.121 -16.519 -16.912 -17.329 -17.679 -18.032 -18.386 -18.665 -18.949 -19.233 -19.545 -19.87 -20.095 -20.342 -20.716 -20.972 -21.243 -21.378 -21.662 -21.974 -22.304 -22.471 -23.005 -22.987 -23.165 -23.363 -23.833 -24.101 -24.392 -24.704 -25.085 -25.566 -26.145 -28.341 -9 ,22719 ,KEBNE ,16692284,Thu Nov 25 18:03:51 CET,Thu Nov 25 19:55:46 CET,0.0 1.828 2.298 2.639 2.895 3.095 3.278 3.453 3.748 3.873 4.006 3.913 4.351 4.448 4.648 4.837 4.993 5.066 5.214 5.332 5.49 5.592 5.684 5.812 5.926 6.036 6.167 6.3 6.461 6.601 6.719 6.849 6.954 7.053 7.168 7.287 7.398 7.515 7.632 7.727 7.796 7.869 7.907 7.901 7.814 7.633 7.419 7.022 6.266 4.929 2.549 -0.391 -2.776 -4.592 -6.14 -7.592 -8.849 -9.917 -10.793 -11.652 -12.362 -13.003 -13.601 -14.153 -14.669 -15.122 -15.581 -15.986 -16.349 -16.729 -17.122 -17.451 -17.773 -18.106 -18.367 -18.635 -18.918 -19.229 -19.561 -19.777 -19.984 -20.3 -20.525 -20.765 -20.898 -21.17 -21.445 -21.754 -21.919 -22.438 -22.437 -22.63 -22.819 -23.227 -23.453 -23.711 -24.005 -24.343 -24.761 -25.31 -26.747 -10 ,11117 ,KEBNE ,16692285,Thu Nov 25 18:04:54 CET,Thu Nov 25 19:56:42 CET,0.0 1.652 2.149 2.494 2.749 2.978 3.175 3.339 3.606 3.731 3.867 3.751 4.203 4.301 4.487 4.656 4.813 4.893 5.043 5.178 5.357 5.465 5.572 5.746 5.911 6.051 6.177 6.286 6.419 6.542 6.643 6.765 6.899 7.023 7.147 7.263 7.36 7.43 7.49 7.566 7.64 7.697 7.728 7.747 7.688 7.575 7.377 6.927 6.275 5.184 2.957 0.237 -2.052 -4.059 -5.749 -7.134 -8.28 -9.339 -10.265 -11.145 -11.853 -12.489 -13.111 -13.688 -14.22 -14.707 -15.213 -15.65 -16.016 -16.4 -16.814 -17.172 -17.532 -17.886 -18.164 -18.465 -18.776 -19.081 -19.399 -19.615 -19.83 -20.189 -20.437 -20.683 -20.813 -21.071 -21.326 -21.581 -21.715 -22.218 -22.153 -22.324 -22.494 -22.866 -23.1 -23.366 -23.648 -23.958 -24.338 -24.987 -28.32 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt deleted file mode 100644 index 118327c6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,3699 ,KEBNE ,16692287,Thu Nov 25 18:04:53 CET,Thu Nov 25 19:57:05 CET,0.0 2.043 2.728 3.236 3.674 4.064 4.398 4.732 5.393 5.692 5.967 5.995 6.744 7.005 7.501 7.978 8.453 8.696 9.169 9.613 10.277 10.713 11.139 11.767 12.385 13.003 13.611 14.209 14.992 15.758 16.524 17.466 18.377 19.264 20.317 21.55 22.791 24.187 25.748 27.479 29.323 31.424 33.959 36.614 39.854 43.625 48.146 53.532 60.239 68.776 80.371 91.485 99.018 104.525 108.694 111.976 114.52 116.616 118.312 119.844 121.029 122.037 122.947 123.731 124.405 124.979 125.553 126.033 126.403 126.745 127.083 127.349 127.588 127.817 127.962 128.082 128.206 128.335 128.465 128.542 128.609 128.705 128.762 128.796 128.803 128.824 128.843 128.831 128.818 128.446 128.734 128.678 128.619 128.475 128.394 128.285 128.107 127.885 127.623 127.269 125.453 -7 ,3241 ,KEBNE ,16692292,Thu Nov 25 18:04:54 CET,Thu Nov 25 19:57:49 CET,0.0 1.795 2.435 2.943 3.381 3.78 4.141 4.467 5.074 5.364 5.646 5.683 6.441 6.698 7.18 7.665 8.149 8.388 8.864 9.339 10.04 10.481 10.908 11.556 12.201 12.83 13.449 14.047 14.843 15.628 16.372 17.297 18.247 19.172 20.254 21.498 22.712 24.078 25.609 27.278 29.071 31.163 33.694 36.364 39.566 43.321 48.047 53.795 60.962 70.13 82.5 94.194 102.1 107.773 111.938 115.226 117.841 119.992 121.688 123.216 124.394 125.331 126.158 126.904 127.555 128.082 128.557 128.973 129.334 129.685 130.023 130.285 130.535 130.747 130.907 131.078 131.209 131.303 131.403 131.474 131.538 131.632 131.677 131.696 131.704 131.712 131.698 131.662 131.638 131.25 131.544 131.506 131.467 131.367 131.289 131.163 130.99 130.78 130.489 130.016 127.506 -9 ,16211 ,KEBNE ,16692294,Thu Nov 25 18:05:56 CET,Thu Nov 25 19:58:07 CET,0.0 1.538 2.148 2.627 3.038 3.414 3.751 4.072 4.681 4.99 5.284 5.345 6.13 6.404 6.927 7.461 7.983 8.231 8.713 9.19 9.874 10.309 10.75 11.411 12.054 12.696 13.332 13.952 14.752 15.539 16.319 17.283 18.253 19.205 20.292 21.527 22.748 24.136 25.703 27.429 29.259 31.425 34.16 37.026 40.439 44.356 49.101 54.79 61.996 71.199 83.522 95.172 103.154 108.952 113.169 116.426 118.992 121.137 122.821 124.364 125.597 126.586 127.453 128.249 128.938 129.5 130.033 130.466 130.818 131.185 131.548 131.819 132.068 132.286 132.441 132.61 132.772 132.924 133.076 133.147 133.202 133.3 133.355 133.399 133.417 133.441 133.452 133.442 133.422 133.035 133.35 133.32 133.273 133.126 133.042 132.934 132.785 132.594 132.343 131.929 129.647 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt deleted file mode 100644 index 22ee06f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30628 ,KEBNE ,16692296,Thu Nov 25 18:05:56 CET,Thu Nov 25 20:03:51 CET,0.0 2.027 2.411 2.685 2.894 3.061 3.213 3.354 3.599 3.729 3.863 3.72 4.197 4.288 4.474 4.653 4.81 4.885 5.029 5.161 5.343 5.454 5.563 5.721 5.879 6.037 6.192 6.348 6.533 6.699 6.859 7.053 7.245 7.435 7.655 7.891 8.099 8.332 8.593 8.855 9.113 9.395 9.701 9.977 10.291 10.657 11.032 11.384 11.757 12.025 12.02 11.754 11.334 10.844 10.439 10.051 9.645 9.252 8.93 8.616 8.329 8.064 7.8 7.547 7.315 7.111 6.893 6.698 6.534 6.351 6.154 5.986 5.814 5.633 5.486 5.344 5.188 5.016 4.842 4.719 4.59 4.384 4.24 4.087 4.012 3.867 3.709 3.538 3.446 2.977 3.159 3.048 2.938 2.688 2.524 2.35 2.174 1.954 1.712 1.415 0.109 -2 ,17296 ,KEBNE ,16692297,Thu Nov 25 18:05:57 CET,Thu Nov 25 20:03:23 CET,0.0 2.491 2.938 3.211 3.422 3.614 3.79 3.944 4.22 4.337 4.439 4.252 4.719 4.807 4.972 5.119 5.258 5.329 5.47 5.61 5.809 5.923 6.031 6.19 6.343 6.485 6.626 6.772 6.954 7.118 7.274 7.462 7.645 7.814 8.002 8.231 8.445 8.671 8.918 9.16 9.403 9.68 9.997 10.28 10.573 10.869 11.194 11.577 11.931 12.168 12.245 12.014 11.639 11.203 10.762 10.355 9.979 9.621 9.312 8.983 8.681 8.419 8.167 7.925 7.688 7.477 7.26 7.058 6.886 6.698 6.502 6.332 6.149 5.965 5.82 5.655 5.479 5.295 5.1 4.971 4.846 4.661 4.526 4.383 4.313 4.163 3.992 3.814 3.723 3.251 3.41 3.288 3.154 2.863 2.715 2.557 2.369 2.136 1.853 1.479 -0.11 -3 ,29125 ,KEBNE ,16692298,Thu Nov 25 18:05:56 CET,Thu Nov 25 20:03:17 CET,0.0 1.599 1.964 2.219 2.417 2.586 2.745 2.887 3.116 3.219 3.321 3.133 3.597 3.687 3.857 4.012 4.169 4.247 4.395 4.541 4.739 4.859 4.981 5.162 5.329 5.479 5.632 5.777 5.969 6.157 6.32 6.505 6.675 6.833 7.011 7.212 7.408 7.615 7.839 8.073 8.301 8.541 8.813 9.098 9.418 9.758 10.106 10.445 10.776 10.995 10.987 10.71 10.342 9.9 9.462 9.063 8.675 8.305 7.984 7.645 7.313 7.003 6.714 6.451 6.225 6.019 5.799 5.598 5.426 5.244 5.041 4.88 4.721 4.543 4.4 4.253 4.109 3.968 3.807 3.683 3.561 3.384 3.262 3.133 3.063 2.914 2.752 2.572 2.478 2.007 2.175 2.059 1.932 1.641 1.499 1.351 1.171 0.965 0.708 0.352 -1.196 -4 ,8880 ,KEBNE ,16692299,Thu Nov 25 18:05:56 CET,Thu Nov 25 20:03:55 CET,0.0 2.063 2.447 2.709 2.919 3.085 3.23 3.377 3.643 3.757 3.871 3.699 4.175 4.26 4.414 4.563 4.702 4.762 4.877 4.997 5.178 5.298 5.412 5.562 5.705 5.845 5.98 6.107 6.274 6.425 6.566 6.75 6.925 7.09 7.286 7.504 7.69 7.898 8.139 8.371 8.602 8.866 9.173 9.462 9.754 10.07 10.424 10.776 11.119 11.373 11.401 11.028 10.514 10.009 9.528 9.057 8.616 8.194 7.834 7.489 7.184 6.906 6.643 6.392 6.15 5.932 5.705 5.505 5.342 5.168 4.976 4.815 4.639 4.449 4.299 4.139 3.966 3.796 3.637 3.527 3.413 3.228 3.098 2.967 2.897 2.746 2.587 2.417 2.32 1.846 2.019 1.903 1.789 1.544 1.403 1.23 1.03 0.805 0.541 0.22 -1.309 -5 ,562 ,KEBNE ,16692300,Thu Nov 25 18:05:56 CET,Thu Nov 25 20:04:20 CET,0.0 1.669 2.053 2.325 2.536 2.726 2.894 3.051 3.306 3.412 3.521 3.348 3.821 3.915 4.087 4.237 4.381 4.455 4.593 4.721 4.912 5.034 5.148 5.309 5.46 5.604 5.742 5.881 6.067 6.24 6.409 6.6 6.77 6.937 7.136 7.356 7.55 7.76 8.002 8.246 8.475 8.737 9.045 9.325 9.641 9.984 10.336 10.669 11.011 11.31 11.392 11.096 10.68 10.264 9.874 9.467 9.07 8.703 8.364 8.005 7.697 7.428 7.171 6.929 6.697 6.483 6.276 6.087 5.918 5.745 5.559 5.396 5.22 5.047 4.913 4.774 4.626 4.472 4.32 4.213 4.097 3.918 3.798 3.671 3.601 3.453 3.292 3.119 3.028 2.557 2.74 2.627 2.515 2.284 2.159 2.008 1.822 1.608 1.345 0.99 -0.909 -6 ,5985 ,KEBNE ,16692301,Thu Nov 25 18:05:56 CET,Thu Nov 25 20:03:30 CET,0.0 1.59 1.961 2.244 2.454 2.611 2.768 2.923 3.195 3.311 3.418 3.228 3.698 3.792 3.973 4.139 4.283 4.355 4.488 4.601 4.761 4.866 4.977 5.146 5.313 5.471 5.606 5.732 5.902 6.071 6.24 6.43 6.608 6.795 7.008 7.232 7.435 7.653 7.89 8.141 8.409 8.687 8.983 9.282 9.615 9.952 10.299 10.654 11.021 11.322 11.415 11.14 10.762 10.376 9.977 9.55 9.152 8.76 8.41 8.053 7.73 7.443 7.189 6.945 6.701 6.481 6.26 6.074 5.913 5.737 5.549 5.388 5.215 5.042 4.911 4.772 4.623 4.463 4.295 4.177 4.057 3.857 3.718 3.573 3.497 3.35 3.207 3.051 2.959 2.48 2.647 2.533 2.41 2.149 2.016 1.87 1.707 1.514 1.272 0.956 -0.669 -7 ,7347 ,KEBNE ,16692302,Thu Nov 25 18:05:56 CET,Thu Nov 25 20:03:50 CET,0.0 1.789 2.148 2.415 2.631 2.811 2.977 3.116 3.361 3.473 3.575 3.393 3.858 3.941 4.099 4.244 4.406 4.485 4.624 4.757 4.937 5.045 5.151 5.306 5.451 5.602 5.742 5.867 6.031 6.185 6.328 6.51 6.678 6.834 7.019 7.216 7.398 7.59 7.791 8.004 8.223 8.453 8.721 9.002 9.314 9.639 9.957 10.246 10.521 10.702 10.753 10.491 10.039 9.595 9.183 8.776 8.387 8.02 7.708 7.367 7.068 6.807 6.547 6.298 6.053 5.837 5.623 5.423 5.242 5.052 4.853 4.676 4.493 4.315 4.178 4.037 3.889 3.737 3.58 3.464 3.338 3.133 2.986 2.829 2.752 2.604 2.448 2.274 2.182 1.71 1.885 1.774 1.654 1.4 1.261 1.1 0.911 0.699 0.427 0.049 -1.623 -8 ,5620 ,KEBNE ,16692303,Thu Nov 25 18:06:59 CET,Thu Nov 25 20:05:58 CET,0.0 2.479 2.92 3.219 3.457 3.671 3.868 4.04 4.356 4.492 4.612 4.462 4.936 5.024 5.205 5.373 5.527 5.602 5.741 5.879 6.076 6.194 6.31 6.481 6.648 6.805 6.944 7.082 7.27 7.451 7.623 7.832 8.021 8.198 8.404 8.633 8.853 9.085 9.301 9.514 9.742 9.999 10.307 10.591 10.909 11.282 11.684 12.065 12.394 12.641 12.723 12.505 12.121 11.693 11.273 10.867 10.52 10.178 9.85 9.518 9.222 8.971 8.748 8.514 8.281 8.08 7.859 7.659 7.48 7.284 7.092 6.932 6.756 6.562 6.413 6.262 6.107 5.948 5.77 5.641 5.505 5.299 5.159 5.005 4.93 4.775 4.605 4.407 4.305 3.829 3.997 3.882 3.753 3.476 3.33 3.162 2.976 2.765 2.513 2.18 0.976 -9 ,8975 ,KEBNE ,16692304,Thu Nov 25 18:06:58 CET,Thu Nov 25 20:05:34 CET,0.0 1.764 2.145 2.421 2.655 2.861 3.03 3.169 3.419 3.539 3.665 3.519 4.008 4.11 4.296 4.461 4.614 4.687 4.825 4.96 5.144 5.257 5.364 5.513 5.666 5.82 5.961 6.1 6.28 6.45 6.613 6.81 6.997 7.172 7.384 7.623 7.833 8.051 8.287 8.538 8.799 9.071 9.362 9.648 9.968 10.299 10.68 11.066 11.393 11.644 11.701 11.403 10.991 10.57 10.146 9.718 9.322 8.955 8.624 8.289 7.98 7.686 7.419 7.181 6.972 6.772 6.545 6.338 6.165 5.988 5.795 5.633 5.469 5.293 5.153 5.009 4.853 4.691 4.522 4.403 4.285 4.09 3.955 3.811 3.732 3.575 3.412 3.235 3.15 2.685 2.877 2.776 2.658 2.386 2.243 2.094 1.92 1.733 1.504 1.157 -0.324 -10 ,3710 ,KEBNE ,16692305,Thu Nov 25 18:06:59 CET,Thu Nov 25 20:06:02 CET,0.0 1.567 1.985 2.27 2.486 2.675 2.861 3.015 3.28 3.404 3.51 3.318 3.786 3.877 4.05 4.22 4.381 4.457 4.594 4.731 4.933 5.046 5.147 5.304 5.455 5.597 5.733 5.867 6.04 6.197 6.354 6.551 6.736 6.91 7.099 7.304 7.501 7.714 7.946 8.193 8.435 8.697 8.989 9.267 9.594 9.944 10.298 10.641 10.989 11.25 11.286 10.944 10.454 9.936 9.475 9.04 8.637 8.287 7.971 7.627 7.313 7.027 6.771 6.537 6.316 6.105 5.88 5.684 5.511 5.33 5.15 5.0 4.841 4.665 4.52 4.365 4.203 4.042 3.882 3.766 3.645 3.458 3.334 3.208 3.141 2.998 2.832 2.658 2.577 2.112 2.297 2.195 2.083 1.83 1.676 1.502 1.32 1.119 0.87 0.52 -0.738 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index bd94b22b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6133 ,KEBNE ,16692306,Thu Nov 25 18:06:59 CET,Thu Nov 25 20:04:29 CET,0.0 2.077 2.453 2.717 2.923 3.104 3.269 3.426 3.715 3.843 3.959 3.778 4.249 4.337 4.511 4.673 4.83 4.908 5.056 5.195 5.4 5.529 5.651 5.829 5.993 6.155 6.316 6.472 6.665 6.852 7.029 7.235 7.436 7.63 7.848 8.093 8.318 8.572 8.86 9.146 9.433 9.758 10.144 10.545 11.026 11.54 12.103 12.736 13.423 14.131 14.852 15.291 15.45 15.407 15.218 15.024 14.847 14.655 14.469 14.285 14.126 13.949 13.745 13.562 13.397 13.228 13.044 12.882 12.742 12.596 12.439 12.302 12.15 11.994 11.861 11.724 11.597 11.462 11.321 11.224 11.124 10.958 10.843 10.723 10.658 10.518 10.365 10.202 10.118 9.66 9.858 9.754 9.64 9.388 9.251 9.118 8.955 8.749 8.52 8.201 6.926 -2 ,16502 ,KEBNE ,16692307,Thu Nov 25 18:08:01 CET,Thu Nov 25 20:05:55 CET,0.0 1.166 1.618 1.98 2.209 2.406 2.583 2.741 3.005 3.13 3.246 3.077 3.551 3.646 3.829 4.002 4.169 4.251 4.413 4.568 4.783 4.914 5.042 5.227 5.417 5.595 5.755 5.921 6.128 6.314 6.498 6.711 6.915 7.126 7.376 7.668 7.944 8.223 8.521 8.842 9.181 9.548 9.968 10.396 10.901 11.479 12.128 12.835 13.643 14.546 15.456 16.025 16.223 16.2 16.069 15.872 15.651 15.423 15.224 15.016 14.8 14.611 14.437 14.264 14.085 13.911 13.745 13.596 13.454 13.297 13.128 12.99 12.848 12.698 12.576 12.449 12.318 12.183 12.049 11.945 11.834 11.662 11.542 11.419 11.352 11.212 11.058 10.88 10.79 10.329 10.498 10.397 10.295 10.037 9.888 9.724 9.544 9.323 9.06 8.731 7.38 -3 ,28594 ,KEBNE ,16692308,Thu Nov 25 18:08:02 CET,Thu Nov 25 20:06:59 CET,0.0 2.018 2.359 2.607 2.808 2.995 3.151 3.287 3.552 3.679 3.798 3.63 4.109 4.205 4.382 4.545 4.702 4.781 4.924 5.054 5.238 5.358 5.48 5.66 5.826 5.993 6.156 6.299 6.488 6.681 6.864 7.074 7.271 7.47 7.708 7.971 8.209 8.467 8.756 9.054 9.369 9.73 10.139 10.54 11.009 11.519 12.106 12.747 13.44 14.176 14.947 15.498 15.687 15.654 15.523 15.366 15.18 14.945 14.744 14.554 14.368 14.203 14.038 13.866 13.686 13.515 13.338 13.177 13.037 12.888 12.733 12.594 12.444 12.3 12.186 12.057 11.921 11.768 11.607 11.504 11.398 11.23 11.103 10.973 10.909 10.77 10.614 10.452 10.373 9.914 10.102 10.0 9.882 9.595 9.44 9.286 9.114 8.899 8.64 8.292 6.967 -4 ,24419 ,KEBNE ,16692309,Thu Nov 25 18:09:04 CET,Thu Nov 25 20:05:11 CET,0.0 1.556 1.929 2.206 2.45 2.67 2.865 3.03 3.309 3.443 3.57 3.417 3.914 4.017 4.207 4.386 4.561 4.643 4.793 4.935 5.149 5.29 5.42 5.596 5.762 5.93 6.093 6.248 6.458 6.659 6.846 7.084 7.316 7.534 7.783 8.061 8.332 8.63 8.952 9.284 9.61 9.969 10.39 10.808 11.281 11.79 12.394 13.097 13.863 14.633 15.395 15.903 16.077 16.068 15.945 15.717 15.484 15.296 15.126 14.897 14.673 14.484 14.288 14.102 13.915 13.738 13.563 13.401 13.261 13.124 12.969 12.827 12.683 12.531 12.405 12.272 12.139 12.003 11.856 11.747 11.63 11.442 11.309 11.174 11.102 10.954 10.794 10.628 10.546 10.087 10.245 10.128 10.011 9.759 9.616 9.46 9.282 9.071 8.824 8.476 6.599 -5 ,18046 ,KEBNE ,16692310,Thu Nov 25 18:09:04 CET,Thu Nov 25 20:03:53 CET,0.0 1.419 1.806 2.058 2.266 2.437 2.596 2.747 3.018 3.145 3.269 3.116 3.594 3.692 3.867 4.022 4.173 4.244 4.379 4.512 4.699 4.815 4.934 5.105 5.282 5.465 5.642 5.808 6.014 6.221 6.41 6.619 6.831 7.027 7.248 7.506 7.746 8.004 8.292 8.606 8.929 9.295 9.72 10.14 10.615 11.101 11.642 12.27 12.99 13.77 14.631 15.173 15.343 15.334 15.21 15.052 14.888 14.7 14.506 14.291 14.106 13.936 13.755 13.572 13.397 13.24 13.081 12.937 12.798 12.63 12.461 12.325 12.169 12.017 11.901 11.767 11.623 11.476 11.319 11.214 11.108 10.933 10.809 10.673 10.602 10.453 10.282 10.09 9.994 9.525 9.685 9.567 9.441 9.172 9.02 8.85 8.67 8.467 8.201 7.837 5.993 -6 ,21036 ,KEBNE ,16692311,Thu Nov 25 18:09:04 CET,Thu Nov 25 20:06:16 CET,0.0 1.264 1.584 1.822 2.026 2.206 2.374 2.524 2.783 2.899 3.008 2.844 3.321 3.416 3.589 3.753 3.908 3.978 4.116 4.252 4.45 4.576 4.699 4.884 5.063 5.237 5.403 5.561 5.77 5.984 6.183 6.405 6.622 6.83 7.056 7.313 7.573 7.848 8.122 8.415 8.74 9.114 9.516 9.901 10.362 10.906 11.54 12.218 12.987 13.827 14.701 15.174 15.269 15.213 15.061 14.841 14.607 14.397 14.21 13.992 13.797 13.63 13.458 13.281 13.109 12.955 12.788 12.63 12.489 12.336 12.174 12.032 11.882 11.721 11.6 11.477 11.336 11.188 11.038 10.934 10.824 10.646 10.522 10.39 10.325 10.185 10.032 9.85 9.761 9.301 9.46 9.35 9.233 8.965 8.812 8.637 8.448 8.237 7.926 7.526 6.276 -7 ,18723 ,KEBNE ,16692312,Thu Nov 25 18:09:04 CET,Thu Nov 25 20:07:07 CET,0.0 1.708 2.047 2.298 2.506 2.672 2.815 2.949 3.189 3.305 3.424 3.258 3.733 3.83 4.016 4.194 4.358 4.436 4.586 4.731 4.946 5.089 5.222 5.4 5.57 5.737 5.893 6.044 6.242 6.443 6.636 6.855 7.071 7.283 7.522 7.788 8.035 8.303 8.595 8.899 9.215 9.568 9.976 10.386 10.858 11.386 12.0 12.664 13.41 14.257 15.147 15.633 15.774 15.77 15.682 15.542 15.352 15.154 14.99 14.811 14.627 14.431 14.239 14.049 13.857 13.694 13.523 13.361 13.222 13.07 12.883 12.726 12.588 12.432 12.305 12.182 12.049 11.911 11.764 11.664 11.558 11.378 11.242 11.111 11.045 10.902 10.75 10.579 10.491 10.028 10.209 10.104 9.988 9.733 9.586 9.408 9.223 9.023 8.764 8.415 6.767 -8 ,17133 ,KEBNE ,16692313,Thu Nov 25 18:09:04 CET,Thu Nov 25 20:08:15 CET,0.0 1.581 1.937 2.169 2.373 2.567 2.735 2.882 3.136 3.249 3.366 3.203 3.681 3.779 3.96 4.125 4.286 4.368 4.528 4.668 4.87 5.005 5.134 5.309 5.47 5.628 5.779 5.925 6.113 6.289 6.469 6.688 6.881 7.061 7.273 7.526 7.798 8.093 8.388 8.7 9.026 9.403 9.868 10.336 10.853 11.441 12.108 12.773 13.511 14.318 15.177 15.727 15.913 15.933 15.84 15.674 15.479 15.266 15.052 14.813 14.596 14.414 14.244 14.076 13.923 13.768 13.588 13.413 13.262 13.118 12.969 12.842 12.711 12.565 12.45 12.335 12.207 12.059 11.902 11.8 11.694 11.529 11.422 11.306 11.237 11.087 10.921 10.744 10.662 10.21 10.387 10.279 10.159 9.883 9.743 9.58 9.385 9.178 8.948 8.557 7.05 -9 ,15113 ,KEBNE ,16692314,Thu Nov 25 18:10:07 CET,Thu Nov 25 20:06:05 CET,0.0 1.819 2.189 2.442 2.638 2.813 2.971 3.131 3.421 3.539 3.648 3.485 3.962 4.05 4.208 4.362 4.521 4.597 4.742 4.876 5.064 5.181 5.295 5.475 5.651 5.812 5.968 6.122 6.309 6.473 6.638 6.848 7.041 7.235 7.464 7.712 7.948 8.213 8.501 8.803 9.111 9.467 9.902 10.322 10.777 11.277 11.856 12.478 13.169 13.919 14.643 15.107 15.263 15.26 15.128 14.914 14.721 14.539 14.34 14.135 13.963 13.808 13.67 13.532 13.368 13.201 13.032 12.861 12.715 12.564 12.39 12.248 12.101 11.955 11.837 11.714 11.588 11.453 11.31 11.211 11.11 10.928 10.788 10.649 10.583 10.441 10.289 10.133 10.048 9.587 9.768 9.662 9.547 9.284 9.141 8.987 8.805 8.606 8.347 7.951 6.425 -10 ,20279 ,KEBNE ,16692315,Thu Nov 25 18:10:07 CET,Thu Nov 25 20:06:34 CET,0.0 1.558 1.934 2.224 2.428 2.612 2.778 2.915 3.156 3.267 3.381 3.213 3.681 3.773 3.953 4.123 4.287 4.363 4.51 4.647 4.844 4.973 5.097 5.276 5.445 5.613 5.771 5.919 6.119 6.303 6.479 6.704 6.912 7.109 7.349 7.609 7.849 8.116 8.399 8.695 9.011 9.389 9.833 10.259 10.762 11.31 11.895 12.557 13.335 14.163 15.022 15.589 15.756 15.701 15.569 15.413 15.225 15.032 14.856 14.667 14.496 14.312 14.118 13.942 13.783 13.63 13.457 13.294 13.155 13.02 12.875 12.74 12.593 12.453 12.346 12.224 12.095 11.97 11.834 11.731 11.628 11.459 11.333 11.207 11.146 11.004 10.851 10.689 10.601 10.14 10.322 10.224 10.104 9.83 9.689 9.537 9.365 9.156 8.918 8.59 7.399 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt deleted file mode 100644 index af7cb23f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8858 ,KEBNE ,16692316,Thu Nov 25 18:10:07 CET,Thu Nov 25 19:59:06 CET,0.0 1.858 2.248 2.545 2.808 3.05 3.257 3.434 3.764 3.93 4.097 3.982 4.534 4.67 4.934 5.187 5.429 5.547 5.769 5.978 6.282 6.486 6.69 6.984 7.28 7.563 7.834 8.113 8.47 8.825 9.183 9.622 10.055 10.461 10.895 11.388 11.882 12.426 13.022 13.659 14.348 15.137 16.043 16.977 18.115 19.383 20.87 22.578 24.654 27.246 30.362 32.895 34.423 35.364 35.923 36.285 36.505 36.647 36.713 36.675 36.562 36.411 36.287 36.179 36.046 35.919 35.773 35.629 35.509 35.378 35.226 35.087 34.914 34.742 34.622 34.476 34.31 34.143 33.96 33.826 33.689 33.453 33.267 33.076 32.981 32.758 32.524 32.292 32.166 31.648 31.729 31.563 31.373 30.946 30.698 30.424 30.124 29.781 29.326 28.649 26.159 -2 ,25415 ,KEBNE ,16692317,Thu Nov 25 18:11:10 CET,Thu Nov 25 19:59:43 CET,0.0 1.672 2.035 2.326 2.592 2.838 3.055 3.244 3.596 3.759 3.908 3.772 4.323 4.456 4.717 4.97 5.215 5.329 5.557 5.781 6.101 6.311 6.52 6.836 7.15 7.442 7.705 7.961 8.309 8.653 8.987 9.407 9.821 10.215 10.666 11.163 11.649 12.203 12.801 13.446 14.12 14.91 15.85 16.788 17.912 19.231 20.793 22.518 24.586 27.145 30.372 32.998 34.458 35.365 35.944 36.265 36.434 36.536 36.549 36.478 36.411 36.314 36.167 36.026 35.889 35.759 35.604 35.431 35.262 35.094 34.933 34.785 34.63 34.473 34.341 34.201 34.036 33.846 33.647 33.517 33.382 33.141 32.95 32.751 32.641 32.387 32.135 31.843 31.683 31.151 31.202 31.011 30.807 30.326 30.084 29.814 29.474 29.11 28.684 28.036 25.014 -3 ,26222 ,KEBNE ,16692318,Thu Nov 25 18:11:09 CET,Thu Nov 25 19:59:50 CET,0.0 0.986 1.431 1.748 1.994 2.217 2.418 2.606 2.942 3.095 3.243 3.114 3.663 3.799 4.061 4.311 4.563 4.686 4.929 5.162 5.509 5.739 5.949 6.247 6.537 6.817 7.091 7.346 7.668 7.992 8.31 8.698 9.085 9.449 9.875 10.397 10.896 11.432 12.018 12.644 13.302 14.05 14.951 15.881 16.97 18.216 19.702 21.474 23.629 26.23 29.463 32.105 33.661 34.663 35.198 35.462 35.65 35.742 35.73 35.675 35.606 35.513 35.423 35.32 35.206 35.103 34.97 34.818 34.694 34.553 34.394 34.245 34.067 33.892 33.763 33.612 33.437 33.254 33.052 32.917 32.776 32.535 32.353 32.147 32.039 31.823 31.603 31.386 31.271 30.766 30.883 30.736 30.57 30.13 29.889 29.652 29.347 28.968 28.522 27.918 25.477 -4 ,9701 ,KEBNE ,16692319,Thu Nov 25 18:11:10 CET,Thu Nov 25 20:01:03 CET,0.0 1.36 1.795 2.13 2.403 2.636 2.86 3.056 3.403 3.574 3.742 3.637 4.196 4.326 4.577 4.829 5.074 5.187 5.414 5.636 5.941 6.138 6.345 6.647 6.924 7.196 7.463 7.724 8.051 8.373 8.712 9.114 9.475 9.83 10.275 10.797 11.285 11.802 12.341 12.938 13.594 14.357 15.261 16.162 17.221 18.422 19.89 21.677 23.84 26.419 29.626 32.291 33.806 34.792 35.392 35.703 35.876 35.976 35.992 35.954 35.891 35.827 35.751 35.636 35.501 35.376 35.258 35.13 35.008 34.895 34.767 34.622 34.457 34.288 34.154 34.014 33.85 33.665 33.463 33.311 33.154 32.917 32.742 32.545 32.447 32.234 32.004 31.782 31.66 31.15 31.236 31.067 30.901 30.511 30.274 30.012 29.694 29.373 28.974 28.34 25.251 -5 ,2685 ,KEBNE ,16692320,Thu Nov 25 18:13:18 CET,Thu Nov 25 19:57:01 CET,0.0 1.769 2.167 2.472 2.723 2.957 3.175 3.375 3.72 3.879 4.033 3.897 4.448 4.587 4.847 5.084 5.33 5.447 5.674 5.894 6.206 6.413 6.604 6.894 7.196 7.491 7.761 8.013 8.35 8.677 8.999 9.392 9.765 10.143 10.602 11.11 11.588 12.136 12.718 13.317 13.993 14.759 15.694 16.688 17.86 19.182 20.662 22.357 24.452 26.976 30.113 32.803 34.292 35.154 35.723 36.023 36.187 36.3 36.305 36.231 36.153 36.074 35.952 35.815 35.67 35.516 35.36 35.234 35.088 34.915 34.723 34.538 34.354 34.165 34.0 33.824 33.655 33.465 33.243 33.093 32.929 32.63 32.433 32.227 32.125 31.93 31.707 31.464 31.332 30.798 30.869 30.699 30.515 30.061 29.801 29.519 29.209 28.867 28.453 27.917 26.044 -6 ,25220 ,KEBNE ,16692321,Thu Nov 25 18:26:49 CET,Thu Nov 25 20:12:28 CET,0.0 1.171 1.561 1.845 2.094 2.309 2.507 2.69 3.022 3.18 3.324 3.17 3.715 3.842 4.095 4.344 4.591 4.712 4.939 5.156 5.476 5.683 5.888 6.192 6.487 6.765 7.028 7.288 7.62 7.945 8.267 8.654 9.038 9.418 9.856 10.349 10.841 11.377 11.936 12.542 13.193 13.963 14.882 15.804 16.897 18.13 19.605 21.324 23.382 25.849 28.896 31.533 33.035 33.868 34.368 34.673 34.785 34.812 34.79 34.725 34.653 34.567 34.466 34.344 34.2 34.05 33.89 33.704 33.53 33.386 33.208 33.043 32.883 32.696 32.542 32.367 32.181 31.996 31.79 31.634 31.47 31.22 31.041 30.854 30.757 30.569 30.348 30.083 29.955 29.431 29.51 29.343 29.167 28.77 28.507 28.224 27.908 27.513 27.05 26.372 23.224 -7 ,1688 ,KEBNE ,16692322,Thu Nov 25 18:28:53 CET,Thu Nov 25 20:14:29 CET,0.0 1.368 1.808 2.118 2.386 2.612 2.815 3.005 3.346 3.523 3.7 3.587 4.163 4.31 4.56 4.792 5.026 5.151 5.401 5.625 5.942 6.155 6.361 6.676 6.976 7.269 7.562 7.838 8.196 8.536 8.858 9.255 9.633 10.002 10.44 10.929 11.414 11.97 12.559 13.176 13.872 14.689 15.627 16.538 17.619 18.86 20.333 22.074 24.17 26.698 29.82 32.343 33.786 34.686 35.227 35.514 35.633 35.645 35.572 35.471 35.338 35.198 35.075 34.94 34.783 34.631 34.475 34.321 34.165 33.964 33.746 33.595 33.444 33.259 33.099 32.936 32.753 32.545 32.345 32.209 32.051 31.789 31.593 31.377 31.271 31.039 30.797 30.553 30.422 29.898 29.97 29.805 29.621 29.185 28.946 28.698 28.413 28.024 27.532 26.864 23.967 -8 ,31580 ,KEBNE ,16692323,Thu Nov 25 18:36:14 CET,Thu Nov 25 20:16:58 CET,0.0 1.216 1.649 1.958 2.245 2.498 2.715 2.917 3.272 3.431 3.594 3.495 4.061 4.205 4.49 4.759 5.008 5.133 5.374 5.598 5.935 6.15 6.363 6.687 7.004 7.316 7.608 7.889 8.239 8.577 8.917 9.341 9.756 10.155 10.623 11.13 11.606 12.146 12.734 13.355 14.023 14.805 15.727 16.668 17.778 19.032 20.554 22.309 24.401 26.915 30.031 32.578 33.989 34.938 35.577 35.914 36.072 36.175 36.175 36.128 36.065 35.971 35.879 35.749 35.615 35.51 35.354 35.172 35.001 34.814 34.632 34.486 34.302 34.074 33.887 33.711 33.541 33.36 33.169 33.037 32.902 32.686 32.542 32.367 32.27 32.07 31.853 31.596 31.448 30.929 31.032 30.861 30.674 30.253 29.995 29.699 29.367 28.991 28.555 27.945 25.82 -9 ,30847 ,KEBNE ,16692324,Thu Nov 25 18:37:18 CET,Thu Nov 25 20:18:34 CET,0.0 1.264 1.66 1.968 2.227 2.461 2.675 2.873 3.229 3.387 3.543 3.409 3.959 4.095 4.352 4.612 4.882 5.005 5.228 5.451 5.77 5.971 6.162 6.438 6.713 6.995 7.27 7.533 7.865 8.185 8.511 8.907 9.289 9.672 10.129 10.635 11.126 11.673 12.248 12.847 13.493 14.259 15.187 16.132 17.24 18.482 19.935 21.633 23.75 26.41 29.735 32.361 33.766 34.668 35.244 35.556 35.781 35.929 35.972 35.971 35.932 35.866 35.77 35.663 35.547 35.388 35.162 34.948 34.781 34.614 34.451 34.32 34.148 33.967 33.835 33.679 33.504 33.339 33.188 33.054 32.898 32.655 32.476 32.289 32.195 32.006 31.791 31.56 31.45 30.93 31.029 30.891 30.717 30.308 30.08 29.825 29.557 29.248 28.852 28.298 26.049 -10 ,22744 ,KEBNE ,16692325,Thu Nov 25 18:38:17 CET,Thu Nov 25 20:24:51 CET,0.0 1.628 2.026 2.335 2.596 2.824 3.055 3.277 3.661 3.841 4.013 3.94 4.522 4.668 4.953 5.229 5.475 5.593 5.823 6.055 6.388 6.593 6.794 7.085 7.372 7.643 7.899 8.162 8.504 8.823 9.148 9.559 9.958 10.344 10.78 11.276 11.763 12.3 12.874 13.494 14.184 14.978 15.922 16.857 17.946 19.217 20.717 22.423 24.565 27.193 30.393 32.968 34.367 35.245 35.772 36.053 36.179 36.141 36.091 36.064 35.969 35.846 35.729 35.624 35.49 35.355 35.208 35.046 34.881 34.686 34.476 34.305 34.132 33.961 33.823 33.677 33.524 33.365 33.191 33.059 32.906 32.626 32.441 32.26 32.161 31.968 31.757 31.517 31.383 30.851 30.938 30.772 30.594 30.206 29.976 29.711 29.413 29.077 28.667 28.088 25.318 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index c627c76d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21906 ,KEBNE ,16692326,Thu Nov 25 18:38:16 CET,Thu Nov 25 20:24:59 CET,0.0 2.147 2.733 3.13 3.459 3.757 4.028 4.258 4.689 4.892 5.066 4.959 5.544 5.715 6.017 6.292 6.548 6.674 6.917 7.153 7.509 7.741 7.965 8.287 8.591 8.887 9.18 9.463 9.839 10.202 10.543 10.956 11.362 11.757 12.217 12.746 13.282 13.878 14.505 15.189 15.933 16.812 17.845 18.88 20.159 21.628 23.312 25.223 27.572 30.494 34.184 37.303 39.027 39.963 40.581 41.089 41.47 41.704 41.806 41.818 41.817 41.804 41.759 41.715 41.661 41.584 41.459 41.331 41.207 41.068 40.906 40.752 40.605 40.422 40.264 40.104 39.922 39.719 39.505 39.354 39.191 38.952 38.772 38.578 38.495 38.329 38.138 37.933 37.819 37.313 37.387 37.225 37.03 36.582 36.319 36.022 35.673 35.255 34.708 33.975 30.87 -2 ,30093 ,KEBNE ,16692327,Thu Nov 25 18:39:19 CET,Thu Nov 25 20:26:36 CET,0.0 1.518 2.026 2.421 2.746 3.043 3.32 3.555 3.975 4.173 4.366 4.292 4.864 5.017 5.301 5.564 5.812 5.937 6.2 6.441 6.8 7.047 7.279 7.612 7.927 8.234 8.525 8.8 9.161 9.512 9.857 10.284 10.703 11.114 11.59 12.133 12.649 13.208 13.838 14.555 15.313 16.165 17.182 18.232 19.481 20.902 22.612 24.59 26.966 29.854 33.402 36.331 38.077 39.227 40.043 40.542 40.827 41.002 41.103 41.186 41.232 41.234 41.207 41.145 41.065 40.967 40.841 40.72 40.594 40.481 40.357 40.221 40.094 39.965 39.828 39.646 39.46 39.283 39.099 38.976 38.844 38.622 38.454 38.272 38.19 38.016 37.785 37.537 37.413 36.9 36.98 36.814 36.631 36.177 35.92 35.633 35.262 34.809 34.227 33.392 29.405 -3 ,17358 ,KEBNE ,16692328,Thu Nov 25 18:39:23 CET,Thu Nov 25 20:23:41 CET,0.0 2.173 2.781 3.171 3.511 3.824 4.121 4.385 4.832 5.027 5.213 5.145 5.729 5.886 6.171 6.435 6.682 6.803 7.043 7.28 7.639 7.875 8.095 8.406 8.716 9.04 9.372 9.679 10.044 10.4 10.741 11.156 11.574 11.979 12.453 12.982 13.494 14.087 14.734 15.424 16.165 17.015 18.026 19.024 20.215 21.634 23.329 25.258 27.594 30.486 34.214 37.315 39.094 40.205 40.991 41.562 41.888 42.094 42.225 42.283 42.317 42.35 42.354 42.292 42.195 42.123 42.038 41.947 41.839 41.67 41.463 41.305 41.17 41.016 40.882 40.753 40.6 40.416 40.216 40.08 39.929 39.681 39.496 39.271 39.146 38.886 38.615 38.313 38.143 37.592 37.604 37.417 37.222 36.769 36.497 36.214 35.912 35.53 35.024 34.22 30.758 -4 ,18840 ,KEBNE ,16692329,Thu Nov 25 18:39:23 CET,Thu Nov 25 20:24:23 CET,0.0 2.766 3.336 3.768 4.1 4.383 4.641 4.873 5.298 5.5 5.688 5.607 6.185 6.346 6.656 6.939 7.208 7.336 7.576 7.834 8.251 8.491 8.704 9.026 9.335 9.643 9.954 10.249 10.622 10.985 11.332 11.757 12.189 12.614 13.104 13.648 14.176 14.755 15.376 16.061 16.804 17.676 18.726 19.784 21.06 22.536 24.228 26.147 28.474 31.288 34.88 37.936 39.689 40.867 41.731 42.311 42.684 42.98 43.138 43.217 43.251 43.236 43.199 43.153 43.085 42.992 42.864 42.716 42.585 42.446 42.287 42.142 41.98 41.819 41.692 41.558 41.399 41.218 41.024 40.878 40.735 40.529 40.378 40.181 40.07 39.841 39.592 39.343 39.222 38.71 38.756 38.581 38.385 37.945 37.696 37.399 37.049 36.645 36.159 35.486 32.2 -5 ,15165 ,KEBNE ,16692330,Thu Nov 25 18:41:26 CET,Thu Nov 25 20:25:53 CET,0.0 1.644 2.15 2.533 2.871 3.166 3.413 3.633 4.051 4.247 4.439 4.373 4.957 5.109 5.4 5.682 5.945 6.069 6.311 6.555 6.906 7.126 7.348 7.672 7.978 8.271 8.561 8.847 9.213 9.571 9.927 10.362 10.781 11.184 11.651 12.182 12.714 13.321 13.98 14.697 15.476 16.371 17.444 18.558 19.843 21.282 22.995 24.945 27.327 30.284 33.973 37.053 38.733 39.702 40.426 40.997 41.366 41.612 41.744 41.788 41.775 41.744 41.7 41.625 41.546 41.475 41.379 41.274 41.181 41.061 40.899 40.754 40.599 40.436 40.322 40.207 40.041 39.843 39.681 39.581 39.463 39.275 39.126 38.921 38.803 38.568 38.297 38.008 37.87 37.353 37.382 37.192 37.007 36.577 36.326 36.072 35.783 35.427 34.923 34.146 25.858 -6 ,32372 ,KEBNE ,16692331,Thu Nov 25 18:42:27 CET,Thu Nov 25 20:31:56 CET,0.0 1.846 2.33 2.693 3.002 3.274 3.534 3.787 4.258 4.464 4.64 4.554 5.129 5.286 5.593 5.876 6.145 6.274 6.514 6.751 7.101 7.326 7.55 7.882 8.202 8.521 8.831 9.128 9.51 9.915 10.309 10.735 11.145 11.552 12.028 12.565 13.099 13.683 14.313 15.013 15.767 16.627 17.642 18.685 19.922 21.331 22.999 24.938 27.234 29.894 33.207 35.957 37.547 38.614 39.39 39.91 40.213 40.427 40.56 40.624 40.621 40.597 40.572 40.54 40.484 40.399 40.309 40.22 40.087 39.947 39.836 39.732 39.587 39.422 39.308 39.193 39.049 38.881 38.7 38.556 38.392 38.125 37.95 37.788 37.698 37.491 37.26 36.996 36.844 36.314 36.357 36.183 35.999 35.584 35.32 34.994 34.667 34.324 33.849 33.131 28.779 -7 ,21440 ,KEBNE ,16692332,Thu Nov 25 18:42:27 CET,Thu Nov 25 20:31:18 CET,0.0 1.484 1.971 2.352 2.684 2.954 3.191 3.428 3.859 4.065 4.256 4.161 4.73 4.87 5.133 5.402 5.672 5.805 6.058 6.29 6.619 6.854 7.101 7.446 7.775 8.079 8.367 8.66 9.033 9.389 9.734 10.142 10.549 10.962 11.445 11.987 12.512 13.082 13.704 14.402 15.144 15.989 17.023 18.073 19.304 20.732 22.412 24.356 26.739 29.639 33.281 36.442 38.324 39.51 40.273 40.737 41.055 41.325 41.488 41.561 41.574 41.557 41.506 41.431 41.355 41.267 41.132 40.997 40.883 40.748 40.601 40.486 40.342 40.174 40.047 39.896 39.706 39.487 39.273 39.128 38.985 38.753 38.585 38.396 38.29 38.073 37.837 37.592 37.455 36.923 36.948 36.756 36.551 36.127 35.875 35.572 35.216 34.771 34.229 33.499 29.456 -8 ,32532 ,KEBNE ,16692333,Thu Nov 25 18:43:29 CET,Thu Nov 25 20:33:19 CET,0.0 1.61 2.116 2.495 2.836 3.119 3.362 3.602 4.038 4.216 4.39 4.303 4.885 5.052 5.396 5.715 5.974 6.101 6.358 6.598 6.958 7.197 7.432 7.766 8.077 8.377 8.66 8.933 9.289 9.643 9.99 10.416 10.854 11.286 11.762 12.279 12.788 13.376 14.02 14.712 15.474 16.34 17.348 18.375 19.612 21.055 22.758 24.745 27.153 30.042 33.541 36.626 38.541 39.74 40.514 41.006 41.351 41.621 41.759 41.849 41.912 41.927 41.884 41.814 41.748 41.665 41.55 41.437 41.329 41.224 41.113 40.997 40.852 40.687 40.559 40.429 40.289 40.135 39.941 39.802 39.673 39.46 39.286 39.085 38.991 38.82 38.619 38.362 38.212 37.687 37.766 37.593 37.407 36.994 36.764 36.517 36.175 35.777 35.282 34.424 31.27 -9 ,28562 ,KEBNE ,16692334,Thu Nov 25 18:43:33 CET,Thu Nov 25 20:28:36 CET,0.0 2.093 2.61 2.982 3.309 3.571 3.813 4.049 4.499 4.703 4.891 4.794 5.364 5.518 5.828 6.112 6.374 6.504 6.757 6.997 7.345 7.569 7.781 8.096 8.405 8.703 9.0 9.284 9.666 10.046 10.399 10.822 11.239 11.65 12.132 12.685 13.225 13.839 14.514 15.23 15.988 16.856 17.894 18.956 20.214 21.631 23.319 25.344 27.788 30.721 34.352 37.517 39.468 40.657 41.447 42.019 42.366 42.558 42.639 42.672 42.655 42.599 42.516 42.4 42.275 42.15 42.036 41.939 41.84 41.725 41.598 41.476 41.34 41.207 41.101 40.983 40.836 40.661 40.47 40.326 40.154 39.876 39.684 39.47 39.363 39.154 38.935 38.698 38.553 38.029 38.095 37.917 37.729 37.291 37.026 36.735 36.437 36.091 35.622 34.969 32.238 -10 ,10820 ,KEBNE ,16692335,Thu Nov 25 18:43:33 CET,Thu Nov 25 20:28:51 CET,0.0 2.575 3.111 3.477 3.785 4.071 4.34 4.58 4.988 5.182 5.36 5.276 5.867 6.023 6.325 6.619 6.911 7.044 7.289 7.547 7.916 8.138 8.347 8.657 8.988 9.299 9.588 9.869 10.217 10.563 10.91 11.343 11.754 12.151 12.615 13.138 13.657 14.24 14.882 15.567 16.321 17.205 18.218 19.239 20.491 21.941 23.616 25.602 28.012 30.829 34.31 37.199 38.813 39.799 40.416 40.837 41.152 41.391 41.503 41.557 41.579 41.546 41.48 41.411 41.332 41.241 41.13 41.027 40.929 40.802 40.663 40.544 40.389 40.199 40.017 39.82 39.654 39.475 39.263 39.113 38.953 38.701 38.514 38.302 38.198 37.981 37.737 37.499 37.372 36.862 36.926 36.745 36.539 36.091 35.828 35.542 35.219 34.808 34.305 33.62 30.376 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 2d23cea0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26273 ,KEBNE ,16692336,Thu Nov 25 18:46:42 CET,Thu Nov 25 20:34:27 CET,0.0 1.156 1.48 1.728 1.925 2.089 2.241 2.382 2.625 2.748 2.866 2.69 3.162 3.254 3.428 3.593 3.756 3.837 3.979 4.104 4.283 4.406 4.527 4.697 4.869 5.036 5.201 5.364 5.563 5.749 5.931 6.153 6.362 6.567 6.801 7.059 7.31 7.6 7.912 8.226 8.553 8.928 9.351 9.773 10.256 10.777 11.393 12.076 12.844 13.658 14.595 15.207 15.379 15.399 15.31 15.148 14.987 14.82 14.651 14.48 14.306 14.116 13.941 13.759 13.583 13.428 13.246 13.088 12.95 12.801 12.643 12.503 12.363 12.234 12.128 12.01 11.874 11.727 11.587 11.491 11.391 11.231 11.114 10.994 10.935 10.811 10.667 10.51 10.427 9.975 10.154 10.049 9.944 9.705 9.574 9.414 9.229 9.0 8.725 8.363 5.543 -2 ,6405 ,KEBNE ,16692337,Thu Nov 25 18:47:45 CET,Thu Nov 25 20:36:42 CET,0.0 1.571 1.862 2.099 2.306 2.479 2.63 2.778 3.044 3.146 3.252 3.097 3.585 3.682 3.862 4.031 4.182 4.256 4.395 4.523 4.712 4.833 4.958 5.141 5.304 5.456 5.605 5.754 5.953 6.145 6.322 6.542 6.757 6.955 7.172 7.407 7.635 7.897 8.172 8.469 8.787 9.118 9.508 9.89 10.329 10.829 11.414 12.051 12.753 13.558 14.434 14.975 15.156 15.206 15.169 15.069 14.928 14.766 14.607 14.423 14.258 14.107 13.924 13.756 13.603 13.445 13.28 13.139 13.002 12.845 12.696 12.577 12.456 12.334 12.234 12.119 12.001 11.88 11.736 11.635 11.531 11.344 11.208 11.084 11.02 10.89 10.748 10.6 10.528 10.075 10.256 10.154 10.05 9.815 9.675 9.517 9.342 9.142 8.886 8.479 7.045 -3 ,365 ,KEBNE ,16692338,Thu Nov 25 18:48:43 CET,Thu Nov 25 20:42:32 CET,0.0 1.549 1.895 2.144 2.355 2.544 2.702 2.841 3.094 3.213 3.323 3.14 3.608 3.694 3.857 4.015 4.167 4.243 4.388 4.531 4.735 4.853 4.966 5.13 5.285 5.439 5.598 5.756 5.951 6.13 6.304 6.512 6.698 6.875 7.09 7.333 7.583 7.855 8.119 8.387 8.694 9.064 9.472 9.875 10.331 10.861 11.468 12.082 12.807 13.663 14.569 15.05 15.172 15.189 15.125 15.023 14.889 14.729 14.563 14.38 14.218 14.072 13.928 13.765 13.602 13.462 13.317 13.177 13.046 12.896 12.724 12.587 12.45 12.315 12.212 12.102 11.983 11.853 11.712 11.612 11.505 11.326 11.203 11.077 11.012 10.879 10.732 10.58 10.499 10.047 10.215 10.096 9.979 9.725 9.59 9.447 9.278 9.083 8.826 8.465 6.657 -4 ,22073 ,KEBNE ,16692339,Thu Nov 25 18:49:49 CET,Thu Nov 25 20:43:07 CET,0.0 1.337 1.661 1.913 2.099 2.28 2.454 2.594 2.854 2.974 3.09 2.924 3.396 3.483 3.655 3.814 3.96 4.033 4.171 4.307 4.506 4.631 4.752 4.932 5.111 5.283 5.44 5.589 5.787 5.976 6.155 6.368 6.586 6.799 7.028 7.272 7.492 7.732 8.001 8.284 8.593 8.963 9.382 9.791 10.264 10.773 11.337 11.949 12.67 13.475 14.354 14.894 15.075 15.066 14.987 14.842 14.672 14.51 14.342 14.143 13.968 13.799 13.624 13.463 13.295 13.133 12.962 12.801 12.651 12.498 12.338 12.192 12.046 11.898 11.789 11.674 11.543 11.404 11.26 11.168 11.073 10.918 10.805 10.676 10.608 10.459 10.303 10.143 10.056 9.597 9.754 9.636 9.508 9.229 9.069 8.893 8.695 8.469 8.217 7.844 5.768 -5 ,5001 ,KEBNE ,16692340,Thu Nov 25 18:49:45 CET,Thu Nov 25 20:44:40 CET,0.0 1.876 2.205 2.45 2.649 2.813 2.959 3.097 3.342 3.452 3.557 3.372 3.846 3.937 4.11 4.271 4.421 4.494 4.631 4.762 4.96 5.089 5.21 5.386 5.548 5.701 5.855 6.002 6.192 6.388 6.583 6.816 7.034 7.235 7.463 7.72 7.965 8.225 8.498 8.781 9.082 9.426 9.834 10.248 10.705 11.193 11.759 12.395 13.089 13.861 14.704 15.22 15.385 15.382 15.285 15.158 15.022 14.872 14.701 14.529 14.367 14.193 14.037 13.885 13.732 13.593 13.458 13.327 13.202 13.06 12.894 12.757 12.607 12.445 12.331 12.22 12.104 11.97 11.824 11.725 11.625 11.468 11.352 11.236 11.175 11.038 10.887 10.72 10.637 10.182 10.333 10.213 10.098 9.823 9.67 9.517 9.34 9.11 8.791 8.359 6.762 -6 ,6407 ,KEBNE ,16692341,Thu Nov 25 18:49:45 CET,Thu Nov 25 20:44:46 CET,0.0 1.307 1.675 1.938 2.167 2.371 2.544 2.697 2.99 3.121 3.239 3.082 3.562 3.648 3.817 3.98 4.124 4.196 4.344 4.481 4.676 4.804 4.927 5.094 5.248 5.404 5.56 5.714 5.909 6.097 6.273 6.467 6.658 6.852 7.076 7.329 7.58 7.85 8.142 8.463 8.805 9.162 9.554 9.97 10.465 10.997 11.644 12.385 13.16 14.049 15.024 15.664 15.923 15.95 15.853 15.703 15.572 15.456 15.327 15.177 15.033 14.881 14.715 14.553 14.402 14.263 14.095 13.932 13.804 13.677 13.537 13.405 13.264 13.134 13.032 12.915 12.802 12.689 12.559 12.468 12.374 12.216 12.105 11.982 11.917 11.787 11.642 11.499 11.428 10.976 11.171 11.08 10.977 10.74 10.612 10.467 10.283 10.067 9.825 9.454 7.572 -7 ,27889 ,KEBNE ,16692342,Thu Nov 25 18:50:48 CET,Thu Nov 25 20:45:39 CET,0.0 1.149 1.463 1.713 1.918 2.097 2.26 2.401 2.654 2.778 2.898 2.725 3.208 3.306 3.487 3.657 3.815 3.886 4.019 4.161 4.359 4.479 4.6 4.787 4.968 5.134 5.288 5.437 5.623 5.799 5.98 6.192 6.394 6.594 6.817 7.059 7.291 7.571 7.87 8.158 8.48 8.852 9.256 9.667 10.157 10.674 11.261 11.904 12.617 13.436 14.369 14.982 15.166 15.187 15.135 15.015 14.881 14.738 14.595 14.43 14.267 14.109 13.946 13.789 13.631 13.491 13.349 13.213 13.101 12.986 12.859 12.744 12.628 12.504 12.407 12.304 12.198 12.088 11.967 11.883 11.795 11.661 11.56 11.441 11.378 11.252 11.117 10.972 10.895 10.438 10.627 10.531 10.425 10.193 10.057 9.909 9.747 9.544 9.294 8.969 7.271 -8 ,16367 ,KEBNE ,16692343,Thu Nov 25 18:50:47 CET,Thu Nov 25 20:45:35 CET,0.0 1.828 2.188 2.434 2.637 2.803 2.95 3.087 3.338 3.451 3.553 3.369 3.846 3.941 4.114 4.281 4.432 4.507 4.658 4.807 5.014 5.144 5.279 5.48 5.668 5.842 6.016 6.189 6.402 6.604 6.797 7.031 7.264 7.478 7.727 8.013 8.281 8.577 8.896 9.238 9.613 10.028 10.523 11.014 11.534 12.091 12.72 13.42 14.224 15.129 16.069 16.63 16.793 16.793 16.728 16.62 16.473 16.292 16.118 15.93 15.749 15.585 15.414 15.242 15.086 14.946 14.797 14.653 14.528 14.4 14.261 14.138 14.004 13.862 13.751 13.639 13.525 13.404 13.274 13.186 13.093 12.932 12.814 12.688 12.624 12.498 12.351 12.192 12.116 11.669 11.866 11.77 11.662 11.398 11.239 11.081 10.912 10.706 10.449 10.102 7.689 -9 ,23233 ,KEBNE ,16692344,Thu Nov 25 18:52:56 CET,Thu Nov 25 20:45:11 CET,0.0 1.377 1.727 1.976 2.174 2.35 2.5 2.636 2.89 3.009 3.126 2.955 3.434 3.528 3.713 3.889 4.051 4.129 4.277 4.423 4.625 4.753 4.88 5.049 5.204 5.362 5.517 5.669 5.872 6.062 6.236 6.445 6.647 6.845 7.078 7.328 7.557 7.817 8.106 8.431 8.762 9.129 9.547 9.941 10.395 10.92 11.514 12.133 12.828 13.614 14.487 15.074 15.317 15.385 15.33 15.169 15.001 14.834 14.677 14.527 14.372 14.217 14.056 13.904 13.768 13.632 13.487 13.346 13.211 13.054 12.901 12.786 12.657 12.518 12.409 12.288 12.163 12.043 11.916 11.821 11.713 11.538 11.419 11.294 11.228 11.092 10.95 10.803 10.726 10.271 10.473 10.376 10.269 10.059 9.913 9.74 9.568 9.363 9.089 8.699 7.142 -10 ,21340 ,KEBNE ,16692345,Thu Nov 25 18:52:57 CET,Thu Nov 25 20:46:00 CET,0.0 1.658 1.993 2.231 2.432 2.617 2.775 2.919 3.18 3.305 3.423 3.248 3.72 3.814 3.992 4.168 4.343 4.421 4.566 4.705 4.902 5.025 5.143 5.316 5.487 5.654 5.814 5.974 6.181 6.366 6.535 6.752 6.965 7.167 7.388 7.625 7.863 8.125 8.407 8.711 9.041 9.403 9.798 10.203 10.696 11.241 11.848 12.505 13.213 14.012 14.855 15.304 15.403 15.326 15.215 15.071 14.929 14.772 14.583 14.388 14.197 14.022 13.863 13.714 13.567 13.416 13.255 13.115 13.002 12.872 12.73 12.616 12.488 12.347 12.243 12.134 12.019 11.904 11.783 11.695 11.602 11.448 11.329 11.209 11.152 11.042 10.903 10.733 10.647 10.18 10.359 10.258 10.146 9.899 9.753 9.595 9.42 9.21 8.947 8.577 7.06 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 70a67831..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18862 ,KEBNE ,17025234,Wed Dec 22 12:10:46 CET,Wed Dec 22 13:52:24 CET,0.0 1.652 2.028 2.31 2.535 2.741 2.933 3.109 3.433 3.58 3.716 3.592 4.111 4.235 4.472 4.712 4.938 5.047 5.26 5.467 5.773 5.975 6.173 6.454 6.72 6.987 7.25 7.505 7.836 8.166 8.493 8.889 9.267 9.645 10.093 10.591 11.078 11.626 12.236 12.886 13.595 14.422 15.386 16.394 17.609 19.008 20.618 22.467 24.793 27.619 31.097 34.133 36.054 37.342 38.257 38.892 39.329 39.633 39.827 39.987 40.049 40.069 40.066 40.022 39.966 39.909 39.823 39.723 39.62 39.474 39.303 39.175 39.06 38.948 38.857 38.741 38.599 38.427 38.266 38.165 38.045 37.859 37.718 37.526 37.428 37.233 36.983 36.701 36.552 36.054 36.004 35.782 35.545 34.931 34.593 34.291 33.961 33.515 32.884 31.982 27.629 -2 ,1200 ,KEBNE ,17025235,Wed Dec 22 12:10:42 CET,Wed Dec 22 13:57:33 CET,0.0 0.936 1.294 1.57 1.806 2.015 2.205 2.381 2.702 2.848 2.985 2.862 3.378 3.505 3.741 3.972 4.199 4.303 4.51 4.718 5.028 5.229 5.415 5.678 5.949 6.223 6.489 6.747 7.085 7.416 7.734 8.127 8.513 8.888 9.324 9.819 10.315 10.871 11.469 12.125 12.848 13.674 14.641 15.637 16.822 18.192 19.83 21.692 23.921 26.718 30.274 33.144 34.79 35.919 36.664 37.159 37.492 37.708 37.854 37.964 38.022 38.041 38.034 37.97 37.87 37.813 37.732 37.643 37.574 37.488 37.388 37.268 37.124 36.984 36.869 36.729 36.58 36.441 36.283 36.167 36.056 35.863 35.696 35.514 35.423 35.236 35.013 34.76 34.628 34.141 34.218 34.087 33.931 33.5 33.242 32.995 32.715 32.308 31.743 30.943 27.123 -3 ,9365 ,KEBNE ,17025236,Wed Dec 22 12:10:42 CET,Wed Dec 22 13:57:12 CET,0.0 1.407 1.799 2.073 2.301 2.504 2.687 2.862 3.208 3.367 3.51 3.39 3.904 4.035 4.289 4.516 4.729 4.838 5.053 5.254 5.552 5.753 5.946 6.221 6.491 6.76 7.022 7.281 7.622 7.95 8.279 8.691 9.092 9.476 9.926 10.442 10.946 11.507 12.13 12.813 13.554 14.399 15.395 16.405 17.591 18.971 20.613 22.546 24.948 27.859 31.518 34.632 36.454 37.706 38.57 39.165 39.568 39.833 40.013 40.141 40.187 40.214 40.239 40.236 40.209 40.132 40.05 39.997 39.93 39.845 39.75 39.659 39.54 39.399 39.283 39.169 39.052 38.904 38.716 38.585 38.456 38.238 38.067 37.877 37.767 37.536 37.306 37.077 36.941 36.448 36.497 36.303 36.093 35.711 35.445 35.041 34.529 33.953 33.284 32.356 28.526 -4 ,22110 ,KEBNE ,17025237,Wed Dec 22 12:10:42 CET,Wed Dec 22 13:56:41 CET,0.0 1.209 1.574 1.848 2.072 2.273 2.47 2.658 2.987 3.141 3.287 3.166 3.684 3.812 4.054 4.291 4.521 4.627 4.834 5.038 5.339 5.537 5.728 5.998 6.262 6.531 6.794 7.051 7.392 7.728 8.063 8.466 8.849 9.224 9.645 10.118 10.602 11.152 11.761 12.428 13.136 13.952 14.913 15.88 17.071 18.46 20.055 21.97 24.403 27.28 30.934 34.245 36.213 37.488 38.329 38.922 39.356 39.655 39.867 40.017 40.123 40.21 40.253 40.271 40.271 40.24 40.183 40.119 40.047 39.962 39.852 39.75 39.646 39.518 39.417 39.298 39.147 38.995 38.853 38.758 38.65 38.478 38.356 38.202 38.111 37.895 37.613 37.271 37.099 36.603 36.654 36.503 36.342 35.922 35.587 35.17 34.745 34.268 33.596 32.555 23.381 -5 ,29185 ,KEBNE ,17025238,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 13:59:27 CET,0.0 1.833 2.215 2.492 2.726 2.936 3.139 3.32 3.667 3.834 3.981 3.863 4.377 4.507 4.756 4.996 5.227 5.336 5.556 5.767 6.069 6.266 6.457 6.744 7.028 7.307 7.583 7.85 8.186 8.518 8.85 9.245 9.618 9.988 10.424 10.922 11.412 11.96 12.552 13.195 13.899 14.71 15.685 16.694 17.906 19.282 20.896 22.866 25.32 28.219 31.745 34.84 36.779 38.079 39.006 39.679 40.155 40.467 40.65 40.789 40.893 40.941 40.921 40.888 40.866 40.858 40.818 40.749 40.69 40.582 40.437 40.319 40.187 40.016 39.855 39.699 39.533 39.353 39.2 39.102 38.975 38.756 38.595 38.433 38.355 38.176 37.989 37.774 37.634 37.129 37.098 36.903 36.718 36.225 35.906 35.528 35.091 34.608 33.934 32.772 28.243 -7 ,17485 ,KEBNE ,17025240,Wed Dec 22 12:12:44 CET,Wed Dec 22 13:58:22 CET,0.0 1.828 2.216 2.507 2.755 2.968 3.158 3.341 3.674 3.82 3.963 3.861 4.385 4.513 4.76 5.0 5.227 5.338 5.552 5.757 6.067 6.261 6.448 6.728 7.0 7.266 7.531 7.795 8.139 8.465 8.782 9.168 9.535 9.892 10.315 10.801 11.277 11.826 12.432 13.088 13.818 14.656 15.639 16.636 17.817 19.202 20.825 22.691 24.993 27.804 31.331 34.383 36.33 37.645 38.508 39.095 39.473 39.755 39.963 40.143 40.287 40.383 40.42 40.406 40.361 40.301 40.26 40.219 40.139 40.025 39.901 39.799 39.697 39.569 39.432 39.279 39.12 38.925 38.722 38.605 38.463 38.222 38.075 37.921 37.838 37.641 37.417 37.175 37.04 36.557 36.554 36.357 36.132 35.602 35.302 34.934 34.524 34.084 33.518 32.596 29.418 -8 ,10317 ,KEBNE ,17025241,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 13:58:43 CET,0.0 1.663 2.06 2.336 2.555 2.759 2.957 3.136 3.466 3.627 3.78 3.681 4.209 4.352 4.618 4.867 5.104 5.216 5.443 5.66 5.971 6.171 6.366 6.649 6.922 7.195 7.463 7.726 8.069 8.404 8.739 9.148 9.546 9.942 10.403 10.91 11.383 11.905 12.494 13.15 13.866 14.687 15.634 16.594 17.765 19.104 20.692 22.582 24.926 27.86 31.481 34.626 36.57 37.877 38.849 39.54 39.995 40.289 40.475 40.623 40.703 40.721 40.704 40.68 40.649 40.605 40.56 40.528 40.47 40.377 40.251 40.141 40.038 39.9 39.774 39.643 39.488 39.315 39.149 39.032 38.875 38.596 38.423 38.262 38.18 38.005 37.809 37.572 37.436 36.96 37.02 36.847 36.653 36.195 35.921 35.653 35.343 34.931 34.456 33.65 29.175 -9 ,16378 ,KEBNE ,17025242,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 13:59:05 CET,0.0 1.293 1.658 1.927 2.16 2.371 2.558 2.728 3.085 3.254 3.405 3.307 3.831 3.96 4.209 4.449 4.674 4.788 5.013 5.224 5.528 5.726 5.92 6.215 6.507 6.792 7.072 7.339 7.693 8.042 8.372 8.762 9.136 9.5 9.937 10.438 10.931 11.485 12.105 12.794 13.517 14.359 15.341 16.328 17.549 18.944 20.603 22.517 24.788 27.641 31.358 34.598 36.472 37.715 38.615 39.207 39.606 39.875 40.03 40.128 40.174 40.203 40.197 40.153 40.113 40.048 39.928 39.817 39.727 39.597 39.43 39.296 39.157 39.004 38.895 38.786 38.659 38.52 38.362 38.25 38.132 37.943 37.794 37.622 37.527 37.329 37.101 36.828 36.689 36.188 36.149 35.956 35.781 35.348 35.102 34.804 34.444 34.045 33.427 32.324 28.631 -10 ,29095 ,KEBNE ,17025243,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 13:59:36 CET,0.0 1.291 1.644 1.921 2.157 2.383 2.586 2.759 3.083 3.24 3.387 3.258 3.776 3.904 4.139 4.369 4.595 4.707 4.925 5.135 5.44 5.637 5.831 6.115 6.387 6.653 6.919 7.181 7.518 7.84 8.166 8.558 8.944 9.329 9.779 10.308 10.818 11.364 11.964 12.629 13.331 14.125 15.082 16.068 17.227 18.528 20.072 21.902 24.247 27.132 30.621 33.829 35.759 37.0 37.857 38.438 38.845 39.12 39.281 39.405 39.493 39.533 39.545 39.528 39.446 39.374 39.317 39.243 39.183 39.091 38.962 38.853 38.731 38.598 38.471 38.34 38.22 38.071 37.871 37.723 37.581 37.376 37.226 37.037 36.94 36.748 36.517 36.253 36.123 35.645 35.652 35.468 35.255 34.778 34.475 34.136 33.78 33.309 32.676 31.845 27.106 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 83301f2d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27660 ,KEBNE ,16692346,Thu Nov 25 18:52:56 CET,Thu Nov 25 20:41:51 CET,0.0 1.411 1.87 2.18 2.445 2.709 2.923 3.099 3.427 3.574 3.705 3.566 4.067 4.191 4.447 4.659 4.842 4.928 5.108 5.283 5.531 5.708 5.87 6.078 6.299 6.529 6.755 6.956 7.187 7.415 7.644 7.916 8.181 8.441 8.734 9.061 9.379 9.733 10.138 10.57 11.007 11.511 12.058 12.545 13.087 13.71 14.392 15.101 15.928 16.736 17.427 17.738 17.651 17.392 17.081 16.741 16.416 16.117 15.824 15.49 15.186 14.925 14.669 14.396 14.14 13.909 13.659 13.432 13.245 13.061 12.851 12.666 12.481 12.278 12.115 11.949 11.742 11.528 11.334 11.194 11.043 10.781 10.584 10.387 10.296 10.109 9.911 9.714 9.604 9.109 9.205 9.061 8.916 8.567 8.379 8.2 7.982 7.713 7.354 6.871 5.202 -2 ,29208 ,KEBNE ,16692347,Thu Nov 25 18:53:55 CET,Thu Nov 25 20:44:07 CET,0.0 1.669 2.113 2.453 2.719 2.928 3.125 3.313 3.648 3.79 3.927 3.801 4.302 4.41 4.622 4.832 5.032 5.122 5.288 5.452 5.686 5.842 5.991 6.202 6.4 6.594 6.782 6.963 7.193 7.418 7.65 7.917 8.171 8.428 8.727 9.06 9.364 9.689 10.031 10.395 10.787 11.234 11.808 12.387 13.013 13.698 14.441 15.189 15.994 16.887 17.842 18.322 18.297 18.1 17.792 17.426 17.089 16.778 16.502 16.171 15.872 15.619 15.356 15.105 14.86 14.623 14.362 14.133 13.945 13.729 13.49 13.278 13.046 12.834 12.676 12.508 12.337 12.157 11.979 11.849 11.688 11.449 11.299 11.109 11.007 10.807 10.587 10.366 10.248 9.748 9.842 9.695 9.549 9.203 9.016 8.82 8.575 8.306 7.993 7.516 5.679 -3 ,14474 ,KEBNE ,16692348,Thu Nov 25 18:54:57 CET,Thu Nov 25 20:43:33 CET,0.0 1.77 2.226 2.593 2.888 3.115 3.334 3.551 3.908 4.049 4.18 4.041 4.544 4.658 4.88 5.095 5.314 5.416 5.587 5.744 5.987 6.144 6.301 6.548 6.775 6.981 7.175 7.372 7.635 7.878 8.108 8.382 8.634 8.875 9.165 9.485 9.787 10.128 10.497 10.885 11.263 11.672 12.153 12.658 13.267 13.891 14.573 15.359 16.227 17.142 18.025 18.46 18.513 18.289 17.974 17.652 17.332 17.029 16.742 16.412 16.104 15.843 15.579 15.335 15.122 14.905 14.666 14.439 14.249 14.051 13.834 13.652 13.462 13.254 13.085 12.92 12.747 12.561 12.364 12.219 12.067 11.82 11.635 11.424 11.316 11.114 10.923 10.717 10.606 10.116 10.245 10.115 9.967 9.608 9.382 9.139 8.881 8.578 8.227 7.738 6.002 -4 ,27807 ,KEBNE ,16692349,Thu Nov 25 18:55:00 CET,Thu Nov 25 20:44:51 CET,0.0 1.877 2.29 2.596 2.843 3.054 3.242 3.405 3.705 3.849 3.982 3.844 4.352 4.473 4.698 4.907 5.101 5.197 5.391 5.575 5.819 5.97 6.122 6.366 6.616 6.847 7.043 7.218 7.455 7.679 7.894 8.156 8.408 8.659 8.953 9.268 9.558 9.882 10.252 10.646 11.068 11.566 12.131 12.665 13.287 13.984 14.727 15.461 16.257 17.153 18.059 18.477 18.42 18.225 18.014 17.702 17.351 17.021 16.724 16.415 16.147 15.915 15.697 15.475 15.237 15.009 14.764 14.526 14.314 14.101 13.892 13.718 13.529 13.344 13.195 13.032 12.857 12.673 12.477 12.326 12.17 11.938 11.77 11.581 11.484 11.275 11.046 10.812 10.692 10.188 10.263 10.096 9.912 9.494 9.274 9.042 8.787 8.505 8.121 7.541 5.889 -5 ,3142 ,KEBNE ,16692350,Thu Nov 25 18:54:58 CET,Thu Nov 25 20:44:42 CET,0.0 2.109 2.529 2.836 3.103 3.329 3.534 3.72 4.048 4.206 4.363 4.259 4.777 4.898 5.119 5.339 5.553 5.653 5.834 5.997 6.238 6.4 6.557 6.786 7.013 7.225 7.432 7.637 7.883 8.117 8.351 8.625 8.875 9.108 9.377 9.682 9.978 10.283 10.617 10.984 11.354 11.779 12.319 12.841 13.401 14.036 14.746 15.506 16.371 17.308 18.188 18.66 18.537 18.175 17.823 17.455 17.134 16.84 16.576 16.251 15.94 15.689 15.428 15.164 14.905 14.668 14.457 14.233 14.014 13.811 13.601 13.422 13.219 12.986 12.809 12.637 12.45 12.264 12.078 11.944 11.8 11.572 11.414 11.233 11.137 10.943 10.743 10.534 10.416 9.914 10.013 9.874 9.723 9.379 9.195 8.984 8.727 8.46 8.179 7.769 5.792 -6 ,5644 ,KEBNE ,16692351,Thu Nov 25 18:54:57 CET,Thu Nov 25 20:44:45 CET,0.0 1.602 2.042 2.408 2.727 2.978 3.188 3.376 3.735 3.896 4.048 3.96 4.479 4.601 4.827 5.046 5.252 5.347 5.535 5.708 5.949 6.116 6.278 6.501 6.708 6.905 7.108 7.316 7.569 7.823 8.072 8.351 8.613 8.873 9.19 9.562 9.921 10.297 10.672 11.057 11.445 11.872 12.426 12.971 13.553 14.163 14.849 15.612 16.425 17.293 18.123 18.506 18.486 18.285 18.007 17.672 17.346 17.037 16.743 16.418 16.139 15.871 15.59 15.312 15.049 14.82 14.583 14.363 14.165 13.966 13.753 13.572 13.377 13.163 12.995 12.821 12.647 12.454 12.234 12.092 11.947 11.7 11.533 11.363 11.28 11.104 10.892 10.652 10.534 10.042 10.136 9.984 9.828 9.47 9.277 9.065 8.814 8.49 8.09 7.533 5.029 -7 ,15640 ,KEBNE ,16692352,Thu Nov 25 18:54:57 CET,Thu Nov 25 20:43:35 CET,0.0 2.532 2.931 3.254 3.543 3.782 3.966 4.132 4.43 4.559 4.69 4.573 5.072 5.179 5.405 5.617 5.795 5.884 6.076 6.259 6.493 6.653 6.812 7.015 7.212 7.417 7.609 7.781 8.011 8.241 8.463 8.722 8.958 9.196 9.472 9.806 10.15 10.502 10.895 11.343 11.775 12.214 12.718 13.23 13.818 14.432 15.128 15.887 16.681 17.484 18.322 18.7 18.539 18.217 17.907 17.579 17.226 16.876 16.537 16.187 15.895 15.625 15.356 15.077 14.778 14.523 14.291 14.081 13.884 13.661 13.44 13.266 13.083 12.883 12.719 12.56 12.386 12.176 11.927 11.763 11.602 11.356 11.202 11.042 10.954 10.749 10.539 10.333 10.205 9.697 9.804 9.658 9.502 9.192 9.013 8.8 8.54 8.243 7.901 7.385 5.605 -8 ,2129 ,KEBNE ,16692353,Thu Nov 25 18:56:00 CET,Thu Nov 25 20:46:20 CET,0.0 1.502 1.981 2.297 2.545 2.784 2.99 3.169 3.487 3.63 3.773 3.644 4.14 4.253 4.481 4.696 4.899 4.995 5.177 5.348 5.607 5.778 5.933 6.162 6.374 6.569 6.782 6.987 7.226 7.46 7.675 7.924 8.176 8.416 8.695 9.019 9.331 9.651 9.994 10.375 10.788 11.276 11.832 12.332 12.892 13.472 14.095 14.81 15.692 16.666 17.517 17.847 17.72 17.493 17.226 16.909 16.585 16.226 15.912 15.642 15.385 15.121 14.852 14.599 14.37 14.164 13.939 13.687 13.473 13.284 13.083 12.903 12.686 12.462 12.287 12.08 11.87 11.666 11.443 11.279 11.108 10.839 10.65 10.473 10.391 10.196 9.959 9.709 9.578 9.062 9.153 9.015 8.86 8.489 8.272 8.043 7.776 7.454 7.077 6.572 4.963 -9 ,19795 ,KEBNE ,16692354,Thu Nov 25 18:56:00 CET,Thu Nov 25 20:46:12 CET,0.0 1.772 2.195 2.536 2.821 3.076 3.319 3.514 3.84 4.004 4.171 4.107 4.638 4.776 5.017 5.246 5.453 5.541 5.717 5.882 6.119 6.275 6.431 6.648 6.851 7.05 7.231 7.409 7.644 7.869 8.091 8.372 8.638 8.883 9.165 9.469 9.754 10.085 10.445 10.82 11.234 11.719 12.304 12.86 13.441 14.038 14.704 15.447 16.217 17.079 17.968 18.29 18.239 18.07 17.829 17.51 17.176 16.85 16.513 16.144 15.836 15.558 15.296 15.068 14.847 14.63 14.395 14.18 13.984 13.761 13.508 13.301 13.09 12.842 12.646 12.463 12.275 12.085 11.877 11.738 11.604 11.38 11.221 11.041 10.937 10.729 10.519 10.284 10.164 9.662 9.72 9.55 9.379 9.048 8.865 8.646 8.392 8.093 7.729 7.207 5.216 -10 ,5865 ,KEBNE ,16692355,Thu Nov 25 18:57:02 CET,Thu Nov 25 20:47:08 CET,0.0 1.525 1.962 2.313 2.619 2.86 3.058 3.232 3.584 3.747 3.908 3.821 4.32 4.426 4.652 4.874 5.077 5.179 5.374 5.554 5.807 5.964 6.117 6.341 6.558 6.765 6.963 7.146 7.374 7.598 7.814 8.064 8.306 8.54 8.8 9.095 9.386 9.726 10.078 10.418 10.774 11.181 11.669 12.181 12.797 13.444 14.091 14.762 15.459 16.195 16.914 17.113 17.006 16.751 16.45 16.15 15.866 15.592 15.296 14.962 14.685 14.411 14.139 13.882 13.628 13.394 13.133 12.905 12.703 12.484 12.246 12.035 11.802 11.561 11.384 11.206 11.022 10.818 10.596 10.44 10.277 10.038 9.872 9.69 9.596 9.406 9.206 8.989 8.859 8.342 8.424 8.266 8.083 7.653 7.418 7.149 6.874 6.591 6.236 5.737 4.227 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt deleted file mode 100644 index 29acd4bd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29345 ,KEBNE ,17025244,Wed Dec 22 12:12:49 CET,Wed Dec 22 14:05:03 CET,0.0 0.386 0.612 0.761 0.88 0.978 1.066 1.15 1.261 1.307 1.352 1.053 1.445 1.478 1.526 1.567 1.611 1.628 1.652 1.675 1.704 1.718 1.733 1.756 1.768 1.778 1.788 1.785 1.764 1.748 1.735 1.712 1.691 1.648 1.578 1.493 1.399 1.287 1.135 0.946 0.72 0.41 0.006 -0.435 -0.995 -1.695 -2.624 -3.814 -5.452 -7.799 -11.395 -15.33 -18.315 -20.679 -22.63 -24.289 -25.666 -26.855 -27.852 -28.82 -29.627 -30.321 -30.968 -31.588 -32.166 -32.668 -33.159 -33.585 -33.961 -34.346 -34.721 -35.036 -35.375 -35.722 -35.978 -36.23 -36.504 -36.793 -37.078 -37.275 -37.476 -37.778 -37.993 -38.214 -38.328 -38.562 -38.809 -39.078 -39.224 -39.778 -39.659 -39.802 -39.963 -40.304 -40.492 -40.693 -40.905 -41.163 -41.47 -41.855 -43.474 -2 ,2408 ,KEBNE ,17025245,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:09:24 CET,0.0 0.516 0.727 0.9 1.034 1.119 1.194 1.265 1.381 1.434 1.481 1.208 1.62 1.656 1.719 1.771 1.811 1.833 1.863 1.887 1.927 1.951 1.976 1.999 2.008 2.013 2.01 2.002 1.991 1.971 1.952 1.919 1.87 1.805 1.721 1.62 1.524 1.407 1.237 1.02 0.771 0.482 0.113 -0.321 -0.894 -1.617 -2.584 -3.849 -5.596 -8.073 -11.826 -15.9 -19.035 -21.507 -23.469 -25.139 -26.517 -27.695 -28.686 -29.644 -30.449 -31.163 -31.826 -32.424 -32.962 -33.448 -33.941 -34.373 -34.736 -35.103 -35.481 -35.79 -36.118 -36.466 -36.728 -36.988 -37.26 -37.554 -37.846 -38.034 -38.221 -38.519 -38.731 -38.947 -39.057 -39.284 -39.526 -39.77 -39.896 -40.436 -40.316 -40.472 -40.638 -40.983 -41.167 -41.375 -41.599 -41.833 -42.146 -42.597 -43.966 -3 ,27655 ,KEBNE ,17025246,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:09:22 CET,0.0 0.621 0.849 1.01 1.134 1.241 1.337 1.428 1.576 1.635 1.686 1.434 1.844 1.867 1.895 1.927 1.979 2.009 2.065 2.117 2.162 2.179 2.197 2.216 2.224 2.238 2.263 2.279 2.283 2.272 2.25 2.223 2.196 2.152 2.075 1.967 1.845 1.708 1.563 1.379 1.158 0.891 0.523 0.094 -0.46 -1.164 -2.115 -3.355 -5.049 -7.483 -11.193 -15.189 -18.175 -20.512 -22.431 -24.086 -25.473 -26.671 -27.665 -28.614 -29.409 -30.099 -30.732 -31.331 -31.889 -32.387 -32.894 -33.337 -33.71 -34.101 -34.495 -34.804 -35.119 -35.446 -35.702 -35.971 -36.242 -36.51 -36.795 -36.992 -37.19 -37.483 -37.681 -37.889 -37.996 -38.215 -38.44 -38.68 -38.812 -39.349 -39.229 -39.376 -39.524 -39.85 -40.037 -40.235 -40.451 -40.698 -41.016 -41.468 -42.637 -4 ,31626 ,KEBNE ,17025247,Wed Dec 22 12:12:46 CET,Wed Dec 22 14:05:53 CET,0.0 0.751 0.93 1.077 1.176 1.275 1.37 1.444 1.558 1.599 1.647 1.369 1.766 1.794 1.851 1.913 1.961 1.977 2.01 2.05 2.112 2.142 2.164 2.195 2.225 2.242 2.24 2.231 2.211 2.201 2.189 2.144 2.085 2.026 1.954 1.861 1.754 1.632 1.502 1.319 1.084 0.791 0.408 -0.035 -0.629 -1.359 -2.316 -3.585 -5.347 -7.837 -11.623 -15.738 -18.824 -21.277 -23.296 -25.003 -26.401 -27.605 -28.617 -29.588 -30.399 -31.105 -31.74 -32.332 -32.87 -33.351 -33.851 -34.28 -34.643 -35.015 -35.396 -35.71 -36.036 -36.363 -36.612 -36.875 -37.145 -37.427 -37.715 -37.907 -38.105 -38.409 -38.621 -38.834 -38.936 -39.15 -39.386 -39.634 -39.761 -40.296 -40.156 -40.294 -40.44 -40.78 -40.972 -41.171 -41.394 -41.644 -41.933 -42.294 -44.099 -5 ,24583 ,KEBNE ,17025248,Wed Dec 22 12:12:49 CET,Wed Dec 22 14:05:00 CET,0.0 0.896 1.177 1.365 1.517 1.629 1.723 1.801 1.936 1.995 2.056 1.804 2.225 2.278 2.355 2.409 2.471 2.499 2.543 2.584 2.622 2.64 2.664 2.7 2.713 2.716 2.73 2.743 2.743 2.733 2.72 2.693 2.652 2.603 2.543 2.459 2.349 2.222 2.068 1.871 1.644 1.358 0.977 0.561 0.025 -0.628 -1.488 -2.648 -4.285 -6.658 -10.234 -14.05 -16.979 -19.343 -21.25 -22.884 -24.267 -25.478 -26.492 -27.465 -28.27 -28.966 -29.629 -30.243 -30.795 -31.308 -31.837 -32.286 -32.669 -33.06 -33.462 -33.789 -34.118 -34.448 -34.706 -34.971 -35.232 -35.512 -35.806 -35.999 -36.193 -36.508 -36.729 -36.95 -37.063 -37.298 -37.537 -37.772 -37.895 -38.425 -38.303 -38.46 -38.619 -38.959 -39.141 -39.327 -39.529 -39.771 -40.067 -40.476 -42.391 -6 ,8005 ,KEBNE ,17025249,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:08:59 CET,0.0 0.583 0.762 0.925 1.039 1.135 1.238 1.326 1.442 1.503 1.564 1.286 1.696 1.74 1.838 1.922 1.96 1.975 2.001 2.022 2.048 2.07 2.094 2.12 2.137 2.139 2.143 2.14 2.128 2.117 2.1 2.069 2.024 1.971 1.894 1.789 1.686 1.566 1.414 1.218 0.995 0.724 0.344 -0.1 -0.672 -1.379 -2.337 -3.594 -5.292 -7.695 -11.377 -15.405 -18.458 -20.88 -22.843 -24.478 -25.813 -26.987 -27.974 -28.925 -29.733 -30.433 -31.067 -31.647 -32.189 -32.676 -33.176 -33.624 -34.008 -34.394 -34.783 -35.098 -35.416 -35.738 -35.98 -36.231 -36.503 -36.797 -37.082 -37.272 -37.476 -37.792 -38.007 -38.229 -38.338 -38.562 -38.812 -39.074 -39.206 -39.748 -39.621 -39.77 -39.934 -40.263 -40.454 -40.669 -40.889 -41.132 -41.409 -41.776 -43.422 -7 ,9187 ,KEBNE ,17025250,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:09:26 CET,0.0 0.492 0.655 0.759 0.881 0.997 1.083 1.156 1.268 1.319 1.365 1.077 1.473 1.5 1.546 1.585 1.628 1.647 1.681 1.719 1.758 1.768 1.78 1.804 1.824 1.833 1.844 1.865 1.866 1.858 1.848 1.815 1.777 1.735 1.664 1.554 1.44 1.311 1.143 0.927 0.698 0.42 0.041 -0.405 -0.972 -1.675 -2.63 -3.863 -5.574 -7.987 -11.627 -15.586 -18.585 -20.998 -22.961 -24.606 -25.976 -27.184 -28.187 -29.151 -29.965 -30.667 -31.323 -31.921 -32.45 -32.921 -33.421 -33.867 -34.232 -34.605 -34.995 -35.312 -35.636 -35.972 -36.229 -36.484 -36.738 -37.0 -37.271 -37.455 -37.651 -37.969 -38.182 -38.392 -38.504 -38.744 -38.985 -39.224 -39.353 -39.893 -39.77 -39.917 -40.073 -40.403 -40.576 -40.763 -40.978 -41.233 -41.524 -41.9 -43.06 -8 ,2758 ,KEBNE ,17025251,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:08:36 CET,0.0 0.512 0.702 0.86 1.015 1.123 1.223 1.314 1.442 1.502 1.557 1.292 1.706 1.744 1.814 1.862 1.909 1.936 1.979 2.014 2.069 2.1 2.121 2.141 2.157 2.176 2.196 2.21 2.223 2.215 2.214 2.221 2.195 2.147 2.085 1.999 1.898 1.781 1.657 1.488 1.242 0.937 0.569 0.171 -0.346 -1.042 -1.981 -3.206 -4.907 -7.308 -11.012 -14.984 -18.006 -20.41 -22.344 -23.998 -25.354 -26.509 -27.46 -28.407 -29.228 -29.924 -30.559 -31.162 -31.711 -32.2 -32.694 -33.112 -33.476 -33.871 -34.269 -34.575 -34.889 -35.214 -35.465 -35.72 -35.976 -36.245 -36.514 -36.7 -36.901 -37.219 -37.451 -37.679 -37.793 -38.031 -38.276 -38.533 -38.662 -39.2 -39.073 -39.22 -39.373 -39.705 -39.893 -40.095 -40.309 -40.571 -40.894 -41.328 -42.876 -9 ,11119 ,KEBNE ,17025252,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:08:44 CET,0.0 0.494 0.714 0.862 0.989 1.1 1.181 1.263 1.411 1.469 1.52 1.253 1.657 1.685 1.745 1.825 1.908 1.94 1.994 2.044 2.115 2.149 2.176 2.218 2.243 2.264 2.285 2.299 2.311 2.309 2.292 2.277 2.247 2.191 2.114 2.022 1.924 1.812 1.686 1.505 1.27 0.989 0.621 0.199 -0.384 -1.122 -2.052 -3.265 -4.926 -7.291 -10.926 -14.884 -17.929 -20.344 -22.291 -23.923 -25.274 -26.453 -27.431 -28.382 -29.165 -29.839 -30.476 -31.075 -31.62 -32.103 -32.596 -33.043 -33.435 -33.821 -34.199 -34.51 -34.833 -35.169 -35.43 -35.69 -35.956 -36.224 -36.497 -36.694 -36.896 -37.201 -37.397 -37.6 -37.703 -37.912 -38.136 -38.363 -38.485 -39.021 -38.892 -39.035 -39.186 -39.517 -39.693 -39.88 -40.079 -40.309 -40.603 -40.989 -42.229 -10 ,26831 ,KEBNE ,17025253,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:09:35 CET,0.0 0.479 0.648 0.772 0.875 0.963 1.039 1.097 1.201 1.257 1.306 1.019 1.425 1.459 1.519 1.587 1.651 1.68 1.728 1.765 1.801 1.815 1.827 1.851 1.891 1.918 1.924 1.924 1.918 1.896 1.87 1.839 1.798 1.741 1.668 1.572 1.456 1.313 1.149 0.951 0.708 0.406 0.02 -0.396 -0.956 -1.667 -2.61 -3.848 -5.54 -7.964 -11.606 -15.518 -18.49 -20.837 -22.763 -24.398 -25.756 -26.963 -27.98 -28.962 -29.772 -30.468 -31.121 -31.715 -32.243 -32.722 -33.223 -33.657 -34.02 -34.386 -34.757 -35.07 -35.396 -35.735 -35.989 -36.244 -36.515 -36.805 -37.095 -37.278 -37.471 -37.775 -37.977 -38.185 -38.289 -38.503 -38.726 -38.963 -39.089 -39.617 -39.488 -39.634 -39.782 -40.095 -40.269 -40.464 -40.672 -40.901 -41.18 -41.561 -42.998 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt deleted file mode 100644 index 69ff9fb8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25790 ,KEBNE ,16692356,Thu Nov 25 18:57:02 CET,Thu Nov 25 20:48:04 CET,0.0 1.629 2.038 2.346 2.626 2.867 3.084 3.285 3.638 3.802 3.973 3.862 4.434 4.579 4.844 5.1 5.353 5.478 5.714 5.939 6.283 6.502 6.708 7.013 7.316 7.607 7.892 8.18 8.553 8.918 9.27 9.679 10.066 10.446 10.91 11.444 11.945 12.499 13.132 13.815 14.54 15.37 16.328 17.336 18.546 19.905 21.498 23.317 25.555 28.31 31.735 34.61 36.209 37.194 37.815 38.205 38.461 38.619 38.683 38.697 38.694 38.691 38.655 38.596 38.561 38.498 38.391 38.292 38.2 38.09 37.969 37.856 37.737 37.636 37.538 37.421 37.287 37.148 37.008 36.914 36.812 36.635 36.517 36.38 36.31 36.175 36.018 35.842 35.751 35.274 35.465 35.346 35.211 34.938 34.795 34.631 34.441 34.212 33.941 33.534 31.385 -2 ,32766 ,KEBNE ,16692357,Thu Nov 25 18:57:02 CET,Thu Nov 25 20:46:37 CET,0.0 1.526 1.96 2.294 2.571 2.803 3.024 3.232 3.596 3.765 3.926 3.79 4.345 4.476 4.743 5.006 5.256 5.373 5.601 5.823 6.135 6.345 6.552 6.843 7.13 7.425 7.715 7.991 8.336 8.673 9.01 9.43 9.84 10.243 10.702 11.21 11.704 12.271 12.881 13.523 14.242 15.075 16.038 17.025 18.22 19.577 21.125 22.932 25.063 27.657 31.038 33.934 35.618 36.685 37.427 37.888 38.14 38.321 38.442 38.5 38.494 38.456 38.385 38.299 38.226 38.153 38.058 37.953 37.845 37.73 37.608 37.497 37.369 37.216 37.096 36.983 36.862 36.746 36.63 36.54 36.443 36.261 36.135 36.019 35.957 35.822 35.658 35.47 35.377 34.897 35.078 34.965 34.84 34.597 34.46 34.29 34.087 33.858 33.584 33.189 30.843 -3 ,17981 ,KEBNE ,16692358,Thu Nov 25 18:57:07 CET,Thu Nov 25 20:46:15 CET,0.0 1.844 2.287 2.615 2.873 3.1 3.316 3.511 3.862 4.028 4.192 4.083 4.649 4.782 5.034 5.274 5.504 5.616 5.842 6.074 6.409 6.614 6.814 7.111 7.394 7.667 7.944 8.22 8.574 8.927 9.26 9.668 10.074 10.469 10.93 11.439 11.932 12.481 13.094 13.778 14.507 15.326 16.294 17.268 18.396 19.686 21.24 23.078 25.269 27.911 31.173 33.762 35.228 36.22 36.882 37.277 37.496 37.611 37.663 37.702 37.703 37.652 37.574 37.492 37.397 37.302 37.195 37.078 36.967 36.851 36.711 36.598 36.491 36.359 36.248 36.134 36.019 35.9 35.759 35.66 35.564 35.411 35.295 35.17 35.1 34.942 34.777 34.609 34.519 34.031 34.203 34.084 33.958 33.688 33.53 33.361 33.186 32.973 32.671 32.249 30.226 -4 ,19242 ,KEBNE ,16692359,Thu Nov 25 18:58:05 CET,Thu Nov 25 20:48:03 CET,0.0 1.721 2.109 2.424 2.693 2.915 3.114 3.302 3.633 3.785 3.938 3.828 4.402 4.539 4.814 5.074 5.313 5.429 5.668 5.896 6.216 6.433 6.641 6.938 7.231 7.521 7.81 8.094 8.463 8.816 9.16 9.573 9.974 10.372 10.847 11.385 11.914 12.501 13.118 13.771 14.466 15.273 16.29 17.334 18.544 19.942 21.611 23.505 25.78 28.557 31.926 34.63 36.176 37.163 37.759 38.148 38.404 38.568 38.635 38.635 38.592 38.531 38.468 38.393 38.31 38.226 38.115 37.995 37.881 37.757 37.631 37.519 37.388 37.239 37.122 37.008 36.89 36.774 36.643 36.544 36.431 36.242 36.118 35.991 35.924 35.779 35.621 35.442 35.347 34.867 35.05 34.937 34.814 34.529 34.362 34.162 33.933 33.664 33.342 32.952 30.604 -6 ,28932 ,KEBNE ,16692361,Thu Nov 25 18:58:05 CET,Thu Nov 25 20:48:41 CET,0.0 1.146 1.595 1.939 2.212 2.438 2.651 2.847 3.203 3.374 3.536 3.392 3.94 4.069 4.329 4.589 4.855 4.984 5.227 5.459 5.806 6.028 6.234 6.525 6.81 7.091 7.368 7.644 8.003 8.337 8.667 9.082 9.492 9.894 10.351 10.859 11.353 11.903 12.502 13.151 13.85 14.641 15.594 16.605 17.79 19.138 20.76 22.618 24.785 27.332 30.56 33.344 34.934 35.878 36.451 36.788 37.008 37.17 37.265 37.313 37.319 37.287 37.225 37.16 37.099 37.032 36.944 36.854 36.758 36.648 36.543 36.445 36.323 36.204 36.111 36.009 35.909 35.802 35.673 35.581 35.491 35.337 35.218 35.086 35.013 34.865 34.705 34.531 34.442 33.968 34.149 34.024 33.895 33.618 33.472 33.291 33.082 32.854 32.573 32.114 30.597 -7 ,24140 ,KEBNE ,16692362,Thu Nov 25 18:58:05 CET,Thu Nov 25 20:50:09 CET,0.0 1.559 2.009 2.369 2.636 2.871 3.085 3.285 3.638 3.795 3.949 3.836 4.409 4.552 4.82 5.068 5.31 5.431 5.676 5.909 6.241 6.457 6.66 6.948 7.23 7.514 7.785 8.049 8.394 8.727 9.061 9.459 9.843 10.228 10.681 11.205 11.729 12.32 12.962 13.639 14.363 15.192 16.158 17.171 18.407 19.774 21.371 23.195 25.38 28.079 31.423 34.149 35.681 36.568 37.128 37.54 37.773 37.89 37.957 37.994 37.983 37.941 37.876 37.815 37.758 37.692 37.609 37.509 37.417 37.325 37.228 37.144 37.048 36.925 36.821 36.721 36.604 36.484 36.365 36.266 36.171 36.014 35.895 35.781 35.722 35.59 35.449 35.301 35.216 34.731 34.903 34.789 34.662 34.357 34.19 34.024 33.826 33.588 33.316 32.939 30.648 -8 ,25776 ,KEBNE ,16692363,Thu Nov 25 18:58:05 CET,Thu Nov 25 20:49:39 CET,0.0 1.572 1.998 2.304 2.57 2.807 3.023 3.219 3.561 3.721 3.872 3.745 4.304 4.445 4.718 4.975 5.238 5.363 5.597 5.819 6.139 6.352 6.57 6.886 7.188 7.482 7.766 8.042 8.406 8.773 9.129 9.556 9.977 10.385 10.861 11.394 11.906 12.484 13.114 13.786 14.509 15.344 16.331 17.33 18.496 19.846 21.427 23.22 25.452 28.114 31.335 34.097 35.656 36.522 37.114 37.504 37.737 37.877 37.917 37.901 37.856 37.809 37.756 37.674 37.575 37.495 37.4 37.301 37.216 37.12 37.015 36.92 36.816 36.697 36.594 36.483 36.38 36.275 36.149 36.063 35.968 35.798 35.672 35.533 35.463 35.317 35.164 34.975 34.874 34.398 34.593 34.483 34.367 34.093 33.939 33.779 33.583 33.363 33.094 32.705 30.954 -9 ,12600 ,KEBNE ,16692364,Thu Nov 25 18:58:05 CET,Thu Nov 25 20:48:59 CET,0.0 1.05 1.443 1.766 2.027 2.256 2.482 2.691 3.035 3.192 3.354 3.258 3.835 3.973 4.256 4.533 4.776 4.893 5.121 5.349 5.69 5.91 6.128 6.448 6.745 7.026 7.317 7.596 7.948 8.301 8.641 9.057 9.46 9.846 10.298 10.821 11.323 11.863 12.468 13.139 13.858 14.686 15.644 16.633 17.846 19.215 20.808 22.634 24.817 27.472 30.786 33.623 35.278 36.308 36.982 37.441 37.691 37.795 37.838 37.863 37.833 37.779 37.734 37.679 37.614 37.518 37.393 37.279 37.184 37.09 36.982 36.879 36.767 36.64 36.527 36.406 36.282 36.146 36.0 35.897 35.784 35.597 35.47 35.344 35.278 35.127 34.961 34.801 34.727 34.257 34.435 34.331 34.225 33.99 33.854 33.677 33.469 33.221 32.933 32.5 30.891 -10 ,7637 ,KEBNE ,16692365,Thu Nov 25 18:58:05 CET,Thu Nov 25 20:48:49 CET,0.0 1.548 1.998 2.296 2.548 2.783 3.005 3.218 3.597 3.766 3.926 3.795 4.36 4.498 4.767 5.022 5.266 5.391 5.639 5.864 6.171 6.37 6.575 6.878 7.173 7.471 7.758 8.026 8.368 8.7 9.026 9.441 9.846 10.235 10.698 11.233 11.744 12.283 12.88 13.519 14.196 15.013 15.959 16.931 18.109 19.405 20.941 22.751 24.933 27.552 30.895 33.696 35.25 36.165 36.735 37.109 37.294 37.369 37.403 37.429 37.438 37.398 37.325 37.257 37.181 37.099 37.0 36.889 36.791 36.693 36.593 36.502 36.384 36.258 36.163 36.065 35.957 35.825 35.677 35.575 35.469 35.299 35.182 35.055 34.985 34.837 34.679 34.495 34.393 33.911 34.071 33.934 33.801 33.545 33.405 33.238 33.034 32.792 32.493 32.098 30.393 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 3aaf5eb8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1873 ,KEBNE ,16692366,Thu Nov 25 18:58:05 CET,Thu Nov 25 20:50:14 CET,0.0 1.737 2.27 2.669 3.0 3.28 3.53 3.786 4.267 4.472 4.658 4.606 5.202 5.371 5.671 5.942 6.217 6.348 6.6 6.848 7.203 7.429 7.653 7.99 8.328 8.662 8.979 9.29 9.694 10.068 10.442 10.928 11.39 11.822 12.376 13.034 13.607 14.209 14.889 15.619 16.39 17.289 18.35 19.42 20.698 22.166 23.905 25.989 28.548 31.632 35.509 38.758 40.631 41.88 42.825 43.497 43.884 44.151 44.327 44.446 44.528 44.575 44.587 44.555 44.501 44.421 44.332 44.257 44.181 44.097 44.003 43.913 43.804 43.689 43.607 43.511 43.396 43.267 43.11 42.986 42.857 42.662 42.515 42.358 42.272 42.098 41.918 41.712 41.601 41.102 41.189 41.044 40.886 40.495 40.285 40.061 39.809 39.498 39.085 38.483 35.981 -2 ,29498 ,KEBNE ,16692367,Thu Nov 25 18:59:08 CET,Thu Nov 25 20:49:37 CET,0.0 2.715 3.31 3.769 4.161 4.485 4.757 5.008 5.493 5.696 5.881 5.795 6.374 6.537 6.847 7.13 7.416 7.567 7.854 8.108 8.476 8.718 8.947 9.289 9.639 9.968 10.275 10.577 10.982 11.382 11.759 12.196 12.628 13.061 13.573 14.151 14.71 15.323 15.999 16.749 17.554 18.497 19.627 20.771 22.092 23.598 25.47 27.649 30.245 33.422 37.35 40.71 42.801 44.131 44.95 45.527 45.951 46.248 46.408 46.519 46.587 46.605 46.603 46.565 46.523 46.489 46.406 46.316 46.229 46.129 46.026 45.927 45.817 45.699 45.579 45.423 45.275 45.118 44.945 44.819 44.684 44.494 44.358 44.204 44.114 43.916 43.696 43.469 43.345 42.825 42.877 42.715 42.552 42.136 41.906 41.668 41.354 40.976 40.561 40.003 37.351 -3 ,20363 ,KEBNE ,16692368,Thu Nov 25 18:59:07 CET,Thu Nov 25 20:50:12 CET,0.0 2.044 2.629 3.044 3.375 3.666 3.929 4.182 4.642 4.848 5.039 4.964 5.542 5.696 5.995 6.28 6.563 6.707 6.988 7.266 7.66 7.918 8.171 8.538 8.875 9.187 9.508 9.82 10.22 10.615 10.994 11.46 11.921 12.363 12.866 13.451 14.011 14.629 15.327 16.063 16.837 17.735 18.808 19.904 21.198 22.656 24.399 26.468 28.944 32.055 36.023 39.28 41.176 42.329 43.094 43.615 43.981 44.23 44.38 44.499 44.566 44.593 44.592 44.58 44.54 44.466 44.375 44.292 44.221 44.121 44.001 43.898 43.79 43.664 43.552 43.447 43.335 43.193 43.03 42.919 42.799 42.589 42.438 42.288 42.208 42.026 41.824 41.622 41.526 41.048 41.164 41.028 40.896 40.591 40.399 40.16 39.876 39.542 39.122 38.571 36.743 -4 ,16463 ,KEBNE ,16692369,Thu Nov 25 18:59:08 CET,Thu Nov 25 20:50:05 CET,0.0 1.385 1.933 2.299 2.637 2.937 3.204 3.463 3.924 4.126 4.312 4.226 4.81 4.979 5.338 5.679 5.974 6.112 6.402 6.683 7.067 7.317 7.557 7.922 8.278 8.602 8.929 9.257 9.675 10.067 10.44 10.898 11.349 11.787 12.285 12.842 13.39 14.022 14.735 15.523 16.354 17.289 18.372 19.49 20.838 22.374 24.169 26.201 28.711 31.763 35.58 38.887 40.777 41.961 42.763 43.336 43.7 43.935 44.116 44.298 44.376 44.415 44.449 44.434 44.399 44.328 44.239 44.135 44.038 43.955 43.869 43.799 43.709 43.586 43.475 43.356 43.236 43.103 42.945 42.823 42.697 42.492 42.33 42.166 42.084 41.904 41.693 41.467 41.365 40.889 40.997 40.842 40.7 40.395 40.203 39.988 39.718 39.379 38.949 38.311 35.159 -5 ,19952 ,KEBNE ,16692370,Thu Nov 25 18:59:07 CET,Thu Nov 25 20:51:29 CET,0.0 1.695 2.191 2.576 2.896 3.175 3.437 3.69 4.151 4.352 4.545 4.481 5.067 5.219 5.516 5.818 6.112 6.256 6.558 6.87 7.29 7.532 7.763 8.102 8.45 8.814 9.161 9.482 9.902 10.314 10.697 11.145 11.593 12.036 12.558 13.154 13.731 14.373 15.085 15.854 16.648 17.535 18.593 19.7 21.031 22.539 24.356 26.464 28.969 31.973 35.858 39.357 41.425 42.635 43.419 43.998 44.397 44.662 44.851 44.976 45.013 44.997 44.967 44.925 44.845 44.757 44.653 44.554 44.44 44.308 44.177 44.073 43.965 43.836 43.733 43.616 43.463 43.286 43.1 42.967 42.82 42.597 42.455 42.311 42.229 42.032 41.839 41.644 41.521 41.015 41.11 40.959 40.803 40.456 40.265 40.047 39.774 39.441 38.996 38.31 35.757 -6 ,32417 ,KEBNE ,16692371,Thu Nov 25 18:59:08 CET,Thu Nov 25 20:50:56 CET,0.0 2.148 2.677 3.066 3.399 3.694 3.963 4.198 4.601 4.8 5.002 4.963 5.549 5.704 6.022 6.311 6.587 6.72 6.981 7.239 7.604 7.84 8.07 8.406 8.726 9.035 9.334 9.634 10.025 10.411 10.784 11.241 11.694 12.124 12.636 13.238 13.806 14.424 15.117 15.886 16.675 17.56 18.634 19.711 21.003 22.515 24.307 26.372 28.898 31.995 35.861 39.264 41.338 42.616 43.47 44.099 44.556 44.869 45.056 45.213 45.308 45.337 45.337 45.323 45.288 45.235 45.171 45.114 45.055 44.971 44.859 44.76 44.67 44.559 44.456 44.348 44.228 44.101 43.972 43.875 43.773 43.604 43.484 43.366 43.303 43.163 43.012 42.843 42.747 42.274 42.404 42.267 42.123 41.803 41.609 41.367 41.096 40.794 40.382 39.82 37.862 -7 ,27325 ,KEBNE ,16692372,Thu Nov 25 18:59:08 CET,Thu Nov 25 20:52:34 CET,0.0 1.805 2.345 2.76 3.084 3.378 3.675 3.931 4.378 4.598 4.812 4.776 5.375 5.538 5.866 6.208 6.561 6.732 7.068 7.38 7.813 8.072 8.317 8.683 9.02 9.347 9.676 9.998 10.4 10.783 11.167 11.646 12.115 12.573 13.09 13.663 14.223 14.842 15.519 16.254 17.034 17.956 19.069 20.175 21.465 22.921 24.664 26.726 29.264 32.439 36.4 39.786 41.862 43.188 44.066 44.664 45.088 45.398 45.559 45.649 45.681 45.693 45.693 45.671 45.647 45.594 45.517 45.452 45.377 45.293 45.184 45.075 44.948 44.777 44.639 44.504 44.348 44.177 44.0 43.864 43.714 43.462 43.284 43.097 42.994 42.786 42.572 42.348 42.241 41.743 41.81 41.639 41.464 41.104 40.877 40.623 40.337 40.006 39.541 38.845 36.233 -8 ,30625 ,KEBNE ,16692373,Thu Nov 25 18:59:08 CET,Thu Nov 25 20:52:36 CET,0.0 1.821 2.315 2.692 2.992 3.259 3.51 3.732 4.123 4.309 4.477 4.378 4.959 5.126 5.444 5.738 6.018 6.148 6.397 6.648 7.002 7.225 7.449 7.785 8.121 8.445 8.752 9.062 9.471 9.855 10.227 10.691 11.127 11.54 12.043 12.622 13.183 13.816 14.511 15.282 16.126 17.071 18.159 19.283 20.664 22.209 23.976 26.057 28.553 31.567 35.405 38.725 40.802 42.142 43.014 43.642 44.068 44.279 44.399 44.499 44.568 44.612 44.621 44.621 44.589 44.542 44.469 44.394 44.317 44.231 44.143 44.061 43.952 43.826 43.729 43.621 43.49 43.339 43.177 43.051 42.925 42.725 42.581 42.412 42.321 42.136 41.943 41.753 41.646 41.139 41.2 41.055 40.902 40.498 40.256 39.985 39.682 39.329 38.883 38.256 36.117 -9 ,21523 ,KEBNE ,16692374,Thu Nov 25 18:59:08 CET,Thu Nov 25 20:52:51 CET,0.0 2.367 2.953 3.401 3.738 4.009 4.256 4.495 4.944 5.142 5.329 5.289 5.903 6.075 6.407 6.708 7.0 7.15 7.435 7.705 8.104 8.364 8.618 8.99 9.354 9.703 10.018 10.313 10.715 11.108 11.472 11.922 12.383 12.83 13.341 13.921 14.478 15.087 15.758 16.483 17.276 18.223 19.357 20.487 21.804 23.292 25.025 27.037 29.48 32.516 36.4 39.644 41.597 42.875 43.705 44.324 44.785 45.09 45.221 45.277 45.279 45.271 45.275 45.232 45.157 45.083 45.0 44.906 44.805 44.692 44.573 44.473 44.361 44.232 44.114 43.995 43.869 43.73 43.582 43.479 43.371 43.198 43.08 42.932 42.842 42.649 42.444 42.219 42.097 41.598 41.702 41.567 41.407 40.994 40.784 40.557 40.269 39.908 39.458 38.849 36.454 -10 ,10658 ,KEBNE ,16692375,Thu Nov 25 19:00:10 CET,Thu Nov 25 20:52:00 CET,0.0 1.474 1.991 2.377 2.708 3.011 3.28 3.536 4.024 4.234 4.425 4.368 4.965 5.136 5.48 5.797 6.078 6.221 6.503 6.763 7.128 7.367 7.606 7.945 8.269 8.59 8.908 9.22 9.624 10.001 10.355 10.791 11.223 11.645 12.127 12.682 13.249 13.873 14.544 15.295 16.09 16.963 17.987 19.072 20.405 21.898 23.66 25.693 28.127 31.093 34.885 38.215 40.134 41.334 42.157 42.728 43.123 43.408 43.586 43.718 43.777 43.772 43.762 43.744 43.707 43.639 43.542 43.463 43.406 43.323 43.224 43.147 43.036 42.918 42.826 42.726 42.621 42.514 42.376 42.269 42.167 42.013 41.896 41.759 41.687 41.54 41.373 41.19 41.089 40.604 40.698 40.513 40.32 39.909 39.667 39.399 39.089 38.705 38.238 37.685 35.536 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt deleted file mode 100644 index ff019359..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21857 ,KEBNE ,16692376,Thu Nov 25 19:00:10 CET,Thu Nov 25 20:54:44 CET,0.0 2.522 3.345 3.927 4.384 4.729 5.026 5.304 5.753 5.957 6.159 6.128 6.712 6.873 7.182 7.46 7.732 7.865 8.097 8.312 8.608 8.796 8.984 9.242 9.479 9.711 9.932 10.148 10.425 10.682 10.931 11.234 11.526 11.8 12.103 12.429 12.729 13.057 13.398 13.749 14.136 14.555 15.003 15.451 15.953 16.501 17.149 17.87 18.673 19.556 20.473 21.118 21.418 21.48 21.357 21.144 20.975 20.831 20.664 20.452 20.244 20.032 19.818 19.627 19.443 19.264 19.073 18.883 18.721 18.568 18.404 18.27 18.107 17.936 17.803 17.65 17.494 17.329 17.147 17.021 16.891 16.683 16.53 16.373 16.297 16.132 15.939 15.74 15.637 15.131 15.309 15.187 15.057 14.769 14.618 14.45 14.223 13.963 13.691 13.299 9.677 -2 ,2364 ,KEBNE ,16692378,Thu Nov 25 19:00:10 CET,Thu Nov 25 20:54:43 CET,0.0 2.693 3.488 3.983 4.368 4.683 4.958 5.194 5.627 5.834 6.022 5.964 6.531 6.681 6.957 7.217 7.468 7.579 7.781 7.978 8.263 8.437 8.603 8.843 9.076 9.311 9.53 9.736 10.004 10.25 10.495 10.805 11.095 11.355 11.644 11.968 12.286 12.628 12.982 13.355 13.744 14.182 14.703 15.226 15.78 16.387 17.137 17.95 18.796 19.762 20.853 21.555 21.91 22.089 22.158 22.197 22.129 21.958 21.77 21.572 21.407 21.264 21.111 20.955 20.817 20.68 20.51 20.366 20.242 20.076 19.896 19.75 19.586 19.423 19.292 19.144 18.998 18.84 18.673 18.567 18.454 18.251 18.113 17.978 17.91 17.769 17.593 17.407 17.305 16.81 17.019 16.914 16.784 16.485 16.319 16.116 15.893 15.657 15.335 14.874 13.087 -3 ,28229 ,KEBNE ,16692379,Thu Nov 25 19:00:10 CET,Thu Nov 25 20:55:00 CET,0.0 2.593 3.487 4.05 4.542 4.984 5.316 5.587 6.007 6.205 6.405 6.339 6.902 7.049 7.317 7.568 7.794 7.901 8.11 8.321 8.621 8.789 8.952 9.202 9.445 9.674 9.891 10.097 10.356 10.613 10.86 11.15 11.435 11.706 12.005 12.327 12.629 12.948 13.286 13.645 14.02 14.433 14.9 15.392 15.961 16.544 17.258 18.103 19.047 20.106 21.227 21.975 22.267 22.323 22.333 22.274 22.139 21.991 21.829 21.624 21.443 21.284 21.119 20.954 20.792 20.647 20.475 20.313 20.183 20.054 19.896 19.767 19.64 19.489 19.379 19.271 19.146 19.008 18.856 18.755 18.658 18.504 18.394 18.273 18.208 18.059 17.893 17.729 17.646 17.166 17.368 17.256 17.139 16.916 16.781 16.614 16.417 16.185 15.903 15.531 12.522 -4 ,27204 ,KEBNE ,16692380,Thu Nov 25 19:01:13 CET,Thu Nov 25 20:54:32 CET,0.0 2.003 2.938 3.6 4.084 4.463 4.779 5.058 5.547 5.759 5.966 5.955 6.553 6.716 7.008 7.29 7.553 7.672 7.893 8.104 8.405 8.608 8.805 9.074 9.329 9.571 9.802 10.027 10.31 10.573 10.837 11.161 11.46 11.739 12.068 12.439 12.782 13.151 13.536 13.938 14.349 14.793 15.313 15.836 16.445 17.102 17.826 18.682 19.631 20.598 21.635 22.317 22.63 22.692 22.625 22.508 22.358 22.198 22.022 21.803 21.619 21.448 21.274 21.093 20.9 20.722 20.542 20.374 20.223 20.062 19.906 19.782 19.643 19.484 19.361 19.231 19.086 18.942 18.77 18.635 18.508 18.304 18.156 17.998 17.917 17.765 17.605 17.403 17.288 16.778 16.908 16.768 16.623 16.31 16.123 15.91 15.692 15.464 15.167 14.775 10.116 -5 ,27398 ,KEBNE ,16692381,Thu Nov 25 19:01:12 CET,Thu Nov 25 20:55:29 CET,0.0 3.179 4.161 4.782 5.289 5.714 6.051 6.35 6.875 7.106 7.32 7.307 7.901 8.066 8.381 8.677 8.936 9.063 9.309 9.542 9.881 10.091 10.293 10.609 10.917 11.189 11.437 11.679 12.004 12.315 12.585 12.892 13.194 13.504 13.885 14.284 14.653 15.053 15.439 15.818 16.233 16.707 17.254 17.828 18.507 19.181 19.889 20.684 21.535 22.462 23.551 24.368 24.669 24.807 24.844 24.744 24.604 24.438 24.278 24.093 23.903 23.721 23.557 23.422 23.296 23.161 22.995 22.823 22.668 22.523 22.365 22.215 22.065 21.917 21.793 21.659 21.517 21.345 21.151 21.018 20.878 20.671 20.54 20.401 20.322 20.15 19.965 19.764 19.661 19.156 19.326 19.201 19.066 18.758 18.578 18.38 18.187 17.97 17.708 17.372 15.42 -6 ,23324 ,KEBNE ,16692382,Thu Nov 25 19:01:13 CET,Thu Nov 25 20:57:23 CET,0.0 2.539 3.401 3.962 4.344 4.651 4.932 5.173 5.595 5.788 5.968 5.888 6.438 6.578 6.838 7.073 7.299 7.414 7.631 7.825 8.103 8.279 8.456 8.712 8.946 9.173 9.39 9.594 9.85 10.082 10.299 10.566 10.834 11.087 11.373 11.704 12.033 12.382 12.747 13.133 13.544 14.012 14.541 15.057 15.674 16.394 17.139 17.927 18.895 19.979 21.181 22.039 22.4 22.523 22.512 22.435 22.337 22.22 22.102 21.934 21.745 21.569 21.414 21.256 21.082 20.928 20.752 20.562 20.407 20.261 20.111 19.98 19.837 19.701 19.58 19.447 19.312 19.156 18.983 18.859 18.726 18.515 18.371 18.218 18.129 17.953 17.785 17.597 17.5 16.995 17.135 16.982 16.827 16.511 16.341 16.141 15.921 15.685 15.368 14.884 6.765 -7 ,21371 ,KEBNE ,16692383,Thu Nov 25 19:01:13 CET,Thu Nov 25 20:55:27 CET,0.0 2.047 2.766 3.273 3.666 3.979 4.264 4.628 5.295 5.494 5.669 5.582 6.131 6.275 6.555 6.817 7.062 7.179 7.404 7.612 7.9 8.086 8.263 8.509 8.75 8.983 9.198 9.401 9.654 9.899 10.146 10.439 10.719 10.984 11.272 11.592 11.899 12.215 12.547 12.899 13.265 13.687 14.172 14.631 15.156 15.756 16.419 17.113 17.894 18.779 19.802 20.448 20.71 20.808 20.78 20.664 20.506 20.312 20.093 19.838 19.616 19.414 19.217 19.025 18.818 18.623 18.419 18.241 18.074 17.892 17.707 17.527 17.334 17.12 16.945 16.777 16.601 16.428 16.265 16.137 15.986 15.775 15.639 15.495 15.42 15.251 15.063 14.842 14.717 14.205 14.365 14.238 14.108 13.829 13.661 13.471 13.25 13.008 12.716 12.299 9.985 -8 ,1822 ,KEBNE ,16692384,Thu Nov 25 19:01:13 CET,Thu Nov 25 20:55:15 CET,0.0 3.101 4.045 4.746 5.429 5.936 6.253 6.541 7.009 7.199 7.384 7.35 7.924 8.084 8.387 8.674 8.94 9.07 9.331 9.56 9.872 10.077 10.269 10.545 10.814 11.066 11.303 11.541 11.852 12.151 12.438 12.771 13.092 13.397 13.727 14.081 14.423 14.799 15.2 15.617 16.042 16.53 17.121 17.684 18.311 19.018 19.861 20.837 21.947 23.158 24.451 25.436 25.972 26.204 26.294 26.29 26.217 26.11 25.986 25.859 25.741 25.618 25.472 25.305 25.143 24.986 24.814 24.662 24.513 24.331 24.165 24.041 23.904 23.751 23.627 23.505 23.375 23.223 23.05 22.927 22.809 22.632 22.508 22.393 22.326 22.171 22.025 21.862 21.769 21.284 21.453 21.318 21.185 20.951 20.8 20.602 20.408 20.211 19.942 19.56 17.436 -9 ,26716 ,KEBNE ,16692385,Thu Nov 25 19:01:12 CET,Thu Nov 25 20:54:58 CET,0.0 2.189 2.949 3.535 4.015 4.414 4.724 5.004 5.476 5.677 5.861 5.79 6.349 6.502 6.787 7.043 7.274 7.386 7.617 7.84 8.138 8.329 8.523 8.804 9.062 9.298 9.541 9.803 10.19 10.531 10.801 11.143 11.478 11.803 12.157 12.526 12.87 13.234 13.621 14.021 14.413 14.834 15.322 15.819 16.43 17.128 17.889 18.67 19.561 20.599 21.792 22.662 23.053 23.249 23.237 23.082 22.931 22.786 22.633 22.426 22.25 22.113 21.966 21.808 21.638 21.464 21.278 21.113 20.963 20.808 20.66 20.527 20.381 20.233 20.101 19.965 19.84 19.708 19.558 19.449 19.341 19.153 19.005 18.853 18.778 18.633 18.483 18.312 18.217 17.717 17.894 17.784 17.654 17.355 17.195 17.02 16.841 16.632 16.345 15.946 5.08 -10 ,22944 ,KEBNE ,16692386,Thu Nov 25 19:01:13 CET,Thu Nov 25 20:56:30 CET,0.0 3.069 4.218 4.936 5.446 5.891 6.268 6.59 7.117 7.336 7.558 7.548 8.136 8.304 8.587 8.842 9.075 9.192 9.438 9.667 9.977 10.17 10.35 10.604 10.841 11.054 11.248 11.434 11.67 11.894 12.117 12.392 12.647 12.891 13.173 13.486 13.8 14.155 14.521 14.885 15.269 15.69 16.158 16.634 17.194 17.831 18.535 19.304 20.187 21.237 22.54 23.452 23.883 24.058 24.069 24.031 23.978 23.901 23.805 23.672 23.525 23.366 23.213 23.055 22.878 22.707 22.532 22.38 22.234 22.087 21.922 21.757 21.584 21.422 21.293 21.154 21.015 20.867 20.703 20.587 20.474 20.287 20.162 20.035 19.963 19.811 19.647 19.464 19.367 18.883 19.072 18.955 18.822 18.521 18.356 18.194 18.021 17.803 17.551 17.249 8.995 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt deleted file mode 100644 index f561a881..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,121 ,KEBNE ,16692387,Thu Nov 25 19:02:15 CET,Thu Nov 25 20:58:18 CET,0.0 0.719 0.936 1.094 1.211 1.306 1.399 1.501 1.659 1.725 1.797 1.537 1.99 2.042 2.142 2.239 2.335 2.382 2.454 2.521 2.631 2.705 2.769 2.859 2.952 3.046 3.127 3.19 3.264 3.335 3.406 3.48 3.533 3.576 3.636 3.716 3.793 3.859 3.91 3.956 3.99 4.035 4.065 4.046 4.015 3.924 3.75 3.504 3.075 2.341 1.103 -0.411 -1.748 -2.883 -3.836 -4.647 -5.324 -5.928 -6.441 -6.955 -7.39 -7.775 -8.146 -8.505 -8.829 -9.1 -9.374 -9.62 -9.83 -10.051 -10.288 -10.472 -10.653 -10.848 -10.999 -11.152 -11.307 -11.467 -11.632 -11.747 -11.872 -12.078 -12.226 -12.378 -12.455 -12.604 -12.745 -12.9 -12.988 -13.48 -13.25 -13.344 -13.447 -13.671 -13.794 -13.91 -14.021 -14.159 -14.326 -14.554 -15.045 -2 ,19280 ,KEBNE ,16692388,Thu Nov 25 19:02:15 CET,Thu Nov 25 20:59:03 CET,0.0 0.376 0.54 0.665 0.78 0.888 0.99 1.079 1.232 1.299 1.362 1.083 1.522 1.568 1.668 1.771 1.857 1.897 1.975 2.041 2.121 2.167 2.218 2.3 2.374 2.458 2.54 2.598 2.659 2.722 2.776 2.849 2.924 2.979 3.04 3.104 3.163 3.221 3.27 3.33 3.397 3.451 3.502 3.528 3.491 3.414 3.294 3.066 2.645 1.943 0.686 -0.912 -2.295 -3.475 -4.434 -5.289 -6.03 -6.691 -7.264 -7.842 -8.314 -8.71 -9.091 -9.447 -9.766 -10.053 -10.35 -10.607 -10.822 -11.027 -11.251 -11.449 -11.642 -11.835 -11.986 -12.138 -12.293 -12.46 -12.626 -12.745 -12.877 -13.074 -13.208 -13.34 -13.403 -13.54 -13.677 -13.828 -13.909 -14.396 -14.182 -14.273 -14.362 -14.568 -14.669 -14.764 -14.868 -14.975 -15.09 -15.297 -15.769 -3 ,16924 ,KEBNE ,16692389,Thu Nov 25 19:03:18 CET,Thu Nov 25 20:59:25 CET,0.0 0.514 0.66 0.758 0.861 0.97 1.063 1.147 1.298 1.369 1.432 1.136 1.571 1.621 1.715 1.801 1.882 1.923 2.008 2.072 2.148 2.201 2.253 2.33 2.406 2.477 2.552 2.62 2.69 2.756 2.815 2.88 2.95 3.007 3.063 3.124 3.17 3.225 3.276 3.315 3.346 3.382 3.408 3.398 3.341 3.219 3.042 2.801 2.384 1.657 0.392 -1.201 -2.501 -3.596 -4.512 -5.297 -6.005 -6.636 -7.143 -7.639 -8.072 -8.457 -8.828 -9.175 -9.473 -9.744 -10.049 -10.321 -10.536 -10.749 -10.963 -11.144 -11.339 -11.534 -11.69 -11.854 -12.014 -12.173 -12.34 -12.458 -12.582 -12.78 -12.914 -13.05 -13.124 -13.271 -13.402 -13.53 -13.596 -14.077 -13.844 -13.933 -14.023 -14.201 -14.304 -14.411 -14.548 -14.724 -14.881 -15.126 -15.876 -4 ,12548 ,KEBNE ,16692390,Thu Nov 25 19:03:18 CET,Thu Nov 25 20:58:43 CET,0.0 0.497 0.747 0.947 1.073 1.182 1.303 1.419 1.613 1.7 1.776 1.519 1.973 2.031 2.126 2.218 2.308 2.349 2.437 2.515 2.614 2.68 2.736 2.802 2.865 2.931 2.994 3.057 3.145 3.236 3.318 3.403 3.478 3.537 3.604 3.682 3.748 3.811 3.871 3.931 3.965 3.973 3.978 3.959 3.903 3.791 3.598 3.306 2.87 2.136 0.763 -0.905 -2.236 -3.357 -4.29 -5.071 -5.742 -6.358 -6.884 -7.425 -7.892 -8.266 -8.617 -8.949 -9.241 -9.494 -9.756 -9.997 -10.208 -10.418 -10.631 -10.814 -11.005 -11.2 -11.34 -11.481 -11.638 -11.803 -11.985 -12.118 -12.247 -12.423 -12.541 -12.681 -12.759 -12.903 -13.055 -13.219 -13.295 -13.783 -13.543 -13.62 -13.712 -13.937 -14.048 -14.16 -14.291 -14.463 -14.643 -14.823 -15.126 -5 ,13642 ,KEBNE ,16692391,Thu Nov 25 19:03:18 CET,Thu Nov 25 21:01:15 CET,0.0 0.507 0.647 0.768 0.866 0.955 1.054 1.145 1.272 1.327 1.382 1.095 1.53 1.581 1.678 1.769 1.855 1.893 1.953 2.014 2.122 2.19 2.242 2.311 2.388 2.462 2.53 2.597 2.674 2.736 2.802 2.885 2.958 3.027 3.095 3.149 3.194 3.243 3.305 3.366 3.397 3.411 3.408 3.393 3.361 3.287 3.147 2.903 2.503 1.837 0.559 -1.055 -2.384 -3.437 -4.327 -5.158 -5.868 -6.492 -7.018 -7.54 -7.964 -8.334 -8.703 -9.057 -9.385 -9.66 -9.935 -10.19 -10.4 -10.612 -10.844 -11.037 -11.214 -11.394 -11.548 -11.707 -11.87 -12.049 -12.244 -12.368 -12.485 -12.671 -12.801 -12.929 -12.992 -13.122 -13.261 -13.41 -13.487 -13.976 -13.728 -13.811 -13.914 -14.119 -14.223 -14.34 -14.462 -14.591 -14.748 -14.958 -15.3 -6 ,15414 ,KEBNE ,16692392,Thu Nov 25 19:03:18 CET,Thu Nov 25 20:59:03 CET,0.0 0.765 0.984 1.134 1.245 1.336 1.429 1.522 1.687 1.765 1.835 1.568 2.003 2.044 2.136 2.224 2.32 2.36 2.427 2.502 2.609 2.687 2.761 2.857 2.935 2.994 3.053 3.105 3.163 3.22 3.277 3.348 3.415 3.476 3.537 3.594 3.649 3.723 3.8 3.868 3.914 3.942 3.947 3.917 3.854 3.751 3.584 3.334 2.933 2.222 0.95 -0.628 -1.929 -3.015 -3.926 -4.73 -5.433 -6.054 -6.59 -7.13 -7.573 -7.961 -8.349 -8.726 -9.063 -9.353 -9.656 -9.932 -10.167 -10.404 -10.65 -10.851 -11.052 -11.249 -11.399 -11.556 -11.717 -11.887 -12.056 -12.17 -12.296 -12.502 -12.638 -12.765 -12.83 -12.964 -13.116 -13.278 -13.363 -13.859 -13.633 -13.723 -13.818 -14.033 -14.148 -14.26 -14.389 -14.535 -14.678 -14.823 -15.344 -7 ,27152 ,KEBNE ,16692393,Thu Nov 25 19:03:18 CET,Thu Nov 25 21:00:50 CET,0.0 0.487 0.664 0.802 0.925 1.018 1.093 1.167 1.305 1.365 1.422 1.154 1.596 1.641 1.723 1.794 1.875 1.915 1.991 2.07 2.178 2.238 2.29 2.366 2.432 2.494 2.555 2.609 2.677 2.746 2.815 2.887 2.946 2.996 3.051 3.111 3.163 3.228 3.285 3.304 3.317 3.332 3.316 3.278 3.232 3.121 2.934 2.69 2.213 1.416 0.073 -1.545 -2.864 -3.943 -4.85 -5.623 -6.247 -6.806 -7.299 -7.794 -8.227 -8.612 -8.964 -9.303 -9.621 -9.901 -10.183 -10.429 -10.652 -10.882 -11.106 -11.289 -11.485 -11.689 -11.834 -11.976 -12.133 -12.308 -12.487 -12.605 -12.714 -12.887 -13.021 -13.153 -13.229 -13.393 -13.531 -13.679 -13.761 -14.242 -14.006 -14.091 -14.186 -14.387 -14.481 -14.588 -14.706 -14.82 -14.939 -15.126 -15.531 -8 ,2341 ,KEBNE ,16692394,Thu Nov 25 19:03:18 CET,Thu Nov 25 21:01:34 CET,0.0 0.496 0.705 0.853 0.967 1.076 1.172 1.256 1.393 1.449 1.506 1.248 1.709 1.776 1.887 1.984 2.077 2.115 2.193 2.272 2.374 2.449 2.522 2.604 2.679 2.75 2.807 2.87 2.956 3.036 3.11 3.19 3.262 3.328 3.408 3.483 3.541 3.594 3.632 3.686 3.75 3.796 3.818 3.797 3.73 3.639 3.48 3.186 2.722 1.992 0.777 -0.735 -2.005 -3.086 -4.024 -4.839 -5.561 -6.229 -6.779 -7.302 -7.742 -8.128 -8.497 -8.835 -9.134 -9.406 -9.709 -9.978 -10.201 -10.431 -10.668 -10.864 -11.059 -11.255 -11.405 -11.554 -11.7 -11.858 -12.046 -12.173 -12.306 -12.522 -12.663 -12.804 -12.872 -13.011 -13.164 -13.323 -13.412 -13.908 -13.686 -13.791 -13.898 -14.135 -14.263 -14.381 -14.514 -14.681 -14.851 -15.042 -15.325 -9 ,18057 ,KEBNE ,16692395,Thu Nov 25 19:03:18 CET,Thu Nov 25 20:58:25 CET,0.0 0.431 0.611 0.771 0.904 1.01 1.1 1.18 1.318 1.381 1.442 1.161 1.6 1.652 1.742 1.828 1.903 1.937 2.002 2.061 2.154 2.218 2.287 2.383 2.461 2.533 2.597 2.646 2.722 2.798 2.844 2.913 2.987 3.052 3.114 3.169 3.219 3.277 3.326 3.355 3.38 3.402 3.418 3.397 3.317 3.182 2.972 2.677 2.2 1.367 -0.053 -1.732 -3.111 -4.263 -5.244 -6.116 -6.864 -7.522 -8.06 -8.568 -9.004 -9.394 -9.768 -10.106 -10.402 -10.66 -10.945 -11.222 -11.447 -11.672 -11.912 -12.104 -12.308 -12.515 -12.663 -12.827 -12.994 -13.154 -13.316 -13.435 -13.563 -13.754 -13.881 -14.006 -14.07 -14.201 -14.359 -14.541 -14.623 -15.113 -14.875 -14.967 -15.065 -15.265 -15.373 -15.505 -15.633 -15.735 -15.869 -16.055 -16.416 -10 ,25444 ,KEBNE ,16692396,Thu Nov 25 19:03:22 CET,Thu Nov 25 20:58:31 CET,0.0 0.495 0.717 0.873 1.01 1.119 1.216 1.304 1.457 1.525 1.583 1.31 1.756 1.813 1.936 2.037 2.118 2.165 2.266 2.366 2.491 2.564 2.635 2.731 2.823 2.909 2.991 3.068 3.151 3.229 3.303 3.407 3.502 3.582 3.675 3.756 3.818 3.891 3.983 4.066 4.13 4.18 4.209 4.209 4.184 4.063 3.839 3.549 3.08 2.309 0.981 -0.698 -2.087 -3.251 -4.217 -5.05 -5.735 -6.341 -6.873 -7.402 -7.855 -8.237 -8.6 -8.961 -9.291 -9.575 -9.867 -10.123 -10.333 -10.549 -10.789 -10.983 -11.19 -11.403 -11.558 -11.72 -11.881 -12.057 -12.254 -12.387 -12.515 -12.695 -12.818 -12.955 -13.024 -13.167 -13.323 -13.496 -13.585 -14.08 -13.867 -13.966 -14.066 -14.26 -14.351 -14.46 -14.581 -14.718 -14.905 -15.106 -15.349 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt deleted file mode 100644 index 03935bf0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1567 ,KEBNE ,16692397,Thu Nov 25 19:04:21 CET,Thu Nov 25 21:01:15 CET,0.0 0.278 0.438 0.573 0.713 0.827 0.945 1.056 1.247 1.338 1.42 1.17 1.646 1.725 1.872 2.019 2.164 2.232 2.372 2.508 2.699 2.821 2.943 3.133 3.31 3.465 3.611 3.751 3.937 4.121 4.294 4.498 4.692 4.892 5.126 5.398 5.673 5.976 6.297 6.623 6.947 7.332 7.797 8.243 8.765 9.358 10.06 10.855 11.753 12.797 14.078 15.11 15.653 15.968 16.175 16.306 16.35 16.328 16.301 16.265 16.187 16.102 16.023 15.947 15.858 15.76 15.658 15.566 15.482 15.393 15.305 15.222 15.142 15.06 14.983 14.898 14.803 14.712 14.616 14.548 14.485 14.373 14.283 14.2 14.156 14.056 13.948 13.838 13.778 13.32 13.572 13.488 13.395 13.215 13.113 13.002 12.881 12.754 12.59 12.341 11.246 -2 ,18512 ,KEBNE ,16692398,Thu Nov 25 19:04:21 CET,Thu Nov 25 21:02:18 CET,0.0 0.393 0.554 0.673 0.787 0.889 0.986 1.094 1.277 1.358 1.438 1.176 1.646 1.716 1.856 1.988 2.114 2.179 2.294 2.397 2.559 2.67 2.779 2.947 3.11 3.255 3.389 3.513 3.675 3.853 4.043 4.261 4.454 4.645 4.87 5.127 5.386 5.668 5.97 6.301 6.645 7.018 7.479 7.944 8.456 9.024 9.678 10.445 11.392 12.483 13.645 14.464 14.84 15.039 15.158 15.152 15.073 14.993 14.909 14.815 14.728 14.63 14.542 14.477 14.384 14.281 14.17 14.069 13.972 13.868 13.775 13.688 13.597 13.503 13.428 13.346 13.255 13.164 13.063 12.991 12.913 12.781 12.688 12.589 12.54 12.441 12.334 12.218 12.157 11.698 11.935 11.852 11.773 11.623 11.543 11.452 11.33 11.183 11.024 10.787 10.455 -3 ,24916 ,KEBNE ,16692399,Thu Nov 25 19:04:20 CET,Thu Nov 25 21:01:31 CET,0.0 0.401 0.6 0.74 0.857 0.982 1.115 1.232 1.427 1.517 1.595 1.352 1.819 1.889 2.032 2.161 2.29 2.357 2.491 2.614 2.792 2.915 3.034 3.198 3.353 3.517 3.669 3.807 3.997 4.184 4.361 4.571 4.765 4.947 5.166 5.419 5.665 5.946 6.244 6.564 6.9 7.266 7.705 8.177 8.729 9.326 10.002 10.764 11.662 12.74 14.03 14.891 15.296 15.541 15.625 15.627 15.601 15.554 15.494 15.391 15.272 15.154 15.034 14.906 14.776 14.647 14.517 14.411 14.305 14.198 14.09 13.999 13.908 13.797 13.707 13.622 13.541 13.454 13.354 13.284 13.208 13.078 12.976 12.871 12.824 12.718 12.597 12.464 12.4 11.955 12.218 12.14 12.062 11.927 11.855 11.748 11.63 11.506 11.308 11.059 10.708 -4 ,4401 ,KEBNE ,16692400,Thu Nov 25 19:04:21 CET,Thu Nov 25 21:00:48 CET,0.0 0.233 0.413 0.566 0.703 0.837 0.948 1.05 1.258 1.348 1.428 1.197 1.679 1.758 1.914 2.056 2.194 2.265 2.402 2.526 2.705 2.814 2.916 3.075 3.227 3.366 3.507 3.646 3.82 3.995 4.176 4.395 4.603 4.802 5.026 5.285 5.534 5.807 6.102 6.415 6.766 7.169 7.628 8.096 8.666 9.297 9.99 10.784 11.785 12.976 14.348 15.444 16.014 16.323 16.504 16.599 16.62 16.59 16.547 16.507 16.471 16.414 16.354 16.288 16.202 16.121 16.03 15.947 15.874 15.804 15.736 15.653 15.558 15.462 15.383 15.305 15.212 15.112 15.021 14.955 14.88 14.76 14.68 14.587 14.538 14.447 14.35 14.239 14.179 13.725 13.976 13.908 13.829 13.653 13.566 13.486 13.4 13.278 13.11 12.92 12.42 -5 ,24482 ,KEBNE ,16692401,Thu Nov 25 19:05:24 CET,Thu Nov 25 21:03:20 CET,0.0 0.39 0.567 0.733 0.877 0.988 1.091 1.185 1.337 1.423 1.513 1.271 1.738 1.806 1.939 2.067 2.194 2.253 2.376 2.494 2.66 2.765 2.87 3.039 3.195 3.338 3.474 3.614 3.81 4.002 4.185 4.401 4.602 4.798 5.018 5.262 5.517 5.796 6.089 6.387 6.711 7.096 7.546 8.005 8.508 9.087 9.78 10.533 11.46 12.593 13.9 14.944 15.474 15.684 15.77 15.846 15.878 15.859 15.823 15.751 15.649 15.566 15.502 15.427 15.353 15.298 15.233 15.154 15.066 14.982 14.905 14.832 14.755 14.67 14.599 14.516 14.432 14.358 14.266 14.187 14.11 14.005 13.936 13.854 13.815 13.747 13.66 13.536 13.466 13.006 13.256 13.188 13.121 12.97 12.881 12.785 12.667 12.555 12.435 12.241 11.799 -6 ,15497 ,KEBNE ,16692402,Thu Nov 25 19:05:24 CET,Thu Nov 25 21:02:57 CET,0.0 0.339 0.551 0.716 0.832 0.94 1.043 1.133 1.3 1.378 1.459 1.235 1.716 1.789 1.929 2.072 2.216 2.291 2.44 2.574 2.756 2.872 2.98 3.128 3.271 3.409 3.55 3.694 3.889 4.062 4.214 4.417 4.626 4.825 5.044 5.286 5.519 5.771 6.044 6.343 6.669 7.026 7.432 7.861 8.381 8.99 9.714 10.52 11.449 12.498 13.695 14.633 15.073 15.276 15.37 15.372 15.34 15.272 15.193 15.126 15.08 15.004 14.882 14.769 14.675 14.582 14.46 14.352 14.265 14.18 14.083 13.987 13.876 13.756 13.67 13.582 13.495 13.399 13.292 13.228 13.163 13.042 12.968 12.894 12.847 12.754 12.652 12.536 12.478 12.02 12.268 12.203 12.14 12.013 11.946 11.859 11.75 11.603 11.426 11.158 10.257 -8 ,29919 ,KEBNE ,16692404,Thu Nov 25 19:05:24 CET,Thu Nov 25 21:03:36 CET,0.0 0.492 0.667 0.841 0.994 1.112 1.238 1.364 1.552 1.638 1.736 1.533 2.035 2.117 2.267 2.413 2.552 2.615 2.738 2.864 3.046 3.165 3.28 3.446 3.598 3.744 3.897 4.041 4.232 4.426 4.602 4.818 5.027 5.224 5.469 5.75 6.017 6.317 6.636 6.975 7.337 7.742 8.227 8.72 9.315 10.014 10.794 11.663 12.685 13.853 15.127 16.056 16.563 16.805 16.863 16.875 16.863 16.836 16.788 16.701 16.636 16.549 16.448 16.365 16.266 16.163 16.069 15.988 15.895 15.804 15.713 15.627 15.553 15.473 15.397 15.326 15.251 15.171 15.089 15.023 14.953 14.847 14.784 14.723 14.683 14.585 14.48 14.376 14.33 13.893 14.156 14.08 14.01 13.879 13.801 13.7 13.584 13.473 13.372 13.208 12.806 -9 ,27963 ,KEBNE ,16692405,Thu Nov 25 19:05:24 CET,Thu Nov 25 21:03:25 CET,0.0 0.605 0.848 1.033 1.17 1.287 1.4 1.497 1.663 1.744 1.829 1.602 2.081 2.161 2.299 2.432 2.576 2.641 2.755 2.872 3.048 3.166 3.283 3.447 3.597 3.745 3.893 4.037 4.225 4.406 4.568 4.759 4.952 5.137 5.356 5.605 5.847 6.128 6.438 6.761 7.095 7.452 7.858 8.263 8.757 9.367 10.083 10.824 11.691 12.733 13.893 14.754 15.207 15.434 15.536 15.577 15.562 15.495 15.434 15.364 15.268 15.189 15.111 15.032 14.955 14.869 14.772 14.68 14.59 14.497 14.392 14.304 14.219 14.131 14.069 13.996 13.903 13.809 13.715 13.645 13.572 13.465 13.383 13.301 13.264 13.187 13.099 12.99 12.937 12.494 12.751 12.679 12.615 12.455 12.361 12.281 12.174 12.043 11.902 11.748 11.454 -10 ,28958 ,KEBNE ,16692406,Thu Nov 25 19:06:26 CET,Thu Nov 25 21:04:22 CET,0.0 0.405 0.618 0.774 0.901 1.018 1.115 1.199 1.36 1.438 1.52 1.29 1.775 1.853 1.998 2.141 2.274 2.337 2.457 2.575 2.746 2.853 2.954 3.095 3.233 3.375 3.521 3.66 3.827 4.0 4.175 4.375 4.564 4.745 4.962 5.203 5.439 5.711 6.003 6.311 6.632 7.017 7.477 7.929 8.461 9.062 9.751 10.511 11.432 12.551 13.84 14.821 15.338 15.622 15.757 15.801 15.791 15.75 15.698 15.614 15.52 15.433 15.357 15.279 15.201 15.133 15.068 14.998 14.927 14.859 14.78 14.697 14.599 14.505 14.442 14.373 14.278 14.195 14.118 14.049 13.987 13.892 13.811 13.719 13.672 13.57 13.455 13.315 13.247 12.79 13.023 12.944 12.861 12.696 12.606 12.515 12.419 12.289 12.102 11.845 11.395 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 8d847944..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,487 ,KEBNE ,16692407,Thu Nov 25 19:06:26 CET,Thu Nov 25 21:00:11 CET,0.0 1.254 1.741 2.109 2.395 2.627 2.857 3.085 3.481 3.644 3.798 3.712 4.225 4.348 4.595 4.824 5.02 5.108 5.294 5.487 5.739 5.89 6.039 6.262 6.472 6.655 6.823 6.99 7.209 7.42 7.622 7.864 8.096 8.316 8.565 8.843 9.101 9.391 9.707 10.045 10.398 10.8 11.285 11.779 12.356 12.968 13.666 14.454 15.357 16.345 17.403 18.204 18.632 18.817 18.785 18.629 18.478 18.318 18.14 17.923 17.72 17.532 17.341 17.144 16.958 16.774 16.559 16.368 16.198 16.021 15.826 15.657 15.473 15.266 15.112 14.969 14.825 14.669 14.502 14.362 14.213 14.02 13.886 13.714 13.618 13.428 13.212 12.965 12.84 12.351 12.454 12.303 12.153 11.815 11.61 11.374 11.103 10.799 10.433 9.939 8.044 -2 ,17830 ,KEBNE ,16692408,Thu Nov 25 19:07:29 CET,Thu Nov 25 20:59:58 CET,0.0 1.543 2.011 2.35 2.613 2.838 3.043 3.223 3.566 3.736 3.888 3.768 4.265 4.383 4.619 4.835 5.046 5.155 5.355 5.533 5.761 5.9 6.04 6.243 6.442 6.63 6.8 6.973 7.199 7.417 7.63 7.886 8.122 8.356 8.632 8.927 9.211 9.518 9.834 10.16 10.522 10.953 11.47 11.977 12.534 13.146 13.87 14.669 15.55 16.525 17.655 18.414 18.668 18.738 18.722 18.65 18.537 18.384 18.217 17.982 17.758 17.589 17.444 17.274 17.088 16.9 16.676 16.473 16.286 16.087 15.869 15.675 15.468 15.255 15.096 14.924 14.734 14.544 14.349 14.211 14.069 13.85 13.705 13.521 13.422 13.232 13.007 12.767 12.654 12.166 12.249 12.087 11.916 11.507 11.239 10.908 10.534 10.109 9.599 8.987 7.07 -4 ,10039 ,KEBNE ,16692410,Thu Nov 25 19:07:30 CET,Thu Nov 25 21:01:52 CET,0.0 1.907 2.425 2.791 3.069 3.297 3.508 3.715 4.08 4.242 4.388 4.254 4.746 4.853 5.065 5.271 5.476 5.575 5.757 5.938 6.204 6.362 6.496 6.693 6.885 7.068 7.261 7.474 7.748 7.982 8.202 8.472 8.726 8.969 9.234 9.508 9.819 10.163 10.491 10.859 11.246 11.646 12.119 12.615 13.185 13.804 14.485 15.248 16.12 17.115 18.279 19.134 19.468 19.529 19.436 19.25 19.041 18.854 18.705 18.539 18.368 18.178 17.987 17.82 17.654 17.465 17.265 17.08 16.904 16.735 16.554 16.395 16.241 16.078 15.938 15.781 15.62 15.449 15.265 15.144 15.015 14.786 14.621 14.435 14.337 14.146 13.933 13.702 13.571 13.074 13.21 13.082 12.934 12.527 12.308 12.087 11.84 11.536 11.13 10.519 8.298 -5 ,20916 ,KEBNE ,16692411,Thu Nov 25 19:07:29 CET,Thu Nov 25 21:02:28 CET,0.0 1.851 2.39 2.761 3.064 3.303 3.521 3.731 4.059 4.216 4.384 4.304 4.827 4.943 5.141 5.351 5.591 5.702 5.892 6.081 6.381 6.565 6.727 6.952 7.176 7.407 7.607 7.785 8.025 8.255 8.458 8.698 8.931 9.168 9.447 9.753 10.043 10.362 10.694 11.04 11.428 11.865 12.37 12.864 13.399 14.01 14.753 15.565 16.465 17.472 18.579 19.326 19.601 19.668 19.652 19.569 19.432 19.276 19.12 18.937 18.756 18.598 18.426 18.244 18.077 17.905 17.704 17.519 17.36 17.191 17.014 16.868 16.721 16.548 16.401 16.242 16.081 15.919 15.742 15.598 15.431 15.17 14.992 14.814 14.722 14.518 14.301 14.08 13.963 13.475 13.595 13.456 13.305 12.941 12.738 12.511 12.246 11.93 11.513 10.887 9.014 -6 ,5661 ,KEBNE ,16692412,Thu Nov 25 19:07:29 CET,Thu Nov 25 21:01:22 CET,0.0 3.078 3.564 3.911 4.179 4.404 4.621 4.818 5.161 5.327 5.488 5.417 5.939 6.068 6.314 6.531 6.731 6.833 7.036 7.221 7.48 7.637 7.78 7.982 8.172 8.36 8.55 8.735 8.954 9.17 9.385 9.637 9.878 10.114 10.379 10.655 10.935 11.263 11.586 11.904 12.243 12.662 13.2 13.715 14.264 14.86 15.544 16.316 17.261 18.31 19.366 20.159 20.509 20.604 20.593 20.515 20.362 20.173 20.013 19.829 19.64 19.437 19.256 19.087 18.902 18.706 18.491 18.322 18.175 18.002 17.829 17.697 17.552 17.368 17.2 17.038 16.887 16.717 16.5 16.339 16.168 15.867 15.678 15.5 15.409 15.219 15.009 14.792 14.675 14.16 14.231 14.066 13.881 13.486 13.267 13.033 12.741 12.399 11.968 11.34 9.168 -7 ,2478 ,KEBNE ,16692413,Thu Nov 25 19:07:29 CET,Thu Nov 25 21:03:25 CET,0.0 1.342 1.807 2.139 2.414 2.649 2.847 3.021 3.355 3.516 3.674 3.582 4.095 4.218 4.445 4.651 4.835 4.924 5.125 5.328 5.61 5.794 5.977 6.244 6.507 6.737 6.927 7.13 7.401 7.634 7.85 8.101 8.333 8.562 8.834 9.131 9.413 9.731 10.089 10.454 10.835 11.272 11.772 12.288 12.86 13.468 14.185 14.957 15.856 16.934 18.121 18.913 19.199 19.251 19.219 19.15 19.018 18.857 18.706 18.512 18.288 18.037 17.782 17.514 17.265 17.062 16.838 16.624 16.44 16.257 16.083 15.93 15.752 15.545 15.381 15.212 15.038 14.852 14.64 14.496 14.354 14.117 13.943 13.765 13.677 13.473 13.245 13.033 12.919 12.427 12.517 12.348 12.168 11.802 11.617 11.396 11.134 10.771 10.253 9.49 5.904 -8 ,2255 ,KEBNE ,16692414,Thu Nov 25 19:07:29 CET,Thu Nov 25 21:00:39 CET,0.0 1.928 2.452 2.796 3.078 3.335 3.565 3.784 4.193 4.362 4.52 4.446 4.973 5.092 5.312 5.531 5.732 5.82 6.006 6.191 6.433 6.582 6.72 6.912 7.101 7.285 7.477 7.662 7.889 8.109 8.331 8.593 8.827 9.065 9.343 9.635 9.909 10.213 10.536 10.877 11.235 11.653 12.135 12.627 13.223 13.88 14.623 15.465 16.434 17.499 18.656 19.423 19.731 19.76 19.712 19.619 19.471 19.304 19.135 18.97 18.815 18.641 18.446 18.23 18.018 17.823 17.613 17.417 17.238 17.067 16.871 16.665 16.437 16.24 16.088 15.922 15.742 15.533 15.306 15.148 15.004 14.778 14.594 14.377 14.274 14.087 13.896 13.677 13.557 13.066 13.162 13.0 12.839 12.479 12.238 11.965 11.678 11.362 10.956 10.374 8.137 -9 ,12829 ,KEBNE ,16692415,Thu Nov 25 19:08:31 CET,Thu Nov 25 21:01:51 CET,0.0 2.466 2.959 3.308 3.573 3.807 4.023 4.213 4.532 4.684 4.832 4.768 5.306 5.436 5.656 5.863 6.066 6.163 6.343 6.513 6.759 6.915 7.065 7.276 7.475 7.665 7.854 8.041 8.269 8.481 8.687 8.95 9.197 9.439 9.71 10.003 10.298 10.617 10.964 11.329 11.707 12.125 12.61 13.109 13.669 14.282 15.001 15.82 16.737 17.773 18.918 19.635 19.909 19.961 19.899 19.789 19.655 19.486 19.314 19.081 18.834 18.613 18.399 18.197 17.998 17.798 17.58 17.372 17.185 17.0 16.813 16.622 16.402 16.201 16.052 15.894 15.715 15.513 15.293 15.143 14.994 14.752 14.582 14.411 14.31 14.083 13.862 13.601 13.458 12.936 13.001 12.846 12.663 12.244 12.013 11.77 11.507 11.193 10.81 10.233 7.853 -10 ,12065 ,KEBNE ,16692416,Thu Nov 25 19:09:35 CET,Thu Nov 25 21:02:53 CET,0.0 1.903 2.373 2.704 2.978 3.215 3.421 3.598 3.934 4.093 4.236 4.11 4.608 4.716 4.898 5.077 5.265 5.36 5.544 5.715 5.947 6.092 6.248 6.482 6.684 6.862 7.035 7.211 7.439 7.656 7.863 8.115 8.354 8.571 8.821 9.131 9.424 9.718 10.034 10.382 10.764 11.193 11.686 12.173 12.721 13.36 14.109 14.917 15.811 16.775 17.919 18.725 19.109 19.273 19.24 19.105 18.922 18.727 18.557 18.356 18.148 17.97 17.819 17.648 17.456 17.275 17.074 16.883 16.711 16.543 16.39 16.255 16.104 15.944 15.792 15.623 15.454 15.266 15.081 14.957 14.812 14.568 14.389 14.196 14.1 13.908 13.715 13.514 13.396 12.879 12.945 12.785 12.608 12.178 11.946 11.689 11.379 11.015 10.553 9.872 7.999 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt deleted file mode 100644 index d020b1c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20068 ,KEBNE ,16692417,Thu Nov 25 19:09:35 CET,Thu Nov 25 21:01:58 CET,0.0 1.366 1.665 1.863 2.016 2.132 2.232 2.32 2.459 2.528 2.594 2.33 2.746 2.792 2.878 2.948 3.011 3.044 3.096 3.135 3.191 3.226 3.254 3.286 3.315 3.33 3.338 3.335 3.322 3.311 3.284 3.238 3.177 3.104 3.005 2.884 2.76 2.607 2.414 2.188 1.92 1.574 1.148 0.691 0.083 -0.7 -1.71 -2.996 -4.819 -7.436 -11.419 -15.767 -19.067 -21.749 -23.929 -25.754 -27.272 -28.607 -29.777 -30.916 -31.871 -32.712 -33.528 -34.292 -34.979 -35.576 -36.19 -36.773 -37.26 -37.769 -38.31 -38.752 -39.204 -39.688 -40.068 -40.443 -40.839 -41.273 -41.709 -41.998 -42.316 -42.843 -43.196 -43.571 -43.76 -44.12 -44.505 -44.931 -45.163 -45.823 -45.925 -46.221 -46.535 -47.195 -47.557 -47.982 -48.46 -49.054 -49.777 -50.704 -55.528 -2 ,10982 ,KEBNE ,16692418,Thu Nov 25 19:09:36 CET,Thu Nov 25 20:59:40 CET,0.0 1.702 2.005 2.225 2.392 2.505 2.604 2.699 2.846 2.907 2.968 2.706 3.127 3.173 3.249 3.311 3.381 3.409 3.45 3.484 3.529 3.562 3.59 3.628 3.651 3.661 3.664 3.67 3.668 3.652 3.627 3.588 3.539 3.475 3.386 3.265 3.138 2.987 2.8 2.573 2.308 1.977 1.559 1.099 0.482 -0.305 -1.318 -2.629 -4.434 -7.051 -11.09 -15.412 -18.688 -21.291 -23.412 -25.257 -26.783 -28.124 -29.326 -30.538 -31.523 -32.327 -33.065 -33.804 -34.535 -35.208 -35.877 -36.421 -36.866 -37.306 -37.747 -38.116 -38.496 -38.89 -39.212 -39.562 -39.97 -40.466 -40.926 -41.179 -41.452 -41.878 -42.156 -42.474 -42.649 -43.011 -43.403 -43.816 -44.029 -44.653 -44.646 -44.889 -45.151 -45.679 -45.981 -46.34 -46.75 -47.182 -47.73 -48.727 -53.275 -3 ,8553 ,KEBNE ,16692419,Thu Nov 25 19:09:35 CET,Thu Nov 25 21:00:24 CET,0.0 1.471 1.749 1.954 2.105 2.223 2.342 2.445 2.591 2.659 2.72 2.439 2.857 2.903 2.992 3.073 3.138 3.161 3.202 3.239 3.293 3.322 3.34 3.359 3.367 3.361 3.353 3.341 3.321 3.305 3.296 3.269 3.211 3.133 3.044 2.941 2.825 2.675 2.484 2.25 1.975 1.643 1.215 0.729 0.068 -0.766 -1.833 -3.197 -5.063 -7.681 -11.704 -16.276 -19.737 -22.406 -24.592 -26.466 -28.044 -29.404 -30.518 -31.602 -32.549 -33.41 -34.206 -34.996 -35.747 -36.38 -37.013 -37.552 -38.003 -38.472 -38.962 -39.374 -39.833 -40.333 -40.724 -41.129 -41.525 -41.9 -42.301 -42.567 -42.834 -43.278 -43.588 -43.916 -44.096 -44.47 -44.867 -45.314 -45.548 -46.203 -46.256 -46.505 -46.771 -47.339 -47.645 -48.006 -48.427 -48.872 -49.433 -50.311 -53.768 -4 ,3517 ,KEBNE ,16692420,Thu Nov 25 19:10:42 CET,Thu Nov 25 21:01:11 CET,0.0 1.437 1.74 1.949 2.109 2.261 2.393 2.495 2.677 2.745 2.809 2.554 2.973 3.022 3.113 3.19 3.257 3.287 3.348 3.401 3.468 3.504 3.53 3.561 3.575 3.576 3.565 3.555 3.548 3.534 3.508 3.473 3.418 3.344 3.247 3.122 2.986 2.821 2.632 2.407 2.14 1.806 1.39 0.942 0.353 -0.397 -1.367 -2.639 -4.432 -7.011 -10.947 -15.231 -18.545 -21.155 -23.279 -25.117 -26.656 -28.019 -29.14 -30.2 -31.165 -32.065 -32.852 -33.532 -34.169 -34.748 -35.323 -35.842 -36.29 -36.758 -37.282 -37.732 -38.209 -38.707 -39.094 -39.479 -39.851 -40.219 -40.611 -40.884 -41.164 -41.629 -41.949 -42.269 -42.442 -42.828 -43.221 -43.621 -43.831 -44.462 -44.507 -44.756 -45.034 -45.676 -46.01 -46.345 -46.749 -47.251 -47.848 -48.651 -52.379 -6 ,31038 ,KEBNE ,16692422,Thu Nov 25 19:11:41 CET,Thu Nov 25 21:02:43 CET,0.0 1.806 2.125 2.333 2.488 2.609 2.717 2.812 2.968 3.036 3.099 2.833 3.25 3.292 3.377 3.452 3.508 3.536 3.582 3.62 3.68 3.709 3.726 3.75 3.773 3.796 3.809 3.803 3.795 3.781 3.764 3.736 3.695 3.642 3.571 3.474 3.357 3.209 3.026 2.822 2.593 2.29 1.87 1.388 0.779 0.021 -0.972 -2.31 -4.179 -6.816 -10.818 -15.106 -18.35 -20.96 -23.091 -24.933 -26.475 -27.76 -28.848 -29.957 -30.905 -31.701 -32.412 -33.064 -33.694 -34.328 -34.979 -35.511 -35.984 -36.491 -37.004 -37.418 -37.867 -38.356 -38.749 -39.14 -39.51 -39.912 -40.323 -40.596 -40.881 -41.318 -41.647 -42.009 -42.211 -42.667 -43.133 -43.61 -43.853 -44.529 -44.687 -44.984 -45.314 -46.042 -46.405 -46.835 -47.328 -47.853 -48.542 -49.574 -54.804 -7 ,11676 ,KEBNE ,16692423,Thu Nov 25 19:11:41 CET,Thu Nov 25 21:01:58 CET,0.0 1.119 1.42 1.631 1.799 1.924 2.026 2.109 2.267 2.34 2.404 2.162 2.587 2.629 2.709 2.779 2.838 2.863 2.907 2.94 2.977 2.998 3.016 3.042 3.064 3.082 3.091 3.092 3.09 3.095 3.083 3.052 3.015 2.95 2.862 2.769 2.667 2.518 2.344 2.142 1.924 1.638 1.236 0.794 0.218 -0.5 -1.472 -2.735 -4.484 -7.053 -10.973 -15.273 -18.502 -21.071 -23.193 -24.992 -26.536 -27.859 -28.934 -30.008 -30.919 -31.721 -32.506 -33.256 -33.945 -34.544 -35.151 -35.677 -36.122 -36.633 -37.201 -37.64 -38.067 -38.499 -38.834 -39.174 -39.519 -39.894 -40.297 -40.58 -40.881 -41.362 -41.71 -42.096 -42.296 -42.659 -43.014 -43.4 -43.604 -44.255 -44.317 -44.58 -44.913 -45.654 -46.06 -46.49 -47.005 -47.644 -48.473 -49.579 -54.006 -8 ,21379 ,KEBNE ,16692424,Thu Nov 25 19:16:55 CET,Thu Nov 25 21:05:57 CET,0.0 1.131 1.457 1.66 1.818 1.935 2.046 2.145 2.293 2.353 2.407 2.133 2.547 2.588 2.662 2.728 2.785 2.808 2.843 2.877 2.918 2.942 2.964 2.997 3.015 3.015 3.02 3.018 3.003 2.975 2.935 2.895 2.842 2.773 2.691 2.597 2.492 2.365 2.228 2.065 1.85 1.544 1.115 0.634 0.038 -0.717 -1.711 -2.985 -4.765 -7.33 -11.266 -15.552 -18.809 -21.412 -23.529 -25.335 -26.849 -28.18 -29.27 -30.326 -31.201 -31.947 -32.673 -33.364 -34.002 -34.569 -35.139 -35.681 -36.176 -36.677 -37.188 -37.607 -38.03 -38.455 -38.793 -39.136 -39.483 -39.851 -40.248 -40.532 -40.827 -41.284 -41.591 -41.891 -42.059 -42.42 -42.775 -43.157 -43.359 -43.976 -43.975 -44.195 -44.48 -45.109 -45.451 -45.867 -46.282 -46.748 -47.36 -48.109 -51.817 -9 ,10575 ,KEBNE ,16692425,Thu Nov 25 19:17:58 CET,Thu Nov 25 21:08:07 CET,0.0 1.448 1.798 2.022 2.182 2.316 2.432 2.532 2.69 2.761 2.825 2.561 2.979 3.02 3.095 3.156 3.204 3.224 3.262 3.297 3.344 3.377 3.405 3.444 3.467 3.479 3.489 3.482 3.469 3.451 3.419 3.38 3.343 3.305 3.241 3.137 3.022 2.867 2.68 2.46 2.202 1.886 1.471 0.987 0.354 -0.426 -1.471 -2.813 -4.627 -7.211 -11.158 -15.45 -18.692 -21.251 -23.359 -25.187 -26.796 -28.24 -29.43 -30.642 -31.7 -32.586 -33.335 -33.992 -34.607 -35.167 -35.76 -36.308 -36.785 -37.298 -37.821 -38.227 -38.647 -39.081 -39.425 -39.797 -40.191 -40.621 -41.079 -41.391 -41.683 -42.109 -42.425 -42.75 -42.913 -43.258 -43.614 -44.0 -44.222 -44.874 -44.991 -45.296 -45.608 -46.232 -46.583 -46.961 -47.349 -47.801 -48.38 -49.19 -53.458 -10 ,6091 ,KEBNE ,16692426,Thu Nov 25 19:25:20 CET,Thu Nov 25 21:12:33 CET,0.0 1.146 1.439 1.612 1.739 1.858 1.97 2.058 2.199 2.26 2.315 2.038 2.452 2.492 2.567 2.628 2.673 2.688 2.722 2.753 2.788 2.811 2.826 2.836 2.841 2.852 2.865 2.863 2.847 2.823 2.797 2.743 2.673 2.607 2.529 2.424 2.305 2.169 2.008 1.803 1.548 1.229 0.807 0.315 -0.334 -1.154 -2.192 -3.537 -5.406 -8.03 -12.044 -16.381 -19.703 -22.369 -24.532 -26.384 -27.931 -29.376 -30.63 -31.776 -32.726 -33.562 -34.315 -34.997 -35.626 -36.249 -36.943 -37.527 -38.026 -38.556 -39.088 -39.498 -39.952 -40.456 -40.836 -41.235 -41.65 -42.08 -42.514 -42.807 -43.102 -43.557 -43.878 -44.232 -44.421 -44.826 -45.218 -45.591 -45.8 -46.445 -46.494 -46.739 -46.995 -47.539 -47.857 -48.242 -48.689 -49.23 -49.882 -50.697 -55.542 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index f3bba0bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22753 ,KEBNE ,17025254,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:04:55 CET,0.0 1.558 1.942 2.212 2.448 2.676 2.861 3.018 3.309 3.44 3.56 3.407 3.885 3.988 4.177 4.339 4.503 4.586 4.719 4.838 5.02 5.135 5.243 5.404 5.547 5.669 5.788 5.901 6.044 6.174 6.3 6.45 6.587 6.716 6.858 7.012 7.156 7.314 7.477 7.638 7.783 7.913 8.042 8.151 8.263 8.358 8.367 8.291 8.085 7.557 6.496 5.095 3.896 2.826 1.869 1.034 0.282 -0.412 -0.995 -1.559 -2.068 -2.594 -3.115 -3.571 -3.96 -4.297 -4.647 -4.97 -5.251 -5.548 -5.876 -6.163 -6.47 -6.782 -7.017 -7.252 -7.497 -7.768 -8.057 -8.249 -8.45 -8.776 -9.008 -9.241 -9.368 -9.639 -9.914 -10.214 -10.371 -10.913 -10.856 -11.036 -11.233 -11.702 -11.957 -12.223 -12.517 -12.838 -13.207 -13.742 -15.914 -2 ,3240 ,KEBNE ,17025255,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:04:38 CET,0.0 1.401 1.793 2.088 2.352 2.566 2.724 2.886 3.172 3.296 3.419 3.27 3.746 3.849 4.044 4.219 4.377 4.449 4.581 4.697 4.859 4.974 5.087 5.226 5.344 5.47 5.604 5.718 5.859 6.005 6.133 6.293 6.437 6.548 6.665 6.795 6.918 7.051 7.18 7.299 7.42 7.546 7.661 7.72 7.762 7.786 7.751 7.624 7.351 6.835 5.767 4.381 3.175 2.119 1.206 0.351 -0.425 -1.189 -1.838 -2.449 -2.992 -3.466 -3.942 -4.42 -4.818 -5.156 -5.523 -5.847 -6.119 -6.405 -6.728 -7.007 -7.286 -7.561 -7.765 -7.996 -8.257 -8.514 -8.775 -8.97 -9.169 -9.476 -9.698 -9.928 -10.058 -10.336 -10.602 -10.87 -11.011 -11.54 -11.477 -11.643 -11.821 -12.218 -12.456 -12.745 -13.068 -13.409 -13.807 -14.338 -16.149 -3 ,23980 ,KEBNE ,17025256,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:05:16 CET,0.0 1.657 2.08 2.388 2.624 2.823 2.99 3.131 3.389 3.502 3.604 3.437 3.908 3.999 4.179 4.347 4.508 4.583 4.707 4.83 5.025 5.14 5.248 5.4 5.545 5.682 5.815 5.938 6.076 6.209 6.346 6.508 6.645 6.77 6.906 7.056 7.194 7.332 7.475 7.616 7.745 7.891 8.024 8.11 8.205 8.27 8.278 8.196 7.978 7.501 6.488 5.175 4.066 3.048 2.099 1.224 0.486 -0.168 -0.758 -1.321 -1.789 -2.26 -2.763 -3.212 -3.584 -3.933 -4.299 -4.623 -4.919 -5.219 -5.545 -5.829 -6.117 -6.393 -6.607 -6.834 -7.072 -7.323 -7.582 -7.769 -7.961 -8.273 -8.505 -8.745 -8.871 -9.134 -9.401 -9.677 -9.826 -10.353 -10.269 -10.45 -10.655 -11.085 -11.306 -11.542 -11.813 -12.124 -12.5 -13.02 -14.614 -4 ,9274 ,KEBNE ,17025257,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:05:39 CET,0.0 1.513 1.866 2.148 2.39 2.586 2.747 2.9 3.188 3.307 3.415 3.243 3.698 3.779 3.954 4.114 4.243 4.308 4.438 4.546 4.689 4.79 4.886 5.017 5.137 5.259 5.385 5.495 5.614 5.743 5.867 5.99 6.105 6.213 6.332 6.485 6.644 6.8 6.944 7.074 7.19 7.314 7.428 7.521 7.609 7.64 7.624 7.521 7.252 6.775 5.84 4.535 3.38 2.389 1.514 0.738 0.076 -0.544 -1.153 -1.8 -2.287 -2.683 -3.088 -3.494 -3.877 -4.224 -4.606 -4.95 -5.222 -5.496 -5.804 -6.085 -6.358 -6.645 -6.87 -7.098 -7.354 -7.616 -7.893 -8.093 -8.293 -8.598 -8.815 -9.045 -9.169 -9.419 -9.666 -9.927 -10.071 -10.604 -10.546 -10.718 -10.892 -11.255 -11.457 -11.696 -11.981 -12.293 -12.664 -13.208 -14.566 -5 ,31044 ,KEBNE ,17025258,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:04:28 CET,0.0 1.216 1.633 1.943 2.172 2.357 2.519 2.683 2.979 3.101 3.214 3.064 3.526 3.612 3.772 3.914 4.044 4.109 4.232 4.361 4.537 4.638 4.738 4.88 5.002 5.11 5.217 5.316 5.443 5.573 5.698 5.838 5.958 6.069 6.202 6.348 6.477 6.593 6.697 6.801 6.91 7.027 7.139 7.253 7.365 7.432 7.455 7.41 7.192 6.677 5.622 4.24 3.057 2.023 1.111 0.266 -0.462 -1.094 -1.639 -2.192 -2.672 -3.101 -3.531 -3.938 -4.307 -4.648 -5.01 -5.348 -5.632 -5.909 -6.216 -6.496 -6.783 -7.085 -7.334 -7.605 -7.871 -8.127 -8.397 -8.58 -8.768 -9.074 -9.292 -9.524 -9.649 -9.89 -10.116 -10.366 -10.509 -11.056 -11.029 -11.212 -11.394 -11.786 -12.015 -12.267 -12.535 -12.838 -13.197 -13.724 -15.543 -6 ,24889 ,KEBNE ,17025259,Wed Dec 22 12:12:45 CET,Wed Dec 22 14:04:15 CET,0.0 2.181 2.617 2.895 3.107 3.274 3.434 3.582 3.849 3.974 4.085 3.905 4.366 4.45 4.607 4.762 4.912 4.982 5.115 5.232 5.403 5.506 5.601 5.751 5.886 6.0 6.108 6.215 6.345 6.466 6.581 6.718 6.849 6.964 7.087 7.222 7.337 7.459 7.583 7.689 7.779 7.867 7.939 7.988 8.031 8.037 8.017 7.91 7.643 7.191 6.261 4.937 3.765 2.742 1.855 1.067 0.386 -0.22 -0.753 -1.361 -1.875 -2.279 -2.718 -3.146 -3.503 -3.824 -4.178 -4.52 -4.833 -5.122 -5.414 -5.685 -5.971 -6.284 -6.527 -6.771 -7.019 -7.269 -7.547 -7.74 -7.919 -8.178 -8.371 -8.59 -8.707 -8.964 -9.238 -9.495 -9.629 -10.165 -10.11 -10.292 -10.491 -10.912 -11.129 -11.368 -11.647 -11.967 -12.345 -12.826 -14.387 -7 ,13335 ,KEBNE ,17025260,Wed Dec 22 12:13:47 CET,Wed Dec 22 14:06:00 CET,0.0 2.321 2.745 3.052 3.311 3.529 3.707 3.867 4.154 4.283 4.405 4.271 4.749 4.834 4.996 5.152 5.313 5.384 5.505 5.62 5.786 5.899 6.011 6.169 6.322 6.469 6.6 6.717 6.864 6.997 7.122 7.263 7.39 7.51 7.649 7.795 7.912 8.027 8.158 8.283 8.39 8.492 8.608 8.723 8.819 8.866 8.852 8.759 8.522 8.003 6.96 5.577 4.328 3.242 2.339 1.556 0.876 0.218 -0.342 -0.914 -1.409 -1.822 -2.262 -2.704 -3.081 -3.41 -3.766 -4.086 -4.384 -4.727 -5.093 -5.372 -5.639 -5.925 -6.162 -6.408 -6.64 -6.859 -7.106 -7.296 -7.506 -7.842 -8.051 -8.265 -8.39 -8.661 -8.938 -9.227 -9.376 -9.907 -9.842 -10.023 -10.216 -10.636 -10.853 -11.074 -11.347 -11.688 -12.099 -12.625 -14.58 -8 ,11546 ,KEBNE ,17025261,Wed Dec 22 12:13:47 CET,Wed Dec 22 14:06:35 CET,0.0 1.535 1.922 2.196 2.429 2.624 2.801 2.954 3.213 3.334 3.455 3.309 3.777 3.867 4.026 4.176 4.318 4.381 4.509 4.638 4.811 4.928 5.051 5.22 5.357 5.465 5.569 5.672 5.801 5.929 6.057 6.21 6.345 6.451 6.564 6.703 6.828 6.96 7.091 7.207 7.333 7.476 7.599 7.674 7.727 7.772 7.769 7.658 7.416 6.917 5.909 4.531 3.371 2.318 1.329 0.461 -0.307 -0.971 -1.518 -2.106 -2.613 -3.038 -3.441 -3.829 -4.214 -4.579 -4.947 -5.248 -5.527 -5.865 -6.206 -6.474 -6.74 -7.029 -7.272 -7.529 -7.808 -8.09 -8.376 -8.583 -8.792 -9.112 -9.344 -9.583 -9.704 -9.957 -10.216 -10.497 -10.646 -11.183 -11.129 -11.302 -11.49 -11.91 -12.142 -12.39 -12.666 -12.996 -13.414 -13.962 -15.963 -9 ,30872 ,KEBNE ,17025262,Wed Dec 22 12:13:47 CET,Wed Dec 22 14:05:57 CET,0.0 1.512 1.936 2.234 2.473 2.667 2.828 2.975 3.252 3.375 3.478 3.29 3.74 3.837 4.025 4.177 4.308 4.377 4.523 4.665 4.862 4.968 5.061 5.195 5.328 5.457 5.579 5.691 5.831 5.967 6.101 6.247 6.374 6.5 6.631 6.746 6.85 6.973 7.087 7.192 7.298 7.419 7.539 7.635 7.717 7.725 7.683 7.613 7.42 6.971 6.022 4.726 3.57 2.559 1.684 0.843 0.095 -0.573 -1.134 -1.669 -2.144 -2.564 -2.995 -3.412 -3.779 -4.103 -4.411 -4.735 -5.05 -5.357 -5.675 -5.956 -6.258 -6.567 -6.814 -7.071 -7.335 -7.609 -7.877 -8.067 -8.268 -8.548 -8.752 -8.985 -9.099 -9.333 -9.578 -9.834 -9.974 -10.516 -10.472 -10.657 -10.863 -11.302 -11.534 -11.786 -12.083 -12.418 -12.813 -13.35 -15.158 -10 ,20546 ,KEBNE ,17025263,Wed Dec 22 12:13:47 CET,Wed Dec 22 14:05:12 CET,0.0 1.458 1.872 2.18 2.443 2.65 2.81 2.947 3.199 3.329 3.456 3.304 3.76 3.833 3.98 4.133 4.272 4.338 4.467 4.582 4.752 4.867 4.969 5.115 5.251 5.37 5.485 5.586 5.697 5.805 5.916 6.048 6.166 6.278 6.404 6.527 6.64 6.759 6.876 7.007 7.142 7.257 7.356 7.474 7.58 7.618 7.607 7.507 7.295 6.86 5.887 4.448 3.215 2.171 1.247 0.404 -0.337 -1.013 -1.566 -2.091 -2.561 -2.982 -3.411 -3.844 -4.237 -4.565 -4.927 -5.296 -5.619 -5.952 -6.282 -6.549 -6.809 -7.094 -7.34 -7.596 -7.859 -8.133 -8.417 -8.614 -8.815 -9.136 -9.349 -9.568 -9.688 -9.933 -10.186 -10.458 -10.597 -11.133 -11.098 -11.28 -11.459 -11.859 -12.09 -12.34 -12.617 -12.925 -13.294 -13.844 -15.334 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 7d1ea67e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16745 ,KEBNE ,16692427,Thu Nov 25 19:27:22 CET,Thu Nov 25 21:19:15 CET,0.0 2.217 2.757 3.173 3.47 3.696 3.896 4.071 4.407 4.555 4.692 4.601 5.095 5.214 5.423 5.598 5.753 5.827 5.989 6.157 6.36 6.48 6.611 6.799 6.962 7.12 7.268 7.415 7.602 7.771 7.932 8.119 8.299 8.455 8.631 8.842 9.053 9.274 9.489 9.718 9.964 10.213 10.466 10.724 11.016 11.326 11.659 11.979 12.245 12.411 12.376 11.929 11.238 10.508 9.875 9.302 8.769 8.232 7.776 7.334 6.935 6.586 6.243 5.901 5.564 5.228 4.858 4.505 4.186 3.866 3.559 3.288 3.009 2.744 2.535 2.301 2.063 1.831 1.568 1.379 1.186 0.849 0.613 0.364 0.23 -0.041 -0.327 -0.63 -0.796 -1.339 -1.37 -1.597 -1.83 -2.371 -2.665 -2.964 -3.317 -3.714 -4.173 -4.794 -6.984 -2 ,10331 ,KEBNE ,16692428,Thu Nov 25 19:27:22 CET,Thu Nov 25 21:19:24 CET,0.0 2.244 2.714 3.072 3.355 3.617 3.839 4.031 4.345 4.483 4.601 4.434 4.904 5.01 5.247 5.466 5.641 5.726 5.894 6.044 6.255 6.392 6.533 6.731 6.911 7.081 7.224 7.367 7.557 7.746 7.922 8.111 8.299 8.491 8.7 8.912 9.112 9.327 9.552 9.777 9.999 10.235 10.517 10.784 11.055 11.366 11.7 12.014 12.317 12.526 12.466 11.996 11.392 10.795 10.212 9.55 8.939 8.454 7.994 7.494 7.035 6.606 6.168 5.798 5.516 5.226 4.863 4.518 4.227 3.925 3.595 3.31 3.019 2.705 2.467 2.244 2.025 1.777 1.464 1.259 1.054 0.71 0.478 0.235 0.107 -0.159 -0.443 -0.741 -0.906 -1.456 -1.452 -1.642 -1.835 -2.284 -2.552 -2.835 -3.142 -3.505 -3.941 -4.55 -7.409 -3 ,21554 ,KEBNE ,16692429,Thu Nov 25 19:27:26 CET,Thu Nov 25 21:16:54 CET,0.0 1.813 2.286 2.616 2.911 3.188 3.411 3.594 3.964 4.12 4.246 4.136 4.647 4.768 4.993 5.214 5.403 5.484 5.653 5.837 6.084 6.237 6.384 6.585 6.792 6.996 7.187 7.366 7.576 7.757 7.915 8.107 8.313 8.503 8.699 8.929 9.153 9.394 9.629 9.835 10.105 10.443 10.761 11.044 11.364 11.705 12.047 12.4 12.717 12.955 12.915 12.413 11.797 11.167 10.581 10.071 9.624 9.162 8.746 8.275 7.849 7.51 7.202 6.866 6.503 6.158 5.782 5.498 5.283 5.043 4.75 4.482 4.21 3.924 3.695 3.448 3.186 2.92 2.639 2.431 2.215 1.878 1.641 1.395 1.267 0.99 0.705 0.413 0.259 -0.271 -0.234 -0.438 -0.662 -1.177 -1.468 -1.794 -2.133 -2.478 -2.986 -3.748 -6.212 -4 ,25084 ,KEBNE ,16692430,Thu Nov 25 19:29:28 CET,Thu Nov 25 21:20:56 CET,0.0 1.667 2.148 2.488 2.753 2.978 3.181 3.366 3.684 3.844 4.013 3.941 4.444 4.569 4.818 5.023 5.187 5.268 5.425 5.57 5.808 5.972 6.103 6.269 6.436 6.615 6.809 6.997 7.226 7.45 7.659 7.884 8.085 8.266 8.467 8.673 8.858 9.068 9.297 9.536 9.776 10.038 10.337 10.611 10.905 11.235 11.576 11.87 12.112 12.294 12.277 11.883 11.352 10.774 10.255 9.776 9.315 8.89 8.505 8.093 7.74 7.412 7.076 6.72 6.357 6.039 5.745 5.508 5.293 5.055 4.768 4.506 4.232 3.96 3.766 3.556 3.328 3.075 2.789 2.578 2.369 2.083 1.862 1.616 1.496 1.241 0.961 0.661 0.49 -0.09 -0.152 -0.354 -0.557 -1.0 -1.246 -1.55 -1.915 -2.32 -2.796 -3.46 -6.164 -5 ,4799 ,KEBNE ,16692431,Thu Nov 25 19:29:28 CET,Thu Nov 25 21:22:02 CET,0.0 1.81 2.322 2.661 2.933 3.16 3.344 3.512 3.829 3.978 4.119 4.008 4.506 4.624 4.839 5.038 5.225 5.318 5.504 5.674 5.886 6.018 6.161 6.364 6.543 6.717 6.89 7.027 7.182 7.346 7.508 7.734 7.975 8.175 8.381 8.613 8.838 9.083 9.329 9.585 9.861 10.156 10.485 10.816 11.174 11.527 11.882 12.207 12.48 12.699 12.722 12.364 11.693 10.821 10.018 9.378 8.862 8.409 8.02 7.618 7.269 6.933 6.586 6.267 5.944 5.602 5.236 4.945 4.682 4.37 4.029 3.751 3.462 3.157 2.925 2.701 2.47 2.234 1.99 1.793 1.568 1.215 0.986 0.754 0.634 0.386 0.098 -0.201 -0.355 -0.891 -0.851 -1.038 -1.246 -1.693 -1.947 -2.209 -2.486 -2.832 -3.292 -3.932 -6.418 -6 ,4121 ,KEBNE ,16692432,Thu Nov 25 19:29:27 CET,Thu Nov 25 21:23:33 CET,0.0 1.515 1.984 2.332 2.645 2.888 3.076 3.27 3.623 3.775 3.919 3.824 4.315 4.433 4.656 4.852 5.06 5.162 5.347 5.516 5.738 5.867 6.012 6.225 6.403 6.57 6.73 6.902 7.121 7.303 7.468 7.662 7.845 8.02 8.223 8.445 8.66 8.871 9.085 9.321 9.559 9.811 10.075 10.349 10.663 10.933 11.193 11.443 11.677 11.84 11.756 11.269 10.676 10.098 9.531 8.947 8.388 7.87 7.423 6.991 6.533 6.038 5.617 5.249 4.879 4.519 4.161 3.848 3.587 3.335 3.046 2.772 2.508 2.259 2.029 1.782 1.523 1.229 0.921 0.704 0.467 0.088 -0.16 -0.398 -0.525 -0.799 -1.092 -1.424 -1.599 -2.14 -2.103 -2.3 -2.53 -3.076 -3.383 -3.697 -4.034 -4.425 -4.908 -5.611 -8.014 -7 ,20391 ,KEBNE ,16692433,Thu Nov 25 19:30:30 CET,Thu Nov 25 21:23:57 CET,0.0 1.452 1.933 2.278 2.54 2.793 3.019 3.213 3.538 3.684 3.821 3.7 4.196 4.308 4.492 4.674 4.85 4.944 5.139 5.328 5.596 5.756 5.908 6.13 6.321 6.493 6.659 6.805 6.992 7.184 7.363 7.548 7.723 7.884 8.069 8.28 8.485 8.723 8.963 9.211 9.464 9.735 10.054 10.352 10.652 10.962 11.276 11.569 11.861 12.038 11.911 11.407 10.798 10.212 9.684 9.091 8.472 7.951 7.552 7.151 6.778 6.418 6.083 5.711 5.284 4.872 4.446 4.09 3.822 3.55 3.22 2.936 2.635 2.335 2.123 1.882 1.593 1.305 1.017 0.823 0.645 0.345 0.116 -0.128 -0.249 -0.497 -0.776 -1.083 -1.245 -1.798 -1.828 -2.028 -2.249 -2.772 -3.035 -3.309 -3.65 -4.083 -4.605 -5.276 -8.002 -8 ,21999 ,KEBNE ,16692434,Thu Nov 25 19:30:34 CET,Thu Nov 25 21:19:51 CET,0.0 1.66 2.213 2.567 2.827 3.053 3.272 3.476 3.854 4.022 4.18 4.098 4.589 4.694 4.881 5.051 5.213 5.289 5.444 5.6 5.793 5.912 6.034 6.202 6.358 6.517 6.68 6.832 7.001 7.16 7.316 7.498 7.667 7.838 8.045 8.252 8.443 8.664 8.899 9.127 9.357 9.624 9.935 10.23 10.549 10.892 11.285 11.671 12.019 12.282 12.262 11.815 11.235 10.62 10.058 9.516 8.988 8.529 8.128 7.688 7.308 6.936 6.579 6.243 5.908 5.597 5.244 4.896 4.579 4.261 3.924 3.64 3.346 3.082 2.887 2.661 2.421 2.159 1.881 1.695 1.517 1.226 0.993 0.736 0.608 0.348 0.068 -0.233 -0.395 -0.941 -0.941 -1.132 -1.343 -1.855 -2.148 -2.454 -2.775 -3.131 -3.573 -4.167 -6.662 -9 ,3558 ,KEBNE ,16692435,Thu Nov 25 19:30:31 CET,Thu Nov 25 21:25:05 CET,0.0 1.398 1.871 2.207 2.491 2.737 2.955 3.147 3.483 3.638 3.781 3.666 4.151 4.249 4.432 4.617 4.794 4.882 5.058 5.233 5.469 5.606 5.754 5.963 6.144 6.313 6.469 6.617 6.792 6.966 7.159 7.381 7.557 7.723 7.914 8.132 8.338 8.562 8.803 9.045 9.283 9.54 9.817 10.062 10.344 10.658 11.013 11.355 11.634 11.828 11.87 11.564 11.041 10.446 9.888 9.388 8.891 8.418 8.033 7.623 7.257 6.883 6.479 6.13 5.811 5.521 5.222 4.943 4.699 4.414 4.099 3.847 3.592 3.323 3.112 2.879 2.609 2.307 2.003 1.8 1.578 1.222 0.977 0.737 0.618 0.367 0.079 -0.253 -0.424 -0.976 -0.965 -1.138 -1.326 -1.768 -2.029 -2.344 -2.685 -3.083 -3.541 -4.193 -6.816 -10 ,2648 ,KEBNE ,16692436,Thu Nov 25 19:30:31 CET,Thu Nov 25 21:25:30 CET,0.0 1.956 2.478 2.793 3.039 3.263 3.469 3.664 3.982 4.114 4.227 4.087 4.57 4.679 4.901 5.106 5.293 5.381 5.543 5.703 5.921 6.045 6.163 6.332 6.496 6.648 6.781 6.915 7.094 7.249 7.389 7.564 7.743 7.923 8.134 8.351 8.546 8.746 8.94 9.153 9.371 9.607 9.887 10.171 10.463 10.729 11.012 11.281 11.544 11.719 11.607 11.143 10.573 9.973 9.428 8.909 8.427 7.954 7.507 7.061 6.614 6.202 5.867 5.545 5.228 4.914 4.542 4.204 3.921 3.654 3.369 3.102 2.832 2.56 2.342 2.106 1.871 1.617 1.341 1.158 0.964 0.61 0.34 0.078 -0.053 -0.328 -0.624 -0.957 -1.136 -1.684 -1.676 -1.86 -2.078 -2.592 -2.867 -3.171 -3.545 -3.985 -4.52 -5.265 -7.695 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 124f2aa6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24457 ,KEBNE ,17025264,Wed Dec 22 12:13:47 CET,Wed Dec 22 14:06:33 CET,0.0 1.156 1.576 1.879 2.146 2.382 2.577 2.742 3.05 3.201 3.349 3.21 3.732 3.856 4.086 4.298 4.487 4.581 4.769 4.95 5.209 5.376 5.545 5.792 6.025 6.242 6.444 6.644 6.905 7.142 7.361 7.658 7.94 8.193 8.476 8.784 9.096 9.474 9.886 10.275 10.658 11.098 11.624 12.146 12.688 13.272 13.985 14.799 15.715 16.705 17.784 18.395 18.556 18.52 18.362 18.134 17.866 17.594 17.307 17.002 16.753 16.508 16.264 16.011 15.768 15.532 15.284 15.084 14.905 14.717 14.528 14.348 14.137 13.931 13.767 13.577 13.38 13.188 12.995 12.851 12.698 12.456 12.281 12.099 12.001 11.795 11.567 11.33 11.213 10.7 10.779 10.596 10.411 9.998 9.758 9.516 9.274 9.009 8.672 8.161 6.171 -2 ,25007 ,KEBNE ,17025265,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:07:36 CET,0.0 1.916 2.346 2.667 2.915 3.128 3.326 3.507 3.84 4.006 4.158 4.011 4.534 4.638 4.832 5.035 5.234 5.328 5.512 5.687 5.951 6.118 6.279 6.513 6.746 6.973 7.178 7.371 7.627 7.885 8.14 8.423 8.684 8.952 9.248 9.565 9.878 10.232 10.617 11.013 11.439 11.932 12.491 13.048 13.696 14.421 15.245 16.124 17.16 18.334 19.43 20.067 20.325 20.257 20.001 19.681 19.378 19.122 18.871 18.565 18.299 18.086 17.876 17.637 17.403 17.195 16.964 16.754 16.572 16.373 16.152 15.963 15.769 15.558 15.392 15.226 15.058 14.885 14.688 14.55 14.411 14.178 14.007 13.826 13.728 13.533 13.326 13.098 12.99 12.489 12.578 12.418 12.257 11.908 11.706 11.476 11.218 10.923 10.564 10.127 8.048 -3 ,10510 ,KEBNE ,17025266,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:07:28 CET,0.0 1.167 1.575 1.863 2.095 2.321 2.528 2.704 3.009 3.143 3.279 3.148 3.671 3.788 4.012 4.235 4.438 4.525 4.7 4.869 5.096 5.246 5.392 5.607 5.813 6.004 6.194 6.385 6.621 6.834 7.039 7.305 7.573 7.829 8.128 8.464 8.804 9.165 9.522 9.91 10.327 10.784 11.313 11.866 12.517 13.197 13.88 14.639 15.625 16.776 17.955 18.523 18.624 18.523 18.266 17.936 17.631 17.347 17.112 16.843 16.574 16.32 16.077 15.869 15.653 15.447 15.216 14.974 14.78 14.58 14.336 14.12 13.911 13.714 13.56 13.388 13.209 13.025 12.828 12.681 12.527 12.294 12.133 11.966 11.882 11.706 11.504 11.275 11.15 10.634 10.722 10.555 10.374 9.961 9.741 9.503 9.203 8.856 8.459 7.908 5.286 -4 ,32742 ,KEBNE ,17025267,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:07:26 CET,0.0 1.763 2.205 2.515 2.764 2.975 3.167 3.347 3.652 3.785 3.911 3.751 4.266 4.377 4.605 4.816 5.012 5.108 5.287 5.462 5.715 5.871 6.013 6.216 6.423 6.623 6.815 6.994 7.226 7.444 7.654 7.91 8.156 8.4 8.703 9.056 9.386 9.732 10.106 10.502 10.899 11.345 11.883 12.42 13.031 13.718 14.484 15.327 16.264 17.251 18.339 18.926 19.014 18.899 18.752 18.594 18.384 18.135 17.865 17.623 17.415 17.16 16.91 16.684 16.472 16.274 16.062 15.87 15.691 15.507 15.322 15.146 14.951 14.745 14.58 14.423 14.266 14.086 13.887 13.749 13.591 13.325 13.145 12.969 12.886 12.709 12.509 12.302 12.187 11.674 11.782 11.632 11.477 11.13 10.907 10.667 10.419 10.137 9.795 9.323 7.404 -5 ,25100 ,KEBNE ,17025268,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:07:30 CET,0.0 1.108 1.488 1.777 2.016 2.216 2.403 2.57 2.885 3.033 3.173 3.038 3.559 3.676 3.907 4.122 4.325 4.422 4.608 4.78 5.041 5.207 5.361 5.593 5.813 6.021 6.227 6.432 6.684 6.925 7.17 7.462 7.724 7.977 8.267 8.576 8.871 9.19 9.531 9.914 10.318 10.75 11.291 11.869 12.523 13.287 14.161 15.115 16.197 17.352 18.503 19.102 19.298 19.343 19.244 19.017 18.756 18.513 18.285 18.031 17.789 17.539 17.301 17.087 16.872 16.655 16.425 16.225 16.039 15.83 15.599 15.414 15.233 15.042 14.881 14.703 14.519 14.337 14.148 14.014 13.883 13.676 13.5 13.302 13.202 12.986 12.755 12.52 12.406 11.886 11.985 11.849 11.685 11.323 11.131 10.928 10.692 10.427 10.129 9.678 7.714 -6 ,3932 ,KEBNE ,17025269,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:07:45 CET,0.0 1.984 2.345 2.63 2.872 3.084 3.279 3.451 3.743 3.872 3.997 3.83 4.341 4.448 4.666 4.869 5.048 5.134 5.306 5.466 5.696 5.85 5.993 6.192 6.395 6.595 6.781 6.955 7.191 7.425 7.649 7.917 8.178 8.43 8.704 9.014 9.317 9.645 10.001 10.375 10.763 11.22 11.781 12.326 12.934 13.609 14.368 15.19 16.084 17.088 18.1 18.595 18.734 18.657 18.482 18.298 18.1 17.889 17.712 17.513 17.281 17.058 16.84 16.632 16.43 16.232 16.01 15.794 15.597 15.375 15.143 14.919 14.662 14.438 14.257 14.077 13.905 13.71 13.505 13.342 13.175 12.924 12.726 12.527 12.443 12.273 12.078 11.868 11.761 11.262 11.381 11.229 11.07 10.723 10.514 10.283 10.041 9.759 9.4 8.96 7.185 -7 ,21818 ,KEBNE ,17025270,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:08:13 CET,0.0 1.526 1.925 2.232 2.489 2.717 2.925 3.113 3.445 3.601 3.74 3.589 4.103 4.212 4.43 4.633 4.822 4.912 5.094 5.269 5.512 5.658 5.803 6.031 6.24 6.438 6.636 6.824 7.072 7.325 7.569 7.853 8.12 8.383 8.716 9.093 9.419 9.774 10.164 10.556 10.975 11.443 11.971 12.523 13.174 13.922 14.796 15.755 16.864 18.034 19.413 20.415 20.646 20.531 20.338 20.148 19.927 19.704 19.476 19.231 18.996 18.739 18.476 18.225 17.98 17.74 17.471 17.213 16.987 16.754 16.513 16.311 16.111 15.926 15.781 15.615 15.433 15.233 15.013 14.86 14.715 14.488 14.325 14.158 14.062 13.852 13.643 13.428 13.313 12.811 12.959 12.824 12.669 12.323 12.128 11.913 11.667 11.365 11.022 10.508 8.098 -8 ,27136 ,KEBNE ,17025271,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:07:38 CET,0.0 1.49 1.921 2.242 2.506 2.715 2.892 3.057 3.37 3.513 3.653 3.525 4.046 4.155 4.368 4.57 4.766 4.862 5.037 5.202 5.446 5.607 5.767 5.992 6.208 6.41 6.593 6.767 7.001 7.227 7.427 7.689 7.955 8.203 8.494 8.812 9.118 9.482 9.878 10.272 10.689 11.156 11.667 12.191 12.833 13.513 14.304 15.239 16.291 17.423 18.533 19.042 19.11 19.053 18.953 18.848 18.689 18.458 18.238 17.993 17.75 17.538 17.338 17.134 16.913 16.679 16.443 16.239 16.05 15.842 15.629 15.468 15.297 15.099 14.945 14.786 14.611 14.423 14.213 14.058 13.904 13.687 13.535 13.37 13.283 13.095 12.899 12.692 12.577 12.074 12.211 12.068 11.916 11.57 11.374 11.171 10.931 10.637 10.294 9.822 7.239 -10 ,29580 ,KEBNE ,17025273,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:07:25 CET,0.0 1.325 1.762 2.096 2.366 2.586 2.786 2.973 3.305 3.472 3.64 3.527 4.053 4.175 4.401 4.609 4.816 4.915 5.104 5.285 5.534 5.703 5.877 6.127 6.361 6.582 6.797 7.004 7.257 7.507 7.755 8.044 8.324 8.586 8.879 9.22 9.553 9.908 10.294 10.707 11.12 11.573 12.147 12.722 13.366 14.09 14.967 15.972 17.03 18.165 19.362 20.066 20.171 20.0 19.774 19.525 19.262 18.949 18.625 18.302 18.04 17.773 17.494 17.249 17.008 16.797 16.597 16.41 16.225 16.009 15.778 15.595 15.411 15.225 15.072 14.9 14.728 14.555 14.371 14.237 14.085 13.839 13.671 13.488 13.396 13.216 13.016 12.781 12.662 12.152 12.265 12.117 11.957 11.614 11.426 11.214 10.956 10.621 10.184 9.63 7.381 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt deleted file mode 100644 index 543c6990..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31382 ,KEBNE ,16692437,Thu Nov 25 19:31:33 CET,Thu Nov 25 21:25:36 CET,0.0 1.662 2.069 2.356 2.59 2.784 2.952 3.114 3.4 3.526 3.648 3.473 3.977 4.072 4.262 4.453 4.634 4.727 4.909 5.065 5.275 5.414 5.539 5.721 5.894 6.058 6.235 6.414 6.637 6.836 7.023 7.26 7.482 7.677 7.912 8.209 8.476 8.736 9.013 9.305 9.614 9.964 10.335 10.694 11.215 11.828 12.387 12.915 13.381 13.628 13.53 13.017 12.399 11.844 11.227 10.595 10.081 9.575 9.091 8.612 8.182 7.79 7.417 7.053 6.715 6.42 6.094 5.776 5.52 5.274 5.007 4.784 4.546 4.275 4.058 3.842 3.629 3.396 3.125 2.944 2.766 2.489 2.303 2.11 2.005 1.79 1.567 1.313 1.172 0.628 0.712 0.554 0.404 0.073 -0.132 -0.358 -0.622 -0.98 -1.41 -1.959 -4.25 -2 ,24498 ,KEBNE ,16692438,Thu Nov 25 19:31:37 CET,Thu Nov 25 21:22:27 CET,0.0 1.983 2.374 2.66 2.901 3.119 3.31 3.489 3.815 3.953 4.081 3.92 4.425 4.529 4.727 4.903 5.082 5.164 5.342 5.525 5.77 5.925 6.062 6.238 6.406 6.569 6.719 6.865 7.056 7.237 7.416 7.636 7.839 8.032 8.246 8.492 8.74 9.003 9.271 9.551 9.847 10.186 10.558 10.912 11.341 11.813 12.316 12.778 13.184 13.542 13.648 13.229 12.649 12.085 11.514 10.948 10.388 9.839 9.383 8.961 8.585 8.229 7.898 7.572 7.252 6.944 6.59 6.271 6.012 5.753 5.471 5.231 4.988 4.741 4.531 4.293 4.056 3.813 3.565 3.404 3.235 2.942 2.713 2.482 2.372 2.157 1.928 1.674 1.545 1.006 1.087 0.91 0.722 0.35 0.158 -0.039 -0.279 -0.59 -0.98 -1.528 -3.572 -3 ,5549 ,KEBNE ,16692439,Thu Nov 25 19:32:36 CET,Thu Nov 25 21:23:28 CET,0.0 1.627 2.011 2.275 2.483 2.665 2.827 2.992 3.297 3.428 3.56 3.401 3.907 4.01 4.197 4.376 4.543 4.623 4.784 4.933 5.145 5.284 5.422 5.622 5.808 5.984 6.152 6.304 6.498 6.7 6.894 7.107 7.312 7.514 7.734 7.969 8.208 8.494 8.789 9.08 9.377 9.694 10.032 10.356 10.783 11.244 11.676 12.081 12.434 12.731 12.85 12.591 12.113 11.525 10.954 10.378 9.837 9.337 8.895 8.427 8.02 7.68 7.329 6.983 6.676 6.392 6.096 5.829 5.589 5.326 5.05 4.801 4.537 4.274 4.06 3.845 3.621 3.367 3.098 2.921 2.739 2.457 2.282 2.103 2.007 1.811 1.61 1.379 1.247 0.719 0.821 0.667 0.504 0.145 -0.057 -0.285 -0.533 -0.83 -1.194 -1.704 -4.222 -4 ,23807 ,KEBNE ,16692440,Thu Nov 25 19:32:35 CET,Thu Nov 25 21:23:45 CET,0.0 1.331 1.737 2.037 2.295 2.499 2.687 2.87 3.203 3.35 3.473 3.278 3.784 3.886 4.073 4.265 4.438 4.523 4.692 4.852 5.109 5.278 5.419 5.601 5.78 5.95 6.108 6.258 6.453 6.64 6.815 7.036 7.263 7.482 7.723 7.967 8.207 8.479 8.75 9.024 9.318 9.651 10.038 10.441 10.864 11.264 11.716 12.163 12.595 12.979 13.087 12.665 12.002 11.313 10.673 10.089 9.508 8.924 8.446 7.985 7.568 7.175 6.808 6.469 6.142 5.832 5.495 5.206 4.959 4.689 4.396 4.16 3.926 3.669 3.475 3.271 3.048 2.8 2.521 2.344 2.167 1.867 1.661 1.447 1.333 1.104 0.873 0.635 0.512 -0.007 0.123 -0.033 -0.198 -0.58 -0.815 -1.097 -1.41 -1.739 -2.106 -2.681 -4.852 -5 ,16207 ,KEBNE ,16692441,Thu Nov 25 19:32:36 CET,Thu Nov 25 21:25:18 CET,0.0 2.001 2.394 2.655 2.871 3.067 3.249 3.407 3.691 3.822 3.96 3.826 4.349 4.464 4.649 4.819 4.999 5.086 5.25 5.413 5.641 5.771 5.899 6.082 6.243 6.393 6.543 6.689 6.886 7.083 7.258 7.475 7.704 7.901 8.107 8.353 8.587 8.829 9.104 9.386 9.665 9.993 10.351 10.682 11.043 11.396 11.768 12.182 12.639 12.986 13.062 12.756 12.268 11.728 11.109 10.481 9.987 9.559 9.128 8.687 8.329 7.963 7.591 7.268 6.973 6.689 6.372 6.087 5.832 5.569 5.307 5.069 4.822 4.58 4.39 4.183 3.955 3.713 3.466 3.298 3.115 2.803 2.588 2.381 2.275 2.048 1.816 1.581 1.457 0.929 1.039 0.88 0.705 0.306 0.094 -0.146 -0.449 -0.805 -1.191 -1.732 -4.671 -6 ,13078 ,KEBNE ,16692442,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:25:54 CET,0.0 1.917 2.314 2.586 2.807 2.993 3.175 3.351 3.667 3.804 3.931 3.76 4.261 4.358 4.547 4.735 4.905 4.978 5.13 5.305 5.554 5.692 5.827 6.021 6.217 6.407 6.576 6.734 6.934 7.12 7.297 7.516 7.721 7.921 8.157 8.413 8.643 8.884 9.15 9.423 9.707 10.021 10.379 10.744 11.139 11.506 11.864 12.234 12.627 12.975 12.984 12.397 11.674 10.908 10.221 9.622 9.055 8.482 7.978 7.465 6.968 6.536 6.15 5.778 5.441 5.126 4.765 4.436 4.175 3.889 3.589 3.354 3.112 2.851 2.644 2.428 2.203 1.984 1.748 1.578 1.393 1.092 0.896 0.703 0.604 0.401 0.165 -0.104 -0.252 -0.809 -0.709 -0.871 -1.043 -1.414 -1.641 -1.902 -2.185 -2.504 -2.903 -3.523 -5.937 -7 ,5927 ,KEBNE ,16692443,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:26:42 CET,0.0 1.612 2.014 2.269 2.467 2.664 2.859 3.021 3.297 3.42 3.538 3.35 3.849 3.953 4.131 4.299 4.472 4.556 4.722 4.885 5.11 5.254 5.386 5.563 5.73 5.895 6.044 6.191 6.379 6.573 6.763 6.973 7.184 7.385 7.614 7.875 8.119 8.378 8.646 8.921 9.197 9.507 9.889 10.248 10.637 11.005 11.378 11.78 12.165 12.464 12.486 12.088 11.539 10.905 10.177 9.484 8.91 8.386 7.953 7.522 7.132 6.748 6.366 6.003 5.67 5.384 5.087 4.798 4.53 4.268 4.006 3.767 3.518 3.257 3.039 2.84 2.651 2.444 2.223 2.059 1.886 1.608 1.399 1.172 1.055 0.802 0.548 0.289 0.137 -0.415 -0.328 -0.493 -0.662 -1.043 -1.263 -1.517 -1.803 -2.119 -2.506 -3.087 -5.439 -8 ,12809 ,KEBNE ,16692444,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:26:21 CET,0.0 1.438 1.845 2.121 2.352 2.556 2.748 2.933 3.259 3.405 3.534 3.364 3.885 4.013 4.251 4.444 4.619 4.702 4.87 5.05 5.335 5.503 5.639 5.825 5.997 6.162 6.325 6.497 6.729 6.93 7.11 7.328 7.535 7.741 8.004 8.291 8.551 8.838 9.138 9.458 9.803 10.156 10.561 10.929 11.301 11.742 12.2 12.621 13.036 13.398 13.539 13.123 12.556 12.012 11.482 10.952 10.472 9.984 9.502 9.035 8.641 8.268 7.889 7.52 7.182 6.845 6.504 6.222 5.958 5.694 5.437 5.211 4.958 4.687 4.46 4.24 4.027 3.795 3.55 3.378 3.201 2.927 2.734 2.532 2.429 2.213 1.971 1.7 1.556 1.002 1.077 0.91 0.741 0.372 0.156 -0.08 -0.344 -0.654 -1.05 -1.616 -4.495 -9 ,9058 ,KEBNE ,16692445,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:25:26 CET,0.0 1.52 1.925 2.205 2.404 2.577 2.747 2.906 3.188 3.313 3.428 3.246 3.748 3.843 4.016 4.191 4.363 4.443 4.598 4.759 4.999 5.144 5.282 5.477 5.648 5.809 5.966 6.135 6.356 6.55 6.734 6.954 7.176 7.384 7.632 7.938 8.199 8.459 8.745 9.048 9.367 9.685 10.032 10.396 10.789 11.194 11.646 12.174 12.715 13.092 13.17 12.908 12.429 11.834 11.218 10.616 10.103 9.612 9.123 8.596 8.15 7.779 7.437 7.096 6.763 6.452 6.12 5.818 5.56 5.29 4.995 4.755 4.513 4.253 4.061 3.856 3.638 3.428 3.202 3.046 2.896 2.637 2.44 2.227 2.115 1.885 1.625 1.36 1.233 0.704 0.81 0.659 0.484 0.092 -0.123 -0.364 -0.631 -0.912 -1.277 -1.832 -4.015 -10 ,16815 ,KEBNE ,16692446,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:26:17 CET,0.0 1.389 1.836 2.153 2.392 2.593 2.78 2.97 3.305 3.45 3.589 3.436 3.94 4.043 4.242 4.418 4.592 4.681 4.842 4.992 5.205 5.336 5.463 5.643 5.831 6.024 6.197 6.363 6.585 6.776 6.945 7.146 7.338 7.526 7.743 7.981 8.191 8.446 8.725 8.988 9.283 9.611 9.974 10.339 10.754 11.167 11.582 12.074 12.624 13.019 13.058 12.662 12.181 11.643 11.066 10.502 9.981 9.472 9.007 8.535 8.115 7.743 7.407 7.074 6.762 6.478 6.165 5.87 5.629 5.387 5.121 4.889 4.641 4.398 4.219 4.013 3.8 3.592 3.362 3.209 3.04 2.755 2.537 2.312 2.201 1.972 1.749 1.508 1.374 0.831 0.919 0.75 0.564 0.149 -0.071 -0.305 -0.575 -0.888 -1.276 -1.797 -3.839 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index ad493456..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2847 ,KEBNE ,16692447,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:26:49 CET,0.0 1.78 2.326 2.756 3.123 3.454 3.759 4.047 4.578 4.819 5.062 5.016 5.742 5.959 6.387 6.809 7.232 7.436 7.831 8.224 8.817 9.211 9.601 10.166 10.716 11.271 11.812 12.339 13.044 13.728 14.41 15.259 16.073 16.867 17.819 18.921 20.012 21.235 22.592 24.087 25.697 27.594 29.897 32.272 35.156 38.547 42.673 47.653 53.973 62.179 73.386 84.06 91.291 96.557 100.45 103.524 105.91 107.839 109.385 110.79 111.852 112.71 113.465 114.137 114.75 115.256 115.73 116.149 116.502 116.797 117.077 117.303 117.511 117.724 117.884 118.033 118.168 118.278 118.352 118.406 118.47 118.535 118.566 118.585 118.594 118.612 118.6 118.553 118.535 118.128 118.413 118.358 118.283 118.05 117.905 117.698 117.474 117.275 116.963 116.322 112.91 -2 ,28489 ,KEBNE ,16692448,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:25:55 CET,0.0 1.498 2.041 2.472 2.818 3.133 3.433 3.737 4.293 4.542 4.783 4.738 5.484 5.709 6.159 6.608 7.046 7.261 7.687 8.114 8.737 9.127 9.505 10.078 10.652 11.211 11.755 12.288 12.99 13.691 14.394 15.263 16.082 16.89 17.858 18.969 20.075 21.334 22.741 24.286 25.969 27.938 30.326 32.814 35.818 39.302 43.531 48.616 55.019 63.246 74.39 85.128 92.459 97.714 101.543 104.57 106.974 108.947 110.521 111.961 113.098 114.019 114.835 115.56 116.172 116.67 117.151 117.571 117.913 118.233 118.557 118.819 119.061 119.288 119.459 119.611 119.733 119.818 119.89 119.936 119.97 120.019 120.033 120.043 120.054 120.063 120.033 119.985 119.939 119.498 119.787 119.718 119.637 119.448 119.303 119.134 118.934 118.64 118.239 117.576 108.386 -3 ,23722 ,KEBNE ,16692449,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:26:33 CET,0.0 1.37 1.922 2.338 2.683 3.013 3.329 3.623 4.183 4.447 4.699 4.669 5.416 5.644 6.093 6.529 6.96 7.175 7.597 8.0 8.592 8.984 9.365 9.923 10.484 11.048 11.614 12.169 12.888 13.6 14.3 15.15 15.998 16.848 17.842 18.993 20.136 21.423 22.872 24.47 26.16 28.083 30.428 32.868 35.796 39.278 43.6 48.798 55.284 63.532 74.767 85.498 92.752 98.045 101.95 104.992 107.401 109.391 110.958 112.391 113.542 114.496 115.329 116.025 116.603 117.106 117.613 118.022 118.353 118.683 118.993 119.239 119.462 119.667 119.815 119.954 120.09 120.196 120.284 120.354 120.418 120.475 120.492 120.482 120.459 120.416 120.352 120.26 120.218 119.803 120.072 119.99 119.905 119.662 119.486 119.266 119.006 118.692 118.301 117.686 114.267 -4 ,26928 ,KEBNE ,16692450,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:27:20 CET,0.0 1.378 1.91 2.335 2.685 2.989 3.283 3.569 4.095 4.349 4.598 4.548 5.298 5.534 5.988 6.436 6.867 7.076 7.481 7.876 8.46 8.836 9.201 9.743 10.292 10.849 11.395 11.926 12.644 13.36 14.055 14.909 15.751 16.599 17.598 18.73 19.861 21.118 22.485 23.986 25.624 27.552 29.893 32.342 35.322 38.794 43.04 48.101 54.42 62.582 73.706 84.412 91.713 96.982 100.94 104.116 106.591 108.575 110.158 111.612 112.737 113.65 114.421 115.105 115.692 116.172 116.654 117.031 117.319 117.599 117.884 118.102 118.305 118.511 118.655 118.789 118.915 119.014 119.078 119.111 119.141 119.148 119.132 119.109 119.097 119.062 119.0 118.912 118.869 118.46 118.713 118.619 118.523 118.211 117.993 117.773 117.559 117.341 116.933 116.23 112.075 -5 ,11116 ,KEBNE ,16692451,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:26:50 CET,0.0 1.593 2.133 2.546 2.886 3.216 3.544 3.831 4.329 4.567 4.804 4.758 5.49 5.706 6.14 6.557 6.969 7.168 7.557 7.939 8.496 8.866 9.23 9.761 10.288 10.821 11.341 11.846 12.52 13.197 13.866 14.688 15.497 16.285 17.216 18.292 19.355 20.561 21.883 23.329 24.923 26.775 29.015 31.379 34.279 37.694 41.927 47.059 53.444 61.573 72.748 83.504 90.716 95.908 99.76 102.82 105.242 107.225 108.811 110.25 111.347 112.243 113.019 113.662 114.221 114.706 115.182 115.593 115.917 116.204 116.463 116.679 116.885 117.074 117.222 117.34 117.412 117.46 117.518 117.545 117.569 117.607 117.589 117.543 117.52 117.478 117.407 117.295 117.24 116.792 117.016 116.925 116.807 116.528 116.381 116.197 115.912 115.532 115.067 114.241 110.514 -6 ,9600 ,KEBNE ,16692452,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:26:07 CET,0.0 1.287 1.818 2.252 2.615 2.945 3.246 3.542 4.107 4.372 4.633 4.617 5.379 5.617 6.079 6.514 6.932 7.138 7.539 7.937 8.536 8.932 9.316 9.872 10.422 10.962 11.504 12.055 12.771 13.471 14.159 15.011 15.871 16.723 17.716 18.843 19.958 21.237 22.681 24.237 25.869 27.784 30.188 32.704 35.699 39.229 43.515 48.603 55.035 63.272 74.35 84.957 92.168 97.355 101.245 104.349 106.782 108.785 110.388 111.836 112.963 113.888 114.701 115.412 116.02 116.526 117.017 117.417 117.727 118.045 118.347 118.542 118.725 118.886 118.98 119.06 119.118 119.17 119.232 119.269 119.302 119.358 119.386 119.412 119.426 119.442 119.426 119.388 119.37 118.957 119.189 119.095 119.013 118.802 118.674 118.502 118.277 118.026 117.697 117.127 111.528 -7 ,12064 ,KEBNE ,16692453,Thu Nov 25 19:34:41 CET,Thu Nov 25 21:27:17 CET,0.0 1.95 2.454 2.847 3.195 3.512 3.803 4.079 4.598 4.841 5.092 5.086 5.84 6.088 6.568 6.997 7.4 7.605 8.009 8.404 8.992 9.377 9.757 10.324 10.884 11.44 11.992 12.528 13.228 13.914 14.595 15.466 16.335 17.167 18.141 19.281 20.4 21.666 23.097 24.648 26.343 28.352 30.766 33.261 36.283 39.757 43.961 49.074 55.568 63.927 75.309 86.13 93.398 98.625 102.549 105.698 108.167 110.174 111.735 113.143 114.234 115.125 115.914 116.593 117.171 117.665 118.147 118.541 118.839 119.109 119.371 119.578 119.762 119.937 120.081 120.225 120.348 120.447 120.528 120.568 120.597 120.596 120.586 120.562 120.541 120.495 120.45 120.416 120.378 119.939 120.184 120.089 119.98 119.722 119.559 119.357 119.133 118.84 118.453 117.898 115.59 -9 ,16474 ,KEBNE ,16692455,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:29:07 CET,0.0 1.566 2.068 2.472 2.834 3.162 3.463 3.751 4.306 4.568 4.818 4.776 5.529 5.765 6.207 6.624 7.039 7.248 7.655 8.065 8.674 9.067 9.45 10.01 10.557 11.103 11.651 12.189 12.891 13.587 14.271 15.12 15.968 16.802 17.804 18.953 20.094 21.412 22.846 24.406 26.107 28.072 30.466 32.957 35.945 39.441 43.694 48.792 55.26 63.659 75.076 85.967 93.367 98.688 102.595 105.672 108.096 110.059 111.578 112.984 114.108 115.013 115.799 116.48 117.08 117.589 118.08 118.495 118.833 119.169 119.501 119.75 119.968 120.168 120.311 120.439 120.565 120.687 120.769 120.798 120.834 120.897 120.921 120.934 120.929 120.89 120.842 120.785 120.754 120.334 120.626 120.557 120.462 120.207 120.045 119.85 119.604 119.279 118.864 118.183 115.15 -10 ,19706 ,KEBNE ,16692456,Thu Nov 25 19:35:44 CET,Thu Nov 25 21:28:04 CET,0.0 1.429 1.946 2.354 2.694 2.998 3.296 3.595 4.129 4.37 4.61 4.568 5.297 5.518 5.956 6.376 6.791 7.002 7.436 7.855 8.463 8.857 9.239 9.802 10.361 10.927 11.482 12.02 12.719 13.411 14.105 14.946 15.764 16.592 17.588 18.734 19.858 21.12 22.559 24.138 25.837 27.802 30.221 32.809 35.922 39.555 43.938 49.144 55.762 64.331 75.961 86.992 94.451 99.778 103.667 106.755 109.161 111.102 112.642 114.028 115.102 115.977 116.741 117.421 118.034 118.556 119.033 119.425 119.714 119.987 120.293 120.531 120.757 120.971 121.11 121.231 121.326 121.39 121.438 121.446 121.439 121.426 121.4 121.369 121.352 121.304 121.249 121.14 121.065 120.612 120.843 120.737 120.625 120.372 120.225 120.04 119.784 119.445 119.011 118.446 114.895 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index a0e39bf9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13164 ,KEBNE ,17025274,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:09:11 CET,0.0 1.757 2.311 2.736 3.111 3.448 3.753 4.044 4.601 4.861 5.115 5.094 5.856 6.093 6.538 6.978 7.407 7.621 8.036 8.437 9.029 9.414 9.795 10.346 10.885 11.416 11.933 12.451 13.156 13.857 14.549 15.399 16.23 17.052 18.037 19.163 20.258 21.478 22.807 24.303 25.955 27.826 30.07 32.426 35.254 38.588 42.682 47.556 53.666 61.429 71.744 81.396 87.801 92.397 95.858 98.621 100.751 102.5 103.881 105.129 106.089 106.852 107.503 108.093 108.62 109.035 109.428 109.756 110.031 110.31 110.567 110.76 110.934 111.088 111.206 111.323 111.425 111.511 111.588 111.631 111.663 111.684 111.691 111.699 111.687 111.623 111.545 111.455 111.411 110.956 111.209 111.116 111.014 110.781 110.636 110.477 110.296 110.05 109.704 109.222 106.976 -2 ,30440 ,KEBNE ,17025275,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:07:31 CET,0.0 1.506 2.028 2.456 2.835 3.157 3.453 3.734 4.284 4.563 4.824 4.799 5.554 5.79 6.253 6.701 7.135 7.343 7.759 8.187 8.817 9.213 9.585 10.131 10.679 11.207 11.723 12.245 12.925 13.588 14.25 15.067 15.871 16.677 17.626 18.695 19.768 20.98 22.295 23.74 25.322 27.154 29.399 31.745 34.554 37.872 41.973 46.915 52.995 60.717 71.244 81.204 87.86 92.695 96.323 99.182 101.391 103.191 104.591 105.817 106.788 107.601 108.307 108.922 109.459 109.917 110.348 110.691 110.945 111.196 111.441 111.636 111.84 112.026 112.157 112.278 112.372 112.455 112.537 112.583 112.618 112.652 112.667 112.655 112.64 112.624 112.593 112.529 112.5 112.062 112.35 112.272 112.186 111.978 111.829 111.657 111.468 111.238 110.859 110.271 108.029 -3 ,16767 ,KEBNE ,17025276,Wed Dec 22 12:14:48 CET,Wed Dec 22 14:08:24 CET,0.0 1.9 2.442 2.895 3.292 3.615 3.9 4.178 4.693 4.95 5.208 5.184 5.949 6.193 6.667 7.114 7.557 7.778 8.203 8.617 9.215 9.595 9.974 10.532 11.079 11.633 12.17 12.678 13.325 13.972 14.633 15.439 16.222 17.005 17.944 19.027 20.086 21.276 22.603 24.075 25.677 27.539 29.8 32.17 35.022 38.324 42.353 47.172 53.183 60.839 71.248 81.306 88.1 92.938 96.542 99.386 101.599 103.373 104.742 106.016 107.02 107.833 108.572 109.215 109.75 110.197 110.618 110.956 111.24 111.487 111.689 111.865 112.035 112.19 112.28 112.362 112.459 112.551 112.635 112.684 112.721 112.747 112.748 112.755 112.752 112.722 112.697 112.653 112.61 112.159 112.437 112.358 112.264 111.999 111.865 111.728 111.527 111.302 110.995 110.514 108.644 -4 ,28717 ,KEBNE ,17025277,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:07:44 CET,0.0 1.679 2.236 2.649 3.01 3.334 3.627 3.92 4.472 4.729 4.978 4.947 5.693 5.919 6.354 6.772 7.194 7.409 7.832 8.243 8.848 9.238 9.616 10.189 10.744 11.282 11.803 12.311 13.005 13.69 14.358 15.194 16.032 16.861 17.809 18.872 19.924 21.12 22.464 23.973 25.619 27.498 29.768 32.145 35.04 38.383 42.326 47.08 53.084 60.666 70.918 80.624 87.152 91.94 95.474 98.224 100.381 102.103 103.464 104.733 105.702 106.486 107.194 107.8 108.302 108.724 109.127 109.457 109.719 109.964 110.189 110.365 110.542 110.713 110.841 110.965 111.07 111.154 111.212 111.23 111.252 111.275 111.262 111.233 111.22 111.19 111.125 111.025 110.972 110.512 110.775 110.705 110.632 110.443 110.313 110.156 109.997 109.807 109.473 108.97 106.233 -5 ,9594 ,KEBNE ,17025278,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:07:21 CET,0.0 1.688 2.226 2.638 2.982 3.303 3.602 3.872 4.39 4.636 4.872 4.819 5.551 5.762 6.189 6.616 7.034 7.248 7.668 8.054 8.608 8.979 9.35 9.896 10.432 10.958 11.468 11.968 12.635 13.303 13.962 14.779 15.598 16.413 17.368 18.455 19.538 20.766 22.097 23.523 25.072 26.901 29.106 31.391 34.209 37.527 41.533 46.263 52.106 59.612 69.803 79.472 85.968 90.706 94.273 97.021 99.173 100.924 102.255 103.406 104.309 105.033 105.658 106.218 106.712 107.127 107.521 107.834 108.073 108.312 108.563 108.749 108.903 109.057 109.165 109.253 109.327 109.389 109.434 109.457 109.48 109.487 109.488 109.477 109.457 109.402 109.332 109.258 109.215 108.765 109.047 108.959 108.845 108.569 108.407 108.229 108.044 107.841 107.547 107.076 105.211 -6 ,12946 ,KEBNE ,17025279,Wed Dec 22 12:14:48 CET,Wed Dec 22 14:07:49 CET,0.0 1.545 2.056 2.453 2.793 3.11 3.405 3.685 4.196 4.441 4.683 4.639 5.376 5.595 6.022 6.444 6.854 7.059 7.46 7.853 8.437 8.816 9.195 9.773 10.338 10.869 11.381 11.882 12.538 13.194 13.84 14.638 15.428 16.199 17.134 18.211 19.249 20.429 21.737 23.17 24.757 26.616 28.827 31.115 33.91 37.194 41.211 46.003 52.027 59.76 70.111 80.035 86.724 91.57 95.16 97.896 100.01 101.736 103.068 104.262 105.236 106.076 106.81 107.411 107.926 108.362 108.757 109.071 109.334 109.577 109.784 109.928 110.059 110.171 110.246 110.313 110.379 110.434 110.488 110.529 110.556 110.581 110.589 110.587 110.576 110.542 110.527 110.501 110.475 110.044 110.353 110.29 110.197 109.957 109.786 109.6 109.418 109.161 108.794 108.292 106.358 -7 ,1864 ,KEBNE ,17025280,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:07:56 CET,0.0 1.708 2.195 2.581 2.932 3.27 3.582 3.869 4.416 4.672 4.92 4.887 5.636 5.851 6.275 6.698 7.12 7.321 7.72 8.122 8.702 9.081 9.46 10.014 10.55 11.079 11.615 12.14 12.823 13.5 14.164 14.995 15.825 16.658 17.652 18.777 19.878 21.118 22.496 23.976 25.561 27.427 29.688 32.048 34.935 38.274 42.256 47.048 53.117 60.952 71.496 81.362 88.069 92.929 96.497 99.194 101.217 102.922 104.289 105.501 106.408 107.157 107.855 108.458 108.958 109.371 109.753 110.067 110.321 110.554 110.776 110.948 111.083 111.208 111.303 111.394 111.476 111.546 111.613 111.639 111.657 111.696 111.695 111.661 111.651 111.627 111.582 111.515 111.465 111.017 111.309 111.226 111.113 110.841 110.67 110.457 110.235 109.962 109.552 108.99 106.36 -8 ,15965 ,KEBNE ,17025281,Wed Dec 22 12:14:48 CET,Wed Dec 22 14:08:12 CET,0.0 1.97 2.488 2.926 3.294 3.616 3.928 4.223 4.787 5.052 5.298 5.273 6.019 6.252 6.714 7.154 7.563 7.762 8.149 8.525 9.083 9.462 9.845 10.395 10.928 11.475 12.034 12.587 13.307 13.987 14.656 15.488 16.294 17.082 18.023 19.106 20.178 21.384 22.708 24.153 25.719 27.535 29.738 32.038 34.839 38.178 42.242 47.12 53.246 61.016 71.528 81.425 88.032 92.801 96.299 99.055 101.215 102.911 104.211 105.471 106.472 107.252 107.92 108.472 108.92 109.315 109.725 110.077 110.365 110.642 110.894 111.075 111.246 111.403 111.52 111.634 111.727 111.79 111.824 111.833 111.831 111.823 111.819 111.796 111.777 111.746 111.714 111.67 111.643 111.202 111.483 111.412 111.333 111.125 110.967 110.787 110.613 110.385 110.058 109.613 107.822 -9 ,18825 ,KEBNE ,17025282,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:07:48 CET,0.0 1.335 1.873 2.322 2.692 3.029 3.332 3.62 4.192 4.465 4.736 4.736 5.482 5.705 6.144 6.585 7.021 7.231 7.642 8.036 8.609 8.995 9.384 9.951 10.495 11.029 11.559 12.081 12.767 13.439 14.096 14.908 15.712 16.504 17.445 18.534 19.602 20.784 22.106 23.545 25.08 26.879 29.054 31.33 34.123 37.412 41.412 46.171 52.087 59.777 70.138 79.827 86.382 91.208 94.791 97.626 99.825 101.509 102.818 104.039 105.007 105.793 106.478 107.086 107.62 108.067 108.474 108.799 109.07 109.322 109.536 109.707 109.873 110.028 110.13 110.209 110.286 110.365 110.416 110.437 110.438 110.417 110.417 110.403 110.392 110.387 110.383 110.322 110.277 109.848 110.157 110.096 110.022 109.873 109.772 109.623 109.453 109.23 108.944 108.516 106.271 -10 ,11578 ,KEBNE ,17025283,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 14:08:12 CET,0.0 1.734 2.284 2.709 3.06 3.389 3.7 3.997 4.545 4.795 5.047 5.015 5.774 6.015 6.481 6.925 7.359 7.577 8.009 8.404 8.982 9.374 9.751 10.318 10.883 11.436 11.992 12.547 13.256 13.936 14.599 15.406 16.207 17.019 17.987 19.108 20.225 21.478 22.858 24.373 26.016 27.933 30.259 32.673 35.591 39.004 43.187 48.183 54.256 61.894 72.185 81.854 88.317 93.007 96.523 99.297 101.409 103.017 104.326 105.586 106.554 107.345 108.028 108.606 109.106 109.541 109.952 110.287 110.554 110.791 111.009 111.189 111.37 111.505 111.578 111.66 111.738 111.804 111.845 111.854 111.864 111.896 111.906 111.89 111.877 111.836 111.778 111.709 111.678 111.238 111.539 111.483 111.393 111.116 110.963 110.76 110.516 110.261 109.962 109.507 107.136 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index c969d0b7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11819 ,KEBNE ,16692457,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:27:28 CET,0.0 1.621 2.196 2.605 2.955 3.273 3.554 3.822 4.331 4.565 4.797 4.784 5.506 5.729 6.144 6.529 6.909 7.095 7.459 7.818 8.338 8.679 9.022 9.529 10.015 10.482 10.935 11.382 11.982 12.574 13.142 13.828 14.512 15.174 15.953 16.864 17.746 18.72 19.803 20.973 22.238 23.691 25.408 27.201 29.406 32.011 35.18 38.944 43.598 49.494 57.456 64.88 69.582 72.978 75.552 77.513 78.892 79.896 80.679 81.388 81.907 82.293 82.624 82.871 83.092 83.303 83.485 83.611 83.714 83.804 83.867 83.914 83.951 83.971 83.962 83.914 83.851 83.8 83.743 83.696 83.635 83.526 83.437 83.346 83.283 83.113 82.908 82.684 82.568 82.05 82.179 82.01 81.825 81.418 81.154 80.868 80.563 80.176 79.631 78.834 75.209 -2 ,5389 ,KEBNE ,16692458,Thu Nov 25 19:34:41 CET,Thu Nov 25 21:27:26 CET,0.0 1.369 1.884 2.265 2.588 2.899 3.18 3.436 3.91 4.144 4.379 4.329 5.024 5.233 5.633 6.011 6.372 6.551 6.896 7.243 7.788 8.134 8.455 8.922 9.366 9.804 10.238 10.662 11.217 11.757 12.287 12.944 13.583 14.199 14.925 15.784 16.636 17.596 18.685 19.886 21.182 22.691 24.533 26.42 28.64 31.199 34.281 37.999 42.671 48.609 56.601 64.057 69.047 72.689 75.344 77.422 78.981 80.125 80.98 81.7 82.231 82.632 82.943 83.205 83.432 83.628 83.806 83.918 83.994 84.045 84.072 84.08 84.082 84.085 84.084 84.068 84.016 83.946 83.869 83.794 83.7 83.54 83.424 83.306 83.245 83.098 82.924 82.732 82.629 82.104 82.194 82.043 81.874 81.469 81.244 80.975 80.663 80.307 79.826 79.104 75.839 -3 ,28699 ,KEBNE ,16692459,Thu Nov 25 19:34:40 CET,Thu Nov 25 21:26:16 CET,0.0 1.48 1.927 2.304 2.64 2.964 3.265 3.52 3.987 4.217 4.441 4.389 5.092 5.298 5.687 6.065 6.432 6.607 6.945 7.293 7.827 8.16 8.479 8.948 9.423 9.882 10.312 10.758 11.348 11.91 12.467 13.163 13.839 14.484 15.244 16.134 17.0 17.972 19.061 20.232 21.512 23.011 24.815 26.655 28.846 31.391 34.531 38.297 42.96 48.919 56.868 64.313 69.307 72.979 75.713 77.821 79.393 80.603 81.547 82.381 82.993 83.506 83.958 84.319 84.583 84.808 85.028 85.134 85.151 85.147 85.194 85.233 85.27 85.312 85.311 85.304 85.305 85.271 85.209 85.16 85.104 85.019 84.961 84.869 84.8 84.659 84.489 84.312 84.221 83.685 83.805 83.675 83.503 83.055 82.808 82.562 82.294 81.94 81.431 80.709 77.709 -4 ,13564 ,KEBNE ,16692460,Thu Nov 25 19:35:42 CET,Thu Nov 25 21:28:10 CET,0.0 1.353 1.829 2.203 2.526 2.821 3.092 3.344 3.825 4.047 4.266 4.197 4.884 5.081 5.48 5.856 6.218 6.401 6.766 7.113 7.602 7.923 8.25 8.733 9.203 9.677 10.153 10.618 11.212 11.798 12.377 13.074 13.77 14.465 15.255 16.151 17.033 18.032 19.159 20.369 21.648 23.12 24.884 26.77 29.051 31.677 34.949 38.871 43.69 49.699 57.535 64.748 69.396 72.644 75.04 76.887 78.279 79.417 80.351 81.222 81.876 82.398 82.814 83.143 83.436 83.655 83.842 83.984 84.093 84.219 84.345 84.409 84.436 84.441 84.422 84.368 84.288 84.218 84.131 84.058 83.985 83.838 83.71 83.566 83.495 83.359 83.187 82.998 82.892 82.365 82.472 82.315 82.139 81.717 81.484 81.218 80.918 80.536 80.037 79.354 76.042 -5 ,21946 ,KEBNE ,16692461,Thu Nov 25 19:35:42 CET,Thu Nov 25 21:29:12 CET,0.0 1.435 1.868 2.218 2.526 2.832 3.136 3.412 3.898 4.117 4.341 4.303 4.99 5.186 5.577 5.956 6.322 6.5 6.842 7.177 7.67 7.994 8.312 8.785 9.256 9.712 10.144 10.56 11.113 11.661 12.201 12.873 13.536 14.197 14.992 15.889 16.758 17.74 18.829 20.01 21.267 22.737 24.52 26.357 28.599 31.231 34.388 38.19 42.939 48.842 56.65 63.901 68.812 72.35 74.887 76.88 78.441 79.7 80.625 81.368 81.932 82.396 82.801 83.105 83.338 83.552 83.755 83.925 84.043 84.136 84.215 84.242 84.242 84.223 84.194 84.164 84.117 84.057 83.972 83.891 83.821 83.68 83.555 83.44 83.379 83.244 83.11 82.94 82.816 82.286 82.418 82.262 82.077 81.712 81.5 81.239 80.926 80.561 80.108 79.475 77.191 -6 ,28690 ,KEBNE ,16692462,Thu Nov 25 19:35:44 CET,Thu Nov 25 21:30:54 CET,0.0 2.23 2.835 3.261 3.607 3.903 4.178 4.445 4.94 5.168 5.383 5.309 5.981 6.167 6.553 6.939 7.309 7.491 7.855 8.213 8.736 9.077 9.404 9.882 10.335 10.774 11.219 11.651 12.213 12.78 13.319 13.954 14.585 15.22 15.98 16.861 17.743 18.734 19.831 21.035 22.324 23.793 25.578 27.426 29.652 32.253 35.377 39.129 43.867 49.781 57.765 65.304 70.328 73.983 76.585 78.57 80.107 81.327 82.247 83.084 83.724 84.201 84.602 84.951 85.241 85.473 85.691 85.874 86.005 86.093 86.164 86.209 86.239 86.236 86.216 86.197 86.153 86.086 86.011 85.962 85.91 85.798 85.685 85.557 85.488 85.349 85.192 84.972 84.862 84.336 84.44 84.305 84.17 83.807 83.565 83.275 82.911 82.463 81.889 81.036 77.274 -7 ,6355 ,KEBNE ,16692463,Thu Nov 25 19:35:44 CET,Thu Nov 25 21:30:54 CET,0.0 1.58 2.086 2.468 2.808 3.112 3.392 3.655 4.137 4.365 4.583 4.516 5.212 5.411 5.792 6.159 6.512 6.688 7.041 7.389 7.898 8.219 8.528 8.987 9.443 9.894 10.352 10.795 11.354 11.917 12.486 13.189 13.871 14.534 15.312 16.207 17.087 18.069 19.187 20.401 21.693 23.201 25.017 26.892 29.139 31.798 35.038 38.902 43.714 49.831 57.935 65.273 70.199 73.743 76.303 78.241 79.737 80.931 81.873 82.721 83.332 83.775 84.138 84.438 84.678 84.898 85.144 85.346 85.471 85.567 85.622 85.659 85.697 85.698 85.687 85.689 85.697 85.665 85.572 85.512 85.452 85.308 85.196 85.08 85.015 84.844 84.657 84.453 84.321 83.788 83.896 83.751 83.573 83.114 82.865 82.591 82.284 81.923 81.425 80.757 77.658 -9 ,27562 ,KEBNE ,16692465,Thu Nov 25 19:36:46 CET,Thu Nov 25 21:29:39 CET,0.0 1.61 2.11 2.49 2.814 3.115 3.4 3.653 4.124 4.358 4.587 4.536 5.22 5.411 5.791 6.161 6.518 6.69 7.032 7.367 7.85 8.166 8.478 8.941 9.384 9.815 10.25 10.69 11.292 11.879 12.443 13.124 13.788 14.443 15.215 16.107 16.98 17.948 19.019 20.204 21.499 23.003 24.807 26.686 29.014 31.737 34.926 38.684 43.372 49.405 57.473 64.789 69.595 73.037 75.539 77.476 78.983 80.228 81.187 82.043 82.645 83.078 83.445 83.727 83.953 84.135 84.26 84.335 84.402 84.486 84.587 84.645 84.668 84.665 84.652 84.617 84.571 84.539 84.483 84.426 84.363 84.265 84.193 84.109 84.05 83.875 83.672 83.467 83.359 82.828 82.914 82.778 82.644 82.279 82.044 81.759 81.42 81.037 80.586 79.927 77.003 -10 ,17090 ,KEBNE ,16692466,Thu Nov 25 19:36:47 CET,Thu Nov 25 21:30:06 CET,0.0 1.275 1.737 2.119 2.436 2.732 3.034 3.317 3.826 4.047 4.257 4.184 4.872 5.068 5.424 5.772 6.134 6.323 6.697 7.056 7.586 7.928 8.25 8.723 9.185 9.624 10.059 10.501 11.07 11.614 12.161 12.835 13.493 14.139 14.906 15.783 16.65 17.628 18.712 19.902 21.179 22.643 24.455 26.361 28.621 31.319 34.613 38.434 43.111 49.101 57.265 64.76 69.603 73.055 75.669 77.684 79.166 80.362 81.289 82.104 82.713 83.193 83.628 84.028 84.329 84.549 84.773 84.922 84.998 85.085 85.199 85.24 85.24 85.209 85.138 85.039 84.934 84.804 84.675 84.613 84.538 84.309 84.115 83.952 83.875 83.688 83.461 83.209 83.067 82.533 82.652 82.498 82.318 81.867 81.592 81.293 80.967 80.577 80.071 79.346 76.156 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt deleted file mode 100644 index 86db98d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,512 ,KEBNE ,16692467,Thu Nov 25 19:36:47 CET,Thu Nov 25 21:30:02 CET,0.0 1.867 2.29 2.616 2.874 3.107 3.319 3.512 3.879 4.024 4.145 3.916 4.514 4.612 4.799 4.985 5.156 5.235 5.384 5.52 5.707 5.819 5.922 6.082 6.221 6.344 6.462 6.571 6.737 6.896 7.034 7.211 7.386 7.55 7.726 7.891 8.019 8.128 8.223 8.275 8.317 8.376 8.389 8.364 8.274 8.078 7.762 7.213 6.32 4.923 2.641 -0.08 -2.32 -4.216 -5.82 -7.309 -8.669 -9.823 -10.809 -11.834 -12.647 -13.343 -14.044 -14.706 -15.309 -15.891 -16.54 -17.102 -17.524 -17.957 -18.442 -18.829 -19.237 -19.683 -20.03 -20.398 -20.768 -21.154 -21.557 -21.825 -22.105 -22.554 -22.859 -23.17 -23.337 -23.682 -24.037 -24.41 -24.607 -25.318 -25.199 -25.403 -25.621 -26.111 -26.388 -26.709 -27.056 -27.429 -27.905 -28.547 -32.85 -2 ,19466 ,KEBNE ,16692468,Thu Nov 25 19:36:47 CET,Thu Nov 25 21:32:35 CET,0.0 2.919 3.608 4.157 4.565 4.908 5.186 5.396 5.753 5.902 6.026 5.752 6.353 6.456 6.626 6.796 6.951 7.025 7.174 7.314 7.501 7.618 7.726 7.884 8.038 8.195 8.336 8.458 8.613 8.75 8.877 9.026 9.166 9.322 9.48 9.597 9.697 9.805 9.898 9.971 10.078 10.186 10.228 10.213 10.148 10.058 9.876 9.54 8.893 7.608 5.136 2.126 -0.341 -2.416 -4.198 -5.798 -7.152 -8.346 -9.352 -10.364 -11.249 -11.995 -12.681 -13.352 -13.971 -14.486 -15.014 -15.494 -15.907 -16.355 -16.806 -17.175 -17.577 -17.995 -18.331 -18.684 -19.026 -19.359 -19.731 -20.003 -20.281 -20.704 -20.989 -21.288 -21.442 -21.752 -22.094 -22.472 -22.668 -23.387 -23.281 -23.504 -23.762 -24.313 -24.632 -24.955 -25.308 -25.745 -26.229 -26.914 -30.198 -3 ,334 ,KEBNE ,16692469,Thu Nov 25 19:36:47 CET,Thu Nov 25 21:32:37 CET,0.0 2.456 2.909 3.223 3.486 3.729 3.935 4.12 4.458 4.604 4.744 4.524 5.138 5.256 5.466 5.658 5.837 5.921 6.083 6.242 6.476 6.611 6.728 6.905 7.082 7.225 7.358 7.495 7.659 7.806 7.947 8.098 8.211 8.317 8.428 8.519 8.6 8.708 8.835 8.948 9.039 9.106 9.154 9.169 9.125 8.997 8.71 8.241 7.516 6.279 3.906 1.019 -1.238 -3.165 -4.996 -6.735 -8.227 -9.568 -10.651 -11.701 -12.566 -13.307 -14.059 -14.759 -15.375 -15.928 -16.512 -17.09 -17.591 -18.073 -18.569 -18.989 -19.425 -19.873 -20.231 -20.588 -20.927 -21.263 -21.616 -21.889 -22.194 -22.654 -22.964 -23.282 -23.443 -23.755 -24.087 -24.459 -24.65 -25.359 -25.292 -25.53 -25.767 -26.273 -26.577 -26.926 -27.303 -27.735 -28.243 -28.902 -31.546 -4 ,16237 ,KEBNE ,16692470,Thu Nov 25 19:37:49 CET,Thu Nov 25 21:32:12 CET,0.0 2.191 2.631 2.959 3.231 3.458 3.667 3.847 4.133 4.257 4.376 4.108 4.695 4.8 4.996 5.178 5.345 5.421 5.557 5.689 5.905 6.036 6.156 6.315 6.46 6.619 6.779 6.895 7.016 7.135 7.228 7.347 7.484 7.604 7.718 7.843 7.938 8.009 8.08 8.139 8.159 8.156 8.142 8.077 7.919 7.672 7.269 6.702 5.852 4.419 1.955 -0.93 -3.299 -5.333 -7.071 -8.577 -9.864 -11.011 -12.007 -13.014 -13.879 -14.638 -15.366 -16.051 -16.674 -17.217 -17.797 -18.361 -18.828 -19.279 -19.755 -20.167 -20.589 -21.022 -21.352 -21.692 -22.056 -22.435 -22.82 -23.096 -23.393 -23.851 -24.158 -24.473 -24.644 -25.007 -25.396 -25.792 -25.997 -26.731 -26.668 -26.918 -27.192 -27.776 -28.089 -28.423 -28.798 -29.252 -29.813 -30.512 -33.4 -5 ,25836 ,KEBNE ,16692471,Thu Nov 25 19:37:49 CET,Thu Nov 25 21:31:41 CET,0.0 2.191 2.689 3.006 3.247 3.47 3.687 3.88 4.214 4.344 4.463 4.213 4.814 4.924 5.126 5.326 5.514 5.604 5.769 5.911 6.102 6.227 6.352 6.534 6.714 6.878 7.006 7.127 7.273 7.402 7.528 7.672 7.796 7.918 8.063 8.203 8.343 8.472 8.588 8.711 8.803 8.893 8.982 9.036 8.984 8.757 8.381 7.827 6.945 5.502 2.986 -0.052 -2.491 -4.534 -6.313 -7.855 -9.19 -10.371 -11.358 -12.368 -13.252 -14.03 -14.77 -15.472 -16.093 -16.628 -17.189 -17.711 -18.212 -18.747 -19.26 -19.671 -20.106 -20.549 -20.881 -21.241 -21.616 -22.01 -22.411 -22.673 -22.942 -23.373 -23.69 -24.027 -24.189 -24.525 -24.866 -25.21 -25.403 -26.136 -26.08 -26.348 -26.64 -27.271 -27.625 -27.999 -28.421 -28.894 -29.447 -30.261 -33.599 -6 ,13982 ,KEBNE ,16692472,Thu Nov 25 19:37:49 CET,Thu Nov 25 21:31:53 CET,0.0 2.464 3.051 3.396 3.668 3.91 4.104 4.274 4.598 4.748 4.876 4.593 5.193 5.316 5.528 5.724 5.904 5.983 6.14 6.295 6.493 6.618 6.75 6.911 7.057 7.191 7.301 7.404 7.544 7.693 7.831 7.994 8.137 8.249 8.384 8.538 8.679 8.821 8.944 9.014 9.052 9.083 9.088 9.036 8.876 8.598 8.196 7.659 6.806 5.404 2.93 -0.018 -2.517 -4.64 -6.312 -7.772 -9.09 -10.243 -11.231 -12.239 -13.097 -13.838 -14.531 -15.238 -15.92 -16.488 -17.027 -17.516 -17.962 -18.417 -18.877 -19.247 -19.615 -20.009 -20.32 -20.644 -20.989 -21.369 -21.776 -22.057 -22.333 -22.748 -23.058 -23.398 -23.562 -23.875 -24.186 -24.519 -24.704 -25.411 -25.335 -25.583 -25.845 -26.381 -26.662 -26.96 -27.303 -27.702 -28.205 -28.853 -31.378 -7 ,18102 ,KEBNE ,16692473,Thu Nov 25 19:37:49 CET,Thu Nov 25 21:31:39 CET,0.0 2.18 2.735 3.093 3.369 3.594 3.783 3.96 4.278 4.418 4.569 4.377 4.988 5.105 5.329 5.524 5.713 5.801 5.956 6.098 6.283 6.405 6.534 6.704 6.843 6.982 7.127 7.274 7.469 7.627 7.767 7.929 8.068 8.194 8.336 8.484 8.586 8.689 8.775 8.844 8.95 9.034 9.066 9.076 9.014 8.846 8.556 8.061 7.239 5.923 3.642 0.971 -1.207 -3.096 -4.665 -5.992 -7.153 -8.203 -9.096 -10.002 -10.763 -11.472 -12.202 -12.928 -13.627 -14.246 -14.877 -15.412 -15.855 -16.323 -16.833 -17.261 -17.69 -18.122 -18.45 -18.788 -19.139 -19.488 -19.845 -20.122 -20.394 -20.766 -21.04 -21.341 -21.501 -21.835 -22.187 -22.563 -22.763 -23.476 -23.397 -23.636 -23.866 -24.34 -24.627 -24.949 -25.285 -25.677 -26.197 -26.883 -29.744 -8 ,5450 ,KEBNE ,16692474,Thu Nov 25 19:37:49 CET,Thu Nov 25 21:33:43 CET,0.0 2.435 2.899 3.231 3.49 3.717 3.926 4.111 4.415 4.547 4.67 4.399 4.988 5.095 5.303 5.494 5.656 5.728 5.875 6.019 6.219 6.34 6.463 6.643 6.81 6.958 7.091 7.231 7.416 7.574 7.706 7.845 7.962 8.076 8.209 8.334 8.437 8.55 8.669 8.792 8.906 9.013 9.096 9.103 9.02 8.921 8.755 8.3 7.449 6.126 3.905 1.155 -1.181 -3.154 -4.785 -6.228 -7.558 -8.779 -9.82 -10.87 -11.809 -12.626 -13.361 -14.026 -14.629 -15.191 -15.8 -16.335 -16.772 -17.229 -17.728 -18.148 -18.582 -19.043 -19.397 -19.77 -20.171 -20.587 -21.002 -21.276 -21.572 -22.055 -22.373 -22.67 -22.823 -23.175 -23.554 -23.947 -24.15 -24.873 -24.825 -25.056 -25.302 -25.856 -26.158 -26.475 -26.817 -27.199 -27.666 -28.366 -31.366 -9 ,15717 ,KEBNE ,16692475,Thu Nov 25 19:48:18 CET,Thu Nov 25 21:42:17 CET,0.0 3.32 3.828 4.166 4.445 4.662 4.859 5.056 5.381 5.513 5.64 5.401 5.999 6.118 6.333 6.516 6.672 6.74 6.883 7.022 7.199 7.305 7.409 7.576 7.746 7.893 8.043 8.18 8.317 8.446 8.575 8.721 8.851 8.964 9.087 9.213 9.33 9.436 9.577 9.747 9.925 10.074 10.108 10.083 10.021 9.891 9.586 9.09 8.368 7.189 5.003 2.299 0.092 -1.798 -3.408 -4.852 -6.174 -7.385 -8.42 -9.436 -10.295 -11.069 -11.814 -12.529 -13.198 -13.775 -14.352 -14.879 -15.327 -15.765 -16.242 -16.654 -17.061 -17.495 -17.864 -18.251 -18.637 -19.046 -19.455 -19.73 -20.02 -20.471 -20.787 -21.11 -21.281 -21.645 -22.028 -22.422 -22.622 -23.355 -23.304 -23.553 -23.812 -24.336 -24.608 -24.921 -25.312 -25.759 -26.289 -26.972 -29.883 -10 ,13192 ,KEBNE ,16692476,Thu Nov 25 19:51:25 CET,Thu Nov 25 21:45:40 CET,0.0 1.681 2.087 2.374 2.641 2.862 3.043 3.214 3.522 3.651 3.771 3.505 4.096 4.195 4.39 4.569 4.728 4.807 4.949 5.093 5.307 5.438 5.561 5.737 5.888 6.02 6.148 6.267 6.413 6.538 6.671 6.821 6.928 7.032 7.161 7.278 7.352 7.414 7.506 7.612 7.683 7.71 7.689 7.634 7.553 7.41 7.085 6.468 5.476 3.956 1.342 -1.845 -4.37 -6.389 -8.075 -9.56 -10.84 -12.016 -13.026 -14.015 -14.876 -15.623 -16.325 -17.027 -17.686 -18.259 -18.861 -19.426 -19.92 -20.405 -20.906 -21.34 -21.799 -22.275 -22.635 -22.994 -23.359 -23.716 -24.081 -24.335 -24.583 -24.987 -25.306 -25.65 -25.818 -26.154 -26.493 -26.839 -27.015 -27.714 -27.608 -27.838 -28.079 -28.59 -28.874 -29.216 -29.598 -30.02 -30.518 -31.073 -33.345 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt deleted file mode 100644 index 384790e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31723 ,KEBNE ,16692477,Thu Nov 25 19:55:35 CET,Thu Nov 25 21:48:19 CET,0.0 1.95 2.515 2.944 3.304 3.628 3.923 4.203 4.737 4.992 5.237 5.244 5.926 6.139 6.553 6.964 7.353 7.538 7.906 8.263 8.794 9.15 9.494 9.994 10.482 10.964 11.444 11.893 12.446 12.985 13.516 14.19 14.887 15.584 16.38 17.29 18.21 19.208 20.33 21.596 22.951 24.538 26.419 28.331 30.625 33.22 36.325 39.99 44.574 50.344 57.938 65.037 69.722 73.06 75.455 77.24 78.587 79.651 80.431 81.114 81.657 82.093 82.427 82.679 82.919 83.102 83.221 83.304 83.362 83.391 83.39 83.382 83.369 83.33 83.293 83.272 83.227 83.151 83.062 82.979 82.88 82.7 82.562 82.421 82.346 82.182 82.018 81.804 81.663 81.165 81.275 81.113 80.939 80.471 80.165 79.877 79.554 79.066 78.496 77.879 73.902 -2 ,15851 ,KEBNE ,16692478,Thu Nov 25 19:55:35 CET,Thu Nov 25 21:48:04 CET,0.0 1.611 2.131 2.53 2.879 3.211 3.537 3.838 4.358 4.604 4.839 4.833 5.509 5.719 6.148 6.549 6.932 7.126 7.484 7.83 8.363 8.701 9.028 9.518 10.013 10.483 10.937 11.401 12.017 12.624 13.221 13.956 14.658 15.323 16.087 17.0 17.949 19.028 20.175 21.396 22.711 24.215 26.053 27.946 30.251 32.974 36.209 40.023 44.805 50.834 58.909 66.484 71.334 74.7 77.172 79.044 80.489 81.677 82.583 83.381 84.0 84.469 84.885 85.258 85.544 85.769 85.993 86.174 86.305 86.419 86.493 86.526 86.548 86.561 86.575 86.585 86.582 86.54 86.469 86.433 86.38 86.241 86.145 86.055 86.01 85.886 85.715 85.521 85.412 84.929 85.024 84.885 84.746 84.337 84.041 83.757 83.466 83.094 82.627 81.728 77.897 -3 ,16183 ,KEBNE ,16692479,Thu Nov 25 19:55:35 CET,Thu Nov 25 21:48:08 CET,0.0 1.798 2.355 2.785 3.159 3.488 3.799 4.08 4.596 4.842 5.081 5.079 5.763 5.976 6.385 6.798 7.209 7.403 7.779 8.145 8.671 9.021 9.368 9.888 10.413 10.918 11.384 11.842 12.464 13.08 13.68 14.427 15.182 15.889 16.675 17.559 18.429 19.46 20.662 21.972 23.371 24.992 26.915 28.847 31.201 33.905 37.077 40.946 45.71 51.566 59.373 66.55 71.183 74.45 76.892 78.827 80.241 81.341 82.217 82.979 83.545 84.022 84.438 84.762 85.014 85.225 85.423 85.554 85.64 85.73 85.806 85.845 85.856 85.864 85.879 85.871 85.827 85.768 85.678 85.59 85.495 85.353 85.228 85.068 84.989 84.81 84.621 84.413 84.276 83.761 83.842 83.677 83.481 83.026 82.768 82.507 82.205 81.753 81.155 80.293 76.781 -4 ,18555 ,KEBNE ,16692480,Thu Nov 25 19:55:35 CET,Thu Nov 25 21:48:23 CET,0.0 1.495 2.039 2.463 2.827 3.155 3.454 3.747 4.293 4.553 4.806 4.808 5.499 5.717 6.124 6.513 6.907 7.1 7.465 7.829 8.375 8.725 9.058 9.532 10.002 10.484 10.968 11.442 12.068 12.682 13.286 14.02 14.739 15.458 16.274 17.162 18.037 19.032 20.126 21.33 22.612 24.093 25.911 27.805 30.069 32.696 35.906 39.736 44.421 50.293 58.147 65.302 69.959 73.201 75.578 77.461 78.904 80.019 80.833 81.568 82.136 82.567 82.934 83.243 83.504 83.713 83.9 84.031 84.122 84.219 84.307 84.355 84.38 84.376 84.362 84.344 84.33 84.323 84.288 84.254 84.215 84.128 84.058 83.979 83.924 83.784 83.639 83.444 83.317 82.845 82.993 82.856 82.668 82.266 82.068 81.819 81.44 80.942 80.313 79.484 75.967 -5 ,7873 ,KEBNE ,16692481,Thu Nov 25 19:56:38 CET,Thu Nov 25 21:50:42 CET,0.0 1.802 2.418 2.858 3.233 3.572 3.882 4.174 4.719 4.974 5.23 5.259 5.947 6.161 6.581 6.996 7.405 7.6 7.974 8.338 8.88 9.234 9.59 10.113 10.598 11.055 11.515 11.992 12.625 13.233 13.821 14.553 15.274 15.979 16.816 17.77 18.716 19.775 20.937 22.216 23.548 25.042 26.864 28.765 31.031 33.621 36.738 40.433 45.096 51.093 58.957 66.047 70.663 73.886 76.231 78.034 79.391 80.46 81.261 81.972 82.511 82.923 83.284 83.611 83.865 84.022 84.15 84.261 84.342 84.398 84.426 84.443 84.459 84.454 84.436 84.398 84.364 84.308 84.24 84.203 84.15 84.022 83.902 83.788 83.72 83.55 83.365 83.129 82.985 82.472 82.555 82.394 82.207 81.735 81.461 81.136 80.738 80.292 79.71 78.794 75.182 -6 ,25119 ,KEBNE ,16692482,Thu Nov 25 19:56:38 CET,Thu Nov 25 21:49:45 CET,0.0 1.433 1.991 2.427 2.807 3.146 3.45 3.736 4.289 4.55 4.801 4.797 5.472 5.68 6.087 6.486 6.871 7.058 7.419 7.776 8.305 8.648 8.999 9.514 10.003 10.493 10.971 11.424 12.015 12.589 13.157 13.866 14.569 15.268 16.087 17.006 17.891 18.897 19.988 21.146 22.408 23.905 25.716 27.573 29.82 32.472 35.702 39.538 44.207 49.973 57.654 64.832 69.533 72.785 75.105 76.936 78.358 79.461 80.276 81.01 81.58 82.026 82.392 82.675 82.92 83.124 83.285 83.397 83.485 83.576 83.656 83.677 83.691 83.703 83.708 83.709 83.686 83.642 83.568 83.506 83.426 83.285 83.199 83.097 83.029 82.881 82.718 82.519 82.415 81.923 82.012 81.864 81.688 81.271 81.02 80.697 80.225 79.658 79.065 78.284 73.857 -7 ,4934 ,KEBNE ,16692483,Thu Nov 25 19:56:38 CET,Thu Nov 25 21:49:40 CET,0.0 1.219 1.766 2.223 2.636 2.989 3.306 3.602 4.155 4.408 4.644 4.627 5.316 5.543 5.984 6.395 6.799 6.997 7.383 7.761 8.32 8.684 9.038 9.559 10.062 10.553 11.035 11.52 12.132 12.735 13.348 14.095 14.843 15.559 16.39 17.311 18.169 19.163 20.277 21.461 22.722 24.196 26.017 27.942 30.177 32.719 35.825 39.493 44.012 49.786 57.598 64.797 69.453 72.726 75.168 77.062 78.46 79.578 80.445 81.184 81.731 82.158 82.543 82.876 83.141 83.33 83.481 83.577 83.631 83.676 83.698 83.707 83.717 83.722 83.711 83.679 83.625 83.542 83.444 83.371 83.299 83.169 83.074 82.976 82.91 82.745 82.562 82.369 82.249 81.748 81.854 81.675 81.479 81.129 80.9 80.607 80.273 79.891 79.373 78.513 75.593 -8 ,28711 ,KEBNE ,16692484,Thu Nov 25 19:56:38 CET,Thu Nov 25 21:49:52 CET,0.0 2.499 3.048 3.479 3.868 4.203 4.506 4.782 5.298 5.546 5.782 5.765 6.443 6.656 7.054 7.45 7.845 8.038 8.42 8.799 9.346 9.706 10.062 10.58 11.084 11.571 12.057 12.544 13.18 13.807 14.419 15.171 15.898 16.601 17.413 18.34 19.254 20.248 21.33 22.522 23.807 25.305 27.115 28.967 31.212 33.812 36.963 40.744 45.46 51.391 59.07 66.064 70.625 73.866 76.216 78.029 79.444 80.561 81.399 82.146 82.706 83.154 83.535 83.809 84.024 84.198 84.355 84.497 84.603 84.673 84.701 84.697 84.685 84.651 84.623 84.589 84.541 84.477 84.387 84.328 84.267 84.128 84.02 83.914 83.847 83.709 83.554 83.374 83.279 82.784 82.874 82.733 82.571 82.199 81.987 81.74 81.428 80.956 80.344 79.572 76.719 -9 ,20665 ,KEBNE ,16692485,Thu Nov 25 19:56:38 CET,Thu Nov 25 21:48:54 CET,0.0 1.965 2.54 2.995 3.394 3.744 4.057 4.346 4.873 5.121 5.361 5.36 6.048 6.269 6.703 7.115 7.508 7.705 8.09 8.469 9.01 9.355 9.69 10.189 10.694 11.195 11.659 12.095 12.691 13.3 13.904 14.615 15.305 16.009 16.843 17.792 18.728 19.785 20.927 22.123 23.395 24.855 26.624 28.485 30.754 33.413 36.56 40.283 45.003 50.908 58.628 65.758 70.373 73.62 76.011 77.818 79.139 80.209 81.073 81.832 82.388 82.829 83.193 83.493 83.743 83.934 84.123 84.272 84.353 84.406 84.451 84.479 84.483 84.441 84.395 84.349 84.289 84.208 84.109 84.049 83.997 83.889 83.775 83.646 83.581 83.444 83.301 83.121 83.025 82.572 82.716 82.57 82.387 81.945 81.727 81.465 81.082 80.647 80.111 79.368 75.986 -10 ,31567 ,KEBNE ,16692486,Thu Nov 25 19:56:39 CET,Thu Nov 25 21:49:58 CET,0.0 2.219 2.774 3.214 3.589 3.925 4.238 4.54 5.085 5.329 5.568 5.557 6.242 6.465 6.888 7.285 7.672 7.861 8.234 8.602 9.143 9.49 9.826 10.33 10.832 11.322 11.801 12.27 12.879 13.478 14.078 14.826 15.56 16.279 17.124 18.088 19.027 20.08 21.272 22.577 23.968 25.541 27.402 29.291 31.519 34.136 37.29 41.01 45.695 51.622 59.293 66.425 71.161 74.438 76.815 78.65 80.0 81.084 81.927 82.664 83.239 83.665 84.002 84.27 84.482 84.639 84.791 84.91 84.969 84.995 85.013 85.032 85.059 85.091 85.092 85.069 85.018 84.934 84.827 84.731 84.636 84.511 84.417 84.297 84.229 84.096 83.944 83.754 83.638 83.133 83.193 83.018 82.827 82.351 82.054 81.755 81.411 80.913 80.3 79.528 72.37 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index dbc73d84..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3144 ,KEBNE ,16692487,Thu Nov 25 19:56:38 CET,Thu Nov 25 21:52:05 CET,0.0 1.017 1.386 1.687 1.929 2.138 2.332 2.498 2.814 2.955 3.092 2.956 3.487 3.611 3.841 4.045 4.246 4.344 4.529 4.707 4.96 5.118 5.28 5.527 5.767 6.0 6.214 6.42 6.693 6.949 7.192 7.498 7.822 8.145 8.507 8.911 9.301 9.726 10.191 10.686 11.215 11.818 12.5 13.216 14.083 15.036 16.13 17.373 18.839 20.612 22.806 24.571 25.522 26.032 26.304 26.446 26.497 26.471 26.413 26.287 26.116 25.958 25.821 25.696 25.53 25.353 25.183 25.035 24.887 24.702 24.512 24.338 24.14 23.939 23.784 23.616 23.428 23.225 23.003 22.859 22.719 22.487 22.313 22.131 22.038 21.848 21.647 21.405 21.267 20.727 20.777 20.611 20.43 20.045 19.835 19.567 19.254 18.906 18.483 17.872 15.372 -2 ,6898 ,KEBNE ,16692488,Thu Nov 25 19:56:38 CET,Thu Nov 25 21:51:00 CET,0.0 1.219 1.625 1.925 2.182 2.435 2.65 2.826 3.147 3.306 3.454 3.297 3.82 3.933 4.154 4.383 4.605 4.71 4.917 5.112 5.386 5.559 5.729 5.976 6.213 6.443 6.665 6.881 7.157 7.433 7.707 8.028 8.336 8.64 8.991 9.386 9.773 10.186 10.622 11.092 11.6 12.193 12.883 13.621 14.486 15.4 16.505 17.819 19.367 21.232 23.545 25.423 26.43 26.891 27.091 27.198 27.239 27.243 27.189 27.069 26.887 26.72 26.559 26.389 26.239 26.094 25.929 25.757 25.573 25.376 25.173 25.018 24.857 24.643 24.477 24.319 24.132 23.928 23.722 23.587 23.448 23.213 23.048 22.857 22.754 22.555 22.339 22.104 21.975 21.456 21.539 21.361 21.17 20.765 20.52 20.234 19.919 19.578 19.136 18.532 16.383 -3 ,8751 ,KEBNE ,16692489,Thu Nov 25 19:56:38 CET,Thu Nov 25 21:51:43 CET,0.0 1.75 2.152 2.438 2.677 2.886 3.074 3.247 3.58 3.738 3.876 3.736 4.269 4.386 4.612 4.815 5.012 5.115 5.311 5.493 5.752 5.915 6.075 6.307 6.528 6.745 6.961 7.182 7.472 7.742 8.012 8.334 8.649 8.964 9.312 9.703 10.096 10.53 11.009 11.521 12.046 12.662 13.365 14.07 14.921 15.884 17.067 18.408 19.957 21.784 23.887 25.529 26.414 26.914 27.173 27.294 27.344 27.306 27.18 27.009 26.867 26.747 26.603 26.417 26.234 26.066 25.871 25.662 25.47 25.277 25.068 24.879 24.665 24.443 24.279 24.103 23.923 23.743 23.535 23.384 23.224 22.948 22.742 22.533 22.437 22.239 21.998 21.717 21.577 21.059 21.157 20.994 20.834 20.45 20.211 19.93 19.608 19.26 18.834 18.174 15.437 -4 ,32697 ,KEBNE ,16692490,Thu Nov 25 19:57:40 CET,Thu Nov 25 21:52:45 CET,0.0 1.557 1.95 2.235 2.471 2.681 2.872 3.041 3.323 3.466 3.608 3.458 3.98 4.094 4.314 4.526 4.726 4.823 5.015 5.188 5.434 5.6 5.758 5.997 6.233 6.453 6.673 6.894 7.195 7.487 7.768 8.099 8.408 8.711 9.069 9.474 9.872 10.32 10.819 11.348 11.873 12.446 13.126 13.802 14.592 15.51 16.584 17.826 19.331 21.068 23.15 24.846 25.74 26.22 26.49 26.668 26.732 26.651 26.514 26.343 26.161 25.973 25.796 25.629 25.465 25.292 25.108 24.939 24.778 24.614 24.441 24.277 24.087 23.872 23.714 23.554 23.384 23.214 23.049 22.939 22.81 22.597 22.445 22.278 22.193 22.007 21.783 21.536 21.407 20.875 20.981 20.831 20.641 20.212 19.971 19.708 19.428 19.115 18.713 18.087 15.643 -5 ,5830 ,KEBNE ,16692491,Thu Nov 25 19:57:40 CET,Thu Nov 25 21:51:24 CET,0.0 1.303 1.751 2.083 2.337 2.542 2.721 2.893 3.202 3.347 3.49 3.342 3.877 4.001 4.246 4.47 4.686 4.795 4.993 5.167 5.412 5.574 5.737 5.988 6.227 6.454 6.682 6.913 7.216 7.502 7.775 8.071 8.337 8.604 8.917 9.279 9.64 10.047 10.508 11.019 11.552 12.132 12.803 13.506 14.385 15.393 16.513 17.761 19.249 20.986 23.134 24.896 25.812 26.272 26.53 26.639 26.654 26.64 26.58 26.508 26.416 26.302 26.173 26.017 25.862 25.717 25.564 25.438 25.314 25.151 24.964 24.801 24.626 24.433 24.269 24.108 23.951 23.773 23.597 23.473 23.337 23.119 22.959 22.78 22.685 22.507 22.321 22.104 21.975 21.464 21.576 21.428 21.278 20.944 20.749 20.542 20.276 19.911 19.463 18.869 16.521 -6 ,24354 ,KEBNE ,16692492,Thu Nov 25 19:57:40 CET,Thu Nov 25 21:52:59 CET,0.0 1.636 2.036 2.334 2.574 2.799 2.993 3.161 3.458 3.598 3.737 3.594 4.126 4.245 4.482 4.709 4.914 5.012 5.207 5.386 5.642 5.813 5.977 6.215 6.453 6.678 6.887 7.101 7.386 7.656 7.921 8.239 8.546 8.845 9.196 9.589 9.953 10.35 10.786 11.258 11.758 12.337 13.015 13.685 14.506 15.437 16.494 17.712 19.174 20.928 23.096 24.867 25.753 26.233 26.52 26.68 26.75 26.717 26.643 26.556 26.405 26.221 26.028 25.812 25.601 25.413 25.178 24.927 24.711 24.513 24.306 24.117 23.931 23.735 23.577 23.403 23.213 23.011 22.794 22.64 22.469 22.204 22.024 21.832 21.728 21.497 21.266 21.014 20.864 20.317 20.317 20.112 19.921 19.491 19.244 18.976 18.665 18.317 17.886 17.26 13.865 -7 ,7982 ,KEBNE ,16692493,Thu Nov 25 19:57:40 CET,Thu Nov 25 21:53:05 CET,0.0 2.068 2.444 2.728 2.975 3.184 3.365 3.525 3.821 3.959 4.085 3.917 4.44 4.549 4.771 4.989 5.192 5.289 5.473 5.651 5.92 6.093 6.252 6.487 6.726 6.954 7.165 7.385 7.675 7.939 8.198 8.508 8.806 9.097 9.433 9.807 10.168 10.558 10.977 11.447 11.949 12.513 13.188 13.881 14.708 15.669 16.825 18.157 19.632 21.324 23.415 25.07 25.958 26.432 26.626 26.687 26.722 26.716 26.638 26.533 26.415 26.249 26.102 25.992 25.866 25.73 25.583 25.44 25.286 25.116 24.948 24.779 24.609 24.447 24.303 24.155 23.997 23.823 23.645 23.518 23.383 23.162 23.007 22.833 22.739 22.544 22.34 22.115 21.993 21.483 21.57 21.415 21.258 20.901 20.685 20.425 20.142 19.823 19.439 18.861 16.599 -8 ,4261 ,KEBNE ,16692494,Thu Nov 25 19:57:44 CET,Thu Nov 25 21:48:37 CET,0.0 1.33 1.732 2.051 2.307 2.527 2.73 2.909 3.223 3.368 3.507 3.353 3.884 4.006 4.236 4.453 4.663 4.761 4.953 5.161 5.47 5.655 5.835 6.116 6.376 6.619 6.856 7.067 7.336 7.594 7.841 8.141 8.425 8.702 9.05 9.471 9.879 10.327 10.81 11.34 11.923 12.583 13.369 14.119 14.946 15.871 16.934 18.18 19.648 21.449 23.598 25.161 26.021 26.485 26.76 26.908 26.939 26.938 26.905 26.824 26.73 26.628 26.506 26.368 26.231 26.076 25.886 25.722 25.565 25.388 25.21 25.068 24.92 24.738 24.579 24.435 24.305 24.155 23.982 23.854 23.71 23.47 23.295 23.102 23.001 22.818 22.638 22.41 22.281 21.76 21.818 21.646 21.489 21.15 20.915 20.647 20.349 19.958 19.477 18.834 15.495 -9 ,6346 ,KEBNE ,16692495,Thu Nov 25 19:58:44 CET,Thu Nov 25 21:54:02 CET,0.0 1.266 1.676 1.984 2.245 2.477 2.702 2.898 3.242 3.406 3.558 3.419 3.955 4.071 4.295 4.518 4.717 4.814 5.0 5.172 5.429 5.605 5.776 6.026 6.279 6.519 6.735 6.949 7.233 7.502 7.751 8.051 8.346 8.621 8.937 9.311 9.669 10.076 10.522 10.996 11.505 12.056 12.699 13.39 14.242 15.233 16.337 17.529 18.97 20.692 22.73 24.453 25.412 25.949 26.233 26.344 26.351 26.298 26.222 26.101 25.974 25.839 25.675 25.499 25.308 25.137 24.974 24.817 24.66 24.479 24.279 24.12 23.944 23.731 23.556 23.373 23.201 23.036 22.853 22.712 22.551 22.301 22.138 21.966 21.875 21.687 21.462 21.196 21.065 20.551 20.645 20.499 20.343 19.953 19.732 19.486 19.219 18.921 18.579 18.08 14.913 -10 ,3552 ,KEBNE ,16692496,Thu Nov 25 19:58:44 CET,Thu Nov 25 21:55:44 CET,0.0 1.589 1.996 2.308 2.572 2.8 3.006 3.194 3.534 3.685 3.824 3.669 4.193 4.305 4.514 4.711 4.902 4.997 5.194 5.388 5.652 5.818 5.982 6.232 6.475 6.705 6.926 7.143 7.409 7.656 7.913 8.221 8.51 8.795 9.121 9.475 9.827 10.228 10.657 11.125 11.618 12.169 12.832 13.542 14.407 15.362 16.47 17.724 19.124 20.761 22.775 24.296 25.125 25.563 25.772 25.935 25.996 25.971 25.915 25.792 25.63 25.453 25.265 25.094 24.942 24.79 24.612 24.451 24.312 24.143 23.963 23.818 23.648 23.474 23.34 23.195 23.041 22.861 22.652 22.502 22.364 22.133 21.933 21.728 21.628 21.424 21.213 20.976 20.855 20.334 20.405 20.24 20.062 19.669 19.44 19.204 18.946 18.637 18.251 17.643 15.22 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 6c610199..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8573 ,KEBNE ,16692497,Thu Nov 25 19:58:44 CET,Thu Nov 25 21:54:30 CET,0.0 1.468 1.901 2.218 2.487 2.733 2.958 3.15 3.494 3.66 3.812 3.689 4.228 4.355 4.587 4.809 5.028 5.136 5.347 5.539 5.803 5.976 6.145 6.387 6.62 6.84 7.056 7.276 7.554 7.811 8.076 8.406 8.712 9.0 9.32 9.664 9.995 10.374 10.803 11.269 11.745 12.254 12.847 13.456 14.153 14.907 15.812 16.836 17.965 19.139 20.263 20.979 21.258 21.185 20.981 20.815 20.66 20.453 20.211 19.923 19.655 19.414 19.163 18.899 18.626 18.38 18.15 17.957 17.773 17.556 17.318 17.118 16.905 16.687 16.512 16.318 16.105 15.88 15.641 15.482 15.319 15.058 14.886 14.697 14.597 14.397 14.192 13.956 13.824 13.295 13.409 13.262 13.099 12.713 12.492 12.24 11.971 11.658 11.256 10.737 8.669 -2 ,6839 ,KEBNE ,16692498,Thu Nov 25 19:58:44 CET,Thu Nov 25 21:54:18 CET,0.0 1.78 2.228 2.533 2.808 3.047 3.248 3.416 3.703 3.842 3.983 3.841 4.364 4.478 4.7 4.911 5.108 5.2 5.387 5.579 5.868 6.052 6.225 6.468 6.695 6.916 7.134 7.345 7.617 7.864 8.098 8.384 8.673 8.958 9.272 9.627 9.979 10.354 10.753 11.187 11.65 12.167 12.771 13.391 14.111 14.892 15.771 16.755 17.872 19.182 20.592 21.436 21.642 21.59 21.454 21.197 20.914 20.618 20.339 20.076 19.818 19.551 19.25 18.949 18.687 18.455 18.186 17.917 17.678 17.427 17.14 16.907 16.691 16.459 16.282 16.108 15.917 15.699 15.453 15.284 15.107 14.83 14.639 14.441 14.346 14.151 13.915 13.659 13.524 12.984 13.076 12.911 12.731 12.319 12.067 11.771 11.464 11.114 10.703 10.132 7.833 -4 ,20176 ,KEBNE ,16692500,Thu Nov 25 19:59:46 CET,Thu Nov 25 21:55:50 CET,0.0 1.211 1.592 1.866 2.111 2.346 2.57 2.771 3.127 3.285 3.44 3.348 3.915 4.06 4.333 4.588 4.833 4.953 5.164 5.355 5.637 5.807 5.966 6.204 6.43 6.649 6.865 7.077 7.35 7.624 7.883 8.168 8.447 8.725 9.06 9.425 9.769 10.13 10.511 10.943 11.4 11.95 12.597 13.211 13.927 14.734 15.675 16.702 17.868 19.244 20.725 21.632 22.002 22.066 21.976 21.705 21.341 20.944 20.572 20.184 19.828 19.522 19.246 18.994 18.75 18.496 18.227 17.974 17.733 17.505 17.268 17.06 16.829 16.594 16.417 16.229 16.034 15.825 15.608 15.446 15.276 15.013 14.806 14.6 14.494 14.272 14.059 13.823 13.69 13.148 13.261 13.104 12.938 12.563 12.329 12.06 11.779 11.444 10.991 10.341 7.643 -5 ,16810 ,KEBNE ,16692501,Thu Nov 25 20:00:50 CET,Thu Nov 25 21:56:39 CET,0.0 1.583 2.012 2.354 2.646 2.892 3.108 3.321 3.668 3.808 3.95 3.831 4.375 4.491 4.697 4.888 5.089 5.195 5.398 5.591 5.863 6.043 6.218 6.462 6.689 6.898 7.107 7.311 7.577 7.842 8.099 8.415 8.725 9.029 9.37 9.732 10.08 10.475 10.897 11.328 11.769 12.287 12.921 13.527 14.219 14.988 15.827 16.77 17.888 19.122 20.324 20.903 20.959 20.673 20.273 19.92 19.571 19.231 18.89 18.574 18.273 17.942 17.633 17.307 16.977 16.702 16.418 16.16 15.931 15.671 15.389 15.149 14.883 14.61 14.417 14.228 14.008 13.753 13.512 13.358 13.196 12.931 12.737 12.538 12.434 12.23 12.006 11.743 11.608 11.068 11.143 10.964 10.774 10.373 10.142 9.877 9.587 9.286 8.901 8.36 6.286 -6 ,29672 ,KEBNE ,16692502,Thu Nov 25 20:00:48 CET,Thu Nov 25 21:57:08 CET,0.0 1.559 1.993 2.281 2.517 2.735 2.933 3.102 3.415 3.557 3.69 3.555 4.083 4.197 4.406 4.599 4.777 4.867 5.046 5.216 5.462 5.624 5.783 6.01 6.218 6.408 6.599 6.794 7.035 7.281 7.532 7.822 8.106 8.388 8.696 9.023 9.346 9.719 10.118 10.53 10.995 11.525 12.113 12.71 13.398 14.168 15.034 15.983 16.971 17.923 18.931 19.4 19.457 19.403 19.211 18.924 18.638 18.333 18.049 17.797 17.565 17.274 16.946 16.638 16.355 16.088 15.818 15.57 15.335 15.084 14.821 14.587 14.333 14.084 13.887 13.677 13.467 13.235 12.986 12.816 12.645 12.387 12.198 11.985 11.877 11.673 11.456 11.208 11.072 10.535 10.641 10.479 10.302 9.894 9.666 9.404 9.115 8.805 8.434 7.889 5.868 -7 ,7307 ,KEBNE ,16692503,Thu Nov 25 20:01:53 CET,Thu Nov 25 21:59:12 CET,0.0 1.436 1.838 2.124 2.38 2.612 2.818 3.019 3.389 3.542 3.698 3.59 4.122 4.251 4.493 4.704 4.899 5.002 5.205 5.386 5.65 5.819 5.989 6.242 6.475 6.697 6.914 7.14 7.441 7.717 7.976 8.297 8.596 8.876 9.196 9.539 9.864 10.225 10.613 11.05 11.53 12.039 12.655 13.296 13.966 14.685 15.521 16.47 17.559 18.662 19.894 20.722 20.909 20.847 20.606 20.276 19.956 19.607 19.233 18.875 18.57 18.244 17.929 17.649 17.376 17.139 16.891 16.648 16.414 16.144 15.875 15.663 15.42 15.16 14.977 14.799 14.606 14.396 14.154 13.975 13.802 13.541 13.364 13.175 13.074 12.871 12.656 12.422 12.294 11.756 11.859 11.707 11.557 11.202 10.999 10.783 10.535 10.25 9.928 9.492 7.635 -8 ,9618 ,KEBNE ,16692504,Thu Nov 25 20:03:57 CET,Thu Nov 25 21:59:34 CET,0.0 2.038 2.48 2.777 3.01 3.226 3.418 3.587 3.893 4.039 4.182 4.045 4.584 4.71 4.928 5.142 5.355 5.459 5.667 5.852 6.102 6.273 6.445 6.688 6.912 7.136 7.353 7.569 7.841 8.088 8.345 8.651 8.943 9.245 9.59 9.959 10.307 10.686 11.102 11.57 12.073 12.631 13.258 13.871 14.587 15.4 16.372 17.429 18.574 19.856 21.241 22.145 22.503 22.516 22.358 22.131 21.895 21.665 21.397 21.071 20.759 20.461 20.194 19.941 19.684 19.416 19.106 18.802 18.543 18.292 18.04 17.832 17.6 17.361 17.178 16.985 16.781 16.558 16.317 16.142 15.971 15.724 15.534 15.331 15.224 14.995 14.75 14.487 14.353 13.823 13.945 13.789 13.633 13.287 13.085 12.874 12.63 12.302 11.911 11.43 8.726 -9 ,27373 ,KEBNE ,16692505,Thu Nov 25 20:03:57 CET,Thu Nov 25 21:59:22 CET,0.0 1.247 1.68 1.994 2.26 2.494 2.705 2.887 3.213 3.361 3.503 3.365 3.905 4.033 4.268 4.487 4.696 4.797 4.983 5.162 5.434 5.599 5.751 5.989 6.219 6.433 6.637 6.843 7.118 7.373 7.619 7.917 8.194 8.463 8.798 9.164 9.489 9.861 10.284 10.718 11.175 11.707 12.323 12.933 13.629 14.373 15.214 16.156 17.216 18.385 19.623 20.476 20.682 20.646 20.504 20.159 19.777 19.439 19.138 18.821 18.523 18.258 17.991 17.704 17.416 17.149 16.862 16.586 16.357 16.119 15.865 15.648 15.415 15.174 14.986 14.78 14.566 14.339 14.085 13.908 13.732 13.465 13.263 13.035 12.925 12.708 12.47 12.21 12.087 11.562 11.665 11.503 11.333 10.966 10.755 10.5 10.223 9.906 9.532 8.955 5.83 -10 ,12017 ,KEBNE ,16692506,Thu Nov 25 20:03:57 CET,Thu Nov 25 21:59:22 CET,0.0 1.331 1.755 2.063 2.312 2.549 2.762 2.939 3.249 3.403 3.566 3.462 4.025 4.164 4.413 4.639 4.862 4.971 5.168 5.352 5.605 5.762 5.915 6.161 6.404 6.626 6.841 7.055 7.326 7.58 7.828 8.13 8.43 8.712 9.042 9.41 9.747 10.134 10.554 11.002 11.489 12.04 12.664 13.264 13.932 14.665 15.53 16.518 17.626 18.818 20.029 20.838 21.069 20.988 20.813 20.539 20.227 19.895 19.586 19.266 18.965 18.689 18.376 18.068 17.781 17.519 17.264 16.996 16.754 16.52 16.277 16.075 15.853 15.604 15.414 15.223 15.023 14.817 14.603 14.444 14.277 14.021 13.846 13.664 13.568 13.366 13.139 12.885 12.753 12.23 12.346 12.172 11.987 11.588 11.357 11.109 10.844 10.54 10.132 9.537 6.753 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 5364740a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6289 ,KEBNE ,16692507,Thu Nov 25 20:03:57 CET,Thu Nov 25 21:57:51 CET,0.0 1.423 1.846 2.15 2.418 2.638 2.814 2.974 3.263 3.391 3.517 3.37 3.858 3.959 4.151 4.324 4.49 4.576 4.74 4.89 5.091 5.221 5.351 5.532 5.71 5.88 6.047 6.215 6.426 6.626 6.838 7.082 7.294 7.491 7.712 7.966 8.227 8.51 8.769 9.023 9.293 9.589 9.929 10.265 10.658 11.084 11.478 11.839 12.18 12.35 12.194 11.621 10.915 10.182 9.446 8.691 7.984 7.325 6.757 6.191 5.7 5.259 4.814 4.399 4.032 3.699 3.357 3.048 2.755 2.451 2.141 1.859 1.563 1.27 1.055 0.837 0.599 0.349 0.088 -0.094 -0.286 -0.581 -0.787 -1.021 -1.143 -1.378 -1.651 -1.959 -2.103 -2.627 -2.559 -2.76 -2.98 -3.446 -3.691 -3.985 -4.357 -4.779 -5.25 -5.886 -8.164 -2 ,15733 ,KEBNE ,16692508,Thu Nov 25 20:03:57 CET,Thu Nov 25 21:58:06 CET,0.0 1.484 1.893 2.176 2.411 2.608 2.787 2.944 3.242 3.379 3.504 3.33 3.812 3.903 4.083 4.255 4.405 4.479 4.626 4.768 4.968 5.091 5.21 5.382 5.553 5.723 5.884 6.031 6.221 6.412 6.596 6.798 6.975 7.157 7.381 7.61 7.821 8.046 8.283 8.55 8.807 9.049 9.323 9.603 9.918 10.258 10.597 10.849 10.988 10.987 10.616 9.683 8.661 7.69 6.824 6.028 5.329 4.697 4.159 3.568 3.006 2.498 2.041 1.625 1.236 0.884 0.514 0.164 -0.148 -0.45 -0.749 -1.006 -1.276 -1.574 -1.799 -2.022 -2.27 -2.543 -2.815 -3.003 -3.208 -3.507 -3.709 -3.933 -4.053 -4.302 -4.573 -4.88 -5.044 -5.582 -5.525 -5.686 -5.862 -6.303 -6.563 -6.85 -7.171 -7.547 -8.024 -8.623 -10.552 -3 ,7382 ,KEBNE ,16692509,Thu Nov 25 20:04:59 CET,Thu Nov 25 21:59:53 CET,0.0 1.242 1.641 1.936 2.197 2.425 2.618 2.778 3.04 3.165 3.29 3.133 3.626 3.721 3.915 4.093 4.258 4.349 4.527 4.681 4.888 5.013 5.125 5.299 5.474 5.636 5.788 5.946 6.155 6.338 6.501 6.698 6.892 7.075 7.269 7.474 7.684 7.915 8.167 8.447 8.711 8.969 9.283 9.592 9.921 10.245 10.59 10.962 11.26 11.42 11.241 10.571 9.742 8.919 8.141 7.419 6.824 6.263 5.712 5.133 4.644 4.187 3.749 3.362 2.977 2.605 2.229 1.906 1.623 1.311 1.006 0.75 0.465 0.164 -0.08 -0.331 -0.587 -0.857 -1.146 -1.341 -1.527 -1.828 -2.057 -2.303 -2.426 -2.673 -2.935 -3.215 -3.36 -3.886 -3.787 -3.94 -4.113 -4.509 -4.741 -4.999 -5.27 -5.604 -6.042 -6.628 -9.032 -4 ,5580 ,KEBNE ,16692510,Thu Nov 25 20:04:59 CET,Thu Nov 25 21:59:27 CET,0.0 2.276 2.686 2.979 3.22 3.437 3.637 3.808 4.091 4.221 4.356 4.216 4.73 4.843 5.051 5.247 5.426 5.509 5.673 5.824 6.04 6.177 6.305 6.489 6.655 6.818 6.977 7.13 7.326 7.515 7.691 7.903 8.107 8.284 8.501 8.743 8.952 9.188 9.461 9.729 9.996 10.294 10.611 10.895 11.238 11.606 11.951 12.293 12.589 12.846 12.784 12.053 11.16 10.194 9.384 8.707 8.091 7.481 6.876 6.279 5.755 5.274 4.851 4.459 4.082 3.749 3.395 3.06 2.763 2.464 2.161 1.901 1.629 1.354 1.132 0.891 0.663 0.435 0.184 0.012 -0.161 -0.446 -0.64 -0.833 -0.942 -1.188 -1.441 -1.697 -1.842 -2.388 -2.327 -2.485 -2.666 -3.089 -3.309 -3.548 -3.831 -4.223 -4.727 -5.374 -7.897 -5 ,9268 ,KEBNE ,16692511,Thu Nov 25 20:04:59 CET,Thu Nov 25 21:57:46 CET,0.0 1.873 2.238 2.508 2.744 2.959 3.136 3.284 3.558 3.682 3.803 3.628 4.104 4.203 4.393 4.554 4.71 4.786 4.924 5.067 5.265 5.388 5.505 5.676 5.842 5.993 6.142 6.281 6.453 6.61 6.763 6.948 7.134 7.322 7.527 7.74 7.957 8.207 8.477 8.765 9.049 9.337 9.616 9.879 10.22 10.63 11.046 11.397 11.644 11.654 11.28 10.51 9.687 8.854 8.023 7.228 6.498 5.818 5.26 4.676 4.14 3.689 3.277 2.864 2.473 2.099 1.677 1.303 1.005 0.705 0.387 0.127 -0.17 -0.499 -0.744 -0.986 -1.236 -1.499 -1.769 -1.965 -2.182 -2.522 -2.764 -3.013 -3.136 -3.41 -3.687 -3.95 -4.088 -4.618 -4.532 -4.691 -4.86 -5.285 -5.538 -5.819 -6.128 -6.462 -6.909 -7.532 -9.974 -6 ,5093 ,KEBNE ,16692512,Thu Nov 25 20:04:59 CET,Thu Nov 25 21:59:26 CET,0.0 1.675 2.099 2.383 2.609 2.795 2.974 3.131 3.397 3.515 3.633 3.468 3.949 4.059 4.269 4.445 4.616 4.689 4.829 4.972 5.175 5.302 5.423 5.609 5.775 5.923 6.07 6.206 6.379 6.556 6.728 6.932 7.115 7.285 7.486 7.702 7.911 8.158 8.433 8.693 8.922 9.175 9.478 9.76 10.076 10.404 10.703 10.956 11.157 11.192 10.857 10.001 9.035 8.154 7.369 6.584 5.86 5.229 4.64 4.027 3.518 3.055 2.604 2.179 1.789 1.445 1.068 0.717 0.425 0.123 -0.191 -0.457 -0.746 -1.039 -1.26 -1.494 -1.752 -2.049 -2.355 -2.551 -2.748 -3.065 -3.292 -3.535 -3.659 -3.916 -4.192 -4.472 -4.62 -5.155 -5.091 -5.26 -5.434 -5.807 -6.018 -6.258 -6.522 -6.832 -7.206 -7.681 -9.804 -7 ,9821 ,KEBNE ,16692513,Thu Nov 25 20:06:01 CET,Thu Nov 25 21:59:16 CET,0.0 1.541 1.919 2.173 2.396 2.609 2.802 2.963 3.241 3.373 3.496 3.323 3.811 3.923 4.153 4.344 4.515 4.599 4.759 4.913 5.133 5.274 5.406 5.599 5.785 5.962 6.134 6.293 6.489 6.681 6.871 7.093 7.298 7.477 7.68 7.912 8.13 8.387 8.659 8.941 9.24 9.554 9.892 10.179 10.442 10.753 11.148 11.527 11.833 11.995 11.701 10.857 9.932 8.998 8.167 7.395 6.709 6.106 5.525 4.913 4.384 3.914 3.463 3.012 2.604 2.226 1.838 1.517 1.226 0.904 0.577 0.294 -0.013 -0.326 -0.571 -0.802 -1.036 -1.292 -1.572 -1.775 -1.986 -2.332 -2.557 -2.771 -2.884 -3.137 -3.429 -3.729 -3.884 -4.436 -4.388 -4.563 -4.752 -5.19 -5.432 -5.699 -5.999 -6.346 -6.794 -7.45 -9.773 -8 ,31175 ,KEBNE ,16692514,Thu Nov 25 20:06:02 CET,Thu Nov 25 22:00:59 CET,0.0 1.456 1.875 2.154 2.386 2.603 2.782 2.944 3.233 3.353 3.474 3.33 3.82 3.918 4.095 4.263 4.429 4.505 4.643 4.776 4.97 5.091 5.214 5.406 5.584 5.74 5.885 6.032 6.228 6.398 6.546 6.733 6.929 7.121 7.333 7.564 7.778 8.006 8.24 8.476 8.742 9.032 9.344 9.625 9.92 10.219 10.531 10.861 11.167 11.289 10.918 10.053 9.15 8.265 7.451 6.68 5.982 5.364 4.829 4.27 3.764 3.297 2.853 2.474 2.143 1.796 1.419 1.1 0.809 0.499 0.176 -0.097 -0.365 -0.613 -0.82 -1.056 -1.299 -1.549 -1.811 -2.006 -2.198 -2.473 -2.68 -2.916 -3.042 -3.313 -3.605 -3.923 -4.092 -4.64 -4.601 -4.793 -4.999 -5.423 -5.683 -5.97 -6.265 -6.614 -7.015 -7.537 -9.384 -9 ,7828 ,KEBNE ,16692515,Thu Nov 25 20:06:01 CET,Thu Nov 25 22:00:55 CET,0.0 1.652 2.058 2.35 2.6 2.821 3.023 3.181 3.442 3.56 3.674 3.506 3.996 4.094 4.283 4.46 4.624 4.702 4.868 5.026 5.233 5.366 5.485 5.662 5.833 5.991 6.146 6.3 6.499 6.685 6.866 7.074 7.263 7.448 7.656 7.885 8.097 8.327 8.587 8.873 9.17 9.496 9.865 10.228 10.64 11.037 11.38 11.64 11.741 11.55 10.931 10.019 9.198 8.395 7.643 6.981 6.363 5.743 5.162 4.533 3.994 3.565 3.176 2.745 2.307 1.9 1.48 1.109 0.793 0.474 0.12 -0.173 -0.458 -0.763 -0.991 -1.206 -1.452 -1.721 -2.007 -2.207 -2.416 -2.788 -3.066 -3.354 -3.494 -3.765 -4.03 -4.307 -4.457 -4.996 -4.966 -5.144 -5.332 -5.786 -6.048 -6.321 -6.602 -6.975 -7.463 -8.12 -10.813 -10 ,23716 ,KEBNE ,16692516,Thu Nov 25 20:07:04 CET,Thu Nov 25 22:00:24 CET,0.0 1.327 1.684 1.957 2.203 2.399 2.565 2.713 2.975 3.095 3.207 3.032 3.523 3.628 3.821 3.991 4.139 4.208 4.355 4.501 4.716 4.853 4.977 5.163 5.343 5.505 5.651 5.797 6.002 6.188 6.355 6.567 6.762 6.94 7.139 7.36 7.593 7.843 8.086 8.346 8.623 8.917 9.244 9.566 9.916 10.274 10.631 10.995 11.317 11.459 11.227 10.535 9.716 8.877 8.128 7.391 6.662 5.994 5.449 4.903 4.428 4.017 3.62 3.221 2.833 2.479 2.115 1.774 1.472 1.165 0.856 0.589 0.315 0.033 -0.199 -0.446 -0.707 -0.981 -1.261 -1.441 -1.625 -1.914 -2.129 -2.386 -2.518 -2.764 -3.019 -3.298 -3.445 -3.982 -3.943 -4.14 -4.333 -4.746 -4.999 -5.275 -5.58 -5.932 -6.345 -6.919 -8.748 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 0d6ddaf6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27010 ,KEBNE ,16692517,Thu Nov 25 20:07:04 CET,Thu Nov 25 22:01:53 CET,0.0 1.42 1.841 2.127 2.347 2.555 2.757 2.932 3.234 3.37 3.505 3.383 3.888 3.998 4.204 4.391 4.54 4.603 4.747 4.897 5.097 5.216 5.344 5.541 5.716 5.877 6.019 6.144 6.307 6.451 6.586 6.752 6.905 7.053 7.223 7.41 7.571 7.722 7.878 8.052 8.215 8.379 8.581 8.774 8.932 9.013 9.032 8.947 8.618 7.932 6.528 4.61 2.972 1.629 0.471 -0.627 -1.572 -2.429 -3.163 -3.876 -4.458 -4.966 -5.471 -5.951 -6.397 -6.819 -7.305 -7.75 -8.101 -8.445 -8.827 -9.141 -9.442 -9.757 -10.002 -10.263 -10.526 -10.793 -11.066 -11.258 -11.463 -11.777 -11.997 -12.22 -12.337 -12.587 -12.849 -13.124 -13.267 -13.799 -13.687 -13.846 -14.016 -14.389 -14.585 -14.811 -15.087 -15.383 -15.735 -16.204 -17.904 -2 ,30168 ,KEBNE ,16692518,Thu Nov 25 20:07:04 CET,Thu Nov 25 22:03:09 CET,0.0 1.632 2.049 2.37 2.643 2.848 3.02 3.177 3.448 3.57 3.682 3.506 3.993 4.096 4.297 4.483 4.668 4.757 4.912 5.064 5.271 5.404 5.536 5.732 5.902 6.041 6.191 6.335 6.496 6.636 6.773 6.929 7.061 7.199 7.374 7.555 7.716 7.927 8.183 8.405 8.566 8.722 8.902 9.07 9.221 9.325 9.361 9.3 9.118 8.566 7.341 5.622 3.959 2.537 1.349 0.287 -0.675 -1.525 -2.22 -2.931 -3.556 -4.128 -4.653 -5.137 -5.596 -6.013 -6.475 -6.906 -7.245 -7.567 -7.89 -8.145 -8.422 -8.73 -8.989 -9.275 -9.588 -9.912 -10.244 -10.478 -10.689 -10.982 -11.19 -11.404 -11.519 -11.761 -11.999 -12.277 -12.421 -12.967 -12.887 -13.058 -13.246 -13.642 -13.852 -14.095 -14.367 -14.663 -14.999 -15.449 -16.919 -3 ,22392 ,KEBNE ,16692519,Thu Nov 25 20:07:04 CET,Thu Nov 25 22:02:55 CET,0.0 1.545 1.937 2.24 2.495 2.714 2.896 3.051 3.332 3.459 3.571 3.393 3.889 3.994 4.198 4.394 4.578 4.668 4.84 4.998 5.223 5.359 5.473 5.638 5.804 5.959 6.096 6.229 6.414 6.584 6.732 6.909 7.072 7.216 7.375 7.562 7.726 7.888 8.082 8.282 8.45 8.579 8.697 8.806 8.96 9.125 9.174 9.104 8.826 8.128 6.759 4.925 3.4 2.111 0.985 -0.026 -0.909 -1.696 -2.395 -3.117 -3.72 -4.257 -4.787 -5.289 -5.761 -6.194 -6.637 -7.02 -7.376 -7.761 -8.143 -8.454 -8.792 -9.143 -9.408 -9.683 -9.963 -10.257 -10.565 -10.773 -10.978 -11.287 -11.494 -11.712 -11.828 -12.057 -12.297 -12.554 -12.701 -13.259 -13.205 -13.391 -13.58 -13.965 -14.178 -14.42 -14.673 -14.973 -15.396 -15.961 -18.004 -4 ,12747 ,KEBNE ,16692520,Thu Nov 25 20:07:04 CET,Thu Nov 25 22:02:38 CET,0.0 1.573 1.96 2.264 2.515 2.729 2.931 3.126 3.48 3.638 3.782 3.631 4.131 4.238 4.442 4.631 4.795 4.875 5.032 5.184 5.392 5.526 5.651 5.82 5.989 6.156 6.311 6.444 6.614 6.777 6.924 7.102 7.267 7.423 7.613 7.825 8.004 8.197 8.443 8.712 8.928 9.116 9.302 9.453 9.613 9.81 9.933 9.812 9.476 8.921 7.762 6.01 4.422 3.028 1.827 0.768 -0.134 -0.935 -1.615 -2.316 -2.977 -3.581 -4.134 -4.635 -5.11 -5.587 -6.07 -6.474 -6.825 -7.174 -7.542 -7.85 -8.17 -8.499 -8.743 -8.989 -9.232 -9.484 -9.756 -9.941 -10.12 -10.388 -10.584 -10.795 -10.904 -11.14 -11.402 -11.679 -11.827 -12.389 -12.32 -12.484 -12.651 -13.026 -13.242 -13.471 -13.735 -14.033 -14.387 -14.839 -16.511 -5 ,19102 ,KEBNE ,16692521,Thu Nov 25 20:08:08 CET,Thu Nov 25 22:05:04 CET,0.0 1.684 2.151 2.497 2.772 3.019 3.246 3.443 3.765 3.91 4.042 3.885 4.389 4.497 4.719 4.938 5.122 5.209 5.372 5.527 5.749 5.882 6.007 6.196 6.385 6.569 6.731 6.882 7.096 7.293 7.477 7.704 7.913 8.088 8.269 8.46 8.638 8.834 9.034 9.212 9.397 9.66 9.947 10.156 10.342 10.507 10.636 10.665 10.421 9.737 8.446 6.633 4.963 3.585 2.411 1.347 0.468 -0.316 -1.054 -1.83 -2.501 -3.109 -3.685 -4.178 -4.622 -5.059 -5.513 -5.905 -6.241 -6.585 -6.932 -7.221 -7.532 -7.849 -8.104 -8.382 -8.652 -8.922 -9.193 -9.372 -9.556 -9.839 -10.044 -10.26 -10.375 -10.613 -10.846 -11.117 -11.266 -11.815 -11.748 -11.919 -12.091 -12.482 -12.704 -12.938 -13.199 -13.521 -13.912 -14.401 -16.202 -7 ,24675 ,KEBNE ,16692523,Thu Nov 25 20:09:11 CET,Thu Nov 25 22:07:00 CET,0.0 1.651 2.06 2.332 2.538 2.725 2.898 3.057 3.369 3.508 3.635 3.501 4.003 4.109 4.307 4.483 4.641 4.721 4.89 5.047 5.242 5.368 5.492 5.661 5.813 5.95 6.1 6.249 6.415 6.562 6.706 6.883 7.055 7.219 7.39 7.548 7.696 7.867 8.039 8.228 8.422 8.634 8.813 8.928 9.059 9.165 9.191 9.038 8.746 8.324 7.243 5.629 4.276 3.061 1.956 0.981 0.131 -0.651 -1.312 -1.963 -2.532 -3.065 -3.573 -4.031 -4.48 -4.891 -5.291 -5.644 -5.943 -6.262 -6.633 -6.965 -7.306 -7.656 -7.92 -8.194 -8.471 -8.743 -9.031 -9.223 -9.41 -9.704 -9.902 -10.105 -10.219 -10.459 -10.711 -10.979 -11.122 -11.674 -11.582 -11.734 -11.895 -12.253 -12.47 -12.711 -12.974 -13.255 -13.561 -14.034 -15.523 -8 ,1255 ,KEBNE ,16692524,Thu Nov 25 20:13:20 CET,Thu Nov 25 22:05:20 CET,0.0 1.559 1.93 2.215 2.474 2.697 2.86 2.997 3.272 3.407 3.535 3.379 3.864 3.962 4.153 4.351 4.541 4.633 4.793 4.943 5.16 5.291 5.42 5.582 5.741 5.913 6.06 6.181 6.337 6.493 6.634 6.791 6.93 7.052 7.193 7.376 7.543 7.705 7.887 8.061 8.237 8.387 8.485 8.574 8.706 8.801 8.756 8.548 8.17 7.611 6.491 4.761 3.223 1.911 0.761 -0.321 -1.28 -2.137 -2.888 -3.611 -4.23 -4.788 -5.305 -5.808 -6.274 -6.692 -7.101 -7.443 -7.738 -8.044 -8.35 -8.619 -8.92 -9.217 -9.447 -9.683 -9.921 -10.166 -10.43 -10.616 -10.796 -11.061 -11.25 -11.456 -11.566 -11.79 -12.01 -12.266 -12.41 -12.951 -12.876 -13.056 -13.236 -13.582 -13.773 -14.004 -14.269 -14.564 -14.904 -15.356 -17.059 -9 ,23160 ,KEBNE ,16692525,Thu Nov 25 20:15:25 CET,Thu Nov 25 22:07:41 CET,0.0 1.776 2.158 2.429 2.65 2.848 3.017 3.169 3.426 3.545 3.67 3.521 4.017 4.121 4.322 4.509 4.67 4.746 4.9 5.04 5.226 5.336 5.439 5.588 5.724 5.854 5.987 6.132 6.318 6.485 6.641 6.821 7.001 7.178 7.354 7.536 7.741 7.978 8.211 8.433 8.652 8.862 9.084 9.297 9.461 9.526 9.572 9.547 9.333 8.802 7.548 5.756 4.151 2.725 1.511 0.45 -0.49 -1.361 -2.095 -2.803 -3.45 -4.008 -4.492 -4.949 -5.394 -5.813 -6.265 -6.668 -6.992 -7.324 -7.676 -7.966 -8.26 -8.562 -8.807 -9.076 -9.352 -9.645 -9.96 -10.164 -10.376 -10.695 -10.913 -11.147 -11.269 -11.505 -11.75 -12.014 -12.156 -12.706 -12.634 -12.813 -12.993 -13.385 -13.611 -13.846 -14.103 -14.412 -14.75 -15.159 -16.626 -10 ,16232 ,KEBNE ,16692526,Thu Nov 25 20:17:32 CET,Thu Nov 25 22:05:10 CET,0.0 1.606 1.975 2.244 2.459 2.647 2.82 2.978 3.265 3.392 3.51 3.363 3.856 3.951 4.135 4.312 4.473 4.556 4.718 4.857 5.046 5.174 5.297 5.464 5.619 5.76 5.9 6.043 6.218 6.391 6.573 6.78 6.955 7.119 7.326 7.523 7.695 7.867 8.031 8.22 8.409 8.596 8.787 8.935 9.077 9.152 9.1 8.978 8.705 8.057 6.656 4.782 3.195 1.827 0.639 -0.456 -1.422 -2.222 -2.876 -3.569 -4.18 -4.716 -5.215 -5.707 -6.178 -6.57 -6.954 -7.341 -7.721 -8.106 -8.499 -8.822 -9.134 -9.455 -9.708 -9.971 -10.261 -10.548 -10.827 -11.033 -11.248 -11.57 -11.804 -12.045 -12.167 -12.423 -12.705 -13.004 -13.143 -13.688 -13.608 -13.768 -13.936 -14.315 -14.525 -14.762 -15.024 -15.307 -15.658 -16.139 -17.983 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 0daca202..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,32438 ,KEBNE ,16692528,Thu Nov 25 20:24:54 CET,Thu Nov 25 22:14:03 CET,0.0 1.35 1.765 2.058 2.294 2.489 2.677 2.847 3.16 3.318 3.452 3.296 3.808 3.916 4.128 4.329 4.521 4.612 4.782 4.948 5.19 5.342 5.493 5.712 5.913 6.116 6.311 6.497 6.733 6.956 7.167 7.418 7.664 7.901 8.176 8.494 8.794 9.122 9.492 9.886 10.267 10.671 11.18 11.712 12.318 12.993 13.782 14.652 15.675 16.847 18.121 19.071 19.539 19.735 19.762 19.689 19.585 19.488 19.387 19.251 19.106 18.948 18.798 18.661 18.511 18.355 18.184 18.044 17.912 17.759 17.603 17.467 17.333 17.186 17.058 16.93 16.796 16.664 16.537 16.443 16.331 16.161 16.051 15.929 15.86 15.693 15.529 15.361 15.266 14.789 14.959 14.85 14.73 14.433 14.281 14.128 13.953 13.76 13.528 13.183 11.724 -3 ,24429 ,KEBNE ,16692529,Thu Nov 25 20:24:54 CET,Thu Nov 25 22:16:30 CET,0.0 1.13 1.513 1.811 2.068 2.274 2.442 2.603 2.905 3.045 3.176 3.028 3.529 3.637 3.843 4.023 4.198 4.285 4.45 4.603 4.828 4.978 5.12 5.337 5.547 5.745 5.942 6.14 6.385 6.608 6.834 7.133 7.414 7.666 7.955 8.274 8.573 8.907 9.275 9.671 10.083 10.524 11.029 11.533 12.122 12.807 13.592 14.416 15.364 16.45 17.763 18.69 19.062 19.236 19.243 19.113 18.977 18.838 18.685 18.51 18.34 18.192 18.038 17.884 17.736 17.588 17.418 17.25 17.105 16.961 16.815 16.69 16.55 16.401 16.293 16.179 16.044 15.903 15.756 15.65 15.54 15.377 15.254 15.116 15.05 14.896 14.732 14.564 14.472 13.995 14.182 14.076 13.961 13.696 13.552 13.382 13.182 12.952 12.643 12.248 10.422 -4 ,2587 ,KEBNE ,16692530,Thu Nov 25 20:25:53 CET,Thu Nov 25 22:18:08 CET,0.0 1.593 2.002 2.296 2.528 2.743 2.94 3.103 3.394 3.526 3.663 3.538 4.053 4.162 4.371 4.565 4.761 4.856 5.035 5.214 5.463 5.614 5.76 5.96 6.145 6.321 6.498 6.673 6.897 7.119 7.336 7.591 7.834 8.069 8.334 8.626 8.927 9.281 9.643 10.007 10.395 10.845 11.371 11.893 12.499 13.176 13.963 14.824 15.808 16.932 18.146 18.93 19.283 19.439 19.478 19.42 19.32 19.202 19.067 18.909 18.766 18.62 18.46 18.302 18.15 18.02 17.879 17.733 17.613 17.498 17.364 17.225 17.066 16.909 16.796 16.668 16.531 16.399 16.255 16.156 16.047 15.867 15.746 15.621 15.557 15.414 15.257 15.088 14.995 14.512 14.696 14.6 14.483 14.207 14.066 13.905 13.717 13.501 13.21 12.785 11.165 -5 ,28932 ,KEBNE ,16692531,Thu Nov 25 20:25:53 CET,Thu Nov 25 22:18:17 CET,0.0 1.379 1.756 2.05 2.3 2.505 2.697 2.882 3.197 3.339 3.479 3.324 3.84 3.96 4.175 4.364 4.546 4.639 4.822 4.986 5.214 5.364 5.506 5.71 5.905 6.088 6.271 6.454 6.68 6.897 7.116 7.398 7.666 7.909 8.193 8.511 8.807 9.127 9.488 9.87 10.257 10.699 11.22 11.72 12.304 12.949 13.675 14.508 15.478 16.617 17.902 18.754 19.086 19.203 19.228 19.179 19.101 18.986 18.852 18.717 18.599 18.49 18.371 18.244 18.093 17.946 17.805 17.672 17.558 17.425 17.274 17.149 17.013 16.872 16.76 16.639 16.509 16.375 16.245 16.155 16.054 15.879 15.75 15.623 15.551 15.384 15.202 14.995 14.893 14.412 14.583 14.471 14.355 14.104 13.961 13.791 13.587 13.358 13.09 12.679 11.437 -6 ,557 ,KEBNE ,16692532,Thu Nov 25 20:25:54 CET,Thu Nov 25 22:21:21 CET,0.0 1.69 2.131 2.444 2.678 2.893 3.078 3.257 3.587 3.727 3.862 3.722 4.227 4.337 4.54 4.731 4.924 5.019 5.199 5.371 5.603 5.747 5.901 6.124 6.321 6.519 6.706 6.886 7.113 7.33 7.549 7.806 8.057 8.303 8.58 8.88 9.164 9.494 9.851 10.227 10.634 11.087 11.604 12.116 12.722 13.41 14.195 15.042 15.953 16.988 18.168 18.908 19.206 19.387 19.434 19.371 19.285 19.159 19.02 18.841 18.673 18.529 18.378 18.218 18.061 17.912 17.755 17.62 17.496 17.36 17.208 17.067 16.916 16.768 16.66 16.54 16.406 16.264 16.113 16.01 15.903 15.732 15.613 15.482 15.414 15.277 15.13 14.971 14.89 14.42 14.612 14.507 14.391 14.114 13.963 13.781 13.569 13.346 13.096 12.782 11.217 -7 ,10481 ,KEBNE ,16692533,Thu Nov 25 20:26:55 CET,Thu Nov 25 22:19:39 CET,0.0 1.382 1.801 2.133 2.41 2.634 2.838 3.033 3.394 3.553 3.693 3.558 4.084 4.207 4.432 4.644 4.85 4.947 5.135 5.308 5.552 5.712 5.857 6.076 6.28 6.476 6.673 6.859 7.112 7.354 7.576 7.847 8.119 8.392 8.707 9.058 9.388 9.733 10.113 10.509 10.929 11.398 11.952 12.527 13.195 13.936 14.78 15.773 16.894 18.085 19.391 20.377 20.851 21.03 21.061 21.03 20.946 20.831 20.69 20.493 20.311 20.136 19.927 19.711 19.531 19.367 19.194 19.055 18.929 18.779 18.614 18.47 18.325 18.178 18.058 17.931 17.795 17.65 17.499 17.389 17.28 17.095 16.961 16.838 16.774 16.638 16.498 16.332 16.241 15.761 15.914 15.786 15.668 15.408 15.247 15.077 14.891 14.671 14.386 13.959 12.142 -8 ,29858 ,KEBNE ,16692534,Thu Nov 25 20:26:57 CET,Thu Nov 25 22:11:43 CET,0.0 1.035 1.431 1.752 2.012 2.223 2.414 2.585 2.904 3.052 3.198 3.07 3.591 3.694 3.894 4.104 4.301 4.399 4.6 4.777 5.009 5.159 5.322 5.563 5.775 5.977 6.172 6.358 6.595 6.819 7.052 7.346 7.624 7.877 8.158 8.478 8.787 9.113 9.468 9.853 10.251 10.719 11.283 11.827 12.466 13.142 13.861 14.694 15.638 16.702 17.884 18.754 19.173 19.316 19.304 19.192 19.036 18.885 18.749 18.556 18.354 18.183 18.026 17.857 17.687 17.528 17.362 17.218 17.079 16.912 16.75 16.628 16.481 16.322 16.191 16.05 15.905 15.758 15.623 15.528 15.421 15.238 15.118 14.996 14.927 14.773 14.61 14.438 14.344 13.87 14.069 13.963 13.843 13.573 13.421 13.257 13.074 12.87 12.598 12.224 10.58 -9 ,22020 ,KEBNE ,16692535,Thu Nov 25 20:29:00 CET,Thu Nov 25 22:21:23 CET,0.0 1.551 1.979 2.321 2.577 2.788 2.986 3.162 3.472 3.606 3.734 3.59 4.089 4.195 4.393 4.568 4.744 4.832 5.009 5.179 5.416 5.58 5.731 5.924 6.114 6.3 6.482 6.659 6.885 7.108 7.32 7.581 7.838 8.088 8.373 8.681 8.973 9.278 9.585 9.939 10.342 10.786 11.29 11.786 12.362 12.988 13.704 14.524 15.482 16.587 17.767 18.543 18.911 19.096 19.177 19.122 19.008 18.879 18.736 18.594 18.466 18.325 18.173 18.025 17.876 17.728 17.563 17.413 17.281 17.142 17.0 16.87 16.72 16.559 16.425 16.291 16.15 16.004 15.851 15.744 15.638 15.448 15.314 15.184 15.12 14.993 14.85 14.685 14.596 14.127 14.317 14.205 14.078 13.809 13.667 13.506 13.329 13.126 12.866 12.463 10.462 -10 ,6133 ,KEBNE ,16692536,Thu Nov 25 20:29:04 CET,Thu Nov 25 22:18:39 CET,0.0 1.432 1.852 2.159 2.417 2.651 2.845 3.016 3.337 3.488 3.623 3.492 4.021 4.14 4.364 4.568 4.765 4.859 5.036 5.213 5.484 5.652 5.802 6.015 6.225 6.43 6.614 6.793 7.024 7.247 7.469 7.733 7.987 8.245 8.543 8.863 9.162 9.498 9.868 10.273 10.713 11.217 11.78 12.307 12.917 13.615 14.416 15.315 16.363 17.516 18.724 19.556 19.932 20.054 19.989 19.827 19.666 19.501 19.323 19.123 18.959 18.837 18.71 18.549 18.376 18.214 18.034 17.87 17.735 17.591 17.427 17.277 17.126 16.97 16.847 16.731 16.602 16.439 16.256 16.124 15.991 15.809 15.686 15.552 15.479 15.318 15.14 14.941 14.841 14.351 14.488 14.359 14.236 13.967 13.81 13.648 13.459 13.213 12.939 12.579 11.169 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt deleted file mode 100644 index 506aa84f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15063 ,KEBNE ,16748395,Mon Nov 29 17:34:56 CET,Mon Nov 29 19:29:54 CET,0.0 2.232 2.854 3.369 3.822 4.249 4.641 5.008 5.707 6.04 6.366 6.437 7.27 7.557 8.123 8.674 9.203 9.469 10.005 10.527 11.281 11.768 12.257 12.983 13.708 14.429 15.129 15.82 16.743 17.647 18.517 19.606 20.714 21.808 23.102 24.592 26.036 27.648 29.432 31.371 33.504 36.0 39.034 42.2 46.097 50.716 56.295 62.953 71.331 82.122 96.912 111.008 120.5 127.338 132.421 136.459 139.592 142.179 144.248 146.144 147.634 148.867 149.966 150.919 151.746 152.44 153.104 153.662 154.103 154.51 154.897 155.175 155.439 155.687 155.821 155.936 156.019 156.006 155.937 155.919 155.88 155.752 155.702 155.675 155.657 155.613 155.534 155.454 155.405 154.969 155.181 155.086 154.982 154.709 154.531 154.295 153.996 153.642 153.135 152.108 145.478 -4 ,9495 ,KEBNE ,16748398,Mon Nov 29 17:34:56 CET,Mon Nov 29 19:28:13 CET,0.0 1.89 2.519 3.029 3.491 3.923 4.324 4.695 5.404 5.736 6.06 6.143 6.983 7.275 7.848 8.408 8.952 9.221 9.75 10.27 11.039 11.549 12.056 12.804 13.522 14.205 14.891 15.573 16.479 17.401 18.322 19.457 20.571 21.67 22.946 24.392 25.806 27.396 29.2 31.147 33.252 35.733 38.717 41.851 45.695 50.191 55.648 62.198 70.443 81.084 95.699 109.807 119.315 126.22 131.392 135.498 138.706 141.24 143.244 145.136 146.61 147.8 148.836 149.747 150.555 151.254 151.943 152.503 152.947 153.359 153.73 154.018 154.289 154.539 154.711 154.863 155.01 155.142 155.255 155.32 155.378 155.448 155.448 155.432 155.432 155.409 155.363 155.3 155.258 154.841 155.034 154.91 154.773 154.434 154.208 153.937 153.589 153.101 152.402 151.19 145.472 -5 ,26158 ,KEBNE ,16748399,Mon Nov 29 17:34:58 CET,Mon Nov 29 19:31:54 CET,0.0 2.143 2.77 3.257 3.684 4.091 4.469 4.834 5.552 5.891 6.216 6.289 7.122 7.417 7.993 8.552 9.102 9.379 9.934 10.472 11.259 11.772 12.257 12.962 13.688 14.414 15.119 15.814 16.733 17.623 18.508 19.602 20.664 21.713 22.953 24.376 25.779 27.378 29.176 31.16 33.296 35.763 38.75 41.871 45.707 50.227 55.669 62.204 70.544 81.361 96.19 110.586 120.367 127.418 132.614 136.686 139.872 142.434 144.46 146.318 147.742 148.926 149.968 150.848 151.617 152.28 152.899 153.384 153.777 154.155 154.511 154.791 155.06 155.319 155.515 155.693 155.839 155.973 156.097 156.162 156.201 156.189 156.155 156.121 156.097 156.027 155.949 155.846 155.779 155.341 155.517 155.375 155.218 154.845 154.625 154.378 154.049 153.565 152.856 151.881 143.849 -6 ,26029 ,KEBNE ,16748400,Mon Nov 29 17:34:57 CET,Mon Nov 29 19:28:37 CET,0.0 1.85 2.494 3.0 3.44 3.86 4.267 4.642 5.331 5.664 5.992 6.078 6.916 7.203 7.783 8.35 8.888 9.149 9.664 10.177 10.947 11.454 11.951 12.68 13.399 14.115 14.821 15.513 16.429 17.352 18.251 19.342 20.435 21.516 22.803 24.313 25.797 27.443 29.26 31.285 33.467 35.933 38.924 42.129 46.093 50.753 56.423 63.088 71.374 82.111 96.796 110.881 120.348 127.087 132.124 136.134 139.272 141.838 143.875 145.737 147.164 148.312 149.349 150.275 151.064 151.723 152.325 152.822 153.227 153.612 154.006 154.316 154.596 154.853 155.05 155.222 155.368 155.501 155.572 155.597 155.604 155.603 155.608 155.555 155.488 155.35 155.229 155.082 154.98 154.468 154.498 154.321 154.114 153.58 153.241 152.823 152.292 151.672 150.844 149.533 144.921 -7 ,4276 ,KEBNE ,16748401,Mon Nov 29 17:34:56 CET,Mon Nov 29 19:29:59 CET,0.0 2.088 2.743 3.244 3.702 4.111 4.49 4.862 5.548 5.869 6.185 6.267 7.109 7.407 8.0 8.567 9.115 9.383 9.914 10.438 11.191 11.689 12.18 12.897 13.608 14.293 14.992 15.694 16.603 17.511 18.413 19.527 20.612 21.659 22.92 24.379 25.782 27.403 29.229 31.193 33.309 35.771 38.792 41.967 45.786 50.225 55.648 62.209 70.492 81.211 95.88 109.959 119.415 126.225 131.382 135.478 138.697 141.329 143.321 145.088 146.465 147.631 148.694 149.596 150.358 151.013 151.687 152.25 152.679 153.046 153.375 153.643 153.904 154.152 154.343 154.514 154.641 154.769 154.905 154.976 155.022 155.034 155.022 154.99 154.966 154.937 154.891 154.819 154.782 154.36 154.564 154.465 154.357 154.103 153.895 153.605 153.257 152.771 152.244 151.189 140.514 -8 ,6888 ,KEBNE ,16748402,Mon Nov 29 17:34:57 CET,Mon Nov 29 19:28:20 CET,0.0 1.453 2.11 2.628 3.1 3.551 3.967 4.353 5.036 5.354 5.669 5.732 6.55 6.834 7.401 7.957 8.494 8.755 9.274 9.787 10.545 11.046 11.538 12.262 12.981 13.702 14.41 15.086 15.975 16.874 17.781 18.888 19.982 21.089 22.4 23.896 25.339 26.939 28.708 30.646 32.745 35.19 38.189 41.343 45.153 49.633 55.09 61.655 69.945 80.53 94.953 108.64 117.869 124.649 129.662 133.663 136.887 139.495 141.535 143.389 144.837 146.002 147.007 147.865 148.625 149.313 149.981 150.537 150.975 151.358 151.718 152.007 152.282 152.517 152.692 152.862 152.998 153.122 153.222 153.254 153.269 153.224 153.12 153.029 152.998 152.898 152.707 152.452 152.314 151.791 151.812 151.59 151.33 150.666 150.294 149.925 149.456 148.774 147.906 146.622 134.989 -9 ,8755 ,KEBNE ,16748403,Mon Nov 29 17:34:57 CET,Mon Nov 29 19:28:03 CET,0.0 2.032 2.615 3.116 3.55 3.945 4.335 4.719 5.431 5.753 6.07 6.163 6.995 7.283 7.85 8.403 8.947 9.222 9.76 10.28 11.056 11.559 12.051 12.779 13.486 14.191 14.89 15.575 16.49 17.401 18.292 19.401 20.504 21.583 22.877 24.37 25.843 27.511 29.327 31.309 33.518 36.094 39.16 42.337 46.186 50.682 56.183 62.844 71.271 82.154 96.949 111.098 120.747 127.718 132.934 137.095 140.29 142.897 144.98 146.871 148.362 149.544 150.566 151.481 152.268 152.971 153.686 154.254 154.675 155.078 155.475 155.783 156.079 156.316 156.44 156.542 156.613 156.665 156.707 156.727 156.724 156.681 156.645 156.576 156.526 156.416 156.299 156.153 156.046 155.557 155.595 155.382 155.162 154.669 154.36 153.958 153.501 152.951 152.138 150.977 145.452 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt deleted file mode 100644 index 90ce6abc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22593 ,KEBNE ,16748415,Mon Nov 29 17:35:58 CET,Mon Nov 29 19:33:52 CET,0.0 2.066 2.712 3.195 3.589 3.945 4.248 4.524 5.046 5.276 5.492 5.401 6.147 6.354 6.766 7.158 7.539 7.715 8.057 8.4 8.914 9.246 9.567 10.038 10.504 10.965 11.41 11.85 12.428 12.988 13.547 14.238 14.895 15.537 16.311 17.218 18.117 19.102 20.181 21.367 22.625 24.093 25.871 27.699 29.905 32.441 35.46 39.045 43.443 48.968 56.363 63.186 67.465 70.392 72.566 74.141 75.254 76.089 76.656 77.126 77.479 77.763 77.99 78.147 78.266 78.347 78.349 78.311 78.29 78.275 78.245 78.214 78.164 78.063 77.955 77.835 77.723 77.595 77.429 77.302 77.177 76.968 76.813 76.651 76.572 76.43 76.273 76.056 75.918 75.312 75.446 75.259 75.069 74.623 74.37 74.092 73.741 73.321 72.833 72.116 69.586 -2 ,4829 ,KEBNE ,16748416,Mon Nov 29 17:35:58 CET,Mon Nov 29 19:30:37 CET,0.0 2.508 3.038 3.429 3.768 4.087 4.384 4.67 5.206 5.456 5.699 5.611 6.353 6.549 6.945 7.354 7.743 7.934 8.306 8.657 9.176 9.512 9.837 10.309 10.769 11.216 11.645 12.077 12.65 13.213 13.768 14.437 15.09 15.74 16.522 17.413 18.27 19.23 20.309 21.5 22.77 24.23 25.967 27.744 29.905 32.463 35.578 39.241 43.731 49.315 56.756 63.593 67.933 70.903 72.979 74.532 75.673 76.542 77.177 77.711 78.086 78.382 78.652 78.839 78.92 78.999 79.086 79.098 79.074 79.062 79.067 79.038 78.986 78.924 78.876 78.827 78.732 78.6 78.466 78.363 78.259 78.066 77.902 77.716 77.621 77.452 77.273 77.066 76.938 76.325 76.496 76.337 76.146 75.712 75.5 75.266 74.94 74.551 74.027 73.33 69.638 -3 ,24461 ,KEBNE ,16748417,Mon Nov 29 17:54:30 CET,Mon Nov 29 19:50:49 CET,0.0 1.896 2.408 2.835 3.188 3.526 3.852 4.135 4.67 4.93 5.177 5.085 5.848 6.058 6.474 6.874 7.268 7.461 7.831 8.189 8.707 9.04 9.369 9.854 10.325 10.785 11.243 11.691 12.268 12.841 13.408 14.092 14.764 15.431 16.228 17.158 18.061 19.062 20.164 21.358 22.653 24.16 25.984 27.854 30.073 32.648 35.755 39.452 44.003 49.746 57.381 64.365 68.734 71.715 73.925 75.566 76.72 77.601 78.266 78.857 79.271 79.57 79.846 80.069 80.227 80.356 80.431 80.468 80.518 80.549 80.551 80.506 80.413 80.313 80.228 80.121 80.006 79.878 79.73 79.631 79.504 79.277 79.118 78.943 78.847 78.656 78.451 78.218 78.104 77.513 77.686 77.544 77.366 76.858 76.566 76.255 75.874 75.391 74.783 73.927 70.549 -4 ,21254 ,KEBNE ,16748418,Mon Nov 29 17:59:39 CET,Mon Nov 29 19:54:05 CET,0.0 1.655 2.198 2.609 2.949 3.257 3.538 3.816 4.322 4.553 4.783 4.691 5.429 5.632 6.03 6.404 6.767 6.946 7.295 7.631 8.117 8.441 8.777 9.275 9.751 10.215 10.667 11.131 11.76 12.361 12.94 13.643 14.319 14.977 15.752 16.647 17.523 18.497 19.585 20.771 22.051 23.527 25.284 27.088 29.253 31.797 34.894 38.547 43.013 48.721 56.248 63.129 67.614 70.78 73.088 74.76 75.922 76.831 77.537 78.127 78.57 78.909 79.187 79.394 79.528 79.642 79.766 79.861 79.905 79.93 79.915 79.88 79.822 79.72 79.651 79.566 79.456 79.328 79.159 79.035 78.907 78.696 78.541 78.356 78.265 78.084 77.862 77.602 77.455 76.85 76.98 76.8 76.607 76.15 75.867 75.517 75.109 74.651 74.055 73.07 69.306 -5 ,7293 ,KEBNE ,16748419,Mon Nov 29 18:24:14 CET,Mon Nov 29 20:19:04 CET,0.0 1.845 2.411 2.854 3.25 3.609 3.941 4.238 4.747 4.986 5.223 5.139 5.89 6.099 6.509 6.907 7.299 7.49 7.844 8.191 8.711 9.047 9.383 9.881 10.351 10.81 11.266 11.721 12.321 12.911 13.49 14.179 14.861 15.555 16.373 17.28 18.164 19.156 20.241 21.445 22.776 24.309 26.13 28.026 30.312 32.941 36.048 39.663 44.153 49.838 57.313 64.184 68.685 71.808 74.041 75.745 77.027 77.998 78.691 79.252 79.691 80.014 80.248 80.453 80.624 80.753 80.852 80.919 80.959 80.964 80.96 80.935 80.879 80.814 80.754 80.67 80.565 80.449 80.298 80.182 80.065 79.887 79.758 79.601 79.498 79.236 78.956 78.673 78.516 77.887 77.996 77.806 77.58 77.038 76.776 76.53 76.2 75.768 75.278 74.568 71.649 -6 ,22036 ,KEBNE ,16748420,Mon Nov 29 19:16:33 CET,Mon Nov 29 21:04:47 CET,0.0 2.253 2.758 3.137 3.465 3.764 4.063 4.347 4.861 5.106 5.341 5.235 5.977 6.179 6.557 6.922 7.277 7.456 7.81 8.149 8.656 8.981 9.299 9.768 10.224 10.677 11.119 11.549 12.116 12.663 13.202 13.887 14.555 15.201 15.96 16.815 17.666 18.637 19.706 20.862 22.114 23.563 25.284 27.078 29.237 31.767 34.808 38.413 42.911 48.57 56.03 62.799 67.136 70.175 72.349 73.975 75.159 76.075 76.803 77.409 77.808 78.082 78.288 78.458 78.589 78.69 78.769 78.781 78.757 78.707 78.641 78.583 78.504 78.404 78.315 78.208 78.086 77.954 77.799 77.691 77.574 77.367 77.225 77.076 76.994 76.817 76.624 76.399 76.265 75.645 75.753 75.561 75.365 74.938 74.676 74.378 74.068 73.647 73.071 72.294 69.59 -7 ,10445 ,KEBNE ,16748421,Mon Nov 29 19:24:56 CET,Mon Nov 29 21:19:13 CET,0.0 1.578 2.122 2.518 2.897 3.245 3.55 3.85 4.394 4.642 4.88 4.787 5.535 5.749 6.157 6.535 6.902 7.084 7.441 7.79 8.303 8.634 8.952 9.416 9.87 10.318 10.759 11.192 11.76 12.325 12.884 13.564 14.22 14.862 15.633 16.536 17.423 18.407 19.497 20.692 21.964 23.406 25.153 27.019 29.288 31.882 34.966 38.581 43.056 48.7 56.149 62.931 67.352 70.414 72.525 74.086 75.293 76.256 76.983 77.569 77.963 78.28 78.538 78.747 78.911 79.049 79.163 79.196 79.207 79.201 79.181 79.17 79.134 79.053 78.973 78.909 78.823 78.694 78.565 78.479 78.384 78.25 78.156 78.028 77.959 77.791 77.563 77.312 77.178 76.567 76.639 76.437 76.224 75.686 75.347 74.993 74.596 74.047 73.392 72.558 66.087 -8 ,28565 ,KEBNE ,16748422,Mon Nov 29 19:26:59 CET,Mon Nov 29 21:22:27 CET,0.0 1.51 2.033 2.467 2.85 3.194 3.501 3.785 4.323 4.575 4.798 4.68 5.429 5.65 6.077 6.49 6.875 7.056 7.409 7.747 8.254 8.597 8.928 9.4 9.857 10.308 10.753 11.183 11.758 12.318 12.856 13.53 14.193 14.843 15.627 16.531 17.401 18.356 19.422 20.602 21.885 23.367 25.173 27.059 29.289 31.885 35.006 38.701 43.312 49.015 56.488 63.262 67.602 70.616 72.716 74.244 75.377 76.273 76.898 77.386 77.772 78.085 78.307 78.469 78.583 78.644 78.675 78.654 78.626 78.594 78.547 78.517 78.469 78.4 78.348 78.271 78.162 78.044 77.917 77.799 77.664 77.468 77.327 77.149 77.065 76.911 76.722 76.514 76.391 75.784 75.917 75.754 75.576 75.097 74.825 74.532 74.2 73.809 73.295 72.51 69.214 -9 ,640 ,KEBNE ,16748423,Mon Nov 29 19:29:06 CET,Mon Nov 29 21:24:44 CET,0.0 1.786 2.329 2.761 3.122 3.442 3.747 4.037 4.585 4.829 5.058 4.947 5.7 5.916 6.347 6.741 7.113 7.298 7.648 7.987 8.476 8.798 9.13 9.619 10.092 10.539 10.975 11.422 12.011 12.585 13.157 13.855 14.519 15.177 15.979 16.915 17.83 18.832 19.915 21.097 22.371 23.882 25.692 27.541 29.785 32.358 35.387 38.964 43.441 49.052 56.386 63.089 67.448 70.416 72.518 74.138 75.328 76.235 76.963 77.625 78.074 78.394 78.683 78.883 79.005 79.116 79.191 79.253 79.296 79.322 79.359 79.319 79.22 79.089 78.993 78.911 78.794 78.659 78.524 78.403 78.266 78.079 77.935 77.783 77.702 77.532 77.336 77.089 76.962 76.358 76.509 76.33 76.141 75.729 75.495 75.241 74.921 74.516 74.034 73.346 71.023 -10 ,21085 ,KEBNE ,16748424,Mon Nov 29 19:29:05 CET,Mon Nov 29 21:26:42 CET,0.0 1.577 2.172 2.59 2.935 3.266 3.584 3.872 4.406 4.652 4.886 4.8 5.551 5.764 6.172 6.566 6.944 7.126 7.479 7.827 8.347 8.69 9.022 9.505 9.967 10.417 10.867 11.304 11.867 12.416 12.96 13.641 14.318 14.988 15.773 16.677 17.568 18.56 19.69 20.933 22.225 23.686 25.466 27.337 29.601 32.223 35.365 39.052 43.571 49.24 56.615 63.335 67.583 70.604 72.856 74.438 75.585 76.519 77.167 77.714 78.145 78.478 78.712 78.868 78.981 79.065 79.124 79.117 79.086 79.05 78.992 78.924 78.841 78.747 78.667 78.581 78.481 78.361 78.215 78.109 78.001 77.821 77.681 77.529 77.448 77.26 77.031 76.777 76.648 76.049 76.172 75.991 75.795 75.348 75.088 74.77 74.42 74.03 73.468 72.667 69.364 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt deleted file mode 100644 index 2874372c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7512 ,KEBNE ,16692557,Thu Nov 25 20:45:37 CET,Thu Nov 25 22:40:42 CET,0.0 1.587 2.11 2.47 2.766 2.999 3.18 3.354 3.676 3.836 3.978 3.858 4.306 4.408 4.639 4.86 5.063 5.152 5.301 5.454 5.672 5.813 5.959 6.15 6.323 6.486 6.629 6.77 6.957 7.148 7.313 7.481 7.647 7.811 7.996 8.183 8.352 8.532 8.707 8.899 9.104 9.327 9.545 9.706 9.842 9.869 9.857 9.826 9.684 9.223 8.091 6.482 4.941 3.565 2.403 1.415 0.52 -0.326 -1.055 -1.802 -2.412 -2.928 -3.436 -3.91 -4.338 -4.744 -5.175 -5.547 -5.855 -6.176 -6.515 -6.782 -7.048 -7.316 -7.515 -7.735 -7.983 -8.247 -8.526 -8.719 -8.915 -9.207 -9.404 -9.611 -9.718 -9.943 -10.177 -10.428 -10.554 -11.04 -10.953 -11.107 -11.261 -11.642 -11.87 -12.116 -12.391 -12.684 -13.028 -13.544 -15.419 -2 ,9149 ,KEBNE ,16692558,Thu Nov 25 20:45:38 CET,Thu Nov 25 22:40:05 CET,0.0 2.135 2.678 3.063 3.355 3.581 3.781 3.967 4.29 4.426 4.559 4.467 4.934 5.05 5.265 5.458 5.627 5.707 5.859 5.994 6.206 6.353 6.489 6.665 6.825 6.975 7.125 7.287 7.484 7.655 7.829 8.043 8.227 8.391 8.586 8.786 8.952 9.139 9.344 9.561 9.749 9.905 10.069 10.218 10.377 10.495 10.536 10.446 10.203 9.688 8.479 6.719 5.136 3.811 2.705 1.71 0.841 0.065 -0.631 -1.334 -1.949 -2.477 -2.933 -3.36 -3.751 -4.094 -4.463 -4.783 -5.058 -5.337 -5.627 -5.867 -6.101 -6.354 -6.561 -6.778 -6.999 -7.227 -7.468 -7.636 -7.81 -8.078 -8.265 -8.454 -8.551 -8.768 -9.03 -9.297 -9.429 -9.933 -9.846 -10.008 -10.18 -10.531 -10.728 -10.975 -11.261 -11.582 -11.955 -12.48 -14.172 -3 ,22684 ,KEBNE ,16692559,Thu Nov 25 20:45:38 CET,Thu Nov 25 22:40:36 CET,0.0 1.833 2.373 2.761 3.05 3.316 3.529 3.72 4.102 4.275 4.426 4.358 4.845 4.968 5.168 5.346 5.503 5.576 5.731 5.886 6.092 6.215 6.336 6.507 6.655 6.794 6.952 7.093 7.231 7.37 7.517 7.68 7.826 7.965 8.118 8.283 8.445 8.611 8.782 8.967 9.158 9.358 9.554 9.713 9.871 10.009 10.113 10.055 9.809 9.289 8.126 6.476 4.975 3.653 2.448 1.354 0.436 -0.365 -1.05 -1.711 -2.244 -2.717 -3.176 -3.599 -3.992 -4.346 -4.717 -5.058 -5.346 -5.645 -5.971 -6.247 -6.528 -6.808 -7.02 -7.258 -7.528 -7.798 -8.082 -8.28 -8.483 -8.798 -9.014 -9.257 -9.378 -9.609 -9.874 -10.162 -10.312 -10.838 -10.788 -10.953 -11.144 -11.578 -11.798 -12.025 -12.298 -12.66 -13.128 -13.729 -16.045 -4 ,22152 ,KEBNE ,16692560,Thu Nov 25 20:45:38 CET,Thu Nov 25 22:41:23 CET,0.0 2.169 2.752 3.143 3.433 3.691 3.908 4.095 4.424 4.563 4.691 4.601 5.07 5.19 5.411 5.605 5.796 5.882 6.036 6.191 6.427 6.561 6.689 6.884 7.057 7.227 7.382 7.521 7.685 7.829 7.965 8.132 8.293 8.443 8.626 8.806 8.963 9.121 9.277 9.465 9.646 9.816 9.986 10.138 10.288 10.386 10.432 10.43 10.237 9.604 8.412 6.844 5.397 4.244 3.301 2.417 1.626 0.925 0.349 -0.248 -0.78 -1.251 -1.701 -2.106 -2.483 -2.853 -3.274 -3.67 -3.996 -4.321 -4.657 -4.922 -5.187 -5.463 -5.683 -5.906 -6.128 -6.372 -6.634 -6.805 -6.99 -7.287 -7.49 -7.701 -7.81 -8.039 -8.275 -8.507 -8.635 -9.131 -9.095 -9.275 -9.453 -9.845 -10.065 -10.316 -10.61 -10.932 -11.287 -11.779 -13.518 -5 ,8008 ,KEBNE ,16692561,Thu Nov 25 20:45:42 CET,Thu Nov 25 22:33:27 CET,0.0 1.914 2.495 2.89 3.192 3.446 3.64 3.814 4.165 4.317 4.444 4.345 4.832 4.964 5.173 5.349 5.516 5.598 5.772 5.928 6.155 6.302 6.421 6.602 6.783 6.934 7.071 7.207 7.373 7.541 7.693 7.853 8.002 8.146 8.322 8.523 8.694 8.861 9.034 9.196 9.379 9.568 9.756 9.934 10.061 10.135 10.161 10.074 9.825 9.277 7.986 6.202 4.645 3.312 2.178 1.104 0.149 -0.711 -1.433 -2.098 -2.642 -3.138 -3.635 -4.106 -4.529 -4.902 -5.279 -5.632 -5.953 -6.261 -6.555 -6.795 -7.049 -7.33 -7.55 -7.771 -8.001 -8.227 -8.458 -8.621 -8.795 -9.089 -9.299 -9.517 -9.634 -9.871 -10.121 -10.383 -10.513 -11.019 -10.968 -11.125 -11.289 -11.675 -11.89 -12.132 -12.412 -12.74 -13.114 -13.606 -15.586 -6 ,28664 ,KEBNE ,16692562,Thu Nov 25 20:45:42 CET,Thu Nov 25 22:37:58 CET,0.0 2.505 3.077 3.479 3.792 4.063 4.298 4.518 4.929 5.085 5.226 5.139 5.625 5.763 6.002 6.202 6.389 6.48 6.659 6.829 7.073 7.215 7.359 7.581 7.758 7.927 8.1 8.246 8.42 8.58 8.734 8.918 9.095 9.253 9.41 9.577 9.74 9.916 10.082 10.235 10.385 10.546 10.71 10.838 10.935 10.98 10.978 10.893 10.674 10.234 9.287 7.76 6.322 5.075 3.998 2.971 2.036 1.223 0.518 -0.183 -0.792 -1.314 -1.786 -2.238 -2.666 -3.051 -3.456 -3.83 -4.16 -4.499 -4.853 -5.15 -5.442 -5.73 -5.961 -6.21 -6.463 -6.714 -6.968 -7.144 -7.315 -7.573 -7.759 -7.959 -8.067 -8.31 -8.565 -8.817 -8.942 -9.445 -9.398 -9.568 -9.733 -10.097 -10.305 -10.551 -10.827 -11.115 -11.469 -12.009 -14.416 -7 ,422 ,KEBNE ,16692563,Thu Nov 25 20:45:38 CET,Thu Nov 25 22:41:16 CET,0.0 1.6 2.165 2.601 2.958 3.211 3.419 3.614 3.98 4.14 4.271 4.152 4.622 4.728 4.939 5.141 5.318 5.403 5.563 5.716 5.911 6.038 6.168 6.338 6.487 6.636 6.78 6.913 7.082 7.244 7.406 7.617 7.815 7.994 8.202 8.411 8.604 8.81 9.002 9.172 9.328 9.487 9.67 9.833 9.977 10.093 10.204 10.201 9.932 9.422 8.289 6.605 5.083 3.761 2.622 1.547 0.605 -0.182 -0.812 -1.428 -1.978 -2.487 -2.973 -3.429 -3.863 -4.263 -4.674 -5.016 -5.294 -5.577 -5.869 -6.118 -6.377 -6.639 -6.842 -7.054 -7.278 -7.52 -7.76 -7.924 -8.094 -8.359 -8.563 -8.776 -8.877 -9.077 -9.3 -9.559 -9.699 -10.206 -10.143 -10.292 -10.449 -10.8 -11.009 -11.24 -11.491 -11.78 -12.156 -12.698 -15.386 -8 ,21869 ,KEBNE ,16692564,Thu Nov 25 20:45:38 CET,Thu Nov 25 22:41:15 CET,0.0 2.492 3.003 3.366 3.64 3.846 4.044 4.245 4.59 4.746 4.884 4.783 5.249 5.354 5.558 5.769 5.973 6.064 6.224 6.362 6.554 6.675 6.787 6.958 7.128 7.286 7.434 7.562 7.724 7.867 7.997 8.176 8.345 8.512 8.703 8.881 9.037 9.227 9.435 9.637 9.85 10.057 10.227 10.357 10.457 10.509 10.514 10.424 10.165 9.668 8.682 7.302 6.033 4.893 3.907 3.03 2.249 1.547 0.944 0.346 -0.162 -0.617 -1.06 -1.485 -1.882 -2.227 -2.564 -2.872 -3.148 -3.443 -3.763 -4.045 -4.345 -4.636 -4.848 -5.066 -5.306 -5.57 -5.86 -6.054 -6.241 -6.546 -6.758 -6.971 -7.081 -7.302 -7.537 -7.809 -7.955 -8.457 -8.378 -8.532 -8.703 -9.1 -9.325 -9.562 -9.825 -10.125 -10.474 -10.991 -12.951 -9 ,22762 ,KEBNE ,16692565,Thu Nov 25 20:45:38 CET,Thu Nov 25 22:43:02 CET,0.0 2.713 3.227 3.579 3.893 4.148 4.375 4.59 4.986 5.145 5.282 5.222 5.705 5.837 6.082 6.268 6.464 6.56 6.714 6.85 7.032 7.153 7.274 7.467 7.652 7.79 7.92 8.052 8.202 8.357 8.506 8.659 8.804 8.946 9.116 9.295 9.444 9.581 9.732 9.891 10.039 10.171 10.303 10.449 10.561 10.65 10.719 10.706 10.547 10.029 8.916 7.404 6.071 4.947 4.001 3.134 2.356 1.682 1.089 0.454 -0.097 -0.58 -1.043 -1.47 -1.863 -2.216 -2.578 -2.902 -3.18 -3.463 -3.756 -4.004 -4.26 -4.529 -4.743 -4.956 -5.169 -5.401 -5.635 -5.8 -5.983 -6.256 -6.44 -6.627 -6.725 -6.943 -7.164 -7.396 -7.529 -8.035 -7.963 -8.119 -8.279 -8.636 -8.828 -9.031 -9.259 -9.546 -9.929 -10.434 -12.152 -10 ,15560 ,KEBNE ,16692566,Thu Nov 25 20:46:41 CET,Thu Nov 25 22:40:53 CET,0.0 2.734 3.362 3.761 4.118 4.382 4.598 4.801 5.186 5.358 5.52 5.426 5.882 6.009 6.271 6.507 6.732 6.842 7.017 7.147 7.316 7.422 7.525 7.684 7.833 7.965 8.102 8.236 8.398 8.554 8.708 8.893 9.067 9.221 9.391 9.576 9.735 9.891 10.045 10.197 10.338 10.493 10.668 10.82 10.95 10.994 11.003 10.964 10.808 10.363 9.265 7.761 6.413 5.268 4.247 3.329 2.579 1.923 1.348 0.76 0.245 -0.22 -0.658 -1.058 -1.424 -1.761 -2.119 -2.437 -2.706 -2.986 -3.273 -3.504 -3.761 -4.042 -4.248 -4.462 -4.7 -4.946 -5.202 -5.38 -5.561 -5.846 -6.047 -6.26 -6.369 -6.601 -6.84 -7.087 -7.237 -7.775 -7.752 -7.922 -8.086 -8.473 -8.72 -8.972 -9.221 -9.551 -10.001 -10.585 -12.791 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index dd898750..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6951 ,KEBNE ,16748405,Mon Nov 29 17:35:57 CET,Mon Nov 29 19:25:12 CET,0.0 1.511 1.87 2.152 2.366 2.551 2.719 2.868 3.148 3.284 3.413 3.288 3.756 3.86 4.052 4.234 4.406 4.487 4.646 4.798 5.011 5.148 5.284 5.48 5.663 5.835 5.995 6.155 6.365 6.573 6.781 7.025 7.262 7.503 7.786 8.093 8.38 8.705 9.05 9.418 9.811 10.258 10.797 11.341 11.947 12.607 13.343 14.072 14.898 15.769 16.517 16.862 16.845 16.671 16.406 16.067 15.723 15.395 15.075 14.735 14.432 14.135 13.828 13.514 13.196 12.919 12.63 12.365 12.136 11.873 11.601 11.389 11.171 10.933 10.746 10.55 10.34 10.115 9.866 9.694 9.516 9.234 9.033 8.793 8.67 8.416 8.14 7.877 7.751 7.29 7.362 7.196 6.987 6.492 6.217 5.895 5.562 5.239 4.8 4.115 1.322 -2 ,20874 ,KEBNE ,16748406,Mon Nov 29 17:35:57 CET,Mon Nov 29 19:25:13 CET,0.0 1.41 1.779 2.031 2.255 2.47 2.661 2.829 3.119 3.251 3.368 3.236 3.7 3.804 3.995 4.172 4.342 4.42 4.569 4.723 4.947 5.092 5.234 5.436 5.635 5.822 6.001 6.18 6.413 6.626 6.825 7.07 7.308 7.545 7.825 8.141 8.431 8.737 9.077 9.435 9.804 10.243 10.794 11.317 11.909 12.582 13.365 14.232 15.194 16.225 17.076 17.566 17.654 17.464 17.234 16.969 16.658 16.307 15.993 15.691 15.427 15.183 14.934 14.692 14.456 14.206 13.912 13.627 13.384 13.152 12.927 12.724 12.479 12.216 12.024 11.832 11.625 11.401 11.169 11.012 10.85 10.583 10.387 10.176 10.067 9.835 9.571 9.272 9.113 8.599 8.564 8.364 8.139 7.633 7.347 7.016 6.636 6.213 5.708 4.985 1.373 -3 ,25660 ,KEBNE ,16748407,Mon Nov 29 17:35:58 CET,Mon Nov 29 19:26:18 CET,0.0 1.444 1.797 2.065 2.283 2.47 2.63 2.784 3.074 3.203 3.327 3.203 3.669 3.769 3.958 4.136 4.301 4.376 4.515 4.651 4.844 4.969 5.093 5.271 5.44 5.611 5.789 5.967 6.196 6.411 6.615 6.862 7.097 7.322 7.577 7.863 8.144 8.444 8.767 9.11 9.478 9.877 10.302 10.736 11.231 11.791 12.488 13.241 14.036 14.876 15.731 16.238 16.334 16.223 15.982 15.666 15.349 15.038 14.721 14.355 14.032 13.703 13.369 13.072 12.816 12.606 12.399 12.195 12.007 11.82 11.624 11.444 11.247 11.028 10.839 10.63 10.419 10.185 9.915 9.725 9.502 9.133 8.914 8.721 8.62 8.383 8.118 7.845 7.703 7.219 7.259 7.083 6.877 6.419 6.157 5.825 5.442 4.99 4.459 3.774 0.726 -4 ,17256 ,KEBNE ,16748408,Mon Nov 29 17:35:57 CET,Mon Nov 29 19:26:15 CET,0.0 1.413 1.785 2.037 2.247 2.434 2.598 2.742 2.998 3.121 3.238 3.099 3.564 3.661 3.847 4.018 4.17 4.242 4.388 4.532 4.753 4.899 5.04 5.25 5.447 5.631 5.81 5.981 6.2 6.408 6.608 6.861 7.112 7.35 7.619 7.916 8.194 8.494 8.816 9.151 9.502 9.875 10.304 10.74 11.289 11.959 12.683 13.474 14.328 15.169 16.028 16.548 16.522 16.241 15.923 15.635 15.378 15.087 14.778 14.418 14.079 13.769 13.465 13.161 12.9 12.661 12.372 12.12 11.9 11.671 11.443 11.226 11.003 10.784 10.592 10.379 10.159 9.947 9.738 9.571 9.388 9.139 8.965 8.734 8.598 8.345 8.107 7.826 7.668 7.164 7.17 6.976 6.759 6.29 6.022 5.695 5.302 4.888 4.436 3.719 0.063 -5 ,21630 ,KEBNE ,16748409,Mon Nov 29 17:36:01 CET,Mon Nov 29 19:16:03 CET,0.0 1.44 1.775 2.026 2.234 2.411 2.569 2.71 2.986 3.115 3.229 3.086 3.543 3.637 3.81 3.98 4.146 4.22 4.362 4.51 4.733 4.881 5.024 5.225 5.413 5.608 5.797 5.968 6.181 6.39 6.594 6.842 7.084 7.305 7.553 7.844 8.131 8.456 8.813 9.199 9.62 10.079 10.595 11.102 11.7 12.368 13.108 13.966 14.868 15.784 16.691 17.081 17.018 16.768 16.5 16.222 15.936 15.618 15.292 14.93 14.594 14.281 13.974 13.678 13.388 13.124 12.864 12.627 12.411 12.177 11.909 11.686 11.461 11.239 11.066 10.866 10.647 10.425 10.183 10.005 9.824 9.522 9.296 9.051 8.927 8.697 8.445 8.173 8.032 7.521 7.484 7.272 7.051 6.607 6.353 6.045 5.678 5.255 4.741 4.026 0.79 -6 ,28237 ,KEBNE ,16748410,Mon Nov 29 17:36:01 CET,Mon Nov 29 19:36:36 CET,0.0 1.761 2.111 2.382 2.599 2.783 2.949 3.101 3.373 3.495 3.612 3.472 3.928 4.025 4.207 4.377 4.548 4.63 4.783 4.933 5.151 5.291 5.423 5.61 5.801 5.985 6.161 6.333 6.543 6.758 6.965 7.197 7.428 7.664 7.933 8.23 8.513 8.827 9.16 9.503 9.848 10.222 10.67 11.122 11.651 12.227 12.89 13.621 14.395 15.235 16.104 16.534 16.524 16.39 16.241 16.093 15.92 15.698 15.459 15.18 14.905 14.645 14.384 14.134 13.898 13.676 13.421 13.202 13.014 12.784 12.554 12.352 12.112 11.872 11.695 11.506 11.291 11.064 10.829 10.652 10.465 10.203 10.015 9.805 9.689 9.436 9.168 8.884 8.742 8.254 8.255 8.056 7.849 7.428 7.175 6.886 6.567 6.179 5.667 4.935 0.853 -7 ,21230 ,KEBNE ,16748411,Mon Nov 29 17:35:58 CET,Mon Nov 29 19:23:44 CET,0.0 1.186 1.57 1.858 2.085 2.283 2.451 2.598 2.869 2.997 3.124 3.009 3.48 3.587 3.784 3.956 4.119 4.202 4.359 4.505 4.713 4.854 4.993 5.191 5.375 5.555 5.739 5.916 6.129 6.336 6.545 6.79 7.026 7.264 7.535 7.845 8.149 8.478 8.843 9.228 9.623 10.054 10.541 11.051 11.643 12.257 12.974 13.784 14.675 15.546 16.264 16.623 16.602 16.437 16.228 15.94 15.628 15.326 15.017 14.672 14.358 14.022 13.697 13.421 13.167 12.915 12.645 12.413 12.171 11.896 11.625 11.399 11.174 10.945 10.775 10.601 10.412 10.218 10.019 9.869 9.711 9.481 9.298 9.103 9.004 8.766 8.48 8.149 7.993 7.483 7.448 7.235 6.975 6.422 6.16 5.872 5.528 5.109 4.532 3.687 -0.531 -8 ,3829 ,KEBNE ,16748412,Mon Nov 29 17:35:58 CET,Mon Nov 29 19:26:53 CET,0.0 1.277 1.633 1.876 2.071 2.255 2.418 2.561 2.815 2.934 3.051 2.923 3.383 3.482 3.673 3.845 4.007 4.089 4.25 4.398 4.607 4.742 4.873 5.066 5.254 5.446 5.633 5.808 6.037 6.259 6.463 6.691 6.914 7.137 7.396 7.676 7.935 8.227 8.576 8.948 9.33 9.766 10.292 10.829 11.448 12.137 12.895 13.726 14.653 15.61 16.52 17.089 17.176 16.995 16.703 16.373 16.019 15.691 15.381 15.044 14.771 14.476 14.172 13.898 13.648 13.443 13.223 12.983 12.755 12.518 12.262 12.033 11.793 11.549 11.364 11.177 10.975 10.743 10.508 10.354 10.181 9.913 9.719 9.511 9.404 9.154 8.874 8.577 8.423 7.915 7.905 7.706 7.489 7.021 6.785 6.518 6.176 5.778 5.235 4.447 1.517 -9 ,27171 ,KEBNE ,16748413,Mon Nov 29 17:35:58 CET,Mon Nov 29 19:25:00 CET,0.0 0.914 1.26 1.53 1.759 1.941 2.098 2.248 2.524 2.643 2.757 2.61 3.067 3.166 3.355 3.526 3.685 3.764 3.926 4.081 4.292 4.433 4.577 4.772 4.95 5.128 5.305 5.477 5.694 5.91 6.124 6.373 6.612 6.846 7.115 7.416 7.707 8.015 8.346 8.714 9.113 9.564 10.099 10.623 11.199 11.86 12.637 13.419 14.181 15.073 16.165 16.66 16.631 16.42 16.096 15.759 15.46 15.15 14.876 14.606 14.352 14.095 13.824 13.565 13.317 13.089 12.839 12.573 12.324 12.057 11.784 11.567 11.363 11.133 10.938 10.731 10.502 10.272 10.032 9.858 9.677 9.405 9.22 9.011 8.899 8.663 8.398 8.12 7.969 7.462 7.449 7.251 7.053 6.639 6.383 6.055 5.7 5.317 4.818 4.084 0.617 -10 ,14054 ,KEBNE ,16748414,Mon Nov 29 17:35:57 CET,Mon Nov 29 19:24:54 CET,0.0 1.178 1.549 1.816 2.03 2.219 2.383 2.528 2.782 2.897 3.008 2.866 3.322 3.415 3.593 3.761 3.913 3.986 4.132 4.275 4.482 4.607 4.725 4.906 5.09 5.274 5.444 5.608 5.815 6.012 6.212 6.451 6.681 6.91 7.176 7.463 7.75 8.069 8.393 8.754 9.158 9.619 10.149 10.685 11.307 11.996 12.74 13.555 14.44 15.315 16.203 16.592 16.605 16.465 16.198 15.926 15.622 15.321 15.064 14.764 14.469 14.211 13.965 13.712 13.461 13.202 12.915 12.665 12.442 12.204 11.949 11.738 11.512 11.239 11.014 10.781 10.546 10.293 10.009 9.814 9.618 9.326 9.134 8.934 8.826 8.609 8.376 8.1 7.933 7.395 7.362 7.153 6.935 6.506 6.261 5.998 5.685 5.261 4.732 3.938 -0.741 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt deleted file mode 100644 index cd3c2d29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28331 ,KEBNE ,16692577,Thu Nov 25 20:48:45 CET,Thu Nov 25 22:37:47 CET,0.0 2.052 2.626 3.062 3.424 3.728 3.986 4.206 4.6 4.775 4.925 4.85 5.346 5.484 5.733 5.951 6.158 6.252 6.408 6.565 6.812 6.976 7.142 7.369 7.569 7.756 7.935 8.106 8.316 8.503 8.675 8.895 9.114 9.327 9.595 9.897 10.152 10.388 10.628 10.916 11.212 11.503 11.836 12.172 12.501 12.792 13.081 13.328 13.445 13.363 12.828 11.669 10.465 9.359 8.389 7.527 6.803 6.166 5.61 5.026 4.495 4.004 3.538 3.118 2.73 2.362 1.962 1.617 1.308 0.967 0.634 0.359 0.062 -0.25 -0.49 -0.739 -1.003 -1.271 -1.535 -1.702 -1.872 -2.15 -2.344 -2.543 -2.648 -2.882 -3.122 -3.371 -3.509 -4.016 -3.971 -4.16 -4.353 -4.734 -4.941 -5.168 -5.424 -5.716 -6.071 -6.543 -8.91 -5 ,32737 ,KEBNE ,16692581,Thu Nov 25 20:49:48 CET,Thu Nov 25 22:38:44 CET,0.0 1.698 2.262 2.678 3.031 3.346 3.627 3.877 4.296 4.466 4.608 4.522 5.03 5.177 5.43 5.649 5.851 5.949 6.14 6.334 6.611 6.77 6.928 7.17 7.401 7.632 7.855 8.068 8.337 8.562 8.76 8.977 9.186 9.399 9.65 9.91 10.128 10.391 10.7 11.011 11.304 11.578 11.838 12.059 12.308 12.55 12.732 12.902 12.987 12.834 12.345 11.276 10.126 9.085 8.119 7.205 6.43 5.753 5.151 4.538 4.013 3.539 3.082 2.626 2.174 1.791 1.417 1.079 0.794 0.494 0.163 -0.108 -0.385 -0.678 -0.893 -1.102 -1.325 -1.567 -1.811 -1.972 -2.139 -2.413 -2.613 -2.816 -2.92 -3.148 -3.401 -3.653 -3.788 -4.308 -4.237 -4.404 -4.587 -4.961 -5.177 -5.44 -5.725 -6.041 -6.428 -6.911 -8.299 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt deleted file mode 100644 index 4b3ec8fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30299 ,KEBNE ,16692587,Thu Nov 25 20:51:52 CET,Thu Nov 25 22:50:17 CET,0.0 1.532 1.862 2.087 2.295 2.482 2.641 2.779 3.01 3.115 3.213 3.023 3.489 3.577 3.752 3.916 4.067 4.138 4.275 4.401 4.583 4.705 4.814 4.972 5.122 5.257 5.383 5.502 5.667 5.822 5.962 6.122 6.267 6.417 6.602 6.803 6.983 7.154 7.325 7.517 7.717 7.924 8.156 8.364 8.576 8.765 8.936 9.092 9.186 9.138 8.793 8.206 7.597 7.018 6.48 5.981 5.523 5.046 4.615 4.207 3.856 3.544 3.259 2.961 2.674 2.415 2.145 1.927 1.738 1.523 1.305 1.112 0.904 0.693 0.527 0.364 0.206 0.037 -0.154 -0.292 -0.427 -0.632 -0.778 -0.93 -1.008 -1.181 -1.359 -1.542 -1.64 -2.117 -1.956 -2.072 -2.198 -2.477 -2.63 -2.796 -2.976 -3.199 -3.496 -3.904 -6.617 -2 ,27352 ,KEBNE ,16692588,Thu Nov 25 20:51:51 CET,Thu Nov 25 22:49:45 CET,0.0 1.483 1.783 2.009 2.192 2.345 2.483 2.608 2.828 2.931 3.032 2.852 3.313 3.392 3.534 3.674 3.817 3.886 4.017 4.148 4.335 4.446 4.55 4.688 4.813 4.938 5.065 5.186 5.335 5.477 5.618 5.78 5.929 6.069 6.228 6.402 6.569 6.759 6.951 7.142 7.341 7.57 7.824 8.042 8.275 8.527 8.789 9.022 9.216 9.305 9.127 8.59 7.972 7.369 6.836 6.319 5.851 5.44 5.074 4.68 4.329 4.006 3.701 3.417 3.136 2.883 2.626 2.383 2.176 1.965 1.737 1.554 1.36 1.156 0.997 0.825 0.642 0.446 0.235 0.091 -0.046 -0.253 -0.406 -0.575 -0.661 -0.831 -1.013 -1.198 -1.291 -1.77 -1.611 -1.732 -1.858 -2.153 -2.326 -2.506 -2.713 -2.953 -3.233 -3.657 -5.427 -3 ,10566 ,KEBNE ,16692589,Thu Nov 25 20:51:52 CET,Thu Nov 25 22:47:50 CET,0.0 1.167 1.517 1.774 1.972 2.145 2.306 2.453 2.729 2.85 2.951 2.77 3.246 3.337 3.522 3.691 3.829 3.894 4.019 4.139 4.31 4.415 4.519 4.67 4.811 4.939 5.06 5.183 5.338 5.487 5.624 5.786 5.935 6.067 6.229 6.416 6.594 6.789 6.985 7.173 7.354 7.543 7.763 7.966 8.186 8.4 8.62 8.833 8.937 8.905 8.608 7.979 7.335 6.741 6.205 5.685 5.204 4.763 4.38 3.99 3.668 3.386 3.106 2.852 2.613 2.38 2.134 1.916 1.724 1.528 1.322 1.138 0.941 0.742 0.59 0.432 0.269 0.096 -0.089 -0.214 -0.351 -0.574 -0.726 -0.882 -0.959 -1.119 -1.289 -1.466 -1.562 -2.04 -1.865 -1.982 -2.098 -2.347 -2.491 -2.653 -2.841 -3.077 -3.362 -3.717 -4.782 -4 ,18064 ,KEBNE ,16692590,Thu Nov 25 20:51:51 CET,Thu Nov 25 22:47:35 CET,0.0 1.821 2.165 2.418 2.607 2.769 2.923 3.061 3.292 3.405 3.514 3.329 3.791 3.876 4.032 4.169 4.297 4.362 4.484 4.598 4.767 4.874 4.975 5.111 5.244 5.373 5.489 5.599 5.744 5.878 6.009 6.173 6.319 6.457 6.616 6.79 6.949 7.121 7.309 7.488 7.673 7.877 8.089 8.267 8.46 8.682 8.895 9.106 9.263 9.268 8.986 8.344 7.716 7.131 6.6 6.111 5.645 5.197 4.814 4.42 4.062 3.735 3.426 3.144 2.885 2.651 2.394 2.149 1.929 1.708 1.488 1.296 1.093 0.882 0.718 0.547 0.372 0.19 -0.002 -0.137 -0.284 -0.513 -0.67 -0.842 -0.935 -1.129 -1.329 -1.534 -1.641 -2.126 -1.96 -2.081 -2.211 -2.502 -2.67 -2.859 -3.068 -3.3 -3.566 -3.932 -5.947 -5 ,20876 ,KEBNE ,16692591,Thu Nov 25 20:51:51 CET,Thu Nov 25 22:47:47 CET,0.0 1.297 1.601 1.832 2.015 2.194 2.355 2.494 2.748 2.861 2.961 2.767 3.226 3.313 3.481 3.626 3.762 3.823 3.942 4.06 4.229 4.336 4.434 4.574 4.708 4.835 4.959 5.081 5.24 5.396 5.532 5.69 5.844 5.98 6.14 6.335 6.517 6.702 6.903 7.11 7.297 7.497 7.734 7.965 8.198 8.435 8.679 8.873 9.001 9.032 8.78 8.189 7.611 7.069 6.544 6.047 5.59 5.158 4.785 4.409 4.092 3.805 3.519 3.267 3.036 2.808 2.567 2.344 2.156 1.959 1.738 1.545 1.342 1.149 0.992 0.815 0.627 0.441 0.254 0.112 -0.039 -0.275 -0.438 -0.599 -0.678 -0.848 -1.03 -1.239 -1.349 -1.843 -1.703 -1.834 -1.971 -2.263 -2.43 -2.625 -2.83 -3.07 -3.379 -3.803 -6.381 -6 ,9041 ,KEBNE ,16692592,Thu Nov 25 20:51:51 CET,Thu Nov 25 22:48:01 CET,0.0 1.897 2.238 2.489 2.689 2.854 3.001 3.144 3.387 3.488 3.585 3.392 3.854 3.94 4.099 4.25 4.394 4.466 4.6 4.713 4.859 4.961 5.067 5.212 5.346 5.469 5.581 5.693 5.846 5.995 6.129 6.286 6.435 6.569 6.712 6.897 7.083 7.269 7.47 7.687 7.885 8.081 8.3 8.483 8.681 8.888 9.111 9.306 9.432 9.459 9.135 8.48 7.848 7.237 6.704 6.184 5.676 5.236 4.873 4.489 4.155 3.856 3.568 3.289 3.03 2.801 2.55 2.32 2.123 1.917 1.698 1.504 1.303 1.107 0.955 0.798 0.632 0.461 0.285 0.163 0.034 -0.177 -0.335 -0.51 -0.598 -0.772 -0.954 -1.154 -1.262 -1.746 -1.607 -1.736 -1.859 -2.148 -2.31 -2.503 -2.716 -2.946 -3.231 -3.613 -5.676 -7 ,26610 ,KEBNE ,16692593,Thu Nov 25 20:51:51 CET,Thu Nov 25 22:48:14 CET,0.0 1.655 1.989 2.212 2.406 2.577 2.727 2.863 3.117 3.23 3.323 3.121 3.575 3.654 3.809 3.96 4.102 4.166 4.286 4.405 4.576 4.681 4.783 4.935 5.095 5.249 5.383 5.503 5.654 5.795 5.923 6.081 6.229 6.362 6.515 6.687 6.853 7.019 7.19 7.379 7.57 7.763 7.964 8.151 8.36 8.592 8.836 9.038 9.156 9.162 8.831 8.164 7.487 6.831 6.255 5.753 5.333 4.943 4.589 4.21 3.879 3.595 3.31 3.053 2.801 2.551 2.308 2.095 1.899 1.696 1.485 1.303 1.105 0.9 0.747 0.592 0.435 0.265 0.075 -0.059 -0.2 -0.418 -0.569 -0.72 -0.795 -0.961 -1.131 -1.32 -1.424 -1.908 -1.759 -1.877 -1.999 -2.274 -2.43 -2.615 -2.832 -3.077 -3.349 -3.697 -5.628 -8 ,25798 ,KEBNE ,16692594,Thu Nov 25 20:51:52 CET,Thu Nov 25 22:50:18 CET,0.0 1.515 1.887 2.145 2.351 2.536 2.7 2.842 3.091 3.2 3.304 3.119 3.59 3.678 3.849 4.007 4.148 4.213 4.333 4.446 4.615 4.734 4.845 4.997 5.14 5.272 5.408 5.533 5.671 5.819 5.961 6.116 6.266 6.406 6.563 6.738 6.916 7.116 7.325 7.533 7.733 7.934 8.163 8.392 8.658 8.916 9.134 9.349 9.527 9.567 9.38 8.814 8.181 7.601 7.063 6.574 6.135 5.713 5.343 4.985 4.667 4.365 4.073 3.799 3.537 3.296 3.053 2.833 2.643 2.447 2.235 2.056 1.871 1.672 1.514 1.359 1.199 1.034 0.848 0.714 0.58 0.369 0.22 0.068 -0.017 -0.2 -0.376 -0.551 -0.65 -1.131 -0.967 -1.076 -1.184 -1.447 -1.609 -1.79 -1.989 -2.21 -2.487 -2.878 -4.27 -9 ,16649 ,KEBNE ,16692595,Thu Nov 25 20:51:51 CET,Thu Nov 25 22:49:02 CET,0.0 1.847 2.163 2.398 2.598 2.774 2.942 3.083 3.309 3.409 3.505 3.314 3.78 3.868 4.026 4.179 4.335 4.41 4.544 4.66 4.823 4.923 5.02 5.164 5.301 5.428 5.552 5.672 5.823 5.961 6.089 6.24 6.373 6.497 6.645 6.809 6.968 7.15 7.325 7.483 7.656 7.858 8.071 8.274 8.496 8.717 8.948 9.154 9.273 9.289 9.12 8.52 7.829 7.167 6.615 6.126 5.656 5.187 4.789 4.396 4.023 3.697 3.41 3.13 2.855 2.616 2.373 2.147 1.945 1.741 1.536 1.356 1.167 0.975 0.822 0.668 0.509 0.335 0.154 0.027 -0.103 -0.301 -0.449 -0.61 -0.692 -0.852 -1.032 -1.227 -1.323 -1.8 -1.653 -1.775 -1.891 -2.152 -2.313 -2.501 -2.706 -2.929 -3.206 -3.582 -5.138 -10 ,26030 ,KEBNE ,16692596,Thu Nov 25 20:51:51 CET,Thu Nov 25 22:47:55 CET,0.0 1.448 1.813 2.083 2.295 2.468 2.618 2.754 3.006 3.118 3.222 3.032 3.493 3.575 3.743 3.895 4.039 4.106 4.232 4.37 4.576 4.701 4.816 4.976 5.12 5.25 5.378 5.509 5.67 5.823 5.972 6.135 6.275 6.419 6.591 6.782 6.972 7.168 7.36 7.554 7.765 7.996 8.256 8.512 8.777 9.008 9.212 9.402 9.539 9.555 9.358 8.819 8.183 7.571 6.983 6.442 5.967 5.506 5.108 4.73 4.4 4.115 3.828 3.519 3.237 2.986 2.714 2.472 2.27 2.064 1.841 1.658 1.472 1.266 1.107 0.934 0.753 0.57 0.378 0.245 0.104 -0.117 -0.276 -0.439 -0.519 -0.681 -0.844 -1.02 -1.117 -1.606 -1.468 -1.595 -1.726 -2.013 -2.166 -2.327 -2.534 -2.767 -3.03 -3.413 -4.856 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt deleted file mode 100644 index 15c5e18c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18166 ,KEBNE ,16692597,Thu Nov 25 20:51:52 CET,Thu Nov 25 22:48:48 CET,0.0 1.96 2.343 2.624 2.846 3.042 3.197 3.348 3.631 3.763 3.884 3.724 4.199 4.293 4.466 4.636 4.806 4.883 5.029 5.173 5.377 5.499 5.621 5.804 5.982 6.153 6.311 6.46 6.652 6.835 7.027 7.274 7.501 7.714 7.964 8.241 8.499 8.783 9.082 9.409 9.77 10.181 10.647 11.12 11.7 12.32 13.001 13.786 14.699 15.735 16.827 17.475 17.677 17.679 17.602 17.471 17.299 17.148 17.003 16.817 16.647 16.473 16.292 16.123 15.959 15.808 15.634 15.487 15.362 15.216 15.063 14.932 14.787 14.638 14.522 14.388 14.245 14.103 13.946 13.84 13.735 13.559 13.436 13.311 13.243 13.096 12.938 12.757 12.67 12.217 12.388 12.283 12.166 11.918 11.78 11.624 11.438 11.226 10.962 10.5 9.146 -2 ,20093 ,KEBNE ,16692598,Thu Nov 25 20:51:51 CET,Thu Nov 25 22:48:03 CET,0.0 1.671 2.036 2.299 2.516 2.713 2.889 3.051 3.339 3.466 3.591 3.449 3.929 4.033 4.24 4.431 4.603 4.693 4.873 5.038 5.253 5.386 5.529 5.745 5.942 6.118 6.286 6.44 6.629 6.824 7.033 7.283 7.514 7.74 8.01 8.319 8.614 8.924 9.245 9.585 9.945 10.365 10.865 11.355 11.9 12.49 13.159 13.896 14.758 15.692 16.735 17.515 17.833 17.937 17.921 17.83 17.678 17.494 17.328 17.161 16.992 16.815 16.65 16.49 16.335 16.188 16.017 15.85 15.704 15.56 15.412 15.279 15.139 15.001 14.887 14.756 14.618 14.483 14.357 14.27 14.162 13.971 13.83 13.682 13.61 13.46 13.3 13.134 13.044 12.581 12.748 12.63 12.504 12.247 12.086 11.898 11.702 11.482 11.178 10.783 9.361 -3 ,15607 ,KEBNE ,16692599,Thu Nov 25 20:51:55 CET,Thu Nov 25 22:42:35 CET,0.0 1.657 1.99 2.246 2.459 2.638 2.81 2.979 3.285 3.409 3.527 3.383 3.855 3.949 4.147 4.336 4.504 4.588 4.747 4.891 5.103 5.237 5.365 5.543 5.711 5.885 6.058 6.221 6.439 6.648 6.843 7.081 7.303 7.507 7.75 8.022 8.276 8.561 8.866 9.178 9.513 9.885 10.307 10.73 11.231 11.801 12.454 13.171 13.98 14.921 15.911 16.547 16.779 16.832 16.796 16.698 16.571 16.426 16.29 16.114 15.94 15.789 15.632 15.484 15.347 15.2 15.036 14.894 14.768 14.635 14.492 14.366 14.238 14.101 13.982 13.863 13.744 13.61 13.461 13.353 13.241 13.068 12.944 12.815 12.75 12.624 12.485 12.314 12.225 11.763 11.928 11.821 11.71 11.481 11.346 11.173 10.967 10.745 10.461 10.078 8.811 -4 ,10097 ,KEBNE ,16692600,Thu Nov 25 20:51:55 CET,Thu Nov 25 22:46:46 CET,0.0 1.114 1.461 1.708 1.914 2.105 2.285 2.444 2.706 2.827 2.941 2.771 3.238 3.33 3.497 3.655 3.815 3.892 4.039 4.182 4.393 4.532 4.664 4.848 5.032 5.215 5.391 5.551 5.748 5.946 6.14 6.367 6.586 6.797 7.044 7.344 7.632 7.933 8.261 8.593 8.926 9.321 9.775 10.223 10.753 11.326 11.993 12.767 13.634 14.567 15.648 16.478 16.809 16.912 16.915 16.849 16.755 16.641 16.513 16.375 16.235 16.102 15.98 15.846 15.7 15.556 15.414 15.287 15.169 15.016 14.845 14.723 14.594 14.449 14.34 14.229 14.111 13.977 13.825 13.711 13.596 13.439 13.331 13.205 13.135 12.981 12.826 12.661 12.566 12.106 12.291 12.198 12.097 11.849 11.708 11.538 11.352 11.156 10.92 10.581 9.351 -5 ,23410 ,KEBNE ,16692601,Thu Nov 25 20:51:55 CET,Thu Nov 25 22:47:20 CET,0.0 1.257 1.644 1.912 2.143 2.347 2.507 2.653 2.944 3.08 3.202 3.046 3.53 3.631 3.829 4.027 4.215 4.299 4.46 4.624 4.841 4.974 5.108 5.298 5.483 5.666 5.84 6.021 6.256 6.455 6.64 6.878 7.121 7.352 7.619 7.917 8.201 8.513 8.842 9.189 9.557 9.97 10.455 10.945 11.49 12.083 12.774 13.573 14.494 15.482 16.625 17.417 17.737 17.841 17.822 17.746 17.63 17.473 17.328 17.173 17.028 16.89 16.734 16.561 16.391 16.252 16.091 15.95 15.837 15.692 15.525 15.384 15.252 15.124 15.015 14.896 14.757 14.606 14.46 14.352 14.234 14.053 13.93 13.803 13.741 13.624 13.484 13.31 13.222 12.77 12.941 12.843 12.737 12.498 12.371 12.216 12.024 11.79 11.53 11.197 9.619 -6 ,19331 ,KEBNE ,16692602,Thu Nov 25 20:52:54 CET,Thu Nov 25 22:48:03 CET,0.0 1.142 1.556 1.81 2.032 2.243 2.42 2.576 2.857 2.984 3.103 2.943 3.411 3.505 3.704 3.893 4.061 4.144 4.307 4.466 4.701 4.851 4.995 5.198 5.38 5.556 5.728 5.89 6.112 6.337 6.546 6.796 7.033 7.26 7.518 7.793 8.062 8.371 8.709 9.058 9.418 9.828 10.292 10.748 11.266 11.828 12.488 13.234 14.079 15.039 16.045 16.692 16.978 17.054 17.035 16.951 16.798 16.611 16.45 16.283 16.106 15.93 15.757 15.587 15.424 15.281 15.12 14.962 14.822 14.661 14.48 14.328 14.161 13.99 13.871 13.748 13.617 13.478 13.328 13.225 13.12 12.931 12.795 12.664 12.595 12.456 12.308 12.126 12.031 11.574 11.76 11.65 11.519 11.237 11.087 10.915 10.711 10.456 10.172 9.808 8.446 -8 ,10884 ,KEBNE ,16692604,Thu Nov 25 20:52:53 CET,Thu Nov 25 22:48:44 CET,0.0 1.649 2.004 2.268 2.479 2.654 2.816 2.965 3.233 3.36 3.481 3.324 3.803 3.902 4.082 4.263 4.442 4.531 4.695 4.845 5.063 5.214 5.357 5.548 5.735 5.907 6.067 6.225 6.43 6.628 6.813 7.037 7.269 7.486 7.723 8.0 8.272 8.563 8.885 9.244 9.619 10.031 10.491 10.949 11.494 12.091 12.764 13.517 14.397 15.336 16.292 16.967 17.251 17.286 17.201 17.108 17.002 16.854 16.686 16.49 16.303 16.126 15.942 15.768 15.612 15.458 15.282 15.113 14.983 14.848 14.686 14.551 14.414 14.257 14.13 14.007 13.873 13.709 13.546 13.444 13.33 13.15 13.032 12.895 12.819 12.673 12.51 12.332 12.238 11.764 11.927 11.826 11.712 11.438 11.295 11.134 10.939 10.73 10.463 10.104 8.771 -9 ,9562 ,KEBNE ,16692605,Thu Nov 25 20:52:54 CET,Thu Nov 25 22:49:08 CET,0.0 1.525 1.923 2.213 2.436 2.616 2.782 2.934 3.216 3.35 3.475 3.332 3.814 3.919 4.105 4.275 4.442 4.524 4.69 4.852 5.084 5.223 5.353 5.556 5.746 5.931 6.115 6.275 6.473 6.676 6.874 7.1 7.324 7.545 7.813 8.125 8.415 8.726 9.061 9.417 9.784 10.206 10.717 11.197 11.715 12.294 12.949 13.656 14.498 15.457 16.43 17.047 17.255 17.311 17.292 17.186 17.036 16.89 16.739 16.545 16.365 16.214 16.048 15.865 15.695 15.549 15.393 15.235 15.088 14.934 14.78 14.654 14.507 14.338 14.207 14.065 13.924 13.781 13.628 13.516 13.399 13.23 13.102 12.961 12.886 12.728 12.556 12.365 12.265 11.813 11.976 11.857 11.724 11.438 11.283 11.096 10.891 10.671 10.407 10.045 8.784 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt deleted file mode 100644 index 7090eff6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31714 ,KEBNE ,16692607,Thu Nov 25 20:52:54 CET,Thu Nov 25 22:50:02 CET,0.0 0.654 0.845 0.961 1.078 1.165 1.241 1.307 1.423 1.47 1.516 1.252 1.667 1.711 1.793 1.858 1.921 1.954 2.01 2.055 2.13 2.183 2.23 2.286 2.335 2.378 2.421 2.465 2.516 2.557 2.582 2.586 2.576 2.563 2.546 2.532 2.498 2.437 2.39 2.335 2.261 2.147 1.957 1.738 1.454 1.07 0.504 -0.253 -1.246 -2.698 -5.108 -7.889 -10.067 -11.793 -13.191 -14.402 -15.423 -16.314 -17.093 -17.87 -18.531 -19.109 -19.63 -20.093 -20.533 -20.931 -21.326 -21.673 -21.973 -22.288 -22.606 -22.872 -23.156 -23.452 -23.682 -23.911 -24.149 -24.397 -24.651 -24.824 -24.996 -25.272 -25.473 -25.685 -25.795 -26.024 -26.266 -26.508 -26.63 -27.16 -27.031 -27.166 -27.312 -27.641 -27.816 -28.009 -28.218 -28.439 -28.699 -29.089 -30.154 -2 ,19084 ,KEBNE ,16692608,Thu Nov 25 20:52:54 CET,Thu Nov 25 22:52:16 CET,0.0 0.252 0.406 0.567 0.695 0.814 0.917 1.004 1.159 1.227 1.284 1.008 1.434 1.48 1.565 1.63 1.681 1.712 1.771 1.827 1.915 1.964 2.007 2.061 2.105 2.153 2.197 2.232 2.278 2.315 2.337 2.352 2.35 2.352 2.355 2.356 2.347 2.311 2.263 2.203 2.118 1.999 1.841 1.647 1.37 1.041 0.534 -0.217 -1.27 -2.805 -5.261 -8.122 -10.379 -12.2 -13.663 -14.922 -16.019 -16.971 -17.775 -18.551 -19.176 -19.715 -20.233 -20.703 -21.123 -21.503 -21.892 -22.243 -22.551 -22.88 -23.218 -23.488 -23.758 -24.027 -24.24 -24.464 -24.692 -24.923 -25.156 -25.322 -25.5 -25.761 -25.93 -26.125 -26.226 -26.43 -26.66 -26.893 -27.006 -27.523 -27.352 -27.479 -27.615 -27.908 -28.071 -28.245 -28.44 -28.681 -28.975 -29.347 -30.785 -3 ,463 ,KEBNE ,16692609,Thu Nov 25 20:53:56 CET,Thu Nov 25 22:49:56 CET,0.0 0.284 0.425 0.556 0.661 0.744 0.815 0.887 1.011 1.066 1.129 0.883 1.309 1.349 1.429 1.502 1.568 1.597 1.642 1.69 1.761 1.804 1.838 1.896 1.959 2.009 2.052 2.092 2.13 2.166 2.202 2.23 2.267 2.301 2.313 2.301 2.283 2.255 2.188 2.09 1.983 1.844 1.652 1.413 1.073 0.649 0.074 -0.711 -1.8 -3.408 -5.952 -8.778 -11.015 -12.854 -14.317 -15.542 -16.585 -17.503 -18.294 -19.07 -19.718 -20.292 -20.834 -21.327 -21.776 -22.185 -22.612 -23.001 -23.332 -23.664 -24.006 -24.284 -24.566 -24.855 -25.071 -25.286 -25.512 -25.758 -26.01 -26.179 -26.352 -26.636 -26.839 -27.045 -27.147 -27.347 -27.567 -27.806 -27.931 -28.459 -28.308 -28.433 -28.571 -28.906 -29.091 -29.287 -29.498 -29.72 -29.982 -30.359 -31.537 -4 ,32070 ,KEBNE ,16692610,Thu Nov 25 20:53:57 CET,Thu Nov 25 22:52:54 CET,0.0 0.461 0.67 0.838 0.974 1.081 1.161 1.233 1.374 1.454 1.528 1.251 1.678 1.741 1.85 1.951 2.049 2.093 2.159 2.211 2.298 2.359 2.411 2.48 2.556 2.638 2.694 2.747 2.797 2.821 2.849 2.884 2.909 2.919 2.923 2.926 2.919 2.895 2.868 2.815 2.726 2.621 2.472 2.281 2.004 1.625 1.107 0.386 -0.65 -2.193 -4.728 -7.624 -9.888 -11.735 -13.274 -14.558 -15.628 -16.608 -17.44 -18.225 -18.879 -19.447 -19.976 -20.479 -20.955 -21.385 -21.822 -22.203 -22.519 -22.846 -23.188 -23.464 -23.745 -24.029 -24.25 -24.479 -24.716 -24.965 -25.218 -25.389 -25.563 -25.828 -26.009 -26.206 -26.308 -26.521 -26.743 -26.975 -27.092 -27.61 -27.454 -27.594 -27.747 -28.05 -28.216 -28.411 -28.611 -28.827 -29.109 -29.499 -31.062 -5 ,27125 ,KEBNE ,16692611,Thu Nov 25 20:53:56 CET,Thu Nov 25 22:50:37 CET,0.0 0.447 0.688 0.872 0.996 1.101 1.221 1.317 1.472 1.55 1.62 1.359 1.797 1.843 1.928 2.013 2.092 2.125 2.183 2.24 2.312 2.366 2.419 2.483 2.537 2.588 2.649 2.706 2.768 2.824 2.876 2.93 2.964 2.984 3.023 3.054 3.056 3.061 3.047 2.982 2.902 2.81 2.667 2.482 2.199 1.852 1.4 0.771 -0.161 -1.627 -3.998 -6.721 -8.914 -10.699 -12.167 -13.428 -14.492 -15.423 -16.199 -16.962 -17.611 -18.164 -18.667 -19.154 -19.598 -19.985 -20.394 -20.76 -21.071 -21.376 -21.679 -21.932 -22.196 -22.479 -22.703 -22.924 -23.145 -23.378 -23.622 -23.789 -23.956 -24.215 -24.403 -24.595 -24.688 -24.888 -25.103 -25.323 -25.435 -25.954 -25.808 -25.94 -26.079 -26.395 -26.569 -26.754 -26.973 -27.214 -27.503 -27.892 -28.96 -6 ,13577 ,KEBNE ,16692612,Thu Nov 25 20:53:56 CET,Thu Nov 25 22:49:41 CET,0.0 0.746 0.971 1.156 1.317 1.451 1.564 1.662 1.827 1.892 1.948 1.663 2.079 2.123 2.211 2.296 2.371 2.407 2.472 2.527 2.61 2.664 2.708 2.764 2.815 2.869 2.917 2.962 3.034 3.107 3.168 3.242 3.3 3.325 3.362 3.4 3.409 3.405 3.388 3.342 3.254 3.111 2.912 2.691 2.403 2.004 1.455 0.696 -0.398 -1.934 -4.374 -7.118 -9.28 -11.095 -12.622 -13.919 -15.017 -15.982 -16.796 -17.596 -18.267 -18.848 -19.391 -19.893 -20.349 -20.757 -21.18 -21.545 -21.864 -22.197 -22.52 -22.781 -23.046 -23.322 -23.547 -23.777 -24.004 -24.238 -24.487 -24.664 -24.847 -25.122 -25.303 -25.493 -25.594 -25.809 -26.03 -26.253 -26.37 -26.894 -26.757 -26.889 -27.031 -27.337 -27.503 -27.682 -27.884 -28.121 -28.405 -28.767 -30.279 -7 ,8013 ,KEBNE ,16692613,Thu Nov 25 20:53:56 CET,Thu Nov 25 22:51:43 CET,0.0 0.457 0.668 0.814 0.954 1.074 1.172 1.263 1.41 1.466 1.526 1.274 1.705 1.751 1.823 1.901 1.975 2.01 2.076 2.132 2.217 2.271 2.321 2.395 2.463 2.525 2.585 2.639 2.686 2.74 2.798 2.84 2.858 2.864 2.869 2.869 2.868 2.848 2.813 2.755 2.669 2.569 2.409 2.208 1.926 1.55 1.031 0.312 -0.747 -2.258 -4.592 -7.245 -9.393 -11.179 -12.639 -13.905 -14.963 -15.881 -16.654 -17.421 -18.067 -18.606 -19.097 -19.557 -19.984 -20.368 -20.763 -21.129 -21.448 -21.766 -22.089 -22.352 -22.621 -22.908 -23.129 -23.351 -23.582 -23.816 -24.067 -24.238 -24.407 -24.681 -24.867 -25.05 -25.15 -25.353 -25.561 -25.79 -25.907 -26.433 -26.289 -26.427 -26.57 -26.866 -27.033 -27.23 -27.439 -27.668 -27.961 -28.352 -30.38 -8 ,22262 ,KEBNE ,16692614,Thu Nov 25 20:54:59 CET,Thu Nov 25 22:51:29 CET,0.0 0.7 0.882 1.01 1.11 1.206 1.298 1.373 1.508 1.566 1.618 1.345 1.763 1.814 1.913 1.987 2.056 2.091 2.15 2.211 2.308 2.363 2.409 2.471 2.52 2.558 2.599 2.633 2.661 2.671 2.688 2.705 2.71 2.721 2.73 2.737 2.74 2.727 2.684 2.622 2.551 2.448 2.311 2.128 1.848 1.477 0.97 0.267 -0.781 -2.333 -4.819 -7.73 -10.047 -11.891 -13.43 -14.735 -15.798 -16.748 -17.543 -18.325 -19.022 -19.631 -20.174 -20.669 -21.113 -21.518 -21.93 -22.292 -22.609 -22.962 -23.334 -23.612 -23.896 -24.198 -24.426 -24.654 -24.895 -25.146 -25.392 -25.56 -25.736 -26.014 -26.202 -26.39 -26.487 -26.681 -26.879 -27.096 -27.211 -27.736 -27.602 -27.746 -27.894 -28.201 -28.38 -28.579 -28.806 -29.061 -29.363 -29.784 -31.153 -9 ,199 ,KEBNE ,16692615,Thu Nov 25 20:54:59 CET,Thu Nov 25 22:52:54 CET,0.0 0.55 0.754 0.906 1.045 1.134 1.199 1.276 1.427 1.495 1.554 1.287 1.718 1.772 1.869 1.948 2.012 2.039 2.09 2.141 2.21 2.264 2.311 2.36 2.407 2.448 2.483 2.519 2.552 2.572 2.592 2.605 2.626 2.656 2.662 2.656 2.642 2.619 2.59 2.521 2.428 2.336 2.214 2.05 1.778 1.386 0.886 0.224 -0.813 -2.377 -4.868 -7.69 -9.869 -11.621 -13.095 -14.375 -15.451 -16.397 -17.205 -17.973 -18.61 -19.184 -19.721 -20.228 -20.684 -21.081 -21.483 -21.834 -22.137 -22.45 -22.773 -23.041 -23.308 -23.576 -23.783 -23.995 -24.215 -24.444 -24.682 -24.852 -25.029 -25.3 -25.492 -25.699 -25.803 -26.021 -26.244 -26.472 -26.59 -27.123 -26.976 -27.104 -27.244 -27.545 -27.713 -27.902 -28.107 -28.328 -28.597 -28.95 -30.183 -10 ,5470 ,KEBNE ,16692616,Thu Nov 25 20:54:59 CET,Thu Nov 25 22:52:26 CET,0.0 0.441 0.646 0.8 0.933 1.065 1.176 1.271 1.444 1.513 1.567 1.312 1.747 1.802 1.902 2.006 2.097 2.142 2.227 2.29 2.381 2.441 2.494 2.562 2.622 2.678 2.733 2.782 2.825 2.854 2.884 2.909 2.922 2.944 2.982 3.003 3.005 3.009 2.997 2.942 2.837 2.725 2.598 2.425 2.15 1.767 1.247 0.551 -0.489 -2.008 -4.418 -7.188 -9.323 -11.033 -12.481 -13.748 -14.813 -15.757 -16.543 -17.296 -17.933 -18.483 -18.999 -19.479 -19.93 -20.328 -20.725 -21.092 -21.408 -21.718 -22.039 -22.311 -22.585 -22.872 -23.094 -23.317 -23.546 -23.78 -24.023 -24.199 -24.374 -24.639 -24.825 -25.022 -25.126 -25.332 -25.541 -25.763 -25.879 -26.409 -26.278 -26.413 -26.551 -26.851 -27.024 -27.212 -27.427 -27.672 -27.954 -28.34 -29.657 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt deleted file mode 100644 index bfb82191..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16611 ,KEBNE ,16692617,Thu Nov 25 20:54:59 CET,Thu Nov 25 22:49:00 CET,0.0 2.07 2.507 2.818 3.055 3.279 3.476 3.637 3.88 3.971 4.055 3.826 4.275 4.347 4.45 4.543 4.648 4.695 4.784 4.865 4.953 5.0 5.04 5.09 5.132 5.166 5.188 5.201 5.217 5.223 5.221 5.232 5.223 5.188 5.149 5.099 5.035 4.947 4.812 4.625 4.41 4.148 3.816 3.414 2.84 2.156 1.264 0.017 -1.733 -4.203 -7.976 -12.206 -15.492 -18.144 -20.266 -22.049 -23.538 -24.835 -25.927 -27.0 -27.92 -28.717 -29.458 -30.134 -30.773 -31.36 -31.932 -32.428 -32.864 -33.325 -33.81 -34.195 -34.57 -34.964 -35.28 -35.609 -35.938 -36.284 -36.648 -36.908 -37.191 -37.609 -37.895 -38.207 -38.373 -38.714 -39.067 -39.462 -39.66 -40.259 -40.246 -40.479 -40.714 -41.286 -41.628 -41.944 -42.269 -42.679 -43.225 -43.971 -47.233 -2 ,31995 ,KEBNE ,16692618,Thu Nov 25 20:54:59 CET,Thu Nov 25 22:49:13 CET,0.0 1.708 2.165 2.411 2.655 2.912 3.121 3.268 3.458 3.545 3.637 3.441 3.894 3.962 4.093 4.221 4.313 4.352 4.422 4.479 4.547 4.585 4.619 4.652 4.672 4.686 4.71 4.728 4.731 4.729 4.725 4.715 4.697 4.668 4.63 4.566 4.472 4.366 4.233 4.062 3.846 3.564 3.221 2.822 2.269 1.556 0.623 -0.612 -2.351 -4.809 -8.612 -12.72 -15.787 -18.256 -20.286 -21.997 -23.395 -24.63 -25.67 -26.648 -27.502 -28.311 -29.092 -29.781 -30.36 -30.886 -31.45 -31.958 -32.39 -32.815 -33.248 -33.612 -33.997 -34.385 -34.668 -34.969 -35.298 -35.668 -36.056 -36.305 -36.559 -36.963 -37.256 -37.563 -37.72 -38.042 -38.385 -38.761 -38.962 -39.586 -39.626 -39.884 -40.146 -40.637 -40.904 -41.228 -41.59 -42.016 -42.524 -43.325 -46.158 -3 ,4897 ,KEBNE ,16692619,Thu Nov 25 20:56:01 CET,Thu Nov 25 22:50:03 CET,0.0 2.043 2.468 2.748 2.991 3.207 3.394 3.562 3.829 3.916 4.003 3.82 4.28 4.36 4.509 4.645 4.737 4.777 4.85 4.905 4.98 5.031 5.075 5.121 5.171 5.221 5.261 5.301 5.334 5.342 5.346 5.341 5.336 5.317 5.27 5.213 5.161 5.086 4.97 4.807 4.618 4.385 4.061 3.668 3.129 2.481 1.601 0.388 -1.312 -3.77 -7.507 -11.573 -14.677 -17.156 -19.161 -20.903 -22.369 -23.618 -24.675 -25.735 -26.651 -27.441 -28.155 -28.812 -29.428 -29.999 -30.592 -31.102 -31.526 -31.943 -32.357 -32.72 -33.125 -33.556 -33.891 -34.225 -34.554 -34.903 -35.287 -35.552 -35.822 -36.249 -36.531 -36.813 -36.963 -37.272 -37.608 -37.987 -38.181 -38.802 -38.805 -39.034 -39.291 -39.892 -40.238 -40.583 -40.978 -41.469 -42.01 -42.778 -46.01 -4 ,30841 ,KEBNE ,16692620,Thu Nov 25 20:56:01 CET,Thu Nov 25 22:50:16 CET,0.0 1.762 2.195 2.534 2.763 2.942 3.093 3.226 3.45 3.538 3.621 3.392 3.833 3.897 4.007 4.11 4.221 4.271 4.36 4.431 4.5 4.539 4.583 4.658 4.712 4.745 4.774 4.802 4.806 4.799 4.799 4.785 4.766 4.747 4.714 4.652 4.58 4.481 4.33 4.155 3.961 3.693 3.356 2.966 2.424 1.73 0.772 -0.492 -2.222 -4.644 -8.327 -12.416 -15.556 -18.041 -20.104 -21.895 -23.394 -24.701 -25.798 -26.861 -27.747 -28.501 -29.207 -29.906 -30.562 -31.147 -31.733 -32.227 -32.654 -33.108 -33.589 -33.98 -34.367 -34.778 -35.121 -35.467 -35.818 -36.225 -36.652 -36.939 -37.209 -37.583 -37.853 -38.152 -38.304 -38.622 -38.963 -39.331 -39.522 -40.147 -40.23 -40.52 -40.815 -41.457 -41.799 -42.1 -42.403 -42.836 -43.448 -44.345 -47.781 -5 ,28661 ,KEBNE ,16692621,Thu Nov 25 20:56:02 CET,Thu Nov 25 22:50:25 CET,0.0 1.636 2.086 2.389 2.627 2.822 2.978 3.13 3.412 3.516 3.602 3.386 3.835 3.908 4.033 4.136 4.242 4.294 4.378 4.44 4.533 4.608 4.68 4.758 4.82 4.868 4.904 4.935 4.963 4.983 4.998 4.994 4.972 4.944 4.914 4.882 4.834 4.745 4.619 4.455 4.249 3.982 3.612 3.234 2.733 2.051 1.136 -0.076 -1.729 -4.098 -7.804 -11.848 -14.879 -17.353 -19.451 -21.261 -22.801 -24.135 -25.195 -26.197 -27.051 -27.828 -28.538 -29.174 -29.777 -30.334 -30.916 -31.454 -31.919 -32.387 -32.859 -33.245 -33.646 -34.072 -34.404 -34.743 -35.099 -35.471 -35.849 -36.114 -36.387 -36.798 -37.077 -37.376 -37.542 -37.906 -38.297 -38.674 -38.857 -39.467 -39.481 -39.728 -39.989 -40.59 -40.935 -41.318 -41.768 -42.278 -42.907 -43.802 -46.566 -6 ,32188 ,KEBNE ,16692622,Thu Nov 25 20:56:01 CET,Thu Nov 25 22:49:55 CET,0.0 1.735 2.185 2.517 2.771 2.96 3.114 3.249 3.474 3.561 3.64 3.434 3.881 3.937 4.035 4.144 4.245 4.286 4.368 4.445 4.545 4.608 4.656 4.703 4.745 4.789 4.824 4.845 4.852 4.848 4.842 4.822 4.79 4.764 4.741 4.695 4.627 4.528 4.405 4.247 4.087 3.89 3.559 3.16 2.623 1.94 0.999 -0.261 -1.994 -4.445 -8.139 -12.152 -15.222 -17.711 -19.761 -21.462 -22.93 -24.227 -25.315 -26.383 -27.264 -28.013 -28.766 -29.532 -30.233 -30.806 -31.365 -31.894 -32.37 -32.843 -33.284 -33.657 -34.039 -34.447 -34.783 -35.128 -35.503 -35.881 -36.242 -36.488 -36.751 -37.186 -37.509 -37.848 -38.005 -38.309 -38.659 -39.008 -39.19 -39.818 -39.818 -40.029 -40.261 -40.822 -41.132 -41.442 -41.784 -42.209 -42.767 -43.55 -46.51 -7 ,29766 ,KEBNE ,16692623,Thu Nov 25 20:56:01 CET,Thu Nov 25 22:50:39 CET,0.0 1.966 2.378 2.638 2.855 3.048 3.204 3.359 3.628 3.729 3.826 3.667 4.13 4.193 4.307 4.406 4.505 4.558 4.638 4.714 4.843 4.918 4.98 5.048 5.098 5.132 5.148 5.172 5.205 5.208 5.203 5.209 5.211 5.185 5.138 5.095 5.036 4.942 4.83 4.688 4.51 4.253 3.863 3.434 2.899 2.229 1.305 0.07 -1.639 -4.093 -7.874 -12.006 -15.088 -17.519 -19.53 -21.255 -22.707 -23.984 -25.04 -26.061 -26.939 -27.712 -28.433 -29.098 -29.72 -30.272 -30.843 -31.359 -31.802 -32.298 -32.821 -33.243 -33.703 -34.163 -34.49 -34.856 -35.26 -35.674 -36.087 -36.354 -36.628 -37.059 -37.362 -37.677 -37.829 -38.15 -38.505 -38.883 -39.079 -39.682 -39.644 -39.87 -40.129 -40.689 -40.983 -41.314 -41.684 -42.127 -42.678 -43.448 -46.494 -8 ,13921 ,KEBNE ,16692624,Thu Nov 25 20:56:01 CET,Thu Nov 25 22:50:15 CET,0.0 2.031 2.441 2.729 2.952 3.125 3.269 3.406 3.679 3.79 3.881 3.664 4.112 4.188 4.315 4.435 4.567 4.625 4.707 4.783 4.878 4.928 4.978 5.027 5.053 5.094 5.142 5.181 5.21 5.217 5.215 5.203 5.181 5.158 5.149 5.111 5.038 4.942 4.819 4.664 4.457 4.192 3.844 3.466 2.98 2.298 1.374 0.164 -1.506 -3.885 -7.631 -11.766 -14.881 -17.379 -19.418 -21.144 -22.602 -23.852 -24.883 -25.882 -26.739 -27.482 -28.162 -28.828 -29.434 -29.953 -30.499 -30.983 -31.401 -31.853 -32.305 -32.688 -33.114 -33.545 -33.862 -34.203 -34.555 -34.906 -35.265 -35.517 -35.791 -36.24 -36.55 -36.853 -37.02 -37.37 -37.717 -38.081 -38.282 -38.926 -38.979 -39.26 -39.561 -40.215 -40.572 -40.975 -41.438 -41.954 -42.563 -43.399 -46.455 -9 ,14396 ,KEBNE ,16692625,Thu Nov 25 20:56:01 CET,Thu Nov 25 22:49:53 CET,0.0 1.426 1.895 2.236 2.487 2.701 2.89 3.02 3.228 3.327 3.41 3.192 3.655 3.745 3.902 4.033 4.132 4.178 4.262 4.326 4.422 4.476 4.531 4.613 4.662 4.696 4.723 4.751 4.796 4.849 4.886 4.89 4.864 4.825 4.782 4.741 4.687 4.597 4.498 4.366 4.196 3.973 3.643 3.251 2.673 1.953 1.067 -0.098 -1.758 -4.163 -7.813 -11.787 -14.881 -17.399 -19.482 -21.309 -22.824 -24.075 -25.121 -26.198 -27.136 -27.917 -28.614 -29.303 -29.967 -30.552 -31.121 -31.611 -32.031 -32.437 -32.874 -33.272 -33.685 -34.126 -34.481 -34.83 -35.162 -35.499 -35.853 -36.104 -36.376 -36.82 -37.143 -37.49 -37.663 -37.995 -38.323 -38.687 -38.899 -39.529 -39.523 -39.773 -40.062 -40.665 -40.968 -41.307 -41.709 -42.196 -42.797 -43.666 -46.653 -10 ,21841 ,KEBNE ,16692626,Thu Nov 25 20:57:03 CET,Thu Nov 25 22:52:46 CET,0.0 2.003 2.499 2.852 3.116 3.319 3.507 3.677 3.979 4.107 4.239 4.119 4.615 4.723 4.884 4.988 5.079 5.118 5.195 5.267 5.35 5.404 5.46 5.526 5.578 5.63 5.671 5.7 5.741 5.765 5.755 5.732 5.71 5.683 5.631 5.555 5.472 5.365 5.233 5.089 4.954 4.787 4.488 4.118 3.625 2.989 2.136 0.978 -0.61 -2.945 -6.682 -10.751 -13.83 -16.302 -18.294 -19.98 -21.392 -22.63 -23.658 -24.669 -25.528 -26.317 -27.099 -27.795 -28.392 -28.907 -29.438 -29.937 -30.379 -30.823 -31.273 -31.641 -32.01 -32.387 -32.707 -33.088 -33.502 -33.943 -34.395 -34.709 -35.04 -35.504 -35.817 -36.166 -36.348 -36.725 -37.119 -37.53 -37.731 -38.344 -38.346 -38.567 -38.808 -39.389 -39.694 -40.004 -40.345 -40.736 -41.256 -42.047 -44.718 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index ff661979..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15123 ,KEBNE ,16692627,Thu Nov 25 20:58:06 CET,Thu Nov 25 22:52:22 CET,0.0 1.193 1.576 1.849 2.08 2.28 2.449 2.61 2.92 3.064 3.2 3.082 3.573 3.686 3.902 4.11 4.316 4.415 4.605 4.795 5.055 5.225 5.393 5.643 5.891 6.127 6.364 6.598 6.883 7.158 7.436 7.775 8.096 8.413 8.788 9.212 9.629 10.099 10.628 11.195 11.788 12.476 13.318 14.162 15.148 16.284 17.61 19.138 21.017 23.403 26.433 28.933 30.439 31.435 32.014 32.402 32.63 32.755 32.839 32.845 32.829 32.82 32.797 32.752 32.703 32.633 32.505 32.37 32.269 32.18 32.083 31.987 31.864 31.731 31.61 31.469 31.33 31.175 30.99 30.859 30.728 30.48 30.293 30.094 29.988 29.765 29.516 29.253 29.12 28.638 28.634 28.452 28.286 27.912 27.687 27.394 27.003 26.534 25.964 25.12 21.425 -2 ,22371 ,KEBNE ,16692628,Thu Nov 25 20:59:08 CET,Thu Nov 25 22:50:06 CET,0.0 1.447 1.827 2.091 2.312 2.515 2.705 2.873 3.166 3.301 3.44 3.332 3.832 3.956 4.18 4.386 4.598 4.708 4.907 5.091 5.351 5.523 5.693 5.933 6.166 6.394 6.614 6.831 7.112 7.401 7.688 8.032 8.368 8.691 9.073 9.512 9.933 10.395 10.894 11.437 12.015 12.652 13.416 14.235 15.223 16.336 17.642 19.129 20.948 23.251 26.169 28.633 30.1 31.031 31.682 32.156 32.443 32.625 32.742 32.835 32.882 32.86 32.809 32.776 32.721 32.642 32.511 32.383 32.305 32.221 32.128 32.049 31.937 31.806 31.698 31.543 31.363 31.154 30.936 30.812 30.678 30.43 30.259 30.094 29.994 29.754 29.483 29.181 29.003 28.469 28.396 28.169 27.948 27.468 27.183 26.83 26.404 25.912 25.381 24.648 21.272 -3 ,20078 ,KEBNE ,16692629,Thu Nov 25 20:59:08 CET,Thu Nov 25 22:51:09 CET,0.0 1.228 1.629 1.919 2.148 2.36 2.558 2.733 3.021 3.157 3.294 3.167 3.664 3.783 4.013 4.233 4.436 4.536 4.734 4.924 5.203 5.38 5.552 5.804 6.044 6.277 6.502 6.721 7.017 7.297 7.559 7.887 8.208 8.523 8.899 9.332 9.749 10.216 10.735 11.283 11.859 12.522 13.311 14.118 15.092 16.177 17.425 18.938 20.797 23.087 26.042 28.576 30.057 30.945 31.549 31.975 32.256 32.429 32.532 32.637 32.698 32.711 32.688 32.616 32.538 32.47 32.391 32.276 32.103 31.921 31.768 31.626 31.475 31.351 31.258 31.126 30.962 30.778 30.58 30.447 30.321 30.11 29.94 29.762 29.67 29.477 29.251 28.986 28.858 28.39 28.409 28.218 27.993 27.497 27.258 27.029 26.743 26.334 25.777 24.979 21.32 -4 ,22868 ,KEBNE ,16692630,Thu Nov 25 20:59:08 CET,Thu Nov 25 22:50:02 CET,0.0 1.164 1.522 1.789 2.006 2.205 2.385 2.545 2.843 2.99 3.136 3.027 3.527 3.646 3.856 4.059 4.263 4.362 4.552 4.738 5.01 5.183 5.351 5.596 5.826 6.053 6.291 6.523 6.819 7.111 7.396 7.747 8.088 8.417 8.794 9.21 9.611 10.06 10.559 11.116 11.719 12.404 13.21 14.041 15.038 16.176 17.52 19.024 20.81 23.043 25.859 28.318 29.854 30.877 31.561 32.042 32.385 32.611 32.72 32.756 32.75 32.728 32.663 32.585 32.514 32.439 32.331 32.214 32.129 32.032 31.877 31.741 31.623 31.508 31.397 31.243 31.052 30.853 30.673 30.561 30.431 30.216 30.036 29.828 29.737 29.535 29.292 29.05 28.934 28.455 28.434 28.244 28.088 27.78 27.585 27.352 27.077 26.735 26.298 25.589 20.211 -5 ,32275 ,KEBNE ,16692631,Thu Nov 25 20:59:12 CET,Thu Nov 25 22:49:44 CET,0.0 1.436 1.833 2.112 2.341 2.555 2.74 2.899 3.196 3.335 3.468 3.347 3.835 3.944 4.154 4.36 4.562 4.658 4.853 5.047 5.321 5.494 5.668 5.92 6.155 6.384 6.609 6.832 7.125 7.411 7.693 8.038 8.371 8.684 9.043 9.465 9.871 10.318 10.807 11.347 11.941 12.622 13.459 14.313 15.312 16.477 17.828 19.358 21.245 23.546 26.412 28.99 30.61 31.706 32.454 32.962 33.349 33.638 33.808 33.909 33.921 33.881 33.823 33.763 33.694 33.594 33.464 33.356 33.275 33.173 33.052 32.968 32.876 32.771 32.68 32.551 32.406 32.256 32.096 31.991 31.886 31.71 31.58 31.435 31.343 31.146 30.942 30.71 30.584 30.092 30.102 29.917 29.718 29.259 29.005 28.733 28.425 28.027 27.521 26.763 23.357 -6 ,3724 ,KEBNE ,16692632,Thu Nov 25 21:00:11 CET,Thu Nov 25 22:52:11 CET,0.0 1.744 2.105 2.363 2.565 2.749 2.916 3.077 3.369 3.502 3.628 3.488 3.985 4.106 4.334 4.557 4.768 4.868 5.065 5.26 5.554 5.737 5.91 6.169 6.419 6.652 6.874 7.092 7.386 7.674 7.952 8.288 8.617 8.938 9.306 9.74 10.177 10.642 11.156 11.71 12.314 13.029 13.837 14.644 15.612 16.714 18.044 19.593 21.406 23.653 26.5 28.985 30.533 31.519 32.155 32.553 32.8 32.974 33.099 33.155 33.156 33.139 33.068 32.967 32.856 32.734 32.601 32.489 32.39 32.285 32.178 32.07 31.919 31.74 31.602 31.446 31.261 31.081 30.905 30.793 30.692 30.508 30.359 30.205 30.13 29.976 29.796 29.598 29.48 29.01 29.087 28.934 28.78 28.433 28.214 27.933 27.533 27.074 26.528 25.71 22.432 -7 ,3179 ,KEBNE ,16692633,Thu Nov 25 21:00:11 CET,Thu Nov 25 22:52:19 CET,0.0 1.254 1.589 1.855 2.082 2.281 2.471 2.653 2.991 3.138 3.269 3.151 3.652 3.771 3.995 4.215 4.423 4.521 4.716 4.904 5.18 5.363 5.55 5.818 6.073 6.32 6.554 6.779 7.069 7.36 7.646 7.986 8.327 8.661 9.04 9.464 9.873 10.343 10.854 11.393 11.962 12.61 13.396 14.209 15.162 16.252 17.573 19.051 20.834 23.11 26.073 28.727 30.304 31.27 31.906 32.358 32.645 32.821 32.925 32.966 32.977 32.967 32.916 32.859 32.796 32.718 32.609 32.489 32.371 32.25 32.112 31.969 31.8 31.604 31.441 31.264 31.102 30.962 30.806 30.681 30.549 30.375 30.245 30.074 29.987 29.808 29.605 29.393 29.272 28.78 28.844 28.679 28.489 28.091 27.861 27.622 27.307 26.937 26.448 25.699 22.099 -8 ,9324 ,KEBNE ,16692634,Thu Nov 25 21:00:11 CET,Thu Nov 25 22:52:28 CET,0.0 1.054 1.429 1.7 1.951 2.17 2.366 2.552 2.876 3.019 3.158 3.041 3.546 3.665 3.894 4.106 4.309 4.411 4.615 4.817 5.106 5.287 5.459 5.716 5.962 6.183 6.4 6.626 6.917 7.194 7.472 7.818 8.147 8.474 8.861 9.289 9.712 10.184 10.694 11.228 11.801 12.466 13.258 14.091 15.07 16.203 17.583 19.18 21.157 23.612 26.72 29.543 31.29 32.361 33.082 33.61 33.943 34.189 34.355 34.47 34.523 34.524 34.508 34.491 34.439 34.353 34.251 34.148 34.036 33.899 33.744 33.612 33.476 33.325 33.211 33.065 32.883 32.685 32.471 32.335 32.205 32.001 31.841 31.664 31.576 31.381 31.16 30.92 30.781 30.285 30.308 30.118 29.925 29.529 29.284 28.989 28.679 28.289 27.753 26.983 24.203 -9 ,27211 ,KEBNE ,16692635,Thu Nov 25 21:00:11 CET,Thu Nov 25 22:51:50 CET,0.0 1.521 1.935 2.217 2.437 2.642 2.827 2.988 3.287 3.427 3.563 3.439 3.938 4.058 4.308 4.548 4.761 4.869 5.08 5.287 5.58 5.762 5.945 6.213 6.469 6.714 6.945 7.175 7.496 7.801 8.086 8.439 8.791 9.141 9.558 10.029 10.471 10.956 11.494 12.074 12.696 13.405 14.209 15.004 15.967 17.103 18.467 20.053 22.007 24.342 27.216 29.801 31.361 32.328 32.991 33.448 33.744 33.892 33.908 33.908 33.872 33.794 33.697 33.604 33.517 33.408 33.254 33.101 32.993 32.852 32.668 32.536 32.386 32.232 32.1 31.934 31.759 31.569 31.359 31.211 31.056 30.836 30.689 30.527 30.446 30.272 30.059 29.82 29.695 29.195 29.179 29.004 28.844 28.522 28.321 28.076 27.757 27.348 26.859 26.051 22.46 -10 ,5122 ,KEBNE ,16692636,Thu Nov 25 21:00:11 CET,Thu Nov 25 22:52:20 CET,0.0 1.024 1.415 1.718 1.956 2.15 2.32 2.486 2.793 2.929 3.06 2.936 3.427 3.548 3.778 3.988 4.184 4.277 4.47 4.658 4.918 5.09 5.257 5.501 5.743 5.971 6.193 6.412 6.689 6.953 7.211 7.537 7.865 8.197 8.577 8.999 9.414 9.881 10.411 10.971 11.543 12.206 13.006 13.815 14.777 15.893 17.246 18.827 20.729 23.065 26.002 28.566 30.12 31.098 31.775 32.259 32.586 32.82 32.947 33.006 33.024 32.998 32.955 32.928 32.879 32.798 32.706 32.627 32.519 32.375 32.242 32.153 32.056 31.912 31.801 31.693 31.569 31.446 31.315 31.22 31.125 30.924 30.767 30.622 30.544 30.377 30.184 29.952 29.832 29.354 29.398 29.249 29.093 28.656 28.354 28.01 27.572 27.008 26.342 25.491 22.367 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt deleted file mode 100644 index 4989e8c6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13699 ,KEBNE ,16692638,Thu Nov 25 21:01:13 CET,Thu Nov 25 22:55:39 CET,0.0 2.086 2.584 2.994 3.342 3.602 3.804 3.983 4.331 4.499 4.654 4.558 5.057 5.198 5.483 5.752 5.985 6.091 6.295 6.493 6.782 6.957 7.129 7.392 7.64 7.867 8.089 8.311 8.596 8.874 9.152 9.491 9.806 10.109 10.461 10.858 11.25 11.682 12.147 12.638 13.171 13.791 14.518 15.259 16.142 17.149 18.348 19.73 21.31 23.185 25.678 27.742 28.892 29.638 30.036 30.279 30.488 30.627 30.688 30.682 30.642 30.584 30.507 30.432 30.341 30.226 30.086 29.957 29.83 29.712 29.602 29.508 29.404 29.28 29.182 29.081 28.976 28.858 28.719 28.618 28.515 28.346 28.207 28.049 27.972 27.824 27.678 27.505 27.412 26.965 27.074 26.934 26.792 26.487 26.323 26.15 25.923 25.628 25.244 24.731 22.736 -2 ,505 ,KEBNE ,16692639,Thu Nov 25 21:01:14 CET,Thu Nov 25 22:57:50 CET,0.0 1.724 2.219 2.584 2.873 3.14 3.39 3.603 3.985 4.167 4.336 4.263 4.778 4.915 5.191 5.452 5.687 5.798 6.014 6.214 6.504 6.692 6.878 7.15 7.413 7.657 7.894 8.135 8.446 8.744 9.039 9.411 9.766 10.106 10.503 10.928 11.342 11.791 12.257 12.782 13.361 13.99 14.758 15.627 16.668 17.812 19.131 20.652 22.458 24.552 27.149 29.316 30.494 31.12 31.448 31.688 31.829 31.888 31.899 31.869 31.819 31.726 31.608 31.507 31.396 31.26 31.106 30.965 30.834 30.691 30.537 30.411 30.277 30.131 30.012 29.873 29.724 29.571 29.411 29.3 29.185 29.011 28.88 28.733 28.656 28.499 28.327 28.135 28.036 27.577 27.716 27.591 27.432 27.067 26.853 26.634 26.398 26.127 25.747 25.182 23.314 -3 ,25199 ,KEBNE ,16692640,Thu Nov 25 21:01:13 CET,Thu Nov 25 22:54:34 CET,0.0 2.218 2.73 3.111 3.406 3.672 3.906 4.117 4.488 4.66 4.826 4.746 5.259 5.4 5.678 5.927 6.145 6.253 6.481 6.701 6.995 7.173 7.358 7.632 7.885 8.133 8.377 8.62 8.92 9.198 9.475 9.819 10.157 10.49 10.867 11.295 11.717 12.179 12.682 13.199 13.738 14.372 15.117 15.864 16.745 17.737 18.889 20.206 21.8 23.718 26.148 28.134 29.236 29.945 30.393 30.713 30.92 31.058 31.118 31.118 31.089 31.022 30.916 30.838 30.762 30.641 30.532 30.437 30.326 30.212 30.102 30.002 29.886 29.755 29.644 29.532 29.429 29.319 29.2 29.099 28.973 28.79 28.669 28.54 28.468 28.298 28.125 27.915 27.801 27.348 27.463 27.326 27.182 26.869 26.683 26.469 26.218 25.925 25.577 25.066 23.198 -4 ,11128 ,KEBNE ,16692641,Thu Nov 25 21:01:14 CET,Thu Nov 25 22:56:22 CET,0.0 2.613 3.113 3.46 3.725 3.951 4.172 4.402 4.812 4.992 5.154 5.059 5.562 5.693 5.942 6.181 6.401 6.514 6.758 6.98 7.292 7.505 7.714 8.017 8.312 8.588 8.854 9.115 9.459 9.792 10.111 10.495 10.856 11.215 11.636 12.09 12.515 12.999 13.527 14.084 14.701 15.397 16.189 17.005 17.993 19.095 20.407 21.931 23.66 25.706 28.31 30.494 31.755 32.587 33.139 33.433 33.565 33.63 33.617 33.591 33.555 33.499 33.419 33.338 33.248 33.145 33.045 32.955 32.861 32.75 32.626 32.504 32.351 32.187 32.061 31.93 31.782 31.629 31.486 31.389 31.285 31.113 30.988 30.85 30.781 30.629 30.449 30.259 30.168 29.731 29.852 29.713 29.578 29.302 29.145 28.953 28.72 28.447 28.126 27.646 25.244 -5 ,14334 ,KEBNE ,16692642,Thu Nov 25 21:01:13 CET,Thu Nov 25 22:55:41 CET,0.0 1.83 2.327 2.678 2.94 3.186 3.428 3.647 4.026 4.197 4.369 4.293 4.797 4.92 5.156 5.381 5.605 5.735 6.0 6.231 6.536 6.728 6.914 7.171 7.418 7.661 7.903 8.128 8.422 8.717 8.996 9.336 9.661 9.976 10.347 10.764 11.152 11.575 12.048 12.566 13.112 13.731 14.46 15.188 16.053 17.025 18.143 19.458 21.049 22.985 25.358 27.381 28.617 29.251 29.588 29.814 29.969 30.069 30.153 30.224 30.217 30.165 30.065 29.976 29.891 29.776 29.661 29.576 29.489 29.378 29.244 29.12 29.002 28.878 28.763 28.647 28.531 28.392 28.243 28.14 28.039 27.862 27.718 27.572 27.498 27.342 27.179 27.005 26.913 26.472 26.611 26.488 26.349 26.053 25.884 25.696 25.49 25.208 24.848 24.378 22.547 -6 ,5654 ,KEBNE ,16692643,Thu Nov 25 21:01:13 CET,Thu Nov 25 22:55:37 CET,0.0 1.802 2.305 2.713 3.03 3.304 3.557 3.771 4.123 4.284 4.45 4.371 4.878 5.012 5.253 5.472 5.686 5.802 6.03 6.238 6.523 6.706 6.894 7.188 7.482 7.756 8.014 8.249 8.544 8.821 9.087 9.431 9.791 10.149 10.554 11.006 11.45 11.935 12.47 13.051 13.672 14.391 15.232 16.088 17.092 18.186 19.413 20.839 22.562 24.62 27.129 29.196 30.369 31.093 31.56 31.834 31.95 31.988 31.992 31.953 31.879 31.805 31.741 31.643 31.522 31.408 31.287 31.174 31.08 30.976 30.858 30.726 30.57 30.435 30.326 30.206 30.076 29.928 29.784 29.686 29.575 29.4 29.285 29.166 29.093 28.934 28.759 28.562 28.456 28.004 28.093 27.933 27.768 27.412 27.2 26.975 26.736 26.434 26.062 25.544 23.848 -7 ,16305 ,KEBNE ,16692644,Thu Nov 25 21:02:16 CET,Thu Nov 25 22:55:13 CET,0.0 1.633 2.14 2.527 2.831 3.061 3.267 3.481 3.921 4.118 4.284 4.21 4.745 4.91 5.191 5.428 5.66 5.777 6.002 6.203 6.494 6.68 6.853 7.101 7.364 7.639 7.907 8.158 8.476 8.793 9.101 9.465 9.814 10.162 10.557 10.99 11.405 11.891 12.439 13.001 13.594 14.268 15.076 15.87 16.774 17.84 19.098 20.514 22.185 24.228 26.751 28.833 29.99 30.635 31.028 31.287 31.432 31.472 31.479 31.488 31.46 31.384 31.277 31.152 31.035 30.924 30.797 30.686 30.581 30.456 30.315 30.2 30.08 29.942 29.834 29.723 29.595 29.442 29.265 29.139 29.012 28.823 28.689 28.55 28.48 28.319 28.148 27.949 27.836 27.385 27.519 27.395 27.257 26.937 26.752 26.551 26.291 25.965 25.648 25.249 23.695 -8 ,24620 ,KEBNE ,16692645,Thu Nov 25 21:02:20 CET,Thu Nov 25 22:57:12 CET,0.0 1.78 2.326 2.71 2.986 3.252 3.505 3.718 4.076 4.242 4.39 4.282 4.784 4.916 5.166 5.382 5.592 5.699 5.906 6.099 6.383 6.565 6.744 7.024 7.292 7.533 7.755 7.972 8.289 8.614 8.933 9.326 9.695 10.054 10.472 10.945 11.39 11.863 12.378 12.944 13.548 14.237 15.048 15.857 16.814 17.914 19.214 20.694 22.507 24.635 27.212 29.393 30.659 31.422 31.853 32.154 32.336 32.435 32.495 32.51 32.507 32.468 32.384 32.268 32.149 32.046 31.938 31.82 31.693 31.565 31.431 31.314 31.183 31.054 30.947 30.818 30.685 30.544 30.392 30.286 30.176 30.005 29.881 29.737 29.66 29.498 29.325 29.143 29.05 28.607 28.732 28.596 28.451 28.139 27.957 27.721 27.429 27.122 26.777 26.293 24.646 -9 ,8602 ,KEBNE ,16692646,Thu Nov 25 21:02:15 CET,Thu Nov 25 22:55:56 CET,0.0 1.43 1.884 2.257 2.549 2.804 3.038 3.246 3.616 3.765 3.905 3.809 4.32 4.458 4.705 4.934 5.151 5.257 5.463 5.666 5.963 6.147 6.322 6.589 6.85 7.092 7.328 7.563 7.871 8.165 8.444 8.79 9.141 9.478 9.86 10.305 10.745 11.224 11.738 12.291 12.887 13.587 14.428 15.258 16.226 17.345 18.683 20.199 21.975 24.152 26.814 29.006 30.217 30.988 31.492 31.735 31.841 31.894 31.913 31.903 31.845 31.783 31.707 31.608 31.509 31.402 31.277 31.16 31.049 30.915 30.759 30.635 30.509 30.384 30.293 30.183 30.063 29.945 29.803 29.698 29.585 29.416 29.298 29.134 29.037 28.855 28.668 28.451 28.33 27.867 27.949 27.783 27.6 27.191 26.989 26.793 26.552 26.235 25.873 25.451 23.635 -10 ,22388 ,KEBNE ,16692647,Thu Nov 25 21:02:16 CET,Thu Nov 25 22:57:39 CET,0.0 2.58 3.147 3.506 3.775 4.015 4.249 4.478 4.859 5.028 5.198 5.123 5.62 5.74 5.98 6.22 6.455 6.571 6.8 7.014 7.307 7.491 7.681 7.967 8.228 8.491 8.74 8.957 9.236 9.519 9.796 10.128 10.448 10.758 11.118 11.514 11.898 12.332 12.816 13.341 13.886 14.516 15.26 16.009 16.888 17.874 19.054 20.42 22.034 23.97 26.443 28.541 29.67 30.356 30.816 31.134 31.312 31.427 31.504 31.5 31.44 31.381 31.321 31.244 31.166 31.089 30.99 30.884 30.77 30.656 30.516 30.394 30.289 30.168 30.066 29.964 29.86 29.752 29.633 29.542 29.434 29.259 29.13 28.99 28.917 28.759 28.564 28.349 28.245 27.788 27.914 27.792 27.661 27.334 27.147 26.934 26.701 26.451 26.147 25.699 23.19 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index d8296734..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27935 ,KEBNE ,17069912,Fri Dec 24 13:03:22 CET,Fri Dec 24 14:58:26 CET,0.0 1.893 2.257 2.511 2.739 2.929 3.09 3.241 3.517 3.646 3.767 3.606 4.086 4.181 4.362 4.532 4.69 4.768 4.916 5.046 5.23 5.357 5.482 5.662 5.823 5.976 6.134 6.282 6.471 6.65 6.82 7.026 7.216 7.389 7.598 7.84 8.061 8.294 8.563 8.862 9.166 9.482 9.829 10.183 10.6 11.041 11.512 11.977 12.481 13.043 13.517 13.532 13.294 12.992 12.688 12.394 12.098 11.798 11.524 11.229 10.962 10.706 10.435 10.186 9.965 9.762 9.548 9.355 9.178 8.991 8.801 8.635 8.457 8.274 8.132 7.984 7.826 7.659 7.486 7.366 7.243 7.046 6.917 6.778 6.697 6.532 6.363 6.18 6.086 5.611 5.78 5.667 5.538 5.233 5.061 4.884 4.676 4.438 4.154 3.761 2.37 -2 ,2905 ,KEBNE ,17069913,Fri Dec 24 13:12:51 CET,Fri Dec 24 15:07:59 CET,0.0 1.231 1.567 1.83 2.039 2.204 2.359 2.5 2.745 2.857 2.975 2.825 3.3 3.387 3.565 3.744 3.903 3.977 4.119 4.255 4.458 4.589 4.71 4.881 5.044 5.195 5.336 5.473 5.653 5.833 5.996 6.185 6.361 6.53 6.742 6.98 7.203 7.432 7.675 7.931 8.198 8.503 8.852 9.181 9.565 10.009 10.497 11.011 11.543 12.01 12.317 12.332 12.178 11.929 11.628 11.307 10.963 10.605 10.31 10.033 9.774 9.526 9.283 9.016 8.757 8.543 8.316 8.103 7.915 7.722 7.518 7.351 7.175 6.985 6.837 6.692 6.533 6.347 6.155 6.028 5.899 5.698 5.559 5.422 5.352 5.188 5.002 4.809 4.703 4.224 4.356 4.231 4.098 3.814 3.655 3.481 3.289 3.036 2.714 2.316 0.058 -3 ,20331 ,KEBNE ,17069914,Fri Dec 24 13:13:54 CET,Fri Dec 24 15:08:08 CET,0.0 1.463 1.817 2.069 2.275 2.459 2.626 2.766 3.019 3.14 3.255 3.105 3.584 3.672 3.858 4.042 4.207 4.285 4.428 4.566 4.76 4.884 5.006 5.183 5.351 5.508 5.66 5.802 5.99 6.174 6.346 6.555 6.756 6.946 7.167 7.414 7.634 7.867 8.137 8.408 8.658 8.943 9.275 9.615 9.998 10.394 10.825 11.294 11.792 12.236 12.562 12.53 12.343 12.094 11.797 11.478 11.169 10.862 10.564 10.251 9.964 9.695 9.431 9.194 8.969 8.752 8.526 8.32 8.139 7.947 7.731 7.55 7.363 7.169 7.013 6.856 6.702 6.538 6.355 6.23 6.106 5.893 5.745 5.606 5.538 5.385 5.203 5.008 4.91 4.438 4.572 4.451 4.33 4.036 3.877 3.709 3.507 3.256 2.957 2.532 0.739 -4 ,26766 ,KEBNE ,17069915,Fri Dec 24 13:24:31 CET,Fri Dec 24 15:20:19 CET,0.0 1.741 2.123 2.38 2.584 2.762 2.92 3.06 3.312 3.433 3.547 3.396 3.894 4.013 4.213 4.362 4.511 4.581 4.712 4.843 5.037 5.159 5.27 5.43 5.588 5.745 5.893 6.039 6.217 6.371 6.532 6.746 6.938 7.122 7.338 7.565 7.788 8.038 8.304 8.587 8.883 9.198 9.57 9.926 10.323 10.774 11.269 11.794 12.333 12.866 13.36 13.504 13.366 13.142 12.9 12.637 12.361 12.092 11.839 11.571 11.338 11.13 10.923 10.707 10.493 10.304 10.099 9.91 9.748 9.575 9.392 9.237 9.076 8.9 8.766 8.621 8.451 8.277 8.095 7.964 7.824 7.595 7.438 7.29 7.213 7.047 6.868 6.669 6.567 6.09 6.241 6.12 5.986 5.669 5.486 5.271 5.021 4.741 4.422 3.981 1.486 -6 ,9462 ,KEBNE ,17069917,Fri Dec 24 13:24:31 CET,Fri Dec 24 15:19:33 CET,0.0 1.587 1.969 2.223 2.437 2.614 2.773 2.914 3.185 3.313 3.43 3.262 3.73 3.817 3.98 4.134 4.297 4.373 4.503 4.631 4.812 4.925 5.034 5.193 5.344 5.488 5.636 5.786 5.964 6.126 6.29 6.487 6.67 6.835 7.037 7.28 7.503 7.74 7.997 8.271 8.564 8.901 9.284 9.632 10.003 10.409 10.858 11.356 11.86 12.357 12.802 12.929 12.787 12.513 12.235 11.946 11.631 11.32 11.029 10.707 10.432 10.201 9.974 9.734 9.503 9.292 9.057 8.845 8.652 8.449 8.256 8.088 7.9 7.697 7.543 7.39 7.228 7.052 6.87 6.742 6.605 6.395 6.247 6.087 6.001 5.824 5.649 5.461 5.354 4.868 5.02 4.903 4.766 4.451 4.271 4.058 3.823 3.571 3.265 2.788 0.924 -7 ,7547 ,KEBNE ,17069918,Fri Dec 24 13:25:36 CET,Fri Dec 24 15:21:58 CET,0.0 1.704 2.035 2.264 2.461 2.637 2.803 2.965 3.245 3.364 3.476 3.327 3.794 3.884 4.061 4.225 4.374 4.441 4.575 4.7 4.876 4.988 5.095 5.248 5.402 5.553 5.698 5.841 6.013 6.167 6.318 6.494 6.663 6.829 7.026 7.24 7.44 7.664 7.896 8.137 8.406 8.716 9.062 9.406 9.773 10.129 10.557 11.032 11.505 11.966 12.351 12.427 12.25 11.928 11.59 11.29 10.989 10.677 10.376 10.064 9.809 9.574 9.33 9.071 8.817 8.6 8.368 8.159 7.99 7.795 7.572 7.386 7.208 7.028 6.887 6.744 6.586 6.413 6.232 6.1 5.963 5.753 5.596 5.43 5.346 5.179 5.003 4.819 4.727 4.248 4.395 4.27 4.129 3.821 3.659 3.483 3.278 3.042 2.745 2.326 0.64 -8 ,6906 ,KEBNE ,17069919,Fri Dec 24 13:26:38 CET,Fri Dec 24 15:21:41 CET,0.0 1.597 1.94 2.179 2.388 2.566 2.714 2.846 3.094 3.204 3.302 3.11 3.566 3.646 3.806 3.965 4.122 4.2 4.347 4.497 4.707 4.826 4.936 5.101 5.264 5.417 5.56 5.698 5.877 6.046 6.213 6.41 6.601 6.786 6.992 7.219 7.427 7.648 7.895 8.158 8.433 8.729 9.052 9.384 9.777 10.206 10.677 11.21 11.748 12.251 12.713 12.895 12.772 12.508 12.231 11.95 11.701 11.428 11.179 10.946 10.704 10.465 10.234 10.021 9.816 9.621 9.419 9.226 9.046 8.854 8.662 8.507 8.327 8.139 7.996 7.841 7.676 7.512 7.346 7.217 7.076 6.857 6.701 6.542 6.463 6.297 6.121 5.933 5.835 5.363 5.511 5.39 5.265 4.992 4.827 4.641 4.437 4.204 3.919 3.503 1.75 -9 ,9526 ,KEBNE ,17069920,Fri Dec 24 13:29:47 CET,Fri Dec 24 15:24:31 CET,0.0 1.817 2.166 2.414 2.606 2.789 2.95 3.082 3.32 3.429 3.533 3.359 3.828 3.913 4.08 4.244 4.392 4.463 4.601 4.73 4.917 5.039 5.158 5.331 5.49 5.629 5.765 5.906 6.084 6.246 6.405 6.596 6.775 6.951 7.177 7.427 7.639 7.873 8.143 8.42 8.689 8.982 9.321 9.67 10.076 10.51 10.985 11.499 12.053 12.645 13.186 13.351 13.206 12.92 12.634 12.327 11.994 11.658 11.339 11.008 10.737 10.494 10.259 10.045 9.828 9.618 9.382 9.157 8.959 8.753 8.541 8.361 8.178 7.991 7.838 7.679 7.526 7.362 7.181 7.059 6.935 6.733 6.592 6.433 6.347 6.188 6.021 5.828 5.723 5.242 5.37 5.237 5.101 4.802 4.631 4.431 4.2 3.94 3.627 3.195 1.327 -10 ,8273 ,KEBNE ,17069921,Fri Dec 24 13:30:51 CET,Fri Dec 24 15:26:18 CET,0.0 2.009 2.361 2.604 2.826 3.038 3.221 3.377 3.673 3.808 3.925 3.75 4.227 4.327 4.511 4.672 4.814 4.88 5.012 5.141 5.327 5.444 5.553 5.715 5.875 6.015 6.147 6.281 6.453 6.616 6.783 6.991 7.187 7.374 7.581 7.816 8.045 8.285 8.533 8.791 9.068 9.373 9.728 10.088 10.511 10.965 11.417 11.893 12.425 12.968 13.456 13.6 13.451 13.246 13.022 12.737 12.46 12.21 11.967 11.692 11.447 11.229 11.001 10.779 10.578 10.396 10.21 10.017 9.837 9.66 9.466 9.296 9.129 8.963 8.834 8.695 8.543 8.388 8.227 8.122 8.008 7.801 7.658 7.52 7.454 7.301 7.126 6.95 6.856 6.395 6.569 6.461 6.335 6.056 5.903 5.728 5.532 5.299 5.012 4.628 2.8 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt deleted file mode 100644 index d66bea3d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15373 ,KEBNE ,16692648,Thu Nov 25 21:02:16 CET,Thu Nov 25 22:55:59 CET,0.0 2.124 2.72 3.095 3.434 3.732 3.974 4.185 4.557 4.726 4.894 4.698 5.353 5.501 5.784 6.071 6.358 6.487 6.706 6.912 7.199 7.387 7.562 7.798 8.049 8.292 8.51 8.744 9.08 9.384 9.653 9.979 10.312 10.62 10.948 11.315 11.683 12.093 12.522 12.978 13.443 13.952 14.568 15.256 16.129 17.005 17.889 18.907 20.175 21.603 23.092 24.079 24.441 24.597 24.689 24.66 24.539 24.384 24.213 24.043 23.859 23.652 23.45 23.26 23.069 22.866 22.658 22.487 22.33 22.144 21.941 21.788 21.632 21.434 21.267 21.096 20.906 20.709 20.495 20.35 20.195 19.948 19.798 19.631 19.535 19.305 19.03 18.757 18.627 17.961 18.053 17.833 17.604 17.152 16.922 16.659 16.327 15.948 15.501 14.841 12.091 -2 ,9424 ,KEBNE ,16692649,Thu Nov 25 21:02:16 CET,Thu Nov 25 22:56:52 CET,0.0 1.876 2.475 2.892 3.208 3.457 3.708 3.931 4.324 4.506 4.67 4.493 5.165 5.313 5.599 5.86 6.103 6.236 6.508 6.749 7.082 7.323 7.57 7.92 8.249 8.559 8.844 9.093 9.386 9.655 9.91 10.208 10.496 10.786 11.124 11.493 11.85 12.241 12.675 13.152 13.645 14.2 14.842 15.476 16.218 17.05 18.039 19.197 20.486 21.958 23.746 25.05 25.666 25.979 26.104 26.073 25.942 25.818 25.676 25.477 25.299 25.108 24.89 24.701 24.534 24.375 24.202 24.003 23.823 23.649 23.446 23.27 23.076 22.854 22.674 22.497 22.33 22.137 21.902 21.752 21.613 21.357 21.177 21.012 20.911 20.704 20.523 20.323 20.217 19.606 19.825 19.661 19.465 19.001 18.744 18.461 18.127 17.732 17.314 16.764 14.0 -3 ,30726 ,KEBNE ,16692650,Thu Nov 25 21:02:16 CET,Thu Nov 25 22:55:45 CET,0.0 4.079 4.568 4.924 5.216 5.494 5.744 5.955 6.343 6.524 6.714 6.585 7.277 7.433 7.688 7.964 8.229 8.341 8.546 8.759 9.074 9.287 9.525 9.865 10.172 10.429 10.655 10.883 11.171 11.434 11.693 12.016 12.323 12.624 12.966 13.324 13.668 14.076 14.54 15.046 15.574 16.111 16.729 17.364 18.077 18.864 19.817 20.904 22.118 23.535 25.187 26.316 26.781 26.993 27.06 26.996 26.886 26.76 26.6 26.393 26.206 26.025 25.834 25.645 25.461 25.268 25.035 24.817 24.63 24.408 24.157 23.93 23.696 23.482 23.311 23.13 22.954 22.752 22.516 22.353 22.186 21.939 21.765 21.567 21.463 21.229 20.963 20.687 20.522 19.846 19.929 19.684 19.449 19.006 18.765 18.437 17.996 17.549 17.043 16.339 4.941 -4 ,3528 ,KEBNE ,16692651,Thu Nov 25 21:02:16 CET,Thu Nov 25 22:55:21 CET,0.0 3.145 3.778 4.208 4.622 4.982 5.24 5.451 5.867 6.066 6.253 6.106 6.789 6.952 7.251 7.526 7.778 7.911 8.186 8.426 8.753 8.959 9.168 9.489 9.807 10.125 10.43 10.73 11.124 11.494 11.853 12.271 12.621 12.929 13.29 13.694 14.074 14.491 14.948 15.439 15.948 16.507 17.145 17.778 18.534 19.407 20.41 21.501 22.757 24.234 25.954 27.261 27.913 28.198 28.283 28.263 28.174 28.038 27.906 27.761 27.617 27.442 27.223 27.006 26.811 26.605 26.383 26.176 26.008 25.853 25.624 25.399 25.156 24.885 24.655 24.409 24.156 23.89 23.625 23.446 23.252 22.959 22.766 22.555 22.444 22.208 21.973 21.706 21.555 20.913 21.098 20.93 20.762 20.376 20.137 19.841 19.515 19.19 18.755 18.106 15.672 -6 ,17233 ,KEBNE ,16692653,Thu Nov 25 21:02:16 CET,Thu Nov 25 22:57:16 CET,0.0 5.263 5.945 6.371 6.702 6.967 7.225 7.473 7.907 8.096 8.29 8.177 8.868 9.024 9.303 9.567 9.839 9.976 10.246 10.519 10.921 11.166 11.404 11.75 12.073 12.376 12.664 12.94 13.29 13.608 13.906 14.28 14.624 14.968 15.413 15.913 16.384 16.9 17.444 18.023 18.653 19.357 20.145 20.936 21.858 22.902 24.135 25.492 27.017 28.695 30.428 31.677 32.197 32.228 32.1 31.9 31.65 31.389 31.157 30.913 30.691 30.466 30.22 29.974 29.751 29.559 29.351 29.147 28.934 28.676 28.372 28.107 27.868 27.631 27.438 27.23 27.023 26.836 26.637 26.493 26.325 26.03 25.834 25.624 25.502 25.25 25.011 24.757 24.608 23.949 24.136 23.983 23.817 23.38 23.123 22.865 22.522 22.078 21.573 20.885 18.299 -7 ,4489 ,KEBNE ,16692654,Thu Nov 25 21:03:18 CET,Thu Nov 25 22:56:28 CET,0.0 2.442 2.954 3.32 3.601 3.864 4.124 4.342 4.708 4.881 5.048 4.839 5.496 5.639 5.882 6.123 6.355 6.472 6.714 6.923 7.217 7.424 7.615 7.859 8.092 8.329 8.573 8.798 9.077 9.36 9.636 9.96 10.251 10.523 10.861 11.256 11.624 12.019 12.456 12.904 13.379 13.927 14.547 15.146 15.854 16.644 17.533 18.559 19.756 21.075 22.544 23.583 24.022 24.228 24.311 24.278 24.149 23.964 23.784 23.576 23.348 23.111 22.881 22.664 22.437 22.24 22.038 21.846 21.668 21.472 21.269 21.104 20.931 20.683 20.438 20.182 19.935 19.69 19.432 19.263 19.094 18.833 18.649 18.448 18.342 18.119 17.886 17.601 17.449 16.795 16.932 16.753 16.586 16.19 15.963 15.696 15.369 14.994 14.529 13.836 10.192 -8 ,30585 ,KEBNE ,16692655,Thu Nov 25 21:03:19 CET,Thu Nov 25 22:56:38 CET,0.0 2.259 2.815 3.209 3.495 3.78 4.059 4.285 4.657 4.843 5.026 4.831 5.493 5.645 5.956 6.248 6.511 6.645 6.913 7.163 7.517 7.742 7.956 8.257 8.53 8.782 9.023 9.257 9.605 9.935 10.213 10.532 10.854 11.176 11.534 11.941 12.342 12.786 13.222 13.654 14.148 14.718 15.366 15.998 16.703 17.517 18.48 19.533 20.747 22.165 23.799 24.94 25.407 25.6 25.654 25.575 25.398 25.211 25.068 24.898 24.705 24.507 24.311 24.103 23.863 23.577 23.255 23.006 22.802 22.565 22.326 22.139 21.941 21.732 21.574 21.404 21.207 20.996 20.767 20.587 20.383 20.057 19.848 19.64 19.527 19.29 19.041 18.79 18.652 18.016 18.259 18.102 17.921 17.523 17.259 16.941 16.639 16.332 15.947 15.432 13.064 -10 ,23686 ,KEBNE ,16692657,Thu Nov 25 21:03:19 CET,Thu Nov 25 22:57:37 CET,0.0 2.737 3.29 3.68 4.006 4.258 4.485 4.709 5.122 5.307 5.472 5.26 5.905 6.038 6.271 6.48 6.691 6.79 6.987 7.203 7.507 7.707 7.923 8.228 8.525 8.794 9.026 9.251 9.533 9.813 10.09 10.41 10.725 11.019 11.362 11.779 12.149 12.52 12.921 13.349 13.812 14.353 14.987 15.607 16.299 17.038 17.882 18.888 20.076 21.496 23.074 24.145 24.614 24.819 24.898 24.845 24.74 24.593 24.427 24.244 24.058 23.88 23.68 23.465 23.262 23.074 22.877 22.69 22.509 22.316 22.111 21.94 21.753 21.561 21.382 21.186 21.006 20.819 20.648 20.491 20.305 20.073 19.919 19.73 19.618 19.369 19.103 18.864 18.739 18.092 18.233 18.06 17.894 17.514 17.286 17.044 16.796 16.507 16.124 15.5 10.951 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 4eb83e2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2919 ,KEBNE ,16692658,Thu Nov 25 21:03:19 CET,Thu Nov 25 22:55:04 CET,0.0 2.827 3.458 3.933 4.328 4.705 5.065 5.39 6.015 6.305 6.579 6.618 7.385 7.629 8.102 8.56 9.002 9.225 9.681 10.113 10.727 11.134 11.538 12.148 12.749 13.336 13.917 14.486 15.236 15.975 16.704 17.612 18.508 19.396 20.456 21.71 22.972 24.399 25.971 27.663 29.492 31.624 34.184 36.892 40.207 44.059 48.746 54.384 61.516 70.739 83.301 95.314 103.481 109.391 113.781 117.261 120.003 122.259 124.031 125.647 126.913 127.944 128.879 129.719 130.423 131.004 131.542 131.961 132.302 132.633 132.936 133.159 133.394 133.602 133.73 133.871 134.0 134.109 134.209 134.254 134.29 134.338 134.358 134.378 134.376 134.33 134.278 134.196 134.148 133.752 133.982 133.897 133.814 133.596 133.454 133.3 133.085 132.81 132.504 131.969 128.215 -2 ,15166 ,KEBNE ,16692659,Thu Nov 25 21:03:19 CET,Thu Nov 25 22:55:28 CET,0.0 2.3 2.893 3.346 3.744 4.092 4.405 4.72 5.367 5.657 5.918 5.932 6.687 6.932 7.386 7.826 8.292 8.522 8.95 9.372 9.99 10.392 10.783 11.361 11.936 12.516 13.088 13.653 14.399 15.126 15.854 16.768 17.67 18.552 19.593 20.812 22.025 23.398 24.895 26.523 28.33 30.455 33.04 35.777 39.075 42.891 47.63 53.352 60.465 69.505 81.757 93.625 101.77 107.721 112.074 115.398 118.024 120.233 122.027 123.666 124.902 125.927 126.843 127.632 128.314 128.885 129.462 129.965 130.362 130.721 131.054 131.31 131.549 131.774 131.935 132.061 132.165 132.25 132.317 132.363 132.426 132.543 132.602 132.633 132.632 132.627 132.622 132.558 132.502 132.071 132.25 132.145 132.011 131.668 131.473 131.262 131.015 130.714 130.339 129.672 125.442 -3 ,17915 ,KEBNE ,16692660,Thu Nov 25 21:04:22 CET,Thu Nov 25 22:56:50 CET,0.0 2.489 3.1 3.553 3.976 4.35 4.685 5.016 5.608 5.893 6.17 6.18 6.921 7.151 7.599 8.049 8.496 8.713 9.141 9.563 10.182 10.585 10.988 11.594 12.186 12.761 13.332 13.911 14.68 15.425 16.153 17.058 17.951 18.828 19.858 21.06 22.268 23.646 25.178 26.853 28.678 30.782 33.338 36.009 39.243 43.096 47.795 53.416 60.594 69.86 82.409 94.357 102.443 108.372 112.79 116.262 118.968 121.16 122.872 124.46 125.735 126.793 127.698 128.462 129.144 129.721 130.254 130.688 131.015 131.33 131.66 131.907 132.117 132.316 132.466 132.603 132.741 132.867 132.965 133.027 133.086 133.154 133.195 133.205 133.194 133.164 133.116 133.028 132.975 132.57 132.834 132.769 132.677 132.419 132.205 131.923 131.657 131.36 130.914 130.194 123.833 -4 ,385 ,KEBNE ,16692661,Thu Nov 25 21:04:22 CET,Thu Nov 25 22:56:41 CET,0.0 1.979 2.598 3.082 3.481 3.831 4.153 4.457 5.03 5.315 5.593 5.596 6.347 6.587 7.071 7.564 8.051 8.287 8.758 9.218 9.869 10.289 10.697 11.289 11.867 12.443 13.022 13.594 14.347 15.1 15.843 16.756 17.67 18.599 19.72 21.003 22.256 23.653 25.196 26.888 28.726 30.87 33.452 36.169 39.513 43.379 48.057 53.75 60.98 70.334 83.131 95.343 103.584 109.557 114.036 117.59 120.346 122.596 124.328 125.869 127.099 128.116 129.04 129.838 130.487 131.049 131.603 132.077 132.482 132.846 133.168 133.438 133.706 133.961 134.133 134.277 134.408 134.529 134.651 134.735 134.795 134.827 134.817 134.8 134.791 134.785 134.79 134.746 134.703 134.299 134.566 134.496 134.39 134.086 133.92 133.746 133.52 133.218 132.834 132.201 128.392 -5 ,27518 ,KEBNE ,16692662,Thu Nov 25 21:04:22 CET,Thu Nov 25 22:56:30 CET,0.0 1.883 2.553 3.04 3.434 3.801 4.146 4.456 5.023 5.293 5.562 5.575 6.323 6.558 7.013 7.461 7.895 8.109 8.549 8.98 9.6 10.008 10.415 11.025 11.617 12.2 12.781 13.371 14.143 14.874 15.602 16.511 17.407 18.297 19.357 20.577 21.771 23.118 24.633 26.317 28.131 30.239 32.802 35.468 38.75 42.631 47.373 53.112 60.239 69.352 81.779 93.666 101.782 107.674 112.05 115.555 118.302 120.551 122.33 123.951 125.239 126.306 127.247 128.064 128.769 129.385 129.987 130.459 130.84 131.209 131.571 131.843 132.088 132.334 132.502 132.649 132.785 132.899 133.003 133.07 133.12 133.184 133.206 133.2 133.203 133.213 133.192 133.143 133.108 132.7 132.952 132.883 132.808 132.654 132.549 132.404 132.188 131.875 131.46 130.857 127.359 -6 ,23654 ,KEBNE ,16692663,Thu Nov 25 21:04:22 CET,Thu Nov 25 22:59:08 CET,0.0 1.988 2.561 3.028 3.43 3.781 4.108 4.439 5.048 5.326 5.605 5.665 6.452 6.722 7.261 7.767 8.238 8.464 8.908 9.342 9.991 10.417 10.836 11.452 12.053 12.644 13.237 13.836 14.627 15.396 16.148 17.087 18.018 18.933 20.026 21.288 22.534 23.951 25.526 27.252 29.11 31.275 33.902 36.655 40.045 44.027 48.86 54.658 61.843 70.945 83.498 95.536 103.563 109.464 113.938 117.429 120.175 122.459 124.232 125.866 127.169 128.23 129.156 129.964 130.655 131.25 131.821 132.294 132.687 133.045 133.397 133.668 133.903 134.086 134.228 134.389 134.539 134.687 134.813 134.876 134.932 134.992 135.012 135.025 135.034 135.032 134.983 134.917 134.881 134.479 134.687 134.587 134.475 134.177 134.007 133.803 133.487 133.061 132.52 131.948 129.625 -7 ,20441 ,KEBNE ,16692664,Thu Nov 25 21:05:24 CET,Thu Nov 25 22:57:48 CET,0.0 2.255 2.86 3.33 3.756 4.133 4.511 4.869 5.447 5.712 5.963 5.949 6.696 6.941 7.434 7.91 8.378 8.606 9.036 9.479 10.153 10.588 11.013 11.627 12.221 12.807 13.388 13.962 14.716 15.46 16.195 17.099 17.993 18.877 19.941 21.178 22.395 23.76 25.272 26.942 28.784 30.917 33.492 36.206 39.486 43.297 47.948 53.597 60.76 69.939 82.366 94.351 102.487 108.469 113.001 116.549 119.321 121.557 123.261 124.832 126.115 127.151 128.018 128.746 129.374 129.919 130.448 130.911 131.292 131.64 131.979 132.241 132.513 132.772 132.943 133.096 133.202 133.281 133.376 133.438 133.477 133.525 133.538 133.521 133.508 133.473 133.432 133.401 133.39 132.992 133.228 133.163 133.058 132.815 132.651 132.431 132.197 131.893 131.505 131.037 124.93 -8 ,21022 ,KEBNE ,16692665,Thu Nov 25 21:06:26 CET,Thu Nov 25 22:57:27 CET,0.0 1.493 2.03 2.5 2.912 3.276 3.606 3.932 4.513 4.78 5.059 5.091 5.853 6.112 6.602 7.075 7.537 7.758 8.187 8.619 9.26 9.676 10.083 10.682 11.282 11.89 12.501 13.103 13.886 14.663 15.437 16.398 17.347 18.254 19.3 20.5 21.694 23.056 24.576 26.259 28.059 30.151 32.765 35.502 38.782 42.636 47.306 52.92 60.005 69.004 81.196 92.926 100.971 106.813 111.217 114.796 117.54 119.705 121.438 123.011 124.236 125.255 126.131 126.899 127.596 128.156 128.685 129.154 129.542 129.897 130.243 130.505 130.731 130.948 131.119 131.298 131.463 131.61 131.745 131.814 131.859 131.908 131.925 131.927 131.916 131.854 131.773 131.653 131.571 131.134 131.346 131.265 131.153 130.893 130.751 130.543 130.277 129.938 129.522 128.939 126.312 -9 ,769 ,KEBNE ,16692666,Thu Nov 25 21:08:31 CET,Thu Nov 25 23:00:31 CET,0.0 2.415 3.0 3.48 3.9 4.27 4.604 4.91 5.479 5.776 6.068 6.12 6.89 7.143 7.636 8.1 8.536 8.746 9.162 9.583 10.208 10.618 11.025 11.624 12.223 12.81 13.378 13.942 14.684 15.418 16.143 17.05 17.947 18.825 19.877 21.1 22.308 23.685 25.222 26.895 28.719 30.84 33.355 35.993 39.254 43.074 47.758 53.354 60.408 69.517 81.92 93.803 101.83 107.755 112.246 115.793 118.576 120.859 122.631 124.2 125.434 126.474 127.386 128.194 128.913 129.516 130.073 130.533 130.921 131.297 131.631 131.882 132.147 132.384 132.519 132.653 132.794 132.917 133.021 133.081 133.149 133.232 133.266 133.288 133.283 133.242 133.146 133.018 132.957 132.518 132.691 132.58 132.454 132.152 131.961 131.727 131.459 131.149 130.756 130.146 125.755 -10 ,12184 ,KEBNE ,16692667,Thu Nov 25 21:13:49 CET,Thu Nov 25 23:02:50 CET,0.0 2.402 3.008 3.482 3.905 4.286 4.607 4.919 5.524 5.794 6.049 6.072 6.86 7.125 7.604 8.082 8.551 8.773 9.222 9.679 10.357 10.804 11.244 11.886 12.506 13.106 13.691 14.269 15.041 15.798 16.549 17.491 18.414 19.325 20.424 21.687 22.912 24.297 25.817 27.473 29.295 31.424 34.01 36.74 40.076 43.975 48.714 54.388 61.511 70.787 83.368 95.294 103.396 109.287 113.697 117.159 119.82 121.976 123.691 125.22 126.412 127.411 128.314 129.081 129.726 130.301 130.852 131.296 131.66 132.02 132.351 132.607 132.863 133.093 133.251 133.396 133.511 133.607 133.701 133.762 133.808 133.855 133.876 133.883 133.886 133.876 133.83 133.737 133.681 133.274 133.507 133.413 133.296 133.018 132.829 132.623 132.392 132.117 131.756 131.144 127.079 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt deleted file mode 100644 index 02a25254..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20167 ,KEBNE ,16692668,Thu Nov 25 21:17:59 CET,Thu Nov 25 23:10:40 CET,0.0 1.482 1.968 2.36 2.689 2.975 3.246 3.499 3.948 4.158 4.355 4.343 4.924 5.088 5.402 5.717 6.03 6.193 6.528 6.85 7.309 7.598 7.877 8.283 8.686 9.103 9.508 9.889 10.374 10.853 11.334 11.921 12.496 13.058 13.704 14.437 15.17 15.999 16.901 17.876 18.869 19.998 21.404 22.823 24.468 26.357 28.571 31.049 34.096 37.784 42.509 46.776 49.303 50.995 52.224 53.113 53.602 53.884 54.087 54.314 54.473 54.573 54.658 54.693 54.658 54.552 54.407 54.284 54.203 54.151 54.09 54.022 53.945 53.841 53.743 53.645 53.54 53.411 53.249 53.134 53.015 52.812 52.663 52.519 52.442 52.276 52.077 51.839 51.713 51.236 51.273 51.103 50.939 50.58 50.36 50.128 49.871 49.591 49.203 48.624 45.935 -2 ,21430 ,KEBNE ,16692669,Thu Nov 25 21:21:02 CET,Thu Nov 25 23:15:53 CET,0.0 1.336 1.829 2.22 2.553 2.844 3.118 3.389 3.906 4.151 4.37 4.331 4.907 5.085 5.428 5.765 6.109 6.278 6.604 6.916 7.365 7.647 7.927 8.337 8.729 9.109 9.484 9.855 10.347 10.834 11.309 11.883 12.437 12.993 13.646 14.398 15.141 15.966 16.862 17.839 18.885 20.081 21.535 23.024 24.795 26.824 29.207 31.96 35.399 39.598 44.557 48.759 51.388 53.082 54.192 54.902 55.33 55.699 55.95 56.097 56.201 56.26 56.247 56.223 56.209 56.173 56.137 56.072 55.985 55.891 55.796 55.713 55.592 55.446 55.34 55.238 55.121 54.991 54.859 54.766 54.666 54.5 54.37 54.214 54.126 53.911 53.679 53.456 53.345 52.896 53.003 52.858 52.691 52.341 52.157 51.955 51.704 51.397 50.987 50.34 48.062 -3 ,12940 ,KEBNE ,16692670,Thu Nov 25 21:21:02 CET,Thu Nov 25 23:16:01 CET,0.0 2.106 2.652 3.026 3.339 3.619 3.862 4.086 4.511 4.705 4.899 4.909 5.504 5.687 6.019 6.333 6.63 6.773 7.055 7.321 7.717 7.996 8.282 8.722 9.143 9.524 9.901 10.267 10.748 11.223 11.687 12.27 12.841 13.383 13.993 14.671 15.341 16.104 16.977 17.928 18.919 20.038 21.373 22.761 24.43 26.359 28.615 31.199 34.421 38.214 42.711 46.769 49.346 51.004 52.054 52.825 53.353 53.689 53.912 54.113 54.228 54.291 54.332 54.315 54.266 54.196 54.119 54.026 53.9 53.775 53.645 53.531 53.431 53.325 53.254 53.189 53.103 52.99 52.853 52.726 52.597 52.449 52.343 52.209 52.121 51.929 51.752 51.56 51.448 50.983 51.083 50.944 50.763 50.377 50.174 49.946 49.692 49.398 49.04 48.541 45.539 -4 ,31018 ,KEBNE ,16692671,Thu Nov 25 21:21:02 CET,Thu Nov 25 23:16:12 CET,0.0 2.069 2.583 2.994 3.338 3.638 3.922 4.18 4.646 4.86 5.054 5.038 5.619 5.795 6.145 6.47 6.799 6.963 7.265 7.568 8.02 8.313 8.594 8.977 9.339 9.693 10.046 10.416 10.89 11.33 11.767 12.321 12.873 13.413 14.023 14.719 15.429 16.224 17.077 17.982 18.913 19.956 21.225 22.542 24.114 25.903 28.093 30.696 33.836 37.753 42.749 47.026 49.557 51.132 52.199 52.934 53.445 53.795 54.054 54.322 54.497 54.598 54.667 54.702 54.69 54.666 54.662 54.664 54.645 54.607 54.562 54.512 54.44 54.351 54.263 54.154 54.047 53.945 53.811 53.681 53.553 53.395 53.286 53.162 53.093 52.935 52.759 52.556 52.457 52.005 52.066 51.922 51.794 51.485 51.3 51.076 50.782 50.429 50.051 49.548 47.334 -5 ,18764 ,KEBNE ,16692672,Thu Nov 25 21:21:06 CET,Thu Nov 25 23:13:02 CET,0.0 1.741 2.308 2.715 3.067 3.387 3.658 3.905 4.343 4.549 4.76 4.785 5.389 5.565 5.894 6.239 6.591 6.761 7.081 7.381 7.81 8.081 8.341 8.712 9.079 9.454 9.833 10.222 10.736 11.23 11.715 12.303 12.863 13.411 14.079 14.861 15.608 16.45 17.411 18.443 19.524 20.706 22.087 23.509 25.203 27.192 29.542 32.212 35.413 39.371 44.378 48.816 51.652 53.512 54.714 55.536 56.16 56.606 56.868 57.039 57.152 57.218 57.237 57.254 57.268 57.264 57.26 57.259 57.222 57.156 57.057 56.955 56.871 56.779 56.683 56.584 56.479 56.356 56.223 56.127 56.022 55.827 55.676 55.519 55.44 55.267 55.072 54.853 54.739 54.273 54.35 54.216 54.063 53.662 53.417 53.144 52.869 52.576 52.156 51.516 48.675 -6 ,31788 ,KEBNE ,16692673,Thu Nov 25 21:26:10 CET,Thu Nov 25 23:21:17 CET,0.0 1.963 2.519 2.986 3.352 3.648 3.919 4.17 4.609 4.82 5.034 5.026 5.599 5.769 6.113 6.443 6.742 6.888 7.188 7.491 7.942 8.23 8.51 8.927 9.323 9.696 10.076 10.461 10.96 11.427 11.883 12.446 13.016 13.597 14.262 15.026 15.786 16.604 17.477 18.429 19.446 20.6 21.98 23.357 24.976 26.914 29.222 31.914 35.28 39.566 45.148 49.948 52.859 54.611 55.79 56.616 57.118 57.536 57.876 58.176 58.368 58.461 58.516 58.559 58.576 58.567 58.53 58.501 58.486 58.449 58.403 58.348 58.252 58.145 58.066 57.976 57.874 57.737 57.584 57.495 57.39 57.177 57.018 56.858 56.77 56.571 56.373 56.169 56.055 55.592 55.707 55.587 55.462 55.166 54.985 54.765 54.5 54.208 53.869 53.412 51.2 -7 ,14902 ,KEBNE ,16692674,Thu Nov 25 21:26:11 CET,Thu Nov 25 23:21:37 CET,0.0 1.56 2.075 2.501 2.846 3.135 3.395 3.631 4.072 4.29 4.51 4.5 5.076 5.25 5.586 5.922 6.256 6.416 6.736 7.047 7.486 7.769 8.048 8.472 8.889 9.291 9.676 10.054 10.545 11.011 11.472 12.046 12.621 13.171 13.8 14.532 15.244 16.049 16.936 17.877 18.9 20.096 21.486 22.874 24.542 26.554 28.937 31.69 35.093 39.087 44.036 48.367 50.969 52.671 53.7 54.41 54.972 55.372 55.622 55.799 55.885 55.912 55.91 55.889 55.854 55.789 55.686 55.573 55.472 55.367 55.258 55.164 55.047 54.929 54.83 54.698 54.56 54.433 54.302 54.167 54.009 53.792 53.636 53.471 53.377 53.201 53.027 52.821 52.714 52.24 52.288 52.139 51.992 51.662 51.453 51.206 50.94 50.63 50.162 49.283 46.089 -8 ,8421 ,KEBNE ,16692675,Thu Nov 25 21:26:11 CET,Thu Nov 25 23:24:08 CET,0.0 2.035 2.529 2.881 3.189 3.483 3.762 4.008 4.434 4.635 4.83 4.792 5.361 5.528 5.85 6.165 6.477 6.642 6.967 7.279 7.733 8.019 8.31 8.744 9.142 9.528 9.911 10.278 10.756 11.225 11.674 12.228 12.795 13.361 14.01 14.735 15.44 16.216 17.075 18.008 19.017 20.197 21.56 22.965 24.655 26.555 28.822 31.433 34.614 38.547 43.567 48.108 50.966 52.763 53.919 54.785 55.434 55.882 56.154 56.356 56.515 56.655 56.739 56.786 56.772 56.707 56.666 56.631 56.573 56.472 56.36 56.273 56.164 56.059 55.975 55.876 55.728 55.559 55.418 55.307 55.17 54.97 54.839 54.695 54.611 54.407 54.164 53.864 53.703 53.218 53.275 53.115 52.948 52.567 52.32 52.028 51.663 51.169 50.596 49.893 47.293 -9 ,32303 ,KEBNE ,16692676,Thu Nov 25 21:26:12 CET,Thu Nov 25 23:21:00 CET,0.0 1.503 2.018 2.415 2.732 3.021 3.28 3.526 3.964 4.162 4.361 4.352 4.939 5.127 5.48 5.799 6.098 6.247 6.548 6.839 7.254 7.527 7.788 8.152 8.51 8.865 9.213 9.555 10.014 10.476 10.917 11.466 12.031 12.583 13.228 13.974 14.708 15.508 16.361 17.283 18.25 19.354 20.722 22.125 23.779 25.749 28.147 30.917 34.2 38.085 42.859 46.901 49.286 50.934 52.168 53.094 53.712 54.089 54.28 54.405 54.489 54.511 54.527 54.532 54.515 54.517 54.482 54.406 54.335 54.234 54.118 54.038 53.949 53.854 53.779 53.68 53.544 53.342 53.119 52.999 52.881 52.683 52.546 52.389 52.303 52.135 51.975 51.8 51.701 51.248 51.348 51.21 51.042 50.657 50.435 50.176 49.882 49.531 49.098 48.338 44.987 -10 ,31092 ,KEBNE ,16692677,Thu Nov 25 21:26:11 CET,Thu Nov 25 23:21:05 CET,0.0 1.429 1.973 2.372 2.714 3.032 3.333 3.61 4.089 4.298 4.517 4.534 5.136 5.331 5.675 5.998 6.304 6.459 6.772 7.066 7.478 7.742 8.002 8.387 8.78 9.167 9.536 9.898 10.376 10.853 11.316 11.881 12.445 12.986 13.621 14.347 15.034 15.786 16.609 17.534 18.583 19.796 21.216 22.672 24.372 26.291 28.638 31.367 34.624 38.614 43.494 47.596 50.186 51.984 53.302 54.254 54.867 55.294 55.614 55.886 56.039 56.139 56.209 56.228 56.236 56.216 56.144 56.084 56.026 55.936 55.827 55.721 55.601 55.464 55.354 55.221 55.07 54.909 54.711 54.552 54.365 54.097 53.935 53.754 53.651 53.412 53.142 52.842 52.665 52.12 52.087 51.926 51.786 51.434 51.223 50.962 50.618 50.17 49.645 48.881 45.875 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 762d15db..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16257 ,KEBNE ,16692678,Thu Nov 25 21:26:11 CET,Thu Nov 25 23:22:02 CET,0.0 1.585 1.948 2.212 2.454 2.683 2.882 3.068 3.389 3.53 3.671 3.546 4.08 4.207 4.447 4.667 4.882 4.994 5.216 5.42 5.701 5.882 6.055 6.316 6.578 6.839 7.097 7.339 7.659 7.966 8.266 8.628 8.955 9.277 9.666 10.111 10.533 11.014 11.559 12.147 12.759 13.448 14.282 15.145 16.177 17.353 18.781 20.432 22.317 24.381 26.681 28.534 29.471 29.914 30.202 30.362 30.403 30.426 30.378 30.198 29.989 29.814 29.668 29.516 29.35 29.183 28.978 28.773 28.595 28.421 28.228 28.018 27.765 27.508 27.334 27.174 27.008 26.839 26.631 26.481 26.337 26.11 25.956 25.794 25.716 25.545 25.337 25.098 24.964 24.462 24.528 24.364 24.198 23.811 23.592 23.357 23.081 22.729 22.305 21.745 17.792 -2 ,22452 ,KEBNE ,16692679,Thu Nov 25 21:26:12 CET,Thu Nov 25 23:19:32 CET,0.0 1.33 1.755 2.048 2.292 2.508 2.699 2.872 3.175 3.315 3.449 3.314 3.842 3.968 4.216 4.445 4.664 4.774 4.99 5.193 5.471 5.655 5.836 6.098 6.356 6.606 6.847 7.085 7.388 7.677 7.97 8.334 8.685 9.03 9.429 9.873 10.313 10.798 11.308 11.873 12.478 13.159 14.006 14.892 15.945 17.161 18.529 20.002 21.682 23.584 25.875 27.614 28.587 29.262 29.669 29.871 29.952 29.921 29.852 29.737 29.576 29.434 29.306 29.164 29.005 28.846 28.674 28.534 28.424 28.292 28.139 28.007 27.857 27.671 27.505 27.338 27.144 26.915 26.689 26.529 26.347 26.072 25.899 25.722 25.614 25.374 25.143 24.878 24.739 24.237 24.313 24.178 24.025 23.646 23.434 23.202 22.944 22.648 22.258 21.597 17.694 -3 ,499 ,KEBNE ,16692680,Thu Nov 25 21:26:12 CET,Thu Nov 25 23:19:36 CET,0.0 1.545 1.929 2.238 2.496 2.711 2.908 3.088 3.413 3.563 3.711 3.58 4.108 4.237 4.473 4.696 4.909 5.015 5.22 5.411 5.693 5.881 6.074 6.351 6.608 6.861 7.108 7.349 7.658 7.954 8.241 8.609 8.977 9.335 9.763 10.24 10.694 11.196 11.748 12.341 12.975 13.719 14.609 15.51 16.546 17.739 19.144 20.746 22.687 24.803 27.391 29.549 30.677 31.333 31.663 31.855 31.948 31.991 31.974 31.888 31.771 31.67 31.555 31.406 31.264 31.112 30.908 30.708 30.544 30.386 30.228 30.087 29.935 29.778 29.639 29.482 29.328 29.169 28.989 28.832 28.653 28.381 28.198 28.011 27.897 27.652 27.395 27.134 27.005 26.48 26.494 26.323 26.14 25.71 25.451 25.178 24.892 24.487 23.943 23.174 20.251 -4 ,18982 ,KEBNE ,16692681,Thu Nov 25 21:26:15 CET,Thu Nov 25 23:20:32 CET,0.0 1.29 1.652 1.947 2.184 2.382 2.566 2.751 3.08 3.225 3.38 3.267 3.799 3.928 4.168 4.388 4.6 4.708 4.917 5.123 5.43 5.624 5.806 6.067 6.32 6.56 6.795 7.033 7.346 7.663 7.982 8.355 8.702 9.043 9.454 9.919 10.381 10.901 11.48 12.109 12.753 13.479 14.368 15.291 16.35 17.569 18.974 20.467 22.258 24.363 26.93 28.874 29.77 30.272 30.577 30.773 30.82 30.729 30.624 30.529 30.373 30.213 30.078 29.907 29.713 29.533 29.35 29.169 28.995 28.814 28.637 28.492 28.324 28.143 28.013 27.867 27.689 27.487 27.273 27.107 26.926 26.676 26.514 26.337 26.235 25.995 25.705 25.391 25.235 24.71 24.715 24.508 24.276 23.78 23.502 23.229 22.95 22.574 22.114 21.484 18.973 -5 ,31446 ,KEBNE ,16692682,Thu Nov 25 21:26:11 CET,Thu Nov 25 23:23:17 CET,0.0 1.333 1.751 2.074 2.333 2.531 2.705 2.873 3.194 3.344 3.489 3.362 3.882 4.0 4.224 4.437 4.638 4.74 4.947 5.145 5.422 5.594 5.768 6.03 6.291 6.551 6.796 7.025 7.317 7.607 7.897 8.256 8.618 8.979 9.373 9.789 10.187 10.646 11.185 11.771 12.399 13.125 13.98 14.84 15.849 17.033 18.462 20.053 21.842 23.936 26.409 28.184 29.043 29.521 29.762 29.894 29.947 29.942 29.898 29.815 29.67 29.526 29.4 29.232 29.041 28.853 28.66 28.476 28.31 28.129 27.925 27.755 27.564 27.365 27.211 27.054 26.893 26.704 26.499 26.352 26.199 25.957 25.787 25.598 25.494 25.287 25.077 24.848 24.724 24.235 24.31 24.143 23.973 23.629 23.422 23.135 22.792 22.389 21.906 21.17 16.342 -6 ,1593 ,KEBNE ,16692683,Thu Nov 25 21:26:12 CET,Thu Nov 25 23:24:00 CET,0.0 1.341 1.714 1.987 2.227 2.445 2.636 2.805 3.102 3.253 3.409 3.286 3.807 3.926 4.158 4.391 4.627 4.739 4.966 5.185 5.484 5.672 5.858 6.136 6.397 6.65 6.9 7.135 7.44 7.742 8.031 8.396 8.765 9.111 9.509 9.975 10.434 10.94 11.502 12.102 12.73 13.438 14.267 15.141 16.146 17.236 18.523 19.991 21.649 23.521 25.769 27.459 28.383 28.901 29.099 29.131 29.104 28.997 28.83 28.654 28.51 28.335 28.132 27.945 27.752 27.574 27.385 27.205 27.039 26.857 26.667 26.509 26.348 26.163 26.003 25.827 25.629 25.411 25.197 25.056 24.908 24.678 24.504 24.326 24.235 24.031 23.784 23.473 23.31 22.794 22.863 22.692 22.497 22.067 21.837 21.58 21.266 20.817 20.224 19.489 16.797 -7 ,20683 ,KEBNE ,16692684,Thu Nov 25 21:26:12 CET,Thu Nov 25 23:21:43 CET,0.0 1.048 1.43 1.707 1.92 2.116 2.312 2.489 2.791 2.931 3.065 2.921 3.451 3.574 3.8 4.02 4.238 4.35 4.569 4.776 5.077 5.262 5.444 5.718 5.987 6.24 6.481 6.724 7.047 7.372 7.684 8.058 8.41 8.751 9.162 9.61 10.034 10.522 11.081 11.694 12.346 13.076 13.933 14.82 15.879 17.078 18.507 20.139 21.995 24.213 26.816 28.803 29.922 30.492 30.777 30.926 30.98 30.987 30.925 30.758 30.58 30.44 30.294 30.106 29.914 29.725 29.508 29.327 29.182 29.028 28.841 28.671 28.498 28.313 28.131 27.939 27.771 27.591 27.412 27.293 27.142 26.848 26.639 26.444 26.34 26.093 25.831 25.554 25.416 24.915 24.928 24.745 24.562 24.104 23.845 23.577 23.273 22.934 22.549 21.978 19.696 -8 ,1611 ,KEBNE ,16692685,Thu Nov 25 21:26:12 CET,Thu Nov 25 23:22:42 CET,0.0 1.253 1.645 1.961 2.233 2.455 2.633 2.797 3.111 3.257 3.394 3.25 3.777 3.905 4.141 4.354 4.552 4.651 4.859 5.066 5.364 5.56 5.754 6.03 6.295 6.543 6.778 7.011 7.327 7.637 7.943 8.331 8.708 9.059 9.48 9.963 10.426 10.927 11.458 12.053 12.703 13.424 14.276 15.154 16.196 17.406 18.792 20.264 21.993 24.154 26.862 29.0 30.005 30.582 30.926 31.042 31.072 31.071 31.015 30.918 30.778 30.633 30.517 30.386 30.241 30.109 29.934 29.751 29.582 29.365 29.126 28.951 28.781 28.581 28.397 28.197 28.006 27.797 27.559 27.393 27.222 26.934 26.711 26.482 26.359 26.099 25.852 25.611 25.472 24.935 24.886 24.656 24.424 23.936 23.662 23.363 23.048 22.674 22.188 21.549 18.704 -9 ,19679 ,KEBNE ,16692686,Thu Nov 25 21:27:15 CET,Thu Nov 25 23:20:47 CET,0.0 1.398 1.75 2.012 2.237 2.44 2.628 2.801 3.125 3.275 3.409 3.261 3.781 3.903 4.131 4.364 4.596 4.707 4.927 5.138 5.432 5.62 5.807 6.075 6.337 6.592 6.848 7.105 7.419 7.716 8.017 8.384 8.743 9.09 9.48 9.929 10.376 10.864 11.394 11.959 12.587 13.322 14.192 15.107 16.17 17.36 18.76 20.321 22.007 23.913 26.419 28.452 29.52 30.02 30.26 30.395 30.35 30.2 30.061 29.98 29.893 29.76 29.607 29.43 29.247 29.092 28.943 28.777 28.59 28.392 28.193 28.031 27.874 27.701 27.552 27.387 27.229 27.069 26.899 26.782 26.649 26.421 26.242 26.022 25.913 25.708 25.47 25.195 25.049 24.547 24.62 24.486 24.359 24.042 23.847 23.609 23.345 23.016 22.604 22.085 19.803 -10 ,26166 ,KEBNE ,16692687,Thu Nov 25 21:27:15 CET,Thu Nov 25 23:21:03 CET,0.0 2.54 2.927 3.206 3.442 3.651 3.849 4.035 4.351 4.494 4.639 4.513 5.042 5.17 5.415 5.644 5.862 5.971 6.187 6.394 6.693 6.892 7.091 7.378 7.636 7.89 8.148 8.389 8.704 9.024 9.331 9.699 10.058 10.409 10.827 11.294 11.737 12.228 12.777 13.376 14.001 14.713 15.594 16.507 17.524 18.663 19.976 21.459 23.315 25.542 28.208 30.362 31.498 32.214 32.603 32.756 32.828 32.811 32.697 32.52 32.323 32.126 31.907 31.665 31.431 31.23 31.035 30.857 30.698 30.51 30.294 30.117 29.91 29.661 29.487 29.318 29.133 28.924 28.704 28.566 28.421 28.184 28.0 27.794 27.691 27.49 27.278 27.048 26.934 26.453 26.476 26.268 26.081 25.682 25.454 25.188 24.907 24.59 24.177 23.532 21.168 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 65dab439..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12995 ,KEBNE ,16692688,Thu Nov 25 21:27:15 CET,Thu Nov 25 23:19:56 CET,0.0 1.58 1.925 2.195 2.424 2.617 2.802 2.973 3.273 3.407 3.531 3.402 3.877 3.987 4.202 4.409 4.608 4.7 4.873 5.042 5.273 5.423 5.575 5.798 6.0 6.188 6.377 6.569 6.804 7.031 7.257 7.533 7.808 8.081 8.402 8.747 9.067 9.415 9.796 10.208 10.635 11.129 11.728 12.337 13.054 13.873 14.824 15.936 17.303 18.93 20.923 22.537 23.428 24.006 24.358 24.498 24.557 24.585 24.543 24.455 24.387 24.326 24.25 24.141 24.019 23.902 23.766 23.657 23.558 23.414 23.258 23.134 23.001 22.849 22.716 22.573 22.413 22.247 22.073 21.945 21.823 21.63 21.486 21.352 21.284 21.102 20.893 20.69 20.586 20.124 20.214 20.063 19.889 19.521 19.302 19.056 18.748 18.378 17.978 17.411 14.902 -2 ,9609 ,KEBNE ,16692689,Thu Nov 25 21:27:15 CET,Thu Nov 25 23:19:08 CET,0.0 1.097 1.433 1.688 1.888 2.074 2.249 2.401 2.675 2.803 2.92 2.78 3.26 3.374 3.57 3.762 3.938 4.02 4.193 4.362 4.606 4.763 4.915 5.149 5.369 5.568 5.764 5.955 6.197 6.431 6.673 6.972 7.259 7.546 7.879 8.246 8.598 8.983 9.386 9.821 10.296 10.838 11.482 12.132 12.891 13.749 14.742 15.86 17.242 18.917 20.915 22.574 23.531 24.096 24.443 24.643 24.731 24.774 24.806 24.814 24.779 24.744 24.685 24.581 24.469 24.371 24.251 24.119 23.989 23.847 23.7 23.555 23.391 23.231 23.104 22.957 22.813 22.678 22.52 22.407 22.289 22.102 21.964 21.82 21.752 21.58 21.376 21.161 21.046 20.594 20.694 20.566 20.434 20.056 19.847 19.664 19.45 19.165 18.76 18.194 16.387 -3 ,29931 ,KEBNE ,16692690,Thu Nov 25 21:27:15 CET,Thu Nov 25 23:19:04 CET,0.0 1.312 1.687 1.972 2.198 2.394 2.57 2.736 3.027 3.162 3.299 3.192 3.683 3.794 3.997 4.192 4.379 4.471 4.65 4.82 5.065 5.228 5.386 5.614 5.836 6.045 6.257 6.469 6.738 6.985 7.212 7.497 7.783 8.061 8.375 8.721 9.065 9.444 9.845 10.269 10.714 11.226 11.843 12.466 13.209 14.069 15.084 16.245 17.61 19.194 21.145 22.9 23.959 24.604 24.957 25.179 25.317 25.354 25.31 25.243 25.204 25.155 25.076 24.997 24.934 24.869 24.771 24.678 24.58 24.444 24.289 24.157 24.023 23.883 23.778 23.672 23.543 23.379 23.174 23.025 22.876 22.657 22.519 22.391 22.318 22.141 21.944 21.73 21.615 21.135 21.191 21.051 20.911 20.528 20.297 20.044 19.766 19.467 19.078 18.516 16.693 -4 ,29230 ,KEBNE ,16692691,Thu Nov 25 21:27:15 CET,Thu Nov 25 23:19:30 CET,0.0 2.075 2.429 2.7 2.926 3.117 3.286 3.439 3.723 3.848 3.962 3.822 4.295 4.393 4.581 4.767 4.952 5.043 5.222 5.394 5.638 5.795 5.95 6.178 6.386 6.587 6.793 6.998 7.267 7.512 7.737 8.009 8.278 8.547 8.86 9.208 9.546 9.927 10.337 10.784 11.254 11.778 12.4 13.033 13.78 14.64 15.621 16.729 18.121 19.786 21.81 23.36 24.206 24.739 25.005 25.15 25.236 25.265 25.252 25.217 25.161 25.095 24.993 24.847 24.715 24.612 24.507 24.398 24.281 24.155 24.02 23.891 23.763 23.626 23.515 23.399 23.27 23.121 22.944 22.827 22.724 22.576 22.458 22.329 22.268 22.129 21.946 21.751 21.658 21.208 21.292 21.135 20.973 20.644 20.423 20.172 19.917 19.618 19.24 18.704 17.027 -5 ,19383 ,KEBNE ,16692692,Thu Nov 25 21:27:15 CET,Thu Nov 25 23:19:11 CET,0.0 1.867 2.233 2.53 2.784 2.987 3.169 3.329 3.625 3.762 3.88 3.731 4.208 4.317 4.529 4.735 4.923 5.011 5.187 5.357 5.588 5.731 5.87 6.075 6.283 6.485 6.676 6.855 7.083 7.306 7.526 7.801 8.073 8.336 8.636 8.979 9.302 9.663 10.064 10.485 10.935 11.455 12.049 12.634 13.339 14.156 15.126 16.255 17.694 19.411 21.344 22.95 23.854 24.321 24.571 24.713 24.758 24.767 24.745 24.657 24.572 24.507 24.447 24.38 24.265 24.145 24.031 23.913 23.784 23.638 23.493 23.373 23.24 23.101 22.988 22.872 22.746 22.609 22.47 22.366 22.259 22.085 21.946 21.79 21.713 21.553 21.359 21.173 21.086 20.624 20.698 20.56 20.404 20.023 19.817 19.601 19.363 19.086 18.725 18.196 15.897 -7 ,26154 ,KEBNE ,16692694,Thu Nov 25 21:28:18 CET,Thu Nov 25 23:21:05 CET,0.0 1.153 1.51 1.779 1.999 2.197 2.378 2.533 2.819 2.955 3.085 2.958 3.43 3.537 3.745 3.941 4.132 4.22 4.386 4.553 4.804 4.961 5.114 5.333 5.54 5.738 5.93 6.111 6.346 6.583 6.808 7.081 7.347 7.604 7.911 8.256 8.589 8.958 9.36 9.796 10.247 10.75 11.349 11.965 12.733 13.614 14.613 15.759 17.11 18.758 20.849 22.638 23.665 24.258 24.623 24.819 24.888 24.906 24.866 24.815 24.775 24.704 24.612 24.508 24.394 24.291 24.182 24.055 23.938 23.816 23.681 23.569 23.443 23.305 23.175 23.021 22.854 22.653 22.428 22.281 22.146 21.927 21.769 21.614 21.53 21.347 21.159 20.955 20.834 20.367 20.471 20.316 20.137 19.758 19.536 19.303 19.029 18.701 18.344 17.836 15.209 -8 ,29806 ,KEBNE ,16692695,Thu Nov 25 21:28:18 CET,Thu Nov 25 23:21:25 CET,0.0 1.052 1.426 1.699 1.923 2.105 2.269 2.431 2.738 2.873 3.0 2.87 3.35 3.46 3.668 3.876 4.074 4.161 4.329 4.506 4.766 4.924 5.071 5.292 5.5 5.695 5.886 6.071 6.312 6.548 6.782 7.063 7.335 7.603 7.91 8.255 8.599 8.988 9.404 9.842 10.311 10.85 11.493 12.156 12.928 13.795 14.827 16.005 17.361 19.0 21.111 22.86 23.858 24.494 24.884 25.098 25.227 25.279 25.269 25.224 25.172 25.094 24.993 24.899 24.796 24.696 24.585 24.468 24.344 24.2 24.055 23.941 23.813 23.668 23.552 23.425 23.297 23.152 22.996 22.887 22.764 22.571 22.421 22.254 22.18 22.035 21.859 21.672 21.573 21.111 21.161 20.977 20.804 20.47 20.257 20.03 19.793 19.5 19.095 18.524 16.245 -9 ,28698 ,KEBNE ,16692696,Thu Nov 25 21:28:18 CET,Thu Nov 25 23:20:54 CET,0.0 1.669 2.027 2.269 2.484 2.678 2.848 3.002 3.274 3.396 3.513 3.368 3.84 3.943 4.125 4.296 4.472 4.558 4.729 4.897 5.126 5.268 5.409 5.621 5.828 6.022 6.214 6.407 6.66 6.899 7.12 7.392 7.655 7.912 8.212 8.54 8.856 9.198 9.59 10.038 10.513 11.05 11.678 12.311 13.058 13.908 14.903 16.038 17.371 18.954 20.871 22.439 23.347 23.851 24.144 24.324 24.429 24.488 24.483 24.414 24.302 24.21 24.127 24.01 23.887 23.76 23.598 23.427 23.282 23.163 23.043 22.92 22.788 22.668 22.566 22.445 22.299 22.134 21.971 21.851 21.698 21.469 21.329 21.161 21.065 20.835 20.591 20.368 20.254 19.783 19.841 19.688 19.545 19.233 19.048 18.855 18.646 18.37 17.971 17.349 15.176 -10 ,3557 ,KEBNE ,16692697,Thu Nov 25 21:28:18 CET,Thu Nov 25 23:20:03 CET,0.0 1.231 1.606 1.86 2.07 2.249 2.418 2.578 2.878 3.011 3.135 2.996 3.461 3.557 3.744 3.929 4.112 4.199 4.364 4.529 4.771 4.934 5.095 5.316 5.522 5.723 5.914 6.102 6.343 6.568 6.791 7.07 7.331 7.589 7.899 8.241 8.567 8.921 9.307 9.735 10.206 10.745 11.366 11.993 12.723 13.549 14.544 15.706 17.096 18.725 20.773 22.518 23.509 24.115 24.467 24.691 24.808 24.845 24.832 24.785 24.742 24.697 24.633 24.544 24.445 24.341 24.233 24.134 24.046 23.951 23.837 23.737 23.627 23.508 23.405 23.286 23.164 23.022 22.865 22.754 22.633 22.439 22.277 22.106 22.021 21.829 21.624 21.402 21.275 20.8 20.883 20.736 20.585 20.21 19.993 19.781 19.523 19.217 18.862 18.317 16.086 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt deleted file mode 100644 index 731752dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30475 ,KEBNE ,16692698,Thu Nov 25 21:28:18 CET,Thu Nov 25 23:21:05 CET,0.0 3.868 4.896 5.667 6.296 6.806 7.225 7.615 8.274 8.545 8.801 8.836 9.356 9.488 9.731 9.953 10.15 10.244 10.424 10.583 10.803 10.939 11.078 11.273 11.439 11.588 11.718 11.828 11.955 12.077 12.185 12.321 12.455 12.554 12.669 12.797 12.899 12.992 13.066 13.139 13.184 13.194 13.182 13.105 12.954 12.733 12.427 11.985 11.301 10.186 8.094 5.58 3.672 2.095 0.786 -0.319 -1.279 -2.143 -2.885 -3.612 -4.213 -4.754 -5.274 -5.765 -6.225 -6.639 -7.061 -7.427 -7.736 -8.053 -8.383 -8.649 -8.931 -9.233 -9.458 -9.699 -9.947 -10.192 -10.442 -10.608 -10.777 -11.049 -11.247 -11.457 -11.561 -11.761 -11.973 -12.215 -12.352 -12.878 -12.764 -12.916 -13.085 -13.467 -13.682 -13.92 -14.176 -14.477 -14.877 -15.424 -19.211 -2 ,30362 ,KEBNE ,16692699,Thu Nov 25 21:28:18 CET,Thu Nov 25 23:20:54 CET,0.0 2.702 3.563 4.15 4.555 4.853 5.107 5.338 5.752 5.938 6.093 6.005 6.52 6.648 6.878 7.083 7.27 7.359 7.526 7.678 7.889 8.025 8.159 8.358 8.537 8.688 8.827 8.965 9.136 9.295 9.435 9.6 9.74 9.844 9.945 10.039 10.109 10.174 10.253 10.331 10.392 10.45 10.467 10.435 10.372 10.21 9.963 9.586 8.82 7.555 5.576 3.278 1.364 -0.222 -1.571 -2.765 -3.756 -4.634 -5.372 -6.089 -6.722 -7.279 -7.779 -8.25 -8.681 -9.065 -9.47 -9.826 -10.126 -10.436 -10.752 -11.024 -11.319 -11.616 -11.843 -12.078 -12.314 -12.561 -12.814 -12.979 -13.157 -13.449 -13.67 -13.895 -14.002 -14.225 -14.471 -14.737 -14.869 -15.392 -15.279 -15.421 -15.579 -15.959 -16.173 -16.406 -16.664 -16.974 -17.342 -17.813 -20.054 -3 ,21075 ,KEBNE ,16692700,Thu Nov 25 21:28:17 CET,Thu Nov 25 23:21:14 CET,0.0 3.123 3.994 4.568 4.904 5.191 5.452 5.685 6.093 6.273 6.429 6.319 6.822 6.949 7.168 7.361 7.55 7.639 7.795 7.942 8.148 8.284 8.42 8.607 8.76 8.896 9.042 9.175 9.322 9.467 9.603 9.753 9.885 10.014 10.161 10.297 10.399 10.502 10.62 10.718 10.768 10.785 10.77 10.72 10.61 10.399 10.039 9.516 8.731 7.44 5.25 2.773 0.802 -0.812 -2.122 -3.242 -4.194 -5.053 -5.781 -6.51 -7.146 -7.685 -8.182 -8.656 -9.103 -9.499 -9.893 -10.243 -10.545 -10.852 -11.174 -11.442 -11.721 -12.008 -12.229 -12.455 -12.684 -12.924 -13.179 -13.355 -13.534 -13.822 -14.029 -14.232 -14.33 -14.542 -14.789 -15.04 -15.17 -15.711 -15.617 -15.782 -15.957 -16.311 -16.508 -16.734 -16.996 -17.293 -17.66 -18.19 -28.878 -4 ,1976 ,KEBNE ,16692701,Thu Nov 25 21:29:20 CET,Thu Nov 25 23:22:19 CET,0.0 2.77 3.612 4.235 4.71 5.104 5.442 5.725 6.227 6.474 6.71 6.753 7.304 7.47 7.793 8.081 8.327 8.451 8.692 8.911 9.207 9.388 9.547 9.767 9.985 10.159 10.308 10.459 10.631 10.792 10.939 11.125 11.3 11.445 11.593 11.74 11.866 11.998 12.113 12.223 12.316 12.377 12.399 12.363 12.243 12.017 11.682 11.153 10.355 9.111 6.982 4.544 2.598 0.977 -0.369 -1.532 -2.505 -3.336 -4.032 -4.738 -5.346 -5.863 -6.348 -6.807 -7.237 -7.642 -8.06 -8.43 -8.756 -9.092 -9.439 -9.729 -10.013 -10.298 -10.525 -10.759 -11.007 -11.265 -11.531 -11.717 -11.902 -12.173 -12.36 -12.57 -12.678 -12.892 -13.118 -13.346 -13.467 -13.998 -13.897 -14.046 -14.196 -14.501 -14.68 -14.899 -15.151 -15.448 -15.799 -16.251 -18.747 -5 ,18302 ,KEBNE ,16692702,Thu Nov 25 21:29:20 CET,Thu Nov 25 23:23:56 CET,0.0 2.935 3.818 4.392 4.743 5.032 5.284 5.512 5.908 6.081 6.255 6.226 6.745 6.859 7.067 7.259 7.439 7.526 7.689 7.838 8.043 8.18 8.312 8.484 8.62 8.748 8.872 8.97 9.092 9.222 9.342 9.455 9.543 9.642 9.753 9.845 9.903 9.932 9.953 9.96 9.947 9.91 9.825 9.699 9.517 9.248 8.829 8.262 7.46 6.253 4.179 1.647 -0.333 -1.917 -3.23 -4.378 -5.405 -6.339 -7.107 -7.839 -8.456 -9.013 -9.542 -10.029 -10.48 -10.891 -11.318 -11.704 -12.033 -12.358 -12.678 -12.95 -13.239 -13.538 -13.765 -14.011 -14.271 -14.534 -14.806 -14.996 -15.209 -15.533 -15.742 -15.962 -16.076 -16.311 -16.56 -16.833 -16.975 -17.528 -17.468 -17.635 -17.814 -18.213 -18.424 -18.656 -18.921 -19.219 -19.575 -20.084 -26.06 -6 ,26621 ,KEBNE ,16692703,Thu Nov 25 21:30:22 CET,Thu Nov 25 23:22:40 CET,0.0 3.414 4.38 5.007 5.394 5.701 5.983 6.233 6.641 6.83 7.002 6.931 7.431 7.546 7.772 7.973 8.164 8.255 8.417 8.565 8.767 8.887 8.999 9.145 9.282 9.405 9.507 9.609 9.735 9.85 9.957 10.078 10.184 10.282 10.402 10.518 10.598 10.678 10.759 10.802 10.805 10.792 10.739 10.658 10.496 10.235 9.889 9.378 8.539 7.164 4.953 2.515 0.561 -1.057 -2.392 -3.564 -4.586 -5.488 -6.223 -6.942 -7.554 -8.079 -8.587 -9.056 -9.489 -9.885 -10.295 -10.666 -10.987 -11.313 -11.641 -11.918 -12.211 -12.502 -12.73 -12.962 -13.187 -13.427 -13.676 -13.845 -14.031 -14.325 -14.525 -14.733 -14.84 -15.065 -15.303 -15.553 -15.691 -16.223 -16.102 -16.263 -16.434 -16.779 -16.971 -17.183 -17.43 -17.737 -18.106 -18.583 -22.378 -7 ,20565 ,KEBNE ,16692704,Thu Nov 25 21:30:23 CET,Thu Nov 25 23:23:52 CET,0.0 3.129 4.039 4.616 5.06 5.45 5.777 6.053 6.567 6.797 7.001 6.99 7.518 7.672 7.955 8.213 8.449 8.548 8.716 8.857 9.043 9.167 9.282 9.422 9.552 9.68 9.797 9.92 10.079 10.23 10.374 10.524 10.662 10.796 10.941 11.091 11.229 11.386 11.511 11.591 11.655 11.672 11.666 11.601 11.447 11.211 10.855 10.366 9.588 8.388 6.364 3.875 1.771 -0.021 -1.501 -2.774 -3.851 -4.802 -5.594 -6.354 -6.994 -7.559 -8.098 -8.606 -9.072 -9.492 -9.933 -10.328 -10.66 -10.988 -11.329 -11.605 -11.889 -12.186 -12.417 -12.665 -12.935 -13.218 -13.505 -13.7 -13.897 -14.219 -14.443 -14.669 -14.792 -15.039 -15.29 -15.557 -15.702 -16.246 -16.191 -16.369 -16.539 -16.874 -17.052 -17.254 -17.501 -17.793 -18.14 -18.6 -23.229 -9 ,2375 ,KEBNE ,16692706,Thu Nov 25 21:31:25 CET,Thu Nov 25 23:26:40 CET,0.0 3.197 4.108 4.743 5.227 5.543 5.793 6.03 6.431 6.598 6.758 6.663 7.151 7.265 7.496 7.707 7.88 7.959 8.111 8.249 8.434 8.547 8.65 8.79 8.924 9.041 9.157 9.271 9.405 9.543 9.657 9.759 9.843 9.919 10.006 10.086 10.152 10.227 10.293 10.335 10.358 10.38 10.393 10.366 10.289 10.107 9.806 9.366 8.672 7.571 5.595 3.189 1.364 -0.178 -1.514 -2.68 -3.676 -4.529 -5.248 -5.96 -6.556 -7.083 -7.584 -8.06 -8.512 -8.925 -9.34 -9.689 -9.996 -10.325 -10.654 -10.921 -11.195 -11.479 -11.702 -11.928 -12.166 -12.401 -12.638 -12.807 -12.977 -13.238 -13.422 -13.621 -13.725 -13.938 -14.175 -14.416 -14.538 -15.06 -14.944 -15.091 -15.246 -15.61 -15.813 -16.024 -16.271 -16.568 -16.924 -17.449 -19.73 -10 ,10055 ,KEBNE ,16692707,Thu Nov 25 21:31:25 CET,Thu Nov 25 23:26:49 CET,0.0 2.41 3.172 3.695 4.086 4.387 4.646 4.879 5.251 5.407 5.558 5.467 5.972 6.099 6.325 6.513 6.695 6.783 6.944 7.093 7.298 7.421 7.543 7.727 7.892 8.039 8.181 8.315 8.479 8.621 8.744 8.873 8.988 9.096 9.206 9.33 9.432 9.518 9.585 9.621 9.631 9.642 9.638 9.58 9.466 9.261 8.861 8.27 7.384 6.057 3.902 1.505 -0.389 -2.044 -3.429 -4.623 -5.674 -6.637 -7.475 -8.313 -9.017 -9.597 -10.135 -10.664 -11.162 -11.609 -12.041 -12.404 -12.709 -13.028 -13.375 -13.659 -13.949 -14.261 -14.509 -14.775 -15.07 -15.361 -15.643 -15.845 -16.048 -16.349 -16.552 -16.76 -16.872 -17.115 -17.384 -17.65 -17.782 -18.322 -18.231 -18.388 -18.556 -18.911 -19.102 -19.319 -19.567 -19.848 -20.189 -20.664 -24.024 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt deleted file mode 100644 index 3a844480..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3026 ,KEBNE ,16692708,Thu Nov 25 21:32:28 CET,Thu Nov 25 23:26:34 CET,0.0 4.222 4.782 5.16 5.499 5.771 5.962 6.125 6.423 6.559 6.683 6.501 6.942 6.99 7.084 7.15 7.194 7.207 7.211 7.217 7.205 7.19 7.17 7.092 6.992 6.865 6.72 6.572 6.376 6.181 5.978 5.704 5.411 5.104 4.73 4.271 3.796 3.278 2.66 1.899 1.048 0.002 -1.342 -2.809 -4.673 -6.91 -9.8 -13.67 -19.059 -26.502 -37.593 -49.294 -57.94 -64.781 -70.293 -74.817 -78.469 -81.628 -84.251 -86.731 -88.756 -90.514 -92.148 -93.637 -94.992 -96.195 -97.411 -98.442 -99.319 -100.238 -101.183 -101.965 -102.756 -103.574 -104.205 -104.863 -105.527 -106.191 -106.855 -107.303 -107.773 -108.476 -108.962 -109.469 -109.719 -110.232 -110.769 -111.299 -111.57 -112.374 -112.507 -112.851 -113.211 -113.942 -114.34 -114.764 -115.204 -115.718 -116.336 -117.109 -121.402 -2 ,27005 ,KEBNE ,16692709,Thu Nov 25 21:32:27 CET,Thu Nov 25 23:26:15 CET,0.0 2.599 3.229 3.654 3.982 4.221 4.428 4.617 4.903 5.012 5.097 4.854 5.28 5.335 5.406 5.43 5.466 5.481 5.475 5.461 5.438 5.406 5.36 5.285 5.236 5.189 5.143 5.071 4.9 4.706 4.501 4.235 3.951 3.64 3.273 2.833 2.335 1.761 1.098 0.315 -0.549 -1.572 -2.884 -4.338 -6.149 -8.352 -11.339 -15.259 -20.436 -27.648 -38.347 -49.478 -57.833 -64.43 -69.678 -74.135 -77.856 -81.015 -83.617 -86.125 -88.224 -90.024 -91.675 -93.188 -94.586 -95.842 -97.097 -98.17 -99.075 -99.993 -100.943 -101.712 -102.469 -103.263 -103.874 -104.488 -105.112 -105.753 -106.44 -106.911 -107.369 -108.081 -108.584 -109.097 -109.357 -109.891 -110.442 -110.992 -111.278 -112.094 -112.223 -112.565 -112.902 -113.64 -114.059 -114.488 -114.968 -115.503 -116.091 -117.012 -122.708 -3 ,32688 ,KEBNE ,16692710,Thu Nov 25 21:32:27 CET,Thu Nov 25 23:26:54 CET,0.0 2.69 3.37 3.825 4.143 4.38 4.59 4.763 5.025 5.124 5.226 5.023 5.463 5.515 5.615 5.687 5.719 5.726 5.74 5.758 5.765 5.75 5.723 5.663 5.582 5.485 5.381 5.262 5.077 4.867 4.652 4.382 4.09 3.791 3.415 2.93 2.43 1.818 1.06 0.199 -0.748 -1.905 -3.349 -4.916 -6.916 -9.331 -12.401 -16.353 -21.71 -29.154 -40.263 -52.068 -60.957 -67.931 -73.405 -77.872 -81.595 -84.869 -87.587 -90.199 -92.324 -94.136 -95.789 -97.278 -98.644 -99.86 -101.098 -102.17 -103.063 -103.967 -104.87 -105.581 -106.335 -107.133 -107.746 -108.403 -109.073 -109.735 -110.413 -110.88 -111.352 -112.058 -112.551 -113.062 -113.319 -113.851 -114.391 -114.941 -115.212 -115.993 -116.042 -116.341 -116.694 -117.439 -117.793 -118.172 -118.591 -119.055 -119.606 -120.309 -122.658 -4 ,16699 ,KEBNE ,16692711,Thu Nov 25 21:32:27 CET,Thu Nov 25 23:26:56 CET,0.0 3.549 4.229 4.684 5.019 5.284 5.516 5.705 5.984 6.076 6.149 5.913 6.364 6.417 6.48 6.538 6.593 6.616 6.664 6.691 6.701 6.697 6.671 6.595 6.507 6.426 6.336 6.219 6.033 5.856 5.666 5.402 5.153 4.896 4.558 4.113 3.647 3.092 2.428 1.7 0.845 -0.225 -1.544 -2.994 -4.863 -7.226 -10.29 -14.133 -19.339 -26.665 -37.612 -49.07 -57.575 -64.326 -69.792 -74.37 -78.122 -81.344 -84.0 -86.566 -88.73 -90.564 -92.256 -93.82 -95.22 -96.47 -97.729 -98.827 -99.775 -100.731 -101.71 -102.514 -103.329 -104.137 -104.756 -105.388 -106.007 -106.632 -107.279 -107.731 -108.203 -108.926 -109.413 -109.906 -110.162 -110.696 -111.236 -111.802 -112.099 -112.91 -113.049 -113.406 -113.763 -114.532 -114.972 -115.468 -115.999 -116.583 -117.276 -118.113 -121.94 -5 ,4449 ,KEBNE ,16692712,Thu Nov 25 21:33:32 CET,Thu Nov 25 23:29:54 CET,0.0 2.197 2.801 3.218 3.509 3.766 3.976 4.143 4.455 4.599 4.707 4.5 4.972 5.031 5.084 5.137 5.194 5.223 5.243 5.239 5.236 5.227 5.2 5.131 5.054 4.958 4.841 4.723 4.564 4.382 4.185 3.931 3.655 3.344 2.973 2.568 2.148 1.628 0.981 0.236 -0.616 -1.671 -3.061 -4.636 -6.604 -9.045 -12.191 -16.166 -21.463 -28.707 -39.683 -51.558 -60.464 -67.416 -72.962 -77.608 -81.434 -84.739 -87.454 -90.053 -92.212 -94.077 -95.812 -97.395 -98.836 -100.123 -101.409 -102.52 -103.467 -104.43 -105.385 -106.179 -107.008 -107.834 -108.454 -109.092 -109.752 -110.423 -111.102 -111.567 -112.04 -112.748 -113.226 -113.724 -113.983 -114.522 -115.061 -115.573 -115.84 -116.638 -116.723 -117.061 -117.423 -118.15 -118.562 -118.995 -119.477 -120.048 -120.689 -121.498 -124.796 -6 ,11142 ,KEBNE ,16692713,Thu Nov 25 21:33:32 CET,Thu Nov 25 23:29:41 CET,0.0 3.612 4.245 4.644 4.887 5.077 5.223 5.323 5.532 5.637 5.714 5.453 5.888 5.937 5.991 6.018 6.024 6.02 5.999 5.975 5.923 5.883 5.835 5.735 5.61 5.48 5.337 5.191 4.988 4.772 4.547 4.235 3.927 3.621 3.244 2.805 2.346 1.796 1.126 0.337 -0.547 -1.615 -2.97 -4.464 -6.396 -8.772 -11.791 -15.701 -21.0 -28.345 -39.315 -50.933 -59.585 -66.347 -71.759 -76.277 -80.016 -83.253 -85.896 -88.373 -90.448 -92.269 -93.951 -95.481 -96.848 -98.089 -99.352 -100.443 -101.371 -102.3 -103.257 -104.043 -104.836 -105.649 -106.271 -106.902 -107.546 -108.197 -108.861 -109.304 -109.74 -110.424 -110.913 -111.4 -111.636 -112.122 -112.63 -113.167 -113.447 -114.233 -114.325 -114.645 -114.977 -115.687 -116.079 -116.501 -116.971 -117.517 -118.152 -118.967 -123.477 -8 ,286 ,KEBNE ,16692715,Thu Nov 25 21:42:56 CET,Thu Nov 25 23:37:06 CET,0.0 3.3 3.963 4.39 4.692 4.92 5.139 5.328 5.59 5.682 5.763 5.534 5.989 6.059 6.127 6.169 6.205 6.206 6.198 6.196 6.142 6.078 6.023 5.923 5.808 5.694 5.569 5.426 5.217 4.996 4.772 4.495 4.19 3.858 3.46 2.982 2.485 1.884 1.158 0.346 -0.555 -1.615 -2.948 -4.465 -6.427 -8.852 -12.011 -16.013 -21.308 -28.571 -39.355 -50.676 -59.233 -65.924 -71.227 -75.703 -79.4 -82.58 -85.224 -87.78 -89.886 -91.711 -93.386 -94.903 -96.294 -97.513 -98.756 -99.86 -100.787 -101.734 -102.704 -103.494 -104.283 -105.075 -105.69 -106.325 -106.977 -107.626 -108.279 -108.721 -109.169 -109.886 -110.379 -110.856 -111.098 -111.61 -112.145 -112.702 -112.991 -113.787 -113.88 -114.2 -114.542 -115.266 -115.682 -116.116 -116.551 -117.021 -117.615 -118.542 -123.94 -10 ,1420 ,KEBNE ,16692717,Thu Nov 25 21:47:06 CET,Thu Nov 25 23:40:57 CET,0.0 3.139 3.712 4.084 4.353 4.557 4.749 4.925 5.156 5.239 5.329 5.124 5.584 5.648 5.731 5.794 5.857 5.892 5.945 5.97 5.961 5.948 5.942 5.922 5.882 5.82 5.739 5.644 5.507 5.337 5.145 4.894 4.614 4.3 3.917 3.466 2.969 2.358 1.677 0.924 0.074 -0.954 -2.277 -3.763 -5.691 -8.033 -10.961 -14.737 -19.909 -27.137 -38.127 -49.736 -58.26 -64.946 -70.361 -74.921 -78.682 -81.879 -84.502 -87.066 -89.188 -91.026 -92.724 -94.267 -95.645 -96.853 -98.112 -99.215 -100.134 -101.055 -101.985 -102.759 -103.56 -104.369 -104.986 -105.623 -106.27 -106.914 -107.551 -107.984 -108.424 -109.094 -109.559 -110.051 -110.303 -110.808 -111.332 -111.874 -112.147 -112.934 -113.026 -113.34 -113.669 -114.355 -114.746 -115.201 -115.721 -116.302 -116.97 -117.835 -121.158 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 79c3feb7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21330 ,KEBNE ,16692718,Thu Nov 25 21:47:06 CET,Thu Nov 25 23:39:04 CET,0.0 1.689 2.072 2.347 2.581 2.774 2.948 3.113 3.39 3.515 3.641 3.512 4.013 4.122 4.312 4.493 4.658 4.736 4.89 5.045 5.275 5.429 5.582 5.806 6.02 6.209 6.402 6.606 6.843 7.052 7.253 7.511 7.771 8.019 8.297 8.6 8.885 9.203 9.55 9.938 10.361 10.822 11.364 11.91 12.544 13.222 13.974 14.813 15.764 16.927 18.186 18.95 19.185 19.164 19.062 18.91 18.706 18.468 18.239 17.999 17.789 17.578 17.343 17.11 16.891 16.682 16.432 16.186 15.983 15.78 15.578 15.407 15.226 15.038 14.891 14.735 14.556 14.359 14.151 13.991 13.81 13.531 13.337 13.127 13.015 12.784 12.533 12.244 12.095 11.595 11.642 11.453 11.249 10.822 10.578 10.28 9.921 9.529 9.06 8.416 4.8 -2 ,1420 ,KEBNE ,16692719,Thu Nov 25 21:47:06 CET,Thu Nov 25 23:38:54 CET,0.0 1.207 1.584 1.88 2.106 2.304 2.505 2.683 2.993 3.143 3.282 3.156 3.656 3.764 3.98 4.191 4.385 4.479 4.666 4.843 5.087 5.241 5.393 5.619 5.831 6.035 6.23 6.42 6.668 6.901 7.126 7.406 7.693 7.964 8.268 8.603 8.917 9.267 9.643 10.045 10.485 10.952 11.479 12.023 12.664 13.378 14.167 15.033 16.012 17.074 18.254 19.054 19.374 19.44 19.387 19.279 19.069 18.738 18.404 18.122 17.887 17.634 17.366 17.122 16.902 16.693 16.476 16.257 16.075 15.898 15.694 15.509 15.283 15.036 14.849 14.657 14.46 14.273 14.072 13.914 13.758 13.549 13.401 13.24 13.156 12.982 12.792 12.562 12.433 11.933 12.013 11.872 11.721 11.348 11.124 10.868 10.531 10.082 9.514 8.704 4.635 -3 ,24285 ,KEBNE ,16692720,Thu Nov 25 21:49:12 CET,Thu Nov 25 23:39:47 CET,0.0 1.599 1.98 2.258 2.506 2.715 2.895 3.06 3.351 3.492 3.627 3.465 3.942 4.041 4.242 4.438 4.63 4.725 4.894 5.059 5.305 5.45 5.588 5.798 6.011 6.205 6.383 6.554 6.777 6.999 7.214 7.473 7.723 7.972 8.247 8.553 8.851 9.162 9.507 9.878 10.268 10.72 11.234 11.756 12.365 13.034 13.785 14.643 15.589 16.555 17.51 18.02 18.19 18.153 18.019 17.852 17.631 17.337 17.073 16.843 16.641 16.439 16.212 15.952 15.689 15.468 15.234 14.999 14.789 14.583 14.365 14.149 13.92 13.704 13.524 13.336 13.135 12.929 12.721 12.574 12.42 12.163 11.962 11.766 11.676 11.465 11.22 10.95 10.815 10.309 10.359 10.194 10.013 9.565 9.325 9.074 8.771 8.416 7.985 7.47 2.41 -4 ,9909 ,KEBNE ,16692721,Thu Nov 25 21:49:15 CET,Thu Nov 25 23:38:00 CET,0.0 1.492 1.875 2.136 2.355 2.552 2.719 2.873 3.167 3.314 3.448 3.296 3.785 3.894 4.085 4.274 4.467 4.559 4.735 4.901 5.125 5.265 5.406 5.615 5.814 6.003 6.181 6.361 6.59 6.802 7.019 7.286 7.538 7.782 8.056 8.363 8.664 8.991 9.347 9.717 10.079 10.491 11.003 11.546 12.208 12.939 13.766 14.676 15.668 16.842 18.142 18.861 19.09 19.073 18.848 18.568 18.288 17.982 17.717 17.436 17.179 16.921 16.637 16.371 16.135 15.917 15.689 15.459 15.237 15.014 14.774 14.556 14.321 14.072 13.883 13.694 13.496 13.296 13.096 12.94 12.761 12.499 12.311 12.086 11.965 11.719 11.464 11.192 11.045 10.511 10.522 10.34 10.136 9.692 9.448 9.175 8.861 8.482 8.063 7.481 4.919 -5 ,1459 ,KEBNE ,16692722,Thu Nov 25 21:49:12 CET,Thu Nov 25 23:40:04 CET,0.0 1.773 2.196 2.479 2.708 2.9 3.074 3.227 3.491 3.615 3.737 3.61 4.114 4.217 4.409 4.598 4.785 4.871 5.042 5.211 5.445 5.588 5.725 5.939 6.146 6.341 6.534 6.716 6.93 7.159 7.378 7.627 7.879 8.125 8.412 8.736 9.041 9.368 9.716 10.087 10.478 10.908 11.42 11.936 12.509 13.179 14.026 14.953 15.945 17.024 18.2 18.881 19.141 19.198 19.116 18.993 18.815 18.602 18.385 18.155 17.942 17.741 17.533 17.326 17.125 16.929 16.724 16.556 16.412 16.237 16.035 15.856 15.667 15.458 15.289 15.121 14.947 14.763 14.556 14.409 14.253 14.003 13.83 13.646 13.552 13.353 13.141 12.908 12.786 12.287 12.355 12.21 12.046 11.638 11.396 11.133 10.868 10.568 10.17 9.626 6.321 -6 ,12150 ,KEBNE ,16692723,Thu Nov 25 21:49:12 CET,Thu Nov 25 23:40:05 CET,0.0 1.254 1.689 1.972 2.194 2.376 2.54 2.697 2.974 3.1 3.224 3.089 3.572 3.676 3.879 4.055 4.213 4.296 4.465 4.626 4.853 4.992 5.132 5.328 5.515 5.702 5.886 6.059 6.278 6.504 6.722 6.988 7.247 7.492 7.769 8.072 8.357 8.676 9.034 9.394 9.77 10.186 10.648 11.128 11.709 12.367 13.125 13.95 14.858 15.904 17.07 17.834 18.064 17.992 17.788 17.545 17.294 17.058 16.835 16.612 16.426 16.224 15.993 15.766 15.536 15.315 15.101 14.931 14.775 14.594 14.395 14.213 14.016 13.801 13.636 13.459 13.265 13.077 12.893 12.76 12.603 12.346 12.169 11.968 11.864 11.66 11.448 11.192 11.036 10.519 10.59 10.43 10.267 9.887 9.641 9.377 9.097 8.758 8.279 7.653 2.443 -7 ,10642 ,KEBNE ,16692724,Thu Nov 25 21:49:12 CET,Thu Nov 25 23:39:54 CET,0.0 1.009 1.355 1.615 1.836 2.027 2.193 2.343 2.619 2.743 2.864 2.732 3.221 3.327 3.535 3.719 3.886 3.965 4.124 4.281 4.509 4.654 4.797 5.023 5.237 5.426 5.61 5.793 6.029 6.253 6.469 6.723 6.96 7.184 7.447 7.746 8.038 8.359 8.709 9.097 9.507 9.953 10.476 11.032 11.644 12.306 13.112 13.947 14.823 15.863 17.048 17.741 17.945 17.923 17.809 17.656 17.454 17.216 16.959 16.679 16.445 16.233 16.007 15.797 15.601 15.398 15.189 15.003 14.831 14.639 14.44 14.273 14.092 13.903 13.744 13.576 13.401 13.215 13.005 12.847 12.693 12.439 12.237 12.026 11.924 11.695 11.444 11.201 11.076 10.577 10.651 10.485 10.308 9.937 9.702 9.434 9.171 8.858 8.475 7.966 4.174 -8 ,3780 ,KEBNE ,16692725,Thu Nov 25 21:49:12 CET,Thu Nov 25 23:40:19 CET,0.0 1.906 2.364 2.685 2.954 3.171 3.359 3.529 3.818 3.95 4.073 3.929 4.432 4.556 4.768 4.95 5.122 5.206 5.373 5.534 5.763 5.912 6.063 6.282 6.495 6.691 6.867 7.05 7.302 7.547 7.771 8.036 8.292 8.531 8.806 9.123 9.423 9.756 10.113 10.478 10.86 11.305 11.837 12.34 12.916 13.579 14.347 15.195 16.125 17.103 18.051 18.654 18.901 18.943 18.816 18.57 18.315 18.065 17.835 17.573 17.325 17.06 16.763 16.501 16.252 16.032 15.83 15.637 15.469 15.292 15.092 14.924 14.74 14.541 14.374 14.188 13.992 13.772 13.545 13.388 13.218 12.944 12.747 12.526 12.412 12.188 11.919 11.624 11.469 10.942 10.996 10.82 10.626 10.265 10.068 9.803 9.494 9.139 8.682 8.1 0.594 -9 ,20820 ,KEBNE ,16692726,Thu Nov 25 21:50:14 CET,Thu Nov 25 23:41:46 CET,0.0 1.899 2.302 2.583 2.806 3.011 3.204 3.38 3.705 3.841 3.966 3.842 4.339 4.45 4.657 4.849 5.036 5.123 5.289 5.447 5.67 5.818 5.959 6.154 6.347 6.54 6.724 6.907 7.15 7.37 7.605 7.919 8.193 8.443 8.75 9.102 9.429 9.766 10.113 10.507 10.943 11.415 11.923 12.425 13.04 13.715 14.444 15.268 16.225 17.288 18.437 19.158 19.408 19.423 19.287 19.085 18.841 18.59 18.335 18.055 17.798 17.539 17.277 17.012 16.753 16.494 16.217 15.985 15.785 15.572 15.352 15.157 14.933 14.723 14.583 14.421 14.231 14.024 13.776 13.607 13.445 13.181 12.988 12.786 12.673 12.411 12.14 11.878 11.739 11.226 11.302 11.122 10.905 10.471 10.223 9.956 9.654 9.269 8.806 8.13 4.191 -10 ,29607 ,KEBNE ,16692727,Thu Nov 25 21:50:15 CET,Thu Nov 25 23:42:05 CET,0.0 1.537 1.94 2.241 2.469 2.668 2.847 3.016 3.328 3.462 3.584 3.428 3.911 4.012 4.208 4.399 4.58 4.665 4.829 4.986 5.203 5.345 5.486 5.709 5.934 6.151 6.351 6.525 6.756 6.992 7.223 7.484 7.726 7.962 8.237 8.563 8.869 9.193 9.541 9.903 10.296 10.761 11.294 11.837 12.485 13.174 13.951 14.804 15.77 16.922 18.178 18.881 19.12 19.14 19.022 18.825 18.549 18.237 17.954 17.683 17.439 17.172 16.906 16.655 16.411 16.202 15.982 15.765 15.569 15.345 15.101 14.908 14.7 14.478 14.292 14.088 13.863 13.627 13.394 13.227 13.039 12.774 12.607 12.411 12.309 12.112 11.898 11.655 11.526 11.04 11.103 10.937 10.742 10.268 10.021 9.756 9.454 9.098 8.621 7.913 5.13 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt deleted file mode 100644 index 340ddd0a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29164 ,KEBNE ,16692729,Thu Nov 25 21:50:14 CET,Thu Nov 25 23:46:26 CET,0.0 2.576 3.066 3.429 3.664 3.823 3.944 4.035 4.19 4.26 4.316 4.015 4.437 4.472 4.53 4.58 4.63 4.655 4.704 4.718 4.681 4.651 4.627 4.578 4.497 4.401 4.3 4.188 3.999 3.769 3.529 3.223 2.9 2.547 2.124 1.628 1.104 0.499 -0.202 -1.015 -1.942 -3.047 -4.43 -5.965 -7.915 -10.349 -13.46 -17.361 -22.523 -29.58 -40.109 -51.158 -59.344 -65.789 -70.921 -75.226 -78.754 -81.786 -84.284 -86.661 -88.625 -90.31 -91.86 -93.27 -94.538 -95.659 -96.808 -97.804 -98.628 -99.475 -100.333 -101.031 -101.758 -102.488 -103.026 -103.565 -104.127 -104.714 -105.305 -105.697 -106.108 -106.716 -107.128 -107.562 -107.781 -108.225 -108.666 -109.127 -109.364 -110.115 -110.123 -110.396 -110.691 -111.317 -111.637 -111.968 -112.335 -112.742 -113.246 -113.909 -116.953 -2 ,27421 ,KEBNE ,16692730,Thu Nov 25 21:50:14 CET,Thu Nov 25 23:46:52 CET,0.0 2.9 3.391 3.725 3.98 4.175 4.328 4.461 4.673 4.763 4.843 4.586 5.027 5.093 5.176 5.213 5.249 5.252 5.237 5.197 5.132 5.085 5.011 4.915 4.841 4.764 4.678 4.571 4.407 4.213 4.005 3.722 3.409 3.071 2.645 2.155 1.659 1.064 0.358 -0.463 -1.365 -2.448 -3.856 -5.421 -7.388 -9.765 -12.799 -16.694 -21.938 -29.146 -39.768 -50.756 -58.913 -65.425 -70.632 -74.955 -78.483 -81.49 -83.951 -86.275 -88.207 -89.888 -91.442 -92.858 -94.124 -95.271 -96.446 -97.463 -98.331 -99.204 -100.092 -100.827 -101.59 -102.366 -102.932 -103.496 -104.07 -104.663 -105.277 -105.699 -106.116 -106.726 -107.145 -107.59 -107.82 -108.296 -108.787 -109.287 -109.545 -110.326 -110.337 -110.606 -110.895 -111.495 -111.815 -112.143 -112.489 -112.913 -113.404 -113.996 -116.031 -3 ,10528 ,KEBNE ,16692731,Thu Nov 25 21:51:17 CET,Thu Nov 25 23:49:11 CET,0.0 2.375 2.917 3.248 3.488 3.675 3.807 3.921 4.086 4.143 4.183 3.849 4.265 4.293 4.335 4.336 4.32 4.322 4.323 4.305 4.246 4.192 4.131 4.025 3.902 3.776 3.648 3.51 3.316 3.109 2.876 2.569 2.255 1.898 1.455 0.945 0.431 -0.189 -0.919 -1.75 -2.66 -3.731 -5.103 -6.598 -8.483 -10.76 -13.721 -17.566 -22.653 -29.591 -39.938 -50.893 -59.057 -65.478 -70.574 -74.777 -78.249 -81.281 -83.757 -86.083 -87.999 -89.649 -91.16 -92.555 -93.813 -94.913 -96.031 -96.996 -97.807 -98.634 -99.492 -100.192 -100.902 -101.64 -102.214 -102.779 -103.336 -103.912 -104.515 -104.927 -105.342 -105.958 -106.375 -106.804 -107.021 -107.46 -107.918 -108.385 -108.622 -109.37 -109.358 -109.624 -109.898 -110.435 -110.746 -111.1 -111.459 -111.879 -112.425 -113.138 -115.398 -4 ,29244 ,KEBNE ,16692732,Thu Nov 25 21:51:16 CET,Thu Nov 25 23:46:09 CET,0.0 2.131 2.56 2.842 3.025 3.16 3.266 3.369 3.535 3.598 3.655 3.37 3.783 3.817 3.895 3.938 3.95 3.956 3.952 3.931 3.889 3.839 3.786 3.722 3.655 3.561 3.438 3.308 3.124 2.931 2.743 2.503 2.247 1.968 1.589 1.121 0.629 0.054 -0.563 -1.25 -2.086 -3.13 -4.475 -5.93 -7.728 -9.966 -12.835 -16.575 -21.673 -28.615 -39.059 -50.016 -57.982 -64.22 -69.258 -73.475 -76.974 -79.967 -82.393 -84.653 -86.528 -88.164 -89.668 -91.071 -92.369 -93.496 -94.614 -95.594 -96.407 -97.228 -98.072 -98.771 -99.474 -100.181 -100.72 -101.268 -101.838 -102.418 -102.996 -103.388 -103.792 -104.4 -104.803 -105.215 -105.424 -105.86 -106.318 -106.784 -107.017 -107.756 -107.733 -107.975 -108.23 -108.794 -109.112 -109.442 -109.773 -110.142 -110.564 -111.094 -112.768 -5 ,21799 ,KEBNE ,16692733,Thu Nov 25 21:52:19 CET,Thu Nov 25 23:47:18 CET,0.0 1.584 1.974 2.196 2.386 2.555 2.688 2.795 2.955 3.018 3.075 2.787 3.207 3.244 3.286 3.292 3.283 3.276 3.266 3.255 3.228 3.208 3.172 3.096 3.029 2.95 2.842 2.721 2.567 2.394 2.198 1.935 1.63 1.317 0.942 0.494 0.026 -0.527 -1.154 -1.901 -2.756 -3.758 -5.035 -6.451 -8.302 -10.676 -13.737 -17.56 -22.692 -29.808 -40.348 -51.464 -59.611 -65.923 -70.959 -75.216 -78.762 -81.777 -84.234 -86.566 -88.523 -90.23 -91.802 -93.246 -94.545 -95.671 -96.78 -97.763 -98.606 -99.425 -100.232 -100.887 -101.567 -102.276 -102.813 -103.352 -103.892 -104.449 -105.023 -105.407 -105.804 -106.418 -106.829 -107.249 -107.464 -107.899 -108.365 -108.865 -109.111 -109.855 -109.865 -110.131 -110.392 -110.928 -111.219 -111.533 -111.884 -112.338 -112.931 -113.774 -117.044 -6 ,798 ,KEBNE ,16692734,Thu Nov 25 21:52:19 CET,Thu Nov 25 23:49:01 CET,0.0 2.252 2.815 3.122 3.33 3.498 3.652 3.77 3.944 4.021 4.096 3.844 4.282 4.326 4.376 4.397 4.424 4.432 4.403 4.37 4.315 4.26 4.201 4.094 3.983 3.87 3.742 3.609 3.423 3.225 3.041 2.814 2.549 2.269 1.925 1.479 1.018 0.472 -0.18 -0.952 -1.87 -2.963 -4.318 -5.857 -7.738 -10.017 -13.121 -17.03 -22.128 -29.095 -39.588 -50.809 -59.139 -65.617 -70.7 -74.887 -78.354 -81.363 -83.844 -86.211 -88.162 -89.801 -91.3 -92.68 -93.931 -95.061 -96.208 -97.199 -98.027 -98.868 -99.73 -100.425 -101.125 -101.832 -102.366 -102.901 -103.446 -104.013 -104.595 -104.987 -105.394 -106.017 -106.439 -106.871 -107.089 -107.529 -107.985 -108.474 -108.73 -109.488 -109.519 -109.791 -110.062 -110.667 -111.031 -111.481 -112.018 -112.567 -113.128 -113.765 -116.626 -7 ,1309 ,KEBNE ,16692735,Thu Nov 25 21:52:19 CET,Thu Nov 25 23:48:11 CET,0.0 3.797 4.327 4.65 4.844 4.979 5.097 5.195 5.341 5.402 5.459 5.175 5.596 5.615 5.636 5.659 5.673 5.674 5.66 5.64 5.571 5.502 5.433 5.313 5.188 5.069 4.939 4.799 4.606 4.394 4.156 3.842 3.526 3.209 2.783 2.252 1.738 1.129 0.4 -0.421 -1.337 -2.446 -3.847 -5.377 -7.266 -9.583 -12.554 -16.258 -21.243 -28.257 -38.843 -49.896 -58.001 -64.424 -69.637 -73.967 -77.482 -80.494 -82.967 -85.341 -87.301 -88.938 -90.419 -91.778 -93.004 -94.108 -95.245 -96.22 -97.04 -97.866 -98.689 -99.354 -100.027 -100.721 -101.252 -101.776 -102.307 -102.854 -103.426 -103.816 -104.207 -104.8 -105.2 -105.607 -105.814 -106.242 -106.704 -107.171 -107.398 -108.134 -108.124 -108.379 -108.629 -109.161 -109.469 -109.796 -110.147 -110.544 -110.967 -111.525 -113.788 -8 ,4398 ,KEBNE ,16692736,Thu Nov 25 21:53:22 CET,Thu Nov 25 23:49:58 CET,0.0 1.972 2.385 2.65 2.85 2.988 3.111 3.214 3.37 3.436 3.486 3.178 3.586 3.617 3.653 3.669 3.675 3.674 3.666 3.645 3.598 3.564 3.528 3.45 3.347 3.224 3.088 2.94 2.731 2.512 2.279 1.97 1.648 1.352 1.008 0.568 0.1 -0.452 -1.101 -1.831 -2.67 -3.706 -4.992 -6.404 -8.218 -10.474 -13.37 -17.14 -22.317 -29.437 -39.978 -50.975 -59.006 -65.307 -70.334 -74.516 -77.956 -80.911 -83.345 -85.639 -87.523 -89.148 -90.653 -92.019 -93.211 -94.284 -95.4 -96.388 -97.237 -98.099 -98.969 -99.653 -100.334 -101.027 -101.557 -102.112 -102.682 -103.247 -103.808 -104.188 -104.572 -105.163 -105.581 -106.0 -106.211 -106.648 -107.111 -107.576 -107.812 -108.563 -108.562 -108.831 -109.114 -109.691 -109.998 -110.324 -110.676 -111.073 -111.518 -112.113 -114.334 -9 ,23101 ,KEBNE ,16692737,Thu Nov 25 21:53:21 CET,Thu Nov 25 23:50:44 CET,0.0 3.314 3.768 4.111 4.388 4.604 4.765 4.884 5.079 5.153 5.22 4.952 5.387 5.432 5.51 5.551 5.577 5.592 5.599 5.581 5.554 5.536 5.504 5.447 5.382 5.311 5.225 5.107 4.95 4.775 4.568 4.315 4.053 3.769 3.393 2.914 2.397 1.797 1.124 0.395 -0.396 -1.407 -2.728 -4.185 -6.024 -8.218 -11.081 -14.845 -19.922 -26.866 -37.096 -47.887 -55.946 -62.234 -67.197 -71.346 -74.812 -77.796 -80.254 -82.622 -84.571 -86.244 -87.768 -89.141 -90.373 -91.46 -92.555 -93.501 -94.316 -95.153 -95.999 -96.688 -97.376 -98.07 -98.611 -99.158 -99.716 -100.283 -100.864 -101.255 -101.653 -102.278 -102.686 -103.1 -103.311 -103.746 -104.208 -104.673 -104.915 -105.677 -105.695 -105.97 -106.26 -106.831 -107.139 -107.475 -107.832 -108.225 -108.656 -109.216 -114.171 -10 ,18940 ,KEBNE ,16692738,Thu Nov 25 21:53:22 CET,Thu Nov 25 23:50:36 CET,0.0 3.471 3.942 4.262 4.463 4.628 4.787 4.912 5.083 5.17 5.262 5.04 5.483 5.528 5.593 5.651 5.699 5.719 5.75 5.746 5.689 5.64 5.582 5.508 5.422 5.314 5.207 5.11 4.963 4.775 4.56 4.272 3.986 3.687 3.297 2.803 2.298 1.715 1.028 0.25 -0.606 -1.661 -3.054 -4.597 -6.538 -8.909 -11.963 -15.818 -20.952 -28.058 -38.669 -49.96 -58.189 -64.523 -69.617 -73.851 -77.372 -80.437 -82.946 -85.33 -87.315 -89.036 -90.594 -91.991 -93.243 -94.372 -95.544 -96.57 -97.422 -98.28 -99.16 -99.866 -100.567 -101.273 -101.838 -102.43 -103.023 -103.639 -104.275 -104.689 -105.109 -105.778 -106.222 -106.656 -106.879 -107.342 -107.823 -108.314 -108.56 -109.319 -109.333 -109.599 -109.864 -110.445 -110.755 -111.099 -111.494 -111.928 -112.469 -113.229 -115.527 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 5572f16d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/protein/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19607 ,KEBNE ,16692739,Thu Nov 25 21:53:22 CET,Thu Nov 25 23:48:48 CET,0.0 2.15 2.64 2.949 3.235 3.496 3.692 3.86 4.198 4.364 4.504 4.389 4.899 5.026 5.27 5.474 5.659 5.748 5.93 6.11 6.368 6.531 6.686 6.913 7.135 7.36 7.574 7.774 8.04 8.326 8.61 8.943 9.267 9.556 9.885 10.268 10.646 11.053 11.471 11.925 12.398 12.926 13.547 14.182 14.955 15.832 16.855 18.029 19.429 21.066 22.92 24.354 25.102 25.461 25.631 25.699 25.682 25.609 25.495 25.343 25.222 25.103 24.961 24.809 24.66 24.501 24.307 24.148 24.01 23.843 23.657 23.502 23.327 23.151 23.021 22.883 22.726 22.543 22.332 22.173 22.025 21.803 21.641 21.447 21.336 21.129 20.91 20.662 20.539 20.053 20.12 19.97 19.818 19.498 19.285 19.036 18.805 18.516 18.108 17.55 14.899 -2 ,30868 ,KEBNE ,16692740,Thu Nov 25 21:54:25 CET,Thu Nov 25 23:49:11 CET,0.0 1.476 1.912 2.259 2.551 2.808 3.029 3.216 3.555 3.701 3.837 3.723 4.233 4.361 4.607 4.846 5.085 5.201 5.425 5.638 5.937 6.128 6.302 6.54 6.763 6.981 7.2 7.415 7.693 7.956 8.2 8.503 8.801 9.081 9.401 9.764 10.114 10.504 10.93 11.389 11.878 12.439 13.064 13.68 14.431 15.268 16.236 17.307 18.589 20.197 22.058 23.443 24.126 24.428 24.556 24.547 24.445 24.309 24.17 24.023 23.874 23.722 23.575 23.395 23.186 22.988 22.773 22.58 22.391 22.175 21.953 21.773 21.592 21.421 21.283 21.116 20.934 20.73 20.507 20.347 20.188 19.931 19.748 19.569 19.467 19.257 19.036 18.784 18.645 18.134 18.228 18.1 17.948 17.552 17.314 17.039 16.718 16.307 15.772 15.02 8.822 -3 ,23995 ,KEBNE ,16692741,Thu Nov 25 21:55:26 CET,Thu Nov 25 23:51:11 CET,0.0 1.949 2.467 2.845 3.159 3.427 3.642 3.84 4.199 4.362 4.5 4.4 4.931 5.063 5.301 5.527 5.73 5.828 6.033 6.239 6.532 6.713 6.878 7.108 7.349 7.593 7.823 8.039 8.31 8.579 8.846 9.159 9.45 9.748 10.111 10.515 10.906 11.335 11.798 12.305 12.847 13.457 14.151 14.863 15.666 16.538 17.569 18.704 20.014 21.632 23.6 25.076 25.876 26.258 26.399 26.454 26.393 26.28 26.157 26.006 25.879 25.735 25.572 25.406 25.244 25.099 24.928 24.769 24.61 24.417 24.227 24.065 23.889 23.705 23.533 23.354 23.179 22.996 22.821 22.696 22.553 22.329 22.162 21.981 21.878 21.657 21.46 21.235 21.076 20.536 20.523 20.326 20.113 19.629 19.387 19.153 18.864 18.491 18.005 17.412 13.919 -4 ,2179 ,KEBNE ,16692742,Thu Nov 25 21:55:27 CET,Thu Nov 25 23:50:27 CET,0.0 2.138 2.57 2.907 3.176 3.416 3.651 3.849 4.166 4.306 4.438 4.327 4.851 4.979 5.216 5.435 5.651 5.761 5.956 6.129 6.385 6.552 6.707 6.938 7.168 7.386 7.592 7.805 8.086 8.341 8.587 8.892 9.184 9.458 9.777 10.137 10.476 10.864 11.295 11.753 12.25 12.814 13.451 14.097 14.854 15.73 16.767 17.912 19.28 20.877 22.69 23.996 24.617 24.982 25.19 25.249 25.202 25.09 24.965 24.791 24.618 24.463 24.312 24.18 24.055 23.919 23.756 23.588 23.427 23.234 22.981 22.754 22.537 22.32 22.138 21.936 21.725 21.511 21.288 21.112 20.913 20.614 20.413 20.198 20.093 19.895 19.682 19.457 19.339 18.852 18.93 18.791 18.647 18.288 18.08 17.804 17.48 17.145 16.736 16.148 12.856 -5 ,14875 ,KEBNE ,16692743,Thu Nov 25 21:56:31 CET,Thu Nov 25 23:52:55 CET,0.0 1.797 2.275 2.58 2.81 3.028 3.246 3.448 3.836 4.008 4.17 4.098 4.61 4.727 4.938 5.137 5.335 5.434 5.622 5.799 6.061 6.23 6.393 6.631 6.851 7.073 7.297 7.507 7.767 8.008 8.244 8.536 8.824 9.113 9.444 9.816 10.175 10.558 10.979 11.445 11.938 12.507 13.191 13.872 14.689 15.598 16.633 17.826 19.203 20.72 22.521 23.923 24.616 24.98 25.12 25.129 25.07 24.926 24.777 24.622 24.49 24.381 24.247 24.087 23.923 23.78 23.615 23.467 23.331 23.17 22.999 22.866 22.719 22.555 22.426 22.287 22.126 21.931 21.728 21.584 21.42 21.153 20.974 20.777 20.668 20.45 20.193 19.885 19.728 19.205 19.216 19.036 18.856 18.421 18.139 17.822 17.527 17.262 16.92 16.398 13.635 -6 ,15035 ,KEBNE ,16692744,Thu Nov 25 21:56:29 CET,Thu Nov 25 23:50:42 CET,0.0 1.83 2.292 2.63 2.888 3.12 3.342 3.532 3.877 4.04 4.189 4.086 4.601 4.727 4.975 5.186 5.377 5.473 5.659 5.852 6.15 6.329 6.498 6.746 6.999 7.234 7.459 7.678 7.958 8.231 8.474 8.761 9.046 9.329 9.656 10.02 10.364 10.755 11.185 11.628 12.085 12.634 13.303 13.97 14.751 15.595 16.586 17.736 19.017 20.52 22.336 23.664 24.282 24.637 24.821 24.869 24.862 24.796 24.687 24.55 24.409 24.269 24.124 23.939 23.758 23.595 23.402 23.235 23.089 22.933 22.772 22.632 22.472 22.304 22.166 22.027 21.882 21.732 21.577 21.448 21.31 21.092 20.939 20.775 20.684 20.49 20.28 20.063 19.94 19.447 19.544 19.393 19.229 18.83 18.597 18.348 18.07 17.753 17.35 16.747 13.877 -7 ,10765 ,KEBNE ,16692745,Thu Nov 25 21:56:29 CET,Thu Nov 25 23:52:25 CET,0.0 1.261 1.682 1.993 2.243 2.458 2.654 2.822 3.127 3.278 3.423 3.315 3.842 3.98 4.244 4.49 4.721 4.832 5.047 5.253 5.524 5.686 5.849 6.081 6.314 6.559 6.795 7.023 7.31 7.576 7.832 8.14 8.432 8.72 9.047 9.417 9.796 10.201 10.639 11.114 11.603 12.146 12.772 13.446 14.241 15.085 16.084 17.175 18.42 19.936 21.747 23.106 23.784 24.056 24.13 24.097 24.011 23.937 23.825 23.646 23.464 23.301 23.14 22.975 22.804 22.64 22.466 22.306 22.173 22.039 21.887 21.755 21.611 21.437 21.301 21.164 20.987 20.753 20.487 20.317 20.15 19.847 19.626 19.418 19.322 19.134 18.911 18.638 18.486 17.984 18.074 17.926 17.775 17.433 17.236 17.013 16.757 16.395 15.916 15.313 11.121 -8 ,20217 ,KEBNE ,16692746,Thu Nov 25 21:57:32 CET,Thu Nov 25 23:53:37 CET,0.0 1.567 2.061 2.444 2.714 2.932 3.148 3.35 3.711 3.867 4.008 3.909 4.423 4.534 4.756 4.983 5.206 5.312 5.507 5.683 5.946 6.137 6.306 6.53 6.762 6.995 7.22 7.435 7.709 7.974 8.219 8.511 8.792 9.06 9.38 9.757 10.112 10.485 10.928 11.435 11.931 12.468 13.122 13.794 14.589 15.463 16.442 17.55 18.888 20.399 22.103 23.495 24.261 24.685 24.903 25.02 25.039 24.986 24.911 24.822 24.711 24.548 24.351 24.172 24.016 23.868 23.698 23.529 23.38 23.243 23.101 22.955 22.807 22.653 22.523 22.374 22.189 21.979 21.781 21.658 21.509 21.249 21.071 20.893 20.8 20.603 20.378 20.107 19.962 19.452 19.508 19.334 19.138 18.669 18.405 18.108 17.783 17.375 16.782 15.98 12.624 -9 ,27122 ,KEBNE ,16692747,Thu Nov 25 21:57:32 CET,Thu Nov 25 23:53:30 CET,0.0 2.242 2.694 3.044 3.332 3.541 3.723 3.913 4.277 4.448 4.607 4.489 4.991 5.122 5.367 5.581 5.788 5.888 6.073 6.258 6.526 6.696 6.855 7.082 7.304 7.522 7.757 7.981 8.247 8.513 8.765 9.056 9.351 9.65 10.003 10.391 10.756 11.142 11.55 11.986 12.45 12.995 13.633 14.265 15.039 15.926 16.939 18.107 19.43 20.977 22.817 24.094 24.726 25.088 25.227 25.264 25.243 25.197 25.142 25.046 24.918 24.796 24.685 24.582 24.455 24.291 24.122 23.974 23.841 23.703 23.564 23.447 23.304 23.148 23.019 22.864 22.686 22.489 22.297 22.183 22.063 21.873 21.732 21.513 21.382 21.15 20.95 20.762 20.657 20.164 20.202 20.03 19.847 19.426 19.19 18.941 18.67 18.323 17.893 17.283 13.76 -10 ,12278 ,KEBNE ,16692748,Thu Nov 25 21:58:34 CET,Thu Nov 25 23:52:05 CET,0.0 1.757 2.242 2.559 2.831 3.069 3.285 3.505 3.851 3.992 4.141 4.066 4.58 4.696 4.934 5.164 5.383 5.493 5.705 5.886 6.149 6.334 6.516 6.774 7.004 7.217 7.43 7.64 7.902 8.153 8.401 8.704 9.0 9.273 9.586 9.964 10.338 10.722 11.136 11.605 12.098 12.654 13.32 13.989 14.794 15.664 16.623 17.726 19.089 20.745 22.565 23.9 24.556 24.823 24.935 24.961 24.913 24.752 24.56 24.394 24.231 24.072 23.866 23.624 23.401 23.213 23.019 22.853 22.697 22.494 22.25 22.072 21.903 21.712 21.568 21.413 21.236 21.049 20.872 20.75 20.607 20.368 20.189 19.998 19.902 19.7 19.493 19.275 19.164 18.693 18.786 18.624 18.44 18.021 17.764 17.439 17.08 16.703 16.204 15.528 12.428 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt deleted file mode 100644 index b206c142..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-2z.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7555 ,KEBNE ,16692749,Thu Nov 25 21:58:35 CET,Thu Nov 25 23:35:27 CET,0.0 1.617 2.148 2.545 2.834 3.088 3.335 3.558 3.914 4.064 4.201 4.124 4.589 4.725 4.985 5.211 5.414 5.514 5.708 5.887 6.143 6.309 6.473 6.713 6.907 7.085 7.262 7.434 7.663 7.87 8.051 8.249 8.43 8.607 8.828 9.06 9.243 9.438 9.621 9.793 9.959 10.116 10.273 10.367 10.408 10.37 10.186 9.804 9.107 7.825 5.553 2.783 0.527 -1.377 -3.062 -4.553 -5.807 -6.895 -7.811 -8.725 -9.494 -10.159 -10.795 -11.388 -11.933 -12.446 -12.982 -13.454 -13.864 -14.281 -14.715 -15.069 -15.421 -15.787 -16.074 -16.392 -16.711 -17.015 -17.342 -17.576 -17.823 -18.183 -18.418 -18.653 -18.77 -19.016 -19.278 -19.55 -19.692 -20.199 -20.139 -20.294 -20.458 -20.823 -21.026 -21.239 -21.474 -21.746 -22.049 -22.415 -23.594 -2 ,32258 ,KEBNE ,16692750,Thu Nov 25 21:58:34 CET,Thu Nov 25 23:36:40 CET,0.0 1.458 1.983 2.35 2.653 2.937 3.192 3.424 3.842 4.018 4.181 4.149 4.632 4.788 5.056 5.277 5.476 5.573 5.752 5.924 6.176 6.336 6.499 6.723 6.921 7.113 7.31 7.483 7.705 7.923 8.12 8.343 8.544 8.741 8.949 9.16 9.362 9.543 9.706 9.887 10.008 10.126 10.273 10.328 10.339 10.321 10.166 9.757 8.994 7.737 5.667 3.319 1.224 -0.655 -2.201 -3.603 -4.827 -5.883 -6.77 -7.654 -8.421 -9.096 -9.736 -10.353 -10.887 -11.358 -11.859 -12.298 -12.686 -13.103 -13.522 -13.862 -14.211 -14.572 -14.85 -15.132 -15.425 -15.724 -16.038 -16.247 -16.462 -16.817 -17.063 -17.311 -17.439 -17.706 -17.984 -18.268 -18.415 -18.925 -18.935 -19.121 -19.308 -19.703 -19.915 -20.152 -20.402 -20.685 -21.021 -21.427 -22.905 -3 ,14279 ,KEBNE ,16692751,Thu Nov 25 21:59:36 CET,Thu Nov 25 23:36:24 CET,0.0 1.256 1.624 1.905 2.15 2.373 2.589 2.786 3.113 3.257 3.403 3.356 3.813 3.933 4.174 4.382 4.578 4.679 4.884 5.086 5.353 5.514 5.664 5.879 6.085 6.265 6.428 6.587 6.803 7.005 7.198 7.437 7.638 7.802 7.966 8.157 8.354 8.538 8.723 8.901 9.039 9.147 9.216 9.272 9.311 9.276 9.151 8.823 8.173 7.062 5.07 2.477 0.208 -1.732 -3.37 -4.84 -6.109 -7.187 -8.137 -9.157 -10.048 -10.82 -11.526 -12.19 -12.824 -13.42 -14.037 -14.561 -14.995 -15.439 -15.894 -16.283 -16.692 -17.109 -17.431 -17.763 -18.097 -18.452 -18.833 -19.077 -19.332 -19.745 -20.03 -20.333 -20.483 -20.793 -21.138 -21.499 -21.675 -22.209 -22.261 -22.474 -22.689 -23.148 -23.416 -23.696 -23.952 -24.219 -24.53 -24.922 -26.113 -4 ,30212 ,KEBNE ,16692752,Thu Nov 25 21:59:37 CET,Thu Nov 25 23:38:35 CET,0.0 1.293 1.714 2.047 2.356 2.635 2.88 3.115 3.53 3.697 3.862 3.836 4.307 4.44 4.689 4.909 5.103 5.204 5.402 5.578 5.825 5.979 6.126 6.34 6.535 6.72 6.906 7.077 7.293 7.495 7.673 7.89 8.094 8.282 8.484 8.691 8.879 9.09 9.314 9.547 9.774 9.995 10.175 10.298 10.405 10.441 10.355 10.113 9.616 8.603 6.498 3.734 1.415 -0.568 -2.241 -3.681 -4.92 -6.046 -6.993 -7.895 -8.667 -9.373 -10.029 -10.644 -11.247 -11.78 -12.301 -12.789 -13.207 -13.62 -14.044 -14.395 -14.764 -15.151 -15.445 -15.745 -16.055 -16.387 -16.736 -16.959 -17.176 -17.515 -17.753 -18.003 -18.139 -18.421 -18.717 -19.03 -19.181 -19.689 -19.657 -19.839 -20.05 -20.498 -20.742 -21.0 -21.27 -21.554 -21.868 -22.247 -23.607 -5 ,26773 ,KEBNE ,16692753,Thu Nov 25 22:00:39 CET,Thu Nov 25 23:37:22 CET,0.0 1.741 2.286 2.701 3.042 3.342 3.61 3.852 4.244 4.424 4.6 4.574 5.048 5.178 5.422 5.671 5.898 5.996 6.199 6.399 6.668 6.837 6.984 7.188 7.383 7.56 7.729 7.899 8.119 8.33 8.517 8.72 8.924 9.12 9.324 9.559 9.762 9.942 10.141 10.321 10.472 10.612 10.731 10.776 10.752 10.735 10.669 10.364 9.636 8.311 5.948 3.067 0.749 -1.153 -2.718 -4.063 -5.224 -6.26 -7.159 -8.074 -8.9 -9.641 -10.31 -10.914 -11.462 -11.966 -12.475 -12.918 -13.325 -13.743 -14.161 -14.522 -14.878 -15.23 -15.514 -15.815 -16.122 -16.451 -16.791 -17.019 -17.249 -17.605 -17.859 -18.117 -18.247 -18.525 -18.817 -19.106 -19.255 -19.773 -19.774 -19.955 -20.133 -20.474 -20.649 -20.85 -21.087 -21.35 -21.648 -22.019 -23.236 -6 ,18087 ,KEBNE ,16692754,Thu Nov 25 21:59:37 CET,Thu Nov 25 23:37:14 CET,0.0 1.503 1.96 2.281 2.549 2.8 3.024 3.228 3.569 3.72 3.873 3.832 4.303 4.433 4.687 4.906 5.113 5.214 5.402 5.583 5.843 6.01 6.16 6.373 6.586 6.778 6.95 7.112 7.316 7.512 7.696 7.918 8.14 8.327 8.518 8.721 8.921 9.147 9.377 9.593 9.762 9.915 10.094 10.211 10.237 10.202 10.089 9.788 9.097 7.864 5.582 2.648 0.253 -1.736 -3.468 -5.044 -6.404 -7.601 -8.58 -9.521 -10.322 -11.042 -11.721 -12.361 -12.958 -13.469 -13.985 -14.452 -14.86 -15.27 -15.682 -16.033 -16.404 -16.76 -17.027 -17.309 -17.612 -17.923 -18.238 -18.462 -18.682 -19.017 -19.255 -19.495 -19.616 -19.867 -20.128 -20.394 -20.544 -21.067 -21.059 -21.24 -21.416 -21.778 -21.981 -22.212 -22.47 -22.751 -23.075 -23.476 -24.914 -7 ,15102 ,KEBNE ,16692755,Thu Nov 25 21:59:37 CET,Thu Nov 25 23:38:36 CET,0.0 1.497 1.849 2.144 2.405 2.64 2.861 3.05 3.377 3.519 3.652 3.581 4.035 4.144 4.353 4.553 4.747 4.844 5.028 5.204 5.45 5.602 5.751 5.957 6.146 6.315 6.471 6.63 6.848 7.044 7.221 7.438 7.641 7.835 8.056 8.295 8.498 8.705 8.894 9.038 9.193 9.348 9.46 9.515 9.504 9.44 9.275 8.907 8.173 6.949 4.814 2.17 -0.079 -1.984 -3.58 -5.011 -6.238 -7.351 -8.302 -9.206 -9.977 -10.653 -11.294 -11.91 -12.471 -12.962 -13.487 -13.968 -14.371 -14.781 -15.21 -15.568 -15.931 -16.309 -16.598 -16.886 -17.185 -17.488 -17.802 -18.018 -18.235 -18.566 -18.798 -19.046 -19.171 -19.427 -19.684 -19.953 -20.092 -20.589 -20.521 -20.664 -20.826 -21.197 -21.388 -21.588 -21.828 -22.109 -22.445 -22.886 -24.21 -8 ,388 ,KEBNE ,16692756,Thu Nov 25 21:59:37 CET,Thu Nov 25 23:37:40 CET,0.0 1.288 1.752 2.11 2.41 2.658 2.85 3.02 3.357 3.529 3.695 3.63 4.081 4.2 4.42 4.615 4.792 4.877 5.05 5.223 5.452 5.589 5.729 5.945 6.139 6.324 6.499 6.651 6.861 7.066 7.228 7.389 7.547 7.707 7.897 8.072 8.207 8.365 8.557 8.787 8.98 9.12 9.268 9.396 9.429 9.363 9.191 8.836 8.179 7.003 4.765 1.938 -0.363 -2.309 -3.95 -5.374 -6.57 -7.661 -8.603 -9.493 -10.272 -10.967 -11.617 -12.225 -12.792 -13.311 -13.847 -14.312 -14.707 -15.113 -15.517 -15.853 -16.195 -16.549 -16.823 -17.103 -17.384 -17.675 -17.98 -18.194 -18.421 -18.759 -18.985 -19.212 -19.323 -19.56 -19.828 -20.128 -20.285 -20.794 -20.745 -20.913 -21.091 -21.452 -21.637 -21.85 -22.09 -22.362 -22.675 -23.101 -24.49 -9 ,14748 ,KEBNE ,16692757,Thu Nov 25 21:59:37 CET,Thu Nov 25 23:37:39 CET,0.0 1.469 1.916 2.265 2.57 2.83 3.048 3.241 3.57 3.714 3.858 3.811 4.282 4.413 4.66 4.88 5.082 5.18 5.373 5.558 5.823 5.98 6.122 6.334 6.535 6.721 6.885 7.04 7.254 7.451 7.634 7.866 8.07 8.253 8.467 8.694 8.908 9.103 9.25 9.376 9.529 9.71 9.877 10.028 10.152 10.155 10.028 9.748 9.251 8.377 6.533 4.073 1.908 0.09 -1.433 -2.814 -3.998 -5.041 -5.976 -6.91 -7.681 -8.364 -9.027 -9.647 -10.197 -10.689 -11.2 -11.645 -12.015 -12.396 -12.799 -13.145 -13.497 -13.844 -14.115 -14.416 -14.727 -15.018 -15.322 -15.548 -15.771 -16.111 -16.356 -16.611 -16.747 -17.026 -17.303 -17.605 -17.759 -18.265 -18.235 -18.417 -18.6 -18.967 -19.169 -19.397 -19.643 -19.915 -20.229 -20.663 -22.26 -10 ,14185 ,KEBNE ,16692758,Thu Nov 25 22:00:39 CET,Thu Nov 25 23:39:54 CET,0.0 2.346 2.859 3.239 3.522 3.749 3.972 4.202 4.632 4.818 4.987 4.943 5.419 5.56 5.806 6.046 6.281 6.382 6.566 6.751 7.024 7.192 7.348 7.568 7.779 7.975 8.134 8.295 8.517 8.702 8.869 9.065 9.247 9.432 9.651 9.864 10.066 10.296 10.528 10.756 10.937 11.049 11.159 11.249 11.261 11.221 11.102 10.79 10.188 9.096 7.038 4.396 2.158 0.273 -1.37 -2.893 -4.238 -5.44 -6.416 -7.33 -8.096 -8.75 -9.37 -9.969 -10.543 -11.065 -11.602 -12.093 -12.535 -12.99 -13.423 -13.762 -14.117 -14.494 -14.79 -15.083 -15.373 -15.686 -16.02 -16.25 -16.48 -16.826 -17.058 -17.286 -17.402 -17.646 -17.894 -18.156 -18.311 -18.832 -18.812 -18.995 -19.183 -19.577 -19.789 -20.02 -20.287 -20.614 -21.009 -21.47 -23.088 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 2c128804..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2aa_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24511 ,KEBNE ,16692759,Thu Nov 25 22:00:39 CET,Thu Nov 25 23:38:39 CET,0.0 1.278 1.678 1.969 2.206 2.408 2.578 2.719 2.975 3.09 3.199 3.08 3.511 3.593 3.76 3.931 4.094 4.173 4.311 4.412 4.552 4.646 4.735 4.857 4.963 5.068 5.175 5.281 5.411 5.531 5.639 5.751 5.854 5.97 6.125 6.268 6.381 6.508 6.622 6.736 6.842 6.929 7.021 7.067 7.03 6.9 6.616 6.117 5.335 4.111 1.945 -0.708 -2.891 -4.749 -6.351 -7.759 -8.961 -10.026 -10.957 -11.893 -12.678 -13.363 -14.029 -14.647 -15.211 -15.724 -16.242 -16.695 -17.072 -17.46 -17.869 -18.208 -18.571 -18.938 -19.238 -19.565 -19.885 -20.221 -20.544 -20.753 -20.973 -21.307 -21.56 -21.816 -21.938 -22.191 -22.451 -22.77 -22.938 -23.439 -23.395 -23.554 -23.731 -24.136 -24.344 -24.583 -24.851 -25.13 -25.478 -25.968 -27.925 -2 ,17759 ,KEBNE ,16692760,Thu Nov 25 22:00:43 CET,Thu Nov 25 23:28:32 CET,0.0 1.253 1.637 1.907 2.114 2.307 2.471 2.612 2.918 3.06 3.186 3.084 3.522 3.635 3.847 4.032 4.197 4.278 4.437 4.583 4.78 4.889 4.987 5.135 5.282 5.413 5.527 5.634 5.78 5.911 6.032 6.182 6.31 6.428 6.584 6.744 6.866 6.995 7.114 7.233 7.357 7.496 7.619 7.683 7.716 7.665 7.513 7.261 6.738 5.579 3.428 0.836 -1.407 -3.361 -5.018 -6.498 -7.75 -8.818 -9.741 -10.663 -11.44 -12.139 -12.802 -13.392 -13.928 -14.415 -14.936 -15.417 -15.816 -16.208 -16.621 -16.961 -17.319 -17.7 -17.985 -18.268 -18.567 -18.871 -19.182 -19.398 -19.613 -19.96 -20.211 -20.463 -20.6 -20.887 -21.153 -21.445 -21.602 -22.116 -22.09 -22.245 -22.415 -22.819 -23.053 -23.301 -23.554 -23.849 -24.232 -24.726 -26.433 -3 ,13034 ,KEBNE ,16692761,Thu Nov 25 22:01:42 CET,Thu Nov 25 23:40:30 CET,0.0 1.238 1.628 1.914 2.156 2.35 2.524 2.671 2.94 3.082 3.215 3.099 3.527 3.621 3.807 3.961 4.099 4.169 4.302 4.439 4.642 4.752 4.846 4.978 5.108 5.231 5.346 5.461 5.612 5.752 5.882 6.032 6.169 6.3 6.44 6.571 6.7 6.835 6.947 7.042 7.123 7.208 7.278 7.319 7.318 7.228 7.036 6.691 6.045 4.944 2.939 0.279 -1.992 -3.91 -5.595 -7.046 -8.269 -9.375 -10.286 -11.173 -11.961 -12.691 -13.36 -13.946 -14.489 -14.976 -15.477 -15.941 -16.34 -16.725 -17.11 -17.447 -17.79 -18.145 -18.435 -18.724 -19.009 -19.307 -19.621 -19.842 -20.077 -20.444 -20.698 -20.952 -21.086 -21.383 -21.689 -21.983 -22.146 -22.689 -22.694 -22.861 -23.056 -23.478 -23.707 -23.968 -24.233 -24.515 -24.849 -25.318 -26.734 -4 ,15059 ,KEBNE ,16692762,Thu Nov 25 22:01:41 CET,Thu Nov 25 23:40:06 CET,0.0 1.419 1.847 2.148 2.381 2.571 2.733 2.892 3.206 3.351 3.474 3.352 3.793 3.896 4.079 4.232 4.379 4.453 4.589 4.733 4.94 5.061 5.167 5.305 5.443 5.587 5.728 5.852 5.989 6.124 6.264 6.428 6.563 6.675 6.792 6.919 7.046 7.19 7.326 7.425 7.469 7.482 7.456 7.423 7.377 7.252 6.967 6.499 5.798 4.622 2.448 -0.25 -2.525 -4.454 -6.07 -7.486 -8.671 -9.713 -10.613 -11.512 -12.273 -12.947 -13.569 -14.139 -14.671 -15.146 -15.635 -16.067 -16.442 -16.85 -17.262 -17.594 -17.943 -18.299 -18.57 -18.852 -19.14 -19.436 -19.773 -20.023 -20.278 -20.661 -20.917 -21.164 -21.291 -21.57 -21.855 -22.132 -22.28 -22.797 -22.828 -23.03 -23.227 -23.662 -23.903 -24.153 -24.422 -24.744 -25.144 -25.704 -27.418 -5 ,31353 ,KEBNE ,16692763,Thu Nov 25 22:01:42 CET,Thu Nov 25 23:41:45 CET,0.0 1.952 2.339 2.625 2.861 3.072 3.264 3.436 3.767 3.917 4.048 3.949 4.384 4.49 4.688 4.88 5.068 5.155 5.322 5.48 5.684 5.794 5.889 6.032 6.176 6.309 6.455 6.597 6.761 6.898 7.02 7.163 7.296 7.422 7.56 7.715 7.821 7.934 8.088 8.233 8.346 8.435 8.511 8.591 8.674 8.687 8.541 8.135 7.399 6.096 3.785 0.976 -1.414 -3.409 -5.036 -6.46 -7.681 -8.779 -9.698 -10.571 -11.344 -12.034 -12.687 -13.303 -13.864 -14.361 -14.865 -15.305 -15.68 -16.074 -16.487 -16.829 -17.177 -17.541 -17.82 -18.113 -18.415 -18.727 -19.05 -19.269 -19.498 -19.861 -20.11 -20.374 -20.512 -20.777 -21.045 -21.331 -21.483 -21.991 -21.979 -22.164 -22.352 -22.757 -22.991 -23.261 -23.544 -23.863 -24.287 -24.838 -26.713 -6 ,1626 ,KEBNE ,16692764,Thu Nov 25 22:03:47 CET,Thu Nov 25 23:42:38 CET,0.0 1.194 1.611 1.928 2.177 2.368 2.535 2.687 2.953 3.073 3.183 3.021 3.436 3.523 3.697 3.856 3.991 4.054 4.18 4.318 4.509 4.624 4.738 4.908 5.052 5.156 5.263 5.369 5.504 5.623 5.726 5.846 5.949 6.043 6.161 6.304 6.426 6.535 6.635 6.731 6.817 6.898 6.94 6.92 6.899 6.845 6.589 6.121 5.358 4.031 1.689 -1.233 -3.621 -5.611 -7.269 -8.702 -9.942 -11.04 -11.986 -12.9 -13.664 -14.344 -14.991 -15.601 -16.157 -16.659 -17.195 -17.668 -18.051 -18.468 -18.904 -19.245 -19.602 -19.974 -20.258 -20.541 -20.841 -21.156 -21.47 -21.687 -21.915 -22.271 -22.509 -22.75 -22.873 -23.127 -23.4 -23.678 -23.827 -24.344 -24.386 -24.585 -24.78 -25.209 -25.481 -25.779 -26.072 -26.383 -26.751 -27.284 -29.186 -7 ,26974 ,KEBNE ,16692765,Thu Nov 25 22:02:44 CET,Thu Nov 25 23:40:14 CET,0.0 1.546 1.904 2.14 2.312 2.47 2.641 2.795 3.03 3.141 3.246 3.085 3.509 3.598 3.767 3.916 4.056 4.124 4.26 4.39 4.572 4.686 4.795 4.943 5.078 5.216 5.348 5.462 5.612 5.757 5.882 6.024 6.149 6.261 6.397 6.553 6.696 6.841 6.973 7.116 7.264 7.416 7.555 7.606 7.621 7.595 7.503 7.311 6.792 5.791 3.999 1.597 -0.525 -2.333 -3.865 -5.277 -6.52 -7.615 -8.561 -9.506 -10.31 -10.997 -11.621 -12.203 -12.754 -13.252 -13.743 -14.173 -14.549 -14.936 -15.338 -15.674 -16.027 -16.387 -16.66 -16.939 -17.224 -17.523 -17.84 -18.064 -18.294 -18.643 -18.881 -19.121 -19.25 -19.517 -19.793 -20.069 -20.202 -20.712 -20.723 -20.897 -21.082 -21.493 -21.723 -21.973 -22.24 -22.551 -22.933 -23.473 -25.376 -8 ,7433 ,KEBNE ,16692766,Thu Nov 25 22:03:47 CET,Thu Nov 25 23:42:25 CET,0.0 1.174 1.541 1.824 2.049 2.234 2.399 2.574 2.902 3.029 3.149 3.019 3.452 3.544 3.711 3.869 4.014 4.082 4.201 4.313 4.472 4.571 4.662 4.784 4.92 5.076 5.219 5.345 5.498 5.628 5.742 5.862 5.982 6.113 6.238 6.356 6.458 6.551 6.642 6.715 6.787 6.842 6.862 6.85 6.789 6.628 6.353 5.924 5.198 3.97 1.752 -1.022 -3.369 -5.291 -6.868 -8.244 -9.426 -10.487 -11.39 -12.283 -13.075 -13.785 -14.432 -15.017 -15.551 -16.029 -16.528 -16.994 -17.399 -17.807 -18.221 -18.554 -18.931 -19.341 -19.629 -19.911 -20.202 -20.505 -20.836 -21.059 -21.277 -21.627 -21.895 -22.171 -22.306 -22.593 -22.872 -23.147 -23.284 -23.772 -23.724 -23.885 -24.047 -24.41 -24.627 -24.865 -25.134 -25.457 -25.823 -26.321 -28.568 -9 ,560 ,KEBNE ,16692767,Thu Nov 25 22:03:47 CET,Thu Nov 25 23:40:30 CET,0.0 1.511 1.912 2.206 2.434 2.628 2.794 2.949 3.238 3.365 3.482 3.348 3.782 3.875 4.055 4.236 4.391 4.466 4.597 4.709 4.866 4.968 5.075 5.228 5.37 5.497 5.607 5.719 5.866 5.998 6.118 6.252 6.373 6.483 6.606 6.763 6.907 7.036 7.176 7.303 7.393 7.459 7.516 7.556 7.569 7.497 7.309 6.93 6.247 5.087 2.855 0.122 -2.153 -4.109 -5.759 -7.19 -8.397 -9.47 -10.403 -11.295 -12.035 -12.738 -13.422 -14.029 -14.588 -15.111 -15.645 -16.105 -16.484 -16.885 -17.315 -17.657 -17.99 -18.333 -18.607 -18.891 -19.184 -19.498 -19.832 -20.058 -20.281 -20.62 -20.86 -21.119 -21.25 -21.529 -21.844 -22.163 -22.326 -22.844 -22.852 -23.062 -23.275 -23.685 -23.895 -24.123 -24.379 -24.688 -25.084 -25.63 -27.749 -10 ,13533 ,KEBNE ,16692768,Thu Nov 25 22:05:53 CET,Thu Nov 25 23:39:02 CET,0.0 1.383 1.78 2.085 2.316 2.516 2.683 2.835 3.146 3.286 3.411 3.318 3.76 3.868 4.081 4.273 4.443 4.51 4.626 4.747 4.917 5.013 5.123 5.3 5.459 5.605 5.738 5.86 5.993 6.113 6.224 6.347 6.464 6.576 6.705 6.848 6.992 7.126 7.221 7.327 7.442 7.539 7.631 7.69 7.683 7.557 7.275 6.835 6.083 4.754 2.495 -0.236 -2.562 -4.541 -6.183 -7.588 -8.812 -9.906 -10.84 -11.738 -12.468 -13.144 -13.787 -14.377 -14.928 -15.413 -15.912 -16.367 -16.758 -17.156 -17.581 -17.926 -18.262 -18.602 -18.868 -19.157 -19.469 -19.772 -20.078 -20.291 -20.502 -20.847 -21.083 -21.312 -21.433 -21.678 -21.923 -22.186 -22.32 -22.806 -22.744 -22.903 -23.09 -23.493 -23.698 -23.923 -24.191 -24.471 -24.789 -25.244 -26.927 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt deleted file mode 100644 index b7ae0b3a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2bb_p38a-2y.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11111 ,KEBNE ,16692769,Thu Nov 25 22:05:54 CET,Thu Nov 25 23:46:41 CET,0.0 1.683 2.229 2.702 3.125 3.513 3.892 4.25 4.897 5.19 5.48 5.579 6.342 6.609 7.133 7.649 8.134 8.37 8.845 9.31 9.988 10.443 10.903 11.593 12.24 12.869 13.494 14.106 14.922 15.728 16.526 17.496 18.451 19.401 20.541 21.844 23.102 24.521 26.118 27.846 29.701 31.911 34.581 37.339 40.704 44.684 49.466 55.06 62.18 71.327 83.624 95.25 103.03 108.662 112.86 116.176 118.698 120.713 122.301 123.755 124.897 125.837 126.671 127.388 128.007 128.523 129.031 129.457 129.79 130.123 130.432 130.66 130.897 131.131 131.291 131.455 131.624 131.78 131.925 132.011 132.077 132.162 132.212 132.252 132.272 132.311 132.326 132.318 132.311 131.953 132.267 132.243 132.202 132.082 132.015 131.911 131.754 131.575 131.344 130.972 127.304 -2 ,27563 ,KEBNE ,16692770,Thu Nov 25 22:05:53 CET,Thu Nov 25 23:34:45 CET,0.0 1.847 2.403 2.828 3.196 3.533 3.856 4.175 4.768 5.052 5.328 5.378 6.119 6.365 6.846 7.323 7.794 8.028 8.48 8.914 9.56 9.981 10.397 11.028 11.664 12.288 12.892 13.491 14.295 15.105 15.901 16.893 17.873 18.822 19.926 21.203 22.477 23.907 25.485 27.215 29.125 31.351 34.031 36.837 40.222 44.184 49.001 54.627 61.703 70.871 83.245 94.835 102.532 108.161 112.323 115.557 118.128 120.199 121.78 123.195 124.298 125.223 126.038 126.739 127.336 127.849 128.372 128.823 129.195 129.543 129.858 130.096 130.325 130.558 130.72 130.851 130.977 131.093 131.189 131.251 131.309 131.374 131.407 131.43 131.435 131.444 131.438 131.394 131.369 131.002 131.271 131.22 131.16 131.005 130.897 130.77 130.593 130.332 130.033 129.64 127.19 -3 ,3754 ,KEBNE ,16692771,Thu Nov 25 22:07:59 CET,Thu Nov 25 23:41:43 CET,0.0 1.96 2.524 2.967 3.359 3.702 4.028 4.343 4.917 5.189 5.466 5.513 6.248 6.49 6.97 7.444 7.913 8.148 8.596 9.032 9.7 10.138 10.566 11.219 11.867 12.5 13.117 13.732 14.536 15.31 16.089 17.057 18.006 18.942 20.053 21.353 22.631 24.076 25.673 27.394 29.28 31.492 34.129 36.852 40.199 44.168 48.939 54.568 61.587 70.547 82.665 94.141 101.867 107.481 111.648 114.896 117.442 119.535 121.161 122.607 123.786 124.767 125.599 126.327 126.962 127.497 128.005 128.449 128.806 129.136 129.455 129.692 129.919 130.132 130.281 130.43 130.574 130.7 130.805 130.864 130.914 130.998 131.048 131.092 131.111 131.128 131.123 131.1 131.09 130.727 131.011 130.972 130.933 130.78 130.673 130.552 130.415 130.254 130.02 129.667 127.736 -4 ,6251 ,KEBNE ,16692772,Thu Nov 25 22:07:59 CET,Thu Nov 25 23:50:43 CET,0.0 2.169 2.766 3.212 3.581 3.922 4.256 4.577 5.147 5.423 5.697 5.754 6.505 6.76 7.249 7.733 8.213 8.446 8.895 9.333 9.986 10.421 10.85 11.484 12.113 12.732 13.342 13.94 14.713 15.48 16.256 17.213 18.164 19.104 20.196 21.462 22.72 24.144 25.763 27.536 29.427 31.614 34.244 37.009 40.378 44.276 48.956 54.527 61.551 70.667 83.047 94.607 102.306 107.908 112.079 115.324 117.872 119.943 121.56 123.042 124.183 125.124 125.984 126.734 127.361 127.899 128.43 128.862 129.211 129.544 129.85 130.086 130.332 130.576 130.738 130.898 131.055 131.197 131.332 131.418 131.495 131.595 131.648 131.687 131.708 131.753 131.792 131.809 131.809 131.454 131.749 131.706 131.659 131.538 131.448 131.354 131.239 131.075 130.842 130.497 128.606 -5 ,9621 ,KEBNE ,16692773,Thu Nov 25 22:12:09 CET,Thu Nov 25 23:39:24 CET,0.0 1.532 2.05 2.493 2.897 3.245 3.565 3.88 4.482 4.773 5.05 5.082 5.816 6.073 6.567 7.036 7.502 7.737 8.219 8.688 9.364 9.815 10.257 10.909 11.545 12.166 12.799 13.433 14.25 15.038 15.816 16.771 17.722 18.667 19.791 21.071 22.343 23.803 25.41 27.149 29.033 31.234 33.874 36.618 39.956 43.873 48.58 54.19 61.222 70.199 82.45 94.069 101.866 107.471 111.62 114.932 117.516 119.558 121.16 122.67 123.846 124.807 125.684 126.446 127.075 127.616 128.143 128.565 128.916 129.269 129.622 129.884 130.121 130.358 130.532 130.7 130.867 131.03 131.182 131.279 131.374 131.494 131.556 131.598 131.62 131.663 131.678 131.681 131.669 131.302 131.597 131.564 131.521 131.403 131.33 131.223 131.065 130.879 130.61 130.181 128.207 -6 ,27845 ,KEBNE ,16692774,Thu Nov 25 22:14:19 CET,Thu Nov 25 23:45:54 CET,0.0 1.772 2.35 2.808 3.203 3.555 3.881 4.193 4.794 5.075 5.34 5.379 6.115 6.363 6.839 7.307 7.772 8.003 8.46 8.918 9.593 10.024 10.453 11.106 11.752 12.388 13.03 13.657 14.477 15.295 16.085 17.057 18.016 18.956 20.074 21.355 22.607 24.016 25.594 27.354 29.233 31.411 34.084 36.854 40.244 44.191 48.927 54.593 61.778 71.033 83.363 95.002 102.799 108.397 112.549 115.817 118.378 120.466 122.077 123.529 124.698 125.672 126.538 127.294 127.931 128.457 128.965 129.377 129.709 130.054 130.382 130.615 130.837 131.062 131.222 131.363 131.511 131.652 131.765 131.837 131.903 131.988 132.026 132.043 132.054 132.076 132.072 132.037 132.007 131.626 131.871 131.818 131.768 131.627 131.527 131.411 131.253 131.048 130.794 130.375 128.124 -7 ,16272 ,KEBNE ,16692775,Thu Nov 25 22:17:26 CET,Thu Nov 25 23:50:36 CET,0.0 1.668 2.252 2.697 3.081 3.444 3.819 4.181 4.825 5.124 5.407 5.472 6.223 6.492 6.998 7.484 7.978 8.226 8.707 9.181 9.871 10.311 10.749 11.406 12.051 12.689 13.322 13.94 14.737 15.514 16.288 17.239 18.171 19.109 20.229 21.525 22.804 24.226 25.819 27.58 29.453 31.631 34.265 36.992 40.315 44.259 49.063 54.716 61.765 70.87 83.282 94.922 102.661 108.288 112.431 115.659 118.161 120.224 121.899 123.413 124.583 125.547 126.409 127.135 127.75 128.294 128.83 129.253 129.588 129.923 130.218 130.433 130.666 130.89 131.052 131.199 131.329 131.458 131.561 131.62 131.68 131.761 131.805 131.841 131.861 131.905 131.936 131.94 131.924 131.553 131.844 131.804 131.743 131.629 131.555 131.455 131.31 131.097 130.825 130.377 128.217 -8 ,20186 ,KEBNE ,16692776,Thu Nov 25 22:18:25 CET,Thu Nov 25 23:53:41 CET,0.0 1.761 2.347 2.812 3.201 3.565 3.904 4.209 4.779 5.051 5.322 5.363 6.097 6.355 6.869 7.382 7.882 8.124 8.607 9.076 9.76 10.204 10.635 11.265 11.896 12.528 13.144 13.76 14.57 15.347 16.124 17.116 18.088 19.031 20.137 21.405 22.67 24.093 25.644 27.356 29.234 31.439 34.132 36.916 40.257 44.187 48.936 54.594 61.758 70.895 83.215 94.915 102.69 108.216 112.36 115.635 118.21 120.31 121.921 123.382 124.57 125.578 126.465 127.213 127.849 128.406 128.944 129.379 129.726 130.061 130.393 130.637 130.858 131.069 131.213 131.347 131.464 131.564 131.659 131.706 131.757 131.841 131.887 131.924 131.94 131.965 131.981 131.98 131.97 131.606 131.88 131.822 131.769 131.643 131.554 131.447 131.328 131.184 130.974 130.625 129.106 -9 ,10786 ,KEBNE ,16692777,Thu Nov 25 22:18:24 CET,Thu Nov 25 23:53:05 CET,0.0 1.562 2.133 2.577 2.98 3.352 3.695 4.023 4.652 4.937 5.209 5.269 6.016 6.288 6.832 7.347 7.84 8.084 8.563 9.031 9.731 10.183 10.624 11.275 11.92 12.558 13.178 13.791 14.595 15.391 16.179 17.15 18.115 19.053 20.16 21.446 22.71 24.13 25.714 27.44 29.292 31.467 34.134 36.931 40.284 44.19 48.937 54.543 61.558 70.601 82.915 94.474 102.136 107.704 111.865 115.125 117.696 119.789 121.429 122.924 124.112 125.113 126.004 126.769 127.42 127.973 128.496 128.933 129.281 129.577 129.86 130.102 130.345 130.572 130.732 130.898 131.034 131.145 131.257 131.326 131.394 131.472 131.521 131.566 131.582 131.608 131.616 131.61 131.606 131.254 131.525 131.465 131.401 131.264 131.176 131.059 130.929 130.768 130.536 130.179 128.405 -10 ,23452 ,KEBNE ,16692778,Thu Nov 25 22:19:31 CET,Thu Nov 25 23:51:37 CET,0.0 2.166 2.895 3.443 3.879 4.267 4.622 4.954 5.586 5.89 6.186 6.291 7.046 7.301 7.798 8.281 8.771 9.014 9.489 9.953 10.638 11.085 11.518 12.172 12.822 13.458 14.075 14.679 15.479 16.265 17.049 18.004 18.944 19.877 20.985 22.261 23.518 24.937 26.523 28.279 30.157 32.347 34.997 37.769 41.123 45.023 49.836 55.524 62.521 71.542 83.712 95.252 103.036 108.615 112.755 116.042 118.613 120.669 122.307 123.842 125.031 125.987 126.838 127.563 128.175 128.724 129.245 129.662 130.006 130.329 130.643 130.875 131.094 131.319 131.474 131.617 131.762 131.897 132.005 132.075 132.146 132.233 132.278 132.311 132.327 132.346 132.343 132.325 132.316 131.966 132.272 132.236 132.195 132.087 132.016 131.916 131.774 131.609 131.362 130.964 129.402 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt deleted file mode 100644 index 9a84232e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-2f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15116 ,KEBNE ,16692779,Thu Nov 25 22:20:29 CET,Thu Nov 25 23:56:53 CET,0.0 1.669 2.025 2.286 2.504 2.7 2.881 3.04 3.297 3.406 3.512 3.352 3.818 3.916 4.111 4.288 4.446 4.517 4.655 4.779 4.96 5.078 5.192 5.361 5.526 5.691 5.851 6.005 6.208 6.401 6.575 6.765 6.949 7.143 7.366 7.603 7.839 8.083 8.332 8.595 8.862 9.154 9.495 9.821 10.183 10.555 10.934 11.346 11.774 12.17 12.334 12.012 11.507 10.975 10.486 10.029 9.593 9.186 8.833 8.451 8.119 7.834 7.562 7.291 7.015 6.767 6.529 6.3 6.083 5.866 5.65 5.467 5.271 5.065 4.905 4.742 4.566 4.378 4.171 4.03 3.882 3.651 3.497 3.335 3.246 3.056 2.845 2.623 2.51 2.022 2.153 2.037 1.914 1.621 1.469 1.311 1.126 0.911 0.651 0.309 -1.111 -2 ,3284 ,KEBNE ,16692780,Thu Nov 25 22:21:32 CET,Fri Nov 26 00:03:45 CET,0.0 1.487 1.852 2.116 2.322 2.495 2.649 2.796 3.062 3.185 3.299 3.137 3.598 3.691 3.863 4.018 4.169 4.242 4.381 4.517 4.739 4.877 5.008 5.203 5.39 5.57 5.726 5.875 6.069 6.264 6.452 6.67 6.882 7.072 7.282 7.515 7.743 7.992 8.251 8.524 8.798 9.097 9.428 9.74 10.112 10.515 10.911 11.315 11.731 12.078 12.259 12.022 11.584 11.081 10.603 10.132 9.683 9.285 8.927 8.559 8.236 7.943 7.646 7.349 7.08 6.839 6.58 6.333 6.116 5.902 5.679 5.49 5.293 5.082 4.917 4.753 4.582 4.394 4.207 4.075 3.941 3.758 3.623 3.476 3.4 3.248 3.091 2.919 2.826 2.363 2.545 2.441 2.322 2.045 1.887 1.714 1.524 1.312 1.057 0.72 -0.819 -3 ,9029 ,KEBNE ,16692781,Thu Nov 25 22:21:31 CET,Thu Nov 25 23:57:19 CET,0.0 1.932 2.297 2.552 2.753 2.935 3.1 3.253 3.52 3.63 3.732 3.569 4.042 4.149 4.337 4.508 4.665 4.736 4.873 5.006 5.203 5.332 5.453 5.627 5.801 5.967 6.12 6.268 6.469 6.665 6.855 7.088 7.3 7.489 7.708 7.965 8.2 8.438 8.683 8.944 9.206 9.492 9.835 10.177 10.546 10.915 11.313 11.732 12.15 12.477 12.558 12.232 11.747 11.196 10.689 10.23 9.788 9.392 9.04 8.667 8.348 8.047 7.751 7.489 7.242 7.005 6.752 6.515 6.307 6.087 5.865 5.688 5.502 5.304 5.146 4.995 4.846 4.691 4.528 4.413 4.295 4.107 3.971 3.825 3.751 3.598 3.439 3.264 3.169 2.704 2.872 2.763 2.651 2.394 2.242 2.078 1.898 1.688 1.424 1.052 -0.886 -4 ,28269 ,KEBNE ,16692782,Thu Nov 25 22:34:07 CET,Fri Nov 26 00:01:52 CET,0.0 1.513 1.872 2.14 2.354 2.531 2.691 2.842 3.102 3.223 3.337 3.173 3.634 3.726 3.911 4.077 4.224 4.296 4.435 4.58 4.797 4.927 5.049 5.235 5.412 5.576 5.737 5.89 6.085 6.266 6.441 6.651 6.841 7.033 7.258 7.511 7.747 7.985 8.25 8.519 8.788 9.091 9.446 9.803 10.163 10.527 10.934 11.352 11.757 12.091 12.213 11.828 11.294 10.787 10.314 9.85 9.405 8.976 8.614 8.253 7.928 7.632 7.344 7.061 6.791 6.541 6.274 6.038 5.839 5.633 5.417 5.226 5.029 4.832 4.67 4.497 4.314 4.136 3.944 3.808 3.675 3.446 3.283 3.118 3.029 2.854 2.674 2.48 2.386 1.917 2.065 1.956 1.837 1.57 1.426 1.274 1.115 0.92 0.665 0.311 -1.015 -5 ,1604 ,KEBNE ,16692783,Thu Nov 25 22:38:16 CET,Fri Nov 26 00:13:02 CET,0.0 1.579 1.897 2.151 2.356 2.529 2.682 2.821 3.087 3.206 3.317 3.148 3.606 3.694 3.867 4.031 4.179 4.255 4.404 4.54 4.732 4.857 4.97 5.123 5.283 5.441 5.585 5.729 5.925 6.101 6.265 6.471 6.669 6.854 7.078 7.33 7.559 7.802 8.068 8.346 8.632 8.94 9.279 9.611 9.99 10.396 10.801 11.197 11.619 12.0 12.093 11.718 11.257 10.763 10.261 9.782 9.346 8.937 8.557 8.158 7.816 7.515 7.219 6.944 6.686 6.435 6.166 5.927 5.719 5.501 5.273 5.08 4.884 4.692 4.541 4.384 4.228 4.062 3.891 3.778 3.656 3.462 3.328 3.183 3.109 2.955 2.794 2.622 2.531 2.064 2.216 2.104 1.983 1.722 1.578 1.405 1.221 1.027 0.778 0.401 -1.385 -6 ,31869 ,KEBNE ,16692784,Thu Nov 25 22:38:20 CET,Fri Nov 26 00:10:57 CET,0.0 1.819 2.176 2.428 2.628 2.82 2.999 3.162 3.479 3.619 3.739 3.589 4.061 4.169 4.369 4.549 4.711 4.792 4.953 5.106 5.322 5.457 5.582 5.764 5.943 6.12 6.299 6.467 6.669 6.859 7.043 7.262 7.47 7.666 7.893 8.15 8.387 8.625 8.877 9.14 9.405 9.717 10.062 10.378 10.748 11.148 11.559 11.974 12.397 12.7 12.788 12.512 12.048 11.572 11.092 10.607 10.172 9.767 9.404 9.024 8.695 8.383 8.088 7.819 7.554 7.318 7.075 6.849 6.649 6.446 6.232 6.05 5.858 5.657 5.508 5.354 5.189 5.003 4.803 4.662 4.516 4.298 4.141 3.97 3.877 3.685 3.504 3.307 3.192 2.706 2.821 2.691 2.567 2.315 2.173 2.019 1.842 1.632 1.396 1.08 -0.417 -7 ,52 ,KEBNE ,16692785,Thu Nov 25 22:39:18 CET,Fri Nov 26 00:13:59 CET,0.0 1.609 1.947 2.202 2.417 2.593 2.752 2.912 3.224 3.359 3.48 3.364 3.852 3.96 4.159 4.34 4.52 4.609 4.777 4.928 5.134 5.271 5.406 5.594 5.762 5.916 6.07 6.219 6.4 6.58 6.756 6.968 7.169 7.363 7.584 7.83 8.057 8.293 8.549 8.817 9.1 9.403 9.738 10.06 10.418 10.789 11.19 11.595 11.986 12.292 12.374 12.128 11.693 11.197 10.697 10.209 9.762 9.325 8.924 8.53 8.193 7.893 7.61 7.334 7.078 6.835 6.574 6.355 6.159 5.951 5.736 5.541 5.328 5.117 4.954 4.771 4.587 4.411 4.216 4.074 3.926 3.694 3.538 3.373 3.286 3.118 2.935 2.724 2.613 2.137 2.253 2.116 1.987 1.708 1.557 1.398 1.224 1.023 0.787 0.472 -0.875 -8 ,12217 ,KEBNE ,16692786,Thu Nov 25 22:40:21 CET,Fri Nov 26 00:15:06 CET,0.0 1.611 1.99 2.245 2.449 2.645 2.83 2.99 3.257 3.372 3.483 3.322 3.783 3.875 4.055 4.226 4.393 4.475 4.632 4.778 4.99 5.131 5.269 5.462 5.636 5.803 5.96 6.106 6.29 6.469 6.647 6.859 7.061 7.251 7.476 7.728 7.963 8.207 8.453 8.729 9.017 9.343 9.7 10.023 10.406 10.805 11.225 11.682 12.111 12.445 12.589 12.321 11.832 11.308 10.825 10.346 9.911 9.51 9.151 8.775 8.439 8.143 7.865 7.579 7.304 7.064 6.803 6.567 6.361 6.149 5.933 5.752 5.558 5.354 5.201 5.049 4.896 4.74 4.573 4.445 4.318 4.148 4.024 3.875 3.798 3.65 3.49 3.314 3.218 2.749 2.903 2.786 2.664 2.393 2.233 2.057 1.877 1.673 1.409 1.029 -1.49 -9 ,6746 ,KEBNE ,16692787,Thu Nov 25 22:40:21 CET,Fri Nov 26 00:19:44 CET,0.0 1.115 1.448 1.7 1.91 2.1 2.272 2.422 2.692 2.82 2.947 2.821 3.296 3.4 3.602 3.793 3.975 4.061 4.214 4.36 4.578 4.719 4.854 5.038 5.226 5.407 5.571 5.735 5.941 6.137 6.321 6.529 6.727 6.928 7.166 7.412 7.63 7.876 8.139 8.415 8.708 9.012 9.358 9.692 10.044 10.406 10.812 11.227 11.611 11.942 12.07 11.758 11.301 10.782 10.295 9.839 9.389 8.96 8.568 8.174 7.84 7.543 7.26 6.984 6.716 6.468 6.2 5.961 5.759 5.553 5.336 5.148 4.959 4.758 4.597 4.435 4.255 4.066 3.88 3.748 3.609 3.388 3.233 3.057 2.965 2.784 2.602 2.409 2.303 1.835 2.001 1.894 1.782 1.534 1.398 1.251 1.084 0.893 0.648 0.291 -0.92 -10 ,28364 ,KEBNE ,16692788,Thu Nov 25 22:40:21 CET,Fri Nov 26 00:17:39 CET,0.0 1.931 2.412 2.755 3.036 3.254 3.436 3.609 3.929 4.069 4.191 4.072 4.555 4.662 4.871 5.067 5.23 5.304 5.454 5.603 5.807 5.937 6.074 6.273 6.455 6.619 6.777 6.942 7.16 7.362 7.546 7.762 7.96 8.142 8.351 8.589 8.812 9.051 9.31 9.573 9.851 10.165 10.5 10.81 11.148 11.512 11.926 12.308 12.673 13.004 13.128 12.78 12.287 11.781 11.28 10.799 10.382 9.993 9.63 9.258 8.935 8.633 8.336 8.056 7.786 7.534 7.266 7.026 6.824 6.612 6.379 6.189 6.005 5.814 5.667 5.511 5.347 5.178 5.005 4.88 4.749 4.552 4.413 4.269 4.194 4.043 3.901 3.75 3.663 3.204 3.38 3.276 3.166 2.906 2.758 2.601 2.423 2.221 1.982 1.642 0.297 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 8ea5a254..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2e_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17529 ,KEBNE ,16692789,Thu Nov 25 22:41:23 CET,Fri Nov 26 00:15:57 CET,0.0 1.836 2.314 2.668 2.935 3.164 3.375 3.576 3.913 4.049 4.178 4.067 4.554 4.668 4.87 5.065 5.257 5.35 5.525 5.685 5.912 6.063 6.211 6.414 6.616 6.82 7.002 7.17 7.393 7.612 7.835 8.095 8.321 8.538 8.8 9.096 9.392 9.717 10.065 10.433 10.802 11.218 11.707 12.179 12.706 13.282 13.94 14.668 15.513 16.429 17.36 17.902 18.043 18.015 17.894 17.726 17.541 17.33 17.106 16.873 16.665 16.473 16.299 16.124 15.944 15.782 15.609 15.44 15.283 15.113 14.943 14.809 14.662 14.499 14.366 14.237 14.11 13.962 13.8 13.695 13.589 13.419 13.302 13.174 13.103 12.96 12.816 12.665 12.576 12.118 12.277 12.171 12.054 11.786 11.642 11.492 11.328 11.132 10.891 10.562 9.351 -2 ,9888 ,KEBNE ,16692790,Thu Nov 25 22:41:23 CET,Fri Nov 26 00:16:27 CET,0.0 1.362 1.811 2.153 2.399 2.595 2.799 2.99 3.308 3.451 3.582 3.463 3.947 4.059 4.28 4.489 4.671 4.757 4.929 5.1 5.347 5.498 5.643 5.847 6.047 6.242 6.431 6.605 6.824 7.045 7.25 7.51 7.762 7.984 8.236 8.521 8.799 9.105 9.43 9.786 10.171 10.589 11.076 11.572 12.133 12.73 13.387 14.11 14.926 15.84 16.833 17.391 17.526 17.507 17.399 17.196 16.984 16.781 16.577 16.352 16.141 15.948 15.746 15.551 15.371 15.202 15.02 14.85 14.702 14.544 14.366 14.206 14.03 13.849 13.717 13.578 13.431 13.283 13.135 13.034 12.93 12.773 12.66 12.537 12.476 12.343 12.182 12.019 11.94 11.495 11.666 11.566 11.462 11.217 11.08 10.93 10.751 10.546 10.29 9.925 8.614 -3 ,12701 ,KEBNE ,16692791,Thu Nov 25 22:41:24 CET,Fri Nov 26 00:16:50 CET,0.0 1.321 1.668 1.93 2.132 2.3 2.454 2.606 2.874 2.99 3.102 2.967 3.449 3.571 3.788 3.987 4.179 4.267 4.446 4.614 4.836 4.982 5.13 5.344 5.535 5.713 5.891 6.065 6.28 6.483 6.681 6.931 7.176 7.408 7.681 7.986 8.272 8.581 8.907 9.266 9.643 10.05 10.518 11.008 11.571 12.157 12.818 13.552 14.387 15.314 16.265 16.808 16.926 16.869 16.751 16.564 16.348 16.133 15.923 15.695 15.495 15.314 15.123 14.937 14.751 14.565 14.374 14.202 14.057 13.899 13.741 13.622 13.483 13.332 13.216 13.084 12.944 12.796 12.637 12.539 12.434 12.258 12.143 12.029 11.965 11.816 11.658 11.493 11.405 10.959 11.137 11.026 10.911 10.681 10.547 10.393 10.225 10.035 9.791 9.444 7.791 -4 ,15521 ,KEBNE ,16692792,Thu Nov 25 22:41:24 CET,Fri Nov 26 00:16:36 CET,0.0 1.095 1.43 1.674 1.875 2.048 2.221 2.382 2.636 2.75 2.867 2.713 3.181 3.278 3.46 3.635 3.8 3.879 4.035 4.199 4.439 4.59 4.743 4.965 5.163 5.346 5.515 5.677 5.892 6.098 6.298 6.548 6.796 7.029 7.295 7.581 7.846 8.152 8.498 8.849 9.219 9.638 10.124 10.61 11.166 11.785 12.47 13.193 13.981 14.891 15.848 16.401 16.532 16.492 16.362 16.174 15.96 15.745 15.559 15.334 15.125 14.944 14.751 14.556 14.368 14.176 13.959 13.771 13.62 13.448 13.254 13.103 12.943 12.767 12.628 12.489 12.347 12.188 12.025 11.913 11.788 11.597 11.476 11.355 11.294 11.165 11.016 10.854 10.773 10.326 10.493 10.392 10.292 10.056 9.917 9.774 9.617 9.429 9.194 8.872 7.403 -5 ,23005 ,KEBNE ,16692793,Thu Nov 25 22:41:23 CET,Fri Nov 26 00:16:56 CET,0.0 1.516 1.901 2.19 2.397 2.581 2.75 2.896 3.16 3.302 3.44 3.309 3.793 3.912 4.135 4.349 4.538 4.63 4.811 4.975 5.206 5.359 5.5 5.699 5.899 6.089 6.275 6.455 6.684 6.905 7.111 7.354 7.593 7.825 8.088 8.384 8.671 8.977 9.296 9.643 10.007 10.429 10.926 11.419 11.975 12.573 13.257 14.012 14.839 15.712 16.63 17.188 17.306 17.234 17.081 16.909 16.721 16.516 16.317 16.094 15.887 15.686 15.486 15.291 15.104 14.927 14.734 14.562 14.415 14.257 14.077 13.922 13.764 13.607 13.487 13.352 13.206 13.048 12.877 12.763 12.655 12.484 12.365 12.244 12.184 12.052 11.902 11.746 11.663 11.211 11.372 11.272 11.17 10.912 10.772 10.617 10.432 10.235 9.987 9.644 7.699 -6 ,684 ,KEBNE ,16692794,Thu Nov 25 22:43:27 CET,Fri Nov 26 00:20:37 CET,0.0 1.394 1.848 2.196 2.459 2.685 2.877 3.048 3.371 3.51 3.638 3.51 3.985 4.092 4.297 4.497 4.683 4.773 4.945 5.113 5.347 5.491 5.644 5.871 6.073 6.26 6.446 6.627 6.856 7.07 7.274 7.524 7.766 7.995 8.259 8.563 8.859 9.177 9.506 9.854 10.214 10.62 11.114 11.596 12.137 12.743 13.445 14.206 15.032 15.923 16.858 17.482 17.69 17.682 17.555 17.36 17.151 16.929 16.711 16.48 16.275 16.092 15.896 15.706 15.529 15.358 15.17 14.986 14.823 14.663 14.493 14.342 14.186 14.01 13.867 13.73 13.595 13.457 13.309 13.204 13.1 12.951 12.845 12.731 12.668 12.532 12.376 12.202 12.113 11.661 11.824 11.708 11.588 11.346 11.213 11.062 10.89 10.699 10.467 10.11 8.804 -7 ,30075 ,KEBNE ,16692795,Thu Nov 25 22:43:28 CET,Fri Nov 26 00:23:28 CET,0.0 1.08 1.426 1.696 1.924 2.115 2.283 2.436 2.688 2.811 2.933 2.78 3.244 3.343 3.541 3.726 3.896 3.985 4.162 4.319 4.541 4.686 4.827 5.026 5.214 5.392 5.572 5.747 5.977 6.207 6.425 6.675 6.909 7.14 7.406 7.703 8.004 8.329 8.662 9.025 9.4 9.807 10.264 10.731 11.309 11.925 12.562 13.277 14.121 15.04 16.056 16.695 16.892 16.9 16.791 16.626 16.425 16.231 16.037 15.803 15.589 15.376 15.17 14.982 14.795 14.615 14.415 14.243 14.099 13.943 13.773 13.63 13.491 13.338 13.214 13.091 12.965 12.819 12.66 12.553 12.445 12.271 12.145 12.015 11.949 11.806 11.656 11.5 11.42 10.97 11.137 11.038 10.934 10.691 10.549 10.387 10.209 10.009 9.763 9.437 7.68 -8 ,20212 ,KEBNE ,16692796,Thu Nov 25 22:43:28 CET,Fri Nov 26 00:19:04 CET,0.0 1.359 1.707 1.962 2.184 2.368 2.524 2.681 2.965 3.107 3.245 3.121 3.59 3.698 3.899 4.078 4.272 4.367 4.541 4.717 4.966 5.12 5.271 5.486 5.678 5.854 6.027 6.204 6.446 6.673 6.882 7.144 7.4 7.631 7.896 8.195 8.471 8.775 9.118 9.494 9.883 10.301 10.773 11.258 11.797 12.382 13.064 13.826 14.648 15.517 16.436 17.029 17.228 17.196 17.051 16.86 16.67 16.455 16.227 15.991 15.785 15.592 15.4 15.203 15.019 14.846 14.665 14.494 14.328 14.154 13.977 13.822 13.669 13.506 13.368 13.231 13.078 12.919 12.757 12.647 12.533 12.342 12.208 12.061 11.985 11.83 11.656 11.475 11.384 10.936 11.089 10.962 10.814 10.5 10.314 10.099 9.884 9.663 9.412 9.078 7.159 -9 ,4213 ,KEBNE ,16692797,Thu Nov 25 22:43:31 CET,Fri Nov 26 00:12:56 CET,0.0 1.429 1.774 2.033 2.242 2.432 2.62 2.8 3.119 3.26 3.394 3.275 3.756 3.878 4.119 4.32 4.504 4.597 4.769 4.932 5.166 5.316 5.467 5.682 5.876 6.057 6.238 6.419 6.64 6.847 7.053 7.304 7.546 7.779 8.04 8.323 8.605 8.919 9.25 9.606 9.981 10.399 10.903 11.395 11.953 12.572 13.264 14.022 14.859 15.792 16.736 17.221 17.34 17.284 17.145 16.98 16.8 16.578 16.358 16.133 15.925 15.726 15.527 15.334 15.145 14.966 14.789 14.618 14.464 14.312 14.139 13.987 13.829 13.664 13.536 13.388 13.218 13.054 12.889 12.774 12.659 12.491 12.375 12.244 12.178 12.037 11.885 11.729 11.645 11.197 11.364 11.257 11.146 10.91 10.776 10.629 10.46 10.265 10.029 9.703 8.167 -10 ,15468 ,KEBNE ,16692798,Thu Nov 25 22:43:32 CET,Fri Nov 26 00:16:38 CET,0.0 1.144 1.438 1.667 1.865 2.033 2.185 2.332 2.597 2.721 2.838 2.673 3.143 3.246 3.431 3.601 3.771 3.855 4.012 4.162 4.387 4.538 4.68 4.88 5.071 5.26 5.439 5.614 5.846 6.059 6.256 6.5 6.742 6.967 7.229 7.525 7.806 8.112 8.438 8.787 9.152 9.552 10.016 10.481 11.015 11.621 12.303 13.055 13.882 14.78 15.77 16.351 16.517 16.513 16.402 16.221 16.011 15.793 15.59 15.368 15.148 14.934 14.724 14.512 14.32 14.149 13.965 13.8 13.644 13.468 13.287 13.14 12.986 12.824 12.691 12.546 12.39 12.223 12.049 11.936 11.825 11.658 11.546 11.425 11.358 11.219 11.073 10.908 10.82 10.37 10.548 10.442 10.325 10.088 9.948 9.782 9.599 9.395 9.159 8.828 7.311 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt deleted file mode 100644 index 7ebdb646..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-2ff.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,61 ,KEBNE ,16692799,Thu Nov 25 22:47:37 CET,Fri Nov 26 00:24:20 CET,0.0 1.054 1.461 1.777 2.027 2.247 2.465 2.663 3.025 3.204 3.368 3.273 3.83 3.977 4.253 4.512 4.751 4.867 5.096 5.326 5.666 5.874 6.077 6.38 6.672 6.956 7.243 7.53 7.899 8.247 8.577 8.974 9.364 9.76 10.227 10.732 11.226 11.78 12.395 13.084 13.792 14.591 15.568 16.565 17.716 19.004 20.536 22.322 24.446 27.025 30.216 32.817 34.287 35.176 35.651 35.933 36.051 36.047 36.013 35.951 35.888 35.804 35.687 35.564 35.413 35.248 35.083 34.918 34.764 34.602 34.432 34.265 34.073 33.888 33.736 33.58 33.402 33.201 32.989 32.833 32.687 32.461 32.273 32.066 31.967 31.79 31.624 31.417 31.295 30.803 30.879 30.712 30.549 30.195 29.991 29.763 29.51 29.204 28.832 28.286 26.041 -2 ,6096 ,KEBNE ,16692800,Thu Nov 25 22:47:37 CET,Fri Nov 26 00:25:55 CET,0.0 1.252 1.687 2.014 2.254 2.455 2.641 2.821 3.183 3.343 3.486 3.351 3.886 4.017 4.268 4.498 4.717 4.824 5.041 5.256 5.568 5.765 5.957 6.245 6.523 6.789 7.048 7.309 7.663 8.017 8.36 8.776 9.175 9.569 10.034 10.543 11.044 11.601 12.21 12.888 13.587 14.374 15.315 16.287 17.452 18.739 20.219 21.927 23.999 26.566 29.714 32.19 33.624 34.451 34.91 35.186 35.346 35.414 35.373 35.277 35.205 35.13 34.989 34.852 34.735 34.601 34.434 34.261 34.103 33.938 33.758 33.603 33.436 33.266 33.131 32.967 32.796 32.63 32.432 32.283 32.126 31.889 31.732 31.55 31.455 31.278 31.092 30.867 30.738 30.231 30.313 30.157 30.001 29.656 29.457 29.242 28.967 28.62 28.211 27.613 25.352 -3 ,28015 ,KEBNE ,16692801,Thu Nov 25 22:47:38 CET,Fri Nov 26 00:27:44 CET,0.0 1.067 1.412 1.696 1.949 2.184 2.405 2.6 2.945 3.111 3.268 3.149 3.689 3.822 4.089 4.358 4.608 4.725 4.949 5.171 5.504 5.719 5.926 6.226 6.513 6.787 7.063 7.341 7.699 8.032 8.358 8.763 9.149 9.521 9.967 10.499 11.014 11.568 12.181 12.85 13.548 14.341 15.309 16.281 17.397 18.676 20.191 21.958 24.069 26.582 29.711 32.337 33.852 34.778 35.35 35.693 35.815 35.858 35.864 35.826 35.755 35.675 35.563 35.39 35.243 35.097 34.893 34.718 34.574 34.408 34.221 34.072 33.913 33.717 33.558 33.392 33.214 33.022 32.838 32.706 32.55 32.318 32.146 31.965 31.872 31.67 31.456 31.215 31.094 30.606 30.724 30.573 30.406 30.029 29.817 29.572 29.288 28.947 28.509 27.847 25.573 -4 ,28751 ,KEBNE ,16692802,Thu Nov 25 22:47:41 CET,Fri Nov 26 00:20:10 CET,0.0 1.646 2.046 2.353 2.606 2.817 3.014 3.204 3.58 3.755 3.917 3.835 4.395 4.544 4.82 5.093 5.353 5.478 5.734 5.971 6.303 6.51 6.713 7.022 7.321 7.611 7.896 8.174 8.541 8.901 9.232 9.631 10.024 10.401 10.869 11.426 11.94 12.5 13.112 13.765 14.455 15.283 16.275 17.243 18.391 19.697 21.231 22.992 25.142 27.757 30.818 33.312 34.75 35.568 36.091 36.45 36.631 36.704 36.688 36.648 36.578 36.467 36.348 36.214 36.074 35.931 35.74 35.57 35.426 35.24 35.039 34.892 34.729 34.535 34.384 34.23 34.069 33.896 33.702 33.558 33.413 33.165 32.984 32.79 32.689 32.487 32.258 32.005 31.882 31.385 31.442 31.275 31.098 30.686 30.457 30.216 29.95 29.638 29.218 28.601 26.235 -5 ,20000 ,KEBNE ,16692803,Thu Nov 25 22:47:42 CET,Fri Nov 26 00:25:23 CET,0.0 1.106 1.495 1.78 2.019 2.232 2.44 2.638 3.012 3.188 3.36 3.289 3.846 3.992 4.259 4.519 4.767 4.893 5.15 5.389 5.739 5.969 6.191 6.501 6.798 7.094 7.383 7.653 8.011 8.354 8.695 9.127 9.525 9.896 10.331 10.841 11.345 11.919 12.548 13.197 13.881 14.682 15.63 16.587 17.702 18.966 20.48 22.267 24.399 26.897 29.982 32.594 33.998 34.8 35.313 35.605 35.727 35.828 35.864 35.786 35.707 35.614 35.499 35.371 35.228 35.087 34.926 34.766 34.614 34.437 34.258 34.119 33.948 33.768 33.631 33.478 33.31 33.129 32.95 32.822 32.664 32.395 32.203 32.006 31.906 31.696 31.482 31.239 31.105 30.593 30.691 30.549 30.37 29.945 29.724 29.491 29.226 28.917 28.514 27.955 25.964 -6 ,7338 ,KEBNE ,16692804,Thu Nov 25 22:48:40 CET,Fri Nov 26 00:24:59 CET,0.0 1.457 1.817 2.115 2.379 2.616 2.819 3.009 3.377 3.55 3.704 3.585 4.126 4.258 4.523 4.781 5.029 5.151 5.393 5.634 5.976 6.197 6.409 6.714 7.006 7.284 7.563 7.846 8.208 8.534 8.877 9.318 9.724 10.104 10.542 11.044 11.527 12.065 12.67 13.321 14.022 14.848 15.819 16.798 17.956 19.277 20.819 22.606 24.744 27.237 30.291 32.867 34.225 35.095 35.647 35.937 36.113 36.217 36.232 36.179 36.089 35.976 35.835 35.665 35.516 35.384 35.206 35.001 34.816 34.633 34.432 34.26 34.075 33.895 33.744 33.567 33.395 33.213 33.021 32.886 32.727 32.475 32.304 32.113 32.007 31.777 31.517 31.232 31.088 30.567 30.606 30.434 30.256 29.89 29.662 29.404 29.117 28.755 28.293 27.657 24.887 -7 ,15739 ,KEBNE ,16692805,Thu Nov 25 22:48:41 CET,Fri Nov 26 00:25:25 CET,0.0 1.48 1.868 2.145 2.372 2.574 2.77 2.949 3.273 3.434 3.587 3.469 4.014 4.165 4.452 4.715 4.972 5.101 5.358 5.604 5.95 6.175 6.39 6.695 6.988 7.269 7.54 7.811 8.173 8.526 8.864 9.258 9.65 10.048 10.523 11.056 11.564 12.119 12.699 13.337 14.025 14.813 15.771 16.747 17.865 19.15 20.681 22.402 24.432 26.941 30.128 32.757 34.225 35.063 35.556 35.908 36.126 36.217 36.232 36.19 36.115 36.044 35.945 35.809 35.676 35.517 35.322 35.184 35.045 34.891 34.731 34.575 34.396 34.194 34.041 33.864 33.666 33.46 33.259 33.127 32.976 32.732 32.551 32.353 32.245 32.011 31.781 31.545 31.414 30.901 30.979 30.82 30.651 30.253 30.025 29.81 29.57 29.279 28.932 28.351 25.646 -8 ,3375 ,KEBNE ,16692806,Thu Nov 25 22:48:40 CET,Fri Nov 26 00:26:43 CET,0.0 1.346 1.73 2.015 2.252 2.469 2.673 2.859 3.201 3.353 3.501 3.377 3.919 4.06 4.348 4.625 4.872 4.992 5.229 5.448 5.753 5.957 6.164 6.471 6.766 7.058 7.35 7.635 8.006 8.365 8.715 9.139 9.552 9.952 10.429 10.972 11.483 12.032 12.624 13.263 13.948 14.724 15.658 16.617 17.768 19.081 20.592 22.344 24.454 27.045 30.229 32.792 34.283 35.194 35.719 36.02 36.219 36.316 36.308 36.252 36.162 36.058 35.952 35.825 35.671 35.511 35.33 35.179 35.047 34.879 34.674 34.501 34.331 34.148 33.984 33.807 33.627 33.452 33.269 33.132 32.987 32.772 32.62 32.456 32.371 32.204 32.029 31.821 31.712 31.223 31.307 31.158 31.006 30.661 30.47 30.244 29.978 29.684 29.326 28.765 26.413 -9 ,1672 ,KEBNE ,16692807,Thu Nov 25 22:48:40 CET,Fri Nov 26 00:25:05 CET,0.0 1.022 1.406 1.699 1.935 2.144 2.339 2.52 2.883 3.049 3.196 3.07 3.607 3.737 3.996 4.242 4.484 4.613 4.867 5.098 5.427 5.638 5.836 6.135 6.429 6.713 7.001 7.272 7.626 7.982 8.328 8.743 9.147 9.526 9.964 10.472 10.961 11.507 12.088 12.728 13.452 14.269 15.204 16.181 17.343 18.627 20.142 21.92 24.035 26.608 29.798 32.385 33.848 34.742 35.254 35.572 35.733 35.771 35.76 35.689 35.591 35.509 35.413 35.264 35.099 34.95 34.79 34.622 34.45 34.256 34.059 33.904 33.735 33.546 33.399 33.232 33.06 32.893 32.7 32.564 32.414 32.166 31.991 31.801 31.706 31.497 31.241 30.969 30.83 30.322 30.413 30.27 30.101 29.696 29.461 29.203 28.928 28.606 28.205 27.63 25.329 -10 ,20130 ,KEBNE ,16692808,Thu Nov 25 22:48:40 CET,Fri Nov 26 00:25:08 CET,0.0 1.247 1.592 1.859 2.101 2.304 2.489 2.668 2.998 3.149 3.302 3.197 3.745 3.882 4.149 4.397 4.63 4.746 4.971 5.189 5.509 5.712 5.912 6.201 6.474 6.737 6.991 7.244 7.567 7.876 8.187 8.566 8.95 9.346 9.799 10.304 10.799 11.371 11.986 12.656 13.386 14.178 15.132 16.111 17.277 18.589 20.11 21.931 24.105 26.645 29.723 32.267 33.789 34.672 35.155 35.51 35.668 35.676 35.652 35.588 35.499 35.38 35.243 35.123 35.001 34.855 34.69 34.532 34.383 34.206 34.022 33.854 33.669 33.495 33.353 33.182 32.986 32.789 32.587 32.441 32.282 32.033 31.853 31.654 31.554 31.347 31.116 30.845 30.708 30.204 30.277 30.114 29.92 29.47 29.235 29.0 28.732 28.413 27.993 27.363 25.388 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index a8677070..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ee_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30037 ,KEBNE ,16692809,Thu Nov 25 22:48:40 CET,Fri Nov 26 00:24:55 CET,0.0 1.643 2.097 2.461 2.761 3.021 3.25 3.45 3.819 3.998 4.172 4.132 4.704 4.857 5.141 5.393 5.64 5.761 5.999 6.233 6.577 6.804 7.019 7.333 7.641 7.933 8.22 8.511 8.909 9.285 9.632 10.067 10.491 10.892 11.351 11.878 12.41 13.011 13.67 14.387 15.162 16.029 17.04 18.089 19.317 20.698 22.329 24.248 26.622 29.472 32.984 36.055 37.847 38.934 39.629 40.081 40.366 40.54 40.65 40.729 40.749 40.721 40.636 40.523 40.417 40.29 40.15 39.992 39.843 39.711 39.545 39.372 39.196 39.028 38.877 38.714 38.563 38.407 38.227 38.097 37.952 37.691 37.489 37.274 37.166 36.963 36.742 36.504 36.379 35.88 35.941 35.778 35.596 35.195 34.964 34.715 34.468 34.179 33.743 33.049 30.144 -2 ,22380 ,KEBNE ,16692810,Thu Nov 25 22:48:40 CET,Fri Nov 26 00:25:34 CET,0.0 2.552 3.05 3.417 3.731 4.001 4.248 4.469 4.89 5.079 5.24 5.16 5.715 5.855 6.142 6.439 6.707 6.842 7.114 7.366 7.73 7.96 8.18 8.505 8.841 9.175 9.472 9.75 10.121 10.492 10.846 11.259 11.68 12.103 12.589 13.14 13.676 14.277 14.942 15.649 16.405 17.288 18.324 19.362 20.577 21.979 23.673 25.655 28.021 30.821 34.281 37.27 38.997 39.986 40.615 41.076 41.358 41.522 41.595 41.616 41.57 41.5 41.397 41.261 41.139 40.994 40.826 40.661 40.493 40.311 40.105 39.923 39.732 39.532 39.374 39.214 39.037 38.829 38.612 38.464 38.304 38.045 37.853 37.65 37.545 37.323 37.074 36.775 36.629 36.122 36.124 35.936 35.739 35.276 35.014 34.718 34.39 33.99 33.476 32.695 29.669 -3 ,8510 ,KEBNE ,16692811,Thu Nov 25 22:48:40 CET,Fri Nov 26 00:25:05 CET,0.0 1.595 2.109 2.48 2.795 3.052 3.287 3.507 3.927 4.124 4.304 4.239 4.802 4.968 5.262 5.531 5.797 5.929 6.186 6.443 6.823 7.061 7.281 7.594 7.899 8.219 8.534 8.825 9.202 9.573 9.937 10.358 10.774 11.184 11.663 12.212 12.744 13.347 14.012 14.712 15.462 16.329 17.344 18.397 19.631 21.017 22.673 24.616 26.983 29.888 33.5 36.467 38.264 39.422 40.114 40.497 40.75 40.936 41.038 41.089 41.084 41.041 40.972 40.899 40.813 40.704 40.563 40.427 40.31 40.175 40.01 39.844 39.672 39.496 39.355 39.21 39.051 38.89 38.726 38.605 38.459 38.217 38.061 37.893 37.803 37.612 37.414 37.199 37.077 36.584 36.666 36.512 36.338 35.952 35.711 35.455 35.18 34.833 34.316 33.576 29.87 -4 ,19492 ,KEBNE ,16692812,Thu Nov 25 22:49:42 CET,Fri Nov 26 00:26:41 CET,0.0 1.798 2.285 2.634 2.946 3.233 3.483 3.712 4.113 4.306 4.499 4.461 5.035 5.2 5.545 5.867 6.134 6.258 6.52 6.79 7.164 7.399 7.624 7.933 8.229 8.525 8.815 9.098 9.473 9.857 10.231 10.666 11.084 11.488 11.963 12.516 13.051 13.634 14.28 14.992 15.754 16.631 17.667 18.714 19.946 21.348 23.006 24.922 27.24 30.056 33.624 36.691 38.48 39.617 40.324 40.763 41.062 41.218 41.275 41.316 41.312 41.256 41.176 41.103 41.03 40.945 40.835 40.714 40.604 40.487 40.319 40.161 39.997 39.8 39.647 39.5 39.338 39.145 38.931 38.795 38.645 38.384 38.217 38.043 37.956 37.759 37.518 37.268 37.134 36.632 36.689 36.527 36.342 35.912 35.67 35.404 35.103 34.764 34.305 33.639 31.19 -5 ,6421 ,KEBNE ,16692813,Thu Nov 25 22:49:42 CET,Fri Nov 26 00:26:32 CET,0.0 1.437 1.882 2.233 2.575 2.839 3.064 3.268 3.645 3.822 3.993 3.912 4.476 4.624 4.888 5.149 5.413 5.547 5.796 6.032 6.372 6.591 6.814 7.152 7.469 7.756 8.049 8.343 8.708 9.064 9.42 9.865 10.291 10.691 11.165 11.716 12.251 12.842 13.496 14.208 14.959 15.825 16.845 17.882 19.127 20.566 22.28 24.252 26.618 29.479 33.033 36.013 37.792 38.949 39.655 40.063 40.313 40.496 40.581 40.629 40.637 40.587 40.517 40.43 40.319 40.202 40.084 39.954 39.829 39.712 39.591 39.46 39.307 39.156 39.023 38.874 38.723 38.564 38.389 38.26 38.11 37.859 37.69 37.504 37.397 37.166 36.898 36.623 36.487 35.981 36.026 35.868 35.712 35.347 35.112 34.859 34.535 34.125 33.67 33.049 29.674 -6 ,6670 ,KEBNE ,16692814,Thu Nov 25 22:49:42 CET,Fri Nov 26 00:27:52 CET,0.0 1.755 2.273 2.654 2.982 3.252 3.495 3.715 4.091 4.273 4.45 4.363 4.921 5.07 5.35 5.629 5.887 6.003 6.233 6.457 6.779 6.99 7.205 7.518 7.823 8.121 8.405 8.679 9.041 9.398 9.749 10.191 10.631 11.051 11.533 12.085 12.618 13.208 13.854 14.561 15.326 16.206 17.249 18.308 19.58 21.08 22.857 24.841 27.211 30.035 33.498 36.507 38.313 39.379 40.091 40.598 40.887 41.019 41.054 41.076 41.036 40.94 40.849 40.758 40.663 40.567 40.46 40.355 40.243 40.1 39.942 39.814 39.688 39.564 39.462 39.352 39.229 39.054 38.84 38.712 38.585 38.374 38.223 38.048 37.957 37.767 37.533 37.285 37.166 36.677 36.742 36.588 36.433 36.032 35.773 35.502 35.233 34.868 34.393 33.668 30.659 -7 ,30820 ,KEBNE ,16692815,Thu Nov 25 22:49:43 CET,Fri Nov 26 00:29:21 CET,0.0 1.863 2.344 2.696 2.992 3.247 3.465 3.661 4.036 4.224 4.4 4.305 4.867 5.039 5.351 5.632 5.895 6.023 6.295 6.572 6.936 7.155 7.375 7.703 8.024 8.332 8.643 8.957 9.351 9.732 10.102 10.541 10.967 11.398 11.902 12.45 13.001 13.627 14.308 15.029 15.8 16.687 17.711 18.801 20.119 21.605 23.343 25.369 27.763 30.594 34.108 36.858 38.428 39.402 39.986 40.344 40.534 40.615 40.614 40.573 40.518 40.448 40.356 40.234 40.092 39.943 39.796 39.651 39.496 39.334 39.154 39.005 38.856 38.679 38.535 38.389 38.213 38.022 37.824 37.66 37.485 37.237 37.047 36.845 36.744 36.531 36.276 36.009 35.881 35.385 35.445 35.276 35.104 34.683 34.438 34.182 33.886 33.543 33.087 32.44 29.242 -8 ,313 ,KEBNE ,16692816,Thu Nov 25 22:49:43 CET,Fri Nov 26 00:26:50 CET,0.0 2.206 2.686 3.051 3.353 3.635 3.875 4.076 4.439 4.616 4.788 4.686 5.24 5.389 5.665 5.945 6.227 6.375 6.656 6.902 7.272 7.507 7.733 8.06 8.372 8.68 8.975 9.256 9.628 10.001 10.37 10.831 11.281 11.699 12.176 12.716 13.245 13.825 14.462 15.156 15.889 16.762 17.813 18.866 20.076 21.442 23.086 24.986 27.299 30.154 33.678 36.625 38.454 39.639 40.371 40.81 41.072 41.251 41.338 41.379 41.404 41.396 41.347 41.269 41.174 41.061 40.914 40.771 40.647 40.511 40.369 40.247 40.087 39.918 39.792 39.666 39.52 39.344 39.152 39.014 38.867 38.609 38.394 38.166 38.057 37.812 37.562 37.31 37.176 36.681 36.74 36.553 36.318 35.774 35.502 35.232 34.875 34.432 33.899 33.119 30.089 -9 ,23967 ,KEBNE ,16692817,Thu Nov 25 22:49:43 CET,Fri Nov 26 00:26:38 CET,0.0 1.756 2.293 2.702 3.017 3.314 3.574 3.808 4.252 4.458 4.663 4.669 5.265 5.447 5.754 6.033 6.315 6.455 6.72 6.969 7.347 7.603 7.844 8.165 8.476 8.777 9.077 9.364 9.737 10.11 10.463 10.89 11.318 11.746 12.257 12.846 13.389 13.965 14.597 15.296 16.06 16.936 17.95 18.986 20.217 21.615 23.282 25.202 27.54 30.375 33.883 36.858 38.595 39.673 40.407 40.895 41.168 41.346 41.447 41.519 41.543 41.511 41.423 41.333 41.258 41.185 41.075 40.922 40.778 40.635 40.494 40.375 40.235 40.055 39.92 39.774 39.602 39.431 39.247 39.117 38.969 38.739 38.575 38.378 38.268 38.041 37.815 37.575 37.432 36.93 36.995 36.825 36.644 36.154 35.847 35.553 35.253 34.884 34.406 33.748 30.638 -10 ,20980 ,KEBNE ,16692818,Thu Nov 25 22:50:46 CET,Fri Nov 26 00:31:31 CET,0.0 1.5 2.031 2.379 2.69 2.962 3.21 3.434 3.811 3.98 4.144 4.07 4.618 4.761 5.044 5.309 5.574 5.716 6.001 6.274 6.633 6.861 7.093 7.411 7.713 8.016 8.312 8.595 8.972 9.354 9.72 10.154 10.583 10.996 11.463 12.009 12.538 13.129 13.794 14.509 15.261 16.112 17.127 18.161 19.381 20.803 22.495 24.447 26.865 29.766 33.316 36.373 38.145 39.283 40.049 40.549 40.841 40.989 41.063 41.12 41.139 41.11 41.039 40.944 40.841 40.753 40.641 40.53 40.423 40.286 40.138 40.018 39.883 39.721 39.594 39.463 39.312 39.139 38.934 38.791 38.648 38.414 38.228 38.01 37.902 37.71 37.516 37.291 37.172 36.683 36.75 36.578 36.395 36.0 35.778 35.527 35.23 34.862 34.377 33.745 31.139 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt deleted file mode 100644 index 1d78775c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2f_p38a-3flz.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27547 ,KEBNE ,16692819,Thu Nov 25 22:50:45 CET,Fri Nov 26 00:27:38 CET,0.0 1.871 2.221 2.461 2.665 2.844 3.008 3.16 3.423 3.545 3.657 3.497 3.964 4.066 4.289 4.5 4.694 4.786 4.969 5.139 5.394 5.566 5.722 5.933 6.127 6.315 6.501 6.682 6.913 7.145 7.368 7.632 7.876 8.105 8.383 8.695 8.985 9.319 9.676 10.04 10.422 10.845 11.34 11.826 12.377 13.014 13.729 14.497 15.388 16.364 17.384 18.015 18.236 18.277 18.224 18.106 17.929 17.747 17.556 17.344 17.172 17.004 16.826 16.644 16.469 16.306 16.132 15.961 15.813 15.649 15.475 15.326 15.16 14.997 14.871 14.736 14.591 14.438 14.284 14.183 14.069 13.885 13.753 13.606 13.53 13.38 13.221 13.055 12.965 12.511 12.668 12.56 12.453 12.216 12.07 11.914 11.75 11.553 11.281 10.884 9.282 -2 ,29000 ,KEBNE ,16692820,Thu Nov 25 22:50:45 CET,Fri Nov 26 00:27:24 CET,0.0 1.596 1.945 2.198 2.409 2.591 2.757 2.912 3.182 3.308 3.421 3.249 3.715 3.81 3.984 4.161 4.349 4.443 4.621 4.786 5.024 5.18 5.323 5.531 5.734 5.917 6.098 6.28 6.506 6.726 6.942 7.198 7.44 7.678 7.968 8.289 8.587 8.903 9.251 9.631 10.004 10.405 10.888 11.393 11.98 12.584 13.258 14.048 14.966 15.952 17.033 17.705 17.891 17.914 17.853 17.736 17.578 17.393 17.217 17.026 16.846 16.673 16.482 16.298 16.129 15.952 15.767 15.602 15.456 15.308 15.148 15.003 14.849 14.678 14.544 14.409 14.27 14.122 13.956 13.841 13.732 13.568 13.448 13.311 13.238 13.089 12.948 12.805 12.723 12.272 12.429 12.321 12.218 11.986 11.851 11.688 11.498 11.295 11.026 10.63 9.166 -3 ,30691 ,KEBNE ,16692821,Thu Nov 25 22:50:45 CET,Fri Nov 26 00:25:35 CET,0.0 1.437 1.786 2.038 2.258 2.445 2.615 2.771 3.034 3.153 3.269 3.131 3.611 3.714 3.91 4.088 4.252 4.334 4.493 4.64 4.854 4.992 5.122 5.308 5.482 5.659 5.833 5.992 6.194 6.388 6.58 6.819 7.064 7.297 7.57 7.882 8.167 8.48 8.815 9.164 9.553 9.986 10.468 10.956 11.515 12.132 12.809 13.564 14.41 15.349 16.407 17.085 17.305 17.341 17.307 17.198 17.036 16.858 16.679 16.482 16.294 16.095 15.901 15.72 15.547 15.384 15.207 15.029 14.873 14.722 14.558 14.432 14.317 14.184 14.069 13.948 13.821 13.686 13.543 13.44 13.33 13.16 13.045 12.929 12.869 12.737 12.585 12.426 12.347 11.911 12.092 11.989 11.886 11.658 11.522 11.378 11.227 11.033 10.795 10.471 8.631 -4 ,22245 ,KEBNE ,16692822,Thu Nov 25 22:50:49 CET,Fri Nov 26 00:23:13 CET,0.0 1.43 1.744 1.972 2.163 2.329 2.485 2.624 2.877 3.0 3.115 2.967 3.438 3.534 3.734 3.932 4.122 4.215 4.396 4.562 4.796 4.952 5.1 5.313 5.517 5.71 5.891 6.064 6.289 6.509 6.72 6.977 7.223 7.446 7.702 7.999 8.286 8.597 8.928 9.286 9.669 10.111 10.644 11.171 11.755 12.378 13.065 13.858 14.787 15.768 16.829 17.556 17.786 17.811 17.764 17.638 17.465 17.266 17.065 16.846 16.632 16.444 16.264 16.082 15.921 15.766 15.581 15.406 15.261 15.116 14.958 14.817 14.668 14.51 14.385 14.251 14.112 13.974 13.826 13.718 13.605 13.43 13.314 13.194 13.124 12.977 12.829 12.666 12.579 12.129 12.287 12.175 12.062 11.804 11.653 11.491 11.322 11.132 10.896 10.551 8.968 -5 ,11969 ,KEBNE ,16692823,Thu Nov 25 22:50:46 CET,Fri Nov 26 00:25:24 CET,0.0 1.648 2.141 2.446 2.683 2.901 3.093 3.274 3.603 3.735 3.861 3.736 4.214 4.326 4.546 4.748 4.932 5.019 5.202 5.377 5.613 5.764 5.909 6.117 6.32 6.51 6.689 6.859 7.086 7.315 7.528 7.775 8.008 8.245 8.518 8.821 9.124 9.447 9.789 10.147 10.517 10.954 11.455 11.939 12.509 13.13 13.866 14.683 15.583 16.561 17.603 18.281 18.508 18.529 18.458 18.332 18.191 18.032 17.86 17.668 17.479 17.298 17.12 16.938 16.767 16.602 16.426 16.267 16.12 15.966 15.791 15.642 15.502 15.363 15.243 15.118 14.99 14.857 14.721 14.621 14.516 14.339 14.21 14.086 14.021 13.878 13.733 13.577 13.493 13.048 13.221 13.118 13.015 12.788 12.656 12.51 12.348 12.155 11.904 11.552 10.231 -6 ,15030 ,KEBNE ,16692824,Thu Nov 25 22:50:46 CET,Fri Nov 26 00:25:22 CET,0.0 1.688 2.031 2.272 2.489 2.685 2.851 2.994 3.252 3.367 3.477 3.312 3.783 3.883 4.082 4.275 4.463 4.556 4.73 4.893 5.127 5.278 5.429 5.642 5.844 6.033 6.215 6.391 6.612 6.832 7.053 7.306 7.541 7.777 8.055 8.371 8.659 8.97 9.306 9.65 10.02 10.432 10.904 11.38 11.929 12.548 13.245 14.032 14.936 15.906 16.946 17.594 17.816 17.864 17.803 17.675 17.501 17.31 17.127 16.899 16.706 16.536 16.354 16.186 16.017 15.853 15.681 15.519 15.379 15.229 15.054 14.906 14.757 14.593 14.468 14.338 14.194 14.049 13.9 13.794 13.681 13.5 13.375 13.232 13.148 12.971 12.792 12.607 12.514 12.066 12.232 12.131 12.026 11.798 11.667 11.517 11.337 11.129 10.88 10.547 9.042 -7 ,20136 ,KEBNE ,16692825,Thu Nov 25 22:50:45 CET,Fri Nov 26 00:28:27 CET,0.0 1.626 1.988 2.265 2.496 2.677 2.835 2.98 3.263 3.398 3.526 3.403 3.884 4.002 4.215 4.414 4.597 4.687 4.868 5.043 5.282 5.424 5.567 5.779 5.975 6.162 6.346 6.527 6.775 7.014 7.239 7.509 7.759 7.994 8.273 8.577 8.862 9.177 9.519 9.891 10.273 10.69 11.167 11.656 12.221 12.832 13.527 14.319 15.223 16.196 17.21 17.83 18.043 18.058 17.994 17.855 17.673 17.496 17.329 17.129 16.933 16.736 16.541 16.35 16.163 15.999 15.825 15.662 15.512 15.347 15.173 15.024 14.87 14.716 14.599 14.477 14.348 14.202 14.038 13.923 13.807 13.614 13.473 13.32 13.245 13.111 12.977 12.828 12.743 12.291 12.452 12.345 12.234 11.967 11.815 11.659 11.481 11.263 10.987 10.603 8.736 -8 ,24624 ,KEBNE ,16692826,Thu Nov 25 22:50:46 CET,Fri Nov 26 00:26:56 CET,0.0 1.696 2.027 2.273 2.478 2.664 2.832 2.973 3.208 3.324 3.443 3.287 3.757 3.857 4.051 4.228 4.395 4.479 4.646 4.814 5.05 5.197 5.341 5.555 5.763 5.957 6.142 6.322 6.558 6.787 6.998 7.248 7.492 7.73 7.999 8.295 8.585 8.903 9.238 9.588 9.965 10.391 10.89 11.372 11.926 12.558 13.271 14.05 14.929 15.901 16.934 17.598 17.831 17.897 17.837 17.685 17.498 17.309 17.126 16.917 16.736 16.561 16.378 16.193 16.015 15.853 15.673 15.498 15.352 15.202 15.044 14.921 14.793 14.65 14.535 14.412 14.281 14.144 14.002 13.902 13.79 13.622 13.509 13.384 13.32 13.189 13.041 12.887 12.815 12.379 12.561 12.466 12.36 12.109 11.966 11.801 11.622 11.412 11.161 10.845 9.363 -9 ,15013 ,KEBNE ,16692827,Thu Nov 25 22:50:46 CET,Fri Nov 26 00:27:43 CET,0.0 1.375 1.695 1.938 2.149 2.333 2.495 2.654 2.952 3.08 3.194 3.052 3.527 3.635 3.841 4.03 4.213 4.301 4.471 4.632 4.864 5.015 5.156 5.358 5.564 5.763 5.945 6.122 6.349 6.558 6.769 7.037 7.289 7.527 7.802 8.114 8.405 8.714 9.045 9.398 9.767 10.184 10.662 11.14 11.703 12.333 13.051 13.851 14.767 15.758 16.782 17.466 17.725 17.744 17.644 17.49 17.328 17.15 16.954 16.732 16.54 16.369 16.208 16.05 15.881 15.707 15.518 15.354 15.215 15.057 14.877 14.724 14.566 14.409 14.29 14.159 14.011 13.85 13.684 13.576 13.468 13.288 13.161 13.027 12.951 12.774 12.589 12.414 12.322 11.865 12.013 11.891 11.763 11.48 11.304 11.105 10.907 10.714 10.477 10.142 8.435 -10 ,5331 ,KEBNE ,16692828,Thu Nov 25 22:50:47 CET,Fri Nov 26 00:29:47 CET,0.0 1.452 1.799 2.075 2.305 2.483 2.636 2.775 3.029 3.154 3.267 3.102 3.572 3.668 3.854 4.038 4.211 4.291 4.446 4.591 4.803 4.939 5.07 5.261 5.452 5.648 5.837 6.02 6.259 6.479 6.695 6.952 7.198 7.438 7.704 8.002 8.294 8.615 8.959 9.343 9.733 10.139 10.623 11.115 11.684 12.307 13.008 13.779 14.641 15.645 16.728 17.389 17.636 17.651 17.56 17.432 17.262 17.078 16.891 16.684 16.498 16.316 16.138 15.962 15.786 15.617 15.435 15.272 15.124 14.968 14.811 14.677 14.525 14.365 14.241 14.102 13.95 13.803 13.648 13.539 13.423 13.226 13.084 12.94 12.869 12.711 12.544 12.368 12.273 11.81 11.949 11.833 11.703 11.392 11.219 11.019 10.783 10.522 10.212 9.772 8.648 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index b19b02f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29839 ,KEBNE ,17025284,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 13:48:15 CET,0.0 1.024 1.357 1.609 1.821 2.003 2.173 2.331 2.618 2.756 2.891 2.773 3.275 3.397 3.625 3.846 4.06 4.164 4.367 4.573 4.884 5.082 5.271 5.551 5.825 6.098 6.366 6.62 6.951 7.285 7.605 8.0 8.394 8.759 9.181 9.67 10.147 10.681 11.265 11.9 12.588 13.366 14.297 15.26 16.399 17.664 19.151 20.937 23.149 25.852 29.14 31.831 33.422 34.444 35.119 35.603 35.936 36.144 36.261 36.364 36.417 36.407 36.372 36.313 36.231 36.158 36.08 35.985 35.878 35.763 35.62 35.474 35.326 35.173 35.051 34.912 34.753 34.579 34.396 34.266 34.133 33.936 33.791 33.627 33.533 33.314 33.092 32.873 32.754 32.276 32.29 32.109 31.891 31.412 31.133 30.827 30.493 30.055 29.459 28.601 22.393 -2 ,21518 ,KEBNE ,17025286,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 13:48:28 CET,0.0 1.267 1.575 1.813 2.022 2.208 2.372 2.526 2.812 2.949 3.084 2.962 3.457 3.577 3.805 4.024 4.241 4.344 4.542 4.735 5.017 5.202 5.383 5.65 5.916 6.168 6.407 6.646 6.96 7.266 7.562 7.92 8.28 8.636 9.057 9.545 10.025 10.56 11.15 11.789 12.478 13.276 14.205 15.158 16.312 17.62 19.148 20.905 23.058 25.764 29.083 31.89 33.584 34.653 35.301 35.741 36.063 36.275 36.404 36.488 36.53 36.531 36.493 36.432 36.346 36.241 36.128 36.034 35.942 35.818 35.678 35.564 35.398 35.199 35.071 34.958 34.829 34.676 34.5 34.379 34.25 34.041 33.888 33.738 33.659 33.448 33.223 33.009 32.896 32.424 32.413 32.229 32.055 31.64 31.384 31.087 30.743 30.352 29.817 29.013 21.785 -3 ,24315 ,KEBNE ,17025287,Wed Dec 22 12:14:49 CET,Wed Dec 22 13:48:09 CET,0.0 1.23 1.565 1.821 2.03 2.209 2.374 2.53 2.821 2.962 3.092 2.959 3.456 3.578 3.808 4.034 4.257 4.361 4.569 4.778 5.076 5.272 5.464 5.744 6.023 6.285 6.541 6.8 7.146 7.479 7.792 8.18 8.555 8.923 9.349 9.833 10.304 10.835 11.426 12.066 12.736 13.492 14.422 15.392 16.539 17.846 19.401 21.206 23.383 26.022 29.27 31.988 33.634 34.676 35.363 35.858 36.17 36.344 36.442 36.519 36.556 36.565 36.559 36.516 36.463 36.398 36.287 36.17 36.058 35.928 35.785 35.663 35.536 35.402 35.285 35.154 35.022 34.877 34.69 34.54 34.395 34.17 34.008 33.847 33.752 33.53 33.277 33.011 32.89 32.433 32.455 32.274 32.09 31.61 31.335 31.053 30.743 30.371 29.855 28.942 24.538 -4 ,247 ,KEBNE ,17025288,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:49:53 CET,0.0 1.352 1.681 1.907 2.111 2.305 2.479 2.64 2.927 3.056 3.184 3.065 3.563 3.681 3.909 4.123 4.335 4.438 4.637 4.834 5.131 5.323 5.514 5.798 6.073 6.333 6.588 6.85 7.187 7.507 7.82 8.197 8.565 8.932 9.361 9.846 10.33 10.874 11.453 12.077 12.738 13.48 14.378 15.343 16.487 17.754 19.284 21.064 23.158 25.797 29.115 31.847 33.474 34.504 35.179 35.63 35.935 36.131 36.265 36.333 36.331 36.341 36.326 36.289 36.236 36.165 36.085 35.991 35.886 35.77 35.659 35.563 35.443 35.29 35.158 35.02 34.861 34.677 34.491 34.373 34.252 34.049 33.899 33.737 33.645 33.426 33.163 32.879 32.736 32.253 32.262 32.089 31.888 31.411 31.144 30.839 30.509 30.102 29.561 28.649 24.557 -5 ,8490 ,KEBNE ,17025289,Wed Dec 22 12:15:51 CET,Wed Dec 22 13:49:22 CET,0.0 1.32 1.675 1.934 2.152 2.339 2.515 2.678 2.969 3.108 3.242 3.122 3.615 3.736 3.979 4.21 4.429 4.54 4.769 4.98 5.271 5.465 5.662 5.952 6.226 6.492 6.763 7.03 7.366 7.697 8.024 8.418 8.799 9.168 9.598 10.086 10.571 11.102 11.671 12.302 12.982 13.76 14.664 15.618 16.79 18.118 19.668 21.448 23.616 26.262 29.515 32.247 33.955 35.062 35.76 36.247 36.578 36.786 36.902 36.976 37.012 37.009 36.991 36.964 36.911 36.843 36.764 36.666 36.556 36.44 36.288 36.14 36.004 35.866 35.747 35.622 35.496 35.335 35.13 34.999 34.873 34.645 34.472 34.301 34.213 34.016 33.782 33.517 33.38 32.891 32.873 32.696 32.484 32.015 31.76 31.436 31.023 30.535 29.965 29.185 24.429 -6 ,5107 ,KEBNE ,17025290,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:51:21 CET,0.0 1.252 1.566 1.813 2.035 2.233 2.413 2.578 2.892 3.045 3.192 3.108 3.619 3.752 4.003 4.232 4.451 4.56 4.77 4.979 5.287 5.486 5.687 5.975 6.249 6.516 6.769 7.016 7.359 7.702 8.033 8.434 8.819 9.189 9.627 10.125 10.611 11.142 11.709 12.326 12.983 13.744 14.666 15.605 16.728 18.016 19.568 21.395 23.553 26.131 29.352 32.155 33.832 34.923 35.607 36.06 36.403 36.64 36.717 36.697 36.657 36.614 36.561 36.503 36.426 36.343 36.255 36.164 36.056 35.913 35.763 35.643 35.513 35.372 35.257 35.129 35.001 34.852 34.678 34.555 34.424 34.212 34.058 33.889 33.788 33.593 33.409 33.164 33.023 32.549 32.589 32.402 32.191 31.78 31.526 31.227 30.847 30.298 29.676 28.899 25.12 -7 ,25983 ,KEBNE ,17025291,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:49:28 CET,0.0 1.127 1.448 1.685 1.895 2.083 2.257 2.429 2.744 2.89 3.029 2.907 3.398 3.518 3.745 3.955 4.165 4.266 4.464 4.658 4.935 5.118 5.288 5.545 5.803 6.057 6.313 6.561 6.883 7.192 7.49 7.853 8.216 8.574 8.987 9.46 9.926 10.452 11.043 11.683 12.352 13.133 14.08 15.048 16.175 17.46 19.0 20.771 22.924 25.56 28.875 31.69 33.387 34.464 35.116 35.564 35.881 36.107 36.254 36.36 36.41 36.414 36.406 36.373 36.309 36.243 36.165 36.063 35.941 35.81 35.699 35.604 35.469 35.286 35.147 35.021 34.885 34.726 34.542 34.407 34.239 33.974 33.802 33.615 33.518 33.317 33.099 32.858 32.721 32.248 32.258 32.065 31.879 31.42 31.144 30.863 30.531 30.068 29.427 28.528 20.004 -8 ,30072 ,KEBNE ,17025292,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:49:57 CET,0.0 1.025 1.361 1.612 1.827 2.021 2.198 2.358 2.644 2.787 2.932 2.82 3.314 3.431 3.664 3.887 4.102 4.206 4.408 4.607 4.891 5.079 5.266 5.535 5.799 6.057 6.314 6.571 6.904 7.222 7.537 7.939 8.327 8.697 9.135 9.63 10.11 10.644 11.24 11.891 12.58 13.357 14.289 15.233 16.362 17.677 19.193 20.946 23.088 25.684 28.945 31.731 33.357 34.401 35.069 35.514 35.831 36.04 36.177 36.274 36.29 36.276 36.238 36.177 36.096 36.017 35.939 35.841 35.735 35.618 35.484 35.365 35.247 35.115 35.003 34.881 34.742 34.588 34.422 34.297 34.157 33.922 33.738 33.54 33.444 33.233 32.961 32.662 32.518 32.045 32.07 31.904 31.724 31.297 31.027 30.725 30.38 29.917 29.332 28.55 23.499 -9 ,17251 ,KEBNE ,17025293,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:49:39 CET,0.0 1.15 1.481 1.733 1.943 2.132 2.305 2.465 2.756 2.896 3.038 2.93 3.42 3.537 3.766 3.99 4.211 4.315 4.518 4.723 5.028 5.217 5.4 5.668 5.924 6.177 6.425 6.663 6.983 7.289 7.593 7.986 8.373 8.754 9.198 9.677 10.15 10.693 11.282 11.926 12.619 13.424 14.377 15.335 16.475 17.763 19.271 21.032 23.198 25.86 29.064 31.759 33.417 34.51 35.216 35.693 36.021 36.238 36.378 36.483 36.531 36.555 36.538 36.499 36.462 36.407 36.316 36.202 36.104 35.996 35.862 35.738 35.608 35.456 35.329 35.192 35.035 34.861 34.676 34.548 34.39 34.111 33.932 33.749 33.65 33.441 33.222 32.977 32.847 32.38 32.412 32.253 32.05 31.587 31.336 31.038 30.687 30.215 29.549 28.535 24.396 -10 ,2766 ,KEBNE ,17025294,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:49:32 CET,0.0 1.309 1.628 1.894 2.127 2.323 2.498 2.655 2.946 3.082 3.209 3.085 3.579 3.696 3.929 4.154 4.364 4.464 4.666 4.857 5.135 5.324 5.515 5.802 6.077 6.338 6.587 6.835 7.16 7.479 7.8 8.19 8.561 8.921 9.356 9.854 10.338 10.885 11.468 12.084 12.759 13.552 14.505 15.493 16.666 17.966 19.483 21.263 23.397 25.906 29.048 31.744 33.29 34.355 35.098 35.559 35.869 36.087 36.21 36.269 36.245 36.211 36.192 36.148 36.088 36.01 35.897 35.807 35.718 35.586 35.432 35.289 35.142 34.992 34.873 34.765 34.646 34.484 34.309 34.196 34.079 33.885 33.726 33.544 33.445 33.254 33.043 32.773 32.628 32.144 32.109 31.905 31.7 31.17 30.844 30.528 30.192 29.8 29.299 28.541 24.665 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 1d3c306e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2ff_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9428 ,KEBNE ,16692829,Thu Nov 25 22:50:46 CET,Fri Nov 26 00:26:02 CET,0.0 1.163 1.563 1.863 2.106 2.314 2.49 2.654 2.954 3.089 3.22 3.083 3.571 3.689 3.906 4.097 4.28 4.37 4.539 4.705 4.97 5.139 5.298 5.536 5.76 5.977 6.183 6.377 6.633 6.889 7.127 7.401 7.671 7.936 8.223 8.517 8.81 9.144 9.504 9.892 10.31 10.769 11.267 11.746 12.329 12.97 13.693 14.491 15.296 16.16 17.027 17.327 17.216 16.967 16.641 16.258 15.838 15.444 15.107 14.753 14.442 14.167 13.895 13.615 13.347 13.101 12.83 12.595 12.4 12.179 11.946 11.748 11.521 11.292 11.127 10.948 10.767 10.589 10.394 10.254 10.107 9.871 9.708 9.544 9.454 9.262 9.049 8.822 8.708 8.231 8.336 8.19 8.043 7.691 7.489 7.271 7.011 6.728 6.407 5.903 4.082 -2 ,27272 ,KEBNE ,16692830,Thu Nov 25 22:50:46 CET,Fri Nov 26 00:28:24 CET,0.0 1.578 2.057 2.438 2.733 2.979 3.188 3.382 3.749 3.913 4.073 3.979 4.466 4.59 4.849 5.092 5.293 5.392 5.591 5.769 6.023 6.186 6.345 6.573 6.795 7.004 7.207 7.402 7.646 7.89 8.131 8.406 8.662 8.912 9.21 9.532 9.832 10.174 10.56 10.957 11.357 11.815 12.354 12.907 13.505 14.128 14.864 15.618 16.412 17.342 18.243 18.559 18.481 18.2 17.83 17.413 17.026 16.677 16.345 15.997 15.69 15.395 15.1 14.81 14.517 14.225 13.919 13.656 13.434 13.204 12.942 12.716 12.488 12.243 12.053 11.857 11.649 11.429 11.203 11.041 10.874 10.622 10.426 10.21 10.102 9.882 9.667 9.442 9.319 8.83 8.909 8.749 8.586 8.24 8.06 7.838 7.56 7.25 6.866 6.317 4.568 -3 ,24654 ,KEBNE ,16692831,Thu Nov 25 22:50:45 CET,Fri Nov 26 00:27:04 CET,0.0 1.364 1.758 2.038 2.299 2.534 2.72 2.897 3.207 3.342 3.477 3.363 3.853 3.964 4.166 4.364 4.548 4.64 4.831 5.013 5.26 5.408 5.543 5.756 5.982 6.203 6.416 6.626 6.886 7.131 7.364 7.633 7.907 8.17 8.462 8.782 9.083 9.418 9.787 10.169 10.587 11.072 11.603 12.114 12.703 13.373 14.092 14.808 15.589 16.367 17.087 17.329 17.116 16.759 16.365 15.957 15.578 15.226 14.887 14.518 14.182 13.859 13.547 13.262 13.007 12.766 12.486 12.21 11.969 11.726 11.474 11.268 11.055 10.831 10.643 10.441 10.251 10.048 9.821 9.673 9.514 9.256 9.08 8.886 8.786 8.565 8.318 8.065 7.933 7.442 7.519 7.372 7.205 6.814 6.617 6.403 6.152 5.853 5.494 4.921 2.253 -4 ,2368 ,KEBNE ,16692832,Thu Nov 25 22:50:45 CET,Fri Nov 26 00:28:21 CET,0.0 3.013 3.496 3.815 4.059 4.262 4.454 4.637 4.952 5.091 5.237 5.153 5.649 5.774 6.022 6.246 6.459 6.564 6.761 6.946 7.206 7.372 7.528 7.748 7.962 8.165 8.36 8.557 8.81 9.056 9.293 9.585 9.867 10.11 10.381 10.696 11.005 11.339 11.704 12.121 12.563 13.027 13.533 14.036 14.617 15.24 15.933 16.725 17.606 18.506 19.251 19.461 19.346 19.037 18.64 18.234 17.851 17.476 17.123 16.743 16.396 16.083 15.787 15.498 15.22 14.963 14.707 14.47 14.246 14.019 13.78 13.579 13.372 13.139 12.951 12.774 12.588 12.382 12.17 12.022 11.856 11.604 11.445 11.276 11.182 10.978 10.745 10.509 10.395 9.904 9.979 9.84 9.682 9.316 9.123 8.915 8.65 8.335 7.977 7.536 5.757 -5 ,32283 ,KEBNE ,16692833,Thu Nov 25 22:50:46 CET,Fri Nov 26 00:26:00 CET,0.0 1.34 1.774 2.108 2.389 2.63 2.837 3.011 3.323 3.47 3.616 3.509 3.999 4.105 4.315 4.533 4.744 4.848 5.044 5.221 5.472 5.63 5.777 6.009 6.248 6.471 6.678 6.878 7.132 7.364 7.586 7.862 8.128 8.375 8.647 8.954 9.265 9.607 9.962 10.352 10.763 11.19 11.676 12.173 12.76 13.413 14.198 15.074 15.927 16.71 17.379 17.553 17.343 17.02 16.684 16.341 15.977 15.595 15.244 14.872 14.534 14.245 13.967 13.699 13.443 13.184 12.914 12.674 12.456 12.215 11.974 11.784 11.577 11.362 11.184 10.993 10.79 10.573 10.354 10.198 10.039 9.799 9.626 9.437 9.336 9.124 8.892 8.654 8.536 8.056 8.15 8.002 7.845 7.504 7.318 7.094 6.785 6.459 6.123 5.658 4.246 -6 ,306 ,KEBNE ,16692834,Thu Nov 25 22:51:49 CET,Fri Nov 26 00:27:20 CET,0.0 1.137 1.558 1.856 2.084 2.313 2.53 2.714 3.061 3.233 3.388 3.283 3.781 3.909 4.158 4.385 4.603 4.707 4.9 5.09 5.377 5.555 5.712 5.935 6.163 6.391 6.602 6.789 7.019 7.255 7.491 7.782 8.052 8.287 8.553 8.854 9.141 9.459 9.83 10.233 10.635 11.105 11.664 12.183 12.76 13.405 14.098 14.821 15.627 16.454 17.179 17.393 17.279 17.021 16.69 16.337 15.945 15.558 15.207 14.838 14.528 14.25 13.981 13.718 13.454 13.215 12.953 12.71 12.511 12.287 12.039 11.834 11.622 11.403 11.221 11.028 10.829 10.612 10.373 10.208 10.038 9.756 9.572 9.394 9.298 9.099 8.895 8.666 8.541 8.046 8.123 7.99 7.844 7.5 7.308 7.104 6.869 6.573 6.209 5.734 4.158 -7 ,2938 ,KEBNE ,16692835,Thu Nov 25 22:51:49 CET,Fri Nov 26 00:27:25 CET,0.0 1.758 2.26 2.656 2.973 3.208 3.427 3.649 4.056 4.224 4.366 4.267 4.763 4.889 5.14 5.356 5.551 5.652 5.861 6.06 6.325 6.486 6.637 6.864 7.082 7.289 7.487 7.679 7.926 8.176 8.431 8.73 9.003 9.262 9.553 9.871 10.186 10.537 10.915 11.322 11.733 12.184 12.69 13.182 13.759 14.399 15.102 15.852 16.673 17.62 18.6 18.973 18.888 18.613 18.238 17.843 17.445 17.071 16.746 16.366 16.009 15.69 15.408 15.134 14.861 14.621 14.375 14.14 13.922 13.702 13.462 13.25 13.033 12.799 12.604 12.409 12.22 12.011 11.794 11.637 11.458 11.188 11.006 10.809 10.711 10.517 10.299 10.061 9.948 9.46 9.554 9.42 9.272 8.931 8.714 8.464 8.179 7.854 7.489 7.053 5.271 -8 ,29906 ,KEBNE ,16692836,Thu Nov 25 22:52:52 CET,Fri Nov 26 00:28:56 CET,0.0 1.751 2.199 2.503 2.746 2.954 3.146 3.323 3.618 3.757 3.896 3.772 4.265 4.38 4.588 4.787 4.981 5.077 5.259 5.448 5.739 5.912 6.071 6.304 6.518 6.72 6.926 7.125 7.38 7.63 7.856 8.127 8.386 8.629 8.925 9.272 9.604 9.948 10.315 10.719 11.141 11.617 12.14 12.631 13.201 13.838 14.557 15.329 16.182 17.027 17.718 17.977 17.857 17.566 17.219 16.854 16.492 16.13 15.793 15.431 15.089 14.78 14.491 14.193 13.909 13.656 13.381 13.133 12.93 12.719 12.464 12.232 11.988 11.759 11.594 11.411 11.221 11.02 10.806 10.654 10.492 10.231 10.035 9.838 9.738 9.515 9.284 9.056 8.933 8.432 8.457 8.283 8.11 7.76 7.564 7.319 7.015 6.667 6.251 5.651 4.063 -9 ,19315 ,KEBNE ,16692837,Thu Nov 25 22:52:52 CET,Fri Nov 26 00:29:18 CET,0.0 1.325 1.752 2.064 2.326 2.543 2.719 2.884 3.22 3.367 3.492 3.365 3.855 3.965 4.171 4.366 4.56 4.654 4.831 4.995 5.232 5.386 5.534 5.754 5.978 6.196 6.403 6.6 6.848 7.094 7.331 7.608 7.873 8.151 8.479 8.799 9.095 9.42 9.781 10.169 10.573 11.028 11.544 12.06 12.624 13.238 13.947 14.692 15.501 16.366 17.103 17.309 17.195 16.972 16.665 16.309 15.951 15.561 15.183 14.776 14.419 14.102 13.785 13.493 13.219 12.964 12.692 12.441 12.222 11.983 11.731 11.519 11.29 11.055 10.87 10.677 10.473 10.254 10.019 9.861 9.707 9.454 9.27 9.055 8.93 8.677 8.452 8.233 8.09 7.572 7.637 7.48 7.3 6.893 6.662 6.411 6.134 5.808 5.425 4.912 3.558 -10 ,16972 ,KEBNE ,16692838,Thu Nov 25 22:52:51 CET,Fri Nov 26 00:30:35 CET,0.0 1.486 1.945 2.282 2.553 2.798 3.014 3.214 3.583 3.749 3.902 3.809 4.301 4.427 4.668 4.878 5.088 5.197 5.401 5.583 5.842 6.01 6.18 6.429 6.651 6.843 7.036 7.234 7.488 7.735 7.977 8.26 8.53 8.785 9.079 9.419 9.746 10.103 10.471 10.864 11.288 11.77 12.32 12.842 13.451 14.097 14.79 15.582 16.478 17.344 18.079 18.317 18.184 17.897 17.52 17.156 16.812 16.455 16.101 15.733 15.414 15.107 14.806 14.501 14.229 13.965 13.672 13.411 13.187 12.963 12.72 12.514 12.296 12.063 11.883 11.694 11.501 11.308 11.092 10.944 10.804 10.566 10.388 10.205 10.111 9.913 9.704 9.481 9.369 8.898 9.012 8.875 8.723 8.38 8.175 7.943 7.711 7.427 7.06 6.537 4.839 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt deleted file mode 100644 index ef7a3c3b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2g_p38a-2h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27266 ,KEBNE ,17025295,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:51:14 CET,0.0 0.596 0.887 1.069 1.214 1.349 1.451 1.553 1.732 1.797 1.86 1.624 2.024 2.072 2.162 2.227 2.273 2.293 2.342 2.39 2.454 2.49 2.518 2.545 2.565 2.584 2.591 2.591 2.594 2.586 2.572 2.547 2.507 2.463 2.399 2.318 2.221 2.092 1.944 1.771 1.567 1.307 0.979 0.596 0.067 -0.61 -1.51 -2.692 -4.349 -6.721 -10.3 -14.265 -17.354 -19.792 -21.768 -23.451 -24.829 -26.013 -27.033 -28.046 -28.887 -29.624 -30.311 -30.946 -31.52 -32.029 -32.549 -33.01 -33.402 -33.802 -34.218 -34.548 -34.887 -35.236 -35.504 -35.783 -36.064 -36.35 -36.65 -36.85 -37.054 -37.366 -37.573 -37.775 -37.879 -38.097 -38.327 -38.577 -38.706 -39.229 -39.111 -39.259 -39.412 -39.746 -39.93 -40.116 -40.32 -40.563 -40.846 -41.203 -42.335 -2 ,10233 ,KEBNE ,17025296,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:52:28 CET,0.0 0.329 0.495 0.636 0.746 0.827 0.886 0.935 1.001 1.039 1.076 0.786 1.166 1.199 1.279 1.354 1.411 1.441 1.503 1.559 1.621 1.662 1.701 1.744 1.788 1.814 1.831 1.837 1.839 1.836 1.823 1.809 1.781 1.733 1.667 1.59 1.5 1.387 1.25 1.082 0.881 0.628 0.287 -0.107 -0.626 -1.301 -2.199 -3.368 -5.023 -7.44 -11.097 -15.023 -18.06 -20.529 -22.512 -24.181 -25.591 -26.808 -27.851 -28.862 -29.678 -30.383 -31.038 -31.656 -32.22 -32.72 -33.237 -33.695 -34.082 -34.463 -34.854 -35.183 -35.522 -35.867 -36.132 -36.418 -36.708 -36.984 -37.256 -37.442 -37.635 -37.942 -38.156 -38.378 -38.49 -38.708 -38.935 -39.18 -39.306 -39.826 -39.708 -39.853 -40.003 -40.323 -40.495 -40.69 -40.907 -41.138 -41.422 -41.797 -42.857 -3 ,26927 ,KEBNE ,17025297,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:51:10 CET,0.0 0.259 0.406 0.52 0.619 0.698 0.78 0.859 0.976 1.018 1.059 0.789 1.173 1.206 1.279 1.358 1.426 1.446 1.488 1.539 1.589 1.606 1.625 1.659 1.687 1.708 1.729 1.748 1.768 1.774 1.763 1.74 1.706 1.668 1.622 1.561 1.477 1.348 1.189 1.011 0.806 0.541 0.183 -0.217 -0.739 -1.389 -2.269 -3.468 -5.144 -7.539 -11.269 -15.355 -18.42 -20.854 -22.871 -24.607 -26.05 -27.284 -28.31 -29.306 -30.135 -30.86 -31.552 -32.169 -32.716 -33.232 -33.757 -34.205 -34.597 -35.01 -35.432 -35.768 -36.113 -36.467 -36.738 -37.018 -37.31 -37.603 -37.898 -38.109 -38.324 -38.645 -38.866 -39.099 -39.22 -39.474 -39.751 -40.035 -40.173 -40.705 -40.61 -40.774 -40.941 -41.291 -41.496 -41.717 -41.972 -42.243 -42.521 -42.886 -44.636 -4 ,30490 ,KEBNE ,17025298,Wed Dec 22 12:15:56 CET,Wed Dec 22 13:47:32 CET,0.0 0.4 0.57 0.679 0.768 0.853 0.916 0.975 1.093 1.141 1.182 0.916 1.303 1.338 1.396 1.433 1.466 1.487 1.531 1.573 1.633 1.676 1.716 1.76 1.798 1.833 1.857 1.872 1.881 1.885 1.875 1.852 1.824 1.786 1.732 1.657 1.569 1.46 1.316 1.134 0.908 0.627 0.267 -0.155 -0.701 -1.38 -2.282 -3.464 -5.102 -7.472 -11.168 -15.176 -18.222 -20.643 -22.577 -24.26 -25.692 -26.904 -27.923 -28.934 -29.784 -30.527 -31.217 -31.841 -32.408 -32.923 -33.444 -33.897 -34.286 -34.69 -35.107 -35.433 -35.767 -36.123 -36.392 -36.657 -36.933 -37.224 -37.527 -37.726 -37.93 -38.246 -38.469 -38.706 -38.825 -39.067 -39.313 -39.575 -39.711 -40.237 -40.114 -40.259 -40.411 -40.724 -40.892 -41.075 -41.287 -41.522 -41.8 -42.173 -43.171 -5 ,24240 ,KEBNE ,17025299,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:51:00 CET,0.0 0.348 0.509 0.622 0.724 0.837 0.921 0.977 1.085 1.148 1.206 0.942 1.331 1.359 1.404 1.45 1.491 1.516 1.563 1.597 1.628 1.649 1.68 1.717 1.727 1.735 1.749 1.751 1.742 1.727 1.701 1.67 1.632 1.583 1.519 1.425 1.332 1.218 1.073 0.9 0.7 0.425 0.066 -0.337 -0.868 -1.528 -2.439 -3.628 -5.285 -7.685 -11.349 -15.365 -18.424 -20.876 -22.844 -24.497 -25.903 -27.125 -28.15 -29.157 -29.99 -30.7 -31.356 -31.981 -32.55 -33.051 -33.575 -34.038 -34.44 -34.846 -35.26 -35.599 -35.936 -36.281 -36.546 -36.821 -37.116 -37.416 -37.705 -37.895 -38.088 -38.391 -38.601 -38.822 -38.935 -39.167 -39.405 -39.654 -39.781 -40.298 -40.167 -40.311 -40.46 -40.778 -40.953 -41.141 -41.338 -41.569 -41.838 -42.175 -43.235 -6 ,9528 ,KEBNE ,17025300,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:53:16 CET,0.0 0.318 0.492 0.616 0.711 0.793 0.854 0.912 1.032 1.081 1.122 0.839 1.216 1.239 1.272 1.309 1.35 1.37 1.397 1.414 1.439 1.449 1.467 1.492 1.513 1.536 1.566 1.581 1.572 1.555 1.537 1.519 1.496 1.462 1.407 1.333 1.258 1.15 1.016 0.845 0.636 0.374 0.015 -0.386 -0.925 -1.619 -2.562 -3.816 -5.506 -7.852 -11.485 -15.493 -18.552 -20.966 -22.94 -24.635 -26.034 -27.247 -28.262 -29.257 -30.09 -30.801 -31.461 -32.065 -32.616 -33.11 -33.623 -34.073 -34.466 -34.875 -35.287 -35.622 -35.96 -36.313 -36.579 -36.848 -37.116 -37.38 -37.652 -37.839 -38.032 -38.344 -38.553 -38.761 -38.866 -39.083 -39.308 -39.533 -39.651 -40.171 -40.045 -40.183 -40.333 -40.678 -40.862 -41.058 -41.263 -41.484 -41.772 -42.258 -43.801 -7 ,8883 ,KEBNE ,17025301,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:51:04 CET,0.0 0.327 0.486 0.605 0.705 0.777 0.847 0.913 1.025 1.074 1.115 0.831 1.205 1.238 1.322 1.396 1.451 1.475 1.53 1.578 1.618 1.642 1.676 1.71 1.73 1.764 1.793 1.811 1.819 1.809 1.788 1.748 1.702 1.657 1.605 1.528 1.437 1.321 1.169 0.98 0.758 0.491 0.14 -0.269 -0.824 -1.511 -2.43 -3.616 -5.187 -7.49 -11.164 -15.163 -18.171 -20.585 -22.589 -24.297 -25.703 -26.903 -27.905 -28.901 -29.731 -30.442 -31.124 -31.747 -32.308 -32.81 -33.328 -33.789 -34.172 -34.562 -34.96 -35.287 -35.632 -35.984 -36.26 -36.554 -36.84 -37.124 -37.429 -37.634 -37.835 -38.154 -38.385 -38.63 -38.753 -39.004 -39.265 -39.539 -39.684 -40.22 -40.126 -40.283 -40.446 -40.81 -41.013 -41.235 -41.481 -41.733 -42.015 -42.388 -43.82 -8 ,17522 ,KEBNE ,17025302,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:51:22 CET,0.0 0.351 0.521 0.676 0.789 0.882 0.977 1.063 1.181 1.233 1.285 1.02 1.399 1.418 1.449 1.476 1.505 1.517 1.538 1.57 1.633 1.674 1.701 1.737 1.764 1.771 1.776 1.781 1.782 1.78 1.769 1.744 1.71 1.664 1.614 1.548 1.433 1.287 1.147 0.982 0.772 0.49 0.114 -0.286 -0.814 -1.511 -2.421 -3.621 -5.274 -7.609 -11.248 -15.249 -18.324 -20.807 -22.804 -24.492 -25.915 -27.144 -28.175 -29.166 -29.989 -30.716 -31.397 -32.028 -32.593 -33.102 -33.625 -34.073 -34.457 -34.858 -35.279 -35.616 -35.947 -36.279 -36.543 -36.82 -37.106 -37.396 -37.689 -37.894 -38.101 -38.414 -38.628 -38.84 -38.95 -39.182 -39.419 -39.66 -39.789 -40.316 -40.187 -40.323 -40.468 -40.793 -40.977 -41.167 -41.374 -41.617 -41.892 -42.218 -43.264 -9 ,7710 ,KEBNE ,17025303,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:51:12 CET,0.0 0.496 0.65 0.767 0.878 0.971 1.043 1.111 1.233 1.277 1.313 1.04 1.424 1.456 1.524 1.577 1.614 1.632 1.673 1.704 1.741 1.761 1.777 1.813 1.85 1.869 1.882 1.89 1.896 1.903 1.901 1.889 1.872 1.837 1.776 1.685 1.579 1.454 1.3 1.106 0.888 0.631 0.279 -0.128 -0.659 -1.344 -2.257 -3.443 -5.079 -7.463 -11.072 -14.983 -17.999 -20.429 -22.419 -24.11 -25.528 -26.751 -27.771 -28.755 -29.583 -30.308 -30.977 -31.598 -32.168 -32.676 -33.184 -33.639 -34.026 -34.416 -34.818 -35.147 -35.491 -35.845 -36.124 -36.407 -36.687 -36.969 -37.275 -37.489 -37.702 -38.038 -38.271 -38.511 -38.63 -38.859 -39.097 -39.354 -39.489 -40.01 -39.881 -40.02 -40.172 -40.494 -40.662 -40.843 -41.05 -41.292 -41.563 -41.92 -43.105 -10 ,26401 ,KEBNE ,17025304,Wed Dec 22 12:15:52 CET,Wed Dec 22 13:51:06 CET,0.0 0.401 0.543 0.648 0.745 0.827 0.89 0.941 1.042 1.098 1.157 0.917 1.316 1.36 1.435 1.496 1.546 1.568 1.613 1.658 1.717 1.747 1.776 1.825 1.848 1.848 1.848 1.848 1.858 1.872 1.877 1.876 1.853 1.816 1.771 1.694 1.599 1.473 1.317 1.14 0.933 0.668 0.299 -0.118 -0.658 -1.368 -2.3 -3.489 -5.124 -7.46 -11.131 -15.202 -18.25 -20.668 -22.659 -24.369 -25.792 -27.032 -28.067 -29.06 -29.895 -30.613 -31.276 -31.903 -32.475 -32.986 -33.519 -33.98 -34.366 -34.767 -35.175 -35.51 -35.858 -36.21 -36.471 -36.743 -37.03 -37.32 -37.617 -37.824 -38.038 -38.357 -38.571 -38.784 -38.89 -39.109 -39.339 -39.574 -39.698 -40.218 -40.094 -40.242 -40.391 -40.705 -40.885 -41.081 -41.288 -41.511 -41.778 -42.125 -43.263 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt deleted file mode 100644 index ffd969df..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-2ff.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5732 ,KEBNE ,16692839,Thu Nov 25 22:52:51 CET,Fri Nov 26 00:29:00 CET,0.0 1.058 1.443 1.737 1.981 2.185 2.372 2.564 2.932 3.097 3.25 3.132 3.682 3.814 4.08 4.339 4.591 4.72 4.966 5.2 5.546 5.77 5.995 6.325 6.642 6.954 7.243 7.518 7.878 8.248 8.622 9.061 9.474 9.867 10.333 10.867 11.387 11.976 12.614 13.294 14.04 14.901 15.924 16.987 18.219 19.604 21.241 23.143 25.408 28.148 31.623 34.443 36.054 37.096 37.76 38.142 38.339 38.488 38.579 38.592 38.57 38.527 38.466 38.381 38.29 38.185 38.054 37.95 37.855 37.749 37.623 37.505 37.366 37.209 37.095 36.979 36.875 36.772 36.639 36.54 36.434 36.271 36.164 36.042 35.973 35.835 35.698 35.547 35.458 34.994 35.174 35.069 34.948 34.68 34.531 34.362 34.179 33.966 33.7 33.353 31.879 -2 ,6352 ,KEBNE ,16692840,Thu Nov 25 22:52:51 CET,Fri Nov 26 00:30:36 CET,0.0 1.198 1.61 1.906 2.147 2.373 2.577 2.761 3.111 3.272 3.431 3.327 3.878 4.018 4.3 4.571 4.831 4.959 5.214 5.454 5.795 6.023 6.25 6.579 6.889 7.191 7.487 7.776 8.155 8.532 8.899 9.339 9.771 10.193 10.676 11.212 11.741 12.344 13.011 13.723 14.455 15.285 16.302 17.35 18.602 20.034 21.702 23.644 25.98 28.763 32.114 34.937 36.599 37.581 38.237 38.679 38.948 39.091 39.149 39.201 39.206 39.172 39.124 39.058 38.97 38.868 38.742 38.617 38.508 38.401 38.294 38.19 38.074 37.938 37.828 37.712 37.591 37.464 37.31 37.204 37.097 36.913 36.774 36.626 36.558 36.421 36.26 36.088 35.988 35.502 35.63 35.507 35.381 35.095 34.929 34.753 34.559 34.325 34.015 33.584 31.393 -3 ,7101 ,KEBNE ,16692841,Thu Nov 25 22:52:51 CET,Fri Nov 26 00:33:44 CET,0.0 1.337 1.665 1.915 2.141 2.346 2.53 2.709 3.051 3.206 3.353 3.212 3.755 3.887 4.143 4.389 4.629 4.756 5.003 5.238 5.578 5.794 6.011 6.326 6.637 6.942 7.231 7.518 7.908 8.285 8.645 9.086 9.515 9.932 10.422 10.975 11.506 12.097 12.751 13.44 14.172 15.018 16.039 17.065 18.281 19.658 21.281 23.199 25.467 28.212 31.626 34.4 35.984 37.022 37.73 38.164 38.419 38.561 38.628 38.666 38.667 38.652 38.623 38.568 38.5 38.443 38.355 38.257 38.173 38.071 37.957 37.855 37.733 37.588 37.471 37.345 37.204 37.064 36.921 36.825 36.711 36.5 36.364 36.23 36.159 36.003 35.826 35.643 35.542 35.056 35.176 35.036 34.88 34.535 34.362 34.185 33.991 33.767 33.468 33.065 31.801 -4 ,8465 ,KEBNE ,16692842,Thu Nov 25 22:52:51 CET,Fri Nov 26 00:31:18 CET,0.0 1.477 1.863 2.138 2.368 2.585 2.789 2.988 3.36 3.521 3.67 3.534 4.08 4.217 4.498 4.773 5.038 5.167 5.413 5.64 5.978 6.203 6.42 6.735 7.042 7.354 7.659 7.946 8.324 8.687 9.03 9.46 9.895 10.317 10.792 11.314 11.823 12.402 13.048 13.754 14.514 15.385 16.414 17.427 18.611 19.98 21.625 23.546 25.873 28.659 32.104 35.024 36.64 37.686 38.369 38.786 39.066 39.277 39.393 39.442 39.444 39.409 39.348 39.268 39.176 39.072 38.948 38.844 38.747 38.637 38.522 38.429 38.318 38.179 38.064 37.941 37.824 37.701 37.569 37.48 37.383 37.219 37.102 36.98 36.919 36.798 36.667 36.524 36.446 35.988 36.169 36.061 35.949 35.709 35.564 35.407 35.226 34.998 34.733 34.37 33.34 -5 ,11762 ,KEBNE ,16692843,Thu Nov 25 22:53:54 CET,Fri Nov 26 00:31:46 CET,0.0 1.293 1.707 2.033 2.29 2.519 2.708 2.88 3.229 3.403 3.565 3.46 4.015 4.156 4.432 4.71 4.984 5.12 5.388 5.633 5.992 6.227 6.45 6.77 7.078 7.373 7.656 7.942 8.323 8.687 9.033 9.46 9.883 10.286 10.75 11.284 11.809 12.399 13.047 13.74 14.485 15.335 16.329 17.329 18.535 19.945 21.622 23.566 25.903 28.681 32.045 34.868 36.491 37.473 38.145 38.567 38.793 38.914 38.951 38.947 38.912 38.882 38.821 38.727 38.647 38.56 38.456 38.371 38.287 38.19 38.078 37.97 37.851 37.731 37.637 37.525 37.398 37.269 37.137 37.037 36.927 36.762 36.646 36.523 36.458 36.311 36.153 35.983 35.896 35.436 35.609 35.506 35.398 35.149 35.009 34.848 34.665 34.442 34.142 33.705 32.248 -6 ,1610 ,KEBNE ,16692844,Thu Nov 25 22:52:52 CET,Fri Nov 26 00:32:49 CET,0.0 0.933 1.276 1.561 1.818 2.048 2.249 2.427 2.743 2.897 3.049 2.92 3.468 3.602 3.853 4.099 4.341 4.458 4.689 4.919 5.255 5.472 5.69 6.015 6.324 6.616 6.901 7.187 7.563 7.926 8.283 8.711 9.117 9.519 9.993 10.534 11.069 11.658 12.301 13.003 13.754 14.608 15.616 16.651 17.858 19.229 20.86 22.758 25.073 27.789 31.161 34.023 35.61 36.611 37.261 37.686 37.981 38.177 38.286 38.359 38.369 38.332 38.271 38.204 38.127 38.036 37.927 37.84 37.771 37.673 37.543 37.43 37.312 37.178 37.069 36.946 36.81 36.669 36.511 36.381 36.24 36.034 35.887 35.732 35.656 35.499 35.317 35.107 34.992 34.511 34.665 34.56 34.449 34.19 34.023 33.834 33.644 33.427 33.142 32.749 31.103 -7 ,30433 ,KEBNE ,16692845,Thu Nov 25 22:52:52 CET,Fri Nov 26 00:30:38 CET,0.0 1.074 1.407 1.666 1.895 2.099 2.279 2.443 2.774 2.934 3.08 2.939 3.475 3.6 3.868 4.146 4.422 4.555 4.806 5.049 5.398 5.628 5.862 6.191 6.498 6.802 7.102 7.399 7.784 8.14 8.499 8.941 9.354 9.769 10.258 10.804 11.341 11.937 12.585 13.268 13.988 14.844 15.872 16.909 18.154 19.563 21.222 23.13 25.397 28.172 31.576 34.286 35.81 36.792 37.438 37.851 38.111 38.295 38.375 38.389 38.388 38.387 38.376 38.328 38.244 38.154 38.052 37.946 37.849 37.741 37.624 37.533 37.427 37.307 37.219 37.124 37.008 36.888 36.774 36.694 36.605 36.459 36.362 36.255 36.19 36.043 35.891 35.733 35.645 35.179 35.363 35.261 35.152 34.912 34.77 34.602 34.414 34.198 33.935 33.569 31.91 -8 ,15920 ,KEBNE ,16692846,Thu Nov 25 22:52:51 CET,Fri Nov 26 00:30:06 CET,0.0 1.025 1.374 1.651 1.88 2.105 2.326 2.516 2.84 2.994 3.145 3.024 3.576 3.712 3.972 4.225 4.462 4.579 4.812 5.045 5.384 5.595 5.807 6.126 6.437 6.748 7.051 7.343 7.713 8.071 8.42 8.852 9.273 9.681 10.167 10.723 11.26 11.854 12.506 13.212 13.963 14.83 15.853 16.879 18.066 19.422 21.044 22.928 25.232 27.991 31.413 34.246 35.824 36.824 37.474 37.879 38.133 38.298 38.365 38.385 38.377 38.328 38.252 38.178 38.116 38.038 37.919 37.81 37.715 37.598 37.464 37.348 37.222 37.091 36.989 36.869 36.738 36.617 36.484 36.378 36.274 36.113 35.982 35.837 35.761 35.599 35.419 35.215 35.109 34.633 34.779 34.654 34.521 34.219 34.033 33.827 33.585 33.285 32.92 32.395 30.736 -9 ,30963 ,KEBNE ,16692847,Thu Nov 25 22:52:51 CET,Fri Nov 26 00:30:10 CET,0.0 1.681 2.061 2.354 2.611 2.851 3.07 3.274 3.659 3.841 4.016 3.943 4.514 4.671 4.97 5.25 5.515 5.649 5.907 6.143 6.488 6.71 6.925 7.242 7.554 7.853 8.14 8.429 8.809 9.168 9.524 9.96 10.377 10.781 11.261 11.812 12.343 12.941 13.6 14.313 15.081 15.963 17.007 18.047 19.274 20.696 22.374 24.28 26.542 29.283 32.643 35.503 37.164 38.21 38.899 39.31 39.559 39.705 39.775 39.814 39.826 39.811 39.769 39.709 39.635 39.553 39.442 39.337 39.237 39.122 38.999 38.895 38.778 38.648 38.543 38.427 38.301 38.166 38.022 37.92 37.814 37.636 37.505 37.368 37.297 37.154 37.005 36.826 36.732 36.255 36.41 36.301 36.189 35.947 35.805 35.64 35.43 35.183 34.914 34.546 33.107 -10 ,294 ,KEBNE ,16692848,Thu Nov 25 22:52:51 CET,Fri Nov 26 00:29:05 CET,0.0 1.042 1.461 1.762 2.026 2.264 2.476 2.673 3.047 3.226 3.397 3.308 3.865 4.021 4.313 4.574 4.832 4.964 5.224 5.469 5.809 6.032 6.257 6.592 6.91 7.213 7.509 7.794 8.159 8.525 8.896 9.347 9.779 10.194 10.668 11.216 11.754 12.345 13.004 13.712 14.466 15.334 16.342 17.378 18.619 20.005 21.656 23.566 25.847 28.658 32.083 34.902 36.571 37.622 38.299 38.742 39.033 39.19 39.258 39.295 39.292 39.249 39.172 39.081 38.988 38.891 38.776 38.66 38.555 38.453 38.353 38.255 38.138 38.011 37.91 37.803 37.682 37.554 37.411 37.305 37.207 37.054 36.944 36.825 36.76 36.616 36.464 36.3 36.214 35.753 35.931 35.821 35.706 35.48 35.343 35.191 35.023 34.815 34.552 34.175 32.936 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 63105832..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2gg_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2510 ,KEBNE ,16692849,Thu Nov 25 22:52:52 CET,Fri Nov 26 00:29:20 CET,0.0 1.606 2.099 2.488 2.821 3.107 3.374 3.598 3.993 4.187 4.366 4.284 4.863 5.044 5.38 5.684 5.977 6.118 6.384 6.641 7.024 7.273 7.505 7.845 8.187 8.525 8.857 9.177 9.574 9.96 10.339 10.809 11.284 11.743 12.272 12.885 13.473 14.108 14.794 15.532 16.345 17.266 18.348 19.47 20.83 22.371 24.173 26.256 28.747 31.791 35.613 38.93 41.008 42.345 43.225 43.854 44.29 44.603 44.78 44.889 44.949 44.975 44.98 44.965 44.943 44.9 44.816 44.719 44.616 44.487 44.325 44.205 44.1 43.95 43.826 43.711 43.586 43.458 43.311 43.195 43.078 42.9 42.772 42.615 42.523 42.343 42.152 41.933 41.808 41.321 41.371 41.196 41.019 40.629 40.42 40.176 39.902 39.571 39.166 38.652 36.115 -2 ,7199 ,KEBNE ,16692850,Thu Nov 25 22:53:54 CET,Fri Nov 26 00:31:00 CET,0.0 2.178 2.642 3.019 3.337 3.633 3.902 4.14 4.597 4.808 5.015 4.986 5.564 5.742 6.098 6.441 6.751 6.899 7.186 7.444 7.819 8.058 8.285 8.641 8.991 9.316 9.631 9.942 10.349 10.747 11.131 11.6 12.062 12.504 13.009 13.591 14.167 14.794 15.474 16.218 17.032 17.964 19.066 20.199 21.537 23.056 24.841 26.957 29.532 32.65 36.564 39.883 41.85 43.061 43.852 44.431 44.81 45.064 45.24 45.361 45.409 45.438 45.397 45.294 45.208 45.141 45.08 45.003 44.92 44.834 44.731 44.629 44.51 44.37 44.253 44.132 44.012 43.871 43.706 43.594 43.478 43.276 43.138 42.994 42.915 42.757 42.592 42.398 42.272 41.771 41.846 41.698 41.523 41.108 40.866 40.595 40.28 39.928 39.481 38.814 36.939 -3 ,12490 ,KEBNE ,16692851,Thu Nov 25 22:53:54 CET,Fri Nov 26 00:32:19 CET,0.0 1.877 2.394 2.778 3.109 3.404 3.681 3.938 4.368 4.56 4.748 4.694 5.278 5.445 5.772 6.102 6.407 6.545 6.83 7.114 7.5 7.737 7.97 8.316 8.643 8.96 9.282 9.595 9.991 10.385 10.766 11.224 11.687 12.161 12.704 13.283 13.845 14.491 15.196 15.951 16.751 17.667 18.778 19.892 21.211 22.726 24.476 26.565 29.206 32.402 36.35 39.748 41.77 43.039 43.906 44.485 44.844 45.123 45.317 45.427 45.445 45.444 45.411 45.327 45.252 45.189 45.101 45.016 44.939 44.839 44.718 44.606 44.488 44.362 44.261 44.145 44.01 43.859 43.684 43.57 43.46 43.262 43.118 42.98 42.902 42.712 42.521 42.321 42.207 41.713 41.767 41.616 41.451 41.079 40.879 40.641 40.37 40.067 39.706 39.143 37.039 -4 ,17077 ,KEBNE ,16692852,Thu Nov 25 22:54:56 CET,Fri Nov 26 00:29:43 CET,0.0 2.012 2.549 2.916 3.255 3.563 3.83 4.065 4.478 4.679 4.871 4.791 5.353 5.497 5.778 6.055 6.303 6.429 6.686 6.93 7.283 7.507 7.735 8.084 8.435 8.771 9.093 9.417 9.823 10.22 10.618 11.092 11.551 11.995 12.514 13.122 13.707 14.349 15.049 15.803 16.624 17.575 18.687 19.812 21.134 22.646 24.537 26.679 29.199 32.393 36.297 39.526 41.447 42.72 43.604 44.197 44.587 44.816 44.953 45.055 45.096 45.113 45.092 45.053 44.995 44.915 44.795 44.641 44.491 44.34 44.191 44.08 43.968 43.812 43.664 43.514 43.37 43.233 43.07 42.93 42.781 42.552 42.406 42.234 42.139 41.953 41.753 41.524 41.384 40.875 40.936 40.8 40.657 40.31 40.102 39.845 39.557 39.236 38.807 38.236 35.815 -5 ,13971 ,KEBNE ,16692853,Thu Nov 25 22:55:59 CET,Fri Nov 26 00:30:54 CET,0.0 1.919 2.468 2.874 3.203 3.496 3.75 3.978 4.427 4.639 4.828 4.778 5.352 5.509 5.826 6.141 6.437 6.575 6.861 7.143 7.525 7.771 8.014 8.366 8.697 9.015 9.327 9.638 10.039 10.436 10.833 11.311 11.778 12.236 12.777 13.399 13.981 14.604 15.292 16.042 16.848 17.751 18.846 19.996 21.333 22.852 24.661 26.788 29.368 32.502 36.468 39.847 41.833 43.112 43.981 44.583 44.975 45.221 45.387 45.513 45.568 45.583 45.583 45.54 45.437 45.319 45.197 45.095 45.015 44.917 44.805 44.71 44.596 44.464 44.36 44.237 44.083 43.915 43.736 43.615 43.489 43.289 43.155 43.002 42.918 42.737 42.547 42.344 42.24 41.786 41.927 41.785 41.62 41.235 41.017 40.784 40.546 40.278 39.903 39.345 37.054 -6 ,10594 ,KEBNE ,16692854,Thu Nov 25 22:55:59 CET,Fri Nov 26 00:33:43 CET,0.0 1.671 2.175 2.545 2.849 3.139 3.385 3.608 4.033 4.233 4.426 4.357 4.928 5.097 5.409 5.687 5.962 6.103 6.375 6.635 7.01 7.242 7.466 7.792 8.128 8.442 8.74 9.039 9.42 9.791 10.167 10.615 11.059 11.508 12.033 12.623 13.206 13.86 14.563 15.318 16.118 17.035 18.11 19.211 20.53 22.052 23.871 26.0 28.545 31.628 35.556 38.897 40.894 42.184 43.053 43.651 44.02 44.305 44.505 44.615 44.668 44.685 44.659 44.632 44.583 44.504 44.426 44.351 44.276 44.186 44.086 43.988 43.871 43.753 43.659 43.54 43.395 43.232 43.05 42.925 42.788 42.536 42.36 42.199 42.12 41.956 41.756 41.528 41.415 40.945 41.042 40.888 40.711 40.305 40.076 39.821 39.524 39.189 38.802 38.252 36.342 -7 ,24163 ,KEBNE ,16692855,Thu Nov 25 22:55:59 CET,Fri Nov 26 00:32:57 CET,0.0 1.833 2.322 2.723 3.081 3.372 3.619 3.844 4.266 4.473 4.676 4.66 5.247 5.416 5.755 6.068 6.355 6.496 6.78 7.064 7.464 7.717 7.963 8.354 8.745 9.086 9.406 9.727 10.133 10.521 10.902 11.389 11.885 12.35 12.872 13.463 14.036 14.673 15.381 16.147 16.954 17.877 18.99 20.116 21.431 22.98 24.894 27.085 29.653 32.807 36.745 40.022 41.938 43.198 44.049 44.634 45.056 45.346 45.502 45.625 45.689 45.7 45.68 45.618 45.55 45.483 45.354 45.2 45.081 44.949 44.784 44.644 44.489 44.348 44.252 44.134 44.013 43.88 43.706 43.588 43.477 43.285 43.145 43.0 42.915 42.732 42.531 42.296 42.171 41.682 41.76 41.602 41.433 41.095 40.901 40.656 40.346 40.012 39.647 39.112 35.813 -8 ,4700 ,KEBNE ,16692856,Thu Nov 25 22:55:59 CET,Fri Nov 26 00:33:09 CET,0.0 2.382 2.905 3.304 3.605 3.885 4.137 4.355 4.767 4.955 5.147 5.097 5.661 5.819 6.131 6.416 6.688 6.826 7.108 7.376 7.739 7.967 8.191 8.517 8.845 9.169 9.47 9.752 10.118 10.495 10.869 11.326 11.775 12.204 12.715 13.291 13.838 14.46 15.168 15.919 16.706 17.626 18.717 19.826 21.157 22.669 24.452 26.57 29.148 32.237 36.044 39.304 41.251 42.514 43.361 43.946 44.366 44.661 44.846 44.974 45.03 45.061 45.063 45.039 45.008 44.962 44.892 44.802 44.71 44.611 44.477 44.347 44.208 44.055 43.944 43.832 43.706 43.557 43.4 43.293 43.185 43.001 42.861 42.725 42.653 42.501 42.335 42.141 42.042 41.579 41.7 41.576 41.438 41.094 40.902 40.657 40.357 40.046 39.673 39.098 36.291 -9 ,29373 ,KEBNE ,16692857,Thu Nov 25 22:55:59 CET,Fri Nov 26 00:32:30 CET,0.0 1.512 2.025 2.407 2.708 2.987 3.243 3.483 3.927 4.127 4.296 4.224 4.804 4.968 5.275 5.554 5.815 5.945 6.208 6.469 6.838 7.067 7.29 7.616 7.934 8.251 8.566 8.883 9.277 9.659 10.039 10.506 10.972 11.422 11.939 12.521 13.093 13.72 14.393 15.128 15.937 16.874 17.955 19.051 20.361 21.886 23.721 25.84 28.36 31.391 35.305 38.678 40.698 41.972 42.798 43.37 43.781 44.062 44.2 44.299 44.364 44.389 44.374 44.339 44.284 44.205 44.109 44.001 43.905 43.806 43.68 43.58 43.474 43.348 43.254 43.151 43.037 42.916 42.781 42.687 42.584 42.42 42.304 42.177 42.103 41.93 41.712 41.457 41.315 40.82 40.919 40.772 40.619 40.254 40.035 39.785 39.504 39.193 38.728 38.04 35.537 -10 ,15544 ,KEBNE ,16692858,Thu Nov 25 22:55:59 CET,Fri Nov 26 00:33:30 CET,0.0 2.322 2.835 3.216 3.548 3.823 4.074 4.297 4.693 4.901 5.104 5.072 5.655 5.809 6.121 6.434 6.733 6.873 7.129 7.381 7.763 8.011 8.252 8.582 8.897 9.242 9.599 9.93 10.339 10.742 11.131 11.588 12.042 12.488 12.999 13.575 14.136 14.754 15.427 16.163 16.967 17.896 18.996 20.119 21.505 23.065 24.853 26.947 29.452 32.516 36.362 39.636 41.63 42.927 43.771 44.377 44.794 45.081 45.241 45.355 45.414 45.434 45.43 45.403 45.366 45.295 45.213 45.142 45.063 44.966 44.854 44.758 44.638 44.492 44.378 44.272 44.154 44.008 43.852 43.726 43.588 43.362 43.19 43.016 42.927 42.741 42.537 42.303 42.167 41.661 41.713 41.56 41.413 41.048 40.826 40.582 40.284 39.922 39.505 38.951 35.857 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt deleted file mode 100644 index 9e438cb4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2h_p38a-2c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18289 ,KEBNE ,16692859,Thu Nov 25 22:55:59 CET,Fri Nov 26 00:32:17 CET,0.0 1.77 2.413 2.911 3.307 3.644 3.957 4.238 4.742 4.979 5.187 5.176 5.748 5.924 6.247 6.531 6.813 6.953 7.22 7.473 7.835 8.051 8.251 8.542 8.808 9.067 9.312 9.54 9.842 10.128 10.401 10.732 11.05 11.35 11.682 12.052 12.407 12.784 13.198 13.633 14.065 14.558 15.143 15.735 16.379 17.073 17.909 18.814 19.822 20.9 21.977 22.734 22.955 22.95 22.881 22.737 22.56 22.38 22.209 21.993 21.774 21.572 21.364 21.161 20.961 20.774 20.573 20.39 20.242 20.078 19.882 19.717 19.555 19.384 19.252 19.13 19.006 18.87 18.719 18.606 18.492 18.33 18.219 18.082 18.007 17.863 17.715 17.533 17.427 16.938 17.11 17.001 16.87 16.563 16.411 16.23 16.036 15.847 15.582 15.163 13.278 -2 ,26120 ,KEBNE ,16692860,Thu Nov 25 22:55:59 CET,Fri Nov 26 00:32:49 CET,0.0 1.813 2.534 3.076 3.484 3.845 4.169 4.469 4.993 5.221 5.439 5.467 6.053 6.245 6.604 6.93 7.241 7.39 7.663 7.919 8.282 8.517 8.747 9.054 9.343 9.642 9.915 10.166 10.486 10.776 11.074 11.44 11.772 12.099 12.479 12.88 13.249 13.645 14.082 14.551 15.025 15.522 16.094 16.69 17.364 18.124 18.979 19.91 20.918 22.018 23.299 24.123 24.392 24.421 24.321 24.157 23.95 23.738 23.541 23.315 23.088 22.879 22.712 22.544 22.336 22.144 21.95 21.761 21.602 21.424 21.239 21.097 20.944 20.78 20.643 20.492 20.337 20.175 20.017 19.9 19.773 19.609 19.495 19.362 19.293 19.147 18.98 18.788 18.694 18.222 18.421 18.312 18.186 17.924 17.791 17.62 17.417 17.194 16.928 16.518 14.155 -3 ,25457 ,KEBNE ,16692861,Thu Nov 25 22:57:01 CET,Fri Nov 26 00:33:20 CET,0.0 2.089 2.75 3.227 3.643 3.993 4.296 4.579 5.09 5.307 5.517 5.532 6.112 6.291 6.618 6.921 7.213 7.349 7.61 7.873 8.236 8.463 8.684 9.003 9.3 9.578 9.85 10.111 10.45 10.761 11.04 11.381 11.705 11.992 12.326 12.701 13.06 13.455 13.879 14.337 14.802 15.307 15.898 16.496 17.195 17.96 18.811 19.72 20.767 21.974 23.253 23.991 24.225 24.222 24.107 23.951 23.764 23.565 23.368 23.139 22.93 22.717 22.509 22.334 22.163 21.988 21.792 21.613 21.442 21.263 21.083 20.924 20.763 20.597 20.458 20.308 20.148 19.969 19.783 19.661 19.547 19.345 19.193 19.048 18.972 18.822 18.668 18.5 18.407 17.917 18.067 17.958 17.843 17.584 17.448 17.289 17.11 16.911 16.661 16.263 13.498 -4 ,12292 ,KEBNE ,16692862,Thu Nov 25 22:57:01 CET,Fri Nov 26 00:32:03 CET,0.0 1.613 2.27 2.731 3.089 3.405 3.716 4.02 4.535 4.762 4.997 5.047 5.636 5.82 6.166 6.494 6.792 6.929 7.206 7.472 7.84 8.072 8.281 8.575 8.865 9.158 9.442 9.701 10.025 10.324 10.606 10.944 11.265 11.565 11.908 12.281 12.644 13.055 13.485 13.927 14.416 14.975 15.552 16.106 16.787 17.584 18.473 19.396 20.422 21.51 22.632 23.283 23.481 23.472 23.358 23.227 23.034 22.807 22.603 22.397 22.2 22.008 21.828 21.627 21.406 21.21 21.015 20.818 20.647 20.47 20.279 20.121 19.974 19.827 19.701 19.571 19.428 19.28 19.123 19.004 18.877 18.715 18.601 18.45 18.371 18.226 18.077 17.901 17.813 17.342 17.521 17.416 17.305 17.032 16.885 16.731 16.559 16.372 16.101 15.699 13.416 -5 ,17282 ,KEBNE ,16692863,Thu Nov 25 22:57:02 CET,Fri Nov 26 00:33:07 CET,0.0 1.647 2.308 2.849 3.243 3.57 3.887 4.168 4.652 4.886 5.108 5.108 5.685 5.854 6.164 6.473 6.766 6.895 7.142 7.401 7.752 7.956 8.159 8.464 8.752 9.008 9.254 9.487 9.795 10.103 10.389 10.717 11.032 11.341 11.686 12.061 12.405 12.792 13.242 13.686 14.114 14.624 15.207 15.797 16.517 17.265 18.115 19.074 20.068 21.196 22.463 23.268 23.587 23.612 23.48 23.295 23.111 22.931 22.741 22.526 22.33 22.156 21.982 21.794 21.606 21.425 21.229 21.057 20.889 20.718 20.55 20.407 20.273 20.134 20.012 19.882 19.744 19.595 19.448 19.342 19.235 19.061 18.946 18.833 18.774 18.645 18.494 18.323 18.228 17.742 17.903 17.783 17.657 17.354 17.193 17.041 16.847 16.61 16.316 15.887 13.523 -6 ,25423 ,KEBNE ,16692864,Thu Nov 25 22:57:02 CET,Fri Nov 26 00:35:22 CET,0.0 1.655 2.279 2.807 3.241 3.608 3.927 4.203 4.71 4.942 5.167 5.196 5.771 5.955 6.307 6.612 6.874 7.003 7.269 7.518 7.874 8.106 8.326 8.635 8.923 9.202 9.478 9.734 10.055 10.385 10.702 11.048 11.378 11.702 12.05 12.428 12.805 13.216 13.634 14.085 14.568 15.077 15.713 16.357 17.058 17.864 18.817 19.811 20.873 21.994 23.191 24.027 24.36 24.416 24.336 24.147 23.929 23.757 23.589 23.356 23.111 22.902 22.702 22.497 22.299 22.122 21.945 21.794 21.649 21.476 21.283 21.121 20.961 20.777 20.621 20.474 20.335 20.184 20.021 19.911 19.8 19.622 19.495 19.361 19.288 19.125 18.946 18.739 18.623 18.123 18.271 18.136 17.978 17.685 17.522 17.328 17.137 16.919 16.557 16.074 5.625 -7 ,14692 ,KEBNE ,16692865,Thu Nov 25 22:57:02 CET,Fri Nov 26 00:33:17 CET,0.0 1.199 1.816 2.315 2.731 3.085 3.411 3.712 4.218 4.446 4.67 4.647 5.193 5.359 5.694 6.006 6.284 6.419 6.699 6.961 7.34 7.572 7.777 8.081 8.386 8.67 8.935 9.191 9.525 9.837 10.128 10.473 10.793 11.102 11.475 11.913 12.317 12.733 13.182 13.623 14.067 14.574 15.179 15.771 16.41 17.103 17.908 18.818 19.869 21.022 22.18 22.966 23.181 23.128 23.021 22.866 22.673 22.464 22.286 22.072 21.843 21.619 21.401 21.205 21.006 20.829 20.631 20.439 20.285 20.12 19.936 19.777 19.614 19.439 19.303 19.153 19.0 18.857 18.699 18.582 18.462 18.281 18.15 18.012 17.945 17.792 17.599 17.358 17.235 16.751 16.913 16.781 16.645 16.385 16.215 16.02 15.822 15.611 15.335 14.886 6.736 -8 ,19365 ,KEBNE ,16692866,Thu Nov 25 22:57:01 CET,Fri Nov 26 00:33:48 CET,0.0 1.702 2.276 2.709 3.073 3.423 3.733 4.009 4.492 4.71 4.928 4.95 5.533 5.714 6.06 6.385 6.68 6.813 7.071 7.328 7.681 7.892 8.104 8.41 8.695 8.977 9.248 9.497 9.819 10.132 10.422 10.768 11.088 11.387 11.743 12.147 12.526 12.92 13.344 13.803 14.283 14.812 15.429 16.036 16.701 17.434 18.252 19.16 20.198 21.285 22.394 23.102 23.347 23.387 23.291 23.107 22.921 22.693 22.454 22.23 22.01 21.804 21.601 21.38 21.189 21.032 20.847 20.678 20.523 20.353 20.178 20.024 19.857 19.691 19.572 19.444 19.304 19.156 18.99 18.864 18.744 18.551 18.409 18.271 18.201 18.065 17.919 17.743 17.644 17.162 17.35 17.253 17.155 16.936 16.786 16.626 16.466 16.233 15.921 15.431 11.489 -9 ,24871 ,KEBNE ,16692867,Thu Nov 25 22:57:02 CET,Fri Nov 26 00:32:33 CET,0.0 2.293 3.08 3.647 4.134 4.508 4.805 5.068 5.514 5.722 5.924 5.915 6.475 6.637 6.956 7.258 7.541 7.676 7.936 8.186 8.547 8.773 8.983 9.276 9.543 9.811 10.069 10.304 10.619 10.923 11.224 11.576 11.899 12.202 12.541 12.918 13.288 13.692 14.119 14.554 15.0 15.506 16.099 16.696 17.394 18.135 18.894 19.699 20.702 21.878 23.118 23.936 24.162 24.122 24.028 23.911 23.726 23.518 23.345 23.143 22.92 22.699 22.487 22.279 22.089 21.916 21.722 21.547 21.399 21.24 21.046 20.863 20.678 20.505 20.36 20.214 20.084 19.938 19.767 19.644 19.51 19.286 19.121 18.944 18.854 18.664 18.465 18.267 18.177 17.709 17.894 17.782 17.66 17.383 17.224 17.068 16.896 16.688 16.401 16.036 13.512 -10 ,25463 ,KEBNE ,16692868,Thu Nov 25 22:57:02 CET,Fri Nov 26 00:33:06 CET,0.0 1.766 2.379 2.799 3.173 3.506 3.801 4.063 4.534 4.758 4.969 4.958 5.528 5.703 6.007 6.273 6.519 6.643 6.903 7.156 7.51 7.726 7.923 8.209 8.502 8.794 9.061 9.308 9.631 9.937 10.222 10.567 10.916 11.245 11.62 12.035 12.391 12.756 13.151 13.575 14.025 14.534 15.112 15.667 16.273 16.943 17.744 18.605 19.571 20.667 21.832 22.576 22.809 22.793 22.685 22.554 22.392 22.181 21.99 21.763 21.507 21.281 21.065 20.852 20.649 20.464 20.275 20.09 19.939 19.783 19.61 19.467 19.31 19.146 19.009 18.877 18.75 18.613 18.477 18.373 18.264 18.081 17.949 17.818 17.747 17.59 17.431 17.262 17.169 16.687 16.844 16.726 16.594 16.298 16.134 15.963 15.764 15.508 15.199 14.757 5.09 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt deleted file mode 100644 index edc06121..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2i_p38a-2h.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2372 ,KEBNE ,16692869,Thu Nov 25 22:57:01 CET,Fri Nov 26 00:34:24 CET,0.0 0.431 0.581 0.683 0.775 0.858 0.929 1.01 1.149 1.206 1.262 0.989 1.409 1.452 1.53 1.593 1.651 1.684 1.751 1.805 1.87 1.918 1.965 2.034 2.099 2.165 2.237 2.307 2.391 2.463 2.531 2.614 2.696 2.773 2.867 2.966 3.032 3.095 3.145 3.195 3.26 3.316 3.346 3.354 3.33 3.252 3.097 2.848 2.44 1.736 0.427 -1.192 -2.532 -3.691 -4.664 -5.496 -6.205 -6.861 -7.418 -7.962 -8.447 -8.867 -9.248 -9.602 -9.924 -10.207 -10.504 -10.774 -11.001 -11.239 -11.491 -11.711 -11.929 -12.138 -12.309 -12.489 -12.67 -12.843 -13.01 -13.12 -13.228 -13.404 -13.524 -13.646 -13.708 -13.839 -13.976 -14.113 -14.183 -14.651 -14.427 -14.508 -14.587 -14.771 -14.865 -14.958 -15.076 -15.219 -15.37 -15.509 -15.738 -2 ,16980 ,KEBNE ,16692870,Thu Nov 25 22:58:05 CET,Fri Nov 26 00:35:07 CET,0.0 0.241 0.387 0.484 0.585 0.68 0.771 0.85 0.978 1.034 1.104 0.88 1.318 1.377 1.481 1.586 1.69 1.742 1.836 1.916 2.03 2.1 2.158 2.248 2.338 2.413 2.482 2.548 2.643 2.737 2.816 2.895 2.969 3.049 3.133 3.212 3.274 3.337 3.395 3.45 3.501 3.528 3.536 3.53 3.506 3.448 3.292 3.001 2.53 1.766 0.445 -1.261 -2.649 -3.797 -4.803 -5.669 -6.411 -7.049 -7.601 -8.145 -8.582 -8.967 -9.343 -9.7 -10.027 -10.319 -10.621 -10.897 -11.129 -11.374 -11.624 -11.824 -12.036 -12.244 -12.404 -12.576 -12.752 -12.924 -13.105 -13.237 -13.364 -13.57 -13.715 -13.86 -13.938 -14.096 -14.247 -14.396 -14.47 -14.93 -14.685 -14.773 -14.862 -15.037 -15.13 -15.234 -15.346 -15.464 -15.59 -15.733 -15.934 -3 ,12792 ,KEBNE ,16692871,Thu Nov 25 22:58:09 CET,Fri Nov 26 00:34:54 CET,0.0 0.387 0.54 0.648 0.742 0.825 0.9 0.964 1.069 1.128 1.191 0.932 1.355 1.396 1.482 1.564 1.646 1.693 1.79 1.875 1.983 2.054 2.129 2.24 2.337 2.418 2.497 2.569 2.66 2.745 2.818 2.906 2.989 3.051 3.107 3.163 3.217 3.295 3.389 3.475 3.539 3.595 3.628 3.617 3.587 3.509 3.341 3.082 2.669 1.929 0.555 -1.14 -2.532 -3.67 -4.657 -5.584 -6.363 -7.011 -7.564 -8.103 -8.551 -8.957 -9.342 -9.691 -10.013 -10.303 -10.595 -10.858 -11.087 -11.321 -11.562 -11.76 -11.961 -12.171 -12.34 -12.514 -12.686 -12.865 -13.061 -13.193 -13.327 -13.537 -13.682 -13.826 -13.903 -14.077 -14.24 -14.39 -14.465 -14.933 -14.702 -14.777 -14.851 -15.023 -15.115 -15.203 -15.294 -15.405 -15.534 -15.66 -15.776 -4 ,13930 ,KEBNE ,16692872,Thu Nov 25 22:58:04 CET,Fri Nov 26 00:32:56 CET,0.0 0.692 0.885 1.011 1.132 1.231 1.315 1.403 1.634 1.752 1.86 1.699 2.16 2.242 2.371 2.466 2.55 2.59 2.676 2.762 2.888 2.967 3.035 3.131 3.221 3.311 3.395 3.464 3.55 3.616 3.68 3.769 3.835 3.898 3.973 4.036 4.104 4.189 4.263 4.318 4.353 4.391 4.424 4.414 4.394 4.334 4.178 3.93 3.535 2.839 1.483 -0.175 -1.502 -2.635 -3.598 -4.429 -5.131 -5.754 -6.294 -6.843 -7.332 -7.749 -8.124 -8.475 -8.81 -9.114 -9.427 -9.698 -9.919 -10.157 -10.427 -10.657 -10.875 -11.094 -11.275 -11.461 -11.65 -11.832 -12.006 -12.121 -12.235 -12.409 -12.527 -12.648 -12.713 -12.845 -12.971 -13.099 -13.167 -13.635 -13.402 -13.484 -13.561 -13.721 -13.815 -13.915 -14.012 -14.113 -14.23 -14.375 -14.697 -5 ,26058 ,KEBNE ,16692873,Thu Nov 25 22:58:05 CET,Fri Nov 26 00:38:31 CET,0.0 0.623 0.917 1.119 1.295 1.435 1.538 1.629 1.812 1.899 1.968 1.716 2.151 2.214 2.335 2.441 2.542 2.591 2.69 2.779 2.894 2.959 3.015 3.107 3.203 3.302 3.396 3.48 3.581 3.663 3.726 3.796 3.868 3.939 4.015 4.088 4.151 4.214 4.283 4.36 4.424 4.467 4.51 4.522 4.495 4.43 4.254 3.967 3.539 2.81 1.507 -0.125 -1.518 -2.678 -3.642 -4.51 -5.262 -5.905 -6.439 -6.988 -7.468 -7.902 -8.308 -8.666 -8.995 -9.293 -9.583 -9.838 -10.07 -10.32 -10.575 -10.78 -10.993 -11.209 -11.383 -11.561 -11.74 -11.92 -12.106 -12.237 -12.371 -12.579 -12.72 -12.864 -12.942 -13.098 -13.251 -13.418 -13.502 -13.977 -13.736 -13.817 -13.904 -14.079 -14.18 -14.296 -14.41 -14.527 -14.65 -14.802 -15.118 -6 ,27192 ,KEBNE ,16692874,Thu Nov 25 22:58:05 CET,Fri Nov 26 00:36:57 CET,0.0 0.328 0.47 0.57 0.643 0.722 0.799 0.872 0.997 1.052 1.106 0.829 1.252 1.296 1.383 1.465 1.527 1.552 1.61 1.672 1.767 1.835 1.913 2.016 2.096 2.167 2.237 2.308 2.398 2.475 2.539 2.617 2.683 2.736 2.799 2.878 2.954 3.021 3.088 3.133 3.147 3.162 3.175 3.163 3.163 3.149 3.02 2.771 2.338 1.614 0.335 -1.299 -2.67 -3.786 -4.731 -5.589 -6.314 -6.926 -7.453 -7.996 -8.449 -8.843 -9.214 -9.561 -9.897 -10.192 -10.481 -10.734 -10.956 -11.191 -11.443 -11.646 -11.843 -12.043 -12.188 -12.327 -12.469 -12.614 -12.772 -12.882 -12.994 -13.172 -13.294 -13.408 -13.466 -13.602 -13.749 -13.887 -13.953 -14.419 -14.176 -14.252 -14.331 -14.513 -14.607 -14.701 -14.794 -14.892 -15.009 -15.144 -15.327 -7 ,20062 ,KEBNE ,16692875,Thu Nov 25 22:58:05 CET,Fri Nov 26 00:37:49 CET,0.0 0.468 0.643 0.779 0.887 0.979 1.065 1.152 1.321 1.398 1.465 1.213 1.635 1.673 1.761 1.849 1.927 1.962 2.023 2.079 2.155 2.2 2.252 2.334 2.404 2.467 2.526 2.57 2.621 2.682 2.745 2.819 2.888 2.954 3.023 3.097 3.172 3.25 3.309 3.349 3.381 3.432 3.449 3.418 3.382 3.322 3.155 2.845 2.39 1.626 0.305 -1.327 -2.661 -3.775 -4.754 -5.635 -6.358 -7.006 -7.565 -8.109 -8.586 -8.997 -9.379 -9.739 -10.073 -10.376 -10.7 -11.0 -11.24 -11.473 -11.712 -11.909 -12.102 -12.296 -12.455 -12.622 -12.793 -12.969 -13.152 -13.285 -13.428 -13.638 -13.78 -13.936 -14.017 -14.179 -14.351 -14.529 -14.617 -15.097 -14.91 -15.018 -15.123 -15.344 -15.46 -15.592 -15.731 -15.886 -16.09 -16.331 -16.827 -8 ,27340 ,KEBNE ,16692876,Thu Nov 25 22:58:05 CET,Fri Nov 26 00:35:22 CET,0.0 0.243 0.371 0.492 0.603 0.69 0.765 0.832 0.964 1.029 1.094 0.837 1.264 1.306 1.383 1.46 1.533 1.567 1.635 1.703 1.815 1.898 1.974 2.066 2.149 2.228 2.302 2.371 2.459 2.547 2.631 2.732 2.811 2.871 2.95 3.033 3.099 3.16 3.224 3.288 3.339 3.378 3.407 3.417 3.389 3.306 3.135 2.873 2.459 1.713 0.33 -1.331 -2.679 -3.827 -4.809 -5.671 -6.428 -7.086 -7.642 -8.209 -8.686 -9.097 -9.481 -9.837 -10.161 -10.438 -10.716 -10.97 -11.184 -11.41 -11.644 -11.834 -12.021 -12.215 -12.358 -12.507 -12.669 -12.823 -12.975 -13.086 -13.199 -13.367 -13.486 -13.611 -13.675 -13.809 -13.943 -14.077 -14.148 -14.618 -14.374 -14.448 -14.53 -14.709 -14.802 -14.897 -14.995 -15.106 -15.227 -15.347 -15.528 -9 ,7910 ,KEBNE ,16692877,Thu Nov 25 23:00:10 CET,Fri Nov 26 00:41:54 CET,0.0 0.299 0.462 0.594 0.717 0.812 0.88 0.942 1.064 1.127 1.185 0.916 1.337 1.375 1.451 1.521 1.584 1.613 1.673 1.73 1.811 1.865 1.914 1.995 2.064 2.122 2.193 2.263 2.338 2.41 2.478 2.556 2.617 2.668 2.735 2.813 2.873 2.948 3.042 3.122 3.19 3.253 3.281 3.285 3.266 3.187 3.027 2.765 2.316 1.553 0.2 -1.508 -2.884 -4.037 -5.038 -5.914 -6.654 -7.306 -7.866 -8.429 -8.916 -9.345 -9.749 -10.109 -10.442 -10.743 -11.048 -11.308 -11.518 -11.735 -11.96 -12.143 -12.329 -12.518 -12.666 -12.813 -12.954 -13.106 -13.266 -13.381 -13.492 -13.658 -13.774 -13.887 -13.948 -14.085 -14.223 -14.364 -14.432 -14.893 -14.655 -14.741 -14.822 -14.985 -15.083 -15.177 -15.281 -15.406 -15.533 -15.682 -15.947 -10 ,12837 ,KEBNE ,16692878,Thu Nov 25 23:03:23 CET,Fri Nov 26 00:34:28 CET,0.0 0.341 0.456 0.586 0.701 0.776 0.856 0.938 1.081 1.145 1.204 0.932 1.361 1.408 1.485 1.562 1.637 1.672 1.737 1.796 1.882 1.937 1.989 2.061 2.13 2.191 2.248 2.306 2.369 2.428 2.488 2.546 2.62 2.706 2.79 2.876 2.956 3.037 3.098 3.147 3.195 3.231 3.248 3.239 3.198 3.118 2.973 2.724 2.296 1.589 0.315 -1.377 -2.79 -3.982 -4.974 -5.827 -6.58 -7.236 -7.789 -8.347 -8.816 -9.208 -9.59 -9.962 -10.287 -10.577 -10.872 -11.131 -11.361 -11.612 -11.874 -12.082 -12.305 -12.534 -12.708 -12.883 -13.054 -13.233 -13.413 -13.54 -13.674 -13.881 -14.028 -14.168 -14.23 -14.361 -14.494 -14.62 -14.689 -15.155 -14.914 -14.993 -15.073 -15.266 -15.366 -15.46 -15.564 -15.675 -15.799 -15.944 -16.142 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt deleted file mode 100644 index 04c64e95..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2j_p38a-2i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32133 ,KEBNE ,16692879,Thu Nov 25 23:11:43 CET,Fri Nov 26 00:44:05 CET,0.0 0.295 0.419 0.529 0.644 0.75 0.838 0.923 1.081 1.149 1.215 0.967 1.425 1.495 1.627 1.752 1.883 1.957 2.104 2.234 2.417 2.539 2.668 2.857 3.024 3.174 3.327 3.485 3.688 3.872 4.054 4.287 4.496 4.702 4.952 5.224 5.485 5.764 6.061 6.397 6.77 7.186 7.672 8.154 8.69 9.308 10.069 10.93 11.905 13.003 14.313 15.383 15.935 16.212 16.351 16.389 16.357 16.296 16.231 16.162 16.087 15.981 15.863 15.764 15.681 15.596 15.491 15.39 15.298 15.202 15.091 14.99 14.886 14.781 14.705 14.634 14.57 14.502 14.425 14.369 14.313 14.225 14.155 14.084 14.051 13.984 13.906 13.814 13.763 13.342 13.629 13.583 13.535 13.433 13.374 13.298 13.219 13.126 13.021 12.892 12.636 -2 ,27572 ,KEBNE ,16692880,Thu Nov 25 23:13:49 CET,Fri Nov 26 00:48:05 CET,0.0 0.286 0.472 0.608 0.735 0.882 1.013 1.109 1.294 1.383 1.485 1.294 1.763 1.847 2.009 2.166 2.306 2.37 2.506 2.637 2.826 2.948 3.071 3.252 3.419 3.577 3.733 3.885 4.074 4.247 4.422 4.641 4.85 5.062 5.318 5.605 5.877 6.172 6.497 6.846 7.227 7.68 8.188 8.68 9.249 9.896 10.648 11.495 12.476 13.6 14.974 16.014 16.521 16.79 16.911 16.936 16.921 16.867 16.794 16.701 16.6 16.502 16.41 16.326 16.237 16.14 16.031 15.937 15.839 15.728 15.616 15.527 15.438 15.34 15.259 15.168 15.064 14.954 14.842 14.772 14.699 14.588 14.516 14.44 14.397 14.307 14.222 14.145 14.103 13.685 13.973 13.924 13.874 13.755 13.675 13.598 13.53 13.449 13.346 13.19 13.005 -3 ,5283 ,KEBNE ,16692881,Thu Nov 25 23:16:53 CET,Fri Nov 26 00:52:12 CET,0.0 0.215 0.347 0.466 0.575 0.691 0.803 0.895 1.054 1.13 1.204 0.952 1.408 1.477 1.631 1.791 1.944 2.013 2.134 2.261 2.452 2.574 2.688 2.86 3.038 3.197 3.342 3.484 3.669 3.865 4.059 4.278 4.494 4.718 4.961 5.234 5.51 5.809 6.127 6.469 6.85 7.274 7.754 8.236 8.797 9.42 10.155 11.036 12.076 13.267 14.672 15.718 16.183 16.385 16.491 16.519 16.499 16.439 16.352 16.224 16.116 16.036 15.933 15.817 15.717 15.632 15.533 15.42 15.315 15.221 15.12 15.029 14.934 14.829 14.747 14.665 14.583 14.491 14.389 14.325 14.258 14.143 14.066 13.993 13.953 13.869 13.776 13.683 13.641 13.224 13.493 13.429 13.37 13.224 13.141 13.071 12.998 12.897 12.782 12.655 12.419 -4 ,10719 ,KEBNE ,16692882,Thu Nov 25 23:16:53 CET,Fri Nov 26 00:52:50 CET,0.0 0.572 0.802 0.988 1.168 1.335 1.472 1.603 1.84 1.938 2.029 1.823 2.306 2.401 2.562 2.706 2.842 2.91 3.048 3.185 3.367 3.476 3.582 3.75 3.912 4.056 4.197 4.353 4.556 4.746 4.934 5.158 5.373 5.583 5.825 6.09 6.356 6.646 6.955 7.308 7.683 8.079 8.548 9.048 9.656 10.325 11.067 11.911 12.867 13.973 15.354 16.414 16.945 17.202 17.289 17.312 17.303 17.262 17.204 17.135 17.045 16.94 16.833 16.734 16.64 16.553 16.445 16.331 16.221 16.126 16.04 15.953 15.856 15.74 15.642 15.533 15.417 15.299 15.183 15.111 15.042 14.944 14.886 14.826 14.795 14.726 14.654 14.564 14.511 14.09 14.35 14.288 14.235 14.125 14.053 13.971 13.889 13.808 13.713 13.611 13.509 -5 ,12704 ,KEBNE ,16692883,Thu Nov 25 23:16:53 CET,Fri Nov 26 00:53:28 CET,0.0 0.24 0.378 0.49 0.59 0.67 0.754 0.841 1.006 1.087 1.161 0.898 1.354 1.418 1.543 1.664 1.778 1.834 1.942 2.043 2.198 2.298 2.392 2.53 2.667 2.799 2.939 3.083 3.276 3.475 3.668 3.904 4.124 4.333 4.587 4.878 5.158 5.467 5.799 6.144 6.504 6.907 7.36 7.833 8.416 9.046 9.767 10.618 11.624 12.778 14.111 15.1 15.586 15.824 15.933 15.98 15.977 15.934 15.874 15.807 15.74 15.661 15.568 15.471 15.373 15.277 15.178 15.082 14.996 14.907 14.799 14.714 14.633 14.54 14.451 14.347 14.242 14.14 14.036 13.967 13.906 13.823 13.764 13.694 13.656 13.583 13.51 13.418 13.366 12.936 13.199 13.153 13.106 12.985 12.925 12.857 12.775 12.703 12.616 12.497 12.203 -6 ,26820 ,KEBNE ,16692884,Thu Nov 25 23:18:57 CET,Fri Nov 26 00:54:12 CET,0.0 0.206 0.343 0.475 0.613 0.725 0.826 0.92 1.075 1.153 1.232 0.99 1.45 1.521 1.657 1.789 1.924 1.985 2.105 2.222 2.386 2.498 2.602 2.749 2.898 3.042 3.18 3.327 3.534 3.735 3.932 4.164 4.38 4.58 4.824 5.113 5.378 5.664 5.982 6.316 6.664 7.057 7.526 8.018 8.593 9.233 9.974 10.794 11.76 12.917 14.231 15.212 15.684 15.943 16.095 16.153 16.14 16.095 16.03 15.923 15.821 15.746 15.668 15.593 15.506 15.403 15.296 15.206 15.118 15.017 14.902 14.804 14.705 14.606 14.533 14.446 14.358 14.267 14.164 14.086 14.009 13.888 13.796 13.701 13.651 13.545 13.417 13.278 13.221 12.799 13.056 12.985 12.918 12.799 12.715 12.625 12.549 12.466 12.342 12.174 11.963 -7 ,3978 ,KEBNE ,16692885,Thu Nov 25 23:18:57 CET,Fri Nov 26 00:54:25 CET,0.0 0.234 0.376 0.505 0.623 0.751 0.887 1.011 1.23 1.335 1.438 1.24 1.717 1.799 1.964 2.138 2.284 2.35 2.478 2.601 2.805 2.936 3.057 3.226 3.38 3.53 3.682 3.84 4.045 4.238 4.423 4.636 4.851 5.067 5.304 5.58 5.844 6.13 6.456 6.812 7.181 7.601 8.09 8.575 9.139 9.781 10.523 11.367 12.378 13.521 14.843 15.839 16.321 16.549 16.631 16.677 16.69 16.644 16.553 16.437 16.327 16.227 16.126 16.016 15.907 15.807 15.707 15.611 15.521 15.428 15.329 15.244 15.144 15.041 14.966 14.883 14.785 14.685 14.592 14.515 14.429 14.309 14.237 14.172 14.137 14.059 13.979 13.888 13.847 13.434 13.71 13.657 13.598 13.463 13.386 13.306 13.224 13.134 13.044 12.929 12.489 -8 ,20161 ,KEBNE ,16692887,Thu Nov 25 23:20:00 CET,Fri Nov 26 00:55:55 CET,0.0 0.254 0.408 0.548 0.657 0.761 0.853 0.937 1.115 1.193 1.269 1.023 1.475 1.539 1.679 1.812 1.931 1.987 2.091 2.201 2.376 2.5 2.62 2.776 2.928 3.079 3.229 3.381 3.581 3.773 3.955 4.17 4.38 4.595 4.85 5.136 5.407 5.702 6.016 6.364 6.73 7.139 7.642 8.141 8.713 9.358 10.116 10.968 11.944 13.115 14.472 15.476 16.001 16.275 16.411 16.47 16.456 16.433 16.38 16.289 16.206 16.118 16.036 15.948 15.848 15.744 15.613 15.504 15.418 15.319 15.216 15.133 15.036 14.924 14.847 14.767 14.661 14.527 14.396 14.327 14.267 14.18 14.114 14.039 14.0 13.916 13.841 13.763 13.722 13.303 13.58 13.532 13.479 13.362 13.291 13.214 13.14 13.051 12.938 12.76 12.445 -9 ,10057 ,KEBNE ,16692888,Thu Nov 25 23:20:00 CET,Fri Nov 26 00:55:27 CET,0.0 0.436 0.635 0.816 0.98 1.125 1.251 1.368 1.585 1.678 1.775 1.587 2.071 2.167 2.34 2.486 2.614 2.681 2.817 2.951 3.143 3.266 3.387 3.562 3.74 3.919 4.092 4.254 4.456 4.65 4.835 5.051 5.259 5.463 5.712 5.996 6.26 6.553 6.875 7.219 7.582 8.005 8.515 9.026 9.623 10.269 10.999 11.806 12.742 13.87 15.188 16.207 16.7 16.964 17.096 17.125 17.096 17.062 17.015 16.931 16.841 16.746 16.652 16.548 16.444 16.344 16.227 16.113 16.012 15.92 15.819 15.743 15.676 15.588 15.519 15.458 15.389 15.316 15.237 15.183 15.133 15.051 14.981 14.903 14.866 14.785 14.703 14.625 14.585 14.159 14.425 14.369 14.307 14.188 14.12 14.045 13.967 13.88 13.799 13.695 13.504 -10 ,10716 ,KEBNE ,16692889,Thu Nov 25 23:20:00 CET,Fri Nov 26 00:55:06 CET,0.0 0.168 0.299 0.413 0.507 0.588 0.663 0.737 0.887 0.96 1.031 0.777 1.226 1.29 1.439 1.581 1.702 1.765 1.903 2.04 2.233 2.359 2.477 2.646 2.812 2.976 3.143 3.3 3.51 3.716 3.904 4.121 4.324 4.532 4.769 5.037 5.308 5.597 5.918 6.281 6.651 7.046 7.499 7.966 8.53 9.184 9.944 10.775 11.744 12.878 14.178 15.187 15.712 15.964 16.051 16.088 16.086 16.029 15.944 15.854 15.777 15.69 15.58 15.464 15.353 15.245 15.142 15.047 14.942 14.832 14.721 14.635 14.544 14.443 14.363 14.275 14.191 14.107 14.014 13.94 13.861 13.728 13.628 13.529 13.477 13.358 13.234 13.116 13.06 12.62 12.842 12.767 12.685 12.523 12.436 12.347 12.273 12.196 12.064 11.918 11.622 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index cf573443..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2l_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4869 ,KEBNE ,16692890,Thu Nov 25 23:20:00 CET,Fri Nov 26 00:55:17 CET,0.0 1.792 2.267 2.56 2.784 2.988 3.167 3.34 3.654 3.79 3.915 3.786 4.267 4.368 4.568 4.756 4.942 5.036 5.224 5.407 5.665 5.831 5.995 6.219 6.423 6.626 6.825 7.014 7.259 7.498 7.719 7.984 8.248 8.501 8.788 9.094 9.39 9.717 10.075 10.445 10.823 11.251 11.757 12.265 12.85 13.504 14.209 14.982 15.866 16.822 17.862 18.502 18.66 18.597 18.425 18.214 17.996 17.774 17.561 17.322 17.083 16.858 16.634 16.402 16.161 15.93 15.697 15.485 15.286 15.062 14.846 14.671 14.475 14.258 14.086 13.903 13.712 13.511 13.298 13.151 12.994 12.739 12.545 12.343 12.236 11.988 11.712 11.445 11.321 10.826 10.874 10.703 10.52 10.121 9.904 9.648 9.339 8.985 8.588 7.957 5.157 -2 ,29117 ,KEBNE ,16692891,Thu Nov 25 23:21:03 CET,Fri Nov 26 00:56:48 CET,0.0 1.68 2.073 2.416 2.683 2.897 3.1 3.296 3.649 3.782 3.911 3.804 4.288 4.408 4.633 4.821 5.007 5.096 5.268 5.452 5.711 5.858 6.004 6.233 6.447 6.637 6.829 7.027 7.274 7.506 7.736 8.0 8.249 8.492 8.772 9.092 9.403 9.731 10.077 10.464 10.869 11.321 11.858 12.365 12.928 13.566 14.273 15.048 15.923 16.895 17.906 18.492 18.639 18.568 18.406 18.18 17.919 17.653 17.417 17.167 16.912 16.675 16.445 16.213 15.98 15.753 15.533 15.341 15.168 14.961 14.717 14.512 14.283 14.044 13.875 13.693 13.474 13.256 13.05 12.902 12.748 12.505 12.308 12.091 11.984 11.768 11.512 11.217 11.071 10.558 10.592 10.43 10.259 9.876 9.654 9.381 9.075 8.701 8.216 7.539 4.521 -3 ,16655 ,KEBNE ,16692892,Thu Nov 25 23:21:03 CET,Fri Nov 26 00:57:03 CET,0.0 2.039 2.46 2.769 3.031 3.269 3.468 3.64 3.966 4.133 4.29 4.186 4.669 4.774 4.973 5.162 5.359 5.45 5.624 5.798 6.032 6.194 6.352 6.56 6.765 6.965 7.17 7.361 7.576 7.795 8.033 8.316 8.576 8.829 9.117 9.426 9.718 10.061 10.433 10.825 11.237 11.671 12.159 12.667 13.25 13.877 14.605 15.399 16.272 17.241 18.326 18.962 19.129 19.096 18.991 18.843 18.622 18.387 18.17 17.915 17.677 17.457 17.219 16.975 16.747 16.501 16.238 16.034 15.827 15.595 15.37 15.177 14.987 14.778 14.605 14.432 14.245 14.031 13.792 13.625 13.454 13.208 13.024 12.824 12.728 12.506 12.261 12.002 11.874 11.391 11.449 11.273 11.078 10.69 10.463 10.192 9.907 9.564 9.105 8.471 6.066 -4 ,4113 ,KEBNE ,16692893,Thu Nov 25 23:21:03 CET,Fri Nov 26 01:01:37 CET,0.0 1.699 2.162 2.483 2.726 2.929 3.119 3.288 3.59 3.72 3.856 3.749 4.238 4.357 4.601 4.814 4.985 5.066 5.222 5.382 5.617 5.766 5.908 6.114 6.307 6.483 6.645 6.814 7.048 7.275 7.501 7.776 8.035 8.272 8.531 8.848 9.174 9.511 9.853 10.208 10.588 11.021 11.523 12.017 12.58 13.199 13.893 14.657 15.521 16.499 17.599 18.268 18.45 18.421 18.305 18.116 17.876 17.631 17.411 17.189 16.972 16.749 16.516 16.295 16.074 15.851 15.609 15.387 15.185 14.961 14.719 14.507 14.282 14.07 13.902 13.717 13.534 13.339 13.134 12.998 12.847 12.589 12.405 12.21 12.106 11.891 11.658 11.397 11.261 10.752 10.8 10.634 10.448 10.034 9.804 9.555 9.28 8.943 8.475 7.814 5.599 -5 ,1462 ,KEBNE ,16692894,Thu Nov 25 23:21:03 CET,Fri Nov 26 00:59:16 CET,0.0 1.956 2.406 2.765 3.029 3.239 3.415 3.571 3.887 4.045 4.184 4.068 4.568 4.704 4.941 5.164 5.383 5.468 5.628 5.786 6.009 6.164 6.315 6.53 6.744 6.951 7.154 7.35 7.601 7.841 8.082 8.375 8.642 8.914 9.231 9.561 9.869 10.217 10.588 10.981 11.395 11.854 12.398 12.937 13.518 14.129 14.851 15.664 16.541 17.486 18.486 19.062 19.205 19.128 18.961 18.754 18.531 18.315 18.087 17.826 17.536 17.258 17.018 16.77 16.534 16.316 16.066 15.844 15.651 15.431 15.207 15.028 14.836 14.633 14.469 14.298 14.121 13.929 13.721 13.58 13.431 13.184 12.993 12.781 12.671 12.426 12.175 11.92 11.79 11.29 11.327 11.153 10.977 10.632 10.408 10.129 9.836 9.487 9.021 8.397 6.387 -6 ,16183 ,KEBNE ,16692895,Thu Nov 25 23:21:03 CET,Fri Nov 26 00:57:10 CET,0.0 1.35 1.782 2.09 2.343 2.572 2.781 2.976 3.303 3.442 3.566 3.439 3.928 4.033 4.229 4.424 4.613 4.708 4.883 5.038 5.283 5.446 5.586 5.769 5.944 6.115 6.291 6.474 6.699 6.911 7.118 7.36 7.591 7.827 8.122 8.448 8.744 9.064 9.41 9.762 10.127 10.551 11.039 11.538 12.126 12.769 13.479 14.258 15.141 16.098 17.104 17.686 17.839 17.801 17.65 17.472 17.243 16.988 16.752 16.49 16.249 16.021 15.794 15.563 15.328 15.094 14.836 14.609 14.399 14.16 13.883 13.666 13.468 13.247 13.051 12.828 12.626 12.439 12.233 12.087 11.932 11.69 11.517 11.329 11.231 11.02 10.771 10.5 10.355 9.829 9.833 9.666 9.5 9.114 8.902 8.659 8.359 8.008 7.616 7.034 4.539 -7 ,11151 ,KEBNE ,16692896,Thu Nov 25 23:21:03 CET,Fri Nov 26 00:57:17 CET,0.0 2.403 2.876 3.212 3.475 3.687 3.902 4.088 4.388 4.527 4.66 4.561 5.056 5.166 5.403 5.614 5.79 5.881 6.062 6.236 6.479 6.627 6.773 6.992 7.194 7.387 7.564 7.735 7.966 8.195 8.424 8.707 8.977 9.23 9.522 9.854 10.166 10.499 10.858 11.237 11.663 12.183 12.745 13.232 13.795 14.423 15.118 15.88 16.759 17.728 18.693 19.28 19.448 19.372 19.189 18.967 18.744 18.532 18.293 18.023 17.799 17.57 17.324 17.094 16.894 16.697 16.473 16.27 16.055 15.812 15.584 15.39 15.177 14.962 14.793 14.609 14.411 14.17 13.936 13.797 13.646 13.395 13.216 13.039 12.94 12.721 12.479 12.215 12.08 11.579 11.603 11.401 11.186 10.753 10.527 10.27 9.972 9.622 9.171 8.528 6.671 -8 ,16895 ,KEBNE ,16692897,Thu Nov 25 23:21:07 CET,Fri Nov 26 00:55:38 CET,0.0 2.174 2.625 2.952 3.229 3.473 3.678 3.865 4.189 4.34 4.478 4.342 4.829 4.941 5.154 5.353 5.557 5.656 5.839 6.013 6.238 6.389 6.529 6.73 6.931 7.113 7.281 7.452 7.678 7.895 8.096 8.348 8.619 8.862 9.123 9.428 9.726 10.061 10.436 10.818 11.208 11.645 12.152 12.652 13.241 13.897 14.621 15.452 16.387 17.391 18.437 19.054 19.263 19.256 19.162 19.016 18.817 18.594 18.335 18.016 17.74 17.497 17.273 17.058 16.847 16.636 16.407 16.217 16.047 15.866 15.673 15.493 15.295 15.072 14.883 14.697 14.516 14.328 14.122 13.965 13.794 13.538 13.351 13.146 13.037 12.796 12.55 12.308 12.176 11.668 11.719 11.541 11.338 10.929 10.674 10.371 10.048 9.685 9.226 8.512 5.014 -9 ,15391 ,KEBNE ,16692898,Thu Nov 25 23:22:06 CET,Fri Nov 26 00:58:11 CET,0.0 1.943 2.387 2.686 2.938 3.153 3.368 3.557 3.878 4.041 4.197 4.105 4.587 4.699 4.928 5.145 5.343 5.445 5.652 5.831 6.068 6.225 6.371 6.595 6.842 7.072 7.285 7.496 7.746 7.975 8.196 8.462 8.728 9.002 9.309 9.615 9.915 10.249 10.602 10.979 11.394 11.862 12.363 12.855 13.427 14.057 14.731 15.477 16.348 17.287 18.33 18.969 19.117 19.087 18.99 18.842 18.673 18.472 18.246 17.964 17.715 17.498 17.27 17.028 16.791 16.588 16.367 16.139 15.94 15.741 15.521 15.329 15.131 14.927 14.773 14.598 14.391 14.176 13.942 13.785 13.637 13.363 13.148 12.924 12.811 12.57 12.3 12.034 11.904 11.397 11.429 11.259 11.067 10.617 10.383 10.139 9.829 9.45 8.978 8.298 5.754 -10 ,9144 ,KEBNE ,16692899,Thu Nov 25 23:22:06 CET,Fri Nov 26 00:57:19 CET,0.0 1.495 1.921 2.213 2.456 2.683 2.893 3.074 3.375 3.509 3.632 3.494 3.981 4.093 4.308 4.504 4.69 4.781 4.951 5.113 5.35 5.514 5.675 5.893 6.118 6.339 6.543 6.742 6.983 7.211 7.44 7.707 7.982 8.245 8.53 8.858 9.157 9.494 9.851 10.223 10.611 11.036 11.531 12.02 12.58 13.182 13.86 14.618 15.467 16.44 17.507 18.2 18.405 18.392 18.271 18.043 17.768 17.489 17.254 16.993 16.751 16.55 16.343 16.12 15.909 15.701 15.454 15.234 15.056 14.859 14.653 14.483 14.289 14.066 13.891 13.72 13.531 13.323 13.113 12.953 12.78 12.527 12.355 12.174 12.081 11.881 11.652 11.401 11.267 10.762 10.799 10.615 10.411 9.993 9.772 9.51 9.174 8.779 8.283 7.589 5.426 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt deleted file mode 100644 index 4b8fda68..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17560 ,KEBNE ,16692900,Thu Nov 25 23:22:05 CET,Fri Nov 26 01:00:30 CET,0.0 1.016 1.385 1.592 1.755 1.897 2.007 2.103 2.282 2.353 2.41 2.154 2.547 2.589 2.664 2.734 2.796 2.826 2.88 2.919 2.973 3.003 3.023 3.052 3.077 3.094 3.105 3.102 3.098 3.089 3.075 3.051 3.006 2.94 2.847 2.738 2.626 2.479 2.295 2.086 1.846 1.537 1.107 0.605 -0.039 -0.82 -1.864 -3.226 -5.073 -7.748 -11.92 -16.508 -20.015 -22.758 -25.041 -27.062 -28.723 -30.141 -31.386 -32.604 -33.636 -34.598 -35.47 -36.276 -37.055 -37.747 -38.449 -39.084 -39.633 -40.18 -40.734 -41.198 -41.672 -42.138 -42.506 -42.915 -43.335 -43.782 -44.253 -44.562 -44.853 -45.316 -45.669 -46.033 -46.218 -46.601 -47.014 -47.496 -47.75 -48.396 -48.514 -48.796 -49.094 -49.737 -50.088 -50.523 -51.003 -51.528 -52.243 -53.203 -61.81 -2 ,17919 ,KEBNE ,16692901,Thu Nov 25 23:22:05 CET,Fri Nov 26 00:57:18 CET,0.0 1.181 1.529 1.752 1.912 2.049 2.176 2.28 2.453 2.533 2.601 2.348 2.744 2.787 2.858 2.928 2.997 3.026 3.088 3.145 3.208 3.24 3.265 3.298 3.328 3.347 3.359 3.363 3.361 3.353 3.329 3.292 3.242 3.182 3.101 3.004 2.896 2.749 2.567 2.351 2.088 1.761 1.343 0.849 0.199 -0.609 -1.683 -3.085 -4.977 -7.686 -11.92 -16.518 -20.011 -22.795 -25.065 -27.028 -28.754 -30.299 -31.555 -32.728 -33.695 -34.534 -35.347 -36.084 -36.729 -37.34 -38.033 -38.692 -39.246 -39.781 -40.304 -40.744 -41.228 -41.715 -42.09 -42.478 -42.861 -43.253 -43.694 -44.005 -44.299 -44.766 -45.103 -45.459 -45.648 -46.05 -46.49 -46.938 -47.179 -47.833 -47.951 -48.232 -48.541 -49.212 -49.569 -49.975 -50.435 -51.008 -51.747 -52.734 -56.536 -3 ,22625 ,KEBNE ,16692902,Thu Nov 25 23:22:06 CET,Fri Nov 26 00:58:24 CET,0.0 1.361 1.69 1.891 2.023 2.16 2.295 2.406 2.596 2.68 2.755 2.514 2.919 2.97 3.06 3.123 3.176 3.206 3.261 3.308 3.363 3.386 3.411 3.443 3.468 3.481 3.474 3.465 3.448 3.418 3.383 3.341 3.294 3.228 3.147 3.028 2.887 2.741 2.563 2.33 2.054 1.717 1.298 0.836 0.204 -0.607 -1.656 -3.055 -5.002 -7.723 -11.908 -16.529 -20.086 -22.92 -25.198 -27.159 -28.81 -30.258 -31.482 -32.76 -33.843 -34.732 -35.584 -36.401 -37.128 -37.764 -38.453 -39.091 -39.634 -40.188 -40.738 -41.164 -41.614 -42.103 -42.487 -42.891 -43.297 -43.707 -44.149 -44.442 -44.741 -45.235 -45.569 -45.918 -46.107 -46.484 -46.872 -47.287 -47.527 -48.19 -48.305 -48.577 -48.87 -49.474 -49.809 -50.181 -50.575 -51.085 -51.725 -52.515 -56.592 -4 ,22654 ,KEBNE ,16692903,Thu Nov 25 23:22:06 CET,Fri Nov 26 00:57:38 CET,0.0 1.4 1.823 2.087 2.247 2.372 2.491 2.588 2.739 2.809 2.88 2.657 3.068 3.115 3.198 3.271 3.325 3.348 3.394 3.426 3.463 3.487 3.507 3.528 3.545 3.561 3.565 3.566 3.566 3.554 3.54 3.513 3.464 3.409 3.339 3.252 3.142 2.995 2.824 2.61 2.344 2.012 1.572 1.068 0.418 -0.402 -1.473 -2.867 -4.817 -7.593 -11.829 -16.46 -19.989 -22.841 -25.143 -27.116 -28.796 -30.224 -31.417 -32.569 -33.527 -34.388 -35.197 -35.99 -36.75 -37.405 -38.055 -38.626 -39.148 -39.718 -40.305 -40.762 -41.238 -41.734 -42.121 -42.535 -42.938 -43.352 -43.791 -44.095 -44.422 -44.944 -45.281 -45.636 -45.829 -46.224 -46.642 -47.075 -47.303 -47.944 -48.08 -48.374 -48.65 -49.265 -49.64 -50.066 -50.529 -51.02 -51.641 -52.568 -57.152 -5 ,6369 ,KEBNE ,16692904,Thu Nov 25 23:22:06 CET,Fri Nov 26 00:57:13 CET,0.0 1.674 2.081 2.346 2.547 2.729 2.891 3.039 3.287 3.378 3.456 3.244 3.655 3.71 3.822 3.918 3.995 4.033 4.108 4.177 4.265 4.311 4.357 4.409 4.439 4.461 4.491 4.515 4.521 4.508 4.482 4.443 4.388 4.327 4.246 4.137 4.024 3.886 3.721 3.521 3.271 2.929 2.478 1.977 1.344 0.569 -0.492 -1.931 -3.874 -6.623 -10.908 -15.611 -19.157 -21.931 -24.202 -26.203 -27.9 -29.386 -30.651 -31.932 -33.053 -34.062 -34.982 -35.755 -36.474 -37.144 -37.818 -38.4 -38.891 -39.404 -39.949 -40.401 -40.883 -41.384 -41.766 -42.143 -42.515 -42.921 -43.363 -43.673 -43.989 -44.482 -44.82 -45.188 -45.38 -45.751 -46.159 -46.61 -46.832 -47.462 -47.562 -47.832 -48.117 -48.729 -49.083 -49.501 -49.942 -50.401 -50.998 -51.963 -55.936 -6 ,29949 ,KEBNE ,16692905,Thu Nov 25 23:22:05 CET,Fri Nov 26 00:57:26 CET,0.0 1.226 1.543 1.769 1.955 2.1 2.22 2.337 2.512 2.59 2.667 2.435 2.839 2.891 2.983 3.063 3.134 3.165 3.212 3.245 3.303 3.335 3.355 3.387 3.41 3.425 3.428 3.428 3.428 3.418 3.402 3.361 3.317 3.275 3.199 3.098 2.996 2.876 2.701 2.472 2.215 1.9 1.473 0.971 0.341 -0.452 -1.525 -2.895 -4.819 -7.603 -11.874 -16.558 -20.075 -22.868 -25.132 -27.062 -28.779 -30.366 -31.724 -33.01 -34.02 -34.885 -35.771 -36.635 -37.353 -37.991 -38.664 -39.258 -39.801 -40.373 -40.956 -41.414 -41.892 -42.385 -42.744 -43.14 -43.558 -43.977 -44.408 -44.699 -45.013 -45.55 -45.928 -46.302 -46.496 -46.879 -47.281 -47.743 -47.984 -48.617 -48.7 -48.976 -49.287 -49.981 -50.325 -50.709 -51.182 -51.709 -52.357 -53.34 -57.456 -7 ,28761 ,KEBNE ,16692906,Thu Nov 25 23:23:08 CET,Fri Nov 26 00:59:44 CET,0.0 0.986 1.302 1.559 1.748 1.885 1.996 2.101 2.306 2.393 2.464 2.234 2.636 2.68 2.762 2.833 2.893 2.919 2.97 3.013 3.074 3.113 3.138 3.157 3.177 3.194 3.206 3.205 3.197 3.183 3.154 3.114 3.067 3.011 2.937 2.826 2.695 2.559 2.394 2.166 1.902 1.577 1.157 0.693 0.052 -0.782 -1.865 -3.286 -5.207 -7.939 -12.135 -16.712 -20.221 -23.042 -25.321 -27.226 -28.864 -30.32 -31.532 -32.699 -33.676 -34.58 -35.48 -36.289 -37.003 -37.651 -38.309 -38.889 -39.405 -39.926 -40.468 -40.94 -41.423 -41.905 -42.283 -42.674 -43.067 -43.485 -43.923 -44.225 -44.523 -44.991 -45.348 -45.727 -45.912 -46.292 -46.709 -47.184 -47.443 -48.112 -48.241 -48.511 -48.805 -49.464 -49.824 -50.235 -50.697 -51.239 -51.906 -52.826 -56.76 -8 ,9692 ,KEBNE ,16692907,Thu Nov 25 23:23:08 CET,Fri Nov 26 01:01:27 CET,0.0 0.906 1.215 1.429 1.596 1.731 1.863 1.996 2.203 2.29 2.364 2.14 2.55 2.597 2.676 2.745 2.812 2.846 2.895 2.937 3.019 3.061 3.081 3.104 3.121 3.124 3.121 3.12 3.125 3.114 3.094 3.067 3.027 2.975 2.896 2.786 2.659 2.512 2.344 2.139 1.889 1.562 1.13 0.634 0.003 -0.778 -1.839 -3.256 -5.203 -7.932 -12.116 -16.668 -20.162 -22.984 -25.287 -27.259 -28.915 -30.355 -31.586 -32.82 -33.863 -34.738 -35.513 -36.223 -36.91 -37.573 -38.291 -38.901 -39.387 -39.901 -40.475 -40.952 -41.449 -41.963 -42.359 -42.77 -43.156 -43.553 -44.008 -44.324 -44.648 -45.16 -45.506 -45.85 -46.03 -46.423 -46.853 -47.29 -47.522 -48.179 -48.307 -48.598 -48.914 -49.596 -49.955 -50.358 -50.793 -51.33 -51.978 -52.944 -56.862 -9 ,28682 ,KEBNE ,16692908,Thu Nov 25 23:24:10 CET,Fri Nov 26 00:58:58 CET,0.0 1.045 1.322 1.566 1.797 1.973 2.101 2.197 2.354 2.42 2.479 2.239 2.643 2.691 2.767 2.828 2.876 2.905 2.968 3.013 3.073 3.102 3.131 3.178 3.209 3.223 3.228 3.235 3.242 3.232 3.215 3.179 3.127 3.067 2.99 2.896 2.783 2.644 2.461 2.24 1.986 1.656 1.231 0.743 0.099 -0.712 -1.773 -3.142 -5.024 -7.706 -11.892 -16.585 -20.189 -23.043 -25.351 -27.312 -28.972 -30.414 -31.669 -32.892 -33.865 -34.727 -35.589 -36.382 -37.086 -37.705 -38.355 -38.955 -39.455 -39.968 -40.525 -40.996 -41.47 -41.934 -42.306 -42.678 -43.081 -43.538 -43.983 -44.295 -44.611 -45.09 -45.421 -45.745 -45.915 -46.309 -46.746 -47.191 -47.423 -48.084 -48.198 -48.462 -48.757 -49.368 -49.705 -50.079 -50.552 -51.141 -51.802 -52.76 -57.231 -10 ,10884 ,KEBNE ,16692909,Thu Nov 25 23:24:10 CET,Fri Nov 26 01:00:51 CET,0.0 1.146 1.465 1.696 1.885 2.044 2.189 2.322 2.507 2.577 2.649 2.423 2.826 2.872 2.956 3.05 3.142 3.177 3.227 3.272 3.327 3.352 3.375 3.405 3.43 3.451 3.46 3.466 3.459 3.431 3.399 3.353 3.302 3.244 3.161 3.053 2.934 2.783 2.598 2.368 2.092 1.762 1.334 0.838 0.181 -0.637 -1.703 -3.098 -5.002 -7.752 -12.02 -16.701 -20.293 -23.16 -25.511 -27.491 -29.134 -30.562 -31.776 -32.964 -33.971 -34.844 -35.652 -36.454 -37.207 -37.873 -38.554 -39.133 -39.628 -40.166 -40.721 -41.189 -41.68 -42.188 -42.569 -42.96 -43.385 -43.834 -44.307 -44.624 -44.966 -45.525 -45.883 -46.238 -46.43 -46.848 -47.276 -47.713 -47.961 -48.627 -48.734 -49.007 -49.319 -50.068 -50.455 -50.875 -51.451 -52.108 -52.802 -53.747 -57.12 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index d67e5f10..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17443 ,KEBNE ,17025305,Wed Dec 22 12:16:54 CET,Wed Dec 22 13:53:06 CET,0.0 1.278 1.668 1.961 2.223 2.462 2.677 2.88 3.218 3.354 3.478 3.357 3.817 3.92 4.11 4.266 4.413 4.487 4.626 4.755 4.941 5.066 5.193 5.354 5.492 5.624 5.753 5.877 6.034 6.169 6.29 6.444 6.597 6.73 6.879 7.059 7.214 7.36 7.523 7.675 7.803 7.93 8.057 8.152 8.244 8.317 8.329 8.265 8.04 7.527 6.466 5.02 3.747 2.591 1.586 0.699 -0.058 -0.713 -1.312 -1.914 -2.442 -2.973 -3.463 -3.907 -4.31 -4.671 -5.083 -5.464 -5.763 -6.059 -6.375 -6.647 -6.948 -7.26 -7.503 -7.756 -8.002 -8.268 -8.565 -8.765 -8.959 -9.27 -9.498 -9.734 -9.853 -10.105 -10.394 -10.702 -10.865 -11.403 -11.375 -11.565 -11.776 -12.215 -12.452 -12.716 -13.021 -13.383 -13.843 -14.431 -16.421 -2 ,9823 ,KEBNE ,17025306,Wed Dec 22 12:16:54 CET,Wed Dec 22 13:53:37 CET,0.0 1.691 2.138 2.477 2.727 2.949 3.156 3.34 3.65 3.783 3.906 3.786 4.249 4.352 4.55 4.739 4.922 5.006 5.151 5.285 5.477 5.605 5.725 5.893 6.049 6.185 6.307 6.419 6.576 6.733 6.875 7.039 7.192 7.33 7.472 7.619 7.766 7.932 8.09 8.237 8.39 8.556 8.723 8.858 8.992 9.073 9.092 9.053 8.877 8.409 7.346 5.895 4.65 3.588 2.65 1.761 0.969 0.275 -0.311 -0.919 -1.478 -1.965 -2.394 -2.833 -3.274 -3.653 -4.017 -4.334 -4.626 -4.957 -5.318 -5.616 -5.911 -6.195 -6.421 -6.675 -6.94 -7.214 -7.516 -7.732 -7.95 -8.292 -8.528 -8.775 -8.901 -9.163 -9.434 -9.716 -9.867 -10.391 -10.36 -10.537 -10.726 -11.165 -11.397 -11.64 -11.922 -12.268 -12.689 -13.236 -14.822 -3 ,28624 ,KEBNE ,17025307,Wed Dec 22 12:16:55 CET,Wed Dec 22 13:53:37 CET,0.0 1.234 1.67 1.983 2.246 2.482 2.694 2.883 3.195 3.332 3.455 3.328 3.795 3.896 4.095 4.286 4.46 4.542 4.688 4.829 5.015 5.123 5.232 5.384 5.52 5.652 5.789 5.917 6.073 6.224 6.368 6.535 6.685 6.818 6.969 7.138 7.298 7.451 7.593 7.753 7.915 8.076 8.218 8.323 8.419 8.493 8.554 8.521 8.357 7.91 6.815 5.331 3.992 2.805 1.774 0.895 0.151 -0.59 -1.225 -1.792 -2.272 -2.738 -3.196 -3.603 -3.98 -4.356 -4.785 -5.168 -5.474 -5.78 -6.112 -6.392 -6.69 -7.002 -7.24 -7.488 -7.745 -8.031 -8.336 -8.537 -8.73 -9.033 -9.259 -9.502 -9.627 -9.883 -10.147 -10.416 -10.564 -11.088 -11.061 -11.255 -11.449 -11.855 -12.096 -12.387 -12.701 -13.035 -13.434 -13.946 -15.65 -4 ,21562 ,KEBNE ,17025308,Wed Dec 22 12:16:55 CET,Wed Dec 22 13:53:50 CET,0.0 1.556 2.042 2.417 2.704 2.946 3.146 3.322 3.658 3.829 3.983 3.888 4.361 4.469 4.658 4.841 5.025 5.12 5.297 5.463 5.69 5.838 5.974 6.136 6.292 6.434 6.566 6.698 6.868 7.031 7.2 7.396 7.565 7.725 7.899 8.081 8.243 8.416 8.583 8.743 8.888 9.058 9.246 9.383 9.486 9.532 9.551 9.476 9.246 8.778 7.734 6.301 5.055 3.97 3.023 2.156 1.387 0.642 -0.014 -0.644 -1.156 -1.646 -2.156 -2.59 -2.979 -3.338 -3.693 -4.023 -4.324 -4.62 -4.925 -5.196 -5.469 -5.764 -6.01 -6.267 -6.529 -6.8 -7.101 -7.315 -7.533 -7.866 -8.095 -8.323 -8.438 -8.69 -8.962 -9.254 -9.408 -9.935 -9.918 -10.11 -10.303 -10.735 -10.988 -11.267 -11.553 -11.847 -12.201 -12.723 -14.54 -5 ,10535 ,KEBNE ,17025309,Wed Dec 22 12:16:59 CET,Wed Dec 22 13:49:40 CET,0.0 1.443 1.909 2.241 2.518 2.755 2.955 3.143 3.478 3.617 3.741 3.619 4.081 4.185 4.375 4.547 4.7 4.771 4.915 5.058 5.271 5.401 5.514 5.677 5.826 5.961 6.085 6.206 6.357 6.505 6.655 6.826 6.97 7.099 7.248 7.396 7.519 7.643 7.786 7.943 8.1 8.257 8.394 8.499 8.604 8.666 8.661 8.58 8.355 7.855 6.792 5.345 4.081 2.992 2.034 1.18 0.435 -0.28 -0.905 -1.5 -2.007 -2.501 -2.964 -3.375 -3.765 -4.124 -4.493 -4.834 -5.131 -5.44 -5.761 -6.038 -6.319 -6.614 -6.866 -7.121 -7.384 -7.66 -7.948 -8.143 -8.332 -8.64 -8.872 -9.123 -9.257 -9.524 -9.791 -10.075 -10.229 -10.754 -10.729 -10.923 -11.121 -11.578 -11.825 -12.083 -12.391 -12.745 -13.185 -13.812 -15.616 -6 ,26036 ,KEBNE ,17025310,Wed Dec 22 12:16:54 CET,Wed Dec 22 13:53:52 CET,0.0 1.478 1.931 2.273 2.561 2.815 3.031 3.221 3.561 3.707 3.828 3.71 4.187 4.305 4.511 4.692 4.876 4.961 5.1 5.235 5.432 5.553 5.665 5.823 5.965 6.096 6.237 6.383 6.547 6.694 6.844 7.024 7.178 7.311 7.453 7.6 7.736 7.881 8.028 8.174 8.332 8.498 8.66 8.78 8.89 8.963 8.96 8.884 8.639 8.145 7.116 5.692 4.455 3.342 2.347 1.463 0.717 0.061 -0.517 -1.106 -1.632 -2.128 -2.567 -3.005 -3.464 -3.886 -4.286 -4.598 -4.885 -5.206 -5.532 -5.818 -6.129 -6.446 -6.693 -6.94 -7.171 -7.425 -7.709 -7.912 -8.128 -8.453 -8.674 -8.899 -9.022 -9.288 -9.555 -9.844 -9.997 -10.521 -10.504 -10.698 -10.897 -11.356 -11.627 -11.899 -12.201 -12.545 -12.946 -13.496 -15.14 -7 ,12904 ,KEBNE ,17025311,Wed Dec 22 12:16:55 CET,Wed Dec 22 13:54:46 CET,0.0 1.417 1.859 2.17 2.428 2.685 2.937 3.148 3.47 3.598 3.718 3.593 4.049 4.148 4.34 4.538 4.725 4.809 4.951 5.07 5.265 5.392 5.498 5.646 5.788 5.922 6.06 6.19 6.34 6.484 6.635 6.811 6.963 7.096 7.241 7.395 7.524 7.665 7.848 8.029 8.191 8.351 8.487 8.581 8.663 8.724 8.75 8.71 8.506 8.002 6.941 5.508 4.264 3.176 2.179 1.256 0.494 -0.151 -0.726 -1.318 -1.847 -2.33 -2.79 -3.238 -3.645 -3.999 -4.36 -4.712 -5.043 -5.381 -5.724 -6.006 -6.306 -6.625 -6.878 -7.147 -7.415 -7.688 -7.982 -8.19 -8.408 -8.755 -8.991 -9.229 -9.346 -9.587 -9.856 -10.147 -10.298 -10.823 -10.804 -10.992 -11.201 -11.635 -11.868 -12.137 -12.447 -12.807 -13.243 -13.88 -15.81 -8 ,1813 ,KEBNE ,17025312,Wed Dec 22 12:16:55 CET,Wed Dec 22 13:53:18 CET,0.0 1.376 1.832 2.186 2.431 2.631 2.83 3.006 3.32 3.453 3.578 3.482 3.954 4.061 4.252 4.44 4.627 4.709 4.873 5.037 5.245 5.354 5.453 5.608 5.756 5.89 6.02 6.144 6.294 6.443 6.584 6.752 6.91 7.033 7.155 7.309 7.46 7.614 7.772 7.941 8.087 8.224 8.395 8.532 8.63 8.695 8.691 8.607 8.388 7.873 6.786 5.363 4.111 3.005 1.969 1.049 0.271 -0.491 -1.105 -1.733 -2.317 -2.801 -3.232 -3.645 -4.059 -4.46 -4.906 -5.278 -5.584 -5.911 -6.236 -6.511 -6.817 -7.152 -7.415 -7.672 -7.92 -8.185 -8.481 -8.693 -8.907 -9.24 -9.479 -9.729 -9.855 -10.102 -10.362 -10.64 -10.795 -11.326 -11.307 -11.502 -11.699 -12.127 -12.37 -12.632 -12.928 -13.251 -13.662 -14.203 -15.851 -9 ,4020 ,KEBNE ,17025313,Wed Dec 22 12:16:54 CET,Wed Dec 22 13:53:13 CET,0.0 1.277 1.719 2.038 2.297 2.501 2.681 2.858 3.154 3.287 3.418 3.305 3.768 3.875 4.07 4.243 4.401 4.472 4.615 4.766 4.969 5.093 5.218 5.393 5.549 5.689 5.84 5.986 6.149 6.304 6.45 6.62 6.778 6.913 7.051 7.201 7.347 7.507 7.66 7.807 7.96 8.106 8.276 8.433 8.545 8.608 8.618 8.54 8.33 7.815 6.681 5.204 3.936 2.853 1.917 1.063 0.338 -0.317 -0.911 -1.548 -2.077 -2.544 -3.052 -3.516 -3.907 -4.246 -4.604 -4.971 -5.318 -5.649 -5.95 -6.215 -6.518 -6.844 -7.093 -7.338 -7.598 -7.883 -8.18 -8.378 -8.593 -8.932 -9.16 -9.397 -9.521 -9.78 -10.057 -10.34 -10.493 -11.028 -11.01 -11.203 -11.402 -11.8 -12.031 -12.291 -12.588 -12.95 -13.399 -14.013 -16.208 -10 ,7782 ,KEBNE ,17025314,Wed Dec 22 12:16:55 CET,Wed Dec 22 13:53:55 CET,0.0 1.29 1.745 2.084 2.353 2.57 2.747 2.918 3.228 3.363 3.481 3.34 3.795 3.895 4.101 4.289 4.448 4.523 4.667 4.798 4.978 5.094 5.212 5.387 5.562 5.717 5.852 5.98 6.137 6.282 6.418 6.565 6.698 6.836 6.994 7.148 7.271 7.398 7.538 7.684 7.812 7.948 8.104 8.224 8.34 8.421 8.467 8.405 8.154 7.666 6.665 5.236 4.007 2.973 2.012 1.118 0.333 -0.364 -0.954 -1.621 -2.232 -2.735 -3.177 -3.585 -3.953 -4.314 -4.697 -5.04 -5.367 -5.688 -5.991 -6.278 -6.586 -6.882 -7.118 -7.376 -7.66 -7.949 -8.244 -8.445 -8.652 -8.978 -9.206 -9.452 -9.584 -9.866 -10.144 -10.428 -10.579 -11.111 -11.077 -11.247 -11.445 -11.906 -12.153 -12.416 -12.691 -13.013 -13.435 -13.99 -15.691 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt deleted file mode 100644 index 1fc3fec4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2m_p38a-3fln.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5578 ,KEBNE ,16692910,Thu Nov 25 23:24:10 CET,Fri Nov 26 01:01:20 CET,0.0 1.544 1.994 2.31 2.605 2.881 3.113 3.314 3.667 3.815 3.957 3.875 4.345 4.454 4.675 4.903 5.113 5.202 5.362 5.512 5.731 5.886 6.034 6.235 6.414 6.58 6.748 6.91 7.109 7.291 7.458 7.654 7.851 8.039 8.237 8.441 8.62 8.823 9.082 9.366 9.629 9.876 10.161 10.453 10.739 11.018 11.307 11.596 11.843 11.998 11.894 11.307 10.635 9.943 9.29 8.691 8.15 7.613 7.104 6.573 6.067 5.602 5.174 4.797 4.427 4.04 3.649 3.306 2.994 2.671 2.369 2.122 1.839 1.527 1.28 1.029 0.749 0.446 0.128 -0.094 -0.324 -0.691 -0.941 -1.194 -1.337 -1.662 -1.989 -2.324 -2.499 -3.053 -3.166 -3.396 -3.624 -4.167 -4.47 -4.771 -5.132 -5.623 -6.213 -7.002 -10.003 -2 ,27100 ,KEBNE ,16692911,Thu Nov 25 23:24:10 CET,Fri Nov 26 01:02:17 CET,0.0 1.451 1.853 2.17 2.453 2.669 2.841 2.994 3.247 3.362 3.49 3.377 3.839 3.952 4.153 4.348 4.537 4.614 4.762 4.918 5.131 5.249 5.374 5.566 5.751 5.917 6.063 6.207 6.392 6.574 6.748 6.982 7.205 7.386 7.61 7.847 8.061 8.301 8.548 8.798 9.027 9.278 9.591 9.891 10.212 10.513 10.796 11.083 11.346 11.451 11.201 10.534 9.82 9.116 8.463 7.83 7.242 6.711 6.233 5.735 5.284 4.866 4.472 4.098 3.735 3.382 2.997 2.664 2.375 2.069 1.74 1.473 1.186 0.853 0.594 0.319 0.039 -0.244 -0.573 -0.789 -0.984 -1.323 -1.593 -1.874 -2.011 -2.286 -2.595 -2.936 -3.091 -3.611 -3.618 -3.829 -4.077 -4.624 -4.91 -5.216 -5.584 -6.038 -6.559 -7.195 -9.87 -3 ,4878 ,KEBNE ,16692912,Thu Nov 25 23:24:10 CET,Fri Nov 26 01:04:41 CET,0.0 1.662 2.139 2.507 2.771 2.996 3.181 3.342 3.671 3.815 3.941 3.824 4.279 4.371 4.549 4.709 4.867 4.945 5.089 5.228 5.419 5.532 5.655 5.859 6.039 6.187 6.328 6.464 6.624 6.801 6.988 7.192 7.39 7.578 7.791 8.057 8.295 8.521 8.758 9.006 9.272 9.549 9.842 10.126 10.43 10.731 11.075 11.391 11.608 11.715 11.493 10.869 10.183 9.515 8.896 8.269 7.701 7.174 6.653 6.066 5.604 5.204 4.788 4.371 3.971 3.6 3.201 2.832 2.522 2.205 1.867 1.594 1.3 0.972 0.712 0.46 0.201 -0.091 -0.411 -0.626 -0.857 -1.238 -1.491 -1.782 -1.937 -2.232 -2.547 -2.892 -3.084 -3.644 -3.689 -3.908 -4.145 -4.673 -4.973 -5.309 -5.701 -6.148 -6.733 -7.511 -10.353 -4 ,5625 ,KEBNE ,16692913,Thu Nov 25 23:24:10 CET,Fri Nov 26 01:02:06 CET,0.0 1.645 2.159 2.567 2.896 3.14 3.353 3.542 3.878 4.027 4.168 4.078 4.541 4.655 4.889 5.111 5.304 5.392 5.575 5.74 5.937 6.066 6.196 6.375 6.55 6.722 6.885 7.038 7.221 7.389 7.554 7.763 7.949 8.132 8.346 8.572 8.781 9.009 9.252 9.497 9.749 10.015 10.299 10.58 10.884 11.186 11.507 11.772 11.923 11.991 11.845 11.286 10.595 9.741 8.98 8.388 7.845 7.347 6.897 6.416 5.98 5.558 5.148 4.759 4.398 4.042 3.667 3.341 3.036 2.73 2.422 2.149 1.858 1.54 1.277 1.004 0.725 0.445 0.166 -0.024 -0.241 -0.627 -0.907 -1.196 -1.337 -1.633 -1.952 -2.293 -2.473 -3.031 -3.107 -3.334 -3.585 -4.144 -4.466 -4.802 -5.176 -5.673 -6.292 -7.066 -9.69 -5 ,878 ,KEBNE ,16692914,Thu Nov 25 23:25:13 CET,Fri Nov 26 01:05:28 CET,0.0 1.448 1.893 2.227 2.46 2.668 2.863 3.055 3.401 3.545 3.691 3.611 4.092 4.206 4.401 4.581 4.758 4.849 5.019 5.173 5.393 5.531 5.677 5.887 6.083 6.272 6.434 6.583 6.785 6.987 7.173 7.397 7.608 7.795 7.998 8.207 8.415 8.666 8.923 9.179 9.465 9.795 10.145 10.443 10.779 11.131 11.451 11.762 12.053 12.213 12.045 11.401 10.66 9.973 9.326 8.661 8.034 7.433 6.893 6.318 5.817 5.403 5.021 4.637 4.24 3.855 3.453 3.065 2.711 2.364 2.043 1.803 1.532 1.203 0.937 0.662 0.347 -0.008 -0.373 -0.605 -0.831 -1.2 -1.458 -1.731 -1.88 -2.195 -2.52 -2.866 -3.048 -3.593 -3.635 -3.84 -4.07 -4.609 -4.906 -5.23 -5.598 -6.03 -6.605 -7.402 -10.012 -6 ,31648 ,KEBNE ,16692915,Thu Nov 25 23:27:18 CET,Fri Nov 26 01:05:25 CET,0.0 1.49 1.941 2.253 2.512 2.755 2.965 3.128 3.406 3.535 3.656 3.522 3.983 4.08 4.254 4.416 4.571 4.645 4.788 4.924 5.118 5.248 5.371 5.545 5.714 5.884 6.053 6.223 6.42 6.589 6.757 6.966 7.17 7.346 7.545 7.772 7.992 8.237 8.487 8.732 8.981 9.28 9.587 9.859 10.166 10.468 10.776 11.094 11.348 11.408 11.182 10.561 9.876 9.117 8.373 7.741 7.165 6.542 5.979 5.427 4.92 4.45 4.014 3.592 3.168 2.786 2.383 2.049 1.767 1.445 1.111 0.811 0.489 0.166 -0.084 -0.346 -0.616 -0.871 -1.155 -1.366 -1.578 -1.947 -2.233 -2.524 -2.671 -2.972 -3.281 -3.598 -3.788 -4.348 -4.381 -4.599 -4.845 -5.383 -5.657 -5.964 -6.363 -6.836 -7.406 -8.209 -10.879 -7 ,12811 ,KEBNE ,16692916,Thu Nov 25 23:27:17 CET,Fri Nov 26 01:05:02 CET,0.0 2.091 2.514 2.856 3.143 3.37 3.558 3.722 4.012 4.138 4.247 4.106 4.57 4.679 4.873 5.057 5.24 5.339 5.544 5.709 5.937 6.081 6.218 6.405 6.577 6.745 6.901 7.057 7.259 7.432 7.588 7.782 7.979 8.178 8.403 8.656 8.892 9.112 9.345 9.604 9.862 10.146 10.438 10.678 10.96 11.257 11.577 11.88 12.134 12.249 12.007 11.372 10.664 9.803 8.931 8.24 7.684 7.141 6.593 6.068 5.622 5.181 4.777 4.404 4.015 3.625 3.247 2.901 2.577 2.263 1.926 1.611 1.283 0.952 0.685 0.397 0.111 -0.164 -0.448 -0.663 -0.899 -1.252 -1.481 -1.715 -1.842 -2.121 -2.429 -2.788 -2.967 -3.504 -3.581 -3.81 -4.06 -4.649 -4.96 -5.305 -5.685 -6.094 -6.621 -7.388 -9.896 -8 ,12911 ,KEBNE ,16692917,Thu Nov 25 23:27:18 CET,Fri Nov 26 01:04:54 CET,0.0 1.542 2.033 2.343 2.609 2.839 3.031 3.207 3.522 3.663 3.808 3.731 4.221 4.348 4.551 4.754 4.945 5.027 5.205 5.378 5.611 5.752 5.886 6.091 6.274 6.441 6.603 6.754 6.945 7.126 7.302 7.522 7.737 7.926 8.112 8.314 8.52 8.753 9.003 9.249 9.512 9.82 10.13 10.413 10.731 11.073 11.44 11.774 12.028 12.136 11.886 11.145 10.368 9.598 8.822 8.133 7.537 6.916 6.364 5.848 5.382 4.965 4.575 4.188 3.831 3.466 3.062 2.708 2.396 2.081 1.734 1.441 1.138 0.802 0.539 0.274 0.011 -0.259 -0.558 -0.776 -1.007 -1.365 -1.613 -1.888 -2.025 -2.285 -2.585 -2.929 -3.111 -3.659 -3.738 -3.979 -4.217 -4.725 -5.024 -5.377 -5.757 -6.207 -6.795 -7.521 -9.724 -9 ,2736 ,KEBNE ,16692918,Thu Nov 25 23:27:18 CET,Fri Nov 26 01:08:00 CET,0.0 1.626 2.04 2.323 2.577 2.779 2.944 3.115 3.458 3.594 3.709 3.558 4.017 4.116 4.318 4.509 4.681 4.766 4.905 5.033 5.225 5.363 5.495 5.671 5.845 6.026 6.197 6.352 6.555 6.742 6.917 7.133 7.335 7.523 7.739 7.987 8.23 8.479 8.724 8.948 9.189 9.453 9.742 10.025 10.313 10.62 10.918 11.201 11.465 11.565 11.346 10.74 10.031 9.332 8.68 8.043 7.394 6.797 6.303 5.806 5.318 4.87 4.49 4.089 3.665 3.306 2.939 2.571 2.25 1.939 1.599 1.296 0.981 0.645 0.387 0.126 -0.131 -0.403 -0.718 -0.925 -1.132 -1.477 -1.732 -2.011 -2.149 -2.425 -2.733 -3.085 -3.277 -3.827 -3.874 -4.095 -4.327 -4.866 -5.203 -5.594 -6.0 -6.454 -7.004 -7.76 -10.079 -10 ,29468 ,KEBNE ,16692919,Thu Nov 25 23:27:18 CET,Fri Nov 26 01:07:56 CET,0.0 1.398 1.849 2.161 2.405 2.639 2.838 2.996 3.287 3.417 3.54 3.408 3.866 3.963 4.15 4.334 4.531 4.625 4.788 4.948 5.171 5.32 5.474 5.695 5.896 6.068 6.239 6.404 6.599 6.779 6.953 7.16 7.349 7.519 7.734 7.97 8.174 8.386 8.593 8.829 9.085 9.37 9.687 9.967 10.286 10.602 10.892 11.148 11.394 11.515 11.291 10.75 10.097 9.425 8.769 8.136 7.587 7.1 6.617 6.035 5.498 5.048 4.65 4.244 3.87 3.549 3.194 2.861 2.546 2.198 1.88 1.608 1.284 0.955 0.697 0.41 0.087 -0.227 -0.516 -0.722 -0.938 -1.277 -1.523 -1.793 -1.934 -2.205 -2.509 -2.878 -3.061 -3.595 -3.634 -3.846 -4.064 -4.583 -4.891 -5.228 -5.604 -6.031 -6.558 -7.31 -9.734 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 06907525..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25558 ,KEBNE ,17025315,Wed Dec 22 12:16:54 CET,Wed Dec 22 13:53:50 CET,0.0 1.205 1.701 2.025 2.313 2.549 2.759 2.95 3.292 3.446 3.599 3.502 4.015 4.138 4.364 4.594 4.813 4.91 5.091 5.274 5.553 5.728 5.897 6.139 6.366 6.582 6.785 6.987 7.258 7.512 7.745 8.026 8.295 8.563 8.87 9.193 9.514 9.875 10.257 10.665 11.082 11.536 12.082 12.635 13.268 13.994 14.791 15.647 16.631 17.628 18.562 19.044 19.103 18.987 18.718 18.365 18.043 17.729 17.424 17.105 16.821 16.547 16.253 15.969 15.718 15.452 15.174 14.953 14.74 14.521 14.286 14.07 13.846 13.614 13.43 13.244 13.059 12.846 12.605 12.447 12.28 12.016 11.841 11.649 11.548 11.35 11.132 10.88 10.744 10.234 10.301 10.134 9.981 9.631 9.413 9.16 8.865 8.546 8.087 7.452 5.641 -2 ,14323 ,KEBNE ,17025316,Wed Dec 22 12:16:55 CET,Wed Dec 22 13:54:15 CET,0.0 1.689 2.193 2.582 2.878 3.106 3.306 3.486 3.828 3.978 4.121 4.031 4.551 4.67 4.898 5.125 5.331 5.428 5.632 5.829 6.097 6.26 6.411 6.621 6.827 7.044 7.261 7.459 7.689 7.916 8.15 8.445 8.731 8.997 9.303 9.642 9.965 10.315 10.691 11.09 11.512 12.003 12.566 13.117 13.727 14.372 15.126 15.988 16.941 17.882 18.806 19.151 19.053 18.875 18.604 18.274 17.925 17.575 17.252 16.907 16.601 16.327 16.048 15.767 15.514 15.278 15.004 14.745 14.518 14.285 14.051 13.844 13.602 13.362 13.191 13.011 12.819 12.59 12.342 12.184 12.03 11.78 11.597 11.4 11.298 11.083 10.859 10.616 10.489 9.989 10.066 9.913 9.745 9.389 9.199 8.975 8.713 8.399 8.006 7.469 5.423 -3 ,2447 ,KEBNE ,17025317,Wed Dec 22 12:16:55 CET,Wed Dec 22 13:54:27 CET,0.0 1.806 2.329 2.704 2.955 3.182 3.41 3.617 3.971 4.129 4.281 4.19 4.713 4.844 5.071 5.278 5.478 5.579 5.779 5.972 6.241 6.41 6.571 6.824 7.063 7.28 7.511 7.745 8.03 8.287 8.535 8.823 9.084 9.342 9.652 9.998 10.318 10.663 11.058 11.499 11.954 12.421 12.937 13.466 14.089 14.787 15.582 16.391 17.252 18.238 19.196 19.625 19.624 19.446 19.222 18.945 18.637 18.333 18.036 17.712 17.425 17.145 16.862 16.614 16.375 16.129 15.878 15.659 15.462 15.241 15.005 14.805 14.593 14.359 14.161 13.956 13.754 13.551 13.33 13.174 13.014 12.771 12.598 12.406 12.304 12.105 11.9 11.669 11.545 11.052 11.129 10.957 10.781 10.402 10.175 9.946 9.68 9.301 8.857 8.262 4.546 -4 ,7243 ,KEBNE ,17025318,Wed Dec 22 12:16:54 CET,Wed Dec 22 13:54:28 CET,0.0 1.674 2.217 2.568 2.825 3.057 3.289 3.506 3.893 4.057 4.209 4.128 4.641 4.767 4.993 5.2 5.405 5.506 5.699 5.881 6.137 6.302 6.463 6.692 6.905 7.121 7.34 7.545 7.806 8.054 8.289 8.569 8.837 9.105 9.424 9.78 10.121 10.498 10.903 11.32 11.739 12.219 12.803 13.37 14.024 14.774 15.586 16.408 17.256 18.221 19.271 19.767 19.79 19.61 19.364 19.075 18.753 18.439 18.112 17.741 17.399 17.072 16.777 16.479 16.186 15.936 15.675 15.425 15.194 14.956 14.711 14.514 14.32 14.112 13.946 13.766 13.576 13.365 13.129 12.964 12.797 12.536 12.357 12.179 12.089 11.904 11.701 11.451 11.314 10.812 10.865 10.706 10.553 10.169 9.943 9.719 9.463 9.128 8.757 8.271 6.324 -5 ,3525 ,KEBNE ,17025319,Wed Dec 22 12:16:55 CET,Wed Dec 22 13:53:46 CET,0.0 1.511 1.979 2.303 2.564 2.809 3.049 3.263 3.611 3.771 3.922 3.82 4.34 4.466 4.709 4.95 5.162 5.259 5.448 5.623 5.892 6.072 6.234 6.472 6.702 6.917 7.123 7.33 7.608 7.866 8.11 8.402 8.678 8.956 9.268 9.606 9.943 10.318 10.717 11.143 11.576 12.038 12.582 13.144 13.808 14.502 15.268 16.101 16.965 17.925 18.878 19.229 19.153 18.936 18.664 18.356 18.008 17.637 17.321 16.99 16.683 16.404 16.109 15.827 15.575 15.338 15.079 14.84 14.631 14.403 14.155 13.962 13.761 13.54 13.369 13.176 12.965 12.743 12.517 12.354 12.171 11.886 11.701 11.518 11.424 11.227 10.993 10.724 10.582 10.072 10.132 9.975 9.818 9.435 9.22 9.007 8.76 8.456 8.103 7.62 5.832 -6 ,13210 ,KEBNE ,17025320,Wed Dec 22 12:16:55 CET,Wed Dec 22 13:54:21 CET,0.0 1.852 2.445 2.861 3.167 3.413 3.637 3.845 4.21 4.366 4.517 4.439 4.965 5.09 5.335 5.578 5.793 5.894 6.092 6.292 6.57 6.734 6.896 7.132 7.353 7.573 7.798 8.006 8.27 8.533 8.782 9.068 9.345 9.62 9.93 10.265 10.593 10.954 11.336 11.752 12.191 12.669 13.225 13.802 14.468 15.162 15.898 16.717 17.652 18.659 19.704 20.237 20.237 20.009 19.689 19.356 19.014 18.664 18.369 18.06 17.762 17.486 17.23 16.979 16.7 16.421 16.141 15.892 15.687 15.482 15.262 15.064 14.834 14.578 14.379 14.172 13.968 13.75 13.516 13.363 13.207 12.96 12.786 12.603 12.502 12.284 12.057 11.832 11.712 11.211 11.274 11.109 10.924 10.526 10.305 10.063 9.795 9.442 8.963 8.347 6.016 -7 ,11789 ,KEBNE ,17025321,Wed Dec 22 12:16:55 CET,Wed Dec 22 13:54:06 CET,0.0 1.258 1.694 2.014 2.282 2.523 2.747 2.948 3.284 3.429 3.575 3.452 3.952 4.063 4.276 4.491 4.702 4.806 5.009 5.199 5.463 5.63 5.792 6.019 6.236 6.449 6.652 6.852 7.117 7.375 7.62 7.91 8.193 8.468 8.783 9.132 9.468 9.835 10.221 10.649 11.086 11.559 12.119 12.671 13.317 14.036 14.837 15.704 16.566 17.375 18.265 18.773 18.74 18.538 18.27 17.94 17.61 17.294 16.997 16.692 16.39 16.114 15.857 15.583 15.298 15.035 14.774 14.54 14.343 14.135 13.921 13.733 13.518 13.301 13.143 12.956 12.73 12.487 12.26 12.113 11.95 11.693 11.515 11.327 11.235 11.043 10.828 10.592 10.461 9.954 10.017 9.845 9.662 9.271 9.073 8.852 8.586 8.298 7.922 7.367 5.084 -8 ,863 ,KEBNE ,17025322,Wed Dec 22 12:16:54 CET,Wed Dec 22 13:54:02 CET,0.0 1.23 1.684 2.03 2.317 2.553 2.755 2.937 3.271 3.424 3.565 3.46 3.977 4.099 4.337 4.551 4.749 4.849 5.043 5.227 5.508 5.684 5.844 6.084 6.328 6.563 6.776 6.973 7.219 7.467 7.727 8.036 8.311 8.569 8.867 9.204 9.527 9.87 10.246 10.651 11.069 11.539 12.086 12.639 13.268 13.947 14.757 15.609 16.488 17.433 18.38 18.847 18.844 18.624 18.305 17.972 17.641 17.301 16.974 16.641 16.346 16.069 15.781 15.504 15.252 15.027 14.763 14.512 14.308 14.098 13.87 13.675 13.469 13.231 13.039 12.841 12.643 12.451 12.251 12.099 11.934 11.673 11.49 11.281 11.164 10.937 10.72 10.471 10.335 9.835 9.916 9.747 9.563 9.144 8.929 8.712 8.457 8.145 7.761 7.23 4.199 -9 ,20844 ,KEBNE ,17025323,Wed Dec 22 12:16:54 CET,Wed Dec 22 13:53:46 CET,0.0 1.537 1.979 2.31 2.576 2.811 3.005 3.195 3.561 3.723 3.876 3.78 4.291 4.407 4.637 4.857 5.055 5.149 5.333 5.514 5.767 5.929 6.098 6.358 6.608 6.841 7.066 7.275 7.545 7.799 8.033 8.318 8.593 8.851 9.146 9.495 9.825 10.182 10.56 10.959 11.399 11.871 12.395 12.911 13.525 14.225 14.989 15.804 16.668 17.598 18.646 19.239 19.28 19.067 18.713 18.31 17.975 17.692 17.418 17.108 16.817 16.533 16.248 15.968 15.715 15.486 15.217 14.965 14.742 14.497 14.236 14.014 13.777 13.527 13.348 13.175 12.99 12.797 12.575 12.407 12.231 11.97 11.792 11.592 11.484 11.277 11.064 10.822 10.687 10.176 10.252 10.108 9.942 9.539 9.323 9.088 8.819 8.491 8.076 7.48 5.115 -10 ,12583 ,KEBNE ,17025324,Wed Dec 22 12:16:55 CET,Wed Dec 22 13:54:08 CET,0.0 1.42 1.875 2.202 2.496 2.748 2.972 3.176 3.537 3.695 3.833 3.712 4.218 4.343 4.591 4.811 5.002 5.107 5.323 5.522 5.807 5.995 6.168 6.404 6.631 6.848 7.064 7.268 7.524 7.778 8.024 8.308 8.579 8.847 9.162 9.507 9.832 10.19 10.572 10.994 11.459 11.984 12.578 13.171 13.851 14.604 15.431 16.349 17.384 18.425 19.454 19.898 19.842 19.622 19.332 18.999 18.673 18.371 18.089 17.774 17.48 17.213 16.949 16.676 16.38 16.111 15.843 15.586 15.352 15.099 14.843 14.641 14.438 14.234 14.069 13.883 13.691 13.492 13.278 13.142 12.999 12.743 12.559 12.369 12.274 12.062 11.839 11.607 11.474 10.97 11.033 10.876 10.721 10.352 10.125 9.882 9.621 9.333 8.937 8.3 6.446 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt deleted file mode 100644 index 3bdac9bb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2n_p38a-2t.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31794 ,KEBNE ,16692920,Thu Nov 25 23:29:26 CET,Fri Nov 26 01:00:11 CET,0.0 1.15 1.644 2.052 2.327 2.587 2.83 3.037 3.408 3.574 3.721 3.627 4.137 4.244 4.442 4.65 4.868 4.968 5.144 5.314 5.573 5.732 5.879 6.1 6.311 6.511 6.712 6.909 7.159 7.398 7.604 7.849 8.091 8.323 8.591 8.881 9.166 9.474 9.792 10.133 10.473 10.846 11.279 11.686 12.119 12.586 13.114 13.611 14.072 14.45 14.533 14.065 13.432 12.765 12.067 11.366 10.731 10.141 9.622 9.092 8.633 8.239 7.857 7.479 7.109 6.773 6.41 6.071 5.776 5.465 5.157 4.895 4.618 4.318 4.084 3.846 3.599 3.346 3.086 2.904 2.708 2.415 2.222 2.003 1.875 1.613 1.361 1.105 0.956 0.413 0.463 0.289 0.113 -0.31 -0.572 -0.845 -1.131 -1.49 -1.925 -2.549 -4.617 -2 ,29373 ,KEBNE ,16692921,Thu Nov 25 23:30:25 CET,Fri Nov 26 01:12:15 CET,0.0 1.341 1.803 2.181 2.464 2.685 2.878 3.066 3.405 3.571 3.744 3.672 4.188 4.308 4.526 4.726 4.918 5.011 5.193 5.38 5.644 5.804 5.957 6.175 6.389 6.597 6.792 6.973 7.206 7.428 7.645 7.921 8.171 8.393 8.661 8.955 9.223 9.532 9.852 10.169 10.501 10.851 11.263 11.66 12.106 12.609 13.111 13.617 14.119 14.511 14.734 14.395 13.713 13.044 12.461 11.865 11.277 10.724 10.247 9.772 9.359 8.981 8.603 8.226 7.866 7.544 7.207 6.9 6.611 6.302 5.981 5.719 5.448 5.173 4.961 4.713 4.454 4.199 3.936 3.755 3.557 3.233 3.006 2.774 2.658 2.424 2.167 1.882 1.724 1.178 1.23 1.059 0.87 0.45 0.217 -0.034 -0.332 -0.681 -1.12 -1.722 -3.738 -3 ,25172 ,KEBNE ,16692922,Thu Nov 25 23:30:25 CET,Fri Nov 26 01:12:06 CET,0.0 1.669 2.146 2.451 2.724 2.972 3.198 3.39 3.704 3.856 4.008 3.9 4.41 4.541 4.777 4.987 5.207 5.31 5.485 5.66 5.918 6.085 6.241 6.447 6.652 6.86 7.059 7.252 7.506 7.739 7.975 8.265 8.513 8.734 8.988 9.27 9.534 9.827 10.153 10.478 10.808 11.166 11.558 11.96 12.404 12.855 13.37 13.921 14.404 14.758 14.902 14.522 13.915 13.268 12.626 11.968 11.343 10.786 10.316 9.83 9.406 9.021 8.644 8.273 7.908 7.57 7.202 6.878 6.591 6.264 5.935 5.667 5.384 5.089 4.86 4.622 4.372 4.117 3.854 3.674 3.485 3.172 2.939 2.695 2.576 2.334 2.069 1.79 1.644 1.113 1.164 0.984 0.798 0.395 0.153 -0.121 -0.414 -0.742 -1.169 -1.777 -4.403 -4 ,5774 ,KEBNE ,16692923,Thu Nov 25 23:35:39 CET,Fri Nov 26 01:14:49 CET,0.0 1.756 2.213 2.522 2.774 2.999 3.204 3.395 3.733 3.889 4.03 3.897 4.382 4.493 4.712 4.913 5.1 5.19 5.371 5.531 5.763 5.925 6.072 6.275 6.498 6.723 6.925 7.097 7.322 7.547 7.744 7.981 8.231 8.472 8.737 9.031 9.301 9.593 9.908 10.235 10.577 10.941 11.34 11.732 12.177 12.677 13.195 13.688 14.228 14.735 15.074 14.918 14.385 13.79 13.158 12.468 11.877 11.345 10.843 10.306 9.842 9.397 8.983 8.606 8.226 7.895 7.562 7.237 6.962 6.675 6.365 6.103 5.836 5.565 5.35 5.123 4.885 4.625 4.354 4.178 4.001 3.706 3.486 3.25 3.136 2.913 2.67 2.409 2.257 1.718 1.778 1.599 1.404 0.972 0.715 0.444 0.166 -0.161 -0.596 -1.205 -3.586 -5 ,10010 ,KEBNE ,16692924,Thu Nov 25 23:35:40 CET,Fri Nov 26 01:06:44 CET,0.0 1.451 1.92 2.28 2.559 2.793 3.001 3.187 3.543 3.702 3.84 3.727 4.242 4.377 4.638 4.883 5.106 5.209 5.394 5.552 5.784 5.948 6.098 6.299 6.505 6.708 6.898 7.079 7.314 7.531 7.736 7.988 8.227 8.456 8.715 8.988 9.241 9.538 9.877 10.205 10.532 10.912 11.337 11.754 12.24 12.741 13.257 13.772 14.202 14.476 14.533 14.116 13.477 12.817 12.11 11.409 10.799 10.241 9.729 9.186 8.727 8.337 7.953 7.567 7.222 6.917 6.578 6.275 6.001 5.693 5.386 5.135 4.882 4.624 4.412 4.181 3.94 3.692 3.436 3.264 3.084 2.785 2.578 2.365 2.253 2.006 1.741 1.468 1.324 0.794 0.834 0.639 0.446 0.001 -0.247 -0.506 -0.825 -1.213 -1.669 -2.235 -4.221 -6 ,18456 ,KEBNE ,16692925,Thu Nov 25 23:36:41 CET,Fri Nov 26 01:16:02 CET,0.0 1.268 1.728 2.059 2.3 2.517 2.721 2.897 3.194 3.337 3.48 3.382 3.899 4.024 4.243 4.43 4.616 4.71 4.915 5.101 5.357 5.526 5.669 5.861 6.047 6.223 6.4 6.582 6.821 7.046 7.25 7.503 7.748 7.977 8.236 8.527 8.8 9.085 9.381 9.699 10.037 10.394 10.788 11.174 11.623 12.089 12.583 13.093 13.639 14.101 14.194 13.783 13.206 12.564 11.947 11.331 10.765 10.191 9.647 9.093 8.633 8.228 7.828 7.446 7.095 6.777 6.44 6.126 5.847 5.557 5.251 5.007 4.758 4.493 4.281 4.067 3.849 3.594 3.319 3.134 2.941 2.648 2.432 2.194 2.076 1.846 1.599 1.319 1.172 0.644 0.694 0.508 0.32 -0.094 -0.32 -0.577 -0.88 -1.223 -1.697 -2.393 -4.98 -7 ,2519 ,KEBNE ,16692926,Thu Nov 25 23:37:43 CET,Fri Nov 26 01:17:01 CET,0.0 1.236 1.687 2.018 2.306 2.561 2.777 2.986 3.34 3.49 3.631 3.512 4.027 4.15 4.376 4.576 4.761 4.854 5.038 5.195 5.428 5.588 5.727 5.92 6.118 6.319 6.507 6.679 6.901 7.119 7.324 7.58 7.827 8.056 8.334 8.634 8.906 9.199 9.496 9.829 10.176 10.534 10.944 11.355 11.84 12.34 12.876 13.383 13.871 14.323 14.424 13.948 13.284 12.583 11.916 11.241 10.589 10.011 9.476 8.929 8.474 8.068 7.694 7.317 6.953 6.634 6.286 5.955 5.682 5.409 5.105 4.855 4.613 4.36 4.15 3.931 3.696 3.45 3.198 3.012 2.807 2.488 2.281 2.073 1.962 1.721 1.476 1.212 1.069 0.53 0.58 0.41 0.22 -0.199 -0.442 -0.708 -0.998 -1.341 -1.787 -2.369 -4.347 -8 ,19350 ,KEBNE ,16692927,Thu Nov 25 23:37:43 CET,Fri Nov 26 01:17:44 CET,0.0 1.362 1.845 2.181 2.42 2.624 2.798 2.963 3.273 3.427 3.575 3.441 3.938 4.06 4.285 4.489 4.697 4.799 4.98 5.147 5.389 5.552 5.713 5.937 6.142 6.332 6.515 6.701 6.944 7.175 7.401 7.664 7.92 8.168 8.433 8.715 8.974 9.244 9.528 9.843 10.168 10.517 10.938 11.339 11.765 12.24 12.762 13.291 13.809 14.229 14.244 13.803 13.236 12.536 11.878 11.242 10.636 10.103 9.642 9.144 8.698 8.304 7.916 7.519 7.149 6.828 6.485 6.157 5.872 5.59 5.295 5.043 4.787 4.508 4.288 4.069 3.825 3.563 3.298 3.111 2.924 2.624 2.403 2.168 2.053 1.816 1.537 1.229 1.075 0.533 0.59 0.422 0.23 -0.177 -0.411 -0.691 -1.005 -1.377 -1.793 -2.29 -4.17 -9 ,2595 ,KEBNE ,16692928,Thu Nov 25 23:37:43 CET,Fri Nov 26 01:15:47 CET,0.0 1.471 1.932 2.263 2.557 2.82 3.046 3.254 3.573 3.725 3.882 3.785 4.293 4.411 4.622 4.826 5.033 5.137 5.319 5.482 5.724 5.884 6.044 6.279 6.515 6.716 6.89 7.06 7.286 7.508 7.715 7.945 8.176 8.415 8.688 8.991 9.275 9.565 9.865 10.206 10.547 10.909 11.352 11.812 12.277 12.711 13.19 13.701 14.209 14.546 14.49 14.044 13.415 12.728 12.102 11.464 10.854 10.317 9.864 9.397 8.943 8.519 8.122 7.728 7.382 7.076 6.722 6.393 6.101 5.803 5.503 5.263 5.001 4.714 4.502 4.294 4.087 3.853 3.59 3.4 3.201 2.886 2.656 2.415 2.293 2.042 1.775 1.506 1.368 0.835 0.878 0.688 0.491 0.072 -0.164 -0.413 -0.694 -1.022 -1.474 -2.164 -4.66 -10 ,109 ,KEBNE ,16692929,Thu Nov 25 23:37:43 CET,Fri Nov 26 01:17:18 CET,0.0 1.44 1.945 2.269 2.515 2.724 2.921 3.1 3.422 3.579 3.725 3.596 4.105 4.23 4.453 4.672 4.897 4.998 5.18 5.35 5.601 5.76 5.912 6.135 6.343 6.559 6.758 6.929 7.165 7.394 7.603 7.855 8.102 8.342 8.604 8.884 9.148 9.445 9.772 10.106 10.47 10.879 11.321 11.735 12.184 12.645 13.133 13.582 14.038 14.466 14.573 14.159 13.498 12.742 12.062 11.413 10.806 10.247 9.743 9.248 8.817 8.39 7.969 7.595 7.248 6.933 6.606 6.299 6.023 5.732 5.436 5.199 4.933 4.649 4.438 4.223 4.01 3.779 3.521 3.337 3.142 2.837 2.63 2.414 2.297 2.044 1.786 1.498 1.345 0.813 0.849 0.672 0.482 0.068 -0.177 -0.461 -0.787 -1.207 -1.737 -2.408 -4.374 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index d151b374..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4756 ,KEBNE ,16692931,Thu Nov 25 23:38:49 CET,Fri Nov 26 01:13:01 CET,0.0 1.309 1.868 2.322 2.716 3.062 3.398 3.72 4.299 4.573 4.839 4.867 5.614 5.846 6.305 6.744 7.166 7.382 7.813 8.234 8.839 9.237 9.639 10.226 10.799 11.37 11.94 12.504 13.236 13.958 14.671 15.544 16.416 17.281 18.288 19.452 20.615 21.921 23.371 24.935 26.643 28.661 31.094 33.634 36.724 40.282 44.578 49.752 56.211 64.593 76.057 86.84 93.999 99.129 102.992 106.062 108.46 110.37 111.851 113.211 114.292 115.182 115.968 116.655 117.243 117.726 118.179 118.559 118.849 119.12 119.371 119.568 119.766 119.955 120.102 120.235 120.332 120.401 120.457 120.479 120.474 120.454 120.435 120.413 120.412 120.4 120.349 120.288 120.245 119.812 120.027 119.945 119.835 119.584 119.415 119.206 118.964 118.639 118.246 117.642 113.928 -2 ,15575 ,KEBNE ,16692932,Thu Nov 25 23:38:46 CET,Fri Nov 26 01:19:56 CET,0.0 1.274 1.789 2.216 2.598 2.934 3.243 3.546 4.135 4.406 4.661 4.65 5.389 5.631 6.104 6.558 6.997 7.217 7.661 8.102 8.729 9.135 9.531 10.118 10.707 11.285 11.851 12.404 13.135 13.861 14.579 15.467 16.336 17.188 18.196 19.345 20.492 21.804 23.254 24.835 26.564 28.574 30.981 33.522 36.618 40.24 44.643 49.854 56.39 64.878 76.264 86.972 94.217 99.422 103.304 106.327 108.642 110.524 111.993 113.331 114.39 115.249 115.98 116.595 117.14 117.607 118.052 118.412 118.703 118.975 119.225 119.426 119.622 119.805 119.911 120.003 120.111 120.212 120.284 120.325 120.339 120.341 120.342 120.319 120.298 120.268 120.233 120.173 120.133 119.713 119.948 119.875 119.797 119.556 119.379 119.194 118.959 118.622 118.199 117.609 114.053 -3 ,31204 ,KEBNE ,16692933,Thu Nov 25 23:38:46 CET,Fri Nov 26 01:20:18 CET,0.0 1.508 2.054 2.478 2.851 3.206 3.537 3.862 4.456 4.728 4.997 5.003 5.75 5.998 6.467 6.92 7.378 7.601 8.019 8.424 9.023 9.427 9.829 10.415 11.0 11.585 12.161 12.726 13.464 14.173 14.871 15.751 16.613 17.467 18.486 19.646 20.788 22.106 23.564 25.135 26.846 28.844 31.291 33.876 37.004 40.6 44.942 50.165 56.741 65.177 76.515 87.21 94.326 99.456 103.334 106.351 108.71 110.652 112.159 113.533 114.588 115.437 116.185 116.836 117.42 117.937 118.44 118.824 119.127 119.423 119.673 119.859 120.042 120.203 120.32 120.444 120.558 120.667 120.768 120.808 120.839 120.892 120.893 120.873 120.869 120.862 120.808 120.71 120.656 120.24 120.495 120.422 120.309 120.038 119.896 119.73 119.481 119.146 118.748 118.103 114.339 -4 ,14215 ,KEBNE ,16692934,Thu Nov 25 23:38:46 CET,Fri Nov 26 01:21:03 CET,0.0 1.194 1.742 2.191 2.573 2.926 3.259 3.569 4.154 4.441 4.705 4.701 5.446 5.7 6.194 6.651 7.09 7.313 7.759 8.191 8.813 9.22 9.622 10.206 10.781 11.355 11.92 12.472 13.206 13.928 14.628 15.499 16.367 17.228 18.247 19.424 20.574 21.857 23.302 24.894 26.582 28.555 30.985 33.545 36.646 40.233 44.595 49.844 56.449 64.874 76.143 86.884 94.106 99.284 103.115 106.131 108.488 110.383 111.854 113.202 114.256 115.106 115.848 116.515 117.092 117.587 118.068 118.459 118.763 119.057 119.343 119.542 119.725 119.901 120.008 120.105 120.205 120.284 120.322 120.328 120.333 120.326 120.315 120.278 120.253 120.189 120.096 119.96 119.876 119.423 119.587 119.49 119.385 119.094 118.922 118.688 118.374 118.0 117.528 116.887 114.156 -5 ,12353 ,KEBNE ,16692935,Thu Nov 25 23:38:46 CET,Fri Nov 26 01:20:14 CET,0.0 1.353 1.889 2.316 2.722 3.121 3.471 3.769 4.341 4.624 4.894 4.892 5.63 5.865 6.317 6.766 7.205 7.417 7.852 8.279 8.909 9.329 9.725 10.298 10.859 11.406 11.952 12.505 13.239 13.963 14.67 15.536 16.392 17.238 18.246 19.409 20.567 21.87 23.306 24.884 26.591 28.569 30.963 33.479 36.528 40.054 44.332 49.483 55.948 64.239 75.529 86.166 93.259 98.323 102.024 104.97 107.258 109.054 110.486 111.807 112.846 113.746 114.557 115.24 115.806 116.287 116.744 117.115 117.436 117.747 118.017 118.214 118.395 118.542 118.646 118.749 118.833 118.897 118.932 118.949 118.979 119.011 119.017 119.005 118.996 118.973 118.921 118.833 118.772 118.349 118.583 118.489 118.362 118.017 117.797 117.53 117.226 116.878 116.336 115.55 112.183 -6 ,2652 ,KEBNE ,16692936,Thu Nov 25 23:38:46 CET,Fri Nov 26 01:19:57 CET,0.0 1.148 1.689 2.133 2.513 2.871 3.188 3.483 4.062 4.344 4.613 4.624 5.369 5.623 6.109 6.573 7.02 7.239 7.672 8.099 8.723 9.122 9.514 10.108 10.69 11.256 11.828 12.393 13.128 13.853 14.563 15.442 16.302 17.139 18.14 19.307 20.467 21.773 23.212 24.774 26.473 28.465 30.872 33.397 36.461 40.02 44.323 49.47 55.982 64.341 75.553 86.008 93.015 98.096 101.925 104.96 107.332 109.283 110.805 112.162 113.229 114.113 114.863 115.502 116.062 116.543 116.997 117.389 117.719 117.993 118.23 118.406 118.558 118.695 118.797 118.891 118.961 119.019 119.072 119.092 119.102 119.121 119.132 119.14 119.129 119.081 119.025 118.95 118.888 118.454 118.656 118.539 118.413 118.156 118.005 117.806 117.54 117.228 116.821 116.187 113.688 -7 ,18204 ,KEBNE ,16692937,Thu Nov 25 23:39:48 CET,Fri Nov 26 01:18:15 CET,0.0 1.213 1.766 2.2 2.556 2.899 3.231 3.53 4.059 4.316 4.578 4.606 5.356 5.59 6.054 6.499 6.929 7.145 7.57 7.989 8.604 9.015 9.419 10.011 10.596 11.171 11.734 12.282 13.007 13.727 14.449 15.33 16.18 17.037 18.057 19.228 20.377 21.667 23.115 24.696 26.404 28.407 30.849 33.383 36.421 39.976 44.323 49.535 56.068 64.432 75.722 86.402 93.588 98.825 102.727 105.756 108.128 110.04 111.541 112.912 113.979 114.842 115.606 116.289 116.869 117.353 117.819 118.199 118.474 118.729 118.983 119.177 119.354 119.517 119.623 119.716 119.807 119.903 119.978 120.005 120.031 120.059 120.056 120.052 120.056 120.041 119.987 119.912 119.875 119.45 119.63 119.522 119.414 119.167 119.013 118.823 118.585 118.241 117.769 117.102 113.498 -8 ,26667 ,KEBNE ,16692938,Thu Nov 25 23:39:48 CET,Fri Nov 26 01:17:21 CET,0.0 1.489 2.092 2.554 2.922 3.243 3.551 3.86 4.44 4.706 4.963 4.965 5.71 5.948 6.419 6.878 7.328 7.545 7.965 8.38 9.0 9.403 9.798 10.392 10.975 11.539 12.098 12.651 13.376 14.103 14.827 15.723 16.608 17.481 18.509 19.658 20.799 22.102 23.543 25.129 26.841 28.836 31.256 33.784 36.869 40.481 44.892 50.175 56.731 65.09 76.358 87.008 94.14 99.225 102.994 105.928 108.218 110.116 111.626 113.031 114.121 114.993 115.784 116.485 117.07 117.543 117.983 118.357 118.654 118.951 119.224 119.417 119.614 119.805 119.947 120.074 120.163 120.242 120.319 120.36 120.395 120.413 120.403 120.39 120.38 120.343 120.297 120.23 120.191 119.787 120.036 119.952 119.86 119.604 119.438 119.245 118.989 118.673 118.238 117.616 113.684 -9 ,18607 ,KEBNE ,16692939,Thu Nov 25 23:39:48 CET,Fri Nov 26 01:18:07 CET,0.0 1.456 1.945 2.343 2.717 3.052 3.37 3.678 4.24 4.501 4.749 4.742 5.497 5.749 6.209 6.655 7.109 7.34 7.793 8.219 8.839 9.251 9.649 10.241 10.831 11.408 11.97 12.52 13.236 13.94 14.655 15.533 16.381 17.22 18.227 19.401 20.561 21.868 23.311 24.903 26.63 28.625 31.043 33.568 36.658 40.24 44.528 49.7 56.184 64.532 75.9 86.643 93.876 99.118 102.97 105.986 108.365 110.29 111.794 113.167 114.249 115.129 115.916 116.622 117.212 117.68 118.136 118.528 118.837 119.118 119.4 119.627 119.814 119.965 120.079 120.192 120.303 120.406 120.501 120.551 120.566 120.572 120.57 120.537 120.518 120.47 120.429 120.393 120.357 119.936 120.143 120.044 119.934 119.648 119.447 119.247 119.038 118.764 118.357 117.693 114.252 -10 ,10149 ,KEBNE ,16692940,Thu Nov 25 23:39:50 CET,Fri Nov 26 01:09:43 CET,0.0 1.19 1.723 2.156 2.535 2.879 3.218 3.541 4.104 4.377 4.648 4.648 5.385 5.621 6.07 6.509 6.945 7.167 7.605 8.024 8.642 9.05 9.448 10.034 10.611 11.185 11.743 12.297 13.035 13.747 14.449 15.314 16.182 17.047 18.067 19.24 20.389 21.678 23.097 24.678 26.403 28.409 30.836 33.369 36.449 40.021 44.369 49.631 56.223 64.586 75.858 86.59 93.765 98.909 102.725 105.659 107.968 109.882 111.362 112.705 113.768 114.654 115.426 116.047 116.598 117.104 117.581 117.952 118.233 118.507 118.767 118.965 119.161 119.347 119.494 119.639 119.773 119.897 119.99 120.032 120.068 120.093 120.081 120.058 120.044 120.005 119.916 119.817 119.774 119.349 119.529 119.419 119.306 119.041 118.862 118.668 118.464 118.178 117.758 117.13 112.86 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index fda51954..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2o_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19823 ,KEBNE ,17025326,Wed Dec 22 12:17:57 CET,Wed Dec 22 13:55:51 CET,0.0 1.609 2.21 2.685 3.082 3.439 3.782 4.099 4.704 4.992 5.261 5.277 6.016 6.254 6.712 7.153 7.586 7.805 8.23 8.644 9.271 9.669 10.058 10.648 11.233 11.81 12.381 12.935 13.651 14.364 15.065 15.931 16.769 17.581 18.566 19.707 20.802 22.039 23.447 24.988 26.662 28.59 30.883 33.31 36.281 39.723 43.888 48.883 55.111 63.107 73.973 84.172 90.849 95.675 99.324 102.141 104.235 105.924 107.272 108.541 109.565 110.381 111.084 111.693 112.21 112.644 113.063 113.411 113.66 113.889 114.133 114.312 114.455 114.583 114.673 114.741 114.772 114.771 114.755 114.754 114.759 114.752 114.738 114.716 114.698 114.649 114.594 114.531 114.477 114.028 114.282 114.212 114.128 113.911 113.749 113.536 113.281 112.953 112.544 112.032 109.842 -2 ,7543 ,KEBNE ,17025327,Wed Dec 22 12:17:57 CET,Wed Dec 22 13:56:14 CET,0.0 1.86 2.432 2.892 3.294 3.665 3.997 4.296 4.867 5.151 5.425 5.421 6.163 6.402 6.878 7.334 7.763 7.974 8.388 8.804 9.419 9.818 10.221 10.82 11.404 11.973 12.532 13.08 13.797 14.503 15.184 16.028 16.884 17.737 18.732 19.854 20.939 22.168 23.551 25.081 26.762 28.723 31.078 33.511 36.461 39.903 44.096 49.078 55.308 63.267 73.99 84.078 90.821 95.739 99.371 102.197 104.392 106.161 107.506 108.723 109.672 110.446 111.133 111.728 112.244 112.684 113.111 113.447 113.699 113.93 114.149 114.318 114.473 114.623 114.729 114.819 114.891 114.943 114.976 114.977 114.972 114.965 114.957 114.939 114.922 114.881 114.82 114.721 114.662 114.215 114.452 114.372 114.278 114.06 113.932 113.756 113.522 113.233 112.844 112.26 110.649 -3 ,2601 ,KEBNE ,17025328,Wed Dec 22 12:17:57 CET,Wed Dec 22 13:56:15 CET,0.0 1.541 2.068 2.497 2.872 3.216 3.55 3.867 4.471 4.748 5.006 5.003 5.742 5.986 6.45 6.889 7.324 7.544 7.974 8.377 8.97 9.365 9.761 10.343 10.898 11.443 11.989 12.538 13.256 13.948 14.634 15.483 16.324 17.162 18.135 19.247 20.358 21.627 23.025 24.532 26.177 28.125 30.493 32.937 35.907 39.366 43.489 48.4 54.572 62.462 73.182 83.408 90.219 95.081 98.676 101.469 103.593 105.318 106.685 107.924 108.918 109.739 110.461 111.071 111.568 112.001 112.423 112.768 113.037 113.277 113.523 113.707 113.865 114.02 114.121 114.206 114.284 114.339 114.377 114.406 114.425 114.428 114.416 114.379 114.357 114.309 114.242 114.152 114.092 113.647 113.881 113.786 113.672 113.408 113.269 113.104 112.881 112.578 112.184 111.53 109.071 -4 ,5869 ,KEBNE ,17025329,Wed Dec 22 12:17:57 CET,Wed Dec 22 13:56:07 CET,0.0 1.412 2.021 2.533 2.952 3.321 3.66 3.972 4.558 4.836 5.116 5.181 5.946 6.187 6.655 7.12 7.567 7.784 8.21 8.632 9.262 9.677 10.083 10.676 11.232 11.783 12.342 12.89 13.604 14.312 15.012 15.87 16.71 17.542 18.549 19.693 20.795 22.051 23.455 24.999 26.667 28.59 30.904 33.325 36.23 39.632 43.793 48.772 55.102 63.136 73.79 83.788 90.483 95.329 98.959 101.801 103.984 105.76 107.175 108.444 109.408 110.197 110.881 111.483 112.007 112.436 112.825 113.149 113.417 113.659 113.881 114.048 114.213 114.366 114.466 114.536 114.593 114.642 114.679 114.69 114.685 114.676 114.665 114.629 114.603 114.538 114.46 114.359 114.291 113.818 113.978 113.849 113.709 113.362 113.16 112.94 112.679 112.353 111.957 111.414 108.986 -5 ,8358 ,KEBNE ,17025330,Wed Dec 22 12:17:57 CET,Wed Dec 22 13:57:42 CET,0.0 1.705 2.35 2.835 3.251 3.617 3.953 4.279 4.876 5.141 5.394 5.415 6.168 6.41 6.88 7.337 7.786 8.006 8.43 8.837 9.441 9.84 10.231 10.812 11.401 11.986 12.542 13.077 13.79 14.494 15.193 16.062 16.921 17.78 18.795 19.944 21.054 22.314 23.718 25.237 26.898 28.853 31.194 33.611 36.526 39.947 44.103 48.988 55.069 62.893 73.447 83.419 90.062 94.806 98.344 101.137 103.314 105.101 106.474 107.686 108.625 109.39 110.082 110.693 111.221 111.671 112.07 112.379 112.635 112.872 113.092 113.25 113.397 113.538 113.635 113.726 113.806 113.845 113.835 113.829 113.824 113.821 113.815 113.767 113.735 113.668 113.588 113.509 113.456 113.023 113.279 113.198 113.113 112.865 112.725 112.575 112.373 112.115 111.782 111.325 109.385 -6 ,6372 ,KEBNE ,17025331,Wed Dec 22 12:17:57 CET,Wed Dec 22 13:56:26 CET,0.0 1.516 2.1 2.602 3.013 3.372 3.699 4.019 4.629 4.907 5.172 5.191 5.929 6.162 6.627 7.085 7.529 7.75 8.174 8.569 9.183 9.595 9.989 10.574 11.157 11.722 12.267 12.803 13.525 14.245 14.948 15.825 16.674 17.495 18.467 19.587 20.705 21.982 23.398 24.924 26.573 28.496 30.814 33.211 36.124 39.536 43.684 48.599 54.686 62.508 73.118 83.068 89.613 94.348 97.909 100.696 102.828 104.543 105.913 107.159 108.129 108.917 109.607 110.213 110.712 111.12 111.52 111.852 112.105 112.333 112.547 112.714 112.867 112.989 113.077 113.146 113.198 113.246 113.278 113.291 113.308 113.315 113.278 113.236 113.215 113.147 113.069 112.974 112.928 112.501 112.712 112.619 112.519 112.258 112.105 111.928 111.718 111.416 111.041 110.549 107.732 -7 ,7045 ,KEBNE ,17025332,Wed Dec 22 12:17:57 CET,Wed Dec 22 13:56:40 CET,0.0 1.374 1.915 2.361 2.765 3.121 3.459 3.783 4.388 4.668 4.934 4.957 5.698 5.933 6.396 6.843 7.287 7.502 7.914 8.326 8.94 9.347 9.751 10.348 10.933 11.502 12.051 12.594 13.311 14.023 14.725 15.582 16.424 17.263 18.259 19.385 20.507 21.778 23.166 24.689 26.35 28.292 30.665 33.125 36.087 39.52 43.62 48.536 54.678 62.453 72.966 82.863 89.495 94.235 97.694 100.444 102.636 104.429 105.791 107.022 108.02 108.833 109.525 110.099 110.592 111.012 111.406 111.733 112.011 112.281 112.526 112.704 112.853 112.991 113.081 113.148 113.218 113.291 113.343 113.369 113.385 113.385 113.37 113.342 113.331 113.284 113.212 113.124 113.061 112.621 112.87 112.783 112.676 112.407 112.266 112.112 111.883 111.573 111.202 110.671 108.385 -8 ,30959 ,KEBNE ,17025333,Wed Dec 22 12:17:57 CET,Wed Dec 22 13:55:37 CET,0.0 1.419 2.002 2.442 2.819 3.191 3.539 3.854 4.437 4.704 4.964 4.974 5.721 5.974 6.458 6.905 7.348 7.566 7.985 8.411 9.032 9.433 9.834 10.425 11.001 11.564 12.114 12.648 13.354 14.062 14.762 15.627 16.47 17.288 18.27 19.415 20.539 21.798 23.193 24.703 26.352 28.272 30.579 32.988 35.909 39.346 43.476 48.394 54.547 62.425 73.108 83.077 89.7 94.427 97.935 100.692 102.829 104.573 105.921 107.116 108.058 108.841 109.492 110.053 110.57 110.977 111.355 111.674 111.909 112.133 112.361 112.514 112.635 112.74 112.82 112.909 112.994 113.041 113.037 113.029 113.034 113.045 113.046 113.022 113.004 112.958 112.89 112.811 112.763 112.322 112.548 112.46 112.368 112.121 111.942 111.718 111.45 111.119 110.726 110.143 107.787 -9 ,26841 ,KEBNE ,17025334,Wed Dec 22 12:17:57 CET,Wed Dec 22 13:56:04 CET,0.0 1.727 2.336 2.797 3.169 3.515 3.844 4.135 4.699 4.986 5.26 5.269 6.005 6.242 6.723 7.196 7.64 7.861 8.29 8.696 9.306 9.71 10.105 10.698 11.289 11.875 12.443 12.991 13.716 14.423 15.114 15.97 16.801 17.631 18.631 19.771 20.895 22.154 23.531 25.056 26.738 28.68 31.012 33.467 36.438 39.883 44.047 48.974 55.118 62.95 73.514 83.543 90.352 95.231 98.77 101.564 103.732 105.455 106.829 108.098 109.053 109.811 110.485 111.062 111.572 112.017 112.436 112.756 112.988 113.218 113.459 113.643 113.795 113.927 114.013 114.087 114.156 114.222 114.272 114.284 114.285 114.27 114.247 114.22 114.211 114.168 114.087 114.003 113.952 113.508 113.761 113.676 113.578 113.354 113.206 113.036 112.801 112.508 112.153 111.531 107.698 -10 ,13336 ,KEBNE ,17025335,Wed Dec 22 12:17:57 CET,Wed Dec 22 13:56:10 CET,0.0 1.66 2.231 2.688 3.053 3.379 3.697 3.995 4.526 4.784 5.036 5.022 5.763 6.002 6.465 6.907 7.344 7.562 7.986 8.399 9.018 9.425 9.816 10.388 10.947 11.509 12.066 12.621 13.349 14.051 14.735 15.585 16.432 17.27 18.252 19.366 20.468 21.726 23.13 24.668 26.314 28.223 30.553 32.983 35.912 39.334 43.491 48.492 54.753 62.73 73.395 83.383 90.129 94.992 98.583 101.363 103.487 105.184 106.537 107.794 108.76 109.544 110.216 110.781 111.258 111.673 112.068 112.38 112.616 112.823 113.019 113.185 113.35 113.486 113.587 113.677 113.764 113.837 113.883 113.906 113.915 113.918 113.908 113.872 113.847 113.784 113.687 113.583 113.53 113.094 113.353 113.256 113.138 112.88 112.713 112.484 112.217 111.91 111.554 110.962 108.841 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index ffc19e2e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19419 ,KEBNE ,16692941,Thu Nov 25 23:40:52 CET,Fri Nov 26 01:24:34 CET,0.0 1.738 2.281 2.684 3.066 3.434 3.762 4.053 4.598 4.848 5.099 5.099 5.782 5.986 6.376 6.746 7.095 7.272 7.633 7.979 8.481 8.824 9.17 9.669 10.147 10.604 11.069 11.532 12.128 12.719 13.307 14.026 14.737 15.441 16.27 17.235 18.178 19.23 20.406 21.704 23.113 24.729 26.649 28.626 31.015 33.807 37.13 40.996 45.762 51.812 59.864 67.227 72.014 75.407 77.898 79.765 81.183 82.355 83.199 83.913 84.498 84.952 85.296 85.542 85.719 85.852 85.958 86.037 86.121 86.205 86.251 86.271 86.278 86.269 86.251 86.209 86.163 86.119 86.063 86.012 85.932 85.759 85.64 85.528 85.465 85.311 85.113 84.897 84.789 84.297 84.474 84.347 84.162 83.713 83.473 83.196 82.878 82.469 81.934 81.19 76.976 -2 ,21137 ,KEBNE ,16692942,Thu Nov 25 23:40:51 CET,Fri Nov 26 01:23:17 CET,0.0 1.998 2.693 3.135 3.498 3.824 4.128 4.428 4.959 5.208 5.435 5.401 6.108 6.331 6.743 7.159 7.562 7.747 8.105 8.467 9.022 9.378 9.728 10.245 10.733 11.2 11.659 12.116 12.72 13.329 13.928 14.649 15.352 16.021 16.824 17.77 18.688 19.725 20.862 22.082 23.409 24.943 26.784 28.737 31.087 33.801 37.076 40.993 45.785 51.736 59.656 66.897 71.583 74.837 77.191 78.988 80.382 81.545 82.425 83.169 83.727 84.155 84.466 84.684 84.832 84.925 85.029 85.119 85.183 85.231 85.235 85.232 85.238 85.221 85.199 85.155 85.062 84.954 84.846 84.757 84.661 84.529 84.423 84.304 84.247 84.1 83.928 83.739 83.631 83.143 83.272 83.118 82.964 82.617 82.4 82.113 81.79 81.42 80.935 80.225 77.135 -3 ,31174 ,KEBNE ,16692943,Thu Nov 25 23:40:52 CET,Fri Nov 26 01:24:26 CET,0.0 2.174 2.801 3.27 3.663 4.006 4.312 4.586 5.099 5.339 5.562 5.524 6.201 6.401 6.803 7.194 7.588 7.784 8.162 8.531 9.062 9.403 9.753 10.261 10.752 11.247 11.727 12.207 12.834 13.446 14.037 14.749 15.447 16.122 16.926 17.863 18.791 19.864 21.056 22.313 23.651 25.223 27.106 29.062 31.452 34.161 37.394 41.257 46.047 52.034 59.953 67.337 72.088 75.371 77.742 79.55 80.908 81.989 82.841 83.569 84.114 84.516 84.818 85.104 85.346 85.519 85.653 85.739 85.809 85.852 85.871 85.879 85.885 85.871 85.851 85.83 85.778 85.701 85.604 85.53 85.449 85.3 85.193 85.071 84.996 84.827 84.644 84.428 84.294 83.777 83.906 83.764 83.583 83.15 82.878 82.561 82.203 81.798 81.281 80.558 76.851 -4 ,7279 ,KEBNE ,16692944,Thu Nov 25 23:40:51 CET,Fri Nov 26 01:21:35 CET,0.0 1.941 2.52 2.931 3.293 3.637 3.943 4.222 4.739 4.977 5.207 5.184 5.878 6.093 6.502 6.907 7.3 7.49 7.857 8.216 8.753 9.107 9.459 9.972 10.461 10.934 11.405 11.862 12.458 13.069 13.665 14.386 15.115 15.83 16.644 17.563 18.484 19.524 20.668 21.912 23.276 24.864 26.786 28.816 31.213 33.96 37.259 41.131 45.951 52.027 59.911 67.278 72.072 75.396 77.832 79.708 81.15 82.238 83.048 83.758 84.305 84.719 85.009 85.24 85.441 85.616 85.74 85.813 85.87 85.924 85.968 85.971 85.96 85.947 85.919 85.859 85.777 85.703 85.623 85.558 85.475 85.35 85.27 85.15 85.079 84.93 84.735 84.519 84.412 83.918 84.046 83.903 83.757 83.424 83.207 82.951 82.618 82.198 81.709 80.959 77.485 -5 ,12162 ,KEBNE ,16692945,Thu Nov 25 23:40:51 CET,Fri Nov 26 01:19:23 CET,0.0 1.842 2.398 2.834 3.198 3.533 3.839 4.106 4.59 4.842 5.1 5.09 5.778 5.995 6.421 6.825 7.223 7.422 7.798 8.157 8.69 9.046 9.392 9.889 10.366 10.838 11.303 11.75 12.33 12.902 13.47 14.165 14.853 15.537 16.35 17.309 18.258 19.307 20.42 21.635 22.965 24.466 26.316 28.311 30.682 33.444 36.777 40.675 45.56 51.682 59.64 67.044 71.878 75.193 77.534 79.264 80.619 81.711 82.511 83.274 83.903 84.376 84.76 85.051 85.232 85.355 85.478 85.57 85.617 85.647 85.676 85.688 85.7 85.693 85.665 85.614 85.54 85.472 85.399 85.338 85.273 85.129 85.005 84.866 84.782 84.605 84.409 84.179 84.055 83.553 83.671 83.513 83.33 82.934 82.716 82.478 82.195 81.78 81.276 80.616 76.939 -6 ,15226 ,KEBNE ,16692946,Thu Nov 25 23:40:52 CET,Fri Nov 26 01:21:23 CET,0.0 1.316 1.774 2.155 2.498 2.822 3.13 3.431 3.989 4.231 4.455 4.429 5.115 5.322 5.715 6.116 6.514 6.701 7.069 7.436 7.967 8.311 8.649 9.145 9.642 10.134 10.613 11.078 11.684 12.274 12.841 13.537 14.226 14.927 15.766 16.714 17.624 18.658 19.821 21.068 22.395 23.949 25.814 27.747 30.044 32.672 35.887 39.79 44.634 50.64 58.565 65.964 70.757 74.044 76.44 78.237 79.537 80.625 81.451 82.13 82.649 83.047 83.365 83.604 83.794 83.963 84.097 84.172 84.227 84.265 84.295 84.321 84.308 84.258 84.227 84.188 84.131 84.074 84.019 83.968 83.897 83.776 83.666 83.522 83.448 83.284 83.104 82.914 82.81 82.309 82.413 82.264 82.075 81.6 81.337 81.044 80.729 80.335 79.771 78.921 73.738 -7 ,13912 ,KEBNE ,16692947,Thu Nov 25 23:40:51 CET,Fri Nov 26 01:24:31 CET,0.0 1.976 2.498 2.914 3.292 3.649 3.962 4.229 4.743 4.983 5.217 5.242 5.941 6.157 6.597 7.018 7.433 7.632 8.001 8.363 8.897 9.244 9.593 10.111 10.598 11.083 11.577 12.057 12.678 13.286 13.866 14.571 15.286 15.986 16.791 17.711 18.632 19.686 20.833 22.089 23.446 24.985 26.853 28.809 31.178 33.913 37.154 40.99 45.675 51.58 59.437 66.664 71.347 74.65 77.079 78.955 80.407 81.519 82.294 82.977 83.471 83.826 84.13 84.376 84.582 84.759 84.911 85.012 85.091 85.146 85.164 85.182 85.171 85.109 85.047 84.983 84.915 84.814 84.668 84.555 84.449 84.314 84.22 84.107 84.039 83.876 83.691 83.44 83.291 82.752 82.802 82.637 82.449 81.997 81.748 81.488 81.205 80.821 80.258 79.46 76.696 -8 ,14284 ,KEBNE ,16692948,Thu Nov 25 23:40:51 CET,Fri Nov 26 01:18:56 CET,0.0 1.61 2.18 2.615 2.968 3.286 3.587 3.87 4.359 4.584 4.816 4.812 5.51 5.722 6.11 6.492 6.871 7.064 7.441 7.793 8.313 8.669 9.022 9.525 10.011 10.482 10.951 11.424 12.053 12.668 13.254 13.98 14.697 15.383 16.204 17.151 18.055 19.048 20.17 21.424 22.775 24.333 26.21 28.179 30.556 33.273 36.492 40.322 45.102 51.125 59.094 66.366 71.05 74.335 76.774 78.718 80.211 81.326 82.16 82.932 83.521 83.959 84.276 84.547 84.776 84.938 85.079 85.2 85.283 85.334 85.385 85.403 85.399 85.376 85.338 85.308 85.281 85.247 85.202 85.156 85.091 84.947 84.83 84.698 84.633 84.506 84.351 84.171 84.053 83.533 83.644 83.499 83.351 83.066 82.907 82.703 82.454 82.104 81.551 80.809 77.724 -9 ,31148 ,KEBNE ,16692949,Thu Nov 25 23:40:51 CET,Fri Nov 26 01:19:11 CET,0.0 1.76 2.354 2.813 3.203 3.545 3.85 4.13 4.684 4.948 5.196 5.199 5.902 6.127 6.573 6.984 7.356 7.536 7.899 8.25 8.755 9.095 9.427 9.911 10.391 10.86 11.32 11.786 12.403 12.99 13.566 14.264 14.95 15.64 16.465 17.414 18.34 19.374 20.496 21.715 23.041 24.588 26.48 28.448 30.781 33.466 36.72 40.585 45.351 51.387 59.485 67.012 71.943 75.434 77.908 79.759 81.177 82.284 83.125 83.865 84.388 84.801 85.145 85.392 85.577 85.715 85.845 85.962 86.044 86.112 86.148 86.132 86.085 86.014 85.955 85.884 85.766 85.655 85.554 85.495 85.453 85.349 85.236 85.124 85.068 84.948 84.811 84.616 84.512 84.033 84.143 83.974 83.8 83.434 83.221 82.973 82.699 82.31 81.805 81.091 78.18 -10 ,14182 ,KEBNE ,16692950,Thu Nov 25 23:40:52 CET,Fri Nov 26 01:19:07 CET,0.0 1.515 2.048 2.47 2.854 3.193 3.493 3.782 4.324 4.573 4.814 4.801 5.5 5.734 6.172 6.569 6.949 7.136 7.508 7.882 8.431 8.783 9.129 9.64 10.146 10.64 11.125 11.605 12.239 12.846 13.412 14.112 14.81 15.497 16.308 17.243 18.168 19.207 20.376 21.625 22.963 24.513 26.365 28.317 30.683 33.418 36.75 40.709 45.532 51.524 59.497 66.893 71.568 74.91 77.429 79.241 80.596 81.716 82.572 83.347 83.91 84.349 84.705 84.967 85.144 85.278 85.405 85.497 85.591 85.681 85.745 85.788 85.81 85.797 85.762 85.713 85.649 85.555 85.432 85.358 85.283 85.145 85.044 84.906 84.825 84.668 84.491 84.245 84.098 83.58 83.687 83.522 83.346 82.961 82.704 82.409 82.09 81.704 81.186 80.476 77.464 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt deleted file mode 100644 index ebe71f30..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2p_p38a-2o.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6631 ,KEBNE ,16692951,Thu Nov 25 23:40:51 CET,Fri Nov 26 01:19:51 CET,0.0 2.713 3.314 3.7 3.994 4.288 4.564 4.784 5.158 5.345 5.515 5.351 5.973 6.116 6.383 6.629 6.854 6.946 7.112 7.29 7.55 7.705 7.843 8.026 8.2 8.366 8.526 8.691 8.906 9.11 9.304 9.551 9.777 9.956 10.123 10.274 10.408 10.559 10.745 10.924 11.053 11.15 11.228 11.275 11.274 11.168 10.925 10.414 9.512 8.139 5.552 2.381 -0.229 -2.47 -4.32 -5.96 -7.325 -8.503 -9.575 -10.679 -11.609 -12.442 -13.225 -13.935 -14.592 -15.182 -15.791 -16.333 -16.785 -17.254 -17.757 -18.178 -18.623 -19.087 -19.445 -19.81 -20.186 -20.577 -20.974 -21.244 -21.547 -22.042 -22.363 -22.679 -22.846 -23.196 -23.547 -23.886 -24.077 -24.804 -24.805 -25.056 -25.313 -25.884 -26.213 -26.575 -26.974 -27.422 -27.929 -28.505 -30.319 -2 ,15402 ,KEBNE ,16692952,Thu Nov 25 23:41:53 CET,Fri Nov 26 01:20:09 CET,0.0 2.754 3.364 3.726 4.013 4.271 4.52 4.737 5.095 5.291 5.467 5.262 5.865 5.999 6.226 6.42 6.605 6.693 6.876 7.057 7.286 7.447 7.596 7.776 7.955 8.142 8.33 8.488 8.676 8.853 9.029 9.273 9.493 9.665 9.825 9.986 10.127 10.245 10.345 10.433 10.528 10.628 10.652 10.607 10.512 10.338 10.035 9.511 8.658 7.27 4.837 1.86 -0.637 -2.713 -4.43 -5.948 -7.287 -8.488 -9.47 -10.461 -11.339 -12.104 -12.838 -13.532 -14.172 -14.756 -15.355 -15.876 -16.332 -16.829 -17.385 -17.84 -18.28 -18.739 -19.086 -19.45 -19.844 -20.24 -20.64 -20.898 -21.164 -21.601 -21.902 -22.225 -22.404 -22.778 -23.148 -23.519 -23.708 -24.401 -24.372 -24.633 -24.892 -25.469 -25.794 -26.121 -26.485 -26.905 -27.43 -28.2 -31.365 -3 ,27670 ,KEBNE ,16692953,Thu Nov 25 23:41:52 CET,Fri Nov 26 01:21:03 CET,0.0 2.118 2.666 3.039 3.375 3.657 3.9 4.108 4.509 4.686 4.844 4.702 5.315 5.427 5.609 5.794 5.993 6.094 6.274 6.438 6.682 6.837 6.986 7.196 7.374 7.538 7.699 7.841 8.043 8.24 8.397 8.572 8.73 8.869 9.015 9.177 9.308 9.428 9.535 9.616 9.692 9.781 9.855 9.867 9.788 9.618 9.345 8.813 7.926 6.55 4.083 1.098 -1.367 -3.494 -5.29 -6.847 -8.196 -9.401 -10.437 -11.476 -12.361 -13.179 -13.975 -14.714 -15.365 -15.934 -16.524 -17.057 -17.533 -18.015 -18.5 -18.925 -19.371 -19.825 -20.17 -20.518 -20.903 -21.329 -21.751 -22.03 -22.324 -22.778 -23.093 -23.434 -23.61 -23.96 -24.33 -24.726 -24.934 -25.643 -25.58 -25.814 -26.086 -26.693 -27.007 -27.353 -27.755 -28.26 -29.034 -30.108 -34.38 -4 ,14071 ,KEBNE ,16692955,Thu Nov 25 23:41:53 CET,Fri Nov 26 01:27:15 CET,0.0 1.494 1.935 2.304 2.648 2.942 3.193 3.407 3.811 3.994 4.146 3.941 4.542 4.67 4.912 5.149 5.377 5.48 5.644 5.803 6.041 6.184 6.324 6.521 6.701 6.871 7.028 7.166 7.336 7.505 7.674 7.865 8.022 8.193 8.391 8.584 8.771 8.948 9.112 9.271 9.437 9.669 9.847 9.842 9.818 9.758 9.556 9.206 8.56 7.353 5.005 2.048 -0.431 -2.668 -4.572 -6.189 -7.596 -8.904 -10.003 -11.043 -11.933 -12.724 -13.483 -14.219 -14.914 -15.535 -16.148 -16.691 -17.168 -17.653 -18.149 -18.566 -19.009 -19.505 -19.896 -20.265 -20.665 -21.074 -21.468 -21.764 -22.069 -22.537 -22.862 -23.193 -23.364 -23.727 -24.108 -24.512 -24.724 -25.426 -25.386 -25.628 -25.87 -26.398 -26.686 -27.008 -27.413 -27.915 -28.504 -29.253 -33.341 -5 ,10764 ,KEBNE ,16692956,Thu Nov 25 23:41:53 CET,Fri Nov 26 01:20:20 CET,0.0 1.842 2.469 2.889 3.193 3.442 3.663 3.86 4.196 4.352 4.504 4.299 4.885 5.006 5.257 5.459 5.643 5.738 5.912 6.087 6.325 6.465 6.613 6.825 7.004 7.171 7.357 7.544 7.76 7.954 8.132 8.318 8.489 8.676 8.871 9.051 9.26 9.461 9.59 9.71 9.819 9.92 9.976 9.975 9.947 9.851 9.614 9.204 8.531 7.209 4.641 1.63 -0.832 -2.927 -4.676 -6.242 -7.661 -8.935 -9.965 -10.982 -11.883 -12.663 -13.406 -14.096 -14.741 -15.381 -16.049 -16.62 -17.113 -17.614 -18.159 -18.619 -19.063 -19.514 -19.862 -20.22 -20.599 -20.974 -21.378 -21.658 -21.944 -22.39 -22.7 -23.038 -23.219 -23.582 -23.933 -24.313 -24.515 -25.222 -25.193 -25.442 -25.699 -26.248 -26.549 -26.902 -27.282 -27.679 -28.149 -28.855 -31.778 -6 ,23004 ,KEBNE ,16692957,Thu Nov 25 23:42:56 CET,Fri Nov 26 01:26:54 CET,0.0 1.729 2.16 2.503 2.776 3.045 3.308 3.505 3.818 3.969 4.108 3.904 4.504 4.632 4.861 5.06 5.256 5.348 5.525 5.716 5.982 6.121 6.25 6.447 6.615 6.767 6.918 7.071 7.263 7.424 7.574 7.779 7.954 8.097 8.269 8.457 8.631 8.79 8.957 9.13 9.319 9.539 9.726 9.854 9.855 9.748 9.536 9.17 8.562 7.375 5.103 2.237 -0.195 -2.291 -4.083 -5.672 -7.02 -8.255 -9.396 -10.518 -11.419 -12.215 -12.97 -13.661 -14.315 -14.92 -15.547 -16.126 -16.618 -17.12 -17.65 -18.085 -18.513 -18.94 -19.286 -19.655 -20.045 -20.443 -20.853 -21.129 -21.407 -21.866 -22.185 -22.499 -22.658 -22.995 -23.347 -23.747 -23.976 -24.697 -24.627 -24.856 -25.124 -25.73 -26.048 -26.387 -26.749 -27.187 -27.73 -28.429 -31.53 -7 ,23529 ,KEBNE ,16692958,Thu Nov 25 23:42:56 CET,Fri Nov 26 01:27:16 CET,0.0 2.655 3.243 3.598 3.87 4.097 4.306 4.518 4.955 5.136 5.28 5.104 5.705 5.826 6.054 6.249 6.426 6.517 6.699 6.871 7.121 7.289 7.442 7.655 7.875 8.062 8.217 8.359 8.532 8.687 8.852 9.068 9.254 9.424 9.605 9.757 9.894 10.086 10.295 10.465 10.628 10.766 10.868 10.932 10.936 10.819 10.533 10.006 9.112 7.675 5.117 1.852 -0.839 -3.005 -4.859 -6.556 -7.966 -9.225 -10.307 -11.363 -12.269 -13.058 -13.823 -14.563 -15.242 -15.85 -16.472 -17.016 -17.479 -17.954 -18.432 -18.826 -19.265 -19.726 -20.096 -20.469 -20.823 -21.204 -21.609 -21.879 -22.161 -22.605 -22.923 -23.258 -23.433 -23.784 -24.127 -24.493 -24.693 -25.401 -25.356 -25.59 -25.861 -26.438 -26.739 -27.09 -27.47 -27.901 -28.444 -29.082 -31.929 -8 ,20713 ,KEBNE ,16692959,Thu Nov 25 23:42:56 CET,Fri Nov 26 01:24:02 CET,0.0 2.199 2.731 3.108 3.416 3.698 3.953 4.203 4.628 4.803 4.961 4.76 5.357 5.474 5.694 5.924 6.152 6.252 6.427 6.603 6.859 7.014 7.153 7.355 7.561 7.728 7.894 8.054 8.237 8.409 8.554 8.706 8.823 8.934 9.103 9.314 9.49 9.656 9.79 9.905 10.005 10.058 10.083 10.11 10.082 9.946 9.697 9.263 8.454 7.084 4.633 1.566 -1.002 -3.154 -4.956 -6.512 -7.877 -9.13 -10.177 -11.231 -12.134 -12.933 -13.698 -14.409 -15.075 -15.705 -16.406 -17.027 -17.53 -18.061 -18.614 -19.049 -19.489 -19.94 -20.285 -20.649 -21.026 -21.41 -21.818 -22.101 -22.389 -22.845 -23.154 -23.467 -23.635 -23.972 -24.32 -24.732 -24.952 -25.669 -25.634 -25.877 -26.129 -26.694 -27.008 -27.347 -27.72 -28.145 -28.683 -29.334 -39.8 -9 ,1463 ,KEBNE ,16692960,Thu Nov 25 23:47:07 CET,Fri Nov 26 01:32:34 CET,0.0 2.46 3.041 3.488 3.829 4.097 4.324 4.529 4.89 5.037 5.176 4.995 5.602 5.719 5.937 6.147 6.333 6.419 6.582 6.732 6.937 7.073 7.208 7.391 7.586 7.764 7.934 8.089 8.256 8.431 8.609 8.816 9.001 9.173 9.377 9.589 9.75 9.918 10.095 10.231 10.316 10.373 10.389 10.366 10.306 10.142 9.825 9.366 8.612 7.218 4.606 1.445 -1.069 -3.211 -5.044 -6.65 -8.012 -9.24 -10.321 -11.379 -12.282 -13.125 -13.917 -14.639 -15.339 -15.963 -16.583 -17.131 -17.62 -18.131 -18.657 -19.098 -19.562 -20.03 -20.382 -20.749 -21.121 -21.51 -21.904 -22.188 -22.496 -22.949 -23.264 -23.586 -23.744 -24.074 -24.438 -24.862 -25.083 -25.796 -25.761 -26.0 -26.258 -26.803 -27.101 -27.448 -27.828 -28.265 -28.839 -29.614 -32.995 -10 ,31925 ,KEBNE ,16692961,Thu Nov 25 23:47:10 CET,Fri Nov 26 01:22:34 CET,0.0 2.489 3.027 3.403 3.721 3.988 4.211 4.408 4.75 4.903 5.051 4.869 5.472 5.594 5.799 5.987 6.175 6.266 6.444 6.604 6.847 7.036 7.206 7.405 7.587 7.77 7.922 8.04 8.186 8.352 8.527 8.707 8.858 8.994 9.133 9.303 9.455 9.561 9.636 9.717 9.806 9.87 9.892 9.881 9.796 9.637 9.394 8.911 8.015 6.593 4.116 0.998 -1.682 -3.927 -5.745 -7.294 -8.619 -9.802 -10.828 -11.869 -12.762 -13.539 -14.234 -14.888 -15.517 -16.083 -16.665 -17.194 -17.674 -18.2 -18.731 -19.145 -19.576 -20.037 -20.425 -20.82 -21.183 -21.548 -21.946 -22.223 -22.521 -22.974 -23.278 -23.613 -23.786 -24.143 -24.504 -24.878 -25.08 -25.802 -25.785 -26.042 -26.315 -26.885 -27.194 -27.523 -27.945 -28.464 -28.997 -29.695 -33.087 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt deleted file mode 100644 index 06a59b06..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2q_p38a-2m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16777 ,KEBNE ,16692962,Thu Nov 25 23:47:06 CET,Fri Nov 26 01:25:46 CET,0.0 1.294 1.826 2.269 2.645 2.969 3.276 3.573 4.1 4.35 4.603 4.634 5.31 5.534 5.964 6.375 6.777 6.975 7.369 7.753 8.296 8.652 8.996 9.497 10.002 10.477 10.947 11.427 12.048 12.659 13.245 13.969 14.703 15.422 16.246 17.152 18.027 19.065 20.25 21.499 22.824 24.346 26.156 28.03 30.292 32.914 36.07 39.802 44.44 50.305 58.014 64.924 69.45 72.637 74.923 76.671 77.992 79.063 79.851 80.506 81.005 81.38 81.693 81.971 82.198 82.362 82.491 82.582 82.639 82.688 82.716 82.715 82.709 82.707 82.688 82.651 82.603 82.535 82.445 82.376 82.31 82.172 82.046 81.901 81.821 81.668 81.514 81.32 81.205 80.743 80.805 80.634 80.462 80.057 79.799 79.473 79.067 78.603 78.001 77.059 72.644 -2 ,22386 ,KEBNE ,16692963,Thu Nov 25 23:47:06 CET,Fri Nov 26 01:26:44 CET,0.0 1.416 1.974 2.449 2.851 3.19 3.505 3.806 4.355 4.615 4.885 4.944 5.614 5.841 6.272 6.672 7.062 7.254 7.626 7.99 8.54 8.901 9.24 9.738 10.237 10.71 11.179 11.656 12.268 12.87 13.471 14.224 14.966 15.668 16.475 17.378 18.271 19.29 20.388 21.594 22.904 24.408 26.224 28.102 30.35 32.958 36.132 39.885 44.594 50.494 58.112 64.98 69.422 72.554 74.784 76.463 77.742 78.777 79.53 80.163 80.668 81.049 81.367 81.644 81.864 82.04 82.171 82.259 82.33 82.359 82.378 82.38 82.354 82.324 82.285 82.237 82.179 82.103 82.008 81.914 81.805 81.628 81.505 81.39 81.329 81.182 80.981 80.726 80.593 80.102 80.132 79.952 79.761 79.314 79.04 78.748 78.425 78.013 77.48 76.721 72.842 -3 ,27857 ,KEBNE ,16692964,Thu Nov 25 23:48:09 CET,Fri Nov 26 01:25:46 CET,0.0 1.497 2.08 2.538 2.915 3.246 3.562 3.868 4.42 4.673 4.924 4.957 5.625 5.846 6.264 6.685 7.089 7.279 7.671 8.059 8.614 8.969 9.305 9.801 10.29 10.781 11.261 11.727 12.337 12.937 13.528 14.245 14.969 15.66 16.46 17.401 18.327 19.334 20.421 21.631 22.914 24.423 26.315 28.301 30.698 33.504 36.803 40.575 45.17 50.915 58.536 65.528 70.044 73.176 75.46 77.204 78.5 79.495 80.268 80.976 81.506 81.917 82.254 82.523 82.741 82.906 83.054 83.162 83.244 83.299 83.311 83.322 83.33 83.306 83.276 83.233 83.17 83.092 82.989 82.916 82.842 82.705 82.603 82.472 82.395 82.239 82.059 81.859 81.747 81.27 81.36 81.198 81.02 80.648 80.413 80.135 79.772 79.306 78.717 77.826 73.43 -4 ,23092 ,KEBNE ,16692965,Thu Nov 25 23:49:11 CET,Fri Nov 26 01:28:41 CET,0.0 1.58 2.131 2.572 2.956 3.302 3.614 3.913 4.476 4.745 5.001 5.031 5.697 5.913 6.343 6.775 7.176 7.368 7.744 8.104 8.65 9.003 9.359 9.876 10.365 10.855 11.332 11.792 12.373 12.959 13.553 14.276 14.995 15.673 16.479 17.448 18.404 19.44 20.547 21.786 23.158 24.724 26.549 28.453 30.744 33.375 36.521 40.255 44.868 50.575 58.091 65.002 69.429 72.522 74.777 76.504 77.81 78.833 79.599 80.281 80.792 81.194 81.536 81.784 81.992 82.175 82.315 82.413 82.488 82.534 82.553 82.551 82.533 82.498 82.457 82.423 82.392 82.346 82.267 82.215 82.149 81.977 81.849 81.717 81.648 81.507 81.342 81.128 81.012 80.537 80.577 80.404 80.223 79.807 79.569 79.292 78.935 78.458 77.86 77.052 73.754 -5 ,13566 ,KEBNE ,16692966,Thu Nov 25 23:49:11 CET,Fri Nov 26 01:30:21 CET,0.0 1.771 2.35 2.81 3.204 3.558 3.885 4.188 4.726 4.98 5.225 5.259 5.947 6.179 6.609 7.017 7.412 7.606 7.984 8.358 8.919 9.281 9.624 10.129 10.633 11.129 11.591 12.048 12.681 13.283 13.867 14.567 15.236 15.889 16.681 17.623 18.533 19.541 20.662 21.891 23.197 24.709 26.566 28.477 30.728 33.335 36.464 40.16 44.783 50.653 58.354 65.332 69.829 72.981 75.252 76.973 78.259 79.271 80.046 80.719 81.248 81.69 82.053 82.327 82.546 82.735 82.909 83.04 83.129 83.192 83.208 83.21 83.205 83.183 83.162 83.125 83.077 83.012 82.892 82.795 82.702 82.541 82.411 82.255 82.179 82.013 81.796 81.561 81.428 80.945 81.003 80.829 80.654 80.234 79.952 79.621 79.221 78.764 78.215 77.296 73.512 -6 ,27047 ,KEBNE ,16692967,Thu Nov 25 23:50:15 CET,Fri Nov 26 01:29:55 CET,0.0 1.551 2.084 2.499 2.875 3.232 3.561 3.872 4.457 4.723 4.978 5.013 5.687 5.913 6.359 6.778 7.177 7.381 7.772 8.128 8.644 8.974 9.303 9.814 10.321 10.822 11.308 11.775 12.374 12.977 13.588 14.328 15.029 15.711 16.525 17.477 18.397 19.423 20.588 21.804 23.12 24.709 26.574 28.461 30.751 33.445 36.695 40.465 45.116 50.937 58.538 65.56 70.132 73.24 75.433 77.169 78.503 79.512 80.26 80.894 81.391 81.795 82.114 82.382 82.605 82.771 82.914 83.015 83.084 83.149 83.194 83.214 83.226 83.216 83.184 83.125 83.053 82.975 82.89 82.819 82.729 82.562 82.431 82.286 82.212 82.075 81.91 81.698 81.585 81.12 81.196 81.015 80.819 80.417 80.183 79.9 79.571 79.201 78.655 77.797 74.701 -7 ,5614 ,KEBNE ,16692968,Thu Nov 25 23:50:15 CET,Fri Nov 26 01:31:22 CET,0.0 1.38 2.0 2.492 2.873 3.215 3.544 3.855 4.415 4.673 4.92 4.943 5.609 5.832 6.28 6.696 7.096 7.301 7.696 8.07 8.608 8.952 9.296 9.818 10.358 10.866 11.345 11.83 12.423 13.0 13.576 14.298 15.017 15.692 16.491 17.426 18.342 19.373 20.515 21.756 23.111 24.721 26.648 28.579 30.873 33.516 36.625 40.254 44.813 50.601 58.276 65.253 69.664 72.792 75.08 76.818 78.133 79.137 79.895 80.586 81.115 81.509 81.84 82.098 82.296 82.441 82.542 82.621 82.683 82.732 82.747 82.731 82.715 82.683 82.632 82.581 82.534 82.468 82.388 82.307 82.213 82.08 81.976 81.858 81.775 81.577 81.39 81.174 81.036 80.548 80.619 80.433 80.237 79.809 79.544 79.231 78.853 78.408 77.936 77.295 74.645 -8 ,14020 ,KEBNE ,16692969,Thu Nov 25 23:50:15 CET,Fri Nov 26 01:31:23 CET,0.0 1.541 2.152 2.603 2.973 3.309 3.624 3.924 4.506 4.781 5.034 5.042 5.701 5.921 6.354 6.768 7.148 7.334 7.721 8.107 8.65 9.011 9.381 9.898 10.399 10.905 11.392 11.854 12.453 13.056 13.655 14.368 15.06 15.748 16.548 17.456 18.342 19.323 20.427 21.675 23.035 24.602 26.472 28.369 30.666 33.345 36.462 40.129 44.778 50.534 57.957 64.913 69.542 72.734 75.003 76.738 78.042 79.068 79.86 80.546 81.046 81.428 81.74 82.0 82.203 82.341 82.458 82.561 82.636 82.694 82.73 82.741 82.749 82.76 82.748 82.715 82.664 82.587 82.507 82.43 82.331 82.153 81.999 81.82 81.736 81.577 81.376 81.142 81.022 80.553 80.631 80.462 80.274 79.816 79.536 79.225 78.842 78.345 77.728 76.916 72.046 -9 ,12215 ,KEBNE ,16692970,Thu Nov 25 23:51:18 CET,Fri Nov 26 01:33:57 CET,0.0 1.428 2.009 2.475 2.859 3.223 3.552 3.85 4.404 4.659 4.912 4.968 5.643 5.864 6.298 6.71 7.114 7.312 7.704 8.085 8.629 8.987 9.34 9.858 10.355 10.83 11.298 11.768 12.384 12.993 13.605 14.364 15.1 15.804 16.609 17.551 18.477 19.526 20.711 21.985 23.318 24.861 26.711 28.635 30.977 33.613 36.757 40.479 45.036 50.801 58.451 65.392 69.908 73.06 75.285 76.99 78.321 79.357 80.147 80.834 81.334 81.745 82.083 82.34 82.541 82.7 82.836 82.909 82.948 83.003 83.041 83.047 83.047 83.026 82.977 82.92 82.868 82.789 82.699 82.646 82.579 82.431 82.313 82.198 82.131 81.963 81.805 81.602 81.469 80.974 81.014 80.846 80.626 80.159 79.898 79.565 79.219 78.831 78.325 77.615 74.205 -10 ,6624 ,KEBNE ,16692971,Thu Nov 25 23:51:17 CET,Fri Nov 26 01:31:29 CET,0.0 1.945 2.509 2.94 3.327 3.681 4.003 4.308 4.851 5.101 5.344 5.388 6.074 6.295 6.726 7.149 7.567 7.769 8.159 8.55 9.104 9.462 9.821 10.351 10.85 11.32 11.786 12.255 12.884 13.487 14.064 14.78 15.511 16.23 17.083 18.046 18.964 19.987 21.145 22.417 23.732 25.242 27.113 29.12 31.494 34.154 37.273 41.046 45.735 51.508 59.046 65.933 70.468 73.648 75.924 77.696 79.058 80.112 80.907 81.576 82.084 82.497 82.82 83.105 83.346 83.496 83.597 83.673 83.713 83.748 83.772 83.766 83.737 83.698 83.668 83.608 83.532 83.451 83.356 83.289 83.195 83.025 82.921 82.814 82.749 82.598 82.426 82.207 82.087 81.612 81.664 81.491 81.311 80.871 80.595 80.304 79.968 79.549 78.999 78.192 74.424 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index e95c028c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24503 ,KEBNE ,16692972,Thu Nov 25 23:51:18 CET,Fri Nov 26 01:32:21 CET,0.0 1.396 1.813 2.125 2.416 2.657 2.865 3.077 3.475 3.637 3.785 3.687 4.218 4.352 4.616 4.864 5.091 5.198 5.399 5.605 5.907 6.109 6.302 6.571 6.826 7.07 7.314 7.55 7.85 8.135 8.412 8.757 9.108 9.434 9.812 10.25 10.658 11.119 11.616 12.13 12.67 13.285 14.016 14.782 15.691 16.685 17.865 19.219 20.757 22.48 24.465 25.931 26.612 26.943 27.057 26.996 26.849 26.67 26.486 26.286 26.08 25.873 25.644 25.405 25.159 24.932 24.707 24.505 24.32 24.103 23.862 23.661 23.459 23.22 23.03 22.854 22.664 22.446 22.206 22.047 21.893 21.634 21.431 21.227 21.127 20.913 20.677 20.417 20.283 19.784 19.871 19.709 19.521 19.07 18.812 18.543 18.245 17.901 17.445 16.779 14.08 -2 ,30119 ,KEBNE ,16692973,Thu Nov 25 23:51:18 CET,Fri Nov 26 01:37:33 CET,0.0 1.196 1.619 1.963 2.236 2.505 2.741 2.939 3.29 3.444 3.591 3.488 4.023 4.159 4.402 4.625 4.84 4.951 5.182 5.401 5.712 5.919 6.118 6.405 6.678 6.934 7.189 7.428 7.741 8.068 8.363 8.712 9.056 9.369 9.726 10.134 10.535 10.988 11.487 12.018 12.572 13.196 13.91 14.628 15.488 16.46 17.608 18.942 20.522 22.3 24.182 25.461 26.031 26.352 26.476 26.431 26.314 26.174 26.03 25.848 25.653 25.474 25.288 25.071 24.851 24.65 24.425 24.203 23.997 23.791 23.584 23.393 23.173 22.955 22.803 22.632 22.439 22.246 22.025 21.864 21.703 21.451 21.255 21.036 20.926 20.696 20.45 20.184 20.036 19.515 19.6 19.451 19.277 18.863 18.619 18.344 18.055 17.726 17.322 16.668 13.865 -3 ,8504 ,KEBNE ,16692974,Thu Nov 25 23:51:21 CET,Fri Nov 26 01:26:09 CET,0.0 1.481 1.913 2.24 2.531 2.805 3.036 3.225 3.566 3.742 3.901 3.801 4.339 4.482 4.745 4.992 5.236 5.351 5.572 5.771 6.056 6.248 6.43 6.696 6.957 7.208 7.452 7.698 8.004 8.285 8.579 8.937 9.271 9.594 9.971 10.402 10.826 11.294 11.797 12.322 12.879 13.516 14.249 14.988 15.855 16.828 17.938 19.189 20.636 22.255 24.13 25.444 26.023 26.245 26.252 26.196 26.093 25.957 25.819 25.635 25.439 25.241 25.018 24.785 24.566 24.373 24.154 23.93 23.74 23.55 23.336 23.15 22.946 22.725 22.565 22.396 22.208 22.007 21.786 21.626 21.461 21.203 21.014 20.811 20.707 20.47 20.216 19.946 19.788 19.259 19.294 19.11 18.925 18.525 18.281 18.016 17.712 17.352 16.933 16.277 13.142 -4 ,14720 ,KEBNE ,16692975,Thu Nov 25 23:51:17 CET,Fri Nov 26 01:31:05 CET,0.0 1.301 1.785 2.127 2.377 2.609 2.83 3.021 3.356 3.531 3.701 3.602 4.139 4.272 4.51 4.748 4.98 5.092 5.302 5.503 5.793 5.984 6.178 6.448 6.699 6.935 7.162 7.381 7.679 7.98 8.258 8.588 8.919 9.244 9.617 10.048 10.463 10.905 11.389 11.908 12.453 13.083 13.817 14.544 15.413 16.414 17.593 18.945 20.54 22.368 24.386 25.828 26.587 26.914 26.984 26.955 26.851 26.69 26.508 26.301 26.102 25.897 25.68 25.459 25.238 25.027 24.804 24.584 24.373 24.159 23.945 23.766 23.573 23.34 23.16 22.979 22.762 22.549 22.345 22.198 22.04 21.761 21.571 21.365 21.254 21.042 20.802 20.519 20.368 19.851 19.924 19.747 19.535 19.091 18.838 18.545 18.209 17.804 17.305 16.599 14.429 -5 ,14803 ,KEBNE ,16692976,Thu Nov 25 23:51:17 CET,Fri Nov 26 01:30:36 CET,0.0 1.159 1.585 1.918 2.224 2.487 2.713 2.914 3.272 3.437 3.596 3.509 4.053 4.182 4.422 4.657 4.881 4.987 5.186 5.389 5.696 5.889 6.079 6.359 6.631 6.886 7.126 7.353 7.642 7.938 8.22 8.551 8.88 9.206 9.598 10.028 10.428 10.876 11.369 11.897 12.445 13.063 13.8 14.522 15.353 16.315 17.471 18.767 20.271 22.065 24.155 25.596 26.236 26.558 26.678 26.643 26.543 26.401 26.228 26.009 25.796 25.598 25.396 25.185 24.99 24.791 24.54 24.305 24.121 23.937 23.734 23.556 23.356 23.129 22.932 22.724 22.515 22.305 22.062 21.888 21.711 21.421 21.218 21.024 20.923 20.711 20.484 20.218 20.076 19.568 19.619 19.431 19.227 18.798 18.578 18.322 18.007 17.617 17.13 16.471 13.757 -6 ,20356 ,KEBNE ,16692977,Thu Nov 25 23:52:20 CET,Fri Nov 26 01:30:19 CET,0.0 1.68 2.117 2.443 2.714 2.965 3.194 3.407 3.779 3.956 4.126 4.034 4.563 4.693 4.948 5.186 5.4 5.507 5.734 5.955 6.255 6.448 6.631 6.885 7.129 7.373 7.612 7.846 8.157 8.465 8.767 9.121 9.457 9.784 10.16 10.592 11.041 11.546 12.069 12.584 13.121 13.742 14.474 15.238 16.134 17.135 18.303 19.6 21.052 22.692 24.693 26.124 26.711 26.983 27.058 27.0 26.838 26.646 26.48 26.294 26.082 25.872 25.672 25.454 25.231 25.026 24.805 24.595 24.412 24.225 24.019 23.817 23.602 23.376 23.194 23.008 22.82 22.617 22.398 22.26 22.109 21.838 21.638 21.423 21.315 21.083 20.841 20.582 20.437 19.915 19.955 19.781 19.599 19.151 18.875 18.598 18.31 17.923 17.426 16.787 14.368 -7 ,13207 ,KEBNE ,16692978,Thu Nov 25 23:52:24 CET,Fri Nov 26 01:27:37 CET,0.0 1.481 1.954 2.3 2.587 2.837 3.046 3.252 3.64 3.806 3.965 3.892 4.432 4.568 4.838 5.095 5.322 5.43 5.645 5.867 6.175 6.362 6.542 6.807 7.073 7.33 7.566 7.784 8.071 8.355 8.634 8.978 9.318 9.652 10.033 10.46 10.868 11.307 11.776 12.286 12.837 13.444 14.155 14.89 15.72 16.639 17.769 19.051 20.53 22.236 24.188 25.626 26.347 26.67 26.721 26.679 26.591 26.427 26.243 26.032 25.817 25.611 25.402 25.18 24.963 24.75 24.515 24.311 24.127 23.922 23.705 23.517 23.303 23.08 22.914 22.732 22.544 22.35 22.135 21.979 21.807 21.532 21.34 21.14 21.027 20.783 20.531 20.269 20.125 19.603 19.669 19.506 19.323 18.93 18.706 18.457 18.156 17.785 17.323 16.628 13.753 -8 ,8088 ,KEBNE ,16692979,Thu Nov 25 23:53:24 CET,Fri Nov 26 01:31:10 CET,0.0 1.292 1.735 2.085 2.364 2.583 2.792 3.0 3.376 3.531 3.684 3.608 4.142 4.275 4.532 4.775 5.011 5.127 5.349 5.558 5.859 6.06 6.259 6.548 6.834 7.096 7.332 7.559 7.86 8.158 8.449 8.792 9.123 9.457 9.841 10.252 10.657 11.103 11.581 12.116 12.685 13.323 14.079 14.838 15.743 16.744 17.845 19.088 20.561 22.285 24.309 25.745 26.414 26.708 26.755 26.695 26.593 26.42 26.227 26.029 25.819 25.593 25.367 25.143 24.932 24.737 24.523 24.309 24.112 23.906 23.695 23.507 23.289 23.067 22.893 22.71 22.515 22.309 22.095 21.934 21.767 21.522 21.352 21.154 21.043 20.816 20.563 20.278 20.13 19.611 19.627 19.456 19.27 18.838 18.608 18.318 17.998 17.662 17.239 16.599 13.57 -9 ,18269 ,KEBNE ,16692980,Thu Nov 25 23:53:22 CET,Fri Nov 26 01:34:34 CET,0.0 1.317 1.741 2.053 2.344 2.621 2.864 3.081 3.468 3.645 3.812 3.72 4.262 4.407 4.664 4.898 5.123 5.235 5.449 5.65 5.937 6.122 6.305 6.57 6.823 7.076 7.316 7.547 7.859 8.164 8.461 8.812 9.135 9.447 9.826 10.259 10.666 11.108 11.601 12.13 12.677 13.306 14.063 14.82 15.682 16.653 17.8 19.076 20.565 22.28 24.329 25.94 26.635 26.922 27.043 27.006 26.9 26.774 26.616 26.412 26.192 25.974 25.758 25.523 25.28 25.041 24.805 24.593 24.397 24.205 23.987 23.792 23.576 23.349 23.172 22.981 22.783 22.562 22.326 22.169 22.01 21.748 21.544 21.329 21.22 20.997 20.756 20.485 20.35 19.848 19.91 19.727 19.529 19.13 18.894 18.616 18.329 17.997 17.527 16.832 14.131 -10 ,13602 ,KEBNE ,16692981,Thu Nov 25 23:53:24 CET,Fri Nov 26 01:34:27 CET,0.0 1.538 2.034 2.396 2.687 2.94 3.176 3.391 3.775 3.947 4.108 4.007 4.529 4.653 4.908 5.158 5.389 5.508 5.751 5.972 6.288 6.484 6.668 6.946 7.205 7.449 7.677 7.892 8.183 8.476 8.765 9.129 9.485 9.811 10.177 10.59 11.007 11.459 11.93 12.446 13.018 13.652 14.393 15.144 15.973 16.91 18.003 19.226 20.647 22.328 24.309 25.726 26.365 26.657 26.726 26.669 26.578 26.454 26.281 26.043 25.824 25.634 25.42 25.189 24.971 24.763 24.544 24.323 24.121 23.933 23.712 23.518 23.321 23.105 22.941 22.77 22.59 22.393 22.176 22.029 21.865 21.588 21.385 21.176 21.068 20.841 20.59 20.324 20.192 19.682 19.723 19.544 19.361 18.95 18.705 18.444 18.159 17.789 17.305 16.706 14.206 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 3eb2c6ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2r_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29891 ,KEBNE ,16692982,Thu Nov 25 23:54:27 CET,Fri Nov 26 01:33:42 CET,0.0 1.18 1.648 2.023 2.382 2.673 2.922 3.156 3.539 3.721 3.906 3.828 4.351 4.482 4.743 4.998 5.244 5.36 5.584 5.803 6.102 6.281 6.455 6.722 6.983 7.228 7.468 7.708 8.012 8.301 8.581 8.918 9.25 9.575 9.942 10.346 10.76 11.224 11.703 12.223 12.8 13.421 14.141 14.851 15.645 16.563 17.571 18.685 19.988 21.335 22.598 23.288 23.418 23.293 23.021 22.685 22.322 21.927 21.57 21.187 20.823 20.484 20.171 19.864 19.558 19.264 18.959 18.689 18.451 18.213 17.947 17.707 17.461 17.204 16.997 16.781 16.554 16.309 16.05 15.869 15.691 15.427 15.227 15.016 14.907 14.667 14.411 14.138 13.994 13.452 13.483 13.304 13.115 12.677 12.437 12.171 11.839 11.433 10.977 10.336 7.699 -2 ,22633 ,KEBNE ,16692983,Thu Nov 25 23:54:26 CET,Fri Nov 26 01:34:17 CET,0.0 1.389 1.847 2.202 2.491 2.736 2.972 3.182 3.564 3.736 3.896 3.805 4.339 4.476 4.737 4.983 5.238 5.361 5.579 5.792 6.102 6.294 6.473 6.736 7.006 7.264 7.514 7.756 8.064 8.366 8.635 8.944 9.247 9.554 9.891 10.278 10.679 11.098 11.552 12.046 12.559 13.132 13.832 14.524 15.287 16.124 17.049 18.034 19.176 20.481 21.818 22.647 22.852 22.705 22.403 22.048 21.663 21.275 20.912 20.509 20.14 19.797 19.46 19.107 18.782 18.5 18.185 17.905 17.661 17.391 17.101 16.86 16.615 16.352 16.137 15.928 15.714 15.474 15.212 15.027 14.836 14.549 14.354 14.14 14.022 13.778 13.506 13.232 13.101 12.575 12.618 12.427 12.242 11.82 11.572 11.314 11.023 10.658 10.212 9.598 7.659 -3 ,9785 ,KEBNE ,16692984,Thu Nov 25 23:54:26 CET,Fri Nov 26 01:34:37 CET,0.0 1.714 2.215 2.569 2.882 3.146 3.353 3.549 3.935 4.11 4.271 4.192 4.725 4.865 5.13 5.385 5.63 5.743 5.965 6.188 6.5 6.703 6.897 7.167 7.431 7.699 7.967 8.228 8.572 8.891 9.183 9.538 9.865 10.182 10.553 10.967 11.368 11.811 12.291 12.806 13.335 13.919 14.627 15.326 16.125 17.006 18.006 19.177 20.474 21.861 23.303 24.128 24.358 24.226 23.912 23.557 23.222 22.852 22.469 22.089 21.78 21.488 21.182 20.873 20.564 20.265 19.953 19.678 19.433 19.174 18.903 18.679 18.441 18.171 17.959 17.745 17.526 17.289 17.037 16.861 16.683 16.408 16.207 15.995 15.886 15.661 15.419 15.149 14.996 14.458 14.518 14.34 14.157 13.774 13.538 13.269 12.983 12.63 12.16 11.457 9.168 -4 ,30099 ,KEBNE ,16692985,Thu Nov 25 23:57:34 CET,Fri Nov 26 01:36:23 CET,0.0 2.272 2.848 3.321 3.667 3.938 4.191 4.414 4.809 4.99 5.164 5.105 5.644 5.791 6.069 6.339 6.586 6.702 6.935 7.162 7.482 7.674 7.86 8.14 8.409 8.662 8.898 9.119 9.416 9.708 9.99 10.337 10.668 10.985 11.364 11.796 12.18 12.598 13.067 13.568 14.103 14.703 15.398 16.091 16.891 17.762 18.743 19.818 21.01 22.302 23.524 24.287 24.49 24.333 24.026 23.7 23.343 22.934 22.56 22.167 21.849 21.548 21.24 20.952 20.655 20.358 20.028 19.737 19.5 19.24 18.935 18.682 18.43 18.161 17.948 17.735 17.522 17.289 17.036 16.864 16.696 16.419 16.201 15.974 15.866 15.63 15.369 15.095 14.953 14.433 14.506 14.342 14.176 13.784 13.537 13.242 12.938 12.598 12.174 11.566 9.662 -5 ,20995 ,KEBNE ,16692986,Thu Nov 25 23:58:36 CET,Fri Nov 26 01:38:33 CET,0.0 1.587 2.045 2.388 2.658 2.909 3.145 3.35 3.728 3.917 4.098 4.033 4.586 4.743 5.022 5.253 5.464 5.573 5.783 5.983 6.275 6.47 6.677 6.979 7.258 7.535 7.795 8.031 8.332 8.612 8.875 9.198 9.516 9.821 10.164 10.548 10.941 11.374 11.856 12.372 12.887 13.479 14.211 14.934 15.734 16.634 17.633 18.697 19.91 21.132 22.398 23.085 23.16 22.991 22.686 22.29 21.871 21.472 21.104 20.715 20.339 19.992 19.656 19.343 19.052 18.761 18.437 18.135 17.88 17.621 17.326 17.082 16.85 16.616 16.422 16.213 15.994 15.767 15.543 15.385 15.215 14.949 14.757 14.546 14.437 14.205 13.956 13.694 13.554 13.022 13.08 12.921 12.752 12.319 12.055 11.782 11.509 11.184 10.78 10.22 7.97 -6 ,7236 ,KEBNE ,16692987,Thu Nov 25 23:58:36 CET,Fri Nov 26 01:41:25 CET,0.0 1.673 2.204 2.588 2.864 3.103 3.336 3.563 3.986 4.177 4.342 4.26 4.805 4.941 5.191 5.429 5.667 5.78 5.987 6.202 6.53 6.734 6.928 7.213 7.485 7.751 8.008 8.259 8.587 8.899 9.203 9.568 9.905 10.228 10.6 11.008 11.403 11.839 12.312 12.825 13.354 13.96 14.67 15.382 16.196 17.062 18.057 19.134 20.3 21.601 22.982 23.709 23.874 23.735 23.469 23.16 22.822 22.466 22.136 21.773 21.44 21.102 20.741 20.413 20.101 19.793 19.475 19.208 18.974 18.71 18.416 18.17 17.92 17.668 17.473 17.26 17.03 16.802 16.567 16.399 16.228 15.963 15.768 15.568 15.463 15.245 14.993 14.702 14.557 14.025 14.091 13.925 13.741 13.328 13.103 12.84 12.529 12.2 11.813 11.224 9.011 -7 ,14390 ,KEBNE ,16692988,Thu Nov 25 23:59:39 CET,Fri Nov 26 01:37:29 CET,0.0 1.65 2.16 2.585 2.915 3.174 3.426 3.648 4.011 4.184 4.358 4.276 4.827 4.992 5.278 5.508 5.723 5.838 6.071 6.283 6.595 6.791 6.97 7.243 7.517 7.784 8.049 8.306 8.624 8.955 9.272 9.623 9.976 10.32 10.701 11.117 11.517 11.967 12.45 12.958 13.484 14.067 14.752 15.456 16.272 17.172 18.178 19.265 20.484 21.833 23.276 24.037 24.259 24.153 23.846 23.483 23.111 22.739 22.371 21.99 21.652 21.334 21.033 20.743 20.443 20.169 19.888 19.642 19.412 19.135 18.849 18.61 18.349 18.079 17.882 17.671 17.443 17.21 16.976 16.81 16.631 16.343 16.131 15.903 15.786 15.545 15.296 15.038 14.897 14.361 14.381 14.195 14.004 13.587 13.346 13.065 12.772 12.406 11.941 11.363 9.389 -8 ,11350 ,KEBNE ,16692989,Thu Nov 25 23:59:39 CET,Fri Nov 26 01:38:45 CET,0.0 1.244 1.68 2.054 2.369 2.623 2.862 3.098 3.503 3.683 3.853 3.784 4.336 4.486 4.759 5.007 5.242 5.363 5.606 5.82 6.126 6.335 6.531 6.817 7.09 7.35 7.601 7.842 8.152 8.432 8.698 9.039 9.355 9.657 10.011 10.406 10.788 11.217 11.7 12.209 12.711 13.269 13.929 14.588 15.378 16.288 17.28 18.313 19.454 20.671 21.753 22.303 22.378 22.163 21.911 21.598 21.218 20.812 20.442 20.059 19.72 19.407 19.107 18.814 18.509 18.205 17.886 17.598 17.331 17.047 16.773 16.547 16.296 16.025 15.821 15.617 15.39 15.148 14.899 14.73 14.562 14.287 14.084 13.876 13.764 13.532 13.285 13.007 12.858 12.323 12.393 12.227 12.033 11.577 11.337 11.094 10.823 10.489 10.092 9.517 7.694 -9 ,24079 ,KEBNE ,16692990,Thu Nov 25 23:59:39 CET,Fri Nov 26 01:38:31 CET,0.0 1.784 2.198 2.54 2.838 3.087 3.328 3.556 3.958 4.135 4.297 4.201 4.739 4.874 5.137 5.382 5.614 5.728 5.959 6.177 6.481 6.681 6.87 7.134 7.395 7.639 7.867 8.095 8.388 8.672 8.964 9.315 9.647 9.957 10.316 10.721 11.111 11.547 11.997 12.47 12.998 13.612 14.292 14.958 15.776 16.672 17.672 18.796 19.997 21.258 22.619 23.393 23.515 23.317 22.988 22.653 22.289 21.894 21.492 21.082 20.746 20.402 20.052 19.729 19.435 19.156 18.872 18.605 18.349 18.092 17.814 17.578 17.336 17.081 16.877 16.657 16.425 16.197 15.962 15.794 15.622 15.33 15.114 14.878 14.756 14.511 14.266 13.995 13.835 13.305 13.367 13.174 12.977 12.57 12.345 12.081 11.764 11.422 10.969 10.284 8.316 -10 ,5831 ,KEBNE ,16692991,Thu Nov 25 23:59:39 CET,Fri Nov 26 01:37:07 CET,0.0 2.01 2.534 2.876 3.162 3.427 3.684 3.916 4.322 4.501 4.665 4.59 5.131 5.274 5.535 5.769 5.985 6.095 6.326 6.547 6.846 7.034 7.221 7.486 7.734 7.975 8.21 8.435 8.736 9.044 9.339 9.696 10.04 10.368 10.74 11.131 11.508 11.934 12.399 12.897 13.424 14.018 14.688 15.359 16.154 17.022 18.017 19.087 20.263 21.607 22.94 23.543 23.574 23.421 23.15 22.814 22.432 22.069 21.748 21.377 21.019 20.674 20.322 19.98 19.664 19.391 19.095 18.8 18.536 18.271 17.999 17.77 17.541 17.294 17.077 16.848 16.619 16.377 16.129 15.964 15.792 15.515 15.31 15.106 15.002 14.762 14.499 14.218 14.073 13.547 13.637 13.472 13.293 12.886 12.66 12.414 12.109 11.745 11.347 10.842 8.791 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index ebfeef88..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23102 ,KEBNE ,16692992,Fri Nov 26 00:00:41 CET,Fri Nov 26 01:40:15 CET,0.0 1.369 1.809 2.146 2.423 2.637 2.82 3.0 3.316 3.451 3.577 3.462 3.959 4.077 4.305 4.531 4.746 4.844 5.019 5.187 5.448 5.61 5.76 5.975 6.179 6.374 6.55 6.712 6.925 7.144 7.362 7.619 7.86 8.089 8.36 8.662 8.94 9.228 9.526 9.845 10.165 10.496 10.913 11.322 11.733 12.164 12.599 13.017 13.305 13.319 12.941 11.923 10.816 9.852 8.957 8.125 7.373 6.641 6.015 5.396 4.845 4.351 3.88 3.414 2.969 2.575 2.191 1.845 1.525 1.188 0.84 0.556 0.262 -0.051 -0.295 -0.554 -0.828 -1.114 -1.416 -1.628 -1.845 -2.162 -2.389 -2.64 -2.764 -3.016 -3.299 -3.599 -3.756 -4.283 -4.268 -4.46 -4.657 -5.064 -5.284 -5.534 -5.839 -6.214 -6.631 -7.217 -9.172 -2 ,4923 ,KEBNE ,16692993,Thu Nov 25 23:59:39 CET,Fri Nov 26 01:38:05 CET,0.0 1.629 2.086 2.425 2.707 2.952 3.166 3.341 3.677 3.835 3.971 3.863 4.361 4.481 4.712 4.923 5.116 5.209 5.41 5.601 5.833 5.975 6.115 6.306 6.497 6.696 6.882 7.055 7.288 7.503 7.702 7.946 8.176 8.391 8.639 8.923 9.186 9.463 9.747 10.023 10.318 10.661 11.058 11.413 11.783 12.206 12.657 13.064 13.376 13.439 13.02 12.043 10.895 9.834 8.895 8.023 7.246 6.55 5.936 5.318 4.772 4.253 3.775 3.321 2.876 2.467 2.039 1.688 1.392 1.064 0.712 0.42 0.11 -0.218 -0.472 -0.736 -1.009 -1.297 -1.599 -1.807 -2.029 -2.374 -2.603 -2.855 -2.989 -3.246 -3.527 -3.856 -4.026 -4.565 -4.549 -4.723 -4.91 -5.331 -5.596 -5.901 -6.212 -6.562 -7.018 -7.658 -9.833 -3 ,22162 ,KEBNE ,16692995,Fri Nov 26 00:02:52 CET,Fri Nov 26 01:32:48 CET,0.0 1.849 2.319 2.614 2.875 3.119 3.32 3.504 3.832 3.974 4.108 3.977 4.475 4.603 4.831 5.03 5.213 5.303 5.493 5.669 5.901 6.053 6.197 6.411 6.624 6.821 6.997 7.173 7.405 7.612 7.822 8.084 8.324 8.542 8.784 9.055 9.321 9.607 9.904 10.215 10.521 10.881 11.325 11.711 12.099 12.518 12.952 13.353 13.647 13.676 13.289 12.361 11.309 10.262 9.274 8.363 7.562 6.833 6.199 5.534 4.95 4.448 3.971 3.529 3.124 2.745 2.332 1.953 1.626 1.282 0.913 0.618 0.327 0.02 -0.233 -0.501 -0.787 -1.076 -1.365 -1.571 -1.779 -2.104 -2.334 -2.591 -2.719 -2.976 -3.258 -3.577 -3.743 -4.266 -4.235 -4.418 -4.604 -5.016 -5.263 -5.531 -5.822 -6.201 -6.681 -7.296 -9.038 -4 ,29286 ,KEBNE ,16692996,Fri Nov 26 00:03:53 CET,Fri Nov 26 01:48:40 CET,0.0 1.315 1.772 2.1 2.376 2.605 2.811 3.011 3.364 3.521 3.672 3.576 4.069 4.183 4.403 4.61 4.806 4.902 5.079 5.233 5.467 5.626 5.777 5.983 6.177 6.368 6.552 6.733 6.961 7.19 7.42 7.669 7.895 8.116 8.377 8.667 8.925 9.205 9.509 9.809 10.103 10.438 10.804 11.135 11.52 11.939 12.336 12.61 12.848 12.95 12.522 11.557 10.487 9.432 8.476 7.6 6.843 6.167 5.537 4.883 4.336 3.858 3.405 2.984 2.584 2.193 1.755 1.371 1.058 0.722 0.37 0.092 -0.204 -0.529 -0.787 -1.052 -1.319 -1.605 -1.903 -2.102 -2.314 -2.633 -2.852 -3.108 -3.245 -3.523 -3.801 -4.101 -4.266 -4.804 -4.777 -4.956 -5.157 -5.579 -5.815 -6.118 -6.463 -6.84 -7.274 -7.922 -10.571 -5 ,6142 ,KEBNE ,16692997,Fri Nov 26 00:11:19 CET,Fri Nov 26 01:45:57 CET,0.0 1.357 1.822 2.147 2.431 2.671 2.864 3.044 3.365 3.513 3.65 3.524 4.013 4.133 4.369 4.581 4.781 4.878 5.064 5.237 5.468 5.617 5.76 5.964 6.161 6.346 6.532 6.714 6.928 7.126 7.322 7.556 7.778 8.0 8.261 8.541 8.801 9.069 9.351 9.662 9.99 10.347 10.719 11.084 11.507 11.938 12.362 12.803 13.263 13.542 13.318 12.424 11.371 10.372 9.437 8.558 7.798 7.085 6.451 5.793 5.213 4.723 4.256 3.797 3.365 2.935 2.464 2.057 1.703 1.331 0.935 0.634 0.339 0.022 -0.217 -0.466 -0.725 -0.988 -1.267 -1.47 -1.684 -2.029 -2.279 -2.544 -2.676 -2.936 -3.215 -3.506 -3.663 -4.195 -4.175 -4.382 -4.61 -5.053 -5.292 -5.562 -5.87 -6.243 -6.702 -7.365 -9.79 -6 ,4759 ,KEBNE ,16692998,Fri Nov 26 00:13:24 CET,Fri Nov 26 01:44:55 CET,0.0 1.461 1.847 2.158 2.451 2.719 2.941 3.121 3.463 3.629 3.781 3.674 4.168 4.281 4.491 4.688 4.876 4.965 5.136 5.312 5.572 5.722 5.863 6.084 6.302 6.491 6.663 6.831 7.051 7.261 7.457 7.695 7.927 8.133 8.361 8.615 8.848 9.104 9.39 9.714 10.056 10.414 10.828 11.223 11.607 11.975 12.374 12.733 12.96 13.062 12.61 11.489 10.342 9.252 8.291 7.425 6.657 5.96 5.354 4.765 4.249 3.764 3.308 2.864 2.421 2.02 1.598 1.233 0.926 0.611 0.283 -0.01 -0.315 -0.634 -0.883 -1.132 -1.386 -1.647 -1.922 -2.121 -2.331 -2.654 -2.886 -3.133 -3.255 -3.501 -3.768 -4.062 -4.216 -4.748 -4.725 -4.908 -5.098 -5.537 -5.798 -6.097 -6.447 -6.826 -7.251 -7.807 -10.091 -7 ,28359 ,KEBNE ,16692999,Fri Nov 26 00:13:21 CET,Fri Nov 26 01:55:25 CET,0.0 1.389 1.802 2.161 2.457 2.696 2.9 3.083 3.419 3.582 3.745 3.642 4.15 4.273 4.486 4.693 4.881 4.967 5.144 5.326 5.573 5.72 5.862 6.071 6.281 6.486 6.68 6.865 7.097 7.322 7.54 7.794 8.036 8.261 8.524 8.81 9.067 9.345 9.635 9.963 10.305 10.639 11.003 11.377 11.789 12.215 12.693 13.076 13.293 13.363 13.012 12.023 10.939 9.945 9.035 8.171 7.417 6.764 6.199 5.599 5.066 4.576 4.097 3.655 3.25 2.873 2.465 2.08 1.756 1.437 1.105 0.826 0.546 0.242 -0.025 -0.293 -0.55 -0.823 -1.113 -1.319 -1.535 -1.878 -2.131 -2.388 -2.507 -2.743 -3.024 -3.347 -3.512 -4.043 -4.025 -4.21 -4.412 -4.849 -5.099 -5.401 -5.724 -6.067 -6.474 -7.051 -8.984 -8 ,5642 ,KEBNE ,16693000,Fri Nov 26 00:13:20 CET,Fri Nov 26 01:50:25 CET,0.0 1.659 2.171 2.502 2.762 3.004 3.202 3.379 3.731 3.879 4.021 3.931 4.432 4.551 4.782 5.002 5.197 5.286 5.463 5.632 5.883 6.049 6.214 6.438 6.635 6.819 7.003 7.179 7.405 7.626 7.819 8.053 8.287 8.506 8.741 8.992 9.238 9.505 9.784 10.064 10.363 10.693 11.08 11.453 11.826 12.221 12.603 12.921 13.201 13.304 12.956 12.077 11.034 10.018 9.091 8.221 7.422 6.643 5.986 5.373 4.817 4.319 3.872 3.444 3.019 2.616 2.2 1.833 1.504 1.156 0.797 0.512 0.236 -0.066 -0.321 -0.593 -0.872 -1.15 -1.449 -1.653 -1.857 -2.184 -2.41 -2.646 -2.771 -3.041 -3.325 -3.603 -3.754 -4.286 -4.276 -4.456 -4.65 -5.134 -5.4 -5.668 -5.978 -6.377 -6.867 -7.601 -10.474 -9 ,20661 ,KEBNE ,16693001,Fri Nov 26 00:14:23 CET,Fri Nov 26 01:51:08 CET,0.0 1.122 1.567 1.904 2.16 2.368 2.55 2.724 3.043 3.194 3.332 3.213 3.702 3.812 4.025 4.226 4.404 4.487 4.65 4.812 5.063 5.218 5.359 5.56 5.755 5.949 6.132 6.307 6.531 6.742 6.952 7.191 7.418 7.656 7.919 8.209 8.479 8.787 9.114 9.423 9.749 10.131 10.554 10.921 11.321 11.764 12.199 12.573 12.92 13.095 12.939 12.125 11.033 10.026 9.042 8.089 7.275 6.577 5.984 5.364 4.799 4.302 3.828 3.376 2.946 2.545 2.128 1.758 1.449 1.127 0.793 0.508 0.207 -0.112 -0.366 -0.617 -0.872 -1.137 -1.417 -1.62 -1.825 -2.133 -2.362 -2.611 -2.737 -3.003 -3.295 -3.603 -3.764 -4.309 -4.339 -4.535 -4.731 -5.2 -5.447 -5.715 -6.02 -6.359 -6.772 -7.387 -9.621 -10 ,27253 ,KEBNE ,16693002,Fri Nov 26 00:15:25 CET,Fri Nov 26 01:52:21 CET,0.0 1.229 1.639 1.942 2.215 2.473 2.689 2.876 3.217 3.369 3.509 3.397 3.887 4.004 4.243 4.465 4.657 4.748 4.93 5.101 5.334 5.485 5.636 5.846 6.035 6.226 6.426 6.614 6.843 7.07 7.28 7.516 7.756 7.999 8.267 8.547 8.801 9.071 9.367 9.673 9.985 10.331 10.692 11.016 11.38 11.791 12.211 12.607 12.966 13.107 12.769 11.815 10.786 9.764 8.763 7.87 7.07 6.326 5.662 5.012 4.463 3.976 3.516 3.057 2.621 2.204 1.783 1.417 1.093 0.748 0.385 0.087 -0.228 -0.547 -0.787 -1.032 -1.301 -1.586 -1.881 -2.102 -2.329 -2.67 -2.903 -3.143 -3.273 -3.541 -3.831 -4.142 -4.307 -4.845 -4.803 -4.99 -5.208 -5.687 -5.958 -6.225 -6.502 -6.845 -7.279 -7.94 -11.103 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt deleted file mode 100644 index 4b0dbd42..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2s_p38a-2n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25564 ,KEBNE ,16693003,Fri Nov 26 00:16:27 CET,Fri Nov 26 01:53:52 CET,0.0 1.288 1.795 2.183 2.491 2.754 2.982 3.185 3.576 3.747 3.9 3.802 4.3 4.423 4.661 4.881 5.101 5.204 5.395 5.565 5.788 5.939 6.081 6.285 6.472 6.633 6.774 6.924 7.14 7.36 7.577 7.81 7.998 8.187 8.396 8.609 8.84 9.122 9.395 9.651 9.928 10.199 10.454 10.637 10.839 11.019 11.104 11.146 11.054 10.638 9.484 7.674 6.058 4.675 3.462 2.401 1.473 0.602 -0.153 -0.878 -1.5 -2.055 -2.581 -3.096 -3.572 -3.996 -4.441 -4.855 -5.217 -5.584 -5.965 -6.266 -6.572 -6.9 -7.167 -7.442 -7.702 -7.974 -8.27 -8.478 -8.693 -9.029 -9.272 -9.521 -9.642 -9.893 -10.164 -10.449 -10.595 -11.128 -11.095 -11.288 -11.48 -11.859 -12.076 -12.331 -12.614 -12.959 -13.372 -13.943 -15.456 -2 ,16063 ,KEBNE ,16693004,Fri Nov 26 00:17:32 CET,Fri Nov 26 01:55:35 CET,0.0 1.607 2.114 2.475 2.766 3.007 3.223 3.405 3.707 3.845 3.983 3.877 4.372 4.477 4.678 4.866 5.037 5.122 5.293 5.458 5.696 5.841 5.973 6.175 6.373 6.552 6.716 6.868 7.07 7.269 7.448 7.662 7.881 8.088 8.309 8.572 8.825 9.06 9.306 9.564 9.812 10.048 10.258 10.447 10.672 10.874 11.016 11.124 11.118 10.779 9.707 8.114 6.582 5.185 4.007 2.933 1.98 1.115 0.389 -0.364 -1.011 -1.558 -2.096 -2.609 -3.074 -3.49 -3.931 -4.315 -4.654 -5.008 -5.395 -5.725 -6.065 -6.41 -6.667 -6.94 -7.234 -7.538 -7.844 -8.053 -8.263 -8.593 -8.828 -9.06 -9.183 -9.452 -9.715 -9.993 -10.142 -10.674 -10.613 -10.786 -10.986 -11.44 -11.677 -11.949 -12.263 -12.615 -13.011 -13.516 -15.146 -3 ,21122 ,KEBNE ,16693005,Fri Nov 26 00:17:32 CET,Fri Nov 26 01:55:45 CET,0.0 1.473 1.966 2.342 2.656 2.914 3.13 3.324 3.687 3.846 3.984 3.85 4.346 4.469 4.692 4.889 5.07 5.16 5.341 5.519 5.768 5.92 6.063 6.267 6.451 6.631 6.814 6.986 7.198 7.38 7.561 7.79 7.981 8.173 8.418 8.671 8.891 9.147 9.398 9.613 9.834 10.122 10.409 10.622 10.878 11.066 11.218 11.368 11.346 10.966 9.844 8.148 6.612 5.251 4.066 2.98 2.034 1.218 0.517 -0.205 -0.809 -1.357 -1.918 -2.417 -2.87 -3.334 -3.822 -4.243 -4.628 -5.047 -5.466 -5.781 -6.104 -6.454 -6.728 -7.01 -7.305 -7.608 -7.929 -8.152 -8.373 -8.708 -8.933 -9.165 -9.286 -9.544 -9.82 -10.099 -10.258 -10.817 -10.798 -10.998 -11.205 -11.656 -11.902 -12.144 -12.434 -12.783 -13.211 -13.749 -15.409 -4 ,23957 ,KEBNE ,16693006,Fri Nov 26 00:17:36 CET,Fri Nov 26 01:52:42 CET,0.0 1.731 2.295 2.685 3.02 3.313 3.542 3.721 4.022 4.17 4.326 4.219 4.715 4.836 5.058 5.285 5.481 5.568 5.746 5.917 6.152 6.291 6.428 6.629 6.821 6.994 7.16 7.327 7.541 7.738 7.912 8.12 8.331 8.53 8.746 8.981 9.194 9.434 9.686 9.919 10.124 10.331 10.538 10.731 10.947 11.168 11.345 11.385 11.226 10.7 9.533 7.915 6.401 5.018 3.847 2.802 1.846 0.996 0.271 -0.451 -1.05 -1.606 -2.173 -2.686 -3.158 -3.622 -4.095 -4.487 -4.826 -5.193 -5.574 -5.876 -6.169 -6.476 -6.723 -6.98 -7.263 -7.568 -7.877 -8.093 -8.32 -8.693 -8.956 -9.219 -9.359 -9.661 -9.967 -10.273 -10.443 -10.99 -10.91 -11.077 -11.263 -11.663 -11.889 -12.13 -12.425 -12.784 -13.207 -13.76 -15.492 -5 ,10493 ,KEBNE ,16693007,Fri Nov 26 00:17:32 CET,Fri Nov 26 01:55:30 CET,0.0 1.775 2.325 2.687 2.992 3.247 3.444 3.626 3.971 4.131 4.279 4.171 4.663 4.774 4.978 5.165 5.346 5.437 5.616 5.779 6.011 6.163 6.311 6.512 6.705 6.884 7.058 7.238 7.451 7.641 7.83 8.059 8.273 8.472 8.711 8.978 9.212 9.46 9.677 9.877 10.096 10.341 10.583 10.817 11.076 11.283 11.41 11.421 11.259 10.777 9.679 8.069 6.633 5.317 4.12 3.055 2.124 1.269 0.535 -0.175 -0.768 -1.29 -1.826 -2.338 -2.789 -3.213 -3.639 -4.016 -4.365 -4.714 -5.08 -5.399 -5.714 -6.032 -6.293 -6.57 -6.846 -7.135 -7.442 -7.663 -7.901 -8.287 -8.535 -8.795 -8.947 -9.257 -9.573 -9.882 -10.047 -10.599 -10.574 -10.767 -10.962 -11.406 -11.66 -11.924 -12.207 -12.535 -12.934 -13.523 -15.457 -6 ,18916 ,KEBNE ,16693008,Fri Nov 26 00:17:32 CET,Fri Nov 26 01:55:35 CET,0.0 1.743 2.211 2.507 2.816 3.109 3.361 3.569 3.924 4.08 4.22 4.138 4.653 4.775 4.997 5.205 5.407 5.505 5.684 5.859 6.102 6.246 6.376 6.569 6.755 6.929 7.101 7.266 7.483 7.679 7.866 8.115 8.354 8.576 8.816 9.024 9.228 9.452 9.649 9.874 10.102 10.311 10.595 10.87 11.097 11.267 11.379 11.383 11.224 10.883 10.003 8.424 6.864 5.481 4.305 3.218 2.232 1.379 0.637 -0.127 -0.767 -1.333 -1.849 -2.33 -2.809 -3.241 -3.687 -4.103 -4.454 -4.815 -5.2 -5.518 -5.847 -6.185 -6.439 -6.703 -6.994 -7.303 -7.606 -7.811 -8.027 -8.36 -8.587 -8.827 -8.946 -9.192 -9.463 -9.73 -9.872 -10.4 -10.329 -10.512 -10.705 -11.12 -11.351 -11.606 -11.889 -12.232 -12.639 -13.142 -14.846 -7 ,8099 ,KEBNE ,16693009,Fri Nov 26 00:18:34 CET,Fri Nov 26 01:58:56 CET,0.0 1.741 2.286 2.679 2.977 3.207 3.42 3.633 4.002 4.171 4.317 4.174 4.645 4.747 4.997 5.237 5.451 5.559 5.758 5.933 6.167 6.311 6.461 6.684 6.88 7.047 7.21 7.377 7.593 7.801 8.003 8.232 8.431 8.613 8.847 9.108 9.317 9.532 9.763 9.995 10.214 10.444 10.691 10.924 11.156 11.342 11.464 11.501 11.408 10.977 9.872 8.231 6.731 5.364 4.173 3.151 2.245 1.439 0.759 0.03 -0.612 -1.19 -1.737 -2.221 -2.668 -3.1 -3.569 -3.99 -4.366 -4.747 -5.133 -5.451 -5.776 -6.114 -6.367 -6.632 -6.909 -7.199 -7.496 -7.685 -7.891 -8.221 -8.461 -8.735 -8.874 -9.143 -9.424 -9.715 -9.859 -10.395 -10.374 -10.568 -10.756 -11.202 -11.457 -11.716 -11.997 -12.33 -12.743 -13.257 -14.949 -8 ,1054 ,KEBNE ,16693010,Fri Nov 26 00:19:37 CET,Fri Nov 26 01:57:48 CET,0.0 1.433 1.873 2.203 2.481 2.731 2.942 3.117 3.458 3.616 3.761 3.66 4.168 4.298 4.543 4.763 4.967 5.066 5.249 5.411 5.644 5.803 5.96 6.179 6.388 6.579 6.748 6.919 7.133 7.326 7.509 7.712 7.9 8.097 8.341 8.587 8.8 9.023 9.251 9.491 9.714 9.964 10.243 10.486 10.768 11.062 11.286 11.362 11.317 10.957 9.804 8.146 6.661 5.341 4.136 3.048 2.109 1.227 0.496 -0.165 -0.742 -1.281 -1.792 -2.259 -2.694 -3.112 -3.582 -3.999 -4.363 -4.743 -5.126 -5.459 -5.797 -6.125 -6.389 -6.653 -6.926 -7.23 -7.539 -7.748 -7.961 -8.286 -8.525 -8.78 -8.901 -9.147 -9.438 -9.756 -9.915 -10.467 -10.443 -10.622 -10.806 -11.234 -11.482 -11.764 -12.053 -12.355 -12.716 -13.24 -15.281 -9 ,7847 ,KEBNE ,16693011,Fri Nov 26 00:20:40 CET,Fri Nov 26 02:03:13 CET,0.0 1.768 2.299 2.679 3.009 3.307 3.554 3.759 4.117 4.259 4.404 4.308 4.802 4.916 5.144 5.364 5.569 5.663 5.84 6.014 6.247 6.388 6.524 6.713 6.885 7.037 7.187 7.336 7.542 7.759 7.975 8.22 8.423 8.628 8.856 9.073 9.268 9.498 9.783 10.079 10.319 10.53 10.758 10.97 11.233 11.487 11.659 11.71 11.578 11.156 10.084 8.381 6.827 5.498 4.336 3.291 2.355 1.484 0.746 0.002 -0.645 -1.21 -1.735 -2.228 -2.699 -3.128 -3.575 -3.978 -4.333 -4.692 -5.071 -5.397 -5.739 -6.074 -6.322 -6.589 -6.873 -7.152 -7.424 -7.613 -7.813 -8.139 -8.376 -8.637 -8.768 -9.042 -9.33 -9.64 -9.801 -10.327 -10.23 -10.389 -10.576 -10.993 -11.203 -11.421 -11.675 -11.955 -12.281 -12.79 -14.699 -10 ,19343 ,KEBNE ,16693012,Fri Nov 26 00:20:43 CET,Fri Nov 26 01:54:04 CET,0.0 1.595 2.054 2.368 2.669 2.93 3.152 3.349 3.702 3.854 3.996 3.9 4.396 4.517 4.74 4.946 5.134 5.222 5.416 5.605 5.857 6.005 6.14 6.342 6.534 6.723 6.914 7.089 7.293 7.485 7.677 7.883 8.069 8.262 8.48 8.715 8.946 9.202 9.44 9.67 9.895 10.112 10.318 10.551 10.849 11.095 11.248 11.273 11.165 10.812 9.761 8.096 6.562 5.221 4.078 3.023 2.084 1.203 0.449 -0.26 -0.89 -1.512 -2.095 -2.602 -3.097 -3.54 -4.001 -4.426 -4.787 -5.16 -5.547 -5.86 -6.177 -6.498 -6.734 -7.004 -7.294 -7.572 -7.857 -8.058 -8.263 -8.595 -8.836 -9.079 -9.204 -9.482 -9.793 -10.107 -10.276 -10.832 -10.782 -10.961 -11.16 -11.587 -11.811 -12.079 -12.4 -12.739 -13.128 -13.645 -15.27 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt deleted file mode 100644 index 33f959f2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2t_p38a-2l.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12323 ,KEBNE ,16693013,Fri Nov 26 00:21:42 CET,Fri Nov 26 01:59:39 CET,0.0 1.554 2.089 2.459 2.739 2.971 3.186 3.38 3.713 3.872 4.037 3.957 4.469 4.594 4.829 5.059 5.276 5.374 5.562 5.745 6.006 6.181 6.356 6.595 6.826 7.047 7.255 7.456 7.709 7.949 8.194 8.509 8.807 9.086 9.388 9.719 10.055 10.435 10.824 11.216 11.639 12.133 12.696 13.254 13.902 14.615 15.397 16.257 17.246 18.303 19.345 19.882 20.002 19.962 19.883 19.759 19.593 19.379 19.167 18.944 18.728 18.537 18.349 18.156 17.971 17.799 17.605 17.412 17.226 17.031 16.839 16.685 16.531 16.353 16.198 16.043 15.893 15.739 15.572 15.45 15.322 15.106 14.967 14.819 14.729 14.521 14.304 14.093 13.985 13.505 13.628 13.498 13.358 13.061 12.9 12.714 12.5 12.227 11.886 11.471 10.258 -2 ,30627 ,KEBNE ,16693014,Fri Nov 26 00:23:47 CET,Fri Nov 26 02:04:09 CET,0.0 1.675 2.168 2.537 2.855 3.123 3.338 3.545 3.906 4.064 4.223 4.145 4.66 4.791 5.042 5.288 5.528 5.634 5.832 6.018 6.269 6.435 6.603 6.845 7.085 7.316 7.533 7.743 8.004 8.251 8.493 8.795 9.083 9.346 9.648 9.997 10.334 10.69 11.072 11.498 11.953 12.446 12.998 13.557 14.195 14.902 15.716 16.569 17.526 18.592 19.741 20.491 20.682 20.63 20.502 20.326 20.135 19.935 19.745 19.508 19.287 19.074 18.845 18.638 18.443 18.263 18.068 17.892 17.729 17.55 17.365 17.214 17.044 16.855 16.717 16.565 16.402 16.244 16.061 15.922 15.786 15.58 15.427 15.265 15.177 15.002 14.829 14.643 14.541 14.062 14.177 14.034 13.881 13.571 13.412 13.221 13.002 12.756 12.411 11.945 10.559 -3 ,16540 ,KEBNE ,16693015,Fri Nov 26 00:23:51 CET,Fri Nov 26 01:56:19 CET,0.0 1.754 2.287 2.662 2.953 3.192 3.417 3.637 4.007 4.16 4.309 4.223 4.739 4.874 5.119 5.351 5.577 5.684 5.891 6.085 6.36 6.528 6.684 6.915 7.145 7.369 7.586 7.791 8.057 8.311 8.554 8.837 9.1 9.353 9.654 9.992 10.304 10.668 11.07 11.475 11.907 12.404 12.953 13.502 14.157 14.884 15.722 16.614 17.6 18.715 19.82 20.416 20.589 20.57 20.456 20.274 20.094 19.902 19.694 19.451 19.221 19.014 18.798 18.581 18.374 18.177 17.963 17.78 17.612 17.42 17.227 17.073 16.919 16.758 16.612 16.458 16.306 16.136 15.949 15.819 15.682 15.464 15.314 15.165 15.092 14.934 14.755 14.562 14.461 13.983 14.116 13.979 13.833 13.553 13.402 13.209 12.951 12.665 12.313 11.841 10.148 -4 ,19736 ,KEBNE ,16693016,Fri Nov 26 00:24:49 CET,Fri Nov 26 02:00:11 CET,0.0 1.597 2.066 2.38 2.652 2.918 3.154 3.365 3.743 3.901 4.052 3.965 4.482 4.613 4.857 5.08 5.298 5.405 5.616 5.812 6.095 6.274 6.439 6.691 6.927 7.145 7.355 7.575 7.856 8.1 8.336 8.625 8.923 9.217 9.527 9.88 10.221 10.6 10.995 11.382 11.796 12.272 12.81 13.345 14.004 14.742 15.551 16.435 17.438 18.491 19.602 20.286 20.49 20.443 20.276 20.091 19.897 19.687 19.479 19.222 18.992 18.788 18.586 18.388 18.189 18.009 17.826 17.659 17.502 17.331 17.145 16.981 16.82 16.657 16.517 16.358 16.184 16.013 15.833 15.706 15.57 15.35 15.196 15.03 14.937 14.746 14.548 14.35 14.246 13.773 13.917 13.778 13.629 13.284 13.073 12.848 12.609 12.338 11.986 11.47 10.077 -5 ,11074 ,KEBNE ,16693017,Fri Nov 26 00:25:52 CET,Fri Nov 26 02:01:27 CET,0.0 1.7 2.18 2.554 2.861 3.118 3.345 3.535 3.865 4.015 4.156 4.048 4.568 4.702 4.945 5.176 5.388 5.488 5.682 5.871 6.151 6.322 6.489 6.728 6.945 7.159 7.378 7.585 7.831 8.068 8.307 8.59 8.856 9.117 9.413 9.734 10.054 10.412 10.793 11.214 11.664 12.166 12.737 13.294 13.935 14.651 15.456 16.319 17.262 18.322 19.523 20.28 20.495 20.464 20.34 20.136 19.886 19.653 19.451 19.222 19.001 18.784 18.555 18.337 18.141 17.951 17.736 17.534 17.363 17.193 17.013 16.843 16.65 16.451 16.302 16.156 16.008 15.835 15.644 15.514 15.373 15.153 15.009 14.856 14.771 14.594 14.416 14.223 14.108 13.623 13.762 13.641 13.51 13.184 12.993 12.792 12.565 12.297 11.955 11.501 9.854 -6 ,4315 ,KEBNE ,16693018,Fri Nov 26 00:25:53 CET,Fri Nov 26 02:01:45 CET,0.0 1.534 2.011 2.365 2.701 2.968 3.179 3.375 3.756 3.933 4.095 4.028 4.547 4.673 4.893 5.103 5.31 5.41 5.61 5.807 6.091 6.262 6.422 6.657 6.879 7.095 7.298 7.493 7.755 8.009 8.264 8.57 8.841 9.101 9.414 9.76 10.085 10.448 10.857 11.287 11.708 12.185 12.733 13.27 13.875 14.522 15.295 16.183 17.151 18.226 19.375 19.994 20.193 20.161 20.0 19.814 19.615 19.381 19.149 18.919 18.705 18.492 18.273 18.054 17.846 17.666 17.476 17.301 17.146 16.954 16.736 16.569 16.384 16.19 16.056 15.914 15.763 15.595 15.427 15.307 15.172 14.967 14.823 14.675 14.601 14.437 14.239 14.034 13.93 13.453 13.588 13.458 13.325 13.014 12.801 12.569 12.339 12.09 11.782 11.342 9.853 -7 ,13885 ,KEBNE ,16693019,Fri Nov 26 00:25:52 CET,Fri Nov 26 02:01:25 CET,0.0 1.375 1.858 2.208 2.507 2.76 2.976 3.182 3.56 3.722 3.875 3.784 4.306 4.447 4.709 4.94 5.143 5.246 5.464 5.676 5.955 6.131 6.299 6.542 6.782 7.01 7.241 7.456 7.715 7.967 8.216 8.512 8.778 9.036 9.343 9.685 10.0 10.347 10.736 11.152 11.576 12.047 12.606 13.162 13.807 14.522 15.351 16.264 17.232 18.299 19.411 20.03 20.227 20.231 20.14 19.986 19.781 19.534 19.295 19.056 18.842 18.628 18.4 18.181 17.956 17.745 17.537 17.348 17.186 17.01 16.837 16.697 16.54 16.352 16.208 16.062 15.9 15.74 15.566 15.433 15.294 15.082 14.943 14.792 14.71 14.545 14.359 14.136 14.02 13.543 13.662 13.521 13.377 13.061 12.881 12.692 12.458 12.181 11.876 11.394 9.581 -8 ,26024 ,KEBNE ,16693020,Fri Nov 26 00:25:52 CET,Fri Nov 26 02:01:25 CET,0.0 1.712 2.251 2.638 2.926 3.166 3.378 3.573 3.937 4.1 4.258 4.199 4.726 4.852 5.096 5.334 5.549 5.651 5.859 6.055 6.326 6.501 6.679 6.917 7.132 7.356 7.567 7.761 8.026 8.287 8.532 8.841 9.154 9.461 9.787 10.129 10.451 10.802 11.191 11.604 12.038 12.529 13.097 13.649 14.287 14.989 15.788 16.674 17.646 18.7 19.806 20.435 20.605 20.595 20.484 20.296 20.085 19.844 19.605 19.333 19.087 18.887 18.688 18.465 18.229 18.012 17.796 17.607 17.445 17.278 17.095 16.933 16.761 16.588 16.448 16.292 16.134 15.972 15.793 15.661 15.522 15.323 15.188 15.048 14.972 14.778 14.574 14.367 14.256 13.774 13.882 13.747 13.597 13.275 13.09 12.881 12.665 12.389 12.039 11.599 10.296 -9 ,3271 ,KEBNE ,16693021,Fri Nov 26 00:25:52 CET,Fri Nov 26 02:02:29 CET,0.0 1.515 2.046 2.446 2.744 2.988 3.224 3.438 3.795 3.965 4.116 4.012 4.529 4.665 4.913 5.136 5.351 5.458 5.662 5.846 6.103 6.278 6.446 6.669 6.898 7.116 7.319 7.527 7.79 8.041 8.283 8.571 8.844 9.106 9.401 9.736 10.063 10.416 10.795 11.21 11.63 12.079 12.632 13.2 13.838 14.548 15.351 16.211 17.163 18.227 19.345 19.963 20.108 20.052 19.92 19.718 19.491 19.247 19.021 18.809 18.618 18.423 18.206 17.981 17.745 17.524 17.311 17.121 16.956 16.79 16.602 16.435 16.258 16.065 15.912 15.758 15.6 15.435 15.257 15.131 15.0 14.787 14.641 14.49 14.405 14.22 14.027 13.836 13.741 13.275 13.426 13.305 13.161 12.848 12.678 12.476 12.233 11.954 11.611 11.117 9.748 -10 ,9666 ,KEBNE ,16693022,Fri Nov 26 00:25:52 CET,Fri Nov 26 02:01:39 CET,0.0 1.903 2.455 2.85 3.152 3.401 3.614 3.805 4.157 4.308 4.467 4.401 4.916 5.04 5.274 5.516 5.739 5.845 6.056 6.254 6.516 6.678 6.834 7.048 7.257 7.48 7.702 7.902 8.157 8.416 8.662 8.951 9.23 9.491 9.79 10.132 10.453 10.801 11.197 11.616 12.035 12.515 13.079 13.638 14.303 15.003 15.765 16.629 17.61 18.671 19.777 20.418 20.647 20.682 20.563 20.375 20.18 19.987 19.791 19.571 19.362 19.161 18.951 18.738 18.534 18.331 18.112 17.923 17.762 17.596 17.417 17.253 17.08 16.907 16.762 16.603 16.437 16.265 16.087 15.963 15.833 15.621 15.471 15.323 15.243 15.058 14.887 14.717 14.624 14.157 14.273 14.142 14.008 13.685 13.509 13.294 13.046 12.784 12.453 11.993 10.675 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt deleted file mode 100644 index 9421d99f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2m.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,29887 ,KEBNE ,16693025,Fri Nov 26 00:25:52 CET,Fri Nov 26 02:04:15 CET,0.0 1.495 2.146 2.657 3.117 3.546 3.945 4.338 5.079 5.409 5.727 5.849 6.67 6.969 7.565 8.131 8.672 8.938 9.456 9.97 10.722 11.224 11.725 12.45 13.167 13.868 14.548 15.226 16.135 17.035 17.927 19.018 20.089 21.133 22.356 23.778 25.197 26.829 28.638 30.605 32.728 35.171 38.095 41.172 44.92 49.312 54.664 61.06 69.095 79.476 93.602 106.995 116.123 122.743 127.644 131.536 134.586 137.09 139.035 140.775 142.157 143.279 144.242 145.064 145.753 146.363 146.988 147.47 147.839 148.2 148.494 148.715 148.967 149.201 149.362 149.53 149.615 149.643 149.723 149.778 149.828 149.87 149.879 149.871 149.85 149.813 149.75 149.658 149.609 149.194 149.401 149.32 149.227 148.911 148.693 148.462 148.173 147.796 147.294 146.45 134.127 -4 ,24819 ,KEBNE ,16693026,Fri Nov 26 00:25:52 CET,Fri Nov 26 02:05:13 CET,0.0 2.048 2.732 3.276 3.727 4.128 4.493 4.848 5.523 5.853 6.178 6.294 7.117 7.41 7.98 8.541 9.104 9.379 9.895 10.405 11.167 11.665 12.16 12.889 13.604 14.303 14.986 15.665 16.553 17.421 18.287 19.376 20.435 21.46 22.692 24.103 25.48 27.034 28.794 30.78 32.913 35.34 38.268 41.337 45.101 49.511 54.925 61.439 69.604 80.102 94.341 107.883 116.968 123.59 128.555 132.457 135.516 138.012 139.95 141.655 142.988 144.143 145.191 146.084 146.817 147.442 148.062 148.581 148.998 149.377 149.725 150.002 150.267 150.495 150.656 150.816 150.959 151.089 151.192 151.245 151.302 151.366 151.367 151.349 151.344 151.319 151.249 151.119 151.039 150.605 150.729 150.581 150.449 150.097 149.854 149.585 149.25 148.774 148.119 147.181 142.001 -5 ,9068 ,KEBNE ,16693027,Fri Nov 26 00:25:52 CET,Fri Nov 26 02:04:19 CET,0.0 1.956 2.644 3.194 3.654 4.049 4.426 4.794 5.49 5.82 6.135 6.221 7.031 7.329 7.904 8.445 8.983 9.256 9.792 10.312 11.066 11.559 12.048 12.771 13.483 14.177 14.861 15.545 16.45 17.333 18.195 19.258 20.316 21.357 22.594 24.01 25.394 26.952 28.698 30.599 32.675 35.183 38.25 41.398 45.151 49.533 54.863 61.314 69.456 79.88 94.142 107.711 116.832 123.454 128.453 132.39 135.419 137.809 139.656 141.371 142.732 143.82 144.772 145.614 146.335 146.944 147.518 147.971 148.327 148.673 148.992 149.225 149.453 149.675 149.821 149.948 150.049 150.128 150.213 150.263 150.296 150.319 150.32 150.312 150.304 150.26 150.179 150.091 150.027 149.587 149.745 149.641 149.525 149.154 148.893 148.592 148.226 147.816 147.236 146.399 142.071 -6 ,11844 ,KEBNE ,16693028,Fri Nov 26 00:26:54 CET,Fri Nov 26 02:06:53 CET,0.0 1.636 2.225 2.684 3.107 3.513 3.895 4.248 4.924 5.25 5.567 5.679 6.503 6.796 7.353 7.906 8.451 8.72 9.248 9.766 10.532 11.034 11.538 12.281 12.999 13.7 14.393 15.085 16.0 16.898 17.782 18.861 19.894 20.918 22.166 23.601 24.973 26.527 28.29 30.229 32.3 34.739 37.778 40.921 44.688 49.146 54.636 61.251 69.417 79.798 94.015 107.435 116.454 123.008 127.952 131.804 134.747 137.132 139.019 140.755 142.098 143.199 144.173 145.03 145.786 146.415 147.003 147.479 147.862 148.226 148.575 148.846 149.092 149.31 149.459 149.62 149.781 149.917 150.017 150.059 150.094 150.158 150.191 150.192 150.178 150.158 150.124 150.025 149.949 149.504 149.637 149.529 149.393 149.059 148.864 148.637 148.382 147.999 147.374 146.409 138.305 -8 ,5937 ,KEBNE ,16693030,Fri Nov 26 00:26:54 CET,Fri Nov 26 02:06:27 CET,0.0 1.38 2.011 2.523 2.953 3.357 3.745 4.108 4.789 5.109 5.425 5.538 6.358 6.654 7.225 7.773 8.303 8.564 9.086 9.606 10.338 10.813 11.298 12.023 12.731 13.423 14.108 14.796 15.696 16.565 17.435 18.535 19.6 20.626 21.851 23.281 24.708 26.299 28.042 29.941 32.022 34.456 37.391 40.459 44.169 48.534 53.834 60.199 68.215 78.466 92.42 105.811 114.865 121.415 126.359 130.245 133.271 135.752 137.674 139.423 140.818 141.934 142.884 143.688 144.4 145.037 145.651 146.165 146.579 146.917 147.21 147.421 147.618 147.847 148.012 148.127 148.185 148.228 148.224 148.195 148.182 148.175 148.149 148.106 148.091 148.052 147.963 147.82 147.732 147.278 147.375 147.234 147.076 146.692 146.448 146.149 145.791 145.295 144.574 143.498 138.059 -9 ,28312 ,KEBNE ,16693031,Fri Nov 26 00:26:55 CET,Fri Nov 26 02:07:24 CET,0.0 2.017 2.702 3.242 3.705 4.125 4.512 4.874 5.562 5.897 6.217 6.318 7.13 7.423 8.004 8.572 9.123 9.392 9.913 10.426 11.206 11.704 12.183 12.911 13.622 14.305 14.989 15.658 16.544 17.428 18.289 19.365 20.419 21.445 22.663 24.077 25.469 27.038 28.78 30.675 32.74 35.15 38.074 41.154 44.88 49.227 54.597 61.052 69.067 79.435 93.613 107.105 116.22 122.728 127.593 131.492 134.561 137.028 138.888 140.52 141.829 142.97 143.958 144.815 145.582 146.175 146.692 147.162 147.55 147.911 148.266 148.548 148.815 149.053 149.201 149.322 149.441 149.531 149.594 149.607 149.607 149.631 149.637 149.634 149.629 149.586 149.485 149.361 149.278 148.833 149.008 148.907 148.773 148.399 148.187 147.949 147.625 147.218 146.68 145.762 139.852 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt deleted file mode 100644 index 620ce709..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2u_p38a-2q.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25049 ,KEBNE ,16693033,Fri Nov 26 00:26:55 CET,Fri Nov 26 02:07:15 CET,0.0 1.49 2.047 2.498 2.895 3.254 3.575 3.868 4.39 4.639 4.89 4.858 5.602 5.82 6.227 6.625 7.021 7.212 7.579 7.931 8.46 8.807 9.143 9.634 10.105 10.574 11.029 11.463 12.035 12.599 13.16 13.845 14.499 15.139 15.908 16.8 17.664 18.637 19.708 20.873 22.14 23.59 25.335 27.154 29.349 31.846 34.833 38.376 42.757 48.201 55.272 61.714 65.803 68.61 70.582 72.055 73.142 73.952 74.543 75.021 75.323 75.532 75.68 75.772 75.811 75.829 75.857 75.834 75.752 75.67 75.601 75.507 75.387 75.243 75.125 75.003 74.863 74.709 74.531 74.407 74.277 74.056 73.899 73.72 73.618 73.401 73.156 72.886 72.747 72.151 72.266 72.078 71.871 71.383 71.084 70.768 70.424 70.028 69.466 68.66 66.079 -2 ,28666 ,KEBNE ,16693034,Fri Nov 26 00:26:55 CET,Fri Nov 26 02:08:29 CET,0.0 1.521 2.079 2.515 2.909 3.262 3.572 3.862 4.419 4.681 4.936 4.903 5.629 5.838 6.254 6.644 7.028 7.221 7.605 7.977 8.5 8.845 9.191 9.696 10.185 10.651 11.102 11.54 12.116 12.679 13.224 13.896 14.563 15.227 15.999 16.88 17.746 18.713 19.796 20.964 22.212 23.656 25.427 27.261 29.452 32.0 35.024 38.543 42.858 48.292 55.389 61.723 65.818 68.672 70.648 72.103 73.19 74.046 74.667 75.122 75.394 75.542 75.657 75.797 75.916 76.014 76.088 76.107 76.095 76.054 75.983 75.903 75.801 75.667 75.533 75.39 75.248 75.123 74.971 74.831 74.696 74.491 74.327 74.146 74.05 73.866 73.657 73.398 73.269 72.698 72.819 72.634 72.424 71.958 71.701 71.404 71.081 70.728 70.244 69.46 66.187 -3 ,20129 ,KEBNE ,16693035,Fri Nov 26 00:27:57 CET,Fri Nov 26 02:08:23 CET,0.0 2.109 2.713 3.154 3.535 3.88 4.203 4.512 5.085 5.343 5.592 5.541 6.28 6.505 6.931 7.336 7.713 7.903 8.276 8.634 9.177 9.533 9.866 10.351 10.832 11.298 11.747 12.194 12.798 13.392 13.972 14.684 15.379 16.045 16.82 17.715 18.599 19.59 20.678 21.871 23.158 24.607 26.342 28.148 30.291 32.776 35.749 39.256 43.569 48.935 55.915 62.217 66.251 69.021 70.986 72.495 73.655 74.499 75.091 75.559 75.889 76.155 76.361 76.516 76.653 76.751 76.808 76.854 76.847 76.811 76.799 76.772 76.703 76.611 76.539 76.451 76.346 76.228 76.089 75.98 75.858 75.664 75.51 75.336 75.245 75.045 74.832 74.584 74.449 73.867 73.976 73.789 73.588 73.162 72.916 72.622 72.288 71.838 71.258 70.582 67.611 -4 ,23220 ,KEBNE ,16693036,Fri Nov 26 00:27:58 CET,Fri Nov 26 02:12:15 CET,0.0 1.591 2.219 2.716 3.118 3.469 3.794 4.089 4.614 4.857 5.093 5.036 5.785 6.007 6.418 6.828 7.226 7.413 7.781 8.153 8.685 9.02 9.34 9.806 10.267 10.717 11.164 11.604 12.18 12.76 13.348 14.064 14.74 15.392 16.158 17.025 17.877 18.85 19.927 21.103 22.359 23.802 25.523 27.308 29.475 31.973 34.95 38.444 42.803 48.263 55.323 61.636 65.67 68.493 70.503 72.036 73.175 73.985 74.542 75.069 75.485 75.767 75.987 76.165 76.295 76.359 76.369 76.356 76.327 76.266 76.169 76.091 75.996 75.892 75.795 75.7 75.601 75.477 75.344 75.246 75.147 74.948 74.787 74.625 74.543 74.357 74.135 73.891 73.765 73.187 73.329 73.17 73.0 72.571 72.315 72.03 71.714 71.346 70.862 70.173 67.95 -5 ,30669 ,KEBNE ,16693037,Fri Nov 26 00:27:57 CET,Fri Nov 26 02:10:07 CET,0.0 1.74 2.349 2.848 3.25 3.583 3.912 4.212 4.738 4.994 5.241 5.193 5.926 6.125 6.515 6.912 7.319 7.506 7.863 8.236 8.784 9.132 9.466 9.961 10.453 10.928 11.377 11.821 12.412 12.989 13.548 14.24 14.929 15.596 16.376 17.267 18.148 19.112 20.164 21.323 22.582 24.042 25.765 27.537 29.713 32.207 35.182 38.722 43.051 48.457 55.504 61.921 66.028 68.838 70.826 72.283 73.368 74.206 74.823 75.352 75.719 75.961 76.158 76.313 76.41 76.455 76.479 76.495 76.504 76.486 76.439 76.38 76.307 76.218 76.126 76.023 75.919 75.798 75.645 75.532 75.412 75.215 75.063 74.894 74.804 74.618 74.409 74.169 74.038 73.456 73.611 73.461 73.282 72.848 72.574 72.243 71.889 71.478 70.957 70.252 67.527 -6 ,1423 ,KEBNE ,16693038,Fri Nov 26 00:27:57 CET,Fri Nov 26 02:10:26 CET,0.0 1.575 2.171 2.626 3.052 3.433 3.773 4.078 4.599 4.847 5.089 5.027 5.766 5.984 6.406 6.809 7.203 7.393 7.751 8.098 8.616 8.963 9.299 9.786 10.263 10.725 11.179 11.633 12.23 12.814 13.379 14.056 14.723 15.396 16.181 17.056 17.92 18.905 19.988 21.156 22.388 23.805 25.534 27.323 29.481 31.967 34.962 38.558 42.961 48.406 55.49 61.863 65.923 68.74 70.788 72.274 73.367 74.227 74.835 75.365 75.76 76.046 76.26 76.425 76.547 76.628 76.679 76.681 76.658 76.648 76.633 76.585 76.533 76.46 76.363 76.248 76.132 76.001 75.828 75.698 75.58 75.402 75.262 75.109 75.025 74.829 74.628 74.41 74.28 73.707 73.854 73.665 73.454 73.03 72.771 72.462 72.157 71.797 71.279 70.551 68.135 -7 ,7805 ,KEBNE ,16693039,Fri Nov 26 00:27:57 CET,Fri Nov 26 02:10:22 CET,0.0 1.749 2.306 2.756 3.16 3.5 3.791 4.066 4.624 4.892 5.134 5.059 5.791 6.011 6.424 6.811 7.208 7.404 7.785 8.143 8.676 9.03 9.365 9.831 10.288 10.749 11.209 11.672 12.264 12.838 13.395 14.076 14.743 15.403 16.18 17.056 17.926 18.903 19.977 21.164 22.422 23.874 25.666 27.506 29.668 32.148 35.112 38.688 43.162 48.545 55.534 61.888 65.878 68.638 70.598 72.035 73.045 73.812 74.388 74.838 75.155 75.401 75.593 75.745 75.848 75.923 75.976 75.988 75.976 75.953 75.911 75.864 75.789 75.703 75.634 75.523 75.389 75.247 75.095 74.973 74.833 74.62 74.476 74.328 74.249 74.064 73.852 73.619 73.479 72.884 73.006 72.821 72.631 72.199 71.903 71.568 71.232 70.805 70.258 69.53 67.401 -8 ,1358 ,KEBNE ,16693040,Fri Nov 26 00:27:57 CET,Fri Nov 26 02:08:55 CET,0.0 1.566 2.156 2.621 2.989 3.319 3.642 3.934 4.476 4.729 4.964 4.91 5.644 5.852 6.254 6.663 7.053 7.241 7.629 8.013 8.572 8.933 9.267 9.747 10.228 10.685 11.127 11.569 12.156 12.731 13.299 14.003 14.69 15.357 16.135 17.027 17.902 18.879 19.95 21.117 22.379 23.834 25.578 27.394 29.595 32.116 35.117 38.668 43.094 48.603 55.681 62.062 66.134 68.907 70.865 72.349 73.426 74.235 74.823 75.32 75.68 75.938 76.135 76.275 76.373 76.438 76.455 76.452 76.46 76.461 76.415 76.342 76.272 76.186 76.098 76.009 75.921 75.812 75.672 75.563 75.437 75.23 75.078 74.903 74.808 74.602 74.379 74.13 73.991 73.399 73.514 73.331 73.133 72.634 72.309 71.954 71.56 71.105 70.486 69.543 62.803 -9 ,13864 ,KEBNE ,16693041,Fri Nov 26 00:27:58 CET,Fri Nov 26 02:09:53 CET,0.0 1.943 2.495 2.921 3.31 3.671 4.004 4.303 4.867 5.126 5.366 5.326 6.087 6.32 6.748 7.174 7.565 7.75 8.117 8.489 9.034 9.374 9.699 10.171 10.636 11.092 11.529 11.959 12.542 13.114 13.674 14.359 15.02 15.667 16.436 17.326 18.194 19.166 20.237 21.387 22.641 24.097 25.848 27.646 29.82 32.35 35.322 38.823 43.16 48.582 55.595 61.886 65.976 68.864 70.902 72.37 73.399 74.202 74.828 75.347 75.709 75.998 76.244 76.407 76.514 76.609 76.685 76.732 76.747 76.737 76.722 76.673 76.576 76.466 76.386 76.302 76.192 76.052 75.897 75.794 75.682 75.485 75.344 75.215 75.141 74.948 74.755 74.528 74.396 73.822 73.938 73.744 73.552 73.127 72.885 72.591 72.269 71.909 71.38 70.577 67.542 -10 ,12323 ,KEBNE ,16693042,Fri Nov 26 00:27:58 CET,Fri Nov 26 02:10:03 CET,0.0 1.291 1.871 2.335 2.707 3.024 3.333 3.637 4.213 4.478 4.713 4.643 5.388 5.61 6.021 6.413 6.793 6.982 7.35 7.706 8.227 8.556 8.883 9.37 9.839 10.296 10.747 11.191 11.786 12.373 12.938 13.623 14.29 14.958 15.758 16.676 17.546 18.504 19.592 20.79 22.054 23.495 25.235 27.055 29.252 31.756 34.791 38.385 42.785 48.346 55.423 61.718 65.776 68.537 70.463 71.869 72.875 73.641 74.191 74.669 75.036 75.289 75.498 75.65 75.73 75.787 75.83 75.836 75.825 75.803 75.74 75.657 75.574 75.482 75.403 75.308 75.185 75.06 74.916 74.805 74.686 74.477 74.321 74.149 74.057 73.872 73.668 73.415 73.289 72.719 72.831 72.651 72.452 71.982 71.699 71.392 71.047 70.619 70.095 69.363 67.08 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt deleted file mode 100644 index 3ffac0be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2x_p38a-2g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6701 ,KEBNE ,16693043,Fri Nov 26 00:27:57 CET,Fri Nov 26 02:02:28 CET,0.0 1.956 2.422 2.791 3.098 3.342 3.549 3.737 4.054 4.187 4.314 4.202 4.644 4.76 4.986 5.19 5.385 5.478 5.659 5.824 6.049 6.194 6.339 6.543 6.718 6.891 7.054 7.21 7.397 7.552 7.701 7.89 8.073 8.243 8.434 8.642 8.841 9.05 9.24 9.427 9.624 9.813 10.013 10.197 10.371 10.552 10.663 10.647 10.484 10.016 8.98 7.599 6.353 5.188 4.117 3.178 2.381 1.664 1.052 0.445 -0.1 -0.585 -1.03 -1.453 -1.85 -2.211 -2.582 -2.911 -3.194 -3.499 -3.821 -4.081 -4.341 -4.614 -4.825 -5.053 -5.302 -5.536 -5.778 -5.969 -6.157 -6.411 -6.586 -6.772 -6.87 -7.075 -7.292 -7.52 -7.638 -8.11 -8.027 -8.169 -8.313 -8.64 -8.828 -9.031 -9.252 -9.507 -9.846 -10.352 -12.59 -2 ,16393 ,KEBNE ,16693044,Fri Nov 26 00:29:00 CET,Fri Nov 26 02:06:05 CET,0.0 2.349 2.869 3.222 3.511 3.746 3.966 4.168 4.53 4.69 4.827 4.746 5.209 5.327 5.531 5.709 5.878 5.962 6.138 6.302 6.529 6.679 6.819 7.007 7.178 7.337 7.51 7.674 7.861 8.028 8.21 8.431 8.616 8.794 9.004 9.23 9.42 9.621 9.822 10.008 10.183 10.369 10.596 10.778 10.933 11.052 11.122 11.128 10.985 10.544 9.405 7.798 6.419 5.23 4.197 3.252 2.432 1.688 1.039 0.392 -0.149 -0.606 -1.051 -1.497 -1.916 -2.279 -2.644 -2.969 -3.247 -3.534 -3.835 -4.099 -4.367 -4.631 -4.834 -5.04 -5.252 -5.477 -5.71 -5.868 -6.031 -6.291 -6.475 -6.666 -6.766 -6.972 -7.177 -7.398 -7.525 -8.004 -7.911 -8.044 -8.197 -8.547 -8.73 -8.937 -9.18 -9.464 -9.838 -10.407 -12.547 -3 ,27789 ,KEBNE ,16693045,Fri Nov 26 00:29:00 CET,Fri Nov 26 02:05:36 CET,0.0 1.876 2.474 2.864 3.164 3.433 3.67 3.902 4.301 4.475 4.63 4.574 5.041 5.16 5.365 5.565 5.755 5.838 6.005 6.17 6.398 6.538 6.678 6.876 7.052 7.213 7.367 7.522 7.712 7.875 8.03 8.22 8.39 8.555 8.757 8.966 9.15 9.348 9.562 9.768 9.975 10.217 10.442 10.609 10.768 10.927 11.023 11.001 10.845 10.388 9.322 7.796 6.446 5.265 4.207 3.275 2.475 1.759 1.15 0.524 -0.026 -0.506 -0.953 -1.374 -1.751 -2.1 -2.478 -2.813 -3.103 -3.407 -3.721 -3.979 -4.239 -4.512 -4.731 -4.954 -5.181 -5.426 -5.68 -5.848 -6.025 -6.29 -6.479 -6.688 -6.791 -7.009 -7.248 -7.485 -7.6 -8.07 -7.983 -8.126 -8.279 -8.617 -8.798 -9.01 -9.247 -9.486 -9.787 -10.215 -12.09 -4 ,1135 ,KEBNE ,16693046,Fri Nov 26 00:29:00 CET,Fri Nov 26 02:05:46 CET,0.0 2.795 3.405 3.788 4.077 4.332 4.572 4.779 5.107 5.26 5.409 5.357 5.814 5.926 6.152 6.357 6.556 6.658 6.861 7.035 7.275 7.434 7.578 7.759 7.927 8.102 8.271 8.419 8.602 8.775 8.929 9.118 9.324 9.51 9.702 9.911 10.095 10.299 10.524 10.728 10.919 11.111 11.308 11.49 11.645 11.764 11.863 11.875 11.672 11.161 10.119 8.569 7.193 5.977 4.883 3.934 3.129 2.415 1.783 1.151 0.611 0.13 -0.3 -0.701 -1.097 -1.464 -1.833 -2.164 -2.456 -2.759 -3.082 -3.353 -3.627 -3.905 -4.126 -4.359 -4.593 -4.832 -5.072 -5.245 -5.43 -5.708 -5.907 -6.119 -6.224 -6.45 -6.702 -6.945 -7.069 -7.547 -7.444 -7.583 -7.729 -8.051 -8.243 -8.454 -8.665 -8.902 -9.205 -9.685 -12.196 -5 ,1919 ,KEBNE ,16693047,Fri Nov 26 00:29:00 CET,Fri Nov 26 02:05:24 CET,0.0 2.216 2.713 3.07 3.339 3.583 3.806 4.01 4.411 4.576 4.713 4.61 5.052 5.16 5.357 5.55 5.756 5.85 6.008 6.151 6.364 6.497 6.627 6.804 6.961 7.119 7.275 7.423 7.615 7.799 7.971 8.173 8.356 8.52 8.717 8.939 9.137 9.338 9.544 9.738 9.922 10.107 10.288 10.462 10.665 10.859 10.939 10.922 10.803 10.34 9.193 7.611 6.272 5.116 4.104 3.211 2.422 1.696 1.061 0.438 -0.081 -0.56 -1.031 -1.473 -1.873 -2.234 -2.607 -2.94 -3.222 -3.515 -3.83 -4.09 -4.369 -4.652 -4.869 -5.099 -5.34 -5.588 -5.84 -6.016 -6.206 -6.508 -6.71 -6.921 -7.033 -7.263 -7.507 -7.768 -7.903 -8.385 -8.328 -8.488 -8.646 -9.013 -9.216 -9.422 -9.653 -9.92 -10.239 -10.694 -13.057 -6 ,20772 ,KEBNE ,16693048,Fri Nov 26 00:30:02 CET,Fri Nov 26 02:04:57 CET,0.0 2.096 2.606 2.958 3.219 3.44 3.635 3.815 4.151 4.31 4.447 4.339 4.795 4.914 5.112 5.296 5.477 5.555 5.717 5.899 6.137 6.273 6.395 6.585 6.763 6.915 7.078 7.237 7.452 7.668 7.838 8.037 8.232 8.408 8.605 8.808 8.998 9.207 9.407 9.61 9.835 10.055 10.255 10.437 10.63 10.793 10.904 10.914 10.722 10.261 9.243 7.745 6.444 5.299 4.25 3.293 2.473 1.745 1.122 0.492 -0.063 -0.545 -0.997 -1.429 -1.833 -2.196 -2.558 -2.878 -3.165 -3.466 -3.779 -4.02 -4.258 -4.521 -4.724 -4.924 -5.135 -5.375 -5.625 -5.784 -5.947 -6.2 -6.381 -6.585 -6.69 -6.887 -7.091 -7.318 -7.438 -7.916 -7.839 -7.981 -8.156 -8.529 -8.729 -8.952 -9.182 -9.443 -9.788 -10.324 -12.767 -7 ,1483 ,KEBNE ,16693049,Fri Nov 26 00:30:02 CET,Fri Nov 26 02:05:31 CET,0.0 1.993 2.472 2.819 3.121 3.371 3.563 3.734 4.032 4.166 4.294 4.202 4.661 4.782 5.006 5.211 5.411 5.513 5.704 5.878 6.102 6.241 6.376 6.567 6.742 6.905 7.082 7.246 7.431 7.601 7.764 7.956 8.126 8.291 8.466 8.665 8.871 9.098 9.329 9.539 9.739 9.963 10.217 10.412 10.576 10.707 10.806 10.797 10.653 10.238 9.2 7.754 6.436 5.303 4.294 3.339 2.534 1.824 1.218 0.612 0.092 -0.368 -0.801 -1.201 -1.588 -1.958 -2.345 -2.673 -2.946 -3.242 -3.562 -3.832 -4.109 -4.394 -4.619 -4.85 -5.083 -5.323 -5.571 -5.746 -5.924 -6.19 -6.378 -6.574 -6.674 -6.887 -7.114 -7.345 -7.46 -7.931 -7.838 -7.985 -8.141 -8.489 -8.675 -8.87 -9.127 -9.441 -9.804 -10.242 -11.803 -8 ,13494 ,KEBNE ,16693050,Fri Nov 26 00:30:02 CET,Fri Nov 26 02:04:18 CET,0.0 1.563 2.071 2.438 2.714 2.96 3.175 3.367 3.709 3.862 3.991 3.875 4.326 4.434 4.628 4.806 4.973 5.057 5.22 5.379 5.621 5.765 5.905 6.114 6.296 6.457 6.618 6.78 6.969 7.133 7.297 7.483 7.647 7.809 7.994 8.189 8.375 8.573 8.771 8.953 9.129 9.327 9.535 9.73 9.914 10.045 10.114 10.146 10.051 9.594 8.572 7.072 5.67 4.431 3.392 2.454 1.634 0.937 0.347 -0.259 -0.804 -1.291 -1.746 -2.183 -2.59 -2.949 -3.329 -3.664 -3.974 -4.317 -4.664 -4.964 -5.288 -5.602 -5.82 -6.051 -6.288 -6.524 -6.78 -6.956 -7.143 -7.44 -7.638 -7.844 -7.956 -8.187 -8.423 -8.679 -8.808 -9.293 -9.252 -9.419 -9.584 -9.924 -10.126 -10.342 -10.551 -10.781 -11.099 -11.581 -13.295 -9 ,6433 ,KEBNE ,16693051,Fri Nov 26 00:30:02 CET,Fri Nov 26 02:08:23 CET,0.0 2.004 2.53 2.849 3.101 3.339 3.533 3.709 4.063 4.236 4.386 4.329 4.788 4.893 5.124 5.336 5.509 5.598 5.773 5.934 6.159 6.305 6.446 6.631 6.805 6.973 7.13 7.28 7.468 7.658 7.858 8.102 8.308 8.487 8.695 8.905 9.08 9.281 9.485 9.7 9.898 10.066 10.236 10.394 10.555 10.673 10.726 10.692 10.521 10.023 8.966 7.467 6.116 4.895 3.841 2.927 2.095 1.336 0.688 0.056 -0.476 -0.932 -1.382 -1.81 -2.199 -2.563 -2.97 -3.336 -3.626 -3.924 -4.233 -4.489 -4.764 -5.049 -5.265 -5.48 -5.699 -5.942 -6.2 -6.369 -6.546 -6.826 -7.013 -7.206 -7.306 -7.515 -7.743 -7.981 -8.099 -8.569 -8.487 -8.625 -8.764 -9.078 -9.257 -9.45 -9.692 -9.967 -10.279 -10.748 -13.141 -10 ,25771 ,KEBNE ,16693052,Fri Nov 26 00:30:03 CET,Fri Nov 26 02:08:44 CET,0.0 2.173 2.698 3.086 3.387 3.629 3.843 4.043 4.402 4.549 4.696 4.618 5.058 5.157 5.353 5.533 5.721 5.81 5.963 6.107 6.293 6.419 6.545 6.718 6.893 7.064 7.222 7.363 7.545 7.728 7.911 8.121 8.301 8.46 8.647 8.86 9.057 9.259 9.472 9.674 9.826 9.984 10.19 10.376 10.531 10.64 10.702 10.707 10.555 10.098 9.005 7.503 6.188 5.042 4.035 3.103 2.303 1.591 0.975 0.343 -0.194 -0.652 -1.097 -1.526 -1.908 -2.25 -2.616 -2.952 -3.24 -3.539 -3.859 -4.127 -4.391 -4.661 -4.878 -5.099 -5.332 -5.571 -5.818 -5.998 -6.191 -6.49 -6.698 -6.917 -7.025 -7.23 -7.444 -7.7 -7.836 -8.326 -8.283 -8.446 -8.615 -8.975 -9.184 -9.423 -9.734 -10.106 -10.549 -11.128 -13.087 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 8350c66e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2599 ,KEBNE ,16693053,Fri Nov 26 00:30:02 CET,Fri Nov 26 02:03:04 CET,0.0 1.097 1.411 1.638 1.818 1.975 2.12 2.25 2.491 2.597 2.698 2.557 2.998 3.085 3.264 3.431 3.582 3.658 3.805 3.944 4.15 4.279 4.398 4.584 4.776 4.963 5.139 5.308 5.539 5.765 5.984 6.249 6.499 6.733 7.012 7.322 7.609 7.929 8.281 8.646 9.02 9.454 9.983 10.514 11.096 11.749 12.505 13.325 14.228 15.15 16.1 16.536 16.546 16.384 16.088 15.79 15.483 15.134 14.808 14.472 14.178 13.894 13.62 13.341 13.061 12.82 12.564 12.313 12.093 11.865 11.621 11.408 11.182 10.956 10.767 10.552 10.333 10.111 9.863 9.688 9.509 9.23 9.029 8.807 8.694 8.46 8.215 7.967 7.821 7.33 7.356 7.197 7.022 6.585 6.318 6.001 5.674 5.304 4.837 4.165 0.928 -2 ,3244 ,KEBNE ,16693054,Fri Nov 26 00:30:02 CET,Fri Nov 26 02:02:38 CET,0.0 1.115 1.401 1.648 1.856 2.026 2.175 2.314 2.563 2.675 2.78 2.637 3.078 3.173 3.372 3.568 3.745 3.829 3.988 4.148 4.383 4.532 4.675 4.889 5.098 5.295 5.473 5.642 5.874 6.098 6.317 6.583 6.825 7.061 7.331 7.632 7.936 8.272 8.622 8.995 9.403 9.856 10.388 10.918 11.52 12.203 12.99 13.853 14.774 15.678 16.596 17.101 17.088 16.859 16.559 16.231 15.885 15.534 15.202 14.854 14.559 14.272 13.972 13.666 13.376 13.112 12.835 12.582 12.355 12.123 11.891 11.69 11.454 11.203 11.01 10.813 10.611 10.389 10.142 9.972 9.787 9.482 9.27 9.068 8.965 8.737 8.496 8.218 8.067 7.58 7.578 7.403 7.211 6.773 6.516 6.243 5.931 5.533 5.005 4.266 1.076 -3 ,301 ,KEBNE ,16693055,Fri Nov 26 00:31:04 CET,Fri Nov 26 02:03:35 CET,0.0 1.065 1.387 1.621 1.82 1.994 2.144 2.277 2.524 2.644 2.752 2.601 3.037 3.133 3.321 3.494 3.665 3.746 3.897 4.046 4.254 4.38 4.503 4.691 4.872 5.049 5.222 5.389 5.604 5.814 6.026 6.295 6.554 6.801 7.084 7.399 7.695 8.016 8.37 8.754 9.144 9.594 10.138 10.664 11.242 11.87 12.636 13.483 14.411 15.373 16.222 16.586 16.587 16.404 16.128 15.773 15.405 15.051 14.75 14.434 14.13 13.845 13.546 13.257 12.991 12.733 12.452 12.189 11.959 11.725 11.483 11.278 11.056 10.814 10.634 10.439 10.22 9.983 9.728 9.56 9.393 9.107 8.896 8.688 8.58 8.359 8.12 7.853 7.705 7.221 7.226 7.039 6.842 6.37 6.093 5.804 5.489 5.122 4.678 4.034 1.315 -4 ,23819 ,KEBNE ,16693056,Fri Nov 26 00:31:05 CET,Fri Nov 26 02:06:03 CET,0.0 1.286 1.585 1.803 1.992 2.153 2.299 2.438 2.686 2.799 2.901 2.748 3.193 3.288 3.467 3.638 3.803 3.881 4.027 4.171 4.399 4.548 4.691 4.9 5.099 5.295 5.476 5.651 5.883 6.104 6.314 6.575 6.841 7.084 7.358 7.673 7.972 8.289 8.629 9.014 9.428 9.889 10.428 10.95 11.524 12.171 12.92 13.724 14.62 15.523 16.341 16.788 16.839 16.658 16.385 16.076 15.735 15.426 15.103 14.737 14.438 14.149 13.856 13.577 13.314 13.079 12.829 12.588 12.369 12.154 11.932 11.718 11.485 11.245 11.067 10.895 10.707 10.498 10.268 10.105 9.943 9.689 9.506 9.303 9.199 8.969 8.697 8.401 8.247 7.758 7.753 7.58 7.382 6.927 6.668 6.384 6.071 5.679 5.137 4.422 1.5 -5 ,3030 ,KEBNE ,16693057,Fri Nov 26 00:31:04 CET,Fri Nov 26 02:04:47 CET,0.0 1.502 1.795 2.008 2.189 2.359 2.504 2.644 2.911 3.025 3.133 2.998 3.446 3.544 3.719 3.876 4.032 4.11 4.257 4.4 4.608 4.737 4.867 5.066 5.247 5.423 5.605 5.785 6.017 6.235 6.439 6.678 6.911 7.162 7.461 7.782 8.093 8.435 8.783 9.154 9.557 10.008 10.531 11.076 11.7 12.389 13.151 13.907 14.787 15.777 16.711 17.092 17.084 16.942 16.71 16.403 16.078 15.748 15.42 15.098 14.807 14.504 14.223 13.967 13.697 13.427 13.138 12.867 12.634 12.392 12.131 11.907 11.678 11.44 11.235 11.027 10.828 10.617 10.394 10.242 10.066 9.771 9.571 9.359 9.244 9.009 8.744 8.438 8.277 7.769 7.711 7.51 7.32 6.894 6.637 6.339 5.981 5.543 5.016 4.343 1.326 -6 ,22593 ,KEBNE ,16693058,Fri Nov 26 00:31:05 CET,Fri Nov 26 02:05:53 CET,0.0 1.176 1.512 1.745 1.941 2.123 2.286 2.425 2.655 2.763 2.869 2.72 3.16 3.254 3.434 3.597 3.755 3.83 3.977 4.128 4.348 4.489 4.621 4.82 5.022 5.21 5.388 5.571 5.825 6.057 6.276 6.545 6.793 7.032 7.32 7.655 7.974 8.299 8.64 9.006 9.411 9.877 10.398 10.952 11.584 12.273 13.045 13.848 14.81 15.857 16.761 17.122 17.151 17.003 16.733 16.408 16.09 15.745 15.396 15.044 14.74 14.441 14.162 13.907 13.668 13.446 13.173 12.931 12.721 12.484 12.247 12.055 11.832 11.591 11.407 11.204 10.983 10.738 10.48 10.3 10.105 9.812 9.599 9.378 9.268 9.016 8.747 8.464 8.321 7.843 7.861 7.692 7.51 7.094 6.854 6.581 6.265 5.893 5.454 4.891 0.933 -7 ,21838 ,KEBNE ,16693059,Fri Nov 26 00:31:05 CET,Fri Nov 26 02:04:38 CET,0.0 1.132 1.442 1.66 1.834 1.992 2.135 2.265 2.509 2.624 2.73 2.581 3.018 3.106 3.283 3.453 3.61 3.686 3.835 3.983 4.181 4.303 4.432 4.62 4.806 4.992 5.164 5.328 5.549 5.767 5.978 6.245 6.501 6.748 7.028 7.341 7.644 7.97 8.315 8.682 9.076 9.54 10.068 10.58 11.192 11.862 12.6 13.388 14.294 15.275 16.14 16.555 16.597 16.451 16.167 15.796 15.402 15.024 14.682 14.325 14.028 13.76 13.48 13.2 12.941 12.688 12.4 12.15 11.923 11.674 11.418 11.207 10.985 10.75 10.548 10.333 10.119 9.898 9.687 9.535 9.361 9.085 8.889 8.659 8.531 8.288 8.046 7.762 7.617 7.143 7.14 6.957 6.768 6.337 6.069 5.755 5.4 4.993 4.526 3.826 0.412 -8 ,7438 ,KEBNE ,16693060,Fri Nov 26 00:31:05 CET,Fri Nov 26 02:05:23 CET,0.0 1.858 2.177 2.42 2.628 2.811 2.981 3.145 3.429 3.555 3.675 3.553 3.998 4.1 4.297 4.487 4.661 4.744 4.908 5.063 5.289 5.44 5.589 5.795 5.987 6.172 6.355 6.535 6.765 6.983 7.192 7.438 7.678 7.92 8.18 8.467 8.758 9.092 9.454 9.846 10.253 10.701 11.225 11.733 12.322 12.974 13.76 14.632 15.549 16.501 17.328 17.705 17.721 17.489 17.184 16.898 16.603 16.283 15.954 15.6 15.282 14.968 14.662 14.371 14.094 13.835 13.556 13.304 13.085 12.846 12.588 12.381 12.162 11.903 11.701 11.51 11.302 11.075 10.841 10.671 10.475 10.156 9.961 9.755 9.643 9.421 9.187 8.94 8.797 8.31 8.319 8.138 7.95 7.522 7.271 6.986 6.677 6.317 5.787 5.077 1.854 -9 ,15700 ,KEBNE ,16693061,Fri Nov 26 00:32:07 CET,Fri Nov 26 02:09:53 CET,0.0 1.251 1.566 1.807 1.999 2.156 2.298 2.437 2.693 2.812 2.926 2.791 3.232 3.327 3.508 3.676 3.836 3.918 4.084 4.24 4.469 4.623 4.771 4.966 5.151 5.338 5.523 5.701 5.933 6.167 6.385 6.645 6.904 7.151 7.423 7.716 8.012 8.35 8.703 9.083 9.478 9.903 10.405 10.92 11.513 12.182 12.928 13.76 14.756 15.703 16.555 17.03 17.029 16.852 16.605 16.304 15.972 15.626 15.317 14.999 14.706 14.422 14.121 13.811 13.514 13.248 12.981 12.735 12.507 12.252 11.971 11.744 11.501 11.25 11.063 10.864 10.658 10.442 10.207 10.043 9.873 9.587 9.383 9.166 9.062 8.836 8.566 8.286 8.144 7.66 7.648 7.45 7.226 6.773 6.528 6.253 5.915 5.484 4.964 4.24 0.925 -10 ,11582 ,KEBNE ,16693062,Fri Nov 26 00:32:07 CET,Fri Nov 26 02:07:06 CET,0.0 1.407 1.726 1.942 2.122 2.276 2.411 2.537 2.765 2.874 2.979 2.829 3.264 3.355 3.528 3.698 3.863 3.939 4.091 4.239 4.445 4.576 4.71 4.914 5.11 5.304 5.486 5.654 5.874 6.083 6.291 6.559 6.82 7.062 7.351 7.684 7.988 8.315 8.668 9.053 9.472 9.937 10.462 10.98 11.572 12.239 12.982 13.792 14.726 15.704 16.579 16.887 16.842 16.607 16.26 15.844 15.462 15.128 14.802 14.451 14.143 13.852 13.536 13.221 12.938 12.67 12.378 12.107 11.879 11.653 11.392 11.161 10.931 10.695 10.517 10.312 10.087 9.875 9.656 9.486 9.298 9.018 8.819 8.599 8.476 8.225 7.977 7.695 7.538 7.04 7.024 6.828 6.626 6.146 5.839 5.525 5.173 4.723 4.194 3.498 0.333 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt deleted file mode 100644 index 81b4aaf2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-2y_p38a-2z.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9429 ,KEBNE ,16693063,Fri Nov 26 00:32:07 CET,Fri Nov 26 02:08:34 CET,0.0 1.492 1.971 2.292 2.547 2.796 3.02 3.221 3.581 3.748 3.903 3.85 4.338 4.475 4.722 4.954 5.178 5.282 5.483 5.685 5.952 6.116 6.289 6.538 6.764 6.983 7.196 7.395 7.644 7.867 8.08 8.359 8.634 8.89 9.167 9.472 9.763 10.079 10.414 10.743 11.087 11.467 11.868 12.224 12.561 12.853 13.117 13.349 13.453 13.259 12.474 11.262 10.151 9.12 8.176 7.261 6.415 5.631 4.979 4.325 3.758 3.276 2.802 2.347 1.931 1.561 1.175 0.831 0.518 0.172 -0.185 -0.473 -0.757 -1.047 -1.288 -1.524 -1.76 -2.012 -2.262 -2.435 -2.618 -2.912 -3.121 -3.342 -3.458 -3.69 -3.917 -4.163 -4.285 -4.762 -4.698 -4.856 -5.025 -5.43 -5.666 -5.921 -6.199 -6.509 -6.886 -7.435 -9.364 -2 ,13025 ,KEBNE ,16693064,Fri Nov 26 00:32:07 CET,Fri Nov 26 02:09:11 CET,0.0 1.948 2.461 2.812 3.131 3.419 3.678 3.912 4.294 4.462 4.615 4.566 5.052 5.179 5.41 5.637 5.864 5.962 6.135 6.31 6.579 6.749 6.905 7.139 7.38 7.593 7.783 7.98 8.235 8.486 8.731 9.003 9.237 9.473 9.764 10.089 10.382 10.696 11.018 11.34 11.652 12.001 12.365 12.677 13.076 13.418 13.651 13.82 13.859 13.666 13.001 11.806 10.634 9.567 8.554 7.642 6.874 6.191 5.578 4.964 4.454 3.973 3.489 3.024 2.615 2.218 1.782 1.403 1.081 0.759 0.413 0.119 -0.188 -0.519 -0.776 -1.027 -1.269 -1.519 -1.796 -1.995 -2.204 -2.523 -2.733 -2.949 -3.063 -3.293 -3.524 -3.78 -3.925 -4.431 -4.406 -4.583 -4.75 -5.101 -5.297 -5.517 -5.78 -6.082 -6.405 -6.892 -8.746 -3 ,17224 ,KEBNE ,16693065,Fri Nov 26 00:33:10 CET,Fri Nov 26 02:07:44 CET,0.0 1.794 2.372 2.797 3.139 3.434 3.695 3.934 4.342 4.52 4.693 4.679 5.176 5.327 5.615 5.891 6.141 6.259 6.477 6.672 6.954 7.13 7.3 7.54 7.757 7.956 8.159 8.365 8.621 8.865 9.089 9.349 9.595 9.826 10.1 10.391 10.649 10.936 11.237 11.54 11.852 12.212 12.623 13.002 13.341 13.597 13.85 14.073 14.217 14.074 13.331 12.11 10.988 9.937 8.957 8.026 7.222 6.498 5.85 5.231 4.706 4.229 3.765 3.319 2.904 2.528 2.133 1.764 1.439 1.1 0.737 0.443 0.15 -0.154 -0.402 -0.658 -0.915 -1.182 -1.46 -1.65 -1.852 -2.192 -2.433 -2.672 -2.791 -3.033 -3.293 -3.581 -3.732 -4.24 -4.203 -4.372 -4.568 -5.026 -5.258 -5.482 -5.734 -6.015 -6.366 -6.911 -8.894 -4 ,25608 ,KEBNE ,16693066,Fri Nov 26 00:33:09 CET,Fri Nov 26 02:08:59 CET,0.0 1.579 2.13 2.553 2.903 3.197 3.446 3.679 4.083 4.258 4.428 4.389 4.874 5.004 5.239 5.479 5.717 5.826 6.048 6.263 6.547 6.723 6.897 7.141 7.352 7.552 7.767 7.975 8.233 8.48 8.707 8.978 9.237 9.493 9.775 10.074 10.368 10.677 10.972 11.261 11.549 11.829 12.175 12.525 12.835 13.138 13.478 13.827 14.074 13.926 13.102 11.902 10.743 9.611 8.647 7.803 7.051 6.382 5.796 5.179 4.63 4.141 3.664 3.217 2.83 2.482 2.091 1.725 1.409 1.081 0.739 0.457 0.165 -0.134 -0.367 -0.603 -0.831 -1.072 -1.347 -1.548 -1.743 -2.034 -2.24 -2.448 -2.558 -2.8 -3.045 -3.299 -3.434 -3.924 -3.871 -4.054 -4.241 -4.585 -4.764 -4.964 -5.193 -5.461 -5.764 -6.169 -7.74 -5 ,23680 ,KEBNE ,16693067,Fri Nov 26 00:33:11 CET,Fri Nov 26 02:12:22 CET,0.0 1.977 2.444 2.792 3.087 3.339 3.58 3.834 4.291 4.495 4.688 4.699 5.198 5.333 5.595 5.847 6.078 6.19 6.412 6.623 6.923 7.112 7.287 7.536 7.755 7.976 8.195 8.385 8.621 8.856 9.091 9.362 9.626 9.871 10.142 10.424 10.673 10.963 11.28 11.585 11.881 12.186 12.525 12.851 13.162 13.427 13.672 13.841 13.92 13.807 13.187 11.972 10.793 9.705 8.702 7.81 7.039 6.309 5.645 5.034 4.519 4.054 3.6 3.165 2.771 2.419 2.06 1.727 1.43 1.108 0.769 0.497 0.208 -0.116 -0.368 -0.611 -0.853 -1.122 -1.42 -1.617 -1.818 -2.145 -2.38 -2.624 -2.748 -3.0 -3.261 -3.521 -3.65 -4.142 -4.076 -4.235 -4.397 -4.737 -4.934 -5.141 -5.364 -5.627 -5.964 -6.448 -7.979 -6 ,4047 ,KEBNE ,16693068,Fri Nov 26 00:33:10 CET,Fri Nov 26 02:09:26 CET,0.0 1.97 2.572 2.986 3.303 3.584 3.826 4.046 4.454 4.638 4.811 4.779 5.266 5.412 5.688 5.93 6.17 6.293 6.516 6.72 7.012 7.196 7.377 7.643 7.895 8.112 8.307 8.502 8.756 9.0 9.224 9.49 9.759 10.014 10.3 10.597 10.859 11.129 11.414 11.707 12.026 12.41 12.783 13.068 13.344 13.598 13.847 14.014 13.974 13.704 13.022 11.869 10.757 9.691 8.712 7.839 7.057 6.337 5.724 5.114 4.606 4.123 3.629 3.195 2.794 2.406 1.998 1.628 1.301 0.955 0.579 0.284 -0.004 -0.317 -0.554 -0.789 -1.035 -1.287 -1.547 -1.726 -1.914 -2.212 -2.416 -2.628 -2.739 -2.97 -3.213 -3.475 -3.615 -4.111 -4.062 -4.23 -4.394 -4.736 -4.927 -5.147 -5.382 -5.656 -6.018 -6.511 -8.479 -7 ,5282 ,KEBNE ,16693069,Fri Nov 26 00:33:10 CET,Fri Nov 26 02:08:57 CET,0.0 1.933 2.537 2.944 3.264 3.549 3.816 4.063 4.497 4.692 4.867 4.837 5.318 5.458 5.75 6.016 6.265 6.384 6.611 6.823 7.126 7.305 7.48 7.745 7.993 8.229 8.436 8.622 8.873 9.126 9.357 9.623 9.883 10.146 10.439 10.731 11.008 11.292 11.567 11.845 12.121 12.433 12.747 12.994 13.251 13.505 13.752 13.956 14.052 13.933 13.236 11.994 10.848 9.764 8.793 7.938 7.151 6.429 5.801 5.148 4.591 4.11 3.667 3.239 2.842 2.468 2.075 1.74 1.443 1.146 0.839 0.59 0.343 0.069 -0.157 -0.383 -0.618 -0.875 -1.139 -1.319 -1.504 -1.812 -2.04 -2.262 -2.372 -2.62 -2.894 -3.164 -3.297 -3.784 -3.706 -3.864 -4.04 -4.432 -4.646 -4.893 -5.17 -5.467 -5.819 -6.289 -8.008 -8 ,13760 ,KEBNE ,16693070,Fri Nov 26 00:33:10 CET,Fri Nov 26 02:10:20 CET,0.0 1.468 1.937 2.295 2.607 2.897 3.168 3.404 3.802 3.98 4.156 4.14 4.635 4.779 5.04 5.277 5.502 5.607 5.817 6.031 6.331 6.518 6.69 6.917 7.149 7.378 7.619 7.846 8.103 8.354 8.587 8.858 9.108 9.359 9.661 9.966 10.24 10.554 10.873 11.179 11.468 11.758 12.111 12.433 12.741 13.061 13.305 13.442 13.464 13.241 12.535 11.364 10.257 9.211 8.213 7.334 6.611 5.915 5.288 4.666 4.122 3.625 3.159 2.721 2.322 1.949 1.551 1.21 0.892 0.552 0.202 -0.1 -0.402 -0.707 -0.941 -1.176 -1.421 -1.685 -1.967 -2.159 -2.352 -2.653 -2.864 -3.091 -3.213 -3.474 -3.751 -4.036 -4.188 -4.705 -4.658 -4.807 -4.966 -5.347 -5.556 -5.763 -6.0 -6.265 -6.593 -7.028 -8.424 -9 ,21184 ,KEBNE ,16693071,Fri Nov 26 00:34:12 CET,Fri Nov 26 02:10:09 CET,0.0 1.833 2.451 2.882 3.215 3.501 3.748 3.977 4.422 4.626 4.807 4.778 5.258 5.405 5.677 5.91 6.123 6.232 6.448 6.662 6.983 7.179 7.358 7.601 7.826 8.048 8.264 8.467 8.729 8.98 9.205 9.451 9.703 9.955 10.236 10.539 10.815 11.114 11.402 11.712 12.039 12.343 12.663 12.949 13.229 13.527 13.772 13.934 13.975 13.748 13.05 11.972 10.932 9.902 8.959 8.11 7.295 6.514 5.773 5.018 4.42 3.91 3.421 2.947 2.503 2.085 1.658 1.286 0.954 0.609 0.262 -0.015 -0.315 -0.639 -0.897 -1.164 -1.427 -1.699 -1.981 -2.159 -2.33 -2.608 -2.806 -3.013 -3.122 -3.339 -3.576 -3.832 -3.964 -4.465 -4.424 -4.584 -4.743 -5.108 -5.326 -5.555 -5.808 -6.126 -6.515 -7.051 -8.368 -10 ,22709 ,KEBNE ,16693072,Fri Nov 26 00:33:10 CET,Fri Nov 26 02:09:18 CET,0.0 1.602 2.194 2.644 3.035 3.35 3.615 3.85 4.28 4.483 4.668 4.678 5.187 5.34 5.623 5.869 6.093 6.208 6.426 6.624 6.905 7.082 7.255 7.504 7.754 7.987 8.193 8.405 8.673 8.922 9.157 9.41 9.63 9.848 10.095 10.365 10.633 10.914 11.186 11.431 11.715 12.043 12.353 12.644 12.954 13.236 13.557 13.911 14.071 13.909 13.289 12.113 10.918 9.843 8.8 7.835 7.021 6.262 5.633 5.004 4.437 3.902 3.356 2.855 2.39 1.986 1.6 1.256 0.968 0.67 0.341 0.053 -0.227 -0.516 -0.754 -1.001 -1.254 -1.509 -1.785 -1.985 -2.189 -2.5 -2.714 -2.929 -3.042 -3.287 -3.53 -3.78 -3.912 -4.404 -4.34 -4.497 -4.663 -5.011 -5.203 -5.428 -5.681 -5.967 -6.332 -6.828 -8.953 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt deleted file mode 100644 index fc484e7e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13891 ,KEBNE ,16693073,Fri Nov 26 00:33:10 CET,Fri Nov 26 02:10:16 CET,0.0 1.65 1.972 2.203 2.422 2.612 2.76 2.888 3.128 3.236 3.338 3.165 3.61 3.696 3.861 4.011 4.143 4.204 4.321 4.433 4.591 4.685 4.773 4.903 5.024 5.141 5.259 5.375 5.525 5.684 5.842 6.021 6.192 6.356 6.533 6.723 6.898 7.084 7.281 7.483 7.703 7.937 8.187 8.414 8.642 8.889 9.143 9.365 9.531 9.56 9.227 8.511 7.82 7.189 6.569 5.973 5.419 4.909 4.482 4.042 3.654 3.319 2.998 2.685 2.386 2.122 1.845 1.592 1.373 1.135 0.883 0.678 0.473 0.25 0.07 -0.112 -0.295 -0.485 -0.675 -0.805 -0.941 -1.146 -1.286 -1.431 -1.506 -1.667 -1.838 -2.009 -2.1 -2.562 -2.401 -2.514 -2.638 -2.91 -3.065 -3.229 -3.408 -3.621 -3.873 -4.204 -5.975 -2 ,29588 ,KEBNE ,16693074,Fri Nov 26 00:33:10 CET,Fri Nov 26 02:07:54 CET,0.0 1.086 1.406 1.635 1.81 1.956 2.104 2.241 2.453 2.553 2.65 2.489 2.95 3.044 3.216 3.37 3.524 3.603 3.751 3.885 4.074 4.198 4.321 4.491 4.652 4.802 4.936 5.065 5.249 5.421 5.563 5.736 5.915 6.083 6.259 6.453 6.639 6.84 7.047 7.26 7.488 7.724 7.959 8.186 8.444 8.696 8.949 9.166 9.316 9.344 9.091 8.436 7.728 7.076 6.442 5.848 5.314 4.818 4.401 3.974 3.593 3.257 2.936 2.624 2.335 2.076 1.802 1.558 1.343 1.121 0.907 0.726 0.527 0.326 0.17 0.006 -0.163 -0.336 -0.514 -0.639 -0.767 -0.966 -1.108 -1.263 -1.346 -1.514 -1.694 -1.881 -1.975 -2.441 -2.294 -2.412 -2.534 -2.821 -2.982 -3.144 -3.324 -3.54 -3.805 -4.163 -5.536 -3 ,453 ,KEBNE ,16693075,Fri Nov 26 00:34:13 CET,Fri Nov 26 02:10:31 CET,0.0 1.575 1.901 2.131 2.313 2.473 2.621 2.746 2.97 3.08 3.182 2.996 3.438 3.517 3.673 3.826 3.966 4.032 4.152 4.273 4.453 4.564 4.664 4.801 4.926 5.049 5.166 5.266 5.389 5.521 5.663 5.839 5.996 6.152 6.34 6.544 6.734 6.936 7.146 7.356 7.563 7.798 8.042 8.245 8.471 8.721 8.97 9.153 9.273 9.266 8.95 8.252 7.473 6.746 6.129 5.556 5.022 4.517 4.081 3.638 3.236 2.893 2.575 2.265 1.966 1.691 1.414 1.174 0.963 0.742 0.508 0.307 0.085 -0.16 -0.348 -0.54 -0.743 -0.95 -1.153 -1.299 -1.458 -1.703 -1.876 -2.052 -2.14 -2.323 -2.532 -2.749 -2.863 -3.352 -3.244 -3.387 -3.536 -3.845 -4.031 -4.241 -4.46 -4.715 -5.034 -5.465 -6.814 -4 ,19426 ,KEBNE ,16693076,Fri Nov 26 00:34:13 CET,Fri Nov 26 02:12:25 CET,0.0 1.47 1.803 2.032 2.226 2.392 2.533 2.657 2.867 2.97 3.073 2.901 3.345 3.433 3.605 3.777 3.941 4.014 4.161 4.297 4.48 4.599 4.716 4.883 5.041 5.192 5.338 5.477 5.653 5.816 5.968 6.15 6.332 6.51 6.697 6.907 7.107 7.305 7.504 7.691 7.895 8.145 8.418 8.652 8.89 9.129 9.352 9.536 9.68 9.691 9.372 8.64 7.881 7.196 6.538 5.916 5.381 4.876 4.445 4.001 3.592 3.245 2.921 2.603 2.293 2.014 1.727 1.464 1.232 0.994 0.747 0.532 0.307 0.08 -0.108 -0.306 -0.494 -0.69 -0.905 -1.051 -1.191 -1.407 -1.569 -1.741 -1.827 -2.003 -2.188 -2.375 -2.471 -2.94 -2.796 -2.916 -3.038 -3.303 -3.449 -3.616 -3.8 -4.005 -4.256 -4.605 -6.075 -5 ,25387 ,KEBNE ,16693077,Fri Nov 26 00:34:13 CET,Fri Nov 26 02:09:21 CET,0.0 1.54 1.891 2.134 2.318 2.483 2.639 2.78 3.017 3.124 3.226 3.045 3.487 3.57 3.731 3.876 4.005 4.067 4.192 4.312 4.478 4.583 4.681 4.821 4.961 5.097 5.243 5.383 5.549 5.704 5.86 6.039 6.199 6.35 6.53 6.73 6.91 7.101 7.305 7.516 7.725 7.949 8.202 8.432 8.673 8.935 9.219 9.432 9.532 9.511 9.176 8.444 7.69 6.987 6.313 5.709 5.196 4.714 4.281 3.829 3.444 3.114 2.779 2.443 2.131 1.852 1.572 1.321 1.095 0.86 0.62 0.415 0.202 -0.018 -0.197 -0.384 -0.571 -0.758 -0.947 -1.074 -1.212 -1.431 -1.579 -1.74 -1.823 -1.982 -2.151 -2.338 -2.441 -2.913 -2.755 -2.868 -2.985 -3.253 -3.404 -3.57 -3.759 -3.972 -4.219 -4.568 -5.949 -6 ,30942 ,KEBNE ,16693078,Fri Nov 26 00:34:13 CET,Fri Nov 26 02:11:27 CET,0.0 1.183 1.505 1.734 1.933 2.114 2.262 2.392 2.64 2.749 2.852 2.683 3.127 3.203 3.351 3.491 3.622 3.686 3.799 3.909 4.066 4.166 4.267 4.419 4.571 4.709 4.834 4.962 5.139 5.306 5.462 5.649 5.813 5.961 6.136 6.332 6.51 6.691 6.881 7.083 7.284 7.507 7.757 7.997 8.259 8.513 8.769 9.004 9.164 9.153 8.776 8.014 7.278 6.578 5.905 5.27 4.718 4.243 3.815 3.366 2.985 2.634 2.299 1.984 1.691 1.416 1.123 0.854 0.61 0.348 0.085 -0.126 -0.359 -0.6 -0.777 -0.966 -1.171 -1.383 -1.591 -1.729 -1.873 -2.098 -2.247 -2.397 -2.476 -2.643 -2.823 -3.01 -3.107 -3.584 -3.477 -3.616 -3.749 -4.034 -4.2 -4.385 -4.585 -4.822 -5.119 -5.532 -7.024 -7 ,29173 ,KEBNE ,16693079,Fri Nov 26 00:34:13 CET,Fri Nov 26 02:10:52 CET,0.0 1.234 1.564 1.798 1.986 2.148 2.289 2.411 2.632 2.736 2.837 2.659 3.103 3.178 3.329 3.472 3.605 3.668 3.796 3.925 4.108 4.229 4.343 4.506 4.666 4.82 4.958 5.086 5.257 5.415 5.556 5.725 5.887 6.035 6.202 6.383 6.552 6.744 6.946 7.144 7.348 7.579 7.838 8.074 8.328 8.571 8.793 9.0 9.164 9.155 8.748 8.029 7.322 6.613 5.942 5.339 4.824 4.346 3.912 3.465 3.067 2.703 2.358 2.027 1.704 1.42 1.125 0.86 0.632 0.393 0.15 -0.057 -0.283 -0.515 -0.691 -0.877 -1.071 -1.274 -1.483 -1.625 -1.771 -2.001 -2.153 -2.312 -2.402 -2.598 -2.807 -3.038 -3.165 -3.659 -3.565 -3.7 -3.839 -4.141 -4.298 -4.476 -4.681 -4.905 -5.161 -5.508 -7.824 -8 ,32236 ,KEBNE ,16693080,Fri Nov 26 00:34:13 CET,Fri Nov 26 02:11:31 CET,0.0 1.541 1.859 2.095 2.29 2.464 2.615 2.749 2.979 3.08 3.187 3.03 3.478 3.567 3.733 3.873 4.007 4.07 4.187 4.298 4.452 4.55 4.649 4.789 4.924 5.057 5.18 5.307 5.479 5.64 5.792 5.971 6.143 6.305 6.483 6.676 6.859 7.06 7.27 7.48 7.679 7.917 8.187 8.406 8.643 8.878 9.099 9.288 9.401 9.371 9.043 8.351 7.601 6.893 6.241 5.655 5.12 4.603 4.156 3.717 3.335 2.974 2.625 2.301 1.998 1.73 1.45 1.195 0.98 0.739 0.479 0.264 0.044 -0.185 -0.364 -0.55 -0.742 -0.923 -1.1 -1.226 -1.361 -1.574 -1.723 -1.883 -1.964 -2.119 -2.289 -2.484 -2.59 -3.063 -2.904 -3.018 -3.133 -3.385 -3.528 -3.685 -3.855 -4.054 -4.313 -4.66 -5.802 -9 ,20365 ,KEBNE ,16693081,Fri Nov 26 00:34:21 CET,Fri Nov 26 02:06:52 CET,0.0 1.285 1.596 1.83 2.012 2.159 2.296 2.427 2.648 2.745 2.835 2.648 3.094 3.18 3.344 3.505 3.669 3.749 3.899 4.043 4.241 4.366 4.486 4.646 4.797 4.95 5.09 5.215 5.386 5.56 5.721 5.909 6.083 6.247 6.427 6.618 6.8 7.009 7.228 7.446 7.649 7.862 8.114 8.345 8.593 8.825 9.055 9.264 9.39 9.398 9.079 8.349 7.629 6.955 6.296 5.669 5.119 4.62 4.191 3.732 3.334 3.007 2.692 2.386 2.094 1.814 1.523 1.268 1.034 0.789 0.551 0.354 0.146 -0.065 -0.234 -0.423 -0.617 -0.807 -1.003 -1.142 -1.288 -1.501 -1.646 -1.803 -1.88 -2.04 -2.214 -2.414 -2.52 -2.993 -2.864 -2.988 -3.115 -3.381 -3.524 -3.69 -3.894 -4.144 -4.432 -4.825 -5.805 -10 ,25603 ,KEBNE ,16693082,Fri Nov 26 00:34:21 CET,Fri Nov 26 02:08:01 CET,0.0 1.468 1.782 2.015 2.19 2.341 2.486 2.624 2.867 2.979 3.084 2.923 3.381 3.48 3.667 3.843 4.017 4.094 4.234 4.363 4.531 4.642 4.755 4.914 5.067 5.219 5.371 5.508 5.666 5.813 5.959 6.135 6.306 6.467 6.644 6.847 7.034 7.214 7.395 7.597 7.806 8.023 8.257 8.485 8.747 8.991 9.257 9.508 9.663 9.67 9.341 8.624 7.886 7.171 6.523 5.911 5.336 4.827 4.396 3.936 3.53 3.172 2.826 2.512 2.212 1.941 1.66 1.406 1.186 0.949 0.689 0.463 0.241 0.018 -0.158 -0.342 -0.528 -0.708 -0.892 -1.029 -1.19 -1.451 -1.637 -1.826 -1.919 -2.111 -2.309 -2.511 -2.619 -3.097 -2.987 -3.134 -3.3 -3.667 -3.858 -4.055 -4.26 -4.506 -4.812 -5.201 -8.923 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt deleted file mode 100644 index 19fc36a8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20710 ,KEBNE ,16693083,Fri Nov 26 00:34:12 CET,Fri Nov 26 02:11:11 CET,0.0 1.278 1.624 1.872 2.059 2.219 2.371 2.511 2.765 2.885 3.0 2.863 3.339 3.45 3.643 3.837 4.035 4.126 4.305 4.483 4.739 4.896 5.048 5.269 5.477 5.68 5.862 6.034 6.264 6.481 6.693 6.95 7.179 7.408 7.696 8.002 8.292 8.631 8.985 9.335 9.707 10.148 10.648 11.134 11.7 12.352 13.14 13.977 14.903 15.963 17.072 17.774 18.044 18.109 18.051 17.935 17.789 17.615 17.443 17.226 17.025 16.849 16.674 16.502 16.324 16.157 15.979 15.815 15.67 15.522 15.366 15.229 15.089 14.94 14.821 14.696 14.557 14.406 14.249 14.135 14.017 13.828 13.699 13.586 13.529 13.4 13.26 13.116 13.042 12.605 12.751 12.649 12.546 12.324 12.189 12.027 11.852 11.658 11.411 11.082 9.754 -2 ,20329 ,KEBNE ,16693084,Fri Nov 26 00:34:13 CET,Fri Nov 26 02:11:37 CET,0.0 1.222 1.537 1.775 1.964 2.129 2.278 2.418 2.688 2.809 2.918 2.764 3.226 3.321 3.495 3.667 3.834 3.915 4.077 4.241 4.478 4.623 4.764 4.974 5.175 5.369 5.561 5.749 5.982 6.204 6.418 6.667 6.895 7.12 7.389 7.695 7.986 8.306 8.657 9.038 9.453 9.901 10.399 10.915 11.521 12.189 12.941 13.732 14.616 15.628 16.706 17.405 17.69 17.75 17.709 17.623 17.479 17.313 17.166 16.979 16.789 16.627 16.476 16.294 16.107 15.947 15.762 15.587 15.441 15.287 15.128 14.988 14.832 14.673 14.556 14.439 14.303 14.141 13.968 13.847 13.723 13.535 13.405 13.256 13.177 13.025 12.856 12.667 12.566 12.115 12.272 12.177 12.083 11.843 11.696 11.549 11.4 11.226 11.012 10.722 9.703 -3 ,6783 ,KEBNE ,16693085,Fri Nov 26 00:35:15 CET,Fri Nov 26 02:11:54 CET,0.0 1.104 1.396 1.634 1.839 2.012 2.168 2.316 2.587 2.707 2.822 2.683 3.147 3.239 3.422 3.606 3.783 3.868 4.042 4.208 4.451 4.608 4.753 4.956 5.152 5.345 5.532 5.711 5.941 6.166 6.374 6.627 6.873 7.112 7.381 7.686 7.987 8.308 8.654 9.016 9.397 9.818 10.318 10.838 11.428 12.085 12.825 13.632 14.587 15.688 16.884 17.691 18.014 18.082 18.036 17.922 17.771 17.595 17.418 17.222 17.042 16.866 16.693 16.528 16.344 16.165 15.985 15.824 15.685 15.537 15.369 15.231 15.093 14.946 14.828 14.7 14.571 14.431 14.271 14.168 14.068 13.906 13.793 13.671 13.607 13.478 13.334 13.182 13.107 12.676 12.857 12.762 12.655 12.407 12.266 12.115 11.963 11.798 11.587 11.291 9.743 -4 ,23372 ,KEBNE ,16693086,Fri Nov 26 00:35:19 CET,Fri Nov 26 02:11:51 CET,0.0 1.519 1.945 2.254 2.482 2.704 2.899 3.051 3.355 3.509 3.646 3.54 4.012 4.125 4.355 4.579 4.786 4.882 5.06 5.221 5.443 5.591 5.738 5.951 6.147 6.345 6.54 6.715 6.939 7.165 7.383 7.636 7.886 8.122 8.392 8.703 8.99 9.296 9.63 9.987 10.367 10.815 11.337 11.846 12.436 13.071 13.799 14.597 15.496 16.566 17.758 18.561 18.867 18.959 18.942 18.852 18.723 18.578 18.419 18.226 18.046 17.879 17.705 17.525 17.34 17.169 16.999 16.83 16.684 16.535 16.385 16.258 16.115 15.957 15.838 15.716 15.576 15.427 15.264 15.144 15.023 14.847 14.71 14.563 14.486 14.326 14.154 13.966 13.874 13.436 13.612 13.509 13.399 13.173 13.044 12.898 12.727 12.538 12.322 11.996 10.646 -5 ,24326 ,KEBNE ,16693087,Fri Nov 26 00:35:15 CET,Fri Nov 26 02:12:20 CET,0.0 1.25 1.542 1.776 1.97 2.144 2.307 2.455 2.715 2.846 2.977 2.858 3.34 3.455 3.667 3.871 4.06 4.15 4.31 4.467 4.703 4.853 5.0 5.209 5.411 5.613 5.811 5.997 6.227 6.453 6.676 6.947 7.205 7.444 7.714 8.024 8.312 8.62 8.965 9.34 9.732 10.17 10.688 11.199 11.781 12.419 13.122 13.91 14.822 15.829 16.962 17.755 18.047 18.127 18.133 18.053 17.888 17.707 17.545 17.337 17.15 16.989 16.83 16.661 16.5 16.346 16.166 16.003 15.859 15.7 15.533 15.402 15.269 15.131 15.018 14.9 14.783 14.66 14.528 14.429 14.326 14.17 14.065 13.94 13.873 13.744 13.605 13.454 13.372 12.938 13.121 13.034 12.94 12.722 12.596 12.455 12.301 12.116 11.889 11.556 10.041 -6 ,5023 ,KEBNE ,16693088,Fri Nov 26 00:35:19 CET,Fri Nov 26 02:06:16 CET,0.0 1.457 1.778 2.023 2.235 2.414 2.559 2.693 2.953 3.075 3.19 3.04 3.501 3.599 3.784 3.959 4.128 4.21 4.364 4.511 4.742 4.898 5.05 5.262 5.456 5.647 5.836 6.017 6.247 6.467 6.682 6.943 7.181 7.414 7.692 7.998 8.296 8.618 8.956 9.314 9.685 10.104 10.611 11.116 11.707 12.362 13.097 13.924 14.856 15.865 16.969 17.708 18.011 18.078 18.044 17.964 17.83 17.662 17.474 17.264 17.078 16.912 16.748 16.581 16.408 16.239 16.066 15.908 15.761 15.596 15.423 15.292 15.159 15.006 14.886 14.767 14.628 14.481 14.336 14.231 14.118 13.926 13.79 13.653 13.583 13.425 13.253 13.075 12.979 12.532 12.701 12.611 12.51 12.268 12.137 12.0 11.834 11.647 11.429 11.11 9.749 -7 ,29293 ,KEBNE ,16693089,Fri Nov 26 00:36:18 CET,Fri Nov 26 02:14:38 CET,0.0 0.959 1.272 1.511 1.701 1.873 2.032 2.178 2.439 2.556 2.665 2.513 2.976 3.075 3.27 3.464 3.658 3.754 3.933 4.108 4.353 4.498 4.644 4.859 5.054 5.245 5.433 5.611 5.832 6.041 6.258 6.525 6.769 7.0 7.252 7.534 7.823 8.153 8.507 8.877 9.264 9.687 10.172 10.682 11.286 11.94 12.694 13.5 14.384 15.407 16.576 17.333 17.605 17.667 17.609 17.505 17.385 17.226 17.066 16.888 16.714 16.551 16.386 16.21 16.037 15.88 15.707 15.536 15.388 15.246 15.088 14.946 14.792 14.636 14.517 14.39 14.268 14.147 14.014 13.918 13.816 13.653 13.541 13.426 13.365 13.236 13.103 12.953 12.874 12.442 12.619 12.522 12.414 12.181 12.056 11.913 11.754 11.577 11.361 11.046 9.723 -8 ,22033 ,KEBNE ,16693090,Fri Nov 26 00:36:18 CET,Fri Nov 26 02:13:34 CET,0.0 1.163 1.457 1.677 1.863 2.025 2.182 2.334 2.611 2.737 2.849 2.692 3.147 3.24 3.412 3.572 3.731 3.807 3.953 4.099 4.334 4.493 4.641 4.851 5.051 5.241 5.421 5.609 5.861 6.1 6.326 6.588 6.833 7.065 7.323 7.608 7.889 8.211 8.569 8.94 9.319 9.745 10.238 10.735 11.322 11.956 12.671 13.474 14.386 15.429 16.572 17.304 17.567 17.623 17.56 17.438 17.28 17.096 16.916 16.724 16.547 16.372 16.2 16.034 15.868 15.717 15.553 15.391 15.244 15.088 14.918 14.779 14.643 14.493 14.365 14.232 14.098 13.945 13.777 13.659 13.53 13.337 13.212 13.076 13.003 12.854 12.693 12.528 12.44 11.991 12.122 12.002 11.886 11.653 11.519 11.373 11.206 11.001 10.754 10.431 9.349 -9 ,23115 ,KEBNE ,16693091,Fri Nov 26 00:37:21 CET,Fri Nov 26 02:15:53 CET,0.0 1.226 1.56 1.827 2.047 2.27 2.47 2.635 2.923 3.054 3.18 3.044 3.512 3.623 3.843 4.044 4.221 4.308 4.482 4.649 4.894 5.052 5.199 5.416 5.626 5.814 5.995 6.186 6.425 6.643 6.856 7.107 7.351 7.589 7.862 8.164 8.447 8.772 9.123 9.493 9.889 10.331 10.845 11.351 11.929 12.56 13.294 14.122 15.071 16.138 17.279 18.028 18.305 18.364 18.309 18.172 18.01 17.848 17.693 17.514 17.343 17.183 17.011 16.832 16.657 16.498 16.327 16.16 16.012 15.859 15.695 15.555 15.404 15.246 15.125 14.986 14.832 14.673 14.513 14.403 14.29 14.1 13.964 13.83 13.758 13.597 13.43 13.249 13.149 12.701 12.832 12.707 12.584 12.329 12.191 12.054 11.902 11.72 11.504 11.186 9.784 -10 ,14503 ,KEBNE ,16693092,Fri Nov 26 00:39:26 CET,Fri Nov 26 02:19:36 CET,0.0 1.213 1.51 1.743 1.934 2.093 2.235 2.368 2.62 2.74 2.852 2.693 3.148 3.242 3.433 3.61 3.779 3.86 4.008 4.158 4.383 4.529 4.673 4.882 5.093 5.305 5.508 5.709 5.958 6.191 6.425 6.701 6.961 7.215 7.524 7.872 8.181 8.525 8.891 9.256 9.64 10.069 10.575 11.097 11.685 12.343 13.084 13.894 14.838 15.854 16.995 17.755 18.01 18.045 17.961 17.838 17.688 17.54 17.392 17.205 17.023 16.839 16.642 16.453 16.288 16.13 15.949 15.778 15.622 15.461 15.299 15.159 15.011 14.858 14.737 14.625 14.513 14.389 14.258 14.168 14.07 13.919 13.81 13.688 13.621 13.484 13.343 13.198 13.119 12.674 12.832 12.736 12.635 12.4 12.264 12.112 11.948 11.772 11.55 11.228 10.035 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt deleted file mode 100644 index a056d1a0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6595 ,KEBNE ,16693093,Fri Nov 26 00:42:33 CET,Fri Nov 26 02:24:29 CET,0.0 0.586 0.825 1.022 1.186 1.288 1.387 1.479 1.625 1.695 1.771 1.548 1.969 2.03 2.128 2.205 2.275 2.313 2.403 2.482 2.581 2.637 2.683 2.741 2.797 2.848 2.896 2.947 3.0 3.041 3.086 3.139 3.179 3.209 3.23 3.238 3.241 3.239 3.229 3.196 3.139 3.049 2.911 2.75 2.519 2.205 1.737 1.058 0.108 -1.285 -3.602 -6.286 -8.388 -10.114 -11.551 -12.791 -13.839 -14.784 -15.586 -16.363 -17.025 -17.601 -18.13 -18.616 -19.069 -19.49 -19.927 -20.303 -20.62 -20.954 -21.285 -21.549 -21.829 -22.129 -22.368 -22.621 -22.882 -23.143 -23.391 -23.557 -23.726 -23.991 -24.173 -24.354 -24.449 -24.639 -24.837 -25.047 -25.155 -25.65 -25.477 -25.601 -25.737 -26.032 -26.194 -26.367 -26.549 -26.757 -27.024 -27.378 -28.301 -2 ,7592 ,KEBNE ,16693094,Fri Nov 26 00:44:43 CET,Fri Nov 26 02:16:03 CET,0.0 0.396 0.542 0.634 0.734 0.833 0.911 0.972 1.089 1.143 1.189 0.917 1.325 1.365 1.431 1.512 1.605 1.648 1.736 1.816 1.911 1.97 2.026 2.083 2.141 2.206 2.266 2.316 2.377 2.435 2.487 2.547 2.593 2.631 2.663 2.691 2.71 2.715 2.698 2.659 2.614 2.567 2.465 2.293 2.04 1.708 1.283 0.659 -0.259 -1.655 -4.026 -6.712 -8.855 -10.611 -12.063 -13.347 -14.427 -15.372 -16.169 -16.934 -17.579 -18.149 -18.686 -19.2 -19.667 -20.071 -20.494 -20.881 -21.2 -21.515 -21.845 -22.122 -22.41 -22.718 -22.958 -23.199 -23.447 -23.701 -23.968 -24.156 -24.349 -24.65 -24.856 -25.065 -25.168 -25.374 -25.598 -25.843 -25.968 -26.477 -26.347 -26.49 -26.637 -26.941 -27.099 -27.269 -27.46 -27.674 -27.926 -28.258 -29.378 -3 ,27411 ,KEBNE ,16693095,Fri Nov 26 00:48:53 CET,Fri Nov 26 02:22:43 CET,0.0 0.198 0.336 0.444 0.537 0.612 0.684 0.763 0.917 0.987 1.051 0.815 1.23 1.289 1.402 1.483 1.561 1.605 1.674 1.728 1.81 1.865 1.921 2.003 2.08 2.142 2.194 2.254 2.323 2.376 2.427 2.486 2.531 2.558 2.584 2.601 2.597 2.602 2.601 2.562 2.496 2.403 2.267 2.095 1.869 1.546 1.058 0.403 -0.512 -1.923 -4.288 -7.039 -9.221 -11.004 -12.443 -13.685 -14.755 -15.684 -16.466 -17.229 -17.878 -18.45 -18.973 -19.447 -19.877 -20.265 -20.669 -21.026 -21.334 -21.648 -21.97 -22.243 -22.52 -22.807 -23.029 -23.25 -23.476 -23.706 -23.95 -24.121 -24.296 -24.572 -24.76 -24.954 -25.054 -25.255 -25.461 -25.674 -25.783 -26.286 -26.153 -26.276 -26.409 -26.717 -26.88 -27.059 -27.256 -27.469 -27.726 -28.081 -28.885 -4 ,13690 ,KEBNE ,16693096,Fri Nov 26 00:52:59 CET,Fri Nov 26 02:27:56 CET,0.0 0.437 0.602 0.721 0.824 0.912 0.99 1.056 1.158 1.209 1.267 1.012 1.417 1.463 1.564 1.656 1.729 1.769 1.848 1.909 2.0 2.061 2.12 2.189 2.243 2.304 2.354 2.397 2.458 2.511 2.557 2.607 2.653 2.699 2.738 2.749 2.745 2.735 2.71 2.673 2.621 2.534 2.392 2.218 1.982 1.64 1.156 0.503 -0.45 -1.884 -4.241 -6.944 -9.097 -10.868 -12.325 -13.59 -14.65 -15.572 -16.35 -17.118 -17.774 -18.336 -18.857 -19.341 -19.79 -20.194 -20.604 -20.962 -21.277 -21.6 -21.917 -22.188 -22.464 -22.743 -22.956 -23.159 -23.366 -23.592 -23.827 -23.989 -24.161 -24.428 -24.609 -24.798 -24.894 -25.088 -25.288 -25.507 -25.626 -26.13 -25.993 -26.134 -26.274 -26.572 -26.744 -26.935 -27.13 -27.351 -27.632 -27.991 -29.314 -5 ,9414 ,KEBNE ,16693097,Fri Nov 26 00:52:59 CET,Fri Nov 26 02:28:30 CET,0.0 0.164 0.293 0.399 0.487 0.582 0.67 0.736 0.848 0.895 0.95 0.693 1.096 1.129 1.192 1.268 1.346 1.375 1.414 1.455 1.52 1.554 1.591 1.654 1.699 1.733 1.775 1.815 1.863 1.898 1.933 1.967 1.979 1.992 2.008 2.016 2.02 2.025 2.01 1.958 1.888 1.794 1.659 1.5 1.278 0.955 0.48 -0.179 -1.118 -2.514 -4.837 -7.54 -9.679 -11.432 -12.884 -14.15 -15.227 -16.169 -16.947 -17.704 -18.354 -18.922 -19.456 -19.956 -20.405 -20.803 -21.226 -21.602 -21.932 -22.269 -22.607 -22.896 -23.178 -23.455 -23.672 -23.895 -24.135 -24.378 -24.623 -24.796 -24.975 -25.247 -25.436 -25.639 -25.746 -25.975 -26.208 -26.452 -26.58 -27.095 -26.964 -27.092 -27.235 -27.542 -27.701 -27.872 -28.06 -28.275 -28.54 -28.889 -30.149 -6 ,31268 ,KEBNE ,16693098,Fri Nov 26 00:54:03 CET,Fri Nov 26 02:30:35 CET,0.0 0.221 0.311 0.422 0.551 0.653 0.722 0.778 0.876 0.925 0.971 0.682 1.079 1.125 1.203 1.266 1.326 1.351 1.405 1.46 1.526 1.574 1.63 1.713 1.784 1.846 1.902 1.949 2.004 2.048 2.097 2.155 2.2 2.234 2.268 2.308 2.326 2.317 2.291 2.252 2.203 2.113 1.967 1.784 1.532 1.224 0.762 0.081 -0.922 -2.467 -4.924 -7.676 -9.882 -11.686 -13.174 -14.453 -15.508 -16.436 -17.232 -18.006 -18.659 -19.231 -19.765 -20.263 -20.724 -21.137 -21.569 -21.952 -22.277 -22.612 -22.955 -23.236 -23.52 -23.81 -24.029 -24.252 -24.492 -24.74 -24.984 -25.154 -25.336 -25.616 -25.807 -26.019 -26.132 -26.353 -26.571 -26.807 -26.936 -27.454 -27.333 -27.481 -27.635 -27.946 -28.113 -28.3 -28.528 -28.761 -29.014 -29.358 -30.342 -7 ,26666 ,KEBNE ,16693099,Fri Nov 26 00:55:05 CET,Fri Nov 26 02:30:26 CET,0.0 0.328 0.502 0.657 0.777 0.887 0.984 1.058 1.192 1.26 1.329 1.094 1.505 1.555 1.665 1.769 1.862 1.906 1.973 2.033 2.118 2.172 2.232 2.311 2.368 2.418 2.466 2.509 2.556 2.602 2.656 2.722 2.769 2.804 2.831 2.857 2.87 2.87 2.863 2.838 2.785 2.698 2.571 2.404 2.181 1.867 1.406 0.771 -0.199 -1.617 -3.921 -6.657 -8.857 -10.644 -12.116 -13.39 -14.481 -15.444 -16.242 -17.022 -17.681 -18.248 -18.773 -19.262 -19.709 -20.113 -20.538 -20.915 -21.238 -21.569 -21.903 -22.172 -22.46 -22.759 -22.994 -23.232 -23.468 -23.721 -23.976 -24.148 -24.328 -24.598 -24.79 -24.995 -25.098 -25.309 -25.535 -25.789 -25.918 -26.428 -26.308 -26.45 -26.608 -26.963 -27.141 -27.322 -27.531 -27.758 -28.021 -28.377 -29.885 -8 ,15775 ,KEBNE ,16693100,Fri Nov 26 00:55:05 CET,Fri Nov 26 02:30:27 CET,0.0 0.201 0.308 0.401 0.489 0.576 0.649 0.713 0.831 0.884 0.942 0.712 1.131 1.179 1.257 1.334 1.409 1.447 1.518 1.588 1.688 1.745 1.803 1.883 1.955 2.014 2.061 2.109 2.171 2.22 2.264 2.3 2.318 2.335 2.35 2.363 2.383 2.387 2.36 2.334 2.289 2.193 2.065 1.934 1.696 1.337 0.846 0.163 -0.829 -2.284 -4.659 -7.428 -9.6 -11.375 -12.87 -14.144 -15.213 -16.182 -16.998 -17.784 -18.439 -19.011 -19.546 -20.048 -20.511 -20.924 -21.354 -21.73 -22.044 -22.373 -22.704 -22.972 -23.264 -23.568 -23.792 -24.02 -24.262 -24.518 -24.787 -24.967 -25.154 -25.451 -25.65 -25.857 -25.964 -26.182 -26.416 -26.657 -26.779 -27.3 -27.218 -27.378 -27.536 -27.847 -28.026 -28.217 -28.408 -28.621 -28.872 -29.2 -29.985 -9 ,3303 ,KEBNE ,16693101,Fri Nov 26 00:56:08 CET,Fri Nov 26 02:31:50 CET,0.0 0.208 0.363 0.492 0.644 0.8 0.925 1.037 1.22 1.301 1.38 1.157 1.578 1.635 1.748 1.853 1.934 1.976 2.053 2.112 2.195 2.253 2.312 2.383 2.438 2.485 2.531 2.578 2.635 2.683 2.734 2.786 2.82 2.849 2.871 2.896 2.921 2.918 2.888 2.869 2.836 2.772 2.657 2.501 2.272 1.948 1.483 0.824 -0.159 -1.7 -4.108 -6.863 -9.102 -10.904 -12.39 -13.645 -14.683 -15.616 -16.413 -17.19 -17.866 -18.449 -18.967 -19.46 -19.908 -20.309 -20.726 -21.097 -21.422 -21.752 -22.093 -22.378 -22.672 -22.965 -23.186 -23.421 -23.667 -23.917 -24.178 -24.354 -24.524 -24.794 -24.99 -25.192 -25.3 -25.517 -25.735 -25.971 -26.093 -26.593 -26.453 -26.59 -26.738 -27.051 -27.219 -27.391 -27.576 -27.793 -28.041 -28.384 -29.493 -10 ,30907 ,KEBNE ,16693102,Fri Nov 26 00:56:08 CET,Fri Nov 26 02:31:11 CET,0.0 0.661 0.892 1.036 1.186 1.336 1.462 1.544 1.668 1.739 1.819 1.596 2.01 2.066 2.171 2.266 2.356 2.397 2.477 2.556 2.664 2.724 2.772 2.841 2.914 2.98 3.036 3.083 3.136 3.188 3.234 3.279 3.319 3.348 3.371 3.383 3.388 3.381 3.344 3.286 3.211 3.117 2.981 2.807 2.563 2.227 1.757 1.097 0.096 -1.433 -3.881 -6.657 -8.815 -10.593 -12.066 -13.335 -14.409 -15.344 -16.138 -16.933 -17.596 -18.155 -18.68 -19.176 -19.629 -20.037 -20.457 -20.828 -21.145 -21.477 -21.831 -22.116 -22.404 -22.7 -22.923 -23.151 -23.389 -23.634 -23.897 -24.081 -24.262 -24.545 -24.741 -24.943 -25.045 -25.264 -25.505 -25.756 -25.885 -26.404 -26.295 -26.442 -26.606 -26.954 -27.144 -27.347 -27.573 -27.848 -28.164 -28.561 -29.706 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt deleted file mode 100644 index 0945764e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24890 ,KEBNE ,16693103,Fri Nov 26 00:56:12 CET,Fri Nov 26 02:28:57 CET,0.0 1.661 2.116 2.408 2.668 2.892 3.074 3.236 3.502 3.62 3.736 3.568 4.007 4.072 4.197 4.316 4.419 4.471 4.567 4.644 4.748 4.807 4.855 4.914 4.975 5.031 5.07 5.102 5.138 5.164 5.176 5.186 5.187 5.174 5.139 5.085 5.018 4.912 4.765 4.601 4.419 4.176 3.83 3.406 2.834 2.112 1.154 -0.085 -1.804 -4.286 -8.126 -12.382 -15.64 -18.267 -20.391 -22.198 -23.723 -25.037 -26.148 -27.235 -28.148 -28.944 -29.693 -30.391 -31.034 -31.621 -32.228 -32.759 -33.204 -33.653 -34.115 -34.498 -34.911 -35.343 -35.666 -36.015 -36.379 -36.743 -37.119 -37.39 -37.68 -38.112 -38.406 -38.726 -38.895 -39.243 -39.61 -40.007 -40.208 -40.809 -40.828 -41.047 -41.295 -41.828 -42.089 -42.404 -42.795 -43.258 -43.873 -44.674 -47.452 -2 ,6506 ,KEBNE ,16693104,Fri Nov 26 00:56:08 CET,Fri Nov 26 02:30:10 CET,0.0 1.634 2.112 2.467 2.709 2.898 3.067 3.204 3.452 3.567 3.674 3.535 3.984 4.047 4.164 4.294 4.415 4.471 4.592 4.69 4.8 4.867 4.928 5.002 5.054 5.091 5.112 5.124 5.142 5.155 5.156 5.152 5.134 5.106 5.071 5.013 4.935 4.83 4.696 4.538 4.347 4.088 3.729 3.329 2.799 2.103 1.192 -0.023 -1.774 -4.284 -8.124 -12.362 -15.554 -18.098 -20.2 -21.989 -23.495 -24.829 -25.98 -27.108 -28.042 -28.891 -29.683 -30.41 -31.074 -31.644 -32.246 -32.794 -33.244 -33.708 -34.199 -34.603 -35.022 -35.427 -35.746 -36.109 -36.48 -36.853 -37.239 -37.51 -37.786 -38.232 -38.547 -38.864 -39.034 -39.394 -39.746 -40.106 -40.312 -40.923 -40.946 -41.196 -41.44 -41.96 -42.285 -42.657 -43.039 -43.482 -44.094 -44.973 -47.998 -3 ,17368 ,KEBNE ,16693105,Fri Nov 26 00:56:08 CET,Fri Nov 26 02:30:19 CET,0.0 1.552 2.01 2.347 2.62 2.859 3.053 3.225 3.509 3.625 3.725 3.549 3.992 4.075 4.224 4.339 4.433 4.475 4.567 4.651 4.751 4.804 4.861 4.933 4.976 5.024 5.058 5.085 5.118 5.139 5.144 5.133 5.114 5.1 5.064 5.008 4.954 4.866 4.73 4.55 4.343 4.085 3.737 3.322 2.78 2.127 1.233 -0.017 -1.738 -4.207 -8.044 -12.284 -15.554 -18.157 -20.29 -22.114 -23.643 -24.957 -26.064 -27.191 -28.134 -28.948 -29.696 -30.398 -31.041 -31.6 -32.205 -32.763 -33.237 -33.704 -34.177 -34.574 -34.985 -35.402 -35.725 -36.062 -36.42 -36.782 -37.152 -37.413 -37.679 -38.113 -38.411 -38.701 -38.856 -39.195 -39.553 -39.916 -40.098 -40.696 -40.733 -40.979 -41.233 -41.785 -42.104 -42.464 -42.889 -43.394 -44.078 -44.987 -48.486 -4 ,20725 ,KEBNE ,16693106,Fri Nov 26 00:57:10 CET,Fri Nov 26 02:31:27 CET,0.0 1.866 2.332 2.582 2.81 3.012 3.17 3.318 3.599 3.719 3.834 3.661 4.093 4.18 4.338 4.452 4.553 4.599 4.686 4.771 4.877 4.939 5.0 5.065 5.112 5.156 5.198 5.227 5.249 5.288 5.326 5.339 5.331 5.311 5.276 5.233 5.187 5.112 4.993 4.83 4.622 4.357 4.012 3.619 3.091 2.429 1.534 0.286 -1.433 -3.893 -7.742 -12.01 -15.282 -17.893 -20.044 -21.898 -23.436 -24.782 -25.902 -26.977 -27.885 -28.672 -29.41 -30.107 -30.762 -31.345 -31.938 -32.47 -32.939 -33.419 -33.904 -34.308 -34.724 -35.148 -35.479 -35.841 -36.213 -36.575 -36.949 -37.204 -37.483 -37.91 -38.193 -38.503 -38.662 -38.993 -39.337 -39.708 -39.906 -40.515 -40.545 -40.765 -41.0 -41.552 -41.877 -42.245 -42.644 -43.132 -43.767 -44.595 -48.111 -5 ,18204 ,KEBNE ,16693107,Fri Nov 26 00:57:11 CET,Fri Nov 26 02:31:54 CET,0.0 1.581 2.09 2.403 2.634 2.832 3.021 3.186 3.466 3.588 3.683 3.488 3.93 4.009 4.13 4.224 4.319 4.364 4.454 4.544 4.647 4.702 4.749 4.808 4.865 4.917 4.958 4.989 5.021 5.05 5.058 5.049 5.038 5.021 4.982 4.907 4.829 4.74 4.611 4.427 4.212 3.968 3.636 3.229 2.685 1.983 1.048 -0.189 -1.919 -4.4 -8.258 -12.503 -15.812 -18.487 -20.649 -22.484 -24.012 -25.338 -26.486 -27.6 -28.517 -29.334 -30.113 -30.822 -31.459 -32.035 -32.617 -33.142 -33.598 -34.065 -34.548 -34.957 -35.373 -35.791 -36.127 -36.488 -36.864 -37.22 -37.582 -37.844 -38.114 -38.571 -38.891 -39.2 -39.359 -39.705 -40.068 -40.441 -40.642 -41.244 -41.245 -41.478 -41.741 -42.31 -42.615 -42.981 -43.406 -43.857 -44.421 -45.228 -48.368 -6 ,18876 ,KEBNE ,16693108,Fri Nov 26 00:58:13 CET,Fri Nov 26 02:32:59 CET,0.0 1.782 2.237 2.562 2.809 3.0 3.167 3.294 3.512 3.625 3.735 3.556 3.991 4.057 4.164 4.269 4.352 4.397 4.505 4.579 4.667 4.725 4.765 4.837 4.91 4.958 5.003 5.035 5.051 5.059 5.067 5.07 5.063 5.042 5.0 4.932 4.84 4.726 4.591 4.427 4.228 3.961 3.603 3.202 2.656 1.926 0.969 -0.263 -1.943 -4.385 -8.278 -12.534 -15.798 -18.411 -20.57 -22.433 -23.954 -25.282 -26.415 -27.496 -28.401 -29.227 -30.025 -30.769 -31.417 -31.987 -32.589 -33.119 -33.572 -34.048 -34.525 -34.91 -35.327 -35.767 -36.113 -36.454 -36.785 -37.129 -37.505 -37.779 -38.055 -38.499 -38.806 -39.105 -39.26 -39.591 -39.954 -40.323 -40.497 -41.087 -41.1 -41.328 -41.582 -42.172 -42.502 -42.87 -43.296 -43.76 -44.296 -45.086 -48.695 -7 ,17976 ,KEBNE ,16693109,Fri Nov 26 00:58:14 CET,Fri Nov 26 02:32:10 CET,0.0 1.638 2.062 2.349 2.561 2.76 2.945 3.088 3.34 3.45 3.546 3.365 3.8 3.871 4.02 4.157 4.286 4.346 4.452 4.549 4.682 4.752 4.808 4.882 4.948 5.016 5.083 5.13 5.183 5.229 5.244 5.252 5.237 5.239 5.252 5.208 5.137 5.025 4.881 4.713 4.519 4.286 3.949 3.542 3.008 2.296 1.336 0.116 -1.568 -4.028 -7.829 -12.105 -15.419 -18.018 -20.119 -21.94 -23.492 -24.854 -25.989 -27.081 -28.004 -28.81 -29.557 -30.263 -30.923 -31.501 -32.093 -32.618 -33.065 -33.535 -34.013 -34.41 -34.838 -35.271 -35.605 -35.961 -36.326 -36.691 -37.092 -37.381 -37.665 -38.118 -38.447 -38.768 -38.92 -39.231 -39.557 -39.922 -40.132 -40.758 -40.822 -41.066 -41.333 -41.911 -42.219 -42.56 -42.946 -43.393 -43.972 -44.721 -47.111 -8 ,30570 ,KEBNE ,16693110,Fri Nov 26 00:58:14 CET,Fri Nov 26 02:33:19 CET,0.0 1.505 2.021 2.327 2.56 2.773 2.944 3.099 3.379 3.497 3.592 3.39 3.821 3.891 4.024 4.133 4.237 4.287 4.359 4.44 4.581 4.655 4.704 4.782 4.841 4.873 4.903 4.927 4.96 4.986 4.989 4.982 4.977 4.959 4.914 4.867 4.814 4.712 4.582 4.426 4.231 3.966 3.626 3.248 2.696 1.992 1.078 -0.149 -1.855 -4.3 -8.179 -12.489 -15.701 -18.276 -20.407 -22.235 -23.797 -25.148 -26.283 -27.383 -28.287 -29.085 -29.856 -30.587 -31.251 -31.836 -32.441 -32.983 -33.447 -33.943 -34.451 -34.858 -35.272 -35.698 -36.043 -36.398 -36.749 -37.144 -37.548 -37.82 -38.117 -38.549 -38.837 -39.147 -39.311 -39.659 -40.024 -40.411 -40.611 -41.225 -41.256 -41.496 -41.754 -42.311 -42.652 -43.026 -43.434 -43.92 -44.512 -45.271 -48.254 -9 ,5796 ,KEBNE ,16693111,Fri Nov 26 00:58:14 CET,Fri Nov 26 02:33:19 CET,0.0 1.593 2.069 2.368 2.603 2.804 2.967 3.101 3.329 3.427 3.532 3.357 3.791 3.857 3.995 4.121 4.208 4.252 4.355 4.458 4.57 4.618 4.66 4.729 4.785 4.824 4.86 4.887 4.908 4.922 4.921 4.93 4.951 4.948 4.91 4.845 4.778 4.673 4.517 4.358 4.176 3.931 3.603 3.216 2.688 2.005 1.113 -0.102 -1.813 -4.253 -8.092 -12.345 -15.59 -18.179 -20.27 -22.054 -23.58 -24.918 -26.039 -27.15 -28.088 -28.892 -29.632 -30.328 -30.979 -31.578 -32.201 -32.769 -33.278 -33.787 -34.288 -34.703 -35.121 -35.554 -35.888 -36.238 -36.594 -36.934 -37.298 -37.56 -37.834 -38.247 -38.532 -38.845 -39.008 -39.326 -39.673 -40.074 -40.27 -40.866 -40.886 -41.114 -41.355 -41.934 -42.276 -42.651 -43.076 -43.55 -44.073 -44.822 -47.897 -10 ,19646 ,KEBNE ,16693112,Fri Nov 26 00:58:14 CET,Fri Nov 26 02:33:06 CET,0.0 1.828 2.24 2.535 2.8 3.015 3.203 3.372 3.631 3.745 3.867 3.705 4.147 4.224 4.343 4.463 4.563 4.608 4.716 4.823 4.923 4.986 5.047 5.105 5.161 5.224 5.289 5.339 5.38 5.395 5.393 5.389 5.389 5.382 5.345 5.28 5.187 5.071 4.937 4.776 4.58 4.313 3.961 3.551 2.999 2.301 1.373 0.141 -1.605 -4.125 -8.003 -12.306 -15.622 -18.236 -20.335 -22.135 -23.673 -25.023 -26.14 -27.239 -28.141 -28.922 -29.694 -30.424 -31.082 -31.665 -32.267 -32.807 -33.286 -33.776 -34.268 -34.678 -35.111 -35.543 -35.883 -36.237 -36.573 -36.922 -37.316 -37.589 -37.861 -38.286 -38.595 -38.91 -39.068 -39.387 -39.729 -40.107 -40.297 -40.895 -40.918 -41.156 -41.428 -42.059 -42.424 -42.789 -43.157 -43.62 -44.205 -44.97 -47.67 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index f81675ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28003 ,KEBNE ,16693113,Fri Nov 26 00:58:14 CET,Fri Nov 26 02:31:00 CET,0.0 1.674 1.995 2.247 2.455 2.637 2.797 2.942 3.228 3.363 3.486 3.357 3.829 3.937 4.145 4.337 4.529 4.625 4.803 4.974 5.229 5.391 5.553 5.804 6.049 6.291 6.528 6.755 7.054 7.354 7.641 7.986 8.318 8.643 9.025 9.452 9.867 10.341 10.855 11.406 12.001 12.677 13.475 14.29 15.277 16.387 17.695 19.245 21.1 23.325 26.082 28.408 29.76 30.607 31.18 31.579 31.826 31.989 32.081 32.114 32.099 32.075 32.032 31.952 31.848 31.757 31.672 31.569 31.456 31.325 31.198 31.103 30.974 30.823 30.69 30.541 30.39 30.232 30.068 29.946 29.809 29.593 29.413 29.219 29.129 28.919 28.663 28.371 28.214 27.714 27.7 27.528 27.378 27.05 26.797 26.516 26.194 25.766 25.232 24.459 20.922 -2 ,20220 ,KEBNE ,16693114,Fri Nov 26 00:58:13 CET,Fri Nov 26 02:31:27 CET,0.0 1.078 1.412 1.662 1.873 2.051 2.217 2.381 2.675 2.805 2.935 2.814 3.288 3.398 3.617 3.834 4.036 4.131 4.321 4.512 4.796 4.977 5.147 5.387 5.621 5.851 6.079 6.302 6.59 6.877 7.16 7.5 7.826 8.143 8.524 8.97 9.387 9.854 10.359 10.892 11.474 12.143 12.932 13.73 14.701 15.805 17.099 18.626 20.459 22.677 25.485 27.852 29.175 30.002 30.557 30.951 31.212 31.382 31.41 31.358 31.349 31.335 31.283 31.216 31.121 31.021 30.918 30.817 30.708 30.557 30.397 30.282 30.145 29.971 29.832 29.684 29.536 29.378 29.197 29.072 28.94 28.742 28.597 28.422 28.336 28.175 27.981 27.76 27.642 27.183 27.217 27.054 26.902 26.58 26.377 26.144 25.83 25.389 24.821 24.073 20.19 -3 ,21460 ,KEBNE ,16693115,Fri Nov 26 00:59:17 CET,Fri Nov 26 02:33:43 CET,0.0 1.284 1.592 1.832 2.039 2.233 2.409 2.573 2.864 2.99 3.118 3.003 3.477 3.591 3.803 3.992 4.176 4.268 4.448 4.619 4.866 5.026 5.183 5.412 5.632 5.848 6.06 6.274 6.574 6.864 7.148 7.493 7.823 8.156 8.547 8.974 9.389 9.856 10.359 10.894 11.484 12.174 12.952 13.765 14.75 15.847 17.153 18.661 20.477 22.677 25.376 27.652 29.038 29.89 30.402 30.765 30.994 31.14 31.229 31.266 31.248 31.193 31.121 31.044 30.958 30.868 30.744 30.614 30.518 30.421 30.277 30.142 29.996 29.837 29.707 29.572 29.434 29.284 29.131 29.008 28.879 28.669 28.518 28.362 28.27 28.071 27.847 27.599 27.469 26.99 26.964 26.773 26.559 26.008 25.707 25.383 25.031 24.638 24.132 23.4 20.593 -4 ,22870 ,KEBNE ,16693116,Fri Nov 26 00:59:17 CET,Fri Nov 26 02:32:33 CET,0.0 1.33 1.647 1.871 2.073 2.255 2.42 2.575 2.85 2.978 3.102 2.968 3.444 3.557 3.767 3.966 4.164 4.259 4.44 4.626 4.899 5.074 5.247 5.5 5.748 5.988 6.223 6.451 6.748 7.04 7.321 7.655 7.983 8.309 8.687 9.117 9.534 9.992 10.495 11.041 11.613 12.271 13.065 13.875 14.83 15.945 17.277 18.755 20.519 22.71 25.462 27.732 29.088 29.94 30.446 30.797 31.043 31.192 31.266 31.295 31.288 31.255 31.193 31.113 31.023 30.936 30.83 30.731 30.632 30.503 30.348 30.216 30.082 29.93 29.772 29.609 29.469 29.3 29.112 28.97 28.827 28.614 28.435 28.259 28.183 28.01 27.8 27.538 27.407 26.934 26.916 26.736 26.533 26.09 25.853 25.564 25.212 24.784 24.251 23.503 19.803 -5 ,19788 ,KEBNE ,16693117,Fri Nov 26 00:59:16 CET,Fri Nov 26 02:31:54 CET,0.0 1.163 1.511 1.771 1.985 2.169 2.345 2.514 2.811 2.945 3.072 2.943 3.419 3.525 3.726 3.922 4.114 4.204 4.382 4.553 4.803 4.967 5.126 5.361 5.59 5.812 6.034 6.261 6.561 6.853 7.143 7.486 7.809 8.13 8.511 8.942 9.364 9.824 10.328 10.886 11.473 12.142 12.948 13.772 14.749 15.864 17.181 18.682 20.491 22.718 25.547 27.892 29.263 30.133 30.65 31.04 31.34 31.52 31.588 31.589 31.547 31.487 31.422 31.333 31.224 31.125 31.001 30.877 30.775 30.659 30.514 30.371 30.211 30.061 29.93 29.773 29.631 29.476 29.29 29.153 29.019 28.804 28.643 28.461 28.365 28.179 27.968 27.717 27.598 27.153 27.218 27.071 26.914 26.527 26.267 25.952 25.568 25.141 24.654 23.907 20.486 -6 ,12057 ,KEBNE ,16693118,Fri Nov 26 01:00:19 CET,Fri Nov 26 02:36:14 CET,0.0 1.814 2.144 2.373 2.569 2.739 2.902 3.062 3.354 3.487 3.611 3.491 3.967 4.076 4.291 4.491 4.687 4.783 4.97 5.155 5.428 5.599 5.762 6.008 6.25 6.483 6.716 6.95 7.26 7.555 7.833 8.178 8.516 8.838 9.212 9.634 10.049 10.52 11.032 11.587 12.177 12.852 13.652 14.446 15.406 16.515 17.81 19.316 21.114 23.33 26.104 28.454 29.862 30.77 31.364 31.746 31.965 32.088 32.145 32.173 32.169 32.125 32.073 32.025 31.95 31.858 31.742 31.614 31.487 31.326 31.164 31.041 30.903 30.748 30.615 30.474 30.333 30.196 30.065 29.965 29.845 29.65 29.508 29.361 29.279 29.089 28.855 28.612 28.482 27.997 28.017 27.851 27.674 27.267 27.021 26.743 26.403 25.97 25.425 24.711 21.781 -7 ,4629 ,KEBNE ,16693119,Fri Nov 26 01:00:19 CET,Fri Nov 26 02:34:57 CET,0.0 1.117 1.422 1.656 1.869 2.062 2.227 2.382 2.677 2.81 2.933 2.811 3.284 3.388 3.59 3.781 3.974 4.07 4.251 4.43 4.679 4.837 4.999 5.248 5.493 5.729 5.965 6.198 6.498 6.795 7.081 7.427 7.754 8.064 8.424 8.84 9.26 9.739 10.251 10.788 11.362 12.036 12.843 13.657 14.649 15.761 17.048 18.545 20.354 22.554 25.298 27.62 28.951 29.791 30.362 30.755 30.993 31.159 31.252 31.265 31.226 31.146 31.059 30.982 30.895 30.81 30.733 30.632 30.514 30.387 30.24 30.127 30.01 29.858 29.746 29.624 29.462 29.286 29.112 28.993 28.859 28.658 28.526 28.362 28.278 28.109 27.912 27.666 27.505 27.002 26.991 26.807 26.616 26.153 25.897 25.625 25.293 24.874 24.402 23.725 20.174 -8 ,29177 ,KEBNE ,16693120,Fri Nov 26 01:01:23 CET,Fri Nov 26 02:35:49 CET,0.0 0.887 1.184 1.402 1.596 1.783 1.954 2.101 2.371 2.495 2.612 2.472 2.937 3.047 3.261 3.469 3.681 3.782 3.979 4.172 4.441 4.617 4.797 5.067 5.317 5.544 5.762 5.979 6.267 6.542 6.811 7.146 7.467 7.783 8.153 8.575 8.988 9.459 9.967 10.512 11.107 11.8 12.627 13.46 14.44 15.557 16.856 18.355 20.188 22.381 25.118 27.538 28.958 29.839 30.411 30.795 31.061 31.225 31.295 31.306 31.313 31.303 31.253 31.191 31.114 31.03 30.93 30.83 30.734 30.614 30.476 30.356 30.23 30.088 29.966 29.847 29.713 29.562 29.397 29.269 29.134 28.919 28.769 28.579 28.48 28.3 28.121 27.921 27.804 27.325 27.341 27.175 26.981 26.6 26.373 26.101 25.795 25.437 24.895 24.109 19.477 -9 ,14473 ,KEBNE ,16693121,Fri Nov 26 01:01:23 CET,Fri Nov 26 02:37:36 CET,0.0 0.922 1.241 1.503 1.719 1.906 2.074 2.226 2.51 2.647 2.777 2.647 3.114 3.216 3.418 3.614 3.801 3.892 4.075 4.255 4.511 4.674 4.833 5.067 5.297 5.523 5.743 5.956 6.233 6.498 6.752 7.067 7.38 7.697 8.059 8.47 8.883 9.343 9.844 10.373 10.933 11.6 12.403 13.223 14.193 15.29 16.575 18.075 19.92 22.172 24.97 27.322 28.657 29.498 30.086 30.486 30.744 30.896 30.97 31.011 31.015 30.969 30.902 30.835 30.761 30.672 30.561 30.444 30.327 30.21 30.092 29.986 29.854 29.695 29.569 29.427 29.263 29.102 28.927 28.806 28.668 28.457 28.304 28.147 28.077 27.914 27.712 27.459 27.318 26.828 26.827 26.667 26.497 26.12 25.903 25.622 25.289 24.911 24.447 23.707 20.062 -10 ,6202 ,KEBNE ,16693122,Fri Nov 26 01:01:25 CET,Fri Nov 26 02:28:47 CET,0.0 1.196 1.501 1.737 1.954 2.136 2.297 2.451 2.721 2.846 2.964 2.825 3.299 3.414 3.631 3.833 4.026 4.115 4.289 4.462 4.712 4.875 5.036 5.269 5.492 5.722 5.954 6.184 6.489 6.777 7.051 7.391 7.721 8.044 8.425 8.846 9.251 9.706 10.212 10.757 11.333 11.994 12.795 13.617 14.593 15.713 16.994 18.462 20.268 22.527 25.304 27.57 28.922 29.792 30.357 30.713 30.936 31.091 31.185 31.235 31.233 31.212 31.184 31.135 31.053 30.962 30.847 30.74 30.645 30.531 30.398 30.288 30.174 30.05 29.94 29.813 29.676 29.527 29.335 29.181 29.032 28.805 28.637 28.451 28.349 28.153 27.963 27.723 27.566 27.08 27.122 26.961 26.8 26.371 26.106 25.847 25.523 25.117 24.628 23.896 20.571 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt deleted file mode 100644 index 9ccb21a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fln_p38a-2x.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29721 ,KEBNE ,16693123,Fri Nov 26 01:02:27 CET,Fri Nov 26 02:41:49 CET,0.0 2.211 2.696 3.009 3.261 3.487 3.676 3.845 4.159 4.306 4.453 4.377 4.864 4.985 5.222 5.445 5.655 5.757 5.959 6.151 6.43 6.617 6.797 7.056 7.308 7.555 7.802 8.039 8.345 8.644 8.935 9.294 9.635 9.962 10.358 10.807 11.221 11.669 12.16 12.689 13.246 13.888 14.641 15.407 16.33 17.388 18.638 20.094 21.789 23.743 26.137 28.025 29.115 29.821 30.233 30.494 30.656 30.705 30.692 30.667 30.609 30.533 30.458 30.368 30.271 30.156 30.016 29.881 29.769 29.647 29.508 29.395 29.259 29.101 28.978 28.846 28.706 28.546 28.378 28.27 28.137 27.916 27.779 27.633 27.546 27.375 27.197 26.998 26.886 26.428 26.518 26.381 26.227 25.9 25.712 25.483 25.217 24.897 24.48 23.89 21.852 -2 ,8598 ,KEBNE ,16693124,Fri Nov 26 01:02:26 CET,Fri Nov 26 02:38:19 CET,0.0 1.935 2.528 2.921 3.238 3.506 3.763 4.014 4.434 4.603 4.759 4.702 5.201 5.337 5.597 5.856 6.097 6.211 6.441 6.67 6.978 7.167 7.361 7.635 7.895 8.15 8.396 8.637 8.954 9.264 9.559 9.912 10.253 10.594 10.998 11.45 11.884 12.346 12.832 13.371 13.955 14.607 15.374 16.167 17.118 18.174 19.373 20.708 22.33 24.337 26.809 28.791 29.903 30.551 30.944 31.185 31.297 31.306 31.284 31.265 31.218 31.14 31.04 30.951 30.854 30.725 30.585 30.47 30.354 30.22 30.085 29.977 29.862 29.728 29.616 29.505 29.384 29.244 29.103 29.011 28.91 28.718 28.563 28.392 28.313 28.153 27.979 27.796 27.696 27.254 27.354 27.226 27.102 26.818 26.65 26.452 26.223 25.951 25.564 25.021 22.662 -3 ,9592 ,KEBNE ,16693125,Fri Nov 26 01:02:25 CET,Fri Nov 26 02:39:05 CET,0.0 1.776 2.266 2.591 2.892 3.156 3.383 3.603 3.998 4.175 4.337 4.26 4.75 4.89 5.164 5.411 5.634 5.74 5.952 6.164 6.48 6.681 6.863 7.13 7.395 7.646 7.884 8.116 8.42 8.707 8.99 9.334 9.672 10.009 10.399 10.823 11.229 11.688 12.208 12.757 13.318 13.979 14.741 15.501 16.428 17.463 18.692 20.075 21.701 23.733 26.135 28.055 29.224 29.922 30.362 30.659 30.794 30.829 30.831 30.803 30.724 30.641 30.541 30.413 30.306 30.194 30.074 29.965 29.842 29.71 29.576 29.462 29.336 29.192 29.075 28.955 28.823 28.681 28.529 28.422 28.307 28.112 27.982 27.841 27.771 27.619 27.449 27.272 27.178 26.741 26.869 26.746 26.603 26.281 26.088 25.872 25.638 25.358 24.989 24.438 22.261 -4 ,7950 ,KEBNE ,16693126,Fri Nov 26 01:02:25 CET,Fri Nov 26 02:38:55 CET,0.0 1.548 2.043 2.456 2.814 3.096 3.321 3.533 3.899 4.079 4.257 4.209 4.707 4.84 5.099 5.35 5.58 5.688 5.919 6.166 6.489 6.676 6.862 7.153 7.461 7.744 7.986 8.211 8.504 8.802 9.094 9.444 9.775 10.097 10.493 10.933 11.349 11.82 12.325 12.868 13.439 14.08 14.854 15.637 16.542 17.579 18.813 20.189 21.8 23.73 26.14 28.175 29.368 30.051 30.45 30.74 30.93 31.031 31.036 31.004 30.969 30.901 30.814 30.722 30.602 30.468 30.322 30.184 30.062 29.947 29.815 29.677 29.535 29.398 29.274 29.144 29.002 28.856 28.71 28.604 28.491 28.293 28.143 27.981 27.891 27.71 27.534 27.313 27.2 26.762 26.862 26.732 26.604 26.324 26.157 25.962 25.744 25.471 25.143 24.701 22.87 -5 ,32174 ,KEBNE ,16693127,Fri Nov 26 01:02:25 CET,Fri Nov 26 02:39:59 CET,0.0 1.936 2.367 2.655 2.894 3.105 3.316 3.534 3.902 4.048 4.186 4.08 4.56 4.68 4.921 5.161 5.378 5.479 5.667 5.852 6.122 6.294 6.467 6.717 6.953 7.195 7.433 7.661 7.972 8.272 8.566 8.923 9.258 9.601 10.003 10.441 10.858 11.308 11.813 12.359 12.919 13.553 14.313 15.103 16.026 17.061 18.294 19.679 21.333 23.319 25.758 27.798 28.97 29.665 30.085 30.353 30.501 30.573 30.575 30.538 30.489 30.396 30.277 30.176 30.081 29.984 29.848 29.724 29.618 29.491 29.353 29.225 29.084 28.936 28.819 28.689 28.533 28.364 28.198 28.083 27.96 27.761 27.625 27.479 27.404 27.241 27.035 26.811 26.702 26.256 26.36 26.229 26.075 25.732 25.54 25.317 25.041 24.731 24.374 23.871 21.967 -6 ,21347 ,KEBNE ,16693128,Fri Nov 26 01:05:33 CET,Fri Nov 26 02:42:32 CET,0.0 1.475 1.917 2.237 2.494 2.718 2.928 3.108 3.428 3.593 3.758 3.688 4.179 4.302 4.544 4.791 5.034 5.153 5.383 5.594 5.9 6.093 6.278 6.557 6.822 7.077 7.328 7.56 7.865 8.161 8.444 8.792 9.135 9.471 9.851 10.274 10.698 11.173 11.676 12.216 12.815 13.498 14.292 15.082 16.001 17.067 18.296 19.702 21.372 23.38 25.905 27.959 29.064 29.691 30.082 30.356 30.51 30.577 30.595 30.562 30.501 30.403 30.287 30.192 30.086 29.975 29.849 29.718 29.59 29.462 29.33 29.208 29.075 28.929 28.808 28.666 28.509 28.354 28.176 28.055 27.944 27.766 27.631 27.477 27.4 27.223 27.021 26.82 26.703 26.252 26.334 26.164 25.994 25.669 25.475 25.243 24.974 24.648 24.313 23.816 21.539 -7 ,18927 ,KEBNE ,16693129,Fri Nov 26 01:05:33 CET,Fri Nov 26 02:42:16 CET,0.0 1.992 2.454 2.788 3.045 3.271 3.485 3.675 4.032 4.195 4.344 4.256 4.741 4.859 5.091 5.328 5.572 5.686 5.921 6.166 6.485 6.679 6.871 7.154 7.423 7.676 7.921 8.171 8.497 8.797 9.076 9.42 9.756 10.083 10.471 10.91 11.331 11.795 12.288 12.816 13.395 14.048 14.805 15.556 16.415 17.422 18.623 19.989 21.6 23.557 26.025 28.051 29.251 30.004 30.424 30.654 30.751 30.767 30.749 30.719 30.7 30.657 30.575 30.473 30.359 30.243 30.125 30.006 29.878 29.74 29.599 29.486 29.373 29.238 29.121 29.006 28.882 28.729 28.569 28.455 28.326 28.122 27.985 27.841 27.762 27.61 27.452 27.262 27.164 26.719 26.825 26.707 26.576 26.241 26.024 25.804 25.585 25.308 24.995 24.516 22.496 -8 ,24862 ,KEBNE ,16693130,Fri Nov 26 01:05:33 CET,Fri Nov 26 02:41:52 CET,0.0 1.681 2.141 2.482 2.739 2.957 3.152 3.35 3.71 3.866 4.012 3.925 4.42 4.55 4.791 5.026 5.251 5.357 5.571 5.786 6.097 6.293 6.475 6.73 6.977 7.218 7.458 7.695 8.006 8.307 8.587 8.92 9.241 9.566 9.959 10.389 10.821 11.338 11.888 12.442 13.016 13.672 14.469 15.272 16.204 17.252 18.449 19.842 21.519 23.536 26.054 28.065 29.195 29.861 30.236 30.467 30.594 30.667 30.697 30.667 30.623 30.544 30.418 30.295 30.167 30.045 29.915 29.802 29.702 29.571 29.405 29.27 29.138 28.986 28.863 28.718 28.559 28.399 28.23 28.118 28.0 27.814 27.677 27.542 27.48 27.349 27.214 27.057 26.959 26.515 26.634 26.519 26.401 26.082 25.892 25.703 25.5 25.256 24.936 24.445 22.614 -9 ,16578 ,KEBNE ,16693131,Fri Nov 26 01:05:33 CET,Fri Nov 26 02:44:45 CET,0.0 1.859 2.258 2.559 2.81 3.027 3.228 3.411 3.74 3.895 4.045 3.953 4.444 4.568 4.804 5.031 5.241 5.345 5.554 5.764 6.065 6.257 6.449 6.733 7.006 7.264 7.508 7.746 8.058 8.355 8.634 8.971 9.302 9.628 10.025 10.487 10.92 11.382 11.886 12.436 13.004 13.633 14.397 15.169 16.075 17.12 18.362 19.768 21.422 23.388 25.794 27.818 28.972 29.634 30.038 30.314 30.491 30.601 30.627 30.615 30.57 30.499 30.39 30.251 30.126 30.01 29.894 29.781 29.656 29.504 29.33 29.191 29.051 28.899 28.781 28.669 28.545 28.392 28.222 28.096 27.972 27.802 27.689 27.55 27.473 27.318 27.15 26.972 26.868 26.405 26.46 26.326 26.182 25.859 25.68 25.476 25.245 24.958 24.594 24.059 21.462 -10 ,32295 ,KEBNE ,16693132,Fri Nov 26 01:06:36 CET,Fri Nov 26 02:45:50 CET,0.0 1.992 2.499 2.827 3.081 3.313 3.517 3.703 4.044 4.196 4.351 4.296 4.809 4.953 5.193 5.414 5.627 5.729 5.933 6.144 6.481 6.689 6.867 7.13 7.391 7.652 7.899 8.136 8.448 8.747 9.035 9.373 9.708 10.038 10.429 10.902 11.38 11.908 12.439 12.971 13.546 14.206 14.966 15.733 16.653 17.695 18.942 20.371 22.042 24.015 26.43 28.45 29.615 30.321 30.74 30.976 31.083 31.155 31.183 31.181 31.14 31.065 30.982 30.877 30.768 30.673 30.561 30.438 30.305 30.147 30.002 29.89 29.772 29.647 29.532 29.411 29.284 29.149 28.988 28.879 28.762 28.565 28.434 28.298 28.221 28.064 27.924 27.77 27.677 27.227 27.32 27.201 27.082 26.773 26.595 26.411 26.182 25.899 25.572 25.087 23.503 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt deleted file mode 100644 index 47c0cf85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-2bb.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25548 ,KEBNE ,16693133,Fri Nov 26 01:07:40 CET,Fri Nov 26 02:36:45 CET,0.0 2.587 3.13 3.518 3.848 4.139 4.418 4.675 5.133 5.341 5.544 5.414 6.072 6.235 6.539 6.834 7.115 7.252 7.524 7.779 8.131 8.343 8.53 8.771 8.992 9.209 9.45 9.701 10.012 10.312 10.634 11.039 11.419 11.786 12.177 12.582 12.97 13.407 13.876 14.354 14.882 15.483 16.135 16.765 17.536 18.424 19.451 20.593 21.885 23.296 24.798 25.864 26.322 26.499 26.537 26.469 26.324 26.16 25.989 25.763 25.548 25.346 25.138 24.921 24.691 24.468 24.227 23.997 23.786 23.57 23.343 23.14 22.894 22.63 22.447 22.271 22.094 21.909 21.683 21.504 21.306 20.988 20.774 20.542 20.424 20.176 19.894 19.603 19.457 18.82 18.924 18.734 18.541 18.044 17.752 17.402 16.998 16.508 15.936 15.169 12.387 -2 ,265 ,KEBNE ,16693134,Fri Nov 26 01:08:40 CET,Fri Nov 26 02:48:01 CET,0.0 2.131 2.667 3.013 3.293 3.524 3.753 3.961 4.319 4.495 4.672 4.506 5.144 5.28 5.557 5.847 6.139 6.269 6.522 6.774 7.142 7.387 7.622 7.928 8.174 8.409 8.676 8.955 9.314 9.633 9.936 10.301 10.627 10.962 11.354 11.758 12.149 12.702 13.326 13.866 14.416 15.028 15.737 16.448 17.268 18.166 19.166 20.289 21.638 23.139 24.798 26.049 26.653 26.919 27.039 27.07 27.009 26.9 26.745 26.547 26.342 26.119 25.88 25.628 25.397 25.157 24.905 24.702 24.502 24.296 24.074 23.874 23.672 23.439 23.243 23.013 22.761 22.526 22.28 22.09 21.871 21.503 21.245 20.975 20.835 20.552 20.267 19.988 19.842 19.208 19.356 19.163 18.953 18.479 18.21 17.914 17.591 17.175 16.653 15.969 12.878 -3 ,20067 ,KEBNE ,16693135,Fri Nov 26 01:08:41 CET,Fri Nov 26 02:48:24 CET,0.0 5.126 5.705 6.09 6.398 6.679 6.933 7.165 7.59 7.785 7.958 7.767 8.408 8.543 8.8 9.046 9.305 9.438 9.697 9.933 10.287 10.531 10.749 11.055 11.346 11.605 11.87 12.163 12.507 12.79 13.089 13.496 13.921 14.307 14.684 15.089 15.495 15.938 16.39 16.891 17.449 18.074 18.781 19.523 20.39 21.306 22.311 23.4 24.7 26.18 27.824 28.941 29.446 29.62 29.621 29.561 29.449 29.301 29.11 28.88 28.647 28.406 28.169 27.942 27.733 27.506 27.247 27.014 26.807 26.606 26.389 26.176 25.937 25.676 25.479 25.289 25.089 24.874 24.653 24.495 24.304 23.985 23.791 23.587 23.468 23.225 22.976 22.717 22.571 21.921 22.013 21.811 21.623 21.145 20.86 20.512 20.121 19.68 19.087 18.328 15.228 -4 ,14081 ,KEBNE ,16693136,Fri Nov 26 01:10:47 CET,Fri Nov 26 02:37:59 CET,0.0 2.882 3.434 3.867 4.264 4.586 4.875 5.149 5.59 5.791 5.995 5.893 6.567 6.743 7.09 7.392 7.657 7.781 8.004 8.241 8.6 8.803 8.986 9.263 9.565 9.89 10.214 10.501 10.86 11.208 11.51 11.888 12.299 12.674 13.08 13.592 14.071 14.54 15.032 15.543 16.099 16.703 17.34 17.962 18.724 19.595 20.552 21.65 22.929 24.358 25.994 27.13 27.618 27.794 27.803 27.675 27.524 27.384 27.193 26.943 26.725 26.516 26.295 26.075 25.851 25.633 25.376 25.088 24.844 24.623 24.388 24.187 23.964 23.701 23.503 23.323 23.108 22.878 22.639 22.47 22.3 22.035 21.851 21.623 21.479 21.187 20.905 20.617 20.454 19.788 19.857 19.628 19.402 18.863 18.53 18.171 17.802 17.413 16.917 16.159 12.823 -5 ,8862 ,KEBNE ,16693137,Fri Nov 26 01:12:51 CET,Fri Nov 26 02:52:24 CET,0.0 2.34 2.878 3.302 3.611 3.855 4.089 4.317 4.69 4.866 5.034 4.817 5.453 5.607 5.915 6.187 6.416 6.526 6.728 6.918 7.209 7.404 7.595 7.868 8.144 8.424 8.68 8.926 9.237 9.545 9.846 10.21 10.577 10.932 11.363 11.851 12.314 12.786 13.246 13.731 14.227 14.8 15.511 16.208 16.961 17.795 18.777 19.905 21.195 22.599 24.152 25.231 25.742 25.956 25.913 25.779 25.624 25.432 25.234 25.0 24.803 24.6 24.353 24.107 23.888 23.7 23.507 23.313 23.128 22.907 22.667 22.451 22.207 21.968 21.782 21.597 21.419 21.22 20.979 20.809 20.65 20.402 20.22 20.018 19.896 19.64 19.403 19.159 19.019 18.387 18.572 18.395 18.172 17.664 17.374 17.032 16.649 16.242 15.787 15.155 7.531 -6 ,25466 ,KEBNE ,16693138,Fri Nov 26 01:12:51 CET,Fri Nov 26 02:52:20 CET,0.0 4.99 5.577 6.001 6.353 6.659 6.941 7.185 7.625 7.829 8.035 7.963 8.659 8.837 9.141 9.409 9.651 9.778 10.041 10.3 10.676 10.915 11.146 11.474 11.768 12.061 12.363 12.628 12.965 13.319 13.629 13.959 14.326 14.734 15.16 15.568 15.963 16.43 16.949 17.466 17.96 18.566 19.292 19.966 20.758 21.644 22.623 23.677 24.889 26.313 27.916 29.14 29.694 29.893 29.953 29.845 29.659 29.471 29.298 29.102 28.893 28.669 28.437 28.205 27.985 27.791 27.591 27.365 27.15 26.948 26.711 26.505 26.277 26.001 25.768 25.545 25.354 25.164 24.939 24.748 24.541 24.246 24.025 23.781 23.661 23.405 23.109 22.801 22.657 22.014 22.152 21.999 21.831 21.393 21.13 20.836 20.486 20.089 19.628 18.974 16.021 -7 ,16729 ,KEBNE ,16693139,Fri Nov 26 01:13:57 CET,Fri Nov 26 02:44:58 CET,0.0 3.507 4.162 4.568 4.913 5.21 5.487 5.752 6.2 6.406 6.597 6.453 7.102 7.25 7.551 7.822 8.076 8.199 8.459 8.717 9.077 9.296 9.484 9.767 10.051 10.316 10.574 10.827 11.176 11.52 11.83 12.169 12.478 12.778 13.169 13.67 14.176 14.721 15.252 15.787 16.319 16.888 17.551 18.205 18.966 19.8 20.745 21.829 23.09 24.525 26.138 27.251 27.759 27.956 27.96 27.872 27.743 27.529 27.277 27.007 26.759 26.519 26.253 25.974 25.728 25.512 25.265 25.041 24.833 24.622 24.387 24.169 23.918 23.665 23.47 23.262 23.068 22.865 22.642 22.474 22.296 22.022 21.829 21.612 21.502 21.265 20.998 20.725 20.575 19.927 20.067 19.866 19.619 19.045 18.72 18.379 18.025 17.574 16.98 16.134 11.076 -8 ,21679 ,KEBNE ,16693140,Fri Nov 26 01:14:55 CET,Fri Nov 26 02:51:17 CET,0.0 3.398 3.873 4.223 4.544 4.848 5.112 5.351 5.764 5.954 6.124 5.94 6.588 6.744 7.059 7.36 7.64 7.764 8.006 8.237 8.555 8.764 8.974 9.28 9.604 9.943 10.237 10.505 10.853 11.152 11.429 11.802 12.145 12.48 12.879 13.287 13.678 14.108 14.573 15.077 15.628 16.256 16.933 17.561 18.31 19.196 20.186 21.241 22.466 23.841 25.415 26.543 26.999 27.158 27.198 27.159 27.013 26.826 26.637 26.407 26.189 25.969 25.746 25.511 25.286 25.091 24.851 24.603 24.381 24.144 23.899 23.696 23.456 23.219 23.053 22.829 22.599 22.372 22.093 21.898 21.703 21.412 21.193 20.952 20.836 20.563 20.248 19.976 19.859 19.248 19.419 19.247 19.061 18.614 18.354 18.054 17.721 17.34 16.872 16.233 13.044 -9 ,879 ,KEBNE ,16693141,Fri Nov 26 01:15:57 CET,Fri Nov 26 02:51:55 CET,0.0 3.481 4.112 4.572 4.941 5.262 5.533 5.765 6.188 6.394 6.582 6.44 7.099 7.251 7.543 7.827 8.087 8.22 8.513 8.755 9.06 9.258 9.44 9.707 9.972 10.23 10.496 10.762 11.094 11.397 11.682 12.026 12.361 12.688 13.089 13.547 13.952 14.387 14.908 15.507 16.046 16.608 17.282 17.959 18.749 19.599 20.564 21.63 22.883 24.351 26.008 27.173 27.658 27.863 27.931 27.891 27.776 27.596 27.381 27.106 26.831 26.589 26.36 26.132 25.924 25.698 25.385 25.081 24.789 24.495 24.234 24.011 23.78 23.54 23.357 23.16 22.928 22.698 22.471 22.295 22.101 21.765 21.522 21.283 21.164 20.916 20.649 20.366 20.206 19.542 19.645 19.452 19.245 18.768 18.473 18.158 17.83 17.461 16.995 16.334 13.052 -10 ,18114 ,KEBNE ,16693142,Fri Nov 26 01:16:59 CET,Fri Nov 26 02:54:01 CET,0.0 2.695 3.334 3.759 4.069 4.374 4.686 4.93 5.33 5.528 5.738 5.631 6.282 6.427 6.728 7.058 7.385 7.536 7.816 8.06 8.386 8.617 8.864 9.191 9.485 9.77 10.027 10.274 10.586 10.886 11.203 11.606 11.969 12.287 12.64 13.034 13.421 13.861 14.353 14.9 15.507 16.151 16.805 17.457 18.229 19.091 20.08 21.194 22.458 23.909 25.562 26.748 27.333 27.576 27.642 27.622 27.488 27.286 27.074 26.844 26.636 26.412 26.145 25.894 25.664 25.451 25.217 24.971 24.76 24.537 24.263 24.025 23.798 23.566 23.348 23.105 22.869 22.636 22.398 22.218 22.023 21.689 21.47 21.267 21.141 20.87 20.564 20.23 20.075 19.443 19.585 19.388 19.166 18.652 18.36 18.04 17.694 17.252 16.729 15.985 12.814 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 4a2df397..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flq_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22204 ,KEBNE ,16693143,Fri Nov 26 01:18:02 CET,Fri Nov 26 02:55:18 CET,0.0 1.567 2.082 2.467 2.839 3.181 3.504 3.82 4.384 4.662 4.949 4.995 5.742 5.991 6.491 6.983 7.463 7.693 8.154 8.623 9.301 9.733 10.156 10.776 11.387 12.011 12.641 13.252 14.057 14.874 15.663 16.624 17.578 18.529 19.649 20.918 22.184 23.609 25.189 26.931 28.791 30.95 33.615 36.389 39.739 43.637 48.387 54.121 61.373 70.691 83.24 95.211 103.345 109.221 113.624 117.121 119.869 122.113 123.872 125.444 126.671 127.694 128.576 129.32 129.984 130.566 131.121 131.584 131.929 132.243 132.56 132.794 133.011 133.221 133.369 133.498 133.613 133.726 133.833 133.89 133.912 133.88 133.836 133.785 133.765 133.708 133.616 133.52 133.476 133.064 133.248 133.154 133.044 132.769 132.595 132.375 132.098 131.808 131.421 130.759 126.065 -2 ,11466 ,KEBNE ,16693144,Fri Nov 26 01:18:03 CET,Fri Nov 26 02:56:43 CET,0.0 1.81 2.489 3.008 3.42 3.77 4.12 4.476 5.134 5.435 5.719 5.779 6.55 6.816 7.31 7.778 8.244 8.475 8.931 9.4 10.081 10.522 10.973 11.638 12.281 12.928 13.574 14.194 15.002 15.786 16.551 17.5 18.437 19.371 20.464 21.712 22.958 24.368 25.929 27.644 29.517 31.697 34.346 37.104 40.418 44.298 49.041 54.813 62.081 71.336 83.798 95.695 103.753 109.516 113.849 117.293 119.991 122.2 123.913 125.443 126.647 127.65 128.532 129.287 129.908 130.413 130.893 131.303 131.652 131.998 132.326 132.557 132.78 133.003 133.162 133.307 133.439 133.555 133.642 133.672 133.699 133.753 133.777 133.789 133.782 133.736 133.645 133.524 133.455 133.029 133.175 133.05 132.933 132.609 132.433 132.226 131.9 131.473 130.936 130.225 126.597 -3 ,11300 ,KEBNE ,16693145,Fri Nov 26 01:18:02 CET,Fri Nov 26 02:55:24 CET,0.0 2.113 2.662 3.093 3.484 3.88 4.247 4.587 5.205 5.508 5.816 5.899 6.662 6.92 7.41 7.881 8.345 8.575 9.045 9.509 10.165 10.596 11.023 11.659 12.288 12.899 13.501 14.097 14.893 15.672 16.43 17.377 18.318 19.242 20.333 21.57 22.811 24.257 25.875 27.61 29.478 31.682 34.355 37.133 40.483 44.419 49.242 55.028 62.299 71.631 84.26 96.176 104.072 109.787 114.098 117.471 120.136 122.356 124.115 125.711 126.966 127.99 128.882 129.638 130.273 130.807 131.336 131.786 132.124 132.444 132.772 133.03 133.283 133.522 133.681 133.807 133.915 134.004 134.053 134.086 134.12 134.111 134.076 134.037 134.012 133.967 133.909 133.824 133.762 133.335 133.513 133.412 133.269 132.929 132.762 132.571 132.342 132.04 131.623 130.965 127.015 -4 ,12096 ,KEBNE ,16693146,Fri Nov 26 01:18:02 CET,Fri Nov 26 02:51:52 CET,0.0 2.33 2.933 3.405 3.804 4.172 4.53 4.873 5.529 5.84 6.134 6.19 6.945 7.199 7.681 8.159 8.642 8.877 9.326 9.772 10.456 10.904 11.339 11.981 12.599 13.205 13.802 14.396 15.178 15.943 16.714 17.665 18.583 19.495 20.589 21.847 23.088 24.495 26.064 27.78 29.661 31.853 34.489 37.268 40.645 44.553 49.331 55.109 62.349 71.597 83.992 95.653 103.574 109.293 113.558 116.964 119.616 121.755 123.455 125.008 126.219 127.23 128.127 128.907 129.56 130.101 130.64 131.082 131.422 131.74 132.044 132.275 132.487 132.684 132.815 132.952 133.079 133.181 133.279 133.324 133.361 133.401 133.411 133.415 133.406 133.363 133.298 133.215 133.154 132.722 132.843 132.691 132.539 132.251 132.091 131.86 131.554 131.174 130.584 129.632 124.235 -5 ,20209 ,KEBNE ,16693147,Fri Nov 26 01:18:02 CET,Fri Nov 26 02:54:24 CET,0.0 1.961 2.536 2.989 3.375 3.739 4.077 4.387 4.968 5.234 5.501 5.54 6.298 6.56 7.057 7.537 7.999 8.229 8.695 9.145 9.786 10.208 10.636 11.252 11.854 12.462 13.063 13.677 14.475 15.228 15.979 16.914 17.854 18.778 19.872 21.141 22.4 23.827 25.386 27.109 28.981 31.157 33.829 36.6 39.958 43.924 48.732 54.482 61.725 71.012 83.669 95.685 103.742 109.645 114.068 117.52 120.241 122.46 124.191 125.776 126.992 127.994 128.909 129.7 130.368 130.934 131.484 131.948 132.318 132.655 132.973 133.219 133.447 133.645 133.775 133.894 134.01 134.116 134.205 134.254 134.28 134.31 134.309 134.273 134.262 134.233 134.184 134.128 134.086 133.687 133.864 133.756 133.663 133.469 133.335 133.162 132.938 132.648 132.23 131.555 126.778 -6 ,11051 ,KEBNE ,16693148,Fri Nov 26 01:19:04 CET,Fri Nov 26 02:54:27 CET,0.0 2.038 2.633 3.135 3.553 3.949 4.347 4.681 5.276 5.565 5.837 5.862 6.604 6.84 7.3 7.762 8.215 8.437 8.876 9.321 9.975 10.399 10.829 11.456 12.06 12.65 13.246 13.835 14.591 15.343 16.104 17.036 17.941 18.847 19.934 21.199 22.467 23.894 25.481 27.249 29.152 31.351 34.034 36.844 40.242 44.177 48.979 54.756 62.005 71.32 83.932 95.846 103.91 109.828 114.237 117.741 120.452 122.638 124.362 125.931 127.168 128.168 129.051 129.833 130.509 131.091 131.65 132.11 132.46 132.793 133.135 133.392 133.628 133.851 134.011 134.157 134.282 134.39 134.477 134.525 134.564 134.591 134.602 134.588 134.562 134.498 134.424 134.332 134.277 133.856 134.025 133.918 133.812 133.608 133.467 133.254 132.962 132.637 132.28 131.614 127.067 -7 ,31819 ,KEBNE ,16693149,Fri Nov 26 01:19:05 CET,Fri Nov 26 02:53:01 CET,0.0 2.224 2.777 3.196 3.596 3.982 4.328 4.659 5.272 5.552 5.83 5.892 6.655 6.918 7.417 7.911 8.406 8.637 9.091 9.539 10.184 10.611 11.037 11.669 12.292 12.911 13.524 14.127 14.909 15.68 16.449 17.4 18.326 19.238 20.337 21.602 22.848 24.276 25.86 27.564 29.425 31.603 34.282 37.062 40.417 44.396 49.185 54.89 62.08 71.301 83.858 95.871 103.958 109.836 114.225 117.657 120.323 122.517 124.251 125.81 126.995 127.979 128.866 129.6 130.202 130.731 131.25 131.652 131.962 132.268 132.586 132.832 133.036 133.213 133.34 133.458 133.562 133.66 133.763 133.827 133.867 133.899 133.914 133.881 133.853 133.819 133.77 133.701 133.665 133.264 133.452 133.357 133.254 132.992 132.826 132.624 132.37 132.063 131.613 130.879 125.17 -8 ,18798 ,KEBNE ,16693150,Fri Nov 26 01:19:05 CET,Fri Nov 26 02:53:57 CET,0.0 2.085 2.618 3.058 3.461 3.808 4.136 4.446 5.006 5.276 5.546 5.564 6.314 6.569 7.069 7.54 7.979 8.203 8.656 9.106 9.778 10.228 10.672 11.305 11.918 12.53 13.134 13.727 14.505 15.265 16.026 16.989 17.935 18.86 19.96 21.218 22.453 23.841 25.394 27.134 29.027 31.216 33.873 36.645 40.022 43.943 48.709 54.466 61.642 70.92 83.645 95.747 103.932 109.829 114.199 117.667 120.363 122.507 124.174 125.743 127.005 128.025 128.939 129.728 130.387 130.951 131.511 131.978 132.335 132.679 133.033 133.291 133.531 133.758 133.908 134.036 134.14 134.229 134.309 134.343 134.349 134.334 134.298 134.247 134.216 134.158 134.085 133.969 133.897 133.48 133.673 133.56 133.444 133.187 133.018 132.833 132.606 132.247 131.702 130.929 126.636 -9 ,26312 ,KEBNE ,16693151,Fri Nov 26 01:20:07 CET,Fri Nov 26 02:57:56 CET,0.0 2.34 3.052 3.615 4.072 4.487 4.864 5.227 5.869 6.155 6.449 6.548 7.326 7.594 8.092 8.562 9.026 9.256 9.702 10.143 10.803 11.242 11.674 12.311 12.934 13.561 14.202 14.808 15.601 16.381 17.135 18.086 19.024 19.943 21.021 22.278 23.531 24.951 26.528 28.241 30.104 32.294 34.937 37.705 41.077 44.998 49.775 55.505 62.692 71.978 84.584 96.52 104.5 110.258 114.604 118.046 120.762 122.969 124.687 126.238 127.467 128.476 129.377 130.166 130.817 131.356 131.884 132.331 132.686 133.012 133.311 133.542 133.768 133.985 134.123 134.233 134.328 134.382 134.416 134.434 134.434 134.436 134.445 134.455 134.446 134.4 134.325 134.232 134.181 133.77 133.956 133.856 133.738 133.432 133.252 133.029 132.753 132.403 131.956 131.251 125.688 -10 ,4252 ,KEBNE ,16693152,Fri Nov 26 01:20:07 CET,Fri Nov 26 02:58:25 CET,0.0 2.574 3.159 3.606 3.997 4.366 4.695 4.985 5.515 5.773 6.04 6.098 6.847 7.087 7.58 8.07 8.558 8.79 9.231 9.673 10.315 10.733 11.155 11.789 12.415 13.049 13.68 14.28 15.058 15.832 16.6 17.543 18.471 19.392 20.486 21.748 22.992 24.389 25.932 27.626 29.484 31.655 34.299 37.062 40.399 44.307 49.061 54.807 62.111 71.486 84.162 96.129 104.148 109.958 114.33 117.79 120.489 122.672 124.392 125.971 127.198 128.186 129.031 129.751 130.376 130.897 131.423 131.89 132.25 132.594 132.921 133.165 133.395 133.607 133.746 133.866 133.98 134.086 134.186 134.249 134.29 134.302 134.295 134.285 134.278 134.262 134.222 134.111 134.034 133.608 133.745 133.613 133.481 133.133 132.945 132.764 132.516 132.207 131.784 131.074 127.74 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt deleted file mode 100644 index 9471c3b5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-2aa.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28018 ,KEBNE ,16693153,Fri Nov 26 01:20:07 CET,Fri Nov 26 02:55:08 CET,0.0 1.3 1.782 2.176 2.502 2.796 3.051 3.277 3.703 3.925 4.145 4.162 4.735 4.913 5.255 5.577 5.895 6.052 6.353 6.677 7.168 7.451 7.719 8.125 8.515 8.91 9.304 9.678 10.166 10.646 11.12 11.685 12.235 12.778 13.428 14.194 14.931 15.721 16.592 17.539 18.536 19.691 21.083 22.526 24.202 26.102 28.402 31.033 34.169 37.973 42.765 46.877 49.298 50.786 51.674 52.256 52.671 52.996 53.238 53.409 53.471 53.466 53.443 53.397 53.319 53.239 53.114 52.999 52.913 52.801 52.681 52.572 52.416 52.226 52.092 51.96 51.805 51.617 51.409 51.257 51.11 50.889 50.712 50.502 50.396 50.183 49.951 49.73 49.612 49.148 49.211 49.052 48.867 48.433 48.216 47.987 47.694 47.328 46.847 46.15 42.884 -2 ,30994 ,KEBNE ,16693154,Fri Nov 26 01:20:07 CET,Fri Nov 26 02:55:22 CET,0.0 1.431 1.975 2.409 2.773 3.082 3.354 3.606 4.05 4.259 4.463 4.456 5.016 5.184 5.517 5.855 6.189 6.351 6.652 6.934 7.37 7.661 7.94 8.339 8.729 9.119 9.504 9.885 10.377 10.856 11.331 11.912 12.475 13.03 13.68 14.4 15.114 15.92 16.796 17.724 18.704 19.821 21.158 22.578 24.255 26.097 28.34 31.062 34.344 38.328 43.258 47.307 49.762 51.415 52.501 53.257 53.787 54.162 54.36 54.476 54.558 54.621 54.654 54.6 54.495 54.367 54.225 54.12 54.015 53.854 53.665 53.522 53.377 53.217 53.07 52.884 52.685 52.46 52.218 52.053 51.882 51.635 51.456 51.264 51.175 50.969 50.703 50.428 50.29 49.8 49.793 49.636 49.456 48.964 48.713 48.454 48.095 47.636 47.132 46.433 43.291 -3 ,20248 ,KEBNE ,16693155,Fri Nov 26 01:20:07 CET,Fri Nov 26 02:55:05 CET,0.0 1.578 2.137 2.589 2.976 3.303 3.583 3.836 4.315 4.551 4.779 4.839 5.426 5.619 5.99 6.337 6.695 6.875 7.216 7.541 8.001 8.297 8.583 8.993 9.392 9.794 10.186 10.563 11.051 11.533 12.015 12.596 13.159 13.718 14.373 15.111 15.818 16.603 17.484 18.454 19.487 20.647 22.053 23.515 25.257 27.309 29.706 32.432 35.647 39.512 44.381 48.512 50.95 52.435 53.384 54.031 54.431 54.692 54.849 54.933 54.965 54.97 54.95 54.902 54.831 54.763 54.684 54.605 54.526 54.419 54.287 54.15 53.988 53.816 53.688 53.528 53.336 53.144 52.935 52.8 52.648 52.38 52.212 52.032 51.936 51.733 51.48 51.174 51.003 50.492 50.468 50.269 50.043 49.553 49.293 49.001 48.637 48.209 47.691 47.017 44.661 -4 ,16048 ,KEBNE ,16693156,Fri Nov 26 01:20:07 CET,Fri Nov 26 02:55:27 CET,0.0 2.263 2.818 3.216 3.525 3.815 4.084 4.325 4.796 5.022 5.248 5.28 5.856 6.043 6.412 6.757 7.081 7.237 7.538 7.84 8.277 8.567 8.857 9.282 9.7 10.104 10.473 10.836 11.335 11.82 12.283 12.836 13.385 13.926 14.564 15.301 16.023 16.834 17.709 18.638 19.642 20.8 22.189 23.628 25.312 27.239 29.512 32.126 35.297 39.16 43.948 48.049 50.565 52.112 53.102 53.837 54.257 54.469 54.587 54.655 54.691 54.661 54.583 54.479 54.356 54.261 54.147 54.003 53.852 53.675 53.496 53.339 53.146 52.948 52.794 52.626 52.447 52.243 52.013 51.86 51.707 51.474 51.3 51.118 51.028 50.828 50.616 50.356 50.213 49.741 49.773 49.602 49.395 48.92 48.642 48.325 47.99 47.566 47.036 46.268 43.382 -5 ,24339 ,KEBNE ,16693157,Fri Nov 26 01:21:09 CET,Fri Nov 26 02:55:57 CET,0.0 1.512 2.037 2.415 2.734 3.025 3.283 3.525 3.993 4.199 4.386 4.359 4.914 5.077 5.401 5.716 6.015 6.16 6.443 6.72 7.119 7.379 7.652 8.071 8.469 8.876 9.281 9.652 10.134 10.617 11.097 11.698 12.279 12.827 13.477 14.245 14.989 15.799 16.676 17.621 18.624 19.764 21.139 22.61 24.343 26.312 28.661 31.326 34.569 38.532 43.38 47.513 50.118 51.86 52.932 53.651 54.152 54.47 54.66 54.749 54.787 54.804 54.762 54.691 54.602 54.47 54.333 54.214 54.087 53.97 53.836 53.685 53.518 53.325 53.165 53.007 52.862 52.694 52.482 52.336 52.187 51.936 51.749 51.553 51.454 51.235 50.981 50.678 50.518 50.025 50.051 49.883 49.705 49.307 49.066 48.779 48.402 47.983 47.507 46.786 43.982 -6 ,3615 ,KEBNE ,16693158,Fri Nov 26 01:21:10 CET,Fri Nov 26 03:00:00 CET,0.0 2.206 2.768 3.176 3.511 3.824 4.102 4.333 4.767 4.975 5.185 5.217 5.8 5.991 6.352 6.694 7.006 7.162 7.48 7.787 8.227 8.514 8.802 9.218 9.623 10.017 10.406 10.796 11.308 11.785 12.248 12.824 13.378 13.915 14.546 15.276 15.998 16.797 17.677 18.638 19.632 20.786 22.17 23.596 25.292 27.26 29.616 32.28 35.449 39.322 44.276 48.429 50.817 52.325 53.338 53.934 54.206 54.4 54.549 54.699 54.771 54.733 54.663 54.587 54.521 54.442 54.315 54.188 54.068 53.923 53.757 53.608 53.43 53.244 53.09 52.917 52.744 52.539 52.31 52.162 52.025 51.783 51.573 51.361 51.261 51.06 50.846 50.613 50.486 49.996 49.962 49.761 49.534 49.038 48.748 48.414 48.027 47.588 47.028 46.282 43.848 -7 ,17727 ,KEBNE ,16693159,Fri Nov 26 01:22:12 CET,Fri Nov 26 02:59:06 CET,0.0 1.507 1.97 2.339 2.651 2.952 3.215 3.444 3.859 4.065 4.263 4.257 4.829 5.015 5.368 5.678 5.982 6.137 6.447 6.746 7.186 7.469 7.753 8.191 8.61 9.016 9.405 9.779 10.258 10.738 11.201 11.734 12.271 12.808 13.436 14.16 14.865 15.667 16.549 17.479 18.493 19.668 21.04 22.473 24.216 26.185 28.486 31.199 34.518 38.607 43.822 48.178 50.638 52.116 53.09 53.774 54.242 54.562 54.762 54.9 54.972 54.984 54.934 54.873 54.772 54.66 54.545 54.414 54.28 54.119 53.944 53.788 53.619 53.437 53.299 53.158 52.995 52.8 52.598 52.445 52.278 52.034 51.87 51.695 51.605 51.414 51.187 50.911 50.767 50.305 50.373 50.215 50.054 49.667 49.424 49.164 48.855 48.475 48.016 47.387 44.689 -8 ,2835 ,KEBNE ,16693160,Fri Nov 26 01:21:09 CET,Fri Nov 26 02:56:50 CET,0.0 1.752 2.231 2.584 2.917 3.247 3.529 3.773 4.218 4.429 4.632 4.623 5.186 5.375 5.735 6.061 6.411 6.585 6.898 7.197 7.637 7.93 8.226 8.655 9.056 9.441 9.814 10.185 10.677 11.16 11.642 12.222 12.794 13.354 13.996 14.728 15.45 16.257 17.146 18.138 19.19 20.322 21.662 23.072 24.726 26.591 28.86 31.529 34.738 38.716 43.74 47.955 50.394 51.9 52.946 53.784 54.281 54.566 54.729 54.805 54.801 54.764 54.712 54.632 54.541 54.45 54.333 54.199 54.066 53.937 53.814 53.68 53.526 53.36 53.197 53.01 52.82 52.625 52.435 52.293 52.133 51.884 51.718 51.542 51.435 51.201 50.996 50.765 50.631 50.158 50.159 49.967 49.739 49.212 48.932 48.613 48.287 47.873 47.331 46.67 43.819 -9 ,9257 ,KEBNE ,16693161,Fri Nov 26 01:21:09 CET,Fri Nov 26 03:00:41 CET,0.0 1.706 2.224 2.595 2.908 3.205 3.47 3.712 4.155 4.352 4.532 4.491 5.042 5.208 5.528 5.832 6.134 6.28 6.563 6.845 7.261 7.537 7.824 8.26 8.685 9.079 9.448 9.829 10.348 10.851 11.315 11.871 12.433 12.981 13.616 14.359 15.094 15.916 16.817 17.747 18.729 19.912 21.321 22.742 24.468 26.434 28.76 31.516 34.739 38.771 44.06 48.534 51.278 52.912 53.9 54.541 54.983 55.289 55.402 55.457 55.509 55.524 55.509 55.434 55.342 55.258 55.126 55.011 54.899 54.75 54.6 54.466 54.31 54.135 53.999 53.845 53.666 53.476 53.275 53.137 52.994 52.749 52.551 52.323 52.207 51.964 51.689 51.378 51.222 50.729 50.708 50.512 50.305 49.832 49.542 49.253 48.956 48.595 48.047 47.319 44.99 -10 ,30417 ,KEBNE ,16693162,Fri Nov 26 01:21:09 CET,Fri Nov 26 02:55:38 CET,0.0 1.357 1.814 2.176 2.476 2.748 2.998 3.227 3.659 3.858 4.044 4.014 4.575 4.747 5.078 5.405 5.711 5.86 6.157 6.441 6.85 7.117 7.375 7.767 8.162 8.545 8.923 9.298 9.787 10.259 10.721 11.287 11.835 12.356 12.978 13.699 14.402 15.209 16.091 17.035 18.028 19.14 20.478 21.874 23.562 25.534 27.96 30.772 34.024 37.951 42.894 47.233 49.852 51.568 52.781 53.654 54.183 54.515 54.752 54.952 55.086 55.149 55.17 55.182 55.136 55.034 54.912 54.795 54.703 54.597 54.434 54.281 54.133 53.986 53.863 53.72 53.551 53.352 53.138 52.979 52.796 52.488 52.274 52.054 51.931 51.698 51.454 51.133 50.949 50.45 50.437 50.248 50.081 49.665 49.414 49.154 48.85 48.493 47.98 47.206 43.674 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 8ee702d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flw_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24693 ,KEBNE ,16693163,Fri Nov 26 01:22:12 CET,Fri Nov 26 03:01:47 CET,0.0 1.092 1.406 1.637 1.84 2.033 2.211 2.363 2.639 2.776 2.909 2.771 3.27 3.393 3.632 3.85 4.066 4.166 4.353 4.542 4.822 5.004 5.186 5.459 5.722 5.967 6.209 6.444 6.753 7.057 7.359 7.732 8.093 8.448 8.863 9.328 9.786 10.296 10.833 11.422 12.04 12.745 13.59 14.454 15.485 16.61 17.906 19.399 21.182 23.274 25.615 27.374 28.245 28.646 28.796 28.826 28.781 28.665 28.525 28.347 28.139 27.93 27.716 27.479 27.251 27.06 26.862 26.663 26.488 26.31 26.102 25.905 25.685 25.445 25.251 25.058 24.857 24.629 24.375 24.191 23.997 23.681 23.473 23.249 23.129 22.89 22.618 22.32 22.169 21.663 21.659 21.455 21.256 20.824 20.565 20.279 19.965 19.616 19.2 18.61 16.372 -2 ,19355 ,KEBNE ,16693164,Fri Nov 26 01:22:12 CET,Fri Nov 26 02:59:29 CET,0.0 1.527 1.846 2.098 2.331 2.521 2.686 2.844 3.139 3.273 3.398 3.252 3.762 3.889 4.134 4.373 4.61 4.727 4.963 5.183 5.481 5.67 5.85 6.113 6.379 6.642 6.897 7.141 7.454 7.77 8.092 8.472 8.829 9.167 9.561 10.037 10.507 11.002 11.533 12.112 12.724 13.424 14.271 15.132 16.1 17.211 18.514 19.962 21.714 23.73 25.94 27.514 28.283 28.715 28.908 28.953 28.943 28.865 28.744 28.561 28.339 28.126 27.911 27.697 27.475 27.244 27.009 26.796 26.603 26.397 26.183 26.003 25.798 25.573 25.394 25.193 24.973 24.755 24.525 24.363 24.188 23.895 23.666 23.422 23.306 23.06 22.794 22.495 22.341 21.843 21.864 21.672 21.48 21.043 20.803 20.552 20.235 19.873 19.453 18.797 15.907 -3 ,2953 ,KEBNE ,16693165,Fri Nov 26 01:23:18 CET,Fri Nov 26 02:55:18 CET,0.0 0.948 1.258 1.5 1.718 1.909 2.083 2.242 2.529 2.666 2.798 2.663 3.17 3.292 3.522 3.743 3.952 4.052 4.252 4.448 4.731 4.915 5.088 5.343 5.607 5.865 6.117 6.367 6.697 7.022 7.33 7.689 8.046 8.394 8.804 9.273 9.726 10.235 10.775 11.338 11.939 12.628 13.419 14.225 15.23 16.351 17.611 19.045 20.736 22.659 24.801 26.433 27.289 27.717 27.866 27.869 27.783 27.654 27.522 27.361 27.186 26.982 26.74 26.496 26.266 26.05 25.825 25.605 25.384 25.154 24.91 24.702 24.515 24.303 24.114 23.903 23.684 23.464 23.23 23.069 22.898 22.603 22.389 22.189 22.088 21.888 21.666 21.431 21.301 20.804 20.846 20.678 20.494 20.099 19.889 19.633 19.347 19.024 18.61 18.031 15.849 -4 ,6957 ,KEBNE ,16693166,Fri Nov 26 01:24:17 CET,Fri Nov 26 03:02:55 CET,0.0 1.141 1.458 1.689 1.882 2.065 2.246 2.408 2.694 2.829 2.959 2.823 3.332 3.449 3.681 3.906 4.111 4.208 4.401 4.588 4.866 5.057 5.24 5.505 5.772 6.03 6.282 6.535 6.863 7.171 7.465 7.824 8.181 8.529 8.921 9.361 9.793 10.292 10.857 11.451 12.079 12.804 13.649 14.489 15.475 16.614 17.95 19.477 21.332 23.425 25.769 27.594 28.448 28.86 29.105 29.15 29.046 28.924 28.801 28.64 28.455 28.26 28.063 27.876 27.683 27.469 27.227 26.989 26.766 26.532 26.282 26.072 25.859 25.649 25.483 25.297 25.094 24.876 24.63 24.445 24.261 23.977 23.773 23.554 23.44 23.214 22.988 22.733 22.581 22.06 22.035 21.841 21.652 21.262 21.04 20.78 20.509 20.18 19.739 19.128 16.571 -5 ,21882 ,KEBNE ,16693167,Fri Nov 26 01:24:17 CET,Fri Nov 26 03:00:51 CET,0.0 0.968 1.285 1.524 1.718 1.892 2.058 2.215 2.509 2.646 2.772 2.625 3.127 3.244 3.474 3.703 3.919 4.02 4.217 4.413 4.688 4.863 5.046 5.306 5.556 5.81 6.063 6.308 6.616 6.92 7.225 7.597 7.952 8.299 8.703 9.157 9.608 10.12 10.67 11.262 11.89 12.601 13.472 14.372 15.439 16.601 17.907 19.325 20.915 22.976 25.536 27.368 28.301 28.755 28.928 28.98 28.959 28.849 28.677 28.446 28.236 28.071 27.907 27.699 27.478 27.274 27.056 26.858 26.672 26.473 26.24 26.034 25.808 25.55 25.351 25.16 24.969 24.756 24.525 24.364 24.183 23.896 23.697 23.479 23.36 23.106 22.845 22.562 22.417 21.925 21.969 21.798 21.621 21.241 21.014 20.758 20.466 20.12 19.695 19.134 16.204 -6 ,8512 ,KEBNE ,16693168,Fri Nov 26 01:25:19 CET,Fri Nov 26 03:05:23 CET,0.0 1.264 1.61 1.862 2.072 2.265 2.44 2.599 2.884 3.025 3.159 3.02 3.528 3.647 3.873 4.087 4.299 4.404 4.61 4.814 5.118 5.304 5.48 5.745 6.012 6.273 6.539 6.798 7.108 7.411 7.712 8.078 8.431 8.778 9.183 9.643 10.107 10.613 11.131 11.699 12.318 13.028 13.871 14.738 15.779 16.918 18.236 19.728 21.406 23.312 25.469 27.058 27.789 28.12 28.27 28.281 28.198 28.037 27.841 27.644 27.476 27.28 27.06 26.855 26.648 26.449 26.23 26.032 25.831 25.588 25.333 25.114 24.901 24.691 24.52 24.339 24.14 23.916 23.671 23.506 23.346 23.048 22.823 22.604 22.482 22.231 21.94 21.635 21.497 21.009 21.052 20.873 20.689 20.315 20.097 19.844 19.573 19.264 18.889 18.355 15.661 -7 ,31442 ,KEBNE ,16693169,Fri Nov 26 01:25:19 CET,Fri Nov 26 03:04:30 CET,0.0 0.833 1.154 1.405 1.615 1.799 1.969 2.131 2.427 2.565 2.691 2.554 3.057 3.168 3.39 3.602 3.802 3.899 4.09 4.282 4.563 4.746 4.921 5.186 5.457 5.717 5.965 6.209 6.531 6.833 7.135 7.517 7.874 8.221 8.633 9.098 9.55 10.059 10.613 11.19 11.789 12.485 13.332 14.183 15.19 16.341 17.669 19.163 20.872 22.893 25.341 27.184 27.989 28.369 28.55 28.576 28.512 28.344 28.146 27.917 27.673 27.411 27.155 26.917 26.701 26.49 26.227 25.984 25.771 25.538 25.279 25.063 24.863 24.663 24.502 24.325 24.138 23.943 23.747 23.606 23.45 23.219 23.057 22.867 22.768 22.558 22.307 22.049 21.916 21.426 21.453 21.274 21.084 20.67 20.44 20.161 19.834 19.454 19.003 18.328 15.66 -8 ,32754 ,KEBNE ,16693170,Fri Nov 26 01:25:19 CET,Fri Nov 26 03:05:09 CET,0.0 1.161 1.527 1.778 2.0 2.195 2.362 2.522 2.84 2.985 3.115 2.981 3.484 3.598 3.814 4.028 4.244 4.344 4.536 4.733 5.016 5.193 5.363 5.623 5.875 6.118 6.366 6.621 6.954 7.266 7.568 7.93 8.277 8.632 9.044 9.49 9.933 10.435 10.977 11.552 12.175 12.886 13.727 14.579 15.573 16.73 18.051 19.45 21.123 23.193 25.718 27.644 28.58 29.027 29.211 29.222 29.116 28.982 28.837 28.629 28.426 28.222 27.983 27.749 27.515 27.29 27.049 26.821 26.606 26.382 26.161 25.967 25.75 25.505 25.325 25.156 24.975 24.772 24.56 24.424 24.282 24.05 23.886 23.713 23.611 23.39 23.17 22.918 22.78 22.288 22.35 22.193 22.019 21.598 21.342 21.051 20.746 20.41 19.945 19.316 16.872 -9 ,7725 ,KEBNE ,16693171,Fri Nov 26 01:26:21 CET,Fri Nov 26 03:01:13 CET,0.0 0.985 1.318 1.58 1.783 1.972 2.153 2.311 2.602 2.737 2.862 2.724 3.229 3.34 3.566 3.789 4.008 4.115 4.319 4.531 4.851 5.051 5.238 5.503 5.769 6.026 6.268 6.507 6.82 7.128 7.432 7.809 8.183 8.538 8.938 9.379 9.818 10.318 10.876 11.481 12.103 12.813 13.666 14.515 15.487 16.594 17.902 19.423 21.186 23.174 25.352 26.828 27.598 28.008 28.183 28.201 28.095 27.94 27.772 27.547 27.336 27.122 26.882 26.643 26.412 26.18 25.913 25.667 25.446 25.194 24.918 24.704 24.483 24.247 24.054 23.852 23.64 23.406 23.16 22.989 22.806 22.485 22.269 22.063 21.947 21.681 21.395 21.101 20.952 20.443 20.432 20.243 20.05 19.631 19.414 19.175 18.914 18.614 18.196 17.641 15.413 -10 ,4566 ,KEBNE ,16693172,Fri Nov 26 01:26:21 CET,Fri Nov 26 03:00:47 CET,0.0 1.427 1.824 2.169 2.481 2.733 2.948 3.141 3.502 3.666 3.815 3.706 4.223 4.359 4.608 4.852 5.104 5.222 5.44 5.645 5.937 6.127 6.314 6.593 6.861 7.114 7.361 7.611 7.938 8.243 8.531 8.892 9.256 9.619 10.032 10.476 10.911 11.408 11.947 12.525 13.138 13.821 14.656 15.544 16.55 17.679 19.041 20.596 22.452 24.631 27.127 29.037 29.939 30.372 30.588 30.662 30.596 30.47 30.37 30.225 30.024 29.785 29.572 29.368 29.146 28.948 28.733 28.523 28.325 28.117 27.898 27.709 27.503 27.279 27.096 26.894 26.695 26.504 26.298 26.141 25.974 25.729 25.561 25.365 25.253 25.008 24.752 24.461 24.295 23.78 23.802 23.644 23.471 23.044 22.807 22.554 22.249 21.912 21.504 20.908 18.808 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt deleted file mode 100644 index 75aaf6b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fly_p38a-2v.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29352 ,KEBNE ,16693173,Fri Nov 26 01:26:25 CET,Fri Nov 26 02:55:06 CET,0.0 1.5 1.804 2.034 2.222 2.391 2.547 2.7 2.972 3.089 3.2 3.057 3.502 3.593 3.775 3.946 4.106 4.186 4.341 4.495 4.72 4.866 5.016 5.238 5.457 5.674 5.874 6.06 6.3 6.536 6.761 7.035 7.311 7.586 7.902 8.247 8.573 8.942 9.358 9.793 10.25 10.779 11.39 12.004 12.722 13.53 14.476 15.579 16.905 18.455 20.286 21.758 22.509 22.933 23.201 23.363 23.413 23.387 23.352 23.27 23.158 23.039 22.904 22.785 22.664 22.537 22.401 22.269 22.147 22.003 21.845 21.706 21.544 21.374 21.247 21.117 20.985 20.832 20.656 20.532 20.399 20.21 20.087 19.944 19.863 19.701 19.523 19.329 19.231 18.783 18.858 18.727 18.582 18.237 18.05 17.84 17.573 17.215 16.809 16.221 14.139 -2 ,13341 ,KEBNE ,16693174,Fri Nov 26 01:27:24 CET,Fri Nov 26 03:00:45 CET,0.0 0.994 1.284 1.494 1.674 1.844 1.993 2.126 2.368 2.476 2.58 2.435 2.882 2.971 3.153 3.332 3.504 3.586 3.748 3.897 4.104 4.244 4.379 4.574 4.769 4.952 5.128 5.31 5.547 5.772 5.99 6.259 6.527 6.788 7.085 7.434 7.776 8.14 8.534 8.957 9.406 9.929 10.539 11.135 11.851 12.679 13.639 14.764 16.1 17.656 19.5 20.975 21.801 22.214 22.389 22.49 22.541 22.533 22.468 22.385 22.312 22.229 22.111 21.968 21.83 21.713 21.59 21.453 21.317 21.179 21.047 20.929 20.792 20.638 20.513 20.368 20.208 20.049 19.868 19.739 19.607 19.397 19.237 19.063 18.974 18.79 18.605 18.402 18.287 17.832 17.922 17.777 17.614 17.279 17.088 16.86 16.602 16.323 15.972 15.459 13.304 -3 ,26221 ,KEBNE ,16693175,Fri Nov 26 01:27:24 CET,Fri Nov 26 03:04:34 CET,0.0 0.945 1.242 1.457 1.635 1.793 1.939 2.082 2.333 2.44 2.546 2.405 2.861 2.959 3.138 3.301 3.456 3.534 3.697 3.861 4.109 4.267 4.416 4.625 4.831 5.036 5.233 5.427 5.68 5.923 6.158 6.433 6.693 6.951 7.249 7.592 7.931 8.299 8.695 9.119 9.567 10.069 10.682 11.321 12.063 12.887 13.821 14.886 16.178 17.757 19.642 21.14 22.019 22.528 22.81 22.974 23.021 23.015 22.987 22.918 22.848 22.762 22.646 22.522 22.394 22.255 22.107 21.939 21.787 21.647 21.491 21.351 21.177 21.001 20.877 20.75 20.625 20.495 20.358 20.259 20.14 19.947 19.809 19.656 19.576 19.404 19.217 19.002 18.879 18.423 18.526 18.402 18.25 17.899 17.701 17.459 17.175 16.873 16.495 15.907 14.236 -4 ,11034 ,KEBNE ,16693176,Fri Nov 26 01:27:24 CET,Fri Nov 26 03:04:51 CET,0.0 1.168 1.477 1.718 1.916 2.078 2.229 2.377 2.635 2.751 2.864 2.729 3.18 3.278 3.459 3.629 3.799 3.878 4.024 4.168 4.388 4.534 4.678 4.895 5.1 5.3 5.493 5.676 5.913 6.15 6.38 6.658 6.927 7.188 7.49 7.833 8.173 8.533 8.93 9.371 9.824 10.333 10.946 11.553 12.272 13.088 14.051 15.163 16.496 18.067 19.938 21.391 22.136 22.601 22.857 22.947 22.949 22.886 22.809 22.7 22.584 22.474 22.355 22.218 22.055 21.897 21.723 21.563 21.434 21.298 21.143 21.013 20.865 20.693 20.556 20.421 20.282 20.125 19.956 19.834 19.703 19.507 19.372 19.216 19.135 18.949 18.737 18.52 18.395 17.925 17.934 17.77 17.606 17.217 16.97 16.688 16.372 16.006 15.583 14.999 13.101 -5 ,19929 ,KEBNE ,16693177,Fri Nov 26 01:27:24 CET,Fri Nov 26 03:06:09 CET,0.0 1.08 1.374 1.59 1.766 1.917 2.058 2.188 2.429 2.55 2.664 2.518 2.971 3.068 3.256 3.438 3.611 3.693 3.844 3.993 4.214 4.357 4.497 4.685 4.859 5.044 5.227 5.4 5.625 5.853 6.076 6.347 6.606 6.863 7.178 7.522 7.858 8.231 8.631 9.063 9.509 10.013 10.613 11.22 11.937 12.767 13.749 14.853 16.157 17.738 19.664 21.193 22.024 22.516 22.788 22.907 22.962 22.99 22.966 22.896 22.801 22.68 22.562 22.445 22.309 22.175 22.032 21.893 21.765 21.614 21.456 21.331 21.193 21.034 20.902 20.77 20.623 20.453 20.258 20.126 20.003 19.788 19.636 19.478 19.393 19.222 19.022 18.798 18.682 18.225 18.273 18.11 17.937 17.551 17.332 17.111 16.869 16.577 16.238 15.772 13.689 -6 ,19210 ,KEBNE ,16693178,Fri Nov 26 01:28:30 CET,Fri Nov 26 02:57:51 CET,0.0 1.104 1.404 1.626 1.824 1.992 2.145 2.288 2.558 2.677 2.788 2.662 3.122 3.227 3.422 3.605 3.786 3.871 4.026 4.176 4.392 4.532 4.673 4.87 5.047 5.218 5.391 5.563 5.784 5.999 6.211 6.466 6.72 6.982 7.29 7.636 7.979 8.349 8.747 9.179 9.637 10.179 10.802 11.407 12.129 12.961 13.913 14.984 16.279 17.807 19.66 21.141 21.916 22.389 22.665 22.807 22.844 22.819 22.79 22.716 22.601 22.487 22.37 22.247 22.113 21.981 21.833 21.686 21.553 21.432 21.32 21.215 21.098 20.958 20.835 20.708 20.574 20.42 20.244 20.129 20.01 19.812 19.67 19.5 19.411 19.242 19.052 18.847 18.75 18.323 18.435 18.311 18.175 17.826 17.601 17.362 17.106 16.805 16.431 15.925 14.401 -7 ,30972 ,KEBNE ,16693179,Fri Nov 26 01:29:29 CET,Fri Nov 26 03:02:44 CET,0.0 1.22 1.519 1.743 1.933 2.098 2.248 2.388 2.658 2.778 2.886 2.732 3.178 3.272 3.461 3.636 3.794 3.875 4.032 4.181 4.387 4.521 4.657 4.855 5.048 5.236 5.415 5.589 5.813 6.026 6.231 6.49 6.748 6.996 7.294 7.644 7.985 8.349 8.736 9.16 9.61 10.114 10.729 11.355 12.073 12.888 13.821 14.882 16.195 17.795 19.699 21.214 22.042 22.549 22.825 22.946 23.0 22.998 22.959 22.897 22.808 22.712 22.601 22.482 22.383 22.262 22.104 21.975 21.852 21.709 21.56 21.432 21.28 21.112 20.983 20.839 20.682 20.518 20.36 20.248 20.113 19.907 19.761 19.601 19.509 19.303 19.096 18.878 18.75 18.289 18.38 18.246 18.102 17.782 17.604 17.386 17.129 16.852 16.488 15.977 14.066 -8 ,21298 ,KEBNE ,16693180,Fri Nov 26 01:30:31 CET,Fri Nov 26 03:03:52 CET,0.0 1.482 1.78 1.995 2.178 2.344 2.501 2.646 2.91 3.024 3.132 2.994 3.442 3.532 3.707 3.878 4.045 4.125 4.278 4.423 4.631 4.769 4.91 5.109 5.294 5.478 5.663 5.85 6.087 6.314 6.54 6.82 7.092 7.357 7.666 8.014 8.342 8.7 9.093 9.512 9.951 10.471 11.112 11.75 12.493 13.333 14.302 15.396 16.69 18.26 20.213 21.811 22.657 23.135 23.414 23.565 23.625 23.639 23.608 23.535 23.462 23.364 23.247 23.111 22.966 22.839 22.698 22.57 22.446 22.306 22.178 22.049 21.897 21.76 21.64 21.487 21.31 21.122 20.945 20.829 20.704 20.49 20.328 20.148 20.061 19.891 19.688 19.434 19.305 18.849 18.904 18.752 18.603 18.263 18.062 17.837 17.562 17.246 16.882 16.327 14.618 -9 ,32182 ,KEBNE ,16693181,Fri Nov 26 01:30:32 CET,Fri Nov 26 03:03:03 CET,0.0 1.055 1.39 1.619 1.8 1.965 2.117 2.258 2.518 2.64 2.759 2.617 3.072 3.174 3.368 3.552 3.725 3.809 3.964 4.109 4.317 4.451 4.59 4.803 5.0 5.182 5.357 5.529 5.749 5.962 6.175 6.445 6.714 6.979 7.291 7.642 7.979 8.354 8.766 9.198 9.652 10.172 10.774 11.385 12.111 12.948 13.902 15.006 16.335 17.914 19.84 21.33 22.165 22.681 22.977 23.133 23.164 23.149 23.114 23.047 22.951 22.841 22.722 22.579 22.438 22.322 22.203 22.088 21.966 21.801 21.626 21.491 21.351 21.202 21.072 20.934 20.794 20.642 20.486 20.378 20.266 20.06 19.897 19.723 19.629 19.433 19.217 18.972 18.851 18.396 18.457 18.29 18.111 17.797 17.607 17.36 17.075 16.741 16.321 15.742 13.832 -10 ,12182 ,KEBNE ,16693182,Fri Nov 26 01:30:31 CET,Fri Nov 26 03:05:27 CET,0.0 1.179 1.478 1.705 1.889 2.045 2.191 2.329 2.587 2.706 2.819 2.684 3.136 3.231 3.405 3.572 3.739 3.828 4.004 4.172 4.422 4.583 4.733 4.946 5.16 5.367 5.57 5.763 6.002 6.237 6.463 6.73 6.987 7.249 7.56 7.903 8.243 8.62 9.019 9.451 9.906 10.427 11.047 11.645 12.339 13.142 14.091 15.179 16.497 18.053 19.903 21.424 22.243 22.693 22.953 23.083 23.117 23.056 22.988 22.918 22.82 22.713 22.601 22.476 22.352 22.21 22.035 21.886 21.751 21.61 21.473 21.342 21.192 21.044 20.92 20.766 20.596 20.426 20.253 20.128 19.999 19.801 19.652 19.492 19.411 19.243 19.066 18.865 18.752 18.31 18.416 18.286 18.135 17.81 17.634 17.427 17.201 16.899 16.5 15.979 14.199 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt deleted file mode 100644 index 45612a69..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3flz_p38a-2c.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10173 ,KEBNE ,16693183,Fri Nov 26 01:31:34 CET,Fri Nov 26 03:06:46 CET,0.0 1.8 2.392 2.859 3.253 3.608 3.926 4.194 4.651 4.848 5.04 5.022 5.529 5.672 5.942 6.174 6.389 6.485 6.669 6.857 7.115 7.266 7.409 7.599 7.79 7.975 8.132 8.28 8.471 8.649 8.799 8.961 9.109 9.242 9.382 9.521 9.637 9.742 9.833 9.922 10.021 10.106 10.184 10.214 10.184 10.103 9.893 9.498 8.82 7.649 5.593 3.15 1.168 -0.459 -1.821 -3.035 -4.08 -5.01 -5.791 -6.576 -7.268 -7.871 -8.424 -8.935 -9.429 -9.883 -10.336 -10.742 -11.1 -11.473 -11.853 -12.168 -12.499 -12.845 -13.114 -13.385 -13.661 -13.944 -14.24 -14.428 -14.63 -14.965 -15.182 -15.391 -15.504 -15.756 -16.022 -16.3 -16.441 -16.971 -16.917 -17.093 -17.278 -17.674 -17.881 -18.112 -18.365 -18.641 -18.993 -19.517 -25.367 -4 ,22978 ,KEBNE ,16693186,Fri Nov 26 01:31:34 CET,Fri Nov 26 03:09:00 CET,0.0 1.895 2.589 3.055 3.417 3.747 4.038 4.3 4.767 4.959 5.132 5.088 5.582 5.709 5.969 6.235 6.483 6.596 6.807 6.995 7.233 7.378 7.517 7.726 7.931 8.111 8.261 8.4 8.578 8.752 8.914 9.076 9.212 9.334 9.465 9.6 9.706 9.807 9.911 10.008 10.073 10.111 10.117 10.062 9.979 9.844 9.631 9.258 8.547 7.396 5.445 3.095 1.112 -0.585 -1.996 -3.229 -4.297 -5.223 -6.02 -6.855 -7.56 -8.165 -8.734 -9.251 -9.733 -10.174 -10.618 -11.005 -11.352 -11.708 -12.054 -12.354 -12.674 -13.002 -13.263 -13.53 -13.805 -14.092 -14.393 -14.594 -14.802 -15.134 -15.375 -15.617 -15.733 -15.987 -16.278 -16.577 -16.728 -17.26 -17.188 -17.36 -17.546 -17.937 -18.151 -18.393 -18.69 -19.025 -19.423 -20.005 -31.633 -5 ,24474 ,KEBNE ,16693187,Fri Nov 26 01:31:34 CET,Fri Nov 26 03:08:46 CET,0.0 1.714 2.426 2.959 3.366 3.687 3.96 4.187 4.604 4.785 4.958 4.943 5.465 5.603 5.86 6.114 6.322 6.419 6.593 6.751 7.008 7.171 7.303 7.484 7.645 7.806 7.963 8.109 8.284 8.437 8.585 8.754 8.896 9.024 9.159 9.306 9.454 9.607 9.749 9.857 9.924 9.978 10.018 9.996 9.921 9.778 9.52 9.093 8.395 7.206 5.171 2.744 0.673 -1.05 -2.485 -3.743 -4.798 -5.748 -6.57 -7.357 -8.03 -8.633 -9.197 -9.715 -10.192 -10.628 -11.072 -11.465 -11.803 -12.16 -12.521 -12.82 -13.133 -13.455 -13.715 -13.978 -14.237 -14.514 -14.805 -15.003 -15.203 -15.519 -15.744 -15.975 -16.095 -16.352 -16.618 -16.885 -17.029 -17.554 -17.463 -17.643 -17.854 -18.273 -18.487 -18.72 -18.991 -19.35 -19.828 -20.484 -24.808 -6 ,27479 ,KEBNE ,16693188,Fri Nov 26 01:32:36 CET,Fri Nov 26 03:07:39 CET,0.0 1.838 2.53 3.031 3.442 3.794 4.097 4.348 4.77 4.964 5.156 5.13 5.633 5.789 6.074 6.296 6.498 6.599 6.792 6.961 7.187 7.322 7.447 7.629 7.834 8.021 8.151 8.277 8.447 8.609 8.763 8.913 9.038 9.155 9.279 9.413 9.539 9.668 9.771 9.875 9.948 9.986 10.008 10.006 9.977 9.881 9.674 9.298 8.632 7.555 5.61 3.185 1.231 -0.436 -1.829 -3.042 -4.096 -5.035 -5.825 -6.602 -7.267 -7.859 -8.429 -8.952 -9.432 -9.866 -10.317 -10.724 -11.08 -11.443 -11.801 -12.094 -12.412 -12.754 -13.013 -13.275 -13.543 -13.817 -14.099 -14.292 -14.485 -14.784 -14.989 -15.2 -15.308 -15.546 -15.807 -16.067 -16.212 -16.745 -16.661 -16.827 -17.018 -17.438 -17.661 -17.89 -18.147 -18.46 -18.84 -19.382 -22.62 -7 ,26630 ,KEBNE ,16693189,Fri Nov 26 01:32:36 CET,Fri Nov 26 03:09:21 CET,0.0 1.992 2.649 3.113 3.501 3.839 4.139 4.391 4.812 5.013 5.192 5.127 5.624 5.769 6.031 6.254 6.434 6.519 6.7 6.873 7.121 7.272 7.42 7.612 7.778 7.941 8.093 8.232 8.412 8.588 8.743 8.906 9.062 9.216 9.379 9.563 9.701 9.819 9.942 10.044 10.129 10.206 10.259 10.262 10.201 10.096 9.875 9.466 8.814 7.661 5.69 3.312 1.297 -0.37 -1.763 -3.006 -4.1 -5.074 -5.867 -6.654 -7.34 -7.928 -8.475 -8.986 -9.448 -9.883 -10.362 -10.782 -11.126 -11.471 -11.837 -12.129 -12.422 -12.74 -12.997 -13.263 -13.527 -13.8 -14.084 -14.279 -14.484 -14.813 -15.033 -15.249 -15.365 -15.606 -15.849 -16.118 -16.261 -16.787 -16.727 -16.896 -17.069 -17.451 -17.663 -17.896 -18.179 -18.503 -18.862 -19.377 -22.374 -8 ,19496 ,KEBNE ,16693190,Fri Nov 26 01:32:36 CET,Fri Nov 26 03:09:45 CET,0.0 2.476 3.095 3.593 3.989 4.314 4.604 4.854 5.269 5.462 5.65 5.646 6.162 6.293 6.523 6.769 7.001 7.114 7.325 7.493 7.738 7.892 8.023 8.203 8.387 8.56 8.718 8.861 9.047 9.229 9.387 9.574 9.73 9.862 10.006 10.145 10.262 10.367 10.459 10.552 10.612 10.63 10.634 10.623 10.579 10.462 10.194 9.791 9.162 8.04 6.082 3.701 1.725 0.073 -1.327 -2.563 -3.64 -4.59 -5.367 -6.129 -6.772 -7.342 -7.895 -8.4 -8.854 -9.283 -9.739 -10.127 -10.468 -10.841 -11.214 -11.528 -11.85 -12.181 -12.443 -12.711 -12.981 -13.258 -13.558 -13.769 -13.977 -14.283 -14.501 -14.735 -14.854 -15.088 -15.337 -15.605 -15.741 -16.262 -16.17 -16.33 -16.509 -16.889 -17.099 -17.35 -17.626 -17.948 -18.346 -18.879 -22.533 -9 ,30589 ,KEBNE ,16693191,Fri Nov 26 01:32:36 CET,Fri Nov 26 03:10:52 CET,0.0 2.793 3.607 4.153 4.582 4.949 5.269 5.549 6.018 6.195 6.348 6.288 6.783 6.902 7.134 7.358 7.557 7.641 7.8 7.958 8.198 8.349 8.508 8.731 8.908 9.075 9.223 9.359 9.536 9.709 9.873 10.048 10.2 10.346 10.503 10.64 10.756 10.9 11.033 11.162 11.255 11.317 11.383 11.401 11.368 11.23 10.975 10.567 9.864 8.751 6.814 4.383 2.424 0.804 -0.607 -1.864 -2.93 -3.885 -4.7 -5.491 -6.165 -6.764 -7.326 -7.835 -8.313 -8.76 -9.216 -9.602 -9.938 -10.295 -10.673 -10.985 -11.303 -11.639 -11.9 -12.158 -12.428 -12.719 -13.017 -13.219 -13.425 -13.749 -13.965 -14.194 -14.319 -14.581 -14.845 -15.116 -15.258 -15.787 -15.755 -15.946 -16.144 -16.533 -16.744 -16.993 -17.274 -17.587 -17.991 -18.579 -21.969 -10 ,243 ,KEBNE ,16693192,Fri Nov 26 01:33:39 CET,Fri Nov 26 03:14:58 CET,0.0 1.587 2.187 2.663 3.06 3.401 3.691 3.947 4.371 4.553 4.718 4.662 5.164 5.299 5.55 5.808 6.04 6.133 6.328 6.528 6.797 6.97 7.12 7.325 7.51 7.668 7.82 7.952 8.11 8.268 8.417 8.577 8.735 8.896 9.062 9.217 9.351 9.477 9.597 9.699 9.785 9.861 9.911 9.918 9.853 9.674 9.408 9.042 8.402 7.309 5.264 2.86 0.953 -0.687 -2.084 -3.326 -4.421 -5.377 -6.173 -6.968 -7.639 -8.223 -8.789 -9.315 -9.782 -10.211 -10.659 -11.053 -11.393 -11.746 -12.119 -12.433 -12.741 -13.061 -13.33 -13.605 -13.872 -14.154 -14.445 -14.636 -14.83 -15.133 -15.34 -15.553 -15.662 -15.893 -16.15 -16.41 -16.549 -17.079 -17.003 -17.174 -17.356 -17.739 -17.969 -18.244 -18.547 -18.891 -19.339 -19.931 -22.267 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt deleted file mode 100644 index 6ee0e932..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14970 ,KEBNE ,16693193,Fri Nov 26 01:33:43 CET,Fri Nov 26 03:01:29 CET,0.0 2.115 2.68 3.07 3.369 3.611 3.822 4.001 4.295 4.424 4.527 4.322 4.759 4.827 4.932 4.995 5.037 5.049 5.053 5.045 4.998 4.967 4.943 4.893 4.822 4.717 4.592 4.465 4.288 4.1 3.889 3.6 3.299 2.987 2.588 2.096 1.608 1.03 0.34 -0.47 -1.409 -2.541 -3.979 -5.58 -7.603 -10.064 -13.222 -17.232 -22.585 -29.956 -41.001 -52.752 -61.368 -68.058 -73.479 -78.016 -81.75 -84.961 -87.579 -90.11 -92.242 -94.061 -95.715 -97.24 -98.636 -99.854 -101.092 -102.173 -103.07 -103.999 -104.966 -105.746 -106.545 -107.353 -107.972 -108.616 -109.281 -109.96 -110.64 -111.093 -111.553 -112.27 -112.788 -113.339 -113.61 -114.148 -114.687 -115.226 -115.505 -116.293 -116.391 -116.716 -117.069 -117.767 -118.118 -118.506 -118.942 -119.399 -119.924 -120.646 -123.021 -2 ,6346 ,KEBNE ,16693194,Fri Nov 26 01:34:42 CET,Fri Nov 26 03:10:40 CET,0.0 3.96 4.555 4.933 5.195 5.412 5.607 5.788 6.095 6.232 6.371 6.227 6.654 6.699 6.793 6.882 6.946 6.958 6.954 6.959 6.932 6.89 6.843 6.753 6.671 6.575 6.466 6.359 6.212 6.037 5.823 5.542 5.261 4.962 4.586 4.137 3.651 3.044 2.328 1.518 0.608 -0.489 -1.9 -3.463 -5.418 -7.824 -10.936 -14.884 -20.207 -27.623 -38.657 -50.26 -58.853 -65.578 -70.979 -75.552 -79.326 -82.522 -85.156 -87.681 -89.762 -91.536 -93.173 -94.69 -96.067 -97.267 -98.446 -99.464 -100.341 -101.249 -102.183 -102.929 -103.681 -104.46 -105.057 -105.656 -106.277 -106.926 -107.574 -108.003 -108.446 -109.145 -109.616 -110.104 -110.359 -110.861 -111.374 -111.921 -112.2 -112.977 -113.05 -113.358 -113.699 -114.424 -114.82 -115.254 -115.724 -116.239 -116.894 -117.84 -121.713 -3 ,6139 ,KEBNE ,16693195,Fri Nov 26 01:34:42 CET,Fri Nov 26 03:11:39 CET,0.0 3.239 3.762 4.181 4.546 4.863 5.113 5.275 5.5 5.577 5.646 5.429 5.857 5.92 6.035 6.111 6.168 6.187 6.215 6.241 6.253 6.25 6.238 6.187 6.144 6.104 6.033 5.93 5.782 5.611 5.417 5.156 4.879 4.585 4.216 3.755 3.251 2.642 1.915 1.096 0.171 -0.934 -2.316 -3.864 -5.874 -8.338 -11.451 -15.44 -20.776 -28.071 -39.079 -50.805 -59.442 -66.164 -71.503 -75.996 -79.703 -82.86 -85.467 -87.998 -90.113 -91.918 -93.573 -95.119 -96.543 -97.782 -99.01 -100.081 -100.978 -101.885 -102.801 -103.557 -104.35 -105.145 -105.736 -106.341 -106.96 -107.588 -108.233 -108.664 -109.106 -109.827 -110.319 -110.787 -111.022 -111.516 -112.026 -112.554 -112.822 -113.584 -113.657 -113.957 -114.264 -114.92 -115.291 -115.693 -116.12 -116.58 -117.117 -117.853 -120.616 -4 ,22562 ,KEBNE ,16693196,Fri Nov 26 01:34:42 CET,Fri Nov 26 03:11:13 CET,0.0 5.174 5.807 6.096 6.348 6.579 6.751 6.882 7.081 7.169 7.264 7.04 7.445 7.474 7.515 7.528 7.533 7.535 7.539 7.521 7.465 7.421 7.359 7.258 7.155 7.037 6.905 6.758 6.558 6.367 6.16 5.876 5.601 5.354 5.05 4.628 4.169 3.646 3.027 2.303 1.462 0.382 -0.995 -2.493 -4.43 -6.845 -9.907 -13.817 -19.132 -26.543 -37.754 -49.651 -58.499 -65.535 -71.134 -75.774 -79.617 -82.918 -85.642 -88.224 -90.355 -92.19 -93.865 -95.393 -96.765 -97.988 -99.234 -100.312 -101.216 -102.151 -103.115 -103.881 -104.655 -105.455 -106.076 -106.712 -107.348 -107.993 -108.664 -109.107 -109.544 -110.243 -110.727 -111.224 -111.478 -111.979 -112.514 -113.074 -113.349 -114.116 -114.205 -114.506 -114.815 -115.488 -115.853 -116.234 -116.639 -117.087 -117.631 -118.32 -120.697 -5 ,28412 ,KEBNE ,16693197,Fri Nov 26 01:34:41 CET,Fri Nov 26 03:13:52 CET,0.0 3.285 4.013 4.46 4.772 4.967 5.118 5.252 5.507 5.614 5.7 5.466 5.899 5.964 6.061 6.141 6.189 6.2 6.202 6.192 6.166 6.132 6.095 6.041 5.953 5.83 5.705 5.576 5.397 5.197 4.987 4.729 4.444 4.143 3.755 3.257 2.754 2.155 1.431 0.63 -0.274 -1.362 -2.712 -4.258 -6.256 -8.703 -11.874 -15.886 -21.239 -28.638 -39.664 -51.319 -59.916 -66.596 -71.935 -76.418 -80.137 -83.323 -85.987 -88.542 -90.622 -92.388 -93.99 -95.504 -96.908 -98.157 -99.442 -100.556 -101.499 -102.464 -103.429 -104.194 -104.965 -105.766 -106.372 -106.983 -107.627 -108.286 -108.929 -109.371 -109.836 -110.539 -111.011 -111.498 -111.743 -112.244 -112.778 -113.332 -113.616 -114.414 -114.575 -114.898 -115.229 -115.951 -116.364 -116.813 -117.303 -117.866 -118.498 -119.28 -123.157 -6 ,15340 ,KEBNE ,16693198,Fri Nov 26 01:34:42 CET,Fri Nov 26 03:13:02 CET,0.0 3.941 4.623 5.03 5.362 5.642 5.856 6.014 6.256 6.372 6.476 6.263 6.682 6.728 6.818 6.902 6.957 6.966 6.951 6.932 6.895 6.846 6.813 6.79 6.731 6.636 6.519 6.394 6.202 6.004 5.825 5.604 5.335 5.019 4.634 4.201 3.722 3.138 2.485 1.734 0.833 -0.291 -1.688 -3.211 -5.171 -7.598 -10.694 -14.685 -20.063 -27.478 -38.37 -49.796 -58.289 -64.947 -70.238 -74.65 -78.349 -81.533 -84.137 -86.611 -88.65 -90.431 -92.103 -93.626 -94.993 -96.198 -97.413 -98.484 -99.398 -100.315 -101.244 -102.018 -102.807 -103.6 -104.207 -104.82 -105.449 -106.103 -106.785 -107.253 -107.716 -108.416 -108.899 -109.383 -109.632 -110.159 -110.726 -111.314 -111.61 -112.407 -112.524 -112.855 -113.215 -113.908 -114.276 -114.692 -115.159 -115.692 -116.367 -117.292 -121.73 -7 ,18101 ,KEBNE ,16693199,Fri Nov 26 01:35:44 CET,Fri Nov 26 03:12:58 CET,0.0 2.791 3.343 3.707 3.983 4.23 4.423 4.571 4.793 4.883 4.989 4.82 5.254 5.321 5.419 5.484 5.517 5.528 5.557 5.587 5.602 5.585 5.568 5.535 5.47 5.383 5.301 5.217 5.083 4.915 4.72 4.463 4.173 3.861 3.482 3.019 2.545 2.004 1.359 0.575 -0.321 -1.416 -2.802 -4.317 -6.237 -8.578 -11.674 -15.674 -20.947 -28.303 -39.384 -51.066 -59.776 -66.66 -72.231 -76.883 -80.69 -83.953 -86.705 -89.371 -91.502 -93.288 -94.971 -96.509 -97.905 -99.164 -100.439 -101.55 -102.472 -103.406 -104.369 -105.17 -105.964 -106.746 -107.367 -108.008 -108.641 -109.282 -109.933 -110.374 -110.821 -111.496 -111.971 -112.478 -112.736 -113.243 -113.757 -114.296 -114.584 -115.378 -115.493 -115.813 -116.152 -116.838 -117.209 -117.618 -118.086 -118.626 -119.268 -120.139 -123.244 -8 ,15572 ,KEBNE ,16693200,Fri Nov 26 01:36:46 CET,Fri Nov 26 03:12:40 CET,0.0 3.206 3.874 4.279 4.622 4.963 5.237 5.421 5.711 5.861 5.996 5.825 6.263 6.33 6.449 6.538 6.597 6.612 6.622 6.626 6.602 6.564 6.535 6.478 6.386 6.29 6.188 6.08 5.908 5.695 5.466 5.183 4.906 4.607 4.214 3.722 3.211 2.617 1.915 1.113 0.241 -0.815 -2.151 -3.689 -5.713 -8.117 -11.203 -15.189 -20.624 -28.167 -39.339 -51.087 -59.918 -66.871 -72.386 -77.032 -80.871 -84.165 -86.894 -89.51 -91.703 -93.604 -95.361 -96.975 -98.392 -99.636 -100.927 -102.051 -102.989 -103.929 -104.893 -105.683 -106.473 -107.282 -107.906 -108.54 -109.186 -109.833 -110.499 -110.945 -111.387 -112.089 -112.569 -113.061 -113.311 -113.822 -114.352 -114.904 -115.203 -115.995 -116.13 -116.465 -116.816 -117.561 -117.971 -118.404 -118.862 -119.405 -120.065 -120.944 -127.909 -9 ,11225 ,KEBNE ,16693201,Fri Nov 26 01:37:48 CET,Fri Nov 26 03:12:16 CET,0.0 7.721 8.327 8.731 9.031 9.247 9.433 9.587 9.803 9.902 9.994 9.77 10.204 10.285 10.409 10.487 10.547 10.565 10.579 10.585 10.602 10.603 10.589 10.536 10.464 10.369 10.268 10.18 10.04 9.862 9.671 9.414 9.141 8.859 8.503 8.074 7.617 7.072 6.446 5.742 4.915 3.856 2.514 1.066 -0.814 -3.136 -6.096 -9.972 -15.291 -22.616 -33.629 -45.444 -54.07 -60.735 -66.152 -70.792 -74.624 -77.951 -80.713 -83.356 -85.543 -87.417 -89.141 -90.692 -92.07 -93.275 -94.484 -95.543 -96.445 -97.384 -98.337 -99.089 -99.867 -100.657 -101.245 -101.847 -102.477 -103.127 -103.801 -104.254 -104.702 -105.396 -105.874 -106.36 -106.61 -107.131 -107.67 -108.231 -108.519 -109.302 -109.424 -109.744 -110.071 -110.766 -111.173 -111.645 -112.149 -112.689 -113.287 -114.154 -123.008 -10 ,23149 ,KEBNE ,16693202,Fri Nov 26 01:37:49 CET,Fri Nov 26 03:12:08 CET,0.0 3.987 4.614 5.024 5.266 5.47 5.647 5.779 5.978 6.054 6.139 5.929 6.33 6.355 6.417 6.457 6.469 6.466 6.46 6.45 6.413 6.369 6.313 6.247 6.176 6.101 6.013 5.91 5.755 5.589 5.406 5.126 4.826 4.503 4.1 3.65 3.166 2.598 1.945 1.15 0.241 -0.886 -2.334 -3.887 -5.872 -8.36 -11.539 -15.528 -20.852 -28.239 -39.393 -51.099 -59.646 -66.322 -71.604 -76.047 -79.755 -82.95 -85.598 -88.15 -90.257 -92.076 -93.737 -95.252 -96.613 -97.833 -99.122 -100.237 -101.163 -102.096 -103.034 -103.789 -104.56 -105.361 -105.98 -106.608 -107.235 -107.866 -108.514 -108.967 -109.434 -110.149 -110.653 -111.155 -111.41 -111.95 -112.475 -113.004 -113.29 -114.081 -114.195 -114.503 -114.814 -115.502 -115.868 -116.27 -116.736 -117.259 -117.851 -118.666 -121.612 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index dc066111..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3636 ,KEBNE ,16693203,Fri Nov 26 01:37:49 CET,Fri Nov 26 03:20:20 CET,0.0 1.023 1.324 1.559 1.757 1.938 2.104 2.247 2.516 2.645 2.77 2.642 3.119 3.221 3.411 3.59 3.77 3.858 4.023 4.179 4.405 4.553 4.698 4.903 5.1 5.291 5.477 5.661 5.895 6.117 6.335 6.588 6.831 7.081 7.377 7.723 8.061 8.418 8.79 9.208 9.657 10.153 10.742 11.331 11.977 12.663 13.463 14.339 15.35 16.565 17.896 18.725 18.902 18.81 18.639 18.419 18.155 17.851 17.567 17.272 16.997 16.719 16.453 16.204 15.966 15.742 15.461 15.199 14.993 14.78 14.537 14.314 14.071 13.826 13.648 13.458 13.261 13.063 12.849 12.707 12.559 12.298 12.107 11.908 11.807 11.58 11.355 11.118 10.985 10.489 10.483 10.306 10.117 9.659 9.402 9.118 8.792 8.416 7.917 7.21 4.238 -2 ,10283 ,KEBNE ,16693204,Fri Nov 26 01:38:51 CET,Fri Nov 26 03:13:49 CET,0.0 1.347 1.735 2.005 2.199 2.367 2.527 2.694 2.996 3.126 3.251 3.106 3.583 3.694 3.904 4.095 4.268 4.348 4.51 4.675 4.914 5.065 5.218 5.445 5.655 5.858 6.049 6.227 6.465 6.706 6.935 7.206 7.474 7.737 8.053 8.406 8.745 9.116 9.496 9.897 10.322 10.805 11.371 11.941 12.617 13.374 14.226 15.146 16.172 17.211 18.231 18.766 18.873 18.74 18.484 18.191 17.882 17.577 17.268 16.932 16.655 16.403 16.125 15.837 15.562 15.319 15.072 14.843 14.631 14.41 14.182 13.994 13.793 13.56 13.371 13.176 12.986 12.768 12.529 12.377 12.215 11.937 11.746 11.553 11.454 11.246 11.041 10.824 10.686 10.198 10.249 10.081 9.909 9.496 9.245 8.934 8.568 8.166 7.663 7.026 4.424 -3 ,17747 ,KEBNE ,16693205,Fri Nov 26 01:38:51 CET,Fri Nov 26 03:14:17 CET,0.0 0.987 1.307 1.537 1.738 1.932 2.108 2.269 2.569 2.711 2.84 2.69 3.16 3.262 3.458 3.64 3.817 3.904 4.072 4.236 4.473 4.625 4.778 5.01 5.231 5.431 5.624 5.813 6.047 6.267 6.491 6.767 7.031 7.283 7.566 7.885 8.197 8.551 8.932 9.336 9.769 10.26 10.814 11.355 11.994 12.7 13.499 14.393 15.389 16.51 17.699 18.291 18.379 18.255 18.069 17.83 17.586 17.333 17.083 16.803 16.538 16.305 16.081 15.848 15.61 15.377 15.126 14.905 14.707 14.489 14.265 14.078 13.874 13.656 13.478 13.287 13.088 12.86 12.61 12.439 12.251 11.967 11.766 11.552 11.452 11.232 10.979 10.713 10.582 10.095 10.158 10.002 9.823 9.399 9.163 8.884 8.562 8.213 7.768 7.099 4.633 -4 ,4872 ,KEBNE ,16693206,Fri Nov 26 01:38:51 CET,Fri Nov 26 03:13:48 CET,0.0 1.306 1.664 1.905 2.087 2.246 2.4 2.554 2.842 2.975 3.091 2.926 3.394 3.494 3.685 3.87 4.052 4.14 4.309 4.479 4.727 4.885 5.039 5.251 5.463 5.675 5.884 6.094 6.343 6.574 6.799 7.067 7.321 7.562 7.847 8.185 8.506 8.858 9.265 9.689 10.117 10.602 11.147 11.706 12.359 13.074 13.893 14.777 15.748 16.818 17.882 18.419 18.482 18.359 18.16 17.904 17.603 17.291 16.987 16.645 16.339 16.055 15.793 15.54 15.3 15.071 14.811 14.599 14.409 14.192 13.97 13.778 13.575 13.352 13.17 12.993 12.802 12.588 12.352 12.183 12.004 11.702 11.503 11.298 11.185 10.953 10.7 10.408 10.257 9.773 9.859 9.708 9.533 9.153 8.948 8.702 8.409 8.1 7.689 7.072 3.966 -5 ,32161 ,KEBNE ,16693207,Fri Nov 26 01:38:51 CET,Fri Nov 26 03:15:21 CET,0.0 1.384 1.732 1.993 2.195 2.385 2.553 2.702 2.969 3.101 3.23 3.101 3.58 3.691 3.899 4.096 4.279 4.37 4.552 4.726 4.987 5.147 5.293 5.503 5.71 5.91 6.103 6.296 6.536 6.769 7.001 7.276 7.543 7.807 8.106 8.448 8.789 9.134 9.492 9.897 10.324 10.794 11.35 11.888 12.523 13.242 14.082 15.006 16.013 17.107 18.194 18.857 19.071 19.057 18.913 18.713 18.493 18.234 17.972 17.7 17.447 17.205 16.972 16.737 16.501 16.278 16.024 15.786 15.593 15.397 15.169 14.961 14.741 14.516 14.322 14.104 13.885 13.668 13.456 13.31 13.144 12.864 12.678 12.501 12.409 12.208 11.992 11.756 11.62 11.125 11.197 11.045 10.868 10.454 10.215 9.972 9.713 9.409 8.987 8.378 4.539 -6 ,15632 ,KEBNE ,16693208,Fri Nov 26 01:40:56 CET,Fri Nov 26 03:17:32 CET,0.0 1.383 1.762 2.036 2.248 2.43 2.59 2.746 3.036 3.165 3.284 3.14 3.608 3.71 3.907 4.091 4.267 4.351 4.512 4.669 4.897 5.044 5.189 5.394 5.589 5.777 5.958 6.133 6.365 6.587 6.803 7.076 7.342 7.594 7.884 8.203 8.512 8.856 9.22 9.598 10.014 10.48 11.0 11.566 12.221 12.934 13.743 14.611 15.624 16.748 17.961 18.688 18.832 18.748 18.572 18.349 18.124 17.859 17.609 17.349 17.078 16.802 16.542 16.304 16.066 15.851 15.608 15.372 15.183 14.965 14.726 14.53 14.322 14.094 13.905 13.708 13.503 13.286 13.057 12.908 12.754 12.504 12.335 12.154 12.057 11.862 11.661 11.435 11.298 10.798 10.849 10.679 10.489 10.098 9.898 9.677 9.413 9.085 8.678 8.017 3.875 -7 ,2073 ,KEBNE ,16693209,Fri Nov 26 01:41:59 CET,Fri Nov 26 03:20:41 CET,0.0 1.373 1.746 2.03 2.242 2.433 2.601 2.749 3.047 3.191 3.311 3.156 3.632 3.736 3.932 4.112 4.286 4.372 4.534 4.694 4.93 5.083 5.228 5.439 5.667 5.886 6.084 6.27 6.52 6.766 6.997 7.28 7.561 7.83 8.144 8.504 8.83 9.185 9.57 9.978 10.412 10.918 11.517 12.084 12.753 13.505 14.323 15.184 16.145 17.224 18.27 18.762 18.913 18.893 18.68 18.407 18.148 17.855 17.552 17.222 16.933 16.664 16.383 16.117 15.871 15.634 15.364 15.111 14.889 14.641 14.383 14.181 13.971 13.732 13.53 13.324 13.115 12.887 12.627 12.443 12.268 12.011 11.833 11.645 11.554 11.379 11.153 10.893 10.768 10.292 10.355 10.189 10.009 9.611 9.387 9.135 8.837 8.497 8.077 7.445 -1.128 -8 ,10905 ,KEBNE ,16693210,Fri Nov 26 01:45:10 CET,Fri Nov 26 03:13:52 CET,0.0 1.116 1.532 1.766 1.979 2.176 2.349 2.5 2.762 2.882 2.996 2.853 3.335 3.448 3.66 3.86 4.058 4.156 4.345 4.544 4.848 5.019 5.175 5.407 5.623 5.824 6.021 6.211 6.447 6.677 6.903 7.177 7.444 7.698 7.988 8.327 8.648 8.989 9.384 9.807 10.218 10.705 11.308 11.885 12.534 13.253 14.091 15.041 16.122 17.322 18.541 19.299 19.551 19.513 19.342 19.113 18.85 18.574 18.322 18.066 17.821 17.574 17.318 17.06 16.812 16.59 16.361 16.137 15.943 15.741 15.519 15.326 15.123 14.901 14.721 14.541 14.346 14.136 13.903 13.732 13.564 13.307 13.117 12.928 12.832 12.604 12.355 12.068 11.913 11.393 11.37 11.186 10.984 10.54 10.279 9.998 9.705 9.364 8.879 8.171 4.663 -9 ,9554 ,KEBNE ,16693211,Fri Nov 26 01:46:12 CET,Fri Nov 26 03:17:44 CET,0.0 1.29 1.634 1.885 2.089 2.263 2.435 2.598 2.884 3.009 3.126 2.967 3.431 3.522 3.7 3.881 4.058 4.141 4.304 4.46 4.685 4.826 4.961 5.165 5.364 5.556 5.747 5.936 6.184 6.425 6.655 6.922 7.181 7.437 7.729 8.055 8.368 8.719 9.094 9.49 9.921 10.409 10.948 11.48 12.103 12.801 13.614 14.508 15.498 16.57 17.656 18.241 18.381 18.314 18.174 18.011 17.774 17.491 17.201 16.843 16.511 16.207 15.92 15.645 15.363 15.102 14.835 14.593 14.378 14.159 13.928 13.714 13.482 13.24 13.045 12.838 12.63 12.407 12.167 11.996 11.827 11.567 11.362 11.154 11.053 10.837 10.594 10.312 10.162 9.661 9.679 9.507 9.321 8.896 8.643 8.356 8.05 7.716 7.286 6.503 3.619 -10 ,27766 ,KEBNE ,16693212,Fri Nov 26 01:49:18 CET,Fri Nov 26 03:30:40 CET,0.0 1.482 1.863 2.116 2.346 2.556 2.733 2.886 3.147 3.275 3.398 3.254 3.725 3.827 4.03 4.219 4.42 4.521 4.707 4.876 5.121 5.285 5.447 5.674 5.89 6.092 6.284 6.477 6.737 6.989 7.22 7.494 7.762 8.019 8.318 8.647 8.966 9.321 9.704 10.113 10.544 11.044 11.632 12.193 12.845 13.59 14.437 15.388 16.409 17.427 18.491 19.147 19.271 19.223 19.072 18.823 18.551 18.28 18.008 17.723 17.461 17.206 16.926 16.661 16.408 16.151 15.886 15.633 15.398 15.15 14.897 14.69 14.474 14.239 14.046 13.85 13.636 13.41 13.174 13.002 12.83 12.554 12.358 12.172 12.081 11.887 11.687 11.481 11.366 10.886 10.947 10.777 10.597 10.16 9.915 9.651 9.339 8.999 8.575 7.914 3.954 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt deleted file mode 100644 index e3ba65cc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12896 ,KEBNE ,16693213,Fri Nov 26 01:51:22 CET,Fri Nov 26 03:25:53 CET,0.0 2.155 2.539 2.748 2.899 3.034 3.169 3.285 3.486 3.574 3.647 3.402 3.818 3.85 3.914 3.974 4.013 4.023 4.016 3.989 3.946 3.908 3.852 3.746 3.634 3.528 3.42 3.291 3.088 2.89 2.681 2.374 2.07 1.775 1.404 0.94 0.432 -0.189 -0.886 -1.68 -2.579 -3.667 -5.071 -6.6 -8.518 -10.867 -13.916 -17.792 -22.977 -30.2 -40.92 -52.281 -60.696 -67.177 -72.346 -76.719 -80.365 -83.489 -86.004 -88.402 -90.412 -92.117 -93.688 -95.137 -96.453 -97.647 -98.833 -99.826 -100.675 -101.561 -102.466 -103.187 -103.919 -104.67 -105.242 -105.829 -106.415 -106.993 -107.567 -107.956 -108.364 -108.982 -109.406 -109.845 -110.064 -110.5 -110.945 -111.401 -111.638 -112.381 -112.386 -112.639 -112.901 -113.469 -113.795 -114.128 -114.46 -114.858 -115.328 -115.956 -118.01 -2 ,18941 ,KEBNE ,16693214,Fri Nov 26 01:51:22 CET,Fri Nov 26 03:26:01 CET,0.0 3.263 3.765 4.071 4.319 4.513 4.698 4.858 5.103 5.217 5.327 5.127 5.555 5.597 5.652 5.699 5.742 5.757 5.755 5.731 5.669 5.616 5.565 5.485 5.387 5.274 5.153 5.031 4.847 4.631 4.403 4.117 3.828 3.523 3.143 2.714 2.238 1.634 0.929 0.143 -0.729 -1.795 -3.144 -4.689 -6.678 -9.08 -12.195 -16.189 -21.493 -28.82 -39.731 -51.181 -59.653 -66.257 -71.437 -75.75 -79.327 -82.365 -84.875 -87.292 -89.293 -91.031 -92.628 -94.065 -95.355 -96.511 -97.686 -98.711 -99.58 -100.463 -101.367 -102.097 -102.841 -103.616 -104.211 -104.809 -105.421 -106.05 -106.687 -107.103 -107.51 -108.118 -108.533 -108.956 -109.172 -109.611 -110.058 -110.535 -110.774 -111.507 -111.535 -111.818 -112.112 -112.737 -113.054 -113.396 -113.788 -114.242 -114.715 -115.35 -117.723 -3 ,4689 ,KEBNE ,16693215,Fri Nov 26 01:52:24 CET,Fri Nov 26 03:27:19 CET,0.0 2.698 3.191 3.538 3.794 3.997 4.197 4.364 4.604 4.695 4.782 4.554 4.969 5.004 5.05 5.1 5.156 5.16 5.145 5.135 5.125 5.104 5.052 4.96 4.848 4.721 4.593 4.447 4.253 4.059 3.863 3.641 3.396 3.112 2.734 2.26 1.757 1.149 0.456 -0.336 -1.22 -2.29 -3.674 -5.188 -7.151 -9.581 -12.663 -16.615 -21.946 -29.216 -39.944 -51.194 -59.52 -66.051 -71.248 -75.607 -79.171 -82.212 -84.747 -87.178 -89.16 -90.846 -92.429 -93.907 -95.237 -96.396 -97.561 -98.579 -99.44 -100.327 -101.225 -101.939 -102.665 -103.422 -103.997 -104.578 -105.162 -105.759 -106.384 -106.81 -107.235 -107.868 -108.307 -108.76 -108.982 -109.434 -109.898 -110.355 -110.588 -111.32 -111.319 -111.581 -111.847 -112.415 -112.73 -113.058 -113.445 -113.867 -114.303 -114.87 -116.567 -4 ,21357 ,KEBNE ,16693216,Fri Nov 26 01:53:27 CET,Fri Nov 26 03:28:01 CET,0.0 2.448 2.962 3.3 3.531 3.694 3.829 3.954 4.146 4.237 4.313 4.035 4.449 4.489 4.549 4.589 4.6 4.593 4.573 4.557 4.511 4.469 4.418 4.332 4.245 4.14 4.023 3.888 3.675 3.47 3.267 2.986 2.68 2.359 1.973 1.536 1.067 0.478 -0.187 -0.938 -1.802 -2.897 -4.324 -5.839 -7.711 -10.005 -13.002 -16.9 -22.151 -29.357 -40.038 -51.33 -59.663 -66.167 -71.311 -75.559 -79.074 -82.09 -84.572 -87.004 -89.027 -90.714 -92.255 -93.68 -94.969 -96.098 -97.258 -98.282 -99.151 -100.039 -100.935 -101.664 -102.407 -103.15 -103.709 -104.283 -104.862 -105.459 -106.077 -106.493 -106.913 -107.546 -107.986 -108.435 -108.665 -109.151 -109.639 -110.126 -110.373 -111.127 -111.159 -111.422 -111.701 -112.325 -112.652 -112.973 -113.311 -113.688 -114.13 -114.682 -116.371 -5 ,4501 ,KEBNE ,16693217,Fri Nov 26 01:53:31 CET,Fri Nov 26 03:24:56 CET,0.0 3.183 3.757 4.165 4.473 4.67 4.79 4.895 5.091 5.169 5.225 4.914 5.308 5.331 5.35 5.362 5.37 5.361 5.331 5.304 5.265 5.229 5.179 5.102 5.017 4.915 4.804 4.679 4.491 4.289 4.075 3.791 3.472 3.138 2.739 2.26 1.781 1.207 0.532 -0.213 -1.075 -2.127 -3.453 -4.915 -6.805 -9.189 -12.233 -16.117 -21.348 -28.634 -39.379 -50.668 -59.023 -65.536 -70.752 -75.128 -78.787 -81.973 -84.549 -86.96 -88.965 -90.697 -92.299 -93.769 -95.108 -96.284 -97.45 -98.477 -99.351 -100.233 -101.13 -101.847 -102.563 -103.293 -103.841 -104.392 -104.955 -105.534 -106.129 -106.538 -106.963 -107.614 -108.045 -108.481 -108.707 -109.169 -109.639 -110.117 -110.351 -111.088 -111.092 -111.344 -111.618 -112.203 -112.498 -112.807 -113.127 -113.477 -113.898 -114.464 -116.342 -6 ,28208 ,KEBNE ,16693218,Fri Nov 26 01:54:29 CET,Fri Nov 26 03:29:01 CET,0.0 2.08 2.501 2.732 2.927 3.096 3.246 3.36 3.512 3.563 3.599 3.318 3.729 3.764 3.833 3.894 3.927 3.923 3.907 3.904 3.874 3.835 3.815 3.77 3.699 3.639 3.544 3.419 3.241 3.033 2.815 2.526 2.242 1.966 1.617 1.163 0.665 0.079 -0.608 -1.412 -2.326 -3.422 -4.813 -6.314 -8.239 -10.62 -13.708 -17.658 -22.883 -30.09 -40.809 -52.199 -60.59 -67.096 -72.296 -76.574 -80.068 -83.087 -85.623 -88.071 -90.093 -91.807 -93.383 -94.842 -96.159 -97.338 -98.537 -99.583 -100.461 -101.349 -102.262 -103.006 -103.76 -104.508 -105.065 -105.641 -106.215 -106.781 -107.361 -107.764 -108.182 -108.82 -109.25 -109.685 -109.908 -110.361 -110.826 -111.312 -111.55 -112.279 -112.275 -112.553 -112.856 -113.473 -113.786 -114.118 -114.456 -114.825 -115.268 -115.858 -117.976 -7 ,4264 ,KEBNE ,16693219,Fri Nov 26 01:54:33 CET,Fri Nov 26 03:25:00 CET,0.0 2.696 3.133 3.46 3.719 3.908 4.027 4.115 4.24 4.291 4.342 4.044 4.436 4.455 4.479 4.48 4.472 4.461 4.441 4.433 4.396 4.348 4.292 4.228 4.153 4.036 3.91 3.769 3.56 3.364 3.156 2.879 2.584 2.264 1.866 1.378 0.874 0.292 -0.373 -1.147 -2.038 -3.127 -4.505 -6.013 -7.965 -10.364 -13.448 -17.397 -22.572 -29.666 -40.347 -51.675 -59.949 -66.452 -71.702 -76.099 -79.692 -82.766 -85.353 -87.851 -89.879 -91.603 -93.203 -94.669 -95.992 -97.171 -98.379 -99.412 -100.284 -101.174 -102.057 -102.768 -103.494 -104.245 -104.817 -105.387 -105.968 -106.566 -107.17 -107.578 -107.996 -108.626 -109.061 -109.541 -109.787 -110.288 -110.804 -111.314 -111.577 -112.339 -112.393 -112.666 -112.942 -113.524 -113.838 -114.18 -114.585 -115.086 -115.605 -116.265 -118.462 -8 ,14718 ,KEBNE ,16693220,Fri Nov 26 01:55:33 CET,Fri Nov 26 03:35:09 CET,0.0 3.136 3.741 4.109 4.379 4.578 4.747 4.887 5.085 5.166 5.232 4.982 5.397 5.433 5.496 5.539 5.564 5.562 5.546 5.539 5.5 5.459 5.412 5.324 5.21 5.084 4.981 4.868 4.667 4.439 4.196 3.885 3.567 3.243 2.849 2.369 1.883 1.32 0.667 -0.073 -0.945 -2.038 -3.419 -4.962 -6.949 -9.391 -12.523 -16.417 -21.552 -28.731 -39.467 -50.807 -59.142 -65.653 -70.934 -75.427 -79.112 -82.296 -84.954 -87.428 -89.447 -91.195 -92.808 -94.287 -95.627 -96.815 -98.012 -99.046 -99.924 -100.816 -101.72 -102.457 -103.205 -103.97 -104.56 -105.148 -105.737 -106.337 -106.957 -107.373 -107.786 -108.427 -108.872 -109.332 -109.566 -110.043 -110.54 -111.052 -111.304 -112.043 -112.062 -112.332 -112.608 -113.232 -113.572 -113.903 -114.25 -114.666 -115.145 -115.712 -117.755 -9 ,20845 ,KEBNE ,16693221,Fri Nov 26 01:56:35 CET,Fri Nov 26 03:31:35 CET,0.0 2.495 3.001 3.354 3.643 3.876 4.065 4.21 4.381 4.449 4.511 4.239 4.682 4.749 4.82 4.843 4.86 4.878 4.893 4.888 4.86 4.81 4.755 4.659 4.541 4.423 4.302 4.173 3.996 3.791 3.565 3.296 3.018 2.711 2.323 1.847 1.332 0.728 0.04 -0.768 -1.667 -2.751 -4.167 -5.701 -7.634 -9.994 -12.995 -16.859 -22.114 -29.325 -40.04 -51.347 -59.689 -66.249 -71.496 -75.86 -79.449 -82.514 -85.038 -87.464 -89.477 -91.211 -92.804 -94.25 -95.566 -96.746 -97.937 -98.974 -99.863 -100.757 -101.663 -102.407 -103.149 -103.885 -104.452 -105.037 -105.627 -106.22 -106.823 -107.228 -107.643 -108.279 -108.71 -109.168 -109.406 -109.873 -110.339 -110.816 -111.06 -111.803 -111.811 -112.082 -112.366 -112.97 -113.295 -113.622 -113.982 -114.394 -114.845 -115.416 -117.635 -10 ,18292 ,KEBNE ,16693222,Fri Nov 26 01:56:36 CET,Fri Nov 26 03:31:37 CET,0.0 2.469 2.84 3.078 3.255 3.387 3.517 3.635 3.806 3.861 3.905 3.622 4.041 4.08 4.106 4.095 4.085 4.084 4.08 4.066 4.02 3.97 3.916 3.827 3.713 3.597 3.465 3.323 3.146 2.971 2.776 2.52 2.261 1.957 1.549 1.057 0.553 -0.033 -0.734 -1.549 -2.469 -3.587 -5.0 -6.542 -8.494 -10.899 -13.992 -17.918 -23.202 -30.42 -41.192 -52.648 -61.066 -67.615 -72.789 -77.086 -80.647 -83.706 -86.218 -88.636 -90.704 -92.494 -94.098 -95.557 -96.869 -98.017 -99.186 -100.204 -101.05 -101.907 -102.811 -103.558 -104.315 -105.085 -105.652 -106.224 -106.79 -107.363 -107.957 -108.352 -108.748 -109.366 -109.799 -110.242 -110.465 -110.91 -111.367 -111.836 -112.075 -112.823 -112.838 -113.095 -113.359 -113.914 -114.214 -114.545 -114.924 -115.365 -115.899 -116.649 -121.75 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt deleted file mode 100644 index 3234b00f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/p38/water/Summary_FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3957 ,KEBNE ,16693223,Fri Nov 26 01:56:39 CET,Fri Nov 26 03:27:38 CET,0.0 1.889 2.371 2.703 2.982 3.215 3.409 3.578 3.881 4.025 4.166 4.058 4.548 4.659 4.869 5.063 5.248 5.34 5.539 5.732 5.983 6.143 6.301 6.519 6.731 6.939 7.148 7.363 7.638 7.901 8.159 8.471 8.785 9.084 9.406 9.777 10.146 10.556 10.992 11.445 11.919 12.464 13.094 13.713 14.44 15.253 16.175 17.239 18.478 19.856 21.467 22.572 23.036 23.201 23.184 23.106 22.967 22.768 22.587 22.385 22.175 21.989 21.794 21.578 21.378 21.169 20.945 20.76 20.58 20.355 20.1 19.881 19.656 19.433 19.248 19.047 18.834 18.599 18.377 18.231 18.066 17.791 17.613 17.428 17.328 17.085 16.799 16.537 16.413 15.925 15.977 15.803 15.607 15.179 14.945 14.643 14.292 13.923 13.419 12.661 9.521 -2 ,20772 ,KEBNE ,16693224,Fri Nov 26 01:56:35 CET,Fri Nov 26 03:31:13 CET,0.0 1.277 1.708 2.026 2.271 2.46 2.63 2.811 3.174 3.322 3.465 3.365 3.866 3.984 4.181 4.367 4.551 4.643 4.827 5.009 5.275 5.449 5.636 5.917 6.186 6.44 6.689 6.93 7.23 7.517 7.782 8.097 8.407 8.711 9.07 9.448 9.794 10.185 10.597 11.027 11.487 12.021 12.663 13.309 14.07 14.939 15.94 17.028 18.285 19.702 21.223 22.345 22.85 23.006 22.976 22.824 22.615 22.375 22.106 21.825 21.586 21.369 21.162 20.928 20.696 20.471 20.247 20.055 19.871 19.674 19.451 19.249 19.029 18.785 18.597 18.406 18.208 17.977 17.717 17.555 17.388 17.104 16.894 16.693 16.597 16.397 16.177 15.917 15.772 15.276 15.305 15.123 14.934 14.503 14.228 13.933 13.611 13.201 12.711 11.975 8.92 -3 ,31575 ,KEBNE ,16693225,Fri Nov 26 01:56:36 CET,Fri Nov 26 03:31:21 CET,0.0 2.313 2.942 3.369 3.707 3.988 4.243 4.468 4.861 5.04 5.211 5.211 5.748 5.894 6.171 6.439 6.682 6.795 7.027 7.25 7.556 7.744 7.915 8.155 8.398 8.642 8.866 9.074 9.343 9.606 9.858 10.162 10.449 10.722 11.044 11.42 11.777 12.161 12.567 12.996 13.47 14.026 14.676 15.32 16.055 16.867 17.796 18.84 20.021 21.333 22.82 23.902 24.418 24.526 24.443 24.351 24.22 24.009 23.777 23.54 23.32 23.121 22.923 22.709 22.499 22.284 22.02 21.784 21.591 21.388 21.173 20.987 20.788 20.557 20.371 20.178 19.971 19.752 19.527 19.374 19.22 18.96 18.77 18.576 18.474 18.23 17.978 17.744 17.616 17.127 17.16 16.986 16.813 16.428 16.192 15.904 15.537 15.105 14.603 13.973 9.452 -4 ,1484 ,KEBNE ,16693226,Fri Nov 26 01:58:41 CET,Fri Nov 26 03:33:15 CET,0.0 1.429 1.815 2.097 2.363 2.586 2.768 2.966 3.357 3.53 3.7 3.641 4.152 4.281 4.521 4.763 4.982 5.081 5.273 5.463 5.757 5.959 6.146 6.402 6.645 6.878 7.108 7.32 7.592 7.868 8.139 8.472 8.781 9.066 9.412 9.791 10.149 10.553 10.984 11.45 11.945 12.492 13.117 13.759 14.535 15.408 16.387 17.468 18.698 20.087 21.575 22.545 22.88 22.96 22.964 22.897 22.756 22.555 22.342 22.102 21.871 21.68 21.487 21.257 21.018 20.809 20.592 20.38 20.193 19.998 19.787 19.608 19.403 19.183 19.01 18.812 18.611 18.406 18.187 18.034 17.876 17.625 17.429 17.2 17.091 16.872 16.632 16.376 16.242 15.751 15.761 15.596 15.429 14.988 14.715 14.428 14.134 13.772 13.317 12.663 9.159 -5 ,17090 ,KEBNE ,16693227,Fri Nov 26 01:59:43 CET,Fri Nov 26 03:36:10 CET,0.0 1.97 2.394 2.686 2.932 3.159 3.379 3.581 3.917 4.07 4.218 4.123 4.63 4.771 5.048 5.305 5.54 5.649 5.845 6.034 6.319 6.502 6.681 6.937 7.171 7.405 7.644 7.869 8.152 8.42 8.686 8.997 9.287 9.566 9.896 10.283 10.652 11.057 11.49 11.945 12.411 12.939 13.552 14.14 14.841 15.649 16.545 17.541 18.744 20.141 21.699 22.832 23.315 23.459 23.422 23.309 23.15 22.966 22.774 22.552 22.336 22.118 21.918 21.72 21.498 21.293 21.096 20.908 20.691 20.421 20.156 19.944 19.705 19.443 19.255 19.082 18.891 18.678 18.458 18.304 18.149 17.896 17.697 17.492 17.388 17.158 16.89 16.601 16.461 15.972 15.997 15.808 15.596 15.119 14.858 14.59 14.29 13.918 13.419 12.655 9.78 -6 ,25541 ,KEBNE ,16693228,Fri Nov 26 02:00:45 CET,Fri Nov 26 03:36:44 CET,0.0 1.285 1.675 1.974 2.245 2.445 2.625 2.8 3.104 3.241 3.367 3.231 3.722 3.841 4.085 4.315 4.527 4.631 4.821 4.995 5.249 5.43 5.616 5.859 6.078 6.293 6.497 6.699 6.966 7.223 7.474 7.771 8.061 8.343 8.677 9.076 9.455 9.865 10.302 10.755 11.232 11.772 12.401 13.03 13.751 14.541 15.48 16.57 17.804 19.144 20.716 21.863 22.298 22.445 22.446 22.318 22.129 21.926 21.721 21.507 21.283 21.052 20.824 20.602 20.394 20.181 19.953 19.748 19.567 19.374 19.176 19.004 18.791 18.57 18.408 18.241 18.06 17.854 17.598 17.404 17.21 16.922 16.73 16.521 16.405 16.166 15.912 15.626 15.473 14.971 14.975 14.783 14.596 14.185 13.945 13.683 13.389 13.009 12.511 11.708 6.33 -7 ,3082 ,KEBNE ,16693229,Fri Nov 26 02:00:45 CET,Fri Nov 26 03:34:42 CET,0.0 1.249 1.644 1.946 2.191 2.415 2.633 2.825 3.138 3.275 3.408 3.288 3.77 3.881 4.105 4.345 4.577 4.677 4.864 5.045 5.326 5.509 5.673 5.909 6.135 6.354 6.571 6.789 7.076 7.346 7.605 7.909 8.205 8.494 8.83 9.205 9.568 9.971 10.402 10.846 11.317 11.859 12.496 13.127 13.853 14.665 15.596 16.697 17.981 19.341 20.893 21.969 22.31 22.393 22.364 22.247 22.086 21.898 21.715 21.48 21.229 20.976 20.747 20.521 20.27 20.036 19.779 19.543 19.332 19.095 18.864 18.66 18.442 18.234 18.056 17.865 17.651 17.407 17.169 16.997 16.825 16.588 16.412 16.212 16.106 15.877 15.605 15.319 15.181 14.676 14.656 14.45 14.231 13.712 13.41 13.109 12.772 12.342 11.831 11.041 7.665 -8 ,32671 ,KEBNE ,16693230,Fri Nov 26 02:01:48 CET,Fri Nov 26 03:35:47 CET,0.0 1.499 1.871 2.104 2.339 2.581 2.806 2.996 3.322 3.475 3.606 3.508 4.003 4.122 4.349 4.559 4.76 4.855 5.036 5.212 5.483 5.669 5.852 6.095 6.317 6.536 6.741 6.944 7.23 7.51 7.764 8.066 8.367 8.648 8.956 9.328 9.707 10.109 10.533 10.998 11.504 12.081 12.734 13.384 14.156 15.011 16.009 17.075 18.211 19.583 21.227 22.286 22.737 22.938 22.942 22.823 22.654 22.468 22.279 22.051 21.831 21.638 21.443 21.235 21.023 20.814 20.581 20.358 20.152 19.926 19.685 19.486 19.263 19.003 18.802 18.611 18.401 18.179 17.965 17.805 17.608 17.289 17.088 16.878 16.775 16.582 16.353 16.09 15.954 15.454 15.505 15.348 15.179 14.796 14.559 14.271 13.953 13.564 13.095 12.432 9.059 -9 ,23676 ,KEBNE ,16693231,Fri Nov 26 02:01:47 CET,Fri Nov 26 03:36:06 CET,0.0 2.169 2.606 2.932 3.194 3.431 3.631 3.825 4.176 4.325 4.458 4.335 4.826 4.944 5.166 5.367 5.561 5.654 5.836 6.017 6.273 6.432 6.596 6.844 7.078 7.302 7.519 7.735 8.009 8.267 8.515 8.807 9.095 9.38 9.712 10.086 10.445 10.828 11.239 11.684 12.154 12.693 13.337 13.98 14.745 15.631 16.645 17.758 18.933 20.261 21.914 23.076 23.53 23.686 23.702 23.593 23.419 23.188 22.948 22.7 22.454 22.216 21.984 21.767 21.557 21.358 21.134 20.919 20.737 20.536 20.312 20.139 19.956 19.743 19.555 19.352 19.153 18.956 18.746 18.584 18.412 18.149 17.975 17.788 17.675 17.443 17.205 16.927 16.782 16.29 16.345 16.176 15.979 15.531 15.285 15.031 14.734 14.331 13.864 13.252 10.045 -10 ,14287 ,KEBNE ,16693232,Fri Nov 26 02:01:48 CET,Fri Nov 26 03:35:41 CET,0.0 1.109 1.538 1.878 2.173 2.409 2.603 2.778 3.069 3.21 3.349 3.232 3.714 3.821 4.022 4.221 4.412 4.5 4.678 4.848 5.089 5.251 5.422 5.701 5.959 6.189 6.411 6.627 6.905 7.167 7.429 7.749 8.045 8.333 8.66 9.035 9.419 9.84 10.274 10.733 11.237 11.813 12.461 13.119 13.86 14.623 15.515 16.544 17.723 19.035 20.602 21.679 22.01 22.044 21.924 21.683 21.424 21.168 20.933 20.696 20.465 20.222 19.974 19.738 19.5 19.276 19.051 18.824 18.614 18.401 18.159 17.961 17.771 17.553 17.366 17.183 17.001 16.789 16.567 16.42 16.271 16.035 15.867 15.664 15.548 15.332 15.114 14.876 14.728 14.217 14.269 14.11 13.934 13.518 13.288 13.019 12.667 12.259 11.737 11.0 7.827 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_19_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_19_23.txt deleted file mode 100644 index 7bc43869..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_19_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19718 ,KEBNE ,16720764,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 02:58:01 CET,0.0 2.639 3.264 3.708 4.075 4.379 4.647 4.886 5.311 5.509 5.704 6.01 6.219 6.384 6.699 6.989 7.26 7.386 7.629 7.863 8.195 8.41 8.616 8.913 9.201 9.468 9.719 9.968 10.291 10.601 10.902 11.258 11.59 11.921 12.311 12.742 13.151 13.599 14.087 14.612 15.179 15.829 16.603 17.395 18.324 19.38 20.606 22.024 23.76 25.873 28.449 30.592 31.89 32.78 33.422 33.869 34.115 34.249 34.306 34.332 34.315 34.259 34.202 34.125 34.035 33.944 33.846 33.744 33.638 33.531 33.42 33.331 33.237 33.119 33.015 32.902 32.775 32.628 32.451 32.325 32.196 31.981 31.824 31.654 31.564 31.374 31.168 30.94 30.82 30.675 30.436 30.289 30.126 29.737 29.511 29.262 28.975 28.654 28.265 27.696 24.895 -2 ,20958 ,KEBNE ,16720765,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:56:22 CET,0.0 2.493 3.055 3.468 3.786 4.07 4.344 4.587 5.013 5.207 5.382 5.655 5.853 6.006 6.283 6.545 6.8 6.919 7.152 7.384 7.705 7.905 8.105 8.393 8.669 8.94 9.2 9.445 9.754 10.043 10.326 10.666 10.997 11.322 11.695 12.119 12.549 13.02 13.522 14.057 14.613 15.238 15.998 16.789 17.711 18.75 19.953 21.344 23.005 24.925 27.325 29.386 30.612 31.405 31.954 32.303 32.523 32.693 32.773 32.805 32.814 32.802 32.757 32.684 32.618 32.534 32.415 32.304 32.192 32.06 31.892 31.753 31.623 31.481 31.37 31.251 31.113 30.968 30.822 30.714 30.597 30.393 30.245 30.093 30.011 29.834 29.638 29.421 29.305 29.159 28.921 28.769 28.601 28.223 28.006 27.761 27.476 27.145 26.723 26.097 23.358 -3 ,30264 ,KEBNE ,16720766,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:57:03 CET,0.0 1.843 2.406 2.823 3.158 3.421 3.662 3.893 4.308 4.492 4.669 4.953 5.161 5.309 5.587 5.847 6.088 6.205 6.431 6.648 6.96 7.16 7.356 7.645 7.915 8.18 8.435 8.677 8.995 9.299 9.594 9.941 10.278 10.611 10.987 11.416 11.849 12.313 12.81 13.342 13.901 14.532 15.263 16.017 16.918 17.933 19.14 20.532 22.176 24.196 26.829 29.142 30.548 31.484 32.106 32.551 32.868 33.105 33.263 33.388 33.465 33.504 33.523 33.483 33.389 33.3 33.204 33.095 32.991 32.881 32.757 32.647 32.529 32.399 32.292 32.176 32.05 31.911 31.758 31.651 31.537 31.327 31.174 31.017 30.935 30.755 30.563 30.358 30.243 30.083 29.83 29.677 29.523 29.181 28.978 28.756 28.509 28.193 27.812 27.252 25.071 -4 ,8422 ,KEBNE ,16720767,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 02:57:31 CET,0.0 2.231 2.918 3.397 3.775 4.077 4.346 4.59 4.991 5.172 5.351 5.639 5.848 5.997 6.289 6.561 6.813 6.934 7.166 7.391 7.723 7.925 8.116 8.4 8.668 8.917 9.158 9.393 9.7 9.999 10.295 10.644 10.979 11.309 11.685 12.105 12.512 12.967 13.461 13.98 14.53 15.153 15.904 16.679 17.588 18.626 19.829 21.177 22.766 24.702 27.253 29.524 30.87 31.715 32.291 32.656 32.837 32.932 32.992 32.969 32.913 32.856 32.771 32.678 32.583 32.484 32.368 32.251 32.134 32.015 31.891 31.777 31.651 31.516 31.405 31.276 31.138 30.992 30.843 30.733 30.611 30.41 30.267 30.116 30.041 29.884 29.698 29.496 29.388 29.239 28.967 28.785 28.608 28.236 28.023 27.795 27.541 27.232 26.825 26.216 23.93 -5 ,26582 ,KEBNE ,16720768,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 02:56:23 CET,0.0 1.882 2.488 2.906 3.24 3.53 3.788 4.019 4.433 4.623 4.798 5.065 5.271 5.418 5.701 5.974 6.223 6.341 6.575 6.791 7.096 7.289 7.475 7.752 8.017 8.264 8.506 8.741 9.038 9.321 9.594 9.922 10.249 10.567 10.924 11.342 11.751 12.185 12.66 13.176 13.715 14.305 15.022 15.771 16.641 17.632 18.789 20.107 21.695 23.633 26.055 28.185 29.524 30.423 31.087 31.579 31.905 32.12 32.263 32.364 32.399 32.403 32.372 32.317 32.258 32.183 32.088 31.988 31.884 31.757 31.604 31.475 31.342 31.199 31.091 30.969 30.836 30.696 30.54 30.426 30.304 30.11 29.966 29.806 29.724 29.545 29.351 29.139 29.018 28.869 28.637 28.489 28.331 27.966 27.755 27.533 27.276 26.98 26.596 26.023 23.741 -6 ,12429 ,KEBNE ,16720769,Sat Nov 27 00:58:25 CET,Sat Nov 27 02:53:06 CET,0.0 2.068 2.654 3.072 3.391 3.679 3.951 4.194 4.604 4.788 4.965 5.248 5.459 5.611 5.901 6.168 6.418 6.54 6.77 6.985 7.298 7.508 7.71 7.995 8.274 8.543 8.79 9.034 9.362 9.675 9.963 10.309 10.65 10.98 11.374 11.814 12.221 12.67 13.155 13.679 14.241 14.872 15.618 16.378 17.281 18.312 19.518 20.936 22.664 24.712 27.301 29.579 31.032 32.014 32.624 33.04 33.321 33.485 33.601 33.698 33.72 33.686 33.615 33.529 33.446 33.36 33.271 33.195 33.102 32.98 32.854 32.75 32.634 32.505 32.391 32.269 32.15 32.021 31.866 31.755 31.636 31.433 31.287 31.136 31.056 30.875 30.68 30.474 30.365 30.216 29.979 29.836 29.68 29.303 29.086 28.844 28.576 28.278 27.89 27.284 24.906 -7 ,29034 ,KEBNE ,16720770,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:56:49 CET,0.0 2.116 2.794 3.268 3.629 3.93 4.2 4.467 4.935 5.128 5.32 5.638 5.846 5.998 6.289 6.553 6.803 6.926 7.162 7.39 7.722 7.931 8.136 8.438 8.726 9.004 9.267 9.52 9.842 10.152 10.456 10.823 11.176 11.526 11.931 12.385 12.824 13.313 13.84 14.395 14.982 15.652 16.439 17.245 18.211 19.287 20.529 21.913 23.596 25.732 28.484 30.862 32.302 33.203 33.814 34.272 34.567 34.778 34.93 35.046 35.099 35.114 35.1 35.049 34.994 34.94 34.865 34.791 34.713 34.602 34.476 34.374 34.262 34.141 34.04 33.93 33.808 33.668 33.506 33.387 33.267 33.084 32.95 32.803 32.723 32.549 32.35 32.128 32.011 31.859 31.626 31.481 31.326 30.986 30.776 30.524 30.236 29.927 29.517 28.941 26.936 -8 ,4715 ,KEBNE ,16720771,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:58:26 CET,0.0 2.142 2.705 3.138 3.484 3.785 4.057 4.302 4.729 4.924 5.104 5.38 5.582 5.729 6.007 6.272 6.515 6.629 6.854 7.073 7.383 7.585 7.781 8.066 8.338 8.596 8.837 9.069 9.378 9.673 9.947 10.27 10.584 10.896 11.264 11.684 12.094 12.537 13.002 13.488 14.009 14.627 15.349 16.08 16.968 17.951 19.074 20.407 22.038 24.05 26.611 28.74 29.992 30.805 31.336 31.702 31.975 32.153 32.242 32.295 32.313 32.313 32.285 32.237 32.18 32.109 32.041 31.973 31.893 31.816 31.729 31.641 31.544 31.431 31.318 31.185 31.044 30.893 30.723 30.6 30.475 30.267 30.124 29.983 29.904 29.731 29.544 29.343 29.237 29.092 28.846 28.692 28.523 28.145 27.924 27.687 27.41 27.066 26.66 26.087 23.138 -9 ,7932 ,KEBNE ,16720772,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 02:57:40 CET,0.0 2.425 3.091 3.517 3.844 4.131 4.389 4.622 5.036 5.235 5.425 5.707 5.905 6.053 6.348 6.627 6.894 7.021 7.255 7.483 7.802 8.005 8.204 8.49 8.771 9.039 9.294 9.539 9.843 10.134 10.417 10.765 11.107 11.436 11.806 12.23 12.648 13.101 13.59 14.113 14.67 15.317 16.073 16.835 17.74 18.742 19.886 21.211 22.855 24.838 27.249 29.321 30.484 31.234 31.773 32.189 32.513 32.732 32.863 32.915 32.899 32.864 32.814 32.757 32.681 32.608 32.51 32.394 32.295 32.177 32.037 31.908 31.767 31.613 31.489 31.364 31.226 31.074 30.917 30.8 30.674 30.486 30.346 30.182 30.096 29.918 29.735 29.528 29.416 29.27 29.036 28.892 28.721 28.323 28.1 27.848 27.582 27.279 26.88 26.288 23.952 -10 ,10723 ,KEBNE ,16720773,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:56:23 CET,0.0 1.865 2.394 2.781 3.106 3.387 3.644 3.876 4.292 4.477 4.652 4.919 5.119 5.265 5.551 5.827 6.088 6.216 6.457 6.681 7.011 7.217 7.415 7.699 7.962 8.214 8.459 8.703 9.018 9.321 9.621 9.978 10.317 10.637 11.012 11.444 11.855 12.313 12.807 13.345 13.912 14.538 15.283 16.038 16.903 17.902 19.098 20.468 22.134 24.188 26.773 29.061 30.525 31.488 32.098 32.495 32.777 32.993 33.147 33.254 33.291 33.286 33.247 33.166 33.084 32.987 32.856 32.749 32.667 32.572 32.446 32.353 32.261 32.138 32.04 31.93 31.783 31.622 31.459 31.336 31.198 30.986 30.839 30.677 30.591 30.411 30.228 30.028 29.909 29.742 29.506 29.368 29.212 28.869 28.686 28.464 28.196 27.887 27.5 26.956 24.831 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_19.txt deleted file mode 100644 index 6fe1f38c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8465 ,KEBNE ,16720774,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:58:30 CET,0.0 2.229 2.783 3.199 3.527 3.808 4.052 4.273 4.667 4.845 5.007 5.254 5.442 5.572 5.808 6.025 6.23 6.325 6.517 6.699 6.936 7.092 7.239 7.443 7.637 7.83 8.015 8.183 8.393 8.599 8.799 9.03 9.252 9.471 9.72 9.979 10.217 10.485 10.771 11.054 11.349 11.682 12.076 12.453 12.849 13.266 13.688 14.082 14.519 14.924 15.074 14.81 14.392 13.987 13.558 13.12 12.729 12.335 11.964 11.583 11.238 10.934 10.654 10.362 10.067 9.792 9.515 9.267 9.04 8.791 8.525 8.311 8.087 7.842 7.655 7.464 7.252 7.027 6.797 6.633 6.455 6.182 5.991 5.783 5.674 5.435 5.187 4.934 4.793 4.597 4.323 4.137 3.936 3.492 3.248 2.987 2.699 2.355 1.918 1.315 -1.549 -2 ,18783 ,KEBNE ,16720775,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:58:03 CET,0.0 1.845 2.391 2.797 3.118 3.39 3.621 3.843 4.251 4.423 4.576 4.798 4.978 5.106 5.346 5.56 5.764 5.864 6.045 6.215 6.449 6.595 6.739 6.946 7.139 7.323 7.499 7.666 7.878 8.073 8.249 8.461 8.684 8.897 9.122 9.374 9.6 9.839 10.103 10.384 10.663 10.955 11.293 11.623 11.988 12.356 12.712 13.087 13.492 13.766 13.878 13.766 13.483 13.123 12.747 12.38 12.017 11.658 11.301 10.947 10.668 10.388 10.095 9.814 9.549 9.301 9.043 8.804 8.588 8.365 8.125 7.905 7.657 7.396 7.205 7.014 6.811 6.593 6.347 6.164 5.971 5.675 5.471 5.264 5.152 4.895 4.604 4.287 4.123 3.917 3.622 3.433 3.237 2.783 2.524 2.252 1.95 1.587 1.097 0.446 -2.65 -3 ,292 ,KEBNE ,16720776,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:59:17 CET,0.0 2.178 2.769 3.145 3.444 3.71 3.953 4.175 4.553 4.726 4.893 5.153 5.335 5.461 5.699 5.902 6.098 6.199 6.394 6.577 6.828 6.98 7.125 7.327 7.523 7.711 7.893 8.06 8.274 8.496 8.703 8.94 9.161 9.367 9.605 9.865 10.104 10.356 10.636 10.933 11.221 11.536 11.898 12.254 12.628 13.01 13.45 13.915 14.346 14.697 14.873 14.675 14.306 13.894 13.475 13.038 12.608 12.189 11.841 11.488 11.163 10.86 10.557 10.274 9.997 9.734 9.457 9.195 8.959 8.715 8.469 8.255 8.031 7.797 7.61 7.412 7.188 6.945 6.69 6.511 6.334 6.063 5.859 5.641 5.529 5.297 5.047 4.762 4.609 4.412 4.116 3.921 3.712 3.234 2.964 2.681 2.384 2.027 1.575 0.97 -1.409 -4 ,4178 ,KEBNE ,16720777,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:58:03 CET,0.0 2.043 2.591 2.985 3.304 3.593 3.851 4.086 4.481 4.645 4.797 5.028 5.212 5.344 5.592 5.828 6.054 6.16 6.355 6.547 6.812 6.966 7.115 7.326 7.526 7.716 7.893 8.066 8.297 8.52 8.721 8.955 9.178 9.394 9.637 9.901 10.142 10.388 10.661 10.944 11.226 11.541 11.883 12.215 12.577 12.967 13.427 13.878 14.32 14.675 14.764 14.552 14.215 13.809 13.373 12.975 12.621 12.268 11.946 11.612 11.296 11.005 10.716 10.44 10.188 9.944 9.668 9.415 9.188 8.948 8.698 8.488 8.275 8.049 7.865 7.667 7.471 7.277 7.065 6.908 6.741 6.475 6.274 6.058 5.946 5.72 5.49 5.244 5.113 4.914 4.642 4.465 4.281 3.848 3.593 3.33 3.031 2.688 2.229 1.559 -0.912 -5 ,21192 ,KEBNE ,16720778,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:58:02 CET,0.0 2.337 2.946 3.351 3.681 3.967 4.209 4.424 4.803 4.977 5.139 5.385 5.572 5.701 5.953 6.187 6.399 6.504 6.698 6.868 7.116 7.277 7.431 7.647 7.85 8.042 8.222 8.391 8.603 8.807 8.993 9.213 9.433 9.639 9.863 10.108 10.346 10.611 10.895 11.177 11.46 11.804 12.186 12.532 12.913 13.291 13.719 14.168 14.637 15.062 15.206 15.002 14.678 14.298 13.905 13.497 13.1 12.704 12.331 11.968 11.658 11.36 11.059 10.768 10.475 10.193 9.896 9.619 9.389 9.149 8.886 8.669 8.448 8.222 8.048 7.857 7.656 7.451 7.222 7.056 6.892 6.623 6.431 6.228 6.121 5.902 5.663 5.394 5.244 5.032 4.738 4.553 4.352 3.916 3.681 3.417 3.098 2.728 2.302 1.641 -0.551 -6 ,18980 ,KEBNE ,16720779,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:58:59 CET,0.0 2.344 2.891 3.261 3.561 3.826 4.07 4.289 4.661 4.824 4.983 5.229 5.42 5.548 5.785 6.001 6.204 6.306 6.509 6.688 6.927 7.077 7.221 7.438 7.643 7.832 8.015 8.189 8.413 8.625 8.826 9.069 9.291 9.502 9.75 10.013 10.254 10.515 10.774 11.048 11.348 11.658 11.994 12.341 12.726 13.106 13.563 14.07 14.537 14.93 15.107 14.902 14.562 14.169 13.794 13.44 13.082 12.725 12.393 12.024 11.689 11.39 11.1 10.819 10.545 10.277 9.989 9.737 9.514 9.275 9.031 8.828 8.605 8.37 8.172 7.954 7.735 7.495 7.245 7.073 6.886 6.598 6.401 6.195 6.083 5.854 5.619 5.356 5.211 5.007 4.731 4.541 4.351 3.942 3.701 3.428 3.098 2.708 2.279 1.667 -1.184 -7 ,18550 ,KEBNE ,16720780,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:57:56 CET,0.0 1.925 2.473 2.865 3.168 3.434 3.68 3.897 4.259 4.426 4.585 4.822 5.007 5.129 5.36 5.575 5.777 5.874 6.047 6.217 6.468 6.625 6.787 7.031 7.248 7.435 7.612 7.785 8.011 8.222 8.419 8.647 8.861 9.063 9.289 9.544 9.774 10.014 10.28 10.55 10.829 11.125 11.448 11.785 12.176 12.566 12.985 13.439 13.852 14.179 14.334 14.129 13.767 13.339 12.891 12.418 11.974 11.588 11.242 10.88 10.547 10.237 9.938 9.651 9.38 9.137 8.882 8.635 8.408 8.181 7.958 7.758 7.534 7.312 7.138 6.941 6.738 6.519 6.272 6.1 5.927 5.66 5.467 5.251 5.134 4.885 4.624 4.354 4.214 4.019 3.747 3.568 3.374 2.921 2.655 2.369 2.05 1.677 1.171 0.497 -2.394 -8 ,26078 ,KEBNE ,16720781,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:57:49 CET,0.0 2.0 2.565 2.945 3.268 3.553 3.795 4.012 4.388 4.557 4.721 4.973 5.149 5.269 5.497 5.711 5.905 5.996 6.175 6.345 6.581 6.733 6.88 7.081 7.274 7.465 7.645 7.816 8.029 8.224 8.419 8.665 8.89 9.087 9.301 9.54 9.766 10.011 10.281 10.559 10.838 11.137 11.479 11.818 12.177 12.547 12.956 13.354 13.739 14.053 14.134 13.867 13.465 13.023 12.563 12.108 11.688 11.296 10.902 10.482 10.121 9.776 9.436 9.122 8.819 8.536 8.26 8.012 7.783 7.542 7.291 7.073 6.827 6.556 6.343 6.129 5.918 5.696 5.448 5.273 5.09 4.796 4.587 4.37 4.257 4.016 3.762 3.482 3.331 3.136 2.88 2.709 2.51 2.055 1.81 1.528 1.19 0.764 0.228 -0.47 -2.836 -9 ,26078 ,KEBNE ,16720782,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:58:24 CET,0.0 2.0 2.565 2.945 3.268 3.553 3.795 4.012 4.388 4.557 4.721 4.973 5.149 5.269 5.497 5.711 5.905 5.996 6.175 6.345 6.581 6.733 6.88 7.081 7.274 7.465 7.645 7.816 8.029 8.224 8.419 8.665 8.89 9.087 9.301 9.54 9.766 10.011 10.281 10.559 10.838 11.137 11.479 11.818 12.177 12.547 12.956 13.354 13.739 14.053 14.134 13.867 13.465 13.023 12.563 12.108 11.688 11.296 10.902 10.482 10.121 9.776 9.436 9.122 8.819 8.536 8.26 8.012 7.783 7.542 7.291 7.073 6.827 6.556 6.343 6.129 5.918 5.696 5.448 5.273 5.09 4.796 4.587 4.37 4.257 4.016 3.762 3.482 3.331 3.136 2.88 2.709 2.51 2.055 1.81 1.528 1.19 0.764 0.228 -0.47 -2.836 -10 ,28122 ,KEBNE ,16720783,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:58:01 CET,0.0 1.909 2.437 2.877 3.239 3.518 3.774 3.995 4.371 4.538 4.69 4.932 5.111 5.238 5.483 5.71 5.913 6.012 6.196 6.367 6.611 6.766 6.919 7.129 7.318 7.496 7.672 7.845 8.064 8.266 8.459 8.682 8.889 9.095 9.327 9.559 9.781 10.023 10.274 10.531 10.792 11.087 11.42 11.745 12.091 12.467 12.919 13.369 13.775 14.139 14.351 14.147 13.768 13.333 12.898 12.457 12.014 11.563 11.141 10.691 10.298 9.948 9.604 9.262 8.937 8.643 8.326 8.03 7.768 7.499 7.21 6.958 6.7 6.436 6.232 6.022 5.794 5.559 5.309 5.127 4.949 4.676 4.47 4.243 4.125 3.898 3.666 3.39 3.242 3.031 2.735 2.558 2.375 1.961 1.719 1.452 1.133 0.774 0.359 -0.218 -2.509 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_30.txt deleted file mode 100644 index f078839f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_24_30.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,6212 ,KEBNE ,17025747,Wed Dec 22 13:01:29 CET,Wed Dec 22 15:03:56 CET,0.0 5.114 5.923 6.494 6.95 7.358 7.718 8.039 8.615 8.874 9.121 9.534 9.802 10.017 10.414 10.766 11.092 11.247 11.542 11.838 12.279 12.546 12.794 13.153 13.494 13.819 14.135 14.441 14.828 15.189 15.521 15.928 16.31 16.667 17.083 17.556 18.002 18.488 19.01 19.56 20.14 20.8 21.597 22.4 23.328 24.335 25.467 26.769 28.311 30.124 32.29 34.09 35.082 35.621 35.953 36.143 36.188 36.182 36.13 36.051 35.965 35.855 35.732 35.605 35.483 35.356 35.19 35.033 34.896 34.756 34.618 34.47 34.295 34.128 33.988 33.825 33.649 33.455 33.236 33.083 32.937 32.713 32.536 32.342 32.245 32.046 31.811 31.543 31.405 31.234 30.972 30.801 30.619 30.196 29.95 29.687 29.357 28.947 28.437 27.707 24.19 -3 ,26853 ,KEBNE ,17025748,Wed Dec 22 13:01:30 CET,Wed Dec 22 15:02:33 CET,0.0 3.949 4.874 5.513 6.036 6.474 6.833 7.13 7.654 7.893 8.117 8.498 8.746 8.934 9.278 9.606 9.921 10.067 10.348 10.617 10.998 11.255 11.517 11.892 12.251 12.581 12.884 13.18 13.582 13.969 14.327 14.751 15.163 15.565 16.017 16.52 17.022 17.565 18.136 18.741 19.398 20.155 20.993 21.795 22.711 23.731 24.916 26.279 27.897 29.776 31.999 33.756 34.738 35.341 35.695 35.884 35.99 36.05 36.043 35.997 35.932 35.855 35.766 35.661 35.552 35.439 35.306 35.176 35.05 34.906 34.748 34.612 34.464 34.307 34.185 34.044 33.89 33.732 33.545 33.395 33.24 33.022 32.868 32.691 32.59 32.366 32.13 31.878 31.744 31.586 31.321 31.157 30.979 30.564 30.32 30.049 29.724 29.339 28.848 28.108 24.826 -4 ,24031 ,KEBNE ,17025749,Wed Dec 22 13:01:30 CET,Wed Dec 22 15:03:32 CET,0.0 3.029 3.85 4.467 4.959 5.377 5.766 6.128 6.769 7.05 7.301 7.703 7.969 8.192 8.619 9.005 9.359 9.522 9.827 10.124 10.557 10.813 11.046 11.388 11.703 12.002 12.306 12.596 12.954 13.307 13.653 14.06 14.447 14.822 15.26 15.761 16.233 16.736 17.274 17.852 18.451 19.12 19.927 20.739 21.681 22.682 23.808 25.128 26.654 28.4 30.545 32.307 33.269 33.83 34.137 34.325 34.408 34.387 34.337 34.264 34.17 34.05 33.921 33.798 33.673 33.544 33.392 33.242 33.102 32.944 32.776 32.635 32.48 32.308 32.167 32.017 31.857 31.68 31.49 31.329 31.133 30.827 30.594 30.331 30.198 29.928 29.637 29.339 29.176 28.962 28.604 28.378 28.143 27.601 27.303 27.016 26.695 26.307 25.802 25.095 21.748 -5 ,5419 ,KEBNE ,17025750,Wed Dec 22 13:01:30 CET,Wed Dec 22 15:02:37 CET,0.0 4.378 5.215 5.816 6.318 6.767 7.168 7.542 8.194 8.479 8.745 9.192 9.48 9.701 10.112 10.472 10.802 10.962 11.283 11.595 12.016 12.287 12.553 12.927 13.279 13.608 13.92 14.231 14.635 15.011 15.351 15.751 16.143 16.539 17.002 17.514 18.006 18.552 19.134 19.732 20.373 21.088 21.92 22.764 23.702 24.711 25.907 27.277 28.788 30.553 32.758 34.531 35.474 35.999 36.357 36.588 36.694 36.734 36.738 36.698 36.619 36.516 36.39 36.249 36.111 35.986 35.853 35.729 35.606 35.454 35.279 35.125 34.96 34.778 34.629 34.476 34.303 34.099 33.884 33.736 33.585 33.343 33.169 32.989 32.898 32.708 32.494 32.232 32.075 31.878 31.58 31.415 31.234 30.834 30.589 30.309 29.983 29.579 29.034 28.187 24.784 -6 ,21971 ,KEBNE ,17026017,Wed Dec 22 13:47:36 CET,Wed Dec 22 15:04:45 CET,0.0 3.886 4.863 5.538 6.067 6.512 6.901 7.249 7.838 8.099 8.351 8.792 9.073 9.294 9.712 10.093 10.445 10.615 10.953 11.273 11.72 11.992 12.238 12.578 12.892 13.198 13.49 13.776 14.141 14.492 14.837 15.254 15.663 16.067 16.533 17.053 17.548 18.073 18.622 19.181 19.752 20.408 21.185 21.955 22.842 23.837 24.98 26.292 27.848 29.664 31.89 33.614 34.55 35.122 35.432 35.566 35.597 35.549 35.47 35.377 35.285 35.179 35.051 34.913 34.762 34.61 34.434 34.251 34.072 33.881 33.688 33.532 33.366 33.189 33.048 32.888 32.716 32.544 32.349 32.206 32.052 31.782 31.588 31.397 31.305 31.115 30.895 30.637 30.509 30.353 30.076 29.911 29.738 29.328 29.068 28.784 28.458 28.003 27.476 26.793 23.62 -7 ,14866 ,KEBNE ,17026018,Wed Dec 22 13:47:38 CET,Wed Dec 22 15:04:25 CET,0.0 5.696 6.549 7.159 7.648 8.047 8.403 8.745 9.342 9.605 9.868 10.298 10.562 10.763 11.125 11.488 11.86 12.028 12.324 12.602 13.0 13.261 13.532 13.913 14.26 14.589 14.901 15.211 15.608 15.973 16.315 16.734 17.143 17.538 18.0 18.517 19.003 19.525 20.077 20.661 21.267 21.931 22.734 23.541 24.483 25.543 26.714 27.986 29.446 31.165 33.301 35.026 35.977 36.49 36.748 36.92 36.986 36.988 36.964 36.901 36.811 36.694 36.566 36.411 36.25 36.116 35.978 35.847 35.719 35.554 35.363 35.215 35.064 34.899 34.771 34.634 34.482 34.313 34.11 33.965 33.821 33.587 33.421 33.242 33.139 32.926 32.708 32.463 32.328 32.166 31.886 31.698 31.493 31.036 30.764 30.442 30.071 29.654 29.114 28.29 24.702 -8 ,21400 ,KEBNE ,17026019,Wed Dec 22 13:47:37 CET,Wed Dec 22 15:05:59 CET,0.0 12.018 12.932 13.581 14.125 14.622 15.071 15.449 16.118 16.418 16.703 17.193 17.483 17.726 18.194 18.594 18.964 19.138 19.468 19.801 20.281 20.56 20.808 21.161 21.504 21.831 22.134 22.424 22.805 23.174 23.547 24.0 24.415 24.808 25.26 25.762 26.237 26.761 27.331 27.928 28.55 29.243 30.045 30.864 31.837 32.944 34.236 35.628 37.181 38.997 41.238 43.049 44.008 44.551 44.869 45.068 45.172 45.198 45.165 45.085 45.004 44.923 44.818 44.71 44.595 44.475 44.336 44.199 44.072 43.926 43.771 43.641 43.493 43.323 43.182 43.042 42.888 42.706 42.508 42.364 42.212 41.965 41.793 41.61 41.512 41.315 41.09 40.824 40.677 40.499 40.222 40.054 39.864 39.429 39.178 38.885 38.529 38.125 37.592 36.779 33.857 -9 ,30426 ,KEBNE ,17025754,Wed Dec 22 13:01:35 CET,Wed Dec 22 15:02:21 CET,0.0 4.605 5.472 6.096 6.602 7.023 7.369 7.692 8.282 8.551 8.798 9.19 9.452 9.652 10.026 10.371 10.689 10.851 11.166 11.457 11.86 12.109 12.348 12.689 13.019 13.33 13.63 13.93 14.323 14.707 15.067 15.483 15.883 16.27 16.716 17.211 17.678 18.183 18.724 19.297 19.912 20.609 21.422 22.225 23.162 24.22 25.411 26.769 28.364 30.172 32.342 34.084 35.006 35.526 35.849 36.031 36.108 36.136 36.125 36.068 35.971 35.852 35.728 35.594 35.452 35.312 35.144 34.986 34.852 34.706 34.539 34.394 34.232 34.048 33.9 33.747 33.589 33.414 33.207 33.061 32.904 32.654 32.484 32.303 32.206 31.991 31.757 31.5 31.353 31.178 30.9 30.737 30.554 30.12 29.867 29.568 29.219 28.837 28.374 27.676 24.414 -10 ,12255 ,KEBNE ,17025755,Wed Dec 22 13:01:38 CET,Wed Dec 22 15:03:10 CET,0.0 5.513 6.446 7.101 7.639 8.087 8.478 8.834 9.455 9.728 9.983 10.415 10.696 10.912 11.308 11.677 12.027 12.195 12.527 12.838 13.268 13.538 13.792 14.163 14.522 14.866 15.195 15.511 15.916 16.287 16.629 17.044 17.438 17.821 18.275 18.766 19.226 19.73 20.27 20.867 21.501 22.201 23.031 23.889 24.864 25.886 27.059 28.417 29.983 31.768 33.912 35.618 36.552 37.092 37.393 37.549 37.612 37.636 37.612 37.547 37.47 37.383 37.27 37.128 36.99 36.868 36.725 36.58 36.433 36.262 36.097 35.965 35.828 35.672 35.532 35.372 35.197 35.006 34.808 34.67 34.516 34.267 34.089 33.895 33.797 33.593 33.351 33.083 32.945 32.776 32.478 32.296 32.107 31.647 31.372 31.075 30.718 30.285 29.771 29.055 25.199 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_19.txt deleted file mode 100644 index ef46b4b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28742 ,KEBNE ,16720784,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:58:10 CET,0.0 2.205 2.822 3.302 3.72 4.108 4.465 4.8 5.424 5.71 5.983 6.335 6.757 6.996 7.462 7.921 8.377 8.604 9.043 9.462 10.07 10.46 10.848 11.418 11.973 12.527 13.064 13.589 14.281 14.971 15.658 16.498 17.319 18.128 19.096 20.222 21.331 22.578 23.957 25.464 27.093 28.996 31.291 33.673 36.593 40.036 44.203 49.167 55.465 63.58 74.607 85.117 92.185 97.292 101.125 104.125 106.423 108.268 109.728 111.068 112.1 112.918 113.639 114.291 114.869 115.358 115.816 116.196 116.51 116.818 117.116 117.324 117.514 117.692 117.805 117.912 118.016 118.106 118.183 118.216 118.235 118.245 118.251 118.242 118.221 118.157 118.072 117.969 117.913 117.769 117.584 117.487 117.383 117.07 116.873 116.656 116.384 116.044 115.606 114.953 111.802 -2 ,18872 ,KEBNE ,16720785,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 03:01:19 CET,0.0 2.183 2.829 3.333 3.78 4.173 4.529 4.864 5.468 5.755 6.032 6.388 6.811 7.059 7.538 7.993 8.433 8.649 9.07 9.482 10.101 10.51 10.902 11.473 12.031 12.587 13.139 13.676 14.377 15.057 15.72 16.544 17.363 18.168 19.117 20.236 21.324 22.515 23.843 25.318 26.908 28.758 31.043 33.448 36.351 39.707 43.799 48.824 55.156 63.155 73.855 84.055 91.01 96.081 99.908 102.905 105.217 107.111 108.57 109.91 110.988 111.873 112.653 113.317 113.869 114.325 114.745 115.079 115.344 115.593 115.819 115.971 116.115 116.273 116.379 116.474 116.565 116.642 116.681 116.68 116.669 116.642 116.62 116.585 116.559 116.496 116.405 116.298 116.228 116.098 115.972 115.866 115.761 115.481 115.292 115.083 114.823 114.434 113.858 112.961 109.272 -3 ,14853 ,KEBNE ,16720786,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 03:01:12 CET,0.0 2.225 2.88 3.388 3.832 4.218 4.568 4.899 5.512 5.799 6.081 6.462 6.9 7.156 7.647 8.105 8.545 8.761 9.194 9.609 10.209 10.605 10.99 11.55 12.109 12.665 13.213 13.745 14.438 15.116 15.787 16.625 17.442 18.251 19.206 20.291 21.379 22.611 23.967 25.479 27.128 28.984 31.184 33.512 36.375 39.734 43.762 48.564 54.714 62.629 73.416 83.662 90.55 95.566 99.336 102.322 104.656 106.568 108.084 109.462 110.537 111.435 112.233 112.927 113.533 114.06 114.559 114.95 115.241 115.504 115.768 115.967 116.15 116.324 116.446 116.557 116.651 116.728 116.797 116.837 116.875 116.91 116.905 116.888 116.873 116.837 116.792 116.724 116.661 116.519 116.341 116.211 116.071 115.735 115.496 115.207 114.891 114.486 113.976 113.203 110.13 -4 ,14455 ,KEBNE ,16720787,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:59:31 CET,0.0 1.899 2.544 3.08 3.516 3.889 4.23 4.544 5.126 5.402 5.67 6.022 6.446 6.694 7.176 7.644 8.093 8.309 8.74 9.16 9.763 10.152 10.536 11.105 11.665 12.215 12.758 13.296 14.006 14.696 15.37 16.204 17.037 17.865 18.832 19.95 21.06 22.292 23.648 25.139 26.756 28.629 30.902 33.276 36.14 39.467 43.491 48.335 54.495 62.44 73.254 83.679 90.748 95.888 99.753 102.817 105.215 107.176 108.721 110.068 111.096 111.953 112.726 113.416 113.995 114.465 114.911 115.286 115.587 115.867 116.144 116.355 116.546 116.736 116.855 116.946 117.04 117.13 117.206 117.251 117.285 117.316 117.317 117.31 117.307 117.281 117.227 117.155 117.094 116.962 116.855 116.763 116.658 116.408 116.24 116.021 115.743 115.4 114.898 114.17 110.769 -5 ,19831 ,KEBNE ,16720788,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 03:00:47 CET,0.0 2.032 2.714 3.244 3.668 4.049 4.409 4.742 5.369 5.666 5.958 6.334 6.77 7.027 7.507 7.965 8.412 8.627 9.057 9.483 10.11 10.524 10.918 11.487 12.05 12.602 13.143 13.679 14.378 15.053 15.721 16.544 17.353 18.161 19.124 20.226 21.315 22.555 23.961 25.494 27.134 29.057 31.362 33.734 36.628 40.044 44.242 49.276 55.52 63.459 74.338 84.729 91.658 96.669 100.433 103.409 105.711 107.538 108.954 110.257 111.269 112.094 112.839 113.473 113.981 114.408 114.805 115.11 115.338 115.562 115.774 115.94 116.109 116.235 116.305 116.371 116.433 116.467 116.471 116.469 116.467 116.451 116.426 116.385 116.35 116.269 116.183 116.074 115.997 115.85 115.658 115.516 115.387 115.088 114.885 114.66 114.385 113.989 113.488 112.695 109.758 -6 ,21391 ,KEBNE ,16720789,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:59:53 CET,0.0 2.047 2.688 3.181 3.594 3.971 4.333 4.681 5.323 5.612 5.886 6.239 6.674 6.928 7.411 7.878 8.328 8.548 8.979 9.404 10.026 10.437 10.842 11.428 12.0 12.556 13.09 13.622 14.33 15.017 15.694 16.532 17.362 18.179 19.145 20.239 21.31 22.517 23.856 25.338 26.972 28.882 31.175 33.572 36.467 39.848 43.956 48.893 55.183 63.23 74.189 84.581 91.495 96.605 100.466 103.499 105.879 107.818 109.32 110.678 111.724 112.562 113.303 113.975 114.569 115.051 115.48 115.822 116.117 116.406 116.666 116.865 117.064 117.246 117.37 117.479 117.568 117.645 117.704 117.729 117.755 117.755 117.723 117.688 117.664 117.6 117.531 117.439 117.369 117.237 117.074 116.941 116.802 116.485 116.266 116.0 115.671 115.248 114.705 113.822 109.639 -7 ,3505 ,KEBNE ,16720790,Sat Nov 27 00:58:22 CET,Sat Nov 27 02:58:10 CET,0.0 2.058 2.728 3.284 3.738 4.124 4.485 4.818 5.432 5.722 6.0 6.364 6.806 7.06 7.547 8.02 8.486 8.71 9.141 9.565 10.186 10.582 10.969 11.551 12.125 12.681 13.229 13.771 14.468 15.167 15.866 16.706 17.531 18.346 19.324 20.445 21.532 22.756 24.118 25.59 27.163 29.004 31.258 33.614 36.48 39.826 43.909 48.856 55.085 63.053 73.821 84.141 91.13 96.188 99.996 103.011 105.362 107.288 108.8 110.153 111.238 112.141 112.932 113.621 114.199 114.681 115.144 115.522 115.83 116.114 116.381 116.581 116.765 116.942 117.064 117.18 117.286 117.369 117.429 117.463 117.484 117.48 117.467 117.441 117.415 117.364 117.317 117.245 117.19 117.067 116.949 116.842 116.719 116.439 116.26 116.019 115.734 115.367 114.86 114.149 111.376 -8 ,4525 ,KEBNE ,16720791,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 02:58:40 CET,0.0 2.107 2.768 3.267 3.696 4.083 4.439 4.769 5.395 5.689 5.967 6.332 6.768 7.021 7.495 7.96 8.402 8.617 9.053 9.48 10.087 10.478 10.863 11.43 11.991 12.546 13.094 13.63 14.332 15.021 15.7 16.547 17.382 18.209 19.2 20.326 21.419 22.648 24.021 25.545 27.205 29.12 31.415 33.816 36.736 40.13 44.23 49.166 55.349 63.33 74.275 84.629 91.612 96.711 100.56 103.643 106.064 108.011 109.501 110.838 111.877 112.721 113.461 114.124 114.72 115.224 115.69 116.055 116.345 116.633 116.9 117.093 117.273 117.43 117.529 117.603 117.655 117.711 117.749 117.755 117.754 117.754 117.751 117.716 117.688 117.605 117.496 117.363 117.282 117.139 116.967 116.854 116.742 116.463 116.278 116.037 115.755 115.406 114.791 113.84 106.682 -9 ,31313 ,KEBNE ,16720792,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 02:59:44 CET,0.0 2.18 2.803 3.275 3.68 4.063 4.428 4.76 5.354 5.636 5.92 6.283 6.707 6.951 7.432 7.896 8.342 8.556 8.976 9.391 10.0 10.401 10.799 11.383 11.956 12.516 13.072 13.624 14.342 15.047 15.74 16.595 17.443 18.268 19.247 20.379 21.499 22.762 24.131 25.627 27.261 29.149 31.438 33.82 36.715 40.139 44.276 49.24 55.448 63.352 74.214 84.613 91.602 96.703 100.589 103.647 106.0 107.942 109.489 110.895 111.994 112.902 113.704 114.389 114.954 115.414 115.857 116.222 116.511 116.782 117.053 117.253 117.422 117.572 117.67 117.762 117.847 117.922 117.98 118.003 118.019 118.016 118.002 117.972 117.947 117.882 117.802 117.709 117.643 117.513 117.37 117.263 117.151 116.893 116.735 116.542 116.314 116.018 115.579 114.83 111.596 -10 ,23634 ,KEBNE ,16720793,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:59:01 CET,0.0 2.223 2.882 3.359 3.778 4.168 4.546 4.9 5.546 5.841 6.125 6.488 6.938 7.199 7.696 8.173 8.636 8.863 9.302 9.736 10.369 10.777 11.185 11.789 12.367 12.928 13.484 14.034 14.753 15.454 16.159 17.029 17.864 18.685 19.671 20.815 21.938 23.193 24.59 26.112 27.766 29.717 32.054 34.477 37.43 40.863 45.004 49.983 56.32 64.506 75.615 86.133 93.235 98.417 102.32 105.421 107.814 109.783 111.35 112.751 113.836 114.748 115.547 116.202 116.727 117.164 117.603 117.958 118.227 118.469 118.697 118.863 118.996 119.103 119.18 119.268 119.336 119.366 119.371 119.361 119.348 119.304 119.254 119.177 119.119 118.985 118.886 118.788 118.724 118.553 118.291 118.125 117.932 117.527 117.294 117.019 116.663 116.243 115.695 114.801 111.177 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_26.txt deleted file mode 100644 index bc5b0c51..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_29_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30276 ,KEBNE ,16720794,Sat Nov 27 00:58:25 CET,Sat Nov 27 02:56:22 CET,0.0 2.108 2.744 3.219 3.616 3.958 4.267 4.56 5.096 5.341 5.563 5.799 6.166 6.367 6.764 7.128 7.473 7.637 7.971 8.304 8.782 9.08 9.36 9.771 10.162 10.555 10.949 11.329 11.821 12.295 12.765 13.345 13.899 14.43 15.055 15.748 16.431 17.2 18.031 18.944 19.922 21.037 22.329 23.594 25.124 26.876 28.928 31.37 34.28 37.739 42.18 46.178 48.669 50.354 51.613 52.55 53.194 53.688 54.053 54.332 54.518 54.647 54.739 54.798 54.817 54.812 54.793 54.766 54.736 54.693 54.639 54.581 54.49 54.376 54.284 54.19 54.083 53.965 53.836 53.727 53.599 53.384 53.233 53.08 52.998 52.822 52.634 52.403 52.27 52.015 51.841 51.679 51.491 51.043 50.782 50.493 50.19 49.812 49.296 48.61 46.111 -2 ,12965 ,KEBNE ,16720795,Sat Nov 27 00:58:25 CET,Sat Nov 27 02:56:22 CET,0.0 2.568 3.23 3.709 4.108 4.455 4.764 5.04 5.542 5.785 6.014 6.269 6.642 6.836 7.216 7.579 7.919 8.087 8.412 8.733 9.207 9.5 9.786 10.215 10.634 11.035 11.419 11.797 12.296 12.771 13.234 13.8 14.344 14.879 15.499 16.195 16.873 17.611 18.409 19.273 20.199 21.269 22.555 23.851 25.374 27.125 29.215 31.633 34.502 38.097 42.693 46.761 49.332 51.037 52.222 53.113 53.715 54.143 54.456 54.661 54.792 54.915 55.01 55.045 55.024 54.993 54.96 54.902 54.832 54.739 54.628 54.545 54.454 54.343 54.245 54.142 54.017 53.882 53.739 53.635 53.527 53.333 53.179 53.005 52.918 52.742 52.539 52.297 52.157 51.88 51.7 51.533 51.344 50.878 50.582 50.236 49.863 49.442 48.909 48.205 45.958 -3 ,25836 ,KEBNE ,16720796,Sat Nov 27 00:58:33 CET,Sat Nov 27 02:56:22 CET,0.0 2.96 3.594 4.07 4.484 4.851 5.172 5.469 6.001 6.246 6.491 6.788 7.171 7.372 7.754 8.12 8.468 8.638 8.968 9.284 9.745 10.047 10.333 10.756 11.181 11.588 11.981 12.359 12.835 13.303 13.773 14.339 14.884 15.409 16.016 16.721 17.397 18.125 18.929 19.806 20.755 21.836 23.117 24.427 25.969 27.717 29.764 32.148 35.065 38.573 42.911 46.716 49.158 50.82 51.868 52.606 53.205 53.677 53.957 54.155 54.276 54.342 54.358 54.339 54.335 54.302 54.233 54.165 54.093 54.019 53.924 53.829 53.727 53.594 53.482 53.363 53.231 53.085 52.935 52.817 52.686 52.489 52.349 52.201 52.115 51.923 51.684 51.396 51.257 51.001 50.813 50.641 50.469 50.054 49.79 49.498 49.148 48.725 48.201 47.505 45.44 -4 ,30066 ,KEBNE ,16720797,Sat Nov 27 00:58:33 CET,Sat Nov 27 02:56:22 CET,0.0 2.418 3.044 3.512 3.902 4.246 4.567 4.864 5.402 5.639 5.864 6.127 6.509 6.712 7.105 7.48 7.833 7.999 8.319 8.63 9.075 9.366 9.659 10.076 10.474 10.86 11.238 11.609 12.096 12.581 13.047 13.608 14.163 14.7 15.332 16.042 16.722 17.473 18.285 19.142 20.078 21.196 22.488 23.785 25.344 27.11 29.194 31.596 34.451 37.933 42.493 46.639 49.193 50.915 52.154 53.007 53.564 54.008 54.349 54.627 54.826 54.973 55.063 55.091 55.093 55.099 55.097 55.067 55.034 54.988 54.914 54.845 54.762 54.666 54.584 54.497 54.395 54.282 54.161 54.066 53.961 53.779 53.645 53.5 53.426 53.276 53.108 52.898 52.786 52.553 52.417 52.269 52.089 51.658 51.429 51.19 50.936 50.63 50.244 49.688 47.8 -5 ,11622 ,KEBNE ,16720798,Sat Nov 27 00:58:33 CET,Sat Nov 27 02:53:25 CET,0.0 2.221 2.833 3.297 3.694 4.065 4.385 4.668 5.204 5.46 5.694 5.967 6.362 6.575 6.976 7.361 7.74 7.921 8.267 8.6 9.072 9.369 9.653 10.073 10.488 10.898 11.295 11.674 12.16 12.637 13.098 13.641 14.193 14.746 15.375 16.08 16.761 17.508 18.329 19.211 20.122 21.169 22.459 23.792 25.361 27.152 29.241 31.62 34.463 38.003 42.645 46.7 49.181 50.831 51.956 52.795 53.415 53.856 54.151 54.374 54.493 54.54 54.591 54.624 54.615 54.589 54.572 54.55 54.513 54.463 54.387 54.295 54.187 54.07 53.964 53.861 53.748 53.61 53.454 53.341 53.228 53.057 52.919 52.741 52.643 52.436 52.209 51.953 51.818 51.557 51.377 51.193 51.002 50.583 50.342 50.067 49.739 49.336 48.809 48.141 46.112 -6 ,4176 ,KEBNE ,16720799,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 02:59:46 CET,0.0 2.105 2.748 3.234 3.626 3.956 4.253 4.534 5.059 5.302 5.548 5.837 6.221 6.43 6.824 7.195 7.552 7.722 8.052 8.378 8.85 9.154 9.44 9.846 10.25 10.656 11.045 11.414 11.892 12.362 12.829 13.404 13.958 14.513 15.165 15.87 16.529 17.25 18.056 18.935 19.869 20.938 22.179 23.434 24.948 26.682 28.727 31.085 33.916 37.449 42.044 46.12 48.706 50.467 51.662 52.497 53.127 53.591 53.913 54.172 54.319 54.446 54.54 54.59 54.611 54.594 54.544 54.487 54.455 54.413 54.344 54.268 54.172 54.044 53.932 53.819 53.709 53.576 53.417 53.317 53.204 53.004 52.856 52.681 52.588 52.402 52.198 51.965 51.832 51.571 51.395 51.223 51.026 50.572 50.294 49.961 49.585 49.193 48.703 47.973 45.635 -7 ,28901 ,KEBNE ,16720800,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 03:01:00 CET,0.0 2.177 2.82 3.316 3.723 4.085 4.405 4.693 5.216 5.46 5.69 5.942 6.309 6.513 6.914 7.284 7.63 7.799 8.137 8.461 8.926 9.231 9.521 9.935 10.334 10.718 11.091 11.463 11.946 12.4 12.855 13.419 13.954 14.465 15.068 15.779 16.459 17.218 18.05 18.93 19.893 21.013 22.303 23.563 25.038 26.748 28.783 31.151 34.028 37.578 42.163 46.099 48.515 50.192 51.37 52.181 52.73 53.167 53.497 53.773 53.976 54.127 54.221 54.26 54.295 54.33 54.309 54.254 54.19 54.097 53.977 53.883 53.803 53.701 53.601 53.479 53.332 53.184 53.033 52.924 52.803 52.593 52.445 52.273 52.18 51.969 51.747 51.538 51.421 51.17 50.975 50.791 50.602 50.17 49.913 49.614 49.272 48.887 48.35 47.571 44.862 -8 ,28823 ,KEBNE ,16720801,Sat Nov 27 00:58:20 CET,Sat Nov 27 03:00:09 CET,0.0 2.409 3.054 3.526 3.93 4.29 4.618 4.922 5.457 5.7 5.939 6.216 6.6 6.799 7.182 7.549 7.889 8.058 8.391 8.712 9.171 9.464 9.746 10.154 10.553 10.946 11.328 11.702 12.189 12.656 13.104 13.657 14.192 14.701 15.296 15.97 16.637 17.367 18.139 18.982 19.91 20.976 22.24 23.522 25.039 26.76 28.82 31.233 34.155 37.786 42.37 46.36 48.876 50.557 51.706 52.588 53.22 53.651 53.953 54.201 54.356 54.448 54.518 54.592 54.656 54.68 54.674 54.648 54.607 54.537 54.44 54.355 54.253 54.144 54.056 53.955 53.844 53.725 53.604 53.503 53.368 53.143 52.978 52.805 52.718 52.522 52.318 52.081 51.934 51.666 51.5 51.328 51.129 50.707 50.47 50.203 49.884 49.494 48.976 48.229 45.945 -9 ,13751 ,KEBNE ,16720802,Sat Nov 27 00:58:22 CET,Sat Nov 27 03:04:09 CET,0.0 1.881 2.533 3.039 3.427 3.76 4.065 4.361 4.903 5.155 5.391 5.642 6.02 6.22 6.608 6.981 7.332 7.502 7.842 8.173 8.635 8.927 9.221 9.661 10.078 10.471 10.853 11.228 11.707 12.172 12.638 13.21 13.76 14.276 14.876 15.568 16.254 17.017 17.837 18.716 19.652 20.721 21.973 23.279 24.83 26.56 28.633 31.093 34.083 37.735 42.396 46.555 49.155 50.924 52.185 53.096 53.756 54.263 54.612 54.872 55.058 55.195 55.299 55.367 55.407 55.419 55.391 55.355 55.32 55.275 55.199 55.118 55.037 54.933 54.832 54.713 54.594 54.471 54.336 54.239 54.122 53.927 53.791 53.65 53.576 53.411 53.206 52.977 52.861 52.606 52.469 52.314 52.13 51.713 51.467 51.198 50.877 50.489 50.011 49.337 46.077 -10 ,25595 ,KEBNE ,16720803,Sat Nov 27 00:58:22 CET,Sat Nov 27 03:00:20 CET,0.0 2.106 2.71 3.166 3.535 3.847 4.142 4.418 4.918 5.157 5.387 5.644 6.028 6.231 6.627 6.992 7.332 7.501 7.828 8.141 8.595 8.897 9.191 9.61 10.015 10.408 10.785 11.16 11.663 12.149 12.621 13.191 13.743 14.278 14.901 15.597 16.266 17.005 17.808 18.683 19.618 20.664 21.885 23.158 24.689 26.423 28.467 30.829 33.803 37.459 41.981 46.003 48.556 50.287 51.513 52.388 53.01 53.468 53.783 54.044 54.23 54.378 54.481 54.548 54.589 54.592 54.577 54.562 54.537 54.508 54.462 54.401 54.321 54.21 54.113 54.004 53.882 53.749 53.594 53.477 53.348 53.123 52.964 52.797 52.712 52.544 52.349 52.129 52.008 51.756 51.569 51.382 51.185 50.761 50.538 50.287 49.991 49.641 49.217 48.618 46.356 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_30_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_30_19.txt deleted file mode 100644 index cd7ae83d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_30_19.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10538 ,KEBNE ,16720804,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 02:59:48 CET,0.0 1.854 2.447 2.864 3.216 3.526 3.8 4.04 4.457 4.643 4.823 5.102 5.284 5.411 5.647 5.877 6.088 6.182 6.371 6.551 6.799 6.961 7.122 7.344 7.541 7.721 7.885 8.031 8.212 8.392 8.552 8.723 8.888 9.031 9.16 9.274 9.367 9.46 9.555 9.637 9.7 9.746 9.769 9.758 9.704 9.578 9.34 8.983 8.36 7.284 5.406 3.165 1.359 -0.172 -1.464 -2.585 -3.575 -4.49 -5.279 -6.038 -6.664 -7.233 -7.794 -8.315 -8.811 -9.275 -9.749 -10.17 -10.546 -10.942 -11.355 -11.711 -12.08 -12.45 -12.75 -13.07 -13.395 -13.729 -14.078 -14.329 -14.597 -15.009 -15.307 -15.618 -15.776 -16.109 -16.474 -16.891 -17.112 -17.378 -17.804 -18.056 -18.307 -18.899 -19.256 -19.649 -20.085 -20.615 -21.266 -22.133 -31.304 -2 ,21252 ,KEBNE ,16720805,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 03:01:15 CET,0.0 3.346 3.999 4.442 4.808 5.118 5.383 5.611 5.99 6.156 6.309 6.56 6.726 6.853 7.082 7.279 7.452 7.536 7.701 7.853 8.06 8.19 8.317 8.478 8.615 8.754 8.886 9.004 9.152 9.288 9.413 9.548 9.663 9.77 9.883 9.998 10.104 10.208 10.308 10.398 10.455 10.491 10.499 10.47 10.396 10.258 10.034 9.66 9.013 7.962 6.16 3.957 2.141 0.652 -0.571 -1.7 -2.697 -3.58 -4.38 -5.188 -5.85 -6.438 -6.996 -7.53 -8.026 -8.464 -8.938 -9.366 -9.731 -10.119 -10.551 -10.911 -11.296 -11.705 -12.03 -12.389 -12.765 -13.15 -13.54 -13.803 -14.078 -14.536 -14.86 -15.185 -15.353 -15.706 -16.066 -16.457 -16.68 -16.962 -17.404 -17.682 -17.966 -18.562 -18.898 -19.294 -19.744 -20.243 -20.851 -21.698 -26.994 -3 ,16907 ,KEBNE ,16720806,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 02:59:22 CET,0.0 3.218 3.833 4.275 4.634 4.923 5.178 5.41 5.806 5.98 6.146 6.422 6.593 6.716 6.946 7.162 7.36 7.455 7.646 7.819 8.049 8.194 8.328 8.496 8.65 8.801 8.942 9.067 9.211 9.33 9.443 9.596 9.745 9.88 10.008 10.114 10.224 10.35 10.454 10.528 10.583 10.633 10.656 10.636 10.563 10.411 10.21 9.87 9.193 8.081 6.209 3.989 2.166 0.642 -0.638 -1.779 -2.777 -3.672 -4.437 -5.191 -5.834 -6.402 -6.944 -7.457 -7.936 -8.38 -8.841 -9.249 -9.605 -9.978 -10.382 -10.724 -11.085 -11.46 -11.746 -12.051 -12.367 -12.708 -13.077 -13.326 -13.578 -13.986 -14.277 -14.57 -14.724 -15.053 -15.393 -15.76 -15.962 -16.215 -16.618 -16.853 -17.1 -17.667 -17.991 -18.349 -18.758 -19.257 -19.87 -20.759 -25.708 -4 ,25987 ,KEBNE ,16720807,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 03:00:42 CET,0.0 2.56 3.184 3.61 3.958 4.243 4.498 4.722 5.11 5.277 5.428 5.67 5.83 5.951 6.165 6.348 6.522 6.608 6.768 6.915 7.106 7.225 7.339 7.494 7.637 7.767 7.885 7.993 8.12 8.245 8.357 8.478 8.588 8.687 8.8 8.92 9.012 9.124 9.241 9.331 9.394 9.43 9.449 9.432 9.367 9.236 9.018 8.637 7.98 6.977 5.297 3.182 1.421 -0.064 -1.357 -2.524 -3.57 -4.515 -5.322 -6.117 -6.796 -7.403 -7.989 -8.563 -9.101 -9.589 -10.093 -10.549 -10.953 -11.372 -11.804 -12.154 -12.516 -12.885 -13.177 -13.497 -13.83 -14.167 -14.516 -14.765 -15.029 -15.442 -15.728 -16.026 -16.179 -16.496 -16.847 -17.244 -17.45 -17.708 -18.125 -18.376 -18.653 -19.276 -19.618 -19.994 -20.419 -20.921 -21.533 -22.401 -31.925 -5 ,776 ,KEBNE ,16720808,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 02:58:47 CET,0.0 2.806 3.436 3.857 4.195 4.497 4.751 4.967 5.346 5.509 5.659 5.909 6.058 6.17 6.385 6.581 6.76 6.84 6.985 7.128 7.329 7.454 7.568 7.727 7.881 8.024 8.15 8.268 8.412 8.546 8.667 8.802 8.935 9.055 9.183 9.329 9.448 9.552 9.643 9.721 9.775 9.802 9.828 9.834 9.783 9.66 9.426 9.025 8.419 7.433 5.647 3.496 1.669 0.091 -1.194 -2.308 -3.269 -4.134 -4.883 -5.636 -6.289 -6.88 -7.468 -8.032 -8.557 -9.055 -9.579 -10.023 -10.401 -10.809 -11.263 -11.636 -12.001 -12.391 -12.701 -13.014 -13.329 -13.65 -14.001 -14.252 -14.513 -14.921 -15.208 -15.522 -15.689 -16.04 -16.424 -16.824 -17.031 -17.293 -17.693 -17.945 -18.22 -18.814 -19.168 -19.578 -20.051 -20.594 -21.244 -22.177 -27.913 -6 ,21865 ,KEBNE ,16720809,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 03:00:11 CET,0.0 2.483 3.192 3.66 4.052 4.371 4.638 4.872 5.26 5.441 5.614 5.871 6.036 6.162 6.377 6.568 6.749 6.835 7.004 7.163 7.375 7.508 7.64 7.823 7.984 8.131 8.259 8.375 8.518 8.656 8.784 8.92 9.034 9.142 9.265 9.396 9.501 9.594 9.674 9.745 9.811 9.865 9.898 9.897 9.855 9.736 9.55 9.232 8.615 7.639 5.981 3.873 2.14 0.741 -0.474 -1.594 -2.563 -3.404 -4.114 -4.829 -5.443 -6.04 -6.639 -7.213 -7.749 -8.226 -8.725 -9.168 -9.566 -9.981 -10.424 -10.81 -11.228 -11.68 -12.034 -12.397 -12.766 -13.175 -13.619 -13.906 -14.183 -14.631 -14.965 -15.317 -15.504 -15.893 -16.295 -16.738 -16.977 -17.272 -17.764 -18.05 -18.339 -18.986 -19.359 -19.761 -20.215 -20.759 -21.448 -22.399 -26.311 -7 ,30783 ,KEBNE ,16720810,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 02:58:46 CET,0.0 2.444 3.126 3.597 3.965 4.264 4.531 4.775 5.167 5.349 5.521 5.789 5.967 6.097 6.338 6.561 6.768 6.871 7.06 7.225 7.46 7.609 7.748 7.939 8.109 8.267 8.421 8.565 8.741 8.913 9.074 9.245 9.394 9.526 9.649 9.77 9.879 9.971 10.05 10.124 10.193 10.247 10.273 10.264 10.197 10.042 9.806 9.47 8.902 7.92 6.181 4.025 2.242 0.759 -0.532 -1.706 -2.693 -3.582 -4.365 -5.156 -5.836 -6.446 -7.019 -7.557 -8.072 -8.536 -9.023 -9.461 -9.831 -10.21 -10.62 -10.976 -11.323 -11.682 -11.978 -12.307 -12.647 -12.981 -13.345 -13.607 -13.868 -14.279 -14.591 -14.938 -15.118 -15.479 -15.852 -16.249 -16.46 -16.745 -17.204 -17.467 -17.74 -18.382 -18.755 -19.157 -19.607 -20.129 -20.803 -21.755 -25.709 -8 ,14863 ,KEBNE ,16720811,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 02:58:48 CET,0.0 4.606 5.268 5.727 6.089 6.384 6.621 6.839 7.211 7.363 7.503 7.73 7.88 7.999 8.222 8.427 8.618 8.708 8.914 9.104 9.318 9.448 9.565 9.732 9.883 10.013 10.139 10.263 10.41 10.537 10.654 10.781 10.893 11.001 11.12 11.247 11.35 11.439 11.537 11.633 11.694 11.727 11.737 11.701 11.615 11.464 11.189 10.751 10.066 9.001 7.224 5.038 3.181 1.652 0.382 -0.72 -1.677 -2.582 -3.402 -4.22 -4.9 -5.493 -6.062 -6.6 -7.097 -7.55 -8.024 -8.453 -8.835 -9.241 -9.656 -10.006 -10.371 -10.737 -11.027 -11.342 -11.667 -11.992 -12.333 -12.578 -12.84 -13.262 -13.554 -13.86 -14.02 -14.357 -14.715 -15.102 -15.31 -15.568 -15.968 -16.213 -16.478 -17.047 -17.355 -17.694 -18.109 -18.624 -19.228 -20.093 -26.519 -10 ,16327 ,KEBNE ,16720813,Sat Nov 27 00:58:21 CET,Sat Nov 27 02:59:41 CET,0.0 2.78 3.435 3.892 4.252 4.553 4.805 5.034 5.428 5.588 5.741 5.981 6.129 6.245 6.456 6.642 6.818 6.902 7.057 7.201 7.416 7.547 7.657 7.808 7.946 8.072 8.188 8.299 8.436 8.56 8.678 8.806 8.915 9.012 9.123 9.239 9.332 9.419 9.498 9.564 9.611 9.636 9.638 9.614 9.556 9.409 9.135 8.683 7.984 6.911 5.092 2.91 1.135 -0.344 -1.644 -2.822 -3.831 -4.719 -5.49 -6.263 -6.931 -7.504 -8.048 -8.579 -9.074 -9.523 -9.995 -10.43 -10.808 -11.207 -11.63 -11.971 -12.333 -12.713 -13.0 -13.304 -13.641 -13.984 -14.336 -14.584 -14.842 -15.267 -15.568 -15.871 -16.026 -16.355 -16.703 -17.074 -17.269 -17.527 -17.936 -18.191 -18.469 -19.081 -19.411 -19.769 -20.171 -20.672 -21.308 -22.147 -25.394 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_23.txt deleted file mode 100644 index e38c6d1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5634 ,KEBNE ,16720814,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:58:09 CET,0.0 2.136 2.7 3.112 3.445 3.73 3.991 4.236 4.686 4.883 5.064 5.359 5.567 5.72 6.009 6.266 6.502 6.618 6.847 7.072 7.398 7.601 7.792 8.064 8.329 8.604 8.866 9.113 9.423 9.713 10.016 10.385 10.724 11.061 11.453 11.887 12.303 12.754 13.234 13.747 14.306 14.938 15.659 16.379 17.212 18.168 19.319 20.679 22.309 24.213 26.552 28.494 29.603 30.287 30.71 30.943 31.037 31.028 30.998 30.952 30.867 30.769 30.655 30.523 30.367 30.207 30.043 29.891 29.743 29.577 29.385 29.216 29.044 28.862 28.711 28.549 28.371 28.167 27.954 27.798 27.629 27.374 27.18 26.961 26.849 26.627 26.392 26.109 25.946 25.75 25.427 25.238 25.013 24.509 24.243 23.915 23.503 23.013 22.429 21.723 18.609 -2 ,22065 ,KEBNE ,16720815,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:58:05 CET,0.0 2.493 3.063 3.465 3.795 4.081 4.339 4.571 4.977 5.168 5.352 5.626 5.828 5.972 6.25 6.524 6.776 6.897 7.128 7.345 7.653 7.847 8.038 8.313 8.572 8.831 9.083 9.32 9.632 9.933 10.227 10.587 10.924 11.246 11.632 12.065 12.473 12.919 13.399 13.918 14.47 15.1 15.833 16.565 17.425 18.408 19.533 20.815 22.414 24.329 26.702 28.647 29.707 30.367 30.782 30.996 31.074 31.09 31.068 30.985 30.871 30.764 30.657 30.547 30.425 30.28 30.072 29.872 29.715 29.53 29.315 29.142 28.973 28.766 28.582 28.397 28.209 28.017 27.804 27.658 27.516 27.272 27.089 26.874 26.755 26.532 26.296 26.018 25.869 25.695 25.396 25.206 25.002 24.561 24.319 24.04 23.712 23.314 22.796 22.132 19.503 -3 ,21540 ,KEBNE ,16720816,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:59:18 CET,0.0 2.329 2.912 3.319 3.661 3.951 4.217 4.461 4.888 5.091 5.28 5.569 5.773 5.919 6.211 6.489 6.742 6.864 7.098 7.325 7.656 7.861 8.058 8.344 8.617 8.874 9.128 9.374 9.685 9.984 10.268 10.61 10.939 11.256 11.617 12.017 12.41 12.855 13.33 13.838 14.379 14.987 15.684 16.402 17.257 18.209 19.324 20.607 22.12 23.935 26.171 28.03 29.137 29.846 30.308 30.589 30.736 30.823 30.849 30.81 30.758 30.698 30.59 30.453 30.319 30.17 29.998 29.846 29.7 29.533 29.354 29.202 29.032 28.848 28.69 28.515 28.337 28.153 27.961 27.814 27.648 27.386 27.172 26.927 26.805 26.56 26.288 26.007 25.868 25.676 25.299 25.079 24.856 24.394 24.118 23.797 23.42 22.973 22.402 21.558 18.213 -4 ,2972 ,KEBNE ,16720817,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:58:13 CET,0.0 2.127 2.685 3.087 3.416 3.691 3.936 4.156 4.546 4.726 4.903 5.179 5.387 5.536 5.813 6.082 6.34 6.464 6.696 6.918 7.234 7.432 7.625 7.905 8.171 8.437 8.693 8.935 9.238 9.527 9.812 10.153 10.491 10.814 11.176 11.579 11.973 12.408 12.885 13.404 13.957 14.572 15.269 15.965 16.784 17.749 18.904 20.228 21.779 23.595 25.859 27.791 28.907 29.587 29.973 30.179 30.274 30.292 30.262 30.173 30.094 30.012 29.895 29.77 29.635 29.501 29.338 29.164 29.003 28.827 28.633 28.456 28.26 28.057 27.902 27.737 27.545 27.331 27.114 26.964 26.809 26.558 26.373 26.165 26.053 25.822 25.591 25.338 25.188 25.003 24.677 24.479 24.27 23.805 23.549 23.25 22.871 22.441 21.941 21.244 18.4 -5 ,21122 ,KEBNE ,16720818,Sat Nov 27 00:59:22 CET,Sat Nov 27 02:57:58 CET,0.0 2.44 3.016 3.432 3.777 4.07 4.338 4.584 5.005 5.198 5.391 5.683 5.887 6.04 6.33 6.601 6.86 6.982 7.218 7.447 7.775 7.988 8.192 8.479 8.746 9.005 9.259 9.508 9.823 10.128 10.431 10.789 11.123 11.449 11.823 12.243 12.648 13.09 13.568 14.071 14.593 15.186 15.908 16.654 17.522 18.509 19.677 20.995 22.544 24.401 26.732 28.726 29.891 30.592 31.021 31.297 31.384 31.321 31.207 31.029 30.879 30.77 30.63 30.468 30.302 30.156 29.998 29.837 29.693 29.53 29.342 29.183 29.022 28.831 28.661 28.467 28.25 28.036 27.82 27.659 27.482 27.204 27.008 26.798 26.686 26.437 26.168 25.876 25.715 25.506 25.161 24.975 24.784 24.336 24.057 23.746 23.412 23.023 22.508 21.783 19.051 -6 ,19259 ,KEBNE ,16720819,Sat Nov 27 00:59:22 CET,Sat Nov 27 02:58:22 CET,0.0 2.266 2.822 3.226 3.541 3.824 4.083 4.32 4.743 4.924 5.097 5.381 5.584 5.731 6.017 6.28 6.528 6.65 6.881 7.1 7.42 7.624 7.817 8.095 8.357 8.609 8.857 9.101 9.406 9.697 9.978 10.317 10.642 10.961 11.334 11.745 12.138 12.582 13.07 13.587 14.131 14.749 15.464 16.197 17.062 18.034 19.175 20.47 22.028 23.914 26.209 28.129 29.243 29.89 30.281 30.532 30.664 30.71 30.719 30.665 30.557 30.437 30.305 30.163 30.017 29.877 29.704 29.529 29.372 29.2 29.015 28.859 28.688 28.495 28.348 28.191 28.01 27.818 27.625 27.484 27.336 27.095 26.894 26.685 26.582 26.368 26.131 25.859 25.706 25.51 25.179 24.987 24.782 24.349 24.094 23.8 23.467 23.057 22.52 21.798 19.269 -7 ,25349 ,KEBNE ,16720820,Sat Nov 27 00:59:22 CET,Sat Nov 27 02:59:09 CET,0.0 2.019 2.591 3.026 3.377 3.691 3.961 4.203 4.64 4.836 5.018 5.306 5.516 5.665 5.95 6.221 6.478 6.599 6.825 7.043 7.361 7.557 7.743 8.018 8.29 8.555 8.805 9.047 9.361 9.662 9.945 10.288 10.632 10.965 11.338 11.749 12.155 12.612 13.096 13.607 14.147 14.767 15.513 16.255 17.125 18.083 19.183 20.475 22.042 23.933 26.246 28.205 29.376 30.108 30.557 30.825 30.958 30.986 30.943 30.842 30.734 30.623 30.49 30.339 30.152 29.965 29.764 29.581 29.441 29.281 29.087 28.904 28.696 28.484 28.321 28.148 27.952 27.714 27.465 27.31 27.148 26.876 26.68 26.479 26.372 26.137 25.875 25.613 25.481 25.302 24.971 24.763 24.537 24.048 23.769 23.468 23.119 22.705 22.207 21.52 18.99 -8 ,760 ,KEBNE ,16720821,Sat Nov 27 00:59:22 CET,Sat Nov 27 02:58:41 CET,0.0 2.104 2.66 3.051 3.377 3.692 3.967 4.2 4.636 4.829 5.01 5.291 5.492 5.637 5.923 6.187 6.43 6.548 6.777 6.992 7.298 7.499 7.697 7.976 8.234 8.485 8.729 8.966 9.267 9.561 9.85 10.199 10.538 10.86 11.225 11.632 12.041 12.491 12.971 13.486 14.013 14.615 15.344 16.076 16.931 17.887 18.989 20.234 21.714 23.565 25.841 27.741 28.868 29.578 30.001 30.239 30.345 30.377 30.368 30.308 30.235 30.157 30.054 29.933 29.782 29.621 29.457 29.29 29.124 28.957 28.754 28.562 28.383 28.193 28.017 27.84 27.667 27.495 27.298 27.143 26.981 26.699 26.502 26.305 26.189 25.913 25.611 25.31 25.146 24.932 24.552 24.327 24.084 23.521 23.208 22.89 22.538 22.112 21.512 20.676 17.529 -9 ,2045 ,KEBNE ,16720822,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:58:16 CET,0.0 2.015 2.596 3.003 3.348 3.633 3.883 4.117 4.521 4.701 4.885 5.193 5.4 5.547 5.824 6.08 6.327 6.448 6.679 6.9 7.22 7.425 7.631 7.919 8.183 8.432 8.677 8.928 9.243 9.535 9.828 10.184 10.511 10.834 11.218 11.636 12.026 12.448 12.907 13.416 13.965 14.585 15.301 16.023 16.884 17.855 18.984 20.259 21.752 23.534 25.818 27.754 28.818 29.483 29.886 30.13 30.291 30.368 30.379 30.338 30.26 30.175 30.085 29.973 29.846 29.712 29.567 29.417 29.267 29.1 28.917 28.758 28.584 28.397 28.249 28.085 27.901 27.707 27.499 27.35 27.185 26.907 26.702 26.482 26.367 26.125 25.875 25.608 25.46 25.279 24.969 24.783 24.59 24.108 23.821 23.511 23.164 22.731 22.177 21.424 18.654 -10 ,23983 ,KEBNE ,16720823,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:59:30 CET,0.0 1.976 2.493 2.895 3.221 3.494 3.74 3.971 4.406 4.604 4.791 5.086 5.294 5.444 5.727 5.993 6.246 6.367 6.605 6.827 7.146 7.35 7.539 7.813 8.087 8.354 8.609 8.852 9.176 9.486 9.771 10.116 10.459 10.791 11.169 11.598 12.014 12.487 12.99 13.506 14.064 14.684 15.406 16.163 17.046 18.006 19.125 20.426 21.975 23.817 26.116 28.059 29.146 29.833 30.265 30.509 30.608 30.641 30.637 30.556 30.469 30.388 30.275 30.128 29.976 29.826 29.67 29.533 29.388 29.226 29.037 28.862 28.687 28.493 28.339 28.182 27.994 27.788 27.581 27.438 27.284 27.018 26.821 26.615 26.503 26.259 26.006 25.704 25.534 25.341 25.007 24.811 24.593 24.063 23.776 23.487 23.139 22.679 22.148 21.429 18.199 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_30.txt deleted file mode 100644 index c4946640..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_31_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29777 ,KEBNE ,16720824,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:59:34 CET,0.0 4.969 5.98 6.721 7.347 7.866 8.298 8.685 9.389 9.718 10.004 10.453 10.733 10.947 11.339 11.712 12.045 12.197 12.496 12.793 13.223 13.49 13.737 14.081 14.407 14.73 15.054 15.354 15.724 16.079 16.421 16.825 17.196 17.558 17.978 18.433 18.867 19.343 19.845 20.364 20.926 21.572 22.313 23.051 23.894 24.819 25.897 27.08 28.438 30.073 31.968 33.406 34.131 34.512 34.676 34.677 34.602 34.485 34.355 34.2 34.034 33.868 33.7 33.511 33.317 33.139 32.925 32.711 32.527 32.334 32.112 31.922 31.719 31.487 31.313 31.133 30.937 30.735 30.495 30.324 30.157 29.886 29.696 29.478 29.357 29.118 28.882 28.622 28.471 28.281 27.949 27.754 27.555 27.096 26.832 26.545 26.233 25.889 25.438 24.715 22.236 -2 ,11441 ,KEBNE ,16720825,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:59:52 CET,0.0 5.738 6.75 7.451 8.029 8.526 8.953 9.322 10.005 10.303 10.554 10.946 11.2 11.397 11.783 12.15 12.493 12.656 12.974 13.277 13.719 14.005 14.28 14.681 15.069 15.435 15.785 16.122 16.548 16.951 17.344 17.807 18.227 18.631 19.122 19.649 20.14 20.697 21.288 21.899 22.52 23.2 24.012 24.834 25.742 26.701 27.755 28.908 30.249 31.847 33.656 34.895 35.486 35.741 35.84 35.833 35.769 35.679 35.575 35.445 35.28 35.102 34.927 34.749 34.576 34.412 34.22 34.032 33.859 33.669 33.466 33.285 33.083 32.875 32.706 32.522 32.335 32.142 31.92 31.757 31.592 31.33 31.129 30.913 30.803 30.575 30.317 30.035 29.892 29.714 29.437 29.27 29.085 28.633 28.366 28.069 27.735 27.339 26.826 26.069 23.036 -3 ,26498 ,KEBNE ,16720826,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 03:01:45 CET,0.0 3.525 4.399 5.034 5.54 5.983 6.363 6.691 7.29 7.552 7.795 8.227 8.498 8.695 9.077 9.459 9.799 9.949 10.252 10.557 10.999 11.27 11.529 11.931 12.323 12.689 13.009 13.301 13.671 14.007 14.329 14.729 15.114 15.474 15.91 16.446 16.958 17.47 18.015 18.589 19.178 19.823 20.547 21.274 22.13 23.071 24.143 25.309 26.638 28.214 30.016 31.363 32.062 32.462 32.651 32.669 32.617 32.545 32.424 32.211 31.995 31.794 31.584 31.378 31.176 30.987 30.775 30.583 30.407 30.208 29.997 29.817 29.618 29.396 29.215 29.032 28.851 28.655 28.432 28.27 28.103 27.83 27.635 27.423 27.313 27.078 26.81 26.523 26.377 26.206 25.889 25.695 25.496 25.062 24.819 24.526 24.172 23.785 23.268 22.477 19.405 -4 ,25710 ,KEBNE ,16720827,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 03:00:58 CET,0.0 5.122 6.207 6.97 7.62 8.17 8.662 9.107 9.91 10.262 10.586 11.157 11.486 11.752 12.245 12.679 13.077 13.264 13.614 13.945 14.435 14.742 14.995 15.318 15.621 15.912 16.193 16.466 16.827 17.176 17.498 17.882 18.257 18.615 19.028 19.489 19.924 20.386 20.887 21.423 21.978 22.608 23.331 24.047 24.897 25.842 26.922 28.14 29.556 31.196 33.188 34.718 35.465 35.877 36.061 36.092 36.046 35.962 35.865 35.708 35.536 35.355 35.161 34.968 34.75 34.543 34.346 34.163 33.991 33.798 33.582 33.386 33.162 32.91 32.718 32.526 32.318 32.091 31.86 31.7 31.528 31.249 31.045 30.822 30.702 30.455 30.196 29.925 29.781 29.597 29.294 29.117 28.93 28.517 28.259 27.955 27.614 27.21 26.682 25.973 23.087 -5 ,31137 ,KEBNE ,16720828,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:59:15 CET,0.0 4.894 5.976 6.748 7.401 7.959 8.452 8.903 9.693 10.045 10.379 10.941 11.262 11.498 11.879 12.214 12.536 12.69 12.998 13.313 13.772 14.053 14.321 14.712 15.088 15.458 15.812 16.142 16.572 16.993 17.386 17.829 18.269 18.67 19.084 19.562 20.01 20.515 21.085 21.654 22.232 22.89 23.641 24.36 25.158 26.067 27.122 28.317 29.734 31.428 33.377 34.723 35.341 35.663 35.807 35.827 35.766 35.654 35.522 35.351 35.189 35.041 34.864 34.66 34.455 34.258 34.048 33.858 33.678 33.478 33.265 33.077 32.876 32.675 32.52 32.358 32.183 31.983 31.757 31.599 31.423 31.125 30.912 30.691 30.583 30.345 30.071 29.78 29.631 29.451 29.145 28.964 28.769 28.334 28.075 27.77 27.422 27.013 26.485 25.764 22.677 -6 ,23636 ,KEBNE ,16720829,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 03:00:23 CET,0.0 4.224 5.177 5.818 6.352 6.82 7.221 7.582 8.209 8.497 8.771 9.213 9.498 9.729 10.151 10.527 10.868 11.027 11.331 11.627 12.061 12.328 12.581 12.941 13.292 13.639 13.977 14.309 14.719 15.102 15.478 15.952 16.415 16.824 17.251 17.706 18.13 18.59 19.088 19.611 20.154 20.776 21.514 22.25 23.12 24.076 25.083 26.203 27.583 29.216 31.137 32.551 33.192 33.465 33.554 33.546 33.504 33.42 33.282 33.098 32.918 32.743 32.556 32.373 32.178 31.967 31.726 31.5 31.29 31.047 30.797 30.587 30.36 30.121 29.93 29.72 29.503 29.272 29.011 28.835 28.66 28.363 28.136 27.893 27.766 27.518 27.259 26.991 26.855 26.677 26.376 26.175 25.943 25.453 25.18 24.882 24.561 24.189 23.675 22.907 19.995 -7 ,25500 ,KEBNE ,16720830,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:59:42 CET,0.0 4.98 5.909 6.576 7.09 7.548 7.933 8.283 8.964 9.281 9.567 10.043 10.337 10.569 11.023 11.45 11.855 12.048 12.418 12.782 13.298 13.617 13.922 14.359 14.733 15.044 15.345 15.629 15.987 16.331 16.66 17.052 17.44 17.814 18.268 18.806 19.309 19.861 20.46 21.109 21.726 22.356 23.144 23.966 24.895 25.878 26.975 28.2 29.617 31.298 33.221 34.669 35.453 35.867 36.082 36.179 36.201 36.13 35.991 35.828 35.673 35.506 35.335 35.15 34.965 34.783 34.563 34.347 34.142 33.939 33.735 33.538 33.324 33.095 32.893 32.694 32.506 32.289 32.045 31.876 31.711 31.466 31.283 31.065 30.951 30.73 30.475 30.186 30.029 29.835 29.494 29.289 29.068 28.599 28.34 28.047 27.72 27.331 26.829 26.114 23.32 -8 ,24181 ,KEBNE ,16720831,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 03:00:45 CET,0.0 3.972 4.912 5.556 6.066 6.512 6.917 7.289 7.963 8.275 8.548 8.957 9.22 9.423 9.797 10.149 10.474 10.644 10.997 11.324 11.743 11.994 12.234 12.563 12.879 13.195 13.535 13.888 14.348 14.787 15.203 15.692 16.115 16.508 16.947 17.423 17.915 18.441 18.977 19.544 20.128 20.789 21.562 22.346 23.277 24.282 25.381 26.552 27.862 29.461 31.419 32.864 33.599 33.994 34.16 34.166 34.074 33.927 33.766 33.592 33.408 33.214 33.02 32.819 32.62 32.435 32.224 32.016 31.838 31.637 31.421 31.239 31.02 30.757 30.551 30.352 30.149 29.929 29.69 29.513 29.327 29.055 28.867 28.667 28.555 28.316 28.068 27.786 27.628 27.445 27.11 26.9 26.685 26.162 25.869 25.559 25.198 24.764 24.227 23.477 20.53 -9 ,30025 ,KEBNE ,16720832,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:59:15 CET,0.0 3.588 4.448 5.104 5.634 6.089 6.49 6.858 7.515 7.808 8.088 8.564 8.862 9.094 9.523 9.932 10.314 10.49 10.827 11.148 11.595 11.886 12.153 12.509 12.831 13.124 13.417 13.702 14.077 14.451 14.8 15.211 15.61 15.982 16.399 16.869 17.33 17.855 18.415 19.011 19.635 20.286 21.025 21.757 22.578 23.496 24.57 25.78 27.225 28.956 30.989 32.521 33.259 33.62 33.797 33.873 33.847 33.737 33.562 33.344 33.137 32.956 32.778 32.564 32.357 32.172 31.966 31.751 31.547 31.334 31.109 30.921 30.718 30.485 30.294 30.099 29.889 29.662 29.437 29.277 29.106 28.823 28.607 28.372 28.247 28.003 27.746 27.451 27.299 27.114 26.768 26.551 26.337 25.892 25.632 25.343 24.987 24.554 24.018 23.291 20.691 -10 ,20562 ,KEBNE ,16720833,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:59:16 CET,0.0 3.568 4.547 5.224 5.77 6.238 6.667 7.066 7.77 8.079 8.364 8.837 9.141 9.397 9.904 10.383 10.837 11.047 11.425 11.778 12.288 12.612 12.909 13.326 13.726 14.116 14.512 14.892 15.336 15.766 16.18 16.679 17.186 17.624 18.074 18.557 19.03 19.562 20.142 20.767 21.399 22.086 22.873 23.673 24.59 25.573 26.641 27.862 29.309 30.938 32.884 34.348 35.119 35.577 35.816 35.899 35.903 35.866 35.78 35.613 35.42 35.239 35.057 34.865 34.677 34.492 34.262 34.022 33.787 33.534 33.266 33.044 32.823 32.591 32.412 32.217 32.007 31.788 31.554 31.391 31.221 30.936 30.725 30.493 30.368 30.108 29.84 29.561 29.415 29.227 28.896 28.709 28.513 28.057 27.768 27.435 27.079 26.688 26.159 25.388 22.335 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_24.txt deleted file mode 100644 index 9f485588..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25457 ,KEBNE ,16720834,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:58:44 CET,0.0 2.283 2.875 3.272 3.57 3.842 4.089 4.312 4.7 4.864 5.014 5.261 5.418 5.539 5.745 5.928 6.103 6.194 6.374 6.536 6.756 6.9 7.027 7.177 7.309 7.44 7.565 7.678 7.81 7.941 8.074 8.209 8.315 8.407 8.511 8.632 8.756 8.881 8.99 9.107 9.23 9.34 9.434 9.474 9.47 9.417 9.262 8.965 8.394 7.253 5.206 2.822 0.917 -0.698 -2.071 -3.236 -4.233 -5.116 -5.856 -6.57 -7.173 -7.713 -8.218 -8.695 -9.129 -9.517 -9.917 -10.268 -10.578 -10.904 -11.242 -11.517 -11.802 -12.103 -12.331 -12.569 -12.825 -13.098 -13.381 -13.575 -13.778 -14.093 -14.31 -14.542 -14.661 -14.906 -15.161 -15.437 -15.584 -15.781 -16.054 -16.234 -16.43 -16.868 -17.11 -17.365 -17.66 -18.004 -18.402 -18.95 -20.895 -2 ,14120 ,KEBNE ,16720835,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:59:31 CET,0.0 1.896 2.445 2.849 3.172 3.436 3.662 3.863 4.224 4.393 4.556 4.826 4.991 5.122 5.353 5.549 5.72 5.797 5.941 6.087 6.3 6.434 6.556 6.712 6.861 7.003 7.134 7.244 7.364 7.475 7.581 7.702 7.815 7.928 8.055 8.189 8.302 8.408 8.508 8.573 8.627 8.695 8.726 8.73 8.713 8.638 8.378 7.842 6.973 5.625 3.444 1.038 -0.732 -2.277 -3.648 -4.825 -5.831 -6.723 -7.476 -8.222 -8.863 -9.422 -9.954 -10.459 -10.916 -11.33 -11.768 -12.156 -12.488 -12.838 -13.197 -13.486 -13.779 -14.086 -14.333 -14.581 -14.834 -15.102 -15.378 -15.569 -15.772 -16.109 -16.347 -16.588 -16.711 -16.965 -17.231 -17.519 -17.673 -17.884 -18.175 -18.354 -18.546 -18.991 -19.238 -19.493 -19.783 -20.152 -20.586 -21.153 -23.082 -3 ,31660 ,KEBNE ,16720836,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:58:57 CET,0.0 2.103 2.666 3.065 3.387 3.653 3.896 4.111 4.457 4.625 4.78 5.024 5.176 5.293 5.509 5.708 5.9 5.996 6.186 6.36 6.602 6.744 6.875 7.069 7.236 7.384 7.532 7.666 7.807 7.914 8.02 8.161 8.312 8.46 8.615 8.764 8.877 8.967 9.058 9.137 9.191 9.234 9.231 9.169 9.022 8.802 8.489 7.981 7.163 5.909 3.884 1.475 -0.49 -2.099 -3.429 -4.565 -5.533 -6.393 -7.124 -7.855 -8.479 -9.02 -9.53 -10.012 -10.468 -10.891 -11.321 -11.697 -12.028 -12.371 -12.715 -12.997 -13.292 -13.595 -13.833 -14.083 -14.333 -14.593 -14.871 -15.07 -15.276 -15.59 -15.807 -16.042 -16.167 -16.419 -16.688 -16.981 -17.131 -17.332 -17.6 -17.77 -17.952 -18.35 -18.58 -18.847 -19.156 -19.504 -19.913 -20.485 -22.238 -4 ,19452 ,KEBNE ,16720837,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:58:27 CET,0.0 2.606 3.166 3.569 3.868 4.123 4.361 4.573 4.947 5.114 5.264 5.503 5.648 5.766 5.984 6.191 6.388 6.477 6.641 6.791 6.993 7.114 7.23 7.397 7.556 7.703 7.831 7.948 8.096 8.229 8.357 8.518 8.656 8.773 8.893 9.02 9.155 9.286 9.399 9.51 9.588 9.65 9.716 9.743 9.701 9.549 9.255 8.795 8.039 6.917 5.194 3.146 1.365 -0.232 -1.576 -2.726 -3.714 -4.587 -5.315 -6.03 -6.642 -7.188 -7.704 -8.182 -8.632 -9.037 -9.447 -9.819 -10.147 -10.476 -10.82 -11.106 -11.393 -11.696 -11.939 -12.193 -12.451 -12.712 -12.99 -13.184 -13.385 -13.703 -13.925 -14.154 -14.275 -14.528 -14.79 -15.065 -15.212 -15.416 -15.691 -15.87 -16.061 -16.491 -16.738 -17.005 -17.31 -17.672 -18.084 -18.684 -21.019 -5 ,21970 ,KEBNE ,16720839,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:59:33 CET,0.0 2.649 3.241 3.668 3.988 4.251 4.497 4.722 5.111 5.28 5.428 5.67 5.824 5.942 6.152 6.349 6.541 6.628 6.79 6.948 7.161 7.292 7.419 7.587 7.733 7.869 8.001 8.124 8.282 8.43 8.555 8.69 8.818 8.939 9.07 9.205 9.325 9.443 9.556 9.656 9.736 9.781 9.769 9.728 9.674 9.535 9.214 8.72 8.008 6.841 4.798 2.476 0.576 -1.04 -2.37 -3.505 -4.462 -5.32 -6.061 -6.805 -7.44 -7.991 -8.509 -8.999 -9.461 -9.872 -10.298 -10.686 -11.011 -11.335 -11.677 -11.962 -12.259 -12.569 -12.814 -13.07 -13.326 -13.596 -13.885 -14.083 -14.284 -14.601 -14.823 -15.046 -15.164 -15.419 -15.678 -15.952 -16.1 -16.303 -16.579 -16.755 -16.943 -17.365 -17.592 -17.835 -18.116 -18.444 -18.841 -19.38 -21.105 -6 ,31157 ,KEBNE ,16720840,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:59:08 CET,0.0 2.11 2.678 3.068 3.371 3.637 3.888 4.108 4.475 4.626 4.77 5.01 5.154 5.267 5.461 5.642 5.816 5.893 6.035 6.16 6.331 6.449 6.556 6.7 6.841 6.969 7.085 7.191 7.311 7.42 7.523 7.652 7.77 7.865 7.963 8.06 8.142 8.213 8.287 8.345 8.372 8.396 8.391 8.337 8.212 7.998 7.676 7.211 6.487 5.328 3.365 1.064 -0.808 -2.412 -3.766 -4.944 -5.961 -6.865 -7.621 -8.353 -8.987 -9.553 -10.09 -10.577 -11.015 -11.415 -11.84 -12.217 -12.533 -12.873 -13.222 -13.503 -13.808 -14.123 -14.362 -14.611 -14.865 -15.13 -15.411 -15.603 -15.803 -16.118 -16.336 -16.569 -16.691 -16.941 -17.203 -17.476 -17.621 -17.819 -18.103 -18.292 -18.485 -18.905 -19.145 -19.409 -19.704 -20.033 -20.428 -20.988 -22.886 -7 ,30044 ,KEBNE ,16720841,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:58:40 CET,0.0 2.082 2.625 3.027 3.356 3.648 3.901 4.124 4.514 4.68 4.823 5.048 5.197 5.309 5.517 5.708 5.877 5.958 6.105 6.24 6.432 6.552 6.672 6.845 7.001 7.142 7.264 7.375 7.503 7.615 7.729 7.869 7.992 8.106 8.226 8.327 8.413 8.498 8.566 8.622 8.631 8.585 8.498 8.357 8.143 7.849 7.457 6.877 5.976 4.661 2.568 0.115 -1.864 -3.466 -4.791 -5.943 -6.942 -7.828 -8.561 -9.292 -9.924 -10.485 -11.011 -11.496 -11.948 -12.361 -12.786 -13.165 -13.493 -13.833 -14.183 -14.469 -14.765 -15.073 -15.315 -15.567 -15.828 -16.104 -16.39 -16.585 -16.787 -17.11 -17.337 -17.577 -17.701 -17.957 -18.237 -18.537 -18.697 -18.904 -19.189 -19.372 -19.561 -19.969 -20.211 -20.482 -20.776 -21.106 -21.495 -22.09 -24.11 -8 ,11377 ,KEBNE ,16720842,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:59:46 CET,0.0 2.273 2.891 3.316 3.645 3.917 4.154 4.364 4.731 4.895 5.04 5.262 5.407 5.521 5.73 5.923 6.099 6.18 6.341 6.497 6.693 6.812 6.934 7.107 7.268 7.408 7.524 7.63 7.768 7.9 8.022 8.162 8.288 8.403 8.517 8.628 8.726 8.821 8.906 8.963 8.974 8.949 8.912 8.848 8.709 8.458 8.1 7.613 6.834 5.537 3.346 0.764 -1.308 -2.977 -4.375 -5.579 -6.606 -7.537 -8.335 -9.108 -9.746 -10.305 -10.834 -11.33 -11.793 -12.218 -12.655 -13.036 -13.361 -13.702 -14.074 -14.379 -14.678 -14.984 -15.224 -15.475 -15.742 -16.017 -16.3 -16.499 -16.707 -17.036 -17.259 -17.488 -17.608 -17.859 -18.134 -18.422 -18.572 -18.792 -19.104 -19.288 -19.474 -19.889 -20.121 -20.381 -20.683 -21.027 -21.448 -22.048 -24.205 -9 ,9966 ,KEBNE ,16720843,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:58:29 CET,0.0 2.049 2.589 2.987 3.31 3.574 3.817 4.026 4.395 4.564 4.716 4.966 5.124 5.246 5.489 5.715 5.91 5.993 6.14 6.277 6.466 6.577 6.681 6.824 6.952 7.07 7.177 7.277 7.393 7.5 7.602 7.714 7.803 7.884 7.973 8.048 8.108 8.161 8.204 8.25 8.27 8.235 8.161 8.062 7.894 7.626 7.222 6.654 5.832 4.519 2.354 -0.123 -2.123 -3.776 -5.149 -6.35 -7.36 -8.242 -8.988 -9.731 -10.372 -10.928 -11.461 -11.955 -12.41 -12.823 -13.241 -13.609 -13.939 -14.284 -14.636 -14.931 -15.238 -15.552 -15.79 -16.039 -16.301 -16.567 -16.845 -17.044 -17.252 -17.58 -17.806 -18.038 -18.156 -18.401 -18.666 -18.953 -19.106 -19.32 -19.623 -19.812 -20.002 -20.425 -20.662 -20.913 -21.187 -21.512 -21.93 -22.478 -24.199 -10 ,27902 ,KEBNE ,16720844,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 02:58:31 CET,0.0 2.074 2.689 3.128 3.449 3.726 3.974 4.186 4.553 4.721 4.889 5.164 5.33 5.46 5.697 5.908 6.106 6.201 6.372 6.534 6.763 6.911 7.048 7.219 7.377 7.528 7.669 7.804 7.965 8.11 8.242 8.398 8.539 8.664 8.804 8.952 9.087 9.228 9.344 9.438 9.542 9.613 9.644 9.64 9.568 9.397 9.048 8.489 7.647 6.416 4.421 2.154 0.321 -1.252 -2.601 -3.771 -4.745 -5.636 -6.402 -7.133 -7.744 -8.279 -8.785 -9.272 -9.745 -10.168 -10.589 -10.961 -11.28 -11.609 -11.957 -12.253 -12.554 -12.855 -13.087 -13.33 -13.585 -13.865 -14.155 -14.356 -14.566 -14.886 -15.113 -15.356 -15.481 -15.732 -15.995 -16.275 -16.426 -16.638 -16.932 -17.114 -17.307 -17.748 -18.002 -18.28 -18.583 -18.916 -19.325 -19.923 -21.834 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_31.txt deleted file mode 100644 index 9327214c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_33_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6587 ,KEBNE ,16720845,Sat Nov 27 00:59:21 CET,Sat Nov 27 03:03:07 CET,0.0 2.701 3.348 3.816 4.198 4.546 4.828 5.066 5.516 5.718 5.909 6.215 6.388 6.541 6.818 7.06 7.29 7.393 7.577 7.752 8.005 8.154 8.288 8.48 8.656 8.821 8.989 9.156 9.369 9.56 9.729 9.905 10.062 10.223 10.428 10.663 10.856 11.011 11.146 11.279 11.423 11.522 11.569 11.613 11.603 11.511 11.32 10.977 10.401 9.415 7.567 5.235 3.352 1.734 0.373 -0.789 -1.82 -2.733 -3.498 -4.269 -4.934 -5.51 -6.037 -6.531 -7.01 -7.454 -7.913 -8.313 -8.652 -9.007 -9.374 -9.672 -9.982 -10.313 -10.573 -10.84 -11.111 -11.388 -11.673 -11.872 -12.084 -12.409 -12.636 -12.878 -13.003 -13.258 -13.54 -13.847 -14.007 -14.223 -14.52 -14.705 -14.896 -15.317 -15.555 -15.818 -16.121 -16.463 -16.875 -17.458 -19.87 -2 ,20306 ,KEBNE ,16720846,Sat Nov 27 01:03:26 CET,Sat Nov 27 03:05:42 CET,0.0 2.379 3.068 3.547 3.915 4.231 4.519 4.773 5.19 5.373 5.548 5.834 6.01 6.157 6.446 6.716 6.954 7.063 7.268 7.448 7.685 7.84 7.995 8.21 8.402 8.579 8.741 8.89 9.072 9.236 9.386 9.578 9.78 9.982 10.186 10.36 10.497 10.613 10.735 10.885 11.018 11.104 11.179 11.216 11.201 11.148 10.958 10.565 9.935 8.872 6.96 4.673 2.788 1.17 -0.144 -1.291 -2.305 -3.221 -3.999 -4.753 -5.401 -5.971 -6.501 -6.994 -7.456 -7.878 -8.311 -8.698 -9.023 -9.35 -9.697 -9.986 -10.289 -10.611 -10.85 -11.094 -11.358 -11.636 -11.931 -12.135 -12.337 -12.658 -12.889 -13.13 -13.258 -13.528 -13.826 -14.132 -14.287 -14.514 -14.832 -15.022 -15.22 -15.662 -15.905 -16.175 -16.477 -16.796 -17.157 -17.687 -19.677 -3 ,2739 ,KEBNE ,16720847,Sat Nov 27 02:23:27 CET,Sat Nov 27 04:26:09 CET,0.0 2.446 3.177 3.673 4.07 4.427 4.71 4.957 5.401 5.604 5.803 6.127 6.312 6.465 6.729 6.965 7.19 7.294 7.495 7.682 7.917 8.064 8.207 8.404 8.605 8.793 8.963 9.125 9.314 9.493 9.652 9.838 10.015 10.174 10.345 10.527 10.694 10.846 10.995 11.126 11.23 11.317 11.393 11.47 11.487 11.433 11.291 10.915 10.228 9.1 7.086 4.681 2.785 1.216 -0.092 -1.245 -2.249 -3.134 -3.883 -4.635 -5.285 -5.854 -6.379 -6.881 -7.347 -7.762 -8.193 -8.582 -8.914 -9.254 -9.61 -9.903 -10.205 -10.518 -10.759 -11.008 -11.273 -11.556 -11.84 -12.035 -12.239 -12.55 -12.769 -13.004 -13.129 -13.39 -13.663 -13.965 -14.122 -14.333 -14.628 -14.813 -15.007 -15.433 -15.664 -15.907 -16.177 -16.505 -16.915 -17.504 -19.774 -4 ,26414 ,KEBNE ,16720848,Sat Nov 27 02:36:51 CET,Sat Nov 27 04:41:10 CET,0.0 2.499 3.155 3.652 4.027 4.337 4.623 4.876 5.287 5.465 5.651 6.006 6.209 6.374 6.684 6.98 7.246 7.365 7.593 7.811 8.117 8.303 8.473 8.706 8.906 9.088 9.261 9.41 9.588 9.755 9.907 10.089 10.252 10.388 10.536 10.703 10.849 10.984 11.108 11.218 11.32 11.409 11.461 11.481 11.436 11.314 11.1 10.724 10.082 8.991 7.064 4.69 2.75 1.098 -0.282 -1.45 -2.441 -3.323 -4.067 -4.794 -5.451 -6.037 -6.563 -7.066 -7.531 -7.962 -8.416 -8.801 -9.132 -9.482 -9.861 -10.18 -10.499 -10.824 -11.071 -11.325 -11.591 -11.869 -12.164 -12.366 -12.574 -12.907 -13.143 -13.386 -13.513 -13.775 -14.04 -14.325 -14.482 -14.7 -14.988 -15.174 -15.377 -15.814 -16.042 -16.284 -16.571 -16.925 -17.36 -17.96 -20.129 -5 ,1993 ,KEBNE ,16720849,Sat Nov 27 02:36:51 CET,Sat Nov 27 04:39:54 CET,0.0 2.437 3.058 3.519 3.93 4.274 4.571 4.833 5.296 5.494 5.668 5.964 6.142 6.288 6.55 6.79 7.021 7.125 7.326 7.517 7.777 7.937 8.091 8.307 8.49 8.666 8.843 9.006 9.192 9.367 9.539 9.728 9.894 10.053 10.226 10.396 10.548 10.691 10.822 10.949 11.066 11.158 11.222 11.238 11.206 11.106 10.874 10.502 9.893 8.821 6.86 4.524 2.633 1.047 -0.295 -1.463 -2.471 -3.369 -4.112 -4.875 -5.537 -6.099 -6.63 -7.144 -7.626 -8.052 -8.488 -8.873 -9.197 -9.542 -9.909 -10.213 -10.534 -10.862 -11.107 -11.364 -11.638 -11.923 -12.22 -12.422 -12.634 -12.976 -13.211 -13.454 -13.58 -13.841 -14.103 -14.391 -14.543 -14.743 -15.025 -15.206 -15.406 -15.864 -16.108 -16.371 -16.673 -17.016 -17.452 -18.061 -20.387 -6 ,23331 ,KEBNE ,16720850,Sat Nov 27 02:53:20 CET,Sat Nov 27 04:52:11 CET,0.0 3.213 3.985 4.567 5.029 5.374 5.659 5.921 6.369 6.555 6.724 7.012 7.184 7.326 7.587 7.814 8.016 8.117 8.315 8.502 8.761 8.921 9.08 9.293 9.486 9.664 9.831 9.987 10.165 10.336 10.503 10.681 10.847 10.998 11.166 11.341 11.488 11.652 11.8 11.928 12.053 12.155 12.22 12.228 12.172 12.066 11.871 11.493 10.814 9.671 7.737 5.321 3.324 1.736 0.408 -0.781 -1.822 -2.747 -3.521 -4.29 -4.938 -5.502 -6.052 -6.585 -7.072 -7.513 -7.971 -8.375 -8.724 -9.08 -9.442 -9.741 -10.052 -10.369 -10.616 -10.874 -11.143 -11.423 -11.721 -11.93 -12.143 -12.479 -12.714 -12.957 -13.087 -13.355 -13.633 -13.941 -14.104 -14.323 -14.623 -14.816 -15.017 -15.446 -15.704 -15.982 -16.276 -16.625 -17.027 -17.565 -19.923 -7 ,13097 ,KEBNE ,16720851,Sat Nov 27 02:54:21 CET,Sat Nov 27 04:49:07 CET,0.0 2.702 3.326 3.802 4.178 4.499 4.791 5.068 5.53 5.731 5.924 6.226 6.4 6.538 6.827 7.095 7.309 7.409 7.614 7.818 8.092 8.256 8.413 8.623 8.82 9.008 9.176 9.335 9.525 9.693 9.864 10.069 10.25 10.401 10.545 10.691 10.823 10.971 11.118 11.233 11.325 11.416 11.484 11.499 11.463 11.341 11.087 10.676 10.052 8.986 7.003 4.625 2.694 1.042 -0.324 -1.495 -2.507 -3.405 -4.162 -4.91 -5.559 -6.131 -6.666 -7.158 -7.615 -8.034 -8.47 -8.872 -9.217 -9.578 -9.959 -10.261 -10.563 -10.874 -11.121 -11.374 -11.644 -11.935 -12.228 -12.428 -12.641 -12.969 -13.202 -13.446 -13.573 -13.834 -14.104 -14.392 -14.548 -14.766 -15.048 -15.227 -15.418 -15.832 -16.067 -16.336 -16.649 -17.01 -17.449 -18.06 -20.228 -8 ,6920 ,KEBNE ,16720852,Sat Nov 27 02:57:21 CET,Sat Nov 27 05:00:19 CET,0.0 2.675 3.428 3.924 4.348 4.695 4.986 5.247 5.689 5.876 6.049 6.341 6.515 6.661 6.918 7.155 7.381 7.482 7.667 7.848 8.095 8.239 8.374 8.562 8.729 8.883 9.037 9.185 9.365 9.538 9.707 9.899 10.061 10.206 10.363 10.526 10.66 10.796 10.93 11.037 11.13 11.222 11.285 11.309 11.268 11.172 10.998 10.621 9.979 8.896 6.877 4.427 2.504 0.893 -0.461 -1.637 -2.645 -3.538 -4.297 -5.04 -5.678 -6.242 -6.767 -7.266 -7.74 -8.161 -8.593 -8.979 -9.312 -9.652 -10.007 -10.303 -10.608 -10.929 -11.177 -11.435 -11.706 -11.981 -12.262 -12.466 -12.678 -13.009 -13.249 -13.499 -13.625 -13.882 -14.155 -14.453 -14.612 -14.833 -15.146 -15.34 -15.543 -15.983 -16.218 -16.481 -16.786 -17.126 -17.569 -18.212 -20.323 -9 ,19170 ,KEBNE ,16720853,Sat Nov 27 02:57:21 CET,Sat Nov 27 05:01:09 CET,0.0 2.329 3.013 3.478 3.87 4.23 4.523 4.775 5.214 5.408 5.596 5.919 6.1 6.244 6.501 6.733 6.958 7.064 7.252 7.433 7.692 7.848 7.992 8.199 8.391 8.551 8.703 8.856 9.04 9.222 9.391 9.574 9.737 9.87 10.022 10.177 10.306 10.444 10.577 10.703 10.824 10.917 10.948 10.912 10.829 10.725 10.534 10.183 9.551 8.406 6.372 3.832 1.828 0.206 -1.16 -2.333 -3.314 -4.167 -4.901 -5.632 -6.247 -6.797 -7.328 -7.819 -8.281 -8.705 -9.138 -9.519 -9.848 -10.192 -10.553 -10.854 -11.166 -11.489 -11.735 -11.987 -12.262 -12.548 -12.842 -13.059 -13.287 -13.623 -13.853 -14.106 -14.236 -14.497 -14.787 -15.101 -15.257 -15.461 -15.744 -15.919 -16.113 -16.56 -16.81 -17.09 -17.404 -17.749 -18.144 -18.71 -21.06 -10 ,17846 ,KEBNE ,16720854,Sat Nov 27 02:57:22 CET,Sat Nov 27 05:00:18 CET,0.0 2.492 3.157 3.65 4.071 4.413 4.691 4.936 5.357 5.544 5.714 5.991 6.161 6.308 6.581 6.813 7.023 7.122 7.306 7.487 7.747 7.905 8.052 8.249 8.43 8.605 8.761 8.895 9.063 9.214 9.359 9.524 9.682 9.831 9.997 10.183 10.337 10.476 10.605 10.722 10.826 10.925 11.023 11.065 11.007 10.923 10.723 10.266 9.565 8.432 6.436 4.072 2.123 0.487 -0.855 -2.011 -3.008 -3.902 -4.653 -5.39 -6.03 -6.608 -7.144 -7.637 -8.097 -8.518 -8.956 -9.345 -9.677 -10.017 -10.372 -10.668 -10.972 -11.287 -11.531 -11.783 -12.049 -12.325 -12.611 -12.808 -13.017 -13.346 -13.575 -13.817 -13.943 -14.216 -14.504 -14.806 -14.959 -15.171 -15.464 -15.647 -15.845 -16.292 -16.538 -16.812 -17.127 -17.467 -17.882 -18.46 -21.058 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_34_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_34_26.txt deleted file mode 100644 index 36869ccc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_34_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2499 ,KEBNE ,16720855,Sat Nov 27 02:57:22 CET,Sat Nov 27 04:57:54 CET,0.0 2.005 2.614 3.033 3.386 3.692 3.945 4.154 4.505 4.666 4.815 5.023 5.249 5.374 5.611 5.823 6.007 6.094 6.268 6.43 6.64 6.767 6.889 7.055 7.216 7.369 7.501 7.617 7.753 7.872 7.986 8.109 8.215 8.314 8.408 8.496 8.569 8.626 8.667 8.673 8.657 8.625 8.553 8.408 8.096 7.61 6.904 5.975 4.626 2.486 -0.967 -4.92 -8.049 -10.554 -12.6 -14.368 -15.866 -17.151 -18.246 -19.336 -20.238 -21.026 -21.763 -22.449 -23.077 -23.644 -24.228 -24.738 -25.183 -25.643 -26.118 -26.506 -26.906 -27.321 -27.647 -27.981 -28.323 -28.671 -29.034 -29.284 -29.534 -29.935 -30.215 -30.498 -30.648 -30.966 -31.293 -31.633 -31.811 -32.127 -32.415 -32.64 -32.876 -33.378 -33.647 -33.941 -34.269 -34.636 -35.064 -35.674 -37.785 -2 ,30387 ,KEBNE ,16720856,Sat Nov 27 02:57:21 CET,Sat Nov 27 04:57:14 CET,0.0 2.123 2.741 3.143 3.472 3.77 4.033 4.264 4.67 4.853 5.022 5.253 5.482 5.605 5.837 6.055 6.251 6.339 6.507 6.668 6.888 7.017 7.139 7.31 7.459 7.579 7.693 7.8 7.907 7.997 8.086 8.183 8.267 8.337 8.397 8.436 8.443 8.449 8.469 8.482 8.467 8.413 8.301 8.128 7.854 7.493 6.94 6.121 4.931 3.014 -0.369 -4.033 -6.844 -9.286 -11.3 -13.008 -14.47 -15.772 -16.861 -17.914 -18.805 -19.588 -20.315 -20.985 -21.62 -22.2 -22.786 -23.297 -23.736 -24.191 -24.656 -25.049 -25.45 -25.855 -26.174 -26.511 -26.862 -27.224 -27.611 -27.872 -28.131 -28.53 -28.802 -29.078 -29.219 -29.511 -29.827 -30.174 -30.349 -30.65 -30.897 -31.1 -31.322 -31.804 -32.072 -32.373 -32.712 -33.101 -33.552 -34.122 -36.414 -3 ,11337 ,KEBNE ,16720857,Sat Nov 27 02:57:26 CET,Sat Nov 27 04:53:24 CET,0.0 2.39 2.995 3.418 3.739 4.009 4.244 4.453 4.832 5.001 5.151 5.33 5.539 5.659 5.872 6.069 6.257 6.344 6.505 6.653 6.852 6.977 7.092 7.249 7.394 7.517 7.627 7.739 7.872 7.974 8.071 8.188 8.285 8.371 8.462 8.537 8.595 8.638 8.645 8.638 8.624 8.565 8.448 8.267 7.962 7.526 6.887 6.012 4.729 2.692 -0.719 -4.558 -7.549 -10.034 -12.11 -13.886 -15.378 -16.673 -17.745 -18.797 -19.694 -20.47 -21.182 -21.849 -22.478 -23.04 -23.614 -24.132 -24.573 -25.031 -25.511 -25.9 -26.293 -26.705 -27.024 -27.342 -27.668 -28.012 -28.362 -28.602 -28.847 -29.23 -29.499 -29.781 -29.931 -30.254 -30.59 -30.922 -31.098 -31.417 -31.687 -31.899 -32.124 -32.595 -32.86 -33.152 -33.48 -33.839 -34.261 -34.867 -37.009 -4 ,28599 ,KEBNE ,16720858,Sat Nov 27 02:57:26 CET,Sat Nov 27 04:53:34 CET,0.0 2.318 2.872 3.268 3.579 3.84 4.089 4.317 4.713 4.886 5.042 5.235 5.447 5.566 5.811 6.038 6.241 6.335 6.494 6.632 6.82 6.94 7.053 7.202 7.345 7.493 7.633 7.754 7.893 8.024 8.141 8.271 8.39 8.482 8.564 8.65 8.722 8.77 8.808 8.848 8.862 8.834 8.744 8.618 8.404 8.074 7.557 6.726 5.414 3.392 0.13 -3.735 -6.778 -9.187 -11.183 -12.932 -14.423 -15.74 -16.848 -17.921 -18.828 -19.627 -20.377 -21.073 -21.71 -22.286 -22.875 -23.396 -23.834 -24.281 -24.743 -25.12 -25.516 -25.937 -26.264 -26.593 -26.927 -27.271 -27.642 -27.901 -28.158 -28.559 -28.837 -29.118 -29.265 -29.577 -29.899 -30.24 -30.422 -30.738 -31.02 -31.236 -31.467 -31.983 -32.274 -32.581 -32.897 -33.25 -33.689 -34.283 -36.273 -5 ,16245 ,KEBNE ,16720859,Sat Nov 27 02:57:30 CET,Sat Nov 27 04:54:05 CET,0.0 1.891 2.494 2.927 3.259 3.562 3.832 4.048 4.435 4.613 4.777 4.988 5.213 5.339 5.578 5.79 5.983 6.075 6.251 6.415 6.635 6.778 6.918 7.102 7.261 7.395 7.52 7.642 7.794 7.935 8.066 8.225 8.376 8.501 8.618 8.744 8.842 8.933 9.012 9.068 9.099 9.082 8.997 8.815 8.499 8.033 7.357 6.397 4.98 2.897 -0.458 -4.301 -7.309 -9.76 -11.792 -13.542 -15.03 -16.324 -17.423 -18.494 -19.382 -20.164 -20.903 -21.587 -22.214 -22.785 -23.377 -23.894 -24.344 -24.821 -25.295 -25.681 -26.084 -26.492 -26.805 -27.131 -27.461 -27.808 -28.17 -28.412 -28.664 -29.076 -29.369 -29.661 -29.807 -30.115 -30.447 -30.798 -30.983 -31.295 -31.572 -31.781 -31.995 -32.469 -32.738 -33.037 -33.375 -33.753 -34.22 -34.878 -36.876 -6 ,20814 ,KEBNE ,16720860,Sat Nov 27 02:57:30 CET,Sat Nov 27 04:54:07 CET,0.0 1.907 2.491 2.886 3.221 3.508 3.751 3.963 4.339 4.503 4.651 4.836 5.055 5.18 5.397 5.608 5.812 5.901 6.067 6.22 6.434 6.57 6.699 6.876 7.026 7.158 7.282 7.401 7.54 7.665 7.79 7.924 8.034 8.145 8.259 8.354 8.425 8.479 8.516 8.548 8.54 8.503 8.424 8.24 7.915 7.476 6.878 5.954 4.596 2.603 -0.742 -4.603 -7.65 -10.153 -12.206 -13.983 -15.488 -16.782 -17.865 -18.925 -19.826 -20.604 -21.336 -22.028 -22.657 -23.222 -23.8 -24.308 -24.746 -25.197 -25.67 -26.065 -26.469 -26.887 -27.211 -27.543 -27.889 -28.243 -28.599 -28.845 -29.109 -29.534 -29.819 -30.111 -30.266 -30.591 -30.923 -31.263 -31.444 -31.763 -32.06 -32.274 -32.488 -32.971 -33.245 -33.522 -33.825 -34.192 -34.619 -35.174 -37.126 -7 ,418 ,KEBNE ,16720861,Sat Nov 27 02:58:23 CET,Sat Nov 27 05:00:12 CET,0.0 2.102 2.711 3.141 3.467 3.734 3.969 4.185 4.561 4.726 4.888 5.09 5.298 5.42 5.65 5.854 6.034 6.118 6.286 6.435 6.625 6.742 6.847 6.998 7.15 7.295 7.422 7.533 7.661 7.779 7.889 8.014 8.131 8.222 8.284 8.332 8.352 8.34 8.305 8.248 8.161 8.043 7.846 7.588 7.237 6.784 6.141 5.175 3.726 1.51 -2.104 -6.166 -9.301 -11.835 -13.917 -15.731 -17.252 -18.587 -19.721 -20.822 -21.75 -22.558 -23.326 -24.064 -24.73 -25.324 -25.95 -26.505 -26.973 -27.45 -27.934 -28.326 -28.733 -29.164 -29.498 -29.85 -30.222 -30.605 -30.99 -31.245 -31.512 -31.928 -32.217 -32.514 -32.664 -32.977 -33.314 -33.679 -33.869 -34.193 -34.488 -34.714 -34.945 -35.425 -35.683 -35.963 -36.28 -36.634 -37.056 -37.624 -39.586 -8 ,31098 ,KEBNE ,16720862,Sat Nov 27 02:58:23 CET,Sat Nov 27 05:00:21 CET,0.0 2.069 2.659 3.074 3.4 3.674 3.927 4.149 4.505 4.66 4.806 4.986 5.207 5.337 5.562 5.758 5.945 6.031 6.193 6.338 6.536 6.663 6.786 6.953 7.106 7.24 7.356 7.472 7.629 7.778 7.896 8.029 8.158 8.269 8.379 8.458 8.502 8.53 8.532 8.509 8.465 8.364 8.203 8.039 7.779 7.373 6.764 5.844 4.477 2.498 -0.776 -4.564 -7.466 -9.792 -11.748 -13.427 -14.853 -16.123 -17.187 -18.197 -19.067 -19.862 -20.615 -21.305 -21.934 -22.504 -23.093 -23.619 -24.065 -24.514 -24.971 -25.349 -25.743 -26.162 -26.49 -26.827 -27.169 -27.517 -27.873 -28.122 -28.381 -28.783 -29.068 -29.368 -29.523 -29.846 -30.18 -30.526 -30.708 -31.024 -31.3 -31.516 -31.748 -32.233 -32.493 -32.78 -33.107 -33.497 -33.978 -34.577 -36.3 -9 ,7929 ,KEBNE ,16720863,Sat Nov 27 02:58:23 CET,Sat Nov 27 04:59:43 CET,0.0 2.42 3.025 3.432 3.75 4.024 4.268 4.482 4.863 5.036 5.191 5.38 5.597 5.72 5.937 6.145 6.346 6.439 6.609 6.764 6.981 7.113 7.237 7.425 7.603 7.765 7.907 8.032 8.189 8.324 8.441 8.57 8.686 8.777 8.879 9.008 9.126 9.217 9.274 9.317 9.344 9.347 9.291 9.164 8.893 8.498 7.915 7.004 5.72 3.719 0.223 -3.752 -6.882 -9.464 -11.551 -13.3 -14.784 -16.108 -17.219 -18.297 -19.199 -19.99 -20.747 -21.451 -22.1 -22.679 -23.26 -23.782 -24.241 -24.709 -25.194 -25.591 -25.988 -26.406 -26.734 -27.07 -27.412 -27.766 -28.132 -28.386 -28.647 -29.053 -29.331 -29.619 -29.772 -30.09 -30.431 -30.793 -30.979 -31.288 -31.551 -31.763 -31.98 -32.45 -32.714 -33.011 -33.347 -33.707 -34.123 -34.701 -36.787 -10 ,27488 ,KEBNE ,16720864,Sat Nov 27 02:58:24 CET,Sat Nov 27 04:58:31 CET,0.0 1.997 2.568 2.978 3.282 3.534 3.761 3.968 4.357 4.533 4.698 4.921 5.153 5.279 5.514 5.722 5.918 6.01 6.182 6.35 6.581 6.721 6.85 7.031 7.198 7.345 7.485 7.619 7.773 7.893 8.009 8.152 8.266 8.365 8.477 8.589 8.672 8.725 8.764 8.8 8.807 8.783 8.715 8.55 8.257 7.843 7.215 6.271 4.89 2.719 -0.879 -4.903 -8.047 -10.548 -12.575 -14.341 -15.85 -17.167 -18.261 -19.337 -20.254 -21.054 -21.801 -22.489 -23.118 -23.671 -24.23 -24.73 -25.165 -25.612 -26.074 -26.464 -26.865 -27.266 -27.578 -27.902 -28.232 -28.585 -28.964 -29.227 -29.494 -29.91 -30.209 -30.515 -30.663 -30.97 -31.298 -31.644 -31.834 -32.157 -32.44 -32.661 -32.891 -33.378 -33.645 -33.952 -34.302 -34.696 -35.133 -35.746 -37.557 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_29.txt deleted file mode 100644 index 5b4e0a7c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12267 ,KEBNE ,16720865,Sat Nov 27 02:58:23 CET,Sat Nov 27 05:00:35 CET,0.0 1.653 2.153 2.502 2.768 2.982 3.171 3.342 3.61 3.724 3.83 3.913 4.099 4.176 4.298 4.396 4.487 4.53 4.6 4.659 4.723 4.751 4.774 4.792 4.794 4.79 4.775 4.74 4.675 4.603 4.522 4.422 4.332 4.216 4.025 3.793 3.554 3.24 2.858 2.42 1.907 1.268 0.443 -0.453 -1.596 -3.048 -4.94 -7.345 -10.591 -15.135 -21.919 -29.096 -34.36 -38.424 -41.7 -44.449 -46.706 -48.659 -50.268 -51.821 -53.121 -54.245 -55.284 -56.244 -57.115 -57.887 -58.667 -59.344 -59.925 -60.515 -61.116 -61.612 -62.121 -62.649 -63.065 -63.487 -63.903 -64.326 -64.769 -65.078 -65.393 -65.886 -66.235 -66.594 -66.774 -67.146 -67.539 -67.941 -68.153 -68.537 -68.834 -69.084 -69.333 -69.851 -70.144 -70.472 -70.824 -71.214 -71.681 -72.258 -73.877 -2 ,10847 ,KEBNE ,16720866,Sat Nov 27 02:58:23 CET,Sat Nov 27 04:59:53 CET,0.0 1.62 2.156 2.583 2.87 3.085 3.294 3.485 3.772 3.888 3.995 4.074 4.245 4.32 4.473 4.608 4.712 4.753 4.828 4.892 4.962 4.995 5.027 5.071 5.097 5.111 5.104 5.083 5.046 4.981 4.911 4.842 4.756 4.645 4.491 4.297 4.073 3.803 3.475 3.083 2.645 2.065 1.323 0.523 -0.525 -1.844 -3.592 -5.86 -8.971 -13.351 -19.864 -26.842 -32.107 -36.23 -39.546 -42.325 -44.61 -46.587 -48.23 -49.789 -51.081 -52.2 -53.246 -54.221 -55.103 -55.894 -56.696 -57.393 -57.979 -58.572 -59.185 -59.691 -60.215 -60.749 -61.162 -61.587 -62.015 -62.453 -62.912 -63.223 -63.535 -64.013 -64.349 -64.696 -64.872 -65.236 -65.627 -66.046 -66.259 -66.644 -66.921 -67.17 -67.44 -67.998 -68.305 -68.635 -68.982 -69.383 -69.854 -70.47 -72.015 -3 ,11299 ,KEBNE ,16720867,Sat Nov 27 02:58:23 CET,Sat Nov 27 05:00:11 CET,0.0 1.634 2.135 2.5 2.79 3.02 3.202 3.37 3.651 3.765 3.872 3.955 4.124 4.198 4.337 4.471 4.574 4.614 4.679 4.725 4.763 4.777 4.786 4.776 4.765 4.753 4.721 4.675 4.6 4.527 4.444 4.324 4.217 4.107 3.955 3.761 3.518 3.187 2.802 2.367 1.854 1.207 0.359 -0.581 -1.756 -3.219 -5.1 -7.494 -10.693 -15.143 -21.761 -28.731 -33.95 -38.034 -41.305 -44.03 -46.262 -48.19 -49.785 -51.302 -52.568 -53.679 -54.7 -55.635 -56.479 -57.231 -58.017 -58.709 -59.295 -59.905 -60.528 -61.03 -61.546 -62.074 -62.474 -62.889 -63.317 -63.75 -64.193 -64.497 -64.803 -65.286 -65.629 -65.975 -66.153 -66.532 -66.946 -67.384 -67.6 -67.983 -68.285 -68.534 -68.791 -69.329 -69.612 -69.92 -70.261 -70.655 -71.142 -71.746 -73.378 -4 ,18157 ,KEBNE ,16720868,Sat Nov 27 02:58:23 CET,Sat Nov 27 05:00:29 CET,0.0 1.968 2.477 2.818 3.103 3.327 3.531 3.704 3.96 4.07 4.182 4.276 4.458 4.53 4.663 4.775 4.867 4.906 4.974 5.02 5.074 5.101 5.127 5.149 5.152 5.153 5.141 5.119 5.088 5.04 4.97 4.87 4.763 4.641 4.471 4.251 4.017 3.74 3.416 3.029 2.56 1.969 1.204 0.358 -0.739 -2.132 -3.979 -6.334 -9.477 -13.818 -20.325 -27.252 -32.375 -36.408 -39.689 -42.46 -44.733 -46.694 -48.323 -49.883 -51.182 -52.304 -53.347 -54.315 -55.199 -55.981 -56.767 -57.457 -58.043 -58.642 -59.264 -59.784 -60.312 -60.838 -61.245 -61.675 -62.116 -62.566 -63.022 -63.333 -63.652 -64.151 -64.502 -64.865 -65.049 -65.423 -65.824 -66.246 -66.463 -66.859 -67.139 -67.382 -67.64 -68.207 -68.527 -68.862 -69.215 -69.622 -70.11 -70.744 -72.582 -5 ,29775 ,KEBNE ,16720869,Sat Nov 27 02:58:23 CET,Sat Nov 27 05:00:28 CET,0.0 1.937 2.441 2.791 3.062 3.292 3.486 3.658 3.953 4.076 4.18 4.252 4.43 4.498 4.617 4.721 4.807 4.848 4.906 4.942 4.977 5.005 5.033 5.042 5.029 5.01 4.981 4.943 4.882 4.81 4.722 4.6 4.471 4.313 4.105 3.855 3.579 3.245 2.855 2.393 1.86 1.206 0.362 -0.571 -1.776 -3.286 -5.19 -7.596 -10.819 -15.26 -21.944 -29.038 -34.241 -38.28 -41.518 -44.223 -46.458 -48.384 -49.992 -51.553 -52.84 -53.948 -55.001 -55.975 -56.863 -57.658 -58.478 -59.198 -59.796 -60.396 -61.014 -61.523 -62.043 -62.576 -62.975 -63.377 -63.791 -64.226 -64.681 -64.992 -65.312 -65.813 -66.153 -66.497 -66.675 -67.038 -67.413 -67.823 -68.038 -68.432 -68.724 -68.961 -69.203 -69.745 -70.048 -70.39 -70.766 -71.18 -71.654 -72.283 -73.866 -6 ,24749 ,KEBNE ,16720870,Sat Nov 27 02:58:23 CET,Sat Nov 27 04:59:36 CET,0.0 2.103 2.674 3.072 3.36 3.613 3.827 4.004 4.302 4.429 4.544 4.654 4.839 4.917 5.045 5.142 5.232 5.273 5.341 5.401 5.488 5.539 5.573 5.619 5.657 5.668 5.672 5.677 5.676 5.656 5.606 5.517 5.412 5.311 5.184 5.01 4.816 4.573 4.289 3.938 3.483 2.924 2.25 1.501 0.512 -0.744 -2.389 -4.5 -7.429 -11.566 -17.89 -24.763 -29.875 -33.883 -37.058 -39.76 -41.985 -43.889 -45.485 -47.021 -48.309 -49.431 -50.481 -51.452 -52.337 -53.118 -53.912 -54.607 -55.194 -55.8 -56.421 -56.931 -57.453 -57.982 -58.391 -58.813 -59.241 -59.677 -60.132 -60.447 -60.768 -61.269 -61.618 -61.974 -62.153 -62.526 -62.923 -63.334 -63.55 -63.94 -64.235 -64.477 -64.729 -65.288 -65.6 -65.927 -66.293 -66.71 -67.2 -67.907 -70.154 -7 ,25845 ,KEBNE ,16720871,Sat Nov 27 02:58:23 CET,Sat Nov 27 04:59:52 CET,0.0 1.847 2.367 2.742 3.061 3.33 3.543 3.724 4.034 4.16 4.274 4.374 4.563 4.646 4.788 4.912 5.033 5.088 5.179 5.257 5.352 5.397 5.432 5.471 5.501 5.511 5.502 5.486 5.457 5.412 5.347 5.263 5.181 5.084 4.944 4.757 4.542 4.288 3.998 3.639 3.206 2.624 1.773 0.823 -0.342 -1.775 -3.653 -6.106 -9.444 -14.01 -20.722 -27.798 -33.061 -37.241 -40.609 -43.395 -45.689 -47.681 -49.349 -50.946 -52.244 -53.362 -54.4 -55.351 -56.222 -57.003 -57.803 -58.512 -59.11 -59.711 -60.324 -60.826 -61.339 -61.875 -62.287 -62.71 -63.144 -63.584 -64.045 -64.362 -64.687 -65.192 -65.541 -65.896 -66.079 -66.463 -66.869 -67.295 -67.51 -67.91 -68.225 -68.48 -68.74 -69.317 -69.628 -69.94 -70.278 -70.669 -71.13 -71.753 -73.406 -8 ,1821 ,KEBNE ,16720872,Sat Nov 27 02:58:23 CET,Sat Nov 27 04:59:47 CET,0.0 1.829 2.353 2.676 2.926 3.144 3.333 3.496 3.788 3.907 4.001 4.075 4.253 4.323 4.434 4.538 4.628 4.671 4.749 4.808 4.87 4.908 4.953 5.003 5.029 5.031 5.021 4.996 4.945 4.885 4.817 4.71 4.579 4.437 4.268 4.067 3.843 3.549 3.184 2.752 2.257 1.639 0.86 0.0 -1.125 -2.542 -4.39 -6.769 -9.998 -14.425 -21.121 -28.256 -33.476 -37.518 -40.709 -43.411 -45.679 -47.634 -49.252 -50.795 -52.067 -53.169 -54.188 -55.129 -55.993 -56.786 -57.598 -58.287 -58.867 -59.465 -60.086 -60.594 -61.108 -61.631 -62.031 -62.441 -62.861 -63.289 -63.733 -64.039 -64.348 -64.82 -65.146 -65.487 -65.664 -66.03 -66.405 -66.785 -66.984 -67.359 -67.665 -67.906 -68.148 -68.673 -68.972 -69.301 -69.655 -70.06 -70.54 -71.233 -73.73 -9 ,6969 ,KEBNE ,16720873,Sat Nov 27 02:58:24 CET,Sat Nov 27 05:00:00 CET,0.0 1.607 2.106 2.474 2.742 2.944 3.111 3.264 3.539 3.654 3.756 3.841 4.01 4.08 4.207 4.299 4.37 4.399 4.458 4.507 4.565 4.595 4.61 4.621 4.631 4.631 4.615 4.589 4.53 4.451 4.372 4.257 4.112 3.952 3.764 3.541 3.288 2.988 2.63 2.19 1.681 1.048 0.22 -0.709 -1.924 -3.418 -5.315 -7.734 -10.951 -15.364 -21.951 -28.889 -34.081 -38.147 -41.372 -44.085 -46.35 -48.282 -49.885 -51.447 -52.731 -53.842 -54.889 -55.85 -56.714 -57.473 -58.238 -58.917 -59.499 -60.081 -60.67 -61.159 -61.661 -62.192 -62.604 -63.017 -63.44 -63.874 -64.323 -64.637 -64.96 -65.444 -65.784 -66.141 -66.324 -66.707 -67.101 -67.508 -67.721 -68.113 -68.407 -68.648 -68.903 -69.454 -69.755 -70.086 -70.46 -70.871 -71.331 -71.925 -73.965 -10 ,4274 ,KEBNE ,16720874,Sat Nov 27 02:58:24 CET,Sat Nov 27 05:00:29 CET,0.0 1.647 2.225 2.612 2.895 3.141 3.345 3.514 3.796 3.911 4.017 4.107 4.291 4.365 4.495 4.614 4.72 4.766 4.845 4.915 5.019 5.071 5.109 5.165 5.213 5.241 5.247 5.238 5.204 5.161 5.116 5.046 4.955 4.84 4.688 4.492 4.266 3.985 3.653 3.258 2.804 2.231 1.475 0.667 -0.343 -1.621 -3.31 -5.54 -8.601 -12.894 -19.476 -26.478 -31.657 -35.747 -39.054 -41.788 -44.025 -45.983 -47.606 -49.166 -50.467 -51.592 -52.641 -53.605 -54.491 -55.289 -56.103 -56.82 -57.43 -58.045 -58.665 -59.171 -59.691 -60.221 -60.632 -61.055 -61.485 -61.931 -62.398 -62.721 -63.051 -63.549 -63.885 -64.24 -64.424 -64.792 -65.169 -65.572 -65.784 -66.183 -66.486 -66.724 -66.97 -67.546 -67.866 -68.196 -68.57 -69.018 -69.546 -70.198 -71.845 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_31.txt deleted file mode 100644 index fd2b37fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28055 ,KEBNE ,17070453,Fri Dec 24 17:25:45 CET,Fri Dec 24 19:26:43 CET,0.0 2.535 3.231 3.743 4.17 4.547 4.894 5.204 5.764 6.036 6.287 6.634 6.937 7.14 7.538 7.908 8.257 8.428 8.752 9.069 9.53 9.82 10.104 10.513 10.9 11.266 11.629 11.988 12.452 12.911 13.352 13.894 14.433 14.967 15.579 16.249 16.907 17.661 18.474 19.317 20.198 21.237 22.493 23.75 25.196 26.814 28.776 31.024 33.676 36.965 41.08 44.636 46.895 48.488 49.608 50.452 51.081 51.522 51.817 52.077 52.261 52.364 52.438 52.485 52.495 52.488 52.474 52.437 52.386 52.311 52.207 52.115 52.021 51.912 51.814 51.705 51.574 51.428 51.247 51.101 50.958 50.732 50.565 50.402 50.32 50.147 49.959 49.757 49.649 49.484 49.221 49.044 48.863 48.419 48.138 47.831 47.509 47.147 46.718 46.052 43.542 -2 ,19734 ,KEBNE ,17070454,Fri Dec 24 17:25:44 CET,Fri Dec 24 19:26:38 CET,0.0 2.604 3.373 3.904 4.328 4.703 5.027 5.323 5.884 6.144 6.386 6.743 7.063 7.275 7.682 8.064 8.426 8.603 8.943 9.271 9.747 10.054 10.354 10.782 11.192 11.584 11.967 12.337 12.824 13.294 13.727 14.252 14.791 15.317 15.916 16.578 17.216 17.949 18.758 19.623 20.541 21.579 22.804 24.047 25.519 27.168 29.092 31.318 34.042 37.465 41.776 45.563 47.979 49.589 50.713 51.559 52.153 52.543 52.797 52.986 53.094 53.146 53.167 53.179 53.174 53.139 53.089 53.014 52.913 52.799 52.688 52.595 52.489 52.345 52.213 52.085 51.956 51.802 51.629 51.51 51.374 51.128 50.959 50.789 50.688 50.467 50.243 50.001 49.862 49.658 49.37 49.186 48.991 48.553 48.299 47.996 47.66 47.259 46.766 46.148 43.756 -3 ,21611 ,KEBNE ,17070455,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:27:06 CET,0.0 2.268 2.953 3.466 3.913 4.291 4.62 4.915 5.452 5.701 5.941 6.3 6.607 6.814 7.206 7.57 7.925 8.1 8.439 8.768 9.26 9.567 9.849 10.261 10.663 11.046 11.426 11.796 12.268 12.71 13.148 13.688 14.189 14.672 15.237 15.874 16.508 17.222 17.998 18.804 19.647 20.646 21.863 23.109 24.583 26.283 28.282 30.519 33.224 36.573 40.828 44.518 46.79 48.336 49.377 50.109 50.654 51.084 51.42 51.707 51.894 52.021 52.082 52.092 52.095 52.086 52.062 52.011 51.944 51.874 51.795 51.713 51.625 51.534 51.454 51.362 51.261 51.154 51.018 50.908 50.796 50.615 50.481 50.338 50.261 50.097 49.914 49.712 49.594 49.406 49.187 49.05 48.88 48.471 48.251 47.993 47.689 47.323 46.838 46.169 43.522 -4 ,3552 ,KEBNE ,17070456,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:26:13 CET,0.0 3.196 3.975 4.567 5.092 5.542 5.923 6.28 6.931 7.221 7.494 7.907 8.25 8.492 8.942 9.344 9.706 9.874 10.194 10.507 10.971 11.276 11.565 11.971 12.365 12.747 13.116 13.48 13.961 14.418 14.854 15.375 15.879 16.374 16.959 17.632 18.287 19.018 19.823 20.681 21.571 22.58 23.8 25.053 26.491 28.132 30.121 32.416 35.162 38.436 42.557 46.118 48.339 49.876 50.966 51.776 52.377 52.772 53.016 53.255 53.417 53.511 53.55 53.553 53.536 53.486 53.417 53.354 53.278 53.2 53.117 53.012 52.892 52.777 52.685 52.573 52.456 52.327 52.174 52.058 51.94 51.759 51.62 51.463 51.372 51.169 50.921 50.64 50.501 50.315 50.046 49.865 49.681 49.286 49.064 48.815 48.504 48.128 47.664 46.965 44.349 -5 ,6766 ,KEBNE ,17070457,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:26:57 CET,0.0 1.942 2.584 3.045 3.438 3.789 4.101 4.396 4.942 5.198 5.451 5.818 6.132 6.342 6.754 7.138 7.499 7.678 8.027 8.357 8.841 9.153 9.452 9.89 10.317 10.721 11.11 11.49 11.978 12.459 12.935 13.508 14.049 14.559 15.146 15.816 16.474 17.183 17.965 18.826 19.704 20.714 21.905 23.109 24.52 26.068 27.932 30.127 32.833 36.15 40.308 43.913 46.124 47.626 48.643 49.396 49.896 50.164 50.354 50.542 50.654 50.751 50.837 50.859 50.831 50.797 50.763 50.715 50.654 50.569 50.468 50.389 50.292 50.188 50.108 49.995 49.846 49.681 49.489 49.341 49.188 48.939 48.76 48.556 48.443 48.221 47.986 47.721 47.583 47.373 47.083 46.893 46.683 46.256 46.014 45.746 45.45 45.065 44.587 43.938 40.468 -6 ,29998 ,KEBNE ,17070458,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:27:49 CET,0.0 2.58 3.256 3.792 4.214 4.586 4.931 5.25 5.817 6.071 6.306 6.652 6.967 7.177 7.582 7.971 8.333 8.508 8.838 9.15 9.6 9.888 10.176 10.595 10.985 11.36 11.726 12.081 12.542 12.997 13.45 13.998 14.516 15.017 15.606 16.269 16.911 17.617 18.405 19.271 20.19 21.226 22.455 23.733 25.207 26.829 28.756 31.013 33.743 37.04 41.169 44.909 47.228 48.73 49.812 50.631 51.248 51.712 52.004 52.212 52.352 52.468 52.565 52.619 52.637 52.63 52.593 52.535 52.461 52.366 52.25 52.142 52.018 51.883 51.767 51.629 51.477 51.309 51.119 50.995 50.872 50.675 50.527 50.36 50.269 50.081 49.885 49.651 49.527 49.358 49.137 48.979 48.777 48.342 48.124 47.869 47.564 47.223 46.783 46.136 43.577 -7 ,14030 ,KEBNE ,17070459,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:28:17 CET,0.0 2.28 3.002 3.502 3.934 4.315 4.656 4.971 5.524 5.775 6.032 6.411 6.735 6.949 7.337 7.698 8.045 8.219 8.554 8.878 9.349 9.651 9.948 10.366 10.766 11.164 11.555 11.93 12.4 12.858 13.314 13.874 14.41 14.918 15.523 16.227 16.901 17.636 18.427 19.282 20.19 21.204 22.416 23.673 25.204 26.951 28.973 31.283 34.025 37.371 41.475 44.962 47.134 48.618 49.584 50.205 50.631 50.979 51.223 51.384 51.493 51.588 51.646 51.649 51.627 51.587 51.508 51.425 51.349 51.265 51.173 51.095 51.007 50.883 50.773 50.661 50.557 50.445 50.298 50.181 50.048 49.831 49.683 49.527 49.446 49.261 49.048 48.814 48.688 48.501 48.259 48.093 47.919 47.513 47.289 47.041 46.743 46.384 45.937 45.304 42.682 -8 ,19839 ,KEBNE ,17070460,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:27:07 CET,0.0 1.835 2.464 2.904 3.269 3.62 3.962 4.274 4.831 5.089 5.334 5.679 5.998 6.208 6.61 6.979 7.331 7.507 7.852 8.171 8.633 8.926 9.197 9.601 9.995 10.382 10.761 11.125 11.595 12.063 12.509 13.043 13.573 14.091 14.699 15.385 16.047 16.778 17.574 18.428 19.354 20.4 21.595 22.796 24.198 25.793 27.677 29.858 32.492 35.756 39.976 43.741 46.08 47.638 48.756 49.601 50.192 50.606 50.897 51.147 51.308 51.428 51.53 51.591 51.637 51.653 51.636 51.593 51.523 51.446 51.373 51.298 51.214 51.111 51.022 50.921 50.785 50.646 50.507 50.394 50.267 50.072 49.94 49.792 49.704 49.516 49.33 49.126 49.017 48.854 48.64 48.493 48.339 47.972 47.761 47.527 47.249 46.927 46.522 45.929 43.599 -9 ,25393 ,KEBNE ,17070461,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:27:06 CET,0.0 2.502 3.186 3.691 4.122 4.493 4.834 5.152 5.709 5.966 6.214 6.587 6.905 7.113 7.5 7.873 8.231 8.407 8.744 9.055 9.502 9.794 10.078 10.487 10.895 11.3 11.694 12.068 12.54 13.006 13.46 13.996 14.514 15.015 15.589 16.24 16.893 17.628 18.427 19.282 20.176 21.211 22.487 23.76 25.249 26.954 28.94 31.25 34.062 37.495 41.803 45.66 48.059 49.651 50.742 51.49 52.043 52.481 52.788 53.039 53.187 53.254 53.281 53.275 53.238 53.181 53.098 53.023 52.934 52.809 52.676 52.557 52.432 52.305 52.185 52.034 51.876 51.71 51.544 51.431 51.305 51.087 50.917 50.747 50.66 50.461 50.236 49.989 49.859 49.673 49.438 49.283 49.101 48.68 48.422 48.107 47.753 47.341 46.81 46.068 43.034 -10 ,12929 ,KEBNE ,17070462,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:27:05 CET,0.0 2.036 2.632 3.088 3.481 3.833 4.138 4.425 4.951 5.2 5.44 5.787 6.101 6.311 6.701 7.082 7.451 7.622 7.957 8.273 8.727 9.03 9.32 9.732 10.136 10.548 10.938 11.308 11.789 12.246 12.696 13.241 13.748 14.234 14.809 15.463 16.097 16.799 17.562 18.386 19.275 20.293 21.478 22.652 24.03 25.65 27.586 29.792 32.469 35.83 39.939 43.365 45.455 46.872 47.892 48.618 49.065 49.378 49.625 49.788 49.885 49.954 49.987 50.005 49.991 49.922 49.8 49.694 49.617 49.521 49.4 49.295 49.178 49.043 48.932 48.814 48.672 48.503 48.302 48.153 48.013 47.812 47.666 47.488 47.39 47.186 46.952 46.68 46.535 46.333 46.064 45.895 45.721 45.323 45.088 44.834 44.541 44.204 43.747 43.021 40.323 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_33.txt deleted file mode 100644 index 419aa935..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10869 ,KEBNE ,16720875,Sat Nov 27 02:58:24 CET,Sat Nov 27 04:58:25 CET,0.0 2.028 2.635 3.092 3.481 3.825 4.134 4.42 4.955 5.189 5.413 5.752 6.059 6.257 6.636 6.997 7.35 7.519 7.845 8.164 8.65 8.959 9.248 9.671 10.081 10.483 10.872 11.245 11.742 12.237 12.715 13.297 13.868 14.418 15.062 15.81 16.542 17.343 18.224 19.194 20.23 21.428 22.879 24.37 26.143 28.193 30.7 33.733 37.465 42.149 48.487 54.461 58.457 61.299 63.383 64.982 66.158 67.058 67.73 68.301 68.728 69.068 69.37 69.616 69.807 69.964 70.083 70.155 70.218 70.266 70.295 70.298 70.278 70.246 70.194 70.118 70.038 69.941 69.833 69.76 69.678 69.541 69.436 69.313 69.249 69.109 68.949 68.763 68.662 68.529 68.281 68.109 67.923 67.55 67.341 67.097 66.834 66.511 66.003 65.249 62.698 -2 ,16146 ,KEBNE ,16720876,Sat Nov 27 02:58:24 CET,Sat Nov 27 04:58:07 CET,0.0 2.444 3.066 3.532 3.935 4.283 4.588 4.876 5.397 5.628 5.857 6.21 6.517 6.713 7.094 7.457 7.803 7.977 8.319 8.642 9.106 9.405 9.692 10.117 10.533 10.933 11.324 11.708 12.217 12.72 13.214 13.797 14.36 14.926 15.58 16.321 17.055 17.887 18.806 19.789 20.844 22.069 23.546 25.08 26.913 29.033 31.641 34.763 38.577 43.337 49.722 55.743 59.685 62.419 64.408 65.924 67.056 67.951 68.636 69.239 69.689 70.046 70.325 70.553 70.752 70.894 71.01 71.075 71.106 71.137 71.16 71.151 71.133 71.108 71.077 71.039 71.0 70.944 70.854 70.779 70.7 70.558 70.444 70.322 70.25 70.075 69.865 69.626 69.5 69.343 69.083 68.921 68.743 68.368 68.153 67.878 67.547 67.119 66.579 65.845 62.722 -3 ,16330 ,KEBNE ,16720877,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 05:00:08 CET,0.0 2.276 2.905 3.383 3.779 4.126 4.439 4.725 5.252 5.504 5.744 6.083 6.397 6.606 7.0 7.368 7.726 7.901 8.235 8.557 9.019 9.324 9.623 10.05 10.469 10.872 11.263 11.647 12.147 12.643 13.128 13.711 14.286 14.862 15.522 16.258 16.984 17.804 18.712 19.69 20.726 21.916 23.355 24.863 26.668 28.768 31.311 34.354 38.151 42.874 49.184 55.023 58.891 61.7 63.745 65.279 66.453 67.414 68.14 68.766 69.212 69.534 69.815 70.054 70.236 70.39 70.532 70.608 70.652 70.695 70.71 70.694 70.663 70.644 70.622 70.573 70.51 70.443 70.367 70.294 70.197 70.04 69.927 69.795 69.719 69.553 69.375 69.177 69.066 68.912 68.626 68.461 68.288 67.907 67.686 67.426 67.129 66.755 66.222 65.445 62.804 -4 ,20326 ,KEBNE ,16720878,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:26 CET,0.0 2.173 2.851 3.339 3.734 4.091 4.418 4.714 5.252 5.498 5.729 6.066 6.373 6.572 6.954 7.323 7.676 7.849 8.185 8.514 8.989 9.296 9.6 10.039 10.461 10.867 11.262 11.642 12.146 12.638 13.117 13.715 14.296 14.856 15.523 16.296 17.042 17.879 18.807 19.807 20.883 22.122 23.623 25.177 27.011 29.141 31.738 34.738 38.4 43.071 49.412 55.439 59.33 62.098 64.157 65.724 66.898 67.818 68.507 69.108 69.559 69.909 70.205 70.431 70.617 70.768 70.881 70.945 70.981 71.012 71.026 71.028 71.029 71.015 70.981 70.942 70.898 70.842 70.745 70.651 70.553 70.374 70.244 70.111 70.04 69.899 69.725 69.516 69.402 69.252 69.003 68.832 68.651 68.286 68.055 67.769 67.41 66.969 66.489 65.832 62.673 -5 ,22666 ,KEBNE ,16720879,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:26 CET,0.0 1.82 2.443 2.945 3.357 3.723 4.022 4.303 4.844 5.083 5.296 5.61 5.907 6.104 6.486 6.851 7.197 7.364 7.692 8.003 8.446 8.742 9.033 9.456 9.872 10.28 10.681 11.075 11.58 12.06 12.532 13.114 13.688 14.249 14.913 15.672 16.414 17.233 18.146 19.146 20.204 21.427 22.918 24.462 26.28 28.385 30.92 33.947 37.823 42.81 49.358 55.351 59.278 62.048 64.076 65.622 66.774 67.668 68.36 68.998 69.501 69.902 70.229 70.495 70.696 70.854 71.001 71.107 71.166 71.199 71.213 71.204 71.193 71.167 71.139 71.109 71.062 71.002 70.923 70.859 70.778 70.625 70.505 70.359 70.287 70.153 70.011 69.836 69.732 69.599 69.381 69.24 69.085 68.706 68.474 68.164 67.794 67.384 66.845 66.028 62.337 -6 ,23451 ,KEBNE ,16720880,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:51 CET,0.0 2.376 3.011 3.471 3.874 4.226 4.54 4.833 5.369 5.616 5.85 6.179 6.479 6.671 7.047 7.409 7.76 7.927 8.263 8.594 9.06 9.353 9.638 10.061 10.474 10.87 11.255 11.639 12.15 12.641 13.12 13.711 14.28 14.825 15.461 16.191 16.916 17.733 18.653 19.676 20.748 21.947 23.403 24.93 26.754 28.882 31.443 34.477 38.269 43.096 49.434 55.244 59.096 61.831 63.799 65.329 66.509 67.433 68.137 68.743 69.179 69.511 69.772 69.99 70.177 70.312 70.425 70.496 70.525 70.522 70.482 70.433 70.383 70.331 70.284 70.225 70.152 70.054 69.961 69.893 69.811 69.644 69.501 69.362 69.284 69.109 68.934 68.74 68.619 68.455 68.174 68.01 67.827 67.368 67.109 66.837 66.499 66.072 65.573 64.867 61.941 -7 ,19218 ,KEBNE ,16720881,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 05:00:42 CET,0.0 1.889 2.504 2.971 3.345 3.68 3.987 4.27 4.79 5.026 5.252 5.594 5.89 6.085 6.454 6.803 7.15 7.316 7.639 7.962 8.428 8.717 9.001 9.426 9.839 10.237 10.624 11.004 11.493 11.979 12.462 13.05 13.611 14.158 14.815 15.563 16.293 17.112 17.995 18.947 19.987 21.187 22.642 24.165 25.988 28.134 30.723 33.774 37.578 42.386 48.831 54.893 58.912 61.748 63.817 65.384 66.558 67.503 68.218 68.844 69.314 69.657 69.964 70.222 70.408 70.567 70.71 70.815 70.89 70.937 70.961 70.964 70.952 70.932 70.897 70.841 70.775 70.696 70.595 70.507 70.402 70.242 70.136 70.019 69.943 69.761 69.552 69.318 69.196 69.023 68.73 68.555 68.335 67.83 67.571 67.273 66.91 66.502 65.991 65.238 61.879 -8 ,11946 ,KEBNE ,16720882,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:47 CET,0.0 2.076 2.641 3.1 3.488 3.818 4.104 4.374 4.898 5.141 5.363 5.678 5.971 6.169 6.55 6.914 7.268 7.437 7.769 8.089 8.545 8.837 9.122 9.549 9.965 10.364 10.749 11.123 11.604 12.085 12.576 13.164 13.723 14.273 14.928 15.681 16.415 17.245 18.166 19.15 20.206 21.423 22.903 24.444 26.282 28.412 30.953 33.938 37.619 42.325 48.676 54.658 58.566 61.264 63.255 64.789 65.961 66.935 67.646 68.217 68.649 69.013 69.337 69.596 69.791 69.923 70.052 70.166 70.217 70.219 70.211 70.216 70.206 70.181 70.166 70.133 70.088 70.01 69.889 69.803 69.712 69.557 69.419 69.276 69.212 69.076 68.903 68.685 68.574 68.419 68.146 67.985 67.809 67.412 67.158 66.848 66.502 66.117 65.659 65.023 61.796 -9 ,31578 ,KEBNE ,16720883,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 05:01:11 CET,0.0 2.472 3.136 3.566 3.943 4.291 4.593 4.874 5.386 5.628 5.867 6.206 6.511 6.705 7.067 7.41 7.744 7.909 8.229 8.537 8.984 9.275 9.567 10.001 10.412 10.807 11.193 11.568 12.054 12.536 13.011 13.601 14.172 14.727 15.396 16.153 16.899 17.734 18.622 19.585 20.634 21.844 23.288 24.799 26.618 28.74 31.348 34.44 38.244 43.003 49.328 55.338 59.309 62.041 64.024 65.569 66.742 67.686 68.404 69.041 69.547 69.956 70.286 70.536 70.745 70.922 71.086 71.213 71.297 71.336 71.329 71.311 71.288 71.234 71.172 71.111 71.02 70.914 70.812 70.736 70.665 70.536 70.417 70.274 70.199 70.053 69.874 69.651 69.537 69.393 69.145 68.968 68.76 68.304 68.061 67.782 67.441 67.056 66.537 65.726 63.117 -10 ,789 ,KEBNE ,16720884,Sat Nov 27 02:59:24 CET,Sat Nov 27 05:00:05 CET,0.0 2.031 2.634 3.103 3.493 3.849 4.178 4.484 5.03 5.279 5.517 5.85 6.144 6.341 6.728 7.099 7.458 7.633 7.969 8.291 8.762 9.064 9.357 9.785 10.21 10.623 11.014 11.394 11.889 12.372 12.844 13.422 13.984 14.534 15.184 15.925 16.646 17.452 18.361 19.351 20.392 21.597 23.053 24.526 26.313 28.443 30.991 33.992 37.747 42.469 48.733 54.611 58.505 61.241 63.228 64.778 65.897 66.735 67.394 67.964 68.396 68.765 69.102 69.369 69.558 69.694 69.805 69.869 69.906 69.91 69.873 69.848 69.826 69.799 69.759 69.694 69.628 69.545 69.45 69.381 69.287 69.137 69.032 68.886 68.797 68.62 68.446 68.247 68.121 67.958 67.724 67.578 67.403 66.972 66.704 66.387 66.064 65.693 65.171 64.446 61.849 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_34.txt deleted file mode 100644 index 56f80f8e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15192 ,KEBNE ,16720885,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 05:01:11 CET,0.0 1.923 2.551 2.986 3.362 3.695 3.985 4.235 4.667 4.868 5.061 5.32 5.592 5.757 6.064 6.35 6.611 6.741 7.003 7.253 7.605 7.829 8.055 8.372 8.668 8.951 9.225 9.493 9.836 10.153 10.449 10.818 11.181 11.536 11.95 12.394 12.811 13.281 13.784 14.32 14.885 15.515 16.241 16.968 17.81 18.731 19.765 20.856 22.113 23.604 25.161 26.18 26.581 26.616 26.476 26.254 25.985 25.723 25.463 25.151 24.876 24.633 24.368 24.089 23.828 23.567 23.278 23.011 22.758 22.489 22.218 21.973 21.722 21.48 21.285 21.074 20.842 20.572 20.288 20.098 19.898 19.58 19.358 19.121 18.99 18.704 18.394 18.06 17.895 17.638 17.321 17.107 16.888 16.408 16.144 15.841 15.451 15.013 14.537 13.887 11.474 -2 ,16933 ,KEBNE ,16720886,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 05:01:10 CET,0.0 2.322 2.891 3.312 3.67 3.971 4.251 4.518 4.976 5.18 5.376 5.652 5.92 6.082 6.384 6.675 6.954 7.085 7.333 7.573 7.914 8.132 8.344 8.662 8.969 9.257 9.532 9.796 10.135 10.461 10.772 11.15 11.517 11.861 12.262 12.728 13.163 13.622 14.13 14.681 15.256 15.91 16.675 17.393 18.199 19.12 20.158 21.259 22.496 23.891 25.346 26.237 26.575 26.659 26.583 26.42 26.237 26.009 25.748 25.453 25.156 24.853 24.583 24.319 24.072 23.846 23.579 23.329 23.099 22.854 22.604 22.385 22.148 21.904 21.7 21.487 21.262 21.022 20.773 20.6 20.413 20.113 19.904 19.682 19.567 19.327 19.056 18.737 18.555 18.279 17.963 17.734 17.484 16.927 16.615 16.276 15.892 15.45 14.917 14.239 12.525 -3 ,5757 ,KEBNE ,16720887,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:58 CET,0.0 1.815 2.393 2.82 3.162 3.475 3.77 4.035 4.522 4.739 4.94 5.228 5.506 5.672 5.997 6.299 6.577 6.708 6.952 7.187 7.53 7.754 7.968 8.275 8.562 8.828 9.093 9.354 9.681 10.006 10.316 10.684 11.04 11.379 11.783 12.222 12.625 13.076 13.579 14.112 14.669 15.303 16.019 16.745 17.59 18.467 19.462 20.57 21.768 23.057 24.418 25.221 25.359 25.316 25.202 24.977 24.719 24.438 24.162 23.89 23.619 23.323 23.012 22.707 22.418 22.155 21.871 21.599 21.355 21.089 20.808 20.572 20.32 20.053 19.845 19.624 19.382 19.14 18.889 18.701 18.491 18.16 17.931 17.692 17.568 17.307 17.026 16.705 16.518 16.242 15.951 15.733 15.515 15.045 14.756 14.418 14.02 13.565 13.018 12.281 9.326 -4 ,2712 ,KEBNE ,16720888,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 05:00:01 CET,0.0 1.627 2.183 2.617 2.981 3.292 3.57 3.822 4.284 4.504 4.712 4.984 5.255 5.416 5.722 6.011 6.288 6.42 6.677 6.937 7.295 7.502 7.706 8.008 8.311 8.612 8.889 9.152 9.49 9.81 10.112 10.47 10.828 11.177 11.562 11.983 12.385 12.826 13.309 13.821 14.357 14.957 15.645 16.338 17.138 18.051 19.081 20.187 21.394 22.709 24.182 25.026 25.323 25.419 25.333 25.154 24.945 24.715 24.466 24.181 23.903 23.65 23.408 23.152 22.914 22.695 22.44 22.187 21.952 21.704 21.445 21.234 21.022 20.78 20.573 20.359 20.124 19.862 19.588 19.396 19.199 18.889 18.642 18.388 18.27 17.999 17.695 17.372 17.208 16.963 16.685 16.476 16.263 15.765 15.477 15.194 14.894 14.476 13.93 13.202 10.683 -5 ,8264 ,KEBNE ,16720889,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 05:00:16 CET,0.0 2.25 2.852 3.269 3.603 3.904 4.182 4.449 4.922 5.127 5.319 5.571 5.838 5.998 6.304 6.593 6.863 6.996 7.252 7.488 7.827 8.053 8.268 8.57 8.859 9.133 9.405 9.669 10.001 10.311 10.611 10.98 11.317 11.639 12.032 12.478 12.889 13.34 13.835 14.361 14.907 15.511 16.224 16.946 17.766 18.631 19.618 20.716 21.977 23.463 25.064 26.058 26.437 26.559 26.5 26.333 26.115 25.859 25.591 25.294 25.003 24.703 24.388 24.08 23.79 23.528 23.268 23.014 22.784 22.543 22.284 22.067 21.844 21.614 21.42 21.209 20.986 20.733 20.463 20.286 20.1 19.798 19.569 19.328 19.212 18.96 18.658 18.333 18.171 17.917 17.617 17.403 17.173 16.633 16.334 16.006 15.606 15.1 14.506 13.722 10.827 -6 ,13859 ,KEBNE ,16720890,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:51 CET,0.0 2.155 2.747 3.186 3.545 3.84 4.108 4.374 4.838 5.041 5.233 5.513 5.781 5.94 6.245 6.536 6.803 6.934 7.187 7.436 7.791 8.004 8.209 8.505 8.789 9.068 9.332 9.584 9.919 10.24 10.532 10.885 11.229 11.563 11.953 12.386 12.804 13.273 13.766 14.293 14.851 15.45 16.126 16.819 17.63 18.474 19.415 20.517 21.833 23.242 24.716 25.633 25.883 25.891 25.797 25.63 25.416 25.14 24.792 24.417 24.107 23.829 23.582 23.334 23.069 22.822 22.549 22.294 22.076 21.845 21.593 21.37 21.124 20.856 20.652 20.452 20.244 20.003 19.742 19.562 19.374 19.057 18.832 18.596 18.469 18.206 17.934 17.651 17.482 17.204 16.886 16.681 16.462 15.937 15.63 15.277 14.873 14.404 13.817 12.972 10.64 -7 ,30330 ,KEBNE ,16720891,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 05:01:12 CET,0.0 2.625 3.257 3.711 4.107 4.448 4.749 5.009 5.479 5.706 5.924 6.216 6.489 6.651 6.956 7.252 7.528 7.664 7.943 8.205 8.557 8.771 8.981 9.292 9.592 9.877 10.141 10.394 10.736 11.063 11.376 11.749 12.101 12.447 12.846 13.289 13.709 14.16 14.648 15.191 15.75 16.352 17.044 17.734 18.528 19.423 20.443 21.516 22.698 24.047 25.602 26.675 27.06 27.062 26.868 26.643 26.432 26.203 25.962 25.666 25.368 25.087 24.807 24.549 24.304 24.067 23.798 23.556 23.345 23.11 22.855 22.628 22.381 22.117 21.909 21.677 21.432 21.178 20.915 20.736 20.532 20.211 19.983 19.718 19.583 19.317 19.025 18.694 18.521 18.255 17.929 17.712 17.492 17.002 16.737 16.438 16.076 15.645 15.094 14.324 12.067 -8 ,5157 ,KEBNE ,16720892,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:40 CET,0.0 1.618 2.173 2.57 2.899 3.185 3.447 3.701 4.164 4.371 4.558 4.821 5.084 5.239 5.536 5.831 6.113 6.24 6.488 6.734 7.069 7.279 7.487 7.787 8.075 8.353 8.622 8.88 9.216 9.548 9.857 10.219 10.577 10.932 11.348 11.788 12.192 12.662 13.171 13.715 14.286 14.885 15.576 16.284 17.097 18.009 19.033 20.17 21.437 22.835 24.428 25.35 25.58 25.569 25.463 25.305 25.109 24.906 24.673 24.38 24.11 23.874 23.65 23.402 23.135 22.871 22.564 22.275 22.024 21.78 21.54 21.328 21.101 20.856 20.651 20.437 20.209 19.971 19.714 19.526 19.329 19.014 18.788 18.554 18.431 18.165 17.876 17.562 17.39 17.116 16.786 16.561 16.333 15.843 15.546 15.191 14.797 14.376 13.882 13.233 10.644 -9 ,26864 ,KEBNE ,16720893,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:44 CET,0.0 1.87 2.451 2.886 3.252 3.56 3.821 4.078 4.544 4.752 4.944 5.195 5.46 5.62 5.916 6.207 6.493 6.628 6.884 7.125 7.484 7.711 7.925 8.244 8.551 8.838 9.121 9.386 9.734 10.088 10.421 10.801 11.155 11.499 11.886 12.333 12.801 13.313 13.833 14.367 14.94 15.599 16.332 17.047 17.868 18.772 19.84 21.019 22.268 23.58 25.024 25.952 26.239 26.29 26.208 25.997 25.767 25.545 25.292 25.012 24.791 24.58 24.353 24.13 23.905 23.685 23.441 23.204 22.982 22.751 22.52 22.321 22.105 21.875 21.699 21.523 21.328 21.101 20.862 20.698 20.528 20.251 20.056 19.842 19.727 19.482 19.219 18.936 18.773 18.527 18.283 18.087 17.876 17.406 17.11 16.777 16.42 16.021 15.519 14.812 12.215 -10 ,8040 ,KEBNE ,16720894,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:56 CET,0.0 2.033 2.582 3.002 3.363 3.674 3.954 4.209 4.66 4.864 5.055 5.305 5.566 5.727 6.037 6.328 6.596 6.725 6.976 7.213 7.559 7.785 8.011 8.33 8.616 8.883 9.153 9.422 9.766 10.091 10.404 10.786 11.154 11.495 11.881 12.336 12.773 13.239 13.742 14.278 14.825 15.437 16.139 16.813 17.568 18.389 19.357 20.467 21.633 22.872 24.222 24.984 25.153 25.087 24.889 24.667 24.411 24.103 23.83 23.537 23.259 23.008 22.772 22.516 22.27 22.039 21.772 21.518 21.292 21.038 20.767 20.536 20.294 20.039 19.827 19.595 19.357 19.12 18.865 18.681 18.496 18.203 17.978 17.741 17.617 17.344 17.065 16.77 16.613 16.351 16.032 15.823 15.611 15.116 14.852 14.563 14.175 13.747 13.277 12.515 9.976 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_49.txt deleted file mode 100644 index 9356e059..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10389 ,KEBNE ,16720895,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:12 CET,0.0 1.187 1.64 1.998 2.27 2.498 2.708 2.898 3.219 3.372 3.524 3.702 3.94 4.063 4.293 4.509 4.703 4.795 4.963 5.118 5.333 5.469 5.602 5.785 5.946 6.095 6.246 6.383 6.559 6.736 6.893 7.073 7.246 7.399 7.568 7.754 7.92 8.091 8.261 8.418 8.58 8.74 8.896 9.039 9.151 9.219 9.255 9.179 8.897 8.351 7.247 5.694 4.403 3.244 2.19 1.235 0.401 -0.329 -0.952 -1.602 -2.184 -2.713 -3.225 -3.678 -4.103 -4.51 -4.941 -5.337 -5.69 -6.062 -6.449 -6.782 -7.128 -7.485 -7.777 -8.08 -8.387 -8.705 -9.054 -9.296 -9.547 -9.942 -10.207 -10.484 -10.631 -10.957 -11.313 -11.711 -11.926 -12.268 -12.622 -12.857 -13.102 -13.638 -13.954 -14.314 -14.737 -15.252 -15.887 -16.795 -20.783 -2 ,27245 ,KEBNE ,16720896,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:20 CET,0.0 1.138 1.59 1.93 2.235 2.507 2.727 2.915 3.251 3.406 3.553 3.722 3.958 4.08 4.29 4.482 4.669 4.764 4.939 5.103 5.346 5.497 5.637 5.831 6.011 6.181 6.337 6.487 6.672 6.843 7.012 7.212 7.382 7.53 7.709 7.913 8.101 8.286 8.473 8.658 8.841 9.041 9.251 9.398 9.519 9.626 9.657 9.578 9.332 8.785 7.597 6.036 4.731 3.587 2.577 1.662 0.857 0.123 -0.502 -1.134 -1.699 -2.224 -2.739 -3.228 -3.688 -4.11 -4.54 -4.93 -5.264 -5.6 -5.97 -6.293 -6.63 -6.964 -7.222 -7.5 -7.791 -8.089 -8.393 -8.617 -8.859 -9.24 -9.505 -9.773 -9.914 -10.232 -10.577 -10.955 -11.166 -11.505 -11.855 -12.088 -12.344 -12.916 -13.231 -13.591 -13.983 -14.448 -15.037 -15.861 -18.729 -3 ,13509 ,KEBNE ,16720897,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:00 CET,0.0 1.317 1.746 2.102 2.421 2.691 2.922 3.145 3.536 3.704 3.866 4.046 4.277 4.392 4.625 4.842 5.028 5.118 5.295 5.468 5.712 5.854 5.983 6.171 6.342 6.515 6.679 6.819 6.995 7.168 7.322 7.485 7.644 7.805 7.983 8.168 8.324 8.471 8.621 8.765 8.892 9.016 9.14 9.243 9.336 9.391 9.364 9.22 8.907 8.305 7.206 5.728 4.369 3.199 2.219 1.361 0.575 -0.213 -0.925 -1.621 -2.231 -2.784 -3.308 -3.812 -4.308 -4.757 -5.246 -5.695 -6.06 -6.446 -6.85 -7.178 -7.509 -7.861 -8.157 -8.466 -8.787 -9.118 -9.465 -9.717 -9.974 -10.399 -10.695 -10.987 -11.147 -11.472 -11.805 -12.186 -12.392 -12.723 -13.093 -13.369 -13.639 -14.227 -14.575 -14.953 -15.39 -15.889 -16.493 -17.323 -20.155 -4 ,8434 ,KEBNE ,16720898,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:53 CET,0.0 1.301 1.806 2.184 2.493 2.76 2.99 3.199 3.557 3.716 3.864 4.03 4.258 4.382 4.62 4.845 5.051 5.148 5.334 5.507 5.749 5.895 6.029 6.226 6.403 6.569 6.73 6.872 7.06 7.23 7.387 7.571 7.729 7.871 8.03 8.214 8.384 8.549 8.717 8.884 9.037 9.172 9.286 9.369 9.424 9.446 9.408 9.267 8.941 8.28 6.986 5.221 3.677 2.354 1.246 0.29 -0.566 -1.357 -2.064 -2.8 -3.436 -3.993 -4.522 -5.061 -5.578 -6.027 -6.506 -6.937 -7.313 -7.717 -8.136 -8.477 -8.826 -9.204 -9.504 -9.808 -10.136 -10.488 -10.85 -11.093 -11.346 -11.756 -12.055 -12.374 -12.533 -12.873 -13.249 -13.644 -13.85 -14.187 -14.559 -14.829 -15.114 -15.775 -16.167 -16.597 -17.089 -17.695 -18.403 -19.299 -24.045 -5 ,4108 ,KEBNE ,16720899,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:11 CET,0.0 1.428 1.976 2.375 2.682 2.939 3.171 3.389 3.791 3.972 4.132 4.332 4.581 4.714 4.949 5.169 5.384 5.487 5.671 5.841 6.068 6.208 6.346 6.555 6.75 6.92 7.075 7.227 7.416 7.591 7.76 7.946 8.115 8.277 8.454 8.651 8.834 9.005 9.165 9.307 9.441 9.578 9.714 9.826 9.932 10.041 10.08 9.979 9.67 9.061 7.906 6.348 5.03 3.882 2.828 1.854 1.013 0.26 -0.381 -1.032 -1.623 -2.162 -2.692 -3.196 -3.66 -4.086 -4.523 -4.929 -5.292 -5.693 -6.129 -6.481 -6.843 -7.216 -7.507 -7.795 -8.112 -8.457 -8.801 -9.051 -9.323 -9.74 -10.023 -10.337 -10.51 -10.894 -11.307 -11.727 -11.941 -12.275 -12.638 -12.888 -13.152 -13.736 -14.068 -14.435 -14.859 -15.329 -15.924 -16.827 -19.954 -6 ,22430 ,KEBNE ,16720900,Sat Nov 27 02:59:25 CET,Sat Nov 27 04:59:06 CET,0.0 1.29 1.759 2.119 2.413 2.66 2.888 3.097 3.466 3.641 3.801 3.977 4.211 4.331 4.541 4.731 4.902 4.988 5.161 5.327 5.559 5.71 5.85 6.044 6.237 6.411 6.565 6.715 6.905 7.075 7.234 7.412 7.557 7.693 7.848 8.017 8.17 8.319 8.473 8.629 8.766 8.885 9.007 9.128 9.227 9.273 9.261 9.149 8.86 8.265 7.086 5.578 4.243 3.046 1.993 1.054 0.199 -0.596 -1.305 -2.007 -2.6 -3.136 -3.654 -4.163 -4.642 -5.07 -5.513 -5.917 -6.254 -6.61 -7.003 -7.342 -7.684 -8.019 -8.284 -8.586 -8.918 -9.262 -9.608 -9.842 -10.097 -10.501 -10.791 -11.09 -11.241 -11.566 -11.917 -12.288 -12.486 -12.811 -13.125 -13.382 -13.666 -14.29 -14.656 -15.065 -15.534 -16.061 -16.705 -17.622 -21.449 -7 ,9882 ,KEBNE ,16720901,Sat Nov 27 02:59:26 CET,Sat Nov 27 04:59:05 CET,0.0 1.377 1.868 2.239 2.548 2.813 3.047 3.252 3.619 3.781 3.926 4.102 4.327 4.446 4.671 4.876 5.076 5.167 5.338 5.499 5.715 5.848 5.977 6.161 6.328 6.486 6.635 6.773 6.949 7.104 7.251 7.416 7.565 7.714 7.888 8.069 8.205 8.342 8.499 8.668 8.823 8.968 9.107 9.21 9.263 9.255 9.217 9.061 8.671 7.937 6.603 4.905 3.404 2.113 1.028 0.079 -0.772 -1.527 -2.167 -2.821 -3.402 -3.94 -4.465 -4.972 -5.434 -5.848 -6.298 -6.701 -7.042 -7.411 -7.803 -8.139 -8.49 -8.861 -9.154 -9.443 -9.74 -10.062 -10.431 -10.702 -10.962 -11.362 -11.654 -11.966 -12.131 -12.475 -12.832 -13.205 -13.409 -13.74 -14.1 -14.36 -14.635 -15.222 -15.557 -15.938 -16.379 -16.882 -17.478 -18.321 -22.202 -8 ,21243 ,KEBNE ,16720902,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:00:23 CET,0.0 1.361 1.822 2.182 2.468 2.706 2.93 3.135 3.485 3.643 3.792 3.961 4.178 4.294 4.509 4.719 4.921 5.012 5.189 5.361 5.593 5.726 5.845 6.02 6.188 6.352 6.51 6.655 6.83 6.979 7.119 7.29 7.45 7.599 7.761 7.931 8.098 8.271 8.444 8.622 8.775 8.9 9.017 9.127 9.239 9.296 9.263 9.113 8.801 8.174 6.878 5.193 3.744 2.491 1.396 0.411 -0.431 -1.217 -1.948 -2.675 -3.299 -3.862 -4.379 -4.864 -5.333 -5.782 -6.252 -6.664 -7.034 -7.433 -7.858 -8.212 -8.578 -8.967 -9.271 -9.575 -9.897 -10.242 -10.6 -10.849 -11.114 -11.543 -11.856 -12.197 -12.369 -12.715 -13.083 -13.484 -13.699 -14.044 -14.413 -14.677 -14.964 -15.606 -15.983 -16.409 -16.895 -17.476 -18.174 -19.134 -23.748 -9 ,4004 ,KEBNE ,16720903,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:00:43 CET,0.0 1.702 2.203 2.575 2.872 3.13 3.37 3.598 3.996 4.169 4.326 4.504 4.731 4.86 5.089 5.3 5.496 5.583 5.74 5.895 6.112 6.249 6.385 6.586 6.766 6.927 7.078 7.222 7.398 7.553 7.696 7.858 8.004 8.145 8.301 8.462 8.61 8.775 8.934 9.068 9.193 9.321 9.456 9.558 9.614 9.64 9.623 9.5 9.201 8.56 7.305 5.708 4.328 3.053 1.941 0.994 0.16 -0.62 -1.297 -1.986 -2.593 -3.126 -3.64 -4.13 -4.597 -5.028 -5.493 -5.923 -6.289 -6.652 -7.016 -7.329 -7.66 -8.008 -8.286 -8.576 -8.878 -9.211 -9.562 -9.8 -10.053 -10.445 -10.717 -11.005 -11.164 -11.503 -11.846 -12.229 -12.447 -12.774 -13.084 -13.324 -13.596 -14.204 -14.54 -14.925 -15.344 -15.835 -16.484 -17.386 -21.949 -10 ,24928 ,KEBNE ,16720904,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:01:34 CET,0.0 1.294 1.788 2.158 2.441 2.676 2.885 3.096 3.48 3.644 3.8 3.991 4.221 4.347 4.584 4.809 5.018 5.11 5.289 5.453 5.687 5.844 5.982 6.165 6.343 6.507 6.658 6.806 6.986 7.148 7.304 7.49 7.659 7.817 7.993 8.163 8.3 8.447 8.596 8.742 8.881 9.021 9.162 9.27 9.352 9.399 9.368 9.217 8.928 8.326 7.096 5.517 4.152 2.976 1.924 0.915 -0.011 -0.838 -1.518 -2.176 -2.741 -3.26 -3.762 -4.256 -4.728 -5.15 -5.583 -5.973 -6.309 -6.687 -7.101 -7.428 -7.781 -8.163 -8.443 -8.721 -9.034 -9.383 -9.749 -10.009 -10.277 -10.67 -10.939 -11.245 -11.412 -11.753 -12.133 -12.547 -12.764 -13.099 -13.475 -13.751 -14.035 -14.698 -15.064 -15.52 -16.166 -16.97 -17.899 -19.136 -23.235 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_62.txt deleted file mode 100644 index bfe8f8b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7679 ,KEBNE ,17026022,Wed Dec 22 13:47:37 CET,Wed Dec 22 15:05:21 CET,0.0 1.103 1.579 1.958 2.291 2.574 2.818 3.05 3.478 3.67 3.854 4.087 4.337 4.486 4.76 5.007 5.235 5.343 5.568 5.789 6.091 6.277 6.45 6.708 6.956 7.19 7.411 7.626 7.898 8.154 8.409 8.713 9.003 9.285 9.618 9.993 10.345 10.73 11.146 11.584 12.039 12.544 13.103 13.641 14.273 15.001 15.842 16.767 17.787 18.853 20.081 21.014 21.384 21.478 21.444 21.303 21.127 20.947 20.735 20.5 20.292 20.059 19.802 19.563 19.34 19.12 18.866 18.633 18.431 18.197 17.934 17.722 17.499 17.258 17.075 16.886 16.677 16.455 16.218 16.049 15.87 15.579 15.367 15.149 15.032 14.784 14.526 14.232 14.073 13.822 13.555 13.369 13.166 12.71 12.453 12.16 11.833 11.44 10.958 10.319 8.09 -2 ,2665 ,KEBNE ,17025757,Wed Dec 22 13:01:38 CET,Wed Dec 22 15:01:32 CET,0.0 1.391 1.881 2.262 2.582 2.866 3.114 3.326 3.734 3.927 4.101 4.329 4.58 4.726 5.002 5.249 5.499 5.619 5.831 6.038 6.329 6.509 6.684 6.936 7.176 7.409 7.631 7.84 8.106 8.366 8.627 8.936 9.207 9.465 9.763 10.092 10.414 10.762 11.141 11.532 11.92 12.355 12.872 13.379 13.956 14.605 15.32 16.113 17.037 18.061 19.209 20.005 20.35 20.419 20.363 20.258 20.084 19.882 19.675 19.442 19.244 19.051 18.831 18.601 18.377 18.156 17.914 17.688 17.492 17.277 17.041 16.84 16.619 16.383 16.193 15.989 15.78 15.554 15.299 15.12 14.935 14.637 14.426 14.193 14.066 13.799 13.505 13.197 13.023 12.749 12.449 12.239 12.024 11.539 11.263 10.965 10.593 10.126 9.589 8.865 6.76 -3 ,7471 ,KEBNE ,17026024,Wed Dec 22 13:47:41 CET,Wed Dec 22 15:03:07 CET,0.0 1.425 1.949 2.358 2.652 2.914 3.162 3.387 3.79 3.98 4.159 4.388 4.641 4.785 5.048 5.295 5.53 5.645 5.865 6.076 6.368 6.555 6.74 7.002 7.249 7.476 7.688 7.896 8.164 8.423 8.675 8.969 9.247 9.524 9.847 10.189 10.519 10.88 11.265 11.665 12.06 12.522 13.078 13.612 14.23 14.945 15.785 16.687 17.695 18.806 20.012 20.996 21.507 21.706 21.715 21.614 21.475 21.291 21.075 20.864 20.67 20.466 20.257 20.052 19.857 19.659 19.44 19.226 19.021 18.801 18.562 18.372 18.175 17.963 17.781 17.576 17.368 17.153 16.927 16.766 16.591 16.309 16.105 15.878 15.761 15.511 15.225 14.929 14.784 14.538 14.255 14.052 13.845 13.39 13.111 12.814 12.492 12.084 11.548 10.802 8.782 -4 ,16445 ,KEBNE ,17026025,Wed Dec 22 13:47:45 CET,Wed Dec 22 15:02:18 CET,0.0 1.136 1.63 2.006 2.328 2.609 2.853 3.074 3.472 3.655 3.828 4.045 4.285 4.424 4.713 4.982 5.226 5.344 5.563 5.768 6.07 6.262 6.439 6.694 6.941 7.172 7.386 7.595 7.867 8.117 8.349 8.634 8.912 9.174 9.481 9.829 10.151 10.508 10.887 11.265 11.667 12.135 12.666 13.174 13.757 14.397 15.148 15.987 16.924 17.934 19.036 19.756 19.997 20.052 19.975 19.805 19.603 19.412 19.192 18.922 18.675 18.435 18.207 17.994 17.773 17.554 17.334 17.136 16.937 16.711 16.473 16.27 16.061 15.836 15.645 15.448 15.246 15.026 14.788 14.622 14.462 14.197 13.998 13.782 13.67 13.441 13.179 12.891 12.735 12.491 12.235 12.039 11.811 11.289 11.011 10.703 10.338 9.913 9.37 8.639 6.454 -5 ,19597 ,KEBNE ,17025760,Wed Dec 22 13:01:43 CET,Wed Dec 22 15:02:21 CET,0.0 1.347 1.862 2.282 2.631 2.934 3.199 3.436 3.849 4.024 4.19 4.415 4.675 4.831 5.128 5.384 5.615 5.728 5.942 6.143 6.442 6.634 6.818 7.088 7.344 7.582 7.806 8.021 8.29 8.546 8.804 9.118 9.404 9.682 9.995 10.333 10.664 11.027 11.408 11.828 12.263 12.718 13.262 13.822 14.469 15.196 15.977 16.772 17.681 18.696 19.758 20.51 20.857 20.971 20.962 20.888 20.737 20.544 20.366 20.173 19.998 19.811 19.614 19.426 19.223 19.019 18.79 18.585 18.399 18.187 17.971 17.789 17.587 17.375 17.205 17.021 16.828 16.628 16.405 16.238 16.069 15.799 15.598 15.377 15.263 15.03 14.77 14.496 14.35 14.103 13.862 13.678 13.471 13.001 12.751 12.484 12.177 11.818 11.397 10.829 8.954 -6 ,24661 ,KEBNE ,17026027,Wed Dec 22 13:47:45 CET,Wed Dec 22 15:04:24 CET,0.0 1.503 2.024 2.405 2.745 3.039 3.298 3.542 3.957 4.143 4.314 4.533 4.787 4.939 5.226 5.488 5.725 5.838 6.062 6.278 6.585 6.778 6.963 7.231 7.495 7.734 7.945 8.144 8.407 8.667 8.91 9.195 9.475 9.742 10.057 10.416 10.747 11.089 11.447 11.828 12.232 12.712 13.247 13.755 14.341 15.006 15.809 16.665 17.6 18.608 19.633 20.351 20.672 20.732 20.689 20.544 20.325 20.097 19.846 19.563 19.325 19.076 18.825 18.598 18.365 18.148 17.909 17.679 17.473 17.261 17.044 16.835 16.599 16.354 16.169 15.971 15.759 15.54 15.302 15.136 14.961 14.657 14.432 14.202 14.082 13.836 13.563 13.26 13.1 12.846 12.566 12.371 12.163 11.731 11.485 11.172 10.823 10.437 9.926 9.203 6.532 -7 ,31554 ,KEBNE ,17025762,Wed Dec 22 13:01:43 CET,Wed Dec 22 15:01:52 CET,0.0 1.293 1.811 2.191 2.519 2.798 3.052 3.29 3.702 3.894 4.077 4.32 4.57 4.712 4.979 5.228 5.464 5.575 5.789 5.996 6.287 6.471 6.647 6.905 7.155 7.388 7.601 7.793 8.05 8.318 8.569 8.859 9.136 9.402 9.702 10.026 10.34 10.677 11.046 11.451 11.865 12.324 12.852 13.367 13.942 14.595 15.338 16.143 17.113 18.135 19.209 20.002 20.317 20.417 20.37 20.226 20.043 19.814 19.588 19.327 19.048 18.8 18.584 18.37 18.143 17.906 17.64 17.392 17.172 16.96 16.732 16.529 16.313 16.082 15.903 15.717 15.524 15.316 15.082 14.913 14.74 14.478 14.278 14.06 13.943 13.684 13.43 13.157 13.006 12.763 12.491 12.29 12.081 11.627 11.372 11.091 10.775 10.404 9.945 9.344 7.062 -8 ,11843 ,KEBNE ,17025763,Wed Dec 22 13:01:48 CET,Wed Dec 22 15:04:02 CET,0.0 1.712 2.222 2.616 2.969 3.266 3.526 3.77 4.217 4.413 4.597 4.833 5.079 5.217 5.487 5.754 6.002 6.114 6.324 6.535 6.834 7.037 7.236 7.501 7.747 7.977 8.202 8.411 8.681 8.942 9.18 9.471 9.759 10.033 10.348 10.703 11.046 11.423 11.821 12.221 12.619 13.07 13.583 14.091 14.691 15.351 16.099 16.957 17.949 19.042 20.194 20.923 21.148 21.139 21.011 20.813 20.606 20.368 20.134 19.905 19.665 19.406 19.164 18.909 18.655 18.411 18.151 17.909 17.69 17.479 17.251 17.041 16.815 16.576 16.384 16.177 15.961 15.732 15.484 15.311 15.137 14.856 14.649 14.423 14.305 14.073 13.832 13.57 13.423 13.176 12.926 12.729 12.519 12.054 11.783 11.495 11.172 10.786 10.302 9.656 7.372 -9 ,13722 ,KEBNE ,17026030,Wed Dec 22 13:49:40 CET,Wed Dec 22 15:03:15 CET,0.0 1.268 1.805 2.197 2.519 2.792 3.045 3.278 3.68 3.862 4.033 4.253 4.501 4.647 4.928 5.185 5.422 5.537 5.753 5.954 6.242 6.422 6.59 6.844 7.087 7.326 7.564 7.783 8.063 8.324 8.57 8.878 9.183 9.477 9.795 10.125 10.443 10.801 11.188 11.599 12.034 12.507 13.049 13.57 14.157 14.799 15.499 16.298 17.23 18.233 19.288 19.98 20.215 20.246 20.109 19.894 19.681 19.441 19.172 18.891 18.66 18.423 18.161 17.893 17.629 17.386 17.131 16.879 16.642 16.4 16.148 15.935 15.709 15.459 15.254 15.044 14.815 14.56 14.296 14.114 13.911 13.578 13.347 13.096 12.964 12.699 12.425 12.129 11.963 11.695 11.366 11.14 10.9 10.383 10.099 9.755 9.373 8.943 8.397 7.61 5.003 -10 ,27843 ,KEBNE ,17026031,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 15:04:31 CET,0.0 1.272 1.759 2.144 2.477 2.774 3.037 3.276 3.702 3.881 4.055 4.3 4.558 4.701 4.964 5.207 5.443 5.558 5.77 5.969 6.255 6.437 6.611 6.857 7.096 7.333 7.561 7.778 8.053 8.307 8.552 8.852 9.13 9.385 9.678 10.01 10.328 10.673 11.041 11.434 11.827 12.252 12.753 13.264 13.883 14.577 15.328 16.157 17.104 18.229 19.509 20.349 20.73 20.838 20.782 20.659 20.494 20.29 20.073 19.85 19.637 19.403 19.159 18.924 18.7 18.49 18.26 18.046 17.852 17.642 17.407 17.199 16.986 16.75 16.559 16.368 16.16 15.938 15.707 15.548 15.375 15.104 14.919 14.707 14.593 14.353 14.102 13.836 13.7 13.473 13.207 13.012 12.813 12.353 12.099 11.823 11.511 11.148 10.72 10.134 7.949 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_63.txt deleted file mode 100644 index 8251385f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_35_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2761 ,KEBNE ,17070463,Fri Dec 24 17:25:44 CET,Fri Dec 24 19:26:09 CET,0.0 1.681 2.208 2.587 2.916 3.214 3.478 3.715 4.158 4.354 4.532 4.77 5.019 5.164 5.437 5.701 5.944 6.048 6.24 6.424 6.696 6.863 7.02 7.245 7.455 7.653 7.84 8.021 8.253 8.477 8.693 8.947 9.188 9.423 9.686 9.985 10.274 10.585 10.915 11.258 11.597 11.959 12.378 12.8 13.261 13.759 14.345 14.967 15.609 16.268 16.993 17.386 17.356 17.173 16.947 16.653 16.334 16.04 15.786 15.515 15.228 14.939 14.665 14.391 14.113 13.859 13.602 13.356 13.116 12.875 12.632 12.422 12.195 11.951 11.759 11.55 11.331 11.105 10.864 10.683 10.5 10.218 10.005 9.781 9.667 9.425 9.159 8.869 8.711 8.441 8.181 7.997 7.793 7.316 7.057 6.78 6.448 6.02 5.516 4.841 2.312 -2 ,13484 ,KEBNE ,17070464,Fri Dec 24 17:25:44 CET,Fri Dec 24 19:26:31 CET,0.0 1.347 1.856 2.211 2.533 2.827 3.09 3.321 3.725 3.916 4.093 4.308 4.552 4.702 4.989 5.245 5.497 5.621 5.851 6.066 6.366 6.545 6.713 6.961 7.2 7.406 7.598 7.799 8.058 8.295 8.519 8.78 9.03 9.268 9.537 9.833 10.097 10.38 10.69 11.007 11.331 11.686 12.092 12.478 12.915 13.391 13.917 14.5 15.107 15.728 16.321 16.53 16.422 16.2 15.939 15.605 15.242 14.913 14.634 14.325 14.029 13.774 13.524 13.252 12.988 12.71 12.407 12.157 11.939 11.715 11.475 11.256 11.033 10.817 10.632 10.424 10.212 9.998 9.764 9.596 9.419 9.142 8.94 8.714 8.601 8.375 8.137 7.86 7.709 7.451 7.186 6.996 6.793 6.334 6.081 5.794 5.459 5.071 4.582 3.863 1.019 -3 ,16713 ,KEBNE ,17070465,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:25:59 CET,0.0 1.408 1.91 2.283 2.608 2.9 3.166 3.39 3.774 3.949 4.118 4.346 4.594 4.738 5.014 5.267 5.496 5.607 5.82 6.021 6.306 6.481 6.651 6.898 7.129 7.35 7.562 7.762 8.01 8.25 8.479 8.75 9.003 9.24 9.516 9.815 10.096 10.406 10.733 11.078 11.461 11.882 12.326 12.747 13.235 13.741 14.303 14.942 15.636 16.394 17.191 17.561 17.539 17.321 17.035 16.712 16.379 16.054 15.751 15.417 15.116 14.833 14.527 14.22 13.915 13.61 13.294 13.018 12.778 12.531 12.26 12.024 11.777 11.53 11.331 11.103 10.858 10.617 10.365 10.179 9.982 9.67 9.451 9.214 9.092 8.84 8.564 8.261 8.103 7.84 7.558 7.354 7.135 6.643 6.38 6.088 5.732 5.319 4.834 4.173 1.408 -4 ,14713 ,KEBNE ,17070466,Fri Dec 24 17:25:42 CET,Fri Dec 24 19:27:04 CET,0.0 1.506 2.019 2.426 2.763 3.05 3.287 3.501 3.878 4.048 4.219 4.456 4.707 4.85 5.115 5.37 5.608 5.717 5.923 6.115 6.396 6.574 6.745 6.987 7.211 7.431 7.637 7.83 8.078 8.31 8.533 8.805 9.053 9.296 9.583 9.896 10.182 10.5 10.843 11.187 11.545 11.934 12.373 12.807 13.295 13.818 14.4 15.028 15.669 16.244 16.709 16.871 16.8 16.625 16.418 16.15 15.866 15.549 15.209 14.849 14.524 14.225 13.952 13.69 13.396 13.107 12.811 12.544 12.312 12.072 11.805 11.567 11.319 11.065 10.868 10.655 10.412 10.151 9.868 9.668 9.467 9.143 8.905 8.638 8.501 8.225 7.929 7.604 7.429 7.142 6.839 6.626 6.409 5.921 5.648 5.345 4.991 4.61 4.172 3.506 1.417 -5 ,1196 ,KEBNE ,17070467,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:25:48 CET,0.0 1.351 1.829 2.21 2.537 2.827 3.089 3.319 3.721 3.9 4.076 4.301 4.539 4.679 4.961 5.219 5.448 5.557 5.77 5.976 6.256 6.431 6.608 6.865 7.094 7.315 7.528 7.725 7.984 8.237 8.474 8.744 8.998 9.249 9.534 9.846 10.137 10.45 10.784 11.128 11.492 11.894 12.334 12.763 13.259 13.781 14.34 14.939 15.557 16.155 16.692 16.901 16.855 16.695 16.457 16.154 15.818 15.494 15.191 14.855 14.537 14.224 13.911 13.607 13.343 13.12 12.88 12.627 12.37 12.093 11.805 11.563 11.316 11.064 10.853 10.624 10.389 10.147 9.894 9.718 9.535 9.236 9.018 8.788 8.669 8.403 8.105 7.808 7.652 7.386 7.126 6.924 6.712 6.249 5.981 5.67 5.345 4.987 4.532 3.927 1.684 -6 ,24662 ,KEBNE ,17070468,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:26:45 CET,0.0 1.391 1.894 2.311 2.657 2.943 3.196 3.425 3.844 4.032 4.216 4.47 4.728 4.87 5.134 5.384 5.623 5.739 5.963 6.178 6.482 6.677 6.855 7.099 7.342 7.568 7.773 7.971 8.228 8.463 8.695 8.973 9.237 9.488 9.772 10.092 10.409 10.751 11.098 11.448 11.804 12.207 12.669 13.11 13.627 14.218 14.849 15.51 16.19 16.882 17.594 17.898 17.86 17.696 17.455 17.145 16.838 16.522 16.226 15.932 15.649 15.386 15.123 14.856 14.595 14.344 14.08 13.831 13.59 13.346 13.097 12.883 12.665 12.425 12.229 12.026 11.82 11.593 11.335 11.156 10.96 10.645 10.433 10.209 10.091 9.849 9.587 9.286 9.122 8.864 8.598 8.402 8.194 7.713 7.453 7.156 6.82 6.438 5.926 5.247 3.02 -7 ,28720 ,KEBNE ,17070469,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:25:21 CET,0.0 1.289 1.862 2.269 2.584 2.868 3.124 3.355 3.757 3.94 4.118 4.346 4.596 4.733 4.999 5.254 5.489 5.601 5.81 6.009 6.293 6.47 6.64 6.879 7.096 7.304 7.506 7.705 7.955 8.192 8.414 8.681 8.936 9.177 9.46 9.767 10.058 10.372 10.685 11.006 11.343 11.725 12.147 12.569 13.058 13.568 14.126 14.725 15.408 16.114 16.791 17.159 17.151 16.953 16.686 16.358 16.049 15.781 15.503 15.168 14.868 14.594 14.306 14.019 13.749 13.5 13.225 12.967 12.736 12.473 12.182 11.946 11.727 11.483 11.274 11.063 10.843 10.612 10.377 10.205 10.017 9.716 9.498 9.263 9.138 8.877 8.62 8.345 8.192 7.923 7.626 7.433 7.217 6.733 6.467 6.172 5.844 5.454 4.967 4.281 2.297 -8 ,18217 ,KEBNE ,17070470,Fri Dec 24 17:25:43 CET,Fri Dec 24 19:25:44 CET,0.0 1.46 1.982 2.369 2.7 3.0 3.255 3.485 3.905 4.098 4.279 4.497 4.745 4.889 5.158 5.412 5.641 5.749 5.961 6.166 6.458 6.637 6.8 7.037 7.274 7.502 7.708 7.915 8.188 8.442 8.671 8.933 9.18 9.422 9.7 9.999 10.288 10.608 10.947 11.292 11.643 12.031 12.462 12.876 13.344 13.874 14.475 15.061 15.683 16.357 16.946 17.175 17.076 16.861 16.644 16.372 16.048 15.726 15.444 15.118 14.815 14.539 14.266 14.003 13.735 13.474 13.204 12.97 12.76 12.521 12.271 12.063 11.842 11.61 11.425 11.229 11.003 10.768 10.53 10.355 10.182 9.9 9.683 9.461 9.343 9.083 8.805 8.501 8.342 8.082 7.818 7.626 7.42 6.929 6.657 6.371 6.049 5.659 5.193 4.536 2.35 -9 ,22896 ,KEBNE ,17070471,Fri Dec 24 17:27:49 CET,Fri Dec 24 19:28:05 CET,0.0 1.639 2.136 2.523 2.854 3.155 3.431 3.686 4.103 4.288 4.457 4.675 4.918 5.057 5.333 5.595 5.837 5.951 6.17 6.373 6.649 6.824 7.001 7.25 7.487 7.723 7.934 8.136 8.396 8.631 8.855 9.126 9.397 9.655 9.939 10.254 10.553 10.87 11.188 11.519 11.875 12.264 12.709 13.146 13.638 14.168 14.74 15.364 16.075 16.859 17.614 17.952 17.912 17.667 17.385 17.093 16.769 16.445 16.138 15.814 15.525 15.229 14.92 14.63 14.358 14.094 13.802 13.54 13.317 13.073 12.809 12.579 12.328 12.085 11.896 11.683 11.452 11.212 10.957 10.772 10.581 10.278 10.062 9.835 9.709 9.452 9.188 8.887 8.725 8.464 8.188 7.997 7.799 7.322 7.045 6.757 6.42 6.029 5.543 4.905 2.649 -10 ,1361 ,KEBNE ,17070472,Fri Dec 24 17:27:49 CET,Fri Dec 24 19:27:11 CET,0.0 1.387 1.928 2.368 2.71 2.999 3.262 3.49 3.9 4.101 4.296 4.53 4.784 4.928 5.193 5.44 5.673 5.788 6.001 6.202 6.498 6.688 6.872 7.128 7.368 7.598 7.809 8.018 8.273 8.503 8.732 9.012 9.273 9.513 9.786 10.104 10.403 10.703 11.018 11.356 11.706 12.095 12.539 12.961 13.436 13.963 14.579 15.287 16.06 16.835 17.542 17.834 17.798 17.615 17.365 17.073 16.75 16.42 16.108 15.769 15.464 15.182 14.887 14.578 14.289 14.032 13.749 13.483 13.241 12.981 12.704 12.483 12.262 12.019 11.824 11.611 11.378 11.141 10.899 10.739 10.572 10.293 10.086 9.853 9.734 9.501 9.254 8.98 8.824 8.568 8.32 8.124 7.919 7.496 7.251 6.976 6.669 6.287 5.817 5.184 3.031 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_29.txt deleted file mode 100644 index d9a7e0ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3984 ,KEBNE ,16720905,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:02:59 CET,0.0 1.883 2.47 2.857 3.145 3.393 3.597 3.756 4.039 4.156 4.237 4.292 4.43 4.488 4.575 4.654 4.722 4.75 4.801 4.846 4.907 4.923 4.923 4.91 4.872 4.822 4.759 4.686 4.585 4.471 4.343 4.157 3.948 3.73 3.459 3.127 2.78 2.354 1.852 1.279 0.578 -0.317 -1.435 -2.657 -4.241 -6.185 -8.651 -11.81 -15.952 -21.581 -30.076 -39.054 -45.582 -50.625 -54.727 -58.221 -61.143 -63.675 -65.78 -67.86 -69.625 -71.144 -72.521 -73.765 -74.873 -75.858 -76.883 -77.793 -78.58 -79.412 -80.25 -80.907 -81.6 -82.34 -82.91 -83.497 -84.091 -84.692 -85.311 -85.728 -86.168 -86.876 -87.365 -87.861 -88.113 -88.64 -89.189 -89.805 -90.162 -90.705 -91.333 -91.766 -92.214 -93.153 -93.683 -94.262 -94.878 -95.594 -96.493 -97.692 -101.906 -2 ,29918 ,KEBNE ,16720906,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:03:40 CET,0.0 2.602 3.092 3.433 3.709 3.93 4.098 4.231 4.464 4.564 4.651 4.727 4.862 4.917 5.021 5.1 5.152 5.174 5.204 5.218 5.204 5.189 5.166 5.113 5.056 4.988 4.906 4.828 4.718 4.574 4.436 4.264 4.075 3.877 3.596 3.233 2.847 2.376 1.811 1.148 0.428 -0.46 -1.619 -2.885 -4.53 -6.521 -9.007 -12.189 -16.451 -22.29 -31.038 -40.149 -46.815 -52.136 -56.382 -59.903 -62.823 -65.367 -67.475 -69.491 -71.179 -72.642 -74.008 -75.253 -76.392 -77.423 -78.46 -79.348 -80.109 -80.889 -81.693 -82.365 -83.054 -83.765 -84.315 -84.897 -85.551 -86.245 -86.959 -87.461 -87.981 -88.794 -89.358 -89.929 -90.217 -90.819 -91.453 -92.131 -92.502 -93.055 -93.654 -94.058 -94.498 -95.478 -96.009 -96.573 -97.193 -97.914 -98.845 -100.112 -104.151 -3 ,7083 ,KEBNE ,16720907,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:02:56 CET,0.0 1.519 2.009 2.372 2.661 2.886 3.076 3.237 3.493 3.597 3.682 3.756 3.894 3.954 4.068 4.162 4.244 4.273 4.316 4.361 4.422 4.444 4.448 4.438 4.422 4.391 4.34 4.28 4.191 4.093 3.974 3.8 3.602 3.401 3.147 2.812 2.46 2.046 1.552 0.974 0.286 -0.576 -1.696 -2.954 -4.525 -6.429 -8.901 -12.088 -16.295 -22.018 -30.521 -39.474 -46.16 -51.393 -55.554 -59.096 -62.043 -64.532 -66.62 -68.665 -70.36 -71.81 -73.144 -74.388 -75.546 -76.64 -77.817 -78.856 -79.716 -80.581 -81.474 -82.207 -82.994 -83.854 -84.524 -85.2 -85.891 -86.582 -87.298 -87.803 -88.319 -89.128 -89.682 -90.239 -90.524 -91.15 -91.81 -92.466 -92.816 -93.351 -93.959 -94.37 -94.786 -95.68 -96.196 -96.771 -97.398 -98.128 -99.032 -100.248 -104.951 -4 ,15102 ,KEBNE ,16720908,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:03:03 CET,0.0 2.182 2.755 3.106 3.354 3.57 3.761 3.909 4.147 4.249 4.343 4.43 4.569 4.63 4.726 4.799 4.858 4.88 4.909 4.926 4.943 4.946 4.943 4.928 4.892 4.846 4.791 4.725 4.616 4.483 4.343 4.149 3.937 3.723 3.457 3.119 2.749 2.289 1.734 1.12 0.429 -0.431 -1.514 -2.705 -4.284 -6.293 -8.845 -12.026 -16.257 -22.069 -30.696 -39.87 -46.701 -52.122 -56.552 -60.265 -63.313 -65.948 -68.154 -70.313 -72.109 -73.662 -75.105 -76.419 -77.629 -78.721 -79.837 -80.828 -81.659 -82.487 -83.364 -84.115 -84.879 -85.645 -86.222 -86.788 -87.355 -87.961 -88.609 -89.069 -89.558 -90.322 -90.844 -91.386 -91.665 -92.242 -92.861 -93.501 -93.83 -94.354 -94.905 -95.288 -95.7 -96.618 -97.152 -97.73 -98.338 -99.027 -99.875 -101.088 -105.26 -5 ,22973 ,KEBNE ,16720909,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:03:05 CET,0.0 1.915 2.4 2.733 2.989 3.207 3.376 3.51 3.736 3.83 3.917 3.976 4.101 4.155 4.243 4.32 4.392 4.418 4.448 4.465 4.47 4.467 4.457 4.427 4.384 4.32 4.238 4.156 4.046 3.915 3.757 3.552 3.334 3.102 2.81 2.442 2.056 1.599 1.07 0.432 -0.317 -1.208 -2.315 -3.537 -5.125 -7.087 -9.6 -12.775 -17.011 -22.822 -31.369 -40.442 -47.142 -52.358 -56.539 -60.074 -63.058 -65.673 -67.831 -69.925 -71.669 -73.168 -74.562 -75.853 -77.037 -78.074 -79.127 -80.056 -80.859 -81.706 -82.612 -83.374 -84.162 -84.956 -85.555 -86.173 -86.83 -87.521 -88.234 -88.733 -89.244 -90.027 -90.563 -91.114 -91.401 -92.006 -92.651 -93.34 -93.7 -94.233 -94.858 -95.282 -95.719 -96.688 -97.215 -97.803 -98.469 -99.198 -100.078 -101.345 -105.427 -6 ,8851 ,KEBNE ,16720910,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:02:24 CET,0.0 2.092 2.648 3.014 3.288 3.499 3.672 3.831 4.092 4.202 4.3 4.375 4.518 4.58 4.673 4.751 4.813 4.839 4.89 4.922 4.945 4.947 4.934 4.894 4.861 4.83 4.787 4.725 4.609 4.461 4.309 4.131 3.94 3.731 3.441 3.076 2.727 2.33 1.85 1.26 0.57 -0.299 -1.429 -2.619 -4.055 -5.809 -8.226 -11.437 -15.712 -21.643 -30.522 -39.956 -46.912 -52.241 -56.544 -60.205 -63.25 -65.937 -68.167 -70.378 -72.252 -73.856 -75.346 -76.709 -77.935 -79.019 -80.138 -81.131 -81.978 -82.856 -83.765 -84.494 -85.232 -86.009 -86.631 -87.293 -87.976 -88.655 -89.337 -89.806 -90.281 -91.01 -91.512 -92.041 -92.318 -92.903 -93.525 -94.16 -94.495 -95.027 -95.618 -96.01 -96.417 -97.346 -97.855 -98.395 -99.01 -99.743 -100.683 -101.952 -106.224 -7 ,31385 ,KEBNE ,16720911,Sat Nov 27 03:00:27 CET,Sat Nov 27 05:02:25 CET,0.0 2.115 2.68 3.077 3.377 3.609 3.814 3.979 4.233 4.343 4.441 4.522 4.656 4.712 4.814 4.904 4.965 4.987 5.03 5.063 5.104 5.119 5.131 5.135 5.115 5.087 5.042 4.98 4.889 4.788 4.669 4.487 4.267 4.037 3.745 3.373 2.987 2.534 1.999 1.383 0.687 -0.193 -1.341 -2.587 -4.147 -6.023 -8.426 -11.468 -15.523 -21.277 -29.957 -38.95 -45.491 -50.604 -54.77 -58.266 -61.172 -63.696 -65.767 -67.787 -69.48 -70.94 -72.296 -73.54 -74.676 -75.694 -76.734 -77.638 -78.408 -79.205 -80.022 -80.676 -81.353 -82.07 -82.619 -83.173 -83.78 -84.457 -85.165 -85.646 -86.14 -86.91 -87.449 -88.014 -88.306 -88.925 -89.569 -90.226 -90.572 -91.108 -91.712 -92.119 -92.563 -93.54 -94.062 -94.647 -95.308 -96.049 -96.928 -98.143 -103.243 -8 ,28343 ,KEBNE ,16720912,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:01:47 CET,0.0 1.63 2.113 2.45 2.749 2.988 3.161 3.306 3.548 3.656 3.746 3.825 3.965 4.022 4.116 4.193 4.25 4.274 4.319 4.351 4.362 4.341 4.316 4.284 4.238 4.171 4.102 4.02 3.894 3.77 3.639 3.454 3.257 3.053 2.792 2.469 2.118 1.687 1.176 0.582 -0.097 -0.952 -2.056 -3.265 -4.806 -6.677 -9.056 -12.092 -16.207 -21.898 -30.286 -39.194 -45.763 -50.875 -54.951 -58.367 -61.239 -63.683 -65.707 -67.709 -69.367 -70.788 -72.088 -73.288 -74.376 -75.338 -76.322 -77.178 -77.91 -78.666 -79.47 -80.147 -80.839 -81.538 -82.061 -82.603 -83.175 -83.746 -84.333 -84.741 -85.175 -85.872 -86.341 -86.826 -87.078 -87.58 -88.092 -88.639 -88.922 -89.39 -89.857 -90.199 -90.573 -91.419 -91.877 -92.366 -92.942 -93.625 -94.45 -95.563 -99.555 -9 ,31785 ,KEBNE ,16720913,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:02:42 CET,0.0 2.091 2.547 2.883 3.15 3.376 3.565 3.709 3.935 4.027 4.119 4.206 4.345 4.405 4.499 4.576 4.639 4.662 4.699 4.732 4.765 4.777 4.786 4.774 4.75 4.717 4.667 4.605 4.512 4.411 4.302 4.149 3.974 3.78 3.527 3.212 2.876 2.453 1.951 1.329 0.576 -0.349 -1.543 -2.842 -4.495 -6.529 -9.095 -12.326 -16.64 -22.628 -31.653 -41.209 -48.178 -53.582 -57.872 -61.374 -64.284 -66.814 -68.918 -70.972 -72.673 -74.132 -75.459 -76.675 -77.803 -78.805 -79.841 -80.775 -81.612 -82.501 -83.399 -84.119 -84.846 -85.598 -86.183 -86.783 -87.397 -88.031 -88.695 -89.15 -89.619 -90.364 -90.881 -91.416 -91.695 -92.274 -92.87 -93.493 -93.827 -94.351 -94.941 -95.347 -95.77 -96.689 -97.199 -97.756 -98.369 -99.075 -99.947 -101.173 -105.253 -10 ,7883 ,KEBNE ,16720914,Sat Nov 27 03:00:27 CET,Sat Nov 27 05:02:58 CET,0.0 1.805 2.305 2.637 2.876 3.06 3.226 3.381 3.631 3.739 3.835 3.908 4.047 4.101 4.182 4.255 4.313 4.337 4.38 4.417 4.447 4.447 4.44 4.42 4.382 4.337 4.287 4.223 4.12 4.0 3.861 3.682 3.501 3.297 3.032 2.706 2.354 1.932 1.432 0.852 0.187 -0.625 -1.672 -2.825 -4.304 -6.184 -8.614 -11.689 -15.818 -21.445 -29.667 -38.362 -44.982 -50.213 -54.362 -57.85 -60.8 -63.424 -65.646 -67.793 -69.568 -71.091 -72.503 -73.817 -75.01 -76.111 -77.314 -78.382 -79.274 -80.199 -81.175 -81.971 -82.777 -83.603 -84.236 -84.879 -85.546 -86.24 -86.948 -87.44 -87.948 -88.716 -89.235 -89.773 -90.054 -90.622 -91.223 -91.865 -92.198 -92.732 -93.36 -93.77 -94.187 -95.137 -95.683 -96.244 -96.865 -97.615 -98.538 -99.749 -104.405 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_35.txt deleted file mode 100644 index b0da54ee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_36_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32380 ,KEBNE ,16720915,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:01:56 CET,0.0 1.709 2.249 2.649 2.985 3.267 3.513 3.725 4.099 4.276 4.433 4.654 4.871 5.006 5.254 5.468 5.664 5.756 5.934 6.107 6.348 6.496 6.641 6.843 7.028 7.195 7.351 7.493 7.666 7.839 7.998 8.181 8.348 8.499 8.669 8.852 9.019 9.162 9.272 9.379 9.486 9.569 9.622 9.651 9.625 9.509 9.301 8.963 8.335 7.27 5.446 3.228 1.49 0.04 -1.211 -2.388 -3.503 -4.47 -5.254 -6.094 -6.841 -7.502 -8.145 -8.794 -9.43 -9.981 -10.527 -11.033 -11.488 -11.947 -12.425 -12.831 -13.263 -13.722 -14.085 -14.448 -14.828 -15.25 -15.688 -15.977 -16.274 -16.759 -17.117 -17.51 -17.721 -18.184 -18.666 -19.171 -19.449 -19.834 -20.358 -20.696 -21.074 -21.914 -22.378 -22.88 -23.435 -24.093 -24.907 -26.023 -30.647 -2 ,1710 ,KEBNE ,16720916,Sat Nov 27 03:00:27 CET,Sat Nov 27 05:02:55 CET,0.0 1.629 2.174 2.575 2.877 3.137 3.356 3.559 3.924 4.076 4.222 4.427 4.634 4.762 4.996 5.211 5.411 5.507 5.686 5.838 6.049 6.188 6.32 6.504 6.687 6.854 7.003 7.143 7.317 7.482 7.637 7.804 7.945 8.081 8.238 8.389 8.518 8.647 8.788 8.922 9.012 9.073 9.14 9.185 9.186 9.112 8.929 8.647 8.096 7.107 5.332 3.151 1.302 -0.396 -1.882 -3.19 -4.308 -5.251 -6.04 -6.877 -7.616 -8.286 -8.933 -9.55 -10.157 -10.722 -11.314 -11.835 -12.281 -12.776 -13.323 -13.776 -14.256 -14.78 -15.188 -15.607 -16.06 -16.53 -17.015 -17.357 -17.713 -18.29 -18.689 -19.098 -19.312 -19.767 -20.259 -20.774 -21.047 -21.436 -21.965 -22.296 -22.66 -23.473 -23.906 -24.383 -24.934 -25.566 -26.352 -27.44 -31.147 -3 ,25332 ,KEBNE ,16720917,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:02:10 CET,0.0 2.039 2.635 3.046 3.363 3.622 3.854 4.068 4.422 4.594 4.764 4.982 5.192 5.318 5.54 5.74 5.935 6.029 6.196 6.353 6.58 6.723 6.857 7.048 7.231 7.386 7.518 7.654 7.821 7.979 8.134 8.299 8.449 8.6 8.76 8.918 9.042 9.16 9.272 9.36 9.446 9.54 9.598 9.598 9.553 9.455 9.246 8.884 8.318 7.425 5.765 3.645 1.791 0.151 -1.428 -2.865 -4.028 -5.062 -5.908 -6.715 -7.423 -8.066 -8.683 -9.258 -9.79 -10.297 -10.853 -11.344 -11.764 -12.241 -12.781 -13.246 -13.742 -14.264 -14.675 -15.091 -15.501 -15.933 -16.406 -16.735 -17.072 -17.609 -17.994 -18.411 -18.633 -19.106 -19.621 -20.153 -20.42 -20.804 -21.342 -21.672 -22.014 -22.798 -23.248 -23.756 -24.332 -25.013 -25.869 -27.003 -30.971 -4 ,20154 ,KEBNE ,16720918,Sat Nov 27 03:00:26 CET,Sat Nov 27 05:02:54 CET,0.0 1.764 2.302 2.712 3.05 3.325 3.565 3.796 4.204 4.378 4.532 4.745 4.965 5.09 5.331 5.567 5.781 5.879 6.058 6.222 6.444 6.573 6.703 6.898 7.079 7.244 7.401 7.548 7.728 7.904 8.065 8.239 8.4 8.547 8.696 8.842 8.967 9.085 9.198 9.315 9.426 9.523 9.571 9.572 9.551 9.482 9.323 8.978 8.356 7.311 5.43 3.164 1.306 -0.251 -1.593 -2.806 -3.844 -4.794 -5.617 -6.443 -7.18 -7.836 -8.438 -9.012 -9.574 -10.106 -10.666 -11.173 -11.604 -12.084 -12.661 -13.131 -13.587 -14.062 -14.43 -14.829 -15.258 -15.71 -16.186 -16.522 -16.868 -17.423 -17.831 -18.257 -18.472 -18.925 -19.403 -19.908 -20.17 -20.53 -21.034 -21.371 -21.726 -22.512 -22.959 -23.458 -24.019 -24.679 -25.473 -26.586 -30.911 -5 ,8009 ,KEBNE ,16720919,Sat Nov 27 03:01:28 CET,Sat Nov 27 05:03:56 CET,0.0 1.565 2.148 2.532 2.854 3.149 3.401 3.627 4.033 4.211 4.389 4.643 4.864 5.001 5.248 5.462 5.66 5.757 5.943 6.116 6.355 6.498 6.636 6.828 7.001 7.156 7.3 7.437 7.615 7.788 7.957 8.151 8.311 8.456 8.626 8.793 8.933 9.093 9.236 9.351 9.457 9.564 9.672 9.733 9.749 9.729 9.603 9.339 8.869 7.989 6.372 4.286 2.486 0.871 -0.604 -1.936 -3.194 -4.377 -5.354 -6.32 -7.204 -8.028 -8.839 -9.61 -10.32 -10.959 -11.645 -12.271 -12.775 -13.29 -13.84 -14.288 -14.764 -15.258 -15.654 -16.079 -16.515 -16.959 -17.418 -17.738 -18.066 -18.608 -18.992 -19.399 -19.619 -20.057 -20.508 -21.001 -21.272 -21.66 -22.182 -22.509 -22.86 -23.663 -24.134 -24.661 -25.228 -25.88 -26.687 -27.784 -31.365 -6 ,2248 ,KEBNE ,16720920,Sat Nov 27 03:01:28 CET,Sat Nov 27 05:03:46 CET,0.0 1.599 2.126 2.553 2.905 3.207 3.461 3.679 4.063 4.247 4.427 4.658 4.859 4.985 5.226 5.453 5.664 5.759 5.952 6.129 6.341 6.473 6.606 6.79 6.957 7.117 7.27 7.406 7.557 7.697 7.835 7.992 8.138 8.265 8.402 8.555 8.69 8.823 8.948 9.077 9.184 9.258 9.327 9.374 9.389 9.31 9.122 8.791 8.183 7.21 5.451 3.199 1.299 -0.33 -1.703 -2.949 -4.087 -5.087 -5.945 -6.853 -7.666 -8.401 -9.13 -9.869 -10.563 -11.184 -11.841 -12.428 -12.948 -13.498 -14.094 -14.585 -15.069 -15.534 -15.893 -16.311 -16.736 -17.164 -17.641 -17.978 -18.328 -18.889 -19.264 -19.655 -19.875 -20.347 -20.844 -21.377 -21.659 -22.047 -22.585 -22.927 -23.27 -24.024 -24.469 -24.965 -25.526 -26.193 -27.019 -28.151 -32.039 -7 ,5132 ,KEBNE ,16720921,Sat Nov 27 03:01:27 CET,Sat Nov 27 05:03:12 CET,0.0 1.713 2.299 2.71 3.037 3.324 3.572 3.799 4.197 4.364 4.523 4.738 4.956 5.085 5.333 5.555 5.739 5.834 6.023 6.195 6.442 6.595 6.734 6.923 7.098 7.26 7.414 7.562 7.74 7.897 8.031 8.186 8.331 8.466 8.629 8.814 8.973 9.111 9.241 9.371 9.475 9.558 9.634 9.66 9.615 9.523 9.351 9.044 8.476 7.487 5.693 3.547 1.836 0.287 -1.142 -2.428 -3.536 -4.524 -5.365 -6.227 -6.974 -7.622 -8.231 -8.811 -9.365 -9.876 -10.429 -10.925 -11.359 -11.827 -12.319 -12.722 -13.139 -13.592 -13.942 -14.305 -14.695 -15.127 -15.59 -15.927 -16.306 -16.888 -17.283 -17.704 -17.917 -18.347 -18.801 -19.269 -19.512 -19.866 -20.342 -20.655 -21.002 -21.754 -22.175 -22.649 -23.179 -23.791 -24.56 -25.711 -29.811 -8 ,11736 ,KEBNE ,16720922,Sat Nov 27 03:01:27 CET,Sat Nov 27 05:03:28 CET,0.0 1.761 2.358 2.783 3.144 3.458 3.72 3.951 4.37 4.548 4.711 4.937 5.154 5.294 5.556 5.785 6.003 6.105 6.293 6.466 6.697 6.834 6.973 7.161 7.324 7.487 7.639 7.771 7.938 8.095 8.241 8.417 8.572 8.703 8.853 9.014 9.151 9.287 9.42 9.539 9.629 9.714 9.808 9.865 9.851 9.773 9.615 9.344 8.881 8.016 6.312 4.13 2.333 0.748 -0.753 -2.044 -3.115 -4.098 -4.928 -5.772 -6.53 -7.214 -7.845 -8.457 -9.043 -9.57 -10.118 -10.614 -11.048 -11.489 -11.939 -12.328 -12.739 -13.168 -13.503 -13.853 -14.218 -14.589 -14.978 -15.259 -15.576 -16.111 -16.498 -16.893 -17.097 -17.526 -17.994 -18.512 -18.778 -19.147 -19.651 -19.989 -20.351 -21.16 -21.627 -22.138 -22.688 -23.325 -24.135 -25.34 -30.469 -9 ,12970 ,KEBNE ,16720923,Sat Nov 27 03:01:28 CET,Sat Nov 27 05:04:48 CET,0.0 1.6 2.16 2.554 2.864 3.132 3.37 3.588 3.966 4.135 4.3 4.545 4.772 4.904 5.141 5.358 5.568 5.672 5.867 6.048 6.293 6.442 6.589 6.788 6.982 7.175 7.339 7.481 7.665 7.839 8.004 8.188 8.345 8.496 8.671 8.845 8.994 9.151 9.302 9.429 9.541 9.624 9.679 9.709 9.69 9.601 9.433 9.167 8.657 7.708 5.919 3.619 1.771 0.22 -1.116 -2.238 -3.22 -4.126 -4.907 -5.718 -6.397 -6.984 -7.581 -8.157 -8.673 -9.127 -9.627 -10.14 -10.605 -11.083 -11.596 -12.031 -12.485 -12.955 -13.323 -13.699 -14.086 -14.496 -14.92 -15.203 -15.499 -15.994 -16.349 -16.719 -16.92 -17.346 -17.791 -18.257 -18.503 -18.865 -19.314 -19.617 -19.943 -20.614 -20.997 -21.444 -21.976 -22.628 -23.42 -24.477 -28.152 -10 ,8740 ,KEBNE ,16720924,Sat Nov 27 03:01:27 CET,Sat Nov 27 05:04:52 CET,0.0 1.865 2.423 2.851 3.214 3.496 3.755 3.998 4.416 4.603 4.763 4.963 5.165 5.287 5.526 5.739 5.93 6.024 6.201 6.368 6.601 6.746 6.881 7.072 7.249 7.407 7.551 7.693 7.875 8.032 8.18 8.356 8.504 8.637 8.782 8.937 9.068 9.191 9.312 9.416 9.496 9.556 9.6 9.603 9.555 9.451 9.239 8.885 8.294 7.346 5.561 3.277 1.343 -0.348 -1.818 -3.115 -4.221 -5.205 -6.011 -6.806 -7.532 -8.185 -8.867 -9.593 -10.307 -10.958 -11.578 -12.137 -12.668 -13.209 -13.737 -14.194 -14.673 -15.149 -15.524 -15.942 -16.368 -16.772 -17.205 -17.521 -17.846 -18.365 -18.74 -19.136 -19.331 -19.728 -20.166 -20.629 -20.881 -21.239 -21.692 -22.006 -22.34 -23.072 -23.48 -23.93 -24.436 -25.036 -25.814 -26.901 -31.128 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_34.txt deleted file mode 100644 index b18d1bef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_34.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8184 ,KEBNE ,16720925,Sat Nov 27 03:01:28 CET,Sat Nov 27 05:02:48 CET,0.0 1.668 2.205 2.61 2.951 3.24 3.491 3.717 4.125 4.308 4.481 4.71 4.951 5.105 5.388 5.651 5.902 6.019 6.234 6.437 6.738 6.93 7.117 7.39 7.649 7.898 8.135 8.361 8.649 8.925 9.182 9.485 9.78 10.067 10.389 10.743 11.085 11.454 11.851 12.238 12.633 13.101 13.626 14.146 14.74 15.381 16.086 16.803 17.559 18.39 19.117 19.27 18.941 18.43 17.956 17.474 16.976 16.464 15.969 15.428 14.946 14.514 14.09 13.666 13.263 12.902 12.532 12.195 11.882 11.521 11.148 10.862 10.535 10.151 9.849 9.548 9.243 8.931 8.594 8.343 8.091 7.697 7.404 7.086 6.93 6.606 6.246 5.848 5.637 5.335 4.891 4.538 4.175 3.5 3.087 2.591 2.002 1.326 0.503 -0.709 -10.122 -6 ,18992 ,KEBNE ,16720930,Sat Nov 27 03:04:32 CET,Sat Nov 27 05:05:50 CET,0.0 1.554 2.083 2.486 2.822 3.113 3.379 3.607 4.014 4.203 4.38 4.635 4.89 5.043 5.337 5.606 5.849 5.967 6.201 6.419 6.724 6.916 7.101 7.369 7.623 7.872 8.108 8.326 8.591 8.848 9.104 9.409 9.707 10.0 10.338 10.717 11.081 11.457 11.84 12.241 12.659 13.135 13.686 14.231 14.837 15.494 16.253 17.074 17.911 18.737 19.465 19.68 19.451 19.025 18.59 18.121 17.652 17.164 16.649 16.096 15.591 15.117 14.671 14.273 13.905 13.507 13.037 12.636 12.29 11.928 11.551 11.236 10.911 10.517 10.184 9.854 9.538 9.23 8.887 8.608 8.298 7.82 7.468 7.076 6.87 6.44 5.964 5.427 5.148 4.795 4.313 4.004 3.674 2.997 2.618 2.18 1.645 1.021 0.256 -0.808 -4.879 -7 ,13253 ,KEBNE ,16720931,Sat Nov 27 03:06:35 CET,Sat Nov 27 05:05:42 CET,0.0 1.634 2.174 2.559 2.862 3.145 3.41 3.648 4.075 4.263 4.437 4.671 4.916 5.065 5.348 5.609 5.854 5.973 6.207 6.431 6.744 6.944 7.137 7.415 7.681 7.938 8.178 8.403 8.701 8.989 9.26 9.58 9.874 10.156 10.491 10.855 11.197 11.566 11.949 12.352 12.773 13.248 13.804 14.349 14.95 15.566 16.258 17.025 17.839 18.633 19.235 19.392 19.096 18.626 18.074 17.504 16.948 16.369 15.874 15.369 14.893 14.454 14.028 13.59 13.18 12.82 12.425 12.059 11.722 11.372 11.017 10.715 10.403 10.055 9.765 9.47 9.15 8.796 8.428 8.175 7.902 7.479 7.186 6.855 6.679 6.31 5.902 5.449 5.193 4.86 4.467 4.216 3.934 3.188 2.748 2.324 1.859 1.254 0.401 -0.898 -5.98 -8 ,24328 ,KEBNE ,16720932,Sat Nov 27 03:33:17 CET,Sat Nov 27 05:33:09 CET,0.0 1.508 2.072 2.464 2.793 3.081 3.334 3.558 3.97 4.161 4.346 4.599 4.844 4.988 5.261 5.523 5.771 5.888 6.118 6.343 6.654 6.841 7.024 7.305 7.573 7.823 8.062 8.288 8.571 8.849 9.123 9.443 9.733 10.011 10.339 10.693 11.029 11.424 11.847 12.277 12.721 13.204 13.759 14.313 14.962 15.681 16.41 17.146 17.933 18.721 19.387 19.46 19.207 18.767 18.259 17.742 17.241 16.75 16.293 15.801 15.348 14.906 14.463 14.063 13.698 13.318 12.852 12.41 12.05 11.7 11.314 10.968 10.606 10.213 9.886 9.521 9.138 8.768 8.393 8.137 7.868 7.443 7.143 6.816 6.643 6.281 5.896 5.456 5.191 4.798 4.24 3.917 3.574 2.781 2.357 1.874 1.276 0.516 -0.405 -1.51 -7.09 -9 ,29572 ,KEBNE ,16720933,Sat Nov 27 03:33:17 CET,Sat Nov 27 05:34:21 CET,0.0 1.742 2.242 2.631 2.955 3.219 3.459 3.68 4.071 4.25 4.423 4.642 4.88 5.022 5.302 5.559 5.793 5.902 6.108 6.31 6.606 6.795 6.98 7.246 7.495 7.738 7.973 8.194 8.473 8.742 9.002 9.313 9.604 9.883 10.2 10.546 10.885 11.241 11.608 12.0 12.419 12.885 13.428 13.952 14.53 15.151 15.859 16.598 17.344 18.165 18.874 19.082 18.884 18.502 18.046 17.519 16.999 16.516 16.063 15.541 15.065 14.644 14.236 13.841 13.466 13.098 12.706 12.362 12.066 11.748 11.391 11.094 10.762 10.4 10.116 9.832 9.524 9.157 8.811 8.582 8.328 7.926 7.632 7.323 7.164 6.818 6.43 6.014 5.789 5.437 4.96 4.658 4.328 3.602 3.163 2.692 2.176 1.543 0.771 -0.445 -10.003 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_35.txt deleted file mode 100644 index c2f5088a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_37_35.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30254 ,KEBNE ,16720935,Sat Nov 27 04:08:07 CET,Sat Nov 27 06:09:57 CET,0.0 1.846 2.423 2.876 3.232 3.539 3.804 4.03 4.429 4.63 4.809 5.022 5.257 5.396 5.667 5.925 6.156 6.27 6.494 6.708 7.009 7.192 7.356 7.582 7.807 8.032 8.238 8.424 8.653 8.867 9.082 9.358 9.627 9.856 10.083 10.325 10.567 10.844 11.14 11.441 11.755 12.123 12.499 12.829 13.217 13.612 13.991 14.305 14.609 14.765 14.397 13.413 12.246 11.11 10.123 9.242 8.398 7.566 6.832 6.093 5.447 4.847 4.267 3.719 3.209 2.731 2.22 1.746 1.302 0.832 0.325 -0.095 -0.534 -0.982 -1.331 -1.702 -2.06 -2.432 -2.86 -3.161 -3.473 -3.996 -4.371 -4.75 -4.936 -5.343 -5.825 -6.35 -6.617 -7.004 -7.562 -7.934 -8.333 -9.219 -9.736 -10.282 -10.89 -11.634 -12.546 -13.691 -24.053 -2 ,8203 ,KEBNE ,16720936,Sat Nov 27 04:08:07 CET,Sat Nov 27 06:09:31 CET,0.0 2.231 2.895 3.381 3.791 4.102 4.374 4.629 5.075 5.278 5.473 5.751 6.008 6.163 6.45 6.714 6.961 7.083 7.312 7.525 7.828 8.016 8.193 8.444 8.682 8.898 9.103 9.306 9.558 9.798 10.024 10.284 10.542 10.795 11.075 11.357 11.636 11.941 12.236 12.558 12.9 13.241 13.624 14.004 14.363 14.665 14.933 15.134 15.219 15.15 14.577 13.382 12.085 10.874 9.791 8.756 7.82 6.996 6.282 5.547 4.925 4.374 3.814 3.248 2.709 2.209 1.692 1.245 0.844 0.401 -0.063 -0.449 -0.842 -1.26 -1.602 -1.95 -2.314 -2.696 -3.092 -3.382 -3.695 -4.177 -4.521 -4.883 -5.069 -5.432 -5.796 -6.221 -6.456 -6.794 -7.22 -7.503 -7.816 -8.552 -8.988 -9.493 -10.052 -10.775 -11.826 -13.24 -21.13 -5 ,11575 ,KEBNE ,16720939,Sat Nov 27 04:41:46 CET,Sat Nov 27 06:43:06 CET,0.0 2.611 3.385 3.916 4.33 4.656 4.949 5.22 5.688 5.884 6.061 6.331 6.589 6.744 7.034 7.302 7.562 7.686 7.919 8.131 8.44 8.632 8.8 9.042 9.278 9.508 9.73 9.927 10.163 10.396 10.615 10.879 11.145 11.4 11.668 11.944 12.199 12.473 12.756 13.046 13.332 13.624 13.962 14.289 14.581 14.835 15.098 15.372 15.583 15.484 14.86 13.684 12.468 11.269 10.12 9.083 8.177 7.378 6.651 5.884 5.233 4.653 4.087 3.529 3.014 2.54 2.031 1.579 1.162 0.725 0.303 -0.047 -0.426 -0.828 -1.137 -1.466 -1.84 -2.215 -2.6 -2.879 -3.165 -3.618 -3.936 -4.281 -4.477 -4.911 -5.351 -5.811 -6.055 -6.397 -6.827 -7.122 -7.439 -8.11 -8.523 -8.991 -9.501 -10.199 -11.102 -12.456 -21.882 -7 ,28030 ,KEBNE ,16720941,Sat Nov 27 04:53:03 CET,Sat Nov 27 06:51:40 CET,0.0 2.542 3.163 3.615 3.957 4.259 4.548 4.805 5.238 5.432 5.609 5.841 6.092 6.244 6.53 6.792 7.037 7.157 7.388 7.606 7.911 8.097 8.272 8.521 8.751 8.956 9.153 9.346 9.587 9.805 10.008 10.242 10.458 10.67 10.915 11.187 11.452 11.718 11.979 12.259 12.557 12.894 13.242 13.545 13.877 14.218 14.494 14.665 14.764 14.581 13.747 12.381 11.065 9.81 8.658 7.571 6.621 5.794 5.045 4.263 3.612 3.008 2.409 1.843 1.33 0.861 0.35 -0.104 -0.498 -0.914 -1.355 -1.749 -2.149 -2.556 -2.872 -3.207 -3.581 -3.954 -4.353 -4.645 -4.956 -5.484 -5.83 -6.18 -6.37 -6.766 -7.186 -7.651 -7.909 -8.299 -8.824 -9.14 -9.467 -10.131 -10.513 -10.965 -11.459 -12.066 -12.879 -14.197 -18.446 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_39.txt deleted file mode 100644 index 90580729..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24185 ,KEBNE ,16720945,Sat Nov 27 04:55:10 CET,Sat Nov 27 06:51:29 CET,0.0 1.253 1.728 2.073 2.345 2.578 2.798 3.001 3.336 3.476 3.612 3.776 3.996 4.109 4.322 4.527 4.716 4.806 4.974 5.127 5.333 5.463 5.589 5.766 5.924 6.071 6.214 6.333 6.473 6.611 6.75 6.913 7.065 7.204 7.349 7.503 7.637 7.778 7.931 8.061 8.18 8.307 8.419 8.508 8.579 8.594 8.535 8.349 7.917 7.082 5.447 3.445 1.831 0.479 -0.694 -1.761 -2.685 -3.535 -4.317 -5.112 -5.803 -6.437 -7.032 -7.58 -8.11 -8.6 -9.094 -9.558 -9.974 -10.384 -10.806 -11.158 -11.519 -11.905 -12.217 -12.557 -12.92 -13.295 -13.685 -13.954 -14.225 -14.667 -15.002 -15.345 -15.512 -15.885 -16.297 -16.726 -16.946 -17.29 -17.666 -17.937 -18.237 -18.882 -19.22 -19.597 -20.062 -20.574 -21.193 -22.051 -25.205 -2 ,21453 ,KEBNE ,16720946,Sat Nov 27 04:58:05 CET,Sat Nov 27 06:58:41 CET,0.0 1.013 1.424 1.731 2.023 2.287 2.517 2.721 3.077 3.239 3.392 3.564 3.785 3.901 4.102 4.291 4.469 4.551 4.713 4.862 5.053 5.174 5.29 5.463 5.638 5.797 5.941 6.077 6.254 6.402 6.524 6.682 6.829 6.962 7.112 7.281 7.434 7.576 7.714 7.856 7.987 8.107 8.229 8.305 8.356 8.37 8.298 8.102 7.727 7.068 5.735 3.974 2.476 1.172 0.035 -1.013 -1.949 -2.818 -3.591 -4.36 -5.01 -5.567 -6.096 -6.607 -7.1 -7.569 -8.078 -8.538 -8.927 -9.318 -9.731 -10.095 -10.49 -10.912 -11.225 -11.536 -11.868 -12.217 -12.592 -12.847 -13.113 -13.547 -13.847 -14.158 -14.324 -14.667 -15.031 -15.427 -15.634 -15.967 -16.316 -16.576 -16.859 -17.473 -17.808 -18.176 -18.601 -19.084 -19.681 -20.541 -23.433 -3 ,6641 ,KEBNE ,16720947,Sat Nov 27 04:58:05 CET,Sat Nov 27 06:57:41 CET,0.0 1.32 1.766 2.094 2.381 2.643 2.874 3.067 3.402 3.561 3.708 3.864 4.084 4.205 4.434 4.631 4.808 4.894 5.06 5.215 5.431 5.566 5.694 5.873 6.032 6.181 6.326 6.462 6.63 6.778 6.913 7.073 7.213 7.332 7.474 7.623 7.748 7.878 8.0 8.117 8.232 8.338 8.442 8.523 8.558 8.533 8.421 8.202 7.811 7.126 5.685 3.706 2.048 0.606 -0.621 -1.729 -2.709 -3.623 -4.428 -5.228 -5.918 -6.525 -7.11 -7.661 -8.188 -8.687 -9.198 -9.65 -10.048 -10.478 -10.918 -11.276 -11.657 -12.061 -12.377 -12.705 -13.053 -13.442 -13.851 -14.13 -14.42 -14.871 -15.178 -15.504 -15.68 -16.041 -16.425 -16.834 -17.052 -17.394 -17.757 -18.019 -18.297 -18.913 -19.279 -19.69 -20.16 -20.688 -21.32 -22.181 -25.236 -4 ,12685 ,KEBNE ,16720948,Sat Nov 27 04:59:06 CET,Sat Nov 27 06:58:45 CET,0.0 1.283 1.733 2.068 2.345 2.586 2.791 2.966 3.295 3.45 3.596 3.777 3.999 4.119 4.332 4.522 4.699 4.781 4.939 5.085 5.287 5.419 5.546 5.721 5.882 6.028 6.162 6.29 6.445 6.589 6.737 6.905 7.046 7.179 7.318 7.465 7.614 7.769 7.923 8.064 8.181 8.289 8.395 8.488 8.536 8.52 8.446 8.256 7.843 7.112 5.725 3.907 2.391 1.05 -0.115 -1.153 -2.08 -2.943 -3.703 -4.445 -5.103 -5.707 -6.273 -6.809 -7.321 -7.811 -8.325 -8.769 -9.175 -9.611 -10.053 -10.415 -10.791 -11.204 -11.524 -11.855 -12.194 -12.537 -12.903 -13.165 -13.43 -13.86 -14.184 -14.525 -14.695 -15.056 -15.451 -15.856 -16.065 -16.397 -16.79 -17.064 -17.34 -17.982 -18.348 -18.737 -19.138 -19.61 -20.23 -21.164 -24.304 -5 ,14482 ,KEBNE ,16720949,Sat Nov 27 04:59:06 CET,Sat Nov 27 06:58:49 CET,0.0 1.126 1.574 1.924 2.226 2.462 2.667 2.863 3.212 3.365 3.506 3.67 3.884 3.992 4.198 4.403 4.591 4.675 4.838 4.995 5.217 5.354 5.478 5.652 5.82 5.974 6.121 6.256 6.414 6.562 6.701 6.86 7.012 7.151 7.305 7.466 7.618 7.771 7.913 8.048 8.19 8.343 8.47 8.571 8.679 8.747 8.716 8.571 8.244 7.622 6.421 4.748 3.216 1.89 0.772 -0.231 -1.092 -1.896 -2.652 -3.409 -4.084 -4.717 -5.32 -5.888 -6.416 -6.901 -7.403 -7.872 -8.293 -8.716 -9.158 -9.554 -9.952 -10.352 -10.676 -11.012 -11.343 -11.7 -12.094 -12.359 -12.629 -13.06 -13.372 -13.687 -13.85 -14.196 -14.55 -14.95 -15.175 -15.511 -15.87 -16.126 -16.396 -16.986 -17.328 -17.712 -18.144 -18.634 -19.238 -20.111 -22.696 -6 ,30702 ,KEBNE ,16720950,Sat Nov 27 04:59:06 CET,Sat Nov 27 06:59:13 CET,0.0 1.039 1.469 1.808 2.088 2.331 2.549 2.733 3.068 3.219 3.359 3.537 3.767 3.897 4.126 4.317 4.492 4.576 4.739 4.893 5.105 5.241 5.369 5.544 5.71 5.869 6.011 6.139 6.297 6.439 6.574 6.735 6.887 7.024 7.167 7.332 7.479 7.618 7.757 7.892 8.014 8.135 8.248 8.328 8.384 8.365 8.262 8.04 7.645 6.971 5.62 3.784 2.164 0.777 -0.415 -1.5 -2.477 -3.362 -4.141 -4.956 -5.676 -6.314 -6.928 -7.513 -8.064 -8.551 -9.058 -9.523 -9.921 -10.345 -10.793 -11.167 -11.563 -11.981 -12.31 -12.654 -13.0 -13.368 -13.776 -14.069 -14.361 -14.817 -15.141 -15.46 -15.623 -15.978 -16.365 -16.782 -17.003 -17.34 -17.712 -17.977 -18.263 -18.895 -19.23 -19.607 -20.037 -20.529 -21.145 -21.95 -24.734 -7 ,22854 ,KEBNE ,16720951,Sat Nov 27 04:59:06 CET,Sat Nov 27 06:58:32 CET,0.0 1.104 1.551 1.892 2.17 2.417 2.64 2.839 3.19 3.351 3.501 3.676 3.906 4.026 4.251 4.456 4.638 4.718 4.875 5.038 5.256 5.381 5.509 5.693 5.848 5.986 6.128 6.27 6.439 6.594 6.739 6.91 7.07 7.222 7.388 7.558 7.71 7.854 7.987 8.129 8.258 8.358 8.446 8.523 8.587 8.588 8.504 8.323 7.951 7.202 5.744 3.942 2.41 1.036 -0.168 -1.296 -2.289 -3.147 -3.875 -4.599 -5.259 -5.87 -6.454 -6.984 -7.458 -7.904 -8.368 -8.778 -9.141 -9.53 -9.923 -10.247 -10.609 -10.98 -11.258 -11.544 -11.821 -12.123 -12.468 -12.709 -12.954 -13.334 -13.609 -13.898 -14.051 -14.387 -14.734 -15.097 -15.289 -15.597 -15.912 -16.133 -16.361 -16.878 -17.182 -17.53 -17.926 -18.397 -18.958 -19.675 -21.835 -8 ,453 ,KEBNE ,16720952,Sat Nov 27 05:00:08 CET,Sat Nov 27 07:00:15 CET,0.0 1.082 1.549 1.907 2.208 2.454 2.665 2.864 3.201 3.35 3.499 3.688 3.911 4.024 4.241 4.438 4.623 4.706 4.857 5.012 5.235 5.378 5.52 5.707 5.87 6.026 6.177 6.315 6.483 6.643 6.792 6.965 7.12 7.261 7.413 7.564 7.702 7.846 7.981 8.108 8.214 8.321 8.449 8.555 8.613 8.605 8.52 8.302 7.915 7.233 5.929 4.172 2.647 1.343 0.191 -0.868 -1.801 -2.668 -3.423 -4.164 -4.825 -5.415 -5.963 -6.48 -6.97 -7.446 -7.942 -8.387 -8.779 -9.159 -9.555 -9.905 -10.263 -10.638 -10.932 -11.228 -11.54 -11.893 -12.277 -12.546 -12.824 -13.271 -13.594 -13.946 -14.129 -14.489 -14.869 -15.27 -15.485 -15.828 -16.195 -16.462 -16.748 -17.372 -17.717 -18.112 -18.55 -19.053 -19.669 -20.517 -23.352 -9 ,20495 ,KEBNE ,16720953,Sat Nov 27 05:00:07 CET,Sat Nov 27 07:01:10 CET,0.0 1.041 1.481 1.816 2.106 2.341 2.544 2.744 3.093 3.235 3.368 3.525 3.745 3.858 4.068 4.25 4.415 4.495 4.657 4.813 5.037 5.177 5.299 5.475 5.641 5.804 5.952 6.082 6.248 6.403 6.541 6.695 6.844 6.984 7.123 7.273 7.42 7.568 7.705 7.823 7.947 8.063 8.152 8.208 8.219 8.199 8.121 7.91 7.532 6.868 5.469 3.636 2.108 0.795 -0.325 -1.33 -2.226 -3.061 -3.772 -4.499 -5.139 -5.724 -6.307 -6.854 -7.35 -7.811 -8.33 -8.81 -9.187 -9.56 -9.959 -10.303 -10.686 -11.072 -11.381 -11.717 -12.068 -12.424 -12.798 -13.072 -13.348 -13.758 -14.035 -14.327 -14.483 -14.812 -15.152 -15.521 -15.721 -16.048 -16.384 -16.618 -16.878 -17.482 -17.834 -18.221 -18.658 -19.176 -19.796 -20.629 -23.499 -10 ,25149 ,KEBNE ,16720954,Sat Nov 27 05:00:08 CET,Sat Nov 27 06:59:47 CET,0.0 1.142 1.555 1.892 2.182 2.415 2.623 2.814 3.162 3.319 3.463 3.63 3.851 3.969 4.178 4.372 4.556 4.644 4.807 4.953 5.156 5.281 5.401 5.575 5.745 5.906 6.043 6.161 6.319 6.477 6.629 6.798 6.954 7.098 7.247 7.396 7.537 7.696 7.85 7.991 8.122 8.243 8.36 8.464 8.562 8.615 8.574 8.447 8.177 7.568 6.275 4.616 3.177 1.897 0.775 -0.258 -1.171 -2.029 -2.806 -3.568 -4.198 -4.797 -5.417 -5.999 -6.525 -6.987 -7.48 -7.941 -8.331 -8.763 -9.233 -9.601 -9.981 -10.405 -10.733 -11.058 -11.393 -11.745 -12.123 -12.394 -12.687 -13.158 -13.501 -13.868 -14.047 -14.401 -14.797 -15.235 -15.461 -15.807 -16.182 -16.442 -16.73 -17.351 -17.687 -18.06 -18.48 -18.97 -19.564 -20.327 -23.088 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_43.txt deleted file mode 100644 index a6760bf0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_38_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17816 ,KEBNE ,16720955,Sat Nov 27 05:00:08 CET,Sat Nov 27 06:59:00 CET,0.0 1.817 2.443 2.893 3.271 3.608 3.892 4.14 4.572 4.769 4.958 5.203 5.465 5.615 5.892 6.153 6.409 6.535 6.765 6.979 7.28 7.47 7.652 7.91 8.169 8.406 8.625 8.84 9.119 9.382 9.633 9.925 10.209 10.498 10.819 11.171 11.506 11.853 12.24 12.667 13.105 13.588 14.129 14.671 15.309 16.026 16.824 17.686 18.658 19.77 21.029 21.815 22.119 22.227 22.191 22.038 21.797 21.52 21.235 20.923 20.653 20.402 20.153 19.903 19.649 19.419 19.172 18.94 18.721 18.468 18.187 17.95 17.697 17.409 17.188 16.971 16.748 16.497 16.225 16.031 15.822 15.488 15.264 15.042 14.926 14.67 14.382 14.073 13.904 13.635 13.311 13.098 12.879 12.343 12.018 11.666 11.306 10.889 10.289 9.468 6.683 -2 ,605 ,KEBNE ,16720956,Sat Nov 27 05:00:07 CET,Sat Nov 27 06:59:08 CET,0.0 3.171 3.896 4.413 4.832 5.182 5.48 5.751 6.228 6.433 6.622 6.891 7.163 7.335 7.649 7.94 8.211 8.333 8.561 8.772 9.07 9.265 9.453 9.718 9.97 10.201 10.416 10.626 10.892 11.152 11.408 11.707 11.989 12.267 12.582 12.923 13.257 13.628 14.022 14.439 14.883 15.4 15.995 16.578 17.265 18.032 18.916 19.907 21.074 22.385 23.787 24.683 25.022 25.145 25.113 24.973 24.808 24.651 24.454 24.166 23.91 23.671 23.428 23.202 22.953 22.676 22.389 22.152 21.942 21.701 21.428 21.18 20.927 20.679 20.473 20.248 20.005 19.76 19.509 19.323 19.115 18.752 18.512 18.292 18.171 17.89 17.584 17.269 17.096 16.812 16.491 16.275 16.047 15.534 15.215 14.83 14.381 13.893 13.273 12.362 8.177 -3 ,23888 ,KEBNE ,16720957,Sat Nov 27 05:00:07 CET,Sat Nov 27 06:59:28 CET,0.0 1.883 2.477 2.911 3.25 3.535 3.807 4.053 4.454 4.638 4.809 5.024 5.265 5.406 5.673 5.912 6.147 6.264 6.48 6.682 6.962 7.14 7.314 7.562 7.801 8.023 8.24 8.454 8.721 8.968 9.215 9.51 9.791 10.066 10.377 10.715 11.048 11.41 11.789 12.191 12.612 13.079 13.611 14.15 14.77 15.446 16.233 17.115 18.107 19.256 20.53 21.319 21.59 21.648 21.59 21.441 21.231 20.983 20.748 20.496 20.247 19.994 19.735 19.465 19.211 18.987 18.725 18.482 18.273 18.044 17.803 17.608 17.408 17.177 16.983 16.784 16.563 16.31 15.999 15.763 15.515 15.121 14.837 14.54 14.381 14.042 13.713 13.377 13.198 12.922 12.603 12.389 12.168 11.655 11.336 10.963 10.538 10.032 9.385 8.496 5.885 -4 ,11218 ,KEBNE ,16720958,Sat Nov 27 05:00:07 CET,Sat Nov 27 06:58:59 CET,0.0 1.937 2.579 3.087 3.488 3.819 4.106 4.358 4.823 5.027 5.203 5.425 5.679 5.819 6.101 6.378 6.62 6.737 6.967 7.177 7.48 7.674 7.859 8.126 8.366 8.601 8.848 9.07 9.346 9.62 9.881 10.191 10.477 10.763 11.092 11.44 11.782 12.148 12.532 12.95 13.398 13.895 14.458 15.029 15.687 16.408 17.266 18.229 19.299 20.503 21.747 22.557 22.799 22.755 22.645 22.482 22.231 21.939 21.671 21.406 21.168 20.928 20.675 20.421 20.187 19.97 19.712 19.474 19.27 19.04 18.775 18.541 18.296 18.043 17.854 17.658 17.44 17.195 16.934 16.752 16.55 16.205 15.974 15.728 15.59 15.316 15.032 14.718 14.542 14.279 14.007 13.814 13.578 13.032 12.739 12.41 12.033 11.621 11.121 10.391 7.513 -5 ,21257 ,KEBNE ,16720959,Sat Nov 27 05:00:07 CET,Sat Nov 27 06:59:00 CET,0.0 1.964 2.67 3.171 3.557 3.88 4.149 4.393 4.812 5.009 5.202 5.439 5.689 5.829 6.086 6.33 6.561 6.673 6.89 7.092 7.378 7.558 7.736 8.001 8.249 8.48 8.709 8.938 9.225 9.494 9.749 10.057 10.354 10.631 10.949 11.305 11.643 12.015 12.418 12.838 13.268 13.747 14.301 14.853 15.498 16.221 17.047 17.964 18.982 20.084 21.34 22.23 22.602 22.713 22.657 22.474 22.248 22.031 21.825 21.572 21.329 21.101 20.857 20.613 20.384 20.146 19.885 19.656 19.444 19.222 18.988 18.775 18.549 18.308 18.102 17.875 17.636 17.389 17.129 16.954 16.767 16.442 16.191 15.904 15.745 15.41 15.062 14.689 14.496 14.215 13.836 13.577 13.296 12.662 12.313 11.894 11.394 10.875 10.217 9.231 5.291 -6 ,11485 ,KEBNE ,16720960,Sat Nov 27 05:00:08 CET,Sat Nov 27 06:59:27 CET,0.0 1.962 2.475 2.877 3.22 3.519 3.796 4.046 4.481 4.668 4.84 5.057 5.299 5.445 5.736 5.994 6.243 6.362 6.577 6.784 7.08 7.269 7.449 7.704 7.955 8.2 8.424 8.631 8.903 9.175 9.436 9.737 10.019 10.295 10.613 10.965 11.306 11.672 12.057 12.46 12.873 13.34 13.884 14.423 15.045 15.735 16.53 17.406 18.428 19.656 21.004 21.839 22.142 22.254 22.229 22.075 21.882 21.667 21.425 21.151 20.838 20.545 20.317 20.092 19.862 19.63 19.367 19.125 18.904 18.658 18.385 18.162 17.941 17.703 17.507 17.298 17.07 16.823 16.551 16.359 16.169 15.835 15.556 15.252 15.106 14.826 14.528 14.205 14.033 13.769 13.452 13.228 12.974 12.38 12.057 11.704 11.292 10.776 10.107 9.227 6.146 -7 ,3077 ,KEBNE ,16720961,Sat Nov 27 05:00:08 CET,Sat Nov 27 06:59:37 CET,0.0 2.017 2.657 3.095 3.444 3.751 4.04 4.304 4.748 4.941 5.113 5.33 5.576 5.714 5.968 6.209 6.443 6.557 6.774 6.982 7.275 7.464 7.646 7.904 8.145 8.37 8.593 8.81 9.076 9.32 9.567 9.876 10.161 10.428 10.728 11.058 11.38 11.741 12.12 12.513 12.927 13.388 13.924 14.462 15.061 15.696 16.43 17.268 18.19 19.234 20.399 21.19 21.518 21.635 21.596 21.423 21.221 21.014 20.803 20.536 20.264 20.028 19.79 19.541 19.308 19.072 18.796 18.534 18.291 18.026 17.751 17.528 17.304 17.047 16.829 16.588 16.333 16.087 15.831 15.647 15.444 15.116 14.88 14.631 14.504 14.232 13.925 13.594 13.416 13.145 12.868 12.67 12.446 11.934 11.621 11.242 10.795 10.275 9.671 8.874 5.512 -8 ,18217 ,KEBNE ,16720962,Sat Nov 27 05:00:07 CET,Sat Nov 27 06:59:27 CET,0.0 1.912 2.566 3.048 3.428 3.759 4.05 4.299 4.706 4.891 5.064 5.288 5.538 5.681 5.928 6.159 6.385 6.494 6.692 6.884 7.174 7.368 7.561 7.828 8.069 8.296 8.516 8.732 8.997 9.251 9.498 9.776 10.041 10.311 10.616 10.946 11.268 11.613 11.978 12.38 12.778 13.204 13.723 14.24 14.84 15.491 16.221 17.022 17.919 18.884 19.893 20.527 20.741 20.747 20.619 20.393 20.151 19.91 19.651 19.349 19.079 18.826 18.559 18.295 18.028 17.752 17.445 17.176 16.934 16.677 16.408 16.178 15.926 15.664 15.467 15.254 15.011 14.737 14.443 14.232 14.025 13.705 13.47 13.22 13.085 12.801 12.511 12.195 12.011 11.722 11.34 11.106 10.871 10.351 10.031 9.648 9.223 8.744 8.117 7.131 3.297 -9 ,23274 ,KEBNE ,16720963,Sat Nov 27 05:00:07 CET,Sat Nov 27 06:58:45 CET,0.0 2.447 3.185 3.688 4.074 4.4 4.668 4.924 5.398 5.597 5.778 6.017 6.273 6.419 6.701 6.964 7.213 7.331 7.56 7.781 8.097 8.289 8.473 8.738 8.987 9.224 9.445 9.658 9.926 10.178 10.428 10.728 11.009 11.288 11.613 11.968 12.312 12.691 13.087 13.502 13.937 14.431 15.017 15.577 16.197 16.868 17.641 18.516 19.533 20.661 21.891 22.785 23.157 23.251 23.21 23.069 22.902 22.678 22.42 22.146 21.907 21.674 21.415 21.159 20.908 20.67 20.412 20.166 19.95 19.711 19.46 19.245 19.005 18.753 18.525 18.285 18.055 17.799 17.519 17.323 17.131 16.836 16.618 16.367 16.232 15.966 15.672 15.356 15.193 14.932 14.632 14.432 14.214 13.668 13.353 13.018 12.661 12.234 11.665 10.923 7.89 -10 ,26187 ,KEBNE ,16720964,Sat Nov 27 05:00:07 CET,Sat Nov 27 06:59:44 CET,0.0 2.193 2.726 3.14 3.521 3.841 4.119 4.369 4.796 4.99 5.174 5.412 5.658 5.795 6.074 6.342 6.576 6.683 6.893 7.1 7.389 7.574 7.756 8.013 8.254 8.481 8.701 8.919 9.207 9.471 9.706 9.985 10.264 10.538 10.849 11.195 11.53 11.899 12.297 12.711 13.148 13.652 14.231 14.789 15.43 16.148 17.0 17.959 19.027 20.197 21.521 22.397 22.632 22.623 22.538 22.352 22.105 21.844 21.576 21.257 20.95 20.681 20.418 20.134 19.852 19.592 19.298 19.014 18.77 18.528 18.269 18.023 17.752 17.482 17.267 17.026 16.784 16.534 16.255 16.057 15.847 15.527 15.278 14.998 14.859 14.555 14.194 13.778 13.56 13.265 12.907 12.662 12.422 11.893 11.572 11.226 10.861 10.389 9.761 8.942 6.031 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_20.txt deleted file mode 100644 index df9c9205..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_20.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15782 ,KEBNE ,16720965,Sat Nov 27 05:00:07 CET,Sat Nov 27 07:00:00 CET,0.0 1.594 2.12 2.517 2.844 3.132 3.398 3.636 4.05 4.249 4.442 4.697 4.944 5.094 5.365 5.614 5.852 5.969 6.184 6.38 6.667 6.851 7.024 7.279 7.526 7.758 7.977 8.191 8.459 8.701 8.936 9.227 9.499 9.758 10.052 10.381 10.693 11.018 11.357 11.72 12.12 12.556 12.987 13.388 13.865 14.375 14.908 15.446 15.958 16.311 16.363 15.92 15.251 14.529 13.826 13.185 12.589 12.007 11.506 10.988 10.529 10.116 9.693 9.276 8.87 8.483 8.082 7.724 7.413 7.094 6.752 6.45 6.132 5.803 5.545 5.275 5.005 4.719 4.411 4.188 3.952 3.595 3.335 3.06 2.914 2.608 2.287 1.945 1.766 1.474 1.13 0.893 0.648 0.1 -0.208 -0.535 -0.904 -1.333 -1.845 -2.579 -4.752 -2 ,32466 ,KEBNE ,16720966,Sat Nov 27 05:00:07 CET,Sat Nov 27 07:00:48 CET,0.0 1.407 1.9 2.278 2.58 2.839 3.077 3.293 3.672 3.839 3.999 4.207 4.439 4.575 4.827 5.064 5.284 5.392 5.6 5.8 6.082 6.256 6.422 6.658 6.887 7.1 7.296 7.486 7.743 7.997 8.231 8.496 8.747 8.988 9.264 9.572 9.864 10.184 10.533 10.884 11.222 11.597 11.992 12.36 12.772 13.173 13.599 14.027 14.403 14.626 14.565 14.028 13.334 12.699 12.08 11.472 10.886 10.305 9.777 9.216 8.741 8.307 7.861 7.43 7.017 6.629 6.237 5.891 5.582 5.267 4.939 4.654 4.341 4.023 3.785 3.527 3.24 2.93 2.612 2.396 2.169 1.802 1.532 1.24 1.092 0.783 0.459 0.113 -0.075 -0.364 -0.683 -0.915 -1.153 -1.699 -2.022 -2.384 -2.773 -3.18 -3.65 -4.346 -6.635 -3 ,18906 ,KEBNE ,16720967,Sat Nov 27 05:00:07 CET,Sat Nov 27 07:00:13 CET,0.0 1.358 1.823 2.178 2.484 2.761 2.995 3.213 3.602 3.772 3.935 4.155 4.386 4.519 4.782 5.035 5.259 5.364 5.571 5.764 6.048 6.219 6.379 6.624 6.852 7.063 7.261 7.445 7.677 7.901 8.118 8.369 8.608 8.83 9.08 9.356 9.619 9.908 10.207 10.521 10.838 11.174 11.549 11.897 12.286 12.69 13.107 13.521 13.881 14.13 14.139 13.704 13.077 12.398 11.744 11.102 10.515 9.968 9.461 8.944 8.498 8.084 7.666 7.249 6.862 6.505 6.127 5.79 5.484 5.165 4.832 4.541 4.24 3.933 3.692 3.437 3.167 2.884 2.576 2.364 2.134 1.763 1.506 1.236 1.096 0.8 0.502 0.187 0.014 -0.257 -0.548 -0.77 -0.999 -1.488 -1.764 -2.06 -2.383 -2.76 -3.198 -3.846 -5.445 -4 ,15901 ,KEBNE ,16720968,Sat Nov 27 05:00:08 CET,Sat Nov 27 07:00:58 CET,0.0 2.026 2.627 3.089 3.439 3.73 4.001 4.248 4.681 4.872 5.05 5.292 5.547 5.697 5.979 6.253 6.51 6.631 6.854 7.06 7.362 7.551 7.732 7.988 8.227 8.446 8.665 8.88 9.138 9.383 9.618 9.895 10.161 10.419 10.697 10.985 11.263 11.577 11.89 12.204 12.504 12.823 13.206 13.565 13.973 14.4 14.839 15.304 15.687 15.965 16.159 15.861 15.328 14.676 13.958 13.293 12.738 12.198 11.689 11.167 10.683 10.231 9.815 9.427 9.063 8.728 8.37 8.041 7.744 7.432 7.103 6.831 6.55 6.26 6.029 5.757 5.468 5.201 4.924 4.725 4.527 4.214 3.989 3.739 3.602 3.342 3.07 2.767 2.605 2.336 2.076 1.87 1.652 1.168 0.892 0.589 0.227 -0.194 -0.692 -1.392 -3.761 -5 ,12966 ,KEBNE ,16720969,Sat Nov 27 05:00:08 CET,Sat Nov 27 07:01:23 CET,0.0 1.459 1.949 2.298 2.592 2.86 3.101 3.32 3.719 3.893 4.051 4.258 4.492 4.627 4.877 5.132 5.376 5.487 5.686 5.869 6.135 6.304 6.477 6.725 6.959 7.174 7.368 7.55 7.784 8.01 8.227 8.479 8.714 8.93 9.177 9.46 9.72 10.008 10.318 10.624 10.932 11.267 11.642 12.028 12.455 12.852 13.232 13.6 13.989 14.278 14.179 13.65 13.016 12.312 11.601 10.897 10.289 9.734 9.227 8.716 8.256 7.822 7.398 6.99 6.61 6.262 5.893 5.547 5.235 4.916 4.582 4.302 4.001 3.671 3.417 3.146 2.868 2.591 2.282 2.057 1.826 1.456 1.2 0.936 0.793 0.494 0.175 -0.16 -0.327 -0.603 -0.923 -1.132 -1.351 -1.846 -2.107 -2.375 -2.7 -3.08 -3.521 -4.137 -5.982 -6 ,17818 ,KEBNE ,16720970,Sat Nov 27 05:00:08 CET,Sat Nov 27 07:01:11 CET,0.0 1.203 1.694 2.065 2.371 2.662 2.927 3.149 3.533 3.707 3.875 4.092 4.321 4.458 4.716 4.952 5.18 5.286 5.485 5.681 5.96 6.139 6.306 6.539 6.757 6.974 7.18 7.359 7.593 7.836 8.068 8.344 8.601 8.832 9.089 9.369 9.632 9.918 10.217 10.512 10.812 11.156 11.54 11.898 12.312 12.734 13.139 13.531 13.896 14.165 14.198 13.729 13.114 12.484 11.843 11.17 10.565 10.016 9.513 8.995 8.524 8.063 7.602 7.156 6.735 6.355 5.96 5.61 5.293 4.954 4.602 4.31 3.998 3.665 3.416 3.158 2.883 2.589 2.274 2.059 1.834 1.473 1.221 0.949 0.805 0.495 0.164 -0.172 -0.344 -0.622 -0.923 -1.118 -1.325 -1.832 -2.11 -2.396 -2.728 -3.124 -3.61 -4.336 -6.747 -7 ,808 ,KEBNE ,16720971,Sat Nov 27 05:00:08 CET,Sat Nov 27 07:01:01 CET,0.0 1.401 1.831 2.145 2.411 2.664 2.908 3.134 3.544 3.723 3.892 4.112 4.344 4.474 4.715 4.953 5.18 5.292 5.516 5.717 5.991 6.177 6.351 6.595 6.825 7.042 7.256 7.456 7.698 7.93 8.154 8.414 8.661 8.899 9.167 9.466 9.754 10.061 10.39 10.729 11.067 11.442 11.865 12.276 12.719 13.139 13.566 14.024 14.49 14.845 14.828 14.364 13.769 13.089 12.416 11.768 11.17 10.589 10.059 9.525 9.046 8.619 8.193 7.753 7.345 6.975 6.585 6.237 5.941 5.631 5.293 4.989 4.671 4.348 4.099 3.828 3.538 3.226 2.883 2.645 2.393 1.985 1.715 1.448 1.304 0.983 0.645 0.305 0.122 -0.169 -0.505 -0.735 -0.991 -1.573 -1.893 -2.269 -2.685 -3.136 -3.647 -4.363 -6.65 -8 ,11412 ,KEBNE ,16720972,Sat Nov 27 05:00:08 CET,Sat Nov 27 07:00:40 CET,0.0 1.585 2.123 2.503 2.825 3.09 3.326 3.545 3.933 4.108 4.272 4.481 4.705 4.839 5.089 5.319 5.538 5.637 5.839 6.032 6.3 6.476 6.638 6.864 7.077 7.279 7.476 7.659 7.896 8.141 8.375 8.635 8.897 9.15 9.413 9.699 9.973 10.268 10.569 10.869 11.173 11.518 11.924 12.293 12.691 13.107 13.534 13.956 14.334 14.596 14.599 14.158 13.534 12.893 12.243 11.572 10.959 10.389 9.868 9.337 8.881 8.45 8.018 7.601 7.209 6.851 6.463 6.101 5.791 5.466 5.129 4.849 4.549 4.232 3.979 3.72 3.451 3.17 2.882 2.676 2.462 2.122 1.875 1.61 1.472 1.172 0.839 0.506 0.326 0.045 -0.253 -0.464 -0.677 -1.15 -1.429 -1.749 -2.109 -2.538 -3.099 -3.779 -5.538 -9 ,31204 ,KEBNE ,16720973,Sat Nov 27 05:00:07 CET,Sat Nov 27 07:00:52 CET,0.0 1.765 2.37 2.814 3.17 3.471 3.74 3.99 4.435 4.641 4.835 5.094 5.348 5.502 5.794 6.057 6.307 6.428 6.652 6.859 7.153 7.337 7.51 7.76 7.991 8.203 8.405 8.6 8.859 9.106 9.321 9.581 9.836 10.084 10.365 10.654 10.923 11.215 11.522 11.844 12.166 12.503 12.883 13.243 13.642 14.06 14.478 14.883 15.263 15.549 15.643 15.322 14.783 14.194 13.622 13.069 12.564 12.052 11.591 11.124 10.712 10.339 9.959 9.594 9.239 8.913 8.573 8.263 8.004 7.737 7.441 7.191 6.932 6.634 6.382 6.109 5.835 5.555 5.245 5.03 4.807 4.431 4.156 3.87 3.723 3.419 3.09 2.745 2.562 2.264 1.933 1.717 1.486 0.961 0.663 0.34 -0.028 -0.467 -1.002 -1.722 -3.569 -10 ,32417 ,KEBNE ,16720974,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:03:34 CET,0.0 1.278 1.77 2.126 2.434 2.702 2.921 3.12 3.499 3.672 3.83 4.039 4.276 4.411 4.665 4.907 5.125 5.231 5.439 5.633 5.909 6.091 6.259 6.488 6.709 6.922 7.127 7.329 7.587 7.83 8.054 8.319 8.577 8.807 9.049 9.333 9.615 9.898 10.196 10.518 10.856 11.222 11.613 11.99 12.42 12.867 13.314 13.732 14.12 14.399 14.397 13.98 13.417 12.77 12.091 11.443 10.843 10.278 9.775 9.251 8.778 8.336 7.896 7.474 7.082 6.721 6.339 5.989 5.692 5.389 5.065 4.797 4.514 4.206 3.955 3.686 3.401 3.104 2.797 2.586 2.371 2.029 1.785 1.537 1.408 1.119 0.806 0.466 0.283 0.009 -0.285 -0.484 -0.697 -1.192 -1.473 -1.787 -2.132 -2.502 -2.979 -3.692 -5.576 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_43.txt deleted file mode 100644 index b9eb6d54..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_41_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8960 ,KEBNE ,16720975,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:04:39 CET,0.0 2.151 2.777 3.193 3.525 3.835 4.105 4.343 4.741 4.918 5.091 5.319 5.561 5.704 5.96 6.189 6.401 6.505 6.706 6.896 7.166 7.337 7.505 7.757 7.983 8.179 8.369 8.558 8.801 9.026 9.237 9.5 9.757 10.004 10.28 10.582 10.874 11.197 11.55 11.92 12.302 12.719 13.197 13.699 14.252 14.833 15.475 16.14 16.878 17.704 18.533 18.816 18.671 18.399 18.07 17.676 17.267 16.875 16.519 16.122 15.755 15.39 15.022 14.713 14.425 14.118 13.782 13.477 13.208 12.92 12.594 12.31 12.017 11.718 11.481 11.23 10.963 10.661 10.344 10.123 9.9 9.528 9.243 8.943 8.783 8.447 8.087 7.709 7.507 7.217 6.89 6.672 6.435 5.874 5.561 5.213 4.819 4.361 3.776 3.004 0.097 -2 ,12782 ,KEBNE ,16720976,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:03:37 CET,0.0 1.906 2.515 2.933 3.279 3.605 3.901 4.153 4.582 4.768 4.94 5.177 5.436 5.583 5.865 6.123 6.351 6.461 6.676 6.886 7.181 7.358 7.524 7.764 7.992 8.222 8.442 8.647 8.907 9.147 9.37 9.638 9.894 10.135 10.42 10.724 10.999 11.297 11.614 11.951 12.296 12.671 13.101 13.533 14.039 14.584 15.205 15.865 16.572 17.333 17.978 18.216 18.162 17.947 17.655 17.337 17.025 16.659 16.294 15.892 15.533 15.207 14.857 14.511 14.169 13.828 13.484 13.178 12.896 12.611 12.312 12.054 11.788 11.505 11.279 11.032 10.764 10.474 10.162 9.951 9.728 9.377 9.128 8.857 8.715 8.413 8.091 7.744 7.56 7.285 6.967 6.741 6.498 5.994 5.697 5.347 4.951 4.473 3.912 3.011 -0.507 -3 ,12472 ,KEBNE ,16720977,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:03:12 CET,0.0 1.864 2.467 2.91 3.241 3.522 3.776 4.004 4.433 4.626 4.798 4.998 5.223 5.368 5.65 5.888 6.103 6.204 6.398 6.582 6.847 7.011 7.166 7.394 7.613 7.819 8.012 8.196 8.437 8.665 8.893 9.165 9.409 9.643 9.912 10.202 10.474 10.791 11.136 11.481 11.826 12.213 12.69 13.173 13.707 14.284 14.901 15.577 16.337 17.14 17.949 18.338 18.335 18.11 17.814 17.448 17.053 16.673 16.314 15.941 15.608 15.274 14.936 14.599 14.281 13.986 13.662 13.36 13.084 12.801 12.498 12.228 11.937 11.634 11.39 11.125 10.855 10.581 10.284 10.076 9.86 9.517 9.273 9.011 8.87 8.582 8.285 7.949 7.769 7.499 7.171 6.954 6.727 6.221 5.938 5.634 5.288 4.826 4.267 3.418 -0.029 -4 ,19329 ,KEBNE ,16720978,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:04:26 CET,0.0 2.172 2.717 3.15 3.518 3.833 4.126 4.372 4.794 4.977 5.145 5.358 5.588 5.723 5.983 6.227 6.445 6.554 6.755 6.94 7.217 7.393 7.564 7.81 8.037 8.248 8.45 8.641 8.88 9.109 9.327 9.585 9.834 10.066 10.333 10.639 10.932 11.255 11.595 11.937 12.293 12.694 13.181 13.671 14.19 14.728 15.328 15.973 16.685 17.461 18.23 18.532 18.441 18.209 17.869 17.491 17.114 16.723 16.373 16.019 15.695 15.381 15.047 14.7 14.373 14.08 13.768 13.476 13.216 12.937 12.646 12.391 12.113 11.823 11.582 11.331 11.07 10.795 10.51 10.308 10.1 9.767 9.519 9.249 9.104 8.789 8.463 8.126 7.951 7.679 7.312 7.045 6.768 6.233 5.925 5.546 5.127 4.687 4.144 3.313 -0.276 -5 ,21423 ,KEBNE ,16720979,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:03:50 CET,0.0 2.659 3.341 3.816 4.193 4.496 4.764 5.009 5.446 5.652 5.85 6.117 6.379 6.527 6.801 7.053 7.289 7.403 7.614 7.81 8.091 8.266 8.433 8.68 8.92 9.148 9.36 9.561 9.811 10.039 10.261 10.533 10.794 11.045 11.333 11.639 11.924 12.245 12.582 12.926 13.281 13.664 14.11 14.565 15.084 15.659 16.326 17.042 17.773 18.466 19.195 19.552 19.481 19.263 18.963 18.581 18.141 17.693 17.276 16.836 16.428 16.024 15.638 15.274 14.93 14.622 14.295 13.979 13.681 13.386 13.084 12.812 12.524 12.217 11.978 11.727 11.449 11.145 10.818 10.598 10.363 9.976 9.708 9.424 9.274 8.971 8.645 8.288 8.095 7.801 7.435 7.198 6.946 6.374 6.045 5.671 5.246 4.774 4.198 3.391 -0.922 -6 ,21103 ,KEBNE ,16720980,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:04:00 CET,0.0 3.124 3.835 4.329 4.703 5.01 5.286 5.532 5.941 6.122 6.294 6.518 6.769 6.911 7.181 7.435 7.671 7.779 7.98 8.17 8.446 8.629 8.802 9.037 9.264 9.485 9.695 9.911 10.189 10.447 10.689 10.961 11.217 11.466 11.762 12.084 12.385 12.72 13.07 13.424 13.807 14.24 14.711 15.177 15.709 16.254 16.887 17.579 18.314 19.03 19.66 19.899 19.778 19.479 19.115 18.737 18.343 17.954 17.572 17.158 16.782 16.426 16.072 15.722 15.389 15.091 14.781 14.481 14.214 13.944 13.655 13.408 13.146 12.87 12.644 12.398 12.139 11.851 11.549 11.346 11.136 10.786 10.532 10.279 10.148 9.869 9.563 9.218 9.031 8.754 8.429 8.209 7.972 7.414 7.084 6.719 6.298 5.797 5.206 4.242 0.731 -7 ,10564 ,KEBNE ,16720981,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:03:51 CET,0.0 1.933 2.55 2.938 3.247 3.523 3.762 3.978 4.368 4.545 4.713 4.923 5.157 5.301 5.566 5.804 6.028 6.137 6.341 6.531 6.803 6.978 7.146 7.384 7.612 7.83 8.038 8.246 8.514 8.759 8.981 9.252 9.511 9.748 10.013 10.316 10.61 10.928 11.265 11.606 11.95 12.324 12.764 13.212 13.702 14.224 14.852 15.571 16.298 17.027 17.699 17.954 17.888 17.621 17.22 16.825 16.447 16.049 15.676 15.293 14.943 14.605 14.266 13.934 13.618 13.324 13.007 12.722 12.471 12.178 11.878 11.626 11.33 11.011 10.767 10.516 10.241 9.945 9.632 9.411 9.193 8.846 8.598 8.345 8.21 7.924 7.605 7.266 7.093 6.825 6.518 6.305 6.078 5.566 5.271 4.941 4.551 4.095 3.557 2.811 0.003 -8 ,5593 ,KEBNE ,16720982,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:05:29 CET,0.0 1.832 2.443 2.898 3.26 3.572 3.837 4.076 4.502 4.69 4.869 5.113 5.367 5.527 5.836 6.11 6.355 6.472 6.702 6.92 7.221 7.402 7.573 7.83 8.076 8.299 8.515 8.724 8.989 9.24 9.472 9.756 10.027 10.273 10.542 10.848 11.155 11.489 11.826 12.186 12.56 12.97 13.432 13.877 14.396 14.979 15.631 16.313 17.04 17.841 18.64 19.015 19.025 18.826 18.515 18.148 17.753 17.351 16.979 16.614 16.253 15.893 15.564 15.229 14.896 14.573 14.222 13.904 13.62 13.319 13.007 12.743 12.453 12.148 11.915 11.668 11.399 11.11 10.796 10.572 10.342 9.989 9.742 9.474 9.326 9.009 8.678 8.353 8.18 7.905 7.574 7.355 7.126 6.588 6.283 5.973 5.634 5.204 4.652 3.742 0.906 -9 ,24927 ,KEBNE ,16720983,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:04:26 CET,0.0 1.591 2.137 2.551 2.893 3.201 3.447 3.646 4.033 4.219 4.388 4.599 4.83 4.967 5.223 5.467 5.698 5.804 6.005 6.199 6.478 6.652 6.82 7.067 7.31 7.539 7.746 7.947 8.215 8.471 8.71 8.994 9.27 9.525 9.809 10.122 10.419 10.738 11.059 11.402 11.767 12.173 12.631 13.071 13.575 14.146 14.781 15.468 16.231 17.049 17.808 18.119 18.138 17.987 17.72 17.43 17.125 16.809 16.525 16.183 15.851 15.539 15.222 14.894 14.561 14.257 13.934 13.62 13.34 13.058 12.775 12.546 12.306 12.042 11.814 11.571 11.316 11.034 10.731 10.509 10.276 9.92 9.669 9.401 9.257 8.957 8.633 8.266 8.076 7.791 7.431 7.188 6.928 6.347 6.024 5.674 5.26 4.765 4.185 3.356 -1.682 -10 ,8060 ,KEBNE ,16720984,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:03:49 CET,0.0 1.926 2.544 2.954 3.315 3.655 3.962 4.223 4.66 4.844 5.018 5.238 5.473 5.617 5.887 6.135 6.358 6.462 6.675 6.879 7.151 7.318 7.484 7.723 7.947 8.165 8.369 8.573 8.829 9.063 9.3 9.59 9.864 10.133 10.441 10.774 11.077 11.395 11.73 12.077 12.424 12.799 13.247 13.704 14.218 14.766 15.382 16.061 16.768 17.504 18.246 18.482 18.366 18.136 17.819 17.471 17.122 16.776 16.436 16.037 15.68 15.35 15.026 14.693 14.373 14.076 13.742 13.435 13.164 12.873 12.559 12.296 12.01 11.701 11.456 11.187 10.905 10.608 10.295 10.078 9.851 9.496 9.25 8.982 8.841 8.543 8.225 7.879 7.69 7.411 7.083 6.86 6.637 6.149 5.852 5.497 5.116 4.721 4.18 3.329 0.024 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_39.txt deleted file mode 100644 index 34106f0c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10489 ,KEBNE ,16720985,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:01:27 CET,0.0 1.447 1.959 2.35 2.653 2.935 3.187 3.384 3.738 3.904 4.063 4.259 4.466 4.574 4.792 4.987 5.169 5.256 5.408 5.552 5.762 5.896 6.007 6.154 6.29 6.411 6.528 6.643 6.776 6.886 6.995 7.127 7.249 7.356 7.462 7.545 7.608 7.676 7.736 7.792 7.827 7.838 7.816 7.747 7.62 7.415 7.077 6.532 5.667 4.345 2.178 -0.384 -2.534 -4.363 -5.933 -7.35 -8.577 -9.665 -10.601 -11.51 -12.266 -12.946 -13.605 -14.239 -14.857 -15.399 -15.926 -16.397 -16.8 -17.223 -17.666 -18.026 -18.408 -18.81 -19.119 -19.451 -19.813 -20.178 -20.553 -20.818 -21.094 -21.533 -21.839 -22.152 -22.312 -22.646 -23.004 -23.399 -23.609 -23.95 -24.289 -24.536 -24.796 -25.344 -25.654 -26.023 -26.436 -26.888 -27.495 -28.287 -32.5 -2 ,18829 ,KEBNE ,16720986,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:01:23 CET,0.0 1.105 1.585 1.953 2.236 2.488 2.712 2.914 3.294 3.459 3.615 3.819 4.046 4.175 4.396 4.581 4.76 4.843 4.989 5.131 5.34 5.465 5.577 5.758 5.929 6.07 6.197 6.316 6.467 6.611 6.743 6.874 6.988 7.09 7.188 7.285 7.386 7.501 7.601 7.661 7.703 7.715 7.66 7.573 7.428 7.196 6.832 6.327 5.574 4.358 2.28 -0.288 -2.446 -4.201 -5.66 -6.964 -8.123 -9.187 -10.083 -10.966 -11.71 -12.358 -12.984 -13.563 -14.093 -14.592 -15.11 -15.563 -15.965 -16.384 -16.812 -17.17 -17.547 -17.948 -18.251 -18.566 -18.9 -19.242 -19.609 -19.863 -20.121 -20.527 -20.821 -21.133 -21.294 -21.633 -21.981 -22.331 -22.52 -22.851 -23.183 -23.414 -23.657 -24.218 -24.535 -24.886 -25.284 -25.754 -26.303 -27.061 -30.306 -3 ,822 ,KEBNE ,16720987,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:02:30 CET,0.0 1.299 1.815 2.192 2.507 2.775 3.024 3.266 3.668 3.84 4.008 4.198 4.418 4.545 4.787 4.998 5.185 5.271 5.433 5.593 5.815 5.948 6.075 6.258 6.425 6.572 6.702 6.821 6.966 7.095 7.211 7.338 7.456 7.567 7.671 7.767 7.856 7.937 8.002 8.057 8.106 8.137 8.132 8.08 7.952 7.734 7.416 6.92 6.092 4.75 2.423 -0.272 -2.416 -4.232 -5.812 -7.188 -8.333 -9.355 -10.252 -11.166 -11.953 -12.64 -13.293 -13.926 -14.515 -15.028 -15.562 -16.039 -16.463 -16.915 -17.356 -17.714 -18.088 -18.476 -18.781 -19.091 -19.418 -19.759 -20.122 -20.387 -20.658 -21.075 -21.373 -21.675 -21.831 -22.146 -22.483 -22.862 -23.049 -23.372 -23.709 -23.937 -24.184 -24.762 -25.069 -25.387 -25.75 -26.162 -26.649 -27.373 -30.719 -4 ,11613 ,KEBNE ,16720988,Sat Nov 27 05:01:08 CET,Sat Nov 27 07:01:24 CET,0.0 1.272 1.736 2.065 2.359 2.625 2.848 3.041 3.382 3.531 3.671 3.837 4.043 4.155 4.362 4.564 4.739 4.817 4.966 5.107 5.304 5.428 5.54 5.687 5.823 5.951 6.072 6.19 6.327 6.448 6.553 6.673 6.794 6.907 7.04 7.166 7.257 7.35 7.436 7.513 7.579 7.61 7.605 7.569 7.45 7.245 6.924 6.424 5.62 4.368 2.254 -0.295 -2.381 -4.159 -5.684 -7.043 -8.222 -9.243 -10.104 -10.956 -11.69 -12.362 -12.999 -13.592 -14.143 -14.644 -15.168 -15.652 -16.063 -16.479 -16.915 -17.276 -17.646 -18.037 -18.351 -18.682 -19.027 -19.381 -19.743 -19.994 -20.254 -20.663 -20.948 -21.245 -21.402 -21.74 -22.096 -22.476 -22.675 -22.998 -23.328 -23.571 -23.828 -24.359 -24.651 -24.998 -25.415 -25.869 -26.412 -27.173 -30.996 -5 ,8376 ,KEBNE ,16720989,Sat Nov 27 05:02:09 CET,Sat Nov 27 07:03:56 CET,0.0 1.259 1.69 2.008 2.264 2.509 2.741 2.945 3.297 3.46 3.615 3.806 4.014 4.128 4.326 4.516 4.699 4.783 4.933 5.071 5.259 5.378 5.492 5.648 5.79 5.921 6.045 6.162 6.308 6.437 6.557 6.695 6.806 6.908 7.024 7.134 7.214 7.279 7.354 7.429 7.488 7.518 7.493 7.435 7.327 7.131 6.809 6.35 5.624 4.435 2.364 -0.158 -2.21 -3.974 -5.447 -6.74 -7.892 -8.957 -9.89 -10.761 -11.482 -12.128 -12.752 -13.341 -13.872 -14.347 -14.84 -15.3 -15.695 -16.089 -16.515 -16.879 -17.259 -17.658 -17.969 -18.286 -18.604 -18.931 -19.279 -19.532 -19.799 -20.207 -20.494 -20.802 -20.96 -21.286 -21.643 -22.029 -22.226 -22.538 -22.839 -23.061 -23.301 -23.836 -24.13 -24.473 -24.875 -25.351 -25.928 -26.699 -29.794 -6 ,15715 ,KEBNE ,16720990,Sat Nov 27 05:02:09 CET,Sat Nov 27 07:03:00 CET,0.0 1.309 1.849 2.245 2.55 2.824 3.07 3.286 3.681 3.851 4.001 4.192 4.411 4.528 4.763 4.967 5.139 5.225 5.391 5.547 5.749 5.871 5.99 6.153 6.303 6.444 6.571 6.688 6.83 6.942 7.056 7.195 7.313 7.418 7.522 7.618 7.702 7.783 7.856 7.914 7.941 7.942 7.891 7.79 7.625 7.388 7.02 6.465 5.663 4.373 2.123 -0.57 -2.804 -4.686 -6.227 -7.558 -8.752 -9.849 -10.771 -11.699 -12.489 -13.173 -13.844 -14.464 -15.041 -15.563 -16.071 -16.541 -16.965 -17.399 -17.859 -18.246 -18.64 -19.046 -19.368 -19.701 -20.034 -20.381 -20.762 -21.024 -21.294 -21.725 -22.022 -22.324 -22.474 -22.787 -23.128 -23.506 -23.704 -24.022 -24.359 -24.6 -24.837 -25.407 -25.719 -26.069 -26.476 -26.938 -27.533 -28.505 -33.1 -7 ,22730 ,KEBNE ,16720991,Sat Nov 27 05:02:09 CET,Sat Nov 27 07:03:24 CET,0.0 1.267 1.828 2.276 2.656 2.976 3.235 3.469 3.883 4.061 4.235 4.456 4.684 4.804 5.029 5.245 5.446 5.543 5.725 5.883 6.086 6.208 6.33 6.508 6.681 6.843 6.98 7.096 7.237 7.371 7.502 7.647 7.768 7.883 8.007 8.119 8.208 8.294 8.354 8.385 8.414 8.43 8.393 8.311 8.184 7.981 7.641 7.095 6.239 4.826 2.449 -0.227 -2.383 -4.167 -5.624 -6.889 -7.989 -9.01 -9.888 -10.75 -11.498 -12.183 -12.819 -13.404 -13.979 -14.509 -15.058 -15.557 -15.974 -16.397 -16.839 -17.205 -17.576 -17.95 -18.255 -18.58 -18.908 -19.24 -19.593 -19.835 -20.076 -20.463 -20.738 -21.045 -21.209 -21.547 -21.909 -22.293 -22.49 -22.809 -23.107 -23.328 -23.565 -24.111 -24.433 -24.784 -25.159 -25.599 -26.229 -27.039 -31.679 -8 ,22871 ,KEBNE ,16720992,Sat Nov 27 05:02:09 CET,Sat Nov 27 07:03:02 CET,0.0 1.328 1.859 2.25 2.561 2.831 3.063 3.277 3.657 3.823 3.968 4.129 4.333 4.446 4.656 4.853 5.038 5.126 5.288 5.436 5.644 5.779 5.901 6.06 6.209 6.349 6.471 6.591 6.74 6.869 6.988 7.117 7.241 7.354 7.472 7.603 7.715 7.816 7.893 7.95 7.999 8.015 7.988 7.935 7.815 7.613 7.324 6.847 6.01 4.706 2.547 -0.09 -2.271 -4.138 -5.643 -6.873 -7.966 -8.957 -9.783 -10.643 -11.436 -12.148 -12.809 -13.416 -13.955 -14.431 -14.965 -15.452 -15.859 -16.273 -16.705 -17.076 -17.458 -17.852 -18.167 -18.486 -18.811 -19.151 -19.517 -19.777 -20.046 -20.471 -20.78 -21.108 -21.274 -21.615 -21.974 -22.349 -22.538 -22.846 -23.16 -23.41 -23.677 -24.23 -24.539 -24.884 -25.251 -25.695 -26.274 -27.072 -33.991 -9 ,22253 ,KEBNE ,16720993,Sat Nov 27 05:02:09 CET,Sat Nov 27 07:02:50 CET,0.0 1.543 2.015 2.369 2.666 2.91 3.134 3.344 3.706 3.865 4.021 4.215 4.434 4.559 4.78 4.978 5.167 5.252 5.406 5.547 5.751 5.882 6.003 6.179 6.336 6.482 6.623 6.752 6.912 7.062 7.188 7.319 7.452 7.57 7.686 7.795 7.884 7.972 8.042 8.099 8.139 8.133 8.091 8.013 7.871 7.661 7.312 6.81 6.055 4.836 2.654 0.1 -1.956 -3.768 -5.271 -6.518 -7.626 -8.64 -9.534 -10.463 -11.249 -11.945 -12.599 -13.178 -13.72 -14.246 -14.794 -15.283 -15.711 -16.156 -16.618 -17.003 -17.404 -17.825 -18.145 -18.461 -18.794 -19.148 -19.526 -19.783 -20.046 -20.464 -20.764 -21.086 -21.244 -21.559 -21.879 -22.216 -22.403 -22.716 -23.036 -23.268 -23.51 -24.068 -24.377 -24.726 -25.125 -25.563 -26.189 -27.027 -31.183 -10 ,14946 ,KEBNE ,16720994,Sat Nov 27 05:02:09 CET,Sat Nov 27 07:03:09 CET,0.0 1.34 1.805 2.161 2.462 2.722 2.955 3.169 3.541 3.701 3.851 4.044 4.266 4.393 4.623 4.814 4.988 5.078 5.241 5.395 5.625 5.754 5.869 6.04 6.198 6.336 6.463 6.586 6.737 6.871 7.003 7.159 7.279 7.366 7.463 7.554 7.624 7.687 7.722 7.749 7.766 7.744 7.69 7.616 7.475 7.259 6.936 6.386 5.504 4.099 1.742 -1.06 -3.388 -5.342 -6.955 -8.341 -9.526 -10.548 -11.404 -12.259 -12.984 -13.621 -14.236 -14.805 -15.345 -15.847 -16.368 -16.84 -17.259 -17.685 -18.107 -18.456 -18.824 -19.206 -19.511 -19.83 -20.159 -20.511 -20.888 -21.147 -21.409 -21.834 -22.131 -22.431 -22.584 -22.911 -23.278 -23.669 -23.877 -24.213 -24.535 -24.772 -25.023 -25.586 -25.902 -26.247 -26.625 -27.06 -27.581 -28.315 -31.21 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_43.txt deleted file mode 100644 index 98f73836..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_42_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7436 ,KEBNE ,16720995,Sat Nov 27 05:02:09 CET,Sat Nov 27 07:04:45 CET,0.0 1.9 2.5 2.92 3.272 3.62 3.932 4.152 4.523 4.704 4.883 5.126 5.374 5.523 5.778 6.006 6.223 6.323 6.512 6.696 6.953 7.104 7.254 7.481 7.693 7.891 8.087 8.278 8.518 8.746 8.971 9.228 9.468 9.703 9.958 10.227 10.485 10.779 11.104 11.436 11.784 12.164 12.575 12.985 13.46 13.964 14.522 15.082 15.672 16.308 16.879 17.035 16.928 16.676 16.348 16.006 15.638 15.266 14.951 14.639 14.346 14.067 13.789 13.533 13.281 12.999 12.685 12.391 12.138 11.898 11.627 11.379 11.126 10.879 10.693 10.485 10.249 10.003 9.742 9.565 9.379 9.073 8.856 8.63 8.517 8.282 8.015 7.729 7.578 7.33 7.069 6.87 6.659 6.185 5.903 5.606 5.269 4.848 4.329 3.615 -0.04 -2 ,29101 ,KEBNE ,16720996,Sat Nov 27 05:02:09 CET,Sat Nov 27 07:05:28 CET,0.0 1.437 2.0 2.429 2.755 3.031 3.27 3.491 3.891 4.074 4.252 4.488 4.728 4.865 5.114 5.347 5.569 5.671 5.863 6.053 6.322 6.49 6.658 6.904 7.13 7.346 7.556 7.751 7.996 8.227 8.443 8.704 8.956 9.2 9.484 9.789 10.05 10.315 10.607 10.907 11.216 11.566 11.952 12.333 12.752 13.201 13.72 14.239 14.772 15.295 15.639 15.59 15.283 14.955 14.591 14.216 13.866 13.477 13.127 12.795 12.463 12.121 11.808 11.521 11.244 10.977 10.695 10.437 10.185 9.908 9.624 9.377 9.113 8.842 8.629 8.406 8.161 7.896 7.643 7.476 7.296 7.008 6.802 6.582 6.463 6.217 5.947 5.637 5.476 5.232 4.982 4.798 4.597 4.12 3.849 3.546 3.202 2.807 2.311 1.62 -1.508 -3 ,18393 ,KEBNE ,16720997,Sat Nov 27 05:03:10 CET,Sat Nov 27 07:07:24 CET,0.0 1.613 2.218 2.648 3.006 3.297 3.539 3.763 4.165 4.357 4.537 4.775 5.023 5.175 5.446 5.707 5.967 6.087 6.298 6.497 6.784 6.968 7.148 7.401 7.627 7.839 8.039 8.223 8.459 8.69 8.911 9.175 9.415 9.633 9.897 10.194 10.465 10.741 11.012 11.284 11.572 11.882 12.239 12.585 12.961 13.364 13.803 14.269 14.74 15.179 15.476 15.422 15.146 14.778 14.374 13.94 13.507 13.102 12.748 12.373 12.019 11.679 11.354 11.034 10.723 10.445 10.129 9.829 9.575 9.304 9.015 8.78 8.535 8.259 8.042 7.831 7.611 7.381 7.147 6.964 6.766 6.479 6.259 6.003 5.872 5.606 5.331 5.029 4.863 4.611 4.343 4.143 3.941 3.511 3.273 2.976 2.605 2.192 1.693 0.986 -2.519 -4 ,24944 ,KEBNE ,16720998,Sat Nov 27 05:03:10 CET,Sat Nov 27 07:06:52 CET,0.0 2.268 2.911 3.358 3.707 4.014 4.279 4.526 4.964 5.158 5.337 5.578 5.827 5.975 6.253 6.505 6.736 6.847 7.06 7.259 7.532 7.7 7.867 8.102 8.316 8.534 8.735 8.92 9.169 9.398 9.605 9.853 10.09 10.322 10.58 10.849 11.102 11.386 11.688 11.993 12.303 12.651 13.06 13.462 13.904 14.36 14.833 15.321 15.8 16.242 16.615 16.692 16.535 16.249 15.905 15.527 15.136 14.74 14.392 14.031 13.705 13.404 13.095 12.79 12.501 12.224 11.921 11.639 11.39 11.113 10.81 10.544 10.27 10.001 9.787 9.563 9.322 9.065 8.788 8.601 8.409 8.097 7.88 7.646 7.523 7.264 6.979 6.659 6.497 6.249 5.962 5.76 5.547 5.085 4.826 4.55 4.232 3.836 3.298 2.586 -0.03 -5 ,17791 ,KEBNE ,16720999,Sat Nov 27 05:03:10 CET,Sat Nov 27 07:06:41 CET,0.0 2.362 2.983 3.439 3.804 4.103 4.369 4.626 5.088 5.281 5.453 5.687 5.934 6.082 6.363 6.622 6.871 6.987 7.197 7.388 7.662 7.838 8.012 8.259 8.488 8.704 8.912 9.108 9.356 9.596 9.823 10.094 10.341 10.562 10.813 11.092 11.351 11.642 11.955 12.274 12.607 12.949 13.318 13.699 14.143 14.632 15.148 15.715 16.348 16.934 17.435 17.531 17.319 16.93 16.463 16.018 15.623 15.243 14.88 14.504 14.172 13.866 13.57 13.278 12.997 12.739 12.461 12.198 11.962 11.711 11.44 11.214 10.979 10.729 10.526 10.306 10.082 9.834 9.567 9.396 9.215 8.906 8.676 8.441 8.322 8.081 7.829 7.527 7.361 7.105 6.797 6.608 6.406 5.913 5.645 5.367 5.041 4.664 4.198 3.418 -0.342 -6 ,7338 ,KEBNE ,16721000,Sat Nov 27 05:03:10 CET,Sat Nov 27 07:06:15 CET,0.0 2.102 2.744 3.207 3.555 3.862 4.139 4.394 4.828 5.015 5.194 5.436 5.679 5.826 6.114 6.368 6.596 6.702 6.898 7.081 7.337 7.501 7.668 7.908 8.12 8.327 8.53 8.713 8.942 9.172 9.387 9.633 9.866 10.082 10.329 10.611 10.874 11.156 11.449 11.755 12.068 12.406 12.794 13.164 13.586 14.052 14.538 15.026 15.565 16.121 16.599 16.729 16.568 16.294 16.001 15.717 15.423 15.108 14.819 14.517 14.227 13.936 13.65 13.384 13.143 12.912 12.633 12.389 12.178 11.923 11.642 11.414 11.185 10.941 10.747 10.557 10.366 10.166 9.945 9.783 9.613 9.329 9.114 8.885 8.768 8.543 8.306 8.012 7.842 7.585 7.344 7.158 6.96 6.526 6.287 6.016 5.706 5.333 4.852 4.146 0.118 -7 ,19025 ,KEBNE ,16721001,Sat Nov 27 05:03:11 CET,Sat Nov 27 07:06:16 CET,0.0 1.556 2.139 2.553 2.875 3.157 3.401 3.625 4.043 4.234 4.405 4.617 4.84 4.977 5.244 5.491 5.717 5.825 6.026 6.217 6.494 6.665 6.822 7.039 7.244 7.441 7.631 7.804 8.019 8.229 8.432 8.678 8.906 9.121 9.363 9.62 9.861 10.124 10.415 10.718 11.014 11.353 11.735 12.076 12.469 12.908 13.369 13.841 14.34 14.801 15.11 15.101 14.837 14.446 14.018 13.582 13.161 12.742 12.383 12.005 11.649 11.321 10.995 10.693 10.391 10.093 9.778 9.495 9.246 8.961 8.656 8.412 8.166 7.909 7.683 7.442 7.211 6.974 6.718 6.531 6.337 6.03 5.814 5.585 5.463 5.206 4.924 4.618 4.455 4.207 3.952 3.746 3.52 3.051 2.763 2.438 2.083 1.708 1.247 0.484 -2.428 -8 ,23662 ,KEBNE ,16721002,Sat Nov 27 05:03:10 CET,Sat Nov 27 07:06:05 CET,0.0 2.265 2.9 3.344 3.718 4.04 4.314 4.557 4.967 5.143 5.317 5.563 5.816 5.958 6.219 6.464 6.679 6.782 6.989 7.186 7.472 7.656 7.83 8.067 8.279 8.494 8.708 8.903 9.153 9.393 9.614 9.872 10.12 10.364 10.646 10.943 11.212 11.515 11.834 12.162 12.499 12.869 13.29 13.689 14.132 14.6 15.114 15.649 16.193 16.775 17.283 17.384 17.222 16.914 16.544 16.178 15.794 15.396 15.038 14.625 14.241 13.927 13.654 13.369 13.063 12.778 12.476 12.192 11.94 11.689 11.425 11.198 10.954 10.703 10.505 10.288 10.057 9.809 9.557 9.382 9.195 8.881 8.658 8.433 8.319 8.078 7.816 7.527 7.373 7.123 6.848 6.662 6.434 5.946 5.679 5.378 5.048 4.664 4.209 3.539 0.894 -9 ,17916 ,KEBNE ,16721003,Sat Nov 27 05:03:10 CET,Sat Nov 27 07:06:57 CET,0.0 1.873 2.481 2.923 3.28 3.598 3.872 4.112 4.556 4.756 4.933 5.168 5.416 5.56 5.84 6.093 6.326 6.441 6.653 6.846 7.13 7.304 7.478 7.74 7.973 8.178 8.369 8.562 8.811 9.039 9.254 9.526 9.785 10.026 10.297 10.588 10.864 11.159 11.465 11.769 12.064 12.395 12.778 13.143 13.551 13.971 14.418 14.895 15.435 16.02 16.543 16.639 16.335 15.914 15.488 15.033 14.594 14.197 13.842 13.451 13.108 12.802 12.501 12.2 11.891 11.59 11.273 10.983 10.726 10.45 10.159 9.911 9.649 9.383 9.167 8.931 8.697 8.458 8.198 8.015 7.818 7.5 7.289 7.074 6.961 6.717 6.446 6.16 6.004 5.756 5.501 5.315 5.11 4.666 4.417 4.139 3.823 3.428 2.946 2.285 -0.632 -10 ,29330 ,KEBNE ,16721004,Sat Nov 27 05:03:10 CET,Sat Nov 27 07:06:41 CET,0.0 2.647 3.284 3.742 4.088 4.36 4.604 4.844 5.251 5.428 5.605 5.852 6.095 6.239 6.497 6.727 6.952 7.064 7.28 7.477 7.743 7.904 8.064 8.295 8.501 8.71 8.921 9.114 9.35 9.57 9.781 10.026 10.253 10.471 10.716 10.994 11.266 11.55 11.85 12.168 12.494 12.845 13.241 13.618 14.035 14.507 15.025 15.556 16.137 16.667 17.069 17.147 16.915 16.589 16.238 15.775 15.334 14.943 14.562 14.158 13.782 13.442 13.123 12.806 12.503 12.221 11.92 11.648 11.398 11.123 10.834 10.576 10.303 10.027 9.808 9.581 9.35 9.107 8.843 8.656 8.467 8.167 7.948 7.719 7.594 7.321 7.029 6.71 6.54 6.289 6.024 5.833 5.619 5.137 4.867 4.567 4.202 3.754 3.26 2.599 -0.348 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_43_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_43_39.txt deleted file mode 100644 index 777e08e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_43_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9593 ,KEBNE ,16721005,Sat Nov 27 05:03:10 CET,Sat Nov 27 06:59:12 CET,0.0 1.229 1.735 2.088 2.406 2.669 2.888 3.086 3.448 3.615 3.772 3.953 4.154 4.27 4.48 4.669 4.844 4.928 5.092 5.238 5.443 5.571 5.69 5.846 5.987 6.128 6.264 6.384 6.521 6.632 6.728 6.848 6.957 7.05 7.137 7.217 7.295 7.358 7.408 7.451 7.47 7.447 7.355 7.226 7.019 6.702 6.227 5.527 4.494 2.911 0.258 -2.814 -5.176 -7.062 -8.62 -9.988 -11.178 -12.2 -13.041 -13.869 -14.579 -15.215 -15.81 -16.35 -16.882 -17.38 -17.864 -18.288 -18.657 -19.03 -19.412 -19.738 -20.078 -20.425 -20.695 -20.984 -21.28 -21.58 -21.899 -22.128 -22.358 -22.725 -22.992 -23.261 -23.396 -23.674 -23.97 -24.281 -24.45 -24.751 -25.009 -25.213 -25.448 -25.973 -26.257 -26.559 -26.915 -27.316 -27.8 -28.502 -31.302 -2 ,5620 ,KEBNE ,16721006,Sat Nov 27 05:03:11 CET,Sat Nov 27 06:59:13 CET,0.0 1.321 1.801 2.173 2.46 2.708 2.935 3.132 3.479 3.637 3.779 3.955 4.156 4.264 4.471 4.65 4.814 4.893 5.045 5.192 5.399 5.526 5.641 5.803 5.951 6.074 6.175 6.273 6.406 6.525 6.627 6.734 6.826 6.911 6.999 7.083 7.146 7.196 7.246 7.269 7.256 7.218 7.109 6.927 6.681 6.346 5.869 5.216 4.248 2.781 0.356 -2.443 -4.696 -6.622 -8.239 -9.614 -10.761 -11.739 -12.554 -13.386 -14.087 -14.691 -15.274 -15.822 -16.312 -16.761 -17.235 -17.653 -18.016 -18.386 -18.762 -19.075 -19.408 -19.763 -20.037 -20.31 -20.595 -20.905 -21.238 -21.458 -21.677 -22.036 -22.288 -22.54 -22.666 -22.94 -23.248 -23.584 -23.759 -24.045 -24.291 -24.498 -24.723 -25.207 -25.472 -25.778 -26.122 -26.516 -27.051 -27.792 -30.818 -3 ,19193 ,KEBNE ,16721007,Sat Nov 27 05:03:10 CET,Sat Nov 27 07:00:04 CET,0.0 1.22 1.745 2.128 2.425 2.662 2.873 3.076 3.433 3.589 3.731 3.893 4.092 4.207 4.426 4.624 4.801 4.883 5.029 5.165 5.364 5.481 5.585 5.716 5.835 5.951 6.06 6.156 6.272 6.373 6.468 6.588 6.691 6.769 6.85 6.934 7.004 7.06 7.106 7.136 7.138 7.118 7.019 6.863 6.659 6.355 5.903 5.257 4.279 2.783 0.39 -2.398 -4.662 -6.589 -8.18 -9.513 -10.635 -11.622 -12.466 -13.278 -13.959 -14.555 -15.112 -15.646 -16.148 -16.606 -17.066 -17.464 -17.813 -18.189 -18.59 -18.914 -19.238 -19.571 -19.836 -20.125 -20.419 -20.715 -21.012 -21.221 -21.445 -21.799 -22.05 -22.306 -22.443 -22.723 -23.012 -23.343 -23.516 -23.796 -24.021 -24.216 -24.443 -24.923 -25.179 -25.486 -25.867 -26.288 -26.748 -27.417 -29.572 -4 ,23352 ,KEBNE ,16721008,Sat Nov 27 05:03:10 CET,Sat Nov 27 07:00:03 CET,0.0 1.661 2.173 2.59 2.944 3.2 3.414 3.612 3.966 4.125 4.275 4.443 4.64 4.753 4.961 5.142 5.309 5.392 5.548 5.69 5.89 6.01 6.12 6.275 6.414 6.529 6.628 6.72 6.846 6.97 7.072 7.188 7.293 7.374 7.459 7.546 7.615 7.676 7.721 7.736 7.732 7.694 7.586 7.427 7.173 6.812 6.302 5.584 4.573 3.066 0.557 -2.273 -4.508 -6.394 -7.965 -9.309 -10.427 -11.41 -12.257 -13.081 -13.771 -14.396 -14.98 -15.511 -16.008 -16.475 -16.965 -17.391 -17.75 -18.116 -18.497 -18.809 -19.138 -19.488 -19.76 -20.044 -20.349 -20.655 -20.978 -21.214 -21.449 -21.811 -22.08 -22.358 -22.499 -22.784 -23.077 -23.394 -23.569 -23.87 -24.152 -24.366 -24.584 -25.055 -25.322 -25.619 -25.962 -26.354 -26.823 -27.569 -30.175 -5 ,23870 ,KEBNE ,16721009,Sat Nov 27 05:03:10 CET,Sat Nov 27 07:00:00 CET,0.0 1.11 1.616 2.001 2.318 2.587 2.827 3.045 3.428 3.606 3.764 3.971 4.187 4.303 4.515 4.713 4.89 4.966 5.113 5.254 5.459 5.583 5.694 5.846 5.976 6.093 6.204 6.313 6.444 6.555 6.655 6.765 6.86 6.936 7.004 7.073 7.136 7.185 7.2 7.212 7.2 7.145 7.048 6.903 6.641 6.271 5.788 5.113 4.064 2.459 -0.089 -2.962 -5.198 -7.063 -8.6 -9.885 -10.987 -11.959 -12.786 -13.614 -14.325 -14.946 -15.536 -16.088 -16.59 -17.046 -17.508 -17.93 -18.308 -18.692 -19.084 -19.411 -19.741 -20.089 -20.362 -20.637 -20.921 -21.224 -21.539 -21.754 -21.981 -22.335 -22.585 -22.841 -22.975 -23.258 -23.55 -23.864 -24.031 -24.318 -24.561 -24.765 -24.991 -25.472 -25.752 -26.059 -26.38 -26.757 -27.257 -27.952 -31.559 -6 ,2739 ,KEBNE ,16721010,Sat Nov 27 05:04:13 CET,Sat Nov 27 07:01:51 CET,0.0 1.157 1.612 1.979 2.307 2.583 2.821 3.036 3.42 3.59 3.736 3.913 4.123 4.246 4.476 4.68 4.864 4.957 5.119 5.254 5.454 5.583 5.701 5.861 6.01 6.146 6.269 6.373 6.491 6.605 6.705 6.81 6.898 6.981 7.076 7.144 7.188 7.229 7.245 7.25 7.25 7.203 7.118 6.988 6.751 6.432 5.958 5.263 4.256 2.748 0.316 -2.417 -4.584 -6.4 -7.933 -9.252 -10.378 -11.387 -12.223 -13.033 -13.715 -14.318 -14.9 -15.432 -15.911 -16.352 -16.833 -17.254 -17.602 -17.962 -18.334 -18.651 -18.991 -19.348 -19.627 -19.905 -20.177 -20.471 -20.795 -21.019 -21.243 -21.594 -21.85 -22.116 -22.253 -22.551 -22.862 -23.204 -23.397 -23.701 -23.979 -24.185 -24.397 -24.869 -25.142 -25.447 -25.8 -26.189 -26.662 -27.378 -29.492 -7 ,31956 ,KEBNE ,16721011,Sat Nov 27 05:04:13 CET,Sat Nov 27 07:01:03 CET,0.0 1.159 1.657 2.015 2.312 2.563 2.785 2.991 3.332 3.487 3.633 3.81 4.017 4.134 4.349 4.544 4.726 4.811 4.968 5.104 5.284 5.396 5.505 5.654 5.793 5.919 6.032 6.137 6.25 6.351 6.446 6.55 6.649 6.747 6.834 6.91 6.978 7.021 7.063 7.107 7.103 7.06 7.005 6.893 6.67 6.372 5.91 5.213 4.175 2.601 0.094 -2.784 -5.104 -6.988 -8.53 -9.869 -11.002 -11.992 -12.831 -13.654 -14.338 -14.934 -15.501 -16.047 -16.553 -17.007 -17.481 -17.903 -18.263 -18.631 -19.01 -19.32 -19.646 -19.984 -20.235 -20.498 -20.786 -21.095 -21.419 -21.644 -21.868 -22.219 -22.475 -22.747 -22.884 -23.148 -23.44 -23.771 -23.941 -24.238 -24.52 -24.722 -24.938 -25.417 -25.686 -25.994 -26.323 -26.687 -27.129 -27.752 -30.098 -8 ,26209 ,KEBNE ,16721012,Sat Nov 27 05:04:13 CET,Sat Nov 27 07:01:39 CET,0.0 1.273 1.75 2.097 2.411 2.698 2.936 3.137 3.49 3.646 3.794 3.996 4.22 4.347 4.589 4.799 4.978 5.056 5.208 5.351 5.53 5.641 5.745 5.885 6.009 6.129 6.241 6.345 6.465 6.567 6.665 6.776 6.87 6.953 7.045 7.124 7.172 7.212 7.25 7.282 7.296 7.275 7.211 7.109 6.946 6.695 6.298 5.693 4.752 3.314 1.01 -1.718 -3.921 -5.711 -7.191 -8.456 -9.565 -10.574 -11.455 -12.299 -12.994 -13.634 -14.232 -14.746 -15.206 -15.637 -16.097 -16.517 -16.876 -17.245 -17.631 -17.948 -18.276 -18.617 -18.883 -19.171 -19.472 -19.782 -20.105 -20.329 -20.558 -20.918 -21.174 -21.45 -21.597 -21.892 -22.188 -22.503 -22.672 -22.958 -23.207 -23.41 -23.632 -24.143 -24.431 -24.734 -25.08 -25.486 -26.003 -26.72 -29.507 -9 ,20401 ,KEBNE ,16721013,Sat Nov 27 05:04:13 CET,Sat Nov 27 07:00:27 CET,0.0 1.364 1.847 2.195 2.496 2.76 2.983 3.175 3.516 3.671 3.813 3.997 4.208 4.325 4.529 4.714 4.879 4.957 5.115 5.268 5.484 5.611 5.723 5.878 6.021 6.153 6.284 6.409 6.554 6.676 6.778 6.88 6.956 7.021 7.091 7.167 7.226 7.27 7.304 7.346 7.353 7.305 7.23 7.111 6.911 6.617 6.178 5.532 4.55 3.084 0.687 -2.047 -4.209 -6.011 -7.518 -8.834 -9.946 -10.953 -11.817 -12.636 -13.316 -13.907 -14.456 -14.98 -15.482 -15.939 -16.426 -16.855 -17.225 -17.629 -18.051 -18.386 -18.714 -19.049 -19.304 -19.571 -19.859 -20.155 -20.454 -20.668 -20.895 -21.247 -21.489 -21.739 -21.872 -22.156 -22.451 -22.75 -22.907 -23.189 -23.425 -23.624 -23.841 -24.305 -24.563 -24.863 -25.206 -25.593 -26.067 -26.804 -29.842 -10 ,6966 ,KEBNE ,16721014,Sat Nov 27 05:04:13 CET,Sat Nov 27 07:01:04 CET,0.0 1.351 1.818 2.163 2.454 2.712 2.953 3.172 3.519 3.658 3.791 3.955 4.159 4.267 4.47 4.665 4.853 4.941 5.09 5.23 5.419 5.534 5.64 5.784 5.925 6.048 6.157 6.267 6.406 6.53 6.638 6.748 6.844 6.947 7.045 7.116 7.172 7.215 7.242 7.257 7.249 7.213 7.158 7.068 6.87 6.555 6.083 5.373 4.302 2.716 0.194 -2.665 -4.905 -6.716 -8.189 -9.484 -10.622 -11.641 -12.498 -13.346 -14.051 -14.666 -15.266 -15.811 -16.307 -16.769 -17.244 -17.665 -18.03 -18.416 -18.825 -19.165 -19.509 -19.856 -20.126 -20.399 -20.689 -21.002 -21.33 -21.553 -21.78 -22.127 -22.37 -22.623 -22.755 -23.038 -23.321 -23.623 -23.791 -24.086 -24.339 -24.534 -24.745 -25.194 -25.459 -25.76 -26.1 -26.494 -26.984 -27.667 -29.662 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_44_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_44_43.txt deleted file mode 100644 index 28ded282..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_44_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32682 ,KEBNE ,16721015,Sat Nov 27 05:05:12 CET,Sat Nov 27 07:02:32 CET,0.0 3.031 3.71 4.137 4.503 4.814 5.068 5.302 5.713 5.887 6.051 6.269 6.495 6.634 6.884 7.115 7.327 7.43 7.638 7.829 8.093 8.255 8.407 8.62 8.825 9.023 9.207 9.381 9.602 9.81 10.009 10.243 10.456 10.657 10.888 11.137 11.371 11.62 11.883 12.152 12.418 12.712 13.028 13.325 13.674 14.022 14.401 14.788 15.139 15.393 15.365 14.898 14.338 13.807 13.298 12.798 12.277 11.768 11.338 10.889 10.494 10.138 9.789 9.448 9.127 8.835 8.537 8.279 8.051 7.802 7.542 7.329 7.103 6.854 6.657 6.451 6.233 6.008 5.769 5.598 5.421 5.138 4.94 4.728 4.618 4.379 4.117 3.837 3.685 3.439 3.189 3.013 2.833 2.455 2.233 1.974 1.671 1.319 0.895 0.415 -0.684 -2 ,14354 ,KEBNE ,16721016,Sat Nov 27 05:05:12 CET,Sat Nov 27 07:02:13 CET,0.0 1.84 2.446 2.9 3.257 3.567 3.859 4.108 4.541 4.731 4.906 5.146 5.383 5.531 5.792 6.027 6.254 6.363 6.565 6.759 7.016 7.177 7.33 7.544 7.751 7.949 8.14 8.314 8.527 8.73 8.927 9.164 9.389 9.599 9.836 10.092 10.328 10.579 10.845 11.131 11.404 11.694 12.023 12.346 12.686 13.012 13.343 13.704 14.081 14.36 14.416 14.117 13.649 13.139 12.615 12.081 11.592 11.115 10.688 10.255 9.883 9.523 9.168 8.843 8.528 8.228 7.914 7.63 7.384 7.124 6.834 6.589 6.341 6.081 5.881 5.676 5.458 5.208 4.948 4.778 4.602 4.316 4.107 3.886 3.774 3.547 3.298 3.016 2.855 2.608 2.369 2.19 1.996 1.577 1.345 1.086 0.788 0.429 0.014 -0.51 -1.882 -3 ,9298 ,KEBNE ,16721017,Sat Nov 27 05:05:12 CET,Sat Nov 27 07:02:57 CET,0.0 2.49 3.181 3.619 3.969 4.271 4.537 4.781 5.202 5.401 5.6 5.853 6.074 6.202 6.435 6.666 6.89 6.998 7.199 7.38 7.626 7.78 7.929 8.154 8.365 8.555 8.74 8.921 9.147 9.343 9.533 9.77 10.002 10.222 10.463 10.734 10.982 11.237 11.506 11.779 12.053 12.347 12.671 12.985 13.347 13.74 14.171 14.631 15.066 15.38 15.45 15.065 14.553 14.037 13.527 13.037 12.569 12.085 11.631 11.207 10.853 10.524 10.2 9.879 9.567 9.274 8.963 8.676 8.429 8.171 7.894 7.673 7.437 7.173 6.966 6.749 6.511 6.265 6.004 5.816 5.632 5.341 5.139 4.93 4.822 4.581 4.297 4.001 3.86 3.621 3.349 3.17 2.977 2.568 2.35 2.094 1.806 1.483 1.079 0.504 -0.71 -4 ,567 ,KEBNE ,16721018,Sat Nov 27 05:05:12 CET,Sat Nov 27 07:01:45 CET,0.0 2.316 2.997 3.494 3.893 4.214 4.491 4.74 5.159 5.347 5.532 5.785 6.019 6.155 6.411 6.645 6.867 6.974 7.179 7.364 7.623 7.803 7.969 8.192 8.405 8.605 8.791 8.967 9.188 9.395 9.604 9.855 10.082 10.299 10.549 10.82 11.068 11.324 11.587 11.863 12.142 12.433 12.759 13.053 13.377 13.727 14.069 14.41 14.72 14.906 14.856 14.439 13.884 13.259 12.666 12.148 11.634 11.136 10.705 10.266 9.869 9.496 9.126 8.759 8.439 8.16 7.857 7.577 7.328 7.078 6.815 6.581 6.338 6.089 5.892 5.681 5.463 5.225 4.972 4.809 4.632 4.336 4.121 3.877 3.741 3.471 3.213 2.936 2.782 2.536 2.28 2.103 1.916 1.512 1.271 1.006 0.721 0.386 0.009 -0.496 -1.849 -5 ,30342 ,KEBNE ,16721019,Sat Nov 27 05:06:13 CET,Sat Nov 27 07:01:11 CET,0.0 2.023 2.647 3.115 3.485 3.778 4.028 4.258 4.655 4.829 4.996 5.235 5.475 5.621 5.875 6.113 6.338 6.444 6.641 6.826 7.091 7.263 7.42 7.637 7.847 8.042 8.222 8.384 8.588 8.79 8.989 9.228 9.444 9.643 9.869 10.122 10.35 10.58 10.828 11.078 11.329 11.594 11.882 12.17 12.512 12.886 13.271 13.63 13.965 14.22 14.255 13.874 13.36 12.865 12.339 11.772 11.244 10.745 10.302 9.865 9.499 9.172 8.837 8.488 8.143 7.835 7.518 7.22 6.963 6.7 6.434 6.214 5.965 5.682 5.457 5.23 4.994 4.728 4.45 4.242 4.018 3.686 3.452 3.212 3.093 2.848 2.563 2.248 2.087 1.83 1.551 1.36 1.16 0.707 0.447 0.156 -0.14 -0.467 -0.881 -1.444 -2.912 -6 ,29361 ,KEBNE ,16721020,Sat Nov 27 05:06:13 CET,Sat Nov 27 07:02:13 CET,0.0 2.282 2.929 3.398 3.754 4.051 4.327 4.59 5.022 5.213 5.399 5.629 5.855 5.996 6.254 6.487 6.701 6.804 7.001 7.188 7.454 7.635 7.804 8.033 8.25 8.452 8.642 8.816 9.048 9.28 9.495 9.74 9.974 10.192 10.436 10.7 10.939 11.191 11.452 11.716 11.983 12.285 12.638 12.982 13.344 13.703 14.086 14.469 14.847 15.117 15.202 14.963 14.546 14.079 13.594 13.118 12.655 12.182 11.773 11.368 10.977 10.628 10.301 9.969 9.658 9.368 9.06 8.782 8.536 8.283 8.008 7.77 7.528 7.285 7.092 6.878 6.639 6.391 6.133 5.949 5.754 5.454 5.248 5.033 4.916 4.656 4.375 4.083 3.932 3.682 3.4 3.201 2.993 2.537 2.29 2.03 1.747 1.438 1.064 0.514 -0.918 -7 ,3839 ,KEBNE ,16721021,Sat Nov 27 05:10:18 CET,Sat Nov 27 07:09:53 CET,0.0 2.299 2.89 3.324 3.703 4.022 4.302 4.55 4.984 5.174 5.343 5.577 5.806 5.942 6.188 6.43 6.663 6.767 6.974 7.169 7.428 7.597 7.753 7.975 8.199 8.419 8.622 8.802 9.03 9.256 9.465 9.699 9.938 10.161 10.401 10.667 10.908 11.164 11.439 11.728 12.015 12.323 12.687 13.046 13.429 13.784 14.13 14.496 14.838 15.076 15.138 14.811 14.3 13.791 13.298 12.785 12.322 11.876 11.441 10.978 10.569 10.201 9.836 9.48 9.139 8.837 8.537 8.252 7.988 7.702 7.398 7.145 6.888 6.615 6.398 6.168 5.91 5.644 5.389 5.207 5.016 4.72 4.499 4.26 4.141 3.878 3.592 3.291 3.136 2.9 2.654 2.469 2.268 1.841 1.604 1.345 1.067 0.754 0.353 -0.198 -1.613 -8 ,30867 ,KEBNE ,16721022,Sat Nov 27 05:33:44 CET,Sat Nov 27 07:28:37 CET,0.0 3.133 3.816 4.34 4.724 5.058 5.346 5.591 6.009 6.197 6.365 6.605 6.836 6.972 7.22 7.446 7.661 7.764 7.961 8.149 8.406 8.572 8.732 8.948 9.154 9.354 9.535 9.711 9.94 10.146 10.343 10.595 10.833 11.044 11.285 11.559 11.802 12.063 12.344 12.633 12.933 13.272 13.653 14.014 14.388 14.758 15.146 15.492 15.832 16.131 16.255 16.042 15.648 15.141 14.619 14.105 13.618 13.138 12.716 12.293 11.928 11.586 11.235 10.898 10.578 10.274 9.941 9.645 9.39 9.112 8.82 8.593 8.342 8.047 7.816 7.594 7.366 7.119 6.857 6.669 6.474 6.17 5.959 5.741 5.627 5.39 5.133 4.841 4.689 4.449 4.188 4.008 3.808 3.37 3.14 2.897 2.615 2.289 1.905 1.418 0.288 -9 ,29325 ,KEBNE ,16721023,Sat Nov 27 05:34:46 CET,Sat Nov 27 07:30:49 CET,0.0 2.044 2.624 3.058 3.401 3.699 3.978 4.222 4.618 4.797 4.964 5.176 5.397 5.532 5.793 6.035 6.251 6.353 6.557 6.744 6.986 7.145 7.301 7.527 7.734 7.917 8.099 8.276 8.49 8.695 8.89 9.124 9.352 9.57 9.808 10.073 10.322 10.573 10.835 11.101 11.38 11.696 12.052 12.386 12.742 13.097 13.453 13.804 14.118 14.381 14.387 13.99 13.531 13.014 12.531 12.069 11.61 11.154 10.744 10.313 9.926 9.577 9.23 8.894 8.574 8.282 7.964 7.675 7.431 7.181 6.919 6.694 6.437 6.153 5.939 5.728 5.503 5.258 5.008 4.832 4.65 4.354 4.143 3.933 3.824 3.59 3.337 3.061 2.905 2.656 2.394 2.21 2.018 1.616 1.395 1.138 0.832 0.466 0.005 -0.595 -1.757 -10 ,8531 ,KEBNE ,16721024,Sat Nov 27 06:09:17 CET,Sat Nov 27 08:04:12 CET,0.0 2.093 2.764 3.193 3.537 3.856 4.131 4.37 4.801 4.996 5.187 5.466 5.704 5.85 6.112 6.336 6.547 6.651 6.85 7.032 7.282 7.444 7.606 7.836 8.05 8.244 8.428 8.618 8.836 9.037 9.238 9.464 9.672 9.872 10.094 10.358 10.611 10.883 11.162 11.441 11.746 12.081 12.441 12.78 13.173 13.575 13.969 14.34 14.711 15.062 15.179 14.923 14.53 14.064 13.574 13.091 12.615 12.133 11.688 11.225 10.82 10.45 10.103 9.783 9.472 9.181 8.869 8.593 8.348 8.089 7.811 7.57 7.321 7.058 6.846 6.621 6.37 6.104 5.832 5.645 5.452 5.128 4.894 4.655 4.531 4.283 4.021 3.723 3.564 3.311 3.056 2.868 2.673 2.228 1.979 1.728 1.439 1.101 0.692 0.136 -1.163 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_44.txt deleted file mode 100644 index 905f013d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,521 ,KEBNE ,16721025,Sat Nov 27 06:10:18 CET,Sat Nov 27 08:09:32 CET,0.0 1.092 1.554 1.885 2.18 2.452 2.675 2.871 3.246 3.41 3.545 3.745 3.952 4.082 4.311 4.513 4.704 4.797 4.968 5.127 5.354 5.491 5.616 5.793 5.961 6.125 6.273 6.41 6.576 6.723 6.876 7.065 7.239 7.395 7.553 7.71 7.86 8.022 8.193 8.358 8.503 8.642 8.765 8.865 8.95 9.002 9.003 8.886 8.609 8.066 6.976 5.449 4.071 2.881 1.828 0.859 -0.005 -0.801 -1.51 -2.223 -2.834 -3.36 -3.846 -4.317 -4.767 -5.186 -5.621 -6.013 -6.371 -6.744 -7.119 -7.426 -7.743 -8.093 -8.379 -8.666 -8.96 -9.267 -9.585 -9.809 -10.043 -10.419 -10.683 -10.957 -11.1 -11.396 -11.696 -12.02 -12.196 -12.462 -12.772 -12.985 -13.21 -13.701 -13.972 -14.259 -14.597 -14.984 -15.44 -16.071 -17.899 -2 ,11449 ,KEBNE ,16721026,Sat Nov 27 06:10:18 CET,Sat Nov 27 08:08:46 CET,0.0 1.292 1.747 2.11 2.4 2.652 2.888 3.108 3.485 3.644 3.792 4.019 4.229 4.353 4.579 4.786 4.986 5.079 5.257 5.427 5.649 5.784 5.915 6.105 6.267 6.423 6.577 6.712 6.896 7.069 7.214 7.38 7.546 7.697 7.853 8.016 8.161 8.318 8.476 8.625 8.785 8.94 9.053 9.151 9.242 9.296 9.318 9.259 9.058 8.572 7.479 5.968 4.703 3.593 2.571 1.629 0.803 0.066 -0.544 -1.203 -1.822 -2.353 -2.852 -3.335 -3.782 -4.212 -4.679 -5.09 -5.43 -5.775 -6.139 -6.435 -6.748 -7.09 -7.363 -7.646 -7.936 -8.238 -8.567 -8.789 -9.008 -9.361 -9.615 -9.884 -10.029 -10.323 -10.629 -10.961 -11.134 -11.403 -11.726 -11.937 -12.156 -12.613 -12.868 -13.153 -13.476 -13.862 -14.316 -14.863 -16.413 -3 ,27828 ,KEBNE ,16721027,Sat Nov 27 06:27:33 CET,Sat Nov 27 08:25:16 CET,0.0 0.97 1.431 1.802 2.103 2.363 2.597 2.802 3.152 3.317 3.473 3.688 3.885 4.005 4.235 4.435 4.615 4.7 4.862 5.021 5.249 5.383 5.509 5.688 5.852 6.01 6.156 6.293 6.466 6.626 6.776 6.942 7.091 7.242 7.403 7.551 7.701 7.862 8.012 8.163 8.307 8.437 8.565 8.67 8.762 8.827 8.835 8.736 8.479 8.0 6.942 5.407 4.061 2.873 1.815 0.86 0.03 -0.714 -1.363 -2.047 -2.639 -3.158 -3.66 -4.129 -4.573 -4.994 -5.416 -5.801 -6.15 -6.503 -6.874 -7.185 -7.494 -7.833 -8.115 -8.403 -8.693 -8.986 -9.301 -9.515 -9.737 -10.102 -10.364 -10.634 -10.772 -11.075 -11.406 -11.75 -11.922 -12.192 -12.536 -12.758 -12.994 -13.507 -13.791 -14.107 -14.44 -14.804 -15.259 -15.887 -17.347 -4 ,3419 ,KEBNE ,16721028,Sat Nov 27 06:41:45 CET,Sat Nov 27 08:39:25 CET,0.0 1.2 1.634 1.988 2.279 2.543 2.792 2.998 3.36 3.519 3.663 3.863 4.059 4.177 4.397 4.603 4.8 4.89 5.052 5.207 5.434 5.578 5.713 5.905 6.073 6.222 6.373 6.516 6.683 6.847 7.008 7.189 7.349 7.508 7.691 7.878 8.036 8.188 8.342 8.482 8.624 8.78 8.92 9.031 9.13 9.178 9.155 9.027 8.739 8.209 7.099 5.532 4.208 3.075 2.087 1.193 0.36 -0.393 -1.047 -1.716 -2.262 -2.746 -3.23 -3.696 -4.13 -4.527 -4.935 -5.305 -5.635 -5.967 -6.313 -6.608 -6.927 -7.263 -7.525 -7.809 -8.105 -8.401 -8.703 -8.921 -9.152 -9.513 -9.767 -10.038 -10.181 -10.482 -10.8 -11.125 -11.298 -11.558 -11.853 -12.069 -12.299 -12.78 -13.045 -13.327 -13.64 -14.0 -14.409 -14.977 -16.515 -5 ,6310 ,KEBNE ,16721029,Sat Nov 27 06:43:47 CET,Sat Nov 27 08:42:59 CET,0.0 1.28 1.736 2.095 2.393 2.654 2.907 3.127 3.482 3.638 3.78 3.97 4.161 4.293 4.532 4.742 4.947 5.041 5.22 5.405 5.661 5.806 5.936 6.124 6.3 6.452 6.59 6.745 6.942 7.118 7.288 7.467 7.627 7.771 7.922 8.089 8.263 8.437 8.607 8.78 8.93 9.076 9.221 9.337 9.44 9.5 9.47 9.323 9.054 8.544 7.426 5.856 4.502 3.311 2.262 1.33 0.496 -0.283 -0.965 -1.611 -2.185 -2.725 -3.238 -3.726 -4.175 -4.604 -5.061 -5.456 -5.793 -6.143 -6.52 -6.837 -7.149 -7.471 -7.728 -8.003 -8.292 -8.577 -8.882 -9.099 -9.322 -9.677 -9.938 -10.212 -10.354 -10.657 -10.966 -11.306 -11.498 -11.774 -12.083 -12.282 -12.495 -12.991 -13.272 -13.576 -13.9 -14.272 -14.73 -15.316 -16.664 -6 ,27731 ,KEBNE ,16721030,Sat Nov 27 06:44:48 CET,Sat Nov 27 08:43:51 CET,0.0 1.213 1.661 2.019 2.314 2.577 2.819 3.032 3.398 3.56 3.721 3.941 4.144 4.263 4.487 4.691 4.886 4.981 5.167 5.343 5.575 5.71 5.84 6.024 6.198 6.366 6.52 6.669 6.858 7.024 7.168 7.332 7.488 7.633 7.794 7.97 8.118 8.27 8.429 8.582 8.745 8.9 9.019 9.113 9.208 9.249 9.195 9.068 8.789 8.168 6.961 5.317 3.875 2.669 1.663 0.77 -0.034 -0.776 -1.437 -2.114 -2.698 -3.221 -3.711 -4.174 -4.621 -5.029 -5.45 -5.834 -6.17 -6.524 -6.892 -7.196 -7.517 -7.855 -8.117 -8.387 -8.671 -8.966 -9.27 -9.488 -9.728 -10.099 -10.346 -10.616 -10.764 -11.078 -11.396 -11.73 -11.909 -12.169 -12.483 -12.708 -12.936 -13.415 -13.677 -13.97 -14.305 -14.678 -15.098 -15.635 -16.971 -7 ,2040 ,KEBNE ,16721031,Sat Nov 27 06:45:52 CET,Sat Nov 27 08:37:21 CET,0.0 1.214 1.675 2.0 2.272 2.509 2.716 2.923 3.284 3.438 3.585 3.783 3.975 4.1 4.343 4.554 4.744 4.829 4.996 5.154 5.378 5.518 5.646 5.826 5.997 6.161 6.307 6.438 6.613 6.774 6.915 7.088 7.254 7.399 7.561 7.734 7.892 8.066 8.237 8.382 8.524 8.671 8.79 8.88 8.965 9.031 9.041 8.932 8.673 8.144 7.092 5.642 4.314 3.151 2.161 1.243 0.41 -0.336 -0.978 -1.614 -2.169 -2.693 -3.206 -3.683 -4.109 -4.488 -4.902 -5.292 -5.637 -5.99 -6.362 -6.676 -6.995 -7.333 -7.594 -7.867 -8.154 -8.448 -8.762 -8.987 -9.236 -9.619 -9.87 -10.124 -10.26 -10.553 -10.866 -11.191 -11.368 -11.631 -11.925 -12.136 -12.362 -12.836 -13.103 -13.399 -13.736 -14.118 -14.534 -15.1 -16.804 -8 ,8445 ,KEBNE ,16721032,Sat Nov 27 06:51:57 CET,Sat Nov 27 08:46:41 CET,0.0 1.033 1.489 1.819 2.084 2.315 2.536 2.745 3.101 3.262 3.409 3.599 3.78 3.899 4.125 4.333 4.527 4.615 4.779 4.944 5.176 5.314 5.438 5.616 5.796 5.959 6.099 6.238 6.419 6.574 6.714 6.885 7.043 7.191 7.356 7.531 7.686 7.837 8.002 8.169 8.32 8.459 8.598 8.716 8.823 8.885 8.871 8.792 8.574 8.061 7.019 5.566 4.265 3.086 2.072 1.192 0.419 -0.279 -0.893 -1.534 -2.101 -2.608 -3.103 -3.565 -3.981 -4.353 -4.744 -5.111 -5.435 -5.768 -6.125 -6.423 -6.727 -7.05 -7.298 -7.558 -7.834 -8.115 -8.403 -8.616 -8.839 -9.178 -9.423 -9.696 -9.838 -10.132 -10.432 -10.752 -10.932 -11.192 -11.501 -11.714 -11.934 -12.398 -12.664 -12.956 -13.268 -13.634 -14.052 -14.561 -15.933 -9 ,11128 ,KEBNE ,16721033,Sat Nov 27 06:51:57 CET,Sat Nov 27 08:47:33 CET,0.0 1.103 1.575 1.93 2.205 2.448 2.687 2.904 3.274 3.437 3.585 3.818 4.025 4.145 4.381 4.602 4.791 4.88 5.045 5.214 5.462 5.612 5.749 5.934 6.105 6.255 6.398 6.54 6.724 6.884 7.026 7.193 7.342 7.488 7.662 7.834 7.984 8.128 8.279 8.436 8.571 8.716 8.85 8.944 9.04 9.096 9.065 8.932 8.618 8.017 6.785 5.111 3.737 2.562 1.528 0.596 -0.222 -0.951 -1.581 -2.216 -2.78 -3.308 -3.826 -4.321 -4.778 -5.2 -5.633 -6.015 -6.358 -6.72 -7.083 -7.386 -7.72 -8.06 -8.323 -8.592 -8.878 -9.184 -9.505 -9.727 -9.958 -10.331 -10.59 -10.87 -11.016 -11.315 -11.634 -11.985 -12.16 -12.419 -12.763 -12.98 -13.194 -13.685 -13.979 -14.287 -14.621 -15.03 -15.51 -16.142 -17.846 -10 ,19956 ,KEBNE ,16721034,Sat Nov 27 06:52:58 CET,Sat Nov 27 08:46:30 CET,0.0 0.944 1.367 1.714 2.008 2.263 2.491 2.702 3.061 3.22 3.377 3.584 3.774 3.89 4.12 4.333 4.514 4.595 4.759 4.909 5.114 5.24 5.357 5.539 5.71 5.862 6.007 6.145 6.321 6.485 6.629 6.788 6.94 7.084 7.234 7.408 7.572 7.739 7.905 8.062 8.2 8.322 8.452 8.557 8.663 8.722 8.709 8.631 8.374 7.821 6.772 5.293 3.942 2.785 1.774 0.844 0.027 -0.715 -1.372 -2.031 -2.586 -3.066 -3.538 -3.994 -4.411 -4.795 -5.198 -5.577 -5.901 -6.217 -6.554 -6.846 -7.158 -7.486 -7.745 -8.003 -8.266 -8.539 -8.822 -9.027 -9.259 -9.63 -9.879 -10.142 -10.277 -10.553 -10.848 -11.171 -11.339 -11.604 -11.926 -12.128 -12.34 -12.835 -13.113 -13.409 -13.731 -14.109 -14.529 -15.076 -16.417 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_49.txt deleted file mode 100644 index f9f86e28..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_46_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5180 ,KEBNE ,16721035,Sat Nov 27 06:52:58 CET,Sat Nov 27 08:47:32 CET,0.0 1.638 2.082 2.398 2.653 2.859 3.038 3.2 3.5 3.637 3.752 3.891 4.062 4.158 4.322 4.463 4.59 4.655 4.772 4.865 4.993 5.077 5.149 5.239 5.319 5.388 5.445 5.497 5.555 5.591 5.611 5.626 5.633 5.626 5.61 5.565 5.498 5.413 5.288 5.139 4.954 4.696 4.345 3.926 3.376 2.691 1.787 0.568 -1.134 -3.616 -7.808 -12.636 -16.331 -19.324 -21.757 -23.789 -25.503 -27.034 -28.344 -29.595 -30.65 -31.586 -32.456 -33.276 -34.016 -34.67 -35.357 -35.97 -36.495 -37.043 -37.617 -38.097 -38.583 -39.089 -39.492 -39.913 -40.339 -40.76 -41.203 -41.526 -41.868 -42.388 -42.733 -43.082 -43.275 -43.692 -44.145 -44.643 -44.905 -45.286 -45.711 -45.983 -46.264 -46.887 -47.23 -47.593 -47.999 -48.456 -48.963 -49.66 -51.295 -2 ,27907 ,KEBNE ,16721036,Sat Nov 27 06:55:00 CET,Sat Nov 27 08:50:08 CET,0.0 1.049 1.458 1.748 1.991 2.208 2.411 2.582 2.86 2.987 3.104 3.246 3.413 3.501 3.677 3.833 3.965 4.023 4.128 4.222 4.354 4.435 4.509 4.599 4.672 4.741 4.801 4.858 4.924 4.971 5.002 5.028 5.038 5.035 5.011 4.966 4.905 4.826 4.725 4.586 4.393 4.149 3.827 3.425 2.886 2.208 1.276 0.015 -1.773 -4.383 -8.557 -13.169 -16.67 -19.52 -21.841 -23.829 -25.52 -27.005 -28.257 -29.48 -30.493 -31.376 -32.233 -33.038 -33.775 -34.437 -35.127 -35.744 -36.262 -36.81 -37.389 -37.855 -38.345 -38.851 -39.235 -39.641 -40.057 -40.485 -40.95 -41.283 -41.618 -42.109 -42.448 -42.806 -42.997 -43.394 -43.798 -44.214 -44.437 -44.786 -45.173 -45.444 -45.726 -46.325 -46.662 -47.023 -47.409 -47.859 -48.422 -49.133 -50.788 -3 ,21546 ,KEBNE ,16721037,Sat Nov 27 06:57:58 CET,Sat Nov 27 08:56:40 CET,0.0 1.389 1.874 2.212 2.464 2.677 2.865 3.03 3.323 3.453 3.57 3.71 3.865 3.947 4.098 4.242 4.373 4.429 4.519 4.603 4.728 4.793 4.851 4.937 5.02 5.089 5.141 5.184 5.231 5.273 5.299 5.313 5.325 5.322 5.298 5.248 5.172 5.074 4.948 4.789 4.604 4.355 3.976 3.548 2.981 2.234 1.251 -0.005 -1.747 -4.345 -8.396 -12.969 -16.496 -19.291 -21.6 -23.645 -25.373 -26.875 -28.152 -29.449 -30.596 -31.588 -32.517 -33.398 -34.192 -34.889 -35.612 -36.279 -36.853 -37.452 -38.092 -38.609 -39.146 -39.732 -40.189 -40.646 -41.116 -41.618 -42.134 -42.485 -42.83 -43.377 -43.776 -44.175 -44.375 -44.813 -45.31 -45.825 -46.073 -46.432 -46.832 -47.12 -47.438 -48.139 -48.524 -48.951 -49.397 -49.89 -50.47 -51.215 -53.386 -4 ,26761 ,KEBNE ,16721038,Sat Nov 27 06:59:00 CET,Sat Nov 27 08:58:19 CET,0.0 1.015 1.425 1.754 2.021 2.241 2.434 2.611 2.905 3.032 3.151 3.297 3.46 3.55 3.719 3.878 4.02 4.079 4.189 4.278 4.384 4.451 4.513 4.6 4.671 4.722 4.774 4.818 4.86 4.9 4.937 4.977 5.004 5.006 4.991 4.973 4.946 4.899 4.814 4.677 4.517 4.284 3.925 3.513 2.986 2.326 1.399 0.171 -1.517 -4.012 -7.926 -12.253 -15.639 -18.421 -20.737 -22.738 -24.425 -25.917 -27.189 -28.423 -29.465 -30.395 -31.263 -32.059 -32.797 -33.462 -34.164 -34.805 -35.347 -35.909 -36.503 -36.993 -37.488 -37.989 -38.388 -38.799 -39.215 -39.657 -40.125 -40.438 -40.754 -41.271 -41.644 -42.008 -42.195 -42.591 -43.01 -43.454 -43.678 -44.019 -44.396 -44.662 -44.945 -45.573 -45.909 -46.251 -46.642 -47.106 -47.621 -48.3 -50.507 -5 ,14386 ,KEBNE ,16721039,Sat Nov 27 06:58:59 CET,Sat Nov 27 08:57:44 CET,0.0 1.014 1.443 1.731 1.98 2.19 2.372 2.532 2.816 2.95 3.069 3.21 3.366 3.443 3.589 3.734 3.861 3.913 4.024 4.126 4.246 4.329 4.409 4.511 4.583 4.645 4.697 4.74 4.788 4.823 4.848 4.859 4.864 4.863 4.842 4.791 4.726 4.636 4.515 4.353 4.162 3.931 3.596 3.189 2.641 1.937 1.017 -0.238 -2.049 -4.74 -8.962 -13.65 -17.307 -20.191 -22.509 -24.549 -26.255 -27.707 -28.949 -30.158 -31.169 -32.055 -32.876 -33.643 -34.364 -35.028 -35.715 -36.327 -36.856 -37.396 -37.974 -38.472 -38.98 -39.503 -39.905 -40.309 -40.724 -41.16 -41.609 -41.912 -42.229 -42.737 -43.105 -43.505 -43.709 -44.119 -44.537 -44.968 -45.199 -45.556 -45.983 -46.272 -46.567 -47.197 -47.541 -47.921 -48.365 -48.865 -49.441 -50.24 -52.864 -6 ,17233 ,KEBNE ,16721040,Sat Nov 27 06:58:59 CET,Sat Nov 27 08:57:39 CET,0.0 1.039 1.418 1.715 1.981 2.204 2.378 2.542 2.846 2.978 3.098 3.249 3.411 3.499 3.653 3.794 3.917 3.973 4.085 4.178 4.315 4.404 4.468 4.552 4.628 4.689 4.748 4.797 4.842 4.867 4.886 4.907 4.908 4.904 4.894 4.857 4.798 4.71 4.584 4.412 4.21 3.961 3.609 3.204 2.653 1.926 0.954 -0.354 -2.18 -4.796 -8.797 -13.204 -16.697 -19.519 -21.805 -23.778 -25.443 -26.957 -28.246 -29.463 -30.488 -31.392 -32.247 -33.035 -33.784 -34.475 -35.19 -35.826 -36.378 -36.933 -37.492 -37.968 -38.464 -38.976 -39.385 -39.823 -40.286 -40.762 -41.229 -41.553 -41.895 -42.43 -42.809 -43.2 -43.389 -43.784 -44.22 -44.66 -44.881 -45.232 -45.646 -45.925 -46.191 -46.755 -47.087 -47.445 -47.836 -48.283 -48.78 -49.401 -51.118 -7 ,14449 ,KEBNE ,16721041,Sat Nov 27 06:58:59 CET,Sat Nov 27 08:57:43 CET,0.0 1.171 1.561 1.896 2.172 2.389 2.577 2.742 3.006 3.129 3.247 3.38 3.54 3.622 3.771 3.915 4.052 4.115 4.231 4.332 4.457 4.532 4.599 4.678 4.749 4.813 4.862 4.898 4.942 4.976 4.997 5.015 5.019 5.013 4.992 4.945 4.876 4.777 4.647 4.482 4.278 4.018 3.66 3.238 2.67 1.942 0.978 -0.326 -2.116 -4.665 -8.722 -13.21 -16.679 -19.477 -21.848 -23.919 -25.619 -27.088 -28.325 -29.525 -30.54 -31.439 -32.294 -33.087 -33.814 -34.466 -35.141 -35.75 -36.28 -36.841 -37.416 -37.882 -38.356 -38.851 -39.226 -39.61 -40.021 -40.455 -40.898 -41.212 -41.548 -42.074 -42.423 -42.779 -42.966 -43.344 -43.739 -44.181 -44.407 -44.745 -45.139 -45.398 -45.67 -46.261 -46.581 -46.937 -47.33 -47.781 -48.338 -49.044 -50.905 -8 ,10661 ,KEBNE ,16721042,Sat Nov 27 06:58:59 CET,Sat Nov 27 08:57:32 CET,0.0 1.255 1.722 2.051 2.33 2.552 2.747 2.919 3.22 3.348 3.466 3.607 3.763 3.848 4.0 4.141 4.269 4.326 4.43 4.521 4.663 4.759 4.836 4.932 5.016 5.084 5.142 5.188 5.243 5.287 5.308 5.328 5.338 5.33 5.314 5.286 5.241 5.161 5.043 4.896 4.71 4.454 4.101 3.681 3.092 2.329 1.354 0.096 -1.705 -4.241 -8.24 -12.729 -16.157 -18.91 -21.246 -23.304 -25.021 -26.543 -27.822 -29.08 -30.139 -31.06 -31.944 -32.77 -33.524 -34.202 -34.891 -35.5 -36.036 -36.604 -37.195 -37.679 -38.171 -38.667 -39.051 -39.449 -39.86 -40.294 -40.757 -41.075 -41.388 -41.868 -42.208 -42.569 -42.757 -43.157 -43.581 -44.017 -44.231 -44.555 -44.926 -45.184 -45.458 -46.097 -46.42 -46.735 -47.113 -47.58 -48.165 -48.889 -50.581 -9 ,32276 ,KEBNE ,16721043,Sat Nov 27 07:00:01 CET,Sat Nov 27 08:59:02 CET,0.0 1.146 1.558 1.86 2.107 2.316 2.49 2.655 2.954 3.082 3.2 3.339 3.496 3.584 3.748 3.888 4.014 4.07 4.18 4.291 4.438 4.524 4.601 4.693 4.764 4.819 4.866 4.91 4.959 5.004 5.038 5.059 5.066 5.057 5.033 4.988 4.924 4.837 4.727 4.574 4.376 4.117 3.764 3.353 2.807 2.121 1.183 -0.072 -1.838 -4.409 -8.44 -12.849 -16.23 -19.013 -21.358 -23.4 -25.138 -26.645 -27.898 -29.137 -30.208 -31.152 -32.048 -32.893 -33.632 -34.296 -35.003 -35.628 -36.163 -36.734 -37.329 -37.801 -38.277 -38.778 -39.173 -39.587 -40.017 -40.456 -40.903 -41.224 -41.553 -42.042 -42.396 -42.764 -42.944 -43.317 -43.714 -44.134 -44.364 -44.711 -45.108 -45.388 -45.671 -46.276 -46.608 -46.954 -47.349 -47.827 -48.371 -49.069 -50.878 -10 ,26861 ,KEBNE ,16721044,Sat Nov 27 07:00:01 CET,Sat Nov 27 08:58:45 CET,0.0 1.386 1.806 2.11 2.346 2.562 2.76 2.93 3.208 3.331 3.446 3.574 3.724 3.8 3.938 4.067 4.197 4.252 4.343 4.424 4.529 4.6 4.669 4.749 4.809 4.855 4.9 4.941 4.997 5.034 5.055 5.065 5.054 5.043 5.015 4.955 4.881 4.784 4.66 4.494 4.283 4.019 3.652 3.228 2.675 1.979 1.044 -0.233 -2.028 -4.657 -8.777 -13.31 -16.831 -19.732 -22.141 -24.159 -25.843 -27.318 -28.603 -29.86 -30.904 -31.835 -32.727 -33.564 -34.318 -35.01 -35.73 -36.355 -36.881 -37.434 -38.011 -38.494 -38.992 -39.494 -39.897 -40.312 -40.732 -41.19 -41.704 -42.055 -42.387 -42.898 -43.261 -43.649 -43.848 -44.26 -44.69 -45.138 -45.377 -45.737 -46.138 -46.412 -46.696 -47.315 -47.65 -48.007 -48.412 -48.872 -49.384 -50.098 -52.188 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_44.txt deleted file mode 100644 index ee652c02..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21825 ,KEBNE ,16721045,Sat Nov 27 07:00:00 CET,Sat Nov 27 08:58:27 CET,0.0 1.459 1.972 2.355 2.698 3.012 3.274 3.505 3.934 4.125 4.298 4.525 4.752 4.903 5.208 5.488 5.731 5.845 6.064 6.263 6.544 6.723 6.889 7.131 7.366 7.583 7.789 7.981 8.214 8.426 8.628 8.881 9.123 9.354 9.611 9.872 10.119 10.405 10.703 11.002 11.304 11.618 11.963 12.289 12.668 13.068 13.466 13.849 14.214 14.505 14.592 14.222 13.698 13.131 12.537 11.984 11.506 11.032 10.583 10.131 9.734 9.364 8.985 8.635 8.314 8.016 7.706 7.416 7.155 6.874 6.583 6.344 6.09 5.817 5.596 5.362 5.114 4.85 4.581 4.386 4.178 3.86 3.626 3.368 3.238 2.971 2.681 2.365 2.199 1.939 1.601 1.378 1.155 0.643 0.349 0.024 -0.342 -0.751 -1.242 -1.877 -3.868 -2 ,22277 ,KEBNE ,16721046,Sat Nov 27 07:00:00 CET,Sat Nov 27 08:58:42 CET,0.0 1.293 1.831 2.223 2.534 2.779 3.008 3.222 3.6 3.773 3.942 4.177 4.4 4.534 4.789 5.026 5.238 5.346 5.561 5.758 6.036 6.209 6.371 6.594 6.809 7.012 7.203 7.386 7.622 7.845 8.065 8.336 8.585 8.81 9.05 9.307 9.546 9.801 10.09 10.403 10.721 11.056 11.402 11.724 12.077 12.446 12.84 13.228 13.563 13.779 13.74 13.315 12.776 12.183 11.603 11.07 10.581 10.105 9.652 9.199 8.824 8.481 8.124 7.762 7.425 7.121 6.79 6.487 6.223 5.936 5.615 5.334 5.035 4.714 4.449 4.181 3.924 3.656 3.363 3.151 2.926 2.578 2.332 2.069 1.936 1.658 1.352 1.009 0.829 0.56 0.234 0.016 -0.211 -0.748 -1.055 -1.371 -1.72 -2.129 -2.592 -3.218 -5.093 -3 ,22790 ,KEBNE ,16721047,Sat Nov 27 07:00:00 CET,Sat Nov 27 08:58:28 CET,0.0 1.449 1.951 2.355 2.667 2.938 3.176 3.376 3.74 3.914 4.085 4.315 4.542 4.677 4.946 5.202 5.439 5.545 5.734 5.921 6.21 6.393 6.567 6.803 7.008 7.199 7.386 7.565 7.788 7.993 8.194 8.432 8.662 8.884 9.13 9.391 9.644 9.929 10.218 10.511 10.815 11.133 11.487 11.844 12.235 12.617 13.018 13.469 13.915 14.249 14.338 14.064 13.622 13.058 12.451 11.854 11.334 10.854 10.419 9.982 9.581 9.226 8.891 8.563 8.246 7.931 7.578 7.248 6.959 6.672 6.374 6.11 5.843 5.553 5.312 5.063 4.802 4.526 4.229 4.022 3.801 3.448 3.206 2.964 2.84 2.575 2.281 1.967 1.797 1.533 1.243 1.052 0.856 0.36 0.061 -0.259 -0.599 -0.963 -1.397 -2.01 -4.097 -4 ,17608 ,KEBNE ,16721048,Sat Nov 27 07:00:00 CET,Sat Nov 27 08:59:21 CET,0.0 1.135 1.573 1.903 2.182 2.426 2.646 2.856 3.227 3.395 3.559 3.795 4.015 4.153 4.403 4.619 4.842 4.951 5.152 5.342 5.605 5.764 5.916 6.15 6.37 6.574 6.778 6.97 7.208 7.435 7.645 7.89 8.134 8.37 8.635 8.937 9.213 9.504 9.802 10.099 10.405 10.726 11.088 11.45 11.83 12.197 12.604 13.027 13.427 13.755 13.754 13.277 12.756 12.254 11.735 11.2 10.708 10.214 9.754 9.302 8.898 8.548 8.208 7.849 7.502 7.187 6.851 6.522 6.233 5.942 5.63 5.342 5.046 4.764 4.535 4.287 4.019 3.741 3.446 3.235 3.018 2.672 2.414 2.124 1.977 1.697 1.406 1.082 0.908 0.644 0.334 0.117 -0.102 -0.58 -0.876 -1.207 -1.549 -1.924 -2.367 -2.998 -4.954 -5 ,17876 ,KEBNE ,16721049,Sat Nov 27 07:00:00 CET,Sat Nov 27 08:58:24 CET,0.0 1.261 1.703 2.03 2.326 2.599 2.829 3.039 3.419 3.583 3.737 3.96 4.19 4.331 4.584 4.808 5.012 5.12 5.332 5.519 5.78 5.941 6.098 6.326 6.537 6.747 6.945 7.116 7.346 7.569 7.768 8.002 8.219 8.434 8.675 8.938 9.193 9.47 9.754 10.024 10.3 10.617 10.977 11.308 11.659 12.024 12.437 12.814 13.139 13.414 13.465 13.157 12.622 11.996 11.422 10.864 10.319 9.803 9.342 8.851 8.42 8.018 7.612 7.224 6.861 6.536 6.192 5.864 5.574 5.273 4.956 4.681 4.382 4.081 3.855 3.617 3.362 3.081 2.777 2.546 2.306 1.945 1.703 1.454 1.312 1.015 0.711 0.372 0.197 -0.06 -0.357 -0.564 -0.789 -1.298 -1.585 -1.889 -2.239 -2.663 -3.159 -3.803 -5.871 -6 ,30351 ,KEBNE ,16721050,Sat Nov 27 07:00:00 CET,Sat Nov 27 08:58:23 CET,0.0 1.267 1.827 2.24 2.6 2.911 3.178 3.412 3.827 4.017 4.197 4.438 4.684 4.832 5.096 5.341 5.577 5.692 5.906 6.098 6.377 6.554 6.721 6.951 7.166 7.374 7.57 7.751 7.982 8.19 8.391 8.659 8.902 9.132 9.391 9.65 9.891 10.149 10.418 10.696 10.974 11.29 11.651 11.998 12.388 12.798 13.239 13.67 14.073 14.423 14.576 14.421 14.078 13.651 13.228 12.783 12.361 11.953 11.564 11.136 10.74 10.386 10.05 9.73 9.435 9.158 8.871 8.614 8.371 8.091 7.781 7.52 7.242 6.962 6.745 6.514 6.268 6.011 5.732 5.533 5.327 4.985 4.73 4.469 4.343 4.079 3.782 3.463 3.299 3.054 2.744 2.542 2.326 1.836 1.552 1.221 0.86 0.45 -0.024 -0.632 -2.774 -7 ,10271 ,KEBNE ,16721051,Sat Nov 27 07:00:00 CET,Sat Nov 27 08:58:28 CET,0.0 1.272 1.743 2.102 2.395 2.645 2.89 3.114 3.502 3.68 3.846 4.07 4.295 4.431 4.683 4.919 5.144 5.254 5.465 5.659 5.923 6.083 6.233 6.466 6.688 6.889 7.093 7.285 7.523 7.757 7.986 8.25 8.493 8.72 8.98 9.26 9.513 9.794 10.078 10.347 10.628 10.945 11.312 11.671 12.063 12.446 12.875 13.319 13.708 13.962 13.989 13.707 13.267 12.723 12.117 11.553 11.04 10.572 10.166 9.717 9.3 8.921 8.547 8.182 7.855 7.553 7.211 6.892 6.618 6.324 6.008 5.735 5.456 5.176 4.943 4.686 4.42 4.151 3.86 3.648 3.427 3.087 2.847 2.59 2.456 2.174 1.878 1.557 1.385 1.124 0.813 0.604 0.378 -0.137 -0.418 -0.739 -1.092 -1.494 -1.986 -2.582 -5.367 -8 ,296 ,KEBNE ,16721052,Sat Nov 27 07:00:00 CET,Sat Nov 27 08:58:43 CET,0.0 1.317 1.831 2.213 2.524 2.791 3.033 3.247 3.634 3.82 3.987 4.209 4.432 4.564 4.832 5.074 5.293 5.402 5.606 5.791 6.049 6.217 6.38 6.598 6.81 7.03 7.246 7.44 7.659 7.892 8.128 8.378 8.617 8.849 9.103 9.363 9.608 9.889 10.162 10.45 10.762 11.076 11.405 11.74 12.124 12.524 12.904 13.24 13.592 13.874 13.894 13.494 12.945 12.391 11.831 11.274 10.765 10.292 9.844 9.35 8.926 8.534 8.156 7.794 7.431 7.095 6.741 6.422 6.141 5.851 5.553 5.288 5.002 4.696 4.446 4.186 3.917 3.628 3.315 3.098 2.876 2.524 2.273 2.012 1.873 1.561 1.242 0.923 0.749 0.477 0.156 -0.061 -0.291 -0.802 -1.086 -1.391 -1.732 -2.113 -2.551 -3.175 -5.109 -9 ,21953 ,KEBNE ,16721053,Sat Nov 27 07:00:00 CET,Sat Nov 27 08:58:47 CET,0.0 1.461 2.002 2.42 2.776 3.092 3.365 3.589 3.977 4.149 4.31 4.515 4.741 4.879 5.13 5.373 5.596 5.7 5.908 6.101 6.365 6.519 6.662 6.889 7.105 7.298 7.49 7.677 7.903 8.119 8.321 8.559 8.782 8.986 9.233 9.504 9.757 10.041 10.326 10.605 10.893 11.207 11.561 11.92 12.311 12.707 13.112 13.511 13.935 14.35 14.501 14.182 13.758 13.297 12.811 12.299 11.809 11.371 10.965 10.535 10.147 9.74 9.32 8.94 8.579 8.245 7.905 7.574 7.279 6.992 6.672 6.374 6.07 5.774 5.537 5.275 4.994 4.694 4.391 4.18 3.951 3.572 3.319 3.063 2.923 2.633 2.32 1.972 1.799 1.55 1.273 1.076 0.861 0.352 0.064 -0.239 -0.595 -0.993 -1.457 -2.108 -4.221 -10 ,7208 ,KEBNE ,16721054,Sat Nov 27 07:00:00 CET,Sat Nov 27 08:58:41 CET,0.0 1.789 2.302 2.67 2.988 3.289 3.55 3.771 4.144 4.312 4.472 4.683 4.894 5.028 5.285 5.516 5.738 5.851 6.073 6.278 6.559 6.733 6.899 7.148 7.386 7.607 7.818 8.013 8.259 8.489 8.708 8.971 9.212 9.432 9.675 9.95 10.216 10.483 10.747 11.016 11.285 11.579 11.93 12.282 12.662 13.059 13.529 14.006 14.433 14.783 14.882 14.548 14.055 13.535 13.035 12.532 12.034 11.556 11.124 10.691 10.303 9.915 9.517 9.156 8.812 8.475 8.125 7.803 7.512 7.211 6.902 6.647 6.372 6.08 5.844 5.587 5.317 5.018 4.716 4.518 4.306 3.979 3.747 3.486 3.346 3.035 2.688 2.33 2.151 1.883 1.588 1.383 1.15 0.635 0.342 0.018 -0.352 -0.765 -1.221 -1.822 -3.724 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_49.txt deleted file mode 100644 index 7aa5e491..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_47_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19872 ,KEBNE ,16721055,Sat Nov 27 07:00:01 CET,Sat Nov 27 08:59:33 CET,0.0 1.266 1.741 2.078 2.348 2.584 2.791 2.973 3.284 3.427 3.573 3.745 3.927 4.031 4.229 4.402 4.552 4.626 4.773 4.914 5.102 5.204 5.295 5.427 5.547 5.664 5.778 5.876 5.988 6.081 6.165 6.264 6.343 6.413 6.485 6.543 6.587 6.604 6.607 6.596 6.549 6.462 6.325 6.135 5.846 5.446 4.875 4.115 3.027 1.402 -1.208 -4.387 -6.928 -8.955 -10.647 -12.149 -13.471 -14.65 -15.666 -16.664 -17.514 -18.275 -18.983 -19.632 -20.237 -20.79 -21.355 -21.857 -22.302 -22.768 -23.26 -23.69 -24.142 -24.604 -24.958 -25.327 -25.709 -26.11 -26.52 -26.801 -27.09 -27.532 -27.853 -28.209 -28.395 -28.769 -29.172 -29.605 -29.833 -30.177 -30.56 -30.837 -31.128 -31.773 -32.129 -32.527 -32.952 -33.444 -34.079 -34.95 -37.879 -2 ,32490 ,KEBNE ,16721056,Sat Nov 27 07:01:01 CET,Sat Nov 27 08:59:53 CET,0.0 1.159 1.57 1.9 2.19 2.429 2.633 2.822 3.166 3.311 3.443 3.604 3.797 3.901 4.091 4.273 4.451 4.533 4.685 4.833 5.023 5.133 5.235 5.39 5.524 5.636 5.737 5.828 5.948 6.057 6.139 6.219 6.295 6.354 6.412 6.471 6.519 6.55 6.554 6.538 6.496 6.422 6.301 6.144 5.895 5.498 4.95 4.231 3.1 1.416 -1.247 -4.347 -6.777 -8.82 -10.56 -12.071 -13.365 -14.511 -15.457 -16.375 -17.193 -17.927 -18.628 -19.324 -19.977 -20.561 -21.169 -21.714 -22.19 -22.672 -23.158 -23.561 -23.982 -24.425 -24.776 -25.14 -25.522 -25.925 -26.345 -26.625 -26.911 -27.369 -27.695 -28.041 -28.228 -28.611 -29.008 -29.448 -29.668 -30.005 -30.379 -30.635 -30.907 -31.53 -31.872 -32.235 -32.64 -33.089 -33.62 -34.292 -36.781 -3 ,27056 ,KEBNE ,16721057,Sat Nov 27 07:01:01 CET,Sat Nov 27 08:59:45 CET,0.0 1.227 1.676 1.979 2.241 2.471 2.665 2.845 3.171 3.309 3.432 3.584 3.769 3.87 4.059 4.233 4.388 4.458 4.587 4.702 4.867 4.972 5.065 5.193 5.316 5.441 5.56 5.659 5.773 5.872 5.947 6.019 6.079 6.137 6.196 6.24 6.271 6.303 6.316 6.303 6.259 6.178 6.062 5.882 5.595 5.207 4.646 3.874 2.768 1.049 -1.745 -4.861 -7.322 -9.389 -11.131 -12.621 -13.886 -15.02 -15.96 -16.897 -17.699 -18.402 -19.064 -19.681 -20.262 -20.81 -21.398 -21.901 -22.338 -22.8 -23.276 -23.67 -24.086 -24.516 -24.854 -25.228 -25.619 -26.033 -26.468 -26.767 -27.076 -27.554 -27.887 -28.239 -28.425 -28.805 -29.187 -29.584 -29.804 -30.155 -30.537 -30.813 -31.099 -31.698 -32.024 -32.394 -32.801 -33.252 -33.779 -34.508 -37.225 -4 ,15325 ,KEBNE ,16721058,Sat Nov 27 07:01:01 CET,Sat Nov 27 09:00:43 CET,0.0 1.217 1.616 1.898 2.153 2.384 2.606 2.814 3.151 3.289 3.417 3.566 3.758 3.872 4.078 4.26 4.427 4.507 4.657 4.793 4.981 5.093 5.191 5.335 5.468 5.577 5.674 5.77 5.887 5.993 6.083 6.178 6.261 6.336 6.414 6.474 6.509 6.529 6.533 6.522 6.497 6.449 6.345 6.165 5.881 5.511 5.01 4.308 3.25 1.648 -1.046 -4.121 -6.508 -8.541 -10.287 -11.839 -13.167 -14.357 -15.369 -16.363 -17.21 -17.961 -18.704 -19.404 -20.034 -20.612 -21.222 -21.768 -22.241 -22.736 -23.242 -23.673 -24.115 -24.557 -24.91 -25.276 -25.65 -26.036 -26.443 -26.725 -27.019 -27.487 -27.826 -28.186 -28.368 -28.74 -29.121 -29.533 -29.751 -30.099 -30.5 -30.771 -31.043 -31.583 -31.887 -32.25 -32.68 -33.155 -33.707 -34.483 -36.671 -5 ,7776 ,KEBNE ,16721059,Sat Nov 27 07:01:01 CET,Sat Nov 27 08:59:47 CET,0.0 1.506 1.916 2.199 2.459 2.696 2.91 3.087 3.385 3.52 3.641 3.782 3.968 4.075 4.285 4.464 4.625 4.701 4.843 4.969 5.143 5.252 5.361 5.506 5.636 5.755 5.862 5.955 6.062 6.162 6.256 6.357 6.433 6.494 6.553 6.612 6.666 6.703 6.707 6.683 6.632 6.558 6.453 6.307 6.071 5.73 5.225 4.494 3.398 1.745 -0.98 -4.146 -6.627 -8.717 -10.506 -12.092 -13.454 -14.631 -15.602 -16.589 -17.473 -18.251 -18.995 -19.691 -20.29 -20.808 -21.355 -21.842 -22.264 -22.704 -23.166 -23.557 -23.968 -24.417 -24.769 -25.119 -25.492 -25.885 -26.289 -26.574 -26.874 -27.363 -27.7 -28.041 -28.223 -28.609 -29.008 -29.439 -29.669 -30.009 -30.374 -30.636 -30.911 -31.542 -31.897 -32.289 -32.728 -33.226 -33.808 -34.584 -36.6 -6 ,3231 ,KEBNE ,16721060,Sat Nov 27 07:01:01 CET,Sat Nov 27 08:59:58 CET,0.0 1.037 1.432 1.714 1.952 2.163 2.349 2.532 2.86 2.993 3.12 3.278 3.469 3.573 3.767 3.95 4.112 4.188 4.327 4.465 4.657 4.76 4.848 4.975 5.105 5.233 5.347 5.451 5.582 5.699 5.798 5.893 5.978 6.063 6.148 6.222 6.276 6.308 6.318 6.315 6.292 6.229 6.127 5.975 5.703 5.329 4.8 4.075 3.045 1.473 -1.185 -4.305 -6.726 -8.734 -10.47 -11.984 -13.268 -14.422 -15.431 -16.452 -17.329 -18.08 -18.773 -19.444 -20.097 -20.709 -21.362 -21.963 -22.472 -22.986 -23.528 -23.987 -24.452 -24.912 -25.278 -25.667 -26.074 -26.495 -26.917 -27.194 -27.467 -27.909 -28.242 -28.6 -28.779 -29.165 -29.603 -30.066 -30.321 -30.705 -31.143 -31.446 -31.763 -32.41 -32.751 -33.129 -33.562 -34.076 -34.704 -35.496 -38.644 -7 ,11451 ,KEBNE ,16721061,Sat Nov 27 07:01:01 CET,Sat Nov 27 09:01:04 CET,0.0 1.12 1.507 1.828 2.064 2.281 2.483 2.66 2.988 3.131 3.259 3.4 3.588 3.693 3.88 4.033 4.18 4.252 4.381 4.506 4.687 4.792 4.892 5.041 5.166 5.271 5.364 5.449 5.554 5.652 5.733 5.824 5.902 5.963 6.015 6.06 6.085 6.098 6.111 6.094 6.047 5.976 5.899 5.775 5.547 5.209 4.687 3.956 2.871 1.178 -1.575 -4.803 -7.482 -9.661 -11.445 -13.001 -14.353 -15.554 -16.588 -17.608 -18.451 -19.219 -19.967 -20.651 -21.286 -21.866 -22.469 -23.017 -23.487 -23.976 -24.501 -24.94 -25.388 -25.856 -26.223 -26.601 -27.004 -27.412 -27.82 -28.11 -28.411 -28.881 -29.226 -29.592 -29.779 -30.161 -30.558 -30.994 -31.23 -31.591 -31.97 -32.234 -32.522 -33.141 -33.499 -33.9 -34.337 -34.828 -35.406 -36.157 -38.424 -8 ,28047 ,KEBNE ,16721062,Sat Nov 27 07:01:01 CET,Sat Nov 27 09:01:05 CET,0.0 1.053 1.477 1.808 2.089 2.345 2.549 2.729 3.057 3.205 3.35 3.516 3.706 3.807 3.994 4.171 4.338 4.411 4.539 4.665 4.847 4.951 5.046 5.191 5.335 5.465 5.574 5.664 5.771 5.872 5.963 6.067 6.157 6.223 6.28 6.326 6.371 6.414 6.435 6.419 6.364 6.301 6.204 6.036 5.771 5.399 4.853 4.139 3.109 1.435 -1.345 -4.647 -7.245 -9.307 -11.076 -12.663 -14.001 -15.187 -16.202 -17.15 -17.939 -18.681 -19.43 -20.122 -20.75 -21.33 -21.943 -22.487 -22.962 -23.449 -23.957 -24.402 -24.855 -25.329 -25.716 -26.109 -26.499 -26.908 -27.332 -27.616 -27.915 -28.406 -28.761 -29.115 -29.292 -29.656 -30.04 -30.468 -30.699 -31.053 -31.45 -31.708 -31.985 -32.632 -32.993 -33.376 -33.807 -34.314 -34.942 -35.798 -38.641 -9 ,26132 ,KEBNE ,16721063,Sat Nov 27 07:01:01 CET,Sat Nov 27 09:01:18 CET,0.0 0.952 1.358 1.649 1.876 2.082 2.271 2.447 2.747 2.877 3.0 3.153 3.344 3.445 3.633 3.807 3.959 4.029 4.176 4.312 4.479 4.582 4.684 4.823 4.943 5.053 5.154 5.247 5.369 5.469 5.545 5.63 5.703 5.761 5.814 5.872 5.918 5.948 5.96 5.958 5.929 5.852 5.728 5.586 5.356 4.984 4.402 3.62 2.53 0.877 -1.874 -5.019 -7.543 -9.673 -11.453 -13.073 -14.47 -15.68 -16.68 -17.674 -18.529 -19.291 -20.014 -20.657 -21.272 -21.859 -22.473 -23.022 -23.507 -24.006 -24.516 -24.929 -25.353 -25.819 -26.189 -26.549 -26.923 -27.346 -27.789 -28.091 -28.42 -28.928 -29.253 -29.595 -29.786 -30.188 -30.599 -31.028 -31.258 -31.62 -32.012 -32.291 -32.587 -33.232 -33.59 -33.993 -34.437 -34.93 -35.54 -36.376 -39.379 -10 ,10003 ,KEBNE ,16721064,Sat Nov 27 07:01:01 CET,Sat Nov 27 09:00:23 CET,0.0 1.538 2.004 2.319 2.578 2.803 3.005 3.193 3.517 3.658 3.798 3.983 4.184 4.288 4.472 4.649 4.803 4.872 5.005 5.127 5.295 5.401 5.505 5.652 5.782 5.897 6.008 6.106 6.217 6.312 6.396 6.493 6.586 6.658 6.717 6.769 6.809 6.845 6.867 6.865 6.838 6.762 6.638 6.472 6.218 5.868 5.376 4.691 3.655 2.06 -0.623 -3.712 -6.192 -8.274 -10.014 -11.57 -12.954 -14.187 -15.206 -16.214 -17.102 -17.88 -18.608 -19.307 -19.963 -20.551 -21.156 -21.711 -22.203 -22.716 -23.244 -23.681 -24.14 -24.603 -24.949 -25.31 -25.701 -26.097 -26.492 -26.781 -27.093 -27.606 -27.966 -28.32 -28.498 -28.88 -29.296 -29.736 -29.958 -30.302 -30.699 -30.979 -31.284 -31.949 -32.302 -32.686 -33.142 -33.693 -34.33 -35.109 -37.907 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_20.txt deleted file mode 100644 index 7fbbf5e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_20.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24745 ,KEBNE ,16721065,Sat Nov 27 07:01:01 CET,Sat Nov 27 08:59:31 CET,0.0 2.304 3.045 3.541 3.931 4.265 4.549 4.801 5.251 5.458 5.649 5.904 6.154 6.305 6.581 6.833 7.072 7.187 7.41 7.622 7.913 8.106 8.295 8.563 8.808 9.034 9.248 9.453 9.723 9.97 10.202 10.484 10.744 10.99 11.28 11.581 11.863 12.177 12.493 12.818 13.173 13.56 13.98 14.386 14.824 15.283 15.755 16.224 16.715 17.079 17.142 16.739 16.13 15.444 14.842 14.316 13.776 13.23 12.739 12.22 11.756 11.342 10.93 10.517 10.119 9.739 9.331 8.958 8.626 8.286 7.936 7.633 7.314 6.974 6.705 6.424 6.13 5.818 5.487 5.253 5.019 4.635 4.339 4.031 3.876 3.558 3.21 2.827 2.63 2.335 2.003 1.771 1.524 0.995 0.681 0.327 -0.073 -0.54 -1.108 -1.847 -3.877 -2 ,9703 ,KEBNE ,16721066,Sat Nov 27 07:02:01 CET,Sat Nov 27 09:00:49 CET,0.0 2.185 2.874 3.391 3.855 4.235 4.54 4.811 5.287 5.5 5.712 6.022 6.28 6.443 6.755 7.038 7.294 7.416 7.655 7.885 8.201 8.392 8.572 8.835 9.09 9.33 9.559 9.775 10.047 10.305 10.564 10.885 11.181 11.454 11.756 12.1 12.435 12.774 13.12 13.482 13.825 14.175 14.577 14.974 15.393 15.834 16.313 16.772 17.154 17.406 17.361 16.774 16.063 15.362 14.705 14.069 13.473 12.912 12.389 11.867 11.413 10.967 10.511 10.068 9.658 9.275 8.867 8.498 8.167 7.821 7.451 7.144 6.835 6.49 6.213 5.946 5.666 5.361 5.035 4.796 4.547 4.169 3.893 3.596 3.441 3.103 2.724 2.301 2.077 1.744 1.32 1.055 0.781 0.175 -0.188 -0.582 -0.986 -1.471 -2.109 -2.887 -4.79 -5 ,17594 ,KEBNE ,16721069,Sat Nov 27 07:02:02 CET,Sat Nov 27 09:00:15 CET,0.0 3.079 3.795 4.315 4.72 5.045 5.337 5.619 6.118 6.332 6.542 6.838 7.107 7.285 7.617 7.914 8.181 8.307 8.555 8.78 9.075 9.264 9.455 9.725 9.969 10.198 10.414 10.619 10.874 11.124 11.363 11.635 11.894 12.132 12.398 12.707 13.007 13.316 13.624 13.949 14.265 14.576 14.925 15.286 15.685 16.061 16.421 16.747 17.036 17.238 17.146 16.563 15.855 15.13 14.448 13.753 13.081 12.454 11.881 11.293 10.801 10.356 9.915 9.495 9.097 8.726 8.326 7.957 7.637 7.298 6.938 6.628 6.312 5.987 5.724 5.442 5.137 4.817 4.479 4.251 4.02 3.637 3.35 3.047 2.899 2.596 2.255 1.88 1.685 1.379 0.997 0.736 0.475 -0.106 -0.448 -0.841 -1.253 -1.684 -2.2 -2.863 -4.677 -6 ,22439 ,KEBNE ,16721070,Sat Nov 27 07:02:02 CET,Sat Nov 27 09:01:26 CET,0.0 2.314 3.112 3.68 4.163 4.572 4.936 5.244 5.746 5.967 6.178 6.475 6.731 6.89 7.22 7.531 7.818 7.953 8.199 8.44 8.789 9.004 9.209 9.502 9.776 10.033 10.27 10.489 10.758 11.027 11.29 11.581 11.856 12.129 12.442 12.763 13.057 13.379 13.711 14.063 14.421 14.798 15.206 15.59 15.992 16.392 16.852 17.311 17.721 18.023 17.97 17.36 16.585 15.807 15.087 14.385 13.722 13.115 12.574 12.014 11.507 11.039 10.596 10.172 9.776 9.406 8.993 8.612 8.281 7.916 7.51 7.183 6.865 6.536 6.266 5.973 5.676 5.367 5.024 4.781 4.53 4.151 3.879 3.578 3.427 3.113 2.758 2.364 2.165 1.869 1.524 1.272 0.996 0.458 0.149 -0.218 -0.619 -1.084 -1.633 -2.351 -4.314 -7 ,14623 ,KEBNE ,16721071,Sat Nov 27 07:02:02 CET,Sat Nov 27 09:02:38 CET,0.0 1.859 2.554 3.058 3.466 3.805 4.121 4.403 4.881 5.097 5.299 5.584 5.842 6.007 6.324 6.609 6.875 6.999 7.233 7.451 7.771 7.987 8.189 8.47 8.731 8.97 9.191 9.405 9.694 9.978 10.248 10.562 10.842 11.097 11.384 11.712 12.018 12.321 12.652 13.033 13.429 13.833 14.275 14.705 15.17 15.645 16.145 16.647 17.076 17.364 17.38 16.924 16.299 15.578 14.875 14.229 13.637 13.105 12.615 12.075 11.608 11.192 10.791 10.412 10.044 9.691 9.306 8.953 8.634 8.297 7.931 7.612 7.283 6.942 6.682 6.403 6.093 5.781 5.447 5.206 4.96 4.563 4.282 3.982 3.828 3.52 3.172 2.769 2.56 2.258 1.86 1.593 1.314 0.699 0.352 -0.061 -0.527 -1.012 -1.624 -2.467 -4.927 -8 ,14932 ,KEBNE ,16721072,Sat Nov 27 07:02:02 CET,Sat Nov 27 09:01:52 CET,0.0 2.438 3.195 3.697 4.121 4.479 4.782 5.05 5.528 5.752 5.959 6.245 6.51 6.668 6.953 7.229 7.486 7.611 7.852 8.075 8.394 8.598 8.79 9.064 9.322 9.572 9.804 10.021 10.301 10.555 10.795 11.081 11.349 11.611 11.924 12.267 12.583 12.91 13.262 13.644 14.021 14.412 14.836 15.235 15.692 16.176 16.683 17.167 17.607 17.937 17.954 17.463 16.762 16.067 15.416 14.793 14.23 13.711 13.222 12.703 12.25 11.843 11.439 11.045 10.665 10.31 9.919 9.558 9.242 8.905 8.556 8.254 7.936 7.595 7.323 7.045 6.732 6.389 6.046 5.809 5.559 5.161 4.884 4.583 4.419 4.079 3.723 3.362 3.168 2.865 2.524 2.298 2.035 1.418 1.102 0.761 0.358 -0.088 -0.662 -1.481 -3.915 -9 ,12368 ,KEBNE ,16721073,Sat Nov 27 07:02:02 CET,Sat Nov 27 09:00:46 CET,0.0 2.4 3.105 3.613 4.024 4.375 4.671 4.939 5.442 5.669 5.874 6.146 6.414 6.579 6.878 7.164 7.435 7.563 7.805 8.046 8.39 8.601 8.797 9.068 9.329 9.57 9.795 10.027 10.317 10.586 10.843 11.149 11.442 11.706 12.019 12.362 12.674 13.026 13.381 13.727 14.062 14.415 14.84 15.258 15.734 16.254 16.782 17.271 17.7 17.97 17.93 17.383 16.707 16.12 15.53 14.948 14.392 13.844 13.355 12.838 12.381 11.972 11.583 11.189 10.796 10.439 10.038 9.681 9.372 9.039 8.688 8.365 8.023 7.69 7.431 7.141 6.823 6.495 6.158 5.929 5.686 5.28 4.989 4.67 4.498 4.144 3.778 3.392 3.195 2.904 2.573 2.348 2.103 1.543 1.229 0.883 0.474 -0.024 -0.644 -1.5 -4.0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_49.txt deleted file mode 100644 index 3415d4bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_48_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14192 ,KEBNE ,16721075,Sat Nov 27 07:02:02 CET,Sat Nov 27 09:01:38 CET,0.0 1.181 1.646 1.983 2.258 2.495 2.708 2.914 3.28 3.44 3.589 3.757 3.966 4.078 4.294 4.494 4.67 4.746 4.885 5.02 5.221 5.348 5.465 5.632 5.789 5.93 6.061 6.181 6.313 6.438 6.557 6.688 6.811 6.919 7.026 7.149 7.25 7.341 7.429 7.501 7.559 7.59 7.591 7.561 7.477 7.297 6.993 6.579 5.923 4.845 2.952 0.539 -1.48 -3.206 -4.692 -5.978 -7.094 -8.126 -9.024 -9.923 -10.686 -11.341 -11.983 -12.615 -13.198 -13.73 -14.288 -14.812 -15.266 -15.724 -16.214 -16.637 -17.064 -17.496 -17.839 -18.188 -18.544 -18.91 -19.294 -19.574 -19.872 -20.341 -20.669 -21.011 -21.194 -21.583 -21.999 -22.44 -22.676 -23.034 -23.413 -23.676 -23.956 -24.564 -24.892 -25.27 -25.707 -26.206 -26.84 -27.684 -29.591 -2 ,23082 ,KEBNE ,16721076,Sat Nov 27 07:02:02 CET,Sat Nov 27 09:00:22 CET,0.0 1.124 1.584 1.907 2.181 2.43 2.662 2.864 3.204 3.35 3.48 3.633 3.838 3.953 4.157 4.342 4.513 4.595 4.754 4.896 5.094 5.22 5.336 5.504 5.655 5.786 5.915 6.037 6.191 6.328 6.45 6.604 6.738 6.848 6.963 7.072 7.174 7.283 7.377 7.452 7.528 7.579 7.588 7.565 7.48 7.321 7.04 6.604 5.949 4.912 3.097 0.826 -1.094 -2.74 -4.161 -5.446 -6.602 -7.652 -8.535 -9.414 -10.174 -10.856 -11.501 -12.105 -12.685 -13.224 -13.785 -14.29 -14.726 -15.179 -15.661 -16.057 -16.458 -16.882 -17.214 -17.554 -17.902 -18.285 -18.7 -18.991 -19.295 -19.763 -20.09 -20.439 -20.629 -21.022 -21.44 -21.907 -22.147 -22.506 -22.911 -23.191 -23.486 -24.126 -24.481 -24.879 -25.319 -25.812 -26.41 -27.225 -29.491 -3 ,13889 ,KEBNE ,16721077,Sat Nov 27 07:02:02 CET,Sat Nov 27 09:00:53 CET,0.0 1.105 1.548 1.899 2.165 2.384 2.592 2.783 3.133 3.29 3.43 3.588 3.8 3.913 4.122 4.32 4.492 4.569 4.715 4.855 5.056 5.18 5.298 5.461 5.602 5.733 5.863 5.977 6.108 6.238 6.351 6.47 6.588 6.7 6.821 6.942 7.04 7.135 7.208 7.259 7.297 7.313 7.286 7.217 7.118 6.938 6.625 6.141 5.381 4.188 2.1 -0.435 -2.514 -4.263 -5.758 -7.102 -8.286 -9.356 -10.29 -11.224 -12.033 -12.769 -13.458 -14.087 -14.663 -15.183 -15.728 -16.22 -16.67 -17.12 -17.567 -17.956 -18.38 -18.84 -19.187 -19.553 -19.927 -20.311 -20.729 -21.012 -21.302 -21.767 -22.098 -22.456 -22.642 -23.022 -23.413 -23.818 -24.044 -24.406 -24.815 -25.079 -25.345 -25.955 -26.304 -26.68 -27.083 -27.537 -28.122 -28.908 -31.484 -4 ,18526 ,KEBNE ,16721078,Sat Nov 27 07:02:02 CET,Sat Nov 27 09:00:21 CET,0.0 1.247 1.699 2.026 2.284 2.509 2.73 2.941 3.304 3.466 3.609 3.772 3.983 4.095 4.289 4.465 4.637 4.718 4.873 5.023 5.216 5.327 5.436 5.599 5.738 5.867 5.99 6.093 6.222 6.351 6.463 6.581 6.692 6.798 6.917 7.044 7.16 7.266 7.355 7.427 7.475 7.498 7.479 7.438 7.374 7.224 6.939 6.481 5.759 4.599 2.532 -0.008 -2.04 -3.716 -5.18 -6.527 -7.704 -8.746 -9.652 -10.573 -11.335 -12.003 -12.655 -13.269 -13.858 -14.418 -14.998 -15.508 -15.948 -16.401 -16.88 -17.289 -17.708 -18.137 -18.473 -18.827 -19.201 -19.606 -20.03 -20.333 -20.651 -21.141 -21.501 -21.872 -22.061 -22.454 -22.876 -23.33 -23.556 -23.896 -24.294 -24.598 -24.935 -25.672 -26.078 -26.485 -26.898 -27.353 -27.938 -28.752 -30.932 -5 ,6578 ,KEBNE ,16721079,Sat Nov 27 07:02:02 CET,Sat Nov 27 09:00:01 CET,0.0 1.246 1.702 2.025 2.304 2.565 2.813 3.024 3.37 3.519 3.653 3.809 4.013 4.124 4.335 4.525 4.693 4.771 4.929 5.071 5.26 5.382 5.497 5.664 5.814 5.949 6.077 6.197 6.354 6.498 6.623 6.759 6.88 6.992 7.108 7.229 7.34 7.45 7.553 7.635 7.702 7.756 7.768 7.729 7.645 7.496 7.244 6.831 6.156 5.058 3.123 0.712 -1.282 -2.962 -4.422 -5.737 -6.885 -7.922 -8.805 -9.68 -10.438 -11.116 -11.769 -12.389 -12.94 -13.436 -13.972 -14.463 -14.889 -15.34 -15.799 -16.178 -16.582 -17.004 -17.334 -17.689 -18.062 -18.453 -18.869 -19.159 -19.456 -19.909 -20.228 -20.578 -20.765 -21.147 -21.546 -21.983 -22.216 -22.567 -22.942 -23.209 -23.483 -24.057 -24.38 -24.755 -25.159 -25.62 -26.21 -26.936 -29.581 -6 ,26515 ,KEBNE ,16721080,Sat Nov 27 07:03:02 CET,Sat Nov 27 09:02:14 CET,0.0 1.297 1.762 2.097 2.374 2.614 2.829 3.013 3.333 3.486 3.627 3.78 3.987 4.105 4.335 4.541 4.717 4.792 4.944 5.106 5.324 5.445 5.558 5.72 5.856 5.975 6.09 6.202 6.338 6.46 6.572 6.696 6.809 6.916 7.047 7.179 7.277 7.357 7.432 7.503 7.555 7.592 7.59 7.539 7.42 7.218 6.909 6.434 5.715 4.547 2.422 -0.115 -2.196 -3.939 -5.421 -6.752 -7.953 -9.04 -9.936 -10.807 -11.583 -12.309 -12.97 -13.573 -14.135 -14.648 -15.167 -15.63 -16.042 -16.477 -16.94 -17.327 -17.727 -18.139 -18.472 -18.825 -19.184 -19.553 -19.94 -20.207 -20.485 -20.932 -21.254 -21.601 -21.781 -22.149 -22.545 -22.974 -23.2 -23.555 -23.953 -24.224 -24.523 -25.191 -25.547 -25.933 -26.367 -26.872 -27.479 -28.318 -30.601 -7 ,9461 ,KEBNE ,16721081,Sat Nov 27 07:03:03 CET,Sat Nov 27 09:03:32 CET,0.0 1.293 1.794 2.184 2.465 2.706 2.933 3.144 3.513 3.664 3.795 3.952 4.16 4.274 4.482 4.658 4.822 4.899 5.046 5.188 5.386 5.509 5.626 5.781 5.918 6.048 6.174 6.297 6.441 6.568 6.688 6.825 6.941 7.049 7.161 7.258 7.343 7.427 7.504 7.568 7.625 7.678 7.703 7.664 7.59 7.463 7.221 6.855 6.219 5.129 3.216 0.885 -1.094 -2.841 -4.333 -5.631 -6.746 -7.744 -8.611 -9.462 -10.18 -10.809 -11.42 -12.031 -12.617 -13.135 -13.668 -14.17 -14.611 -15.052 -15.504 -15.894 -16.306 -16.723 -17.044 -17.379 -17.737 -18.122 -18.507 -18.775 -19.061 -19.514 -19.83 -20.164 -20.339 -20.693 -21.093 -21.539 -21.768 -22.12 -22.497 -22.751 -23.024 -23.655 -24.009 -24.383 -24.801 -25.292 -25.865 -26.648 -29.193 -8 ,15212 ,KEBNE ,16721082,Sat Nov 27 07:03:03 CET,Sat Nov 27 09:03:18 CET,0.0 1.076 1.489 1.805 2.073 2.298 2.498 2.686 3.031 3.191 3.341 3.521 3.726 3.836 4.046 4.239 4.405 4.481 4.633 4.783 4.987 5.11 5.225 5.385 5.52 5.643 5.765 5.886 6.032 6.158 6.282 6.426 6.542 6.637 6.74 6.853 6.964 7.076 7.174 7.264 7.331 7.375 7.394 7.359 7.261 7.077 6.777 6.336 5.614 4.409 2.396 -0.124 -2.225 -4.008 -5.569 -6.924 -8.092 -9.116 -9.983 -10.864 -11.628 -12.319 -12.972 -13.573 -14.149 -14.688 -15.251 -15.759 -16.195 -16.636 -17.091 -17.475 -17.865 -18.271 -18.607 -18.964 -19.325 -19.694 -20.083 -20.355 -20.642 -21.104 -21.435 -21.782 -21.967 -22.367 -22.78 -23.208 -23.431 -23.774 -24.15 -24.423 -24.719 -25.366 -25.729 -26.107 -26.5 -26.97 -27.537 -28.271 -30.412 -9 ,26478 ,KEBNE ,16721083,Sat Nov 27 07:03:03 CET,Sat Nov 27 09:04:38 CET,0.0 0.816 1.181 1.5 1.761 1.966 2.16 2.343 2.65 2.791 2.928 3.114 3.334 3.443 3.649 3.838 4.015 4.103 4.273 4.423 4.62 4.735 4.842 4.997 5.145 5.278 5.405 5.525 5.664 5.792 5.908 6.042 6.167 6.279 6.387 6.504 6.62 6.732 6.847 6.955 7.037 7.108 7.16 7.146 7.078 6.951 6.714 6.297 5.631 4.617 2.852 0.605 -1.215 -2.766 -4.129 -5.305 -6.326 -7.284 -8.134 -8.965 -9.677 -10.304 -10.891 -11.448 -11.976 -12.455 -12.945 -13.391 -13.772 -14.168 -14.6 -14.966 -15.347 -15.764 -16.108 -16.464 -16.82 -17.182 -17.564 -17.829 -18.096 -18.514 -18.821 -19.158 -19.334 -19.705 -20.106 -20.529 -20.752 -21.089 -21.439 -21.687 -21.958 -22.584 -22.927 -23.288 -23.679 -24.16 -24.758 -25.536 -27.509 -10 ,4505 ,KEBNE ,16721084,Sat Nov 27 07:03:03 CET,Sat Nov 27 09:02:18 CET,0.0 1.088 1.522 1.86 2.129 2.355 2.562 2.758 3.091 3.232 3.37 3.539 3.747 3.857 4.059 4.263 4.459 4.549 4.712 4.854 5.058 5.188 5.304 5.468 5.617 5.747 5.859 5.974 6.125 6.25 6.362 6.492 6.612 6.713 6.824 6.951 7.056 7.166 7.269 7.346 7.416 7.479 7.497 7.457 7.357 7.168 6.855 6.411 5.755 4.739 2.97 0.665 -1.337 -3.044 -4.51 -5.869 -7.079 -8.125 -9.025 -9.916 -10.678 -11.365 -12.018 -12.637 -13.236 -13.807 -14.386 -14.87 -15.291 -15.755 -16.246 -16.655 -17.073 -17.498 -17.834 -18.187 -18.555 -18.938 -19.351 -19.645 -19.936 -20.398 -20.729 -21.069 -21.253 -21.649 -22.063 -22.489 -22.709 -23.061 -23.473 -23.748 -24.047 -24.697 -25.043 -25.415 -25.851 -26.368 -26.958 -27.731 -29.87 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_39.txt deleted file mode 100644 index ca500f26..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25 ,KEBNE ,16721085,Sat Nov 27 07:03:03 CET,Sat Nov 27 09:01:51 CET,0.0 1.19 1.68 2.108 2.488 2.812 3.099 3.342 3.74 3.941 4.132 4.348 4.633 4.8 5.089 5.337 5.573 5.685 5.893 6.093 6.374 6.554 6.735 6.985 7.204 7.407 7.611 7.803 8.044 8.278 8.493 8.75 9.009 9.251 9.511 9.795 10.068 10.373 10.694 11.018 11.345 11.707 12.095 12.442 12.818 13.209 13.647 14.129 14.597 15.022 15.333 15.132 14.736 14.347 13.944 13.564 13.202 12.824 12.488 12.161 11.855 11.54 11.243 10.97 10.71 10.459 10.184 9.931 9.708 9.472 9.213 8.997 8.778 8.549 8.361 8.165 7.956 7.718 7.464 7.292 7.11 6.816 6.609 6.395 6.279 6.04 5.798 5.531 5.388 5.121 4.922 4.755 4.578 4.196 3.981 3.729 3.452 3.14 2.76 2.263 0.976 -2 ,13973 ,KEBNE ,16721086,Sat Nov 27 07:04:03 CET,Sat Nov 27 09:02:56 CET,0.0 1.812 2.347 2.767 3.114 3.406 3.664 3.899 4.32 4.512 4.687 4.896 5.16 5.306 5.569 5.803 6.032 6.138 6.341 6.546 6.839 7.015 7.188 7.429 7.662 7.878 8.079 8.277 8.529 8.773 9.007 9.27 9.509 9.734 9.996 10.291 10.557 10.834 11.124 11.427 11.738 12.117 12.545 12.9 13.317 13.769 14.251 14.753 15.276 15.789 16.138 16.124 15.909 15.52 15.112 14.758 14.405 14.07 13.758 13.406 13.084 12.784 12.494 12.196 11.907 11.655 11.389 11.147 10.931 10.7 10.466 10.271 10.049 9.806 9.617 9.426 9.229 9.009 8.766 8.6 8.426 8.127 7.92 7.721 7.612 7.374 7.129 6.875 6.744 6.488 6.306 6.142 5.968 5.58 5.351 5.112 4.85 4.553 4.179 3.641 2.312 -3 ,5455 ,KEBNE ,16721087,Sat Nov 27 07:04:04 CET,Sat Nov 27 09:03:28 CET,0.0 1.709 2.303 2.714 3.064 3.378 3.658 3.899 4.335 4.536 4.724 4.95 5.213 5.354 5.622 5.867 6.112 6.231 6.449 6.654 6.938 7.12 7.297 7.55 7.793 8.014 8.218 8.41 8.659 8.892 9.11 9.378 9.635 9.871 10.126 10.397 10.651 10.938 11.246 11.558 11.864 12.189 12.561 12.932 13.361 13.812 14.292 14.78 15.256 15.702 16.019 15.861 15.575 15.28 14.909 14.474 13.994 13.523 13.101 12.659 12.293 11.955 11.613 11.279 10.971 10.7 10.42 10.167 9.941 9.697 9.436 9.225 9.013 8.782 8.595 8.392 8.167 7.942 7.711 7.541 7.362 7.08 6.887 6.687 6.577 6.347 6.106 5.857 5.723 5.452 5.243 5.083 4.912 4.507 4.261 3.985 3.702 3.384 3.015 2.542 1.264 -4 ,24118 ,KEBNE ,16721088,Sat Nov 27 07:04:03 CET,Sat Nov 27 09:01:08 CET,0.0 1.264 1.803 2.199 2.539 2.851 3.131 3.366 3.779 3.973 4.166 4.396 4.655 4.786 5.048 5.305 5.535 5.646 5.865 6.071 6.368 6.549 6.716 6.956 7.179 7.396 7.613 7.815 8.056 8.287 8.508 8.756 8.982 9.21 9.473 9.751 10.025 10.317 10.613 10.92 11.237 11.586 11.973 12.344 12.752 13.184 13.636 14.101 14.533 14.874 15.048 14.904 14.636 14.296 13.909 13.503 13.072 12.635 12.274 11.939 11.629 11.33 11.025 10.714 10.407 10.121 9.839 9.594 9.369 9.118 8.851 8.625 8.39 8.141 7.94 7.734 7.531 7.329 7.094 6.92 6.744 6.462 6.269 6.068 5.958 5.726 5.48 5.209 5.07 4.811 4.617 4.453 4.274 3.893 3.675 3.435 3.173 2.867 2.48 1.953 0.505 -5 ,4467 ,KEBNE ,16721089,Sat Nov 27 07:04:03 CET,Sat Nov 27 09:01:38 CET,0.0 1.486 1.993 2.39 2.725 3.017 3.258 3.485 3.933 4.132 4.31 4.521 4.785 4.932 5.213 5.469 5.709 5.824 6.042 6.248 6.536 6.718 6.893 7.139 7.373 7.586 7.787 7.988 8.239 8.471 8.695 8.964 9.223 9.462 9.725 10.018 10.289 10.569 10.865 11.169 11.478 11.832 12.238 12.617 13.016 13.445 13.917 14.405 14.915 15.355 15.67 15.516 15.055 14.58 14.114 13.668 13.254 12.878 12.54 12.182 11.856 11.545 11.224 10.905 10.615 10.353 10.073 9.815 9.591 9.359 9.103 8.882 8.652 8.399 8.19 7.975 7.772 7.567 7.339 7.17 6.991 6.717 6.52 6.306 6.199 5.97 5.722 5.462 5.321 5.054 4.842 4.665 4.484 4.076 3.843 3.594 3.324 3.009 2.651 2.172 0.609 -6 ,857 ,KEBNE ,16721090,Sat Nov 27 07:04:03 CET,Sat Nov 27 09:02:26 CET,0.0 1.113 1.62 2.01 2.346 2.644 2.906 3.144 3.535 3.723 3.911 4.116 4.379 4.525 4.794 5.044 5.284 5.401 5.609 5.801 6.089 6.273 6.444 6.686 6.911 7.128 7.336 7.538 7.796 8.035 8.27 8.545 8.798 9.042 9.314 9.597 9.856 10.138 10.454 10.776 11.082 11.403 11.765 12.134 12.55 12.993 13.498 14.0 14.473 14.889 15.098 14.965 14.625 14.225 13.803 13.339 12.886 12.476 12.111 11.72 11.365 11.024 10.698 10.408 10.13 9.87 9.61 9.359 9.126 8.878 8.609 8.377 8.127 7.871 7.659 7.43 7.196 6.937 6.662 6.472 6.276 5.977 5.761 5.535 5.417 5.163 4.896 4.599 4.443 4.155 3.915 3.734 3.543 3.122 2.887 2.619 2.315 1.977 1.554 0.989 -0.607 -7 ,18723 ,KEBNE ,16721091,Sat Nov 27 07:04:04 CET,Sat Nov 27 09:02:59 CET,0.0 1.699 2.291 2.72 3.081 3.409 3.674 3.924 4.381 4.588 4.781 5.01 5.29 5.446 5.738 6.01 6.266 6.385 6.608 6.818 7.116 7.308 7.49 7.751 8.0 8.23 8.447 8.644 8.892 9.134 9.353 9.614 9.863 10.096 10.367 10.652 10.907 11.182 11.496 11.841 12.189 12.541 12.931 13.334 13.774 14.212 14.696 15.197 15.655 16.048 16.324 16.304 16.036 15.667 15.273 14.862 14.464 14.066 13.727 13.395 13.078 12.789 12.512 12.239 11.97 11.713 11.442 11.204 11.001 10.777 10.536 10.328 10.101 9.861 9.68 9.498 9.293 9.065 8.836 8.678 8.51 8.249 8.063 7.861 7.756 7.536 7.296 7.04 6.896 6.623 6.424 6.251 6.063 5.64 5.418 5.178 4.9 4.583 4.192 3.7 2.071 -8 ,9933 ,KEBNE ,16721092,Sat Nov 27 07:04:03 CET,Sat Nov 27 09:01:23 CET,0.0 1.378 1.912 2.297 2.62 2.899 3.157 3.386 3.782 3.963 4.136 4.353 4.62 4.764 5.037 5.281 5.5 5.603 5.81 6.01 6.299 6.478 6.649 6.894 7.119 7.328 7.526 7.713 7.95 8.174 8.384 8.629 8.858 9.08 9.33 9.61 9.902 10.225 10.552 10.876 11.188 11.548 11.961 12.351 12.787 13.225 13.708 14.181 14.66 15.114 15.352 15.141 14.74 14.341 13.963 13.576 13.154 12.741 12.399 12.062 11.761 11.472 11.175 10.889 10.611 10.341 10.061 9.806 9.569 9.316 9.038 8.805 8.574 8.327 8.13 7.925 7.714 7.495 7.248 7.079 6.904 6.614 6.41 6.2 6.089 5.847 5.593 5.327 5.185 4.919 4.729 4.561 4.386 3.993 3.769 3.513 3.228 2.904 2.538 2.054 0.648 -9 ,3169 ,KEBNE ,16721093,Sat Nov 27 07:04:03 CET,Sat Nov 27 09:02:54 CET,0.0 1.509 2.001 2.383 2.718 2.992 3.248 3.498 3.941 4.128 4.301 4.501 4.762 4.91 5.19 5.441 5.669 5.78 5.992 6.194 6.466 6.633 6.8 7.048 7.277 7.495 7.697 7.885 8.136 8.376 8.597 8.859 9.102 9.329 9.594 9.895 10.183 10.495 10.808 11.121 11.443 11.788 12.183 12.568 12.992 13.458 13.962 14.453 14.922 15.341 15.643 15.518 15.186 14.768 14.281 13.794 13.339 12.908 12.523 12.136 11.816 11.539 11.256 10.973 10.696 10.419 10.133 9.88 9.645 9.397 9.136 8.914 8.68 8.414 8.193 7.965 7.728 7.492 7.249 7.075 6.896 6.619 6.417 6.2 6.087 5.853 5.61 5.356 5.217 4.949 4.756 4.59 4.411 4.001 3.76 3.499 3.198 2.853 2.465 1.932 0.344 -10 ,7812 ,KEBNE ,16721094,Sat Nov 27 07:04:04 CET,Sat Nov 27 09:01:09 CET,0.0 1.3 1.799 2.221 2.568 2.863 3.12 3.355 3.781 3.975 4.159 4.378 4.648 4.802 5.087 5.338 5.569 5.679 5.9 6.11 6.389 6.561 6.725 6.963 7.189 7.416 7.628 7.826 8.075 8.303 8.519 8.778 9.026 9.257 9.506 9.781 10.053 10.344 10.635 10.942 11.248 11.57 11.955 12.34 12.767 13.189 13.662 14.182 14.694 15.148 15.407 15.321 15.022 14.657 14.259 13.842 13.446 13.063 12.696 12.298 11.926 11.587 11.277 10.982 10.702 10.443 10.168 9.928 9.712 9.472 9.211 8.982 8.757 8.513 8.313 8.115 7.907 7.677 7.44 7.277 7.106 6.838 6.642 6.419 6.308 6.093 5.853 5.586 5.449 5.191 4.993 4.812 4.624 4.226 4.005 3.759 3.467 3.141 2.777 2.301 1.019 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_44.txt deleted file mode 100644 index 7dc587c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_49_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9335 ,KEBNE ,16721095,Sat Nov 27 07:04:04 CET,Sat Nov 27 09:01:09 CET,0.0 1.423 1.951 2.35 2.701 3.009 3.304 3.579 4.061 4.28 4.49 4.771 5.074 5.248 5.588 5.918 6.215 6.355 6.632 6.901 7.298 7.544 7.772 8.104 8.43 8.741 9.033 9.322 9.696 10.061 10.416 10.829 11.227 11.622 12.091 12.616 13.12 13.667 14.255 14.893 15.568 16.313 17.187 18.097 19.189 20.413 21.843 23.462 25.383 27.699 30.618 33.155 34.738 35.868 36.647 37.192 37.56 37.832 38.032 38.174 38.247 38.271 38.274 38.257 38.232 38.194 38.134 38.079 38.018 37.937 37.834 37.742 37.646 37.532 37.429 37.315 37.204 37.067 36.909 36.811 36.704 36.524 36.387 36.246 36.17 35.998 35.827 35.635 35.531 35.344 35.187 35.059 34.919 34.586 34.395 34.185 33.943 33.663 33.328 32.882 31.763 -2 ,31165 ,KEBNE ,16721096,Sat Nov 27 07:04:03 CET,Sat Nov 27 09:02:06 CET,0.0 1.492 2.053 2.466 2.833 3.167 3.466 3.743 4.261 4.493 4.703 4.981 5.283 5.464 5.793 6.101 6.401 6.546 6.83 7.1 7.492 7.728 7.952 8.293 8.615 8.927 9.232 9.52 9.89 10.261 10.615 11.04 11.448 11.834 12.286 12.795 13.288 13.82 14.411 15.06 15.731 16.488 17.393 18.309 19.399 20.65 22.101 23.793 25.845 28.272 31.293 33.956 35.593 36.617 37.338 37.875 38.231 38.494 38.678 38.804 38.878 38.913 38.919 38.892 38.845 38.813 38.758 38.688 38.617 38.529 38.438 38.352 38.238 38.116 38.027 37.924 37.81 37.687 37.545 37.443 37.331 37.148 37.015 36.862 36.781 36.607 36.41 36.192 36.082 35.885 35.69 35.538 35.385 35.068 34.884 34.667 34.424 34.13 33.794 33.382 32.134 -3 ,23604 ,KEBNE ,16721097,Sat Nov 27 07:05:04 CET,Sat Nov 27 09:02:48 CET,0.0 1.361 1.915 2.357 2.735 3.083 3.398 3.688 4.203 4.438 4.657 4.931 5.223 5.398 5.752 6.085 6.393 6.547 6.838 7.105 7.497 7.748 7.982 8.333 8.667 8.981 9.289 9.578 9.949 10.324 10.684 11.099 11.503 11.9 12.361 12.871 13.374 13.934 14.536 15.181 15.882 16.685 17.596 18.525 19.654 20.929 22.41 24.129 26.214 28.779 32.073 34.955 36.724 37.9 38.689 39.243 39.609 39.868 40.057 40.184 40.246 40.28 40.306 40.305 40.271 40.234 40.191 40.133 40.07 39.997 39.913 39.844 39.764 39.66 39.569 39.467 39.365 39.254 39.114 39.012 38.912 38.751 38.618 38.477 38.4 38.227 38.054 37.862 37.75 37.553 37.398 37.262 37.115 36.781 36.591 36.376 36.127 35.843 35.521 35.1 33.627 -4 ,29702 ,KEBNE ,16721098,Sat Nov 27 07:05:04 CET,Sat Nov 27 09:02:35 CET,0.0 1.464 2.03 2.458 2.849 3.19 3.5 3.792 4.314 4.554 4.773 5.066 5.378 5.564 5.913 6.244 6.555 6.706 7.007 7.282 7.663 7.912 8.153 8.493 8.821 9.139 9.457 9.761 10.139 10.503 10.858 11.293 11.704 12.098 12.567 13.107 13.618 14.168 14.764 15.401 16.076 16.852 17.766 18.688 19.808 21.061 22.529 24.271 26.388 29.01 32.294 35.098 36.812 37.923 38.664 39.197 39.571 39.837 40.007 40.119 40.183 40.204 40.205 40.204 40.189 40.152 40.086 40.025 39.972 39.899 39.805 39.72 39.623 39.513 39.427 39.331 39.216 39.096 38.954 38.843 38.726 38.545 38.425 38.296 38.226 38.073 37.896 37.701 37.593 37.401 37.231 37.099 36.962 36.64 36.453 36.25 36.017 35.715 35.358 34.918 33.732 -5 ,6008 ,KEBNE ,16721099,Sat Nov 27 07:05:05 CET,Sat Nov 27 09:02:36 CET,0.0 1.187 1.745 2.181 2.542 2.866 3.151 3.405 3.873 4.105 4.315 4.582 4.874 5.047 5.382 5.694 5.991 6.137 6.427 6.711 7.111 7.353 7.582 7.926 8.271 8.604 8.909 9.205 9.593 9.97 10.331 10.769 11.186 11.575 12.022 12.542 13.05 13.588 14.167 14.804 15.463 16.194 17.065 17.945 19.0 20.22 21.665 23.347 25.371 27.796 30.905 33.632 35.284 36.386 37.131 37.679 38.074 38.337 38.5 38.617 38.684 38.727 38.743 38.731 38.699 38.655 38.597 38.53 38.46 38.388 38.305 38.219 38.123 38.022 37.938 37.843 37.739 37.617 37.488 37.401 37.304 37.137 37.011 36.874 36.796 36.629 36.449 36.255 36.144 35.937 35.775 35.648 35.514 35.184 34.982 34.757 34.519 34.265 33.932 33.471 32.322 -6 ,4333 ,KEBNE ,16721100,Sat Nov 27 07:05:04 CET,Sat Nov 27 09:02:09 CET,0.0 1.433 1.942 2.351 2.702 3.016 3.31 3.587 4.085 4.307 4.525 4.822 5.121 5.296 5.64 5.977 6.314 6.473 6.76 7.056 7.496 7.752 7.992 8.334 8.664 8.995 9.322 9.643 10.055 10.438 10.787 11.202 11.605 11.99 12.445 12.978 13.496 14.061 14.665 15.311 16.007 16.782 17.71 18.692 19.836 21.148 22.723 24.543 26.685 29.209 32.287 35.026 36.759 37.886 38.639 39.158 39.525 39.784 39.952 40.08 40.16 40.215 40.248 40.249 40.223 40.19 40.131 40.035 39.946 39.873 39.793 39.704 39.598 39.492 39.393 39.287 39.178 39.056 38.929 38.833 38.721 38.549 38.433 38.302 38.231 38.078 37.902 37.704 37.602 37.415 37.264 37.127 36.977 36.65 36.454 36.229 35.991 35.719 35.385 34.978 33.887 -7 ,23804 ,KEBNE ,16721101,Sat Nov 27 07:05:04 CET,Sat Nov 27 09:02:09 CET,0.0 1.668 2.238 2.692 3.069 3.412 3.729 3.996 4.482 4.71 4.924 5.213 5.509 5.681 6.021 6.364 6.689 6.84 7.127 7.407 7.817 8.068 8.31 8.655 8.982 9.307 9.616 9.914 10.311 10.685 11.038 11.476 11.897 12.311 12.787 13.3 13.789 14.329 14.925 15.57 16.252 17.03 17.936 18.87 19.97 21.205 22.698 24.426 26.487 28.962 32.108 34.816 36.496 37.668 38.441 38.982 39.357 39.62 39.789 39.906 39.993 40.034 40.028 40.015 39.995 39.957 39.905 39.853 39.789 39.715 39.642 39.575 39.488 39.381 39.295 39.203 39.098 38.975 38.84 38.735 38.619 38.434 38.287 38.122 38.041 37.885 37.709 37.515 37.411 37.215 37.042 36.91 36.765 36.435 36.251 36.046 35.808 35.5 35.137 34.687 33.441 -8 ,22809 ,KEBNE ,16721102,Sat Nov 27 07:06:05 CET,Sat Nov 27 09:04:29 CET,0.0 1.462 1.965 2.361 2.696 2.987 3.256 3.515 4.007 4.245 4.47 4.775 5.091 5.286 5.66 6.019 6.35 6.507 6.807 7.083 7.477 7.736 7.991 8.375 8.729 9.053 9.372 9.668 10.043 10.407 10.766 11.202 11.615 12.022 12.502 13.037 13.569 14.169 14.8 15.439 16.116 16.903 17.813 18.741 19.837 21.055 22.5 24.206 26.238 28.691 31.875 34.602 36.338 37.565 38.364 38.931 39.352 39.647 39.841 39.995 40.085 40.12 40.121 40.099 40.051 40.01 39.952 39.873 39.805 39.734 39.643 39.557 39.465 39.357 39.254 39.149 39.043 38.925 38.785 38.677 38.575 38.391 38.259 38.121 38.045 37.896 37.732 37.548 37.446 37.246 37.07 36.928 36.79 36.478 36.298 36.105 35.868 35.58 35.231 34.784 33.56 -9 ,9789 ,KEBNE ,16721103,Sat Nov 27 07:06:05 CET,Sat Nov 27 09:03:12 CET,0.0 1.47 2.104 2.602 2.994 3.319 3.611 3.887 4.372 4.589 4.802 5.077 5.373 5.559 5.908 6.213 6.502 6.645 6.919 7.188 7.563 7.801 8.042 8.391 8.732 9.084 9.434 9.763 10.163 10.53 10.885 11.328 11.755 12.165 12.626 13.13 13.627 14.192 14.809 15.462 16.162 16.959 17.879 18.816 19.916 21.142 22.572 24.223 26.22 28.64 31.652 34.272 35.917 37.014 37.746 38.251 38.609 38.877 39.044 39.164 39.241 39.263 39.264 39.247 39.209 39.139 39.051 38.983 38.909 38.83 38.741 38.65 38.558 38.455 38.365 38.268 38.159 38.043 37.903 37.796 37.692 37.543 37.428 37.289 37.211 37.049 36.862 36.651 36.545 36.35 36.166 36.017 35.874 35.541 35.342 35.119 34.862 34.568 34.226 33.775 32.415 -10 ,7333 ,KEBNE ,16721104,Sat Nov 27 07:06:05 CET,Sat Nov 27 09:04:18 CET,0.0 1.504 2.029 2.456 2.831 3.165 3.461 3.737 4.233 4.447 4.663 4.973 5.287 5.477 5.839 6.196 6.514 6.658 6.951 7.234 7.651 7.916 8.17 8.521 8.845 9.166 9.479 9.797 10.243 10.653 11.034 11.509 11.946 12.346 12.801 13.311 13.815 14.381 14.991 15.629 16.309 17.068 17.959 18.874 19.96 21.208 22.62 24.25 26.215 28.572 31.541 34.135 35.739 36.826 37.575 38.121 38.504 38.769 38.947 39.08 39.161 39.204 39.208 39.192 39.17 39.131 39.066 39.002 38.941 38.859 38.768 38.699 38.606 38.497 38.413 38.318 38.206 38.075 37.93 37.817 37.689 37.485 37.341 37.199 37.125 36.963 36.787 36.589 36.479 36.29 36.132 35.991 35.836 35.492 35.304 35.096 34.853 34.554 34.195 33.728 32.547 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_52_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_52_35.txt deleted file mode 100644 index 1b6d3b05..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_52_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5923 ,KEBNE ,16721105,Sat Nov 27 07:06:05 CET,Sat Nov 27 09:09:12 CET,0.0 1.189 1.671 2.008 2.3 2.57 2.808 3.027 3.43 3.611 3.778 3.971 4.21 4.343 4.596 4.819 5.045 5.151 5.344 5.534 5.799 5.964 6.117 6.341 6.563 6.777 6.975 7.16 7.388 7.611 7.83 8.08 8.316 8.54 8.79 9.071 9.333 9.601 9.88 10.163 10.449 10.771 11.148 11.514 11.894 12.286 12.72 13.148 13.534 13.889 14.072 13.809 13.365 12.809 12.28 11.806 11.33 10.865 10.479 10.077 9.691 9.351 9.027 8.69 8.37 8.076 7.771 7.494 7.235 6.95 6.648 6.403 6.137 5.833 5.596 5.354 5.101 4.853 4.604 4.423 4.238 3.923 3.679 3.428 3.3 3.048 2.783 2.493 2.343 2.085 1.803 1.599 1.399 0.95 0.69 0.384 0.032 -0.377 -0.894 -1.641 -4.051 -2 ,13074 ,KEBNE ,16721106,Sat Nov 27 07:07:06 CET,Sat Nov 27 09:10:13 CET,0.0 1.276 1.749 2.106 2.401 2.665 2.9 3.112 3.508 3.689 3.859 4.061 4.295 4.421 4.665 4.901 5.112 5.213 5.422 5.612 5.863 6.022 6.181 6.414 6.622 6.825 7.028 7.223 7.467 7.685 7.884 8.114 8.335 8.546 8.792 9.063 9.32 9.6 9.9 10.199 10.486 10.802 11.165 11.523 11.897 12.261 12.655 13.056 13.445 13.727 13.708 13.361 12.916 12.399 11.839 11.286 10.751 10.231 9.768 9.268 8.817 8.423 8.049 7.705 7.404 7.11 6.775 6.476 6.218 5.939 5.647 5.398 5.149 4.884 4.663 4.433 4.192 3.943 3.678 3.492 3.293 2.987 2.77 2.535 2.417 2.171 1.899 1.6 1.44 1.173 0.919 0.704 0.466 -0.026 -0.288 -0.579 -0.94 -1.347 -1.817 -2.472 -4.855 -3 ,22821 ,KEBNE ,16721107,Sat Nov 27 07:07:06 CET,Sat Nov 27 09:09:55 CET,0.0 1.557 2.067 2.487 2.833 3.112 3.353 3.571 3.953 4.12 4.279 4.488 4.73 4.861 5.11 5.334 5.544 5.646 5.845 6.035 6.282 6.435 6.59 6.817 7.033 7.228 7.414 7.592 7.812 8.033 8.252 8.502 8.736 8.962 9.2 9.46 9.71 9.973 10.261 10.568 10.874 11.206 11.582 11.933 12.298 12.678 13.086 13.515 13.934 14.256 14.39 14.108 13.664 13.217 12.755 12.259 11.767 11.317 10.886 10.37 9.938 9.575 9.203 8.839 8.502 8.201 7.896 7.627 7.38 7.103 6.795 6.536 6.277 6.014 5.814 5.605 5.375 5.125 4.865 4.682 4.48 4.16 3.936 3.692 3.56 3.274 2.96 2.619 2.436 2.138 1.813 1.583 1.359 0.848 0.549 0.217 -0.151 -0.579 -1.113 -1.812 -4.04 -4 ,3183 ,KEBNE ,16721108,Sat Nov 27 07:07:06 CET,Sat Nov 27 09:09:45 CET,0.0 1.61 2.121 2.501 2.805 3.084 3.35 3.58 3.971 4.153 4.325 4.522 4.765 4.896 5.129 5.365 5.59 5.694 5.892 6.071 6.333 6.501 6.653 6.874 7.094 7.306 7.504 7.694 7.93 8.154 8.369 8.612 8.848 9.083 9.349 9.627 9.881 10.153 10.435 10.732 11.041 11.382 11.758 12.121 12.523 12.941 13.389 13.839 14.3 14.727 14.978 14.794 14.402 13.993 13.579 13.173 12.792 12.401 12.058 11.678 11.32 10.997 10.644 10.27 9.949 9.68 9.376 9.092 8.849 8.601 8.32 8.076 7.828 7.568 7.365 7.149 6.906 6.643 6.366 6.175 5.972 5.666 5.465 5.243 5.121 4.838 4.516 4.169 3.995 3.727 3.444 3.239 3.03 2.532 2.237 1.91 1.557 1.188 0.66 -0.094 -2.555 -5 ,27464 ,KEBNE ,16721109,Sat Nov 27 07:07:06 CET,Sat Nov 27 09:10:27 CET,0.0 1.334 1.819 2.195 2.503 2.764 3.003 3.225 3.61 3.792 3.962 4.176 4.429 4.571 4.843 5.097 5.326 5.433 5.631 5.814 6.072 6.24 6.401 6.63 6.844 7.037 7.237 7.435 7.676 7.907 8.121 8.358 8.572 8.787 9.036 9.294 9.54 9.827 10.137 10.448 10.764 11.097 11.478 11.857 12.264 12.687 13.153 13.625 14.064 14.418 14.592 14.412 14.083 13.662 13.206 12.768 12.331 11.855 11.392 10.899 10.479 10.115 9.764 9.403 9.053 8.729 8.381 8.073 7.807 7.528 7.229 6.986 6.727 6.44 6.206 5.965 5.727 5.483 5.218 5.031 4.838 4.524 4.296 4.06 3.933 3.68 3.434 3.16 3.001 2.735 2.485 2.288 2.073 1.53 1.212 0.891 0.53 0.105 -0.414 -1.137 -3.16 -6 ,10949 ,KEBNE ,16721110,Sat Nov 27 07:07:06 CET,Sat Nov 27 09:10:30 CET,0.0 1.493 1.97 2.309 2.589 2.834 3.06 3.272 3.663 3.851 4.013 4.197 4.437 4.572 4.828 5.056 5.274 5.376 5.556 5.728 5.98 6.141 6.292 6.52 6.738 6.935 7.121 7.295 7.519 7.732 7.931 8.178 8.411 8.625 8.872 9.128 9.363 9.622 9.892 10.179 10.493 10.831 11.196 11.539 11.939 12.354 12.767 13.203 13.653 14.001 14.156 13.987 13.557 13.013 12.513 12.059 11.598 11.166 10.762 10.309 9.915 9.554 9.18 8.815 8.479 8.169 7.831 7.524 7.257 6.954 6.627 6.36 6.079 5.78 5.545 5.304 5.058 4.807 4.54 4.349 4.147 3.815 3.567 3.312 3.188 2.912 2.615 2.305 2.129 1.835 1.54 1.344 1.123 0.598 0.313 0.01 -0.364 -0.821 -1.359 -2.1 -4.586 -7 ,10538 ,KEBNE ,16721111,Sat Nov 27 07:07:06 CET,Sat Nov 27 09:10:28 CET,0.0 1.364 1.845 2.248 2.587 2.866 3.113 3.33 3.695 3.863 4.019 4.191 4.423 4.555 4.802 5.023 5.23 5.333 5.553 5.755 6.016 6.177 6.33 6.555 6.772 6.978 7.175 7.363 7.606 7.834 8.043 8.292 8.529 8.745 9.003 9.29 9.557 9.862 10.169 10.46 10.761 11.108 11.491 11.852 12.267 12.69 13.112 13.532 13.96 14.344 14.542 14.268 13.771 13.217 12.688 12.165 11.663 11.194 10.768 10.326 9.921 9.567 9.227 8.879 8.537 8.209 7.87 7.568 7.305 7.026 6.727 6.464 6.183 5.889 5.654 5.419 5.175 4.91 4.633 4.44 4.234 3.918 3.697 3.445 3.311 3.032 2.747 2.453 2.295 2.034 1.788 1.605 1.42 0.98 0.735 0.448 0.1 -0.296 -0.787 -1.483 -3.855 -8 ,23327 ,KEBNE ,16721112,Sat Nov 27 07:07:06 CET,Sat Nov 27 09:10:15 CET,0.0 1.676 2.204 2.587 2.899 3.168 3.418 3.637 4.026 4.209 4.374 4.578 4.818 4.948 5.189 5.415 5.627 5.728 5.935 6.132 6.41 6.584 6.742 6.976 7.194 7.402 7.596 7.775 8.011 8.241 8.456 8.702 8.931 9.152 9.403 9.671 9.926 10.207 10.499 10.79 11.085 11.388 11.73 12.076 12.463 12.862 13.274 13.693 14.121 14.462 14.561 14.273 13.818 13.33 12.82 12.312 11.85 11.391 10.963 10.529 10.158 9.823 9.492 9.171 8.86 8.565 8.25 7.969 7.738 7.499 7.23 6.999 6.748 6.479 6.271 6.047 5.803 5.546 5.29 5.121 4.924 4.598 4.39 4.162 4.027 3.76 3.496 3.19 3.027 2.763 2.472 2.248 2.035 1.58 1.328 1.037 0.676 0.244 -0.287 -1.076 -3.933 -9 ,12037 ,KEBNE ,16721113,Sat Nov 27 07:07:06 CET,Sat Nov 27 09:10:38 CET,0.0 1.494 2.047 2.459 2.809 3.094 3.34 3.578 4.014 4.201 4.381 4.607 4.858 4.993 5.254 5.494 5.719 5.828 6.04 6.239 6.52 6.698 6.862 7.091 7.305 7.507 7.702 7.893 8.133 8.348 8.568 8.831 9.063 9.285 9.533 9.791 10.031 10.305 10.589 10.877 11.179 11.503 11.844 12.174 12.563 12.965 13.38 13.813 14.245 14.618 14.84 14.696 14.338 13.929 13.462 13.016 12.583 12.106 11.685 11.248 10.86 10.526 10.196 9.874 9.552 9.239 8.912 8.611 8.349 8.08 7.788 7.541 7.28 6.979 6.741 6.5 6.243 5.976 5.7 5.508 5.314 5.017 4.794 4.561 4.438 4.179 3.903 3.609 3.452 3.181 2.911 2.696 2.476 2.027 1.784 1.502 1.172 0.779 0.295 -0.436 -3.337 -10 ,6328 ,KEBNE ,16721114,Sat Nov 27 07:08:07 CET,Sat Nov 27 09:12:18 CET,0.0 1.328 1.784 2.141 2.471 2.753 2.991 3.208 3.588 3.763 3.922 4.121 4.362 4.501 4.752 4.975 5.18 5.28 5.475 5.665 5.93 6.091 6.251 6.485 6.696 6.887 7.073 7.253 7.49 7.714 7.917 8.149 8.37 8.588 8.832 9.086 9.334 9.607 9.879 10.166 10.476 10.82 11.209 11.574 11.949 12.327 12.747 13.18 13.628 14.033 14.175 13.898 13.458 12.95 12.42 11.882 11.345 10.842 10.403 9.94 9.527 9.136 8.753 8.402 8.082 7.789 7.467 7.148 6.86 6.577 6.295 6.06 5.816 5.547 5.327 5.112 4.886 4.627 4.35 4.164 3.972 3.662 3.437 3.199 3.077 2.821 2.54 2.222 2.058 1.796 1.533 1.328 1.113 0.634 0.358 0.07 -0.234 -0.647 -1.223 -1.961 -4.566 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_35.txt deleted file mode 100644 index f60745f0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1194 ,KEBNE ,16721115,Sat Nov 27 07:10:09 CET,Sat Nov 27 09:18:56 CET,0.0 1.949 2.494 2.879 3.208 3.492 3.729 3.943 4.326 4.496 4.651 4.836 5.075 5.207 5.456 5.688 5.895 5.991 6.181 6.366 6.624 6.783 6.932 7.141 7.349 7.552 7.736 7.908 8.13 8.349 8.56 8.807 9.034 9.252 9.498 9.756 10.006 10.282 10.573 10.876 11.187 11.543 11.957 12.354 12.788 13.237 13.708 14.186 14.669 15.07 15.242 14.971 14.514 13.978 13.452 12.919 12.388 11.9 11.465 10.98 10.491 10.032 9.585 9.165 8.764 8.373 7.944 7.55 7.21 6.848 6.445 6.103 5.741 5.351 5.048 4.721 4.381 4.021 3.65 3.388 3.103 2.664 2.349 2.0 1.82 1.447 1.032 0.584 0.359 0.027 -0.396 -0.663 -0.947 -1.64 -2.054 -2.524 -3.05 -3.659 -4.398 -5.439 -9.118 -2 ,9160 ,KEBNE ,16721116,Sat Nov 27 07:26:22 CET,Sat Nov 27 09:29:35 CET,0.0 1.614 2.143 2.552 2.87 3.124 3.348 3.563 3.964 4.144 4.305 4.488 4.722 4.859 5.112 5.345 5.564 5.661 5.843 6.016 6.269 6.43 6.582 6.799 7.008 7.208 7.389 7.565 7.806 8.028 8.234 8.477 8.688 8.884 9.114 9.366 9.604 9.89 10.194 10.489 10.781 11.076 11.428 11.789 12.174 12.56 12.995 13.464 13.939 14.312 14.426 14.246 13.788 13.181 12.626 12.044 11.464 10.883 10.33 9.744 9.222 8.771 8.337 7.899 7.447 7.013 6.552 6.137 5.78 5.402 5.007 4.677 4.324 3.934 3.611 3.273 2.917 2.553 2.185 1.919 1.647 1.221 0.917 0.581 0.398 0.025 -0.367 -0.785 -1.025 -1.385 -1.823 -2.124 -2.445 -3.146 -3.53 -3.923 -4.393 -4.952 -5.627 -6.602 -9.513 -3 ,3859 ,KEBNE ,16721117,Sat Nov 27 07:29:24 CET,Sat Nov 27 09:33:26 CET,0.0 1.577 2.09 2.467 2.777 3.038 3.266 3.475 3.845 4.011 4.165 4.347 4.575 4.701 4.93 5.156 5.375 5.478 5.682 5.872 6.124 6.288 6.446 6.662 6.86 7.05 7.23 7.403 7.63 7.839 8.043 8.283 8.498 8.704 8.94 9.198 9.44 9.709 10.002 10.299 10.594 10.906 11.247 11.577 11.959 12.407 12.897 13.386 13.855 14.255 14.462 14.239 13.834 13.314 12.731 12.125 11.582 11.06 10.561 10.009 9.499 9.046 8.624 8.187 7.75 7.354 6.937 6.568 6.236 5.879 5.497 5.158 4.796 4.438 4.149 3.841 3.524 3.185 2.825 2.563 2.297 1.881 1.567 1.225 1.046 0.678 0.307 -0.099 -0.322 -0.654 -1.079 -1.371 -1.667 -2.31 -2.671 -3.078 -3.547 -4.079 -4.76 -5.634 -9.056 -4 ,31953 ,KEBNE ,16721118,Sat Nov 27 07:31:26 CET,Sat Nov 27 09:36:30 CET,0.0 1.549 2.035 2.401 2.716 2.991 3.232 3.439 3.8 3.969 4.129 4.316 4.555 4.689 4.946 5.186 5.399 5.5 5.701 5.886 6.134 6.296 6.451 6.674 6.884 7.08 7.271 7.453 7.678 7.889 8.092 8.329 8.549 8.751 8.985 9.244 9.495 9.772 10.059 10.352 10.649 10.991 11.368 11.709 12.113 12.548 12.999 13.468 13.954 14.366 14.562 14.383 14.014 13.539 12.98 12.404 11.838 11.267 10.731 10.141 9.653 9.253 8.838 8.453 8.106 7.731 7.305 6.932 6.596 6.224 5.829 5.496 5.145 4.786 4.5 4.183 3.85 3.496 3.12 2.87 2.609 2.172 1.859 1.53 1.363 1.014 0.615 0.184 -0.041 -0.39 -0.841 -1.129 -1.426 -2.116 -2.515 -2.951 -3.43 -4.062 -4.839 -5.769 -10.334 -5 ,14912 ,KEBNE ,16721119,Sat Nov 27 08:04:59 CET,Sat Nov 27 10:09:09 CET,0.0 1.656 2.167 2.593 2.956 3.234 3.47 3.679 4.052 4.227 4.383 4.556 4.788 4.908 5.139 5.356 5.561 5.66 5.849 6.031 6.289 6.458 6.628 6.862 7.071 7.267 7.451 7.628 7.86 8.081 8.288 8.526 8.749 8.959 9.197 9.47 9.721 9.977 10.251 10.542 10.852 11.172 11.523 11.879 12.285 12.73 13.197 13.678 14.191 14.647 14.929 14.731 14.302 13.846 13.393 12.899 12.409 11.913 11.45 10.983 10.578 10.146 9.669 9.21 8.771 8.354 7.909 7.49 7.105 6.715 6.305 5.967 5.626 5.273 4.996 4.696 4.365 4.006 3.634 3.374 3.096 2.645 2.327 2.005 1.841 1.499 1.143 0.738 0.511 0.173 -0.264 -0.548 -0.84 -1.553 -1.967 -2.435 -2.974 -3.579 -4.31 -5.279 -8.944 -6 ,1148 ,KEBNE ,16721120,Sat Nov 27 08:09:03 CET,Sat Nov 27 10:13:15 CET,0.0 1.614 2.194 2.635 2.991 3.289 3.544 3.771 4.172 4.35 4.512 4.691 4.921 5.048 5.29 5.518 5.727 5.822 6.009 6.191 6.445 6.604 6.76 6.985 7.186 7.381 7.566 7.74 7.968 8.177 8.375 8.614 8.836 9.041 9.268 9.531 9.784 10.054 10.327 10.602 10.891 11.222 11.595 11.945 12.335 12.721 13.114 13.534 13.968 14.354 14.539 14.276 13.797 13.23 12.634 12.045 11.457 10.874 10.328 9.761 9.286 8.851 8.416 7.985 7.552 7.134 6.702 6.317 5.967 5.595 5.207 4.868 4.509 4.14 3.837 3.516 3.193 2.86 2.498 2.248 1.983 1.553 1.24 0.902 0.723 0.367 -0.007 -0.431 -0.65 -0.986 -1.41 -1.7 -1.993 -2.607 -2.964 -3.388 -3.861 -4.377 -5.026 -5.999 -9.826 -7 ,21317 ,KEBNE ,16721121,Sat Nov 27 08:10:04 CET,Sat Nov 27 10:15:06 CET,0.0 1.362 1.848 2.209 2.507 2.779 3.026 3.24 3.614 3.781 3.942 4.136 4.37 4.501 4.75 4.985 5.198 5.295 5.484 5.67 5.937 6.1 6.246 6.454 6.655 6.852 7.039 7.216 7.439 7.645 7.849 8.099 8.332 8.543 8.781 9.047 9.293 9.554 9.842 10.149 10.46 10.799 11.163 11.504 11.891 12.323 12.803 13.29 13.734 14.097 14.279 14.004 13.496 12.948 12.357 11.712 11.137 10.617 10.181 9.73 9.271 8.855 8.457 8.062 7.7 7.358 6.958 6.603 6.279 5.883 5.49 5.198 4.889 4.583 4.35 4.087 3.817 3.529 3.21 2.965 2.689 2.266 1.994 1.732 1.598 1.3 0.979 0.636 0.45 0.154 -0.198 -0.429 -0.665 -1.266 -1.639 -2.034 -2.479 -3.006 -3.645 -4.554 -7.893 -8 ,25074 ,KEBNE ,16721122,Sat Nov 27 08:25:23 CET,Sat Nov 27 10:28:58 CET,0.0 1.489 1.987 2.352 2.661 2.93 3.159 3.36 3.722 3.89 4.05 4.237 4.473 4.599 4.837 5.061 5.27 5.369 5.556 5.731 5.983 6.146 6.311 6.548 6.765 6.958 7.137 7.309 7.527 7.745 7.952 8.197 8.432 8.65 8.897 9.168 9.421 9.705 10.001 10.294 10.598 10.944 11.336 11.7 12.118 12.577 13.041 13.494 13.926 14.245 14.323 14.11 13.647 13.113 12.655 12.164 11.663 11.149 10.651 10.132 9.684 9.283 8.881 8.486 8.088 7.685 7.252 6.858 6.516 6.159 5.794 5.505 5.197 4.851 4.553 4.227 3.893 3.545 3.181 2.926 2.648 2.185 1.869 1.552 1.381 1.013 0.597 0.141 -0.1 -0.45 -0.863 -1.139 -1.429 -2.053 -2.424 -2.857 -3.366 -3.984 -4.771 -5.894 -10.459 -9 ,15797 ,KEBNE ,16721123,Sat Nov 27 08:37:43 CET,Sat Nov 27 10:35:05 CET,0.0 1.562 2.08 2.414 2.695 2.953 3.178 3.389 3.769 3.934 4.093 4.282 4.523 4.646 4.879 5.104 5.319 5.422 5.623 5.812 6.076 6.241 6.391 6.611 6.821 7.021 7.214 7.388 7.619 7.843 8.047 8.293 8.529 8.752 9.009 9.29 9.545 9.809 10.098 10.406 10.716 11.042 11.39 11.723 12.117 12.544 12.951 13.378 13.879 14.359 14.653 14.513 14.079 13.48 12.889 12.371 11.898 11.436 11.01 10.501 9.997 9.517 9.057 8.638 8.241 7.854 7.431 7.033 6.675 6.303 5.906 5.567 5.222 4.838 4.512 4.181 3.849 3.479 3.074 2.792 2.499 2.043 1.72 1.364 1.188 0.843 0.459 0.048 -0.16 -0.478 -0.865 -1.141 -1.431 -2.089 -2.467 -2.861 -3.327 -3.898 -4.612 -5.547 -8.38 -10 ,11222 ,KEBNE ,16721124,Sat Nov 27 08:39:41 CET,Sat Nov 27 10:43:05 CET,0.0 1.648 2.15 2.553 2.88 3.153 3.393 3.613 3.995 4.155 4.299 4.467 4.7 4.83 5.067 5.28 5.486 5.584 5.758 5.925 6.183 6.351 6.51 6.732 6.94 7.137 7.328 7.515 7.755 7.97 8.164 8.404 8.635 8.849 9.078 9.324 9.549 9.783 10.036 10.309 10.588 10.899 11.279 11.644 12.035 12.454 12.899 13.338 13.745 14.002 14.024 13.641 12.989 12.345 11.736 11.101 10.479 9.892 9.362 8.818 8.345 7.918 7.483 7.065 6.678 6.315 5.926 5.574 5.281 4.97 4.604 4.282 3.941 3.57 3.277 2.982 2.678 2.329 1.944 1.684 1.42 1.023 0.75 0.456 0.289 -0.057 -0.409 -0.793 -1.004 -1.338 -1.771 -2.062 -2.358 -3.047 -3.446 -3.863 -4.287 -4.819 -5.53 -6.442 -9.653 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_52.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_52.txt deleted file mode 100644 index fb038447..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_53_52.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26797 ,KEBNE ,16721125,Sat Nov 27 08:43:46 CET,Sat Nov 27 10:49:07 CET,0.0 1.702 2.278 2.695 3.023 3.304 3.552 3.78 4.185 4.37 4.548 4.773 5.025 5.16 5.432 5.701 5.935 6.041 6.246 6.456 6.744 6.916 7.076 7.302 7.523 7.738 7.941 8.128 8.365 8.599 8.829 9.097 9.333 9.551 9.808 10.097 10.363 10.646 10.961 11.3 11.654 12.023 12.388 12.755 13.181 13.601 14.031 14.48 14.952 15.361 15.51 15.281 14.911 14.461 13.924 13.379 12.933 12.494 12.068 11.646 11.251 10.873 10.525 10.159 9.77 9.406 9.046 8.732 8.459 8.166 7.808 7.487 7.168 6.842 6.596 6.346 6.065 5.748 5.419 5.203 4.984 4.608 4.334 4.048 3.898 3.589 3.262 2.893 2.681 2.348 1.946 1.655 1.37 0.788 0.443 0.069 -0.345 -0.823 -1.392 -2.101 -4.915 -2 ,15113 ,KEBNE ,16721126,Sat Nov 27 08:44:48 CET,Sat Nov 27 10:50:12 CET,0.0 1.666 2.242 2.673 3.011 3.302 3.564 3.79 4.18 4.363 4.537 4.765 5.022 5.166 5.433 5.677 5.908 6.018 6.231 6.431 6.711 6.883 7.046 7.289 7.514 7.715 7.909 8.097 8.334 8.554 8.767 9.014 9.251 9.483 9.732 10.012 10.292 10.595 10.903 11.217 11.535 11.907 12.341 12.735 13.158 13.586 14.027 14.471 14.939 15.378 15.592 15.296 14.869 14.393 13.892 13.436 13.002 12.57 12.118 11.564 11.063 10.617 10.18 9.764 9.399 9.081 8.743 8.409 8.112 7.809 7.478 7.204 6.925 6.586 6.309 6.045 5.78 5.51 5.21 4.996 4.78 4.453 4.216 3.939 3.793 3.503 3.186 2.836 2.655 2.373 2.066 1.831 1.596 1.084 0.785 0.457 0.077 -0.369 -0.858 -1.495 -4.7 -3 ,19391 ,KEBNE ,16721127,Sat Nov 27 08:46:52 CET,Sat Nov 27 10:47:13 CET,0.0 2.036 2.624 3.062 3.402 3.692 3.937 4.155 4.535 4.708 4.886 5.12 5.367 5.512 5.781 6.04 6.285 6.4 6.625 6.821 7.081 7.254 7.423 7.656 7.867 8.068 8.271 8.463 8.706 8.952 9.177 9.433 9.669 9.889 10.136 10.409 10.688 10.987 11.273 11.55 11.843 12.163 12.514 12.856 13.252 13.676 14.138 14.629 15.092 15.471 15.695 15.51 15.112 14.616 14.098 13.615 13.192 12.789 12.369 11.839 11.355 10.92 10.479 10.053 9.651 9.292 8.916 8.569 8.249 7.884 7.492 7.162 6.815 6.477 6.215 5.919 5.612 5.298 4.971 4.735 4.476 4.068 3.776 3.465 3.304 2.971 2.638 2.278 2.083 1.767 1.386 1.121 0.807 0.164 -0.145 -0.509 -0.92 -1.373 -1.976 -2.81 -4.947 -4 ,21210 ,KEBNE ,16721128,Sat Nov 27 08:46:54 CET,Sat Nov 27 10:48:07 CET,0.0 1.538 2.106 2.517 2.816 3.065 3.299 3.516 3.906 4.086 4.248 4.441 4.682 4.813 5.062 5.301 5.526 5.63 5.814 5.986 6.242 6.407 6.566 6.801 7.022 7.22 7.41 7.591 7.812 8.023 8.234 8.473 8.677 8.874 9.108 9.361 9.603 9.873 10.166 10.476 10.779 11.104 11.467 11.789 12.134 12.488 12.861 13.251 13.632 14.0 14.23 14.084 13.731 13.294 12.812 12.323 11.867 11.431 11.015 10.545 10.152 9.814 9.464 9.124 8.789 8.466 8.141 7.853 7.593 7.299 6.981 6.725 6.466 6.172 5.948 5.727 5.488 5.233 4.977 4.8 4.607 4.296 4.072 3.844 3.728 3.474 3.205 2.925 2.778 2.529 2.287 2.085 1.863 1.397 1.149 0.882 0.563 0.184 -0.302 -0.896 -3.006 -5 ,30914 ,KEBNE ,16721129,Sat Nov 27 08:47:53 CET,Sat Nov 27 10:48:16 CET,0.0 1.609 2.168 2.574 2.927 3.237 3.523 3.791 4.245 4.445 4.634 4.877 5.137 5.277 5.544 5.802 6.052 6.168 6.379 6.576 6.856 7.036 7.22 7.481 7.725 7.952 8.159 8.355 8.594 8.813 9.023 9.284 9.524 9.743 9.998 10.292 10.557 10.85 11.176 11.504 11.828 12.162 12.526 12.888 13.307 13.756 14.203 14.609 15.007 15.364 15.639 15.524 15.139 14.695 14.273 13.876 13.447 13.012 12.622 12.197 11.763 11.387 11.062 10.729 10.388 10.043 9.69 9.378 9.083 8.741 8.359 8.049 7.732 7.397 7.129 6.851 6.565 6.252 5.934 5.7 5.44 5.037 4.748 4.457 4.312 3.994 3.647 3.247 3.029 2.699 2.339 2.071 1.788 1.201 0.863 0.495 0.077 -0.464 -1.117 -1.939 -4.845 -6 ,3 ,KEBNE ,16721130,Sat Nov 27 08:47:55 CET,Sat Nov 27 10:49:37 CET,0.0 1.6 2.164 2.596 2.936 3.216 3.465 3.679 4.046 4.217 4.389 4.616 4.867 5.008 5.272 5.524 5.755 5.865 6.083 6.288 6.571 6.748 6.917 7.152 7.385 7.608 7.812 8.006 8.258 8.486 8.695 8.947 9.185 9.408 9.662 9.94 10.197 10.478 10.774 11.092 11.421 11.761 12.153 12.555 13.01 13.467 13.925 14.367 14.824 15.246 15.445 15.161 14.663 14.086 13.557 13.077 12.575 12.074 11.622 11.148 10.71 10.298 9.885 9.456 9.042 8.667 8.281 7.929 7.615 7.276 6.915 6.617 6.307 5.977 5.718 5.444 5.147 4.829 4.493 4.264 4.017 3.624 3.347 3.052 2.902 2.563 2.191 1.818 1.616 1.293 0.865 0.594 0.331 -0.238 -0.574 -0.951 -1.356 -1.813 -2.373 -3.103 -5.435 -7 ,17939 ,KEBNE ,16721131,Sat Nov 27 08:50:58 CET,Sat Nov 27 10:52:05 CET,0.0 1.802 2.345 2.718 3.03 3.325 3.582 3.806 4.203 4.39 4.578 4.812 5.068 5.228 5.527 5.786 6.022 6.134 6.352 6.56 6.839 7.01 7.179 7.425 7.655 7.874 8.081 8.27 8.506 8.735 8.964 9.235 9.481 9.713 9.983 10.281 10.553 10.837 11.155 11.499 11.82 12.162 12.559 12.938 13.354 13.764 14.198 14.632 15.063 15.502 15.767 15.597 15.269 14.796 14.319 13.907 13.514 13.131 12.798 12.392 11.94 11.498 11.079 10.655 10.206 9.792 9.388 9.053 8.765 8.498 8.25 8.031 7.781 7.502 7.295 7.074 6.822 6.547 6.269 6.077 5.871 5.553 5.333 5.107 4.987 4.724 4.44 4.123 3.958 3.695 3.432 3.241 3.014 2.491 2.214 1.93 1.639 1.296 0.851 0.258 -1.526 -8 ,12792 ,KEBNE ,16721132,Sat Nov 27 08:57:02 CET,Sat Nov 27 11:01:05 CET,0.0 1.593 2.122 2.521 2.869 3.161 3.405 3.615 4.012 4.195 4.365 4.58 4.836 4.982 5.247 5.498 5.73 5.84 6.051 6.256 6.547 6.722 6.888 7.126 7.359 7.581 7.791 8.001 8.254 8.474 8.684 8.947 9.206 9.435 9.672 9.929 10.173 10.449 10.744 11.03 11.314 11.641 12.006 12.354 12.734 13.129 13.554 13.962 14.383 14.796 15.011 14.818 14.453 13.994 13.429 12.801 12.182 11.591 11.141 10.749 10.381 9.997 9.595 9.207 8.83 8.478 8.101 7.76 7.465 7.153 6.808 6.524 6.246 5.93 5.662 5.381 5.086 4.772 4.434 4.2 3.959 3.569 3.297 3.016 2.87 2.574 2.255 1.9 1.716 1.435 1.136 0.915 0.661 0.103 -0.213 -0.569 -0.956 -1.43 -2.059 -2.909 -4.977 -9 ,12056 ,KEBNE ,16721133,Sat Nov 27 08:58:04 CET,Sat Nov 27 11:02:17 CET,0.0 1.787 2.361 2.774 3.112 3.405 3.669 3.914 4.35 4.547 4.719 4.939 5.183 5.319 5.59 5.845 6.074 6.177 6.38 6.574 6.853 7.032 7.196 7.427 7.646 7.853 8.048 8.235 8.486 8.719 8.93 9.176 9.411 9.626 9.856 10.108 10.346 10.644 10.983 11.306 11.64 12.019 12.411 12.769 13.169 13.584 14.047 14.525 14.974 15.294 15.428 15.279 14.928 14.456 13.973 13.478 13.01 12.539 12.095 11.623 11.17 10.742 10.326 9.933 9.587 9.261 8.895 8.568 8.288 7.997 7.688 7.405 7.089 6.755 6.488 6.216 5.948 5.658 5.332 5.097 4.847 4.449 4.18 3.911 3.767 3.455 3.132 2.773 2.566 2.242 1.867 1.617 1.337 0.7 0.344 -0.054 -0.48 -0.976 -1.575 -2.341 -4.533 -10 ,12856 ,KEBNE ,16721134,Sat Nov 27 08:58:04 CET,Sat Nov 27 11:02:11 CET,0.0 1.488 2.071 2.522 2.855 3.143 3.395 3.618 3.996 4.175 4.345 4.533 4.772 4.897 5.13 5.345 5.547 5.643 5.828 6.012 6.274 6.439 6.596 6.815 7.021 7.216 7.397 7.565 7.788 8.003 8.209 8.451 8.668 8.872 9.11 9.372 9.613 9.871 10.145 10.433 10.724 11.04 11.425 11.813 12.263 12.755 13.272 13.76 14.246 14.691 14.927 14.847 14.517 14.082 13.653 13.271 12.879 12.478 12.139 11.777 11.431 11.097 10.774 10.456 10.152 9.894 9.629 9.373 9.147 8.922 8.687 8.471 8.217 7.943 7.725 7.479 7.2 6.917 6.625 6.427 6.239 5.947 5.732 5.498 5.373 5.107 4.827 4.537 4.386 4.135 3.895 3.713 3.525 3.076 2.811 2.536 2.232 1.838 1.335 0.673 -1.739 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_35.txt deleted file mode 100644 index 517842af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13691 ,KEBNE ,16721135,Sat Nov 27 08:58:04 CET,Sat Nov 27 11:01:54 CET,0.0 1.516 1.987 2.332 2.622 2.884 3.121 3.337 3.709 3.879 4.043 4.234 4.469 4.593 4.831 5.049 5.259 5.359 5.547 5.729 5.988 6.153 6.306 6.52 6.734 6.931 7.118 7.304 7.535 7.759 7.977 8.23 8.455 8.655 8.886 9.144 9.389 9.658 9.95 10.241 10.523 10.835 11.178 11.491 11.855 12.267 12.686 13.09 13.504 13.877 14.023 13.677 13.113 12.447 11.727 11.04 10.427 9.836 9.287 8.718 8.213 7.744 7.295 6.853 6.426 6.035 5.617 5.235 4.892 4.522 4.127 3.803 3.465 3.1 2.817 2.525 2.224 1.915 1.589 1.36 1.114 0.714 0.418 0.108 -0.05 -0.363 -0.682 -1.084 -1.303 -1.633 -2.025 -2.296 -2.58 -3.166 -3.511 -3.882 -4.295 -4.791 -5.403 -6.223 -9.878 -2 ,32661 ,KEBNE ,16721136,Sat Nov 27 08:58:03 CET,Sat Nov 27 11:01:02 CET,0.0 1.691 2.226 2.608 2.921 3.194 3.434 3.646 4.009 4.173 4.327 4.513 4.753 4.883 5.132 5.367 5.582 5.684 5.88 6.068 6.337 6.496 6.643 6.858 7.065 7.26 7.443 7.621 7.845 8.052 8.251 8.489 8.718 8.928 9.167 9.444 9.709 9.993 10.277 10.576 10.874 11.192 11.541 11.875 12.257 12.672 13.115 13.562 14.054 14.48 14.718 14.618 14.325 13.869 13.267 12.703 12.231 11.777 11.38 10.946 10.526 10.153 9.762 9.357 8.994 8.668 8.318 7.995 7.703 7.387 7.056 6.782 6.491 6.182 5.934 5.66 5.368 5.068 4.746 4.514 4.274 3.898 3.631 3.347 3.189 2.857 2.517 2.145 1.944 1.64 1.291 1.041 0.776 0.171 -0.183 -0.562 -0.974 -1.457 -2.117 -3.058 -6.38 -3 ,13595 ,KEBNE ,16721137,Sat Nov 27 08:59:05 CET,Sat Nov 27 11:02:42 CET,0.0 1.549 2.049 2.426 2.73 2.989 3.216 3.426 3.798 3.96 4.117 4.304 4.544 4.673 4.909 5.126 5.329 5.427 5.614 5.79 6.046 6.211 6.376 6.612 6.826 7.028 7.216 7.386 7.602 7.811 8.011 8.246 8.464 8.674 8.917 9.182 9.429 9.693 9.962 10.239 10.52 10.826 11.191 11.555 11.969 12.401 12.847 13.297 13.761 14.199 14.434 14.19 13.702 13.106 12.498 11.948 11.427 10.913 10.447 9.969 9.559 9.183 8.79 8.4 8.038 7.706 7.35 6.999 6.681 6.352 6.004 5.719 5.419 5.074 4.795 4.517 4.222 3.894 3.548 3.312 3.064 2.679 2.411 2.12 1.967 1.647 1.28 0.872 0.673 0.371 0.018 -0.239 -0.521 -1.168 -1.54 -1.924 -2.357 -2.884 -3.545 -4.442 -7.774 -4 ,10381 ,KEBNE ,16721138,Sat Nov 27 08:59:04 CET,Sat Nov 27 11:02:20 CET,0.0 1.297 1.795 2.172 2.491 2.766 3.008 3.22 3.592 3.765 3.927 4.123 4.36 4.489 4.737 4.966 5.174 5.274 5.475 5.662 5.913 6.07 6.222 6.441 6.649 6.848 7.042 7.223 7.439 7.644 7.834 8.066 8.292 8.504 8.751 9.023 9.28 9.546 9.807 10.086 10.395 10.735 11.116 11.501 11.908 12.297 12.743 13.259 13.809 14.334 14.674 14.589 14.287 13.812 13.278 12.754 12.255 11.808 11.389 10.938 10.536 10.149 9.75 9.368 9.016 8.678 8.303 7.951 7.639 7.315 6.979 6.692 6.382 6.052 5.783 5.486 5.19 4.891 4.571 4.331 4.083 3.727 3.472 3.191 3.044 2.749 2.418 2.052 1.869 1.576 1.225 0.977 0.727 0.162 -0.17 -0.566 -1.009 -1.494 -2.078 -2.869 -6.17 -5 ,12042 ,KEBNE ,16721139,Sat Nov 27 08:59:05 CET,Sat Nov 27 11:02:20 CET,0.0 1.212 1.676 2.032 2.349 2.623 2.852 3.066 3.448 3.616 3.777 3.979 4.224 4.353 4.601 4.827 5.035 5.136 5.334 5.517 5.776 5.944 6.107 6.342 6.554 6.747 6.928 7.102 7.327 7.548 7.756 7.991 8.216 8.432 8.68 8.956 9.216 9.489 9.772 10.066 10.355 10.693 11.068 11.424 11.835 12.252 12.681 13.109 13.507 13.835 13.948 13.692 13.265 12.638 11.992 11.376 10.795 10.274 9.807 9.283 8.804 8.381 7.945 7.502 7.069 6.671 6.269 5.903 5.592 5.286 4.967 4.702 4.422 4.106 3.849 3.579 3.291 2.966 2.602 2.362 2.123 1.739 1.456 1.14 0.976 0.657 0.313 -0.055 -0.244 -0.556 -0.916 -1.149 -1.409 -2.008 -2.338 -2.728 -3.173 -3.644 -4.214 -5.048 -8.518 -6 ,11913 ,KEBNE ,16721140,Sat Nov 27 08:59:05 CET,Sat Nov 27 11:02:14 CET,0.0 1.444 1.973 2.377 2.685 2.936 3.164 3.368 3.729 3.895 4.053 4.238 4.469 4.6 4.842 5.045 5.244 5.345 5.54 5.728 5.988 6.148 6.297 6.511 6.72 6.909 7.086 7.262 7.483 7.691 7.887 8.113 8.33 8.543 8.779 9.046 9.303 9.574 9.853 10.156 10.471 10.798 11.181 11.564 11.982 12.403 12.859 13.349 13.836 14.282 14.578 14.444 14.04 13.544 13.046 12.537 12.01 11.508 11.055 10.562 10.101 9.684 9.308 8.939 8.571 8.219 7.828 7.468 7.157 6.833 6.495 6.21 5.906 5.589 5.349 5.094 4.822 4.553 4.267 4.045 3.825 3.47 3.2 2.926 2.789 2.483 2.144 1.79 1.593 1.299 1.002 0.776 0.524 0.005 -0.297 -0.636 -1.009 -1.451 -1.986 -2.763 -6.353 -7 ,14112 ,KEBNE ,16721141,Sat Nov 27 08:59:05 CET,Sat Nov 27 11:02:49 CET,0.0 1.682 2.179 2.532 2.838 3.096 3.32 3.527 3.893 4.063 4.229 4.429 4.663 4.787 5.019 5.233 5.438 5.54 5.739 5.923 6.168 6.317 6.465 6.677 6.875 7.064 7.245 7.422 7.65 7.857 8.049 8.288 8.519 8.733 8.976 9.256 9.514 9.783 10.069 10.367 10.666 10.995 11.372 11.737 12.165 12.627 13.108 13.592 14.061 14.439 14.659 14.411 13.859 13.248 12.659 12.066 11.526 11.01 10.53 10.046 9.617 9.188 8.748 8.334 7.959 7.607 7.216 6.875 6.568 6.236 5.887 5.593 5.28 4.944 4.692 4.421 4.111 3.787 3.454 3.225 2.995 2.618 2.343 2.066 1.925 1.604 1.257 0.89 0.695 0.392 0.051 -0.194 -0.467 -1.127 -1.481 -1.838 -2.265 -2.749 -3.38 -4.266 -7.286 -8 ,1565 ,KEBNE ,16721142,Sat Nov 27 08:59:05 CET,Sat Nov 27 11:02:26 CET,0.0 1.659 2.149 2.519 2.83 3.104 3.36 3.59 3.981 4.159 4.326 4.532 4.775 4.908 5.166 5.399 5.602 5.701 5.902 6.088 6.349 6.521 6.679 6.895 7.102 7.296 7.486 7.679 7.929 8.145 8.349 8.603 8.844 9.065 9.304 9.563 9.814 10.085 10.362 10.657 10.965 11.292 11.651 11.988 12.391 12.815 13.22 13.643 14.091 14.442 14.499 14.236 13.809 13.31 12.749 12.181 11.695 11.211 10.748 10.266 9.847 9.456 9.073 8.714 8.352 8.005 7.645 7.307 7.002 6.691 6.368 6.086 5.785 5.462 5.207 4.949 4.684 4.395 4.079 3.87 3.644 3.269 3.012 2.727 2.579 2.286 1.954 1.577 1.379 1.074 0.713 0.47 0.193 -0.419 -0.757 -1.142 -1.585 -2.126 -2.777 -3.681 -6.939 -9 ,5853 ,KEBNE ,16721143,Sat Nov 27 08:59:05 CET,Sat Nov 27 11:02:25 CET,0.0 1.194 1.62 1.952 2.229 2.468 2.684 2.883 3.24 3.404 3.56 3.761 3.995 4.125 4.369 4.593 4.804 4.904 5.101 5.292 5.555 5.719 5.874 6.101 6.332 6.553 6.761 6.952 7.18 7.393 7.598 7.84 8.074 8.298 8.556 8.848 9.123 9.407 9.693 9.989 10.292 10.621 11.007 11.396 11.81 12.236 12.709 13.191 13.654 14.065 14.334 14.185 13.817 13.398 12.907 12.384 11.913 11.453 11.009 10.53 10.118 9.73 9.343 8.978 8.64 8.326 7.966 7.645 7.365 7.053 6.717 6.428 6.115 5.801 5.566 5.319 5.048 4.742 4.422 4.203 3.982 3.631 3.366 3.085 2.932 2.606 2.271 1.903 1.708 1.404 1.034 0.769 0.47 -0.193 -0.562 -0.966 -1.418 -1.962 -2.613 -3.473 -6.44 -10 ,9761 ,KEBNE ,16721144,Sat Nov 27 08:59:05 CET,Sat Nov 27 11:02:27 CET,0.0 1.5 1.999 2.35 2.647 2.915 3.148 3.363 3.742 3.911 4.073 4.277 4.513 4.639 4.878 5.1 5.313 5.415 5.596 5.764 6.005 6.157 6.305 6.522 6.73 6.93 7.117 7.298 7.526 7.732 7.923 8.157 8.386 8.597 8.844 9.115 9.36 9.626 9.907 10.201 10.496 10.821 11.189 11.553 11.98 12.454 12.967 13.465 13.943 14.337 14.56 14.316 13.824 13.268 12.695 12.136 11.586 11.063 10.604 10.104 9.664 9.273 8.892 8.517 8.137 7.78 7.417 7.081 6.776 6.458 6.104 5.778 5.449 5.125 4.854 4.575 4.295 3.985 3.671 3.461 3.23 2.859 2.596 2.321 2.179 1.879 1.56 1.211 1.025 0.735 0.401 0.16 -0.096 -0.663 -0.985 -1.357 -1.763 -2.224 -2.802 -3.666 -6.47 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_57.txt deleted file mode 100644 index 79e3dca4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_54_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29852 ,KEBNE ,16721145,Sat Nov 27 08:59:05 CET,Sat Nov 27 11:02:43 CET,0.0 1.356 1.834 2.192 2.513 2.793 3.038 3.282 3.737 3.935 4.113 4.336 4.576 4.715 4.975 5.209 5.428 5.534 5.751 5.967 6.269 6.456 6.637 6.898 7.137 7.362 7.58 7.784 8.041 8.285 8.501 8.754 8.999 9.25 9.542 9.856 10.165 10.496 10.853 11.225 11.6 12.01 12.484 12.957 13.451 13.975 14.613 15.326 16.079 16.77 17.369 17.675 17.646 17.44 17.114 16.71 16.314 15.938 15.601 15.233 14.912 14.625 14.337 14.058 13.769 13.491 13.204 12.936 12.692 12.436 12.17 11.951 11.726 11.468 11.255 11.044 10.818 10.559 10.276 10.083 9.881 9.56 9.324 9.066 8.944 8.706 8.431 8.131 7.97 7.709 7.428 7.216 7.001 6.542 6.259 5.916 5.542 5.129 4.603 3.799 1.341 -2 ,31657 ,KEBNE ,16721146,Sat Nov 27 08:59:05 CET,Sat Nov 27 11:02:45 CET,0.0 1.324 1.833 2.216 2.551 2.848 3.101 3.323 3.71 3.884 4.044 4.245 4.487 4.623 4.883 5.128 5.369 5.48 5.697 5.916 6.22 6.408 6.587 6.843 7.077 7.293 7.509 7.724 8.0 8.261 8.507 8.798 9.074 9.338 9.651 9.989 10.296 10.649 11.046 11.455 11.878 12.361 12.88 13.367 13.901 14.483 15.122 15.768 16.517 17.331 18.132 18.43 18.341 18.081 17.707 17.263 16.825 16.443 16.091 15.695 15.364 15.067 14.759 14.442 14.121 13.827 13.5 13.191 12.916 12.629 12.332 12.078 11.805 11.494 11.232 10.967 10.703 10.421 10.118 9.915 9.701 9.323 9.061 8.805 8.668 8.362 8.037 7.704 7.53 7.261 6.973 6.761 6.511 5.943 5.625 5.288 4.908 4.427 3.848 3.049 0.198 -3 ,14059 ,KEBNE ,16721147,Sat Nov 27 08:59:05 CET,Sat Nov 27 11:02:44 CET,0.0 1.593 2.149 2.565 2.899 3.184 3.439 3.684 4.136 4.329 4.5 4.719 4.973 5.11 5.372 5.621 5.852 5.965 6.173 6.367 6.651 6.83 7.004 7.245 7.47 7.702 7.92 8.122 8.392 8.652 8.907 9.211 9.499 9.764 10.061 10.383 10.673 11.001 11.364 11.728 12.088 12.492 12.984 13.471 14.01 14.604 15.253 15.903 16.612 17.388 18.02 18.17 18.071 17.822 17.452 17.028 16.585 16.175 15.837 15.457 15.088 14.719 14.344 13.994 13.662 13.355 13.027 12.724 12.465 12.172 11.872 11.632 11.36 11.069 10.836 10.594 10.341 10.068 9.79 9.609 9.414 9.074 8.82 8.538 8.396 8.115 7.811 7.48 7.309 7.033 6.726 6.515 6.291 5.773 5.468 5.144 4.758 4.272 3.68 2.879 0.413 -4 ,27823 ,KEBNE ,16721148,Sat Nov 27 09:00:05 CET,Sat Nov 27 11:03:35 CET,0.0 2.048 2.625 3.036 3.365 3.629 3.865 4.086 4.489 4.681 4.86 5.077 5.319 5.455 5.724 5.978 6.219 6.332 6.539 6.737 7.018 7.206 7.386 7.634 7.873 8.102 8.328 8.549 8.818 9.072 9.313 9.61 9.903 10.169 10.451 10.764 11.073 11.413 11.803 12.218 12.624 13.05 13.54 14.001 14.498 15.047 15.683 16.355 17.054 17.877 18.755 19.134 19.059 18.849 18.581 18.26 17.924 17.555 17.215 16.865 16.533 16.215 15.904 15.586 15.27 14.961 14.616 14.309 14.027 13.718 13.401 13.143 12.872 12.571 12.338 12.096 11.838 11.553 11.243 11.031 10.806 10.441 10.182 9.911 9.77 9.471 9.137 8.777 8.586 8.289 7.964 7.716 7.444 6.857 6.528 6.152 5.711 5.176 4.555 3.756 1.019 -5 ,6934 ,KEBNE ,16721149,Sat Nov 27 09:00:05 CET,Sat Nov 27 11:04:47 CET,0.0 1.678 2.256 2.682 3.029 3.313 3.553 3.767 4.166 4.349 4.517 4.734 4.981 5.123 5.377 5.622 5.844 5.946 6.147 6.348 6.625 6.795 6.958 7.204 7.441 7.651 7.849 8.043 8.301 8.555 8.794 9.078 9.345 9.594 9.865 10.171 10.462 10.77 11.111 11.462 11.818 12.212 12.658 13.126 13.657 14.188 14.771 15.386 16.1 16.873 17.528 17.784 17.737 17.501 17.2 16.838 16.476 16.131 15.802 15.446 15.092 14.749 14.416 14.118 13.848 13.574 13.267 12.986 12.736 12.466 12.182 11.956 11.726 11.472 11.262 11.045 10.803 10.544 10.271 10.067 9.855 9.512 9.261 8.988 8.838 8.515 8.187 7.845 7.657 7.364 7.024 6.788 6.543 5.973 5.625 5.227 4.79 4.311 3.699 2.823 -0.5 -6 ,15762 ,KEBNE ,16721150,Sat Nov 27 09:00:06 CET,Sat Nov 27 11:03:49 CET,0.0 2.037 2.592 3.006 3.344 3.638 3.893 4.107 4.484 4.657 4.822 5.043 5.296 5.433 5.7 5.963 6.214 6.335 6.559 6.771 7.076 7.262 7.43 7.682 7.928 8.153 8.37 8.576 8.841 9.092 9.339 9.633 9.904 10.173 10.493 10.85 11.174 11.512 11.862 12.224 12.595 13.01 13.489 13.967 14.518 15.107 15.764 16.496 17.266 17.987 18.702 19.044 18.981 18.733 18.392 18.002 17.622 17.261 16.929 16.564 16.198 15.851 15.529 15.222 14.918 14.638 14.338 14.044 13.774 13.499 13.219 12.975 12.707 12.41 12.163 11.91 11.635 11.334 11.022 10.805 10.586 10.249 10.014 9.764 9.637 9.366 9.048 8.705 8.533 8.257 7.962 7.737 7.479 6.96 6.669 6.323 5.944 5.507 4.957 4.156 1.19 -7 ,22503 ,KEBNE ,16721151,Sat Nov 27 09:00:05 CET,Sat Nov 27 11:03:22 CET,0.0 1.658 2.197 2.585 2.922 3.205 3.453 3.686 4.106 4.3 4.478 4.691 4.95 5.098 5.364 5.602 5.821 5.93 6.151 6.374 6.672 6.853 7.037 7.3 7.543 7.772 7.998 8.214 8.493 8.748 8.977 9.26 9.532 9.79 10.09 10.428 10.738 11.041 11.392 11.767 12.147 12.58 13.057 13.524 14.044 14.62 15.277 15.98 16.762 17.562 18.221 18.396 18.246 17.947 17.622 17.281 16.89 16.465 16.084 15.703 15.328 14.968 14.641 14.33 14.014 13.714 13.389 13.075 12.804 12.521 12.214 11.953 11.666 11.376 11.151 10.907 10.649 10.36 10.059 9.856 9.637 9.298 9.064 8.821 8.696 8.431 8.145 7.833 7.658 7.374 7.083 6.866 6.637 6.144 5.846 5.501 5.122 4.684 4.072 3.225 -0.169 -8 ,8128 ,KEBNE ,16721152,Sat Nov 27 09:01:06 CET,Sat Nov 27 11:04:25 CET,0.0 1.745 2.307 2.702 3.04 3.335 3.596 3.828 4.212 4.387 4.562 4.783 5.031 5.175 5.445 5.705 5.95 6.067 6.288 6.49 6.78 6.967 7.148 7.402 7.648 7.889 8.118 8.33 8.585 8.836 9.083 9.38 9.665 9.929 10.235 10.57 10.898 11.257 11.608 11.981 12.384 12.844 13.378 13.89 14.43 15.018 15.707 16.45 17.301 18.17 18.862 19.082 18.968 18.688 18.327 17.936 17.575 17.211 16.848 16.427 16.049 15.694 15.342 15.037 14.752 14.469 14.139 13.829 13.574 13.308 13.031 12.801 12.549 12.281 12.057 11.817 11.574 11.315 11.019 10.805 10.585 10.242 9.985 9.706 9.569 9.291 8.999 8.666 8.48 8.198 7.893 7.666 7.414 6.819 6.46 6.062 5.652 5.217 4.655 3.885 1.392 -9 ,10678 ,KEBNE ,16721153,Sat Nov 27 09:00:06 CET,Sat Nov 27 11:03:56 CET,0.0 1.178 1.695 2.064 2.38 2.648 2.886 3.111 3.525 3.713 3.884 4.083 4.33 4.479 4.747 4.987 5.218 5.334 5.553 5.755 6.046 6.218 6.378 6.618 6.86 7.088 7.303 7.509 7.771 8.027 8.273 8.567 8.841 9.097 9.385 9.71 10.035 10.391 10.783 11.205 11.639 12.089 12.559 13.026 13.569 14.132 14.719 15.439 16.316 17.18 17.985 18.334 18.278 18.048 17.773 17.467 17.129 16.79 16.485 16.146 15.816 15.491 15.128 14.78 14.481 14.226 13.951 13.672 13.421 13.168 12.909 12.691 12.462 12.218 12.022 11.796 11.552 11.319 11.059 10.866 10.669 10.364 10.15 9.911 9.784 9.521 9.227 8.89 8.703 8.405 8.064 7.832 7.589 7.046 6.724 6.38 5.975 5.475 4.877 4.055 0.866 -10 ,16795 ,KEBNE ,16721154,Sat Nov 27 09:00:05 CET,Sat Nov 27 11:03:23 CET,0.0 1.235 1.726 2.119 2.465 2.753 3.01 3.245 3.673 3.866 4.043 4.257 4.502 4.646 4.924 5.185 5.428 5.538 5.739 5.94 6.231 6.411 6.589 6.852 7.097 7.326 7.553 7.769 8.042 8.299 8.543 8.831 9.105 9.375 9.696 10.038 10.346 10.678 11.047 11.451 11.877 12.345 12.891 13.442 14.044 14.66 15.33 16.054 16.873 17.704 18.469 18.74 18.558 18.275 18.0 17.704 17.352 16.997 16.667 16.28 15.933 15.623 15.311 14.981 14.655 14.369 14.059 13.756 13.483 13.207 12.932 12.708 12.458 12.177 11.961 11.733 11.489 11.22 10.915 10.709 10.506 10.183 9.961 9.725 9.604 9.343 9.06 8.753 8.578 8.304 8.006 7.807 7.603 7.109 6.808 6.467 6.086 5.641 5.118 4.351 1.367 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_55_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_55_35.txt deleted file mode 100644 index 30bd4abb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_55_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31495 ,KEBNE ,16721155,Sat Nov 27 09:00:05 CET,Sat Nov 27 11:01:18 CET,0.0 1.677 2.249 2.638 2.982 3.285 3.538 3.773 4.177 4.347 4.507 4.711 4.946 5.083 5.349 5.589 5.799 5.899 6.098 6.281 6.542 6.711 6.871 7.1 7.32 7.526 7.719 7.909 8.139 8.364 8.583 8.838 9.075 9.283 9.52 9.796 10.054 10.315 10.583 10.879 11.181 11.497 11.868 12.23 12.632 13.057 13.508 13.984 14.482 14.897 15.13 15.039 14.774 14.4 14.002 13.641 13.317 12.993 12.686 12.339 12.027 11.741 11.464 11.202 10.936 10.679 10.41 10.179 9.982 9.771 9.549 9.357 9.153 8.935 8.756 8.569 8.371 8.154 7.921 7.761 7.594 7.327 7.138 6.93 6.827 6.618 6.385 6.126 5.99 5.754 5.531 5.366 5.19 4.794 4.568 4.32 4.046 3.723 3.33 2.783 1.075 -2 ,13898 ,KEBNE ,16721156,Sat Nov 27 09:00:05 CET,Sat Nov 27 11:00:37 CET,0.0 1.551 2.112 2.5 2.825 3.125 3.388 3.616 4.016 4.184 4.341 4.552 4.784 4.914 5.15 5.371 5.583 5.686 5.883 6.072 6.341 6.502 6.657 6.884 7.1 7.305 7.499 7.684 7.921 8.141 8.353 8.598 8.821 9.039 9.287 9.553 9.804 10.082 10.358 10.648 10.949 11.256 11.61 11.956 12.32 12.689 13.088 13.51 13.918 14.268 14.487 14.418 14.156 13.808 13.448 13.085 12.736 12.398 12.075 11.728 11.432 11.17 10.917 10.67 10.419 10.177 9.928 9.698 9.487 9.265 9.033 8.836 8.618 8.382 8.2 8.017 7.829 7.63 7.421 7.272 7.119 6.875 6.696 6.504 6.399 6.183 5.958 5.722 5.594 5.357 5.166 5.007 4.833 4.449 4.233 3.989 3.71 3.381 2.98 2.438 0.163 -3 ,14112 ,KEBNE ,16721157,Sat Nov 27 09:01:06 CET,Sat Nov 27 11:02:11 CET,0.0 1.802 2.319 2.684 2.983 3.24 3.473 3.686 4.048 4.222 4.391 4.586 4.83 4.974 5.235 5.466 5.698 5.804 5.994 6.17 6.409 6.563 6.721 6.936 7.128 7.32 7.502 7.674 7.902 8.122 8.324 8.562 8.782 8.985 9.216 9.473 9.714 9.972 10.244 10.521 10.795 11.107 11.468 11.806 12.175 12.572 12.981 13.413 13.89 14.372 14.731 14.656 14.347 13.986 13.623 13.249 12.866 12.483 12.163 11.822 11.501 11.21 10.938 10.683 10.428 10.182 9.933 9.711 9.517 9.314 9.092 8.91 8.713 8.5 8.338 8.165 7.976 7.769 7.557 7.404 7.24 6.983 6.79 6.596 6.497 6.278 6.046 5.808 5.672 5.426 5.235 5.079 4.912 4.528 4.299 4.04 3.759 3.422 2.989 2.389 0.406 -4 ,17700 ,KEBNE ,16721158,Sat Nov 27 09:01:06 CET,Sat Nov 27 11:02:35 CET,0.0 1.739 2.301 2.697 3.018 3.287 3.524 3.735 4.11 4.278 4.433 4.625 4.872 5.011 5.261 5.486 5.699 5.802 6.006 6.202 6.479 6.651 6.804 7.023 7.24 7.444 7.635 7.816 8.051 8.275 8.479 8.72 8.939 9.146 9.387 9.654 9.903 10.166 10.446 10.735 11.042 11.367 11.704 12.042 12.412 12.795 13.222 13.646 14.077 14.487 14.822 14.824 14.586 14.274 13.904 13.516 13.15 12.809 12.51 12.196 11.912 11.651 11.376 11.112 10.87 10.649 10.415 10.192 9.994 9.789 9.557 9.356 9.156 8.939 8.771 8.6 8.41 8.208 7.998 7.851 7.697 7.446 7.256 7.049 6.94 6.723 6.491 6.229 6.095 5.862 5.673 5.516 5.347 4.953 4.727 4.479 4.203 3.888 3.488 2.95 1.074 -5 ,5628 ,KEBNE ,16721159,Sat Nov 27 09:01:06 CET,Sat Nov 27 11:01:52 CET,0.0 1.652 2.232 2.632 2.937 3.198 3.436 3.653 4.042 4.222 4.399 4.606 4.836 4.959 5.201 5.438 5.662 5.769 5.971 6.154 6.402 6.562 6.723 6.947 7.156 7.357 7.543 7.722 7.952 8.164 8.362 8.605 8.835 9.049 9.29 9.56 9.814 10.085 10.364 10.646 10.94 11.24 11.566 11.881 12.227 12.621 13.03 13.425 13.806 14.119 14.334 14.21 13.858 13.43 13.027 12.651 12.274 11.886 11.546 11.186 10.861 10.585 10.305 10.022 9.757 9.522 9.27 9.035 8.824 8.584 8.328 8.113 7.885 7.646 7.461 7.278 7.086 6.874 6.639 6.475 6.31 6.052 5.862 5.665 5.565 5.352 5.127 4.889 4.758 4.514 4.31 4.139 3.956 3.542 3.313 3.069 2.786 2.452 2.066 1.505 -0.455 -6 ,21427 ,KEBNE ,16721160,Sat Nov 27 09:01:06 CET,Sat Nov 27 11:02:14 CET,0.0 1.552 2.088 2.48 2.816 3.095 3.331 3.551 3.945 4.117 4.278 4.472 4.706 4.835 5.074 5.317 5.552 5.657 5.856 6.046 6.306 6.47 6.633 6.865 7.076 7.27 7.459 7.638 7.859 8.072 8.279 8.518 8.741 8.951 9.193 9.47 9.726 9.987 10.264 10.547 10.844 11.174 11.546 11.903 12.282 12.684 13.098 13.5 13.902 14.243 14.462 14.397 14.094 13.734 13.375 12.991 12.625 12.287 11.974 11.651 11.368 11.097 10.831 10.564 10.31 10.073 9.801 9.56 9.348 9.117 8.882 8.685 8.471 8.236 8.047 7.848 7.64 7.421 7.193 7.033 6.861 6.596 6.406 6.203 6.1 5.88 5.637 5.375 5.24 5.001 4.784 4.61 4.435 4.034 3.802 3.552 3.271 2.916 2.48 1.901 0.067 -7 ,18938 ,KEBNE ,16721161,Sat Nov 27 09:01:06 CET,Sat Nov 27 11:02:48 CET,0.0 1.706 2.246 2.63 2.96 3.231 3.454 3.666 4.046 4.218 4.379 4.569 4.793 4.921 5.166 5.392 5.6 5.699 5.893 6.076 6.334 6.496 6.654 6.868 7.069 7.27 7.463 7.648 7.883 8.104 8.311 8.545 8.765 8.988 9.24 9.499 9.743 10.002 10.282 10.576 10.863 11.182 11.534 11.852 12.219 12.638 13.103 13.54 13.961 14.364 14.645 14.632 14.436 14.142 13.828 13.479 13.108 12.746 12.396 12.01 11.671 11.382 11.109 10.834 10.562 10.301 10.025 9.787 9.575 9.341 9.09 8.884 8.667 8.427 8.239 8.044 7.831 7.608 7.373 7.207 7.027 6.751 6.561 6.357 6.253 6.032 5.791 5.534 5.395 5.14 4.913 4.739 4.559 4.168 3.943 3.691 3.424 3.091 2.656 2.076 0.046 -8 ,2955 ,KEBNE ,16721162,Sat Nov 27 09:01:06 CET,Sat Nov 27 11:02:43 CET,0.0 1.956 2.49 2.865 3.156 3.399 3.622 3.845 4.25 4.431 4.593 4.781 5.012 5.142 5.397 5.627 5.829 5.929 6.123 6.31 6.583 6.753 6.912 7.131 7.338 7.535 7.722 7.906 8.145 8.365 8.569 8.809 9.039 9.254 9.5 9.769 10.01 10.271 10.555 10.844 11.149 11.481 11.829 12.16 12.538 12.916 13.322 13.754 14.186 14.558 14.836 14.772 14.47 14.147 13.826 13.468 13.109 12.766 12.461 12.143 11.851 11.584 11.319 11.063 10.808 10.573 10.328 10.108 9.914 9.693 9.458 9.256 9.038 8.808 8.633 8.455 8.261 8.059 7.833 7.67 7.511 7.259 7.082 6.898 6.801 6.586 6.355 6.098 5.955 5.716 5.521 5.358 5.179 4.767 4.537 4.277 3.998 3.691 3.313 2.784 1.249 -9 ,1615 ,KEBNE ,16721163,Sat Nov 27 09:01:06 CET,Sat Nov 27 11:02:08 CET,0.0 1.615 2.193 2.62 2.955 3.23 3.47 3.69 4.068 4.239 4.41 4.631 4.876 5.011 5.27 5.504 5.723 5.833 6.048 6.243 6.514 6.691 6.854 7.079 7.295 7.497 7.687 7.862 8.091 8.311 8.516 8.755 8.977 9.192 9.442 9.722 9.972 10.233 10.508 10.793 11.085 11.391 11.74 12.085 12.479 12.883 13.277 13.676 14.091 14.433 14.645 14.518 14.151 13.75 13.362 12.986 12.639 12.289 11.953 11.604 11.323 11.053 10.754 10.461 10.171 9.888 9.596 9.345 9.126 8.906 8.673 8.472 8.269 8.05 7.877 7.693 7.485 7.269 7.044 6.882 6.719 6.469 6.287 6.094 5.994 5.773 5.525 5.265 5.133 4.888 4.662 4.49 4.313 3.932 3.708 3.438 3.143 2.815 2.401 1.788 -0.515 -10 ,14812 ,KEBNE ,16721164,Sat Nov 27 09:01:06 CET,Sat Nov 27 11:02:02 CET,0.0 1.732 2.269 2.659 2.996 3.286 3.533 3.749 4.131 4.316 4.493 4.705 4.942 5.075 5.319 5.535 5.739 5.84 6.032 6.222 6.506 6.685 6.841 7.056 7.259 7.458 7.655 7.843 8.078 8.293 8.489 8.726 8.959 9.173 9.415 9.68 9.931 10.2 10.477 10.765 11.058 11.365 11.723 12.081 12.469 12.874 13.299 13.694 14.086 14.457 14.649 14.548 14.299 13.965 13.629 13.278 12.93 12.588 12.269 11.947 11.642 11.343 11.073 10.825 10.584 10.348 10.078 9.833 9.621 9.393 9.151 8.954 8.749 8.532 8.355 8.166 7.968 7.764 7.553 7.407 7.256 6.999 6.811 6.612 6.509 6.296 6.061 5.804 5.668 5.423 5.215 5.042 4.859 4.47 4.241 3.991 3.71 3.361 2.941 2.419 0.885 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_35.txt deleted file mode 100644 index 5f3c5875..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22021 ,KEBNE ,16721165,Sat Nov 27 09:02:07 CET,Sat Nov 27 11:04:38 CET,0.0 1.768 2.306 2.705 3.036 3.301 3.542 3.767 4.18 4.367 4.535 4.749 4.995 5.132 5.393 5.642 5.881 5.992 6.189 6.378 6.659 6.831 6.99 7.221 7.444 7.654 7.848 8.034 8.269 8.494 8.721 9.001 9.271 9.52 9.795 10.092 10.371 10.678 10.994 11.309 11.626 11.984 12.419 12.825 13.245 13.706 14.253 14.868 15.536 16.24 16.886 17.134 17.102 16.971 16.749 16.455 16.145 15.849 15.595 15.337 15.11 14.892 14.659 14.431 14.215 13.998 13.758 13.54 13.354 13.152 12.925 12.733 12.538 12.338 12.174 11.985 11.784 11.572 11.347 11.19 11.028 10.781 10.602 10.396 10.288 10.058 9.803 9.535 9.393 9.141 8.916 8.731 8.537 8.101 7.855 7.572 7.236 6.873 6.395 5.657 2.541 -2 ,23155 ,KEBNE ,16721166,Sat Nov 27 09:02:07 CET,Sat Nov 27 11:04:27 CET,0.0 1.71 2.218 2.595 2.93 3.216 3.458 3.676 4.071 4.243 4.397 4.584 4.821 4.957 5.213 5.44 5.648 5.748 5.952 6.145 6.397 6.561 6.725 6.956 7.183 7.403 7.603 7.795 8.05 8.287 8.513 8.795 9.058 9.291 9.556 9.846 10.114 10.418 10.741 11.057 11.377 11.742 12.154 12.564 13.017 13.484 14.005 14.573 15.187 15.814 16.418 16.658 16.587 16.392 16.108 15.784 15.471 15.181 14.899 14.589 14.29 14.014 13.78 13.536 13.276 13.028 12.77 12.541 12.327 12.093 11.843 11.648 11.447 11.214 11.034 10.842 10.634 10.424 10.203 10.044 9.878 9.612 9.428 9.233 9.129 8.919 8.689 8.43 8.289 8.046 7.847 7.686 7.51 7.105 6.863 6.604 6.319 5.97 5.558 4.994 2.45 -3 ,3084 ,KEBNE ,16721167,Sat Nov 27 09:02:07 CET,Sat Nov 27 11:04:34 CET,0.0 1.806 2.394 2.806 3.151 3.433 3.673 3.896 4.286 4.459 4.626 4.831 5.069 5.2 5.454 5.703 5.934 6.041 6.239 6.42 6.688 6.862 7.022 7.25 7.466 7.671 7.868 8.06 8.314 8.55 8.773 9.029 9.263 9.498 9.774 10.078 10.351 10.633 10.935 11.257 11.592 11.96 12.378 12.77 13.229 13.761 14.349 14.964 15.648 16.353 17.015 17.281 17.214 16.994 16.727 16.443 16.124 15.784 15.48 15.158 14.874 14.617 14.368 14.135 13.904 13.677 13.431 13.214 13.028 12.827 12.615 12.446 12.255 12.039 11.865 11.673 11.471 11.26 11.039 10.885 10.725 10.478 10.295 10.087 9.98 9.768 9.525 9.252 9.109 8.863 8.641 8.467 8.287 7.877 7.637 7.369 7.065 6.705 6.263 5.643 3.353 -4 ,21993 ,KEBNE ,16721168,Sat Nov 27 09:02:07 CET,Sat Nov 27 11:05:48 CET,0.0 1.35 1.819 2.175 2.494 2.767 3.012 3.256 3.676 3.851 4.019 4.235 4.481 4.619 4.876 5.114 5.348 5.459 5.668 5.863 6.133 6.314 6.482 6.711 6.939 7.159 7.365 7.565 7.819 8.046 8.261 8.524 8.776 9.022 9.3 9.586 9.854 10.17 10.51 10.862 11.226 11.6 12.022 12.462 12.967 13.475 14.0 14.582 15.285 16.003 16.545 16.7 16.588 16.342 16.06 15.79 15.522 15.237 14.963 14.661 14.39 14.139 13.888 13.63 13.38 13.154 12.915 12.698 12.502 12.285 12.04 11.832 11.617 11.383 11.2 11.02 10.839 10.64 10.419 10.266 10.109 9.841 9.648 9.456 9.352 9.14 8.917 8.664 8.535 8.306 8.095 7.924 7.749 7.362 7.141 6.903 6.625 6.268 5.785 5.125 1.752 -5 ,30125 ,KEBNE ,16721169,Sat Nov 27 09:02:07 CET,Sat Nov 27 11:04:14 CET,0.0 1.393 1.928 2.328 2.672 2.95 3.177 3.392 3.764 3.94 4.109 4.307 4.538 4.672 4.92 5.15 5.369 5.476 5.678 5.88 6.166 6.334 6.498 6.738 6.963 7.174 7.372 7.557 7.802 8.036 8.26 8.539 8.802 9.034 9.303 9.609 9.881 10.178 10.504 10.841 11.181 11.553 11.97 12.392 12.878 13.37 13.901 14.468 15.055 15.662 16.174 16.234 16.017 15.731 15.412 15.076 14.737 14.403 14.116 13.817 13.551 13.305 13.056 12.786 12.525 12.284 12.024 11.792 11.578 11.347 11.107 10.908 10.698 10.475 10.299 10.113 9.908 9.7 9.482 9.323 9.158 8.89 8.692 8.482 8.376 8.156 7.915 7.669 7.543 7.302 7.086 6.925 6.752 6.325 6.086 5.83 5.532 5.178 4.744 4.105 1.76 -6 ,3949 ,KEBNE ,16721170,Sat Nov 27 09:02:07 CET,Sat Nov 27 11:05:39 CET,0.0 1.581 2.094 2.479 2.795 3.066 3.308 3.523 3.889 4.064 4.232 4.429 4.674 4.815 5.065 5.304 5.531 5.636 5.832 6.017 6.292 6.469 6.636 6.879 7.115 7.331 7.528 7.726 7.976 8.209 8.437 8.714 8.975 9.207 9.467 9.769 10.059 10.37 10.689 11.018 11.365 11.75 12.18 12.584 13.051 13.573 14.126 14.753 15.473 16.212 16.884 17.138 17.066 16.871 16.65 16.394 16.109 15.824 15.534 15.204 14.925 14.673 14.393 14.112 13.864 13.631 13.382 13.154 12.951 12.739 12.521 12.327 12.103 11.869 11.684 11.484 11.272 11.059 10.842 10.693 10.534 10.28 10.102 9.916 9.822 9.614 9.384 9.141 9.01 8.782 8.595 8.436 8.257 7.836 7.599 7.34 7.054 6.716 6.289 5.689 3.488 -7 ,26643 ,KEBNE ,16721171,Sat Nov 27 09:02:08 CET,Sat Nov 27 11:04:33 CET,0.0 1.606 2.178 2.606 2.955 3.256 3.5 3.706 4.083 4.266 4.436 4.626 4.867 5.012 5.277 5.518 5.748 5.86 6.071 6.266 6.533 6.706 6.882 7.127 7.348 7.559 7.754 7.937 8.166 8.388 8.613 8.877 9.133 9.374 9.628 9.908 10.189 10.501 10.824 11.148 11.491 11.877 12.321 12.754 13.227 13.761 14.366 14.976 15.633 16.293 16.866 17.103 17.067 16.903 16.672 16.411 16.126 15.851 15.606 15.34 15.074 14.825 14.598 14.353 14.107 13.878 13.636 13.409 13.207 12.993 12.76 12.568 12.366 12.152 11.974 11.782 11.583 11.379 11.168 11.012 10.853 10.62 10.451 10.261 10.16 9.945 9.725 9.487 9.354 9.117 8.909 8.738 8.552 8.128 7.896 7.652 7.38 7.041 6.598 5.922 3.156 -8 ,15254 ,KEBNE ,16721172,Sat Nov 27 09:02:07 CET,Sat Nov 27 11:05:59 CET,0.0 1.961 2.508 2.906 3.24 3.515 3.761 3.987 4.391 4.57 4.735 4.936 5.176 5.312 5.569 5.808 6.025 6.131 6.336 6.533 6.8 6.968 7.133 7.364 7.586 7.8 8.012 8.211 8.448 8.666 8.875 9.13 9.368 9.6 9.866 10.161 10.447 10.762 11.098 11.435 11.787 12.173 12.591 13.009 13.498 14.014 14.557 15.128 15.74 16.384 16.998 17.269 17.279 17.161 16.955 16.706 16.428 16.128 15.852 15.553 15.26 14.982 14.708 14.446 14.209 13.998 13.759 13.521 13.316 13.113 12.901 12.71 12.502 12.273 12.086 11.893 11.698 11.5 11.276 11.117 10.953 10.69 10.499 10.304 10.204 9.987 9.753 9.508 9.374 9.13 8.914 8.744 8.549 8.108 7.859 7.584 7.272 6.891 6.434 5.77 3.211 -9 ,21665 ,KEBNE ,16721173,Sat Nov 27 09:02:08 CET,Sat Nov 27 11:06:00 CET,0.0 1.947 2.467 2.853 3.173 3.456 3.706 3.925 4.331 4.52 4.698 4.908 5.153 5.288 5.539 5.786 6.019 6.126 6.327 6.525 6.81 6.988 7.16 7.403 7.63 7.844 8.047 8.241 8.49 8.723 8.945 9.203 9.44 9.67 9.931 10.225 10.51 10.82 11.158 11.514 11.878 12.265 12.701 13.18 13.76 14.345 14.949 15.579 16.237 16.92 17.573 17.875 17.877 17.712 17.462 17.182 16.914 16.644 16.369 16.041 15.755 15.52 15.274 15.03 14.794 14.58 14.345 14.116 13.923 13.724 13.511 13.332 13.144 12.939 12.779 12.6 12.402 12.2 11.984 11.833 11.675 11.433 11.265 11.076 10.971 10.749 10.516 10.27 10.144 9.914 9.719 9.543 9.348 8.915 8.672 8.407 8.085 7.687 7.229 6.609 3.618 -10 ,212 ,KEBNE ,16721174,Sat Nov 27 09:02:07 CET,Sat Nov 27 11:06:04 CET,0.0 1.696 2.198 2.582 2.924 3.203 3.439 3.653 4.04 4.211 4.371 4.577 4.829 4.966 5.217 5.438 5.644 5.745 5.937 6.122 6.402 6.578 6.738 6.977 7.208 7.434 7.644 7.825 8.056 8.285 8.523 8.805 9.051 9.298 9.574 9.861 10.139 10.45 10.779 11.124 11.475 11.85 12.278 12.702 13.171 13.68 14.264 14.864 15.496 16.128 16.751 17.071 17.059 16.864 16.605 16.317 16.018 15.726 15.461 15.192 14.95 14.717 14.481 14.251 14.027 13.803 13.56 13.35 13.164 12.949 12.714 12.522 12.322 12.101 11.924 11.756 11.581 11.373 11.152 11.002 10.844 10.593 10.42 10.237 10.14 9.934 9.713 9.472 9.345 9.118 8.911 8.753 8.572 8.166 7.939 7.689 7.41 7.07 6.614 5.941 3.72 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_55.txt deleted file mode 100644 index 7807f625..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_56_55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19474 ,KEBNE ,16721175,Sat Nov 27 09:02:07 CET,Sat Nov 27 11:05:53 CET,0.0 1.738 2.258 2.647 2.982 3.258 3.511 3.743 4.147 4.326 4.491 4.689 4.932 5.074 5.349 5.6 5.827 5.933 6.127 6.315 6.587 6.76 6.929 7.164 7.388 7.599 7.79 7.974 8.211 8.428 8.63 8.889 9.144 9.376 9.651 9.961 10.239 10.52 10.808 11.119 11.467 11.861 12.295 12.712 13.188 13.705 14.257 14.839 15.466 16.131 16.736 16.949 16.872 16.675 16.423 16.108 15.779 15.479 15.202 14.92 14.658 14.392 14.119 13.848 13.595 13.361 13.112 12.888 12.691 12.475 12.253 12.062 11.84 11.605 11.425 11.232 11.035 10.838 10.629 10.483 10.321 10.05 9.862 9.665 9.563 9.357 9.13 8.877 8.748 8.514 8.306 8.136 7.953 7.56 7.338 7.092 6.807 6.472 6.044 5.457 3.316 -2 ,7243 ,KEBNE ,16721176,Sat Nov 27 09:02:08 CET,Sat Nov 27 11:05:46 CET,0.0 1.591 2.12 2.519 2.84 3.103 3.342 3.556 3.943 4.116 4.278 4.486 4.723 4.854 5.111 5.337 5.547 5.647 5.834 6.023 6.298 6.469 6.63 6.868 7.094 7.303 7.508 7.699 7.931 8.15 8.367 8.626 8.875 9.117 9.404 9.724 10.022 10.336 10.661 10.993 11.34 11.73 12.155 12.564 13.008 13.487 14.044 14.644 15.28 15.935 16.562 16.745 16.639 16.409 16.153 15.894 15.59 15.278 14.985 14.668 14.393 14.14 13.879 13.628 13.392 13.163 12.916 12.691 12.49 12.278 12.06 11.881 11.68 11.459 11.29 11.112 10.927 10.738 10.535 10.389 10.24 9.99 9.812 9.623 9.519 9.311 9.082 8.841 8.711 8.477 8.308 8.158 7.982 7.553 7.299 7.029 6.742 6.397 5.952 5.34 3.511 -3 ,9820 ,KEBNE ,16721177,Sat Nov 27 09:03:08 CET,Sat Nov 27 11:06:59 CET,0.0 1.897 2.465 2.869 3.192 3.487 3.754 3.982 4.36 4.535 4.702 4.9 5.144 5.275 5.527 5.777 6.004 6.11 6.315 6.507 6.771 6.939 7.107 7.335 7.547 7.754 7.949 8.132 8.367 8.592 8.805 9.053 9.278 9.504 9.774 10.056 10.324 10.621 10.931 11.266 11.598 11.953 12.37 12.784 13.26 13.753 14.265 14.817 15.441 16.093 16.67 16.891 16.857 16.619 16.31 16.025 15.77 15.478 15.177 14.867 14.591 14.344 14.106 13.878 13.655 13.434 13.195 12.98 12.783 12.579 12.363 12.173 11.971 11.75 11.569 11.392 11.207 11.009 10.81 10.673 10.524 10.289 10.121 9.939 9.84 9.625 9.397 9.144 9.011 8.785 8.606 8.456 8.29 7.91 7.684 7.42 7.132 6.81 6.392 5.753 3.021 -4 ,16878 ,KEBNE ,16721178,Sat Nov 27 09:03:08 CET,Sat Nov 27 11:06:20 CET,0.0 1.571 2.114 2.509 2.826 3.097 3.339 3.548 3.917 4.087 4.247 4.437 4.692 4.83 5.079 5.317 5.537 5.644 5.857 6.059 6.34 6.509 6.664 6.884 7.097 7.305 7.508 7.704 7.95 8.193 8.424 8.689 8.938 9.173 9.447 9.761 10.051 10.354 10.681 11.013 11.349 11.721 12.152 12.59 13.088 13.588 14.139 14.755 15.417 16.105 16.736 16.975 16.942 16.8 16.585 16.309 16.023 15.736 15.445 15.143 14.874 14.62 14.374 14.126 13.881 13.656 13.433 13.228 13.039 12.829 12.601 12.416 12.213 11.986 11.811 11.628 11.426 11.215 11.002 10.855 10.7 10.452 10.267 10.069 9.968 9.759 9.541 9.296 9.156 8.917 8.735 8.577 8.399 7.998 7.761 7.481 7.163 6.815 6.402 5.792 3.857 -5 ,13261 ,KEBNE ,16721179,Sat Nov 27 09:03:08 CET,Sat Nov 27 11:06:28 CET,0.0 1.677 2.206 2.626 2.983 3.293 3.578 3.826 4.226 4.403 4.572 4.79 5.045 5.19 5.466 5.702 5.921 6.026 6.224 6.405 6.659 6.827 6.989 7.209 7.422 7.624 7.813 7.996 8.232 8.473 8.698 8.946 9.181 9.409 9.666 9.948 10.219 10.516 10.843 11.176 11.495 11.848 12.245 12.639 13.097 13.565 14.057 14.609 15.217 15.837 16.448 16.69 16.592 16.365 16.122 15.857 15.566 15.266 14.979 14.684 14.418 14.169 13.922 13.667 13.419 13.196 12.962 12.751 12.562 12.354 12.135 11.954 11.757 11.542 11.382 11.211 11.034 10.847 10.635 10.49 10.333 10.075 9.889 9.69 9.586 9.372 9.137 8.876 8.745 8.517 8.306 8.132 7.946 7.528 7.284 7.006 6.698 6.342 5.921 5.313 3.168 -6 ,10124 ,KEBNE ,16721180,Sat Nov 27 09:03:08 CET,Sat Nov 27 11:06:29 CET,0.0 1.634 2.139 2.528 2.863 3.138 3.374 3.59 3.963 4.133 4.299 4.509 4.746 4.881 5.133 5.365 5.592 5.699 5.894 6.083 6.346 6.509 6.668 6.897 7.109 7.303 7.483 7.658 7.886 8.112 8.333 8.594 8.849 9.088 9.354 9.654 9.923 10.2 10.5 10.813 11.123 11.464 11.866 12.252 12.665 13.136 13.683 14.23 14.785 15.347 15.883 16.112 16.02 15.8 15.553 15.269 14.958 14.65 14.363 14.056 13.78 13.506 13.24 12.988 12.73 12.479 12.222 12.005 11.806 11.595 11.384 11.202 10.997 10.782 10.615 10.436 10.25 10.042 9.822 9.672 9.51 9.247 9.052 8.847 8.746 8.536 8.316 8.073 7.945 7.716 7.494 7.323 7.136 6.73 6.512 6.257 5.955 5.607 5.174 4.562 2.42 -7 ,6452 ,KEBNE ,16721181,Sat Nov 27 09:03:08 CET,Sat Nov 27 11:06:26 CET,0.0 1.832 2.397 2.784 3.103 3.391 3.64 3.855 4.238 4.406 4.559 4.755 4.993 5.121 5.361 5.591 5.81 5.917 6.127 6.314 6.568 6.727 6.888 7.133 7.356 7.561 7.767 7.959 8.184 8.403 8.617 8.869 9.107 9.339 9.61 9.916 10.202 10.497 10.809 11.14 11.488 11.853 12.257 12.661 13.132 13.642 14.202 14.801 15.433 16.085 16.674 16.911 16.825 16.594 16.342 16.044 15.738 15.438 15.134 14.816 14.545 14.281 14.007 13.757 13.523 13.293 13.047 12.83 12.63 12.41 12.174 11.972 11.772 11.57 11.416 11.249 11.058 10.854 10.649 10.506 10.347 10.075 9.883 9.697 9.605 9.404 9.173 8.918 8.787 8.555 8.35 8.189 8.023 7.637 7.407 7.155 6.872 6.535 6.109 5.506 3.297 -8 ,29864 ,KEBNE ,16721182,Sat Nov 27 09:03:08 CET,Sat Nov 27 11:06:39 CET,0.0 1.466 1.976 2.391 2.726 2.999 3.24 3.459 3.853 4.035 4.199 4.402 4.662 4.806 5.071 5.298 5.506 5.608 5.806 5.997 6.262 6.429 6.585 6.802 7.023 7.234 7.428 7.622 7.871 8.1 8.315 8.564 8.791 8.999 9.252 9.533 9.786 10.062 10.368 10.699 11.047 11.428 11.866 12.279 12.735 13.244 13.799 14.357 14.924 15.514 16.031 16.219 16.164 15.966 15.693 15.395 15.067 14.727 14.412 14.059 13.757 13.507 13.253 13.0 12.75 12.507 12.27 12.056 11.858 11.643 11.406 11.204 10.983 10.753 10.574 10.379 10.18 9.973 9.755 9.604 9.447 9.196 9.022 8.834 8.731 8.508 8.282 8.028 7.888 7.649 7.441 7.269 7.087 6.673 6.444 6.193 5.898 5.537 5.103 4.51 2.859 -9 ,6613 ,KEBNE ,16721183,Sat Nov 27 09:03:08 CET,Sat Nov 27 11:05:36 CET,0.0 1.798 2.377 2.778 3.098 3.387 3.638 3.87 4.297 4.485 4.662 4.871 5.121 5.257 5.504 5.733 5.953 6.061 6.263 6.456 6.737 6.911 7.083 7.322 7.537 7.747 7.95 8.138 8.39 8.647 8.883 9.145 9.392 9.634 9.897 10.172 10.447 10.751 11.069 11.42 11.782 12.144 12.535 12.925 13.382 13.878 14.443 15.03 15.636 16.262 16.903 17.209 17.124 16.869 16.568 16.245 15.878 15.502 15.189 14.862 14.577 14.308 14.034 13.765 13.505 13.276 13.029 12.792 12.583 12.367 12.138 11.937 11.724 11.507 11.337 11.149 10.936 10.714 10.482 10.328 10.174 9.932 9.756 9.563 9.461 9.241 9.002 8.741 8.603 8.356 8.139 7.969 7.788 7.374 7.141 6.893 6.596 6.254 5.828 5.214 2.866 -10 ,7444 ,KEBNE ,16721184,Sat Nov 27 09:03:09 CET,Sat Nov 27 11:07:45 CET,0.0 1.304 1.811 2.195 2.513 2.794 3.034 3.256 3.644 3.816 3.981 4.172 4.408 4.54 4.795 5.028 5.243 5.346 5.542 5.727 5.989 6.16 6.336 6.574 6.787 6.997 7.205 7.406 7.663 7.905 8.125 8.388 8.638 8.864 9.116 9.391 9.65 9.935 10.249 10.596 10.943 11.317 11.756 12.174 12.636 13.141 13.695 14.248 14.851 15.501 15.998 16.097 15.976 15.752 15.47 15.185 14.862 14.54 14.266 13.969 13.693 13.45 13.223 12.985 12.75 12.52 12.265 12.044 11.857 11.644 11.41 11.219 11.01 10.795 10.626 10.447 10.259 10.061 9.858 9.71 9.555 9.331 9.165 8.966 8.866 8.663 8.448 8.22 8.101 7.873 7.676 7.516 7.333 6.92 6.689 6.421 6.117 5.752 5.309 4.73 1.9 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_57_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_57_35.txt deleted file mode 100644 index 7abd409a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_57_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22127 ,KEBNE ,16721185,Sat Nov 27 09:03:08 CET,Sat Nov 27 11:05:45 CET,0.0 1.599 2.126 2.496 2.812 3.076 3.308 3.522 3.9 4.06 4.209 4.398 4.616 4.734 4.966 5.183 5.372 5.463 5.646 5.821 6.072 6.226 6.378 6.59 6.784 6.964 7.133 7.297 7.508 7.7 7.872 8.09 8.294 8.477 8.672 8.882 9.094 9.329 9.561 9.786 10.025 10.284 10.545 10.807 11.093 11.347 11.609 11.827 11.983 12.023 11.783 11.137 10.39 9.652 8.974 8.349 7.772 7.237 6.769 6.311 5.908 5.539 5.174 4.831 4.511 4.186 3.831 3.523 3.249 2.962 2.645 2.37 2.104 1.829 1.61 1.389 1.152 0.897 0.634 0.452 0.264 -0.045 -0.266 -0.485 -0.592 -0.823 -1.085 -1.375 -1.532 -1.794 -2.042 -2.228 -2.426 -2.881 -3.143 -3.445 -3.765 -4.145 -4.629 -5.266 -7.158 -2 ,28709 ,KEBNE ,16721186,Sat Nov 27 09:03:08 CET,Sat Nov 27 11:05:15 CET,0.0 1.498 2.021 2.416 2.734 2.995 3.237 3.462 3.829 3.996 4.167 4.377 4.599 4.719 4.945 5.152 5.34 5.43 5.616 5.791 6.029 6.174 6.314 6.53 6.737 6.925 7.095 7.261 7.474 7.666 7.844 8.06 8.273 8.47 8.686 8.919 9.132 9.359 9.586 9.826 10.077 10.35 10.641 10.888 11.142 11.397 11.648 11.859 12.001 11.989 11.596 10.794 9.962 9.144 8.422 7.782 7.197 6.62 6.112 5.626 5.189 4.79 4.402 4.032 3.689 3.373 3.038 2.731 2.455 2.157 1.845 1.585 1.31 1.022 0.806 0.596 0.376 0.122 -0.143 -0.322 -0.512 -0.809 -1.021 -1.248 -1.37 -1.627 -1.905 -2.208 -2.357 -2.607 -2.854 -3.055 -3.261 -3.715 -3.985 -4.273 -4.589 -4.972 -5.445 -6.051 -8.22 -3 ,21660 ,KEBNE ,16721187,Sat Nov 27 09:03:08 CET,Sat Nov 27 11:05:43 CET,0.0 1.315 1.825 2.196 2.504 2.766 2.997 3.206 3.564 3.731 3.884 4.062 4.289 4.421 4.672 4.888 5.087 5.187 5.371 5.541 5.777 5.926 6.072 6.277 6.466 6.65 6.83 6.993 7.183 7.367 7.552 7.774 7.975 8.162 8.377 8.605 8.812 9.038 9.271 9.5 9.725 9.966 10.246 10.495 10.737 10.99 11.262 11.543 11.771 11.795 11.413 10.631 9.841 9.079 8.408 7.799 7.246 6.726 6.274 5.797 5.373 4.982 4.597 4.24 3.893 3.583 3.264 2.955 2.69 2.416 2.117 1.87 1.611 1.333 1.113 0.889 0.664 0.419 0.148 -0.044 -0.252 -0.576 -0.803 -1.059 -1.191 -1.441 -1.708 -1.997 -2.142 -2.4 -2.673 -2.882 -3.1 -3.551 -3.801 -4.111 -4.463 -4.84 -5.298 -5.918 -7.761 -4 ,27259 ,KEBNE ,16721188,Sat Nov 27 09:03:08 CET,Sat Nov 27 11:05:45 CET,0.0 2.384 2.954 3.369 3.699 3.977 4.227 4.437 4.781 4.95 5.12 5.316 5.544 5.684 5.941 6.19 6.416 6.514 6.692 6.866 7.109 7.262 7.407 7.609 7.814 8.005 8.18 8.347 8.56 8.773 8.968 9.183 9.378 9.57 9.789 10.02 10.239 10.475 10.726 10.976 11.213 11.465 11.758 12.025 12.288 12.564 12.832 13.045 13.179 13.19 12.852 12.13 11.34 10.548 9.844 9.146 8.546 8.045 7.574 7.081 6.648 6.262 5.879 5.517 5.175 4.837 4.49 4.201 3.934 3.642 3.341 3.086 2.823 2.539 2.311 2.073 1.83 1.589 1.331 1.151 0.959 0.649 0.431 0.195 0.073 -0.18 -0.439 -0.724 -0.883 -1.159 -1.436 -1.635 -1.858 -2.313 -2.55 -2.818 -3.127 -3.484 -3.912 -4.528 -6.369 -5 ,8770 ,KEBNE ,16721189,Sat Nov 27 09:03:08 CET,Sat Nov 27 11:05:15 CET,0.0 1.74 2.262 2.66 2.991 3.276 3.536 3.755 4.114 4.27 4.42 4.611 4.84 4.967 5.207 5.433 5.647 5.746 5.928 6.099 6.34 6.493 6.638 6.856 7.06 7.242 7.417 7.585 7.799 8.002 8.195 8.414 8.606 8.786 8.993 9.219 9.431 9.659 9.897 10.144 10.391 10.649 10.94 11.216 11.501 11.773 12.002 12.196 12.368 12.386 12.024 11.238 10.449 9.721 9.049 8.417 7.844 7.313 6.853 6.389 5.984 5.608 5.239 4.898 4.586 4.285 3.961 3.684 3.441 3.173 2.88 2.64 2.399 2.142 1.933 1.716 1.493 1.255 0.998 0.821 0.636 0.34 0.113 -0.132 -0.252 -0.493 -0.763 -1.048 -1.205 -1.48 -1.744 -1.929 -2.121 -2.565 -2.828 -3.094 -3.392 -3.745 -4.155 -4.778 -6.767 -6 ,19347 ,KEBNE ,16721190,Sat Nov 27 09:04:09 CET,Sat Nov 27 11:07:24 CET,0.0 1.608 2.156 2.524 2.815 3.088 3.337 3.551 3.92 4.077 4.23 4.428 4.657 4.788 5.014 5.228 5.42 5.515 5.707 5.883 6.117 6.269 6.417 6.62 6.808 6.985 7.16 7.329 7.532 7.72 7.901 8.119 8.318 8.502 8.714 8.948 9.167 9.403 9.649 9.897 10.145 10.408 10.696 10.966 11.218 11.489 11.8 12.031 12.207 12.232 11.875 11.093 10.272 9.51 8.842 8.189 7.562 6.998 6.515 6.014 5.569 5.163 4.784 4.432 4.084 3.759 3.403 3.083 2.807 2.517 2.213 1.951 1.692 1.424 1.204 0.97 0.716 0.463 0.216 0.032 -0.159 -0.451 -0.66 -0.887 -1.009 -1.267 -1.548 -1.845 -1.998 -2.252 -2.51 -2.707 -2.916 -3.376 -3.624 -3.898 -4.214 -4.567 -4.988 -5.6 -7.387 -7 ,12897 ,KEBNE ,16721191,Sat Nov 27 09:04:08 CET,Sat Nov 27 11:05:23 CET,0.0 2.427 3.0 3.393 3.707 3.976 4.218 4.434 4.823 4.992 5.146 5.348 5.572 5.69 5.917 6.13 6.334 6.431 6.608 6.781 7.031 7.189 7.328 7.534 7.744 7.939 8.121 8.285 8.479 8.668 8.858 9.084 9.305 9.512 9.735 9.98 10.208 10.447 10.68 10.911 11.146 11.404 11.71 11.982 12.239 12.49 12.743 12.945 13.084 13.08 12.698 11.926 11.141 10.44 9.807 9.197 8.653 8.161 7.71 7.238 6.809 6.409 6.032 5.683 5.351 5.034 4.685 4.379 4.109 3.835 3.553 3.301 3.038 2.76 2.537 2.307 2.065 1.811 1.548 1.362 1.165 0.854 0.64 0.417 0.3 0.055 -0.215 -0.516 -0.682 -0.95 -1.196 -1.378 -1.581 -2.043 -2.289 -2.556 -2.862 -3.254 -3.728 -4.324 -6.009 -8 ,7915 ,KEBNE ,16721192,Sat Nov 27 09:04:09 CET,Sat Nov 27 11:08:04 CET,0.0 1.608 2.12 2.508 2.8 3.05 3.276 3.491 3.861 4.02 4.179 4.39 4.62 4.751 4.983 5.193 5.395 5.496 5.695 5.877 6.119 6.27 6.417 6.625 6.818 6.994 7.161 7.326 7.529 7.721 7.918 8.14 8.33 8.507 8.714 8.955 9.177 9.403 9.625 9.848 10.084 10.346 10.618 10.855 11.097 11.328 11.559 11.742 11.847 11.848 11.564 10.842 10.029 9.229 8.543 7.936 7.361 6.83 6.381 5.924 5.511 5.142 4.789 4.436 4.101 3.796 3.477 3.174 2.903 2.628 2.354 2.12 1.861 1.594 1.375 1.136 0.891 0.623 0.355 0.174 -0.014 -0.302 -0.51 -0.745 -0.869 -1.115 -1.38 -1.66 -1.806 -2.054 -2.279 -2.467 -2.663 -3.08 -3.339 -3.633 -3.963 -4.352 -4.791 -5.363 -7.228 -9 ,6956 ,KEBNE ,16721193,Sat Nov 27 09:04:09 CET,Sat Nov 27 11:07:57 CET,0.0 1.573 2.112 2.507 2.815 3.075 3.316 3.531 3.91 4.082 4.247 4.444 4.664 4.793 5.046 5.257 5.446 5.541 5.725 5.899 6.135 6.282 6.431 6.641 6.83 7.01 7.186 7.353 7.558 7.752 7.939 8.158 8.381 8.584 8.792 9.018 9.226 9.449 9.683 9.916 10.143 10.379 10.644 10.895 11.137 11.393 11.624 11.785 11.923 11.914 11.598 10.932 10.176 9.443 8.788 8.178 7.623 7.118 6.677 6.196 5.764 5.386 5.023 4.669 4.333 4.032 3.688 3.376 3.121 2.852 2.569 2.33 2.087 1.824 1.599 1.366 1.117 0.861 0.603 0.416 0.221 -0.096 -0.327 -0.57 -0.692 -0.927 -1.188 -1.48 -1.627 -1.883 -2.132 -2.323 -2.527 -2.965 -3.22 -3.513 -3.848 -4.229 -4.688 -5.354 -7.403 -10 ,29313 ,KEBNE ,16721194,Sat Nov 27 09:06:11 CET,Sat Nov 27 11:09:11 CET,0.0 1.601 2.149 2.555 2.858 3.119 3.36 3.578 3.982 4.166 4.328 4.528 4.756 4.883 5.124 5.341 5.544 5.635 5.806 5.979 6.225 6.381 6.528 6.727 6.918 7.1 7.279 7.448 7.659 7.86 8.036 8.241 8.452 8.649 8.852 9.076 9.273 9.495 9.727 9.951 10.179 10.42 10.702 10.948 11.196 11.452 11.693 11.871 11.984 11.957 11.599 10.947 10.274 9.584 8.939 8.341 7.777 7.243 6.781 6.284 5.833 5.441 5.076 4.73 4.399 4.098 3.785 3.484 3.211 2.929 2.632 2.378 2.12 1.847 1.626 1.402 1.16 0.896 0.618 0.423 0.226 -0.077 -0.288 -0.511 -0.632 -0.881 -1.141 -1.437 -1.591 -1.839 -2.099 -2.299 -2.507 -2.963 -3.214 -3.487 -3.806 -4.188 -4.637 -5.252 -7.362 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_58.txt deleted file mode 100644 index 52759800..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15840 ,KEBNE ,16721195,Sat Nov 27 09:06:11 CET,Sat Nov 27 11:07:18 CET,0.0 1.148 1.653 2.034 2.361 2.643 2.891 3.117 3.518 3.685 3.834 4.024 4.237 4.367 4.606 4.819 5.019 5.112 5.287 5.453 5.69 5.846 5.991 6.188 6.36 6.516 6.669 6.818 7.001 7.176 7.346 7.535 7.699 7.857 8.047 8.26 8.456 8.645 8.827 9.0 9.164 9.326 9.504 9.666 9.816 9.943 9.993 9.916 9.699 9.206 8.12 6.623 5.319 4.165 3.14 2.247 1.457 0.688 0.019 -0.623 -1.174 -1.683 -2.18 -2.647 -3.089 -3.478 -3.872 -4.245 -4.569 -4.899 -5.246 -5.539 -5.843 -6.16 -6.414 -6.684 -6.965 -7.254 -7.565 -7.778 -7.983 -8.317 -8.567 -8.823 -8.953 -9.233 -9.539 -9.867 -10.042 -10.314 -10.611 -10.821 -11.031 -11.506 -11.778 -12.077 -12.417 -12.8 -13.269 -13.861 -15.421 -2 ,16499 ,KEBNE ,16721196,Sat Nov 27 09:06:11 CET,Sat Nov 27 11:09:10 CET,0.0 1.078 1.521 1.867 2.179 2.438 2.668 2.875 3.237 3.394 3.544 3.739 3.958 4.084 4.31 4.528 4.722 4.814 4.982 5.145 5.385 5.522 5.644 5.817 5.987 6.152 6.319 6.473 6.652 6.822 6.976 7.164 7.337 7.496 7.676 7.869 8.045 8.223 8.42 8.618 8.792 8.97 9.156 9.316 9.459 9.535 9.522 9.417 9.143 8.582 7.472 5.991 4.716 3.548 2.504 1.546 0.685 -0.096 -0.758 -1.41 -1.962 -2.452 -2.921 -3.364 -3.782 -4.176 -4.584 -4.933 -5.238 -5.564 -5.923 -6.223 -6.526 -6.839 -7.075 -7.325 -7.594 -7.871 -8.171 -8.387 -8.604 -8.939 -9.186 -9.449 -9.581 -9.856 -10.165 -10.505 -10.677 -10.947 -11.251 -11.462 -11.677 -12.181 -12.463 -12.766 -13.093 -13.471 -13.929 -14.553 -16.497 -3 ,24292 ,KEBNE ,16721197,Sat Nov 27 09:10:14 CET,Sat Nov 27 11:11:47 CET,0.0 1.126 1.588 1.944 2.245 2.509 2.758 2.981 3.353 3.514 3.661 3.854 4.072 4.198 4.419 4.627 4.818 4.904 5.069 5.22 5.433 5.569 5.701 5.887 6.049 6.205 6.361 6.51 6.695 6.862 7.019 7.195 7.36 7.517 7.686 7.862 8.028 8.198 8.358 8.521 8.684 8.853 9.023 9.156 9.281 9.373 9.402 9.335 9.108 8.6 7.555 6.065 4.701 3.506 2.439 1.504 0.675 -0.081 -0.72 -1.371 -1.951 -2.456 -2.928 -3.381 -3.803 -4.188 -4.598 -4.972 -5.298 -5.629 -5.96 -6.242 -6.555 -6.876 -7.122 -7.381 -7.648 -7.929 -8.24 -8.458 -8.68 -9.029 -9.276 -9.539 -9.677 -9.957 -10.259 -10.596 -10.771 -11.042 -11.332 -11.539 -11.768 -12.28 -12.554 -12.852 -13.185 -13.573 -14.045 -14.698 -16.652 -4 ,15099 ,KEBNE ,16721198,Sat Nov 27 09:10:14 CET,Sat Nov 27 11:10:46 CET,0.0 1.125 1.588 1.939 2.229 2.479 2.702 2.91 3.265 3.42 3.576 3.795 4.01 4.136 4.366 4.571 4.77 4.863 5.033 5.194 5.423 5.573 5.715 5.911 6.091 6.253 6.399 6.542 6.731 6.904 7.071 7.267 7.444 7.605 7.774 7.953 8.129 8.313 8.505 8.708 8.897 9.1 9.321 9.482 9.631 9.767 9.864 9.891 9.77 9.341 8.354 6.965 5.674 4.533 3.55 2.672 1.885 1.173 0.56 -0.06 -0.586 -1.052 -1.498 -1.923 -2.332 -2.719 -3.137 -3.518 -3.838 -4.159 -4.494 -4.779 -5.082 -5.396 -5.637 -5.891 -6.165 -6.461 -6.759 -6.966 -7.181 -7.532 -7.78 -8.028 -8.155 -8.426 -8.721 -9.043 -9.203 -9.463 -9.753 -9.959 -10.173 -10.628 -10.896 -11.197 -11.516 -11.872 -12.346 -12.981 -14.624 -5 ,23563 ,KEBNE ,16721199,Sat Nov 27 09:10:14 CET,Sat Nov 27 11:11:22 CET,0.0 1.314 1.81 2.184 2.487 2.76 3.007 3.234 3.611 3.765 3.92 4.127 4.345 4.47 4.702 4.923 5.127 5.222 5.408 5.587 5.83 5.976 6.113 6.316 6.499 6.657 6.804 6.942 7.122 7.294 7.44 7.608 7.773 7.928 8.1 8.277 8.444 8.634 8.826 9.008 9.193 9.366 9.51 9.622 9.73 9.799 9.814 9.734 9.489 8.957 7.841 6.282 4.896 3.732 2.742 1.863 1.079 0.355 -0.282 -0.938 -1.51 -2.018 -2.516 -2.985 -3.418 -3.808 -4.211 -4.574 -4.896 -5.24 -5.578 -5.858 -6.158 -6.465 -6.702 -6.958 -7.25 -7.554 -7.861 -8.077 -8.298 -8.651 -8.906 -9.171 -9.308 -9.597 -9.905 -10.241 -10.415 -10.69 -10.98 -11.19 -11.428 -11.942 -12.21 -12.504 -12.846 -13.222 -13.669 -14.291 -15.631 -6 ,15750 ,KEBNE ,16721200,Sat Nov 27 09:11:16 CET,Sat Nov 27 11:12:34 CET,0.0 1.001 1.463 1.815 2.11 2.377 2.616 2.822 3.194 3.362 3.512 3.719 3.946 4.071 4.297 4.522 4.725 4.819 5.006 5.176 5.414 5.56 5.693 5.883 6.064 6.235 6.388 6.526 6.705 6.881 7.04 7.223 7.389 7.546 7.724 7.901 8.073 8.243 8.411 8.588 8.744 8.896 9.048 9.159 9.282 9.418 9.505 9.525 9.43 9.058 8.005 6.468 5.184 4.101 3.116 2.207 1.437 0.736 0.128 -0.486 -1.007 -1.485 -1.959 -2.393 -2.797 -3.177 -3.569 -3.915 -4.227 -4.564 -4.907 -5.195 -5.503 -5.827 -6.085 -6.354 -6.631 -6.921 -7.246 -7.471 -7.69 -8.031 -8.275 -8.523 -8.652 -8.937 -9.24 -9.568 -9.739 -10.002 -10.264 -10.46 -10.674 -11.15 -11.428 -11.728 -12.06 -12.434 -12.882 -13.479 -15.007 -7 ,27102 ,KEBNE ,16721201,Sat Nov 27 09:11:15 CET,Sat Nov 27 11:12:35 CET,0.0 1.424 1.903 2.265 2.578 2.841 3.06 3.251 3.603 3.769 3.926 4.134 4.341 4.459 4.69 4.901 5.096 5.19 5.371 5.531 5.752 5.893 6.025 6.204 6.369 6.534 6.692 6.835 7.012 7.173 7.329 7.515 7.686 7.837 8.0 8.172 8.321 8.487 8.662 8.83 8.992 9.154 9.32 9.463 9.587 9.658 9.666 9.595 9.389 8.951 7.987 6.466 5.109 3.958 2.955 2.078 1.286 0.538 -0.093 -0.727 -1.286 -1.767 -2.22 -2.658 -3.074 -3.471 -3.882 -4.24 -4.543 -4.868 -5.216 -5.498 -5.803 -6.127 -6.386 -6.656 -6.931 -7.214 -7.508 -7.719 -7.951 -8.315 -8.574 -8.846 -8.979 -9.25 -9.547 -9.875 -10.043 -10.316 -10.605 -10.812 -11.033 -11.52 -11.799 -12.118 -12.479 -12.877 -13.345 -13.99 -15.488 -8 ,22209 ,KEBNE ,16721202,Sat Nov 27 09:11:15 CET,Sat Nov 27 11:11:55 CET,0.0 1.088 1.541 1.881 2.157 2.404 2.617 2.808 3.167 3.332 3.484 3.675 3.888 4.012 4.242 4.451 4.646 4.735 4.904 5.061 5.292 5.434 5.559 5.732 5.912 6.086 6.244 6.39 6.557 6.715 6.872 7.062 7.233 7.391 7.561 7.728 7.887 8.058 8.232 8.389 8.535 8.696 8.838 8.957 9.079 9.155 9.143 9.053 8.873 8.421 7.282 5.711 4.371 3.221 2.248 1.406 0.67 -0.037 -0.671 -1.307 -1.853 -2.356 -2.834 -3.277 -3.702 -4.093 -4.502 -4.864 -5.169 -5.492 -5.832 -6.117 -6.421 -6.748 -7.006 -7.275 -7.545 -7.823 -8.127 -8.338 -8.551 -8.889 -9.139 -9.402 -9.535 -9.824 -10.128 -10.448 -10.62 -10.903 -11.223 -11.442 -11.664 -12.146 -12.415 -12.716 -13.059 -13.452 -13.921 -14.547 -16.709 -9 ,31457 ,KEBNE ,16721203,Sat Nov 27 09:11:15 CET,Sat Nov 27 11:12:55 CET,0.0 1.066 1.527 1.85 2.117 2.354 2.571 2.768 3.131 3.303 3.468 3.689 3.906 4.035 4.267 4.477 4.682 4.781 4.959 5.122 5.355 5.507 5.653 5.846 6.019 6.19 6.352 6.497 6.691 6.866 7.017 7.204 7.382 7.541 7.715 7.901 8.069 8.241 8.408 8.569 8.725 8.865 8.997 9.122 9.263 9.381 9.424 9.346 9.098 8.67 7.658 6.191 4.892 3.733 2.751 1.871 1.088 0.375 -0.24 -0.872 -1.429 -1.911 -2.365 -2.805 -3.221 -3.594 -3.981 -4.332 -4.644 -4.979 -5.333 -5.632 -5.948 -6.267 -6.507 -6.76 -7.023 -7.3 -7.594 -7.795 -8.014 -8.354 -8.588 -8.844 -8.971 -9.238 -9.527 -9.836 -10.002 -10.266 -10.544 -10.743 -10.954 -11.407 -11.652 -11.93 -12.244 -12.61 -13.064 -13.64 -14.994 -10 ,505 ,KEBNE ,16721204,Sat Nov 27 09:11:15 CET,Sat Nov 27 11:12:49 CET,0.0 1.396 1.883 2.238 2.552 2.825 3.054 3.262 3.64 3.804 3.961 4.175 4.391 4.516 4.743 4.951 5.136 5.22 5.384 5.54 5.765 5.902 6.031 6.23 6.418 6.587 6.746 6.897 7.085 7.249 7.396 7.571 7.737 7.886 8.039 8.218 8.384 8.547 8.706 8.857 9.036 9.249 9.431 9.559 9.664 9.767 9.817 9.737 9.504 8.965 7.917 6.501 5.254 4.129 3.095 2.197 1.435 0.741 0.145 -0.455 -0.984 -1.477 -1.95 -2.401 -2.841 -3.256 -3.673 -4.03 -4.344 -4.664 -5.0 -5.292 -5.599 -5.907 -6.142 -6.388 -6.667 -6.976 -7.29 -7.497 -7.716 -8.074 -8.332 -8.599 -8.731 -9.017 -9.336 -9.685 -9.859 -10.13 -10.418 -10.612 -10.829 -11.343 -11.625 -11.93 -12.261 -12.624 -13.048 -13.595 -15.031 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_62.txt deleted file mode 100644 index 11637ab4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_59_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12174 ,KEBNE ,16721205,Sat Nov 27 09:11:15 CET,Sat Nov 27 11:12:19 CET,0.0 1.346 1.912 2.309 2.61 2.878 3.125 3.349 3.747 3.931 4.111 4.375 4.615 4.753 5.006 5.242 5.461 5.565 5.765 5.965 6.246 6.411 6.579 6.818 7.041 7.25 7.433 7.622 7.872 8.102 8.317 8.561 8.789 9.006 9.245 9.494 9.733 9.995 10.267 10.532 10.795 11.097 11.414 11.703 12.031 12.345 12.677 12.989 13.246 13.385 13.178 12.484 11.669 10.936 10.272 9.607 9.0 8.454 7.958 7.442 6.987 6.571 6.181 5.794 5.419 5.08 4.712 4.373 4.064 3.739 3.414 3.152 2.869 2.551 2.297 2.032 1.773 1.512 1.233 1.035 0.82 0.474 0.231 -0.022 -0.152 -0.425 -0.728 -1.061 -1.237 -1.506 -1.823 -2.04 -2.26 -2.735 -2.988 -3.245 -3.534 -3.884 -4.324 -4.861 -6.715 -2 ,15562 ,KEBNE ,16721206,Sat Nov 27 09:13:18 CET,Sat Nov 27 11:14:17 CET,0.0 1.031 1.478 1.824 2.128 2.387 2.628 2.848 3.218 3.384 3.538 3.749 3.965 4.095 4.347 4.574 4.777 4.882 5.081 5.263 5.512 5.659 5.801 6.012 6.214 6.409 6.591 6.757 6.966 7.161 7.344 7.557 7.755 7.951 8.172 8.395 8.616 8.862 9.114 9.382 9.641 9.913 10.229 10.519 10.785 11.059 11.348 11.563 11.674 11.619 11.199 10.272 9.262 8.371 7.577 6.844 6.201 5.584 5.028 4.441 3.907 3.427 2.969 2.522 2.096 1.713 1.298 0.916 0.597 0.271 -0.069 -0.352 -0.663 -1.008 -1.272 -1.537 -1.816 -2.109 -2.41 -2.617 -2.839 -3.2 -3.461 -3.732 -3.869 -4.171 -4.499 -4.861 -5.047 -5.313 -5.628 -5.842 -6.075 -6.584 -6.876 -7.206 -7.576 -8.037 -8.605 -9.339 -11.471 -3 ,16013 ,KEBNE ,16721207,Sat Nov 27 09:19:25 CET,Sat Nov 27 11:23:25 CET,0.0 1.06 1.532 1.893 2.198 2.459 2.702 2.927 3.323 3.502 3.664 3.861 4.065 4.191 4.43 4.655 4.872 4.977 5.177 5.371 5.646 5.816 5.976 6.199 6.413 6.605 6.782 6.956 7.178 7.39 7.58 7.792 7.986 8.182 8.417 8.662 8.878 9.11 9.353 9.604 9.849 10.108 10.385 10.629 10.9 11.156 11.402 11.637 11.794 11.792 11.479 10.672 9.75 8.961 8.283 7.567 6.88 6.217 5.587 4.958 4.431 3.961 3.484 3.026 2.628 2.256 1.864 1.523 1.222 0.895 0.558 0.27 -0.029 -0.332 -0.58 -0.844 -1.134 -1.45 -1.772 -1.997 -2.223 -2.588 -2.864 -3.146 -3.287 -3.598 -3.924 -4.26 -4.447 -4.734 -5.09 -5.337 -5.585 -6.112 -6.411 -6.738 -7.107 -7.567 -8.139 -8.859 -11.107 -4 ,10780 ,KEBNE ,16721208,Sat Nov 27 09:30:39 CET,Sat Nov 27 11:29:02 CET,0.0 1.106 1.526 1.852 2.147 2.403 2.635 2.839 3.195 3.369 3.535 3.744 3.953 4.082 4.319 4.542 4.753 4.856 5.053 5.24 5.495 5.65 5.796 6.001 6.202 6.385 6.572 6.767 6.989 7.178 7.36 7.581 7.789 7.982 8.199 8.439 8.665 8.897 9.131 9.379 9.628 9.883 10.158 10.414 10.704 10.995 11.237 11.424 11.579 11.601 11.279 10.558 9.787 9.022 8.269 7.569 6.951 6.348 5.789 5.226 4.729 4.271 3.808 3.374 2.96 2.564 2.161 1.795 1.469 1.122 0.749 0.443 0.126 -0.201 -0.46 -0.739 -1.04 -1.364 -1.69 -1.907 -2.133 -2.518 -2.8 -3.082 -3.226 -3.525 -3.858 -4.228 -4.417 -4.694 -5.037 -5.29 -5.56 -6.157 -6.481 -6.813 -7.197 -7.646 -8.21 -8.926 -10.983 -5 ,28605 ,KEBNE ,16721209,Sat Nov 27 09:33:43 CET,Sat Nov 27 11:32:47 CET,0.0 0.926 1.359 1.691 1.954 2.199 2.432 2.639 3.009 3.181 3.351 3.578 3.805 3.942 4.187 4.412 4.636 4.741 4.931 5.111 5.36 5.517 5.669 5.879 6.079 6.265 6.428 6.588 6.801 6.992 7.171 7.383 7.573 7.754 7.971 8.2 8.416 8.665 8.92 9.158 9.389 9.638 9.925 10.192 10.461 10.711 10.924 11.11 11.23 11.162 10.663 9.811 8.972 8.175 7.453 6.777 6.154 5.588 5.104 4.605 4.12 3.653 3.219 2.824 2.447 2.086 1.711 1.376 1.077 0.764 0.425 0.123 -0.196 -0.529 -0.779 -1.028 -1.297 -1.603 -1.933 -2.152 -2.371 -2.722 -2.983 -3.274 -3.424 -3.73 -4.063 -4.417 -4.599 -4.876 -5.214 -5.433 -5.665 -6.198 -6.517 -6.898 -7.298 -7.73 -8.322 -9.106 -11.178 -6 ,5172 ,KEBNE ,16721210,Sat Nov 27 09:36:47 CET,Sat Nov 27 11:36:54 CET,0.0 1.327 1.811 2.168 2.468 2.734 2.978 3.191 3.55 3.71 3.862 4.082 4.306 4.44 4.695 4.919 5.123 5.222 5.418 5.619 5.891 6.054 6.206 6.417 6.612 6.794 6.961 7.117 7.328 7.524 7.703 7.921 8.127 8.32 8.538 8.785 9.009 9.241 9.478 9.717 9.954 10.209 10.519 10.832 11.155 11.444 11.727 11.988 12.165 12.218 11.954 11.28 10.523 9.811 9.162 8.544 7.962 7.391 6.893 6.395 5.946 5.527 5.13 4.755 4.391 4.047 3.683 3.359 3.069 2.746 2.415 2.147 1.866 1.565 1.316 1.051 0.787 0.518 0.227 0.025 -0.185 -0.527 -0.768 -1.019 -1.144 -1.41 -1.703 -2.009 -2.174 -2.432 -2.717 -2.927 -3.153 -3.632 -3.9 -4.194 -4.562 -4.99 -5.458 -6.095 -7.935 -7 ,21640 ,KEBNE ,16721211,Sat Nov 27 10:09:28 CET,Sat Nov 27 12:08:28 CET,0.0 1.39 1.871 2.247 2.555 2.812 3.05 3.258 3.621 3.786 3.952 4.183 4.414 4.552 4.801 5.037 5.261 5.371 5.573 5.758 6.023 6.182 6.33 6.554 6.771 6.965 7.144 7.312 7.518 7.713 7.903 8.136 8.358 8.546 8.741 8.965 9.172 9.383 9.602 9.83 10.066 10.324 10.617 10.872 11.108 11.356 11.64 11.871 11.977 11.906 11.453 10.583 9.689 8.815 7.998 7.24 6.601 6.044 5.524 4.959 4.46 4.017 3.581 3.148 2.734 2.363 1.978 1.609 1.285 0.955 0.61 0.305 -0.017 -0.335 -0.589 -0.866 -1.152 -1.443 -1.757 -1.986 -2.217 -2.57 -2.823 -3.084 -3.222 -3.52 -3.846 -4.214 -4.41 -4.699 -5.043 -5.278 -5.517 -6.02 -6.314 -6.645 -7.022 -7.46 -8.022 -8.81 -11.151 -8 ,1448 ,KEBNE ,16721212,Sat Nov 27 10:13:33 CET,Sat Nov 27 12:12:48 CET,0.0 1.426 1.841 2.159 2.437 2.692 2.916 3.138 3.543 3.717 3.88 4.082 4.3 4.437 4.671 4.878 5.077 5.18 5.38 5.559 5.811 5.968 6.121 6.329 6.513 6.692 6.864 7.021 7.224 7.425 7.621 7.835 8.029 8.208 8.418 8.651 8.857 9.076 9.297 9.525 9.761 10.018 10.303 10.575 10.856 11.098 11.334 11.551 11.697 11.625 11.102 10.172 9.253 8.407 7.609 6.845 6.136 5.474 4.903 4.328 3.825 3.359 2.909 2.484 2.078 1.681 1.254 0.871 0.537 0.192 -0.17 -0.473 -0.786 -1.106 -1.361 -1.627 -1.903 -2.193 -2.501 -2.727 -2.962 -3.333 -3.602 -3.881 -4.028 -4.345 -4.685 -5.043 -5.233 -5.515 -5.833 -6.051 -6.283 -6.836 -7.151 -7.487 -7.864 -8.294 -8.799 -9.463 -11.206 -9 ,7003 ,KEBNE ,16721213,Sat Nov 27 10:15:37 CET,Sat Nov 27 12:15:50 CET,0.0 1.211 1.683 2.054 2.344 2.596 2.837 3.042 3.386 3.546 3.702 3.924 4.138 4.261 4.495 4.718 4.929 5.033 5.238 5.424 5.674 5.838 5.993 6.192 6.392 6.59 6.766 6.941 7.18 7.406 7.608 7.848 8.071 8.268 8.496 8.749 8.976 9.215 9.474 9.75 10.026 10.319 10.656 10.954 11.264 11.578 11.892 12.171 12.388 12.452 12.195 11.581 10.907 10.192 9.498 8.834 8.244 7.713 7.212 6.672 6.205 5.779 5.349 4.941 4.556 4.194 3.818 3.487 3.196 2.882 2.539 2.259 1.98 1.677 1.433 1.18 0.908 0.606 0.29 0.068 -0.164 -0.522 -0.772 -1.031 -1.17 -1.458 -1.764 -2.111 -2.295 -2.575 -2.904 -3.128 -3.37 -3.908 -4.214 -4.565 -4.956 -5.421 -5.976 -6.672 -8.765 -10 ,2126 ,KEBNE ,16721214,Sat Nov 27 10:21:48 CET,Sat Nov 27 12:20:14 CET,0.0 0.902 1.326 1.669 1.961 2.21 2.452 2.673 3.058 3.23 3.386 3.603 3.83 3.963 4.202 4.418 4.616 4.712 4.896 5.07 5.322 5.481 5.625 5.826 6.018 6.191 6.357 6.524 6.745 6.935 7.103 7.315 7.518 7.712 7.931 8.175 8.408 8.643 8.887 9.15 9.434 9.734 10.058 10.362 10.671 10.985 11.3 11.536 11.72 11.751 11.323 10.504 9.721 8.986 8.304 7.657 7.056 6.462 5.906 5.334 4.823 4.363 3.926 3.496 3.096 2.757 2.394 2.059 1.766 1.452 1.116 0.829 0.538 0.209 -0.059 -0.322 -0.596 -0.889 -1.211 -1.438 -1.659 -2.011 -2.263 -2.529 -2.667 -2.945 -3.243 -3.568 -3.741 -4.015 -4.343 -4.561 -4.805 -5.369 -5.699 -6.064 -6.447 -6.881 -7.384 -8.017 -10.105 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_58.txt deleted file mode 100644 index 111ae51f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5786 ,KEBNE ,16721215,Sat Nov 27 10:29:55 CET,Sat Nov 27 12:31:07 CET,0.0 2.547 3.129 3.611 3.992 4.293 4.546 4.773 5.25 5.465 5.641 5.868 6.109 6.262 6.547 6.803 7.042 7.15 7.361 7.569 7.859 8.029 8.191 8.441 8.677 8.892 9.098 9.295 9.551 9.806 10.045 10.318 10.578 10.826 11.107 11.428 11.73 12.045 12.376 12.706 13.037 13.42 13.863 14.29 14.775 15.308 15.911 16.537 17.157 17.76 18.231 18.23 17.934 17.524 17.077 16.617 16.183 15.772 15.377 14.935 14.554 14.23 13.921 13.6 13.26 12.949 12.626 12.309 12.032 11.738 11.423 11.157 10.871 10.583 10.352 10.101 9.836 9.541 9.235 9.017 8.79 8.441 8.174 7.888 7.747 7.471 7.174 6.849 6.666 6.37 6.009 5.771 5.521 4.919 4.582 4.201 3.762 3.268 2.667 1.747 -1.173 -2 ,18305 ,KEBNE ,16721216,Sat Nov 27 10:29:55 CET,Sat Nov 27 12:32:20 CET,0.0 1.519 2.116 2.63 3.055 3.375 3.625 3.853 4.258 4.459 4.654 4.925 5.188 5.349 5.65 5.906 6.141 6.257 6.48 6.69 6.99 7.184 7.371 7.626 7.863 8.092 8.311 8.524 8.784 9.047 9.307 9.599 9.876 10.131 10.412 10.745 11.054 11.364 11.695 12.046 12.443 12.861 13.297 13.736 14.225 14.741 15.27 15.803 16.383 17.017 17.521 17.559 17.251 16.833 16.359 15.852 15.346 14.713 14.154 13.704 13.327 12.958 12.547 12.138 11.741 11.386 11.046 10.749 10.476 10.183 9.87 9.594 9.302 8.992 8.737 8.433 8.085 7.742 7.421 7.201 6.976 6.63 6.362 6.04 5.874 5.562 5.25 4.904 4.715 4.435 4.115 3.89 3.651 3.075 2.718 2.299 1.81 1.251 0.624 -0.195 -3.379 -3 ,5574 ,KEBNE ,16721217,Sat Nov 27 10:29:55 CET,Sat Nov 27 12:30:52 CET,0.0 2.622 3.416 3.993 4.407 4.713 4.988 5.241 5.689 5.883 6.068 6.328 6.588 6.749 7.043 7.301 7.534 7.644 7.868 8.09 8.385 8.566 8.738 8.976 9.204 9.421 9.625 9.823 10.075 10.324 10.56 10.833 11.086 11.321 11.601 11.927 12.229 12.546 12.869 13.204 13.56 13.945 14.382 14.802 15.264 15.75 16.262 16.841 17.433 18.01 18.507 18.553 18.36 18.089 17.713 17.274 16.846 16.426 16.024 15.574 15.177 14.793 14.399 14.015 13.652 13.331 12.983 12.654 12.371 12.066 11.737 11.467 11.178 10.87 10.614 10.329 10.03 9.715 9.397 9.185 8.972 8.625 8.36 8.082 7.94 7.643 7.323 6.97 6.778 6.487 6.156 5.927 5.676 5.105 4.78 4.418 4.014 3.486 2.846 1.958 -1.684 -4 ,29701 ,KEBNE ,16721218,Sat Nov 27 10:36:05 CET,Sat Nov 27 12:30:56 CET,0.0 2.312 2.877 3.275 3.62 3.925 4.195 4.429 4.847 5.03 5.205 5.433 5.678 5.821 6.089 6.343 6.593 6.712 6.946 7.168 7.46 7.643 7.821 8.073 8.305 8.524 8.744 8.961 9.227 9.472 9.702 9.983 10.242 10.471 10.736 11.038 11.319 11.623 11.959 12.305 12.654 13.048 13.501 13.929 14.368 14.84 15.36 15.907 16.507 17.015 17.264 17.141 16.764 16.314 15.853 15.358 14.872 14.385 13.942 13.477 13.038 12.6 12.171 11.782 11.411 11.067 10.711 10.389 10.112 9.822 9.501 9.224 8.935 8.623 8.354 8.027 7.667 7.302 6.942 6.718 6.495 6.155 5.908 5.628 5.478 5.151 4.792 4.388 4.154 3.796 3.348 3.085 2.822 2.24 1.933 1.605 1.203 0.68 0.062 -0.765 -5.116 -5 ,32115 ,KEBNE ,16721219,Sat Nov 27 10:44:10 CET,Sat Nov 27 12:45:05 CET,0.0 1.708 2.264 2.675 3.034 3.342 3.595 3.824 4.238 4.428 4.609 4.858 5.106 5.26 5.554 5.817 6.055 6.172 6.392 6.595 6.891 7.095 7.299 7.571 7.81 8.037 8.261 8.472 8.74 9.0 9.243 9.512 9.761 10.002 10.276 10.579 10.872 11.204 11.554 11.927 12.322 12.719 13.151 13.583 14.071 14.565 15.076 15.597 16.16 16.75 17.225 17.186 16.824 16.381 15.96 15.536 15.102 14.634 14.182 13.741 13.361 12.998 12.62 12.255 11.912 11.575 11.22 10.909 10.635 10.339 10.015 9.732 9.423 9.065 8.753 8.406 8.034 7.68 7.342 7.111 6.875 6.502 6.24 5.975 5.838 5.545 5.228 4.876 4.668 4.347 3.946 3.684 3.41 2.832 2.509 2.147 1.71 1.196 0.598 -0.257 -3.244 -6 ,27783 ,KEBNE ,16721220,Sat Nov 27 10:48:17 CET,Sat Nov 27 12:45:39 CET,0.0 1.773 2.348 2.787 3.157 3.465 3.739 3.985 4.413 4.598 4.769 5.007 5.26 5.41 5.722 6.009 6.247 6.359 6.573 6.786 7.08 7.258 7.434 7.697 7.947 8.179 8.397 8.602 8.865 9.114 9.346 9.626 9.89 10.13 10.415 10.739 11.035 11.354 11.713 12.081 12.45 12.846 13.291 13.716 14.182 14.687 15.222 15.798 16.36 16.838 17.24 17.233 17.0 16.698 16.28 15.785 15.334 14.884 14.454 13.999 13.615 13.295 12.954 12.567 12.205 11.898 11.54 11.205 10.934 10.647 10.323 10.036 9.742 9.445 9.206 8.954 8.69 8.389 8.01 7.745 7.496 7.137 6.877 6.596 6.462 6.182 5.862 5.506 5.327 5.019 4.591 4.304 4.022 3.451 3.1 2.7 2.263 1.799 1.238 0.396 -3.374 -7 ,25639 ,KEBNE ,16721221,Sat Nov 27 10:49:16 CET,Sat Nov 27 12:51:37 CET,0.0 1.486 2.036 2.49 2.874 3.17 3.442 3.696 4.133 4.33 4.516 4.827 5.145 5.354 5.712 5.989 6.23 6.346 6.564 6.779 7.089 7.279 7.458 7.703 7.928 8.135 8.332 8.529 8.777 9.011 9.243 9.525 9.78 10.014 10.296 10.61 10.902 11.217 11.556 11.903 12.247 12.646 13.109 13.544 14.003 14.496 15.048 15.617 16.211 16.806 17.328 17.365 17.092 16.733 16.323 15.891 15.449 15.041 14.672 14.244 13.855 13.478 13.117 12.78 12.455 12.151 11.817 11.5 11.188 10.824 10.456 10.167 9.866 9.552 9.298 9.019 8.728 8.431 8.126 7.918 7.692 7.33 7.081 6.799 6.652 6.35 6.021 5.619 5.399 5.119 4.813 4.578 4.326 3.764 3.42 3.006 2.517 1.933 1.224 0.214 -3.799 -8 ,1573 ,KEBNE ,16721222,Sat Nov 27 10:49:18 CET,Sat Nov 27 12:46:43 CET,0.0 1.512 2.102 2.528 2.879 3.185 3.462 3.707 4.11 4.304 4.495 4.735 4.98 5.125 5.4 5.668 5.918 6.038 6.266 6.477 6.775 6.957 7.13 7.379 7.609 7.829 8.037 8.228 8.478 8.717 8.944 9.212 9.461 9.709 10.004 10.301 10.568 10.871 11.198 11.541 11.895 12.278 12.717 13.156 13.641 14.149 14.696 15.301 15.921 16.457 16.94 17.023 16.748 16.341 15.927 15.502 15.022 14.518 14.094 13.642 13.221 12.836 12.445 12.09 11.727 11.353 10.981 10.57 10.212 9.905 9.588 9.318 9.023 8.705 8.454 8.188 7.907 7.587 7.2 6.911 6.597 6.127 5.838 5.567 5.421 5.099 4.779 4.441 4.253 3.962 3.634 3.394 3.135 2.542 2.216 1.866 1.438 0.917 0.319 -0.574 -3.804 -9 ,2780 ,KEBNE ,16721223,Sat Nov 27 10:49:20 CET,Sat Nov 27 12:46:58 CET,0.0 1.441 2.011 2.416 2.759 3.059 3.313 3.531 3.919 4.094 4.265 4.51 4.762 4.902 5.161 5.419 5.667 5.785 6.01 6.221 6.522 6.709 6.882 7.129 7.361 7.578 7.79 7.993 8.249 8.481 8.702 8.977 9.241 9.49 9.781 10.096 10.391 10.708 11.041 11.388 11.723 12.103 12.541 12.953 13.427 13.933 14.485 15.076 15.669 16.19 16.544 16.436 16.058 15.599 15.163 14.754 14.343 13.904 13.491 13.046 12.639 12.272 11.916 11.567 11.237 10.928 10.596 10.292 10.023 9.723 9.368 9.01 8.597 8.218 7.964 7.708 7.417 7.093 6.733 6.462 6.188 5.75 5.417 5.054 4.873 4.503 4.102 3.687 3.468 3.149 2.758 2.487 2.198 1.551 1.17 0.763 0.312 -0.247 -0.932 -1.872 -5.68 -10 ,9584 ,KEBNE ,16721224,Sat Nov 27 10:50:18 CET,Sat Nov 27 12:52:31 CET,0.0 2.64 3.374 3.913 4.334 4.7 5.027 5.327 5.8 5.989 6.178 6.402 6.639 6.784 7.054 7.294 7.517 7.625 7.836 8.044 8.336 8.514 8.688 8.945 9.19 9.417 9.623 9.819 10.062 10.308 10.544 10.819 11.093 11.345 11.618 11.915 12.205 12.517 12.841 13.189 13.548 13.933 14.35 14.754 15.242 15.778 16.328 16.871 17.444 18.061 18.538 18.579 18.343 17.95 17.484 16.981 16.47 15.98 15.555 15.116 14.723 14.349 13.977 13.638 13.328 13.013 12.65 12.318 12.025 11.711 11.372 11.08 10.767 10.438 10.18 9.898 9.595 9.299 9.0 8.78 8.543 8.167 7.898 7.587 7.423 7.095 6.751 6.393 6.195 5.889 5.51 5.254 4.994 4.43 4.087 3.71 3.252 2.661 1.934 0.896 -6.707 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_59.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_59.txt deleted file mode 100644 index 5dd398c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_60_59.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19795 ,KEBNE ,16721225,Sat Nov 27 10:50:22 CET,Sat Nov 27 12:49:38 CET,0.0 1.992 2.607 3.067 3.468 3.816 4.107 4.381 4.879 5.108 5.336 5.672 5.951 6.132 6.465 6.782 7.099 7.255 7.54 7.795 8.155 8.379 8.598 8.909 9.198 9.476 9.743 10.016 10.363 10.677 10.99 11.372 11.727 12.079 12.493 12.926 13.351 13.836 14.35 14.872 15.404 16.012 16.7 17.355 18.104 18.965 19.932 20.936 22.08 23.503 25.068 26.056 26.509 26.658 26.649 26.533 26.389 26.192 25.959 25.754 25.562 25.351 25.157 24.967 24.758 24.545 24.315 24.105 23.918 23.731 23.53 23.352 23.158 22.942 22.776 22.592 22.339 22.056 21.802 21.639 21.452 21.118 20.903 20.69 20.559 20.243 19.908 19.552 19.367 19.116 18.758 18.539 18.344 17.837 17.513 17.158 16.743 16.26 15.692 14.959 12.141 -2 ,8989 ,KEBNE ,16721226,Sat Nov 27 10:52:24 CET,Sat Nov 27 12:50:35 CET,0.0 1.485 2.089 2.528 2.886 3.215 3.557 3.902 4.486 4.723 4.926 5.208 5.477 5.648 5.973 6.271 6.552 6.689 6.954 7.198 7.558 7.785 7.996 8.304 8.593 8.869 9.126 9.376 9.709 10.027 10.33 10.695 11.05 11.383 11.75 12.146 12.531 12.979 13.486 14.017 14.561 15.153 15.803 16.445 17.195 18.033 19.013 20.145 21.478 23.04 24.898 26.347 27.1 27.5 27.658 27.644 27.505 27.292 27.074 26.845 26.641 26.438 26.227 26.002 25.767 25.526 25.263 25.031 24.821 24.594 24.346 24.129 23.888 23.635 23.434 23.214 22.989 22.751 22.491 22.307 22.108 21.786 21.551 21.287 21.147 20.853 20.545 20.223 20.053 19.801 19.498 19.26 18.989 18.433 18.11 17.759 17.367 16.912 16.388 15.6 12.754 -3 ,3324 ,KEBNE ,16721227,Sat Nov 27 11:01:32 CET,Sat Nov 27 13:02:40 CET,0.0 1.758 2.405 2.837 3.2 3.521 3.812 4.08 4.574 4.801 5.009 5.288 5.56 5.737 6.069 6.354 6.623 6.757 7.028 7.283 7.643 7.869 8.075 8.376 8.666 8.945 9.218 9.475 9.81 10.136 10.464 10.859 11.22 11.56 11.939 12.363 12.784 13.245 13.721 14.22 14.737 15.306 15.986 16.669 17.443 18.321 19.315 20.416 21.668 23.075 24.768 26.026 26.601 26.884 26.955 26.844 26.709 26.583 26.411 26.17 25.935 25.707 25.458 25.185 24.917 24.671 24.387 24.095 23.832 23.572 23.314 23.096 22.843 22.558 22.338 22.095 21.817 21.508 21.176 20.953 20.721 20.341 20.073 19.8 19.652 19.341 19.007 18.628 18.426 18.146 17.773 17.511 17.237 16.625 16.306 15.992 15.576 15.079 14.562 13.832 11.279 -4 ,21410 ,KEBNE ,16721228,Sat Nov 27 11:01:33 CET,Sat Nov 27 13:02:51 CET,0.0 2.764 3.62 4.202 4.617 4.968 5.292 5.586 6.095 6.313 6.52 6.84 7.138 7.33 7.697 8.04 8.36 8.514 8.801 9.066 9.437 9.67 9.892 10.217 10.532 10.831 11.122 11.403 11.74 12.06 12.375 12.765 13.133 13.481 13.887 14.333 14.776 15.266 15.778 16.325 16.892 17.526 18.266 18.987 19.799 20.708 21.745 22.859 24.128 25.644 27.421 28.665 29.166 29.285 29.258 29.196 29.057 28.859 28.652 28.382 28.119 27.872 27.624 27.354 27.069 26.804 26.519 26.252 25.997 25.73 25.476 25.256 25.004 24.751 24.524 24.243 23.935 23.636 23.361 23.182 22.987 22.652 22.405 22.156 22.03 21.743 21.448 21.141 20.951 20.639 20.247 20.003 19.739 19.182 18.883 18.547 18.155 17.695 17.161 16.436 14.362 -5 ,12204 ,KEBNE ,16721229,Sat Nov 27 11:01:33 CET,Sat Nov 27 13:03:05 CET,0.0 1.937 2.604 3.081 3.452 3.771 4.068 4.354 4.836 5.042 5.248 5.528 5.79 5.955 6.266 6.563 6.845 6.976 7.223 7.469 7.824 8.091 8.368 8.704 8.996 9.273 9.542 9.8 10.138 10.459 10.75 11.091 11.439 11.772 12.143 12.559 12.949 13.368 13.819 14.309 14.816 15.394 16.074 16.739 17.512 18.378 19.378 20.465 21.706 23.187 25.012 26.412 27.024 27.268 27.343 27.318 27.205 27.044 26.854 26.628 26.428 26.227 26.003 25.772 25.539 25.324 25.092 24.865 24.653 24.431 24.19 23.978 23.725 23.452 23.261 23.065 22.863 22.628 22.372 22.202 22.02 21.725 21.526 21.307 21.186 20.939 20.673 20.342 20.168 19.928 19.657 19.445 19.195 18.635 18.298 17.903 17.458 16.982 16.415 15.547 8.817 -6 ,26890 ,KEBNE ,16721230,Sat Nov 27 11:01:32 CET,Sat Nov 27 13:02:46 CET,0.0 1.761 2.326 2.83 3.253 3.59 3.893 4.168 4.664 4.895 5.107 5.412 5.695 5.898 6.28 6.587 6.874 7.014 7.289 7.539 7.88 8.108 8.33 8.644 8.948 9.238 9.512 9.762 10.08 10.401 10.706 11.059 11.403 11.733 12.12 12.56 12.975 13.405 13.861 14.351 14.852 15.424 16.084 16.748 17.537 18.399 19.354 20.406 21.672 23.188 24.934 26.238 26.869 27.175 27.288 27.297 27.232 27.121 26.977 26.761 26.554 26.357 26.152 25.954 25.755 25.541 25.308 25.106 24.917 24.703 24.47 24.262 24.036 23.801 23.612 23.409 23.192 22.956 22.711 22.531 22.332 21.973 21.715 21.458 21.317 21.024 20.704 20.309 20.082 19.8 19.48 19.223 18.922 18.246 17.894 17.54 17.145 16.683 16.138 15.318 11.609 -7 ,17845 ,KEBNE ,16721231,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 13:03:39 CET,0.0 1.733 2.267 2.678 3.053 3.398 3.702 3.966 4.423 4.624 4.817 5.127 5.435 5.623 5.94 6.236 6.507 6.643 6.916 7.169 7.514 7.734 7.951 8.255 8.539 8.806 9.071 9.33 9.654 9.967 10.263 10.631 10.983 11.328 11.729 12.15 12.555 13.006 13.493 14.009 14.552 15.156 15.866 16.583 17.391 18.264 19.246 20.385 21.723 23.273 25.095 26.425 27.124 27.465 27.504 27.402 27.257 27.105 26.948 26.75 26.558 26.354 26.145 25.929 25.711 25.522 25.306 25.086 24.882 24.668 24.431 24.22 23.998 23.758 23.551 23.334 23.091 22.805 22.522 22.339 22.147 21.838 21.608 21.348 21.212 20.93 20.626 20.312 20.151 19.898 19.565 19.337 19.08 18.518 18.207 17.864 17.475 16.956 16.275 15.385 11.741 -8 ,29166 ,KEBNE ,16721232,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 13:04:07 CET,0.0 1.913 2.655 3.201 3.596 3.942 4.256 4.523 4.989 5.23 5.462 5.778 6.067 6.242 6.557 6.852 7.137 7.272 7.536 7.794 8.15 8.367 8.577 8.884 9.177 9.465 9.734 9.984 10.303 10.617 10.93 11.305 11.65 11.968 12.352 12.796 13.218 13.667 14.135 14.628 15.136 15.713 16.398 17.075 17.858 18.721 19.713 20.792 22.009 23.474 25.181 26.409 26.975 27.219 27.289 27.25 27.185 27.095 26.947 26.763 26.564 26.349 26.113 25.862 25.606 25.357 25.098 24.865 24.657 24.427 24.191 23.988 23.756 23.505 23.296 23.081 22.866 22.637 22.375 22.181 21.995 21.709 21.5 21.27 21.152 20.888 20.581 20.267 20.103 19.836 19.495 19.263 19.027 18.512 18.214 17.881 17.485 16.947 16.184 15.171 11.625 -9 ,12831 ,KEBNE ,16721233,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 13:04:04 CET,0.0 3.07 3.777 4.245 4.641 4.97 5.288 5.619 6.229 6.501 6.718 6.98 7.25 7.417 7.741 8.048 8.346 8.494 8.763 9.014 9.378 9.613 9.833 10.138 10.429 10.704 10.972 11.24 11.588 11.911 12.216 12.586 12.939 13.282 13.67 14.096 14.506 14.937 15.396 15.901 16.424 17.015 17.718 18.419 19.228 20.104 21.099 22.201 23.502 25.011 26.73 28.04 28.641 28.912 29.01 28.966 28.861 28.735 28.583 28.396 28.209 28.007 27.792 27.588 27.402 27.224 27.015 26.823 26.643 26.437 26.232 26.053 25.841 25.621 25.427 25.207 24.951 24.647 24.335 24.115 23.888 23.538 23.26 22.979 22.857 22.611 22.314 21.943 21.744 21.461 21.098 20.873 20.65 20.11 19.809 19.457 19.049 18.588 17.968 17.053 13.346 -10 ,12303 ,KEBNE ,16721234,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 13:03:47 CET,0.0 1.977 2.687 3.194 3.566 3.893 4.195 4.478 4.974 5.203 5.418 5.717 6.001 6.178 6.5 6.798 7.076 7.21 7.459 7.701 8.048 8.272 8.5 8.827 9.125 9.413 9.711 10.005 10.353 10.672 10.992 11.368 11.722 12.072 12.466 12.909 13.334 13.801 14.298 14.81 15.335 15.92 16.583 17.249 18.071 18.999 20.005 21.067 22.256 23.627 25.256 26.412 26.875 27.07 27.137 27.115 27.029 26.894 26.735 26.527 26.332 26.146 25.926 25.681 25.435 25.218 25.016 24.823 24.631 24.43 24.206 24.005 23.785 23.499 23.227 22.981 22.784 22.575 22.344 22.176 21.989 21.659 21.37 21.054 20.927 20.677 20.391 20.076 19.906 19.658 19.308 19.039 18.767 18.239 17.955 17.633 17.242 16.74 16.07 15.097 11.791 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_33.txt deleted file mode 100644 index 31d4f659..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14910 ,KEBNE ,17025766,Wed Dec 22 13:01:50 CET,Wed Dec 22 15:00:57 CET,0.0 2.925 3.763 4.327 4.794 5.214 5.585 5.922 6.515 6.79 7.062 7.472 7.776 7.986 8.405 8.826 9.216 9.397 9.754 10.096 10.585 10.898 11.203 11.656 12.093 12.511 12.919 13.319 13.845 14.35 14.825 15.41 15.982 16.536 17.181 17.902 18.607 19.405 20.274 21.226 22.245 23.397 24.753 26.149 27.836 29.781 32.115 34.839 38.135 42.262 47.72 52.678 55.83 58.034 59.631 60.834 61.726 62.424 62.944 63.37 63.678 63.889 64.041 64.153 64.222 64.272 64.3 64.303 64.275 64.225 64.184 64.153 64.092 64.001 63.923 63.835 63.725 63.597 63.469 63.385 63.282 63.092 62.939 62.764 62.685 62.517 62.301 62.057 61.929 61.761 61.498 61.348 61.185 60.814 60.59 60.33 60.016 59.663 59.184 58.517 55.966 -2 ,13444 ,KEBNE ,17025767,Wed Dec 22 13:01:50 CET,Wed Dec 22 14:59:15 CET,0.0 2.895 3.664 4.243 4.734 5.168 5.551 5.892 6.522 6.819 7.089 7.491 7.811 8.022 8.434 8.823 9.187 9.374 9.753 10.1 10.584 10.892 11.192 11.639 12.063 12.459 12.86 13.268 13.794 14.3 14.806 15.423 16.0 16.559 17.214 17.963 18.699 19.505 20.376 21.317 22.308 23.438 24.808 26.231 27.916 29.857 32.141 34.819 38.187 42.31 47.686 52.72 55.96 58.2 59.826 61.037 61.948 62.655 63.175 63.625 63.951 64.209 64.436 64.612 64.736 64.787 64.778 64.778 64.796 64.803 64.781 64.73 64.674 64.619 64.567 64.488 64.363 64.234 64.127 64.04 63.932 63.742 63.584 63.426 63.348 63.152 62.932 62.688 62.534 62.33 61.998 61.83 61.642 61.201 60.936 60.614 60.239 59.744 59.141 58.335 55.405 -3 ,28177 ,KEBNE ,17025768,Wed Dec 22 13:01:50 CET,Wed Dec 22 14:59:49 CET,0.0 3.729 4.535 5.087 5.522 5.905 6.269 6.6 7.169 7.424 7.678 8.079 8.4 8.63 9.078 9.482 9.854 10.033 10.38 10.717 11.195 11.503 11.805 12.249 12.686 13.108 13.511 13.905 14.425 14.926 15.403 15.972 16.523 17.067 17.711 18.439 19.146 19.945 20.822 21.77 22.788 23.956 25.344 26.714 28.31 30.198 32.475 35.143 38.425 42.54 47.94 52.762 55.816 57.935 59.485 60.614 61.426 62.077 62.577 62.998 63.293 63.494 63.643 63.769 63.859 63.917 63.96 63.955 63.926 63.883 63.826 63.773 63.707 63.622 63.555 63.467 63.35 63.221 63.061 62.936 62.794 62.594 62.467 62.315 62.227 62.024 61.816 61.594 61.469 61.307 61.04 60.873 60.684 60.254 60.006 59.72 59.369 58.964 58.433 57.603 54.676 -4 ,18130 ,KEBNE ,17026035,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 15:03:16 CET,0.0 3.706 4.506 5.07 5.532 5.926 6.281 6.621 7.262 7.543 7.807 8.228 8.563 8.814 9.282 9.697 10.077 10.264 10.627 10.968 11.471 11.798 12.105 12.537 12.964 13.374 13.777 14.184 14.713 15.219 15.707 16.285 16.845 17.411 18.081 18.829 19.554 20.352 21.225 22.186 23.195 24.332 25.735 27.198 28.908 30.853 33.171 35.904 39.222 43.349 48.727 53.54 56.758 59.074 60.72 61.905 62.751 63.416 63.909 64.342 64.682 64.929 65.104 65.251 65.369 65.425 65.454 65.44 65.393 65.358 65.322 65.27 65.2 65.126 65.052 64.96 64.865 64.75 64.643 64.565 64.455 64.275 64.147 64.008 63.939 63.773 63.547 63.294 63.15 62.975 62.701 62.522 62.301 61.841 61.617 61.346 60.994 60.539 59.997 59.256 55.681 -5 ,22198 ,KEBNE ,17026036,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 15:00:19 CET,0.0 2.708 3.444 4.0 4.448 4.836 5.177 5.48 6.054 6.328 6.591 7.0 7.341 7.594 8.064 8.499 8.92 9.118 9.476 9.823 10.312 10.608 10.9 11.332 11.758 12.194 12.604 12.982 13.482 13.968 14.432 15.01 15.575 16.126 16.789 17.548 18.271 19.073 19.951 20.893 21.899 23.052 24.458 25.899 27.582 29.524 31.844 34.598 37.976 42.045 47.274 52.224 55.498 57.796 59.47 60.715 61.605 62.307 62.813 63.234 63.557 63.807 63.995 64.142 64.246 64.298 64.335 64.369 64.394 64.381 64.328 64.265 64.186 64.09 64.002 63.898 63.776 63.652 63.522 63.434 63.335 63.155 63.027 62.893 62.814 62.641 62.449 62.229 62.105 61.939 61.673 61.516 61.336 60.904 60.653 60.393 60.096 59.75 59.32 58.696 56.598 -6 ,23923 ,KEBNE ,17025771,Wed Dec 22 13:01:50 CET,Wed Dec 22 14:59:26 CET,0.0 2.624 3.392 3.971 4.441 4.835 5.179 5.495 6.087 6.37 6.627 7.019 7.352 7.58 8.018 8.424 8.806 8.992 9.342 9.679 10.181 10.501 10.807 11.252 11.672 12.083 12.493 12.889 13.403 13.904 14.387 14.981 15.552 16.105 16.742 17.454 18.141 18.909 19.769 20.711 21.735 22.885 24.25 25.668 27.367 29.32 31.662 34.429 37.829 42.192 47.824 52.955 56.36 58.728 60.388 61.623 62.541 63.234 63.727 64.132 64.423 64.653 64.841 64.953 64.96 64.922 64.896 64.847 64.782 64.714 64.624 64.526 64.428 64.335 64.257 64.16 64.053 63.938 63.805 63.713 63.616 63.451 63.318 63.159 63.059 62.814 62.556 62.295 62.164 61.992 61.673 61.489 61.299 60.879 60.622 60.31 59.933 59.441 58.877 58.164 55.722 -7 ,3225 ,KEBNE ,17025772,Wed Dec 22 13:01:50 CET,Wed Dec 22 15:00:41 CET,0.0 2.907 3.605 4.14 4.581 4.981 5.35 5.685 6.276 6.54 6.791 7.173 7.487 7.713 8.143 8.534 8.906 9.091 9.447 9.798 10.3 10.612 10.922 11.384 11.823 12.242 12.649 13.039 13.549 14.037 14.506 15.091 15.667 16.224 16.865 17.593 18.306 19.098 19.958 20.91 21.959 23.132 24.509 25.946 27.683 29.677 32.017 34.73 38.077 42.272 47.778 52.808 55.993 58.232 59.834 61.006 61.864 62.574 63.145 63.6 63.9 64.128 64.311 64.427 64.516 64.584 64.633 64.659 64.658 64.644 64.599 64.515 64.422 64.336 64.261 64.175 64.069 63.949 63.812 63.709 63.601 63.424 63.284 63.12 63.034 62.845 62.631 62.39 62.253 62.083 61.755 61.559 61.359 60.9 60.626 60.317 59.962 59.542 59.051 58.371 54.822 -8 ,27415 ,KEBNE ,17026039,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 15:00:41 CET,0.0 3.483 4.248 4.836 5.322 5.739 6.119 6.464 7.087 7.366 7.621 8.014 8.332 8.551 8.976 9.375 9.743 9.918 10.255 10.585 11.079 11.391 11.695 12.143 12.569 12.986 13.387 13.78 14.302 14.783 15.238 15.801 16.359 16.906 17.552 18.281 18.964 19.715 20.563 21.485 22.485 23.638 24.99 26.378 28.032 29.926 32.202 34.933 38.324 42.491 47.835 52.738 55.93 58.089 59.643 60.799 61.655 62.306 62.775 63.192 63.489 63.738 63.954 64.091 64.183 64.25 64.3 64.328 64.328 64.292 64.229 64.159 64.085 63.992 63.91 63.835 63.752 63.647 63.517 63.414 63.295 63.094 62.944 62.788 62.703 62.509 62.306 62.091 61.966 61.798 61.515 61.359 61.19 60.755 60.502 60.233 59.932 59.561 59.107 58.441 55.904 -9 ,25991 ,KEBNE ,17025774,Wed Dec 22 13:02:03 CET,Wed Dec 22 15:00:51 CET,0.0 2.467 3.127 3.651 4.131 4.559 4.908 5.212 5.785 6.054 6.306 6.691 7.0 7.222 7.652 8.057 8.441 8.623 8.975 9.317 9.801 10.108 10.417 10.866 11.295 11.719 12.131 12.528 13.042 13.534 14.014 14.609 15.173 15.715 16.363 17.096 17.811 18.594 19.455 20.416 21.422 22.552 23.894 25.259 26.92 28.86 31.148 33.831 37.137 41.248 46.62 51.456 54.566 56.809 58.37 59.521 60.419 61.105 61.592 62.01 62.298 62.502 62.67 62.796 62.889 62.942 62.98 62.992 62.974 62.946 62.897 62.843 62.789 62.72 62.642 62.555 62.444 62.296 62.129 62.004 61.88 61.687 61.53 61.364 61.277 61.098 60.893 60.638 60.497 60.323 60.036 59.869 59.667 59.188 58.933 58.633 58.278 57.87 57.379 56.633 53.557 -10 ,5190 ,KEBNE ,17026041,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 15:00:53 CET,0.0 3.096 3.882 4.449 4.916 5.323 5.681 6.011 6.617 6.892 7.152 7.542 7.845 8.065 8.475 8.862 9.258 9.448 9.801 10.133 10.612 10.919 11.206 11.641 12.073 12.494 12.904 13.309 13.832 14.325 14.798 15.37 15.933 16.488 17.14 17.868 18.564 19.358 20.234 21.186 22.216 23.404 24.812 26.234 27.9 29.783 32.008 34.624 37.873 41.967 47.288 52.107 55.22 57.414 58.992 60.162 61.028 61.697 62.179 62.54 62.794 62.995 63.163 63.305 63.403 63.475 63.523 63.535 63.526 63.49 63.44 63.381 63.313 63.247 63.188 63.117 63.023 62.915 62.798 62.689 62.556 62.364 62.232 62.084 62.009 61.816 61.595 61.359 61.211 61.027 60.74 60.562 60.345 59.856 59.586 59.271 58.891 58.466 57.944 57.199 54.277 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_44.txt deleted file mode 100644 index fdf06ac1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_44.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,17351 ,KEBNE ,17025777,Wed Dec 22 13:02:18 CET,Wed Dec 22 14:58:30 CET,0.0 1.306 1.792 2.203 2.556 2.859 3.111 3.339 3.765 3.958 4.137 4.378 4.616 4.765 5.054 5.319 5.567 5.688 5.917 6.126 6.429 6.622 6.803 7.056 7.294 7.531 7.76 7.971 8.24 8.502 8.748 9.036 9.312 9.566 9.864 10.212 10.527 10.852 11.21 11.579 11.947 12.361 12.837 13.287 13.777 14.304 14.937 15.629 16.271 16.876 17.481 17.75 17.716 17.564 17.35 17.084 16.785 16.489 16.235 15.96 15.695 15.449 15.215 14.982 14.746 14.512 14.251 14.011 13.811 13.61 13.393 13.205 13.001 12.778 12.598 12.416 12.231 12.025 11.8 11.64 11.462 11.176 10.979 10.773 10.67 10.451 10.209 9.959 9.822 9.593 9.367 9.194 9.01 8.622 8.395 8.135 7.855 7.532 7.138 6.586 5.25 -3 ,23347 ,KEBNE ,17026044,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 14:59:50 CET,0.0 1.435 1.958 2.329 2.65 2.943 3.201 3.437 3.871 4.071 4.248 4.483 4.731 4.893 5.185 5.435 5.677 5.8 6.033 6.261 6.582 6.774 6.949 7.195 7.427 7.647 7.862 8.065 8.322 8.568 8.807 9.072 9.324 9.578 9.86 10.178 10.481 10.791 11.12 11.469 11.814 12.215 12.688 13.128 13.613 14.141 14.727 15.371 16.083 16.839 17.595 18.001 18.065 17.951 17.741 17.472 17.198 16.913 16.638 16.359 16.104 15.859 15.621 15.397 15.174 14.954 14.729 14.525 14.33 14.118 13.896 13.71 13.513 13.302 13.143 12.968 12.774 12.576 12.355 12.199 12.038 11.774 11.583 11.382 11.277 11.048 10.801 10.546 10.41 10.18 9.95 9.767 9.57 9.152 8.909 8.622 8.317 7.992 7.568 6.962 5.071 -4 ,17762 ,KEBNE ,17026045,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 15:03:08 CET,0.0 1.155 1.679 2.068 2.377 2.665 2.92 3.156 3.596 3.789 3.965 4.201 4.428 4.561 4.819 5.078 5.331 5.446 5.669 5.883 6.173 6.349 6.517 6.774 7.02 7.246 7.462 7.681 7.97 8.232 8.47 8.76 9.057 9.327 9.613 9.938 10.247 10.576 10.927 11.281 11.645 12.044 12.512 12.969 13.465 14.012 14.584 15.162 15.812 16.498 17.122 17.373 17.332 17.185 16.964 16.681 16.371 16.057 15.754 15.43 15.166 14.916 14.664 14.43 14.2 13.977 13.736 13.51 13.304 13.085 12.852 12.665 12.474 12.259 12.081 11.89 11.69 11.482 11.268 11.121 10.966 10.699 10.502 10.299 10.189 9.95 9.694 9.411 9.259 9.026 8.771 8.588 8.395 7.967 7.73 7.474 7.201 6.856 6.434 5.873 4.502 -5 ,17655 ,KEBNE ,17026046,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 15:01:25 CET,0.0 1.327 1.864 2.296 2.649 2.94 3.204 3.443 3.864 4.065 4.251 4.493 4.735 4.896 5.193 5.476 5.735 5.856 6.093 6.313 6.628 6.837 7.022 7.268 7.5 7.723 7.939 8.143 8.4 8.646 8.888 9.181 9.458 9.713 9.996 10.304 10.594 10.919 11.263 11.611 11.992 12.414 12.863 13.296 13.809 14.377 15.003 15.679 16.418 17.15 17.839 18.169 18.139 17.931 17.701 17.44 17.151 16.843 16.534 16.234 15.949 15.675 15.435 15.194 14.948 14.714 14.466 14.234 14.008 13.749 13.48 13.26 13.033 12.808 12.629 12.438 12.24 12.022 11.785 11.619 11.443 11.157 10.962 10.769 10.662 10.435 10.205 9.951 9.818 9.602 9.383 9.21 9.019 8.605 8.371 8.114 7.831 7.496 7.11 6.619 5.384 -6 ,20199 ,KEBNE ,17025781,Wed Dec 22 13:04:24 CET,Wed Dec 22 15:00:34 CET,0.0 1.174 1.665 2.054 2.393 2.68 2.938 3.182 3.62 3.814 3.987 4.222 4.449 4.596 4.892 5.159 5.393 5.503 5.719 5.924 6.211 6.389 6.567 6.838 7.105 7.355 7.584 7.809 8.099 8.37 8.622 8.92 9.212 9.491 9.803 10.15 10.479 10.825 11.188 11.568 11.964 12.405 12.875 13.335 13.87 14.426 15.058 15.741 16.456 17.158 17.78 18.009 17.965 17.815 17.598 17.329 17.077 16.835 16.593 16.324 16.062 15.804 15.556 15.309 15.071 14.853 14.606 14.387 14.195 13.975 13.738 13.552 13.362 13.133 12.944 12.763 12.573 12.366 12.139 11.979 11.812 11.542 11.349 11.145 11.038 10.816 10.58 10.321 10.185 9.96 9.735 9.564 9.37 8.958 8.724 8.461 8.177 7.852 7.455 6.904 5.546 -9 ,14194 ,KEBNE ,17025784,Wed Dec 22 13:04:24 CET,Wed Dec 22 15:00:22 CET,0.0 1.519 2.105 2.514 2.851 3.162 3.426 3.672 4.116 4.315 4.505 4.753 4.993 5.142 5.426 5.703 5.962 6.076 6.29 6.499 6.778 6.949 7.125 7.387 7.64 7.874 8.09 8.291 8.551 8.81 9.05 9.337 9.612 9.862 10.149 10.469 10.778 11.108 11.449 11.822 12.207 12.608 13.046 13.491 13.998 14.54 15.163 15.813 16.475 17.141 17.785 18.079 18.033 17.859 17.627 17.339 17.062 16.79 16.525 16.235 15.973 15.725 15.468 15.214 14.975 14.755 14.513 14.276 14.055 13.834 13.612 13.422 13.224 13.005 12.827 12.632 12.421 12.206 11.978 11.814 11.646 11.391 11.206 11.002 10.897 10.68 10.433 10.166 10.027 9.805 9.569 9.394 9.209 8.783 8.533 8.26 7.97 7.629 7.217 6.686 5.269 -10 ,9651 ,KEBNE ,17026051,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 15:02:04 CET,0.0 1.292 1.79 2.165 2.483 2.757 2.995 3.217 3.638 3.835 4.018 4.264 4.499 4.643 4.914 5.177 5.422 5.536 5.765 5.98 6.273 6.456 6.628 6.893 7.147 7.377 7.6 7.822 8.102 8.362 8.612 8.904 9.185 9.46 9.762 10.073 10.371 10.698 11.054 11.427 11.804 12.241 12.73 13.178 13.674 14.224 14.858 15.508 16.202 16.933 17.613 17.876 17.807 17.653 17.44 17.175 16.915 16.67 16.416 16.109 15.845 15.607 15.358 15.121 14.9 14.683 14.447 14.227 14.025 13.812 13.585 13.389 13.179 12.962 12.791 12.604 12.402 12.181 11.955 11.794 11.617 11.346 11.163 10.971 10.863 10.632 10.392 10.134 9.997 9.772 9.536 9.36 9.168 8.756 8.525 8.275 7.991 7.67 7.293 6.782 5.131 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_49.txt deleted file mode 100644 index 9d712835..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16040 ,KEBNE ,16721235,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 12:59:26 CET,0.0 1.125 1.529 1.842 2.094 2.315 2.521 2.71 3.032 3.177 3.322 3.498 3.698 3.805 4.005 4.18 4.348 4.435 4.597 4.724 4.898 5.009 5.113 5.248 5.367 5.49 5.61 5.718 5.85 5.967 6.063 6.171 6.272 6.35 6.424 6.495 6.55 6.61 6.661 6.693 6.704 6.688 6.625 6.529 6.392 6.149 5.75 5.205 4.373 3.01 0.836 -1.707 -3.781 -5.491 -6.919 -8.144 -9.207 -10.146 -10.944 -11.735 -12.403 -12.996 -13.566 -14.118 -14.641 -15.109 -15.577 -15.988 -16.359 -16.754 -17.142 -17.464 -17.801 -18.162 -18.456 -18.745 -19.033 -19.344 -19.683 -19.924 -20.158 -20.523 -20.789 -21.053 -21.193 -21.496 -21.812 -22.145 -22.326 -22.638 -22.93 -23.141 -23.357 -23.868 -24.147 -24.437 -24.758 -25.125 -25.571 -26.133 -27.847 -2 ,2957 ,KEBNE ,16721236,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 12:59:20 CET,0.0 1.243 1.7 2.06 2.336 2.577 2.798 2.99 3.324 3.463 3.586 3.738 3.935 4.037 4.221 4.396 4.563 4.647 4.805 4.945 5.135 5.252 5.36 5.509 5.64 5.755 5.859 5.958 6.085 6.204 6.306 6.421 6.534 6.626 6.716 6.814 6.89 6.947 7.003 7.064 7.114 7.117 7.065 6.969 6.777 6.482 6.042 5.423 4.529 3.148 0.807 -1.955 -4.18 -5.935 -7.344 -8.607 -9.718 -10.694 -11.502 -12.301 -13.01 -13.627 -14.191 -14.735 -15.246 -15.705 -16.173 -16.589 -16.955 -17.328 -17.714 -18.04 -18.381 -18.739 -19.019 -19.311 -19.615 -19.929 -20.251 -20.467 -20.701 -21.083 -21.336 -21.598 -21.739 -22.033 -22.348 -22.69 -22.878 -23.183 -23.471 -23.688 -23.911 -24.388 -24.65 -24.934 -25.26 -25.634 -26.097 -26.74 -28.382 -3 ,5263 ,KEBNE ,16721237,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 12:59:51 CET,0.0 1.237 1.64 1.935 2.18 2.394 2.586 2.756 3.056 3.192 3.321 3.472 3.669 3.774 3.977 4.163 4.332 4.408 4.552 4.7 4.915 5.037 5.149 5.301 5.427 5.542 5.658 5.779 5.918 6.028 6.132 6.243 6.33 6.404 6.48 6.552 6.61 6.655 6.691 6.711 6.72 6.71 6.653 6.559 6.39 6.12 5.705 5.118 4.263 2.933 0.708 -1.81 -3.806 -5.492 -6.943 -8.194 -9.214 -10.145 -10.945 -11.712 -12.388 -12.992 -13.551 -14.09 -14.615 -15.086 -15.557 -15.975 -16.33 -16.701 -17.078 -17.383 -17.705 -18.046 -18.328 -18.612 -18.889 -19.191 -19.517 -19.738 -19.961 -20.313 -20.577 -20.873 -21.026 -21.334 -21.67 -22.043 -22.233 -22.542 -22.833 -23.053 -23.296 -23.813 -24.081 -24.39 -24.784 -25.25 -25.782 -26.418 -27.989 -4 ,6062 ,KEBNE ,16721238,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 12:59:41 CET,0.0 1.386 1.876 2.232 2.535 2.803 3.026 3.215 3.541 3.684 3.823 3.988 4.183 4.287 4.478 4.66 4.826 4.906 5.059 5.196 5.38 5.49 5.592 5.734 5.857 5.978 6.098 6.211 6.331 6.43 6.52 6.623 6.716 6.791 6.881 6.971 7.038 7.102 7.148 7.176 7.199 7.194 7.154 7.076 6.915 6.674 6.322 5.774 4.929 3.594 1.346 -1.284 -3.37 -5.103 -6.527 -7.762 -8.849 -9.807 -10.635 -11.477 -12.183 -12.793 -13.387 -13.957 -14.486 -14.961 -15.446 -15.871 -16.241 -16.635 -17.037 -17.364 -17.7 -18.042 -18.307 -18.594 -18.893 -19.219 -19.575 -19.818 -20.069 -20.457 -20.718 -20.989 -21.131 -21.431 -21.748 -22.09 -22.264 -22.557 -22.834 -23.043 -23.271 -23.779 -24.073 -24.385 -24.71 -25.096 -25.562 -26.146 -27.522 -5 ,22194 ,KEBNE ,16721239,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 12:59:25 CET,0.0 1.255 1.702 2.027 2.282 2.52 2.742 2.936 3.253 3.398 3.537 3.717 3.927 4.034 4.236 4.421 4.597 4.676 4.829 4.974 5.149 5.267 5.387 5.532 5.654 5.772 5.893 6.0 6.11 6.22 6.326 6.429 6.515 6.591 6.667 6.726 6.78 6.841 6.881 6.894 6.89 6.874 6.82 6.715 6.552 6.297 5.873 5.276 4.419 3.029 0.717 -1.858 -3.947 -5.706 -7.19 -8.463 -9.519 -10.44 -11.224 -12.008 -12.709 -13.326 -13.889 -14.424 -14.927 -15.388 -15.853 -16.262 -16.616 -17.001 -17.415 -17.752 -18.101 -18.459 -18.738 -19.052 -19.38 -19.701 -20.039 -20.269 -20.507 -20.891 -21.162 -21.451 -21.596 -21.884 -22.199 -22.543 -22.729 -23.048 -23.338 -23.555 -23.792 -24.311 -24.59 -24.894 -25.239 -25.661 -26.152 -26.766 -28.522 -6 ,5140 ,KEBNE ,16721240,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 13:00:14 CET,0.0 1.282 1.729 2.075 2.377 2.63 2.848 3.055 3.401 3.542 3.676 3.843 4.049 4.161 4.378 4.565 4.738 4.823 4.975 5.109 5.309 5.437 5.55 5.702 5.839 5.965 6.074 6.165 6.276 6.374 6.464 6.579 6.686 6.786 6.893 6.976 7.047 7.122 7.173 7.215 7.246 7.251 7.214 7.123 6.973 6.74 6.354 5.767 4.887 3.574 1.357 -1.264 -3.389 -5.131 -6.554 -7.798 -8.885 -9.823 -10.602 -11.406 -12.092 -12.697 -13.277 -13.812 -14.307 -14.756 -15.225 -15.642 -15.994 -16.361 -16.743 -17.063 -17.395 -17.735 -18.009 -18.305 -18.612 -18.939 -19.276 -19.503 -19.743 -20.132 -20.398 -20.667 -20.806 -21.095 -21.417 -21.76 -21.945 -22.268 -22.567 -22.777 -22.992 -23.469 -23.745 -24.062 -24.428 -24.872 -25.396 -26.045 -28.219 -7 ,9025 ,KEBNE ,16721241,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 12:59:42 CET,0.0 1.164 1.567 1.879 2.144 2.393 2.616 2.807 3.142 3.295 3.445 3.61 3.817 3.943 4.169 4.362 4.528 4.602 4.748 4.879 5.076 5.206 5.318 5.461 5.587 5.709 5.836 5.951 6.079 6.191 6.286 6.409 6.531 6.629 6.727 6.811 6.873 6.925 6.966 7.002 7.021 7.013 6.956 6.86 6.708 6.478 6.096 5.494 4.6 3.269 1.012 -1.667 -3.827 -5.561 -6.983 -8.218 -9.268 -10.22 -11.022 -11.812 -12.484 -13.084 -13.656 -14.215 -14.744 -15.209 -15.681 -16.099 -16.456 -16.818 -17.2 -17.522 -17.849 -18.19 -18.469 -18.764 -19.066 -19.381 -19.717 -19.952 -20.195 -20.561 -20.82 -21.099 -21.245 -21.556 -21.878 -22.215 -22.407 -22.735 -23.101 -23.375 -23.652 -24.251 -24.585 -24.956 -25.382 -25.888 -26.484 -27.221 -29.137 -8 ,15562 ,KEBNE ,16721242,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 13:00:10 CET,0.0 1.124 1.568 1.92 2.199 2.434 2.642 2.826 3.139 3.283 3.422 3.595 3.793 3.903 4.114 4.303 4.473 4.554 4.699 4.841 5.048 5.175 5.288 5.444 5.593 5.733 5.86 5.971 6.093 6.203 6.306 6.427 6.532 6.625 6.724 6.818 6.897 6.976 7.05 7.101 7.129 7.133 7.111 7.063 6.946 6.71 6.307 5.704 4.806 3.428 1.154 -1.481 -3.666 -5.474 -7.002 -8.329 -9.445 -10.457 -11.298 -12.097 -12.791 -13.417 -13.997 -14.531 -15.019 -15.469 -15.943 -16.387 -16.78 -17.168 -17.567 -17.9 -18.246 -18.607 -18.88 -19.161 -19.457 -19.768 -20.09 -20.307 -20.529 -20.884 -21.145 -21.424 -21.569 -21.863 -22.177 -22.531 -22.72 -23.029 -23.317 -23.529 -23.754 -24.248 -24.522 -24.822 -25.18 -25.596 -26.101 -26.817 -28.516 -9 ,24074 ,KEBNE ,16721243,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 13:00:00 CET,0.0 1.158 1.632 1.974 2.269 2.53 2.761 2.965 3.308 3.457 3.6 3.78 3.985 4.086 4.277 4.463 4.632 4.711 4.865 5.005 5.185 5.299 5.409 5.566 5.707 5.829 5.941 6.049 6.176 6.284 6.383 6.495 6.601 6.692 6.784 6.876 6.952 7.016 7.053 7.065 7.083 7.087 7.045 6.954 6.792 6.534 6.118 5.528 4.663 3.294 1.014 -1.646 -3.801 -5.488 -6.852 -8.055 -9.058 -9.975 -10.787 -11.594 -12.277 -12.884 -13.479 -14.05 -14.573 -15.016 -15.471 -15.885 -16.242 -16.62 -17.012 -17.331 -17.659 -18.002 -18.286 -18.589 -18.905 -19.23 -19.557 -19.78 -20.012 -20.383 -20.646 -20.923 -21.069 -21.366 -21.672 -21.985 -22.158 -22.47 -22.761 -22.971 -23.198 -23.68 -23.943 -24.236 -24.567 -24.945 -25.412 -26.04 -27.827 -10 ,3288 ,KEBNE ,16721244,Sat Nov 27 11:02:34 CET,Sat Nov 27 13:00:20 CET,0.0 1.183 1.612 1.933 2.218 2.457 2.681 2.896 3.239 3.379 3.511 3.67 3.864 3.972 4.184 4.37 4.538 4.617 4.768 4.909 5.102 5.213 5.324 5.482 5.615 5.728 5.836 5.946 6.083 6.202 6.307 6.426 6.539 6.638 6.722 6.806 6.881 6.954 7.006 7.035 7.048 7.035 6.982 6.868 6.683 6.397 5.948 5.278 4.334 2.974 0.689 -2.033 -4.258 -6.083 -7.543 -8.771 -9.833 -10.814 -11.673 -12.512 -13.215 -13.841 -14.427 -14.973 -15.496 -15.981 -16.473 -16.894 -17.245 -17.611 -18.014 -18.355 -18.708 -19.069 -19.341 -19.62 -19.915 -20.228 -20.549 -20.78 -21.025 -21.41 -21.675 -21.95 -22.091 -22.385 -22.703 -23.034 -23.214 -23.518 -23.795 -24.005 -24.23 -24.738 -25.017 -25.324 -25.656 -26.052 -26.524 -27.134 -28.556 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_58.txt deleted file mode 100644 index 31bff7a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_62_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5704 ,KEBNE ,17026052,Wed Dec 22 13:49:38 CET,Wed Dec 22 15:05:25 CET,0.0 1.592 2.157 2.635 3.023 3.358 3.646 3.895 4.32 4.508 4.689 4.936 5.184 5.334 5.609 5.864 6.102 6.219 6.452 6.664 6.951 7.132 7.296 7.524 7.734 7.936 8.141 8.334 8.57 8.802 9.028 9.286 9.523 9.735 9.971 10.238 10.484 10.735 10.987 11.236 11.484 11.767 12.065 12.316 12.566 12.812 13.071 13.301 13.405 13.324 12.89 12.073 11.299 10.573 9.909 9.286 8.713 8.184 7.7 7.223 6.826 6.451 6.089 5.743 5.398 5.065 4.725 4.434 4.176 3.909 3.632 3.39 3.136 2.868 2.652 2.427 2.207 1.983 1.722 1.544 1.372 1.087 0.883 0.666 0.546 0.296 0.029 -0.247 -0.39 -0.641 -0.883 -1.056 -1.24 -1.66 -1.906 -2.17 -2.437 -2.731 -3.077 -3.527 -4.701 -2 ,14584 ,KEBNE ,17026053,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 15:05:52 CET,0.0 1.767 2.386 2.859 3.218 3.53 3.825 4.085 4.52 4.709 4.884 5.137 5.383 5.531 5.806 6.058 6.299 6.414 6.62 6.812 7.09 7.263 7.423 7.656 7.894 8.113 8.306 8.492 8.726 8.935 9.136 9.381 9.609 9.823 10.066 10.339 10.588 10.842 11.102 11.377 11.65 11.949 12.279 12.551 12.829 13.102 13.347 13.537 13.663 13.637 13.269 12.51 11.731 10.996 10.324 9.694 9.132 8.6 8.124 7.648 7.235 6.864 6.497 6.141 5.802 5.504 5.197 4.909 4.655 4.38 4.095 3.863 3.607 3.337 3.132 2.918 2.681 2.437 2.191 2.017 1.834 1.542 1.341 1.125 1.004 0.747 0.485 0.197 0.048 -0.194 -0.437 -0.62 -0.813 -1.23 -1.457 -1.714 -2.004 -2.329 -2.72 -3.236 -4.486 -3 ,3082 ,KEBNE ,17025788,Wed Dec 22 13:05:25 CET,Wed Dec 22 15:04:58 CET,0.0 1.844 2.476 2.919 3.267 3.577 3.855 4.092 4.497 4.694 4.889 5.153 5.4 5.552 5.836 6.091 6.328 6.442 6.659 6.861 7.146 7.322 7.49 7.727 7.938 8.135 8.328 8.514 8.744 8.961 9.168 9.414 9.64 9.843 10.074 10.326 10.56 10.805 11.055 11.328 11.595 11.844 12.104 12.354 12.622 12.875 13.121 13.302 13.384 13.323 12.88 12.055 11.214 10.423 9.761 9.149 8.593 8.072 7.604 7.151 6.758 6.386 6.017 5.669 5.33 5.017 4.71 4.435 4.188 3.921 3.648 3.422 3.176 2.918 2.717 2.512 2.293 2.054 1.805 1.635 1.451 1.157 0.948 0.722 0.606 0.367 0.111 -0.152 -0.294 -0.547 -0.79 -0.97 -1.166 -1.601 -1.826 -2.064 -2.351 -2.692 -3.081 -3.547 -4.557 -4 ,1598 ,KEBNE ,17026055,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 15:05:25 CET,0.0 1.78 2.369 2.802 3.165 3.471 3.744 4.009 4.497 4.713 4.909 5.163 5.408 5.552 5.84 6.104 6.33 6.436 6.656 6.868 7.154 7.332 7.507 7.759 7.992 8.205 8.394 8.573 8.81 9.039 9.246 9.483 9.704 9.911 10.152 10.416 10.649 10.891 11.154 11.413 11.671 11.938 12.235 12.516 12.79 13.043 13.286 13.511 13.64 13.568 13.089 12.262 11.449 10.687 9.981 9.347 8.78 8.233 7.753 7.278 6.86 6.462 6.085 5.752 5.433 5.126 4.797 4.489 4.214 3.94 3.66 3.418 3.168 2.916 2.709 2.484 2.256 2.024 1.783 1.618 1.437 1.149 0.955 0.736 0.614 0.366 0.115 -0.15 -0.294 -0.537 -0.756 -0.932 -1.123 -1.566 -1.808 -2.061 -2.333 -2.659 -3.068 -3.564 -4.742 -5 ,841 ,KEBNE ,17025790,Wed Dec 22 13:05:26 CET,Wed Dec 22 15:03:12 CET,0.0 1.795 2.389 2.844 3.204 3.493 3.772 4.024 4.438 4.631 4.81 5.042 5.277 5.421 5.698 5.957 6.208 6.326 6.538 6.74 7.027 7.204 7.377 7.625 7.861 8.091 8.302 8.493 8.738 8.966 9.182 9.434 9.667 9.883 10.134 10.406 10.637 10.899 11.181 11.445 11.712 12.004 12.319 12.629 12.97 13.254 13.481 13.679 13.825 13.808 13.418 12.632 11.813 11.044 10.343 9.734 9.177 8.645 8.181 7.697 7.282 6.914 6.554 6.186 5.831 5.517 5.199 4.914 4.649 4.364 4.067 3.813 3.555 3.29 3.08 2.864 2.634 2.396 2.153 1.982 1.8 1.502 1.291 1.072 0.957 0.715 0.457 0.175 0.032 -0.208 -0.425 -0.59 -0.769 -1.209 -1.461 -1.713 -1.986 -2.295 -2.697 -3.223 -4.409 -6 ,25622 ,KEBNE ,17026057,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 15:06:15 CET,0.0 1.654 2.285 2.739 3.104 3.41 3.684 3.932 4.373 4.579 4.77 5.041 5.289 5.439 5.731 5.995 6.233 6.355 6.589 6.799 7.091 7.268 7.431 7.665 7.884 8.086 8.272 8.46 8.699 8.914 9.118 9.354 9.572 9.775 9.983 10.201 10.418 10.646 10.879 11.126 11.379 11.653 11.949 12.24 12.547 12.824 13.082 13.267 13.379 13.367 13.01 12.284 11.516 10.763 10.092 9.493 8.95 8.442 7.973 7.474 7.053 6.692 6.347 6.006 5.681 5.381 5.058 4.765 4.506 4.232 3.942 3.701 3.456 3.197 2.996 2.781 2.553 2.325 2.086 1.918 1.74 1.457 1.253 1.039 0.927 0.681 0.416 0.141 -0.004 -0.252 -0.485 -0.669 -0.859 -1.267 -1.49 -1.739 -2.048 -2.382 -2.72 -3.174 -4.568 -7 ,7261 ,KEBNE ,17025792,Wed Dec 22 13:07:30 CET,Wed Dec 22 15:05:54 CET,0.0 1.932 2.585 3.049 3.419 3.726 3.996 4.259 4.724 4.928 5.112 5.36 5.609 5.767 6.059 6.32 6.554 6.664 6.88 7.086 7.378 7.553 7.714 7.947 8.17 8.385 8.597 8.805 9.062 9.292 9.498 9.735 9.963 10.172 10.4 10.654 10.888 11.127 11.379 11.641 11.897 12.164 12.436 12.708 13.005 13.271 13.49 13.665 13.741 13.614 13.172 12.303 11.433 10.623 9.907 9.28 8.729 8.224 7.76 7.264 6.831 6.453 6.098 5.751 5.419 5.11 4.784 4.494 4.235 3.96 3.663 3.416 3.167 2.902 2.693 2.478 2.248 2.001 1.746 1.571 1.394 1.113 0.911 0.702 0.594 0.361 0.102 -0.173 -0.315 -0.561 -0.782 -0.949 -1.141 -1.568 -1.799 -2.058 -2.348 -2.68 -3.066 -3.554 -4.754 -8 ,28250 ,KEBNE ,17025793,Wed Dec 22 13:07:31 CET,Wed Dec 22 15:05:37 CET,0.0 1.934 2.52 2.98 3.341 3.648 3.915 4.156 4.578 4.769 4.95 5.197 5.438 5.59 5.88 6.141 6.38 6.492 6.706 6.899 7.171 7.352 7.527 7.771 7.993 8.197 8.385 8.57 8.81 9.02 9.207 9.43 9.646 9.853 10.075 10.315 10.541 10.78 11.006 11.219 11.46 11.723 11.988 12.227 12.487 12.731 12.939 13.099 13.2 13.12 12.658 11.873 11.061 10.273 9.596 8.989 8.442 7.955 7.531 7.1 6.708 6.339 5.991 5.657 5.335 5.036 4.719 4.434 4.183 3.921 3.648 3.411 3.161 2.901 2.7 2.495 2.283 2.061 1.823 1.643 1.452 1.157 0.95 0.726 0.607 0.368 0.125 -0.139 -0.283 -0.54 -0.777 -0.942 -1.117 -1.524 -1.767 -2.022 -2.301 -2.625 -3.018 -3.531 -4.802 -9 ,25403 ,KEBNE ,17025794,Wed Dec 22 13:07:30 CET,Wed Dec 22 15:05:37 CET,0.0 1.463 2.063 2.516 2.882 3.201 3.475 3.731 4.2 4.404 4.59 4.864 5.116 5.272 5.583 5.85 6.096 6.217 6.436 6.643 6.94 7.12 7.296 7.549 7.768 7.962 8.147 8.326 8.556 8.764 8.964 9.21 9.431 9.632 9.863 10.123 10.376 10.65 10.919 11.183 11.44 11.724 12.046 12.327 12.623 12.897 13.141 13.373 13.545 13.522 13.065 12.341 11.634 10.908 10.22 9.542 8.939 8.411 7.956 7.494 7.086 6.713 6.347 6.012 5.692 5.39 5.069 4.778 4.531 4.27 3.998 3.773 3.527 3.259 3.046 2.824 2.594 2.353 2.092 1.916 1.746 1.447 1.23 1.025 0.923 0.696 0.447 0.175 0.029 -0.21 -0.431 -0.596 -0.796 -1.26 -1.503 -1.752 -2.004 -2.29 -2.646 -3.138 -4.434 -10 ,1905 ,KEBNE ,17025795,Wed Dec 22 13:07:30 CET,Wed Dec 22 15:05:27 CET,0.0 1.667 2.289 2.748 3.137 3.469 3.753 4.014 4.452 4.641 4.823 5.094 5.344 5.488 5.756 6.0 6.223 6.332 6.547 6.747 7.043 7.216 7.366 7.593 7.814 8.017 8.214 8.416 8.664 8.886 9.087 9.319 9.546 9.754 9.985 10.229 10.453 10.702 10.945 11.183 11.429 11.695 11.978 12.245 12.543 12.833 13.111 13.351 13.473 13.392 13.005 12.269 11.514 10.786 10.104 9.475 8.917 8.417 7.974 7.51 7.103 6.716 6.315 5.945 5.622 5.305 4.962 4.665 4.407 4.13 3.847 3.61 3.36 3.105 2.898 2.686 2.464 2.22 1.96 1.778 1.592 1.31 1.107 0.886 0.77 0.53 0.279 0.011 -0.131 -0.376 -0.608 -0.785 -0.967 -1.36 -1.583 -1.822 -2.094 -2.429 -2.839 -3.346 -4.664 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_62.txt deleted file mode 100644 index 7662eed0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_63_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9463 ,KEBNE ,16721245,Sat Nov 27 11:03:36 CET,Sat Nov 27 13:00:44 CET,0.0 1.369 1.904 2.284 2.581 2.857 3.098 3.315 3.708 3.888 4.056 4.253 4.492 4.641 4.912 5.156 5.384 5.49 5.698 5.902 6.193 6.375 6.541 6.771 6.988 7.193 7.394 7.595 7.856 8.101 8.32 8.571 8.818 9.057 9.321 9.621 9.918 10.227 10.55 10.888 11.235 11.627 12.065 12.487 12.976 13.515 14.12 14.791 15.549 16.333 16.999 17.298 17.251 17.074 16.835 16.531 16.209 15.899 15.61 15.282 14.987 14.726 14.482 14.237 14.012 13.793 13.542 13.308 13.093 12.867 12.64 12.448 12.232 12.004 11.822 11.631 11.43 11.224 11.01 10.854 10.684 10.402 10.214 10.021 9.914 9.692 9.457 9.198 9.063 8.83 8.598 8.422 8.229 7.835 7.612 7.363 7.081 6.751 6.369 5.828 4.495 -2 ,15245 ,KEBNE ,16721246,Sat Nov 27 11:03:35 CET,Sat Nov 27 13:00:00 CET,0.0 1.172 1.658 2.024 2.344 2.619 2.861 3.088 3.495 3.681 3.854 4.058 4.292 4.43 4.689 4.929 5.149 5.255 5.473 5.68 5.958 6.129 6.294 6.535 6.775 7.001 7.207 7.398 7.639 7.876 8.102 8.358 8.608 8.853 9.124 9.413 9.69 10.015 10.359 10.691 11.013 11.381 11.805 12.201 12.674 13.188 13.733 14.297 14.905 15.546 16.158 16.427 16.349 16.117 15.848 15.554 15.263 14.965 14.677 14.385 14.115 13.859 13.597 13.318 13.052 12.826 12.585 12.347 12.139 11.921 11.696 11.499 11.277 11.053 10.876 10.687 10.483 10.269 10.043 9.878 9.704 9.422 9.222 9.013 8.903 8.669 8.418 8.157 8.015 7.779 7.542 7.36 7.165 6.762 6.545 6.302 6.03 5.713 5.311 4.79 3.436 -3 ,27581 ,KEBNE ,16721247,Sat Nov 27 11:03:35 CET,Sat Nov 27 13:00:52 CET,0.0 1.53 2.034 2.389 2.705 2.99 3.242 3.475 3.9 4.093 4.276 4.522 4.785 4.939 5.218 5.489 5.738 5.852 6.077 6.276 6.566 6.766 6.956 7.221 7.463 7.692 7.911 8.118 8.384 8.635 8.873 9.149 9.418 9.673 9.95 10.267 10.577 10.909 11.265 11.642 12.029 12.452 12.928 13.393 13.921 14.475 15.072 15.689 16.319 16.952 17.557 17.806 17.753 17.512 17.206 16.88 16.575 16.293 16.021 15.741 15.483 15.224 14.969 14.719 14.451 14.205 13.964 13.732 13.517 13.286 13.043 12.847 12.63 12.399 12.232 12.055 11.864 11.661 11.44 11.284 11.118 10.849 10.668 10.48 10.375 10.162 9.94 9.699 9.565 9.336 9.127 8.956 8.77 8.369 8.148 7.894 7.611 7.287 6.89 6.373 5.121 -4 ,3218 ,KEBNE ,16721248,Sat Nov 27 11:03:36 CET,Sat Nov 27 13:00:41 CET,0.0 1.18 1.626 1.995 2.319 2.595 2.84 3.058 3.459 3.642 3.802 4.005 4.245 4.389 4.668 4.916 5.153 5.273 5.492 5.705 6.003 6.171 6.336 6.584 6.815 7.036 7.25 7.451 7.707 7.942 8.168 8.441 8.692 8.933 9.221 9.532 9.811 10.118 10.444 10.787 11.132 11.509 11.956 12.388 12.874 13.401 13.972 14.583 15.299 16.081 16.787 17.139 17.198 17.059 16.833 16.568 16.266 15.955 15.68 15.374 15.074 14.794 14.518 14.257 14.002 13.76 13.51 13.27 13.048 12.814 12.584 12.399 12.197 11.987 11.819 11.631 11.436 11.228 11.013 10.864 10.702 10.444 10.261 10.07 9.968 9.744 9.505 9.244 9.1 8.873 8.658 8.493 8.324 7.927 7.694 7.449 7.159 6.811 6.407 5.882 4.509 -5 ,20180 ,KEBNE ,16721249,Sat Nov 27 11:03:36 CET,Sat Nov 27 13:00:41 CET,0.0 1.299 1.766 2.125 2.432 2.714 2.966 3.193 3.595 3.777 3.95 4.168 4.401 4.535 4.802 5.06 5.3 5.417 5.633 5.835 6.127 6.307 6.473 6.704 6.924 7.138 7.345 7.541 7.779 8.007 8.238 8.528 8.797 9.049 9.335 9.653 9.955 10.261 10.583 10.939 11.297 11.685 12.134 12.562 13.037 13.539 14.088 14.686 15.361 16.103 16.881 17.261 17.275 17.122 16.875 16.584 16.278 15.973 15.694 15.408 15.131 14.861 14.614 14.373 14.136 13.901 13.657 13.443 13.255 13.049 12.832 12.657 12.448 12.216 12.041 11.861 11.668 11.459 11.232 11.077 10.917 10.655 10.47 10.28 10.178 9.957 9.729 9.479 9.34 9.11 8.883 8.713 8.531 8.127 7.894 7.644 7.366 7.044 6.662 6.118 4.642 -6 ,11824 ,KEBNE ,16721250,Sat Nov 27 11:03:36 CET,Sat Nov 27 13:00:41 CET,0.0 1.254 1.724 2.104 2.44 2.741 3.005 3.23 3.611 3.788 3.968 4.211 4.449 4.587 4.852 5.102 5.342 5.455 5.673 5.875 6.154 6.331 6.494 6.73 6.949 7.169 7.385 7.578 7.82 8.051 8.28 8.548 8.8 9.033 9.306 9.617 9.9 10.207 10.53 10.874 11.233 11.643 12.102 12.536 13.026 13.576 14.175 14.796 15.491 16.206 16.893 17.274 17.368 17.31 17.138 16.9 16.635 16.348 16.074 15.805 15.574 15.36 15.143 14.91 14.678 14.46 14.204 13.978 13.788 13.574 13.337 13.14 12.94 12.715 12.529 12.336 12.133 11.924 11.705 11.55 11.382 11.121 10.947 10.763 10.662 10.439 10.197 9.945 9.809 9.579 9.356 9.188 9.014 8.633 8.425 8.199 7.942 7.629 7.24 6.703 5.255 -7 ,24865 ,KEBNE ,16721251,Sat Nov 27 11:03:36 CET,Sat Nov 27 13:00:42 CET,0.0 1.256 1.736 2.132 2.469 2.756 3.009 3.241 3.652 3.829 3.985 4.206 4.448 4.584 4.838 5.075 5.3 5.409 5.625 5.825 6.112 6.292 6.457 6.693 6.917 7.132 7.345 7.542 7.776 8.011 8.255 8.545 8.807 9.052 9.334 9.656 9.952 10.253 10.586 10.937 11.291 11.702 12.17 12.604 13.103 13.628 14.177 14.749 15.347 15.981 16.551 16.778 16.716 16.53 16.31 16.035 15.745 15.441 15.13 14.774 14.455 14.181 13.904 13.627 13.354 13.106 12.84 12.592 12.384 12.159 11.908 11.691 11.461 11.232 11.052 10.847 10.63 10.412 10.179 10.012 9.842 9.564 9.364 9.155 9.047 8.827 8.59 8.318 8.168 7.927 7.707 7.532 7.342 6.929 6.701 6.443 6.144 5.81 5.409 4.903 3.728 -8 ,13804 ,KEBNE ,16721252,Sat Nov 27 11:03:36 CET,Sat Nov 27 13:00:59 CET,0.0 1.295 1.778 2.145 2.458 2.729 2.97 3.189 3.566 3.738 3.91 4.137 4.384 4.529 4.805 5.059 5.284 5.388 5.599 5.806 6.086 6.269 6.449 6.697 6.926 7.141 7.358 7.561 7.812 8.05 8.279 8.562 8.827 9.073 9.34 9.647 9.951 10.274 10.609 10.967 11.337 11.75 12.216 12.656 13.15 13.679 14.285 14.975 15.722 16.475 17.223 17.587 17.605 17.47 17.236 16.981 16.725 16.472 16.25 15.981 15.726 15.499 15.253 14.985 14.726 14.492 14.244 14.018 13.814 13.599 13.374 13.181 12.968 12.735 12.549 12.358 12.155 11.934 11.697 11.532 11.366 11.098 10.9 10.69 10.582 10.356 10.121 9.871 9.738 9.514 9.288 9.121 8.953 8.596 8.382 8.126 7.843 7.528 7.141 6.62 5.136 -9 ,22608 ,KEBNE ,16721253,Sat Nov 27 11:03:36 CET,Sat Nov 27 13:00:33 CET,0.0 1.176 1.659 2.006 2.294 2.543 2.765 2.975 3.38 3.568 3.734 3.93 4.172 4.312 4.564 4.801 5.031 5.144 5.35 5.541 5.814 5.98 6.142 6.378 6.609 6.832 7.037 7.228 7.478 7.717 7.932 8.194 8.451 8.702 8.985 9.286 9.574 9.892 10.238 10.61 10.978 11.372 11.837 12.287 12.774 13.286 13.851 14.444 15.067 15.754 16.449 16.827 16.819 16.614 16.398 16.141 15.835 15.519 15.24 14.956 14.687 14.421 14.161 13.916 13.677 13.445 13.194 12.95 12.729 12.506 12.276 12.086 11.881 11.65 11.464 11.27 11.076 10.87 10.635 10.475 10.315 10.057 9.864 9.646 9.538 9.32 9.081 8.823 8.689 8.458 8.243 8.085 7.908 7.504 7.266 7.006 6.726 6.395 5.987 5.504 4.163 -10 ,18605 ,KEBNE ,16721254,Sat Nov 27 11:03:36 CET,Sat Nov 27 13:00:18 CET,0.0 1.287 1.76 2.123 2.425 2.699 2.934 3.147 3.543 3.719 3.883 4.085 4.315 4.449 4.711 4.948 5.169 5.278 5.484 5.675 5.955 6.131 6.293 6.525 6.739 6.949 7.159 7.363 7.624 7.865 8.082 8.347 8.608 8.848 9.122 9.431 9.72 10.022 10.338 10.668 11.004 11.373 11.795 12.207 12.671 13.181 13.738 14.31 14.92 15.499 15.992 16.179 16.113 15.92 15.659 15.388 15.111 14.82 14.54 14.226 13.944 13.686 13.424 13.176 12.946 12.726 12.488 12.274 12.081 11.86 11.622 11.42 11.206 10.98 10.797 10.605 10.398 10.185 9.965 9.809 9.642 9.374 9.184 8.981 8.879 8.667 8.428 8.172 8.037 7.812 7.591 7.411 7.218 6.82 6.585 6.323 6.025 5.678 5.272 4.725 3.113 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_64_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_64_63.txt deleted file mode 100644 index cada28d4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_64_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,778 ,KEBNE ,16721255,Sat Nov 27 11:04:36 CET,Sat Nov 27 13:02:14 CET,0.0 1.358 1.895 2.303 2.62 2.899 3.17 3.431 3.859 4.046 4.226 4.455 4.693 4.838 5.117 5.37 5.603 5.709 5.919 6.12 6.408 6.588 6.757 7.008 7.238 7.448 7.642 7.835 8.078 8.3 8.518 8.774 9.001 9.209 9.444 9.703 9.954 10.219 10.498 10.795 11.092 11.433 11.839 12.211 12.603 13.004 13.419 13.828 14.276 14.65 14.835 14.705 14.331 13.903 13.502 13.103 12.687 12.285 11.935 11.552 11.196 10.878 10.563 10.248 9.957 9.69 9.401 9.133 8.898 8.661 8.411 8.188 7.952 7.707 7.514 7.297 7.071 6.853 6.619 6.445 6.26 5.976 5.772 5.564 5.457 5.226 4.967 4.678 4.536 4.293 4.06 3.863 3.645 3.199 2.963 2.706 2.411 2.04 1.622 1.107 -0.476 -2 ,17217 ,KEBNE ,16721256,Sat Nov 27 11:04:37 CET,Sat Nov 27 13:02:14 CET,0.0 1.201 1.732 2.117 2.44 2.722 2.977 3.217 3.64 3.826 4.003 4.24 4.485 4.624 4.887 5.135 5.355 5.459 5.675 5.877 6.154 6.331 6.496 6.722 6.933 7.141 7.341 7.525 7.767 7.994 8.195 8.438 8.678 8.898 9.148 9.426 9.681 9.953 10.239 10.533 10.831 11.141 11.493 11.847 12.23 12.651 13.108 13.511 13.874 14.146 14.237 13.996 13.593 13.146 12.705 12.249 11.809 11.4 11.02 10.634 10.295 9.975 9.678 9.395 9.118 8.854 8.57 8.312 8.089 7.849 7.585 7.37 7.14 6.896 6.707 6.51 6.289 6.044 5.789 5.618 5.449 5.153 4.943 4.729 4.617 4.385 4.122 3.829 3.677 3.429 3.179 2.989 2.792 2.356 2.11 1.841 1.544 1.206 0.799 0.239 -1.414 -3 ,12280 ,KEBNE ,16721257,Sat Nov 27 11:04:36 CET,Sat Nov 27 13:02:22 CET,0.0 1.373 1.835 2.2 2.512 2.767 2.996 3.216 3.629 3.804 3.96 4.178 4.42 4.557 4.815 5.061 5.296 5.408 5.616 5.81 6.079 6.243 6.398 6.63 6.851 7.056 7.253 7.436 7.672 7.893 8.097 8.341 8.568 8.777 9.021 9.295 9.545 9.815 10.089 10.362 10.647 10.959 11.31 11.647 12.024 12.426 12.854 13.274 13.712 14.089 14.217 13.913 13.498 13.055 12.589 12.133 11.71 11.292 10.924 10.526 10.158 9.829 9.497 9.172 8.864 8.576 8.275 8.001 7.761 7.505 7.237 7.014 6.783 6.545 6.354 6.145 5.916 5.673 5.411 5.232 5.049 4.749 4.546 4.334 4.222 3.995 3.751 3.467 3.315 3.067 2.839 2.667 2.474 2.028 1.781 1.497 1.183 0.834 0.442 -0.041 -1.358 -4 ,6292 ,KEBNE ,16721258,Sat Nov 27 11:04:37 CET,Sat Nov 27 13:02:34 CET,0.0 1.145 1.662 2.047 2.366 2.644 2.9 3.149 3.6 3.795 3.97 4.18 4.413 4.555 4.829 5.066 5.284 5.389 5.588 5.78 6.052 6.223 6.389 6.628 6.842 7.044 7.246 7.434 7.659 7.872 8.076 8.31 8.529 8.75 9.015 9.293 9.547 9.836 10.138 10.438 10.741 11.069 11.439 11.781 12.147 12.545 12.962 13.366 13.773 14.14 14.323 14.152 13.812 13.392 12.94 12.487 12.067 11.678 11.324 10.941 10.598 10.267 9.939 9.635 9.358 9.101 8.826 8.567 8.329 8.079 7.814 7.594 7.364 7.123 6.939 6.738 6.512 6.273 6.025 5.849 5.658 5.362 5.152 4.926 4.81 4.57 4.298 3.996 3.842 3.592 3.359 3.178 2.979 2.538 2.303 2.036 1.719 1.363 0.94 0.404 -0.817 -5 ,8014 ,KEBNE ,16721259,Sat Nov 27 11:04:36 CET,Sat Nov 27 13:02:14 CET,0.0 1.427 1.913 2.283 2.604 2.897 3.169 3.418 3.85 4.04 4.21 4.44 4.683 4.821 5.083 5.331 5.56 5.666 5.865 6.062 6.342 6.515 6.677 6.911 7.138 7.347 7.553 7.743 7.966 8.184 8.406 8.665 8.907 9.135 9.391 9.679 9.948 10.23 10.513 10.813 11.122 11.467 11.85 12.207 12.605 13.008 13.447 13.928 14.41 14.834 15.079 14.906 14.553 14.121 13.65 13.185 12.764 12.375 12.02 11.639 11.298 10.996 10.706 10.402 10.098 9.826 9.535 9.275 9.052 8.801 8.535 8.325 8.091 7.839 7.642 7.426 7.205 6.977 6.736 6.563 6.375 6.077 5.877 5.655 5.539 5.305 5.043 4.76 4.609 4.36 4.114 3.932 3.726 3.254 3.001 2.723 2.406 2.035 1.594 0.988 -0.709 -6 ,27677 ,KEBNE ,16721260,Sat Nov 27 11:04:36 CET,Sat Nov 27 13:02:13 CET,0.0 1.266 1.766 2.158 2.499 2.798 3.058 3.289 3.712 3.898 4.07 4.31 4.561 4.705 4.989 5.243 5.465 5.574 5.786 5.988 6.283 6.462 6.624 6.849 7.064 7.276 7.479 7.674 7.912 8.137 8.355 8.611 8.834 9.05 9.307 9.575 9.83 10.113 10.401 10.696 10.995 11.294 11.638 11.986 12.366 12.768 13.207 13.646 14.047 14.367 14.513 14.216 13.751 13.292 12.826 12.358 11.923 11.521 11.168 10.79 10.456 10.158 9.855 9.559 9.278 9.001 8.698 8.434 8.198 7.942 7.664 7.424 7.19 6.95 6.765 6.57 6.356 6.123 5.869 5.693 5.508 5.212 5.004 4.782 4.665 4.42 4.164 3.899 3.761 3.516 3.29 3.114 2.921 2.491 2.244 1.973 1.662 1.301 0.877 0.298 -1.209 -7 ,26213 ,KEBNE ,16721261,Sat Nov 27 11:05:37 CET,Sat Nov 27 13:03:59 CET,0.0 1.821 2.344 2.718 3.054 3.35 3.609 3.853 4.284 4.472 4.654 4.876 5.119 5.27 5.561 5.819 6.045 6.157 6.377 6.585 6.862 7.039 7.209 7.443 7.673 7.896 8.098 8.292 8.534 8.756 8.972 9.237 9.49 9.724 9.979 10.26 10.527 10.801 11.08 11.364 11.662 12.0 12.386 12.728 13.095 13.478 13.887 14.317 14.715 15.021 15.114 14.858 14.457 14.009 13.536 13.073 12.648 12.232 11.856 11.469 11.112 10.789 10.478 10.174 9.893 9.63 9.333 9.059 8.824 8.58 8.329 8.111 7.874 7.63 7.435 7.232 7.011 6.769 6.518 6.342 6.16 5.875 5.668 5.438 5.318 5.062 4.794 4.508 4.352 4.093 3.827 3.625 3.407 2.925 2.661 2.364 2.014 1.614 1.142 0.525 -1.554 -8 ,5516 ,KEBNE ,16721262,Sat Nov 27 11:05:37 CET,Sat Nov 27 13:03:14 CET,0.0 1.476 1.981 2.385 2.711 2.987 3.237 3.467 3.876 4.06 4.233 4.464 4.704 4.85 5.126 5.371 5.599 5.712 5.925 6.118 6.389 6.558 6.719 6.938 7.141 7.343 7.545 7.735 7.979 8.209 8.422 8.672 8.907 9.125 9.362 9.624 9.875 10.144 10.435 10.734 11.029 11.343 11.704 12.066 12.471 12.908 13.332 13.736 14.17 14.581 14.758 14.516 14.134 13.707 13.274 12.844 12.436 12.026 11.656 11.291 10.951 10.626 10.305 9.998 9.703 9.423 9.125 8.849 8.61 8.362 8.092 7.869 7.639 7.39 7.191 6.979 6.751 6.512 6.256 6.077 5.891 5.586 5.369 5.134 5.015 4.78 4.518 4.226 4.077 3.83 3.589 3.406 3.215 2.784 2.529 2.252 1.938 1.57 1.114 0.464 -1.527 -9 ,20928 ,KEBNE ,16721263,Sat Nov 27 11:05:37 CET,Sat Nov 27 13:03:15 CET,0.0 1.167 1.686 2.082 2.399 2.677 2.922 3.151 3.568 3.744 3.906 4.117 4.357 4.5 4.772 5.036 5.272 5.374 5.566 5.759 6.037 6.204 6.357 6.581 6.8 7.002 7.192 7.377 7.62 7.836 8.032 8.268 8.491 8.703 8.937 9.192 9.44 9.719 10.007 10.302 10.601 10.925 11.287 11.616 11.976 12.34 12.745 13.183 13.592 13.936 14.102 13.905 13.534 13.147 12.754 12.324 11.91 11.52 11.18 10.829 10.495 10.184 9.876 9.578 9.291 9.025 8.759 8.521 8.308 8.083 7.851 7.659 7.455 7.226 7.037 6.844 6.639 6.416 6.173 5.998 5.82 5.549 5.361 5.159 5.054 4.828 4.579 4.311 4.163 3.924 3.705 3.532 3.34 2.894 2.65 2.388 2.081 1.741 1.341 0.774 -1.053 -10 ,30066 ,KEBNE ,16721264,Sat Nov 27 11:05:37 CET,Sat Nov 27 13:03:16 CET,0.0 1.206 1.685 2.04 2.345 2.622 2.862 3.083 3.483 3.655 3.821 4.037 4.283 4.42 4.669 4.895 5.123 5.232 5.439 5.634 5.886 6.05 6.212 6.448 6.678 6.89 7.089 7.279 7.525 7.753 7.973 8.228 8.458 8.68 8.942 9.234 9.498 9.762 10.047 10.361 10.677 11.012 11.378 11.721 12.105 12.525 12.981 13.428 13.889 14.276 14.391 14.227 13.902 13.512 13.083 12.64 12.261 11.878 11.532 11.193 10.897 10.621 10.329 10.039 9.761 9.501 9.217 8.959 8.732 8.482 8.216 7.994 7.771 7.536 7.338 7.125 6.914 6.711 6.492 6.331 6.156 5.869 5.666 5.454 5.346 5.112 4.853 4.582 4.431 4.175 3.941 3.768 3.587 3.16 2.903 2.623 2.306 1.932 1.511 1.029 -0.186 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_63.txt deleted file mode 100644 index 15e7171c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21402 ,KEBNE ,16721265,Sat Nov 27 11:05:37 CET,Sat Nov 27 13:02:59 CET,0.0 1.216 1.716 2.074 2.383 2.667 2.924 3.159 3.56 3.727 3.891 4.131 4.372 4.511 4.776 5.011 5.229 5.335 5.544 5.749 6.023 6.186 6.344 6.575 6.787 6.988 7.172 7.349 7.577 7.778 7.974 8.216 8.443 8.656 8.887 9.126 9.357 9.604 9.854 10.118 10.389 10.673 11.007 11.329 11.666 12.038 12.404 12.677 12.892 13.08 12.938 12.379 11.818 11.25 10.726 10.235 9.786 9.354 8.961 8.553 8.187 7.848 7.529 7.229 6.934 6.663 6.392 6.133 5.891 5.634 5.371 5.148 4.907 4.65 4.445 4.233 4.014 3.794 3.545 3.371 3.198 2.909 2.703 2.487 2.376 2.129 1.864 1.592 1.444 1.197 0.979 0.807 0.613 0.168 -0.07 -0.319 -0.601 -0.939 -1.37 -1.956 -3.47 -2 ,28705 ,KEBNE ,16721266,Sat Nov 27 11:05:37 CET,Sat Nov 27 13:03:47 CET,0.0 1.639 2.187 2.554 2.87 3.143 3.396 3.637 4.04 4.222 4.388 4.592 4.821 4.953 5.211 5.451 5.691 5.805 6.002 6.195 6.471 6.636 6.796 7.015 7.22 7.427 7.623 7.807 8.045 8.269 8.474 8.721 8.957 9.168 9.405 9.665 9.903 10.163 10.433 10.69 10.948 11.245 11.567 11.873 12.225 12.556 12.882 13.189 13.475 13.667 13.565 13.098 12.546 11.981 11.442 10.94 10.463 10.028 9.637 9.21 8.837 8.502 8.165 7.84 7.533 7.245 6.95 6.687 6.453 6.214 5.961 5.739 5.511 5.266 5.073 4.869 4.643 4.4 4.144 3.968 3.787 3.494 3.282 3.063 2.947 2.693 2.433 2.161 2.014 1.77 1.534 1.355 1.173 0.745 0.488 0.224 -0.051 -0.383 -0.806 -1.361 -2.909 -3 ,3777 ,KEBNE ,16721267,Sat Nov 27 11:05:37 CET,Sat Nov 27 13:03:06 CET,0.0 1.343 1.831 2.224 2.556 2.836 3.103 3.339 3.726 3.903 4.075 4.305 4.536 4.666 4.909 5.131 5.335 5.434 5.633 5.817 6.07 6.232 6.394 6.621 6.835 7.036 7.224 7.402 7.624 7.833 8.038 8.288 8.505 8.709 8.954 9.218 9.467 9.73 9.997 10.271 10.545 10.852 11.219 11.57 11.955 12.338 12.74 13.154 13.529 13.82 13.894 13.561 13.115 12.668 12.149 11.595 11.109 10.65 10.249 9.873 9.548 9.239 8.921 8.603 8.298 8.017 7.719 7.454 7.229 6.989 6.734 6.524 6.303 6.064 5.867 5.656 5.433 5.195 4.944 4.774 4.597 4.316 4.119 3.916 3.808 3.569 3.321 3.046 2.9 2.663 2.441 2.263 2.064 1.638 1.386 1.105 0.822 0.498 0.079 -0.447 -1.728 -4 ,8409 ,KEBNE ,16721268,Sat Nov 27 11:06:38 CET,Sat Nov 27 13:04:39 CET,0.0 1.609 2.154 2.543 2.841 3.108 3.35 3.568 3.97 4.155 4.329 4.528 4.749 4.879 5.124 5.354 5.57 5.67 5.867 6.051 6.314 6.48 6.634 6.852 7.066 7.266 7.45 7.626 7.841 8.04 8.228 8.454 8.67 8.875 9.114 9.37 9.597 9.842 10.112 10.385 10.653 10.94 11.266 11.578 11.908 12.254 12.619 13.0 13.347 13.536 13.489 13.097 12.564 12.037 11.524 11.013 10.531 10.077 9.689 9.295 8.942 8.626 8.312 8.008 7.726 7.465 7.189 6.934 6.709 6.481 6.237 6.022 5.791 5.559 5.386 5.198 4.984 4.754 4.522 4.369 4.212 3.943 3.737 3.524 3.42 3.204 2.967 2.695 2.544 2.31 2.098 1.925 1.738 1.338 1.09 0.813 0.51 0.152 -0.273 -0.799 -1.983 -5 ,9601 ,KEBNE ,16721269,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:04:55 CET,0.0 1.291 1.79 2.183 2.526 2.821 3.072 3.294 3.685 3.858 4.027 4.226 4.461 4.592 4.822 5.056 5.294 5.398 5.586 5.774 6.05 6.225 6.389 6.601 6.814 7.019 7.2 7.374 7.592 7.802 8.001 8.237 8.461 8.672 8.915 9.172 9.404 9.647 9.896 10.176 10.466 10.754 11.079 11.403 11.759 12.115 12.476 12.827 13.182 13.457 13.417 13.027 12.554 12.025 11.46 10.918 10.429 9.978 9.582 9.156 8.782 8.446 8.116 7.8 7.498 7.216 6.914 6.633 6.386 6.122 5.841 5.607 5.367 5.123 4.928 4.722 4.504 4.268 4.03 3.863 3.676 3.382 3.183 2.977 2.865 2.613 2.357 2.087 1.94 1.691 1.457 1.279 1.092 0.659 0.425 0.176 -0.113 -0.451 -0.863 -1.394 -2.655 -6 ,7979 ,KEBNE ,16721270,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:04:38 CET,0.0 1.431 1.932 2.3 2.618 2.884 3.123 3.356 3.744 3.922 4.092 4.293 4.525 4.661 4.904 5.132 5.34 5.443 5.654 5.847 6.115 6.285 6.443 6.673 6.88 7.075 7.27 7.454 7.681 7.892 8.087 8.322 8.549 8.759 8.987 9.233 9.476 9.76 10.046 10.305 10.581 10.91 11.271 11.604 11.972 12.356 12.751 13.087 13.345 13.495 13.432 13.016 12.486 11.969 11.468 10.969 10.519 10.118 9.738 9.298 8.909 8.562 8.238 7.939 7.655 7.388 7.1 6.837 6.599 6.339 6.072 5.857 5.632 5.385 5.188 4.979 4.751 4.516 4.275 4.101 3.913 3.598 3.375 3.16 3.049 2.81 2.553 2.274 2.133 1.898 1.656 1.47 1.284 0.896 0.676 0.417 0.12 -0.192 -0.561 -1.097 -2.432 -7 ,22460 ,KEBNE ,16721271,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:04:38 CET,0.0 1.402 1.908 2.271 2.601 2.903 3.182 3.429 3.836 4.012 4.181 4.406 4.639 4.788 5.086 5.346 5.565 5.665 5.866 6.059 6.317 6.477 6.638 6.865 7.072 7.268 7.453 7.635 7.871 8.096 8.31 8.56 8.797 9.018 9.255 9.514 9.769 10.055 10.35 10.642 10.931 11.241 11.582 11.898 12.259 12.646 13.038 13.404 13.783 14.102 14.188 13.866 13.336 12.789 12.268 11.795 11.344 10.874 10.471 10.065 9.691 9.349 9.027 8.698 8.377 8.089 7.78 7.501 7.264 7.018 6.761 6.549 6.329 6.09 5.897 5.694 5.487 5.266 5.025 4.853 4.67 4.387 4.195 3.999 3.894 3.659 3.401 3.126 2.983 2.734 2.497 2.329 2.152 1.763 1.535 1.272 0.958 0.597 0.197 -0.329 -1.88 -8 ,455 ,KEBNE ,16721272,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:04:50 CET,0.0 1.288 1.822 2.232 2.575 2.886 3.143 3.373 3.806 4.006 4.181 4.387 4.624 4.763 5.022 5.264 5.489 5.596 5.799 5.992 6.263 6.431 6.591 6.806 7.011 7.212 7.405 7.587 7.817 8.04 8.25 8.487 8.709 8.915 9.153 9.432 9.693 9.98 10.272 10.574 10.89 11.209 11.546 11.852 12.192 12.54 12.871 13.249 13.672 13.94 13.915 13.494 13.015 12.545 12.063 11.557 11.068 10.626 10.231 9.821 9.439 9.075 8.732 8.395 8.084 7.807 7.499 7.224 6.986 6.729 6.457 6.23 5.987 5.724 5.522 5.305 5.065 4.818 4.576 4.409 4.228 3.932 3.723 3.497 3.376 3.13 2.884 2.627 2.488 2.246 2.005 1.83 1.646 1.212 0.956 0.679 0.374 0.008 -0.423 -0.976 -2.358 -9 ,11106 ,KEBNE ,16721273,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:04:39 CET,0.0 1.452 1.976 2.381 2.715 2.982 3.241 3.476 3.858 4.035 4.2 4.417 4.641 4.774 5.024 5.252 5.468 5.569 5.769 5.954 6.206 6.369 6.524 6.74 6.948 7.152 7.339 7.513 7.729 7.933 8.136 8.389 8.639 8.862 9.104 9.374 9.622 9.885 10.16 10.431 10.698 10.984 11.307 11.618 11.929 12.266 12.661 13.015 13.326 13.567 13.561 13.116 12.575 12.01 11.439 10.927 10.478 10.032 9.612 9.163 8.776 8.454 8.14 7.824 7.536 7.268 6.976 6.69 6.431 6.166 5.899 5.666 5.42 5.156 4.938 4.717 4.492 4.248 3.984 3.8 3.619 3.343 3.139 2.922 2.812 2.581 2.327 2.059 1.919 1.674 1.439 1.262 1.084 0.676 0.433 0.162 -0.128 -0.45 -0.849 -1.395 -2.844 -10 ,4502 ,KEBNE ,16721274,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:04:07 CET,0.0 1.405 1.902 2.283 2.579 2.844 3.097 3.324 3.726 3.905 4.079 4.307 4.546 4.686 4.946 5.182 5.414 5.521 5.719 5.905 6.169 6.337 6.495 6.724 6.934 7.122 7.305 7.494 7.724 7.931 8.129 8.361 8.58 8.787 9.025 9.296 9.561 9.838 10.118 10.393 10.664 10.982 11.337 11.627 11.96 12.355 12.758 13.11 13.417 13.683 13.787 13.428 12.893 12.356 11.845 11.349 10.912 10.513 10.123 9.726 9.399 9.072 8.728 8.398 8.103 7.844 7.56 7.29 7.061 6.824 6.566 6.352 6.13 5.883 5.678 5.471 5.263 5.043 4.804 4.629 4.447 4.165 3.964 3.746 3.631 3.395 3.147 2.874 2.725 2.471 2.228 2.053 1.879 1.49 1.262 0.996 0.703 0.375 -0.011 -0.527 -2.01 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_64.txt deleted file mode 100644 index 330e36d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_65_64.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20343 ,KEBNE ,16721275,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:05:13 CET,0.0 1.638 2.341 2.833 3.227 3.561 3.861 4.151 4.671 4.887 5.097 5.388 5.657 5.818 6.096 6.342 6.579 6.694 6.92 7.121 7.392 7.574 7.751 8.001 8.232 8.456 8.67 8.865 9.113 9.351 9.58 9.856 10.12 10.377 10.679 10.99 11.251 11.538 11.86 12.194 12.511 12.824 13.143 13.426 13.784 14.178 14.533 14.894 15.198 15.352 15.208 14.623 14.046 13.537 13.026 12.514 12.038 11.579 11.181 10.78 10.422 10.096 9.776 9.46 9.162 8.895 8.616 8.348 8.11 7.864 7.602 7.379 7.139 6.886 6.687 6.478 6.265 6.035 5.779 5.598 5.412 5.127 4.923 4.705 4.597 4.369 4.115 3.835 3.684 3.434 3.192 3.015 2.825 2.385 2.127 1.844 1.526 1.16 0.729 0.178 -1.403 -2 ,16204 ,KEBNE ,16721276,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:04:59 CET,0.0 1.623 2.249 2.703 3.07 3.39 3.667 3.906 4.347 4.542 4.722 4.962 5.203 5.353 5.654 5.93 6.178 6.303 6.549 6.772 7.066 7.251 7.442 7.704 7.937 8.158 8.374 8.582 8.845 9.097 9.337 9.617 9.88 10.129 10.386 10.666 10.936 11.214 11.485 11.759 12.04 12.343 12.722 13.142 13.599 13.993 14.325 14.669 15.075 15.259 15.011 14.465 13.839 13.243 12.664 12.105 11.626 11.154 10.699 10.243 9.863 9.527 9.196 8.864 8.533 8.217 7.895 7.6 7.339 7.082 6.814 6.577 6.33 6.081 5.884 5.67 5.442 5.205 4.958 4.783 4.606 4.329 4.118 3.896 3.781 3.534 3.266 2.99 2.843 2.595 2.347 2.162 1.968 1.533 1.296 1.034 0.724 0.373 -0.025 -0.548 -2.139 -3 ,27648 ,KEBNE ,16721277,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:05:09 CET,0.0 1.241 1.75 2.155 2.485 2.788 3.055 3.289 3.697 3.878 4.053 4.271 4.51 4.658 4.942 5.194 5.445 5.569 5.797 6.013 6.314 6.5 6.679 6.937 7.178 7.404 7.624 7.831 8.089 8.343 8.573 8.846 9.109 9.351 9.642 9.957 10.229 10.498 10.776 11.076 11.373 11.685 12.039 12.391 12.772 13.127 13.478 13.844 14.223 14.524 14.585 14.196 13.633 13.071 12.535 12.031 11.567 11.112 10.707 10.302 9.946 9.613 9.263 8.915 8.598 8.309 8.008 7.732 7.486 7.224 6.948 6.717 6.472 6.211 6.005 5.79 5.566 5.318 5.053 4.878 4.695 4.4 4.179 3.948 3.834 3.591 3.329 3.047 2.894 2.646 2.421 2.254 2.068 1.653 1.423 1.168 0.877 0.524 0.107 -0.383 -1.622 -4 ,10870 ,KEBNE ,16721278,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:05:36 CET,0.0 1.653 2.268 2.703 3.075 3.394 3.686 3.937 4.388 4.59 4.768 5.0 5.236 5.38 5.664 5.92 6.155 6.268 6.479 6.678 6.959 7.136 7.306 7.544 7.771 7.983 8.172 8.355 8.614 8.875 9.117 9.385 9.617 9.833 10.072 10.349 10.622 10.904 11.203 11.504 11.804 12.132 12.486 12.825 13.181 13.522 13.863 14.169 14.434 14.623 14.526 14.069 13.557 12.993 12.397 11.85 11.389 10.948 10.528 10.094 9.717 9.375 9.042 8.735 8.443 8.164 7.851 7.563 7.32 7.068 6.812 6.597 6.362 6.11 5.919 5.712 5.478 5.238 4.997 4.832 4.657 4.367 4.158 3.935 3.82 3.592 3.345 3.065 2.919 2.67 2.409 2.229 2.038 1.605 1.355 1.08 0.781 0.433 0.025 -0.496 -1.778 -5 ,16490 ,KEBNE ,16721279,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:05:35 CET,0.0 1.642 2.217 2.616 2.956 3.248 3.507 3.741 4.169 4.37 4.552 4.797 5.038 5.178 5.444 5.679 5.899 6.016 6.251 6.466 6.772 6.971 7.156 7.403 7.633 7.852 8.06 8.264 8.536 8.787 9.003 9.239 9.458 9.69 9.968 10.258 10.509 10.759 11.02 11.3 11.6 11.906 12.224 12.535 12.874 13.23 13.596 13.916 14.195 14.414 14.396 13.986 13.499 12.945 12.422 11.964 11.503 11.04 10.636 10.227 9.862 9.517 9.165 8.833 8.528 8.248 7.94 7.668 7.428 7.171 6.903 6.669 6.417 6.16 5.966 5.755 5.525 5.287 5.03 4.851 4.671 4.372 4.15 3.924 3.811 3.56 3.295 3.015 2.869 2.621 2.373 2.192 2.013 1.595 1.351 1.085 0.799 0.477 0.074 -0.48 -1.837 -6 ,10439 ,KEBNE ,16721280,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:04:58 CET,0.0 1.558 2.108 2.515 2.83 3.116 3.377 3.619 4.038 4.217 4.399 4.65 4.896 5.039 5.301 5.548 5.784 5.892 6.105 6.301 6.563 6.733 6.901 7.136 7.359 7.569 7.764 7.954 8.204 8.432 8.646 8.914 9.159 9.398 9.68 9.971 10.227 10.487 10.767 11.056 11.341 11.643 11.979 12.296 12.631 12.983 13.338 13.676 13.984 14.19 14.163 13.782 13.243 12.661 12.086 11.524 11.012 10.531 10.115 9.685 9.299 8.943 8.592 8.256 7.933 7.639 7.333 7.049 6.797 6.541 6.27 6.033 5.777 5.509 5.303 5.089 4.867 4.629 4.376 4.202 4.025 3.748 3.544 3.32 3.203 2.962 2.698 2.402 2.25 2.005 1.764 1.577 1.382 0.962 0.736 0.47 0.175 -0.162 -0.543 -1.037 -2.542 -7 ,2565 ,KEBNE ,16721281,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:05:29 CET,0.0 1.616 2.201 2.649 3.022 3.335 3.6 3.831 4.221 4.399 4.572 4.788 5.02 5.161 5.411 5.651 5.883 5.99 6.187 6.379 6.657 6.835 7.015 7.257 7.471 7.677 7.865 8.046 8.289 8.529 8.768 9.044 9.29 9.509 9.747 10.027 10.28 10.545 10.821 11.121 11.436 11.782 12.167 12.513 12.861 13.193 13.571 13.9 14.094 14.179 13.964 13.371 12.738 12.1 11.508 10.952 10.455 9.994 9.596 9.192 8.82 8.492 8.171 7.845 7.535 7.237 6.914 6.631 6.385 6.129 5.856 5.621 5.377 5.113 4.895 4.671 4.443 4.207 3.965 3.798 3.622 3.344 3.136 2.913 2.797 2.55 2.287 2.007 1.86 1.614 1.384 1.209 1.017 0.602 0.372 0.112 -0.176 -0.498 -0.912 -1.487 -2.948 -8 ,19041 ,KEBNE ,16721282,Sat Nov 27 11:06:39 CET,Sat Nov 27 13:04:51 CET,0.0 1.387 1.946 2.366 2.709 3.018 3.295 3.554 4.017 4.226 4.413 4.659 4.905 5.055 5.352 5.621 5.871 5.988 6.218 6.437 6.723 6.908 7.084 7.316 7.543 7.771 7.992 8.194 8.446 8.68 8.883 9.119 9.345 9.564 9.809 10.075 10.336 10.624 10.913 11.196 11.491 11.816 12.15 12.445 12.745 13.055 13.397 13.73 14.014 14.185 14.102 13.614 13.05 12.472 11.928 11.386 10.887 10.408 9.963 9.507 9.118 8.784 8.466 8.152 7.853 7.573 7.267 6.994 6.756 6.509 6.25 6.038 5.806 5.561 5.372 5.159 4.935 4.698 4.437 4.252 4.058 3.765 3.559 3.337 3.222 2.98 2.723 2.438 2.285 2.04 1.789 1.594 1.398 0.956 0.703 0.434 0.13 -0.206 -0.605 -1.108 -2.269 -9 ,28356 ,KEBNE ,16721283,Sat Nov 27 11:07:40 CET,Sat Nov 27 13:06:43 CET,0.0 1.641 2.19 2.648 3.004 3.306 3.59 3.851 4.26 4.441 4.626 4.873 5.116 5.266 5.544 5.797 6.027 6.135 6.348 6.56 6.864 7.044 7.211 7.447 7.658 7.852 8.041 8.235 8.487 8.723 8.924 9.155 9.381 9.589 9.831 10.102 10.336 10.573 10.829 11.098 11.364 11.654 11.972 12.273 12.629 13.016 13.408 13.736 13.973 14.213 14.23 13.77 13.21 12.666 12.108 11.545 11.041 10.569 10.154 9.731 9.356 9.032 8.717 8.403 8.094 7.803 7.491 7.206 6.97 6.73 6.466 6.234 5.995 5.747 5.552 5.348 5.133 4.911 4.671 4.502 4.319 4.038 3.846 3.633 3.518 3.29 3.051 2.774 2.625 2.386 2.152 1.984 1.809 1.413 1.187 0.932 0.652 0.33 -0.065 -0.581 -1.923 -10 ,14509 ,KEBNE ,16721284,Sat Nov 27 11:07:40 CET,Sat Nov 27 13:07:06 CET,0.0 1.323 1.857 2.27 2.618 2.909 3.159 3.397 3.843 4.035 4.208 4.451 4.702 4.847 5.12 5.369 5.585 5.688 5.889 6.095 6.386 6.559 6.734 6.995 7.223 7.43 7.634 7.825 8.063 8.29 8.497 8.736 8.966 9.19 9.447 9.726 9.976 10.24 10.542 10.872 11.219 11.587 11.986 12.369 12.763 13.16 13.557 13.936 14.285 14.495 14.405 13.929 13.367 12.802 12.269 11.728 11.238 10.821 10.44 9.992 9.589 9.251 8.932 8.627 8.333 8.057 7.767 7.49 7.243 6.994 6.725 6.492 6.238 5.976 5.771 5.558 5.345 5.112 4.858 4.683 4.501 4.208 3.998 3.784 3.676 3.45 3.205 2.941 2.801 2.556 2.313 2.133 1.949 1.534 1.288 1.014 0.718 0.396 -0.005 -0.598 -2.2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_49.txt deleted file mode 100644 index b80a03a7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20658 ,KEBNE ,16721285,Sat Nov 27 11:07:39 CET,Sat Nov 27 13:06:41 CET,0.0 1.278 1.801 2.236 2.582 2.871 3.145 3.4 3.882 4.105 4.327 4.581 4.929 5.106 5.442 5.769 6.088 6.241 6.534 6.819 7.229 7.491 7.747 8.12 8.475 8.816 9.154 9.487 9.91 10.316 10.718 11.213 11.695 12.163 12.707 13.32 13.916 14.576 15.291 16.054 16.88 17.874 19.059 20.237 21.64 23.212 25.007 27.104 29.639 32.819 36.916 40.537 42.794 44.228 45.226 45.955 46.398 46.67 46.844 46.968 47.07 47.12 47.122 47.11 47.086 47.037 46.948 46.844 46.737 46.621 46.498 46.392 46.286 46.16 46.055 45.936 45.81 45.675 45.504 45.372 45.241 45.037 44.871 44.7 44.618 44.413 44.165 43.876 43.721 43.446 43.193 43.001 42.81 42.395 42.144 41.838 41.491 41.036 40.421 39.541 36.578 -2 ,24447 ,KEBNE ,16721286,Sat Nov 27 11:07:40 CET,Sat Nov 27 13:06:30 CET,0.0 1.479 2.012 2.41 2.754 3.075 3.364 3.641 4.158 4.389 4.607 4.852 5.208 5.395 5.762 6.1 6.417 6.571 6.877 7.176 7.596 7.868 8.128 8.498 8.854 9.197 9.532 9.864 10.308 10.737 11.148 11.651 12.148 12.631 13.169 13.77 14.361 15.029 15.757 16.55 17.43 18.426 19.582 20.767 22.186 23.842 25.768 28.003 30.728 34.001 38.187 41.859 44.104 45.599 46.584 47.282 47.803 48.172 48.417 48.593 48.702 48.739 48.73 48.709 48.636 48.553 48.468 48.376 48.286 48.178 48.06 47.955 47.825 47.672 47.545 47.416 47.275 47.093 46.886 46.753 46.61 46.378 46.218 46.036 45.935 45.71 45.466 45.207 45.072 44.817 44.61 44.419 44.21 43.774 43.513 43.19 42.78 42.255 41.646 40.863 38.425 -3 ,23276 ,KEBNE ,16721287,Sat Nov 27 11:08:40 CET,Sat Nov 27 13:09:26 CET,0.0 1.367 1.955 2.412 2.799 3.134 3.436 3.718 4.214 4.439 4.658 4.906 5.263 5.447 5.804 6.145 6.466 6.623 6.927 7.229 7.66 7.927 8.192 8.579 8.945 9.298 9.637 9.968 10.408 10.838 11.249 11.745 12.223 12.685 13.224 13.846 14.45 15.118 15.86 16.647 17.481 18.449 19.614 20.822 22.28 23.954 25.909 28.226 31.061 34.409 38.831 42.774 45.032 46.519 47.556 48.274 48.768 49.097 49.304 49.498 49.637 49.69 49.716 49.739 49.734 49.685 49.608 49.537 49.464 49.362 49.226 49.097 48.962 48.807 48.685 48.575 48.444 48.289 48.104 47.962 47.808 47.564 47.393 47.2 47.104 46.917 46.656 46.337 46.15 45.849 45.553 45.338 45.128 44.627 44.346 44.05 43.699 43.277 42.774 42.034 39.009 -4 ,27958 ,KEBNE ,16721288,Sat Nov 27 11:08:40 CET,Sat Nov 27 13:09:21 CET,0.0 1.391 1.937 2.346 2.685 2.976 3.246 3.501 3.969 4.182 4.385 4.616 4.965 5.152 5.511 5.849 6.17 6.326 6.619 6.9 7.306 7.562 7.811 8.179 8.546 8.911 9.263 9.597 10.033 10.453 10.868 11.368 11.853 12.328 12.886 13.515 14.093 14.718 15.418 16.194 17.058 18.065 19.239 20.467 21.938 23.596 25.59 27.913 30.656 33.917 38.116 41.962 44.379 45.974 47.06 47.845 48.4 48.798 49.066 49.263 49.375 49.437 49.461 49.449 49.4 49.352 49.294 49.228 49.156 49.055 48.94 48.84 48.735 48.615 48.504 48.382 48.238 48.061 47.878 47.758 47.632 47.422 47.263 47.088 46.991 46.772 46.489 46.161 45.989 45.695 45.425 45.237 45.035 44.529 44.239 43.906 43.524 43.096 42.582 41.8 38.258 -5 ,17691 ,KEBNE ,16721289,Sat Nov 27 11:08:40 CET,Sat Nov 27 13:08:34 CET,0.0 1.575 2.101 2.51 2.879 3.204 3.5 3.771 4.272 4.492 4.7 4.944 5.307 5.498 5.853 6.195 6.519 6.674 6.978 7.262 7.669 7.937 8.202 8.593 8.961 9.31 9.653 9.989 10.426 10.847 11.258 11.765 12.253 12.722 13.265 13.865 14.452 15.106 15.824 16.611 17.448 18.415 19.583 20.796 22.227 23.874 25.829 28.122 30.882 34.217 38.429 41.938 44.133 45.64 46.653 47.356 47.814 48.115 48.333 48.53 48.646 48.688 48.684 48.643 48.575 48.486 48.372 48.26 48.141 48.016 47.879 47.754 47.626 47.471 47.327 47.16 46.975 46.8 46.63 46.501 46.35 46.1 45.925 45.724 45.62 45.398 45.158 44.892 44.738 44.468 44.224 44.011 43.785 43.292 43.009 42.708 42.353 41.856 41.165 40.203 36.572 -6 ,13368 ,KEBNE ,16721290,Sat Nov 27 11:09:42 CET,Sat Nov 27 13:09:02 CET,0.0 1.277 1.816 2.245 2.621 2.963 3.263 3.549 4.067 4.295 4.514 4.758 5.116 5.297 5.626 5.958 6.291 6.452 6.755 7.05 7.471 7.745 8.019 8.406 8.778 9.15 9.511 9.857 10.293 10.707 11.108 11.598 12.078 12.548 13.081 13.692 14.296 14.96 15.678 16.47 17.335 18.318 19.481 20.659 22.071 23.689 25.595 27.857 30.545 33.669 37.734 41.423 43.726 45.186 46.106 46.766 47.226 47.546 47.736 47.859 47.902 47.877 47.829 47.782 47.718 47.658 47.584 47.493 47.396 47.292 47.175 47.052 46.915 46.752 46.605 46.45 46.294 46.124 45.936 45.797 45.641 45.394 45.198 44.997 44.899 44.674 44.418 44.129 43.978 43.712 43.462 43.263 43.073 42.642 42.387 42.094 41.736 41.286 40.657 39.835 37.44 -7 ,21792 ,KEBNE ,16721291,Sat Nov 27 11:09:42 CET,Sat Nov 27 13:10:25 CET,0.0 1.33 1.875 2.299 2.654 2.96 3.24 3.522 4.046 4.272 4.485 4.733 5.088 5.272 5.618 5.947 6.272 6.427 6.728 7.025 7.441 7.704 7.968 8.358 8.727 9.078 9.419 9.759 10.2 10.608 10.999 11.493 11.977 12.447 12.994 13.62 14.233 14.908 15.638 16.421 17.265 18.251 19.431 20.636 22.075 23.737 25.723 28.076 30.942 34.383 38.585 42.227 44.523 46.038 47.105 47.876 48.367 48.722 48.969 49.101 49.178 49.223 49.221 49.201 49.154 49.089 48.997 48.897 48.803 48.683 48.549 48.436 48.302 48.142 48.005 47.856 47.688 47.517 47.338 47.199 47.047 46.796 46.605 46.399 46.293 46.069 45.827 45.57 45.423 45.155 44.947 44.764 44.543 43.983 43.683 43.317 42.877 42.375 41.727 40.82 37.925 -8 ,11251 ,KEBNE ,16721292,Sat Nov 27 11:11:43 CET,Sat Nov 27 13:09:49 CET,0.0 1.314 1.898 2.358 2.738 3.072 3.374 3.649 4.166 4.401 4.625 4.889 5.25 5.445 5.816 6.163 6.504 6.662 6.97 7.256 7.673 7.945 8.206 8.58 8.94 9.296 9.649 9.983 10.41 10.831 11.238 11.737 12.227 12.701 13.252 13.855 14.433 15.109 15.854 16.658 17.536 18.539 19.716 20.905 22.294 23.888 25.85 28.19 31.036 34.481 38.723 42.358 44.644 46.21 47.307 48.072 48.595 48.949 49.153 49.289 49.354 49.409 49.454 49.457 49.424 49.363 49.273 49.167 49.056 48.946 48.831 48.728 48.615 48.483 48.375 48.254 48.105 47.937 47.775 47.653 47.513 47.282 47.094 46.889 46.784 46.548 46.296 46.021 45.874 45.615 45.373 45.151 44.88 44.218 43.898 43.598 43.249 42.818 42.167 41.332 38.728 -9 ,9095 ,KEBNE ,16721293,Sat Nov 27 11:11:43 CET,Sat Nov 27 13:10:47 CET,0.0 1.441 1.995 2.393 2.75 3.076 3.361 3.635 4.137 4.361 4.573 4.803 5.148 5.331 5.698 6.053 6.392 6.55 6.849 7.139 7.556 7.824 8.082 8.455 8.814 9.16 9.495 9.823 10.256 10.672 11.072 11.571 12.067 12.534 13.071 13.679 14.265 14.922 15.638 16.415 17.261 18.235 19.38 20.561 21.934 23.466 25.281 27.347 29.909 33.225 37.627 41.46 43.737 45.234 46.251 46.998 47.52 47.839 48.016 48.159 48.243 48.296 48.325 48.306 48.261 48.215 48.149 48.055 47.938 47.804 47.661 47.531 47.384 47.229 47.102 46.949 46.769 46.582 46.39 46.247 46.096 45.849 45.667 45.477 45.381 45.17 44.937 44.678 44.533 44.266 44.027 43.83 43.596 43.075 42.808 42.479 42.093 41.643 41.058 40.216 36.988 -10 ,4340 ,KEBNE ,16721294,Sat Nov 27 11:12:45 CET,Sat Nov 27 13:11:59 CET,0.0 1.446 2.013 2.396 2.721 3.027 3.321 3.598 4.082 4.299 4.517 4.775 5.134 5.314 5.661 6.017 6.349 6.502 6.801 7.085 7.496 7.768 8.037 8.418 8.778 9.125 9.473 9.814 10.257 10.69 11.115 11.615 12.092 12.565 13.128 13.765 14.385 15.061 15.784 16.564 17.404 18.358 19.481 20.675 22.112 23.727 25.643 27.917 30.614 33.808 37.885 41.407 43.572 45.02 45.989 46.656 47.089 47.386 47.602 47.788 47.911 47.975 47.984 47.983 47.982 47.955 47.884 47.783 47.684 47.567 47.41 47.269 47.133 46.98 46.858 46.722 46.56 46.389 46.2 46.057 45.905 45.651 45.472 45.276 45.167 44.933 44.679 44.404 44.248 43.978 43.746 43.517 43.269 42.802 42.526 42.213 41.812 41.313 40.752 40.014 36.956 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_65.txt deleted file mode 100644 index d4f57fd6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22765 ,KEBNE ,16721295,Sat Nov 27 11:12:45 CET,Sat Nov 27 13:11:36 CET,0.0 1.387 1.97 2.399 2.756 3.084 3.406 3.708 4.257 4.516 4.754 5.033 5.403 5.608 6.001 6.373 6.739 6.916 7.253 7.577 8.036 8.332 8.625 9.062 9.486 9.885 10.278 10.661 11.158 11.66 12.139 12.711 13.28 13.829 14.47 15.212 15.937 16.739 17.61 18.566 19.606 20.791 22.21 23.689 25.492 27.578 30.048 32.955 36.611 41.308 47.583 53.478 57.371 60.116 62.104 63.654 64.868 65.815 66.54 67.179 67.665 68.059 68.38 68.644 68.863 69.024 69.159 69.264 69.329 69.37 69.392 69.397 69.372 69.331 69.315 69.287 69.245 69.182 69.082 69.008 68.938 68.813 68.707 68.596 68.538 68.413 68.282 68.123 68.027 67.834 67.719 67.586 67.438 67.107 66.907 66.68 66.39 66.037 65.583 64.961 63.184 -2 ,18901 ,KEBNE ,16721296,Sat Nov 27 11:12:45 CET,Sat Nov 27 13:12:47 CET,0.0 1.2 1.733 2.156 2.526 2.861 3.165 3.445 3.981 4.236 4.48 4.77 5.149 5.355 5.754 6.119 6.463 6.637 6.972 7.287 7.74 8.034 8.321 8.743 9.162 9.575 9.979 10.371 10.872 11.353 11.824 12.41 12.987 13.546 14.197 14.944 15.665 16.466 17.357 18.339 19.396 20.604 22.044 23.534 25.344 27.442 29.948 32.902 36.564 41.211 47.405 53.188 57.073 59.864 61.913 63.493 64.699 65.64 66.335 66.981 67.493 67.875 68.199 68.479 68.689 68.849 68.994 69.096 69.167 69.225 69.273 69.305 69.312 69.291 69.252 69.193 69.124 69.038 68.939 68.877 68.809 68.656 68.538 68.41 68.342 68.193 68.004 67.79 67.68 67.475 67.296 67.137 66.967 66.582 66.361 66.122 65.85 65.524 65.115 64.54 63.037 -3 ,29874 ,KEBNE ,16721297,Sat Nov 27 11:12:45 CET,Sat Nov 27 13:12:07 CET,0.0 1.503 2.049 2.48 2.865 3.195 3.501 3.795 4.32 4.562 4.8 5.082 5.458 5.665 6.071 6.445 6.79 6.958 7.296 7.628 8.107 8.417 8.719 9.166 9.597 10.005 10.4 10.782 11.288 11.782 12.261 12.848 13.419 13.972 14.618 15.361 16.091 16.918 17.819 18.774 19.809 21.003 22.433 23.916 25.705 27.784 30.284 33.267 36.995 41.734 48.039 53.973 57.994 60.824 62.834 64.361 65.56 66.53 67.267 67.91 68.391 68.767 69.073 69.299 69.452 69.581 69.706 69.795 69.866 69.919 69.948 69.968 69.97 69.945 69.916 69.888 69.852 69.792 69.722 69.66 69.584 69.456 69.355 69.248 69.186 69.042 68.874 68.683 68.587 68.39 68.197 68.038 67.854 67.447 67.236 66.995 66.706 66.361 65.954 65.369 63.587 -4 ,3341 ,KEBNE ,16721298,Sat Nov 27 11:12:45 CET,Sat Nov 27 13:11:57 CET,0.0 1.427 1.975 2.439 2.828 3.166 3.484 3.764 4.29 4.543 4.78 5.054 5.42 5.623 6.008 6.369 6.718 6.888 7.225 7.552 8.018 8.328 8.63 9.051 9.451 9.848 10.242 10.627 11.127 11.621 12.111 12.699 13.267 13.834 14.509 15.257 15.985 16.798 17.691 18.675 19.725 20.916 22.355 23.85 25.643 27.739 30.242 33.209 36.926 41.65 47.989 53.91 57.803 60.59 62.64 64.221 65.409 66.366 67.122 67.792 68.272 68.625 68.926 69.176 69.391 69.566 69.703 69.81 69.875 69.933 69.987 70.005 70.016 70.018 70.003 69.978 69.934 69.871 69.805 69.762 69.708 69.605 69.521 69.42 69.365 69.222 69.071 68.917 68.828 68.644 68.489 68.347 68.188 67.81 67.589 67.337 67.053 66.712 66.285 65.671 63.983 -5 ,25489 ,KEBNE ,16721299,Sat Nov 27 11:13:46 CET,Sat Nov 27 13:12:59 CET,0.0 1.698 2.289 2.72 3.128 3.477 3.782 4.063 4.585 4.821 5.046 5.307 5.69 5.895 6.283 6.653 7.006 7.178 7.511 7.833 8.305 8.606 8.898 9.325 9.741 10.145 10.538 10.934 11.444 11.933 12.421 13.021 13.591 14.148 14.814 15.558 16.272 17.078 17.967 18.918 19.939 21.129 22.563 24.039 25.805 27.888 30.404 33.342 36.951 41.511 47.666 53.48 57.325 60.047 62.086 63.661 64.833 65.754 66.44 67.033 67.493 67.869 68.185 68.44 68.65 68.808 68.94 69.036 69.11 69.174 69.214 69.217 69.213 69.212 69.19 69.163 69.125 69.052 68.953 68.895 68.825 68.682 68.568 68.445 68.377 68.23 68.072 67.902 67.814 67.607 67.428 67.265 67.09 66.737 66.546 66.318 66.056 65.734 65.277 64.646 62.793 -6 ,8357 ,KEBNE ,16721300,Sat Nov 27 11:13:46 CET,Sat Nov 27 13:12:57 CET,0.0 1.424 2.053 2.537 2.93 3.261 3.553 3.834 4.378 4.636 4.889 5.168 5.533 5.73 6.111 6.484 6.833 7.003 7.347 7.679 8.162 8.474 8.778 9.208 9.624 10.044 10.45 10.837 11.344 11.845 12.345 12.953 13.531 14.096 14.762 15.504 16.218 17.026 17.911 18.881 19.909 21.081 22.515 24.011 25.808 27.87 30.372 33.338 37.01 41.723 48.05 53.96 57.875 60.607 62.584 64.133 65.329 66.264 66.972 67.621 68.122 68.5 68.823 69.107 69.334 69.504 69.646 69.752 69.837 69.904 69.935 69.927 69.911 69.903 69.899 69.887 69.861 69.82 69.753 69.691 69.628 69.524 69.433 69.327 69.275 69.159 68.996 68.787 68.68 68.492 68.38 68.254 68.105 67.752 67.546 67.309 67.028 66.718 66.304 65.748 63.896 -7 ,22485 ,KEBNE ,16721301,Sat Nov 27 11:14:47 CET,Sat Nov 27 13:14:23 CET,0.0 1.342 1.913 2.34 2.714 3.056 3.364 3.645 4.162 4.397 4.624 4.895 5.272 5.472 5.859 6.232 6.589 6.76 7.092 7.419 7.887 8.189 8.486 8.917 9.336 9.745 10.14 10.524 11.025 11.513 11.998 12.596 13.179 13.75 14.417 15.181 15.924 16.733 17.609 18.571 19.614 20.821 22.276 23.771 25.578 27.706 30.259 33.261 36.963 41.648 47.899 53.684 57.547 60.339 62.403 63.992 65.221 66.192 66.901 67.5 67.979 68.379 68.69 68.968 69.204 69.376 69.524 69.641 69.725 69.78 69.823 69.838 69.838 69.831 69.821 69.794 69.737 69.684 69.629 69.568 69.497 69.392 69.309 69.222 69.162 69.012 68.861 68.691 68.596 68.397 68.247 68.107 67.945 67.564 67.339 67.092 66.828 66.506 66.098 65.523 63.669 -8 ,22041 ,KEBNE ,16721302,Sat Nov 27 11:25:00 CET,Sat Nov 27 13:27:49 CET,0.0 1.585 2.167 2.628 3.005 3.356 3.673 3.958 4.472 4.708 4.938 5.223 5.599 5.8 6.186 6.568 6.941 7.117 7.444 7.756 8.237 8.552 8.848 9.271 9.674 10.075 10.469 10.85 11.34 11.826 12.304 12.875 13.43 13.969 14.607 15.338 16.054 16.857 17.751 18.731 19.798 21.021 22.47 23.974 25.784 27.855 30.333 33.304 36.991 41.616 47.842 53.706 57.584 60.383 62.437 64.002 65.2 66.153 66.888 67.56 68.073 68.482 68.814 69.071 69.283 69.448 69.596 69.713 69.798 69.87 69.919 69.933 69.938 69.948 69.951 69.926 69.886 69.847 69.79 69.752 69.711 69.609 69.529 69.444 69.393 69.283 69.162 69.007 68.915 68.727 68.581 68.462 68.321 67.972 67.793 67.581 67.299 66.95 66.545 66.008 64.396 -9 ,9800 ,KEBNE ,16721303,Sat Nov 27 11:30:03 CET,Sat Nov 27 13:27:28 CET,0.0 1.306 1.926 2.389 2.779 3.125 3.431 3.717 4.261 4.519 4.768 5.055 5.428 5.637 6.037 6.414 6.767 6.941 7.279 7.6 8.071 8.38 8.674 9.11 9.553 9.972 10.369 10.761 11.271 11.768 12.246 12.828 13.395 13.952 14.611 15.361 16.087 16.893 17.794 18.786 19.843 21.062 22.51 23.984 25.768 27.846 30.339 33.295 36.963 41.566 47.726 53.557 57.484 60.358 62.457 64.033 65.214 66.14 66.859 67.529 68.046 68.461 68.805 69.079 69.286 69.435 69.58 69.691 69.755 69.814 69.868 69.886 69.875 69.852 69.826 69.79 69.751 69.694 69.611 69.537 69.454 69.324 69.222 69.106 69.049 68.92 68.757 68.574 68.475 68.277 68.123 67.981 67.837 67.533 67.351 67.129 66.847 66.493 66.027 65.408 63.193 -10 ,23276 ,KEBNE ,16721304,Sat Nov 27 11:33:06 CET,Sat Nov 27 13:31:18 CET,0.0 1.033 1.573 1.992 2.352 2.675 2.97 3.256 3.779 4.028 4.261 4.516 4.881 5.08 5.466 5.834 6.168 6.325 6.654 6.996 7.478 7.775 8.068 8.501 8.916 9.32 9.717 10.102 10.603 11.095 11.573 12.158 12.726 13.287 13.937 14.669 15.397 16.204 17.097 18.067 19.111 20.328 21.783 23.289 25.098 27.167 29.65 32.595 36.274 40.921 47.012 52.716 56.517 59.221 61.207 62.747 63.949 64.924 65.678 66.334 66.81 67.182 67.49 67.741 67.929 68.059 68.177 68.275 68.342 68.399 68.458 68.491 68.507 68.514 68.5 68.465 68.421 68.365 68.289 68.234 68.175 68.048 67.925 67.789 67.718 67.559 67.379 67.195 67.104 66.903 66.757 66.618 66.471 66.168 65.978 65.738 65.449 65.117 64.739 64.21 62.631 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_68.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_68.txt deleted file mode 100644 index 0c46f672..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_67_68.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19321 ,KEBNE ,16721305,Sat Nov 27 11:37:09 CET,Sat Nov 27 13:37:01 CET,0.0 1.748 2.416 2.887 3.271 3.623 3.938 4.217 4.733 4.976 5.217 5.51 5.888 6.1 6.521 6.902 7.259 7.43 7.771 8.101 8.556 8.852 9.142 9.56 9.971 10.359 10.722 11.082 11.548 11.991 12.425 12.933 13.423 13.935 14.545 15.231 15.882 16.591 17.367 18.193 19.054 20.014 21.119 22.224 23.529 24.998 26.725 28.792 31.35 34.387 38.243 41.721 43.924 45.458 46.588 47.429 48.006 48.426 48.719 48.949 49.107 49.226 49.308 49.356 49.393 49.408 49.401 49.377 49.332 49.275 49.213 49.157 49.094 49.015 48.947 48.864 48.76 48.643 48.521 48.429 48.331 48.188 48.079 47.945 47.869 47.707 47.52 47.32 47.215 46.988 46.854 46.7 46.534 46.199 45.995 45.737 45.463 45.164 44.787 44.25 42.887 -2 ,22021 ,KEBNE ,16721306,Sat Nov 27 12:08:51 CET,Sat Nov 27 14:07:54 CET,0.0 1.714 2.352 2.831 3.267 3.66 3.994 4.3 4.876 5.127 5.357 5.636 6.001 6.196 6.569 6.929 7.278 7.444 7.757 8.061 8.499 8.784 9.073 9.478 9.857 10.233 10.606 10.968 11.428 11.866 12.291 12.811 13.32 13.811 14.387 15.05 15.691 16.394 17.148 17.966 18.827 19.78 20.923 22.106 23.518 25.072 26.839 28.948 31.533 34.75 38.759 42.164 44.339 45.783 46.785 47.52 48.047 48.461 48.768 48.983 49.125 49.237 49.306 49.34 49.344 49.328 49.303 49.267 49.211 49.146 49.083 49.023 48.939 48.834 48.744 48.637 48.518 48.39 48.25 48.16 48.065 47.897 47.767 47.625 47.554 47.402 47.232 47.024 46.906 46.674 46.547 46.409 46.247 45.885 45.682 45.451 45.178 44.848 44.435 43.882 42.43 -3 ,3256 ,KEBNE ,16721307,Sat Nov 27 12:13:01 CET,Sat Nov 27 14:12:15 CET,0.0 1.659 2.239 2.707 3.106 3.441 3.753 4.054 4.603 4.852 5.086 5.354 5.726 5.929 6.322 6.693 7.053 7.224 7.544 7.849 8.301 8.594 8.877 9.277 9.662 10.045 10.407 10.752 11.214 11.666 12.092 12.603 13.107 13.605 14.179 14.819 15.436 16.121 16.881 17.685 18.539 19.55 20.738 21.944 23.361 24.906 26.614 28.551 30.968 34.009 37.94 41.41 43.617 45.119 46.155 46.93 47.502 47.918 48.21 48.44 48.581 48.678 48.757 48.801 48.815 48.826 48.814 48.768 48.723 48.669 48.598 48.534 48.466 48.381 48.306 48.21 48.094 47.975 47.853 47.763 47.657 47.479 47.349 47.212 47.137 46.976 46.801 46.604 46.496 46.263 46.138 45.997 45.834 45.461 45.252 45.025 44.768 44.456 44.059 43.509 41.934 -4 ,31923 ,KEBNE ,16721308,Sat Nov 27 12:16:08 CET,Sat Nov 27 14:16:00 CET,0.0 2.033 2.716 3.213 3.635 4.0 4.319 4.612 5.138 5.38 5.61 5.885 6.265 6.471 6.863 7.23 7.576 7.742 8.073 8.395 8.852 9.138 9.413 9.817 10.199 10.566 10.912 11.238 11.685 12.145 12.573 13.087 13.597 14.079 14.644 15.29 15.922 16.625 17.402 18.231 19.09 20.068 21.242 22.457 23.928 25.527 27.274 29.255 31.686 34.694 38.541 42.024 44.239 45.766 46.811 47.593 48.182 48.622 48.941 49.183 49.359 49.487 49.569 49.615 49.638 49.641 49.619 49.593 49.557 49.508 49.442 49.374 49.29 49.19 49.106 49.013 48.911 48.798 48.668 48.568 48.46 48.294 48.166 48.02 47.95 47.805 47.632 47.428 47.324 47.094 46.96 46.828 46.683 46.371 46.178 45.937 45.665 45.354 44.967 44.446 43.048 -5 ,20821 ,KEBNE ,16721309,Sat Nov 27 12:21:19 CET,Sat Nov 27 14:19:27 CET,0.0 1.549 2.215 2.691 3.111 3.493 3.826 4.133 4.697 4.948 5.175 5.446 5.817 6.011 6.395 6.763 7.114 7.28 7.598 7.91 8.357 8.649 8.934 9.344 9.74 10.124 10.497 10.859 11.326 11.787 12.226 12.77 13.297 13.775 14.313 14.926 15.529 16.215 16.979 17.8 18.691 19.719 20.934 22.146 23.518 25.018 26.768 28.798 31.407 34.795 39.009 42.608 44.861 46.377 47.449 48.266 48.862 49.3 49.608 49.876 50.07 50.199 50.284 50.321 50.335 50.345 50.338 50.324 50.301 50.255 50.187 50.122 50.046 49.97 49.904 49.823 49.739 49.642 49.529 49.439 49.336 49.172 49.056 48.926 48.853 48.702 48.527 48.327 48.223 47.994 47.862 47.714 47.56 47.228 47.03 46.813 46.561 46.272 45.874 45.321 43.917 -6 ,21522 ,KEBNE ,16721310,Sat Nov 27 12:31:37 CET,Sat Nov 27 14:30:31 CET,0.0 1.836 2.508 3.037 3.46 3.815 4.145 4.458 5.014 5.268 5.509 5.797 6.166 6.366 6.754 7.132 7.503 7.676 7.999 8.314 8.788 9.087 9.365 9.764 10.156 10.539 10.904 11.256 11.727 12.191 12.628 13.161 13.678 14.184 14.764 15.399 16.027 16.732 17.492 18.315 19.161 20.084 21.205 22.381 23.773 25.325 27.149 29.275 31.774 34.774 38.728 42.269 44.471 45.94 46.969 47.76 48.337 48.769 49.075 49.319 49.505 49.627 49.695 49.749 49.79 49.801 49.801 49.788 49.756 49.708 49.648 49.583 49.509 49.426 49.36 49.28 49.187 49.082 48.954 48.861 48.763 48.596 48.47 48.34 48.273 48.123 47.964 47.783 47.681 47.461 47.338 47.199 47.052 46.728 46.522 46.275 45.996 45.703 45.364 44.837 43.29 -7 ,5754 ,KEBNE ,16721311,Sat Nov 27 12:31:37 CET,Sat Nov 27 14:30:01 CET,0.0 1.674 2.282 2.74 3.169 3.551 3.892 4.21 4.773 5.027 5.267 5.554 5.945 6.156 6.54 6.898 7.244 7.416 7.756 8.08 8.552 8.856 9.144 9.549 9.941 10.323 10.696 11.065 11.527 11.967 12.418 12.971 13.503 14.013 14.603 15.239 15.815 16.455 17.15 17.892 18.7 19.655 20.762 21.861 23.169 24.7 26.495 28.565 31.05 34.106 38.138 41.758 44.004 45.522 46.622 47.42 47.979 48.425 48.748 48.983 49.142 49.246 49.294 49.314 49.336 49.352 49.336 49.297 49.258 49.197 49.115 49.042 48.97 48.894 48.832 48.75 48.646 48.545 48.431 48.343 48.245 48.081 47.959 47.824 47.749 47.586 47.415 47.212 47.096 46.86 46.751 46.605 46.438 46.091 45.909 45.693 45.436 45.123 44.721 44.212 43.093 -8 ,15081 ,KEBNE ,16721312,Sat Nov 27 12:31:41 CET,Sat Nov 27 14:23:45 CET,0.0 1.772 2.434 2.889 3.275 3.617 3.929 4.218 4.739 4.983 5.222 5.507 5.865 6.057 6.427 6.783 7.129 7.296 7.613 7.924 8.389 8.698 8.991 9.413 9.812 10.181 10.541 10.899 11.359 11.806 12.248 12.781 13.291 13.786 14.364 15.024 15.669 16.391 17.168 18.008 18.897 19.879 21.035 22.234 23.663 25.295 27.202 29.31 31.77 34.796 38.641 42.058 44.24 45.728 46.756 47.535 48.126 48.564 48.854 49.08 49.243 49.336 49.389 49.43 49.443 49.43 49.405 49.379 49.348 49.297 49.222 49.151 49.07 48.972 48.89 48.8 48.7 48.591 48.466 48.37 48.267 48.104 47.974 47.827 47.752 47.589 47.397 47.206 47.104 46.875 46.776 46.656 46.512 46.172 45.973 45.754 45.499 45.193 44.813 44.284 42.896 -9 ,4596 ,KEBNE ,16721313,Sat Nov 27 12:32:38 CET,Sat Nov 27 14:32:31 CET,0.0 1.661 2.291 2.801 3.231 3.604 3.941 4.249 4.819 5.07 5.301 5.578 5.949 6.156 6.537 6.896 7.231 7.384 7.68 7.975 8.402 8.679 8.945 9.318 9.686 10.045 10.383 10.716 11.171 11.596 11.989 12.463 12.917 13.364 13.908 14.557 15.192 15.88 16.61 17.365 18.126 18.997 20.028 21.085 22.401 23.988 25.81 27.827 30.309 33.331 37.121 40.525 42.643 44.012 44.976 45.7 46.197 46.585 46.869 47.092 47.267 47.389 47.466 47.514 47.533 47.53 47.508 47.468 47.422 47.37 47.311 47.244 47.163 47.072 46.999 46.918 46.82 46.717 46.599 46.506 46.406 46.234 46.107 45.984 45.915 45.76 45.597 45.412 45.313 45.089 44.956 44.814 44.656 44.312 44.123 43.905 43.657 43.367 42.977 42.436 41.132 -10 ,26833 ,KEBNE ,16721314,Sat Nov 27 12:45:52 CET,Sat Nov 27 14:44:16 CET,0.0 1.677 2.306 2.802 3.232 3.599 3.92 4.219 4.746 4.974 5.196 5.455 5.816 6.01 6.383 6.754 7.11 7.277 7.586 7.885 8.33 8.613 8.885 9.295 9.699 10.087 10.47 10.841 11.295 11.733 12.166 12.683 13.183 13.666 14.214 14.834 15.456 16.154 16.909 17.672 18.45 19.359 20.442 21.551 22.849 24.309 26.002 27.97 30.403 33.433 37.381 40.89 43.074 44.569 45.588 46.32 46.867 47.288 47.599 47.856 48.02 48.136 48.224 48.274 48.298 48.299 48.267 48.228 48.193 48.149 48.081 48.005 47.914 47.813 47.736 47.643 47.536 47.416 47.282 47.187 47.089 46.922 46.788 46.646 46.577 46.434 46.267 46.074 45.966 45.732 45.591 45.442 45.275 44.91 44.711 44.496 44.254 43.954 43.588 43.061 41.367 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_49.txt deleted file mode 100644 index 69490ad2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13178 ,KEBNE ,16721315,Sat Nov 27 12:45:54 CET,Sat Nov 27 14:39:53 CET,0.0 1.478 2.019 2.398 2.721 3.032 3.309 3.552 3.963 4.154 4.334 4.533 4.792 4.929 5.182 5.419 5.647 5.755 5.96 6.156 6.435 6.612 6.787 7.032 7.25 7.451 7.646 7.843 8.106 8.353 8.583 8.851 9.107 9.356 9.634 9.931 10.213 10.514 10.834 11.156 11.491 11.865 12.273 12.683 13.148 13.639 14.181 14.731 15.279 15.767 16.052 15.842 15.4 14.844 14.234 13.658 13.12 12.607 12.144 11.645 11.197 10.802 10.434 10.042 9.662 9.324 8.947 8.59 8.282 7.958 7.613 7.324 7.021 6.687 6.414 6.14 5.855 5.532 5.201 4.984 4.741 4.349 4.08 3.801 3.652 3.334 2.998 2.643 2.453 2.139 1.825 1.575 1.311 0.695 0.341 -0.03 -0.512 -1.189 -1.9 -2.723 -5.989 -2 ,8414 ,KEBNE ,16721316,Sat Nov 27 12:46:55 CET,Sat Nov 27 14:41:03 CET,0.0 1.026 1.486 1.842 2.142 2.411 2.639 2.853 3.242 3.424 3.601 3.796 4.051 4.185 4.437 4.669 4.881 4.979 5.177 5.369 5.642 5.816 5.981 6.219 6.445 6.654 6.853 7.041 7.274 7.507 7.733 7.995 8.245 8.484 8.755 9.06 9.351 9.67 9.995 10.323 10.661 11.034 11.474 11.893 12.363 12.875 13.434 14.041 14.684 15.295 15.653 15.527 15.198 14.728 14.198 13.669 13.166 12.681 12.221 11.71 11.257 10.866 10.508 10.157 9.816 9.491 9.125 8.786 8.495 8.193 7.866 7.577 7.265 6.92 6.649 6.379 6.103 5.822 5.508 5.274 5.037 4.679 4.425 4.15 4.006 3.712 3.385 3.029 2.851 2.554 2.208 1.95 1.667 1.044 0.735 0.387 -0.034 -0.518 -1.185 -2.259 -5.962 -3 ,14762 ,KEBNE ,16721317,Sat Nov 27 12:47:58 CET,Sat Nov 27 14:42:41 CET,0.0 1.322 1.797 2.143 2.428 2.702 2.95 3.17 3.569 3.738 3.9 4.106 4.374 4.508 4.757 4.985 5.199 5.309 5.52 5.717 6.018 6.203 6.372 6.614 6.838 7.059 7.263 7.445 7.683 7.908 8.123 8.388 8.642 8.882 9.155 9.466 9.75 10.045 10.375 10.72 11.059 11.428 11.86 12.303 12.798 13.315 13.886 14.509 15.133 15.707 16.141 16.023 15.648 15.148 14.577 14.022 13.48 12.961 12.5 12.013 11.588 11.174 10.75 10.367 10.009 9.675 9.34 9.027 8.728 8.393 8.047 7.77 7.485 7.194 6.96 6.714 6.443 6.16 5.873 5.656 5.419 5.044 4.772 4.475 4.321 4.015 3.704 3.367 3.178 2.864 2.557 2.305 2.016 1.365 1.025 0.657 0.218 -0.313 -0.978 -1.912 -5.153 -4 ,30377 ,KEBNE ,16721318,Sat Nov 27 12:50:00 CET,Sat Nov 27 14:45:42 CET,0.0 1.181 1.66 2.013 2.331 2.612 2.861 3.09 3.484 3.665 3.835 4.029 4.302 4.457 4.728 4.961 5.194 5.314 5.538 5.747 6.034 6.21 6.385 6.632 6.862 7.084 7.298 7.499 7.745 7.979 8.2 8.463 8.715 8.956 9.236 9.53 9.803 10.107 10.42 10.755 11.109 11.504 11.97 12.422 12.927 13.466 13.988 14.511 15.102 15.692 16.168 16.193 15.88 15.446 15.022 14.618 14.231 13.818 13.406 12.931 12.467 12.047 11.627 11.219 10.825 10.45 10.057 9.697 9.382 9.045 8.688 8.384 8.059 7.712 7.432 7.135 6.828 6.508 6.172 5.937 5.683 5.274 4.994 4.687 4.529 4.22 3.902 3.548 3.33 2.976 2.611 2.368 2.114 1.532 1.189 0.819 0.39 -0.11 -0.775 -1.837 -5.614 -5 ,12196 ,KEBNE ,16721319,Sat Nov 27 12:51:01 CET,Sat Nov 27 14:46:09 CET,0.0 1.45 1.972 2.369 2.714 2.999 3.26 3.501 3.93 4.124 4.295 4.493 4.772 4.921 5.198 5.466 5.715 5.833 6.065 6.278 6.573 6.761 6.941 7.205 7.453 7.681 7.899 8.108 8.384 8.64 8.873 9.161 9.445 9.711 10.001 10.31 10.598 10.913 11.252 11.608 11.952 12.322 12.757 13.191 13.699 14.23 14.798 15.408 16.042 16.666 17.269 17.367 17.013 16.543 16.015 15.473 14.952 14.456 13.996 13.512 13.082 12.663 12.228 11.838 11.498 11.16 10.784 10.437 10.121 9.796 9.464 9.167 8.847 8.513 8.256 7.992 7.724 7.445 7.145 6.931 6.701 6.336 6.062 5.774 5.629 5.327 4.999 4.616 4.401 4.058 3.681 3.405 3.11 2.432 2.067 1.683 1.253 0.712 0.052 -0.824 -4.395 -6 ,32734 ,KEBNE ,16721320,Sat Nov 27 12:51:59 CET,Sat Nov 27 14:51:49 CET,0.0 1.382 1.87 2.214 2.512 2.788 3.036 3.258 3.674 3.867 4.047 4.261 4.522 4.659 4.927 5.17 5.398 5.507 5.722 5.923 6.187 6.365 6.54 6.773 7.016 7.258 7.465 7.651 7.896 8.135 8.353 8.61 8.858 9.091 9.363 9.667 9.951 10.257 10.586 10.915 11.238 11.613 12.038 12.457 12.937 13.424 13.909 14.381 14.937 15.529 15.912 15.782 15.375 14.901 14.404 13.908 13.409 12.931 12.524 12.078 11.684 11.333 10.971 10.599 10.235 9.9 9.543 9.228 8.958 8.641 8.293 8.011 7.72 7.42 7.181 6.917 6.638 6.351 6.041 5.825 5.607 5.254 4.992 4.719 4.577 4.271 3.943 3.604 3.427 3.12 2.816 2.598 2.37 1.868 1.581 1.215 0.76 0.28 -0.285 -1.208 -4.788 -7 ,7742 ,KEBNE ,16721321,Sat Nov 27 12:52:59 CET,Sat Nov 27 14:52:35 CET,0.0 1.441 2.001 2.417 2.745 3.014 3.255 3.487 3.91 4.086 4.254 4.465 4.732 4.867 5.124 5.371 5.597 5.703 5.907 6.106 6.4 6.594 6.779 7.04 7.281 7.5 7.711 7.915 8.179 8.43 8.655 8.925 9.191 9.446 9.734 10.03 10.305 10.604 10.928 11.284 11.648 12.036 12.472 12.92 13.427 13.959 14.577 15.213 15.802 16.366 16.845 16.866 16.505 16.001 15.527 15.041 14.512 13.986 13.456 12.848 12.321 11.862 11.414 10.987 10.592 10.209 9.808 9.456 9.142 8.804 8.438 8.12 7.799 7.48 7.215 6.929 6.619 6.291 5.951 5.715 5.476 5.101 4.831 4.541 4.391 4.07 3.722 3.342 3.137 2.823 2.523 2.288 2.014 1.421 1.098 0.721 0.289 -0.205 -0.811 -1.765 -5.748 -8 ,13235 ,KEBNE ,16721322,Sat Nov 27 13:00:09 CET,Sat Nov 27 14:59:01 CET,0.0 1.138 1.617 1.998 2.315 2.575 2.815 3.041 3.452 3.63 3.799 4.007 4.269 4.412 4.681 4.924 5.157 5.267 5.484 5.69 5.967 6.146 6.319 6.573 6.813 7.03 7.236 7.433 7.681 7.917 8.148 8.427 8.692 8.931 9.201 9.514 9.808 10.128 10.472 10.804 11.149 11.536 11.967 12.396 12.862 13.346 13.898 14.527 15.192 15.806 16.232 16.215 15.89 15.496 15.033 14.522 14.055 13.631 13.245 12.789 12.36 11.963 11.577 11.195 10.825 10.476 10.097 9.758 9.478 9.199 8.894 8.63 8.339 8.024 7.769 7.51 7.255 6.982 6.682 6.471 6.254 5.919 5.685 5.432 5.295 4.996 4.673 4.313 4.12 3.784 3.393 3.135 2.836 2.115 1.752 1.399 0.907 0.272 -0.394 -1.245 -4.304 -9 ,7440 ,KEBNE ,16721323,Sat Nov 27 13:00:09 CET,Sat Nov 27 14:58:26 CET,0.0 1.137 1.6 1.97 2.284 2.561 2.815 3.034 3.409 3.597 3.774 3.974 4.239 4.37 4.636 4.882 5.096 5.198 5.397 5.592 5.876 6.052 6.218 6.46 6.698 6.928 7.138 7.334 7.579 7.816 8.049 8.316 8.572 8.821 9.097 9.403 9.682 9.977 10.293 10.615 10.954 11.352 11.817 12.26 12.744 13.26 13.814 14.371 14.945 15.475 15.889 15.895 15.528 14.981 14.43 13.844 13.241 12.633 12.047 11.447 10.94 10.498 10.069 9.626 9.2 8.825 8.448 8.1 7.79 7.446 7.057 6.726 6.371 5.993 5.71 5.439 5.158 4.861 4.563 4.353 4.119 3.74 3.474 3.191 3.05 2.77 2.465 2.121 1.929 1.605 1.263 1.03 0.793 0.248 -0.078 -0.449 -0.909 -1.491 -2.261 -3.361 -7.242 -10 ,27521 ,KEBNE ,16721324,Sat Nov 27 13:00:09 CET,Sat Nov 27 14:58:24 CET,0.0 1.039 1.491 1.848 2.152 2.414 2.652 2.884 3.283 3.454 3.619 3.818 4.075 4.209 4.467 4.706 4.929 5.035 5.234 5.426 5.704 5.876 6.037 6.279 6.51 6.719 6.931 7.142 7.41 7.662 7.89 8.154 8.41 8.657 8.935 9.243 9.534 9.84 10.156 10.486 10.851 11.25 11.691 12.117 12.581 13.067 13.594 14.134 14.67 15.256 15.613 15.46 15.175 14.783 14.302 13.816 13.338 12.845 12.392 11.907 11.492 11.124 10.769 10.432 10.082 9.748 9.409 9.089 8.795 8.478 8.149 7.885 7.61 7.318 7.073 6.81 6.545 6.263 5.961 5.738 5.492 5.102 4.836 4.557 4.413 4.099 3.751 3.396 3.214 2.9 2.6 2.379 2.127 1.539 1.232 0.884 0.346 -0.253 -1.004 -1.944 -5.191 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_65.txt deleted file mode 100644 index 6207f363..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_68_65.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5864 ,KEBNE ,17026062,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 15:08:51 CET,0.0 1.562 2.138 2.552 2.903 3.212 3.482 3.729 4.173 4.372 4.568 4.818 5.11 5.286 5.598 5.877 6.139 6.265 6.519 6.764 7.113 7.336 7.549 7.856 8.149 8.432 8.716 9.0 9.356 9.677 9.979 10.349 10.716 11.078 11.487 11.947 12.4 12.898 13.431 13.999 14.613 15.286 16.073 16.913 17.899 18.98 20.232 21.678 23.427 25.575 28.226 30.396 31.619 32.374 32.841 33.156 33.382 33.464 33.471 33.413 33.31 33.2 33.085 32.964 32.812 32.65 32.479 32.331 32.199 32.044 31.867 31.717 31.556 31.37 31.213 31.032 30.828 30.609 30.375 30.206 30.03 29.731 29.499 29.264 29.152 28.936 28.696 28.398 28.236 27.986 27.737 27.546 27.341 26.888 26.628 26.327 25.971 25.552 25.043 24.391 22.044 -2 ,25854 ,KEBNE ,17025797,Wed Dec 22 13:07:30 CET,Wed Dec 22 15:07:51 CET,0.0 1.183 1.735 2.17 2.537 2.858 3.145 3.41 3.888 4.106 4.31 4.568 4.861 5.022 5.336 5.633 5.91 6.043 6.301 6.545 6.898 7.122 7.336 7.653 7.952 8.236 8.511 8.773 9.098 9.413 9.723 10.098 10.454 10.8 11.212 11.678 12.126 12.609 13.135 13.704 14.301 14.965 15.725 16.504 17.407 18.424 19.627 21.013 22.689 24.684 27.164 29.238 30.399 31.109 31.585 31.862 31.99 32.053 32.049 31.964 31.868 31.783 31.672 31.54 31.378 31.216 31.045 30.87 30.67 30.447 30.234 30.045 29.85 29.648 29.484 29.303 29.109 28.898 28.674 28.518 28.349 28.079 27.86 27.632 27.522 27.299 27.065 26.783 26.618 26.344 26.072 25.885 25.665 25.185 24.908 24.574 24.192 23.77 23.267 22.545 20.542 -4 ,16295 ,KEBNE ,17026065,Wed Dec 22 13:49:43 CET,Wed Dec 22 15:09:47 CET,0.0 1.223 1.743 2.131 2.471 2.77 3.048 3.319 3.82 4.05 4.261 4.523 4.816 4.989 5.318 5.606 5.875 6.01 6.276 6.537 6.9 7.127 7.347 7.653 7.947 8.232 8.505 8.771 9.115 9.46 9.79 10.185 10.57 10.929 11.349 11.827 12.275 12.754 13.275 13.84 14.443 15.135 15.936 16.744 17.685 18.748 20.03 21.488 23.186 25.334 28.034 30.191 31.393 32.057 32.426 32.628 32.685 32.675 32.648 32.608 32.565 32.479 32.371 32.244 32.097 31.941 31.736 31.567 31.425 31.264 31.091 30.94 30.759 30.549 30.387 30.211 30.019 29.815 29.594 29.428 29.252 28.98 28.797 28.602 28.48 28.217 27.951 27.674 27.521 27.27 27.006 26.808 26.605 26.134 25.856 25.556 25.225 24.819 24.308 23.639 21.64 -5 ,27355 ,KEBNE ,17025800,Wed Dec 22 13:07:30 CET,Wed Dec 22 15:07:18 CET,0.0 1.593 2.227 2.685 3.051 3.39 3.692 3.964 4.458 4.68 4.897 5.185 5.482 5.659 5.992 6.295 6.58 6.719 6.988 7.243 7.608 7.838 8.061 8.382 8.692 8.993 9.279 9.553 9.907 10.243 10.572 10.985 11.366 11.72 12.124 12.573 13.01 13.504 14.05 14.621 15.202 15.869 16.677 17.514 18.495 19.57 20.826 22.271 23.99 26.02 28.487 30.533 31.718 32.386 32.734 32.889 32.948 32.968 32.965 32.934 32.847 32.724 32.567 32.406 32.268 32.123 31.951 31.779 31.615 31.434 31.234 31.06 30.862 30.652 30.487 30.297 30.08 29.856 29.63 29.468 29.297 29.029 28.849 28.66 28.551 28.323 28.074 27.785 27.629 27.372 27.13 26.935 26.721 26.225 25.932 25.597 25.215 24.772 24.254 23.606 21.613 -6 ,17456 ,KEBNE ,17025801,Wed Dec 22 13:08:32 CET,Wed Dec 22 15:08:50 CET,0.0 1.605 2.201 2.652 3.021 3.338 3.634 3.904 4.385 4.605 4.823 5.111 5.404 5.574 5.901 6.205 6.49 6.627 6.891 7.143 7.496 7.72 7.936 8.246 8.551 8.847 9.125 9.397 9.749 10.083 10.399 10.777 11.136 11.484 11.897 12.355 12.798 13.291 13.824 14.393 14.995 15.681 16.466 17.235 18.152 19.208 20.485 21.951 23.618 25.608 28.079 30.155 31.323 32.015 32.437 32.674 32.803 32.864 32.872 32.841 32.763 32.663 32.553 32.429 32.276 32.108 31.932 31.777 31.616 31.433 31.249 31.08 30.905 30.721 30.555 30.381 30.201 30.006 29.793 29.637 29.479 29.223 29.032 28.836 28.735 28.505 28.256 27.995 27.844 27.579 27.297 27.098 26.889 26.434 26.18 25.899 25.597 25.222 24.734 24.088 21.967 -7 ,27252 ,KEBNE ,17026068,Wed Dec 22 13:49:44 CET,Wed Dec 22 15:08:58 CET,0.0 1.478 2.017 2.456 2.852 3.186 3.49 3.767 4.241 4.455 4.653 4.912 5.21 5.385 5.702 5.995 6.283 6.42 6.681 6.932 7.286 7.519 7.743 8.058 8.351 8.625 8.901 9.171 9.509 9.838 10.156 10.539 10.909 11.272 11.691 12.163 12.624 13.127 13.654 14.209 14.803 15.475 16.27 17.07 18.024 19.093 20.313 21.721 23.347 25.235 27.511 29.364 30.445 31.084 31.478 31.715 31.792 31.795 31.77 31.682 31.577 31.471 31.343 31.196 31.034 30.862 30.661 30.469 30.306 30.145 29.968 29.813 29.646 29.468 29.334 29.182 29.0 28.792 28.569 28.428 28.284 28.045 27.857 27.637 27.524 27.282 27.012 26.728 26.563 26.295 26.043 25.859 25.663 25.226 24.965 24.653 24.284 23.867 23.313 22.525 20.098 -8 ,13126 ,KEBNE ,17026069,Wed Dec 22 13:49:40 CET,Wed Dec 22 15:09:55 CET,0.0 1.387 1.969 2.38 2.74 3.082 3.4 3.692 4.203 4.434 4.644 4.899 5.185 5.353 5.683 5.994 6.283 6.42 6.7 6.97 7.335 7.573 7.796 8.106 8.405 8.693 8.971 9.234 9.574 9.901 10.218 10.601 10.965 11.322 11.753 12.257 12.729 13.24 13.778 14.333 14.924 15.579 16.349 17.159 18.13 19.189 20.412 21.833 23.551 25.632 28.194 30.397 31.671 32.405 32.829 33.114 33.275 33.32 33.326 33.276 33.195 33.105 32.975 32.803 32.62 32.467 32.293 32.112 31.954 31.784 31.601 31.442 31.25 31.031 30.86 30.678 30.48 30.273 30.04 29.877 29.715 29.449 29.268 29.082 28.981 28.758 28.519 28.243 28.082 27.817 27.521 27.297 27.053 26.497 26.186 25.876 25.557 25.147 24.602 23.947 22.023 -9 ,26822 ,KEBNE ,17025804,Wed Dec 22 13:08:32 CET,Wed Dec 22 15:08:01 CET,0.0 1.108 1.594 1.972 2.318 2.612 2.871 3.125 3.61 3.819 4.019 4.286 4.578 4.749 5.073 5.365 5.649 5.785 6.04 6.301 6.684 6.914 7.134 7.455 7.762 8.052 8.328 8.598 8.951 9.295 9.636 10.04 10.432 10.817 11.253 11.726 12.172 12.681 13.23 13.793 14.398 15.097 15.924 16.749 17.729 18.83 20.071 21.498 23.192 25.191 27.655 29.708 30.881 31.62 32.044 32.3 32.451 32.528 32.553 32.524 32.457 32.373 32.284 32.174 32.035 31.889 31.738 31.609 31.471 31.303 31.126 30.976 30.812 30.634 30.494 30.332 30.129 29.895 29.647 29.485 29.322 29.059 28.873 28.672 28.567 28.361 28.133 27.862 27.706 27.449 27.205 27.026 26.833 26.404 26.142 25.84 25.524 25.142 24.654 23.941 22.173 -10 ,30655 ,KEBNE ,17026071,Wed Dec 22 13:49:38 CET,Wed Dec 22 15:09:09 CET,0.0 1.141 1.672 2.067 2.39 2.692 2.979 3.24 3.709 3.922 4.127 4.389 4.68 4.844 5.168 5.479 5.765 5.898 6.152 6.403 6.757 6.99 7.222 7.539 7.84 8.139 8.419 8.69 9.047 9.381 9.709 10.112 10.49 10.861 11.293 11.765 12.231 12.736 13.271 13.857 14.478 15.169 15.976 16.795 17.756 18.837 20.103 21.539 23.24 25.34 27.964 30.109 31.345 32.063 32.428 32.642 32.705 32.695 32.678 32.58 32.427 32.302 32.179 32.022 31.857 31.689 31.514 31.338 31.165 30.988 30.813 30.64 30.413 30.164 29.982 29.795 29.594 29.382 29.147 28.987 28.831 28.588 28.401 28.195 28.088 27.865 27.619 27.328 27.169 26.92 26.65 26.456 26.24 25.76 25.475 25.173 24.856 24.44 23.934 23.249 20.678 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_65.txt deleted file mode 100644 index 5b8d1d06..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9135 ,KEBNE ,16721325,Sat Nov 27 13:00:09 CET,Sat Nov 27 14:58:59 CET,0.0 1.543 2.086 2.495 2.805 3.078 3.315 3.524 3.903 4.087 4.266 4.48 4.709 4.84 5.091 5.328 5.556 5.664 5.868 6.062 6.337 6.509 6.676 6.918 7.141 7.346 7.54 7.724 7.962 8.186 8.398 8.652 8.886 9.111 9.375 9.658 9.919 10.202 10.514 10.85 11.194 11.545 11.928 12.324 12.766 13.241 13.792 14.416 15.139 15.836 16.439 16.724 16.659 16.436 16.131 15.808 15.492 15.204 14.933 14.613 14.304 13.99 13.692 13.423 13.167 12.925 12.654 12.395 12.162 11.919 11.665 11.452 11.23 10.989 10.78 10.546 10.29 10.016 9.736 9.544 9.359 9.062 8.824 8.581 8.464 8.204 7.904 7.579 7.409 7.141 6.872 6.677 6.466 5.995 5.729 5.433 5.122 4.756 4.287 3.632 1.9 -2 ,28489 ,KEBNE ,16721326,Sat Nov 27 13:00:10 CET,Sat Nov 27 14:58:45 CET,0.0 1.33 1.854 2.26 2.609 2.922 3.183 3.408 3.819 4.005 4.181 4.408 4.643 4.781 5.061 5.329 5.56 5.672 5.893 6.093 6.36 6.526 6.691 6.924 7.149 7.367 7.568 7.756 7.994 8.222 8.439 8.701 8.949 9.183 9.458 9.751 10.018 10.331 10.678 11.022 11.368 11.762 12.211 12.624 13.083 13.583 14.135 14.726 15.401 16.095 16.715 16.94 16.868 16.636 16.295 15.948 15.622 15.322 15.045 14.724 14.405 14.1 13.797 13.518 13.244 12.969 12.674 12.394 12.148 11.885 11.614 11.384 11.145 10.898 10.69 10.473 10.221 9.944 9.668 9.474 9.271 8.95 8.719 8.463 8.32 8.041 7.744 7.408 7.231 6.949 6.632 6.423 6.202 5.694 5.403 5.06 4.689 4.262 3.712 2.997 0.905 -3 ,14369 ,KEBNE ,16721327,Sat Nov 27 13:00:09 CET,Sat Nov 27 14:59:04 CET,0.0 1.392 1.949 2.34 2.676 2.965 3.224 3.472 3.916 4.1 4.279 4.518 4.768 4.918 5.203 5.455 5.678 5.784 5.985 6.187 6.487 6.667 6.837 7.085 7.319 7.536 7.748 7.951 8.192 8.417 8.632 8.884 9.132 9.375 9.655 9.96 10.242 10.541 10.852 11.186 11.544 11.924 12.335 12.756 13.232 13.731 14.28 14.859 15.474 16.171 16.811 17.002 16.901 16.676 16.44 16.141 15.806 15.482 15.181 14.861 14.564 14.257 13.958 13.705 13.443 13.183 12.913 12.673 12.45 12.189 11.921 11.707 11.478 11.236 11.047 10.847 10.626 10.379 10.117 9.942 9.761 9.442 9.213 8.98 8.848 8.554 8.248 7.922 7.749 7.479 7.161 6.942 6.714 6.208 5.924 5.622 5.269 4.836 4.328 3.687 1.449 -4 ,2910 ,KEBNE ,16721328,Sat Nov 27 13:00:10 CET,Sat Nov 27 14:59:03 CET,0.0 1.289 1.817 2.199 2.536 2.839 3.094 3.329 3.761 3.956 4.146 4.385 4.633 4.771 5.048 5.316 5.553 5.666 5.883 6.083 6.359 6.537 6.712 6.961 7.202 7.435 7.655 7.861 8.126 8.375 8.606 8.876 9.131 9.377 9.653 9.955 10.251 10.568 10.896 11.239 11.593 11.997 12.453 12.888 13.386 13.925 14.532 15.196 15.903 16.622 17.336 17.652 17.607 17.415 17.185 16.928 16.649 16.348 16.063 15.768 15.477 15.176 14.869 14.52 14.15 13.821 13.463 13.141 12.893 12.619 12.325 12.089 11.835 11.568 11.341 11.105 10.867 10.601 10.299 10.103 9.915 9.617 9.395 9.144 9.014 8.73 8.43 8.109 7.942 7.671 7.367 7.154 6.935 6.435 6.148 5.805 5.404 4.98 4.465 3.774 1.241 -5 ,11720 ,KEBNE ,16721329,Sat Nov 27 13:00:09 CET,Sat Nov 27 14:58:42 CET,0.0 1.134 1.61 1.98 2.306 2.586 2.826 3.043 3.441 3.62 3.786 3.991 4.223 4.359 4.628 4.881 5.109 5.214 5.422 5.628 5.914 6.094 6.261 6.497 6.728 6.95 7.154 7.346 7.598 7.836 8.055 8.312 8.557 8.788 9.061 9.372 9.658 9.954 10.264 10.603 10.957 11.336 11.764 12.184 12.667 13.204 13.764 14.338 14.951 15.547 16.074 16.31 16.309 16.15 15.913 15.621 15.329 15.032 14.728 14.417 14.133 13.858 13.596 13.33 13.072 12.819 12.542 12.304 12.092 11.855 11.566 11.331 11.087 10.834 10.658 10.458 10.23 9.995 9.741 9.552 9.351 9.032 8.804 8.569 8.45 8.205 7.945 7.645 7.481 7.211 6.912 6.719 6.525 6.077 5.8 5.5 5.181 4.815 4.368 3.753 1.443 -6 ,1968 ,KEBNE ,16721330,Sat Nov 27 13:01:11 CET,Sat Nov 27 15:00:17 CET,0.0 1.115 1.612 1.991 2.321 2.631 2.904 3.145 3.572 3.757 3.925 4.152 4.39 4.528 4.796 5.053 5.284 5.393 5.608 5.812 6.098 6.275 6.437 6.668 6.894 7.111 7.317 7.517 7.759 7.989 8.215 8.478 8.723 8.959 9.229 9.524 9.794 10.086 10.389 10.713 11.064 11.434 11.853 12.277 12.764 13.279 13.819 14.392 15.053 15.785 16.426 16.603 16.481 16.269 16.027 15.769 15.505 15.202 14.882 14.542 14.25 13.965 13.695 13.442 13.18 12.92 12.608 12.3 12.043 11.777 11.488 11.248 11.002 10.751 10.542 10.311 10.071 9.824 9.578 9.395 9.189 8.86 8.619 8.38 8.258 8.003 7.737 7.434 7.274 7.022 6.771 6.575 6.369 5.905 5.645 5.359 5.047 4.666 4.185 3.551 1.533 -7 ,16055 ,KEBNE ,16721331,Sat Nov 27 13:01:10 CET,Sat Nov 27 15:00:36 CET,0.0 1.665 2.174 2.581 2.92 3.194 3.435 3.659 4.047 4.22 4.379 4.597 4.841 4.983 5.249 5.496 5.723 5.833 6.044 6.249 6.539 6.722 6.897 7.138 7.369 7.595 7.805 8.001 8.257 8.503 8.733 8.999 9.251 9.493 9.764 10.071 10.373 10.691 11.015 11.352 11.7 12.079 12.53 12.971 13.462 13.984 14.516 15.071 15.688 16.35 16.964 17.129 17.044 16.856 16.565 16.222 15.896 15.582 15.301 14.989 14.699 14.427 14.132 13.839 13.549 13.267 12.958 12.647 12.377 12.131 11.859 11.62 11.372 11.087 10.86 10.637 10.405 10.161 9.907 9.721 9.514 9.171 8.926 8.662 8.53 8.253 7.962 7.676 7.517 7.238 6.937 6.726 6.497 6.003 5.717 5.405 5.056 4.67 4.223 3.591 1.384 -8 ,28336 ,KEBNE ,16721332,Sat Nov 27 13:01:11 CET,Sat Nov 27 15:00:49 CET,0.0 1.582 2.122 2.543 2.877 3.167 3.432 3.679 4.115 4.313 4.499 4.737 4.983 5.127 5.398 5.651 5.901 6.021 6.245 6.461 6.765 6.954 7.135 7.389 7.619 7.834 8.045 8.248 8.509 8.763 8.997 9.272 9.543 9.796 10.078 10.4 10.713 11.038 11.377 11.718 12.056 12.429 12.868 13.296 13.766 14.265 14.803 15.337 15.876 16.453 16.963 17.001 16.811 16.541 16.191 15.829 15.471 15.106 14.781 14.425 14.092 13.787 13.486 13.2 12.936 12.684 12.397 12.14 11.887 11.586 11.298 11.067 10.814 10.573 10.369 10.115 9.858 9.598 9.325 9.144 8.938 8.588 8.343 8.098 7.97 7.701 7.42 7.123 6.967 6.708 6.432 6.22 5.99 5.477 5.183 4.857 4.517 4.164 3.714 3.047 1.313 -9 ,8838 ,KEBNE ,16721333,Sat Nov 27 13:01:11 CET,Sat Nov 27 15:00:13 CET,0.0 1.365 1.915 2.326 2.655 2.947 3.225 3.469 3.895 4.08 4.257 4.502 4.751 4.895 5.157 5.392 5.624 5.736 5.937 6.126 6.392 6.564 6.729 6.962 7.185 7.395 7.597 7.788 8.029 8.268 8.495 8.762 9.018 9.252 9.517 9.807 10.08 10.391 10.721 11.055 11.393 11.772 12.209 12.634 13.117 13.617 14.177 14.788 15.437 16.073 16.647 16.897 16.868 16.666 16.359 16.062 15.745 15.426 15.129 14.783 14.449 14.135 13.847 13.561 13.218 12.888 12.595 12.341 12.101 11.842 11.57 11.337 11.086 10.821 10.603 10.37 10.14 9.898 9.611 9.395 9.169 8.815 8.572 8.313 8.178 7.898 7.6 7.295 7.134 6.873 6.595 6.384 6.157 5.656 5.37 5.053 4.716 4.326 3.821 3.118 1.41 -10 ,13260 ,KEBNE ,16721334,Sat Nov 27 13:01:11 CET,Sat Nov 27 15:00:03 CET,0.0 1.556 2.116 2.552 2.916 3.223 3.475 3.702 4.115 4.301 4.471 4.706 4.963 5.102 5.377 5.627 5.857 5.97 6.184 6.38 6.658 6.834 7.004 7.254 7.484 7.697 7.908 8.107 8.356 8.594 8.822 9.093 9.346 9.593 9.875 10.176 10.457 10.759 11.083 11.419 11.766 12.14 12.554 12.979 13.46 13.934 14.436 14.986 15.591 16.219 16.784 17.016 16.945 16.746 16.493 16.178 15.841 15.512 15.228 14.893 14.563 14.283 14.009 13.736 13.476 13.223 12.955 12.693 12.458 12.222 11.941 11.695 11.465 11.226 11.025 10.811 10.59 10.356 10.095 9.918 9.733 9.41 9.176 8.936 8.81 8.551 8.284 7.992 7.829 7.57 7.296 7.085 6.858 6.353 6.086 5.807 5.482 5.097 4.674 4.165 2.439 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_70.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_70.txt deleted file mode 100644 index f278654e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_69_70.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29334 ,KEBNE ,16721335,Sat Nov 27 13:01:11 CET,Sat Nov 27 15:01:47 CET,0.0 2.021 2.612 3.03 3.377 3.657 3.895 4.121 4.534 4.718 4.891 5.115 5.358 5.491 5.742 5.986 6.216 6.319 6.509 6.692 6.953 7.118 7.279 7.519 7.743 7.942 8.129 8.31 8.539 8.757 8.958 9.188 9.403 9.604 9.831 10.083 10.319 10.556 10.807 11.082 11.343 11.619 11.956 12.269 12.611 12.982 13.363 13.696 13.965 14.134 14.113 13.773 13.315 12.828 12.309 11.781 11.329 10.907 10.492 10.05 9.667 9.337 9.025 8.706 8.393 8.105 7.799 7.525 7.287 7.034 6.772 6.556 6.322 6.068 5.872 5.664 5.442 5.215 4.975 4.806 4.629 4.357 4.169 3.968 3.856 3.628 3.391 3.132 2.988 2.742 2.529 2.356 2.171 1.751 1.514 1.25 0.953 0.606 0.206 -0.323 -2.045 -2 ,27745 ,KEBNE ,16721336,Sat Nov 27 13:01:11 CET,Sat Nov 27 15:01:50 CET,0.0 1.941 2.494 2.861 3.168 3.468 3.731 3.956 4.365 4.544 4.71 4.914 5.147 5.286 5.53 5.749 5.949 6.048 6.244 6.432 6.708 6.886 7.048 7.266 7.471 7.662 7.843 8.021 8.246 8.456 8.655 8.881 9.098 9.307 9.533 9.779 10.014 10.254 10.504 10.772 11.045 11.351 11.689 11.998 12.324 12.677 13.052 13.377 13.668 13.926 13.977 13.612 13.145 12.666 12.203 11.75 11.318 10.89 10.505 10.122 9.785 9.461 9.145 8.849 8.571 8.32 8.05 7.796 7.563 7.317 7.066 6.853 6.625 6.374 6.175 5.978 5.768 5.541 5.304 5.135 4.956 4.667 4.455 4.236 4.127 3.9 3.66 3.39 3.244 2.994 2.754 2.573 2.384 1.979 1.756 1.498 1.197 0.852 0.419 -0.199 -2.082 -3 ,4936 ,KEBNE ,16721337,Sat Nov 27 13:01:11 CET,Sat Nov 27 15:02:05 CET,0.0 1.561 2.081 2.455 2.793 3.062 3.295 3.505 3.875 4.044 4.197 4.395 4.623 4.746 4.975 5.208 5.432 5.532 5.719 5.897 6.159 6.324 6.476 6.681 6.87 7.059 7.238 7.419 7.655 7.848 8.028 8.265 8.487 8.678 8.886 9.125 9.344 9.59 9.869 10.146 10.427 10.742 11.085 11.399 11.721 12.077 12.475 12.845 13.128 13.34 13.449 13.136 12.658 12.143 11.637 11.161 10.716 10.286 9.882 9.465 9.117 8.805 8.495 8.19 7.894 7.608 7.3 7.026 6.777 6.517 6.249 6.028 5.8 5.555 5.355 5.147 4.945 4.723 4.469 4.3 4.132 3.866 3.681 3.476 3.369 3.149 2.902 2.633 2.49 2.239 2.013 1.838 1.655 1.248 1.01 0.747 0.445 0.109 -0.279 -0.849 -2.982 -4 ,20328 ,KEBNE ,16721338,Sat Nov 27 13:01:11 CET,Sat Nov 27 15:01:10 CET,0.0 1.952 2.536 2.973 3.312 3.59 3.835 4.055 4.442 4.615 4.78 4.994 5.234 5.365 5.6 5.821 6.03 6.13 6.319 6.505 6.763 6.917 7.068 7.281 7.48 7.663 7.838 8.019 8.251 8.454 8.644 8.864 9.063 9.254 9.475 9.723 9.946 10.161 10.386 10.62 10.864 11.132 11.438 11.729 12.037 12.362 12.705 13.041 13.391 13.663 13.652 13.303 12.843 12.349 11.868 11.394 10.957 10.555 10.191 9.814 9.484 9.179 8.869 8.563 8.28 8.019 7.732 7.471 7.246 7.006 6.755 6.539 6.306 6.056 5.854 5.646 5.423 5.195 4.971 4.806 4.626 4.35 4.166 3.973 3.868 3.634 3.389 3.14 3.005 2.759 2.543 2.382 2.207 1.799 1.572 1.323 1.022 0.687 0.282 -0.26 -2.111 -5 ,16358 ,KEBNE ,16721339,Sat Nov 27 13:01:11 CET,Sat Nov 27 15:01:48 CET,0.0 1.913 2.418 2.792 3.125 3.418 3.676 3.914 4.331 4.51 4.67 4.873 5.106 5.233 5.469 5.688 5.893 5.992 6.192 6.376 6.62 6.771 6.919 7.135 7.34 7.532 7.709 7.876 8.083 8.27 8.45 8.672 8.887 9.094 9.331 9.592 9.828 10.068 10.314 10.56 10.818 11.089 11.393 11.7 12.017 12.324 12.65 12.974 13.28 13.544 13.593 13.265 12.794 12.274 11.765 11.265 10.813 10.386 9.999 9.6 9.253 8.938 8.627 8.327 8.029 7.756 7.469 7.21 6.984 6.748 6.504 6.291 6.057 5.812 5.62 5.424 5.222 5.001 4.763 4.597 4.426 4.144 3.946 3.736 3.624 3.384 3.132 2.878 2.737 2.485 2.249 2.07 1.89 1.496 1.265 1.013 0.732 0.398 -0.025 -0.631 -2.517 -6 ,4202 ,KEBNE ,16721340,Sat Nov 27 13:01:11 CET,Sat Nov 27 15:01:01 CET,0.0 1.951 2.498 2.912 3.237 3.514 3.761 3.985 4.353 4.508 4.657 4.859 5.091 5.224 5.463 5.685 5.905 6.01 6.217 6.403 6.644 6.801 6.955 7.163 7.367 7.563 7.742 7.911 8.126 8.328 8.51 8.735 8.958 9.163 9.396 9.651 9.887 10.136 10.4 10.668 10.938 11.227 11.549 11.878 12.223 12.565 12.927 13.258 13.553 13.783 13.843 13.507 13.011 12.523 12.065 11.624 11.206 10.809 10.456 10.085 9.741 9.434 9.14 8.836 8.546 8.287 7.993 7.694 7.443 7.197 6.932 6.716 6.495 6.25 6.058 5.861 5.659 5.439 5.204 5.038 4.864 4.584 4.383 4.174 4.061 3.827 3.581 3.318 3.175 2.925 2.681 2.498 2.308 1.918 1.702 1.45 1.156 0.821 0.412 -0.131 -1.867 -7 ,18293 ,KEBNE ,16721341,Sat Nov 27 13:01:11 CET,Sat Nov 27 15:01:27 CET,0.0 1.776 2.351 2.774 3.122 3.444 3.727 3.96 4.351 4.521 4.681 4.894 5.138 5.284 5.552 5.785 6.002 6.106 6.308 6.495 6.754 6.912 7.065 7.292 7.495 7.697 7.896 8.074 8.302 8.521 8.74 8.998 9.23 9.45 9.695 9.943 10.173 10.422 10.683 10.949 11.227 11.521 11.839 12.139 12.446 12.764 13.082 13.393 13.674 13.895 13.967 13.67 13.262 12.806 12.348 11.922 11.507 11.093 10.704 10.292 9.943 9.625 9.311 9.013 8.728 8.452 8.153 7.897 7.677 7.439 7.183 6.966 6.74 6.492 6.299 6.099 5.889 5.676 5.445 5.283 5.109 4.819 4.622 4.422 4.313 4.089 3.85 3.577 3.427 3.17 2.945 2.769 2.581 2.193 1.963 1.693 1.389 1.038 0.623 0.065 -1.706 -8 ,900 ,KEBNE ,16721342,Sat Nov 27 13:03:13 CET,Sat Nov 27 15:02:54 CET,0.0 1.886 2.44 2.835 3.156 3.432 3.681 3.904 4.275 4.44 4.595 4.788 5.021 5.149 5.384 5.611 5.822 5.92 6.105 6.279 6.533 6.688 6.832 7.038 7.229 7.414 7.602 7.786 8.011 8.214 8.407 8.633 8.846 9.056 9.287 9.535 9.773 10.025 10.287 10.561 10.831 11.121 11.43 11.712 12.036 12.385 12.743 13.069 13.409 13.666 13.651 13.317 12.869 12.378 11.907 11.458 11.025 10.596 10.21 9.83 9.49 9.162 8.847 8.543 8.247 7.963 7.661 7.398 7.163 6.906 6.643 6.431 6.209 5.969 5.778 5.579 5.365 5.133 4.883 4.705 4.521 4.239 4.039 3.819 3.708 3.49 3.254 2.987 2.848 2.607 2.38 2.205 2.02 1.608 1.363 1.099 0.795 0.454 0.03 -0.566 -2.443 -9 ,26912 ,KEBNE ,16721343,Sat Nov 27 13:03:13 CET,Sat Nov 27 15:02:48 CET,0.0 1.626 2.157 2.539 2.849 3.113 3.34 3.539 3.879 4.042 4.201 4.406 4.637 4.766 4.996 5.217 5.426 5.524 5.716 5.89 6.128 6.284 6.43 6.634 6.823 7.001 7.171 7.337 7.56 7.767 7.955 8.184 8.415 8.636 8.867 9.115 9.362 9.625 9.89 10.154 10.419 10.691 10.985 11.282 11.596 11.927 12.28 12.604 12.934 13.185 13.181 12.86 12.478 12.033 11.557 11.071 10.636 10.26 9.895 9.491 9.145 8.832 8.524 8.21 7.902 7.622 7.331 7.066 6.821 6.568 6.295 6.066 5.834 5.582 5.389 5.191 4.986 4.766 4.533 4.376 4.215 3.948 3.751 3.545 3.437 3.205 2.961 2.706 2.576 2.349 2.126 1.945 1.754 1.341 1.12 0.878 0.589 0.262 -0.171 -0.756 -2.603 -10 ,14436 ,KEBNE ,16721344,Sat Nov 27 13:03:13 CET,Sat Nov 27 15:03:32 CET,0.0 1.718 2.249 2.632 2.943 3.221 3.468 3.675 4.048 4.217 4.377 4.585 4.816 4.94 5.175 5.388 5.586 5.686 5.879 6.052 6.305 6.47 6.63 6.863 7.074 7.277 7.47 7.65 7.878 8.084 8.285 8.522 8.734 8.933 9.162 9.423 9.662 9.906 10.16 10.43 10.703 10.985 11.293 11.585 11.911 12.243 12.612 12.989 13.299 13.518 13.557 13.259 12.805 12.35 11.925 11.487 11.072 10.682 10.315 9.93 9.595 9.296 9.005 8.724 8.453 8.196 7.91 7.642 7.404 7.15 6.892 6.685 6.46 6.22 6.038 5.851 5.648 5.433 5.205 5.042 4.873 4.615 4.43 4.224 4.119 3.915 3.695 3.436 3.3 3.071 2.857 2.689 2.513 2.112 1.879 1.622 1.333 1.001 0.574 -0.046 -1.721 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_70_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_70_62.txt deleted file mode 100644 index 8cf0d956..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/protein/Summary_FEP_70_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16531 ,KEBNE ,16721345,Sat Nov 27 13:03:13 CET,Sat Nov 27 15:01:48 CET,0.0 1.087 1.596 2.001 2.328 2.616 2.878 3.107 3.516 3.712 3.899 4.149 4.405 4.556 4.841 5.117 5.368 5.482 5.702 5.909 6.209 6.404 6.587 6.843 7.087 7.32 7.545 7.762 8.036 8.299 8.562 8.862 9.138 9.409 9.718 10.047 10.357 10.7 11.056 11.432 11.831 12.284 12.797 13.305 13.897 14.557 15.27 16.015 16.841 17.748 18.8 19.561 19.875 19.946 19.884 19.703 19.474 19.249 19.014 18.777 18.56 18.342 18.101 17.865 17.631 17.392 17.131 16.889 16.679 16.463 16.228 16.012 15.79 15.559 15.38 15.199 14.999 14.783 14.55 14.382 14.206 13.925 13.717 13.491 13.372 13.126 12.861 12.572 12.425 12.191 11.936 11.739 11.523 11.025 10.745 10.451 10.109 9.699 9.223 8.45 5.582 -2 ,25080 ,KEBNE ,16721346,Sat Nov 27 13:03:14 CET,Sat Nov 27 15:02:26 CET,0.0 1.269 1.805 2.23 2.579 2.88 3.146 3.379 3.782 3.962 4.137 4.376 4.63 4.777 5.066 5.34 5.583 5.696 5.911 6.118 6.421 6.606 6.776 7.027 7.275 7.511 7.735 7.944 8.207 8.464 8.712 8.997 9.266 9.532 9.843 10.177 10.494 10.852 11.232 11.619 12.02 12.474 12.992 13.504 14.071 14.686 15.406 16.215 17.115 18.073 19.11 19.801 19.999 19.972 19.881 19.713 19.497 19.288 19.063 18.802 18.567 18.34 18.101 17.862 17.632 17.408 17.169 16.958 16.772 16.576 16.364 16.179 15.981 15.747 15.557 15.366 15.155 14.94 14.714 14.547 14.371 14.082 13.866 13.645 13.533 13.287 13.04 12.774 12.618 12.365 12.092 11.888 11.669 11.175 10.897 10.574 10.182 9.717 9.16 8.4 5.205 -3 ,15316 ,KEBNE ,16721347,Sat Nov 27 13:03:13 CET,Sat Nov 27 15:01:24 CET,0.0 1.197 1.732 2.143 2.468 2.753 2.999 3.226 3.653 3.84 4.015 4.247 4.491 4.634 4.911 5.165 5.405 5.519 5.736 5.95 6.248 6.433 6.612 6.863 7.115 7.355 7.578 7.784 8.044 8.302 8.549 8.841 9.11 9.364 9.665 10.0 10.326 10.678 11.044 11.424 11.81 12.242 12.738 13.239 13.806 14.403 15.066 15.842 16.761 17.758 18.81 19.536 19.786 19.789 19.686 19.496 19.284 19.074 18.866 18.672 18.454 18.212 17.992 17.76 17.511 17.275 17.03 16.818 16.632 16.428 16.201 16.006 15.788 15.547 15.369 15.19 14.985 14.77 14.549 14.387 14.223 13.947 13.727 13.5 13.384 13.131 12.867 12.594 12.447 12.204 11.925 11.718 11.491 10.978 10.708 10.404 10.046 9.63 9.049 8.201 5.646 -4 ,27496 ,KEBNE ,16721348,Sat Nov 27 13:03:13 CET,Sat Nov 27 15:01:49 CET,0.0 1.722 2.313 2.705 3.014 3.29 3.558 3.806 4.221 4.404 4.584 4.838 5.103 5.259 5.545 5.815 6.064 6.185 6.416 6.632 6.933 7.119 7.303 7.572 7.822 8.056 8.276 8.49 8.774 9.038 9.284 9.573 9.838 10.092 10.391 10.734 11.054 11.396 11.767 12.153 12.555 13.01 13.531 14.031 14.591 15.225 15.939 16.69 17.531 18.47 19.505 20.155 20.343 20.329 20.186 19.957 19.755 19.53 19.264 18.951 18.665 18.41 18.157 17.912 17.687 17.472 17.23 16.995 16.782 16.565 16.34 16.145 15.918 15.684 15.502 15.301 15.086 14.834 14.57 14.394 14.2 13.878 13.646 13.412 13.294 13.043 12.77 12.45 12.269 12.004 11.721 11.523 11.308 10.814 10.524 10.186 9.771 9.294 8.732 7.936 5.052 -5 ,29418 ,KEBNE ,16721349,Sat Nov 27 13:03:13 CET,Sat Nov 27 15:02:06 CET,0.0 1.204 1.762 2.139 2.465 2.765 3.033 3.294 3.754 3.948 4.128 4.357 4.612 4.76 5.051 5.321 5.564 5.683 5.914 6.14 6.461 6.657 6.839 7.096 7.342 7.583 7.81 8.023 8.299 8.564 8.815 9.1 9.379 9.656 9.975 10.317 10.63 10.979 11.351 11.731 12.138 12.598 13.107 13.607 14.189 14.812 15.519 16.281 17.115 18.041 19.05 19.785 20.027 20.019 19.915 19.761 19.568 19.348 19.128 18.871 18.617 18.363 18.112 17.866 17.618 17.393 17.153 16.93 16.734 16.523 16.286 16.07 15.844 15.611 15.435 15.252 15.035 14.798 14.553 14.385 14.209 13.917 13.702 13.482 13.37 13.126 12.863 12.565 12.41 12.169 11.91 11.707 11.476 10.954 10.664 10.345 9.96 9.52 8.999 8.256 4.613 -6 ,13906 ,KEBNE ,16721350,Sat Nov 27 13:03:13 CET,Sat Nov 27 15:01:49 CET,0.0 1.253 1.765 2.156 2.48 2.77 3.042 3.274 3.666 3.85 4.021 4.251 4.503 4.649 4.927 5.179 5.415 5.529 5.748 5.957 6.25 6.439 6.623 6.884 7.13 7.364 7.589 7.806 8.074 8.326 8.565 8.859 9.141 9.404 9.709 10.037 10.338 10.688 11.074 11.467 11.871 12.336 12.871 13.391 13.985 14.629 15.361 16.161 17.044 18.036 19.13 19.757 19.933 20.004 19.93 19.73 19.493 19.26 19.033 18.76 18.496 18.258 18.041 17.814 17.586 17.386 17.159 16.928 16.718 16.507 16.283 16.078 15.855 15.62 15.432 15.238 15.028 14.805 14.572 14.404 14.215 13.905 13.697 13.474 13.355 13.114 12.848 12.544 12.387 12.138 11.873 11.674 11.452 10.966 10.707 10.422 10.071 9.671 9.166 8.39 5.655 -7 ,400 ,KEBNE ,16721351,Sat Nov 27 13:03:13 CET,Sat Nov 27 15:01:41 CET,0.0 1.236 1.748 2.144 2.466 2.75 3.013 3.242 3.642 3.83 4.01 4.244 4.496 4.644 4.939 5.217 5.475 5.595 5.818 6.027 6.318 6.508 6.697 6.956 7.2 7.431 7.651 7.87 8.141 8.396 8.634 8.906 9.162 9.41 9.703 10.022 10.328 10.673 11.039 11.415 11.81 12.25 12.731 13.201 13.754 14.365 15.05 15.796 16.637 17.615 18.698 19.372 19.632 19.647 19.506 19.294 19.07 18.86 18.639 18.383 18.135 17.915 17.715 17.505 17.276 17.037 16.779 16.554 16.365 16.164 15.946 15.761 15.544 15.299 15.112 14.912 14.691 14.457 14.226 14.06 13.873 13.582 13.373 13.154 13.042 12.806 12.54 12.234 12.064 11.804 11.509 11.312 11.122 10.666 10.405 10.106 9.766 9.394 8.933 8.28 6.416 -8 ,24202 ,KEBNE ,16721352,Sat Nov 27 13:03:14 CET,Sat Nov 27 15:02:10 CET,0.0 1.333 1.861 2.244 2.558 2.84 3.113 3.367 3.818 4.018 4.196 4.422 4.676 4.828 5.113 5.37 5.609 5.728 5.956 6.168 6.478 6.665 6.839 7.097 7.341 7.571 7.792 8.011 8.288 8.541 8.792 9.11 9.403 9.672 9.98 10.323 10.646 10.99 11.357 11.738 12.137 12.582 13.098 13.615 14.185 14.82 15.552 16.337 17.19 18.131 19.157 19.76 19.951 19.965 19.87 19.709 19.534 19.319 19.103 18.879 18.664 18.456 18.233 17.995 17.756 17.536 17.302 17.086 16.891 16.662 16.416 16.223 16.021 15.806 15.621 15.418 15.2 14.961 14.728 14.564 14.383 14.087 13.87 13.638 13.516 13.259 12.978 12.665 12.496 12.234 11.954 11.758 11.547 11.04 10.75 10.428 10.061 9.606 9.023 8.256 5.194 -9 ,26088 ,KEBNE ,16721353,Sat Nov 27 13:03:13 CET,Sat Nov 27 15:01:46 CET,0.0 1.181 1.704 2.124 2.468 2.761 3.018 3.244 3.666 3.859 4.039 4.268 4.5 4.634 4.906 5.17 5.412 5.527 5.748 5.949 6.24 6.431 6.613 6.864 7.107 7.349 7.574 7.789 8.065 8.318 8.562 8.85 9.114 9.37 9.67 10.001 10.327 10.676 11.041 11.422 11.807 12.261 12.795 13.308 13.905 14.547 15.259 16.03 16.892 17.834 18.835 19.362 19.472 19.412 19.255 19.07 18.856 18.598 18.326 18.019 17.732 17.462 17.188 16.923 16.673 16.433 16.172 15.926 15.704 15.472 15.233 15.029 14.807 14.564 14.372 14.163 13.942 13.72 13.481 13.317 13.145 12.863 12.662 12.445 12.328 12.066 11.779 11.464 11.291 11.029 10.755 10.549 10.331 9.841 9.568 9.26 8.888 8.442 7.933 7.244 3.895 -10 ,820 ,KEBNE ,16721354,Sat Nov 27 13:04:14 CET,Sat Nov 27 15:03:52 CET,0.0 1.73 2.285 2.696 3.028 3.308 3.567 3.792 4.21 4.401 4.582 4.826 5.073 5.218 5.501 5.768 6.009 6.12 6.339 6.555 6.861 7.048 7.222 7.476 7.725 7.951 8.168 8.389 8.662 8.913 9.148 9.419 9.686 9.954 10.266 10.595 10.907 11.253 11.617 12.008 12.415 12.858 13.37 13.863 14.43 15.019 15.677 16.418 17.237 18.175 19.155 19.747 19.907 19.888 19.821 19.675 19.488 19.287 19.077 18.839 18.601 18.351 18.087 17.821 17.56 17.329 17.088 16.865 16.669 16.463 16.245 16.044 15.829 15.605 15.422 15.231 15.031 14.821 14.59 14.419 14.241 13.942 13.727 13.508 13.394 13.161 12.906 12.616 12.464 12.216 11.943 11.738 11.522 11.043 10.769 10.474 10.107 9.679 9.194 8.486 5.673 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_19_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_19_23.txt deleted file mode 100644 index 8ddc7566..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_19_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6382 ,KEBNE ,16721355,Sat Nov 27 13:04:14 CET,Sat Nov 27 14:38:34 CET,0.0 1.593 2.118 2.508 2.808 3.071 3.312 3.529 3.908 4.09 4.27 4.556 4.745 4.888 5.166 5.428 5.676 5.792 6.017 6.237 6.555 6.757 6.953 7.245 7.522 7.782 8.031 8.277 8.596 8.92 9.234 9.608 9.977 10.336 10.745 11.198 11.643 12.129 12.668 13.252 13.863 14.558 15.392 16.254 17.236 18.345 19.677 21.204 23.039 25.267 28.035 30.45 31.991 32.969 33.612 34.078 34.383 34.571 34.684 34.753 34.766 34.748 34.712 34.671 34.62 34.562 34.481 34.382 34.294 34.203 34.089 33.998 33.903 33.793 33.704 33.609 33.502 33.382 33.257 33.161 33.049 32.872 32.748 32.606 32.532 32.378 32.211 32.043 31.952 31.83 31.613 31.485 31.343 31.035 30.863 30.665 30.443 30.166 29.806 29.333 27.535 -2 ,31161 ,KEBNE ,16721356,Sat Nov 27 13:04:14 CET,Sat Nov 27 14:38:35 CET,0.0 2.483 2.939 3.274 3.555 3.801 4.03 4.252 4.658 4.836 5.006 5.272 5.463 5.609 5.894 6.166 6.424 6.544 6.773 7.0 7.331 7.538 7.732 8.018 8.3 8.574 8.832 9.077 9.393 9.696 9.992 10.35 10.701 11.042 11.431 11.863 12.286 12.76 13.282 13.854 14.454 15.146 15.969 16.8 17.789 18.912 20.23 21.77 23.609 25.792 28.536 30.868 32.325 33.281 33.886 34.296 34.564 34.718 34.818 34.894 34.902 34.867 34.834 34.793 34.721 34.646 34.556 34.467 34.376 34.27 34.156 34.049 33.925 33.79 33.688 33.58 33.458 33.328 33.173 33.061 32.95 32.769 32.64 32.506 32.435 32.277 32.107 31.925 31.827 31.711 31.516 31.395 31.258 30.949 30.773 30.573 30.351 30.089 29.74 29.245 27.392 -3 ,10586 ,KEBNE ,16721357,Sat Nov 27 13:04:14 CET,Sat Nov 27 14:38:40 CET,0.0 1.64 2.141 2.492 2.785 3.054 3.294 3.518 3.933 4.116 4.285 4.566 4.765 4.911 5.183 5.438 5.683 5.801 6.026 6.248 6.567 6.767 6.964 7.249 7.517 7.782 8.045 8.299 8.623 8.931 9.229 9.593 9.949 10.29 10.687 11.151 11.6 12.099 12.642 13.213 13.816 14.51 15.326 16.139 17.108 18.224 19.529 21.026 22.853 25.103 28.002 30.484 31.951 32.895 33.496 33.887 34.148 34.353 34.471 34.527 34.552 34.561 34.551 34.533 34.505 34.45 34.366 34.276 34.199 34.117 34.024 33.939 33.841 33.726 33.629 33.538 33.438 33.318 33.192 33.1 32.999 32.836 32.718 32.594 32.529 32.373 32.198 32.014 31.913 31.786 31.563 31.436 31.298 30.994 30.825 30.636 30.406 30.123 29.785 29.324 26.948 -4 ,22581 ,KEBNE ,16721358,Sat Nov 27 13:04:14 CET,Sat Nov 27 14:38:54 CET,0.0 1.642 2.243 2.676 3.028 3.35 3.63 3.897 4.395 4.624 4.833 5.175 5.392 5.559 5.862 6.132 6.391 6.517 6.756 6.994 7.34 7.557 7.766 8.083 8.385 8.659 8.925 9.186 9.518 9.841 10.154 10.538 10.92 11.278 11.689 12.161 12.615 13.107 13.639 14.225 14.841 15.541 16.365 17.183 18.175 19.311 20.615 22.115 23.96 26.23 29.002 31.313 32.78 33.737 34.353 34.77 35.054 35.27 35.391 35.45 35.466 35.438 35.404 35.369 35.311 35.238 35.156 35.075 34.996 34.895 34.78 34.68 34.571 34.461 34.368 34.259 34.144 34.022 33.883 33.785 33.683 33.515 33.393 33.265 33.196 33.044 32.872 32.684 32.583 32.457 32.247 32.122 31.986 31.684 31.513 31.321 31.086 30.803 30.465 29.998 27.662 -5 ,22715 ,KEBNE ,16721359,Sat Nov 27 13:04:14 CET,Sat Nov 27 14:38:39 CET,0.0 2.249 2.864 3.346 3.72 4.031 4.313 4.574 5.018 5.229 5.445 5.829 6.064 6.24 6.54 6.799 7.039 7.156 7.384 7.603 7.923 8.125 8.323 8.624 8.913 9.193 9.471 9.735 10.081 10.407 10.728 11.119 11.482 11.842 12.26 12.718 13.164 13.66 14.194 14.767 15.372 16.058 16.877 17.723 18.738 19.862 21.163 22.681 24.557 26.887 29.793 32.256 33.759 34.692 35.289 35.698 35.974 36.171 36.294 36.372 36.418 36.45 36.442 36.395 36.358 36.321 36.262 36.201 36.141 36.066 35.977 35.904 35.825 35.732 35.652 35.56 35.453 35.332 35.213 35.123 35.017 34.86 34.752 34.631 34.56 34.407 34.254 34.085 33.986 33.863 33.645 33.516 33.376 33.054 32.866 32.655 32.416 32.144 31.816 31.349 29.537 -6 ,22142 ,KEBNE ,16721360,Sat Nov 27 13:04:15 CET,Sat Nov 27 14:38:44 CET,0.0 1.984 2.484 2.85 3.163 3.436 3.674 3.889 4.28 4.46 4.632 4.912 5.107 5.254 5.54 5.82 6.081 6.199 6.426 6.641 6.954 7.158 7.357 7.642 7.912 8.174 8.429 8.675 8.99 9.294 9.595 9.962 10.323 10.672 11.07 11.529 11.974 12.469 13.013 13.586 14.205 14.922 15.758 16.61 17.609 18.728 20.06 21.577 23.403 25.622 28.421 30.803 32.174 33.057 33.657 34.069 34.361 34.58 34.704 34.762 34.769 34.756 34.728 34.685 34.636 34.568 34.483 34.4 34.307 34.199 34.081 33.977 33.874 33.75 33.645 33.535 33.409 33.278 33.142 33.033 32.903 32.689 32.544 32.392 32.312 32.15 31.982 31.801 31.704 31.584 31.366 31.237 31.101 30.796 30.62 30.418 30.18 29.906 29.573 29.097 26.901 -7 ,6873 ,KEBNE ,16721361,Sat Nov 27 13:04:14 CET,Sat Nov 27 14:38:52 CET,0.0 1.367 1.919 2.336 2.682 2.945 3.185 3.411 3.808 3.987 4.158 4.436 4.63 4.776 5.049 5.299 5.537 5.655 5.884 6.1 6.409 6.61 6.821 7.14 7.442 7.725 7.99 8.245 8.569 8.888 9.195 9.559 9.922 10.278 10.696 11.176 11.64 12.137 12.678 13.271 13.893 14.578 15.382 16.219 17.224 18.361 19.67 21.172 23.0 25.206 27.965 30.437 31.956 32.852 33.418 33.853 34.161 34.363 34.473 34.524 34.543 34.529 34.486 34.438 34.382 34.311 34.22 34.133 34.048 33.959 33.87 33.773 33.656 33.539 33.453 33.356 33.237 33.112 32.986 32.889 32.784 32.618 32.494 32.362 32.294 32.145 31.979 31.795 31.689 31.559 31.347 31.219 31.086 30.792 30.613 30.41 30.19 29.91 29.564 29.095 27.164 -8 ,29310 ,KEBNE ,16721362,Sat Nov 27 13:04:14 CET,Sat Nov 27 14:38:34 CET,0.0 1.501 2.04 2.414 2.716 2.981 3.219 3.445 3.845 4.022 4.193 4.473 4.671 4.817 5.091 5.35 5.594 5.714 5.952 6.175 6.478 6.672 6.864 7.148 7.424 7.687 7.937 8.186 8.515 8.835 9.174 9.592 9.965 10.32 10.734 11.196 11.647 12.153 12.711 13.288 13.882 14.573 15.398 16.215 17.163 18.284 19.613 21.139 22.968 25.179 27.994 30.469 31.926 32.847 33.484 33.919 34.232 34.462 34.589 34.661 34.693 34.68 34.65 34.616 34.568 34.519 34.449 34.366 34.27 34.165 34.067 33.974 33.87 33.764 33.673 33.573 33.466 33.347 33.215 33.123 33.023 32.855 32.738 32.612 32.541 32.39 32.224 32.02 31.91 31.792 31.578 31.447 31.314 31.012 30.835 30.624 30.383 30.114 29.779 29.284 27.59 -9 ,22981 ,KEBNE ,16721363,Sat Nov 27 13:04:14 CET,Sat Nov 27 14:41:50 CET,0.0 1.769 2.27 2.645 2.936 3.199 3.442 3.658 4.049 4.244 4.432 4.719 4.914 5.061 5.338 5.6 5.847 5.967 6.204 6.43 6.753 6.954 7.151 7.436 7.697 7.95 8.202 8.446 8.76 9.074 9.386 9.748 10.099 10.451 10.851 11.296 11.723 12.195 12.706 13.257 13.844 14.523 15.325 16.134 17.098 18.2 19.514 21.026 22.861 25.108 27.932 30.338 31.786 32.779 33.436 33.839 34.095 34.254 34.343 34.409 34.442 34.431 34.378 34.32 34.26 34.181 34.092 34.013 33.937 33.855 33.759 33.674 33.584 33.478 33.384 33.278 33.165 33.046 32.912 32.815 32.71 32.535 32.411 32.28 32.208 32.052 31.874 31.69 31.598 31.481 31.281 31.162 31.031 30.714 30.527 30.324 30.092 29.815 29.487 29.032 26.745 -10 ,10215 ,KEBNE ,16721364,Sat Nov 27 13:05:14 CET,Sat Nov 27 14:41:35 CET,0.0 2.051 2.562 2.93 3.23 3.508 3.763 3.991 4.383 4.562 4.734 5.016 5.214 5.356 5.623 5.873 6.118 6.24 6.478 6.705 7.021 7.219 7.413 7.693 7.96 8.223 8.483 8.727 9.037 9.349 9.652 10.016 10.368 10.71 11.106 11.543 11.975 12.47 13.011 13.576 14.175 14.849 15.656 16.49 17.469 18.589 19.891 21.381 23.194 25.454 28.29 30.762 32.242 33.171 33.791 34.203 34.472 34.644 34.743 34.808 34.824 34.814 34.786 34.733 34.663 34.597 34.52 34.422 34.339 34.253 34.14 34.038 33.932 33.809 33.712 33.614 33.503 33.383 33.251 33.153 33.047 32.868 32.74 32.612 32.542 32.385 32.224 32.045 31.944 31.821 31.596 31.472 31.345 31.035 30.833 30.614 30.384 30.093 29.73 29.239 26.851 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_19.txt deleted file mode 100644 index bb634d89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17749 ,KEBNE ,16721365,Sat Nov 27 13:05:15 CET,Sat Nov 27 14:42:38 CET,0.0 1.556 2.029 2.372 2.637 2.874 3.09 3.286 3.638 3.799 3.947 4.171 4.344 4.463 4.683 4.886 5.076 5.167 5.345 5.514 5.759 5.914 6.061 6.269 6.466 6.66 6.85 7.025 7.243 7.449 7.653 7.901 8.128 8.342 8.583 8.844 9.092 9.358 9.633 9.927 10.234 10.559 10.921 11.283 11.684 12.086 12.524 12.983 13.41 13.76 13.924 13.658 13.207 12.723 12.235 11.72 11.215 10.737 10.323 9.902 9.537 9.205 8.871 8.546 8.232 7.94 7.629 7.355 7.122 6.876 6.616 6.398 6.167 5.926 5.742 5.542 5.339 5.132 4.906 4.746 4.572 4.284 4.076 3.863 3.757 3.528 3.277 3.008 2.866 2.669 2.396 2.232 2.043 1.616 1.38 1.111 0.806 0.455 -0.002 -0.623 -2.724 -2 ,19711 ,KEBNE ,16721366,Sat Nov 27 13:05:15 CET,Sat Nov 27 14:41:55 CET,0.0 1.618 2.081 2.437 2.718 2.955 3.164 3.349 3.687 3.836 3.97 4.18 4.348 4.468 4.698 4.913 5.107 5.2 5.371 5.532 5.763 5.908 6.049 6.25 6.442 6.621 6.787 6.949 7.152 7.348 7.532 7.742 7.945 8.149 8.384 8.652 8.905 9.164 9.442 9.73 10.032 10.381 10.755 11.094 11.477 11.923 12.421 12.883 13.335 13.738 13.884 13.598 13.158 12.67 12.148 11.626 11.134 10.654 10.237 9.836 9.482 9.14 8.813 8.511 8.212 7.937 7.645 7.381 7.155 6.907 6.654 6.437 6.202 5.948 5.748 5.544 5.34 5.121 4.881 4.717 4.544 4.271 4.067 3.851 3.744 3.53 3.299 3.03 2.886 2.694 2.406 2.232 2.05 1.628 1.39 1.124 0.822 0.484 0.064 -0.542 -2.892 -3 ,1604 ,KEBNE ,16721367,Sat Nov 27 13:05:15 CET,Sat Nov 27 14:41:39 CET,0.0 1.916 2.37 2.719 2.992 3.226 3.441 3.638 3.999 4.154 4.297 4.527 4.699 4.819 5.043 5.251 5.447 5.539 5.716 5.881 6.113 6.257 6.395 6.601 6.792 6.967 7.137 7.301 7.51 7.701 7.889 8.112 8.319 8.514 8.737 8.984 9.209 9.458 9.718 9.977 10.252 10.568 10.922 11.27 11.661 12.065 12.494 12.913 13.297 13.608 13.701 13.386 12.917 12.375 11.839 11.341 10.895 10.465 10.07 9.658 9.297 8.962 8.626 8.311 8.016 7.737 7.444 7.177 6.944 6.714 6.464 6.245 6.017 5.771 5.583 5.386 5.162 4.922 4.675 4.502 4.317 4.03 3.833 3.627 3.516 3.286 3.044 2.775 2.631 2.443 2.169 1.991 1.807 1.381 1.123 0.845 0.544 0.202 -0.199 -0.766 -3.41 -4 ,22627 ,KEBNE ,16721368,Sat Nov 27 13:05:15 CET,Sat Nov 27 14:42:24 CET,0.0 1.573 2.0 2.321 2.578 2.818 3.03 3.207 3.515 3.655 3.789 3.997 4.158 4.269 4.476 4.663 4.848 4.938 5.104 5.263 5.497 5.643 5.779 5.971 6.153 6.325 6.489 6.647 6.846 7.03 7.207 7.435 7.648 7.84 8.059 8.316 8.564 8.823 9.097 9.377 9.661 9.967 10.319 10.677 11.062 11.445 11.877 12.324 12.752 13.132 13.268 12.99 12.576 12.046 11.545 11.071 10.602 10.16 9.77 9.374 9.008 8.662 8.337 8.017 7.717 7.43 7.104 6.794 6.529 6.272 6.015 5.804 5.581 5.353 5.159 4.944 4.727 4.505 4.269 4.105 3.927 3.634 3.438 3.24 3.133 2.898 2.66 2.402 2.25 2.049 1.776 1.599 1.405 1.009 0.771 0.508 0.24 -0.08 -0.525 -1.148 -3.728 -5 ,17723 ,KEBNE ,16721369,Sat Nov 27 13:05:15 CET,Sat Nov 27 14:41:45 CET,0.0 1.558 2.056 2.397 2.668 2.92 3.142 3.33 3.662 3.812 3.959 4.188 4.356 4.475 4.698 4.903 5.093 5.182 5.352 5.509 5.732 5.872 6.01 6.212 6.401 6.584 6.768 6.949 7.184 7.4 7.602 7.84 8.063 8.283 8.53 8.797 9.044 9.303 9.584 9.885 10.195 10.529 10.888 11.232 11.616 12.016 12.459 12.901 13.318 13.667 13.809 13.548 13.071 12.558 12.024 11.513 11.075 10.648 10.282 9.891 9.516 9.184 8.868 8.565 8.278 8.002 7.702 7.434 7.198 6.946 6.694 6.488 6.259 6.017 5.831 5.629 5.406 5.181 4.956 4.789 4.604 4.321 4.134 3.931 3.822 3.6 3.363 3.102 2.962 2.771 2.502 2.332 2.149 1.746 1.524 1.279 0.97 0.604 0.172 -0.385 -2.36 -6 ,2986 ,KEBNE ,16721370,Sat Nov 27 13:05:15 CET,Sat Nov 27 14:41:36 CET,0.0 1.672 2.09 2.421 2.707 2.951 3.167 3.358 3.69 3.833 3.97 4.182 4.342 4.457 4.677 4.876 5.062 5.152 5.321 5.485 5.723 5.871 6.01 6.21 6.399 6.579 6.751 6.913 7.114 7.313 7.508 7.744 7.969 8.17 8.396 8.643 8.889 9.163 9.44 9.719 10.0 10.305 10.654 11.01 11.397 11.81 12.237 12.666 13.097 13.431 13.556 13.243 12.762 12.281 11.771 11.258 10.792 10.372 10.002 9.596 9.208 8.846 8.515 8.201 7.894 7.61 7.313 7.044 6.81 6.566 6.305 6.072 5.838 5.6 5.407 5.205 4.988 4.763 4.529 4.365 4.189 3.91 3.713 3.505 3.397 3.17 2.924 2.645 2.496 2.304 2.037 1.857 1.66 1.232 0.992 0.728 0.416 0.064 -0.357 -0.942 -3.338 -7 ,7317 ,KEBNE ,16721371,Sat Nov 27 13:05:15 CET,Sat Nov 27 14:42:45 CET,0.0 1.614 2.228 2.64 2.944 3.212 3.453 3.686 4.086 4.249 4.407 4.654 4.83 4.955 5.189 5.42 5.634 5.735 5.928 6.107 6.35 6.516 6.678 6.887 7.082 7.275 7.459 7.626 7.837 8.062 8.283 8.519 8.744 8.958 9.204 9.482 9.74 10.021 10.298 10.581 10.887 11.206 11.563 11.918 12.308 12.733 13.183 13.621 14.031 14.367 14.508 14.218 13.749 13.249 12.712 12.167 11.675 11.235 10.857 10.46 10.099 9.768 9.454 9.15 8.848 8.579 8.298 8.027 7.798 7.562 7.301 7.081 6.857 6.614 6.427 6.239 6.034 5.81 5.572 5.41 5.239 4.964 4.765 4.539 4.417 4.17 3.908 3.638 3.498 3.297 3.005 2.824 2.623 2.185 1.946 1.671 1.376 1.03 0.616 -0.01 -2.17 -8 ,3603 ,KEBNE ,16721372,Sat Nov 27 13:05:15 CET,Sat Nov 27 14:42:45 CET,0.0 1.751 2.2 2.528 2.809 3.046 3.251 3.439 3.776 3.93 4.078 4.31 4.482 4.608 4.831 5.033 5.227 5.317 5.487 5.651 5.882 6.036 6.181 6.374 6.559 6.738 6.903 7.065 7.276 7.49 7.695 7.933 8.157 8.366 8.621 8.901 9.15 9.41 9.689 9.99 10.299 10.624 10.988 11.337 11.719 12.145 12.583 13.009 13.443 13.802 13.911 13.682 13.252 12.761 12.251 11.727 11.252 10.803 10.388 9.954 9.569 9.215 8.866 8.536 8.236 7.974 7.691 7.424 7.187 6.935 6.661 6.431 6.196 5.941 5.745 5.548 5.341 5.118 4.877 4.704 4.518 4.23 4.037 3.835 3.728 3.499 3.241 2.959 2.817 2.62 2.337 2.163 1.972 1.547 1.312 1.061 0.781 0.439 0.027 -0.575 -3.285 -9 ,14679 ,KEBNE ,16721373,Sat Nov 27 13:05:15 CET,Sat Nov 27 14:42:39 CET,0.0 1.548 1.973 2.3 2.573 2.814 3.04 3.239 3.576 3.728 3.873 4.09 4.257 4.376 4.597 4.8 4.984 5.069 5.237 5.406 5.651 5.801 5.937 6.128 6.322 6.507 6.68 6.847 7.053 7.244 7.435 7.669 7.893 8.106 8.359 8.643 8.907 9.192 9.482 9.77 10.062 10.391 10.788 11.164 11.562 11.983 12.433 12.866 13.282 13.671 13.814 13.504 13.046 12.552 12.062 11.548 11.036 10.579 10.182 9.773 9.407 9.068 8.723 8.39 8.099 7.819 7.509 7.221 6.963 6.689 6.41 6.185 5.952 5.703 5.504 5.288 5.064 4.83 4.576 4.409 4.236 3.948 3.744 3.532 3.42 3.179 2.923 2.656 2.507 2.309 2.015 1.832 1.645 1.235 1.005 0.754 0.461 0.077 -0.408 -1.05 -3.106 -10 ,13522 ,KEBNE ,16721374,Sat Nov 27 13:06:16 CET,Sat Nov 27 14:43:36 CET,0.0 2.448 2.972 3.335 3.632 3.882 4.1 4.306 4.662 4.829 4.993 5.264 5.445 5.576 5.832 6.063 6.275 6.383 6.586 6.781 7.054 7.216 7.373 7.594 7.801 7.992 8.174 8.355 8.588 8.803 9.0 9.235 9.463 9.675 9.91 10.188 10.449 10.714 10.998 11.294 11.601 11.938 12.32 12.687 13.076 13.481 13.92 14.358 14.788 15.146 15.259 14.944 14.45 13.927 13.398 12.881 12.415 11.96 11.525 11.085 10.705 10.362 10.045 9.753 9.474 9.203 8.909 8.639 8.401 8.15 7.878 7.649 7.42 7.181 6.988 6.789 6.58 6.352 6.106 5.937 5.77 5.498 5.297 5.077 4.962 4.729 4.489 4.223 4.083 3.897 3.622 3.448 3.266 2.831 2.579 2.318 2.026 1.656 1.223 0.653 -1.717 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_30.txt deleted file mode 100644 index a3bd8aba..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_24_30.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32290 ,KEBNE ,17025806,Wed Dec 22 13:09:34 CET,Wed Dec 22 14:46:38 CET,0.0 2.897 3.685 4.288 4.743 5.127 5.475 5.8 6.423 6.709 6.97 7.41 7.675 7.887 8.278 8.619 8.935 9.086 9.373 9.649 10.044 10.301 10.552 10.911 11.263 11.586 11.896 12.205 12.596 12.978 13.341 13.775 14.195 14.584 15.049 15.582 16.088 16.65 17.237 17.844 18.488 19.255 20.171 21.069 22.116 23.3 24.675 26.174 27.963 30.147 32.719 34.762 35.825 36.312 36.508 36.554 36.509 36.428 36.314 36.177 36.008 35.81 35.614 35.417 35.209 35.009 34.791 34.597 34.424 34.231 34.032 33.859 33.667 33.471 33.316 33.121 32.904 32.699 32.492 32.345 32.191 31.94 31.76 31.572 31.47 31.246 31.001 30.735 30.594 30.418 30.108 29.926 29.727 29.177 28.871 28.589 28.274 27.904 27.431 26.735 23.79 -2 ,12820 ,KEBNE ,17026073,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 14:47:43 CET,0.0 3.356 4.161 4.75 5.233 5.631 5.985 6.301 6.858 7.116 7.373 7.791 8.053 8.274 8.669 9.023 9.359 9.512 9.808 10.099 10.514 10.776 11.025 11.39 11.761 12.116 12.445 12.758 13.155 13.525 13.879 14.309 14.736 15.163 15.662 16.222 16.742 17.311 17.93 18.593 19.287 20.061 20.954 21.845 22.884 24.08 25.453 26.977 28.759 30.812 33.386 35.431 36.508 37.176 37.508 37.653 37.716 37.693 37.642 37.523 37.38 37.252 37.081 36.887 36.703 36.52 36.321 36.148 35.964 35.756 35.537 35.348 35.152 34.946 34.785 34.601 34.398 34.192 33.985 33.846 33.694 33.443 33.261 33.066 32.96 32.735 32.49 32.215 32.07 31.903 31.613 31.435 31.245 30.834 30.594 30.322 30.019 29.649 29.133 28.38 20.576 -3 ,3519 ,KEBNE ,17026074,Wed Dec 22 13:49:38 CET,Wed Dec 22 14:47:48 CET,0.0 7.24 8.18 8.791 9.282 9.691 10.057 10.396 10.98 11.239 11.499 11.93 12.182 12.394 12.801 13.165 13.49 13.652 13.974 14.284 14.729 15.011 15.276 15.648 16.003 16.34 16.659 16.96 17.351 17.738 18.105 18.543 18.957 19.358 19.838 20.362 20.863 21.419 22.033 22.699 23.387 24.153 25.051 25.977 27.059 28.259 29.685 31.286 33.075 35.088 37.503 39.431 40.394 40.826 41.077 41.223 41.232 41.179 41.068 40.933 40.818 40.691 40.532 40.357 40.173 39.997 39.808 39.625 39.457 39.274 39.066 38.891 38.705 38.504 38.351 38.196 38.019 37.81 37.593 37.451 37.307 37.053 36.863 36.673 36.573 36.355 36.102 35.81 35.658 35.477 35.119 34.912 34.701 34.235 33.974 33.678 33.31 32.918 32.507 31.909 27.447 -5 ,12822 ,KEBNE ,17026076,Wed Dec 22 13:49:39 CET,Wed Dec 22 14:48:56 CET,0.0 3.527 4.226 4.709 5.094 5.442 5.756 6.029 6.515 6.74 6.957 7.308 7.541 7.716 8.056 8.367 8.665 8.812 9.098 9.38 9.772 10.01 10.245 10.632 11.028 11.413 11.752 12.038 12.407 12.78 13.139 13.571 13.997 14.398 14.858 15.384 15.893 16.449 17.065 17.717 18.39 19.126 19.989 20.908 21.984 23.167 24.549 26.1 27.934 30.084 32.568 34.492 35.43 35.932 36.17 36.238 36.186 36.087 35.96 35.77 35.588 35.411 35.215 34.996 34.785 34.586 34.364 34.167 33.99 33.771 33.527 33.336 33.136 32.922 32.759 32.597 32.431 32.25 32.039 31.87 31.689 31.406 31.194 30.967 30.846 30.608 30.356 30.073 29.923 29.741 29.426 29.231 29.006 28.497 28.211 27.883 27.528 27.122 26.604 25.845 21.33 -8 ,14569 ,KEBNE ,17025813,Wed Dec 22 13:11:37 CET,Wed Dec 22 14:47:45 CET,0.0 6.397 7.134 7.654 8.092 8.447 8.765 9.067 9.583 9.816 10.035 10.385 10.617 10.8 11.151 11.476 11.776 11.927 12.215 12.48 12.851 13.081 13.304 13.637 13.96 14.264 14.561 14.852 15.231 15.603 15.964 16.393 16.819 17.236 17.706 18.232 18.737 19.289 19.884 20.517 21.186 21.949 22.832 23.718 24.788 26.003 27.384 28.937 30.749 32.883 35.363 37.112 37.991 38.538 38.798 38.89 38.901 38.822 38.747 38.651 38.499 38.341 38.185 38.034 37.886 37.72 37.531 37.355 37.182 36.988 36.785 36.618 36.427 36.21 36.04 35.868 35.699 35.506 35.279 35.107 34.924 34.667 34.495 34.308 34.21 34.01 33.792 33.537 33.398 33.239 32.934 32.758 32.577 32.101 31.794 31.454 31.078 30.647 30.098 29.282 26.158 -10 ,18358 ,KEBNE ,17026081,Wed Dec 22 13:50:41 CET,Wed Dec 22 14:57:48 CET,0.0 5.896 6.708 7.287 7.747 8.139 8.501 8.822 9.388 9.636 9.868 10.272 10.524 10.725 11.111 11.471 11.815 11.976 12.279 12.577 13.006 13.28 13.547 13.928 14.3 14.652 14.977 15.288 15.69 16.089 16.474 16.93 17.369 17.792 18.268 18.803 19.325 19.899 20.528 21.195 21.881 22.644 23.552 24.478 25.559 26.749 28.14 29.736 31.545 33.633 36.116 38.081 39.084 39.592 39.84 39.921 39.895 39.821 39.707 39.517 39.334 39.16 38.97 38.778 38.583 38.384 38.172 37.967 37.775 37.576 37.361 37.174 36.966 36.756 36.597 36.429 36.248 36.043 35.829 35.687 35.528 35.261 35.071 34.865 34.762 34.516 34.243 33.959 33.804 33.614 33.26 33.055 32.831 32.338 32.063 31.755 31.399 30.961 30.409 29.657 21.234 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_19.txt deleted file mode 100644 index ba1852a4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19348 ,KEBNE ,16721375,Sat Nov 27 13:06:16 CET,Sat Nov 27 14:45:08 CET,0.0 1.97 2.552 3.018 3.419 3.787 4.129 4.449 5.037 5.316 5.584 5.932 6.346 6.584 7.056 7.525 7.972 8.19 8.627 9.057 9.686 10.091 10.49 11.093 11.679 12.26 12.836 13.392 14.116 14.826 15.532 16.407 17.266 18.123 19.131 20.264 21.39 22.667 24.062 25.601 27.289 29.243 31.584 34.007 36.954 40.416 44.59 49.615 55.899 63.966 74.876 85.083 91.912 96.782 100.337 103.122 105.272 107.035 108.42 109.646 110.587 111.344 112.008 112.575 113.075 113.511 113.907 114.216 114.45 114.669 114.873 115.017 115.157 115.273 115.332 115.383 115.428 115.462 115.492 115.505 115.497 115.454 115.41 115.353 115.33 115.275 115.18 115.037 114.947 114.818 114.676 114.559 114.416 114.028 113.781 113.528 113.234 112.842 112.365 111.621 106.923 -2 ,27449 ,KEBNE ,16721376,Sat Nov 27 13:06:16 CET,Sat Nov 27 14:44:16 CET,0.0 1.978 2.589 3.039 3.424 3.789 4.13 4.453 5.044 5.32 5.593 5.956 6.378 6.624 7.098 7.554 8.008 8.234 8.672 9.096 9.712 10.11 10.508 11.095 11.661 12.22 12.781 13.334 14.045 14.747 15.445 16.312 17.168 18.002 18.99 20.146 21.297 22.563 23.938 25.465 27.117 29.035 31.374 33.804 36.734 40.199 44.411 49.385 55.617 63.589 74.351 84.561 91.378 96.27 99.908 102.774 105.014 106.823 108.244 109.541 110.55 111.358 112.06 112.686 113.223 113.659 114.067 114.399 114.661 114.912 115.138 115.303 115.459 115.575 115.638 115.708 115.768 115.798 115.823 115.839 115.846 115.801 115.762 115.739 115.712 115.628 115.519 115.393 115.331 115.215 115.049 114.912 114.765 114.451 114.245 113.985 113.69 113.333 112.833 112.098 108.336 -3 ,18993 ,KEBNE ,16721377,Sat Nov 27 13:06:16 CET,Sat Nov 27 14:43:59 CET,0.0 1.774 2.344 2.799 3.195 3.552 3.876 4.189 4.79 5.069 5.334 5.681 6.091 6.334 6.809 7.27 7.718 7.939 8.386 8.819 9.439 9.843 10.247 10.848 11.426 11.985 12.526 13.054 13.765 14.476 15.171 16.036 16.886 17.708 18.675 19.797 20.909 22.175 23.58 25.083 26.709 28.621 30.936 33.361 36.317 39.747 43.91 48.975 55.292 63.29 74.094 84.34 91.261 96.191 99.78 102.609 104.85 106.657 108.054 109.327 110.314 111.113 111.812 112.405 112.905 113.319 113.696 113.981 114.202 114.431 114.649 114.807 114.949 115.06 115.133 115.201 115.254 115.287 115.307 115.314 115.317 115.298 115.268 115.209 115.173 115.091 114.969 114.834 114.761 114.634 114.491 114.365 114.22 113.885 113.674 113.438 113.175 112.805 112.267 111.437 107.095 -4 ,19079 ,KEBNE ,16721378,Sat Nov 27 13:07:17 CET,Sat Nov 27 14:45:29 CET,0.0 1.892 2.544 3.064 3.519 3.93 4.308 4.651 5.284 5.576 5.862 6.259 6.691 6.944 7.427 7.917 8.393 8.614 9.058 9.496 10.136 10.555 10.968 11.579 12.179 12.761 13.338 13.899 14.623 15.344 16.043 16.92 17.776 18.599 19.586 20.73 21.86 23.119 24.529 26.079 27.734 29.65 31.996 34.463 37.45 40.921 45.058 50.023 56.278 64.259 75.049 85.271 92.11 96.959 100.536 103.411 105.652 107.456 108.858 110.118 111.095 111.857 112.517 113.113 113.638 114.056 114.431 114.746 114.999 115.239 115.473 115.648 115.803 115.941 116.034 116.109 116.166 116.217 116.255 116.264 116.248 116.211 116.186 116.145 116.114 116.024 115.925 115.805 115.736 115.617 115.455 115.326 115.183 114.874 114.674 114.427 114.125 113.74 113.249 112.551 106.094 -5 ,29476 ,KEBNE ,16721379,Sat Nov 27 13:07:17 CET,Sat Nov 27 14:45:44 CET,0.0 1.595 2.201 2.657 3.061 3.422 3.753 4.076 4.684 4.967 5.236 5.584 6.0 6.244 6.737 7.202 7.637 7.855 8.289 8.711 9.328 9.729 10.123 10.718 11.295 11.845 12.386 12.931 13.65 14.362 15.07 15.937 16.779 17.603 18.58 19.693 20.802 22.078 23.503 25.05 26.699 28.623 30.969 33.405 36.383 39.877 44.097 49.203 55.572 63.539 74.226 84.281 91.078 96.002 99.701 102.626 104.878 106.732 108.203 109.484 110.436 111.245 111.971 112.555 113.035 113.442 113.826 114.148 114.401 114.633 114.844 115.011 115.179 115.309 115.394 115.481 115.551 115.603 115.644 115.667 115.676 115.661 115.63 115.583 115.554 115.47 115.355 115.238 115.173 115.039 114.865 114.743 114.615 114.29 114.09 113.851 113.555 113.195 112.735 112.056 109.026 -6 ,7887 ,KEBNE ,16721380,Sat Nov 27 13:07:17 CET,Sat Nov 27 14:44:41 CET,0.0 1.651 2.238 2.702 3.125 3.511 3.837 4.147 4.74 5.017 5.281 5.646 6.075 6.324 6.806 7.268 7.714 7.934 8.368 8.786 9.39 9.789 10.184 10.762 11.333 11.895 12.446 12.996 13.718 14.427 15.127 15.994 16.851 17.696 18.703 19.868 21.002 22.26 23.668 25.209 26.872 28.804 31.12 33.541 36.522 40.024 44.216 49.149 55.298 63.285 74.124 84.309 91.116 96.025 99.687 102.545 104.755 106.565 107.977 109.227 110.193 110.975 111.688 112.323 112.841 113.249 113.621 113.932 114.182 114.41 114.628 114.782 114.935 115.091 115.193 115.282 115.361 115.424 115.464 115.476 115.47 115.438 115.409 115.359 115.325 115.247 115.153 115.029 114.956 114.825 114.664 114.541 114.379 114.013 113.805 113.546 113.245 112.883 112.373 111.694 108.54 -7 ,2721 ,KEBNE ,16721381,Sat Nov 27 13:07:17 CET,Sat Nov 27 14:42:50 CET,0.0 2.053 2.627 3.086 3.49 3.861 4.205 4.53 5.139 5.422 5.69 6.044 6.466 6.713 7.187 7.653 8.099 8.318 8.752 9.172 9.791 10.193 10.589 11.17 11.738 12.305 12.861 13.403 14.118 14.824 15.525 16.385 17.239 18.085 19.096 20.256 21.38 22.655 24.065 25.605 27.281 29.217 31.581 34.06 37.024 40.455 44.609 49.609 55.842 63.761 74.563 84.763 91.546 96.452 100.132 103.01 105.25 107.059 108.442 109.714 110.713 111.523 112.239 112.846 113.368 113.808 114.217 114.531 114.774 115.017 115.228 115.384 115.532 115.651 115.726 115.796 115.863 115.915 115.947 115.968 115.966 115.93 115.887 115.819 115.786 115.727 115.652 115.526 115.447 115.32 115.139 115.01 114.868 114.486 114.264 114.003 113.674 113.255 112.721 111.984 108.742 -8 ,31762 ,KEBNE ,16721382,Sat Nov 27 13:09:19 CET,Sat Nov 27 14:48:20 CET,0.0 1.711 2.27 2.723 3.142 3.523 3.871 4.193 4.781 5.066 5.343 5.702 6.132 6.384 6.871 7.338 7.788 8.009 8.439 8.859 9.481 9.892 10.288 10.867 11.448 12.012 12.564 13.109 13.835 14.56 15.281 16.163 17.014 17.844 18.829 19.965 21.088 22.355 23.759 25.283 26.925 28.858 31.206 33.654 36.611 40.061 44.277 49.273 55.508 63.565 74.502 84.795 91.584 96.469 100.17 103.04 105.222 107.02 108.422 109.677 110.67 111.498 112.212 112.803 113.306 113.713 114.089 114.401 114.647 114.882 115.089 115.231 115.358 115.476 115.543 115.584 115.617 115.644 115.655 115.656 115.659 115.631 115.599 115.568 115.548 115.461 115.333 115.199 115.13 115.016 114.86 114.733 114.6 114.288 114.078 113.823 113.466 113.036 112.522 111.773 108.707 -9 ,21642 ,KEBNE ,16721383,Sat Nov 27 13:09:19 CET,Sat Nov 27 14:47:35 CET,0.0 1.725 2.32 2.786 3.186 3.557 3.906 4.24 4.866 5.151 5.425 5.786 6.202 6.441 6.909 7.376 7.832 8.057 8.496 8.92 9.542 9.942 10.338 10.934 11.512 12.076 12.637 13.188 13.907 14.619 15.316 16.178 17.031 17.881 18.881 20.01 21.128 22.403 23.811 25.332 26.987 28.918 31.235 33.646 36.593 40.076 44.282 49.3 55.589 63.524 74.227 84.46 91.273 96.131 99.799 102.706 104.931 106.679 108.031 109.273 110.249 111.057 111.766 112.38 112.908 113.339 113.728 114.026 114.262 114.489 114.704 114.874 115.036 115.165 115.239 115.302 115.341 115.377 115.412 115.422 115.428 115.432 115.408 115.357 115.32 115.219 115.103 114.978 114.906 114.774 114.604 114.474 114.343 114.027 113.82 113.569 113.25 112.862 112.331 111.503 107.042 -10 ,13187 ,KEBNE ,16721384,Sat Nov 27 13:10:20 CET,Sat Nov 27 14:50:42 CET,0.0 1.842 2.403 2.861 3.267 3.619 3.952 4.276 4.881 5.166 5.446 5.808 6.243 6.495 6.987 7.467 7.919 8.134 8.563 8.993 9.596 9.996 10.409 11.011 11.595 12.167 12.739 13.305 14.043 14.749 15.418 16.243 17.077 17.929 18.942 20.07 21.166 22.391 23.755 25.253 26.858 28.73 31.012 33.423 36.344 39.727 43.798 48.705 54.845 62.643 73.207 83.22 89.979 94.857 98.471 101.32 103.522 105.305 106.713 108.003 109.016 109.812 110.491 111.083 111.602 112.034 112.429 112.744 113.008 113.262 113.479 113.628 113.756 113.875 113.969 114.057 114.125 114.182 114.219 114.231 114.233 114.209 114.171 114.117 114.085 114.01 113.913 113.795 113.721 113.584 113.398 113.271 113.118 112.719 112.487 112.222 111.91 111.481 110.971 110.247 107.454 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_26.txt deleted file mode 100644 index d25f3691..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_29_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4840 ,KEBNE ,16721385,Sat Nov 27 13:10:20 CET,Sat Nov 27 14:53:16 CET,0.0 2.164 2.744 3.175 3.556 3.886 4.177 4.45 4.954 5.181 5.41 5.669 6.025 6.218 6.598 6.953 7.297 7.47 7.799 8.116 8.584 8.892 9.19 9.624 10.051 10.457 10.834 11.205 11.716 12.211 12.677 13.246 13.804 14.373 15.034 15.762 16.469 17.239 18.066 18.958 19.916 21.024 22.362 23.75 25.36 27.143 29.27 31.727 34.663 38.306 42.961 47.056 49.576 51.188 52.262 53.035 53.569 53.941 54.197 54.421 54.571 54.642 54.674 54.696 54.688 54.665 54.627 54.556 54.478 54.391 54.303 54.207 54.099 53.99 53.89 53.778 53.657 53.514 53.353 53.244 53.129 52.928 52.777 52.611 52.513 52.304 52.082 51.828 51.682 51.405 51.178 50.995 50.792 50.287 50.003 49.707 49.376 48.996 48.537 47.856 45.392 -2 ,14868 ,KEBNE ,16721386,Sat Nov 27 13:10:20 CET,Sat Nov 27 14:47:08 CET,0.0 2.057 2.624 3.048 3.414 3.746 4.045 4.327 4.845 5.078 5.3 5.558 5.918 6.113 6.49 6.852 7.202 7.37 7.702 8.016 8.468 8.771 9.067 9.489 9.898 10.289 10.678 11.07 11.574 12.05 12.497 13.043 13.579 14.095 14.699 15.389 16.059 16.818 17.663 18.555 19.491 20.567 21.841 23.149 24.732 26.551 28.658 31.098 34.061 37.711 42.385 46.362 48.778 50.414 51.531 52.345 52.926 53.339 53.62 53.848 53.999 54.088 54.131 54.153 54.156 54.125 54.081 54.025 53.965 53.903 53.827 53.751 53.661 53.552 53.456 53.351 53.23 53.097 52.95 52.837 52.718 52.521 52.377 52.223 52.139 51.958 51.754 51.508 51.373 51.123 50.938 50.773 50.595 50.201 49.991 49.76 49.482 49.151 48.708 48.041 45.951 -3 ,26398 ,KEBNE ,16721387,Sat Nov 27 13:11:22 CET,Sat Nov 27 14:50:04 CET,0.0 1.737 2.27 2.682 3.045 3.371 3.67 3.948 4.456 4.697 4.928 5.189 5.551 5.746 6.117 6.47 6.819 6.989 7.326 7.655 8.122 8.424 8.724 9.158 9.575 9.991 10.39 10.777 11.287 11.782 12.256 12.843 13.408 13.947 14.591 15.318 16.009 16.79 17.648 18.533 19.474 20.575 21.892 23.208 24.786 26.622 28.767 31.234 34.211 37.857 42.43 46.407 48.881 50.57 51.721 52.553 53.129 53.542 53.812 54.022 54.176 54.282 54.353 54.369 54.365 54.359 54.334 54.289 54.236 54.168 54.079 53.98 53.867 53.737 53.637 53.536 53.408 53.264 53.102 52.987 52.862 52.67 52.539 52.387 52.301 52.099 51.864 51.616 51.487 51.23 51.044 50.853 50.644 50.204 49.958 49.679 49.342 48.934 48.433 47.753 45.193 -4 ,3611 ,KEBNE ,16721388,Sat Nov 27 13:11:22 CET,Sat Nov 27 14:52:07 CET,0.0 1.795 2.353 2.793 3.154 3.482 3.782 4.065 4.591 4.831 5.058 5.318 5.693 5.895 6.273 6.633 6.978 7.145 7.465 7.776 8.248 8.553 8.843 9.258 9.665 10.059 10.445 10.832 11.313 11.758 12.213 12.786 13.331 13.859 14.455 15.143 15.821 16.556 17.386 18.294 19.299 20.461 21.805 23.149 24.696 26.486 28.637 31.118 34.13 37.757 42.356 46.361 48.791 50.4 51.486 52.293 52.881 53.281 53.552 53.778 53.922 54.027 54.111 54.154 54.16 54.149 54.131 54.107 54.061 53.98 53.878 53.796 53.72 53.63 53.539 53.427 53.308 53.181 53.025 52.919 52.801 52.599 52.462 52.309 52.227 52.042 51.841 51.617 51.489 51.232 51.057 50.902 50.73 50.326 50.1 49.85 49.563 49.222 48.793 48.234 45.886 -5 ,27235 ,KEBNE ,16721389,Sat Nov 27 13:12:23 CET,Sat Nov 27 14:50:50 CET,0.0 1.773 2.306 2.717 3.078 3.4 3.691 3.956 4.448 4.686 4.921 5.199 5.569 5.76 6.131 6.493 6.84 7.007 7.336 7.649 8.094 8.389 8.681 9.104 9.509 9.908 10.298 10.689 11.186 11.638 12.1 12.677 13.238 13.783 14.413 15.125 15.828 16.623 17.485 18.388 19.322 20.432 21.748 23.065 24.648 26.415 28.483 30.872 33.826 37.451 41.984 45.987 48.43 50.017 51.097 51.911 52.515 52.954 53.251 53.487 53.635 53.713 53.756 53.77 53.754 53.724 53.675 53.603 53.538 53.465 53.362 53.277 53.181 53.057 52.96 52.859 52.75 52.622 52.481 52.379 52.262 52.066 51.921 51.756 51.667 51.498 51.312 51.094 50.977 50.731 50.56 50.406 50.234 49.855 49.645 49.4 49.136 48.831 48.414 47.82 45.888 -6 ,2726 ,KEBNE ,16721390,Sat Nov 27 13:12:22 CET,Sat Nov 27 14:49:20 CET,0.0 2.306 2.855 3.286 3.646 3.97 4.275 4.554 5.071 5.313 5.537 5.79 6.148 6.337 6.699 7.044 7.376 7.543 7.876 8.196 8.64 8.923 9.207 9.626 10.032 10.415 10.787 11.172 11.673 12.14 12.595 13.167 13.71 14.224 14.848 15.581 16.293 17.071 17.924 18.849 19.811 20.893 22.172 23.471 25.008 26.782 28.926 31.366 34.274 37.916 42.572 46.608 49.071 50.701 51.87 52.735 53.339 53.779 54.05 54.27 54.428 54.532 54.576 54.569 54.559 54.55 54.525 54.484 54.44 54.365 54.265 54.18 54.084 53.975 53.873 53.761 53.649 53.525 53.383 53.279 53.173 53.008 52.879 52.728 52.642 52.457 52.261 52.052 51.934 51.685 51.509 51.348 51.179 50.791 50.565 50.311 50.016 49.682 49.293 48.674 46.406 -7 ,31981 ,KEBNE ,16721391,Sat Nov 27 13:12:22 CET,Sat Nov 27 14:49:33 CET,0.0 2.111 2.826 3.336 3.765 4.149 4.497 4.802 5.328 5.573 5.819 6.122 6.49 6.694 7.096 7.472 7.825 8.002 8.364 8.7 9.174 9.477 9.768 10.208 10.636 11.046 11.451 11.838 12.336 12.836 13.331 13.907 14.449 14.988 15.633 16.348 17.01 17.77 18.612 19.509 20.478 21.59 22.933 24.332 25.961 27.768 29.888 32.29 35.164 38.742 43.309 47.337 49.864 51.531 52.66 53.438 53.978 54.387 54.666 54.88 55.029 55.128 55.19 55.201 55.162 55.119 55.069 55.01 54.951 54.874 54.774 54.69 54.602 54.509 54.427 54.323 54.204 54.067 53.92 53.815 53.709 53.539 53.407 53.257 53.173 52.99 52.802 52.598 52.481 52.239 52.071 51.904 51.726 51.338 51.127 50.893 50.607 50.246 49.748 49.019 44.656 -8 ,29864 ,KEBNE ,16721392,Sat Nov 27 13:12:23 CET,Sat Nov 27 14:50:49 CET,0.0 1.567 2.12 2.548 2.917 3.246 3.539 3.81 4.316 4.558 4.788 5.055 5.43 5.628 6.003 6.358 6.692 6.857 7.18 7.484 7.921 8.206 8.491 8.915 9.321 9.714 10.097 10.469 10.957 11.43 11.89 12.471 13.036 13.578 14.224 14.957 15.661 16.433 17.296 18.227 19.175 20.265 21.604 22.962 24.548 26.353 28.455 30.854 33.774 37.412 42.091 46.152 48.651 50.367 51.509 52.315 52.906 53.324 53.622 53.854 53.987 54.074 54.127 54.141 54.114 54.075 54.017 53.936 53.853 53.769 53.678 53.576 53.453 53.32 53.208 53.085 52.949 52.807 52.642 52.519 52.39 52.169 52.007 51.847 51.763 51.572 51.344 51.08 50.948 50.699 50.491 50.308 50.121 49.728 49.501 49.238 48.91 48.522 48.107 47.586 45.571 -9 ,1887 ,KEBNE ,16721393,Sat Nov 27 13:13:23 CET,Sat Nov 27 14:50:38 CET,0.0 1.6 2.153 2.563 2.898 3.19 3.467 3.718 4.171 4.382 4.58 4.803 5.158 5.341 5.697 6.029 6.344 6.501 6.804 7.105 7.54 7.818 8.092 8.488 8.875 9.273 9.662 10.035 10.546 11.044 11.494 12.038 12.573 13.088 13.676 14.33 14.999 15.772 16.611 17.523 18.475 19.55 20.822 22.134 23.713 25.498 27.644 30.137 33.117 36.775 41.283 45.224 47.724 49.371 50.499 51.31 51.89 52.347 52.654 52.879 53.036 53.142 53.218 53.252 53.26 53.243 53.175 53.09 53.011 52.928 52.834 52.753 52.667 52.561 52.474 52.377 52.258 52.137 52.009 51.916 51.807 51.613 51.471 51.316 51.234 51.057 50.859 50.634 50.509 50.26 50.095 49.938 49.761 49.353 49.123 48.867 48.577 48.237 47.816 47.207 44.832 -10 ,28097 ,KEBNE ,16721394,Sat Nov 27 13:13:23 CET,Sat Nov 27 14:50:41 CET,0.0 2.312 2.847 3.287 3.647 3.963 4.256 4.525 5.023 5.262 5.488 5.745 6.115 6.311 6.681 7.03 7.371 7.531 7.849 8.17 8.63 8.931 9.223 9.638 10.042 10.437 10.825 11.207 11.705 12.188 12.652 13.217 13.769 14.318 14.948 15.634 16.326 17.106 17.947 18.852 19.801 20.898 22.228 23.573 25.162 26.978 29.06 31.475 34.414 38.053 42.725 46.722 49.118 50.707 51.82 52.638 53.23 53.663 53.959 54.192 54.343 54.433 54.47 54.469 54.443 54.41 54.353 54.281 54.204 54.114 54.025 53.94 53.84 53.724 53.616 53.491 53.352 53.203 53.047 52.928 52.795 52.585 52.441 52.289 52.207 52.04 51.853 51.632 51.513 51.274 51.112 50.95 50.783 50.392 50.163 49.922 49.633 49.263 48.754 48.062 45.92 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_30_19.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_30_19.txt deleted file mode 100644 index aa59df24..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_30_19.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1289 ,KEBNE ,16721395,Sat Nov 27 13:13:24 CET,Sat Nov 27 14:51:11 CET,0.0 1.992 2.502 2.882 3.202 3.463 3.697 3.909 4.255 4.407 4.545 4.763 4.917 5.048 5.296 5.51 5.687 5.772 5.943 6.096 6.311 6.448 6.567 6.737 6.887 7.027 7.158 7.279 7.435 7.573 7.697 7.835 7.962 8.08 8.204 8.342 8.457 8.57 8.713 8.833 8.902 8.976 9.015 9.016 8.996 8.922 8.742 8.369 7.706 6.596 4.552 2.027 -0.04 -1.808 -3.266 -4.505 -5.589 -6.585 -7.444 -8.312 -9.071 -9.735 -10.356 -10.927 -11.453 -11.948 -12.477 -12.939 -13.337 -13.764 -14.224 -14.609 -15.003 -15.408 -15.724 -16.062 -16.407 -16.756 -17.129 -17.392 -17.66 -18.064 -18.354 -18.663 -18.822 -19.15 -19.505 -19.909 -20.129 -20.39 -20.833 -21.092 -21.356 -21.93 -22.247 -22.585 -22.966 -23.437 -24.039 -24.833 -29.8 -2 ,30363 ,KEBNE ,16721396,Sat Nov 27 13:15:25 CET,Sat Nov 27 14:52:51 CET,0.0 2.026 2.482 2.843 3.131 3.367 3.582 3.777 4.114 4.255 4.384 4.616 4.765 4.878 5.074 5.241 5.396 5.471 5.619 5.773 5.981 6.104 6.224 6.384 6.525 6.66 6.789 6.904 7.035 7.157 7.274 7.395 7.504 7.603 7.713 7.834 7.944 8.073 8.211 8.321 8.387 8.446 8.507 8.523 8.478 8.386 8.184 7.742 7.002 5.872 3.851 1.369 -0.638 -2.378 -3.884 -5.189 -6.31 -7.315 -8.197 -9.089 -9.818 -10.448 -11.069 -11.665 -12.228 -12.727 -13.234 -13.684 -14.074 -14.487 -14.914 -15.27 -15.647 -16.041 -16.348 -16.672 -17.0 -17.342 -17.71 -17.966 -18.221 -18.612 -18.889 -19.18 -19.328 -19.632 -19.952 -20.301 -20.493 -20.734 -21.107 -21.339 -21.582 -22.102 -22.407 -22.756 -23.169 -23.632 -24.189 -24.975 -29.188 -3 ,24982 ,KEBNE ,16721397,Sat Nov 27 13:27:39 CET,Sat Nov 27 15:02:12 CET,0.0 2.342 2.894 3.302 3.622 3.875 4.11 4.317 4.651 4.792 4.93 5.171 5.321 5.439 5.664 5.875 6.077 6.172 6.34 6.497 6.727 6.863 6.984 7.159 7.321 7.472 7.608 7.732 7.887 8.033 8.176 8.338 8.48 8.609 8.75 8.901 9.041 9.17 9.293 9.413 9.494 9.546 9.58 9.582 9.559 9.456 9.196 8.79 8.204 7.188 5.171 2.649 0.622 -1.103 -2.587 -3.888 -5.015 -6.023 -6.876 -7.718 -8.456 -9.107 -9.719 -10.301 -10.838 -11.327 -11.848 -12.322 -12.735 -13.168 -13.616 -13.98 -14.359 -14.764 -15.074 -15.397 -15.742 -16.09 -16.444 -16.69 -16.935 -17.308 -17.566 -17.826 -17.961 -18.258 -18.567 -18.871 -19.036 -19.256 -19.609 -19.83 -20.052 -20.513 -20.773 -21.068 -21.397 -21.774 -22.257 -22.931 -25.867 -4 ,5688 ,KEBNE ,16721398,Sat Nov 27 13:28:41 CET,Sat Nov 27 15:10:32 CET,0.0 2.502 3.02 3.402 3.704 3.97 4.202 4.398 4.731 4.885 5.034 5.275 5.427 5.538 5.743 5.941 6.121 6.202 6.361 6.51 6.717 6.847 6.969 7.154 7.339 7.507 7.651 7.771 7.914 8.042 8.17 8.332 8.469 8.588 8.716 8.852 8.97 9.068 9.164 9.249 9.323 9.408 9.461 9.455 9.421 9.297 9.036 8.646 7.981 6.864 4.856 2.387 0.365 -1.363 -2.881 -4.233 -5.363 -6.37 -7.238 -8.098 -8.834 -9.478 -10.083 -10.659 -11.196 -11.69 -12.211 -12.671 -13.068 -13.495 -13.951 -14.328 -14.72 -15.115 -15.413 -15.731 -16.063 -16.413 -16.787 -17.05 -17.324 -17.751 -18.055 -18.372 -18.538 -18.885 -19.241 -19.622 -19.829 -20.082 -20.495 -20.736 -20.98 -21.528 -21.842 -22.198 -22.602 -23.084 -23.657 -24.475 -31.89 -5 ,13264 ,KEBNE ,16721399,Sat Nov 27 13:31:44 CET,Sat Nov 27 15:06:28 CET,0.0 2.039 2.545 2.918 3.231 3.491 3.703 3.896 4.227 4.377 4.524 4.768 4.917 5.033 5.249 5.439 5.616 5.697 5.847 5.997 6.204 6.328 6.445 6.613 6.763 6.892 7.021 7.145 7.29 7.424 7.548 7.682 7.811 7.966 8.144 8.299 8.43 8.563 8.697 8.806 8.896 8.976 9.02 9.02 8.986 8.875 8.637 8.256 7.628 6.492 4.409 1.98 -0.012 -1.735 -3.204 -4.489 -5.609 -6.602 -7.429 -8.245 -8.947 -9.575 -10.166 -10.706 -11.213 -11.683 -12.171 -12.604 -12.982 -13.378 -13.792 -14.143 -14.504 -14.873 -15.161 -15.475 -15.802 -16.148 -16.514 -16.761 -17.016 -17.411 -17.692 -17.983 -18.13 -18.434 -18.771 -19.131 -19.323 -19.571 -19.946 -20.176 -20.422 -20.949 -21.26 -21.616 -22.007 -22.453 -23.021 -23.828 -29.252 -6 ,29566 ,KEBNE ,16721400,Sat Nov 27 13:37:51 CET,Sat Nov 27 15:13:58 CET,0.0 2.342 2.881 3.257 3.553 3.799 4.024 4.224 4.576 4.738 4.89 5.138 5.282 5.398 5.612 5.8 5.982 6.073 6.233 6.369 6.564 6.691 6.807 6.969 7.121 7.265 7.399 7.518 7.67 7.809 7.937 8.095 8.232 8.361 8.509 8.651 8.771 8.89 8.985 9.06 9.128 9.19 9.248 9.251 9.17 9.049 8.862 8.502 7.823 6.669 4.664 2.213 0.204 -1.506 -2.952 -4.226 -5.339 -6.352 -7.208 -8.045 -8.77 -9.425 -10.04 -10.629 -11.184 -11.679 -12.197 -12.651 -13.039 -13.457 -13.89 -14.252 -14.634 -15.026 -15.33 -15.652 -15.989 -16.34 -16.702 -16.948 -17.207 -17.62 -17.898 -18.189 -18.344 -18.668 -19.012 -19.375 -19.57 -19.816 -20.209 -20.442 -20.686 -21.237 -21.556 -21.932 -22.357 -22.818 -23.359 -24.108 -28.635 -7 ,13276 ,KEBNE ,16721401,Sat Nov 27 14:08:32 CET,Sat Nov 27 15:43:09 CET,0.0 2.44 2.959 3.333 3.655 3.948 4.202 4.413 4.771 4.932 5.073 5.301 5.459 5.585 5.814 6.041 6.242 6.333 6.512 6.683 6.939 7.098 7.237 7.444 7.619 7.766 7.9 8.019 8.175 8.314 8.438 8.597 8.746 8.853 8.959 9.082 9.189 9.297 9.418 9.521 9.588 9.639 9.646 9.647 9.615 9.507 9.324 8.935 8.29 7.241 5.283 2.796 0.805 -0.853 -2.302 -3.584 -4.711 -5.722 -6.576 -7.427 -8.169 -8.82 -9.419 -10.001 -10.557 -11.059 -11.567 -12.027 -12.434 -12.852 -13.289 -13.665 -14.064 -14.464 -14.782 -15.119 -15.463 -15.827 -16.209 -16.466 -16.734 -17.163 -17.458 -17.774 -17.941 -18.288 -18.654 -19.051 -19.258 -19.51 -19.917 -20.173 -20.442 -21.019 -21.348 -21.716 -22.123 -22.588 -23.179 -23.969 -27.301 -8 ,1373 ,KEBNE ,16721402,Sat Nov 27 14:12:38 CET,Sat Nov 27 15:48:09 CET,0.0 2.47 3.008 3.395 3.691 3.948 4.182 4.384 4.74 4.893 5.037 5.276 5.422 5.538 5.755 5.939 6.109 6.196 6.353 6.487 6.674 6.799 6.925 7.095 7.239 7.371 7.499 7.627 7.783 7.911 8.031 8.183 8.321 8.443 8.581 8.711 8.822 8.931 9.035 9.14 9.224 9.275 9.275 9.25 9.222 9.174 9.049 8.68 7.982 6.886 4.863 2.318 0.298 -1.425 -2.876 -4.135 -5.28 -6.314 -7.175 -8.036 -8.756 -9.348 -9.906 -10.45 -10.942 -11.385 -11.854 -12.277 -12.651 -13.023 -13.407 -13.745 -14.097 -14.457 -14.731 -15.007 -15.298 -15.603 -15.919 -16.142 -16.371 -16.744 -17.006 -17.267 -17.407 -17.698 -17.999 -18.32 -18.49 -18.709 -19.04 -19.249 -19.469 -19.938 -20.197 -20.486 -20.828 -21.236 -21.706 -22.353 -25.156 -9 ,25409 ,KEBNE ,16721403,Sat Nov 27 14:12:38 CET,Sat Nov 27 15:47:12 CET,0.0 2.484 3.044 3.472 3.79 4.036 4.254 4.454 4.804 4.96 5.105 5.34 5.489 5.61 5.823 6.012 6.193 6.279 6.435 6.578 6.78 6.912 7.046 7.238 7.413 7.568 7.7 7.827 7.991 8.137 8.273 8.415 8.547 8.68 8.835 8.986 9.088 9.195 9.317 9.446 9.553 9.633 9.681 9.679 9.645 9.579 9.415 9.075 8.409 7.251 5.267 2.883 0.812 -0.969 -2.422 -3.702 -4.79 -5.777 -6.647 -7.494 -8.206 -8.847 -9.476 -10.053 -10.581 -11.093 -11.617 -12.072 -12.477 -12.889 -13.319 -13.681 -14.052 -14.444 -14.762 -15.097 -15.437 -15.777 -16.139 -16.395 -16.663 -17.087 -17.377 -17.687 -17.845 -18.157 -18.495 -18.883 -19.092 -19.34 -19.732 -19.971 -20.22 -20.763 -21.059 -21.385 -21.763 -22.22 -22.805 -23.603 -27.541 -10 ,10946 ,KEBNE ,16721404,Sat Nov 27 14:12:38 CET,Sat Nov 27 15:48:19 CET,0.0 2.264 2.799 3.21 3.552 3.839 4.062 4.253 4.582 4.73 4.868 5.102 5.24 5.341 5.528 5.709 5.888 5.971 6.124 6.261 6.446 6.563 6.675 6.828 6.965 7.095 7.216 7.327 7.462 7.587 7.697 7.819 7.933 8.045 8.177 8.325 8.459 8.574 8.665 8.752 8.829 8.888 8.94 8.968 8.974 8.902 8.691 8.314 7.653 6.498 4.484 2.141 0.168 -1.546 -2.983 -4.264 -5.391 -6.401 -7.274 -8.12 -8.849 -9.5 -10.11 -10.674 -11.206 -11.689 -12.19 -12.658 -13.06 -13.471 -13.91 -14.28 -14.659 -15.046 -15.34 -15.636 -15.947 -16.275 -16.624 -16.869 -17.122 -17.522 -17.804 -18.104 -18.261 -18.589 -18.94 -19.305 -19.494 -19.74 -20.143 -20.387 -20.64 -21.219 -21.53 -21.866 -22.267 -22.731 -23.286 -24.067 -27.815 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_23.txt deleted file mode 100644 index 6045c37f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29168 ,KEBNE ,16721405,Sat Nov 27 14:16:43 CET,Sat Nov 27 15:52:44 CET,0.0 1.781 2.245 2.598 2.898 3.157 3.382 3.603 4.008 4.177 4.34 4.598 4.777 4.911 5.167 5.407 5.639 5.75 5.963 6.169 6.462 6.65 6.831 7.101 7.358 7.608 7.857 8.092 8.388 8.673 8.95 9.291 9.624 9.942 10.313 10.72 11.105 11.54 12.007 12.504 13.024 13.61 14.293 14.976 15.781 16.685 17.751 18.965 20.375 22.068 24.146 25.736 26.621 27.171 27.449 27.579 27.63 27.622 27.574 27.477 27.376 27.272 27.13 26.976 26.833 26.693 26.544 26.398 26.257 26.095 25.918 25.785 25.644 25.479 25.336 25.18 25.021 24.855 24.674 24.541 24.398 24.164 23.994 23.815 23.719 23.515 23.296 23.039 22.905 22.757 22.471 22.297 22.114 21.702 21.47 21.202 20.9 20.567 20.162 19.605 17.264 -2 ,2213 ,KEBNE ,16721406,Sat Nov 27 14:19:47 CET,Sat Nov 27 15:54:43 CET,0.0 1.823 2.316 2.684 2.979 3.232 3.462 3.67 4.047 4.218 4.379 4.642 4.819 4.953 5.213 5.449 5.678 5.791 6.008 6.22 6.517 6.705 6.89 7.153 7.401 7.636 7.864 8.086 8.373 8.649 8.913 9.233 9.542 9.844 10.19 10.581 10.965 11.393 11.854 12.346 12.866 13.441 14.111 14.801 15.641 16.555 17.593 18.806 20.214 21.924 24.065 25.722 26.605 27.116 27.39 27.537 27.592 27.582 27.524 27.421 27.293 27.159 27.011 26.831 26.666 26.507 26.314 26.134 25.97 25.784 25.583 25.426 25.254 25.057 24.904 24.747 24.575 24.396 24.196 24.043 23.883 23.629 23.443 23.262 23.175 22.974 22.732 22.465 22.333 22.181 21.898 21.73 21.542 21.103 20.865 20.622 20.341 19.988 19.497 18.814 15.943 -3 ,8988 ,KEBNE ,16721407,Sat Nov 27 14:24:57 CET,Sat Nov 27 15:53:21 CET,0.0 2.086 2.556 2.924 3.224 3.479 3.708 3.919 4.305 4.49 4.666 4.935 5.116 5.254 5.52 5.769 6.002 6.113 6.322 6.526 6.82 7.003 7.183 7.45 7.71 7.956 8.186 8.405 8.684 8.956 9.217 9.533 9.84 10.134 10.476 10.856 11.247 11.679 12.124 12.606 13.12 13.718 14.443 15.149 15.968 16.901 17.957 19.157 20.585 22.277 24.361 26.069 26.969 27.48 27.794 27.944 27.983 27.957 27.874 27.753 27.623 27.471 27.305 27.14 26.965 26.8 26.614 26.424 26.253 26.071 25.87 25.704 25.521 25.306 25.141 24.969 24.771 24.557 24.328 24.167 24.003 23.747 23.572 23.395 23.295 23.081 22.86 22.599 22.449 22.275 21.973 21.812 21.631 21.197 20.949 20.658 20.352 19.996 19.546 18.917 16.162 -4 ,20917 ,KEBNE ,16721408,Sat Nov 27 14:31:02 CET,Sat Nov 27 16:05:43 CET,0.0 2.29 2.744 3.095 3.391 3.643 3.874 4.086 4.455 4.621 4.781 5.045 5.23 5.37 5.631 5.875 6.105 6.217 6.434 6.637 6.926 7.111 7.292 7.551 7.801 8.047 8.28 8.502 8.798 9.079 9.34 9.656 9.964 10.259 10.603 10.996 11.378 11.796 12.253 12.745 13.259 13.852 14.542 15.233 16.072 17.017 18.132 19.424 20.904 22.633 24.692 26.325 27.242 27.784 28.074 28.211 28.245 28.231 28.179 28.066 27.916 27.761 27.614 27.466 27.301 27.145 26.984 26.826 26.68 26.511 26.32 26.165 25.989 25.792 25.631 25.45 25.263 25.077 24.877 24.733 24.588 24.346 24.169 23.997 23.906 23.699 23.465 23.214 23.081 22.918 22.638 22.478 22.289 21.837 21.594 21.327 21.013 20.644 20.211 19.61 17.318 -5 ,30695 ,KEBNE ,16721409,Sat Nov 27 14:31:02 CET,Sat Nov 27 16:05:41 CET,0.0 1.62 2.061 2.398 2.672 2.911 3.134 3.347 3.734 3.911 4.075 4.339 4.519 4.661 4.938 5.184 5.416 5.528 5.746 5.948 6.241 6.429 6.607 6.869 7.124 7.372 7.605 7.83 8.13 8.434 8.728 9.059 9.378 9.694 10.061 10.47 10.866 11.324 11.812 12.31 12.844 13.451 14.157 14.856 15.666 16.582 17.646 18.848 20.282 21.977 24.052 25.786 26.729 27.232 27.518 27.655 27.684 27.658 27.589 27.466 27.323 27.176 27.014 26.852 26.704 26.548 26.355 26.18 26.032 25.856 25.657 25.497 25.326 25.135 24.983 24.826 24.647 24.452 24.26 24.118 23.966 23.752 23.583 23.392 23.296 23.095 22.881 22.634 22.499 22.338 22.022 21.836 21.647 21.222 20.992 20.736 20.418 20.062 19.627 19.036 16.404 -6 ,4841 ,KEBNE ,16721410,Sat Nov 27 14:33:04 CET,Sat Nov 27 16:09:08 CET,0.0 1.666 2.098 2.428 2.706 2.959 3.182 3.376 3.731 3.889 4.037 4.278 4.449 4.584 4.837 5.069 5.299 5.411 5.622 5.822 6.113 6.294 6.469 6.722 6.957 7.182 7.409 7.639 7.942 8.236 8.516 8.846 9.165 9.487 9.858 10.266 10.652 11.069 11.513 11.995 12.515 13.1 13.79 14.467 15.258 16.175 17.263 18.517 19.975 21.697 23.785 25.388 26.197 26.66 26.922 27.077 27.167 27.175 27.119 27.033 26.929 26.808 26.668 26.516 26.378 26.234 26.055 25.908 25.785 25.641 25.468 25.316 25.155 24.98 24.844 24.694 24.528 24.352 24.158 24.022 23.875 23.63 23.454 23.265 23.167 22.966 22.757 22.523 22.39 22.237 21.947 21.783 21.605 21.203 20.983 20.738 20.454 20.135 19.689 19.06 16.202 -7 ,25626 ,KEBNE ,16721411,Sat Nov 27 14:39:12 CET,Sat Nov 27 16:13:56 CET,0.0 1.589 2.057 2.39 2.679 2.942 3.176 3.389 3.79 3.967 4.123 4.385 4.566 4.701 4.969 5.22 5.448 5.559 5.786 6.003 6.293 6.474 6.657 6.926 7.177 7.416 7.648 7.879 8.174 8.452 8.716 9.033 9.342 9.638 9.978 10.374 10.75 11.152 11.599 12.082 12.59 13.159 13.828 14.515 15.305 16.181 17.202 18.391 19.843 21.588 23.755 25.478 26.374 26.885 27.199 27.383 27.443 27.452 27.419 27.322 27.213 27.1 26.969 26.831 26.685 26.543 26.381 26.218 26.068 25.905 25.736 25.58 25.405 25.221 25.072 24.912 24.735 24.551 24.354 24.213 24.062 23.815 23.63 23.435 23.337 23.133 22.912 22.673 22.552 22.393 22.075 21.895 21.71 21.283 21.048 20.795 20.483 20.14 19.744 19.142 16.647 -8 ,8900 ,KEBNE ,16721412,Sat Nov 27 14:39:12 CET,Sat Nov 27 16:13:47 CET,0.0 1.96 2.517 2.925 3.26 3.566 3.849 4.119 4.61 4.826 5.025 5.353 5.552 5.7 5.978 6.242 6.491 6.609 6.83 7.049 7.379 7.584 7.775 8.056 8.331 8.6 8.852 9.084 9.388 9.681 9.961 10.303 10.638 10.956 11.321 11.732 12.114 12.538 12.996 13.472 13.98 14.574 15.289 16.018 16.871 17.806 18.879 20.093 21.541 23.26 25.31 26.98 27.905 28.45 28.772 28.954 29.016 28.958 28.861 28.756 28.632 28.492 28.35 28.196 28.027 27.866 27.699 27.544 27.398 27.226 27.03 26.87 26.69 26.482 26.315 26.126 25.933 25.743 25.549 25.408 25.253 25.007 24.829 24.65 24.563 24.367 24.139 23.89 23.759 23.602 23.296 23.115 22.928 22.516 22.273 22.001 21.708 21.358 20.892 20.265 17.661 -9 ,8626 ,KEBNE ,16721413,Sat Nov 27 14:39:12 CET,Sat Nov 27 16:13:46 CET,0.0 1.883 2.359 2.709 3.001 3.25 3.484 3.704 4.09 4.265 4.433 4.705 4.886 5.018 5.274 5.52 5.75 5.857 6.067 6.277 6.573 6.757 6.94 7.2 7.451 7.688 7.914 8.139 8.431 8.708 8.983 9.315 9.629 9.943 10.301 10.701 11.092 11.519 11.984 12.478 12.997 13.604 14.316 15.022 15.833 16.718 17.776 19.004 20.428 22.165 24.295 25.932 26.833 27.356 27.656 27.825 27.904 27.904 27.821 27.688 27.561 27.449 27.335 27.193 27.037 26.88 26.71 26.547 26.4 26.248 26.078 25.923 25.744 25.554 25.398 25.226 25.04 24.832 24.614 24.469 24.321 24.082 23.905 23.714 23.619 23.417 23.179 22.905 22.766 22.612 22.326 22.159 21.976 21.555 21.303 21.01 20.678 20.3 19.833 19.19 16.193 -10 ,18997 ,KEBNE ,16721414,Sat Nov 27 14:39:12 CET,Sat Nov 27 16:14:08 CET,0.0 1.831 2.314 2.654 2.943 3.214 3.447 3.65 4.02 4.185 4.341 4.596 4.772 4.906 5.173 5.421 5.647 5.758 5.974 6.179 6.474 6.665 6.845 7.099 7.345 7.581 7.81 8.04 8.356 8.66 8.94 9.293 9.631 9.942 10.304 10.71 11.102 11.529 11.985 12.479 13.005 13.611 14.31 15.011 15.836 16.748 17.827 19.078 20.566 22.319 24.356 25.966 26.832 27.341 27.629 27.752 27.787 27.752 27.681 27.564 27.417 27.269 27.126 26.97 26.818 26.683 26.524 26.355 26.195 26.023 25.843 25.687 25.519 25.338 25.19 25.031 24.858 24.67 24.46 24.311 24.158 23.912 23.734 23.54 23.437 23.219 22.989 22.736 22.597 22.442 22.175 22.014 21.835 21.434 21.178 20.869 20.549 20.187 19.728 19.122 16.418 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_30.txt deleted file mode 100644 index 7aec04e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_31_30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20823 ,KEBNE ,16721415,Sat Nov 27 14:39:12 CET,Sat Nov 27 16:14:28 CET,0.0 3.466 4.161 4.697 5.16 5.561 5.897 6.191 6.716 6.951 7.172 7.543 7.78 7.973 8.322 8.645 8.943 9.089 9.376 9.646 10.039 10.3 10.536 10.853 11.171 11.478 11.776 12.066 12.433 12.792 13.135 13.547 13.957 14.346 14.789 15.299 15.766 16.257 16.794 17.354 17.939 18.597 19.371 20.122 20.953 21.897 22.987 24.193 25.626 27.233 28.915 30.082 30.621 30.785 30.75 30.607 30.416 30.198 29.946 29.653 29.387 29.135 28.863 28.601 28.361 28.129 27.879 27.636 27.417 27.192 26.947 26.741 26.531 26.305 26.115 25.919 25.72 25.5 25.259 25.09 24.921 24.64 24.427 24.202 24.086 23.851 23.6 23.33 23.184 23.0 22.691 22.515 22.326 21.881 21.629 21.33 20.995 20.616 20.166 19.539 16.844 -2 ,6352 ,KEBNE ,16721416,Sat Nov 27 14:39:12 CET,Sat Nov 27 16:14:30 CET,0.0 8.297 9.061 9.6 10.041 10.429 10.762 11.056 11.595 11.846 12.082 12.473 12.712 12.903 13.253 13.578 13.89 14.042 14.333 14.606 14.986 15.216 15.432 15.752 16.072 16.388 16.685 16.967 17.335 17.688 18.029 18.431 18.816 19.184 19.605 20.084 20.533 21.031 21.581 22.157 22.72 23.331 24.038 24.747 25.595 26.571 27.658 28.866 30.228 31.75 33.48 34.667 35.128 35.255 35.176 35.01 34.803 34.546 34.288 34.023 33.779 33.531 33.276 33.034 32.787 32.549 32.307 32.081 31.881 31.655 31.402 31.192 30.965 30.728 30.546 30.346 30.135 29.896 29.627 29.45 29.272 28.973 28.757 28.542 28.431 28.194 27.946 27.686 27.539 27.35 27.044 26.861 26.655 26.186 25.925 25.64 25.316 24.959 24.532 23.876 20.563 -3 ,14554 ,KEBNE ,16721417,Sat Nov 27 14:39:12 CET,Sat Nov 27 16:14:32 CET,0.0 3.213 3.877 4.396 4.842 5.224 5.55 5.851 6.405 6.65 6.874 7.249 7.483 7.668 8.011 8.33 8.637 8.785 9.073 9.352 9.747 10.001 10.244 10.585 10.905 11.205 11.491 11.776 12.138 12.484 12.838 13.274 13.686 14.079 14.531 15.009 15.472 15.98 16.524 17.1 17.692 18.355 19.109 19.838 20.684 21.652 22.76 23.966 25.339 26.889 28.58 29.716 30.157 30.302 30.293 30.162 29.952 29.72 29.494 29.234 28.962 28.677 28.402 28.141 27.88 27.625 27.352 27.113 26.903 26.681 26.43 26.21 25.977 25.723 25.531 25.336 25.119 24.902 24.684 24.523 24.345 24.058 23.852 23.636 23.521 23.261 22.996 22.732 22.589 22.41 22.08 21.886 21.686 21.271 21.032 20.741 20.395 20.007 19.539 18.923 16.583 -4 ,20956 ,KEBNE ,16721418,Sat Nov 27 14:39:12 CET,Sat Nov 27 16:14:30 CET,0.0 2.875 3.579 4.122 4.558 4.932 5.267 5.574 6.128 6.381 6.616 7.009 7.233 7.423 7.802 8.147 8.462 8.612 8.902 9.19 9.608 9.871 10.127 10.484 10.82 11.143 11.453 11.757 12.135 12.503 12.851 13.258 13.663 14.054 14.497 14.985 15.456 15.958 16.489 17.064 17.674 18.351 19.105 19.848 20.718 21.664 22.742 23.934 25.324 26.945 28.635 29.768 30.268 30.395 30.347 30.221 30.027 29.794 29.577 29.325 29.096 28.871 28.616 28.379 28.144 27.925 27.699 27.473 27.27 27.053 26.812 26.618 26.41 26.184 26.003 25.799 25.579 25.354 25.114 24.933 24.748 24.474 24.281 24.078 23.974 23.752 23.499 23.224 23.084 22.915 22.609 22.421 22.23 21.819 21.569 21.27 20.943 20.58 20.116 19.496 16.698 -5 ,5897 ,KEBNE ,16721419,Sat Nov 27 14:40:15 CET,Sat Nov 27 16:11:23 CET,0.0 2.99 3.748 4.279 4.678 5.032 5.362 5.673 6.189 6.419 6.648 7.055 7.302 7.488 7.841 8.177 8.491 8.641 8.93 9.201 9.593 9.836 10.062 10.389 10.706 11.014 11.314 11.607 11.977 12.332 12.661 13.058 13.45 13.843 14.291 14.762 15.23 15.738 16.267 16.823 17.397 18.044 18.8 19.574 20.464 21.469 22.62 23.832 25.164 26.701 28.403 29.528 29.983 30.073 30.013 29.871 29.657 29.405 29.158 28.881 28.621 28.368 28.107 27.862 27.613 27.369 27.098 26.842 26.627 26.399 26.147 25.929 25.687 25.424 25.221 25.021 24.824 24.604 24.369 24.206 24.026 23.752 23.568 23.372 23.266 23.042 22.795 22.513 22.362 22.176 21.866 21.692 21.496 21.043 20.787 20.504 20.195 19.844 19.369 18.683 15.928 -6 ,9410 ,KEBNE ,16721420,Sat Nov 27 14:41:16 CET,Sat Nov 27 16:13:16 CET,0.0 2.71 3.4 3.935 4.333 4.675 4.976 5.254 5.713 5.923 6.124 6.432 6.643 6.816 7.136 7.425 7.708 7.843 8.096 8.336 8.676 8.896 9.114 9.439 9.74 10.01 10.272 10.536 10.877 11.195 11.521 11.925 12.298 12.639 13.022 13.466 13.899 14.363 14.85 15.371 15.906 16.51 17.242 17.982 18.821 19.719 20.754 21.863 23.073 24.453 25.974 27.036 27.438 27.56 27.519 27.382 27.231 27.022 26.767 26.494 26.229 25.93 25.635 25.366 25.109 24.863 24.594 24.359 24.146 23.922 23.702 23.515 23.308 23.085 22.903 22.706 22.503 22.285 22.056 21.894 21.712 21.396 21.175 20.964 20.852 20.622 20.382 20.118 19.975 19.795 19.469 19.289 19.095 18.665 18.445 18.183 17.872 17.476 16.983 16.303 13.73 -7 ,24565 ,KEBNE ,16721421,Sat Nov 27 14:42:16 CET,Sat Nov 27 16:18:45 CET,0.0 2.943 3.699 4.272 4.749 5.129 5.484 5.815 6.372 6.635 6.887 7.311 7.556 7.759 8.141 8.494 8.842 9.009 9.312 9.596 10.004 10.261 10.496 10.833 11.17 11.492 11.804 12.11 12.497 12.848 13.177 13.582 13.972 14.365 14.823 15.313 15.778 16.276 16.819 17.397 18.018 18.707 19.481 20.255 21.129 22.051 23.107 24.336 25.703 27.255 28.991 30.16 30.627 30.78 30.751 30.597 30.386 30.122 29.84 29.534 29.216 28.88 28.588 28.355 28.109 27.884 27.649 27.425 27.228 27.015 26.795 26.602 26.396 26.183 26.007 25.819 25.621 25.398 25.159 25.003 24.836 24.569 24.38 24.184 24.083 23.86 23.59 23.292 23.145 22.96 22.633 22.44 22.23 21.779 21.532 21.243 20.919 20.552 20.091 19.459 17.371 -8 ,8806 ,KEBNE ,16721422,Sat Nov 27 14:42:16 CET,Sat Nov 27 16:18:39 CET,0.0 3.495 4.192 4.698 5.148 5.535 5.873 6.195 6.735 6.972 7.202 7.589 7.831 8.023 8.371 8.707 9.04 9.19 9.477 9.768 10.18 10.427 10.663 11.007 11.329 11.632 11.919 12.192 12.548 12.899 13.233 13.638 14.023 14.387 14.808 15.283 15.745 16.241 16.756 17.306 17.893 18.565 19.332 20.063 20.95 21.931 22.984 24.155 25.528 27.073 28.828 30.018 30.461 30.615 30.602 30.476 30.272 30.064 29.847 29.562 29.304 29.067 28.81 28.535 28.274 28.036 27.779 27.545 27.329 27.098 26.847 26.631 26.398 26.147 25.941 25.727 25.519 25.302 25.065 24.9 24.73 24.456 24.264 24.051 23.935 23.704 23.456 23.186 23.04 22.852 22.536 22.346 22.147 21.715 21.466 21.19 20.878 20.505 20.05 19.433 16.231 -9 ,28954 ,KEBNE ,16721423,Sat Nov 27 14:42:16 CET,Sat Nov 27 16:18:52 CET,0.0 3.083 3.843 4.393 4.806 5.163 5.489 5.778 6.305 6.552 6.792 7.198 7.433 7.621 7.975 8.307 8.628 8.773 9.045 9.31 9.709 9.965 10.202 10.538 10.878 11.21 11.518 11.81 12.172 12.509 12.826 13.233 13.622 13.98 14.393 14.843 15.27 15.741 16.268 16.814 17.387 18.044 18.796 19.545 20.417 21.376 22.485 23.719 25.046 26.545 28.245 29.369 29.838 29.999 29.946 29.791 29.607 29.392 29.157 28.88 28.629 28.347 28.072 27.838 27.602 27.368 27.097 26.851 26.627 26.386 26.141 25.935 25.723 25.497 25.31 25.11 24.9 24.679 24.447 24.283 24.107 23.826 23.629 23.416 23.298 23.046 22.78 22.504 22.36 22.177 21.838 21.645 21.447 21.009 20.765 20.495 20.188 19.829 19.365 18.686 13.955 -10 ,21706 ,KEBNE ,16721424,Sat Nov 27 14:42:16 CET,Sat Nov 27 16:19:06 CET,0.0 3.014 3.695 4.222 4.646 5.022 5.339 5.634 6.181 6.422 6.643 7.015 7.249 7.432 7.778 8.111 8.425 8.578 8.862 9.13 9.522 9.769 10.009 10.356 10.672 10.973 11.265 11.543 11.902 12.248 12.584 12.987 13.375 13.751 14.183 14.667 15.133 15.64 16.162 16.687 17.262 17.936 18.712 19.458 20.311 21.262 22.316 23.481 24.833 26.361 28.05 29.279 29.836 30.005 29.951 29.801 29.614 29.384 29.134 28.859 28.597 28.335 28.072 27.802 27.545 27.306 27.049 26.811 26.589 26.347 26.087 25.867 25.64 25.406 25.229 25.043 24.836 24.618 24.385 24.217 24.042 23.763 23.569 23.367 23.259 23.028 22.762 22.466 22.317 22.137 21.814 21.626 21.429 20.995 20.736 20.446 20.129 19.726 19.236 18.636 15.933 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_24.txt deleted file mode 100644 index f2411249..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_24.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5923 ,KEBNE ,16721425,Sat Nov 27 14:42:16 CET,Sat Nov 27 16:18:24 CET,0.0 1.49 1.938 2.261 2.519 2.749 2.956 3.13 3.431 3.569 3.701 3.923 4.05 4.147 4.323 4.485 4.635 4.705 4.838 4.964 5.141 5.247 5.347 5.48 5.604 5.717 5.822 5.926 6.061 6.173 6.269 6.376 6.489 6.596 6.7 6.814 6.917 6.992 7.041 7.09 7.109 7.116 7.104 7.029 6.869 6.62 6.206 5.587 4.7 3.322 1.048 -1.662 -3.868 -5.699 -7.216 -8.498 -9.584 -10.558 -11.392 -12.213 -12.91 -13.52 -14.088 -14.608 -15.091 -15.528 -15.978 -16.371 -16.708 -17.057 -17.418 -17.715 -18.02 -18.34 -18.58 -18.829 -19.097 -19.374 -19.66 -19.859 -20.061 -20.377 -20.597 -20.833 -20.962 -21.223 -21.49 -21.777 -21.928 -22.13 -22.423 -22.594 -22.779 -23.193 -23.424 -23.67 -23.949 -24.262 -24.63 -25.114 -26.526 -2 ,32172 ,KEBNE ,16721426,Sat Nov 27 14:42:16 CET,Sat Nov 27 16:18:54 CET,0.0 1.698 2.148 2.451 2.704 2.93 3.134 3.311 3.618 3.758 3.88 4.085 4.213 4.311 4.496 4.673 4.832 4.899 5.029 5.152 5.317 5.423 5.523 5.658 5.786 5.908 6.022 6.12 6.233 6.335 6.433 6.542 6.632 6.709 6.788 6.865 6.924 6.981 7.045 7.095 7.133 7.158 7.113 7.02 6.877 6.637 6.25 5.666 4.781 3.402 1.086 -1.691 -3.944 -5.772 -7.268 -8.565 -9.657 -10.625 -11.464 -12.272 -12.96 -13.573 -14.137 -14.666 -15.155 -15.606 -16.09 -16.513 -16.864 -17.227 -17.606 -17.91 -18.217 -18.536 -18.784 -19.039 -19.303 -19.574 -19.856 -20.051 -20.254 -20.574 -20.79 -21.018 -21.14 -21.4 -21.672 -21.952 -22.099 -22.295 -22.576 -22.749 -22.928 -23.316 -23.532 -23.771 -24.043 -24.346 -24.689 -25.139 -26.701 -3 ,8675 ,KEBNE ,16721427,Sat Nov 27 14:43:17 CET,Sat Nov 27 16:19:34 CET,0.0 1.715 2.173 2.488 2.747 2.998 3.223 3.407 3.723 3.86 3.994 4.219 4.344 4.445 4.63 4.795 4.945 5.015 5.148 5.279 5.458 5.565 5.661 5.795 5.921 6.037 6.139 6.234 6.355 6.458 6.547 6.662 6.768 6.859 6.948 7.036 7.107 7.159 7.201 7.243 7.282 7.274 7.231 7.175 7.018 6.776 6.452 5.89 4.951 3.505 1.101 -1.722 -3.976 -5.779 -7.271 -8.6 -9.733 -10.714 -11.551 -12.387 -13.066 -13.654 -14.226 -14.753 -15.23 -15.654 -16.102 -16.494 -16.821 -17.17 -17.537 -17.843 -18.157 -18.482 -18.73 -18.987 -19.253 -19.532 -19.822 -20.021 -20.229 -20.544 -20.762 -20.996 -21.117 -21.368 -21.643 -21.935 -22.081 -22.274 -22.553 -22.726 -22.907 -23.294 -23.508 -23.757 -24.027 -24.323 -24.693 -25.163 -26.596 -4 ,16192 ,KEBNE ,16721428,Sat Nov 27 14:43:17 CET,Sat Nov 27 16:20:02 CET,0.0 1.515 1.992 2.33 2.582 2.8 3.008 3.187 3.496 3.643 3.78 3.991 4.111 4.21 4.384 4.551 4.707 4.778 4.912 5.039 5.21 5.315 5.419 5.554 5.672 5.787 5.893 5.995 6.135 6.261 6.371 6.492 6.604 6.711 6.822 6.928 7.011 7.078 7.129 7.163 7.181 7.195 7.158 7.051 6.871 6.627 6.261 5.679 4.767 3.365 1.021 -1.682 -3.857 -5.644 -7.1 -8.388 -9.501 -10.48 -11.332 -12.165 -12.857 -13.474 -14.047 -14.575 -15.064 -15.5 -15.944 -16.339 -16.679 -17.029 -17.386 -17.68 -17.989 -18.311 -18.559 -18.81 -19.064 -19.331 -19.622 -19.822 -20.027 -20.351 -20.57 -20.801 -20.922 -21.169 -21.425 -21.692 -21.84 -22.04 -22.312 -22.478 -22.653 -23.041 -23.265 -23.511 -23.771 -24.075 -24.456 -24.945 -26.486 -5 ,4623 ,KEBNE ,16721429,Sat Nov 27 14:43:18 CET,Sat Nov 27 16:18:12 CET,0.0 2.017 2.445 2.742 2.99 3.209 3.408 3.587 3.907 4.047 4.171 4.384 4.507 4.61 4.796 4.966 5.121 5.19 5.323 5.457 5.634 5.738 5.84 5.985 6.113 6.23 6.345 6.443 6.558 6.662 6.762 6.88 6.987 7.084 7.175 7.248 7.303 7.356 7.411 7.466 7.492 7.506 7.497 7.416 7.25 7.032 6.687 6.112 5.206 3.837 1.621 -1.062 -3.306 -5.143 -6.674 -8.032 -9.168 -10.137 -10.952 -11.751 -12.424 -13.022 -13.574 -14.076 -14.544 -14.974 -15.417 -15.82 -16.168 -16.52 -16.888 -17.192 -17.501 -17.817 -18.063 -18.318 -18.584 -18.856 -19.133 -19.331 -19.543 -19.866 -20.086 -20.314 -20.433 -20.676 -20.928 -21.199 -21.345 -21.542 -21.817 -21.988 -22.172 -22.582 -22.806 -23.045 -23.308 -23.618 -23.998 -24.493 -26.1 -6 ,18243 ,KEBNE ,16721430,Sat Nov 27 14:43:18 CET,Sat Nov 27 16:19:41 CET,0.0 1.496 1.944 2.28 2.557 2.798 2.997 3.173 3.485 3.626 3.757 3.977 4.107 4.213 4.402 4.568 4.714 4.786 4.924 5.05 5.221 5.325 5.427 5.572 5.7 5.819 5.93 6.031 6.147 6.254 6.357 6.468 6.566 6.653 6.741 6.827 6.907 6.986 7.066 7.122 7.144 7.129 7.067 6.977 6.843 6.603 6.199 5.621 4.77 3.4 0.997 -1.791 -4.001 -5.82 -7.327 -8.646 -9.768 -10.749 -11.585 -12.402 -13.089 -13.695 -14.271 -14.816 -15.313 -15.752 -16.198 -16.597 -16.936 -17.284 -17.642 -17.93 -18.229 -18.54 -18.782 -19.034 -19.297 -19.575 -19.865 -20.068 -20.273 -20.583 -20.805 -21.042 -21.161 -21.407 -21.671 -21.956 -22.106 -22.302 -22.58 -22.75 -22.933 -23.323 -23.54 -23.778 -24.034 -24.336 -24.687 -25.127 -27.018 -7 ,24758 ,KEBNE ,16721431,Sat Nov 27 14:43:22 CET,Sat Nov 27 16:14:33 CET,0.0 1.745 2.185 2.516 2.778 3.0 3.199 3.376 3.689 3.831 3.955 4.164 4.29 4.391 4.569 4.733 4.887 4.958 5.095 5.222 5.397 5.506 5.611 5.754 5.882 6.004 6.113 6.213 6.334 6.443 6.544 6.662 6.753 6.828 6.918 7.014 7.088 7.141 7.189 7.229 7.236 7.22 7.187 7.113 6.978 6.738 6.341 5.742 4.813 3.404 1.056 -1.723 -3.934 -5.732 -7.249 -8.58 -9.71 -10.692 -11.528 -12.342 -13.017 -13.62 -14.198 -14.732 -15.229 -15.683 -16.14 -16.551 -16.912 -17.281 -17.661 -17.976 -18.299 -18.631 -18.888 -19.147 -19.409 -19.682 -19.967 -20.165 -20.374 -20.696 -20.911 -21.136 -21.254 -21.499 -21.763 -22.043 -22.189 -22.384 -22.661 -22.836 -23.018 -23.423 -23.651 -23.893 -24.164 -24.468 -24.843 -25.325 -26.872 -8 ,9793 ,KEBNE ,16721432,Sat Nov 27 14:43:18 CET,Sat Nov 27 16:19:28 CET,0.0 1.633 2.096 2.432 2.694 2.928 3.138 3.333 3.664 3.813 3.951 4.177 4.302 4.406 4.608 4.8 4.971 5.048 5.192 5.329 5.522 5.648 5.774 5.943 6.084 6.209 6.334 6.45 6.586 6.718 6.829 6.949 7.06 7.159 7.271 7.385 7.489 7.58 7.623 7.647 7.653 7.643 7.608 7.509 7.327 7.057 6.65 6.026 5.105 3.698 1.317 -1.454 -3.674 -5.508 -7.006 -8.265 -9.331 -10.295 -11.116 -11.917 -12.603 -13.206 -13.766 -14.282 -14.754 -15.19 -15.635 -16.015 -16.349 -16.701 -17.055 -17.35 -17.664 -17.989 -18.233 -18.486 -18.757 -19.033 -19.314 -19.512 -19.717 -20.029 -20.246 -20.472 -20.594 -20.847 -21.107 -21.382 -21.525 -21.719 -22.009 -22.187 -22.373 -22.768 -22.979 -23.215 -23.483 -23.777 -24.148 -24.645 -26.097 -9 ,13037 ,KEBNE ,16721433,Sat Nov 27 14:43:17 CET,Sat Nov 27 16:19:12 CET,0.0 1.863 2.31 2.641 2.894 3.106 3.295 3.465 3.765 3.899 4.025 4.228 4.35 4.449 4.629 4.788 4.938 5.011 5.152 5.282 5.454 5.56 5.662 5.801 5.937 6.059 6.164 6.268 6.389 6.497 6.603 6.717 6.82 6.916 7.013 7.102 7.178 7.255 7.334 7.401 7.43 7.423 7.376 7.276 7.108 6.869 6.483 5.915 5.037 3.612 1.21 -1.571 -3.759 -5.555 -7.052 -8.335 -9.436 -10.41 -11.226 -12.042 -12.729 -13.329 -13.911 -14.465 -14.971 -15.432 -15.909 -16.312 -16.662 -17.023 -17.396 -17.708 -18.023 -18.348 -18.599 -18.859 -19.127 -19.405 -19.698 -19.896 -20.099 -20.418 -20.646 -20.886 -21.01 -21.267 -21.548 -21.845 -21.991 -22.182 -22.457 -22.627 -22.808 -23.2 -23.413 -23.647 -23.912 -24.228 -24.615 -25.09 -26.844 -10 ,15658 ,KEBNE ,16721434,Sat Nov 27 14:44:19 CET,Sat Nov 27 16:20:30 CET,0.0 1.484 1.968 2.295 2.552 2.778 2.983 3.169 3.494 3.629 3.745 3.951 4.074 4.177 4.363 4.533 4.69 4.76 4.893 5.022 5.199 5.306 5.415 5.563 5.69 5.8 5.898 5.998 6.137 6.258 6.367 6.492 6.597 6.695 6.799 6.899 6.979 7.047 7.105 7.158 7.19 7.177 7.116 7.031 6.865 6.592 6.245 5.696 4.78 3.369 0.972 -1.775 -3.954 -5.768 -7.274 -8.574 -9.689 -10.668 -11.496 -12.33 -13.038 -13.65 -14.222 -14.756 -15.251 -15.706 -16.178 -16.595 -16.952 -17.318 -17.703 -18.028 -18.364 -18.702 -18.961 -19.239 -19.523 -19.814 -20.11 -20.312 -20.526 -20.853 -21.079 -21.312 -21.427 -21.673 -21.943 -22.22 -22.363 -22.554 -22.824 -22.997 -23.183 -23.589 -23.816 -24.058 -24.323 -24.628 -24.996 -25.483 -27.043 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_31.txt deleted file mode 100644 index 4d53bc59..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_33_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9021 ,KEBNE ,16721435,Sat Nov 27 14:44:19 CET,Sat Nov 27 16:20:52 CET,0.0 2.173 2.714 3.097 3.396 3.658 3.895 4.11 4.488 4.651 4.803 5.077 5.226 5.353 5.591 5.81 6.023 6.127 6.329 6.511 6.762 6.923 7.069 7.269 7.462 7.652 7.83 7.985 8.173 8.35 8.517 8.732 8.94 9.105 9.286 9.492 9.67 9.844 10.013 10.174 10.322 10.459 10.573 10.643 10.665 10.633 10.576 10.38 9.906 9.013 7.325 5.146 3.294 1.708 0.378 -0.763 -1.778 -2.688 -3.443 -4.198 -4.865 -5.436 -5.966 -6.468 -6.939 -7.38 -7.826 -8.215 -8.559 -8.911 -9.261 -9.554 -9.855 -10.158 -10.391 -10.634 -10.883 -11.148 -11.433 -11.625 -11.823 -12.133 -12.351 -12.578 -12.693 -12.931 -13.185 -13.461 -13.61 -13.801 -14.085 -14.258 -14.436 -14.82 -15.032 -15.264 -15.519 -15.823 -16.199 -16.699 -18.497 -2 ,12631 ,KEBNE ,16721436,Sat Nov 27 14:45:20 CET,Sat Nov 27 16:21:50 CET,0.0 2.353 2.96 3.361 3.699 3.991 4.246 4.481 4.88 5.052 5.218 5.497 5.648 5.771 6.0 6.208 6.399 6.494 6.676 6.851 7.108 7.268 7.419 7.638 7.839 8.015 8.177 8.327 8.518 8.699 8.876 9.088 9.273 9.433 9.609 9.807 9.986 10.16 10.333 10.5 10.653 10.787 10.915 11.014 11.071 11.088 11.009 10.772 10.323 9.462 7.844 5.722 3.912 2.377 1.076 -0.071 -1.084 -1.98 -2.734 -3.481 -4.121 -4.69 -5.217 -5.706 -6.158 -6.567 -6.986 -7.363 -7.696 -8.042 -8.393 -8.677 -8.969 -9.266 -9.499 -9.742 -9.993 -10.255 -10.522 -10.708 -10.907 -11.215 -11.429 -11.654 -11.773 -12.018 -12.273 -12.55 -12.697 -12.888 -13.164 -13.333 -13.51 -13.904 -14.123 -14.361 -14.62 -14.912 -15.302 -15.795 -17.794 -3 ,27982 ,KEBNE ,16721437,Sat Nov 27 14:45:20 CET,Sat Nov 27 16:20:22 CET,0.0 2.11 2.617 3.007 3.324 3.592 3.836 4.063 4.449 4.616 4.782 5.056 5.204 5.325 5.544 5.756 5.952 6.046 6.229 6.398 6.62 6.756 6.893 7.1 7.298 7.464 7.609 7.748 7.925 8.088 8.241 8.414 8.569 8.727 8.902 9.065 9.211 9.363 9.511 9.641 9.747 9.863 9.982 10.069 10.128 10.125 10.034 9.83 9.372 8.467 6.751 4.582 2.782 1.257 -0.016 -1.145 -2.143 -3.013 -3.755 -4.498 -5.129 -5.702 -6.243 -6.737 -7.185 -7.593 -8.017 -8.389 -8.707 -9.031 -9.368 -9.654 -9.95 -10.263 -10.506 -10.757 -11.015 -11.278 -11.549 -11.74 -11.94 -12.25 -12.473 -12.711 -12.83 -13.076 -13.346 -13.633 -13.779 -13.967 -14.24 -14.412 -14.586 -14.959 -15.174 -15.419 -15.697 -16.02 -16.43 -16.967 -18.942 -4 ,20054 ,KEBNE ,16721438,Sat Nov 27 14:45:20 CET,Sat Nov 27 16:21:48 CET,0.0 2.412 2.98 3.347 3.636 3.905 4.148 4.355 4.714 4.889 5.047 5.314 5.467 5.59 5.812 6.025 6.227 6.322 6.505 6.672 6.905 7.051 7.186 7.381 7.567 7.73 7.885 8.036 8.217 8.393 8.549 8.714 8.866 9.008 9.169 9.336 9.479 9.625 9.774 9.913 10.051 10.178 10.285 10.386 10.479 10.493 10.398 10.149 9.692 8.846 7.161 5.012 3.228 1.734 0.436 -0.732 -1.728 -2.608 -3.365 -4.114 -4.748 -5.326 -5.877 -6.382 -6.853 -7.276 -7.691 -8.046 -8.359 -8.687 -9.025 -9.322 -9.632 -9.936 -10.17 -10.414 -10.673 -10.945 -11.223 -11.414 -11.609 -11.92 -12.141 -12.368 -12.486 -12.73 -12.989 -13.274 -13.425 -13.616 -13.891 -14.064 -14.248 -14.649 -14.877 -15.119 -15.384 -15.709 -16.098 -16.644 -18.579 -5 ,8980 ,KEBNE ,16721439,Sat Nov 27 14:45:20 CET,Sat Nov 27 16:23:59 CET,0.0 2.143 2.666 3.041 3.368 3.652 3.895 4.111 4.502 4.679 4.849 5.136 5.293 5.422 5.647 5.854 6.052 6.146 6.32 6.491 6.727 6.866 6.997 7.175 7.343 7.507 7.662 7.815 8.018 8.206 8.38 8.582 8.762 8.936 9.129 9.325 9.489 9.642 9.809 9.968 10.099 10.223 10.345 10.438 10.48 10.483 10.408 10.16 9.687 8.833 7.178 5.022 3.214 1.668 0.349 -0.825 -1.825 -2.712 -3.467 -4.208 -4.849 -5.406 -5.931 -6.426 -6.893 -7.32 -7.763 -8.157 -8.492 -8.839 -9.201 -9.508 -9.829 -10.161 -10.411 -10.667 -10.945 -11.241 -11.542 -11.747 -11.953 -12.267 -12.485 -12.71 -12.825 -13.065 -13.321 -13.601 -13.753 -13.943 -14.228 -14.405 -14.59 -15.008 -15.231 -15.465 -15.724 -16.021 -16.365 -16.83 -18.666 -6 ,12207 ,KEBNE ,16721440,Sat Nov 27 14:46:22 CET,Sat Nov 27 16:24:15 CET,0.0 2.051 2.577 2.971 3.29 3.555 3.79 4.002 4.377 4.539 4.7 4.992 5.145 5.27 5.505 5.718 5.921 6.015 6.179 6.342 6.575 6.72 6.855 7.048 7.227 7.386 7.537 7.684 7.867 8.029 8.177 8.349 8.519 8.677 8.838 9.005 9.152 9.298 9.446 9.583 9.713 9.843 9.962 10.026 10.032 9.981 9.854 9.591 9.093 8.187 6.459 4.281 2.439 0.896 -0.409 -1.575 -2.566 -3.434 -4.175 -4.916 -5.554 -6.107 -6.642 -7.147 -7.605 -8.024 -8.456 -8.845 -9.183 -9.539 -9.918 -10.226 -10.531 -10.832 -11.066 -11.307 -11.563 -11.836 -12.122 -12.312 -12.502 -12.808 -13.033 -13.268 -13.391 -13.645 -13.902 -14.182 -14.334 -14.529 -14.829 -15.012 -15.198 -15.59 -15.801 -16.035 -16.311 -16.637 -17.051 -17.639 -19.883 -7 ,12528 ,KEBNE ,16721441,Sat Nov 27 14:46:22 CET,Sat Nov 27 16:23:14 CET,0.0 2.411 2.969 3.383 3.722 4.012 4.279 4.518 4.94 5.119 5.267 5.53 5.682 5.815 6.058 6.272 6.478 6.577 6.765 6.944 7.195 7.343 7.484 7.681 7.858 8.022 8.174 8.321 8.499 8.658 8.805 8.964 9.112 9.246 9.395 9.564 9.712 9.859 10.008 10.145 10.259 10.371 10.482 10.55 10.59 10.591 10.509 10.281 9.814 8.994 7.433 5.333 3.522 1.968 0.662 -0.469 -1.446 -2.328 -3.083 -3.82 -4.441 -4.983 -5.491 -5.964 -6.402 -6.808 -7.231 -7.606 -7.926 -8.253 -8.603 -8.896 -9.197 -9.507 -9.743 -9.99 -10.246 -10.512 -10.803 -11.001 -11.205 -11.526 -11.742 -11.972 -12.095 -12.342 -12.598 -12.884 -13.033 -13.221 -13.498 -13.669 -13.845 -14.244 -14.481 -14.727 -14.989 -15.301 -15.665 -16.13 -17.73 -8 ,2648 ,KEBNE ,16721442,Sat Nov 27 14:46:25 CET,Sat Nov 27 16:17:05 CET,0.0 2.094 2.669 3.076 3.412 3.685 3.919 4.134 4.504 4.669 4.831 5.112 5.258 5.377 5.613 5.844 6.049 6.144 6.325 6.493 6.729 6.878 7.027 7.24 7.435 7.626 7.8 7.955 8.155 8.342 8.508 8.716 8.912 9.083 9.268 9.457 9.627 9.807 9.983 10.147 10.303 10.456 10.595 10.673 10.713 10.7 10.585 10.309 9.809 8.951 7.211 5.015 3.244 1.732 0.481 -0.638 -1.613 -2.451 -3.172 -3.883 -4.495 -5.049 -5.579 -6.075 -6.534 -6.959 -7.395 -7.772 -8.103 -8.446 -8.797 -9.092 -9.397 -9.704 -9.944 -10.193 -10.447 -10.715 -10.996 -11.185 -11.38 -11.691 -11.904 -12.125 -12.242 -12.484 -12.737 -13.005 -13.148 -13.334 -13.619 -13.802 -13.987 -14.38 -14.593 -14.84 -15.109 -15.4 -15.766 -16.291 -17.925 -9 ,25880 ,KEBNE ,16721443,Sat Nov 27 14:46:25 CET,Sat Nov 27 16:18:37 CET,0.0 2.086 2.664 3.078 3.408 3.683 3.928 4.157 4.551 4.717 4.874 5.13 5.273 5.401 5.64 5.858 6.068 6.16 6.33 6.489 6.714 6.863 7.001 7.197 7.374 7.539 7.701 7.844 8.014 8.183 8.347 8.542 8.72 8.869 9.045 9.233 9.401 9.571 9.732 9.884 10.023 10.149 10.257 10.334 10.386 10.384 10.286 10.026 9.521 8.607 6.85 4.681 2.894 1.362 0.081 -1.041 -2.023 -2.909 -3.663 -4.388 -4.994 -5.526 -6.024 -6.49 -6.925 -7.322 -7.744 -8.119 -8.437 -8.769 -9.121 -9.408 -9.702 -10.013 -10.257 -10.503 -10.756 -11.025 -11.311 -11.506 -11.705 -12.017 -12.238 -12.474 -12.599 -12.856 -13.116 -13.394 -13.544 -13.737 -14.031 -14.206 -14.388 -14.807 -15.043 -15.284 -15.539 -15.837 -16.2 -16.694 -18.234 -10 ,15932 ,KEBNE ,16721444,Sat Nov 27 14:47:23 CET,Sat Nov 27 16:23:19 CET,0.0 2.011 2.578 2.986 3.302 3.575 3.844 4.077 4.438 4.609 4.774 5.048 5.198 5.323 5.547 5.752 5.947 6.041 6.225 6.398 6.621 6.762 6.898 7.087 7.264 7.431 7.585 7.726 7.904 8.068 8.217 8.384 8.537 8.688 8.865 9.057 9.221 9.391 9.561 9.709 9.844 9.971 10.1 10.193 10.243 10.252 10.153 9.904 9.448 8.62 7.018 4.882 3.092 1.574 0.264 -0.88 -1.874 -2.761 -3.5 -4.237 -4.861 -5.41 -5.927 -6.411 -6.87 -7.286 -7.716 -8.105 -8.441 -8.807 -9.195 -9.5 -9.822 -10.165 -10.423 -10.687 -10.957 -11.246 -11.55 -11.751 -11.955 -12.266 -12.486 -12.71 -12.824 -13.067 -13.328 -13.605 -13.749 -13.938 -14.204 -14.378 -14.564 -14.942 -15.158 -15.399 -15.674 -15.989 -16.41 -16.965 -18.872 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_34_26.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_34_26.txt deleted file mode 100644 index 0821b80b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_34_26.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30776 ,KEBNE ,16721445,Sat Nov 27 14:48:24 CET,Sat Nov 27 16:27:06 CET,0.0 1.708 2.143 2.473 2.732 2.952 3.153 3.326 3.623 3.755 3.888 4.065 4.249 4.353 4.546 4.719 4.88 4.954 5.084 5.205 5.383 5.49 5.587 5.716 5.834 5.941 6.038 6.13 6.224 6.308 6.389 6.467 6.529 6.587 6.642 6.687 6.727 6.758 6.756 6.719 6.656 6.566 6.393 6.146 5.799 5.284 4.511 3.474 1.981 -0.293 -3.926 -8.095 -11.395 -14.063 -16.287 -18.196 -19.819 -21.239 -22.423 -23.602 -24.597 -25.455 -26.258 -26.999 -27.669 -28.274 -28.902 -29.451 -29.925 -30.413 -30.91 -31.322 -31.749 -32.196 -32.55 -32.907 -33.267 -33.64 -34.024 -34.287 -34.558 -34.97 -35.25 -35.538 -35.689 -36.002 -36.322 -36.668 -36.85 -37.149 -37.417 -37.623 -37.838 -38.311 -38.573 -38.841 -39.125 -39.457 -39.84 -40.335 -42.065 -2 ,10660 ,KEBNE ,16721446,Sat Nov 27 14:49:26 CET,Sat Nov 27 16:28:48 CET,0.0 1.883 2.368 2.697 2.952 3.172 3.384 3.573 3.89 4.036 4.168 4.323 4.503 4.6 4.777 4.947 5.1 5.167 5.3 5.426 5.602 5.706 5.794 5.919 6.038 6.147 6.254 6.357 6.471 6.582 6.684 6.781 6.871 6.957 7.024 7.085 7.137 7.162 7.183 7.16 7.085 6.974 6.794 6.571 6.244 5.763 5.032 3.967 2.441 0.192 -3.44 -7.58 -10.829 -13.48 -15.662 -17.549 -19.156 -20.557 -21.736 -22.882 -23.853 -24.706 -25.502 -26.243 -26.917 -27.53 -28.156 -28.706 -29.174 -29.66 -30.167 -30.582 -31.008 -31.447 -31.788 -32.138 -32.493 -32.847 -33.21 -33.461 -33.715 -34.107 -34.381 -34.66 -34.807 -35.113 -35.439 -35.784 -35.955 -36.248 -36.51 -36.713 -36.927 -37.387 -37.635 -37.908 -38.199 -38.524 -38.907 -39.406 -41.09 -3 ,24564 ,KEBNE ,16721447,Sat Nov 27 14:49:26 CET,Sat Nov 27 16:26:07 CET,0.0 1.891 2.359 2.703 2.987 3.228 3.433 3.62 3.949 4.089 4.218 4.38 4.564 4.668 4.851 5.018 5.176 5.25 5.387 5.508 5.672 5.776 5.878 6.013 6.128 6.234 6.321 6.402 6.511 6.597 6.66 6.745 6.824 6.883 6.936 6.981 7.005 7.008 6.997 6.959 6.878 6.742 6.552 6.328 5.973 5.489 4.799 3.79 2.257 -0.076 -3.802 -8.045 -11.349 -14.018 -16.18 -18.039 -19.61 -20.974 -22.103 -23.201 -24.139 -24.968 -25.746 -26.46 -27.111 -27.689 -28.293 -28.83 -29.279 -29.744 -30.229 -30.62 -31.027 -31.457 -31.777 -32.097 -32.433 -32.787 -33.153 -33.402 -33.664 -34.069 -34.343 -34.628 -34.774 -35.072 -35.386 -35.727 -35.909 -36.209 -36.483 -36.688 -36.896 -37.34 -37.59 -37.858 -38.145 -38.457 -38.832 -39.342 -40.92 -4 ,12525 ,KEBNE ,16721448,Sat Nov 27 14:50:27 CET,Sat Nov 27 16:27:22 CET,0.0 1.68 2.153 2.508 2.775 2.993 3.179 3.348 3.677 3.83 3.966 4.122 4.301 4.398 4.571 4.725 4.875 4.947 5.075 5.191 5.355 5.459 5.555 5.688 5.806 5.91 6.007 6.101 6.207 6.295 6.37 6.45 6.522 6.586 6.657 6.715 6.733 6.734 6.739 6.726 6.663 6.54 6.357 6.129 5.777 5.288 4.592 3.586 2.077 -0.206 -3.879 -8.08 -11.411 -14.133 -16.381 -18.299 -19.91 -21.294 -22.458 -23.626 -24.613 -25.464 -26.26 -26.994 -27.662 -28.273 -28.904 -29.459 -29.944 -30.441 -30.944 -31.361 -31.78 -32.214 -32.553 -32.905 -33.265 -33.62 -33.998 -34.269 -34.549 -34.971 -35.259 -35.563 -35.722 -36.053 -36.403 -36.767 -36.951 -37.245 -37.512 -37.713 -37.918 -38.365 -38.613 -38.887 -39.19 -39.544 -39.981 -40.543 -42.031 -5 ,25931 ,KEBNE ,16721449,Sat Nov 27 14:50:27 CET,Sat Nov 27 16:28:51 CET,0.0 1.806 2.264 2.602 2.874 3.115 3.323 3.505 3.834 3.985 4.116 4.262 4.44 4.545 4.74 4.919 5.074 5.146 5.285 5.414 5.592 5.699 5.797 5.93 6.056 6.167 6.259 6.345 6.452 6.543 6.621 6.71 6.779 6.831 6.892 6.946 6.982 7.021 7.03 7.004 6.928 6.801 6.622 6.385 6.021 5.491 4.786 3.796 2.32 0.081 -3.596 -7.827 -11.089 -13.756 -15.979 -17.872 -19.478 -20.923 -22.131 -23.259 -24.2 -25.029 -25.798 -26.511 -27.167 -27.76 -28.367 -28.893 -29.347 -29.817 -30.291 -30.679 -31.084 -31.508 -31.836 -32.171 -32.508 -32.857 -33.22 -33.47 -33.725 -34.125 -34.405 -34.692 -34.839 -35.152 -35.475 -35.808 -35.983 -36.274 -36.532 -36.731 -36.945 -37.411 -37.662 -37.928 -38.209 -38.522 -38.891 -39.376 -41.082 -6 ,3698 ,KEBNE ,16721450,Sat Nov 27 14:51:29 CET,Sat Nov 27 16:32:17 CET,0.0 1.732 2.228 2.556 2.813 3.031 3.232 3.411 3.728 3.866 3.994 4.16 4.338 4.433 4.606 4.765 4.921 4.995 5.127 5.248 5.413 5.509 5.594 5.721 5.847 5.96 6.06 6.143 6.247 6.339 6.423 6.507 6.573 6.635 6.683 6.717 6.742 6.756 6.77 6.758 6.69 6.581 6.409 6.163 5.801 5.322 4.621 3.614 2.153 -0.088 -3.752 -7.894 -11.144 -13.779 -15.961 -17.848 -19.447 -20.845 -22.02 -23.178 -24.132 -24.954 -25.742 -26.469 -27.134 -27.742 -28.372 -28.921 -29.39 -29.879 -30.372 -30.785 -31.216 -31.662 -31.995 -32.327 -32.67 -33.02 -33.383 -33.629 -33.882 -34.278 -34.549 -34.826 -34.974 -35.29 -35.608 -35.939 -36.113 -36.405 -36.665 -36.869 -37.081 -37.527 -37.768 -38.034 -38.337 -38.679 -39.066 -39.555 -40.947 -7 ,23939 ,KEBNE ,16721451,Sat Nov 27 14:51:29 CET,Sat Nov 27 16:29:20 CET,0.0 1.667 2.118 2.426 2.679 2.895 3.082 3.244 3.525 3.654 3.775 3.928 4.107 4.2 4.368 4.52 4.663 4.725 4.834 4.937 5.088 5.187 5.277 5.395 5.502 5.598 5.687 5.764 5.857 5.942 6.009 6.075 6.131 6.177 6.231 6.273 6.275 6.271 6.268 6.232 6.171 6.064 5.87 5.606 5.222 4.733 4.05 3.052 1.557 -0.741 -4.434 -8.587 -11.868 -14.528 -16.71 -18.591 -20.161 -21.519 -22.661 -23.785 -24.734 -25.549 -26.312 -27.029 -27.689 -28.294 -28.928 -29.473 -29.927 -30.384 -30.848 -31.231 -31.617 -32.006 -32.311 -32.628 -32.948 -33.283 -33.631 -33.869 -34.119 -34.505 -34.767 -35.034 -35.173 -35.452 -35.746 -36.07 -36.235 -36.51 -36.731 -36.915 -37.11 -37.518 -37.732 -37.967 -38.245 -38.567 -38.936 -39.39 -40.705 -8 ,29363 ,KEBNE ,16721452,Sat Nov 27 14:51:28 CET,Sat Nov 27 16:28:15 CET,0.0 1.606 2.06 2.4 2.665 2.897 3.098 3.276 3.601 3.744 3.874 4.035 4.212 4.326 4.556 4.753 4.931 5.015 5.167 5.313 5.52 5.641 5.753 5.91 6.043 6.166 6.282 6.385 6.515 6.629 6.723 6.822 6.9 6.968 7.034 7.079 7.118 7.155 7.169 7.144 7.075 6.978 6.817 6.576 6.189 5.65 4.924 3.922 2.45 0.202 -3.505 -7.729 -11.014 -13.688 -15.889 -17.783 -19.392 -20.81 -21.987 -23.125 -24.085 -24.933 -25.732 -26.462 -27.131 -27.727 -28.323 -28.854 -29.31 -29.781 -30.272 -30.681 -31.101 -31.527 -31.85 -32.18 -32.521 -32.872 -33.244 -33.498 -33.754 -34.156 -34.428 -34.71 -34.859 -35.168 -35.486 -35.817 -35.987 -36.278 -36.546 -36.756 -36.971 -37.422 -37.668 -37.93 -38.208 -38.524 -38.903 -39.399 -40.814 -9 ,7598 ,KEBNE ,16721453,Sat Nov 27 14:51:28 CET,Sat Nov 27 16:28:14 CET,0.0 1.716 2.173 2.529 2.81 3.032 3.226 3.402 3.703 3.831 3.957 4.13 4.312 4.412 4.59 4.749 4.91 4.986 5.127 5.26 5.432 5.531 5.624 5.749 5.867 5.973 6.072 6.168 6.274 6.372 6.466 6.567 6.658 6.734 6.793 6.843 6.88 6.896 6.905 6.883 6.811 6.702 6.521 6.303 5.978 5.501 4.789 3.762 2.274 0.025 -3.649 -7.877 -11.172 -13.806 -16.0 -17.884 -19.448 -20.798 -21.932 -23.059 -24.011 -24.833 -25.59 -26.299 -26.949 -27.531 -28.151 -28.704 -29.163 -29.633 -30.108 -30.494 -30.896 -31.32 -31.649 -31.983 -32.32 -32.662 -33.026 -33.281 -33.536 -33.93 -34.205 -34.489 -34.631 -34.926 -35.238 -35.565 -35.737 -36.031 -36.308 -36.518 -36.735 -37.205 -37.455 -37.723 -38.022 -38.351 -38.743 -39.249 -40.641 -10 ,16727 ,KEBNE ,16721454,Sat Nov 27 14:51:28 CET,Sat Nov 27 16:28:14 CET,0.0 1.424 1.862 2.197 2.469 2.702 2.903 3.088 3.406 3.547 3.683 3.857 4.04 4.146 4.351 4.528 4.676 4.745 4.872 4.99 5.151 5.251 5.346 5.489 5.62 5.726 5.825 5.924 6.06 6.175 6.26 6.358 6.454 6.526 6.58 6.634 6.66 6.671 6.674 6.662 6.609 6.51 6.339 6.086 5.723 5.201 4.467 3.467 1.988 -0.268 -3.927 -8.11 -11.403 -14.089 -16.289 -18.166 -19.775 -21.183 -22.365 -23.543 -24.544 -25.394 -26.171 -26.893 -27.55 -28.137 -28.733 -29.26 -29.718 -30.192 -30.671 -31.063 -31.478 -31.903 -32.224 -32.555 -32.903 -33.258 -33.618 -33.864 -34.119 -34.52 -34.801 -35.086 -35.234 -35.545 -35.859 -36.195 -36.372 -36.665 -36.919 -37.113 -37.319 -37.783 -38.034 -38.297 -38.587 -38.915 -39.299 -39.793 -41.27 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_29.txt deleted file mode 100644 index d1636669..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29346 ,KEBNE ,16721455,Sat Nov 27 14:51:29 CET,Sat Nov 27 16:29:35 CET,0.0 1.317 1.714 2.001 2.241 2.445 2.61 2.744 2.982 3.087 3.181 3.25 3.409 3.477 3.596 3.686 3.752 3.78 3.825 3.866 3.906 3.924 3.94 3.951 3.954 3.939 3.908 3.867 3.802 3.727 3.641 3.509 3.363 3.208 3.014 2.776 2.524 2.213 1.834 1.404 0.915 0.321 -0.429 -1.302 -2.439 -3.854 -5.763 -8.209 -11.474 -16.019 -22.866 -30.172 -35.616 -39.873 -43.299 -46.168 -48.551 -50.614 -52.304 -53.942 -55.31 -56.48 -57.583 -58.601 -59.508 -60.309 -61.12 -61.824 -62.422 -63.037 -63.674 -64.182 -64.704 -65.247 -65.662 -66.087 -66.518 -66.958 -67.411 -67.728 -68.045 -68.517 -68.844 -69.197 -69.38 -69.753 -70.145 -70.551 -70.757 -71.122 -71.39 -71.629 -71.876 -72.377 -72.661 -72.973 -73.299 -73.651 -74.077 -74.631 -76.993 -2 ,2751 ,KEBNE ,16721456,Sat Nov 27 14:52:30 CET,Sat Nov 27 16:33:53 CET,0.0 1.337 1.731 2.011 2.209 2.382 2.534 2.667 2.878 2.952 3.018 3.06 3.2 3.246 3.331 3.387 3.427 3.447 3.474 3.487 3.504 3.506 3.502 3.485 3.448 3.405 3.358 3.302 3.218 3.121 3.02 2.89 2.736 2.564 2.356 2.09 1.802 1.481 1.116 0.684 0.167 -0.491 -1.351 -2.277 -3.433 -4.873 -6.782 -9.222 -12.504 -17.132 -24.047 -31.347 -36.754 -40.976 -44.358 -47.21 -49.561 -51.58 -53.253 -54.87 -56.213 -57.365 -58.431 -59.424 -60.327 -61.128 -61.936 -62.65 -63.256 -63.879 -64.532 -65.066 -65.61 -66.154 -66.567 -66.987 -67.422 -67.858 -68.307 -68.615 -68.93 -69.419 -69.752 -70.098 -70.28 -70.652 -71.022 -71.401 -71.59 -71.945 -72.204 -72.423 -72.645 -73.137 -73.42 -73.709 -74.016 -74.363 -74.74 -75.224 -76.484 -3 ,5813 ,KEBNE ,16721457,Sat Nov 27 14:52:29 CET,Sat Nov 27 16:30:06 CET,0.0 2.403 2.981 3.35 3.653 3.899 4.086 4.238 4.497 4.617 4.727 4.817 4.978 5.049 5.188 5.306 5.398 5.438 5.51 5.574 5.644 5.679 5.711 5.748 5.764 5.756 5.734 5.71 5.675 5.618 5.555 5.47 5.362 5.231 5.052 4.844 4.634 4.35 3.988 3.566 3.066 2.455 1.661 0.756 -0.395 -1.86 -3.772 -6.185 -9.43 -13.961 -20.821 -28.171 -33.612 -37.89 -41.335 -44.19 -46.58 -48.662 -50.362 -52.006 -53.387 -54.58 -55.685 -56.7 -57.618 -58.435 -59.273 -59.998 -60.602 -61.222 -61.851 -62.371 -62.914 -63.464 -63.877 -64.299 -64.73 -65.171 -65.628 -65.946 -66.268 -66.761 -67.103 -67.448 -67.624 -67.99 -68.372 -68.771 -68.975 -69.344 -69.6 -69.823 -70.065 -70.6 -70.886 -71.189 -71.513 -71.873 -72.291 -72.831 -74.338 -4 ,10690 ,KEBNE ,16721458,Sat Nov 27 14:53:31 CET,Sat Nov 27 16:31:20 CET,0.0 1.302 1.72 2.022 2.254 2.441 2.605 2.763 3.036 3.154 3.255 3.325 3.475 3.535 3.639 3.722 3.802 3.839 3.905 3.948 3.982 4.003 4.022 4.038 4.03 4.003 3.972 3.939 3.886 3.817 3.74 3.612 3.467 3.323 3.125 2.874 2.634 2.345 2.008 1.619 1.145 0.549 -0.249 -1.17 -2.345 -3.788 -5.655 -8.081 -11.354 -15.946 -22.879 -30.26 -35.721 -39.953 -43.34 -46.175 -48.519 -50.537 -52.212 -53.82 -55.148 -56.304 -57.372 -58.35 -59.234 -60.019 -60.826 -61.532 -62.134 -62.756 -63.402 -63.926 -64.45 -64.991 -65.407 -65.832 -66.268 -66.706 -67.153 -67.459 -67.768 -68.266 -68.61 -68.954 -69.128 -69.489 -69.866 -70.261 -70.47 -70.839 -71.106 -71.337 -71.578 -72.087 -72.369 -72.672 -73.002 -73.366 -73.794 -74.35 -75.836 -5 ,6149 ,KEBNE ,16721459,Sat Nov 27 14:53:31 CET,Sat Nov 27 16:36:17 CET,0.0 1.462 1.891 2.183 2.406 2.583 2.743 2.885 3.127 3.241 3.338 3.399 3.552 3.615 3.725 3.802 3.856 3.884 3.951 4.004 4.041 4.065 4.087 4.1 4.096 4.087 4.065 4.03 3.974 3.911 3.839 3.731 3.604 3.45 3.264 3.036 2.788 2.49 2.135 1.725 1.229 0.598 -0.214 -1.115 -2.25 -3.669 -5.557 -7.969 -11.2 -15.762 -22.656 -29.976 -35.43 -39.701 -43.128 -45.99 -48.352 -50.409 -52.109 -53.722 -55.068 -56.254 -57.34 -58.317 -59.206 -59.993 -60.805 -61.514 -62.104 -62.709 -63.339 -63.857 -64.388 -64.929 -65.341 -65.77 -66.202 -66.632 -67.075 -67.38 -67.694 -68.184 -68.521 -68.873 -69.052 -69.41 -69.773 -70.154 -70.353 -70.72 -70.996 -71.234 -71.484 -72.004 -72.281 -72.577 -72.899 -73.251 -73.658 -74.165 -75.363 -6 ,9024 ,KEBNE ,16721460,Sat Nov 27 14:53:31 CET,Sat Nov 27 16:32:46 CET,0.0 1.642 2.098 2.414 2.68 2.906 3.092 3.261 3.535 3.65 3.758 3.843 4.007 4.082 4.201 4.299 4.393 4.441 4.518 4.574 4.642 4.674 4.699 4.719 4.728 4.735 4.73 4.716 4.676 4.615 4.545 4.458 4.358 4.241 4.093 3.882 3.645 3.375 3.035 2.608 2.129 1.514 0.688 -0.237 -1.405 -2.828 -4.668 -7.066 -10.353 -14.906 -21.733 -29.024 -34.465 -38.747 -42.159 -45.055 -47.465 -49.517 -51.236 -52.893 -54.246 -55.433 -56.536 -57.536 -58.453 -59.282 -60.116 -60.846 -61.478 -62.124 -62.765 -63.282 -63.83 -64.395 -64.821 -65.247 -65.681 -66.125 -66.587 -66.903 -67.225 -67.726 -68.076 -68.443 -68.635 -69.022 -69.415 -69.829 -70.044 -70.426 -70.737 -70.986 -71.249 -71.808 -72.099 -72.406 -72.749 -73.127 -73.551 -74.07 -75.652 -7 ,30671 ,KEBNE ,16721461,Sat Nov 27 14:58:36 CET,Sat Nov 27 16:34:42 CET,0.0 1.522 1.963 2.286 2.533 2.727 2.893 3.039 3.279 3.38 3.464 3.513 3.672 3.742 3.855 3.938 4.001 4.029 4.089 4.142 4.197 4.217 4.234 4.241 4.239 4.229 4.206 4.172 4.11 4.038 3.956 3.833 3.705 3.585 3.424 3.204 2.969 2.677 2.325 1.912 1.425 0.819 0.005 -0.912 -2.054 -3.475 -5.323 -7.703 -10.987 -15.591 -22.521 -29.843 -35.275 -39.548 -42.968 -45.82 -48.213 -50.309 -52.044 -53.694 -55.06 -56.242 -57.34 -58.349 -59.262 -60.084 -60.904 -61.623 -62.243 -62.862 -63.494 -64.021 -64.564 -65.116 -65.533 -65.966 -66.42 -66.87 -67.325 -67.642 -67.977 -68.484 -68.822 -69.18 -69.365 -69.732 -70.113 -70.515 -70.727 -71.115 -71.447 -71.705 -71.97 -72.554 -72.877 -73.217 -73.569 -73.956 -74.408 -75.011 -76.676 -8 ,10123 ,KEBNE ,16721462,Sat Nov 27 14:58:36 CET,Sat Nov 27 16:34:59 CET,0.0 1.526 2.002 2.311 2.579 2.805 2.985 3.146 3.404 3.504 3.598 3.672 3.825 3.898 4.031 4.14 4.23 4.266 4.326 4.374 4.429 4.457 4.485 4.512 4.521 4.521 4.515 4.502 4.462 4.409 4.349 4.241 4.119 3.989 3.815 3.601 3.371 3.091 2.761 2.369 1.894 1.279 0.506 -0.349 -1.501 -2.963 -4.86 -7.289 -10.563 -15.097 -21.933 -29.246 -34.683 -38.975 -42.414 -45.302 -47.696 -49.766 -51.48 -53.125 -54.497 -55.685 -56.781 -57.791 -58.704 -59.532 -60.38 -61.1 -61.718 -62.365 -63.023 -63.554 -64.09 -64.634 -65.054 -65.485 -65.922 -66.359 -66.813 -67.131 -67.452 -67.944 -68.285 -68.636 -68.818 -69.19 -69.576 -69.971 -70.176 -70.557 -70.838 -71.061 -71.292 -71.799 -72.074 -72.38 -72.722 -73.105 -73.542 -74.075 -75.421 -9 ,5837 ,KEBNE ,16721463,Sat Nov 27 14:59:37 CET,Sat Nov 27 16:36:05 CET,0.0 1.308 1.724 2.037 2.282 2.46 2.612 2.746 2.994 3.105 3.201 3.276 3.429 3.484 3.586 3.676 3.747 3.776 3.822 3.859 3.91 3.942 3.958 3.959 3.949 3.932 3.909 3.881 3.838 3.792 3.742 3.647 3.525 3.396 3.239 3.037 2.794 2.494 2.164 1.764 1.266 0.661 -0.116 -0.988 -2.15 -3.618 -5.498 -7.942 -11.242 -15.762 -22.569 -29.845 -35.268 -39.512 -42.927 -45.825 -48.194 -50.232 -51.951 -53.618 -54.994 -56.173 -57.264 -58.269 -59.19 -60.011 -60.846 -61.58 -62.193 -62.813 -63.453 -63.974 -64.512 -65.077 -65.511 -65.951 -66.398 -66.854 -67.313 -67.62 -67.936 -68.436 -68.777 -69.119 -69.293 -69.652 -70.028 -70.412 -70.614 -70.99 -71.271 -71.499 -71.738 -72.268 -72.565 -72.878 -73.206 -73.582 -74.012 -74.55 -76.026 -10 ,30339 ,KEBNE ,16721464,Sat Nov 27 14:59:38 CET,Sat Nov 27 16:35:57 CET,0.0 1.349 1.768 2.054 2.278 2.467 2.619 2.75 2.986 3.084 3.17 3.232 3.384 3.448 3.557 3.644 3.714 3.745 3.816 3.877 3.934 3.953 3.959 3.962 3.968 3.963 3.941 3.923 3.893 3.836 3.753 3.634 3.501 3.359 3.184 2.953 2.696 2.397 2.04 1.614 1.117 0.5 -0.29 -1.177 -2.301 -3.698 -5.557 -7.965 -11.239 -15.813 -22.659 -29.989 -35.457 -39.727 -43.141 -46.013 -48.407 -50.461 -52.166 -53.818 -55.18 -56.361 -57.466 -58.464 -59.367 -60.179 -61.011 -61.742 -62.364 -62.997 -63.642 -64.164 -64.689 -65.237 -65.66 -66.086 -66.517 -66.961 -67.419 -67.727 -68.042 -68.546 -68.894 -69.246 -69.427 -69.803 -70.186 -70.578 -70.784 -71.164 -71.451 -71.686 -71.927 -72.439 -72.716 -73.012 -73.338 -73.712 -74.137 -74.647 -75.905 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_31.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_31.txt deleted file mode 100644 index 99c1f609..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_31.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12905 ,KEBNE ,17070473,Fri Dec 24 17:27:50 CET,Fri Dec 24 19:04:12 CET,0.0 2.859 3.486 3.983 4.38 4.736 5.054 5.352 5.904 6.147 6.374 6.724 7.021 7.223 7.615 7.992 8.363 8.539 8.866 9.184 9.635 9.93 10.22 10.629 11.034 11.45 11.863 12.248 12.744 13.232 13.694 14.247 14.8 15.352 15.982 16.677 17.367 18.138 18.964 19.845 20.774 21.825 23.052 24.284 25.768 27.495 29.519 31.846 34.671 38.069 42.328 46.042 48.268 49.707 50.72 51.483 52.02 52.372 52.618 52.8 52.885 52.957 53.008 53.017 53.002 52.967 52.916 52.851 52.775 52.676 52.559 52.459 52.346 52.218 52.114 52.001 51.874 51.732 51.577 51.469 51.349 51.133 50.966 50.783 50.689 50.499 50.302 50.078 49.945 49.767 49.507 49.34 49.159 48.769 48.548 48.271 47.961 47.601 47.168 46.539 44.303 -2 ,3147 ,KEBNE ,17070474,Fri Dec 24 17:27:50 CET,Fri Dec 24 19:05:59 CET,0.0 2.422 3.101 3.628 4.081 4.483 4.843 5.178 5.793 6.074 6.339 6.748 7.077 7.305 7.737 8.142 8.539 8.736 9.106 9.458 9.959 10.281 10.6 11.063 11.508 11.927 12.334 12.729 13.233 13.742 14.231 14.816 15.39 15.943 16.567 17.255 17.928 18.666 19.475 20.335 21.245 22.289 23.512 24.771 26.309 28.064 30.131 32.57 35.496 38.913 43.154 46.879 49.116 50.589 51.58 52.247 52.732 53.089 53.301 53.428 53.495 53.523 53.522 53.503 53.459 53.392 53.289 53.183 53.08 52.968 52.831 52.701 52.576 52.436 52.315 52.184 52.037 51.871 51.695 51.562 51.423 51.212 51.048 50.861 50.762 50.568 50.358 50.119 49.991 49.818 49.569 49.412 49.234 48.803 48.558 48.292 47.98 47.622 47.198 46.587 43.492 -3 ,17300 ,KEBNE ,17070475,Fri Dec 24 17:27:49 CET,Fri Dec 24 19:04:18 CET,0.0 2.081 2.72 3.201 3.598 3.953 4.281 4.588 5.134 5.392 5.64 6.02 6.33 6.534 6.939 7.321 7.671 7.844 8.188 8.522 8.995 9.304 9.605 10.035 10.45 10.85 11.237 11.613 12.09 12.564 13.038 13.606 14.163 14.703 15.344 16.076 16.77 17.537 18.36 19.24 20.191 21.286 22.549 23.827 25.338 27.027 29.053 31.439 34.287 37.647 41.792 45.443 47.71 49.204 50.218 50.946 51.407 51.691 51.906 52.071 52.142 52.168 52.18 52.165 52.123 52.076 52.009 51.936 51.859 51.741 51.6 51.487 51.36 51.215 51.092 50.949 50.803 50.654 50.487 50.375 50.258 50.053 49.903 49.746 49.663 49.479 49.268 49.027 48.9 48.729 48.474 48.319 48.151 47.762 47.544 47.291 46.964 46.616 46.225 45.588 42.324 -4 ,30078 ,KEBNE ,17070476,Fri Dec 24 17:27:49 CET,Fri Dec 24 19:03:49 CET,0.0 2.785 3.395 3.861 4.266 4.633 4.949 5.225 5.737 5.987 6.223 6.568 6.858 7.056 7.444 7.809 8.161 8.334 8.663 8.972 9.418 9.708 9.992 10.413 10.818 11.221 11.612 11.98 12.465 12.951 13.429 14.0 14.541 15.075 15.704 16.382 17.043 17.785 18.585 19.461 20.407 21.466 22.73 24.049 25.594 27.337 29.385 31.747 34.618 38.119 42.379 45.947 48.143 49.626 50.682 51.44 51.935 52.29 52.523 52.668 52.723 52.732 52.718 52.686 52.623 52.562 52.489 52.406 52.325 52.229 52.137 52.054 51.94 51.81 51.709 51.596 51.472 51.338 51.181 51.065 50.942 50.741 50.587 50.414 50.323 50.126 49.914 49.689 49.567 49.402 49.161 49.004 48.826 48.414 48.18 47.916 47.599 47.211 46.753 46.138 43.42 -5 ,24933 ,KEBNE ,17070477,Fri Dec 24 17:27:50 CET,Fri Dec 24 19:03:53 CET,0.0 1.752 2.348 2.789 3.135 3.452 3.771 4.057 4.533 4.764 4.981 5.288 5.572 5.762 6.131 6.475 6.819 6.993 7.319 7.63 8.072 8.363 8.644 9.041 9.436 9.837 10.237 10.615 11.097 11.577 12.053 12.623 13.163 13.678 14.276 14.946 15.598 16.341 17.151 18.026 18.964 20.018 21.253 22.513 23.995 25.687 27.698 29.985 32.76 36.184 40.372 43.948 46.173 47.649 48.622 49.303 49.776 50.118 50.307 50.417 50.485 50.525 50.534 50.499 50.445 50.399 50.341 50.259 50.178 50.067 49.934 49.822 49.691 49.539 49.413 49.279 49.135 48.973 48.774 48.635 48.506 48.289 48.122 47.944 47.85 47.663 47.463 47.246 47.131 46.965 46.714 46.538 46.347 45.935 45.71 45.461 45.143 44.76 44.296 43.651 41.228 -6 ,27122 ,KEBNE ,17070478,Fri Dec 24 17:27:51 CET,Fri Dec 24 19:00:02 CET,0.0 2.132 2.725 3.197 3.574 3.905 4.205 4.484 5.009 5.25 5.471 5.807 6.097 6.295 6.673 7.046 7.4 7.563 7.874 8.184 8.653 8.954 9.244 9.671 10.091 10.499 10.876 11.243 11.726 12.177 12.614 13.164 13.71 14.238 14.856 15.568 16.252 16.998 17.811 18.697 19.653 20.743 22.011 23.268 24.748 26.438 28.448 30.765 33.527 36.95 41.305 45.022 47.306 48.775 49.751 50.451 50.938 51.265 51.47 51.633 51.723 51.765 51.797 51.793 51.748 51.699 51.621 51.539 51.453 51.342 51.222 51.115 50.979 50.833 50.726 50.601 50.471 50.338 50.185 50.066 49.938 49.736 49.581 49.417 49.331 49.138 48.925 48.696 48.568 48.394 48.142 47.979 47.808 47.376 47.105 46.825 46.521 46.162 45.739 45.132 42.188 -7 ,25278 ,KEBNE ,17070479,Fri Dec 24 17:27:53 CET,Fri Dec 24 18:59:13 CET,0.0 2.045 2.621 3.073 3.461 3.8 4.107 4.402 4.955 5.212 5.448 5.789 6.079 6.276 6.677 7.05 7.402 7.579 7.922 8.234 8.681 8.981 9.275 9.705 10.112 10.489 10.863 11.244 11.739 12.223 12.69 13.227 13.741 14.254 14.85 15.537 16.202 16.921 17.748 18.647 19.581 20.65 21.92 23.193 24.706 26.441 28.462 30.817 33.61 37.007 41.4 45.113 47.366 48.857 49.846 50.548 51.043 51.407 51.644 51.798 51.865 51.908 51.945 51.929 51.877 51.83 51.757 51.675 51.604 51.524 51.425 51.335 51.233 51.108 51.007 50.903 50.775 50.616 50.444 50.321 50.19 49.98 49.831 49.661 49.568 49.368 49.151 48.925 48.794 48.606 48.347 48.191 48.027 47.678 47.454 47.196 46.903 46.535 46.097 45.455 42.204 -8 ,12637 ,KEBNE ,17070480,Fri Dec 24 17:27:50 CET,Fri Dec 24 19:03:59 CET,0.0 1.933 2.502 2.945 3.322 3.658 3.953 4.226 4.739 4.969 5.188 5.5 5.778 5.968 6.336 6.675 7.004 7.17 7.49 7.788 8.238 8.546 8.842 9.239 9.612 9.974 10.332 10.689 11.14 11.567 11.986 12.504 13.023 13.539 14.143 14.835 15.507 16.242 17.053 17.915 18.842 19.911 21.151 22.432 23.951 25.658 27.672 30.004 32.792 36.216 40.51 44.123 46.381 47.869 48.879 49.575 50.046 50.416 50.649 50.781 50.862 50.911 50.924 50.9 50.868 50.848 50.8 50.729 50.658 50.571 50.46 50.357 50.232 50.097 49.992 49.869 49.731 49.575 49.402 49.284 49.163 48.948 48.791 48.636 48.549 48.359 48.157 47.929 47.797 47.627 47.392 47.247 47.091 46.702 46.473 46.207 45.915 45.579 45.16 44.512 40.207 -9 ,21210 ,KEBNE ,17070481,Fri Dec 24 17:27:50 CET,Fri Dec 24 19:05:34 CET,0.0 1.955 2.535 2.966 3.346 3.671 3.959 4.232 4.734 4.972 5.207 5.543 5.833 6.018 6.373 6.703 7.017 7.171 7.48 7.778 8.202 8.479 8.753 9.151 9.538 9.918 10.282 10.625 11.065 11.492 11.911 12.433 12.939 13.438 14.025 14.675 15.303 16.018 16.805 17.644 18.527 19.547 20.846 22.242 23.829 25.531 27.526 29.848 32.624 35.99 40.308 44.052 46.246 47.651 48.601 49.278 49.748 50.068 50.265 50.39 50.457 50.491 50.505 50.479 50.433 50.384 50.311 50.233 50.134 50.007 49.868 49.758 49.651 49.515 49.404 49.288 49.145 48.983 48.809 48.688 48.553 48.345 48.191 48.006 47.917 47.738 47.524 47.293 47.174 47.009 46.761 46.601 46.425 46.017 45.781 45.518 45.212 44.851 44.433 43.796 41.74 -10 ,12903 ,KEBNE ,17070482,Fri Dec 24 17:27:49 CET,Fri Dec 24 19:03:48 CET,0.0 2.131 2.706 3.152 3.543 3.899 4.198 4.47 5.001 5.239 5.462 5.798 6.084 6.281 6.666 7.029 7.361 7.529 7.87 8.191 8.633 8.913 9.188 9.6 10.009 10.392 10.765 11.13 11.597 12.068 12.535 13.099 13.636 14.162 14.798 15.518 16.213 16.989 17.821 18.691 19.609 20.692 21.979 23.244 24.745 26.458 28.431 30.733 33.547 36.969 41.351 45.101 47.309 48.77 49.773 50.474 50.935 51.248 51.457 51.608 51.676 51.687 51.68 51.663 51.613 51.558 51.474 51.374 51.277 51.152 51.02 50.912 50.795 50.661 50.548 50.415 50.278 50.138 49.974 49.848 49.705 49.467 49.288 49.091 48.99 48.781 48.549 48.29 48.146 47.963 47.697 47.518 47.329 46.903 46.654 46.373 46.046 45.672 45.155 44.451 41.848 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_33.txt deleted file mode 100644 index 955dfb3e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_33.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1625 ,KEBNE ,16721465,Sat Nov 27 14:59:38 CET,Sat Nov 27 16:34:56 CET,0.0 1.908 2.452 2.882 3.235 3.539 3.815 4.08 4.561 4.789 5.016 5.349 5.638 5.832 6.204 6.57 6.923 7.086 7.401 7.713 8.171 8.471 8.761 9.172 9.574 9.975 10.372 10.755 11.246 11.736 12.217 12.798 13.36 13.919 14.587 15.362 16.127 16.956 17.856 18.848 19.928 21.193 22.714 24.297 26.215 28.403 31.002 34.083 37.9 42.692 49.047 54.872 58.606 61.207 63.121 64.628 65.745 66.547 67.151 67.691 68.083 68.406 68.678 68.889 69.052 69.162 69.239 69.29 69.322 69.345 69.348 69.339 69.314 69.27 69.222 69.146 69.072 68.995 68.901 68.827 68.742 68.59 68.476 68.361 68.295 68.154 67.99 67.782 67.667 67.532 67.291 67.138 66.965 66.569 66.341 66.095 65.803 65.44 65.015 64.381 60.924 -2 ,1425 ,KEBNE ,16721466,Sat Nov 27 14:59:37 CET,Sat Nov 27 16:35:19 CET,0.0 2.067 2.612 3.011 3.352 3.658 3.936 4.199 4.697 4.925 5.146 5.474 5.751 5.929 6.284 6.642 6.989 7.155 7.481 7.803 8.268 8.559 8.845 9.26 9.666 10.082 10.484 10.871 11.377 11.868 12.349 12.935 13.5 14.055 14.722 15.481 16.217 17.053 17.974 18.981 20.055 21.297 22.819 24.397 26.287 28.44 31.029 34.104 37.874 42.685 49.09 54.963 58.809 61.488 63.398 64.855 65.926 66.71 67.297 67.814 68.18 68.455 68.691 68.866 69.001 69.111 69.207 69.277 69.321 69.351 69.356 69.346 69.307 69.261 69.231 69.178 69.114 69.026 68.9 68.816 68.73 68.578 68.463 68.343 68.279 68.133 67.961 67.764 67.659 67.52 67.269 67.122 66.969 66.608 66.383 66.128 65.828 65.483 65.032 64.39 62.162 -3 ,10432 ,KEBNE ,16721467,Sat Nov 27 14:59:38 CET,Sat Nov 27 16:35:12 CET,0.0 1.94 2.483 2.9 3.241 3.548 3.846 4.126 4.611 4.835 5.045 5.358 5.653 5.851 6.23 6.589 6.938 7.105 7.433 7.746 8.194 8.496 8.79 9.211 9.623 10.031 10.419 10.797 11.294 11.772 12.254 12.842 13.413 13.966 14.615 15.372 16.116 16.938 17.823 18.81 19.898 21.143 22.625 24.182 26.078 28.28 30.929 34.029 37.817 42.613 48.924 54.623 58.362 61.044 62.968 64.387 65.436 66.277 66.923 67.473 67.853 68.141 68.399 68.582 68.705 68.803 68.894 68.953 68.995 69.037 69.052 69.024 68.967 68.901 68.844 68.776 68.695 68.607 68.514 68.443 68.367 68.226 68.11 67.984 67.911 67.756 67.587 67.399 67.296 67.163 66.908 66.753 66.596 66.224 65.977 65.717 65.446 65.105 64.672 64.068 61.544 -4 ,8019 ,KEBNE ,16721468,Sat Nov 27 14:59:38 CET,Sat Nov 27 16:35:15 CET,0.0 2.026 2.637 3.086 3.473 3.821 4.13 4.429 4.98 5.225 5.457 5.808 6.103 6.308 6.693 7.056 7.41 7.583 7.92 8.248 8.72 9.034 9.339 9.773 10.195 10.594 10.985 11.372 11.873 12.369 12.872 13.492 14.092 14.681 15.38 16.16 16.893 17.723 18.662 19.698 20.795 22.056 23.585 25.139 26.994 29.149 31.764 34.852 38.622 43.28 49.41 55.135 58.803 61.293 63.132 64.553 65.621 66.442 67.068 67.598 67.973 68.284 68.526 68.705 68.834 68.91 68.987 69.049 69.081 69.089 69.091 69.097 69.089 69.056 69.009 68.935 68.855 68.769 68.655 68.576 68.493 68.356 68.257 68.122 68.047 67.892 67.716 67.51 67.389 67.248 66.994 66.842 66.679 66.292 66.061 65.801 65.519 65.192 64.736 64.071 60.933 -5 ,14872 ,KEBNE ,16721469,Sat Nov 27 15:00:39 CET,Sat Nov 27 16:36:21 CET,0.0 1.62 2.159 2.583 2.947 3.258 3.546 3.82 4.313 4.545 4.781 5.131 5.421 5.628 6.036 6.421 6.791 6.967 7.309 7.641 8.122 8.427 8.725 9.159 9.568 9.97 10.365 10.751 11.269 11.79 12.298 12.906 13.499 14.082 14.758 15.531 16.29 17.151 18.108 19.117 20.201 21.481 23.011 24.581 26.467 28.645 31.265 34.363 38.148 42.891 49.133 54.934 58.758 61.381 63.25 64.677 65.74 66.569 67.216 67.759 68.134 68.428 68.68 68.891 69.052 69.174 69.27 69.326 69.35 69.36 69.364 69.363 69.347 69.296 69.245 69.194 69.122 69.026 68.923 68.847 68.758 68.59 68.463 68.328 68.256 68.101 67.922 67.716 67.609 67.475 67.224 67.072 66.904 66.516 66.293 66.068 65.788 65.415 64.926 64.242 61.711 -6 ,25245 ,KEBNE ,16721470,Sat Nov 27 15:00:39 CET,Sat Nov 27 16:36:22 CET,0.0 1.987 2.569 2.994 3.339 3.639 3.916 4.179 4.658 4.884 5.104 5.435 5.731 5.934 6.324 6.687 7.032 7.194 7.504 7.817 8.282 8.577 8.863 9.29 9.712 10.123 10.539 10.94 11.445 11.947 12.44 13.041 13.637 14.212 14.883 15.67 16.442 17.296 18.227 19.23 20.311 21.572 23.084 24.635 26.507 28.673 31.243 34.309 38.141 42.944 49.267 54.911 58.55 61.103 62.943 64.33 65.357 66.167 66.778 67.282 67.655 67.963 68.215 68.399 68.541 68.656 68.745 68.801 68.832 68.844 68.843 68.83 68.794 68.724 68.673 68.626 68.559 68.477 68.375 68.302 68.229 68.094 67.98 67.849 67.779 67.621 67.441 67.232 67.119 66.984 66.735 66.582 66.418 66.038 65.808 65.545 65.234 64.86 64.391 63.742 60.88 -7 ,31087 ,KEBNE ,16721471,Sat Nov 27 15:00:39 CET,Sat Nov 27 16:36:21 CET,0.0 1.652 2.17 2.579 2.934 3.241 3.513 3.771 4.255 4.479 4.693 5.01 5.294 5.491 5.864 6.217 6.562 6.734 7.069 7.381 7.842 8.147 8.435 8.861 9.276 9.67 10.056 10.437 10.935 11.428 11.917 12.506 13.073 13.626 14.282 15.049 15.794 16.611 17.526 18.546 19.633 20.891 22.421 23.995 25.883 28.065 30.664 33.732 37.552 42.327 48.588 54.481 58.362 61.002 62.912 64.398 65.508 66.356 66.98 67.512 67.897 68.172 68.396 68.561 68.666 68.748 68.812 68.854 68.883 68.908 68.912 68.901 68.88 68.838 68.796 68.731 68.656 68.584 68.497 68.419 68.331 68.191 68.083 67.961 67.892 67.736 67.565 67.355 67.234 67.092 66.83 66.672 66.504 66.153 65.949 65.705 65.447 65.125 64.662 63.952 60.584 -8 ,24899 ,KEBNE ,16721472,Sat Nov 27 15:01:40 CET,Sat Nov 27 16:37:12 CET,0.0 1.939 2.477 2.884 3.225 3.537 3.841 4.122 4.631 4.87 5.098 5.436 5.723 5.908 6.261 6.608 6.951 7.12 7.444 7.767 8.241 8.529 8.813 9.241 9.648 10.059 10.473 10.876 11.421 11.938 12.425 13.026 13.628 14.211 14.886 15.672 16.434 17.273 18.195 19.206 20.287 21.527 23.02 24.562 26.399 28.526 31.103 34.124 37.823 42.473 48.621 54.268 57.923 60.473 62.307 63.64 64.647 65.447 66.036 66.55 66.966 67.299 67.571 67.798 67.963 68.08 68.175 68.254 68.296 68.295 68.288 68.278 68.249 68.207 68.17 68.12 68.062 67.989 67.874 67.786 67.698 67.551 67.45 67.338 67.27 67.107 66.925 66.73 66.624 66.495 66.266 66.127 65.974 65.622 65.403 65.157 64.875 64.544 64.119 63.444 60.721 -9 ,21992 ,KEBNE ,16721473,Sat Nov 27 15:01:40 CET,Sat Nov 27 16:38:03 CET,0.0 1.862 2.427 2.842 3.201 3.525 3.817 4.081 4.576 4.813 5.046 5.387 5.675 5.869 6.246 6.596 6.93 7.094 7.414 7.723 8.172 8.461 8.743 9.158 9.566 9.963 10.357 10.743 11.234 11.717 12.184 12.752 13.312 13.871 14.544 15.334 16.09 16.908 17.814 18.8 19.873 21.121 22.609 24.159 26.035 28.187 30.797 33.939 37.784 42.596 48.972 54.747 58.5 61.102 63.014 64.509 65.641 66.495 67.103 67.648 68.042 68.341 68.575 68.778 68.964 69.085 69.16 69.211 69.247 69.272 69.269 69.258 69.253 69.239 69.213 69.169 69.12 69.06 68.98 68.916 68.84 68.699 68.601 68.5 68.433 68.265 68.096 67.922 67.827 67.712 67.477 67.327 67.174 66.826 66.615 66.363 66.069 65.723 65.304 64.729 61.1 -10 ,22010 ,KEBNE ,16721474,Sat Nov 27 15:01:40 CET,Sat Nov 27 16:38:09 CET,0.0 1.978 2.554 2.976 3.327 3.641 3.927 4.188 4.666 4.888 5.105 5.433 5.722 5.917 6.292 6.655 6.994 7.158 7.479 7.789 8.24 8.525 8.804 9.22 9.634 10.04 10.436 10.83 11.34 11.83 12.316 12.917 13.501 14.076 14.754 15.526 16.296 17.16 18.091 19.099 20.173 21.426 22.962 24.532 26.403 28.592 31.215 34.275 37.973 42.704 49.125 54.945 58.609 61.112 62.948 64.356 65.367 66.149 66.747 67.26 67.631 67.904 68.141 68.338 68.489 68.594 68.672 68.717 68.733 68.749 68.764 68.751 68.714 68.644 68.581 68.53 68.473 68.393 68.295 68.22 68.132 67.994 67.877 67.739 67.666 67.515 67.362 67.176 67.069 66.939 66.711 66.555 66.371 65.981 65.769 65.512 65.209 64.859 64.463 63.925 61.182 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_34.txt deleted file mode 100644 index c6ed9643..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_34.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4970 ,KEBNE ,16721475,Sat Nov 27 15:01:40 CET,Sat Nov 27 16:37:35 CET,0.0 1.665 2.159 2.557 2.888 3.163 3.418 3.658 4.09 4.288 4.471 4.717 4.962 5.117 5.423 5.704 5.967 6.097 6.351 6.599 6.95 7.167 7.384 7.696 7.988 8.271 8.55 8.818 9.151 9.466 9.763 10.131 10.5 10.86 11.278 11.75 12.217 12.722 13.249 13.794 14.378 15.059 15.823 16.568 17.433 18.402 19.508 20.691 21.964 23.322 24.756 25.65 25.929 25.91 25.741 25.459 25.168 24.876 24.566 24.243 23.97 23.714 23.424 23.123 22.834 22.554 22.264 22.001 21.78 21.539 21.259 21.025 20.787 20.54 20.333 20.12 19.913 19.678 19.427 19.257 19.078 18.799 18.593 18.373 18.259 18.008 17.749 17.465 17.304 17.07 16.812 16.618 16.408 15.981 15.742 15.468 15.158 14.78 14.324 13.734 11.47 -2 ,18033 ,KEBNE ,16721476,Sat Nov 27 15:01:40 CET,Sat Nov 27 16:37:41 CET,0.0 1.646 2.141 2.523 2.862 3.154 3.404 3.641 4.087 4.289 4.487 4.76 5.018 5.179 5.477 5.744 6.006 6.138 6.395 6.64 6.976 7.179 7.383 7.693 7.982 8.267 8.546 8.803 9.136 9.474 9.795 10.167 10.532 10.886 11.304 11.786 12.242 12.734 13.27 13.823 14.397 15.06 15.843 16.594 17.445 18.392 19.422 20.504 21.741 23.171 24.609 25.467 25.821 25.86 25.67 25.413 25.153 24.873 24.579 24.23 23.918 23.634 23.357 23.065 22.757 22.477 22.179 21.899 21.655 21.404 21.13 20.899 20.654 20.394 20.189 19.981 19.761 19.515 19.257 19.082 18.903 18.61 18.4 18.173 18.058 17.822 17.557 17.274 17.124 16.884 16.61 16.434 16.245 15.809 15.555 15.263 14.934 14.55 14.063 13.398 10.433 -3 ,1261 ,KEBNE ,16721477,Sat Nov 27 15:01:40 CET,Sat Nov 27 16:37:18 CET,0.0 1.51 2.012 2.389 2.705 2.988 3.245 3.482 3.894 4.075 4.251 4.509 4.765 4.924 5.219 5.506 5.794 5.931 6.186 6.424 6.767 6.992 7.211 7.535 7.843 8.134 8.425 8.699 9.052 9.402 9.743 10.134 10.506 10.876 11.309 11.795 12.275 12.785 13.278 13.807 14.394 15.045 15.767 16.495 17.348 18.29 19.328 20.444 21.726 23.1 24.506 25.313 25.526 25.483 25.327 25.088 24.788 24.488 24.204 23.864 23.55 23.249 22.957 22.688 22.428 22.178 21.889 21.619 21.384 21.14 20.886 20.665 20.427 20.177 19.979 19.772 19.56 19.34 19.106 18.935 18.753 18.47 18.262 18.032 17.918 17.676 17.422 17.148 16.992 16.761 16.506 16.32 16.119 15.682 15.422 15.126 14.788 14.397 13.925 13.266 11.358 -4 ,32280 ,KEBNE ,16721478,Sat Nov 27 15:02:41 CET,Sat Nov 27 16:38:05 CET,0.0 1.455 1.969 2.349 2.672 2.96 3.22 3.459 3.878 4.054 4.226 4.481 4.735 4.893 5.188 5.464 5.733 5.862 6.112 6.354 6.691 6.903 7.1 7.4 7.691 7.968 8.247 8.529 8.894 9.23 9.559 9.966 10.341 10.691 11.111 11.596 12.038 12.523 13.061 13.632 14.208 14.848 15.622 16.392 17.225 18.098 19.111 20.224 21.489 22.891 24.291 25.143 25.451 25.474 25.343 25.141 24.898 24.63 24.381 24.095 23.807 23.529 23.252 22.976 22.708 22.457 22.189 21.941 21.718 21.481 21.228 21.013 20.785 20.54 20.351 20.147 19.927 19.693 19.432 19.255 19.073 18.771 18.564 18.352 18.235 17.973 17.694 17.41 17.261 17.031 16.752 16.56 16.363 15.903 15.636 15.342 15.019 14.648 14.202 13.605 11.3 -5 ,1265 ,KEBNE ,16721479,Sat Nov 27 15:02:41 CET,Sat Nov 27 16:38:28 CET,0.0 1.532 2.044 2.44 2.779 3.082 3.341 3.575 3.999 4.197 4.386 4.646 4.905 5.069 5.374 5.663 5.934 6.064 6.319 6.557 6.891 7.111 7.328 7.642 7.936 8.212 8.481 8.738 9.062 9.374 9.695 10.086 10.451 10.804 11.208 11.663 12.08 12.54 13.081 13.648 14.209 14.84 15.593 16.336 17.181 18.123 19.175 20.309 21.6 23.031 24.542 25.425 25.707 25.678 25.541 25.339 25.087 24.818 24.537 24.222 23.946 23.698 23.43 23.164 22.902 22.641 22.369 22.118 21.885 21.633 21.374 21.152 20.912 20.647 20.443 20.242 20.026 19.796 19.549 19.377 19.206 18.931 18.724 18.505 18.391 18.144 17.884 17.607 17.45 17.214 16.934 16.735 16.541 16.123 15.88 15.601 15.292 14.934 14.462 13.805 11.625 -6 ,27364 ,KEBNE ,16721480,Sat Nov 27 15:02:41 CET,Sat Nov 27 16:38:15 CET,0.0 1.733 2.243 2.644 2.98 3.277 3.544 3.782 4.193 4.383 4.567 4.813 5.067 5.234 5.537 5.827 6.115 6.253 6.52 6.785 7.154 7.388 7.614 7.943 8.27 8.58 8.873 9.148 9.501 9.836 10.155 10.537 10.89 11.237 11.651 12.118 12.596 13.113 13.651 14.212 14.789 15.429 16.192 16.962 17.814 18.747 19.807 20.908 22.085 23.415 24.87 25.796 26.071 26.075 25.958 25.745 25.442 25.131 24.842 24.518 24.221 23.941 23.667 23.393 23.121 22.84 22.537 22.264 22.017 21.767 21.507 21.281 21.045 20.811 20.623 20.422 20.213 19.995 19.763 19.595 19.415 19.116 18.896 18.668 18.556 18.324 18.063 17.787 17.644 17.415 17.138 16.942 16.739 16.285 16.016 15.724 15.397 15.023 14.55 13.907 11.478 -7 ,16305 ,KEBNE ,16721481,Sat Nov 27 15:02:41 CET,Sat Nov 27 16:38:20 CET,0.0 1.745 2.346 2.784 3.143 3.455 3.738 4.009 4.488 4.699 4.901 5.203 5.472 5.646 5.959 6.246 6.522 6.656 6.915 7.181 7.568 7.801 8.025 8.346 8.649 8.962 9.263 9.53 9.873 10.216 10.551 10.96 11.34 11.704 12.116 12.572 13.019 13.489 14.001 14.548 15.103 15.741 16.494 17.246 18.1 19.031 20.066 21.171 22.442 23.873 25.364 26.343 26.622 26.587 26.436 26.227 25.976 25.678 25.392 25.065 24.761 24.476 24.187 23.898 23.597 23.313 23.014 22.731 22.483 22.217 21.928 21.682 21.446 21.204 20.989 20.76 20.527 20.294 20.044 19.86 19.673 19.375 19.16 18.935 18.819 18.579 18.309 18.021 17.88 17.655 17.37 17.187 16.993 16.548 16.288 16.002 15.689 15.316 14.883 14.261 10.912 -8 ,6545 ,KEBNE ,16721482,Sat Nov 27 15:02:41 CET,Sat Nov 27 16:38:27 CET,0.0 2.237 2.827 3.24 3.578 3.894 4.178 4.439 4.914 5.12 5.307 5.578 5.848 6.031 6.377 6.687 6.963 7.096 7.364 7.617 7.974 8.21 8.433 8.752 9.053 9.349 9.632 9.904 10.271 10.611 10.941 11.353 11.749 12.125 12.561 13.033 13.483 13.993 14.526 15.074 15.644 16.292 17.058 17.815 18.675 19.573 20.57 21.717 23.009 24.389 25.86 26.662 26.863 26.877 26.762 26.524 26.235 25.902 25.597 25.279 24.95 24.633 24.34 24.054 23.763 23.498 23.209 22.937 22.698 22.448 22.187 21.958 21.714 21.459 21.26 21.062 20.851 20.618 20.369 20.19 20.007 19.731 19.539 19.325 19.207 18.954 18.689 18.4 18.248 18.024 17.772 17.594 17.399 16.926 16.644 16.347 16.043 15.67 15.202 14.587 12.485 -9 ,30503 ,KEBNE ,16721483,Sat Nov 27 15:02:41 CET,Sat Nov 27 16:39:29 CET,0.0 1.818 2.333 2.733 3.068 3.359 3.627 3.872 4.306 4.519 4.726 5.016 5.28 5.444 5.759 6.068 6.356 6.495 6.763 7.033 7.407 7.634 7.861 8.187 8.504 8.816 9.103 9.378 9.736 10.075 10.402 10.799 11.181 11.562 11.999 12.479 12.943 13.429 13.944 14.485 15.056 15.713 16.497 17.283 18.158 19.094 20.17 21.382 22.732 24.199 25.663 26.588 26.899 26.859 26.71 26.486 26.187 25.87 25.57 25.268 25.006 24.754 24.494 24.223 23.966 23.721 23.45 23.195 22.968 22.74 22.497 22.288 22.061 21.811 21.616 21.413 21.186 20.941 20.694 20.521 20.325 20.024 19.815 19.59 19.477 19.239 18.983 18.716 18.573 18.341 18.058 17.871 17.684 17.25 16.992 16.713 16.392 16.012 15.54 14.87 12.538 -10 ,3410 ,KEBNE ,16721484,Sat Nov 27 15:02:41 CET,Sat Nov 27 16:39:10 CET,0.0 1.606 2.074 2.438 2.752 3.031 3.28 3.524 3.972 4.163 4.347 4.599 4.847 5.005 5.299 5.592 5.881 6.017 6.276 6.528 6.881 7.101 7.315 7.622 7.917 8.192 8.453 8.72 9.088 9.424 9.737 10.139 10.521 10.882 11.296 11.763 12.22 12.72 13.249 13.793 14.385 15.062 15.832 16.604 17.491 18.417 19.41 20.524 21.807 23.128 24.458 25.308 25.571 25.538 25.364 25.13 24.874 24.602 24.299 23.937 23.613 23.325 23.042 22.768 22.498 22.23 21.942 21.675 21.438 21.192 20.926 20.699 20.449 20.18 19.979 19.764 19.547 19.316 19.048 18.87 18.687 18.403 18.206 17.979 17.862 17.617 17.344 17.057 16.901 16.659 16.369 16.175 15.966 15.507 15.248 14.944 14.588 14.166 13.644 12.89 10.293 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_49.txt deleted file mode 100644 index 879612d6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23045 ,KEBNE ,16721485,Sat Nov 27 15:02:41 CET,Sat Nov 27 16:37:52 CET,0.0 1.291 1.812 2.194 2.524 2.817 3.068 3.282 3.67 3.846 3.996 4.186 4.403 4.528 4.758 4.97 5.166 5.255 5.432 5.59 5.81 5.954 6.096 6.31 6.509 6.683 6.828 6.954 7.111 7.266 7.419 7.598 7.77 7.919 8.075 8.249 8.405 8.559 8.69 8.814 8.93 9.034 9.138 9.204 9.242 9.23 9.128 8.867 8.348 7.474 5.921 3.918 2.171 0.634 -0.684 -1.827 -2.829 -3.757 -4.549 -5.338 -6.03 -6.661 -7.244 -7.796 -8.32 -8.803 -9.308 -9.745 -10.139 -10.564 -11.014 -11.395 -11.784 -12.194 -12.504 -12.831 -13.178 -13.528 -13.889 -14.145 -14.422 -14.861 -15.168 -15.484 -15.64 -15.968 -16.336 -16.735 -16.947 -17.282 -17.664 -17.918 -18.187 -18.785 -19.13 -19.497 -19.889 -20.39 -21.032 -21.832 -24.495 -2 ,20990 ,KEBNE ,16721486,Sat Nov 27 15:02:41 CET,Sat Nov 27 16:38:54 CET,0.0 1.51 2.031 2.39 2.677 2.921 3.146 3.344 3.69 3.849 3.999 4.19 4.401 4.525 4.758 4.957 5.141 5.227 5.395 5.552 5.765 5.896 6.022 6.207 6.382 6.542 6.69 6.832 7.009 7.167 7.296 7.455 7.631 7.788 7.946 8.115 8.265 8.409 8.546 8.667 8.787 8.903 8.995 9.055 9.079 9.051 8.922 8.655 8.143 7.243 5.707 3.737 2.042 0.567 -0.714 -1.833 -2.818 -3.733 -4.533 -5.348 -6.054 -6.659 -7.227 -7.779 -8.297 -8.756 -9.246 -9.697 -10.103 -10.525 -10.959 -11.32 -11.685 -12.077 -12.394 -12.724 -13.068 -13.418 -13.759 -14.005 -14.279 -14.708 -15.007 -15.334 -15.497 -15.842 -16.238 -16.642 -16.85 -17.183 -17.53 -17.76 -18.014 -18.585 -18.903 -19.24 -19.607 -20.053 -20.59 -21.315 -23.819 -3 ,15849 ,KEBNE ,16721487,Sat Nov 27 15:02:41 CET,Sat Nov 27 16:37:44 CET,0.0 1.299 1.879 2.294 2.611 2.883 3.147 3.397 3.823 3.997 4.153 4.347 4.566 4.695 4.946 5.166 5.361 5.451 5.613 5.773 6.004 6.141 6.278 6.472 6.634 6.788 6.93 7.057 7.213 7.361 7.501 7.665 7.819 7.963 8.121 8.296 8.46 8.605 8.75 8.891 9.012 9.13 9.216 9.267 9.277 9.212 9.073 8.797 8.274 7.407 5.841 3.797 2.067 0.614 -0.631 -1.78 -2.798 -3.707 -4.488 -5.259 -5.93 -6.554 -7.156 -7.718 -8.242 -8.72 -9.242 -9.717 -10.112 -10.525 -10.954 -11.323 -11.709 -12.106 -12.418 -12.729 -13.056 -13.418 -13.787 -14.029 -14.282 -14.711 -15.021 -15.345 -15.509 -15.847 -16.215 -16.616 -16.827 -17.157 -17.517 -17.763 -18.021 -18.601 -18.938 -19.292 -19.692 -20.174 -20.739 -21.534 -24.717 -4 ,14081 ,KEBNE ,16721488,Sat Nov 27 15:02:42 CET,Sat Nov 27 16:38:48 CET,0.0 1.24 1.698 2.044 2.328 2.576 2.807 3.013 3.404 3.579 3.727 3.903 4.115 4.231 4.447 4.662 4.857 4.952 5.129 5.281 5.5 5.643 5.775 5.952 6.111 6.263 6.405 6.534 6.701 6.85 6.978 7.143 7.295 7.418 7.559 7.713 7.847 7.98 8.11 8.244 8.376 8.498 8.604 8.66 8.666 8.647 8.525 8.243 7.777 6.924 5.336 3.355 1.656 0.193 -1.048 -2.16 -3.147 -4.069 -4.873 -5.666 -6.345 -6.97 -7.569 -8.127 -8.649 -9.129 -9.625 -10.066 -10.45 -10.862 -11.295 -11.662 -12.062 -12.475 -12.803 -13.142 -13.475 -13.81 -14.159 -14.399 -14.65 -15.038 -15.313 -15.641 -15.814 -16.155 -16.524 -16.932 -17.15 -17.472 -17.818 -18.072 -18.348 -18.922 -19.253 -19.641 -20.072 -20.567 -21.147 -21.939 -24.756 -5 ,11156 ,KEBNE ,16721489,Sat Nov 27 15:02:41 CET,Sat Nov 27 16:38:45 CET,0.0 1.073 1.549 1.923 2.221 2.468 2.686 2.892 3.265 3.42 3.561 3.744 3.955 4.072 4.286 4.491 4.696 4.791 4.964 5.116 5.328 5.469 5.607 5.802 5.973 6.14 6.306 6.458 6.645 6.82 6.98 7.163 7.324 7.466 7.618 7.781 7.933 8.093 8.246 8.394 8.538 8.659 8.753 8.818 8.838 8.788 8.661 8.394 7.927 7.105 5.541 3.57 1.845 0.294 -1.03 -2.206 -3.222 -4.116 -4.897 -5.726 -6.448 -7.054 -7.634 -8.208 -8.73 -9.199 -9.699 -10.154 -10.556 -10.966 -11.379 -11.716 -12.064 -12.432 -12.725 -13.04 -13.4 -13.773 -14.151 -14.419 -14.683 -15.075 -15.373 -15.706 -15.874 -16.2 -16.541 -16.922 -17.128 -17.452 -17.804 -18.062 -18.344 -18.938 -19.27 -19.642 -20.055 -20.521 -21.125 -22.006 -24.814 -6 ,23647 ,KEBNE ,16721490,Sat Nov 27 15:02:41 CET,Sat Nov 27 16:38:14 CET,0.0 1.422 1.888 2.228 2.529 2.823 3.073 3.284 3.646 3.799 3.944 4.128 4.349 4.473 4.699 4.91 5.1 5.186 5.362 5.536 5.784 5.939 6.078 6.266 6.44 6.592 6.737 6.884 7.07 7.232 7.368 7.545 7.712 7.853 8.006 8.158 8.296 8.443 8.598 8.741 8.879 9.013 9.122 9.202 9.226 9.182 9.029 8.733 8.282 7.494 5.937 3.955 2.297 0.845 -0.431 -1.592 -2.592 -3.47 -4.271 -5.073 -5.734 -6.333 -6.922 -7.481 -7.994 -8.475 -8.977 -9.432 -9.823 -10.231 -10.683 -11.048 -11.428 -11.837 -12.149 -12.485 -12.838 -13.185 -13.549 -13.809 -14.075 -14.487 -14.776 -15.081 -15.24 -15.58 -15.956 -16.35 -16.559 -16.884 -17.261 -17.515 -17.77 -18.345 -18.681 -19.047 -19.455 -19.941 -20.479 -21.219 -24.229 -7 ,4523 ,KEBNE ,16721491,Sat Nov 27 15:03:41 CET,Sat Nov 27 16:38:43 CET,0.0 1.019 1.481 1.83 2.127 2.367 2.579 2.766 3.129 3.303 3.462 3.65 3.856 3.969 4.184 4.388 4.584 4.68 4.86 5.017 5.232 5.375 5.511 5.694 5.86 6.025 6.172 6.304 6.477 6.645 6.794 6.952 7.101 7.23 7.375 7.547 7.699 7.842 7.973 8.101 8.225 8.331 8.411 8.472 8.515 8.497 8.41 8.169 7.674 6.809 5.234 3.188 1.445 -0.037 -1.355 -2.508 -3.49 -4.388 -5.152 -5.889 -6.539 -7.144 -7.736 -8.306 -8.826 -9.296 -9.805 -10.272 -10.684 -11.122 -11.56 -11.908 -12.275 -12.681 -12.992 -13.301 -13.631 -13.978 -14.338 -14.584 -14.85 -15.274 -15.569 -15.876 -16.037 -16.387 -16.749 -17.13 -17.339 -17.66 -18.003 -18.249 -18.517 -19.11 -19.457 -19.849 -20.273 -20.751 -21.401 -22.32 -26.089 -8 ,1137 ,KEBNE ,16721492,Sat Nov 27 15:03:42 CET,Sat Nov 27 16:38:54 CET,0.0 1.325 1.854 2.196 2.488 2.733 2.946 3.149 3.538 3.717 3.881 4.077 4.286 4.409 4.645 4.867 5.077 5.176 5.364 5.534 5.772 5.922 6.06 6.251 6.435 6.609 6.759 6.898 7.067 7.221 7.394 7.6 7.769 7.925 8.1 8.276 8.431 8.594 8.75 8.894 9.02 9.134 9.224 9.287 9.325 9.285 9.173 8.925 8.454 7.596 5.987 3.929 2.173 0.667 -0.662 -1.816 -2.801 -3.711 -4.509 -5.299 -5.967 -6.566 -7.157 -7.748 -8.277 -8.751 -9.253 -9.698 -10.081 -10.48 -10.922 -11.303 -11.695 -12.085 -12.383 -12.696 -13.026 -13.38 -13.739 -13.988 -14.257 -14.688 -14.992 -15.296 -15.458 -15.804 -16.169 -16.577 -16.79 -17.127 -17.509 -17.759 -18.023 -18.625 -18.958 -19.315 -19.712 -20.182 -20.809 -21.709 -24.827 -9 ,27906 ,KEBNE ,16721493,Sat Nov 27 15:03:42 CET,Sat Nov 27 16:38:46 CET,0.0 1.181 1.641 1.999 2.3 2.557 2.779 2.974 3.324 3.483 3.625 3.808 4.02 4.139 4.369 4.582 4.782 4.872 5.038 5.195 5.431 5.589 5.729 5.904 6.058 6.208 6.352 6.496 6.687 6.849 6.988 7.155 7.31 7.45 7.602 7.76 7.891 8.031 8.174 8.296 8.401 8.491 8.576 8.638 8.687 8.668 8.554 8.35 7.929 7.131 5.559 3.448 1.695 0.231 -1.028 -2.14 -3.123 -4.048 -4.849 -5.636 -6.318 -6.931 -7.514 -8.072 -8.574 -9.041 -9.549 -9.992 -10.379 -10.797 -11.247 -11.609 -11.985 -12.403 -12.724 -13.039 -13.372 -13.725 -14.079 -14.329 -14.599 -15.042 -15.348 -15.655 -15.816 -16.148 -16.517 -16.929 -17.141 -17.469 -17.854 -18.121 -18.395 -19.011 -19.362 -19.742 -20.148 -20.601 -21.153 -21.947 -25.245 -10 ,15500 ,KEBNE ,16721494,Sat Nov 27 15:04:43 CET,Sat Nov 27 16:41:11 CET,0.0 1.305 1.81 2.169 2.448 2.687 2.894 3.077 3.405 3.553 3.694 3.875 4.078 4.189 4.392 4.588 4.77 4.855 5.025 5.189 5.405 5.537 5.669 5.855 6.026 6.176 6.309 6.433 6.58 6.721 6.864 7.023 7.162 7.301 7.464 7.625 7.752 7.879 8.014 8.145 8.262 8.366 8.455 8.512 8.543 8.543 8.471 8.234 7.746 6.868 5.289 3.294 1.522 0.07 -1.155 -2.272 -3.24 -4.101 -4.851 -5.621 -6.311 -6.936 -7.482 -7.973 -8.448 -8.893 -9.35 -9.783 -10.189 -10.589 -10.98 -11.31 -11.67 -12.044 -12.344 -12.669 -12.999 -13.338 -13.686 -13.929 -14.194 -14.627 -14.927 -15.232 -15.402 -15.754 -16.108 -16.498 -16.709 -17.032 -17.374 -17.626 -17.89 -18.48 -18.825 -19.194 -19.59 -20.057 -20.617 -21.296 -24.064 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_62.txt deleted file mode 100644 index dde79f72..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_62.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,10249 ,KEBNE ,17025817,Wed Dec 22 13:23:59 CET,Wed Dec 22 15:00:24 CET,0.0 1.416 1.92 2.314 2.635 2.914 3.171 3.4 3.797 3.977 4.151 4.399 4.647 4.797 5.065 5.324 5.575 5.694 5.918 6.133 6.444 6.636 6.814 7.076 7.328 7.558 7.776 7.982 8.238 8.494 8.753 9.067 9.36 9.644 9.976 10.339 10.672 11.034 11.424 11.817 12.226 12.702 13.247 13.784 14.392 15.042 15.788 16.591 17.473 18.499 19.555 20.171 20.333 20.291 20.148 19.903 19.623 19.357 19.108 18.802 18.505 18.248 18.001 17.759 17.505 17.262 16.998 16.744 16.521 16.279 16.024 15.808 15.581 15.335 15.135 14.929 14.711 14.486 14.249 14.076 13.888 13.587 13.373 13.148 13.029 12.785 12.534 12.254 12.102 11.865 11.584 11.384 11.169 10.709 10.445 10.153 9.816 9.411 8.921 8.241 6.163 -4 ,17095 ,KEBNE ,17026085,Wed Dec 22 13:50:41 CET,Wed Dec 22 15:02:10 CET,0.0 1.234 1.701 2.099 2.457 2.748 2.995 3.225 3.635 3.823 4.002 4.249 4.492 4.65 4.952 5.212 5.455 5.575 5.802 6.017 6.316 6.508 6.693 6.967 7.238 7.488 7.726 7.958 8.253 8.528 8.775 9.07 9.362 9.638 9.947 10.285 10.604 10.964 11.357 11.784 12.219 12.675 13.211 13.735 14.332 14.99 15.71 16.532 17.484 18.477 19.436 19.931 20.023 19.95 19.819 19.605 19.326 19.023 18.746 18.46 18.181 17.907 17.632 17.362 17.102 16.864 16.615 16.374 16.164 15.941 15.695 15.486 15.255 15.004 14.8 14.598 14.393 14.176 13.94 13.771 13.599 13.322 13.122 12.909 12.795 12.558 12.304 12.027 11.865 11.611 11.326 11.131 10.919 10.439 10.164 9.878 9.562 9.198 8.741 8.1 6.036 -5 ,27655 ,KEBNE ,17025820,Wed Dec 22 13:23:59 CET,Wed Dec 22 15:00:02 CET,0.0 1.564 2.112 2.557 2.908 3.184 3.421 3.644 4.036 4.224 4.411 4.655 4.897 5.056 5.349 5.606 5.844 5.958 6.176 6.389 6.707 6.916 7.108 7.368 7.623 7.875 8.109 8.34 8.641 8.915 9.163 9.461 9.753 10.034 10.361 10.715 11.041 11.402 11.809 12.225 12.636 13.1 13.636 14.158 14.751 15.424 16.186 17.008 17.903 18.847 19.865 20.415 20.543 20.495 20.357 20.125 19.865 19.61 19.351 19.055 18.78 18.496 18.208 17.949 17.701 17.472 17.226 16.999 16.799 16.572 16.314 16.089 15.853 15.605 15.4 15.186 14.965 14.729 14.489 14.327 14.158 13.883 13.682 13.458 13.347 13.133 12.893 12.616 12.463 12.238 11.996 11.817 11.625 11.222 10.995 10.725 10.407 10.044 9.597 8.985 6.96 -6 ,11766 ,KEBNE ,17025821,Wed Dec 22 13:23:59 CET,Wed Dec 22 14:59:26 CET,0.0 1.382 1.873 2.22 2.524 2.798 3.048 3.302 3.753 3.945 4.127 4.377 4.615 4.753 5.028 5.287 5.531 5.654 5.89 6.112 6.421 6.612 6.791 7.055 7.314 7.566 7.806 8.039 8.341 8.616 8.867 9.167 9.471 9.76 10.083 10.436 10.767 11.143 11.538 11.936 12.356 12.826 13.371 13.926 14.569 15.25 15.983 16.797 17.708 18.658 19.653 20.241 20.386 20.328 20.119 19.844 19.565 19.302 19.067 18.794 18.529 18.289 18.055 17.823 17.594 17.343 17.078 16.859 16.659 16.433 16.187 15.98 15.763 15.531 15.333 15.117 14.899 14.668 14.421 14.245 14.051 13.746 13.528 13.304 13.188 12.935 12.671 12.381 12.228 12.001 11.736 11.543 11.339 10.903 10.633 10.316 9.968 9.55 9.015 8.346 6.215 -7 ,9367 ,KEBNE ,17025822,Wed Dec 22 13:23:59 CET,Wed Dec 22 14:59:25 CET,0.0 1.262 1.77 2.155 2.496 2.791 3.053 3.29 3.697 3.884 4.053 4.289 4.534 4.681 4.948 5.199 5.428 5.535 5.749 5.948 6.231 6.412 6.587 6.829 7.057 7.276 7.484 7.684 7.936 8.188 8.438 8.729 9.005 9.261 9.55 9.89 10.217 10.568 10.942 11.331 11.742 12.195 12.71 13.213 13.775 14.408 15.14 15.916 16.749 17.675 18.623 19.222 19.384 19.304 19.135 18.913 18.656 18.383 18.128 17.86 17.598 17.331 17.063 16.81 16.55 16.314 16.07 15.84 15.647 15.435 15.18 14.967 14.75 14.517 14.342 14.158 13.955 13.746 13.525 13.373 13.205 12.937 12.754 12.543 12.435 12.211 11.943 11.654 11.505 11.269 11.006 10.822 10.616 10.152 9.89 9.607 9.282 8.887 8.433 7.808 5.345 -8 ,10637 ,KEBNE ,17026089,Wed Dec 22 13:50:40 CET,Wed Dec 22 15:02:42 CET,0.0 1.272 1.797 2.173 2.48 2.779 3.05 3.284 3.703 3.892 4.062 4.29 4.524 4.676 4.971 5.24 5.488 5.6 5.816 6.021 6.314 6.5 6.686 6.963 7.219 7.466 7.7 7.929 8.227 8.497 8.749 9.055 9.353 9.639 9.959 10.322 10.671 11.029 11.417 11.823 12.234 12.703 13.24 13.756 14.362 15.029 15.786 16.665 17.631 18.652 19.689 20.275 20.443 20.418 20.241 19.971 19.709 19.432 19.143 18.838 18.554 18.282 18.005 17.735 17.493 17.271 17.001 16.739 16.524 16.287 16.025 15.818 15.614 15.373 15.166 14.957 14.742 14.5 14.242 14.066 13.884 13.595 13.392 13.178 13.061 12.81 12.552 12.289 12.143 11.914 11.686 11.525 11.346 10.948 10.712 10.432 10.134 9.794 9.361 8.766 6.704 -10 ,5124 ,KEBNE ,17026091,Wed Dec 22 13:50:40 CET,Wed Dec 22 15:05:44 CET,0.0 1.399 1.916 2.321 2.659 2.944 3.19 3.422 3.853 4.048 4.223 4.463 4.703 4.845 5.109 5.361 5.604 5.717 5.941 6.159 6.455 6.643 6.833 7.123 7.397 7.643 7.878 8.103 8.38 8.643 8.909 9.218 9.512 9.808 10.14 10.5 10.832 11.19 11.587 11.998 12.406 12.858 13.409 13.955 14.545 15.222 15.992 16.789 17.691 18.666 19.597 20.183 20.283 20.177 20.02 19.797 19.548 19.276 19.026 18.754 18.49 18.233 17.976 17.698 17.43 17.194 16.941 16.696 16.475 16.24 15.973 15.757 15.545 15.316 15.122 14.918 14.697 14.461 14.224 14.053 13.875 13.583 13.367 13.139 13.02 12.78 12.517 12.234 12.077 11.836 11.561 11.373 11.188 10.764 10.506 10.218 9.9 9.538 9.08 8.458 6.905 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_63.txt deleted file mode 100644 index af18721a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_35_63.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,136 ,KEBNE ,17070483,Fri Dec 24 17:27:50 CET,Fri Dec 24 19:03:32 CET,0.0 1.433 1.921 2.27 2.579 2.857 3.109 3.328 3.724 3.912 4.086 4.302 4.536 4.677 4.943 5.2 5.445 5.558 5.772 5.973 6.26 6.445 6.62 6.869 7.097 7.314 7.537 7.748 8.009 8.265 8.516 8.796 9.052 9.306 9.597 9.915 10.22 10.544 10.895 11.265 11.623 12.024 12.493 12.954 13.459 13.978 14.575 15.208 15.851 16.482 17.018 17.173 17.044 16.741 16.343 15.937 15.579 15.214 14.853 14.48 14.139 13.818 13.5 13.212 12.937 12.675 12.398 12.119 11.877 11.634 11.355 11.113 10.862 10.59 10.381 10.174 9.94 9.685 9.425 9.234 9.032 8.729 8.524 8.297 8.173 7.915 7.635 7.341 7.183 6.936 6.668 6.477 6.286 5.847 5.572 5.248 4.915 4.537 4.09 3.493 1.557 -2 ,30872 ,KEBNE ,17070484,Fri Dec 24 17:27:50 CET,Fri Dec 24 19:04:22 CET,0.0 1.356 1.89 2.292 2.618 2.891 3.143 3.373 3.793 3.981 4.158 4.408 4.649 4.795 5.069 5.319 5.556 5.674 5.901 6.107 6.391 6.571 6.746 6.998 7.243 7.48 7.703 7.926 8.214 8.479 8.72 8.993 9.26 9.525 9.812 10.118 10.417 10.739 11.073 11.419 11.783 12.181 12.633 13.103 13.622 14.18 14.795 15.415 16.089 16.738 17.254 17.334 17.133 16.838 16.474 16.062 15.649 15.246 14.889 14.527 14.174 13.841 13.544 13.252 12.941 12.637 12.33 12.058 11.81 11.554 11.299 11.071 10.837 10.594 10.379 10.157 9.937 9.711 9.458 9.271 9.084 8.794 8.582 8.361 8.243 8.001 7.74 7.441 7.278 7.039 6.797 6.607 6.409 5.963 5.72 5.453 5.127 4.745 4.308 3.681 1.938 -3 ,3713 ,KEBNE ,17070485,Fri Dec 24 17:27:49 CET,Fri Dec 24 19:02:57 CET,0.0 1.467 2.004 2.41 2.757 3.066 3.344 3.598 4.056 4.26 4.454 4.715 4.947 5.095 5.38 5.653 5.902 6.014 6.224 6.439 6.742 6.916 7.085 7.328 7.558 7.776 7.985 8.184 8.436 8.678 8.899 9.153 9.408 9.666 9.955 10.26 10.55 10.86 11.184 11.533 11.896 12.289 12.739 13.178 13.666 14.182 14.754 15.403 16.115 16.8 17.33 17.453 17.216 16.887 16.564 16.167 15.788 15.445 15.11 14.736 14.387 14.054 13.746 13.466 13.183 12.901 12.611 12.365 12.144 11.9 11.647 11.432 11.198 10.943 10.731 10.508 10.274 10.007 9.719 9.534 9.348 9.051 8.847 8.622 8.499 8.241 7.972 7.688 7.534 7.283 6.997 6.794 6.584 6.134 5.878 5.58 5.23 4.844 4.356 3.634 1.589 -4 ,4432 ,KEBNE ,17070486,Fri Dec 24 17:28:57 CET,Fri Dec 24 19:00:32 CET,0.0 1.199 1.687 2.083 2.409 2.68 2.924 3.138 3.533 3.721 3.891 4.118 4.355 4.502 4.778 5.028 5.26 5.369 5.585 5.788 6.065 6.242 6.416 6.662 6.898 7.12 7.325 7.524 7.786 8.039 8.275 8.554 8.816 9.07 9.376 9.722 10.036 10.373 10.749 11.134 11.493 11.884 12.356 12.821 13.338 13.907 14.492 15.056 15.66 16.309 16.904 17.059 16.867 16.53 16.152 15.752 15.348 14.95 14.597 14.229 13.906 13.589 13.269 12.978 12.681 12.389 12.08 11.803 11.556 11.3 11.037 10.818 10.582 10.325 10.114 9.892 9.666 9.44 9.197 9.006 8.809 8.513 8.305 8.083 7.965 7.717 7.449 7.154 6.999 6.753 6.462 6.25 6.019 5.53 5.271 4.99 4.677 4.34 3.916 3.257 0.925 -5 ,18554 ,KEBNE ,17070487,Fri Dec 24 17:34:09 CET,Fri Dec 24 19:08:58 CET,0.0 1.3 1.826 2.214 2.524 2.798 3.052 3.286 3.693 3.868 4.032 4.265 4.502 4.64 4.898 5.136 5.36 5.472 5.694 5.904 6.195 6.374 6.549 6.799 7.034 7.264 7.497 7.714 7.978 8.231 8.472 8.751 9.02 9.27 9.548 9.87 10.179 10.509 10.856 11.214 11.587 12.009 12.483 12.94 13.455 13.989 14.583 15.245 15.928 16.613 17.192 17.271 17.069 16.774 16.399 15.96 15.556 15.178 14.828 14.477 14.178 13.901 13.608 13.299 13.002 12.724 12.421 12.143 11.896 11.645 11.371 11.116 10.848 10.583 10.384 10.167 9.936 9.698 9.436 9.249 9.063 8.754 8.528 8.304 8.186 7.91 7.604 7.299 7.146 6.906 6.657 6.466 6.244 5.772 5.516 5.208 4.869 4.505 4.021 3.321 1.192 -6 ,22985 ,KEBNE ,17070488,Fri Dec 24 17:35:11 CET,Fri Dec 24 19:10:36 CET,0.0 1.249 1.817 2.276 2.63 2.914 3.16 3.387 3.795 3.979 4.148 4.367 4.603 4.744 5.012 5.268 5.513 5.627 5.835 6.038 6.328 6.513 6.695 6.952 7.188 7.408 7.627 7.839 8.101 8.35 8.596 8.881 9.149 9.418 9.718 10.05 10.352 10.677 11.033 11.402 11.79 12.212 12.687 13.144 13.644 14.194 14.818 15.438 16.068 16.688 17.211 17.32 17.105 16.779 16.411 16.028 15.631 15.228 14.878 14.488 14.122 13.785 13.452 13.136 12.837 12.559 12.269 11.997 11.758 11.488 11.185 10.958 10.721 10.456 10.25 10.033 9.795 9.547 9.298 9.112 8.915 8.622 8.416 8.193 8.07 7.813 7.527 7.218 7.064 6.816 6.528 6.335 6.136 5.69 5.443 5.159 4.834 4.481 4.039 3.43 1.491 -7 ,16185 ,KEBNE ,17070489,Fri Dec 24 17:39:29 CET,Fri Dec 24 19:17:22 CET,0.0 1.072 1.568 1.94 2.254 2.518 2.754 2.966 3.32 3.478 3.634 3.862 4.09 4.225 4.483 4.715 4.94 5.05 5.258 5.463 5.763 5.945 6.11 6.332 6.549 6.767 6.973 7.161 7.405 7.646 7.874 8.149 8.415 8.653 8.922 9.226 9.507 9.803 10.104 10.425 10.766 11.145 11.569 11.978 12.455 12.975 13.535 14.13 14.787 15.422 15.947 16.054 15.868 15.605 15.307 14.932 14.547 14.191 13.845 13.469 13.125 12.834 12.562 12.278 11.996 11.729 11.459 11.217 11.006 10.773 10.519 10.304 10.072 9.822 9.61 9.394 9.178 8.941 8.683 8.511 8.338 8.057 7.864 7.657 7.546 7.31 7.046 6.757 6.608 6.384 6.155 5.979 5.785 5.363 5.136 4.885 4.597 4.269 3.898 3.376 1.227 -8 ,16090 ,KEBNE ,17070490,Fri Dec 24 17:41:38 CET,Fri Dec 24 19:16:48 CET,0.0 1.27 1.756 2.159 2.485 2.782 3.051 3.287 3.7 3.881 4.06 4.295 4.53 4.67 4.941 5.203 5.449 5.564 5.78 5.996 6.301 6.49 6.676 6.939 7.182 7.409 7.63 7.842 8.109 8.373 8.618 8.903 9.175 9.428 9.73 10.081 10.409 10.74 11.09 11.462 11.836 12.26 12.75 13.227 13.739 14.259 14.832 15.445 16.099 16.707 17.211 17.397 17.24 16.893 16.454 16.012 15.609 15.207 14.843 14.47 14.102 13.75 13.426 13.115 12.803 12.51 12.203 11.926 11.675 11.411 11.139 10.902 10.655 10.399 10.198 9.993 9.766 9.523 9.271 9.091 8.904 8.609 8.393 8.161 8.047 7.817 7.56 7.259 7.091 6.841 6.567 6.367 6.153 5.649 5.372 5.076 4.738 4.368 3.914 3.287 1.302 -9 ,21563 ,KEBNE ,17070491,Fri Dec 24 17:41:40 CET,Fri Dec 24 19:11:33 CET,0.0 1.298 1.799 2.2 2.534 2.806 3.051 3.28 3.684 3.87 4.049 4.291 4.524 4.671 4.949 5.203 5.438 5.552 5.769 5.962 6.233 6.413 6.59 6.836 7.074 7.304 7.525 7.739 8.011 8.265 8.499 8.781 9.062 9.331 9.628 9.946 10.24 10.56 10.895 11.252 11.629 12.034 12.481 12.926 13.459 14.001 14.55 15.139 15.777 16.402 16.859 16.941 16.718 16.375 16.0 15.611 15.256 14.882 14.543 14.172 13.819 13.499 13.157 12.839 12.541 12.247 11.929 11.658 11.418 11.148 10.869 10.629 10.378 10.115 9.907 9.687 9.451 9.207 8.938 8.746 8.546 8.226 8.001 7.779 7.672 7.44 7.188 6.898 6.735 6.486 6.216 6.018 5.813 5.347 5.091 4.804 4.467 4.089 3.643 3.049 1.325 -10 ,8678 ,KEBNE ,17070492,Fri Dec 24 17:43:45 CET,Fri Dec 24 19:18:25 CET,0.0 1.309 1.851 2.247 2.562 2.817 3.059 3.287 3.71 3.908 4.093 4.339 4.575 4.718 4.978 5.22 5.455 5.566 5.781 5.989 6.26 6.434 6.616 6.868 7.095 7.312 7.514 7.716 7.991 8.248 8.486 8.763 9.022 9.266 9.56 9.895 10.207 10.553 10.911 11.272 11.658 12.065 12.521 12.969 13.457 13.961 14.534 15.147 15.774 16.434 17.028 17.171 16.991 16.71 16.372 15.95 15.537 15.165 14.815 14.443 14.114 13.812 13.508 13.209 12.906 12.613 12.324 12.061 11.823 11.57 11.283 11.045 10.809 10.557 10.353 10.136 9.911 9.672 9.413 9.224 9.024 8.724 8.511 8.292 8.181 7.936 7.662 7.373 7.226 6.982 6.702 6.502 6.297 5.841 5.567 5.28 4.948 4.559 4.097 3.469 1.32 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_29.txt deleted file mode 100644 index 0cf47160..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20205 ,KEBNE ,16721495,Sat Nov 27 15:06:45 CET,Sat Nov 27 16:43:27 CET,0.0 1.488 1.919 2.237 2.473 2.671 2.84 2.977 3.186 3.268 3.34 3.394 3.512 3.556 3.637 3.694 3.734 3.75 3.767 3.775 3.774 3.764 3.757 3.73 3.674 3.606 3.533 3.452 3.331 3.208 3.074 2.892 2.698 2.486 2.203 1.854 1.494 1.061 0.553 -0.034 -0.701 -1.519 -2.57 -3.751 -5.276 -7.163 -9.584 -12.687 -16.908 -22.763 -31.517 -40.875 -47.784 -53.144 -57.377 -60.893 -63.852 -66.423 -68.557 -70.626 -72.352 -73.856 -75.239 -76.501 -77.658 -78.701 -79.765 -80.698 -81.508 -82.34 -83.195 -83.895 -84.613 -85.36 -85.924 -86.486 -87.068 -87.697 -88.334 -88.743 -89.16 -89.849 -90.355 -90.881 -91.142 -91.685 -92.264 -92.897 -93.243 -93.75 -94.293 -94.659 -95.049 -95.935 -96.416 -96.934 -97.543 -98.251 -99.105 -100.265 -104.31 -2 ,16220 ,KEBNE ,16721496,Sat Nov 27 15:10:52 CET,Sat Nov 27 16:54:48 CET,0.0 1.25 1.667 1.95 2.177 2.348 2.503 2.642 2.836 2.913 2.979 3.027 3.14 3.181 3.253 3.308 3.344 3.357 3.375 3.386 3.389 3.379 3.363 3.332 3.288 3.234 3.173 3.112 3.019 2.894 2.753 2.585 2.396 2.176 1.892 1.55 1.18 0.726 0.203 -0.398 -1.095 -1.946 -3.032 -4.217 -5.754 -7.634 -10.048 -13.209 -17.488 -23.415 -32.134 -41.357 -48.185 -53.513 -57.809 -61.462 -64.479 -67.013 -69.124 -71.152 -72.817 -74.259 -75.616 -76.882 -78.02 -79.05 -80.124 -81.077 -81.875 -82.682 -83.525 -84.225 -84.963 -85.721 -86.275 -86.832 -87.426 -88.042 -88.671 -89.095 -89.559 -90.335 -90.857 -91.384 -91.645 -92.19 -92.796 -93.439 -93.761 -94.254 -94.814 -95.195 -95.591 -96.445 -96.951 -97.501 -98.072 -98.731 -99.546 -100.654 -104.4 -3 ,113 ,KEBNE ,16721497,Sat Nov 27 15:14:57 CET,Sat Nov 27 16:52:50 CET,0.0 1.12 1.537 1.828 2.045 2.208 2.347 2.471 2.675 2.753 2.827 2.893 3.01 3.05 3.123 3.183 3.231 3.252 3.281 3.292 3.289 3.281 3.259 3.217 3.164 3.097 3.011 2.92 2.801 2.667 2.528 2.34 2.14 1.932 1.658 1.325 0.974 0.548 0.044 -0.555 -1.249 -2.094 -3.175 -4.378 -5.89 -7.778 -10.266 -13.388 -17.601 -23.473 -32.11 -41.188 -47.986 -53.341 -57.671 -61.324 -64.316 -66.899 -69.079 -71.17 -72.927 -74.46 -75.85 -77.104 -78.238 -79.259 -80.326 -81.261 -82.045 -82.838 -83.675 -84.374 -85.069 -85.779 -86.33 -86.904 -87.502 -88.151 -88.831 -89.296 -89.795 -90.573 -91.085 -91.6 -91.86 -92.387 -92.944 -93.544 -93.86 -94.359 -94.932 -95.34 -95.769 -96.698 -97.212 -97.762 -98.372 -99.063 -99.901 -101.01 -104.879 -4 ,29785 ,KEBNE ,16721498,Sat Nov 27 15:43:27 CET,Sat Nov 27 17:20:05 CET,0.0 1.152 1.562 1.845 2.061 2.235 2.393 2.538 2.743 2.821 2.895 2.954 3.068 3.114 3.197 3.252 3.284 3.298 3.32 3.332 3.336 3.329 3.315 3.284 3.242 3.187 3.109 3.018 2.902 2.773 2.622 2.41 2.192 1.971 1.684 1.323 0.947 0.493 -0.03 -0.614 -1.281 -2.109 -3.173 -4.377 -5.948 -7.885 -10.342 -13.5 -17.713 -23.485 -32.178 -41.391 -48.217 -53.552 -57.796 -61.365 -64.355 -66.903 -69.015 -71.037 -72.707 -74.193 -75.602 -76.905 -78.091 -79.143 -80.206 -81.121 -81.913 -82.739 -83.577 -84.259 -84.954 -85.668 -86.247 -86.839 -87.429 -88.08 -88.757 -89.192 -89.635 -90.324 -90.798 -91.304 -91.577 -92.138 -92.708 -93.335 -93.665 -94.166 -94.71 -95.08 -95.485 -96.391 -96.904 -97.466 -98.074 -98.784 -99.614 -100.723 -104.411 -5 ,23192 ,KEBNE ,16721499,Sat Nov 27 15:47:32 CET,Sat Nov 27 17:24:13 CET,0.0 1.182 1.644 1.971 2.186 2.351 2.505 2.627 2.83 2.917 2.986 3.049 3.172 3.213 3.286 3.339 3.379 3.397 3.423 3.442 3.456 3.45 3.434 3.399 3.352 3.291 3.208 3.113 2.99 2.861 2.72 2.532 2.322 2.097 1.817 1.464 1.083 0.63 0.1 -0.509 -1.213 -2.075 -3.148 -4.328 -5.855 -7.76 -10.219 -13.378 -17.631 -23.483 -32.179 -41.336 -48.1 -53.448 -57.715 -61.256 -64.187 -66.716 -68.842 -70.899 -72.607 -74.094 -75.448 -76.691 -77.834 -78.843 -79.892 -80.824 -81.61 -82.414 -83.262 -83.972 -84.683 -85.404 -85.959 -86.531 -87.111 -87.709 -88.332 -88.752 -89.186 -89.873 -90.365 -90.888 -91.16 -91.714 -92.288 -92.93 -93.266 -93.767 -94.336 -94.712 -95.11 -96.016 -96.495 -97.031 -97.648 -98.341 -99.177 -100.273 -103.722 -6 ,20835 ,KEBNE ,16721500,Sat Nov 27 15:48:34 CET,Sat Nov 27 17:26:08 CET,0.0 1.562 1.977 2.244 2.449 2.619 2.775 2.915 3.122 3.205 3.285 3.351 3.471 3.513 3.583 3.645 3.692 3.71 3.728 3.734 3.732 3.719 3.696 3.655 3.598 3.528 3.451 3.372 3.255 3.125 2.979 2.773 2.564 2.348 2.072 1.716 1.351 0.922 0.397 -0.201 -0.879 -1.733 -2.823 -4.009 -5.538 -7.45 -9.889 -12.975 -17.226 -23.086 -31.662 -40.738 -47.475 -52.783 -57.051 -60.637 -63.657 -66.254 -68.403 -70.51 -72.245 -73.731 -75.125 -76.411 -77.565 -78.598 -79.653 -80.584 -81.386 -82.194 -83.01 -83.679 -84.404 -85.144 -85.677 -86.222 -86.802 -87.411 -88.044 -88.485 -88.95 -89.689 -90.194 -90.688 -90.945 -91.515 -92.093 -92.715 -93.05 -93.546 -94.065 -94.442 -94.849 -95.752 -96.272 -96.824 -97.414 -98.107 -98.939 -100.053 -103.664 -7 ,30566 ,KEBNE ,16721501,Sat Nov 27 15:48:33 CET,Sat Nov 27 17:26:18 CET,0.0 1.075 1.507 1.812 2.022 2.191 2.347 2.479 2.678 2.76 2.834 2.908 3.03 3.074 3.154 3.217 3.256 3.268 3.292 3.308 3.308 3.306 3.298 3.267 3.222 3.162 3.094 3.023 2.902 2.773 2.635 2.437 2.237 2.018 1.735 1.393 1.034 0.613 0.112 -0.477 -1.154 -1.993 -3.076 -4.27 -5.815 -7.735 -10.206 -13.36 -17.568 -23.433 -32.167 -41.302 -48.137 -53.517 -57.843 -61.442 -64.387 -66.932 -69.063 -71.124 -72.815 -74.315 -75.734 -77.024 -78.207 -79.27 -80.354 -81.271 -82.063 -82.899 -83.747 -84.444 -85.161 -85.904 -86.457 -87.026 -87.634 -88.264 -88.907 -89.355 -89.831 -90.561 -91.039 -91.544 -91.831 -92.422 -93.004 -93.658 -93.997 -94.498 -95.033 -95.394 -95.794 -96.678 -97.173 -97.704 -98.295 -98.987 -99.795 -100.833 -104.583 -8 ,30876 ,KEBNE ,16721502,Sat Nov 27 15:53:39 CET,Sat Nov 27 17:31:51 CET,0.0 1.303 1.687 1.936 2.142 2.319 2.473 2.595 2.788 2.874 2.944 3.006 3.129 3.179 3.256 3.306 3.356 3.375 3.396 3.405 3.405 3.396 3.374 3.325 3.278 3.224 3.147 3.055 2.925 2.785 2.643 2.457 2.245 2.034 1.77 1.42 1.037 0.582 0.054 -0.543 -1.216 -2.063 -3.151 -4.347 -5.892 -7.796 -10.291 -13.483 -17.758 -23.64 -32.316 -41.481 -48.188 -53.394 -57.567 -61.101 -64.067 -66.617 -68.741 -70.828 -72.52 -73.976 -75.323 -76.536 -77.672 -78.693 -79.737 -80.657 -81.436 -82.24 -83.08 -83.784 -84.479 -85.174 -85.728 -86.291 -86.888 -87.54 -88.195 -88.634 -89.085 -89.773 -90.263 -90.793 -91.073 -91.628 -92.201 -92.832 -93.163 -93.655 -94.168 -94.54 -94.952 -95.882 -96.397 -96.933 -97.523 -98.251 -99.119 -100.267 -104.413 -9 ,1754 ,KEBNE ,16721503,Sat Nov 27 15:53:43 CET,Sat Nov 27 17:23:58 CET,0.0 1.4 1.832 2.119 2.333 2.518 2.666 2.796 3.023 3.105 3.177 3.234 3.35 3.398 3.475 3.526 3.567 3.588 3.609 3.615 3.611 3.601 3.579 3.535 3.495 3.453 3.396 3.322 3.205 3.077 2.939 2.745 2.536 2.312 2.03 1.676 1.3 0.854 0.325 -0.269 -0.939 -1.772 -2.852 -4.045 -5.554 -7.439 -9.883 -13.006 -17.246 -23.113 -31.819 -41.045 -47.827 -53.122 -57.434 -61.023 -63.983 -66.557 -68.663 -70.717 -72.433 -73.916 -75.272 -76.496 -77.613 -78.627 -79.707 -80.657 -81.449 -82.254 -83.056 -83.692 -84.356 -85.06 -85.623 -86.199 -86.779 -87.401 -88.04 -88.47 -88.92 -89.605 -90.099 -90.639 -90.921 -91.499 -92.079 -92.687 -93.009 -93.51 -94.061 -94.433 -94.841 -95.732 -96.23 -96.796 -97.414 -98.125 -98.929 -99.965 -103.524 -10 ,1133 ,KEBNE ,16721504,Sat Nov 27 15:55:41 CET,Sat Nov 27 17:32:43 CET,0.0 1.72 2.107 2.386 2.609 2.777 2.925 3.048 3.25 3.34 3.419 3.485 3.607 3.654 3.74 3.806 3.842 3.855 3.879 3.898 3.902 3.896 3.882 3.839 3.784 3.718 3.649 3.575 3.459 3.323 3.173 2.972 2.748 2.507 2.196 1.821 1.454 1.027 0.523 -0.06 -0.721 -1.548 -2.624 -3.817 -5.358 -7.248 -9.687 -12.833 -17.065 -22.873 -31.453 -40.604 -47.352 -52.648 -56.993 -60.606 -63.574 -66.16 -68.279 -70.317 -72.032 -73.489 -74.845 -76.092 -77.223 -78.292 -79.387 -80.34 -81.158 -81.998 -82.863 -83.545 -84.224 -84.911 -85.461 -86.06 -86.685 -87.331 -87.979 -88.415 -88.856 -89.531 -90.006 -90.494 -90.764 -91.346 -91.933 -92.567 -92.906 -93.413 -93.98 -94.364 -94.767 -95.66 -96.16 -96.686 -97.287 -98.008 -98.86 -99.942 -103.695 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_35.txt deleted file mode 100644 index 06c26cd5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_36_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20692 ,KEBNE ,16721505,Sat Nov 27 16:05:53 CET,Sat Nov 27 17:42:35 CET,0.0 1.357 1.868 2.26 2.593 2.853 3.075 3.288 3.653 3.801 3.937 4.135 4.333 4.452 4.672 4.881 5.074 5.164 5.334 5.49 5.709 5.846 5.971 6.14 6.3 6.461 6.612 6.746 6.9 7.04 7.18 7.344 7.483 7.613 7.757 7.903 8.04 8.188 8.324 8.438 8.55 8.668 8.761 8.824 8.852 8.811 8.678 8.393 7.904 7.081 5.528 3.495 1.825 0.388 -0.859 -1.986 -3.013 -3.93 -4.724 -5.548 -6.269 -6.899 -7.512 -8.08 -8.606 -9.111 -9.66 -10.183 -10.632 -11.082 -11.562 -11.977 -12.413 -12.875 -13.219 -13.563 -13.933 -14.32 -14.728 -15.016 -15.303 -15.753 -16.102 -16.474 -16.665 -17.07 -17.507 -17.969 -18.203 -18.539 -19.01 -19.309 -19.62 -20.327 -20.746 -21.215 -21.748 -22.363 -23.091 -24.07 -27.536 -2 ,18147 ,KEBNE ,16721506,Sat Nov 27 16:05:53 CET,Sat Nov 27 17:42:17 CET,0.0 1.248 1.772 2.13 2.43 2.697 2.926 3.128 3.483 3.638 3.781 3.996 4.193 4.313 4.528 4.726 4.916 5.004 5.162 5.312 5.537 5.683 5.818 6.002 6.17 6.327 6.465 6.594 6.763 6.929 7.081 7.244 7.401 7.546 7.694 7.842 7.978 8.116 8.261 8.398 8.535 8.667 8.773 8.832 8.859 8.826 8.686 8.42 7.93 7.026 5.328 3.161 1.351 -0.161 -1.452 -2.608 -3.631 -4.547 -5.326 -6.083 -6.744 -7.382 -8.008 -8.589 -9.118 -9.634 -10.197 -10.69 -11.105 -11.511 -11.939 -12.331 -12.732 -13.142 -13.47 -13.816 -14.186 -14.576 -14.998 -15.289 -15.592 -16.075 -16.421 -16.787 -16.973 -17.363 -17.783 -18.241 -18.492 -18.843 -19.328 -19.634 -19.952 -20.676 -21.099 -21.556 -22.056 -22.637 -23.353 -24.34 -28.056 -3 ,10765 ,KEBNE ,16721507,Sat Nov 27 16:09:58 CET,Sat Nov 27 17:47:42 CET,0.0 1.301 1.817 2.212 2.534 2.794 3.008 3.2 3.546 3.701 3.854 4.057 4.25 4.374 4.592 4.785 4.955 5.035 5.2 5.354 5.576 5.717 5.845 6.021 6.177 6.322 6.463 6.597 6.762 6.917 7.058 7.208 7.356 7.5 7.661 7.841 7.996 8.138 8.295 8.465 8.606 8.738 8.857 8.937 8.984 8.965 8.835 8.543 8.032 7.202 5.623 3.619 1.913 0.436 -0.793 -1.894 -2.862 -3.725 -4.526 -5.325 -5.961 -6.575 -7.21 -7.765 -8.258 -8.756 -9.294 -9.759 -10.18 -10.638 -11.098 -11.479 -11.875 -12.28 -12.606 -12.958 -13.32 -13.71 -14.137 -14.437 -14.754 -15.264 -15.599 -15.938 -16.126 -16.528 -16.949 -17.383 -17.618 -17.952 -18.399 -18.701 -19.028 -19.735 -20.146 -20.595 -21.091 -21.683 -22.456 -23.544 -27.532 -4 ,2364 ,KEBNE ,16721508,Sat Nov 27 16:12:02 CET,Sat Nov 27 17:44:01 CET,0.0 1.198 1.677 2.039 2.327 2.566 2.778 2.978 3.334 3.493 3.639 3.838 4.03 4.149 4.355 4.542 4.723 4.813 4.989 5.146 5.358 5.49 5.614 5.794 5.971 6.145 6.314 6.469 6.661 6.84 6.997 7.165 7.323 7.467 7.619 7.782 7.926 8.063 8.195 8.324 8.451 8.569 8.668 8.73 8.758 8.728 8.588 8.296 7.821 6.965 5.358 3.326 1.551 0.053 -1.232 -2.432 -3.485 -4.369 -5.132 -5.923 -6.628 -7.287 -7.898 -8.487 -9.049 -9.54 -10.059 -10.537 -10.964 -11.402 -11.839 -12.233 -12.657 -13.089 -13.436 -13.799 -14.177 -14.58 -15.011 -15.319 -15.619 -16.079 -16.416 -16.777 -16.971 -17.373 -17.808 -18.294 -18.544 -18.872 -19.32 -19.619 -19.94 -20.654 -21.066 -21.532 -22.046 -22.634 -23.354 -24.353 -28.556 -5 ,24716 ,KEBNE ,16721509,Sat Nov 27 16:14:02 CET,Sat Nov 27 17:50:19 CET,0.0 1.147 1.644 2.004 2.291 2.543 2.77 2.967 3.301 3.455 3.603 3.807 4.006 4.133 4.363 4.585 4.791 4.885 5.053 5.216 5.457 5.618 5.765 5.951 6.12 6.279 6.432 6.587 6.774 6.941 7.1 7.283 7.448 7.591 7.754 7.929 8.1 8.27 8.418 8.556 8.673 8.786 8.887 8.974 9.029 9.025 8.921 8.639 8.148 7.326 5.767 3.734 2.024 0.547 -0.715 -1.814 -2.792 -3.735 -4.536 -5.325 -6.05 -6.704 -7.335 -7.923 -8.459 -8.955 -9.457 -9.914 -10.333 -10.757 -11.189 -11.556 -11.947 -12.349 -12.663 -12.998 -13.367 -13.775 -14.174 -14.445 -14.751 -15.233 -15.573 -15.923 -16.1 -16.488 -16.929 -17.424 -17.686 -18.034 -18.498 -18.794 -19.106 -19.813 -20.212 -20.657 -21.159 -21.75 -22.496 -23.526 -27.225 -6 ,4927 ,KEBNE ,16721510,Sat Nov 27 16:14:03 CET,Sat Nov 27 17:50:14 CET,0.0 1.405 1.856 2.178 2.47 2.745 2.987 3.182 3.504 3.659 3.812 4.013 4.201 4.319 4.536 4.752 4.946 5.03 5.191 5.334 5.535 5.67 5.793 5.97 6.138 6.288 6.431 6.569 6.736 6.881 7.018 7.184 7.346 7.499 7.66 7.846 8.014 8.169 8.312 8.425 8.544 8.67 8.774 8.838 8.884 8.892 8.793 8.545 8.054 7.218 5.653 3.614 1.842 0.31 -0.962 -2.122 -3.136 -4.055 -4.883 -5.696 -6.393 -7.028 -7.632 -8.219 -8.798 -9.31 -9.834 -10.337 -10.775 -11.224 -11.7 -12.089 -12.504 -12.945 -13.275 -13.627 -14.002 -14.389 -14.831 -15.137 -15.433 -15.908 -16.234 -16.561 -16.737 -17.132 -17.566 -18.018 -18.259 -18.591 -19.04 -19.337 -19.669 -20.416 -20.832 -21.301 -21.82 -22.405 -23.093 -24.038 -27.723 -7 ,22889 ,KEBNE ,16721511,Sat Nov 27 16:14:03 CET,Sat Nov 27 17:50:13 CET,0.0 1.222 1.715 2.079 2.366 2.606 2.824 3.021 3.368 3.53 3.68 3.875 4.06 4.174 4.398 4.606 4.788 4.872 5.027 5.186 5.402 5.532 5.666 5.852 6.012 6.157 6.288 6.416 6.586 6.738 6.879 7.06 7.218 7.357 7.509 7.668 7.82 7.968 8.111 8.236 8.355 8.484 8.615 8.691 8.709 8.686 8.563 8.298 7.82 6.963 5.395 3.429 1.763 0.338 -0.915 -2.071 -3.079 -4.005 -4.831 -5.636 -6.336 -7.009 -7.668 -8.249 -8.756 -9.237 -9.748 -10.215 -10.643 -11.089 -11.56 -11.939 -12.318 -12.741 -13.087 -13.454 -13.85 -14.254 -14.679 -14.97 -15.284 -15.803 -16.15 -16.508 -16.693 -17.09 -17.524 -17.977 -18.233 -18.602 -19.096 -19.416 -19.77 -20.56 -20.982 -21.454 -22.016 -22.666 -23.475 -24.57 -28.455 -8 ,28559 ,KEBNE ,16721512,Sat Nov 27 16:14:05 CET,Sat Nov 27 17:46:47 CET,0.0 1.514 2.078 2.436 2.725 2.992 3.221 3.429 3.834 4.024 4.187 4.409 4.607 4.732 4.956 5.163 5.357 5.447 5.615 5.808 6.096 6.249 6.389 6.583 6.771 6.95 7.112 7.265 7.457 7.629 7.789 7.981 8.153 8.303 8.465 8.644 8.795 8.931 9.064 9.196 9.317 9.433 9.536 9.593 9.61 9.569 9.427 9.165 8.693 7.796 6.185 4.192 2.477 1.017 -0.281 -1.459 -2.458 -3.333 -4.078 -4.83 -5.483 -6.084 -6.679 -7.225 -7.731 -8.221 -8.746 -9.221 -9.648 -10.082 -10.512 -10.886 -11.291 -11.696 -12.004 -12.336 -12.704 -13.11 -13.524 -13.812 -14.115 -14.587 -14.928 -15.286 -15.465 -15.866 -16.311 -16.775 -17.014 -17.358 -17.831 -18.121 -18.456 -19.23 -19.672 -20.137 -20.628 -21.222 -21.952 -23.027 -27.493 -9 ,10007 ,KEBNE ,16721513,Sat Nov 27 16:15:04 CET,Sat Nov 27 17:51:45 CET,0.0 1.392 1.882 2.244 2.519 2.74 2.932 3.118 3.483 3.639 3.765 3.922 4.091 4.199 4.398 4.575 4.743 4.827 4.99 5.144 5.349 5.474 5.588 5.754 5.897 6.022 6.153 6.279 6.437 6.588 6.732 6.893 7.031 7.148 7.261 7.38 7.498 7.609 7.708 7.825 7.932 8.018 8.096 8.146 8.175 8.116 7.942 7.668 7.183 6.323 4.767 2.754 0.973 -0.563 -1.849 -2.971 -4.045 -5.031 -5.83 -6.633 -7.348 -7.992 -8.616 -9.199 -9.718 -10.19 -10.698 -11.192 -11.614 -12.025 -12.448 -12.818 -13.213 -13.638 -13.97 -14.307 -14.663 -15.022 -15.4 -15.661 -15.927 -16.362 -16.694 -17.035 -17.205 -17.554 -17.942 -18.37 -18.595 -18.932 -19.401 -19.683 -19.99 -20.665 -21.041 -21.474 -21.966 -22.555 -23.269 -24.307 -28.117 -10 ,19604 ,KEBNE ,16721514,Sat Nov 27 16:15:04 CET,Sat Nov 27 17:51:42 CET,0.0 1.738 2.206 2.58 2.892 3.154 3.379 3.578 3.933 4.094 4.241 4.459 4.655 4.769 4.981 5.183 5.377 5.464 5.624 5.783 6.0 6.125 6.241 6.412 6.587 6.754 6.905 7.038 7.209 7.369 7.515 7.686 7.84 7.986 8.143 8.297 8.439 8.589 8.731 8.856 8.974 9.101 9.208 9.28 9.301 9.256 9.153 8.913 8.463 7.586 5.895 3.748 1.996 0.553 -0.68 -1.81 -2.776 -3.658 -4.439 -5.195 -5.878 -6.517 -7.103 -7.654 -8.212 -8.759 -9.323 -9.795 -10.219 -10.67 -11.128 -11.512 -11.931 -12.365 -12.702 -13.057 -13.437 -13.838 -14.243 -14.514 -14.808 -15.341 -15.735 -16.156 -16.371 -16.802 -17.26 -17.743 -17.999 -18.353 -18.84 -19.143 -19.463 -20.193 -20.599 -21.024 -21.495 -22.022 -22.658 -23.545 -26.934 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_34.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_34.txt deleted file mode 100644 index 8db65adc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_34.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29148 ,KEBNE ,16721515,Sat Nov 27 16:15:04 CET,Sat Nov 27 17:52:57 CET,0.0 1.327 1.737 2.092 2.391 2.631 2.852 3.059 3.441 3.613 3.771 3.976 4.184 4.316 4.572 4.804 5.014 5.119 5.32 5.502 5.76 5.923 6.08 6.317 6.541 6.743 6.934 7.128 7.389 7.627 7.847 8.128 8.395 8.637 8.916 9.23 9.523 9.833 10.17 10.519 10.875 11.277 11.743 12.187 12.676 13.198 13.738 14.301 14.886 15.348 15.514 15.115 14.508 13.901 13.238 12.53 11.82 11.092 10.442 9.774 9.189 8.685 8.214 7.755 7.316 6.903 6.473 6.104 5.771 5.409 5.048 4.749 4.409 4.05 3.757 3.451 3.167 2.877 2.562 2.334 2.101 1.718 1.427 1.117 0.951 0.598 0.233 -0.146 -0.355 -0.657 -1.089 -1.353 -1.626 -2.273 -2.619 -3.009 -3.522 -4.157 -4.991 -6.232 -14.206 -2 ,22336 ,KEBNE ,16721516,Sat Nov 27 16:15:04 CET,Sat Nov 27 17:53:10 CET,0.0 2.005 2.423 2.758 3.046 3.291 3.504 3.702 4.051 4.209 4.363 4.576 4.786 4.92 5.178 5.418 5.635 5.738 5.933 6.112 6.38 6.555 6.721 6.953 7.172 7.386 7.594 7.787 8.036 8.274 8.494 8.76 9.031 9.301 9.597 9.914 10.202 10.506 10.825 11.174 11.554 11.958 12.385 12.804 13.293 13.807 14.353 14.86 15.349 15.78 15.999 15.784 15.271 14.59 13.904 13.256 12.647 12.024 11.439 10.871 10.374 9.895 9.428 9.0 8.605 8.223 7.812 7.439 7.112 6.739 6.309 5.962 5.624 5.256 4.975 4.679 4.333 3.963 3.592 3.336 3.057 2.611 2.318 2.008 1.844 1.502 1.115 0.682 0.467 0.173 -0.269 -0.563 -0.874 -1.569 -1.943 -2.331 -2.772 -3.344 -4.117 -5.231 -9.829 -4 ,15843 ,KEBNE ,16721518,Sat Nov 27 16:15:08 CET,Sat Nov 27 17:49:35 CET,0.0 1.457 1.925 2.262 2.548 2.797 3.032 3.247 3.597 3.763 3.926 4.149 4.362 4.49 4.724 4.94 5.153 5.257 5.456 5.645 5.93 6.106 6.262 6.497 6.716 6.917 7.111 7.303 7.553 7.796 8.037 8.316 8.572 8.81 9.079 9.395 9.698 10.015 10.341 10.692 11.053 11.445 11.886 12.312 12.788 13.305 13.856 14.376 14.856 15.219 15.336 14.921 14.262 13.578 12.922 12.273 11.655 11.077 10.551 9.963 9.417 8.944 8.497 8.062 7.651 7.277 6.893 6.549 6.241 5.931 5.594 5.288 4.949 4.566 4.278 4.003 3.714 3.413 3.086 2.847 2.614 2.25 1.97 1.667 1.509 1.204 0.874 0.468 0.257 -0.023 -0.403 -0.665 -0.938 -1.565 -1.944 -2.327 -2.745 -3.243 -3.924 -4.927 -11.2 -6 ,1784 ,KEBNE ,16721520,Sat Nov 27 16:19:08 CET,Sat Nov 27 17:58:10 CET,0.0 1.339 1.764 2.113 2.41 2.656 2.872 3.075 3.462 3.636 3.791 3.997 4.21 4.343 4.59 4.818 5.036 5.141 5.34 5.528 5.797 5.972 6.138 6.37 6.59 6.796 6.999 7.203 7.464 7.699 7.924 8.2 8.458 8.707 8.987 9.289 9.572 9.885 10.207 10.546 10.912 11.315 11.789 12.275 12.808 13.332 13.866 14.399 14.892 15.344 15.528 15.153 14.542 13.874 13.207 12.53 11.91 11.309 10.775 10.24 9.746 9.255 8.749 8.272 7.825 7.41 6.981 6.575 6.203 5.843 5.508 5.227 4.906 4.566 4.313 4.044 3.752 3.452 3.133 2.911 2.681 2.315 2.063 1.798 1.652 1.325 0.976 0.593 0.371 0.052 -0.403 -0.689 -0.985 -1.637 -2.018 -2.444 -2.99 -3.662 -4.428 -5.422 -15.708 -7 ,3545 ,KEBNE ,16721521,Sat Nov 27 16:19:08 CET,Sat Nov 27 17:58:24 CET,0.0 1.51 1.964 2.296 2.582 2.824 3.038 3.246 3.635 3.801 3.952 4.168 4.375 4.506 4.765 5.014 5.254 5.368 5.592 5.797 6.096 6.288 6.462 6.714 6.962 7.195 7.417 7.634 7.9 8.151 8.411 8.729 9.023 9.294 9.589 9.91 10.225 10.557 10.899 11.263 11.636 12.042 12.493 12.919 13.428 13.979 14.521 15.036 15.558 16.011 16.198 15.846 15.201 14.493 13.779 13.097 12.429 11.777 11.235 10.688 10.204 9.765 9.331 8.914 8.51 8.129 7.718 7.346 7.038 6.7 6.325 6.016 5.681 5.306 4.995 4.671 4.356 4.037 3.676 3.414 3.156 2.732 2.419 2.102 1.94 1.586 1.205 0.778 0.551 0.238 -0.234 -0.522 -0.819 -1.538 -1.972 -2.447 -2.984 -3.598 -4.399 -5.554 -12.968 -8 ,7094 ,KEBNE ,16721522,Sat Nov 27 16:19:08 CET,Sat Nov 27 17:58:25 CET,0.0 1.493 1.967 2.326 2.599 2.836 3.054 3.257 3.618 3.772 3.919 4.131 4.344 4.476 4.724 4.948 5.156 5.257 5.458 5.65 5.92 6.096 6.265 6.506 6.736 6.95 7.154 7.35 7.596 7.83 8.056 8.324 8.581 8.826 9.109 9.427 9.732 10.066 10.423 10.797 11.172 11.589 12.067 12.555 13.104 13.631 14.181 14.77 15.368 15.827 15.961 15.631 15.039 14.343 13.673 13.016 12.38 11.769 11.224 10.676 10.187 9.725 9.245 8.742 8.271 7.832 7.403 7.051 6.721 6.37 6.027 5.728 5.406 5.064 4.78 4.483 4.191 3.908 3.603 3.373 3.122 2.689 2.382 2.06 1.891 1.557 1.196 0.808 0.603 0.309 -0.11 -0.381 -0.663 -1.298 -1.664 -2.06 -2.552 -3.137 -3.836 -4.912 -16.567 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_35.txt deleted file mode 100644 index cfef1a04..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_37_35.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -5 ,1830 ,KEBNE ,16721529,Sat Nov 27 16:20:10 CET,Sat Nov 27 17:59:39 CET,0.0 2.114 2.681 3.111 3.473 3.8 4.104 4.373 4.843 5.052 5.245 5.513 5.759 5.926 6.246 6.545 6.82 6.947 7.183 7.405 7.74 7.937 8.127 8.405 8.644 8.873 9.103 9.318 9.582 9.831 10.064 10.336 10.591 10.827 11.098 11.406 11.696 12.011 12.34 12.687 13.034 13.379 13.716 14.029 14.378 14.715 15.022 15.24 15.339 15.143 14.245 12.707 11.114 9.665 8.385 7.185 6.131 5.173 4.349 3.525 2.8 2.145 1.505 0.894 0.337 -0.158 -0.68 -1.168 -1.604 -2.043 -2.49 -2.864 -3.251 -3.648 -3.966 -4.307 -4.684 -5.089 -5.518 -5.821 -6.127 -6.625 -6.974 -7.337 -7.523 -7.886 -8.294 -8.741 -8.973 -9.294 -9.665 -9.908 -10.189 -10.839 -11.216 -11.645 -12.148 -12.793 -13.611 -14.667 -21.492 -9 ,17021 ,KEBNE ,16721533,Sat Nov 27 16:21:10 CET,Sat Nov 27 17:59:18 CET,0.0 1.997 2.594 2.979 3.276 3.565 3.824 4.055 4.463 4.644 4.813 5.052 5.271 5.412 5.69 5.933 6.158 6.272 6.487 6.674 6.94 7.121 7.294 7.537 7.76 7.975 8.185 8.382 8.637 8.874 9.092 9.357 9.594 9.822 10.084 10.365 10.645 10.936 11.224 11.504 11.786 12.103 12.435 12.76 13.101 13.383 13.611 13.715 13.718 13.5 12.605 11.043 9.556 8.164 6.873 5.72 4.72 3.79 2.968 2.142 1.431 0.798 0.187 -0.422 -1.009 -1.559 -2.162 -2.697 -3.154 -3.622 -4.116 -4.534 -4.957 -5.404 -5.734 -6.064 -6.419 -6.795 -7.201 -7.472 -7.742 -8.194 -8.525 -8.875 -9.065 -9.474 -9.899 -10.341 -10.563 -10.887 -11.338 -11.62 -11.907 -12.506 -12.862 -13.252 -13.675 -14.226 -14.958 -16.201 -29.637 -10 ,18073 ,KEBNE ,16721534,Sat Nov 27 16:21:10 CET,Sat Nov 27 18:00:39 CET,0.0 2.283 2.83 3.23 3.588 3.882 4.137 4.376 4.783 4.961 5.131 5.383 5.605 5.748 6.012 6.258 6.487 6.593 6.792 6.973 7.23 7.402 7.568 7.799 8.013 8.212 8.396 8.575 8.837 9.073 9.282 9.543 9.788 10.02 10.275 10.559 10.833 11.105 11.371 11.634 11.897 12.187 12.506 12.783 13.058 13.282 13.482 13.608 13.543 13.173 12.159 10.569 9.07 7.685 6.434 5.31 4.356 3.485 2.705 1.888 1.154 0.486 -0.143 -0.749 -1.347 -1.896 -2.436 -2.872 -3.242 -3.639 -4.067 -4.428 -4.813 -5.217 -5.529 -5.841 -6.19 -6.575 -6.963 -7.229 -7.509 -7.96 -8.269 -8.609 -8.793 -9.156 -9.534 -9.937 -10.162 -10.481 -10.887 -11.163 -11.477 -12.156 -12.521 -12.97 -13.532 -14.12 -14.879 -16.136 -22.636 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_39.txt deleted file mode 100644 index 784f01f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10775 ,KEBNE ,16721535,Sat Nov 27 16:21:11 CET,Sat Nov 27 17:57:47 CET,0.0 1.253 1.734 2.078 2.351 2.587 2.81 3.02 3.374 3.521 3.668 3.865 4.082 4.204 4.438 4.67 4.886 4.982 5.15 5.302 5.514 5.658 5.798 5.98 6.151 6.313 6.47 6.621 6.804 6.964 7.107 7.274 7.427 7.573 7.744 7.929 8.089 8.25 8.414 8.575 8.724 8.863 8.99 9.084 9.139 9.13 9.052 8.85 8.434 7.664 6.076 4.011 2.237 0.698 -0.618 -1.811 -2.848 -3.76 -4.562 -5.381 -6.066 -6.696 -7.323 -7.897 -8.433 -8.923 -9.429 -9.898 -10.309 -10.748 -11.22 -11.598 -11.989 -12.415 -12.747 -13.083 -13.424 -13.787 -14.184 -14.472 -14.774 -15.241 -15.568 -15.91 -16.08 -16.435 -16.827 -17.259 -17.489 -17.827 -18.211 -18.486 -18.785 -19.443 -19.813 -20.202 -20.62 -21.1 -21.714 -22.556 -25.835 -2 ,26108 ,KEBNE ,16721536,Sat Nov 27 16:22:11 CET,Sat Nov 27 17:58:45 CET,0.0 1.325 1.84 2.2 2.473 2.724 2.943 3.125 3.443 3.595 3.735 3.897 4.105 4.227 4.453 4.674 4.892 4.991 5.173 5.345 5.585 5.731 5.867 6.058 6.24 6.402 6.55 6.688 6.867 7.038 7.188 7.359 7.524 7.675 7.845 8.023 8.172 8.32 8.482 8.661 8.806 8.932 9.042 9.09 9.14 9.154 9.056 8.805 8.373 7.602 6.069 4.096 2.37 0.877 -0.4 -1.555 -2.61 -3.585 -4.41 -5.22 -5.914 -6.549 -7.159 -7.734 -8.281 -8.776 -9.302 -9.779 -10.187 -10.609 -11.061 -11.447 -11.856 -12.286 -12.614 -12.947 -13.293 -13.667 -14.055 -14.328 -14.613 -15.059 -15.405 -15.761 -15.926 -16.263 -16.642 -17.045 -17.251 -17.579 -17.976 -18.249 -18.543 -19.174 -19.543 -19.963 -20.438 -20.997 -21.674 -22.539 -25.611 -3 ,5447 ,KEBNE ,16721537,Sat Nov 27 16:22:11 CET,Sat Nov 27 17:58:48 CET,0.0 1.209 1.676 2.033 2.328 2.583 2.814 3.027 3.401 3.564 3.722 3.932 4.154 4.284 4.519 4.733 4.94 5.038 5.209 5.37 5.586 5.716 5.843 6.019 6.185 6.343 6.489 6.624 6.79 6.94 7.097 7.289 7.449 7.599 7.759 7.918 8.069 8.218 8.358 8.493 8.618 8.747 8.883 8.987 9.04 9.035 8.97 8.788 8.355 7.556 6.035 4.02 2.315 0.814 -0.489 -1.637 -2.652 -3.592 -4.413 -5.243 -5.953 -6.572 -7.174 -7.767 -8.318 -8.834 -9.378 -9.854 -10.26 -10.688 -11.135 -11.513 -11.899 -12.294 -12.624 -12.972 -13.327 -13.695 -14.089 -14.371 -14.655 -15.116 -15.443 -15.785 -15.965 -16.322 -16.715 -17.143 -17.361 -17.707 -18.131 -18.406 -18.691 -19.357 -19.74 -20.147 -20.592 -21.113 -21.764 -22.649 -24.999 -4 ,10254 ,KEBNE ,16721538,Sat Nov 27 16:24:14 CET,Sat Nov 27 18:01:18 CET,0.0 1.242 1.707 2.072 2.372 2.626 2.867 3.085 3.459 3.629 3.786 3.982 4.195 4.317 4.55 4.765 4.962 5.05 5.213 5.377 5.615 5.761 5.898 6.088 6.258 6.419 6.564 6.695 6.876 7.039 7.18 7.346 7.492 7.631 7.797 7.967 8.118 8.276 8.427 8.572 8.71 8.85 8.966 9.036 9.107 9.116 9.012 8.809 8.397 7.588 6.07 4.123 2.445 0.946 -0.319 -1.471 -2.492 -3.391 -4.189 -4.995 -5.695 -6.327 -6.923 -7.494 -8.037 -8.553 -9.116 -9.592 -9.999 -10.424 -10.858 -11.242 -11.659 -12.073 -12.389 -12.733 -13.088 -13.445 -13.821 -14.095 -14.394 -14.862 -15.183 -15.52 -15.699 -16.081 -16.483 -16.905 -17.12 -17.457 -17.873 -18.155 -18.442 -19.078 -19.433 -19.817 -20.254 -20.792 -21.457 -22.303 -25.191 -5 ,31604 ,KEBNE ,16721539,Sat Nov 27 16:24:14 CET,Sat Nov 27 18:00:23 CET,0.0 1.191 1.696 2.069 2.356 2.608 2.818 3.006 3.353 3.511 3.659 3.845 4.071 4.204 4.455 4.679 4.874 4.966 5.148 5.324 5.566 5.712 5.854 6.054 6.229 6.401 6.561 6.706 6.887 7.049 7.208 7.396 7.564 7.723 7.888 8.052 8.208 8.354 8.517 8.67 8.811 8.964 9.078 9.16 9.227 9.24 9.165 8.971 8.572 7.808 6.263 4.237 2.532 1.084 -0.208 -1.352 -2.337 -3.242 -4.011 -4.781 -5.449 -6.06 -6.636 -7.145 -7.646 -8.103 -8.583 -9.038 -9.436 -9.846 -10.294 -10.672 -11.048 -11.46 -11.786 -12.101 -12.42 -12.764 -13.119 -13.371 -13.648 -14.088 -14.385 -14.704 -14.875 -15.217 -15.577 -15.976 -16.192 -16.526 -16.936 -17.211 -17.489 -18.089 -18.432 -18.793 -19.208 -19.72 -20.332 -21.137 -24.614 -6 ,19275 ,KEBNE ,16721540,Sat Nov 27 16:24:14 CET,Sat Nov 27 18:03:16 CET,0.0 1.338 1.79 2.121 2.417 2.691 2.925 3.128 3.497 3.665 3.819 4.003 4.207 4.318 4.532 4.725 4.907 4.997 5.161 5.31 5.533 5.673 5.8 5.983 6.156 6.325 6.478 6.615 6.783 6.934 7.086 7.266 7.429 7.571 7.727 7.888 8.028 8.169 8.317 8.448 8.555 8.671 8.793 8.882 8.929 8.921 8.828 8.609 8.172 7.381 5.83 3.743 2.065 0.661 -0.572 -1.695 -2.636 -3.47 -4.235 -4.984 -5.628 -6.231 -6.794 -7.332 -7.84 -8.309 -8.81 -9.237 -9.613 -10.038 -10.478 -10.839 -11.208 -11.622 -11.953 -12.276 -12.616 -12.971 -13.354 -13.617 -13.872 -14.283 -14.595 -14.924 -15.099 -15.458 -15.824 -16.206 -16.414 -16.739 -17.124 -17.393 -17.666 -18.268 -18.618 -19.0 -19.408 -19.904 -20.514 -21.383 -25.349 -7 ,11940 ,KEBNE ,16721541,Sat Nov 27 16:25:14 CET,Sat Nov 27 18:03:19 CET,0.0 1.443 1.918 2.288 2.595 2.834 3.045 3.249 3.621 3.79 3.949 4.162 4.383 4.504 4.722 4.929 5.122 5.213 5.388 5.554 5.788 5.927 6.057 6.237 6.4 6.557 6.706 6.844 7.02 7.188 7.353 7.552 7.716 7.864 8.038 8.22 8.373 8.526 8.685 8.845 8.987 9.119 9.243 9.318 9.34 9.312 9.234 9.023 8.587 7.742 6.213 4.282 2.625 1.202 -0.059 -1.231 -2.256 -3.196 -4.012 -4.787 -5.445 -6.058 -6.677 -7.28 -7.838 -8.33 -8.86 -9.351 -9.768 -10.202 -10.657 -11.031 -11.425 -11.839 -12.155 -12.486 -12.835 -13.208 -13.602 -13.875 -14.166 -14.624 -14.934 -15.256 -15.428 -15.796 -16.2 -16.629 -16.841 -17.179 -17.579 -17.836 -18.119 -18.746 -19.101 -19.483 -19.896 -20.378 -20.986 -21.82 -24.919 -8 ,7667 ,KEBNE ,16721542,Sat Nov 27 16:26:15 CET,Sat Nov 27 18:02:35 CET,0.0 1.31 1.819 2.199 2.503 2.782 3.026 3.24 3.6 3.762 3.92 4.11 4.32 4.439 4.659 4.868 5.07 5.168 5.357 5.529 5.768 5.917 6.055 6.247 6.429 6.599 6.758 6.912 7.104 7.273 7.424 7.589 7.74 7.879 8.039 8.218 8.367 8.509 8.654 8.797 8.929 9.042 9.141 9.2 9.245 9.251 9.15 8.953 8.574 7.822 6.351 4.396 2.655 1.116 -0.197 -1.353 -2.386 -3.352 -4.15 -4.938 -5.642 -6.283 -6.904 -7.501 -8.069 -8.611 -9.163 -9.628 -10.03 -10.454 -10.908 -11.294 -11.698 -12.104 -12.43 -12.773 -13.113 -13.469 -13.866 -14.147 -14.43 -14.886 -15.206 -15.534 -15.705 -16.071 -16.469 -16.882 -17.102 -17.446 -17.823 -18.087 -18.388 -19.054 -19.424 -19.817 -20.26 -20.793 -21.46 -22.34 -25.358 -9 ,10114 ,KEBNE ,16721543,Sat Nov 27 16:27:17 CET,Sat Nov 27 18:05:44 CET,0.0 1.342 1.869 2.218 2.512 2.767 2.995 3.204 3.563 3.726 3.873 4.049 4.26 4.378 4.587 4.778 4.96 5.047 5.219 5.379 5.607 5.742 5.867 6.048 6.222 6.38 6.524 6.664 6.827 6.972 7.113 7.272 7.413 7.548 7.713 7.885 8.042 8.209 8.373 8.531 8.665 8.81 8.96 9.052 9.086 9.063 8.973 8.749 8.325 7.547 6.034 4.025 2.273 0.764 -0.539 -1.691 -2.709 -3.652 -4.469 -5.311 -6.038 -6.676 -7.289 -7.883 -8.433 -8.934 -9.471 -9.945 -10.364 -10.813 -11.261 -11.636 -12.033 -12.451 -12.778 -13.114 -13.483 -13.857 -14.239 -14.508 -14.766 -15.195 -15.533 -15.89 -16.076 -16.448 -16.832 -17.262 -17.488 -17.816 -18.204 -18.467 -18.742 -19.377 -19.733 -20.125 -20.556 -21.065 -21.701 -22.59 -26.171 -10 ,26612 ,KEBNE ,16721544,Sat Nov 27 16:28:17 CET,Sat Nov 27 18:05:11 CET,0.0 1.409 1.936 2.321 2.636 2.909 3.123 3.329 3.723 3.897 4.057 4.269 4.492 4.617 4.844 5.043 5.222 5.307 5.475 5.632 5.847 5.98 6.102 6.286 6.467 6.631 6.779 6.919 7.091 7.245 7.385 7.553 7.711 7.854 8.005 8.165 8.318 8.465 8.611 8.75 8.873 9.003 9.128 9.21 9.29 9.323 9.237 9.022 8.577 7.791 6.323 4.414 2.782 1.366 0.094 -1.079 -2.098 -3.025 -3.817 -4.623 -5.329 -5.974 -6.574 -7.13 -7.685 -8.2 -8.714 -9.168 -9.571 -9.99 -10.43 -10.8 -11.19 -11.604 -11.924 -12.269 -12.621 -12.97 -13.362 -13.644 -13.93 -14.395 -14.729 -15.078 -15.263 -15.644 -16.053 -16.501 -16.728 -17.056 -17.447 -17.715 -18.004 -18.634 -18.99 -19.397 -19.844 -20.366 -21.022 -21.946 -25.063 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_43.txt deleted file mode 100644 index 923a9df4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_38_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29037 ,KEBNE ,16721545,Sat Nov 27 16:29:19 CET,Sat Nov 27 18:08:31 CET,0.0 1.844 2.541 3.018 3.408 3.755 4.05 4.304 4.774 5.001 5.211 5.527 5.814 6.002 6.338 6.644 6.928 7.068 7.33 7.586 7.965 8.194 8.409 8.725 9.03 9.307 9.568 9.831 10.17 10.496 10.809 11.182 11.551 11.898 12.299 12.729 13.114 13.549 14.028 14.507 15.01 15.583 16.233 16.895 17.636 18.427 19.328 20.33 21.424 22.661 23.95 24.654 24.847 24.763 24.569 24.306 24.0 23.671 23.35 23.02 22.71 22.424 22.136 21.832 21.513 21.213 20.917 20.635 20.37 20.105 19.817 19.567 19.311 19.019 18.775 18.517 18.241 17.96 17.673 17.461 17.242 16.91 16.678 16.421 16.277 15.973 15.647 15.293 15.106 14.836 14.472 14.248 14.016 13.481 13.184 12.846 12.448 11.97 11.395 10.612 7.608 -2 ,17168 ,KEBNE ,16721546,Sat Nov 27 16:29:18 CET,Sat Nov 27 18:06:52 CET,0.0 1.924 2.528 2.95 3.293 3.606 3.898 4.174 4.652 4.868 5.075 5.385 5.668 5.85 6.185 6.486 6.763 6.898 7.152 7.409 7.792 8.029 8.249 8.578 8.878 9.161 9.451 9.721 10.048 10.358 10.661 11.036 11.382 11.697 12.068 12.509 12.92 13.336 13.779 14.279 14.817 15.398 16.074 16.741 17.465 18.279 19.228 20.24 21.358 22.583 23.813 24.488 24.638 24.546 24.332 24.061 23.752 23.41 23.083 22.726 22.402 22.087 21.777 21.499 21.225 20.959 20.668 20.402 20.162 19.884 19.588 19.343 19.062 18.766 18.546 18.311 18.05 17.776 17.478 17.259 17.036 16.692 16.452 16.205 16.074 15.787 15.479 15.147 14.979 14.728 14.376 14.157 13.934 13.452 13.161 12.819 12.447 12.019 11.489 10.645 7.615 -3 ,17562 ,KEBNE ,16721547,Sat Nov 27 16:29:18 CET,Sat Nov 27 18:05:24 CET,0.0 2.063 2.618 3.051 3.426 3.753 4.045 4.308 4.758 4.959 5.157 5.448 5.713 5.889 6.231 6.541 6.83 6.973 7.232 7.482 7.846 8.075 8.293 8.607 8.923 9.209 9.463 9.71 10.039 10.351 10.637 10.989 11.343 11.686 12.069 12.493 12.894 13.33 13.801 14.302 14.82 15.398 16.059 16.717 17.461 18.28 19.2 20.226 21.385 22.672 24.114 24.94 25.133 25.067 24.834 24.566 24.28 23.96 23.647 23.294 22.966 22.658 22.328 22.01 21.724 21.438 21.115 20.832 20.581 20.305 20.024 19.799 19.533 19.242 19.03 18.8 18.546 18.269 17.963 17.753 17.545 17.201 16.966 16.725 16.59 16.299 15.992 15.647 15.463 15.203 14.84 14.614 14.401 13.901 13.584 13.229 12.852 12.403 11.816 11.01 7.737 -4 ,21009 ,KEBNE ,16721548,Sat Nov 27 16:29:18 CET,Sat Nov 27 18:05:40 CET,0.0 1.95 2.574 3.037 3.424 3.759 4.065 4.325 4.809 5.031 5.233 5.531 5.799 5.97 6.293 6.611 6.888 7.012 7.262 7.5 7.834 8.054 8.266 8.572 8.863 9.153 9.426 9.672 10.004 10.338 10.654 11.044 11.432 11.775 12.143 12.567 12.971 13.419 13.897 14.389 14.895 15.466 16.151 16.815 17.583 18.437 19.345 20.299 21.433 22.732 24.024 24.788 25.0 24.925 24.751 24.5 24.232 23.975 23.698 23.369 23.055 22.763 22.452 22.136 21.839 21.575 21.279 20.98 20.724 20.46 20.183 19.948 19.698 19.434 19.215 18.979 18.724 18.447 18.157 17.965 17.751 17.397 17.15 16.874 16.734 16.434 16.11 15.769 15.594 15.34 14.986 14.757 14.51 13.963 13.658 13.288 12.859 12.375 11.835 11.081 8.281 -5 ,2841 ,KEBNE ,16721549,Sat Nov 27 16:29:18 CET,Sat Nov 27 18:05:30 CET,0.0 1.74 2.329 2.782 3.136 3.455 3.766 4.039 4.49 4.689 4.888 5.182 5.443 5.607 5.915 6.203 6.462 6.589 6.841 7.078 7.426 7.652 7.86 8.155 8.44 8.703 8.973 9.24 9.555 9.848 10.144 10.508 10.852 11.161 11.512 11.922 12.321 12.757 13.216 13.69 14.203 14.789 15.458 16.123 16.866 17.692 18.615 19.594 20.672 21.867 23.232 24.046 24.197 24.132 23.956 23.696 23.403 23.075 22.743 22.384 22.056 21.764 21.474 21.179 20.883 20.584 20.269 19.973 19.694 19.411 19.12 18.87 18.604 18.324 18.112 17.887 17.644 17.389 17.093 16.877 16.652 16.287 16.042 15.79 15.652 15.361 15.05 14.72 14.55 14.301 13.952 13.717 13.48 12.968 12.68 12.342 11.935 11.454 10.856 10.115 6.27 -6 ,7795 ,KEBNE ,16721550,Sat Nov 27 16:30:19 CET,Sat Nov 27 18:07:38 CET,0.0 2.588 3.246 3.754 4.167 4.492 4.776 5.05 5.549 5.784 6.009 6.318 6.593 6.773 7.086 7.379 7.682 7.829 8.098 8.353 8.71 8.939 9.164 9.489 9.784 10.058 10.335 10.607 10.943 11.269 11.581 11.946 12.308 12.655 13.038 13.47 13.893 14.343 14.832 15.354 15.888 16.455 17.119 17.786 18.527 19.34 20.236 21.213 22.344 23.608 24.886 25.619 25.807 25.72 25.525 25.274 24.985 24.693 24.4 24.063 23.749 23.432 23.126 22.838 22.565 22.312 22.03 21.75 21.498 21.223 20.93 20.693 20.427 20.147 19.924 19.684 19.441 19.17 18.865 18.652 18.446 18.137 17.913 17.668 17.532 17.235 16.923 16.578 16.39 16.126 15.76 15.519 15.267 14.736 14.434 14.09 13.711 13.284 12.706 11.899 8.253 -7 ,16838 ,KEBNE ,16721551,Sat Nov 27 16:30:19 CET,Sat Nov 27 18:06:25 CET,0.0 1.58 2.166 2.647 3.063 3.406 3.704 3.975 4.447 4.657 4.853 5.17 5.445 5.619 5.943 6.246 6.53 6.667 6.928 7.172 7.531 7.758 7.985 8.312 8.628 8.933 9.209 9.479 9.818 10.137 10.45 10.819 11.17 11.514 11.905 12.335 12.748 13.191 13.647 14.129 14.656 15.237 15.897 16.545 17.288 18.102 19.019 20.056 21.2 22.459 23.809 24.6 24.748 24.632 24.48 24.237 23.926 23.639 23.345 22.973 22.633 22.322 22.015 21.702 21.382 21.083 20.761 20.477 20.232 19.96 19.692 19.472 19.235 18.976 18.756 18.529 18.296 18.04 17.759 17.557 17.344 17.015 16.78 16.537 16.412 16.15 15.861 15.53 15.349 15.097 14.785 14.58 14.349 13.822 13.53 13.183 12.753 12.256 11.708 11.033 8.293 -8 ,27787 ,KEBNE ,16721552,Sat Nov 27 16:30:19 CET,Sat Nov 27 18:06:57 CET,0.0 1.961 2.551 2.972 3.353 3.691 3.989 4.254 4.726 4.942 5.155 5.473 5.746 5.931 6.273 6.577 6.871 7.01 7.272 7.534 7.909 8.147 8.367 8.67 8.967 9.253 9.537 9.806 10.138 10.469 10.782 11.163 11.525 11.855 12.228 12.646 13.032 13.457 13.952 14.483 15.018 15.618 16.312 16.98 17.72 18.524 19.39 20.35 21.444 22.651 23.978 24.741 24.9 24.847 24.652 24.336 24.031 23.731 23.412 23.057 22.74 22.443 22.126 21.809 21.496 21.19 20.874 20.598 20.34 20.056 19.764 19.518 19.264 19.008 18.806 18.584 18.338 18.074 17.784 17.581 17.37 17.019 16.771 16.5 16.367 16.102 15.806 15.471 15.293 15.037 14.691 14.472 14.239 13.699 13.396 13.065 12.7 12.262 11.694 10.875 7.858 -9 ,20762 ,KEBNE ,16721553,Sat Nov 27 16:32:21 CET,Sat Nov 27 18:08:27 CET,0.0 1.453 2.035 2.52 2.925 3.243 3.516 3.764 4.25 4.471 4.675 4.985 5.252 5.429 5.777 6.083 6.365 6.506 6.788 7.052 7.431 7.669 7.889 8.202 8.484 8.748 9.025 9.292 9.615 9.925 10.227 10.577 10.911 11.242 11.618 12.036 12.458 12.932 13.43 13.926 14.408 14.966 15.623 16.254 16.994 17.84 18.806 19.834 20.949 22.166 23.455 24.208 24.352 24.245 24.066 23.814 23.526 23.227 22.947 22.64 22.336 22.049 21.752 21.45 21.145 20.868 20.576 20.285 20.037 19.785 19.504 19.265 19.013 18.74 18.523 18.295 18.052 17.791 17.514 17.322 17.117 16.761 16.513 16.262 16.124 15.824 15.502 15.157 14.97 14.711 14.356 14.126 13.887 13.312 12.985 12.636 12.242 11.781 11.213 10.398 7.204 -10 ,24724 ,KEBNE ,16721554,Sat Nov 27 16:33:22 CET,Sat Nov 27 18:13:22 CET,0.0 1.988 2.584 3.063 3.451 3.785 4.088 4.347 4.838 5.078 5.297 5.607 5.866 6.034 6.381 6.708 7.006 7.153 7.435 7.69 8.047 8.27 8.483 8.795 9.101 9.391 9.664 9.928 10.255 10.566 10.87 11.227 11.575 11.903 12.284 12.729 13.132 13.576 14.061 14.565 15.115 15.722 16.375 17.025 17.791 18.65 19.619 20.592 21.611 22.803 24.126 24.856 25.049 24.968 24.78 24.549 24.269 23.949 23.649 23.3 22.972 22.672 22.365 22.069 21.778 21.505 21.203 20.916 20.664 20.386 20.082 19.84 19.575 19.293 19.06 18.794 18.529 18.255 17.958 17.748 17.527 17.181 16.939 16.68 16.541 16.236 15.922 15.599 15.427 15.177 14.83 14.606 14.378 13.861 13.562 13.223 12.831 12.336 11.795 11.083 7.667 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_20.txt deleted file mode 100644 index a1744e22..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_20.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6213 ,KEBNE ,16721555,Sat Nov 27 16:33:21 CET,Sat Nov 27 18:11:09 CET,0.0 1.534 2.081 2.5 2.862 3.16 3.402 3.627 4.037 4.211 4.38 4.642 4.874 5.014 5.267 5.515 5.764 5.88 6.103 6.314 6.605 6.784 6.949 7.178 7.398 7.611 7.818 8.02 8.288 8.545 8.773 9.035 9.306 9.576 9.871 10.182 10.463 10.783 11.132 11.486 11.85 12.25 12.688 13.09 13.53 13.992 14.472 14.929 15.35 15.623 15.574 15.026 14.299 13.559 12.826 12.144 11.529 10.944 10.411 9.858 9.372 8.912 8.448 8.006 7.584 7.193 6.775 6.384 6.045 5.696 5.34 5.053 4.738 4.401 4.138 3.84 3.53 3.223 2.907 2.681 2.438 2.066 1.796 1.5 1.353 1.051 0.73 0.397 0.217 -0.051 -0.382 -0.615 -0.856 -1.379 -1.686 -2.033 -2.417 -2.839 -3.3 -3.898 -5.955 -2 ,21738 ,KEBNE ,16721556,Sat Nov 27 16:34:23 CET,Sat Nov 27 18:14:13 CET,0.0 1.256 1.733 2.122 2.458 2.74 3.01 3.256 3.69 3.897 4.089 4.368 4.611 4.767 5.059 5.324 5.559 5.674 5.906 6.124 6.433 6.635 6.816 7.07 7.313 7.541 7.75 7.951 8.229 8.495 8.729 9.006 9.273 9.526 9.814 10.138 10.46 10.8 11.147 11.502 11.862 12.276 12.709 13.112 13.592 14.081 14.565 15.028 15.477 15.787 15.729 15.174 14.447 13.745 13.07 12.371 11.723 11.107 10.565 10.016 9.511 9.03 8.567 8.136 7.735 7.358 6.956 6.59 6.264 5.905 5.52 5.207 4.891 4.575 4.334 4.072 3.785 3.49 3.191 2.977 2.743 2.374 2.117 1.849 1.706 1.409 1.095 0.756 0.575 0.303 -0.022 -0.237 -0.458 -0.958 -1.244 -1.58 -1.966 -2.36 -2.832 -3.601 -5.656 -3 ,31283 ,KEBNE ,16721557,Sat Nov 27 16:35:23 CET,Sat Nov 27 18:09:56 CET,0.0 1.298 1.751 2.114 2.433 2.705 2.939 3.172 3.616 3.802 3.978 4.226 4.447 4.598 4.881 5.128 5.375 5.496 5.717 5.918 6.2 6.384 6.563 6.829 7.083 7.31 7.534 7.757 8.053 8.334 8.588 8.884 9.163 9.439 9.75 10.07 10.367 10.695 11.046 11.395 11.737 12.104 12.519 12.933 13.4 13.878 14.342 14.785 15.195 15.449 15.421 14.879 14.141 13.425 12.728 12.051 11.4 10.779 10.255 9.701 9.204 8.76 8.308 7.869 7.46 7.082 6.691 6.332 6.015 5.694 5.358 5.063 4.752 4.426 4.169 3.894 3.607 3.317 3.012 2.793 2.56 2.195 1.944 1.681 1.544 1.268 0.959 0.621 0.443 0.177 -0.136 -0.347 -0.565 -1.057 -1.349 -1.67 -2.028 -2.45 -2.969 -3.666 -5.406 -4 ,27531 ,KEBNE ,16721558,Sat Nov 27 16:35:23 CET,Sat Nov 27 18:09:52 CET,0.0 1.178 1.737 2.172 2.53 2.821 3.066 3.298 3.704 3.886 4.063 4.311 4.543 4.696 4.99 5.26 5.505 5.624 5.844 6.048 6.337 6.519 6.7 6.962 7.2 7.432 7.653 7.847 8.092 8.328 8.565 8.857 9.12 9.365 9.666 10.005 10.304 10.614 10.949 11.302 11.658 12.037 12.436 12.83 13.287 13.728 14.156 14.565 14.964 15.326 15.318 14.756 14.06 13.329 12.61 11.907 11.267 10.652 10.087 9.496 8.995 8.544 8.091 7.653 7.236 6.837 6.414 6.044 5.713 5.382 5.042 4.743 4.431 4.098 3.837 3.56 3.271 2.97 2.645 2.42 2.192 1.837 1.575 1.295 1.148 0.834 0.513 0.187 -0.001 -0.27 -0.586 -0.808 -1.046 -1.594 -1.887 -2.197 -2.555 -2.939 -3.379 -3.991 -5.741 -5 ,8143 ,KEBNE ,16721559,Sat Nov 27 16:36:24 CET,Sat Nov 27 18:11:33 CET,0.0 1.173 1.641 1.987 2.295 2.562 2.78 2.978 3.345 3.523 3.697 3.941 4.163 4.3 4.557 4.797 5.015 5.118 5.331 5.539 5.831 6.018 6.192 6.433 6.65 6.862 7.079 7.282 7.538 7.79 8.028 8.32 8.598 8.848 9.124 9.425 9.708 10.019 10.349 10.675 11.019 11.388 11.801 12.194 12.629 13.073 13.518 13.971 14.358 14.624 14.602 14.031 13.367 12.659 11.926 11.243 10.618 9.998 9.444 8.881 8.379 7.929 7.495 7.082 6.696 6.314 5.9 5.541 5.228 4.902 4.565 4.276 3.958 3.617 3.356 3.088 2.802 2.509 2.202 1.974 1.748 1.398 1.144 0.881 0.745 0.458 0.158 -0.16 -0.334 -0.598 -0.913 -1.123 -1.34 -1.841 -2.121 -2.41 -2.753 -3.18 -3.718 -4.507 -7.483 -6 ,22686 ,KEBNE ,16721560,Sat Nov 27 16:35:24 CET,Sat Nov 27 18:10:24 CET,0.0 1.191 1.638 2.007 2.34 2.639 2.907 3.153 3.599 3.795 3.976 4.233 4.463 4.609 4.894 5.144 5.38 5.49 5.709 5.924 6.232 6.433 6.616 6.876 7.124 7.355 7.567 7.768 8.026 8.27 8.497 8.754 9.011 9.258 9.532 9.831 10.106 10.44 10.819 11.199 11.571 11.966 12.417 12.859 13.341 13.807 14.263 14.738 15.208 15.548 15.505 14.982 14.329 13.609 12.888 12.19 11.551 10.952 10.398 9.829 9.34 8.87 8.421 7.997 7.579 7.192 6.785 6.415 6.093 5.757 5.406 5.113 4.8 4.47 4.216 3.945 3.662 3.364 3.043 2.822 2.592 2.231 1.969 1.681 1.532 1.242 0.943 0.601 0.423 0.163 -0.151 -0.369 -0.606 -1.13 -1.422 -1.745 -2.113 -2.536 -3.03 -3.67 -5.549 -7 ,22679 ,KEBNE ,16721561,Sat Nov 27 16:35:23 CET,Sat Nov 27 18:10:40 CET,0.0 1.239 1.775 2.165 2.481 2.753 3.006 3.255 3.706 3.893 4.061 4.298 4.525 4.676 4.957 5.22 5.457 5.563 5.76 5.946 6.231 6.423 6.607 6.881 7.147 7.394 7.619 7.836 8.104 8.358 8.602 8.896 9.174 9.427 9.711 10.023 10.309 10.625 10.951 11.287 11.638 12.01 12.43 12.837 13.275 13.752 14.272 14.725 15.096 15.354 15.301 14.696 13.94 13.234 12.56 11.866 11.242 10.657 10.107 9.542 9.014 8.536 8.092 7.668 7.27 6.891 6.484 6.118 5.797 5.461 5.103 4.806 4.507 4.179 3.896 3.602 3.307 2.995 2.669 2.448 2.219 1.84 1.577 1.306 1.162 0.85 0.525 0.193 0.011 -0.27 -0.622 -0.857 -1.102 -1.657 -1.965 -2.289 -2.675 -3.114 -3.58 -4.197 -6.061 -8 ,23206 ,KEBNE ,16721562,Sat Nov 27 16:35:23 CET,Sat Nov 27 18:10:14 CET,0.0 1.179 1.704 2.076 2.383 2.661 2.906 3.134 3.54 3.725 3.906 4.149 4.378 4.536 4.826 5.095 5.342 5.458 5.683 5.9 6.213 6.401 6.587 6.857 7.094 7.324 7.542 7.741 8.006 8.267 8.515 8.8 9.052 9.303 9.594 9.906 10.206 10.531 10.867 11.203 11.533 11.904 12.339 12.757 13.223 13.711 14.21 14.669 15.08 15.358 15.304 14.73 14.006 13.291 12.606 11.887 11.186 10.529 9.963 9.388 8.855 8.364 7.906 7.473 7.054 6.67 6.268 5.895 5.568 5.225 4.869 4.569 4.256 3.932 3.676 3.392 3.09 2.789 2.476 2.245 2.004 1.644 1.384 1.107 0.964 0.668 0.356 0.021 -0.162 -0.438 -0.742 -0.962 -1.215 -1.752 -2.044 -2.381 -2.761 -3.171 -3.681 -4.438 -5.928 -9 ,8120 ,KEBNE ,16721563,Sat Nov 27 16:36:25 CET,Sat Nov 27 18:17:44 CET,0.0 1.536 2.126 2.577 2.92 3.189 3.418 3.628 4.014 4.185 4.349 4.582 4.807 4.962 5.262 5.531 5.779 5.893 6.107 6.314 6.612 6.808 7.004 7.285 7.549 7.804 8.044 8.267 8.533 8.786 9.038 9.339 9.618 9.878 10.186 10.521 10.83 11.163 11.503 11.864 12.256 12.665 13.107 13.527 13.984 14.488 15.013 15.505 15.941 16.221 16.117 15.597 14.927 14.222 13.565 12.914 12.294 11.7 11.16 10.591 10.076 9.613 9.184 8.762 8.347 7.963 7.578 7.233 6.915 6.594 6.264 5.98 5.679 5.361 5.103 4.833 4.551 4.262 3.952 3.717 3.478 3.135 2.892 2.622 2.48 2.189 1.883 1.561 1.385 1.114 0.78 0.563 0.341 -0.154 -0.442 -0.757 -1.108 -1.532 -2.035 -2.707 -4.256 -10 ,31321 ,KEBNE ,16721564,Sat Nov 27 16:36:24 CET,Sat Nov 27 18:11:27 CET,0.0 1.024 1.51 1.878 2.173 2.433 2.678 2.909 3.334 3.53 3.711 3.968 4.204 4.376 4.699 4.972 5.207 5.319 5.551 5.76 6.045 6.235 6.421 6.676 6.93 7.177 7.402 7.61 7.87 8.118 8.344 8.607 8.861 9.111 9.396 9.704 9.989 10.295 10.624 10.961 11.302 11.681 12.103 12.497 12.932 13.397 13.893 14.386 14.827 15.079 15.015 14.448 13.713 12.954 12.183 11.463 10.798 10.156 9.583 8.999 8.481 8.025 7.599 7.173 6.76 6.385 5.977 5.598 5.277 4.947 4.59 4.276 3.939 3.596 3.333 3.039 2.733 2.433 2.112 1.89 1.662 1.299 1.042 0.769 0.619 0.298 -0.029 -0.377 -0.57 -0.842 -1.157 -1.359 -1.565 -2.054 -2.33 -2.647 -3.004 -3.419 -3.925 -4.549 -6.443 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_43.txt deleted file mode 100644 index e32e34d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_41_43.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31955 ,KEBNE ,16721565,Sat Nov 27 16:36:25 CET,Sat Nov 27 18:11:10 CET,0.0 1.199 1.666 1.999 2.292 2.576 2.817 3.035 3.446 3.628 3.793 4.023 4.253 4.406 4.688 4.931 5.165 5.277 5.487 5.689 5.989 6.179 6.36 6.627 6.882 7.12 7.349 7.573 7.864 8.126 8.357 8.631 8.892 9.141 9.442 9.786 10.105 10.461 10.832 11.211 11.606 12.039 12.564 13.074 13.6 14.203 14.871 15.552 16.318 17.083 17.768 18.024 17.891 17.617 17.264 16.818 16.38 15.97 15.583 15.17 14.791 14.422 14.056 13.688 13.319 12.98 12.625 12.296 12.002 11.698 11.374 11.081 10.784 10.49 10.255 10.007 9.748 9.476 9.179 8.967 8.756 8.431 8.179 7.891 7.746 7.451 7.124 6.762 6.564 6.297 5.951 5.721 5.467 4.927 4.642 4.319 3.934 3.476 2.904 2.058 -0.316 -3 ,26812 ,KEBNE ,16721567,Sat Nov 27 16:37:26 CET,Sat Nov 27 18:11:49 CET,0.0 1.455 1.944 2.331 2.657 2.934 3.181 3.397 3.79 3.968 4.134 4.364 4.59 4.735 4.996 5.249 5.509 5.634 5.856 6.074 6.392 6.579 6.75 7.012 7.26 7.486 7.702 7.908 8.177 8.427 8.667 8.967 9.263 9.55 9.866 10.207 10.535 10.896 11.279 11.662 12.061 12.501 12.998 13.489 14.051 14.667 15.333 16.038 16.822 17.625 18.374 18.662 18.519 18.245 17.902 17.52 17.161 16.771 16.393 15.976 15.583 15.229 14.883 14.55 14.219 13.893 13.536 13.223 12.946 12.64 12.33 12.079 11.818 11.544 11.309 11.058 10.803 10.518 10.217 10.016 9.815 9.493 9.251 9.004 8.87 8.577 8.275 7.966 7.807 7.563 7.249 7.041 6.814 6.271 5.983 5.687 5.309 4.858 4.334 3.59 1.218 -4 ,9712 ,KEBNE ,16721568,Sat Nov 27 16:37:26 CET,Sat Nov 27 18:11:49 CET,0.0 1.084 1.539 1.894 2.211 2.477 2.711 2.929 3.325 3.506 3.685 3.947 4.174 4.32 4.597 4.845 5.08 5.192 5.406 5.612 5.897 6.073 6.244 6.488 6.721 6.956 7.178 7.381 7.655 7.924 8.185 8.499 8.808 9.092 9.395 9.751 10.083 10.431 10.794 11.153 11.537 11.993 12.504 12.991 13.555 14.164 14.882 15.672 16.498 17.347 18.123 18.422 18.351 18.137 17.853 17.494 17.122 16.729 16.317 15.852 15.448 15.088 14.724 14.371 14.044 13.739 13.407 13.091 12.81 12.508 12.171 11.888 11.614 11.333 11.102 10.851 10.583 10.308 10.002 9.785 9.567 9.22 8.974 8.712 8.573 8.273 7.958 7.631 7.462 7.205 6.849 6.622 6.384 5.866 5.578 5.253 4.876 4.436 3.905 3.198 -0.786 -5 ,25396 ,KEBNE ,16721569,Sat Nov 27 16:37:26 CET,Sat Nov 27 18:11:26 CET,0.0 1.33 1.799 2.152 2.465 2.737 2.99 3.222 3.618 3.797 3.967 4.233 4.474 4.618 4.912 5.188 5.445 5.565 5.777 5.982 6.275 6.465 6.651 6.907 7.146 7.366 7.582 7.796 8.07 8.34 8.604 8.914 9.19 9.451 9.758 10.101 10.419 10.77 11.147 11.523 11.912 12.352 12.839 13.326 13.906 14.512 15.184 15.919 16.674 17.451 18.238 18.531 18.4 18.14 17.824 17.445 17.057 16.666 16.296 15.89 15.522 15.174 14.837 14.511 14.178 13.857 13.523 13.215 12.94 12.646 12.322 12.06 11.804 11.522 11.281 11.033 10.785 10.511 10.198 9.983 9.774 9.44 9.203 8.956 8.823 8.542 8.231 7.897 7.718 7.463 7.136 6.913 6.682 6.162 5.869 5.534 5.13 4.689 4.145 3.403 0.594 -6 ,28916 ,KEBNE ,16721570,Sat Nov 27 16:37:26 CET,Sat Nov 27 18:11:47 CET,0.0 1.341 1.882 2.274 2.58 2.856 3.106 3.332 3.736 3.912 4.087 4.33 4.551 4.691 4.959 5.214 5.445 5.556 5.766 5.962 6.24 6.415 6.594 6.863 7.111 7.352 7.576 7.781 8.042 8.278 8.507 8.791 9.06 9.311 9.597 9.91 10.205 10.529 10.877 11.251 11.657 12.114 12.621 13.103 13.654 14.27 14.927 15.637 16.417 17.258 18.072 18.351 18.269 18.036 17.708 17.332 16.95 16.539 16.15 15.752 15.393 15.046 14.702 14.371 14.056 13.749 13.416 13.116 12.841 12.541 12.23 11.971 11.704 11.424 11.191 10.936 10.678 10.419 10.143 9.945 9.737 9.402 9.166 8.905 8.764 8.475 8.154 7.798 7.613 7.35 7.003 6.791 6.577 6.107 5.826 5.506 5.177 4.746 4.16 3.401 0.967 -7 ,12273 ,KEBNE ,16721571,Sat Nov 27 16:37:26 CET,Sat Nov 27 18:11:49 CET,0.0 1.413 1.885 2.242 2.533 2.813 3.084 3.319 3.741 3.934 4.102 4.348 4.575 4.71 4.973 5.225 5.466 5.578 5.795 6.02 6.328 6.512 6.698 6.956 7.196 7.427 7.65 7.875 8.154 8.402 8.658 8.982 9.27 9.548 9.86 10.206 10.533 10.869 11.239 11.615 12.001 12.44 12.958 13.478 14.049 14.644 15.321 16.033 16.804 17.657 18.482 18.772 18.675 18.401 17.998 17.568 17.165 16.753 16.371 15.969 15.588 15.225 14.85 14.483 14.133 13.807 13.464 13.141 12.853 12.551 12.227 11.94 11.634 11.328 11.081 10.823 10.558 10.273 9.969 9.74 9.496 9.12 8.859 8.578 8.435 8.125 7.772 7.411 7.232 6.97 6.63 6.412 6.18 5.651 5.357 5.022 4.647 4.187 3.593 2.87 0.459 -8 ,59 ,KEBNE ,16721572,Sat Nov 27 16:38:27 CET,Sat Nov 27 18:12:41 CET,0.0 1.612 2.143 2.509 2.832 3.124 3.364 3.592 4.006 4.188 4.374 4.653 4.894 5.048 5.342 5.613 5.852 5.965 6.191 6.406 6.716 6.918 7.104 7.365 7.627 7.868 8.097 8.323 8.603 8.867 9.123 9.423 9.71 9.988 10.305 10.653 10.977 11.331 11.707 12.092 12.484 12.924 13.424 13.918 14.501 15.152 15.871 16.611 17.354 18.124 18.912 19.187 19.074 18.782 18.419 18.008 17.558 17.128 16.725 16.286 15.9 15.564 15.219 14.857 14.518 14.203 13.862 13.536 13.259 12.979 12.669 12.403 12.12 11.813 11.567 11.298 11.014 10.726 10.42 10.205 9.979 9.633 9.395 9.133 9.001 8.717 8.395 8.027 7.834 7.579 7.26 7.052 6.829 6.313 6.018 5.673 5.258 4.796 4.226 3.384 0.033 -9 ,23178 ,KEBNE ,16721573,Sat Nov 27 16:38:27 CET,Sat Nov 27 18:13:35 CET,0.0 1.256 1.702 2.071 2.403 2.684 2.928 3.166 3.599 3.789 3.964 4.207 4.43 4.572 4.851 5.103 5.331 5.447 5.68 5.89 6.188 6.39 6.578 6.851 7.096 7.319 7.554 7.774 8.052 8.329 8.583 8.877 9.149 9.405 9.725 10.083 10.414 10.772 11.136 11.514 11.909 12.338 12.836 13.346 13.936 14.558 15.213 15.927 16.719 17.532 18.261 18.564 18.483 18.221 17.886 17.503 17.11 16.688 16.279 15.86 15.449 15.055 14.684 14.34 13.995 13.681 13.349 13.02 12.731 12.438 12.135 11.873 11.576 11.268 11.028 10.762 10.49 10.202 9.895 9.692 9.472 9.124 8.867 8.578 8.432 8.128 7.816 7.484 7.299 7.025 6.66 6.437 6.202 5.696 5.422 5.102 4.72 4.302 3.817 3.108 0.787 -10 ,12045 ,KEBNE ,16721574,Sat Nov 27 16:38:27 CET,Sat Nov 27 18:13:02 CET,0.0 1.48 1.966 2.344 2.651 2.931 3.194 3.42 3.812 3.998 4.174 4.426 4.657 4.804 5.088 5.361 5.623 5.749 5.98 6.192 6.492 6.682 6.87 7.15 7.408 7.648 7.888 8.111 8.377 8.635 8.886 9.203 9.499 9.755 10.053 10.396 10.712 11.056 11.439 11.819 12.205 12.656 13.162 13.642 14.197 14.803 15.477 16.187 16.981 17.824 18.532 18.795 18.678 18.404 18.059 17.679 17.283 16.872 16.489 16.061 15.64 15.249 14.877 14.52 14.174 13.857 13.517 13.193 12.909 12.611 12.287 12.017 11.729 11.427 11.194 10.94 10.669 10.389 10.104 9.896 9.661 9.29 9.04 8.767 8.617 8.308 7.984 7.618 7.417 7.15 6.815 6.587 6.335 5.767 5.437 5.053 4.592 4.058 3.491 2.797 0.32 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_39.txt deleted file mode 100644 index c4e5e2aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15317 ,KEBNE ,16721575,Sat Nov 27 16:38:27 CET,Sat Nov 27 18:13:13 CET,0.0 1.179 1.663 2.023 2.319 2.578 2.805 2.996 3.346 3.511 3.665 3.871 4.063 4.179 4.411 4.615 4.802 4.888 5.052 5.204 5.423 5.563 5.689 5.861 6.018 6.16 6.289 6.408 6.567 6.716 6.85 7.004 7.145 7.266 7.395 7.527 7.642 7.755 7.855 7.961 8.048 8.073 8.056 8.006 7.894 7.715 7.412 6.914 6.123 4.839 2.544 -0.186 -2.444 -4.387 -5.997 -7.409 -8.654 -9.759 -10.691 -11.632 -12.454 -13.18 -13.859 -14.47 -15.042 -15.58 -16.157 -16.66 -17.088 -17.556 -18.035 -18.417 -18.839 -19.29 -19.63 -19.975 -20.328 -20.692 -21.097 -21.376 -21.643 -22.071 -22.384 -22.712 -22.876 -23.216 -23.574 -23.956 -24.163 -24.49 -24.844 -25.083 -25.355 -25.941 -26.267 -26.623 -27.007 -27.441 -28.01 -28.806 -31.145 -2 ,3352 ,KEBNE ,16721576,Sat Nov 27 16:38:26 CET,Sat Nov 27 18:13:13 CET,0.0 1.259 1.73 2.079 2.345 2.592 2.816 3.01 3.36 3.514 3.66 3.853 4.05 4.171 4.396 4.599 4.789 4.876 5.037 5.193 5.401 5.525 5.655 5.835 5.986 6.126 6.267 6.399 6.551 6.696 6.824 6.963 7.1 7.235 7.356 7.465 7.571 7.665 7.74 7.81 7.889 7.943 7.94 7.902 7.796 7.586 7.263 6.804 6.056 4.772 2.543 -0.147 -2.344 -4.19 -5.753 -7.13 -8.341 -9.42 -10.359 -11.321 -12.142 -12.872 -13.552 -14.187 -14.786 -15.334 -15.916 -16.421 -16.851 -17.294 -17.733 -18.108 -18.519 -18.954 -19.288 -19.633 -19.989 -20.354 -20.735 -21.0 -21.273 -21.716 -22.025 -22.334 -22.498 -22.852 -23.223 -23.609 -23.816 -24.149 -24.523 -24.776 -25.035 -25.609 -25.949 -26.313 -26.687 -27.1 -27.618 -28.31 -30.629 -3 ,16637 ,KEBNE ,16721577,Sat Nov 27 16:38:27 CET,Sat Nov 27 18:13:25 CET,0.0 1.052 1.467 1.792 2.075 2.33 2.55 2.746 3.093 3.252 3.408 3.619 3.819 3.946 4.178 4.391 4.591 4.681 4.859 5.027 5.244 5.378 5.508 5.68 5.831 5.974 6.111 6.235 6.385 6.517 6.632 6.757 6.877 7.005 7.15 7.295 7.399 7.484 7.569 7.647 7.704 7.732 7.722 7.669 7.563 7.363 7.055 6.611 5.855 4.561 2.293 -0.52 -2.85 -4.783 -6.419 -7.852 -9.086 -10.187 -11.11 -12.019 -12.797 -13.497 -14.155 -14.783 -15.38 -15.906 -16.444 -16.933 -17.36 -17.816 -18.3 -18.696 -19.102 -19.527 -19.859 -20.196 -20.545 -20.907 -21.281 -21.543 -21.817 -22.254 -22.563 -22.888 -23.056 -23.407 -23.793 -24.207 -24.422 -24.747 -25.098 -25.337 -25.6 -26.195 -26.509 -26.841 -27.216 -27.666 -28.202 -28.853 -30.81 -4 ,24695 ,KEBNE ,16721578,Sat Nov 27 16:38:27 CET,Sat Nov 27 18:13:15 CET,0.0 1.211 1.684 2.018 2.303 2.562 2.799 3.024 3.424 3.592 3.753 3.965 4.169 4.294 4.516 4.713 4.908 5.001 5.163 5.313 5.533 5.672 5.804 5.984 6.147 6.294 6.42 6.543 6.696 6.837 6.969 7.12 7.248 7.361 7.488 7.63 7.758 7.869 7.969 8.047 8.084 8.105 8.113 8.097 8.021 7.849 7.549 7.066 6.271 5.01 2.905 0.268 -1.963 -3.849 -5.509 -6.99 -8.23 -9.317 -10.265 -11.228 -12.053 -12.778 -13.462 -14.115 -14.702 -15.228 -15.777 -16.267 -16.705 -17.148 -17.607 -17.991 -18.381 -18.801 -19.138 -19.478 -19.835 -20.211 -20.588 -20.856 -21.138 -21.591 -21.91 -22.218 -22.378 -22.744 -23.123 -23.505 -23.713 -24.047 -24.427 -24.67 -24.916 -25.479 -25.8 -26.188 -26.606 -27.044 -27.631 -28.485 -31.897 -5 ,17523 ,KEBNE ,16721579,Sat Nov 27 16:38:26 CET,Sat Nov 27 18:14:09 CET,0.0 1.127 1.609 1.945 2.235 2.48 2.707 2.923 3.288 3.454 3.613 3.819 4.019 4.137 4.356 4.563 4.751 4.839 5.007 5.158 5.371 5.505 5.622 5.774 5.923 6.073 6.208 6.329 6.477 6.616 6.746 6.893 7.027 7.146 7.276 7.422 7.546 7.662 7.748 7.812 7.874 7.921 7.951 7.94 7.872 7.739 7.486 7.027 6.242 4.955 2.763 0.019 -2.278 -4.183 -5.769 -7.162 -8.394 -9.498 -10.458 -11.407 -12.197 -12.909 -13.59 -14.232 -14.85 -15.416 -15.987 -16.496 -16.945 -17.407 -17.887 -18.299 -18.731 -19.174 -19.517 -19.857 -20.218 -20.615 -21.013 -21.279 -21.561 -22.012 -22.329 -22.651 -22.807 -23.128 -23.5 -23.914 -24.132 -24.465 -24.829 -25.079 -25.33 -25.878 -26.213 -26.605 -27.017 -27.468 -28.01 -28.705 -31.231 -6 ,11368 ,KEBNE ,16721580,Sat Nov 27 16:38:27 CET,Sat Nov 27 18:13:20 CET,0.0 1.239 1.73 2.089 2.388 2.628 2.844 3.058 3.435 3.592 3.734 3.939 4.144 4.258 4.483 4.695 4.87 4.947 5.103 5.258 5.466 5.585 5.705 5.881 6.033 6.177 6.313 6.442 6.593 6.725 6.849 6.994 7.137 7.26 7.383 7.508 7.602 7.697 7.787 7.859 7.916 7.955 7.957 7.907 7.816 7.632 7.291 6.781 5.973 4.713 2.446 -0.346 -2.583 -4.442 -6.031 -7.442 -8.689 -9.807 -10.743 -11.675 -12.468 -13.172 -13.868 -14.521 -15.128 -15.679 -16.238 -16.744 -17.173 -17.626 -18.108 -18.495 -18.896 -19.32 -19.654 -20.004 -20.368 -20.76 -21.171 -21.45 -21.744 -22.208 -22.524 -22.87 -23.047 -23.405 -23.799 -24.206 -24.418 -24.738 -25.096 -25.365 -25.65 -26.311 -26.665 -27.029 -27.45 -27.925 -28.516 -29.316 -31.822 -7 ,26009 ,KEBNE ,16721581,Sat Nov 27 16:38:26 CET,Sat Nov 27 18:13:10 CET,0.0 1.309 1.799 2.151 2.45 2.707 2.953 3.183 3.547 3.701 3.847 4.042 4.244 4.36 4.576 4.775 4.956 5.046 5.212 5.356 5.554 5.683 5.808 5.981 6.135 6.274 6.4 6.515 6.657 6.795 6.926 7.078 7.204 7.315 7.433 7.555 7.661 7.754 7.845 7.929 8.001 8.06 8.075 8.034 7.946 7.774 7.462 6.972 6.228 4.986 2.696 -0.064 -2.344 -4.285 -5.887 -7.307 -8.61 -9.755 -10.7 -11.647 -12.43 -13.121 -13.814 -14.475 -15.09 -15.643 -16.202 -16.698 -17.124 -17.572 -18.041 -18.427 -18.836 -19.287 -19.634 -19.982 -20.336 -20.694 -21.08 -21.363 -21.651 -22.098 -22.413 -22.736 -22.906 -23.253 -23.612 -24.009 -24.217 -24.536 -24.903 -25.158 -25.424 -26.016 -26.341 -26.721 -27.17 -27.654 -28.216 -28.959 -31.253 -8 ,19604 ,KEBNE ,16721582,Sat Nov 27 16:39:27 CET,Sat Nov 27 18:13:58 CET,0.0 1.31 1.815 2.182 2.47 2.713 2.928 3.115 3.466 3.633 3.788 3.983 4.172 4.288 4.508 4.702 4.88 4.963 5.116 5.261 5.467 5.596 5.72 5.901 6.061 6.208 6.343 6.465 6.615 6.749 6.879 7.018 7.137 7.257 7.397 7.54 7.663 7.781 7.887 7.977 8.038 8.066 8.066 8.023 7.911 7.732 7.43 6.977 6.271 5.032 2.866 0.157 -2.151 -4.069 -5.672 -7.082 -8.286 -9.366 -10.335 -11.324 -12.153 -12.85 -13.504 -14.151 -14.752 -15.279 -15.83 -16.34 -16.793 -17.274 -17.76 -18.137 -18.522 -18.934 -19.261 -19.618 -19.989 -20.357 -20.737 -21.002 -21.273 -21.714 -22.033 -22.36 -22.526 -22.876 -23.255 -23.644 -23.852 -24.194 -24.586 -24.846 -25.119 -25.7 -26.032 -26.418 -26.844 -27.33 -27.904 -28.707 -31.749 -9 ,14072 ,KEBNE ,16721583,Sat Nov 27 16:39:27 CET,Sat Nov 27 18:14:13 CET,0.0 1.407 1.852 2.2 2.504 2.754 2.972 3.185 3.566 3.726 3.878 4.077 4.276 4.394 4.609 4.805 4.986 5.075 5.243 5.399 5.614 5.738 5.854 6.012 6.156 6.301 6.444 6.571 6.718 6.848 6.963 7.093 7.213 7.324 7.45 7.574 7.674 7.777 7.861 7.918 7.963 7.982 7.965 7.909 7.783 7.604 7.28 6.752 5.958 4.647 2.355 -0.452 -2.804 -4.722 -6.347 -7.809 -9.028 -10.106 -11.048 -12.016 -12.835 -13.546 -14.248 -14.91 -15.516 -16.067 -16.637 -17.15 -17.6 -18.058 -18.533 -18.931 -19.344 -19.783 -20.123 -20.464 -20.825 -21.2 -21.587 -21.862 -22.136 -22.562 -22.873 -23.194 -23.364 -23.728 -24.109 -24.512 -24.724 -25.059 -25.433 -25.669 -25.922 -26.525 -26.848 -27.2 -27.603 -28.074 -28.668 -29.444 -31.87 -10 ,12315 ,KEBNE ,16721584,Sat Nov 27 16:39:28 CET,Sat Nov 27 18:14:32 CET,0.0 1.472 1.993 2.353 2.615 2.857 3.08 3.27 3.599 3.743 3.881 4.045 4.233 4.35 4.555 4.742 4.928 5.017 5.189 5.331 5.522 5.643 5.754 5.916 6.072 6.223 6.358 6.475 6.615 6.745 6.873 7.015 7.135 7.232 7.343 7.48 7.581 7.663 7.738 7.806 7.849 7.85 7.844 7.801 7.671 7.468 7.15 6.646 5.822 4.501 2.253 -0.405 -2.636 -4.566 -6.142 -7.551 -8.786 -9.876 -10.816 -11.743 -12.551 -13.273 -13.956 -14.597 -15.176 -15.723 -16.311 -16.822 -17.262 -17.725 -18.203 -18.606 -19.04 -19.499 -19.85 -20.206 -20.573 -20.953 -21.355 -21.635 -21.925 -22.387 -22.724 -23.073 -23.246 -23.604 -23.995 -24.394 -24.599 -24.925 -25.279 -25.519 -25.769 -26.347 -26.686 -27.061 -27.461 -27.937 -28.568 -29.451 -32.425 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_43.txt deleted file mode 100644 index 1c830277..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_42_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12438 ,KEBNE ,16721585,Sat Nov 27 16:39:28 CET,Sat Nov 27 18:13:49 CET,0.0 1.423 1.889 2.266 2.583 2.842 3.076 3.294 3.702 3.871 4.023 4.238 4.457 4.597 4.848 5.077 5.294 5.398 5.596 5.783 6.053 6.232 6.408 6.664 6.913 7.152 7.377 7.594 7.884 8.148 8.381 8.666 8.955 9.229 9.534 9.868 10.17 10.495 10.838 11.184 11.541 11.948 12.415 12.86 13.378 13.982 14.622 15.258 15.963 16.673 17.275 17.453 17.311 17.046 16.71 16.342 15.978 15.59 15.222 14.854 14.533 14.232 13.949 13.683 13.405 13.127 12.833 12.565 12.326 12.071 11.816 11.586 11.326 11.064 10.864 10.642 10.402 10.152 9.881 9.698 9.506 9.197 8.986 8.766 8.65 8.388 8.097 7.795 7.635 7.393 7.106 6.904 6.691 6.251 5.999 5.723 5.419 5.054 4.595 3.99 2.387 -2 ,28477 ,KEBNE ,16721586,Sat Nov 27 16:39:28 CET,Sat Nov 27 18:13:39 CET,0.0 1.283 1.865 2.286 2.608 2.88 3.136 3.366 3.784 3.979 4.164 4.424 4.653 4.799 5.057 5.307 5.546 5.656 5.882 6.096 6.39 6.585 6.766 7.018 7.256 7.476 7.688 7.89 8.15 8.396 8.638 8.928 9.194 9.448 9.723 10.01 10.289 10.597 10.925 11.293 11.689 12.11 12.594 13.076 13.611 14.17 14.773 15.433 16.169 16.929 17.616 17.862 17.764 17.506 17.188 16.853 16.527 16.213 15.882 15.504 15.175 14.867 14.549 14.262 14.008 13.759 13.488 13.242 13.016 12.768 12.505 12.282 12.049 11.8 11.6 11.393 11.184 10.964 10.726 10.56 10.386 10.105 9.903 9.683 9.567 9.328 9.073 8.791 8.641 8.416 8.157 7.977 7.78 7.328 7.075 6.795 6.481 6.135 5.7 5.084 3.105 -3 ,2139 ,KEBNE ,16721587,Sat Nov 27 16:39:28 CET,Sat Nov 27 18:14:48 CET,0.0 1.264 1.774 2.161 2.454 2.714 2.957 3.187 3.588 3.758 3.927 4.169 4.384 4.531 4.809 5.057 5.281 5.39 5.607 5.824 6.135 6.322 6.498 6.749 7.0 7.235 7.451 7.666 7.951 8.218 8.454 8.738 9.01 9.256 9.54 9.864 10.172 10.496 10.834 11.201 11.592 12.02 12.513 12.986 13.488 14.026 14.643 15.28 15.945 16.609 17.201 17.464 17.332 17.025 16.699 16.346 15.969 15.582 15.222 14.821 14.467 14.163 13.865 13.555 13.263 13.006 12.726 12.464 12.229 11.975 11.704 11.459 11.2 10.945 10.74 10.52 10.28 10.032 9.782 9.609 9.429 9.134 8.911 8.677 8.559 8.298 8.022 7.742 7.594 7.363 7.071 6.878 6.664 6.184 5.918 5.626 5.307 4.922 4.449 3.857 1.649 -4 ,28913 ,KEBNE ,16721588,Sat Nov 27 16:39:28 CET,Sat Nov 27 18:14:04 CET,0.0 1.744 2.305 2.746 3.074 3.338 3.571 3.785 4.183 4.361 4.527 4.757 4.982 5.126 5.389 5.635 5.871 5.986 6.206 6.409 6.692 6.885 7.074 7.328 7.569 7.802 8.016 8.216 8.473 8.737 8.989 9.277 9.559 9.825 10.103 10.413 10.722 11.039 11.374 11.728 12.103 12.531 13.003 13.453 13.986 14.554 15.161 15.802 16.486 17.22 17.925 18.233 18.137 17.865 17.557 17.192 16.781 16.389 16.065 15.723 15.391 15.089 14.788 14.479 14.184 13.904 13.592 13.326 13.106 12.872 12.623 12.399 12.157 11.897 11.687 11.465 11.232 10.987 10.723 10.535 10.329 10.005 9.787 9.551 9.428 9.157 8.867 8.573 8.416 8.171 7.876 7.693 7.489 7.033 6.779 6.495 6.185 5.827 5.413 4.812 2.629 -5 ,7212 ,KEBNE ,16721589,Sat Nov 27 16:39:28 CET,Sat Nov 27 18:14:45 CET,0.0 1.157 1.626 1.984 2.282 2.553 2.822 3.073 3.497 3.685 3.864 4.127 4.358 4.5 4.756 5.011 5.259 5.376 5.596 5.809 6.117 6.31 6.495 6.758 7.012 7.26 7.486 7.695 7.97 8.253 8.518 8.807 9.08 9.34 9.654 10.015 10.345 10.681 11.037 11.411 11.783 12.172 12.618 13.073 13.62 14.205 14.806 15.414 16.096 16.834 17.422 17.547 17.357 17.079 16.769 16.422 16.065 15.695 15.35 14.993 14.667 14.344 14.03 13.744 13.467 13.198 12.899 12.62 12.373 12.096 11.803 11.568 11.322 11.058 10.85 10.629 10.402 10.17 9.91 9.726 9.537 9.225 9.008 8.793 8.679 8.424 8.152 7.856 7.689 7.448 7.161 6.958 6.735 6.241 5.967 5.671 5.355 4.999 4.544 3.914 1.63 -6 ,11845 ,KEBNE ,16721590,Sat Nov 27 16:39:28 CET,Sat Nov 27 18:14:34 CET,0.0 1.343 1.856 2.216 2.535 2.833 3.097 3.315 3.693 3.873 4.044 4.295 4.524 4.681 4.991 5.259 5.508 5.627 5.853 6.069 6.371 6.558 6.73 6.981 7.227 7.465 7.684 7.901 8.177 8.442 8.7 8.986 9.254 9.526 9.841 10.169 10.471 10.808 11.168 11.532 11.907 12.327 12.804 13.256 13.774 14.329 14.929 15.597 16.328 17.067 17.769 18.005 17.827 17.518 17.199 16.825 16.447 16.077 15.724 15.364 15.036 14.728 14.417 14.104 13.793 13.499 13.188 12.905 12.665 12.417 12.146 11.919 11.69 11.445 11.238 11.028 10.809 10.58 10.338 10.158 9.96 9.647 9.423 9.192 9.08 8.843 8.584 8.296 8.142 7.908 7.624 7.434 7.231 6.77 6.526 6.263 5.959 5.601 5.161 4.573 2.492 -7 ,28838 ,KEBNE ,16721591,Sat Nov 27 16:40:29 CET,Sat Nov 27 18:16:02 CET,0.0 1.524 2.071 2.477 2.818 3.108 3.366 3.597 4.005 4.195 4.37 4.618 4.84 4.984 5.259 5.499 5.723 5.836 6.052 6.253 6.549 6.739 6.914 7.164 7.407 7.637 7.864 8.088 8.363 8.618 8.876 9.193 9.47 9.723 10.023 10.369 10.686 10.996 11.315 11.655 12.022 12.435 12.891 13.307 13.779 14.343 14.984 15.611 16.262 16.96 17.658 17.909 17.778 17.489 17.142 16.776 16.399 16.021 15.678 15.309 14.978 14.67 14.361 14.066 13.782 13.509 13.205 12.932 12.692 12.438 12.168 11.926 11.663 11.388 11.173 10.946 10.705 10.457 10.203 10.023 9.842 9.552 9.339 9.105 8.986 8.744 8.476 8.179 8.022 7.78 7.483 7.288 7.082 6.637 6.377 6.096 5.775 5.396 4.961 4.355 2.409 -8 ,27299 ,KEBNE ,16721592,Sat Nov 27 16:41:29 CET,Sat Nov 27 18:17:00 CET,0.0 1.096 1.571 1.928 2.223 2.484 2.74 2.989 3.42 3.604 3.781 4.031 4.259 4.41 4.677 4.936 5.183 5.302 5.527 5.733 6.008 6.187 6.371 6.619 6.85 7.085 7.309 7.524 7.792 8.037 8.267 8.538 8.804 9.06 9.351 9.692 10.01 10.337 10.702 11.091 11.482 11.899 12.369 12.834 13.34 13.903 14.52 15.136 15.806 16.505 17.129 17.247 17.077 16.811 16.471 16.126 15.768 15.401 15.063 14.674 14.332 14.026 13.695 13.359 13.058 12.795 12.506 12.237 11.998 11.74 11.47 11.229 10.961 10.683 10.466 10.24 10.006 9.766 9.503 9.318 9.126 8.822 8.612 8.378 8.247 7.982 7.726 7.455 7.303 7.075 6.796 6.597 6.395 5.955 5.71 5.429 5.119 4.787 4.386 3.789 1.528 -9 ,7928 ,KEBNE ,16721593,Sat Nov 27 16:50:37 CET,Sat Nov 27 18:24:51 CET,0.0 1.793 2.319 2.688 3.005 3.3 3.576 3.819 4.218 4.393 4.566 4.827 5.063 5.218 5.517 5.791 6.038 6.158 6.387 6.596 6.889 7.083 7.263 7.525 7.767 7.991 8.214 8.426 8.701 8.952 9.174 9.438 9.704 9.965 10.242 10.567 10.879 11.197 11.541 11.9 12.272 12.696 13.157 13.603 14.127 14.678 15.264 15.876 16.546 17.199 17.768 17.969 17.808 17.506 17.179 16.837 16.475 16.111 15.79 15.447 15.123 14.815 14.504 14.201 13.911 13.636 13.352 13.095 12.851 12.575 12.297 12.068 11.809 11.543 11.342 11.125 10.893 10.64 10.381 10.211 10.022 9.697 9.477 9.263 9.153 8.922 8.661 8.37 8.217 7.981 7.705 7.528 7.335 6.892 6.65 6.378 6.071 5.698 5.224 4.616 2.808 -10 ,2894 ,KEBNE ,16721594,Sat Nov 27 16:51:38 CET,Sat Nov 27 18:25:53 CET,0.0 1.489 2.065 2.518 2.879 3.162 3.407 3.636 4.026 4.204 4.377 4.633 4.866 5.011 5.306 5.578 5.814 5.933 6.162 6.379 6.687 6.881 7.07 7.35 7.617 7.855 8.077 8.299 8.575 8.823 9.056 9.329 9.592 9.848 10.143 10.468 10.764 11.078 11.408 11.757 12.12 12.5 12.938 13.371 13.877 14.458 15.102 15.729 16.362 17.059 17.764 17.956 17.775 17.52 17.228 16.859 16.473 16.076 15.693 15.332 15.025 14.729 14.408 14.081 13.783 13.496 13.182 12.908 12.66 12.394 12.112 11.871 11.62 11.356 11.14 10.927 10.703 10.454 10.201 10.017 9.815 9.484 9.258 9.026 8.895 8.617 8.333 8.019 7.864 7.637 7.358 7.164 6.949 6.477 6.221 5.947 5.632 5.266 4.836 4.263 2.347 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_43_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_43_39.txt deleted file mode 100644 index 3a2f2864..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_43_39.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25890 ,KEBNE ,16721595,Sat Nov 27 16:51:38 CET,Sat Nov 27 18:26:36 CET,0.0 1.193 1.694 2.047 2.341 2.578 2.786 2.972 3.297 3.45 3.595 3.779 3.967 4.084 4.295 4.488 4.674 4.759 4.908 5.049 5.253 5.372 5.472 5.631 5.78 5.908 6.041 6.159 6.296 6.421 6.531 6.668 6.79 6.892 6.997 7.087 7.159 7.235 7.279 7.301 7.306 7.275 7.196 7.083 6.892 6.571 6.111 5.434 4.384 2.76 0.023 -3.155 -5.659 -7.741 -9.466 -10.948 -12.167 -13.267 -14.239 -15.19 -16.001 -16.736 -17.439 -18.08 -18.681 -19.248 -19.836 -20.343 -20.777 -21.233 -21.706 -22.094 -22.493 -22.896 -23.202 -23.526 -23.875 -24.24 -24.608 -24.869 -25.145 -25.577 -25.872 -26.178 -26.338 -26.655 -26.982 -27.356 -27.562 -27.886 -28.225 -28.459 -28.694 -29.214 -29.515 -29.858 -30.217 -30.642 -31.185 -31.848 -33.709 -2 ,9382 ,KEBNE ,16721596,Sat Nov 27 16:53:40 CET,Sat Nov 27 18:29:17 CET,0.0 1.112 1.545 1.889 2.168 2.414 2.656 2.858 3.201 3.368 3.518 3.705 3.895 4.01 4.219 4.409 4.582 4.663 4.809 4.948 5.151 5.28 5.409 5.584 5.739 5.878 5.992 6.087 6.203 6.312 6.414 6.528 6.631 6.724 6.817 6.904 6.975 7.052 7.117 7.138 7.144 7.124 7.053 6.935 6.735 6.427 5.954 5.283 4.264 2.705 0.098 -3.036 -5.594 -7.669 -9.397 -10.931 -12.249 -13.418 -14.417 -15.396 -16.229 -16.971 -17.643 -18.254 -18.839 -19.363 -19.897 -20.393 -20.821 -21.259 -21.708 -22.078 -22.473 -22.894 -23.216 -23.545 -23.881 -24.235 -24.618 -24.874 -25.126 -25.519 -25.798 -26.1 -26.264 -26.601 -26.951 -27.32 -27.516 -27.822 -28.157 -28.404 -28.663 -29.212 -29.499 -29.808 -30.149 -30.526 -30.99 -31.602 -33.263 -3 ,6727 ,KEBNE ,16721597,Sat Nov 27 16:55:43 CET,Sat Nov 27 18:36:44 CET,0.0 1.445 2.005 2.4 2.7 2.952 3.185 3.392 3.742 3.906 4.059 4.258 4.453 4.571 4.783 4.969 5.144 5.231 5.395 5.544 5.759 5.898 6.017 6.171 6.332 6.474 6.598 6.717 6.854 6.977 7.093 7.218 7.33 7.439 7.545 7.626 7.693 7.753 7.791 7.815 7.849 7.849 7.764 7.65 7.481 7.176 6.719 6.082 5.071 3.486 0.834 -2.34 -4.882 -6.932 -8.66 -10.163 -11.441 -12.6 -13.577 -14.519 -15.321 -16.029 -16.7 -17.323 -17.901 -18.429 -18.978 -19.464 -19.882 -20.321 -20.775 -21.154 -21.555 -21.974 -22.297 -22.613 -22.938 -23.281 -23.633 -23.878 -24.143 -24.557 -24.838 -25.129 -25.28 -25.597 -25.934 -26.308 -26.514 -26.834 -27.181 -27.425 -27.66 -28.159 -28.446 -28.77 -29.121 -29.506 -29.983 -30.665 -32.424 -4 ,22581 ,KEBNE ,16721598,Sat Nov 27 17:10:59 CET,Sat Nov 27 18:44:10 CET,0.0 1.245 1.696 2.04 2.356 2.62 2.84 3.03 3.35 3.488 3.617 3.804 3.993 4.102 4.312 4.513 4.699 4.779 4.925 5.067 5.251 5.363 5.47 5.617 5.755 5.877 5.986 6.098 6.237 6.362 6.464 6.566 6.662 6.737 6.823 6.935 7.019 7.087 7.133 7.15 7.163 7.146 7.073 6.943 6.726 6.414 5.928 5.209 4.136 2.484 -0.201 -3.319 -5.87 -7.997 -9.764 -11.314 -12.612 -13.741 -14.733 -15.73 -16.576 -17.311 -18.001 -18.65 -19.249 -19.779 -20.33 -20.824 -21.251 -21.695 -22.144 -22.528 -22.945 -23.366 -23.676 -23.997 -24.341 -24.703 -25.088 -25.351 -25.614 -26.041 -26.331 -26.641 -26.807 -27.136 -27.491 -27.874 -28.068 -28.379 -28.717 -28.952 -29.211 -29.774 -30.077 -30.407 -30.753 -31.126 -31.565 -32.137 -33.928 -5 ,28367 ,KEBNE ,16721599,Sat Nov 27 17:16:06 CET,Sat Nov 27 18:50:54 CET,0.0 1.098 1.562 1.912 2.208 2.461 2.673 2.861 3.175 3.313 3.439 3.597 3.771 3.875 4.068 4.244 4.417 4.493 4.631 4.761 4.938 5.043 5.139 5.281 5.422 5.543 5.646 5.741 5.854 5.95 6.043 6.149 6.231 6.305 6.402 6.506 6.579 6.641 6.696 6.739 6.762 6.74 6.643 6.491 6.269 5.955 5.534 4.906 3.88 2.262 -0.431 -3.586 -6.114 -8.199 -9.914 -11.372 -12.652 -13.836 -14.83 -15.816 -16.659 -17.369 -18.04 -18.693 -19.273 -19.783 -20.329 -20.826 -21.26 -21.698 -22.147 -22.527 -22.924 -23.336 -23.658 -23.987 -24.329 -24.681 -25.042 -25.293 -25.563 -26.004 -26.313 -26.627 -26.791 -27.137 -27.493 -27.865 -28.057 -28.365 -28.684 -28.919 -29.171 -29.719 -30.012 -30.328 -30.685 -31.073 -31.56 -32.188 -33.924 -6 ,523 ,KEBNE ,16721600,Sat Nov 27 17:19:10 CET,Sat Nov 27 18:53:47 CET,0.0 1.753 2.242 2.574 2.851 3.085 3.296 3.502 3.866 4.02 4.158 4.342 4.529 4.641 4.85 5.034 5.211 5.296 5.451 5.598 5.818 5.948 6.069 6.244 6.388 6.513 6.63 6.74 6.874 6.989 7.096 7.228 7.336 7.427 7.518 7.592 7.639 7.68 7.704 7.7 7.698 7.672 7.596 7.479 7.278 6.948 6.472 5.791 4.749 3.181 0.549 -2.533 -5.053 -7.183 -8.917 -10.434 -11.738 -12.918 -13.925 -14.89 -15.714 -16.454 -17.16 -17.808 -18.395 -18.945 -19.528 -20.036 -20.478 -20.927 -21.38 -21.775 -22.181 -22.586 -22.916 -23.252 -23.587 -23.934 -24.298 -24.55 -24.811 -25.228 -25.523 -25.823 -25.978 -26.303 -26.653 -27.031 -27.23 -27.548 -27.866 -28.086 -28.312 -28.826 -29.128 -29.446 -29.802 -30.199 -30.623 -31.246 -33.26 -7 ,17982 ,KEBNE ,16721601,Sat Nov 27 17:19:10 CET,Sat Nov 27 18:54:16 CET,0.0 1.339 1.827 2.168 2.452 2.697 2.914 3.101 3.418 3.567 3.71 3.912 4.109 4.236 4.468 4.663 4.829 4.909 5.076 5.236 5.458 5.591 5.713 5.859 5.98 6.106 6.22 6.32 6.441 6.556 6.656 6.765 6.87 6.976 7.082 7.167 7.232 7.292 7.344 7.374 7.375 7.363 7.311 7.195 7.0 6.687 6.21 5.536 4.574 3.035 0.352 -2.782 -5.328 -7.44 -9.182 -10.687 -11.986 -13.158 -14.139 -15.082 -15.894 -16.602 -17.287 -17.954 -18.56 -19.108 -19.67 -20.179 -20.606 -21.048 -21.528 -21.937 -22.351 -22.78 -23.116 -23.448 -23.795 -24.155 -24.531 -24.793 -25.069 -25.504 -25.807 -26.111 -26.264 -26.575 -26.911 -27.293 -27.495 -27.814 -28.141 -28.376 -28.629 -29.153 -29.451 -29.78 -30.158 -30.592 -31.111 -31.831 -33.601 -8 ,31341 ,KEBNE ,16721602,Sat Nov 27 17:20:11 CET,Sat Nov 27 18:53:59 CET,0.0 1.228 1.657 1.996 2.284 2.534 2.759 2.952 3.297 3.452 3.593 3.794 3.995 4.116 4.324 4.502 4.668 4.75 4.911 5.049 5.246 5.38 5.503 5.665 5.806 5.934 6.048 6.158 6.3 6.422 6.529 6.663 6.788 6.886 6.981 7.065 7.124 7.171 7.199 7.221 7.205 7.183 7.124 7.001 6.809 6.505 6.046 5.317 4.243 2.639 -0.029 -3.131 -5.692 -7.807 -9.565 -11.134 -12.449 -13.61 -14.589 -15.552 -16.38 -17.112 -17.811 -18.47 -19.067 -19.594 -20.137 -20.626 -21.062 -21.519 -21.986 -22.365 -22.757 -23.163 -23.481 -23.813 -24.155 -24.507 -24.872 -25.133 -25.41 -25.831 -26.116 -26.407 -26.559 -26.88 -27.223 -27.6 -27.798 -28.107 -28.445 -28.681 -28.924 -29.434 -29.723 -30.039 -30.373 -30.751 -31.204 -31.877 -33.692 -10 ,20866 ,KEBNE ,16721604,Sat Nov 27 17:22:14 CET,Sat Nov 27 19:01:20 CET,0.0 1.21 1.662 2.055 2.357 2.607 2.832 3.038 3.393 3.564 3.726 3.923 4.111 4.218 4.413 4.603 4.779 4.861 5.012 5.145 5.342 5.47 5.593 5.755 5.892 6.022 6.139 6.242 6.369 6.487 6.597 6.727 6.84 6.934 7.028 7.11 7.17 7.226 7.273 7.289 7.277 7.239 7.15 7.002 6.772 6.447 5.97 5.279 4.232 2.63 -0.056 -3.126 -5.602 -7.675 -9.429 -10.949 -12.242 -13.404 -14.384 -15.359 -16.206 -16.933 -17.608 -18.258 -18.869 -19.399 -19.95 -20.459 -20.9 -21.365 -21.841 -22.222 -22.625 -23.056 -23.379 -23.692 -24.029 -24.391 -24.762 -25.019 -25.283 -25.697 -25.994 -26.314 -26.481 -26.813 -27.158 -27.529 -27.726 -28.044 -28.382 -28.613 -28.846 -29.332 -29.593 -29.918 -30.302 -30.758 -31.28 -31.992 -33.669 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_44_43.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_44_43.txt deleted file mode 100644 index 5d3c8e20..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_44_43.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32453 ,KEBNE ,16721605,Sat Nov 27 17:24:20 CET,Sat Nov 27 18:51:39 CET,0.0 1.525 2.035 2.43 2.765 3.044 3.317 3.579 4.01 4.202 4.392 4.678 4.897 5.036 5.298 5.551 5.787 5.897 6.117 6.333 6.623 6.806 6.988 7.248 7.488 7.705 7.919 8.135 8.394 8.622 8.834 9.103 9.365 9.603 9.882 10.186 10.464 10.76 11.059 11.357 11.677 12.04 12.438 12.826 13.264 13.714 14.193 14.695 15.204 15.647 15.906 15.748 15.34 14.835 14.355 13.892 13.412 12.957 12.556 12.134 11.748 11.411 11.098 10.764 10.432 10.138 9.836 9.55 9.29 9.024 8.751 8.513 8.26 8.0 7.79 7.581 7.364 7.118 6.859 6.679 6.494 6.199 5.987 5.761 5.645 5.397 5.135 4.856 4.707 4.478 4.218 4.038 3.852 3.446 3.208 2.949 2.65 2.287 1.866 1.339 -0.124 -2 ,3662 ,KEBNE ,16721606,Sat Nov 27 17:25:17 CET,Sat Nov 27 18:58:42 CET,0.0 2.042 2.641 3.062 3.408 3.724 3.995 4.229 4.663 4.864 5.044 5.3 5.535 5.695 5.978 6.24 6.51 6.636 6.86 7.08 7.386 7.571 7.748 8.004 8.245 8.471 8.682 8.892 9.161 9.41 9.644 9.91 10.162 10.397 10.667 10.959 11.22 11.525 11.87 12.222 12.574 12.963 13.379 13.771 14.205 14.681 15.209 15.714 16.2 16.586 16.806 16.591 16.15 15.666 15.205 14.701 14.22 13.801 13.423 13.024 12.67 12.338 11.993 11.646 11.334 11.055 10.746 10.457 10.194 9.923 9.646 9.415 9.154 8.877 8.67 8.459 8.228 7.968 7.701 7.515 7.316 6.996 6.772 6.549 6.43 6.176 5.907 5.615 5.458 5.217 4.936 4.757 4.569 4.125 3.871 3.6 3.282 2.924 2.539 2.018 0.499 -3 ,12278 ,KEBNE ,16721607,Sat Nov 27 17:26:19 CET,Sat Nov 27 19:00:38 CET,0.0 1.516 2.061 2.449 2.77 3.08 3.371 3.628 4.06 4.246 4.427 4.703 4.928 5.07 5.346 5.607 5.842 5.954 6.179 6.397 6.713 6.914 7.099 7.343 7.565 7.792 8.017 8.22 8.468 8.711 8.966 9.262 9.543 9.812 10.106 10.434 10.721 11.031 11.367 11.708 12.057 12.446 12.881 13.278 13.72 14.197 14.694 15.175 15.621 15.997 16.196 16.031 15.675 15.217 14.76 14.321 13.872 13.423 13.036 12.632 12.275 11.932 11.576 11.241 10.919 10.618 10.314 10.041 9.804 9.548 9.262 9.026 8.79 8.537 8.337 8.127 7.904 7.665 7.413 7.234 7.04 6.725 6.497 6.255 6.125 5.849 5.566 5.272 5.114 4.88 4.616 4.429 4.218 3.749 3.5 3.231 2.913 2.57 2.165 1.614 0.1 -4 ,30066 ,KEBNE ,16721608,Sat Nov 27 17:27:20 CET,Sat Nov 27 19:02:06 CET,0.0 1.9 2.461 2.834 3.166 3.474 3.736 3.979 4.448 4.659 4.841 5.114 5.339 5.483 5.752 6.009 6.268 6.391 6.608 6.822 7.129 7.311 7.501 7.785 8.034 8.265 8.49 8.707 8.98 9.254 9.519 9.819 10.097 10.359 10.658 10.982 11.278 11.587 11.903 12.231 12.577 12.958 13.375 13.808 14.315 14.814 15.324 15.821 16.314 16.771 17.016 16.85 16.464 15.987 15.521 15.058 14.591 14.108 13.708 13.306 12.921 12.587 12.254 11.921 11.618 11.348 11.047 10.768 10.525 10.265 9.993 9.753 9.506 9.264 9.067 8.852 8.629 8.378 8.11 7.926 7.729 7.41 7.181 6.956 6.843 6.594 6.325 6.033 5.881 5.656 5.392 5.208 5.005 4.547 4.285 3.978 3.647 3.274 2.799 2.226 0.771 -5 ,21026 ,KEBNE ,16721609,Sat Nov 27 17:27:20 CET,Sat Nov 27 19:05:46 CET,0.0 1.715 2.275 2.686 3.025 3.321 3.594 3.845 4.259 4.449 4.637 4.906 5.128 5.27 5.543 5.803 6.036 6.153 6.404 6.627 6.926 7.125 7.319 7.59 7.837 8.07 8.296 8.511 8.784 9.045 9.304 9.613 9.907 10.171 10.46 10.792 11.087 11.384 11.693 12.02 12.367 12.746 13.144 13.507 13.929 14.398 14.887 15.373 15.837 16.241 16.481 16.311 15.969 15.564 15.113 14.665 14.246 13.82 13.428 13.028 12.69 12.37 12.044 11.727 11.423 11.142 10.847 10.576 10.326 10.063 9.796 9.57 9.334 9.094 8.905 8.698 8.464 8.205 7.936 7.755 7.562 7.252 7.037 6.816 6.7 6.459 6.196 5.908 5.756 5.536 5.291 5.107 4.901 4.437 4.191 3.927 3.624 3.28 2.866 2.316 0.664 -6 ,28335 ,KEBNE ,16721610,Sat Nov 27 17:32:27 CET,Sat Nov 27 19:07:08 CET,0.0 1.443 2.039 2.474 2.834 3.157 3.442 3.7 4.154 4.36 4.564 4.85 5.093 5.265 5.556 5.818 6.069 6.186 6.41 6.628 6.94 7.137 7.33 7.59 7.822 8.04 8.249 8.455 8.714 8.966 9.213 9.499 9.767 10.028 10.313 10.621 10.928 11.27 11.606 11.944 12.292 12.674 13.085 13.473 13.933 14.403 14.881 15.364 15.844 16.253 16.531 16.429 16.067 15.639 15.176 14.696 14.229 13.804 13.415 12.992 12.615 12.272 11.944 11.629 11.324 11.029 10.716 10.423 10.169 9.922 9.634 9.376 9.119 8.854 8.644 8.421 8.187 7.931 7.658 7.473 7.279 6.961 6.734 6.494 6.371 6.131 5.872 5.581 5.424 5.191 4.921 4.729 4.52 4.084 3.842 3.59 3.323 3.029 2.632 2.089 0.532 -7 ,18197 ,KEBNE ,16721611,Sat Nov 27 17:33:28 CET,Sat Nov 27 19:06:43 CET,0.0 1.647 2.172 2.624 3.012 3.316 3.564 3.795 4.217 4.399 4.58 4.851 5.077 5.227 5.511 5.767 6.011 6.13 6.364 6.59 6.93 7.145 7.337 7.605 7.856 8.093 8.311 8.519 8.787 9.042 9.28 9.57 9.836 10.071 10.355 10.68 10.987 11.32 11.669 11.999 12.328 12.71 13.142 13.545 13.979 14.439 14.932 15.437 15.944 16.415 16.66 16.512 16.19 15.772 15.329 14.867 14.436 14.018 13.634 13.236 12.888 12.564 12.248 11.954 11.661 11.366 11.055 10.784 10.531 10.267 9.993 9.758 9.519 9.268 9.069 8.858 8.631 8.392 8.148 7.979 7.801 7.509 7.294 7.067 6.953 6.71 6.443 6.155 6.002 5.774 5.492 5.3 5.109 4.684 4.44 4.182 3.897 3.57 3.193 2.654 1.316 -8 ,8228 ,KEBNE ,16721612,Sat Nov 27 17:42:41 CET,Sat Nov 27 19:16:04 CET,0.0 1.98 2.584 3.026 3.376 3.698 3.986 4.238 4.672 4.871 5.06 5.321 5.538 5.687 5.987 6.275 6.541 6.664 6.9 7.119 7.429 7.625 7.804 8.076 8.338 8.578 8.802 9.015 9.297 9.563 9.803 10.096 10.367 10.616 10.895 11.198 11.503 11.84 12.185 12.538 12.902 13.279 13.684 14.092 14.557 15.062 15.617 16.139 16.614 17.05 17.293 17.111 16.719 16.261 15.813 15.356 14.924 14.519 14.125 13.706 13.326 12.987 12.67 12.358 12.054 11.75 11.426 11.132 10.879 10.628 10.356 10.121 9.863 9.584 9.369 9.15 8.929 8.692 8.439 8.265 8.08 7.783 7.576 7.357 7.241 6.998 6.73 6.425 6.259 6.026 5.754 5.567 5.361 4.881 4.595 4.298 3.999 3.655 3.188 2.514 0.895 -9 ,28111 ,KEBNE ,16721613,Sat Nov 27 17:42:41 CET,Sat Nov 27 19:16:04 CET,0.0 1.842 2.337 2.726 3.035 3.313 3.591 3.839 4.268 4.462 4.654 4.942 5.166 5.32 5.613 5.878 6.123 6.236 6.45 6.655 6.947 7.129 7.301 7.532 7.746 7.957 8.16 8.349 8.591 8.826 9.052 9.34 9.605 9.84 10.096 10.385 10.675 10.996 11.337 11.677 12.004 12.371 12.782 13.17 13.604 14.051 14.529 15.003 15.47 15.882 16.138 16.001 15.645 15.199 14.74 14.276 13.825 13.382 12.984 12.578 12.205 11.846 11.483 11.135 10.827 10.551 10.26 9.988 9.739 9.475 9.194 8.962 8.717 8.453 8.245 8.024 7.783 7.537 7.279 7.095 6.906 6.608 6.387 6.156 6.038 5.787 5.518 5.224 5.072 4.84 4.564 4.379 4.183 3.739 3.497 3.244 2.944 2.605 2.16 1.564 0.334 -10 ,8749 ,KEBNE ,16721614,Sat Nov 27 17:44:45 CET,Sat Nov 27 19:13:47 CET,0.0 1.818 2.383 2.833 3.213 3.523 3.804 4.055 4.506 4.711 4.9 5.19 5.433 5.586 5.877 6.156 6.412 6.535 6.785 7.016 7.305 7.489 7.676 7.94 8.187 8.418 8.632 8.831 9.084 9.333 9.563 9.837 10.094 10.32 10.584 10.895 11.197 11.515 11.838 12.178 12.532 12.909 13.34 13.747 14.21 14.705 15.21 15.689 16.139 16.543 16.778 16.612 16.253 15.828 15.379 14.925 14.49 14.051 13.645 13.235 12.87 12.532 12.217 11.919 11.615 11.332 11.04 10.77 10.534 10.285 10.019 9.791 9.554 9.299 9.095 8.884 8.669 8.432 8.167 7.987 7.81 7.522 7.315 7.094 6.981 6.737 6.469 6.195 6.053 5.829 5.572 5.388 5.197 4.766 4.518 4.266 3.975 3.64 3.239 2.69 1.224 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_44.txt deleted file mode 100644 index 2a21b935..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30963 ,KEBNE ,16721615,Sat Nov 27 17:48:47 CET,Sat Nov 27 19:24:00 CET,0.0 0.984 1.392 1.703 1.996 2.252 2.471 2.662 3.0 3.158 3.308 3.521 3.708 3.833 4.064 4.269 4.46 4.558 4.749 4.921 5.159 5.308 5.45 5.658 5.852 6.029 6.201 6.364 6.564 6.74 6.909 7.119 7.305 7.47 7.66 7.871 8.068 8.277 8.497 8.719 8.911 9.098 9.298 9.485 9.663 9.801 9.896 9.889 9.746 9.353 8.406 7.094 5.929 4.859 3.904 3.046 2.285 1.575 0.936 0.303 -0.243 -0.727 -1.162 -1.579 -1.978 -2.344 -2.739 -3.097 -3.399 -3.71 -4.039 -4.323 -4.627 -4.947 -5.198 -5.455 -5.714 -5.987 -6.291 -6.503 -6.72 -7.06 -7.3 -7.546 -7.672 -7.949 -8.255 -8.566 -8.73 -8.967 -9.235 -9.425 -9.634 -10.101 -10.365 -10.65 -10.961 -11.333 -11.787 -12.357 -13.715 -2 ,20752 ,KEBNE ,16721616,Sat Nov 27 17:47:48 CET,Sat Nov 27 19:18:29 CET,0.0 1.204 1.716 2.079 2.358 2.605 2.829 3.033 3.401 3.557 3.701 3.93 4.13 4.263 4.505 4.721 4.918 5.014 5.201 5.379 5.628 5.782 5.922 6.134 6.336 6.508 6.671 6.824 7.012 7.197 7.374 7.573 7.758 7.941 8.134 8.336 8.527 8.721 8.909 9.103 9.315 9.519 9.699 9.842 9.976 10.099 10.176 10.141 9.96 9.534 8.613 7.338 6.187 5.134 4.222 3.384 2.612 1.919 1.33 0.733 0.194 -0.298 -0.773 -1.23 -1.649 -2.032 -2.436 -2.798 -3.123 -3.461 -3.807 -4.09 -4.372 -4.668 -4.917 -5.19 -5.465 -5.748 -6.054 -6.266 -6.482 -6.811 -7.049 -7.302 -7.431 -7.695 -7.987 -8.298 -8.466 -8.714 -9.0 -9.203 -9.419 -9.857 -10.095 -10.366 -10.678 -11.033 -11.435 -11.921 -13.246 -3 ,4607 ,KEBNE ,16721617,Sat Nov 27 17:49:52 CET,Sat Nov 27 19:20:25 CET,0.0 1.275 1.753 2.103 2.385 2.625 2.85 3.057 3.427 3.602 3.773 4.018 4.208 4.335 4.574 4.79 4.985 5.079 5.267 5.439 5.667 5.81 5.957 6.166 6.355 6.546 6.729 6.896 7.101 7.308 7.496 7.689 7.867 8.031 8.219 8.448 8.662 8.865 9.048 9.221 9.407 9.605 9.781 9.935 10.143 10.324 10.425 10.427 10.309 9.973 9.06 7.718 6.532 5.492 4.555 3.669 2.891 2.188 1.571 0.945 0.409 -0.062 -0.519 -0.953 -1.369 -1.755 -2.136 -2.48 -2.785 -3.12 -3.473 -3.752 -4.044 -4.35 -4.594 -4.861 -5.145 -5.438 -5.732 -5.929 -6.142 -6.48 -6.714 -6.974 -7.106 -7.365 -7.662 -7.986 -8.149 -8.387 -8.679 -8.877 -9.084 -9.538 -9.792 -10.05 -10.326 -10.662 -11.113 -11.674 -12.911 -4 ,689 ,KEBNE ,16721618,Sat Nov 27 17:50:49 CET,Sat Nov 27 19:24:47 CET,0.0 1.498 1.976 2.325 2.629 2.897 3.136 3.343 3.708 3.873 4.029 4.246 4.434 4.563 4.807 5.036 5.247 5.344 5.525 5.696 5.942 6.096 6.236 6.442 6.638 6.804 6.964 7.129 7.331 7.509 7.687 7.903 8.092 8.267 8.479 8.696 8.887 9.086 9.296 9.503 9.704 9.915 10.119 10.311 10.501 10.65 10.729 10.705 10.597 10.252 9.353 8.081 6.88 5.801 4.89 4.058 3.281 2.575 1.973 1.387 0.876 0.396 -0.069 -0.523 -0.935 -1.297 -1.69 -2.044 -2.352 -2.669 -2.993 -3.28 -3.587 -3.893 -4.131 -4.381 -4.644 -4.932 -5.226 -5.427 -5.642 -5.983 -6.226 -6.477 -6.611 -6.882 -7.168 -7.483 -7.658 -7.913 -8.217 -8.42 -8.629 -9.078 -9.329 -9.6 -9.901 -10.253 -10.652 -11.161 -12.426 -5 ,3220 ,KEBNE ,16721619,Sat Nov 27 17:50:49 CET,Sat Nov 27 19:24:31 CET,0.0 1.179 1.638 2.01 2.307 2.557 2.783 2.993 3.365 3.53 3.689 3.927 4.119 4.239 4.468 4.693 4.903 5.006 5.213 5.4 5.653 5.81 5.955 6.154 6.339 6.521 6.698 6.861 7.057 7.239 7.407 7.618 7.817 7.993 8.188 8.388 8.563 8.752 8.962 9.166 9.353 9.545 9.739 9.914 10.095 10.251 10.358 10.368 10.248 9.89 9.018 7.739 6.589 5.546 4.59 3.735 2.997 2.311 1.705 1.096 0.565 0.085 -0.379 -0.816 -1.224 -1.593 -1.985 -2.35 -2.675 -3.004 -3.353 -3.656 -3.961 -4.264 -4.509 -4.764 -5.02 -5.302 -5.608 -5.819 -6.038 -6.39 -6.631 -6.874 -7.002 -7.271 -7.555 -7.866 -8.03 -8.27 -8.561 -8.765 -8.981 -9.452 -9.71 -9.997 -10.328 -10.701 -11.159 -11.767 -13.068 -6 ,11562 ,KEBNE ,16721620,Sat Nov 27 17:50:49 CET,Sat Nov 27 19:24:50 CET,0.0 0.984 1.438 1.795 2.082 2.332 2.549 2.75 3.118 3.28 3.438 3.67 3.864 3.991 4.231 4.46 4.665 4.763 4.948 5.131 5.397 5.563 5.726 5.96 6.159 6.336 6.505 6.676 6.891 7.08 7.253 7.46 7.662 7.841 8.036 8.255 8.448 8.647 8.856 9.055 9.231 9.427 9.655 9.854 10.029 10.174 10.287 10.286 10.129 9.722 8.764 7.453 6.3 5.239 4.275 3.421 2.673 1.975 1.372 0.771 0.254 -0.211 -0.652 -1.07 -1.461 -1.815 -2.205 -2.563 -2.87 -3.186 -3.508 -3.777 -4.064 -4.367 -4.606 -4.863 -5.153 -5.452 -5.759 -5.974 -6.19 -6.527 -6.758 -6.989 -7.109 -7.363 -7.647 -7.955 -8.116 -8.36 -8.663 -8.864 -9.072 -9.524 -9.779 -10.058 -10.36 -10.699 -11.139 -11.714 -13.095 -7 ,17798 ,KEBNE ,16721621,Sat Nov 27 17:51:51 CET,Sat Nov 27 19:25:30 CET,0.0 1.311 1.755 2.093 2.383 2.635 2.861 3.065 3.434 3.601 3.756 3.985 4.182 4.319 4.576 4.806 5.021 5.119 5.303 5.484 5.734 5.88 6.012 6.208 6.404 6.592 6.769 6.93 7.128 7.321 7.502 7.713 7.912 8.1 8.313 8.557 8.774 8.971 9.17 9.373 9.569 9.776 9.982 10.138 10.275 10.413 10.527 10.554 10.471 10.146 9.263 7.946 6.717 5.629 4.723 3.909 3.146 2.452 1.872 1.282 0.761 0.282 -0.197 -0.649 -1.063 -1.436 -1.827 -2.179 -2.494 -2.832 -3.176 -3.448 -3.731 -4.047 -4.295 -4.543 -4.8 -5.073 -5.363 -5.566 -5.777 -6.104 -6.341 -6.591 -6.726 -6.999 -7.288 -7.61 -7.777 -8.017 -8.307 -8.494 -8.696 -9.192 -9.459 -9.729 -10.055 -10.426 -10.844 -11.417 -12.851 -8 ,19816 ,KEBNE ,16721622,Sat Nov 27 17:51:51 CET,Sat Nov 27 19:25:54 CET,0.0 1.206 1.74 2.104 2.394 2.659 2.908 3.126 3.498 3.662 3.817 4.048 4.237 4.364 4.6 4.817 5.026 5.124 5.308 5.474 5.711 5.857 5.992 6.187 6.366 6.526 6.68 6.831 7.022 7.199 7.372 7.576 7.767 7.944 8.132 8.348 8.56 8.764 8.964 9.169 9.381 9.592 9.776 9.931 10.07 10.198 10.3 10.305 10.158 9.768 8.871 7.567 6.39 5.329 4.395 3.568 2.815 2.126 1.49 0.85 0.32 -0.149 -0.601 -1.068 -1.502 -1.876 -2.283 -2.658 -2.968 -3.291 -3.631 -3.913 -4.21 -4.525 -4.778 -5.046 -5.323 -5.62 -5.934 -6.154 -6.386 -6.746 -6.996 -7.252 -7.389 -7.669 -7.95 -8.264 -8.431 -8.676 -8.966 -9.154 -9.352 -9.787 -10.032 -10.303 -10.614 -11.003 -11.449 -12.047 -13.813 -9 ,29191 ,KEBNE ,16721623,Sat Nov 27 17:51:51 CET,Sat Nov 27 19:25:55 CET,0.0 1.122 1.6 1.941 2.22 2.467 2.687 2.897 3.274 3.448 3.613 3.846 4.032 4.15 4.379 4.59 4.786 4.88 5.052 5.221 5.478 5.642 5.796 6.001 6.189 6.369 6.531 6.682 6.876 7.054 7.213 7.409 7.601 7.767 7.943 8.147 8.333 8.511 8.692 8.877 9.064 9.243 9.447 9.669 9.859 9.972 10.047 10.079 9.956 9.582 8.735 7.435 6.225 5.17 4.244 3.404 2.681 2.018 1.42 0.794 0.232 -0.255 -0.705 -1.139 -1.551 -1.928 -2.326 -2.682 -3.004 -3.338 -3.675 -3.96 -4.259 -4.574 -4.827 -5.091 -5.365 -5.657 -5.961 -6.171 -6.388 -6.735 -6.978 -7.234 -7.365 -7.644 -7.944 -8.25 -8.415 -8.664 -8.957 -9.141 -9.341 -9.788 -10.044 -10.325 -10.635 -10.989 -11.426 -11.982 -13.2 -10 ,10392 ,KEBNE ,16721624,Sat Nov 27 17:52:53 CET,Sat Nov 27 19:28:04 CET,0.0 1.148 1.583 1.914 2.188 2.434 2.658 2.856 3.202 3.357 3.503 3.731 3.921 4.043 4.278 4.495 4.693 4.792 4.985 5.162 5.392 5.536 5.672 5.873 6.07 6.251 6.417 6.567 6.755 6.934 7.111 7.324 7.517 7.694 7.887 8.093 8.279 8.476 8.687 8.889 9.095 9.297 9.492 9.675 9.821 9.952 10.057 10.051 9.917 9.522 8.636 7.319 6.117 5.071 4.164 3.31 2.534 1.831 1.206 0.571 0.024 -0.459 -0.923 -1.361 -1.778 -2.157 -2.545 -2.918 -3.239 -3.562 -3.899 -4.186 -4.489 -4.8 -5.04 -5.289 -5.557 -5.844 -6.143 -6.347 -6.556 -6.896 -7.139 -7.386 -7.516 -7.786 -8.063 -8.362 -8.528 -8.765 -9.073 -9.277 -9.478 -9.931 -10.2 -10.492 -10.802 -11.164 -11.599 -12.126 -13.289 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_49.txt deleted file mode 100644 index 4dd08b19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_46_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25847 ,KEBNE ,16721625,Sat Nov 27 17:52:57 CET,Sat Nov 27 19:23:06 CET,0.0 0.81 1.263 1.599 1.875 2.124 2.324 2.501 2.825 2.964 3.088 3.25 3.41 3.506 3.68 3.834 3.973 4.038 4.158 4.27 4.429 4.522 4.599 4.705 4.826 4.938 5.028 5.107 5.207 5.299 5.359 5.41 5.455 5.481 5.494 5.483 5.447 5.405 5.342 5.25 5.138 4.941 4.658 4.342 3.902 3.324 2.507 1.386 -0.188 -2.5 -6.208 -10.451 -13.747 -16.392 -18.633 -20.566 -22.175 -23.607 -24.812 -25.997 -27.006 -27.89 -28.742 -29.545 -30.286 -30.952 -31.636 -32.24 -32.761 -33.309 -33.871 -34.335 -34.828 -35.33 -35.735 -36.153 -36.58 -37.019 -37.46 -37.778 -38.105 -38.61 -38.95 -39.299 -39.486 -39.867 -40.254 -40.683 -40.921 -41.277 -41.666 -41.931 -42.224 -42.845 -43.191 -43.57 -43.981 -44.445 -45.024 -45.798 -47.58 -2 ,8801 ,KEBNE ,16721626,Sat Nov 27 17:53:55 CET,Sat Nov 27 19:28:22 CET,0.0 0.981 1.405 1.761 2.032 2.254 2.441 2.611 2.913 3.05 3.182 3.363 3.537 3.639 3.829 4.008 4.155 4.224 4.35 4.465 4.636 4.734 4.821 4.949 5.069 5.17 5.248 5.319 5.423 5.512 5.574 5.628 5.665 5.685 5.689 5.683 5.673 5.649 5.597 5.509 5.381 5.186 4.921 4.61 4.16 3.548 2.694 1.565 -0.026 -2.387 -6.113 -10.337 -13.699 -16.442 -18.677 -20.597 -22.253 -23.697 -24.932 -26.149 -27.183 -28.121 -28.986 -29.783 -30.506 -31.171 -31.881 -32.517 -33.073 -33.646 -34.226 -34.696 -35.177 -35.684 -36.083 -36.496 -36.925 -37.363 -37.821 -38.131 -38.451 -38.957 -39.317 -39.699 -39.899 -40.315 -40.749 -41.209 -41.454 -41.819 -42.245 -42.515 -42.801 -43.415 -43.745 -44.115 -44.516 -44.956 -45.515 -46.293 -48.083 -3 ,1689 ,KEBNE ,16721627,Sat Nov 27 17:53:55 CET,Sat Nov 27 19:28:25 CET,0.0 1.144 1.541 1.874 2.14 2.361 2.559 2.738 3.063 3.204 3.341 3.538 3.706 3.807 3.999 4.171 4.327 4.403 4.539 4.662 4.837 4.943 5.036 5.155 5.262 5.362 5.442 5.511 5.605 5.678 5.732 5.777 5.805 5.835 5.88 5.923 5.93 5.91 5.869 5.791 5.663 5.508 5.295 4.986 4.538 3.954 3.119 1.992 0.413 -1.928 -5.629 -9.867 -13.189 -15.843 -18.083 -20.029 -21.686 -23.15 -24.4 -25.661 -26.729 -27.662 -28.528 -29.312 -30.056 -30.739 -31.45 -32.082 -32.613 -33.161 -33.739 -34.219 -34.716 -35.23 -35.619 -36.012 -36.425 -36.872 -37.334 -37.648 -37.966 -38.464 -38.823 -39.197 -39.386 -39.769 -40.179 -40.632 -40.87 -41.219 -41.634 -41.905 -42.192 -42.812 -43.147 -43.516 -43.941 -44.421 -44.983 -45.72 -47.736 -4 ,26124 ,KEBNE ,16721628,Sat Nov 27 17:53:55 CET,Sat Nov 27 19:28:22 CET,0.0 1.145 1.546 1.855 2.122 2.364 2.57 2.736 3.019 3.146 3.273 3.459 3.623 3.716 3.887 4.04 4.186 4.252 4.378 4.501 4.659 4.752 4.839 4.955 5.049 5.131 5.216 5.297 5.4 5.482 5.538 5.597 5.639 5.679 5.722 5.732 5.711 5.677 5.629 5.557 5.44 5.277 5.042 4.718 4.259 3.66 2.834 1.744 0.134 -2.254 -6.017 -10.304 -13.655 -16.369 -18.63 -20.584 -22.245 -23.74 -24.991 -26.209 -27.266 -28.189 -29.044 -29.853 -30.606 -31.268 -31.96 -32.587 -33.102 -33.634 -34.218 -34.698 -35.173 -35.665 -36.045 -36.446 -36.869 -37.298 -37.744 -38.051 -38.375 -38.862 -39.186 -39.541 -39.727 -40.114 -40.533 -40.985 -41.214 -41.557 -41.955 -42.244 -42.556 -43.211 -43.559 -43.93 -44.338 -44.801 -45.369 -46.099 -48.045 -5 ,28 ,KEBNE ,16721629,Sat Nov 27 17:55:01 CET,Sat Nov 27 19:26:34 CET,0.0 1.12 1.533 1.842 2.107 2.339 2.543 2.72 3.028 3.161 3.284 3.447 3.603 3.696 3.862 4.011 4.16 4.233 4.362 4.482 4.646 4.74 4.82 4.929 5.025 5.11 5.188 5.257 5.334 5.408 5.475 5.539 5.59 5.626 5.648 5.648 5.649 5.635 5.582 5.494 5.356 5.168 4.911 4.602 4.17 3.572 2.774 1.725 0.156 -2.212 -5.968 -10.226 -13.546 -16.261 -18.484 -20.407 -22.068 -23.524 -24.753 -25.945 -26.971 -27.899 -28.782 -29.599 -30.342 -31.029 -31.719 -32.322 -32.865 -33.423 -33.998 -34.482 -34.988 -35.504 -35.9 -36.308 -36.729 -37.153 -37.59 -37.894 -38.226 -38.761 -39.114 -39.473 -39.663 -40.061 -40.49 -40.943 -41.179 -41.532 -41.922 -42.187 -42.481 -43.136 -43.493 -43.874 -44.276 -44.736 -45.272 -46.005 -47.844 -6 ,20152 ,KEBNE ,16721630,Sat Nov 27 17:58:02 CET,Sat Nov 27 19:33:43 CET,0.0 1.152 1.549 1.83 2.06 2.279 2.476 2.656 2.985 3.132 3.263 3.435 3.602 3.7 3.876 4.043 4.19 4.254 4.369 4.483 4.64 4.732 4.826 4.955 5.061 5.147 5.221 5.283 5.359 5.437 5.511 5.575 5.611 5.649 5.686 5.704 5.693 5.654 5.597 5.515 5.392 5.204 4.935 4.619 4.19 3.628 2.837 1.725 0.12 -2.249 -5.956 -10.161 -13.498 -16.176 -18.377 -20.286 -21.925 -23.353 -24.549 -25.753 -26.783 -27.697 -28.54 -29.327 -30.084 -30.76 -31.434 -32.053 -32.6 -33.156 -33.726 -34.193 -34.681 -35.179 -35.562 -35.966 -36.393 -36.841 -37.293 -37.603 -37.922 -38.415 -38.76 -39.126 -39.319 -39.723 -40.136 -40.568 -40.806 -41.155 -41.544 -41.799 -42.083 -42.708 -43.043 -43.412 -43.829 -44.305 -44.875 -45.628 -47.546 -7 ,9897 ,KEBNE ,16721631,Sat Nov 27 17:59:03 CET,Sat Nov 27 19:34:35 CET,0.0 0.947 1.356 1.647 1.882 2.106 2.305 2.467 2.732 2.853 2.966 3.114 3.264 3.358 3.537 3.693 3.833 3.9 4.03 4.15 4.313 4.406 4.487 4.586 4.67 4.747 4.816 4.878 4.945 5.005 5.067 5.125 5.164 5.192 5.203 5.2 5.188 5.163 5.105 5.012 4.895 4.725 4.476 4.182 3.749 3.153 2.334 1.213 -0.384 -2.727 -6.494 -10.788 -14.169 -16.94 -19.23 -21.196 -22.839 -24.274 -25.496 -26.72 -27.759 -28.681 -29.564 -30.373 -31.117 -31.802 -32.502 -33.117 -33.628 -34.155 -34.727 -35.193 -35.667 -36.157 -36.545 -36.953 -37.366 -37.796 -38.245 -38.548 -38.87 -39.387 -39.747 -40.12 -40.313 -40.715 -41.136 -41.588 -41.827 -42.176 -42.578 -42.858 -43.147 -43.779 -44.128 -44.502 -44.887 -45.356 -45.932 -46.661 -48.693 -8 ,11491 ,KEBNE ,16721632,Sat Nov 27 17:59:03 CET,Sat Nov 27 19:34:48 CET,0.0 1.053 1.499 1.817 2.078 2.312 2.515 2.692 3.005 3.141 3.269 3.43 3.588 3.682 3.847 4.004 4.141 4.204 4.332 4.442 4.588 4.679 4.771 4.892 5.0 5.108 5.19 5.264 5.35 5.414 5.472 5.53 5.583 5.625 5.646 5.656 5.649 5.614 5.563 5.489 5.365 5.19 4.929 4.626 4.206 3.603 2.743 1.584 -0.036 -2.422 -6.163 -10.35 -13.663 -16.372 -18.579 -20.501 -22.167 -23.636 -24.873 -26.088 -27.123 -28.05 -28.938 -29.779 -30.522 -31.179 -31.871 -32.499 -33.043 -33.593 -34.174 -34.665 -35.174 -35.682 -36.077 -36.498 -36.925 -37.363 -37.811 -38.123 -38.438 -38.934 -39.285 -39.653 -39.848 -40.249 -40.676 -41.129 -41.365 -41.714 -42.095 -42.357 -42.637 -43.251 -43.601 -43.96 -44.359 -44.848 -45.442 -46.211 -47.952 -9 ,31222 ,KEBNE ,16721633,Sat Nov 27 17:59:03 CET,Sat Nov 27 19:34:34 CET,0.0 1.025 1.449 1.767 2.051 2.264 2.447 2.623 2.927 3.06 3.19 3.365 3.529 3.627 3.803 3.963 4.111 4.18 4.309 4.419 4.563 4.655 4.741 4.85 4.939 5.027 5.11 5.172 5.244 5.317 5.376 5.432 5.487 5.518 5.536 5.555 5.562 5.55 5.497 5.406 5.278 5.109 4.881 4.597 4.169 3.577 2.77 1.66 0.076 -2.293 -6.054 -10.233 -13.51 -16.198 -18.416 -20.322 -21.977 -23.458 -24.716 -25.956 -26.998 -27.911 -28.755 -29.56 -30.326 -31.003 -31.698 -32.314 -32.856 -33.422 -33.999 -34.473 -34.945 -35.43 -35.818 -36.224 -36.655 -37.108 -37.57 -37.889 -38.211 -38.706 -39.055 -39.427 -39.623 -40.038 -40.471 -40.913 -41.146 -41.495 -41.89 -42.158 -42.45 -43.107 -43.45 -43.81 -44.217 -44.685 -45.254 -45.989 -47.988 -10 ,7453 ,KEBNE ,16721634,Sat Nov 27 17:59:03 CET,Sat Nov 27 19:34:18 CET,0.0 1.358 1.831 2.178 2.456 2.685 2.886 3.066 3.366 3.503 3.632 3.812 3.97 4.077 4.274 4.432 4.574 4.645 4.785 4.909 5.067 5.161 5.258 5.399 5.527 5.648 5.741 5.813 5.9 5.979 6.046 6.102 6.135 6.161 6.179 6.176 6.161 6.135 6.082 5.983 5.839 5.648 5.392 5.081 4.627 4.003 3.177 2.102 0.565 -1.779 -5.561 -9.776 -13.049 -15.715 -17.983 -19.956 -21.607 -23.086 -24.343 -25.559 -26.585 -27.492 -28.364 -29.168 -29.904 -30.58 -31.283 -31.894 -32.408 -32.948 -33.525 -34.001 -34.487 -35.008 -35.409 -35.823 -36.254 -36.684 -37.135 -37.458 -37.8 -38.328 -38.691 -39.069 -39.258 -39.652 -40.094 -40.569 -40.814 -41.171 -41.575 -41.857 -42.165 -42.822 -43.178 -43.565 -43.981 -44.442 -44.995 -45.723 -47.491 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_44.txt deleted file mode 100644 index 37e86f30..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13986 ,KEBNE ,16721635,Sat Nov 27 17:59:03 CET,Sat Nov 27 19:34:18 CET,0.0 1.328 1.819 2.17 2.459 2.714 2.935 3.144 3.543 3.728 3.895 4.131 4.345 4.489 4.766 5.013 5.239 5.342 5.547 5.75 6.033 6.204 6.361 6.584 6.792 7.003 7.218 7.419 7.675 7.921 8.156 8.431 8.69 8.929 9.21 9.512 9.786 10.084 10.407 10.738 11.068 11.427 11.828 12.219 12.665 13.146 13.644 14.146 14.708 15.203 15.457 15.344 15.006 14.564 14.106 13.649 13.223 12.795 12.383 11.975 11.614 11.268 10.918 10.586 10.283 9.999 9.684 9.395 9.14 8.861 8.567 8.325 8.072 7.807 7.598 7.376 7.138 6.883 6.602 6.403 6.198 5.861 5.632 5.393 5.264 4.984 4.673 4.364 4.206 3.96 3.661 3.46 3.24 2.756 2.496 2.228 1.924 1.572 1.165 0.548 -0.934 -2 ,22006 ,KEBNE ,16721636,Sat Nov 27 17:59:03 CET,Sat Nov 27 19:35:22 CET,0.0 1.65 2.25 2.672 3.015 3.288 3.531 3.764 4.197 4.39 4.564 4.809 5.021 5.168 5.46 5.731 5.987 6.102 6.314 6.519 6.803 6.977 7.157 7.423 7.677 7.915 8.13 8.338 8.589 8.832 9.065 9.322 9.567 9.807 10.074 10.354 10.627 10.914 11.221 11.551 11.891 12.274 12.703 13.109 13.553 14.017 14.515 15.012 15.506 15.973 16.281 16.155 15.792 15.369 14.919 14.455 13.991 13.569 13.192 12.775 12.412 12.073 11.726 11.385 11.039 10.718 10.394 10.085 9.81 9.54 9.252 8.984 8.715 8.445 8.225 8.0 7.756 7.499 7.23 7.034 6.822 6.493 6.258 6.002 5.881 5.647 5.376 5.084 4.933 4.703 4.431 4.232 4.023 3.555 3.285 3.0 2.703 2.381 1.989 1.486 0.122 -3 ,23132 ,KEBNE ,16721637,Sat Nov 27 18:00:05 CET,Sat Nov 27 19:36:02 CET,0.0 1.486 2.035 2.424 2.758 3.031 3.264 3.485 3.887 4.071 4.241 4.476 4.682 4.823 5.117 5.378 5.625 5.748 5.968 6.177 6.48 6.666 6.843 7.088 7.319 7.544 7.758 7.964 8.216 8.456 8.688 8.951 9.2 9.444 9.728 10.036 10.321 10.625 10.94 11.265 11.584 11.937 12.372 12.782 13.198 13.626 14.074 14.563 15.094 15.548 15.815 15.671 15.295 14.838 14.362 13.877 13.459 13.03 12.618 12.193 11.777 11.4 11.03 10.676 10.365 10.065 9.731 9.433 9.182 8.925 8.635 8.385 8.127 7.855 7.638 7.406 7.165 6.914 6.644 6.45 6.247 5.939 5.72 5.486 5.356 5.069 4.783 4.484 4.32 4.076 3.775 3.572 3.356 2.89 2.635 2.359 2.056 1.712 1.307 0.76 -0.777 -4 ,17289 ,KEBNE ,16721638,Sat Nov 27 18:00:05 CET,Sat Nov 27 19:36:04 CET,0.0 1.161 1.723 2.156 2.489 2.761 3.002 3.228 3.651 3.853 4.049 4.33 4.561 4.714 4.993 5.248 5.48 5.597 5.825 6.034 6.329 6.518 6.707 6.965 7.214 7.455 7.667 7.852 8.087 8.321 8.548 8.815 9.07 9.31 9.586 9.884 10.145 10.44 10.772 11.103 11.419 11.774 12.206 12.641 13.084 13.544 14.056 14.564 15.061 15.507 15.787 15.628 15.267 14.859 14.445 14.006 13.561 13.139 12.766 12.34 11.944 11.582 11.223 10.886 10.559 10.245 9.923 9.617 9.343 9.068 8.773 8.531 8.289 8.019 7.804 7.587 7.364 7.135 6.886 6.706 6.521 6.236 6.03 5.81 5.693 5.439 5.154 4.868 4.728 4.505 4.236 4.046 3.836 3.371 3.124 2.85 2.537 2.183 1.756 1.184 -0.352 -5 ,17808 ,KEBNE ,16721639,Sat Nov 27 18:01:06 CET,Sat Nov 27 19:36:47 CET,0.0 1.419 1.962 2.38 2.716 3.005 3.284 3.546 3.981 4.172 4.348 4.596 4.824 4.967 5.236 5.494 5.738 5.856 6.079 6.286 6.571 6.751 6.922 7.17 7.41 7.63 7.832 8.032 8.285 8.516 8.743 9.019 9.272 9.513 9.797 10.11 10.39 10.682 11.003 11.339 11.682 12.054 12.472 12.88 13.343 13.82 14.327 14.854 15.396 15.878 16.113 15.967 15.633 15.214 14.758 14.287 13.847 13.416 13.026 12.611 12.237 11.894 11.541 11.191 10.855 10.557 10.252 9.963 9.693 9.408 9.116 8.871 8.614 8.345 8.136 7.915 7.675 7.408 7.133 6.944 6.742 6.435 6.23 6.006 5.884 5.634 5.368 5.07 4.904 4.652 4.353 4.161 3.961 3.526 3.274 3.009 2.721 2.359 1.921 1.326 -0.622 -6 ,11608 ,KEBNE ,16721640,Sat Nov 27 18:01:06 CET,Sat Nov 27 19:38:02 CET,0.0 1.424 1.908 2.268 2.591 2.871 3.112 3.333 3.748 3.942 4.123 4.395 4.631 4.781 5.074 5.343 5.578 5.69 5.91 6.12 6.411 6.597 6.773 7.018 7.255 7.472 7.673 7.865 8.123 8.382 8.617 8.89 9.158 9.416 9.689 9.974 10.252 10.557 10.874 11.199 11.527 11.892 12.308 12.713 13.157 13.612 14.101 14.572 15.029 15.45 15.692 15.587 15.291 14.894 14.437 13.957 13.498 13.072 12.677 12.266 11.9 11.572 11.249 10.93 10.611 10.307 9.984 9.681 9.409 9.119 8.815 8.57 8.328 8.066 7.843 7.609 7.363 7.109 6.828 6.628 6.426 6.09 5.857 5.616 5.489 5.232 4.959 4.649 4.484 4.25 3.985 3.799 3.599 3.162 2.915 2.629 2.32 1.975 1.543 0.97 -0.275 -7 ,1881 ,KEBNE ,16721641,Sat Nov 27 18:01:06 CET,Sat Nov 27 19:36:44 CET,0.0 1.124 1.59 1.962 2.271 2.555 2.834 3.074 3.466 3.647 3.825 4.104 4.343 4.502 4.787 5.04 5.27 5.379 5.594 5.803 6.1 6.296 6.478 6.729 6.965 7.177 7.374 7.565 7.813 8.046 8.257 8.508 8.751 8.986 9.255 9.548 9.828 10.124 10.431 10.769 11.119 11.49 11.902 12.306 12.762 13.256 13.769 14.255 14.769 15.218 15.443 15.314 14.991 14.572 14.113 13.659 13.213 12.79 12.408 11.976 11.588 11.228 10.867 10.52 10.199 9.903 9.586 9.276 9.007 8.742 8.457 8.207 7.946 7.672 7.451 7.22 6.974 6.719 6.45 6.265 6.083 5.784 5.558 5.312 5.181 4.916 4.642 4.344 4.18 3.928 3.635 3.44 3.231 2.782 2.523 2.233 1.901 1.51 1.067 0.538 -0.785 -8 ,32324 ,KEBNE ,16721642,Sat Nov 27 18:01:06 CET,Sat Nov 27 19:37:16 CET,0.0 1.257 1.785 2.201 2.532 2.799 3.043 3.276 3.719 3.911 4.086 4.352 4.577 4.724 4.997 5.247 5.487 5.599 5.805 5.995 6.278 6.461 6.629 6.867 7.097 7.312 7.509 7.697 7.945 8.184 8.402 8.693 8.994 9.258 9.551 9.876 10.174 10.484 10.803 11.131 11.469 11.832 12.226 12.616 13.034 13.466 13.956 14.415 14.867 15.325 15.604 15.473 15.109 14.655 14.157 13.664 13.193 12.726 12.303 11.872 11.482 11.116 10.769 10.435 10.116 9.809 9.488 9.204 8.962 8.706 8.418 8.173 7.921 7.655 7.443 7.216 6.979 6.732 6.466 6.283 6.084 5.766 5.549 5.325 5.211 4.952 4.67 4.384 4.234 3.997 3.707 3.523 3.335 2.929 2.695 2.421 2.105 1.744 1.298 0.724 -0.676 -9 ,24919 ,KEBNE ,16721643,Sat Nov 27 18:01:06 CET,Sat Nov 27 19:37:17 CET,0.0 1.261 1.75 2.139 2.48 2.776 3.042 3.275 3.692 3.877 4.053 4.341 4.572 4.716 4.994 5.237 5.473 5.589 5.801 5.998 6.287 6.483 6.675 6.933 7.169 7.393 7.602 7.79 8.024 8.256 8.48 8.753 9.021 9.278 9.563 9.868 10.154 10.455 10.758 11.089 11.424 11.774 12.18 12.575 13.012 13.458 13.932 14.433 14.948 15.439 15.757 15.715 15.445 15.046 14.594 14.104 13.638 13.206 12.806 12.356 11.967 11.631 11.291 10.951 10.632 10.335 10.015 9.726 9.479 9.222 8.949 8.718 8.465 8.198 7.985 7.76 7.53 7.275 6.999 6.805 6.601 6.278 6.049 5.798 5.669 5.401 5.104 4.799 4.641 4.412 4.156 3.981 3.782 3.351 3.121 2.868 2.583 2.247 1.845 1.289 -0.287 -10 ,7484 ,KEBNE ,16721644,Sat Nov 27 18:01:06 CET,Sat Nov 27 19:37:00 CET,0.0 1.287 1.77 2.118 2.397 2.667 2.92 3.149 3.563 3.747 3.902 4.128 4.352 4.499 4.773 5.016 5.244 5.359 5.583 5.794 6.089 6.277 6.451 6.692 6.929 7.152 7.361 7.549 7.776 7.998 8.21 8.459 8.706 8.94 9.206 9.498 9.763 10.05 10.352 10.664 10.982 11.332 11.723 12.094 12.516 12.967 13.45 13.958 14.478 14.94 15.205 15.069 14.725 14.294 13.822 13.352 12.92 12.475 12.06 11.623 11.238 10.906 10.579 10.239 9.91 9.615 9.292 8.998 8.738 8.456 8.17 7.927 7.674 7.413 7.202 6.985 6.761 6.523 6.269 6.086 5.895 5.592 5.375 5.142 5.019 4.76 4.484 4.195 4.04 3.814 3.564 3.374 3.159 2.704 2.455 2.179 1.872 1.527 1.098 0.523 -1.147 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_49.txt deleted file mode 100644 index bd4c647e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_47_49.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11716 ,KEBNE ,16721645,Sat Nov 27 18:02:07 CET,Sat Nov 27 19:38:57 CET,0.0 1.132 1.574 1.895 2.16 2.394 2.612 2.813 3.17 3.324 3.462 3.643 3.827 3.939 4.16 4.355 4.529 4.611 4.768 4.905 5.091 5.199 5.3 5.448 5.585 5.707 5.811 5.913 6.046 6.164 6.266 6.363 6.444 6.525 6.611 6.68 6.727 6.759 6.783 6.799 6.788 6.736 6.626 6.481 6.259 5.935 5.489 4.834 3.768 2.16 -0.479 -3.583 -6.04 -8.059 -9.774 -11.302 -12.596 -13.751 -14.743 -15.713 -16.519 -17.225 -17.914 -18.562 -19.161 -19.727 -20.324 -20.843 -21.286 -21.754 -22.252 -22.663 -23.071 -23.494 -23.854 -24.224 -24.596 -24.982 -25.376 -25.648 -25.932 -26.415 -26.747 -27.087 -27.269 -27.64 -28.045 -28.46 -28.671 -29.013 -29.399 -29.669 -29.954 -30.53 -30.849 -31.197 -31.581 -32.05 -32.631 -33.408 -35.424 -2 ,19064 ,KEBNE ,16721646,Sat Nov 27 18:03:08 CET,Sat Nov 27 19:39:34 CET,0.0 1.306 1.719 2.04 2.312 2.54 2.751 2.931 3.242 3.384 3.524 3.696 3.877 3.981 4.173 4.35 4.52 4.601 4.75 4.887 5.074 5.181 5.281 5.42 5.551 5.681 5.8 5.907 6.025 6.134 6.244 6.358 6.45 6.533 6.612 6.679 6.741 6.804 6.843 6.869 6.898 6.888 6.802 6.654 6.409 6.07 5.607 4.948 3.896 2.318 -0.257 -3.278 -5.666 -7.673 -9.435 -10.999 -12.291 -13.428 -14.397 -15.364 -16.206 -16.94 -17.635 -18.307 -18.917 -19.458 -20.039 -20.544 -20.978 -21.448 -21.959 -22.378 -22.803 -23.227 -23.562 -23.933 -24.311 -24.695 -25.093 -25.38 -25.683 -26.153 -26.472 -26.81 -26.986 -27.335 -27.722 -28.127 -28.344 -28.687 -29.068 -29.331 -29.61 -30.208 -30.548 -30.93 -31.335 -31.796 -32.407 -33.209 -35.691 -3 ,6625 ,KEBNE ,16721647,Sat Nov 27 18:04:10 CET,Sat Nov 27 19:41:59 CET,0.0 1.145 1.571 1.908 2.19 2.443 2.661 2.854 3.209 3.367 3.506 3.683 3.867 3.978 4.18 4.354 4.518 4.595 4.74 4.862 5.027 5.138 5.246 5.39 5.518 5.639 5.746 5.838 5.964 6.08 6.169 6.273 6.373 6.456 6.534 6.597 6.649 6.71 6.766 6.785 6.772 6.737 6.652 6.516 6.295 5.977 5.472 4.772 3.774 2.179 -0.434 -3.491 -5.998 -8.026 -9.767 -11.253 -12.496 -13.645 -14.611 -15.589 -16.444 -17.185 -17.858 -18.481 -19.072 -19.619 -20.19 -20.691 -21.135 -21.627 -22.129 -22.519 -22.94 -23.411 -23.764 -24.121 -24.503 -24.903 -25.318 -25.599 -25.889 -26.357 -26.68 -27.02 -27.203 -27.583 -27.972 -28.381 -28.6 -28.93 -29.302 -29.56 -29.839 -30.465 -30.803 -31.175 -31.594 -32.062 -32.614 -33.372 -35.701 -4 ,436 ,KEBNE ,16721648,Sat Nov 27 18:04:10 CET,Sat Nov 27 19:43:06 CET,0.0 1.199 1.612 1.946 2.229 2.469 2.69 2.895 3.241 3.392 3.534 3.723 3.91 4.018 4.239 4.437 4.603 4.682 4.821 4.953 5.143 5.251 5.354 5.502 5.633 5.754 5.867 5.963 6.088 6.201 6.294 6.391 6.479 6.555 6.63 6.695 6.757 6.82 6.859 6.875 6.861 6.826 6.752 6.619 6.401 6.076 5.615 4.957 3.91 2.291 -0.365 -3.398 -5.757 -7.723 -9.382 -10.861 -12.145 -13.299 -14.258 -15.178 -16.015 -16.784 -17.49 -18.131 -18.733 -19.29 -19.884 -20.412 -20.862 -21.332 -21.838 -22.265 -22.699 -23.139 -23.47 -23.826 -24.206 -24.597 -25.0 -25.278 -25.568 -26.026 -26.356 -26.708 -26.883 -27.228 -27.6 -28.004 -28.229 -28.572 -28.954 -29.231 -29.528 -30.179 -30.533 -30.885 -31.298 -31.786 -32.35 -33.071 -35.002 -5 ,1001 ,KEBNE ,16721649,Sat Nov 27 18:06:12 CET,Sat Nov 27 19:42:56 CET,0.0 1.184 1.666 1.984 2.252 2.494 2.699 2.886 3.221 3.368 3.511 3.694 3.884 3.989 4.185 4.366 4.526 4.603 4.747 4.877 5.055 5.167 5.276 5.423 5.555 5.676 5.786 5.887 6.011 6.136 6.241 6.345 6.443 6.528 6.619 6.704 6.766 6.815 6.858 6.89 6.883 6.832 6.731 6.591 6.37 6.038 5.557 4.881 3.868 2.276 -0.403 -3.453 -5.898 -7.965 -9.658 -11.149 -12.431 -13.565 -14.539 -15.516 -16.365 -17.108 -17.823 -18.509 -19.13 -19.692 -20.264 -20.769 -21.205 -21.653 -22.121 -22.514 -22.933 -23.368 -23.709 -24.062 -24.431 -24.822 -25.235 -25.527 -25.823 -26.286 -26.607 -26.943 -27.119 -27.497 -27.903 -28.318 -28.533 -28.868 -29.252 -29.516 -29.782 -30.364 -30.706 -31.086 -31.509 -31.964 -32.504 -33.259 -35.355 -6 ,1120 ,KEBNE ,16721650,Sat Nov 27 18:06:13 CET,Sat Nov 27 19:42:24 CET,0.0 1.324 1.794 2.125 2.395 2.624 2.824 3.008 3.347 3.5 3.64 3.813 3.996 4.106 4.32 4.505 4.67 4.75 4.9 5.04 5.234 5.351 5.453 5.603 5.734 5.846 5.96 6.062 6.189 6.302 6.393 6.48 6.555 6.631 6.709 6.777 6.833 6.88 6.908 6.912 6.888 6.831 6.719 6.597 6.404 6.075 5.595 4.896 3.879 2.333 -0.315 -3.333 -5.73 -7.726 -9.412 -10.891 -12.136 -13.271 -14.245 -15.218 -16.034 -16.737 -17.434 -18.077 -18.65 -19.191 -19.746 -20.237 -20.669 -21.12 -21.601 -22.03 -22.486 -22.936 -23.287 -23.659 -24.053 -24.469 -24.887 -25.174 -25.467 -25.934 -26.264 -26.609 -26.791 -27.159 -27.545 -27.98 -28.21 -28.545 -28.916 -29.188 -29.477 -30.1 -30.447 -30.834 -31.265 -31.736 -32.316 -33.156 -35.481 -7 ,9297 ,KEBNE ,16721651,Sat Nov 27 18:06:13 CET,Sat Nov 27 19:42:33 CET,0.0 1.177 1.591 1.915 2.199 2.45 2.661 2.844 3.175 3.321 3.445 3.599 3.779 3.884 4.078 4.255 4.417 4.497 4.654 4.8 4.995 5.105 5.21 5.354 5.487 5.623 5.746 5.845 5.967 6.083 6.206 6.343 6.447 6.533 6.617 6.697 6.765 6.814 6.843 6.861 6.848 6.801 6.71 6.574 6.362 6.033 5.516 4.786 3.725 2.134 -0.479 -3.591 -6.075 -8.096 -9.794 -11.297 -12.578 -13.704 -14.668 -15.636 -16.477 -17.209 -17.889 -18.536 -19.136 -19.691 -20.284 -20.802 -21.246 -21.712 -22.19 -22.593 -23.028 -23.475 -23.804 -24.168 -24.563 -24.961 -25.371 -25.659 -25.951 -26.404 -26.73 -27.063 -27.236 -27.599 -27.991 -28.409 -28.629 -28.961 -29.323 -29.588 -29.87 -30.479 -30.82 -31.203 -31.638 -32.141 -32.712 -33.467 -36.101 -8 ,12548 ,KEBNE ,16721652,Sat Nov 27 18:06:13 CET,Sat Nov 27 19:44:21 CET,0.0 1.416 1.838 2.187 2.496 2.751 2.959 3.155 3.505 3.656 3.799 3.993 4.187 4.305 4.508 4.686 4.842 4.916 5.06 5.197 5.39 5.5 5.598 5.739 5.867 5.986 6.096 6.195 6.32 6.427 6.525 6.64 6.732 6.803 6.883 6.982 7.067 7.125 7.149 7.152 7.133 7.077 6.977 6.833 6.59 6.236 5.738 5.065 4.048 2.451 -0.155 -3.167 -5.566 -7.543 -9.204 -10.69 -11.99 -13.157 -14.152 -15.136 -15.955 -16.684 -17.405 -18.084 -18.713 -19.271 -19.839 -20.375 -20.842 -21.3 -21.794 -22.224 -22.663 -23.107 -23.458 -23.828 -24.218 -24.62 -25.006 -25.274 -25.569 -26.037 -26.369 -26.723 -26.901 -27.25 -27.627 -28.065 -28.291 -28.633 -29.024 -29.28 -29.548 -30.15 -30.498 -30.866 -31.276 -31.776 -32.402 -33.252 -35.575 -9 ,27540 ,KEBNE ,16721653,Sat Nov 27 18:06:12 CET,Sat Nov 27 19:42:38 CET,0.0 0.948 1.359 1.666 1.943 2.193 2.405 2.608 2.947 3.089 3.235 3.418 3.598 3.706 3.905 4.082 4.236 4.305 4.441 4.574 4.761 4.876 4.995 5.162 5.305 5.436 5.55 5.652 5.774 5.888 5.999 6.126 6.229 6.32 6.423 6.522 6.585 6.638 6.686 6.716 6.718 6.674 6.584 6.445 6.231 5.918 5.441 4.738 3.696 2.108 -0.55 -3.584 -6.018 -8.039 -9.687 -11.168 -12.504 -13.701 -14.712 -15.695 -16.536 -17.262 -17.942 -18.6 -19.211 -19.772 -20.367 -20.888 -21.333 -21.793 -22.265 -22.671 -23.115 -23.566 -23.907 -24.269 -24.648 -25.039 -25.454 -25.741 -26.024 -26.477 -26.803 -27.143 -27.314 -27.677 -28.082 -28.513 -28.734 -29.082 -29.481 -29.741 -30.022 -30.667 -31.024 -31.391 -31.805 -32.309 -32.901 -33.715 -36.08 -10 ,29091 ,KEBNE ,16721654,Sat Nov 27 18:07:14 CET,Sat Nov 27 19:45:02 CET,0.0 1.22 1.689 2.028 2.301 2.535 2.743 2.918 3.221 3.359 3.494 3.684 3.881 3.994 4.205 4.391 4.553 4.633 4.781 4.916 5.099 5.217 5.335 5.498 5.631 5.75 5.865 5.964 6.085 6.202 6.298 6.403 6.51 6.596 6.668 6.744 6.818 6.876 6.921 6.948 6.94 6.908 6.837 6.713 6.502 6.175 5.691 4.989 3.972 2.427 -0.216 -3.283 -5.663 -7.64 -9.316 -10.81 -12.092 -13.225 -14.194 -15.165 -16.003 -16.752 -17.479 -18.159 -18.768 -19.307 -19.876 -20.392 -20.83 -21.285 -21.776 -22.199 -22.623 -23.046 -23.388 -23.748 -24.119 -24.502 -24.911 -25.199 -25.486 -25.938 -26.261 -26.601 -26.787 -27.179 -27.574 -28.0 -28.229 -28.558 -28.918 -29.174 -29.455 -30.11 -30.455 -30.804 -31.19 -31.658 -32.218 -32.964 -35.014 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_20.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_20.txt deleted file mode 100644 index 077d473e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_20.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2105 ,KEBNE ,16721655,Sat Nov 27 18:07:14 CET,Sat Nov 27 19:43:50 CET,0.0 2.722 3.476 4.014 4.424 4.768 5.068 5.357 5.868 6.101 6.338 6.683 6.947 7.13 7.473 7.797 8.094 8.228 8.485 8.72 9.08 9.322 9.533 9.835 10.123 10.389 10.645 10.88 11.181 11.482 11.76 12.087 12.409 12.709 13.052 13.418 13.757 14.114 14.489 14.875 15.258 15.695 16.178 16.634 17.162 17.716 18.279 18.835 19.363 19.799 20.014 19.699 19.142 18.52 17.863 17.2 16.599 16.026 15.462 14.885 14.417 13.986 13.548 13.126 12.732 12.37 11.982 11.633 11.326 11.0 10.66 10.388 10.101 9.792 9.549 9.289 9.022 8.744 8.414 8.182 7.95 7.579 7.323 7.049 6.91 6.619 6.299 5.966 5.785 5.51 5.186 4.968 4.738 4.255 3.982 3.662 3.261 2.824 2.346 1.674 -0.444 -2 ,2633 ,KEBNE ,16721656,Sat Nov 27 18:08:16 CET,Sat Nov 27 19:45:24 CET,0.0 2.272 2.994 3.512 3.921 4.278 4.597 4.883 5.365 5.582 5.8 6.116 6.368 6.536 6.844 7.133 7.417 7.561 7.844 8.099 8.467 8.707 8.921 9.225 9.515 9.789 10.059 10.312 10.625 10.926 11.199 11.525 11.855 12.162 12.498 12.852 13.193 13.6 14.018 14.432 14.86 15.324 15.869 16.383 16.941 17.531 18.136 18.786 19.432 19.917 20.063 19.643 18.967 18.254 17.596 16.925 16.279 15.685 15.149 14.596 14.127 13.692 13.275 12.871 12.468 12.093 11.693 11.329 11.027 10.725 10.385 10.087 9.773 9.445 9.186 8.912 8.631 8.342 8.038 7.82 7.588 7.23 6.987 6.738 6.599 6.298 5.976 5.632 5.455 5.19 4.858 4.628 4.408 3.966 3.712 3.412 3.062 2.629 2.063 1.354 -0.872 -3 ,10964 ,KEBNE ,16721657,Sat Nov 27 18:09:17 CET,Sat Nov 27 19:48:00 CET,0.0 2.068 2.747 3.221 3.608 3.938 4.23 4.501 5.02 5.256 5.474 5.791 6.06 6.243 6.569 6.869 7.167 7.312 7.571 7.811 8.164 8.387 8.594 8.891 9.179 9.449 9.7 9.936 10.229 10.522 10.825 11.156 11.46 11.761 12.105 12.471 12.802 13.172 13.568 13.992 14.424 14.87 15.366 15.867 16.383 16.874 17.433 18.002 18.552 19.0 19.108 18.674 18.063 17.395 16.678 15.957 15.303 14.714 14.177 13.586 13.079 12.647 12.22 11.8 11.408 11.053 10.683 10.335 10.024 9.702 9.353 9.063 8.77 8.444 8.181 7.914 7.642 7.356 7.047 6.831 6.605 6.223 5.953 5.683 5.541 5.245 4.944 4.634 4.471 4.209 3.866 3.628 3.389 2.866 2.571 2.253 1.871 1.439 0.92 0.262 -1.341 -4 ,4856 ,KEBNE ,16721658,Sat Nov 27 18:09:17 CET,Sat Nov 27 19:45:27 CET,0.0 1.896 2.534 3.02 3.387 3.716 4.014 4.301 4.821 5.043 5.256 5.577 5.84 6.01 6.331 6.631 6.914 7.046 7.289 7.534 7.893 8.119 8.342 8.639 8.911 9.174 9.416 9.652 9.967 10.273 10.547 10.869 11.183 11.493 11.834 12.201 12.563 12.952 13.348 13.749 14.175 14.635 15.127 15.607 16.17 16.754 17.345 17.94 18.528 19.043 19.255 18.843 18.222 17.556 16.884 16.218 15.609 15.021 14.483 13.92 13.411 12.953 12.531 12.13 11.728 11.35 10.953 10.577 10.26 9.932 9.582 9.294 8.988 8.663 8.406 8.142 7.873 7.582 7.265 7.036 6.794 6.424 6.153 5.865 5.719 5.418 5.102 4.773 4.593 4.311 3.947 3.709 3.461 2.904 2.589 2.235 1.828 1.369 0.823 0.164 -2.05 -5 ,22411 ,KEBNE ,16721659,Sat Nov 27 18:09:17 CET,Sat Nov 27 19:43:49 CET,0.0 2.471 3.119 3.593 3.992 4.346 4.664 4.954 5.471 5.71 5.927 6.233 6.495 6.678 7.014 7.318 7.613 7.749 8.006 8.26 8.606 8.823 9.037 9.342 9.633 9.904 10.171 10.43 10.739 11.038 11.348 11.709 12.024 12.324 12.665 13.034 13.38 13.745 14.113 14.506 14.909 15.363 15.898 16.381 16.917 17.478 18.06 18.659 19.239 19.692 19.85 19.572 19.07 18.44 17.805 17.184 16.568 15.999 15.501 14.956 14.464 14.014 13.592 13.196 12.817 12.458 12.064 11.711 11.411 11.092 10.742 10.455 10.158 9.849 9.596 9.33 9.06 8.767 8.463 8.255 8.028 7.663 7.402 7.129 6.993 6.707 6.399 6.068 5.889 5.615 5.291 5.085 4.863 4.358 4.087 3.786 3.432 3.042 2.574 1.937 0.203 -6 ,17869 ,KEBNE ,16721660,Sat Nov 27 18:09:17 CET,Sat Nov 27 19:45:56 CET,0.0 2.057 2.732 3.223 3.645 4.013 4.334 4.623 5.105 5.331 5.551 5.877 6.14 6.318 6.656 6.988 7.283 7.415 7.684 7.933 8.268 8.483 8.702 9.011 9.291 9.569 9.839 10.084 10.401 10.702 10.979 11.304 11.62 11.918 12.255 12.634 12.981 13.334 13.697 14.094 14.512 14.948 15.433 15.893 16.361 16.864 17.472 18.112 18.697 19.143 19.226 18.794 18.199 17.507 16.834 16.175 15.55 14.959 14.414 13.845 13.361 12.907 12.456 12.05 11.659 11.28 10.889 10.546 10.245 9.926 9.573 9.27 8.953 8.618 8.363 8.101 7.837 7.558 7.258 7.051 6.833 6.476 6.204 5.932 5.802 5.524 5.225 4.904 4.74 4.491 4.194 3.982 3.75 3.185 2.885 2.581 2.225 1.795 1.317 0.702 -1.047 -7 ,7979 ,KEBNE ,16721661,Sat Nov 27 18:09:17 CET,Sat Nov 27 19:45:24 CET,0.0 1.935 2.549 3.012 3.402 3.757 4.085 4.363 4.835 5.05 5.25 5.569 5.844 6.011 6.318 6.607 6.886 7.022 7.287 7.539 7.88 8.105 8.321 8.607 8.895 9.178 9.436 9.682 9.998 10.301 10.594 10.944 11.258 11.544 11.874 12.247 12.593 12.961 13.36 13.772 14.185 14.622 15.123 15.638 16.193 16.768 17.391 18.011 18.651 19.171 19.332 18.956 18.349 17.622 16.921 16.275 15.69 15.117 14.57 14.007 13.531 13.117 12.71 12.292 11.896 11.528 11.137 10.781 10.474 10.16 9.825 9.54 9.232 8.902 8.646 8.383 8.109 7.817 7.496 7.275 7.053 6.7 6.444 6.169 6.026 5.733 5.432 5.106 4.934 4.674 4.38 4.169 3.949 3.485 3.221 2.935 2.62 2.255 1.816 1.229 -0.521 -8 ,14466 ,KEBNE ,16721662,Sat Nov 27 18:09:17 CET,Sat Nov 27 19:44:08 CET,0.0 1.926 2.538 3.042 3.474 3.842 4.15 4.418 4.893 5.11 5.325 5.652 5.923 6.109 6.448 6.755 7.051 7.199 7.478 7.732 8.081 8.295 8.496 8.806 9.107 9.385 9.64 9.887 10.21 10.517 10.802 11.153 11.48 11.776 12.129 12.527 12.905 13.291 13.685 14.093 14.522 14.997 15.528 16.048 16.607 17.183 17.763 18.294 18.774 19.185 19.292 18.895 18.274 17.553 16.848 16.174 15.547 14.965 14.445 13.889 13.412 12.981 12.547 12.13 11.736 11.355 10.958 10.615 10.304 9.967 9.622 9.34 9.035 8.708 8.452 8.184 7.912 7.634 7.335 7.118 6.885 6.51 6.239 5.963 5.827 5.543 5.241 4.908 4.722 4.449 4.147 3.947 3.736 3.254 2.962 2.646 2.313 1.895 1.352 0.652 -1.036 -9 ,9187 ,KEBNE ,16721663,Sat Nov 27 18:10:18 CET,Sat Nov 27 19:45:12 CET,0.0 1.568 2.175 2.647 3.052 3.41 3.721 3.997 4.498 4.727 4.933 5.227 5.492 5.668 5.987 6.292 6.577 6.715 6.978 7.232 7.598 7.83 8.055 8.365 8.651 8.921 9.175 9.426 9.745 10.038 10.31 10.625 10.929 11.222 11.549 11.927 12.285 12.651 13.042 13.469 13.898 14.355 14.867 15.359 15.904 16.493 17.123 17.677 18.217 18.693 18.779 18.338 17.75 17.054 16.341 15.658 15.009 14.421 13.914 13.382 12.895 12.443 12.009 11.585 11.161 10.774 10.375 10.003 9.685 9.367 9.034 8.743 8.435 8.107 7.852 7.593 7.32 7.015 6.69 6.471 6.238 5.876 5.623 5.363 5.228 4.953 4.668 4.357 4.188 3.931 3.634 3.425 3.188 2.643 2.354 2.053 1.712 1.327 0.902 0.3 -1.386 -10 ,18148 ,KEBNE ,16721664,Sat Nov 27 18:10:18 CET,Sat Nov 27 19:44:54 CET,0.0 1.723 2.34 2.756 3.114 3.435 3.737 4.027 4.523 4.745 4.954 5.243 5.496 5.666 5.994 6.31 6.601 6.735 6.996 7.248 7.601 7.821 8.041 8.354 8.643 8.925 9.194 9.443 9.76 10.059 10.345 10.687 11.013 11.329 11.669 12.038 12.416 12.814 13.21 13.637 14.068 14.52 15.03 15.515 16.056 16.618 17.179 17.738 18.264 18.7 18.837 18.483 17.923 17.274 16.612 15.964 15.35 14.797 14.3 13.769 13.28 12.839 12.414 11.98 11.589 11.22 10.812 10.455 10.157 9.838 9.493 9.193 8.885 8.573 8.325 8.069 7.795 7.501 7.189 6.972 6.755 6.409 6.166 5.91 5.77 5.484 5.179 4.826 4.64 4.38 4.103 3.902 3.678 3.18 2.917 2.634 2.304 1.89 1.39 0.802 -0.656 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_49.txt deleted file mode 100644 index 8c34ccc5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_48_49.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18725 ,KEBNE ,16721665,Sat Nov 27 18:11:20 CET,Sat Nov 27 19:46:06 CET,0.0 1.27 1.711 2.004 2.281 2.531 2.752 2.969 3.349 3.514 3.669 3.868 4.074 4.192 4.404 4.61 4.815 4.914 5.094 5.252 5.459 5.582 5.706 5.883 6.043 6.192 6.325 6.452 6.609 6.757 6.896 7.047 7.194 7.343 7.501 7.638 7.751 7.856 7.956 8.066 8.143 8.191 8.235 8.231 8.17 8.036 7.763 7.311 6.572 5.362 3.212 0.573 -1.559 -3.355 -4.917 -6.331 -7.56 -8.687 -9.659 -10.604 -11.411 -12.132 -12.822 -13.477 -14.088 -14.638 -15.221 -15.74 -16.178 -16.657 -17.167 -17.569 -17.972 -18.389 -18.718 -19.067 -19.431 -19.809 -20.222 -20.512 -20.802 -21.267 -21.603 -21.946 -22.121 -22.476 -22.843 -23.248 -23.469 -23.809 -24.197 -24.462 -24.735 -25.316 -25.632 -25.99 -26.403 -26.88 -27.458 -28.19 -30.012 -2 ,22434 ,KEBNE ,16721666,Sat Nov 27 18:11:20 CET,Sat Nov 27 19:46:38 CET,0.0 1.278 1.754 2.089 2.357 2.602 2.823 3.026 3.403 3.582 3.753 3.983 4.198 4.322 4.546 4.752 4.953 5.044 5.21 5.371 5.601 5.736 5.875 6.071 6.226 6.376 6.511 6.643 6.808 6.949 7.084 7.234 7.367 7.49 7.63 7.769 7.884 7.987 8.069 8.144 8.212 8.274 8.325 8.31 8.215 8.061 7.806 7.385 6.678 5.478 3.36 0.779 -1.391 -3.22 -4.794 -6.196 -7.403 -8.469 -9.406 -10.353 -11.144 -11.837 -12.509 -13.156 -13.749 -14.291 -14.861 -15.361 -15.802 -16.271 -16.737 -17.125 -17.539 -17.963 -18.298 -18.643 -19.005 -19.388 -19.793 -20.071 -20.352 -20.779 -21.078 -21.405 -21.584 -21.969 -22.351 -22.754 -22.965 -23.282 -23.646 -23.907 -24.185 -24.799 -25.136 -25.506 -25.914 -26.371 -26.895 -27.602 -29.632 -3 ,12056 ,KEBNE ,16721667,Sat Nov 27 18:11:20 CET,Sat Nov 27 19:46:33 CET,0.0 1.254 1.771 2.174 2.467 2.708 2.918 3.101 3.433 3.577 3.71 3.897 4.099 4.217 4.441 4.641 4.825 4.913 5.082 5.244 5.459 5.592 5.715 5.889 6.063 6.229 6.374 6.497 6.653 6.798 6.932 7.087 7.225 7.343 7.46 7.589 7.707 7.813 7.906 7.985 8.059 8.124 8.149 8.111 8.022 7.898 7.668 7.236 6.517 5.365 3.349 0.816 -1.307 -3.162 -4.783 -6.187 -7.392 -8.489 -9.42 -10.333 -11.138 -11.85 -12.517 -13.149 -13.734 -14.282 -14.881 -15.404 -15.842 -16.315 -16.816 -17.216 -17.626 -18.066 -18.411 -18.766 -19.134 -19.508 -19.916 -20.201 -20.492 -20.948 -21.262 -21.589 -21.758 -22.128 -22.541 -22.959 -23.171 -23.507 -23.878 -24.136 -24.406 -25.0 -25.339 -25.714 -26.127 -26.583 -27.131 -27.86 -29.869 -5 ,20291 ,KEBNE ,16721669,Sat Nov 27 18:11:20 CET,Sat Nov 27 19:45:58 CET,0.0 1.084 1.548 1.913 2.22 2.47 2.686 2.884 3.231 3.384 3.519 3.698 3.905 4.023 4.242 4.453 4.658 4.752 4.926 5.097 5.329 5.462 5.585 5.754 5.915 6.064 6.205 6.353 6.542 6.695 6.834 6.994 7.123 7.24 7.379 7.513 7.625 7.748 7.856 7.946 8.029 8.09 8.116 8.126 8.084 7.939 7.66 7.184 6.434 5.252 3.132 0.514 -1.685 -3.537 -5.06 -6.412 -7.619 -8.705 -9.659 -10.654 -11.482 -12.195 -12.885 -13.519 -14.107 -14.647 -15.21 -15.72 -16.169 -16.647 -17.142 -17.545 -17.966 -18.409 -18.749 -19.101 -19.466 -19.842 -20.23 -20.501 -20.797 -21.266 -21.587 -21.912 -22.077 -22.426 -22.796 -23.195 -23.419 -23.767 -24.138 -24.39 -24.655 -25.207 -25.534 -25.925 -26.361 -26.827 -27.374 -28.138 -29.941 -6 ,518 ,KEBNE ,16721670,Sat Nov 27 18:11:20 CET,Sat Nov 27 19:45:56 CET,0.0 1.159 1.657 2.021 2.288 2.528 2.755 2.957 3.308 3.472 3.632 3.837 4.046 4.159 4.384 4.604 4.785 4.868 5.037 5.197 5.405 5.537 5.665 5.852 6.029 6.203 6.365 6.501 6.665 6.823 6.965 7.118 7.252 7.372 7.522 7.67 7.781 7.887 7.994 8.09 8.17 8.23 8.247 8.228 8.155 8.012 7.746 7.316 6.604 5.362 3.247 0.686 -1.44 -3.266 -4.828 -6.217 -7.424 -8.501 -9.441 -10.382 -11.183 -11.884 -12.55 -13.162 -13.745 -14.305 -14.892 -15.403 -15.835 -16.299 -16.788 -17.194 -17.606 -18.033 -18.378 -18.744 -19.113 -19.489 -19.892 -20.172 -20.45 -20.891 -21.204 -21.544 -21.728 -22.111 -22.501 -22.918 -23.136 -23.455 -23.825 -24.085 -24.357 -24.978 -25.319 -25.689 -26.115 -26.626 -27.247 -28.091 -30.394 -7 ,31985 ,KEBNE ,16721671,Sat Nov 27 18:12:22 CET,Sat Nov 27 19:47:24 CET,0.0 1.392 1.855 2.202 2.486 2.72 2.935 3.125 3.451 3.598 3.745 3.937 4.135 4.252 4.482 4.688 4.888 4.981 5.156 5.322 5.536 5.662 5.778 5.952 6.114 6.26 6.39 6.508 6.663 6.809 6.946 7.125 7.296 7.433 7.569 7.708 7.835 7.967 8.088 8.19 8.284 8.374 8.423 8.411 8.368 8.264 8.053 7.673 6.953 5.733 3.631 1.038 -1.144 -2.966 -4.532 -5.929 -7.15 -8.267 -9.201 -10.114 -10.908 -11.628 -12.331 -12.996 -13.609 -14.156 -14.739 -15.265 -15.706 -16.164 -16.639 -17.036 -17.468 -17.929 -18.281 -18.636 -19.003 -19.39 -19.818 -20.114 -20.399 -20.851 -21.184 -21.54 -21.717 -22.082 -22.467 -22.868 -23.088 -23.43 -23.817 -24.082 -24.36 -24.976 -25.316 -25.685 -26.095 -26.562 -27.134 -27.915 -30.08 -8 ,28650 ,KEBNE ,16721672,Sat Nov 27 18:12:21 CET,Sat Nov 27 19:46:55 CET,0.0 1.185 1.632 1.966 2.267 2.523 2.749 2.948 3.293 3.449 3.595 3.794 4.001 4.123 4.34 4.535 4.723 4.818 5.005 5.166 5.38 5.515 5.639 5.82 5.995 6.147 6.289 6.429 6.593 6.746 6.887 7.044 7.186 7.315 7.447 7.578 7.7 7.818 7.923 8.02 8.098 8.143 8.142 8.109 8.054 7.951 7.719 7.331 6.67 5.469 3.358 0.758 -1.422 -3.283 -4.855 -6.223 -7.421 -8.522 -9.468 -10.385 -11.156 -11.857 -12.544 -13.207 -13.825 -14.389 -14.956 -15.456 -15.915 -16.392 -16.881 -17.291 -17.71 -18.15 -18.498 -18.851 -19.223 -19.626 -20.041 -20.331 -20.625 -21.073 -21.403 -21.771 -21.953 -22.326 -22.733 -23.145 -23.361 -23.695 -24.081 -24.346 -24.62 -25.223 -25.539 -25.871 -26.263 -26.708 -27.255 -27.965 -30.109 -9 ,32481 ,KEBNE ,16721673,Sat Nov 27 18:12:22 CET,Sat Nov 27 19:47:13 CET,0.0 1.257 1.749 2.095 2.375 2.644 2.877 3.084 3.444 3.599 3.748 3.932 4.136 4.259 4.483 4.7 4.891 4.977 5.146 5.314 5.535 5.665 5.787 5.972 6.146 6.302 6.447 6.576 6.731 6.869 7.008 7.16 7.297 7.427 7.569 7.718 7.848 7.962 8.063 8.177 8.279 8.352 8.406 8.422 8.361 8.212 7.925 7.459 6.718 5.493 3.346 0.713 -1.455 -3.298 -4.905 -6.315 -7.502 -8.579 -9.506 -10.418 -11.218 -11.946 -12.635 -13.287 -13.9 -14.448 -15.009 -15.513 -15.953 -16.418 -16.905 -17.302 -17.707 -18.13 -18.473 -18.838 -19.207 -19.587 -20.008 -20.311 -20.611 -21.062 -21.381 -21.722 -21.898 -22.266 -22.656 -23.066 -23.273 -23.585 -23.915 -24.17 -24.451 -25.068 -25.41 -25.769 -26.166 -26.654 -27.188 -27.873 -29.779 -10 ,9768 ,KEBNE ,16721674,Sat Nov 27 18:12:21 CET,Sat Nov 27 19:48:08 CET,0.0 1.042 1.515 1.916 2.251 2.502 2.716 2.919 3.289 3.448 3.584 3.747 3.946 4.063 4.287 4.493 4.691 4.783 4.946 5.102 5.316 5.447 5.571 5.735 5.886 6.028 6.162 6.285 6.435 6.577 6.696 6.827 6.944 7.036 7.14 7.261 7.364 7.465 7.566 7.642 7.705 7.764 7.818 7.837 7.78 7.621 7.312 6.83 6.113 4.962 2.824 0.194 -1.949 -3.826 -5.442 -6.859 -8.057 -9.15 -10.099 -11.018 -11.815 -12.539 -13.238 -13.881 -14.445 -14.972 -15.534 -16.02 -16.447 -16.893 -17.356 -17.752 -18.172 -18.613 -18.95 -19.299 -19.671 -20.047 -20.443 -20.724 -21.023 -21.497 -21.819 -22.148 -22.314 -22.663 -23.035 -23.432 -23.648 -23.979 -24.342 -24.598 -24.871 -25.479 -25.806 -26.159 -26.573 -27.035 -27.585 -28.299 -30.185 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_39.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_39.txt deleted file mode 100644 index b08c6b04..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_39.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14001 ,KEBNE ,16721675,Sat Nov 27 18:12:21 CET,Sat Nov 27 19:46:35 CET,0.0 1.361 1.874 2.262 2.602 2.907 3.18 3.408 3.808 4.0 4.182 4.396 4.66 4.809 5.083 5.336 5.581 5.701 5.937 6.167 6.483 6.671 6.847 7.117 7.378 7.621 7.853 8.067 8.327 8.577 8.825 9.122 9.399 9.658 9.964 10.316 10.633 10.973 11.344 11.732 12.132 12.551 13.034 13.498 14.002 14.579 15.189 15.752 16.388 17.043 17.456 17.344 16.986 16.567 16.126 15.648 15.188 14.75 14.336 13.919 13.549 13.199 12.848 12.516 12.219 11.931 11.618 11.352 11.125 10.868 10.592 10.36 10.106 9.83 9.619 9.398 9.17 8.934 8.668 8.488 8.298 7.983 7.775 7.557 7.442 7.197 6.933 6.653 6.504 6.237 5.996 5.809 5.614 5.168 4.915 4.642 4.358 4.033 3.649 3.161 1.643 -2 ,20319 ,KEBNE ,16721676,Sat Nov 27 18:12:22 CET,Sat Nov 27 19:46:55 CET,0.0 1.792 2.331 2.73 3.067 3.37 3.635 3.876 4.312 4.506 4.695 4.946 5.215 5.367 5.647 5.91 6.171 6.299 6.53 6.759 7.08 7.271 7.451 7.715 7.968 8.199 8.424 8.639 8.903 9.15 9.395 9.684 9.943 10.2 10.503 10.83 11.149 11.501 11.858 12.231 12.628 13.052 13.52 13.978 14.485 15.012 15.563 16.141 16.734 17.296 17.655 17.582 17.28 16.862 16.409 15.971 15.543 15.12 14.732 14.331 13.972 13.652 13.348 13.033 12.728 12.444 12.139 11.866 11.63 11.383 11.124 10.904 10.663 10.411 10.209 9.991 9.77 9.543 9.302 9.128 8.945 8.645 8.44 8.235 8.128 7.889 7.626 7.339 7.187 6.928 6.714 6.539 6.359 5.966 5.74 5.485 5.193 4.863 4.463 3.937 2.697 -3 ,27970 ,KEBNE ,16721677,Sat Nov 27 18:12:21 CET,Sat Nov 27 19:46:55 CET,0.0 1.194 1.717 2.085 2.376 2.648 2.906 3.141 3.555 3.745 3.937 4.192 4.459 4.606 4.896 5.164 5.418 5.542 5.776 5.994 6.312 6.515 6.697 6.961 7.211 7.446 7.676 7.898 8.18 8.442 8.681 8.966 9.233 9.494 9.811 10.165 10.497 10.846 11.202 11.582 11.966 12.373 12.846 13.302 13.803 14.375 15.006 15.629 16.255 16.806 17.143 17.059 16.763 16.355 15.871 15.383 14.94 14.485 14.056 13.616 13.222 12.878 12.551 12.236 11.925 11.617 11.299 11.01 10.754 10.493 10.22 9.988 9.74 9.482 9.278 9.049 8.808 8.571 8.312 8.129 7.951 7.662 7.446 7.219 7.103 6.861 6.606 6.328 6.18 5.917 5.681 5.497 5.302 4.873 4.629 4.377 4.114 3.792 3.408 2.886 1.495 -4 ,14393 ,KEBNE ,16721678,Sat Nov 27 18:13:23 CET,Sat Nov 27 19:47:32 CET,0.0 1.391 1.956 2.401 2.765 3.056 3.316 3.545 3.96 4.152 4.336 4.569 4.836 4.991 5.294 5.583 5.839 5.959 6.197 6.431 6.765 6.968 7.161 7.433 7.689 7.936 8.166 8.379 8.661 8.944 9.211 9.505 9.78 10.054 10.376 10.735 11.062 11.406 11.785 12.185 12.588 13.033 13.529 13.988 14.49 15.024 15.629 16.233 16.843 17.422 17.848 17.855 17.533 17.127 16.674 16.194 15.741 15.319 14.927 14.506 14.115 13.752 13.419 13.102 12.792 12.494 12.18 11.893 11.637 11.372 11.083 10.83 10.568 10.304 10.098 9.876 9.639 9.388 9.129 8.948 8.743 8.417 8.204 7.98 7.86 7.599 7.325 7.042 6.888 6.626 6.411 6.232 6.042 5.618 5.38 5.113 4.825 4.495 4.105 3.589 2.431 -5 ,11354 ,KEBNE ,16721679,Sat Nov 27 18:13:23 CET,Sat Nov 27 19:47:36 CET,0.0 1.421 1.973 2.399 2.736 3.023 3.272 3.496 3.913 4.108 4.29 4.512 4.779 4.936 5.23 5.503 5.759 5.879 6.11 6.332 6.649 6.856 7.055 7.332 7.592 7.831 8.058 8.277 8.55 8.802 9.042 9.329 9.606 9.874 10.173 10.493 10.803 11.148 11.503 11.873 12.257 12.683 13.18 13.646 14.161 14.729 15.363 16.02 16.706 17.356 17.796 17.737 17.426 17.061 16.622 16.169 15.76 15.371 15.003 14.601 14.208 13.821 13.474 13.139 12.812 12.52 12.215 11.927 11.667 11.404 11.141 10.915 10.652 10.373 10.162 9.955 9.739 9.507 9.252 9.063 8.864 8.56 8.349 8.125 8.013 7.777 7.526 7.246 7.087 6.814 6.57 6.382 6.192 5.774 5.537 5.293 5.022 4.7 4.319 3.793 2.577 -6 ,13260 ,KEBNE ,16721680,Sat Nov 27 18:13:23 CET,Sat Nov 27 19:47:30 CET,0.0 1.513 2.086 2.517 2.856 3.15 3.417 3.657 4.088 4.284 4.465 4.687 4.959 5.113 5.399 5.644 5.872 5.989 6.214 6.424 6.723 6.911 7.099 7.375 7.634 7.869 8.084 8.291 8.564 8.834 9.091 9.405 9.699 9.968 10.271 10.597 10.903 11.239 11.602 11.97 12.346 12.78 13.29 13.77 14.286 14.852 15.474 16.077 16.689 17.351 17.849 17.768 17.395 16.917 16.451 16.012 15.558 15.118 14.703 14.277 13.901 13.546 13.214 12.896 12.591 12.304 11.999 11.726 11.482 11.22 10.943 10.709 10.471 10.216 10.011 9.794 9.562 9.318 9.054 8.876 8.696 8.394 8.177 7.955 7.839 7.598 7.345 7.074 6.93 6.668 6.45 6.271 6.084 5.669 5.434 5.173 4.87 4.52 4.109 3.572 2.252 -7 ,2594 ,KEBNE ,16721681,Sat Nov 27 18:13:23 CET,Sat Nov 27 19:47:34 CET,0.0 1.241 1.772 2.18 2.519 2.827 3.112 3.364 3.802 3.996 4.174 4.417 4.691 4.848 5.137 5.395 5.635 5.75 5.978 6.201 6.518 6.711 6.887 7.153 7.409 7.639 7.861 8.069 8.336 8.592 8.821 9.105 9.39 9.648 9.942 10.27 10.578 10.927 11.296 11.663 12.037 12.46 12.944 13.404 13.921 14.484 15.091 15.727 16.389 17.012 17.397 17.29 16.912 16.441 15.996 15.53 15.064 14.625 14.212 13.805 13.449 13.107 12.772 12.431 12.112 11.833 11.538 11.25 10.993 10.733 10.449 10.212 9.974 9.721 9.505 9.281 9.057 8.828 8.571 8.385 8.189 7.874 7.658 7.423 7.298 7.033 6.759 6.48 6.338 6.08 5.861 5.684 5.494 5.06 4.825 4.561 4.264 3.947 3.55 3.024 1.665 -8 ,27826 ,KEBNE ,16721682,Sat Nov 27 18:13:24 CET,Sat Nov 27 19:47:57 CET,0.0 1.556 2.163 2.606 2.934 3.23 3.499 3.736 4.171 4.366 4.555 4.814 5.093 5.245 5.529 5.795 6.038 6.151 6.379 6.597 6.898 7.097 7.289 7.554 7.805 8.033 8.255 8.473 8.746 9.011 9.271 9.577 9.871 10.142 10.433 10.766 11.094 11.439 11.803 12.179 12.562 13.012 13.516 13.975 14.491 15.053 15.623 16.185 16.809 17.4 17.817 17.809 17.469 17.008 16.538 16.053 15.563 15.105 14.715 14.3 13.925 13.567 13.22 12.888 12.578 12.291 11.97 11.688 11.446 11.187 10.908 10.677 10.435 10.16 9.936 9.695 9.439 9.192 8.937 8.753 8.566 8.276 8.057 7.818 7.7 7.47 7.211 6.925 6.777 6.514 6.306 6.134 5.946 5.54 5.313 5.074 4.801 4.476 4.108 3.588 1.848 -9 ,3520 ,KEBNE ,16721683,Sat Nov 27 18:14:25 CET,Sat Nov 27 19:48:26 CET,0.0 1.214 1.729 2.138 2.494 2.782 3.045 3.281 3.676 3.86 4.047 4.293 4.566 4.719 5.003 5.268 5.519 5.64 5.872 6.095 6.402 6.588 6.771 7.043 7.293 7.526 7.752 7.965 8.231 8.496 8.763 9.069 9.355 9.641 9.962 10.31 10.643 10.995 11.372 11.765 12.162 12.601 13.115 13.614 14.166 14.727 15.257 15.828 16.489 17.153 17.626 17.664 17.412 17.014 16.563 16.097 15.635 15.17 14.747 14.309 13.929 13.587 13.241 12.9 12.564 12.24 11.895 11.593 11.339 11.077 10.794 10.552 10.303 10.04 9.83 9.609 9.376 9.134 8.88 8.705 8.516 8.2 7.967 7.731 7.619 7.389 7.133 6.851 6.712 6.455 6.212 6.023 5.827 5.401 5.17 4.926 4.637 4.3 3.889 3.352 1.907 -10 ,21753 ,KEBNE ,16721684,Sat Nov 27 18:14:26 CET,Sat Nov 27 19:53:38 CET,0.0 1.273 1.742 2.123 2.463 2.769 3.048 3.299 3.75 3.957 4.147 4.385 4.656 4.814 5.115 5.387 5.652 5.781 6.018 6.24 6.546 6.73 6.914 7.177 7.413 7.641 7.864 8.076 8.348 8.608 8.86 9.16 9.457 9.731 10.033 10.362 10.678 11.033 11.412 11.799 12.187 12.614 13.098 13.6 14.183 14.767 15.375 16.026 16.69 17.309 17.708 17.597 17.231 16.757 16.283 15.801 15.34 14.912 14.525 14.111 13.747 13.412 13.071 12.755 12.46 12.172 11.866 11.588 11.335 11.071 10.775 10.515 10.24 9.957 9.742 9.511 9.278 9.036 8.77 8.587 8.401 8.105 7.891 7.673 7.561 7.322 7.066 6.792 6.643 6.378 6.147 5.964 5.776 5.358 5.117 4.851 4.55 4.218 3.841 3.278 1.777 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_44.txt deleted file mode 100644 index aed131dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_49_44.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9622 ,KEBNE ,16721685,Sat Nov 27 18:14:25 CET,Sat Nov 27 19:53:10 CET,0.0 1.863 2.492 2.97 3.343 3.669 3.972 4.253 4.76 5.002 5.233 5.561 5.872 6.069 6.459 6.82 7.162 7.324 7.634 7.93 8.347 8.616 8.878 9.25 9.608 9.965 10.311 10.633 11.043 11.45 11.854 12.334 12.802 13.261 13.783 14.346 14.899 15.541 16.204 16.906 17.666 18.507 19.494 20.515 21.71 23.048 24.626 26.421 28.526 31.062 34.285 37.027 38.653 39.722 40.416 40.918 41.278 41.517 41.684 41.818 41.88 41.904 41.918 41.906 41.87 41.813 41.736 41.67 41.583 41.482 41.376 41.284 41.189 41.076 40.984 40.881 40.753 40.617 40.488 40.394 40.292 40.128 40.0 39.861 39.783 39.612 39.426 39.228 39.12 38.93 38.761 38.63 38.488 38.163 37.98 37.779 37.548 37.282 36.974 36.582 35.412 -2 ,11197 ,KEBNE ,16721686,Sat Nov 27 18:14:25 CET,Sat Nov 27 19:48:18 CET,0.0 1.425 2.069 2.548 2.958 3.331 3.655 3.937 4.471 4.719 4.955 5.289 5.607 5.809 6.185 6.538 6.873 7.034 7.349 7.654 8.08 8.349 8.618 9.002 9.365 9.708 10.033 10.348 10.769 11.19 11.6 12.087 12.547 12.991 13.495 14.063 14.637 15.282 15.943 16.634 17.4 18.269 19.271 20.307 21.516 22.832 24.347 26.111 28.248 30.863 34.123 36.925 38.612 39.707 40.452 40.955 41.301 41.545 41.713 41.829 41.876 41.889 41.876 41.845 41.777 41.709 41.659 41.599 41.524 41.425 41.298 41.189 41.083 40.966 40.856 40.74 40.62 40.495 40.358 40.247 40.129 39.941 39.803 39.661 39.585 39.419 39.241 39.046 38.943 38.761 38.587 38.456 38.316 38.002 37.824 37.624 37.402 37.16 36.873 36.451 35.357 -3 ,19345 ,KEBNE ,16721687,Sat Nov 27 18:14:25 CET,Sat Nov 27 19:48:18 CET,0.0 1.393 2.004 2.453 2.84 3.199 3.531 3.823 4.343 4.588 4.824 5.158 5.461 5.65 6.022 6.372 6.699 6.854 7.167 7.471 7.907 8.196 8.468 8.851 9.211 9.568 9.922 10.258 10.687 11.087 11.473 11.942 12.391 12.833 13.36 13.944 14.501 15.116 15.766 16.476 17.243 18.103 19.117 20.126 21.292 22.653 24.247 26.044 28.178 30.766 33.992 36.735 38.409 39.509 40.258 40.78 41.131 41.37 41.527 41.636 41.676 41.678 41.653 41.629 41.595 41.533 41.446 41.349 41.26 41.171 41.043 40.917 40.808 40.7 40.603 40.483 40.354 40.22 40.067 39.947 39.805 39.577 39.435 39.288 39.205 39.022 38.824 38.615 38.506 38.318 38.136 37.999 37.845 37.497 37.315 37.113 36.889 36.629 36.287 35.891 34.558 -4 ,9233 ,KEBNE ,16721688,Sat Nov 27 18:14:25 CET,Sat Nov 27 19:48:25 CET,0.0 1.566 2.132 2.606 3.012 3.37 3.69 3.985 4.54 4.79 5.016 5.328 5.634 5.834 6.227 6.587 6.924 7.091 7.422 7.73 8.164 8.451 8.729 9.119 9.486 9.834 10.178 10.513 10.947 11.362 11.743 12.206 12.67 13.114 13.623 14.213 14.774 15.375 16.018 16.71 17.449 18.279 19.265 20.29 21.502 22.826 24.358 26.133 28.291 30.972 34.288 37.127 38.812 39.879 40.58 41.07 41.376 41.582 41.714 41.791 41.815 41.811 41.799 41.773 41.739 41.679 41.6 41.52 41.425 41.311 41.196 41.103 41.0 40.888 40.799 40.693 40.579 40.468 40.337 40.232 40.128 39.968 39.843 39.703 39.624 39.457 39.279 39.077 38.97 38.782 38.596 38.447 38.289 37.955 37.77 37.572 37.346 37.076 36.739 36.29 35.215 -5 ,27119 ,KEBNE ,16721689,Sat Nov 27 18:14:25 CET,Sat Nov 27 19:49:34 CET,0.0 1.797 2.4 2.863 3.262 3.625 3.954 4.257 4.814 5.069 5.313 5.656 5.981 6.18 6.552 6.918 7.258 7.42 7.739 8.046 8.479 8.752 9.018 9.416 9.792 10.148 10.495 10.818 11.236 11.644 12.044 12.532 12.996 13.441 13.959 14.536 15.092 15.712 16.374 17.087 17.832 18.639 19.593 20.573 21.746 23.117 24.701 26.493 28.609 31.159 34.354 37.068 38.756 39.87 40.611 41.139 41.495 41.732 41.882 41.971 42.011 42.03 42.03 42.001 41.961 41.915 41.837 41.763 41.692 41.586 41.465 41.351 41.217 41.083 40.972 40.844 40.708 40.576 40.434 40.33 40.219 40.044 39.914 39.768 39.69 39.521 39.343 39.143 39.035 38.856 38.677 38.528 38.371 38.038 37.845 37.641 37.42 37.153 36.829 36.35 35.183 -6 ,30499 ,KEBNE ,16721690,Sat Nov 27 18:14:25 CET,Sat Nov 27 19:48:23 CET,0.0 1.88 2.502 2.983 3.391 3.758 4.097 4.412 4.93 5.156 5.379 5.697 6.008 6.209 6.593 6.945 7.275 7.432 7.739 8.04 8.472 8.739 9.006 9.398 9.774 10.146 10.5 10.838 11.274 11.689 12.09 12.573 13.043 13.501 14.03 14.623 15.186 15.809 16.482 17.174 17.919 18.772 19.766 20.794 22.015 23.375 24.917 26.675 28.788 31.326 34.498 37.206 38.874 39.987 40.743 41.241 41.564 41.789 41.927 42.02 42.062 42.086 42.088 42.058 41.997 41.929 41.868 41.79 41.705 41.612 41.505 41.419 41.317 41.184 41.074 40.955 40.822 40.675 40.517 40.411 40.301 40.112 39.973 39.816 39.729 39.556 39.367 39.152 39.035 38.845 38.663 38.53 38.386 38.067 37.884 37.676 37.423 37.121 36.79 36.358 35.124 -7 ,15729 ,KEBNE ,16721691,Sat Nov 27 18:14:25 CET,Sat Nov 27 19:49:10 CET,0.0 1.259 1.826 2.258 2.635 2.977 3.28 3.565 4.081 4.314 4.543 4.879 5.205 5.41 5.775 6.141 6.49 6.649 6.964 7.262 7.683 7.953 8.214 8.593 8.963 9.313 9.651 9.973 10.386 10.791 11.189 11.669 12.122 12.559 13.073 13.657 14.194 14.769 15.409 16.094 16.825 17.65 18.635 19.644 20.815 22.132 23.687 25.461 27.562 30.146 33.349 36.14 37.829 38.909 39.615 40.1 40.426 40.621 40.757 40.878 40.933 40.942 40.933 40.909 40.871 40.828 40.755 40.682 40.614 40.522 40.42 40.332 40.229 40.109 40.008 39.894 39.775 39.65 39.5 39.385 39.263 39.076 38.939 38.787 38.706 38.546 38.368 38.169 38.067 37.886 37.725 37.595 37.451 37.1 36.916 36.72 36.481 36.211 35.873 35.406 34.163 -8 ,31155 ,KEBNE ,16721692,Sat Nov 27 18:14:25 CET,Sat Nov 27 19:48:13 CET,0.0 1.483 2.103 2.58 2.961 3.31 3.629 3.918 4.424 4.669 4.922 5.283 5.605 5.81 6.198 6.561 6.906 7.077 7.405 7.713 8.147 8.426 8.701 9.084 9.456 9.831 10.187 10.521 10.946 11.355 11.755 12.232 12.679 13.104 13.599 14.156 14.693 15.311 15.983 16.677 17.421 18.28 19.273 20.272 21.437 22.746 24.305 26.078 28.252 30.886 34.103 36.857 38.534 39.625 40.366 40.863 41.189 41.421 41.571 41.654 41.681 41.686 41.678 41.648 41.59 41.535 41.469 41.395 41.32 41.24 41.149 41.054 40.945 40.82 40.709 40.597 40.483 40.35 40.204 40.094 39.956 39.735 39.593 39.437 39.355 39.19 39.017 38.821 38.711 38.518 38.335 38.203 38.056 37.726 37.534 37.317 37.094 36.848 36.529 36.104 35.009 -9 ,21776 ,KEBNE ,16721693,Sat Nov 27 18:15:27 CET,Sat Nov 27 19:49:44 CET,0.0 1.685 2.283 2.746 3.14 3.482 3.8 4.098 4.651 4.912 5.148 5.471 5.79 5.994 6.368 6.714 7.043 7.203 7.516 7.816 8.232 8.498 8.76 9.147 9.512 9.858 10.188 10.504 10.918 11.319 11.715 12.185 12.638 13.09 13.607 14.181 14.732 15.35 16.022 16.725 17.474 18.335 19.311 20.281 21.496 22.881 24.45 26.242 28.377 30.952 34.157 36.915 38.605 39.698 40.399 40.875 41.192 41.408 41.556 41.656 41.711 41.748 41.74 41.704 41.656 41.594 41.512 41.437 41.372 41.289 41.193 41.106 40.999 40.875 40.777 40.663 40.539 40.405 40.256 40.148 40.037 39.86 39.72 39.571 39.497 39.317 39.116 38.912 38.799 38.616 38.455 38.321 38.172 37.848 37.666 37.471 37.257 37.005 36.699 36.219 34.955 -10 ,5797 ,KEBNE ,16721694,Sat Nov 27 18:15:27 CET,Sat Nov 27 19:50:17 CET,0.0 1.525 2.227 2.727 3.144 3.553 3.892 4.191 4.779 5.045 5.278 5.592 5.9 6.092 6.456 6.813 7.169 7.337 7.656 7.96 8.376 8.641 8.911 9.306 9.674 10.022 10.368 10.716 11.151 11.554 11.934 12.399 12.861 13.308 13.82 14.391 14.934 15.523 16.178 16.888 17.636 18.509 19.539 20.547 21.723 23.049 24.597 26.381 28.473 30.989 34.238 36.99 38.648 39.738 40.464 40.991 41.355 41.61 41.753 41.841 41.88 41.889 41.884 41.866 41.835 41.785 41.717 41.632 41.539 41.436 41.317 41.208 41.089 40.962 40.857 40.744 40.623 40.473 40.304 40.188 40.064 39.863 39.723 39.577 39.499 39.339 39.164 38.971 38.865 38.677 38.483 38.344 38.199 37.859 37.677 37.474 37.23 36.958 36.637 36.248 35.271 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_52_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_52_35.txt deleted file mode 100644 index 9dc4b938..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_52_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11897 ,KEBNE ,16721695,Sat Nov 27 18:15:26 CET,Sat Nov 27 19:51:35 CET,0.0 1.061 1.519 1.855 2.137 2.38 2.588 2.773 3.118 3.281 3.438 3.638 3.853 3.976 4.214 4.429 4.63 4.728 4.916 5.099 5.372 5.534 5.681 5.893 6.101 6.297 6.481 6.654 6.873 7.083 7.286 7.525 7.746 7.961 8.199 8.454 8.703 8.979 9.279 9.58 9.87 10.177 10.535 10.905 11.313 11.745 12.215 12.716 13.206 13.654 13.983 13.835 13.5 13.12 12.694 12.241 11.808 11.407 11.046 10.656 10.291 9.956 9.618 9.292 8.995 8.717 8.407 8.124 7.883 7.638 7.373 7.143 6.895 6.627 6.429 6.223 5.995 5.764 5.528 5.355 5.168 4.854 4.621 4.386 4.269 4.02 3.753 3.467 3.314 3.077 2.817 2.63 2.437 1.993 1.736 1.44 1.111 0.767 0.371 -0.205 -1.815 -2 ,8067 ,KEBNE ,16721696,Sat Nov 27 18:15:27 CET,Sat Nov 27 19:52:44 CET,0.0 1.037 1.452 1.777 2.047 2.281 2.486 2.683 3.047 3.208 3.354 3.535 3.751 3.87 4.101 4.315 4.515 4.613 4.807 4.986 5.236 5.397 5.552 5.771 5.976 6.175 6.362 6.534 6.749 6.961 7.166 7.394 7.608 7.817 8.053 8.316 8.563 8.818 9.089 9.38 9.68 10.006 10.374 10.741 11.126 11.525 11.965 12.401 12.861 13.31 13.611 13.486 13.168 12.796 12.385 11.984 11.611 11.213 10.834 10.449 10.109 9.796 9.483 9.174 8.862 8.574 8.262 7.974 7.725 7.456 7.176 6.941 6.706 6.446 6.234 6.016 5.779 5.519 5.252 5.076 4.885 4.568 4.352 4.129 4.004 3.746 3.475 3.186 3.037 2.785 2.535 2.358 2.172 1.753 1.499 1.201 0.878 0.513 0.047 -0.592 -2.257 -3 ,15365 ,KEBNE ,16721697,Sat Nov 27 18:15:27 CET,Sat Nov 27 19:52:49 CET,0.0 1.277 1.699 2.032 2.325 2.579 2.801 3.006 3.362 3.514 3.653 3.832 4.044 4.162 4.386 4.6 4.802 4.9 5.093 5.275 5.52 5.674 5.824 6.04 6.244 6.437 6.621 6.794 7.017 7.223 7.422 7.663 7.888 8.102 8.336 8.601 8.859 9.135 9.427 9.725 10.02 10.331 10.723 11.12 11.546 11.985 12.435 12.883 13.328 13.73 13.954 13.842 13.504 13.065 12.652 12.227 11.788 11.37 10.988 10.578 10.213 9.876 9.547 9.225 8.931 8.658 8.346 8.066 7.838 7.592 7.314 7.097 6.864 6.613 6.417 6.195 5.965 5.729 5.476 5.298 5.11 4.812 4.609 4.39 4.276 4.041 3.783 3.508 3.365 3.127 2.896 2.712 2.524 2.118 1.869 1.593 1.278 0.899 0.425 -0.204 -2.197 -4 ,6786 ,KEBNE ,16721698,Sat Nov 27 18:16:29 CET,Sat Nov 27 19:54:17 CET,0.0 1.015 1.428 1.723 1.986 2.215 2.424 2.629 2.985 3.15 3.304 3.496 3.713 3.836 4.073 4.297 4.511 4.609 4.79 4.962 5.21 5.361 5.502 5.714 5.919 6.114 6.303 6.478 6.695 6.908 7.111 7.36 7.598 7.821 8.089 8.374 8.643 8.94 9.231 9.516 9.821 10.171 10.57 10.958 11.383 11.822 12.274 12.74 13.242 13.716 14.004 13.864 13.466 13.008 12.575 12.141 11.709 11.268 10.86 10.449 10.083 9.742 9.407 9.077 8.767 8.49 8.196 7.91 7.644 7.376 7.106 6.885 6.648 6.386 6.175 5.965 5.745 5.499 5.241 5.065 4.886 4.6 4.393 4.172 4.063 3.837 3.594 3.311 3.156 2.918 2.65 2.455 2.262 1.819 1.565 1.29 0.979 0.627 0.195 -0.423 -2.045 -5 ,10608 ,KEBNE ,16721699,Sat Nov 27 18:18:32 CET,Sat Nov 27 20:01:42 CET,0.0 0.888 1.233 1.522 1.759 1.962 2.148 2.315 2.608 2.745 2.874 3.021 3.223 3.329 3.528 3.711 3.883 3.968 4.13 4.286 4.515 4.659 4.787 4.967 5.147 5.325 5.488 5.636 5.829 6.017 6.196 6.405 6.613 6.805 7.021 7.271 7.509 7.763 8.026 8.294 8.565 8.876 9.241 9.611 10.049 10.499 10.962 11.45 11.936 12.381 12.68 12.549 12.188 11.764 11.332 10.86 10.393 9.967 9.561 9.136 8.769 8.437 8.11 7.788 7.476 7.175 6.861 6.579 6.329 6.079 5.81 5.576 5.336 5.072 4.866 4.657 4.433 4.194 3.943 3.766 3.574 3.263 3.043 2.812 2.695 2.463 2.217 1.939 1.795 1.55 1.295 1.116 0.918 0.458 0.197 -0.09 -0.407 -0.783 -1.244 -1.914 -4.021 -6 ,18291 ,KEBNE ,16721700,Sat Nov 27 18:18:32 CET,Sat Nov 27 19:54:42 CET,0.0 1.482 1.971 2.333 2.631 2.877 3.084 3.272 3.607 3.773 3.932 4.115 4.333 4.454 4.679 4.888 5.094 5.197 5.389 5.564 5.813 5.976 6.133 6.348 6.547 6.744 6.93 7.101 7.32 7.527 7.731 7.974 8.199 8.429 8.693 8.98 9.249 9.532 9.83 10.133 10.455 10.808 11.187 11.559 11.993 12.462 12.951 13.421 13.919 14.36 14.605 14.428 14.023 13.594 13.153 12.688 12.226 11.809 11.447 11.075 10.74 10.421 10.092 9.765 9.464 9.181 8.866 8.574 8.331 8.07 7.769 7.507 7.257 7.01 6.807 6.586 6.357 6.126 5.873 5.686 5.492 5.204 4.996 4.771 4.659 4.417 4.142 3.839 3.679 3.439 3.199 3.022 2.846 2.432 2.188 1.925 1.608 1.234 0.792 0.172 -1.531 -7 ,11106 ,KEBNE ,16721701,Sat Nov 27 18:25:44 CET,Sat Nov 27 20:02:07 CET,0.0 1.246 1.699 2.034 2.317 2.558 2.763 2.951 3.295 3.448 3.593 3.777 3.993 4.117 4.339 4.552 4.759 4.855 5.039 5.211 5.452 5.603 5.752 5.967 6.166 6.352 6.527 6.696 6.91 7.11 7.302 7.535 7.761 7.98 8.225 8.481 8.718 8.98 9.252 9.537 9.826 10.146 10.523 10.91 11.355 11.782 12.254 12.754 13.226 13.656 13.854 13.627 13.211 12.742 12.284 11.835 11.402 10.962 10.55 10.126 9.763 9.432 9.112 8.815 8.508 8.208 7.909 7.642 7.415 7.176 6.913 6.693 6.455 6.188 5.978 5.77 5.554 5.324 5.072 4.889 4.697 4.394 4.186 3.965 3.851 3.614 3.345 3.064 2.918 2.668 2.394 2.196 1.988 1.552 1.311 1.032 0.716 0.366 -0.068 -0.655 -2.194 -8 ,28171 ,KEBNE ,16721702,Sat Nov 27 18:26:47 CET,Sat Nov 27 20:03:24 CET,0.0 1.034 1.446 1.775 2.049 2.288 2.495 2.684 3.023 3.18 3.338 3.531 3.743 3.864 4.108 4.333 4.535 4.632 4.821 5.009 5.271 5.435 5.595 5.817 6.023 6.225 6.416 6.592 6.813 7.026 7.226 7.457 7.685 7.908 8.153 8.411 8.655 8.924 9.195 9.472 9.776 10.101 10.437 10.76 11.155 11.57 12.015 12.466 12.913 13.357 13.678 13.677 13.408 13.044 12.62 12.188 11.817 11.457 11.113 10.721 10.395 10.095 9.781 9.47 9.175 8.909 8.605 8.32 8.07 7.804 7.532 7.321 7.084 6.803 6.594 6.379 6.142 5.9 5.645 5.462 5.271 4.967 4.747 4.508 4.385 4.146 3.891 3.614 3.463 3.22 2.963 2.769 2.569 2.112 1.842 1.56 1.258 0.883 0.407 -0.222 -2.024 -9 ,3164 ,KEBNE ,16721703,Sat Nov 27 18:26:47 CET,Sat Nov 27 20:04:20 CET,0.0 1.186 1.643 1.982 2.258 2.503 2.716 2.912 3.26 3.418 3.565 3.748 3.963 4.082 4.312 4.536 4.745 4.842 5.027 5.204 5.458 5.614 5.763 5.982 6.192 6.387 6.571 6.735 6.942 7.147 7.339 7.574 7.802 8.006 8.232 8.497 8.747 9.019 9.316 9.614 9.917 10.245 10.604 10.96 11.364 11.778 12.22 12.679 13.141 13.593 13.917 13.864 13.581 13.222 12.854 12.448 12.004 11.563 11.178 10.762 10.385 10.052 9.729 9.417 9.115 8.81 8.475 8.188 7.947 7.688 7.421 7.199 6.957 6.696 6.49 6.286 6.063 5.816 5.569 5.398 5.212 4.919 4.707 4.476 4.356 4.115 3.877 3.613 3.463 3.225 2.983 2.807 2.621 2.174 1.918 1.642 1.333 0.98 0.566 0.006 -2.11 -10 ,28699 ,KEBNE ,16721704,Sat Nov 27 18:29:55 CET,Sat Nov 27 20:07:53 CET,0.0 1.172 1.609 1.943 2.223 2.469 2.684 2.876 3.236 3.398 3.548 3.742 3.96 4.085 4.319 4.543 4.751 4.85 5.041 5.229 5.496 5.655 5.806 6.019 6.221 6.413 6.597 6.783 7.025 7.241 7.436 7.667 7.89 8.104 8.357 8.632 8.889 9.164 9.449 9.744 10.037 10.36 10.748 11.145 11.598 12.036 12.505 12.98 13.404 13.813 14.073 13.896 13.5 13.105 12.702 12.273 11.851 11.435 11.063 10.657 10.289 9.945 9.604 9.286 8.985 8.692 8.372 8.099 7.867 7.613 7.343 7.113 6.875 6.629 6.436 6.215 5.984 5.755 5.497 5.309 5.113 4.809 4.586 4.357 4.242 3.99 3.717 3.438 3.29 3.048 2.805 2.633 2.449 2.027 1.801 1.543 1.234 0.857 0.398 -0.162 -1.689 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_35.txt deleted file mode 100644 index 83b1d804..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4608 ,KEBNE ,16721705,Sat Nov 27 18:37:14 CET,Sat Nov 27 20:21:54 CET,0.0 0.898 1.304 1.615 1.871 2.104 2.31 2.497 2.842 3.001 3.147 3.334 3.559 3.686 3.923 4.141 4.343 4.44 4.62 4.793 5.044 5.203 5.354 5.573 5.783 5.971 6.159 6.346 6.584 6.812 7.031 7.285 7.523 7.771 8.051 8.351 8.628 8.925 9.247 9.583 9.925 10.294 10.702 11.088 11.518 11.988 12.522 13.054 13.573 14.05 14.323 14.112 13.658 13.126 12.624 12.178 11.744 11.303 10.892 10.479 10.102 9.731 9.366 9.001 8.649 8.333 8.009 7.702 7.429 7.132 6.804 6.541 6.274 5.993 5.779 5.556 5.307 5.032 4.747 4.542 4.321 3.985 3.753 3.514 3.389 3.126 2.834 2.512 2.347 2.085 1.767 1.554 1.324 0.808 0.511 0.198 -0.145 -0.551 -1.064 -1.758 -3.812 -2 ,20726 ,KEBNE ,16721706,Sat Nov 27 18:44:31 CET,Sat Nov 27 20:21:27 CET,0.0 1.163 1.607 1.942 2.202 2.432 2.639 2.83 3.177 3.339 3.497 3.693 3.91 4.034 4.271 4.488 4.688 4.784 4.968 5.137 5.373 5.523 5.676 5.896 6.097 6.292 6.472 6.643 6.868 7.087 7.304 7.566 7.825 8.072 8.349 8.644 8.905 9.203 9.524 9.838 10.147 10.504 10.912 11.312 11.773 12.265 12.809 13.339 13.885 14.395 14.729 14.643 14.368 14.024 13.575 13.088 12.635 12.203 11.813 11.391 11.02 10.694 10.359 10.018 9.688 9.371 9.031 8.726 8.448 8.167 7.877 7.623 7.373 7.11 6.895 6.669 6.411 6.137 5.861 5.66 5.452 5.124 4.888 4.635 4.495 4.209 3.922 3.607 3.439 3.182 2.887 2.689 2.478 1.984 1.703 1.37 1.01 0.607 0.078 -0.591 -2.8 -3 ,30533 ,KEBNE ,16721707,Sat Nov 27 18:51:49 CET,Sat Nov 27 20:29:53 CET,0.0 1.119 1.577 1.923 2.201 2.447 2.67 2.877 3.235 3.39 3.539 3.722 3.936 4.057 4.288 4.507 4.717 4.816 5.004 5.179 5.416 5.569 5.72 5.926 6.122 6.306 6.48 6.652 6.878 7.09 7.293 7.54 7.759 7.957 8.204 8.483 8.735 9.016 9.303 9.601 9.908 10.225 10.602 10.962 11.355 11.783 12.255 12.738 13.241 13.752 14.052 13.946 13.612 13.236 12.852 12.436 12.017 11.587 11.197 10.811 10.446 10.101 9.751 9.401 9.077 8.755 8.406 8.098 7.835 7.549 7.236 6.98 6.72 6.446 6.217 5.961 5.701 5.435 5.152 4.969 4.78 4.452 4.21 3.94 3.8 3.527 3.249 2.945 2.781 2.526 2.247 2.042 1.828 1.355 1.094 0.79 0.41 -0.041 -0.594 -1.383 -5.465 -4 ,15753 ,KEBNE ,16721708,Sat Nov 27 18:51:54 CET,Sat Nov 27 20:22:53 CET,0.0 1.275 1.736 2.095 2.396 2.633 2.843 3.037 3.385 3.55 3.71 3.896 4.105 4.221 4.462 4.69 4.899 4.998 5.177 5.351 5.601 5.76 5.916 6.141 6.344 6.527 6.712 6.896 7.12 7.332 7.542 7.791 8.017 8.227 8.466 8.751 9.037 9.337 9.655 9.994 10.336 10.701 11.113 11.509 11.964 12.458 12.95 13.449 13.983 14.474 14.832 14.713 14.286 13.862 13.46 13.0 12.53 12.044 11.563 11.091 10.722 10.397 10.072 9.737 9.397 9.083 8.763 8.471 8.204 7.912 7.606 7.362 7.085 6.778 6.548 6.302 6.039 5.759 5.454 5.236 5.022 4.699 4.454 4.194 4.062 3.784 3.49 3.166 2.993 2.718 2.401 2.185 1.953 1.45 1.174 0.863 0.514 0.11 -0.376 -1.158 -4.354 -5 ,15906 ,KEBNE ,16721709,Sat Nov 27 18:54:57 CET,Sat Nov 27 20:32:14 CET,0.0 0.867 1.243 1.514 1.744 1.953 2.133 2.295 2.601 2.745 2.874 3.026 3.23 3.341 3.557 3.758 3.938 4.024 4.2 4.369 4.592 4.731 4.876 5.092 5.294 5.474 5.638 5.803 6.008 6.2 6.393 6.617 6.83 7.034 7.262 7.54 7.807 8.077 8.364 8.671 8.989 9.343 9.729 10.068 10.444 10.867 11.349 11.859 12.388 12.877 13.254 13.224 12.922 12.502 12.015 11.51 11.025 10.591 10.188 9.755 9.381 9.028 8.666 8.303 7.958 7.642 7.305 7.001 6.76 6.495 6.174 5.918 5.645 5.355 5.14 4.907 4.657 4.4 4.137 3.953 3.741 3.398 3.167 2.921 2.791 2.511 2.201 1.868 1.697 1.443 1.186 0.987 0.745 0.177 -0.129 -0.438 -0.793 -1.218 -1.711 -2.359 -4.665 -6 ,26815 ,KEBNE ,16721710,Sat Nov 27 18:54:57 CET,Sat Nov 27 20:33:29 CET,0.0 1.2 1.587 1.882 2.134 2.357 2.557 2.754 3.116 3.276 3.428 3.615 3.831 3.959 4.19 4.402 4.612 4.713 4.902 5.07 5.321 5.487 5.64 5.861 6.074 6.277 6.47 6.649 6.878 7.091 7.293 7.538 7.774 7.991 8.226 8.501 8.77 9.039 9.322 9.628 9.958 10.325 10.721 11.09 11.498 11.954 12.44 12.937 13.452 13.888 14.241 14.255 13.965 13.578 13.169 12.739 12.326 11.95 11.602 11.208 10.828 10.474 10.13 9.787 9.452 9.131 8.795 8.491 8.215 7.914 7.605 7.348 7.067 6.784 6.556 6.306 6.051 5.791 5.513 5.307 5.103 4.766 4.525 4.27 4.134 3.871 3.599 3.295 3.125 2.864 2.547 2.323 2.103 1.628 1.346 1.014 0.655 0.225 -0.318 -1.036 -3.207 -7 ,12662 ,KEBNE ,16721711,Sat Nov 27 18:59:08 CET,Sat Nov 27 20:36:20 CET,0.0 1.088 1.568 1.923 2.198 2.44 2.659 2.868 3.23 3.391 3.547 3.744 3.968 4.098 4.352 4.585 4.793 4.889 5.077 5.261 5.524 5.687 5.837 6.052 6.256 6.445 6.629 6.805 7.033 7.249 7.441 7.667 7.889 8.109 8.359 8.624 8.882 9.169 9.471 9.792 10.123 10.489 10.901 11.288 11.727 12.194 12.678 13.165 13.652 14.096 14.423 14.382 14.063 13.633 13.178 12.755 12.357 11.915 11.457 10.978 10.581 10.224 9.878 9.537 9.189 8.865 8.529 8.213 7.944 7.678 7.386 7.14 6.9 6.63 6.408 6.179 5.932 5.655 5.354 5.153 4.954 4.633 4.396 4.151 4.022 3.732 3.419 3.096 2.93 2.673 2.377 2.172 1.96 1.461 1.168 0.847 0.476 0.024 -0.493 -1.182 -3.358 -8 ,5364 ,KEBNE ,16721712,Sat Nov 27 19:01:13 CET,Sat Nov 27 20:39:24 CET,0.0 1.047 1.442 1.76 2.04 2.276 2.485 2.692 3.069 3.229 3.373 3.551 3.769 3.893 4.118 4.34 4.547 4.646 4.83 4.994 5.238 5.403 5.554 5.768 5.978 6.187 6.382 6.562 6.802 7.024 7.217 7.439 7.664 7.887 8.148 8.44 8.715 9.001 9.29 9.6 9.935 10.309 10.718 11.111 11.585 12.078 12.566 13.054 13.557 14.01 14.272 14.143 13.779 13.359 12.872 12.362 11.934 11.537 11.156 10.75 10.38 10.02 9.662 9.317 8.987 8.659 8.295 7.956 7.661 7.364 7.068 6.818 6.551 6.251 6.002 5.743 5.489 5.237 4.959 4.755 4.546 4.215 3.965 3.701 3.566 3.281 2.979 2.649 2.479 2.222 1.919 1.695 1.447 0.943 0.664 0.341 -0.009 -0.417 -0.957 -1.687 -4.718 -9 ,23734 ,KEBNE ,16721713,Sat Nov 27 19:02:15 CET,Sat Nov 27 20:40:20 CET,0.0 1.062 1.483 1.791 2.066 2.311 2.527 2.726 3.078 3.237 3.384 3.565 3.79 3.912 4.143 4.364 4.576 4.68 4.869 5.045 5.313 5.484 5.637 5.851 6.05 6.238 6.424 6.604 6.826 7.03 7.229 7.471 7.696 7.919 8.179 8.459 8.712 8.976 9.256 9.561 9.861 10.184 10.57 10.939 11.345 11.761 12.225 12.724 13.221 13.648 13.897 13.689 13.257 12.819 12.377 11.96 11.542 11.106 10.716 10.29 9.925 9.599 9.252 8.89 8.548 8.235 7.917 7.639 7.389 7.116 6.803 6.542 6.281 6.008 5.798 5.572 5.328 5.072 4.79 4.585 4.366 4.026 3.797 3.558 3.43 3.153 2.831 2.48 2.303 2.027 1.692 1.476 1.263 0.799 0.531 0.225 -0.12 -0.516 -1.029 -1.77 -4.667 -10 ,19174 ,KEBNE ,16721714,Sat Nov 27 19:02:17 CET,Sat Nov 27 20:45:53 CET,0.0 1.22 1.644 1.969 2.238 2.469 2.677 2.875 3.234 3.392 3.547 3.76 3.98 4.105 4.337 4.548 4.745 4.837 5.017 5.191 5.447 5.602 5.75 5.975 6.187 6.384 6.572 6.758 6.994 7.213 7.414 7.643 7.868 8.078 8.317 8.599 8.867 9.15 9.436 9.739 10.065 10.43 10.828 11.218 11.677 12.149 12.629 13.117 13.643 14.12 14.391 14.257 13.904 13.464 12.93 12.409 11.993 11.586 11.204 10.777 10.386 10.045 9.716 9.392 9.063 8.744 8.425 8.134 7.847 7.534 7.217 6.965 6.691 6.392 6.167 5.935 5.673 5.403 5.119 4.924 4.72 4.383 4.157 3.909 3.781 3.5 3.193 2.899 2.744 2.486 2.196 1.993 1.786 1.319 1.032 0.701 0.331 -0.077 -0.532 -1.1 -3.194 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_52.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_52.txt deleted file mode 100644 index cb09e189..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_53_52.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7792 ,KEBNE ,16721715,Sat Nov 27 19:06:26 CET,Sat Nov 27 20:51:00 CET,0.0 1.243 1.758 2.156 2.509 2.827 3.076 3.297 3.71 3.882 4.045 4.277 4.512 4.658 4.921 5.157 5.387 5.493 5.688 5.878 6.151 6.326 6.494 6.738 6.985 7.228 7.458 7.682 7.942 8.187 8.423 8.69 8.948 9.191 9.461 9.758 10.033 10.327 10.651 10.985 11.33 11.71 12.125 12.502 12.902 13.321 13.771 14.224 14.642 14.991 15.203 15.012 14.612 14.121 13.617 13.15 12.682 12.198 11.782 11.38 11.016 10.662 10.307 9.977 9.67 9.381 9.06 8.752 8.485 8.222 7.965 7.739 7.495 7.234 7.014 6.784 6.543 6.281 6.019 5.832 5.642 5.312 5.066 4.847 4.731 4.467 4.201 3.919 3.761 3.505 3.226 3.032 2.829 2.355 2.079 1.778 1.423 1.043 0.6 -0.047 -2.235 -2 ,31304 ,KEBNE ,16721716,Sat Nov 27 19:07:28 CET,Sat Nov 27 20:46:28 CET,0.0 1.352 1.878 2.294 2.629 2.925 3.194 3.432 3.829 4.0 4.166 4.408 4.649 4.793 5.07 5.319 5.547 5.657 5.862 6.044 6.31 6.477 6.635 6.894 7.132 7.349 7.568 7.775 8.048 8.302 8.525 8.783 9.032 9.266 9.527 9.817 10.09 10.38 10.684 10.995 11.31 11.65 12.04 12.425 12.851 13.305 13.802 14.281 14.721 15.097 15.283 15.098 14.694 14.254 13.802 13.284 12.796 12.338 11.887 11.392 10.997 10.651 10.298 9.959 9.658 9.395 9.087 8.816 8.588 8.324 8.042 7.81 7.565 7.303 7.089 6.868 6.642 6.399 6.141 5.953 5.75 5.422 5.194 4.943 4.803 4.52 4.224 3.931 3.779 3.524 3.267 3.072 2.853 2.368 2.095 1.794 1.476 1.112 0.647 0.011 -1.678 -3 ,26745 ,KEBNE ,16721717,Sat Nov 27 19:07:28 CET,Sat Nov 27 20:44:54 CET,0.0 1.282 1.839 2.258 2.583 2.858 3.11 3.332 3.697 3.863 4.023 4.243 4.471 4.611 4.869 5.11 5.336 5.436 5.638 5.838 6.113 6.298 6.486 6.743 6.976 7.197 7.402 7.595 7.853 8.093 8.307 8.558 8.801 9.03 9.283 9.565 9.825 10.109 10.42 10.75 11.096 11.483 11.911 12.319 12.764 13.216 13.695 14.158 14.629 15.055 15.275 15.079 14.655 14.144 13.618 13.107 12.632 12.179 11.77 11.327 10.936 10.575 10.225 9.905 9.584 9.279 8.961 8.677 8.41 8.128 7.845 7.6 7.334 7.039 6.812 6.583 6.349 6.104 5.85 5.675 5.488 5.177 4.955 4.727 4.609 4.365 4.082 3.765 3.614 3.372 3.082 2.887 2.689 2.244 1.989 1.701 1.385 1.015 0.569 -0.037 -1.848 -4 ,12997 ,KEBNE ,16721718,Sat Nov 27 19:10:38 CET,Sat Nov 27 20:49:24 CET,0.0 1.426 1.967 2.336 2.654 2.946 3.219 3.455 3.869 4.063 4.242 4.477 4.715 4.857 5.114 5.357 5.591 5.703 5.916 6.113 6.387 6.559 6.725 6.974 7.206 7.42 7.627 7.819 8.049 8.281 8.514 8.776 9.023 9.27 9.56 9.872 10.168 10.479 10.795 11.126 11.455 11.807 12.218 12.62 13.056 13.512 13.98 14.435 14.906 15.393 15.743 15.548 15.092 14.59 14.09 13.609 13.145 12.705 12.303 11.849 11.441 11.072 10.697 10.362 10.066 9.772 9.452 9.157 8.901 8.641 8.363 8.123 7.866 7.586 7.355 7.118 6.891 6.662 6.401 6.215 6.033 5.732 5.525 5.3 5.165 4.884 4.621 4.348 4.195 3.94 3.643 3.424 3.192 2.689 2.419 2.123 1.787 1.412 0.954 0.309 -1.666 -5 ,6957 ,KEBNE ,16721719,Sat Nov 27 19:14:48 CET,Sat Nov 27 20:48:10 CET,0.0 1.653 2.114 2.517 2.863 3.148 3.386 3.598 4.002 4.179 4.333 4.558 4.802 4.949 5.227 5.49 5.737 5.852 6.06 6.255 6.528 6.693 6.86 7.108 7.344 7.57 7.782 7.981 8.227 8.449 8.662 8.917 9.157 9.389 9.653 9.939 10.21 10.507 10.809 11.136 11.486 11.861 12.268 12.651 13.081 13.509 13.956 14.424 14.883 15.286 15.557 15.409 15.028 14.553 14.079 13.601 13.143 12.708 12.291 11.871 11.502 11.152 10.815 10.48 10.158 9.878 9.574 9.29 9.044 8.778 8.485 8.224 7.948 7.681 7.482 7.27 7.043 6.81 6.564 6.387 6.188 5.874 5.655 5.432 5.313 5.059 4.801 4.518 4.356 4.08 3.785 3.587 3.376 2.913 2.667 2.396 2.064 1.682 1.243 0.671 -1.073 -7 ,4382 ,KEBNE ,16721721,Sat Nov 27 19:16:52 CET,Sat Nov 27 20:54:31 CET,0.0 1.173 1.663 2.025 2.338 2.616 2.864 3.095 3.481 3.649 3.815 4.047 4.282 4.424 4.685 4.926 5.145 5.251 5.459 5.655 5.93 6.094 6.256 6.493 6.725 6.95 7.151 7.336 7.582 7.832 8.058 8.321 8.57 8.806 9.082 9.394 9.678 9.973 10.291 10.621 10.948 11.297 11.689 12.072 12.492 12.905 13.372 13.859 14.322 14.722 14.941 14.705 14.29 13.832 13.352 12.876 12.447 12.028 11.634 11.219 10.84 10.504 10.174 9.854 9.549 9.254 8.933 8.646 8.407 8.143 7.857 7.608 7.345 7.084 6.88 6.656 6.417 6.159 5.89 5.717 5.547 5.261 5.043 4.799 4.667 4.388 4.101 3.799 3.628 3.36 3.071 2.888 2.701 2.267 2.019 1.734 1.421 1.084 0.684 0.142 -1.575 -8 ,16849 ,KEBNE ,16721722,Sat Nov 27 19:16:52 CET,Sat Nov 27 20:54:34 CET,0.0 1.364 1.845 2.226 2.564 2.869 3.122 3.332 3.688 3.845 4.001 4.212 4.437 4.578 4.846 5.093 5.32 5.431 5.652 5.846 6.116 6.292 6.463 6.698 6.909 7.125 7.335 7.53 7.793 8.039 8.271 8.539 8.788 9.038 9.317 9.599 9.867 10.157 10.44 10.74 11.081 11.458 11.849 12.235 12.667 13.106 13.612 14.151 14.67 15.071 15.304 15.182 14.819 14.329 13.842 13.383 12.936 12.53 12.154 11.731 11.349 10.995 10.641 10.295 9.972 9.679 9.36 9.075 8.821 8.539 8.253 8.02 7.769 7.502 7.275 7.031 6.788 6.535 6.27 6.081 5.877 5.543 5.313 5.097 4.982 4.715 4.439 4.145 3.974 3.705 3.43 3.254 3.08 2.664 2.405 2.116 1.789 1.429 0.99 0.351 -1.571 -9 ,18736 ,KEBNE ,16721723,Sat Nov 27 19:18:59 CET,Sat Nov 27 20:52:59 CET,0.0 1.21 1.661 2.012 2.315 2.582 2.838 3.076 3.482 3.661 3.824 4.035 4.267 4.405 4.663 4.904 5.138 5.253 5.462 5.657 5.94 6.116 6.278 6.524 6.761 6.97 7.168 7.367 7.61 7.841 8.064 8.333 8.584 8.802 9.061 9.345 9.611 9.901 10.219 10.547 10.872 11.226 11.602 11.974 12.383 12.797 13.253 13.737 14.251 14.717 14.949 14.754 14.34 13.868 13.398 12.911 12.427 11.998 11.609 11.179 10.797 10.441 10.104 9.784 9.47 9.178 8.868 8.59 8.34 8.056 7.741 7.487 7.225 6.948 6.743 6.519 6.271 6.014 5.744 5.569 5.395 5.107 4.903 4.689 4.575 4.321 4.048 3.762 3.607 3.356 3.093 2.909 2.704 2.22 1.954 1.676 1.368 0.983 0.493 -0.131 -1.673 -10 ,10964 ,KEBNE ,16721724,Sat Nov 27 19:21:07 CET,Sat Nov 27 20:55:14 CET,0.0 1.256 1.74 2.122 2.46 2.75 2.994 3.208 3.599 3.776 3.937 4.141 4.379 4.511 4.746 4.978 5.203 5.308 5.508 5.697 5.973 6.152 6.317 6.548 6.781 6.997 7.184 7.364 7.594 7.817 8.036 8.306 8.565 8.812 9.086 9.381 9.66 9.953 10.257 10.573 10.894 11.231 11.608 11.996 12.424 12.872 13.329 13.765 14.254 14.698 14.854 14.581 14.147 13.661 13.183 12.728 12.301 11.87 11.43 10.981 10.629 10.306 9.973 9.648 9.342 9.049 8.741 8.463 8.22 7.972 7.704 7.468 7.215 6.941 6.722 6.503 6.27 6.01 5.729 5.532 5.324 4.98 4.743 4.502 4.376 4.106 3.817 3.51 3.355 3.107 2.83 2.626 2.417 1.967 1.71 1.431 1.113 0.753 0.318 -0.312 -2.49 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_35.txt deleted file mode 100644 index 96f9065f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17399 ,KEBNE ,16721725,Sat Nov 27 19:24:10 CET,Sat Nov 27 21:02:44 CET,0.0 1.158 1.609 1.915 2.19 2.441 2.661 2.861 3.225 3.387 3.536 3.703 3.916 4.038 4.275 4.494 4.684 4.773 4.95 5.13 5.385 5.546 5.705 5.925 6.13 6.323 6.505 6.675 6.899 7.113 7.308 7.541 7.766 7.98 8.22 8.483 8.741 9.034 9.339 9.641 9.94 10.267 10.647 10.993 11.373 11.805 12.249 12.707 13.201 13.674 14.015 13.911 13.568 13.198 12.796 12.364 11.966 11.565 11.185 10.79 10.422 10.07 9.725 9.395 9.061 8.739 8.415 8.113 7.831 7.527 7.215 6.966 6.693 6.4 6.176 5.937 5.681 5.412 5.123 4.919 4.706 4.361 4.121 3.869 3.735 3.457 3.169 2.875 2.716 2.449 2.161 1.956 1.725 1.213 0.938 0.633 0.272 -0.143 -0.647 -1.347 -3.758 -2 ,21305 ,KEBNE ,16721726,Sat Nov 27 19:24:14 CET,Sat Nov 27 20:57:04 CET,0.0 0.965 1.319 1.587 1.816 2.009 2.187 2.355 2.65 2.789 2.919 3.058 3.251 3.357 3.559 3.753 3.943 4.037 4.207 4.361 4.579 4.72 4.853 5.047 5.237 5.412 5.582 5.743 5.94 6.131 6.315 6.531 6.747 6.96 7.186 7.418 7.632 7.865 8.123 8.392 8.675 8.979 9.321 9.67 10.062 10.507 10.968 11.407 11.866 12.312 12.648 12.607 12.326 11.888 11.439 11.042 10.643 10.238 9.856 9.449 9.087 8.746 8.416 8.096 7.785 7.488 7.182 6.905 6.632 6.351 6.055 5.798 5.538 5.269 5.066 4.843 4.592 4.347 4.099 3.909 3.703 3.375 3.141 2.889 2.762 2.498 2.221 1.932 1.769 1.509 1.187 0.963 0.736 0.209 -0.1 -0.425 -0.787 -1.204 -1.681 -2.338 -4.705 -3 ,29007 ,KEBNE ,16721727,Sat Nov 27 19:25:12 CET,Sat Nov 27 21:02:14 CET,0.0 1.328 1.755 2.073 2.331 2.552 2.762 2.966 3.314 3.461 3.601 3.791 4.011 4.133 4.366 4.576 4.771 4.869 5.049 5.216 5.463 5.622 5.774 5.99 6.196 6.394 6.59 6.776 7.007 7.221 7.414 7.639 7.851 8.061 8.307 8.567 8.829 9.121 9.41 9.704 10.003 10.339 10.733 11.098 11.474 11.869 12.306 12.744 13.17 13.555 13.822 13.742 13.426 13.013 12.583 12.176 11.761 11.336 10.957 10.57 10.209 9.87 9.534 9.205 8.9 8.595 8.264 7.978 7.724 7.465 7.196 6.953 6.691 6.398 6.162 5.927 5.682 5.407 5.099 4.893 4.688 4.361 4.123 3.874 3.739 3.454 3.171 2.854 2.681 2.424 2.132 1.931 1.728 1.27 0.982 0.642 0.288 -0.131 -0.657 -1.405 -3.74 -4 ,17467 ,KEBNE ,16721728,Sat Nov 27 19:25:12 CET,Sat Nov 27 21:02:17 CET,0.0 1.518 1.963 2.29 2.569 2.81 3.016 3.199 3.535 3.701 3.858 4.056 4.277 4.403 4.637 4.863 5.075 5.172 5.364 5.548 5.797 5.953 6.103 6.319 6.528 6.726 6.917 7.1 7.32 7.53 7.734 7.974 8.199 8.409 8.651 8.905 9.136 9.411 9.701 9.986 10.273 10.598 10.995 11.352 11.736 12.164 12.63 13.105 13.566 14.004 14.315 14.259 13.977 13.592 13.127 12.676 12.285 11.867 11.452 11.058 10.723 10.381 10.032 9.69 9.368 9.084 8.761 8.457 8.185 7.883 7.575 7.34 7.099 6.824 6.599 6.359 6.109 5.859 5.582 5.376 5.151 4.783 4.533 4.269 4.131 3.863 3.573 3.255 3.093 2.837 2.553 2.348 2.125 1.619 1.32 0.979 0.623 0.193 -0.355 -1.059 -3.52 -5 ,5946 ,KEBNE ,16721729,Sat Nov 27 19:25:12 CET,Sat Nov 27 21:02:26 CET,0.0 1.198 1.62 1.932 2.203 2.452 2.663 2.852 3.191 3.347 3.485 3.655 3.872 3.994 4.228 4.445 4.652 4.749 4.935 5.112 5.36 5.516 5.669 5.893 6.106 6.301 6.485 6.668 6.894 7.109 7.311 7.543 7.771 7.984 8.219 8.471 8.713 8.971 9.245 9.538 9.837 10.165 10.539 10.897 11.285 11.703 12.147 12.625 13.115 13.562 13.875 13.764 13.487 13.144 12.718 12.257 11.806 11.334 10.913 10.442 10.012 9.646 9.279 8.927 8.593 8.28 7.946 7.64 7.379 7.096 6.773 6.492 6.206 5.911 5.683 5.451 5.2 4.925 4.636 4.433 4.223 3.881 3.631 3.376 3.244 2.948 2.627 2.285 2.104 1.832 1.536 1.319 1.08 0.579 0.307 -0.011 -0.387 -0.794 -1.277 -1.953 -4.291 -6 ,29378 ,KEBNE ,16721730,Sat Nov 27 19:26:15 CET,Sat Nov 27 21:03:17 CET,0.0 1.206 1.625 1.941 2.218 2.461 2.679 2.878 3.226 3.381 3.533 3.725 3.938 4.059 4.28 4.488 4.686 4.778 4.959 5.132 5.372 5.52 5.668 5.886 6.087 6.275 6.456 6.631 6.845 7.048 7.248 7.488 7.702 7.904 8.145 8.418 8.669 8.931 9.224 9.538 9.838 10.159 10.537 10.907 11.325 11.768 12.225 12.691 13.153 13.594 13.952 13.855 13.489 13.042 12.587 12.17 11.766 11.33 10.937 10.539 10.176 9.828 9.492 9.166 8.86 8.581 8.265 7.971 7.71 7.442 7.156 6.915 6.653 6.353 6.112 5.867 5.614 5.349 5.063 4.862 4.648 4.305 4.069 3.825 3.7 3.453 3.179 2.855 2.676 2.402 2.085 1.868 1.63 1.117 0.827 0.495 0.13 -0.284 -0.781 -1.424 -3.342 -7 ,28653 ,KEBNE ,16721731,Sat Nov 27 19:26:15 CET,Sat Nov 27 21:03:26 CET,0.0 1.146 1.596 1.931 2.207 2.457 2.678 2.872 3.235 3.397 3.544 3.735 3.956 4.081 4.323 4.545 4.746 4.843 5.03 5.207 5.447 5.598 5.741 5.949 6.147 6.339 6.53 6.707 6.925 7.139 7.347 7.599 7.826 8.038 8.284 8.55 8.792 9.062 9.355 9.646 9.947 10.281 10.665 11.036 11.441 11.847 12.285 12.746 13.212 13.648 13.973 13.899 13.567 13.155 12.691 12.212 11.772 11.35 10.957 10.548 10.19 9.849 9.498 9.153 8.843 8.563 8.245 7.948 7.684 7.4 7.094 6.842 6.566 6.263 6.02 5.773 5.513 5.227 4.942 4.747 4.537 4.216 3.978 3.73 3.605 3.321 3.021 2.716 2.554 2.288 1.968 1.76 1.558 1.06 0.759 0.416 0.011 -0.432 -0.942 -1.643 -3.969 -8 ,26631 ,KEBNE ,16721732,Sat Nov 27 19:26:15 CET,Sat Nov 27 21:03:34 CET,0.0 1.401 1.842 2.179 2.448 2.717 2.951 3.139 3.475 3.62 3.759 3.936 4.153 4.276 4.51 4.728 4.931 5.028 5.209 5.381 5.634 5.792 5.936 6.146 6.351 6.54 6.719 6.896 7.129 7.342 7.542 7.786 8.007 8.219 8.464 8.739 8.999 9.276 9.557 9.867 10.198 10.533 10.904 11.27 11.681 12.11 12.571 13.039 13.494 13.95 14.278 14.135 13.757 13.336 12.903 12.451 12.02 11.591 11.223 10.851 10.5 10.177 9.852 9.526 9.195 8.879 8.554 8.251 7.985 7.702 7.391 7.137 6.859 6.533 6.289 6.052 5.797 5.531 5.251 5.055 4.847 4.509 4.271 4.017 3.887 3.625 3.331 2.998 2.811 2.532 2.222 2.015 1.795 1.267 0.976 0.65 0.276 -0.153 -0.659 -1.32 -3.777 -9 ,13500 ,KEBNE ,16721733,Sat Nov 27 19:27:21 CET,Sat Nov 27 21:01:38 CET,0.0 1.532 1.936 2.254 2.537 2.769 2.967 3.162 3.519 3.674 3.821 4.008 4.223 4.341 4.576 4.801 5.011 5.111 5.294 5.467 5.716 5.874 6.031 6.251 6.452 6.644 6.821 6.993 7.226 7.436 7.628 7.86 8.088 8.314 8.563 8.832 9.09 9.37 9.662 9.957 10.253 10.568 10.912 11.264 11.666 12.07 12.514 12.991 13.476 13.92 14.252 14.202 13.951 13.605 13.208 12.797 12.359 11.939 11.568 11.171 10.794 10.444 10.1 9.768 9.44 9.125 8.799 8.514 8.257 7.991 7.72 7.474 7.201 6.913 6.696 6.47 6.217 5.949 5.667 5.469 5.265 4.907 4.649 4.392 4.251 3.959 3.641 3.303 3.133 2.863 2.559 2.359 2.144 1.669 1.395 1.071 0.699 0.247 -0.262 -0.916 -3.001 -10 ,7241 ,KEBNE ,16721734,Sat Nov 27 19:28:20 CET,Sat Nov 27 21:07:00 CET,0.0 1.094 1.559 1.887 2.142 2.371 2.58 2.771 3.114 3.276 3.431 3.625 3.844 3.961 4.173 4.375 4.572 4.667 4.86 5.042 5.285 5.44 5.583 5.783 5.988 6.187 6.371 6.541 6.768 6.992 7.2 7.443 7.662 7.871 8.105 8.36 8.619 8.901 9.197 9.498 9.803 10.152 10.545 10.911 11.327 11.763 12.198 12.649 13.145 13.638 13.906 13.69 13.252 12.731 12.236 11.766 11.273 10.8 10.387 9.937 9.545 9.167 8.792 8.433 8.083 7.769 7.428 7.098 6.813 6.515 6.21 5.952 5.657 5.346 5.126 4.898 4.651 4.393 4.112 3.91 3.702 3.384 3.155 2.902 2.77 2.503 2.217 1.916 1.76 1.494 1.201 0.987 0.741 0.2 -0.095 -0.422 -0.805 -1.249 -1.81 -2.547 -4.971 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_57.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_57.txt deleted file mode 100644 index cbdca4f2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_54_57.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13872 ,KEBNE ,16721735,Sat Nov 27 19:29:23 CET,Sat Nov 27 21:06:36 CET,0.0 1.509 2.002 2.369 2.717 3.052 3.333 3.584 4.011 4.194 4.364 4.597 4.838 4.988 5.277 5.535 5.771 5.888 6.119 6.326 6.612 6.795 6.97 7.221 7.467 7.698 7.92 8.152 8.445 8.714 8.97 9.269 9.564 9.847 10.171 10.533 10.875 11.251 11.651 12.063 12.482 12.954 13.502 14.036 14.631 15.268 15.948 16.669 17.45 18.316 19.232 19.682 19.701 19.522 19.237 18.917 18.608 18.302 17.99 17.63 17.29 16.967 16.62 16.275 15.957 15.677 15.384 15.097 14.846 14.596 14.327 14.106 13.873 13.611 13.417 13.213 13.0 12.774 12.53 12.347 12.146 11.839 11.623 11.391 11.266 11.01 10.738 10.45 10.301 10.05 9.748 9.553 9.356 8.888 8.596 8.257 7.866 7.435 6.967 6.355 4.749 -2 ,9264 ,KEBNE ,16721736,Sat Nov 27 19:29:23 CET,Sat Nov 27 21:06:45 CET,0.0 1.359 1.864 2.246 2.579 2.87 3.113 3.331 3.732 3.914 4.083 4.319 4.555 4.694 4.966 5.219 5.453 5.568 5.792 6.0 6.291 6.477 6.658 6.913 7.146 7.371 7.597 7.814 8.088 8.365 8.628 8.934 9.23 9.509 9.811 10.153 10.499 10.876 11.265 11.667 12.079 12.524 13.047 13.565 14.162 14.803 15.514 16.293 17.101 17.952 18.769 19.106 19.057 18.86 18.577 18.224 17.874 17.527 17.192 16.857 16.548 16.235 15.923 15.63 15.346 15.073 14.804 14.549 14.298 14.033 13.752 13.525 13.292 13.051 12.853 12.638 12.417 12.182 11.937 11.76 11.576 11.291 11.071 10.829 10.712 10.461 10.178 9.872 9.71 9.455 9.18 8.988 8.778 8.302 8.003 7.673 7.303 6.9 6.419 5.673 3.46 -3 ,2264 ,KEBNE ,16721737,Sat Nov 27 19:29:23 CET,Sat Nov 27 21:06:31 CET,0.0 1.325 1.842 2.219 2.541 2.834 3.095 3.344 3.772 3.943 4.104 4.341 4.582 4.725 4.993 5.241 5.473 5.584 5.8 6.002 6.288 6.476 6.656 6.912 7.161 7.397 7.619 7.844 8.137 8.408 8.663 8.951 9.233 9.52 9.856 10.219 10.563 10.935 11.312 11.695 12.09 12.543 13.062 13.591 14.235 14.927 15.676 16.454 17.31 18.223 19.116 19.617 19.68 19.492 19.18 18.852 18.507 18.16 17.817 17.449 17.123 16.831 16.537 16.226 15.941 15.674 15.379 15.097 14.846 14.574 14.271 14.014 13.756 13.506 13.307 13.085 12.843 12.583 12.307 12.106 11.9 11.579 11.357 11.13 11.011 10.768 10.504 10.208 10.041 9.779 9.47 9.265 9.039 8.522 8.256 7.952 7.59 7.207 6.763 6.093 3.811 -4 ,20772 ,KEBNE ,16721738,Sat Nov 27 19:34:36 CET,Sat Nov 27 21:13:07 CET,0.0 1.39 1.909 2.316 2.64 2.921 3.17 3.397 3.804 4.001 4.183 4.417 4.649 4.787 5.059 5.313 5.546 5.66 5.876 6.091 6.412 6.6 6.768 7.027 7.289 7.532 7.754 7.962 8.228 8.484 8.728 9.023 9.314 9.597 9.929 10.291 10.613 10.973 11.356 11.744 12.162 12.652 13.183 13.688 14.285 14.924 15.633 16.412 17.268 18.152 19.041 19.493 19.47 19.254 18.978 18.651 18.313 17.97 17.636 17.268 16.92 16.602 16.289 15.985 15.696 15.419 15.107 14.827 14.591 14.345 14.091 13.871 13.615 13.342 13.131 12.916 12.704 12.482 12.237 12.062 11.871 11.55 11.335 11.113 10.992 10.736 10.472 10.195 10.035 9.785 9.514 9.321 9.126 8.701 8.438 8.131 7.783 7.404 6.946 6.258 3.746 -5 ,22745 ,KEBNE ,16721739,Sat Nov 27 19:34:36 CET,Sat Nov 27 21:12:02 CET,0.0 1.144 1.647 2.025 2.323 2.593 2.831 3.055 3.45 3.633 3.803 4.016 4.25 4.396 4.671 4.919 5.146 5.254 5.474 5.686 5.992 6.192 6.374 6.627 6.866 7.1 7.329 7.536 7.8 8.074 8.34 8.642 8.926 9.197 9.5 9.835 10.179 10.55 10.923 11.335 11.773 12.242 12.794 13.353 13.962 14.61 15.318 16.074 16.933 17.867 18.778 19.253 19.256 19.052 18.782 18.464 18.11 17.753 17.421 17.057 16.736 16.459 16.169 15.877 15.583 15.306 15.023 14.75 14.519 14.286 14.029 13.803 13.555 13.268 13.037 12.812 12.584 12.336 12.068 11.883 11.685 11.352 11.129 10.91 10.794 10.538 10.248 9.933 9.768 9.523 9.275 9.092 8.888 8.442 8.174 7.892 7.587 7.221 6.736 6.1 4.207 -6 ,23402 ,KEBNE ,16721740,Sat Nov 27 19:34:36 CET,Sat Nov 27 21:13:11 CET,0.0 1.557 2.09 2.478 2.8 3.076 3.336 3.575 3.984 4.164 4.333 4.571 4.81 4.95 5.215 5.453 5.682 5.799 6.015 6.22 6.511 6.699 6.888 7.155 7.403 7.638 7.868 8.1 8.397 8.67 8.93 9.242 9.539 9.819 10.123 10.47 10.814 11.167 11.546 11.97 12.398 12.862 13.403 13.934 14.523 15.158 15.858 16.591 17.401 18.252 19.008 19.36 19.346 19.167 18.917 18.603 18.266 17.893 17.548 17.202 16.866 16.559 16.257 15.938 15.621 15.323 15.025 14.755 14.51 14.25 13.986 13.765 13.543 13.309 13.113 12.921 12.718 12.482 12.229 12.059 11.885 11.611 11.416 11.204 11.09 10.857 10.608 10.308 10.145 9.904 9.646 9.465 9.27 8.791 8.538 8.284 7.98 7.61 7.183 6.656 5.131 -7 ,29605 ,KEBNE ,16721741,Sat Nov 27 19:35:38 CET,Sat Nov 27 21:13:51 CET,0.0 1.302 1.797 2.195 2.529 2.814 3.078 3.32 3.731 3.913 4.094 4.355 4.613 4.769 5.046 5.306 5.552 5.673 5.902 6.116 6.439 6.641 6.815 7.058 7.304 7.542 7.766 7.981 8.253 8.513 8.763 9.062 9.338 9.603 9.915 10.251 10.55 10.881 11.24 11.627 12.058 12.52 13.044 13.551 14.108 14.738 15.483 16.304 17.165 18.106 19.081 19.524 19.519 19.348 19.081 18.775 18.487 18.197 17.892 17.528 17.212 16.919 16.6 16.276 15.975 15.699 15.401 15.123 14.869 14.607 14.337 14.106 13.851 13.566 13.34 13.111 12.883 12.633 12.366 12.18 11.982 11.668 11.447 11.223 11.104 10.831 10.525 10.192 10.026 9.78 9.496 9.294 9.087 8.604 8.325 8.036 7.71 7.3 6.769 6.03 3.524 -8 ,17298 ,KEBNE ,16721742,Sat Nov 27 19:35:38 CET,Sat Nov 27 21:14:12 CET,0.0 1.198 1.703 2.1 2.438 2.718 2.959 3.183 3.589 3.772 3.937 4.153 4.389 4.536 4.827 5.089 5.334 5.457 5.69 5.906 6.218 6.414 6.593 6.853 7.093 7.318 7.54 7.767 8.072 8.354 8.624 8.944 9.242 9.531 9.875 10.248 10.564 10.888 11.262 11.672 12.094 12.557 13.088 13.6 14.165 14.796 15.531 16.306 17.129 17.994 18.777 19.173 19.177 18.977 18.72 18.416 18.085 17.75 17.412 17.058 16.757 16.458 16.149 15.85 15.559 15.283 15.001 14.747 14.525 14.298 14.026 13.773 13.524 13.266 13.05 12.825 12.596 12.354 12.105 11.933 11.754 11.458 11.231 10.987 10.857 10.579 10.298 10.017 9.865 9.613 9.328 9.13 8.923 8.468 8.199 7.908 7.586 7.208 6.727 6.063 4.118 -9 ,219 ,KEBNE ,16721743,Sat Nov 27 19:35:38 CET,Sat Nov 27 21:14:19 CET,0.0 1.29 1.798 2.166 2.486 2.772 3.03 3.276 3.724 3.914 4.078 4.296 4.538 4.685 4.967 5.234 5.489 5.617 5.86 6.076 6.386 6.584 6.779 7.058 7.306 7.544 7.775 7.992 8.278 8.567 8.834 9.141 9.431 9.702 9.998 10.333 10.676 11.033 11.388 11.765 12.156 12.607 13.124 13.63 14.23 14.882 15.599 16.355 17.153 18.007 18.856 19.272 19.341 19.216 18.936 18.618 18.323 17.996 17.647 17.284 16.957 16.652 16.367 16.069 15.766 15.496 15.215 14.961 14.738 14.503 14.257 14.047 13.804 13.53 13.316 13.092 12.85 12.608 12.363 12.18 11.987 11.694 11.479 11.236 11.106 10.83 10.534 10.214 10.038 9.761 9.457 9.266 9.043 8.564 8.294 7.992 7.669 7.287 6.812 6.188 4.285 -10 ,9418 ,KEBNE ,16721744,Sat Nov 27 19:35:38 CET,Sat Nov 27 21:14:07 CET,0.0 1.43 1.974 2.381 2.721 2.996 3.249 3.491 3.916 4.089 4.249 4.476 4.71 4.852 5.122 5.373 5.614 5.728 5.943 6.152 6.469 6.673 6.864 7.134 7.392 7.625 7.837 8.054 8.333 8.583 8.814 9.109 9.413 9.694 10.016 10.374 10.705 11.068 11.455 11.857 12.281 12.748 13.286 13.823 14.43 15.084 15.805 16.547 17.4 18.358 19.215 19.563 19.482 19.257 19.008 18.714 18.393 18.084 17.78 17.44 17.122 16.821 16.535 16.241 15.947 15.645 15.313 15.032 14.804 14.568 14.304 14.076 13.84 13.578 13.352 13.108 12.852 12.588 12.319 12.138 11.945 11.628 11.406 11.178 11.058 10.801 10.534 10.232 10.064 9.819 9.552 9.358 9.142 8.707 8.481 8.217 7.875 7.453 6.968 6.344 4.377 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_55_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_55_35.txt deleted file mode 100644 index 91d4532f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_55_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11890 ,KEBNE ,16721745,Sat Nov 27 19:36:41 CET,Sat Nov 27 21:14:05 CET,0.0 1.249 1.664 1.99 2.277 2.537 2.766 2.971 3.331 3.489 3.641 3.84 4.053 4.174 4.407 4.632 4.832 4.925 5.103 5.275 5.523 5.675 5.823 6.032 6.24 6.441 6.622 6.797 7.022 7.226 7.427 7.661 7.874 8.092 8.354 8.636 8.89 9.174 9.478 9.781 10.104 10.452 10.82 11.174 11.558 11.953 12.357 12.771 13.171 13.479 13.561 13.209 12.713 12.192 11.694 11.222 10.758 10.302 9.897 9.501 9.154 8.815 8.483 8.165 7.847 7.55 7.229 6.942 6.699 6.453 6.211 5.998 5.766 5.525 5.329 5.132 4.933 4.718 4.49 4.339 4.188 3.926 3.745 3.562 3.464 3.256 3.034 2.79 2.66 2.436 2.231 2.069 1.896 1.537 1.344 1.121 0.86 0.57 0.22 -0.252 -1.699 -2 ,8143 ,KEBNE ,16721746,Sat Nov 27 19:36:41 CET,Sat Nov 27 21:14:24 CET,0.0 1.167 1.611 1.941 2.211 2.446 2.656 2.849 3.19 3.344 3.488 3.677 3.897 4.021 4.258 4.467 4.662 4.759 4.941 5.112 5.354 5.505 5.646 5.845 6.045 6.237 6.411 6.572 6.787 6.996 7.181 7.406 7.623 7.831 8.075 8.354 8.613 8.862 9.112 9.392 9.674 9.953 10.276 10.587 10.95 11.322 11.704 12.113 12.479 12.807 12.954 12.634 12.109 11.572 11.1 10.632 10.179 9.751 9.362 8.966 8.611 8.288 7.976 7.655 7.374 7.128 6.844 6.594 6.384 6.148 5.893 5.682 5.457 5.22 5.035 4.845 4.644 4.414 4.18 4.028 3.863 3.599 3.414 3.208 3.106 2.897 2.676 2.436 2.301 2.077 1.871 1.716 1.555 1.183 0.973 0.741 0.475 0.18 -0.169 -0.67 -2.196 -3 ,10698 ,KEBNE ,16721747,Sat Nov 27 19:37:43 CET,Sat Nov 27 21:15:17 CET,0.0 1.077 1.522 1.861 2.141 2.382 2.593 2.779 3.115 3.277 3.445 3.659 3.874 3.992 4.208 4.406 4.592 4.686 4.873 5.043 5.282 5.437 5.584 5.793 5.99 6.171 6.343 6.514 6.749 6.985 7.21 7.474 7.713 7.928 8.182 8.459 8.718 9.0 9.289 9.594 9.895 10.219 10.59 10.932 11.315 11.717 12.139 12.576 13.019 13.347 13.406 13.041 12.538 12.043 11.571 11.068 10.594 10.177 9.788 9.385 9.017 8.679 8.359 8.043 7.727 7.428 7.116 6.855 6.639 6.403 6.143 5.934 5.726 5.498 5.32 5.128 4.92 4.717 4.51 4.358 4.197 3.935 3.74 3.538 3.436 3.222 3.001 2.764 2.629 2.397 2.193 2.039 1.875 1.514 1.314 1.092 0.845 0.576 0.227 -0.279 -1.599 -4 ,3498 ,KEBNE ,16721748,Sat Nov 27 19:37:44 CET,Sat Nov 27 21:14:30 CET,0.0 1.41 1.849 2.209 2.505 2.761 2.971 3.16 3.523 3.689 3.843 4.039 4.259 4.379 4.603 4.813 5.015 5.111 5.292 5.467 5.709 5.86 6.012 6.234 6.443 6.629 6.799 6.964 7.172 7.372 7.564 7.787 7.994 8.193 8.42 8.672 8.919 9.19 9.476 9.765 10.064 10.404 10.775 11.118 11.505 11.915 12.344 12.756 13.121 13.435 13.532 13.222 12.748 12.228 11.717 11.226 10.78 10.356 9.971 9.579 9.232 8.915 8.584 8.25 7.94 7.66 7.364 7.083 6.843 6.6 6.341 6.12 5.887 5.639 5.434 5.209 4.978 4.746 4.493 4.317 4.143 3.853 3.644 3.425 3.307 3.074 2.834 2.564 2.423 2.193 1.991 1.844 1.687 1.326 1.12 0.894 0.641 0.348 0.005 -0.46 -1.898 -5 ,12390 ,KEBNE ,16721749,Sat Nov 27 19:37:44 CET,Sat Nov 27 21:15:28 CET,0.0 1.183 1.62 1.935 2.215 2.471 2.694 2.883 3.218 3.371 3.517 3.71 3.936 4.065 4.309 4.535 4.741 4.838 5.029 5.22 5.49 5.65 5.791 6.003 6.203 6.386 6.584 6.775 7.003 7.224 7.43 7.676 7.914 8.131 8.377 8.657 8.928 9.213 9.501 9.808 10.142 10.494 10.873 11.264 11.683 12.098 12.523 12.922 13.318 13.678 13.863 13.601 13.142 12.645 12.139 11.63 11.178 10.732 10.305 9.892 9.543 9.225 8.914 8.62 8.34 8.08 7.812 7.564 7.334 7.094 6.855 6.649 6.423 6.191 6.007 5.819 5.625 5.4 5.167 5.016 4.857 4.595 4.407 4.206 4.104 3.897 3.673 3.433 3.304 3.081 2.865 2.697 2.528 2.163 1.96 1.742 1.496 1.207 0.867 0.413 -1.031 -6 ,7248 ,KEBNE ,16721750,Sat Nov 27 19:37:43 CET,Sat Nov 27 21:15:09 CET,0.0 1.371 1.835 2.176 2.467 2.745 2.986 3.188 3.543 3.708 3.868 4.066 4.278 4.407 4.651 4.886 5.105 5.214 5.424 5.619 5.897 6.068 6.233 6.468 6.685 6.891 7.097 7.3 7.54 7.752 7.958 8.205 8.437 8.668 8.929 9.199 9.452 9.74 10.037 10.327 10.63 10.958 11.317 11.693 12.11 12.502 12.907 13.308 13.713 14.041 14.119 13.836 13.409 12.887 12.36 11.865 11.406 10.954 10.558 10.159 9.798 9.461 9.137 8.838 8.562 8.302 8.008 7.747 7.521 7.289 7.045 6.831 6.604 6.373 6.195 6.001 5.793 5.585 5.363 5.21 5.051 4.787 4.595 4.389 4.286 4.075 3.851 3.623 3.502 3.281 3.067 2.91 2.747 2.374 2.162 1.925 1.659 1.375 1.04 0.562 -0.68 -7 ,23483 ,KEBNE ,16721751,Sat Nov 27 19:37:44 CET,Sat Nov 27 21:15:20 CET,0.0 1.304 1.758 2.119 2.4 2.624 2.847 3.061 3.438 3.606 3.758 3.949 4.165 4.285 4.514 4.731 4.939 5.038 5.216 5.378 5.614 5.767 5.919 6.147 6.357 6.545 6.721 6.884 7.097 7.306 7.501 7.725 7.934 8.143 8.377 8.633 8.882 9.144 9.405 9.664 9.94 10.253 10.6 10.936 11.314 11.722 12.131 12.526 12.938 13.29 13.41 13.106 12.608 12.1 11.642 11.175 10.718 10.288 9.904 9.509 9.155 8.807 8.471 8.161 7.871 7.591 7.267 6.989 6.76 6.511 6.258 6.044 5.811 5.564 5.375 5.172 4.942 4.702 4.453 4.274 4.093 3.806 3.606 3.394 3.282 3.066 2.836 2.581 2.451 2.232 2.039 1.891 1.729 1.351 1.141 0.903 0.647 0.364 0.018 -0.448 -1.835 -8 ,17199 ,KEBNE ,16721752,Sat Nov 27 19:38:46 CET,Sat Nov 27 21:17:38 CET,0.0 1.431 1.895 2.235 2.525 2.77 2.977 3.17 3.521 3.687 3.842 4.036 4.257 4.379 4.601 4.812 5.019 5.12 5.312 5.495 5.762 5.92 6.066 6.27 6.463 6.648 6.815 6.981 7.195 7.397 7.593 7.822 8.039 8.246 8.475 8.729 8.983 9.276 9.583 9.88 10.174 10.482 10.832 11.177 11.555 11.943 12.345 12.753 13.139 13.436 13.477 13.136 12.658 12.158 11.673 11.188 10.721 10.284 9.874 9.439 9.081 8.744 8.405 8.084 7.782 7.496 7.195 6.934 6.708 6.474 6.219 5.986 5.744 5.497 5.297 5.096 4.893 4.679 4.453 4.297 4.143 3.898 3.722 3.532 3.432 3.224 2.995 2.75 2.622 2.404 2.216 2.06 1.887 1.493 1.277 1.052 0.805 0.511 0.165 -0.291 -1.643 -9 ,27431 ,KEBNE ,16721753,Sat Nov 27 19:39:49 CET,Sat Nov 27 21:17:44 CET,0.0 1.311 1.733 2.059 2.34 2.585 2.804 3.002 3.358 3.519 3.667 3.857 4.07 4.196 4.425 4.634 4.828 4.921 5.106 5.276 5.511 5.662 5.811 6.026 6.232 6.426 6.605 6.783 7.017 7.244 7.467 7.717 7.942 8.166 8.435 8.735 9.003 9.291 9.598 9.902 10.2 10.523 10.874 11.211 11.6 12.003 12.443 12.898 13.339 13.676 13.795 13.486 12.97 12.419 11.887 11.378 10.896 10.447 10.048 9.629 9.272 8.943 8.616 8.297 7.987 7.699 7.405 7.14 6.884 6.615 6.354 6.131 5.885 5.624 5.419 5.204 4.991 4.771 4.538 4.378 4.217 3.943 3.746 3.556 3.459 3.245 3.013 2.765 2.632 2.397 2.186 2.035 1.868 1.481 1.278 1.057 0.8 0.513 0.175 -0.3 -1.858 -10 ,11032 ,KEBNE ,16721754,Sat Nov 27 19:39:48 CET,Sat Nov 27 21:17:20 CET,0.0 1.406 1.841 2.151 2.406 2.652 2.883 3.082 3.451 3.616 3.766 3.966 4.184 4.31 4.54 4.757 4.963 5.057 5.239 5.407 5.643 5.795 5.942 6.148 6.349 6.55 6.735 6.905 7.122 7.331 7.529 7.754 7.964 8.168 8.413 8.675 8.913 9.161 9.413 9.693 9.983 10.286 10.637 11.004 11.415 11.815 12.209 12.616 13.042 13.363 13.429 13.131 12.677 12.181 11.685 11.176 10.698 10.277 9.896 9.493 9.143 8.822 8.496 8.181 7.9 7.631 7.341 7.072 6.83 6.584 6.319 6.085 5.842 5.582 5.373 5.161 4.946 4.722 4.486 4.324 4.161 3.894 3.702 3.507 3.405 3.185 2.963 2.725 2.596 2.376 2.167 2.008 1.838 1.461 1.263 1.043 0.785 0.481 0.112 -0.36 -1.763 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_35.txt deleted file mode 100644 index fb96ceb6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_35.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5442 ,KEBNE ,16721755,Sat Nov 27 19:42:56 CET,Sat Nov 27 21:22:37 CET,0.0 0.964 1.453 1.813 2.111 2.385 2.627 2.84 3.218 3.392 3.559 3.784 4.01 4.143 4.4 4.649 4.899 5.014 5.226 5.422 5.701 5.879 6.041 6.279 6.515 6.733 6.941 7.143 7.399 7.639 7.863 8.127 8.387 8.643 8.935 9.238 9.519 9.823 10.142 10.484 10.842 11.248 11.72 12.179 12.697 13.239 13.801 14.412 15.084 15.758 16.335 16.487 16.399 16.193 15.925 15.622 15.312 15.013 14.743 14.433 14.122 13.828 13.527 13.228 12.952 12.687 12.41 12.178 11.96 11.722 11.481 11.275 11.054 10.815 10.612 10.406 10.205 9.999 9.788 9.631 9.459 9.196 9.011 8.812 8.709 8.494 8.25 7.988 7.85 7.62 7.404 7.24 7.064 6.673 6.447 6.202 5.927 5.612 5.238 4.73 2.948 -2 ,12449 ,KEBNE ,16721756,Sat Nov 27 19:42:57 CET,Sat Nov 27 21:20:56 CET,0.0 1.194 1.608 1.936 2.233 2.492 2.714 2.913 3.285 3.454 3.611 3.808 4.03 4.152 4.38 4.606 4.821 4.918 5.102 5.286 5.551 5.727 5.907 6.159 6.4 6.633 6.846 7.057 7.329 7.58 7.808 8.066 8.318 8.578 8.88 9.19 9.483 9.807 10.161 10.524 10.885 11.285 11.738 12.189 12.709 13.273 13.865 14.457 15.09 15.734 16.305 16.508 16.427 16.187 15.876 15.563 15.252 14.94 14.65 14.326 14.02 13.739 13.468 13.192 12.918 12.668 12.407 12.154 11.92 11.678 11.437 11.232 11.018 10.784 10.589 10.388 10.182 9.978 9.758 9.597 9.429 9.137 8.924 8.712 8.601 8.37 8.123 7.847 7.704 7.479 7.25 7.076 6.892 6.465 6.224 5.97 5.676 5.328 4.896 4.316 2.338 -3 ,23641 ,KEBNE ,16721757,Sat Nov 27 19:42:57 CET,Sat Nov 27 21:21:01 CET,0.0 0.986 1.414 1.742 2.03 2.276 2.499 2.7 3.068 3.23 3.385 3.59 3.812 3.939 4.199 4.437 4.653 4.754 4.947 5.135 5.41 5.587 5.755 5.997 6.214 6.409 6.598 6.777 7.004 7.229 7.442 7.686 7.92 8.149 8.414 8.708 8.989 9.302 9.631 9.967 10.312 10.692 11.143 11.604 12.108 12.635 13.202 13.81 14.461 15.112 15.706 15.947 15.878 15.648 15.348 15.007 14.682 14.362 14.048 13.717 13.42 13.15 12.883 12.617 12.351 12.098 11.808 11.536 11.316 11.092 10.853 10.661 10.449 10.215 10.025 9.819 9.611 9.392 9.163 8.997 8.821 8.559 8.37 8.172 8.068 7.835 7.583 7.311 7.169 6.931 6.688 6.512 6.319 5.89 5.658 5.41 5.124 4.764 4.326 3.751 2.016 -4 ,1335 ,KEBNE ,16721758,Sat Nov 27 19:42:56 CET,Sat Nov 27 21:20:53 CET,0.0 1.526 2.065 2.454 2.771 3.056 3.301 3.517 3.887 4.061 4.228 4.44 4.673 4.812 5.094 5.355 5.584 5.69 5.893 6.091 6.363 6.53 6.695 6.931 7.161 7.381 7.584 7.782 8.032 8.273 8.5 8.768 9.032 9.267 9.537 9.852 10.151 10.471 10.807 11.164 11.534 11.932 12.389 12.834 13.33 13.851 14.401 15.0 15.666 16.361 16.986 17.226 17.152 16.968 16.733 16.471 16.194 15.898 15.579 15.218 14.913 14.637 14.348 14.05 13.77 13.513 13.23 12.985 12.759 12.503 12.256 12.046 11.828 11.609 11.435 11.258 11.065 10.849 10.629 10.472 10.303 10.047 9.876 9.693 9.594 9.383 9.156 8.905 8.774 8.547 8.328 8.171 7.998 7.612 7.4 7.152 6.862 6.529 6.149 5.629 3.892 -5 ,6907 ,KEBNE ,16721759,Sat Nov 27 19:43:59 CET,Sat Nov 27 21:21:55 CET,0.0 1.096 1.542 1.88 2.17 2.425 2.648 2.858 3.24 3.408 3.563 3.754 3.978 4.106 4.348 4.58 4.795 4.892 5.075 5.253 5.506 5.668 5.836 6.09 6.319 6.536 6.748 6.957 7.225 7.473 7.706 7.972 8.218 8.466 8.744 9.039 9.328 9.647 9.998 10.368 10.744 11.139 11.588 12.025 12.504 13.031 13.607 14.215 14.875 15.56 16.189 16.423 16.356 16.147 15.865 15.544 15.224 14.889 14.562 14.25 13.962 13.675 13.397 13.136 12.888 12.644 12.384 12.144 11.934 11.709 11.463 11.254 11.038 10.817 10.634 10.441 10.244 10.026 9.785 9.603 9.421 9.159 8.965 8.756 8.644 8.397 8.145 7.877 7.73 7.49 7.253 7.079 6.894 6.487 6.251 5.984 5.676 5.306 4.863 4.229 2.391 -6 ,3180 ,KEBNE ,16721760,Sat Nov 27 19:43:59 CET,Sat Nov 27 21:20:21 CET,0.0 1.236 1.669 2.023 2.316 2.565 2.786 2.988 3.356 3.524 3.681 3.888 4.117 4.244 4.482 4.711 4.937 5.048 5.257 5.442 5.711 5.885 6.048 6.28 6.495 6.696 6.89 7.069 7.297 7.528 7.749 8.013 8.256 8.483 8.745 9.021 9.272 9.562 9.886 10.224 10.567 10.956 11.407 11.85 12.362 12.893 13.462 14.099 14.763 15.43 16.055 16.234 16.125 15.942 15.673 15.325 15.003 14.687 14.371 14.042 13.741 13.442 13.143 12.86 12.583 12.315 12.026 11.769 11.558 11.328 11.075 10.87 10.653 10.407 10.212 10.005 9.794 9.578 9.354 9.199 9.032 8.77 8.582 8.383 8.281 8.066 7.835 7.585 7.449 7.222 7.02 6.853 6.675 6.302 6.081 5.835 5.569 5.265 4.887 4.362 2.592 -7 ,1174 ,KEBNE ,16721761,Sat Nov 27 19:43:59 CET,Sat Nov 27 21:22:17 CET,0.0 1.28 1.814 2.203 2.515 2.782 3.026 3.245 3.633 3.813 3.979 4.188 4.425 4.563 4.827 5.063 5.281 5.392 5.597 5.791 6.091 6.28 6.452 6.693 6.92 7.135 7.349 7.553 7.799 8.029 8.264 8.55 8.801 9.026 9.294 9.599 9.888 10.204 10.545 10.919 11.312 11.726 12.168 12.595 13.093 13.645 14.242 14.864 15.533 16.214 16.815 17.057 16.951 16.708 16.439 16.115 15.785 15.463 15.148 14.813 14.511 14.234 13.966 13.697 13.43 13.192 12.954 12.745 12.545 12.324 12.096 11.897 11.686 11.455 11.266 11.075 10.868 10.653 10.432 10.263 10.09 9.832 9.646 9.45 9.352 9.149 8.922 8.68 8.55 8.323 8.115 7.955 7.78 7.375 7.161 6.918 6.637 6.334 5.967 5.444 3.637 -8 ,157 ,KEBNE ,16721762,Sat Nov 27 19:43:59 CET,Sat Nov 27 21:24:13 CET,0.0 1.643 2.158 2.589 2.954 3.262 3.533 3.773 4.211 4.402 4.576 4.801 5.042 5.183 5.442 5.681 5.912 6.028 6.241 6.441 6.733 6.91 7.077 7.314 7.537 7.752 7.965 8.178 8.437 8.682 8.918 9.177 9.423 9.665 9.934 10.25 10.56 10.885 11.221 11.569 11.926 12.317 12.77 13.216 13.718 14.246 14.83 15.458 16.108 16.722 17.279 17.453 17.345 17.123 16.852 16.539 16.198 15.861 15.542 15.21 14.907 14.625 14.346 14.071 13.809 13.551 13.263 13.017 12.804 12.58 12.341 12.13 11.907 11.678 11.5 11.311 11.116 10.915 10.692 10.521 10.344 10.085 9.904 9.71 9.598 9.371 9.133 8.87 8.73 8.496 8.262 8.091 7.917 7.529 7.315 7.085 6.804 6.467 6.063 5.529 4.016 -9 ,32455 ,KEBNE ,16721763,Sat Nov 27 19:45:01 CET,Sat Nov 27 21:21:30 CET,0.0 1.257 1.716 2.067 2.353 2.596 2.811 3.01 3.357 3.521 3.679 3.882 4.116 4.253 4.504 4.752 4.997 5.113 5.333 5.545 5.85 6.037 6.216 6.468 6.696 6.925 7.154 7.359 7.602 7.838 8.085 8.384 8.654 8.903 9.185 9.489 9.783 10.105 10.428 10.757 11.108 11.5 11.944 12.385 12.878 13.428 14.076 14.748 15.418 16.093 16.697 16.854 16.717 16.452 16.153 15.826 15.469 15.137 14.865 14.553 14.261 14.01 13.768 13.52 13.276 13.046 12.799 12.567 12.364 12.158 11.93 11.718 11.495 11.266 11.098 10.928 10.735 10.538 10.341 10.186 10.011 9.729 9.534 9.333 9.232 9.022 8.797 8.561 8.425 8.189 7.959 7.793 7.626 7.244 7.034 6.8 6.512 6.181 5.799 5.292 3.983 -10 ,1991 ,KEBNE ,16721764,Sat Nov 27 19:45:01 CET,Sat Nov 27 21:21:31 CET,0.0 1.307 1.749 2.091 2.373 2.625 2.857 3.066 3.436 3.605 3.773 3.985 4.218 4.362 4.616 4.861 5.095 5.198 5.398 5.591 5.862 6.039 6.21 6.441 6.66 6.868 7.074 7.273 7.52 7.756 7.991 8.286 8.557 8.797 9.072 9.373 9.654 9.968 10.317 10.686 11.049 11.454 11.92 12.359 12.852 13.397 14.009 14.629 15.264 15.957 16.659 16.901 16.779 16.561 16.296 15.965 15.642 15.358 15.077 14.747 14.435 14.137 13.836 13.543 13.274 13.02 12.751 12.507 12.268 12.017 11.772 11.548 11.311 11.071 10.877 10.678 10.475 10.257 10.014 9.843 9.672 9.392 9.193 8.978 8.86 8.618 8.364 8.091 7.945 7.709 7.485 7.31 7.125 6.675 6.416 6.161 5.865 5.528 5.084 4.448 2.42 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_55.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_55.txt deleted file mode 100644 index 69a5834c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_56_55.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20351 ,KEBNE ,16721765,Sat Nov 27 19:45:01 CET,Sat Nov 27 21:24:30 CET,0.0 1.515 2.006 2.411 2.726 2.974 3.198 3.414 3.808 3.996 4.171 4.402 4.643 4.782 5.056 5.307 5.548 5.659 5.855 6.047 6.337 6.529 6.707 6.948 7.18 7.416 7.646 7.86 8.131 8.389 8.635 8.921 9.179 9.417 9.696 10.014 10.317 10.65 10.993 11.345 11.705 12.11 12.599 13.066 13.58 14.145 14.76 15.402 16.1 16.826 17.508 17.763 17.72 17.555 17.322 17.04 16.754 16.462 16.183 15.907 15.655 15.41 15.171 14.941 14.71 14.481 14.23 13.997 13.79 13.583 13.359 13.163 12.967 12.761 12.588 12.408 12.222 12.01 11.782 11.639 11.496 11.25 11.074 10.891 10.795 10.597 10.372 10.129 10.003 9.788 9.591 9.427 9.256 8.877 8.652 8.413 8.167 7.863 7.486 7.023 5.17 -2 ,1952 ,KEBNE ,16721766,Sat Nov 27 19:46:04 CET,Sat Nov 27 21:22:27 CET,0.0 1.351 1.868 2.242 2.548 2.809 3.043 3.262 3.668 3.844 4.013 4.241 4.467 4.606 4.869 5.101 5.322 5.428 5.629 5.82 6.104 6.29 6.465 6.713 6.955 7.187 7.397 7.597 7.864 8.124 8.36 8.623 8.876 9.121 9.402 9.721 10.029 10.355 10.693 11.047 11.42 11.844 12.312 12.749 13.259 13.811 14.402 15.039 15.737 16.463 17.151 17.425 17.368 17.192 16.945 16.667 16.379 16.095 15.83 15.534 15.247 14.981 14.716 14.441 14.175 13.932 13.673 13.436 13.226 13.006 12.761 12.559 12.354 12.122 11.941 11.75 11.559 11.358 11.123 10.963 10.805 10.563 10.386 10.195 10.099 9.897 9.67 9.413 9.275 9.038 8.79 8.609 8.416 7.965 7.715 7.459 7.177 6.841 6.429 5.868 3.826 -3 ,28678 ,KEBNE ,16721767,Sat Nov 27 19:46:04 CET,Sat Nov 27 21:23:50 CET,0.0 1.302 1.787 2.148 2.449 2.706 2.924 3.119 3.482 3.649 3.805 3.998 4.224 4.352 4.593 4.822 5.044 5.15 5.358 5.544 5.804 5.972 6.135 6.374 6.594 6.802 6.995 7.177 7.417 7.647 7.868 8.151 8.413 8.645 8.91 9.193 9.472 9.78 10.107 10.454 10.832 11.261 11.752 12.234 12.738 13.269 13.846 14.477 15.232 16.02 16.699 16.97 16.876 16.627 16.361 16.056 15.739 15.457 15.188 14.875 14.579 14.299 14.023 13.76 13.515 13.276 13.021 12.795 12.584 12.356 12.116 11.909 11.675 11.434 11.257 11.066 10.866 10.661 10.444 10.287 10.124 9.859 9.657 9.445 9.337 9.118 8.883 8.626 8.496 8.279 8.061 7.9 7.738 7.389 7.175 6.919 6.61 6.244 5.821 5.252 3.865 -4 ,16450 ,KEBNE ,16721768,Sat Nov 27 19:46:04 CET,Sat Nov 27 21:22:51 CET,0.0 1.002 1.464 1.797 2.073 2.325 2.552 2.751 3.098 3.254 3.4 3.592 3.818 3.947 4.193 4.41 4.62 4.728 4.937 5.128 5.384 5.547 5.704 5.929 6.152 6.363 6.565 6.754 6.998 7.242 7.476 7.757 8.015 8.258 8.539 8.862 9.166 9.484 9.821 10.179 10.55 10.963 11.445 11.915 12.445 13.013 13.631 14.289 14.993 15.726 16.423 16.739 16.692 16.494 16.253 15.949 15.626 15.32 15.037 14.717 14.397 14.122 13.871 13.608 13.346 13.101 12.84 12.608 12.41 12.193 11.959 11.759 11.55 11.325 11.138 10.938 10.731 10.519 10.295 10.139 9.979 9.728 9.554 9.372 9.278 9.081 8.867 8.641 8.521 8.301 8.096 7.944 7.781 7.412 7.205 6.976 6.706 6.387 6.004 5.497 4.062 -5 ,16822 ,KEBNE ,16721769,Sat Nov 27 19:47:06 CET,Sat Nov 27 21:23:42 CET,0.0 1.126 1.603 1.944 2.225 2.486 2.708 2.919 3.304 3.467 3.619 3.815 4.044 4.186 4.443 4.682 4.908 5.015 5.221 5.41 5.686 5.864 6.025 6.252 6.477 6.699 6.908 7.101 7.347 7.583 7.823 8.107 8.374 8.633 8.928 9.256 9.576 9.919 10.275 10.648 11.029 11.455 11.929 12.374 12.902 13.509 14.157 14.817 15.536 16.262 16.939 17.241 17.182 16.927 16.59 16.245 15.95 15.66 15.391 15.096 14.809 14.547 14.273 14.006 13.748 13.504 13.248 13.012 12.807 12.6 12.381 12.185 11.985 11.773 11.595 11.409 11.217 11.018 10.805 10.646 10.472 10.205 10.023 9.826 9.72 9.487 9.244 8.995 8.866 8.645 8.427 8.276 8.114 7.759 7.538 7.287 6.997 6.67 6.269 5.705 4.215 -6 ,29884 ,KEBNE ,16721770,Sat Nov 27 19:46:04 CET,Sat Nov 27 21:24:16 CET,0.0 1.587 2.008 2.358 2.666 2.93 3.161 3.372 3.741 3.903 4.065 4.273 4.497 4.628 4.87 5.099 5.317 5.421 5.625 5.825 6.108 6.279 6.447 6.702 6.943 7.17 7.384 7.592 7.859 8.11 8.356 8.652 8.921 9.161 9.436 9.745 10.036 10.356 10.689 11.048 11.419 11.817 12.276 12.716 13.227 13.779 14.403 15.073 15.762 16.496 17.216 17.539 17.491 17.294 17.051 16.766 16.46 16.123 15.817 15.51 15.231 14.982 14.727 14.478 14.247 14.034 13.796 13.575 13.374 13.151 12.924 12.734 12.525 12.308 12.138 11.949 11.757 11.563 11.37 11.23 11.074 10.834 10.666 10.487 10.391 10.185 9.974 9.748 9.623 9.409 9.226 9.076 8.919 8.573 8.365 8.125 7.866 7.57 7.185 6.684 4.861 -7 ,23451 ,KEBNE ,16721771,Sat Nov 27 19:46:04 CET,Sat Nov 27 21:23:41 CET,0.0 1.388 1.909 2.324 2.666 2.95 3.205 3.437 3.833 4.011 4.184 4.427 4.674 4.817 5.079 5.323 5.536 5.637 5.837 6.038 6.335 6.52 6.694 6.941 7.162 7.368 7.581 7.793 8.051 8.287 8.514 8.791 9.049 9.293 9.58 9.909 10.217 10.538 10.892 11.26 11.632 12.045 12.531 12.998 13.474 13.99 14.592 15.209 15.879 16.589 17.271 17.558 17.467 17.275 17.04 16.754 16.465 16.151 15.842 15.516 15.232 14.969 14.701 14.452 14.218 13.987 13.73 13.493 13.279 13.048 12.814 12.624 12.414 12.188 12.015 11.837 11.636 11.419 11.185 11.019 10.855 10.588 10.408 10.224 10.12 9.904 9.689 9.46 9.337 9.128 8.939 8.792 8.636 8.285 8.081 7.855 7.6 7.307 6.952 6.441 4.672 -8 ,6647 ,KEBNE ,16721772,Sat Nov 27 19:46:04 CET,Sat Nov 27 21:24:59 CET,0.0 1.412 1.868 2.204 2.491 2.733 2.943 3.143 3.502 3.664 3.821 4.024 4.245 4.375 4.625 4.852 5.068 5.17 5.363 5.535 5.789 5.958 6.114 6.337 6.554 6.769 6.972 7.153 7.39 7.619 7.84 8.106 8.361 8.601 8.863 9.171 9.468 9.766 10.082 10.427 10.784 11.168 11.603 12.044 12.543 13.094 13.716 14.368 15.051 15.792 16.558 16.865 16.816 16.615 16.346 16.032 15.701 15.371 15.091 14.796 14.5 14.208 13.929 13.66 13.373 13.098 12.822 12.589 12.392 12.164 11.929 11.733 11.504 11.247 11.061 10.88 10.679 10.459 10.214 10.045 9.88 9.624 9.428 9.222 9.122 8.9 8.67 8.419 8.276 8.05 7.853 7.698 7.526 7.138 6.929 6.704 6.451 6.163 5.801 5.283 3.488 -9 ,10912 ,KEBNE ,16721773,Sat Nov 27 19:46:04 CET,Sat Nov 27 21:25:21 CET,0.0 1.272 1.778 2.159 2.49 2.787 3.043 3.259 3.625 3.793 3.95 4.162 4.393 4.534 4.794 5.023 5.247 5.367 5.594 5.799 6.089 6.27 6.438 6.684 6.919 7.147 7.369 7.576 7.844 8.103 8.345 8.62 8.875 9.123 9.416 9.746 10.055 10.374 10.725 11.094 11.449 11.853 12.317 12.767 13.296 13.863 14.467 15.129 15.824 16.544 17.28 17.643 17.637 17.474 17.239 16.968 16.686 16.375 16.073 15.733 15.419 15.121 14.837 14.58 14.327 14.084 13.806 13.558 13.33 13.07 12.797 12.584 12.36 12.124 11.95 11.762 11.554 11.339 11.118 10.967 10.812 10.552 10.361 10.151 10.04 9.816 9.583 9.344 9.218 8.996 8.769 8.597 8.422 8.027 7.795 7.544 7.27 6.955 6.564 5.976 3.887 -10 ,13777 ,KEBNE ,16721774,Sat Nov 27 19:47:06 CET,Sat Nov 27 21:23:36 CET,0.0 1.154 1.595 1.931 2.214 2.456 2.675 2.879 3.243 3.408 3.57 3.784 4.026 4.167 4.43 4.668 4.886 4.988 5.188 5.373 5.639 5.808 5.966 6.193 6.414 6.626 6.836 7.032 7.266 7.496 7.708 7.97 8.228 8.469 8.746 9.045 9.328 9.652 10.001 10.343 10.703 11.129 11.599 12.058 12.606 13.178 13.774 14.425 15.12 15.825 16.526 16.912 16.931 16.74 16.452 16.128 15.806 15.468 15.16 14.855 14.577 14.312 14.044 13.783 13.535 13.292 13.036 12.799 12.587 12.374 12.147 11.951 11.725 11.494 11.327 11.143 10.938 10.72 10.485 10.315 10.152 9.896 9.701 9.499 9.396 9.168 8.934 8.697 8.569 8.346 8.129 7.97 7.806 7.445 7.244 7.029 6.789 6.496 6.137 5.66 4.242 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_57_35.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_57_35.txt deleted file mode 100644 index f3200e90..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_57_35.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,3686 ,KEBNE ,16721776,Sat Nov 27 19:47:07 CET,Sat Nov 27 21:23:24 CET,0.0 1.209 1.624 1.932 2.191 2.42 2.622 2.815 3.166 3.317 3.46 3.635 3.84 3.958 4.177 4.388 4.593 4.693 4.881 5.053 5.291 5.434 5.574 5.786 5.975 6.147 6.317 6.478 6.679 6.884 7.079 7.287 7.477 7.662 7.862 8.07 8.271 8.501 8.738 8.968 9.199 9.44 9.725 10.009 10.314 10.601 10.885 11.153 11.305 11.253 10.835 10.009 9.159 8.326 7.594 6.947 6.339 5.77 5.268 4.731 4.272 3.874 3.462 3.047 2.664 2.331 1.981 1.666 1.396 1.108 0.804 0.551 0.294 0.013 -0.215 -0.446 -0.698 -0.979 -1.262 -1.45 -1.653 -1.98 -2.199 -2.42 -2.533 -2.771 -3.045 -3.345 -3.496 -3.73 -3.964 -4.14 -4.327 -4.746 -4.987 -5.253 -5.545 -5.893 -6.344 -6.932 -8.407 -3 ,15128 ,KEBNE ,16721777,Sat Nov 27 19:47:07 CET,Sat Nov 27 21:23:25 CET,0.0 0.863 1.219 1.486 1.707 1.909 2.099 2.273 2.575 2.709 2.833 2.977 3.167 3.275 3.481 3.67 3.843 3.919 4.07 4.22 4.419 4.547 4.675 4.851 5.019 5.179 5.325 5.468 5.669 5.862 6.04 6.263 6.461 6.626 6.815 7.051 7.275 7.499 7.733 7.962 8.188 8.438 8.719 8.977 9.256 9.539 9.813 10.05 10.217 10.217 9.869 9.108 8.307 7.563 6.894 6.276 5.69 5.138 4.644 4.143 3.718 3.338 2.965 2.593 2.249 1.946 1.624 1.316 1.053 0.796 0.528 0.285 0.025 -0.243 -0.463 -0.685 -0.912 -1.163 -1.431 -1.612 -1.796 -2.088 -2.297 -2.524 -2.635 -2.852 -3.078 -3.326 -3.47 -3.695 -3.894 -4.062 -4.245 -4.644 -4.852 -5.083 -5.341 -5.635 -5.991 -6.446 -7.581 -4 ,19940 ,KEBNE ,16721778,Sat Nov 27 19:47:06 CET,Sat Nov 27 21:23:27 CET,0.0 0.99 1.402 1.727 2.007 2.251 2.469 2.669 3.024 3.18 3.33 3.533 3.74 3.857 4.091 4.303 4.496 4.588 4.762 4.933 5.172 5.314 5.452 5.664 5.862 6.044 6.215 6.37 6.574 6.779 6.969 7.181 7.384 7.582 7.804 8.03 8.235 8.449 8.668 8.89 9.119 9.374 9.636 9.883 10.157 10.425 10.68 10.91 11.055 11.03 10.674 9.908 9.05 8.204 7.431 6.744 6.133 5.566 5.067 4.536 4.062 3.64 3.236 2.865 2.521 2.166 1.765 1.425 1.151 0.873 0.563 0.29 0.016 -0.272 -0.511 -0.774 -1.046 -1.305 -1.566 -1.764 -1.981 -2.305 -2.523 -2.753 -2.872 -3.125 -3.391 -3.68 -3.838 -4.09 -4.35 -4.531 -4.724 -5.137 -5.367 -5.626 -5.924 -6.261 -6.666 -7.244 -8.598 -5 ,30456 ,KEBNE ,16721779,Sat Nov 27 19:47:06 CET,Sat Nov 27 21:23:43 CET,0.0 1.252 1.661 1.993 2.261 2.496 2.713 2.909 3.248 3.404 3.551 3.742 3.953 4.072 4.291 4.501 4.688 4.777 4.951 5.118 5.354 5.506 5.656 5.863 6.054 6.242 6.415 6.578 6.79 6.987 7.169 7.375 7.565 7.76 7.976 8.203 8.425 8.663 8.91 9.147 9.381 9.651 9.963 10.251 10.539 10.827 11.112 11.338 11.482 11.507 11.174 10.321 9.442 8.627 7.899 7.239 6.656 6.099 5.596 5.093 4.643 4.223 3.819 3.432 3.08 2.759 2.404 2.078 1.797 1.508 1.202 0.939 0.665 0.371 0.143 -0.089 -0.336 -0.59 -0.859 -1.047 -1.24 -1.545 -1.76 -1.992 -2.112 -2.358 -2.631 -2.921 -3.07 -3.316 -3.574 -3.76 -3.962 -4.4 -4.646 -4.91 -5.203 -5.566 -6.029 -6.658 -8.267 -6 ,9138 ,KEBNE ,16721780,Sat Nov 27 19:47:06 CET,Sat Nov 27 21:23:42 CET,0.0 1.098 1.549 1.861 2.118 2.366 2.583 2.77 3.134 3.297 3.445 3.64 3.844 3.962 4.179 4.381 4.585 4.683 4.867 5.041 5.278 5.428 5.568 5.761 5.947 6.13 6.307 6.467 6.662 6.854 7.044 7.265 7.463 7.642 7.841 8.077 8.318 8.573 8.833 9.096 9.379 9.688 9.999 10.277 10.569 10.858 11.155 11.43 11.615 11.634 11.28 10.474 9.616 8.862 8.157 7.471 6.887 6.348 5.861 5.345 4.898 4.503 4.117 3.748 3.386 3.036 2.671 2.347 2.058 1.751 1.428 1.159 0.885 0.604 0.388 0.151 -0.098 -0.356 -0.632 -0.813 -0.998 -1.294 -1.506 -1.738 -1.857 -2.104 -2.364 -2.641 -2.789 -3.031 -3.266 -3.44 -3.624 -4.033 -4.262 -4.522 -4.823 -5.175 -5.612 -6.168 -8.0 -7 ,28900 ,KEBNE ,16721781,Sat Nov 27 19:47:07 CET,Sat Nov 27 21:23:25 CET,0.0 1.327 1.808 2.18 2.487 2.74 2.952 3.141 3.471 3.617 3.763 3.959 4.167 4.289 4.507 4.708 4.897 4.989 5.165 5.33 5.568 5.717 5.86 6.06 6.248 6.422 6.588 6.753 6.95 7.131 7.309 7.527 7.742 7.945 8.181 8.431 8.645 8.88 9.139 9.412 9.684 9.973 10.286 10.594 10.923 11.227 11.543 11.807 11.953 11.926 11.494 10.67 9.822 9.003 8.253 7.554 6.908 6.318 5.815 5.294 4.823 4.391 3.984 3.594 3.22 2.887 2.542 2.227 1.958 1.677 1.374 1.118 0.857 0.582 0.363 0.129 -0.12 -0.381 -0.652 -0.83 -1.014 -1.32 -1.543 -1.777 -1.892 -2.14 -2.412 -2.685 -2.829 -3.066 -3.293 -3.468 -3.664 -4.075 -4.302 -4.577 -4.888 -5.231 -5.65 -6.26 -7.784 -8 ,13748 ,KEBNE ,16721782,Sat Nov 27 19:48:09 CET,Sat Nov 27 21:24:37 CET,0.0 1.194 1.662 2.019 2.311 2.575 2.813 3.021 3.38 3.542 3.697 3.897 4.109 4.242 4.5 4.746 4.968 5.069 5.265 5.457 5.72 5.89 6.053 6.269 6.472 6.671 6.86 7.034 7.252 7.457 7.644 7.867 8.083 8.288 8.524 8.766 8.992 9.258 9.534 9.797 10.055 10.347 10.672 10.964 11.266 11.563 11.854 12.102 12.283 12.292 11.922 11.152 10.323 9.509 8.772 8.083 7.45 6.857 6.348 5.843 5.388 4.976 4.573 4.185 3.827 3.501 3.149 2.809 2.508 2.211 1.903 1.63 1.344 1.062 0.848 0.62 0.385 0.142 -0.116 -0.294 -0.489 -0.8 -1.01 -1.232 -1.346 -1.599 -1.881 -2.192 -2.352 -2.595 -2.853 -3.033 -3.219 -3.629 -3.877 -4.15 -4.442 -4.758 -5.12 -5.619 -6.999 -9 ,7093 ,KEBNE ,16721783,Sat Nov 27 19:48:09 CET,Sat Nov 27 21:28:02 CET,0.0 1.294 1.76 2.108 2.401 2.654 2.884 3.082 3.423 3.583 3.744 3.961 4.176 4.309 4.564 4.782 4.974 5.066 5.246 5.424 5.669 5.824 5.971 6.171 6.368 6.566 6.759 6.942 7.161 7.36 7.548 7.775 7.992 8.185 8.394 8.634 8.861 9.1 9.347 9.605 9.898 10.203 10.497 10.796 11.114 11.388 11.641 11.907 12.151 12.204 11.803 10.912 10.073 9.277 8.481 7.756 7.158 6.598 6.09 5.557 5.102 4.717 4.34 3.963 3.605 3.275 2.914 2.588 2.316 2.026 1.712 1.445 1.181 0.914 0.709 0.493 0.252 0.007 -0.252 -0.44 -0.633 -0.934 -1.158 -1.401 -1.523 -1.767 -2.018 -2.287 -2.436 -2.681 -2.942 -3.128 -3.326 -3.772 -4.011 -4.27 -4.574 -4.93 -5.324 -5.839 -7.024 -10 ,19700 ,KEBNE ,16721784,Sat Nov 27 19:48:09 CET,Sat Nov 27 21:24:19 CET,0.0 1.041 1.478 1.825 2.1 2.339 2.557 2.751 3.093 3.257 3.41 3.59 3.797 3.924 4.152 4.363 4.556 4.644 4.823 4.989 5.207 5.351 5.493 5.689 5.875 6.053 6.223 6.388 6.599 6.794 6.983 7.205 7.404 7.599 7.826 8.078 8.308 8.553 8.812 9.076 9.329 9.592 9.902 10.2 10.495 10.775 11.06 11.334 11.553 11.623 11.273 10.449 9.651 8.863 8.126 7.412 6.752 6.166 5.645 5.109 4.634 4.23 3.843 3.455 3.079 2.737 2.387 2.079 1.815 1.525 1.22 0.96 0.685 0.413 0.202 -0.022 -0.258 -0.513 -0.781 -0.965 -1.16 -1.473 -1.687 -1.908 -2.026 -2.277 -2.552 -2.844 -2.992 -3.234 -3.474 -3.643 -3.828 -4.248 -4.481 -4.727 -5.02 -5.359 -5.758 -6.31 -8.075 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_58.txt deleted file mode 100644 index 3d97e510..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_58.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10099 ,KEBNE ,16721785,Sat Nov 27 19:48:09 CET,Sat Nov 27 21:23:41 CET,0.0 1.2 1.682 2.063 2.354 2.611 2.858 3.077 3.471 3.651 3.81 4.019 4.226 4.36 4.601 4.821 5.029 5.132 5.329 5.516 5.772 5.934 6.093 6.307 6.497 6.672 6.847 7.024 7.235 7.426 7.607 7.805 7.994 8.194 8.41 8.615 8.814 9.042 9.267 9.482 9.684 9.918 10.192 10.401 10.589 10.758 10.863 10.877 10.737 10.329 9.382 8.033 6.834 5.75 4.788 3.89 3.108 2.416 1.786 1.159 0.631 0.155 -0.311 -0.756 -1.169 -1.553 -1.957 -2.321 -2.632 -2.958 -3.301 -3.593 -3.892 -4.195 -4.446 -4.695 -4.945 -5.217 -5.512 -5.723 -5.937 -6.259 -6.485 -6.733 -6.866 -7.136 -7.42 -7.727 -7.892 -8.145 -8.421 -8.611 -8.807 -9.247 -9.499 -9.784 -10.133 -10.513 -10.91 -11.409 -12.56 -2 ,9123 ,KEBNE ,16721786,Sat Nov 27 19:48:09 CET,Sat Nov 27 21:24:38 CET,0.0 1.374 1.87 2.264 2.567 2.828 3.072 3.301 3.693 3.869 4.043 4.284 4.495 4.627 4.893 5.136 5.355 5.465 5.663 5.85 6.117 6.278 6.423 6.643 6.858 7.044 7.208 7.373 7.587 7.782 7.963 8.186 8.389 8.568 8.771 8.984 9.177 9.392 9.608 9.809 10.013 10.239 10.478 10.675 10.861 11.015 11.127 11.169 11.048 10.631 9.71 8.394 7.221 6.165 5.211 4.324 3.542 2.85 2.233 1.595 1.055 0.578 0.121 -0.296 -0.699 -1.085 -1.478 -1.823 -2.127 -2.451 -2.795 -3.083 -3.38 -3.684 -3.91 -4.151 -4.412 -4.691 -5.0 -5.207 -5.42 -5.761 -5.997 -6.243 -6.367 -6.631 -6.912 -7.216 -7.374 -7.618 -7.908 -8.108 -8.314 -8.762 -9.009 -9.284 -9.592 -9.94 -10.35 -10.883 -12.238 -3 ,10669 ,KEBNE ,16721787,Sat Nov 27 19:48:09 CET,Sat Nov 27 21:24:42 CET,0.0 1.349 1.861 2.241 2.562 2.849 3.104 3.334 3.727 3.906 4.064 4.267 4.465 4.595 4.841 5.06 5.272 5.373 5.556 5.734 5.99 6.14 6.276 6.483 6.676 6.85 7.013 7.165 7.359 7.546 7.72 7.929 8.123 8.309 8.533 8.762 8.956 9.158 9.35 9.52 9.703 9.897 10.103 10.303 10.487 10.638 10.741 10.753 10.596 10.16 9.202 7.832 6.609 5.519 4.555 3.681 2.914 2.241 1.656 1.055 0.533 0.062 -0.386 -0.799 -1.185 -1.544 -1.922 -2.261 -2.557 -2.866 -3.193 -3.469 -3.754 -4.049 -4.277 -4.513 -4.759 -5.002 -5.261 -5.441 -5.623 -5.92 -6.138 -6.37 -6.485 -6.717 -6.97 -7.241 -7.386 -7.624 -7.867 -8.038 -8.216 -8.616 -8.839 -9.08 -9.353 -9.679 -10.072 -10.601 -11.892 -4 ,20541 ,KEBNE ,16721788,Sat Nov 27 19:48:09 CET,Sat Nov 27 21:23:54 CET,0.0 1.396 1.897 2.258 2.594 2.874 3.109 3.331 3.716 3.879 4.033 4.243 4.439 4.565 4.807 5.022 5.228 5.326 5.505 5.685 5.943 6.101 6.261 6.484 6.692 6.881 7.052 7.213 7.407 7.587 7.761 7.975 8.171 8.359 8.57 8.781 8.985 9.209 9.414 9.612 9.817 10.025 10.262 10.479 10.668 10.836 10.959 10.987 10.885 10.523 9.588 8.256 7.051 5.936 4.942 4.079 3.32 2.599 1.977 1.355 0.807 0.312 -0.161 -0.604 -1.01 -1.381 -1.784 -2.15 -2.455 -2.767 -3.114 -3.419 -3.723 -4.037 -4.287 -4.544 -4.812 -5.09 -5.383 -5.591 -5.803 -6.135 -6.366 -6.601 -6.729 -7.003 -7.298 -7.609 -7.77 -8.022 -8.296 -8.487 -8.689 -9.159 -9.427 -9.702 -9.999 -10.331 -10.745 -11.326 -12.514 -5 ,24740 ,KEBNE ,16721789,Sat Nov 27 19:48:10 CET,Sat Nov 27 21:24:06 CET,0.0 1.252 1.742 2.102 2.408 2.712 2.966 3.184 3.568 3.728 3.882 4.105 4.309 4.437 4.684 4.909 5.112 5.209 5.404 5.6 5.862 6.02 6.175 6.386 6.573 6.746 6.917 7.082 7.279 7.478 7.679 7.908 8.122 8.318 8.524 8.741 8.937 9.134 9.347 9.57 9.783 10.01 10.239 10.43 10.621 10.785 10.908 10.943 10.868 10.581 9.713 8.409 7.249 6.195 5.207 4.282 3.474 2.745 2.124 1.506 0.984 0.515 0.044 -0.397 -0.795 -1.165 -1.571 -1.94 -2.257 -2.569 -2.893 -3.168 -3.457 -3.769 -4.012 -4.264 -4.541 -4.843 -5.153 -5.37 -5.594 -5.938 -6.177 -6.427 -6.555 -6.83 -7.129 -7.436 -7.6 -7.86 -8.145 -8.344 -8.552 -9.009 -9.26 -9.54 -9.848 -10.193 -10.622 -11.172 -12.754 -6 ,9200 ,KEBNE ,16721790,Sat Nov 27 19:49:11 CET,Sat Nov 27 21:24:39 CET,0.0 1.293 1.833 2.214 2.556 2.855 3.092 3.293 3.662 3.835 3.996 4.224 4.434 4.566 4.812 5.044 5.265 5.37 5.559 5.742 5.998 6.156 6.311 6.528 6.731 6.926 7.1 7.267 7.477 7.672 7.858 8.062 8.262 8.447 8.646 8.861 9.065 9.284 9.491 9.691 9.899 10.122 10.341 10.535 10.726 10.864 10.974 11.024 10.9 10.511 9.581 8.231 7.018 5.921 4.933 4.05 3.283 2.586 1.985 1.392 0.873 0.391 -0.071 -0.499 -0.91 -1.29 -1.678 -2.025 -2.33 -2.641 -2.961 -3.243 -3.55 -3.856 -4.094 -4.35 -4.623 -4.912 -5.208 -5.416 -5.634 -5.978 -6.224 -6.48 -6.613 -6.886 -7.172 -7.481 -7.647 -7.905 -8.191 -8.385 -8.593 -9.045 -9.297 -9.563 -9.852 -10.212 -10.659 -11.239 -12.544 -7 ,23319 ,KEBNE ,16721791,Sat Nov 27 19:49:11 CET,Sat Nov 27 21:24:55 CET,0.0 1.125 1.591 1.929 2.227 2.482 2.693 2.888 3.25 3.414 3.562 3.754 3.946 4.066 4.289 4.487 4.674 4.766 4.943 5.103 5.325 5.47 5.607 5.801 5.992 6.165 6.33 6.503 6.72 6.911 7.101 7.326 7.528 7.72 7.923 8.129 8.325 8.536 8.734 8.928 9.127 9.348 9.604 9.828 10.048 10.234 10.362 10.409 10.312 9.987 9.143 7.822 6.567 5.476 4.511 3.602 2.799 2.081 1.473 0.855 0.315 -0.163 -0.625 -1.064 -1.464 -1.828 -2.207 -2.551 -2.858 -3.175 -3.511 -3.804 -4.118 -4.465 -4.727 -4.976 -5.232 -5.505 -5.801 -6.004 -6.215 -6.553 -6.793 -7.045 -7.17 -7.435 -7.725 -8.037 -8.194 -8.436 -8.717 -8.905 -9.098 -9.532 -9.768 -10.028 -10.321 -10.647 -11.046 -11.606 -13.081 -8 ,17472 ,KEBNE ,16721792,Sat Nov 27 19:49:12 CET,Sat Nov 27 21:25:04 CET,0.0 1.162 1.669 2.038 2.359 2.619 2.843 3.068 3.497 3.683 3.839 4.054 4.272 4.414 4.675 4.906 5.118 5.225 5.431 5.606 5.846 6.007 6.159 6.362 6.562 6.758 6.942 7.111 7.322 7.527 7.703 7.903 8.104 8.298 8.499 8.7 8.893 9.097 9.307 9.519 9.715 9.928 10.171 10.371 10.528 10.649 10.748 10.783 10.667 10.326 9.48 8.157 6.928 5.811 4.823 3.961 3.197 2.486 1.853 1.21 0.675 0.192 -0.276 -0.702 -1.1 -1.473 -1.867 -2.219 -2.533 -2.869 -3.199 -3.469 -3.77 -4.092 -4.342 -4.597 -4.86 -5.136 -5.425 -5.628 -5.831 -6.139 -6.357 -6.594 -6.718 -6.969 -7.237 -7.523 -7.673 -7.914 -8.179 -8.371 -8.565 -8.985 -9.216 -9.464 -9.747 -10.072 -10.446 -10.896 -12.349 -9 ,8347 ,KEBNE ,16721793,Sat Nov 27 19:49:12 CET,Sat Nov 27 21:24:52 CET,0.0 1.278 1.824 2.228 2.531 2.799 3.041 3.261 3.671 3.852 4.018 4.256 4.464 4.586 4.83 5.066 5.279 5.385 5.584 5.757 6.027 6.2 6.357 6.578 6.771 6.955 7.124 7.291 7.514 7.715 7.909 8.126 8.332 8.533 8.747 8.972 9.171 9.379 9.58 9.761 9.954 10.165 10.377 10.564 10.747 10.898 10.979 10.972 10.844 10.442 9.47 8.049 6.8 5.718 4.774 3.891 3.12 2.422 1.8 1.181 0.647 0.153 -0.32 -0.76 -1.171 -1.552 -1.957 -2.304 -2.6 -2.921 -3.263 -3.552 -3.865 -4.184 -4.418 -4.664 -4.924 -5.198 -5.487 -5.693 -5.915 -6.256 -6.492 -6.737 -6.867 -7.143 -7.425 -7.727 -7.888 -8.134 -8.409 -8.603 -8.801 -9.224 -9.473 -9.752 -10.072 -10.449 -10.901 -11.441 -12.807 -10 ,10210 ,KEBNE ,16721794,Sat Nov 27 19:49:12 CET,Sat Nov 27 21:24:59 CET,0.0 1.153 1.632 1.988 2.285 2.565 2.806 3.004 3.367 3.536 3.694 3.91 4.115 4.246 4.498 4.737 4.957 5.057 5.242 5.425 5.68 5.832 5.979 6.186 6.375 6.553 6.719 6.877 7.08 7.266 7.445 7.648 7.836 8.026 8.246 8.471 8.664 8.867 9.073 9.286 9.487 9.689 9.906 10.099 10.305 10.481 10.598 10.649 10.548 10.187 9.299 7.965 6.76 5.687 4.759 3.911 3.128 2.42 1.831 1.223 0.68 0.2 -0.263 -0.697 -1.091 -1.455 -1.843 -2.193 -2.494 -2.801 -3.127 -3.405 -3.691 -3.981 -4.205 -4.441 -4.688 -4.947 -5.225 -5.422 -5.624 -5.958 -6.204 -6.455 -6.584 -6.852 -7.127 -7.418 -7.571 -7.817 -8.076 -8.254 -8.449 -8.875 -9.114 -9.36 -9.634 -9.969 -10.386 -10.882 -12.02 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_62.txt deleted file mode 100644 index 82ff31a0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_59_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20312 ,KEBNE ,16721795,Sat Nov 27 19:49:12 CET,Sat Nov 27 21:23:57 CET,0.0 1.246 1.738 2.107 2.422 2.694 2.93 3.133 3.494 3.663 3.827 4.055 4.262 4.395 4.645 4.886 5.107 5.213 5.426 5.623 5.891 6.053 6.203 6.408 6.608 6.807 6.995 7.178 7.412 7.635 7.838 8.079 8.311 8.525 8.773 9.04 9.278 9.528 9.789 10.057 10.341 10.65 10.974 11.261 11.585 11.895 12.158 12.392 12.589 12.628 12.289 11.534 10.722 9.926 9.196 8.493 7.84 7.24 6.712 6.168 5.684 5.246 4.812 4.404 4.023 3.678 3.325 2.991 2.699 2.394 2.067 1.8 1.515 1.205 0.964 0.71 0.435 0.153 -0.122 -0.32 -0.54 -0.869 -1.1 -1.349 -1.477 -1.756 -2.058 -2.378 -2.541 -2.794 -3.112 -3.321 -3.54 -4.037 -4.316 -4.603 -4.898 -5.268 -5.775 -6.419 -7.933 -2 ,11285 ,KEBNE ,16721796,Sat Nov 27 19:49:12 CET,Sat Nov 27 21:25:22 CET,0.0 1.254 1.769 2.148 2.45 2.71 2.952 3.183 3.57 3.744 3.913 4.144 4.359 4.5 4.755 4.983 5.199 5.3 5.492 5.679 5.947 6.114 6.274 6.498 6.708 6.903 7.087 7.263 7.492 7.713 7.909 8.137 8.361 8.562 8.783 9.034 9.279 9.523 9.761 10.007 10.279 10.594 10.932 11.238 11.547 11.841 12.142 12.403 12.61 12.68 12.367 11.573 10.728 9.92 9.177 8.473 7.837 7.252 6.725 6.179 5.701 5.275 4.867 4.462 4.059 3.705 3.342 3.0 2.697 2.38 2.043 1.767 1.488 1.19 0.942 0.697 0.454 0.178 -0.127 -0.331 -0.531 -0.865 -1.107 -1.353 -1.478 -1.75 -2.043 -2.355 -2.523 -2.778 -3.088 -3.301 -3.533 -4.02 -4.304 -4.634 -4.989 -5.376 -5.827 -6.415 -7.923 -3 ,27354 ,KEBNE ,16721797,Sat Nov 27 19:50:15 CET,Sat Nov 27 21:25:56 CET,0.0 1.084 1.584 1.997 2.325 2.596 2.829 3.041 3.427 3.608 3.782 4.032 4.256 4.388 4.622 4.85 5.072 5.178 5.385 5.573 5.828 5.994 6.153 6.385 6.605 6.809 7.004 7.189 7.426 7.64 7.828 8.049 8.272 8.474 8.697 8.949 9.18 9.425 9.676 9.942 10.226 10.523 10.831 11.126 11.475 11.818 12.121 12.435 12.716 12.811 12.541 11.819 11.028 10.261 9.507 8.838 8.248 7.671 7.147 6.601 6.121 5.689 5.257 4.855 4.474 4.123 3.751 3.412 3.133 2.82 2.483 2.214 1.938 1.645 1.396 1.145 0.902 0.637 0.334 0.121 -0.084 -0.397 -0.627 -0.884 -1.018 -1.303 -1.618 -1.945 -2.103 -2.354 -2.672 -2.876 -3.085 -3.548 -3.817 -4.113 -4.426 -4.794 -5.245 -5.834 -7.479 -4 ,22846 ,KEBNE ,16721798,Sat Nov 27 19:50:14 CET,Sat Nov 27 21:26:12 CET,0.0 1.31 1.82 2.2 2.523 2.804 3.048 3.285 3.705 3.883 4.052 4.283 4.496 4.646 4.911 5.147 5.371 5.477 5.683 5.874 6.126 6.288 6.444 6.653 6.857 7.062 7.259 7.443 7.679 7.909 8.13 8.377 8.603 8.825 9.06 9.314 9.567 9.82 10.081 10.369 10.674 10.978 11.285 11.564 11.871 12.199 12.524 12.788 12.971 13.013 12.663 11.895 11.075 10.261 9.518 8.84 8.202 7.588 7.051 6.502 6.016 5.596 5.193 4.782 4.396 4.041 3.666 3.337 3.037 2.717 2.389 2.111 1.831 1.533 1.292 1.037 0.763 0.481 0.175 -0.036 -0.24 -0.573 -0.816 -1.062 -1.193 -1.469 -1.766 -2.083 -2.248 -2.493 -2.79 -2.998 -3.215 -3.696 -3.962 -4.261 -4.592 -4.948 -5.406 -6.042 -7.541 -5 ,22396 ,KEBNE ,16721799,Sat Nov 27 19:50:15 CET,Sat Nov 27 21:25:41 CET,0.0 1.378 1.898 2.286 2.632 2.909 3.131 3.348 3.739 3.904 4.061 4.286 4.503 4.636 4.885 5.12 5.35 5.459 5.668 5.875 6.148 6.316 6.475 6.695 6.9 7.098 7.282 7.455 7.68 7.894 8.095 8.33 8.555 8.776 9.018 9.27 9.495 9.74 10.025 10.299 10.556 10.845 11.176 11.497 11.83 12.15 12.468 12.745 12.934 12.942 12.627 11.946 11.173 10.403 9.662 8.936 8.3 7.72 7.185 6.636 6.169 5.75 5.344 4.945 4.578 4.244 3.878 3.555 3.27 2.966 2.651 2.382 2.098 1.795 1.568 1.341 1.09 0.806 0.496 0.287 0.08 -0.248 -0.489 -0.748 -0.885 -1.171 -1.477 -1.839 -2.029 -2.28 -2.571 -2.781 -2.994 -3.47 -3.752 -4.069 -4.408 -4.797 -5.275 -5.882 -7.613 -6 ,26521 ,KEBNE ,16721800,Sat Nov 27 19:51:17 CET,Sat Nov 27 21:27:19 CET,0.0 1.444 1.981 2.37 2.683 2.976 3.231 3.457 3.853 4.03 4.201 4.451 4.668 4.803 5.057 5.291 5.518 5.63 5.838 6.033 6.308 6.477 6.639 6.868 7.086 7.279 7.452 7.621 7.842 8.06 8.274 8.513 8.738 8.955 9.206 9.488 9.735 9.978 10.235 10.506 10.774 11.056 11.379 11.684 11.98 12.26 12.545 12.82 13.063 13.157 12.817 12.058 11.29 10.509 9.758 9.074 8.462 7.875 7.351 6.815 6.348 5.917 5.502 5.109 4.739 4.397 4.023 3.678 3.356 3.019 2.675 2.388 2.093 1.787 1.554 1.314 1.058 0.778 0.487 0.286 0.082 -0.246 -0.496 -0.761 -0.897 -1.174 -1.47 -1.796 -1.966 -2.211 -2.505 -2.708 -2.917 -3.382 -3.644 -3.941 -4.277 -4.658 -5.097 -5.649 -7.876 -7 ,3365 ,KEBNE ,16721801,Sat Nov 27 19:52:19 CET,Sat Nov 27 21:28:37 CET,0.0 1.23 1.704 2.047 2.344 2.611 2.853 3.068 3.461 3.646 3.812 4.046 4.257 4.387 4.627 4.857 5.07 5.175 5.381 5.568 5.837 6.008 6.165 6.386 6.602 6.818 7.02 7.211 7.455 7.681 7.886 8.119 8.343 8.558 8.808 9.081 9.333 9.584 9.833 10.082 10.345 10.635 10.964 11.304 11.655 11.99 12.304 12.53 12.683 12.689 12.354 11.553 10.682 9.875 9.14 8.443 7.816 7.229 6.701 6.164 5.71 5.311 4.906 4.507 4.136 3.788 3.405 3.063 2.764 2.435 2.094 1.804 1.491 1.158 0.891 0.622 0.358 0.077 -0.225 -0.437 -0.653 -0.991 -1.241 -1.513 -1.653 -1.948 -2.258 -2.578 -2.742 -2.991 -3.293 -3.502 -3.724 -4.22 -4.497 -4.827 -5.2 -5.622 -6.105 -6.716 -9.01 -8 ,32381 ,KEBNE ,16721802,Sat Nov 27 19:53:22 CET,Sat Nov 27 21:33:11 CET,0.0 1.387 1.858 2.186 2.485 2.754 3.0 3.233 3.645 3.833 3.996 4.216 4.428 4.559 4.813 5.051 5.265 5.365 5.551 5.729 5.983 6.155 6.325 6.557 6.777 6.99 7.19 7.376 7.608 7.819 8.017 8.24 8.446 8.639 8.856 9.113 9.36 9.623 9.887 10.154 10.425 10.728 11.06 11.357 11.694 12.018 12.298 12.524 12.711 12.765 12.447 11.709 10.879 10.048 9.309 8.65 8.054 7.498 6.986 6.454 5.997 5.584 5.179 4.781 4.399 4.046 3.686 3.36 3.07 2.764 2.445 2.175 1.892 1.599 1.36 1.101 0.833 0.555 0.267 0.071 -0.131 -0.46 -0.688 -0.927 -1.06 -1.349 -1.659 -1.971 -2.134 -2.375 -2.668 -2.873 -3.097 -3.585 -3.861 -4.169 -4.518 -4.891 -5.312 -5.909 -7.677 -9 ,9200 ,KEBNE ,16721803,Sat Nov 27 19:53:22 CET,Sat Nov 27 21:29:08 CET,0.0 1.084 1.556 1.923 2.237 2.523 2.78 3.011 3.429 3.609 3.778 4.031 4.244 4.377 4.636 4.876 5.103 5.214 5.418 5.614 5.908 6.078 6.231 6.465 6.681 6.879 7.078 7.27 7.511 7.732 7.939 8.178 8.408 8.634 8.877 9.134 9.376 9.639 9.906 10.187 10.483 10.789 11.115 11.403 11.711 11.989 12.261 12.528 12.689 12.699 12.377 11.621 10.783 9.963 9.212 8.513 7.887 7.301 6.768 6.198 5.709 5.28 4.857 4.453 4.067 3.711 3.335 3.002 2.714 2.398 2.052 1.774 1.493 1.184 0.94 0.687 0.424 0.141 -0.166 -0.379 -0.591 -0.908 -1.134 -1.391 -1.527 -1.798 -2.086 -2.4 -2.565 -2.807 -3.098 -3.297 -3.508 -3.964 -4.217 -4.497 -4.817 -5.204 -5.655 -6.218 -7.899 -10 ,7837 ,KEBNE ,16721804,Sat Nov 27 19:53:22 CET,Sat Nov 27 21:28:51 CET,0.0 1.558 2.075 2.451 2.76 3.04 3.295 3.532 3.959 4.155 4.34 4.599 4.831 4.98 5.241 5.496 5.735 5.848 6.061 6.262 6.552 6.721 6.871 7.083 7.302 7.518 7.707 7.887 8.13 8.36 8.561 8.79 9.003 9.205 9.444 9.704 9.944 10.205 10.489 10.78 11.055 11.353 11.679 11.993 12.313 12.632 12.974 13.249 13.422 13.446 13.124 12.291 11.387 10.537 9.756 9.04 8.399 7.779 7.215 6.645 6.161 5.724 5.284 4.871 4.494 4.138 3.77 3.44 3.131 2.798 2.463 2.183 1.884 1.582 1.35 1.098 0.833 0.558 0.269 0.064 -0.153 -0.494 -0.729 -0.983 -1.124 -1.402 -1.68 -1.987 -2.152 -2.397 -2.688 -2.893 -3.118 -3.603 -3.872 -4.173 -4.5 -4.866 -5.28 -5.808 -7.058 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_58.txt deleted file mode 100644 index 1306aa7b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_58.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7649 ,KEBNE ,16721805,Sat Nov 27 19:54:25 CET,Sat Nov 27 21:36:16 CET,0.0 2.682 3.336 3.821 4.245 4.633 4.939 5.196 5.641 5.828 6.01 6.28 6.519 6.681 7.022 7.342 7.626 7.771 8.062 8.325 8.709 8.958 9.203 9.517 9.766 10.001 10.227 10.442 10.718 10.975 11.208 11.482 11.747 12.0 12.293 12.608 12.904 13.229 13.582 13.95 14.299 14.692 15.152 15.579 16.047 16.552 17.073 17.58 18.109 18.596 18.938 18.916 18.608 18.167 17.698 17.206 16.72 16.289 15.888 15.457 15.072 14.709 14.358 14.016 13.699 13.384 13.04 12.734 12.438 12.116 11.787 11.464 11.079 10.684 10.38 10.073 9.763 9.409 9.029 8.773 8.508 8.079 7.786 7.49 7.329 6.984 6.618 6.208 5.997 5.717 5.372 5.14 4.886 4.342 4.043 3.672 3.221 2.755 2.169 1.288 -1.854 -2 ,27689 ,KEBNE ,16721806,Sat Nov 27 19:54:25 CET,Sat Nov 27 21:32:01 CET,0.0 1.827 2.418 2.892 3.308 3.657 3.988 4.283 4.772 5.002 5.223 5.549 5.826 6.007 6.329 6.637 6.928 7.07 7.352 7.613 7.989 8.242 8.485 8.793 9.077 9.347 9.613 9.903 10.226 10.487 10.734 11.022 11.31 11.577 11.862 12.211 12.546 12.868 13.194 13.537 13.886 14.264 14.705 15.147 15.647 16.225 16.953 17.659 18.261 18.879 19.194 18.774 18.041 17.453 17.033 16.596 16.135 15.692 15.291 14.854 14.466 14.105 13.744 13.387 13.046 12.728 12.397 12.09 11.804 11.459 11.043 10.708 10.411 10.118 9.88 9.612 9.337 9.078 8.796 8.592 8.359 7.954 7.651 7.321 7.175 6.881 6.527 6.136 5.927 5.633 5.284 5.048 4.781 4.21 3.897 3.529 3.112 2.596 1.967 1.112 -2.719 -3 ,3064 ,KEBNE ,16721807,Sat Nov 27 19:55:26 CET,Sat Nov 27 21:31:54 CET,0.0 1.931 2.645 3.164 3.589 3.94 4.234 4.51 5.025 5.261 5.486 5.791 6.037 6.188 6.51 6.808 7.05 7.167 7.395 7.606 7.909 8.095 8.271 8.525 8.775 9.029 9.299 9.564 9.86 10.109 10.362 10.672 10.962 11.278 11.682 12.109 12.45 12.782 13.139 13.496 13.857 14.244 14.665 15.085 15.561 16.047 16.573 17.09 17.617 18.155 18.503 18.384 18.041 17.611 17.115 16.59 16.111 15.651 15.222 14.745 14.315 13.966 13.617 13.244 12.88 12.546 12.193 11.874 11.617 11.347 11.029 10.739 10.437 10.124 9.879 9.614 9.341 9.056 8.746 8.523 8.286 7.899 7.629 7.356 7.216 6.922 6.596 6.243 6.047 5.771 5.448 5.217 4.968 4.39 4.064 3.702 3.301 2.834 2.276 1.532 -1.069 -4 ,1022 ,KEBNE ,16721808,Sat Nov 27 20:02:46 CET,Sat Nov 27 21:45:29 CET,0.0 2.456 3.145 3.671 4.086 4.439 4.761 5.056 5.545 5.77 5.998 6.347 6.628 6.796 7.078 7.351 7.616 7.748 8.004 8.23 8.532 8.726 8.921 9.196 9.443 9.684 9.913 10.129 10.406 10.662 10.9 11.183 11.436 11.677 11.969 12.295 12.607 12.929 13.262 13.62 13.979 14.37 14.803 15.211 15.676 16.163 16.693 17.246 17.772 18.251 18.64 18.578 18.213 17.797 17.368 16.891 16.434 16.02 15.623 15.19 14.795 14.437 14.109 13.785 13.469 13.176 12.779 12.413 12.156 11.878 11.562 11.3 11.028 10.735 10.501 10.255 9.997 9.719 9.414 9.202 8.977 8.593 8.332 8.062 7.917 7.595 7.215 6.814 6.613 6.321 5.919 5.669 5.409 4.852 4.539 4.19 3.779 3.277 2.664 1.761 -2.507 -5 ,22365 ,KEBNE ,16721809,Sat Nov 27 20:02:45 CET,Sat Nov 27 21:38:50 CET,0.0 1.923 2.485 2.939 3.34 3.703 4.028 4.314 4.783 4.988 5.173 5.435 5.682 5.831 6.09 6.344 6.583 6.694 6.912 7.116 7.4 7.583 7.752 7.982 8.199 8.405 8.6 8.79 9.044 9.29 9.518 9.785 10.043 10.281 10.563 10.874 11.163 11.495 11.838 12.168 12.513 12.908 13.36 13.795 14.252 14.726 15.244 15.76 16.299 16.8 17.155 17.209 16.974 16.618 16.204 15.781 15.369 14.955 14.578 14.172 13.803 13.47 13.133 12.803 12.484 12.192 11.886 11.586 11.32 11.044 10.749 10.501 10.251 9.987 9.769 9.54 9.285 9.005 8.697 8.461 8.234 7.91 7.661 7.386 7.248 6.935 6.585 6.22 6.022 5.739 5.367 5.124 4.872 4.307 3.999 3.652 3.24 2.78 2.172 1.277 -3.159 -6 ,30009 ,KEBNE ,16721810,Sat Nov 27 20:03:48 CET,Sat Nov 27 21:40:30 CET,0.0 1.829 2.428 2.896 3.27 3.61 3.915 4.165 4.581 4.768 4.954 5.227 5.472 5.642 5.974 6.296 6.606 6.744 6.979 7.188 7.491 7.682 7.857 8.109 8.352 8.579 8.793 8.993 9.242 9.473 9.697 9.962 10.22 10.461 10.722 11.004 11.272 11.581 11.906 12.239 12.571 12.924 13.346 13.763 14.212 14.706 15.248 15.752 16.26 16.794 17.189 17.149 16.876 16.507 16.076 15.621 15.172 14.753 14.363 13.946 13.581 13.252 12.906 12.562 12.257 11.977 11.683 11.422 11.168 10.834 10.417 10.097 9.811 9.516 9.291 9.058 8.812 8.53 8.204 7.997 7.802 7.476 7.238 6.991 6.867 6.605 6.31 5.993 5.814 5.551 5.261 5.039 4.778 4.197 3.863 3.511 3.119 2.647 2.049 1.175 -5.519 -7 ,5586 ,KEBNE ,16721811,Sat Nov 27 20:04:51 CET,Sat Nov 27 21:42:22 CET,0.0 2.254 2.815 3.282 3.662 4.0 4.282 4.529 5.037 5.287 5.521 5.871 6.154 6.345 6.701 7.02 7.33 7.483 7.77 8.042 8.431 8.675 8.912 9.254 9.586 9.901 10.19 10.461 10.785 11.05 11.287 11.57 11.83 12.089 12.385 12.701 13.006 13.332 13.67 14.023 14.375 14.748 15.173 15.586 16.045 16.544 17.113 17.67 18.205 18.743 19.144 19.155 18.83 18.386 17.942 17.479 17.037 16.621 16.239 15.829 15.447 15.082 14.723 14.384 14.049 13.696 13.272 12.924 12.665 12.376 12.025 11.696 11.399 11.118 10.88 10.64 10.386 10.102 9.798 9.572 9.34 9.012 8.777 8.506 8.359 8.054 7.741 7.396 7.205 6.917 6.515 6.252 5.991 5.406 5.057 4.677 4.278 3.77 3.1 2.166 -0.877 -8 ,29705 ,KEBNE ,16721812,Sat Nov 27 20:07:59 CET,Sat Nov 27 21:46:16 CET,0.0 1.905 2.59 3.148 3.589 3.956 4.291 4.583 5.083 5.314 5.539 5.887 6.163 6.358 6.712 7.016 7.312 7.461 7.711 7.928 8.235 8.428 8.622 8.902 9.172 9.421 9.642 9.858 10.143 10.405 10.645 10.919 11.173 11.413 11.681 11.978 12.265 12.577 12.901 13.234 13.591 13.987 14.433 14.855 15.3 15.78 16.301 16.87 17.487 18.044 18.45 18.412 18.087 17.666 17.248 16.839 16.43 15.995 15.581 15.121 14.699 14.333 13.985 13.658 13.345 13.021 12.67 12.347 12.074 11.795 11.488 11.223 10.934 10.619 10.341 10.032 9.743 9.472 9.176 8.962 8.74 8.397 8.154 7.889 7.747 7.446 7.128 6.806 6.639 6.364 6.034 5.806 5.536 4.935 4.603 4.243 3.826 3.311 2.695 1.877 -1.195 -9 ,1436 ,KEBNE ,16721813,Sat Nov 27 20:17:22 CET,Sat Nov 27 21:56:45 CET,0.0 2.009 2.703 3.209 3.639 4.012 4.351 4.631 5.07 5.288 5.503 5.779 6.02 6.179 6.469 6.738 6.977 7.09 7.319 7.54 7.849 8.037 8.209 8.468 8.715 8.952 9.183 9.396 9.659 9.909 10.143 10.403 10.655 10.902 11.179 11.489 11.779 12.085 12.424 12.771 13.121 13.509 13.953 14.406 14.915 15.411 15.915 16.428 16.939 17.431 17.788 17.779 17.55 17.161 16.715 16.247 15.773 15.329 14.918 14.475 14.096 13.726 13.356 13.011 12.69 12.398 12.069 11.758 11.482 11.195 10.896 10.639 10.37 10.087 9.856 9.61 9.342 9.055 8.733 8.487 8.251 7.923 7.667 7.365 7.225 6.936 6.607 6.24 6.045 5.773 5.444 5.219 4.978 4.383 4.026 3.663 3.268 2.793 2.205 1.342 -1.382 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_59.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_59.txt deleted file mode 100644 index bf120020..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_60_59.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,3880 ,KEBNE ,16721816,Sat Nov 27 20:22:35 CET,Sat Nov 27 22:06:47 CET,0.0 1.81 2.515 3.031 3.48 3.862 4.198 4.525 5.093 5.342 5.577 5.928 6.213 6.411 6.758 7.092 7.429 7.586 7.899 8.204 8.589 8.84 9.111 9.462 9.763 10.053 10.329 10.586 10.927 11.252 11.542 11.895 12.246 12.578 12.946 13.354 13.756 14.188 14.667 15.184 15.695 16.265 16.92 17.574 18.34 19.197 20.179 21.223 22.423 23.849 25.481 26.623 27.134 27.338 27.375 27.279 27.118 26.915 26.715 26.476 26.234 26.029 25.803 25.551 25.291 25.047 24.788 24.537 24.311 24.077 23.797 23.54 23.28 23.025 22.825 22.611 22.388 22.148 21.88 21.674 21.436 21.041 20.758 20.45 20.294 19.961 19.602 19.253 19.069 18.799 18.44 18.212 17.951 17.337 16.999 16.67 16.292 15.802 15.163 14.279 9.818 -3 ,8584 ,KEBNE ,16721817,Sat Nov 27 20:22:35 CET,Sat Nov 27 21:59:09 CET,0.0 2.375 3.035 3.548 3.997 4.38 4.722 5.028 5.582 5.839 6.072 6.44 6.739 6.954 7.369 7.755 8.106 8.258 8.554 8.852 9.279 9.546 9.785 10.132 10.492 10.844 11.183 11.515 11.899 12.217 12.525 12.94 13.378 13.824 14.291 14.725 15.14 15.59 16.064 16.575 17.114 17.695 18.354 19.042 19.831 20.675 21.617 22.686 23.931 25.343 26.934 27.976 28.403 28.546 28.509 28.405 28.275 28.084 27.881 27.635 27.369 27.113 26.836 26.551 26.276 26.001 25.698 25.438 25.211 24.947 24.664 24.434 24.193 23.942 23.749 23.548 23.329 23.067 22.779 22.587 22.378 22.006 21.709 21.4 21.252 20.963 20.656 20.314 20.136 19.867 19.535 19.306 19.026 18.406 18.059 17.674 17.269 16.795 16.195 15.477 13.014 -4 ,14990 ,KEBNE ,16721818,Sat Nov 27 20:23:40 CET,Sat Nov 27 21:54:05 CET,0.0 2.245 2.852 3.297 3.681 4.053 4.366 4.65 5.153 5.364 5.572 5.902 6.17 6.365 6.758 7.124 7.464 7.629 7.945 8.233 8.615 8.846 9.059 9.347 9.64 9.933 10.201 10.451 10.783 11.117 11.439 11.822 12.184 12.524 12.907 13.339 13.755 14.194 14.656 15.15 15.674 16.276 16.956 17.624 18.41 19.275 20.23 21.259 22.476 23.865 25.44 26.575 27.07 27.233 27.216 27.09 26.879 26.659 26.451 26.213 26.005 25.807 25.581 25.257 24.881 24.541 24.206 23.945 23.724 23.479 23.21 22.977 22.741 22.493 22.265 21.993 21.699 21.387 21.062 20.848 20.617 20.221 19.965 19.729 19.606 19.33 19.007 18.639 18.452 18.19 17.803 17.552 17.274 16.642 16.298 15.939 15.55 15.048 14.394 13.518 10.048 -5 ,24232 ,KEBNE ,16721819,Sat Nov 27 20:26:41 CET,Sat Nov 27 22:05:10 CET,0.0 2.243 2.936 3.449 3.87 4.191 4.468 4.737 5.2 5.407 5.614 5.926 6.2 6.397 6.783 7.139 7.453 7.591 7.853 8.112 8.466 8.685 8.9 9.216 9.533 9.833 10.107 10.37 10.701 11.01 11.312 11.679 12.022 12.357 12.732 13.14 13.548 14.009 14.493 14.997 15.507 16.064 16.723 17.377 18.104 18.903 19.843 20.895 22.076 23.426 24.972 26.089 26.615 26.819 26.825 26.73 26.564 26.345 26.13 25.892 25.66 25.424 25.164 24.895 24.654 24.42 24.136 23.889 23.665 23.408 23.163 22.951 22.707 22.447 22.242 22.025 21.748 21.414 21.104 20.923 20.72 20.387 20.174 19.909 19.75 19.417 19.076 18.715 18.529 18.292 17.995 17.795 17.553 16.99 16.664 16.299 15.895 15.406 14.75 13.927 10.715 -6 ,17350 ,KEBNE ,16721820,Sat Nov 27 20:26:41 CET,Sat Nov 27 22:04:54 CET,0.0 2.164 2.924 3.435 3.855 4.226 4.552 4.862 5.434 5.681 5.887 6.166 6.421 6.595 6.928 7.231 7.526 7.67 7.931 8.182 8.522 8.738 8.963 9.279 9.564 9.833 10.096 10.355 10.696 11.024 11.338 11.712 12.073 12.419 12.807 13.231 13.629 14.073 14.55 15.046 15.564 16.139 16.792 17.44 18.179 19.004 19.954 21.023 22.255 23.613 25.161 26.293 26.787 26.956 26.971 26.878 26.721 26.522 26.317 26.066 25.816 25.575 25.315 25.054 24.803 24.548 24.277 24.033 23.816 23.571 23.292 23.032 22.716 22.359 22.1 21.851 21.586 21.27 20.946 20.758 20.556 20.209 19.937 19.641 19.486 19.153 18.816 18.469 18.295 18.051 17.718 17.509 17.283 16.769 16.494 16.175 15.809 15.374 14.785 13.883 11.108 -7 ,32708 ,KEBNE ,16721821,Sat Nov 27 20:26:42 CET,Sat Nov 27 22:05:06 CET,0.0 2.832 3.487 4.016 4.48 4.885 5.233 5.533 6.038 6.274 6.501 6.811 7.074 7.244 7.573 7.887 8.187 8.326 8.598 8.886 9.315 9.596 9.874 10.248 10.6 10.928 11.216 11.479 11.819 12.149 12.449 12.777 13.103 13.444 13.828 14.259 14.674 15.103 15.581 16.109 16.634 17.21 17.884 18.519 19.234 20.035 20.95 21.999 23.201 24.548 26.084 27.211 27.683 27.848 27.874 27.797 27.615 27.404 27.201 26.965 26.731 26.495 26.261 26.023 25.784 25.546 25.257 24.928 24.613 24.275 23.898 23.595 23.289 22.956 22.726 22.498 22.227 21.924 21.584 21.345 21.132 20.806 20.529 20.221 20.06 19.717 19.342 18.967 18.794 18.541 18.174 17.939 17.711 17.165 16.839 16.486 16.087 15.614 15.022 14.257 10.203 -8 ,29898 ,KEBNE ,16721822,Sat Nov 27 20:26:41 CET,Sat Nov 27 22:05:02 CET,0.0 1.894 2.629 3.161 3.603 3.997 4.335 4.644 5.2 5.445 5.679 6.025 6.304 6.487 6.809 7.105 7.39 7.529 7.793 8.046 8.414 8.652 8.869 9.171 9.466 9.744 10.011 10.272 10.601 10.915 11.272 11.758 12.155 12.481 12.867 13.3 13.702 14.136 14.618 15.135 15.67 16.249 16.912 17.583 18.344 19.157 20.124 21.222 22.415 23.766 25.321 26.419 26.899 27.05 27.0 26.847 26.681 26.485 26.249 25.956 25.685 25.442 25.2 24.956 24.722 24.498 24.238 24.004 23.793 23.551 23.275 23.035 22.764 22.427 22.153 21.878 21.59 21.315 21.061 20.884 20.682 20.353 20.115 19.841 19.695 19.405 19.083 18.745 18.572 18.312 17.95 17.715 17.475 16.981 16.698 16.337 15.919 15.448 14.873 13.994 10.827 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_33.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_33.txt deleted file mode 100644 index 7258416b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_33.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6876 ,KEBNE ,17025826,Wed Dec 22 13:29:08 CET,Wed Dec 22 15:04:56 CET,0.0 2.644 3.435 4.056 4.544 4.974 5.387 5.754 6.354 6.622 6.88 7.301 7.609 7.837 8.275 8.677 9.064 9.253 9.618 9.962 10.452 10.777 11.098 11.559 11.996 12.414 12.833 13.254 13.797 14.312 14.799 15.396 15.989 16.556 17.235 18.036 18.793 19.631 20.56 21.537 22.572 23.747 25.153 26.623 28.357 30.342 32.739 35.546 39.007 43.385 49.037 54.042 57.234 59.409 60.902 61.983 62.758 63.367 63.842 64.218 64.459 64.64 64.785 64.881 64.94 64.98 64.999 64.992 64.951 64.873 64.794 64.73 64.65 64.549 64.454 64.353 64.24 64.111 63.964 63.848 63.723 63.54 63.395 63.228 63.136 62.932 62.709 62.443 62.307 62.15 61.819 61.623 61.43 60.985 60.716 60.417 60.074 59.652 59.091 58.253 55.067 -2 ,198 ,KEBNE ,17026093,Wed Dec 22 13:50:41 CET,Wed Dec 22 15:05:11 CET,0.0 2.198 2.896 3.517 4.048 4.463 4.825 5.149 5.767 6.047 6.316 6.753 7.066 7.293 7.699 8.085 8.464 8.643 8.984 9.322 9.813 10.121 10.426 10.873 11.307 11.741 12.161 12.559 13.086 13.607 14.104 14.705 15.286 15.848 16.513 17.264 17.997 18.817 19.707 20.661 21.699 22.906 24.345 25.807 27.545 29.556 31.972 34.799 38.236 42.543 48.284 53.503 56.782 58.97 60.522 61.704 62.566 63.199 63.631 63.996 64.266 64.458 64.594 64.687 64.75 64.774 64.771 64.758 64.74 64.702 64.641 64.577 64.498 64.405 64.315 64.209 64.087 63.961 63.824 63.713 63.597 63.41 63.274 63.105 63.004 62.794 62.579 62.341 62.209 62.054 61.748 61.566 61.365 60.913 60.642 60.346 60.032 59.631 59.104 58.336 55.217 -3 ,9586 ,KEBNE ,17026094,Wed Dec 22 13:50:41 CET,Wed Dec 22 15:05:17 CET,0.0 2.575 3.31 3.846 4.334 4.757 5.104 5.444 6.07 6.332 6.589 7.005 7.308 7.526 7.941 8.331 8.713 8.902 9.268 9.614 10.12 10.447 10.767 11.23 11.67 12.101 12.51 12.901 13.421 13.943 14.451 15.071 15.66 16.222 16.912 17.702 18.452 19.278 20.165 21.118 22.149 23.359 24.816 26.284 28.045 30.081 32.492 35.328 38.779 43.061 48.651 53.74 56.968 59.144 60.679 61.816 62.609 63.215 63.663 64.004 64.25 64.431 64.547 64.618 64.675 64.715 64.719 64.708 64.684 64.631 64.56 64.494 64.417 64.326 64.245 64.141 64.02 63.875 63.702 63.583 63.465 63.261 63.101 62.931 62.841 62.643 62.411 62.17 62.039 61.87 61.531 61.336 61.134 60.723 60.48 60.198 59.864 59.428 58.908 58.157 55.206 -4 ,12314 ,KEBNE ,17026095,Wed Dec 22 13:50:41 CET,Wed Dec 22 15:06:10 CET,0.0 2.56 3.274 3.793 4.253 4.666 5.034 5.365 5.972 6.256 6.516 6.934 7.242 7.466 7.885 8.28 8.676 8.868 9.225 9.577 10.086 10.4 10.704 11.16 11.624 12.069 12.5 12.921 13.444 13.956 14.467 15.096 15.704 16.286 16.958 17.713 18.45 19.275 20.195 21.188 22.232 23.434 24.89 26.385 28.14 30.153 32.555 35.382 38.834 43.113 48.698 53.768 56.95 59.085 60.622 61.79 62.661 63.299 63.745 64.126 64.376 64.553 64.687 64.764 64.806 64.837 64.843 64.827 64.806 64.761 64.697 64.628 64.542 64.434 64.338 64.229 64.106 63.968 63.804 63.692 63.575 63.369 63.221 63.062 62.977 62.784 62.563 62.296 62.155 61.996 61.695 61.522 61.331 60.896 60.644 60.341 59.975 59.563 59.04 58.275 55.77 -5 ,16712 ,KEBNE ,17026096,Wed Dec 22 13:50:40 CET,Wed Dec 22 15:06:07 CET,0.0 2.732 3.552 4.078 4.514 4.914 5.284 5.631 6.222 6.487 6.739 7.147 7.455 7.68 8.107 8.509 8.881 9.062 9.42 9.763 10.249 10.57 10.89 11.35 11.8 12.233 12.658 13.069 13.601 14.14 14.668 15.295 15.878 16.443 17.12 17.873 18.613 19.449 20.358 21.342 22.356 23.537 24.977 26.425 28.165 30.174 32.589 35.391 38.833 43.086 48.552 53.629 56.807 58.921 60.441 61.575 62.386 62.972 63.395 63.748 63.987 64.16 64.295 64.393 64.439 64.453 64.446 64.427 64.404 64.357 64.291 64.222 64.127 64.014 63.932 63.845 63.734 63.599 63.442 63.329 63.209 63.007 62.857 62.693 62.599 62.389 62.158 61.894 61.752 61.593 61.255 61.056 60.858 60.389 60.117 59.826 59.491 59.104 58.604 57.848 54.998 -6 ,562 ,KEBNE ,17026097,Wed Dec 22 13:50:40 CET,Wed Dec 22 15:05:08 CET,0.0 2.706 3.522 4.101 4.588 4.994 5.334 5.65 6.224 6.503 6.776 7.201 7.52 7.753 8.19 8.608 9.001 9.188 9.548 9.883 10.377 10.702 11.009 11.462 11.896 12.317 12.738 13.149 13.661 14.159 14.678 15.31 15.906 16.481 17.154 17.921 18.656 19.466 20.372 21.342 22.371 23.557 24.976 26.437 28.184 30.216 32.642 35.459 38.962 43.263 48.669 53.685 56.851 58.954 60.457 61.582 62.4 62.974 63.388 63.763 64.021 64.209 64.379 64.514 64.584 64.606 64.598 64.578 64.56 64.531 64.48 64.422 64.348 64.259 64.183 64.086 63.977 63.851 63.678 63.559 63.441 63.226 63.077 62.923 62.831 62.598 62.355 62.122 61.985 61.825 61.55 61.372 61.171 60.767 60.505 60.191 59.824 59.388 58.855 58.041 55.243 -7 ,14989 ,KEBNE ,17025832,Wed Dec 22 13:32:13 CET,Wed Dec 22 15:07:13 CET,0.0 2.816 3.612 4.131 4.578 5.0 5.381 5.724 6.318 6.588 6.85 7.273 7.584 7.807 8.235 8.637 9.023 9.21 9.56 9.901 10.408 10.734 11.053 11.516 11.964 12.402 12.818 13.231 13.765 14.269 14.767 15.365 15.947 16.52 17.182 17.933 18.678 19.516 20.442 21.448 22.5 23.69 25.122 26.606 28.371 30.395 32.816 35.668 39.168 43.477 49.04 54.031 57.191 59.348 60.846 61.987 62.822 63.434 63.879 64.228 64.475 64.657 64.788 64.885 64.942 64.978 64.991 64.98 64.948 64.899 64.827 64.745 64.65 64.536 64.44 64.329 64.196 64.059 63.906 63.794 63.676 63.471 63.314 63.132 63.036 62.833 62.62 62.385 62.26 62.103 61.788 61.598 61.393 60.918 60.638 60.349 60.036 59.649 59.133 58.428 55.95 -8 ,28899 ,KEBNE ,17026099,Wed Dec 22 13:50:41 CET,Wed Dec 22 15:07:53 CET,0.0 2.482 3.276 3.82 4.259 4.641 4.985 5.32 5.942 6.22 6.479 6.899 7.209 7.433 7.876 8.296 8.68 8.862 9.229 9.573 10.055 10.39 10.711 11.159 11.604 12.037 12.459 12.877 13.407 13.924 14.429 15.026 15.616 16.211 16.907 17.672 18.413 19.257 20.188 21.157 22.192 23.387 24.798 26.262 28.011 30.036 32.473 35.309 38.739 43.055 48.696 53.714 56.83 58.946 60.439 61.509 62.289 62.891 63.342 63.689 63.931 64.119 64.237 64.319 64.379 64.406 64.41 64.399 64.345 64.263 64.191 64.115 64.004 63.873 63.779 63.667 63.529 63.394 63.25 63.143 63.01 62.785 62.632 62.458 62.361 62.148 61.919 61.652 61.507 61.34 61.023 60.842 60.64 60.181 59.897 59.575 59.237 58.83 58.301 57.612 54.858 -10 ,29747 ,KEBNE ,17026101,Wed Dec 22 13:50:41 CET,Wed Dec 22 15:08:05 CET,0.0 2.263 3.065 3.642 4.104 4.514 4.878 5.214 5.84 6.132 6.401 6.821 7.124 7.343 7.769 8.163 8.544 8.729 9.096 9.449 9.949 10.276 10.59 11.047 11.492 11.932 12.362 12.774 13.305 13.811 14.303 14.906 15.508 16.091 16.76 17.521 18.262 19.103 20.012 20.989 22.021 23.195 24.627 26.093 27.859 29.875 32.24 35.05 38.526 42.78 48.337 53.372 56.498 58.625 60.155 61.259 62.048 62.623 63.021 63.355 63.606 63.794 63.921 64.0 64.046 64.06 64.045 64.012 63.985 63.946 63.877 63.795 63.703 63.606 63.507 63.401 63.282 63.147 63.0 62.883 62.756 62.54 62.372 62.19 62.094 61.891 61.663 61.428 61.304 61.15 60.847 60.666 60.471 60.002 59.726 59.432 59.061 58.571 58.033 57.245 54.467 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_44.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_44.txt deleted file mode 100644 index 6d1eb393..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_44.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21257 ,KEBNE ,17025836,Wed Dec 22 13:32:14 CET,Wed Dec 22 15:06:29 CET,0.0 1.293 1.85 2.275 2.607 2.896 3.142 3.365 3.792 3.987 4.166 4.434 4.671 4.82 5.104 5.38 5.639 5.756 5.976 6.19 6.504 6.716 6.913 7.182 7.429 7.662 7.892 8.109 8.376 8.626 8.867 9.161 9.441 9.713 10.024 10.353 10.675 11.015 11.356 11.716 12.085 12.492 12.971 13.45 13.973 14.496 15.062 15.647 16.277 16.897 17.421 17.573 17.427 17.187 16.865 16.473 16.094 15.727 15.389 15.022 14.691 14.408 14.121 13.818 13.541 13.302 13.035 12.786 12.573 12.342 12.078 11.859 11.637 11.406 11.227 11.03 10.817 10.591 10.359 10.195 10.008 9.697 9.482 9.266 9.158 8.924 8.678 8.415 8.272 8.052 7.816 7.658 7.481 7.102 6.878 6.625 6.348 6.002 5.586 5.08 3.817 -3 ,5650 ,KEBNE ,17025838,Wed Dec 22 13:32:14 CET,Wed Dec 22 15:06:41 CET,0.0 1.258 1.781 2.197 2.55 2.843 3.111 3.361 3.8 4.0 4.186 4.452 4.695 4.852 5.154 5.423 5.665 5.786 6.024 6.247 6.547 6.74 6.927 7.195 7.432 7.66 7.887 8.103 8.393 8.665 8.907 9.191 9.47 9.748 10.046 10.353 10.646 10.959 11.295 11.655 12.022 12.431 12.915 13.379 13.888 14.417 14.982 15.574 16.204 16.831 17.295 17.39 17.239 16.951 16.609 16.235 15.869 15.521 15.189 14.828 14.507 14.221 13.947 13.672 13.405 13.153 12.886 12.638 12.417 12.179 11.928 11.718 11.478 11.227 11.044 10.845 10.63 10.403 10.158 9.994 9.825 9.563 9.376 9.173 9.067 8.844 8.615 8.369 8.226 7.999 7.749 7.575 7.39 6.975 6.739 6.488 6.208 5.895 5.518 5.01 3.889 -6 ,27537 ,KEBNE ,17026107,Wed Dec 22 13:50:40 CET,Wed Dec 22 15:07:42 CET,0.0 1.383 1.91 2.36 2.706 3.014 3.299 3.55 3.976 4.169 4.365 4.654 4.893 5.043 5.329 5.594 5.837 5.955 6.186 6.405 6.714 6.909 7.102 7.38 7.643 7.893 8.121 8.338 8.621 8.89 9.149 9.446 9.722 9.984 10.272 10.604 10.925 11.257 11.623 11.992 12.38 12.804 13.233 13.661 14.151 14.67 15.232 15.841 16.513 17.174 17.718 17.834 17.628 17.333 17.006 16.619 16.219 15.859 15.542 15.187 14.875 14.606 14.344 14.074 13.805 13.558 13.294 13.049 12.82 12.574 12.322 12.104 11.881 11.654 11.469 11.271 11.06 10.83 10.572 10.391 10.212 9.944 9.766 9.578 9.473 9.25 9.019 8.767 8.628 8.412 8.172 8.002 7.826 7.425 7.197 6.952 6.692 6.395 6.025 5.531 4.195 -7 ,13378 ,KEBNE ,17025842,Wed Dec 22 13:32:14 CET,Wed Dec 22 15:08:04 CET,0.0 1.463 2.047 2.493 2.841 3.143 3.396 3.627 4.073 4.28 4.47 4.729 4.967 5.118 5.392 5.647 5.887 6.002 6.227 6.441 6.743 6.937 7.12 7.367 7.603 7.834 8.051 8.26 8.523 8.771 9.023 9.327 9.613 9.886 10.174 10.478 10.781 11.105 11.432 11.761 12.116 12.528 12.988 13.427 13.914 14.451 15.047 15.68 16.375 17.04 17.59 17.768 17.668 17.417 17.115 16.81 16.502 16.192 15.89 15.567 15.285 15.009 14.733 14.481 14.251 14.025 13.77 13.543 13.345 13.131 12.904 12.692 12.451 12.211 12.032 11.851 11.668 11.471 11.258 11.095 10.908 10.628 10.439 10.23 10.126 9.911 9.678 9.432 9.282 9.06 8.834 8.66 8.471 8.075 7.85 7.605 7.321 7.015 6.636 6.112 4.746 -9 ,21562 ,KEBNE ,17025844,Wed Dec 22 13:32:14 CET,Wed Dec 22 15:07:35 CET,0.0 1.351 1.845 2.231 2.548 2.838 3.102 3.338 3.764 3.961 4.143 4.394 4.621 4.774 5.063 5.334 5.592 5.714 5.945 6.171 6.491 6.68 6.863 7.137 7.391 7.632 7.855 8.072 8.355 8.615 8.864 9.153 9.427 9.685 9.987 10.325 10.646 10.991 11.332 11.703 12.081 12.487 12.96 13.428 13.93 14.454 15.039 15.635 16.293 16.966 17.574 17.692 17.512 17.275 16.985 16.653 16.269 15.892 15.566 15.211 14.898 14.615 14.327 14.035 13.764 13.521 13.264 13.011 12.776 12.524 12.255 12.038 11.823 11.601 11.416 11.207 10.978 10.732 10.485 10.31 10.133 9.871 9.674 9.455 9.346 9.131 8.893 8.624 8.477 8.257 8.003 7.821 7.627 7.207 6.964 6.695 6.413 6.097 5.721 5.23 3.642 -10 ,16108 ,KEBNE ,17026111,Wed Dec 22 13:50:40 CET,Wed Dec 22 15:08:35 CET,0.0 1.453 1.973 2.389 2.757 3.098 3.389 3.637 4.084 4.281 4.468 4.735 4.963 5.11 5.384 5.645 5.888 6.003 6.233 6.457 6.776 6.966 7.142 7.405 7.655 7.893 8.124 8.335 8.592 8.845 9.092 9.38 9.65 9.905 10.217 10.563 10.882 11.22 11.567 11.945 12.345 12.771 13.24 13.692 14.195 14.734 15.319 15.917 16.542 17.147 17.632 17.73 17.572 17.266 16.893 16.523 16.181 15.838 15.533 15.21 14.896 14.604 14.319 14.034 13.76 13.503 13.228 12.983 12.759 12.526 12.285 12.073 11.86 11.633 11.444 11.252 11.035 10.795 10.555 10.39 10.22 9.946 9.75 9.549 9.443 9.216 8.971 8.714 8.57 8.34 8.074 7.898 7.717 7.307 7.079 6.834 6.55 6.213 5.808 5.278 3.736 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_49.txt deleted file mode 100644 index 465b2bc5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_49.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,28530 ,KEBNE ,16721826,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:02:57 CET,0.0 1.093 1.504 1.824 2.099 2.351 2.573 2.772 3.14 3.31 3.46 3.644 3.832 3.942 4.145 4.333 4.498 4.575 4.725 4.871 5.072 5.19 5.311 5.478 5.617 5.742 5.866 5.992 6.125 6.24 6.356 6.479 6.593 6.692 6.803 6.92 7.009 7.082 7.138 7.186 7.21 7.191 7.134 7.043 6.882 6.598 6.153 5.517 4.564 3.109 0.64 -2.273 -4.597 -6.518 -8.12 -9.509 -10.724 -11.798 -12.714 -13.629 -14.417 -15.086 -15.724 -16.343 -16.898 -17.398 -17.936 -18.429 -18.846 -19.278 -19.73 -20.108 -20.498 -20.896 -21.203 -21.514 -21.84 -22.186 -22.537 -22.784 -23.041 -23.449 -23.742 -24.044 -24.194 -24.502 -24.841 -25.208 -25.396 -25.695 -26.015 -26.245 -26.479 -27.01 -27.306 -27.6 -27.929 -28.334 -28.802 -29.4 -30.714 -5 ,30053 ,KEBNE ,16721829,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:02:57 CET,0.0 1.126 1.608 1.97 2.236 2.486 2.713 2.915 3.286 3.444 3.587 3.788 3.986 4.096 4.295 4.482 4.654 4.734 4.882 5.009 5.19 5.312 5.418 5.563 5.702 5.832 5.954 6.07 6.204 6.317 6.421 6.517 6.609 6.712 6.813 6.91 6.991 7.058 7.111 7.157 7.18 7.17 7.112 7.014 6.847 6.583 6.148 5.515 4.584 3.174 0.777 -2.135 -4.462 -6.373 -7.985 -9.389 -10.571 -11.632 -12.537 -13.424 -14.186 -14.877 -15.522 -16.108 -16.655 -17.171 -17.706 -18.167 -18.566 -18.979 -19.405 -19.751 -20.103 -20.478 -20.774 -21.084 -21.408 -21.748 -22.118 -22.369 -22.622 -23.028 -23.304 -23.582 -23.728 -24.031 -24.339 -24.691 -24.88 -25.183 -25.493 -25.717 -25.954 -26.465 -26.759 -27.064 -27.385 -27.77 -28.242 -28.821 -30.248 -6 ,14909 ,KEBNE ,16721830,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:04:46 CET,0.0 1.021 1.45 1.781 2.053 2.293 2.509 2.708 3.094 3.26 3.399 3.566 3.755 3.87 4.087 4.285 4.453 4.529 4.685 4.831 5.028 5.14 5.244 5.407 5.567 5.709 5.834 5.945 6.069 6.18 6.293 6.42 6.522 6.625 6.737 6.842 6.925 6.989 7.049 7.1 7.124 7.126 7.081 6.98 6.817 6.569 6.173 5.553 4.619 3.186 0.746 -2.159 -4.555 -6.557 -8.169 -9.554 -10.758 -11.838 -12.754 -13.675 -14.479 -15.169 -15.813 -16.435 -17.022 -17.545 -18.07 -18.538 -18.956 -19.398 -19.856 -20.231 -20.619 -21.024 -21.339 -21.661 -22.001 -22.366 -22.737 -22.997 -23.259 -23.655 -23.942 -24.241 -24.39 -24.715 -25.064 -25.417 -25.607 -25.901 -26.19 -26.416 -26.658 -27.185 -27.471 -27.777 -28.114 -28.482 -28.918 -29.577 -31.143 -7 ,21265 ,KEBNE ,16721831,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:04:33 CET,0.0 1.204 1.651 1.96 2.229 2.472 2.688 2.896 3.239 3.383 3.526 3.715 3.91 4.021 4.233 4.418 4.577 4.656 4.815 4.958 5.151 5.27 5.376 5.515 5.638 5.763 5.889 6.004 6.147 6.283 6.402 6.548 6.68 6.788 6.91 7.019 7.105 7.18 7.234 7.27 7.288 7.285 7.245 7.164 6.992 6.717 6.278 5.638 4.726 3.261 0.767 -2.079 -4.315 -6.211 -7.841 -9.24 -10.447 -11.503 -12.384 -13.291 -14.06 -14.726 -15.362 -15.96 -16.503 -16.985 -17.482 -17.938 -18.338 -18.745 -19.18 -19.55 -19.939 -20.329 -20.623 -20.928 -21.252 -21.614 -21.993 -22.245 -22.516 -22.948 -23.238 -23.545 -23.703 -24.03 -24.37 -24.719 -24.902 -25.2 -25.512 -25.735 -25.963 -26.483 -26.774 -27.091 -27.449 -27.837 -28.289 -28.857 -30.161 -10 ,22417 ,KEBNE ,16721834,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:02:33 CET,0.0 1.25 1.749 2.081 2.354 2.595 2.814 3.01 3.325 3.465 3.604 3.789 3.994 4.112 4.308 4.486 4.656 4.738 4.892 5.029 5.223 5.34 5.449 5.613 5.765 5.892 6.01 6.129 6.274 6.403 6.506 6.613 6.709 6.799 6.897 6.986 7.06 7.13 7.192 7.23 7.25 7.239 7.191 7.097 6.919 6.651 6.247 5.634 4.683 3.165 0.657 -2.216 -4.56 -6.53 -8.179 -9.606 -10.811 -11.86 -12.758 -13.664 -14.45 -15.165 -15.851 -16.492 -17.074 -17.598 -18.135 -18.608 -19.02 -19.444 -19.882 -20.25 -20.647 -21.069 -21.392 -21.711 -22.036 -22.384 -22.742 -22.987 -23.25 -23.671 -23.961 -24.254 -24.407 -24.749 -25.113 -25.47 -25.651 -25.954 -26.265 -26.488 -26.717 -27.221 -27.508 -27.829 -28.175 -28.55 -29.023 -29.619 -31.012 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_58.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_58.txt deleted file mode 100644 index 3662366b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_62_58.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26346 ,KEBNE ,17026112,Wed Dec 22 13:50:41 CET,Wed Dec 22 15:11:26 CET,0.0 1.542 2.117 2.574 2.942 3.251 3.521 3.762 4.188 4.374 4.543 4.79 5.021 5.163 5.419 5.651 5.876 5.982 6.183 6.371 6.62 6.782 6.942 7.169 7.381 7.573 7.759 7.944 8.177 8.393 8.601 8.849 9.07 9.279 9.528 9.789 10.009 10.252 10.515 10.768 11.021 11.296 11.608 11.908 12.221 12.497 12.765 13.007 13.21 13.259 12.913 12.201 11.442 10.697 10.023 9.425 8.857 8.302 7.849 7.395 6.977 6.608 6.248 5.916 5.606 5.318 5.022 4.734 4.479 4.219 3.946 3.714 3.463 3.192 2.987 2.776 2.557 2.338 2.098 1.927 1.754 1.474 1.275 1.07 0.96 0.728 0.484 0.217 0.07 -0.168 -0.412 -0.582 -0.771 -1.193 -1.414 -1.657 -1.932 -2.244 -2.602 -3.095 -4.399 -2 ,18796 ,KEBNE ,17026113,Wed Dec 22 13:50:40 CET,Wed Dec 22 15:09:05 CET,0.0 1.869 2.433 2.845 3.175 3.447 3.717 3.973 4.401 4.594 4.773 5.028 5.255 5.391 5.647 5.906 6.145 6.252 6.458 6.651 6.927 7.097 7.255 7.483 7.701 7.897 8.087 8.28 8.509 8.72 8.932 9.185 9.432 9.661 9.903 10.155 10.378 10.627 10.9 11.176 11.447 11.734 12.046 12.358 12.704 13.032 13.324 13.545 13.709 13.702 13.359 12.633 11.835 11.076 10.381 9.728 9.148 8.613 8.123 7.622 7.181 6.782 6.398 6.026 5.684 5.372 5.033 4.723 4.462 4.188 3.892 3.652 3.392 3.094 2.866 2.636 2.391 2.136 1.865 1.678 1.487 1.18 0.957 0.73 0.618 0.373 0.109 -0.163 -0.313 -0.548 -0.782 -0.965 -1.157 -1.554 -1.78 -2.031 -2.311 -2.616 -2.988 -3.523 -4.836 -3 ,13912 ,KEBNE ,17025848,Wed Dec 22 13:33:16 CET,Wed Dec 22 15:08:07 CET,0.0 1.093 1.598 1.993 2.331 2.619 2.882 3.141 3.607 3.802 3.975 4.225 4.443 4.577 4.831 5.065 5.29 5.4 5.606 5.795 6.052 6.215 6.373 6.599 6.814 7.02 7.22 7.403 7.632 7.849 8.052 8.299 8.541 8.763 8.997 9.251 9.49 9.746 10.009 10.271 10.54 10.828 11.128 11.444 11.791 12.107 12.425 12.698 12.925 12.987 12.597 11.804 11.045 10.335 9.647 9.006 8.456 7.917 7.406 6.893 6.455 6.07 5.707 5.35 5.007 4.683 4.339 4.045 3.792 3.52 3.23 2.978 2.716 2.451 2.245 2.026 1.798 1.561 1.307 1.126 0.935 0.648 0.446 0.223 0.107 -0.141 -0.401 -0.678 -0.819 -1.043 -1.279 -1.452 -1.637 -2.042 -2.272 -2.513 -2.777 -3.082 -3.439 -3.934 -5.23 -4 ,9699 ,KEBNE ,17025849,Wed Dec 22 13:33:16 CET,Wed Dec 22 15:09:21 CET,0.0 1.72 2.286 2.723 3.045 3.316 3.574 3.802 4.203 4.394 4.575 4.834 5.059 5.2 5.46 5.708 5.948 6.063 6.273 6.461 6.73 6.896 7.054 7.295 7.521 7.743 7.955 8.145 8.385 8.609 8.817 9.06 9.291 9.513 9.76 10.014 10.262 10.546 10.835 11.113 11.383 11.682 12.0 12.295 12.595 12.892 13.204 13.469 13.664 13.675 13.268 12.528 11.762 11.006 10.334 9.701 9.11 8.561 8.077 7.585 7.134 6.725 6.368 6.021 5.678 5.368 5.042 4.738 4.477 4.216 3.933 3.69 3.445 3.174 2.956 2.741 2.506 2.255 2.006 1.829 1.632 1.33 1.121 0.903 0.794 0.559 0.307 0.041 -0.099 -0.33 -0.586 -0.766 -0.953 -1.366 -1.594 -1.842 -2.118 -2.434 -2.813 -3.331 -4.679 -5 ,681 ,KEBNE ,17026116,Wed Dec 22 13:50:40 CET,Wed Dec 22 15:10:17 CET,0.0 1.535 2.106 2.539 2.874 3.185 3.453 3.67 4.066 4.257 4.434 4.68 4.916 5.071 5.352 5.601 5.825 5.937 6.151 6.355 6.647 6.815 6.972 7.205 7.431 7.641 7.844 8.033 8.267 8.479 8.682 8.948 9.197 9.418 9.662 9.925 10.186 10.462 10.738 11.016 11.285 11.563 11.857 12.147 12.455 12.747 13.067 13.336 13.489 13.466 13.117 12.403 11.68 11.009 10.352 9.705 9.131 8.598 8.102 7.592 7.161 6.77 6.396 6.048 5.699 5.372 5.034 4.739 4.497 4.241 3.959 3.718 3.457 3.187 2.977 2.758 2.527 2.278 2.015 1.836 1.643 1.327 1.107 0.877 0.76 0.518 0.263 -0.017 -0.173 -0.423 -0.676 -0.857 -1.045 -1.476 -1.722 -1.981 -2.281 -2.622 -2.97 -3.456 -4.688 -7 ,22601 ,KEBNE ,17025852,Wed Dec 22 13:33:15 CET,Wed Dec 22 15:08:11 CET,0.0 1.678 2.211 2.642 3.003 3.301 3.582 3.823 4.251 4.444 4.622 4.877 5.103 5.245 5.504 5.743 5.973 6.085 6.295 6.485 6.758 6.936 7.104 7.351 7.568 7.764 7.958 8.148 8.391 8.613 8.822 9.08 9.319 9.532 9.783 10.057 10.309 10.575 10.85 11.133 11.415 11.729 12.067 12.362 12.696 13.011 13.3 13.573 13.749 13.788 13.511 12.746 11.929 11.172 10.502 9.909 9.346 8.792 8.308 7.811 7.374 6.972 6.585 6.223 5.871 5.547 5.214 4.916 4.648 4.365 4.087 3.851 3.588 3.304 3.082 2.87 2.65 2.411 2.145 1.956 1.76 1.439 1.214 0.974 0.854 0.62 0.357 0.074 -0.075 -0.322 -0.57 -0.74 -0.923 -1.307 -1.527 -1.775 -2.046 -2.368 -2.75 -3.267 -4.396 -8 ,25869 ,KEBNE ,17026119,Wed Dec 22 13:50:41 CET,Wed Dec 22 15:09:59 CET,0.0 1.452 1.981 2.369 2.708 2.997 3.257 3.503 3.961 4.155 4.326 4.567 4.799 4.954 5.238 5.493 5.725 5.836 6.06 6.271 6.561 6.739 6.905 7.144 7.365 7.574 7.774 7.955 8.173 8.379 8.578 8.821 9.048 9.266 9.507 9.765 10.003 10.235 10.483 10.75 11.019 11.331 11.685 11.994 12.317 12.629 12.954 13.247 13.423 13.456 13.145 12.423 11.666 10.904 10.211 9.582 9.002 8.451 7.948 7.449 7.015 6.596 6.197 5.823 5.469 5.145 4.807 4.502 4.236 3.969 3.69 3.447 3.19 2.912 2.692 2.465 2.236 2.007 1.747 1.566 1.383 1.071 0.837 0.596 0.471 0.212 -0.047 -0.322 -0.468 -0.698 -0.941 -1.117 -1.302 -1.744 -1.988 -2.25 -2.554 -2.894 -3.256 -3.708 -4.753 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_62.txt deleted file mode 100644 index 47f06232..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_63_62.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13445 ,KEBNE ,16721835,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:04:08 CET,0.0 1.156 1.682 2.099 2.401 2.665 2.915 3.147 3.556 3.731 3.888 4.104 4.329 4.461 4.725 4.985 5.233 5.346 5.556 5.764 6.064 6.255 6.439 6.692 6.926 7.157 7.378 7.581 7.839 8.085 8.318 8.589 8.848 9.106 9.398 9.722 10.027 10.359 10.707 11.072 11.447 11.86 12.329 12.772 13.302 13.876 14.47 15.154 15.917 16.653 17.347 17.664 17.618 17.428 17.189 16.914 16.612 16.319 16.061 15.757 15.476 15.215 14.946 14.672 14.404 14.149 13.873 13.625 13.408 13.171 12.916 12.713 12.507 12.277 12.087 11.887 11.676 11.46 11.237 11.07 10.899 10.625 10.429 10.231 10.126 9.897 9.648 9.366 9.217 8.987 8.731 8.555 8.383 7.988 7.749 7.495 7.225 6.916 6.545 6.064 4.804 -2 ,15609 ,KEBNE ,16721836,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:02:37 CET,0.0 1.46 1.995 2.36 2.679 2.965 3.217 3.43 3.806 3.994 4.17 4.411 4.648 4.786 5.039 5.283 5.513 5.618 5.828 6.04 6.334 6.516 6.689 6.93 7.168 7.398 7.616 7.822 8.066 8.3 8.533 8.817 9.1 9.375 9.687 10.008 10.29 10.592 10.904 11.241 11.625 12.052 12.51 12.958 13.488 14.033 14.637 15.313 16.038 16.779 17.478 17.77 17.711 17.501 17.227 16.956 16.673 16.365 16.07 15.732 15.437 15.177 14.909 14.636 14.377 14.135 13.871 13.617 13.382 13.152 12.921 12.718 12.49 12.251 12.072 11.886 11.688 11.475 11.24 11.073 10.903 10.644 10.456 10.244 10.139 9.931 9.699 9.45 9.316 9.104 8.883 8.722 8.556 8.188 7.989 7.768 7.503 7.196 6.833 6.381 5.058 -3 ,11916 ,KEBNE ,16721837,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:04:15 CET,0.0 1.089 1.618 2.0 2.317 2.611 2.879 3.094 3.474 3.648 3.818 4.069 4.304 4.443 4.709 4.956 5.187 5.298 5.507 5.708 5.991 6.178 6.362 6.617 6.851 7.067 7.267 7.454 7.704 7.952 8.19 8.468 8.723 8.971 9.265 9.595 9.899 10.206 10.528 10.867 11.219 11.634 12.145 12.636 13.147 13.699 14.312 14.937 15.617 16.338 17.029 17.29 17.242 17.073 16.783 16.468 16.179 15.873 15.564 15.238 14.944 14.677 14.428 14.186 13.941 13.697 13.438 13.207 13.003 12.782 12.541 12.337 12.116 11.89 11.724 11.54 11.348 11.139 10.904 10.738 10.561 10.281 10.094 9.893 9.784 9.557 9.311 9.041 8.891 8.659 8.388 8.202 8.019 7.617 7.376 7.124 6.853 6.519 6.123 5.578 4.239 -5 ,17650 ,KEBNE ,16721839,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:02:38 CET,0.0 0.915 1.34 1.702 2.025 2.305 2.535 2.756 3.174 3.364 3.542 3.783 4.015 4.159 4.433 4.69 4.927 5.038 5.252 5.459 5.76 5.95 6.127 6.38 6.612 6.819 7.026 7.235 7.507 7.76 7.991 8.267 8.546 8.808 9.09 9.404 9.71 10.043 10.393 10.761 11.153 11.588 12.067 12.532 13.062 13.65 14.294 14.923 15.599 16.34 17.043 17.36 17.32 17.124 16.892 16.614 16.3 15.999 15.714 15.381 15.084 14.805 14.528 14.279 14.053 13.833 13.577 13.336 13.123 12.906 12.681 12.495 12.295 12.08 11.911 11.719 11.519 11.322 11.103 10.942 10.776 10.511 10.312 10.102 9.996 9.777 9.536 9.275 9.136 8.907 8.657 8.498 8.328 7.916 7.682 7.435 7.16 6.832 6.464 6.017 4.762 -6 ,14302 ,KEBNE ,16721840,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:02:50 CET,0.0 1.198 1.662 2.022 2.329 2.599 2.835 3.051 3.437 3.618 3.79 4.013 4.239 4.375 4.637 4.893 5.121 5.227 5.451 5.665 5.948 6.122 6.292 6.541 6.774 6.992 7.217 7.436 7.696 7.942 8.176 8.465 8.749 9.018 9.327 9.662 9.975 10.313 10.666 11.03 11.392 11.797 12.264 12.725 13.27 13.864 14.519 15.195 15.893 16.64 17.374 17.736 17.746 17.555 17.255 16.932 16.62 16.3 16.0 15.672 15.375 15.097 14.822 14.549 14.281 14.034 13.778 13.545 13.335 13.104 12.855 12.64 12.417 12.182 11.991 11.798 11.602 11.394 11.158 10.993 10.82 10.542 10.357 10.163 10.06 9.832 9.591 9.346 9.217 9.006 8.797 8.647 8.488 8.125 7.918 7.69 7.435 7.147 6.813 6.396 5.462 -7 ,31849 ,KEBNE ,16721841,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:04:11 CET,0.0 1.193 1.715 2.102 2.42 2.704 2.943 3.159 3.563 3.736 3.895 4.111 4.332 4.465 4.735 4.989 5.212 5.323 5.534 5.738 6.044 6.231 6.402 6.645 6.88 7.112 7.333 7.54 7.809 8.07 8.307 8.585 8.838 9.075 9.356 9.673 9.965 10.267 10.599 10.963 11.341 11.761 12.243 12.728 13.279 13.847 14.462 15.127 15.851 16.587 17.28 17.593 17.47 17.231 16.995 16.707 16.402 16.107 15.822 15.501 15.216 14.94 14.676 14.424 14.171 13.925 13.65 13.398 13.175 12.945 12.706 12.485 12.249 12.008 11.818 11.624 11.422 11.207 10.972 10.801 10.633 10.365 10.178 9.986 9.881 9.66 9.424 9.176 9.042 8.818 8.561 8.379 8.193 7.805 7.574 7.305 7.023 6.731 6.352 5.794 4.347 -8 ,8290 ,KEBNE ,16721842,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:02:27 CET,0.0 1.148 1.581 1.944 2.266 2.539 2.772 2.999 3.42 3.611 3.79 4.032 4.265 4.408 4.681 4.938 5.175 5.288 5.497 5.697 5.996 6.181 6.349 6.592 6.829 7.057 7.271 7.47 7.71 7.945 8.183 8.46 8.722 8.977 9.27 9.592 9.9 10.232 10.578 10.94 11.304 11.729 12.234 12.687 13.172 13.699 14.289 14.955 15.712 16.491 17.219 17.549 17.475 17.255 16.995 16.707 16.402 16.093 15.783 15.457 15.183 14.916 14.65 14.394 14.145 13.906 13.634 13.381 13.167 12.947 12.704 12.497 12.291 12.075 11.901 11.718 11.524 11.317 11.098 10.942 10.781 10.532 10.346 10.133 10.019 9.787 9.544 9.282 9.144 8.931 8.714 8.56 8.386 7.961 7.713 7.465 7.197 6.888 6.515 6.007 4.46 -9 ,7786 ,KEBNE ,16721843,Sat Nov 27 20:28:44 CET,Sat Nov 27 22:04:00 CET,0.0 1.31 1.762 2.128 2.451 2.733 2.972 3.184 3.562 3.735 3.908 4.154 4.388 4.53 4.798 5.048 5.287 5.402 5.616 5.824 6.117 6.293 6.461 6.711 6.958 7.188 7.403 7.609 7.87 8.124 8.374 8.658 8.924 9.188 9.481 9.808 10.127 10.454 10.792 11.156 11.531 11.942 12.415 12.885 13.404 13.958 14.6 15.29 16.005 16.735 17.465 17.753 17.659 17.446 17.183 16.878 16.563 16.247 15.933 15.615 15.336 15.069 14.802 14.541 14.299 14.076 13.818 13.571 13.363 13.147 12.919 12.722 12.503 12.265 12.081 11.884 11.681 11.477 11.267 11.11 10.935 10.663 10.472 10.271 10.163 9.933 9.698 9.445 9.308 9.099 8.879 8.713 8.528 8.117 7.895 7.66 7.397 7.105 6.754 6.268 5.112 -10 ,21950 ,KEBNE ,16721844,Sat Nov 27 20:32:49 CET,Sat Nov 27 22:07:07 CET,0.0 1.112 1.583 1.925 2.219 2.489 2.747 2.979 3.374 3.552 3.725 3.986 4.216 4.349 4.622 4.875 5.105 5.218 5.431 5.635 5.929 6.11 6.278 6.513 6.742 6.966 7.174 7.367 7.616 7.872 8.108 8.38 8.646 8.897 9.174 9.476 9.782 10.111 10.463 10.839 11.212 11.624 12.094 12.562 13.102 13.692 14.328 14.963 15.653 16.395 17.088 17.345 17.285 17.102 16.853 16.541 16.187 15.869 15.575 15.247 14.965 14.699 14.434 14.173 13.918 13.687 13.45 13.23 13.023 12.801 12.561 12.358 12.147 11.926 11.737 11.536 11.334 11.121 10.906 10.75 10.575 10.312 10.133 9.933 9.827 9.609 9.38 9.135 9.005 8.792 8.545 8.364 8.182 7.804 7.581 7.335 7.073 6.764 6.373 5.906 4.875 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_64_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_64_63.txt deleted file mode 100644 index f6573c98..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_64_63.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,6664 ,KEBNE ,16721848,Sat Nov 27 20:32:49 CET,Sat Nov 27 22:07:01 CET,0.0 1.204 1.694 2.073 2.39 2.665 2.919 3.145 3.535 3.71 3.875 4.125 4.359 4.494 4.751 5.0 5.236 5.348 5.567 5.777 6.057 6.227 6.393 6.632 6.869 7.1 7.309 7.509 7.767 8.013 8.249 8.522 8.79 9.044 9.317 9.612 9.903 10.23 10.558 10.872 11.185 11.535 11.924 12.301 12.733 13.209 13.697 14.186 14.724 15.239 15.557 15.345 14.975 14.558 14.108 13.68 13.243 12.802 12.431 12.062 11.724 11.399 11.085 10.791 10.506 10.226 9.923 9.64 9.391 9.141 8.877 8.647 8.41 8.173 7.982 7.777 7.564 7.342 7.103 6.929 6.743 6.457 6.259 6.05 5.94 5.697 5.433 5.165 5.03 4.798 4.542 4.359 4.172 3.731 3.478 3.204 2.892 2.547 2.117 1.572 0.077 -5 ,2889 ,KEBNE ,16721849,Sat Nov 27 20:32:49 CET,Sat Nov 27 22:07:57 CET,0.0 1.271 1.805 2.215 2.535 2.81 3.061 3.289 3.701 3.889 4.06 4.283 4.513 4.659 4.936 5.186 5.41 5.517 5.728 5.927 6.204 6.379 6.546 6.787 7.008 7.219 7.432 7.636 7.893 8.133 8.358 8.629 8.877 9.112 9.38 9.685 9.972 10.275 10.614 10.957 11.302 11.687 12.128 12.555 12.996 13.448 13.959 14.481 14.964 15.419 15.704 15.544 15.18 14.757 14.321 13.877 13.433 13.004 12.624 12.224 11.872 11.55 11.229 10.909 10.6 10.328 10.023 9.736 9.486 9.221 8.959 8.733 8.491 8.231 8.025 7.809 7.582 7.339 7.069 6.879 6.691 6.405 6.204 5.998 5.883 5.637 5.375 5.085 4.935 4.702 4.471 4.301 4.114 3.702 3.478 3.216 2.917 2.578 2.172 1.675 0.377 -6 ,7626 ,KEBNE ,16721850,Sat Nov 27 20:32:49 CET,Sat Nov 27 22:06:45 CET,0.0 1.066 1.551 1.951 2.264 2.542 2.786 3.01 3.431 3.615 3.783 4.01 4.239 4.382 4.655 4.915 5.163 5.273 5.474 5.679 5.975 6.162 6.35 6.609 6.84 7.05 7.249 7.443 7.682 7.906 8.118 8.391 8.666 8.922 9.213 9.523 9.8 10.112 10.431 10.753 11.102 11.503 11.934 12.315 12.74 13.194 13.693 14.232 14.752 15.217 15.538 15.414 15.055 14.659 14.242 13.783 13.344 12.929 12.534 12.104 11.748 11.426 11.091 10.779 10.501 10.23 9.938 9.671 9.44 9.2 8.931 8.702 8.458 8.196 7.984 7.765 7.545 7.315 7.071 6.898 6.717 6.429 6.221 6.002 5.887 5.646 5.405 5.151 5.011 4.78 4.534 4.352 4.167 3.781 3.557 3.306 3.033 2.694 2.276 1.711 0.492 -7 ,30866 ,KEBNE ,16721851,Sat Nov 27 20:32:49 CET,Sat Nov 27 22:06:49 CET,0.0 1.167 1.647 2.005 2.318 2.611 2.88 3.114 3.522 3.71 3.881 4.119 4.355 4.504 4.791 5.039 5.261 5.367 5.581 5.79 6.072 6.255 6.433 6.686 6.927 7.156 7.375 7.578 7.83 8.067 8.289 8.552 8.797 9.025 9.278 9.567 9.858 10.168 10.496 10.842 11.203 11.593 12.014 12.416 12.864 13.323 13.843 14.388 14.911 15.368 15.635 15.496 15.143 14.74 14.309 13.829 13.361 12.955 12.603 12.24 11.892 11.552 11.24 10.947 10.655 10.372 10.071 9.796 9.547 9.279 9.015 8.803 8.575 8.338 8.149 7.943 7.715 7.476 7.239 7.067 6.887 6.605 6.398 6.18 6.069 5.846 5.601 5.326 5.181 4.942 4.694 4.511 4.321 3.912 3.678 3.432 3.175 2.873 2.506 1.948 0.586 -8 ,19132 ,KEBNE ,16721852,Sat Nov 27 20:32:49 CET,Sat Nov 27 22:08:09 CET,0.0 1.13 1.632 2.002 2.315 2.599 2.866 3.1 3.495 3.667 3.835 4.075 4.31 4.455 4.722 4.966 5.209 5.321 5.532 5.738 6.029 6.214 6.39 6.637 6.863 7.074 7.284 7.488 7.739 7.971 8.187 8.453 8.715 8.956 9.232 9.549 9.838 10.139 10.452 10.772 11.106 11.47 11.893 12.314 12.765 13.243 13.748 14.254 14.774 15.255 15.566 15.37 15.008 14.61 14.215 13.796 13.376 12.987 12.631 12.247 11.881 11.556 11.253 10.947 10.653 10.37 10.058 9.779 9.541 9.293 9.03 8.807 8.57 8.317 8.122 7.914 7.686 7.454 7.225 7.056 6.875 6.593 6.392 6.177 6.065 5.832 5.566 5.278 5.132 4.905 4.674 4.497 4.314 3.909 3.674 3.407 3.112 2.784 2.375 1.826 0.605 -9 ,355 ,KEBNE ,16721853,Sat Nov 27 20:32:49 CET,Sat Nov 27 22:06:40 CET,0.0 1.18 1.701 2.107 2.439 2.724 2.971 3.2 3.601 3.784 3.948 4.165 4.401 4.551 4.825 5.081 5.334 5.455 5.676 5.885 6.181 6.373 6.555 6.803 7.029 7.237 7.439 7.631 7.874 8.11 8.332 8.598 8.858 9.1 9.366 9.667 9.958 10.264 10.601 10.955 11.301 11.656 12.044 12.451 12.934 13.438 13.953 14.459 14.969 15.434 15.688 15.578 15.291 14.895 14.454 14.007 13.588 13.197 12.806 12.397 12.053 11.727 11.406 11.1 10.805 10.529 10.229 9.949 9.706 9.455 9.186 8.957 8.716 8.461 8.258 8.046 7.826 7.598 7.358 7.181 6.991 6.702 6.504 6.291 6.179 5.946 5.699 5.426 5.277 5.039 4.805 4.628 4.439 3.989 3.736 3.472 3.181 2.859 2.47 1.963 0.709 -10 ,27580 ,KEBNE ,16721854,Sat Nov 27 20:32:49 CET,Sat Nov 27 22:06:54 CET,0.0 1.242 1.726 2.119 2.433 2.7 2.954 3.2 3.623 3.801 3.976 4.207 4.432 4.575 4.844 5.081 5.307 5.423 5.647 5.861 6.169 6.365 6.553 6.804 7.034 7.251 7.458 7.654 7.905 8.151 8.39 8.658 8.92 9.177 9.463 9.779 10.063 10.364 10.7 11.044 11.394 11.767 12.156 12.549 12.996 13.481 13.979 14.454 14.978 15.434 15.682 15.553 15.202 14.756 14.325 13.888 13.468 13.065 12.692 12.307 11.954 11.62 11.299 10.996 10.7 10.423 10.113 9.818 9.559 9.297 9.019 8.785 8.543 8.278 8.067 7.848 7.62 7.39 7.161 6.995 6.815 6.519 6.312 6.097 5.984 5.743 5.48 5.196 5.045 4.804 4.569 4.402 4.202 3.763 3.531 3.267 2.977 2.651 2.251 1.712 0.26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_63.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_63.txt deleted file mode 100644 index 6fa2aa5f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_63.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14215 ,KEBNE ,16721855,Sat Nov 27 20:32:51 CET,Sat Nov 27 22:08:04 CET,0.0 1.216 1.695 2.064 2.373 2.647 2.886 3.109 3.514 3.693 3.87 4.115 4.337 4.465 4.718 4.968 5.195 5.304 5.514 5.7 5.963 6.142 6.308 6.533 6.758 6.966 7.162 7.346 7.573 7.799 8.015 8.275 8.527 8.753 9.009 9.301 9.572 9.854 10.158 10.473 10.792 11.147 11.542 11.907 12.281 12.642 13.038 13.442 13.784 14.065 14.123 13.754 13.248 12.677 12.109 11.584 11.096 10.628 10.22 9.796 9.418 9.058 8.708 8.394 8.091 7.787 7.476 7.206 6.961 6.694 6.411 6.176 5.931 5.681 5.474 5.252 5.02 4.779 4.513 4.327 4.139 3.846 3.648 3.433 3.319 3.084 2.827 2.563 2.424 2.189 1.952 1.783 1.605 1.202 0.971 0.718 0.439 0.107 -0.295 -0.784 -2.08 -2 ,3834 ,KEBNE ,16721856,Sat Nov 27 20:32:51 CET,Sat Nov 27 22:06:40 CET,0.0 1.145 1.595 1.935 2.206 2.459 2.699 2.914 3.288 3.453 3.61 3.827 4.042 4.17 4.414 4.644 4.847 4.94 5.12 5.299 5.558 5.721 5.881 6.113 6.333 6.539 6.729 6.906 7.121 7.333 7.54 7.779 8.009 8.227 8.477 8.748 8.994 9.262 9.565 9.877 10.183 10.517 10.872 11.23 11.618 11.965 12.343 12.742 13.124 13.402 13.462 13.139 12.681 12.159 11.642 11.119 10.612 10.128 9.686 9.235 8.857 8.505 8.152 7.81 7.488 7.208 6.901 6.611 6.359 6.09 5.808 5.575 5.322 5.05 4.842 4.623 4.386 4.143 3.896 3.718 3.523 3.215 3.003 2.785 2.673 2.451 2.216 1.946 1.802 1.565 1.311 1.131 0.945 0.538 0.31 0.063 -0.218 -0.584 -1.007 -1.508 -2.772 -3 ,24300 ,KEBNE ,16721857,Sat Nov 27 20:33:50 CET,Sat Nov 27 22:08:06 CET,0.0 1.229 1.7 2.087 2.401 2.671 2.908 3.122 3.476 3.636 3.788 3.994 4.218 4.352 4.594 4.822 5.05 5.156 5.354 5.547 5.81 5.976 6.138 6.368 6.588 6.8 6.994 7.186 7.443 7.674 7.897 8.163 8.398 8.62 8.884 9.175 9.45 9.757 10.071 10.391 10.715 11.038 11.388 11.739 12.135 12.544 12.959 13.366 13.768 14.084 14.164 13.778 13.224 12.635 12.037 11.485 10.978 10.49 10.068 9.62 9.238 8.897 8.544 8.203 7.887 7.596 7.273 6.981 6.739 6.479 6.199 5.973 5.742 5.49 5.286 5.073 4.838 4.599 4.357 4.177 3.99 3.697 3.49 3.278 3.163 2.921 2.667 2.384 2.235 2.0 1.745 1.558 1.357 0.946 0.732 0.485 0.19 -0.135 -0.513 -1.011 -2.529 -4 ,31019 ,KEBNE ,16721858,Sat Nov 27 20:33:50 CET,Sat Nov 27 22:09:34 CET,0.0 1.334 1.849 2.236 2.533 2.794 3.047 3.28 3.666 3.847 4.018 4.241 4.464 4.602 4.866 5.098 5.335 5.45 5.649 5.84 6.111 6.282 6.449 6.683 6.908 7.122 7.323 7.518 7.77 8.005 8.229 8.487 8.719 8.946 9.212 9.503 9.773 10.055 10.349 10.655 10.965 11.306 11.679 12.022 12.403 12.806 13.196 13.569 13.956 14.277 14.312 13.924 13.406 12.845 12.306 11.761 11.247 10.76 10.326 9.891 9.512 9.171 8.84 8.52 8.201 7.92 7.633 7.353 7.114 6.862 6.587 6.353 6.111 5.873 5.685 5.486 5.277 5.051 4.805 4.629 4.445 4.156 3.955 3.742 3.629 3.385 3.113 2.805 2.644 2.404 2.175 1.999 1.802 1.363 1.127 0.872 0.584 0.25 -0.162 -0.726 -2.095 -5 ,29098 ,KEBNE ,16721859,Sat Nov 27 20:33:50 CET,Sat Nov 27 22:09:32 CET,0.0 1.331 1.775 2.129 2.434 2.688 2.925 3.156 3.566 3.749 3.915 4.135 4.359 4.498 4.777 5.032 5.257 5.366 5.568 5.76 6.037 6.203 6.363 6.598 6.828 7.044 7.243 7.431 7.665 7.88 8.087 8.331 8.563 8.783 9.04 9.331 9.596 9.889 10.203 10.519 10.836 11.186 11.57 11.939 12.354 12.758 13.187 13.606 13.994 14.321 14.37 14.003 13.505 12.986 12.486 11.972 11.483 11.039 10.615 10.153 9.739 9.36 9.003 8.658 8.34 8.057 7.743 7.449 7.192 6.921 6.636 6.39 6.135 5.873 5.66 5.444 5.225 4.999 4.764 4.597 4.413 4.106 3.893 3.662 3.537 3.278 3.013 2.739 2.594 2.368 2.123 1.947 1.754 1.317 1.087 0.84 0.554 0.236 -0.123 -0.637 -1.835 -6 ,2992 ,KEBNE ,16721860,Sat Nov 27 20:33:49 CET,Sat Nov 27 22:08:01 CET,0.0 0.981 1.473 1.845 2.169 2.452 2.699 2.919 3.302 3.479 3.652 3.906 4.137 4.274 4.546 4.799 5.022 5.132 5.355 5.562 5.844 6.021 6.193 6.441 6.685 6.918 7.134 7.328 7.579 7.82 8.03 8.274 8.512 8.732 8.979 9.256 9.524 9.814 10.113 10.418 10.724 11.06 11.441 11.797 12.209 12.633 13.068 13.482 13.857 14.166 14.194 13.835 13.363 12.831 12.266 11.738 11.254 10.794 10.369 9.905 9.48 9.097 8.74 8.385 8.06 7.769 7.427 7.124 6.882 6.628 6.354 6.111 5.844 5.562 5.346 5.119 4.874 4.619 4.355 4.172 3.98 3.668 3.44 3.199 3.075 2.821 2.55 2.258 2.106 1.87 1.616 1.439 1.259 0.863 0.65 0.391 0.096 -0.214 -0.606 -1.119 -2.415 -7 ,32266 ,KEBNE ,16721861,Sat Nov 27 20:33:49 CET,Sat Nov 27 22:09:03 CET,0.0 1.484 1.984 2.367 2.684 2.947 3.194 3.424 3.833 4.014 4.176 4.397 4.618 4.751 5.003 5.242 5.473 5.584 5.776 5.956 6.22 6.389 6.553 6.792 7.009 7.208 7.401 7.601 7.863 8.095 8.31 8.572 8.817 9.038 9.279 9.561 9.85 10.146 10.447 10.737 11.01 11.323 11.673 12.023 12.415 12.813 13.284 13.757 14.2 14.531 14.54 14.132 13.624 13.092 12.56 12.027 11.511 11.022 10.597 10.169 9.808 9.498 9.183 8.857 8.54 8.252 7.957 7.685 7.432 7.166 6.881 6.637 6.393 6.142 5.937 5.72 5.488 5.242 4.98 4.79 4.597 4.307 4.099 3.869 3.75 3.498 3.225 2.933 2.78 2.547 2.315 2.141 1.963 1.583 1.356 1.1 0.817 0.488 0.088 -0.446 -1.605 -8 ,19402 ,KEBNE ,16721862,Sat Nov 27 20:33:50 CET,Sat Nov 27 22:08:10 CET,0.0 1.038 1.495 1.869 2.194 2.481 2.732 2.971 3.411 3.609 3.788 4.017 4.246 4.389 4.649 4.888 5.115 5.225 5.439 5.632 5.899 6.065 6.23 6.467 6.687 6.907 7.121 7.313 7.548 7.779 7.998 8.249 8.492 8.718 8.97 9.233 9.478 9.759 10.053 10.337 10.628 10.963 11.368 11.766 12.177 12.573 12.976 13.38 13.753 14.056 14.091 13.708 13.196 12.665 12.124 11.608 11.133 10.65 10.229 9.8 9.426 9.102 8.769 8.42 8.094 7.815 7.517 7.244 7.004 6.747 6.473 6.232 5.987 5.736 5.533 5.32 5.107 4.89 4.647 4.478 4.309 4.038 3.842 3.631 3.522 3.3 3.069 2.811 2.671 2.439 2.214 2.055 1.886 1.515 1.315 1.087 0.834 0.55 0.215 -0.229 -1.327 -9 ,20500 ,KEBNE ,16721863,Sat Nov 27 20:33:50 CET,Sat Nov 27 22:09:10 CET,0.0 1.061 1.457 1.774 2.05 2.305 2.543 2.742 3.102 3.263 3.415 3.619 3.833 3.958 4.191 4.412 4.628 4.728 4.915 5.097 5.361 5.518 5.66 5.876 6.078 6.267 6.444 6.608 6.825 7.044 7.255 7.496 7.708 7.91 8.153 8.416 8.676 8.962 9.25 9.54 9.821 10.12 10.464 10.789 11.146 11.535 11.943 12.312 12.666 12.96 13.023 12.703 12.175 11.661 11.156 10.631 10.146 9.685 9.278 8.861 8.488 8.144 7.809 7.485 7.171 6.883 6.588 6.312 6.062 5.816 5.565 5.354 5.139 4.902 4.705 4.503 4.29 4.064 3.833 3.669 3.502 3.238 3.042 2.825 2.714 2.49 2.249 1.994 1.853 1.626 1.424 1.262 1.081 0.695 0.472 0.218 -0.045 -0.351 -0.708 -1.161 -2.41 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_64.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_64.txt deleted file mode 100644 index e3da5030..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_65_64.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -6 ,81 ,KEBNE ,16721870,Sat Nov 27 20:34:51 CET,Sat Nov 27 22:09:09 CET,0.0 1.276 1.867 2.271 2.593 2.871 3.118 3.354 3.777 3.973 4.161 4.405 4.634 4.783 5.066 5.321 5.566 5.683 5.907 6.117 6.411 6.593 6.762 7.012 7.261 7.498 7.717 7.924 8.175 8.402 8.622 8.885 9.13 9.366 9.635 9.934 10.211 10.502 10.818 11.164 11.508 11.854 12.24 12.607 13.016 13.479 13.928 14.326 14.732 15.019 15.034 14.551 13.877 13.199 12.585 11.98 11.414 10.889 10.427 9.976 9.575 9.188 8.806 8.439 8.083 7.759 7.413 7.091 6.824 6.55 6.256 6.008 5.75 5.475 5.265 5.046 4.801 4.548 4.277 4.091 3.9 3.591 3.38 3.162 3.047 2.798 2.529 2.234 2.078 1.841 1.588 1.404 1.208 0.785 0.547 0.278 -0.017 -0.343 -0.75 -1.289 -2.734 -7 ,16607 ,KEBNE ,16721871,Sat Nov 27 20:34:51 CET,Sat Nov 27 22:10:41 CET,0.0 1.014 1.502 1.893 2.242 2.548 2.804 3.031 3.435 3.612 3.778 4.017 4.245 4.389 4.656 4.908 5.144 5.261 5.491 5.704 6.012 6.211 6.399 6.667 6.915 7.136 7.334 7.528 7.781 8.019 8.245 8.512 8.764 8.996 9.258 9.56 9.845 10.143 10.455 10.773 11.098 11.472 11.899 12.299 12.756 13.198 13.606 14.049 14.493 14.821 14.862 14.447 13.835 13.152 12.484 11.849 11.273 10.733 10.256 9.777 9.353 8.967 8.604 8.26 7.923 7.61 7.283 6.974 6.689 6.391 6.085 5.829 5.568 5.277 5.048 4.823 4.592 4.35 4.094 3.911 3.714 3.401 3.181 2.957 2.838 2.582 2.314 2.032 1.882 1.641 1.357 1.166 0.973 0.551 0.319 0.04 -0.289 -0.64 -1.046 -1.559 -2.879 -8 ,17808 ,KEBNE ,16721872,Sat Nov 27 20:34:51 CET,Sat Nov 27 22:08:51 CET,0.0 1.163 1.636 2.006 2.331 2.619 2.856 3.061 3.423 3.595 3.77 4.018 4.249 4.396 4.682 4.927 5.146 5.255 5.46 5.652 5.93 6.106 6.276 6.516 6.737 6.954 7.17 7.369 7.617 7.859 8.08 8.331 8.574 8.797 9.042 9.324 9.598 9.894 10.199 10.502 10.814 11.163 11.535 11.891 12.33 12.81 13.262 13.673 14.077 14.384 14.413 13.977 13.347 12.645 11.979 11.371 10.789 10.24 9.778 9.298 8.865 8.487 8.124 7.775 7.449 7.149 6.818 6.504 6.222 5.924 5.615 5.361 5.098 4.835 4.626 4.389 4.145 3.903 3.634 3.442 3.246 2.941 2.718 2.483 2.365 2.105 1.815 1.507 1.343 1.091 0.811 0.614 0.42 -0.002 -0.234 -0.499 -0.81 -1.161 -1.591 -2.145 -3.487 -9 ,8931 ,KEBNE ,16721873,Sat Nov 27 20:36:54 CET,Sat Nov 27 22:11:16 CET,0.0 1.379 1.838 2.198 2.51 2.775 3.03 3.278 3.706 3.892 4.063 4.305 4.535 4.692 5.0 5.263 5.508 5.621 5.83 6.036 6.324 6.504 6.683 6.954 7.2 7.417 7.629 7.829 8.073 8.314 8.546 8.813 9.059 9.298 9.583 9.915 10.227 10.548 10.886 11.235 11.589 11.944 12.322 12.721 13.144 13.577 14.064 14.561 14.971 15.189 15.188 14.731 14.098 13.421 12.767 12.122 11.525 10.984 10.492 10.012 9.605 9.22 8.835 8.464 8.13 7.821 7.466 7.154 6.884 6.593 6.295 6.043 5.775 5.497 5.277 5.051 4.811 4.551 4.273 4.081 3.885 3.563 3.332 3.095 2.973 2.724 2.464 2.184 2.032 1.79 1.535 1.351 1.147 0.683 0.424 0.148 -0.151 -0.49 -0.913 -1.473 -2.679 -10 ,2391 ,KEBNE ,16721874,Sat Nov 27 20:39:58 CET,Sat Nov 27 22:16:27 CET,0.0 1.596 2.213 2.684 3.038 3.326 3.577 3.811 4.2 4.375 4.562 4.83 5.064 5.212 5.493 5.747 5.981 6.096 6.324 6.535 6.809 6.981 7.145 7.381 7.61 7.833 8.05 8.258 8.521 8.763 8.989 9.26 9.518 9.76 10.023 10.301 10.581 10.879 11.197 11.546 11.902 12.289 12.701 13.067 13.478 13.933 14.387 14.819 15.239 15.589 15.666 15.175 14.558 13.923 13.282 12.681 12.111 11.543 11.041 10.554 10.136 9.733 9.344 8.983 8.643 8.322 7.985 7.688 7.425 7.156 6.864 6.604 6.325 6.039 5.822 5.599 5.357 5.086 4.795 4.608 4.422 4.115 3.888 3.653 3.532 3.286 3.027 2.732 2.571 2.324 2.066 1.884 1.686 1.247 1.001 0.723 0.417 0.07 -0.366 -0.933 -2.203 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_49.txt deleted file mode 100644 index 39dbe648..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_49.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5352 ,KEBNE ,16721875,Sat Nov 27 20:40:59 CET,Sat Nov 27 22:16:50 CET,0.0 1.203 1.722 2.138 2.48 2.788 3.079 3.344 3.824 4.052 4.27 4.529 4.871 5.055 5.414 5.761 6.089 6.243 6.564 6.881 7.309 7.585 7.858 8.251 8.631 9.002 9.372 9.729 10.166 10.58 10.989 11.502 11.996 12.468 13.038 13.684 14.317 15.002 15.72 16.509 17.383 18.369 19.522 20.704 22.074 23.638 25.481 27.601 30.152 33.143 36.888 40.046 41.868 43.012 43.734 44.2 44.526 44.782 44.907 44.961 44.967 44.928 44.859 44.768 44.675 44.57 44.417 44.276 44.155 44.009 43.84 43.686 43.501 43.332 43.192 43.015 42.841 42.66 42.469 42.324 42.169 41.933 41.753 41.547 41.433 41.182 40.923 40.65 40.499 40.24 39.99 39.793 39.58 39.113 38.857 38.55 38.225 37.848 37.336 36.614 33.792 -5 ,23797 ,KEBNE ,16721879,Sat Nov 27 20:45:05 CET,Sat Nov 27 22:19:26 CET,0.0 1.107 1.625 2.048 2.408 2.72 3.002 3.258 3.737 3.964 4.182 4.433 4.783 4.976 5.331 5.677 6.009 6.165 6.469 6.77 7.206 7.486 7.76 8.146 8.504 8.849 9.189 9.533 9.974 10.391 10.805 11.303 11.782 12.252 12.807 13.433 14.024 14.683 15.409 16.191 17.033 17.995 19.133 20.289 21.678 23.264 25.087 27.157 29.666 32.748 36.495 39.649 41.565 42.731 43.451 43.941 44.242 44.398 44.469 44.498 44.459 44.391 44.323 44.238 44.117 43.975 43.823 43.671 43.53 43.39 43.218 43.062 42.894 42.697 42.537 42.369 42.187 41.989 41.78 41.622 41.455 41.193 40.995 40.77 40.649 40.397 40.151 39.899 39.76 39.497 39.262 39.065 38.836 38.362 38.088 37.765 37.408 37.03 36.53 35.765 32.635 -6 ,19510 ,KEBNE ,16721880,Sat Nov 27 20:46:10 CET,Sat Nov 27 22:27:05 CET,0.0 1.16 1.698 2.125 2.502 2.836 3.122 3.391 3.88 4.104 4.319 4.573 4.916 5.103 5.456 5.803 6.136 6.294 6.597 6.898 7.338 7.62 7.888 8.272 8.639 8.987 9.338 9.69 10.131 10.541 10.953 11.459 11.948 12.424 12.97 13.593 14.199 14.87 15.595 16.373 17.201 18.16 19.289 20.417 21.767 23.319 25.187 27.281 29.738 32.833 36.602 39.787 41.714 42.872 43.586 44.037 44.344 44.55 44.639 44.673 44.639 44.569 44.502 44.428 44.322 44.177 44.001 43.866 43.744 43.592 43.405 43.228 43.044 42.837 42.673 42.504 42.306 42.079 41.859 41.715 41.557 41.296 41.103 40.892 40.785 40.541 40.262 39.966 39.814 39.546 39.302 39.118 38.919 38.439 38.148 37.834 37.486 37.076 36.547 35.83 34.201 -7 ,28910 ,KEBNE ,16721881,Sat Nov 27 20:47:08 CET,Sat Nov 27 22:23:44 CET,0.0 1.398 1.933 2.379 2.744 3.054 3.342 3.615 4.102 4.33 4.549 4.802 5.145 5.342 5.714 6.057 6.387 6.541 6.841 7.137 7.552 7.821 8.09 8.483 8.859 9.222 9.573 9.91 10.344 10.77 11.192 11.7 12.173 12.627 13.174 13.799 14.405 15.061 15.782 16.578 17.424 18.388 19.527 20.684 22.037 23.581 25.407 27.486 30.031 33.153 36.909 40.047 41.894 43.054 43.783 44.258 44.576 44.781 44.87 44.894 44.884 44.856 44.779 44.656 44.534 44.422 44.299 44.16 44.036 43.917 43.771 43.632 43.465 43.266 43.109 42.954 42.785 42.597 42.382 42.225 42.072 41.818 41.623 41.415 41.311 41.081 40.809 40.511 40.355 40.085 39.848 39.66 39.455 38.986 38.719 38.413 38.062 37.663 37.114 36.365 33.899 -8 ,12498 ,KEBNE ,16721882,Sat Nov 27 20:49:12 CET,Sat Nov 27 22:19:11 CET,0.0 1.084 1.573 1.971 2.324 2.637 2.915 3.183 3.68 3.918 4.164 4.477 4.828 5.02 5.389 5.742 6.068 6.224 6.526 6.811 7.229 7.506 7.772 8.154 8.525 8.883 9.238 9.586 10.023 10.449 10.863 11.36 11.835 12.286 12.834 13.466 14.061 14.728 15.474 16.274 17.105 18.04 19.157 20.302 21.631 23.121 24.91 27.009 29.584 32.711 36.458 39.456 41.2 42.297 42.981 43.44 43.74 43.938 44.055 44.098 44.084 44.009 43.897 43.811 43.73 43.612 43.455 43.313 43.178 43.021 42.821 42.656 42.492 42.299 42.151 41.997 41.824 41.644 41.455 41.306 41.138 40.857 40.653 40.439 40.324 40.064 39.801 39.538 39.391 39.128 38.906 38.721 38.507 38.027 37.772 37.496 37.142 36.683 36.096 35.349 33.027 -9 ,4768 ,KEBNE ,16721883,Sat Nov 27 20:49:10 CET,Sat Nov 27 22:23:50 CET,0.0 1.169 1.709 2.099 2.449 2.752 3.025 3.279 3.746 3.971 4.184 4.433 4.779 4.962 5.304 5.642 5.967 6.121 6.419 6.714 7.129 7.395 7.663 8.046 8.419 8.786 9.144 9.491 9.94 10.374 10.79 11.297 11.791 12.256 12.813 13.462 14.086 14.786 15.53 16.314 17.149 18.102 19.229 20.372 21.733 23.292 25.121 27.195 29.716 32.812 36.52 39.546 41.283 42.371 43.072 43.535 43.835 44.042 44.17 44.215 44.175 44.111 44.045 43.947 43.826 43.716 43.595 43.453 43.315 43.164 42.994 42.833 42.66 42.471 42.314 42.15 41.953 41.737 41.523 41.367 41.202 40.96 40.785 40.587 40.474 40.197 39.906 39.607 39.448 39.191 38.955 38.765 38.558 38.055 37.763 37.443 37.107 36.72 36.207 35.524 33.295 -10 ,257 ,KEBNE ,16721884,Sat Nov 27 20:49:10 CET,Sat Nov 27 22:24:45 CET,0.0 1.149 1.618 1.983 2.31 2.617 2.916 3.181 3.663 3.887 4.091 4.336 4.674 4.859 5.209 5.546 5.879 6.042 6.357 6.665 7.102 7.372 7.634 8.013 8.39 8.753 9.106 9.451 9.892 10.313 10.719 11.217 11.704 12.182 12.736 13.359 13.972 14.649 15.375 16.169 17.016 17.952 19.085 20.269 21.648 23.207 25.0 27.03 29.501 32.531 36.346 39.491 41.268 42.419 43.184 43.678 43.983 44.184 44.31 44.34 44.3 44.252 44.189 44.086 43.969 43.877 43.763 43.626 43.481 43.323 43.148 42.986 42.816 42.645 42.494 42.324 42.154 41.976 41.772 41.618 41.47 41.242 41.054 40.846 40.74 40.505 40.25 39.957 39.799 39.545 39.335 39.145 38.949 38.513 38.267 37.987 37.641 37.231 36.733 36.038 31.992 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_65.txt deleted file mode 100644 index 0e1b5098..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_65.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18753 ,KEBNE ,16721885,Sat Nov 27 20:49:10 CET,Sat Nov 27 22:23:33 CET,0.0 1.352 1.915 2.368 2.78 3.142 3.457 3.742 4.267 4.51 4.738 5.02 5.381 5.581 5.97 6.345 6.704 6.881 7.227 7.555 8.029 8.333 8.629 9.068 9.486 9.89 10.28 10.658 11.164 11.662 12.136 12.715 13.278 13.821 14.471 15.217 15.942 16.752 17.66 18.64 19.665 20.838 22.243 23.699 25.423 27.418 29.83 32.665 36.174 40.598 46.512 52.027 55.612 58.109 59.936 61.345 62.423 63.26 63.894 64.453 64.882 65.206 65.458 65.679 65.857 65.997 66.119 66.214 66.287 66.334 66.357 66.371 66.386 66.388 66.377 66.36 66.337 66.301 66.241 66.183 66.116 66.0 65.9 65.786 65.734 65.617 65.476 65.323 65.241 65.072 64.959 64.853 64.73 64.413 64.224 64.019 63.798 63.546 63.238 62.805 61.554 -2 ,15980 ,KEBNE ,16721886,Sat Nov 27 20:49:10 CET,Sat Nov 27 22:23:46 CET,0.0 1.038 1.589 2.018 2.384 2.723 3.042 3.326 3.837 4.077 4.308 4.599 4.953 5.155 5.555 5.932 6.284 6.458 6.792 7.111 7.575 7.872 8.168 8.612 9.034 9.438 9.838 10.229 10.75 11.255 11.723 12.306 12.888 13.436 14.068 14.798 15.527 16.348 17.245 18.208 19.254 20.474 21.916 23.386 25.147 27.202 29.64 32.499 36.058 40.548 46.449 51.843 55.399 57.916 59.759 61.194 62.27 63.108 63.759 64.333 64.754 65.077 65.352 65.581 65.76 65.899 66.025 66.125 66.195 66.24 66.267 66.271 66.273 66.268 66.246 66.208 66.164 66.115 66.045 65.982 65.916 65.803 65.699 65.592 65.54 65.424 65.299 65.166 65.086 64.903 64.76 64.65 64.533 64.257 64.086 63.901 63.695 63.425 63.079 62.599 61.333 -3 ,24440 ,KEBNE ,16721887,Sat Nov 27 20:49:10 CET,Sat Nov 27 22:24:49 CET,0.0 1.23 1.776 2.233 2.637 2.989 3.305 3.593 4.118 4.372 4.611 4.909 5.282 5.497 5.906 6.296 6.661 6.833 7.167 7.492 7.96 8.259 8.557 8.986 9.412 9.838 10.236 10.613 11.111 11.608 12.089 12.661 13.223 13.773 14.418 15.155 15.858 16.661 17.548 18.512 19.538 20.698 22.091 23.557 25.335 27.342 29.743 32.617 36.194 40.705 46.665 52.11 55.669 58.178 59.978 61.374 62.431 63.299 63.955 64.497 64.919 65.243 65.498 65.712 65.895 66.04 66.16 66.24 66.294 66.336 66.362 66.373 66.365 66.334 66.302 66.267 66.215 66.152 66.089 66.038 65.976 65.856 65.755 65.646 65.587 65.459 65.299 65.121 65.032 64.86 64.747 64.633 64.513 64.238 64.067 63.874 63.652 63.369 63.002 62.555 61.268 -4 ,14004 ,KEBNE ,16721888,Sat Nov 27 20:49:10 CET,Sat Nov 27 22:23:40 CET,0.0 1.088 1.553 1.946 2.303 2.625 2.91 3.162 3.64 3.869 4.09 4.364 4.72 4.918 5.298 5.657 5.999 6.171 6.506 6.817 7.262 7.552 7.83 8.239 8.64 9.031 9.415 9.786 10.264 10.73 11.193 11.763 12.307 12.848 13.498 14.236 14.972 15.797 16.68 17.645 18.685 19.88 21.307 22.767 24.539 26.588 29.019 31.882 35.363 39.75 45.615 51.064 54.634 57.159 59.014 60.438 61.5 62.335 62.972 63.532 63.951 64.276 64.552 64.79 64.991 65.144 65.279 65.382 65.453 65.501 65.534 65.556 65.56 65.545 65.528 65.497 65.442 65.371 65.301 65.251 65.194 65.087 64.998 64.902 64.851 64.736 64.594 64.431 64.343 64.173 64.044 63.923 63.797 63.517 63.347 63.143 62.899 62.617 62.247 61.78 60.506 -5 ,9538 ,KEBNE ,16721889,Sat Nov 27 20:50:12 CET,Sat Nov 27 22:27:20 CET,0.0 1.337 1.881 2.276 2.644 2.989 3.306 3.6 4.131 4.384 4.624 4.928 5.295 5.503 5.904 6.295 6.654 6.824 7.165 7.505 7.98 8.28 8.575 9.009 9.423 9.828 10.231 10.621 11.123 11.615 12.103 12.697 13.267 13.815 14.466 15.224 15.965 16.774 17.645 18.589 19.617 20.806 22.215 23.661 25.416 27.451 29.874 32.719 36.243 40.706 46.716 52.246 55.798 58.3 60.099 61.455 62.507 63.34 63.952 64.499 64.919 65.248 65.529 65.754 65.934 66.065 66.17 66.261 66.324 66.378 66.418 66.433 66.438 66.426 66.412 66.395 66.36 66.302 66.23 66.18 66.121 66.005 65.906 65.798 65.743 65.622 65.493 65.342 65.252 65.084 64.953 64.83 64.7 64.402 64.228 64.038 63.809 63.508 63.127 62.574 61.021 -6 ,29500 ,KEBNE ,16721890,Sat Nov 27 20:51:14 CET,Sat Nov 27 22:26:03 CET,0.0 1.599 2.199 2.656 3.036 3.372 3.688 3.991 4.553 4.811 5.054 5.366 5.724 5.929 6.315 6.67 7.015 7.189 7.544 7.883 8.355 8.65 8.951 9.402 9.834 10.252 10.653 11.045 11.556 12.04 12.52 13.118 13.706 14.273 14.93 15.684 16.407 17.212 18.101 19.066 20.094 21.28 22.722 24.209 25.976 28.021 30.488 33.359 36.881 41.366 47.236 52.659 56.244 58.774 60.616 62.035 63.11 63.955 64.585 65.143 65.573 65.918 66.207 66.428 66.595 66.723 66.83 66.905 66.958 67.001 67.026 67.03 67.026 67.004 66.972 66.925 66.866 66.808 66.734 66.675 66.611 66.492 66.394 66.291 66.237 66.103 65.957 65.805 65.717 65.542 65.415 65.293 65.148 64.84 64.668 64.453 64.201 63.929 63.597 63.101 61.362 -7 ,18615 ,KEBNE ,16721891,Sat Nov 27 20:51:14 CET,Sat Nov 27 22:27:13 CET,0.0 1.262 1.814 2.253 2.633 2.965 3.262 3.533 4.043 4.288 4.519 4.824 5.187 5.393 5.814 6.223 6.603 6.781 7.13 7.47 7.953 8.269 8.576 9.026 9.46 9.871 10.272 10.659 11.164 11.653 12.128 12.706 13.267 13.817 14.462 15.211 15.937 16.739 17.614 18.561 19.599 20.793 22.227 23.719 25.509 27.57 30.029 32.879 36.396 40.865 46.757 52.257 55.856 58.4 60.227 61.608 62.661 63.492 64.119 64.685 65.102 65.431 65.722 65.96 66.144 66.285 66.41 66.502 66.566 66.617 66.651 66.666 66.669 66.658 66.637 66.606 66.565 66.518 66.455 66.399 66.338 66.227 66.144 66.057 66.01 65.896 65.773 65.636 65.554 65.385 65.277 65.164 65.029 64.711 64.53 64.343 64.136 63.862 63.503 63.017 61.857 -8 ,31418 ,KEBNE ,16721892,Sat Nov 27 20:51:14 CET,Sat Nov 27 22:26:59 CET,0.0 0.988 1.489 1.866 2.215 2.531 2.805 3.064 3.541 3.761 3.977 4.24 4.587 4.786 5.161 5.511 5.863 6.029 6.338 6.647 7.096 7.391 7.681 8.107 8.517 8.899 9.282 9.662 10.142 10.609 11.075 11.639 12.187 12.712 13.318 14.026 14.742 15.547 16.416 17.369 18.392 19.548 20.938 22.388 24.127 26.125 28.483 31.287 34.789 39.248 45.167 50.616 54.246 56.807 58.685 60.117 61.186 62.046 62.703 63.291 63.746 64.1 64.394 64.633 64.826 64.973 65.104 65.217 65.291 65.354 65.402 65.418 65.435 65.45 65.434 65.408 65.381 65.337 65.285 65.251 65.211 65.117 65.042 64.961 64.911 64.805 64.697 64.561 64.485 64.327 64.232 64.125 64.005 63.755 63.601 63.416 63.212 62.982 62.711 62.323 61.131 -9 ,20613 ,KEBNE ,16721893,Sat Nov 27 20:51:17 CET,Sat Nov 27 22:32:00 CET,0.0 1.382 1.946 2.395 2.769 3.116 3.423 3.704 4.232 4.473 4.703 4.988 5.35 5.56 5.959 6.349 6.716 6.889 7.23 7.562 8.046 8.356 8.649 9.076 9.495 9.895 10.278 10.661 11.165 11.651 12.134 12.717 13.273 13.81 14.441 15.174 15.897 16.707 17.6 18.568 19.61 20.805 22.238 23.722 25.477 27.52 29.945 32.811 36.373 40.784 46.648 52.1 55.684 58.244 60.101 61.502 62.556 63.386 64.022 64.59 65.011 65.334 65.61 65.848 66.045 66.191 66.322 66.415 66.46 66.497 66.531 66.554 66.569 66.562 66.54 66.505 66.463 66.408 66.346 66.29 66.217 66.089 65.988 65.89 65.841 65.725 65.591 65.441 65.355 65.18 65.038 64.916 64.785 64.475 64.305 64.116 63.881 63.599 63.252 62.79 61.453 -10 ,30581 ,KEBNE ,16721894,Sat Nov 27 20:53:18 CET,Sat Nov 27 22:24:21 CET,0.0 1.355 1.907 2.339 2.702 3.025 3.338 3.641 4.185 4.434 4.68 4.986 5.345 5.546 5.931 6.305 6.659 6.826 7.165 7.49 7.95 8.25 8.545 8.972 9.388 9.798 10.196 10.59 11.104 11.604 12.106 12.708 13.281 13.838 14.486 15.236 15.966 16.755 17.63 18.589 19.619 20.828 22.269 23.723 25.457 27.472 29.876 32.701 36.208 40.648 46.493 51.895 55.458 58.003 59.848 61.235 62.283 63.116 63.742 64.294 64.708 65.031 65.307 65.533 65.722 65.864 65.975 66.059 66.105 66.133 66.17 66.197 66.198 66.176 66.149 66.122 66.092 66.045 65.98 65.93 65.874 65.772 65.692 65.585 65.52 65.378 65.238 65.091 65.008 64.834 64.704 64.586 64.462 64.174 63.996 63.794 63.558 63.284 62.951 62.472 61.031 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_68.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_68.txt deleted file mode 100644 index 4fc354d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_67_68.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,25335 ,KEBNE ,16721896,Sat Nov 27 20:55:19 CET,Sat Nov 27 22:30:23 CET,0.0 1.423 1.999 2.441 2.824 3.18 3.504 3.806 4.329 4.564 4.796 5.086 5.444 5.649 6.036 6.393 6.721 6.882 7.206 7.52 7.966 8.25 8.527 8.934 9.33 9.704 10.069 10.427 10.89 11.329 11.767 12.297 12.799 13.307 13.884 14.515 15.149 15.844 16.593 17.398 18.252 19.244 20.395 21.56 22.946 24.496 26.334 28.483 31.081 34.315 38.395 41.904 44.098 45.594 46.581 47.317 47.848 48.222 48.494 48.729 48.901 49.01 49.07 49.087 49.084 49.073 49.037 48.977 48.93 48.89 48.813 48.729 48.637 48.532 48.449 48.354 48.244 48.126 47.988 47.885 47.781 47.605 47.47 47.332 47.264 47.114 46.946 46.758 46.659 46.449 46.308 46.169 46.024 45.72 45.542 45.324 45.081 44.811 44.471 43.961 42.663 -3 ,752 ,KEBNE ,16721897,Sat Nov 27 20:55:19 CET,Sat Nov 27 22:30:16 CET,0.0 1.505 2.137 2.603 2.977 3.323 3.651 3.945 4.474 4.729 4.975 5.295 5.661 5.879 6.297 6.666 7.021 7.193 7.52 7.841 8.298 8.586 8.864 9.284 9.696 10.087 10.461 10.824 11.294 11.744 12.188 12.72 13.233 13.724 14.281 14.924 15.545 16.226 16.978 17.781 18.644 19.634 20.797 22.023 23.46 25.042 26.919 29.12 31.809 35.049 39.036 42.615 44.869 46.338 47.326 48.041 48.558 48.92 49.167 49.351 49.478 49.569 49.62 49.627 49.619 49.607 49.583 49.545 49.495 49.429 49.34 49.263 49.167 49.052 48.963 48.863 48.749 48.623 48.493 48.395 48.288 48.122 48.003 47.877 47.813 47.674 47.517 47.334 47.229 47.016 46.864 46.73 46.587 46.251 46.069 45.866 45.619 45.317 44.952 44.449 43.252 -4 ,17613 ,KEBNE ,16721898,Sat Nov 27 20:56:24 CET,Sat Nov 27 22:28:10 CET,0.0 1.557 2.215 2.7 3.091 3.442 3.752 4.018 4.522 4.775 5.017 5.309 5.663 5.863 6.241 6.6 6.942 7.105 7.423 7.735 8.19 8.471 8.737 9.14 9.528 9.904 10.27 10.626 11.094 11.534 11.959 12.485 13.01 13.518 14.104 14.761 15.401 16.129 16.902 17.718 18.579 19.54 20.691 21.881 23.301 24.915 26.822 29.037 31.653 34.838 38.857 42.302 44.514 45.986 47.013 47.802 48.364 48.771 49.049 49.263 49.39 49.476 49.545 49.586 49.584 49.573 49.558 49.512 49.459 49.392 49.316 49.254 49.172 49.074 48.997 48.909 48.799 48.674 48.547 48.454 48.355 48.201 48.079 47.937 47.865 47.715 47.539 47.348 47.247 47.036 46.896 46.752 46.594 46.269 46.1 45.911 45.668 45.373 45.04 44.591 43.324 -5 ,24905 ,KEBNE ,16721899,Sat Nov 27 20:57:26 CET,Sat Nov 27 22:28:10 CET,0.0 1.357 1.869 2.29 2.655 2.989 3.307 3.583 4.063 4.28 4.492 4.747 5.094 5.289 5.653 5.975 6.275 6.424 6.719 7.003 7.415 7.692 7.962 8.367 8.753 9.105 9.448 9.791 10.23 10.654 11.064 11.548 12.029 12.497 13.041 13.669 14.273 14.949 15.693 16.473 17.307 18.295 19.467 20.637 22.017 23.574 25.401 27.538 30.13 33.317 37.422 40.998 43.184 44.685 45.739 46.484 47.025 47.439 47.749 48.008 48.178 48.286 48.364 48.423 48.447 48.45 48.442 48.428 48.406 48.366 48.307 48.252 48.185 48.098 48.027 47.954 47.869 47.768 47.661 47.582 47.493 47.356 47.254 47.136 47.062 46.903 46.741 46.569 46.476 46.271 46.153 46.04 45.915 45.617 45.449 45.258 45.047 44.801 44.488 44.061 43.064 -6 ,23669 ,KEBNE ,16721900,Sat Nov 27 21:02:30 CET,Sat Nov 27 22:37:37 CET,0.0 1.412 1.958 2.413 2.816 3.174 3.493 3.772 4.301 4.548 4.778 5.073 5.43 5.632 6.026 6.405 6.763 6.937 7.264 7.564 7.995 8.276 8.553 8.952 9.339 9.717 10.071 10.414 10.871 11.315 11.729 12.232 12.724 13.194 13.747 14.394 15.011 15.693 16.455 17.267 18.133 19.117 20.308 21.523 22.945 24.598 26.537 28.734 31.316 34.451 38.444 41.982 44.183 45.607 46.578 47.294 47.796 48.143 48.388 48.581 48.711 48.799 48.849 48.878 48.893 48.893 48.865 48.821 48.784 48.742 48.685 48.628 48.553 48.458 48.372 48.268 48.159 48.049 47.923 47.825 47.72 47.552 47.421 47.277 47.203 47.046 46.867 46.667 46.559 46.341 46.205 46.083 45.944 45.575 45.359 45.138 44.894 44.609 44.256 43.817 42.662 -7 ,20479 ,KEBNE ,16721901,Sat Nov 27 21:02:30 CET,Sat Nov 27 22:37:31 CET,0.0 1.263 1.794 2.264 2.674 3.031 3.351 3.644 4.17 4.41 4.647 4.966 5.324 5.518 5.883 6.228 6.579 6.752 7.084 7.411 7.869 8.155 8.431 8.832 9.225 9.598 9.963 10.321 10.783 11.217 11.619 12.126 12.648 13.14 13.71 14.368 14.998 15.687 16.412 17.2 18.067 19.058 20.24 21.438 22.829 24.417 26.314 28.484 31.07 34.255 38.297 41.819 44.002 45.451 46.44 47.184 47.727 48.087 48.345 48.564 48.678 48.752 48.807 48.837 48.839 48.825 48.804 48.762 48.711 48.644 48.561 48.497 48.42 48.32 48.244 48.169 48.072 47.962 47.844 47.75 47.645 47.474 47.35 47.219 47.143 46.98 46.803 46.596 46.485 46.264 46.13 46.0 45.861 45.522 45.303 45.057 44.806 44.515 44.16 43.717 42.363 -8 ,19092 ,KEBNE ,16721902,Sat Nov 27 21:02:34 CET,Sat Nov 27 22:34:53 CET,0.0 1.613 2.212 2.695 3.103 3.477 3.81 4.092 4.602 4.85 5.086 5.373 5.736 5.934 6.304 6.653 6.996 7.167 7.49 7.806 8.25 8.532 8.812 9.204 9.573 9.942 10.306 10.657 11.107 11.546 11.966 12.466 12.963 13.449 14.006 14.641 15.264 15.96 16.721 17.52 18.379 19.401 20.604 21.788 23.161 24.718 26.596 28.801 31.387 34.5 38.543 42.113 44.329 45.805 46.821 47.584 48.129 48.491 48.731 48.937 49.077 49.196 49.271 49.287 49.283 49.277 49.248 49.198 49.157 49.107 49.043 48.979 48.898 48.805 48.725 48.632 48.522 48.4 48.268 48.172 48.067 47.897 47.768 47.617 47.538 47.37 47.186 46.978 46.87 46.662 46.528 46.405 46.269 45.97 45.797 45.584 45.343 45.042 44.651 44.12 42.784 -9 ,20460 ,KEBNE ,16721903,Sat Nov 27 21:03:31 CET,Sat Nov 27 22:39:02 CET,0.0 1.452 2.0 2.417 2.772 3.096 3.378 3.646 4.138 4.36 4.569 4.808 5.148 5.339 5.703 6.051 6.393 6.551 6.857 7.161 7.584 7.848 8.104 8.497 8.882 9.249 9.614 9.961 10.389 10.819 11.238 11.75 12.271 12.776 13.346 13.995 14.636 15.339 16.107 16.94 17.814 18.797 19.951 21.141 22.578 24.188 26.076 28.263 30.854 34.089 38.229 41.777 43.954 45.43 46.461 47.192 47.714 48.09 48.366 48.597 48.722 48.796 48.847 48.877 48.887 48.883 48.857 48.813 48.764 48.705 48.631 48.56 48.482 48.398 48.329 48.247 48.149 48.036 47.907 47.819 47.718 47.529 47.394 47.249 47.174 47.022 46.848 46.645 46.535 46.32 46.173 46.041 45.893 45.56 45.376 45.162 44.928 44.646 44.287 43.801 42.577 -10 ,21202 ,KEBNE ,16721904,Sat Nov 27 21:04:33 CET,Sat Nov 27 22:40:31 CET,0.0 1.285 1.857 2.276 2.623 2.953 3.271 3.557 4.081 4.328 4.562 4.847 5.208 5.405 5.755 6.105 6.443 6.605 6.937 7.265 7.709 7.98 8.251 8.651 9.038 9.421 9.801 10.15 10.584 11.021 11.45 11.957 12.452 12.95 13.531 14.183 14.804 15.513 16.287 17.115 17.99 18.955 20.101 21.269 22.668 24.26 26.137 28.31 30.966 34.236 38.332 41.894 44.094 45.58 46.633 47.376 47.907 48.291 48.537 48.74 48.897 49.006 49.073 49.119 49.143 49.141 49.13 49.102 49.059 49.006 48.94 48.867 48.772 48.66 48.564 48.461 48.344 48.229 48.109 48.009 47.9 47.724 47.599 47.466 47.394 47.23 47.048 46.837 46.725 46.514 46.387 46.261 46.124 45.817 45.627 45.4 45.152 44.851 44.475 44.043 42.786 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_49.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_49.txt deleted file mode 100644 index 3a752ad1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_49.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23718 ,KEBNE ,16721905,Sat Nov 27 21:03:31 CET,Sat Nov 27 22:37:58 CET,0.0 1.099 1.549 1.9 2.204 2.474 2.736 2.97 3.355 3.534 3.701 3.906 4.16 4.304 4.567 4.8 5.026 5.134 5.338 5.536 5.813 5.985 6.151 6.385 6.61 6.831 7.041 7.239 7.479 7.703 7.931 8.207 8.451 8.675 8.929 9.221 9.498 9.789 10.106 10.45 10.782 11.114 11.492 11.861 12.249 12.641 13.017 13.327 13.652 13.912 13.715 13.001 12.216 11.393 10.588 9.81 9.112 8.469 7.899 7.327 6.819 6.356 5.903 5.489 5.091 4.699 4.284 3.902 3.577 3.244 2.873 2.545 2.211 1.879 1.623 1.349 1.072 0.782 0.458 0.239 0.006 -0.396 -0.67 -0.947 -1.094 -1.407 -1.763 -2.156 -2.362 -2.677 -2.991 -3.239 -3.503 -4.064 -4.375 -4.712 -5.116 -5.601 -6.177 -6.955 -9.318 -2 ,19824 ,KEBNE ,16721906,Sat Nov 27 21:03:31 CET,Sat Nov 27 22:39:35 CET,0.0 1.364 1.846 2.189 2.483 2.743 2.982 3.204 3.587 3.757 3.918 4.122 4.369 4.505 4.763 5.002 5.222 5.331 5.547 5.744 6.024 6.212 6.396 6.662 6.914 7.142 7.348 7.545 7.798 8.03 8.252 8.537 8.811 9.054 9.332 9.64 9.904 10.188 10.502 10.842 11.173 11.522 11.907 12.281 12.695 13.1 13.478 13.801 14.113 14.309 14.157 13.498 12.692 11.848 11.03 10.263 9.569 8.92 8.348 7.769 7.256 6.793 6.342 5.9 5.47 5.063 4.654 4.306 3.973 3.593 3.203 2.886 2.543 2.173 1.886 1.599 1.309 1.019 0.691 0.445 0.207 -0.155 -0.416 -0.705 -0.871 -1.206 -1.535 -1.898 -2.086 -2.39 -2.715 -2.933 -3.161 -3.716 -4.042 -4.394 -4.791 -5.265 -5.808 -6.562 -9.62 -3 ,32595 ,KEBNE ,16721907,Sat Nov 27 21:04:33 CET,Sat Nov 27 22:40:08 CET,0.0 1.127 1.572 1.911 2.221 2.496 2.738 2.958 3.355 3.545 3.725 3.962 4.224 4.365 4.621 4.864 5.096 5.205 5.414 5.614 5.904 6.089 6.26 6.499 6.727 6.948 7.156 7.35 7.58 7.793 8.01 8.269 8.515 8.751 9.023 9.316 9.592 9.89 10.203 10.519 10.838 11.183 11.545 11.877 12.241 12.623 13.013 13.379 13.665 13.769 13.506 12.74 11.927 11.119 10.341 9.583 8.87 8.214 7.662 7.084 6.554 6.077 5.605 5.137 4.703 4.324 3.925 3.565 3.24 2.875 2.487 2.172 1.841 1.463 1.155 0.846 0.538 0.226 -0.104 -0.338 -0.576 -0.991 -1.287 -1.584 -1.738 -2.051 -2.404 -2.793 -2.995 -3.316 -3.664 -3.918 -4.178 -4.769 -5.095 -5.447 -5.854 -6.33 -6.862 -7.629 -10.341 -4 ,15152 ,KEBNE ,16721908,Sat Nov 27 21:06:37 CET,Sat Nov 27 22:42:13 CET,0.0 1.217 1.715 2.085 2.38 2.638 2.885 3.105 3.475 3.649 3.822 4.046 4.292 4.432 4.695 4.923 5.145 5.254 5.455 5.645 5.914 6.081 6.247 6.493 6.725 6.937 7.144 7.346 7.593 7.827 8.055 8.321 8.555 8.776 9.032 9.325 9.611 9.92 10.241 10.555 10.869 11.212 11.592 11.963 12.363 12.755 13.162 13.542 13.854 14.032 13.847 13.13 12.327 11.51 10.688 9.9 9.179 8.518 7.925 7.312 6.782 6.305 5.847 5.4 4.976 4.586 4.181 3.818 3.5 3.176 2.838 2.544 2.218 1.872 1.607 1.349 1.069 0.737 0.39 0.143 -0.111 -0.477 -0.737 -1.03 -1.182 -1.5 -1.835 -2.195 -2.391 -2.704 -3.02 -3.255 -3.497 -4.022 -4.324 -4.65 -5.044 -5.511 -6.061 -6.742 -9.193 -5 ,25012 ,KEBNE ,16721909,Sat Nov 27 21:07:39 CET,Sat Nov 27 22:43:52 CET,0.0 1.12 1.602 1.997 2.315 2.587 2.837 3.065 3.45 3.621 3.781 3.995 4.255 4.393 4.647 4.878 5.102 5.216 5.431 5.627 5.913 6.089 6.257 6.501 6.729 6.948 7.159 7.362 7.617 7.85 8.063 8.329 8.591 8.836 9.098 9.382 9.669 9.976 10.289 10.61 10.932 11.304 11.729 12.103 12.494 12.897 13.304 13.668 13.948 14.091 13.906 13.146 12.23 11.357 10.568 9.788 9.093 8.467 7.902 7.321 6.808 6.349 5.898 5.444 5.018 4.613 4.176 3.791 3.464 3.127 2.756 2.443 2.111 1.758 1.503 1.241 0.95 0.647 0.336 0.109 -0.132 -0.501 -0.774 -1.062 -1.205 -1.502 -1.83 -2.202 -2.393 -2.684 -2.969 -3.204 -3.466 -4.019 -4.324 -4.676 -5.081 -5.52 -6.063 -6.83 -9.822 -6 ,29043 ,KEBNE ,16721910,Sat Nov 27 21:07:39 CET,Sat Nov 27 22:42:25 CET,0.0 1.38 1.899 2.274 2.585 2.858 3.099 3.316 3.697 3.873 4.036 4.242 4.5 4.642 4.906 5.148 5.377 5.488 5.699 5.894 6.176 6.362 6.532 6.781 7.031 7.256 7.462 7.663 7.915 8.157 8.391 8.669 8.922 9.164 9.437 9.733 10.016 10.29 10.569 10.889 11.243 11.625 12.035 12.429 12.85 13.262 13.646 13.964 14.243 14.462 14.363 13.649 12.767 11.925 11.157 10.407 9.726 9.066 8.448 7.847 7.327 6.855 6.397 5.941 5.53 5.146 4.745 4.386 4.061 3.727 3.354 3.044 2.729 2.374 2.101 1.827 1.534 1.226 0.9 0.678 0.437 0.021 -0.276 -0.567 -0.716 -1.031 -1.372 -1.749 -1.952 -2.265 -2.586 -2.829 -3.091 -3.633 -3.931 -4.266 -4.643 -5.107 -5.711 -6.551 -9.256 -7 ,3961 ,KEBNE ,16721911,Sat Nov 27 21:07:39 CET,Sat Nov 27 22:42:43 CET,0.0 1.239 1.728 2.108 2.407 2.667 2.905 3.13 3.517 3.693 3.865 4.069 4.317 4.453 4.705 4.943 5.167 5.275 5.481 5.673 5.942 6.115 6.288 6.537 6.763 6.976 7.176 7.368 7.619 7.855 8.089 8.364 8.613 8.845 9.093 9.368 9.637 9.932 10.247 10.563 10.895 11.255 11.642 12.007 12.39 12.763 13.159 13.528 13.834 13.987 13.794 13.154 12.326 11.489 10.701 9.958 9.271 8.589 7.994 7.398 6.878 6.419 5.958 5.5 5.091 4.723 4.312 3.935 3.611 3.266 2.886 2.57 2.234 1.892 1.641 1.364 1.067 0.773 0.46 0.233 -0.006 -0.39 -0.653 -0.936 -1.094 -1.43 -1.78 -2.146 -2.331 -2.63 -2.96 -3.207 -3.477 -4.053 -4.372 -4.744 -5.173 -5.635 -6.173 -7.032 -10.267 -10 ,7496 ,KEBNE ,16721914,Sat Nov 27 21:09:42 CET,Sat Nov 27 22:44:16 CET,0.0 1.182 1.704 2.087 2.394 2.678 2.942 3.172 3.572 3.749 3.913 4.12 4.366 4.506 4.772 5.021 5.256 5.365 5.576 5.771 6.039 6.214 6.385 6.625 6.849 7.067 7.29 7.498 7.742 7.968 8.188 8.458 8.718 8.957 9.22 9.498 9.764 10.058 10.36 10.69 11.046 11.424 11.809 12.165 12.573 12.995 13.428 13.801 14.129 14.351 14.072 13.295 12.51 11.7 10.9 10.122 9.404 8.769 8.203 7.597 7.068 6.602 6.153 5.723 5.301 4.889 4.449 4.048 3.71 3.356 2.98 2.668 2.341 1.985 1.706 1.432 1.142 0.811 0.477 0.257 0.018 -0.363 -0.614 -0.878 -1.03 -1.341 -1.655 -2.017 -2.212 -2.528 -2.878 -3.125 -3.393 -3.984 -4.31 -4.67 -5.088 -5.589 -6.178 -7.023 -9.795 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_65.txt deleted file mode 100644 index 0d905b35..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_68_65.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2419 ,KEBNE ,17026122,Wed Dec 22 13:50:40 CET,Wed Dec 22 15:12:01 CET,0.0 1.297 1.902 2.364 2.741 3.058 3.333 3.59 4.069 4.285 4.486 4.745 5.022 5.199 5.562 5.888 6.181 6.327 6.601 6.861 7.233 7.469 7.694 8.028 8.34 8.627 8.908 9.181 9.53 9.864 10.191 10.572 10.949 11.317 11.74 12.209 12.641 13.109 13.621 14.19 14.799 15.477 16.276 17.09 18.019 19.036 20.203 21.473 22.959 24.819 27.002 28.593 29.345 29.698 29.847 29.899 29.879 29.785 29.678 29.516 29.346 29.199 29.027 28.841 28.665 28.473 28.258 28.066 27.895 27.709 27.509 27.347 27.175 26.994 26.844 26.668 26.481 26.293 26.088 25.938 25.778 25.508 25.311 25.102 24.989 24.764 24.544 24.288 24.142 23.912 23.662 23.484 23.291 22.858 22.624 22.369 22.074 21.699 21.239 20.659 18.26 -3 ,16469 ,KEBNE ,17026124,Wed Dec 22 13:50:41 CET,Wed Dec 22 15:14:13 CET,0.0 1.429 1.982 2.415 2.767 3.067 3.338 3.596 4.057 4.268 4.482 4.771 5.045 5.214 5.545 5.843 6.122 6.26 6.525 6.776 7.136 7.371 7.609 7.944 8.253 8.548 8.838 9.112 9.454 9.78 10.097 10.48 10.848 11.216 11.632 12.08 12.506 12.995 13.534 14.105 14.685 15.331 16.137 16.946 17.856 18.851 20.0 21.297 22.811 24.578 26.632 28.249 29.044 29.378 29.534 29.594 29.583 29.481 29.328 29.156 28.985 28.819 28.645 28.476 28.283 28.06 27.842 27.646 27.471 27.282 27.048 26.847 26.648 26.429 26.258 26.088 25.911 25.721 25.499 25.341 25.176 24.908 24.724 24.525 24.419 24.193 23.94 23.671 23.534 23.313 23.065 22.885 22.695 22.273 22.037 21.763 21.463 21.137 20.722 20.114 18.411 -4 ,13402 ,KEBNE ,17025859,Wed Dec 22 13:36:21 CET,Wed Dec 22 15:13:01 CET,0.0 1.474 1.981 2.377 2.726 3.033 3.303 3.558 4.049 4.273 4.476 4.759 5.042 5.212 5.539 5.85 6.127 6.259 6.527 6.796 7.173 7.406 7.624 7.927 8.235 8.539 8.826 9.099 9.444 9.781 10.115 10.513 10.886 11.243 11.645 12.088 12.522 13.024 13.574 14.15 14.765 15.448 16.231 17.018 17.899 18.863 19.985 21.268 22.77 24.539 26.636 28.203 28.985 29.383 29.594 29.679 29.638 29.528 29.392 29.22 29.044 28.848 28.636 28.424 28.22 28.036 27.837 27.651 27.473 27.276 27.079 26.902 26.714 26.514 26.339 26.158 25.976 25.776 25.556 25.403 25.238 24.975 24.789 24.589 24.481 24.249 23.999 23.739 23.594 23.357 23.117 22.951 22.763 22.332 22.099 21.843 21.525 21.134 20.693 20.118 18.454 -5 ,8666 ,KEBNE ,17025860,Wed Dec 22 13:36:21 CET,Wed Dec 22 15:13:33 CET,0.0 1.439 2.001 2.392 2.723 3.026 3.298 3.551 4.002 4.22 4.43 4.704 4.98 5.143 5.457 5.757 6.039 6.178 6.445 6.693 7.044 7.276 7.497 7.813 8.103 8.38 8.658 8.929 9.279 9.615 9.938 10.321 10.694 11.059 11.477 11.961 12.427 12.914 13.451 14.029 14.617 15.277 16.038 16.796 17.693 18.71 19.855 21.138 22.674 24.461 26.56 28.099 28.822 29.21 29.4 29.449 29.417 29.331 29.229 29.103 28.952 28.775 28.577 28.362 28.158 27.973 27.765 27.565 27.379 27.181 26.973 26.791 26.592 26.383 26.212 26.033 25.849 25.645 25.435 25.289 25.123 24.869 24.694 24.497 24.387 24.163 23.937 23.671 23.52 23.289 23.039 22.865 22.678 22.238 21.985 21.712 21.405 21.046 20.594 20.033 18.372 -6 ,5731 ,KEBNE ,17025861,Wed Dec 22 13:36:21 CET,Wed Dec 22 15:13:06 CET,0.0 1.42 1.978 2.388 2.733 3.032 3.302 3.552 4.02 4.231 4.432 4.694 4.971 5.138 5.446 5.737 6.019 6.158 6.429 6.682 7.053 7.292 7.513 7.815 8.098 8.371 8.646 8.915 9.258 9.588 9.907 10.301 10.679 11.04 11.47 11.944 12.384 12.863 13.385 13.939 14.523 15.179 15.923 16.69 17.588 18.606 19.805 21.103 22.586 24.346 26.438 28.003 28.797 29.217 29.426 29.479 29.435 29.316 29.165 29.002 28.844 28.676 28.48 28.283 28.082 27.88 27.663 27.456 27.275 27.089 26.876 26.686 26.481 26.252 26.062 25.873 25.664 25.439 25.226 25.078 24.917 24.647 24.456 24.265 24.165 23.936 23.692 23.452 23.317 23.089 22.853 22.679 22.478 22.048 21.809 21.54 21.244 20.9 20.492 19.916 17.917 -7 ,15977 ,KEBNE ,17025862,Wed Dec 22 13:36:21 CET,Wed Dec 22 15:12:53 CET,0.0 1.536 2.101 2.523 2.878 3.189 3.483 3.75 4.207 4.419 4.617 4.878 5.159 5.335 5.67 5.984 6.278 6.419 6.684 6.93 7.3 7.533 7.751 8.088 8.406 8.702 8.989 9.257 9.6 9.93 10.241 10.61 10.962 11.324 11.759 12.233 12.691 13.211 13.765 14.329 14.923 15.591 16.391 17.194 18.11 19.151 20.346 21.637 23.141 24.993 27.146 28.699 29.422 29.769 29.97 30.067 30.037 29.935 29.819 29.647 29.473 29.299 29.118 28.947 28.78 28.602 28.393 28.198 28.033 27.86 27.67 27.505 27.325 27.115 26.942 26.762 26.566 26.362 26.142 25.98 25.813 25.549 25.364 25.175 25.069 24.84 24.594 24.33 24.191 23.958 23.703 23.536 23.364 22.945 22.713 22.461 22.173 21.855 21.458 20.848 18.609 -8 ,5944 ,KEBNE ,17026129,Wed Dec 22 13:51:41 CET,Wed Dec 22 15:13:29 CET,0.0 1.157 1.655 2.039 2.397 2.721 3.005 3.276 3.746 3.952 4.157 4.433 4.715 4.884 5.195 5.487 5.765 5.9 6.166 6.431 6.798 7.028 7.26 7.606 7.928 8.22 8.502 8.778 9.148 9.5 9.821 10.218 10.612 10.985 11.413 11.876 12.306 12.787 13.29 13.835 14.445 15.128 15.886 16.638 17.555 18.585 19.778 21.103 22.574 24.271 26.322 27.91 28.702 29.076 29.174 29.193 29.175 29.099 28.975 28.791 28.591 28.4 28.2 27.993 27.813 27.64 27.44 27.245 27.055 26.86 26.662 26.486 26.298 26.093 25.925 25.744 25.538 25.324 25.116 24.971 24.819 24.562 24.373 24.167 24.058 23.833 23.58 23.3 23.147 22.908 22.661 22.481 22.287 21.856 21.597 21.309 20.995 20.638 20.21 19.648 17.747 -9 ,23099 ,KEBNE ,17025864,Wed Dec 22 13:36:21 CET,Wed Dec 22 15:13:29 CET,0.0 1.153 1.682 2.105 2.477 2.808 3.106 3.392 3.899 4.123 4.33 4.588 4.858 5.026 5.341 5.637 5.917 6.052 6.317 6.567 6.92 7.148 7.366 7.672 7.963 8.25 8.521 8.781 9.132 9.468 9.785 10.178 10.583 10.973 11.411 11.879 12.323 12.821 13.34 13.896 14.507 15.186 15.955 16.728 17.636 18.631 19.78 21.106 22.64 24.411 26.491 28.008 28.747 29.135 29.309 29.378 29.35 29.232 29.087 28.897 28.706 28.518 28.326 28.143 27.965 27.774 27.567 27.387 27.219 27.027 26.818 26.635 26.432 26.225 26.058 25.867 25.666 25.469 25.255 25.094 24.918 24.649 24.458 24.245 24.123 23.887 23.658 23.397 23.258 23.03 22.794 22.62 22.439 22.031 21.797 21.513 21.197 20.857 20.418 19.802 18.43 -10 ,26228 ,KEBNE ,17025865,Wed Dec 22 13:36:21 CET,Wed Dec 22 15:12:57 CET,0.0 1.472 2.03 2.44 2.794 3.095 3.358 3.597 4.039 4.261 4.47 4.744 5.025 5.186 5.496 5.788 6.062 6.198 6.453 6.698 7.062 7.29 7.502 7.814 8.12 8.419 8.703 8.974 9.336 9.673 9.987 10.361 10.724 11.083 11.494 11.955 12.402 12.903 13.451 14.036 14.647 15.313 16.096 16.879 17.785 18.819 19.996 21.309 22.844 24.619 26.709 28.364 29.23 29.619 29.793 29.849 29.853 29.788 29.639 29.442 29.253 29.082 28.904 28.735 28.552 28.35 28.125 27.906 27.715 27.525 27.316 27.14 26.95 26.732 26.559 26.376 26.172 25.958 25.742 25.591 25.431 25.173 24.987 24.794 24.697 24.484 24.246 23.99 23.854 23.618 23.338 23.148 22.956 22.519 22.275 21.997 21.69 21.353 20.914 20.333 18.727 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_65.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_65.txt deleted file mode 100644 index b98fce10..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_65.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26841 ,KEBNE ,16721915,Sat Nov 27 21:09:42 CET,Sat Nov 27 22:45:48 CET,0.0 1.301 1.873 2.293 2.618 2.919 3.175 3.406 3.827 4.006 4.165 4.377 4.6 4.737 4.997 5.237 5.474 5.589 5.806 6.009 6.289 6.468 6.642 6.881 7.112 7.348 7.575 7.781 8.043 8.289 8.515 8.777 9.033 9.289 9.576 9.874 10.152 10.472 10.808 11.158 11.537 11.944 12.393 12.831 13.302 13.812 14.375 14.958 15.559 16.159 16.65 16.635 16.331 15.983 15.63 15.232 14.797 14.35 13.96 13.578 13.231 12.923 12.626 12.303 11.986 11.702 11.401 11.123 10.873 10.592 10.287 10.049 9.801 9.503 9.263 9.019 8.756 8.491 8.217 8.032 7.844 7.544 7.325 7.085 6.962 6.695 6.408 6.104 5.938 5.683 5.382 5.189 4.994 4.529 4.262 3.959 3.616 3.21 2.741 2.129 -0.064 -2 ,29434 ,KEBNE ,16721916,Sat Nov 27 21:09:42 CET,Sat Nov 27 22:44:36 CET,0.0 1.252 1.733 2.111 2.437 2.735 2.984 3.199 3.585 3.756 3.924 4.156 4.385 4.531 4.803 5.057 5.287 5.397 5.619 5.83 6.114 6.298 6.479 6.735 6.969 7.183 7.396 7.604 7.859 8.103 8.348 8.636 8.904 9.151 9.429 9.732 10.009 10.31 10.652 11.025 11.391 11.79 12.254 12.713 13.23 13.77 14.348 14.975 15.598 16.167 16.656 16.736 16.515 16.155 15.692 15.198 14.726 14.277 13.863 13.438 13.081 12.75 12.418 12.101 11.799 11.52 11.22 10.931 10.685 10.433 10.169 9.92 9.644 9.365 9.138 8.915 8.699 8.475 8.226 8.048 7.866 7.577 7.365 7.136 7.023 6.778 6.506 6.209 6.045 5.796 5.513 5.332 5.143 4.688 4.428 4.139 3.822 3.458 3.039 2.494 -0.022 -5 ,8053 ,KEBNE ,16721919,Sat Nov 27 21:12:47 CET,Sat Nov 27 22:48:19 CET,0.0 1.244 1.732 2.109 2.459 2.765 3.02 3.237 3.634 3.821 4.005 4.266 4.502 4.647 4.915 5.157 5.388 5.5 5.721 5.932 6.229 6.411 6.584 6.84 7.09 7.326 7.549 7.755 8.011 8.263 8.495 8.773 9.05 9.312 9.606 9.926 10.216 10.523 10.865 11.213 11.564 11.964 12.42 12.857 13.353 13.891 14.451 15.056 15.702 16.338 16.838 16.925 16.702 16.348 15.987 15.616 15.221 14.803 14.423 14.044 13.703 13.399 13.075 12.764 12.483 12.187 11.862 11.587 11.35 11.1 10.833 10.604 10.352 10.078 9.871 9.657 9.42 9.159 8.877 8.673 8.455 8.107 7.874 7.64 7.518 7.255 6.984 6.696 6.531 6.276 5.991 5.79 5.575 5.078 4.812 4.538 4.228 3.864 3.399 2.713 0.469 -6 ,2010 ,KEBNE ,16721920,Sat Nov 27 21:13:49 CET,Sat Nov 27 22:50:30 CET,0.0 1.174 1.67 2.028 2.355 2.646 2.895 3.118 3.515 3.692 3.865 4.11 4.339 4.479 4.767 5.05 5.298 5.411 5.629 5.836 6.117 6.286 6.456 6.705 6.932 7.15 7.362 7.568 7.827 8.078 8.318 8.593 8.852 9.092 9.367 9.666 9.945 10.256 10.601 10.966 11.323 11.715 12.163 12.593 13.078 13.593 14.144 14.715 15.33 15.924 16.361 16.398 16.141 15.785 15.443 15.065 14.659 14.261 13.873 13.445 13.058 12.707 12.373 12.024 11.679 11.367 11.047 10.777 10.531 10.25 9.96 9.727 9.487 9.238 9.035 8.818 8.586 8.333 8.078 7.89 7.692 7.385 7.15 6.896 6.771 6.522 6.249 5.953 5.793 5.548 5.271 5.069 4.847 4.368 4.106 3.805 3.472 3.055 2.533 1.888 -0.259 -7 ,20487 ,KEBNE ,16721921,Sat Nov 27 21:13:49 CET,Sat Nov 27 22:51:34 CET,0.0 1.545 2.006 2.384 2.701 2.973 3.22 3.447 3.849 4.03 4.202 4.434 4.663 4.809 5.094 5.358 5.591 5.704 5.923 6.12 6.397 6.576 6.741 6.972 7.199 7.421 7.625 7.823 8.079 8.317 8.551 8.84 9.109 9.356 9.617 9.907 10.189 10.49 10.805 11.142 11.489 11.865 12.309 12.754 13.248 13.76 14.31 14.878 15.468 16.048 16.515 16.59 16.357 15.963 15.531 15.134 14.756 14.371 14.016 13.632 13.272 12.918 12.572 12.249 11.942 11.652 11.342 11.069 10.824 10.559 10.281 10.047 9.801 9.534 9.314 9.072 8.81 8.547 8.271 8.085 7.888 7.559 7.329 7.096 6.975 6.716 6.447 6.143 5.989 5.75 5.479 5.291 5.087 4.632 4.367 4.066 3.705 3.309 2.862 2.267 -0.106 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_70.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_70.txt deleted file mode 100644 index 48ed6325..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_69_70.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30232 ,KEBNE ,16721925,Sat Nov 27 21:14:02 CET,Sat Nov 27 22:45:30 CET,0.0 1.471 2.002 2.415 2.73 2.984 3.204 3.402 3.753 3.919 4.08 4.3 4.527 4.661 4.915 5.144 5.347 5.444 5.635 5.82 6.073 6.231 6.38 6.594 6.796 6.988 7.175 7.365 7.613 7.826 8.025 8.275 8.522 8.743 8.981 9.249 9.498 9.758 10.039 10.324 10.61 10.944 11.308 11.631 11.981 12.358 12.78 13.2 13.591 13.938 14.098 13.854 13.421 12.954 12.499 12.046 11.605 11.172 10.761 10.334 9.978 9.643 9.305 8.979 8.677 8.396 8.084 7.803 7.562 7.315 7.049 6.817 6.579 6.325 6.115 5.898 5.678 5.446 5.195 5.018 4.841 4.557 4.343 4.102 3.98 3.736 3.476 3.207 3.062 2.825 2.58 2.404 2.22 1.809 1.579 1.312 1.013 0.69 0.301 -0.238 -1.675 -2 ,19628 ,KEBNE ,16721926,Sat Nov 27 21:14:02 CET,Sat Nov 27 22:46:42 CET,0.0 1.722 2.22 2.565 2.855 3.114 3.344 3.552 3.92 4.088 4.252 4.48 4.703 4.835 5.075 5.301 5.516 5.618 5.822 6.02 6.29 6.45 6.601 6.828 7.039 7.228 7.41 7.589 7.827 8.059 8.275 8.519 8.741 8.973 9.245 9.524 9.769 10.042 10.343 10.656 10.968 11.291 11.642 11.982 12.378 12.784 13.19 13.589 14.005 14.389 14.569 14.293 13.857 13.398 12.94 12.485 12.021 11.576 11.179 10.76 10.382 10.049 9.731 9.407 9.1 8.824 8.533 8.259 8.022 7.769 7.501 7.271 7.03 6.795 6.606 6.406 6.202 5.988 5.745 5.574 5.402 5.124 4.926 4.717 4.61 4.379 4.127 3.86 3.721 3.49 3.249 3.081 2.912 2.54 2.319 2.068 1.787 1.466 1.062 0.538 -0.86 -3 ,19231 ,KEBNE ,16721927,Sat Nov 27 21:14:02 CET,Sat Nov 27 22:42:54 CET,0.0 1.372 1.89 2.288 2.601 2.874 3.112 3.319 3.692 3.864 4.022 4.227 4.442 4.567 4.805 5.034 5.251 5.354 5.541 5.707 5.957 6.122 6.275 6.492 6.715 6.922 7.106 7.287 7.521 7.742 7.947 8.202 8.437 8.65 8.905 9.181 9.432 9.698 9.982 10.291 10.603 10.933 11.285 11.601 11.955 12.335 12.718 13.082 13.44 13.779 13.944 13.676 13.256 12.787 12.315 11.859 11.419 10.969 10.577 10.163 9.806 9.506 9.195 8.882 8.589 8.324 8.049 7.784 7.548 7.315 7.064 6.844 6.611 6.361 6.161 5.943 5.713 5.471 5.231 5.072 4.907 4.625 4.422 4.218 4.11 3.881 3.637 3.376 3.232 2.999 2.776 2.612 2.438 2.056 1.838 1.581 1.274 0.926 0.507 -0.077 -1.66 -4 ,16289 ,KEBNE ,16721928,Sat Nov 27 21:14:00 CET,Sat Nov 27 22:46:10 CET,0.0 1.483 1.984 2.337 2.632 2.883 3.094 3.292 3.659 3.824 3.988 4.205 4.42 4.554 4.809 5.037 5.239 5.336 5.526 5.719 5.984 6.149 6.31 6.536 6.742 6.931 7.116 7.3 7.533 7.759 7.977 8.231 8.475 8.689 8.936 9.218 9.461 9.723 9.995 10.272 10.549 10.852 11.205 11.538 11.905 12.304 12.724 13.137 13.534 13.825 13.88 13.58 13.127 12.626 12.137 11.648 11.187 10.774 10.407 9.996 9.626 9.305 8.985 8.678 8.381 8.092 7.789 7.524 7.284 7.029 6.758 6.521 6.275 6.016 5.81 5.596 5.377 5.145 4.89 4.719 4.546 4.262 4.054 3.83 3.718 3.492 3.252 2.997 2.854 2.62 2.368 2.193 2.013 1.588 1.35 1.105 0.833 0.507 0.09 -0.461 -1.952 -5 ,5657 ,KEBNE ,16721929,Sat Nov 27 21:13:52 CET,Sat Nov 27 22:46:59 CET,0.0 1.059 1.459 1.793 2.078 2.312 2.53 2.714 3.023 3.171 3.313 3.503 3.708 3.828 4.047 4.253 4.437 4.521 4.689 4.854 5.085 5.228 5.364 5.563 5.749 5.921 6.085 6.238 6.435 6.624 6.808 7.031 7.232 7.436 7.695 7.959 8.187 8.455 8.734 9.018 9.307 9.618 9.982 10.319 10.684 11.056 11.416 11.776 12.131 12.427 12.519 12.252 11.806 11.336 10.895 10.432 10.007 9.617 9.246 8.851 8.503 8.196 7.903 7.609 7.323 7.07 6.801 6.563 6.352 6.107 5.855 5.656 5.453 5.234 5.056 4.869 4.669 4.457 4.23 4.08 3.928 3.674 3.493 3.3 3.194 2.982 2.774 2.548 2.426 2.217 2.03 1.879 1.727 1.392 1.195 0.981 0.734 0.456 0.12 -0.308 -1.394 -6 ,8168 ,KEBNE ,16721930,Sat Nov 27 21:14:00 CET,Sat Nov 27 22:42:54 CET,0.0 1.343 1.861 2.235 2.531 2.788 3.017 3.222 3.596 3.772 3.938 4.165 4.387 4.527 4.788 5.022 5.238 5.339 5.546 5.745 6.009 6.173 6.333 6.566 6.775 6.978 7.174 7.353 7.591 7.833 8.049 8.3 8.549 8.775 9.019 9.277 9.523 9.79 10.074 10.367 10.662 10.987 11.343 11.691 12.093 12.513 12.928 13.349 13.751 14.071 14.224 13.963 13.47 12.959 12.455 11.972 11.534 11.1 10.696 10.292 9.948 9.628 9.296 8.96 8.649 8.358 8.049 7.782 7.522 7.24 6.968 6.747 6.515 6.259 6.053 5.843 5.626 5.401 5.153 4.972 4.785 4.483 4.264 4.039 3.922 3.685 3.439 3.184 3.056 2.831 2.604 2.442 2.28 1.877 1.626 1.365 1.069 0.721 0.298 -0.283 -1.856 -7 ,2504 ,KEBNE ,16721931,Sat Nov 27 21:14:49 CET,Sat Nov 27 22:52:37 CET,0.0 1.105 1.538 1.869 2.144 2.372 2.57 2.755 3.088 3.233 3.36 3.521 3.723 3.843 4.06 4.264 4.46 4.55 4.715 4.872 5.099 5.245 5.39 5.599 5.791 5.983 6.169 6.343 6.57 6.77 6.948 7.174 7.401 7.607 7.84 8.097 8.328 8.567 8.822 9.092 9.352 9.646 9.963 10.254 10.598 10.968 11.36 11.734 12.099 12.4 12.508 12.278 11.908 11.47 11.02 10.559 10.116 9.703 9.345 8.954 8.597 8.267 7.942 7.645 7.364 7.097 6.812 6.559 6.34 6.116 5.886 5.686 5.464 5.229 5.044 4.857 4.657 4.442 4.223 4.074 3.909 3.648 3.467 3.276 3.176 2.972 2.757 2.531 2.415 2.211 2.03 1.887 1.735 1.405 1.213 0.978 0.715 0.407 0.038 -0.476 -1.703 -8 ,21160 ,KEBNE ,16721932,Sat Nov 27 21:14:50 CET,Sat Nov 27 22:52:49 CET,0.0 1.272 1.811 2.213 2.516 2.782 3.017 3.23 3.623 3.812 3.984 4.206 4.43 4.565 4.824 5.058 5.273 5.375 5.571 5.758 6.017 6.182 6.34 6.547 6.742 6.945 7.135 7.309 7.531 7.748 7.957 8.204 8.433 8.637 8.866 9.12 9.354 9.617 9.908 10.209 10.516 10.853 11.202 11.527 11.906 12.291 12.689 13.082 13.439 13.739 13.836 13.496 13.022 12.518 12.001 11.495 11.048 10.632 10.256 9.892 9.543 9.205 8.884 8.561 8.243 7.956 7.67 7.412 7.18 6.946 6.697 6.471 6.234 5.994 5.804 5.605 5.398 5.176 4.933 4.76 4.588 4.303 4.094 3.881 3.772 3.544 3.303 3.042 2.901 2.673 2.438 2.267 2.084 1.666 1.425 1.174 0.882 0.562 0.2 -0.296 -1.717 -9 ,7555 ,KEBNE ,16721933,Sat Nov 27 21:14:50 CET,Sat Nov 27 22:52:40 CET,0.0 1.132 1.624 2.001 2.296 2.546 2.768 2.971 3.322 3.491 3.656 3.866 4.079 4.208 4.458 4.696 4.911 5.007 5.201 5.383 5.637 5.801 5.952 6.171 6.382 6.573 6.75 6.934 7.171 7.392 7.604 7.855 8.094 8.303 8.545 8.826 9.077 9.354 9.647 9.951 10.252 10.567 10.945 11.321 11.722 12.096 12.495 12.896 13.274 13.618 13.745 13.467 13.043 12.561 12.058 11.564 11.085 10.621 10.217 9.811 9.461 9.134 8.813 8.503 8.205 7.937 7.652 7.386 7.15 6.891 6.609 6.38 6.15 5.913 5.723 5.526 5.331 5.113 4.88 4.717 4.546 4.28 4.085 3.868 3.759 3.547 3.31 3.043 2.902 2.674 2.453 2.286 2.106 1.697 1.473 1.228 0.946 0.62 0.22 -0.31 -1.595 -10 ,4099 ,KEBNE ,16721934,Sat Nov 27 21:14:50 CET,Sat Nov 27 22:51:30 CET,0.0 1.511 2.023 2.404 2.702 2.971 3.22 3.431 3.81 3.989 4.153 4.353 4.563 4.689 4.927 5.142 5.348 5.447 5.641 5.829 6.102 6.266 6.409 6.614 6.815 7.009 7.189 7.367 7.599 7.813 8.018 8.265 8.507 8.729 8.966 9.222 9.472 9.745 10.035 10.34 10.639 10.964 11.326 11.679 12.06 12.436 12.838 13.229 13.622 13.993 14.166 13.935 13.478 12.963 12.493 12.025 11.586 11.133 10.727 10.336 9.969 9.648 9.341 9.045 8.754 8.451 8.145 7.877 7.645 7.392 7.114 6.886 6.642 6.387 6.182 5.967 5.747 5.504 5.251 5.081 4.908 4.617 4.41 4.203 4.093 3.869 3.637 3.385 3.243 3.013 2.78 2.608 2.429 2.032 1.811 1.56 1.261 0.908 0.499 -0.05 -1.338 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_70_62.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_70_62.txt deleted file mode 100644 index 52e331a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/pfkfb3/water/Summary_FEP_70_62.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12158 ,KEBNE ,16721935,Sat Nov 27 21:14:50 CET,Sat Nov 27 22:51:26 CET,0.0 1.35 1.853 2.258 2.585 2.871 3.13 3.372 3.808 4.0 4.182 4.43 4.664 4.816 5.097 5.347 5.588 5.703 5.92 6.128 6.418 6.603 6.784 7.039 7.283 7.522 7.755 7.972 8.244 8.502 8.751 9.057 9.339 9.592 9.887 10.234 10.556 10.894 11.252 11.634 12.038 12.482 12.983 13.45 13.993 14.582 15.231 15.979 16.815 17.668 18.485 18.931 18.953 18.787 18.584 18.321 18.026 17.721 17.423 17.104 16.81 16.528 16.262 15.994 15.736 15.494 15.233 14.981 14.759 14.535 14.285 14.069 13.847 13.608 13.419 13.219 12.995 12.756 12.516 12.357 12.184 11.881 11.668 11.447 11.329 11.063 10.784 10.49 10.338 10.099 9.802 9.599 9.395 8.927 8.667 8.396 8.077 7.719 7.248 6.586 4.581 -2 ,20365 ,KEBNE ,16721936,Sat Nov 27 21:14:50 CET,Sat Nov 27 22:52:36 CET,0.0 1.329 1.84 2.215 2.552 2.858 3.122 3.359 3.796 3.984 4.151 4.38 4.625 4.786 5.081 5.347 5.59 5.708 5.929 6.13 6.41 6.591 6.773 7.042 7.302 7.54 7.756 7.963 8.216 8.465 8.727 9.027 9.304 9.572 9.87 10.206 10.523 10.859 11.217 11.59 11.983 12.418 12.916 13.402 13.956 14.559 15.216 15.952 16.755 17.594 18.49 18.909 18.872 18.705 18.485 18.221 17.956 17.65 17.336 16.999 16.704 16.445 16.162 15.865 15.582 15.306 15.01 14.753 14.53 14.286 14.021 13.8 13.57 13.325 13.129 12.921 12.703 12.475 12.229 12.052 11.861 11.56 11.348 11.135 11.026 10.79 10.537 10.252 10.1 9.859 9.582 9.396 9.185 8.722 8.468 8.191 7.874 7.481 7.006 6.35 4.12 -3 ,3865 ,KEBNE ,16721937,Sat Nov 27 21:14:50 CET,Sat Nov 27 22:52:07 CET,0.0 1.126 1.571 1.95 2.27 2.559 2.811 3.03 3.417 3.597 3.77 4.014 4.254 4.403 4.668 4.923 5.171 5.287 5.518 5.744 6.059 6.255 6.446 6.711 6.953 7.191 7.424 7.655 7.943 8.207 8.448 8.752 9.046 9.307 9.602 9.942 10.265 10.606 10.974 11.36 11.754 12.194 12.696 13.182 13.741 14.347 15.016 15.731 16.528 17.349 18.161 18.552 18.566 18.43 18.175 17.869 17.582 17.265 16.949 16.623 16.328 16.052 15.77 15.483 15.214 14.968 14.696 14.443 14.213 13.972 13.721 13.512 13.293 13.055 12.864 12.669 12.466 12.234 11.981 11.805 11.627 11.335 11.123 10.896 10.774 10.529 10.271 9.983 9.825 9.584 9.31 9.101 8.877 8.393 8.117 7.829 7.511 7.103 6.603 5.941 3.913 -4 ,13020 ,KEBNE ,16721938,Sat Nov 27 21:15:51 CET,Sat Nov 27 22:52:40 CET,0.0 1.307 1.792 2.169 2.488 2.759 3.006 3.241 3.677 3.871 4.045 4.278 4.509 4.66 4.932 5.189 5.431 5.546 5.771 5.983 6.283 6.472 6.658 6.926 7.176 7.413 7.643 7.862 8.135 8.393 8.637 8.933 9.219 9.483 9.786 10.122 10.444 10.794 11.174 11.554 11.91 12.33 12.851 13.338 13.858 14.441 15.086 15.777 16.541 17.323 18.102 18.505 18.51 18.33 18.059 17.774 17.486 17.16 16.849 16.522 16.214 15.935 15.664 15.383 15.099 14.832 14.551 14.302 14.086 13.837 13.559 13.335 13.102 12.852 12.66 12.46 12.247 12.019 11.772 11.589 11.393 11.088 10.875 10.654 10.539 10.29 10.021 9.734 9.578 9.335 9.041 8.849 8.652 8.216 7.957 7.675 7.342 6.936 6.421 5.741 3.704 -5 ,20348 ,KEBNE ,16721939,Sat Nov 27 21:15:52 CET,Sat Nov 27 22:53:32 CET,0.0 1.349 1.852 2.213 2.511 2.778 3.025 3.241 3.619 3.792 3.956 4.171 4.397 4.538 4.804 5.04 5.267 5.378 5.589 5.789 6.078 6.269 6.443 6.689 6.921 7.15 7.373 7.579 7.843 8.097 8.331 8.604 8.878 9.133 9.416 9.73 10.025 10.339 10.68 11.033 11.383 11.776 12.24 12.696 13.226 13.872 14.604 15.331 16.115 16.931 17.707 18.133 18.159 17.995 17.768 17.527 17.265 16.975 16.674 16.317 16.009 15.727 15.427 15.134 14.865 14.626 14.37 14.134 13.919 13.691 13.459 13.262 13.038 12.783 12.584 12.38 12.164 11.93 11.697 11.53 11.335 11.034 10.821 10.597 10.485 10.25 9.988 9.699 9.547 9.319 9.056 8.871 8.665 8.188 7.925 7.646 7.326 6.931 6.433 5.746 3.765 -6 ,11874 ,KEBNE ,16721940,Sat Nov 27 21:15:52 CET,Sat Nov 27 22:53:35 CET,0.0 1.295 1.808 2.174 2.489 2.766 3.017 3.25 3.671 3.863 4.035 4.278 4.514 4.662 4.944 5.2 5.433 5.545 5.763 5.969 6.254 6.436 6.619 6.89 7.152 7.395 7.615 7.823 8.093 8.345 8.591 8.882 9.147 9.411 9.721 10.062 10.389 10.74 11.103 11.491 11.897 12.34 12.844 13.333 13.901 14.516 15.183 15.95 16.792 17.625 18.48 18.931 18.986 18.889 18.736 18.493 18.171 17.837 17.538 17.235 16.947 16.662 16.38 16.12 15.868 15.626 15.354 15.093 14.862 14.629 14.401 14.204 13.98 13.742 13.556 13.361 13.142 12.916 12.688 12.519 12.342 12.053 11.848 11.622 11.497 11.241 10.97 10.674 10.517 10.278 9.996 9.803 9.582 9.074 8.803 8.509 8.179 7.784 7.289 6.636 4.701 -7 ,3589 ,KEBNE ,16721941,Sat Nov 27 21:15:52 CET,Sat Nov 27 22:53:22 CET,0.0 1.506 1.987 2.369 2.706 3.007 3.258 3.48 3.893 4.078 4.252 4.499 4.742 4.89 5.16 5.399 5.632 5.75 5.973 6.187 6.5 6.699 6.879 7.124 7.358 7.592 7.829 8.053 8.336 8.61 8.865 9.148 9.427 9.701 10.009 10.357 10.689 11.053 11.419 11.789 12.174 12.61 13.127 13.614 14.157 14.747 15.396 16.092 16.829 17.658 18.48 18.8 18.783 18.638 18.4 18.111 17.813 17.505 17.219 16.91 16.626 16.366 16.099 15.816 15.541 15.297 15.032 14.787 14.571 14.344 14.085 13.855 13.623 13.379 13.189 12.987 12.767 12.53 12.28 12.103 11.915 11.628 11.427 11.212 11.094 10.843 10.566 10.272 10.124 9.881 9.593 9.408 9.205 8.753 8.501 8.214 7.882 7.485 7.005 6.403 4.871 -8 ,2315 ,KEBNE ,16721942,Sat Nov 27 21:17:55 CET,Sat Nov 27 22:56:10 CET,0.0 1.618 2.142 2.544 2.873 3.147 3.389 3.634 4.087 4.272 4.441 4.68 4.915 5.06 5.339 5.599 5.836 5.949 6.159 6.361 6.675 6.874 7.047 7.295 7.541 7.775 8.002 8.219 8.485 8.743 8.99 9.295 9.6 9.877 10.18 10.529 10.858 11.203 11.576 11.961 12.343 12.762 13.271 13.768 14.327 14.94 15.617 16.374 17.185 17.965 18.745 19.152 19.176 19.039 18.803 18.503 18.198 17.91 17.625 17.308 17.015 16.736 16.444 16.161 15.901 15.641 15.366 15.11 14.885 14.645 14.376 14.163 13.932 13.676 13.484 13.275 13.047 12.816 12.564 12.378 12.19 11.897 11.689 11.47 11.361 11.127 10.86 10.549 10.387 10.158 9.877 9.674 9.474 9.057 8.819 8.54 8.212 7.807 7.314 6.678 4.638 -9 ,19518 ,KEBNE ,16721943,Sat Nov 27 21:17:55 CET,Sat Nov 27 22:56:03 CET,0.0 1.145 1.656 1.991 2.278 2.551 2.814 3.049 3.47 3.667 3.846 4.095 4.342 4.499 4.794 5.082 5.353 5.482 5.717 5.934 6.232 6.414 6.595 6.861 7.106 7.33 7.543 7.753 8.017 8.266 8.508 8.811 9.085 9.336 9.629 9.963 10.281 10.609 10.966 11.35 11.747 12.177 12.674 13.167 13.721 14.337 15.006 15.73 16.522 17.364 18.218 18.628 18.622 18.471 18.259 17.986 17.669 17.343 17.061 16.749 16.436 16.152 15.884 15.619 15.352 15.074 14.771 14.522 14.308 14.067 13.8 13.577 13.348 13.098 12.902 12.692 12.464 12.217 11.958 11.778 11.591 11.292 11.075 10.843 10.719 10.46 10.191 9.896 9.734 9.496 9.217 9.028 8.832 8.38 8.123 7.827 7.462 7.045 6.567 5.932 3.872 -10 ,21373 ,KEBNE ,16721944,Sat Nov 27 21:17:55 CET,Sat Nov 27 22:54:41 CET,0.0 1.184 1.673 2.047 2.342 2.602 2.84 3.06 3.46 3.638 3.813 4.052 4.28 4.424 4.694 4.945 5.175 5.287 5.508 5.717 6.018 6.207 6.384 6.633 6.868 7.081 7.279 7.478 7.737 7.983 8.214 8.493 8.775 9.054 9.382 9.742 10.063 10.403 10.765 11.147 11.556 12.013 12.523 13.011 13.556 14.149 14.801 15.498 16.258 17.068 17.905 18.328 18.385 18.231 17.958 17.659 17.384 17.114 16.858 16.56 16.253 15.969 15.705 15.447 15.184 14.933 14.667 14.417 14.185 13.931 13.677 13.461 13.232 12.993 12.798 12.597 12.39 12.162 11.906 11.725 11.543 11.251 11.031 10.811 10.7 10.461 10.192 9.892 9.725 9.478 9.202 9.007 8.798 8.341 8.071 7.765 7.441 7.036 6.52 5.858 3.424 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_11_10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_11_10.txt deleted file mode 100644 index 4db4cb0e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_11_10.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23853 ,KEBNE ,16721952,Sat Nov 27 21:21:00 CET,Sat Nov 27 23:19:55 CET,0.0 1.054 1.481 1.823 2.135 2.416 2.654 2.862 3.234 3.403 3.56 3.785 4.03 4.178 4.453 4.719 4.983 5.11 5.338 5.548 5.865 6.073 6.276 6.573 6.861 7.141 7.416 7.679 8.008 8.337 8.654 9.02 9.372 9.716 10.118 10.578 11.017 11.494 12.02 12.585 13.189 13.863 14.644 15.437 16.389 17.48 18.741 20.154 21.812 23.802 26.249 28.177 29.226 29.882 30.268 30.493 30.614 30.64 30.612 30.552 30.443 30.316 30.175 29.997 29.795 29.579 29.348 29.14 28.945 28.727 28.514 28.335 28.122 27.911 27.764 27.605 27.397 27.159 26.904 26.714 26.512 26.193 25.957 25.719 25.607 25.367 25.11 24.851 24.713 24.516 24.248 24.066 23.851 23.368 23.106 22.825 22.496 22.071 21.505 20.717 17.993 -2 ,15385 ,KEBNE ,16721953,Sat Nov 27 21:21:00 CET,Sat Nov 27 23:21:19 CET,0.0 0.854 1.271 1.596 1.899 2.159 2.38 2.583 2.941 3.112 3.273 3.505 3.734 3.874 4.152 4.415 4.658 4.773 4.996 5.213 5.515 5.715 5.925 6.216 6.485 6.75 7.008 7.253 7.574 7.883 8.175 8.542 8.905 9.241 9.634 10.097 10.554 11.035 11.547 12.108 12.681 13.336 14.109 14.894 15.841 16.882 18.084 19.459 21.077 22.976 25.237 27.174 28.319 29.009 29.433 29.674 29.794 29.85 29.869 29.844 29.787 29.704 29.598 29.474 29.328 29.198 29.072 28.933 28.766 28.574 28.388 28.239 28.074 27.873 27.708 27.536 27.351 27.151 26.919 26.745 26.565 26.271 26.069 25.869 25.759 25.53 25.286 25.013 24.867 24.652 24.362 24.179 23.972 23.467 23.198 22.907 22.575 22.196 21.692 20.996 18.47 -4 ,3413 ,KEBNE ,16721955,Sat Nov 27 21:22:02 CET,Sat Nov 27 23:20:50 CET,0.0 0.787 1.216 1.543 1.801 2.023 2.239 2.437 2.804 2.982 3.15 3.377 3.612 3.758 4.038 4.302 4.557 4.684 4.931 5.171 5.519 5.739 5.953 6.258 6.548 6.819 7.083 7.342 7.682 8.005 8.309 8.667 9.025 9.378 9.777 10.21 10.623 11.088 11.606 12.175 12.77 13.44 14.224 14.992 15.887 16.911 18.104 19.474 21.097 23.039 25.465 27.442 28.539 29.165 29.597 29.889 29.98 29.985 29.937 29.873 29.804 29.665 29.511 29.393 29.251 29.104 28.964 28.824 28.677 28.5 28.308 28.149 27.958 27.741 27.574 27.403 27.227 27.035 26.838 26.701 26.559 26.319 26.122 25.918 25.823 25.625 25.422 25.187 25.041 24.828 24.566 24.387 24.196 23.764 23.514 23.256 22.947 22.549 22.068 21.377 18.398 -5 ,1413 ,KEBNE ,16721956,Sat Nov 27 21:22:03 CET,Sat Nov 27 23:22:01 CET,0.0 0.721 1.099 1.412 1.689 1.938 2.161 2.357 2.728 2.91 3.082 3.315 3.546 3.691 3.963 4.21 4.448 4.567 4.812 5.059 5.406 5.614 5.814 6.105 6.4 6.687 6.954 7.209 7.543 7.862 8.165 8.537 8.898 9.262 9.693 10.179 10.643 11.144 11.701 12.301 12.915 13.621 14.473 15.317 16.285 17.4 18.741 20.271 22.024 24.115 26.582 28.508 29.668 30.37 30.746 30.93 30.947 30.905 30.871 30.813 30.72 30.603 30.459 30.292 30.13 29.956 29.758 29.565 29.39 29.228 29.039 28.851 28.643 28.428 28.271 28.104 27.911 27.719 27.531 27.382 27.219 26.976 26.81 26.639 26.547 26.343 26.125 25.897 25.773 25.578 25.344 25.19 25.02 24.634 24.416 24.154 23.837 23.502 23.109 22.509 19.691 -6 ,31899 ,KEBNE ,16721957,Sat Nov 27 21:22:03 CET,Sat Nov 27 23:22:29 CET,0.0 0.871 1.344 1.714 2.003 2.27 2.529 2.76 3.16 3.341 3.519 3.77 3.997 4.142 4.421 4.686 4.942 5.07 5.301 5.514 5.833 6.039 6.241 6.536 6.815 7.085 7.335 7.58 7.908 8.234 8.555 8.939 9.309 9.665 10.082 10.546 11.0 11.5 12.041 12.621 13.209 13.867 14.683 15.522 16.484 17.533 18.781 20.222 21.904 23.926 26.408 28.5 29.713 30.441 30.878 31.163 31.342 31.411 31.399 31.325 31.211 31.071 30.923 30.786 30.636 30.466 30.282 30.114 29.967 29.799 29.607 29.43 29.233 29.017 28.831 28.647 28.467 28.276 28.071 27.922 27.759 27.496 27.303 27.111 27.01 26.761 26.478 26.169 26.007 25.792 25.523 25.338 25.133 24.696 24.454 24.194 23.901 23.538 23.119 22.498 19.068 -9 ,27602 ,KEBNE ,16721960,Sat Nov 27 21:22:02 CET,Sat Nov 27 23:21:04 CET,0.0 0.932 1.351 1.658 1.955 2.221 2.439 2.643 3.007 3.174 3.336 3.558 3.779 3.913 4.169 4.415 4.651 4.767 4.996 5.223 5.534 5.724 5.915 6.197 6.463 6.731 6.994 7.253 7.589 7.903 8.198 8.54 8.868 9.209 9.622 10.087 10.536 11.028 11.554 12.112 12.7 13.376 14.178 14.989 15.955 17.074 18.372 19.845 21.617 23.664 26.147 28.181 29.307 29.941 30.291 30.461 30.486 30.443 30.363 30.236 30.106 29.98 29.84 29.679 29.511 29.339 29.145 28.962 28.798 28.63 28.445 28.287 28.112 27.925 27.788 27.647 27.478 27.279 27.064 26.911 26.754 26.519 26.356 26.18 26.078 25.844 25.603 25.345 25.208 25.017 24.778 24.618 24.448 24.022 23.768 23.5 23.214 22.873 22.405 21.688 18.681 -10 ,608 ,KEBNE ,16721961,Sat Nov 27 21:22:03 CET,Sat Nov 27 23:22:57 CET,0.0 0.847 1.217 1.528 1.793 2.029 2.259 2.46 2.841 3.023 3.195 3.448 3.686 3.837 4.114 4.364 4.606 4.723 4.954 5.187 5.522 5.73 5.932 6.228 6.507 6.778 7.044 7.303 7.645 7.979 8.296 8.671 9.026 9.369 9.764 10.211 10.643 11.112 11.615 12.158 12.727 13.385 14.169 14.945 15.87 16.912 18.12 19.524 21.2 23.115 25.442 27.384 28.426 29.001 29.376 29.594 29.676 29.671 29.632 29.564 29.472 29.374 29.261 29.125 28.983 28.856 28.713 28.566 28.431 28.259 28.045 27.853 27.637 27.426 27.285 27.139 26.98 26.795 26.588 26.439 26.274 26.016 25.846 25.656 25.549 25.339 25.119 24.875 24.746 24.558 24.317 24.156 23.988 23.559 23.308 23.045 22.744 22.367 21.915 21.267 18.159 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index b4db3756..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20596 ,KEBNE ,16721962,Sat Nov 27 21:23:04 CET,Sat Nov 27 23:24:43 CET,0.0 2.691 3.177 3.499 3.76 3.988 4.181 4.35 4.656 4.792 4.915 5.057 5.243 5.339 5.533 5.716 5.882 5.964 6.106 6.234 6.426 6.539 6.644 6.792 6.927 7.06 7.185 7.298 7.432 7.553 7.663 7.786 7.904 8.002 8.089 8.195 8.318 8.449 8.545 8.606 8.662 8.712 8.732 8.703 8.648 8.527 8.278 7.821 7.042 5.784 3.51 0.771 -1.552 -3.544 -5.191 -6.652 -7.915 -9.058 -10.077 -11.101 -12.01 -12.815 -13.523 -14.194 -14.825 -15.397 -15.981 -16.492 -16.94 -17.402 -17.894 -18.3 -18.719 -19.159 -19.526 -19.922 -20.309 -20.695 -21.077 -21.339 -21.614 -22.032 -22.347 -22.699 -22.878 -23.254 -23.639 -24.045 -24.27 -24.613 -24.978 -25.244 -25.519 -26.141 -26.486 -26.862 -27.318 -27.871 -28.565 -29.518 -32.242 -2 ,1918 ,KEBNE ,16721963,Sat Nov 27 21:23:07 CET,Sat Nov 27 23:23:09 CET,0.0 1.891 2.387 2.722 2.979 3.194 3.378 3.554 3.866 4.001 4.131 4.277 4.447 4.54 4.723 4.883 5.024 5.09 5.22 5.341 5.509 5.617 5.72 5.863 5.995 6.122 6.238 6.345 6.485 6.609 6.717 6.852 6.977 7.086 7.199 7.31 7.407 7.493 7.575 7.65 7.702 7.73 7.742 7.724 7.659 7.533 7.271 6.814 6.061 4.774 2.407 -0.431 -2.798 -4.909 -6.665 -8.177 -9.499 -10.675 -11.676 -12.7 -13.588 -14.346 -15.088 -15.837 -16.551 -17.175 -17.827 -18.406 -18.899 -19.425 -19.975 -20.429 -20.894 -21.386 -21.796 -22.211 -22.592 -22.98 -23.4 -23.704 -24.028 -24.537 -24.877 -25.223 -25.415 -25.814 -26.231 -26.673 -26.906 -27.265 -27.636 -27.904 -28.19 -28.791 -29.113 -29.46 -29.856 -30.302 -30.851 -31.641 -34.874 -3 ,14134 ,KEBNE ,16721964,Sat Nov 27 21:23:07 CET,Sat Nov 27 23:22:40 CET,0.0 2.732 3.217 3.544 3.824 4.064 4.272 4.47 4.808 4.946 5.08 5.246 5.448 5.557 5.744 5.919 6.094 6.176 6.327 6.473 6.666 6.784 6.898 7.061 7.209 7.351 7.499 7.631 7.777 7.917 8.056 8.232 8.401 8.549 8.709 8.865 9.01 9.16 9.309 9.442 9.535 9.603 9.629 9.617 9.534 9.332 9.018 8.551 7.818 6.688 4.525 1.743 -0.529 -2.491 -4.119 -5.487 -6.673 -7.825 -8.867 -9.908 -10.785 -11.533 -12.263 -12.961 -13.601 -14.18 -14.796 -15.36 -15.837 -16.326 -16.838 -17.245 -17.646 -18.085 -18.425 -18.773 -19.149 -19.563 -20.013 -20.329 -20.66 -21.195 -21.556 -21.915 -22.11 -22.512 -22.927 -23.381 -23.626 -23.993 -24.406 -24.69 -24.994 -25.667 -26.033 -26.46 -26.949 -27.517 -28.188 -29.079 -32.716 -5 ,15563 ,KEBNE ,16721966,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:23:52 CET,0.0 3.015 3.525 3.871 4.149 4.366 4.562 4.751 5.1 5.253 5.396 5.565 5.765 5.874 6.106 6.304 6.481 6.57 6.733 6.884 7.105 7.241 7.364 7.545 7.71 7.873 8.028 8.168 8.346 8.51 8.666 8.854 9.026 9.185 9.369 9.555 9.717 9.884 10.043 10.188 10.335 10.472 10.57 10.607 10.615 10.611 10.512 10.249 9.737 8.711 6.741 4.277 2.218 0.484 -1.018 -2.364 -3.543 -4.616 -5.52 -6.441 -7.231 -7.923 -8.592 -9.214 -9.787 -10.304 -10.865 -11.385 -11.843 -12.319 -12.801 -13.216 -13.655 -14.115 -14.48 -14.85 -15.25 -15.679 -16.124 -16.439 -16.763 -17.275 -17.631 -18.002 -18.201 -18.625 -19.07 -19.529 -19.781 -20.158 -20.617 -20.925 -21.246 -21.95 -22.366 -22.816 -23.303 -23.845 -24.494 -25.429 -30.044 -6 ,9189 ,KEBNE ,16721967,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:24:56 CET,0.0 2.091 2.612 2.973 3.265 3.528 3.752 3.939 4.27 4.428 4.573 4.726 4.927 5.045 5.27 5.473 5.666 5.756 5.923 6.077 6.294 6.43 6.568 6.762 6.919 7.063 7.208 7.35 7.532 7.692 7.841 8.011 8.175 8.336 8.495 8.648 8.788 8.934 9.093 9.237 9.335 9.434 9.529 9.597 9.654 9.633 9.512 9.29 8.823 8.024 6.524 4.476 2.631 0.939 -0.52 -1.788 -2.92 -3.964 -4.864 -5.785 -6.586 -7.273 -7.935 -8.598 -9.212 -9.773 -10.373 -10.927 -11.425 -11.95 -12.486 -12.917 -13.368 -13.851 -14.229 -14.629 -15.034 -15.442 -15.877 -16.181 -16.505 -17.015 -17.381 -17.77 -17.963 -18.37 -18.807 -19.275 -19.529 -19.91 -20.361 -20.661 -20.985 -21.719 -22.104 -22.532 -23.048 -23.638 -24.356 -25.338 -32.165 -8 ,14786 ,KEBNE ,16721969,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:23:57 CET,0.0 1.776 2.256 2.576 2.839 3.066 3.265 3.442 3.752 3.893 4.018 4.159 4.347 4.445 4.62 4.792 4.95 5.021 5.152 5.281 5.458 5.56 5.664 5.812 5.935 6.06 6.18 6.291 6.431 6.568 6.691 6.812 6.926 7.05 7.178 7.291 7.399 7.52 7.617 7.699 7.773 7.818 7.86 7.884 7.85 7.746 7.518 7.096 6.41 5.212 2.997 0.325 -1.85 -3.719 -5.29 -6.636 -7.799 -8.916 -9.912 -10.903 -11.783 -12.521 -13.197 -13.859 -14.46 -14.985 -15.535 -16.072 -16.548 -17.026 -17.524 -17.957 -18.431 -18.913 -19.295 -19.7 -20.108 -20.521 -20.952 -21.263 -21.591 -22.054 -22.378 -22.723 -22.895 -23.261 -23.642 -24.041 -24.245 -24.559 -24.903 -25.156 -25.428 -26.08 -26.456 -26.871 -27.329 -27.857 -28.526 -29.472 -32.608 -9 ,12178 ,KEBNE ,16721970,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:23:42 CET,0.0 2.01 2.508 2.825 3.092 3.326 3.531 3.726 4.059 4.201 4.337 4.506 4.709 4.819 5.027 5.208 5.367 5.442 5.6 5.749 5.958 6.092 6.213 6.389 6.552 6.702 6.83 6.942 7.07 7.192 7.313 7.44 7.552 7.648 7.75 7.863 7.959 8.067 8.177 8.262 8.327 8.362 8.367 8.345 8.27 8.11 7.784 7.27 6.415 5.028 2.588 -0.377 -2.785 -4.789 -6.56 -8.21 -9.615 -10.902 -12.058 -13.206 -14.189 -15.01 -15.793 -16.57 -17.271 -17.935 -18.651 -19.28 -19.802 -20.339 -20.913 -21.365 -21.82 -22.291 -22.66 -23.043 -23.449 -23.865 -24.282 -24.596 -24.927 -25.43 -25.773 -26.125 -26.309 -26.694 -27.104 -27.534 -27.764 -28.124 -28.504 -28.763 -29.034 -29.649 -30.003 -30.386 -30.828 -31.352 -32.014 -32.9 -35.785 -10 ,10208 ,KEBNE ,16721971,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:25:11 CET,0.0 2.01 2.529 2.909 3.22 3.478 3.707 3.905 4.245 4.398 4.541 4.719 4.933 5.039 5.233 5.417 5.589 5.677 5.851 6.016 6.234 6.365 6.491 6.671 6.841 6.995 7.138 7.281 7.462 7.624 7.775 7.947 8.097 8.237 8.405 8.603 8.8 9.0 9.185 9.355 9.496 9.633 9.785 9.897 9.965 9.99 9.876 9.597 9.096 8.137 6.392 4.181 2.317 0.734 -0.678 -1.977 -3.091 -4.099 -4.985 -5.886 -6.686 -7.385 -8.036 -8.665 -9.247 -9.767 -10.328 -10.846 -11.3 -11.767 -12.236 -12.628 -13.046 -13.492 -13.84 -14.194 -14.557 -14.934 -15.33 -15.598 -15.877 -16.349 -16.68 -17.018 -17.199 -17.559 -17.929 -18.327 -18.542 -18.889 -19.281 -19.578 -19.893 -20.532 -20.88 -21.277 -21.745 -22.282 -22.963 -23.932 -36.041 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_4_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_4_3.txt deleted file mode 100644 index 7c8bf72f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_4_3.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14209 ,KEBNE ,16721972,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:22:59 CET,0.0 1.017 1.428 1.753 2.012 2.233 2.442 2.643 2.992 3.157 3.319 3.286 3.73 3.834 4.04 4.242 4.432 4.53 4.719 4.888 5.141 5.309 5.46 5.67 5.874 6.07 6.255 6.424 6.64 6.86 7.073 7.325 7.568 7.788 8.029 8.286 8.539 8.83 9.115 9.406 9.726 10.064 10.414 10.739 11.11 11.507 11.913 12.263 12.553 12.797 12.822 12.377 11.731 11.06 10.424 9.813 9.25 8.728 8.241 7.727 7.286 6.877 6.493 6.136 5.8 5.49 5.165 4.868 4.595 4.308 4.023 3.782 3.525 3.26 3.056 2.835 2.597 2.343 2.071 1.886 1.707 1.432 1.234 1.028 0.918 0.69 0.459 0.205 0.076 -0.388 -0.394 -0.56 -0.726 -1.108 -1.321 -1.584 -1.859 -2.136 -2.447 -2.941 -4.388 -2 ,13786 ,KEBNE ,16721973,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:23:57 CET,0.0 0.814 1.12 1.374 1.597 1.785 1.951 2.107 2.415 2.565 2.703 2.651 3.101 3.221 3.446 3.644 3.83 3.919 4.098 4.268 4.492 4.64 4.792 5.006 5.205 5.391 5.575 5.759 5.983 6.192 6.398 6.641 6.863 7.075 7.334 7.631 7.907 8.173 8.438 8.734 9.039 9.369 9.729 10.067 10.457 10.841 11.202 11.577 11.893 12.093 12.068 11.606 10.956 10.252 9.633 9.049 8.49 7.958 7.485 6.992 6.565 6.191 5.821 5.461 5.111 4.779 4.433 4.131 3.864 3.592 3.319 3.078 2.813 2.528 2.304 2.09 1.883 1.651 1.4 1.231 1.053 0.761 0.568 0.367 0.254 0.015 -0.234 -0.502 -0.642 -1.101 -1.075 -1.243 -1.426 -1.814 -2.018 -2.23 -2.465 -2.751 -3.092 -3.545 -4.922 -3 ,1608 ,KEBNE ,16721974,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:24:22 CET,0.0 1.052 1.411 1.684 1.922 2.129 2.331 2.531 2.864 3.009 3.144 3.092 3.547 3.68 3.919 4.127 4.323 4.42 4.607 4.79 5.053 5.215 5.374 5.609 5.832 6.043 6.232 6.413 6.656 6.89 7.103 7.348 7.575 7.795 8.055 8.341 8.611 8.893 9.177 9.478 9.783 10.104 10.461 10.803 11.174 11.555 11.96 12.358 12.684 12.877 12.764 12.128 11.424 10.761 10.134 9.511 8.896 8.329 7.852 7.37 6.932 6.525 6.111 5.72 5.374 5.055 4.694 4.355 4.07 3.763 3.451 3.193 2.923 2.645 2.425 2.194 1.946 1.684 1.415 1.236 1.051 0.745 0.53 0.302 0.185 -0.05 -0.307 -0.592 -0.748 -1.219 -1.217 -1.399 -1.582 -1.957 -2.156 -2.381 -2.637 -2.924 -3.228 -3.604 -4.718 -4 ,29820 ,KEBNE ,16721975,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:24:21 CET,0.0 1.08 1.423 1.701 1.933 2.162 2.351 2.493 2.77 2.908 3.036 2.941 3.365 3.475 3.702 3.917 4.105 4.199 4.384 4.554 4.794 4.956 5.105 5.314 5.518 5.711 5.902 6.09 6.313 6.518 6.719 6.947 7.167 7.382 7.626 7.903 8.166 8.448 8.747 9.05 9.348 9.679 10.053 10.408 10.814 11.209 11.599 12.0 12.349 12.539 12.38 11.827 11.127 10.397 9.733 9.124 8.579 8.033 7.527 7.013 6.554 6.151 5.764 5.391 5.052 4.731 4.395 4.103 3.839 3.562 3.275 3.033 2.771 2.497 2.288 2.059 1.817 1.563 1.308 1.127 0.928 0.619 0.412 0.199 0.083 -0.162 -0.417 -0.684 -0.819 -1.29 -1.282 -1.447 -1.629 -2.001 -2.203 -2.421 -2.658 -2.924 -3.212 -3.606 -4.778 -5 ,27543 ,KEBNE ,16721976,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:23:52 CET,0.0 1.13 1.518 1.8 2.053 2.274 2.454 2.615 2.921 3.068 3.214 3.155 3.595 3.711 3.945 4.171 4.377 4.472 4.655 4.832 5.088 5.252 5.411 5.639 5.858 6.071 6.271 6.455 6.682 6.905 7.117 7.359 7.589 7.812 8.064 8.333 8.578 8.841 9.134 9.444 9.767 10.107 10.495 10.862 11.221 11.577 11.93 12.278 12.6 12.762 12.628 12.116 11.46 10.799 10.168 9.568 9.036 8.52 8.043 7.537 7.108 6.726 6.331 5.955 5.606 5.284 4.941 4.632 4.368 4.086 3.776 3.522 3.275 3.013 2.796 2.575 2.349 2.094 1.82 1.633 1.431 1.126 0.921 0.692 0.572 0.325 0.071 -0.192 -0.334 -0.803 -0.813 -0.994 -1.186 -1.608 -1.822 -2.039 -2.286 -2.572 -2.917 -3.298 -4.332 -6 ,11716 ,KEBNE ,16721977,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:22:49 CET,0.0 0.989 1.425 1.701 1.922 2.133 2.328 2.495 2.789 2.918 3.037 2.977 3.412 3.521 3.732 3.939 4.128 4.218 4.399 4.577 4.827 4.993 5.139 5.339 5.546 5.736 5.914 6.092 6.316 6.533 6.741 6.974 7.193 7.401 7.637 7.899 8.155 8.433 8.715 9.012 9.311 9.616 9.955 10.293 10.692 11.105 11.534 11.964 12.342 12.591 12.479 11.951 11.257 10.499 9.796 9.138 8.548 8.001 7.51 6.996 6.527 6.105 5.713 5.337 4.963 4.612 4.257 3.948 3.671 3.376 3.082 2.844 2.582 2.308 2.094 1.858 1.608 1.347 1.091 0.915 0.718 0.416 0.214 0.001 -0.112 -0.342 -0.593 -0.864 -1.01 -1.499 -1.534 -1.726 -1.919 -2.325 -2.55 -2.79 -3.051 -3.337 -3.684 -4.152 -5.347 -7 ,1220 ,KEBNE ,16721978,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:23:48 CET,0.0 1.224 1.542 1.808 2.036 2.243 2.452 2.642 2.976 3.132 3.269 3.19 3.621 3.732 3.956 4.16 4.34 4.425 4.596 4.764 5.003 5.164 5.322 5.541 5.742 5.933 6.12 6.306 6.535 6.741 6.936 7.173 7.405 7.629 7.88 8.164 8.431 8.724 9.023 9.308 9.599 9.934 10.312 10.677 11.072 11.455 11.851 12.237 12.579 12.788 12.626 12.017 11.337 10.644 9.975 9.328 8.745 8.192 7.708 7.197 6.728 6.317 5.931 5.558 5.205 4.882 4.527 4.2 3.913 3.618 3.31 3.06 2.8 2.518 2.297 2.067 1.826 1.562 1.263 1.038 0.802 0.438 0.178 -0.094 -0.237 -0.537 -0.835 -1.156 -1.323 -1.819 -1.863 -2.065 -2.292 -2.823 -3.122 -3.422 -3.752 -4.152 -4.631 -5.265 -6.936 -8 ,17950 ,KEBNE ,16721979,Sat Nov 27 21:24:06 CET,Sat Nov 27 23:23:46 CET,0.0 1.071 1.439 1.727 1.976 2.186 2.368 2.539 2.848 2.977 3.099 3.018 3.461 3.576 3.773 3.96 4.136 4.226 4.404 4.558 4.77 4.911 5.051 5.248 5.441 5.634 5.822 6.005 6.233 6.447 6.654 6.894 7.122 7.338 7.584 7.851 8.11 8.401 8.711 9.044 9.386 9.74 10.116 10.488 10.914 11.347 11.813 12.281 12.661 12.885 12.842 12.348 11.721 11.101 10.494 9.917 9.372 8.836 8.377 7.93 7.527 7.131 6.742 6.387 6.051 5.733 5.391 5.08 4.806 4.525 4.236 3.992 3.743 3.493 3.283 3.044 2.801 2.539 2.263 2.084 1.906 1.612 1.396 1.163 1.043 0.797 0.545 0.265 0.115 -0.352 -0.32 -0.486 -0.664 -1.037 -1.235 -1.451 -1.691 -1.996 -2.374 -2.819 -3.807 -9 ,25618 ,KEBNE ,16721980,Sat Nov 27 21:24:06 CET,Sat Nov 27 23:23:30 CET,0.0 0.981 1.346 1.666 1.954 2.176 2.357 2.523 2.827 2.964 3.099 3.044 3.491 3.602 3.799 3.986 4.175 4.268 4.448 4.624 4.871 5.031 5.18 5.394 5.601 5.805 5.987 6.152 6.377 6.6 6.81 7.054 7.284 7.508 7.755 8.014 8.27 8.55 8.834 9.12 9.419 9.751 10.124 10.497 10.886 11.268 11.675 12.085 12.492 12.73 12.588 11.981 11.269 10.565 9.898 9.248 8.637 8.085 7.588 7.086 6.657 6.279 5.919 5.568 5.241 4.944 4.634 4.349 4.087 3.814 3.53 3.293 3.041 2.764 2.54 2.309 2.082 1.853 1.606 1.43 1.242 0.931 0.681 0.395 0.257 -0.017 -0.344 -0.723 -0.909 -1.403 -1.435 -1.634 -1.841 -2.25 -2.501 -2.816 -3.129 -3.432 -3.79 -4.322 -5.636 -10 ,11010 ,KEBNE ,16721981,Sat Nov 27 21:24:06 CET,Sat Nov 27 23:24:37 CET,0.0 0.958 1.346 1.618 1.859 2.083 2.288 2.478 2.822 2.971 3.115 3.088 3.535 3.655 3.897 4.129 4.352 4.46 4.654 4.828 5.073 5.239 5.403 5.622 5.83 6.027 6.226 6.42 6.653 6.868 7.065 7.287 7.494 7.698 7.947 8.226 8.483 8.751 9.03 9.328 9.629 9.949 10.304 10.642 11.023 11.405 11.748 12.062 12.366 12.592 12.513 11.987 11.346 10.7 10.043 9.423 8.894 8.363 7.884 7.407 6.973 6.576 6.209 5.858 5.518 5.183 4.811 4.476 4.173 3.844 3.508 3.214 2.91 2.606 2.365 2.12 1.867 1.598 1.303 1.1 0.888 0.55 0.305 0.059 -0.062 -0.317 -0.596 -0.914 -1.072 -1.544 -1.538 -1.705 -1.895 -2.33 -2.566 -2.815 -3.072 -3.376 -3.735 -4.163 -5.251 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_7_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_7_6.txt deleted file mode 100644 index e669fdb1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_7_6.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2156 ,KEBNE ,16721982,Sat Nov 27 21:24:06 CET,Sat Nov 27 23:20:07 CET,0.0 1.698 2.121 2.4 2.635 2.826 2.986 3.138 3.409 3.534 3.648 3.5 3.926 4.01 4.17 4.308 4.422 4.476 4.576 4.662 4.781 4.858 4.931 5.023 5.103 5.178 5.239 5.292 5.364 5.44 5.495 5.539 5.564 5.575 5.603 5.64 5.665 5.679 5.67 5.628 5.564 5.485 5.36 5.187 4.908 4.478 3.862 3.036 1.823 -0.068 -3.225 -6.955 -9.902 -12.396 -14.524 -16.368 -17.932 -19.267 -20.389 -21.575 -22.612 -23.471 -24.239 -24.949 -25.623 -26.265 -26.932 -27.511 -28.019 -28.564 -29.142 -29.613 -30.102 -30.592 -30.946 -31.332 -31.752 -32.18 -32.635 -32.979 -33.331 -33.833 -34.198 -34.584 -34.77 -35.15 -35.549 -35.973 -36.195 -36.798 -37.0 -37.322 -37.679 -38.437 -38.847 -39.292 -39.823 -40.475 -41.247 -42.157 -45.422 -2 ,29282 ,KEBNE ,16721983,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:20:28 CET,0.0 1.128 1.567 1.85 2.078 2.278 2.454 2.604 2.836 2.945 3.048 2.88 3.291 3.366 3.498 3.616 3.727 3.781 3.874 3.962 4.078 4.145 4.209 4.299 4.384 4.459 4.53 4.598 4.685 4.765 4.822 4.885 4.955 5.012 5.057 5.084 5.097 5.111 5.11 5.088 5.064 5.009 4.872 4.661 4.351 3.919 3.292 2.422 1.134 -0.818 -4.03 -7.902 -11.11 -13.756 -16.013 -17.986 -19.689 -21.226 -22.516 -23.812 -24.898 -25.823 -26.674 -27.484 -28.275 -28.999 -29.747 -30.431 -31.028 -31.635 -32.262 -32.778 -33.296 -33.828 -34.237 -34.649 -35.081 -35.528 -35.998 -36.343 -36.708 -37.265 -37.658 -38.065 -38.274 -38.738 -39.23 -39.748 -40.012 -40.634 -40.792 -41.076 -41.384 -42.149 -42.619 -43.154 -43.764 -44.423 -45.227 -46.352 -50.132 -3 ,26237 ,KEBNE ,16721984,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:20:42 CET,0.0 1.319 1.808 2.13 2.385 2.628 2.847 3.038 3.363 3.501 3.62 3.5 3.935 4.037 4.227 4.396 4.545 4.614 4.748 4.865 5.023 5.127 5.215 5.335 5.456 5.573 5.682 5.769 5.853 5.916 5.961 6.005 6.052 6.107 6.166 6.214 6.24 6.246 6.235 6.219 6.201 6.161 6.061 5.889 5.613 5.207 4.611 3.758 2.488 0.582 -2.678 -6.668 -9.778 -12.314 -14.503 -16.469 -18.172 -19.701 -21.052 -22.378 -23.447 -24.361 -25.23 -26.064 -26.849 -27.563 -28.3 -28.946 -29.491 -30.058 -30.641 -31.128 -31.632 -32.148 -32.555 -32.973 -33.416 -33.881 -34.358 -34.682 -35.008 -35.529 -35.895 -36.271 -36.465 -36.889 -37.339 -37.799 -38.038 -38.663 -38.797 -39.066 -39.345 -40.043 -40.446 -40.852 -41.31 -41.892 -42.625 -43.62 -47.198 -7 ,5996 ,KEBNE ,16721988,Sat Nov 27 21:24:05 CET,Sat Nov 27 23:20:39 CET,0.0 2.207 2.606 2.868 3.068 3.248 3.408 3.548 3.803 3.908 3.995 3.814 4.212 4.276 4.393 4.496 4.593 4.641 4.729 4.821 4.951 5.019 5.082 5.165 5.239 5.303 5.36 5.416 5.473 5.521 5.568 5.625 5.686 5.734 5.77 5.795 5.807 5.799 5.768 5.704 5.63 5.546 5.401 5.217 4.933 4.502 3.922 3.106 1.909 0.104 -2.901 -6.512 -9.467 -11.914 -13.984 -15.828 -17.479 -18.96 -20.203 -21.483 -22.582 -23.524 -24.405 -25.235 -26.001 -26.723 -27.491 -28.157 -28.732 -29.359 -30.04 -30.584 -31.113 -31.642 -32.054 -32.479 -32.924 -33.408 -33.905 -34.235 -34.569 -35.075 -35.431 -35.815 -36.014 -36.426 -36.861 -37.341 -37.604 -38.246 -38.43 -38.735 -39.06 -39.772 -40.164 -40.588 -41.082 -41.642 -42.305 -43.285 -47.128 -8 ,30130 ,KEBNE ,16721989,Sat Nov 27 21:25:07 CET,Sat Nov 27 23:21:28 CET,0.0 2.064 2.539 2.838 3.103 3.336 3.518 3.684 3.956 4.076 4.188 4.046 4.461 4.549 4.699 4.823 4.948 5.009 5.108 5.194 5.309 5.384 5.459 5.561 5.654 5.734 5.812 5.879 5.947 6.007 6.049 6.104 6.151 6.172 6.189 6.193 6.189 6.177 6.13 6.062 5.967 5.812 5.594 5.33 4.944 4.417 3.722 2.799 1.435 -0.65 -4.115 -8.207 -11.527 -14.17 -16.336 -18.337 -20.147 -21.799 -23.214 -24.598 -25.785 -26.816 -27.743 -28.637 -29.474 -30.199 -30.928 -31.581 -32.163 -32.814 -33.514 -34.056 -34.6 -35.165 -35.607 -36.053 -36.497 -36.976 -37.481 -37.827 -38.186 -38.739 -39.128 -39.53 -39.739 -40.166 -40.636 -41.17 -41.453 -42.135 -42.384 -42.708 -43.055 -43.846 -44.279 -44.746 -45.279 -45.864 -46.537 -47.495 -51.347 -9 ,13365 ,KEBNE ,16721990,Sat Nov 27 21:25:06 CET,Sat Nov 27 23:22:46 CET,0.0 1.403 1.858 2.163 2.417 2.643 2.84 3.008 3.326 3.467 3.595 3.511 3.941 4.029 4.176 4.307 4.418 4.468 4.568 4.683 4.855 4.934 5.0 5.097 5.175 5.252 5.323 5.385 5.446 5.487 5.526 5.597 5.678 5.736 5.771 5.788 5.782 5.762 5.716 5.627 5.529 5.4 5.178 4.894 4.534 4.094 3.511 2.717 1.542 -0.281 -3.401 -7.061 -9.979 -12.429 -14.523 -16.44 -18.181 -19.71 -20.946 -22.156 -23.218 -24.156 -25.033 -25.845 -26.586 -27.276 -28.018 -28.689 -29.259 -29.862 -30.512 -31.04 -31.568 -32.1 -32.511 -32.939 -33.373 -33.824 -34.289 -34.607 -34.949 -35.486 -35.87 -36.281 -36.49 -36.918 -37.344 -37.777 -38.005 -38.64 -38.822 -39.12 -39.438 -40.156 -40.552 -40.976 -41.468 -42.028 -42.737 -43.758 -47.55 -10 ,1566 ,KEBNE ,16721991,Sat Nov 27 21:25:06 CET,Sat Nov 27 23:21:40 CET,0.0 1.186 1.631 1.983 2.272 2.505 2.712 2.909 3.227 3.342 3.442 3.293 3.709 3.79 3.952 4.088 4.192 4.246 4.347 4.445 4.602 4.698 4.784 4.891 4.975 5.044 5.114 5.181 5.259 5.33 5.389 5.445 5.488 5.52 5.556 5.586 5.59 5.596 5.576 5.505 5.399 5.257 5.066 4.861 4.558 4.111 3.486 2.598 1.306 -0.656 -3.788 -7.345 -10.17 -12.538 -14.688 -16.705 -18.48 -20.038 -21.408 -22.775 -23.914 -24.923 -25.853 -26.719 -27.526 -28.244 -28.997 -29.682 -30.253 -30.836 -31.46 -31.97 -32.485 -33.02 -33.422 -33.832 -34.269 -34.71 -35.17 -35.504 -35.848 -36.368 -36.741 -37.146 -37.356 -37.791 -38.248 -38.711 -38.949 -39.578 -39.769 -40.069 -40.384 -41.091 -41.475 -41.876 -42.302 -42.787 -43.416 -44.266 -47.149 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_7_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_7_Example-1.txt deleted file mode 100644 index f9cb52db..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_7_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8547 ,KEBNE ,16721992,Sat Nov 27 21:25:07 CET,Sat Nov 27 23:22:49 CET,0.0 1.641 2.32 2.773 3.094 3.346 3.576 3.779 4.117 4.252 4.382 4.313 4.756 4.846 5.015 5.165 5.306 5.368 5.478 5.585 5.719 5.793 5.864 5.951 6.013 6.065 6.1 6.128 6.164 6.188 6.2 6.203 6.185 6.147 6.089 5.987 5.872 5.733 5.548 5.32 5.012 4.578 3.976 3.297 2.455 1.418 0.039 -1.778 -4.364 -8.064 -13.656 -19.783 -24.497 -28.32 -31.499 -34.237 -36.565 -38.631 -40.372 -42.022 -43.392 -44.64 -45.77 -46.782 -47.751 -48.62 -49.521 -50.358 -51.075 -51.798 -52.517 -53.073 -53.666 -54.326 -54.847 -55.371 -55.917 -56.493 -57.101 -57.537 -57.968 -58.594 -59.018 -59.47 -59.712 -60.225 -60.765 -61.34 -61.64 -62.363 -62.627 -62.978 -63.327 -64.034 -64.408 -64.798 -65.221 -65.71 -66.306 -67.183 -70.721 -2 ,27212 ,KEBNE ,16721993,Sat Nov 27 21:25:07 CET,Sat Nov 27 23:23:29 CET,0.0 1.913 2.435 2.82 3.132 3.368 3.585 3.783 4.1 4.231 4.344 4.215 4.646 4.729 4.878 5.03 5.168 5.228 5.335 5.416 5.534 5.604 5.649 5.689 5.726 5.754 5.76 5.748 5.731 5.705 5.655 5.578 5.503 5.429 5.316 5.162 4.987 4.759 4.496 4.171 3.795 3.348 2.701 1.929 0.94 -0.295 -1.893 -3.976 -6.888 -11.026 -17.369 -24.304 -29.568 -33.765 -37.2 -40.113 -42.543 -44.649 -46.442 -48.207 -49.711 -51.038 -52.261 -53.391 -54.413 -55.311 -56.235 -57.04 -57.727 -58.453 -59.198 -59.797 -60.397 -61.019 -61.492 -61.965 -62.451 -62.942 -63.453 -63.81 -64.174 -64.73 -65.116 -65.511 -65.71 -66.142 -66.594 -67.058 -67.307 -67.977 -68.08 -68.371 -68.685 -69.375 -69.795 -70.282 -70.773 -71.289 -71.952 -72.909 -76.372 -3 ,7110 ,KEBNE ,16721994,Sat Nov 27 21:25:07 CET,Sat Nov 27 23:23:02 CET,0.0 2.393 2.842 3.185 3.469 3.695 3.888 4.049 4.31 4.435 4.551 4.4 4.823 4.908 5.039 5.139 5.228 5.276 5.364 5.428 5.501 5.543 5.579 5.612 5.644 5.663 5.66 5.646 5.612 5.584 5.553 5.503 5.448 5.376 5.261 5.113 4.96 4.775 4.535 4.22 3.846 3.368 2.726 2.007 1.101 -0.047 -1.555 -3.501 -6.149 -9.894 -15.682 -22.173 -27.194 -31.259 -34.551 -37.335 -39.686 -41.712 -43.42 -45.07 -46.484 -47.743 -48.92 -49.999 -50.972 -51.853 -52.752 -53.545 -54.22 -54.921 -55.628 -56.194 -56.784 -57.403 -57.876 -58.338 -58.823 -59.341 -59.86 -60.208 -60.571 -61.143 -61.538 -61.94 -62.146 -62.564 -62.99 -63.439 -63.676 -64.336 -64.459 -64.734 -65.019 -65.616 -65.95 -66.347 -66.8 -67.298 -67.908 -68.686 -71.93 -4 ,13632 ,KEBNE ,16721995,Sat Nov 27 21:25:06 CET,Sat Nov 27 23:24:36 CET,0.0 2.69 3.209 3.577 3.87 4.108 4.31 4.483 4.759 4.876 4.988 4.855 5.274 5.347 5.473 5.589 5.706 5.755 5.837 5.909 5.994 6.04 6.088 6.155 6.224 6.285 6.328 6.356 6.363 6.354 6.342 6.308 6.264 6.211 6.111 5.969 5.813 5.627 5.416 5.153 4.842 4.438 3.886 3.239 2.376 1.282 -0.194 -2.075 -4.639 -8.516 -14.72 -21.564 -26.815 -30.997 -34.463 -37.387 -39.744 -41.756 -43.484 -45.178 -46.6 -47.852 -49.031 -50.109 -51.08 -51.954 -52.865 -53.67 -54.338 -55.032 -55.772 -56.368 -56.956 -57.555 -58.022 -58.502 -58.99 -59.486 -59.984 -60.328 -60.691 -61.253 -61.624 -62.003 -62.201 -62.615 -63.064 -63.509 -63.735 -64.384 -64.536 -64.837 -65.155 -65.798 -66.154 -66.558 -66.989 -67.458 -68.053 -68.933 -72.311 -5 ,7098 ,KEBNE ,16721996,Sat Nov 27 21:25:06 CET,Sat Nov 27 23:22:46 CET,0.0 2.235 2.736 3.099 3.37 3.563 3.747 3.937 4.27 4.403 4.51 4.38 4.801 4.875 5.016 5.135 5.234 5.279 5.366 5.456 5.57 5.627 5.691 5.769 5.813 5.835 5.839 5.845 5.847 5.835 5.804 5.758 5.701 5.629 5.533 5.409 5.255 5.04 4.792 4.513 4.16 3.697 3.116 2.461 1.574 0.479 -0.975 -2.893 -5.493 -9.245 -15.178 -21.679 -26.596 -30.551 -33.849 -36.751 -39.251 -41.447 -43.343 -45.217 -46.715 -47.988 -49.162 -50.266 -51.315 -52.259 -53.224 -54.076 -54.805 -55.565 -56.351 -56.978 -57.628 -58.291 -58.775 -59.275 -59.785 -60.307 -60.845 -61.197 -61.556 -62.141 -62.55 -62.983 -63.21 -63.667 -64.129 -64.6 -64.848 -65.506 -65.624 -65.915 -66.23 -66.921 -67.289 -67.668 -68.13 -68.673 -69.293 -70.157 -73.286 -6 ,31011 ,KEBNE ,16721997,Sat Nov 27 21:25:07 CET,Sat Nov 27 23:22:45 CET,0.0 2.717 3.386 3.789 4.082 4.333 4.55 4.734 5.032 5.16 5.286 5.191 5.634 5.737 5.921 6.077 6.21 6.271 6.379 6.462 6.542 6.594 6.641 6.686 6.719 6.741 6.753 6.759 6.761 6.75 6.727 6.681 6.625 6.569 6.486 6.369 6.242 6.076 5.83 5.521 5.185 4.788 4.239 3.576 2.7 1.623 0.2 -1.654 -4.161 -7.713 -13.149 -19.182 -23.924 -27.725 -30.855 -33.565 -35.873 -37.919 -39.6 -41.212 -42.601 -43.837 -45.015 -46.124 -47.141 -48.047 -48.98 -49.805 -50.495 -51.205 -51.933 -52.526 -53.13 -53.752 -54.239 -54.751 -55.279 -55.795 -56.303 -56.657 -57.022 -57.583 -57.97 -58.366 -58.574 -59.014 -59.455 -59.901 -60.134 -60.777 -60.889 -61.167 -61.449 -62.059 -62.398 -62.773 -63.196 -63.699 -64.293 -65.074 -68.477 -7 ,8126 ,KEBNE ,16721998,Sat Nov 27 21:25:06 CET,Sat Nov 27 23:22:46 CET,0.0 2.077 2.736 3.18 3.53 3.831 4.079 4.259 4.535 4.659 4.78 4.662 5.056 5.121 5.271 5.409 5.532 5.582 5.659 5.722 5.804 5.848 5.888 5.931 5.963 5.992 6.021 6.025 6.009 5.972 5.924 5.851 5.762 5.675 5.549 5.401 5.247 5.035 4.788 4.496 4.141 3.693 3.072 2.359 1.465 0.318 -1.247 -3.259 -5.966 -9.903 -15.865 -22.086 -26.731 -30.494 -33.705 -36.473 -38.757 -40.732 -42.375 -43.963 -45.313 -46.503 -47.602 -48.608 -49.506 -50.302 -51.132 -51.855 -52.466 -53.108 -53.777 -54.317 -54.871 -55.435 -55.864 -56.327 -56.815 -57.323 -57.867 -58.243 -58.613 -59.185 -59.592 -60.019 -60.247 -60.705 -61.21 -61.75 -61.999 -62.651 -62.814 -63.119 -63.419 -64.037 -64.385 -64.771 -65.233 -65.749 -66.33 -67.093 -70.575 -8 ,21155 ,KEBNE ,16721999,Sat Nov 27 21:25:06 CET,Sat Nov 27 23:24:11 CET,0.0 2.3 2.892 3.316 3.613 3.848 4.056 4.227 4.51 4.621 4.713 4.54 4.949 5.019 5.137 5.241 5.333 5.378 5.459 5.525 5.606 5.651 5.695 5.761 5.81 5.837 5.854 5.871 5.874 5.845 5.795 5.724 5.645 5.553 5.424 5.249 5.079 4.88 4.611 4.286 3.909 3.452 2.816 2.068 1.146 -0.008 -1.503 -3.456 -6.157 -10.077 -16.183 -22.906 -28.136 -32.313 -35.748 -38.774 -41.31 -43.425 -45.136 -46.83 -48.319 -49.597 -50.749 -51.827 -52.825 -53.71 -54.617 -55.421 -56.09 -56.763 -57.461 -58.043 -58.643 -59.264 -59.74 -60.216 -60.7 -61.2 -61.716 -62.054 -62.395 -62.952 -63.35 -63.757 -63.968 -64.403 -64.855 -65.316 -65.546 -66.184 -66.287 -66.56 -66.852 -67.496 -67.845 -68.227 -68.656 -69.141 -69.721 -70.532 -73.298 -9 ,15556 ,KEBNE ,16722000,Sat Nov 27 21:25:07 CET,Sat Nov 27 23:22:47 CET,0.0 2.3 2.924 3.312 3.618 3.863 4.067 4.261 4.608 4.752 4.869 4.713 5.117 5.189 5.332 5.456 5.566 5.621 5.721 5.816 5.939 5.993 6.028 6.059 6.071 6.088 6.109 6.12 6.123 6.118 6.093 6.049 6.011 5.963 5.886 5.778 5.648 5.486 5.282 5.02 4.706 4.282 3.723 3.121 2.32 1.267 -0.146 -2.019 -4.601 -8.217 -13.88 -20.23 -25.171 -29.036 -32.201 -34.997 -37.344 -39.379 -41.076 -42.721 -44.086 -45.28 -46.399 -47.426 -48.357 -49.198 -50.059 -50.817 -51.472 -52.15 -52.864 -53.443 -54.024 -54.618 -55.076 -55.53 -55.991 -56.477 -56.988 -57.346 -57.713 -58.269 -58.649 -59.059 -59.276 -59.706 -60.135 -60.592 -60.836 -61.483 -61.578 -61.865 -62.168 -62.779 -63.118 -63.511 -63.967 -64.48 -65.056 -65.809 -68.501 -10 ,13503 ,KEBNE ,16722001,Sat Nov 27 21:25:06 CET,Sat Nov 27 23:22:19 CET,0.0 1.242 1.764 2.147 2.467 2.737 2.971 3.174 3.508 3.652 3.785 3.68 4.111 4.208 4.393 4.565 4.723 4.797 4.937 5.054 5.205 5.291 5.35 5.406 5.458 5.509 5.545 5.559 5.571 5.594 5.603 5.585 5.546 5.492 5.41 5.276 5.12 4.955 4.734 4.422 4.064 3.63 3.039 2.34 1.44 0.329 -1.138 -3.071 -5.762 -9.624 -15.614 -22.257 -27.344 -31.393 -34.701 -37.665 -40.24 -42.401 -44.176 -45.919 -47.369 -48.622 -49.784 -50.861 -51.875 -52.796 -53.737 -54.546 -55.233 -55.941 -56.652 -57.224 -57.819 -58.466 -58.957 -59.444 -59.947 -60.472 -61.008 -61.37 -61.738 -62.301 -62.694 -63.113 -63.331 -63.773 -64.232 -64.713 -64.963 -65.62 -65.77 -66.082 -66.414 -67.089 -67.455 -67.865 -68.303 -68.835 -69.456 -70.246 -73.156 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_6.txt deleted file mode 100644 index 11f0e196..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,265 ,KEBNE ,16722002,Sat Nov 27 21:26:08 CET,Sat Nov 27 23:24:05 CET,0.0 1.727 2.263 2.627 2.938 3.214 3.443 3.652 4.042 4.227 4.399 4.297 4.841 4.985 5.256 5.505 5.748 5.866 6.084 6.299 6.623 6.837 7.05 7.357 7.647 7.918 8.184 8.45 8.784 9.102 9.42 9.804 10.169 10.528 10.951 11.41 11.86 12.359 12.897 13.497 14.118 14.79 15.603 16.444 17.434 18.596 19.961 21.522 23.382 25.632 28.508 31.014 32.485 33.409 33.973 34.274 34.436 34.585 34.686 34.737 34.743 34.705 34.646 34.571 34.484 34.387 34.253 34.107 33.983 33.84 33.676 33.538 33.403 33.264 33.142 33.016 32.884 32.719 32.514 32.366 32.231 32.01 31.829 31.635 31.537 31.34 31.145 30.924 30.797 30.29 30.385 30.229 30.056 29.653 29.406 29.135 28.838 28.498 28.064 27.372 24.969 -2 ,21404 ,KEBNE ,16722003,Sat Nov 27 21:26:08 CET,Sat Nov 27 23:24:46 CET,0.0 2.297 2.837 3.22 3.55 3.849 4.126 4.365 4.764 4.946 5.121 5.036 5.588 5.729 5.995 6.252 6.501 6.625 6.858 7.09 7.452 7.667 7.864 8.16 8.451 8.743 9.024 9.283 9.618 9.948 10.277 10.679 11.056 11.42 11.848 12.327 12.79 13.283 13.814 14.39 15.004 15.704 16.526 17.356 18.352 19.511 20.879 22.468 24.341 26.614 29.458 31.979 33.577 34.544 35.159 35.594 35.881 36.071 36.206 36.297 36.327 36.334 36.285 36.185 36.074 35.966 35.854 35.741 35.628 35.518 35.417 35.312 35.184 35.059 34.937 34.801 34.662 34.504 34.342 34.228 34.11 33.919 33.782 33.632 33.545 33.349 33.124 32.884 32.766 32.254 32.351 32.202 32.042 31.661 31.425 31.153 30.839 30.476 30.032 29.388 26.847 -3 ,15079 ,KEBNE ,16722004,Sat Nov 27 21:26:08 CET,Sat Nov 27 23:24:10 CET,0.0 2.088 2.613 3.022 3.369 3.68 3.938 4.168 4.592 4.783 4.963 4.89 5.462 5.614 5.907 6.182 6.437 6.556 6.79 7.024 7.358 7.576 7.792 8.098 8.388 8.656 8.92 9.176 9.501 9.816 10.125 10.501 10.841 11.173 11.583 12.045 12.478 12.966 13.517 14.114 14.73 15.421 16.237 17.109 18.14 19.255 20.604 22.16 24.014 26.24 29.001 31.414 32.928 33.878 34.473 34.878 35.106 35.244 35.322 35.33 35.32 35.311 35.282 35.23 35.167 35.09 35.002 34.909 34.793 34.653 34.497 34.36 34.228 34.079 33.953 33.808 33.651 33.498 33.311 33.166 33.026 32.812 32.644 32.457 32.361 32.143 31.896 31.624 31.484 30.961 31.03 30.878 30.719 30.328 30.102 29.856 29.569 29.203 28.75 28.161 26.076 -4 ,1279 ,KEBNE ,16722005,Sat Nov 27 21:26:08 CET,Sat Nov 27 23:23:56 CET,0.0 2.35 2.865 3.263 3.605 3.875 4.104 4.312 4.697 4.875 5.043 4.967 5.532 5.683 5.971 6.245 6.511 6.641 6.886 7.12 7.456 7.66 7.853 8.137 8.428 8.708 8.97 9.227 9.559 9.877 10.185 10.545 10.9 11.268 11.678 12.107 12.555 13.082 13.644 14.25 14.898 15.601 16.433 17.262 18.229 19.363 20.662 22.18 24.05 26.337 29.183 31.596 33.09 34.106 34.755 35.227 35.549 35.753 35.92 36.056 36.129 36.156 36.147 36.113 36.047 35.975 35.904 35.819 35.732 35.632 35.536 35.441 35.325 35.195 35.084 34.975 34.845 34.681 34.504 34.38 34.253 34.041 33.886 33.712 33.622 33.443 33.231 32.99 32.857 32.334 32.386 32.225 32.068 31.707 31.488 31.229 30.955 30.639 30.188 29.525 26.745 -5 ,6308 ,KEBNE ,16722006,Sat Nov 27 21:26:08 CET,Sat Nov 27 23:25:00 CET,0.0 2.16 2.67 3.056 3.391 3.688 3.94 4.159 4.544 4.721 4.891 4.795 5.35 5.494 5.771 6.028 6.27 6.383 6.599 6.824 7.143 7.352 7.561 7.839 8.105 8.382 8.654 8.908 9.224 9.527 9.827 10.194 10.546 10.893 11.316 11.801 12.265 12.785 13.345 13.942 14.577 15.31 16.176 17.027 18.016 19.164 20.538 22.106 23.939 26.192 29.188 31.819 33.324 34.314 34.946 35.343 35.613 35.812 35.918 35.943 35.965 35.972 35.944 35.871 35.774 35.682 35.568 35.446 35.317 35.19 35.051 34.923 34.791 34.632 34.504 34.366 34.228 34.082 33.917 33.788 33.639 33.4 33.23 33.057 32.97 32.778 32.558 32.31 32.177 31.658 31.713 31.545 31.373 30.952 30.71 30.448 30.135 29.756 29.283 28.642 25.502 -6 ,11625 ,KEBNE ,16722007,Sat Nov 27 21:27:09 CET,Sat Nov 27 23:26:04 CET,0.0 1.76 2.263 2.642 2.964 3.244 3.498 3.722 4.105 4.29 4.475 4.374 4.938 5.089 5.364 5.634 5.912 6.046 6.303 6.546 6.88 7.09 7.292 7.595 7.892 8.168 8.438 8.697 9.033 9.363 9.681 10.073 10.443 10.788 11.203 11.676 12.128 12.641 13.198 13.797 14.441 15.149 15.983 16.83 17.819 18.939 20.261 21.818 23.719 26.015 28.804 31.299 32.913 33.918 34.544 34.972 35.263 35.439 35.558 35.648 35.67 35.648 35.605 35.546 35.469 35.396 35.294 35.168 35.049 34.93 34.802 34.687 34.563 34.422 34.306 34.19 34.065 33.915 33.749 33.64 33.53 33.338 33.207 33.073 32.991 32.81 32.626 32.406 32.288 31.784 31.903 31.743 31.556 31.132 30.905 30.656 30.363 30.003 29.547 28.882 26.311 -7 ,10661 ,KEBNE ,16722008,Sat Nov 27 21:28:11 CET,Sat Nov 27 23:26:12 CET,0.0 1.896 2.418 2.768 3.05 3.3 3.53 3.736 4.088 4.258 4.424 4.327 4.873 5.001 5.263 5.521 5.769 5.888 6.107 6.311 6.602 6.797 6.998 7.285 7.55 7.807 8.064 8.325 8.654 8.979 9.297 9.665 10.003 10.337 10.735 11.197 11.662 12.169 12.712 13.311 13.958 14.681 15.525 16.395 17.413 18.546 19.878 21.378 23.205 25.482 28.369 30.796 32.205 33.092 33.709 34.129 34.358 34.494 34.542 34.568 34.581 34.568 34.515 34.439 34.355 34.238 34.108 34.014 33.912 33.774 33.634 33.503 33.334 33.147 32.998 32.842 32.675 32.508 32.356 32.243 32.105 31.897 31.762 31.588 31.479 31.261 31.039 30.808 30.688 30.161 30.241 30.083 29.902 29.493 29.28 29.044 28.769 28.432 27.987 27.362 24.783 -8 ,25709 ,KEBNE ,16722009,Sat Nov 27 21:28:10 CET,Sat Nov 27 23:25:49 CET,0.0 1.85 2.379 2.739 3.025 3.28 3.505 3.711 4.096 4.272 4.434 4.32 4.863 4.999 5.253 5.494 5.728 5.839 6.058 6.268 6.567 6.765 6.963 7.252 7.526 7.795 8.055 8.307 8.622 8.908 9.184 9.542 9.894 10.227 10.607 11.053 11.511 12.012 12.531 13.09 13.705 14.407 15.212 16.043 17.049 18.179 19.517 21.065 22.916 25.218 28.142 30.615 31.982 32.83 33.408 33.768 34.01 34.188 34.269 34.288 34.294 34.285 34.247 34.19 34.118 34.038 33.933 33.806 33.689 33.558 33.419 33.312 33.197 33.045 32.913 32.761 32.598 32.448 32.297 32.175 32.026 31.783 31.611 31.441 31.354 31.161 30.93 30.661 30.521 30.002 30.067 29.891 29.696 29.27 29.049 28.792 28.487 28.12 27.633 26.924 23.237 -9 ,24515 ,KEBNE ,16722010,Sat Nov 27 21:28:10 CET,Sat Nov 27 23:26:51 CET,0.0 2.368 2.881 3.244 3.543 3.79 4.01 4.215 4.592 4.77 4.932 4.838 5.383 5.522 5.793 6.05 6.284 6.395 6.629 6.855 7.172 7.379 7.576 7.856 8.123 8.39 8.649 8.899 9.227 9.54 9.846 10.217 10.574 10.929 11.347 11.807 12.244 12.74 13.309 13.918 14.525 15.216 16.056 16.924 17.921 19.012 20.314 21.831 23.663 25.915 28.746 31.116 32.486 33.316 33.883 34.252 34.422 34.54 34.595 34.593 34.558 34.507 34.442 34.388 34.346 34.281 34.169 34.046 33.925 33.786 33.644 33.517 33.378 33.24 33.12 32.994 32.865 32.706 32.516 32.377 32.235 32.017 31.865 31.686 31.585 31.362 31.086 30.778 30.629 30.087 30.124 29.932 29.738 29.315 29.053 28.775 28.486 28.144 27.665 26.929 24.182 -10 ,30400 ,KEBNE ,16722011,Sat Nov 27 21:28:10 CET,Sat Nov 27 23:25:32 CET,0.0 2.028 2.527 2.898 3.202 3.483 3.747 3.965 4.348 4.531 4.712 4.655 5.219 5.368 5.645 5.906 6.147 6.258 6.474 6.693 7.019 7.23 7.421 7.699 7.988 8.272 8.544 8.8 9.125 9.436 9.744 10.127 10.495 10.859 11.275 11.755 12.218 12.714 13.259 13.846 14.463 15.159 15.981 16.828 17.855 19.049 20.444 22.032 23.971 26.274 29.166 31.639 33.105 34.076 34.703 35.112 35.423 35.653 35.775 35.807 35.804 35.801 35.763 35.676 35.587 35.532 35.474 35.384 35.259 35.125 35.003 34.905 34.796 34.667 34.548 34.417 34.292 34.156 33.995 33.881 33.76 33.545 33.392 33.235 33.148 32.967 32.763 32.539 32.419 31.902 31.959 31.796 31.65 31.303 31.082 30.828 30.52 30.17 29.743 29.086 26.298 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt deleted file mode 100644 index f7a7b61f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,20869 ,KEBNE ,16722015,Sat Nov 27 21:28:11 CET,Sat Nov 27 23:28:07 CET,0.0 1.979 2.515 2.945 3.303 3.59 3.825 4.04 4.454 4.645 4.808 4.679 5.228 5.358 5.602 5.825 6.039 6.149 6.361 6.558 6.846 7.028 7.201 7.443 7.675 7.9 8.103 8.296 8.548 8.792 9.032 9.32 9.598 9.856 10.131 10.443 10.74 11.06 11.413 11.786 12.168 12.593 13.077 13.55 14.107 14.681 15.255 15.864 16.511 17.154 17.699 17.89 17.802 17.571 17.273 16.926 16.574 16.253 15.965 15.66 15.35 15.07 14.812 14.56 14.304 14.045 13.776 13.52 13.288 13.04 12.762 12.545 12.335 12.101 11.912 11.72 11.516 11.303 11.093 10.947 10.785 10.515 10.318 10.112 10.011 9.811 9.588 9.34 9.209 8.673 8.817 8.662 8.494 8.149 7.94 7.693 7.424 7.093 6.715 6.176 4.079 -5 ,12409 ,KEBNE ,16722016,Sat Nov 27 21:28:11 CET,Sat Nov 27 23:29:17 CET,0.0 2.542 3.163 3.567 3.894 4.175 4.424 4.646 5.038 5.212 5.368 5.261 5.812 5.948 6.195 6.43 6.659 6.77 6.975 7.175 7.453 7.625 7.798 8.038 8.254 8.474 8.698 8.914 9.182 9.432 9.664 9.927 10.184 10.431 10.729 11.069 11.372 11.696 12.037 12.385 12.746 13.151 13.616 14.057 14.543 15.073 15.658 16.285 16.946 17.627 18.314 18.556 18.357 18.048 17.724 17.359 16.988 16.663 16.361 16.019 15.714 15.432 15.158 14.876 14.608 14.367 14.087 13.835 13.634 13.425 13.205 13.013 12.815 12.61 12.451 12.275 12.09 11.89 11.672 11.527 11.381 11.141 10.958 10.763 10.662 10.452 10.238 9.999 9.87 9.338 9.463 9.304 9.142 8.797 8.6 8.397 8.176 7.903 7.553 7.05 4.923 -6 ,16471 ,KEBNE ,16722017,Sat Nov 27 21:28:11 CET,Sat Nov 27 23:27:53 CET,0.0 2.119 2.657 3.033 3.333 3.608 3.857 4.072 4.485 4.666 4.815 4.674 5.212 5.34 5.583 5.813 6.031 6.141 6.354 6.541 6.799 6.975 7.15 7.408 7.658 7.887 8.098 8.29 8.541 8.786 9.008 9.266 9.506 9.74 10.017 10.334 10.638 10.957 11.293 11.648 12.031 12.426 12.861 13.286 13.772 14.312 14.906 15.562 16.264 16.988 17.604 17.802 17.701 17.41 17.037 16.653 16.323 16.007 15.698 15.377 15.088 14.787 14.48 14.211 13.967 13.738 13.497 13.269 13.066 12.862 12.639 12.449 12.26 12.053 11.878 11.707 11.534 11.35 11.143 11.002 10.849 10.595 10.423 10.245 10.148 9.942 9.735 9.499 9.371 8.84 8.99 8.854 8.702 8.369 8.175 7.96 7.727 7.45 7.076 6.558 4.573 -10 ,723 ,KEBNE ,16722021,Sat Nov 27 21:28:12 CET,Sat Nov 27 23:29:56 CET,0.0 2.543 3.092 3.461 3.747 4.004 4.226 4.419 4.795 4.969 5.132 5.027 5.568 5.701 5.964 6.212 6.442 6.55 6.752 6.94 7.224 7.408 7.573 7.802 8.032 8.251 8.463 8.674 8.936 9.178 9.412 9.694 9.96 10.228 10.545 10.882 11.204 11.545 11.911 12.299 12.692 13.126 13.616 14.095 14.642 15.235 15.852 16.525 17.284 17.994 18.565 18.621 18.429 18.145 17.832 17.528 17.207 16.853 16.53 16.224 15.94 15.656 15.377 15.11 14.861 14.624 14.371 14.151 13.96 13.759 13.546 13.365 13.174 12.976 12.824 12.666 12.497 12.307 12.109 11.966 11.818 11.585 11.413 11.237 11.15 10.977 10.785 10.565 10.444 9.911 10.067 9.929 9.79 9.464 9.262 9.058 8.827 8.541 8.195 7.715 5.664 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt deleted file mode 100644 index 1c33a439..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,32542 ,KEBNE ,16722025,Sat Nov 27 21:28:11 CET,Sat Nov 27 23:26:00 CET,0.0 0.813 1.164 1.428 1.664 1.882 2.108 2.298 2.595 2.737 2.875 2.741 3.28 3.416 3.68 3.938 4.17 4.271 4.468 4.657 4.904 5.061 5.219 5.438 5.66 5.877 6.075 6.271 6.522 6.78 7.026 7.281 7.52 7.753 8.031 8.336 8.611 8.916 9.238 9.541 9.822 10.125 10.49 10.872 11.28 11.68 12.078 12.493 12.868 13.073 13.064 12.64 11.918 11.118 10.415 9.751 9.127 8.53 7.998 7.487 7.052 6.618 6.189 5.803 5.442 5.118 4.772 4.453 4.161 3.853 3.541 3.271 2.994 2.695 2.447 2.18 1.913 1.645 1.372 1.183 0.973 0.641 0.415 0.185 0.069 -0.183 -0.461 -0.739 -0.885 -1.468 -1.433 -1.641 -1.869 -2.365 -2.645 -2.948 -3.293 -3.664 -4.126 -4.85 -8.205 -5 ,4163 ,KEBNE ,16722026,Sat Nov 27 21:28:11 CET,Sat Nov 27 23:26:44 CET,0.0 0.952 1.439 1.798 2.064 2.315 2.521 2.68 2.948 3.078 3.217 3.07 3.596 3.702 3.913 4.123 4.323 4.415 4.599 4.778 5.028 5.196 5.36 5.591 5.819 6.031 6.228 6.433 6.698 6.936 7.153 7.414 7.674 7.911 8.188 8.494 8.767 9.051 9.346 9.65 9.967 10.332 10.733 11.111 11.556 12.042 12.555 13.031 13.42 13.668 13.621 13.127 12.47 11.706 10.976 10.304 9.67 9.019 8.372 7.687 7.092 6.572 6.1 5.653 5.238 4.87 4.484 4.139 3.855 3.574 3.286 3.045 2.806 2.557 2.347 2.106 1.858 1.618 1.351 1.16 0.972 0.682 0.479 0.262 0.145 -0.088 -0.318 -0.582 -0.722 -1.279 -1.166 -1.338 -1.519 -1.937 -2.172 -2.417 -2.71 -3.056 -3.465 -4.069 -6.895 -6 ,29045 ,KEBNE ,16722027,Sat Nov 27 21:28:11 CET,Sat Nov 27 23:25:23 CET,0.0 0.818 1.22 1.544 1.818 2.043 2.234 2.417 2.749 2.891 3.031 2.892 3.412 3.523 3.75 3.971 4.195 4.301 4.491 4.667 4.93 5.11 5.28 5.518 5.756 5.98 6.171 6.349 6.583 6.798 7.011 7.293 7.554 7.776 8.02 8.315 8.602 8.894 9.184 9.5 9.855 10.237 10.654 11.052 11.462 11.882 12.339 12.789 13.25 13.593 13.543 13.039 12.305 11.485 10.686 9.92 9.247 8.617 8.042 7.447 6.931 6.47 5.998 5.527 5.12 4.758 4.365 3.998 3.666 3.321 2.964 2.654 2.328 1.99 1.716 1.443 1.159 0.854 0.544 0.314 0.061 -0.323 -0.579 -0.861 -1.017 -1.342 -1.693 -2.065 -2.238 -2.823 -2.792 -3.001 -3.227 -3.742 -4.016 -4.299 -4.63 -5.031 -5.579 -6.394 -9.397 -10 ,23361 ,KEBNE ,16722031,Sat Nov 27 21:29:12 CET,Sat Nov 27 23:27:19 CET,0.0 0.859 1.214 1.5 1.748 1.961 2.16 2.356 2.707 2.852 2.989 2.846 3.376 3.498 3.722 3.919 4.111 4.208 4.394 4.558 4.798 4.953 5.11 5.358 5.587 5.8 6.003 6.186 6.412 6.623 6.833 7.098 7.359 7.614 7.904 8.214 8.5 8.801 9.115 9.436 9.755 10.101 10.49 10.86 11.285 11.691 12.074 12.434 12.719 12.83 12.592 11.955 11.189 10.437 9.725 9.009 8.372 7.796 7.276 6.713 6.221 5.796 5.395 5.007 4.635 4.297 3.955 3.647 3.356 3.051 2.723 2.442 2.155 1.857 1.63 1.389 1.13 0.861 0.583 0.377 0.162 -0.177 -0.416 -0.674 -0.819 -1.106 -1.407 -1.719 -1.874 -2.447 -2.386 -2.582 -2.791 -3.242 -3.501 -3.777 -4.086 -4.493 -4.99 -5.709 -9.483 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt deleted file mode 100644 index ae136616..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22733 ,KEBNE ,16722032,Sat Nov 27 21:29:12 CET,Sat Nov 27 23:28:21 CET,0.0 2.964 3.757 4.288 4.689 5.029 5.347 5.642 6.161 6.404 6.629 6.913 7.181 7.347 7.657 7.935 8.215 8.344 8.575 8.794 9.108 9.319 9.512 9.773 10.012 10.252 10.494 10.707 10.968 11.224 11.477 11.762 12.027 12.291 12.595 12.914 13.193 13.486 13.812 14.161 14.501 14.826 15.194 15.589 15.991 16.363 16.715 17.039 17.32 17.471 17.263 16.537 15.79 15.088 14.382 13.695 13.063 12.483 11.997 11.475 11.023 10.622 10.221 9.813 9.42 9.072 8.712 8.384 8.078 7.757 7.444 7.183 6.904 6.61 6.385 6.155 5.903 5.62 5.313 5.104 4.897 4.562 4.317 4.074 3.949 3.679 3.393 3.08 2.907 2.615 2.336 2.125 1.905 1.419 1.138 0.832 0.455 0.006 -0.53 -1.289 -3.767 -2 ,19274 ,KEBNE ,16722033,Sat Nov 27 21:30:13 CET,Sat Nov 27 23:29:11 CET,0.0 2.589 3.339 3.885 4.319 4.666 4.968 5.253 5.737 5.933 6.124 6.378 6.647 6.796 7.097 7.361 7.597 7.72 7.956 8.178 8.497 8.691 8.874 9.135 9.377 9.607 9.844 10.063 10.335 10.606 10.85 11.118 11.374 11.636 11.913 12.221 12.52 12.799 13.077 13.376 13.689 14.038 14.43 14.784 15.156 15.582 16.05 16.445 16.761 16.948 16.697 16.026 15.286 14.487 13.753 13.089 12.467 11.899 11.432 10.945 10.493 10.082 9.675 9.297 8.958 8.64 8.276 7.942 7.663 7.368 7.04 6.765 6.483 6.188 5.957 5.703 5.448 5.19 4.916 4.716 4.504 4.173 3.941 3.686 3.553 3.289 3.003 2.685 2.514 2.233 1.948 1.745 1.533 1.044 0.745 0.412 0.041 -0.4 -0.948 -1.718 -4.165 -3 ,14861 ,KEBNE ,16722034,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:30:48 CET,0.0 3.174 3.95 4.474 4.903 5.26 5.559 5.823 6.278 6.492 6.694 6.949 7.222 7.386 7.666 7.923 8.169 8.287 8.523 8.746 9.039 9.226 9.403 9.65 9.888 10.122 10.346 10.558 10.819 11.06 11.288 11.565 11.84 12.083 12.347 12.641 12.929 13.238 13.549 13.88 14.213 14.568 14.941 15.316 15.734 16.086 16.435 16.79 17.112 17.301 17.123 16.507 15.751 14.962 14.247 13.581 12.966 12.371 11.828 11.28 10.813 10.395 9.965 9.563 9.2 8.85 8.464 8.125 7.84 7.526 7.203 6.948 6.676 6.394 6.165 5.912 5.656 5.396 5.099 4.892 4.679 4.339 4.107 3.865 3.736 3.462 3.179 2.879 2.719 2.442 2.194 2.007 1.796 1.308 1.046 0.757 0.415 -0.018 -0.573 -1.315 -4.832 -4 ,4058 ,KEBNE ,16722035,Sat Nov 27 21:32:16 CET,Sat Nov 27 23:31:19 CET,0.0 3.382 4.166 4.706 5.142 5.52 5.832 6.109 6.597 6.818 7.023 7.296 7.58 7.76 8.08 8.357 8.613 8.73 8.961 9.186 9.49 9.684 9.873 10.152 10.422 10.658 10.883 11.099 11.345 11.576 11.793 12.057 12.312 12.552 12.815 13.102 13.387 13.677 13.98 14.292 14.61 14.932 15.273 15.62 15.988 16.401 16.856 17.237 17.545 17.719 17.517 16.774 15.91 15.109 14.398 13.741 13.145 12.566 12.041 11.525 11.072 10.67 10.284 9.895 9.539 9.204 8.828 8.512 8.256 7.972 7.662 7.405 7.122 6.834 6.613 6.379 6.132 5.865 5.587 5.395 5.184 4.837 4.609 4.366 4.235 3.969 3.678 3.346 3.169 2.885 2.62 2.417 2.193 1.691 1.424 1.137 0.792 0.371 -0.157 -0.886 -4.055 -5 ,28181 ,KEBNE ,16722036,Sat Nov 27 21:33:17 CET,Sat Nov 27 23:35:39 CET,0.0 2.612 3.323 3.83 4.235 4.57 4.875 5.154 5.644 5.855 6.046 6.308 6.575 6.729 7.021 7.283 7.519 7.634 7.85 8.056 8.344 8.52 8.71 8.992 9.245 9.478 9.689 9.89 10.143 10.377 10.61 10.888 11.152 11.405 11.695 12.012 12.302 12.638 12.975 13.32 13.679 14.032 14.407 14.8 15.2 15.556 15.948 16.339 16.639 16.768 16.532 15.854 15.058 14.317 13.642 12.946 12.313 11.751 11.25 10.725 10.27 9.876 9.495 9.111 8.738 8.396 8.055 7.754 7.486 7.199 6.902 6.651 6.374 6.085 5.865 5.635 5.381 5.114 4.839 4.639 4.432 4.115 3.882 3.634 3.506 3.241 2.956 2.641 2.478 2.209 1.936 1.732 1.526 1.06 0.793 0.472 -0.001 -0.638 -1.433 -2.517 -5.504 -6 ,2488 ,KEBNE ,16722037,Sat Nov 27 21:36:21 CET,Sat Nov 27 23:37:25 CET,0.0 2.61 3.373 3.931 4.364 4.715 5.032 5.315 5.799 6.018 6.222 6.468 6.721 6.883 7.188 7.465 7.721 7.845 8.077 8.285 8.581 8.765 8.945 9.196 9.431 9.663 9.88 10.089 10.348 10.593 10.829 11.095 11.342 11.575 11.845 12.153 12.446 12.748 13.044 13.354 13.687 14.029 14.384 14.717 15.076 15.433 15.788 16.152 16.438 16.574 16.367 15.663 14.878 14.069 13.318 12.619 11.974 11.405 10.925 10.423 9.972 9.554 9.156 8.755 8.361 7.995 7.627 7.313 7.03 6.732 6.422 6.157 5.88 5.576 5.338 5.104 4.852 4.598 4.334 4.138 3.931 3.608 3.381 3.138 3.012 2.74 2.441 2.118 1.945 1.66 1.393 1.192 0.98 0.523 0.25 -0.075 -0.443 -0.888 -1.429 -2.204 -4.749 -7 ,14740 ,KEBNE ,16722038,Sat Nov 27 21:39:25 CET,Sat Nov 27 23:37:53 CET,0.0 2.735 3.496 4.023 4.463 4.828 5.128 5.408 5.92 6.149 6.365 6.652 6.931 7.096 7.412 7.692 7.953 8.081 8.326 8.548 8.849 9.041 9.236 9.519 9.764 9.986 10.196 10.395 10.651 10.896 11.13 11.403 11.662 11.912 12.188 12.476 12.755 13.043 13.323 13.615 13.927 14.258 14.619 14.974 15.348 15.725 16.112 16.463 16.736 16.859 16.59 15.82 15.017 14.185 13.404 12.693 12.05 11.449 10.906 10.361 9.888 9.459 9.047 8.652 8.26 7.904 7.561 7.23 6.929 6.64 6.333 6.07 5.806 5.536 5.313 5.065 4.809 4.548 4.283 4.097 3.897 3.602 3.397 3.165 3.047 2.801 2.519 2.211 2.054 1.792 1.535 1.336 1.129 0.669 0.391 0.076 -0.267 -0.666 -1.18 -1.915 -4.2 -8 ,6262 ,KEBNE ,16722039,Sat Nov 27 21:41:28 CET,Sat Nov 27 23:40:23 CET,0.0 2.376 3.155 3.697 4.124 4.485 4.807 5.095 5.61 5.835 6.042 6.314 6.577 6.739 7.044 7.319 7.582 7.712 7.956 8.169 8.473 8.669 8.851 9.115 9.367 9.6 9.809 10.009 10.271 10.528 10.764 11.025 11.286 11.544 11.818 12.12 12.408 12.709 13.016 13.332 13.647 13.997 14.397 14.742 15.086 15.457 15.876 16.246 16.537 16.696 16.499 15.839 15.059 14.303 13.612 12.95 12.341 11.782 11.287 10.778 10.321 9.909 9.511 9.124 8.77 8.432 8.073 7.76 7.485 7.191 6.871 6.604 6.319 6.013 5.782 5.542 5.289 5.019 4.73 4.523 4.303 3.976 3.761 3.525 3.397 3.134 2.848 2.539 2.369 2.083 1.795 1.582 1.369 0.885 0.614 0.308 -0.057 -0.498 -1.062 -1.819 -4.511 -9 ,4912 ,KEBNE ,16722040,Sat Nov 27 21:41:28 CET,Sat Nov 27 23:41:33 CET,0.0 2.649 3.474 4.036 4.466 4.806 5.1 5.366 5.847 6.068 6.273 6.558 6.822 6.979 7.298 7.581 7.837 7.973 8.223 8.441 8.736 8.909 9.076 9.333 9.586 9.818 10.038 10.251 10.507 10.742 10.961 11.217 11.47 11.714 11.972 12.261 12.545 12.848 13.156 13.485 13.843 14.208 14.621 15.041 15.494 15.946 16.404 16.854 17.152 17.252 17.005 16.25 15.441 14.646 13.859 13.094 12.433 11.846 11.351 10.857 10.413 9.985 9.556 9.15 8.769 8.427 8.073 7.742 7.452 7.149 6.825 6.553 6.271 5.966 5.723 5.474 5.212 4.953 4.693 4.512 4.325 4.017 3.789 3.555 3.433 3.172 2.897 2.595 2.426 2.146 1.882 1.674 1.441 0.924 0.651 0.35 0.008 -0.387 -0.874 -1.574 -4.334 -10 ,22058 ,KEBNE ,16722041,Sat Nov 27 21:41:28 CET,Sat Nov 27 23:39:58 CET,0.0 2.654 3.456 4.031 4.499 4.892 5.237 5.548 6.071 6.3 6.51 6.79 7.072 7.23 7.531 7.807 8.068 8.201 8.447 8.657 8.962 9.171 9.368 9.652 9.907 10.132 10.346 10.547 10.801 11.039 11.268 11.546 11.813 12.065 12.344 12.644 12.951 13.283 13.598 13.912 14.245 14.625 15.017 15.36 15.789 16.243 16.645 16.975 17.273 17.477 17.381 16.769 15.992 15.217 14.503 13.81 13.179 12.625 12.131 11.615 11.161 10.754 10.354 9.966 9.598 9.271 8.933 8.626 8.357 8.073 7.772 7.495 7.197 6.903 6.669 6.415 6.147 5.887 5.601 5.386 5.178 4.868 4.653 4.417 4.289 4.022 3.729 3.403 3.23 2.949 2.674 2.464 2.245 1.727 1.418 1.095 0.75 0.336 -0.199 -0.953 -3.158 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 62477a96..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23983 ,KEBNE ,16722042,Sat Nov 27 21:41:28 CET,Sat Nov 27 23:40:50 CET,0.0 3.231 4.026 4.573 5.001 5.346 5.652 5.924 6.382 6.591 6.793 7.065 7.328 7.486 7.797 8.088 8.358 8.479 8.701 8.915 9.212 9.397 9.572 9.819 10.066 10.315 10.55 10.763 11.045 11.311 11.541 11.808 12.073 12.318 12.582 12.881 13.163 13.433 13.705 13.998 14.301 14.611 14.93 15.244 15.588 15.91 16.171 16.39 16.527 16.451 15.908 14.871 13.833 12.813 11.944 11.165 10.424 9.751 9.181 8.612 8.111 7.652 7.222 6.811 6.421 6.063 5.67 5.303 4.994 4.676 4.336 4.06 3.767 3.457 3.222 2.968 2.689 2.406 2.122 1.927 1.713 1.377 1.151 0.901 0.768 0.498 0.201 -0.125 -0.292 -0.582 -0.883 -1.097 -1.311 -1.801 -2.087 -2.405 -2.757 -3.183 -3.722 -4.455 -7.167 -2 ,27846 ,KEBNE ,16722043,Sat Nov 27 21:42:29 CET,Sat Nov 27 23:43:48 CET,0.0 3.576 4.396 4.964 5.399 5.75 6.063 6.347 6.843 7.066 7.272 7.562 7.84 8.012 8.322 8.605 8.883 9.012 9.247 9.468 9.779 9.978 10.178 10.45 10.695 10.929 11.146 11.347 11.609 11.858 12.091 12.359 12.603 12.835 13.112 13.418 13.685 13.97 14.27 14.571 14.879 15.198 15.508 15.8 16.133 16.458 16.757 17.032 17.256 17.267 16.845 15.861 14.784 13.795 12.9 12.079 11.378 10.743 10.18 9.61 9.087 8.595 8.118 7.671 7.256 6.864 6.445 6.087 5.774 5.437 5.085 4.783 4.475 4.164 3.916 3.653 3.391 3.122 2.833 2.631 2.426 2.069 1.813 1.557 1.422 1.151 0.849 0.511 0.337 0.053 -0.222 -0.448 -0.694 -1.231 -1.541 -1.874 -2.227 -2.651 -3.188 -3.932 -6.074 -3 ,9532 ,KEBNE ,16722044,Sat Nov 27 21:46:34 CET,Sat Nov 27 23:49:07 CET,0.0 3.606 4.416 4.964 5.385 5.743 6.064 6.356 6.854 7.073 7.279 7.541 7.812 7.979 8.276 8.547 8.814 8.943 9.177 9.399 9.727 9.935 10.126 10.389 10.633 10.857 11.075 11.277 11.523 11.755 11.971 12.23 12.487 12.728 12.988 13.265 13.517 13.778 14.049 14.328 14.607 14.888 15.178 15.463 15.764 16.074 16.361 16.584 16.737 16.668 16.087 15.052 14.028 13.038 12.128 11.306 10.548 9.843 9.248 8.633 8.097 7.645 7.223 6.823 6.433 6.06 5.674 5.334 5.03 4.705 4.374 4.099 3.807 3.511 3.284 3.039 2.781 2.507 2.216 2.016 1.807 1.464 1.209 0.944 0.81 0.517 0.201 -0.13 -0.297 -0.586 -0.851 -1.059 -1.284 -1.774 -2.056 -2.39 -2.765 -3.185 -3.71 -4.443 -6.685 -4 ,436 ,KEBNE ,16722045,Sat Nov 27 21:46:34 CET,Sat Nov 27 23:47:09 CET,0.0 3.562 4.377 4.927 5.373 5.739 6.035 6.316 6.829 7.048 7.268 7.591 7.865 8.03 8.335 8.622 8.883 9.006 9.243 9.458 9.754 9.949 10.132 10.374 10.607 10.836 11.048 11.243 11.488 11.715 11.919 12.152 12.381 12.608 12.849 13.097 13.323 13.561 13.814 14.075 14.331 14.627 14.953 15.242 15.547 15.876 16.151 16.282 16.322 16.162 15.557 14.495 13.437 12.467 11.588 10.725 9.92 9.194 8.577 7.936 7.398 6.949 6.523 6.106 5.686 5.296 4.898 4.541 4.22 3.881 3.536 3.238 2.932 2.622 2.373 2.117 1.843 1.54 1.238 1.03 0.811 0.466 0.213 -0.048 -0.183 -0.472 -0.775 -1.085 -1.255 -1.548 -1.814 -2.015 -2.232 -2.728 -3.0 -3.298 -3.648 -4.055 -4.571 -5.298 -7.787 -7 ,5590 ,KEBNE ,16722048,Sat Nov 27 21:54:49 CET,Sat Nov 27 23:48:32 CET,0.0 4.027 4.816 5.392 5.861 6.243 6.575 6.868 7.379 7.609 7.821 8.116 8.387 8.55 8.855 9.141 9.409 9.533 9.766 9.99 10.319 10.517 10.697 10.962 11.202 11.425 11.643 11.846 12.11 12.372 12.626 12.921 13.192 13.436 13.705 14.006 14.286 14.556 14.826 15.11 15.406 15.73 16.076 16.386 16.683 16.99 17.287 17.469 17.566 17.533 17.014 15.991 14.967 13.993 13.062 12.163 11.398 10.717 10.119 9.515 9.002 8.537 8.072 7.647 7.247 6.873 6.484 6.13 5.82 5.483 5.126 4.836 4.538 4.226 3.985 3.727 3.453 3.179 2.882 2.665 2.445 2.098 1.844 1.578 1.445 1.164 0.863 0.551 0.386 0.1 -0.171 -0.385 -0.606 -1.106 -1.388 -1.687 -2.029 -2.445 -2.978 -3.696 -6.845 -10 ,10044 ,KEBNE ,16722051,Sat Nov 27 21:57:49 CET,Sat Nov 27 23:59:11 CET,0.0 3.144 3.915 4.436 4.868 5.246 5.577 5.862 6.357 6.581 6.786 7.046 7.314 7.475 7.772 8.037 8.277 8.397 8.629 8.854 9.179 9.382 9.571 9.818 10.048 10.274 10.491 10.694 10.951 11.192 11.417 11.689 11.947 12.181 12.439 12.724 12.989 13.28 13.588 13.897 14.199 14.508 14.853 15.175 15.488 15.766 16.043 16.284 16.394 16.255 15.63 14.544 13.473 12.485 11.533 10.627 9.865 9.164 8.516 7.878 7.35 6.88 6.416 5.967 5.567 5.191 4.758 4.375 4.075 3.776 3.465 3.197 2.894 2.546 2.276 2.017 1.754 1.462 1.144 0.942 0.733 0.385 0.139 -0.119 -0.255 -0.544 -0.843 -1.169 -1.346 -1.646 -1.907 -2.101 -2.325 -2.823 -3.086 -3.391 -3.752 -4.18 -4.71 -5.435 -8.284 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt deleted file mode 100644 index 4dcb537a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11414 ,KEBNE ,16722052,Sat Nov 27 21:59:51 CET,Sat Nov 27 23:57:31 CET,0.0 1.976 2.488 2.798 3.011 3.192 3.351 3.47 3.654 3.74 3.802 3.79 3.937 3.971 4.033 4.071 4.074 4.071 4.041 4.02 3.985 3.93 3.87 3.789 3.696 3.581 3.448 3.296 3.087 2.866 2.633 2.327 1.986 1.645 1.228 0.726 0.22 -0.377 -1.068 -1.885 -2.81 -3.931 -5.326 -6.827 -8.756 -11.134 -14.121 -17.873 -22.908 -29.747 -39.794 -50.402 -58.242 -64.311 -69.177 -73.256 -76.616 -79.538 -81.992 -84.349 -86.277 -87.926 -89.447 -90.829 -92.082 -93.235 -94.438 -95.49 -96.38 -97.265 -98.161 -98.89 -99.628 -100.386 -100.97 -101.575 -102.198 -102.835 -103.469 -103.901 -104.35 -105.044 -105.535 -106.034 -106.29 -106.835 -107.399 -107.975 -108.272 -108.794 -109.212 -109.551 -109.92 -110.719 -111.143 -111.587 -112.096 -112.678 -113.359 -114.305 -117.265 -3 ,8717 ,KEBNE ,16722054,Sat Nov 27 22:02:55 CET,Sun Nov 28 00:01:21 CET,0.0 2.298 2.709 2.994 3.203 3.358 3.468 3.559 3.696 3.749 3.797 3.763 3.894 3.927 3.96 3.972 3.98 3.981 3.961 3.927 3.845 3.775 3.694 3.575 3.466 3.339 3.204 3.064 2.862 2.644 2.414 2.118 1.809 1.481 1.083 0.612 0.104 -0.5 -1.177 -1.953 -2.837 -3.924 -5.289 -6.757 -8.662 -11.024 -13.976 -17.675 -22.605 -29.382 -39.476 -50.066 -57.899 -64.145 -69.161 -73.322 -76.728 -79.649 -82.075 -84.401 -86.33 -88.021 -89.578 -90.973 -92.227 -93.358 -94.516 -95.528 -96.411 -97.334 -98.283 -99.065 -99.871 -100.694 -101.305 -101.91 -102.522 -103.146 -103.79 -104.233 -104.683 -105.375 -105.846 -106.334 -106.586 -107.096 -107.633 -108.187 -108.471 -108.988 -109.4 -109.728 -110.072 -110.856 -111.299 -111.74 -112.202 -112.733 -113.36 -114.26 -117.6 -4 ,2489 ,KEBNE ,16722055,Sat Nov 27 22:02:56 CET,Sun Nov 28 00:01:20 CET,0.0 1.942 2.398 2.691 2.907 3.075 3.185 3.289 3.458 3.513 3.56 3.529 3.649 3.662 3.672 3.664 3.653 3.65 3.627 3.587 3.513 3.461 3.405 3.294 3.166 3.044 2.913 2.779 2.599 2.411 2.215 1.937 1.65 1.344 0.951 0.493 0.013 -0.566 -1.242 -2.019 -2.903 -3.998 -5.384 -6.885 -8.802 -11.167 -14.152 -17.877 -22.854 -29.745 -40.033 -50.779 -58.656 -64.785 -69.679 -73.784 -77.173 -80.078 -82.474 -84.79 -86.729 -88.414 -89.974 -91.411 -92.729 -93.929 -95.145 -96.199 -97.091 -97.995 -98.926 -99.686 -100.46 -101.243 -101.841 -102.465 -103.108 -103.777 -104.454 -104.904 -105.398 -106.217 -106.784 -107.366 -107.669 -108.285 -108.936 -109.579 -109.872 -110.388 -110.812 -111.154 -111.521 -112.315 -112.749 -113.215 -113.736 -114.326 -115.028 -115.993 -118.414 -6 ,30311 ,KEBNE ,16722057,Sat Nov 27 22:02:55 CET,Sun Nov 28 00:01:29 CET,0.0 2.183 2.708 3.05 3.303 3.499 3.667 3.799 3.975 4.047 4.105 4.095 4.233 4.26 4.305 4.326 4.321 4.313 4.305 4.289 4.213 4.143 4.079 3.98 3.864 3.734 3.598 3.456 3.269 3.068 2.836 2.536 2.22 1.896 1.519 1.063 0.571 -0.024 -0.717 -1.502 -2.392 -3.495 -4.887 -6.39 -8.289 -10.597 -13.54 -17.239 -22.153 -28.999 -39.196 -49.779 -57.505 -63.499 -68.278 -72.294 -75.623 -78.493 -80.831 -83.056 -84.912 -86.526 -88.059 -89.459 -90.702 -91.789 -92.916 -93.941 -94.827 -95.734 -96.659 -97.417 -98.186 -98.976 -99.584 -100.208 -100.856 -101.507 -102.168 -102.611 -103.057 -103.758 -104.241 -104.751 -105.011 -105.538 -106.08 -106.662 -106.973 -107.495 -107.901 -108.24 -108.609 -109.407 -109.838 -110.311 -110.825 -111.396 -112.165 -113.338 -116.742 -7 ,21110 ,KEBNE ,16722058,Sat Nov 27 22:03:56 CET,Sun Nov 28 00:01:45 CET,0.0 2.473 2.905 3.18 3.403 3.589 3.735 3.837 3.963 4.01 4.045 3.998 4.124 4.143 4.159 4.143 4.113 4.1 4.076 4.045 3.994 3.95 3.891 3.782 3.678 3.564 3.427 3.283 3.068 2.844 2.615 2.315 1.989 1.649 1.245 0.768 0.272 -0.314 -1.015 -1.831 -2.74 -3.839 -5.224 -6.74 -8.679 -11.029 -13.995 -17.736 -22.725 -29.636 -39.868 -50.55 -58.473 -64.7 -69.651 -73.828 -77.288 -80.218 -82.637 -84.965 -86.922 -88.63 -90.179 -91.604 -92.907 -94.06 -95.246 -96.289 -97.18 -98.113 -99.071 -99.84 -100.623 -101.411 -102.017 -102.675 -103.347 -104.009 -104.687 -105.151 -105.637 -106.396 -106.91 -107.456 -107.741 -108.312 -108.904 -109.529 -109.854 -110.387 -110.868 -111.229 -111.593 -112.383 -112.825 -113.316 -113.874 -114.493 -115.274 -116.411 -120.175 -8 ,3857 ,KEBNE ,16722059,Sat Nov 27 22:02:55 CET,Sun Nov 28 00:01:16 CET,0.0 1.513 2.098 2.453 2.733 2.921 3.064 3.184 3.411 3.504 3.565 3.553 3.691 3.729 3.781 3.807 3.826 3.828 3.81 3.776 3.711 3.658 3.591 3.496 3.395 3.277 3.155 3.015 2.813 2.596 2.358 2.042 1.703 1.375 0.992 0.529 0.061 -0.497 -1.16 -1.91 -2.76 -3.824 -5.173 -6.659 -8.559 -10.889 -13.852 -17.611 -22.721 -29.768 -40.233 -51.169 -59.11 -65.297 -70.267 -74.47 -77.906 -80.861 -83.36 -85.75 -87.804 -89.624 -91.278 -92.763 -94.116 -95.342 -96.607 -97.718 -98.673 -99.643 -100.617 -101.418 -102.217 -103.03 -103.665 -104.294 -104.925 -105.58 -106.256 -106.709 -107.158 -107.846 -108.326 -108.844 -109.124 -109.688 -110.265 -110.878 -111.188 -111.717 -112.158 -112.496 -112.839 -113.615 -114.049 -114.519 -115.028 -115.617 -116.345 -117.253 -119.963 -9 ,8491 ,KEBNE ,16722060,Sat Nov 27 22:03:56 CET,Sun Nov 28 00:02:32 CET,0.0 1.772 2.206 2.51 2.742 2.886 3.006 3.106 3.246 3.297 3.336 3.3 3.452 3.501 3.582 3.612 3.599 3.589 3.559 3.526 3.46 3.402 3.342 3.239 3.117 2.986 2.862 2.734 2.558 2.401 2.228 1.967 1.703 1.436 1.096 0.675 0.222 -0.338 -1.027 -1.833 -2.75 -3.855 -5.239 -6.773 -8.707 -11.036 -14.03 -17.817 -22.86 -29.829 -40.068 -50.799 -58.636 -64.751 -69.677 -73.805 -77.246 -80.211 -82.696 -85.103 -87.095 -88.829 -90.441 -91.915 -93.271 -94.491 -95.72 -96.784 -97.694 -98.632 -99.576 -100.354 -101.165 -101.998 -102.633 -103.262 -103.904 -104.571 -105.271 -105.756 -106.247 -106.994 -107.499 -108.023 -108.295 -108.848 -109.427 -110.048 -110.37 -110.908 -111.405 -111.768 -112.149 -112.986 -113.441 -113.932 -114.47 -115.123 -115.94 -116.974 -119.775 -10 ,15263 ,KEBNE ,16722061,Sat Nov 27 22:03:56 CET,Sun Nov 28 00:02:18 CET,0.0 2.175 2.569 2.815 2.994 3.129 3.243 3.345 3.536 3.61 3.675 3.685 3.815 3.829 3.852 3.859 3.847 3.832 3.799 3.757 3.695 3.649 3.592 3.494 3.377 3.257 3.129 2.982 2.775 2.558 2.332 2.047 1.749 1.434 1.063 0.592 0.072 -0.528 -1.222 -2.005 -2.88 -3.951 -5.31 -6.812 -8.714 -11.025 -14.026 -17.829 -22.842 -29.672 -39.773 -50.453 -58.357 -64.565 -69.565 -73.713 -77.145 -80.114 -82.57 -84.954 -86.908 -88.568 -90.109 -91.537 -92.845 -94.02 -95.215 -96.259 -97.152 -98.054 -98.985 -99.76 -100.545 -101.335 -101.93 -102.538 -103.161 -103.817 -104.502 -104.963 -105.437 -106.171 -106.679 -107.192 -107.456 -108.009 -108.583 -109.187 -109.501 -110.038 -110.476 -110.819 -111.173 -111.947 -112.385 -112.849 -113.374 -113.99 -114.717 -115.68 -119.251 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt deleted file mode 100644 index a2719bcc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,9277 ,KEBNE ,16722064,Sat Nov 27 22:04:58 CET,Sun Nov 28 00:05:11 CET,0.0 2.721 3.506 4.049 4.479 4.829 5.135 5.407 5.89 6.107 6.297 6.537 6.814 6.979 7.299 7.596 7.865 7.995 8.238 8.456 8.768 8.969 9.16 9.434 9.692 9.94 10.179 10.429 10.747 11.032 11.307 11.634 11.949 12.23 12.548 12.907 13.248 13.633 14.032 14.43 14.824 15.273 15.807 16.333 16.943 17.602 18.28 18.968 19.73 20.542 21.217 21.359 21.122 20.733 20.347 19.969 19.591 19.194 18.795 18.376 18.036 17.702 17.362 17.04 16.724 16.422 16.108 15.822 15.577 15.327 15.045 14.808 14.565 14.293 14.075 13.86 13.643 13.406 13.135 12.952 12.753 12.426 12.206 11.97 11.844 11.579 11.311 11.018 10.856 10.573 10.323 10.129 9.914 9.398 9.098 8.77 8.402 7.972 7.431 6.626 2.17 -5 ,28363 ,KEBNE ,16722066,Sat Nov 27 22:04:58 CET,Sun Nov 28 00:06:18 CET,0.0 2.259 3.007 3.531 3.958 4.315 4.622 4.891 5.362 5.569 5.76 6.001 6.274 6.431 6.756 7.069 7.332 7.461 7.719 7.957 8.28 8.475 8.667 8.952 9.22 9.482 9.725 9.956 10.262 10.547 10.808 11.107 11.4 11.68 11.998 12.377 12.732 13.1 13.517 13.955 14.398 14.883 15.425 15.92 16.468 17.066 17.715 18.419 19.23 20.072 20.756 20.929 20.681 20.282 19.862 19.354 18.847 18.406 18.015 17.593 17.215 16.857 16.49 16.14 15.819 15.529 15.219 14.912 14.65 14.387 14.101 13.872 13.625 13.348 13.127 12.892 12.654 12.403 12.134 11.943 11.737 11.421 11.197 10.964 10.84 10.56 10.251 9.908 9.733 9.446 9.154 8.942 8.712 8.162 7.867 7.537 7.151 6.699 6.127 5.313 1.272 -6 ,26483 ,KEBNE ,16722067,Sat Nov 27 22:04:58 CET,Sun Nov 28 00:05:15 CET,0.0 2.592 3.33 3.854 4.283 4.666 4.986 5.262 5.75 5.968 6.173 6.432 6.702 6.859 7.17 7.458 7.715 7.831 8.048 8.263 8.586 8.786 8.964 9.22 9.474 9.721 9.968 10.212 10.522 10.816 11.089 11.408 11.708 11.986 12.302 12.66 13.016 13.401 13.777 14.156 14.557 15.014 15.52 16.022 16.609 17.244 17.908 18.546 19.223 19.932 20.612 20.815 20.626 20.291 19.863 19.37 18.927 18.514 18.126 17.73 17.374 17.041 16.715 16.394 16.067 15.761 15.457 15.185 14.95 14.705 14.43 14.184 13.927 13.655 13.443 13.225 12.994 12.756 12.507 12.324 12.125 11.822 11.602 11.353 11.225 10.974 10.701 10.397 10.237 9.966 9.708 9.509 9.303 8.834 8.548 8.218 7.835 7.4 6.868 6.077 2.596 -9 ,31949 ,KEBNE ,16722070,Sat Nov 27 22:04:57 CET,Sun Nov 28 00:05:06 CET,0.0 2.698 3.43 3.923 4.326 4.672 4.969 5.235 5.704 5.908 6.12 6.415 6.702 6.872 7.202 7.507 7.788 7.928 8.202 8.448 8.765 8.971 9.168 9.439 9.697 9.953 10.194 10.423 10.711 10.986 11.247 11.544 11.841 12.127 12.435 12.768 13.09 13.453 13.835 14.22 14.616 15.065 15.565 16.061 16.642 17.261 17.956 18.687 19.41 20.073 20.605 20.697 20.438 20.086 19.709 19.27 18.855 18.483 18.131 17.754 17.414 17.09 16.788 16.49 16.184 15.902 15.598 15.328 15.091 14.832 14.552 14.325 14.084 13.798 13.578 13.358 13.129 12.899 12.649 12.47 12.282 11.976 11.76 11.539 11.423 11.179 10.918 10.628 10.477 10.217 9.968 9.769 9.565 9.1 8.829 8.536 8.206 7.795 7.268 6.526 3.831 -10 ,27654 ,KEBNE ,16722071,Sat Nov 27 22:04:58 CET,Sun Nov 28 00:05:42 CET,0.0 2.683 3.477 4.03 4.484 4.852 5.141 5.407 5.904 6.119 6.321 6.578 6.875 7.038 7.344 7.649 7.937 8.065 8.299 8.528 8.878 9.084 9.272 9.566 9.849 10.102 10.334 10.559 10.846 11.118 11.372 11.67 11.954 12.226 12.543 12.886 13.203 13.56 13.953 14.38 14.812 15.291 15.828 16.33 16.898 17.494 18.15 18.839 19.621 20.445 21.12 21.235 20.961 20.588 20.172 19.725 19.269 18.815 18.428 18.015 17.648 17.328 17.002 16.678 16.366 16.067 15.75 15.483 15.25 14.997 14.731 14.508 14.277 14.015 13.802 13.592 13.366 13.114 12.854 12.669 12.464 12.146 11.924 11.692 11.57 11.304 11.025 10.729 10.562 10.276 10.031 9.83 9.617 9.121 8.835 8.529 8.176 7.761 7.213 6.408 3.435 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt deleted file mode 100644 index 00ac0830..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20676 ,KEBNE ,17026144,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:51:25 CET,0.0 2.317 2.828 3.142 3.387 3.612 3.793 3.941 4.185 4.266 4.336 4.357 4.523 4.578 4.664 4.729 4.77 4.782 4.795 4.794 4.77 4.738 4.697 4.64 4.585 4.517 4.43 4.335 4.205 4.051 3.898 3.68 3.411 3.143 2.815 2.411 1.985 1.488 0.915 0.255 -0.493 -1.408 -2.59 -3.868 -5.5 -7.5 -10.029 -13.253 -17.592 -23.611 -32.534 -42.078 -49.138 -54.605 -59.023 -62.755 -65.842 -68.571 -70.864 -73.016 -74.782 -76.353 -77.866 -79.268 -80.531 -81.658 -82.805 -83.802 -84.647 -85.517 -86.419 -87.146 -87.897 -88.689 -89.294 -89.913 -90.554 -91.23 -91.928 -92.393 -92.879 -93.632 -94.153 -94.715 -95.002 -95.601 -96.25 -96.927 -97.286 -97.867 -98.468 -98.913 -99.38 -100.393 -100.944 -101.536 -102.206 -102.954 -103.847 -105.115 -109.725 -2 ,20486 ,KEBNE ,17026145,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:52:13 CET,0.0 2.284 2.831 3.164 3.411 3.623 3.791 3.934 4.182 4.275 4.365 4.427 4.605 4.656 4.749 4.836 4.91 4.936 4.986 5.017 5.034 5.023 5.003 4.981 4.941 4.902 4.876 4.843 4.765 4.634 4.47 4.258 4.041 3.805 3.496 3.12 2.722 2.249 1.683 1.018 0.275 -0.604 -1.721 -2.996 -4.626 -6.618 -9.214 -12.518 -16.935 -23.064 -32.203 -41.906 -49.084 -54.676 -59.165 -62.934 -66.034 -68.704 -70.908 -73.037 -74.826 -76.369 -77.812 -79.162 -80.379 -81.502 -82.679 -83.699 -84.574 -85.467 -86.383 -87.136 -87.91 -88.712 -89.336 -89.969 -90.615 -91.298 -92.028 -92.518 -92.999 -93.74 -94.258 -94.797 -95.075 -95.667 -96.277 -96.881 -97.197 -97.746 -98.23 -98.585 -98.958 -99.762 -100.203 -100.705 -101.278 -101.93 -102.699 -103.783 -107.971 -3 ,281 ,KEBNE ,17026146,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:51:04 CET,0.0 2.046 2.524 2.846 3.103 3.293 3.452 3.587 3.819 3.915 3.997 4.012 4.172 4.23 4.336 4.419 4.481 4.504 4.535 4.568 4.582 4.567 4.547 4.489 4.432 4.378 4.304 4.209 4.069 3.912 3.752 3.565 3.348 3.116 2.826 2.456 2.064 1.571 0.999 0.34 -0.432 -1.376 -2.548 -3.853 -5.535 -7.577 -10.224 -13.547 -17.927 -24.052 -33.334 -43.148 -50.349 -55.965 -60.463 -64.258 -67.449 -70.181 -72.402 -74.592 -76.439 -78.008 -79.448 -80.775 -81.999 -83.113 -84.227 -85.198 -86.036 -86.867 -87.706 -88.393 -89.083 -89.806 -90.366 -90.94 -91.539 -92.142 -92.77 -93.206 -93.644 -94.316 -94.774 -95.252 -95.508 -96.022 -96.549 -97.105 -97.396 -97.933 -98.409 -98.764 -99.145 -99.986 -100.454 -100.985 -101.6 -102.308 -103.132 -104.242 -110.757 -4 ,19229 ,KEBNE ,17026147,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:50:54 CET,0.0 1.705 2.291 2.691 3.001 3.235 3.443 3.627 3.886 3.978 4.063 4.104 4.291 4.344 4.438 4.519 4.583 4.614 4.647 4.669 4.68 4.676 4.67 4.657 4.649 4.597 4.501 4.404 4.265 4.116 3.944 3.693 3.429 3.151 2.808 2.41 1.988 1.493 0.933 0.291 -0.46 -1.398 -2.554 -3.837 -5.488 -7.507 -10.068 -13.313 -17.753 -23.974 -33.22 -42.994 -50.235 -55.895 -60.448 -64.308 -67.515 -70.263 -72.552 -74.813 -76.717 -78.361 -79.863 -81.223 -82.489 -83.634 -84.8 -85.83 -86.708 -87.601 -88.507 -89.248 -90.019 -90.816 -91.424 -92.054 -92.708 -93.389 -94.09 -94.567 -95.046 -95.778 -96.282 -96.806 -97.083 -97.651 -98.247 -98.899 -99.247 -99.823 -100.383 -100.811 -101.276 -102.306 -102.87 -103.47 -104.133 -104.879 -105.815 -107.127 -111.636 -5 ,30073 ,KEBNE ,17026148,Wed Dec 22 13:51:46 CET,Wed Dec 22 15:47:34 CET,0.0 1.705 2.17 2.447 2.667 2.834 2.953 3.066 3.287 3.371 3.437 3.414 3.567 3.6 3.661 3.708 3.735 3.738 3.739 3.737 3.715 3.688 3.661 3.615 3.559 3.495 3.413 3.322 3.186 3.04 2.874 2.64 2.372 2.089 1.756 1.351 0.928 0.421 -0.159 -0.8 -1.559 -2.528 -3.745 -5.079 -6.815 -8.924 -11.627 -15.028 -19.5 -25.734 -35.076 -45.066 -52.563 -58.411 -63.065 -66.973 -70.229 -73.049 -75.427 -77.704 -79.568 -81.204 -82.744 -84.167 -85.458 -86.608 -87.794 -88.837 -89.728 -90.629 -91.565 -92.367 -93.208 -94.061 -94.698 -95.36 -96.053 -96.758 -97.483 -97.982 -98.482 -99.238 -99.762 -100.318 -100.606 -101.203 -101.825 -102.474 -102.805 -103.366 -103.897 -104.291 -104.707 -105.597 -106.08 -106.622 -107.251 -107.956 -108.79 -109.933 -114.973 -6 ,27253 ,KEBNE ,17026149,Wed Dec 22 13:51:45 CET,Wed Dec 22 15:46:18 CET,0.0 2.351 2.841 3.153 3.401 3.598 3.75 3.876 4.075 4.156 4.232 4.254 4.422 4.468 4.533 4.593 4.647 4.663 4.669 4.661 4.633 4.606 4.579 4.54 4.478 4.401 4.314 4.206 4.058 3.897 3.725 3.517 3.281 3.014 2.667 2.24 1.797 1.265 0.681 0.03 -0.729 -1.637 -2.809 -4.119 -5.782 -7.839 -10.49 -13.805 -18.254 -24.48 -33.704 -43.412 -50.66 -56.366 -61.002 -64.904 -68.102 -70.839 -73.113 -75.356 -77.24 -78.86 -80.359 -81.72 -82.952 -84.068 -85.23 -86.241 -87.089 -87.964 -88.867 -89.589 -90.322 -91.095 -91.692 -92.298 -92.911 -93.529 -94.162 -94.605 -95.053 -95.734 -96.217 -96.708 -96.96 -97.501 -98.066 -98.655 -98.957 -99.488 -99.963 -100.339 -100.739 -101.6 -102.078 -102.583 -103.168 -103.877 -104.72 -105.835 -110.2 -7 ,11871 ,KEBNE ,17026150,Wed Dec 22 13:52:44 CET,Wed Dec 22 15:53:49 CET,0.0 2.47 2.973 3.316 3.554 3.744 3.918 4.06 4.265 4.336 4.394 4.397 4.551 4.592 4.658 4.709 4.737 4.747 4.751 4.747 4.739 4.721 4.696 4.637 4.56 4.473 4.375 4.274 4.126 3.966 3.8 3.579 3.346 3.098 2.765 2.353 1.935 1.44 0.863 0.203 -0.568 -1.519 -2.702 -4.022 -5.712 -7.783 -10.458 -13.834 -18.334 -24.56 -33.854 -43.666 -50.863 -56.52 -61.114 -65.013 -68.287 -71.094 -73.375 -75.559 -77.407 -79.045 -80.632 -82.089 -83.365 -84.487 -85.621 -86.615 -87.455 -88.303 -89.167 -89.892 -90.655 -91.441 -92.06 -92.718 -93.408 -94.11 -94.829 -95.317 -95.812 -96.571 -97.079 -97.625 -97.917 -98.506 -99.113 -99.738 -100.046 -100.577 -101.036 -101.386 -101.756 -102.558 -103.006 -103.512 -104.112 -104.833 -105.703 -106.88 -111.946 -8 ,15294 ,KEBNE ,17026151,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:52:30 CET,0.0 2.642 3.257 3.672 4.004 4.264 4.484 4.682 4.997 5.116 5.222 5.281 5.474 5.54 5.641 5.72 5.784 5.815 5.845 5.86 5.877 5.884 5.888 5.865 5.828 5.781 5.717 5.636 5.536 5.416 5.264 5.071 4.863 4.613 4.306 3.964 3.597 3.154 2.633 2.011 1.257 0.338 -0.827 -2.151 -3.796 -5.803 -8.38 -11.55 -15.786 -21.737 -30.643 -40.077 -47.118 -52.726 -57.277 -61.187 -64.53 -67.45 -69.858 -72.147 -74.044 -75.668 -77.157 -78.551 -79.85 -81.018 -82.183 -83.219 -84.134 -85.06 -86.009 -86.775 -87.545 -88.327 -88.927 -89.539 -90.17 -90.844 -91.539 -92.01 -92.494 -93.261 -93.799 -94.345 -94.632 -95.232 -95.844 -96.478 -96.814 -97.377 -97.889 -98.274 -98.685 -99.596 -100.102 -100.679 -101.312 -102.015 -102.858 -104.063 -108.757 -9 ,18107 ,KEBNE ,17026152,Wed Dec 22 13:51:41 CET,Wed Dec 22 15:51:06 CET,0.0 1.96 2.477 2.801 3.003 3.165 3.321 3.455 3.671 3.76 3.827 3.821 3.989 4.031 4.096 4.134 4.151 4.154 4.15 4.145 4.121 4.091 4.062 3.996 3.904 3.815 3.724 3.629 3.506 3.372 3.209 2.98 2.753 2.504 2.157 1.725 1.298 0.806 0.23 -0.412 -1.155 -2.092 -3.288 -4.598 -6.291 -8.389 -11.022 -14.29 -18.725 -24.948 -34.197 -44.012 -51.29 -56.995 -61.633 -65.515 -68.662 -71.406 -73.695 -75.919 -77.81 -79.449 -80.965 -82.368 -83.637 -84.779 -85.966 -87.0 -87.9 -88.844 -89.79 -90.571 -91.387 -92.197 -92.825 -93.487 -94.172 -94.878 -95.597 -96.078 -96.578 -97.377 -97.916 -98.454 -98.74 -99.33 -99.944 -100.61 -100.957 -101.524 -102.07 -102.469 -102.882 -103.815 -104.349 -104.913 -105.536 -106.28 -107.18 -108.392 -113.3 -10 ,17768 ,KEBNE ,17026153,Wed Dec 22 13:51:41 CET,Wed Dec 22 15:51:38 CET,0.0 2.246 2.755 3.077 3.31 3.501 3.656 3.794 4.021 4.109 4.192 4.222 4.404 4.463 4.554 4.625 4.673 4.687 4.712 4.729 4.743 4.752 4.751 4.725 4.696 4.661 4.6 4.535 4.429 4.314 4.202 4.015 3.793 3.574 3.311 2.982 2.619 2.199 1.7 1.105 0.367 -0.586 -1.779 -3.097 -4.791 -6.874 -9.531 -12.881 -17.385 -23.651 -32.888 -42.626 -49.899 -55.597 -60.108 -63.949 -67.199 -69.964 -72.243 -74.458 -76.312 -77.892 -79.349 -80.691 -81.916 -83.044 -84.202 -85.183 -86.014 -86.879 -87.758 -88.466 -89.202 -89.99 -90.607 -91.242 -91.888 -92.552 -93.254 -93.735 -94.218 -94.966 -95.488 -96.033 -96.32 -96.913 -97.517 -98.165 -98.504 -99.058 -99.588 -99.979 -100.382 -101.278 -101.776 -102.324 -102.961 -103.661 -104.478 -105.653 -110.561 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt deleted file mode 100644 index 6492a966..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10947 ,KEBNE ,16722072,Sat Nov 27 22:04:58 CET,Sun Nov 28 00:04:37 CET,0.0 2.696 3.444 3.949 4.38 4.783 5.135 5.438 5.977 6.223 6.449 6.741 7.052 7.236 7.574 7.896 8.189 8.319 8.567 8.812 9.176 9.402 9.609 9.909 10.189 10.45 10.696 10.95 11.276 11.574 11.868 12.225 12.553 12.856 13.208 13.579 13.944 14.353 14.778 15.228 15.706 16.251 16.888 17.512 18.212 18.977 19.878 20.872 21.919 23.019 24.03 24.511 24.601 24.421 24.038 23.704 23.375 22.951 22.526 22.123 21.788 21.457 21.138 20.807 20.472 20.173 19.87 19.597 19.35 19.082 18.775 18.512 18.241 17.941 17.713 17.481 17.221 16.94 16.649 16.455 16.262 15.95 15.714 15.472 15.354 15.094 14.791 14.458 14.288 14.013 13.748 13.55 13.333 12.83 12.544 12.231 11.869 11.428 10.853 10.063 6.79 -2 ,15195 ,KEBNE ,16722073,Sat Nov 27 22:05:59 CET,Sun Nov 28 00:05:12 CET,0.0 2.001 2.698 3.197 3.613 3.97 4.272 4.544 5.008 5.206 5.388 5.618 5.896 6.053 6.335 6.629 6.923 7.055 7.299 7.538 7.893 8.116 8.325 8.627 8.921 9.203 9.454 9.692 9.999 10.292 10.58 10.917 11.237 11.56 11.931 12.352 12.739 13.136 13.57 14.041 14.528 15.055 15.639 16.232 16.971 17.775 18.648 19.56 20.578 21.733 22.874 23.312 23.225 22.97 22.656 22.298 21.921 21.55 21.195 20.804 20.456 20.138 19.822 19.501 19.18 18.88 18.573 18.292 18.042 17.797 17.531 17.274 16.991 16.692 16.459 16.227 15.992 15.746 15.492 15.309 15.109 14.796 14.587 14.368 14.244 13.978 13.703 13.407 13.252 12.994 12.738 12.552 12.34 11.864 11.597 11.296 10.964 10.566 9.975 9.129 6.965 -4 ,31574 ,KEBNE ,16722075,Sat Nov 27 22:05:59 CET,Sun Nov 28 00:05:09 CET,0.0 3.052 3.865 4.419 4.859 5.242 5.579 5.87 6.408 6.649 6.867 7.144 7.439 7.612 7.94 8.246 8.525 8.655 8.91 9.153 9.504 9.736 9.954 10.254 10.53 10.801 11.055 11.295 11.627 11.936 12.223 12.578 12.913 13.234 13.619 14.056 14.461 14.883 15.325 15.791 16.275 16.805 17.419 18.027 18.704 19.433 20.226 21.113 22.097 23.087 24.087 24.55 24.615 24.549 24.293 23.932 23.561 23.181 22.81 22.405 22.064 21.741 21.392 21.049 20.725 20.411 20.093 19.838 19.601 19.345 19.078 18.841 18.591 18.332 18.129 17.899 17.641 17.38 17.12 16.934 16.726 16.4 16.18 15.952 15.825 15.555 15.285 14.987 14.826 14.536 14.2 13.967 13.739 13.229 12.913 12.553 12.162 11.716 11.153 10.372 7.518 -5 ,22195 ,KEBNE ,16722076,Sat Nov 27 22:05:59 CET,Sun Nov 28 00:05:44 CET,0.0 2.777 3.511 4.04 4.455 4.789 5.082 5.353 5.834 6.054 6.265 6.535 6.828 7.004 7.341 7.64 7.91 8.045 8.309 8.549 8.889 9.101 9.3 9.578 9.846 10.109 10.361 10.618 10.941 11.232 11.516 11.864 12.19 12.511 12.881 13.27 13.631 14.039 14.492 14.961 15.438 15.978 16.59 17.237 18.006 18.819 19.723 20.641 21.58 22.564 23.513 23.934 23.939 23.672 23.305 22.927 22.518 22.122 21.768 21.364 20.997 20.665 20.334 20.004 19.688 19.395 19.091 18.82 18.558 18.271 17.974 17.723 17.454 17.177 16.954 16.721 16.49 16.239 15.971 15.773 15.569 15.253 15.026 14.79 14.653 14.349 14.033 13.696 13.521 13.251 12.955 12.737 12.513 12.023 11.738 11.389 11.001 10.556 9.97 9.112 5.912 -6 ,28656 ,KEBNE ,16722077,Sat Nov 27 22:05:59 CET,Sun Nov 28 00:05:15 CET,0.0 2.955 3.693 4.256 4.711 5.073 5.4 5.704 6.246 6.499 6.726 7.008 7.304 7.488 7.82 8.12 8.397 8.528 8.777 9.013 9.346 9.563 9.771 10.056 10.334 10.596 10.846 11.089 11.411 11.714 11.991 12.337 12.676 13.008 13.384 13.78 14.167 14.595 15.03 15.485 15.973 16.492 17.096 17.721 18.408 19.194 20.141 21.187 22.289 23.416 24.587 25.25 25.307 25.087 24.777 24.376 23.911 23.457 23.067 22.65 22.249 21.883 21.555 21.234 20.91 20.579 20.225 19.927 19.672 19.412 19.148 18.919 18.674 18.428 18.231 18.022 17.808 17.578 17.318 17.121 16.918 16.598 16.366 16.128 16.003 15.737 15.451 15.124 14.953 14.679 14.379 14.164 13.945 13.446 13.158 12.842 12.464 12.009 11.447 10.623 8.415 -7 ,16123 ,KEBNE ,16722078,Sat Nov 27 22:07:01 CET,Sun Nov 28 00:09:42 CET,0.0 2.645 3.397 3.901 4.308 4.664 4.973 5.254 5.764 5.995 6.196 6.432 6.714 6.882 7.185 7.461 7.726 7.856 8.104 8.327 8.646 8.862 9.068 9.36 9.648 9.939 10.204 10.445 10.765 11.063 11.36 11.727 12.069 12.398 12.777 13.199 13.59 13.991 14.406 14.849 15.328 15.89 16.529 17.138 17.836 18.602 19.461 20.342 21.275 22.292 23.364 23.89 23.851 23.554 23.125 22.714 22.329 21.931 21.545 21.154 20.822 20.511 20.203 19.863 19.527 19.242 18.931 18.644 18.39 18.121 17.833 17.584 17.312 17.024 16.807 16.565 16.302 16.034 15.753 15.559 15.361 15.026 14.775 14.518 14.384 14.105 13.808 13.475 13.296 13.006 12.701 12.48 12.246 11.732 11.426 11.082 10.706 10.264 9.728 8.974 6.557 -8 ,23696 ,KEBNE ,16722079,Sat Nov 27 22:08:01 CET,Sun Nov 28 00:06:46 CET,0.0 3.523 4.305 4.83 5.243 5.599 5.917 6.202 6.695 6.921 7.135 7.407 7.706 7.887 8.2 8.488 8.778 8.912 9.16 9.404 9.761 9.989 10.204 10.497 10.769 11.031 11.292 11.54 11.869 12.19 12.487 12.825 13.143 13.469 13.844 14.266 14.668 15.088 15.531 15.994 16.471 17.025 17.677 18.287 18.979 19.79 20.712 21.628 22.611 23.716 24.779 25.337 25.395 25.186 24.906 24.569 24.212 23.847 23.471 23.063 22.713 22.381 22.054 21.748 21.445 21.162 20.851 20.563 20.304 20.049 19.788 19.551 19.287 18.996 18.762 18.516 18.26 17.995 17.707 17.501 17.293 16.965 16.724 16.469 16.333 16.049 15.758 15.445 15.281 15.005 14.721 14.514 14.291 13.801 13.52 13.21 12.854 12.431 11.9 11.087 8.481 -9 ,19153 ,KEBNE ,16722080,Sat Nov 27 22:07:00 CET,Sun Nov 28 00:05:15 CET,0.0 3.023 3.784 4.288 4.698 5.065 5.386 5.667 6.172 6.392 6.597 6.881 7.175 7.345 7.668 7.975 8.252 8.381 8.637 8.882 9.222 9.435 9.644 9.947 10.234 10.502 10.761 10.999 11.299 11.594 11.879 12.235 12.57 12.875 13.233 13.662 14.082 14.513 14.953 15.413 15.877 16.391 16.961 17.504 18.169 18.948 19.796 20.689 21.697 22.783 23.864 24.265 24.166 23.995 23.73 23.396 23.018 22.619 22.228 21.783 21.393 21.042 20.714 20.398 20.075 19.76 19.436 19.13 18.85 18.554 18.233 17.983 17.716 17.413 17.179 16.931 16.671 16.395 16.102 15.904 15.698 15.372 15.133 14.875 14.74 14.465 14.169 13.842 13.672 13.383 13.097 12.884 12.654 12.16 11.89 11.577 11.217 10.779 10.216 9.424 6.405 -10 ,12600 ,KEBNE ,16722081,Sat Nov 27 22:07:00 CET,Sun Nov 28 00:05:10 CET,0.0 2.501 3.321 3.898 4.332 4.685 4.988 5.265 5.756 5.968 6.174 6.432 6.715 6.877 7.2 7.512 7.788 7.918 8.18 8.426 8.765 8.977 9.188 9.487 9.771 10.051 10.318 10.574 10.902 11.218 11.524 11.876 12.195 12.521 12.882 13.26 13.631 14.029 14.469 14.924 15.385 15.923 16.534 17.119 17.799 18.525 19.31 20.189 21.225 22.38 23.394 23.78 23.805 23.695 23.467 23.172 22.795 22.406 22.081 21.697 21.332 21.005 20.678 20.356 20.052 19.766 19.459 19.168 18.914 18.64 18.334 18.077 17.814 17.546 17.331 17.081 16.818 16.551 16.266 16.065 15.845 15.494 15.247 14.989 14.858 14.578 14.278 13.962 13.792 13.505 13.182 12.965 12.738 12.218 11.903 11.55 11.171 10.737 10.173 9.345 6.701 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 2172144c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21906 ,KEBNE ,16722082,Sat Nov 27 22:07:00 CET,Sun Nov 28 00:05:51 CET,0.0 3.488 4.258 4.82 5.273 5.668 6.006 6.319 6.873 7.092 7.292 7.546 7.845 8.018 8.329 8.627 8.909 9.039 9.29 9.519 9.848 10.061 10.265 10.563 10.856 11.113 11.334 11.562 11.868 12.143 12.394 12.717 13.023 13.303 13.625 13.975 14.309 14.667 15.039 15.43 15.837 16.281 16.748 17.178 17.657 18.164 18.747 19.317 19.855 20.355 20.627 20.44 20.029 19.548 19.052 18.516 18.022 17.558 17.1 16.627 16.212 15.797 15.385 15.012 14.665 14.335 13.979 13.641 13.344 13.036 12.708 12.431 12.153 11.862 11.621 11.366 11.087 10.799 10.504 10.287 10.062 9.713 9.465 9.206 9.069 8.784 8.473 8.122 7.942 7.652 7.39 7.169 6.932 6.419 6.125 5.793 5.423 4.98 4.427 3.694 0.919 -2 ,13142 ,KEBNE ,16722083,Sat Nov 27 22:07:00 CET,Sun Nov 28 00:06:26 CET,0.0 3.519 4.354 4.949 5.379 5.738 6.057 6.353 6.872 7.093 7.312 7.6 7.899 8.068 8.388 8.687 8.974 9.114 9.371 9.612 9.956 10.162 10.359 10.65 10.922 11.177 11.413 11.629 11.908 12.18 12.452 12.776 13.081 13.384 13.727 14.113 14.498 14.915 15.352 15.797 16.239 16.737 17.294 17.804 18.37 19.014 19.746 20.491 21.216 21.806 22.002 21.613 21.012 20.331 19.64 18.988 18.394 17.798 17.272 16.752 16.299 15.891 15.479 15.07 14.69 14.322 13.936 13.602 13.298 12.974 12.631 12.36 12.076 11.768 11.536 11.288 11.023 10.752 10.471 10.277 10.064 9.716 9.468 9.211 9.077 8.806 8.525 8.207 8.025 7.723 7.423 7.212 6.993 6.493 6.202 5.873 5.503 5.077 4.551 3.8 1.983 -3 ,8405 ,KEBNE ,16722084,Sat Nov 27 22:07:00 CET,Sun Nov 28 00:06:02 CET,0.0 2.767 3.613 4.244 4.742 5.143 5.49 5.81 6.361 6.596 6.808 7.059 7.353 7.516 7.833 8.13 8.412 8.545 8.799 9.037 9.351 9.549 9.75 10.03 10.293 10.553 10.8 11.043 11.363 11.67 11.947 12.274 12.584 12.868 13.194 13.556 13.914 14.29 14.66 15.046 15.423 15.839 16.327 16.823 17.363 17.938 18.543 19.129 19.735 20.249 20.411 19.97 19.352 18.634 17.904 17.199 16.556 15.928 15.355 14.783 14.28 13.818 13.383 12.963 12.572 12.218 11.846 11.514 11.223 10.914 10.591 10.301 9.981 9.659 9.413 9.152 8.881 8.6 8.301 8.093 7.869 7.508 7.266 7.013 6.876 6.589 6.28 5.944 5.766 5.466 5.196 4.983 4.76 4.236 3.933 3.608 3.244 2.804 2.239 1.474 -1.263 -6 ,23289 ,KEBNE ,16722087,Sat Nov 27 22:08:01 CET,Sun Nov 28 00:06:55 CET,0.0 5.255 6.039 6.589 7.011 7.363 7.687 7.982 8.482 8.704 8.912 9.184 9.478 9.644 9.967 10.281 10.566 10.698 10.952 11.196 11.532 11.742 11.952 12.256 12.535 12.786 13.02 13.255 13.553 13.845 14.122 14.438 14.736 15.032 15.387 15.769 16.122 16.507 16.925 17.38 17.86 18.401 18.976 19.49 20.031 20.56 21.094 21.593 22.085 22.508 22.613 22.065 21.308 20.571 19.875 19.141 18.446 17.844 17.296 16.727 16.243 15.799 15.364 14.945 14.55 14.192 13.819 13.464 13.163 12.863 12.538 12.269 11.992 11.702 11.469 11.206 10.933 10.66 10.371 10.171 9.963 9.636 9.404 9.153 9.019 8.745 8.45 8.131 7.962 7.67 7.397 7.174 6.937 6.425 6.139 5.821 5.452 5.011 4.448 3.694 1.327 -7 ,6937 ,KEBNE ,16722088,Sat Nov 27 22:08:01 CET,Sun Nov 28 00:06:58 CET,0.0 2.589 3.363 3.939 4.416 4.797 5.13 5.435 5.99 6.244 6.472 6.787 7.102 7.285 7.625 7.941 8.229 8.359 8.602 8.823 9.142 9.36 9.57 9.849 10.117 10.379 10.632 10.874 11.185 11.47 11.729 12.043 12.347 12.624 12.941 13.3 13.638 14.0 14.375 14.762 15.171 15.606 16.1 16.583 17.113 17.74 18.418 19.133 19.828 20.325 20.475 19.827 19.012 18.261 17.549 16.817 16.136 15.55 15.055 14.522 14.034 13.599 13.169 12.744 12.351 11.976 11.558 11.184 10.874 10.558 10.227 9.949 9.644 9.314 9.062 8.799 8.516 8.231 7.927 7.707 7.464 7.07 6.797 6.508 6.36 6.055 5.743 5.421 5.248 4.949 4.666 4.461 4.233 3.702 3.404 3.095 2.74 2.304 1.786 1.047 -1.651 -8 ,4722 ,KEBNE ,16722089,Sat Nov 27 22:08:01 CET,Sun Nov 28 00:08:14 CET,0.0 4.135 4.961 5.547 5.978 6.358 6.689 6.98 7.496 7.73 7.954 8.225 8.546 8.733 9.059 9.358 9.637 9.768 10.014 10.246 10.591 10.815 11.025 11.343 11.634 11.898 12.157 12.403 12.71 13.01 13.297 13.622 13.92 14.202 14.542 14.935 15.307 15.694 16.088 16.492 16.912 17.401 17.967 18.503 19.096 19.659 20.244 20.854 21.457 21.922 22.106 21.729 21.072 20.373 19.67 18.979 18.335 17.723 17.209 16.709 16.225 15.761 15.313 14.891 14.509 14.146 13.758 13.411 13.099 12.763 12.417 12.128 11.81 11.467 11.201 10.923 10.642 10.359 10.053 9.835 9.613 9.254 8.996 8.713 8.565 8.267 7.951 7.611 7.433 7.14 6.817 6.583 6.337 5.794 5.491 5.161 4.806 4.378 3.823 2.963 0.256 -9 ,10331 ,KEBNE ,16722090,Sat Nov 27 22:08:01 CET,Sun Nov 28 00:06:44 CET,0.0 2.702 3.513 4.059 4.497 4.883 5.221 5.52 6.031 6.251 6.466 6.761 7.066 7.244 7.591 7.918 8.214 8.352 8.62 8.871 9.188 9.387 9.587 9.875 10.135 10.385 10.647 10.904 11.236 11.54 11.802 12.126 12.442 12.728 13.04 13.393 13.742 14.102 14.466 14.865 15.299 15.763 16.308 16.865 17.455 18.043 18.707 19.378 19.987 20.553 20.754 20.366 19.823 19.183 18.539 17.892 17.3 16.767 16.283 15.741 15.27 14.878 14.516 14.144 13.778 13.435 13.067 12.755 12.482 12.174 11.844 11.57 11.296 11.01 10.777 10.532 10.261 9.984 9.689 9.474 9.256 8.908 8.661 8.409 8.272 7.983 7.685 7.368 7.183 6.882 6.619 6.414 6.192 5.673 5.372 5.053 4.684 4.223 3.668 2.893 0.153 -10 ,392 ,KEBNE ,16722091,Sat Nov 27 22:08:01 CET,Sun Nov 28 00:07:35 CET,0.0 3.047 3.868 4.438 4.895 5.277 5.61 5.912 6.435 6.667 6.881 7.146 7.435 7.611 7.957 8.264 8.534 8.661 8.902 9.146 9.49 9.702 9.906 10.196 10.463 10.707 10.944 11.184 11.49 11.78 12.067 12.392 12.688 12.979 13.319 13.69 14.025 14.374 14.767 15.19 15.61 16.095 16.684 17.226 17.807 18.422 19.018 19.593 20.168 20.581 20.657 20.188 19.479 18.733 18.028 17.366 16.731 16.142 15.658 15.139 14.647 14.204 13.794 13.401 12.987 12.577 12.16 11.791 11.47 11.137 10.788 10.498 10.208 9.923 9.683 9.411 9.141 8.857 8.555 8.345 8.115 7.751 7.485 7.206 7.072 6.797 6.492 6.153 5.974 5.67 5.388 5.175 4.946 4.434 4.142 3.819 3.433 2.959 2.389 1.614 -0.68 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt deleted file mode 100644 index 83f889e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23518 ,KEBNE ,16722092,Sat Nov 27 22:08:01 CET,Sun Nov 28 00:09:14 CET,0.0 2.753 3.538 4.107 4.582 5.008 5.402 5.751 6.342 6.618 6.883 7.201 7.606 7.834 8.279 8.692 9.081 9.266 9.628 9.974 10.473 10.802 11.12 11.574 12.008 12.426 12.848 13.253 13.762 14.267 14.758 15.348 15.919 16.47 17.117 17.853 18.589 19.42 20.3 21.23 22.256 23.46 24.831 26.246 27.943 29.803 31.955 34.487 37.71 41.705 46.636 50.912 53.463 55.125 56.208 56.927 57.405 57.656 57.75 57.778 57.743 57.69 57.589 57.454 57.312 57.155 56.971 56.801 56.639 56.457 56.268 56.101 55.912 55.693 55.512 55.321 55.116 54.89 54.645 54.473 54.288 53.99 53.782 53.564 53.446 53.194 52.923 52.614 52.44 52.147 51.821 51.574 51.302 50.69 50.345 49.966 49.535 49.023 48.386 47.403 43.19 -2 ,844 ,KEBNE ,16722093,Sat Nov 27 22:08:01 CET,Sun Nov 28 00:07:48 CET,0.0 2.073 2.823 3.361 3.798 4.189 4.542 4.857 5.429 5.693 5.947 6.267 6.674 6.892 7.312 7.713 8.075 8.25 8.582 8.903 9.367 9.671 9.976 10.424 10.851 11.261 11.655 12.046 12.56 13.044 13.519 14.102 14.664 15.214 15.866 16.607 17.325 18.12 18.996 19.928 20.912 22.05 23.419 24.821 26.481 28.418 30.748 33.424 36.624 40.498 45.321 49.511 52.113 53.812 54.851 55.541 55.981 56.254 56.431 56.543 56.561 56.54 56.515 56.449 56.333 56.203 56.05 55.901 55.765 55.599 55.416 55.25 55.063 54.861 54.695 54.511 54.317 54.105 53.878 53.724 53.549 53.266 53.06 52.826 52.704 52.454 52.174 51.854 51.682 51.39 51.067 50.838 50.599 50.036 49.696 49.316 48.895 48.408 47.79 46.825 38.537 -3 ,26462 ,KEBNE ,16722094,Sat Nov 27 22:08:02 CET,Sun Nov 28 00:07:47 CET,0.0 2.503 3.283 3.847 4.299 4.689 5.042 5.365 5.947 6.216 6.476 6.792 7.187 7.409 7.829 8.231 8.603 8.777 9.115 9.45 9.948 10.269 10.573 11.014 11.438 11.849 12.244 12.623 13.103 13.568 14.023 14.583 15.132 15.678 16.33 17.074 17.815 18.649 19.547 20.482 21.488 22.675 24.077 25.53 27.239 29.151 31.403 34.057 37.287 41.2 46.116 50.321 52.896 54.567 55.702 56.55 57.118 57.511 57.786 57.986 58.121 58.208 58.233 58.209 58.153 58.065 57.941 57.833 57.732 57.611 57.488 57.376 57.233 57.032 56.871 56.718 56.551 56.376 56.176 56.024 55.866 55.623 55.442 55.237 55.131 54.918 54.673 54.404 54.253 53.974 53.739 53.547 53.321 52.825 52.525 52.169 51.779 51.304 50.672 49.711 44.215 -4 ,29000 ,KEBNE ,16722095,Sat Nov 27 22:08:02 CET,Sun Nov 28 00:09:23 CET,0.0 3.067 3.846 4.402 4.875 5.293 5.658 5.977 6.547 6.827 7.116 7.506 7.918 8.142 8.558 8.949 9.336 9.525 9.878 10.216 10.721 11.037 11.337 11.78 12.221 12.66 13.089 13.494 13.999 14.484 14.942 15.511 16.096 16.666 17.317 18.064 18.788 19.589 20.473 21.428 22.474 23.668 25.067 26.472 28.123 30.056 32.357 34.956 37.963 41.5 45.896 49.71 51.895 53.224 54.109 54.744 55.205 55.512 55.71 55.888 55.989 56.058 56.133 56.144 56.119 56.076 55.995 55.913 55.829 55.704 55.552 55.429 55.285 55.101 54.952 54.802 54.629 54.444 54.235 54.082 53.932 53.691 53.508 53.315 53.216 53.012 52.778 52.517 52.376 52.121 51.845 51.631 51.409 50.934 50.645 50.316 49.941 49.484 48.906 48.001 43.589 -5 ,24770 ,KEBNE ,16722096,Sat Nov 27 22:08:01 CET,Sun Nov 28 00:07:44 CET,0.0 1.85 2.592 3.165 3.638 4.023 4.357 4.667 5.248 5.513 5.765 6.086 6.46 6.669 7.059 7.431 7.784 7.955 8.296 8.631 9.118 9.423 9.716 10.157 10.597 11.018 11.408 11.778 12.28 12.766 13.227 13.801 14.353 14.877 15.489 16.204 16.899 17.659 18.499 19.407 20.386 21.544 22.954 24.381 26.048 27.912 30.1 32.69 35.849 39.72 44.543 48.513 50.867 52.5 53.596 54.31 54.758 55.02 55.152 55.23 55.249 55.236 55.162 55.055 54.935 54.802 54.651 54.493 54.345 54.158 53.94 53.756 53.554 53.337 53.163 52.965 52.752 52.534 52.294 52.122 51.936 51.639 51.43 51.195 51.068 50.805 50.539 50.234 50.057 49.772 49.45 49.232 49.009 48.491 48.185 47.825 47.407 46.912 46.27 45.338 40.599 -6 ,25629 ,KEBNE ,16722097,Sat Nov 27 22:08:02 CET,Sun Nov 28 00:08:18 CET,0.0 3.097 4.211 4.999 5.625 6.198 6.719 7.172 8.005 8.382 8.684 9.0 9.402 9.629 10.07 10.491 10.884 11.071 11.424 11.763 12.253 12.575 12.894 13.351 13.783 14.2 14.605 14.988 15.489 15.983 16.467 17.063 17.637 18.191 18.842 19.581 20.286 21.066 21.933 22.855 23.836 24.964 26.291 27.647 29.246 31.111 33.338 35.96 39.185 43.048 47.873 52.025 54.634 56.382 57.583 58.487 59.112 59.533 59.795 60.0 60.137 60.198 60.164 60.057 59.943 59.829 59.689 59.524 59.338 59.146 58.951 58.778 58.601 58.393 58.207 58.014 57.807 57.583 57.354 57.18 56.986 56.679 56.446 56.214 56.094 55.827 55.549 55.248 55.082 54.793 54.469 54.226 53.978 53.408 53.078 52.722 52.312 51.824 51.206 50.316 44.6 -7 ,8822 ,KEBNE ,16722098,Sat Nov 27 22:08:02 CET,Sun Nov 28 00:09:27 CET,0.0 2.772 3.644 4.249 4.728 5.136 5.505 5.847 6.477 6.769 7.048 7.412 7.807 8.024 8.453 8.857 9.243 9.437 9.806 10.154 10.657 10.993 11.313 11.752 12.201 12.647 13.058 13.448 13.965 14.476 14.954 15.529 16.093 16.648 17.302 18.034 18.746 19.533 20.4 21.349 22.353 23.477 24.794 26.159 27.771 29.573 31.753 34.324 37.471 41.452 46.445 50.705 53.315 55.068 56.209 56.953 57.397 57.693 57.907 58.067 58.161 58.201 58.196 58.137 58.013 57.861 57.722 57.616 57.501 57.343 57.168 57.01 56.832 56.634 56.461 56.27 56.069 55.83 55.544 55.348 55.149 54.819 54.579 54.33 54.2 53.934 53.648 53.326 53.16 52.876 52.517 52.271 52.006 51.441 51.137 50.79 50.359 49.805 49.088 48.081 42.78 -8 ,26084 ,KEBNE ,16722099,Sat Nov 27 22:08:02 CET,Sun Nov 28 00:07:54 CET,0.0 3.467 4.246 4.82 5.285 5.705 6.083 6.397 6.954 7.212 7.461 7.767 8.156 8.361 8.765 9.172 9.55 9.731 10.084 10.408 10.872 11.172 11.471 11.92 12.349 12.748 13.134 13.524 14.041 14.549 15.027 15.593 16.154 16.702 17.346 18.08 18.792 19.573 20.417 21.333 22.287 23.371 24.68 26.023 27.618 29.46 31.714 34.375 37.518 41.278 45.898 49.795 52.169 53.71 54.723 55.43 55.962 56.311 56.461 56.551 56.547 56.473 56.439 56.403 56.304 56.171 56.011 55.835 55.658 55.456 55.234 55.051 54.845 54.614 54.431 54.238 54.005 53.748 53.479 53.301 53.128 52.832 52.602 52.349 52.221 51.959 51.67 51.349 51.168 50.855 50.502 50.25 49.986 49.37 49.012 48.622 48.168 47.633 46.952 45.952 41.593 -9 ,14232 ,KEBNE ,16722100,Sat Nov 27 22:09:03 CET,Sun Nov 28 00:09:36 CET,0.0 3.297 4.12 4.722 5.197 5.631 6.025 6.37 6.963 7.241 7.511 7.817 8.205 8.426 8.865 9.294 9.687 9.864 10.224 10.582 11.075 11.392 11.69 12.116 12.535 12.948 13.35 13.747 14.268 14.773 15.258 15.834 16.396 16.958 17.613 18.342 19.05 19.834 20.697 21.62 22.626 23.806 25.178 26.557 28.188 30.038 32.199 34.702 37.773 41.621 46.438 50.602 53.18 54.843 55.973 56.831 57.457 57.91 58.209 58.441 58.585 58.64 58.671 58.673 58.626 58.559 58.468 58.377 58.309 58.212 58.083 57.986 57.868 57.726 57.598 57.452 57.308 57.153 56.973 56.834 56.687 56.466 56.294 56.096 55.997 55.78 55.523 55.251 55.112 54.868 54.618 54.43 54.209 53.669 53.379 53.053 52.659 52.179 51.532 50.522 45.203 -10 ,11757 ,KEBNE ,16722101,Sat Nov 27 22:09:02 CET,Sun Nov 28 00:08:42 CET,0.0 2.518 3.332 3.911 4.378 4.78 5.144 5.485 6.103 6.378 6.632 6.948 7.35 7.576 7.992 8.385 8.764 8.952 9.314 9.656 10.154 10.473 10.783 11.23 11.665 12.088 12.485 12.869 13.377 13.877 14.367 14.947 15.507 16.065 16.709 17.422 18.118 18.905 19.749 20.661 21.66 22.796 24.132 25.485 27.079 28.907 31.11 33.664 36.779 40.667 45.652 50.014 52.676 54.421 55.467 56.057 56.365 56.545 56.662 56.736 56.746 56.714 56.659 56.569 56.443 56.319 56.18 56.036 55.879 55.706 55.525 55.359 55.174 54.954 54.757 54.549 54.328 54.083 53.813 53.621 53.417 53.077 52.832 52.556 52.41 52.107 51.779 51.424 51.233 50.913 50.553 50.318 50.071 49.498 49.159 48.796 48.36 47.828 47.191 46.284 41.196 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 9f1c51ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29410 ,KEBNE ,16722102,Sat Nov 27 22:09:02 CET,Sun Nov 28 00:09:36 CET,0.0 3.703 4.522 5.108 5.567 6.006 6.4 6.724 7.289 7.556 7.814 8.127 8.528 8.743 9.145 9.529 9.892 10.066 10.398 10.723 11.206 11.506 11.791 12.217 12.627 13.012 13.389 13.76 14.222 14.662 15.115 15.665 16.193 16.705 17.299 17.977 18.625 19.358 20.165 21.017 21.899 22.883 24.04 25.196 26.592 28.196 30.048 32.207 34.78 37.783 41.518 44.661 46.497 47.693 48.433 48.898 49.191 49.348 49.41 49.415 49.371 49.314 49.223 49.094 48.961 48.822 48.667 48.505 48.335 48.145 47.934 47.745 47.546 47.338 47.161 46.96 46.748 46.519 46.283 46.111 45.932 45.651 45.44 45.213 45.097 44.859 44.59 44.301 44.148 43.868 43.584 43.377 43.159 42.653 42.371 42.064 41.711 41.283 40.704 39.837 32.345 -3 ,27442 ,KEBNE ,16722104,Sat Nov 27 22:09:03 CET,Sun Nov 28 00:09:56 CET,0.0 3.727 4.545 5.143 5.621 6.028 6.393 6.729 7.322 7.591 7.847 8.144 8.519 8.721 9.124 9.513 9.872 10.044 10.369 10.679 11.144 11.44 11.722 12.133 12.528 12.909 13.284 13.648 14.11 14.572 15.032 15.578 16.106 16.611 17.194 17.874 18.522 19.204 19.955 20.795 21.69 22.698 23.895 25.122 26.561 28.176 30.079 32.233 34.878 38.116 41.987 45.089 46.869 47.971 48.611 49.007 49.261 49.362 49.371 49.328 49.229 49.127 49.015 48.869 48.718 48.561 48.362 48.188 48.039 47.861 47.65 47.464 47.256 47.029 46.855 46.668 46.471 46.253 46.008 45.831 45.648 45.373 45.161 44.924 44.788 44.487 44.174 43.839 43.663 43.345 43.034 42.805 42.565 42.036 41.727 41.352 40.919 40.413 39.774 38.853 34.327 -5 ,24996 ,KEBNE ,16722106,Sat Nov 27 22:09:03 CET,Sun Nov 28 00:11:18 CET,0.0 2.892 3.819 4.512 5.04 5.503 5.913 6.283 6.96 7.254 7.524 7.839 8.24 8.459 8.876 9.278 9.656 9.845 10.221 10.561 11.033 11.349 11.659 12.09 12.521 12.944 13.328 13.706 14.201 14.678 15.137 15.695 16.233 16.757 17.372 18.076 18.75 19.493 20.323 21.222 22.16 23.199 24.414 25.681 27.184 28.881 30.902 33.216 35.922 39.115 42.967 46.065 47.87 48.997 49.677 50.053 50.191 50.21 50.169 50.048 49.892 49.724 49.542 49.359 49.187 49.011 48.8 48.594 48.406 48.199 47.956 47.752 47.545 47.317 47.129 46.921 46.7 46.464 46.201 46.014 45.827 45.549 45.349 45.125 44.999 44.738 44.459 44.162 44.009 43.72 43.442 43.233 43.01 42.508 42.206 41.856 41.462 40.971 40.374 39.511 35.256 -6 ,2544 ,KEBNE ,16722107,Sat Nov 27 22:09:03 CET,Sun Nov 28 00:11:14 CET,0.0 3.274 4.118 4.736 5.238 5.674 6.049 6.375 6.962 7.236 7.499 7.806 8.192 8.409 8.815 9.21 9.584 9.76 10.104 10.437 10.926 11.247 11.546 11.965 12.378 12.785 13.184 13.567 14.045 14.52 14.994 15.551 16.074 16.583 17.201 17.879 18.516 19.244 20.041 20.906 21.854 22.943 24.181 25.428 26.924 28.633 30.68 33.057 35.919 39.42 43.819 47.492 49.58 50.838 51.646 52.163 52.433 52.568 52.609 52.569 52.464 52.341 52.204 52.035 51.857 51.691 51.499 51.3 51.115 50.921 50.707 50.524 50.336 50.123 49.935 49.723 49.502 49.266 49.016 48.847 48.666 48.363 48.138 47.892 47.761 47.484 47.174 46.828 46.64 46.333 46.041 45.809 45.566 45.065 44.787 44.472 44.105 43.633 43.017 42.078 38.471 -7 ,12031 ,KEBNE ,16722108,Sat Nov 27 22:09:03 CET,Sun Nov 28 00:11:19 CET,0.0 3.471 4.304 4.889 5.373 5.787 6.165 6.513 7.112 7.385 7.639 7.953 8.337 8.555 8.969 9.363 9.728 9.895 10.217 10.523 10.967 11.261 11.553 11.973 12.381 12.78 13.157 13.521 13.991 14.434 14.866 15.401 15.915 16.416 17.018 17.685 18.319 19.032 19.828 20.67 21.55 22.594 23.829 25.041 26.481 28.125 29.982 32.087 34.699 37.915 41.834 45.0 46.815 47.843 48.354 48.618 48.73 48.763 48.719 48.597 48.45 48.271 48.079 47.869 47.637 47.427 47.224 47.018 46.817 46.613 46.385 46.169 45.936 45.695 45.501 45.287 45.057 44.809 44.548 44.37 44.182 43.874 43.643 43.384 43.258 43.003 42.722 42.41 42.244 41.963 41.683 41.475 41.262 40.742 40.434 40.097 39.726 39.271 38.667 37.809 34.192 -8 ,13972 ,KEBNE ,16722109,Sat Nov 27 22:10:04 CET,Sun Nov 28 00:13:04 CET,0.0 3.237 4.02 4.595 5.125 5.61 6.004 6.344 6.934 7.209 7.484 7.826 8.211 8.423 8.842 9.251 9.637 9.819 10.168 10.497 10.959 11.253 11.547 11.985 12.416 12.833 13.23 13.622 14.131 14.607 15.062 15.622 16.157 16.681 17.301 18.0 18.672 19.403 20.17 20.988 21.875 22.895 24.139 25.426 26.947 28.657 30.654 32.975 35.742 39.143 43.302 46.746 48.783 49.988 50.722 51.214 51.489 51.609 51.622 51.581 51.525 51.438 51.311 51.118 50.885 50.669 50.449 50.248 50.064 49.851 49.612 49.415 49.205 48.968 48.775 48.556 48.332 48.105 47.86 47.679 47.474 47.146 46.911 46.66 46.524 46.24 45.93 45.585 45.401 45.1 44.805 44.585 44.346 43.797 43.488 43.137 42.726 42.243 41.606 40.684 36.241 -9 ,5544 ,KEBNE ,16722110,Sat Nov 27 22:10:04 CET,Sun Nov 28 00:11:19 CET,0.0 3.38 4.242 4.811 5.288 5.71 6.082 6.419 7.02 7.3 7.565 7.867 8.261 8.482 8.899 9.28 9.64 9.821 10.171 10.489 10.946 11.246 11.546 11.976 12.388 12.79 13.172 13.538 14.018 14.489 14.952 15.502 16.027 16.543 17.145 17.833 18.475 19.165 19.943 20.79 21.696 22.714 23.918 25.176 26.628 28.254 30.186 32.423 35.057 38.12 41.94 45.034 46.726 47.752 48.345 48.677 48.853 48.933 48.922 48.848 48.742 48.612 48.456 48.278 48.106 47.949 47.755 47.569 47.404 47.204 46.971 46.774 46.557 46.338 46.174 45.983 45.773 45.543 45.29 45.105 44.9 44.576 44.353 44.116 43.989 43.744 43.49 43.181 43.006 42.708 42.409 42.181 41.947 41.396 41.074 40.717 40.293 39.795 39.15 38.196 33.849 -10 ,9603 ,KEBNE ,16722111,Sat Nov 27 22:10:04 CET,Sun Nov 28 00:12:25 CET,0.0 3.513 4.361 4.987 5.475 5.889 6.258 6.591 7.185 7.445 7.704 8.03 8.421 8.63 9.034 9.416 9.778 9.949 10.277 10.62 11.121 11.426 11.725 12.153 12.556 12.944 13.317 13.683 14.162 14.632 15.093 15.65 16.181 16.703 17.331 18.038 18.724 19.464 20.25 21.09 21.973 23.013 24.262 25.496 26.969 28.678 30.692 33.074 35.911 39.168 43.017 46.219 48.069 49.216 49.951 50.376 50.584 50.695 50.749 50.759 50.721 50.644 50.54 50.419 50.276 50.112 49.92 49.725 49.552 49.376 49.178 48.999 48.796 48.583 48.431 48.266 48.077 47.874 47.653 47.488 47.311 47.027 46.823 46.612 46.497 46.242 45.978 45.686 45.519 45.223 44.946 44.74 44.532 44.044 43.741 43.391 42.989 42.521 41.95 41.098 35.557 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt deleted file mode 100644 index abf020bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15425 ,KEBNE ,17026154,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:50:34 CET,0.0 2.78 3.476 3.93 4.241 4.498 4.74 4.96 5.349 5.505 5.636 5.831 5.943 6.05 6.246 6.391 6.531 6.601 6.726 6.839 7.01 7.102 7.172 7.288 7.4 7.494 7.581 7.665 7.751 7.825 7.902 7.998 8.082 8.135 8.161 8.182 8.207 8.203 8.134 8.013 7.884 7.718 7.473 7.131 6.56 5.795 4.751 3.27 1.279 -1.611 -6.596 -12.622 -17.437 -21.27 -24.422 -27.192 -29.561 -31.704 -33.508 -35.237 -36.708 -38.011 -39.246 -40.405 -41.496 -42.489 -43.481 -44.352 -45.103 -45.861 -46.632 -47.251 -47.864 -48.481 -48.955 -49.435 -49.925 -50.429 -50.956 -51.336 -51.728 -52.323 -52.74 -53.188 -53.409 -53.853 -54.363 -54.921 -55.205 -55.587 -56.117 -56.455 -56.827 -57.641 -58.073 -58.566 -59.092 -59.656 -60.346 -61.261 -64.995 -2 ,23717 ,KEBNE ,17026155,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:50:47 CET,0.0 2.932 3.626 4.106 4.471 4.741 4.968 5.154 5.492 5.65 5.778 6.001 6.135 6.25 6.456 6.632 6.775 6.842 6.973 7.09 7.247 7.331 7.407 7.515 7.6 7.68 7.751 7.794 7.831 7.86 7.897 7.956 7.985 7.983 7.976 7.93 7.87 7.803 7.697 7.54 7.341 7.085 6.699 6.249 5.684 4.93 3.875 2.438 0.386 -2.796 -8.152 -14.228 -18.984 -22.914 -26.157 -28.944 -31.278 -33.268 -34.95 -36.579 -37.922 -39.075 -40.165 -41.206 -42.15 -42.995 -43.912 -44.744 -45.442 -46.145 -46.863 -47.449 -48.061 -48.701 -49.183 -49.67 -50.167 -50.675 -51.179 -51.502 -51.833 -52.376 -52.766 -53.165 -53.368 -53.774 -54.185 -54.619 -54.846 -55.167 -55.617 -55.887 -56.165 -56.777 -57.122 -57.517 -57.931 -58.38 -58.946 -59.698 -62.056 -3 ,25518 ,KEBNE ,17026156,Wed Dec 22 13:51:41 CET,Wed Dec 22 15:50:08 CET,0.0 2.722 3.336 3.724 3.998 4.226 4.421 4.606 4.926 5.073 5.214 5.433 5.564 5.684 5.893 6.074 6.24 6.311 6.427 6.542 6.708 6.803 6.874 6.948 7.016 7.077 7.119 7.164 7.22 7.245 7.255 7.263 7.262 7.251 7.23 7.164 7.071 6.965 6.843 6.678 6.46 6.172 5.758 5.317 4.748 3.968 2.904 1.392 -0.877 -4.198 -9.397 -15.249 -19.862 -23.679 -26.859 -29.582 -31.947 -34.069 -35.81 -37.487 -38.952 -40.262 -41.461 -42.535 -43.532 -44.436 -45.362 -46.164 -46.838 -47.551 -48.29 -48.908 -49.543 -50.178 -50.659 -51.134 -51.609 -52.099 -52.616 -52.981 -53.397 -54.055 -54.484 -54.911 -55.123 -55.554 -56.02 -56.503 -56.753 -57.105 -57.593 -57.891 -58.204 -58.888 -59.26 -59.699 -60.206 -60.735 -61.388 -62.288 -66.121 -4 ,28183 ,KEBNE ,17026157,Wed Dec 22 13:51:41 CET,Wed Dec 22 15:49:32 CET,0.0 2.841 3.417 3.827 4.149 4.404 4.618 4.813 5.157 5.31 5.444 5.651 5.783 5.887 6.081 6.255 6.409 6.48 6.636 6.78 6.965 7.083 7.194 7.354 7.496 7.614 7.703 7.755 7.827 7.925 8.006 8.092 8.17 8.222 8.271 8.3 8.31 8.321 8.289 8.208 8.092 7.902 7.567 7.114 6.449 5.592 4.492 2.987 0.804 -2.521 -7.833 -13.772 -18.611 -22.575 -25.781 -28.513 -30.825 -32.821 -34.485 -36.127 -37.493 -38.679 -39.784 -40.81 -41.774 -42.63 -43.488 -44.235 -44.872 -45.516 -46.183 -46.749 -47.347 -47.952 -48.41 -48.882 -49.372 -49.866 -50.37 -50.726 -51.097 -51.671 -52.077 -52.518 -52.735 -53.169 -53.642 -54.164 -54.452 -54.841 -55.428 -55.798 -56.173 -56.937 -57.34 -57.787 -58.296 -58.936 -59.717 -60.789 -67.952 -5 ,25431 ,KEBNE ,17026158,Wed Dec 22 13:51:41 CET,Wed Dec 22 15:50:24 CET,0.0 3.035 3.658 4.07 4.383 4.637 4.852 5.04 5.39 5.542 5.674 5.898 6.03 6.146 6.345 6.49 6.614 6.677 6.799 6.895 7.025 7.102 7.163 7.244 7.313 7.364 7.407 7.441 7.489 7.535 7.572 7.598 7.601 7.607 7.594 7.52 7.45 7.37 7.234 7.06 6.865 6.634 6.271 5.769 5.058 4.18 3.037 1.52 -0.606 -3.841 -9.318 -15.552 -20.328 -24.054 -26.99 -29.578 -31.906 -34.017 -35.791 -37.537 -39.006 -40.269 -41.419 -42.465 -43.447 -44.347 -45.26 -46.082 -46.797 -47.53 -48.307 -48.949 -49.602 -50.278 -50.803 -51.343 -51.888 -52.457 -53.047 -53.435 -53.83 -54.419 -54.804 -55.2 -55.4 -55.794 -56.204 -56.622 -56.848 -57.179 -57.6 -57.86 -58.131 -58.726 -59.072 -59.478 -59.913 -60.413 -60.972 -61.734 -64.995 -6 ,30386 ,KEBNE ,17026159,Wed Dec 22 13:51:41 CET,Wed Dec 22 15:49:34 CET,0.0 3.535 4.264 4.701 5.001 5.256 5.484 5.697 6.075 6.218 6.348 6.586 6.705 6.795 6.975 7.129 7.277 7.352 7.491 7.627 7.814 7.924 8.029 8.179 8.296 8.371 8.452 8.54 8.614 8.659 8.727 8.82 8.89 8.944 8.988 9.0 8.982 8.928 8.801 8.625 8.45 8.246 7.958 7.601 7.038 6.251 5.15 3.645 1.544 -1.528 -6.687 -12.613 -17.191 -21.011 -24.217 -26.906 -29.128 -31.118 -32.812 -34.463 -35.859 -37.053 -38.163 -39.193 -40.125 -40.998 -41.948 -42.802 -43.539 -44.289 -45.043 -45.67 -46.313 -46.989 -47.512 -48.022 -48.539 -49.077 -49.641 -50.028 -50.413 -51.013 -51.44 -51.874 -52.1 -52.57 -53.065 -53.597 -53.87 -54.236 -54.748 -55.06 -55.386 -56.088 -56.504 -56.975 -57.507 -58.101 -58.814 -59.878 -66.357 -7 ,10880 ,KEBNE ,17026160,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:50:25 CET,0.0 4.882 5.571 6.0 6.304 6.55 6.773 6.974 7.314 7.464 7.6 7.825 7.964 8.072 8.289 8.49 8.679 8.767 8.92 9.05 9.241 9.365 9.47 9.613 9.734 9.819 9.891 9.958 10.023 10.073 10.122 10.174 10.219 10.251 10.274 10.286 10.256 10.184 10.101 10.003 9.835 9.59 9.226 8.744 8.095 7.25 6.11 4.586 2.474 -0.729 -6.105 -12.29 -17.217 -21.163 -24.377 -27.168 -29.571 -31.722 -33.522 -35.288 -36.782 -38.054 -39.228 -40.314 -41.312 -42.2 -43.091 -43.886 -44.589 -45.31 -46.029 -46.633 -47.264 -47.861 -48.299 -48.769 -49.248 -49.734 -50.239 -50.591 -50.977 -51.615 -52.074 -52.547 -52.783 -53.286 -53.815 -54.36 -54.646 -55.037 -55.607 -55.943 -56.285 -57.007 -57.378 -57.773 -58.211 -58.71 -59.343 -60.249 -64.146 -8 ,16787 ,KEBNE ,17026161,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:50:14 CET,0.0 2.891 3.523 3.991 4.354 4.647 4.887 5.09 5.43 5.59 5.741 5.97 6.099 6.224 6.449 6.637 6.803 6.87 6.995 7.118 7.273 7.358 7.456 7.609 7.759 7.886 7.973 8.054 8.164 8.245 8.289 8.335 8.376 8.407 8.423 8.443 8.467 8.448 8.357 8.22 8.06 7.862 7.574 7.17 6.577 5.797 4.768 3.357 1.277 -1.775 -6.532 -12.163 -16.896 -20.811 -24.068 -26.797 -29.066 -31.067 -32.761 -34.44 -35.859 -37.108 -38.274 -39.355 -40.357 -41.25 -42.159 -42.97 -43.657 -44.36 -45.095 -45.7 -46.322 -46.963 -47.466 -47.991 -48.542 -49.08 -49.613 -49.993 -50.398 -51.041 -51.481 -51.932 -52.168 -52.668 -53.203 -53.805 -54.133 -54.561 -55.199 -55.577 -55.966 -56.789 -57.218 -57.668 -58.156 -58.698 -59.399 -60.484 -65.522 -9 ,11512 ,KEBNE ,17026162,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:50:41 CET,0.0 4.958 5.689 6.099 6.41 6.695 6.954 7.154 7.484 7.631 7.777 8.023 8.142 8.239 8.442 8.612 8.751 8.822 8.955 9.082 9.269 9.378 9.465 9.596 9.73 9.822 9.888 9.948 10.008 10.062 10.102 10.14 10.169 10.165 10.134 10.092 10.066 10.048 9.967 9.839 9.698 9.498 9.163 8.764 8.234 7.523 6.561 5.228 3.211 0.089 -5.14 -11.132 -15.771 -19.52 -22.621 -25.313 -27.518 -29.423 -31.101 -32.827 -34.316 -35.603 -36.803 -37.904 -38.917 -39.841 -40.802 -41.638 -42.357 -43.123 -43.919 -44.567 -45.213 -45.89 -46.417 -46.943 -47.48 -48.034 -48.622 -49.038 -49.471 -50.143 -50.606 -51.078 -51.308 -51.754 -52.224 -52.723 -52.984 -53.355 -53.895 -54.219 -54.549 -55.252 -55.632 -56.082 -56.602 -57.182 -57.901 -58.925 -62.375 -10 ,21656 ,KEBNE ,17026163,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:50:39 CET,0.0 4.086 4.813 5.256 5.592 5.887 6.147 6.377 6.761 6.92 7.077 7.332 7.481 7.603 7.819 8.014 8.192 8.272 8.42 8.57 8.775 8.874 8.944 9.041 9.131 9.202 9.277 9.358 9.461 9.545 9.624 9.718 9.785 9.844 9.886 9.899 9.91 9.904 9.824 9.701 9.565 9.341 9.01 8.612 8.045 7.285 6.295 4.959 2.867 -0.334 -5.498 -11.542 -16.256 -20.067 -23.245 -26.024 -28.472 -30.667 -32.509 -34.253 -35.68 -36.926 -38.097 -39.178 -40.165 -41.05 -41.953 -42.779 -43.5 -44.232 -44.99 -45.618 -46.266 -46.934 -47.438 -47.937 -48.438 -48.961 -49.526 -49.927 -50.343 -50.951 -51.343 -51.749 -51.964 -52.413 -52.878 -53.389 -53.666 -54.018 -54.533 -54.84 -55.149 -55.834 -56.21 -56.619 -57.08 -57.599 -58.271 -59.273 -63.114 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt deleted file mode 100644 index 59a9f83d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,20059 ,KEBNE ,16722114,Sat Nov 27 22:10:04 CET,Sun Nov 28 00:12:32 CET,0.0 1.02 1.472 1.819 2.116 2.369 2.612 2.824 3.229 3.434 3.625 3.864 4.134 4.302 4.626 4.908 5.165 5.287 5.528 5.77 6.118 6.348 6.579 6.9 7.198 7.493 7.786 8.065 8.407 8.75 9.088 9.491 9.875 10.243 10.664 11.128 11.579 12.062 12.592 13.17 13.773 14.423 15.145 15.873 16.708 17.653 18.735 19.907 21.239 22.648 24.071 24.974 25.305 25.365 25.308 25.187 24.961 24.721 24.476 24.174 23.877 23.606 23.344 23.073 22.807 22.541 22.242 21.961 21.711 21.457 21.188 20.949 20.695 20.436 20.239 20.025 19.797 19.551 19.277 19.091 18.902 18.606 18.398 18.168 18.046 17.792 17.525 17.217 17.05 16.779 16.527 16.335 16.131 15.694 15.441 15.151 14.814 14.419 13.937 13.305 10.177 -4 ,819 ,KEBNE ,16722115,Sat Nov 27 22:10:04 CET,Sun Nov 28 00:13:59 CET,0.0 1.095 1.568 1.97 2.316 2.623 2.908 3.166 3.626 3.827 4.013 4.25 4.533 4.696 4.998 5.311 5.621 5.755 6.017 6.269 6.625 6.856 7.086 7.413 7.703 7.99 8.283 8.562 8.925 9.273 9.597 9.989 10.375 10.754 11.19 11.658 12.099 12.595 13.129 13.686 14.283 14.956 15.697 16.429 17.266 18.168 19.203 20.353 21.636 23.052 24.677 25.82 26.262 26.389 26.317 26.155 25.93 25.667 25.422 25.168 24.93 24.667 24.407 24.178 23.945 23.699 23.427 23.191 22.979 22.74 22.481 22.254 22.007 21.744 21.543 21.33 21.098 20.849 20.591 20.407 20.201 19.883 19.669 19.431 19.308 19.056 18.786 18.496 18.335 18.066 17.818 17.639 17.444 16.983 16.718 16.438 16.139 15.773 15.321 14.736 12.484 -8 ,6063 ,KEBNE ,16722119,Sat Nov 27 22:11:05 CET,Sun Nov 28 00:14:35 CET,0.0 1.096 1.512 1.823 2.125 2.41 2.658 2.893 3.318 3.512 3.705 3.958 4.226 4.38 4.693 4.982 5.244 5.376 5.629 5.862 6.202 6.421 6.632 6.946 7.256 7.554 7.836 8.098 8.443 8.781 9.1 9.494 9.872 10.239 10.666 11.134 11.595 12.094 12.622 13.188 13.769 14.415 15.166 15.9 16.771 17.753 18.844 20.012 21.329 22.718 24.132 24.964 25.225 25.243 25.086 24.817 24.54 24.267 23.993 23.685 23.384 23.107 22.822 22.524 22.256 22.004 21.713 21.445 21.196 20.93 20.666 20.44 20.189 19.928 19.722 19.511 19.289 19.042 18.779 18.594 18.4 18.107 17.906 17.682 17.567 17.342 17.08 16.782 16.625 16.37 16.12 15.933 15.738 15.302 15.051 14.765 14.454 14.111 13.695 13.099 10.991 -9 ,32329 ,KEBNE ,16722120,Sat Nov 27 22:12:06 CET,Sun Nov 28 00:14:49 CET,0.0 1.385 1.915 2.369 2.731 3.03 3.297 3.527 3.94 4.137 4.326 4.565 4.854 5.011 5.323 5.642 5.935 6.07 6.335 6.592 6.942 7.161 7.374 7.681 7.976 8.266 8.546 8.819 9.18 9.521 9.836 10.218 10.594 10.96 11.374 11.817 12.249 12.738 13.253 13.789 14.34 14.968 15.728 16.462 17.271 18.154 19.122 20.218 21.493 22.915 24.436 25.358 25.706 25.781 25.665 25.439 25.198 24.958 24.703 24.401 24.125 23.88 23.635 23.386 23.123 22.873 22.617 22.38 22.171 21.946 21.701 21.492 21.268 21.029 20.83 20.622 20.404 20.174 19.922 19.726 19.521 19.17 18.899 18.616 18.468 18.168 17.827 17.436 17.251 16.964 16.631 16.399 16.151 15.618 15.297 14.92 14.517 14.015 13.363 12.39 9.027 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index 0a02cc2e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,11635 ,KEBNE ,16722124,Sat Nov 27 22:14:08 CET,Sun Nov 28 00:15:08 CET,0.0 3.446 4.135 4.611 4.991 5.317 5.611 5.875 6.325 6.524 6.711 6.944 7.23 7.389 7.694 7.954 8.189 8.31 8.547 8.77 9.094 9.294 9.479 9.757 10.017 10.256 10.487 10.707 11.0 11.274 11.523 11.828 12.11 12.396 12.722 13.074 13.45 13.879 14.315 14.786 15.28 15.795 16.412 17.005 17.617 18.235 18.863 19.528 20.197 20.837 21.331 21.376 21.052 20.527 19.981 19.438 18.906 18.37 17.852 17.341 16.925 16.538 16.15 15.775 15.394 15.045 14.706 14.401 14.113 13.808 13.512 13.248 12.944 12.64 12.416 12.182 11.905 11.599 11.293 11.075 10.852 10.522 10.291 10.048 9.923 9.667 9.379 9.062 8.899 8.616 8.371 8.181 7.972 7.514 7.272 7.009 6.698 6.315 5.856 5.218 2.81 -4 ,14397 ,KEBNE ,16722125,Sat Nov 27 22:14:08 CET,Sun Nov 28 00:16:48 CET,0.0 4.106 4.916 5.454 5.864 6.201 6.485 6.736 7.165 7.359 7.545 7.787 8.072 8.243 8.562 8.844 9.11 9.249 9.505 9.741 10.076 10.28 10.47 10.743 11.02 11.293 11.555 11.8 12.114 12.414 12.688 13.019 13.341 13.651 13.991 14.351 14.693 15.066 15.467 15.878 16.298 16.779 17.325 17.839 18.398 18.995 19.661 20.328 20.975 21.567 21.914 21.803 21.406 20.879 20.269 19.65 19.103 18.582 18.099 17.609 17.178 16.78 16.439 16.122 15.792 15.479 15.141 14.837 14.57 14.289 14.002 13.75 13.454 13.156 12.928 12.692 12.464 12.196 11.902 11.706 11.497 11.193 10.991 10.763 10.641 10.393 10.139 9.867 9.702 9.405 9.183 8.996 8.798 8.376 8.137 7.848 7.495 7.132 6.722 6.143 3.438 -5 ,6166 ,KEBNE ,16722126,Sat Nov 27 22:14:08 CET,Sun Nov 28 00:14:44 CET,0.0 7.487 8.24 8.735 9.121 9.464 9.778 10.068 10.563 10.786 10.994 11.262 11.564 11.732 12.055 12.355 12.638 12.766 13.008 13.244 13.577 13.779 13.976 14.262 14.538 14.801 15.038 15.262 15.539 15.812 16.069 16.383 16.698 16.991 17.34 17.731 18.097 18.507 18.952 19.389 19.833 20.345 20.914 21.451 22.014 22.57 23.178 23.864 24.628 25.423 25.923 25.791 25.408 24.907 24.369 23.855 23.363 22.867 22.417 21.902 21.429 21.025 20.636 20.273 19.933 19.608 19.263 18.942 18.67 18.392 18.084 17.82 17.55 17.27 17.043 16.802 16.55 16.272 15.981 15.778 15.569 15.243 15.016 14.793 14.677 14.421 14.126 13.815 13.658 13.382 13.142 12.944 12.733 12.288 12.038 11.742 11.406 11.059 10.585 9.892 7.677 -6 ,17222 ,KEBNE ,16722127,Sat Nov 27 22:14:08 CET,Sun Nov 28 00:14:58 CET,0.0 3.42 4.177 4.715 5.117 5.434 5.708 5.967 6.455 6.668 6.851 7.077 7.372 7.52 7.796 8.088 8.374 8.496 8.732 8.968 9.283 9.486 9.684 9.963 10.228 10.48 10.722 10.951 11.242 11.508 11.764 12.086 12.391 12.675 12.983 13.311 13.64 14.014 14.411 14.822 15.241 15.715 16.241 16.744 17.323 17.947 18.613 19.295 19.992 20.634 21.048 20.863 20.39 19.927 19.432 18.884 18.367 17.86 17.418 16.951 16.507 16.101 15.717 15.344 15.004 14.676 14.287 13.952 13.672 13.38 13.079 12.82 12.551 12.269 12.047 11.807 11.558 11.311 11.044 10.853 10.649 10.296 10.026 9.76 9.629 9.342 9.046 8.708 8.514 8.198 7.857 7.61 7.361 6.783 6.463 6.145 5.824 5.454 5.011 4.417 1.949 -7 ,25908 ,KEBNE ,16722128,Sat Nov 27 22:14:09 CET,Sun Nov 28 00:16:16 CET,0.0 3.288 4.025 4.541 4.962 5.325 5.654 5.945 6.401 6.608 6.806 7.047 7.341 7.517 7.845 8.143 8.428 8.563 8.824 9.068 9.398 9.603 9.809 10.088 10.35 10.621 10.876 11.121 11.424 11.695 11.971 12.315 12.621 12.904 13.24 13.616 13.964 14.32 14.694 15.088 15.489 15.932 16.422 16.904 17.476 18.084 18.715 19.346 19.998 20.657 21.09 21.01 20.651 20.182 19.663 19.134 18.637 18.163 17.742 17.26 16.81 16.421 16.033 15.65 15.291 14.96 14.63 14.34 14.069 13.777 13.482 13.231 12.96 12.676 12.452 12.217 11.956 11.687 11.434 11.254 11.056 10.746 10.528 10.308 10.189 9.932 9.66 9.361 9.205 8.921 8.619 8.388 8.174 7.735 7.488 7.224 6.922 6.575 6.183 5.641 3.002 -8 ,31378 ,KEBNE ,16722129,Sat Nov 27 22:14:09 CET,Sun Nov 28 00:15:00 CET,0.0 5.776 6.506 6.998 7.404 7.762 8.073 8.366 8.856 9.066 9.265 9.508 9.802 9.967 10.268 10.542 10.817 10.949 11.185 11.413 11.746 11.95 12.143 12.418 12.688 12.952 13.195 13.415 13.716 14.012 14.284 14.62 14.936 15.232 15.578 15.955 16.3 16.674 17.056 17.467 17.902 18.361 18.881 19.38 19.971 20.626 21.329 22.024 22.664 23.256 23.742 23.751 23.474 22.981 22.401 21.859 21.296 20.735 20.252 19.787 19.376 18.973 18.589 18.217 17.871 17.557 17.216 16.911 16.645 16.346 16.026 15.776 15.52 15.241 15.02 14.792 14.544 14.273 13.977 13.777 13.594 13.288 13.06 12.83 12.709 12.449 12.175 11.878 11.718 11.434 11.211 11.02 10.787 10.254 9.968 9.687 9.415 9.099 8.718 8.204 5.395 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt deleted file mode 100644 index 91d434d0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,21810 ,KEBNE ,16722133,Sat Nov 27 22:14:08 CET,Sun Nov 28 00:13:56 CET,0.0 1.084 1.413 1.681 1.923 2.132 2.355 2.568 2.893 3.036 3.183 3.05 3.597 3.719 3.941 4.157 4.362 4.457 4.631 4.805 5.059 5.214 5.366 5.599 5.825 6.048 6.279 6.49 6.742 6.996 7.242 7.532 7.812 8.073 8.374 8.718 9.06 9.439 9.846 10.274 10.716 11.196 11.759 12.326 12.943 13.607 14.329 15.058 15.812 16.496 16.993 17.114 16.908 16.492 16.024 15.605 15.193 14.776 14.437 14.084 13.736 13.408 13.081 12.758 12.448 12.155 11.849 11.593 11.366 11.132 10.893 10.688 10.465 10.205 10.005 9.809 9.596 9.372 9.131 8.961 8.771 8.444 8.227 8.007 7.891 7.65 7.398 7.137 6.996 6.457 6.527 6.353 6.176 5.78 5.545 5.275 4.973 4.597 4.126 3.483 0.361 -3 ,16001 ,KEBNE ,16722134,Sat Nov 27 22:14:08 CET,Sun Nov 28 00:15:15 CET,0.0 0.972 1.341 1.681 1.974 2.222 2.448 2.657 3.025 3.189 3.358 3.296 3.841 3.972 4.205 4.422 4.643 4.743 4.931 5.121 5.385 5.56 5.753 6.032 6.289 6.538 6.774 7.012 7.323 7.612 7.889 8.208 8.501 8.784 9.105 9.466 9.817 10.2 10.626 11.068 11.487 11.942 12.444 12.924 13.498 14.104 14.757 15.475 16.246 17.048 17.684 17.715 17.412 16.978 16.555 16.166 15.769 15.324 14.888 14.448 14.088 13.786 13.493 13.167 12.84 12.539 12.219 11.922 11.655 11.387 11.114 10.887 10.632 10.369 10.172 9.948 9.704 9.453 9.194 9.015 8.827 8.532 8.309 8.06 7.943 7.709 7.437 7.137 6.982 6.429 6.492 6.302 6.097 5.629 5.389 5.137 4.826 4.445 3.966 3.317 -0.027 -4 ,29476 ,KEBNE ,16722135,Sat Nov 27 22:14:08 CET,Sun Nov 28 00:13:40 CET,0.0 1.067 1.461 1.723 1.939 2.145 2.35 2.538 2.883 3.048 3.204 3.088 3.618 3.741 3.988 4.23 4.453 4.563 4.775 4.967 5.242 5.424 5.598 5.849 6.084 6.313 6.533 6.75 7.035 7.292 7.537 7.837 8.131 8.422 8.764 9.113 9.43 9.785 10.166 10.564 10.98 11.433 11.946 12.448 13.021 13.653 14.323 14.978 15.707 16.441 16.959 17.018 16.784 16.402 15.963 15.551 15.156 14.736 14.346 13.968 13.63 13.308 12.993 12.684 12.397 12.104 11.785 11.504 11.243 10.955 10.654 10.402 10.144 9.891 9.674 9.435 9.191 8.945 8.698 8.516 8.323 8.026 7.813 7.589 7.467 7.209 6.97 6.711 6.566 6.017 6.089 5.915 5.741 5.334 5.09 4.82 4.489 4.108 3.633 2.901 -0.49 -5 ,26304 ,KEBNE ,16722136,Sat Nov 27 22:15:09 CET,Sun Nov 28 00:14:48 CET,0.0 1.16 1.525 1.807 2.018 2.219 2.429 2.631 3.005 3.175 3.328 3.202 3.732 3.863 4.106 4.323 4.525 4.628 4.833 5.025 5.308 5.497 5.668 5.92 6.174 6.399 6.609 6.825 7.099 7.357 7.613 7.903 8.194 8.487 8.805 9.156 9.498 9.884 10.29 10.694 11.118 11.607 12.183 12.739 13.344 13.964 14.64 15.334 16.038 16.704 17.219 17.303 17.045 16.651 16.222 15.767 15.297 14.871 14.518 14.152 13.795 13.449 13.132 12.838 12.547 12.26 11.952 11.684 11.452 11.192 10.911 10.673 10.415 10.137 9.919 9.711 9.501 9.267 9.007 8.826 8.639 8.346 8.129 7.902 7.788 7.551 7.305 7.028 6.878 6.334 6.427 6.258 6.078 5.691 5.444 5.135 4.793 4.415 3.962 3.334 0.003 -6 ,32507 ,KEBNE ,16722137,Sat Nov 27 22:15:09 CET,Sun Nov 28 00:16:28 CET,0.0 0.805 1.115 1.331 1.52 1.684 1.828 1.966 2.241 2.373 2.494 2.319 2.83 2.929 3.114 3.294 3.472 3.562 3.748 3.924 4.159 4.303 4.453 4.682 4.892 5.1 5.309 5.516 5.802 6.064 6.284 6.556 6.858 7.143 7.458 7.818 8.144 8.475 8.824 9.199 9.579 9.995 10.452 10.907 11.407 11.907 12.463 13.104 13.848 14.549 15.032 15.089 14.849 14.499 14.101 13.679 13.261 12.825 12.451 12.073 11.705 11.362 11.054 10.764 10.467 10.188 9.902 9.642 9.414 9.16 8.881 8.653 8.416 8.174 7.98 7.767 7.544 7.317 7.079 6.9 6.709 6.394 6.17 5.929 5.795 5.536 5.256 4.961 4.82 4.277 4.333 4.151 3.958 3.572 3.331 3.045 2.728 2.372 1.938 1.288 -1.263 -7 ,9497 ,KEBNE ,16722138,Sat Nov 27 22:15:09 CET,Sun Nov 28 00:14:49 CET,0.0 0.716 0.972 1.219 1.463 1.703 1.91 2.092 2.426 2.569 2.7 2.562 3.084 3.194 3.407 3.61 3.81 3.914 4.115 4.307 4.597 4.776 4.936 5.196 5.443 5.665 5.883 6.086 6.341 6.594 6.846 7.135 7.408 7.68 7.99 8.33 8.64 8.972 9.35 9.741 10.154 10.611 11.097 11.597 12.153 12.742 13.411 14.104 14.863 15.686 16.339 16.468 16.311 15.99 15.589 15.187 14.752 14.31 13.896 13.439 13.043 12.71 12.378 12.031 11.73 11.457 11.132 10.835 10.574 10.293 10.012 9.767 9.495 9.224 9.006 8.776 8.541 8.297 8.035 7.857 7.681 7.398 7.196 6.984 6.874 6.633 6.368 6.099 5.953 5.393 5.456 5.28 5.068 4.572 4.309 4.02 3.706 3.335 2.873 2.201 -0.978 -8 ,11817 ,KEBNE ,16722139,Sat Nov 27 22:17:14 CET,Sun Nov 28 00:16:48 CET,0.0 0.658 0.921 1.147 1.346 1.518 1.671 1.832 2.159 2.304 2.43 2.255 2.779 2.893 3.105 3.311 3.502 3.597 3.798 3.992 4.27 4.441 4.596 4.833 5.065 5.292 5.513 5.717 5.965 6.2 6.46 6.767 7.032 7.302 7.615 7.966 8.305 8.661 9.055 9.453 9.83 10.256 10.766 11.269 11.845 12.469 13.145 13.821 14.491 15.147 15.571 15.4 15.096 14.728 14.262 13.791 13.342 12.896 12.454 11.995 11.595 11.241 10.903 10.566 10.248 9.974 9.693 9.419 9.173 8.91 8.632 8.391 8.115 7.799 7.558 7.331 7.09 6.828 6.56 6.373 6.168 5.849 5.616 5.373 5.25 4.987 4.698 4.404 4.259 3.708 3.79 3.607 3.398 2.929 2.662 2.362 2.013 1.614 1.133 0.352 -4.119 -9 ,7138 ,KEBNE ,16722140,Sat Nov 27 22:17:14 CET,Sun Nov 28 00:18:13 CET,0.0 0.684 0.962 1.184 1.388 1.582 1.755 1.918 2.225 2.361 2.491 2.327 2.845 2.95 3.153 3.355 3.568 3.67 3.853 4.031 4.301 4.479 4.644 4.868 5.095 5.314 5.519 5.724 5.994 6.243 6.486 6.778 7.05 7.318 7.636 7.981 8.317 8.704 9.103 9.517 9.942 10.403 10.937 11.457 12.031 12.622 13.238 13.856 14.513 15.202 15.78 15.875 15.628 15.241 14.784 14.295 13.825 13.373 12.96 12.524 12.142 11.781 11.424 11.084 10.763 10.464 10.151 9.861 9.593 9.31 9.028 8.802 8.564 8.314 8.114 7.896 7.667 7.42 7.164 6.986 6.795 6.491 6.28 6.06 5.945 5.708 5.456 5.173 5.018 4.475 4.573 4.409 4.212 3.735 3.447 3.127 2.801 2.409 1.912 1.193 -1.952 -10 ,8375 ,KEBNE ,16722141,Sat Nov 27 22:17:14 CET,Sun Nov 28 00:16:53 CET,0.0 1.279 1.702 2.029 2.3 2.534 2.76 2.99 3.4 3.58 3.742 3.653 4.217 4.361 4.636 4.897 5.139 5.252 5.462 5.668 5.959 6.129 6.293 6.54 6.778 7.004 7.217 7.426 7.71 7.98 8.231 8.522 8.809 9.089 9.4 9.742 10.071 10.437 10.835 11.248 11.67 12.145 12.658 13.147 13.712 14.286 14.961 15.68 16.391 17.164 17.871 18.038 17.795 17.419 17.0 16.579 16.167 15.752 15.375 14.979 14.616 14.303 13.999 13.688 13.386 13.092 12.774 12.477 12.219 11.942 11.629 11.385 11.144 10.876 10.658 10.416 10.158 9.897 9.615 9.42 9.217 8.9 8.683 8.453 8.33 8.051 7.772 7.492 7.337 6.766 6.847 6.659 6.459 6.006 5.76 5.491 5.153 4.774 4.317 3.645 0.171 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 5c7d9387..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15329 ,KEBNE ,16722142,Sat Nov 27 22:17:13 CET,Sun Nov 28 00:15:41 CET,0.0 2.381 2.721 2.904 3.029 3.107 3.137 3.137 3.11 3.093 3.063 2.751 2.904 2.836 2.692 2.536 2.352 2.253 2.051 1.838 1.517 1.297 1.065 0.71 0.352 -0.025 -0.424 -0.82 -1.349 -1.898 -2.443 -3.14 -3.879 -4.628 -5.534 -6.605 -7.693 -8.949 -10.375 -11.969 -13.78 -15.995 -18.757 -21.73 -25.49 -30.034 -35.726 -42.751 -51.934 -64.379 -82.427 -100.97 -114.327 -124.528 -132.554 -139.182 -144.585 -149.202 -152.999 -156.636 -159.609 -162.13 -164.438 -166.541 -168.44 -170.119 -171.815 -173.272 -174.495 -175.727 -176.986 -178.011 -179.053 -180.101 -180.881 -181.684 -182.51 -183.336 -184.164 -184.727 -185.291 -186.131 -186.705 -187.295 -187.592 -188.192 -188.812 -189.457 -189.788 -190.524 -190.804 -191.171 -191.535 -192.294 -192.707 -193.133 -193.587 -194.095 -194.709 -195.499 -198.107 -2 ,17255 ,KEBNE ,16722143,Sat Nov 27 22:17:13 CET,Sun Nov 28 00:16:35 CET,0.0 1.737 2.085 2.251 2.355 2.418 2.448 2.471 2.472 2.438 2.399 2.085 2.244 2.183 2.044 1.875 1.686 1.589 1.387 1.167 0.838 0.62 0.401 0.057 -0.303 -0.659 -1.037 -1.431 -1.97 -2.514 -3.064 -3.802 -4.545 -5.271 -6.163 -7.242 -8.345 -9.611 -11.049 -12.679 -14.521 -16.744 -19.519 -22.523 -26.297 -30.861 -36.571 -43.641 -52.932 -65.472 -83.596 -102.161 -115.527 -125.706 -133.74 -140.382 -145.801 -150.44 -154.259 -157.878 -160.868 -163.438 -165.78 -167.882 -169.772 -171.441 -173.102 -174.544 -175.756 -176.983 -178.234 -179.256 -180.282 -181.326 -182.125 -182.925 -183.739 -184.566 -185.404 -185.955 -186.507 -187.357 -187.939 -188.532 -188.838 -189.462 -190.091 -190.748 -191.088 -191.837 -192.109 -192.463 -192.825 -193.587 -193.979 -194.392 -194.857 -195.373 -195.946 -196.693 -199.199 -3 ,10637 ,KEBNE ,16722144,Sat Nov 27 22:20:20 CET,Sun Nov 28 00:17:34 CET,0.0 2.35 2.692 2.885 3.0 3.071 3.117 3.137 3.136 3.105 3.055 2.739 2.887 2.812 2.664 2.506 2.333 2.248 2.071 1.871 1.541 1.318 1.082 0.713 0.339 -0.048 -0.447 -0.848 -1.39 -1.954 -2.539 -3.278 -4.023 -4.785 -5.722 -6.826 -7.936 -9.234 -10.726 -12.394 -14.24 -16.431 -19.164 -22.164 -25.954 -30.521 -36.226 -43.285 -52.53 -65.004 -83.04 -101.551 -114.96 -125.187 -133.233 -139.918 -145.359 -149.954 -153.727 -157.325 -160.264 -162.794 -165.125 -167.227 -169.1 -170.745 -172.423 -173.887 -175.109 -176.327 -177.559 -178.57 -179.592 -180.616 -181.392 -182.174 -182.973 -183.792 -184.623 -185.183 -185.749 -186.617 -187.222 -187.855 -188.183 -188.848 -189.5 -190.154 -190.491 -191.256 -191.599 -191.993 -192.406 -193.276 -193.711 -194.147 -194.617 -195.127 -195.723 -196.54 -199.81 -4 ,481 ,KEBNE ,16722145,Sat Nov 27 22:20:21 CET,Sun Nov 28 00:14:50 CET,0.0 1.892 2.277 2.487 2.596 2.67 2.732 2.774 2.787 2.756 2.714 2.408 2.571 2.515 2.388 2.241 2.063 1.974 1.792 1.606 1.327 1.125 0.908 0.598 0.279 -0.079 -0.447 -0.827 -1.351 -1.893 -2.456 -3.189 -3.936 -4.69 -5.596 -6.673 -7.787 -9.058 -10.502 -12.143 -13.981 -16.197 -18.975 -21.954 -25.662 -30.174 -35.845 -42.864 -52.007 -64.424 -82.468 -100.929 -114.35 -124.639 -132.723 -139.41 -144.857 -149.476 -153.274 -156.908 -159.871 -162.388 -164.706 -166.811 -168.698 -170.366 -172.056 -173.524 -174.751 -175.977 -177.216 -178.23 -179.258 -180.298 -181.081 -181.865 -182.662 -183.462 -184.284 -184.844 -185.397 -186.235 -186.809 -187.399 -187.699 -188.299 -188.896 -189.527 -189.855 -190.586 -190.869 -191.228 -191.591 -192.334 -192.728 -193.128 -193.566 -194.076 -194.669 -195.427 -197.813 -5 ,4530 ,KEBNE ,16722146,Sat Nov 27 22:24:24 CET,Sun Nov 28 00:23:37 CET,0.0 1.749 2.091 2.287 2.412 2.484 2.53 2.553 2.57 2.556 2.523 2.224 2.376 2.315 2.185 2.022 1.853 1.765 1.571 1.357 1.039 0.832 0.621 0.276 -0.103 -0.48 -0.863 -1.261 -1.792 -2.334 -2.894 -3.641 -4.412 -5.185 -6.126 -7.239 -8.362 -9.667 -11.154 -12.803 -14.621 -16.799 -19.523 -22.488 -26.201 -30.647 -36.234 -43.229 -52.431 -64.827 -82.819 -101.372 -114.755 -124.983 -133.022 -139.709 -145.151 -149.745 -153.515 -157.108 -160.064 -162.595 -164.923 -167.011 -168.88 -170.563 -172.249 -173.691 -174.91 -176.147 -177.4 -178.411 -179.417 -180.427 -181.201 -181.99 -182.798 -183.616 -184.44 -184.986 -185.539 -186.394 -186.985 -187.606 -187.928 -188.592 -189.277 -189.991 -190.351 -191.116 -191.448 -191.833 -192.222 -193.025 -193.455 -193.907 -194.386 -194.909 -195.495 -196.219 -197.789 -6 ,2073 ,KEBNE ,16722147,Sat Nov 27 22:24:23 CET,Sun Nov 28 00:22:13 CET,0.0 2.583 2.97 3.21 3.343 3.428 3.488 3.518 3.494 3.466 3.431 3.138 3.298 3.241 3.109 2.96 2.797 2.709 2.516 2.31 1.994 1.775 1.535 1.189 0.826 0.433 0.04 -0.349 -0.893 -1.453 -2.008 -2.731 -3.491 -4.253 -5.163 -6.253 -7.368 -8.651 -10.115 -11.754 -13.596 -15.844 -18.622 -21.596 -25.346 -29.869 -35.545 -42.59 -51.822 -64.288 -82.405 -101.007 -114.431 -124.75 -132.866 -139.547 -145.014 -149.672 -153.487 -157.071 -160.0 -162.535 -164.866 -166.97 -168.85 -170.514 -172.203 -173.671 -174.892 -176.11 -177.341 -178.344 -179.357 -180.371 -181.142 -181.926 -182.716 -183.522 -184.337 -184.892 -185.458 -186.315 -186.899 -187.496 -187.791 -188.388 -189.008 -189.655 -189.988 -190.73 -191.017 -191.389 -191.762 -192.53 -192.936 -193.36 -193.816 -194.307 -194.848 -195.537 -197.815 -7 ,25984 ,KEBNE ,16722148,Sat Nov 27 22:24:23 CET,Sun Nov 28 00:22:04 CET,0.0 1.824 2.177 2.329 2.404 2.468 2.5 2.484 2.411 2.368 2.326 2.023 2.171 2.101 1.95 1.779 1.603 1.516 1.319 1.098 0.755 0.528 0.3 -0.055 -0.42 -0.809 -1.212 -1.609 -2.147 -2.712 -3.279 -3.984 -4.722 -5.473 -6.391 -7.476 -8.576 -9.854 -11.311 -12.963 -14.795 -16.969 -19.708 -22.695 -26.432 -30.894 -36.5 -43.483 -52.611 -65.02 -82.984 -101.352 -114.601 -124.766 -132.765 -139.381 -144.801 -149.402 -153.145 -156.714 -159.643 -162.117 -164.393 -166.473 -168.337 -169.998 -171.689 -173.138 -174.341 -175.557 -176.793 -177.796 -178.827 -179.889 -180.689 -181.484 -182.275 -183.083 -183.91 -184.46 -185.022 -185.88 -186.456 -187.052 -187.36 -187.976 -188.602 -189.249 -189.575 -190.315 -190.591 -190.942 -191.305 -192.074 -192.488 -192.935 -193.396 -193.878 -194.429 -195.168 -197.973 -8 ,2791 ,KEBNE ,16722149,Sat Nov 27 22:24:23 CET,Sun Nov 28 00:22:03 CET,0.0 2.041 2.365 2.562 2.687 2.74 2.779 2.796 2.765 2.739 2.715 2.433 2.598 2.543 2.384 2.205 2.028 1.933 1.738 1.54 1.22 0.999 0.777 0.44 0.082 -0.299 -0.68 -1.073 -1.603 -2.136 -2.7 -3.425 -4.175 -4.94 -5.855 -6.918 -7.998 -9.272 -10.737 -12.386 -14.223 -16.439 -19.212 -22.202 -25.936 -30.446 -36.17 -43.271 -52.52 -64.979 -82.963 -101.322 -114.641 -124.889 -132.932 -139.559 -144.958 -149.559 -153.335 -156.926 -159.862 -162.372 -164.679 -166.778 -168.672 -170.348 -172.021 -173.482 -174.718 -175.948 -177.207 -178.235 -179.267 -180.317 -181.113 -181.907 -182.718 -183.546 -184.379 -184.939 -185.508 -186.375 -186.961 -187.554 -187.854 -188.464 -189.086 -189.719 -190.04 -190.779 -191.06 -191.415 -191.776 -192.523 -192.933 -193.381 -193.85 -194.348 -194.926 -195.661 -197.99 -9 ,30596 ,KEBNE ,16722150,Sat Nov 27 22:24:23 CET,Sun Nov 28 00:21:51 CET,0.0 2.147 2.504 2.673 2.772 2.824 2.85 2.87 2.898 2.888 2.863 2.578 2.726 2.658 2.509 2.344 2.169 2.076 1.882 1.682 1.353 1.11 0.862 0.514 0.153 -0.248 -0.647 -1.041 -1.579 -2.126 -2.699 -3.436 -4.171 -4.923 -5.84 -6.92 -8.016 -9.304 -10.788 -12.437 -14.275 -16.503 -19.297 -22.305 -26.069 -30.606 -36.285 -43.295 -52.48 -64.961 -83.031 -101.583 -114.966 -125.208 -133.275 -139.924 -145.334 -149.908 -153.664 -157.257 -160.219 -162.756 -165.067 -167.178 -169.065 -170.73 -172.429 -173.89 -175.126 -176.382 -177.647 -178.675 -179.715 -180.765 -181.564 -182.371 -183.172 -183.985 -184.833 -185.409 -185.984 -186.84 -187.434 -188.053 -188.357 -188.968 -189.6 -190.264 -190.6 -191.346 -191.633 -191.989 -192.353 -193.127 -193.543 -193.994 -194.464 -194.953 -195.515 -196.212 -198.535 -10 ,20824 ,KEBNE ,16722151,Sat Nov 27 22:25:26 CET,Sun Nov 28 00:19:30 CET,0.0 1.62 1.987 2.154 2.261 2.324 2.36 2.377 2.371 2.329 2.282 1.969 2.124 2.072 1.937 1.777 1.61 1.517 1.316 1.111 0.794 0.573 0.341 -0.021 -0.382 -0.75 -1.141 -1.547 -2.076 -2.614 -3.17 -3.877 -4.597 -5.343 -6.272 -7.357 -8.442 -9.711 -11.151 -12.767 -14.581 -16.767 -19.526 -22.5 -26.192 -30.647 -36.286 -43.243 -52.379 -64.863 -82.833 -101.234 -114.559 -124.771 -132.802 -139.436 -144.841 -149.445 -153.226 -156.825 -159.767 -162.269 -164.588 -166.691 -168.545 -170.17 -171.828 -173.283 -174.516 -175.765 -177.005 -178.011 -179.043 -180.078 -180.87 -181.681 -182.504 -183.337 -184.192 -184.764 -185.335 -186.213 -186.801 -187.397 -187.703 -188.324 -188.961 -189.61 -189.943 -190.693 -191.008 -191.376 -191.747 -192.516 -192.925 -193.37 -193.836 -194.326 -194.924 -195.705 -198.212 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt deleted file mode 100644 index 26131bea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2319 ,KEBNE ,16722152,Sat Nov 27 22:25:24 CET,Sun Nov 28 00:20:23 CET,0.0 0.564 0.902 1.141 1.324 1.509 1.688 1.852 2.139 2.271 2.399 2.241 2.761 2.874 3.096 3.314 3.512 3.595 3.763 3.935 4.184 4.341 4.482 4.687 4.898 5.106 5.312 5.528 5.794 6.041 6.289 6.575 6.843 7.108 7.41 7.743 8.071 8.444 8.831 9.233 9.668 10.156 10.705 11.241 11.892 12.603 13.381 14.25 15.264 16.393 17.541 18.26 18.508 18.568 18.523 18.391 18.2 17.964 17.754 17.531 17.304 17.11 16.918 16.724 16.557 16.395 16.204 16.032 15.881 15.713 15.535 15.386 15.233 15.071 14.945 14.805 14.657 14.499 14.336 14.234 14.12 13.935 13.812 13.684 13.616 13.46 13.275 13.083 12.991 12.506 12.726 12.626 12.513 12.278 12.155 12.028 11.897 11.736 11.53 11.297 10.99 -2 ,1925 ,KEBNE ,16722153,Sat Nov 27 22:25:24 CET,Sun Nov 28 00:19:56 CET,0.0 0.721 1.028 1.271 1.483 1.653 1.814 1.971 2.274 2.421 2.56 2.413 2.94 3.068 3.323 3.547 3.753 3.85 4.037 4.21 4.468 4.648 4.828 5.096 5.365 5.623 5.848 6.064 6.357 6.64 6.92 7.259 7.575 7.891 8.262 8.661 9.038 9.442 9.872 10.321 10.792 11.353 11.999 12.631 13.336 14.091 14.998 16.005 17.093 18.261 19.392 20.129 20.407 20.35 20.207 20.019 19.82 19.626 19.401 19.141 18.9 18.652 18.403 18.177 17.97 17.769 17.551 17.346 17.148 16.927 16.714 16.547 16.357 16.15 15.989 15.82 15.647 15.466 15.271 15.146 15.022 14.816 14.675 14.522 14.446 14.304 14.142 13.963 13.867 13.362 13.551 13.416 13.267 12.988 12.834 12.653 12.479 12.29 12.022 11.668 10.859 -3 ,5034 ,KEBNE ,16722154,Sat Nov 27 22:26:26 CET,Sun Nov 28 00:20:17 CET,0.0 0.876 1.171 1.375 1.556 1.74 1.919 2.074 2.391 2.556 2.704 2.57 3.123 3.256 3.488 3.702 3.93 4.045 4.253 4.447 4.726 4.9 5.066 5.316 5.55 5.769 5.992 6.209 6.476 6.724 6.978 7.306 7.621 7.92 8.266 8.639 8.983 9.375 9.812 10.263 10.736 11.251 11.818 12.406 13.139 13.959 14.866 15.844 16.903 18.044 19.212 19.899 20.104 20.113 20.037 19.875 19.682 19.438 19.172 18.917 18.681 18.428 18.17 17.941 17.748 17.559 17.348 17.153 16.983 16.8 16.584 16.405 16.224 16.031 15.872 15.714 15.568 15.42 15.248 15.114 14.968 14.743 14.595 14.448 14.37 14.21 14.044 13.853 13.748 13.25 13.465 13.351 13.225 12.974 12.844 12.695 12.525 12.347 12.138 11.838 11.334 -4 ,14231 ,KEBNE ,16722155,Sat Nov 27 22:27:28 CET,Sun Nov 28 00:27:26 CET,0.0 0.431 0.682 0.887 1.066 1.23 1.381 1.528 1.827 1.971 2.117 1.992 2.518 2.627 2.826 3.027 3.237 3.334 3.51 3.682 3.931 4.099 4.27 4.505 4.734 4.952 5.159 5.361 5.635 5.916 6.172 6.463 6.746 7.027 7.361 7.739 8.1 8.482 8.888 9.33 9.793 10.313 10.925 11.522 12.172 12.902 13.726 14.602 15.646 16.87 18.092 18.757 18.954 18.875 18.675 18.45 18.207 17.984 17.779 17.545 17.3 17.051 16.837 16.636 16.426 16.234 16.026 15.84 15.681 15.507 15.314 15.154 15.002 14.831 14.679 14.524 14.349 14.159 13.97 13.835 13.701 13.496 13.35 13.203 13.123 12.955 12.781 12.603 12.513 12.015 12.191 12.093 11.999 11.795 11.681 11.561 11.43 11.265 11.076 10.889 10.549 -5 ,8821 ,KEBNE ,16722156,Sat Nov 27 22:27:28 CET,Sun Nov 28 00:22:34 CET,0.0 0.687 1.001 1.276 1.511 1.733 1.917 2.076 2.397 2.562 2.731 2.602 3.139 3.26 3.505 3.732 3.942 4.047 4.258 4.462 4.753 4.922 5.078 5.309 5.525 5.725 5.916 6.116 6.372 6.602 6.826 7.108 7.392 7.666 7.98 8.32 8.648 9.016 9.396 9.818 10.264 10.78 11.389 11.958 12.588 13.262 14.098 15.007 15.985 17.141 18.368 19.114 19.418 19.532 19.524 19.402 19.206 18.995 18.775 18.523 18.289 18.104 17.93 17.742 17.561 17.391 17.202 17.012 16.833 16.653 16.456 16.286 16.107 15.922 15.782 15.637 15.482 15.327 15.164 15.046 14.927 14.752 14.628 14.485 14.409 14.25 14.076 13.902 13.811 13.32 13.526 13.432 13.328 13.054 12.889 12.726 12.562 12.385 12.189 11.912 11.374 -6 ,31550 ,KEBNE ,16722157,Sat Nov 27 22:27:28 CET,Sun Nov 28 00:21:44 CET,0.0 0.816 1.152 1.443 1.689 1.897 2.076 2.253 2.574 2.724 2.867 2.725 3.269 3.406 3.669 3.907 4.125 4.231 4.432 4.631 4.924 5.101 5.277 5.543 5.793 6.017 6.219 6.425 6.7 6.953 7.21 7.54 7.848 8.143 8.472 8.835 9.219 9.63 10.034 10.45 10.914 11.456 12.067 12.673 13.34 14.079 14.951 15.907 16.974 18.083 19.188 19.825 20.045 20.021 19.895 19.716 19.47 19.214 18.965 18.672 18.397 18.154 17.911 17.675 17.465 17.263 17.044 16.848 16.674 16.483 16.293 16.142 15.964 15.767 15.618 15.455 15.282 15.101 14.917 14.796 14.655 14.435 14.284 14.126 14.046 13.871 13.684 13.497 13.399 12.895 13.06 12.934 12.805 12.509 12.362 12.222 12.07 11.898 11.684 11.365 10.645 -7 ,16344 ,KEBNE ,16722158,Sat Nov 27 22:27:28 CET,Sun Nov 28 00:22:29 CET,0.0 0.599 0.869 1.09 1.306 1.502 1.679 1.828 2.097 2.227 2.352 2.181 2.705 2.819 3.028 3.237 3.455 3.56 3.745 3.914 4.173 4.345 4.514 4.747 4.971 5.198 5.423 5.649 5.933 6.2 6.473 6.8 7.105 7.4 7.736 8.112 8.467 8.835 9.245 9.693 10.162 10.689 11.294 11.891 12.587 13.346 14.144 15.034 16.048 17.122 18.321 19.067 19.279 19.271 19.134 18.901 18.65 18.401 18.14 17.848 17.578 17.326 17.103 16.892 16.657 16.422 16.184 15.972 15.774 15.567 15.37 15.194 15.007 14.814 14.662 14.516 14.359 14.185 14.003 13.876 13.743 13.527 13.372 13.206 13.126 12.973 12.798 12.597 12.489 11.996 12.198 12.088 11.974 11.739 11.608 11.467 11.313 11.144 10.952 10.702 10.264 -8 ,510 ,KEBNE ,16722159,Sat Nov 27 22:28:37 CET,Sun Nov 28 00:18:36 CET,0.0 0.592 0.883 1.139 1.359 1.542 1.697 1.858 2.17 2.306 2.432 2.267 2.804 2.933 3.183 3.417 3.623 3.721 3.918 4.115 4.399 4.578 4.758 5.025 5.286 5.541 5.774 6.004 6.306 6.586 6.85 7.165 7.481 7.79 8.124 8.482 8.839 9.224 9.616 10.052 10.515 11.03 11.637 12.213 12.878 13.628 14.468 15.384 16.379 17.404 18.481 19.158 19.347 19.33 19.208 19.033 18.829 18.576 18.331 18.07 17.831 17.601 17.353 17.099 16.869 16.667 16.456 16.252 16.06 15.856 15.661 15.493 15.305 15.12 14.962 14.795 14.63 14.452 14.267 14.139 14.01 13.807 13.657 13.494 13.408 13.227 13.047 12.864 12.76 12.258 12.432 12.301 12.169 11.92 11.778 11.615 11.436 11.245 11.027 10.672 9.814 -9 ,11844 ,KEBNE ,16722160,Sat Nov 27 22:28:37 CET,Sun Nov 28 00:18:22 CET,0.0 0.616 0.878 1.06 1.249 1.439 1.596 1.744 2.035 2.163 2.287 2.133 2.658 2.788 3.047 3.277 3.486 3.582 3.766 3.957 4.224 4.39 4.555 4.79 5.017 5.247 5.482 5.692 5.964 6.247 6.519 6.855 7.18 7.493 7.852 8.223 8.564 8.946 9.364 9.808 10.275 10.785 11.381 11.991 12.686 13.448 14.285 15.168 16.174 17.3 18.495 19.255 19.463 19.435 19.3 19.09 18.858 18.614 18.364 18.088 17.83 17.587 17.348 17.126 16.902 16.661 16.4 16.175 15.996 15.814 15.62 15.458 15.292 15.097 14.922 14.744 14.575 14.418 14.239 14.108 13.988 13.79 13.643 13.483 13.398 13.231 13.06 12.886 12.798 12.308 12.508 12.394 12.263 11.975 11.834 11.693 11.533 11.362 11.15 10.893 10.462 -10 ,20354 ,KEBNE ,16722161,Sat Nov 27 22:30:32 CET,Sun Nov 28 00:23:20 CET,0.0 0.66 0.958 1.175 1.366 1.548 1.714 1.878 2.196 2.344 2.479 2.312 2.845 2.964 3.183 3.394 3.602 3.701 3.889 4.081 4.359 4.524 4.681 4.918 5.145 5.362 5.584 5.799 6.068 6.325 6.58 6.895 7.181 7.452 7.761 8.113 8.47 8.85 9.244 9.676 10.119 10.584 11.148 11.736 12.381 13.083 13.886 14.737 15.705 16.772 17.856 18.506 18.702 18.661 18.512 18.315 18.082 17.817 17.567 17.301 17.028 16.76 16.513 16.288 16.085 15.908 15.714 15.529 15.365 15.196 15.014 14.861 14.704 14.536 14.404 14.255 14.092 13.931 13.776 13.666 13.539 13.339 13.206 13.061 12.988 12.838 12.675 12.519 12.431 11.945 12.154 12.052 11.95 11.707 11.586 11.46 11.302 11.134 10.938 10.676 10.11 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 08dc9ddf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27661 ,KEBNE ,16722162,Sat Nov 27 22:30:32 CET,Sun Nov 28 00:31:10 CET,0.0 2.126 2.755 3.188 3.518 3.812 4.09 4.352 4.796 4.988 5.177 5.106 5.716 5.887 6.189 6.476 6.744 6.871 7.122 7.363 7.717 7.944 8.16 8.48 8.804 9.121 9.432 9.732 10.1 10.46 10.815 11.242 11.651 12.04 12.487 12.98 13.455 14.003 14.624 15.3 15.977 16.718 17.589 18.484 19.557 20.757 22.153 23.747 25.673 27.892 30.419 32.409 33.462 34.019 34.298 34.353 34.273 34.195 34.088 33.934 33.738 33.519 33.326 33.1 32.841 32.596 32.344 32.118 31.896 31.655 31.397 31.17 30.942 30.704 30.511 30.309 30.077 29.829 29.563 29.382 29.208 28.931 28.73 28.501 28.378 28.121 27.816 27.466 27.298 26.732 26.724 26.498 26.266 25.769 25.5 25.171 24.769 24.314 23.752 22.911 19.415 -2 ,14328 ,KEBNE ,16722163,Sat Nov 27 22:30:32 CET,Sun Nov 28 00:31:27 CET,0.0 2.599 3.202 3.638 4.016 4.333 4.587 4.818 5.261 5.471 5.668 5.593 6.194 6.348 6.641 6.934 7.21 7.342 7.6 7.839 8.185 8.409 8.619 8.917 9.206 9.494 9.784 10.062 10.416 10.76 11.09 11.481 11.861 12.247 12.71 13.217 13.688 14.218 14.802 15.401 16.01 16.723 17.56 18.418 19.487 20.698 22.034 23.513 25.315 27.488 29.909 31.779 32.851 33.46 33.73 33.805 33.782 33.695 33.535 33.265 32.985 32.763 32.57 32.353 32.103 31.828 31.519 31.241 31.004 30.758 30.509 30.296 30.071 29.853 29.669 29.473 29.276 29.058 28.802 28.596 28.394 28.09 27.851 27.587 27.46 27.222 26.947 26.633 26.471 25.89 25.935 25.746 25.533 25.045 24.764 24.425 24.0 23.517 22.868 21.941 17.782 -3 ,30035 ,KEBNE ,16722164,Sat Nov 27 22:30:32 CET,Sun Nov 28 00:32:09 CET,0.0 2.502 3.14 3.582 3.966 4.287 4.547 4.786 5.242 5.463 5.669 5.601 6.214 6.376 6.679 6.968 7.249 7.387 7.648 7.903 8.283 8.515 8.731 9.045 9.34 9.628 9.911 10.194 10.568 10.913 11.256 11.671 12.07 12.466 12.929 13.425 13.901 14.442 15.038 15.7 16.392 17.177 18.08 18.957 20.011 21.212 22.551 24.042 25.833 28.102 30.874 32.886 33.909 34.453 34.677 34.723 34.676 34.514 34.291 34.005 33.745 33.496 33.214 32.923 32.656 32.38 32.073 31.807 31.562 31.308 31.038 30.803 30.546 30.271 30.06 29.842 29.603 29.336 29.063 28.878 28.68 28.365 28.139 27.88 27.733 27.436 27.129 26.795 26.624 26.042 26.089 25.866 25.596 24.952 24.604 24.244 23.826 23.35 22.799 21.919 18.405 -5 ,24472 ,KEBNE ,16722166,Sat Nov 27 22:32:38 CET,Sun Nov 28 00:38:23 CET,0.0 3.138 3.772 4.199 4.54 4.831 5.078 5.297 5.719 5.929 6.134 6.083 6.691 6.854 7.173 7.472 7.746 7.874 8.122 8.361 8.708 8.936 9.154 9.457 9.748 10.034 10.315 10.593 10.944 11.278 11.621 12.044 12.445 12.84 13.285 13.775 14.261 14.8 15.384 16.01 16.664 17.401 18.253 19.11 20.142 21.316 22.734 24.404 26.336 28.536 31.154 33.252 34.327 34.899 35.213 35.342 35.359 35.327 35.249 35.11 34.951 34.789 34.588 34.367 34.145 33.907 33.649 33.428 33.235 33.035 32.82 32.612 32.39 32.143 31.924 31.716 31.507 31.275 31.026 30.848 30.656 30.317 30.059 29.811 29.688 29.403 29.096 28.747 28.542 27.951 27.966 27.722 27.461 26.898 26.586 26.248 25.807 25.28 24.685 23.782 20.335 -6 ,3610 ,KEBNE ,16722167,Sat Nov 27 22:35:42 CET,Sun Nov 28 00:34:43 CET,0.0 2.574 3.229 3.678 4.057 4.391 4.675 4.922 5.35 5.543 5.735 5.656 6.272 6.445 6.778 7.086 7.379 7.523 7.805 8.06 8.424 8.675 8.916 9.247 9.573 9.892 10.18 10.447 10.807 11.15 11.478 11.894 12.301 12.678 13.114 13.6 14.067 14.588 15.162 15.808 16.486 17.24 18.126 19.032 20.094 21.25 22.597 24.168 26.03 28.222 30.913 33.12 34.31 34.925 35.241 35.415 35.459 35.417 35.315 35.156 34.992 34.817 34.622 34.394 34.157 33.943 33.686 33.422 33.192 32.952 32.691 32.462 32.214 31.958 31.747 31.524 31.298 31.052 30.778 30.584 30.371 30.002 29.748 29.491 29.347 29.066 28.794 28.489 28.326 27.74 27.754 27.528 27.281 26.729 26.407 26.039 25.652 25.2 24.575 23.689 19.067 -7 ,1889 ,KEBNE ,16722168,Sat Nov 27 22:37:41 CET,Sun Nov 28 00:37:35 CET,0.0 2.744 3.334 3.746 4.085 4.392 4.666 4.925 5.388 5.585 5.769 5.696 6.292 6.455 6.767 7.052 7.322 7.453 7.707 7.944 8.294 8.524 8.742 9.057 9.375 9.685 9.975 10.254 10.623 10.975 11.317 11.752 12.172 12.576 13.044 13.56 14.065 14.614 15.202 15.835 16.514 17.311 18.21 19.086 20.139 21.351 22.772 24.361 26.276 28.608 31.383 33.591 34.749 35.388 35.717 35.838 35.841 35.777 35.686 35.548 35.364 35.167 34.979 34.789 34.592 34.401 34.183 33.956 33.732 33.479 33.192 32.949 32.709 32.45 32.252 32.041 31.792 31.532 31.267 31.075 30.871 30.536 30.283 30.01 29.869 29.585 29.269 28.937 28.771 28.171 28.169 27.94 27.681 27.134 26.828 26.465 26.07 25.632 25.095 24.303 18.467 -8 ,28956 ,KEBNE ,16722169,Sat Nov 27 22:38:42 CET,Sun Nov 28 00:39:28 CET,0.0 3.675 4.297 4.694 5.019 5.326 5.607 5.849 6.303 6.514 6.713 6.63 7.234 7.396 7.716 8.021 8.311 8.446 8.704 8.958 9.313 9.538 9.765 10.089 10.4 10.713 11.008 11.3 11.688 12.052 12.404 12.83 13.235 13.629 14.094 14.629 15.13 15.687 16.272 16.88 17.56 18.335 19.21 20.083 21.141 22.346 23.733 25.333 27.204 29.355 32.173 34.321 35.257 35.74 35.972 36.091 36.088 36.007 35.863 35.625 35.415 35.202 34.956 34.71 34.457 34.198 33.916 33.651 33.405 33.14 32.84 32.597 32.359 32.108 31.904 31.672 31.427 31.178 30.917 30.725 30.512 30.178 29.951 29.71 29.572 29.294 29.028 28.723 28.541 27.957 27.952 27.718 27.465 26.893 26.559 26.149 25.694 25.212 24.609 23.741 20.226 -9 ,6159 ,KEBNE ,16722170,Sat Nov 27 22:38:43 CET,Sun Nov 28 00:38:45 CET,0.0 2.734 3.336 3.787 4.187 4.53 4.825 5.072 5.533 5.76 5.969 5.914 6.538 6.708 7.037 7.353 7.642 7.788 8.08 8.346 8.719 8.964 9.208 9.558 9.885 10.217 10.533 10.82 11.187 11.552 11.915 12.337 12.731 13.105 13.552 14.063 14.552 15.104 15.695 16.328 17.007 17.75 18.637 19.556 20.66 21.908 23.342 24.996 26.933 29.238 32.144 34.548 35.815 36.537 36.998 37.259 37.391 37.413 37.36 37.227 37.055 36.891 36.711 36.521 36.317 36.111 35.878 35.657 35.482 35.301 35.099 34.929 34.73 34.502 34.32 34.119 33.903 33.689 33.473 33.314 33.132 32.828 32.613 32.399 32.283 32.012 31.736 31.442 31.279 30.697 30.756 30.572 30.354 29.814 29.485 29.124 28.744 28.31 27.767 27.056 23.854 -10 ,2224 ,KEBNE ,16722171,Sat Nov 27 22:38:42 CET,Sun Nov 28 00:39:06 CET,0.0 2.301 2.94 3.414 3.799 4.109 4.384 4.634 5.097 5.302 5.502 5.432 6.044 6.209 6.528 6.827 7.106 7.24 7.513 7.786 8.171 8.405 8.642 8.999 9.325 9.635 9.938 10.222 10.594 10.963 11.318 11.729 12.132 12.532 12.98 13.469 13.961 14.532 15.138 15.782 16.471 17.226 18.094 18.998 20.104 21.379 22.829 24.449 26.419 28.8 31.701 34.161 35.599 36.402 36.809 37.044 37.162 37.171 37.136 37.072 36.973 36.838 36.68 36.52 36.353 36.173 35.97 35.78 35.618 35.438 35.234 35.06 34.855 34.621 34.437 34.25 34.045 33.817 33.57 33.399 33.226 32.961 32.761 32.541 32.426 32.191 31.934 31.599 31.419 30.846 30.91 30.714 30.506 30.05 29.781 29.496 29.177 28.795 28.342 27.683 24.514 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt deleted file mode 100644 index 265ea7fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29076 ,KEBNE ,16722172,Sat Nov 27 22:38:42 CET,Sun Nov 28 00:40:56 CET,0.0 2.938 3.562 3.979 4.332 4.63 4.873 5.094 5.491 5.652 5.813 5.699 6.27 6.397 6.638 6.848 7.041 7.137 7.309 7.465 7.703 7.848 7.98 8.176 8.372 8.552 8.715 8.869 9.066 9.263 9.446 9.648 9.824 10.005 10.228 10.454 10.648 10.86 11.078 11.298 11.527 11.751 12.029 12.313 12.559 12.8 13.007 13.088 12.973 12.4 11.25 9.623 7.953 6.375 4.939 3.685 2.574 1.526 0.61 -0.314 -1.098 -1.801 -2.481 -3.133 -3.73 -4.261 -4.82 -5.352 -5.81 -6.27 -6.745 -7.134 -7.529 -7.95 -8.286 -8.636 -9.011 -9.401 -9.803 -10.07 -10.335 -10.774 -11.079 -11.399 -11.571 -11.923 -12.298 -12.683 -12.878 -13.527 -13.529 -13.765 -14.028 -14.64 -14.993 -15.392 -15.829 -16.337 -16.951 -17.818 -22.603 -2 ,15140 ,KEBNE ,16722173,Sat Nov 27 22:38:42 CET,Sun Nov 28 00:39:33 CET,0.0 2.082 2.654 3.064 3.382 3.639 3.873 4.082 4.448 4.61 4.755 4.583 5.152 5.281 5.518 5.725 5.909 5.994 6.169 6.343 6.574 6.719 6.861 7.066 7.26 7.439 7.607 7.773 7.989 8.192 8.372 8.57 8.758 8.951 9.165 9.387 9.6 9.812 10.02 10.234 10.458 10.694 10.931 11.144 11.411 11.681 11.91 12.06 12.061 11.797 11.015 9.692 8.409 7.233 6.196 5.285 4.459 3.666 2.949 2.223 1.603 1.022 0.436 -0.124 -0.652 -1.13 -1.634 -2.091 -2.508 -2.952 -3.403 -3.788 -4.211 -4.679 -5.046 -5.419 -5.803 -6.2 -6.63 -6.924 -7.216 -7.7 -8.047 -8.401 -8.584 -8.968 -9.379 -9.806 -10.035 -10.74 -10.8 -11.078 -11.366 -11.977 -12.318 -12.698 -13.122 -13.598 -14.168 -15.02 -18.435 -6 ,9414 ,KEBNE ,16722177,Sat Nov 27 22:38:42 CET,Sun Nov 28 00:39:30 CET,0.0 3.186 3.757 4.164 4.496 4.789 5.063 5.312 5.715 5.885 6.049 5.916 6.481 6.602 6.82 7.038 7.235 7.324 7.503 7.679 7.931 8.095 8.251 8.459 8.653 8.836 9.008 9.168 9.363 9.553 9.735 9.942 10.13 10.316 10.532 10.773 11.003 11.233 11.48 11.741 11.988 12.252 12.554 12.83 13.103 13.316 13.508 13.686 13.74 13.507 12.686 11.345 10.103 9.001 7.963 6.959 6.06 5.255 4.551 3.837 3.216 2.657 2.099 1.56 1.096 0.673 0.225 -0.177 -0.54 -0.921 -1.335 -1.686 -2.039 -2.405 -2.705 -3.002 -3.308 -3.63 -3.956 -4.19 -4.434 -4.825 -5.097 -5.376 -5.523 -5.831 -6.163 -6.491 -6.661 -7.312 -7.288 -7.496 -7.727 -8.278 -8.603 -8.971 -9.369 -9.825 -10.365 -11.118 -14.003 -7 ,25231 ,KEBNE ,16722178,Sat Nov 27 22:38:42 CET,Sun Nov 28 00:40:22 CET,0.0 2.479 3.079 3.486 3.816 4.103 4.369 4.598 4.976 5.142 5.296 5.138 5.711 5.841 6.08 6.302 6.507 6.609 6.804 6.975 7.216 7.365 7.51 7.722 7.924 8.106 8.279 8.445 8.652 8.848 9.031 9.256 9.461 9.644 9.876 10.152 10.395 10.621 10.845 11.082 11.323 11.573 11.814 12.011 12.216 12.393 12.502 12.444 12.164 11.609 10.308 8.346 6.511 4.869 3.429 2.152 1.055 0.044 -0.86 -1.767 -2.551 -3.261 -3.938 -4.591 -5.176 -5.701 -6.266 -6.771 -7.211 -7.672 -8.177 -8.584 -8.98 -9.396 -9.731 -10.084 -10.45 -10.835 -11.24 -11.523 -11.805 -12.253 -12.563 -12.871 -13.038 -13.388 -13.763 -14.182 -14.394 -15.062 -15.086 -15.332 -15.586 -16.165 -16.503 -16.867 -17.263 -17.741 -18.31 -19.095 -22.429 -8 ,5317 ,KEBNE ,16722179,Sat Nov 27 22:38:42 CET,Sun Nov 28 00:39:29 CET,0.0 3.369 3.896 4.308 4.648 4.916 5.145 5.355 5.721 5.897 6.06 5.908 6.475 6.596 6.823 7.052 7.266 7.363 7.556 7.727 7.97 8.136 8.298 8.531 8.75 8.946 9.117 9.271 9.477 9.685 9.875 10.087 10.283 10.483 10.708 10.935 11.148 11.385 11.632 11.867 12.087 12.308 12.544 12.778 13.037 13.28 13.505 13.651 13.65 13.372 12.586 11.326 10.142 9.017 7.945 6.92 6.013 5.216 4.498 3.753 3.085 2.465 1.876 1.328 0.828 0.377 -0.123 -0.581 -0.972 -1.38 -1.797 -2.129 -2.486 -2.865 -3.148 -3.446 -3.768 -4.094 -4.432 -4.679 -4.957 -5.397 -5.682 -5.97 -6.118 -6.43 -6.755 -7.099 -7.287 -7.933 -7.916 -8.143 -8.385 -8.941 -9.26 -9.603 -9.976 -10.416 -10.955 -11.724 -15.555 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 88bd7b15..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,23429 ,KEBNE ,16722183,Sat Nov 27 22:39:44 CET,Sun Nov 28 00:41:16 CET,0.0 1.905 2.506 2.937 3.293 3.607 3.892 4.153 4.626 4.838 5.046 5.003 5.646 5.825 6.167 6.478 6.78 6.93 7.214 7.492 7.886 8.128 8.38 8.761 9.108 9.437 9.76 10.081 10.497 10.894 11.289 11.767 12.215 12.662 13.184 13.766 14.342 14.986 15.693 16.451 17.248 18.139 19.211 20.331 21.649 23.209 25.073 27.188 29.729 32.855 36.846 40.362 42.622 44.166 45.218 45.971 46.544 46.959 47.233 47.463 47.598 47.679 47.761 47.827 47.855 47.84 47.791 47.736 47.69 47.649 47.591 47.522 47.435 47.339 47.266 47.181 47.063 46.934 46.804 46.705 46.587 46.392 46.268 46.125 46.05 45.906 45.749 45.564 45.459 44.945 45.102 44.964 44.825 44.488 44.283 44.069 43.814 43.47 43.056 42.478 40.251 -3 ,2765 ,KEBNE ,16722184,Sat Nov 27 22:39:44 CET,Sun Nov 28 00:39:49 CET,0.0 1.973 2.522 2.929 3.272 3.561 3.818 4.055 4.472 4.671 4.868 4.769 5.391 5.553 5.862 6.157 6.447 6.587 6.868 7.136 7.505 7.742 7.987 8.359 8.706 9.045 9.376 9.704 10.131 10.541 10.942 11.433 11.901 12.347 12.876 13.472 14.032 14.646 15.347 16.122 16.926 17.847 18.957 20.117 21.51 23.047 24.839 26.93 29.417 32.549 36.588 40.033 42.145 43.432 44.329 45.065 45.507 45.787 46.008 46.209 46.354 46.455 46.54 46.581 46.619 46.657 46.648 46.614 46.589 46.551 46.491 46.436 46.354 46.232 46.121 45.991 45.86 45.73 45.564 45.439 45.311 45.1 44.938 44.766 44.678 44.483 44.277 44.051 43.922 43.391 43.549 43.407 43.251 42.925 42.726 42.448 42.085 41.635 41.104 40.4 38.338 -4 ,444 ,KEBNE ,16722185,Sat Nov 27 22:40:46 CET,Sun Nov 28 00:41:14 CET,0.0 2.252 2.839 3.28 3.626 3.917 4.183 4.426 4.856 5.059 5.254 5.148 5.765 5.936 6.249 6.548 6.839 6.98 7.252 7.518 7.904 8.154 8.396 8.748 9.091 9.42 9.738 10.04 10.432 10.82 11.207 11.68 12.128 12.57 13.093 13.68 14.26 14.922 15.61 16.348 17.161 18.09 19.194 20.308 21.626 23.142 24.934 27.059 29.652 32.809 36.86 40.429 42.657 44.209 45.342 46.173 46.778 47.227 47.526 47.744 47.813 47.813 47.818 47.831 47.844 47.846 47.844 47.836 47.81 47.755 47.685 47.625 47.564 47.483 47.399 47.315 47.235 47.144 47.027 46.935 46.844 46.708 46.599 46.47 46.402 46.255 46.099 45.933 45.844 45.337 45.514 45.382 45.238 44.934 44.756 44.545 44.313 44.057 43.729 43.224 41.431 -5 ,19877 ,KEBNE ,16722186,Sat Nov 27 22:40:50 CET,Sun Nov 28 00:40:25 CET,0.0 2.095 2.656 3.052 3.376 3.658 3.904 4.144 4.576 4.771 4.954 4.851 5.482 5.661 6.008 6.309 6.587 6.726 7.007 7.27 7.631 7.873 8.116 8.472 8.821 9.153 9.478 9.801 10.218 10.613 11.002 11.475 11.92 12.367 12.909 13.524 14.135 14.791 15.488 16.273 17.093 18.0 19.073 20.183 21.521 23.055 24.834 26.929 29.484 32.677 36.984 40.823 43.214 44.828 46.01 46.878 47.48 47.966 48.273 48.491 48.652 48.776 48.864 48.903 48.907 48.898 48.877 48.851 48.833 48.793 48.73 48.673 48.591 48.492 48.398 48.294 48.19 48.075 47.95 47.856 47.753 47.6 47.499 47.387 47.326 47.202 47.063 46.893 46.798 46.29 46.483 46.363 46.23 45.919 45.732 45.524 45.282 44.969 44.594 44.096 41.58 -6 ,7057 ,KEBNE ,16722187,Sat Nov 27 22:42:49 CET,Sun Nov 28 00:42:47 CET,0.0 2.062 2.623 3.043 3.378 3.653 3.906 4.141 4.596 4.813 5.017 4.942 5.584 5.759 6.101 6.426 6.712 6.849 7.13 7.4 7.79 8.051 8.301 8.652 8.995 9.33 9.66 9.985 10.391 10.785 11.177 11.655 12.125 12.587 13.115 13.693 14.252 14.89 15.596 16.351 17.14 18.052 19.175 20.335 21.707 23.279 25.178 27.371 29.987 33.231 37.281 40.836 43.114 44.664 45.756 46.527 47.099 47.554 47.87 48.119 48.283 48.398 48.468 48.513 48.535 48.524 48.493 48.457 48.412 48.347 48.266 48.19 48.114 48.036 47.956 47.855 47.761 47.666 47.533 47.432 47.33 47.16 47.051 46.92 46.85 46.72 46.575 46.418 46.334 45.828 46.02 45.903 45.776 45.474 45.286 45.072 44.843 44.587 44.275 43.818 41.851 -7 ,2744 ,KEBNE ,16722188,Sat Nov 27 22:42:50 CET,Sun Nov 28 00:43:01 CET,0.0 2.525 3.052 3.464 3.806 4.104 4.381 4.642 5.118 5.327 5.52 5.444 6.085 6.268 6.588 6.879 7.166 7.309 7.589 7.863 8.254 8.505 8.753 9.123 9.488 9.832 10.156 10.473 10.885 11.292 11.69 12.163 12.614 13.053 13.573 14.185 14.78 15.433 16.151 16.91 17.706 18.62 19.731 20.888 22.237 23.759 25.544 27.642 30.197 33.335 37.434 41.014 43.086 44.362 45.256 45.887 46.318 46.627 46.848 46.981 47.042 47.112 47.175 47.22 47.254 47.268 47.265 47.248 47.23 47.204 47.153 47.101 47.021 46.915 46.832 46.744 46.641 46.529 46.412 46.32 46.227 46.084 45.975 45.865 45.805 45.667 45.51 45.334 45.242 44.742 44.943 44.821 44.674 44.344 44.16 43.931 43.66 43.38 43.033 42.47 39.152 -8 ,1093 ,KEBNE ,16722189,Sat Nov 27 22:42:49 CET,Sun Nov 28 00:43:07 CET,0.0 3.165 3.685 4.07 4.415 4.721 4.989 5.217 5.637 5.839 6.03 5.933 6.562 6.734 7.049 7.353 7.645 7.783 8.055 8.312 8.698 8.954 9.191 9.533 9.881 10.204 10.497 10.788 11.176 11.552 11.921 12.384 12.832 13.283 13.819 14.407 14.991 15.642 16.355 17.144 17.979 18.89 19.954 21.067 22.378 23.854 25.597 27.668 30.205 33.26 37.166 40.661 42.833 44.296 45.287 45.965 46.447 46.812 47.071 47.281 47.421 47.52 47.57 47.586 47.597 47.6 47.569 47.518 47.468 47.409 47.336 47.258 47.161 47.052 46.978 46.898 46.806 46.714 46.601 46.513 46.424 46.26 46.133 46.009 45.938 45.776 45.602 45.418 45.325 44.82 44.999 44.875 44.743 44.463 44.3 44.1 43.88 43.603 43.253 42.786 40.691 -10 ,15403 ,KEBNE ,16722191,Sat Nov 27 22:43:55 CET,Sun Nov 28 00:36:48 CET,0.0 1.931 2.538 2.963 3.307 3.608 3.894 4.179 4.67 4.886 5.089 5.009 5.655 5.836 6.18 6.504 6.798 6.945 7.227 7.493 7.897 8.16 8.415 8.794 9.152 9.502 9.846 10.173 10.588 10.996 11.405 11.902 12.372 12.83 13.361 13.961 14.538 15.166 15.857 16.6 17.398 18.324 19.436 20.575 21.923 23.448 25.223 27.313 29.884 33.018 36.909 40.394 42.652 44.157 45.22 45.968 46.519 46.968 47.281 47.534 47.714 47.817 47.863 47.905 47.936 47.94 47.926 47.881 47.83 47.781 47.722 47.673 47.611 47.538 47.471 47.396 47.314 47.215 47.102 47.012 46.913 46.739 46.619 46.506 46.445 46.303 46.132 45.956 45.858 45.347 45.526 45.4 45.257 44.934 44.738 44.492 44.226 43.933 43.579 43.05 40.881 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt deleted file mode 100644 index 523de582..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16977 ,KEBNE ,17026164,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:53:21 CET,0.0 2.101 2.719 3.195 3.59 3.934 4.24 4.524 5.031 5.264 5.48 5.416 6.078 6.265 6.613 6.949 7.283 7.446 7.749 8.04 8.469 8.761 9.041 9.431 9.812 10.178 10.532 10.89 11.357 11.798 12.23 12.764 13.296 13.82 14.424 15.087 15.722 16.439 17.206 18.056 18.978 20.003 21.229 22.486 23.965 25.612 27.543 29.834 32.695 36.219 40.769 44.908 47.531 49.316 50.579 51.572 52.301 52.812 53.19 53.515 53.74 53.916 54.065 54.175 54.258 54.31 54.334 54.331 54.314 54.29 54.242 54.187 54.128 54.06 53.991 53.911 53.835 53.741 53.624 53.543 53.456 53.3 53.195 53.095 53.034 52.892 52.747 52.572 52.468 51.942 52.103 51.978 51.837 51.524 51.327 51.105 50.853 50.521 50.138 49.644 46.619 -2 ,24901 ,KEBNE ,17026165,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:52:45 CET,0.0 2.11 2.737 3.194 3.569 3.901 4.199 4.461 4.936 5.168 5.385 5.322 5.977 6.162 6.508 6.842 7.168 7.331 7.643 7.933 8.355 8.634 8.906 9.288 9.653 10.01 10.359 10.703 11.145 11.563 11.98 12.501 13.003 13.492 14.072 14.721 15.33 16.024 16.806 17.634 18.504 19.499 20.725 21.976 23.441 25.176 27.234 29.614 32.463 35.917 40.359 44.372 46.987 48.734 49.909 50.797 51.43 51.866 52.186 52.445 52.603 52.724 52.822 52.882 52.914 52.92 52.912 52.904 52.888 52.857 52.806 52.757 52.687 52.587 52.504 52.418 52.306 52.18 52.061 51.981 51.893 51.728 51.602 51.452 51.374 51.228 51.06 50.869 50.765 50.255 50.43 50.301 50.135 49.75 49.547 49.325 49.032 48.671 48.237 47.608 45.311 -3 ,8043 ,KEBNE ,17026166,Wed Dec 22 13:51:41 CET,Wed Dec 22 15:52:50 CET,0.0 2.649 3.284 3.746 4.142 4.476 4.762 5.047 5.577 5.809 6.033 6.01 6.66 6.851 7.206 7.548 7.881 8.041 8.345 8.645 9.075 9.346 9.611 9.989 10.351 10.71 11.062 11.404 11.833 12.249 12.667 13.168 13.65 14.117 14.67 15.307 15.928 16.632 17.403 18.238 19.133 20.163 21.402 22.683 24.211 25.907 27.884 30.205 33.005 36.516 41.052 45.134 47.695 49.407 50.672 51.628 52.343 52.889 53.276 53.581 53.793 53.97 54.114 54.21 54.289 54.317 54.302 54.291 54.259 54.217 54.175 54.128 54.075 54.026 53.976 53.897 53.816 53.73 53.618 53.536 53.449 53.292 53.179 53.064 53.004 52.869 52.707 52.53 52.436 51.927 52.108 51.984 51.847 51.544 51.356 51.137 50.884 50.564 50.151 49.601 47.395 -4 ,30370 ,KEBNE ,17026167,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:53:12 CET,0.0 2.361 2.937 3.395 3.766 4.076 4.36 4.614 5.083 5.292 5.499 5.458 6.115 6.306 6.665 6.994 7.306 7.461 7.762 8.049 8.466 8.74 9.005 9.392 9.761 10.113 10.46 10.798 11.245 11.692 12.142 12.687 13.199 13.707 14.309 14.988 15.634 16.335 17.114 17.981 18.882 19.896 21.129 22.422 23.963 25.704 27.791 30.24 33.182 36.731 41.149 45.132 47.695 49.407 50.621 51.526 52.176 52.674 53.028 53.266 53.388 53.434 53.471 53.511 53.542 53.575 53.598 53.61 53.604 53.575 53.519 53.456 53.394 53.334 53.281 53.221 53.145 53.053 52.954 52.882 52.805 52.675 52.584 52.47 52.407 52.293 52.158 52.006 51.924 51.423 51.619 51.501 51.362 51.036 50.841 50.625 50.39 50.095 49.692 49.11 46.465 -5 ,17479 ,KEBNE ,17026168,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:54:51 CET,0.0 3.028 3.61 4.067 4.492 4.87 5.181 5.476 6.015 6.246 6.467 6.414 7.055 7.24 7.612 7.963 8.29 8.449 8.772 9.089 9.533 9.807 10.067 10.453 10.827 11.197 11.56 11.915 12.378 12.828 13.269 13.788 14.278 14.768 15.344 16.001 16.664 17.384 18.149 18.966 19.838 20.851 22.051 23.268 24.707 26.358 28.286 30.555 33.33 36.719 41.061 45.021 47.598 49.408 50.669 51.541 52.149 52.626 52.965 53.221 53.393 53.52 53.631 53.695 53.696 53.641 53.549 53.463 53.379 53.288 53.197 53.111 53.006 52.903 52.825 52.738 52.64 52.522 52.373 52.273 52.185 52.025 51.894 51.759 51.681 51.506 51.326 51.115 51.008 50.505 50.679 50.549 50.409 50.101 49.935 49.727 49.475 49.191 48.824 48.249 46.058 -6 ,7649 ,KEBNE ,17026169,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:54:18 CET,0.0 2.477 3.092 3.563 3.933 4.252 4.542 4.798 5.258 5.485 5.702 5.659 6.305 6.482 6.836 7.189 7.514 7.666 7.97 8.272 8.704 8.978 9.241 9.619 9.992 10.357 10.706 11.048 11.49 11.923 12.349 12.873 13.377 13.86 14.448 15.099 15.719 16.423 17.176 17.977 18.828 19.822 21.024 22.259 23.739 25.427 27.425 29.723 32.528 36.088 40.648 44.774 47.303 48.96 50.153 51.012 51.624 52.101 52.456 52.73 52.916 53.041 53.143 53.23 53.264 53.274 53.277 53.256 53.224 53.177 53.117 53.052 52.978 52.903 52.834 52.759 52.663 52.536 52.39 52.284 52.175 52.01 51.899 51.779 51.71 51.567 51.403 51.21 51.115 50.613 50.78 50.65 50.514 50.226 50.055 49.846 49.613 49.33 48.959 48.444 46.033 -7 ,15583 ,KEBNE ,17026170,Wed Dec 22 13:51:42 CET,Wed Dec 22 15:52:58 CET,0.0 2.871 3.424 3.825 4.189 4.536 4.83 5.088 5.545 5.749 5.947 5.877 6.51 6.688 7.032 7.352 7.662 7.813 8.103 8.387 8.797 9.065 9.323 9.695 10.065 10.427 10.776 11.126 11.563 11.974 12.384 12.868 13.342 13.824 14.384 15.006 15.623 16.323 17.078 17.87 18.719 19.698 20.862 22.048 23.481 25.14 27.085 29.311 31.963 35.275 39.595 43.303 45.577 47.141 48.234 49.064 49.667 50.098 50.34 50.455 50.504 50.53 50.559 50.61 50.662 50.691 50.705 50.687 50.644 50.596 50.547 50.492 50.433 50.359 50.296 50.228 50.144 50.049 49.933 49.845 49.757 49.614 49.509 49.392 49.33 49.207 49.079 48.921 48.818 48.296 48.504 48.395 48.27 47.986 47.808 47.604 47.375 47.098 46.74 46.197 44.022 -8 ,24308 ,KEBNE ,17026171,Wed Dec 22 13:52:44 CET,Wed Dec 22 15:53:40 CET,0.0 2.46 3.093 3.587 4.006 4.348 4.635 4.898 5.367 5.585 5.796 5.754 6.382 6.554 6.883 7.201 7.509 7.656 7.936 8.199 8.576 8.818 9.059 9.432 9.806 10.173 10.516 10.835 11.245 11.651 12.058 12.561 13.053 13.536 14.109 14.761 15.388 16.067 16.818 17.639 18.502 19.482 20.657 21.844 23.27 24.918 26.832 29.096 31.881 35.344 39.866 43.802 46.256 47.903 48.968 49.788 50.422 50.922 51.3 51.602 51.81 51.946 52.043 52.133 52.219 52.271 52.296 52.297 52.287 52.273 52.244 52.197 52.132 52.066 52.017 51.953 51.858 51.75 51.643 51.56 51.466 51.314 51.192 51.061 50.991 50.824 50.645 50.478 50.384 49.864 50.015 49.878 49.73 49.399 49.208 48.982 48.711 48.394 47.994 47.426 44.288 -9 ,21527 ,KEBNE ,17026172,Wed Dec 22 13:52:44 CET,Wed Dec 22 15:54:38 CET,0.0 2.314 2.967 3.451 3.822 4.155 4.459 4.738 5.218 5.43 5.65 5.625 6.276 6.47 6.826 7.164 7.488 7.641 7.939 8.239 8.677 8.961 9.228 9.614 9.991 10.35 10.7 11.029 11.45 11.871 12.285 12.795 13.289 13.771 14.358 15.004 15.609 16.286 17.021 17.82 18.7 19.705 20.87 22.06 23.511 25.181 27.14 29.384 32.158 35.661 40.182 44.195 46.671 48.379 49.595 50.458 51.083 51.558 51.903 52.198 52.41 52.582 52.716 52.803 52.849 52.849 52.824 52.803 52.787 52.752 52.69 52.631 52.552 52.456 52.378 52.296 52.197 52.076 51.938 51.837 51.731 51.546 51.394 51.243 51.179 51.033 50.856 50.657 50.554 50.049 50.199 50.06 49.909 49.551 49.348 49.138 48.893 48.606 48.253 47.717 45.469 -10 ,18456 ,KEBNE ,17026173,Wed Dec 22 13:52:47 CET,Wed Dec 22 15:50:29 CET,0.0 2.939 3.58 4.05 4.422 4.738 5.027 5.291 5.788 6.023 6.242 6.225 6.869 7.046 7.392 7.718 8.041 8.193 8.478 8.756 9.182 9.454 9.705 10.076 10.433 10.778 11.128 11.481 11.935 12.369 12.793 13.294 13.767 14.239 14.81 15.465 16.105 16.804 17.563 18.383 19.245 20.234 21.44 22.673 24.098 25.737 27.723 30.036 32.802 36.21 40.777 44.912 47.417 49.043 50.205 51.079 51.714 52.232 52.594 52.859 53.051 53.196 53.283 53.343 53.392 53.398 53.397 53.388 53.351 53.293 53.226 53.167 53.093 52.994 52.911 52.825 52.73 52.637 52.537 52.455 52.365 52.204 52.081 51.942 51.874 51.727 51.567 51.396 51.297 50.795 50.953 50.824 50.693 50.361 50.166 49.957 49.72 49.412 49.053 48.511 45.929 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt deleted file mode 100644 index 9e0b1c43..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26059 ,KEBNE ,16722192,Sat Nov 27 22:43:55 CET,Sun Nov 28 00:31:59 CET,0.0 2.072 2.549 2.893 3.184 3.421 3.626 3.81 4.137 4.278 4.421 4.639 4.818 4.935 5.178 5.409 5.607 5.699 5.891 6.081 6.342 6.507 6.663 6.867 7.064 7.246 7.413 7.578 7.785 7.983 8.172 8.381 8.577 8.754 8.94 9.162 9.374 9.583 9.805 10.066 10.31 10.519 10.739 10.908 11.065 11.239 11.39 11.41 11.251 10.798 9.694 8.064 6.571 5.213 4.022 2.957 1.996 1.111 0.335 -0.42 -1.057 -1.66 -2.286 -2.899 -3.442 -3.942 -4.5 -4.98 -5.378 -5.817 -6.311 -6.723 -7.172 -7.63 -7.957 -8.305 -8.664 -9.03 -9.41 -9.681 -9.971 -10.427 -10.728 -11.035 -11.209 -11.592 -11.975 -12.383 -12.601 -12.905 -13.325 -13.593 -13.892 -14.546 -14.888 -15.258 -15.712 -16.248 -16.868 -17.642 -20.171 -2 ,30583 ,KEBNE ,16722193,Sat Nov 27 22:44:52 CET,Sun Nov 28 00:41:18 CET,0.0 2.515 3.012 3.387 3.68 3.946 4.22 4.48 4.875 5.044 5.202 5.407 5.595 5.724 5.943 6.121 6.285 6.366 6.525 6.692 6.928 7.073 7.21 7.401 7.589 7.773 7.94 8.1 8.301 8.481 8.66 8.883 9.095 9.308 9.555 9.818 10.055 10.319 10.599 10.881 11.161 11.442 11.748 12.031 12.301 12.529 12.758 13.001 13.193 13.114 12.603 11.587 10.391 9.215 8.157 7.172 6.286 5.466 4.7 3.87 3.118 2.438 1.776 1.149 0.572 0.041 -0.512 -1.011 -1.464 -1.918 -2.371 -2.782 -3.219 -3.653 -4.009 -4.379 -4.739 -5.097 -5.478 -5.745 -6.013 -6.448 -6.781 -7.121 -7.285 -7.638 -8.011 -8.393 -8.595 -8.891 -9.28 -9.535 -9.793 -10.358 -10.681 -11.059 -11.51 -12.019 -12.613 -13.425 -16.879 -3 ,23220 ,KEBNE ,16722194,Sat Nov 27 22:44:52 CET,Sun Nov 28 00:40:24 CET,0.0 3.178 3.76 4.119 4.408 4.654 4.856 5.038 5.391 5.549 5.681 5.863 6.053 6.169 6.401 6.606 6.791 6.883 7.053 7.209 7.451 7.61 7.752 7.954 8.146 8.335 8.518 8.681 8.872 9.06 9.236 9.45 9.662 9.864 10.097 10.353 10.59 10.835 11.094 11.345 11.583 11.867 12.184 12.488 12.816 13.02 13.122 13.232 13.264 13.01 11.909 10.165 8.654 7.268 5.981 4.787 3.693 2.659 1.783 0.944 0.2 -0.501 -1.188 -1.816 -2.367 -2.846 -3.357 -3.846 -4.264 -4.701 -5.171 -5.564 -5.979 -6.405 -6.736 -7.087 -7.463 -7.857 -8.272 -8.557 -8.855 -9.341 -9.672 -10.022 -10.213 -10.598 -10.99 -11.403 -11.612 -11.912 -12.28 -12.531 -12.822 -13.458 -13.796 -14.175 -14.585 -15.054 -15.606 -16.325 -19.25 -4 ,27676 ,KEBNE ,16722195,Sat Nov 27 22:44:52 CET,Sun Nov 28 00:41:17 CET,0.0 2.509 3.111 3.506 3.799 4.041 4.272 4.498 4.884 5.041 5.178 5.384 5.58 5.705 5.94 6.149 6.35 6.454 6.649 6.835 7.088 7.233 7.378 7.598 7.796 7.985 8.18 8.36 8.56 8.738 8.926 9.167 9.39 9.595 9.826 10.111 10.364 10.606 10.868 11.135 11.4 11.689 12.031 12.348 12.677 12.98 13.193 13.381 13.529 13.456 12.937 11.756 10.406 9.164 8.075 7.147 6.294 5.395 4.625 3.857 3.127 2.448 1.796 1.168 0.592 0.044 -0.543 -1.069 -1.528 -1.985 -2.438 -2.813 -3.237 -3.67 -3.996 -4.356 -4.738 -5.133 -5.539 -5.815 -6.109 -6.575 -6.884 -7.201 -7.363 -7.724 -8.131 -8.558 -8.789 -9.106 -9.528 -9.784 -10.061 -10.657 -10.986 -11.362 -11.803 -12.352 -13.037 -13.966 -18.349 -5 ,5848 ,KEBNE ,16722196,Sat Nov 27 22:44:52 CET,Sun Nov 28 00:40:05 CET,0.0 2.81 3.348 3.707 3.99 4.232 4.437 4.613 4.922 5.081 5.24 5.457 5.631 5.745 5.95 6.143 6.341 6.435 6.598 6.754 6.996 7.15 7.298 7.504 7.69 7.86 8.03 8.197 8.393 8.555 8.715 8.915 9.1 9.284 9.479 9.715 9.958 10.235 10.526 10.775 10.995 11.205 11.447 11.683 11.967 12.32 12.687 12.894 12.884 12.667 11.745 10.056 8.47 7.09 5.856 4.649 3.576 2.643 1.743 0.775 -0.012 -0.671 -1.295 -1.9 -2.486 -3.003 -3.525 -4.011 -4.43 -4.843 -5.294 -5.686 -6.113 -6.591 -6.941 -7.276 -7.612 -7.966 -8.346 -8.619 -8.9 -9.332 -9.652 -9.999 -10.176 -10.549 -10.952 -11.369 -11.589 -11.896 -12.246 -12.479 -12.728 -13.312 -13.646 -14.007 -14.394 -14.824 -15.383 -16.239 -19.266 -9 ,24109 ,KEBNE ,16722200,Sat Nov 27 22:44:52 CET,Sun Nov 28 00:40:25 CET,0.0 3.175 3.723 4.103 4.391 4.621 4.839 5.044 5.402 5.561 5.714 5.947 6.136 6.266 6.512 6.736 6.952 7.046 7.222 7.395 7.623 7.772 7.927 8.16 8.378 8.586 8.779 8.952 9.166 9.369 9.561 9.798 10.014 10.21 10.437 10.688 10.937 11.198 11.452 11.718 11.996 12.276 12.561 12.841 13.133 13.385 13.573 13.646 13.528 13.099 11.964 10.139 8.402 6.885 5.593 4.405 3.284 2.215 1.299 0.437 -0.304 -0.962 -1.556 -2.115 -2.655 -3.175 -3.765 -4.306 -4.748 -5.196 -5.669 -6.072 -6.494 -6.932 -7.27 -7.614 -7.976 -8.35 -8.729 -8.997 -9.278 -9.722 -10.036 -10.365 -10.538 -10.896 -11.271 -11.685 -11.906 -12.207 -12.588 -12.834 -13.116 -13.773 -14.118 -14.494 -14.922 -15.404 -16.014 -16.926 -20.392 -10 ,18807 ,KEBNE ,16722201,Sat Nov 27 22:44:52 CET,Sun Nov 28 00:40:02 CET,0.0 2.172 2.771 3.204 3.529 3.808 4.037 4.236 4.588 4.742 4.887 5.09 5.281 5.407 5.633 5.827 6.005 6.094 6.273 6.447 6.703 6.858 6.998 7.21 7.425 7.625 7.807 7.982 8.2 8.401 8.605 8.877 9.131 9.34 9.57 9.846 10.103 10.376 10.657 10.91 11.163 11.43 11.725 12.013 12.308 12.587 12.854 13.028 13.038 12.691 11.573 9.821 8.044 6.424 5.084 3.859 2.765 1.738 0.829 -0.062 -0.837 -1.557 -2.268 -2.921 -3.511 -4.051 -4.635 -5.177 -5.636 -6.11 -6.607 -7.01 -7.422 -7.859 -8.205 -8.576 -8.957 -9.33 -9.734 -10.029 -10.315 -10.766 -11.097 -11.429 -11.604 -11.972 -12.346 -12.736 -12.934 -13.225 -13.584 -13.818 -14.088 -14.685 -15.016 -15.391 -15.81 -16.293 -16.88 -17.711 -20.936 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt deleted file mode 100644 index 36c0bbcb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18464 ,KEBNE ,17026174,Wed Dec 22 13:52:47 CET,Wed Dec 22 15:49:11 CET,0.0 2.204 2.712 3.079 3.371 3.612 3.818 4.009 4.356 4.507 4.646 4.807 4.983 5.094 5.299 5.487 5.661 5.736 5.876 6.007 6.181 6.292 6.407 6.57 6.7 6.811 6.913 7.003 7.116 7.208 7.276 7.353 7.415 7.456 7.502 7.55 7.59 7.614 7.61 7.575 7.503 7.38 7.168 6.895 6.522 5.985 5.153 3.985 2.282 -0.247 -4.351 -9.086 -12.868 -16.072 -18.806 -21.168 -23.175 -24.963 -26.451 -27.874 -29.076 -30.152 -31.152 -32.043 -32.853 -33.594 -34.373 -35.057 -35.636 -36.257 -36.909 -37.461 -38.031 -38.603 -39.042 -39.499 -39.969 -40.442 -40.927 -41.262 -41.603 -42.134 -42.514 -42.911 -43.112 -43.516 -43.953 -44.437 -44.697 -45.078 -45.515 -45.805 -46.114 -46.777 -47.154 -47.591 -48.062 -48.566 -49.204 -50.169 -54.127 -2 ,31291 ,KEBNE ,17026175,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:54:04 CET,0.0 2.156 2.708 3.122 3.439 3.68 3.875 4.063 4.411 4.555 4.684 4.877 5.056 5.178 5.409 5.611 5.799 5.888 6.051 6.197 6.404 6.527 6.639 6.803 6.95 7.077 7.192 7.29 7.407 7.51 7.604 7.702 7.772 7.827 7.879 7.925 7.949 7.964 7.977 7.955 7.865 7.714 7.488 7.2 6.794 6.228 5.392 4.217 2.576 0.124 -3.865 -8.51 -12.29 -15.335 -17.902 -20.21 -22.124 -23.797 -25.199 -26.568 -27.785 -28.855 -29.869 -30.833 -31.699 -32.462 -33.253 -33.968 -34.58 -35.201 -35.831 -36.349 -36.888 -37.449 -37.89 -38.334 -38.782 -39.265 -39.77 -40.105 -40.445 -40.978 -41.342 -41.739 -41.968 -42.424 -42.86 -43.307 -43.551 -43.936 -44.354 -44.627 -44.919 -45.533 -45.883 -46.284 -46.736 -47.281 -47.939 -48.803 -52.682 -3 ,26019 ,KEBNE ,17026176,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:52:30 CET,0.0 1.9 2.388 2.717 2.984 3.231 3.448 3.643 4.052 4.248 4.4 4.609 4.795 4.913 5.133 5.334 5.506 5.585 5.739 5.88 6.086 6.226 6.346 6.497 6.644 6.776 6.896 7.003 7.118 7.212 7.304 7.405 7.481 7.537 7.588 7.632 7.649 7.67 7.669 7.623 7.562 7.477 7.313 7.066 6.687 6.137 5.363 4.324 2.798 0.438 -3.589 -8.43 -12.249 -15.402 -18.083 -20.412 -22.384 -24.132 -25.657 -27.181 -28.455 -29.556 -30.557 -31.473 -32.314 -33.056 -33.826 -34.508 -35.077 -35.671 -36.301 -36.83 -37.377 -37.949 -38.401 -38.86 -39.315 -39.78 -40.269 -40.599 -40.945 -41.492 -41.866 -42.258 -42.463 -42.876 -43.32 -43.808 -44.049 -44.388 -44.775 -45.051 -45.338 -45.962 -46.333 -46.736 -47.146 -47.651 -48.322 -49.226 -54.425 -4 ,18803 ,KEBNE ,17026177,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:52:12 CET,0.0 2.151 2.882 3.435 3.916 4.313 4.611 4.876 5.314 5.504 5.694 5.977 6.197 6.334 6.577 6.797 7.006 7.097 7.267 7.426 7.627 7.75 7.865 8.024 8.169 8.291 8.402 8.509 8.626 8.723 8.815 8.937 9.047 9.128 9.2 9.268 9.327 9.365 9.364 9.34 9.286 9.186 8.986 8.714 8.328 7.804 7.022 5.894 4.393 2.112 -1.915 -6.641 -10.315 -13.362 -15.891 -18.069 -19.961 -21.619 -23.038 -24.439 -25.638 -26.707 -27.696 -28.607 -29.422 -30.149 -30.924 -31.607 -32.185 -32.802 -33.459 -33.992 -34.521 -35.062 -35.485 -35.917 -36.374 -36.854 -37.355 -37.702 -38.052 -38.602 -38.991 -39.405 -39.614 -40.047 -40.499 -40.954 -41.191 -41.545 -41.979 -42.29 -42.597 -43.245 -43.617 -44.022 -44.482 -45.002 -45.65 -46.618 -51.663 -5 ,662 ,KEBNE ,17026178,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:53:12 CET,0.0 2.673 3.335 3.79 4.204 4.553 4.852 5.117 5.528 5.706 5.88 6.15 6.359 6.483 6.705 6.907 7.103 7.193 7.362 7.518 7.728 7.855 7.961 8.109 8.241 8.363 8.483 8.588 8.723 8.832 8.921 9.014 9.084 9.143 9.216 9.277 9.321 9.35 9.339 9.304 9.24 9.107 8.898 8.645 8.228 7.666 6.849 5.662 3.962 1.343 -2.939 -7.938 -11.835 -14.965 -17.659 -20.051 -22.092 -23.923 -25.432 -26.9 -28.198 -29.321 -30.331 -31.282 -32.171 -32.979 -33.819 -34.546 -35.163 -35.807 -36.471 -37.027 -37.603 -38.178 -38.607 -39.035 -39.466 -39.918 -40.417 -40.748 -41.067 -41.568 -41.92 -42.288 -42.476 -42.866 -43.289 -43.772 -44.037 -44.421 -44.859 -45.137 -45.423 -46.073 -46.454 -46.89 -47.386 -47.912 -48.566 -49.525 -53.937 -6 ,3762 ,KEBNE ,17026179,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:52:30 CET,0.0 1.712 2.2 2.579 2.885 3.164 3.426 3.658 4.026 4.183 4.328 4.542 4.735 4.858 5.072 5.247 5.409 5.487 5.638 5.789 5.985 6.101 6.219 6.37 6.52 6.673 6.802 6.912 7.042 7.146 7.228 7.321 7.41 7.499 7.569 7.626 7.688 7.728 7.728 7.696 7.649 7.567 7.386 7.087 6.629 5.998 5.133 3.961 2.2 -0.426 -4.706 -9.647 -13.58 -16.92 -19.68 -22.025 -24.003 -25.77 -27.33 -28.907 -30.157 -31.176 -32.15 -33.089 -33.98 -34.799 -35.651 -36.406 -37.056 -37.725 -38.384 -38.907 -39.455 -40.013 -40.446 -40.9 -41.363 -41.825 -42.323 -42.684 -43.058 -43.642 -44.05 -44.463 -44.666 -45.077 -45.52 -45.994 -46.241 -46.614 -47.015 -47.316 -47.627 -48.279 -48.657 -49.072 -49.526 -50.05 -50.706 -51.642 -55.994 -7 ,30008 ,KEBNE ,17026180,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:53:49 CET,0.0 2.18 2.75 3.098 3.374 3.627 3.87 4.086 4.425 4.584 4.732 4.921 5.108 5.237 5.484 5.695 5.877 5.967 6.135 6.295 6.511 6.625 6.734 6.894 7.051 7.202 7.334 7.443 7.563 7.675 7.767 7.861 7.95 8.017 8.067 8.112 8.153 8.196 8.209 8.184 8.114 7.989 7.779 7.511 7.115 6.565 5.803 4.665 2.95 0.37 -3.825 -8.666 -12.554 -15.833 -18.609 -20.986 -22.967 -24.683 -26.082 -27.489 -28.732 -29.799 -30.764 -31.674 -32.561 -33.374 -34.205 -34.949 -35.577 -36.207 -36.843 -37.347 -37.866 -38.405 -38.831 -39.281 -39.735 -40.208 -40.718 -41.079 -41.448 -42.007 -42.399 -42.794 -42.995 -43.426 -43.888 -44.384 -44.657 -45.045 -45.461 -45.758 -46.079 -46.743 -47.135 -47.575 -48.055 -48.587 -49.23 -50.182 -54.264 -8 ,19319 ,KEBNE ,17026181,Wed Dec 22 13:53:47 CET,Wed Dec 22 15:53:07 CET,0.0 2.469 3.03 3.404 3.743 4.013 4.255 4.492 4.87 5.016 5.151 5.346 5.52 5.629 5.826 6.007 6.174 6.257 6.428 6.578 6.782 6.913 7.029 7.188 7.329 7.456 7.58 7.692 7.827 7.938 8.028 8.124 8.212 8.292 8.364 8.419 8.454 8.461 8.437 8.39 8.293 8.133 7.899 7.616 7.232 6.669 5.798 4.569 2.799 0.319 -3.589 -8.301 -12.103 -15.224 -17.813 -20.088 -22.028 -23.753 -25.227 -26.631 -27.809 -28.866 -29.875 -30.808 -31.648 -32.405 -33.192 -33.89 -34.481 -35.091 -35.733 -36.259 -36.792 -37.347 -37.783 -38.235 -38.701 -39.193 -39.692 -40.028 -40.377 -40.908 -41.281 -41.674 -41.878 -42.293 -42.756 -43.262 -43.522 -43.9 -44.338 -44.634 -44.92 -45.552 -45.897 -46.258 -46.68 -47.228 -47.969 -48.969 -54.158 -9 ,29521 ,KEBNE ,17026182,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:52:39 CET,0.0 2.327 2.866 3.254 3.561 3.839 4.073 4.267 4.601 4.748 4.891 5.095 5.282 5.398 5.621 5.829 6.025 6.12 6.288 6.437 6.648 6.772 6.879 7.021 7.152 7.274 7.393 7.503 7.632 7.739 7.831 7.927 7.998 8.052 8.107 8.169 8.211 8.235 8.219 8.172 8.095 7.95 7.747 7.468 7.027 6.45 5.613 4.443 2.772 0.258 -3.888 -8.661 -12.322 -15.286 -17.764 -19.875 -21.642 -23.227 -24.628 -26.002 -27.16 -28.21 -29.199 -30.095 -30.926 -31.701 -32.511 -33.239 -33.852 -34.477 -35.128 -35.679 -36.249 -36.824 -37.278 -37.745 -38.206 -38.682 -39.184 -39.526 -39.876 -40.418 -40.798 -41.198 -41.402 -41.822 -42.244 -42.697 -42.93 -43.279 -43.718 -43.997 -44.283 -44.94 -45.303 -45.704 -46.147 -46.645 -47.25 -48.184 -52.901 -10 ,8981 ,KEBNE ,17026183,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:52:26 CET,0.0 1.946 2.477 2.859 3.166 3.416 3.638 3.831 4.175 4.337 4.483 4.684 4.86 4.97 5.163 5.329 5.483 5.551 5.695 5.843 6.038 6.167 6.292 6.46 6.593 6.702 6.799 6.891 7.019 7.124 7.21 7.318 7.411 7.469 7.537 7.615 7.636 7.614 7.575 7.514 7.4 7.237 6.996 6.69 6.278 5.712 4.891 3.713 1.977 -0.641 -4.92 -9.785 -13.653 -16.734 -19.247 -21.417 -23.246 -24.914 -26.352 -27.79 -28.999 -30.051 -31.032 -31.93 -32.801 -33.605 -34.404 -35.112 -35.719 -36.344 -36.988 -37.523 -38.085 -38.656 -39.115 -39.594 -40.077 -40.57 -41.066 -41.403 -41.75 -42.286 -42.671 -43.075 -43.284 -43.731 -44.201 -44.696 -44.944 -45.309 -45.77 -46.084 -46.394 -47.078 -47.467 -47.91 -48.417 -49.005 -49.724 -50.667 -58.273 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt deleted file mode 100644 index 0b6eec4a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10824 ,KEBNE ,16722202,Sat Nov 27 22:45:53 CET,Sun Nov 28 00:43:52 CET,0.0 1.933 2.513 2.912 3.218 3.489 3.724 3.929 4.283 4.434 4.574 4.786 4.985 5.126 5.38 5.595 5.79 5.882 6.058 6.232 6.482 6.651 6.821 7.053 7.26 7.449 7.625 7.792 8.014 8.24 8.455 8.714 8.961 9.18 9.431 9.709 9.974 10.278 10.577 10.866 11.169 11.506 11.893 12.267 12.687 13.128 13.582 14.016 14.437 14.811 14.956 14.631 14.01 13.295 12.636 11.988 11.388 10.817 10.246 9.694 9.239 8.808 8.399 8.012 7.635 7.295 6.945 6.629 6.355 6.057 5.748 5.481 5.208 4.922 4.684 4.425 4.152 3.884 3.584 3.369 3.158 2.831 2.59 2.331 2.2 1.929 1.644 1.322 1.159 0.938 0.64 0.448 0.24 -0.227 -0.489 -0.788 -1.144 -1.572 -2.081 -2.793 -6.138 -3 ,711 ,KEBNE ,16722204,Sat Nov 27 22:45:57 CET,Sun Nov 28 00:41:07 CET,0.0 1.717 2.185 2.525 2.809 3.049 3.258 3.452 3.807 3.979 4.152 4.422 4.647 4.796 5.047 5.259 5.46 5.569 5.789 5.999 6.288 6.454 6.607 6.843 7.077 7.29 7.488 7.672 7.924 8.171 8.394 8.65 8.904 9.145 9.413 9.708 9.966 10.256 10.562 10.881 11.241 11.624 12.023 12.417 12.842 13.247 13.705 14.201 14.628 14.971 15.109 14.737 14.174 13.556 12.954 12.328 11.691 11.074 10.539 10.008 9.547 9.134 8.745 8.359 7.981 7.622 7.24 6.905 6.625 6.341 6.016 5.725 5.429 5.114 4.866 4.625 4.373 4.096 3.801 3.596 3.389 3.082 2.873 2.656 2.527 2.245 1.983 1.722 1.569 1.334 1.037 0.828 0.601 0.126 -0.13 -0.411 -0.724 -1.072 -1.541 -2.212 -4.42 -4 ,8713 ,KEBNE ,16722205,Sat Nov 27 22:46:58 CET,Sun Nov 28 00:41:53 CET,0.0 2.008 2.635 3.056 3.385 3.664 3.905 4.119 4.481 4.637 4.795 5.02 5.21 5.344 5.59 5.808 6.009 6.104 6.283 6.457 6.711 6.873 7.029 7.242 7.442 7.638 7.832 8.02 8.262 8.493 8.709 8.962 9.203 9.441 9.719 10.01 10.266 10.551 10.865 11.209 11.566 11.919 12.306 12.666 13.062 13.488 13.92 14.343 14.73 14.975 14.863 14.298 13.643 12.992 12.358 11.763 11.189 10.639 10.146 9.641 9.193 8.765 8.332 7.939 7.579 7.234 6.885 6.562 6.276 5.968 5.626 5.347 5.058 4.747 4.486 4.219 3.938 3.645 3.359 3.164 2.965 2.616 2.349 2.084 1.958 1.7 1.421 1.102 0.937 0.717 0.442 0.24 0.023 -0.424 -0.661 -0.932 -1.259 -1.652 -2.123 -2.766 -5.289 -5 ,19460 ,KEBNE ,16722206,Sat Nov 27 22:46:58 CET,Sun Nov 28 00:43:06 CET,0.0 2.044 2.542 2.871 3.153 3.408 3.628 3.816 4.151 4.305 4.453 4.689 4.904 5.034 5.263 5.478 5.67 5.76 5.957 6.168 6.436 6.587 6.728 6.933 7.13 7.318 7.502 7.684 7.915 8.133 8.345 8.594 8.817 9.019 9.291 9.605 9.867 10.158 10.476 10.8 11.126 11.505 11.939 12.293 12.683 13.095 13.532 13.996 14.397 14.67 14.668 14.115 13.461 12.772 12.089 11.457 10.857 10.266 9.749 9.209 8.721 8.303 7.901 7.507 7.134 6.799 6.447 6.121 5.835 5.531 5.205 4.936 4.657 4.363 4.118 3.846 3.564 3.271 2.968 2.763 2.547 2.192 1.932 1.659 1.527 1.258 0.948 0.61 0.439 0.197 -0.137 -0.344 -0.557 -1.052 -1.316 -1.603 -1.955 -2.355 -2.836 -3.555 -5.901 -7 ,32736 ,KEBNE ,16722208,Sat Nov 27 22:47:59 CET,Sun Nov 28 00:43:34 CET,0.0 2.24 2.811 3.175 3.478 3.733 3.959 4.167 4.537 4.71 4.876 5.132 5.326 5.454 5.694 5.924 6.143 6.253 6.46 6.646 6.919 7.088 7.238 7.453 7.673 7.901 8.104 8.279 8.5 8.719 8.932 9.183 9.42 9.646 9.915 10.193 10.439 10.721 11.028 11.334 11.661 12.033 12.421 12.809 13.278 13.743 14.151 14.569 15.029 15.393 15.402 14.992 14.428 13.768 13.079 12.399 11.784 11.198 10.696 10.192 9.709 9.238 8.8 8.387 7.999 7.624 7.24 6.914 6.612 6.289 5.96 5.686 5.396 5.097 4.865 4.626 4.363 4.078 3.789 3.581 3.352 2.992 2.747 2.503 2.375 2.103 1.815 1.514 1.356 1.124 0.828 0.63 0.396 -0.142 -0.425 -0.725 -1.059 -1.433 -1.904 -2.594 -5.204 -9 ,523 ,KEBNE ,16722210,Sat Nov 27 22:48:57 CET,Sun Nov 28 00:46:38 CET,0.0 2.246 2.817 3.214 3.567 3.871 4.121 4.326 4.683 4.851 5.009 5.248 5.444 5.575 5.828 6.07 6.282 6.386 6.589 6.772 7.047 7.226 7.393 7.623 7.824 8.022 8.218 8.395 8.623 8.842 9.047 9.289 9.525 9.756 10.011 10.305 10.58 10.869 11.181 11.496 11.847 12.261 12.7 13.118 13.575 14.019 14.486 14.944 15.329 15.622 15.738 15.31 14.592 13.836 13.105 12.415 11.827 11.227 10.672 10.141 9.674 9.264 8.861 8.48 8.116 7.762 7.371 7.019 6.712 6.374 6.0 5.696 5.411 5.116 4.884 4.654 4.422 4.155 3.862 3.668 3.458 3.105 2.864 2.629 2.509 2.237 1.95 1.662 1.507 1.271 0.959 0.754 0.523 0.034 -0.222 -0.495 -0.817 -1.242 -1.79 -2.56 -4.931 -10 ,26469 ,KEBNE ,16722211,Sat Nov 27 22:50:59 CET,Sun Nov 28 00:48:48 CET,0.0 2.626 3.162 3.544 3.869 4.15 4.407 4.649 5.105 5.294 5.449 5.653 5.843 5.967 6.207 6.43 6.637 6.73 6.916 7.101 7.34 7.487 7.639 7.859 8.066 8.267 8.457 8.641 8.873 9.09 9.292 9.535 9.786 10.032 10.311 10.619 10.891 11.154 11.436 11.746 12.071 12.434 12.833 13.22 13.667 14.131 14.605 15.04 15.424 15.741 15.836 15.374 14.727 14.086 13.421 12.748 12.175 11.635 11.126 10.598 10.132 9.713 9.316 8.923 8.551 8.216 7.86 7.521 7.209 6.913 6.597 6.322 6.046 5.753 5.519 5.27 5.009 4.728 4.436 4.234 4.015 3.674 3.432 3.18 3.067 2.835 2.543 2.194 2.02 1.789 1.493 1.277 1.047 0.551 0.278 -0.016 -0.356 -0.759 -1.255 -1.889 -4.194 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index 0c1927c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12667 ,KEBNE ,16722212,Sat Nov 27 22:52:01 CET,Sun Nov 28 00:49:36 CET,0.0 3.049 3.555 3.911 4.185 4.406 4.596 4.758 5.042 5.166 5.273 5.397 5.556 5.645 5.824 5.995 6.146 6.215 6.337 6.452 6.611 6.705 6.789 6.901 7.005 7.089 7.161 7.245 7.349 7.431 7.505 7.571 7.604 7.621 7.627 7.639 7.637 7.618 7.571 7.462 7.329 7.16 6.9 6.593 6.138 5.51 4.624 3.382 1.705 -0.638 -4.568 -9.157 -12.775 -15.758 -18.259 -20.453 -22.237 -23.756 -25.059 -26.338 -27.435 -28.396 -29.3 -30.165 -30.957 -31.658 -32.388 -33.054 -33.614 -34.169 -34.74 -35.213 -35.702 -36.21 -36.616 -37.026 -37.434 -37.867 -38.322 -38.632 -38.972 -39.487 -39.823 -40.173 -40.364 -40.744 -41.137 -41.569 -41.783 -42.108 -42.451 -42.694 -42.953 -43.516 -43.818 -44.163 -44.583 -45.07 -45.644 -46.454 -49.557 -2 ,10999 ,KEBNE ,16722213,Sat Nov 27 22:52:00 CET,Sun Nov 28 00:50:52 CET,0.0 2.102 2.62 2.974 3.251 3.49 3.699 3.878 4.185 4.314 4.439 4.605 4.767 4.866 5.036 5.197 5.344 5.41 5.531 5.639 5.811 5.909 5.977 6.074 6.162 6.244 6.331 6.402 6.478 6.539 6.58 6.631 6.685 6.708 6.723 6.744 6.73 6.693 6.631 6.522 6.376 6.166 5.851 5.489 5.038 4.441 3.597 2.507 0.974 -1.378 -5.196 -9.464 -12.867 -15.799 -18.23 -20.346 -22.138 -23.745 -25.176 -26.561 -27.723 -28.77 -29.749 -30.664 -31.509 -32.251 -33.023 -33.72 -34.315 -34.912 -35.512 -35.996 -36.48 -36.971 -37.358 -37.759 -38.154 -38.565 -39.005 -39.303 -39.612 -40.09 -40.417 -40.78 -40.978 -41.415 -41.884 -42.375 -42.62 -42.964 -43.375 -43.647 -43.916 -44.504 -44.826 -45.2 -45.646 -46.16 -46.776 -47.628 -51.039 -3 ,21314 ,KEBNE ,16722214,Sat Nov 27 22:52:01 CET,Sun Nov 28 00:50:37 CET,0.0 2.046 2.563 2.931 3.243 3.5 3.696 3.878 4.192 4.329 4.459 4.637 4.795 4.893 5.065 5.221 5.363 5.422 5.534 5.656 5.821 5.906 5.985 6.094 6.201 6.296 6.371 6.441 6.524 6.593 6.662 6.741 6.802 6.838 6.85 6.845 6.852 6.847 6.782 6.687 6.552 6.358 6.093 5.753 5.312 4.716 3.874 2.798 1.234 -1.114 -4.897 -9.241 -12.84 -15.977 -18.485 -20.558 -22.337 -23.969 -25.4 -26.806 -27.981 -28.984 -29.917 -30.787 -31.584 -32.31 -33.053 -33.706 -34.267 -34.845 -35.447 -35.936 -36.438 -36.956 -37.352 -37.756 -38.17 -38.6 -39.04 -39.338 -39.651 -40.149 -40.485 -40.823 -41.0 -41.373 -41.757 -42.161 -42.366 -42.684 -43.038 -43.28 -43.547 -44.136 -44.453 -44.827 -45.244 -45.734 -46.37 -47.164 -50.58 -4 ,12490 ,KEBNE ,16722215,Sat Nov 27 22:53:01 CET,Sun Nov 28 00:50:40 CET,0.0 2.31 2.846 3.222 3.521 3.749 3.951 4.13 4.439 4.574 4.7 4.885 5.049 5.151 5.332 5.484 5.623 5.689 5.814 5.927 6.073 6.165 6.256 6.392 6.504 6.593 6.675 6.75 6.84 6.915 6.98 7.042 7.082 7.116 7.15 7.152 7.126 7.093 7.048 6.969 6.842 6.638 6.357 6.017 5.562 4.955 4.09 2.98 1.405 -0.944 -4.741 -9.065 -12.474 -15.349 -17.882 -20.101 -21.889 -23.45 -24.802 -26.142 -27.266 -28.219 -29.111 -29.937 -30.667 -31.361 -32.118 -32.789 -33.354 -33.912 -34.484 -34.966 -35.457 -35.978 -36.395 -36.819 -37.265 -37.716 -38.163 -38.472 -38.794 -39.278 -39.623 -39.988 -40.174 -40.548 -40.926 -41.324 -41.541 -41.897 -42.262 -42.52 -42.798 -43.388 -43.708 -44.076 -44.485 -44.941 -45.505 -46.295 -49.383 -5 ,13873 ,KEBNE ,16722216,Sat Nov 27 22:53:01 CET,Sun Nov 28 00:51:20 CET,0.0 2.231 2.724 3.074 3.36 3.613 3.833 4.027 4.343 4.476 4.606 4.774 4.921 5.001 5.163 5.32 5.457 5.519 5.634 5.746 5.902 6.0 6.091 6.211 6.322 6.416 6.496 6.562 6.627 6.687 6.755 6.814 6.852 6.905 6.956 6.96 6.944 6.911 6.838 6.75 6.625 6.42 6.13 5.766 5.294 4.714 3.871 2.696 1.064 -1.317 -5.192 -9.632 -13.152 -16.044 -18.469 -20.562 -22.321 -23.903 -25.239 -26.612 -27.819 -28.848 -29.792 -30.685 -31.51 -32.231 -32.989 -33.65 -34.205 -34.789 -35.39 -35.883 -36.407 -36.96 -37.391 -37.858 -38.353 -38.851 -39.334 -39.649 -39.982 -40.492 -40.843 -41.208 -41.392 -41.784 -42.203 -42.665 -42.916 -43.271 -43.638 -43.892 -44.167 -44.761 -45.089 -45.454 -45.863 -46.308 -46.887 -47.689 -50.707 -6 ,3111 ,KEBNE ,16722217,Sat Nov 27 22:53:01 CET,Sun Nov 28 00:50:40 CET,0.0 2.092 2.664 3.052 3.342 3.577 3.792 3.986 4.318 4.462 4.591 4.784 4.958 5.052 5.236 5.402 5.542 5.607 5.729 5.843 6.033 6.152 6.245 6.368 6.467 6.552 6.636 6.726 6.834 6.923 6.997 7.071 7.13 7.169 7.202 7.231 7.251 7.239 7.207 7.151 7.042 6.855 6.59 6.275 5.823 5.226 4.437 3.32 1.603 -0.862 -4.715 -9.169 -12.75 -15.665 -18.077 -20.15 -21.871 -23.405 -24.718 -26.001 -27.071 -27.997 -28.89 -29.722 -30.485 -31.196 -31.941 -32.619 -33.202 -33.777 -34.342 -34.813 -35.303 -35.803 -36.188 -36.582 -36.998 -37.445 -37.902 -38.208 -38.526 -39.031 -39.37 -39.717 -39.901 -40.28 -40.666 -41.063 -41.279 -41.627 -41.982 -42.225 -42.477 -43.029 -43.355 -43.719 -44.099 -44.511 -45.017 -45.848 -48.658 -7 ,11539 ,KEBNE ,16722218,Sat Nov 27 22:53:02 CET,Sun Nov 28 00:51:40 CET,0.0 1.946 2.413 2.736 3.002 3.239 3.448 3.623 3.911 4.035 4.158 4.321 4.485 4.576 4.735 4.877 5.004 5.064 5.181 5.287 5.433 5.522 5.605 5.719 5.813 5.904 6.0 6.083 6.169 6.242 6.309 6.363 6.396 6.431 6.468 6.481 6.466 6.422 6.347 6.262 6.143 5.958 5.713 5.435 5.039 4.447 3.575 2.397 0.723 -1.8 -5.819 -10.368 -14.003 -16.972 -19.377 -21.447 -23.255 -24.828 -26.144 -27.432 -28.491 -29.452 -30.403 -31.273 -32.064 -32.807 -33.599 -34.309 -34.911 -35.504 -36.104 -36.596 -37.093 -37.607 -38.054 -38.542 -39.012 -39.503 -40.006 -40.348 -40.727 -41.313 -41.713 -42.133 -42.346 -42.784 -43.234 -43.716 -43.969 -44.344 -44.757 -45.041 -45.346 -45.999 -46.344 -46.709 -47.124 -47.597 -48.153 -48.893 -52.59 -8 ,1940 ,KEBNE ,16722219,Sat Nov 27 22:53:02 CET,Sun Nov 28 00:50:53 CET,0.0 2.084 2.598 2.954 3.239 3.472 3.672 3.844 4.149 4.287 4.414 4.584 4.741 4.835 5.008 5.154 5.285 5.351 5.472 5.581 5.731 5.824 5.922 6.057 6.165 6.253 6.336 6.405 6.482 6.547 6.611 6.679 6.739 6.792 6.831 6.859 6.863 6.836 6.786 6.712 6.612 6.468 6.234 5.918 5.466 4.888 4.116 3.022 1.343 -1.2 -5.135 -9.558 -13.218 -16.274 -18.69 -20.703 -22.421 -23.964 -25.282 -26.601 -27.694 -28.644 -29.543 -30.374 -31.133 -31.804 -32.525 -33.183 -33.739 -34.308 -34.901 -35.389 -35.883 -36.396 -36.791 -37.191 -37.609 -38.033 -38.465 -38.762 -39.076 -39.572 -39.907 -40.305 -40.521 -40.916 -41.311 -41.74 -41.962 -42.305 -42.655 -42.905 -43.184 -43.803 -44.146 -44.525 -44.914 -45.342 -45.905 -46.722 -49.35 -9 ,694 ,KEBNE ,16722220,Sat Nov 27 22:53:01 CET,Sun Nov 28 00:50:42 CET,0.0 2.148 2.634 2.993 3.286 3.512 3.697 3.877 4.188 4.327 4.457 4.602 4.767 4.857 5.027 5.17 5.29 5.349 5.475 5.587 5.715 5.796 5.879 5.996 6.092 6.176 6.249 6.307 6.379 6.436 6.479 6.509 6.513 6.52 6.547 6.583 6.575 6.54 6.502 6.427 6.299 6.105 5.823 5.512 5.092 4.495 3.661 2.545 0.922 -1.551 -5.372 -9.687 -13.116 -15.96 -18.391 -20.487 -22.247 -23.839 -25.182 -26.484 -27.578 -28.511 -29.425 -30.286 -31.077 -31.822 -32.569 -33.218 -33.775 -34.33 -34.905 -35.393 -35.889 -36.379 -36.751 -37.141 -37.542 -37.954 -38.381 -38.675 -38.978 -39.449 -39.788 -40.15 -40.326 -40.686 -41.076 -41.476 -41.681 -42.003 -42.368 -42.642 -42.929 -43.536 -43.864 -44.199 -44.573 -45.008 -45.595 -46.468 -49.9 -10 ,8980 ,KEBNE ,16722221,Sat Nov 27 22:53:02 CET,Sun Nov 28 00:50:02 CET,0.0 2.342 2.91 3.331 3.65 3.903 4.129 4.327 4.654 4.788 4.916 5.084 5.257 5.361 5.561 5.735 5.887 5.959 6.085 6.218 6.397 6.489 6.586 6.73 6.847 6.955 7.05 7.12 7.208 7.284 7.357 7.433 7.484 7.517 7.529 7.53 7.52 7.497 7.458 7.393 7.317 7.145 6.835 6.5 6.059 5.497 4.689 3.549 1.876 -0.63 -4.622 -9.297 -12.991 -15.967 -18.41 -20.506 -22.29 -23.976 -25.491 -26.947 -28.156 -29.229 -30.249 -31.207 -32.073 -32.851 -33.645 -34.338 -34.918 -35.511 -36.137 -36.649 -37.168 -37.704 -38.115 -38.536 -38.973 -39.421 -39.884 -40.192 -40.508 -41.007 -41.349 -41.704 -41.882 -42.253 -42.656 -43.08 -43.305 -43.667 -44.046 -44.298 -44.55 -45.126 -45.474 -45.826 -46.206 -46.659 -47.197 -47.917 -50.743 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt deleted file mode 100644 index 778a4f4e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7957 ,KEBNE ,16722222,Sat Nov 27 22:53:02 CET,Sun Nov 28 00:50:22 CET,0.0 2.974 3.499 3.842 4.133 4.421 4.669 4.862 5.208 5.373 5.521 5.72 5.899 6.019 6.263 6.475 6.665 6.763 6.953 7.132 7.378 7.539 7.694 7.889 8.069 8.253 8.421 8.573 8.773 8.972 9.158 9.372 9.577 9.773 10.014 10.279 10.524 10.795 11.042 11.286 11.529 11.809 12.139 12.457 12.8 13.108 13.368 13.516 13.536 13.295 12.52 11.223 9.911 8.637 7.43 6.301 5.306 4.37 3.536 2.716 2.013 1.398 0.818 0.26 -0.232 -0.709 -1.248 -1.686 -2.058 -2.463 -2.858 -3.188 -3.549 -3.942 -4.251 -4.554 -4.882 -5.226 -5.584 -5.844 -6.105 -6.484 -6.749 -7.032 -7.175 -7.472 -7.788 -8.123 -8.308 -8.591 -8.926 -9.151 -9.387 -9.906 -10.188 -10.513 -10.904 -11.339 -11.868 -12.615 -15.045 -2 ,22339 ,KEBNE ,16722223,Sat Nov 27 22:53:02 CET,Sun Nov 28 00:48:39 CET,0.0 2.508 3.162 3.589 3.889 4.123 4.342 4.537 4.861 5.014 5.166 5.398 5.598 5.736 5.996 6.228 6.442 6.532 6.705 6.878 7.125 7.286 7.439 7.659 7.865 8.061 8.251 8.434 8.678 8.91 9.114 9.346 9.55 9.748 9.99 10.23 10.452 10.704 10.972 11.246 11.517 11.794 12.113 12.407 12.71 13.047 13.378 13.693 13.956 13.916 13.238 11.98 10.571 9.224 8.098 7.098 6.175 5.346 4.653 3.935 3.276 2.696 2.16 1.642 1.126 0.628 0.092 -0.379 -0.758 -1.129 -1.51 -1.836 -2.173 -2.535 -2.823 -3.113 -3.422 -3.752 -4.102 -4.349 -4.594 -4.992 -5.284 -5.584 -5.739 -6.057 -6.409 -6.815 -7.026 -7.322 -7.69 -7.925 -8.159 -8.666 -8.948 -9.283 -9.672 -10.123 -10.703 -11.552 -14.602 -3 ,15699 ,KEBNE ,16722224,Sat Nov 27 22:53:02 CET,Sun Nov 28 00:49:42 CET,0.0 3.504 4.083 4.452 4.772 5.042 5.262 5.474 5.848 6.009 6.164 6.394 6.585 6.711 6.95 7.154 7.351 7.46 7.654 7.823 8.079 8.233 8.379 8.607 8.816 9.011 9.205 9.369 9.577 9.79 9.982 10.21 10.421 10.605 10.832 11.088 11.318 11.569 11.833 12.099 12.359 12.638 12.974 13.298 13.639 14.01 14.357 14.579 14.692 14.741 14.453 13.488 12.423 11.481 10.607 9.636 8.659 7.796 7.114 6.455 5.864 5.324 4.799 4.272 3.756 3.294 2.82 2.405 2.036 1.655 1.272 0.955 0.611 0.223 -0.074 -0.377 -0.683 -0.974 -1.285 -1.526 -1.779 -2.15 -2.399 -2.676 -2.824 -3.107 -3.406 -3.759 -3.951 -4.226 -4.536 -4.747 -4.97 -5.49 -5.8 -6.141 -6.54 -7.009 -7.582 -8.417 -11.282 -4 ,30814 ,KEBNE ,16722225,Sat Nov 27 22:53:02 CET,Sun Nov 28 00:50:41 CET,0.0 2.567 3.089 3.446 3.745 3.983 4.203 4.426 4.81 4.981 5.145 5.391 5.589 5.713 5.938 6.142 6.342 6.448 6.648 6.82 7.067 7.226 7.371 7.581 7.794 7.999 8.179 8.339 8.563 8.78 8.955 9.152 9.361 9.566 9.773 10.002 10.236 10.473 10.689 10.913 11.166 11.442 11.726 12.006 12.29 12.548 12.89 13.268 13.58 13.717 13.436 12.524 11.439 10.379 9.314 8.287 7.394 6.591 5.886 5.154 4.514 3.961 3.467 2.975 2.472 2.012 1.536 1.095 0.698 0.313 -0.072 -0.388 -0.712 -1.064 -1.343 -1.645 -1.973 -2.287 -2.599 -2.832 -3.091 -3.498 -3.775 -4.08 -4.239 -4.57 -4.9 -5.242 -5.435 -5.716 -6.058 -6.282 -6.522 -7.066 -7.363 -7.706 -8.089 -8.504 -9.018 -9.73 -13.187 -5 ,22302 ,KEBNE ,16722226,Sat Nov 27 22:53:02 CET,Sun Nov 28 00:48:46 CET,0.0 2.989 3.573 3.997 4.365 4.667 4.906 5.105 5.473 5.645 5.797 5.989 6.172 6.291 6.518 6.736 6.94 7.049 7.255 7.43 7.691 7.852 8.001 8.227 8.437 8.639 8.817 8.967 9.175 9.37 9.55 9.78 9.995 10.207 10.453 10.711 10.932 11.172 11.443 11.73 12.027 12.349 12.71 13.03 13.381 13.739 14.04 14.26 14.359 14.236 13.529 12.184 10.904 9.664 8.515 7.456 6.523 5.696 4.975 4.22 3.566 2.976 2.415 1.905 1.405 0.93 0.433 0.002 -0.349 -0.72 -1.119 -1.447 -1.787 -2.141 -2.406 -2.68 -2.977 -3.281 -3.591 -3.821 -4.077 -4.47 -4.739 -5.015 -5.16 -5.479 -5.815 -6.177 -6.379 -6.673 -7.022 -7.243 -7.468 -7.972 -8.288 -8.65 -9.071 -9.551 -10.129 -10.998 -14.586 -6 ,28999 ,KEBNE ,16722227,Sat Nov 27 22:54:03 CET,Sun Nov 28 00:51:40 CET,0.0 2.697 3.244 3.619 3.913 4.173 4.411 4.614 4.959 5.114 5.262 5.49 5.69 5.816 6.057 6.279 6.48 6.573 6.746 6.909 7.155 7.316 7.475 7.693 7.893 8.088 8.27 8.437 8.631 8.82 9.022 9.25 9.447 9.634 9.857 10.115 10.35 10.586 10.817 11.057 11.338 11.673 12.028 12.375 12.716 13.033 13.318 13.531 13.694 13.661 13.065 11.946 10.733 9.503 8.427 7.46 6.599 5.798 5.116 4.46 3.871 3.335 2.814 2.291 1.777 1.305 0.834 0.4 0.014 -0.389 -0.807 -1.154 -1.496 -1.833 -2.106 -2.395 -2.689 -3.008 -3.376 -3.654 -3.932 -4.318 -4.588 -4.884 -5.046 -5.379 -5.698 -6.031 -6.218 -6.505 -6.904 -7.135 -7.372 -7.899 -8.173 -8.497 -8.889 -9.313 -9.875 -10.687 -13.549 -7 ,30478 ,KEBNE ,16722228,Sat Nov 27 22:54:03 CET,Sun Nov 28 00:51:15 CET,0.0 3.093 3.665 4.056 4.328 4.568 4.799 5.001 5.352 5.507 5.644 5.854 6.03 6.142 6.356 6.566 6.779 6.874 7.038 7.207 7.461 7.622 7.773 7.972 8.155 8.326 8.485 8.644 8.853 9.057 9.255 9.483 9.69 9.885 10.103 10.356 10.605 10.868 11.137 11.387 11.638 11.919 12.252 12.576 12.912 13.243 13.568 13.82 13.999 13.988 13.475 12.475 11.364 10.199 9.152 8.223 7.317 6.438 5.695 4.939 4.284 3.716 3.166 2.626 2.119 1.678 1.22 0.782 0.424 0.052 -0.394 -0.784 -1.182 -1.56 -1.843 -2.152 -2.464 -2.8 -3.156 -3.398 -3.664 -4.064 -4.339 -4.644 -4.81 -5.159 -5.516 -5.906 -6.114 -6.396 -6.73 -6.964 -7.212 -7.74 -8.017 -8.322 -8.682 -9.123 -9.674 -10.4 -13.216 -8 ,22188 ,KEBNE ,16722229,Sat Nov 27 22:54:03 CET,Sun Nov 28 00:50:09 CET,0.0 2.608 3.128 3.501 3.787 4.024 4.241 4.464 4.883 5.065 5.231 5.453 5.65 5.778 6.009 6.224 6.43 6.528 6.714 6.882 7.12 7.276 7.429 7.644 7.827 7.991 8.152 8.31 8.514 8.704 8.873 9.098 9.326 9.53 9.766 10.031 10.257 10.483 10.736 11.004 11.271 11.525 11.786 12.074 12.408 12.732 12.969 13.127 13.187 12.911 12.0 10.504 9.117 7.93 6.879 5.86 4.956 4.089 3.372 2.733 2.168 1.643 1.138 0.681 0.237 -0.189 -0.671 -1.122 -1.501 -1.899 -2.3 -2.632 -2.979 -3.337 -3.617 -3.896 -4.167 -4.467 -4.829 -5.084 -5.341 -5.742 -6.016 -6.308 -6.463 -6.79 -7.135 -7.51 -7.706 -7.996 -8.38 -8.619 -8.865 -9.39 -9.677 -10.01 -10.393 -10.833 -11.399 -12.193 -15.552 -9 ,19592 ,KEBNE ,16722230,Sat Nov 27 22:54:03 CET,Sun Nov 28 00:51:40 CET,0.0 2.321 2.895 3.275 3.578 3.837 4.054 4.26 4.617 4.767 4.911 5.121 5.302 5.424 5.666 5.887 6.083 6.177 6.354 6.518 6.755 6.894 7.028 7.244 7.461 7.649 7.818 7.984 8.186 8.372 8.548 8.77 8.989 9.187 9.429 9.718 9.968 10.214 10.498 10.8 11.089 11.404 11.783 12.159 12.535 12.872 13.193 13.481 13.655 13.536 12.942 11.788 10.503 9.316 8.192 7.123 6.231 5.478 4.84 4.177 3.593 3.071 2.572 2.091 1.617 1.171 0.704 0.265 -0.104 -0.486 -0.909 -1.262 -1.636 -2.018 -2.301 -2.594 -2.904 -3.228 -3.565 -3.801 -4.031 -4.396 -4.653 -4.916 -5.059 -5.354 -5.673 -6.019 -6.191 -6.454 -6.763 -6.976 -7.206 -7.697 -7.967 -8.269 -8.609 -9.027 -9.578 -10.363 -14.441 -10 ,22976 ,KEBNE ,16722231,Sat Nov 27 22:54:03 CET,Sun Nov 28 00:49:53 CET,0.0 2.045 2.594 2.985 3.282 3.539 3.781 3.993 4.37 4.539 4.697 4.91 5.089 5.204 5.424 5.641 5.832 5.925 6.119 6.299 6.54 6.691 6.847 7.068 7.266 7.462 7.652 7.827 8.037 8.24 8.437 8.656 8.861 9.06 9.283 9.53 9.762 9.996 10.244 10.501 10.75 10.991 11.269 11.582 11.91 12.148 12.36 12.543 12.628 12.448 11.637 10.349 9.164 7.967 6.853 5.864 4.976 4.149 3.385 2.657 2.035 1.454 0.914 0.392 -0.098 -0.543 -0.993 -1.393 -1.737 -2.085 -2.464 -2.787 -3.118 -3.469 -3.749 -4.044 -4.351 -4.683 -5.039 -5.277 -5.525 -5.914 -6.185 -6.48 -6.633 -6.94 -7.258 -7.609 -7.791 -8.06 -8.355 -8.562 -8.796 -9.309 -9.587 -9.916 -10.298 -10.736 -11.239 -11.93 -15.103 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt deleted file mode 100644 index 23f6ecf9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26954 ,KEBNE ,16722232,Sat Nov 27 22:54:03 CET,Sun Nov 28 00:53:07 CET,0.0 0.975 1.398 1.754 2.054 2.342 2.618 2.867 3.324 3.538 3.747 4.035 4.326 4.492 4.801 5.11 5.411 5.556 5.839 6.108 6.511 6.782 7.047 7.435 7.812 8.18 8.538 8.88 9.324 9.763 10.201 10.723 11.216 11.701 12.271 12.929 13.567 14.295 15.12 16.002 16.954 18.041 19.314 20.645 22.242 24.051 26.228 28.782 31.874 35.747 40.82 45.483 48.507 50.591 52.089 53.234 54.117 54.812 55.311 55.74 56.067 56.312 56.527 56.709 56.85 56.969 57.067 57.125 57.148 57.158 57.165 57.161 57.145 57.12 57.09 57.051 57.009 56.96 56.892 56.835 56.777 56.67 56.582 56.484 56.433 56.323 56.188 56.037 55.963 55.836 55.671 55.556 55.444 55.18 55.013 54.817 54.583 54.315 53.988 53.503 51.34 -2 ,22616 ,KEBNE ,16722233,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:53:41 CET,0.0 0.754 1.185 1.534 1.853 2.148 2.422 2.692 3.208 3.435 3.644 3.932 4.226 4.413 4.78 5.122 5.461 5.624 5.932 6.241 6.685 6.966 7.242 7.645 8.032 8.409 8.778 9.13 9.594 10.06 10.502 11.035 11.563 12.085 12.692 13.373 14.027 14.736 15.511 16.34 17.249 18.347 19.644 20.941 22.506 24.304 26.428 28.953 32.085 36.005 41.158 45.947 49.088 51.255 52.8 54.002 54.943 55.681 56.225 56.69 57.032 57.29 57.504 57.69 57.839 57.943 58.037 58.106 58.154 58.19 58.213 58.22 58.2 58.168 58.144 58.111 58.066 58.012 57.939 57.883 57.823 57.716 57.642 57.558 57.51 57.406 57.275 57.109 57.022 56.867 56.709 56.603 56.489 56.223 56.054 55.868 55.664 55.398 55.047 54.528 51.537 -3 ,23404 ,KEBNE ,16722234,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:54:33 CET,0.0 0.877 1.363 1.764 2.107 2.419 2.713 2.98 3.435 3.64 3.853 4.148 4.451 4.643 5.02 5.368 5.693 5.853 6.165 6.468 6.913 7.2 7.483 7.899 8.293 8.67 9.028 9.377 9.834 10.288 10.723 11.252 11.77 12.262 12.842 13.499 14.148 14.863 15.627 16.474 17.388 18.421 19.643 20.885 22.38 24.119 26.196 28.662 31.706 35.534 40.597 45.325 48.402 50.488 52.002 53.169 54.04 54.737 55.24 55.644 55.945 56.185 56.38 56.534 56.652 56.74 56.812 56.873 56.911 56.931 56.934 56.918 56.886 56.843 56.81 56.774 56.724 56.662 56.602 56.551 56.488 56.371 56.272 56.178 56.134 56.039 55.913 55.756 55.673 55.531 55.385 55.273 55.163 54.903 54.741 54.559 54.357 54.111 53.77 53.243 50.604 -4 ,1579 ,KEBNE ,16722235,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:52:37 CET,0.0 0.93 1.468 1.893 2.241 2.542 2.807 3.064 3.555 3.797 4.032 4.353 4.673 4.874 5.257 5.624 5.968 6.13 6.443 6.755 7.202 7.487 7.772 8.187 8.594 8.982 9.346 9.699 10.172 10.628 11.057 11.595 12.144 12.681 13.272 13.928 14.574 15.285 16.072 16.921 17.832 18.882 20.144 21.467 23.023 24.793 26.953 29.444 32.475 36.359 41.489 46.244 49.391 51.577 53.161 54.399 55.31 56.016 56.544 56.985 57.324 57.577 57.771 57.941 58.059 58.147 58.223 58.267 58.302 58.325 58.336 58.339 58.342 58.322 58.286 58.252 58.21 58.153 58.089 58.041 57.991 57.891 57.807 57.717 57.669 57.562 57.434 57.288 57.209 57.074 56.942 56.83 56.709 56.399 56.224 56.034 55.796 55.523 55.166 54.604 51.541 -5 ,7564 ,KEBNE ,16722236,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:53:06 CET,0.0 1.171 1.72 2.14 2.501 2.806 3.088 3.36 3.859 4.088 4.302 4.588 4.9 5.098 5.471 5.812 6.134 6.293 6.611 6.921 7.364 7.643 7.91 8.306 8.702 9.08 9.435 9.791 10.262 10.719 11.163 11.703 12.232 12.736 13.332 14.016 14.67 15.404 16.212 17.062 17.968 19.019 20.272 21.581 23.147 24.903 26.98 29.425 32.45 36.293 41.431 46.277 49.436 51.599 53.156 54.38 55.314 56.023 56.551 57.018 57.37 57.644 57.855 58.01 58.147 58.261 58.361 58.428 58.465 58.494 58.506 58.487 58.466 58.452 58.42 58.372 58.317 58.251 58.176 58.119 58.06 57.957 57.882 57.805 57.758 57.646 57.524 57.388 57.317 57.188 57.064 56.953 56.84 56.555 56.383 56.196 55.956 55.669 55.322 54.773 51.841 -6 ,10494 ,KEBNE ,16722237,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:53:10 CET,0.0 1.182 1.698 2.09 2.404 2.686 2.951 3.194 3.649 3.863 4.065 4.355 4.651 4.827 5.163 5.488 5.807 5.967 6.285 6.591 7.014 7.285 7.556 7.974 8.393 8.779 9.149 9.508 9.972 10.425 10.863 11.395 11.916 12.425 13.025 13.708 14.345 15.042 15.843 16.723 17.65 18.737 20.056 21.445 23.058 24.821 26.947 29.428 32.488 36.349 41.387 46.065 49.1 51.196 52.731 53.911 54.786 55.458 55.993 56.483 56.844 57.107 57.311 57.487 57.635 57.749 57.831 57.879 57.911 57.936 57.948 57.944 57.93 57.895 57.852 57.802 57.737 57.673 57.607 57.553 57.488 57.373 57.293 57.208 57.163 57.061 56.933 56.79 56.71 56.556 56.405 56.294 56.174 55.901 55.738 55.553 55.337 55.077 54.738 54.193 51.363 -7 ,5192 ,KEBNE ,16722238,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:54:28 CET,0.0 0.928 1.418 1.823 2.17 2.482 2.79 3.066 3.529 3.75 3.957 4.238 4.527 4.703 5.055 5.39 5.706 5.863 6.173 6.471 6.903 7.181 7.457 7.856 8.236 8.611 8.983 9.347 9.817 10.266 10.7 11.224 11.728 12.238 12.838 13.496 14.142 14.874 15.677 16.521 17.413 18.454 19.704 20.98 22.487 24.202 26.22 28.63 31.598 35.364 40.395 44.949 47.972 50.058 51.506 52.61 53.439 54.098 54.603 55.047 55.375 55.631 55.853 56.031 56.174 56.286 56.353 56.385 56.4 56.405 56.413 56.415 56.405 56.385 56.352 56.302 56.249 56.19 56.129 56.076 56.012 55.918 55.831 55.734 55.693 55.602 55.466 55.317 55.247 55.108 54.989 54.88 54.747 54.421 54.245 54.055 53.822 53.534 53.187 52.712 50.227 -8 ,5192 ,KEBNE ,16722239,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:52:50 CET,0.0 0.928 1.418 1.823 2.17 2.482 2.79 3.066 3.529 3.75 3.957 4.238 4.527 4.703 5.055 5.39 5.706 5.863 6.173 6.471 6.903 7.181 7.457 7.856 8.236 8.611 8.983 9.347 9.817 10.266 10.7 11.224 11.728 12.238 12.838 13.496 14.142 14.874 15.677 16.521 17.413 18.454 19.704 20.98 22.487 24.202 26.22 28.63 31.598 35.364 40.395 44.949 47.972 50.058 51.506 52.61 53.439 54.098 54.603 55.047 55.375 55.631 55.853 56.031 56.174 56.286 56.353 56.385 56.4 56.405 56.413 56.415 56.405 56.385 56.352 56.302 56.249 56.19 56.129 56.076 56.012 55.918 55.831 55.734 55.693 55.602 55.466 55.317 55.247 55.108 54.989 54.88 54.747 54.421 54.245 54.055 53.822 53.534 53.187 52.712 50.227 -9 ,23169 ,KEBNE ,16722240,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:53:12 CET,0.0 1.0 1.502 1.93 2.291 2.587 2.859 3.123 3.605 3.824 4.036 4.327 4.637 4.822 5.163 5.491 5.822 5.982 6.284 6.581 7.002 7.27 7.541 7.934 8.308 8.675 9.036 9.395 9.863 10.305 10.734 11.258 11.758 12.247 12.834 13.496 14.133 14.84 15.613 16.444 17.349 18.415 19.667 20.942 22.487 24.294 26.461 28.979 32.04 35.917 41.047 45.74 48.804 50.981 52.548 53.676 54.528 55.234 55.761 56.202 56.523 56.78 56.993 57.164 57.298 57.399 57.491 57.548 57.575 57.593 57.599 57.59 57.558 57.516 57.478 57.428 57.379 57.325 57.248 57.182 57.109 56.982 56.888 56.791 56.733 56.596 56.457 56.328 56.25 56.103 55.969 55.857 55.727 55.414 55.23 55.041 54.821 54.548 54.187 53.678 51.211 -10 ,14822 ,KEBNE ,16722241,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:54:27 CET,0.0 1.131 1.676 2.089 2.449 2.766 3.057 3.325 3.843 4.086 4.309 4.598 4.906 5.099 5.469 5.814 6.146 6.303 6.601 6.887 7.315 7.596 7.873 8.279 8.659 9.015 9.358 9.704 10.162 10.609 11.044 11.578 12.088 12.579 13.166 13.843 14.494 15.206 15.986 16.856 17.796 18.84 20.094 21.394 22.95 24.717 26.792 29.256 32.338 36.233 41.32 45.968 48.979 51.085 52.647 53.775 54.606 55.269 55.789 56.254 56.601 56.864 57.055 57.219 57.367 57.481 57.574 57.647 57.696 57.721 57.741 57.749 57.746 57.726 57.692 57.652 57.604 57.546 57.479 57.419 57.343 57.234 57.159 57.075 57.031 56.934 56.818 56.678 56.598 56.445 56.289 56.186 56.076 55.809 55.658 55.475 55.258 55.0 54.651 54.126 51.728 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt deleted file mode 100644 index d6863f13..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10424 ,KEBNE ,17026184,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:54:17 CET,0.0 2.139 2.419 2.538 2.546 2.493 2.417 2.325 2.103 1.972 1.834 1.414 1.364 1.213 0.905 0.56 0.201 0.023 -0.335 -0.705 -1.302 -1.709 -2.121 -2.769 -3.436 -4.095 -4.757 -5.451 -6.389 -7.334 -8.3 -9.517 -10.729 -11.967 -13.482 -15.257 -17.043 -19.109 -21.442 -24.035 -26.913 -30.312 -34.534 -39.098 -44.805 -51.689 -60.294 -70.9 -84.782 -103.504 -130.402 -157.775 -177.372 -192.34 -204.122 -213.857 -221.763 -228.475 -233.971 -239.179 -243.462 -247.115 -250.436 -253.478 -256.22 -258.621 -261.023 -263.101 -264.867 -266.638 -268.421 -269.859 -271.304 -272.774 -273.892 -275.011 -276.136 -277.275 -278.427 -279.207 -280.007 -281.216 -282.033 -282.883 -283.31 -284.179 -285.072 -285.978 -286.439 -287.312 -287.883 -288.371 -288.885 -289.985 -290.571 -291.213 -291.869 -292.581 -293.403 -294.308 -295.956 -2 ,15518 ,KEBNE ,17026185,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:53:07 CET,0.0 1.821 2.019 2.098 2.14 2.134 2.075 1.979 1.722 1.579 1.43 1.006 0.964 0.799 0.455 0.092 -0.295 -0.497 -0.902 -1.301 -1.929 -2.37 -2.811 -3.476 -4.154 -4.84 -5.532 -6.234 -7.18 -8.121 -9.068 -10.277 -11.497 -12.728 -14.219 -15.984 -17.766 -19.818 -22.137 -24.731 -27.63 -31.066 -35.313 -39.88 -45.59 -52.459 -61.061 -71.715 -85.497 -104.054 -130.929 -158.25 -178.008 -193.043 -204.873 -214.733 -222.775 -229.629 -235.179 -240.407 -244.705 -248.389 -251.752 -254.761 -257.446 -259.822 -262.211 -264.258 -265.995 -267.745 -269.494 -270.911 -272.344 -273.79 -274.885 -275.996 -277.119 -278.237 -279.36 -280.115 -280.871 -282.022 -282.797 -283.585 -283.982 -284.789 -285.622 -286.464 -286.895 -287.736 -288.206 -288.666 -289.143 -290.115 -290.627 -291.18 -291.766 -292.384 -293.071 -293.929 -296.443 -3 ,3378 ,KEBNE ,17026186,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:53:15 CET,0.0 1.798 2.085 2.197 2.221 2.19 2.126 2.04 1.825 1.699 1.561 1.147 1.102 0.943 0.605 0.254 -0.107 -0.296 -0.688 -1.087 -1.701 -2.116 -2.536 -3.192 -3.873 -4.548 -5.227 -5.919 -6.846 -7.784 -8.735 -9.944 -11.171 -12.429 -13.962 -15.748 -17.54 -19.622 -21.987 -24.622 -27.547 -31.026 -35.315 -39.909 -45.656 -52.581 -61.263 -72.024 -86.066 -104.878 -131.85 -159.313 -179.052 -194.182 -206.088 -215.935 -223.983 -230.832 -236.431 -241.74 -246.072 -249.774 -253.177 -256.25 -258.98 -261.397 -263.854 -265.989 -267.793 -269.593 -271.415 -272.888 -274.349 -275.811 -276.916 -278.025 -279.151 -280.283 -281.423 -282.196 -282.978 -284.173 -284.974 -285.786 -286.197 -287.037 -287.888 -288.722 -289.141 -289.972 -290.477 -290.948 -291.432 -292.434 -292.954 -293.52 -294.118 -294.724 -295.395 -296.242 -299.398 -4 ,27878 ,KEBNE ,17026187,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:53:00 CET,0.0 1.902 2.209 2.334 2.386 2.41 2.378 2.309 2.143 2.038 1.918 1.537 1.511 1.354 1.044 0.713 0.352 0.17 -0.192 -0.577 -1.164 -1.56 -1.976 -2.616 -3.262 -3.913 -4.579 -5.267 -6.199 -7.149 -8.105 -9.306 -10.506 -11.701 -13.141 -14.866 -16.627 -18.641 -20.949 -23.556 -26.436 -29.868 -34.128 -38.671 -44.323 -51.156 -59.72 -70.372 -84.307 -103.078 -130.077 -157.384 -176.901 -191.81 -203.526 -213.185 -221.078 -227.77 -233.232 -238.419 -242.649 -246.23 -249.51 -252.508 -255.21 -257.592 -260.006 -262.086 -263.812 -265.562 -267.326 -268.737 -270.166 -271.626 -272.726 -273.828 -274.945 -276.068 -277.203 -277.976 -278.759 -279.925 -280.714 -281.52 -281.923 -282.737 -283.572 -284.421 -284.854 -285.694 -286.208 -286.668 -287.135 -288.125 -288.642 -289.162 -289.718 -290.334 -291.055 -291.963 -294.542 -5 ,8553 ,KEBNE ,17026188,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:53:11 CET,0.0 1.852 2.139 2.256 2.263 2.221 2.169 2.104 1.887 1.755 1.63 1.26 1.23 1.081 0.756 0.431 0.088 -0.095 -0.475 -0.86 -1.465 -1.887 -2.315 -2.96 -3.6 -4.243 -4.906 -5.576 -6.481 -7.411 -8.352 -9.526 -10.725 -11.953 -13.417 -15.158 -16.933 -18.98 -21.32 -23.909 -26.759 -30.191 -34.504 -39.134 -44.874 -51.737 -60.298 -70.932 -84.872 -103.627 -130.593 -158.055 -177.72 -192.76 -204.59 -214.321 -222.246 -228.939 -234.393 -239.567 -243.798 -247.416 -250.732 -253.727 -256.386 -258.718 -261.079 -263.128 -264.848 -266.585 -268.321 -269.713 -271.128 -272.562 -273.644 -274.734 -275.828 -276.935 -278.055 -278.807 -279.56 -280.711 -281.504 -282.31 -282.711 -283.519 -284.345 -285.207 -285.652 -286.498 -286.993 -287.462 -287.934 -288.902 -289.409 -289.944 -290.522 -291.138 -291.817 -292.656 -294.904 -6 ,26068 ,KEBNE ,17026189,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:54:27 CET,0.0 1.584 1.912 2.042 2.079 2.067 2.012 1.94 1.758 1.64 1.501 1.085 1.044 0.886 0.55 0.186 -0.188 -0.373 -0.758 -1.133 -1.719 -2.129 -2.555 -3.216 -3.87 -4.528 -5.201 -5.892 -6.813 -7.748 -8.707 -9.912 -11.122 -12.352 -13.851 -15.631 -17.438 -19.506 -21.828 -24.427 -27.316 -30.774 -35.09 -39.716 -45.459 -52.335 -60.965 -71.656 -85.621 -104.418 -131.433 -158.986 -178.811 -193.938 -205.799 -215.555 -223.491 -230.244 -235.754 -241.019 -245.366 -249.053 -252.414 -255.456 -258.197 -260.643 -263.112 -265.236 -267.015 -268.81 -270.622 -272.09 -273.584 -275.085 -276.218 -277.343 -278.462 -279.607 -280.779 -281.574 -282.37 -283.57 -284.381 -285.225 -285.646 -286.473 -287.323 -288.195 -288.636 -289.47 -289.96 -290.441 -290.95 -291.986 -292.505 -293.053 -293.64 -294.262 -294.963 -295.854 -298.677 -7 ,5820 ,KEBNE ,17026190,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:52:59 CET,0.0 1.646 1.856 1.932 1.947 1.907 1.831 1.745 1.556 1.435 1.311 0.939 0.912 0.752 0.415 0.061 -0.29 -0.468 -0.839 -1.222 -1.813 -2.223 -2.655 -3.299 -3.933 -4.587 -5.255 -5.934 -6.85 -7.774 -8.711 -9.905 -11.118 -12.343 -13.842 -15.607 -17.379 -19.434 -21.771 -24.392 -27.316 -30.792 -35.087 -39.678 -45.407 -52.308 -60.959 -71.665 -85.594 -104.295 -131.325 -158.947 -178.764 -193.869 -205.738 -215.518 -223.448 -230.201 -235.735 -240.985 -245.265 -248.901 -252.233 -255.259 -257.969 -260.358 -262.772 -264.852 -266.596 -268.353 -270.112 -271.532 -272.971 -274.418 -275.511 -276.617 -277.737 -278.862 -279.997 -280.763 -281.546 -282.742 -283.549 -284.356 -284.758 -285.577 -286.433 -287.319 -287.768 -288.629 -289.155 -289.639 -290.13 -291.151 -291.702 -292.273 -292.873 -293.527 -294.251 -295.123 -297.382 -8 ,2591 ,KEBNE ,17026191,Wed Dec 22 13:53:46 CET,Wed Dec 22 15:52:56 CET,0.0 1.916 2.149 2.239 2.284 2.291 2.245 2.18 1.987 1.864 1.73 1.334 1.311 1.164 0.823 0.457 0.081 -0.112 -0.496 -0.886 -1.486 -1.881 -2.295 -2.925 -3.562 -4.235 -4.913 -5.594 -6.511 -7.439 -8.383 -9.579 -10.784 -11.993 -13.452 -15.194 -16.962 -18.985 -21.287 -23.895 -26.815 -30.282 -34.561 -39.16 -44.898 -51.746 -60.299 -70.925 -84.794 -103.41 -130.236 -157.579 -177.247 -192.295 -204.079 -213.804 -221.745 -228.461 -233.926 -239.133 -243.453 -247.13 -250.463 -253.516 -256.281 -258.688 -261.085 -263.164 -264.91 -266.665 -268.435 -269.867 -271.3 -272.751 -273.853 -274.954 -276.053 -277.182 -278.334 -279.104 -279.885 -281.073 -281.872 -282.682 -283.089 -283.909 -284.757 -285.651 -286.121 -287.001 -287.544 -288.036 -288.542 -289.605 -290.159 -290.764 -291.402 -292.047 -292.769 -293.63 -295.238 -9 ,22623 ,KEBNE ,17026192,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:54:48 CET,0.0 1.865 2.124 2.202 2.198 2.146 2.066 1.971 1.764 1.647 1.507 1.078 1.06 0.917 0.577 0.224 -0.135 -0.324 -0.716 -1.119 -1.737 -2.154 -2.573 -3.218 -3.881 -4.555 -5.232 -5.912 -6.828 -7.739 -8.669 -9.857 -11.061 -12.281 -13.761 -15.521 -17.312 -19.37 -21.695 -24.271 -27.102 -30.518 -34.796 -39.384 -45.092 -51.938 -60.557 -71.225 -85.174 -104.063 -131.055 -158.375 -178.014 -192.966 -204.692 -214.391 -222.288 -229.003 -234.507 -239.701 -243.95 -247.586 -250.922 -253.988 -256.737 -259.132 -261.518 -263.584 -265.325 -267.071 -268.83 -270.249 -271.681 -273.148 -274.277 -275.427 -276.587 -277.753 -278.924 -279.704 -280.496 -281.713 -282.536 -283.376 -283.809 -284.679 -285.565 -286.482 -286.938 -287.801 -288.356 -288.854 -289.387 -290.54 -291.144 -291.783 -292.443 -293.151 -293.969 -294.957 -297.44 -10 ,24055 ,KEBNE ,17026193,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:54:05 CET,0.0 2.494 2.809 2.929 2.964 2.944 2.896 2.831 2.67 2.569 2.438 2.013 1.973 1.819 1.506 1.183 0.847 0.672 0.302 -0.081 -0.676 -1.095 -1.518 -2.156 -2.804 -3.455 -4.125 -4.807 -5.732 -6.664 -7.586 -8.759 -9.973 -11.209 -12.706 -14.475 -16.257 -18.291 -20.591 -23.196 -26.09 -29.534 -33.823 -38.389 -44.065 -50.953 -59.591 -70.247 -84.111 -102.691 -129.427 -156.63 -176.124 -191.038 -202.776 -212.499 -220.405 -227.107 -232.601 -237.792 -242.025 -245.649 -248.952 -251.927 -254.596 -256.954 -259.321 -261.374 -263.128 -264.895 -266.665 -268.086 -269.523 -270.994 -272.105 -273.224 -274.355 -275.482 -276.636 -277.429 -278.236 -279.444 -280.261 -281.112 -281.55 -282.45 -283.356 -284.262 -284.716 -285.571 -286.128 -286.635 -287.164 -288.247 -288.811 -289.396 -289.994 -290.631 -291.366 -292.319 -295.073 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt deleted file mode 100644 index 7c6a5fea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20078 ,KEBNE ,17070494,Fri Dec 24 17:43:45 CET,Fri Dec 24 19:41:53 CET,0.0 2.126 2.704 3.139 3.503 3.818 4.093 4.346 4.82 5.03 5.216 5.451 5.731 5.893 6.195 6.491 6.766 6.904 7.203 7.476 7.848 8.085 8.317 8.666 9.011 9.358 9.694 10.013 10.427 10.841 11.248 11.749 12.235 12.705 13.266 13.901 14.493 15.085 15.714 16.416 17.158 17.97 18.892 19.824 20.922 22.233 23.8 25.539 27.644 30.2 33.431 36.17 37.806 38.868 39.524 39.926 40.161 40.31 40.353 40.356 40.337 40.293 40.22 40.118 40.013 39.893 39.769 39.65 39.541 39.44 39.302 39.161 39.008 38.836 38.694 38.545 38.387 38.222 38.041 37.897 37.746 37.509 37.338 37.163 37.071 36.892 36.677 36.427 36.299 36.072 35.859 35.69 35.517 35.11 34.859 34.56 34.232 33.865 33.375 32.711 30.424 -2 ,19073 ,KEBNE ,17070495,Fri Dec 24 17:43:49 CET,Fri Dec 24 19:33:31 CET,0.0 2.71 3.319 3.768 4.098 4.41 4.697 4.951 5.415 5.621 5.826 6.112 6.416 6.6 6.943 7.269 7.58 7.726 8.008 8.304 8.732 9.01 9.281 9.635 9.974 10.304 10.611 10.907 11.312 11.725 12.113 12.575 13.017 13.437 13.966 14.595 15.217 15.912 16.646 17.434 18.279 19.216 20.204 21.136 22.235 23.45 24.895 26.572 28.595 31.171 34.409 36.942 38.428 39.481 40.181 40.624 40.862 41.009 41.111 41.164 41.144 41.08 41.011 40.933 40.848 40.758 40.627 40.486 40.375 40.237 40.068 39.925 39.76 39.588 39.456 39.304 39.132 38.958 38.771 38.635 38.499 38.296 38.155 37.983 37.882 37.686 37.477 37.226 37.089 36.855 36.636 36.472 36.291 35.89 35.664 35.394 35.06 34.705 34.255 33.619 30.849 -3 ,11475 ,KEBNE ,17070496,Fri Dec 24 17:45:55 CET,Fri Dec 24 19:44:01 CET,0.0 2.743 3.306 3.723 4.069 4.377 4.669 4.949 5.466 5.687 5.883 6.13 6.44 6.622 6.961 7.276 7.557 7.694 7.973 8.235 8.618 8.879 9.126 9.481 9.83 10.159 10.49 10.821 11.237 11.644 12.052 12.557 13.055 13.524 14.057 14.673 15.279 15.952 16.675 17.411 18.174 19.093 20.141 21.173 22.446 23.931 25.627 27.52 29.858 32.794 36.498 39.602 41.399 42.51 43.263 43.82 44.176 44.389 44.486 44.527 44.526 44.478 44.406 44.31 44.197 44.077 43.916 43.753 43.623 43.485 43.321 43.184 43.045 42.885 42.751 42.603 42.437 42.251 42.042 41.88 41.715 41.473 41.286 41.075 40.973 40.774 40.561 40.312 40.175 39.947 39.696 39.524 39.338 38.92 38.69 38.407 38.059 37.653 37.153 36.408 33.571 -4 ,12381 ,KEBNE ,17070497,Fri Dec 24 17:46:59 CET,Fri Dec 24 19:44:01 CET,0.0 2.911 3.506 3.941 4.286 4.597 4.882 5.144 5.6 5.795 5.999 6.306 6.603 6.758 7.048 7.338 7.611 7.742 8.025 8.32 8.738 8.995 9.237 9.593 9.925 10.247 10.572 10.894 11.319 11.71 12.075 12.516 12.942 13.352 13.85 14.408 14.907 15.44 16.02 16.654 17.371 18.207 19.207 20.2 21.339 22.606 24.079 25.832 27.909 30.385 33.597 36.411 38.074 39.161 39.869 40.285 40.5 40.638 40.688 40.651 40.575 40.464 40.364 40.284 40.17 40.057 39.964 39.857 39.741 39.62 39.475 39.332 39.172 38.999 38.849 38.696 38.524 38.335 38.147 37.998 37.849 37.626 37.442 37.23 37.12 36.902 36.678 36.424 36.282 36.053 35.804 35.607 35.385 34.946 34.699 34.415 34.1 33.742 33.309 32.708 29.765 -5 ,11924 ,KEBNE ,17070498,Fri Dec 24 17:46:59 CET,Fri Dec 24 19:43:56 CET,0.0 3.652 4.245 4.645 5.017 5.34 5.599 5.839 6.299 6.503 6.698 6.963 7.248 7.417 7.742 8.062 8.375 8.528 8.82 9.089 9.458 9.693 9.93 10.276 10.594 10.902 11.213 11.514 11.915 12.31 12.68 13.111 13.524 13.93 14.427 14.97 15.447 15.98 16.582 17.255 18.016 18.89 19.897 20.87 21.953 23.178 24.666 26.478 28.679 31.323 34.643 37.484 39.182 40.22 40.863 41.267 41.53 41.711 41.816 41.86 41.821 41.774 41.74 41.669 41.555 41.447 41.342 41.21 41.068 40.913 40.758 40.634 40.484 40.309 40.167 40.009 39.835 39.663 39.477 39.339 39.196 38.954 38.774 38.575 38.466 38.254 38.039 37.793 37.649 37.407 37.164 36.987 36.802 36.398 36.168 35.912 35.626 35.261 34.785 34.108 31.363 -6 ,16794 ,KEBNE ,17070499,Fri Dec 24 17:48:04 CET,Fri Dec 24 19:45:54 CET,0.0 2.593 3.179 3.627 3.985 4.294 4.595 4.876 5.369 5.584 5.777 6.047 6.342 6.524 6.854 7.155 7.459 7.606 7.887 8.148 8.52 8.763 8.995 9.344 9.691 10.032 10.368 10.694 11.109 11.507 11.874 12.284 12.705 13.134 13.636 14.224 14.796 15.429 16.091 16.758 17.443 18.204 19.087 19.972 21.02 22.25 23.777 25.603 27.778 30.348 33.532 36.263 37.923 38.916 39.508 39.971 40.289 40.479 40.575 40.599 40.59 40.556 40.513 40.44 40.332 40.224 40.095 39.971 39.858 39.724 39.552 39.408 39.264 39.105 38.979 38.846 38.712 38.571 38.404 38.269 38.127 37.892 37.733 37.578 37.493 37.318 37.12 36.885 36.761 36.542 36.348 36.205 36.048 35.695 35.484 35.249 34.976 34.618 34.129 33.404 31.119 -7 ,8003 ,KEBNE ,17070500,Fri Dec 24 17:48:04 CET,Fri Dec 24 19:46:14 CET,0.0 3.506 4.13 4.584 4.963 5.26 5.535 5.786 6.236 6.457 6.67 6.936 7.228 7.398 7.737 8.062 8.372 8.519 8.801 9.083 9.471 9.72 9.965 10.315 10.664 10.995 11.306 11.614 12.03 12.435 12.81 13.261 13.721 14.162 14.668 15.259 15.823 16.425 17.071 17.771 18.515 19.365 20.351 21.334 22.534 23.917 25.587 27.496 29.662 32.222 35.487 38.281 39.814 40.678 41.198 41.491 41.621 41.655 41.639 41.602 41.546 41.442 41.271 41.095 40.926 40.752 40.545 40.346 40.181 39.994 39.783 39.596 39.397 39.18 39.005 38.835 38.652 38.443 38.199 38.018 37.818 37.483 37.251 37.022 36.901 36.623 36.314 36.001 35.85 35.599 35.316 35.102 34.862 34.332 34.046 33.739 33.393 32.989 32.456 31.69 28.308 -8 ,8325 ,KEBNE ,17070501,Fri Dec 24 17:49:09 CET,Fri Dec 24 19:46:29 CET,0.0 2.693 3.366 3.774 4.1 4.377 4.651 4.928 5.405 5.63 5.83 6.057 6.351 6.516 6.829 7.138 7.427 7.567 7.847 8.141 8.558 8.815 9.069 9.438 9.79 10.125 10.445 10.757 11.18 11.596 11.991 12.482 12.934 13.343 13.808 14.341 14.871 15.441 16.057 16.708 17.369 18.136 19.072 20.096 21.375 22.836 24.554 26.436 28.498 30.986 34.204 36.989 38.716 39.825 40.519 40.921 41.174 41.338 41.423 41.451 41.411 41.337 41.244 41.118 40.964 40.835 40.704 40.568 40.439 40.283 40.107 39.965 39.803 39.619 39.472 39.32 39.154 38.99 38.812 38.663 38.511 38.269 38.087 37.891 37.788 37.579 37.364 37.125 36.991 36.772 36.562 36.389 36.197 35.783 35.552 35.27 34.917 34.503 34.013 33.383 30.298 -9 ,27069 ,KEBNE ,17070502,Fri Dec 24 17:49:10 CET,Fri Dec 24 19:48:01 CET,0.0 3.205 3.821 4.288 4.691 5.025 5.324 5.608 6.091 6.302 6.521 6.853 7.152 7.329 7.678 7.994 8.299 8.447 8.725 8.985 9.36 9.606 9.848 10.218 10.575 10.906 11.223 11.537 11.958 12.362 12.741 13.171 13.588 14.017 14.493 15.017 15.534 16.104 16.725 17.38 18.057 18.82 19.781 20.812 21.978 23.238 24.704 26.399 28.438 30.979 34.134 36.822 38.441 39.37 39.956 40.377 40.598 40.714 40.788 40.83 40.802 40.72 40.632 40.542 40.446 40.32 40.155 39.998 39.84 39.663 39.478 39.303 39.111 38.91 38.746 38.581 38.402 38.203 37.986 37.829 37.674 37.424 37.236 37.027 36.912 36.679 36.437 36.177 36.034 35.792 35.538 35.358 35.172 34.765 34.513 34.224 33.909 33.507 32.991 32.331 29.053 -10 ,31361 ,KEBNE ,17070503,Fri Dec 24 17:50:13 CET,Fri Dec 24 19:48:23 CET,0.0 2.183 2.824 3.295 3.668 4.012 4.323 4.586 5.047 5.258 5.456 5.708 6.008 6.178 6.484 6.785 7.083 7.224 7.495 7.767 8.191 8.466 8.724 9.091 9.442 9.773 10.086 10.394 10.805 11.201 11.591 12.069 12.508 12.933 13.433 13.981 14.492 15.044 15.66 16.318 16.994 17.824 18.863 19.929 21.127 22.421 23.954 25.746 27.866 30.377 33.492 36.119 37.636 38.598 39.247 39.68 39.956 40.152 40.29 40.343 40.317 40.288 40.237 40.147 40.051 39.947 39.828 39.711 39.6 39.484 39.342 39.219 39.078 38.893 38.741 38.584 38.41 38.207 37.984 37.837 37.689 37.445 37.261 37.063 36.958 36.734 36.504 36.266 36.129 35.888 35.643 35.456 35.251 34.835 34.602 34.321 34.022 33.664 33.211 32.517 29.519 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt deleted file mode 100644 index 2d781f07..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9972 ,KEBNE ,16722242,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:53:09 CET,0.0 2.922 3.856 4.588 5.196 5.722 6.182 6.601 7.352 7.688 8.012 8.525 8.932 9.224 9.808 10.364 10.877 11.133 11.647 12.162 12.912 13.389 13.852 14.499 15.119 15.73 16.317 16.886 17.631 18.381 19.113 20.005 20.887 21.747 22.749 23.897 25.031 26.287 27.681 29.198 30.828 32.734 35.025 37.4 40.235 43.505 47.357 51.84 57.411 64.266 73.338 81.631 86.903 90.555 93.188 95.199 96.709 97.901 98.781 99.562 100.178 100.672 101.074 101.369 101.581 101.748 101.898 102.006 102.064 102.097 102.123 102.126 102.132 102.113 102.065 102.002 101.916 101.795 101.657 101.551 101.429 101.199 101.019 100.829 100.728 100.541 100.316 100.053 99.926 99.767 99.435 99.235 99.013 98.515 98.25 97.941 97.533 97.044 96.443 95.586 92.004 -2 ,27 ,KEBNE ,16722243,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:53:59 CET,0.0 2.728 3.553 4.166 4.656 5.113 5.538 5.941 6.668 7.005 7.329 7.821 8.222 8.513 9.076 9.611 10.11 10.349 10.839 11.319 12.014 12.465 12.9 13.528 14.135 14.726 15.297 15.856 16.584 17.29 17.977 18.819 19.638 20.436 21.401 22.539 23.655 24.9 26.28 27.767 29.36 31.216 33.431 35.749 38.548 41.695 45.336 49.534 54.775 61.424 70.197 78.239 83.501 87.322 90.052 92.066 93.62 94.845 95.795 96.624 97.222 97.695 98.1 98.44 98.712 98.9 99.06 99.201 99.295 99.373 99.448 99.485 99.501 99.496 99.473 99.441 99.395 99.346 99.287 99.232 99.166 99.057 98.964 98.852 98.792 98.644 98.485 98.317 98.221 98.101 97.878 97.745 97.6 97.242 97.022 96.756 96.404 95.971 95.43 94.61 90.469 -3 ,31836 ,KEBNE ,16722244,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:54:54 CET,0.0 2.902 3.826 4.499 5.042 5.507 5.938 6.374 7.169 7.514 7.842 8.356 8.757 9.035 9.591 10.147 10.693 10.962 11.482 11.968 12.659 13.102 13.532 14.191 14.855 15.483 16.085 16.671 17.423 18.153 18.879 19.767 20.637 21.503 22.515 23.659 24.78 26.032 27.423 28.941 30.56 32.423 34.686 37.059 39.861 43.056 46.909 51.458 56.972 64.006 73.572 82.195 87.723 91.644 94.444 96.533 98.129 99.389 100.299 101.081 101.721 102.261 102.739 103.128 103.398 103.581 103.732 103.859 103.956 104.014 104.039 104.041 103.996 103.911 103.853 103.782 103.683 103.578 103.47 103.377 103.263 103.087 102.967 102.829 102.746 102.542 102.306 102.028 101.876 101.711 101.386 101.199 100.992 100.53 100.262 99.954 99.556 99.041 98.343 97.347 93.449 -4 ,19372 ,KEBNE ,16722245,Sat Nov 27 22:55:04 CET,Sun Nov 28 00:53:34 CET,0.0 2.87 3.725 4.367 4.885 5.321 5.729 6.127 6.863 7.186 7.488 7.956 8.362 8.64 9.182 9.697 10.195 10.444 10.909 11.34 11.992 12.428 12.873 13.532 14.162 14.768 15.349 15.907 16.628 17.337 18.018 18.852 19.675 20.498 21.493 22.644 23.781 25.069 26.484 27.994 29.612 31.483 33.709 36.045 38.874 42.137 46.104 50.717 56.404 63.683 73.372 82.218 87.946 91.95 94.787 96.96 98.637 99.95 100.924 101.799 102.507 103.041 103.498 103.902 104.223 104.482 104.666 104.774 104.813 104.812 104.845 104.89 104.956 105.021 105.042 105.036 105.018 104.958 104.854 104.75 104.619 104.423 104.283 104.123 104.029 103.822 103.597 103.358 103.233 103.08 102.745 102.568 102.378 101.942 101.699 101.414 101.061 100.634 100.104 99.32 94.187 -5 ,5643 ,KEBNE ,16722246,Sat Nov 27 22:57:06 CET,Sun Nov 28 00:57:54 CET,0.0 3.576 4.443 5.034 5.596 6.093 6.491 6.862 7.556 7.873 8.172 8.632 9.014 9.281 9.808 10.32 10.807 11.051 11.534 12.005 12.698 13.135 13.558 14.178 14.772 15.349 15.913 16.466 17.206 17.935 18.63 19.469 20.289 21.107 22.075 23.182 24.262 25.475 26.815 28.253 29.809 31.629 33.801 36.038 38.733 41.799 45.41 49.703 55.089 61.889 70.714 78.95 84.474 88.271 90.959 93.004 94.537 95.687 96.551 97.353 97.96 98.381 98.743 99.091 99.338 99.494 99.645 99.741 99.805 99.842 99.844 99.848 99.844 99.831 99.813 99.773 99.701 99.606 99.503 99.421 99.313 99.136 98.989 98.807 98.713 98.522 98.324 98.084 97.945 97.784 97.473 97.291 97.08 96.604 96.327 96.006 95.63 95.168 94.553 93.672 89.673 -6 ,2498 ,KEBNE ,16722247,Sat Nov 27 22:57:06 CET,Sun Nov 28 00:57:13 CET,0.0 3.424 4.407 5.152 5.747 6.195 6.585 6.968 7.66 7.977 8.279 8.746 9.13 9.408 9.965 10.478 10.95 11.18 11.635 12.078 12.722 13.152 13.575 14.201 14.829 15.441 16.039 16.615 17.352 18.055 18.751 19.621 20.471 21.302 22.285 23.395 24.476 25.694 27.048 28.525 30.129 31.997 34.214 36.515 39.269 42.435 46.252 50.854 56.622 63.835 73.458 82.397 88.302 92.434 95.256 97.444 99.253 100.768 101.921 102.866 103.561 104.138 104.616 105.003 105.312 105.492 105.629 105.758 105.848 105.927 105.987 106.031 106.072 106.056 106.002 105.929 105.858 105.779 105.652 105.556 105.454 105.275 105.129 104.984 104.907 104.722 104.517 104.269 104.128 103.976 103.689 103.514 103.322 102.865 102.604 102.292 101.89 101.364 100.714 99.841 95.954 -10 ,27240 ,KEBNE ,16722251,Sat Nov 27 23:18:35 CET,Sun Nov 28 01:17:21 CET,0.0 4.663 5.677 6.45 7.094 7.643 8.119 8.556 9.38 9.763 10.13 10.712 11.158 11.482 12.09 12.659 13.204 13.473 13.998 14.498 15.214 15.692 16.155 16.812 17.447 18.076 18.685 19.276 20.049 20.787 21.499 22.364 23.213 24.046 25.024 26.158 27.279 28.534 29.945 31.489 33.141 35.033 37.276 39.637 42.516 45.819 49.733 54.206 59.581 66.391 75.464 83.671 89.001 92.742 95.429 97.462 98.973 100.168 101.115 101.952 102.559 102.979 103.347 103.666 103.88 103.99 104.026 104.052 104.073 104.081 104.072 104.05 103.989 103.892 103.805 103.705 103.601 103.483 103.357 103.253 103.116 102.881 102.7 102.497 102.384 102.137 101.876 101.583 101.421 101.236 100.865 100.648 100.428 99.927 99.623 99.273 98.852 98.346 97.718 96.819 93.232 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt deleted file mode 100644 index 51f3593e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15951 ,KEBNE ,16722252,Sat Nov 27 23:18:35 CET,Sun Nov 28 01:20:10 CET,0.0 1.105 1.493 1.799 2.077 2.337 2.585 2.807 3.177 3.345 3.51 3.718 3.981 4.131 4.43 4.712 4.976 5.1 5.336 5.571 5.903 6.11 6.315 6.618 6.909 7.18 7.444 7.699 8.018 8.33 8.63 8.993 9.331 9.646 10.017 10.433 10.827 11.258 11.717 12.199 12.693 13.226 13.865 14.528 15.276 16.089 17.014 18.053 19.254 20.547 21.875 22.721 22.981 22.933 22.778 22.561 22.319 22.029 21.719 21.417 21.154 20.881 20.606 20.333 20.076 19.85 19.607 19.379 19.179 18.961 18.723 18.524 18.289 18.048 17.854 17.63 17.391 17.14 16.887 16.711 16.522 16.203 15.98 15.751 15.628 15.381 15.117 14.839 14.701 14.447 14.22 14.029 13.811 13.329 13.066 12.768 12.438 12.063 11.573 10.855 7.269 -2 ,25543 ,KEBNE ,16722253,Sat Nov 27 23:18:35 CET,Sun Nov 28 01:17:54 CET,0.0 1.034 1.431 1.703 1.93 2.164 2.379 2.573 2.937 3.095 3.242 3.42 3.668 3.807 4.092 4.354 4.594 4.708 4.939 5.16 5.458 5.653 5.846 6.124 6.394 6.654 6.898 7.129 7.437 7.731 8.017 8.365 8.675 8.982 9.358 9.778 10.183 10.626 11.072 11.537 12.047 12.61 13.266 13.923 14.65 15.423 16.324 17.327 18.391 19.525 20.745 21.465 21.608 21.517 21.314 21.011 20.637 20.251 19.95 19.589 19.25 18.951 18.635 18.327 18.034 17.766 17.456 17.153 16.903 16.654 16.379 16.144 15.896 15.641 15.43 15.204 14.981 14.749 14.499 14.318 14.136 13.856 13.648 13.425 13.305 13.044 12.769 12.456 12.286 12.02 11.766 11.579 11.371 10.91 10.641 10.327 9.988 9.591 9.08 8.331 4.888 -6 ,24484 ,KEBNE ,16722257,Sat Nov 27 23:18:35 CET,Sun Nov 28 01:18:49 CET,0.0 0.911 1.247 1.525 1.795 2.055 2.295 2.502 2.872 3.044 3.198 3.376 3.628 3.758 4.02 4.275 4.514 4.637 4.874 5.104 5.446 5.659 5.855 6.129 6.385 6.618 6.838 7.062 7.376 7.67 7.956 8.3 8.615 8.933 9.297 9.697 10.101 10.527 10.965 11.435 11.917 12.469 13.1 13.729 14.452 15.218 16.132 17.167 18.355 19.719 21.067 21.926 22.214 22.139 21.966 21.708 21.379 21.024 20.694 20.326 19.958 19.627 19.278 18.956 18.686 18.433 18.143 17.86 17.609 17.338 17.044 16.783 16.509 16.223 15.996 15.761 15.542 15.309 15.041 14.85 14.651 14.323 14.089 13.846 13.716 13.437 13.126 12.793 12.625 12.35 12.081 11.883 11.668 11.18 10.883 10.547 10.177 9.751 9.174 8.381 5.162 -7 ,31139 ,KEBNE ,16722258,Sat Nov 27 23:18:35 CET,Sun Nov 28 01:19:41 CET,0.0 0.989 1.311 1.576 1.831 2.068 2.265 2.441 2.78 2.952 3.116 3.296 3.56 3.706 4.007 4.274 4.508 4.624 4.856 5.078 5.39 5.604 5.812 6.096 6.369 6.634 6.894 7.147 7.458 7.755 8.052 8.437 8.806 9.147 9.535 9.957 10.358 10.81 11.312 11.825 12.352 12.963 13.675 14.376 15.183 16.044 17.036 18.143 19.357 20.679 21.986 22.771 23.046 23.046 22.89 22.643 22.376 22.088 21.794 21.461 21.129 20.843 20.588 20.318 20.053 19.815 19.547 19.3 19.076 18.842 18.6 18.37 18.112 17.845 17.624 17.374 17.123 16.866 16.591 16.4 16.198 15.892 15.672 15.428 15.296 15.032 14.76 14.434 14.251 13.957 13.698 13.5 13.28 12.781 12.509 12.199 11.84 11.435 10.95 10.22 5.634 -8 ,9253 ,KEBNE ,16722259,Sat Nov 27 23:18:35 CET,Sun Nov 28 01:18:23 CET,0.0 1.233 1.699 2.044 2.342 2.612 2.863 3.076 3.432 3.604 3.772 3.934 4.198 4.345 4.623 4.894 5.153 5.281 5.53 5.766 6.103 6.317 6.514 6.787 7.055 7.318 7.572 7.811 8.113 8.406 8.69 9.037 9.381 9.715 10.086 10.492 10.879 11.328 11.821 12.333 12.873 13.449 14.112 14.783 15.529 16.325 17.235 18.281 19.531 20.969 22.55 23.638 24.11 24.221 24.126 23.926 23.625 23.272 22.916 22.53 22.215 21.925 21.613 21.323 21.06 20.777 20.476 20.227 20.01 19.762 19.474 19.252 19.023 18.774 18.584 18.387 18.184 17.958 17.706 17.539 17.361 17.077 16.889 16.685 16.574 16.329 16.063 15.771 15.619 15.37 15.154 14.974 14.765 14.237 13.934 13.617 13.272 12.862 12.337 11.567 6.518 -9 ,28801 ,KEBNE ,16722260,Sat Nov 27 23:20:38 CET,Sun Nov 28 01:20:13 CET,0.0 0.935 1.321 1.64 1.932 2.194 2.429 2.645 3.064 3.263 3.446 3.64 3.912 4.062 4.334 4.593 4.852 4.974 5.207 5.424 5.738 5.941 6.132 6.425 6.701 6.964 7.229 7.481 7.809 8.133 8.437 8.791 9.128 9.44 9.791 10.191 10.574 10.996 11.458 11.944 12.433 12.977 13.638 14.289 15.029 15.868 16.825 17.885 19.112 20.497 21.946 22.899 23.215 23.18 22.942 22.635 22.314 21.966 21.636 21.283 20.973 20.695 20.408 20.115 19.81 19.505 19.207 18.953 18.723 18.473 18.215 17.985 17.732 17.466 17.258 17.039 16.803 16.562 16.319 16.144 15.96 15.669 15.458 15.232 15.117 14.881 14.619 14.338 14.19 13.928 13.64 13.439 13.225 12.747 12.486 12.175 11.801 11.383 10.887 10.156 6.115 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt deleted file mode 100644 index f43246c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16189 ,KEBNE ,16722262,Sat Nov 27 23:20:38 CET,Sun Nov 28 01:18:28 CET,0.0 2.723 3.148 3.424 3.64 3.804 3.922 4.02 4.2 4.256 4.302 4.279 4.417 4.44 4.485 4.513 4.528 4.531 4.53 4.521 4.486 4.459 4.421 4.34 4.252 4.163 4.059 3.949 3.796 3.625 3.447 3.212 2.965 2.702 2.372 1.973 1.563 1.108 0.567 -0.063 -0.771 -1.659 -2.798 -4.05 -5.663 -7.665 -10.205 -13.411 -17.67 -23.523 -32.255 -41.504 -48.347 -53.698 -58.044 -61.679 -64.65 -67.204 -69.314 -71.345 -73.04 -74.512 -75.88 -77.129 -78.257 -79.262 -80.275 -81.142 -81.88 -82.648 -83.439 -84.081 -84.73 -85.395 -85.903 -86.426 -86.968 -87.514 -88.07 -88.444 -88.824 -89.412 -89.805 -90.207 -90.414 -90.831 -91.254 -91.693 -91.915 -92.363 -92.636 -92.89 -93.166 -93.763 -94.073 -94.415 -94.796 -95.214 -95.69 -96.313 -98.5 -2 ,21287 ,KEBNE ,16722263,Sat Nov 27 23:20:38 CET,Sun Nov 28 01:18:52 CET,0.0 3.04 3.494 3.801 4.044 4.227 4.383 4.51 4.686 4.767 4.84 4.835 4.995 5.036 5.074 5.1 5.12 5.118 5.106 5.092 5.057 5.022 4.989 4.936 4.856 4.759 4.665 4.558 4.386 4.197 3.991 3.724 3.45 3.179 2.862 2.472 2.066 1.592 1.024 0.356 -0.381 -1.288 -2.477 -3.782 -5.401 -7.387 -9.941 -13.154 -17.483 -23.533 -32.532 -41.967 -48.881 -54.203 -58.433 -61.955 -64.885 -67.425 -69.537 -71.574 -73.254 -74.703 -76.058 -77.31 -78.425 -79.402 -80.408 -81.311 -82.06 -82.814 -83.616 -84.26 -84.898 -85.547 -86.043 -86.564 -87.089 -87.62 -88.167 -88.536 -88.921 -89.515 -89.922 -90.339 -90.543 -90.954 -91.394 -91.862 -92.11 -92.582 -92.898 -93.171 -93.44 -94.005 -94.316 -94.655 -95.034 -95.468 -95.957 -96.632 -98.912 -4 ,15843 ,KEBNE ,16722265,Sat Nov 27 23:21:39 CET,Sun Nov 28 01:19:51 CET,0.0 1.812 2.263 2.56 2.761 2.907 3.025 3.128 3.31 3.381 3.434 3.406 3.547 3.566 3.611 3.651 3.673 3.681 3.694 3.691 3.653 3.62 3.577 3.502 3.423 3.341 3.249 3.136 2.964 2.796 2.623 2.396 2.156 1.896 1.572 1.157 0.736 0.278 -0.257 -0.903 -1.646 -2.541 -3.684 -4.972 -6.623 -8.604 -11.087 -14.272 -18.598 -24.563 -33.365 -42.522 -49.205 -54.386 -58.591 -62.171 -65.143 -67.702 -69.814 -71.827 -73.508 -74.957 -76.3 -77.533 -78.632 -79.617 -80.613 -81.484 -82.226 -82.977 -83.752 -84.377 -85.014 -85.681 -86.194 -86.709 -87.211 -87.711 -88.248 -88.626 -89.01 -89.583 -89.975 -90.382 -90.587 -91.004 -91.417 -91.84 -92.064 -92.513 -92.819 -93.074 -93.332 -93.929 -94.267 -94.61 -94.962 -95.347 -95.817 -96.444 -99.056 -5 ,27818 ,KEBNE ,16722266,Sat Nov 27 23:21:39 CET,Sun Nov 28 01:19:40 CET,0.0 2.16 2.597 2.867 3.08 3.256 3.399 3.529 3.722 3.785 3.851 3.851 3.997 4.03 4.081 4.101 4.123 4.134 4.129 4.107 4.075 4.055 4.036 3.98 3.881 3.776 3.666 3.547 3.372 3.189 3.008 2.77 2.516 2.255 1.941 1.562 1.157 0.665 0.087 -0.552 -1.291 -2.187 -3.324 -4.574 -6.135 -8.078 -10.559 -13.716 -17.928 -23.695 -32.219 -41.205 -47.843 -53.048 -57.183 -60.596 -63.437 -65.891 -67.939 -69.915 -71.532 -72.918 -74.205 -75.399 -76.49 -77.454 -78.435 -79.298 -80.016 -80.759 -81.526 -82.141 -82.766 -83.402 -83.889 -84.389 -84.896 -85.412 -85.943 -86.303 -86.674 -87.256 -87.653 -88.056 -88.263 -88.679 -89.114 -89.578 -89.822 -90.275 -90.556 -90.809 -91.073 -91.638 -91.959 -92.315 -92.696 -93.131 -93.627 -94.274 -96.58 -6 ,6774 ,KEBNE ,16722267,Sat Nov 27 23:21:39 CET,Sun Nov 28 01:19:39 CET,0.0 2.024 2.477 2.785 3.007 3.158 3.291 3.402 3.561 3.625 3.678 3.653 3.795 3.818 3.842 3.859 3.875 3.872 3.854 3.828 3.776 3.742 3.698 3.614 3.536 3.452 3.352 3.235 3.067 2.902 2.734 2.501 2.252 1.986 1.646 1.235 0.813 0.319 -0.247 -0.902 -1.642 -2.534 -3.651 -4.871 -6.466 -8.458 -10.967 -14.142 -18.472 -24.483 -33.402 -42.761 -49.7 -55.086 -59.379 -63.015 -66.005 -68.557 -70.689 -72.749 -74.455 -75.921 -77.272 -78.507 -79.623 -80.624 -81.657 -82.552 -83.301 -84.069 -84.855 -85.483 -86.139 -86.82 -87.329 -87.847 -88.373 -88.905 -89.455 -89.834 -90.209 -90.78 -91.184 -91.59 -91.797 -92.228 -92.668 -93.134 -93.376 -93.831 -94.136 -94.406 -94.697 -95.318 -95.641 -96.009 -96.426 -96.887 -97.414 -98.085 -100.361 -7 ,25270 ,KEBNE ,16722268,Sat Nov 27 23:21:39 CET,Sun Nov 28 01:21:41 CET,0.0 1.91 2.354 2.635 2.851 3.016 3.154 3.272 3.446 3.515 3.567 3.546 3.693 3.724 3.777 3.813 3.831 3.835 3.842 3.846 3.842 3.821 3.789 3.74 3.678 3.601 3.507 3.402 3.265 3.134 2.973 2.736 2.494 2.251 1.955 1.592 1.209 0.735 0.161 -0.5 -1.244 -2.141 -3.283 -4.556 -6.179 -8.114 -10.613 -13.812 -18.097 -24.031 -32.816 -42.075 -48.876 -54.211 -58.513 -62.061 -64.951 -67.467 -69.559 -71.588 -73.282 -74.744 -76.097 -77.328 -78.443 -79.426 -80.408 -81.272 -82.015 -82.781 -83.577 -84.225 -84.889 -85.572 -86.09 -86.616 -87.154 -87.697 -88.258 -88.639 -89.027 -89.618 -90.02 -90.43 -90.642 -91.087 -91.55 -92.033 -92.286 -92.754 -93.042 -93.318 -93.596 -94.173 -94.509 -94.885 -95.299 -95.754 -96.273 -96.942 -99.37 -8 ,6541 ,KEBNE ,16722269,Sat Nov 27 23:21:40 CET,Sun Nov 28 01:19:50 CET,0.0 2.071 2.533 2.819 3.029 3.198 3.327 3.446 3.665 3.753 3.817 3.79 3.944 3.971 4.022 4.071 4.093 4.096 4.101 4.09 4.067 4.038 4.003 3.946 3.872 3.805 3.73 3.625 3.469 3.307 3.129 2.885 2.641 2.395 2.075 1.689 1.279 0.784 0.227 -0.424 -1.178 -2.108 -3.289 -4.571 -6.173 -8.102 -10.635 -13.828 -18.095 -24.11 -33.074 -42.603 -49.613 -55.032 -59.338 -62.964 -65.974 -68.552 -70.675 -72.703 -74.382 -75.843 -77.196 -78.434 -79.538 -80.504 -81.501 -82.384 -83.132 -83.877 -84.636 -85.265 -85.904 -86.561 -87.062 -87.557 -88.053 -88.571 -89.108 -89.472 -89.836 -90.393 -90.784 -91.186 -91.391 -91.821 -92.273 -92.734 -92.964 -93.41 -93.703 -93.982 -94.261 -94.845 -95.178 -95.529 -95.889 -96.287 -96.771 -97.433 -99.417 -10 ,16489 ,KEBNE ,16722271,Sat Nov 27 23:21:40 CET,Sun Nov 28 01:20:14 CET,0.0 2.288 2.749 3.053 3.271 3.428 3.55 3.655 3.846 3.922 3.975 3.943 4.08 4.101 4.137 4.151 4.143 4.134 4.11 4.084 4.038 4.007 3.978 3.914 3.84 3.755 3.663 3.569 3.424 3.261 3.092 2.857 2.594 2.318 1.978 1.576 1.144 0.628 0.03 -0.64 -1.37 -2.257 -3.387 -4.611 -6.176 -8.127 -10.628 -13.8 -18.049 -23.924 -32.675 -41.933 -48.788 -54.141 -58.426 -62.04 -65.02 -67.558 -69.665 -71.702 -73.389 -74.839 -76.185 -77.435 -78.587 -79.624 -80.663 -81.562 -82.322 -83.073 -83.821 -84.436 -85.069 -85.718 -86.217 -86.713 -87.219 -87.762 -88.327 -88.701 -89.075 -89.642 -90.037 -90.455 -90.664 -91.097 -91.555 -92.027 -92.278 -92.755 -93.054 -93.319 -93.596 -94.197 -94.546 -94.946 -95.387 -95.845 -96.338 -96.98 -99.743 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt deleted file mode 100644 index 5e14fc2c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7616 ,KEBNE ,16748523,Tue Nov 30 05:10:33 CET,Tue Nov 30 07:14:57 CET,0.0 1.01 1.406 1.731 1.969 2.163 2.349 2.519 2.824 2.98 3.133 3.061 3.502 3.63 3.867 4.088 4.297 4.395 4.577 4.753 5.02 5.188 5.35 5.583 5.798 5.994 6.188 6.374 6.606 6.816 7.007 7.247 7.482 7.703 7.958 8.23 8.482 8.759 9.044 9.349 9.645 9.956 10.32 10.653 11.014 11.392 11.771 12.13 12.415 12.546 12.36 11.717 10.881 10.055 9.289 8.553 7.923 7.353 6.841 6.311 5.853 5.437 5.015 4.612 4.229 3.863 3.488 3.147 2.85 2.551 2.24 1.97 1.684 1.384 1.137 0.882 0.627 0.355 0.063 -0.127 -0.321 -0.642 -0.854 -1.09 -1.216 -1.468 -1.738 -2.013 -2.168 -2.656 -2.692 -2.888 -3.087 -3.516 -3.779 -4.107 -4.471 -4.885 -5.401 -6.081 -9.63 -2 ,1150 ,KEBNE ,16748524,Tue Nov 30 05:11:34 CET,Tue Nov 30 07:12:51 CET,0.0 0.95 1.423 1.775 2.029 2.271 2.499 2.689 3.015 3.173 3.327 3.294 3.748 3.865 4.072 4.271 4.459 4.552 4.729 4.894 5.138 5.297 5.452 5.679 5.897 6.111 6.318 6.507 6.739 6.948 7.144 7.38 7.603 7.821 8.085 8.374 8.636 8.901 9.167 9.45 9.735 10.04 10.414 10.783 11.138 11.478 11.836 12.177 12.466 12.616 12.371 11.608 10.869 10.197 9.53 8.915 8.394 7.879 7.385 6.887 6.462 6.085 5.711 5.32 4.946 4.621 4.26 3.92 3.638 3.346 3.038 2.782 2.504 2.208 1.98 1.745 1.502 1.248 0.98 0.79 0.589 0.274 0.053 -0.179 -0.307 -0.585 -0.874 -1.188 -1.361 -1.86 -1.904 -2.106 -2.322 -2.792 -3.046 -3.331 -3.69 -4.121 -4.633 -5.3 -8.368 -3 ,9836 ,KEBNE ,16748525,Tue Nov 30 05:13:35 CET,Tue Nov 30 07:16:27 CET,0.0 0.922 1.284 1.585 1.84 2.054 2.246 2.428 2.763 2.928 3.071 3.01 3.455 3.569 3.787 4.004 4.214 4.312 4.495 4.664 4.903 5.064 5.222 5.439 5.64 5.823 5.992 6.163 6.405 6.637 6.844 7.078 7.316 7.548 7.801 8.071 8.309 8.589 8.877 9.139 9.407 9.71 10.048 10.362 10.684 11.026 11.411 11.784 12.166 12.475 12.423 11.847 11.149 10.472 9.858 9.233 8.679 8.175 7.714 7.265 6.847 6.432 6.008 5.578 5.168 4.801 4.421 4.087 3.807 3.528 3.232 2.961 2.659 2.343 2.102 1.859 1.604 1.331 1.021 0.803 0.587 0.251 0.018 -0.228 -0.351 -0.589 -0.844 -1.129 -1.285 -1.762 -1.792 -1.99 -2.207 -2.69 -2.96 -3.261 -3.587 -3.974 -4.475 -5.17 -8.469 -4 ,18122 ,KEBNE ,16748526,Tue Nov 30 05:13:35 CET,Tue Nov 30 07:17:05 CET,0.0 0.923 1.298 1.582 1.823 2.039 2.228 2.407 2.764 2.925 3.075 3.029 3.475 3.599 3.85 4.084 4.287 4.379 4.563 4.733 4.969 5.123 5.271 5.489 5.702 5.902 6.089 6.266 6.5 6.732 6.939 7.184 7.428 7.655 7.905 8.177 8.435 8.715 9.015 9.314 9.62 9.957 10.327 10.69 11.082 11.487 11.92 12.366 12.763 12.988 12.941 12.503 11.919 11.302 10.709 10.144 9.583 9.06 8.616 8.129 7.695 7.292 6.914 6.563 6.219 5.894 5.539 5.231 4.973 4.676 4.357 4.093 3.795 3.478 3.235 2.99 2.748 2.484 2.209 2.019 1.819 1.496 1.268 1.026 0.897 0.64 0.366 0.04 -0.135 -0.64 -0.692 -0.879 -1.072 -1.531 -1.795 -2.089 -2.428 -2.793 -3.27 -3.925 -6.475 -5 ,16369 ,KEBNE ,16748527,Tue Nov 30 05:18:41 CET,Tue Nov 30 07:20:03 CET,0.0 1.0 1.406 1.717 1.988 2.201 2.385 2.567 2.885 3.037 3.183 3.121 3.564 3.682 3.914 4.135 4.354 4.454 4.641 4.831 5.093 5.255 5.421 5.654 5.864 6.063 6.262 6.455 6.682 6.892 7.1 7.351 7.588 7.808 8.061 8.35 8.61 8.87 9.142 9.446 9.778 10.118 10.467 10.807 11.194 11.598 12.007 12.395 12.726 12.938 12.91 12.478 11.888 11.285 10.697 10.1 9.543 9.038 8.601 8.14 7.705 7.317 6.952 6.582 6.219 5.872 5.505 5.191 4.917 4.622 4.302 4.034 3.766 3.492 3.277 3.037 2.785 2.523 2.259 2.086 1.903 1.602 1.381 1.144 1.017 0.746 0.468 0.166 0.003 -0.489 -0.522 -0.713 -0.918 -1.36 -1.629 -1.933 -2.262 -2.656 -3.15 -3.865 -7.01 -6 ,25238 ,KEBNE ,16748528,Tue Nov 30 05:20:42 CET,Tue Nov 30 07:21:38 CET,0.0 1.255 1.618 1.878 2.118 2.323 2.525 2.725 3.068 3.211 3.351 3.295 3.732 3.842 4.063 4.268 4.453 4.549 4.737 4.907 5.157 5.319 5.47 5.68 5.883 6.077 6.26 6.429 6.643 6.861 7.076 7.323 7.554 7.777 8.033 8.321 8.581 8.852 9.138 9.441 9.752 10.089 10.471 10.838 11.239 11.639 12.061 12.463 12.785 12.964 12.805 12.243 11.643 11.002 10.328 9.655 9.052 8.506 7.999 7.467 7.01 6.587 6.159 5.75 5.363 4.999 4.611 4.276 3.992 3.696 3.372 3.073 2.77 2.462 2.214 1.967 1.708 1.434 1.155 0.952 0.737 0.409 0.182 -0.072 -0.204 -0.448 -0.712 -0.997 -1.143 -1.632 -1.659 -1.852 -2.066 -2.527 -2.797 -3.105 -3.424 -3.773 -4.225 -4.921 -7.195 -7 ,17950 ,KEBNE ,16748529,Tue Nov 30 05:24:51 CET,Tue Nov 30 07:17:54 CET,0.0 1.392 1.776 2.065 2.298 2.499 2.688 2.868 3.19 3.335 3.467 3.396 3.838 3.952 4.176 4.388 4.577 4.666 4.838 5.003 5.242 5.393 5.539 5.749 5.96 6.153 6.323 6.485 6.695 6.904 7.104 7.333 7.55 7.755 7.989 8.255 8.505 8.762 9.031 9.321 9.618 9.93 10.281 10.632 11.029 11.408 11.787 12.161 12.467 12.628 12.502 11.91 11.18 10.447 9.77 9.125 8.525 7.967 7.487 7.002 6.554 6.143 5.752 5.386 5.034 4.709 4.392 4.114 3.875 3.62 3.326 3.059 2.789 2.515 2.303 2.085 1.858 1.625 1.376 1.209 1.031 0.736 0.523 0.297 0.178 -0.061 -0.305 -0.569 -0.71 -1.192 -1.201 -1.378 -1.56 -1.976 -2.205 -2.453 -2.739 -3.093 -3.536 -4.175 -7.423 -8 ,20262 ,KEBNE ,16748530,Tue Nov 30 05:29:52 CET,Tue Nov 30 07:30:13 CET,0.0 1.074 1.482 1.814 2.081 2.302 2.502 2.673 2.99 3.141 3.28 3.225 3.667 3.783 4.021 4.238 4.442 4.548 4.747 4.928 5.175 5.337 5.5 5.732 5.96 6.17 6.365 6.545 6.772 6.988 7.187 7.423 7.655 7.876 8.135 8.433 8.692 8.957 9.235 9.521 9.824 10.153 10.513 10.843 11.164 11.49 11.843 12.21 12.55 12.745 12.629 12.067 11.387 10.691 10.011 9.369 8.771 8.203 7.685 7.159 6.697 6.269 5.851 5.438 5.059 4.73 4.378 4.043 3.749 3.45 3.139 2.882 2.612 2.331 2.096 1.85 1.597 1.332 1.074 0.888 0.696 0.426 0.222 -0.018 -0.14 -0.389 -0.651 -0.936 -1.091 -1.574 -1.576 -1.755 -1.958 -2.395 -2.624 -2.879 -3.166 -3.522 -3.985 -4.624 -7.719 -9 ,2314 ,KEBNE ,16748531,Tue Nov 30 05:45:10 CET,Tue Nov 30 07:46:16 CET,0.0 1.014 1.421 1.766 2.034 2.242 2.424 2.602 2.925 3.084 3.232 3.178 3.632 3.752 3.989 4.209 4.407 4.501 4.688 4.864 5.118 5.273 5.426 5.65 5.855 6.043 6.221 6.394 6.612 6.815 7.019 7.272 7.515 7.75 8.01 8.279 8.541 8.834 9.126 9.405 9.693 10.014 10.375 10.718 11.089 11.457 11.804 12.098 12.335 12.479 12.291 11.538 10.748 10.039 9.343 8.658 8.055 7.528 7.041 6.509 6.039 5.622 5.215 4.807 4.41 4.04 3.65 3.308 3.022 2.724 2.403 2.134 1.852 1.569 1.346 1.104 0.862 0.62 0.352 0.16 -0.034 -0.359 -0.591 -0.838 -0.963 -1.213 -1.477 -1.762 -1.92 -2.413 -2.459 -2.653 -2.86 -3.34 -3.606 -3.899 -4.239 -4.615 -5.113 -5.832 -9.007 -10 ,16200 ,KEBNE ,16748532,Tue Nov 30 05:51:16 CET,Tue Nov 30 07:52:24 CET,0.0 1.066 1.448 1.747 1.994 2.212 2.411 2.589 2.904 3.056 3.199 3.126 3.566 3.685 3.923 4.145 4.352 4.448 4.625 4.803 5.068 5.236 5.395 5.604 5.808 6.021 6.219 6.409 6.663 6.886 7.086 7.327 7.557 7.786 8.03 8.281 8.526 8.787 9.078 9.394 9.693 9.994 10.322 10.651 11.022 11.397 11.784 12.148 12.448 12.559 12.297 11.596 10.76 9.969 9.309 8.688 8.113 7.574 7.079 6.587 6.161 5.768 5.398 5.035 4.688 4.364 4.005 3.684 3.41 3.12 2.821 2.569 2.3 2.028 1.81 1.577 1.333 1.076 0.801 0.617 0.434 0.135 -0.077 -0.309 -0.431 -0.678 -0.944 -1.236 -1.381 -1.853 -1.91 -2.109 -2.307 -2.76 -3.012 -3.285 -3.598 -3.968 -4.411 -5.052 -7.852 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt deleted file mode 100644 index e87fd938..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4435 ,KEBNE ,16748513,Tue Nov 30 04:59:20 CET,Tue Nov 30 07:00:29 CET,0.0 1.064 1.526 1.92 2.213 2.445 2.658 2.851 3.232 3.403 3.558 3.532 3.99 4.119 4.357 4.597 4.822 4.928 5.145 5.349 5.638 5.818 5.989 6.23 6.459 6.679 6.896 7.103 7.355 7.609 7.85 8.127 8.401 8.644 8.904 9.199 9.488 9.825 10.174 10.513 10.869 11.27 11.73 12.139 12.567 13.047 13.568 14.073 14.538 14.906 15.005 14.623 14.0 13.316 12.659 12.04 11.485 10.948 10.438 9.899 9.44 9.033 8.615 8.181 7.76 7.38 6.98 6.616 6.298 5.958 5.602 5.315 5.014 4.698 4.453 4.2 3.937 3.66 3.36 3.15 2.927 2.544 2.278 2.019 1.885 1.592 1.281 0.936 0.753 0.251 0.2 0.003 -0.204 -0.683 -0.945 -1.264 -1.652 -2.048 -2.511 -3.199 -5.992 -2 ,22286 ,KEBNE ,16748514,Tue Nov 30 05:00:22 CET,Tue Nov 30 07:01:42 CET,0.0 1.441 2.072 2.517 2.803 3.085 3.374 3.623 4.066 4.256 4.423 4.432 4.904 5.055 5.335 5.586 5.824 5.941 6.182 6.436 6.769 6.954 7.156 7.455 7.717 7.954 8.171 8.392 8.686 8.957 9.224 9.568 9.898 10.192 10.518 10.867 11.196 11.576 11.975 12.375 12.774 13.19 13.644 14.08 14.552 15.023 15.531 16.057 16.568 16.997 17.236 17.088 16.61 16.007 15.428 14.851 14.295 13.784 13.323 12.837 12.403 12.023 11.679 11.357 11.052 10.77 10.46 10.175 9.919 9.657 9.402 9.181 8.927 8.663 8.466 8.255 8.025 7.766 7.502 7.332 7.147 6.843 6.627 6.395 6.276 6.025 5.746 5.451 5.302 4.835 4.84 4.67 4.476 4.04 3.807 3.547 3.238 2.871 2.405 1.605 -1.699 -3 ,23599 ,KEBNE ,16748515,Tue Nov 30 05:01:23 CET,Tue Nov 30 07:06:58 CET,0.0 1.316 1.797 2.164 2.482 2.772 3.024 3.268 3.745 3.971 4.179 4.254 4.759 4.93 5.25 5.544 5.814 5.935 6.163 6.398 6.745 6.971 7.178 7.459 7.725 7.978 8.217 8.444 8.737 9.028 9.319 9.669 9.98 10.261 10.578 10.917 11.244 11.598 11.98 12.383 12.775 13.187 13.634 14.048 14.475 14.935 15.472 15.991 16.503 17.008 17.388 17.265 16.807 16.251 15.752 15.273 14.784 14.32 13.889 13.427 13.033 12.66 12.271 11.908 11.567 11.238 10.89 10.582 10.333 10.085 9.796 9.538 9.268 8.983 8.757 8.525 8.287 8.02 7.724 7.519 7.311 6.999 6.792 6.567 6.437 6.171 5.913 5.651 5.508 5.028 4.992 4.806 4.606 4.173 3.904 3.603 3.285 2.915 2.428 1.748 -1.28 -4 ,15411 ,KEBNE ,16748516,Tue Nov 30 05:03:25 CET,Tue Nov 30 07:03:50 CET,0.0 1.119 1.558 1.907 2.168 2.388 2.589 2.78 3.142 3.313 3.487 3.512 3.986 4.132 4.414 4.661 4.9 5.007 5.208 5.425 5.735 5.924 6.094 6.336 6.577 6.801 7.01 7.207 7.466 7.721 7.968 8.251 8.514 8.776 9.09 9.445 9.767 10.089 10.418 10.746 11.083 11.457 11.869 12.274 12.708 13.147 13.618 14.076 14.53 14.888 14.943 14.519 13.987 13.457 12.931 12.374 11.83 11.324 10.866 10.39 9.979 9.61 9.257 8.916 8.594 8.298 7.964 7.664 7.406 7.12 6.813 6.57 6.309 6.026 5.807 5.56 5.292 5.031 4.766 4.579 4.381 4.067 3.848 3.605 3.475 3.211 2.943 2.649 2.478 1.978 1.947 1.763 1.562 1.108 0.85 0.578 0.262 -0.124 -0.611 -1.271 -4.893 -5 ,27336 ,KEBNE ,16748517,Tue Nov 30 05:06:28 CET,Tue Nov 30 07:08:14 CET,0.0 1.38 1.925 2.306 2.643 2.92 3.184 3.431 3.872 4.073 4.25 4.255 4.74 4.897 5.191 5.464 5.712 5.836 6.081 6.312 6.631 6.826 7.028 7.331 7.609 7.872 8.129 8.378 8.678 8.949 9.206 9.52 9.825 10.125 10.471 10.842 11.186 11.563 11.97 12.392 12.828 13.282 13.788 14.311 14.882 15.43 16.004 16.583 17.113 17.566 17.854 17.565 16.984 16.431 15.905 15.365 14.862 14.368 13.909 13.446 13.053 12.685 12.324 11.969 11.622 11.299 10.974 10.684 10.414 10.127 9.826 9.57 9.303 9.009 8.768 8.52 8.268 8.005 7.711 7.492 7.271 6.928 6.688 6.445 6.319 6.053 5.771 5.473 5.315 4.82 4.73 4.519 4.312 3.849 3.575 3.267 2.924 2.517 2.046 1.416 -1.026 -6 ,13913 ,KEBNE ,16748518,Tue Nov 30 05:06:28 CET,Tue Nov 30 07:07:37 CET,0.0 1.167 1.654 2.036 2.328 2.589 2.858 3.095 3.512 3.697 3.875 3.905 4.381 4.531 4.817 5.117 5.387 5.505 5.745 5.981 6.32 6.539 6.747 7.057 7.335 7.563 7.777 7.988 8.266 8.524 8.758 9.039 9.307 9.554 9.821 10.1 10.373 10.672 10.984 11.319 11.657 12.014 12.417 12.828 13.287 13.748 14.221 14.752 15.305 15.749 15.998 15.796 15.328 14.817 14.314 13.804 13.344 12.919 12.53 12.132 11.779 11.446 11.116 10.799 10.492 10.199 9.884 9.594 9.345 9.078 8.792 8.554 8.313 8.069 7.873 7.662 7.439 7.218 6.976 6.809 6.64 6.378 6.201 6.009 5.907 5.682 5.449 5.204 5.067 4.611 4.63 4.469 4.293 3.926 3.722 3.475 3.184 2.854 2.46 1.884 -0.299 -7 ,27684 ,KEBNE ,16748519,Tue Nov 30 05:07:29 CET,Tue Nov 30 07:07:16 CET,0.0 1.295 1.785 2.176 2.506 2.807 3.081 3.315 3.727 3.914 4.072 4.047 4.526 4.685 4.984 5.238 5.48 5.602 5.817 6.016 6.313 6.507 6.695 6.954 7.187 7.427 7.663 7.871 8.141 8.401 8.644 8.936 9.221 9.495 9.809 10.153 10.458 10.778 11.119 11.481 11.888 12.319 12.736 13.146 13.608 14.072 14.578 15.108 15.623 16.05 16.251 16.038 15.573 15.046 14.528 13.983 13.469 12.973 12.488 11.973 11.548 11.173 10.796 10.435 10.104 9.787 9.444 9.133 8.851 8.561 8.265 8.004 7.724 7.434 7.189 6.934 6.685 6.411 6.105 5.892 5.685 5.364 5.129 4.871 4.742 4.492 4.213 3.915 3.757 3.253 3.212 3.026 2.808 2.309 2.035 1.754 1.443 1.047 0.516 -0.208 -3.298 -8 ,15772 ,KEBNE ,16748520,Tue Nov 30 05:07:29 CET,Tue Nov 30 07:08:06 CET,0.0 1.159 1.695 2.098 2.451 2.744 3.002 3.221 3.635 3.834 4.012 3.999 4.467 4.624 4.935 5.224 5.491 5.608 5.832 6.051 6.349 6.538 6.729 7.012 7.277 7.523 7.747 7.962 8.251 8.52 8.776 9.086 9.373 9.632 9.915 10.225 10.517 10.837 11.18 11.57 11.991 12.413 12.874 13.318 13.805 14.317 14.875 15.46 16.05 16.575 16.79 16.603 16.248 15.81 15.364 14.885 14.407 13.948 13.522 13.07 12.67 12.305 11.954 11.596 11.243 10.923 10.581 10.279 10.032 9.776 9.49 9.243 8.988 8.728 8.52 8.291 8.043 7.788 7.521 7.329 7.136 6.846 6.655 6.445 6.331 6.088 5.831 5.564 5.419 4.935 4.908 4.732 4.547 4.133 3.894 3.617 3.317 2.943 2.47 1.602 -1.322 -9 ,8077 ,KEBNE ,16748521,Tue Nov 30 05:07:29 CET,Tue Nov 30 07:11:08 CET,0.0 1.418 1.874 2.239 2.513 2.731 2.941 3.15 3.539 3.718 3.869 3.828 4.275 4.397 4.622 4.855 5.098 5.217 5.442 5.652 5.972 6.173 6.359 6.612 6.857 7.093 7.314 7.521 7.77 8.02 8.276 8.576 8.86 9.139 9.439 9.745 10.031 10.35 10.695 11.036 11.375 11.759 12.171 12.544 12.963 13.437 13.987 14.557 15.135 15.606 15.785 15.577 15.216 14.737 14.185 13.595 13.039 12.518 12.067 11.594 11.16 10.776 10.401 10.031 9.685 9.368 9.016 8.688 8.41 8.117 7.797 7.533 7.26 6.97 6.743 6.499 6.246 5.984 5.695 5.494 5.285 4.959 4.738 4.492 4.365 4.128 3.865 3.558 3.393 2.902 2.864 2.669 2.456 1.987 1.721 1.429 1.108 0.71 0.239 -0.397 -3.659 -10 ,22617 ,KEBNE ,16748522,Tue Nov 30 05:09:32 CET,Tue Nov 30 07:11:43 CET,0.0 1.173 1.627 1.984 2.261 2.494 2.711 2.917 3.324 3.503 3.656 3.631 4.093 4.226 4.472 4.703 4.93 5.041 5.261 5.467 5.756 5.948 6.128 6.38 6.62 6.865 7.106 7.338 7.632 7.912 8.181 8.49 8.785 9.054 9.371 9.724 10.047 10.41 10.8 11.196 11.587 12.032 12.551 13.041 13.579 14.143 14.753 15.408 16.095 16.733 17.099 16.894 16.453 15.93 15.4 14.869 14.366 13.876 13.424 12.959 12.558 12.187 11.827 11.473 11.125 10.801 10.465 10.161 9.892 9.615 9.319 9.072 8.83 8.562 8.332 8.101 7.867 7.618 7.357 7.17 6.971 6.659 6.438 6.205 6.086 5.828 5.548 5.262 5.111 4.645 4.66 4.498 4.31 3.887 3.654 3.39 3.076 2.705 2.24 1.63 -1.581 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt deleted file mode 100644 index 82a6ad71..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16292 ,KEBNE ,17026194,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:54:31 CET,0.0 2.934 3.545 3.965 4.296 4.573 4.813 5.039 5.426 5.588 5.726 5.66 6.103 6.218 6.427 6.611 6.766 6.836 6.97 7.103 7.287 7.398 7.499 7.624 7.739 7.852 7.951 8.037 8.143 8.23 8.28 8.337 8.402 8.457 8.494 8.501 8.491 8.451 8.39 8.311 8.211 8.055 7.814 7.527 7.085 6.505 5.732 4.556 2.662 -0.31 -4.972 -10.333 -14.561 -17.853 -20.619 -23.014 -25.012 -26.787 -28.282 -29.773 -31.05 -32.242 -33.454 -34.553 -35.5 -36.332 -37.184 -37.945 -38.614 -39.323 -40.068 -40.692 -41.333 -41.986 -42.495 -43.017 -43.539 -44.083 -44.655 -45.036 -45.424 -46.018 -46.4 -46.785 -46.988 -47.427 -47.905 -48.43 -48.706 -49.355 -49.551 -49.855 -50.17 -50.834 -51.192 -51.577 -52.023 -52.543 -53.199 -54.093 -57.749 -2 ,15861 ,KEBNE ,17026195,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:45:44 CET,0.0 2.933 3.631 4.106 4.443 4.713 4.943 5.15 5.531 5.7 5.849 5.795 6.23 6.345 6.554 6.744 6.904 6.975 7.119 7.259 7.44 7.547 7.654 7.805 7.934 8.041 8.147 8.254 8.384 8.487 8.554 8.606 8.654 8.712 8.764 8.795 8.805 8.81 8.814 8.794 8.728 8.6 8.411 8.129 7.732 7.178 6.375 5.313 3.658 1.088 -3.144 -8.356 -12.66 -16.082 -18.87 -21.254 -23.288 -25.139 -26.68 -28.193 -29.505 -30.646 -31.754 -32.817 -33.749 -34.558 -35.405 -36.166 -36.806 -37.443 -38.105 -38.653 -39.214 -39.788 -40.236 -40.705 -41.19 -41.673 -42.174 -42.527 -42.882 -43.443 -43.829 -44.205 -44.401 -44.815 -45.254 -45.711 -45.941 -46.564 -46.717 -46.994 -47.285 -47.936 -48.303 -48.711 -49.179 -49.697 -50.336 -51.225 -54.523 -3 ,15852 ,KEBNE ,17026196,Wed Dec 22 13:55:49 CET,Wed Dec 22 15:54:46 CET,0.0 2.648 3.317 3.732 4.051 4.326 4.583 4.795 5.133 5.288 5.44 5.388 5.824 5.939 6.164 6.373 6.556 6.636 6.78 6.934 7.135 7.236 7.337 7.463 7.572 7.676 7.777 7.873 7.989 8.082 8.153 8.236 8.296 8.335 8.358 8.386 8.396 8.357 8.293 8.198 8.071 7.913 7.675 7.358 6.9 6.313 5.485 4.284 2.472 -0.398 -4.982 -10.296 -14.356 -17.647 -20.503 -22.983 -25.085 -26.93 -28.477 -30.004 -31.288 -32.41 -33.471 -34.449 -35.345 -36.155 -36.982 -37.687 -38.286 -38.923 -39.576 -40.09 -40.609 -41.158 -41.592 -42.026 -42.476 -42.952 -43.428 -43.772 -44.136 -44.7 -45.076 -45.441 -45.642 -46.065 -46.501 -46.978 -47.217 -47.841 -47.989 -48.29 -48.621 -49.309 -49.7 -50.155 -50.63 -51.143 -51.781 -52.67 -55.531 -4 ,20833 ,KEBNE ,17026197,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:54:30 CET,0.0 3.112 3.724 4.102 4.392 4.666 4.903 5.09 5.426 5.564 5.679 5.561 5.973 6.069 6.238 6.387 6.521 6.589 6.726 6.846 6.988 7.073 7.164 7.283 7.383 7.463 7.52 7.577 7.645 7.697 7.749 7.804 7.825 7.835 7.846 7.835 7.819 7.779 7.708 7.588 7.397 7.134 6.807 6.442 5.944 5.313 4.401 3.135 1.34 -1.259 -5.515 -10.569 -14.75 -18.123 -20.958 -23.58 -25.903 -27.906 -29.532 -31.133 -32.44 -33.553 -34.626 -35.622 -36.532 -37.347 -38.166 -38.889 -39.497 -40.113 -40.768 -41.311 -41.867 -42.433 -42.884 -43.359 -43.833 -44.315 -44.815 -45.159 -45.507 -46.041 -46.408 -46.779 -46.966 -47.356 -47.786 -48.246 -48.481 -49.105 -49.267 -49.557 -49.853 -50.502 -50.895 -51.315 -51.766 -52.275 -52.884 -53.739 -56.546 -5 ,7378 ,KEBNE ,17026198,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:54:48 CET,0.0 2.494 3.2 3.683 4.088 4.404 4.653 4.853 5.199 5.361 5.502 5.409 5.828 5.924 6.119 6.286 6.433 6.505 6.648 6.781 6.973 7.087 7.186 7.318 7.427 7.533 7.639 7.728 7.82 7.911 7.983 8.055 8.126 8.181 8.217 8.237 8.247 8.242 8.206 8.129 8.007 7.852 7.616 7.311 6.899 6.297 5.346 4.01 2.077 -0.987 -5.849 -11.336 -15.632 -19.084 -22.039 -24.665 -26.868 -28.788 -30.435 -32.09 -33.467 -34.63 -35.707 -36.716 -37.642 -38.476 -39.354 -40.154 -40.811 -41.46 -42.174 -42.769 -43.37 -43.985 -44.447 -44.916 -45.4 -45.899 -46.415 -46.77 -47.147 -47.734 -48.124 -48.516 -48.713 -49.128 -49.564 -50.039 -50.299 -50.948 -51.122 -51.406 -51.7 -52.349 -52.738 -53.143 -53.583 -54.074 -54.692 -55.568 -58.765 -6 ,21128 ,KEBNE ,17026199,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:54:09 CET,0.0 3.049 3.647 4.055 4.378 4.636 4.878 5.094 5.446 5.587 5.713 5.629 6.052 6.158 6.354 6.518 6.654 6.718 6.846 6.971 7.147 7.256 7.364 7.503 7.616 7.717 7.811 7.893 7.983 8.058 8.12 8.194 8.266 8.308 8.334 8.362 8.361 8.345 8.328 8.262 8.132 7.97 7.728 7.416 6.956 6.315 5.462 4.313 2.49 -0.373 -4.826 -9.807 -13.791 -17.054 -19.745 -22.122 -24.147 -25.884 -27.334 -28.744 -29.935 -30.979 -31.943 -32.841 -33.665 -34.397 -35.16 -35.841 -36.421 -37.003 -37.587 -38.069 -38.592 -39.148 -39.56 -39.965 -40.385 -40.834 -41.292 -41.606 -41.934 -42.443 -42.796 -43.174 -43.376 -43.777 -44.175 -44.598 -44.823 -45.433 -45.556 -45.827 -46.115 -46.768 -47.144 -47.543 -47.974 -48.471 -49.052 -49.826 -53.035 -7 ,11488 ,KEBNE ,17026200,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:52:45 CET,0.0 2.72 3.319 3.744 4.086 4.353 4.592 4.81 5.159 5.306 5.457 5.407 5.849 5.963 6.174 6.369 6.536 6.613 6.761 6.891 7.066 7.176 7.276 7.397 7.509 7.635 7.745 7.834 7.94 8.031 8.118 8.211 8.274 8.323 8.386 8.441 8.452 8.426 8.372 8.283 8.145 7.964 7.734 7.429 6.969 6.331 5.476 4.314 2.585 -0.111 -4.722 -10.02 -14.203 -17.557 -20.318 -22.701 -24.717 -26.509 -28.03 -29.516 -30.743 -31.815 -32.833 -33.794 -34.686 -35.507 -36.331 -37.021 -37.654 -38.353 -39.064 -39.643 -40.227 -40.825 -41.292 -41.781 -42.276 -42.779 -43.295 -43.652 -44.014 -44.565 -44.951 -45.358 -45.575 -46.035 -46.503 -46.961 -47.207 -47.859 -48.034 -48.329 -48.638 -49.347 -49.75 -50.167 -50.617 -51.167 -51.837 -52.676 -55.641 -8 ,22852 ,KEBNE ,17026201,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:53:32 CET,0.0 2.595 3.273 3.755 4.126 4.411 4.672 4.905 5.255 5.401 5.536 5.46 5.899 6.017 6.215 6.401 6.575 6.642 6.788 6.931 7.089 7.174 7.255 7.369 7.479 7.585 7.679 7.764 7.862 7.948 8.016 8.09 8.157 8.207 8.253 8.275 8.279 8.277 8.261 8.225 8.116 7.918 7.65 7.327 6.864 6.209 5.207 3.843 1.925 -1.031 -5.812 -11.164 -15.408 -19.018 -22.041 -24.644 -26.873 -28.847 -30.48 -32.054 -33.386 -34.559 -35.664 -36.696 -37.65 -38.516 -39.395 -40.168 -40.819 -41.475 -42.174 -42.76 -43.359 -43.97 -44.451 -44.934 -45.411 -45.929 -46.497 -46.873 -47.252 -47.864 -48.292 -48.744 -48.974 -49.421 -49.882 -50.38 -50.644 -51.286 -51.454 -51.733 -52.002 -52.643 -53.047 -53.5 -54.009 -54.633 -55.345 -56.221 -58.59 -9 ,19040 ,KEBNE ,17026202,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:53:51 CET,0.0 3.033 3.634 4.038 4.385 4.667 4.914 5.136 5.526 5.683 5.833 5.795 6.228 6.336 6.537 6.717 6.881 6.961 7.108 7.232 7.398 7.506 7.602 7.738 7.865 7.981 8.077 8.167 8.293 8.389 8.458 8.531 8.603 8.664 8.712 8.744 8.747 8.731 8.707 8.658 8.556 8.409 8.188 7.885 7.449 6.866 6.062 4.956 3.313 0.708 -3.908 -9.402 -13.759 -17.267 -20.047 -22.509 -24.663 -26.553 -28.147 -29.682 -30.939 -32.035 -33.085 -34.068 -34.977 -35.82 -36.7 -37.502 -38.188 -38.868 -39.576 -40.158 -40.749 -41.348 -41.827 -42.34 -42.882 -43.447 -43.99 -44.35 -44.732 -45.322 -45.729 -46.165 -46.406 -46.924 -47.459 -48.021 -48.321 -49.014 -49.285 -49.637 -50.005 -50.801 -51.252 -51.751 -52.309 -52.965 -53.792 -55.007 -58.865 -10 ,21750 ,KEBNE ,17026203,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:53:19 CET,0.0 3.145 3.836 4.343 4.731 5.034 5.29 5.525 5.917 6.084 6.24 6.193 6.641 6.756 6.963 7.159 7.331 7.408 7.558 7.696 7.868 7.975 8.078 8.213 8.336 8.453 8.561 8.675 8.847 9.003 9.122 9.259 9.372 9.457 9.532 9.594 9.611 9.594 9.57 9.51 9.43 9.334 9.171 8.92 8.519 7.911 7.003 5.723 3.867 1.276 -2.842 -7.75 -11.813 -15.258 -18.128 -20.532 -22.537 -24.311 -25.821 -27.292 -28.514 -29.566 -30.59 -31.59 -32.506 -33.323 -34.157 -34.867 -35.485 -36.133 -36.798 -37.361 -37.937 -38.514 -38.946 -39.409 -39.928 -40.458 -40.951 -41.293 -41.676 -42.277 -42.691 -43.096 -43.296 -43.71 -44.14 -44.591 -44.825 -45.45 -45.61 -45.882 -46.163 -46.774 -47.112 -47.5 -47.951 -48.443 -49.033 -49.938 -53.714 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt deleted file mode 100644 index 4169a774..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/protein/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9277 ,KEBNE ,16748503,Tue Nov 30 04:49:10 CET,Tue Nov 30 06:50:36 CET,0.0 4.026 5.002 5.76 6.448 7.082 7.683 8.259 9.345 9.864 10.372 11.037 11.853 12.335 13.27 14.164 15.019 15.454 16.339 17.215 18.501 19.329 20.122 21.292 22.453 23.607 24.75 25.885 27.406 28.935 30.452 32.325 34.181 36.022 38.214 40.732 43.213 46.04 49.181 52.623 56.384 60.799 66.179 71.859 78.819 87.003 97.062 109.291 124.881 145.356 173.962 201.997 221.538 236.123 247.252 256.244 263.442 269.422 274.204 278.634 282.218 285.234 287.92 290.302 292.394 294.2 295.987 297.516 298.804 300.08 301.328 302.313 303.297 304.253 304.945 305.629 306.301 306.968 307.625 308.053 308.475 309.082 309.471 309.863 310.053 310.405 310.752 311.085 311.245 311.399 311.693 311.812 311.931 312.144 312.208 312.243 312.242 312.192 312.048 311.727 309.343 -2 ,12661 ,KEBNE ,16748504,Tue Nov 30 04:51:12 CET,Tue Nov 30 06:52:46 CET,0.0 2.812 3.749 4.517 5.216 5.876 6.484 7.043 8.095 8.605 9.13 9.839 10.632 11.093 12.015 12.929 13.82 14.262 15.127 15.977 17.238 18.064 18.875 20.079 21.252 22.406 23.562 24.714 26.241 27.737 29.205 31.026 32.838 34.637 36.769 39.221 41.664 44.459 47.585 51.014 54.757 59.151 64.51 70.157 77.084 85.241 95.26 107.451 122.997 143.38 171.83 199.851 219.32 233.803 244.913 253.876 261.039 266.997 271.768 276.21 279.786 282.782 285.489 287.912 290.032 291.868 293.704 295.253 296.526 297.794 299.052 300.033 301.003 301.969 302.683 303.388 304.081 304.758 305.419 305.845 306.262 306.862 307.252 307.644 307.832 308.195 308.544 308.879 309.044 309.189 309.486 309.619 309.729 309.895 309.968 310.021 310.036 309.996 309.88 309.6 307.711 -3 ,22650 ,KEBNE ,16748505,Tue Nov 30 04:51:13 CET,Tue Nov 30 06:53:34 CET,0.0 2.515 3.443 4.211 4.869 5.477 6.063 6.621 7.649 8.158 8.658 9.306 10.092 10.555 11.489 12.381 13.225 13.644 14.49 15.33 16.572 17.394 18.212 19.414 20.598 21.774 22.923 24.058 25.561 27.058 28.561 30.431 32.28 34.106 36.27 38.765 41.223 43.982 47.051 50.449 54.168 58.547 63.892 69.498 76.413 84.587 94.603 106.809 122.431 142.898 171.347 199.345 218.885 233.461 244.642 253.671 260.837 266.766 271.553 276.022 279.586 282.569 285.257 287.655 289.779 291.591 293.358 294.854 296.08 297.295 298.505 299.478 300.448 301.392 302.09 302.784 303.467 304.141 304.8 305.233 305.663 306.298 306.711 307.099 307.29 307.671 308.036 308.382 308.546 308.678 308.971 309.102 309.219 309.401 309.461 309.5 309.509 309.452 309.307 309.0 306.91 -4 ,30784 ,KEBNE ,16748506,Tue Nov 30 04:52:13 CET,Tue Nov 30 06:50:51 CET,0.0 2.559 3.451 4.155 4.796 5.399 5.977 6.534 7.564 8.05 8.529 9.148 9.919 10.364 11.245 12.116 12.975 13.396 14.219 15.021 16.239 17.05 17.853 19.043 20.23 21.403 22.547 23.687 25.204 26.713 28.209 30.068 31.91 33.736 35.92 38.402 40.839 43.66 46.785 50.167 53.853 58.186 63.536 69.189 76.072 84.198 94.195 106.304 121.745 142.077 170.512 198.541 218.08 232.64 243.788 252.77 259.939 265.926 270.736 275.223 278.843 281.852 284.552 286.97 289.123 290.989 292.81 294.364 295.655 296.933 298.193 299.188 300.168 301.116 301.82 302.529 303.222 303.898 304.578 305.017 305.442 306.071 306.471 306.866 307.059 307.443 307.821 308.172 308.328 308.451 308.685 308.777 308.858 308.947 308.959 308.944 308.905 308.83 308.645 308.262 306.176 -5 ,10250 ,KEBNE ,16748507,Tue Nov 30 04:53:14 CET,Tue Nov 30 06:54:50 CET,0.0 2.837 3.851 4.638 5.325 5.966 6.577 7.163 8.3 8.836 9.363 10.075 10.9 11.405 12.378 13.313 14.225 14.675 15.551 16.399 17.646 18.468 19.283 20.495 21.683 22.857 24.014 25.151 26.661 28.155 29.635 31.479 33.304 35.109 37.257 39.739 42.211 45.007 48.12 51.561 55.325 59.75 65.146 70.827 77.783 85.958 95.969 108.143 123.733 144.203 172.724 200.749 220.225 234.694 245.785 254.711 261.854 267.792 272.539 276.98 280.556 283.55 286.246 288.656 290.785 292.629 294.449 295.996 297.266 298.512 299.756 300.758 301.757 302.728 303.423 304.107 304.802 305.474 306.121 306.549 306.967 307.579 307.976 308.36 308.541 308.903 309.263 309.596 309.755 309.883 310.151 310.261 310.374 310.538 310.576 310.618 310.614 310.546 310.407 310.102 307.475 -6 ,19250 ,KEBNE ,16748508,Tue Nov 30 04:53:14 CET,Tue Nov 30 06:53:57 CET,0.0 2.195 3.032 3.73 4.345 4.914 5.462 6.009 7.059 7.565 8.058 8.684 9.464 9.91 10.789 11.671 12.53 12.951 13.783 14.607 15.825 16.635 17.446 18.645 19.834 21.007 22.173 23.336 24.88 26.407 27.905 29.746 31.562 33.367 35.529 38.017 40.465 43.252 46.394 49.85 53.603 58.019 63.423 69.108 76.065 84.313 94.47 106.774 122.424 142.938 171.557 199.744 219.404 234.046 245.256 254.279 261.47 267.457 272.254 276.718 280.329 283.373 286.098 288.514 290.635 292.477 294.301 295.849 297.132 298.416 299.677 300.657 301.633 302.593 303.304 304.009 304.701 305.371 306.023 306.446 306.862 307.489 307.898 308.302 308.497 308.866 309.219 309.549 309.71 309.847 310.126 310.242 310.351 310.532 310.595 310.617 310.599 310.525 310.355 310.024 307.892 -7 ,22369 ,KEBNE ,16748509,Tue Nov 30 04:54:15 CET,Tue Nov 30 06:55:35 CET,0.0 4.664 5.616 6.373 7.073 7.727 8.333 8.9 9.955 10.468 10.965 11.597 12.398 12.883 13.84 14.769 15.669 16.113 16.989 17.849 19.132 19.979 20.813 22.05 23.248 24.424 25.597 26.774 28.337 29.875 31.384 33.238 35.061 36.875 39.049 41.577 44.091 46.93 50.092 53.58 57.376 61.833 67.286 73.013 80.038 88.38 98.582 110.928 126.707 147.275 175.862 204.002 223.515 237.997 249.103 258.025 265.131 271.064 275.81 280.244 283.826 286.822 289.523 291.919 294.035 295.886 297.715 299.25 300.504 301.736 302.948 303.911 304.874 305.822 306.518 307.216 307.908 308.59 309.252 309.681 310.104 310.709 311.1 311.474 311.66 312.032 312.393 312.73 312.889 313.023 313.313 313.431 313.543 313.757 313.837 313.858 313.825 313.773 313.656 313.339 310.858 -8 ,3861 ,KEBNE ,16748510,Tue Nov 30 04:55:16 CET,Tue Nov 30 06:57:35 CET,0.0 3.217 4.219 4.975 5.639 6.27 6.871 7.438 8.503 9.006 9.507 10.187 10.99 11.455 12.36 13.244 14.102 14.516 15.347 16.204 17.471 18.296 19.119 20.338 21.522 22.689 23.854 25.002 26.505 27.989 29.448 31.252 33.069 34.902 37.08 39.58 42.054 44.857 47.996 51.438 55.178 59.579 64.956 70.613 77.562 85.762 95.831 108.049 123.513 143.74 171.99 199.753 219.026 233.239 244.112 252.924 260.003 265.88 270.586 275.029 278.648 281.691 284.413 286.829 288.953 290.801 292.642 294.204 295.468 296.699 297.924 298.898 299.859 300.799 301.484 302.15 302.801 303.446 304.076 304.481 304.881 305.472 305.855 306.222 306.403 306.748 307.092 307.436 307.601 307.752 308.054 308.178 308.287 308.469 308.516 308.531 308.522 308.482 308.359 308.039 305.801 -9 ,21419 ,KEBNE ,16748511,Tue Nov 30 04:57:18 CET,Tue Nov 30 07:00:40 CET,0.0 3.076 4.026 4.807 5.508 6.128 6.696 7.258 8.35 8.872 9.383 10.044 10.835 11.295 12.19 13.084 13.971 14.4 15.249 16.093 17.318 18.116 18.917 20.104 21.261 22.421 23.574 24.71 26.213 27.701 29.187 31.02 32.835 34.647 36.809 39.295 41.757 44.572 47.713 51.166 54.945 59.384 64.793 70.484 77.441 85.636 95.672 107.875 123.451 143.886 172.471 200.613 220.168 234.625 245.623 254.482 261.552 267.399 272.111 276.538 280.093 283.075 285.773 288.187 290.31 292.141 293.938 295.444 296.701 297.962 299.205 300.184 301.15 302.085 302.774 303.472 304.162 304.842 305.494 305.912 306.325 306.924 307.32 307.697 307.878 308.231 308.564 308.895 309.06 309.2 309.505 309.645 309.762 309.913 309.979 310.044 310.053 310.015 309.922 309.636 307.545 -10 ,22403 ,KEBNE ,16748512,Tue Nov 30 04:58:21 CET,Tue Nov 30 06:52:21 CET,0.0 2.612 3.527 4.281 4.955 5.581 6.165 6.709 7.739 8.243 8.737 9.374 10.169 10.636 11.537 12.407 13.28 13.713 14.565 15.405 16.64 17.45 18.249 19.432 20.601 21.759 22.913 24.06 25.582 27.086 28.585 30.424 32.218 33.994 36.13 38.613 41.085 43.902 47.048 50.519 54.282 58.681 64.055 69.732 76.697 84.909 94.987 107.294 123.068 143.7 172.344 200.393 219.852 234.255 245.205 254.117 261.335 267.36 272.206 276.74 280.381 283.415 286.164 288.637 290.804 292.683 294.534 296.078 297.353 298.609 299.833 300.815 301.803 302.771 303.48 304.169 304.846 305.536 306.222 306.676 307.128 307.785 308.216 308.629 308.827 309.225 309.602 309.958 310.132 310.284 310.638 310.782 310.903 311.106 311.201 311.276 311.287 311.244 311.106 310.809 307.818 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_11_10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_11_10.txt deleted file mode 100644 index c9533c62..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_11_10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15135 ,KEBNE ,16722302,Sat Nov 27 23:24:43 CET,Sun Nov 28 00:59:29 CET,0.0 0.693 1.072 1.403 1.671 1.914 2.158 2.402 2.867 3.083 3.289 3.531 3.847 4.023 4.374 4.699 5.001 5.151 5.435 5.705 6.107 6.368 6.605 6.938 7.285 7.635 7.977 8.302 8.703 9.106 9.514 9.992 10.423 10.836 11.337 11.9 12.451 13.051 13.708 14.421 15.148 15.966 16.995 18.076 19.279 20.624 22.25 24.068 26.091 28.448 31.311 33.806 35.291 36.151 36.676 36.963 37.051 37.02 36.971 36.924 36.811 36.654 36.499 36.299 36.108 35.952 35.769 35.574 35.359 35.141 34.928 34.737 34.524 34.313 34.137 33.931 33.715 33.489 33.249 33.072 32.892 32.624 32.438 32.236 32.133 31.927 31.709 31.477 31.347 31.105 30.895 30.733 30.55 30.152 29.933 29.702 29.452 29.11 28.644 28.018 24.403 -2 ,26403 ,KEBNE ,16722303,Sat Nov 27 23:24:43 CET,Sun Nov 28 00:59:42 CET,0.0 0.762 1.267 1.615 1.909 2.175 2.421 2.662 3.102 3.294 3.475 3.673 3.96 4.117 4.434 4.728 5.02 5.167 5.447 5.712 6.106 6.361 6.6 6.956 7.296 7.628 7.96 8.293 8.71 9.074 9.429 9.894 10.362 10.807 11.313 11.886 12.417 12.999 13.656 14.363 15.093 15.902 16.859 17.87 19.086 20.392 21.849 23.516 25.572 28.061 31.126 33.694 35.101 35.912 36.403 36.724 36.945 37.069 37.041 36.944 36.843 36.733 36.585 36.423 36.287 36.144 35.964 35.799 35.653 35.502 35.332 35.168 34.981 34.775 34.62 34.452 34.279 34.096 33.87 33.716 33.575 33.361 33.212 33.042 32.947 32.745 32.536 32.314 32.187 31.943 31.737 31.555 31.349 30.901 30.661 30.405 30.09 29.672 29.144 28.426 23.941 -3 ,16280 ,KEBNE ,16722304,Sat Nov 27 23:24:43 CET,Sun Nov 28 01:02:45 CET,0.0 0.765 1.194 1.503 1.778 2.033 2.272 2.491 2.894 3.076 3.249 3.481 3.796 3.967 4.287 4.571 4.841 4.983 5.266 5.531 5.909 6.149 6.377 6.702 7.018 7.326 7.63 7.922 8.29 8.649 8.997 9.416 9.84 10.273 10.763 11.311 11.859 12.461 13.08 13.712 14.415 15.222 16.165 17.181 18.335 19.568 21.022 22.693 24.696 27.052 30.045 32.538 33.937 34.825 35.354 35.681 35.877 35.985 36.013 35.992 35.923 35.829 35.734 35.589 35.418 35.27 35.082 34.913 34.771 34.6 34.414 34.246 34.068 33.871 33.714 33.562 33.394 33.198 32.979 32.831 32.681 32.417 32.207 31.993 31.887 31.653 31.399 31.135 30.998 30.754 30.517 30.341 30.153 29.703 29.434 29.134 28.821 28.453 27.986 27.228 22.865 -4 ,17621 ,KEBNE ,16722305,Sat Nov 27 23:24:43 CET,Sun Nov 28 00:59:54 CET,0.0 0.535 0.844 1.127 1.371 1.576 1.775 1.989 2.394 2.574 2.743 2.922 3.221 3.378 3.683 3.992 4.294 4.44 4.717 4.974 5.353 5.609 5.868 6.249 6.61 6.964 7.31 7.648 8.108 8.566 9.01 9.547 10.073 10.581 11.169 11.859 12.55 13.334 14.144 14.941 15.756 16.637 17.663 18.718 19.928 21.294 22.889 24.687 26.792 29.252 32.201 34.671 36.023 36.735 37.118 37.295 37.369 37.438 37.449 37.376 37.236 37.105 36.932 36.737 36.586 36.438 36.275 36.103 35.941 35.779 35.606 35.472 35.333 35.18 35.06 34.921 34.76 34.59 34.415 34.298 34.168 33.944 33.788 33.616 33.515 33.309 33.117 32.902 32.783 32.564 32.367 32.202 32.008 31.576 31.343 31.043 30.693 30.26 29.735 28.963 25.159 -5 ,15017 ,KEBNE ,16722306,Sat Nov 27 23:24:42 CET,Sun Nov 28 00:58:52 CET,0.0 0.467 0.786 1.035 1.247 1.453 1.655 1.839 2.186 2.354 2.516 2.699 2.986 3.13 3.411 3.691 3.961 4.093 4.351 4.588 4.937 5.172 5.408 5.745 6.07 6.381 6.67 6.954 7.337 7.718 8.088 8.539 8.981 9.411 9.923 10.504 11.053 11.66 12.326 13.059 13.834 14.691 15.709 16.741 17.909 19.223 20.794 22.534 24.535 26.904 29.826 32.238 33.611 34.421 34.936 35.284 35.444 35.52 35.488 35.38 35.306 35.216 35.108 34.977 34.818 34.648 34.459 34.3 34.16 34.018 33.879 33.747 33.602 33.452 33.32 33.18 33.033 32.886 32.719 32.573 32.411 32.152 31.968 31.777 31.675 31.447 31.208 30.954 30.819 30.576 30.367 30.197 30.004 29.599 29.377 29.116 28.784 28.38 27.88 27.121 20.14 -6 ,12366 ,KEBNE ,16722307,Sat Nov 27 23:24:42 CET,Sun Nov 28 01:00:05 CET,0.0 0.604 0.941 1.221 1.49 1.714 1.898 2.081 2.429 2.593 2.753 2.921 3.206 3.354 3.629 3.908 4.189 4.317 4.566 4.812 5.159 5.381 5.606 5.961 6.31 6.639 6.962 7.285 7.699 8.085 8.457 8.903 9.354 9.803 10.299 10.863 11.419 12.046 12.723 13.441 14.201 15.023 15.993 17.002 18.195 19.563 21.13 22.884 24.863 27.17 30.033 32.441 33.831 34.695 35.249 35.573 35.743 35.837 35.853 35.818 35.75 35.635 35.506 35.377 35.243 35.087 34.886 34.715 34.571 34.411 34.247 34.082 33.906 33.726 33.58 33.422 33.239 33.039 32.837 32.697 32.548 32.309 32.125 31.9 31.778 31.54 31.296 31.026 30.869 30.619 30.405 30.228 30.05 29.611 29.348 29.069 28.721 28.265 27.679 26.868 23.487 -7 ,24028 ,KEBNE ,16722308,Sat Nov 27 23:24:42 CET,Sun Nov 28 00:58:48 CET,0.0 0.765 1.186 1.522 1.799 2.047 2.266 2.474 2.884 3.063 3.233 3.469 3.783 3.95 4.272 4.573 4.857 4.995 5.27 5.542 5.931 6.175 6.405 6.744 7.064 7.386 7.71 8.025 8.442 8.838 9.207 9.643 10.087 10.536 11.07 11.677 12.256 12.88 13.551 14.26 14.996 15.859 16.894 17.929 19.125 20.517 22.146 23.921 25.97 28.438 31.417 33.863 35.291 36.137 36.656 36.948 37.13 37.232 37.237 37.212 37.168 37.081 36.967 36.846 36.697 36.539 36.379 36.241 36.107 35.944 35.763 35.589 35.401 35.235 35.103 34.948 34.785 34.608 34.414 34.271 34.127 33.914 33.765 33.595 33.5 33.314 33.117 32.898 32.777 32.547 32.369 32.198 31.996 31.548 31.294 31.013 30.685 30.297 29.808 29.118 24.786 -8 ,23072 ,KEBNE ,16722309,Sat Nov 27 23:25:44 CET,Sun Nov 28 01:02:58 CET,0.0 0.816 1.248 1.576 1.852 2.11 2.356 2.587 2.999 3.185 3.37 3.583 3.883 4.045 4.362 4.668 4.942 5.075 5.336 5.594 5.958 6.184 6.408 6.74 7.074 7.382 7.661 7.946 8.346 8.75 9.146 9.614 10.05 10.481 10.979 11.501 12.007 12.587 13.221 13.892 14.594 15.415 16.41 17.409 18.581 19.877 21.325 22.99 24.992 27.407 30.373 32.738 34.066 34.938 35.455 35.747 35.913 35.985 36.009 35.971 35.874 35.788 35.694 35.559 35.388 35.22 35.061 34.9 34.75 34.589 34.396 34.228 34.047 33.871 33.74 33.581 33.423 33.265 33.067 32.925 32.78 32.543 32.356 32.15 32.053 31.864 31.651 31.404 31.28 31.051 30.823 30.646 30.457 30.029 29.784 29.487 29.156 28.772 28.234 27.429 23.89 -9 ,30701 ,KEBNE ,16722310,Sat Nov 27 23:25:44 CET,Sun Nov 28 01:01:09 CET,0.0 0.766 1.15 1.466 1.751 2.018 2.257 2.474 2.873 3.054 3.231 3.434 3.721 3.881 4.192 4.477 4.754 4.885 5.144 5.406 5.785 6.024 6.248 6.571 6.9 7.229 7.543 7.842 8.226 8.588 8.967 9.44 9.879 10.317 10.845 11.44 11.993 12.594 13.263 13.975 14.686 15.462 16.422 17.458 18.642 19.929 21.477 23.211 25.21 27.59 30.593 33.138 34.537 35.375 35.887 36.177 36.367 36.481 36.493 36.466 36.418 36.32 36.177 36.04 35.908 35.763 35.59 35.418 35.26 35.082 34.887 34.727 34.551 34.343 34.157 33.952 33.735 33.506 33.247 33.055 32.86 32.562 32.374 32.196 32.102 31.896 31.675 31.397 31.241 30.995 30.789 30.614 30.42 30.01 29.771 29.515 29.239 28.874 28.429 27.911 25.63 -10 ,26300 ,KEBNE ,16722311,Sat Nov 27 23:25:44 CET,Sun Nov 28 01:01:01 CET,0.0 0.596 0.886 1.151 1.392 1.594 1.783 1.977 2.365 2.552 2.729 2.911 3.192 3.343 3.643 3.924 4.174 4.295 4.538 4.781 5.149 5.399 5.643 5.99 6.339 6.688 7.026 7.349 7.775 8.178 8.559 9.022 9.467 9.917 10.444 11.023 11.586 12.191 12.824 13.509 14.247 15.11 16.103 17.125 18.363 19.659 21.146 22.888 24.907 27.328 30.313 32.732 34.113 34.953 35.463 35.753 35.879 35.911 35.862 35.766 35.63 35.478 35.305 35.11 34.933 34.743 34.52 34.318 34.137 33.943 33.728 33.539 33.328 33.078 32.865 32.662 32.476 32.279 32.067 31.908 31.738 31.491 31.303 31.096 30.992 30.755 30.495 30.245 30.11 29.86 29.671 29.509 29.312 28.878 28.643 28.378 28.043 27.658 27.238 26.661 24.474 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index ac38446a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_11_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2246 ,KEBNE ,16722312,Sat Nov 27 23:25:44 CET,Sun Nov 28 01:02:56 CET,0.0 2.529 3.035 3.389 3.661 3.887 4.095 4.289 4.628 4.776 4.919 5.042 5.288 5.394 5.588 5.767 5.93 6.012 6.178 6.328 6.537 6.672 6.799 6.961 7.112 7.262 7.4 7.535 7.707 7.87 8.032 8.214 8.379 8.544 8.738 8.947 9.153 9.369 9.549 9.698 9.838 9.998 10.158 10.28 10.376 10.407 10.358 10.176 9.762 8.928 7.262 5.026 3.034 1.242 -0.346 -1.747 -2.883 -3.889 -4.823 -5.8 -6.633 -7.358 -8.078 -8.765 -9.377 -9.931 -10.511 -11.021 -11.46 -11.928 -12.41 -12.823 -13.251 -13.672 -13.996 -14.321 -14.675 -15.042 -15.416 -15.685 -15.96 -16.38 -16.668 -16.972 -17.139 -17.481 -17.823 -18.175 -18.368 -18.729 -18.983 -19.217 -19.454 -19.977 -20.265 -20.557 -20.908 -21.298 -21.733 -22.33 -24.707 -2 ,26968 ,KEBNE ,16722313,Sat Nov 27 23:25:44 CET,Sun Nov 28 01:01:11 CET,0.0 2.048 2.587 2.94 3.221 3.467 3.676 3.87 4.251 4.436 4.603 4.765 5.037 5.176 5.442 5.665 5.863 5.961 6.165 6.372 6.648 6.809 6.961 7.17 7.371 7.569 7.753 7.921 8.121 8.292 8.441 8.629 8.817 8.991 9.176 9.365 9.555 9.761 9.962 10.154 10.335 10.532 10.715 10.815 10.878 10.927 10.89 10.68 10.238 9.413 7.766 5.495 3.503 1.798 0.342 -0.972 -2.142 -3.212 -4.136 -5.044 -5.819 -6.541 -7.249 -7.903 -8.507 -9.07 -9.688 -10.234 -10.682 -11.123 -11.589 -12.003 -12.434 -12.868 -13.227 -13.6 -13.95 -14.321 -14.721 -14.996 -15.281 -15.72 -16.043 -16.38 -16.549 -16.879 -17.218 -17.603 -17.807 -18.177 -18.467 -18.69 -18.919 -19.449 -19.734 -20.036 -20.363 -20.718 -21.145 -21.717 -23.734 -3 ,5955 ,KEBNE ,16722314,Sat Nov 27 23:25:44 CET,Sun Nov 28 01:00:10 CET,0.0 2.155 2.654 3.017 3.283 3.498 3.711 3.907 4.257 4.415 4.554 4.649 4.88 4.981 5.194 5.404 5.598 5.695 5.886 6.057 6.317 6.49 6.646 6.842 7.01 7.183 7.378 7.554 7.738 7.914 8.094 8.299 8.476 8.64 8.828 9.051 9.27 9.468 9.634 9.799 9.954 10.095 10.224 10.326 10.397 10.382 10.281 10.05 9.59 8.755 7.15 5.019 3.031 1.225 -0.279 -1.607 -2.753 -3.836 -4.762 -5.642 -6.404 -7.096 -7.789 -8.432 -9.048 -9.614 -10.172 -10.663 -11.113 -11.595 -12.072 -12.454 -12.853 -13.266 -13.583 -13.913 -14.251 -14.608 -14.987 -15.24 -15.496 -15.911 -16.197 -16.493 -16.647 -16.96 -17.293 -17.659 -17.85 -18.208 -18.448 -18.664 -18.908 -19.445 -19.758 -20.109 -20.499 -20.923 -21.447 -22.174 -24.562 -5 ,8669 ,KEBNE ,16722316,Sat Nov 27 23:25:44 CET,Sun Nov 28 01:00:10 CET,0.0 2.63 3.195 3.54 3.799 4.039 4.259 4.469 4.829 4.977 5.112 5.224 5.478 5.591 5.795 5.985 6.175 6.262 6.413 6.565 6.793 6.92 7.031 7.216 7.407 7.573 7.727 7.872 8.059 8.235 8.398 8.583 8.747 8.918 9.111 9.322 9.506 9.673 9.837 10.014 10.184 10.342 10.48 10.556 10.603 10.627 10.554 10.298 9.813 8.943 7.284 5.091 3.147 1.389 -0.17 -1.62 -2.857 -3.927 -4.857 -5.777 -6.579 -7.304 -7.993 -8.641 -9.238 -9.776 -10.346 -10.881 -11.368 -11.851 -12.308 -12.702 -13.128 -13.578 -13.923 -14.277 -14.65 -15.026 -15.408 -15.663 -15.917 -16.307 -16.591 -16.914 -17.086 -17.427 -17.774 -18.135 -18.327 -18.699 -18.978 -19.207 -19.441 -19.909 -20.181 -20.503 -20.865 -21.29 -21.771 -22.414 -24.885 -8 ,15821 ,KEBNE ,16722319,Sat Nov 27 23:26:46 CET,Sun Nov 28 01:03:36 CET,0.0 1.207 1.573 1.861 2.105 2.314 2.51 2.693 3.015 3.16 3.302 3.434 3.686 3.797 4.007 4.212 4.413 4.508 4.681 4.842 5.08 5.232 5.382 5.593 5.799 6.006 6.193 6.359 6.568 6.766 6.95 7.179 7.393 7.556 7.731 7.913 8.073 8.275 8.498 8.684 8.835 8.973 9.109 9.212 9.271 9.303 9.233 8.991 8.54 7.628 5.881 3.668 1.706 0.051 -1.358 -2.671 -3.826 -4.907 -5.836 -6.75 -7.524 -8.189 -8.816 -9.401 -9.964 -10.481 -11.022 -11.53 -11.969 -12.426 -12.907 -13.305 -13.714 -14.143 -14.482 -14.831 -15.202 -15.585 -15.997 -16.289 -16.581 -17.039 -17.352 -17.673 -17.849 -18.218 -18.594 -18.991 -19.196 -19.567 -19.875 -20.117 -20.359 -20.89 -21.205 -21.559 -21.932 -22.359 -22.883 -23.596 -25.614 -9 ,4668 ,KEBNE ,16722320,Sat Nov 27 23:26:46 CET,Sun Nov 28 01:03:29 CET,0.0 2.143 2.684 3.04 3.321 3.565 3.775 3.966 4.318 4.481 4.626 4.739 4.988 5.095 5.286 5.464 5.631 5.707 5.86 6.012 6.222 6.369 6.508 6.684 6.85 7.013 7.163 7.302 7.49 7.663 7.813 7.988 8.159 8.328 8.511 8.697 8.855 9.002 9.156 9.334 9.503 9.68 9.837 9.948 10.06 10.098 10.043 9.843 9.394 8.517 6.761 4.518 2.664 1.004 -0.454 -1.702 -2.83 -3.857 -4.716 -5.588 -6.366 -7.018 -7.626 -8.222 -8.801 -9.363 -9.95 -10.475 -10.926 -11.385 -11.882 -12.301 -12.729 -13.181 -13.534 -13.899 -14.262 -14.626 -14.996 -15.259 -15.533 -15.978 -16.304 -16.628 -16.796 -17.159 -17.54 -17.937 -18.153 -18.534 -18.83 -19.062 -19.297 -19.837 -20.132 -20.447 -20.794 -21.205 -21.715 -22.361 -24.743 -10 ,5807 ,KEBNE ,16722321,Sat Nov 27 23:26:46 CET,Sun Nov 28 01:02:35 CET,0.0 1.242 1.616 1.899 2.143 2.352 2.543 2.718 3.028 3.179 3.331 3.476 3.744 3.868 4.099 4.317 4.514 4.6 4.769 4.943 5.197 5.358 5.512 5.733 5.942 6.133 6.304 6.469 6.683 6.883 7.064 7.285 7.489 7.663 7.866 8.083 8.283 8.475 8.645 8.831 9.025 9.197 9.358 9.464 9.54 9.582 9.532 9.344 8.946 8.101 6.343 4.082 2.088 0.368 -1.122 -2.52 -3.701 -4.701 -5.57 -6.488 -7.302 -8.04 -8.725 -9.363 -9.967 -10.517 -11.094 -11.607 -12.043 -12.5 -12.966 -13.352 -13.767 -14.202 -14.525 -14.848 -15.198 -15.567 -15.933 -16.192 -16.473 -16.922 -17.226 -17.536 -17.701 -18.029 -18.382 -18.762 -18.952 -19.307 -19.582 -19.816 -20.054 -20.548 -20.803 -21.089 -21.423 -21.808 -22.272 -22.886 -24.947 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_4_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_4_3.txt deleted file mode 100644 index a15b510a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_4_3.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,20228 ,KEBNE ,16722323,Sat Nov 27 23:26:45 CET,Sun Nov 28 01:02:16 CET,0.0 0.803 1.201 1.522 1.756 1.972 2.166 2.339 2.658 2.8 2.941 2.85 3.324 3.43 3.64 3.844 4.045 4.138 4.306 4.474 4.727 4.888 5.038 5.242 5.433 5.619 5.793 5.96 6.184 6.389 6.584 6.821 7.032 7.247 7.52 7.819 8.096 8.378 8.658 8.928 9.193 9.478 9.793 10.105 10.448 10.787 11.124 11.442 11.689 11.8 11.608 10.928 10.173 9.441 8.704 8.051 7.485 6.935 6.445 5.945 5.518 5.123 4.72 4.313 3.939 3.607 3.261 2.959 2.699 2.44 2.162 1.929 1.68 1.414 1.202 0.973 0.74 0.489 0.222 0.051 -0.124 -0.412 -0.614 -0.83 -0.941 -1.168 -1.413 -1.675 -1.813 -2.322 -2.253 -2.402 -2.566 -2.944 -3.14 -3.369 -3.629 -3.928 -4.333 -4.831 -6.218 -3 ,31155 ,KEBNE ,16722324,Sat Nov 27 23:26:46 CET,Sun Nov 28 01:01:27 CET,0.0 1.002 1.384 1.667 1.898 2.09 2.276 2.439 2.743 2.888 3.014 2.876 3.355 3.476 3.694 3.876 4.049 4.137 4.317 4.497 4.734 4.876 5.013 5.228 5.431 5.617 5.808 5.985 6.204 6.407 6.594 6.841 7.071 7.256 7.485 7.74 7.964 8.198 8.451 8.734 9.011 9.307 9.642 9.948 10.289 10.633 10.972 11.288 11.567 11.736 11.56 10.911 10.186 9.438 8.739 8.093 7.477 6.893 6.396 5.889 5.442 5.019 4.597 4.194 3.829 3.495 3.117 2.789 2.511 2.211 1.901 1.638 1.358 1.066 0.853 0.648 0.419 0.169 -0.09 -0.267 -0.439 -0.711 -0.918 -1.137 -1.249 -1.482 -1.741 -2.033 -2.178 -2.688 -2.626 -2.785 -2.953 -3.349 -3.584 -3.824 -4.059 -4.343 -4.679 -5.147 -6.358 -4 ,12632 ,KEBNE ,16722325,Sat Nov 27 23:26:46 CET,Sun Nov 28 01:00:51 CET,0.0 0.928 1.293 1.558 1.792 2.005 2.194 2.367 2.668 2.802 2.931 2.818 3.302 3.42 3.636 3.84 4.041 4.132 4.308 4.484 4.723 4.876 5.017 5.217 5.426 5.63 5.804 5.973 6.198 6.405 6.597 6.83 7.046 7.235 7.466 7.725 7.97 8.233 8.502 8.762 9.015 9.305 9.629 9.949 10.289 10.609 10.94 11.26 11.529 11.692 11.56 10.924 10.148 9.419 8.709 8.03 7.43 6.867 6.36 5.845 5.393 4.965 4.57 4.21 3.865 3.545 3.207 2.914 2.662 2.389 2.089 1.827 1.563 1.311 1.106 0.879 0.657 0.427 0.181 0.012 -0.166 -0.44 -0.639 -0.854 -0.963 -1.183 -1.426 -1.679 -1.821 -2.334 -2.26 -2.427 -2.615 -3.045 -3.276 -3.512 -3.787 -4.096 -4.422 -4.869 -6.299 -5 ,4510 ,KEBNE ,16722326,Sat Nov 27 23:26:45 CET,Sun Nov 28 01:02:37 CET,0.0 0.836 1.249 1.584 1.832 2.031 2.218 2.385 2.697 2.851 2.991 2.868 3.343 3.461 3.67 3.855 4.04 4.127 4.295 4.467 4.718 4.873 5.012 5.216 5.407 5.573 5.732 5.888 6.092 6.299 6.492 6.711 6.929 7.146 7.39 7.651 7.884 8.114 8.354 8.61 8.89 9.21 9.564 9.888 10.248 10.627 11.008 11.364 11.657 11.759 11.549 10.925 10.175 9.466 8.787 8.123 7.533 6.982 6.489 5.989 5.54 5.114 4.71 4.348 4.013 3.703 3.363 3.036 2.757 2.489 2.216 1.972 1.713 1.45 1.248 1.032 0.8 0.555 0.31 0.144 -0.042 -0.361 -0.563 -0.776 -0.893 -1.124 -1.369 -1.643 -1.786 -2.296 -2.257 -2.432 -2.62 -3.006 -3.209 -3.432 -3.697 -4.043 -4.43 -4.924 -6.037 -7 ,6245 ,KEBNE ,16722328,Sat Nov 27 23:26:45 CET,Sun Nov 28 01:01:26 CET,0.0 0.915 1.311 1.629 1.89 2.108 2.307 2.475 2.78 2.924 3.051 2.934 3.411 3.523 3.732 3.934 4.126 4.213 4.4 4.588 4.82 4.956 5.093 5.299 5.507 5.711 5.906 6.082 6.287 6.481 6.671 6.911 7.128 7.319 7.542 7.789 8.035 8.293 8.557 8.829 9.089 9.38 9.734 10.053 10.4 10.787 11.17 11.519 11.803 11.925 11.685 11.014 10.264 9.517 8.835 8.204 7.616 7.057 6.564 6.058 5.609 5.21 4.821 4.451 4.101 3.772 3.412 3.089 2.814 2.523 2.223 1.969 1.707 1.443 1.23 0.991 0.747 0.492 0.223 0.04 -0.14 -0.409 -0.599 -0.81 -0.924 -1.153 -1.381 -1.633 -1.769 -2.262 -2.175 -2.342 -2.525 -2.929 -3.148 -3.399 -3.685 -3.988 -4.361 -4.851 -6.138 -10 ,8531 ,KEBNE ,16722331,Sat Nov 27 23:26:45 CET,Sun Nov 28 01:00:50 CET,0.0 0.921 1.338 1.655 1.895 2.1 2.292 2.467 2.776 2.921 3.064 2.964 3.442 3.55 3.761 3.967 4.155 4.239 4.392 4.536 4.766 4.925 5.073 5.284 5.485 5.674 5.844 6.006 6.221 6.42 6.614 6.846 7.051 7.242 7.458 7.7 7.944 8.217 8.496 8.783 9.068 9.379 9.719 10.032 10.39 10.758 11.126 11.457 11.755 11.932 11.712 10.994 10.215 9.412 8.668 7.988 7.368 6.797 6.288 5.779 5.339 4.923 4.529 4.174 3.854 3.564 3.232 2.93 2.672 2.394 2.101 1.857 1.602 1.334 1.133 0.914 0.667 0.426 0.186 0.01 -0.175 -0.463 -0.668 -0.885 -0.996 -1.229 -1.472 -1.736 -1.878 -2.386 -2.313 -2.471 -2.634 -3.001 -3.211 -3.434 -3.679 -3.97 -4.328 -4.852 -5.999 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_7_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_7_6.txt deleted file mode 100644 index 68b6e4de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_7_6.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,30447 ,KEBNE ,16722334,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:04:46 CET,0.0 1.053 1.446 1.721 1.952 2.142 2.313 2.466 2.716 2.823 2.92 2.719 3.177 3.256 3.4 3.539 3.668 3.722 3.825 3.915 4.029 4.1 4.171 4.272 4.355 4.432 4.512 4.588 4.679 4.747 4.801 4.855 4.889 4.926 4.97 5.028 5.072 5.087 5.091 5.077 5.033 4.936 4.767 4.562 4.302 3.97 3.455 2.677 1.504 -0.294 -3.279 -6.768 -9.607 -12.103 -14.267 -16.116 -17.709 -19.162 -20.42 -21.661 -22.751 -23.74 -24.655 -25.493 -26.268 -27.001 -27.75 -28.402 -28.974 -29.557 -30.14 -30.629 -31.161 -31.722 -32.155 -32.61 -33.082 -33.551 -34.022 -34.357 -34.708 -35.27 -35.666 -36.078 -36.297 -36.739 -37.197 -37.698 -37.96 -38.639 -38.747 -39.038 -39.353 -40.079 -40.48 -40.917 -41.394 -41.927 -42.606 -43.529 -46.239 -4 ,13991 ,KEBNE ,16722335,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:03:06 CET,0.0 1.261 1.727 2.038 2.247 2.447 2.634 2.792 3.06 3.183 3.296 3.11 3.572 3.658 3.825 3.967 4.086 4.144 4.259 4.363 4.513 4.609 4.695 4.817 4.929 5.027 5.126 5.223 5.325 5.416 5.508 5.622 5.731 5.811 5.879 5.947 6.01 6.07 6.111 6.136 6.127 6.071 6.012 5.945 5.822 5.577 5.09 4.315 3.182 1.456 -1.454 -4.928 -7.791 -10.152 -12.241 -14.163 -15.77 -17.206 -18.48 -19.756 -20.846 -21.804 -22.727 -23.599 -24.392 -25.079 -25.797 -26.47 -27.062 -27.68 -28.314 -28.85 -29.408 -29.976 -30.409 -30.851 -31.297 -31.782 -32.3 -32.645 -33.003 -33.558 -33.928 -34.314 -34.523 -34.969 -35.455 -35.967 -36.219 -36.901 -37.053 -37.356 -37.686 -38.383 -38.761 -39.178 -39.667 -40.234 -40.9 -41.812 -44.84 -5 ,2684 ,KEBNE ,16722336,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:04:03 CET,0.0 1.279 1.645 1.92 2.137 2.323 2.479 2.616 2.861 2.967 3.064 2.852 3.3 3.377 3.511 3.625 3.742 3.8 3.906 4.007 4.139 4.222 4.303 4.417 4.52 4.613 4.695 4.761 4.832 4.9 4.975 5.055 5.104 5.155 5.219 5.268 5.294 5.313 5.327 5.314 5.269 5.192 5.067 4.91 4.683 4.339 3.817 3.05 1.889 0.129 -2.823 -6.29 -9.218 -11.745 -13.866 -15.742 -17.422 -18.909 -20.175 -21.49 -22.588 -23.553 -24.495 -25.371 -26.156 -26.893 -27.661 -28.327 -28.904 -29.491 -30.1 -30.606 -31.145 -31.7 -32.129 -32.586 -33.041 -33.504 -33.984 -34.318 -34.66 -35.197 -35.585 -35.985 -36.194 -36.643 -37.112 -37.602 -37.86 -38.547 -38.691 -38.987 -39.309 -40.029 -40.43 -40.847 -41.32 -41.891 -42.571 -43.496 -46.528 -6 ,25297 ,KEBNE ,16722337,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:02:35 CET,0.0 1.099 1.465 1.723 1.938 2.134 2.297 2.435 2.684 2.793 2.894 2.715 3.186 3.27 3.412 3.53 3.64 3.697 3.796 3.88 4.006 4.089 4.167 4.269 4.371 4.473 4.556 4.629 4.717 4.804 4.894 4.988 5.047 5.089 5.141 5.198 5.239 5.257 5.255 5.242 5.205 5.131 5.035 4.907 4.667 4.328 3.822 3.089 2.023 0.309 -2.612 -6.096 -8.942 -11.339 -13.43 -15.287 -16.886 -18.3 -19.508 -20.747 -21.817 -22.759 -23.656 -24.509 -25.293 -25.995 -26.727 -27.378 -27.95 -28.548 -29.171 -29.697 -30.249 -30.833 -31.276 -31.723 -32.191 -32.68 -33.181 -33.534 -33.9 -34.466 -34.86 -35.276 -35.489 -35.905 -36.337 -36.809 -37.067 -37.775 -37.943 -38.239 -38.551 -39.263 -39.673 -40.103 -40.553 -41.09 -41.765 -42.69 -45.607 -8 ,12076 ,KEBNE ,16722339,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:01:49 CET,0.0 1.12 1.48 1.757 1.965 2.135 2.278 2.416 2.706 2.826 2.918 2.701 3.157 3.241 3.386 3.507 3.617 3.673 3.772 3.858 3.984 4.056 4.122 4.221 4.313 4.409 4.5 4.573 4.671 4.764 4.856 4.954 5.012 5.057 5.098 5.127 5.161 5.192 5.2 5.206 5.196 5.138 5.03 4.867 4.615 4.277 3.768 3.008 1.891 0.208 -2.658 -6.029 -8.85 -11.239 -13.268 -15.135 -16.751 -18.156 -19.406 -20.722 -21.87 -22.848 -23.741 -24.569 -25.346 -26.065 -26.786 -27.44 -28.036 -28.63 -29.226 -29.726 -30.255 -30.811 -31.249 -31.706 -32.168 -32.659 -33.175 -33.511 -33.855 -34.421 -34.802 -35.184 -35.396 -35.836 -36.292 -36.767 -37.014 -37.704 -37.849 -38.146 -38.472 -39.181 -39.552 -39.975 -40.464 -41.041 -41.775 -42.826 -45.831 -9 ,8918 ,KEBNE ,16722340,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:01:53 CET,0.0 1.07 1.452 1.7 1.911 2.114 2.282 2.415 2.645 2.746 2.842 2.643 3.1 3.181 3.331 3.452 3.57 3.627 3.733 3.826 3.948 4.021 4.093 4.211 4.322 4.418 4.494 4.562 4.652 4.746 4.827 4.898 4.951 5.011 5.08 5.136 5.186 5.215 5.208 5.182 5.167 5.137 5.04 4.883 4.659 4.364 3.887 3.159 2.085 0.411 -2.516 -6.107 -9.082 -11.56 -13.676 -15.584 -17.26 -18.745 -20.016 -21.317 -22.411 -23.343 -24.208 -25.039 -25.828 -26.556 -27.31 -27.984 -28.578 -29.195 -29.82 -30.333 -30.873 -31.429 -31.869 -32.332 -32.806 -33.298 -33.811 -34.159 -34.511 -35.047 -35.437 -35.849 -36.051 -36.457 -36.883 -37.33 -37.571 -38.252 -38.365 -38.656 -38.981 -39.68 -40.067 -40.497 -40.978 -41.531 -42.235 -43.269 -47.913 -10 ,16490 ,KEBNE ,16722341,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:02:40 CET,0.0 1.179 1.534 1.84 2.142 2.391 2.579 2.745 3.033 3.158 3.279 3.139 3.62 3.724 3.922 4.101 4.244 4.302 4.419 4.545 4.724 4.836 4.943 5.094 5.249 5.392 5.526 5.644 5.781 5.925 6.045 6.163 6.268 6.354 6.421 6.453 6.48 6.513 6.54 6.566 6.56 6.513 6.398 6.225 5.963 5.596 5.081 4.329 3.22 1.497 -1.454 -4.996 -7.885 -10.367 -12.537 -14.532 -16.217 -17.643 -18.853 -20.105 -21.227 -22.224 -23.169 -24.036 -24.852 -25.58 -26.289 -26.94 -27.514 -28.109 -28.731 -29.258 -29.814 -30.386 -30.816 -31.252 -31.724 -32.228 -32.736 -33.072 -33.431 -34.031 -34.434 -34.831 -35.043 -35.482 -35.934 -36.422 -36.692 -37.384 -37.507 -37.805 -38.125 -38.817 -39.214 -39.663 -40.144 -40.698 -41.403 -42.366 -45.461 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_7_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_7_Example-1.txt deleted file mode 100644 index aa193f98..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_7_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9898 ,KEBNE ,16722342,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:03:00 CET,0.0 1.615 2.085 2.425 2.68 2.906 3.1 3.267 3.552 3.67 3.789 3.609 4.063 4.139 4.266 4.381 4.487 4.537 4.627 4.709 4.837 4.915 4.986 5.073 5.142 5.211 5.275 5.321 5.367 5.408 5.441 5.466 5.46 5.432 5.402 5.349 5.244 5.096 4.907 4.667 4.392 4.049 3.558 2.97 2.18 1.161 -0.187 -2.026 -4.583 -8.216 -13.9 -20.28 -25.307 -29.336 -32.72 -35.608 -38.006 -40.129 -41.921 -43.658 -45.121 -46.393 -47.555 -48.655 -49.696 -50.631 -51.572 -52.398 -53.094 -53.794 -54.532 -55.145 -55.758 -56.389 -56.871 -57.358 -57.86 -58.368 -58.893 -59.259 -59.649 -60.271 -60.68 -61.092 -61.302 -61.735 -62.209 -62.715 -62.979 -63.694 -63.819 -64.132 -64.468 -65.188 -65.581 -66.022 -66.495 -67.025 -67.714 -68.637 -71.403 -2 ,7480 ,KEBNE ,16722343,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:03:20 CET,0.0 1.652 2.116 2.451 2.72 2.944 3.125 3.282 3.556 3.675 3.785 3.598 4.057 4.146 4.32 4.462 4.569 4.62 4.723 4.811 4.916 4.983 5.043 5.116 5.187 5.241 5.294 5.36 5.418 5.424 5.403 5.382 5.35 5.288 5.198 5.105 5.001 4.843 4.647 4.418 4.139 3.743 3.204 2.619 1.856 0.857 -0.512 -2.301 -4.824 -8.515 -14.203 -20.442 -25.284 -29.259 -32.572 -35.446 -37.893 -40.059 -41.875 -43.621 -45.098 -46.392 -47.605 -48.723 -49.748 -50.676 -51.633 -52.481 -53.194 -53.92 -54.64 -55.212 -55.818 -56.462 -56.965 -57.485 -58.0 -58.516 -59.047 -59.428 -59.833 -60.429 -60.828 -61.255 -61.477 -61.938 -62.407 -62.897 -63.161 -63.884 -64.015 -64.321 -64.63 -65.316 -65.7 -66.137 -66.632 -67.173 -67.819 -68.631 -71.632 -3 ,14792 ,KEBNE ,16722344,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:03:31 CET,0.0 1.317 1.728 2.03 2.262 2.47 2.645 2.795 3.057 3.167 3.265 3.08 3.546 3.624 3.757 3.884 3.998 4.056 4.156 4.235 4.343 4.417 4.504 4.636 4.732 4.798 4.85 4.885 4.929 4.978 5.005 5.005 4.988 4.964 4.913 4.834 4.756 4.651 4.481 4.251 3.987 3.626 3.14 2.569 1.758 0.745 -0.61 -2.42 -4.953 -8.601 -14.2 -20.49 -25.347 -29.24 -32.532 -35.438 -37.933 -40.105 -41.931 -43.714 -45.18 -46.45 -47.637 -48.759 -49.784 -50.713 -51.657 -52.457 -53.153 -53.89 -54.644 -55.246 -55.859 -56.49 -56.994 -57.526 -58.049 -58.574 -59.118 -59.49 -59.871 -60.459 -60.872 -61.312 -61.539 -62.005 -62.483 -62.977 -63.236 -63.946 -64.044 -64.352 -64.669 -65.304 -65.65 -66.063 -66.543 -67.047 -67.611 -68.403 -70.971 -4 ,11473 ,KEBNE ,16722345,Sat Nov 27 23:27:47 CET,Sun Nov 28 01:02:33 CET,0.0 1.323 1.718 2.025 2.275 2.483 2.661 2.813 3.053 3.157 3.263 3.078 3.54 3.617 3.758 3.885 3.996 4.042 4.128 4.199 4.282 4.335 4.377 4.436 4.496 4.543 4.576 4.604 4.634 4.634 4.614 4.585 4.561 4.529 4.475 4.389 4.267 4.113 3.944 3.744 3.481 3.145 2.7 2.159 1.392 0.399 -0.935 -2.678 -5.091 -8.669 -14.263 -20.513 -25.415 -29.433 -32.77 -35.638 -38.07 -40.187 -41.952 -43.693 -45.164 -46.447 -47.638 -48.767 -49.804 -50.716 -51.655 -52.479 -53.176 -53.895 -54.626 -55.221 -55.848 -56.495 -56.991 -57.506 -58.032 -58.564 -59.124 -59.509 -59.891 -60.47 -60.862 -61.272 -61.491 -61.953 -62.445 -62.98 -63.26 -64.001 -64.164 -64.467 -64.781 -65.475 -65.872 -66.305 -66.768 -67.309 -67.968 -68.782 -70.887 -6 ,24680 ,KEBNE ,16722347,Sat Nov 27 23:27:49 CET,Sun Nov 28 01:03:24 CET,0.0 1.716 2.158 2.442 2.671 2.87 3.033 3.169 3.434 3.563 3.672 3.466 3.922 3.994 4.121 4.246 4.364 4.417 4.513 4.593 4.702 4.767 4.824 4.913 4.98 5.022 5.055 5.074 5.092 5.103 5.111 5.106 5.09 5.07 5.015 4.921 4.814 4.679 4.48 4.222 3.929 3.564 3.053 2.418 1.581 0.576 -0.768 -2.592 -5.111 -8.72 -14.288 -20.523 -25.481 -29.545 -32.892 -35.771 -38.187 -40.268 -42.046 -43.811 -45.292 -46.576 -47.781 -48.92 -49.947 -50.862 -51.813 -52.651 -53.359 -54.087 -54.852 -55.469 -56.086 -56.72 -57.206 -57.698 -58.194 -58.713 -59.263 -59.642 -60.018 -60.604 -61.014 -61.434 -61.653 -62.11 -62.592 -63.107 -63.371 -64.086 -64.195 -64.478 -64.778 -65.46 -65.859 -66.271 -66.712 -67.226 -67.89 -68.778 -71.275 -7 ,14983 ,KEBNE ,16722348,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:03:26 CET,0.0 1.882 2.382 2.723 2.993 3.211 3.391 3.547 3.808 3.922 4.024 3.823 4.281 4.362 4.502 4.624 4.746 4.805 4.908 5.001 5.122 5.194 5.257 5.322 5.382 5.437 5.486 5.53 5.569 5.596 5.62 5.631 5.607 5.563 5.497 5.399 5.282 5.15 4.987 4.759 4.475 4.156 3.709 3.124 2.366 1.398 0.062 -1.705 -4.202 -7.824 -13.454 -19.884 -24.797 -28.8 -32.231 -35.148 -37.629 -39.818 -41.601 -43.342 -44.831 -46.14 -47.364 -48.491 -49.523 -50.442 -51.373 -52.203 -52.923 -53.675 -54.426 -55.019 -55.631 -56.269 -56.765 -57.279 -57.801 -58.33 -58.879 -59.265 -59.666 -60.281 -60.705 -61.134 -61.355 -61.816 -62.304 -62.805 -63.062 -63.779 -63.879 -64.17 -64.488 -65.141 -65.485 -65.89 -66.329 -66.813 -67.412 -68.286 -71.112 -8 ,10238 ,KEBNE ,16722349,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:02:21 CET,0.0 1.396 1.812 2.114 2.365 2.571 2.74 2.891 3.153 3.26 3.367 3.195 3.649 3.723 3.857 3.959 4.057 4.108 4.204 4.274 4.356 4.402 4.444 4.508 4.568 4.628 4.675 4.695 4.709 4.728 4.739 4.725 4.683 4.629 4.566 4.486 4.381 4.243 4.066 3.839 3.57 3.214 2.701 2.141 1.395 0.388 -0.951 -2.742 -5.212 -8.773 -14.456 -21.117 -26.43 -30.591 -33.995 -37.01 -39.477 -41.641 -43.502 -45.281 -46.752 -48.025 -49.224 -50.33 -51.358 -52.287 -53.224 -54.077 -54.823 -55.555 -56.296 -56.909 -57.533 -58.176 -58.67 -59.177 -59.691 -60.208 -60.74 -61.12 -61.513 -62.103 -62.507 -62.932 -63.157 -63.629 -64.118 -64.623 -64.88 -65.586 -65.675 -65.952 -66.232 -66.9 -67.278 -67.668 -68.115 -68.667 -69.346 -70.25 -72.669 -9 ,14581 ,KEBNE ,16722350,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:03:24 CET,0.0 1.689 2.178 2.523 2.793 3.014 3.207 3.376 3.659 3.791 3.909 3.729 4.19 4.273 4.428 4.564 4.689 4.754 4.88 4.98 5.119 5.212 5.296 5.404 5.497 5.576 5.632 5.677 5.724 5.746 5.745 5.738 5.719 5.703 5.68 5.622 5.542 5.433 5.294 5.087 4.807 4.437 3.943 3.396 2.651 1.661 0.331 -1.453 -3.978 -7.568 -13.225 -19.581 -24.602 -28.776 -32.17 -35.078 -37.612 -39.889 -41.751 -43.491 -44.942 -46.204 -47.394 -48.484 -49.477 -50.385 -51.32 -52.14 -52.848 -53.578 -54.306 -54.899 -55.51 -56.145 -56.64 -57.136 -57.644 -58.173 -58.721 -59.094 -59.473 -60.061 -60.466 -60.886 -61.104 -61.547 -61.998 -62.472 -62.724 -63.434 -63.526 -63.838 -64.166 -64.836 -65.206 -65.621 -66.099 -66.647 -67.333 -68.324 -71.494 -10 ,538 ,KEBNE ,16722351,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:02:17 CET,0.0 2.851 3.403 3.769 4.053 4.281 4.484 4.667 4.963 5.085 5.193 5.004 5.463 5.541 5.693 5.832 5.935 5.983 6.07 6.146 6.244 6.292 6.341 6.405 6.467 6.541 6.599 6.647 6.699 6.726 6.748 6.756 6.755 6.742 6.686 6.614 6.525 6.379 6.186 5.942 5.639 5.281 4.808 4.235 3.427 2.385 1.029 -0.779 -3.345 -7.044 -12.788 -19.119 -23.919 -27.856 -31.21 -34.124 -36.602 -38.737 -40.541 -42.325 -43.802 -45.107 -46.35 -47.489 -48.524 -49.45 -50.403 -51.269 -52.011 -52.731 -53.454 -54.061 -54.672 -55.305 -55.803 -56.31 -56.843 -57.394 -57.937 -58.307 -58.692 -59.324 -59.764 -60.181 -60.39 -60.821 -61.277 -61.771 -62.026 -62.742 -62.853 -63.154 -63.46 -64.144 -64.519 -64.897 -65.332 -65.846 -66.476 -67.359 -69.774 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_6.txt deleted file mode 100644 index 68b94e29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2812 ,KEBNE ,16722352,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:01:18 CET,0.0 1.125 1.54 1.871 2.145 2.385 2.616 2.839 3.24 3.437 3.637 3.544 4.165 4.331 4.637 4.912 5.17 5.296 5.538 5.767 6.103 6.331 6.558 6.887 7.193 7.475 7.749 8.017 8.372 8.719 9.056 9.481 9.893 10.271 10.736 11.273 11.753 12.276 12.865 13.513 14.206 14.975 15.841 16.715 17.772 18.959 20.332 21.886 23.788 26.116 29.002 31.461 32.835 33.634 34.141 34.465 34.664 34.715 34.691 34.646 34.56 34.473 34.361 34.212 34.067 33.936 33.78 33.623 33.462 33.29 33.103 32.942 32.769 32.58 32.438 32.29 32.137 31.963 31.775 31.645 31.497 31.271 31.104 30.878 30.759 30.545 30.309 30.057 29.926 29.366 29.51 29.348 29.178 28.788 28.546 28.297 28.027 27.7 27.288 26.774 25.418 -2 ,29771 ,KEBNE ,16722353,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:02:10 CET,0.0 1.152 1.634 1.991 2.287 2.547 2.797 3.025 3.4 3.573 3.742 3.597 4.194 4.337 4.628 4.898 5.162 5.297 5.547 5.784 6.14 6.365 6.571 6.886 7.201 7.485 7.764 8.041 8.396 8.741 9.069 9.479 9.882 10.272 10.728 11.238 11.728 12.263 12.836 13.461 14.126 14.871 15.765 16.684 17.771 18.977 20.387 22.009 23.955 26.308 29.222 31.647 33.025 33.823 34.302 34.61 34.801 34.879 34.876 34.819 34.709 34.585 34.454 34.311 34.156 34.008 33.863 33.723 33.569 33.405 33.24 33.101 32.95 32.762 32.617 32.471 32.31 32.142 31.948 31.813 31.674 31.446 31.282 31.097 30.994 30.794 30.592 30.349 30.223 29.673 29.83 29.686 29.517 29.148 28.945 28.699 28.419 28.089 27.67 27.071 25.643 -3 ,29545 ,KEBNE ,16722354,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:00:55 CET,0.0 1.208 1.667 2.012 2.284 2.529 2.758 2.981 3.396 3.58 3.75 3.609 4.217 4.374 4.663 4.922 5.172 5.301 5.574 5.84 6.205 6.443 6.678 7.007 7.319 7.613 7.894 8.164 8.517 8.866 9.199 9.585 9.964 10.339 10.777 11.292 11.794 12.354 12.966 13.617 14.287 15.037 15.932 16.839 17.918 19.13 20.523 22.115 24.029 26.342 29.218 31.63 33.018 33.855 34.363 34.702 34.9 34.987 35.007 34.984 34.893 34.77 34.642 34.501 34.358 34.206 34.038 33.883 33.724 33.546 33.374 33.222 33.05 32.865 32.711 32.543 32.354 32.155 31.958 31.824 31.69 31.454 31.274 31.09 30.992 30.797 30.599 30.371 30.249 29.697 29.845 29.687 29.498 29.086 28.867 28.634 28.365 28.047 27.654 27.107 25.429 -4 ,15584 ,KEBNE ,16722355,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:01:10 CET,0.0 1.201 1.669 2.02 2.312 2.555 2.781 2.988 3.378 3.578 3.759 3.61 4.213 4.362 4.643 4.922 5.204 5.34 5.589 5.832 6.187 6.406 6.608 6.911 7.217 7.513 7.799 8.073 8.429 8.784 9.119 9.536 9.932 10.303 10.755 11.243 11.699 12.244 12.847 13.486 14.18 14.956 15.849 16.739 17.78 18.949 20.347 21.948 23.865 26.207 29.079 31.476 32.85 33.692 34.199 34.533 34.751 34.837 34.841 34.802 34.725 34.624 34.51 34.392 34.258 34.12 33.955 33.801 33.671 33.515 33.326 33.164 32.986 32.795 32.641 32.467 32.291 32.104 31.898 31.749 31.584 31.325 31.153 30.956 30.845 30.625 30.402 30.15 30.005 29.435 29.565 29.404 29.225 28.825 28.601 28.33 28.0 27.593 27.108 26.466 24.486 -5 ,686 ,KEBNE ,16722356,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:01:16 CET,0.0 1.068 1.495 1.818 2.094 2.344 2.576 2.797 3.201 3.378 3.547 3.432 4.048 4.203 4.489 4.751 4.992 5.112 5.357 5.6 5.947 6.162 6.372 6.692 7.003 7.294 7.58 7.866 8.251 8.626 8.97 9.375 9.761 10.132 10.577 11.086 11.556 12.08 12.664 13.288 13.956 14.739 15.672 16.614 17.75 19.025 20.442 22.033 23.926 26.221 29.09 31.499 32.839 33.672 34.179 34.481 34.667 34.744 34.766 34.717 34.614 34.514 34.395 34.243 34.088 33.939 33.777 33.607 33.451 33.283 33.091 32.923 32.727 32.507 32.332 32.16 31.992 31.808 31.596 31.445 31.282 30.998 30.79 30.568 30.455 30.226 29.988 29.739 29.602 29.044 29.162 28.991 28.817 28.4 28.152 27.884 27.593 27.226 26.778 26.162 24.444 -6 ,8173 ,KEBNE ,16722357,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:01:23 CET,0.0 1.269 1.726 2.072 2.372 2.643 2.884 3.098 3.468 3.639 3.807 3.687 4.304 4.458 4.749 5.036 5.317 5.446 5.697 5.94 6.284 6.495 6.695 6.991 7.282 7.564 7.84 8.111 8.458 8.807 9.161 9.589 9.99 10.37 10.824 11.343 11.85 12.401 12.984 13.592 14.226 14.977 15.891 16.817 17.91 19.125 20.547 22.169 24.118 26.493 29.383 31.784 33.108 33.895 34.433 34.791 35.0 35.112 35.139 35.105 35.016 34.902 34.772 34.627 34.493 34.359 34.192 34.039 33.911 33.779 33.598 33.429 33.26 33.087 32.95 32.796 32.643 32.469 32.272 32.131 31.976 31.738 31.555 31.348 31.241 31.014 30.776 30.533 30.404 29.838 29.942 29.768 29.584 29.166 28.927 28.664 28.354 27.993 27.544 26.98 25.179 -7 ,28291 ,KEBNE ,16722358,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:02:35 CET,0.0 1.214 1.66 2.001 2.299 2.567 2.824 3.055 3.446 3.635 3.815 3.701 4.325 4.486 4.796 5.094 5.381 5.52 5.782 6.024 6.362 6.576 6.796 7.12 7.432 7.748 8.054 8.343 8.724 9.083 9.431 9.86 10.271 10.665 11.105 11.6 12.069 12.603 13.204 13.858 14.556 15.335 16.243 17.154 18.248 19.509 20.936 22.548 24.503 26.865 29.776 32.199 33.606 34.474 34.96 35.224 35.395 35.486 35.507 35.473 35.402 35.33 35.252 35.142 35.016 34.881 34.713 34.544 34.384 34.209 34.02 33.871 33.715 33.53 33.378 33.224 33.062 32.88 32.679 32.535 32.379 32.145 31.973 31.773 31.668 31.444 31.192 30.916 30.779 30.212 30.31 30.135 29.942 29.492 29.254 28.972 28.641 28.237 27.735 27.052 25.193 -8 ,15601 ,KEBNE ,16722359,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:01:08 CET,0.0 1.82 2.335 2.711 3.029 3.298 3.53 3.741 4.123 4.296 4.455 4.304 4.904 5.047 5.323 5.589 5.845 5.969 6.214 6.45 6.779 6.996 7.209 7.514 7.811 8.104 8.385 8.65 9.008 9.358 9.685 10.091 10.497 10.885 11.316 11.808 12.292 12.826 13.409 14.039 14.726 15.499 16.357 17.24 18.326 19.554 20.953 22.588 24.554 26.891 29.758 32.107 33.428 34.254 34.823 35.151 35.331 35.462 35.501 35.473 35.413 35.322 35.203 35.057 34.891 34.739 34.58 34.432 34.287 34.126 33.951 33.777 33.591 33.407 33.264 33.117 32.954 32.773 32.585 32.459 32.324 32.096 31.931 31.76 31.665 31.453 31.23 31.003 30.877 30.311 30.453 30.305 30.141 29.778 29.538 29.266 28.998 28.693 28.298 27.748 26.188 -9 ,1250 ,KEBNE ,16722360,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:01:24 CET,0.0 1.369 1.857 2.208 2.5 2.776 3.025 3.229 3.602 3.773 3.94 3.815 4.427 4.576 4.855 5.131 5.384 5.506 5.753 5.989 6.322 6.536 6.746 7.042 7.325 7.605 7.871 8.123 8.467 8.802 9.127 9.527 9.903 10.26 10.682 11.16 11.621 12.144 12.72 13.341 14.004 14.737 15.584 16.471 17.541 18.757 20.163 21.711 23.576 25.884 28.774 31.225 32.604 33.405 33.897 34.199 34.34 34.424 34.466 34.42 34.288 34.158 34.039 33.9 33.744 33.597 33.447 33.311 33.157 32.979 32.806 32.653 32.483 32.29 32.147 31.993 31.818 31.607 31.369 31.211 31.056 30.806 30.625 30.438 30.334 30.114 29.901 29.684 29.554 28.99 29.126 28.976 28.816 28.467 28.26 28.009 27.729 27.403 26.972 26.348 24.639 -10 ,6448 ,KEBNE ,16722361,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:02:28 CET,0.0 2.226 2.727 3.106 3.433 3.694 3.926 4.149 4.539 4.706 4.864 4.717 5.32 5.455 5.714 5.958 6.182 6.301 6.54 6.761 7.091 7.314 7.533 7.85 8.152 8.447 8.735 9.015 9.376 9.73 10.066 10.472 10.869 11.255 11.692 12.168 12.641 13.169 13.737 14.373 15.079 15.849 16.758 17.673 18.695 19.85 21.21 22.779 24.672 26.971 29.782 32.153 33.518 34.378 34.931 35.26 35.428 35.499 35.516 35.472 35.381 35.288 35.185 35.042 34.902 34.751 34.571 34.405 34.24 34.055 33.852 33.689 33.516 33.324 33.172 33.007 32.826 32.633 32.41 32.24 32.072 31.816 31.629 31.425 31.322 31.116 30.88 30.617 30.486 29.928 30.035 29.856 29.666 29.2 28.936 28.646 28.318 27.956 27.511 26.932 25.005 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt deleted file mode 100644 index dc07bdaf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-2.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26856 ,KEBNE ,16722362,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:02:11 CET,0.0 1.546 2.023 2.347 2.63 2.879 3.098 3.307 3.694 3.859 4.028 3.906 4.502 4.633 4.896 5.133 5.358 5.471 5.689 5.89 6.178 6.36 6.549 6.826 7.062 7.286 7.505 7.721 8.008 8.302 8.585 8.909 9.207 9.501 9.846 10.208 10.555 10.922 11.309 11.714 12.14 12.604 13.136 13.67 14.235 14.832 15.478 16.144 16.838 17.498 17.948 17.921 17.619 17.201 16.741 16.271 15.826 15.406 15.015 14.57 14.165 13.795 13.419 13.067 12.74 12.417 12.054 11.737 11.475 11.194 10.903 10.666 10.408 10.135 9.926 9.707 9.476 9.235 8.985 8.818 8.644 8.351 8.149 7.937 7.832 7.623 7.397 7.15 7.022 6.424 6.579 6.422 6.248 5.885 5.686 5.47 5.233 4.962 4.608 4.168 3.03 -2 ,18952 ,KEBNE ,16722363,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:02:34 CET,0.0 1.345 1.803 2.158 2.456 2.707 2.932 3.132 3.482 3.646 3.807 3.656 4.249 4.383 4.639 4.871 5.092 5.197 5.396 5.594 5.878 6.059 6.236 6.483 6.719 6.967 7.221 7.457 7.739 8.01 8.276 8.586 8.872 9.152 9.491 9.86 10.207 10.58 10.986 11.419 11.845 12.306 12.828 13.342 13.902 14.498 15.174 15.88 16.596 17.284 17.783 17.784 17.525 17.13 16.665 16.201 15.736 15.292 14.899 14.465 14.076 13.724 13.383 13.051 12.725 12.409 12.081 11.797 11.546 11.278 11.001 10.762 10.503 10.228 10.019 9.806 9.58 9.34 9.093 8.921 8.731 8.435 8.232 8.018 7.912 7.692 7.459 7.217 7.084 6.499 6.674 6.524 6.374 6.042 5.844 5.619 5.387 5.129 4.813 4.385 2.978 -3 ,13192 ,KEBNE ,16722364,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:03:33 CET,0.0 1.258 1.835 2.294 2.567 2.831 3.082 3.292 3.66 3.824 3.983 3.823 4.408 4.544 4.81 5.047 5.266 5.38 5.595 5.784 6.07 6.252 6.427 6.681 6.92 7.147 7.363 7.576 7.866 8.149 8.409 8.72 9.035 9.343 9.682 10.055 10.414 10.782 11.163 11.572 11.998 12.461 13.001 13.548 14.125 14.723 15.389 16.083 16.802 17.482 17.939 17.913 17.595 17.155 16.695 16.258 15.817 15.378 14.985 14.582 14.198 13.836 13.494 13.155 12.834 12.537 12.208 11.921 11.661 11.375 11.081 10.826 10.555 10.291 10.099 9.889 9.675 9.451 9.214 9.056 8.89 8.625 8.44 8.248 8.144 7.916 7.69 7.464 7.341 6.758 6.927 6.774 6.61 6.243 6.038 5.816 5.584 5.309 4.961 4.514 3.219 -4 ,615 ,KEBNE ,16722365,Sat Nov 27 23:27:48 CET,Sun Nov 28 01:02:38 CET,0.0 1.276 1.741 2.111 2.403 2.642 2.841 3.035 3.409 3.579 3.733 3.559 4.144 4.271 4.522 4.764 4.982 5.09 5.309 5.522 5.808 5.988 6.172 6.441 6.687 6.931 7.17 7.391 7.669 7.937 8.209 8.536 8.85 9.156 9.481 9.84 10.199 10.578 10.968 11.375 11.796 12.243 12.753 13.262 13.822 14.448 15.147 15.86 16.611 17.329 17.889 17.952 17.621 17.149 16.693 16.281 15.879 15.45 15.059 14.633 14.242 13.861 13.471 13.132 12.83 12.547 12.26 12.002 11.758 11.5 11.226 10.98 10.739 10.506 10.298 10.073 9.854 9.614 9.358 9.179 9.008 8.745 8.55 8.342 8.228 7.983 7.724 7.46 7.32 6.714 6.835 6.661 6.483 6.08 5.84 5.573 5.278 4.928 4.459 3.867 1.917 -7 ,2327 ,KEBNE ,16722368,Sat Nov 27 23:28:49 CET,Sun Nov 28 01:03:15 CET,0.0 1.438 1.919 2.288 2.597 2.884 3.132 3.339 3.711 3.879 4.036 3.894 4.501 4.645 4.94 5.235 5.491 5.608 5.844 6.068 6.388 6.588 6.782 7.066 7.344 7.618 7.878 8.127 8.427 8.706 8.98 9.316 9.623 9.906 10.241 10.607 10.95 11.344 11.765 12.209 12.667 13.183 13.78 14.314 14.884 15.478 16.086 16.729 17.428 18.091 18.566 18.557 18.182 17.719 17.228 16.726 16.253 15.791 15.361 14.892 14.508 14.175 13.84 13.507 13.186 12.904 12.578 12.272 12.02 11.741 11.431 11.181 10.921 10.643 10.431 10.209 9.979 9.75 9.522 9.362 9.191 8.936 8.759 8.566 8.467 8.261 8.04 7.799 7.671 7.085 7.249 7.099 6.94 6.589 6.409 6.212 5.97 5.69 5.352 4.886 3.61 -8 ,29482 ,KEBNE ,16722369,Sat Nov 27 23:28:49 CET,Sun Nov 28 01:03:11 CET,0.0 1.472 1.947 2.322 2.631 2.887 3.118 3.324 3.689 3.855 4.015 3.864 4.448 4.578 4.836 5.071 5.281 5.383 5.585 5.795 6.088 6.272 6.462 6.729 6.982 7.231 7.482 7.728 8.029 8.312 8.591 8.913 9.212 9.5 9.835 10.198 10.54 10.918 11.296 11.662 12.076 12.568 13.073 13.571 14.155 14.753 15.405 16.082 16.768 17.411 17.881 17.859 17.523 17.059 16.592 16.13 15.661 15.207 14.796 14.353 13.949 13.578 13.226 12.891 12.574 12.29 11.993 11.713 11.458 11.192 10.908 10.666 10.427 10.181 9.984 9.773 9.532 9.28 9.027 8.851 8.675 8.401 8.199 7.983 7.87 7.616 7.352 7.1 6.968 6.37 6.539 6.391 6.231 5.876 5.673 5.442 5.165 4.866 4.518 4.015 2.748 -9 ,30518 ,KEBNE ,16722370,Sat Nov 27 23:28:49 CET,Sun Nov 28 01:03:20 CET,0.0 1.367 1.827 2.167 2.445 2.677 2.886 3.092 3.479 3.648 3.81 3.666 4.273 4.418 4.681 4.913 5.135 5.245 5.457 5.662 5.963 6.153 6.335 6.595 6.838 7.058 7.274 7.502 7.793 8.048 8.295 8.603 8.903 9.185 9.505 9.855 10.187 10.539 10.926 11.341 11.761 12.228 12.74 13.237 13.816 14.431 15.087 15.784 16.509 17.177 17.656 17.602 17.272 16.827 16.357 15.893 15.419 14.972 14.57 14.128 13.747 13.39 13.037 12.701 12.386 12.109 11.814 11.54 11.298 11.05 10.79 10.562 10.315 10.049 9.844 9.633 9.404 9.158 8.895 8.716 8.538 8.259 8.064 7.855 7.748 7.533 7.29 7.031 6.9 6.314 6.481 6.337 6.177 5.799 5.596 5.377 5.119 4.805 4.422 3.945 2.522 -10 ,11598 ,KEBNE ,16722371,Sat Nov 27 23:28:49 CET,Sun Nov 28 01:04:34 CET,0.0 1.962 2.505 2.894 3.185 3.438 3.671 3.892 4.275 4.442 4.605 4.479 5.091 5.226 5.464 5.699 5.928 6.042 6.267 6.462 6.723 6.894 7.071 7.333 7.573 7.815 8.054 8.274 8.547 8.82 9.09 9.406 9.691 9.966 10.296 10.636 10.945 11.302 11.694 12.105 12.518 12.974 13.523 14.062 14.597 15.128 15.721 16.366 17.063 17.739 18.257 18.242 17.874 17.4 16.967 16.509 16.032 15.583 15.143 14.671 14.296 13.961 13.607 13.272 12.963 12.67 12.363 12.097 11.847 11.564 11.284 11.048 10.782 10.5 10.298 10.086 9.855 9.617 9.361 9.182 8.996 8.707 8.509 8.298 8.179 7.929 7.668 7.391 7.25 6.643 6.756 6.587 6.41 5.978 5.723 5.439 5.139 4.824 4.435 3.949 2.751 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt deleted file mode 100644 index 4b50582a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-1_Example-3.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9729 ,KEBNE ,16722372,Sat Nov 27 23:28:49 CET,Sun Nov 28 01:02:27 CET,0.0 0.936 1.225 1.458 1.658 1.835 2.006 2.191 2.51 2.648 2.779 2.568 3.14 3.258 3.49 3.72 3.935 4.03 4.21 4.387 4.654 4.831 4.995 5.217 5.431 5.638 5.837 6.033 6.283 6.518 6.749 7.025 7.288 7.541 7.821 8.127 8.435 8.764 9.1 9.458 9.823 10.208 10.626 11.03 11.497 11.953 12.386 12.862 13.307 13.586 13.483 12.833 12.029 11.196 10.403 9.651 8.972 8.337 7.777 7.203 6.665 6.16 5.697 5.265 4.849 4.45 4.038 3.658 3.299 2.94 2.588 2.303 2.005 1.679 1.425 1.162 0.886 0.591 0.282 0.071 -0.151 -0.507 -0.759 -1.026 -1.162 -1.439 -1.739 -2.059 -2.234 -2.872 -2.788 -3.004 -3.244 -3.788 -4.1 -4.453 -4.845 -5.274 -5.766 -6.396 -9.722 -2 ,6883 ,KEBNE ,16722373,Sat Nov 27 23:28:49 CET,Sun Nov 28 01:03:45 CET,0.0 0.953 1.235 1.497 1.724 1.899 2.049 2.195 2.464 2.592 2.715 2.485 3.036 3.139 3.348 3.539 3.718 3.804 3.96 4.116 4.352 4.492 4.63 4.839 5.031 5.219 5.406 5.596 5.843 6.078 6.304 6.567 6.814 7.049 7.311 7.607 7.899 8.204 8.514 8.838 9.186 9.584 10.029 10.444 10.869 11.293 11.781 12.22 12.6 12.853 12.652 11.843 10.934 10.055 9.226 8.443 7.704 6.997 6.37 5.74 5.192 4.686 4.193 3.715 3.284 2.88 2.452 2.086 1.753 1.393 1.024 0.709 0.373 0.028 -0.248 -0.538 -0.837 -1.149 -1.475 -1.71 -1.952 -2.325 -2.598 -2.892 -3.041 -3.331 -3.643 -3.993 -4.184 -4.83 -4.767 -5.0 -5.247 -5.751 -6.051 -6.399 -6.788 -7.245 -7.794 -8.535 -10.424 -4 ,6397 ,KEBNE ,16722375,Sat Nov 27 23:28:49 CET,Sun Nov 28 01:02:17 CET,0.0 0.566 0.873 1.171 1.441 1.665 1.861 2.041 2.37 2.513 2.65 2.475 3.049 3.167 3.399 3.614 3.828 3.934 4.135 4.321 4.569 4.725 4.878 5.101 5.331 5.556 5.758 5.964 6.234 6.495 6.737 7.01 7.295 7.575 7.866 8.185 8.487 8.795 9.128 9.481 9.835 10.209 10.638 11.054 11.53 12.029 12.535 12.967 13.325 13.594 13.465 12.83 12.037 11.249 10.463 9.651 8.914 8.2 7.568 6.961 6.429 5.944 5.455 4.996 4.572 4.148 3.706 3.311 2.972 2.633 2.272 1.976 1.674 1.313 0.998 0.704 0.425 0.131 -0.168 -0.372 -0.585 -0.929 -1.166 -1.413 -1.542 -1.804 -2.071 -2.369 -2.54 -3.196 -3.131 -3.323 -3.525 -3.941 -4.183 -4.481 -4.811 -5.191 -5.636 -6.202 -7.933 -5 ,7808 ,KEBNE ,16722376,Sat Nov 27 23:28:49 CET,Sun Nov 28 01:02:18 CET,0.0 0.931 1.225 1.473 1.719 1.919 2.093 2.268 2.595 2.744 2.878 2.687 3.265 3.382 3.608 3.827 4.05 4.153 4.343 4.535 4.8 4.963 5.123 5.377 5.613 5.816 6.018 6.221 6.481 6.72 6.95 7.226 7.498 7.758 8.032 8.355 8.671 8.986 9.311 9.666 10.023 10.401 10.843 11.264 11.712 12.177 12.676 13.147 13.523 13.771 13.599 12.856 12.009 11.152 10.339 9.594 8.932 8.307 7.732 7.136 6.615 6.156 5.707 5.247 4.83 4.451 4.051 3.684 3.359 3.032 2.676 2.378 2.079 1.77 1.524 1.265 0.99 0.694 0.389 0.177 -0.045 -0.398 -0.645 -0.906 -1.043 -1.32 -1.614 -1.931 -2.09 -2.719 -2.714 -2.941 -3.137 -3.559 -3.824 -4.122 -4.431 -4.819 -5.32 -6.001 -8.21 -6 ,14055 ,KEBNE ,16722377,Sat Nov 27 23:28:49 CET,Sun Nov 28 01:02:35 CET,0.0 0.664 0.918 1.148 1.373 1.584 1.785 1.978 2.362 2.525 2.675 2.511 3.085 3.199 3.42 3.65 3.87 3.975 4.179 4.365 4.633 4.802 4.972 5.215 5.431 5.639 5.843 6.038 6.277 6.513 6.743 7.0 7.27 7.535 7.821 8.136 8.425 8.759 9.114 9.465 9.842 10.237 10.691 11.146 11.614 12.087 12.562 13.022 13.416 13.653 13.496 12.806 12.024 11.256 10.496 9.732 9.013 8.345 7.779 7.188 6.643 6.141 5.645 5.173 4.74 4.354 3.95 3.568 3.224 2.897 2.571 2.287 1.982 1.645 1.374 1.098 0.839 0.573 0.28 0.075 -0.137 -0.46 -0.699 -0.96 -1.096 -1.384 -1.702 -2.036 -2.207 -2.849 -2.781 -2.991 -3.22 -3.742 -4.034 -4.359 -4.738 -5.238 -5.82 -6.53 -9.577 -7 ,21932 ,KEBNE ,16722378,Sat Nov 27 23:28:49 CET,Sun Nov 28 01:02:58 CET,0.0 0.644 0.9 1.096 1.264 1.422 1.576 1.718 1.985 2.111 2.232 2.006 2.576 2.7 2.922 3.137 3.355 3.453 3.642 3.821 4.071 4.231 4.384 4.605 4.829 5.036 5.234 5.43 5.681 5.936 6.177 6.446 6.696 6.947 7.247 7.568 7.863 8.197 8.546 8.88 9.205 9.572 10.037 10.477 10.949 11.433 11.901 12.376 12.807 13.076 12.97 12.271 11.41 10.552 9.74 8.959 8.249 7.632 7.103 6.542 6.044 5.593 5.136 4.705 4.306 3.897 3.462 3.101 2.802 2.478 2.119 1.825 1.513 1.183 0.915 0.626 0.35 0.071 -0.255 -0.488 -0.716 -1.081 -1.335 -1.598 -1.739 -2.04 -2.347 -2.664 -2.839 -3.507 -3.503 -3.721 -3.943 -4.429 -4.72 -5.066 -5.449 -5.833 -6.277 -6.92 -8.887 -8 ,27517 ,KEBNE ,16722379,Sat Nov 27 23:28:49 CET,Sun Nov 28 01:03:02 CET,0.0 0.726 1.044 1.301 1.503 1.678 1.848 2.009 2.296 2.426 2.542 2.304 2.862 2.964 3.156 3.339 3.52 3.609 3.783 3.962 4.225 4.388 4.55 4.793 5.024 5.252 5.461 5.66 5.927 6.169 6.396 6.662 6.923 7.172 7.453 7.777 8.084 8.406 8.746 9.116 9.511 9.927 10.354 10.767 11.222 11.678 12.154 12.618 13.036 13.278 13.099 12.439 11.665 10.836 10.023 9.261 8.576 7.927 7.35 6.774 6.25 5.768 5.283 4.814 4.396 4.018 3.615 3.24 2.914 2.585 2.228 1.925 1.613 1.277 1.009 0.739 0.459 0.143 -0.194 -0.419 -0.655 -1.026 -1.288 -1.566 -1.71 -2.012 -2.338 -2.67 -2.829 -3.457 -3.396 -3.591 -3.801 -4.276 -4.552 -4.86 -5.193 -5.571 -6.027 -6.815 -11.392 -9 ,26769 ,KEBNE ,16722380,Sat Nov 27 23:28:49 CET,Sun Nov 28 01:03:21 CET,0.0 0.854 1.109 1.358 1.622 1.85 2.027 2.18 2.445 2.559 2.678 2.449 3.003 3.102 3.313 3.525 3.748 3.86 4.056 4.235 4.513 4.696 4.873 5.126 5.351 5.561 5.756 5.948 6.2 6.428 6.649 6.932 7.198 7.454 7.727 8.019 8.336 8.695 9.053 9.417 9.775 10.135 10.541 10.918 11.342 11.782 12.186 12.556 12.891 13.018 12.717 11.939 11.048 10.134 9.288 8.487 7.733 7.023 6.375 5.738 5.204 4.683 4.166 3.694 3.255 2.84 2.408 2.033 1.709 1.365 0.975 0.644 0.314 -0.026 -0.303 -0.588 -0.88 -1.197 -1.555 -1.801 -2.041 -2.427 -2.687 -2.965 -3.117 -3.418 -3.733 -4.073 -4.253 -4.891 -4.83 -5.051 -5.272 -5.76 -6.049 -6.352 -6.677 -7.031 -7.473 -8.093 -9.614 -10 ,4840 ,KEBNE ,16722381,Sat Nov 27 23:28:50 CET,Sun Nov 28 01:06:04 CET,0.0 0.899 1.302 1.579 1.774 1.946 2.107 2.252 2.515 2.64 2.766 2.561 3.128 3.249 3.479 3.697 3.9 3.996 4.188 4.378 4.644 4.801 4.943 5.144 5.348 5.563 5.774 5.975 6.239 6.501 6.749 7.033 7.31 7.581 7.875 8.217 8.565 8.917 9.288 9.692 10.11 10.587 11.109 11.57 12.04 12.512 13.0 13.445 13.853 14.111 13.889 13.177 12.384 11.534 10.741 10.006 9.328 8.685 8.11 7.526 7.022 6.554 6.085 5.628 5.198 4.809 4.405 4.032 3.699 3.362 3.013 2.713 2.41 2.098 1.836 1.56 1.28 0.991 0.693 0.47 0.234 -0.11 -0.355 -0.627 -0.775 -1.07 -1.375 -1.717 -1.884 -2.507 -2.403 -2.596 -2.801 -3.272 -3.535 -3.833 -4.197 -4.671 -5.225 -5.992 -9.4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt deleted file mode 100644 index 88227f0d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-22.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,20634 ,KEBNE ,16722383,Sat Nov 27 23:29:50 CET,Sun Nov 28 01:04:47 CET,0.0 2.228 2.893 3.406 3.837 4.225 4.578 4.893 5.439 5.68 5.918 6.21 6.553 6.726 7.071 7.413 7.737 7.886 8.149 8.4 8.769 9.008 9.239 9.575 9.904 10.22 10.517 10.784 11.104 11.404 11.676 12.0 12.322 12.623 12.966 13.333 13.66 14.033 14.442 14.822 15.18 15.562 16.007 16.443 16.913 17.375 17.827 18.236 18.547 18.721 18.501 17.73 16.829 15.924 15.081 14.249 13.519 12.859 12.25 11.566 10.929 10.36 9.81 9.269 8.779 8.341 7.864 7.434 7.049 6.647 6.227 5.883 5.518 5.117 4.81 4.491 4.159 3.823 3.461 3.206 2.956 2.562 2.277 1.979 1.821 1.491 1.134 0.749 0.549 0.186 -0.089 -0.32 -0.567 -1.102 -1.402 -1.731 -2.096 -2.515 -3.021 -3.717 -5.783 -4 ,31964 ,KEBNE ,16722385,Sat Nov 27 23:29:50 CET,Sun Nov 28 01:04:52 CET,0.0 2.315 3.15 3.747 4.199 4.578 4.914 5.211 5.753 6.005 6.236 6.519 6.872 7.078 7.476 7.838 8.168 8.309 8.557 8.793 9.135 9.363 9.601 9.95 10.292 10.609 10.895 11.173 11.53 11.871 12.205 12.606 12.963 13.276 13.598 13.993 14.393 14.799 15.231 15.635 16.016 16.429 16.869 17.289 17.757 18.239 18.705 19.118 19.431 19.553 19.247 18.42 17.484 16.582 15.794 15.032 14.307 13.635 12.993 12.281 11.638 11.051 10.495 9.96 9.442 8.971 8.496 8.107 7.778 7.431 7.07 6.749 6.38 5.976 5.666 5.341 4.975 4.601 4.231 3.964 3.684 3.249 2.941 2.621 2.457 2.117 1.76 1.4 1.225 0.885 0.644 0.429 0.2 -0.297 -0.57 -0.868 -1.197 -1.55 -2.002 -2.6 -4.473 -5 ,14209 ,KEBNE ,16722386,Sat Nov 27 23:30:52 CET,Sun Nov 28 01:08:31 CET,0.0 2.236 2.974 3.526 3.965 4.332 4.664 4.97 5.513 5.755 5.986 6.272 6.624 6.818 7.195 7.541 7.853 8.007 8.317 8.611 9.025 9.284 9.527 9.864 10.192 10.507 10.82 11.119 11.479 11.822 12.137 12.503 12.839 13.142 13.49 13.873 14.224 14.591 14.975 15.372 15.788 16.232 16.707 17.131 17.574 18.035 18.476 18.876 19.203 19.384 19.158 18.335 17.406 16.442 15.552 14.745 14.005 13.319 12.716 12.092 11.51 10.976 10.468 9.994 9.565 9.152 8.707 8.304 7.948 7.571 7.172 6.845 6.498 6.127 5.831 5.51 5.172 4.819 4.452 4.208 3.963 3.578 3.313 3.031 2.879 2.572 2.256 1.919 1.738 1.385 1.143 0.931 0.704 0.214 -0.056 -0.37 -0.731 -1.135 -1.635 -2.345 -5.402 -6 ,8841 ,KEBNE ,16722387,Sat Nov 27 23:31:53 CET,Sun Nov 28 01:05:31 CET,0.0 2.539 3.262 3.782 4.205 4.586 4.925 5.216 5.743 5.987 6.224 6.544 6.909 7.093 7.443 7.77 8.079 8.227 8.503 8.774 9.165 9.401 9.617 9.922 10.209 10.488 10.762 11.034 11.39 11.721 12.028 12.421 12.788 13.11 13.48 13.884 14.288 14.712 15.119 15.557 16.019 16.517 17.04 17.474 17.884 18.323 18.784 19.158 19.48 19.666 19.459 18.713 17.801 16.86 16.02 15.211 14.464 13.806 13.214 12.581 12.018 11.489 10.969 10.467 9.964 9.486 8.98 8.543 8.168 7.749 7.299 6.938 6.568 6.161 5.843 5.515 5.168 4.814 4.436 4.156 3.86 3.416 3.109 2.785 2.618 2.267 1.906 1.526 1.327 0.971 0.702 0.473 0.223 -0.326 -0.622 -0.946 -1.321 -1.757 -2.273 -2.964 -5.096 -7 ,24680 ,KEBNE ,16722388,Sat Nov 27 23:31:53 CET,Sun Nov 28 01:07:00 CET,0.0 3.399 4.195 4.771 5.232 5.615 5.94 6.227 6.716 6.946 7.173 7.414 7.737 7.907 8.214 8.518 8.803 8.936 9.208 9.473 9.897 10.188 10.45 10.793 11.095 11.398 11.679 11.929 12.264 12.585 12.88 13.239 13.578 13.894 14.236 14.598 14.942 15.311 15.705 16.111 16.5 16.914 17.378 17.828 18.29 18.709 19.158 19.573 19.876 20.037 19.826 19.054 18.154 17.218 16.277 15.378 14.576 13.818 13.138 12.436 11.81 11.247 10.713 10.221 9.76 9.312 8.829 8.399 7.995 7.565 7.131 6.771 6.43 6.096 5.829 5.543 5.232 4.889 4.519 4.264 4.001 3.6 3.323 3.026 2.871 2.553 2.22 1.878 1.693 1.338 1.068 0.838 0.601 0.091 -0.207 -0.542 -0.892 -1.349 -1.911 -2.611 -5.078 -8 ,16902 ,KEBNE ,16722389,Sat Nov 27 23:35:59 CET,Sun Nov 28 01:14:38 CET,0.0 2.123 2.793 3.292 3.678 4.01 4.321 4.602 5.082 5.309 5.544 5.819 6.173 6.376 6.732 7.06 7.392 7.551 7.856 8.156 8.576 8.837 9.099 9.474 9.808 10.118 10.409 10.689 11.042 11.377 11.688 12.056 12.404 12.724 13.111 13.52 13.875 14.255 14.61 14.979 15.377 15.798 16.268 16.708 17.188 17.645 18.085 18.506 18.847 19.025 18.769 17.912 16.969 16.115 15.244 14.355 13.551 12.802 12.106 11.402 10.807 10.26 9.755 9.289 8.854 8.443 8.002 7.62 7.285 6.916 6.509 6.163 5.819 5.46 5.19 4.921 4.626 4.301 3.957 3.725 3.489 3.109 2.844 2.564 2.421 2.121 1.782 1.418 1.229 0.88 0.611 0.388 0.146 -0.402 -0.709 -1.052 -1.442 -1.901 -2.489 -3.337 -7.412 -9 ,23728 ,KEBNE ,16722390,Sat Nov 27 23:38:01 CET,Sun Nov 28 01:16:41 CET,0.0 1.943 2.583 3.069 3.513 3.907 4.237 4.519 5.008 5.239 5.455 5.707 6.047 6.239 6.603 6.944 7.247 7.388 7.666 7.936 8.327 8.568 8.799 9.125 9.443 9.744 10.037 10.328 10.711 11.099 11.452 11.831 12.186 12.53 12.921 13.367 13.767 14.165 14.581 15.015 15.454 15.874 16.272 16.654 17.089 17.527 17.973 18.384 18.721 18.839 18.537 17.747 16.786 15.832 14.932 14.036 13.186 12.398 11.703 11.068 10.552 10.046 9.549 9.081 8.612 8.18 7.74 7.35 7.018 6.651 6.236 5.888 5.542 5.185 4.898 4.612 4.305 3.974 3.633 3.39 3.15 2.765 2.471 2.156 1.99 1.663 1.338 0.933 0.701 0.317 -0.022 -0.286 -0.558 -1.115 -1.42 -1.763 -2.157 -2.6 -3.101 -3.778 -5.97 -10 ,23098 ,KEBNE ,16722391,Sat Nov 27 23:38:01 CET,Sun Nov 28 01:11:43 CET,0.0 2.644 3.384 3.923 4.364 4.767 5.111 5.411 5.952 6.178 6.386 6.636 6.974 7.154 7.498 7.847 8.169 8.314 8.601 8.883 9.289 9.538 9.782 10.115 10.42 10.725 11.013 11.278 11.609 11.911 12.194 12.552 12.91 13.253 13.644 14.052 14.413 14.786 15.143 15.494 15.877 16.297 16.767 17.204 17.668 18.135 18.552 18.917 19.27 19.463 19.219 18.488 17.585 16.69 15.896 15.103 14.383 13.735 13.137 12.534 12.006 11.525 11.014 10.475 9.972 9.498 9.006 8.573 8.178 7.747 7.299 6.94 6.554 6.156 5.846 5.516 5.184 4.844 4.471 4.203 3.925 3.504 3.224 2.931 2.775 2.458 2.135 1.77 1.578 1.236 0.963 0.72 0.476 -0.064 -0.381 -0.711 -1.08 -1.513 -2.027 -2.715 -4.717 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 68c32a01..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,691 ,KEBNE ,16722392,Sat Nov 27 23:40:04 CET,Sun Nov 28 01:14:30 CET,0.0 2.589 3.223 3.687 4.069 4.404 4.704 4.981 5.458 5.664 5.86 6.087 6.412 6.576 6.885 7.174 7.44 7.568 7.815 8.048 8.382 8.598 8.809 9.109 9.387 9.646 9.9 10.149 10.449 10.716 10.97 11.266 11.541 11.796 12.098 12.451 12.782 13.13 13.498 13.864 14.225 14.642 15.096 15.487 15.864 16.198 16.49 16.717 16.839 16.682 15.905 14.558 13.28 12.119 11.038 10.04 9.156 8.343 7.604 6.829 6.155 5.564 5.007 4.469 3.965 3.513 3.046 2.639 2.247 1.789 1.324 0.935 0.515 0.091 -0.239 -0.586 -0.942 -1.317 -1.71 -1.974 -2.249 -2.694 -3.006 -3.329 -3.492 -3.835 -4.222 -4.628 -4.83 -5.206 -5.5 -5.733 -5.975 -6.528 -6.844 -7.175 -7.522 -7.931 -8.448 -9.157 -11.212 -2 ,3126 ,KEBNE ,16722393,Sat Nov 27 23:41:05 CET,Sun Nov 28 01:15:30 CET,0.0 2.738 3.542 4.177 4.718 5.146 5.526 5.86 6.452 6.729 6.995 7.339 7.708 7.922 8.318 8.673 9.003 9.162 9.457 9.747 10.155 10.411 10.65 10.991 11.319 11.631 11.914 12.182 12.521 12.829 13.114 13.419 13.701 13.989 14.303 14.645 14.97 15.306 15.631 15.963 16.313 16.69 17.106 17.475 17.826 18.136 18.397 18.599 18.705 18.553 17.903 16.725 15.503 14.344 13.284 12.295 11.429 10.616 9.873 9.132 8.495 7.924 7.37 6.839 6.343 5.86 5.354 4.918 4.528 4.103 3.631 3.243 2.842 2.42 2.104 1.774 1.431 1.082 0.706 0.447 0.184 -0.24 -0.535 -0.852 -1.019 -1.359 -1.724 -2.113 -2.313 -2.686 -2.975 -3.219 -3.477 -4.023 -4.326 -4.659 -5.045 -5.487 -6.055 -6.779 -8.737 -3 ,11104 ,KEBNE ,16722394,Sat Nov 27 23:41:05 CET,Sun Nov 28 01:15:30 CET,0.0 2.314 2.988 3.532 3.966 4.329 4.65 4.939 5.475 5.715 5.933 6.191 6.51 6.69 7.043 7.353 7.647 7.791 8.057 8.308 8.669 8.906 9.134 9.446 9.745 10.033 10.3 10.556 10.885 11.185 11.47 11.818 12.15 12.453 12.796 13.208 13.602 14.002 14.422 14.844 15.239 15.656 16.112 16.552 17.009 17.431 17.822 18.096 18.217 18.069 17.378 16.107 14.796 13.585 12.509 11.497 10.608 9.788 9.043 8.286 7.644 7.081 6.517 5.939 5.388 4.883 4.349 3.866 3.447 3.005 2.54 2.145 1.724 1.286 0.937 0.57 0.188 -0.202 -0.603 -0.878 -1.152 -1.596 -1.921 -2.258 -2.441 -2.818 -3.203 -3.624 -3.848 -4.239 -4.572 -4.835 -5.111 -5.718 -6.069 -6.446 -6.862 -7.361 -7.921 -8.641 -10.806 -4 ,13781 ,KEBNE ,16722395,Sat Nov 27 23:42:08 CET,Sun Nov 28 01:17:42 CET,0.0 3.15 3.933 4.516 5.0 5.412 5.782 6.121 6.738 7.019 7.28 7.614 7.975 8.183 8.578 8.936 9.264 9.412 9.676 9.919 10.26 10.48 10.692 10.992 11.268 11.524 11.779 12.027 12.331 12.613 12.875 13.18 13.461 13.72 14.008 14.333 14.647 14.977 15.322 15.677 16.034 16.409 16.795 17.15 17.541 17.939 18.313 18.64 18.817 18.645 17.886 16.585 15.313 14.17 13.153 12.205 11.361 10.567 9.859 9.151 8.531 7.948 7.362 6.824 6.348 5.903 5.434 5.013 4.638 4.251 3.846 3.497 3.132 2.738 2.433 2.119 1.779 1.427 1.066 0.821 0.575 0.179 -0.102 -0.389 -0.536 -0.848 -1.19 -1.552 -1.744 -2.12 -2.419 -2.652 -2.898 -3.449 -3.757 -4.123 -4.551 -5.029 -5.605 -6.432 -11.083 -5 ,6991 ,KEBNE ,16722396,Sat Nov 27 23:44:10 CET,Sun Nov 28 01:19:42 CET,0.0 3.644 4.399 4.969 5.419 5.796 6.135 6.431 6.958 7.205 7.438 7.726 8.074 8.259 8.61 8.946 9.262 9.41 9.695 9.97 10.346 10.585 10.821 11.164 11.484 11.787 12.074 12.333 12.651 12.954 13.248 13.595 13.912 14.213 14.564 14.938 15.294 15.68 16.069 16.468 16.835 17.207 17.639 18.016 18.429 18.859 19.238 19.47 19.536 19.341 18.514 17.218 15.966 14.826 13.833 12.9 12.018 11.162 10.362 9.545 8.854 8.235 7.629 7.038 6.48 5.979 5.451 4.96 4.541 4.108 3.64 3.247 2.84 2.415 2.086 1.747 1.385 0.99 0.588 0.31 0.006 -0.489 -0.821 -1.143 -1.315 -1.692 -2.084 -2.491 -2.7 -3.076 -3.369 -3.604 -3.854 -4.426 -4.738 -5.068 -5.441 -5.882 -6.426 -7.156 -9.314 -6 ,28268 ,KEBNE ,16722397,Sat Nov 27 23:48:14 CET,Sun Nov 28 01:22:42 CET,0.0 2.413 3.05 3.529 3.915 4.243 4.538 4.799 5.275 5.503 5.73 6.018 6.356 6.538 6.869 7.175 7.482 7.626 7.914 8.197 8.601 8.841 9.073 9.415 9.74 10.056 10.341 10.607 10.948 11.259 11.537 11.876 12.213 12.545 12.916 13.304 13.66 14.032 14.44 14.851 15.256 15.642 15.992 16.299 16.651 16.985 17.264 17.506 17.61 17.476 16.754 15.518 14.307 13.096 12.054 11.159 10.318 9.524 8.812 8.11 7.504 6.902 6.291 5.704 5.178 4.736 4.27 3.842 3.473 3.079 2.682 2.361 2.012 1.636 1.338 1.025 0.702 0.371 0.028 -0.212 -0.468 -0.871 -1.156 -1.444 -1.592 -1.918 -2.263 -2.628 -2.825 -3.2 -3.493 -3.726 -3.964 -4.506 -4.815 -5.162 -5.556 -6.018 -6.603 -7.442 -11.938 -7 ,27938 ,KEBNE ,16722398,Sat Nov 27 23:49:16 CET,Sun Nov 28 01:29:55 CET,0.0 3.805 4.749 5.403 5.913 6.347 6.734 7.083 7.689 7.952 8.191 8.472 8.815 9.004 9.366 9.713 10.034 10.178 10.448 10.708 11.067 11.29 11.513 11.832 12.127 12.406 12.67 12.925 13.24 13.52 13.786 14.086 14.366 14.632 14.916 15.253 15.585 15.948 16.327 16.721 17.125 17.546 17.994 18.397 18.803 19.165 19.514 19.784 19.926 19.839 19.128 17.889 16.628 15.39 14.233 13.16 12.191 11.278 10.45 9.636 8.973 8.381 7.8 7.254 6.764 6.313 5.786 5.286 4.87 4.431 3.952 3.554 3.151 2.737 2.405 2.052 1.685 1.296 0.906 0.648 0.378 -0.065 -0.37 -0.672 -0.835 -1.177 -1.54 -1.923 -2.117 -2.483 -2.749 -2.978 -3.215 -3.745 -4.033 -4.335 -4.698 -5.132 -5.635 -6.334 -8.793 -8 ,21974 ,KEBNE ,16722399,Sat Nov 27 23:49:20 CET,Sun Nov 28 01:19:06 CET,0.0 2.729 3.513 4.073 4.537 4.926 5.242 5.528 6.058 6.314 6.557 6.851 7.204 7.375 7.677 7.959 8.213 8.331 8.564 8.788 9.103 9.3 9.496 9.782 10.045 10.302 10.555 10.789 11.079 11.368 11.641 11.959 12.279 12.561 12.855 13.176 13.473 13.791 14.123 14.463 14.794 15.151 15.527 15.887 16.276 16.626 16.966 17.28 17.461 17.355 16.629 15.264 13.908 12.651 11.525 10.54 9.663 8.871 8.2 7.5 6.892 6.337 5.815 5.332 4.869 4.429 3.926 3.441 3.01 2.555 2.085 1.708 1.327 0.939 0.643 0.315 -0.045 -0.407 -0.787 -1.05 -1.319 -1.742 -2.04 -2.363 -2.538 -2.892 -3.256 -3.642 -3.837 -4.201 -4.486 -4.726 -4.977 -5.517 -5.807 -6.122 -6.504 -6.962 -7.504 -8.201 -10.671 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt deleted file mode 100644 index 35c52fe3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-23_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,26723 ,KEBNE ,16722403,Sat Nov 27 23:58:27 CET,Sun Nov 28 01:32:00 CET,0.0 1.273 1.575 1.8 1.959 2.085 2.207 2.32 2.472 2.539 2.595 2.518 2.705 2.749 2.817 2.878 2.924 2.937 2.95 2.958 2.968 2.959 2.947 2.93 2.895 2.845 2.782 2.724 2.626 2.489 2.336 2.143 1.958 1.768 1.517 1.187 0.844 0.408 -0.117 -0.728 -1.441 -2.299 -3.428 -4.706 -6.351 -8.39 -11.071 -14.528 -19.268 -25.998 -36.042 -46.605 -54.397 -60.552 -65.522 -69.716 -73.206 -76.213 -78.741 -81.208 -83.241 -84.95 -86.531 -88.023 -89.367 -90.548 -91.745 -92.829 -93.768 -94.714 -95.695 -96.509 -97.357 -98.217 -98.865 -99.523 -100.188 -100.888 -101.62 -102.115 -102.611 -103.384 -103.915 -104.452 -104.726 -105.281 -105.857 -106.465 -106.767 -107.32 -107.709 -108.058 -108.421 -109.192 -109.598 -110.037 -110.54 -111.099 -111.745 -112.638 -115.86 -4 ,16422 ,KEBNE ,16722405,Sat Nov 27 23:59:28 CET,Sun Nov 28 01:36:37 CET,0.0 1.084 1.39 1.599 1.775 1.928 2.046 2.132 2.278 2.363 2.442 2.406 2.602 2.647 2.718 2.764 2.81 2.823 2.839 2.855 2.845 2.848 2.862 2.862 2.839 2.806 2.75 2.68 2.582 2.464 2.328 2.149 1.974 1.778 1.506 1.174 0.805 0.367 -0.142 -0.725 -1.405 -2.32 -3.589 -5.004 -6.782 -8.992 -11.854 -15.451 -20.219 -26.827 -36.674 -47.145 -55.071 -61.258 -66.186 -70.385 -73.845 -76.873 -79.417 -81.872 -83.921 -85.668 -87.281 -88.78 -90.136 -91.37 -92.665 -93.787 -94.702 -95.626 -96.613 -97.424 -98.253 -99.104 -99.747 -100.421 -101.125 -101.835 -102.575 -103.083 -103.597 -104.388 -104.943 -105.508 -105.786 -106.363 -106.958 -107.576 -107.898 -108.493 -108.95 -109.319 -109.694 -110.533 -110.989 -111.484 -112.034 -112.62 -113.321 -114.233 -116.652 -6 ,10937 ,KEBNE ,16722407,Sun Nov 28 00:01:30 CET,Sun Nov 28 01:34:50 CET,0.0 1.352 1.682 1.929 2.125 2.266 2.397 2.517 2.695 2.769 2.829 2.769 2.958 3.0 3.066 3.126 3.158 3.172 3.209 3.219 3.217 3.229 3.234 3.198 3.137 3.067 2.995 2.921 2.823 2.71 2.58 2.4 2.189 1.954 1.671 1.34 0.976 0.521 -0.008 -0.603 -1.268 -2.125 -3.282 -4.563 -6.222 -8.319 -11.034 -14.515 -19.241 -25.81 -35.719 -46.385 -54.288 -60.455 -65.405 -69.556 -73.053 -76.061 -78.533 -80.948 -82.933 -84.636 -86.224 -87.688 -89.031 -90.224 -91.441 -92.521 -93.447 -94.393 -95.355 -96.14 -96.942 -97.778 -98.406 -99.032 -99.681 -100.379 -101.106 -101.597 -102.106 -102.899 -103.44 -103.989 -104.268 -104.837 -105.431 -106.033 -106.333 -106.903 -107.319 -107.666 -108.029 -108.806 -109.221 -109.675 -110.164 -110.695 -111.299 -112.03 -113.788 -7 ,15777 ,KEBNE ,16722408,Sun Nov 28 00:01:30 CET,Sun Nov 28 01:35:03 CET,0.0 1.072 1.402 1.647 1.82 1.964 2.088 2.186 2.351 2.42 2.488 2.465 2.654 2.696 2.769 2.804 2.809 2.813 2.82 2.818 2.789 2.788 2.792 2.76 2.704 2.623 2.535 2.447 2.307 2.153 1.992 1.752 1.489 1.21 0.853 0.438 0.027 -0.475 -1.077 -1.761 -2.489 -3.376 -4.562 -5.883 -7.61 -9.817 -12.657 -16.235 -21.043 -27.628 -37.355 -47.727 -55.393 -61.395 -66.25 -70.403 -73.879 -76.857 -79.317 -81.689 -83.696 -85.438 -87.023 -88.496 -89.847 -91.048 -92.297 -93.387 -94.301 -95.231 -96.186 -96.963 -97.758 -98.584 -99.215 -99.865 -100.522 -101.192 -101.901 -102.39 -102.884 -103.651 -104.179 -104.736 -105.021 -105.591 -106.209 -106.867 -107.205 -107.803 -108.269 -108.652 -109.039 -109.867 -110.311 -110.791 -111.347 -111.963 -112.669 -113.612 -116.391 -8 ,32170 ,KEBNE ,16722409,Sun Nov 28 00:01:30 CET,Sun Nov 28 01:35:08 CET,0.0 1.114 1.378 1.56 1.706 1.832 1.949 2.054 2.224 2.298 2.362 2.304 2.493 2.525 2.573 2.619 2.655 2.679 2.713 2.72 2.735 2.741 2.739 2.723 2.686 2.62 2.539 2.479 2.399 2.295 2.154 1.949 1.764 1.571 1.315 0.994 0.674 0.265 -0.295 -0.935 -1.648 -2.526 -3.671 -5.022 -6.8 -8.958 -11.711 -15.247 -19.964 -26.515 -36.338 -46.857 -54.66 -60.813 -65.833 -70.101 -73.601 -76.6 -79.161 -81.686 -83.803 -85.631 -87.276 -88.745 -90.078 -91.302 -92.615 -93.771 -94.736 -95.72 -96.719 -97.544 -98.388 -99.261 -99.944 -100.633 -101.338 -102.042 -102.752 -103.264 -103.792 -104.583 -105.124 -105.676 -105.962 -106.564 -107.192 -107.834 -108.157 -108.744 -109.204 -109.571 -109.941 -110.761 -111.222 -111.708 -112.21 -112.812 -113.559 -114.479 -117.352 -10 ,15817 ,KEBNE ,16722411,Sun Nov 28 00:02:32 CET,Sun Nov 28 01:36:33 CET,0.0 1.332 1.685 1.965 2.186 2.369 2.525 2.647 2.841 2.929 3.008 2.99 3.203 3.27 3.379 3.452 3.514 3.536 3.559 3.584 3.622 3.636 3.638 3.626 3.592 3.56 3.53 3.475 3.378 3.282 3.163 2.997 2.819 2.625 2.378 2.051 1.705 1.271 0.757 0.17 -0.53 -1.41 -2.538 -3.797 -5.428 -7.487 -10.14 -13.564 -18.285 -24.898 -34.825 -45.293 -53.125 -59.284 -64.263 -68.477 -71.943 -74.944 -77.461 -79.847 -81.812 -83.537 -85.166 -86.676 -88.067 -89.326 -90.595 -91.696 -92.645 -93.617 -94.618 -95.453 -96.296 -97.14 -97.795 -98.471 -99.162 -99.873 -100.588 -101.065 -101.557 -102.328 -102.854 -103.399 -103.685 -104.272 -104.872 -105.487 -105.802 -106.391 -106.821 -107.188 -107.575 -108.431 -108.894 -109.373 -109.899 -110.483 -111.167 -112.061 -114.799 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt deleted file mode 100644 index 2d8fb65e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-22.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16056 ,KEBNE ,16722412,Sun Nov 28 00:02:32 CET,Sun Nov 28 01:37:02 CET,0.0 1.857 2.474 2.9 3.276 3.626 3.925 4.194 4.69 4.917 5.129 5.355 5.692 5.87 6.201 6.513 6.811 6.951 7.217 7.483 7.87 8.104 8.326 8.653 8.964 9.242 9.504 9.769 10.106 10.423 10.732 11.121 11.482 11.806 12.194 12.644 13.066 13.528 14.029 14.551 15.076 15.635 16.273 16.905 17.604 18.311 19.083 19.93 20.81 21.712 22.488 22.646 22.364 21.918 21.404 20.829 20.281 19.772 19.298 18.781 18.344 17.962 17.565 17.184 16.824 16.49 16.143 15.798 15.456 15.081 14.685 14.347 14.005 13.67 13.427 13.17 12.897 12.609 12.301 12.074 11.822 11.411 11.102 10.772 10.602 10.265 9.922 9.55 9.355 9.003 8.736 8.5 8.245 7.663 7.332 6.979 6.608 6.163 5.587 4.791 1.8 -2 ,14359 ,KEBNE ,16722413,Sun Nov 28 00:02:32 CET,Sun Nov 28 01:37:03 CET,0.0 2.095 2.71 3.197 3.588 3.931 4.248 4.524 5.045 5.29 5.519 5.779 6.149 6.356 6.723 7.059 7.385 7.543 7.842 8.131 8.555 8.823 9.086 9.478 9.854 10.217 10.552 10.878 11.304 11.707 12.086 12.525 12.938 13.319 13.779 14.261 14.669 15.141 15.678 16.229 16.776 17.376 18.087 18.787 19.508 20.291 21.165 22.059 22.988 23.821 24.49 24.624 24.404 24.032 23.589 23.093 22.597 22.132 21.646 21.091 20.614 20.209 19.829 19.457 19.087 18.73 18.357 18.008 17.699 17.384 17.035 16.726 16.413 16.082 15.82 15.541 15.238 14.916 14.581 14.361 14.146 13.817 13.591 13.351 13.218 12.951 12.673 12.362 12.198 11.876 11.647 11.431 11.195 10.664 10.373 10.056 9.693 9.272 8.74 7.976 4.566 -4 ,2311 ,KEBNE ,16722415,Sun Nov 28 00:03:34 CET,Sun Nov 28 01:39:03 CET,0.0 6.663 7.544 8.197 8.718 9.152 9.537 9.89 10.5 10.769 11.016 11.328 11.706 11.919 12.326 12.694 13.038 13.198 13.477 13.744 14.139 14.39 14.635 14.992 15.322 15.629 15.92 16.201 16.582 16.95 17.318 17.792 18.229 18.63 19.113 19.646 20.123 20.612 21.126 21.651 22.196 22.816 23.504 24.189 24.922 25.653 26.436 27.273 28.136 29.039 29.841 29.988 29.738 29.282 28.76 28.168 27.586 27.043 26.541 26.043 25.578 25.131 24.698 24.274 23.847 23.431 23.005 22.606 22.245 21.871 21.468 21.121 20.754 20.378 20.075 19.758 19.446 19.118 18.762 18.514 18.256 17.842 17.545 17.234 17.077 16.748 16.393 16.024 15.832 15.474 15.159 14.893 14.606 13.995 13.655 13.27 12.796 12.243 11.621 10.796 7.117 -6 ,29329 ,KEBNE ,16722417,Sun Nov 28 00:05:37 CET,Sun Nov 28 01:41:17 CET,0.0 2.857 3.618 4.139 4.59 5.0 5.341 5.646 6.18 6.428 6.669 6.965 7.342 7.544 7.917 8.272 8.621 8.789 9.109 9.408 9.835 10.117 10.405 10.814 11.188 11.533 11.863 12.187 12.584 12.964 13.325 13.712 14.047 14.369 14.785 15.288 15.763 16.271 16.783 17.308 17.841 18.407 19.07 19.705 20.376 21.093 21.878 22.693 23.541 24.358 25.038 25.187 24.977 24.59 24.122 23.661 23.207 22.762 22.355 21.909 21.514 21.121 20.695 20.274 19.881 19.525 19.139 18.782 18.462 18.127 17.788 17.494 17.169 16.825 16.545 16.262 15.971 15.659 15.322 15.077 14.822 14.42 14.138 13.853 13.702 13.377 13.037 12.681 12.495 12.143 11.85 11.62 11.393 10.867 10.55 10.183 9.764 9.282 8.729 7.99 4.917 -7 ,12486 ,KEBNE ,16722418,Sun Nov 28 00:05:37 CET,Sun Nov 28 01:39:58 CET,0.0 3.051 3.953 4.549 5.004 5.399 5.754 6.074 6.662 6.92 7.16 7.454 7.824 8.024 8.398 8.729 9.036 9.185 9.468 9.731 10.103 10.349 10.581 10.901 11.207 11.51 11.813 12.113 12.493 12.851 13.193 13.595 13.988 14.344 14.736 15.179 15.585 16.01 16.509 17.057 17.588 18.172 18.835 19.519 20.303 21.108 21.957 22.832 23.782 24.689 25.457 25.675 25.41 24.953 24.447 23.944 23.475 23.011 22.592 22.161 21.747 21.356 20.96 20.556 20.175 19.809 19.412 19.057 18.754 18.453 18.138 17.858 17.554 17.24 16.998 16.747 16.483 16.196 15.909 15.715 15.508 15.166 14.92 14.665 14.531 14.252 13.947 13.626 13.46 13.136 12.924 12.717 12.49 12.016 11.752 11.448 11.101 10.702 10.214 9.56 7.273 -9 ,28734 ,KEBNE ,16722420,Sun Nov 28 00:05:36 CET,Sun Nov 28 01:41:00 CET,0.0 2.386 3.117 3.632 4.047 4.403 4.732 5.035 5.598 5.861 6.105 6.39 6.758 6.954 7.326 7.692 8.031 8.193 8.497 8.778 9.19 9.453 9.715 10.083 10.42 10.746 11.062 11.373 11.758 12.114 12.457 12.886 13.294 13.679 14.128 14.616 15.074 15.587 16.131 16.685 17.271 17.915 18.628 19.334 20.123 20.923 21.794 22.716 23.675 24.598 25.42 25.624 25.387 25.026 24.594 24.118 23.675 23.263 22.83 22.331 21.876 21.447 21.033 20.644 20.272 19.876 19.443 19.052 18.69 18.298 17.882 17.543 17.193 16.848 16.58 16.284 15.967 15.641 15.308 15.076 14.835 14.447 14.177 13.902 13.757 13.446 13.124 12.782 12.604 12.264 12.008 11.788 11.554 11.073 10.796 10.467 10.094 9.668 9.158 8.513 5.96 -10 ,27888 ,KEBNE ,16722421,Sun Nov 28 00:05:36 CET,Sun Nov 28 01:39:53 CET,0.0 2.401 3.144 3.684 4.121 4.501 4.843 5.163 5.748 6.0 6.24 6.537 6.91 7.112 7.499 7.857 8.192 8.35 8.654 8.941 9.365 9.644 9.91 10.294 10.66 11.005 11.336 11.656 12.059 12.452 12.826 13.257 13.672 14.08 14.512 14.933 15.327 15.767 16.244 16.731 17.221 17.787 18.45 19.125 19.87 20.614 21.432 22.272 23.152 24.039 24.773 24.954 24.75 24.396 23.964 23.47 22.95 22.435 21.981 21.494 21.042 20.616 20.186 19.79 19.434 19.094 18.717 18.353 18.031 17.696 17.328 17.032 16.722 16.38 16.105 15.814 15.502 15.177 14.846 14.612 14.367 13.987 13.72 13.437 13.286 12.954 12.598 12.223 12.025 11.669 11.397 11.175 10.94 10.368 10.038 9.695 9.302 8.835 8.276 7.457 2.725 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt deleted file mode 100644 index e7186131..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-24_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2272 ,KEBNE ,17026204,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:29:30 CET,0.0 1.143 1.483 1.721 1.904 2.068 2.234 2.369 2.569 2.657 2.751 2.781 3.017 3.084 3.21 3.317 3.397 3.431 3.488 3.543 3.611 3.659 3.707 3.754 3.78 3.773 3.751 3.732 3.688 3.664 3.624 3.502 3.368 3.226 3.035 2.802 2.572 2.268 1.904 1.475 0.948 0.257 -0.685 -1.759 -3.206 -5.035 -7.434 -10.542 -14.72 -20.59 -29.559 -39.089 -46.23 -51.919 -56.484 -60.312 -63.495 -66.253 -68.533 -70.737 -72.627 -74.28 -75.791 -77.171 -78.399 -79.493 -80.628 -81.639 -82.499 -83.36 -84.261 -85.013 -85.774 -86.557 -87.166 -87.778 -88.396 -89.034 -89.718 -90.186 -90.665 -91.423 -91.934 -92.459 -92.739 -93.309 -93.887 -94.519 -94.856 -95.449 -95.917 -96.304 -96.704 -97.563 -98.034 -98.565 -99.153 -99.843 -100.715 -101.848 -107.981 -2 ,31250 ,KEBNE ,17026205,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:29:18 CET,0.0 1.165 1.534 1.789 1.99 2.165 2.325 2.448 2.644 2.741 2.832 2.83 3.058 3.12 3.228 3.325 3.411 3.446 3.498 3.539 3.603 3.626 3.63 3.652 3.663 3.648 3.642 3.635 3.599 3.545 3.483 3.364 3.222 3.072 2.878 2.662 2.427 2.128 1.759 1.274 0.695 0.006 -0.873 -1.859 -3.203 -4.998 -7.321 -10.222 -14.278 -20.181 -29.134 -38.678 -45.761 -51.316 -55.847 -59.672 -62.903 -65.662 -67.927 -70.177 -72.088 -73.725 -75.228 -76.643 -77.908 -79.023 -80.221 -81.278 -82.16 -83.091 -84.036 -84.802 -85.58 -86.365 -86.963 -87.587 -88.25 -88.916 -89.58 -90.039 -90.526 -91.29 -91.83 -92.397 -92.69 -93.289 -93.926 -94.596 -94.946 -95.559 -96.032 -96.421 -96.817 -97.667 -98.141 -98.662 -99.245 -99.874 -100.586 -101.577 -105.212 -3 ,3963 ,KEBNE ,17026206,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:29:19 CET,0.0 1.267 1.603 1.844 2.019 2.181 2.344 2.488 2.724 2.815 2.897 2.879 3.104 3.164 3.28 3.385 3.468 3.501 3.566 3.634 3.721 3.763 3.8 3.84 3.869 3.896 3.908 3.904 3.859 3.813 3.781 3.716 3.628 3.517 3.341 3.117 2.88 2.529 2.07 1.506 0.85 0.113 -0.8 -1.87 -3.27 -4.976 -7.254 -10.333 -14.558 -20.455 -29.309 -38.764 -45.865 -51.517 -56.084 -59.914 -63.082 -65.839 -68.207 -70.566 -72.531 -74.191 -75.747 -77.186 -78.496 -79.65 -80.821 -81.87 -82.773 -83.715 -84.672 -85.44 -86.212 -86.996 -87.631 -88.289 -88.966 -89.671 -90.393 -90.89 -91.388 -92.171 -92.712 -93.268 -93.55 -94.12 -94.733 -95.375 -95.699 -96.29 -96.765 -97.154 -97.557 -98.425 -98.908 -99.442 -100.015 -100.664 -101.451 -102.422 -106.708 -4 ,21648 ,KEBNE ,17026207,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:30:26 CET,0.0 1.025 1.382 1.635 1.839 1.988 2.116 2.237 2.441 2.541 2.635 2.631 2.852 2.912 3.031 3.125 3.206 3.253 3.342 3.411 3.459 3.476 3.491 3.493 3.491 3.481 3.47 3.47 3.454 3.41 3.345 3.237 3.127 3.015 2.862 2.658 2.427 2.127 1.73 1.272 0.775 0.112 -0.818 -1.851 -3.192 -4.991 -7.354 -10.405 -14.677 -20.548 -29.337 -38.879 -45.976 -51.564 -56.062 -59.854 -63.057 -65.902 -68.282 -70.566 -72.494 -74.161 -75.71 -77.144 -78.461 -79.632 -80.829 -81.901 -82.817 -83.735 -84.655 -85.429 -86.238 -87.052 -87.666 -88.295 -88.938 -89.603 -90.31 -90.785 -91.271 -92.043 -92.567 -93.106 -93.389 -93.986 -94.611 -95.241 -95.564 -96.154 -96.626 -97.025 -97.442 -98.36 -98.856 -99.369 -99.913 -100.551 -101.297 -102.29 -106.3 -5 ,8743 ,KEBNE ,17026208,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:31:41 CET,0.0 1.38 1.687 1.926 2.136 2.298 2.43 2.55 2.756 2.852 2.943 2.933 3.155 3.207 3.274 3.34 3.407 3.438 3.493 3.546 3.613 3.642 3.664 3.68 3.68 3.67 3.662 3.652 3.636 3.586 3.509 3.405 3.288 3.177 3.037 2.822 2.576 2.265 1.893 1.417 0.828 0.151 -0.7 -1.697 -3.009 -4.696 -7.072 -10.113 -14.135 -19.86 -28.556 -37.912 -45.079 -50.771 -55.32 -59.179 -62.4 -65.235 -67.623 -69.909 -71.815 -73.49 -75.039 -76.451 -77.76 -78.944 -80.113 -81.119 -81.985 -82.884 -83.829 -84.618 -85.424 -86.252 -86.899 -87.562 -88.233 -88.91 -89.631 -90.127 -90.62 -91.38 -91.908 -92.463 -92.748 -93.335 -93.934 -94.566 -94.904 -95.515 -96.018 -96.404 -96.792 -97.64 -98.101 -98.603 -99.168 -99.798 -100.555 -101.512 -105.444 -6 ,12402 ,KEBNE ,17026209,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:29:18 CET,0.0 1.364 1.669 1.886 2.066 2.218 2.362 2.487 2.68 2.777 2.862 2.849 3.077 3.135 3.236 3.321 3.395 3.425 3.486 3.542 3.608 3.634 3.656 3.692 3.712 3.716 3.704 3.687 3.627 3.556 3.492 3.401 3.305 3.177 2.963 2.683 2.402 2.066 1.678 1.219 0.648 -0.076 -1.016 -2.063 -3.379 -5.04 -7.288 -10.282 -14.323 -19.969 -28.706 -38.148 -45.251 -50.939 -55.49 -59.321 -62.496 -65.197 -67.49 -69.703 -71.55 -73.18 -74.716 -76.172 -77.496 -78.66 -79.83 -80.857 -81.76 -82.71 -83.676 -84.472 -85.282 -86.108 -86.773 -87.445 -88.115 -88.832 -89.548 -90.023 -90.53 -91.293 -91.803 -92.34 -92.61 -93.18 -93.792 -94.418 -94.739 -95.33 -95.763 -96.131 -96.518 -97.383 -97.824 -98.284 -98.838 -99.469 -100.207 -101.184 -105.054 -7 ,3468 ,KEBNE ,17026210,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:29:52 CET,0.0 1.229 1.548 1.802 1.993 2.159 2.316 2.447 2.656 2.746 2.829 2.818 3.042 3.099 3.201 3.289 3.361 3.387 3.438 3.482 3.514 3.543 3.592 3.625 3.636 3.666 3.681 3.66 3.621 3.586 3.535 3.425 3.304 3.146 2.918 2.655 2.382 2.075 1.726 1.282 0.76 0.125 -0.748 -1.752 -3.077 -4.763 -7.052 -10.076 -14.207 -20.034 -28.856 -38.374 -45.514 -51.163 -55.762 -59.636 -62.876 -65.654 -67.96 -70.209 -72.104 -73.757 -75.313 -76.744 -78.009 -79.189 -80.43 -81.481 -82.388 -83.35 -84.319 -85.096 -85.884 -86.711 -87.356 -88.015 -88.684 -89.384 -90.112 -90.611 -91.129 -91.912 -92.447 -93.007 -93.301 -93.915 -94.57 -95.24 -95.565 -96.159 -96.613 -96.988 -97.393 -98.282 -98.761 -99.261 -99.818 -100.457 -101.233 -102.261 -105.815 -8 ,23692 ,KEBNE ,17026211,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:29:20 CET,0.0 1.501 1.834 2.068 2.247 2.402 2.547 2.666 2.851 2.94 3.025 3.025 3.251 3.302 3.408 3.519 3.61 3.645 3.706 3.746 3.774 3.789 3.797 3.806 3.814 3.81 3.805 3.799 3.782 3.732 3.649 3.541 3.426 3.309 3.136 2.92 2.7 2.373 1.967 1.521 1.018 0.363 -0.545 -1.55 -2.876 -4.63 -7.019 -10.174 -14.357 -20.19 -29.089 -38.649 -45.801 -51.502 -56.088 -59.95 -63.196 -66.01 -68.353 -70.631 -72.572 -74.237 -75.763 -77.201 -78.515 -79.642 -80.822 -81.904 -82.803 -83.689 -84.576 -85.303 -86.088 -86.908 -87.526 -88.156 -88.802 -89.474 -90.149 -90.617 -91.109 -91.863 -92.392 -92.962 -93.248 -93.817 -94.421 -95.07 -95.404 -95.998 -96.455 -96.852 -97.265 -98.111 -98.568 -99.064 -99.612 -100.248 -101.029 -102.07 -106.427 -9 ,10746 ,KEBNE ,17026212,Wed Dec 22 13:54:48 CET,Wed Dec 22 15:29:35 CET,0.0 1.327 1.642 1.896 2.083 2.228 2.372 2.506 2.708 2.792 2.877 2.884 3.13 3.196 3.293 3.384 3.465 3.496 3.552 3.598 3.651 3.683 3.716 3.757 3.788 3.807 3.794 3.76 3.7 3.652 3.596 3.499 3.381 3.242 3.076 2.844 2.576 2.258 1.869 1.411 0.873 0.17 -0.74 -1.802 -3.208 -4.939 -7.277 -10.374 -14.569 -20.436 -29.353 -38.841 -45.968 -51.65 -56.224 -60.16 -63.456 -66.239 -68.562 -70.867 -72.78 -74.403 -75.937 -77.37 -78.664 -79.797 -80.941 -81.981 -82.877 -83.776 -84.724 -85.513 -86.346 -87.222 -87.89 -88.571 -89.285 -90.012 -90.734 -91.221 -91.714 -92.499 -93.062 -93.638 -93.922 -94.489 -95.103 -95.773 -96.114 -96.703 -97.142 -97.53 -97.921 -98.761 -99.24 -99.743 -100.292 -100.888 -101.563 -102.514 -106.237 -10 ,25212 ,KEBNE ,17026213,Wed Dec 22 13:55:49 CET,Wed Dec 22 15:32:20 CET,0.0 1.402 1.721 1.966 2.166 2.331 2.47 2.601 2.833 2.918 2.997 2.96 3.17 3.219 3.292 3.358 3.416 3.439 3.492 3.533 3.583 3.603 3.605 3.602 3.587 3.567 3.533 3.502 3.484 3.44 3.369 3.268 3.159 3.029 2.898 2.748 2.518 2.206 1.833 1.358 0.798 0.14 -0.72 -1.728 -3.074 -4.807 -7.069 -9.995 -14.017 -19.772 -28.671 -38.248 -45.454 -51.099 -55.579 -59.38 -62.604 -65.409 -67.749 -69.984 -71.833 -73.431 -74.934 -76.357 -77.674 -78.833 -80.031 -81.092 -81.982 -82.878 -83.794 -84.573 -85.386 -86.211 -86.852 -87.496 -88.162 -88.872 -89.585 -90.06 -90.564 -91.337 -91.852 -92.403 -92.683 -93.254 -93.855 -94.504 -94.838 -95.44 -95.909 -96.294 -96.703 -97.571 -98.032 -98.556 -99.144 -99.826 -100.6 -101.643 -106.045 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt deleted file mode 100644 index dafbc498..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-23.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4259 ,KEBNE ,16722422,Sun Nov 28 00:05:36 CET,Sun Nov 28 01:41:31 CET,0.0 2.569 3.283 3.814 4.271 4.675 5.028 5.335 5.891 6.153 6.401 6.701 7.079 7.287 7.705 8.106 8.47 8.644 8.978 9.292 9.756 10.059 10.337 10.737 11.118 11.483 11.834 12.166 12.577 12.961 13.351 13.815 14.257 14.69 15.159 15.685 16.193 16.745 17.347 17.963 18.602 19.35 20.223 21.04 21.884 22.749 23.711 24.712 25.821 27.065 28.264 28.896 28.906 28.651 28.306 27.893 27.49 27.066 26.63 26.131 25.678 25.27 24.869 24.477 24.09 23.727 23.349 22.999 22.689 22.37 22.055 21.784 21.484 21.168 20.913 20.645 20.366 20.073 19.762 19.542 19.314 18.963 18.721 18.461 18.318 18.011 17.703 17.37 17.188 16.856 16.605 16.391 16.157 15.603 15.272 14.892 14.458 13.952 13.344 12.484 8.989 -5 ,21854 ,KEBNE ,16722426,Sun Nov 28 00:05:36 CET,Sun Nov 28 01:40:57 CET,0.0 1.863 2.443 2.891 3.262 3.587 3.88 4.148 4.636 4.863 5.079 5.322 5.681 5.875 6.241 6.566 6.851 6.991 7.272 7.549 7.947 8.209 8.47 8.833 9.181 9.522 9.845 10.161 10.562 10.945 11.308 11.743 12.18 12.595 13.08 13.617 14.117 14.649 15.179 15.746 16.385 17.08 17.831 18.58 19.464 20.434 21.476 22.595 23.856 25.153 26.349 26.953 27.098 26.947 26.638 26.328 25.964 25.528 25.087 24.607 24.21 23.872 23.538 23.207 22.856 22.503 22.124 21.753 21.42 21.079 20.723 20.428 20.115 19.792 19.525 19.226 18.914 18.592 18.261 18.045 17.836 17.474 17.202 16.92 16.777 16.485 16.164 15.831 15.658 15.334 15.073 14.856 14.635 14.153 13.885 13.581 13.234 12.812 12.286 11.569 8.951 -6 ,14943 ,KEBNE ,16722427,Sun Nov 28 00:05:36 CET,Sun Nov 28 01:39:31 CET,0.0 1.577 2.175 2.625 3.013 3.342 3.623 3.891 4.354 4.567 4.776 5.012 5.369 5.553 5.902 6.23 6.534 6.68 6.965 7.24 7.633 7.883 8.127 8.471 8.792 9.096 9.397 9.695 10.078 10.456 10.818 11.242 11.642 12.022 12.472 12.969 13.409 13.886 14.41 14.975 15.574 16.251 17.037 17.794 18.646 19.561 20.541 21.615 22.828 24.111 25.362 25.958 25.998 25.778 25.461 25.099 24.712 24.297 23.883 23.462 23.098 22.75 22.39 22.053 21.739 21.433 21.076 20.716 20.389 20.043 19.674 19.359 19.015 18.648 18.366 18.076 17.769 17.436 17.085 16.835 16.572 16.16 15.869 15.571 15.411 15.082 14.744 14.387 14.2 13.858 13.606 13.395 13.171 12.665 12.391 12.104 11.788 11.417 10.93 10.323 8.203 -7 ,4862 ,KEBNE ,16722428,Sun Nov 28 00:05:37 CET,Sun Nov 28 01:39:36 CET,0.0 2.181 2.947 3.539 4.066 4.518 4.909 5.26 5.892 6.173 6.438 6.778 7.173 7.398 7.805 8.186 8.535 8.705 9.048 9.385 9.863 10.156 10.432 10.852 11.242 11.589 11.917 12.236 12.669 13.102 13.508 13.969 14.402 14.813 15.284 15.82 16.338 16.887 17.476 18.099 18.717 19.396 20.196 20.94 21.732 22.595 23.567 24.606 25.757 27.049 28.314 28.913 29.023 28.878 28.558 28.157 27.744 27.318 26.89 26.417 25.98 25.54 25.093 24.686 24.294 23.918 23.522 23.142 22.804 22.459 22.095 21.809 21.513 21.17 20.9 20.633 20.349 20.047 19.715 19.488 19.256 18.866 18.592 18.316 18.165 17.859 17.546 17.184 16.99 16.653 16.377 16.149 15.914 15.381 15.079 14.743 14.363 13.925 13.391 12.605 9.868 -8 ,25345 ,KEBNE ,16722429,Sun Nov 28 00:05:37 CET,Sun Nov 28 01:39:44 CET,0.0 1.741 2.375 2.822 3.17 3.49 3.778 4.035 4.505 4.72 4.922 5.154 5.509 5.685 6.017 6.34 6.651 6.798 7.078 7.353 7.755 8.0 8.231 8.575 8.916 9.246 9.568 9.874 10.267 10.642 11.001 11.437 11.854 12.253 12.708 13.203 13.685 14.219 14.767 15.324 15.874 16.502 17.261 17.988 18.795 19.682 20.672 21.724 22.892 24.14 25.313 25.881 25.875 25.642 25.338 24.984 24.593 24.206 23.865 23.48 23.117 22.752 22.375 22.025 21.697 21.364 20.994 20.643 20.304 19.934 19.533 19.191 18.83 18.457 18.174 17.892 17.594 17.277 16.946 16.705 16.454 16.062 15.782 15.479 15.319 14.993 14.65 14.29 14.106 13.759 13.491 13.269 13.04 12.512 12.227 11.94 11.592 11.191 10.691 10.017 7.749 -9 ,15052 ,KEBNE ,16722430,Sun Nov 28 00:06:39 CET,Sun Nov 28 01:41:17 CET,0.0 3.79 4.694 5.312 5.811 6.231 6.604 6.927 7.502 7.766 8.003 8.258 8.627 8.828 9.204 9.556 9.885 10.042 10.342 10.618 10.996 11.236 11.471 11.813 12.144 12.465 12.77 13.059 13.427 13.789 14.135 14.532 14.925 15.334 15.806 16.326 16.813 17.319 17.855 18.43 19.018 19.648 20.403 21.162 22.004 22.949 24.025 25.172 26.355 27.552 28.705 29.359 29.445 29.225 28.863 28.434 28.005 27.599 27.172 26.692 26.281 25.92 25.538 25.134 24.76 24.42 24.045 23.68 23.359 23.017 22.628 22.313 21.998 21.651 21.387 21.113 20.811 20.494 20.178 19.959 19.717 19.342 19.093 18.831 18.691 18.39 18.077 17.723 17.521 17.168 16.915 16.694 16.451 15.894 15.569 15.205 14.798 14.322 13.715 12.877 9.883 -10 ,30683 ,KEBNE ,16722431,Sun Nov 28 00:06:39 CET,Sun Nov 28 01:40:29 CET,0.0 1.792 2.374 2.807 3.176 3.5 3.781 4.043 4.531 4.762 4.98 5.204 5.551 5.735 6.098 6.444 6.754 6.898 7.177 7.449 7.834 8.083 8.328 8.667 8.986 9.289 9.585 9.875 10.231 10.566 10.891 11.298 11.696 12.082 12.527 13.02 13.492 14.024 14.563 15.104 15.699 16.38 17.16 17.878 18.691 19.601 20.613 21.681 22.806 24.056 25.304 25.949 25.968 25.7 25.396 25.061 24.652 24.215 23.815 23.378 22.957 22.577 22.222 21.847 21.485 21.149 20.799 20.493 20.199 19.865 19.512 19.216 18.903 18.573 18.309 18.034 17.746 17.437 17.093 16.848 16.599 16.215 15.944 15.657 15.506 15.197 14.887 14.565 14.383 14.032 13.765 13.545 13.311 12.786 12.487 12.147 11.741 11.254 10.653 9.793 5.54 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 3c2b4bf9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-25_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9977 ,KEBNE ,16722432,Sun Nov 28 00:06:38 CET,Sun Nov 28 01:42:06 CET,0.0 3.566 4.466 5.077 5.57 5.991 6.367 6.698 7.276 7.536 7.778 8.037 8.386 8.589 8.992 9.343 9.658 9.807 10.101 10.394 10.805 11.068 11.312 11.643 11.956 12.264 12.571 12.86 13.199 13.513 13.821 14.196 14.553 14.888 15.266 15.674 16.065 16.503 16.962 17.445 17.932 18.465 19.084 19.661 20.323 21.012 21.731 22.486 23.147 23.614 23.784 23.328 22.563 21.782 20.946 20.078 19.302 18.58 17.922 17.217 16.602 16.075 15.569 15.072 14.593 14.127 13.647 13.265 12.924 12.556 12.187 11.863 11.485 11.072 10.752 10.421 10.085 9.745 9.391 9.137 8.866 8.442 8.16 7.858 7.702 7.395 7.062 6.696 6.504 6.146 5.887 5.674 5.449 4.956 4.69 4.401 4.076 3.692 3.186 2.505 0.311 -2 ,6708 ,KEBNE ,16722433,Sun Nov 28 00:06:38 CET,Sun Nov 28 01:41:11 CET,0.0 2.589 3.38 3.944 4.399 4.812 5.178 5.496 6.076 6.336 6.591 6.91 7.288 7.499 7.91 8.297 8.654 8.824 9.15 9.457 9.913 10.205 10.48 10.871 11.242 11.607 11.954 12.256 12.623 12.977 13.331 13.767 14.174 14.537 14.926 15.359 15.77 16.199 16.645 17.12 17.606 18.136 18.721 19.297 19.944 20.631 21.408 22.173 22.911 23.591 23.979 23.578 22.801 21.979 21.136 20.339 19.622 18.916 18.272 17.62 17.045 16.485 15.916 15.372 14.861 14.403 13.918 13.476 13.095 12.681 12.235 11.86 11.476 11.07 10.745 10.405 10.062 9.707 9.33 9.072 8.809 8.399 8.116 7.814 7.654 7.334 6.988 6.606 6.4 6.028 5.736 5.496 5.243 4.672 4.353 4.003 3.642 3.229 2.701 1.975 -0.093 -3 ,10475 ,KEBNE ,16722434,Sun Nov 28 00:06:39 CET,Sun Nov 28 01:40:53 CET,0.0 2.719 3.5 4.096 4.55 4.932 5.286 5.603 6.137 6.38 6.612 6.881 7.255 7.463 7.841 8.193 8.532 8.698 9.036 9.353 9.786 10.054 10.308 10.671 11.009 11.338 11.666 11.978 12.367 12.743 13.102 13.514 13.908 14.306 14.751 15.215 15.649 16.111 16.605 17.119 17.645 18.25 18.934 19.528 20.17 20.825 21.525 22.278 23.016 23.58 23.73 23.21 22.44 21.587 20.745 19.938 19.165 18.396 17.758 17.161 16.59 16.059 15.576 15.099 14.604 14.137 13.675 13.272 12.914 12.531 12.125 11.774 11.407 11.047 10.76 10.449 10.126 9.79 9.441 9.203 8.949 8.511 8.194 7.872 7.709 7.375 7.026 6.646 6.441 6.07 5.794 5.564 5.306 4.731 4.416 4.063 3.672 3.241 2.708 1.996 -0.077 -4 ,30274 ,KEBNE ,16722435,Sun Nov 28 00:06:38 CET,Sun Nov 28 01:40:53 CET,0.0 3.315 4.1 4.686 5.178 5.578 5.911 6.217 6.757 6.99 7.216 7.484 7.843 8.044 8.431 8.773 9.085 9.241 9.537 9.82 10.228 10.481 10.729 11.085 11.417 11.732 12.043 12.349 12.72 13.056 13.382 13.756 14.117 14.472 14.848 15.277 15.701 16.162 16.661 17.156 17.642 18.167 18.757 19.335 19.972 20.647 21.389 22.127 22.821 23.394 23.681 23.353 22.666 21.871 21.104 20.359 19.659 18.989 18.365 17.708 17.144 16.656 16.191 15.733 15.283 14.864 14.407 13.988 13.609 13.192 12.761 12.399 12.007 11.594 11.278 10.943 10.59 10.224 9.838 9.562 9.276 8.837 8.531 8.223 8.066 7.751 7.412 7.048 6.863 6.51 6.267 6.055 5.822 5.313 5.036 4.734 4.395 4.008 3.558 2.945 1.215 -5 ,4329 ,KEBNE ,16722436,Sun Nov 28 00:06:38 CET,Sun Nov 28 01:40:57 CET,0.0 3.016 3.772 4.319 4.784 5.177 5.515 5.817 6.341 6.568 6.778 7.0 7.342 7.52 7.865 8.176 8.461 8.602 8.878 9.127 9.481 9.706 9.916 10.219 10.5 10.789 11.069 11.324 11.654 11.976 12.295 12.679 13.025 13.331 13.699 14.156 14.612 15.079 15.546 16.025 16.511 17.053 17.658 18.254 18.913 19.593 20.342 21.073 21.749 22.368 22.692 22.279 21.526 20.656 19.835 19.061 18.342 17.675 17.087 16.462 15.911 15.406 14.889 14.375 13.879 13.429 12.96 12.553 12.217 11.836 11.397 11.046 10.706 10.356 10.091 9.813 9.504 9.176 8.832 8.601 8.369 7.98 7.689 7.379 7.211 6.86 6.505 6.113 5.91 5.544 5.262 5.032 4.774 4.206 3.906 3.566 3.17 2.724 2.206 1.544 -0.587 -6 ,25230 ,KEBNE ,16722437,Sun Nov 28 00:07:40 CET,Sun Nov 28 01:42:04 CET,0.0 2.781 3.469 3.997 4.45 4.834 5.183 5.497 6.059 6.322 6.567 6.825 7.179 7.377 7.753 8.101 8.438 8.603 8.913 9.193 9.598 9.856 10.105 10.46 10.79 11.11 11.417 11.69 12.019 12.337 12.647 13.036 13.429 13.812 14.227 14.653 15.038 15.458 15.911 16.393 16.891 17.429 18.052 18.64 19.289 19.976 20.698 21.45 22.156 22.735 22.998 22.555 21.846 21.025 20.151 19.307 18.523 17.814 17.25 16.685 16.132 15.599 15.077 14.588 14.129 13.685 13.212 12.77 12.365 11.947 11.519 11.151 10.775 10.378 10.059 9.73 9.39 9.048 8.699 8.448 8.177 7.767 7.482 7.184 7.034 6.711 6.369 6.019 5.834 5.469 5.17 4.925 4.68 4.128 3.823 3.493 3.11 2.67 2.161 1.482 -0.651 -8 ,1547 ,KEBNE ,16722439,Sun Nov 28 00:07:40 CET,Sun Nov 28 01:41:58 CET,0.0 2.357 3.019 3.496 3.887 4.241 4.553 4.832 5.354 5.586 5.806 6.047 6.391 6.568 6.896 7.2 7.487 7.636 7.943 8.23 8.641 8.899 9.14 9.503 9.845 10.182 10.517 10.827 11.224 11.604 11.952 12.366 12.77 13.145 13.578 14.075 14.526 14.989 15.495 16.035 16.562 17.138 17.81 18.438 19.117 19.785 20.509 21.241 21.87 22.365 22.538 22.137 21.503 20.751 20.002 19.272 18.564 17.85 17.236 16.625 16.069 15.569 15.092 14.643 14.209 13.803 13.372 12.98 12.651 12.3 11.892 11.531 11.144 10.734 10.423 10.099 9.751 9.388 9.001 8.732 8.458 8.025 7.725 7.409 7.243 6.911 6.567 6.181 5.978 5.617 5.356 5.127 4.877 4.301 3.975 3.623 3.234 2.788 2.237 1.506 -0.577 -9 ,9353 ,KEBNE ,16722440,Sun Nov 28 00:07:40 CET,Sun Nov 28 01:42:05 CET,0.0 2.939 3.672 4.243 4.704 5.098 5.436 5.735 6.261 6.496 6.723 7.009 7.381 7.58 7.962 8.319 8.655 8.815 9.115 9.405 9.802 10.038 10.27 10.628 11.002 11.354 11.674 11.986 12.377 12.745 13.108 13.532 13.912 14.301 14.747 15.174 15.576 16.017 16.49 17.004 17.544 18.13 18.739 19.312 20.016 20.777 21.514 22.281 23.079 23.682 23.891 23.458 22.696 21.88 21.072 20.255 19.5 18.747 18.07 17.385 16.75 16.16 15.612 15.081 14.575 14.121 13.65 13.225 12.835 12.414 11.976 11.621 11.243 10.841 10.536 10.224 9.923 9.634 9.329 9.112 8.887 8.532 8.28 8.018 7.883 7.592 7.278 6.933 6.747 6.395 6.146 5.929 5.692 5.171 4.888 4.572 4.203 3.774 3.259 2.536 -0.045 -10 ,4148 ,KEBNE ,16722441,Sun Nov 28 00:07:40 CET,Sun Nov 28 01:42:04 CET,0.0 2.623 3.389 3.928 4.391 4.793 5.139 5.458 6.017 6.272 6.517 6.789 7.156 7.349 7.713 8.06 8.384 8.534 8.824 9.099 9.488 9.74 9.989 10.354 10.718 11.062 11.379 11.687 12.086 12.451 12.806 13.239 13.639 14.022 14.466 14.919 15.331 15.793 16.254 16.754 17.299 17.86 18.484 19.098 19.753 20.427 21.137 21.881 22.65 23.295 23.606 23.193 22.478 21.694 20.869 20.112 19.461 18.824 18.23 17.579 16.984 16.456 15.947 15.45 14.966 14.518 14.06 13.65 13.273 12.867 12.454 12.099 11.735 11.362 11.057 10.741 10.405 10.06 9.722 9.48 9.222 8.811 8.521 8.229 8.081 7.763 7.422 7.064 6.871 6.509 6.244 6.006 5.745 5.164 4.847 4.5 4.111 3.647 3.075 2.274 -0.957 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt deleted file mode 100644 index f3c7141d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-23.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8552 ,KEBNE ,16722442,Sun Nov 28 00:07:40 CET,Sun Nov 28 01:42:06 CET,0.0 2.181 3.004 3.618 4.125 4.558 4.938 5.292 5.951 6.259 6.562 6.919 7.378 7.623 8.095 8.544 8.99 9.208 9.624 10.033 10.613 10.98 11.34 11.862 12.354 12.831 13.312 13.783 14.38 14.947 15.52 16.247 16.948 17.618 18.396 19.269 20.115 21.047 22.044 23.086 24.131 25.322 26.753 28.195 29.907 31.896 34.242 36.897 40.059 43.888 48.661 52.7 55.061 56.591 57.596 58.272 58.667 58.86 58.929 58.938 58.893 58.794 58.67 58.523 58.376 58.219 58.011 57.815 57.632 57.43 57.202 57.005 56.803 56.578 56.389 56.19 55.976 55.733 55.469 55.277 55.069 54.739 54.496 54.231 54.101 53.84 53.552 53.224 53.048 52.717 52.464 52.235 51.992 51.428 51.112 50.775 50.383 49.915 49.321 48.455 43.738 -3 ,11675 ,KEBNE ,16722444,Sun Nov 28 00:08:41 CET,Sun Nov 28 01:44:14 CET,0.0 3.572 4.515 5.172 5.696 6.151 6.564 6.944 7.612 7.91 8.19 8.517 8.98 9.229 9.683 10.123 10.55 10.752 11.142 11.529 12.101 12.466 12.818 13.337 13.831 14.308 14.784 15.25 15.851 16.422 16.969 17.623 18.244 18.832 19.515 20.305 21.082 21.915 22.804 23.779 24.813 25.989 27.397 28.868 30.602 32.544 34.87 37.558 40.785 44.673 49.517 53.71 56.255 57.879 58.916 59.643 60.118 60.435 60.627 60.72 60.746 60.712 60.623 60.505 60.363 60.214 60.046 59.874 59.711 59.535 59.347 59.181 58.981 58.753 58.569 58.381 58.185 57.97 57.741 57.579 57.403 57.124 56.93 56.718 56.604 56.367 56.109 55.823 55.669 55.35 55.131 54.948 54.735 54.24 53.956 53.632 53.296 52.912 52.347 51.455 42.899 -4 ,20628 ,KEBNE ,16722445,Sun Nov 28 00:08:42 CET,Sun Nov 28 01:43:12 CET,0.0 1.428 2.032 2.489 2.871 3.229 3.565 3.876 4.459 4.737 5.004 5.28 5.722 5.965 6.429 6.861 7.257 7.447 7.826 8.195 8.734 9.081 9.424 9.932 10.421 10.903 11.376 11.841 12.445 13.028 13.581 14.242 14.882 15.488 16.201 17.013 17.821 18.729 19.683 20.699 21.803 23.067 24.52 25.994 27.759 29.775 32.153 34.873 38.098 41.964 46.73 50.769 53.114 54.563 55.508 56.136 56.5 56.734 56.866 56.905 56.885 56.831 56.744 56.652 56.534 56.381 56.192 56.018 55.862 55.699 55.51 55.329 55.128 54.886 54.694 54.504 54.297 54.049 53.774 53.589 53.388 53.088 52.882 52.649 52.523 52.245 51.955 51.626 51.452 51.134 50.885 50.656 50.415 49.874 49.54 49.149 48.725 48.244 47.637 46.797 42.284 -5 ,21226 ,KEBNE ,16722446,Sun Nov 28 00:08:41 CET,Sun Nov 28 01:43:04 CET,0.0 2.328 3.088 3.637 4.091 4.492 4.854 5.188 5.784 6.055 6.315 6.596 7.044 7.291 7.764 8.213 8.63 8.831 9.216 9.588 10.136 10.491 10.827 11.308 11.791 12.267 12.719 13.162 13.759 14.338 14.896 15.566 16.21 16.833 17.56 18.398 19.212 20.089 21.019 22.05 23.187 24.494 25.993 27.456 29.225 31.251 33.553 36.242 39.535 43.53 48.485 52.626 55.02 56.482 57.404 58.06 58.469 58.697 58.799 58.816 58.805 58.771 58.708 58.604 58.463 58.345 58.193 58.015 57.861 57.689 57.49 57.316 57.116 56.884 56.693 56.507 56.317 56.108 55.865 55.684 55.487 55.163 54.939 54.709 54.59 54.329 54.05 53.744 53.578 53.249 52.994 52.775 52.526 51.963 51.649 51.31 50.94 50.479 49.863 48.994 44.312 -6 ,27035 ,KEBNE ,16722447,Sun Nov 28 00:08:41 CET,Sun Nov 28 01:43:08 CET,0.0 4.128 5.066 5.748 6.289 6.733 7.133 7.496 8.163 8.472 8.766 9.094 9.544 9.789 10.267 10.72 11.154 11.364 11.76 12.135 12.678 13.014 13.343 13.831 14.294 14.75 15.201 15.644 16.221 16.791 17.337 17.988 18.639 19.275 20.017 20.847 21.642 22.517 23.474 24.512 25.602 26.841 28.316 29.834 31.632 33.668 36.058 38.819 42.137 46.06 50.815 54.896 57.316 58.838 59.84 60.513 60.937 61.206 61.345 61.366 61.328 61.26 61.162 61.054 60.942 60.813 60.64 60.456 60.289 60.114 59.905 59.72 59.54 59.346 59.174 58.972 58.763 58.531 58.243 58.053 57.871 57.562 57.344 57.12 56.993 56.73 56.455 56.16 55.99 55.655 55.412 55.192 54.963 54.451 54.148 53.808 53.411 52.923 52.304 51.413 40.536 -7 ,14255 ,KEBNE ,16722448,Sun Nov 28 00:08:41 CET,Sun Nov 28 01:43:11 CET,0.0 2.371 3.127 3.725 4.231 4.684 5.103 5.526 6.303 6.645 6.959 7.334 7.818 8.092 8.62 9.125 9.593 9.817 10.244 10.655 11.252 11.648 12.039 12.602 13.148 13.668 14.174 14.664 15.288 15.878 16.453 17.153 17.832 18.493 19.244 20.098 20.95 21.886 22.899 23.977 25.062 26.284 27.765 29.297 31.071 33.053 35.352 38.081 41.437 45.453 50.436 54.518 56.877 58.424 59.458 60.11 60.562 60.868 61.024 61.076 61.062 61.052 61.019 60.92 60.781 60.653 60.515 60.374 60.241 60.073 59.888 59.709 59.478 59.225 59.031 58.828 58.61 58.385 58.137 57.956 57.764 57.459 57.239 57.008 56.873 56.581 56.284 55.965 55.797 55.464 55.192 54.956 54.714 54.175 53.849 53.473 53.029 52.515 51.876 50.951 44.561 -9 ,6272 ,KEBNE ,16722450,Sun Nov 28 00:09:43 CET,Sun Nov 28 01:44:04 CET,0.0 1.751 2.373 2.869 3.29 3.656 3.987 4.298 4.895 5.17 5.429 5.731 6.162 6.385 6.819 7.238 7.636 7.825 8.209 8.583 9.13 9.487 9.838 10.373 10.91 11.423 11.898 12.35 12.939 13.513 14.068 14.742 15.38 16.007 16.75 17.568 18.353 19.226 20.194 21.255 22.361 23.616 25.126 26.649 28.448 30.493 32.896 35.662 39.007 43.04 48.003 52.302 54.837 56.352 57.353 58.05 58.472 58.732 58.899 58.998 59.012 58.97 58.91 58.828 58.703 58.545 58.367 58.203 58.049 57.884 57.693 57.517 57.326 57.128 56.971 56.789 56.567 56.316 56.062 55.891 55.712 55.422 55.211 54.981 54.863 54.614 54.323 54.016 53.858 53.544 53.333 53.123 52.892 52.403 52.137 51.827 51.421 50.928 50.334 49.429 45.898 -10 ,27422 ,KEBNE ,16722451,Sun Nov 28 00:09:43 CET,Sun Nov 28 01:44:06 CET,0.0 2.62 3.424 3.975 4.445 4.88 5.264 5.618 6.273 6.583 6.901 7.279 7.753 8.011 8.487 8.935 9.369 9.581 10.0 10.408 11.009 11.403 11.78 12.318 12.831 13.322 13.806 14.307 14.968 15.578 16.162 16.871 17.549 18.217 18.998 19.88 20.743 21.672 22.676 23.758 24.908 26.247 27.833 29.387 31.151 33.121 35.447 38.184 41.435 45.417 50.507 54.793 57.318 58.956 60.036 60.731 61.123 61.357 61.518 61.602 61.564 61.491 61.404 61.293 61.157 60.998 60.817 60.628 60.46 60.259 60.009 59.802 59.588 59.344 59.151 58.958 58.727 58.463 58.186 58.001 57.827 57.541 57.325 57.087 56.965 56.705 56.415 56.108 55.931 55.591 55.339 55.111 54.854 54.262 53.921 53.565 53.172 52.695 52.085 51.138 47.324 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt deleted file mode 100644 index 0682a1e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-26_Example-24.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19976 ,KEBNE ,16722452,Sun Nov 28 00:09:43 CET,Sun Nov 28 01:44:42 CET,0.0 2.965 3.78 4.389 4.917 5.373 5.775 6.144 6.832 7.135 7.417 7.735 8.181 8.434 8.925 9.388 9.833 10.04 10.434 10.821 11.385 11.751 12.117 12.629 13.121 13.6 14.044 14.475 15.05 15.613 16.144 16.777 17.396 18.001 18.68 19.416 20.139 20.943 21.792 22.721 23.737 24.906 26.31 27.717 29.312 31.07 33.127 35.472 38.237 41.485 45.395 48.569 50.238 51.147 51.64 51.946 52.103 52.112 52.066 51.967 51.823 51.673 51.509 51.294 51.043 50.81 50.561 50.337 50.132 49.908 49.65 49.421 49.177 48.917 48.713 48.482 48.223 47.96 47.681 47.486 47.292 46.956 46.722 46.496 46.375 46.106 45.793 45.448 45.263 44.91 44.652 44.417 44.147 43.546 43.216 42.869 42.481 42.025 41.438 40.611 37.619 -2 ,19174 ,KEBNE ,16722453,Sun Nov 28 00:09:43 CET,Sun Nov 28 01:45:59 CET,0.0 3.014 3.824 4.431 4.94 5.362 5.74 6.091 6.732 7.021 7.304 7.643 8.104 8.366 8.87 9.343 9.778 9.989 10.398 10.785 11.34 11.692 12.037 12.517 12.983 13.448 13.898 14.312 14.811 15.295 15.785 16.392 16.966 17.517 18.188 18.935 19.619 20.389 21.23 22.112 23.042 24.125 25.398 26.661 28.165 29.887 31.927 34.241 36.978 40.189 44.066 47.233 49.012 50.054 50.614 50.96 51.14 51.16 51.109 51.027 50.911 50.78 50.623 50.453 50.277 50.092 49.877 49.672 49.478 49.23 48.951 48.701 48.439 48.173 47.948 47.714 47.465 47.192 46.895 46.673 46.438 46.07 45.819 45.547 45.402 45.123 44.821 44.487 44.308 43.948 43.674 43.432 43.175 42.61 42.298 41.961 41.57 41.095 40.481 39.629 35.873 -3 ,17203 ,KEBNE ,16722454,Sun Nov 28 00:09:43 CET,Sun Nov 28 01:46:05 CET,0.0 2.905 3.699 4.303 4.782 5.219 5.616 5.96 6.581 6.867 7.15 7.471 7.914 8.156 8.63 9.071 9.486 9.686 10.085 10.482 11.063 11.438 11.79 12.276 12.755 13.229 13.682 14.117 14.687 15.235 15.738 16.334 16.895 17.463 18.156 18.945 19.698 20.508 21.41 22.377 23.406 24.564 25.89 27.229 28.824 30.658 32.787 35.15 37.954 41.236 45.087 48.249 49.937 50.874 51.372 51.647 51.81 51.859 51.82 51.713 51.574 51.415 51.233 51.056 50.878 50.682 50.444 50.22 50.023 49.804 49.545 49.322 49.104 48.876 48.676 48.445 48.192 47.928 47.653 47.461 47.271 46.969 46.752 46.519 46.392 46.127 45.84 45.521 45.352 45.011 44.759 44.533 44.296 43.746 43.419 43.081 42.718 42.26 41.652 40.714 35.095 -4 ,20823 ,KEBNE ,16722455,Sun Nov 28 00:09:43 CET,Sun Nov 28 01:45:46 CET,0.0 4.075 4.99 5.625 6.133 6.579 6.969 7.319 7.966 8.255 8.524 8.816 9.256 9.485 9.914 10.324 10.714 10.905 11.287 11.654 12.176 12.516 12.854 13.347 13.813 14.265 14.705 15.119 15.653 16.181 16.697 17.303 17.853 18.391 19.044 19.798 20.553 21.371 22.242 23.145 24.054 25.143 26.469 27.765 29.262 30.989 33.012 35.305 38.014 41.232 45.15 48.252 50.008 51.045 51.571 51.811 51.91 51.89 51.78 51.612 51.419 51.229 51.053 50.869 50.665 50.457 50.218 49.989 49.791 49.567 49.318 49.11 48.886 48.648 48.454 48.233 47.995 47.741 47.471 47.274 47.069 46.761 46.528 46.273 46.134 45.859 45.576 45.26 45.09 44.746 44.493 44.274 44.044 43.508 43.192 42.848 42.459 41.968 41.328 40.421 36.714 -5 ,22222 ,KEBNE ,16722456,Sun Nov 28 00:10:45 CET,Sun Nov 28 01:53:29 CET,0.0 2.501 3.285 3.942 4.533 5.035 5.453 5.819 6.471 6.773 7.084 7.479 7.95 8.198 8.667 9.129 9.579 9.801 10.222 10.608 11.137 11.462 11.789 12.271 12.731 13.184 13.629 14.048 14.604 15.161 15.677 16.305 16.921 17.513 18.207 18.99 19.746 20.579 21.476 22.414 23.399 24.518 25.844 27.178 28.762 30.572 32.632 34.935 37.654 40.873 44.681 47.678 49.278 50.222 50.771 51.003 51.033 51.008 50.955 50.839 50.712 50.568 50.381 50.148 49.901 49.673 49.404 49.145 48.908 48.649 48.383 48.147 47.876 47.578 47.343 47.104 46.853 46.568 46.253 46.033 45.817 45.495 45.272 45.027 44.892 44.616 44.326 44.016 43.849 43.512 43.285 43.078 42.855 42.302 41.976 41.616 41.206 40.709 40.098 39.253 35.094 -9 ,29200 ,KEBNE ,16722460,Sun Nov 28 00:10:44 CET,Sun Nov 28 01:45:50 CET,0.0 2.792 3.585 4.172 4.662 5.082 5.482 5.854 6.54 6.867 7.178 7.558 8.029 8.283 8.756 9.201 9.63 9.841 10.246 10.63 11.186 11.549 11.914 12.439 12.927 13.398 13.843 14.278 14.852 15.382 15.866 16.46 17.04 17.612 18.314 19.108 19.863 20.691 21.553 22.445 23.422 24.576 25.914 27.241 28.825 30.627 32.706 35.011 37.702 40.857 44.629 47.662 49.352 50.332 50.835 51.076 51.166 51.175 51.103 50.925 50.738 50.558 50.359 50.157 49.951 49.748 49.514 49.296 49.101 48.885 48.646 48.434 48.208 47.947 47.737 47.521 47.266 46.985 46.7 46.506 46.306 45.974 45.727 45.47 45.344 45.085 44.79 44.466 44.295 43.941 43.688 43.492 43.281 42.758 42.469 42.148 41.758 41.295 40.743 39.952 36.082 -10 ,12993 ,KEBNE ,16722461,Sun Nov 28 00:11:46 CET,Sun Nov 28 01:46:34 CET,0.0 3.425 4.2 4.744 5.213 5.628 5.996 6.343 6.984 7.292 7.601 7.961 8.42 8.661 9.122 9.551 9.951 10.15 10.539 10.908 11.431 11.771 12.104 12.586 13.062 13.524 13.978 14.424 14.995 15.542 16.082 16.747 17.385 17.996 18.671 19.431 20.2 21.07 21.992 22.937 23.926 25.033 26.342 27.677 29.241 31.017 33.031 35.228 37.843 40.943 44.655 47.708 49.412 50.4 50.902 51.178 51.307 51.309 51.241 51.073 50.862 50.669 50.453 50.203 49.955 49.701 49.419 49.172 48.953 48.712 48.449 48.232 48.003 47.743 47.516 47.28 47.058 46.813 46.523 46.32 46.117 45.787 45.553 45.311 45.177 44.883 44.557 44.202 44.022 43.675 43.416 43.189 42.959 42.448 42.147 41.795 41.4 40.949 40.342 39.45 29.21 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt deleted file mode 100644 index df523043..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-27_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30911 ,KEBNE ,17026214,Wed Dec 22 13:55:49 CET,Wed Dec 22 15:29:25 CET,0.0 2.907 3.517 3.943 4.27 4.546 4.781 4.98 5.32 5.467 5.599 5.794 5.969 6.073 6.293 6.499 6.657 6.725 6.866 7.008 7.19 7.304 7.424 7.6 7.763 7.908 8.062 8.206 8.374 8.528 8.649 8.784 8.886 8.966 9.042 9.128 9.212 9.236 9.261 9.314 9.316 9.275 9.17 8.98 8.623 8.13 7.485 6.458 4.839 2.157 -2.621 -8.216 -12.623 -16.195 -19.167 -21.757 -23.958 -25.882 -27.478 -29.024 -30.338 -31.509 -32.609 -33.591 -34.478 -35.281 -36.114 -36.849 -37.482 -38.152 -38.843 -39.409 -39.981 -40.57 -41.027 -41.501 -41.98 -42.468 -42.983 -43.331 -43.683 -44.243 -44.633 -45.036 -45.247 -45.672 -46.119 -46.582 -46.824 -47.206 -47.632 -47.921 -48.208 -48.856 -49.227 -49.607 -50.003 -50.443 -51.019 -51.78 -53.812 -2 ,6377 ,KEBNE ,17026215,Wed Dec 22 13:55:49 CET,Wed Dec 22 15:29:21 CET,0.0 1.675 2.226 2.64 2.963 3.226 3.46 3.681 4.091 4.27 4.435 4.676 4.871 5.009 5.264 5.482 5.689 5.788 5.96 6.112 6.315 6.446 6.574 6.745 6.91 7.075 7.213 7.339 7.503 7.628 7.736 7.887 8.016 8.127 8.232 8.333 8.432 8.531 8.631 8.696 8.693 8.602 8.478 8.327 7.996 7.438 6.615 5.419 3.662 0.906 -3.789 -9.342 -13.805 -17.457 -20.511 -23.148 -25.389 -27.337 -28.958 -30.563 -31.931 -33.145 -34.243 -35.263 -36.237 -37.105 -37.979 -38.748 -39.409 -40.08 -40.754 -41.307 -41.902 -42.519 -42.974 -43.446 -43.952 -44.466 -44.999 -45.377 -45.756 -46.314 -46.694 -47.105 -47.328 -47.769 -48.215 -48.693 -48.938 -49.304 -49.688 -49.971 -50.274 -50.911 -51.27 -51.668 -52.097 -52.577 -53.137 -53.922 -57.36 -3 ,16727 ,KEBNE ,17026216,Wed Dec 22 13:55:54 CET,Wed Dec 22 15:22:18 CET,0.0 1.989 2.522 2.914 3.243 3.537 3.787 4.001 4.398 4.581 4.742 4.984 5.194 5.341 5.582 5.773 5.959 6.053 6.228 6.397 6.649 6.806 6.956 7.173 7.369 7.551 7.705 7.854 8.057 8.229 8.379 8.522 8.613 8.678 8.741 8.827 8.882 8.925 8.972 8.992 8.963 8.898 8.792 8.557 8.126 7.517 6.656 5.437 3.59 0.678 -4.21 -9.861 -14.256 -17.832 -20.823 -23.449 -25.717 -27.657 -29.266 -30.827 -32.125 -33.295 -34.399 -35.388 -36.317 -37.16 -37.995 -38.742 -39.374 -39.994 -40.647 -41.192 -41.747 -42.332 -42.795 -43.268 -43.748 -44.256 -44.791 -45.151 -45.507 -46.059 -46.454 -46.87 -47.082 -47.512 -47.957 -48.409 -48.647 -49.021 -49.423 -49.717 -50.021 -50.67 -51.028 -51.405 -51.804 -52.26 -52.794 -53.523 -56.55 -4 ,26181 ,KEBNE ,17026217,Wed Dec 22 13:55:49 CET,Wed Dec 22 15:29:45 CET,0.0 2.38 2.898 3.308 3.631 3.901 4.175 4.416 4.802 4.975 5.127 5.336 5.52 5.633 5.826 6.014 6.201 6.287 6.451 6.616 6.852 6.997 7.134 7.321 7.487 7.635 7.784 7.926 8.1 8.272 8.425 8.582 8.715 8.845 8.985 9.086 9.145 9.218 9.287 9.319 9.3 9.186 8.999 8.741 8.296 7.754 6.951 5.754 3.93 1.022 -3.807 -9.385 -13.832 -17.574 -20.696 -23.38 -25.661 -27.647 -29.326 -30.978 -32.329 -33.464 -34.516 -35.485 -36.402 -37.254 -38.115 -38.873 -39.525 -40.188 -40.865 -41.443 -42.07 -42.702 -43.193 -43.703 -44.198 -44.7 -45.217 -45.574 -45.932 -46.476 -46.871 -47.281 -47.485 -47.9 -48.33 -48.778 -49.011 -49.381 -49.809 -50.105 -50.403 -50.999 -51.337 -51.699 -52.102 -52.593 -53.216 -54.029 -57.248 -5 ,25333 ,KEBNE ,17026218,Wed Dec 22 13:55:49 CET,Wed Dec 22 15:30:59 CET,0.0 2.584 3.179 3.606 3.956 4.225 4.462 4.696 5.087 5.241 5.4 5.656 5.852 5.976 6.21 6.425 6.631 6.725 6.888 7.033 7.235 7.361 7.478 7.638 7.772 7.882 8.0 8.13 8.268 8.379 8.503 8.672 8.845 9.01 9.178 9.328 9.46 9.575 9.674 9.759 9.766 9.71 9.577 9.381 9.066 8.537 7.688 6.492 4.815 2.017 -2.891 -8.515 -12.971 -16.587 -19.646 -22.313 -24.565 -26.569 -28.292 -29.957 -31.297 -32.48 -33.603 -34.63 -35.578 -36.447 -37.348 -38.148 -38.829 -39.533 -40.257 -40.848 -41.459 -42.076 -42.54 -43.016 -43.508 -44.015 -44.524 -44.878 -45.244 -45.799 -46.195 -46.61 -46.813 -47.221 -47.654 -48.132 -48.385 -48.768 -49.163 -49.455 -49.777 -50.455 -50.811 -51.189 -51.594 -52.055 -52.598 -53.298 -55.764 -6 ,3145 ,KEBNE ,17026219,Wed Dec 22 13:55:53 CET,Wed Dec 22 15:26:44 CET,0.0 2.794 3.467 3.934 4.272 4.556 4.819 5.043 5.437 5.615 5.77 5.983 6.166 6.284 6.498 6.681 6.863 6.949 7.096 7.234 7.429 7.555 7.675 7.842 7.993 8.146 8.288 8.401 8.535 8.679 8.809 8.938 9.043 9.111 9.183 9.263 9.323 9.385 9.396 9.38 9.372 9.251 8.991 8.688 8.267 7.605 6.659 5.418 3.588 0.806 -4.038 -9.829 -14.331 -18.022 -20.987 -23.502 -25.678 -27.609 -29.249 -30.875 -32.259 -33.461 -34.573 -35.592 -36.53 -37.378 -38.265 -39.058 -39.728 -40.418 -41.143 -41.734 -42.314 -42.908 -43.373 -43.857 -44.345 -44.845 -45.388 -45.765 -46.142 -46.711 -47.103 -47.511 -47.717 -48.148 -48.6 -49.051 -49.294 -49.673 -50.103 -50.401 -50.703 -51.369 -51.726 -52.118 -52.58 -53.079 -53.643 -54.358 -56.562 -7 ,55 ,KEBNE ,17026220,Wed Dec 22 13:55:51 CET,Wed Dec 22 15:25:55 CET,0.0 2.874 3.388 3.734 3.993 4.227 4.463 4.686 5.076 5.259 5.446 5.738 5.938 6.072 6.337 6.555 6.737 6.826 7.014 7.198 7.455 7.617 7.754 7.935 8.124 8.309 8.467 8.598 8.769 8.943 9.094 9.251 9.399 9.53 9.662 9.776 9.832 9.862 9.896 9.915 9.891 9.804 9.662 9.469 9.12 8.635 7.867 6.599 4.696 1.858 -2.951 -8.529 -12.852 -16.357 -19.325 -21.941 -24.147 -26.051 -27.66 -29.266 -30.625 -31.781 -32.854 -33.858 -34.759 -35.56 -36.384 -37.154 -37.837 -38.518 -39.196 -39.744 -40.31 -40.898 -41.349 -41.813 -42.297 -42.781 -43.278 -43.618 -43.96 -44.493 -44.875 -45.28 -45.483 -45.904 -46.342 -46.801 -47.047 -47.411 -47.807 -48.082 -48.362 -48.955 -49.288 -49.659 -50.073 -50.542 -51.164 -52.065 -55.735 -8 ,27938 ,KEBNE ,17026221,Wed Dec 22 13:55:49 CET,Wed Dec 22 15:29:15 CET,0.0 1.845 2.38 2.77 3.097 3.368 3.624 3.857 4.281 4.448 4.591 4.811 5.001 5.108 5.308 5.503 5.69 5.793 5.993 6.162 6.384 6.517 6.635 6.805 6.969 7.111 7.239 7.366 7.539 7.698 7.844 8.006 8.161 8.308 8.442 8.561 8.662 8.758 8.817 8.806 8.712 8.542 8.322 8.072 7.715 7.152 6.371 5.218 3.368 0.552 -4.251 -9.85 -14.307 -17.942 -20.956 -23.599 -25.857 -27.836 -29.471 -31.016 -32.329 -33.48 -34.549 -35.566 -36.489 -37.279 -38.086 -38.803 -39.416 -40.054 -40.717 -41.279 -41.873 -42.503 -42.985 -43.461 -43.945 -44.453 -44.977 -45.338 -45.701 -46.25 -46.646 -47.055 -47.27 -47.723 -48.169 -48.654 -48.924 -49.314 -49.709 -49.983 -50.259 -50.839 -51.181 -51.585 -52.022 -52.535 -53.193 -54.082 -57.617 -9 ,28967 ,KEBNE ,17026222,Wed Dec 22 13:55:49 CET,Wed Dec 22 15:29:15 CET,0.0 1.978 2.509 2.914 3.267 3.54 3.768 3.975 4.376 4.565 4.733 4.988 5.194 5.331 5.578 5.803 5.998 6.088 6.261 6.431 6.664 6.796 6.918 7.107 7.289 7.455 7.599 7.726 7.893 8.047 8.182 8.322 8.458 8.585 8.706 8.837 8.943 9.003 9.048 9.066 9.017 8.936 8.762 8.506 8.171 7.697 6.943 5.745 3.89 1.018 -3.736 -9.243 -13.673 -17.289 -20.27 -22.854 -25.048 -26.987 -28.592 -30.126 -31.429 -32.575 -33.672 -34.698 -35.619 -36.46 -37.366 -38.18 -38.856 -39.555 -40.288 -40.869 -41.469 -42.096 -42.564 -43.039 -43.53 -44.032 -44.554 -44.899 -45.252 -45.812 -46.206 -46.613 -46.819 -47.263 -47.737 -48.225 -48.473 -48.854 -49.257 -49.542 -49.845 -50.492 -50.843 -51.216 -51.645 -52.123 -52.667 -53.371 -56.147 -10 ,15332 ,KEBNE ,17026223,Wed Dec 22 13:55:49 CET,Wed Dec 22 15:29:14 CET,0.0 2.164 2.634 3.032 3.37 3.662 3.93 4.144 4.482 4.635 4.772 4.956 5.133 5.243 5.458 5.655 5.847 5.937 6.092 6.236 6.422 6.551 6.69 6.878 7.034 7.176 7.314 7.435 7.588 7.74 7.883 8.027 8.133 8.239 8.371 8.504 8.608 8.725 8.834 8.846 8.762 8.611 8.404 8.127 7.701 7.083 6.213 5.038 3.246 0.425 -4.294 -9.892 -14.392 -18.054 -21.064 -23.627 -25.82 -27.814 -29.508 -31.119 -32.448 -33.589 -34.664 -35.671 -36.573 -37.376 -38.196 -38.933 -39.596 -40.261 -40.93 -41.498 -42.091 -42.699 -43.155 -43.612 -44.068 -44.525 -45.007 -45.337 -45.661 -46.173 -46.547 -46.944 -47.152 -47.582 -48.027 -48.494 -48.732 -49.111 -49.533 -49.821 -50.127 -50.776 -51.125 -51.509 -51.928 -52.419 -53.032 -53.858 -57.502 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt deleted file mode 100644 index bd2bcf5b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_Example-29.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -4 ,1481 ,KEBNE ,16722465,Sun Nov 28 00:11:45 CET,Sun Nov 28 01:48:15 CET,0.0 0.83 1.214 1.564 1.861 2.103 2.332 2.544 2.971 3.187 3.379 3.584 3.931 4.108 4.434 4.748 5.052 5.201 5.491 5.763 6.162 6.417 6.666 7.022 7.348 7.676 8.008 8.322 8.708 9.099 9.484 9.924 10.35 10.745 11.185 11.709 12.201 12.723 13.3 13.926 14.553 15.228 16.054 16.887 17.819 18.811 19.889 21.042 22.339 23.724 25.071 25.784 25.902 25.786 25.511 25.126 24.712 24.301 23.913 23.475 23.085 22.709 22.316 21.939 21.561 21.199 20.832 20.494 20.194 19.881 19.56 19.303 19.034 18.737 18.504 18.269 18.015 17.735 17.451 17.263 17.077 16.782 16.564 16.328 16.207 15.965 15.705 15.433 15.284 14.979 14.795 14.622 14.454 14.072 13.843 13.556 13.255 12.947 12.534 11.955 9.664 -5 ,26166 ,KEBNE ,16722466,Sun Nov 28 00:11:45 CET,Sun Nov 28 01:48:11 CET,0.0 1.671 2.212 2.611 2.931 3.217 3.477 3.716 4.162 4.369 4.575 4.816 5.16 5.348 5.709 6.028 6.323 6.476 6.766 7.027 7.406 7.652 7.888 8.234 8.569 8.898 9.207 9.503 9.879 10.242 10.597 11.027 11.433 11.828 12.285 12.793 13.288 13.839 14.425 15.012 15.642 16.348 17.121 17.905 18.797 19.766 20.847 22.042 23.372 24.808 26.25 26.923 26.982 26.745 26.412 26.035 25.649 25.286 24.936 24.525 24.11 23.733 23.384 23.028 22.69 22.363 21.992 21.67 21.385 21.07 20.744 20.486 20.223 19.938 19.701 19.454 19.202 18.92 18.621 18.424 18.219 17.872 17.631 17.389 17.264 17.018 16.764 16.489 16.345 16.041 15.855 15.684 15.496 15.086 14.847 14.575 14.289 13.979 13.605 13.03 10.952 -6 ,25759 ,KEBNE ,16722467,Sun Nov 28 00:11:45 CET,Sun Nov 28 01:48:14 CET,0.0 0.693 1.049 1.339 1.599 1.854 2.094 2.318 2.736 2.938 3.135 3.322 3.653 3.816 4.131 4.421 4.701 4.844 5.136 5.408 5.806 6.071 6.316 6.672 7.021 7.362 7.683 7.976 8.365 8.75 9.12 9.568 9.993 10.401 10.859 11.383 11.886 12.427 13.025 13.641 14.27 14.994 15.866 16.699 17.624 18.649 19.752 20.934 22.263 23.691 25.056 25.787 25.892 25.675 25.254 24.798 24.362 23.937 23.531 23.082 22.703 22.331 21.964 21.621 21.289 20.974 20.604 20.27 19.985 19.678 19.356 19.084 18.787 18.475 18.239 17.994 17.745 17.474 17.172 16.969 16.756 16.391 16.141 15.9 15.773 15.506 15.25 14.989 14.841 14.53 14.374 14.214 14.032 13.617 13.384 13.133 12.857 12.544 12.162 11.606 9.319 -7 ,5386 ,KEBNE ,16722468,Sun Nov 28 00:12:46 CET,Sun Nov 28 01:49:08 CET,0.0 0.921 1.309 1.61 1.892 2.167 2.395 2.588 2.944 3.119 3.294 3.47 3.811 3.988 4.313 4.625 4.929 5.079 5.377 5.657 6.06 6.313 6.557 6.928 7.281 7.611 7.93 8.235 8.623 8.999 9.368 9.817 10.238 10.637 11.099 11.628 12.141 12.7 13.289 13.914 14.587 15.334 16.223 17.108 18.084 19.098 20.205 21.406 22.719 24.113 25.516 26.238 26.312 26.177 25.892 25.516 25.068 24.606 24.217 23.809 23.414 23.048 22.701 22.345 21.995 21.671 21.313 20.978 20.691 20.4 20.088 19.827 19.555 19.264 19.037 18.808 18.558 18.288 17.997 17.788 17.581 17.252 17.013 16.784 16.663 16.398 16.136 15.87 15.717 15.399 15.194 15.009 14.807 14.391 14.157 13.895 13.596 13.225 12.772 12.208 10.594 -9 ,19161 ,KEBNE ,16722470,Sun Nov 28 00:12:47 CET,Sun Nov 28 01:48:00 CET,0.0 0.73 1.12 1.439 1.707 1.959 2.189 2.385 2.733 2.899 3.057 3.236 3.569 3.736 4.04 4.303 4.568 4.698 4.938 5.172 5.527 5.755 5.973 6.292 6.608 6.93 7.247 7.545 7.913 8.281 8.648 9.084 9.5 9.897 10.36 10.854 11.306 11.823 12.395 12.972 13.592 14.316 15.134 15.938 16.826 17.787 18.877 20.057 21.411 22.839 24.202 24.859 24.89 24.683 24.322 23.922 23.52 23.08 22.689 22.279 21.903 21.551 21.187 20.828 20.48 20.151 19.794 19.466 19.191 18.893 18.559 18.281 18.001 17.721 17.498 17.26 17.012 16.747 16.482 16.306 16.129 15.841 15.637 15.421 15.305 15.059 14.784 14.487 14.343 14.049 13.846 13.649 13.455 13.041 12.815 12.561 12.281 11.945 11.476 10.911 8.845 -10 ,3166 ,KEBNE ,16722471,Sun Nov 28 00:13:48 CET,Sun Nov 28 01:50:03 CET,0.0 0.837 1.173 1.498 1.791 2.05 2.304 2.535 2.943 3.135 3.317 3.502 3.834 3.996 4.305 4.593 4.867 4.997 5.254 5.511 5.892 6.139 6.378 6.706 7.033 7.355 7.661 7.971 8.359 8.723 9.094 9.547 9.956 10.356 10.825 11.351 11.857 12.388 12.951 13.554 14.192 14.917 15.744 16.556 17.48 18.511 19.652 20.78 22.017 23.402 24.772 25.424 25.429 25.186 24.812 24.399 23.992 23.551 23.15 22.753 22.394 22.038 21.671 21.329 21.02 20.731 20.42 20.133 19.882 19.607 19.295 19.027 18.755 18.477 18.258 18.022 17.768 17.491 17.204 17.01 16.8 16.474 16.244 15.991 15.861 15.574 15.25 14.94 14.787 14.48 14.276 14.071 13.855 13.415 13.191 12.943 12.631 12.214 11.725 11.071 8.612 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index 690f34a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,28832 ,KEBNE ,16722473,Sun Nov 28 00:13:48 CET,Sun Nov 28 01:48:11 CET,0.0 1.821 2.474 2.946 3.349 3.707 4.015 4.288 4.789 5.034 5.261 5.504 5.85 6.034 6.39 6.743 7.083 7.253 7.588 7.865 8.212 8.439 8.668 8.995 9.306 9.597 9.879 10.153 10.514 10.874 11.218 11.612 11.974 12.327 12.74 13.184 13.598 14.059 14.578 15.12 15.654 16.232 16.873 17.491 18.168 18.881 19.678 20.508 21.411 22.252 22.821 22.735 22.128 21.396 20.726 20.045 19.366 18.705 18.127 17.54 17.02 16.566 16.12 15.665 15.225 14.81 14.388 14.017 13.695 13.359 12.998 12.695 12.388 12.064 11.804 11.542 11.262 10.958 10.649 10.428 10.185 9.797 9.538 9.276 9.14 8.858 8.544 8.191 8.015 7.683 7.436 7.222 6.994 6.49 6.22 5.919 5.584 5.189 4.689 4.043 2.008 -3 ,21950 ,KEBNE ,16722474,Sun Nov 28 00:14:50 CET,Sun Nov 28 01:49:05 CET,0.0 1.893 2.487 2.897 3.252 3.562 3.844 4.099 4.576 4.8 5.009 5.229 5.579 5.758 6.1 6.419 6.729 6.883 7.178 7.45 7.83 8.092 8.346 8.701 9.026 9.337 9.638 9.912 10.258 10.625 10.982 11.385 11.775 12.152 12.589 13.07 13.514 13.994 14.498 15.017 15.554 16.119 16.749 17.342 18.003 18.719 19.443 20.115 20.832 21.498 21.901 21.698 21.067 20.317 19.599 18.918 18.263 17.631 17.045 16.426 15.903 15.451 14.987 14.519 14.07 13.655 13.216 12.813 12.477 12.144 11.796 11.478 11.133 10.786 10.522 10.239 9.941 9.625 9.279 9.037 8.809 8.467 8.221 7.973 7.836 7.543 7.249 6.935 6.774 6.443 6.242 6.067 5.89 5.521 5.32 5.086 4.813 4.501 4.117 3.608 1.614 -5 ,22649 ,KEBNE ,16722476,Sun Nov 28 00:14:50 CET,Sun Nov 28 01:50:32 CET,0.0 3.263 3.951 4.455 4.86 5.174 5.457 5.734 6.237 6.456 6.668 6.896 7.244 7.429 7.773 8.071 8.339 8.467 8.702 8.92 9.242 9.444 9.641 9.937 10.229 10.529 10.831 11.114 11.45 11.77 12.091 12.467 12.809 13.142 13.539 13.969 14.361 14.78 15.247 15.745 16.206 16.715 17.312 17.872 18.497 19.16 19.928 20.702 21.419 22.046 22.338 21.998 21.308 20.612 19.937 19.227 18.551 17.946 17.436 16.858 16.347 15.886 15.393 14.922 14.513 14.132 13.717 13.357 13.046 12.696 12.317 12.014 11.705 11.39 11.144 10.874 10.581 10.28 9.982 9.774 9.548 9.199 8.954 8.692 8.555 8.283 8.014 7.723 7.564 7.238 7.036 6.837 6.642 6.223 5.981 5.706 5.389 5.066 4.702 4.133 2.454 -6 ,6122 ,KEBNE ,16722477,Sun Nov 28 00:15:51 CET,Sun Nov 28 01:51:27 CET,0.0 2.1 2.638 3.074 3.433 3.773 4.093 4.353 4.837 5.053 5.246 5.456 5.799 5.977 6.307 6.602 6.883 7.016 7.287 7.552 7.931 8.185 8.415 8.735 9.05 9.352 9.641 9.914 10.267 10.603 10.922 11.308 11.67 12.012 12.414 12.862 13.288 13.762 14.278 14.799 15.321 15.889 16.527 17.154 17.852 18.626 19.473 20.353 21.249 22.041 22.555 22.343 21.848 21.257 20.619 19.969 19.353 18.813 18.338 17.795 17.282 16.811 16.354 15.935 15.572 15.214 14.824 14.46 14.122 13.784 13.44 13.157 12.85 12.518 12.272 12.015 11.741 11.454 11.16 10.952 10.731 10.393 10.148 9.882 9.746 9.471 9.188 8.895 8.737 8.398 8.16 7.952 7.734 7.234 6.966 6.704 6.414 6.052 5.551 4.869 2.251 -7 ,27520 ,KEBNE ,16722478,Sun Nov 28 00:14:50 CET,Sun Nov 28 01:50:12 CET,0.0 2.677 3.414 3.91 4.313 4.667 4.961 5.224 5.718 5.94 6.138 6.348 6.697 6.872 7.187 7.482 7.764 7.9 8.161 8.402 8.762 9.0 9.228 9.533 9.823 10.106 10.369 10.618 10.952 11.27 11.585 11.964 12.288 12.615 13.0 13.409 13.793 14.217 14.671 15.128 15.614 16.15 16.755 17.357 18.03 18.748 19.521 20.301 21.144 21.952 22.508 22.425 22.021 21.476 20.859 20.216 19.613 19.039 18.522 17.955 17.452 16.998 16.568 16.174 15.792 15.429 15.03 14.687 14.389 14.06 13.711 13.418 13.131 12.827 12.591 12.359 12.118 11.866 11.599 11.41 11.207 10.875 10.651 10.419 10.293 10.027 9.748 9.461 9.303 8.966 8.769 8.573 8.359 7.886 7.608 7.311 6.992 6.639 6.236 5.655 2.919 -9 ,8899 ,KEBNE ,16722480,Sun Nov 28 00:14:50 CET,Sun Nov 28 01:49:09 CET,0.0 2.104 2.678 3.137 3.482 3.794 4.07 4.318 4.811 5.031 5.24 5.477 5.83 6.007 6.325 6.622 6.899 7.032 7.299 7.553 7.906 8.128 8.353 8.682 8.988 9.29 9.565 9.822 10.168 10.49 10.804 11.197 11.563 11.892 12.265 12.692 13.083 13.496 13.935 14.403 14.889 15.412 15.996 16.587 17.253 17.926 18.666 19.415 20.176 20.885 21.206 20.907 20.327 19.652 18.917 18.171 17.507 16.919 16.385 15.766 15.203 14.699 14.204 13.72 13.269 12.859 12.446 12.081 11.741 11.381 11.003 10.705 10.401 10.061 9.787 9.495 9.192 8.888 8.573 8.357 8.139 7.8 7.571 7.315 7.177 6.907 6.635 6.342 6.181 5.86 5.678 5.489 5.284 4.849 4.62 4.372 4.07 3.74 3.353 2.812 0.715 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt deleted file mode 100644 index 22f1edfb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-2_Example-4.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22789 ,KEBNE ,16722482,Sun Nov 28 00:15:53 CET,Sun Nov 28 01:46:02 CET,0.0 0.906 1.255 1.508 1.767 1.983 2.174 2.352 2.677 2.844 2.986 2.807 3.391 3.522 3.787 4.027 4.25 4.353 4.548 4.745 5.033 5.217 5.404 5.676 5.92 6.161 6.395 6.611 6.888 7.154 7.416 7.735 8.045 8.336 8.659 9.021 9.375 9.759 10.16 10.583 11.01 11.488 12.073 12.635 13.254 13.923 14.633 15.381 16.197 16.974 17.481 17.442 17.085 16.555 15.948 15.345 14.788 14.247 13.742 13.196 12.721 12.289 11.869 11.472 11.093 10.733 10.347 9.994 9.693 9.397 9.071 8.781 8.483 8.166 7.925 7.673 7.386 7.105 6.827 6.635 6.438 6.125 5.899 5.654 5.53 5.296 5.041 4.747 4.597 3.992 4.105 3.926 3.732 3.291 3.051 2.796 2.491 2.105 1.65 1.021 -0.787 -2 ,2259 ,KEBNE ,16722483,Sun Nov 28 00:15:51 CET,Sun Nov 28 01:50:13 CET,0.0 0.778 1.096 1.33 1.538 1.731 1.922 2.095 2.399 2.527 2.653 2.456 3.028 3.144 3.368 3.57 3.771 3.876 4.075 4.254 4.511 4.673 4.83 5.061 5.291 5.514 5.729 5.943 6.22 6.483 6.73 7.033 7.344 7.636 7.947 8.289 8.634 9.021 9.417 9.826 10.272 10.753 11.3 11.837 12.378 12.958 13.658 14.404 15.141 15.787 16.245 16.163 15.713 15.153 14.619 14.076 13.523 12.975 12.495 11.996 11.54 11.119 10.696 10.271 9.885 9.555 9.195 8.836 8.518 8.2 7.873 7.595 7.313 7.022 6.79 6.535 6.25 5.96 5.65 5.423 5.197 4.857 4.627 4.402 4.286 4.034 3.763 3.479 3.324 2.722 2.834 2.639 2.421 1.972 1.73 1.453 1.153 0.834 0.421 -0.188 -1.915 -3 ,4058 ,KEBNE ,16722484,Sun Nov 28 00:15:51 CET,Sun Nov 28 01:50:28 CET,0.0 1.123 1.511 1.809 2.091 2.317 2.509 2.689 3.041 3.205 3.363 3.215 3.796 3.929 4.196 4.448 4.681 4.79 5.008 5.208 5.483 5.677 5.873 6.136 6.385 6.618 6.827 7.027 7.293 7.565 7.834 8.146 8.452 8.762 9.111 9.482 9.834 10.236 10.662 11.101 11.569 12.071 12.632 13.198 13.821 14.469 15.163 15.865 16.618 17.357 17.894 17.91 17.63 17.16 16.622 16.109 15.639 15.156 14.692 14.224 13.806 13.413 13.033 12.659 12.298 11.956 11.61 11.316 11.044 10.744 10.427 10.164 9.894 9.615 9.396 9.146 8.873 8.605 8.339 8.158 7.976 7.655 7.409 7.174 7.055 6.805 6.554 6.271 6.114 5.509 5.616 5.431 5.229 4.776 4.523 4.227 3.897 3.545 3.067 2.389 -1.392 -4 ,15425 ,KEBNE ,16722485,Sun Nov 28 00:15:51 CET,Sun Nov 28 01:50:11 CET,0.0 0.739 1.061 1.31 1.493 1.667 1.837 1.999 2.284 2.401 2.517 2.292 2.858 2.976 3.198 3.398 3.599 3.699 3.882 4.058 4.32 4.482 4.639 4.876 5.11 5.338 5.547 5.751 6.031 6.306 6.573 6.894 7.2 7.483 7.812 8.177 8.506 8.881 9.294 9.714 10.153 10.643 11.238 11.827 12.463 13.142 13.888 14.689 15.503 16.246 16.886 16.993 16.688 16.234 15.737 15.207 14.68 14.165 13.696 13.227 12.8 12.388 11.97 11.546 11.156 10.817 10.473 10.15 9.835 9.493 9.15 8.881 8.606 8.297 8.05 7.798 7.528 7.24 6.936 6.732 6.518 6.166 5.921 5.677 5.544 5.279 5.019 4.735 4.588 3.994 4.108 3.92 3.72 3.296 3.067 2.801 2.489 2.129 1.694 1.083 -0.71 -6 ,22626 ,KEBNE ,16722487,Sun Nov 28 00:15:51 CET,Sun Nov 28 01:50:25 CET,0.0 1.087 1.492 1.818 2.101 2.356 2.572 2.757 3.099 3.252 3.402 3.243 3.832 3.964 4.209 4.444 4.675 4.784 4.984 5.185 5.487 5.673 5.858 6.128 6.378 6.618 6.84 7.051 7.331 7.604 7.862 8.167 8.469 8.751 9.082 9.476 9.865 10.283 10.726 11.193 11.672 12.196 12.784 13.353 13.98 14.647 15.338 16.09 16.901 17.648 18.325 18.485 18.199 17.751 17.249 16.729 16.227 15.752 15.34 14.882 14.477 14.091 13.693 13.342 13.013 12.676 12.306 11.967 11.668 11.362 11.042 10.771 10.486 10.183 9.954 9.712 9.459 9.191 8.896 8.7 8.504 8.187 7.951 7.7 7.581 7.328 7.039 6.742 6.594 5.997 6.086 5.892 5.692 5.249 4.992 4.723 4.43 4.056 3.545 2.816 -0.78 -7 ,29055 ,KEBNE ,16722488,Sun Nov 28 00:15:51 CET,Sun Nov 28 01:50:22 CET,0.0 0.782 1.024 1.226 1.438 1.613 1.757 1.889 2.151 2.282 2.413 2.213 2.78 2.892 3.117 3.322 3.516 3.609 3.79 3.965 4.218 4.379 4.535 4.769 4.988 5.199 5.422 5.643 5.906 6.161 6.417 6.714 6.997 7.288 7.619 7.983 8.344 8.766 9.206 9.635 10.079 10.561 11.114 11.677 12.299 12.972 13.737 14.532 15.349 16.082 16.612 16.595 16.276 15.844 15.36 14.881 14.435 13.976 13.516 13.019 12.572 12.162 11.767 11.386 11.029 10.698 10.351 10.048 9.761 9.452 9.146 8.888 8.623 8.354 8.132 7.9 7.667 7.426 7.162 6.967 6.761 6.438 6.227 6.012 5.893 5.636 5.366 5.084 4.935 4.329 4.445 4.265 4.072 3.634 3.379 3.108 2.817 2.448 1.982 1.221 -1.415 -8 ,11424 ,KEBNE ,16722489,Sun Nov 28 00:15:51 CET,Sun Nov 28 01:50:27 CET,0.0 0.842 1.131 1.371 1.609 1.82 2.018 2.191 2.504 2.643 2.763 2.547 3.118 3.228 3.44 3.649 3.843 3.942 4.139 4.32 4.574 4.728 4.877 5.123 5.361 5.567 5.777 5.988 6.247 6.503 6.76 7.061 7.346 7.636 7.971 8.342 8.683 9.05 9.457 9.88 10.332 10.836 11.379 11.906 12.529 13.213 13.967 14.725 15.478 16.211 16.822 16.878 16.58 16.166 15.686 15.166 14.645 14.145 13.706 13.239 12.815 12.408 11.983 11.604 11.25 10.885 10.505 10.177 9.878 9.551 9.225 8.945 8.649 8.341 8.096 7.849 7.593 7.302 6.988 6.775 6.535 6.172 5.939 5.696 5.576 5.315 5.034 4.737 4.573 3.96 4.026 3.816 3.604 3.155 2.911 2.619 2.288 1.851 1.23 0.492 -3.361 -9 ,10114 ,KEBNE ,16722490,Sun Nov 28 00:15:51 CET,Sun Nov 28 01:51:38 CET,0.0 0.924 1.297 1.53 1.714 1.913 2.093 2.259 2.564 2.699 2.827 2.615 3.18 3.292 3.525 3.747 3.949 4.045 4.231 4.413 4.669 4.839 5.012 5.268 5.526 5.78 6.006 6.209 6.492 6.777 7.048 7.367 7.663 7.948 8.275 8.649 9.016 9.393 9.805 10.271 10.723 11.196 11.795 12.408 13.059 13.697 14.386 15.153 15.971 16.732 17.304 17.26 16.785 16.152 15.492 14.824 14.193 13.589 13.079 12.566 12.096 11.671 11.264 10.872 10.509 10.178 9.802 9.453 9.153 8.843 8.517 8.244 7.957 7.637 7.392 7.153 6.889 6.605 6.315 6.118 5.918 5.589 5.362 5.124 4.991 4.729 4.468 4.192 4.048 3.443 3.523 3.316 3.094 2.625 2.352 2.072 1.757 1.357 0.843 0.033 -3.423 -10 ,9302 ,KEBNE ,16722491,Sun Nov 28 00:16:52 CET,Sun Nov 28 01:52:34 CET,0.0 0.462 0.773 0.985 1.175 1.371 1.547 1.707 2.007 2.145 2.276 2.074 2.643 2.754 2.961 3.156 3.351 3.451 3.653 3.845 4.119 4.31 4.491 4.741 4.988 5.219 5.453 5.683 5.95 6.213 6.482 6.793 7.085 7.375 7.714 8.101 8.477 8.879 9.291 9.728 10.208 10.717 11.289 11.865 12.489 13.145 13.867 14.622 15.395 16.106 16.638 16.637 16.276 15.785 15.288 14.746 14.201 13.72 13.306 12.852 12.418 12.014 11.63 11.267 10.919 10.573 10.208 9.886 9.6 9.304 8.999 8.75 8.479 8.18 7.95 7.723 7.489 7.231 6.939 6.741 6.557 6.268 6.053 5.819 5.699 5.461 5.192 4.903 4.753 4.147 4.24 4.038 3.825 3.356 3.104 2.832 2.486 2.09 1.632 0.981 -2.077 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 88c12212..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-30_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25742 ,KEBNE ,16722492,Sun Nov 28 00:16:52 CET,Sun Nov 28 01:51:59 CET,0.0 0.963 1.186 1.321 1.413 1.47 1.491 1.496 1.47 1.453 1.425 1.062 1.259 1.199 1.054 0.879 0.702 0.611 0.421 0.221 -0.105 -0.333 -0.546 -0.87 -1.217 -1.567 -1.928 -2.303 -2.811 -3.335 -3.878 -4.565 -5.268 -5.981 -6.849 -7.882 -8.943 -10.179 -11.598 -13.202 -14.989 -17.14 -19.839 -22.789 -26.469 -30.93 -36.598 -43.639 -52.888 -65.429 -83.694 -102.471 -116.056 -126.502 -134.737 -141.614 -147.291 -152.109 -156.027 -159.757 -162.841 -165.459 -167.832 -170.014 -172.018 -173.79 -175.597 -177.156 -178.438 -179.74 -181.078 -182.164 -183.258 -184.366 -185.201 -186.044 -186.909 -187.806 -188.723 -189.323 -189.918 -190.831 -191.458 -192.093 -192.419 -193.081 -193.751 -194.432 -194.771 -195.57 -195.823 -196.184 -196.548 -197.275 -197.658 -198.063 -198.492 -198.942 -199.426 -199.999 -201.311 -3 ,28835 ,KEBNE ,16722494,Sun Nov 28 00:16:52 CET,Sun Nov 28 01:52:00 CET,0.0 1.123 1.358 1.505 1.606 1.652 1.699 1.761 1.82 1.822 1.813 1.501 1.72 1.68 1.571 1.437 1.286 1.207 1.035 0.858 0.583 0.384 0.176 -0.156 -0.5 -0.854 -1.219 -1.593 -2.106 -2.634 -3.164 -3.839 -4.542 -5.252 -6.13 -7.187 -8.255 -9.486 -10.879 -12.466 -14.267 -16.427 -19.13 -22.064 -25.725 -30.15 -35.769 -42.762 -52.018 -64.604 -82.851 -101.61 -115.157 -125.607 -133.899 -140.731 -146.371 -151.215 -155.166 -158.913 -161.994 -164.636 -167.042 -169.214 -171.186 -172.964 -174.756 -176.264 -177.524 -178.82 -180.128 -181.18 -182.252 -183.341 -184.161 -184.979 -185.811 -186.651 -187.497 -188.068 -188.647 -189.533 -190.154 -190.797 -191.11 -191.742 -192.38 -193.024 -193.362 -194.161 -194.402 -194.755 -195.117 -195.905 -196.314 -196.722 -197.143 -197.585 -198.073 -198.649 -199.897 -4 ,8375 ,KEBNE ,16722495,Sun Nov 28 00:17:53 CET,Sun Nov 28 01:51:29 CET,0.0 1.099 1.361 1.494 1.57 1.609 1.62 1.611 1.549 1.51 1.461 1.079 1.276 1.204 1.049 0.892 0.716 0.623 0.427 0.216 -0.098 -0.307 -0.525 -0.859 -1.206 -1.562 -1.923 -2.302 -2.828 -3.351 -3.881 -4.571 -5.27 -5.983 -6.86 -7.885 -8.924 -10.134 -11.533 -13.127 -14.897 -17.03 -19.731 -22.658 -26.32 -30.762 -36.409 -43.48 -52.777 -65.293 -83.473 -102.167 -115.683 -126.129 -134.393 -141.257 -146.862 -151.612 -155.526 -159.293 -162.397 -165.046 -167.483 -169.697 -171.691 -173.443 -175.219 -176.758 -178.046 -179.344 -180.637 -181.683 -182.754 -183.847 -184.678 -185.514 -186.358 -187.211 -188.067 -188.643 -189.224 -190.119 -190.742 -191.367 -191.678 -192.305 -192.933 -193.567 -193.889 -194.669 -194.897 -195.248 -195.602 -196.345 -196.727 -197.116 -197.523 -197.969 -198.465 -199.033 -200.325 -5 ,26855 ,KEBNE ,16722496,Sun Nov 28 00:17:54 CET,Sun Nov 28 01:51:49 CET,0.0 0.97 1.22 1.373 1.472 1.57 1.637 1.665 1.678 1.666 1.647 1.327 1.54 1.49 1.366 1.22 1.071 0.993 0.828 0.637 0.327 0.127 -0.082 -0.406 -0.736 -1.08 -1.444 -1.825 -2.34 -2.863 -3.408 -4.104 -4.818 -5.541 -6.403 -7.428 -8.5 -9.745 -11.148 -12.759 -14.574 -16.733 -19.429 -22.359 -26.034 -30.467 -36.074 -43.112 -52.391 -64.974 -83.229 -101.991 -115.604 -126.093 -134.369 -141.199 -146.796 -151.6 -155.554 -159.347 -162.455 -165.087 -167.521 -169.768 -171.78 -173.547 -175.299 -176.786 -178.051 -179.333 -180.633 -181.703 -182.791 -183.89 -184.725 -185.58 -186.444 -187.307 -188.186 -188.778 -189.389 -190.337 -190.974 -191.609 -191.932 -192.599 -193.276 -193.935 -194.262 -195.053 -195.311 -195.672 -196.026 -196.77 -197.162 -197.562 -197.977 -198.428 -198.923 -199.481 -200.832 -6 ,6939 ,KEBNE ,16722497,Sun Nov 28 00:17:54 CET,Sun Nov 28 01:51:47 CET,0.0 1.075 1.343 1.462 1.523 1.559 1.583 1.583 1.548 1.513 1.463 1.086 1.28 1.211 1.061 0.901 0.722 0.633 0.448 0.245 -0.086 -0.315 -0.549 -0.911 -1.262 -1.631 -2.017 -2.405 -2.919 -3.444 -3.993 -4.694 -5.403 -6.112 -6.966 -7.982 -9.037 -10.28 -11.709 -13.328 -15.122 -17.276 -20.002 -22.919 -26.562 -30.987 -36.606 -43.633 -52.814 -65.311 -83.584 -102.414 -116.039 -126.491 -134.761 -141.622 -147.213 -151.945 -155.845 -159.599 -162.672 -165.282 -167.667 -169.844 -171.812 -173.535 -175.276 -176.794 -178.081 -179.387 -180.723 -181.803 -182.88 -183.975 -184.811 -185.637 -186.46 -187.288 -188.124 -188.697 -189.278 -190.139 -190.726 -191.337 -191.643 -192.268 -192.913 -193.573 -193.912 -194.709 -194.943 -195.294 -195.646 -196.408 -196.803 -197.205 -197.633 -198.098 -198.6 -199.207 -200.754 -7 ,18786 ,KEBNE ,16722498,Sun Nov 28 00:17:53 CET,Sun Nov 28 01:52:46 CET,0.0 2.153 2.45 2.608 2.712 2.774 2.787 2.783 2.715 2.67 2.629 2.249 2.433 2.359 2.205 2.025 1.833 1.737 1.545 1.338 1.0 0.764 0.517 0.151 -0.223 -0.605 -0.993 -1.387 -1.925 -2.485 -3.058 -3.787 -4.532 -5.279 -6.193 -7.299 -8.417 -9.693 -11.15 -12.782 -14.6 -16.778 -19.5 -22.436 -26.071 -30.477 -36.091 -43.1 -52.302 -64.831 -83.125 -102.026 -115.715 -126.159 -134.38 -141.195 -146.774 -151.497 -155.355 -159.032 -162.076 -164.728 -167.175 -169.402 -171.406 -173.195 -174.998 -176.535 -177.836 -179.154 -180.472 -181.536 -182.617 -183.696 -184.504 -185.321 -186.142 -186.978 -187.839 -188.429 -189.01 -189.87 -190.472 -191.097 -191.412 -192.043 -192.678 -193.332 -193.669 -194.459 -194.703 -195.062 -195.425 -196.185 -196.591 -197.008 -197.449 -197.925 -198.46 -199.156 -201.784 -8 ,32152 ,KEBNE ,16722499,Sun Nov 28 00:18:55 CET,Sun Nov 28 01:53:49 CET,0.0 1.047 1.311 1.45 1.532 1.573 1.601 1.627 1.621 1.587 1.537 1.163 1.363 1.3 1.158 0.996 0.819 0.724 0.517 0.309 -0.007 -0.222 -0.436 -0.773 -1.135 -1.513 -1.898 -2.288 -2.817 -3.345 -3.875 -4.554 -5.246 -5.946 -6.812 -7.871 -8.935 -10.178 -11.617 -13.232 -15.039 -17.202 -19.907 -22.828 -26.486 -30.919 -36.539 -43.564 -52.752 -65.232 -83.413 -102.14 -115.768 -126.277 -134.56 -141.405 -147.016 -151.822 -155.769 -159.528 -162.585 -165.198 -167.619 -169.827 -171.831 -173.623 -175.421 -176.963 -178.262 -179.574 -180.905 -181.986 -183.092 -184.2 -185.031 -185.877 -186.75 -187.639 -188.535 -189.14 -189.75 -190.679 -191.301 -191.948 -192.279 -192.934 -193.592 -194.264 -194.613 -195.418 -195.674 -196.036 -196.411 -197.178 -197.569 -197.961 -198.358 -198.793 -199.291 -199.855 -201.231 -9 ,29114 ,KEBNE ,16722500,Sun Nov 28 00:19:03 CET,Sun Nov 28 01:48:45 CET,0.0 1.013 1.226 1.328 1.39 1.423 1.437 1.442 1.418 1.39 1.35 0.975 1.162 1.088 0.941 0.789 0.622 0.531 0.344 0.15 -0.157 -0.362 -0.577 -0.92 -1.268 -1.619 -1.991 -2.379 -2.907 -3.445 -3.993 -4.707 -5.421 -6.136 -7.015 -8.082 -9.173 -10.433 -11.874 -13.5 -15.328 -17.521 -20.242 -23.182 -26.845 -31.278 -36.893 -43.9 -53.177 -65.77 -84.053 -102.889 -116.554 -126.985 -135.247 -142.141 -147.737 -152.476 -156.356 -160.055 -163.092 -165.706 -168.148 -170.366 -172.345 -174.1 -175.868 -177.389 -178.672 -179.982 -181.322 -182.402 -183.494 -184.589 -185.416 -186.27 -187.148 -188.026 -188.892 -189.477 -190.079 -191.016 -191.658 -192.301 -192.623 -193.287 -193.953 -194.617 -194.959 -195.76 -196.042 -196.418 -196.796 -197.588 -198.008 -198.459 -198.941 -199.464 -200.008 -200.594 -201.848 -10 ,17777 ,KEBNE ,16722501,Sun Nov 28 00:19:03 CET,Sun Nov 28 01:49:54 CET,0.0 0.971 1.198 1.359 1.459 1.496 1.52 1.53 1.502 1.463 1.417 1.039 1.228 1.162 1.03 0.877 0.709 0.616 0.426 0.232 -0.074 -0.287 -0.514 -0.867 -1.21 -1.58 -1.977 -2.378 -2.913 -3.449 -4.003 -4.725 -5.45 -6.18 -7.084 -8.153 -9.224 -10.459 -11.88 -13.489 -15.279 -17.435 -20.129 -23.045 -26.704 -31.113 -36.704 -43.704 -52.959 -65.56 -83.852 -102.678 -116.291 -126.76 -135.037 -141.851 -147.407 -152.184 -156.113 -159.845 -162.908 -165.534 -167.96 -170.186 -172.191 -173.956 -175.724 -177.262 -178.563 -179.887 -181.233 -182.31 -183.403 -184.514 -185.347 -186.196 -187.057 -187.927 -188.81 -189.399 -189.999 -190.948 -191.6 -192.248 -192.582 -193.254 -193.924 -194.615 -194.975 -195.798 -196.065 -196.431 -196.817 -197.624 -198.037 -198.465 -198.93 -199.436 -199.987 -200.626 -201.851 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt deleted file mode 100644 index ffc421d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-3_Example-4.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10504 ,KEBNE ,16722502,Sun Nov 28 00:19:58 CET,Sun Nov 28 01:50:33 CET,0.0 0.328 0.54 0.725 0.891 1.04 1.174 1.312 1.59 1.718 1.835 1.619 2.19 2.3 2.515 2.717 2.912 3.006 3.209 3.419 3.719 3.9 4.07 4.332 4.586 4.847 5.093 5.308 5.585 5.865 6.147 6.476 6.787 7.097 7.475 7.864 8.22 8.636 9.089 9.563 10.048 10.608 11.277 11.908 12.635 13.461 14.391 15.405 16.55 17.775 18.974 19.681 19.874 19.76 19.45 19.089 18.721 18.356 18.023 17.638 17.326 17.056 16.777 16.521 16.281 16.049 15.8 15.58 15.384 15.175 14.962 14.792 14.606 14.401 14.241 14.066 13.889 13.701 13.504 13.374 13.238 13.025 12.877 12.721 12.638 12.466 12.291 12.116 12.028 11.499 11.778 11.688 11.597 11.408 11.302 11.182 11.051 10.899 10.719 10.523 10.098 -2 ,21590 ,KEBNE ,16722503,Sun Nov 28 00:20:58 CET,Sun Nov 28 01:54:37 CET,0.0 0.413 0.58 0.752 0.922 1.09 1.246 1.391 1.658 1.782 1.894 1.644 2.204 2.303 2.502 2.707 2.915 3.021 3.225 3.421 3.715 3.898 4.07 4.343 4.615 4.864 5.112 5.352 5.647 5.941 6.237 6.586 6.911 7.231 7.582 7.971 8.358 8.767 9.211 9.701 10.209 10.762 11.388 12.03 12.754 13.507 14.374 15.355 16.479 17.674 18.9 19.675 19.887 19.805 19.6 19.376 19.131 18.828 18.523 18.205 17.923 17.676 17.42 17.153 16.903 16.674 16.432 16.192 15.983 15.77 15.534 15.34 15.145 14.949 14.794 14.623 14.449 14.269 14.068 13.934 13.801 13.578 13.423 13.272 13.195 13.028 12.853 12.682 12.59 12.048 12.304 12.208 12.119 11.929 11.806 11.665 11.518 11.354 11.189 11.024 10.614 -3 ,22907 ,KEBNE ,16722504,Sun Nov 28 00:20:57 CET,Sun Nov 28 01:55:38 CET,0.0 0.496 0.717 0.918 1.082 1.238 1.376 1.504 1.771 1.906 2.04 1.839 2.421 2.536 2.76 2.987 3.208 3.313 3.506 3.7 3.989 4.171 4.347 4.608 4.858 5.097 5.328 5.56 5.864 6.142 6.413 6.743 7.061 7.359 7.698 8.087 8.465 8.887 9.332 9.813 10.317 10.891 11.566 12.239 13.005 13.827 14.743 15.698 16.772 17.943 19.098 19.801 20.023 19.997 19.82 19.544 19.233 18.926 18.662 18.373 18.096 17.85 17.615 17.366 17.109 16.873 16.621 16.393 16.192 15.977 15.753 15.581 15.418 15.248 15.114 14.969 14.811 14.65 14.494 14.388 14.271 14.092 13.967 13.833 13.764 13.628 13.479 13.314 13.23 12.695 12.965 12.876 12.78 12.56 12.441 12.321 12.201 12.071 11.916 11.699 11.305 -4 ,12879 ,KEBNE ,16722505,Sun Nov 28 00:20:57 CET,Sun Nov 28 01:55:27 CET,0.0 0.418 0.666 0.884 1.077 1.25 1.418 1.583 1.861 1.985 2.101 1.857 2.417 2.513 2.721 2.934 3.14 3.233 3.415 3.602 3.865 4.041 4.214 4.454 4.681 4.906 5.111 5.308 5.574 5.833 6.091 6.397 6.694 6.994 7.34 7.723 8.102 8.533 8.999 9.481 9.985 10.583 11.288 11.969 12.736 13.55 14.452 15.454 16.574 17.768 19.043 19.765 19.897 19.823 19.656 19.448 19.21 18.939 18.686 18.421 18.145 17.848 17.563 17.307 17.058 16.83 16.599 16.37 16.162 15.937 15.701 15.514 15.316 15.121 14.976 14.822 14.667 14.503 14.317 14.195 14.082 13.914 13.799 13.669 13.603 13.464 13.32 13.175 13.1 12.576 12.855 12.763 12.663 12.463 12.358 12.239 12.113 11.986 11.843 11.652 11.251 -5 ,24295 ,KEBNE ,16722506,Sun Nov 28 00:21:59 CET,Sun Nov 28 01:56:11 CET,0.0 0.621 0.913 1.116 1.281 1.453 1.609 1.753 2.034 2.159 2.28 2.062 2.626 2.741 2.977 3.207 3.426 3.532 3.733 3.928 4.22 4.405 4.583 4.843 5.095 5.34 5.57 5.795 6.096 6.39 6.669 7.012 7.338 7.652 8.028 8.453 8.86 9.28 9.723 10.208 10.702 11.25 11.919 12.605 13.409 14.247 15.159 16.179 17.263 18.43 19.671 20.397 20.598 20.504 20.302 20.062 19.78 19.475 19.208 18.908 18.615 18.361 18.11 17.852 17.599 17.355 17.103 16.868 16.675 16.491 16.286 16.12 15.95 15.77 15.632 15.493 15.353 15.199 15.035 14.917 14.783 14.581 14.452 14.319 14.25 14.106 13.956 13.802 13.723 13.2 13.469 13.374 13.281 13.078 12.96 12.835 12.709 12.574 12.422 12.223 11.82 -6 ,14968 ,KEBNE ,16722507,Sun Nov 28 00:21:58 CET,Sun Nov 28 01:55:21 CET,0.0 0.416 0.667 0.881 1.095 1.302 1.484 1.652 1.963 2.102 2.245 2.061 2.642 2.767 3.005 3.219 3.428 3.535 3.755 3.966 4.261 4.453 4.634 4.899 5.156 5.388 5.617 5.849 6.151 6.434 6.711 7.056 7.374 7.674 8.029 8.43 8.809 9.218 9.668 10.147 10.639 11.186 11.824 12.482 13.254 14.072 14.98 15.981 17.056 18.232 19.47 20.186 20.428 20.381 20.157 19.864 19.574 19.301 19.033 18.722 18.43 18.171 17.916 17.669 17.442 17.224 16.983 16.76 16.571 16.39 16.2 16.033 15.854 15.672 15.528 15.383 15.224 15.062 14.894 14.77 14.646 14.462 14.33 14.185 14.115 13.983 13.841 13.692 13.618 13.083 13.32 13.226 13.139 12.94 12.832 12.719 12.602 12.487 12.335 12.135 11.842 -7 ,19779 ,KEBNE ,16722508,Sun Nov 28 00:23:00 CET,Sun Nov 28 01:57:48 CET,0.0 0.442 0.668 0.843 1.019 1.188 1.347 1.511 1.811 1.952 2.094 1.907 2.492 2.617 2.87 3.112 3.334 3.437 3.633 3.826 4.115 4.309 4.489 4.741 5.002 5.268 5.518 5.757 6.08 6.384 6.674 7.049 7.404 7.74 8.127 8.565 8.984 9.444 9.954 10.484 11.051 11.716 12.475 13.203 14.023 14.901 15.853 16.842 17.942 19.151 20.338 21.035 21.252 21.18 20.957 20.709 20.458 20.172 19.868 19.57 19.32 19.067 18.805 18.548 18.311 18.085 17.847 17.639 17.462 17.28 17.086 16.931 16.768 16.592 16.459 16.325 16.182 16.032 15.885 15.772 15.652 15.477 15.354 15.22 15.147 14.998 14.85 14.696 14.614 14.081 14.343 14.244 14.143 13.931 13.818 13.701 13.565 13.432 13.272 13.073 12.669 -8 ,31050 ,KEBNE ,16722509,Sun Nov 28 00:23:00 CET,Sun Nov 28 01:58:21 CET,0.0 0.57 0.83 1.081 1.349 1.572 1.756 1.938 2.303 2.474 2.635 2.49 3.09 3.224 3.472 3.721 3.982 4.104 4.328 4.549 4.879 5.085 5.285 5.579 5.865 6.147 6.415 6.671 7.005 7.322 7.617 7.986 8.346 8.683 9.068 9.509 9.93 10.402 10.912 11.462 12.025 12.638 13.368 14.07 14.825 15.597 16.443 17.385 18.408 19.468 20.604 21.303 21.47 21.356 21.134 20.883 20.582 20.263 19.965 19.658 19.393 19.139 18.873 18.607 18.357 18.137 17.893 17.664 17.469 17.263 17.065 16.888 16.689 16.494 16.34 16.175 15.996 15.814 15.641 15.525 15.404 15.216 15.082 14.94 14.864 14.704 14.541 14.378 14.289 13.746 14.025 13.937 13.827 13.612 13.497 13.382 13.279 13.154 13.011 12.848 12.373 -9 ,8680 ,KEBNE ,16722510,Sun Nov 28 00:22:59 CET,Sun Nov 28 01:56:27 CET,0.0 0.385 0.705 0.99 1.239 1.449 1.639 1.82 2.173 2.333 2.469 2.267 2.85 2.968 3.197 3.423 3.64 3.748 3.951 4.142 4.43 4.612 4.787 5.049 5.309 5.55 5.777 5.997 6.29 6.583 6.855 7.187 7.506 7.81 8.157 8.542 8.925 9.358 9.836 10.349 10.869 11.42 12.073 12.725 13.456 14.271 15.203 16.214 17.319 18.517 19.77 20.462 20.637 20.57 20.352 20.069 19.791 19.498 19.197 18.885 18.612 18.362 18.108 17.827 17.554 17.308 17.049 16.805 16.591 16.376 16.131 15.931 15.738 15.534 15.366 15.188 15.004 14.809 14.605 14.469 14.328 14.116 13.979 13.828 13.752 13.598 13.435 13.27 13.191 12.66 12.915 12.82 12.726 12.526 12.416 12.301 12.171 12.004 11.819 11.614 11.311 -10 ,29768 ,KEBNE ,16722511,Sun Nov 28 00:22:59 CET,Sun Nov 28 01:56:14 CET,0.0 0.532 0.755 0.919 1.077 1.232 1.371 1.505 1.759 1.887 2.015 1.801 2.375 2.486 2.7 2.886 3.068 3.161 3.336 3.508 3.758 3.927 4.09 4.316 4.553 4.802 5.034 5.253 5.536 5.816 6.105 6.45 6.763 7.062 7.409 7.793 8.163 8.577 9.015 9.478 9.986 10.542 11.15 11.766 12.517 13.367 14.269 15.256 16.423 17.652 18.786 19.365 19.499 19.402 19.208 18.939 18.666 18.383 18.097 17.768 17.476 17.221 16.971 16.719 16.46 16.213 15.947 15.708 15.493 15.268 15.044 14.86 14.655 14.454 14.299 14.131 13.951 13.756 13.557 13.423 13.293 13.098 12.96 12.831 12.771 12.642 12.504 12.353 12.276 11.746 12.026 11.935 11.832 11.627 11.524 11.417 11.297 11.17 11.028 10.839 10.313 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt deleted file mode 100644 index c9116e7d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,970 ,KEBNE ,16722512,Sun Nov 28 00:23:00 CET,Sun Nov 28 01:57:33 CET,0.0 1.601 2.087 2.495 2.847 3.131 3.386 3.625 4.053 4.246 4.43 4.291 4.938 5.102 5.419 5.72 6.001 6.137 6.404 6.659 7.031 7.262 7.478 7.809 8.128 8.423 8.715 9.005 9.379 9.759 10.136 10.564 10.973 11.384 11.865 12.415 12.939 13.508 14.127 14.787 15.514 16.302 17.171 18.089 19.175 20.421 21.904 23.552 25.501 27.824 30.591 32.805 33.971 34.527 34.806 34.952 34.993 34.964 34.852 34.659 34.483 34.304 34.087 33.845 33.598 33.372 33.121 32.878 32.671 32.445 32.186 31.97 31.725 31.457 31.255 31.047 30.824 30.588 30.345 30.169 30.003 29.755 29.562 29.351 29.24 29.018 28.788 28.539 28.397 27.781 27.87 27.676 27.479 27.02 26.754 26.447 26.095 25.731 25.246 24.368 20.263 -2 ,10136 ,KEBNE ,16722513,Sun Nov 28 00:24:01 CET,Sun Nov 28 01:59:50 CET,0.0 1.478 1.993 2.364 2.695 2.993 3.251 3.488 3.932 4.145 4.342 4.224 4.875 5.033 5.327 5.609 5.893 6.032 6.303 6.563 6.927 7.159 7.386 7.73 8.059 8.375 8.681 8.974 9.358 9.725 10.067 10.481 10.893 11.298 11.781 12.341 12.872 13.457 14.113 14.823 15.57 16.405 17.347 18.278 19.386 20.618 22.036 23.652 25.545 27.888 30.801 33.062 34.23 34.872 35.243 35.404 35.4 35.309 35.188 35.018 34.855 34.691 34.486 34.234 33.993 33.79 33.548 33.307 33.097 32.88 32.639 32.422 32.199 31.948 31.753 31.551 31.328 31.102 30.857 30.673 30.482 30.169 29.946 29.699 29.566 29.303 29.036 28.735 28.565 27.94 28.049 27.864 27.675 27.259 27.013 26.719 26.353 25.966 25.505 24.841 22.263 -3 ,27471 ,KEBNE ,16722514,Sun Nov 28 00:24:01 CET,Sun Nov 28 01:58:23 CET,0.0 1.551 2.161 2.608 2.972 3.341 3.67 3.939 4.414 4.638 4.859 4.794 5.458 5.635 5.984 6.318 6.626 6.777 7.074 7.353 7.731 7.964 8.2 8.552 8.892 9.217 9.517 9.81 10.209 10.597 10.947 11.366 11.803 12.222 12.703 13.265 13.808 14.38 15.009 15.692 16.415 17.228 18.16 19.103 20.212 21.466 22.913 24.533 26.466 28.781 31.582 33.793 34.97 35.658 36.045 36.237 36.263 36.204 36.087 35.95 35.85 35.72 35.542 35.336 35.137 34.939 34.713 34.507 34.31 34.089 33.851 33.656 33.475 33.3 33.138 32.946 32.758 32.559 32.344 32.193 32.028 31.76 31.566 31.362 31.255 31.019 30.748 30.486 30.352 29.741 29.851 29.676 29.501 29.102 28.862 28.562 28.236 27.87 27.421 26.682 23.586 -4 ,13631 ,KEBNE ,16722515,Sun Nov 28 00:26:03 CET,Sun Nov 28 02:00:33 CET,0.0 1.453 1.994 2.417 2.769 3.049 3.317 3.573 4.017 4.215 4.401 4.26 4.912 5.076 5.396 5.704 5.997 6.138 6.407 6.665 7.037 7.293 7.547 7.899 8.24 8.575 8.893 9.212 9.64 10.038 10.412 10.865 11.311 11.755 12.267 12.84 13.384 13.968 14.593 15.245 15.918 16.688 17.599 18.538 19.621 20.827 22.24 23.86 25.799 28.075 30.791 32.937 34.125 34.853 35.271 35.448 35.466 35.395 35.297 35.176 34.999 34.787 34.599 34.399 34.167 33.95 33.721 33.484 33.26 33.033 32.79 32.58 32.352 32.112 31.923 31.71 31.487 31.25 31.002 30.832 30.638 30.292 30.053 29.824 29.706 29.452 29.169 28.874 28.705 28.071 28.152 27.947 27.718 27.199 26.903 26.571 26.188 25.755 25.261 24.6 21.929 -5 ,26434 ,KEBNE ,16722516,Sun Nov 28 00:26:03 CET,Sun Nov 28 02:01:54 CET,0.0 2.714 3.335 3.787 4.147 4.445 4.714 4.956 5.368 5.554 5.726 5.572 6.208 6.364 6.665 6.948 7.225 7.362 7.625 7.875 8.243 8.476 8.702 9.028 9.347 9.679 9.995 10.286 10.666 11.037 11.395 11.82 12.239 12.658 13.14 13.682 14.207 14.79 15.431 16.113 16.82 17.63 18.571 19.507 20.639 21.892 23.322 24.992 26.988 29.284 32.084 34.365 35.569 36.219 36.545 36.698 36.712 36.652 36.563 36.415 36.229 36.008 35.774 35.545 35.309 35.081 34.837 34.608 34.411 34.197 33.964 33.768 33.548 33.3 33.097 32.861 32.602 32.35 32.077 31.884 31.681 31.355 31.136 30.903 30.783 30.551 30.292 29.985 29.821 29.195 29.286 29.085 28.841 28.301 28.018 27.7 27.318 26.835 26.219 25.373 22.626 -6 ,22711 ,KEBNE ,16722517,Sun Nov 28 00:26:03 CET,Sun Nov 28 02:00:32 CET,0.0 1.534 2.068 2.481 2.791 3.069 3.333 3.578 4.034 4.241 4.429 4.292 4.942 5.105 5.403 5.678 5.95 6.088 6.369 6.645 7.022 7.256 7.5 7.864 8.202 8.52 8.841 9.156 9.555 9.941 10.319 10.775 11.217 11.639 12.118 12.65 13.156 13.723 14.345 15.009 15.705 16.473 17.376 18.312 19.436 20.705 22.173 23.838 25.754 28.028 30.84 33.083 34.202 34.81 35.165 35.322 35.336 35.264 35.163 35.023 34.842 34.651 34.462 34.258 34.048 33.857 33.664 33.442 33.226 33.011 32.768 32.564 32.35 32.121 31.93 31.729 31.523 31.285 31.016 30.821 30.616 30.284 30.059 29.826 29.708 29.485 29.239 28.971 28.831 28.222 28.35 28.167 27.979 27.571 27.326 27.028 26.687 26.303 25.796 25.063 22.515 -7 ,4079 ,KEBNE ,16722518,Sun Nov 28 00:26:04 CET,Sun Nov 28 02:00:38 CET,0.0 1.537 2.059 2.451 2.775 3.074 3.393 3.692 4.184 4.422 4.646 4.543 5.191 5.351 5.667 5.98 6.278 6.416 6.683 6.94 7.319 7.576 7.832 8.188 8.523 8.862 9.182 9.491 9.898 10.283 10.651 11.099 11.551 11.99 12.495 13.052 13.59 14.187 14.802 15.451 16.165 16.991 17.947 18.898 20.024 21.324 22.853 24.54 26.512 28.837 31.583 33.759 34.897 35.544 35.95 36.143 36.171 36.143 36.068 35.904 35.713 35.53 35.311 35.074 34.851 34.634 34.394 34.147 33.912 33.683 33.447 33.246 33.027 32.776 32.58 32.384 32.162 31.917 31.659 31.474 31.3 31.034 30.835 30.626 30.516 30.275 30.008 29.728 29.581 28.968 29.088 28.894 28.668 28.168 27.908 27.647 27.338 26.966 26.526 25.855 23.792 -8 ,3404 ,KEBNE ,16722519,Sun Nov 28 00:26:04 CET,Sun Nov 28 02:01:38 CET,0.0 1.798 2.325 2.7 3.011 3.293 3.571 3.838 4.295 4.487 4.675 4.569 5.225 5.389 5.722 6.027 6.307 6.447 6.711 6.964 7.335 7.581 7.823 8.171 8.506 8.829 9.136 9.431 9.826 10.202 10.552 10.982 11.411 11.832 12.314 12.862 13.391 13.973 14.605 15.278 15.994 16.815 17.774 18.726 19.82 21.095 22.603 24.275 26.228 28.524 31.276 33.451 34.676 35.338 35.654 35.796 35.828 35.799 35.696 35.545 35.396 35.2 34.938 34.691 34.456 34.212 33.954 33.715 33.511 33.307 33.091 32.902 32.683 32.44 32.247 32.05 31.846 31.604 31.353 31.184 30.986 30.66 30.425 30.177 30.056 29.801 29.544 29.273 29.129 28.531 28.67 28.5 28.303 27.858 27.611 27.335 27.021 26.612 26.109 25.477 23.459 -9 ,8028 ,KEBNE ,16722520,Sun Nov 28 00:26:04 CET,Sun Nov 28 02:00:40 CET,0.0 1.566 2.125 2.53 2.856 3.142 3.401 3.648 4.093 4.294 4.485 4.359 5.019 5.183 5.482 5.777 6.055 6.193 6.475 6.757 7.158 7.408 7.652 8.012 8.356 8.693 9.036 9.353 9.753 10.144 10.525 10.986 11.425 11.848 12.337 12.873 13.392 13.988 14.639 15.319 16.034 16.861 17.82 18.756 19.849 21.101 22.558 24.225 26.19 28.48 31.22 33.394 34.553 35.205 35.573 35.718 35.747 35.716 35.614 35.48 35.335 35.172 34.966 34.731 34.501 34.281 34.034 33.784 33.562 33.34 33.104 32.896 32.666 32.423 32.23 32.007 31.744 31.483 31.216 31.027 30.822 30.489 30.261 30.015 29.886 29.616 29.306 28.97 28.801 28.17 28.255 28.031 27.774 27.206 26.905 26.594 26.224 25.804 25.304 24.598 22.562 -10 ,16463 ,KEBNE ,16722521,Sun Nov 28 00:26:04 CET,Sun Nov 28 02:00:16 CET,0.0 1.639 2.214 2.631 2.97 3.26 3.537 3.797 4.237 4.441 4.638 4.545 5.223 5.405 5.745 6.066 6.38 6.53 6.819 7.105 7.519 7.78 8.024 8.376 8.721 9.04 9.344 9.646 10.044 10.436 10.824 11.299 11.751 12.174 12.64 13.156 13.673 14.257 14.898 15.572 16.279 17.094 18.05 18.99 20.075 21.33 22.791 24.422 26.374 28.696 31.447 33.668 34.903 35.613 35.989 36.2 36.295 36.272 36.183 36.049 35.91 35.761 35.604 35.425 35.217 34.999 34.751 34.525 34.33 34.133 33.915 33.73 33.549 33.349 33.177 32.991 32.783 32.552 32.309 32.148 31.973 31.684 31.477 31.252 31.137 30.897 30.627 30.342 30.192 29.579 29.693 29.51 29.318 28.904 28.663 28.372 28.031 27.622 27.126 26.421 23.645 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt deleted file mode 100644 index c6222258..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-5_Example-6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13742 ,KEBNE ,16722522,Sun Nov 28 00:26:04 CET,Sun Nov 28 02:01:53 CET,0.0 3.597 4.161 4.556 4.862 5.118 5.336 5.536 5.893 6.051 6.196 5.978 6.582 6.697 6.92 7.122 7.321 7.42 7.599 7.77 8.012 8.158 8.296 8.502 8.697 8.883 9.062 9.238 9.468 9.701 9.931 10.193 10.428 10.653 10.921 11.214 11.49 11.805 12.143 12.476 12.821 13.164 13.528 13.867 14.202 14.533 14.834 15.083 15.222 15.034 14.236 12.701 11.265 9.971 8.659 7.414 6.343 5.365 4.529 3.68 2.933 2.264 1.603 0.983 0.401 -0.137 -0.677 -1.173 -1.601 -2.04 -2.522 -2.925 -3.348 -3.793 -4.138 -4.495 -4.869 -5.263 -5.665 -5.94 -6.232 -6.711 -7.05 -7.392 -7.567 -7.929 -8.311 -8.723 -8.947 -9.676 -9.662 -9.909 -10.164 -10.755 -11.106 -11.501 -11.896 -12.313 -12.82 -13.498 -15.749 -2 ,8550 ,KEBNE ,16722523,Sun Nov 28 00:26:04 CET,Sun Nov 28 02:00:44 CET,0.0 1.53 2.016 2.354 2.638 2.89 3.13 3.341 3.684 3.844 3.994 3.798 4.416 4.549 4.794 5.01 5.2 5.287 5.462 5.642 5.892 6.04 6.179 6.381 6.602 6.819 7.014 7.193 7.409 7.616 7.812 8.047 8.288 8.532 8.809 9.114 9.394 9.677 9.972 10.288 10.61 10.959 11.324 11.619 11.909 12.217 12.506 12.646 12.653 12.486 11.814 10.565 9.281 8.04 6.944 5.953 5.031 4.167 3.392 2.608 1.917 1.277 0.639 0.004 -0.607 -1.17 -1.748 -2.27 -2.711 -3.162 -3.661 -4.086 -4.517 -4.965 -5.298 -5.649 -6.031 -6.408 -6.792 -7.073 -7.368 -7.811 -8.1 -8.396 -8.55 -8.883 -9.241 -9.605 -9.796 -10.502 -10.436 -10.671 -10.923 -11.457 -11.746 -12.069 -12.435 -12.859 -13.411 -14.198 -16.799 -3 ,17642 ,KEBNE ,16722524,Sun Nov 28 00:26:04 CET,Sun Nov 28 02:00:58 CET,0.0 1.765 2.294 2.644 2.939 3.211 3.438 3.628 3.958 4.108 4.26 4.077 4.698 4.83 5.1 5.357 5.588 5.703 5.924 6.128 6.423 6.612 6.792 7.042 7.261 7.463 7.662 7.864 8.109 8.339 8.564 8.836 9.09 9.321 9.587 9.899 10.213 10.528 10.801 11.081 11.382 11.692 12.023 12.316 12.641 12.961 13.259 13.494 13.573 13.394 12.678 11.36 10.043 8.821 7.668 6.534 5.439 4.449 3.616 2.784 2.041 1.405 0.801 0.18 -0.413 -0.956 -1.525 -2.059 -2.526 -2.989 -3.454 -3.854 -4.271 -4.709 -5.051 -5.397 -5.775 -6.182 -6.611 -6.904 -7.204 -7.666 -7.989 -8.34 -8.516 -8.856 -9.21 -9.599 -9.806 -10.515 -10.456 -10.683 -10.931 -11.492 -11.791 -12.101 -12.472 -12.879 -13.367 -14.089 -16.358 -4 ,13018 ,KEBNE ,16722525,Sun Nov 28 00:26:04 CET,Sun Nov 28 02:02:00 CET,0.0 1.887 2.375 2.725 3.017 3.28 3.528 3.74 4.082 4.244 4.391 4.182 4.794 4.913 5.133 5.34 5.538 5.633 5.83 6.018 6.28 6.448 6.598 6.805 7.023 7.241 7.438 7.617 7.841 8.068 8.295 8.548 8.791 9.027 9.299 9.622 9.927 10.211 10.454 10.696 10.934 11.193 11.516 11.844 12.203 12.533 12.812 12.973 12.993 12.799 12.072 10.782 9.475 8.241 7.08 5.918 4.85 3.877 3.022 2.173 1.433 0.769 0.129 -0.486 -1.061 -1.589 -2.12 -2.607 -3.047 -3.479 -3.924 -4.324 -4.756 -5.194 -5.534 -5.882 -6.241 -6.61 -6.983 -7.26 -7.539 -7.951 -8.256 -8.576 -8.743 -9.095 -9.462 -9.858 -10.069 -10.777 -10.711 -10.958 -11.216 -11.778 -12.109 -12.478 -12.861 -13.284 -13.787 -14.53 -17.517 -5 ,26441 ,KEBNE ,16722526,Sun Nov 28 00:26:04 CET,Sun Nov 28 02:00:50 CET,0.0 4.275 4.817 5.183 5.483 5.734 5.958 6.161 6.511 6.66 6.803 6.598 7.202 7.319 7.541 7.749 7.95 8.045 8.217 8.387 8.627 8.777 8.927 9.138 9.347 9.547 9.741 9.928 10.165 10.389 10.603 10.857 11.094 11.336 11.614 11.908 12.168 12.423 12.692 12.975 13.252 13.552 13.899 14.221 14.528 14.815 15.097 15.311 15.391 15.264 14.59 13.184 11.801 10.471 9.161 7.919 6.819 5.832 4.993 4.1 3.309 2.62 1.983 1.389 0.831 0.296 -0.28 -0.795 -1.247 -1.695 -2.149 -2.524 -2.926 -3.346 -3.664 -4.007 -4.36 -4.703 -5.079 -5.346 -5.604 -6.008 -6.294 -6.595 -6.752 -7.079 -7.423 -7.778 -7.964 -8.668 -8.61 -8.841 -9.094 -9.691 -10.026 -10.394 -10.799 -11.254 -11.809 -12.525 -14.753 -6 ,3581 ,KEBNE ,16722527,Sun Nov 28 00:28:10 CET,Sun Nov 28 02:08:38 CET,0.0 1.706 2.206 2.587 2.91 3.179 3.41 3.614 3.974 4.138 4.286 4.095 4.711 4.84 5.081 5.311 5.535 5.643 5.852 6.05 6.335 6.516 6.687 6.938 7.186 7.407 7.605 7.801 8.064 8.304 8.526 8.789 9.034 9.246 9.504 9.821 10.104 10.384 10.661 10.953 11.247 11.565 11.908 12.23 12.584 12.915 13.215 13.414 13.5 13.364 12.683 11.447 10.13 8.926 7.79 6.632 5.569 4.581 3.701 2.819 2.061 1.372 0.722 0.095 -0.508 -1.052 -1.627 -2.126 -2.556 -3.026 -3.523 -3.949 -4.376 -4.792 -5.121 -5.468 -5.832 -6.223 -6.628 -6.904 -7.205 -7.696 -8.035 -8.386 -8.568 -8.95 -9.346 -9.766 -9.994 -10.731 -10.735 -10.994 -11.267 -11.903 -12.268 -12.643 -13.042 -13.508 -14.071 -14.791 -16.865 -7 ,9275 ,KEBNE ,16722528,Sun Nov 28 00:32:15 CET,Sun Nov 28 01:59:57 CET,0.0 2.102 2.659 3.056 3.35 3.601 3.838 4.039 4.388 4.557 4.706 4.491 5.103 5.234 5.469 5.677 5.877 5.979 6.177 6.359 6.609 6.759 6.898 7.104 7.317 7.512 7.682 7.852 8.081 8.303 8.512 8.771 9.017 9.249 9.51 9.778 10.03 10.316 10.619 10.935 11.246 11.557 11.95 12.297 12.631 12.994 13.337 13.605 13.703 13.522 12.773 11.34 9.93 8.624 7.39 6.191 5.135 4.165 3.283 2.405 1.666 0.988 0.349 -0.24 -0.787 -1.295 -1.837 -2.344 -2.808 -3.274 -3.737 -4.127 -4.534 -4.962 -5.306 -5.663 -6.039 -6.428 -6.831 -7.111 -7.393 -7.834 -8.154 -8.496 -8.667 -9.028 -9.448 -9.912 -10.132 -10.832 -10.75 -10.978 -11.225 -11.771 -12.063 -12.362 -12.689 -13.094 -13.638 -14.351 -16.413 -8 ,13527 ,KEBNE ,16722529,Sun Nov 28 00:32:11 CET,Sun Nov 28 02:07:09 CET,0.0 1.425 1.91 2.272 2.563 2.816 3.046 3.245 3.598 3.756 3.891 3.664 4.266 4.385 4.621 4.84 5.035 5.129 5.319 5.499 5.734 5.887 6.049 6.278 6.474 6.675 6.882 7.078 7.324 7.552 7.768 8.016 8.246 8.465 8.721 9.014 9.289 9.588 9.889 10.169 10.476 10.79 11.124 11.442 11.728 12.038 12.381 12.609 12.645 12.418 11.634 10.287 8.935 7.641 6.446 5.285 4.201 3.192 2.308 1.404 0.613 -0.083 -0.724 -1.292 -1.844 -2.381 -2.948 -3.461 -3.892 -4.325 -4.786 -5.176 -5.559 -5.946 -6.267 -6.615 -6.968 -7.32 -7.681 -7.947 -8.236 -8.675 -8.964 -9.267 -9.43 -9.761 -10.105 -10.473 -10.669 -11.382 -11.329 -11.57 -11.819 -12.326 -12.635 -12.999 -13.402 -13.844 -14.339 -15.031 -17.174 -9 ,28638 ,KEBNE ,16722530,Sun Nov 28 00:32:11 CET,Sun Nov 28 02:06:55 CET,0.0 1.75 2.308 2.697 2.976 3.228 3.449 3.646 3.998 4.157 4.303 4.1 4.713 4.839 5.069 5.28 5.482 5.58 5.771 5.954 6.212 6.373 6.526 6.753 6.974 7.189 7.394 7.592 7.853 8.096 8.328 8.594 8.832 9.054 9.309 9.618 9.907 10.182 10.452 10.722 10.993 11.281 11.612 11.941 12.248 12.515 12.789 13.033 13.151 12.922 12.121 10.794 9.43 8.185 7.048 5.953 4.926 3.944 3.038 2.131 1.374 0.693 0.053 -0.563 -1.133 -1.638 -2.184 -2.691 -3.132 -3.581 -4.047 -4.457 -4.882 -5.321 -5.662 -5.991 -6.336 -6.708 -7.096 -7.362 -7.644 -8.103 -8.425 -8.751 -8.911 -9.244 -9.602 -9.991 -10.198 -10.91 -10.841 -11.072 -11.323 -11.877 -12.196 -12.546 -12.905 -13.306 -13.8 -14.49 -16.863 -10 ,12293 ,KEBNE ,16722531,Sun Nov 28 00:33:13 CET,Sun Nov 28 02:09:15 CET,0.0 1.674 2.285 2.73 3.113 3.42 3.678 3.901 4.301 4.491 4.668 4.509 5.144 5.292 5.565 5.806 6.04 6.158 6.38 6.576 6.847 7.022 7.184 7.42 7.652 7.862 8.058 8.246 8.511 8.771 9.009 9.297 9.555 9.789 10.04 10.324 10.625 10.943 11.273 11.627 11.966 12.296 12.649 12.975 13.318 13.658 13.967 14.191 14.282 14.118 13.484 12.261 10.954 9.657 8.483 7.454 6.484 5.531 4.672 3.785 3.005 2.298 1.615 1.003 0.45 -0.088 -0.655 -1.155 -1.593 -2.054 -2.559 -2.989 -3.436 -3.898 -4.25 -4.606 -4.954 -5.32 -5.705 -5.972 -6.248 -6.664 -6.964 -7.284 -7.451 -7.808 -8.172 -8.547 -8.746 -9.451 -9.381 -9.611 -9.86 -10.406 -10.702 -11.018 -11.376 -11.804 -12.308 -12.965 -14.799 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt deleted file mode 100644 index a4c8c0b8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,17139 ,KEBNE ,16722533,Sun Nov 28 00:35:20 CET,Sun Nov 28 02:06:41 CET,0.0 1.224 1.689 2.066 2.382 2.666 2.917 3.146 3.588 3.793 3.989 3.874 4.55 4.717 5.047 5.364 5.661 5.809 6.099 6.386 6.818 7.098 7.363 7.75 8.142 8.533 8.907 9.264 9.716 10.156 10.585 11.111 11.634 12.168 12.794 13.492 14.158 14.844 15.593 16.42 17.293 18.296 19.489 20.693 22.102 23.729 25.699 27.921 30.493 33.613 37.648 41.183 43.274 44.605 45.477 46.07 46.452 46.674 46.83 46.959 47.001 47.017 47.014 46.971 46.888 46.779 46.667 46.575 46.482 46.365 46.233 46.121 46.007 45.867 45.733 45.596 45.456 45.307 45.152 45.046 44.933 44.755 44.623 44.468 44.385 44.19 43.989 43.809 43.715 43.159 43.392 43.269 43.132 42.837 42.671 42.49 42.271 41.991 41.643 41.204 39.766 -5 ,22163 ,KEBNE ,16722536,Sun Nov 28 00:37:22 CET,Sun Nov 28 02:04:37 CET,0.0 2.241 2.768 3.176 3.506 3.78 4.039 4.278 4.72 4.921 5.11 4.955 5.615 5.777 6.113 6.443 6.772 6.937 7.238 7.522 7.943 8.217 8.482 8.873 9.259 9.622 9.973 10.315 10.74 11.163 11.599 12.127 12.622 13.113 13.699 14.347 14.981 15.696 16.467 17.286 18.156 19.159 20.349 21.565 22.998 24.6 26.526 28.774 31.418 34.634 38.576 41.92 43.982 45.257 46.098 46.691 47.045 47.285 47.479 47.615 47.676 47.705 47.708 47.702 47.655 47.588 47.518 47.432 47.352 47.258 47.145 47.042 46.916 46.768 46.659 46.54 46.413 46.274 46.119 46.025 45.918 45.722 45.575 45.398 45.312 45.147 44.967 44.788 44.693 44.13 44.317 44.177 44.018 43.671 43.491 43.308 43.097 42.855 42.577 42.145 40.871 -6 ,32505 ,KEBNE ,16722537,Sun Nov 28 00:38:19 CET,Sun Nov 28 02:12:20 CET,0.0 1.148 1.668 2.04 2.352 2.643 2.903 3.136 3.554 3.757 3.964 3.845 4.509 4.679 5.001 5.311 5.616 5.764 6.058 6.337 6.744 7.004 7.253 7.632 8.004 8.363 8.717 9.066 9.511 9.938 10.334 10.824 11.324 11.804 12.391 13.094 13.753 14.462 15.23 16.062 16.949 17.949 19.177 20.441 21.898 23.495 25.329 27.501 30.132 33.305 37.309 40.791 42.89 44.244 45.195 45.906 46.376 46.667 46.834 46.942 46.995 47.02 47.031 47.017 46.973 46.903 46.815 46.739 46.663 46.576 46.459 46.346 46.233 46.111 46.017 45.908 45.775 45.624 45.453 45.334 45.217 45.044 44.924 44.787 44.706 44.53 44.311 44.072 43.964 43.397 43.616 43.491 43.365 43.105 42.946 42.766 42.57 42.3 41.972 41.568 40.335 -7 ,1881 ,KEBNE ,16722538,Sun Nov 28 00:39:22 CET,Sun Nov 28 02:13:21 CET,0.0 1.344 1.924 2.32 2.637 2.909 3.16 3.395 3.831 4.041 4.239 4.109 4.791 4.966 5.295 5.61 5.908 6.055 6.352 6.641 7.069 7.358 7.643 8.045 8.421 8.774 9.122 9.478 9.945 10.396 10.846 11.375 11.874 12.366 12.934 13.595 14.238 14.942 15.717 16.541 17.403 18.376 19.538 20.715 22.135 23.812 25.762 27.974 30.589 33.729 37.668 40.995 43.045 44.474 45.382 45.968 46.384 46.694 46.874 46.986 47.051 47.066 47.042 46.981 46.912 46.87 46.82 46.731 46.63 46.537 46.434 46.33 46.222 46.089 45.972 45.85 45.718 45.57 45.414 45.309 45.19 45.001 44.867 44.733 44.671 44.535 44.377 44.205 44.108 43.543 43.772 43.651 43.517 43.208 43.031 42.835 42.616 42.372 42.084 41.706 40.569 -9 ,15812 ,KEBNE ,16722540,Sun Nov 28 00:39:21 CET,Sun Nov 28 02:19:04 CET,0.0 1.235 1.747 2.135 2.455 2.74 3.015 3.282 3.794 4.027 4.247 4.154 4.856 5.05 5.395 5.738 6.076 6.24 6.564 6.879 7.318 7.61 7.902 8.307 8.687 9.055 9.425 9.8 10.262 10.712 11.165 11.684 12.186 12.669 13.207 13.829 14.446 15.13 15.879 16.691 17.542 18.487 19.655 20.839 22.205 23.758 25.615 27.78 30.372 33.55 37.548 40.943 42.927 44.225 45.106 45.751 46.196 46.483 46.674 46.799 46.863 46.907 46.921 46.896 46.852 46.777 46.672 46.586 46.5 46.394 46.282 46.172 46.036 45.896 45.788 45.681 45.562 45.433 45.303 45.216 45.116 44.935 44.817 44.693 44.626 44.492 44.341 44.146 44.041 43.483 43.718 43.603 43.48 43.207 43.045 42.87 42.671 42.415 42.108 41.663 40.402 -10 ,16359 ,KEBNE ,16722541,Sun Nov 28 00:39:22 CET,Sun Nov 28 02:13:28 CET,0.0 1.14 1.564 1.907 2.226 2.522 2.778 3.015 3.458 3.665 3.855 3.721 4.388 4.567 4.921 5.24 5.542 5.693 5.995 6.284 6.688 6.948 7.2 7.572 7.935 8.276 8.605 8.927 9.344 9.747 10.156 10.676 11.17 11.657 12.22 12.84 13.455 14.159 14.941 15.762 16.648 17.674 18.874 20.09 21.515 23.107 24.984 27.196 29.906 33.13 37.102 40.562 42.597 43.937 44.871 45.489 45.886 46.135 46.279 46.351 46.383 46.41 46.415 46.41 46.393 46.35 46.267 46.184 46.118 46.031 45.923 45.828 45.729 45.626 45.534 45.435 45.333 45.218 45.086 44.993 44.898 44.741 44.626 44.504 44.438 44.295 44.145 43.989 43.906 43.36 43.594 43.473 43.344 43.034 42.861 42.682 42.478 42.226 41.895 41.396 39.561 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt deleted file mode 100644 index e28bf1bf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-6_Example-2.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14567 ,KEBNE ,17026224,Wed Dec 22 13:55:49 CET,Wed Dec 22 15:32:21 CET,0.0 1.293 1.83 2.268 2.656 2.98 3.266 3.559 4.107 4.364 4.609 4.558 5.267 5.481 5.872 6.221 6.559 6.721 7.038 7.348 7.795 8.079 8.358 8.769 9.184 9.597 9.99 10.374 10.886 11.379 11.852 12.432 12.982 13.503 14.108 14.776 15.425 16.142 16.908 17.744 18.651 19.701 20.937 22.217 23.755 25.506 27.564 29.859 32.608 36.006 40.181 43.729 45.94 47.396 48.335 49.018 49.534 49.861 50.05 50.196 50.289 50.333 50.337 50.313 50.278 50.223 50.138 50.033 49.94 49.847 49.73 49.623 49.511 49.401 49.3 49.165 49.026 48.881 48.717 48.593 48.468 48.299 48.174 48.028 47.952 47.798 47.624 47.44 47.343 46.791 47.029 46.908 46.781 46.446 46.243 46.021 45.78 45.517 45.189 44.716 43.309 -2 ,15424 ,KEBNE ,17026225,Wed Dec 22 13:55:50 CET,Wed Dec 22 15:31:41 CET,0.0 1.356 1.862 2.264 2.587 2.872 3.132 3.371 3.815 4.025 4.233 4.142 4.826 5.012 5.372 5.71 6.039 6.201 6.508 6.791 7.217 7.502 7.772 8.164 8.554 8.929 9.296 9.667 10.156 10.655 11.128 11.67 12.204 12.716 13.315 14.014 14.703 15.451 16.263 17.139 18.066 19.145 20.402 21.672 23.17 24.853 26.874 29.224 31.988 35.355 39.548 43.091 45.313 46.799 47.8 48.49 48.973 49.301 49.46 49.573 49.664 49.704 49.708 49.706 49.692 49.663 49.602 49.528 49.464 49.392 49.299 49.2 49.09 48.964 48.864 48.757 48.629 48.498 48.352 48.238 48.11 47.894 47.745 47.594 47.512 47.337 47.149 46.948 46.838 46.269 46.48 46.347 46.207 45.88 45.688 45.47 45.243 44.983 44.612 44.109 42.704 -3 ,9052 ,KEBNE ,17026226,Wed Dec 22 13:55:49 CET,Wed Dec 22 15:30:57 CET,0.0 1.394 1.9 2.279 2.608 2.924 3.205 3.455 3.912 4.119 4.32 4.224 4.914 5.105 5.478 5.83 6.161 6.325 6.655 6.967 7.423 7.718 7.999 8.408 8.803 9.182 9.554 9.939 10.443 10.908 11.358 11.896 12.422 12.944 13.555 14.26 14.972 15.744 16.564 17.454 18.375 19.401 20.609 21.864 23.37 25.05 27.02 29.314 32.058 35.362 39.53 43.2 45.448 46.87 47.836 48.521 48.948 49.272 49.497 49.636 49.734 49.793 49.795 49.754 49.705 49.646 49.559 49.479 49.406 49.308 49.192 49.094 48.991 48.866 48.766 48.668 48.548 48.424 48.29 48.192 48.096 47.928 47.798 47.659 47.59 47.441 47.267 47.064 46.965 46.419 46.636 46.507 46.377 46.071 45.896 45.703 45.467 45.194 44.867 44.346 42.889 -4 ,24460 ,KEBNE ,17026227,Wed Dec 22 13:55:50 CET,Wed Dec 22 15:31:08 CET,0.0 1.376 1.87 2.24 2.56 2.853 3.123 3.373 3.814 4.023 4.231 4.12 4.809 4.993 5.334 5.663 5.988 6.149 6.452 6.743 7.179 7.459 7.734 8.136 8.511 8.883 9.276 9.674 10.175 10.646 11.088 11.639 12.198 12.731 13.35 14.052 14.731 15.478 16.284 17.151 18.096 19.175 20.4 21.633 23.122 24.877 26.955 29.236 31.888 35.216 39.49 43.182 45.386 46.772 47.697 48.313 48.718 48.99 49.147 49.273 49.355 49.378 49.352 49.279 49.182 49.096 49.001 48.887 48.761 48.64 48.548 48.469 48.367 48.26 48.167 48.061 47.934 47.79 47.66 47.567 47.455 47.263 47.126 46.982 46.905 46.747 46.569 46.374 46.276 45.724 45.93 45.787 45.637 45.277 45.057 44.829 44.585 44.27 43.869 43.344 41.364 -5 ,16666 ,KEBNE ,17026228,Wed Dec 22 13:56:52 CET,Wed Dec 22 15:32:32 CET,0.0 1.305 1.787 2.149 2.466 2.764 3.048 3.309 3.775 3.992 4.201 4.099 4.781 4.958 5.319 5.672 5.991 6.148 6.464 6.777 7.218 7.495 7.764 8.162 8.539 8.895 9.243 9.588 10.04 10.485 10.923 11.446 11.96 12.47 13.074 13.766 14.431 15.171 15.97 16.827 17.756 18.823 20.114 21.452 23.001 24.713 26.73 29.066 31.803 35.128 39.385 43.084 45.321 46.822 47.808 48.453 48.891 49.177 49.365 49.515 49.597 49.633 49.622 49.589 49.548 49.496 49.436 49.368 49.289 49.191 49.085 49.002 48.9 48.776 48.684 48.583 48.463 48.332 48.178 48.065 47.951 47.772 47.651 47.532 47.468 47.317 47.145 46.971 46.878 46.315 46.527 46.393 46.262 45.951 45.768 45.575 45.346 45.076 44.742 44.301 42.891 -6 ,16888 ,KEBNE ,17026229,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:32:47 CET,0.0 1.493 2.146 2.666 3.066 3.395 3.707 3.986 4.487 4.735 4.977 4.934 5.637 5.842 6.241 6.607 6.949 7.112 7.43 7.747 8.203 8.499 8.781 9.185 9.579 9.968 10.355 10.736 11.23 11.704 12.153 12.699 13.222 13.699 14.285 14.971 15.627 16.357 17.151 18.003 18.92 19.955 21.17 22.448 23.993 25.698 27.651 29.972 32.773 36.148 40.426 44.02 46.175 47.635 48.609 49.292 49.772 50.077 50.272 50.422 50.502 50.524 50.508 50.478 50.437 50.372 50.288 50.193 50.102 49.995 49.86 49.749 49.627 49.5 49.399 49.277 49.131 48.97 48.789 48.657 48.535 48.36 48.234 48.101 48.03 47.864 47.688 47.501 47.406 46.858 47.101 46.982 46.838 46.516 46.347 46.155 45.932 45.68 45.38 44.948 43.662 -7 ,27601 ,KEBNE ,17026230,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:41 CET,0.0 2.338 2.892 3.314 3.674 3.97 4.236 4.49 4.958 5.17 5.371 5.27 5.961 6.146 6.484 6.801 7.115 7.268 7.559 7.842 8.249 8.514 8.777 9.167 9.555 9.93 10.302 10.67 11.145 11.62 12.074 12.622 13.173 13.712 14.338 15.04 15.714 16.462 17.299 18.219 19.182 20.247 21.493 22.784 24.321 26.005 27.936 30.222 33.025 36.385 40.603 44.27 46.484 47.932 48.856 49.445 49.841 50.143 50.35 50.487 50.552 50.581 50.564 50.498 50.431 50.392 50.344 50.284 50.223 50.13 50.01 49.907 49.798 49.675 49.573 49.458 49.333 49.2 49.042 48.926 48.814 48.642 48.498 48.335 48.252 48.076 47.89 47.703 47.61 47.06 47.275 47.14 47.002 46.703 46.521 46.312 46.064 45.766 45.388 44.893 43.497 -8 ,15250 ,KEBNE ,17026231,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:47 CET,0.0 3.15 3.788 4.24 4.59 4.904 5.199 5.464 5.936 6.163 6.38 6.301 7.002 7.198 7.577 7.934 8.271 8.431 8.734 9.028 9.456 9.744 10.027 10.43 10.842 11.239 11.594 11.946 12.422 12.896 13.367 13.919 14.429 14.942 15.554 16.238 16.907 17.649 18.463 19.334 20.242 21.285 22.525 23.798 25.33 27.058 29.086 31.45 34.329 37.805 42.184 45.923 48.125 49.633 50.675 51.407 51.908 52.243 52.456 52.599 52.668 52.711 52.745 52.742 52.7 52.642 52.582 52.524 52.458 52.371 52.28 52.214 52.131 52.014 51.926 51.839 51.734 51.618 51.501 51.415 51.321 51.168 51.052 50.923 50.854 50.705 50.543 50.378 50.284 49.718 49.935 49.815 49.676 49.362 49.189 49.005 48.801 48.553 48.237 47.784 46.541 -9 ,24072 ,KEBNE ,17026232,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:53 CET,0.0 1.25 1.764 2.146 2.465 2.74 2.995 3.247 3.707 3.907 4.107 4.018 4.708 4.888 5.232 5.55 5.858 6.008 6.301 6.584 6.994 7.263 7.531 7.928 8.309 8.687 9.061 9.428 9.91 10.378 10.827 11.366 11.893 12.424 13.031 13.703 14.36 15.088 15.885 16.743 17.658 18.713 19.977 21.251 22.754 24.456 26.483 28.857 31.691 35.12 39.416 43.106 45.397 46.866 47.848 48.575 49.091 49.46 49.676 49.817 49.869 49.907 49.936 49.938 49.932 49.887 49.789 49.691 49.604 49.503 49.392 49.292 49.18 49.054 48.949 48.814 48.657 48.515 48.378 48.271 48.151 47.958 47.826 47.68 47.602 47.452 47.275 47.07 46.969 46.407 46.589 46.442 46.278 45.909 45.71 45.489 45.239 44.91 44.461 43.881 42.151 -10 ,7471 ,KEBNE ,17026233,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:32:08 CET,0.0 1.282 1.798 2.168 2.48 2.786 3.056 3.304 3.782 4.002 4.214 4.102 4.779 4.956 5.305 5.627 5.939 6.09 6.386 6.683 7.123 7.406 7.678 8.065 8.448 8.825 9.199 9.581 10.079 10.558 11.009 11.556 12.092 12.616 13.218 13.898 14.558 15.278 16.087 16.978 17.944 19.036 20.285 21.569 23.073 24.741 26.727 29.031 31.874 35.327 39.603 43.254 45.404 46.783 47.669 48.283 48.764 49.068 49.257 49.403 49.441 49.464 49.476 49.468 49.453 49.409 49.33 49.242 49.157 49.059 48.945 48.844 48.743 48.622 48.515 48.406 48.276 48.133 47.973 47.846 47.721 47.517 47.358 47.199 47.115 46.945 46.764 46.559 46.447 45.88 46.083 45.944 45.787 45.431 45.23 45.01 44.744 44.421 43.997 43.431 41.759 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt deleted file mode 100644 index 39126642..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,18977 ,KEBNE ,16722543,Sun Nov 28 00:40:22 CET,Sun Nov 28 02:13:55 CET,0.0 1.356 1.839 2.217 2.533 2.795 3.022 3.226 3.595 3.754 3.911 4.116 4.382 4.514 4.744 4.98 5.214 5.33 5.554 5.764 6.05 6.236 6.414 6.655 6.9 7.142 7.365 7.581 7.864 8.129 8.375 8.661 8.949 9.222 9.53 9.852 10.138 10.465 10.811 11.165 11.515 11.875 12.275 12.689 13.153 13.589 13.955 14.251 14.464 14.465 13.93 12.571 11.138 9.727 8.416 7.265 6.221 5.231 4.354 3.441 2.655 1.941 1.204 0.491 -0.159 -0.735 -1.335 -1.892 -2.365 -2.834 -3.313 -3.721 -4.155 -4.602 -4.951 -5.311 -5.685 -6.081 -6.501 -6.792 -7.1 -7.614 -7.971 -8.338 -8.531 -8.928 -9.353 -9.807 -10.037 -10.398 -10.778 -11.047 -11.335 -11.988 -12.367 -12.771 -13.193 -13.667 -14.253 -14.995 -17.468 -3 ,192 ,KEBNE ,16722544,Sun Nov 28 00:40:22 CET,Sun Nov 28 02:14:06 CET,0.0 1.36 1.769 2.097 2.376 2.622 2.84 3.028 3.375 3.542 3.697 3.877 4.134 4.275 4.542 4.773 4.987 5.101 5.322 5.525 5.805 5.977 6.15 6.42 6.677 6.916 7.148 7.369 7.675 7.981 8.243 8.537 8.819 9.093 9.405 9.716 9.97 10.245 10.544 10.886 11.254 11.611 11.989 12.404 12.883 13.279 13.652 13.967 14.107 14.055 13.437 12.064 10.603 9.231 8.017 6.894 5.848 4.864 4.03 3.178 2.39 1.69 1.041 0.402 -0.222 -0.791 -1.385 -1.939 -2.426 -2.93 -3.43 -3.822 -4.226 -4.646 -4.97 -5.307 -5.704 -6.142 -6.552 -6.812 -7.101 -7.59 -7.925 -8.282 -8.476 -8.883 -9.295 -9.696 -9.905 -10.251 -10.638 -10.915 -11.196 -11.781 -12.102 -12.476 -12.928 -13.465 -14.096 -14.922 -17.797 -4 ,9751 ,KEBNE ,16722545,Sun Nov 28 00:40:22 CET,Sun Nov 28 02:14:20 CET,0.0 1.42 1.863 2.216 2.506 2.732 2.921 3.105 3.456 3.61 3.762 3.952 4.205 4.329 4.557 4.781 5.007 5.121 5.355 5.58 5.895 6.109 6.323 6.618 6.876 7.132 7.396 7.639 7.926 8.188 8.438 8.733 9.026 9.347 9.685 10.015 10.351 10.704 11.079 11.486 11.895 12.321 12.748 13.143 13.607 14.098 14.591 15.045 15.383 15.532 15.083 13.81 12.507 11.153 9.848 8.711 7.679 6.646 5.658 4.645 3.821 3.089 2.376 1.722 1.102 0.524 -0.082 -0.631 -1.095 -1.591 -2.134 -2.597 -3.044 -3.46 -3.818 -4.232 -4.648 -5.056 -5.5 -5.818 -6.14 -6.636 -6.993 -7.38 -7.58 -7.987 -8.412 -8.879 -9.122 -9.486 -9.905 -10.194 -10.486 -11.091 -11.437 -11.804 -12.203 -12.661 -13.208 -13.973 -16.536 -6 ,828 ,KEBNE ,16722547,Sun Nov 28 00:40:22 CET,Sun Nov 28 02:14:01 CET,0.0 1.17 1.574 1.882 2.154 2.409 2.631 2.827 3.195 3.358 3.517 3.701 3.946 4.068 4.292 4.518 4.733 4.836 5.039 5.231 5.489 5.661 5.849 6.117 6.366 6.6 6.823 7.042 7.321 7.604 7.903 8.243 8.532 8.806 9.111 9.458 9.812 10.2 10.59 10.942 11.313 11.711 12.106 12.534 13.005 13.465 13.912 14.308 14.678 14.888 14.512 13.233 11.758 10.319 8.984 7.782 6.735 5.722 4.781 3.797 2.949 2.178 1.435 0.757 0.126 -0.45 -1.05 -1.587 -2.081 -2.612 -3.146 -3.61 -4.108 -4.601 -4.99 -5.39 -5.779 -6.195 -6.632 -6.928 -7.238 -7.723 -8.06 -8.407 -8.583 -8.967 -9.375 -9.805 -10.042 -10.41 -10.82 -11.088 -11.362 -11.983 -12.349 -12.737 -13.155 -13.64 -14.227 -15.012 -17.117 -7 ,12785 ,KEBNE ,16722548,Sun Nov 28 00:40:22 CET,Sun Nov 28 02:13:59 CET,0.0 1.16 1.728 2.142 2.449 2.729 2.984 3.218 3.609 3.787 3.965 4.196 4.454 4.605 4.901 5.177 5.431 5.544 5.743 5.941 6.221 6.385 6.543 6.766 6.986 7.214 7.424 7.623 7.882 8.131 8.372 8.652 8.912 9.172 9.48 9.82 10.132 10.469 10.842 11.197 11.543 11.921 12.321 12.701 13.115 13.508 13.882 14.174 14.352 14.346 13.786 12.357 10.838 9.42 8.105 6.889 5.819 4.865 4.028 3.18 2.457 1.819 1.202 0.593 -0.011 -0.585 -1.147 -1.652 -2.099 -2.549 -3.048 -3.46 -3.877 -4.322 -4.677 -5.06 -5.451 -5.829 -6.226 -6.505 -6.779 -7.202 -7.509 -7.859 -8.039 -8.389 -8.765 -9.168 -9.367 -9.696 -10.035 -10.289 -10.579 -11.207 -11.555 -11.954 -12.425 -12.981 -13.612 -14.456 -17.529 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt deleted file mode 100644 index 07b83ee7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-28.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,332 ,KEBNE ,17026234,Wed Dec 22 13:56:52 CET,Wed Dec 22 15:33:07 CET,0.0 1.85 2.372 2.728 3.004 3.251 3.484 3.682 4.001 4.145 4.282 4.426 4.67 4.789 5.005 5.209 5.397 5.485 5.663 5.821 6.03 6.151 6.254 6.41 6.564 6.717 6.869 7.02 7.205 7.363 7.494 7.613 7.714 7.809 7.95 8.117 8.208 8.283 8.38 8.445 8.462 8.444 8.362 8.238 8.056 7.709 7.135 6.372 5.101 2.945 -0.945 -5.93 -9.967 -13.319 -16.142 -18.62 -20.751 -22.645 -24.252 -25.855 -27.276 -28.501 -29.63 -30.687 -31.65 -32.499 -33.378 -34.211 -34.911 -35.606 -36.331 -36.926 -37.549 -38.192 -38.676 -39.168 -39.68 -40.206 -40.743 -41.129 -41.551 -42.189 -42.603 -43.047 -43.276 -43.738 -44.245 -44.779 -45.049 -45.486 -45.913 -46.228 -46.557 -47.299 -47.713 -48.188 -48.712 -49.301 -50.047 -51.047 -54.702 -2 ,1383 ,KEBNE ,17026235,Wed Dec 22 13:56:52 CET,Wed Dec 22 15:34:32 CET,0.0 1.974 2.481 2.865 3.161 3.407 3.615 3.806 4.182 4.355 4.517 4.683 4.923 5.046 5.261 5.455 5.634 5.724 5.91 6.09 6.319 6.444 6.563 6.74 6.895 7.039 7.179 7.311 7.49 7.676 7.85 8.026 8.175 8.315 8.467 8.621 8.756 8.886 8.985 9.045 9.075 9.07 9.009 8.843 8.573 8.237 7.62 6.601 5.077 2.775 -0.999 -5.968 -10.235 -13.808 -16.743 -19.225 -21.41 -23.365 -24.955 -26.494 -27.823 -29.003 -30.118 -31.137 -32.062 -32.907 -33.786 -34.564 -35.228 -35.915 -36.627 -37.204 -37.779 -38.378 -38.846 -39.345 -39.869 -40.405 -40.953 -41.315 -41.71 -42.367 -42.826 -43.274 -43.502 -43.986 -44.496 -45.038 -45.337 -45.828 -46.308 -46.63 -46.972 -47.733 -48.152 -48.584 -49.046 -49.573 -50.205 -51.027 -53.338 -3 ,29872 ,KEBNE ,17026236,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:46 CET,0.0 1.702 2.225 2.644 2.944 3.186 3.387 3.576 3.927 4.092 4.233 4.375 4.596 4.701 4.903 5.094 5.276 5.363 5.525 5.679 5.912 6.049 6.171 6.333 6.491 6.653 6.778 6.888 7.034 7.177 7.319 7.487 7.622 7.716 7.819 7.936 8.06 8.194 8.303 8.399 8.473 8.485 8.431 8.289 8.007 7.597 6.953 5.985 4.432 1.971 -2.217 -7.142 -11.178 -14.678 -17.623 -20.123 -22.212 -24.082 -25.693 -27.278 -28.612 -29.754 -30.833 -31.87 -32.879 -33.835 -34.784 -35.585 -36.272 -36.978 -37.685 -38.274 -38.894 -39.503 -39.965 -40.448 -40.95 -41.475 -42.02 -42.414 -42.813 -43.434 -43.875 -44.304 -44.518 -44.978 -45.47 -45.986 -46.254 -46.698 -47.16 -47.493 -47.827 -48.536 -48.953 -49.405 -49.878 -50.408 -51.089 -52.11 -55.126 -4 ,7872 ,KEBNE ,17026237,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:33:38 CET,0.0 1.893 2.398 2.733 3.011 3.25 3.447 3.625 3.955 4.105 4.25 4.42 4.648 4.756 4.962 5.149 5.328 5.416 5.595 5.743 5.935 6.062 6.177 6.343 6.508 6.671 6.811 6.936 7.102 7.253 7.38 7.522 7.659 7.778 7.903 8.036 8.15 8.255 8.364 8.477 8.569 8.621 8.622 8.55 8.371 8.049 7.479 6.659 5.416 3.259 -0.684 -5.544 -9.561 -12.952 -15.817 -18.277 -20.433 -22.41 -24.07 -25.697 -27.046 -28.19 -29.294 -30.326 -31.258 -32.135 -33.048 -33.832 -34.517 -35.219 -35.92 -36.517 -37.137 -37.765 -38.257 -38.763 -39.281 -39.818 -40.374 -40.76 -41.157 -41.755 -42.166 -42.582 -42.793 -43.234 -43.72 -44.293 -44.595 -45.044 -45.488 -45.814 -46.168 -46.975 -47.406 -47.869 -48.411 -49.058 -49.86 -50.949 -54.397 -5 ,3127 ,KEBNE ,17026238,Wed Dec 22 13:56:52 CET,Wed Dec 22 15:32:33 CET,0.0 2.374 2.946 3.351 3.673 3.93 4.155 4.346 4.658 4.799 4.944 5.114 5.366 5.494 5.712 5.908 6.083 6.169 6.327 6.469 6.664 6.795 6.92 7.079 7.232 7.383 7.513 7.628 7.771 7.896 8.001 8.097 8.177 8.256 8.347 8.413 8.444 8.469 8.482 8.455 8.373 8.267 8.126 7.923 7.575 7.068 6.336 5.298 3.721 1.178 -2.999 -8.126 -12.515 -16.128 -19.106 -21.681 -23.929 -25.945 -27.642 -29.313 -30.73 -31.936 -33.055 -34.089 -35.03 -35.896 -36.794 -37.61 -38.31 -39.026 -39.76 -40.334 -40.93 -41.579 -42.07 -42.552 -43.062 -43.601 -44.164 -44.558 -44.964 -45.594 -46.044 -46.512 -46.751 -47.262 -47.792 -48.333 -48.609 -49.051 -49.482 -49.79 -50.114 -50.801 -51.19 -51.63 -52.103 -52.632 -53.307 -54.247 -57.986 -6 ,5592 ,KEBNE ,17026239,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:54 CET,0.0 2.77 3.299 3.655 3.963 4.236 4.442 4.633 4.987 5.138 5.28 5.419 5.649 5.749 5.944 6.131 6.306 6.389 6.543 6.678 6.868 6.996 7.111 7.256 7.407 7.556 7.681 7.792 7.924 8.05 8.183 8.328 8.437 8.534 8.656 8.789 8.891 8.982 9.061 9.105 9.102 9.058 8.972 8.806 8.498 8.038 7.343 6.343 4.811 2.401 -1.784 -6.806 -10.989 -14.47 -17.297 -19.842 -22.061 -23.965 -25.563 -27.139 -28.492 -29.675 -30.8 -31.859 -32.818 -33.695 -34.614 -35.429 -36.114 -36.804 -37.51 -38.096 -38.723 -39.384 -39.901 -40.411 -40.91 -41.415 -41.964 -42.356 -42.776 -43.412 -43.818 -44.252 -44.471 -44.905 -45.393 -45.948 -46.232 -46.668 -47.076 -47.376 -47.697 -48.46 -48.865 -49.276 -49.769 -50.366 -51.082 -52.048 -55.519 -7 ,6854 ,KEBNE ,17026240,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:33:17 CET,0.0 1.466 1.915 2.248 2.533 2.777 2.991 3.187 3.537 3.689 3.832 4.007 4.259 4.379 4.593 4.785 4.96 5.046 5.205 5.355 5.573 5.706 5.829 6.004 6.162 6.292 6.409 6.533 6.7 6.857 6.99 7.141 7.28 7.399 7.532 7.673 7.797 7.896 7.952 7.992 8.038 8.082 8.107 8.052 7.886 7.597 7.076 6.221 4.925 2.739 -1.302 -6.456 -10.592 -13.958 -16.812 -19.307 -21.469 -23.375 -24.972 -26.552 -27.894 -29.067 -30.189 -31.295 -32.305 -33.176 -34.062 -34.845 -35.544 -36.29 -37.064 -37.7 -38.367 -39.054 -39.575 -40.11 -40.668 -41.232 -41.785 -42.164 -42.564 -43.201 -43.646 -44.087 -44.298 -44.746 -45.258 -45.811 -46.11 -46.579 -47.033 -47.362 -47.724 -48.502 -48.912 -49.368 -49.87 -50.422 -51.102 -51.981 -54.683 -8 ,10136 ,KEBNE ,17026241,Wed Dec 22 13:56:52 CET,Wed Dec 22 15:34:34 CET,0.0 2.513 3.005 3.373 3.67 3.919 4.129 4.323 4.673 4.83 4.961 5.067 5.285 5.398 5.633 5.835 6.017 6.103 6.269 6.424 6.64 6.795 6.945 7.154 7.341 7.509 7.67 7.816 7.994 8.175 8.336 8.5 8.643 8.763 8.896 9.033 9.147 9.281 9.411 9.488 9.527 9.549 9.531 9.422 9.197 8.801 8.096 7.052 5.501 3.02 -1.314 -6.439 -10.585 -14.036 -16.979 -19.537 -21.722 -23.655 -25.283 -26.887 -28.237 -29.426 -30.558 -31.639 -32.645 -33.543 -34.438 -35.233 -35.936 -36.643 -37.382 -38.03 -38.704 -39.386 -39.895 -40.403 -40.926 -41.458 -42.015 -42.408 -42.812 -43.444 -43.885 -44.331 -44.566 -45.057 -45.551 -46.072 -46.35 -46.795 -47.223 -47.532 -47.859 -48.578 -48.98 -49.43 -49.899 -50.445 -51.2 -52.224 -55.231 -9 ,22485 ,KEBNE ,17026242,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:32:33 CET,0.0 2.041 2.57 2.95 3.221 3.462 3.67 3.848 4.183 4.338 4.475 4.624 4.855 4.971 5.203 5.403 5.58 5.663 5.821 5.975 6.177 6.303 6.432 6.61 6.779 6.942 7.09 7.219 7.368 7.516 7.659 7.817 7.964 8.1 8.247 8.402 8.533 8.651 8.751 8.841 8.909 8.945 8.924 8.815 8.582 8.185 7.537 6.564 5.008 2.504 -1.749 -6.818 -10.868 -14.318 -17.223 -19.714 -21.827 -23.711 -25.344 -26.935 -28.263 -29.485 -30.633 -31.678 -32.645 -33.531 -34.429 -35.19 -35.846 -36.546 -37.299 -37.927 -38.564 -39.216 -39.721 -40.24 -40.792 -41.355 -41.924 -42.327 -42.738 -43.382 -43.835 -44.297 -44.532 -45.02 -45.541 -46.099 -46.381 -46.817 -47.272 -47.595 -47.92 -48.646 -49.056 -49.497 -49.979 -50.52 -51.128 -51.928 -54.275 -10 ,9447 ,KEBNE ,17026243,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:32:33 CET,0.0 2.034 2.475 2.802 3.121 3.389 3.594 3.785 4.14 4.306 4.467 4.641 4.877 4.99 5.198 5.397 5.598 5.691 5.868 6.038 6.256 6.371 6.48 6.652 6.825 6.993 7.14 7.263 7.41 7.554 7.693 7.856 7.99 8.092 8.193 8.293 8.4 8.485 8.526 8.542 8.549 8.545 8.464 8.313 8.029 7.607 6.96 5.982 4.489 2.025 -2.239 -7.288 -11.424 -14.873 -17.733 -20.25 -22.408 -24.276 -25.851 -27.421 -28.798 -30.02 -31.142 -32.194 -33.192 -34.088 -34.993 -35.775 -36.432 -37.131 -37.877 -38.498 -39.15 -39.821 -40.332 -40.862 -41.404 -41.966 -42.544 -42.936 -43.341 -43.963 -44.407 -44.873 -45.109 -45.598 -46.102 -46.625 -46.9 -47.345 -47.76 -48.07 -48.409 -49.119 -49.51 -49.957 -50.449 -51.035 -51.797 -52.831 -56.246 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt deleted file mode 100644 index eb573d88..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_Example-9.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25962 ,KEBNE ,16722552,Sun Nov 28 00:40:22 CET,Sun Nov 28 02:14:48 CET,0.0 1.235 1.752 2.173 2.495 2.76 3.015 3.258 3.68 3.869 4.049 4.266 4.523 4.671 4.958 5.236 5.499 5.614 5.847 6.094 6.441 6.653 6.857 7.141 7.415 7.684 7.929 8.157 8.466 8.773 9.067 9.405 9.708 10.001 10.361 10.755 11.119 11.51 11.916 12.359 12.809 13.274 13.785 14.268 14.824 15.433 16.056 16.677 17.343 17.956 18.336 18.07 17.532 16.82 16.011 15.224 14.527 13.895 13.316 12.705 12.192 11.731 11.269 10.817 10.392 10.014 9.614 9.259 8.95 8.577 8.169 7.841 7.486 7.12 6.837 6.533 6.211 5.885 5.569 5.351 5.118 4.75 4.482 4.201 4.051 3.734 3.395 3.034 2.845 2.542 2.254 2.046 1.839 1.384 1.114 0.788 0.4 -0.029 -0.527 -1.214 -3.569 -2 ,28735 ,KEBNE ,16722553,Sun Nov 28 00:40:21 CET,Sun Nov 28 02:14:45 CET,0.0 2.539 3.054 3.425 3.738 4.005 4.222 4.417 4.777 4.941 5.093 5.257 5.513 5.66 5.923 6.161 6.389 6.5 6.721 6.947 7.264 7.448 7.629 7.896 8.141 8.369 8.585 8.787 9.03 9.273 9.524 9.801 10.057 10.339 10.674 11.019 11.391 11.795 12.155 12.533 12.967 13.416 13.908 14.416 14.955 15.542 16.168 16.759 17.358 17.932 18.202 17.858 17.207 16.487 15.797 15.077 14.393 13.818 13.312 12.719 12.206 11.764 11.298 10.826 10.369 9.954 9.538 9.158 8.827 8.486 8.101 7.761 7.426 7.048 6.749 6.463 6.154 5.815 5.469 5.238 4.988 4.592 4.326 4.053 3.901 3.57 3.247 2.903 2.722 2.417 2.097 1.88 1.66 1.162 0.881 0.567 0.216 -0.17 -0.651 -1.248 -2.728 -4 ,8155 ,KEBNE ,16722555,Sun Nov 28 00:41:23 CET,Sun Nov 28 02:16:50 CET,0.0 1.373 1.879 2.292 2.631 2.922 3.179 3.417 3.842 4.046 4.239 4.492 4.777 4.936 5.234 5.508 5.768 5.901 6.166 6.417 6.757 6.971 7.183 7.513 7.819 8.086 8.346 8.593 8.909 9.206 9.478 9.795 10.106 10.435 10.811 11.205 11.569 11.953 12.358 12.785 13.214 13.676 14.246 14.8 15.406 16.045 16.731 17.427 18.101 18.681 18.91 18.581 18.082 17.44 16.75 16.109 15.515 14.925 14.33 13.703 13.164 12.693 12.23 11.745 11.298 10.888 10.459 10.08 9.726 9.359 8.984 8.667 8.334 7.992 7.707 7.409 7.107 6.775 6.421 6.178 5.922 5.519 5.243 4.949 4.805 4.523 4.218 3.86 3.677 3.39 3.099 2.885 2.659 2.155 1.875 1.57 1.241 0.861 0.416 -0.107 -1.737 -5 ,19829 ,KEBNE ,16722556,Sun Nov 28 00:41:23 CET,Sun Nov 28 02:16:35 CET,0.0 2.68 3.309 3.719 4.042 4.337 4.606 4.817 5.176 5.361 5.539 5.734 5.982 6.124 6.402 6.657 6.903 7.017 7.215 7.411 7.723 7.933 8.131 8.396 8.64 8.86 9.075 9.303 9.619 9.924 10.192 10.485 10.77 11.053 11.373 11.731 12.076 12.455 12.849 13.269 13.71 14.191 14.72 15.226 15.804 16.397 17.042 17.702 18.369 18.991 19.29 18.995 18.401 17.718 16.986 16.315 15.716 15.082 14.504 13.911 13.379 12.87 12.391 11.981 11.568 11.14 10.645 10.199 9.848 9.495 9.113 8.789 8.453 8.084 7.79 7.486 7.178 6.851 6.508 6.279 6.037 5.645 5.368 5.074 4.916 4.578 4.215 3.857 3.684 3.399 3.114 2.89 2.652 2.135 1.86 1.558 1.219 0.831 0.356 -0.247 -1.873 -6 ,7553 ,KEBNE ,16722557,Sun Nov 28 00:41:23 CET,Sun Nov 28 02:16:06 CET,0.0 1.296 1.836 2.214 2.513 2.797 3.057 3.281 3.691 3.888 4.074 4.304 4.585 4.743 5.017 5.272 5.523 5.647 5.896 6.118 6.411 6.605 6.81 7.105 7.379 7.646 7.899 8.142 8.438 8.696 8.947 9.27 9.57 9.858 10.184 10.562 10.925 11.269 11.633 12.027 12.433 12.881 13.391 13.896 14.444 15.011 15.694 16.387 17.003 17.508 17.703 17.367 16.77 16.076 15.345 14.567 13.823 13.121 12.533 11.928 11.369 10.871 10.359 9.864 9.42 9.01 8.585 8.207 7.87 7.511 7.13 6.821 6.505 6.142 5.84 5.539 5.23 4.902 4.569 4.343 4.106 3.709 3.425 3.139 2.984 2.645 2.299 1.946 1.763 1.458 1.146 0.905 0.658 0.141 -0.141 -0.45 -0.793 -1.189 -1.65 -2.263 -4.783 -7 ,18823 ,KEBNE ,16722558,Sun Nov 28 00:41:27 CET,Sun Nov 28 02:11:33 CET,0.0 1.144 1.601 1.994 2.323 2.597 2.851 3.092 3.533 3.726 3.908 4.161 4.443 4.605 4.917 5.191 5.447 5.571 5.805 6.027 6.333 6.51 6.687 6.952 7.214 7.476 7.733 7.985 8.303 8.608 8.898 9.238 9.565 9.885 10.237 10.613 10.966 11.347 11.759 12.193 12.637 13.148 13.758 14.299 14.849 15.439 16.088 16.733 17.354 17.893 18.186 17.846 17.186 16.47 15.808 15.175 14.487 13.758 13.117 12.469 11.912 11.442 10.993 10.542 10.088 9.659 9.228 8.848 8.515 8.152 7.803 7.535 7.232 6.898 6.631 6.339 6.032 5.721 5.387 5.149 4.906 4.534 4.27 3.98 3.817 3.471 3.132 2.779 2.588 2.281 1.958 1.732 1.502 1.008 0.741 0.44 0.095 -0.298 -0.762 -1.367 -2.932 -8 ,14808 ,KEBNE ,16722559,Sun Nov 28 00:41:23 CET,Sun Nov 28 02:17:29 CET,0.0 1.219 1.683 2.035 2.341 2.615 2.849 3.094 3.543 3.738 3.923 4.144 4.421 4.573 4.853 5.142 5.416 5.543 5.794 6.024 6.333 6.533 6.724 7.001 7.278 7.549 7.802 8.05 8.361 8.642 8.915 9.25 9.581 9.89 10.215 10.579 10.943 11.352 11.787 12.205 12.625 13.12 13.686 14.219 14.788 15.368 16.021 16.731 17.433 18.115 18.484 18.113 17.5 16.863 16.161 15.432 14.792 14.181 13.588 12.969 12.443 11.955 11.447 10.927 10.46 10.06 9.639 9.26 8.927 8.579 8.207 7.882 7.547 7.192 6.903 6.596 6.281 5.959 5.614 5.373 5.128 4.764 4.519 4.26 4.124 3.836 3.523 3.179 2.998 2.711 2.455 2.236 2.01 1.553 1.298 1.018 0.706 0.338 -0.141 -0.792 -4.311 -9 ,6501 ,KEBNE ,16722560,Sun Nov 28 00:41:23 CET,Sun Nov 28 02:15:54 CET,0.0 1.381 1.96 2.35 2.641 2.918 3.169 3.39 3.794 3.978 4.157 4.395 4.669 4.828 5.15 5.438 5.698 5.831 6.101 6.343 6.669 6.887 7.112 7.447 7.79 8.094 8.356 8.612 8.915 9.212 9.496 9.818 10.136 10.457 10.828 11.226 11.588 11.975 12.356 12.734 13.173 13.66 14.166 14.652 15.208 15.817 16.447 17.093 17.757 18.308 18.585 18.271 17.631 16.92 16.273 15.634 14.978 14.371 13.836 13.25 12.727 12.248 11.775 11.315 10.891 10.505 10.076 9.701 9.394 9.063 8.702 8.406 8.094 7.747 7.492 7.222 6.923 6.609 6.252 6.01 5.781 5.423 5.162 4.884 4.742 4.45 4.146 3.816 3.637 3.345 3.062 2.856 2.639 2.197 1.949 1.664 1.343 0.993 0.614 0.119 -1.314 -10 ,19497 ,KEBNE ,16722561,Sun Nov 28 00:41:23 CET,Sun Nov 28 02:16:35 CET,0.0 1.391 1.811 2.129 2.392 2.626 2.864 3.08 3.455 3.63 3.792 3.985 4.235 4.371 4.639 4.903 5.153 5.262 5.466 5.666 5.954 6.145 6.334 6.601 6.839 7.05 7.25 7.444 7.696 7.938 8.167 8.464 8.765 9.05 9.387 9.755 10.1 10.458 10.805 11.152 11.553 12.004 12.493 12.979 13.532 14.15 14.789 15.418 16.06 16.625 16.94 16.658 16.016 15.269 14.538 13.828 13.145 12.499 11.921 11.308 10.759 10.276 9.824 9.365 8.919 8.498 8.05 7.66 7.33 6.985 6.62 6.309 5.971 5.617 5.337 5.051 4.754 4.423 4.055 3.804 3.551 3.153 2.888 2.612 2.462 2.152 1.812 1.452 1.258 0.953 0.651 0.432 0.201 -0.308 -0.581 -0.872 -1.198 -1.578 -2.014 -2.614 -4.156 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt deleted file mode 100644 index b008bd8a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32182 ,KEBNE ,16722562,Sun Nov 28 00:41:23 CET,Sun Nov 28 02:16:42 CET,0.0 2.114 2.629 2.976 3.26 3.493 3.686 3.853 4.142 4.268 4.387 4.492 4.706 4.8 4.975 5.137 5.28 5.34 5.464 5.576 5.731 5.823 5.893 5.987 6.079 6.174 6.268 6.352 6.449 6.546 6.634 6.75 6.878 6.975 7.074 7.172 7.252 7.335 7.399 7.434 7.45 7.423 7.322 7.162 6.873 6.39 5.631 4.559 3.023 0.631 -3.476 -8.249 -12.234 -15.482 -18.121 -20.524 -22.577 -24.35 -25.833 -27.3 -28.559 -29.667 -30.748 -31.747 -32.632 -33.427 -34.264 -35.046 -35.701 -36.351 -37.034 -37.587 -38.16 -38.775 -39.255 -39.754 -40.259 -40.767 -41.3 -41.669 -42.042 -42.647 -43.059 -43.474 -43.692 -44.144 -44.623 -45.121 -45.379 -45.795 -46.172 -46.464 -46.781 -47.454 -47.814 -48.208 -48.643 -49.143 -49.729 -50.448 -52.17 -3 ,16768 ,KEBNE ,16722564,Sun Nov 28 00:41:23 CET,Sun Nov 28 02:15:42 CET,0.0 1.138 1.45 1.686 1.906 2.119 2.299 2.462 2.767 2.906 3.029 3.141 3.355 3.456 3.644 3.81 3.977 4.056 4.189 4.314 4.496 4.612 4.724 4.878 5.013 5.136 5.256 5.37 5.513 5.633 5.739 5.869 5.976 6.069 6.17 6.257 6.316 6.368 6.404 6.413 6.395 6.342 6.195 5.954 5.584 5.041 4.23 3.102 1.503 -0.807 -4.717 -9.544 -13.432 -16.667 -19.397 -21.757 -23.807 -25.651 -27.186 -28.651 -29.91 -31.024 -32.053 -33.01 -33.888 -34.68 -35.481 -36.198 -36.847 -37.509 -38.176 -38.726 -39.303 -39.909 -40.368 -40.834 -41.31 -41.815 -42.367 -42.723 -43.07 -43.626 -44.013 -44.398 -44.6 -45.027 -45.473 -45.952 -46.213 -46.642 -47.035 -47.322 -47.622 -48.248 -48.601 -49.002 -49.435 -49.907 -50.469 -51.175 -53.062 -4 ,20424 ,KEBNE ,16722565,Sun Nov 28 00:41:23 CET,Sun Nov 28 02:16:58 CET,0.0 1.128 1.46 1.717 1.945 2.159 2.362 2.545 2.852 2.976 3.091 3.196 3.405 3.492 3.666 3.831 3.965 4.021 4.13 4.243 4.408 4.504 4.592 4.722 4.854 4.983 5.098 5.197 5.32 5.441 5.549 5.678 5.797 5.886 5.982 6.075 6.144 6.207 6.247 6.244 6.216 6.145 6.021 5.851 5.528 4.998 4.201 3.041 1.322 -1.209 -5.483 -10.501 -14.447 -17.708 -20.449 -22.849 -24.919 -26.723 -28.234 -29.775 -31.087 -32.241 -33.329 -34.331 -35.253 -36.081 -36.918 -37.674 -38.328 -39.013 -39.745 -40.344 -40.942 -41.553 -42.036 -42.533 -43.034 -43.553 -44.103 -44.478 -44.858 -45.46 -45.864 -46.268 -46.474 -46.906 -47.359 -47.815 -48.058 -48.47 -48.852 -49.145 -49.459 -50.157 -50.514 -50.879 -51.322 -51.857 -52.476 -53.258 -56.671 -6 ,13785 ,KEBNE ,16722567,Sun Nov 28 00:42:28 CET,Sun Nov 28 02:13:35 CET,0.0 2.913 3.408 3.755 4.04 4.284 4.484 4.65 4.93 5.049 5.162 5.274 5.486 5.58 5.751 5.9 6.037 6.105 6.239 6.363 6.527 6.624 6.707 6.815 6.925 7.03 7.121 7.208 7.304 7.381 7.459 7.544 7.619 7.692 7.77 7.833 7.889 7.953 7.993 8.035 8.097 8.115 8.014 7.83 7.535 7.082 6.431 5.484 4.031 1.703 -2.303 -7.138 -11.143 -14.461 -17.192 -19.58 -21.643 -23.478 -25.073 -26.652 -27.906 -28.971 -30.014 -31.011 -31.937 -32.775 -33.633 -34.39 -35.047 -35.741 -36.455 -37.034 -37.62 -38.21 -38.668 -39.139 -39.63 -40.144 -40.675 -41.034 -41.407 -41.986 -42.375 -42.794 -43.013 -43.456 -43.924 -44.419 -44.669 -45.08 -45.459 -45.737 -46.026 -46.657 -46.997 -47.345 -47.765 -48.221 -48.749 -49.44 -51.336 -7 ,14219 ,KEBNE ,16722568,Sun Nov 28 00:43:25 CET,Sun Nov 28 02:18:05 CET,0.0 2.596 3.121 3.474 3.724 3.928 4.118 4.293 4.607 4.748 4.874 4.983 5.194 5.293 5.49 5.652 5.783 5.844 5.959 6.075 6.25 6.363 6.467 6.623 6.771 6.923 7.084 7.221 7.364 7.474 7.57 7.691 7.809 7.927 8.033 8.132 8.22 8.254 8.259 8.247 8.199 8.106 7.926 7.673 7.346 6.931 6.317 5.43 4.081 1.889 -2.005 -6.707 -10.437 -13.581 -16.306 -18.685 -20.705 -22.582 -24.191 -25.707 -26.978 -28.067 -29.11 -30.087 -30.986 -31.838 -32.739 -33.535 -34.182 -34.826 -35.516 -36.099 -36.694 -37.326 -37.831 -38.322 -38.813 -39.32 -39.845 -40.214 -40.6 -41.203 -41.61 -42.023 -42.235 -42.669 -43.125 -43.606 -43.863 -44.29 -44.678 -44.961 -45.258 -45.908 -46.267 -46.661 -47.09 -47.566 -48.146 -48.915 -51.042 -8 ,29329 ,KEBNE ,16722569,Sun Nov 28 00:43:25 CET,Sun Nov 28 02:17:52 CET,0.0 1.303 1.692 2.0 2.234 2.412 2.568 2.707 2.953 3.077 3.201 3.291 3.488 3.57 3.732 3.884 4.021 4.082 4.192 4.301 4.462 4.559 4.645 4.772 4.893 4.996 5.086 5.172 5.279 5.381 5.469 5.569 5.651 5.708 5.752 5.766 5.777 5.808 5.828 5.805 5.746 5.644 5.468 5.226 4.842 4.324 3.554 2.414 0.743 -1.806 -6.028 -11.009 -14.949 -18.172 -20.876 -23.208 -25.194 -26.965 -28.465 -29.938 -31.213 -32.321 -33.366 -34.369 -35.299 -36.116 -36.94 -37.657 -38.292 -38.958 -39.639 -40.191 -40.727 -41.291 -41.735 -42.178 -42.648 -43.147 -43.646 -43.979 -44.311 -44.833 -45.217 -45.63 -45.839 -46.264 -46.704 -47.163 -47.399 -47.803 -48.177 -48.46 -48.76 -49.397 -49.752 -50.144 -50.55 -50.989 -51.52 -52.263 -54.112 -9 ,26122 ,KEBNE ,16722570,Sun Nov 28 00:43:25 CET,Sun Nov 28 02:18:26 CET,0.0 1.19 1.573 1.833 2.058 2.271 2.457 2.611 2.896 3.027 3.146 3.279 3.503 3.6 3.791 3.96 4.118 4.195 4.344 4.471 4.644 4.769 4.886 5.037 5.167 5.291 5.414 5.535 5.688 5.812 5.926 6.046 6.148 6.239 6.337 6.418 6.447 6.457 6.483 6.525 6.551 6.542 6.463 6.311 6.04 5.61 4.968 3.965 2.406 -0.063 -4.282 -9.274 -13.272 -16.561 -19.344 -21.747 -23.751 -25.513 -27.007 -28.494 -29.792 -30.946 -32.015 -33.006 -33.915 -34.747 -35.629 -36.415 -37.094 -37.797 -38.517 -39.108 -39.693 -40.261 -40.696 -41.165 -41.668 -42.168 -42.666 -43.012 -43.383 -43.965 -44.366 -44.812 -45.042 -45.473 -45.921 -46.426 -46.695 -47.125 -47.537 -47.836 -48.142 -48.801 -49.159 -49.548 -49.979 -50.461 -50.995 -51.683 -53.808 -10 ,14598 ,KEBNE ,16722571,Sun Nov 28 00:43:30 CET,Sun Nov 28 02:14:05 CET,0.0 1.172 1.505 1.759 1.978 2.162 2.321 2.468 2.736 2.868 3.002 3.141 3.358 3.463 3.671 3.853 4.008 4.077 4.218 4.361 4.546 4.651 4.749 4.892 5.024 5.143 5.256 5.353 5.462 5.564 5.649 5.737 5.809 5.875 5.963 6.065 6.163 6.248 6.293 6.297 6.264 6.182 6.061 5.893 5.564 5.101 4.474 3.511 2.019 -0.301 -4.241 -9.055 -13.052 -16.378 -19.144 -21.517 -23.568 -25.407 -26.971 -28.477 -29.704 -30.786 -31.831 -32.831 -33.72 -34.509 -35.352 -36.082 -36.692 -37.302 -37.926 -38.452 -38.993 -39.57 -40.03 -40.508 -40.996 -41.51 -42.053 -42.408 -42.754 -43.31 -43.686 -44.067 -44.274 -44.698 -45.174 -45.681 -45.924 -46.322 -46.685 -46.964 -47.255 -47.904 -48.277 -48.68 -49.124 -49.671 -50.338 -51.179 -54.145 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt deleted file mode 100644 index c6a47ded..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_Example-9_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22823 ,KEBNE ,16722572,Sun Nov 28 00:44:26 CET,Sun Nov 28 02:19:07 CET,0.0 2.544 3.087 3.477 3.8 4.083 4.344 4.588 5.003 5.177 5.326 5.513 5.779 5.935 6.217 6.456 6.669 6.779 7.004 7.207 7.502 7.691 7.862 8.084 8.291 8.5 8.696 8.89 9.145 9.384 9.635 9.949 10.275 10.609 10.985 11.375 11.666 11.964 12.3 12.669 13.045 13.419 13.828 14.201 14.572 14.967 15.316 15.604 15.821 15.781 15.162 13.886 12.548 11.248 10.11 9.066 8.113 7.209 6.422 5.656 4.989 4.382 3.792 3.225 2.711 2.253 1.775 1.353 0.977 0.581 0.171 -0.183 -0.596 -1.051 -1.399 -1.763 -2.153 -2.538 -2.914 -3.164 -3.411 -3.848 -4.166 -4.478 -4.64 -4.983 -5.361 -5.745 -5.929 -6.242 -6.563 -6.805 -7.05 -7.566 -7.854 -8.178 -8.547 -8.989 -9.511 -10.192 -12.126 -2 ,20749 ,KEBNE ,16722573,Sun Nov 28 00:44:30 CET,Sun Nov 28 02:15:27 CET,0.0 1.328 1.78 2.179 2.515 2.801 3.047 3.271 3.663 3.837 4.01 4.236 4.505 4.652 4.91 5.167 5.414 5.526 5.741 5.94 6.227 6.416 6.601 6.863 7.117 7.366 7.59 7.807 8.112 8.397 8.648 8.939 9.223 9.514 9.847 10.195 10.496 10.83 11.201 11.574 11.962 12.365 12.765 13.135 13.541 14.0 14.482 14.856 15.11 15.101 14.477 13.247 11.93 10.735 9.558 8.439 7.462 6.543 5.776 4.967 4.278 3.708 3.119 2.502 1.914 1.413 0.9 0.4 -0.067 -0.569 -1.055 -1.414 -1.789 -2.193 -2.509 -2.833 -3.162 -3.514 -3.886 -4.146 -4.428 -4.84 -5.112 -5.433 -5.609 -5.963 -6.323 -6.692 -6.888 -7.211 -7.526 -7.764 -8.015 -8.588 -8.906 -9.245 -9.619 -10.07 -10.574 -11.21 -13.261 -5 ,19654 ,KEBNE ,16722576,Sun Nov 28 00:47:30 CET,Sun Nov 28 02:21:08 CET,0.0 2.734 3.327 3.746 4.074 4.335 4.563 4.775 5.148 5.309 5.473 5.689 5.952 6.097 6.363 6.616 6.841 6.953 7.186 7.403 7.693 7.856 8.012 8.263 8.506 8.737 8.958 9.162 9.433 9.705 9.962 10.241 10.486 10.736 11.032 11.333 11.65 12.047 12.411 12.722 13.021 13.333 13.683 14.03 14.382 14.76 15.136 15.412 15.584 15.492 14.829 13.559 12.236 11.032 9.964 8.971 8.062 7.187 6.407 5.604 4.891 4.265 3.685 3.143 2.6 2.092 1.533 0.99 0.555 0.135 -0.308 -0.666 -1.039 -1.437 -1.736 -2.051 -2.372 -2.704 -3.056 -3.294 -3.548 -3.962 -4.255 -4.547 -4.696 -5.02 -5.369 -5.725 -5.907 -6.226 -6.517 -6.74 -6.991 -7.559 -7.868 -8.193 -8.558 -8.996 -9.502 -10.137 -12.227 -6 ,4222 ,KEBNE ,16722577,Sun Nov 28 00:49:33 CET,Sun Nov 28 02:24:10 CET,0.0 1.157 1.549 1.854 2.106 2.318 2.518 2.702 3.045 3.215 3.377 3.571 3.822 3.948 4.204 4.462 4.698 4.803 4.999 5.182 5.437 5.599 5.764 6.007 6.22 6.424 6.621 6.809 7.073 7.319 7.54 7.79 8.027 8.262 8.534 8.823 9.098 9.425 9.773 10.106 10.42 10.759 11.121 11.441 11.784 12.104 12.4 12.623 12.735 12.74 12.261 11.083 9.813 8.674 7.628 6.625 5.736 4.852 4.009 3.19 2.525 1.915 1.311 0.746 0.196 -0.317 -0.844 -1.323 -1.737 -2.182 -2.647 -3.022 -3.426 -3.845 -4.162 -4.478 -4.79 -5.112 -5.453 -5.706 -5.982 -6.407 -6.707 -7.015 -7.176 -7.518 -7.866 -8.247 -8.445 -8.776 -9.091 -9.326 -9.575 -10.095 -10.381 -10.714 -11.094 -11.51 -12.027 -12.701 -14.686 -7 ,19759 ,KEBNE ,16722578,Sun Nov 28 00:49:33 CET,Sun Nov 28 02:22:47 CET,0.0 2.031 2.581 3.008 3.341 3.595 3.828 4.053 4.454 4.637 4.806 4.989 5.25 5.397 5.66 5.903 6.143 6.275 6.542 6.797 7.165 7.381 7.576 7.85 8.092 8.304 8.518 8.739 9.048 9.377 9.675 9.99 10.277 10.54 10.794 11.035 11.311 11.633 11.936 12.226 12.542 12.935 13.342 13.713 14.11 14.463 14.813 15.148 15.401 15.333 14.565 13.219 11.938 10.747 9.622 8.565 7.607 6.726 5.979 5.198 4.498 3.882 3.274 2.675 2.097 1.567 1.027 0.539 0.133 -0.285 -0.737 -1.121 -1.519 -1.933 -2.268 -2.6 -2.934 -3.29 -3.653 -3.909 -4.189 -4.623 -4.926 -5.244 -5.404 -5.732 -6.085 -6.474 -6.687 -7.025 -7.341 -7.581 -7.834 -8.39 -8.704 -9.05 -9.427 -9.886 -10.457 -11.184 -13.161 -8 ,32087 ,KEBNE ,16722579,Sun Nov 28 00:49:33 CET,Sun Nov 28 02:22:59 CET,0.0 1.223 1.562 1.827 2.079 2.3 2.498 2.674 2.978 3.123 3.267 3.423 3.661 3.781 4.012 4.26 4.52 4.64 4.875 5.107 5.419 5.607 5.79 6.06 6.31 6.567 6.812 7.019 7.266 7.505 7.751 8.046 8.32 8.569 8.853 9.177 9.474 9.771 10.095 10.437 10.754 11.09 11.429 11.718 12.062 12.429 12.785 13.099 13.298 13.269 12.659 11.363 10.038 8.762 7.616 6.567 5.636 4.759 3.97 3.211 2.596 2.01 1.434 0.871 0.331 -0.158 -0.688 -1.174 -1.614 -2.078 -2.544 -2.944 -3.372 -3.797 -4.12 -4.459 -4.812 -5.173 -5.56 -5.824 -6.096 -6.524 -6.821 -7.154 -7.331 -7.682 -8.041 -8.411 -8.606 -8.927 -9.213 -9.435 -9.67 -10.195 -10.492 -10.812 -11.167 -11.56 -12.036 -12.656 -14.345 -9 ,26820 ,KEBNE ,16722580,Sun Nov 28 00:50:36 CET,Sun Nov 28 02:24:50 CET,0.0 1.727 2.231 2.602 2.945 3.228 3.457 3.666 4.068 4.26 4.439 4.652 4.902 5.03 5.297 5.555 5.78 5.889 6.096 6.308 6.656 6.87 7.051 7.305 7.551 7.764 7.98 8.2 8.483 8.753 8.994 9.298 9.583 9.847 10.153 10.467 10.767 11.076 11.381 11.714 12.04 12.396 12.784 13.149 13.581 14.04 14.46 14.764 14.978 14.992 14.297 12.988 11.741 10.492 9.341 8.274 7.295 6.429 5.623 4.814 4.154 3.566 2.999 2.441 1.908 1.415 0.902 0.437 0.011 -0.451 -0.934 -1.326 -1.713 -2.123 -2.448 -2.782 -3.117 -3.45 -3.812 -4.08 -4.38 -4.833 -5.123 -5.423 -5.587 -5.955 -6.335 -6.722 -6.927 -7.272 -7.606 -7.837 -8.079 -8.609 -8.878 -9.173 -9.545 -10.001 -10.514 -11.145 -13.114 -10 ,6045 ,KEBNE ,16722581,Sun Nov 28 00:50:36 CET,Sun Nov 28 02:24:18 CET,0.0 2.649 3.385 3.798 4.131 4.394 4.618 4.835 5.241 5.422 5.587 5.781 6.03 6.172 6.444 6.686 6.915 7.025 7.243 7.442 7.726 7.91 8.082 8.359 8.638 8.878 9.106 9.354 9.664 9.921 10.161 10.444 10.741 11.021 11.295 11.587 11.868 12.191 12.513 12.83 13.164 13.578 14.019 14.364 14.739 15.09 15.432 15.769 15.995 15.942 15.374 14.15 12.85 11.713 10.651 9.577 8.637 7.804 7.066 6.322 5.668 5.066 4.464 3.88 3.327 2.82 2.264 1.745 1.331 0.917 0.464 0.088 -0.282 -0.665 -0.973 -1.29 -1.612 -1.947 -2.314 -2.58 -2.863 -3.306 -3.615 -3.934 -4.1 -4.446 -4.813 -5.205 -5.403 -5.734 -6.066 -6.301 -6.551 -7.127 -7.445 -7.774 -8.137 -8.559 -9.094 -9.791 -11.854 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt deleted file mode 100644 index 18824d79..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_10.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14562 ,KEBNE ,16722582,Sun Nov 28 00:50:36 CET,Sun Nov 28 02:24:19 CET,0.0 0.374 0.621 0.861 1.083 1.292 1.485 1.678 2.06 2.24 2.417 2.589 2.92 3.082 3.394 3.71 4.027 4.178 4.474 4.777 5.231 5.518 5.807 6.25 6.686 7.102 7.501 7.899 8.41 8.898 9.391 9.997 10.58 11.155 11.839 12.612 13.362 14.204 15.142 16.151 17.228 18.453 19.884 21.363 23.161 25.197 27.565 30.272 33.517 37.475 42.483 46.958 49.736 51.565 52.875 53.862 54.546 55.063 55.412 55.692 55.897 55.988 56.043 56.087 56.109 56.113 56.086 56.046 55.991 55.934 55.865 55.795 55.703 55.58 55.476 55.353 55.221 55.082 54.944 54.848 54.728 54.537 54.399 54.227 54.133 53.943 53.737 53.526 53.419 53.206 53.031 52.871 52.705 52.353 52.159 51.924 51.657 51.358 51.015 50.575 49.135 -2 ,13488 ,KEBNE ,16722583,Sun Nov 28 00:50:36 CET,Sun Nov 28 02:24:09 CET,0.0 0.845 1.253 1.59 1.886 2.174 2.438 2.681 3.134 3.346 3.555 3.784 4.13 4.314 4.665 4.999 5.334 5.494 5.804 6.109 6.562 6.855 7.143 7.561 7.962 8.357 8.744 9.115 9.61 10.11 10.603 11.215 11.804 12.371 13.015 13.72 14.396 15.179 16.067 17.01 17.996 19.146 20.521 21.909 23.535 25.341 27.52 30.088 33.186 37.053 42.084 46.551 49.381 51.323 52.678 53.705 54.452 54.994 55.381 55.704 55.914 56.077 56.21 56.304 56.365 56.39 56.384 56.378 56.365 56.337 56.303 56.256 56.203 56.148 56.095 56.028 55.94 55.842 55.753 55.687 55.609 55.476 55.372 55.258 55.196 55.058 54.904 54.73 54.646 54.467 54.37 54.253 54.132 53.868 53.702 53.513 53.289 53.013 52.66 52.148 49.844 -3 ,2997 ,KEBNE ,16722584,Sun Nov 28 00:50:36 CET,Sun Nov 28 02:25:14 CET,0.0 0.769 1.158 1.503 1.827 2.129 2.398 2.661 3.164 3.383 3.591 3.829 4.176 4.35 4.693 5.023 5.35 5.511 5.835 6.157 6.623 6.929 7.23 7.674 8.103 8.52 8.93 9.32 9.821 10.318 10.798 11.37 11.927 12.483 13.13 13.873 14.605 15.403 16.283 17.208 18.173 19.321 20.698 22.111 23.801 25.758 28.013 30.581 33.8 37.751 42.745 47.254 50.158 52.11 53.456 54.41 55.107 55.65 56.055 56.408 56.628 56.773 56.898 56.995 57.052 57.086 57.089 57.04 56.988 56.957 56.916 56.866 56.802 56.723 56.663 56.588 56.5 56.424 56.334 56.256 56.18 56.048 55.95 55.851 55.799 55.696 55.576 55.421 55.329 55.129 55.012 54.902 54.785 54.507 54.351 54.177 53.955 53.696 53.365 52.88 50.792 -4 ,32470 ,KEBNE ,16722585,Sun Nov 28 00:50:36 CET,Sun Nov 28 02:24:15 CET,0.0 0.409 0.663 0.914 1.145 1.348 1.554 1.754 2.143 2.327 2.503 2.694 3.026 3.188 3.504 3.823 4.132 4.287 4.595 4.888 5.321 5.593 5.854 6.247 6.632 7.017 7.398 7.762 8.242 8.731 9.212 9.785 10.331 10.876 11.53 12.293 13.074 13.923 14.822 15.791 16.831 18.039 19.456 20.902 22.651 24.606 26.847 29.514 32.791 36.791 41.877 46.456 49.362 51.364 52.755 53.742 54.425 54.941 55.312 55.572 55.723 55.829 55.915 55.966 55.98 55.975 55.962 55.923 55.843 55.749 55.642 55.545 55.451 55.336 55.243 55.137 54.995 54.823 54.636 54.513 54.396 54.206 54.062 53.911 53.832 53.65 53.452 53.233 53.122 52.919 52.779 52.641 52.496 52.206 52.035 51.858 51.682 51.462 51.183 50.792 49.328 -5 ,18765 ,KEBNE ,16722586,Sun Nov 28 00:51:35 CET,Sun Nov 28 02:26:17 CET,0.0 0.667 0.977 1.255 1.512 1.732 1.94 2.144 2.514 2.697 2.878 3.061 3.395 3.56 3.887 4.204 4.513 4.667 4.971 5.256 5.666 5.943 6.212 6.604 6.993 7.385 7.768 8.146 8.659 9.162 9.641 10.223 10.82 11.423 12.13 12.926 13.684 14.527 15.442 16.394 17.431 18.646 20.064 21.513 23.21 25.147 27.505 30.234 33.471 37.377 42.4 46.909 49.704 51.603 52.933 53.902 54.616 55.136 55.496 55.782 55.991 56.148 56.257 56.318 56.331 56.322 56.301 56.288 56.257 56.194 56.127 56.053 55.965 55.874 55.801 55.726 55.642 55.536 55.417 55.333 55.239 55.093 54.997 54.891 54.827 54.682 54.533 54.374 54.29 54.09 53.974 53.866 53.743 53.452 53.291 53.107 52.891 52.643 52.363 51.996 50.533 -6 ,2546 ,KEBNE ,16722587,Sun Nov 28 00:51:35 CET,Sun Nov 28 02:26:38 CET,0.0 0.709 1.105 1.442 1.754 2.036 2.288 2.538 2.987 3.198 3.407 3.625 3.974 4.167 4.531 4.865 5.193 5.361 5.702 6.032 6.502 6.811 7.116 7.548 7.954 8.357 8.763 9.151 9.653 10.151 10.632 11.234 11.826 12.4 13.055 13.788 14.53 15.355 16.224 17.142 18.128 19.28 20.673 22.125 23.837 25.743 28.016 30.668 33.826 37.672 42.606 47.003 49.74 51.562 52.797 53.691 54.395 54.937 55.329 55.654 55.874 56.019 56.121 56.222 56.3 56.34 56.361 56.358 56.335 56.296 56.219 56.141 56.076 56.008 55.938 55.869 55.794 55.687 55.587 55.527 55.446 55.304 55.206 55.089 55.021 54.88 54.736 54.575 54.48 54.287 54.183 54.074 53.957 53.67 53.492 53.291 53.05 52.764 52.384 51.822 49.18 -7 ,30070 ,KEBNE ,16722588,Sun Nov 28 00:51:35 CET,Sun Nov 28 02:26:30 CET,0.0 0.807 1.266 1.637 1.935 2.192 2.449 2.701 3.163 3.375 3.572 3.79 4.14 4.315 4.655 4.987 5.314 5.475 5.788 6.093 6.541 6.838 7.133 7.562 7.991 8.398 8.784 9.16 9.633 10.111 10.586 11.156 11.73 12.298 12.956 13.713 14.442 15.231 16.079 17.016 18.046 19.215 20.583 21.947 23.576 25.473 27.708 30.284 33.419 37.382 42.465 46.924 49.769 51.733 53.1 54.09 54.803 55.317 55.708 56.067 56.329 56.508 56.616 56.686 56.743 56.773 56.749 56.722 56.68 56.604 56.522 56.425 56.314 56.21 56.133 56.047 55.955 55.859 55.738 55.648 55.556 55.407 55.299 55.174 55.101 54.949 54.783 54.595 54.492 54.287 54.171 54.056 53.936 53.644 53.463 53.258 53.047 52.803 52.504 52.131 50.671 -8 ,20822 ,KEBNE ,16722589,Sun Nov 28 00:51:35 CET,Sun Nov 28 02:26:25 CET,0.0 0.721 1.153 1.507 1.814 2.097 2.357 2.597 3.05 3.262 3.454 3.649 3.991 4.172 4.549 4.923 5.272 5.441 5.765 6.089 6.562 6.86 7.154 7.597 8.021 8.423 8.816 9.21 9.727 10.227 10.714 11.32 11.903 12.468 13.135 13.897 14.627 15.42 16.314 17.278 18.298 19.468 20.838 22.244 23.965 25.871 28.045 30.654 33.855 37.693 42.581 47.005 49.831 51.743 53.061 54.055 54.778 55.298 55.676 55.974 56.167 56.324 56.464 56.581 56.634 56.626 56.602 56.561 56.515 56.443 56.349 56.254 56.14 56.026 55.932 55.827 55.72 55.607 55.475 55.376 55.274 55.116 55.005 54.879 54.809 54.644 54.456 54.258 54.153 53.946 53.808 53.681 53.536 53.236 53.082 52.896 52.694 52.476 52.187 51.822 50.474 -9 ,29744 ,KEBNE ,16722590,Sun Nov 28 00:51:36 CET,Sun Nov 28 02:27:17 CET,0.0 0.794 1.204 1.531 1.87 2.171 2.426 2.673 3.152 3.38 3.59 3.833 4.196 4.395 4.773 5.117 5.443 5.605 5.92 6.219 6.659 6.951 7.237 7.66 8.072 8.479 8.883 9.261 9.752 10.231 10.702 11.284 11.854 12.428 13.104 13.855 14.568 15.356 16.208 17.14 18.144 19.283 20.684 22.109 23.713 25.597 27.918 30.563 33.68 37.548 42.57 47.026 49.87 51.758 53.09 54.104 54.854 55.419 55.803 56.09 56.291 56.426 56.53 56.617 56.658 56.666 56.648 56.624 56.612 56.586 56.548 56.505 56.45 56.383 56.319 56.246 56.135 56.006 55.881 55.799 55.713 55.553 55.445 55.31 55.229 55.065 54.896 54.698 54.593 54.398 54.307 54.202 54.084 53.795 53.624 53.434 53.212 52.941 52.58 52.013 47.52 -10 ,27912 ,KEBNE ,16722591,Sun Nov 28 00:51:35 CET,Sun Nov 28 02:26:39 CET,0.0 0.501 0.822 1.05 1.259 1.474 1.691 1.895 2.274 2.457 2.634 2.807 3.128 3.285 3.617 3.941 4.248 4.394 4.67 4.948 5.379 5.667 5.95 6.358 6.767 7.189 7.606 8.009 8.53 9.038 9.534 10.14 10.73 11.308 11.97 12.714 13.448 14.269 15.154 16.114 17.196 18.417 19.816 21.223 22.907 24.884 27.218 29.866 33.075 37.039 42.093 46.627 49.467 51.36 52.664 53.587 54.223 54.677 54.974 55.201 55.368 55.477 55.534 55.561 55.587 55.587 55.539 55.488 55.458 55.409 55.335 55.271 55.196 55.112 55.04 54.948 54.842 54.734 54.612 54.518 54.413 54.249 54.124 53.997 53.934 53.8 53.656 53.497 53.409 53.211 53.088 52.959 52.824 52.53 52.357 52.176 51.965 51.7 51.4 51.027 49.803 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt deleted file mode 100644 index 1b62c3fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7074 ,KEBNE ,17026244,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:34 CET,0.0 1.083 1.297 1.426 1.492 1.484 1.438 1.365 1.175 1.08 0.978 0.565 0.593 0.463 0.172 -0.148 -0.465 -0.628 -0.972 -1.334 -1.894 -2.27 -2.645 -3.232 -3.849 -4.476 -5.114 -5.761 -6.635 -7.527 -8.43 -9.571 -10.727 -11.904 -13.333 -15.017 -16.717 -18.659 -20.881 -23.394 -26.195 -29.573 -33.801 -38.328 -43.974 -50.766 -59.284 -69.905 -83.843 -102.683 -129.848 -157.659 -177.747 -193.129 -205.219 -215.194 -223.343 -230.277 -235.955 -241.34 -245.753 -249.551 -253.021 -256.133 -258.909 -261.351 -263.82 -265.971 -267.771 -269.571 -271.393 -272.88 -274.359 -275.844 -276.987 -278.143 -279.301 -280.474 -281.67 -282.47 -283.271 -284.483 -285.315 -286.163 -286.589 -287.43 -288.284 -289.157 -289.6 -290.507 -290.977 -291.448 -291.943 -292.973 -293.502 -294.07 -294.66 -295.293 -296.011 -296.9 -299.254 -2 ,26296 ,KEBNE ,17026245,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:17 CET,0.0 2.524 2.82 2.949 2.983 2.96 2.896 2.806 2.596 2.487 2.365 1.925 1.941 1.786 1.458 1.111 0.749 0.566 0.208 -0.168 -0.752 -1.139 -1.541 -2.163 -2.808 -3.452 -4.095 -4.745 -5.617 -6.517 -7.433 -8.6 -9.789 -10.985 -12.437 -14.164 -15.893 -17.859 -20.11 -22.663 -25.51 -28.919 -33.128 -37.659 -43.349 -50.168 -58.758 -69.413 -83.275 -102.03 -129.227 -157.118 -177.158 -192.605 -204.759 -214.699 -222.823 -229.718 -235.332 -240.674 -245.075 -248.847 -252.303 -255.46 -258.289 -260.768 -263.272 -265.443 -267.281 -269.143 -271.008 -272.499 -274.013 -275.548 -276.717 -277.896 -279.078 -280.281 -281.488 -282.299 -283.123 -284.36 -285.202 -286.069 -286.5 -287.365 -288.252 -289.163 -289.626 -290.548 -291.055 -291.54 -292.035 -293.064 -293.614 -294.185 -294.76 -295.322 -295.906 -296.626 -299.02 -3 ,20836 ,KEBNE ,17026246,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:33 CET,0.0 0.897 1.142 1.273 1.312 1.324 1.33 1.301 1.155 1.062 0.955 0.55 0.574 0.434 0.162 -0.118 -0.443 -0.612 -0.957 -1.324 -1.882 -2.259 -2.658 -3.269 -3.875 -4.5 -5.133 -5.772 -6.651 -7.535 -8.424 -9.564 -10.717 -11.874 -13.293 -14.972 -16.661 -18.61 -20.839 -23.386 -26.206 -29.536 -33.703 -38.224 -43.897 -50.707 -59.211 -69.747 -83.635 -102.483 -129.641 -157.573 -177.7 -192.983 -205.049 -215.082 -223.265 -230.188 -235.85 -241.232 -245.634 -249.371 -252.797 -255.908 -258.7 -261.202 -263.743 -265.913 -267.744 -269.606 -271.474 -272.962 -274.47 -276.005 -277.163 -278.334 -279.519 -280.711 -281.917 -282.739 -283.565 -284.813 -285.669 -286.551 -286.989 -287.85 -288.734 -289.666 -290.141 -291.071 -291.595 -292.088 -292.589 -293.612 -294.145 -294.7 -295.281 -295.914 -296.595 -297.401 -299.119 -4 ,31947 ,KEBNE ,17026247,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:07 CET,0.0 0.742 0.889 0.95 0.97 0.954 0.922 0.862 0.671 0.557 0.431 0.007 0.02 -0.146 -0.486 -0.833 -1.197 -1.375 -1.741 -2.113 -2.661 -3.043 -3.439 -4.037 -4.648 -5.274 -5.915 -6.566 -7.438 -8.32 -9.209 -10.344 -11.505 -12.676 -14.098 -15.755 -17.434 -19.382 -21.604 -24.114 -26.931 -30.274 -34.413 -38.929 -44.572 -51.355 -59.915 -70.543 -84.51 -103.393 -130.568 -158.337 -178.403 -193.763 -205.884 -215.94 -224.095 -231.028 -236.691 -242.056 -246.477 -250.253 -253.727 -256.903 -259.736 -262.237 -264.777 -266.948 -268.762 -270.599 -272.467 -273.969 -275.468 -276.993 -278.142 -279.299 -280.482 -281.682 -282.91 -283.731 -284.552 -285.827 -286.686 -287.549 -287.987 -288.862 -289.758 -290.681 -291.142 -292.062 -292.582 -293.077 -293.596 -294.679 -295.224 -295.766 -296.346 -296.982 -297.705 -298.593 -300.504 -5 ,25626 ,KEBNE ,17026248,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:11 CET,0.0 1.45 1.817 1.996 2.081 2.098 2.095 2.061 1.92 1.827 1.708 1.286 1.314 1.186 0.914 0.595 0.244 0.062 -0.286 -0.594 -1.033 -1.372 -1.757 -2.361 -2.978 -3.603 -4.237 -4.882 -5.76 -6.64 -7.528 -8.658 -9.796 -10.948 -12.391 -14.103 -15.802 -17.781 -20.028 -22.555 -25.398 -28.793 -32.975 -37.434 -43.047 -49.861 -58.443 -69.112 -83.025 -101.789 -128.998 -156.929 -177.047 -192.442 -204.483 -214.411 -222.536 -229.451 -235.139 -240.562 -244.996 -248.777 -252.222 -255.351 -258.2 -260.709 -263.231 -265.424 -267.276 -269.152 -271.061 -272.6 -274.143 -275.691 -276.86 -278.035 -279.221 -280.422 -281.628 -282.435 -283.241 -284.466 -285.304 -286.152 -286.577 -287.427 -288.278 -289.169 -289.623 -290.519 -290.992 -291.472 -291.964 -292.983 -293.499 -294.029 -294.579 -295.167 -295.8 -296.493 -298.263 -6 ,27527 ,KEBNE ,17026249,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:33 CET,0.0 1.12 1.32 1.391 1.374 1.346 1.291 1.204 1.015 0.913 0.797 0.36 0.37 0.222 -0.092 -0.431 -0.775 -0.952 -1.322 -1.693 -2.229 -2.602 -2.99 -3.586 -4.206 -4.852 -5.501 -6.146 -7.022 -7.914 -8.824 -9.982 -11.146 -12.317 -13.753 -15.469 -17.196 -19.192 -21.469 -24.025 -26.859 -30.254 -34.49 -39.037 -44.7 -51.506 -60.025 -70.573 -84.409 -103.151 -130.276 -157.969 -178.065 -193.496 -205.56 -215.527 -223.666 -230.557 -236.205 -241.61 -246.028 -249.798 -253.284 -256.433 -259.234 -261.712 -264.247 -266.454 -268.32 -270.196 -272.079 -273.597 -275.113 -276.617 -277.76 -278.924 -280.097 -281.274 -282.46 -283.268 -284.086 -285.334 -286.163 -286.984 -287.403 -288.254 -289.098 -289.964 -290.413 -291.32 -291.785 -292.26 -292.741 -293.713 -294.221 -294.747 -295.292 -295.87 -296.517 -297.271 -298.907 -7 ,8244 ,KEBNE ,17026250,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:28 CET,0.0 1.101 1.283 1.35 1.353 1.315 1.254 1.17 0.988 0.883 0.763 0.328 0.34 0.195 -0.106 -0.41 -0.728 -0.899 -1.214 -1.491 -1.977 -2.357 -2.755 -3.36 -3.977 -4.61 -5.259 -5.912 -6.803 -7.716 -8.627 -9.767 -10.919 -12.08 -13.472 -15.125 -16.821 -18.787 -21.018 -23.546 -26.34 -29.654 -33.826 -38.312 -43.925 -50.688 -59.179 -69.766 -83.666 -102.45 -129.571 -157.246 -177.249 -192.606 -204.668 -214.643 -222.769 -229.651 -235.312 -240.743 -245.175 -248.939 -252.408 -255.539 -258.348 -260.86 -263.381 -265.557 -267.391 -269.228 -271.097 -272.615 -274.14 -275.666 -276.83 -278.016 -279.214 -280.425 -281.639 -282.456 -283.287 -284.56 -285.417 -286.281 -286.72 -287.599 -288.485 -289.381 -289.835 -290.746 -291.219 -291.693 -292.181 -293.18 -293.689 -294.204 -294.74 -295.303 -295.925 -296.612 -298.282 -8 ,17878 ,KEBNE ,17026251,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:33:33 CET,0.0 2.059 2.322 2.43 2.472 2.442 2.364 2.282 2.077 1.95 1.823 1.389 1.396 1.235 0.902 0.551 0.191 0.012 -0.362 -0.746 -1.324 -1.722 -2.14 -2.785 -3.421 -4.065 -4.725 -5.402 -6.314 -7.228 -8.138 -9.276 -10.439 -11.618 -13.048 -14.755 -16.473 -18.442 -20.703 -23.239 -26.053 -29.425 -33.614 -38.107 -43.722 -50.53 -59.073 -69.648 -83.478 -102.237 -129.45 -157.223 -177.136 -192.364 -204.316 -214.181 -222.25 -229.115 -234.774 -240.195 -244.643 -248.442 -251.915 -255.052 -257.856 -260.322 -262.829 -265.01 -266.854 -268.72 -270.602 -272.113 -273.622 -275.173 -276.345 -277.515 -278.702 -279.895 -281.11 -281.932 -282.751 -283.989 -284.836 -285.691 -286.114 -286.974 -287.875 -288.798 -289.26 -290.189 -290.739 -291.248 -291.752 -292.792 -293.333 -293.901 -294.502 -295.15 -295.857 -296.65 -298.281 -9 ,30258 ,KEBNE ,17026252,Wed Dec 22 13:56:51 CET,Wed Dec 22 15:31:42 CET,0.0 0.924 1.106 1.176 1.173 1.158 1.118 1.05 0.904 0.809 0.69 0.256 0.269 0.114 -0.225 -0.571 -0.915 -1.093 -1.453 -1.825 -2.421 -2.826 -3.231 -3.86 -4.495 -5.119 -5.76 -6.416 -7.287 -8.167 -9.041 -10.156 -11.317 -12.487 -13.906 -15.573 -17.256 -19.222 -21.461 -23.978 -26.787 -30.143 -34.339 -38.851 -44.482 -51.226 -59.647 -70.194 -84.143 -102.925 -130.01 -157.774 -177.788 -193.162 -205.27 -215.28 -223.436 -230.311 -235.935 -241.286 -245.684 -249.416 -252.815 -255.915 -258.69 -261.149 -263.639 -265.773 -267.57 -269.397 -271.249 -272.748 -274.279 -275.83 -276.982 -278.14 -279.321 -280.515 -281.725 -282.542 -283.371 -284.649 -285.512 -286.383 -286.819 -287.696 -288.599 -289.53 -289.998 -290.906 -291.371 -291.841 -292.31 -293.278 -293.794 -294.324 -294.852 -295.414 -296.03 -296.706 -298.552 -10 ,21254 ,KEBNE ,17026253,Wed Dec 22 13:57:52 CET,Wed Dec 22 15:34:19 CET,0.0 1.075 1.228 1.267 1.266 1.223 1.147 1.067 0.868 0.743 0.604 0.155 0.164 0.013 -0.287 -0.607 -0.941 -1.112 -1.468 -1.84 -2.416 -2.807 -3.199 -3.805 -4.43 -5.062 -5.709 -6.375 -7.279 -8.191 -9.098 -10.239 -11.397 -12.578 -14.022 -15.719 -17.443 -19.444 -21.708 -24.224 -27.03 -30.413 -34.63 -39.15 -44.759 -51.544 -60.08 -70.648 -84.492 -103.239 -130.38 -158.105 -178.103 -193.437 -205.54 -215.516 -223.633 -230.538 -236.144 -241.427 -245.762 -249.468 -252.881 -256.008 -258.797 -261.274 -263.784 -265.948 -267.768 -269.611 -271.482 -272.974 -274.48 -276.003 -277.146 -278.302 -279.46 -280.629 -281.812 -282.604 -283.405 -284.625 -285.443 -286.271 -286.692 -287.546 -288.413 -289.29 -289.738 -290.646 -291.119 -291.598 -292.094 -293.099 -293.614 -294.147 -294.694 -295.273 -295.914 -296.628 -298.101 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt deleted file mode 100644 index 8a607325..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31462 ,KEBNE ,17070504,Fri Dec 24 17:50:12 CET,Fri Dec 24 19:24:55 CET,0.0 1.511 2.041 2.461 2.823 3.147 3.447 3.729 4.269 4.507 4.722 4.982 5.353 5.555 5.933 6.295 6.643 6.807 7.128 7.432 7.865 8.154 8.435 8.833 9.237 9.648 10.043 10.424 10.915 11.391 11.868 12.452 13.014 13.543 14.135 14.814 15.495 16.244 17.033 17.851 18.732 19.731 20.885 22.052 23.428 25.001 26.825 28.929 31.473 34.579 38.427 41.557 43.424 44.601 45.284 45.64 45.849 46.02 46.08 46.047 45.972 45.863 45.716 45.547 45.402 45.261 45.081 44.912 44.748 44.551 44.317 44.089 43.852 43.621 43.433 43.236 43.031 42.806 42.58 42.433 42.278 42.03 41.837 41.625 41.519 41.295 41.047 40.791 40.652 40.368 40.148 39.958 39.759 39.329 39.084 38.83 38.545 38.223 37.844 37.338 35.46 -2 ,26278 ,KEBNE ,17070505,Fri Dec 24 17:51:15 CET,Fri Dec 24 19:25:39 CET,0.0 1.615 2.204 2.648 3.007 3.312 3.601 3.878 4.376 4.609 4.848 5.163 5.549 5.763 6.171 6.562 6.932 7.11 7.443 7.773 8.258 8.559 8.843 9.255 9.656 10.067 10.475 10.849 11.336 11.822 12.286 12.842 13.385 13.914 14.536 15.243 15.903 16.614 17.381 18.202 19.101 20.16 21.393 22.616 24.017 25.566 27.48 29.753 32.371 35.472 39.375 42.604 44.487 45.698 46.476 46.956 47.166 47.244 47.231 47.151 47.041 46.879 46.697 46.535 46.391 46.26 46.117 45.967 45.793 45.589 45.374 45.168 44.933 44.695 44.505 44.295 44.077 43.847 43.589 43.41 43.226 42.93 42.71 42.478 42.371 42.142 41.887 41.608 41.465 41.19 40.945 40.754 40.555 40.105 39.857 39.575 39.249 38.883 38.441 37.834 36.168 -3 ,4453 ,KEBNE ,17070506,Fri Dec 24 17:52:19 CET,Fri Dec 24 19:25:37 CET,0.0 1.732 2.291 2.726 3.106 3.445 3.761 4.044 4.557 4.796 5.031 5.321 5.683 5.882 6.253 6.594 6.936 7.109 7.438 7.757 8.241 8.535 8.815 9.238 9.632 10.021 10.408 10.773 11.258 11.734 12.181 12.744 13.297 13.827 14.457 15.158 15.836 16.607 17.412 18.245 19.147 20.17 21.337 22.503 23.868 25.4 27.218 29.33 31.878 34.948 38.819 42.106 43.998 45.139 45.845 46.316 46.591 46.74 46.797 46.783 46.731 46.634 46.492 46.34 46.188 46.036 45.837 45.627 45.464 45.274 45.044 44.871 44.687 44.481 44.298 44.078 43.847 43.616 43.382 43.215 43.038 42.771 42.587 42.395 42.287 42.063 41.814 41.522 41.356 41.06 40.861 40.687 40.48 39.995 39.733 39.441 39.114 38.746 38.257 37.513 34.869 -4 ,3745 ,KEBNE ,17070507,Fri Dec 24 17:55:30 CET,Fri Dec 24 19:28:38 CET,0.0 1.336 1.874 2.248 2.587 2.906 3.196 3.483 4.013 4.244 4.451 4.707 5.081 5.291 5.685 6.065 6.422 6.59 6.938 7.274 7.768 8.077 8.361 8.8 9.239 9.651 10.033 10.392 10.872 11.366 11.842 12.421 12.982 13.517 14.124 14.802 15.457 16.167 16.953 17.842 18.791 19.866 21.118 22.402 23.97 25.723 27.703 29.904 32.563 35.763 39.707 43.071 44.992 46.16 46.893 47.322 47.555 47.656 47.651 47.636 47.629 47.578 47.501 47.415 47.298 47.175 47.033 46.881 46.724 46.54 46.331 46.134 45.917 45.681 45.501 45.315 45.109 44.886 44.656 44.503 44.345 44.084 43.895 43.696 43.588 43.36 43.12 42.877 42.753 42.485 42.307 42.133 41.947 41.56 41.335 41.081 40.794 40.473 40.107 39.563 37.731 -5 ,10185 ,KEBNE ,17070508,Fri Dec 24 17:58:41 CET,Fri Dec 24 19:33:54 CET,0.0 1.329 1.831 2.257 2.635 2.968 3.278 3.569 4.071 4.293 4.506 4.77 5.128 5.322 5.702 6.051 6.387 6.557 6.894 7.229 7.695 7.989 8.283 8.715 9.126 9.521 9.926 10.334 10.857 11.356 11.825 12.399 12.95 13.46 14.099 14.852 15.542 16.3 17.123 17.979 18.916 19.954 21.078 22.23 23.616 25.264 27.161 29.229 31.823 34.955 38.793 41.962 43.75 44.859 45.612 46.057 46.278 46.4 46.415 46.35 46.296 46.257 46.185 46.076 45.95 45.82 45.664 45.5 45.341 45.165 44.962 44.779 44.568 44.325 44.129 43.909 43.654 43.384 43.103 42.915 42.731 42.425 42.213 41.997 41.876 41.613 41.335 41.024 40.86 40.577 40.357 40.153 39.927 39.482 39.224 38.919 38.595 38.206 37.713 37.062 35.259 -6 ,3270 ,KEBNE ,17070509,Fri Dec 24 18:46:00 CET,Fri Dec 24 20:19:47 CET,0.0 2.436 3.102 3.595 3.984 4.336 4.65 4.929 5.462 5.702 5.924 6.182 6.545 6.739 7.084 7.399 7.726 7.896 8.225 8.553 9.013 9.3 9.589 10.018 10.45 10.872 11.264 11.646 12.155 12.645 13.115 13.701 14.27 14.803 15.422 16.112 16.776 17.546 18.37 19.2 20.078 21.086 22.24 23.419 24.893 26.536 28.384 30.533 33.112 36.189 39.989 43.175 45.012 46.153 46.888 47.354 47.624 47.733 47.723 47.665 47.617 47.545 47.424 47.268 47.104 46.941 46.759 46.612 46.487 46.34 46.155 45.98 45.787 45.585 45.416 45.222 45.042 44.871 44.661 44.513 44.356 44.085 43.896 43.692 43.581 43.339 43.074 42.781 42.637 42.368 42.155 41.979 41.784 41.325 41.07 40.801 40.489 40.12 39.663 38.982 33.422 -7 ,22086 ,KEBNE ,17070510,Fri Dec 24 18:59:49 CET,Fri Dec 24 20:28:53 CET,0.0 1.666 2.208 2.625 2.974 3.307 3.616 3.903 4.442 4.686 4.93 5.223 5.59 5.798 6.202 6.586 6.938 7.108 7.443 7.757 8.211 8.512 8.803 9.239 9.646 10.039 10.437 10.82 11.324 11.817 12.297 12.868 13.405 13.939 14.564 15.26 15.958 16.762 17.616 18.495 19.422 20.472 21.692 22.947 24.445 26.087 27.96 30.147 32.824 36.077 40.016 43.2 45.045 46.251 47.003 47.493 47.774 47.933 48.03 48.042 47.992 47.934 47.847 47.732 47.631 47.5 47.292 47.081 46.904 46.722 46.516 46.333 46.148 45.949 45.768 45.544 45.306 45.074 44.836 44.676 44.513 44.216 44.01 43.818 43.715 43.488 43.246 42.984 42.849 42.592 42.414 42.246 42.069 41.64 41.399 41.142 40.834 40.489 40.089 39.541 37.495 -8 ,4439 ,KEBNE ,17070511,Fri Dec 24 19:00:50 CET,Fri Dec 24 20:30:47 CET,0.0 1.612 2.182 2.577 2.889 3.171 3.441 3.692 4.146 4.355 4.549 4.762 5.111 5.304 5.686 6.047 6.38 6.534 6.841 7.153 7.591 7.871 8.137 8.51 8.864 9.212 9.561 9.898 10.328 10.747 11.154 11.627 12.104 12.571 13.116 13.777 14.431 15.135 15.894 16.743 17.652 18.675 19.888 21.11 22.549 24.205 26.129 28.274 30.833 33.894 37.694 40.85 42.667 43.807 44.539 45.041 45.344 45.504 45.544 45.466 45.371 45.289 45.191 45.074 44.918 44.758 44.596 44.433 44.263 44.075 43.879 43.688 43.468 43.24 43.069 42.87 42.636 42.409 42.198 42.059 41.914 41.651 41.456 41.253 41.141 40.902 40.673 40.433 40.299 40.033 39.833 39.656 39.484 39.079 38.842 38.589 38.313 37.981 37.587 37.088 35.451 -9 ,15911 ,KEBNE ,17070512,Fri Dec 24 19:00:52 CET,Fri Dec 24 20:32:25 CET,0.0 1.727 2.382 2.839 3.22 3.597 3.93 4.214 4.712 4.949 5.181 5.45 5.811 6.008 6.402 6.779 7.138 7.318 7.669 7.997 8.468 8.786 9.095 9.518 9.925 10.312 10.69 11.061 11.522 11.972 12.433 13.009 13.549 14.054 14.644 15.314 15.941 16.651 17.453 18.282 19.176 20.233 21.426 22.572 23.96 25.585 27.466 29.609 32.154 35.307 39.222 42.561 44.543 45.748 46.506 46.974 47.275 47.402 47.389 47.38 47.341 47.245 47.113 46.982 46.874 46.771 46.635 46.48 46.332 46.164 45.958 45.774 45.584 45.389 45.224 45.05 44.864 44.661 44.455 44.316 44.167 43.909 43.706 43.486 43.373 43.136 42.892 42.614 42.464 42.184 41.942 41.751 41.548 41.087 40.847 40.581 40.245 39.84 39.323 38.56 35.963 -10 ,8059 ,KEBNE ,17070513,Fri Dec 24 19:03:56 CET,Fri Dec 24 20:36:59 CET,0.0 2.777 3.367 3.787 4.126 4.427 4.701 4.958 5.441 5.65 5.841 6.062 6.409 6.594 6.937 7.259 7.585 7.747 8.072 8.379 8.821 9.097 9.37 9.781 10.173 10.543 10.899 11.25 11.686 12.109 12.525 13.037 13.528 13.995 14.554 15.215 15.876 16.595 17.393 18.251 19.134 20.156 21.369 22.626 24.128 25.752 27.689 29.975 32.543 35.565 39.458 42.785 44.715 45.837 46.527 47.034 47.328 47.428 47.429 47.375 47.303 47.198 47.08 46.953 46.798 46.62 46.406 46.197 45.991 45.768 45.567 45.387 45.15 44.912 44.707 44.492 44.29 44.063 43.815 43.64 43.46 43.164 42.951 42.727 42.608 42.347 42.062 41.766 41.616 41.325 41.069 40.871 40.672 40.222 39.966 39.689 39.382 39.016 38.593 38.078 35.979 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt deleted file mode 100644 index 073a11c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24540 ,KEBNE ,16722592,Sun Nov 28 00:51:35 CET,Sun Nov 28 02:27:11 CET,0.0 2.253 3.029 3.639 4.118 4.559 5.007 5.413 6.112 6.435 6.744 7.171 7.624 7.921 8.474 8.994 9.492 9.738 10.223 10.687 11.366 11.82 12.258 12.898 13.527 14.128 14.725 15.312 16.08 16.837 17.567 18.465 19.351 20.221 21.238 22.383 23.49 24.706 26.033 27.482 29.054 30.872 33.047 35.311 38.09 41.293 45.106 49.668 55.292 62.317 71.673 80.113 85.325 88.998 91.749 93.682 94.977 95.986 96.772 97.43 97.892 98.26 98.571 98.787 98.953 99.089 99.204 99.263 99.266 99.259 99.245 99.223 99.201 99.149 99.076 98.992 98.906 98.812 98.693 98.587 98.475 98.287 98.111 97.908 97.802 97.575 97.338 97.068 96.906 96.678 96.401 96.225 96.026 95.577 95.321 95.018 94.665 94.242 93.695 92.915 90.688 -2 ,20046 ,KEBNE ,16722593,Sun Nov 28 00:51:35 CET,Sun Nov 28 02:27:01 CET,0.0 2.06 2.786 3.346 3.832 4.274 4.674 5.056 5.749 6.061 6.368 6.798 7.244 7.522 8.064 8.574 9.067 9.308 9.786 10.26 10.951 11.406 11.848 12.493 13.133 13.758 14.368 14.971 15.75 16.5 17.23 18.143 19.051 19.926 20.949 22.116 23.236 24.501 25.902 27.423 29.06 30.97 33.252 35.574 38.368 41.61 45.534 50.159 55.887 63.037 72.226 80.677 86.264 90.154 92.816 94.808 96.406 97.628 98.543 99.33 99.851 100.245 100.586 100.859 101.061 101.2 101.302 101.354 101.345 101.296 101.247 101.219 101.19 101.135 101.068 100.981 100.876 100.766 100.639 100.536 100.424 100.207 100.033 99.856 99.765 99.567 99.337 99.072 98.934 98.729 98.432 98.229 98.015 97.499 97.213 96.922 96.582 96.189 95.689 94.9 92.077 -3 ,18937 ,KEBNE ,16722594,Sun Nov 28 00:51:35 CET,Sun Nov 28 02:27:01 CET,0.0 1.912 2.676 3.263 3.75 4.205 4.617 4.994 5.711 6.052 6.372 6.803 7.229 7.503 8.072 8.623 9.138 9.386 9.876 10.355 11.057 11.512 11.939 12.569 13.181 13.784 14.387 14.975 15.758 16.525 17.268 18.169 19.035 19.899 20.938 22.119 23.266 24.529 25.894 27.404 29.049 30.925 33.173 35.523 38.359 41.606 45.472 50.074 55.792 62.889 72.317 80.918 86.365 90.096 92.798 94.885 96.463 97.636 98.5 99.288 99.863 100.303 100.662 100.951 101.21 101.422 101.587 101.708 101.799 101.862 101.9 101.902 101.864 101.796 101.741 101.67 101.569 101.44 101.293 101.185 101.055 100.853 100.724 100.574 100.482 100.287 100.086 99.861 99.731 99.524 99.248 99.074 98.877 98.411 98.154 97.84 97.463 97.005 96.407 95.602 92.9 -4 ,7721 ,KEBNE ,16722595,Sun Nov 28 00:52:37 CET,Sun Nov 28 02:27:46 CET,0.0 2.454 3.234 3.825 4.296 4.713 5.1 5.463 6.156 6.501 6.846 7.349 7.811 8.098 8.663 9.199 9.716 9.967 10.456 10.934 11.632 12.082 12.509 13.129 13.746 14.356 14.959 15.552 16.315 17.055 17.777 18.656 19.516 20.383 21.422 22.58 23.703 24.956 26.361 27.882 29.475 31.318 33.584 35.964 38.762 42.003 45.889 50.474 56.116 63.175 72.593 81.04 86.313 89.891 92.381 94.262 95.732 96.919 97.734 98.393 98.89 99.247 99.537 99.793 100.007 100.134 100.245 100.34 100.395 100.426 100.41 100.363 100.305 100.236 100.151 100.048 99.954 99.84 99.694 99.592 99.47 99.241 99.084 98.938 98.844 98.617 98.387 98.135 98.0 97.796 97.525 97.346 97.134 96.66 96.397 96.121 95.787 95.353 94.813 94.047 91.127 -5 ,28028 ,KEBNE ,16722596,Sun Nov 28 00:52:37 CET,Sun Nov 28 02:27:57 CET,0.0 2.55 3.398 4.013 4.549 5.008 5.423 5.825 6.55 6.869 7.187 7.647 8.079 8.349 8.873 9.37 9.84 10.062 10.501 10.942 11.6 12.027 12.438 13.058 13.679 14.277 14.864 15.445 16.206 16.944 17.666 18.567 19.435 20.275 21.255 22.361 23.455 24.688 26.053 27.557 29.18 31.036 33.255 35.529 38.281 41.512 45.344 49.814 55.388 62.515 71.952 80.635 86.26 90.17 92.907 94.936 96.486 97.698 98.594 99.383 99.922 100.293 100.65 100.925 101.082 101.204 101.308 101.393 101.442 101.486 101.57 101.609 101.617 101.625 101.613 101.565 101.488 101.396 101.274 101.16 101.032 100.843 100.699 100.532 100.444 100.257 100.046 99.816 99.695 99.499 99.226 99.046 98.847 98.397 98.127 97.805 97.434 97.001 96.429 95.605 92.217 -6 ,27500 ,KEBNE ,16722597,Sun Nov 28 00:52:37 CET,Sun Nov 28 02:28:10 CET,0.0 2.095 2.895 3.498 4.004 4.474 4.908 5.283 5.991 6.327 6.649 7.091 7.538 7.826 8.373 8.902 9.413 9.658 10.148 10.635 11.343 11.785 12.212 12.841 13.473 14.105 14.724 15.321 16.09 16.849 17.59 18.495 19.388 20.268 21.279 22.417 23.535 24.799 26.198 27.71 29.342 31.236 33.485 35.777 38.483 41.628 45.427 49.94 55.575 62.741 72.005 80.401 85.95 89.773 92.43 94.419 96.005 97.349 98.265 98.953 99.487 99.908 100.245 100.529 100.731 100.889 101.036 101.136 101.189 101.206 101.208 101.204 101.19 101.147 101.11 101.078 101.024 100.929 100.812 100.735 100.655 100.508 100.385 100.246 100.174 100.017 99.816 99.573 99.454 99.28 99.039 98.863 98.691 98.328 98.105 97.843 97.528 97.121 96.547 95.679 92.164 -7 ,30559 ,KEBNE ,16722598,Sun Nov 28 00:53:38 CET,Sun Nov 28 02:27:18 CET,0.0 2.206 2.95 3.502 3.993 4.442 4.844 5.221 5.912 6.233 6.538 6.961 7.404 7.68 8.228 8.768 9.28 9.521 9.993 10.464 11.163 11.618 12.054 12.69 13.304 13.905 14.523 15.128 15.881 16.617 17.351 18.252 19.122 19.971 20.979 22.135 23.266 24.507 25.844 27.324 28.927 30.749 32.945 35.268 38.049 41.293 45.213 49.723 55.302 62.429 71.93 80.706 86.242 89.975 92.705 94.846 96.401 97.532 98.381 99.114 99.661 100.099 100.457 100.761 100.984 101.134 101.245 101.313 101.355 101.35 101.322 101.292 101.231 101.126 101.016 100.906 100.814 100.712 100.583 100.488 100.368 100.14 99.968 99.787 99.691 99.483 99.268 99.03 98.89 98.688 98.44 98.269 98.083 97.658 97.422 97.14 96.796 96.376 95.856 95.149 92.976 -8 ,31912 ,KEBNE ,16722599,Sun Nov 28 00:53:38 CET,Sun Nov 28 02:27:24 CET,0.0 2.117 2.863 3.466 3.978 4.429 4.838 5.222 5.896 6.222 6.553 6.995 7.437 7.718 8.267 8.786 9.302 9.559 10.035 10.498 11.168 11.608 12.039 12.686 13.325 13.931 14.517 15.087 15.836 16.558 17.271 18.176 19.058 19.928 20.934 22.056 23.161 24.388 25.747 27.236 28.855 30.721 32.953 35.256 38.042 41.268 45.08 49.595 55.238 62.473 71.953 80.399 85.756 89.53 92.276 94.28 95.747 96.888 97.716 98.477 99.086 99.473 99.716 99.913 100.068 100.183 100.276 100.314 100.306 100.264 100.208 100.158 100.095 100.005 99.914 99.801 99.683 99.571 99.422 99.298 99.175 98.97 98.806 98.627 98.54 98.354 98.137 97.865 97.707 97.502 97.264 97.08 96.879 96.453 96.2 95.91 95.551 95.102 94.563 93.837 91.531 -9 ,17410 ,KEBNE ,16722600,Sun Nov 28 00:54:40 CET,Sun Nov 28 02:28:36 CET,0.0 3.324 4.255 4.881 5.395 5.884 6.347 6.779 7.547 7.875 8.187 8.651 9.117 9.4 9.916 10.404 10.893 11.134 11.59 12.036 12.678 13.092 13.51 14.121 14.719 15.315 15.891 16.433 17.134 17.853 18.577 19.448 20.281 21.095 22.063 23.155 24.233 25.487 26.885 28.391 30.033 31.921 34.153 36.464 39.234 42.471 46.35 50.917 56.555 63.646 73.113 81.713 87.213 91.137 94.061 96.248 97.786 98.931 99.789 100.569 101.127 101.489 101.776 102.02 102.271 102.522 102.749 102.93 103.059 103.166 103.255 103.271 103.231 103.169 103.109 103.03 102.943 102.839 102.693 102.588 102.472 102.273 102.119 101.949 101.867 101.683 101.482 101.25 101.115 100.924 100.66 100.479 100.293 99.826 99.561 99.262 98.909 98.483 97.922 97.131 94.13 -10 ,17830 ,KEBNE ,16722601,Sun Nov 28 00:53:39 CET,Sun Nov 28 02:27:18 CET,0.0 1.914 2.677 3.225 3.68 4.108 4.509 4.876 5.566 5.912 6.246 6.701 7.128 7.4 7.957 8.473 8.972 9.217 9.687 10.169 10.892 11.328 11.757 12.414 13.033 13.631 14.228 14.809 15.557 16.282 16.997 17.899 18.774 19.61 20.606 21.736 22.832 24.058 25.445 26.979 28.615 30.521 32.781 35.123 37.968 41.198 45.042 49.622 55.243 62.278 71.579 80.144 85.679 89.51 92.265 94.313 95.804 96.983 97.9 98.692 99.307 99.802 100.22 100.566 100.83 101.066 101.308 101.449 101.544 101.649 101.732 101.786 101.832 101.85 101.851 101.855 101.838 101.797 101.741 101.694 101.601 101.379 101.223 101.075 100.989 100.769 100.528 100.27 100.139 99.949 99.694 99.526 99.336 98.872 98.606 98.303 97.939 97.511 96.994 96.264 93.251 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt deleted file mode 100644 index 3d22b26f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25703 ,KEBNE ,16722602,Sun Nov 28 00:53:38 CET,Sun Nov 28 02:29:47 CET,0.0 1.622 2.026 2.337 2.609 2.86 3.107 3.331 3.709 3.892 4.077 4.261 4.583 4.747 5.052 5.336 5.595 5.722 5.98 6.22 6.553 6.773 6.981 7.293 7.606 7.902 8.184 8.457 8.813 9.148 9.468 9.85 10.223 10.587 10.996 11.466 11.927 12.398 12.905 13.442 14.009 14.643 15.357 16.058 16.83 17.655 18.544 19.507 20.61 21.719 22.819 23.417 23.393 23.128 22.785 22.392 21.959 21.528 21.127 20.687 20.295 19.929 19.566 19.204 18.85 18.529 18.206 17.894 17.589 17.282 16.977 16.709 16.427 16.128 15.87 15.587 15.308 15.027 14.739 14.552 14.36 14.044 13.814 13.558 13.43 13.181 12.902 12.584 12.416 12.095 11.916 11.751 11.561 11.115 10.877 10.613 10.32 9.987 9.581 9.027 7.39 -2 ,27201 ,KEBNE ,16722603,Sun Nov 28 00:53:38 CET,Sun Nov 28 02:29:40 CET,0.0 1.541 1.968 2.306 2.583 2.838 3.067 3.277 3.662 3.847 4.021 4.176 4.487 4.623 4.881 5.138 5.379 5.496 5.731 5.947 6.252 6.447 6.632 6.911 7.193 7.458 7.717 7.988 8.35 8.689 9.011 9.395 9.766 10.118 10.514 10.962 11.375 11.832 12.331 12.859 13.421 14.055 14.768 15.469 16.263 17.112 18.037 19.011 20.107 21.321 22.506 23.047 23.033 22.798 22.453 22.037 21.589 21.131 20.736 20.298 19.883 19.5 19.113 18.718 18.328 17.968 17.6 17.275 17.001 16.713 16.386 16.122 15.849 15.553 15.323 15.077 14.801 14.534 14.271 14.082 13.895 13.587 13.354 13.1 12.977 12.73 12.453 12.151 11.998 11.699 11.534 11.351 11.157 10.754 10.535 10.285 9.994 9.658 9.259 8.777 6.958 -3 ,17941 ,KEBNE ,16722604,Sun Nov 28 00:53:38 CET,Sun Nov 28 02:28:15 CET,0.0 0.604 0.943 1.201 1.44 1.667 1.875 2.075 2.461 2.639 2.806 2.951 3.264 3.408 3.678 3.946 4.201 4.323 4.566 4.809 5.164 5.385 5.606 5.914 6.199 6.479 6.749 7.003 7.332 7.68 8.021 8.446 8.871 9.273 9.717 10.198 10.674 11.192 11.731 12.29 12.892 13.559 14.302 15.012 15.828 16.742 17.752 18.85 20.026 21.205 22.385 23.027 23.027 22.749 22.389 21.946 21.457 21.008 20.615 20.176 19.773 19.394 19.013 18.632 18.294 17.981 17.613 17.277 16.997 16.706 16.382 16.106 15.814 15.482 15.229 14.986 14.724 14.445 14.155 13.946 13.725 13.389 13.16 12.928 12.808 12.549 12.276 11.97 11.805 11.483 11.283 11.1 10.907 10.459 10.219 9.969 9.672 9.331 8.957 8.491 6.862 -4 ,10028 ,KEBNE ,16722605,Sun Nov 28 00:53:38 CET,Sun Nov 28 02:28:19 CET,0.0 1.402 1.801 2.127 2.428 2.706 2.969 3.209 3.65 3.858 4.043 4.206 4.523 4.681 4.993 5.295 5.578 5.716 5.982 6.227 6.57 6.78 6.998 7.327 7.629 7.914 8.184 8.451 8.81 9.151 9.456 9.831 10.21 10.574 10.988 11.449 11.888 12.369 12.865 13.379 13.921 14.516 15.239 15.953 16.723 17.583 18.517 19.519 20.653 21.843 23.058 23.582 23.562 23.399 23.101 22.696 22.251 21.834 21.464 21.037 20.609 20.21 19.838 19.461 19.1 18.767 18.388 18.054 17.779 17.481 17.145 16.869 16.591 16.272 16.023 15.775 15.518 15.252 14.96 14.756 14.539 14.194 13.957 13.707 13.576 13.306 13.018 12.717 12.557 12.238 12.005 11.807 11.603 11.159 10.907 10.612 10.294 9.967 9.533 8.971 7.461 -5 ,2304 ,KEBNE ,16722606,Sun Nov 28 00:54:40 CET,Sun Nov 28 02:30:23 CET,0.0 0.786 1.101 1.388 1.685 1.956 2.191 2.402 2.775 2.951 3.118 3.259 3.566 3.71 3.994 4.273 4.531 4.659 4.915 5.153 5.508 5.755 5.995 6.33 6.654 6.964 7.251 7.528 7.88 8.216 8.546 8.933 9.305 9.67 10.117 10.643 11.128 11.64 12.179 12.75 13.346 13.992 14.736 15.468 16.317 17.256 18.252 19.325 20.527 21.795 23.063 23.701 23.807 23.694 23.459 23.138 22.793 22.43 22.078 21.695 21.315 20.926 20.538 20.166 19.812 19.492 19.123 18.758 18.444 18.131 17.814 17.556 17.279 16.98 16.744 16.501 16.262 16.007 15.737 15.557 15.351 15.015 14.795 14.562 14.436 14.184 13.918 13.616 13.464 13.159 12.96 12.775 12.581 12.148 11.908 11.648 11.363 11.04 10.623 10.092 8.178 -6 ,3055 ,KEBNE ,16722607,Sun Nov 28 00:54:40 CET,Sun Nov 28 02:30:20 CET,0.0 1.883 2.526 3.008 3.386 3.674 3.936 4.176 4.601 4.8 4.986 5.16 5.478 5.64 5.951 6.238 6.517 6.652 6.912 7.157 7.514 7.74 7.95 8.255 8.562 8.856 9.126 9.379 9.712 10.057 10.401 10.8 11.168 11.505 11.877 12.298 12.711 13.172 13.665 14.186 14.723 15.328 16.026 16.695 17.448 18.286 19.262 20.314 21.458 22.74 24.045 24.72 24.822 24.648 24.37 24.052 23.711 23.349 22.989 22.589 22.242 21.905 21.554 21.216 20.886 20.583 20.276 19.983 19.708 19.412 19.103 18.85 18.585 18.303 18.082 17.859 17.633 17.387 17.117 16.928 16.726 16.412 16.215 15.989 15.86 15.616 15.361 15.068 14.918 14.619 14.412 14.226 14.036 13.61 13.368 13.099 12.778 12.393 11.915 11.22 7.071 -7 ,29404 ,KEBNE ,16722608,Sun Nov 28 00:54:40 CET,Sun Nov 28 02:30:41 CET,0.0 0.76 1.1 1.381 1.636 1.874 2.105 2.306 2.673 2.865 3.063 3.269 3.596 3.765 4.088 4.379 4.654 4.782 5.019 5.241 5.562 5.781 5.995 6.298 6.59 6.887 7.188 7.481 7.851 8.211 8.555 8.951 9.331 9.706 10.163 10.678 11.155 11.663 12.223 12.817 13.42 14.091 14.831 15.542 16.396 17.34 18.382 19.534 20.797 22.193 23.619 24.423 24.55 24.417 24.17 23.841 23.472 23.05 22.633 22.173 21.744 21.359 20.98 20.601 20.254 19.926 19.549 19.172 18.845 18.538 18.22 17.938 17.634 17.325 17.077 16.815 16.553 16.27 15.96 15.74 15.506 15.149 14.914 14.657 14.518 14.239 13.934 13.599 13.416 13.085 12.845 12.629 12.393 11.865 11.572 11.267 10.931 10.551 10.088 9.434 7.572 -8 ,12009 ,KEBNE ,16722609,Sun Nov 28 00:54:40 CET,Sun Nov 28 02:29:06 CET,0.0 1.529 1.942 2.256 2.544 2.81 3.052 3.269 3.643 3.814 3.987 4.143 4.447 4.595 4.879 5.148 5.427 5.563 5.816 6.058 6.416 6.641 6.857 7.175 7.478 7.769 8.046 8.321 8.669 9.011 9.349 9.727 10.099 10.458 10.87 11.35 11.8 12.284 12.784 13.308 13.864 14.49 15.209 15.909 16.692 17.556 18.571 19.679 20.849 22.059 23.172 23.703 23.759 23.549 23.208 22.783 22.348 21.928 21.528 21.102 20.705 20.33 19.941 19.561 19.223 18.912 18.567 18.235 17.937 17.614 17.249 16.949 16.655 16.32 16.046 15.772 15.494 15.204 14.92 14.736 14.546 14.238 14.012 13.774 13.65 13.399 13.143 12.871 12.722 12.411 12.201 12.002 11.814 11.431 11.202 10.958 10.672 10.342 9.973 9.449 7.892 -9 ,3943 ,KEBNE ,16722610,Sun Nov 28 00:54:40 CET,Sun Nov 28 02:29:06 CET,0.0 1.819 2.266 2.607 2.899 3.177 3.424 3.645 4.063 4.245 4.416 4.583 4.896 5.041 5.343 5.636 5.891 6.014 6.267 6.507 6.823 7.027 7.229 7.524 7.806 8.082 8.356 8.624 8.978 9.302 9.619 10.02 10.394 10.75 11.161 11.623 12.051 12.505 13.015 13.549 14.102 14.732 15.434 16.143 16.925 17.786 18.764 19.766 20.906 22.233 23.604 24.36 24.525 24.321 23.957 23.53 23.093 22.648 22.236 21.808 21.4 21.028 20.688 20.338 19.974 19.643 19.288 18.958 18.672 18.358 18.039 17.774 17.462 17.138 16.879 16.606 16.343 16.086 15.823 15.635 15.445 15.148 14.927 14.69 14.568 14.314 14.053 13.758 13.602 13.293 13.081 12.888 12.673 12.215 11.985 11.736 11.472 11.163 10.75 10.228 8.594 -10 ,4521 ,KEBNE ,16722611,Sun Nov 28 00:55:42 CET,Sun Nov 28 02:31:31 CET,0.0 0.77 1.139 1.415 1.664 1.876 2.072 2.284 2.692 2.874 3.056 3.243 3.559 3.701 3.977 4.269 4.54 4.662 4.894 5.116 5.45 5.668 5.887 6.219 6.541 6.856 7.153 7.433 7.801 8.152 8.487 8.892 9.3 9.687 10.121 10.615 11.066 11.555 12.099 12.692 13.304 13.953 14.667 15.396 16.233 17.152 18.199 19.288 20.463 21.739 23.014 23.694 23.839 23.719 23.421 23.084 22.749 22.382 22.02 21.642 21.307 20.975 20.643 20.318 19.987 19.677 19.368 19.093 18.846 18.56 18.243 17.981 17.706 17.417 17.185 16.949 16.711 16.461 16.2 16.015 15.816 15.495 15.264 15.007 14.874 14.612 14.329 14.022 13.858 13.539 13.303 13.092 12.864 12.356 12.077 11.756 11.386 10.952 10.43 9.696 6.639 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt deleted file mode 100644 index 32891f0c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5057 ,KEBNE ,16722612,Sun Nov 28 00:57:44 CET,Sun Nov 28 02:33:55 CET,0.0 2.098 2.554 2.861 3.12 3.308 3.439 3.548 3.731 3.814 3.89 3.838 4.041 4.07 4.114 4.146 4.157 4.164 4.17 4.162 4.146 4.13 4.117 4.098 4.064 4.03 3.985 3.92 3.833 3.743 3.651 3.518 3.353 3.164 2.917 2.617 2.316 1.955 1.502 0.952 0.333 -0.444 -1.477 -2.615 -4.09 -5.899 -8.227 -11.213 -15.226 -20.852 -29.328 -38.468 -45.372 -50.829 -55.227 -58.947 -62.034 -64.673 -66.88 -69.013 -70.801 -72.367 -73.785 -75.081 -76.268 -77.334 -78.421 -79.369 -80.18 -81.01 -81.867 -82.557 -83.247 -83.977 -84.53 -85.086 -85.663 -86.256 -86.862 -87.273 -87.688 -88.316 -88.741 -89.162 -89.375 -89.813 -90.266 -90.743 -90.988 -91.496 -91.753 -92.019 -92.294 -92.88 -93.177 -93.491 -93.826 -94.185 -94.615 -95.106 -96.9 -2 ,14214 ,KEBNE ,16722613,Sun Nov 28 00:58:46 CET,Sun Nov 28 02:34:32 CET,0.0 1.265 1.664 1.916 2.148 2.348 2.513 2.663 2.906 3.006 3.094 3.088 3.32 3.385 3.497 3.576 3.626 3.647 3.694 3.732 3.78 3.806 3.817 3.824 3.809 3.778 3.748 3.709 3.637 3.553 3.466 3.343 3.197 3.021 2.804 2.53 2.236 1.891 1.461 0.94 0.345 -0.398 -1.388 -2.494 -3.942 -5.78 -8.19 -11.258 -15.382 -21.087 -29.648 -38.781 -45.629 -51.033 -55.434 -59.161 -62.24 -64.892 -67.077 -69.203 -70.977 -72.507 -73.909 -75.202 -76.411 -77.476 -78.555 -79.508 -80.309 -81.127 -81.974 -82.668 -83.373 -84.089 -84.638 -85.202 -85.768 -86.327 -86.894 -87.292 -87.696 -88.293 -88.701 -89.116 -89.329 -89.779 -90.242 -90.701 -90.939 -91.45 -91.693 -91.957 -92.241 -92.838 -93.155 -93.482 -93.822 -94.206 -94.628 -95.122 -96.579 -3 ,28920 ,KEBNE ,16722614,Sun Nov 28 00:59:48 CET,Sun Nov 28 02:34:01 CET,0.0 1.746 2.189 2.514 2.787 2.998 3.153 3.274 3.481 3.579 3.682 3.699 3.921 3.972 4.057 4.127 4.184 4.205 4.229 4.238 4.244 4.239 4.24 4.231 4.199 4.154 4.089 4.017 3.904 3.766 3.621 3.425 3.221 3.008 2.733 2.409 2.074 1.664 1.177 0.624 -0.004 -0.79 -1.84 -3.034 -4.561 -6.422 -8.791 -11.86 -15.977 -21.691 -30.328 -39.566 -46.44 -51.867 -56.28 -59.985 -63.013 -65.592 -67.73 -69.832 -71.636 -73.203 -74.63 -75.943 -77.137 -78.2 -79.317 -80.318 -81.154 -81.987 -82.828 -83.511 -84.233 -84.978 -85.524 -86.085 -86.664 -87.235 -87.81 -88.212 -88.637 -89.293 -89.737 -90.189 -90.421 -90.894 -91.364 -91.847 -92.1 -92.61 -92.866 -93.128 -93.404 -93.996 -94.309 -94.654 -95.024 -95.417 -95.844 -96.367 -97.84 -4 ,4422 ,KEBNE ,16722615,Sun Nov 28 00:59:48 CET,Sun Nov 28 02:34:04 CET,0.0 1.079 1.431 1.664 1.826 1.951 2.069 2.195 2.419 2.501 2.572 2.529 2.736 2.773 2.839 2.889 2.931 2.955 2.981 2.984 2.99 2.994 2.998 2.996 2.986 2.965 2.915 2.861 2.792 2.696 2.573 2.413 2.238 2.026 1.735 1.39 1.06 0.655 0.159 -0.399 -1.048 -1.847 -2.859 -4.0 -5.458 -7.233 -9.463 -12.311 -16.28 -21.867 -30.434 -39.638 -46.54 -52.019 -56.387 -60.102 -63.181 -65.789 -67.928 -69.988 -71.723 -73.232 -74.632 -75.895 -77.028 -78.041 -79.091 -80.005 -80.788 -81.593 -82.407 -83.066 -83.735 -84.431 -84.96 -85.491 -86.028 -86.58 -87.146 -87.533 -87.927 -88.53 -88.949 -89.384 -89.61 -90.063 -90.508 -90.962 -91.199 -91.704 -91.933 -92.195 -92.469 -93.03 -93.327 -93.653 -93.993 -94.359 -94.808 -95.357 -96.702 -5 ,12570 ,KEBNE ,16722616,Sun Nov 28 00:59:48 CET,Sun Nov 28 02:33:31 CET,0.0 1.323 1.691 1.909 2.087 2.251 2.413 2.544 2.744 2.843 2.934 2.93 3.159 3.214 3.311 3.395 3.454 3.48 3.527 3.576 3.61 3.605 3.604 3.603 3.602 3.579 3.528 3.481 3.415 3.337 3.235 3.077 2.901 2.701 2.453 2.166 1.859 1.485 1.04 0.483 -0.179 -0.969 -1.961 -3.047 -4.484 -6.34 -8.708 -11.724 -15.838 -21.527 -30.063 -39.208 -46.056 -51.462 -55.79 -59.447 -62.569 -65.276 -67.499 -69.653 -71.421 -72.937 -74.363 -75.676 -76.859 -77.911 -78.986 -79.922 -80.709 -81.518 -82.349 -83.019 -83.709 -84.435 -84.995 -85.559 -86.121 -86.69 -87.282 -87.683 -88.096 -88.73 -89.154 -89.582 -89.799 -90.252 -90.72 -91.197 -91.438 -91.945 -92.202 -92.467 -92.734 -93.298 -93.604 -93.937 -94.282 -94.64 -95.068 -95.593 -97.015 -6 ,8107 ,KEBNE ,16722617,Sun Nov 28 00:59:48 CET,Sun Nov 28 02:33:30 CET,0.0 1.138 1.434 1.647 1.828 1.966 2.07 2.147 2.307 2.386 2.444 2.373 2.572 2.604 2.659 2.717 2.757 2.765 2.783 2.806 2.822 2.826 2.827 2.829 2.819 2.788 2.772 2.751 2.696 2.635 2.554 2.422 2.26 2.091 1.892 1.614 1.283 0.851 0.34 -0.235 -0.892 -1.707 -2.736 -3.887 -5.367 -7.161 -9.502 -12.557 -16.713 -22.469 -31.025 -40.141 -46.992 -52.423 -56.792 -60.505 -63.582 -66.223 -68.437 -70.559 -72.343 -73.903 -75.345 -76.668 -77.867 -78.921 -79.986 -80.928 -81.727 -82.544 -83.382 -84.065 -84.761 -85.475 -86.02 -86.569 -87.122 -87.688 -88.27 -88.659 -89.057 -89.687 -90.113 -90.535 -90.745 -91.18 -91.634 -92.095 -92.331 -92.841 -93.109 -93.375 -93.641 -94.229 -94.546 -94.864 -95.192 -95.554 -95.98 -96.501 -98.012 -7 ,20091 ,KEBNE ,16722618,Sun Nov 28 01:00:49 CET,Sun Nov 28 02:35:37 CET,0.0 1.07 1.335 1.521 1.687 1.834 1.969 2.083 2.229 2.289 2.346 2.289 2.49 2.527 2.575 2.616 2.662 2.678 2.696 2.704 2.711 2.723 2.736 2.736 2.705 2.662 2.625 2.59 2.503 2.37 2.241 2.06 1.866 1.682 1.443 1.128 0.792 0.389 -0.102 -0.657 -1.295 -2.08 -3.061 -4.138 -5.55 -7.371 -9.762 -12.823 -16.951 -22.649 -31.203 -40.501 -47.457 -52.954 -57.36 -61.11 -64.225 -66.894 -69.129 -71.289 -73.102 -74.646 -76.067 -77.385 -78.586 -79.643 -80.712 -81.653 -82.455 -83.29 -84.143 -84.84 -85.55 -86.274 -86.819 -87.345 -87.879 -88.435 -88.988 -89.355 -89.729 -90.327 -90.739 -91.151 -91.358 -91.769 -92.189 -92.634 -92.87 -93.359 -93.577 -93.825 -94.076 -94.603 -94.88 -95.175 -95.491 -95.837 -96.222 -96.673 -97.962 -8 ,28175 ,KEBNE ,16722619,Sun Nov 28 01:00:49 CET,Sun Nov 28 02:35:42 CET,0.0 1.062 1.362 1.57 1.745 1.891 2.002 2.079 2.222 2.286 2.349 2.285 2.483 2.517 2.582 2.64 2.682 2.703 2.744 2.759 2.738 2.719 2.709 2.734 2.762 2.744 2.704 2.649 2.586 2.517 2.421 2.267 2.084 1.886 1.633 1.331 1.03 0.667 0.224 -0.301 -0.918 -1.702 -2.74 -3.845 -5.255 -7.073 -9.396 -12.372 -16.462 -22.218 -30.793 -39.909 -46.746 -52.161 -56.529 -60.177 -63.196 -65.831 -68.034 -70.206 -72.017 -73.546 -74.96 -76.257 -77.449 -78.523 -79.627 -80.576 -81.369 -82.187 -83.013 -83.7 -84.409 -85.121 -85.674 -86.234 -86.794 -87.377 -87.975 -88.382 -88.796 -89.438 -89.871 -90.3 -90.52 -90.965 -91.418 -91.879 -92.116 -92.626 -92.884 -93.147 -93.422 -94.008 -94.316 -94.636 -94.974 -95.342 -95.748 -96.24 -97.613 -9 ,28343 ,KEBNE ,16722620,Sun Nov 28 01:01:49 CET,Sun Nov 28 02:35:47 CET,0.0 2.164 2.586 2.859 3.04 3.183 3.309 3.41 3.584 3.66 3.717 3.647 3.852 3.892 3.948 3.981 3.998 3.999 3.993 3.971 3.934 3.9 3.864 3.808 3.739 3.663 3.577 3.491 3.386 3.265 3.115 2.915 2.717 2.511 2.244 1.914 1.583 1.216 0.773 0.243 -0.355 -1.134 -2.147 -3.258 -4.692 -6.472 -8.843 -11.91 -15.987 -21.727 -30.396 -39.661 -46.564 -51.959 -56.344 -60.059 -63.1 -65.734 -67.919 -69.983 -71.718 -73.241 -74.677 -76.013 -77.209 -78.273 -79.367 -80.333 -81.155 -81.979 -82.795 -83.451 -84.123 -84.792 -85.318 -85.864 -86.412 -86.968 -87.526 -87.917 -88.321 -88.923 -89.334 -89.762 -89.987 -90.44 -90.889 -91.35 -91.595 -92.105 -92.364 -92.634 -92.911 -93.519 -93.853 -94.21 -94.613 -95.083 -95.608 -96.289 -98.306 -10 ,1874 ,KEBNE ,16722621,Sun Nov 28 01:01:50 CET,Sun Nov 28 02:36:37 CET,0.0 1.706 2.187 2.515 2.786 2.992 3.149 3.292 3.531 3.627 3.713 3.707 3.937 3.991 4.062 4.127 4.181 4.203 4.233 4.243 4.252 4.245 4.231 4.199 4.138 4.068 3.999 3.922 3.811 3.685 3.534 3.327 3.115 2.904 2.653 2.342 2.001 1.581 1.083 0.517 -0.106 -0.898 -1.941 -3.048 -4.464 -6.266 -8.598 -11.6 -15.696 -21.424 -29.95 -38.967 -45.756 -51.209 -55.613 -59.278 -62.31 -64.986 -67.226 -69.351 -71.111 -72.646 -74.069 -75.389 -76.617 -77.708 -78.819 -79.795 -80.617 -81.458 -82.317 -83.01 -83.699 -84.399 -84.934 -85.473 -86.024 -86.587 -87.168 -87.565 -87.964 -88.582 -88.998 -89.424 -89.644 -90.1 -90.571 -91.047 -91.286 -91.788 -92.048 -92.316 -92.593 -93.163 -93.451 -93.742 -94.061 -94.427 -94.858 -95.391 -97.079 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_3.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_4.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt deleted file mode 100644 index 88f89896..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_6.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21471 ,KEBNE ,17026254,Wed Dec 22 13:57:52 CET,Wed Dec 22 15:31:32 CET,0.0 1.731 2.385 2.839 3.203 3.488 3.729 3.956 4.351 4.524 4.689 4.62 5.107 5.218 5.423 5.612 5.781 5.859 6.012 6.15 6.336 6.446 6.554 6.712 6.855 6.975 7.071 7.163 7.269 7.362 7.442 7.53 7.603 7.655 7.726 7.803 7.844 7.856 7.854 7.817 7.703 7.551 7.354 7.091 6.698 6.163 5.395 4.199 2.319 -0.425 -4.959 -10.342 -14.529 -17.99 -20.862 -23.316 -25.405 -27.242 -28.807 -30.304 -31.552 -32.68 -33.72 -34.666 -35.538 -36.325 -37.165 -37.891 -38.486 -39.111 -39.754 -40.289 -40.845 -41.414 -41.852 -42.29 -42.729 -43.179 -43.652 -43.968 -44.293 -44.822 -45.176 -45.542 -45.734 -46.129 -46.547 -47.004 -47.246 -47.925 -48.022 -48.276 -48.54 -49.162 -49.524 -49.889 -50.283 -50.777 -51.371 -52.107 -54.013 -2 ,2868 ,KEBNE ,17026255,Wed Dec 22 13:57:52 CET,Wed Dec 22 15:32:47 CET,0.0 1.938 2.63 3.058 3.383 3.66 3.903 4.123 4.49 4.643 4.78 4.675 5.161 5.279 5.489 5.668 5.853 5.941 6.088 6.216 6.38 6.485 6.583 6.705 6.827 6.935 7.033 7.124 7.218 7.303 7.38 7.461 7.519 7.555 7.589 7.614 7.629 7.651 7.638 7.568 7.457 7.297 7.049 6.729 6.254 5.664 4.851 3.616 1.817 -0.845 -5.449 -10.934 -15.17 -18.657 -21.523 -23.93 -25.97 -27.781 -29.345 -30.894 -32.186 -33.313 -34.352 -35.289 -36.148 -36.923 -37.738 -38.481 -39.097 -39.703 -40.336 -40.848 -41.37 -41.928 -42.356 -42.801 -43.255 -43.713 -44.174 -44.479 -44.804 -45.321 -45.667 -46.03 -46.216 -46.602 -47.016 -47.471 -47.71 -48.372 -48.46 -48.72 -48.992 -49.611 -49.96 -50.331 -50.745 -51.23 -51.808 -52.595 -55.09 -3 ,13475 ,KEBNE ,17026256,Wed Dec 22 13:57:52 CET,Wed Dec 22 15:32:54 CET,0.0 1.835 2.479 2.901 3.236 3.548 3.813 4.039 4.431 4.606 4.78 4.721 5.205 5.318 5.533 5.723 5.89 5.972 6.129 6.26 6.451 6.566 6.664 6.808 6.933 7.049 7.16 7.257 7.366 7.467 7.562 7.665 7.754 7.827 7.892 7.947 7.964 7.937 7.882 7.787 7.662 7.501 7.274 7.004 6.591 6.006 5.148 3.916 2.066 -0.835 -5.635 -11.271 -15.649 -19.162 -22.048 -24.491 -26.58 -28.428 -29.97 -31.486 -32.758 -33.835 -34.846 -35.819 -36.689 -37.464 -38.278 -38.985 -39.593 -40.215 -40.849 -41.375 -41.913 -42.464 -42.895 -43.337 -43.78 -44.242 -44.736 -45.074 -45.405 -45.924 -46.29 -46.654 -46.839 -47.225 -47.632 -48.066 -48.299 -48.957 -49.029 -49.294 -49.572 -50.222 -50.589 -50.968 -51.356 -51.795 -52.33 -53.063 -55.64 -4 ,910 ,KEBNE ,17026257,Wed Dec 22 13:57:53 CET,Wed Dec 22 15:33:33 CET,0.0 1.694 2.257 2.673 3.043 3.344 3.581 3.796 4.169 4.331 4.478 4.384 4.868 4.983 5.204 5.402 5.574 5.657 5.802 5.921 6.072 6.159 6.248 6.369 6.478 6.583 6.689 6.79 6.909 7.012 7.095 7.19 7.279 7.363 7.443 7.513 7.576 7.574 7.524 7.456 7.357 7.235 7.007 6.704 6.297 5.706 4.819 3.551 1.721 -0.963 -5.479 -10.89 -15.106 -18.538 -21.433 -23.911 -25.979 -27.775 -29.273 -30.754 -32.017 -33.121 -34.133 -35.057 -35.912 -36.689 -37.48 -38.176 -38.773 -39.388 -40.035 -40.562 -41.097 -41.639 -42.054 -42.474 -42.9 -43.348 -43.803 -44.118 -44.459 -44.984 -45.343 -45.717 -45.907 -46.291 -46.699 -47.13 -47.348 -48.002 -48.101 -48.374 -48.653 -49.253 -49.58 -49.946 -50.36 -50.869 -51.472 -52.335 -54.37 -5 ,11171 ,KEBNE ,17026258,Wed Dec 22 13:57:52 CET,Wed Dec 22 15:32:46 CET,0.0 2.192 2.804 3.225 3.543 3.799 4.024 4.221 4.563 4.723 4.861 4.737 5.219 5.342 5.556 5.745 5.939 6.031 6.203 6.369 6.594 6.724 6.841 7.001 7.145 7.284 7.423 7.547 7.688 7.828 7.935 8.03 8.103 8.157 8.212 8.26 8.292 8.318 8.315 8.287 8.246 8.12 7.85 7.517 7.076 6.454 5.602 4.459 2.687 -0.094 -4.735 -10.175 -14.52 -18.058 -20.94 -23.404 -25.435 -27.195 -28.702 -30.211 -31.504 -32.612 -33.634 -34.583 -35.454 -36.236 -37.007 -37.69 -38.298 -38.918 -39.552 -40.081 -40.631 -41.191 -41.621 -42.051 -42.502 -42.971 -43.447 -43.776 -44.112 -44.655 -45.033 -45.406 -45.597 -45.994 -46.404 -46.88 -47.136 -47.808 -47.911 -48.18 -48.449 -49.03 -49.373 -49.746 -50.123 -50.585 -51.169 -51.896 -53.984 -6 ,21523 ,KEBNE ,17026259,Wed Dec 22 13:57:52 CET,Wed Dec 22 15:32:55 CET,0.0 1.504 2.146 2.582 2.94 3.267 3.51 3.7 4.054 4.243 4.421 4.338 4.829 4.944 5.134 5.318 5.494 5.572 5.724 5.856 6.024 6.14 6.249 6.39 6.517 6.627 6.731 6.827 6.937 7.03 7.118 7.205 7.287 7.358 7.42 7.497 7.541 7.536 7.494 7.44 7.375 7.237 7.014 6.734 6.313 5.727 4.907 3.725 1.865 -0.976 -5.686 -11.132 -15.416 -18.921 -21.758 -24.199 -26.317 -28.148 -29.666 -31.157 -32.421 -33.549 -34.599 -35.544 -36.406 -37.181 -37.984 -38.696 -39.287 -39.881 -40.5 -41.019 -41.562 -42.135 -42.586 -43.042 -43.499 -43.959 -44.437 -44.76 -45.092 -45.619 -45.975 -46.341 -46.532 -46.914 -47.321 -47.769 -48.005 -48.668 -48.764 -49.045 -49.334 -49.956 -50.274 -50.632 -51.053 -51.522 -52.096 -52.88 -55.058 -7 ,22294 ,KEBNE ,17026260,Wed Dec 22 13:57:52 CET,Wed Dec 22 15:32:00 CET,0.0 1.99 2.566 2.973 3.335 3.647 3.898 4.115 4.517 4.693 4.836 4.727 5.211 5.329 5.537 5.727 5.907 5.985 6.141 6.287 6.473 6.591 6.69 6.837 6.979 7.095 7.206 7.307 7.432 7.55 7.646 7.727 7.783 7.833 7.874 7.897 7.91 7.91 7.885 7.832 7.743 7.6 7.371 7.075 6.618 5.985 5.183 4.021 2.181 -0.61 -5.206 -10.573 -14.861 -18.349 -21.243 -23.744 -25.828 -27.651 -29.168 -30.625 -31.872 -32.969 -33.989 -34.942 -35.804 -36.562 -37.373 -38.083 -38.683 -39.302 -39.931 -40.444 -40.965 -41.506 -41.924 -42.357 -42.793 -43.246 -43.725 -44.047 -44.384 -44.917 -45.276 -45.631 -45.815 -46.205 -46.607 -47.046 -47.282 -47.931 -47.996 -48.267 -48.556 -49.19 -49.522 -49.888 -50.33 -50.848 -51.443 -52.246 -54.353 -8 ,26314 ,KEBNE ,17026261,Wed Dec 22 13:57:52 CET,Wed Dec 22 15:32:47 CET,0.0 1.808 2.517 3.003 3.377 3.674 3.908 4.107 4.502 4.669 4.805 4.703 5.188 5.306 5.523 5.717 5.892 5.973 6.117 6.26 6.456 6.565 6.67 6.827 6.959 7.066 7.165 7.252 7.356 7.454 7.543 7.633 7.697 7.759 7.833 7.885 7.917 7.939 7.925 7.874 7.789 7.646 7.436 7.143 6.689 6.051 5.142 3.958 2.121 -0.891 -5.607 -10.82 -15.03 -18.535 -21.409 -23.891 -26.002 -27.871 -29.407 -30.867 -32.125 -33.245 -34.309 -35.264 -36.108 -36.888 -37.695 -38.395 -38.996 -39.64 -40.309 -40.838 -41.375 -41.929 -42.364 -42.799 -43.235 -43.687 -44.139 -44.452 -44.777 -45.296 -45.668 -46.05 -46.245 -46.66 -47.097 -47.544 -47.776 -48.442 -48.529 -48.791 -49.065 -49.674 -50.015 -50.394 -50.816 -51.28 -51.824 -52.618 -55.183 -9 ,27628 ,KEBNE ,17026262,Wed Dec 22 13:57:52 CET,Wed Dec 22 15:32:11 CET,0.0 1.841 2.431 2.84 3.157 3.448 3.707 3.921 4.272 4.437 4.585 4.48 4.961 5.081 5.299 5.493 5.673 5.765 5.93 6.067 6.252 6.371 6.476 6.617 6.754 6.876 6.995 7.1 7.208 7.309 7.393 7.485 7.573 7.636 7.702 7.787 7.847 7.862 7.837 7.774 7.685 7.54 7.295 6.999 6.535 5.852 4.917 3.652 1.838 -0.975 -5.508 -10.771 -15.113 -18.611 -21.472 -23.963 -26.061 -27.874 -29.433 -30.946 -32.179 -33.246 -34.232 -35.162 -36.047 -36.845 -37.653 -38.363 -38.96 -39.559 -40.174 -40.696 -41.234 -41.773 -42.184 -42.609 -43.067 -43.546 -44.036 -44.369 -44.709 -45.239 -45.596 -45.968 -46.165 -46.573 -46.99 -47.415 -47.642 -48.304 -48.39 -48.652 -48.925 -49.531 -49.852 -50.207 -50.595 -51.033 -51.67 -52.562 -54.863 -10 ,2785 ,KEBNE ,17026263,Wed Dec 22 13:57:53 CET,Wed Dec 22 15:33:34 CET,0.0 1.715 2.296 2.752 3.117 3.4 3.639 3.853 4.225 4.397 4.55 4.451 4.942 5.072 5.317 5.534 5.711 5.781 5.908 6.046 6.235 6.346 6.45 6.606 6.751 6.875 6.984 7.087 7.198 7.289 7.367 7.456 7.534 7.578 7.607 7.614 7.598 7.59 7.565 7.518 7.441 7.266 6.982 6.69 6.254 5.596 4.66 3.365 1.519 -1.294 -5.988 -11.527 -15.902 -19.411 -22.318 -24.843 -26.965 -28.79 -30.341 -31.825 -33.071 -34.195 -35.225 -36.147 -36.981 -37.743 -38.526 -39.213 -39.795 -40.38 -41.011 -41.533 -42.058 -42.621 -43.032 -43.437 -43.873 -44.324 -44.796 -45.117 -45.451 -45.976 -46.337 -46.714 -46.903 -47.302 -47.735 -48.162 -48.378 -49.033 -49.096 -49.36 -49.636 -50.252 -50.582 -50.943 -51.357 -51.845 -52.431 -53.24 -56.499 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt deleted file mode 100644 index a2869faa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/shp2/water/Summary_FEP_SHP836-2_Example-27.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 04494994..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13742 ,KEBNE ,16723327,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:49:48 CET,0.0 1.973 2.565 2.982 3.339 3.672 3.968 4.211 4.644 4.865 5.073 5.237 5.617 5.786 6.104 6.403 6.686 6.823 7.088 7.33 7.661 7.874 8.09 8.394 8.664 8.92 9.185 9.44 9.758 10.073 10.357 10.696 11.041 11.368 11.721 12.123 12.546 13.001 13.454 13.924 14.424 14.95 15.487 15.995 16.595 17.206 17.767 18.202 18.528 18.673 18.108 16.568 15.017 13.494 12.072 10.826 9.694 8.64 7.736 6.814 6.038 5.364 4.702 4.087 3.502 2.942 2.37 1.87 1.453 1.022 0.578 0.208 -0.187 -0.592 -0.895 -1.203 -1.528 -1.86 -2.209 -2.444 -2.69 -3.098 -3.393 -3.702 -3.86 -4.185 -4.516 -4.852 -5.038 -5.453 -5.645 -5.857 -6.082 -6.586 -6.856 -7.159 -7.479 -7.833 -8.294 -8.913 -10.719 -2 ,16590 ,KEBNE ,16723328,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:51:05 CET,0.0 2.292 2.914 3.403 3.798 4.076 4.333 4.6 5.07 5.282 5.473 5.617 6.007 6.171 6.469 6.752 7.033 7.177 7.466 7.72 8.057 8.276 8.493 8.804 9.085 9.352 9.604 9.843 10.149 10.45 10.745 11.08 11.375 11.665 12.028 12.449 12.836 13.235 13.657 14.09 14.53 15.015 15.54 16.041 16.571 17.116 17.678 18.101 18.396 18.419 17.719 16.377 15.014 13.66 12.413 11.253 10.179 9.184 8.302 7.354 6.567 5.889 5.236 4.623 4.015 3.429 2.825 2.306 1.869 1.418 0.939 0.537 0.137 -0.264 -0.585 -0.928 -1.269 -1.633 -2.013 -2.264 -2.514 -2.915 -3.2 -3.496 -3.655 -3.979 -4.324 -4.694 -4.883 -5.305 -5.512 -5.727 -5.959 -6.462 -6.723 -7.007 -7.357 -7.739 -8.173 -8.779 -10.338 -3 ,7313 ,KEBNE ,16723329,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:49:16 CET,0.0 2.002 2.558 2.956 3.31 3.62 3.916 4.191 4.638 4.842 5.05 5.216 5.599 5.771 6.09 6.387 6.651 6.778 7.025 7.246 7.557 7.758 7.937 8.204 8.476 8.733 8.985 9.229 9.548 9.838 10.107 10.444 10.752 11.038 11.38 11.745 12.089 12.467 12.864 13.281 13.691 14.145 14.672 15.159 15.656 16.188 16.778 17.323 17.707 17.728 17.006 15.37 13.586 11.992 10.618 9.371 8.279 7.272 6.399 5.489 4.664 3.956 3.313 2.7 2.137 1.623 1.051 0.511 0.06 -0.397 -0.862 -1.238 -1.645 -2.081 -2.405 -2.726 -3.056 -3.401 -3.759 -4.003 -4.245 -4.604 -4.882 -5.185 -5.326 -5.612 -5.922 -6.26 -6.435 -6.832 -7.015 -7.218 -7.422 -7.886 -8.14 -8.393 -8.661 -8.981 -9.384 -9.914 -11.404 -7 ,24732 ,KEBNE ,16723333,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:50:00 CET,0.0 2.022 2.538 2.985 3.368 3.661 3.91 4.162 4.626 4.824 5.01 5.165 5.538 5.7 6.017 6.308 6.579 6.717 7.0 7.256 7.606 7.833 8.053 8.343 8.614 8.889 9.159 9.417 9.726 10.013 10.293 10.628 10.95 11.257 11.604 11.98 12.318 12.691 13.104 13.506 13.881 14.326 14.845 15.357 15.927 16.438 16.973 17.493 17.912 17.998 17.291 15.785 14.2 12.636 11.198 9.844 8.637 7.506 6.522 5.61 4.868 4.203 3.53 2.896 2.303 1.773 1.235 0.76 0.35 -0.097 -0.57 -0.95 -1.342 -1.78 -2.131 -2.5 -2.862 -3.227 -3.61 -3.862 -4.126 -4.553 -4.847 -5.15 -5.308 -5.628 -5.96 -6.32 -6.514 -6.93 -7.156 -7.379 -7.613 -8.111 -8.363 -8.647 -8.986 -9.359 -9.788 -10.381 -11.754 -8 ,20298 ,KEBNE ,16723334,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:50:35 CET,0.0 1.669 2.251 2.685 3.024 3.341 3.637 3.901 4.345 4.547 4.757 4.965 5.368 5.549 5.885 6.194 6.48 6.623 6.898 7.152 7.516 7.74 7.953 8.253 8.529 8.794 9.056 9.312 9.649 9.963 10.253 10.609 10.953 11.265 11.602 11.975 12.326 12.701 13.105 13.538 13.998 14.52 15.08 15.612 16.225 16.829 17.448 17.941 18.235 18.214 17.276 15.605 14.137 12.853 11.641 10.426 9.283 8.23 7.345 6.435 5.643 4.97 4.313 3.659 3.064 2.534 1.985 1.47 1.003 0.546 0.091 -0.29 -0.692 -1.136 -1.479 -1.804 -2.114 -2.429 -2.771 -3.009 -3.257 -3.648 -3.913 -4.187 -4.326 -4.622 -4.959 -5.317 -5.5 -5.912 -6.11 -6.321 -6.535 -6.994 -7.258 -7.53 -7.838 -8.185 -8.58 -9.102 -10.414 -9 ,23847 ,KEBNE ,16723335,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:49:41 CET,0.0 1.495 2.075 2.5 2.846 3.177 3.491 3.748 4.202 4.413 4.591 4.718 5.101 5.259 5.54 5.801 6.046 6.166 6.397 6.621 6.966 7.203 7.427 7.736 8.024 8.302 8.567 8.819 9.141 9.434 9.708 10.038 10.358 10.669 11.032 11.424 11.789 12.181 12.575 12.985 13.412 13.856 14.367 14.877 15.399 15.937 16.446 16.902 17.317 17.401 16.711 15.265 13.762 12.31 11.005 9.733 8.546 7.499 6.628 5.751 4.964 4.232 3.543 2.915 2.32 1.76 1.173 0.657 0.223 -0.219 -0.695 -1.104 -1.508 -1.914 -2.235 -2.578 -2.933 -3.3 -3.682 -3.941 -4.219 -4.65 -4.948 -5.256 -5.416 -5.74 -6.063 -6.421 -6.611 -7.025 -7.203 -7.412 -7.637 -8.18 -8.481 -8.793 -9.13 -9.509 -9.955 -10.452 -11.919 -10 ,20633 ,KEBNE ,16723336,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:50:15 CET,0.0 2.176 2.752 3.194 3.555 3.891 4.183 4.433 4.834 5.017 5.204 5.344 5.736 5.912 6.225 6.517 6.798 6.928 7.172 7.402 7.737 7.95 8.153 8.447 8.745 9.024 9.273 9.522 9.842 10.149 10.433 10.76 11.082 11.393 11.739 12.126 12.485 12.857 13.252 13.665 14.075 14.494 14.946 15.377 15.854 16.324 16.803 17.252 17.508 17.458 16.637 15.1 13.614 12.215 10.934 9.727 8.648 7.678 6.825 5.929 5.141 4.453 3.813 3.2 2.62 2.099 1.548 1.061 0.641 0.199 -0.242 -0.615 -1.015 -1.425 -1.747 -2.093 -2.45 -2.813 -3.185 -3.449 -3.73 -4.131 -4.419 -4.742 -4.912 -5.262 -5.607 -5.955 -6.131 -6.539 -6.702 -6.914 -7.151 -7.672 -7.956 -8.256 -8.562 -8.952 -9.45 -10.1 -11.83 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt deleted file mode 100644 index 4f9304ab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4810 ,KEBNE ,16723337,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 04:00:34 CET,0.0 5.677 6.723 7.444 8.049 8.594 9.103 9.546 10.372 10.769 11.139 11.529 12.175 12.472 13.044 13.555 14.022 14.242 14.678 15.105 15.707 16.105 16.475 17.008 17.509 17.993 18.467 18.909 19.478 20.028 20.56 21.191 21.814 22.378 22.96 23.63 24.288 25.003 25.796 26.602 27.414 28.371 29.49 30.523 31.527 32.538 33.626 34.787 36.125 37.456 38.633 39.023 38.841 38.423 37.822 37.148 36.497 35.882 35.317 34.671 34.06 33.502 32.961 32.449 31.956 31.489 30.981 30.48 29.992 29.453 28.901 28.435 27.969 27.486 27.093 26.695 26.252 25.771 25.303 24.986 24.637 24.075 23.703 23.312 23.102 22.663 22.177 21.672 21.419 20.847 20.576 20.282 19.958 19.244 18.827 18.33 17.767 17.151 16.486 15.576 12.076 -2 ,4557 ,KEBNE ,16723338,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:59:26 CET,0.0 4.192 5.169 5.794 6.347 6.796 7.177 7.554 8.193 8.468 8.748 8.952 9.52 9.751 10.199 10.638 11.062 11.264 11.643 12.002 12.508 12.83 13.137 13.571 14.008 14.43 14.834 15.227 15.704 16.168 16.631 17.148 17.612 18.079 18.642 19.255 19.828 20.46 21.141 21.884 22.633 23.403 24.271 25.135 26.122 27.158 28.261 29.442 30.663 31.747 32.433 32.065 31.225 30.253 29.282 28.337 27.414 26.552 25.808 25.018 24.27 23.558 22.861 22.223 21.595 21.009 20.409 19.863 19.385 18.878 18.338 17.877 17.39 16.88 16.489 16.083 15.651 15.201 14.718 14.386 14.045 13.511 13.133 12.735 12.53 12.078 11.61 11.132 10.879 10.3 10.013 9.697 9.37 8.675 8.286 7.868 7.419 6.88 6.185 5.227 2.234 -3 ,5067 ,KEBNE ,16723339,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:59:40 CET,0.0 2.206 2.981 3.512 3.938 4.306 4.654 4.973 5.535 5.794 6.036 6.149 6.681 6.9 7.327 7.735 8.105 8.276 8.607 8.919 9.365 9.649 9.931 10.34 10.719 11.086 11.433 11.78 12.239 12.676 13.116 13.644 14.119 14.583 15.131 15.714 16.276 16.875 17.532 18.29 19.059 19.889 20.81 21.685 22.754 23.964 25.269 26.564 27.834 29.242 30.676 31.279 31.045 30.557 30.008 29.362 28.699 28.063 27.44 26.752 26.152 25.629 25.065 24.485 23.961 23.468 22.946 22.466 22.057 21.545 20.979 20.57 20.153 19.702 19.299 18.883 18.48 18.05 17.597 17.287 16.961 16.419 16.043 15.662 15.473 15.088 14.668 14.214 13.968 13.397 13.13 12.831 12.514 11.787 11.368 10.892 10.364 9.765 9.063 8.173 5.701 -4 ,28050 ,KEBNE ,16723340,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 04:00:18 CET,0.0 2.978 3.989 4.765 5.402 5.959 6.474 6.936 7.722 8.067 8.396 8.71 9.342 9.653 10.213 10.688 11.154 11.398 11.855 12.277 12.898 13.298 13.673 14.164 14.608 15.039 15.452 15.84 16.333 16.828 17.317 17.87 18.392 18.897 19.521 20.226 20.8 21.377 21.973 22.581 23.223 23.962 24.876 25.748 26.631 27.566 28.618 29.727 30.9 32.051 32.85 32.791 32.19 31.342 30.452 29.564 28.717 27.868 27.051 26.205 25.496 24.842 24.178 23.536 22.923 22.353 21.766 21.207 20.721 20.23 19.687 19.229 18.751 18.175 17.701 17.23 16.722 16.176 15.598 15.212 14.827 14.224 13.786 13.314 13.063 12.522 11.941 11.319 10.989 10.351 9.958 9.588 9.22 8.428 7.956 7.437 6.884 6.249 5.46 4.367 1.05 -5 ,19705 ,KEBNE ,16723341,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:59:37 CET,0.0 2.841 3.606 4.173 4.643 5.054 5.416 5.748 6.344 6.627 6.907 7.071 7.619 7.839 8.265 8.678 9.072 9.256 9.597 9.913 10.382 10.682 10.968 11.372 11.745 12.103 12.461 12.833 13.317 13.764 14.182 14.692 15.19 15.662 16.214 16.821 17.419 18.058 18.702 19.411 20.126 20.875 21.763 22.598 23.494 24.554 25.707 26.747 27.773 28.745 29.413 29.207 28.491 27.62 26.729 25.836 24.978 24.19 23.479 22.694 22.013 21.424 20.83 20.235 19.644 19.078 18.483 17.942 17.476 16.976 16.446 16.01 15.548 15.06 14.685 14.301 13.887 13.437 12.967 12.636 12.286 11.761 11.397 11.014 10.808 10.366 9.928 9.482 9.248 8.699 8.48 8.215 7.925 7.285 6.943 6.562 6.133 5.627 5.056 4.324 2.141 -6 ,20551 ,KEBNE ,16723342,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 04:00:44 CET,0.0 3.769 4.857 5.63 6.301 6.876 7.378 7.814 8.551 8.9 9.24 9.579 10.216 10.496 11.034 11.544 12.028 12.28 12.769 13.198 13.771 14.154 14.556 15.11 15.62 16.122 16.603 17.048 17.636 18.21 18.738 19.376 19.997 20.584 21.287 22.078 22.765 23.447 24.164 24.919 25.662 26.493 27.44 28.326 29.333 30.434 31.618 32.894 34.333 35.819 36.852 36.915 36.528 36.005 35.372 34.613 33.839 33.102 32.447 31.754 31.147 30.564 29.993 29.453 28.926 28.416 27.779 27.165 26.646 26.095 25.512 25.032 24.544 24.018 23.592 23.159 22.744 22.302 21.831 21.51 21.185 20.667 20.268 19.846 19.629 19.167 18.68 18.168 17.892 17.304 17.038 16.726 16.419 15.75 15.378 14.963 14.468 13.908 13.204 12.253 9.416 -7 ,13111 ,KEBNE ,16723343,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:59:20 CET,0.0 4.0 4.962 5.707 6.324 6.871 7.35 7.779 8.549 8.891 9.213 9.488 10.102 10.388 10.936 11.434 11.887 12.113 12.583 13.02 13.623 14.019 14.396 14.943 15.468 15.938 16.38 16.82 17.401 17.942 18.456 19.078 19.663 20.244 20.901 21.572 22.199 22.865 23.584 24.371 25.17 26.045 27.01 27.916 28.884 29.913 31.14 32.393 33.672 34.939 35.989 36.247 35.981 35.505 34.832 34.071 33.379 32.695 32.058 31.384 30.732 30.112 29.52 28.97 28.442 27.924 27.361 26.847 26.383 25.89 25.376 24.93 24.469 23.984 23.585 23.175 22.756 22.282 21.784 21.447 21.104 20.555 20.153 19.739 19.521 19.061 18.581 18.095 17.853 17.296 17.046 16.739 16.397 15.654 15.24 14.777 14.229 13.584 12.817 11.756 8.198 -8 ,19883 ,KEBNE ,16723344,Sun Nov 28 01:59:52 CET,Sun Nov 28 03:59:32 CET,0.0 4.447 5.422 6.199 6.855 7.419 7.931 8.373 9.148 9.528 9.901 10.231 10.863 11.142 11.678 12.196 12.697 12.93 13.345 13.755 14.357 14.736 15.075 15.562 16.012 16.413 16.802 17.179 17.672 18.143 18.579 19.108 19.635 20.123 20.688 21.347 21.966 22.601 23.279 24.059 24.851 25.664 26.556 27.438 28.474 29.614 30.88 32.253 33.7 35.124 36.445 36.858 36.332 35.496 34.598 33.648 32.732 31.849 31.079 30.296 29.575 28.899 28.248 27.65 27.038 26.405 25.724 25.162 24.648 24.041 23.405 22.862 22.279 21.675 21.213 20.755 20.278 19.772 19.231 18.852 18.463 17.842 17.417 16.981 16.753 16.282 15.772 15.211 14.911 14.281 13.87 13.48 13.086 12.2 11.708 11.188 10.634 9.994 9.195 8.185 4.68 -9 ,20729 ,KEBNE ,16723345,Sun Nov 28 01:59:52 CET,Sun Nov 28 04:00:34 CET,0.0 4.197 5.225 5.917 6.574 7.167 7.68 8.141 8.952 9.31 9.644 9.965 10.588 10.881 11.431 11.932 12.421 12.66 13.116 13.551 14.186 14.59 14.979 15.508 16.001 16.481 16.95 17.409 17.988 18.529 19.046 19.658 20.236 20.811 21.478 22.213 22.925 23.666 24.465 25.311 26.117 26.986 27.912 28.78 29.779 30.848 31.975 33.122 34.43 35.75 36.787 36.971 36.507 35.844 35.12 34.392 33.705 33.026 32.406 31.702 31.033 30.442 29.862 29.291 28.753 28.264 27.745 27.254 26.815 26.328 25.803 25.352 24.884 24.425 24.074 23.691 23.264 22.783 22.223 21.803 21.367 20.69 20.209 19.69 19.427 18.883 18.3 17.718 17.415 16.793 16.428 16.052 15.664 14.82 14.346 13.84 13.283 12.659 11.914 10.9 7.505 -10 ,5110 ,KEBNE ,16723346,Sun Nov 28 01:59:52 CET,Sun Nov 28 03:59:22 CET,0.0 3.858 5.015 5.841 6.532 7.116 7.664 8.167 8.987 9.368 9.72 10.036 10.67 10.971 11.538 12.044 12.509 12.735 13.167 13.553 14.084 14.427 14.788 15.316 15.779 16.216 16.64 17.038 17.534 18.004 18.464 19.033 19.598 20.143 20.748 21.42 22.044 22.692 23.39 24.146 24.931 25.837 26.872 27.847 28.915 30.067 31.385 32.719 34.095 35.367 36.202 36.177 35.704 35.02 34.277 33.536 32.74 31.861 31.068 30.308 29.617 28.977 28.378 27.804 27.246 26.711 26.147 25.637 25.17 24.668 24.156 23.748 23.327 22.877 22.525 22.16 21.775 21.35 20.916 20.64 20.354 19.865 19.518 19.177 19.004 18.644 18.228 17.777 17.533 16.979 16.794 16.519 16.228 15.603 15.257 14.904 14.532 14.074 13.531 12.819 10.747 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt deleted file mode 100644 index 46fbeecc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13110 ,KEBNE ,16723347,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:57:19 CET,0.0 2.44 3.384 4.074 4.676 5.164 5.593 5.967 6.668 7.006 7.309 7.546 8.142 8.41 8.941 9.431 9.876 10.09 10.503 10.895 11.469 11.836 12.196 12.726 13.246 13.752 14.223 14.672 15.251 15.821 16.364 17.018 17.652 18.255 18.955 19.754 20.505 21.3 22.138 23.011 23.938 24.973 26.139 27.32 28.705 30.16 31.785 33.493 35.184 36.684 37.606 37.374 36.466 35.314 34.005 32.639 31.403 30.237 29.157 28.023 27.046 26.199 25.401 24.653 23.946 23.3 22.641 22.049 21.542 21.011 20.454 19.998 19.525 19.018 18.598 18.153 17.693 17.23 16.768 16.441 16.097 15.551 15.176 14.783 14.579 14.151 13.681 13.179 12.915 12.321 12.119 11.838 11.519 10.815 10.455 10.057 9.605 9.135 8.563 7.757 5.746 -2 ,3324 ,KEBNE ,16723348,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:58:03 CET,0.0 2.555 3.411 4.053 4.601 5.068 5.501 5.912 6.65 6.994 7.317 7.601 8.212 8.48 8.985 9.453 9.888 10.108 10.537 10.925 11.48 11.847 12.208 12.723 13.229 13.721 14.194 14.643 15.202 15.744 16.268 16.91 17.529 18.12 18.789 19.516 20.241 21.064 21.944 22.867 23.824 24.896 26.145 27.313 28.628 30.052 31.464 32.972 34.806 36.525 37.619 37.437 36.405 35.103 33.711 32.412 31.224 30.143 29.191 28.166 27.265 26.434 25.655 24.929 24.261 23.659 23.017 22.447 21.95 21.429 20.875 20.388 19.884 19.362 18.955 18.547 18.104 17.638 17.164 16.817 16.462 15.939 15.566 15.181 14.982 14.566 14.13 13.663 13.411 12.82 12.584 12.292 11.984 11.279 10.879 10.429 9.954 9.452 8.844 8.063 6.117 -3 ,30173 ,KEBNE ,16723349,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:58:51 CET,0.0 2.885 3.641 4.254 4.8 5.305 5.775 6.193 6.969 7.319 7.641 7.922 8.531 8.789 9.288 9.776 10.248 10.474 10.9 11.311 11.912 12.286 12.65 13.184 13.686 14.161 14.627 15.094 15.692 16.279 16.846 17.508 18.141 18.736 19.407 20.18 20.964 21.806 22.617 23.425 24.28 25.243 26.353 27.468 28.727 30.024 31.449 32.883 34.379 35.917 36.86 36.578 35.573 34.329 33.11 31.857 30.677 29.578 28.604 27.63 26.738 25.929 25.166 24.456 23.796 23.184 22.531 21.943 21.451 20.944 20.416 19.96 19.473 18.964 18.555 18.127 17.685 17.236 16.785 16.468 16.133 15.6 15.214 14.806 14.602 14.192 13.741 13.268 13.024 12.443 12.197 11.892 11.59 10.958 10.607 10.21 9.763 9.28 8.756 8.061 6.086 -4 ,4676 ,KEBNE ,16723350,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:57:38 CET,0.0 2.304 3.096 3.751 4.287 4.707 5.128 5.525 6.241 6.55 6.847 7.122 7.732 7.992 8.488 8.959 9.408 9.628 10.044 10.443 11.024 11.397 11.762 12.272 12.744 13.212 13.661 14.096 14.664 15.207 15.71 16.321 16.928 17.494 18.134 18.854 19.551 20.325 21.166 22.009 22.853 23.835 24.982 26.108 27.403 28.82 30.387 32.017 33.768 35.431 36.342 35.75 34.448 32.955 31.548 30.261 29.075 27.924 26.889 25.83 24.921 24.095 23.31 22.57 21.882 21.256 20.575 19.964 19.432 18.882 18.297 17.79 17.283 16.752 16.326 15.904 15.479 15.043 14.574 14.23 13.884 13.368 13.004 12.615 12.414 11.992 11.532 11.036 10.786 10.194 9.981 9.709 9.412 8.767 8.409 7.987 7.519 6.99 6.337 5.441 2.008 -5 ,16340 ,KEBNE ,16723351,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:57:50 CET,0.0 2.845 3.689 4.308 4.819 5.31 5.755 6.146 6.86 7.181 7.483 7.709 8.291 8.55 9.046 9.538 10.014 10.239 10.664 11.059 11.631 12.0 12.352 12.853 13.347 13.838 14.299 14.756 15.343 15.902 16.43 17.032 17.613 18.175 18.825 19.582 20.298 21.043 21.812 22.643 23.559 24.608 25.812 27.006 28.349 29.674 31.058 32.577 34.309 35.838 36.666 36.32 35.18 33.82 32.518 31.295 30.133 28.987 27.964 26.957 26.079 25.279 24.507 23.782 23.108 22.468 21.776 21.162 20.652 20.117 19.542 19.06 18.567 18.049 17.634 17.208 16.764 16.308 15.83 15.488 15.147 14.617 14.232 13.827 13.618 13.17 12.7 12.238 11.999 11.418 11.196 10.901 10.592 9.894 9.493 9.051 8.561 8.023 7.388 6.463 3.676 -6 ,17448 ,KEBNE ,16723352,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:58:30 CET,0.0 2.369 3.274 3.93 4.48 4.966 5.426 5.841 6.567 6.899 7.198 7.423 8.034 8.308 8.814 9.276 9.725 9.948 10.388 10.806 11.408 11.805 12.176 12.705 13.217 13.713 14.196 14.642 15.225 15.809 16.363 16.983 17.57 18.158 18.843 19.628 20.372 21.183 22.077 22.993 23.884 24.838 25.915 27.039 28.287 29.571 31.087 32.638 34.043 35.19 35.743 35.279 34.266 32.935 31.471 30.104 28.962 27.909 26.915 25.865 24.986 24.213 23.444 22.689 21.985 21.371 20.747 20.167 19.656 19.12 18.564 18.112 17.638 17.151 16.769 16.357 15.934 15.492 15.019 14.686 14.351 13.839 13.475 13.089 12.884 12.472 12.058 11.607 11.358 10.765 10.541 10.241 9.929 9.258 8.87 8.456 7.998 7.449 6.797 5.948 3.584 -7 ,10617 ,KEBNE ,16723353,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:57:02 CET,0.0 2.654 3.442 4.057 4.582 5.044 5.454 5.838 6.542 6.862 7.18 7.46 8.072 8.334 8.801 9.247 9.674 9.882 10.288 10.675 11.225 11.577 11.922 12.425 12.92 13.389 13.84 14.281 14.834 15.376 15.915 16.559 17.169 17.752 18.428 19.169 19.88 20.701 21.587 22.533 23.508 24.537 25.675 26.748 27.943 29.292 30.741 32.269 33.853 35.123 36.046 35.662 34.52 33.29 32.013 30.694 29.475 28.337 27.331 26.313 25.46 24.678 23.881 23.142 22.463 21.854 21.227 20.651 20.137 19.58 19.002 18.529 18.049 17.566 17.181 16.776 16.359 15.922 15.474 15.165 14.843 14.321 13.943 13.563 13.373 12.983 12.571 12.119 11.878 11.289 11.081 10.795 10.5 9.859 9.49 9.083 8.62 8.077 7.414 6.502 3.734 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt deleted file mode 100644 index 939f51f4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24586 ,KEBNE ,16723357,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:58:34 CET,0.0 1.821 2.372 2.808 3.193 3.519 3.789 4.028 4.472 4.671 4.841 4.918 5.3 5.452 5.73 5.984 6.222 6.337 6.562 6.773 7.063 7.255 7.441 7.698 7.937 8.161 8.371 8.569 8.823 9.058 9.275 9.539 9.795 10.03 10.287 10.554 10.787 11.019 11.233 11.442 11.663 11.879 12.067 12.203 12.296 12.271 12.071 11.682 10.955 9.59 6.962 3.592 0.694 -1.991 -4.321 -6.304 -8.023 -9.556 -10.9 -12.276 -13.473 -14.557 -15.586 -16.542 -17.421 -18.211 -19.02 -19.736 -20.356 -21.005 -21.685 -22.257 -22.849 -23.439 -23.888 -24.361 -24.855 -25.342 -25.847 -26.203 -26.572 -27.162 -27.579 -28.003 -28.211 -28.656 -29.157 -29.677 -29.945 -30.509 -30.807 -31.123 -31.461 -32.175 -32.565 -33.012 -33.478 -33.981 -34.611 -35.508 -38.755 -2 ,7719 ,KEBNE ,16723358,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 04:00:06 CET,0.0 1.903 2.563 3.024 3.401 3.721 3.99 4.239 4.713 4.931 5.137 5.266 5.669 5.83 6.126 6.405 6.654 6.769 6.996 7.212 7.515 7.703 7.88 8.137 8.395 8.651 8.883 9.087 9.357 9.603 9.813 10.065 10.291 10.499 10.738 10.995 11.238 11.482 11.713 11.963 12.207 12.395 12.551 12.655 12.686 12.649 12.517 12.213 11.63 10.326 7.524 3.901 0.7 -2.095 -4.398 -6.372 -8.091 -9.686 -11.072 -12.429 -13.581 -14.605 -15.577 -16.525 -17.413 -18.187 -19.0 -19.722 -20.339 -20.999 -21.681 -22.239 -22.828 -23.429 -23.879 -24.364 -24.885 -25.427 -25.985 -26.361 -26.739 -27.336 -27.77 -28.212 -28.429 -28.881 -29.372 -29.902 -30.175 -30.735 -31.085 -31.409 -31.74 -32.461 -32.869 -33.297 -33.773 -34.34 -35.002 -35.811 -38.1 -3 ,20807 ,KEBNE ,16723359,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:58:32 CET,0.0 1.584 2.166 2.618 3.002 3.348 3.653 3.919 4.356 4.547 4.726 4.824 5.216 5.369 5.658 5.924 6.181 6.308 6.541 6.744 7.04 7.224 7.392 7.644 7.888 8.116 8.328 8.534 8.792 9.025 9.244 9.492 9.727 9.924 10.122 10.368 10.601 10.814 11.012 11.195 11.355 11.507 11.643 11.735 11.784 11.747 11.51 11.027 10.191 8.687 5.876 2.337 -0.705 -3.368 -5.601 -7.552 -9.302 -10.946 -12.37 -13.782 -14.932 -15.922 -16.911 -17.853 -18.705 -19.466 -20.259 -20.949 -21.543 -22.182 -22.858 -23.407 -23.953 -24.515 -24.958 -25.401 -25.871 -26.382 -26.894 -27.239 -27.58 -28.098 -28.479 -28.875 -29.075 -29.496 -29.946 -30.41 -30.658 -31.203 -31.491 -31.799 -32.114 -32.796 -33.195 -33.672 -34.219 -34.818 -35.548 -36.579 -39.463 -4 ,2089 ,KEBNE ,16723360,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:59:26 CET,0.0 1.911 2.482 2.888 3.242 3.552 3.817 4.065 4.496 4.675 4.844 4.938 5.341 5.496 5.774 6.044 6.305 6.429 6.666 6.885 7.192 7.382 7.555 7.809 8.058 8.282 8.486 8.684 8.934 9.151 9.346 9.587 9.803 10.013 10.263 10.529 10.746 10.96 11.189 11.407 11.608 11.812 12.028 12.202 12.34 12.379 12.209 11.796 11.087 9.791 6.958 3.243 0.241 -2.401 -4.651 -6.603 -8.334 -9.895 -11.232 -12.55 -13.686 -14.705 -15.654 -16.559 -17.42 -18.203 -19.003 -19.703 -20.324 -20.992 -21.681 -22.249 -22.832 -23.422 -23.881 -24.374 -24.882 -25.387 -25.914 -26.272 -26.63 -27.198 -27.607 -28.04 -28.26 -28.72 -29.213 -29.715 -29.968 -30.509 -30.797 -31.105 -31.438 -32.151 -32.551 -33.006 -33.492 -34.022 -34.699 -35.571 -38.6 -5 ,3770 ,KEBNE ,16723361,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:59:44 CET,0.0 2.057 2.603 3.001 3.357 3.673 3.952 4.207 4.671 4.879 5.07 5.176 5.569 5.717 5.993 6.247 6.494 6.614 6.852 7.069 7.343 7.514 7.678 7.919 8.149 8.364 8.577 8.779 9.026 9.26 9.484 9.749 9.991 10.208 10.455 10.718 10.935 11.158 11.397 11.648 11.9 12.109 12.293 12.41 12.459 12.435 12.241 11.835 10.987 9.368 6.36 2.483 -0.773 -3.452 -5.715 -7.804 -9.651 -11.256 -12.625 -14.01 -15.148 -16.125 -17.092 -18.016 -18.87 -19.645 -20.453 -21.173 -21.776 -22.4 -23.068 -23.629 -24.203 -24.784 -25.228 -25.677 -26.143 -26.622 -27.124 -27.479 -27.844 -28.396 -28.78 -29.202 -29.414 -29.846 -30.324 -30.845 -31.123 -31.686 -32.008 -32.335 -32.681 -33.439 -33.857 -34.289 -34.781 -35.371 -36.056 -36.99 -40.243 -6 ,27345 ,KEBNE ,16723362,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:58:51 CET,0.0 1.965 2.609 3.06 3.41 3.708 3.972 4.212 4.643 4.841 5.03 5.139 5.537 5.698 5.99 6.258 6.504 6.623 6.864 7.082 7.371 7.569 7.76 8.035 8.303 8.56 8.801 9.017 9.269 9.492 9.72 10.005 10.267 10.492 10.729 10.974 11.208 11.486 11.755 11.983 12.192 12.403 12.598 12.728 12.823 12.826 12.663 12.238 11.433 9.939 6.955 3.227 -0.026 -2.751 -5.084 -7.21 -9.034 -10.625 -11.969 -13.267 -14.357 -15.382 -16.387 -17.309 -18.152 -18.914 -19.689 -20.39 -21.006 -21.636 -22.289 -22.83 -23.381 -23.96 -24.403 -24.86 -25.348 -25.852 -26.377 -26.735 -27.09 -27.642 -28.038 -28.482 -28.71 -29.158 -29.638 -30.142 -30.413 -30.97 -31.267 -31.587 -31.935 -32.686 -33.091 -33.536 -34.032 -34.606 -35.281 -36.134 -38.998 -7 ,24487 ,KEBNE ,16723363,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:58:54 CET,0.0 1.865 2.46 2.898 3.266 3.568 3.85 4.108 4.57 4.784 4.978 5.09 5.48 5.628 5.917 6.189 6.433 6.553 6.786 7.002 7.318 7.512 7.69 7.937 8.151 8.345 8.543 8.743 8.992 9.225 9.439 9.684 9.916 10.122 10.339 10.597 10.824 11.039 11.264 11.465 11.619 11.775 11.933 12.044 12.102 12.11 11.992 11.582 10.808 9.363 6.631 3.071 -0.081 -2.832 -5.201 -7.267 -9.1 -10.765 -12.164 -13.563 -14.732 -15.738 -16.685 -17.582 -18.422 -19.174 -19.948 -20.639 -21.236 -21.88 -22.561 -23.1 -23.665 -24.272 -24.751 -25.242 -25.762 -26.32 -26.906 -27.3 -27.707 -28.363 -28.828 -29.324 -29.576 -30.089 -30.625 -31.192 -31.489 -32.061 -32.384 -32.7 -33.03 -33.764 -34.173 -34.6 -35.091 -35.663 -36.324 -37.218 -40.383 -8 ,1047 ,KEBNE ,16723364,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:59:37 CET,0.0 1.825 2.414 2.851 3.231 3.562 3.842 4.1 4.56 4.764 4.939 5.012 5.402 5.554 5.846 6.121 6.373 6.493 6.713 6.916 7.21 7.394 7.582 7.843 8.081 8.316 8.533 8.728 8.978 9.222 9.47 9.754 9.995 10.201 10.41 10.652 10.878 11.09 11.327 11.593 11.823 12.019 12.23 12.424 12.549 12.519 12.265 11.691 10.778 9.234 6.241 2.555 -0.535 -3.153 -5.48 -7.605 -9.377 -10.934 -12.283 -13.628 -14.772 -15.798 -16.784 -17.709 -18.554 -19.331 -20.15 -20.864 -21.488 -22.148 -22.824 -23.362 -23.941 -24.565 -25.036 -25.519 -26.022 -26.544 -27.068 -27.428 -27.807 -28.403 -28.816 -29.226 -29.438 -29.892 -30.377 -30.883 -31.137 -31.68 -31.959 -32.284 -32.623 -33.314 -33.699 -34.105 -34.56 -35.09 -35.807 -36.785 -39.468 -9 ,29572 ,KEBNE ,16723365,Sun Nov 28 01:59:51 CET,Sun Nov 28 03:58:14 CET,0.0 1.88 2.5 2.956 3.319 3.647 3.936 4.184 4.602 4.802 4.995 5.107 5.52 5.684 5.977 6.245 6.489 6.612 6.851 7.057 7.33 7.51 7.688 7.936 8.181 8.413 8.63 8.843 9.091 9.321 9.548 9.819 10.057 10.259 10.489 10.742 10.957 11.171 11.394 11.582 11.733 11.853 11.975 12.068 12.082 11.992 11.713 11.203 10.322 8.716 5.641 1.736 -1.578 -4.374 -6.702 -8.809 -10.664 -12.325 -13.743 -15.101 -16.253 -17.29 -18.259 -19.168 -20.011 -20.781 -21.561 -22.242 -22.842 -23.467 -24.117 -24.658 -25.214 -25.792 -26.241 -26.691 -27.151 -27.652 -28.172 -28.543 -28.932 -29.524 -29.943 -30.366 -30.589 -31.071 -31.56 -32.065 -32.336 -32.896 -33.198 -33.495 -33.797 -34.509 -34.908 -35.316 -35.79 -36.323 -36.949 -37.695 -40.204 -10 ,8956 ,KEBNE ,16723366,Sun Nov 28 01:59:52 CET,Sun Nov 28 03:59:06 CET,0.0 1.629 2.218 2.65 2.981 3.3 3.607 3.87 4.313 4.512 4.715 4.837 5.229 5.393 5.69 5.949 6.191 6.307 6.524 6.732 7.031 7.217 7.4 7.66 7.894 8.116 8.325 8.52 8.776 9.022 9.251 9.519 9.789 10.019 10.253 10.513 10.737 10.966 11.218 11.494 11.755 11.982 12.177 12.299 12.357 12.318 12.116 11.675 10.877 9.446 6.6 2.99 -0.129 -2.843 -5.106 -7.151 -8.93 -10.48 -11.822 -13.169 -14.363 -15.452 -16.47 -17.422 -18.275 -19.034 -19.845 -20.572 -21.194 -21.83 -22.474 -23.015 -23.568 -24.137 -24.589 -25.065 -25.563 -26.065 -26.562 -26.909 -27.281 -27.862 -28.27 -28.703 -28.927 -29.388 -29.862 -30.365 -30.64 -31.198 -31.486 -31.798 -32.119 -32.822 -33.216 -33.652 -34.133 -34.651 -35.308 -36.247 -39.058 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index b771e647..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13687 ,KEBNE ,16723367,Sun Nov 28 01:59:52 CET,Sun Nov 28 03:54:40 CET,0.0 0.465 0.814 1.124 1.428 1.695 1.919 2.337 2.537 2.736 2.872 3.283 3.448 3.762 4.064 4.359 4.504 4.784 5.051 5.432 5.681 5.925 6.274 6.613 6.943 7.268 7.592 8.0 8.381 8.754 9.209 9.637 10.059 10.569 11.118 11.627 12.214 12.868 13.568 14.297 15.109 16.038 16.936 17.995 19.186 20.503 21.903 23.471 25.236 27.09 28.206 28.504 28.359 28.014 27.545 27.027 26.584 26.171 25.652 25.149 24.637 24.068 23.469 22.868 22.293 21.684 21.145 20.697 20.228 19.697 19.223 18.721 18.212 17.825 17.412 16.937 16.411 15.873 15.51 15.134 14.503 14.069 13.656 13.442 12.983 12.455 11.891 11.609 11.083 10.617 10.259 9.92 9.168 8.642 8.091 7.558 6.959 6.117 4.581 -2 ,25876 ,KEBNE ,16723368,Sun Nov 28 01:59:52 CET,Sun Nov 28 03:53:56 CET,0.0 0.511 0.905 1.247 1.552 1.813 2.049 2.521 2.743 2.946 3.079 3.502 3.68 4.009 4.328 4.642 4.79 5.082 5.366 5.767 6.024 6.27 6.647 7.009 7.363 7.712 8.03 8.443 8.863 9.258 9.703 10.12 10.526 11.012 11.581 12.133 12.742 13.4 14.082 14.803 15.622 16.559 17.475 18.532 19.726 21.073 22.509 24.109 25.911 27.912 29.053 29.268 29.08 28.673 28.157 27.655 27.141 26.622 26.098 25.63 25.185 24.7 24.248 23.805 23.279 22.684 22.143 21.656 21.152 20.622 20.171 19.698 19.184 18.785 18.389 17.97 17.503 16.983 16.618 16.254 15.697 15.312 14.882 14.66 14.228 13.769 13.263 12.992 12.5 12.111 11.753 11.367 10.502 9.976 9.412 8.825 8.048 7.076 5.724 -3 ,2234 ,KEBNE ,16723369,Sun Nov 28 02:00:54 CET,Sun Nov 28 03:54:50 CET,0.0 0.488 0.851 1.167 1.455 1.738 1.996 2.444 2.655 2.846 2.966 3.387 3.56 3.885 4.209 4.52 4.675 4.966 5.237 5.631 5.883 6.134 6.48 6.821 7.16 7.483 7.787 8.19 8.593 8.972 9.415 9.845 10.268 10.746 11.289 11.807 12.37 12.99 13.658 14.355 15.157 16.09 16.983 18.051 19.288 20.736 22.32 24.123 26.018 27.807 28.735 28.841 28.617 28.09 27.491 26.96 26.425 25.794 24.921 24.057 23.249 22.464 21.731 21.072 20.455 19.787 19.185 18.659 18.102 17.505 17.004 16.485 15.942 15.513 15.07 14.616 14.12 13.583 13.22 12.861 12.275 11.843 11.389 11.167 10.688 10.135 9.561 9.257 8.722 8.274 7.915 7.535 6.62 6.088 5.539 4.894 4.107 3.223 1.98 -4 ,16893 ,KEBNE ,16723370,Sun Nov 28 02:00:54 CET,Sun Nov 28 03:54:32 CET,0.0 0.551 0.918 1.211 1.486 1.748 1.977 2.406 2.621 2.835 2.999 3.424 3.599 3.931 4.245 4.552 4.705 4.998 5.265 5.631 5.866 6.103 6.46 6.817 7.158 7.477 7.793 8.221 8.635 9.03 9.492 9.934 10.374 10.885 11.463 12.024 12.625 13.244 13.894 14.588 15.395 16.336 17.245 18.316 19.532 20.912 22.406 24.035 25.818 27.786 29.011 29.159 28.809 28.329 27.85 27.304 26.687 26.074 25.405 24.794 24.204 23.622 23.079 22.573 22.075 21.549 21.089 20.673 20.22 19.757 19.368 18.945 18.502 18.163 17.801 17.42 16.998 16.523 16.201 15.883 15.384 14.97 14.47 14.224 13.782 13.333 12.81 12.526 12.016 11.593 11.245 10.897 10.036 9.547 9.044 8.39 7.689 6.914 5.431 -5 ,31482 ,KEBNE ,16723371,Sun Nov 28 02:00:54 CET,Sun Nov 28 03:56:01 CET,0.0 0.561 0.993 1.336 1.626 1.92 2.187 2.623 2.833 3.031 3.146 3.553 3.722 4.058 4.374 4.655 4.79 5.08 5.369 5.778 6.044 6.293 6.658 7.025 7.378 7.702 8.006 8.408 8.81 9.197 9.663 10.105 10.516 11.002 11.556 12.086 12.679 13.31 13.972 14.672 15.458 16.361 17.236 18.249 19.389 20.704 22.219 23.959 25.733 27.536 28.503 28.561 28.267 27.819 27.242 26.557 25.873 25.261 24.61 24.039 23.541 23.048 22.538 22.062 21.609 21.108 20.677 20.308 19.908 19.459 19.05 18.615 18.162 17.807 17.47 17.132 16.761 16.358 16.055 15.744 15.268 14.92 14.53 14.317 13.891 13.456 12.986 12.751 12.279 11.878 11.522 11.156 10.438 10.012 9.52 8.96 8.28 7.376 6.035 -6 ,22611 ,KEBNE ,16723372,Sun Nov 28 02:00:54 CET,Sun Nov 28 03:55:05 CET,0.0 0.537 0.96 1.31 1.604 1.899 2.179 2.666 2.889 3.098 3.257 3.69 3.863 4.198 4.53 4.841 4.995 5.283 5.554 5.965 6.226 6.469 6.825 7.184 7.533 7.874 8.211 8.642 9.043 9.431 9.909 10.351 10.767 11.263 11.832 12.374 12.957 13.594 14.264 14.959 15.75 16.645 17.535 18.58 19.724 21.065 22.521 24.163 26.073 28.121 29.322 29.443 28.979 28.319 27.637 26.955 26.25 25.6 24.945 24.384 23.851 23.33 22.844 22.365 21.924 21.474 21.058 20.674 20.253 19.803 19.401 18.971 18.521 18.171 17.828 17.466 17.096 16.694 16.388 16.075 15.6 15.249 14.891 14.704 14.269 13.809 13.333 13.092 12.616 12.19 11.853 11.526 10.755 10.298 9.784 9.209 8.503 7.52 6.216 -7 ,32015 ,KEBNE ,16723373,Sun Nov 28 02:00:54 CET,Sun Nov 28 03:54:23 CET,0.0 0.555 0.969 1.323 1.659 1.968 2.239 2.729 2.967 3.199 3.396 3.825 4.011 4.353 4.672 4.989 5.149 5.459 5.753 6.16 6.416 6.67 7.048 7.406 7.749 8.085 8.394 8.77 9.12 9.449 9.865 10.269 10.646 11.093 11.604 12.084 12.579 13.106 13.679 14.273 14.959 15.763 16.511 17.365 18.377 19.496 20.695 21.996 23.198 24.17 24.337 23.894 23.246 22.525 21.76 20.996 20.264 19.63 18.956 18.317 17.693 17.106 16.564 16.031 15.518 14.962 14.451 13.996 13.524 13.027 12.607 12.157 11.659 11.226 10.784 10.354 9.899 9.441 9.103 8.721 8.14 7.745 7.314 7.082 6.599 6.09 5.545 5.257 4.727 4.282 3.918 3.497 2.585 2.099 1.536 0.857 0.048 -0.979 -2.469 -8 ,13394 ,KEBNE ,16723374,Sun Nov 28 02:00:54 CET,Sun Nov 28 03:55:05 CET,0.0 0.498 0.889 1.2 1.468 1.725 1.961 2.392 2.589 2.772 2.905 3.316 3.48 3.806 4.114 4.397 4.532 4.809 5.089 5.473 5.711 5.948 6.285 6.609 6.927 7.238 7.55 7.942 8.314 8.684 9.139 9.582 10.002 10.487 11.046 11.59 12.174 12.805 13.499 14.224 15.003 15.876 16.759 17.773 18.887 20.151 21.469 22.833 24.237 25.478 26.115 26.268 26.025 25.573 25.047 24.525 23.991 23.433 22.849 22.321 21.816 21.293 20.781 20.315 19.863 19.364 18.891 18.459 17.995 17.502 17.082 16.643 16.176 15.787 15.37 14.934 14.474 13.977 13.64 13.328 12.851 12.48 12.075 11.865 11.424 10.96 10.455 10.176 9.669 9.235 8.876 8.486 7.678 7.23 6.74 6.18 5.508 4.681 3.307 -9 ,9558 ,KEBNE ,16723375,Sun Nov 28 02:00:54 CET,Sun Nov 28 03:54:27 CET,0.0 0.468 0.845 1.141 1.399 1.647 1.882 2.3 2.48 2.649 2.739 3.141 3.306 3.617 3.937 4.26 4.411 4.699 4.962 5.334 5.581 5.815 6.169 6.525 6.851 7.166 7.468 7.858 8.249 8.636 9.115 9.592 10.046 10.539 11.098 11.647 12.24 12.861 13.533 14.245 15.004 15.866 16.744 17.748 18.854 20.237 21.824 23.547 25.403 27.247 28.152 28.237 27.963 27.468 26.797 26.109 25.444 24.832 24.197 23.62 23.095 22.578 22.063 21.528 21.014 20.494 20.004 19.583 19.163 18.712 18.32 17.882 17.431 17.105 16.753 16.356 15.945 15.51 15.209 14.909 14.415 14.041 13.641 13.443 13.024 12.566 12.097 11.865 11.384 10.947 10.605 10.243 9.471 9.053 8.525 7.855 7.073 6.075 4.769 -10 ,12366 ,KEBNE ,16723376,Sun Nov 28 02:00:59 CET,Sun Nov 28 03:48:50 CET,0.0 0.461 0.798 1.082 1.362 1.616 1.834 2.24 2.451 2.652 2.775 3.183 3.349 3.653 3.938 4.214 4.351 4.617 4.865 5.217 5.449 5.672 6.018 6.376 6.721 7.047 7.35 7.731 8.086 8.425 8.834 9.225 9.605 10.058 10.573 11.073 11.624 12.22 12.823 13.423 14.137 14.993 15.867 16.904 17.988 19.237 20.631 22.056 23.431 24.799 25.473 25.317 24.915 24.457 23.997 23.519 23.009 22.475 21.836 21.229 20.611 19.981 19.403 18.882 18.405 17.898 17.442 17.053 16.655 16.24 15.881 15.481 15.059 14.716 14.35 13.948 13.519 13.063 12.745 12.434 11.911 11.541 11.157 10.949 10.504 10.053 9.58 9.311 8.808 8.396 8.04 7.659 6.826 6.348 5.82 5.197 4.415 3.474 2.05 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt deleted file mode 100644 index 35ddd9f4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3184 ,KEBNE ,16723377,Sun Nov 28 02:01:53 CET,Sun Nov 28 04:02:37 CET,0.0 2.5 3.433 4.178 4.71 5.163 5.601 6.045 6.833 7.169 7.51 7.836 8.44 8.702 9.223 9.702 10.171 10.424 10.888 11.28 11.86 12.229 12.595 13.117 13.602 14.083 14.527 14.971 15.579 16.145 16.676 17.293 17.893 18.493 19.202 19.981 20.688 21.45 22.257 23.095 23.97 24.976 26.066 26.983 27.935 28.895 29.935 31.042 32.166 33.258 34.146 33.763 32.406 30.832 29.31 27.824 26.464 25.099 23.844 22.624 21.583 20.672 19.791 18.909 18.067 17.301 16.485 15.734 15.099 14.462 13.818 13.295 12.717 12.088 11.612 11.132 10.608 10.076 9.558 9.208 8.846 8.245 7.825 7.396 7.181 6.748 6.263 5.737 5.455 4.836 4.481 4.149 3.813 3.085 2.715 2.303 1.826 1.291 0.647 -0.113 -2.757 -2 ,5841 ,KEBNE ,16723378,Sun Nov 28 02:01:53 CET,Sun Nov 28 04:02:15 CET,0.0 2.524 3.339 3.96 4.475 4.884 5.243 5.597 6.263 6.587 6.893 7.145 7.726 7.987 8.483 8.935 9.368 9.592 10.038 10.445 10.99 11.341 11.687 12.203 12.73 13.236 13.716 14.174 14.758 15.314 15.842 16.444 17.019 17.585 18.213 18.861 19.488 20.204 20.907 21.598 22.299 23.064 23.934 24.756 25.679 26.723 27.877 28.994 30.02 30.81 31.097 30.463 29.238 28.011 26.779 25.458 24.258 23.109 22.078 20.956 19.867 18.934 18.083 17.215 16.374 15.592 14.729 13.963 13.322 12.629 11.904 11.304 10.649 9.951 9.433 8.954 8.443 7.862 7.256 6.848 6.439 5.82 5.365 4.848 4.583 4.063 3.508 2.929 2.641 2.02 1.615 1.245 0.85 -0.022 -0.506 -1.023 -1.595 -2.287 -3.193 -4.404 -8.052 -3 ,24989 ,KEBNE ,16723379,Sun Nov 28 02:01:54 CET,Sun Nov 28 04:03:20 CET,0.0 3.111 4.027 4.708 5.252 5.756 6.227 6.65 7.381 7.711 8.02 8.304 8.917 9.188 9.687 10.142 10.579 10.787 11.198 11.595 12.16 12.533 12.893 13.406 13.907 14.391 14.84 15.269 15.844 16.407 16.949 17.591 18.218 18.838 19.538 20.296 20.988 21.734 22.561 23.442 24.379 25.405 26.575 27.681 28.828 30.056 31.437 32.978 34.572 36.038 37.064 36.667 35.236 33.508 31.969 30.483 29.078 27.7 26.381 25.075 24.023 23.068 22.147 21.3 20.498 19.757 18.935 18.191 17.581 16.93 16.213 15.597 14.956 14.311 13.849 13.367 12.846 12.289 11.719 11.34 10.93 10.31 9.884 9.433 9.181 8.643 8.097 7.528 7.24 6.646 6.324 5.975 5.601 4.773 4.325 3.832 3.285 2.653 1.9 0.934 -1.839 -4 ,6070 ,KEBNE ,16723380,Sun Nov 28 02:02:56 CET,Sun Nov 28 04:04:18 CET,0.0 4.213 5.336 6.105 6.771 7.373 7.924 8.427 9.227 9.598 9.978 10.355 10.979 11.272 11.846 12.363 12.844 13.077 13.536 13.998 14.672 15.087 15.465 15.984 16.468 16.955 17.422 17.826 18.363 18.918 19.441 20.065 20.659 21.204 21.782 22.44 23.093 23.809 24.583 25.404 26.216 27.057 28.061 29.005 29.969 30.984 32.025 33.141 34.317 35.591 36.615 36.233 35.19 33.881 32.471 30.932 29.458 28.107 26.942 25.804 24.778 23.804 22.865 21.996 21.177 20.407 19.624 18.932 18.353 17.757 17.097 16.533 15.95 15.327 14.844 14.349 13.822 13.239 12.626 12.228 11.833 11.2 10.732 10.237 9.979 9.444 8.914 8.347 8.039 7.43 7.085 6.746 6.389 5.585 5.138 4.665 4.187 3.634 2.893 1.857 -0.709 -5 ,25807 ,KEBNE ,16723381,Sun Nov 28 02:02:56 CET,Sun Nov 28 04:04:18 CET,0.0 3.182 4.106 4.813 5.403 5.953 6.465 6.94 7.793 8.164 8.511 8.823 9.459 9.768 10.329 10.837 11.317 11.552 12.014 12.479 13.143 13.567 13.97 14.546 15.086 15.59 16.088 16.583 17.209 17.797 18.362 19.033 19.679 20.299 20.998 21.798 22.578 23.435 24.368 25.325 26.318 27.383 28.498 29.518 30.661 31.883 33.193 34.549 35.711 36.443 36.501 35.475 34.185 33.032 31.991 30.864 29.748 28.676 27.655 26.553 25.584 24.715 23.834 22.992 22.245 21.546 20.791 20.105 19.486 18.832 18.14 17.573 17.01 16.406 15.922 15.411 14.875 14.327 13.752 13.354 12.945 12.306 11.847 11.357 11.107 10.597 10.048 9.469 9.163 8.527 8.124 7.759 7.375 6.551 6.109 5.615 5.024 4.383 3.661 2.76 0.603 -6 ,540 ,KEBNE ,16723382,Sun Nov 28 02:02:56 CET,Sun Nov 28 04:04:44 CET,0.0 4.237 5.276 5.9 6.407 6.888 7.35 7.775 8.513 8.838 9.154 9.405 9.981 10.237 10.749 11.263 11.727 11.946 12.383 12.805 13.41 13.793 14.176 14.708 15.213 15.713 16.199 16.668 17.281 17.879 18.432 19.076 19.681 20.247 20.904 21.644 22.353 23.099 23.869 24.706 25.588 26.551 27.64 28.683 29.895 31.34 32.93 34.517 36.091 37.524 38.531 38.163 36.98 35.465 33.859 32.291 30.849 29.545 28.396 27.18 26.106 25.112 24.156 23.265 22.427 21.681 20.899 20.164 19.512 18.845 18.143 17.535 16.91 16.295 15.83 15.359 14.868 14.317 13.725 13.322 12.904 12.243 11.781 11.313 11.073 10.56 9.99 9.395 9.088 8.477 8.132 7.757 7.369 6.594 6.156 5.65 5.113 4.493 3.715 2.765 0.077 -8 ,25849 ,KEBNE ,16723384,Sun Nov 28 02:05:02 CET,Sun Nov 28 03:59:29 CET,0.0 3.574 4.554 5.344 6.007 6.592 7.155 7.649 8.521 8.945 9.369 9.808 10.479 10.828 11.502 12.112 12.631 12.88 13.363 13.814 14.484 14.92 15.337 15.919 16.447 16.964 17.474 17.977 18.624 19.21 19.792 20.536 21.263 21.967 22.742 23.589 24.408 25.292 26.259 27.305 28.396 29.58 30.875 32.148 33.64 35.249 36.94 38.689 40.491 42.14 43.258 43.355 42.762 41.696 40.498 39.281 38.092 36.891 35.78 34.64 33.654 32.771 31.859 30.97 30.113 29.315 28.496 27.757 27.116 26.46 25.767 25.176 24.56 23.924 23.456 22.944 22.393 21.841 21.274 20.885 20.485 19.83 19.37 18.905 18.665 18.159 17.59 16.982 16.676 16.069 15.755 15.423 15.053 14.182 13.694 13.188 12.609 11.972 11.246 10.367 7.684 -9 ,19911 ,KEBNE ,16723385,Sun Nov 28 02:07:02 CET,Sun Nov 28 04:08:31 CET,0.0 2.638 3.494 4.152 4.717 5.2 5.611 5.992 6.734 7.073 7.387 7.642 8.239 8.502 9.015 9.526 10.02 10.251 10.691 11.113 11.754 12.181 12.603 13.215 13.795 14.329 14.83 15.327 15.972 16.579 17.153 17.869 18.57 19.236 19.984 20.774 21.512 22.396 23.379 24.337 25.327 26.428 27.511 28.497 29.638 30.859 32.203 33.532 34.801 35.932 36.49 35.905 34.844 33.679 32.389 30.886 29.471 28.131 26.924 25.666 24.54 23.512 22.547 21.605 20.699 19.878 19.013 18.258 17.609 16.906 16.137 15.499 14.852 14.185 13.668 13.142 12.606 12.06 11.457 11.017 10.586 9.943 9.501 9.036 8.8 8.311 7.753 7.171 6.874 6.264 5.939 5.611 5.282 4.6 4.209 3.769 3.287 2.758 2.116 1.271 -1.472 -10 ,23961 ,KEBNE ,16723386,Sun Nov 28 02:07:06 CET,Sun Nov 28 04:06:17 CET,0.0 3.228 4.016 4.653 5.195 5.692 6.16 6.575 7.316 7.677 8.029 8.35 8.97 9.25 9.813 10.334 10.846 11.116 11.643 12.103 12.721 13.146 13.568 14.157 14.717 15.279 15.838 16.356 16.982 17.574 18.129 18.746 19.337 19.934 20.634 21.396 22.119 22.924 23.736 24.586 25.42 26.289 27.319 28.253 29.249 30.301 31.339 32.42 33.5 34.48 35.05 34.462 33.425 32.135 30.828 29.552 28.283 27.03 25.885 24.757 23.807 22.95 22.104 21.261 20.452 19.743 18.992 18.308 17.732 17.113 16.467 15.945 15.398 14.815 14.347 13.859 13.348 12.799 12.235 11.858 11.465 10.846 10.414 9.953 9.705 9.199 8.686 8.14 7.851 7.246 6.883 6.533 6.161 5.326 4.86 4.383 3.885 3.302 2.619 1.725 -0.777 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index 5752020f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29612 ,KEBNE ,16723387,Sun Nov 28 02:08:03 CET,Sun Nov 28 04:06:16 CET,0.0 1.996 2.682 3.216 3.663 4.064 4.436 4.789 5.442 5.732 6.003 6.141 6.757 7.007 7.485 7.927 8.356 8.567 8.974 9.365 9.929 10.279 10.624 11.15 11.636 12.114 12.591 13.034 13.581 14.11 14.631 15.247 15.857 16.48 17.209 18.006 18.736 19.552 20.461 21.39 22.356 23.445 24.697 25.98 27.484 29.138 30.989 32.994 35.292 37.949 41.026 43.324 44.516 45.097 45.309 45.314 45.168 44.928 44.671 44.336 44.025 43.606 43.091 42.63 42.171 41.718 41.223 40.779 40.381 39.959 39.53 39.157 38.748 38.302 37.954 37.583 37.19 36.798 36.4 36.128 35.833 35.313 34.931 34.555 34.37 33.965 33.527 33.098 32.876 32.313 32.137 31.87 31.575 30.901 30.518 30.104 29.607 29.036 28.335 27.398 24.53 -3 ,6996 ,KEBNE ,16723389,Sun Nov 28 02:09:09 CET,Sun Nov 28 04:13:04 CET,0.0 1.348 2.048 2.616 3.139 3.595 3.991 4.368 5.025 5.324 5.607 5.765 6.392 6.646 7.126 7.577 8.01 8.216 8.605 8.981 9.544 9.907 10.262 10.785 11.286 11.771 12.229 12.671 13.256 13.816 14.346 15.012 15.649 16.222 16.894 17.664 18.394 19.178 20.033 20.935 21.888 22.967 24.2 25.463 26.916 28.534 30.407 32.489 34.853 37.65 40.876 43.169 44.251 44.711 44.865 44.786 44.553 44.262 43.899 43.368 42.88 42.474 42.057 41.591 41.136 40.679 40.167 39.718 39.302 38.845 38.331 37.909 37.482 37.014 36.643 36.267 35.886 35.479 35.046 34.746 34.438 33.934 33.58 33.225 33.029 32.617 32.199 31.716 31.459 30.86 30.601 30.296 29.971 29.244 28.829 28.358 27.811 27.2 26.48 25.511 22.951 -5 ,26158 ,KEBNE ,16723391,Sun Nov 28 02:10:07 CET,Sun Nov 28 04:09:50 CET,0.0 1.926 2.64 3.224 3.661 4.038 4.394 4.732 5.382 5.692 5.975 6.134 6.75 6.998 7.465 7.918 8.357 8.565 8.974 9.365 9.916 10.267 10.607 11.114 11.602 12.069 12.515 12.94 13.492 14.055 14.603 15.255 15.879 16.469 17.157 17.94 18.698 19.517 20.385 21.345 22.36 23.494 24.836 26.175 27.726 29.425 31.331 33.402 35.813 38.72 41.997 44.388 45.656 46.317 46.554 46.486 46.246 45.927 45.653 45.352 45.026 44.721 44.37 43.931 43.461 43.016 42.525 42.07 41.664 41.25 40.847 40.484 40.066 39.629 39.277 38.91 38.547 38.163 37.738 37.443 37.129 36.626 36.275 35.905 35.719 35.315 34.882 34.428 34.179 33.591 33.357 33.042 32.702 31.946 31.536 31.103 30.604 29.996 29.295 28.386 24.623 -7 ,8455 ,KEBNE ,16723393,Sun Nov 28 02:12:13 CET,Sun Nov 28 04:09:50 CET,0.0 2.013 2.815 3.416 3.887 4.276 4.643 4.992 5.645 5.94 6.225 6.416 7.042 7.301 7.776 8.225 8.659 8.87 9.284 9.672 10.208 10.569 10.926 11.441 11.943 12.418 12.881 13.323 13.901 14.459 14.974 15.606 16.239 16.812 17.463 18.22 18.937 19.735 20.583 21.501 22.48 23.537 24.717 25.899 27.303 28.894 30.723 32.809 35.262 38.057 41.347 43.809 45.059 45.764 46.102 46.136 45.998 45.803 45.524 45.102 44.648 44.217 43.765 43.274 42.812 42.354 41.848 41.424 41.04 40.606 40.172 39.821 39.448 39.041 38.691 38.318 37.925 37.514 37.089 36.793 36.503 36.049 35.725 35.382 35.202 34.803 34.388 33.96 33.725 33.156 32.923 32.615 32.309 31.625 31.203 30.718 30.224 29.695 29.05 28.134 25.245 -8 ,12486 ,KEBNE ,16723394,Sun Nov 28 02:13:11 CET,Sun Nov 28 04:11:11 CET,0.0 1.735 2.443 3.025 3.525 3.939 4.318 4.668 5.306 5.607 5.888 6.061 6.687 6.935 7.398 7.835 8.278 8.495 8.889 9.281 9.845 10.19 10.527 11.021 11.492 11.95 12.405 12.843 13.409 13.956 14.479 15.106 15.706 16.288 16.971 17.759 18.542 19.409 20.324 21.261 22.26 23.387 24.695 26.045 27.587 29.26 31.168 33.229 35.569 38.363 41.714 44.197 45.512 46.172 46.453 46.564 46.539 46.382 46.143 45.776 45.373 44.967 44.57 44.198 43.77 43.311 42.853 42.438 42.05 41.658 41.221 40.831 40.438 40.029 39.696 39.357 39.008 38.612 38.182 37.881 37.575 37.08 36.724 36.353 36.155 35.748 35.313 34.833 34.584 33.996 33.752 33.458 33.151 32.462 32.071 31.622 31.094 30.51 29.814 28.841 25.262 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt deleted file mode 100644 index b9730f2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,2387 ,KEBNE ,16723398,Sun Nov 28 02:14:13 CET,Sun Nov 28 04:12:43 CET,0.0 2.653 3.591 4.285 4.832 5.341 5.825 6.266 7.068 7.424 7.756 8.04 8.709 9.002 9.559 10.1 10.625 10.889 11.394 11.843 12.502 12.942 13.366 13.978 14.567 15.139 15.694 16.242 16.935 17.597 18.255 19.051 19.845 20.644 21.556 22.55 23.479 24.491 25.54 26.671 27.885 29.243 30.889 32.49 34.304 36.394 38.881 41.654 44.696 47.862 50.982 52.954 53.746 53.93 53.667 53.224 52.681 52.04 51.434 50.793 50.198 49.635 49.075 48.492 47.929 47.415 46.873 46.381 45.925 45.443 44.942 44.518 44.063 43.546 43.121 42.705 42.311 41.882 41.373 41.0 40.617 40.022 39.592 39.146 38.926 38.458 37.967 37.447 37.172 36.581 36.316 36.014 35.689 34.98 34.586 34.182 33.728 33.163 32.465 31.516 28.875 -3 ,18335 ,KEBNE ,16723399,Sun Nov 28 02:14:13 CET,Sun Nov 28 04:12:45 CET,0.0 2.215 3.027 3.684 4.312 4.848 5.32 5.76 6.586 6.972 7.342 7.654 8.327 8.639 9.25 9.828 10.377 10.635 11.124 11.598 12.274 12.704 13.124 13.768 14.388 14.963 15.533 16.082 16.783 17.468 18.145 18.971 19.742 20.492 21.388 22.39 23.333 24.435 25.648 26.89 28.164 29.559 31.243 32.933 34.876 37.015 39.434 42.12 45.357 48.93 52.43 54.812 55.724 55.939 55.74 55.265 54.687 54.049 53.448 52.844 52.263 51.714 51.147 50.575 49.995 49.455 48.917 48.431 48.0 47.553 47.064 46.625 46.146 45.647 45.277 44.896 44.515 44.115 43.672 43.364 43.04 42.525 42.154 41.755 41.55 41.113 40.666 40.188 39.931 39.341 39.066 38.727 38.372 37.59 37.163 36.709 36.213 35.651 34.967 33.971 30.414 -4 ,16811 ,KEBNE ,16723400,Sun Nov 28 02:14:13 CET,Sun Nov 28 04:12:45 CET,0.0 2.505 3.363 4.033 4.585 5.083 5.528 5.948 6.755 7.127 7.487 7.8 8.477 8.784 9.368 9.933 10.466 10.712 11.176 11.615 12.267 12.698 13.107 13.698 14.282 14.876 15.464 16.035 16.789 17.531 18.254 19.079 19.805 20.516 21.352 22.309 23.266 24.319 25.432 26.656 27.974 29.435 31.188 32.992 35.089 37.338 39.889 42.701 45.786 49.217 52.795 54.932 55.621 55.75 55.617 55.196 54.634 54.07 53.529 52.93 52.351 51.762 51.197 50.661 50.126 49.611 49.07 48.582 48.155 47.701 47.202 46.788 46.349 45.879 45.505 45.116 44.721 44.311 43.887 43.574 43.213 42.63 42.227 41.82 41.617 41.193 40.724 40.22 39.958 39.366 39.071 38.73 38.375 37.599 37.164 36.711 36.231 35.566 34.728 33.728 30.327 -5 ,8239 ,KEBNE ,16723401,Sun Nov 28 02:15:14 CET,Sun Nov 28 04:13:41 CET,0.0 3.931 4.809 5.469 6.044 6.54 6.987 7.425 8.215 8.565 8.904 9.164 9.811 10.093 10.641 11.152 11.631 11.87 12.342 12.813 13.495 13.939 14.372 14.973 15.538 16.102 16.653 17.18 17.874 18.588 19.303 20.114 20.87 21.63 22.51 23.47 24.41 25.444 26.534 27.721 28.979 30.393 31.999 33.586 35.486 37.634 40.049 42.657 45.594 48.664 51.847 53.973 54.764 54.843 54.553 54.086 53.566 53.017 52.463 51.836 51.259 50.703 50.158 49.634 49.092 48.577 48.01 47.488 47.042 46.571 46.089 45.685 45.268 44.805 44.413 44.018 43.621 43.194 42.747 42.432 42.094 41.497 41.053 40.618 40.395 39.932 39.433 38.903 38.64 38.038 37.738 37.424 37.108 36.355 35.94 35.497 34.992 34.376 33.544 32.397 27.654 -6 ,13335 ,KEBNE ,16723402,Sun Nov 28 02:14:17 CET,Sun Nov 28 04:10:27 CET,0.0 2.452 3.371 4.074 4.668 5.217 5.707 6.131 6.919 7.289 7.65 7.967 8.637 8.929 9.52 10.081 10.589 10.839 11.325 11.782 12.457 12.903 13.336 13.946 14.52 15.082 15.634 16.17 16.875 17.552 18.207 18.992 19.734 20.473 21.345 22.343 23.305 24.312 25.415 26.617 27.859 29.222 30.82 32.453 34.392 36.629 39.134 41.887 45.053 48.465 52.091 54.555 55.508 55.604 55.242 54.744 54.199 53.602 53.006 52.361 51.774 51.198 50.595 50.014 49.461 48.951 48.38 47.843 47.386 46.886 46.367 45.907 45.409 44.922 44.538 44.138 43.726 43.269 42.798 42.488 42.146 41.606 41.232 40.835 40.604 40.1 39.623 39.128 38.868 38.282 38.02 37.705 37.387 36.662 36.245 35.744 35.204 34.613 33.806 32.736 29.343 -8 ,543 ,KEBNE ,16723404,Sun Nov 28 02:14:13 CET,Sun Nov 28 04:12:13 CET,0.0 1.585 2.326 2.94 3.467 3.973 4.468 4.903 5.68 6.049 6.408 6.718 7.382 7.671 8.236 8.798 9.341 9.6 10.092 10.547 11.199 11.627 12.032 12.609 13.178 13.737 14.278 14.817 15.52 16.198 16.855 17.616 18.332 19.04 19.876 20.851 21.819 22.857 23.952 25.117 26.346 27.797 29.503 31.138 33.018 35.067 37.41 40.077 43.158 46.604 50.353 52.699 53.568 53.738 53.443 52.958 52.4 51.768 51.131 50.424 49.768 49.15 48.563 48.017 47.477 46.927 46.344 45.825 45.349 44.823 44.288 43.821 43.332 42.793 42.36 41.933 41.482 41.031 40.547 40.197 39.833 39.283 38.914 38.534 38.335 37.907 37.443 36.923 36.651 36.059 35.76 35.441 35.106 34.34 33.923 33.479 32.979 32.391 31.672 30.658 26.616 -9 ,30388 ,KEBNE ,16723405,Sun Nov 28 02:14:13 CET,Sun Nov 28 04:12:28 CET,0.0 3.154 4.012 4.676 5.209 5.7 6.159 6.577 7.322 7.671 8.003 8.249 8.896 9.178 9.743 10.286 10.798 11.047 11.538 12.006 12.681 13.133 13.57 14.197 14.807 15.386 15.931 16.458 17.142 17.801 18.46 19.266 20.037 20.788 21.663 22.656 23.6 24.624 25.735 26.916 28.158 29.566 31.262 32.998 35.029 37.294 39.76 42.471 45.613 49.158 53.093 55.381 56.108 56.151 55.829 55.349 54.763 54.121 53.512 52.846 52.211 51.609 51.024 50.425 49.851 49.353 48.822 48.335 47.898 47.439 46.947 46.505 46.055 45.621 45.26 44.859 44.443 44.019 43.568 43.24 42.91 42.408 42.026 41.599 41.365 40.888 40.416 39.929 39.682 39.111 38.857 38.532 38.179 37.383 36.945 36.48 35.98 35.377 34.626 33.621 30.416 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 6a28bfdc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -5 ,30866 ,KEBNE ,16723411,Sun Nov 28 02:15:18 CET,Sun Nov 28 04:08:27 CET,0.0 1.492 2.01 2.408 2.732 3.024 3.294 3.554 4.062 4.303 4.532 4.679 5.163 5.359 5.742 6.117 6.47 6.642 6.989 7.31 7.766 8.067 8.365 8.802 9.224 9.643 10.05 10.443 10.964 11.468 11.947 12.526 13.113 13.686 14.347 15.114 15.851 16.672 17.604 18.638 19.739 20.976 22.472 24.021 25.805 27.823 30.198 32.836 35.951 39.75 44.396 48.314 50.527 51.883 52.769 53.27 53.544 53.693 53.741 53.704 53.623 53.514 53.362 53.192 52.998 52.793 52.544 52.292 52.052 51.8 51.549 51.307 51.032 50.752 50.535 50.309 50.06 49.788 49.465 49.229 49.001 48.599 48.297 47.993 47.832 47.471 47.08 46.669 46.437 45.954 45.613 45.324 45.028 44.388 43.988 43.496 42.963 42.358 41.69 40.558 30.973 -6 ,9823 ,KEBNE ,16723412,Sun Nov 28 02:15:14 CET,Sun Nov 28 04:09:32 CET,0.0 1.59 2.114 2.519 2.87 3.188 3.488 3.775 4.315 4.566 4.797 4.937 5.44 5.664 6.088 6.479 6.86 7.042 7.402 7.756 8.264 8.592 8.909 9.372 9.835 10.289 10.723 11.141 11.684 12.214 12.723 13.347 13.967 14.585 15.316 16.151 16.932 17.78 18.714 19.728 20.825 22.076 23.53 25.03 26.832 28.91 31.394 34.146 37.422 41.512 46.343 50.101 52.272 53.566 54.338 54.817 55.069 55.197 55.241 55.195 55.101 54.947 54.733 54.506 54.275 54.034 53.72 53.388 53.124 52.839 52.5 52.222 51.957 51.687 51.471 51.236 50.965 50.667 50.343 50.109 49.858 49.464 49.169 48.831 48.669 48.327 47.951 47.58 47.369 46.905 46.629 46.358 46.075 45.414 44.989 44.531 44.07 43.404 42.488 41.246 34.499 -10 ,5096 ,KEBNE ,16723416,Sun Nov 28 02:16:17 CET,Sun Nov 28 04:10:14 CET,0.0 1.214 1.708 2.112 2.505 2.878 3.197 3.483 4.029 4.288 4.534 4.727 5.236 5.452 5.875 6.279 6.664 6.858 7.24 7.615 8.164 8.511 8.838 9.327 9.817 10.301 10.76 11.192 11.75 12.305 12.85 13.502 14.129 14.747 15.501 16.338 17.148 18.074 19.11 20.233 21.39 22.729 24.373 26.051 28.024 30.242 32.842 35.854 39.498 43.853 48.836 52.798 54.977 56.175 56.915 57.371 57.657 57.775 57.744 57.68 57.585 57.433 57.279 57.124 56.938 56.746 56.546 56.314 56.029 55.705 55.406 55.159 54.869 54.571 54.351 54.119 53.841 53.522 53.211 52.989 52.743 52.341 52.028 51.691 51.536 51.196 50.818 50.428 50.221 49.759 49.423 49.149 48.848 48.112 47.694 47.246 46.709 46.024 45.097 43.908 34.913 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt deleted file mode 100644 index 55b8bad2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17684 ,KEBNE ,16723417,Sun Nov 28 02:16:17 CET,Sun Nov 28 04:11:04 CET,0.0 1.097 1.525 1.876 2.206 2.499 2.79 3.088 3.65 3.915 4.172 4.384 4.91 5.148 5.598 6.036 6.455 6.655 7.047 7.432 8.019 8.395 8.761 9.305 9.828 10.34 10.84 11.324 11.982 12.634 13.264 14.033 14.777 15.504 16.357 17.348 18.331 19.409 20.593 21.871 23.221 24.792 26.714 28.705 31.044 33.716 36.87 40.517 44.957 50.475 57.539 63.775 67.737 70.429 72.298 73.663 74.623 75.27 75.725 76.096 76.359 76.575 76.7 76.748 76.74 76.68 76.597 76.461 76.272 76.076 75.899 75.727 75.505 75.26 75.083 74.871 74.612 74.333 74.023 73.799 73.566 73.191 72.926 72.633 72.486 72.174 71.836 71.474 71.267 70.844 70.5 70.216 69.919 69.274 68.913 68.472 67.928 67.234 66.351 65.22 57.112 -2 ,4670 ,KEBNE ,16723418,Sun Nov 28 02:16:21 CET,Sun Nov 28 04:08:48 CET,0.0 1.177 1.665 2.106 2.511 2.864 3.19 3.492 4.035 4.294 4.548 4.742 5.263 5.497 5.941 6.369 6.785 6.997 7.405 7.78 8.337 8.717 9.094 9.639 10.171 10.7 11.208 11.697 12.347 12.974 13.574 14.322 15.057 15.772 16.617 17.578 18.545 19.638 20.822 22.116 23.511 25.126 27.06 29.018 31.332 33.993 37.149 40.815 45.348 51.041 58.232 64.448 68.231 70.537 72.053 73.18 73.995 74.626 75.024 75.279 75.431 75.516 75.578 75.613 75.581 75.505 75.415 75.319 75.222 75.111 74.978 74.848 74.691 74.494 74.329 74.161 73.966 73.761 73.545 73.377 73.194 72.873 72.658 72.448 72.323 72.021 71.685 71.345 71.167 70.778 70.532 70.29 70.027 69.422 69.087 68.684 68.197 67.641 66.88 65.706 60.437 -4 ,11358 ,KEBNE ,16723420,Sun Nov 28 02:17:19 CET,Sun Nov 28 04:12:44 CET,0.0 1.238 1.732 2.145 2.522 2.866 3.182 3.465 3.998 4.258 4.506 4.694 5.198 5.427 5.869 6.287 6.703 6.903 7.301 7.709 8.295 8.674 9.037 9.553 10.068 10.572 11.053 11.533 12.165 12.779 13.392 14.147 14.888 15.602 16.428 17.376 18.309 19.362 20.515 21.761 23.094 24.639 26.516 28.413 30.657 33.271 36.42 40.079 44.472 49.894 56.832 62.916 66.645 69.113 70.712 71.886 72.73 73.336 73.796 74.121 74.3 74.375 74.372 74.329 74.223 74.114 74.032 73.949 73.846 73.676 73.433 73.229 73.025 72.793 72.597 72.376 72.128 71.839 71.508 71.288 71.059 70.627 70.303 70.004 69.853 69.498 69.107 68.673 68.441 67.988 67.63 67.343 67.004 66.226 65.812 65.373 64.871 64.26 63.534 62.493 56.805 -5 ,8403 ,KEBNE ,16723421,Sun Nov 28 02:17:19 CET,Sun Nov 28 04:12:10 CET,0.0 1.069 1.551 1.93 2.287 2.592 2.89 3.181 3.717 3.982 4.246 4.442 4.947 5.176 5.621 6.06 6.479 6.688 7.096 7.488 8.075 8.454 8.826 9.365 9.884 10.395 10.908 11.402 12.038 12.664 13.276 14.027 14.744 15.44 16.286 17.27 18.235 19.313 20.478 21.733 23.108 24.697 26.587 28.526 30.858 33.583 36.85 40.726 45.427 51.009 57.972 64.171 68.048 70.482 72.086 73.281 74.134 74.716 75.044 75.298 75.525 75.705 75.82 75.897 75.906 75.841 75.742 75.637 75.544 75.417 75.257 75.115 74.933 74.723 74.555 74.363 74.143 73.911 73.648 73.46 73.264 72.932 72.673 72.397 72.258 71.959 71.63 71.263 71.071 70.687 70.407 70.145 69.873 69.272 68.931 68.535 68.082 67.548 66.879 66.01 54.739 -6 ,17428 ,KEBNE ,16723422,Sun Nov 28 02:17:19 CET,Sun Nov 28 04:13:22 CET,0.0 0.986 1.428 1.803 2.15 2.474 2.792 3.114 3.715 4.002 4.269 4.473 4.985 5.214 5.659 6.082 6.502 6.706 7.099 7.489 8.064 8.432 8.79 9.32 9.841 10.371 10.887 11.38 12.035 12.668 13.289 14.064 14.806 15.521 16.376 17.357 18.324 19.407 20.568 21.823 23.202 24.789 26.715 28.723 31.084 33.789 37.011 40.694 45.215 50.796 57.706 63.684 67.464 70.066 71.838 73.054 73.946 74.664 75.187 75.568 75.767 75.856 75.868 75.836 75.755 75.661 75.563 75.464 75.357 75.232 75.092 74.944 74.754 74.505 74.296 74.081 73.839 73.587 73.319 73.114 72.887 72.564 72.354 72.107 71.981 71.72 71.386 71.031 70.856 70.467 70.193 69.905 69.622 68.946 68.567 68.164 67.729 67.153 66.432 65.447 55.517 -8 ,10165 ,KEBNE ,16723424,Sun Nov 28 02:17:19 CET,Sun Nov 28 04:13:07 CET,0.0 1.222 1.775 2.218 2.612 2.97 3.295 3.6 4.158 4.431 4.705 4.969 5.496 5.732 6.2 6.637 7.065 7.272 7.677 8.072 8.64 8.994 9.348 9.896 10.404 10.899 11.405 11.885 12.504 13.129 13.748 14.503 15.233 15.953 16.809 17.786 18.733 19.788 20.96 22.222 23.559 25.094 26.938 28.842 31.133 33.773 36.865 40.436 44.77 50.128 56.996 63.013 66.716 69.162 70.875 72.132 73.019 73.68 74.163 74.538 74.688 74.731 74.81 74.847 74.79 74.685 74.515 74.319 74.145 73.963 73.757 73.58 73.373 73.132 72.941 72.737 72.504 72.258 71.984 71.766 71.528 71.124 70.815 70.505 70.358 70.029 69.646 69.25 69.047 68.629 68.355 68.108 67.817 67.172 66.816 66.386 65.898 65.29 64.568 63.552 55.737 -10 ,15463 ,KEBNE ,16723426,Sun Nov 28 02:18:20 CET,Sun Nov 28 04:14:32 CET,0.0 0.988 1.441 1.826 2.166 2.486 2.794 3.076 3.595 3.852 4.1 4.275 4.777 4.997 5.424 5.836 6.245 6.445 6.827 7.203 7.763 8.127 8.482 8.997 9.498 9.985 10.458 10.931 11.551 12.165 12.782 13.546 14.273 14.983 15.832 16.81 17.779 18.862 20.057 21.347 22.717 24.285 26.14 28.032 30.298 32.986 36.207 39.851 44.21 49.514 56.324 62.387 66.134 68.603 70.28 71.464 72.278 72.906 73.363 73.71 73.949 74.071 74.057 73.997 73.924 73.831 73.712 73.568 73.455 73.354 73.225 73.091 72.917 72.709 72.529 72.326 72.11 71.867 71.609 71.43 71.233 70.91 70.688 70.456 70.325 70.033 69.694 69.325 69.128 68.717 68.486 68.259 67.979 67.26 66.84 66.419 65.965 65.389 64.713 63.513 52.926 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index f1b5143c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16531 ,KEBNE ,16723427,Sun Nov 28 02:18:20 CET,Sun Nov 28 04:18:16 CET,0.0 0.783 1.45 2.025 2.546 3.043 3.515 4.412 4.843 5.263 5.553 6.432 6.803 7.529 8.231 8.913 9.252 9.915 10.552 11.486 12.101 12.708 13.615 14.526 15.416 16.278 17.121 18.236 19.326 20.381 21.7 23.016 24.314 25.843 27.601 29.33 31.284 33.426 35.739 38.264 41.214 44.827 48.619 53.168 58.488 64.95 72.613 82.204 94.491 111.041 126.544 136.909 144.441 150.006 154.322 157.632 160.327 162.445 164.337 165.82 167.021 168.038 168.899 169.623 170.225 170.776 171.184 171.48 171.78 172.066 172.204 172.337 172.497 172.607 172.699 172.728 172.695 172.635 172.582 172.509 172.377 172.272 172.134 172.056 171.875 171.631 171.361 171.21 170.697 170.6 170.341 170.075 169.459 169.04 168.543 167.941 167.187 166.189 164.535 -2 ,3488 ,KEBNE ,16723428,Sun Nov 28 02:18:21 CET,Sun Nov 28 04:18:08 CET,0.0 0.771 1.44 2.05 2.601 3.097 3.566 4.483 4.916 5.335 5.62 6.523 6.91 7.653 8.357 9.049 9.389 10.04 10.683 11.641 12.273 12.894 13.793 14.675 15.548 16.409 17.26 18.38 19.478 20.57 21.916 23.239 24.533 26.034 27.755 29.47 31.42 33.574 35.901 38.422 41.363 44.914 48.613 53.1 58.316 64.691 72.299 81.61 93.432 109.515 124.78 134.925 142.181 147.523 151.654 154.938 157.612 159.678 161.464 162.783 163.859 164.778 165.586 166.322 166.924 167.448 167.849 168.173 168.489 168.753 168.914 169.013 169.089 169.109 169.088 169.059 169.01 168.945 168.896 168.824 168.668 168.548 168.402 168.318 168.098 167.839 167.576 167.429 166.937 166.86 166.586 166.28 165.629 165.236 164.761 164.202 163.522 162.66 161.46 -3 ,4180 ,KEBNE ,16723429,Sun Nov 28 02:19:22 CET,Sun Nov 28 04:18:56 CET,0.0 0.863 1.558 2.196 2.772 3.287 3.782 4.723 5.15 5.554 5.837 6.705 7.083 7.825 8.539 9.225 9.57 10.265 10.931 11.901 12.542 13.185 14.129 15.039 15.936 16.799 17.647 18.777 19.878 20.964 22.297 23.603 24.89 26.417 28.17 29.891 31.826 33.955 36.312 38.869 41.805 45.383 49.13 53.632 58.9 65.327 72.957 82.525 94.794 111.313 126.904 137.26 144.71 150.222 154.528 157.876 160.58 162.694 164.589 166.062 167.23 168.248 169.153 169.908 170.522 171.105 171.572 171.95 172.305 172.63 172.864 173.042 173.183 173.239 173.237 173.218 173.177 173.105 173.019 172.918 172.785 172.676 172.563 172.513 172.363 172.157 171.93 171.799 171.314 171.232 171.031 170.813 170.227 169.834 169.361 168.796 168.14 167.385 166.224 -4 ,10631 ,KEBNE ,16723430,Sun Nov 28 02:19:25 CET,Sun Nov 28 04:25:27 CET,0.0 0.862 1.563 2.157 2.689 3.193 3.681 4.572 4.983 5.401 5.709 6.604 6.984 7.703 8.403 9.09 9.434 10.106 10.743 11.677 12.29 12.908 13.823 14.708 15.586 16.459 17.317 18.441 19.533 20.597 21.926 23.257 24.555 26.081 27.843 29.588 31.553 33.728 36.106 38.672 41.65 45.235 48.988 53.54 58.877 65.373 73.11 82.898 95.393 112.089 127.934 138.591 146.26 151.908 156.322 159.749 162.462 164.565 166.469 167.948 169.154 170.18 171.062 171.837 172.373 172.828 173.244 173.556 173.834 174.075 174.222 174.346 174.465 174.561 174.643 174.68 174.706 174.717 174.703 174.691 174.656 174.599 174.446 174.335 174.168 173.981 173.745 173.618 173.113 172.991 172.757 172.482 171.883 171.54 171.103 170.54 169.845 168.978 167.709 -5 ,3123 ,KEBNE ,16723431,Sun Nov 28 02:19:22 CET,Sun Nov 28 04:18:58 CET,0.0 0.779 1.435 2.032 2.574 3.067 3.544 4.442 4.856 5.262 5.54 6.423 6.801 7.542 8.255 8.942 9.275 9.923 10.562 11.501 12.122 12.738 13.642 14.536 15.424 16.288 17.128 18.241 19.345 20.435 21.782 23.1 24.394 25.916 27.642 29.351 31.284 33.411 35.727 38.238 41.194 44.77 48.498 53.011 58.3 64.706 72.307 81.884 94.019 110.107 125.416 135.804 143.201 148.59 152.841 156.161 158.808 160.851 162.66 164.043 165.156 166.117 166.898 167.581 168.196 168.73 169.145 169.477 169.768 170.001 170.152 170.294 170.397 170.428 170.418 170.406 170.38 170.336 170.283 170.201 170.029 169.889 169.748 169.673 169.492 169.258 168.973 168.826 168.358 168.31 168.098 167.861 167.217 166.802 166.331 165.788 165.144 164.317 162.986 -6 ,31654 ,KEBNE ,16723432,Sun Nov 28 02:19:22 CET,Sun Nov 28 04:20:17 CET,0.0 0.816 1.486 2.083 2.624 3.128 3.612 4.516 4.956 5.369 5.646 6.524 6.898 7.638 8.363 9.064 9.408 10.099 10.776 11.747 12.379 13.003 13.931 14.842 15.713 16.565 17.409 18.506 19.591 20.667 21.971 23.251 24.521 26.023 27.774 29.496 31.404 33.513 35.822 38.337 41.268 44.794 48.469 52.95 58.204 64.605 72.309 81.997 94.332 110.946 126.621 137.057 144.642 150.275 154.607 157.891 160.458 162.4 164.102 165.455 166.602 167.606 168.458 169.156 169.716 170.255 170.696 171.037 171.355 171.634 171.834 172.012 172.154 172.248 172.36 172.431 172.44 172.43 172.391 172.346 172.299 172.25 172.155 172.086 171.937 171.74 171.471 171.327 170.849 170.807 170.605 170.355 169.725 169.394 168.982 168.385 167.682 166.76 165.276 -7 ,21900 ,KEBNE ,16723433,Sun Nov 28 02:21:26 CET,Sun Nov 28 04:21:16 CET,0.0 0.826 1.475 2.037 2.563 3.068 3.554 4.432 4.858 5.278 5.586 6.482 6.852 7.567 8.261 8.963 9.318 9.997 10.652 11.638 12.289 12.915 13.829 14.736 15.629 16.501 17.345 18.44 19.544 20.646 21.991 23.308 24.625 26.2 28.0 29.772 31.773 33.973 36.367 38.952 41.951 45.565 49.34 53.915 59.193 65.603 73.216 82.696 94.885 111.159 126.097 136.137 143.348 148.543 152.785 156.23 158.982 161.144 163.072 164.541 165.734 166.789 167.691 168.413 168.989 169.541 170.022 170.417 170.773 171.056 171.245 171.414 171.544 171.64 171.74 171.787 171.766 171.759 171.767 171.746 171.662 171.562 171.43 171.362 171.201 170.967 170.651 170.494 170.034 170.034 169.836 169.609 168.991 168.607 168.188 167.714 167.143 166.407 165.365 -8 ,4444 ,KEBNE ,16723434,Sun Nov 28 02:22:28 CET,Sun Nov 28 04:22:53 CET,0.0 0.809 1.491 2.114 2.688 3.213 3.711 4.645 5.094 5.541 5.881 6.779 7.165 7.925 8.661 9.371 9.718 10.402 11.073 12.052 12.683 13.308 14.242 15.143 16.022 16.897 17.76 18.903 20.028 21.123 22.482 23.825 25.125 26.66 28.433 30.168 32.11 34.268 36.634 39.221 42.223 45.819 49.582 54.142 59.457 65.958 73.685 83.275 95.412 111.703 127.166 137.416 144.696 150.096 154.319 157.56 160.136 162.086 163.848 165.234 166.331 167.268 168.043 168.654 169.163 169.634 169.991 170.28 170.552 170.782 170.914 171.03 171.144 171.192 171.224 171.238 171.21 171.136 171.072 171.019 170.918 170.793 170.638 170.561 170.334 170.011 169.678 169.514 169.034 168.932 168.684 168.439 167.805 167.348 166.84 166.238 165.446 164.464 163.125 -9 ,19035 ,KEBNE ,16723435,Sun Nov 28 02:23:29 CET,Sun Nov 28 04:22:59 CET,0.0 0.966 1.742 2.468 3.112 3.701 4.268 5.245 5.674 6.099 6.39 7.282 7.66 8.398 9.134 9.859 10.216 10.901 11.576 12.57 13.207 13.833 14.751 15.655 16.548 17.417 18.272 19.404 20.517 21.629 22.994 24.319 25.614 27.145 28.907 30.642 32.604 34.797 37.202 39.79 42.782 46.411 50.202 54.762 60.035 66.409 74.05 83.623 95.753 111.964 127.189 137.267 144.391 149.608 153.617 156.729 159.365 161.473 163.369 164.9 166.167 167.214 168.054 168.772 169.403 169.977 170.398 170.71 171.039 171.366 171.593 171.803 171.991 172.111 172.214 172.288 172.343 172.344 172.288 172.232 172.17 172.094 171.995 171.938 171.794 171.634 171.364 171.182 170.689 170.654 170.422 170.15 169.528 169.185 168.805 168.337 167.735 166.982 165.856 -10 ,4141 ,KEBNE ,16723436,Sun Nov 28 02:23:29 CET,Sun Nov 28 04:23:29 CET,0.0 0.795 1.474 2.089 2.665 3.185 3.669 4.558 4.98 5.4 5.706 6.588 6.965 7.696 8.399 9.097 9.446 10.125 10.774 11.712 12.335 12.954 13.85 14.732 15.616 16.489 17.354 18.489 19.606 20.709 22.077 23.418 24.719 26.258 28.029 29.764 31.725 33.927 36.35 38.973 42.011 45.645 49.401 53.936 59.273 65.783 73.434 82.991 95.331 112.057 127.772 138.092 145.522 151.209 155.714 159.179 161.951 164.063 165.979 167.494 168.684 169.693 170.543 171.222 171.778 172.307 172.742 173.083 173.417 173.718 173.913 174.066 174.209 174.335 174.405 174.376 174.326 174.291 174.279 174.258 174.195 174.095 173.951 173.886 173.712 173.453 173.167 173.014 172.512 172.533 172.366 172.148 171.608 171.255 170.816 170.269 169.572 168.67 167.473 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt deleted file mode 100644 index 68eead88..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12710 ,KEBNE ,16723437,Sun Nov 28 02:24:32 CET,Sun Nov 28 04:25:58 CET,0.0 2.156 3.093 3.826 4.481 5.049 5.583 6.095 7.093 7.567 7.998 8.322 9.248 9.658 10.469 11.25 11.982 12.337 13.047 13.735 14.741 15.401 16.04 16.963 17.873 18.784 19.678 20.55 21.696 22.817 23.92 25.299 26.615 27.848 29.298 31.04 32.777 34.706 36.802 39.007 41.346 44.076 47.379 50.777 54.836 59.615 65.37 72.109 80.513 91.078 105.163 118.193 126.767 132.93 137.371 140.702 143.191 145.126 146.541 147.654 148.467 149.164 149.718 150.157 150.55 150.885 151.185 151.407 151.53 151.615 151.712 151.745 151.737 151.715 151.675 151.611 151.532 151.434 151.312 151.215 151.107 150.906 150.743 150.574 150.474 150.253 150.02 149.743 149.585 149.048 149.033 148.763 148.461 147.893 147.523 147.052 146.478 145.732 144.844 143.59 136.969 -2 ,6275 ,KEBNE ,16723438,Sun Nov 28 02:24:31 CET,Sun Nov 28 04:25:14 CET,0.0 2.037 2.88 3.575 4.212 4.83 5.4 5.924 6.906 7.362 7.804 8.132 9.016 9.395 10.128 10.851 11.593 11.971 12.714 13.432 14.488 15.157 15.813 16.765 17.677 18.587 19.461 20.301 21.439 22.579 23.68 25.018 26.337 27.618 29.135 30.906 32.587 34.393 36.395 38.568 40.906 43.594 46.812 50.214 54.335 59.075 64.725 71.471 79.789 90.141 103.903 116.732 125.201 131.199 135.507 138.658 140.994 142.891 144.425 145.753 146.757 147.574 148.236 148.761 149.144 149.389 149.566 149.711 149.825 149.916 149.971 149.996 150.022 150.027 150.0 149.936 149.857 149.768 149.652 149.574 149.488 149.308 149.154 148.969 148.871 148.686 148.473 148.215 148.061 147.507 147.447 147.223 146.971 146.329 145.903 145.46 145.001 144.382 143.653 142.562 138.329 -3 ,7891 ,KEBNE ,16723439,Sun Nov 28 02:24:31 CET,Sun Nov 28 04:25:15 CET,0.0 2.318 3.205 3.888 4.554 5.133 5.66 6.154 7.082 7.543 7.984 8.285 9.155 9.539 10.274 10.972 11.686 12.048 12.75 13.43 14.433 15.07 15.675 16.57 17.433 18.275 19.131 19.962 21.015 22.08 23.136 24.428 25.709 26.966 28.443 30.104 31.731 33.576 35.609 37.794 40.156 42.93 46.272 49.763 53.919 58.617 64.204 70.722 78.857 89.152 102.499 114.741 122.678 128.166 132.089 134.968 137.151 138.938 140.305 141.483 142.345 142.985 143.5 143.943 144.308 144.585 144.875 145.083 145.192 145.256 145.262 145.282 145.287 145.221 145.18 145.145 145.046 144.903 144.732 144.597 144.44 144.163 143.966 143.758 143.646 143.401 143.137 142.83 142.644 142.089 142.056 141.837 141.608 141.133 140.84 140.464 140.001 139.488 138.704 137.438 128.083 -4 ,12022 ,KEBNE ,16723440,Sun Nov 28 02:24:31 CET,Sun Nov 28 04:25:20 CET,0.0 2.169 3.043 3.781 4.392 4.952 5.469 5.942 6.831 7.268 7.693 7.982 8.857 9.235 9.99 10.717 11.412 11.746 12.395 13.031 13.948 14.548 15.146 16.036 16.893 17.73 18.566 19.385 20.473 21.572 22.634 23.932 25.213 26.456 27.923 29.605 31.245 33.084 35.114 37.301 39.655 42.383 45.693 49.173 53.408 58.292 64.049 70.8 79.161 89.684 103.488 116.059 124.113 129.677 133.762 136.921 139.264 141.067 142.365 143.373 144.028 144.543 145.016 145.378 145.627 145.806 145.936 146.013 146.071 146.119 146.143 146.157 146.153 146.132 146.11 146.034 145.917 145.77 145.598 145.468 145.341 145.149 145.0 144.828 144.722 144.436 144.085 143.714 143.5 142.928 142.831 142.571 142.295 141.61 141.218 140.802 140.359 139.775 139.077 138.118 132.76 -5 ,22016 ,KEBNE ,16723441,Sun Nov 28 02:24:32 CET,Sun Nov 28 04:25:06 CET,0.0 2.002 2.889 3.644 4.284 4.895 5.479 6.002 6.978 7.434 7.879 8.229 9.123 9.525 10.315 11.065 11.791 12.145 12.828 13.502 14.488 15.124 15.751 16.661 17.549 18.421 19.29 20.15 21.273 22.383 23.45 24.743 26.013 27.254 28.7 30.381 32.049 33.936 35.998 38.264 40.791 43.651 46.965 50.342 54.389 59.066 64.67 71.384 79.827 90.396 104.225 116.808 124.994 130.775 135.01 138.21 140.569 142.417 143.841 145.037 145.899 146.602 147.173 147.62 147.985 148.25 148.506 148.722 148.858 148.944 148.978 148.976 148.957 148.92 148.89 148.854 148.792 148.718 148.607 148.506 148.421 148.276 148.142 147.988 147.891 147.689 147.489 147.248 147.12 146.617 146.629 146.463 146.268 145.736 145.416 145.015 144.566 144.088 143.402 142.412 138.61 -6 ,8915 ,KEBNE ,16723442,Sun Nov 28 02:25:34 CET,Sun Nov 28 04:26:46 CET,0.0 2.598 3.548 4.253 4.887 5.473 6.023 6.551 7.534 7.992 8.448 8.825 9.73 10.136 10.932 11.701 12.434 12.798 13.525 14.229 15.267 15.934 16.576 17.519 18.446 19.363 20.257 21.131 22.294 23.435 24.551 25.903 27.209 28.497 29.98 31.689 33.415 35.303 37.356 39.643 42.091 44.897 48.232 51.649 55.694 60.344 66.015 72.744 81.158 91.663 105.561 118.413 126.9 132.662 136.676 139.757 142.015 143.898 145.383 146.572 147.431 148.142 148.72 149.179 149.534 149.796 150.044 150.221 150.319 150.398 150.492 150.536 150.54 150.534 150.489 150.434 150.38 150.288 150.167 150.066 149.93 149.643 149.432 149.236 149.132 148.902 148.622 148.31 148.161 147.642 147.623 147.385 147.092 146.372 145.941 145.489 144.996 144.444 143.74 142.641 136.752 -7 ,26758 ,KEBNE ,16723443,Sun Nov 28 02:25:34 CET,Sun Nov 28 04:26:09 CET,0.0 2.418 3.286 4.022 4.689 5.265 5.785 6.312 7.303 7.766 8.206 8.533 9.432 9.81 10.553 11.297 12.036 12.394 13.07 13.73 14.725 15.378 16.009 16.932 17.826 18.704 19.561 20.426 21.573 22.665 23.732 25.064 26.389 27.675 29.164 30.847 32.52 34.455 36.534 38.76 41.219 44.031 47.318 50.675 54.673 59.368 65.04 71.627 79.732 90.004 103.637 115.94 123.796 129.378 133.618 136.975 139.505 141.44 142.919 144.211 145.149 145.89 146.536 147.066 147.456 147.721 147.95 148.128 148.239 148.321 148.385 148.412 148.417 148.407 148.355 148.238 148.083 147.915 147.752 147.63 147.498 147.288 147.105 146.886 146.768 146.541 146.29 145.983 145.793 145.228 145.177 144.94 144.678 144.044 143.669 143.265 142.81 142.226 141.46 140.174 134.623 -8 ,27604 ,KEBNE ,16723444,Sun Nov 28 02:25:34 CET,Sun Nov 28 04:26:36 CET,0.0 1.958 2.894 3.665 4.314 4.901 5.421 5.952 6.981 7.448 7.889 8.221 9.141 9.537 10.317 11.08 11.812 12.165 12.85 13.537 14.565 15.239 15.893 16.837 17.756 18.67 19.566 20.453 21.614 22.72 23.799 25.118 26.431 27.741 29.257 30.989 32.636 34.495 36.64 38.988 41.43 44.158 47.454 50.837 54.899 59.697 65.393 72.036 80.238 90.498 104.387 117.367 125.808 131.775 136.153 139.405 141.82 143.766 145.212 146.47 147.404 148.134 148.746 149.224 149.631 149.951 150.211 150.404 150.555 150.681 150.762 150.801 150.803 150.768 150.733 150.677 150.585 150.468 150.333 150.198 150.002 149.642 149.363 149.058 148.894 148.513 148.147 147.869 147.721 147.19 147.168 146.943 146.707 146.066 145.647 145.205 144.619 143.931 143.056 141.607 129.675 -9 ,28450 ,KEBNE ,16723445,Sun Nov 28 02:25:34 CET,Sun Nov 28 04:26:01 CET,0.0 1.815 2.625 3.281 3.9 4.502 5.031 5.522 6.444 6.878 7.298 7.628 8.524 8.905 9.681 10.42 11.132 11.487 12.185 12.855 13.839 14.496 15.132 16.065 16.976 17.87 18.766 19.639 20.748 21.822 22.902 24.254 25.569 26.834 28.305 30.0 31.687 33.596 35.716 37.962 40.276 42.985 46.255 49.629 53.73 58.409 64.032 70.617 78.494 88.409 101.846 114.186 122.268 128.124 132.348 135.538 138.044 140.052 141.551 142.89 143.839 144.515 145.082 145.53 145.882 146.187 146.461 146.62 146.724 146.819 146.885 146.926 146.897 146.822 146.778 146.721 146.632 146.526 146.388 146.255 146.101 145.844 145.63 145.412 145.291 144.99 144.639 144.228 144.052 143.532 143.51 143.289 143.066 142.559 142.248 141.873 141.331 140.604 139.641 138.274 133.602 -10 ,26948 ,KEBNE ,16723446,Sun Nov 28 02:25:33 CET,Sun Nov 28 04:26:14 CET,0.0 1.621 2.455 3.088 3.663 4.223 4.71 5.174 6.116 6.575 7.004 7.291 8.183 8.571 9.316 10.031 10.745 11.091 11.76 12.41 13.368 13.993 14.606 15.495 16.366 17.244 18.107 18.958 20.076 21.188 22.278 23.624 24.967 26.273 27.799 29.549 31.294 33.235 35.304 37.476 39.787 42.479 45.718 49.219 53.472 58.206 63.812 70.407 78.65 89.008 102.563 115.002 123.123 128.863 133.005 136.147 138.514 140.275 141.536 142.603 143.382 144.016 144.536 144.995 145.401 145.665 145.905 146.11 146.244 146.365 146.444 146.434 146.39 146.351 146.324 146.269 146.172 146.065 145.947 145.863 145.772 145.594 145.461 145.314 145.212 144.946 144.648 144.328 144.152 143.614 143.546 143.294 143.054 142.513 142.16 141.739 141.214 140.606 139.94 138.955 133.684 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt deleted file mode 100644 index 0389ae53..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20572 ,KEBNE ,17026288,Wed Dec 22 13:57:52 CET,Wed Dec 22 15:58:49 CET,0.0 1.9 2.72 3.4 4.03 4.62 5.166 5.663 6.557 6.983 7.401 7.729 8.646 9.058 9.84 10.594 11.309 11.665 12.376 13.055 14.041 14.695 15.351 16.334 17.273 18.167 19.04 19.898 21.026 22.136 23.228 24.559 25.869 27.172 28.732 30.525 32.279 34.26 36.463 38.869 41.478 44.474 48.059 51.83 56.434 61.778 68.267 76.101 85.956 98.509 115.168 130.798 141.301 148.721 154.02 158.008 161.054 163.471 165.337 167.059 168.347 169.275 170.063 170.758 171.307 171.783 172.242 172.578 172.798 172.993 173.149 173.223 173.292 173.353 173.394 173.412 173.383 173.321 173.23 173.158 173.082 172.932 172.773 172.603 172.505 172.247 171.978 171.643 171.439 170.926 170.855 170.635 170.392 169.801 169.435 169.031 168.576 168.031 167.305 166.183 162.563 -2 ,11098 ,KEBNE ,17026289,Wed Dec 22 13:57:53 CET,Wed Dec 22 15:58:51 CET,0.0 2.445 3.448 4.188 4.857 5.458 6.023 6.539 7.467 7.926 8.373 8.694 9.593 9.976 10.722 11.45 12.157 12.512 13.216 13.882 14.848 15.487 16.107 17.028 17.933 18.832 19.718 20.591 21.741 22.875 24.004 25.389 26.737 28.064 29.637 31.409 33.171 35.172 37.372 39.768 42.362 45.367 48.997 52.81 57.401 62.77 69.321 77.123 86.822 99.165 115.665 131.006 141.113 148.448 153.812 157.943 161.178 163.64 165.456 167.09 168.336 169.325 170.168 170.844 171.445 171.969 172.432 172.833 173.129 173.354 173.583 173.753 173.883 174.003 174.086 174.142 174.162 174.15 174.11 174.075 174.031 173.92 173.808 173.67 173.58 173.339 173.09 172.848 172.705 172.226 172.165 171.929 171.681 171.145 170.825 170.402 169.93 169.419 168.782 167.886 164.662 -3 ,8392 ,KEBNE ,17026290,Wed Dec 22 13:58:54 CET,Wed Dec 22 15:58:26 CET,0.0 2.245 3.216 3.958 4.599 5.197 5.777 6.323 7.289 7.753 8.209 8.557 9.467 9.852 10.598 11.316 12.011 12.354 13.022 13.676 14.651 15.296 15.942 16.891 17.805 18.706 19.587 20.461 21.608 22.731 23.835 25.188 26.525 27.851 29.434 31.259 33.036 35.014 37.202 39.605 42.215 45.228 48.878 52.729 57.363 62.804 69.386 77.141 86.854 99.252 115.939 131.674 142.005 149.293 154.642 158.733 161.862 164.378 166.37 168.192 169.596 170.725 171.686 172.449 173.039 173.546 174.017 174.355 174.624 174.853 175.087 175.275 175.398 175.483 175.522 175.537 175.532 175.514 175.487 175.42 175.323 175.162 175.013 174.845 174.747 174.524 174.311 174.076 173.922 173.44 173.314 173.043 172.774 172.172 171.782 171.328 170.832 170.234 169.463 168.309 164.167 -4 ,18479 ,KEBNE ,17026291,Wed Dec 22 13:58:54 CET,Wed Dec 22 15:59:34 CET,0.0 2.077 3.054 3.832 4.513 5.135 5.709 6.234 7.205 7.666 8.115 8.475 9.383 9.787 10.574 11.329 12.05 12.406 13.112 13.806 14.819 15.471 16.125 17.101 18.048 18.974 19.859 20.704 21.798 22.88 23.957 25.272 26.562 27.845 29.354 31.062 32.756 34.667 36.775 39.101 41.621 44.548 48.128 51.823 56.25 61.498 67.943 75.59 85.063 97.118 113.264 128.454 138.585 146.025 151.537 155.756 158.974 161.492 163.442 165.229 166.602 167.739 168.744 169.587 170.292 170.881 171.441 171.864 172.18 172.446 172.646 172.78 172.858 172.887 172.894 172.875 172.853 172.861 172.859 172.797 172.724 172.637 172.539 172.406 172.317 172.141 171.959 171.735 171.61 171.123 171.005 170.753 170.466 169.849 169.511 169.131 168.705 168.18 167.502 166.557 163.28 -5 ,10978 ,KEBNE ,17026292,Wed Dec 22 13:58:54 CET,Wed Dec 22 15:59:19 CET,0.0 2.277 3.262 4.1 4.741 5.321 5.881 6.394 7.305 7.745 8.178 8.497 9.388 9.771 10.522 11.256 11.965 12.313 13.016 13.709 14.694 15.334 15.972 16.899 17.804 18.692 19.556 20.402 21.498 22.582 23.656 24.967 26.268 27.562 29.093 30.843 32.577 34.522 36.67 39.025 41.568 44.535 48.113 51.826 56.299 61.516 67.793 75.149 84.362 96.287 112.346 127.411 137.477 144.599 149.765 153.843 156.989 159.485 161.445 163.178 164.523 165.631 166.592 167.414 168.035 168.496 168.933 169.293 169.546 169.761 169.993 170.183 170.297 170.347 170.368 170.379 170.398 170.401 170.385 170.356 170.307 170.201 170.108 169.966 169.885 169.711 169.494 169.24 169.087 168.623 168.607 168.377 168.126 167.57 167.232 166.822 166.327 165.766 165.074 164.087 160.741 -6 ,81 ,KEBNE ,17026293,Wed Dec 22 13:58:55 CET,Wed Dec 22 15:59:23 CET,0.0 2.138 3.175 3.988 4.667 5.274 5.822 6.354 7.366 7.831 8.281 8.671 9.604 10.015 10.812 11.576 12.325 12.683 13.371 14.045 15.028 15.68 16.313 17.215 18.097 18.969 19.826 20.677 21.794 22.886 23.956 25.29 26.611 27.9 29.433 31.207 32.953 34.9 37.033 39.357 41.889 44.852 48.432 52.161 56.692 61.99 68.382 76.028 85.659 97.989 114.632 130.307 140.88 148.486 153.979 158.126 161.352 163.884 165.747 167.455 168.79 169.908 170.913 171.711 172.408 173.0 173.469 173.813 174.076 174.333 174.637 174.864 175.014 175.073 175.073 175.049 175.0 174.931 174.827 174.748 174.69 174.596 174.479 174.344 174.278 174.087 173.846 173.606 173.46 172.969 172.931 172.735 172.486 171.922 171.614 171.285 170.877 170.371 169.76 168.861 166.061 -7 ,15704 ,KEBNE ,17026294,Wed Dec 22 13:58:55 CET,Wed Dec 22 15:59:54 CET,0.0 2.298 3.269 4.004 4.644 5.235 5.783 6.278 7.201 7.641 8.062 8.355 9.236 9.612 10.353 11.063 11.75 12.089 12.763 13.42 14.382 15.013 15.631 16.535 17.426 18.299 19.152 20.008 21.116 22.199 23.293 24.652 25.983 27.288 28.824 30.567 32.282 34.208 36.342 38.685 41.231 44.218 47.752 51.397 55.873 61.1 67.408 75.007 84.63 96.88 113.343 128.857 139.104 146.379 151.847 156.139 159.426 162.027 164.007 165.737 167.08 168.216 169.159 169.891 170.442 170.877 171.3 171.624 171.852 172.031 172.169 172.261 172.345 172.404 172.432 172.44 172.408 172.351 172.268 172.206 172.134 171.95 171.795 171.632 171.536 171.267 170.921 170.54 170.344 169.844 169.816 169.619 169.39 168.834 168.497 168.116 167.701 167.188 166.517 165.668 162.647 -8 ,9603 ,KEBNE ,17026295,Wed Dec 22 13:58:55 CET,Wed Dec 22 15:59:31 CET,0.0 2.308 3.392 4.287 5.006 5.623 6.184 6.696 7.636 8.088 8.537 8.914 9.838 10.244 11.028 11.784 12.506 12.86 13.549 14.226 15.218 15.863 16.502 17.44 18.354 19.245 20.101 20.954 22.081 23.184 24.278 25.624 26.942 28.234 29.804 31.606 33.343 35.285 37.442 39.826 42.396 45.376 48.999 52.743 57.23 62.441 68.674 76.074 85.23 96.887 112.843 127.896 137.808 144.874 150.101 154.065 157.135 159.67 161.619 163.34 164.609 165.607 166.504 167.265 167.904 168.414 168.867 169.255 169.543 169.78 169.983 170.115 170.216 170.268 170.288 170.304 170.318 170.292 170.227 170.175 170.121 170.05 169.996 169.909 169.849 169.717 169.564 169.376 169.26 168.792 168.727 168.533 168.326 167.828 167.55 167.24 166.829 166.27 165.493 164.285 159.671 -9 ,28796 ,KEBNE ,17026296,Wed Dec 22 13:59:57 CET,Wed Dec 22 16:01:18 CET,0.0 2.139 3.086 3.813 4.462 5.051 5.577 6.097 7.112 7.573 8.005 8.377 9.32 9.74 10.534 11.29 12.004 12.34 12.99 13.636 14.604 15.233 15.843 16.736 17.617 18.484 19.327 20.161 21.272 22.368 23.436 24.736 26.037 27.333 28.856 30.612 32.342 34.273 36.413 38.758 41.269 44.199 47.778 51.509 56.04 61.294 67.619 75.114 84.481 96.358 112.31 127.318 137.085 144.153 149.427 153.532 156.714 159.229 161.157 162.852 164.157 165.213 166.142 166.947 167.606 168.132 168.596 168.955 169.217 169.482 169.744 169.912 170.059 170.154 170.168 170.145 170.096 170.041 169.955 169.877 169.799 169.658 169.533 169.352 169.25 169.049 168.803 168.487 168.305 167.789 167.7 167.453 167.175 166.563 166.203 165.776 165.284 164.717 164.013 163.001 159.031 -10 ,21201 ,KEBNE ,17026297,Wed Dec 22 13:59:56 CET,Wed Dec 22 16:00:12 CET,0.0 1.907 2.818 3.521 4.139 4.71 5.225 5.713 6.621 7.051 7.466 7.775 8.682 9.076 9.854 10.605 11.309 11.658 12.346 13.007 13.969 14.596 15.224 16.166 17.089 17.974 18.845 19.709 20.843 21.946 23.016 24.344 25.669 26.976 28.512 30.291 32.018 33.94 36.089 38.445 41.036 44.07 47.699 51.479 56.087 61.48 68.028 75.768 85.19 96.786 112.133 126.755 136.532 143.452 148.529 152.494 155.564 157.957 159.823 161.495 162.809 163.891 164.777 165.495 166.066 166.55 167.035 167.408 167.687 167.943 168.161 168.315 168.459 168.569 168.617 168.648 168.661 168.636 168.579 168.536 168.479 168.334 168.213 168.067 167.981 167.777 167.529 167.22 167.058 166.586 166.483 166.266 166.036 165.479 165.156 164.788 164.353 163.861 163.245 162.315 159.0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index 063bd7e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20293 ,KEBNE ,16723447,Sun Nov 28 02:25:33 CET,Sun Nov 28 04:24:47 CET,0.0 2.521 3.217 3.708 4.116 4.483 4.826 5.126 5.673 5.925 6.149 6.244 6.764 6.956 7.327 7.668 7.982 8.138 8.428 8.699 9.104 9.359 9.606 9.962 10.298 10.614 10.921 11.232 11.615 11.964 12.313 12.736 13.143 13.537 13.973 14.447 14.884 15.368 15.897 16.437 16.98 17.58 18.294 19.002 19.77 20.599 21.538 22.458 23.339 24.179 24.744 24.55 23.974 23.232 22.426 21.663 20.956 20.251 19.587 18.867 18.232 17.673 17.105 16.53 15.984 15.476 14.915 14.381 13.937 13.478 12.978 12.565 12.127 11.67 11.317 10.94 10.532 10.102 9.666 9.363 9.037 8.533 8.171 7.774 7.571 7.139 6.667 6.16 5.901 5.324 5.105 4.78 4.423 3.642 3.209 2.72 2.146 1.466 0.693 -0.315 -2.821 -2 ,25314 ,KEBNE ,16723448,Sun Nov 28 02:25:33 CET,Sun Nov 28 04:23:26 CET,0.0 1.658 2.282 2.76 3.142 3.475 3.791 4.091 4.635 4.882 5.115 5.229 5.755 5.951 6.33 6.685 7.007 7.157 7.438 7.704 8.095 8.352 8.6 8.962 9.307 9.638 9.96 10.257 10.634 11.0 11.344 11.748 12.129 12.503 12.927 13.391 13.845 14.34 14.863 15.404 15.967 16.598 17.346 18.105 18.952 19.815 20.734 21.688 22.582 23.459 24.156 24.03 23.416 22.676 21.887 21.049 20.226 19.382 18.595 17.825 17.177 16.555 15.933 15.334 14.764 14.227 13.638 13.117 12.667 12.191 11.692 11.246 10.768 10.292 9.919 9.529 9.105 8.64 8.18 7.881 7.561 7.04 6.69 6.33 6.138 5.734 5.306 4.831 4.578 3.985 3.735 3.43 3.119 2.414 2.011 1.561 1.05 0.462 -0.264 -1.23 -3.685 -3 ,11327 ,KEBNE ,16723449,Sun Nov 28 02:25:34 CET,Sun Nov 28 04:24:08 CET,0.0 1.704 2.328 2.801 3.213 3.576 3.882 4.157 4.665 4.902 5.13 5.235 5.762 5.962 6.328 6.661 6.99 7.147 7.432 7.705 8.092 8.34 8.585 8.938 9.282 9.613 9.928 10.241 10.633 11.001 11.359 11.796 12.205 12.591 13.034 13.521 13.987 14.489 15.033 15.598 16.158 16.77 17.484 18.203 19.009 19.863 20.844 21.844 22.801 23.75 24.466 24.323 23.767 23.095 22.395 21.704 21.058 20.41 19.717 18.957 18.265 17.595 16.988 16.402 15.825 15.294 14.716 14.207 13.769 13.31 12.837 12.433 11.995 11.54 11.182 10.791 10.396 9.99 9.519 9.181 8.848 8.322 7.94 7.551 7.357 6.945 6.473 5.943 5.659 5.057 4.828 4.51 4.163 3.414 3.014 2.553 2.002 1.365 0.646 -0.318 -3.688 -7 ,28259 ,KEBNE ,16723453,Sun Nov 28 02:25:33 CET,Sun Nov 28 04:23:54 CET,0.0 1.658 2.293 2.771 3.165 3.496 3.833 4.164 4.74 4.989 5.212 5.316 5.835 6.027 6.387 6.708 7.027 7.176 7.452 7.722 8.099 8.338 8.57 8.91 9.239 9.558 9.863 10.156 10.53 10.884 11.228 11.645 12.044 12.418 12.849 13.325 13.768 14.258 14.784 15.348 15.936 16.576 17.295 17.996 18.782 19.607 20.516 21.426 22.377 23.309 23.922 23.921 23.405 22.605 21.785 20.978 20.179 19.414 18.744 18.023 17.387 16.82 16.245 15.676 15.14 14.648 14.126 13.65 13.221 12.751 12.27 11.865 11.41 10.951 10.601 10.225 9.822 9.388 8.933 8.618 8.299 7.815 7.478 7.113 6.924 6.508 6.02 5.467 5.155 4.505 4.204 3.858 3.47 2.665 2.214 1.683 1.111 0.459 -0.332 -1.375 -4.171 -8 ,11168 ,KEBNE ,16723454,Sun Nov 28 02:25:33 CET,Sun Nov 28 04:24:25 CET,0.0 1.391 1.976 2.453 2.898 3.286 3.605 3.891 4.389 4.613 4.837 4.955 5.464 5.657 6.039 6.404 6.749 6.908 7.211 7.5 7.912 8.175 8.426 8.771 9.1 9.424 9.726 10.023 10.415 10.784 11.129 11.535 11.934 12.316 12.74 13.221 13.681 14.182 14.733 15.317 15.949 16.632 17.364 18.054 18.834 19.69 20.643 21.635 22.622 23.528 24.18 24.069 23.464 22.666 21.788 20.871 19.993 19.153 18.421 17.683 17.039 16.452 15.853 15.224 14.6 14.017 13.387 12.833 12.372 11.898 11.389 10.944 10.505 10.073 9.734 9.359 8.95 8.525 8.081 7.765 7.428 6.906 6.512 6.086 5.876 5.439 4.976 4.465 4.189 3.581 3.315 2.983 2.647 1.907 1.487 1.025 0.5 -0.088 -0.839 -1.816 -4.302 -9 ,15285 ,KEBNE ,16723455,Sun Nov 28 02:25:33 CET,Sun Nov 28 04:23:15 CET,0.0 1.372 2.029 2.555 2.991 3.352 3.68 4.002 4.569 4.81 5.029 5.128 5.656 5.85 6.214 6.551 6.887 7.051 7.366 7.669 8.079 8.32 8.551 8.902 9.252 9.584 9.896 10.192 10.583 10.968 11.325 11.755 12.16 12.544 12.995 13.487 13.956 14.485 15.052 15.629 16.214 16.88 17.655 18.419 19.285 20.191 21.135 22.068 22.99 23.851 24.384 24.082 23.371 22.584 21.814 21.03 20.251 19.437 18.667 17.879 17.153 16.487 15.861 15.297 14.779 14.295 13.803 13.349 12.927 12.479 12.001 11.589 11.168 10.703 10.313 9.902 9.47 9.024 8.544 8.215 7.882 7.328 6.949 6.572 6.367 5.924 5.455 4.94 4.669 4.065 3.771 3.452 3.12 2.363 1.935 1.481 0.972 0.339 -0.45 -1.432 -3.909 -10 ,19957 ,KEBNE ,16723456,Sun Nov 28 02:26:34 CET,Sun Nov 28 04:25:50 CET,0.0 1.819 2.505 2.993 3.39 3.747 4.074 4.368 4.885 5.115 5.337 5.442 5.963 6.154 6.511 6.836 7.155 7.31 7.621 7.928 8.362 8.632 8.894 9.274 9.628 9.968 10.294 10.615 11.016 11.379 11.735 12.162 12.554 12.917 13.347 13.835 14.294 14.78 15.288 15.829 16.389 17.036 17.783 18.485 19.248 20.024 20.883 21.794 22.747 23.735 24.453 24.411 23.953 23.222 22.422 21.595 20.773 19.997 19.304 18.574 17.934 17.344 16.723 16.118 15.559 15.022 14.437 13.918 13.468 12.995 12.52 12.104 11.654 11.176 10.792 10.384 9.959 9.537 9.094 8.778 8.45 7.961 7.621 7.248 7.048 6.625 6.164 5.677 5.43 4.835 4.599 4.279 3.941 3.195 2.763 2.271 1.744 1.155 0.397 -0.582 -3.121 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt deleted file mode 100644 index cecf227a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19557 ,KEBNE ,16723457,Sun Nov 28 02:27:37 CET,Sun Nov 28 04:27:16 CET,0.0 2.207 2.982 3.587 4.11 4.552 4.931 5.27 5.846 6.114 6.375 6.542 7.082 7.296 7.701 8.077 8.418 8.578 8.902 9.215 9.659 9.942 10.199 10.547 10.876 11.186 11.497 11.796 12.168 12.521 12.886 13.294 13.614 13.929 14.302 14.698 15.075 15.451 15.818 16.234 16.669 17.105 17.526 17.892 18.244 18.488 18.512 18.286 17.801 16.723 14.356 11.167 8.452 6.081 3.998 2.122 0.47 -1.056 -2.38 -3.693 -4.805 -5.788 -6.733 -7.607 -8.417 -9.156 -9.919 -10.599 -11.194 -11.818 -12.46 -13.002 -13.562 -14.125 -14.554 -15.0 -15.462 -15.941 -16.436 -16.779 -17.125 -17.662 -18.037 -18.428 -18.627 -19.038 -19.483 -19.98 -20.249 -20.885 -21.12 -21.429 -21.74 -22.411 -22.772 -23.193 -23.657 -24.121 -24.69 -25.495 -28.012 -2 ,22307 ,KEBNE ,16723458,Sun Nov 28 02:26:34 CET,Sun Nov 28 04:26:23 CET,0.0 2.183 2.937 3.517 3.971 4.358 4.724 5.072 5.689 5.97 6.243 6.407 6.947 7.157 7.551 7.931 8.296 8.461 8.79 9.108 9.552 9.818 10.066 10.432 10.774 11.105 11.416 11.706 12.088 12.442 12.769 13.163 13.526 13.857 14.22 14.615 15.012 15.428 15.859 16.308 16.716 17.137 17.605 17.99 18.248 18.313 18.211 17.962 17.476 16.39 14.127 10.964 8.107 5.603 3.446 1.501 -0.19 -1.686 -2.965 -4.263 -5.393 -6.384 -7.317 -8.216 -9.068 -9.831 -10.605 -11.269 -11.848 -12.449 -13.065 -13.607 -14.196 -14.783 -15.218 -15.648 -16.09 -16.57 -17.091 -17.458 -17.839 -18.458 -18.879 -19.292 -19.506 -19.952 -20.438 -20.961 -21.229 -21.869 -22.065 -22.365 -22.703 -23.462 -23.881 -24.344 -24.816 -25.319 -25.893 -26.728 -29.084 -3 ,11921 ,KEBNE ,16723459,Sun Nov 28 02:27:37 CET,Sun Nov 28 04:26:29 CET,0.0 2.078 2.832 3.363 3.82 4.225 4.601 4.948 5.577 5.865 6.127 6.274 6.811 7.019 7.411 7.794 8.17 8.35 8.691 9.009 9.445 9.717 9.972 10.357 10.717 11.041 11.362 11.673 12.052 12.403 12.749 13.184 13.583 13.931 14.309 14.719 15.11 15.517 15.956 16.381 16.737 17.142 17.567 17.893 18.199 18.435 18.501 18.321 17.792 16.78 14.695 11.734 9.231 6.941 4.821 2.875 1.203 -0.294 -1.581 -2.839 -3.913 -4.882 -5.804 -6.652 -7.45 -8.179 -8.964 -9.697 -10.334 -10.99 -11.671 -12.224 -12.8 -13.403 -13.856 -14.316 -14.79 -15.281 -15.809 -16.174 -16.537 -17.088 -17.49 -17.923 -18.141 -18.578 -19.032 -19.526 -19.795 -20.444 -20.666 -20.961 -21.253 -21.917 -22.305 -22.758 -23.273 -23.834 -24.491 -25.35 -27.422 -4 ,2725 ,KEBNE ,16723460,Sun Nov 28 02:27:37 CET,Sun Nov 28 04:26:14 CET,0.0 1.433 2.184 2.742 3.192 3.594 3.986 4.354 4.994 5.27 5.536 5.727 6.277 6.506 6.932 7.337 7.711 7.885 8.22 8.534 8.974 9.256 9.527 9.922 10.299 10.644 10.988 11.318 11.718 12.111 12.504 12.966 13.376 13.731 14.104 14.512 14.916 15.337 15.77 16.201 16.576 16.933 17.344 17.759 18.17 18.491 18.596 18.533 18.241 17.285 14.997 11.74 8.929 6.46 4.287 2.33 0.549 -1.06 -2.432 -3.757 -4.862 -5.847 -6.77 -7.65 -8.473 -9.22 -9.991 -10.669 -11.246 -11.846 -12.482 -13.041 -13.591 -14.129 -14.552 -14.977 -15.425 -15.888 -16.355 -16.678 -17.026 -17.59 -17.982 -18.392 -18.602 -19.036 -19.478 -19.945 -20.203 -20.837 -21.042 -21.339 -21.651 -22.356 -22.755 -23.177 -23.625 -24.178 -24.864 -25.706 -27.604 -5 ,18511 ,KEBNE ,16723461,Sun Nov 28 02:27:37 CET,Sun Nov 28 04:27:43 CET,0.0 2.284 3.137 3.769 4.285 4.712 5.094 5.417 5.999 6.27 6.523 6.693 7.244 7.458 7.869 8.277 8.661 8.837 9.163 9.479 9.935 10.215 10.478 10.866 11.234 11.569 11.88 12.152 12.483 12.814 13.153 13.563 13.933 14.295 14.712 15.151 15.555 15.964 16.385 16.826 17.264 17.72 18.195 18.621 19.022 19.372 19.627 19.723 19.518 18.642 16.386 13.128 10.407 8.032 5.947 4.057 2.382 0.859 -0.478 -1.814 -2.945 -3.919 -4.841 -5.751 -6.621 -7.396 -8.19 -8.909 -9.536 -10.17 -10.785 -11.283 -11.814 -12.373 -12.805 -13.246 -13.712 -14.21 -14.711 -15.045 -15.393 -15.943 -16.332 -16.731 -16.927 -17.33 -17.778 -18.267 -18.514 -19.126 -19.298 -19.585 -19.882 -20.526 -20.901 -21.306 -21.753 -22.284 -22.873 -23.644 -26.092 -6 ,972 ,KEBNE ,16723462,Sun Nov 28 02:27:37 CET,Sun Nov 28 04:26:14 CET,0.0 2.509 3.343 3.938 4.413 4.838 5.21 5.552 6.184 6.481 6.761 6.947 7.491 7.704 8.143 8.561 8.934 9.113 9.457 9.784 10.245 10.52 10.768 11.14 11.513 11.866 12.207 12.546 12.982 13.37 13.728 14.135 14.5 14.861 15.264 15.689 16.061 16.435 16.862 17.335 17.79 18.188 18.579 18.94 19.256 19.488 19.576 19.419 18.874 17.731 15.356 12.093 9.248 6.786 4.658 2.695 0.929 -0.599 -1.918 -3.256 -4.368 -5.356 -6.321 -7.236 -8.085 -8.873 -9.675 -10.363 -10.962 -11.569 -12.193 -12.738 -13.303 -13.904 -14.407 -14.899 -15.361 -15.849 -16.368 -16.709 -17.058 -17.626 -18.027 -18.46 -18.687 -19.141 -19.622 -20.119 -20.383 -21.033 -21.243 -21.547 -21.855 -22.519 -22.896 -23.322 -23.77 -24.258 -24.837 -25.59 -27.584 -7 ,16355 ,KEBNE ,16723463,Sun Nov 28 02:27:37 CET,Sun Nov 28 04:27:43 CET,0.0 1.983 2.797 3.37 3.847 4.261 4.639 4.995 5.645 5.935 6.202 6.359 6.904 7.124 7.535 7.901 8.256 8.426 8.739 9.04 9.479 9.755 10.029 10.43 10.785 11.11 11.415 11.708 12.082 12.432 12.778 13.214 13.606 13.955 14.346 14.746 15.113 15.514 15.909 16.283 16.66 17.092 17.528 17.897 18.287 18.553 18.69 18.657 18.202 17.046 14.516 11.085 8.113 5.679 3.625 1.705 0.009 -1.499 -2.819 -4.167 -5.275 -6.249 -7.205 -8.081 -8.895 -9.659 -10.452 -11.16 -11.775 -12.404 -13.062 -13.599 -14.151 -14.74 -15.185 -15.644 -16.135 -16.638 -17.151 -17.503 -17.863 -18.42 -18.812 -19.224 -19.43 -19.841 -20.282 -20.764 -21.021 -21.652 -21.808 -22.103 -22.434 -23.128 -23.5 -23.899 -24.361 -24.892 -25.537 -26.349 -28.053 -8 ,6767 ,KEBNE ,16723464,Sun Nov 28 02:27:37 CET,Sun Nov 28 04:28:07 CET,0.0 2.335 3.141 3.734 4.216 4.6 4.942 5.263 5.836 6.123 6.398 6.546 7.083 7.291 7.688 8.051 8.396 8.564 8.887 9.191 9.618 9.895 10.17 10.56 10.918 11.257 11.58 11.877 12.249 12.6 12.911 13.283 13.645 13.99 14.38 14.806 15.233 15.674 16.092 16.525 16.943 17.362 17.851 18.283 18.643 18.912 19.01 18.853 18.313 17.118 14.749 11.638 8.89 6.471 4.387 2.485 0.813 -0.685 -2.006 -3.333 -4.486 -5.519 -6.49 -7.402 -8.242 -9.018 -9.814 -10.519 -11.129 -11.75 -12.396 -12.937 -13.501 -14.099 -14.573 -15.035 -15.526 -16.064 -16.61 -16.985 -17.369 -17.943 -18.329 -18.744 -18.963 -19.428 -19.912 -20.41 -20.668 -21.288 -21.465 -21.766 -22.097 -22.81 -23.189 -23.6 -24.067 -24.608 -25.282 -26.176 -28.578 -9 ,23872 ,KEBNE ,16723465,Sun Nov 28 02:27:37 CET,Sun Nov 28 04:28:10 CET,0.0 2.751 3.726 4.431 4.999 5.505 5.936 6.324 6.988 7.267 7.532 7.742 8.286 8.492 8.917 9.321 9.7 9.881 10.211 10.508 10.903 11.162 11.427 11.793 12.141 12.475 12.786 13.08 13.45 13.806 14.14 14.526 14.874 15.188 15.57 15.989 16.356 16.752 17.174 17.554 17.907 18.334 18.771 19.056 19.34 19.62 19.809 19.765 19.276 18.162 15.741 12.241 9.247 6.707 4.442 2.446 0.713 -0.864 -2.184 -3.503 -4.664 -5.689 -6.673 -7.605 -8.442 -9.194 -9.975 -10.676 -11.268 -11.862 -12.501 -13.047 -13.609 -14.19 -14.636 -15.079 -15.527 -15.998 -16.497 -16.846 -17.206 -17.752 -18.137 -18.561 -18.778 -19.226 -19.689 -20.165 -20.423 -21.051 -21.238 -21.529 -21.833 -22.502 -22.871 -23.267 -23.727 -24.307 -24.974 -25.839 -28.083 -10 ,251 ,KEBNE ,16723466,Sun Nov 28 02:27:37 CET,Sun Nov 28 04:27:43 CET,0.0 2.558 3.392 3.998 4.482 4.897 5.281 5.639 6.257 6.529 6.792 6.956 7.495 7.701 8.088 8.462 8.811 8.981 9.308 9.627 10.096 10.391 10.677 11.063 11.403 11.721 12.028 12.321 12.702 13.063 13.396 13.81 14.212 14.549 14.901 15.315 15.705 16.117 16.541 16.958 17.363 17.796 18.259 18.639 18.953 19.195 19.309 19.26 18.816 17.675 15.231 11.772 8.877 6.358 4.139 2.174 0.487 -1.008 -2.252 -3.478 -4.561 -5.537 -6.485 -7.404 -8.247 -9.003 -9.809 -10.52 -11.118 -11.758 -12.455 -13.01 -13.578 -14.17 -14.625 -15.111 -15.605 -16.118 -16.647 -16.996 -17.351 -17.926 -18.329 -18.745 -18.958 -19.397 -19.856 -20.338 -20.593 -21.208 -21.37 -21.656 -21.978 -22.709 -23.09 -23.486 -23.939 -24.458 -25.063 -25.951 -28.261 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index d8ee2878..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26687 ,KEBNE ,16723467,Sun Nov 28 02:27:37 CET,Sun Nov 28 04:30:48 CET,0.0 2.508 3.153 3.617 4.033 4.41 4.735 5.034 5.592 5.845 6.076 6.264 6.704 6.894 7.266 7.625 7.957 8.111 8.412 8.703 9.125 9.39 9.645 10.015 10.36 10.71 11.048 11.366 11.768 12.139 12.483 12.893 13.295 13.688 14.132 14.642 15.14 15.67 16.226 16.798 17.398 18.104 18.895 19.604 20.398 21.241 22.16 23.177 24.294 25.406 26.39 26.67 26.5 26.078 25.536 24.976 24.467 23.983 23.502 22.983 22.535 22.117 21.688 21.27 20.871 20.524 20.156 19.805 19.495 19.168 18.826 18.529 18.216 17.901 17.65 17.374 17.084 16.788 16.48 16.261 16.029 15.678 15.432 15.174 15.039 14.74 14.412 14.069 13.895 13.487 13.351 13.133 12.908 12.421 12.145 11.844 11.515 11.135 10.681 10.09 8.329 -2 ,16416 ,KEBNE ,16723468,Sun Nov 28 02:28:38 CET,Sun Nov 28 04:31:33 CET,0.0 2.785 3.499 4.016 4.434 4.799 5.117 5.413 5.96 6.203 6.432 6.609 7.05 7.249 7.614 7.957 8.296 8.454 8.768 9.072 9.49 9.754 10.009 10.385 10.752 11.099 11.419 11.723 12.12 12.495 12.853 13.28 13.675 14.063 14.527 15.03 15.488 15.971 16.483 17.019 17.57 18.198 18.921 19.63 20.43 21.268 22.183 23.179 24.244 25.325 26.288 26.53 26.238 25.767 25.243 24.716 24.172 23.62 23.126 22.599 22.135 21.693 21.251 20.821 20.415 20.046 19.651 19.29 18.981 18.654 18.294 17.981 17.652 17.314 17.036 16.736 16.431 16.116 15.79 15.56 15.306 14.915 14.647 14.365 14.216 13.881 13.534 13.178 12.988 12.554 12.39 12.166 11.933 11.429 11.134 10.801 10.426 10.03 9.569 8.935 6.675 -3 ,26460 ,KEBNE ,16723469,Sun Nov 28 02:28:38 CET,Sun Nov 28 04:32:10 CET,0.0 1.934 2.595 3.144 3.544 3.881 4.208 4.513 5.061 5.308 5.546 5.734 6.175 6.364 6.724 7.065 7.393 7.554 7.862 8.151 8.552 8.808 9.056 9.409 9.759 10.091 10.405 10.701 11.084 11.45 11.793 12.204 12.615 13.009 13.451 13.944 14.422 14.969 15.536 16.096 16.664 17.286 18.006 18.737 19.545 20.368 21.282 22.259 23.325 24.442 25.374 25.689 25.51 25.024 24.479 23.905 23.316 22.765 22.269 21.721 21.227 20.774 20.327 19.901 19.477 19.081 18.675 18.309 17.994 17.649 17.271 16.958 16.634 16.299 16.04 15.761 15.464 15.158 14.828 14.587 14.335 13.952 13.691 13.415 13.271 12.968 12.631 12.27 12.094 11.677 11.532 11.315 11.087 10.588 10.313 10.017 9.65 9.217 8.753 8.123 5.716 -4 ,11398 ,KEBNE ,16723470,Sun Nov 28 02:28:38 CET,Sun Nov 28 04:31:46 CET,0.0 2.087 2.747 3.255 3.693 4.06 4.387 4.677 5.19 5.433 5.681 5.931 6.404 6.599 6.952 7.293 7.618 7.77 8.076 8.371 8.785 9.054 9.319 9.685 10.037 10.38 10.699 11.003 11.403 11.789 12.146 12.578 13.013 13.431 13.898 14.411 14.886 15.391 15.926 16.475 17.031 17.666 18.402 19.109 19.894 20.741 21.668 22.662 23.738 24.771 25.603 25.792 25.492 24.981 24.419 23.875 23.308 22.716 22.201 21.649 21.15 20.695 20.246 19.814 19.393 18.984 18.575 18.218 17.886 17.526 17.149 16.838 16.493 16.12 15.838 15.55 15.245 14.908 14.544 14.295 14.038 13.634 13.352 13.068 12.931 12.646 12.341 12.009 11.812 11.372 11.187 10.954 10.707 10.148 9.825 9.485 9.132 8.734 8.248 7.616 5.598 -5 ,2251 ,KEBNE ,16723471,Sun Nov 28 02:28:38 CET,Sun Nov 28 04:30:42 CET,0.0 2.3 2.972 3.483 3.88 4.222 4.537 4.832 5.372 5.616 5.856 6.036 6.485 6.681 7.055 7.41 7.739 7.896 8.202 8.486 8.884 9.147 9.399 9.756 10.097 10.421 10.732 11.04 11.438 11.816 12.179 12.611 13.021 13.409 13.847 14.31 14.749 15.24 15.791 16.389 17.007 17.667 18.398 19.139 19.973 20.832 21.789 22.814 23.867 24.937 25.88 26.056 25.728 25.262 24.739 24.178 23.613 23.08 22.59 22.078 21.626 21.17 20.705 20.273 19.868 19.491 19.094 18.737 18.424 18.081 17.711 17.403 17.082 16.742 16.467 16.194 15.915 15.613 15.293 15.06 14.821 14.441 14.163 13.89 13.752 13.465 13.147 12.805 12.63 12.211 12.036 11.814 11.6 11.113 10.834 10.536 10.207 9.832 9.334 8.655 6.666 -6 ,7550 ,KEBNE ,16723472,Sun Nov 28 02:28:38 CET,Sun Nov 28 04:30:16 CET,0.0 2.445 3.245 3.847 4.347 4.791 5.195 5.543 6.17 6.462 6.731 6.984 7.462 7.694 8.156 8.553 8.894 9.056 9.365 9.664 10.093 10.353 10.612 10.983 11.316 11.638 11.956 12.255 12.629 12.99 13.332 13.744 14.155 14.551 14.996 15.494 15.978 16.489 17.027 17.597 18.17 18.819 19.592 20.324 21.129 22.024 22.997 24.013 25.122 26.294 27.343 27.51 27.202 26.767 26.274 25.745 25.183 24.62 24.092 23.564 23.107 22.669 22.25 21.85 21.463 21.091 20.695 20.348 20.01 19.639 19.264 18.956 18.629 18.282 18.018 17.739 17.453 17.154 16.812 16.586 16.365 15.969 15.685 15.404 15.262 14.938 14.58 14.195 13.997 13.562 13.372 13.156 12.916 12.381 12.09 11.782 11.43 10.996 10.518 9.93 8.228 -7 ,30205 ,KEBNE ,16723473,Sun Nov 28 02:29:39 CET,Sun Nov 28 04:32:04 CET,0.0 2.064 2.677 3.197 3.674 4.068 4.397 4.692 5.242 5.493 5.72 5.899 6.341 6.533 6.903 7.262 7.605 7.767 8.08 8.386 8.811 9.068 9.317 9.695 10.055 10.386 10.707 11.024 11.432 11.812 12.169 12.595 12.999 13.377 13.813 14.31 14.794 15.3 15.829 16.389 16.972 17.637 18.392 19.097 19.871 20.742 21.697 22.713 23.843 24.917 25.736 25.846 25.537 25.042 24.496 23.942 23.402 22.874 22.358 21.828 21.351 20.907 20.481 20.089 19.711 19.342 18.953 18.6 18.297 17.969 17.579 17.243 16.924 16.589 16.316 16.039 15.759 15.465 15.152 14.921 14.678 14.312 14.071 13.822 13.682 13.388 13.076 12.742 12.565 12.138 11.961 11.721 11.462 10.934 10.655 10.34 9.972 9.542 9.06 8.451 6.555 -8 ,8918 ,KEBNE ,16723474,Sun Nov 28 02:29:39 CET,Sun Nov 28 04:31:31 CET,0.0 2.145 2.876 3.38 3.784 4.152 4.484 4.784 5.327 5.566 5.787 5.961 6.416 6.602 6.962 7.314 7.637 7.786 8.082 8.376 8.794 9.056 9.318 9.688 10.028 10.36 10.69 11.008 11.408 11.794 12.157 12.598 13.015 13.401 13.838 14.323 14.829 15.382 15.925 16.486 17.065 17.742 18.522 19.252 20.064 20.929 21.895 22.934 24.089 25.253 26.166 26.476 26.302 25.903 25.417 24.821 24.207 23.614 23.066 22.498 22.006 21.559 21.132 20.721 20.327 19.97 19.582 19.213 18.893 18.563 18.219 17.932 17.614 17.29 17.041 16.768 16.482 16.193 15.883 15.654 15.41 15.046 14.791 14.518 14.376 14.083 13.783 13.463 13.287 12.858 12.694 12.474 12.243 11.739 11.455 11.148 10.809 10.405 9.962 9.392 7.45 -9 ,5033 ,KEBNE ,16723475,Sun Nov 28 02:29:39 CET,Sun Nov 28 04:32:12 CET,0.0 2.389 3.08 3.585 3.995 4.365 4.705 5.022 5.576 5.823 6.056 6.233 6.671 6.86 7.228 7.57 7.898 8.069 8.394 8.684 9.098 9.363 9.611 9.962 10.312 10.653 10.97 11.272 11.655 12.027 12.387 12.802 13.199 13.59 14.041 14.525 14.981 15.492 16.043 16.618 17.2 17.85 18.605 19.326 20.141 21.015 21.953 22.976 24.072 25.11 26.0 26.2 25.879 25.414 24.873 24.289 23.744 23.223 22.741 22.212 21.734 21.302 20.888 20.469 20.058 19.678 19.258 18.877 18.564 18.234 17.874 17.579 17.264 16.932 16.676 16.409 16.134 15.849 15.54 15.314 15.071 14.686 14.416 14.13 13.973 13.653 13.318 12.951 12.765 12.336 12.182 11.979 11.764 11.271 10.985 10.663 10.3 9.904 9.468 8.856 6.874 -10 ,676 ,KEBNE ,16723476,Sun Nov 28 02:30:41 CET,Sun Nov 28 04:33:59 CET,0.0 2.186 2.818 3.3 3.687 4.034 4.366 4.688 5.248 5.483 5.711 5.932 6.386 6.582 6.957 7.304 7.63 7.789 8.1 8.386 8.793 9.061 9.321 9.695 10.039 10.374 10.706 11.024 11.423 11.795 12.153 12.571 12.953 13.332 13.777 14.252 14.716 15.25 15.818 16.395 16.993 17.638 18.361 19.095 19.905 20.742 21.649 22.6 23.593 24.548 25.204 25.217 24.9 24.393 23.807 23.226 22.672 22.115 21.596 21.068 20.606 20.172 19.726 19.283 18.869 18.477 18.051 17.672 17.341 16.985 16.608 16.284 15.929 15.568 15.286 14.985 14.686 14.385 14.067 13.828 13.582 13.186 12.907 12.648 12.511 12.207 11.881 11.524 11.328 10.884 10.696 10.46 10.195 9.597 9.275 8.966 8.637 8.253 7.714 6.982 5.153 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt deleted file mode 100644 index b0b9d7be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24298 ,KEBNE ,16723477,Sun Nov 28 02:30:41 CET,Sun Nov 28 04:30:52 CET,0.0 1.791 2.492 3.058 3.478 3.82 4.122 4.417 4.942 5.162 5.365 5.497 5.92 6.083 6.401 6.718 7.023 7.167 7.432 7.671 8.013 8.238 8.478 8.828 9.139 9.438 9.725 9.995 10.334 10.648 10.939 11.28 11.592 11.887 12.229 12.596 12.918 13.259 13.645 14.028 14.35 14.686 15.041 15.295 15.531 15.779 15.956 15.921 15.534 14.474 12.205 8.999 6.146 3.645 1.408 -0.578 -2.314 -3.88 -5.225 -6.624 -7.834 -8.895 -9.891 -10.807 -11.664 -12.434 -13.237 -13.971 -14.603 -15.24 -15.883 -16.413 -16.965 -17.557 -18.013 -18.468 -18.941 -19.451 -20.008 -20.384 -20.758 -21.372 -21.801 -22.243 -22.468 -22.922 -23.408 -23.905 -24.179 -24.757 -25.074 -25.394 -25.743 -26.518 -26.943 -27.388 -27.855 -28.379 -29.037 -29.958 -33.041 -2 ,17500 ,KEBNE ,16723478,Sun Nov 28 02:30:41 CET,Sun Nov 28 04:31:21 CET,0.0 1.675 2.25 2.703 3.103 3.47 3.786 4.059 4.542 4.775 4.994 5.153 5.593 5.78 6.14 6.462 6.752 6.891 7.161 7.412 7.765 7.983 8.185 8.476 8.759 9.033 9.29 9.538 9.863 10.16 10.442 10.781 11.084 11.374 11.71 12.071 12.412 12.799 13.188 13.564 13.954 14.354 14.721 15.035 15.354 15.603 15.799 15.874 15.641 14.891 12.888 9.711 6.81 4.244 2.004 0.007 -1.739 -3.367 -4.75 -6.116 -7.272 -8.293 -9.3 -10.253 -11.141 -11.943 -12.767 -13.514 -14.157 -14.814 -15.483 -16.042 -16.639 -17.268 -17.749 -18.241 -18.751 -19.257 -19.791 -20.167 -20.548 -21.159 -21.567 -21.982 -22.202 -22.667 -23.162 -23.684 -23.96 -24.542 -24.879 -25.19 -25.528 -26.283 -26.665 -27.081 -27.577 -28.177 -28.886 -29.814 -32.788 -3 ,20632 ,KEBNE ,16723479,Sun Nov 28 02:30:41 CET,Sun Nov 28 04:31:17 CET,0.0 1.792 2.468 2.956 3.345 3.699 4.008 4.266 4.713 4.932 5.138 5.258 5.681 5.852 6.156 6.431 6.71 6.843 7.094 7.342 7.67 7.869 8.07 8.376 8.661 8.911 9.15 9.388 9.684 9.946 10.196 10.502 10.797 11.069 11.372 11.694 11.996 12.309 12.616 12.923 13.224 13.511 13.774 13.998 14.2 14.308 14.253 14.061 13.549 12.377 9.972 6.554 3.406 0.656 -1.648 -3.699 -5.521 -7.167 -8.545 -9.88 -11.019 -12.019 -12.993 -13.926 -14.783 -15.557 -16.356 -17.062 -17.667 -18.282 -18.922 -19.476 -20.065 -20.664 -21.124 -21.604 -22.111 -22.642 -23.203 -23.591 -23.987 -24.596 -25.013 -25.453 -25.684 -26.168 -26.661 -27.17 -27.445 -28.018 -28.344 -28.67 -29.01 -29.735 -30.135 -30.584 -31.127 -31.734 -32.47 -33.46 -36.489 -4 ,20344 ,KEBNE ,16723480,Sun Nov 28 02:31:43 CET,Sun Nov 28 04:32:19 CET,0.0 1.997 2.643 3.12 3.524 3.897 4.219 4.498 4.999 5.23 5.445 5.597 6.032 6.201 6.523 6.847 7.161 7.306 7.565 7.822 8.188 8.407 8.633 8.952 9.246 9.528 9.794 10.048 10.367 10.679 10.984 11.339 11.654 11.943 12.277 12.64 12.971 13.335 13.704 14.061 14.409 14.797 15.247 15.621 15.962 16.224 16.274 16.136 15.82 14.88 12.653 9.34 6.355 3.783 1.464 -0.65 -2.493 -4.107 -5.489 -6.857 -8.004 -9.022 -9.998 -10.915 -11.746 -12.514 -13.319 -14.015 -14.631 -15.277 -15.94 -16.491 -17.043 -17.61 -18.055 -18.51 -18.965 -19.406 -19.847 -20.176 -20.542 -21.106 -21.499 -21.902 -22.102 -22.532 -22.988 -23.487 -23.761 -24.314 -24.62 -24.944 -25.281 -26.034 -26.433 -26.847 -27.323 -27.885 -28.564 -29.502 -34.607 -5 ,30696 ,KEBNE ,16723481,Sun Nov 28 02:31:43 CET,Sun Nov 28 04:32:13 CET,0.0 1.821 2.423 2.863 3.234 3.551 3.841 4.125 4.634 4.866 5.087 5.24 5.671 5.845 6.179 6.481 6.761 6.898 7.15 7.393 7.75 7.974 8.188 8.5 8.793 9.064 9.325 9.586 9.901 10.189 10.458 10.763 11.058 11.354 11.707 12.081 12.424 12.745 13.054 13.404 13.749 14.132 14.569 14.951 15.297 15.602 15.822 15.759 15.401 14.475 12.062 8.481 5.58 3.2 1.068 -0.869 -2.579 -4.145 -5.478 -6.807 -7.952 -8.984 -9.919 -10.779 -11.601 -12.352 -13.156 -13.89 -14.523 -15.157 -15.809 -16.355 -16.943 -17.539 -17.99 -18.474 -18.988 -19.508 -20.026 -20.398 -20.78 -21.351 -21.761 -22.196 -22.419 -22.874 -23.376 -23.937 -24.215 -24.755 -25.031 -25.339 -25.674 -26.426 -26.86 -27.327 -27.887 -28.494 -29.189 -30.233 -33.761 -6 ,19076 ,KEBNE ,16723482,Sun Nov 28 02:32:44 CET,Sun Nov 28 04:33:24 CET,0.0 1.925 2.489 2.93 3.316 3.684 4.012 4.284 4.751 4.958 5.155 5.29 5.725 5.906 6.263 6.588 6.878 7.013 7.277 7.536 7.906 8.133 8.341 8.643 8.937 9.201 9.456 9.701 10.01 10.307 10.589 10.924 11.239 11.53 11.86 12.233 12.581 12.942 13.283 13.623 13.987 14.352 14.719 15.045 15.337 15.594 15.776 15.746 15.389 14.412 12.192 8.942 6.004 3.5 1.279 -0.812 -2.629 -4.274 -5.66 -6.984 -8.128 -9.141 -10.112 -11.065 -11.944 -12.729 -13.553 -14.296 -14.936 -15.591 -16.284 -16.851 -17.421 -17.992 -18.424 -18.893 -19.374 -19.875 -20.408 -20.769 -21.14 -21.711 -22.116 -22.551 -22.774 -23.236 -23.728 -24.248 -24.524 -25.09 -25.4 -25.713 -26.038 -26.76 -27.181 -27.651 -28.182 -28.797 -29.452 -30.313 -33.941 -7 ,10668 ,KEBNE ,16723483,Sun Nov 28 02:32:44 CET,Sun Nov 28 04:33:26 CET,0.0 1.629 2.301 2.792 3.22 3.615 3.967 4.262 4.787 5.025 5.244 5.423 5.86 6.033 6.367 6.685 6.967 7.097 7.36 7.628 7.987 8.21 8.423 8.713 8.995 9.283 9.557 9.811 10.143 10.461 10.762 11.111 11.435 11.743 12.082 12.451 12.798 13.172 13.558 13.921 14.279 14.676 15.113 15.484 15.859 16.198 16.417 16.371 15.999 15.08 12.921 9.841 7.103 4.603 2.405 0.496 -1.207 -2.764 -4.082 -5.456 -6.66 -7.69 -8.658 -9.571 -10.41 -11.172 -11.971 -12.663 -13.253 -13.877 -14.534 -15.069 -15.62 -16.196 -16.636 -17.089 -17.557 -18.048 -18.559 -18.914 -19.272 -19.814 -20.204 -20.614 -20.829 -21.27 -21.706 -22.179 -22.447 -23.004 -23.265 -23.569 -23.92 -24.661 -25.06 -25.506 -25.971 -26.493 -27.127 -27.948 -30.411 -8 ,27701 ,KEBNE ,16723484,Sun Nov 28 02:32:44 CET,Sun Nov 28 04:32:38 CET,0.0 2.388 3.004 3.44 3.833 4.179 4.495 4.776 5.301 5.543 5.756 5.906 6.338 6.51 6.839 7.143 7.431 7.57 7.837 8.1 8.462 8.684 8.906 9.222 9.511 9.794 10.069 10.321 10.65 10.979 11.297 11.649 11.964 12.274 12.632 13.005 13.334 13.683 14.05 14.424 14.764 15.088 15.459 15.802 16.164 16.494 16.689 16.698 16.355 15.471 13.374 10.141 7.158 4.633 2.435 0.461 -1.267 -2.832 -4.211 -5.63 -6.836 -7.889 -8.863 -9.782 -10.653 -11.453 -12.26 -12.975 -13.586 -14.198 -14.84 -15.388 -15.961 -16.561 -17.036 -17.505 -17.98 -18.499 -19.04 -19.415 -19.796 -20.374 -20.793 -21.23 -21.451 -21.932 -22.444 -23.002 -23.3 -23.874 -24.23 -24.567 -24.922 -25.737 -26.182 -26.64 -27.2 -27.871 -28.585 -29.464 -31.922 -9 ,15047 ,KEBNE ,16723485,Sun Nov 28 02:33:45 CET,Sun Nov 28 04:33:32 CET,0.0 1.899 2.526 3.018 3.41 3.728 4.009 4.265 4.726 4.948 5.172 5.319 5.741 5.907 6.219 6.517 6.799 6.932 7.179 7.425 7.785 8.01 8.217 8.507 8.792 9.057 9.306 9.548 9.855 10.145 10.414 10.738 11.057 11.367 11.703 12.049 12.404 12.791 13.186 13.58 13.951 14.329 14.729 15.092 15.451 15.697 15.862 15.872 15.516 14.542 12.266 8.983 6.09 3.603 1.395 -0.692 -2.48 -4.064 -5.469 -6.902 -8.099 -9.114 -10.096 -11.007 -11.843 -12.623 -13.431 -14.152 -14.764 -15.389 -16.057 -16.615 -17.185 -17.77 -18.215 -18.671 -19.161 -19.661 -20.173 -20.547 -20.94 -21.56 -21.987 -22.42 -22.64 -23.088 -23.561 -24.094 -24.377 -24.944 -25.244 -25.552 -25.897 -26.644 -27.066 -27.525 -28.011 -28.565 -29.237 -30.176 -33.72 -10 ,27420 ,KEBNE ,16723486,Sun Nov 28 02:33:46 CET,Sun Nov 28 04:33:30 CET,0.0 1.766 2.401 2.887 3.291 3.641 3.931 4.193 4.672 4.884 5.087 5.236 5.663 5.832 6.155 6.468 6.765 6.907 7.182 7.439 7.788 8.01 8.229 8.536 8.821 9.095 9.351 9.59 9.899 10.199 10.473 10.792 11.095 11.378 11.698 12.035 12.359 12.72 13.091 13.447 13.783 14.134 14.554 14.963 15.377 15.762 16.044 16.079 15.689 14.648 12.291 8.915 6.067 3.728 1.691 -0.158 -1.825 -3.363 -4.654 -5.943 -7.054 -8.068 -9.038 -9.931 -10.759 -11.522 -12.32 -13.031 -13.67 -14.331 -14.995 -15.549 -16.115 -16.666 -17.098 -17.57 -18.034 -18.502 -19.025 -19.379 -19.74 -20.336 -20.731 -21.119 -21.324 -21.752 -22.233 -22.754 -23.025 -23.576 -23.849 -24.158 -24.513 -25.299 -25.739 -26.237 -26.76 -27.361 -28.047 -28.91 -32.223 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt deleted file mode 100644 index 0134a616..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23321 ,KEBNE ,17026298,Wed Dec 22 13:59:57 CET,Wed Dec 22 16:02:19 CET,0.0 2.374 3.097 3.671 4.163 4.569 4.905 5.21 5.774 6.02 6.26 6.483 6.942 7.137 7.514 7.883 8.249 8.426 8.748 9.052 9.504 9.791 10.063 10.468 10.872 11.259 11.619 11.954 12.381 12.787 13.196 13.712 14.182 14.621 15.133 15.693 16.228 16.815 17.449 18.111 18.775 19.492 20.269 21.07 22.053 23.065 24.11 25.264 26.475 27.564 28.391 28.359 27.815 27.178 26.52 25.839 25.148 24.471 23.868 23.246 22.702 22.199 21.709 21.238 20.792 20.375 19.945 19.557 19.194 18.828 18.467 18.149 17.812 17.456 17.169 16.876 16.567 16.241 15.9 15.664 15.421 15.036 14.766 14.468 14.307 13.988 13.651 13.276 13.077 12.621 12.411 12.165 11.903 11.348 11.025 10.673 10.314 9.912 9.421 8.783 6.999 -2 ,19662 ,KEBNE ,17026299,Wed Dec 22 14:00:59 CET,Wed Dec 22 16:03:23 CET,0.0 2.582 3.239 3.72 4.129 4.515 4.853 5.162 5.714 5.979 6.23 6.431 6.89 7.091 7.481 7.848 8.204 8.37 8.68 8.979 9.413 9.699 9.98 10.394 10.787 11.151 11.502 11.834 12.264 12.697 13.116 13.621 14.085 14.513 15.009 15.574 16.12 16.715 17.373 18.086 18.832 19.648 20.525 21.391 22.387 23.45 24.615 25.853 27.168 28.407 29.391 29.533 29.201 28.705 28.131 27.512 26.864 26.209 25.637 25.069 24.543 24.034 23.541 23.077 22.616 22.17 21.704 21.293 20.933 20.558 20.172 19.847 19.504 19.148 18.876 18.586 18.273 17.946 17.62 17.389 17.145 16.772 16.51 16.231 16.084 15.768 15.432 15.081 14.894 14.458 14.279 14.056 13.818 13.337 13.069 12.773 12.439 12.022 11.553 10.929 8.873 -3 ,17384 ,KEBNE ,17026300,Wed Dec 22 14:03:03 CET,Wed Dec 22 16:04:17 CET,0.0 2.223 2.892 3.358 3.778 4.17 4.513 4.808 5.311 5.54 5.773 5.997 6.447 6.64 7.011 7.355 7.679 7.847 8.184 8.501 8.947 9.24 9.532 9.934 10.309 10.678 11.031 11.371 11.81 12.229 12.636 13.128 13.603 14.06 14.589 15.176 15.723 16.32 16.948 17.599 18.307 19.109 20.033 20.907 21.91 23.023 24.171 25.38 26.704 28.034 29.294 29.783 29.671 29.199 28.582 27.954 27.344 26.746 26.177 25.577 25.024 24.523 24.046 23.584 23.149 22.755 22.335 21.93 21.567 21.182 20.789 20.476 20.145 19.794 19.516 19.23 18.936 18.618 18.273 18.028 17.778 17.405 17.136 16.851 16.706 16.396 16.075 15.745 15.563 15.119 14.931 14.719 14.501 14.006 13.736 13.445 13.105 12.716 12.253 11.65 9.78 -4 ,26095 ,KEBNE ,17026301,Wed Dec 22 14:03:03 CET,Wed Dec 22 16:04:04 CET,0.0 1.553 2.185 2.707 3.144 3.524 3.876 4.185 4.744 5.008 5.259 5.472 5.931 6.137 6.526 6.894 7.24 7.408 7.735 8.055 8.497 8.763 9.022 9.387 9.74 10.083 10.406 10.713 11.115 11.519 11.916 12.384 12.809 13.211 13.68 14.209 14.728 15.293 15.888 16.524 17.194 17.908 18.72 19.527 20.401 21.327 22.361 23.452 24.58 25.557 26.16 26.122 25.627 24.934 24.224 23.528 22.866 22.221 21.608 20.987 20.455 19.956 19.441 18.923 18.435 18.003 17.555 17.14 16.778 16.402 16.015 15.68 15.318 14.944 14.653 14.346 14.038 13.734 13.402 13.158 12.904 12.503 12.22 11.912 11.755 11.447 11.112 10.756 10.567 10.131 9.964 9.75 9.517 8.978 8.688 8.363 7.98 7.555 7.04 6.348 4.105 -5 ,14800 ,KEBNE ,17026302,Wed Dec 22 14:03:07 CET,Wed Dec 22 16:03:52 CET,0.0 2.054 2.691 3.169 3.571 3.934 4.274 4.577 5.123 5.377 5.619 5.826 6.288 6.492 6.868 7.241 7.617 7.794 8.128 8.445 8.9 9.187 9.459 9.851 10.233 10.598 10.936 11.266 11.704 12.132 12.552 13.041 13.512 13.97 14.485 15.065 15.618 16.24 16.91 17.586 18.306 19.137 20.081 20.983 21.99 23.081 24.219 25.348 26.442 27.557 28.506 28.613 28.235 27.644 26.982 26.331 25.677 25.068 24.527 23.912 23.355 22.827 22.3 21.807 21.355 20.94 20.491 20.093 19.748 19.383 18.999 18.681 18.33 17.952 17.665 17.363 17.051 16.726 16.383 16.151 15.91 15.519 15.245 14.962 14.806 14.483 14.143 13.741 13.518 13.045 12.804 12.542 12.259 11.652 11.33 10.987 10.595 10.104 9.537 8.798 6.881 -6 ,21489 ,KEBNE ,17026303,Wed Dec 22 14:03:03 CET,Wed Dec 22 16:04:25 CET,0.0 1.967 2.607 3.083 3.481 3.843 4.173 4.441 4.953 5.198 5.431 5.62 6.069 6.269 6.626 6.977 7.326 7.496 7.821 8.121 8.552 8.831 9.099 9.498 9.885 10.263 10.623 10.964 11.403 11.817 12.21 12.686 13.143 13.591 14.108 14.666 15.178 15.733 16.323 16.928 17.595 18.335 19.187 20.056 20.935 21.809 22.761 23.8 24.865 25.744 26.392 26.392 26.008 25.427 24.747 24.093 23.466 22.838 22.253 21.655 21.119 20.603 20.066 19.556 19.129 18.743 18.328 17.945 17.609 17.273 16.925 16.633 16.31 15.957 15.682 15.396 15.1 14.792 14.474 14.245 14.008 13.643 13.387 13.11 12.964 12.654 12.324 11.977 11.787 11.345 11.184 10.972 10.741 10.221 9.927 9.62 9.28 8.862 8.34 7.727 6.131 -7 ,8245 ,KEBNE ,17026304,Wed Dec 22 14:03:03 CET,Wed Dec 22 16:04:23 CET,0.0 1.843 2.492 2.997 3.445 3.833 4.168 4.489 5.072 5.334 5.581 5.796 6.255 6.456 6.857 7.229 7.566 7.727 8.039 8.352 8.819 9.116 9.391 9.785 10.171 10.529 10.865 11.201 11.639 12.054 12.449 12.922 13.385 13.834 14.343 14.916 15.472 16.071 16.718 17.418 18.151 18.938 19.82 20.716 21.738 22.853 24.12 25.379 26.617 27.892 29.026 29.468 29.149 28.512 27.917 27.321 26.736 26.14 25.564 24.962 24.425 23.941 23.445 22.967 22.532 22.115 21.656 21.223 20.861 20.509 20.145 19.828 19.48 19.107 18.82 18.518 18.196 17.861 17.525 17.305 17.071 16.683 16.41 16.125 15.976 15.669 15.333 14.972 14.789 14.357 14.164 13.926 13.675 13.108 12.789 12.469 12.125 11.718 11.298 10.744 8.631 -8 ,18009 ,KEBNE ,17026305,Wed Dec 22 14:04:05 CET,Wed Dec 22 16:05:19 CET,0.0 1.782 2.403 2.889 3.334 3.712 4.02 4.297 4.829 5.082 5.31 5.476 5.916 6.117 6.51 6.874 7.218 7.385 7.718 8.048 8.502 8.781 9.045 9.425 9.792 10.133 10.454 10.777 11.192 11.583 11.968 12.439 12.897 13.329 13.823 14.391 14.922 15.468 16.036 16.619 17.246 17.942 18.712 19.487 20.365 21.317 22.372 23.469 24.621 25.725 26.71 26.936 26.585 25.943 25.184 24.466 23.813 23.158 22.556 21.943 21.383 20.88 20.407 19.946 19.504 19.098 18.658 18.253 17.91 17.546 17.158 16.832 16.501 16.161 15.894 15.618 15.318 15.003 14.67 14.439 14.208 13.822 13.546 13.265 13.117 12.8 12.472 12.133 11.959 11.533 11.365 11.143 10.912 10.415 10.13 9.803 9.446 9.036 8.515 7.854 5.908 -9 ,29862 ,KEBNE ,17026306,Wed Dec 22 14:05:07 CET,Wed Dec 22 16:07:23 CET,0.0 1.638 2.365 2.905 3.291 3.652 3.992 4.288 4.849 5.105 5.327 5.5 5.936 6.124 6.49 6.842 7.179 7.342 7.672 8.0 8.449 8.73 9.01 9.406 9.784 10.148 10.49 10.822 11.254 11.668 12.076 12.554 13.002 13.443 13.966 14.551 15.092 15.666 16.271 16.911 17.615 18.417 19.315 20.21 21.134 22.018 22.965 23.905 24.863 25.833 26.697 26.827 26.413 25.769 25.094 24.395 23.709 23.068 22.487 21.879 21.351 20.845 20.346 19.879 19.425 19.01 18.579 18.196 17.862 17.491 17.109 16.814 16.513 16.183 15.919 15.638 15.331 15.009 14.666 14.432 14.192 13.817 13.555 13.273 13.12 12.797 12.458 12.108 11.924 11.486 11.296 11.055 10.816 10.295 9.99 9.608 9.201 8.803 8.324 7.605 5.406 -10 ,25066 ,KEBNE ,17026307,Wed Dec 22 14:05:07 CET,Wed Dec 22 16:07:07 CET,0.0 1.88 2.551 3.025 3.448 3.828 4.159 4.46 4.993 5.232 5.471 5.674 6.124 6.322 6.703 7.048 7.369 7.525 7.83 8.116 8.544 8.832 9.103 9.481 9.849 10.208 10.542 10.867 11.287 11.69 12.082 12.536 12.971 13.386 13.862 14.412 14.936 15.491 16.064 16.666 17.281 17.934 18.674 19.424 20.277 21.142 22.099 23.159 24.23 25.177 25.871 25.822 25.259 24.534 23.771 23.051 22.36 21.699 21.13 20.54 19.985 19.456 18.949 18.459 17.995 17.566 17.115 16.707 16.365 15.998 15.61 15.304 14.974 14.615 14.322 14.008 13.672 13.325 12.978 12.731 12.479 12.102 11.83 11.533 11.373 11.041 10.693 10.316 10.113 9.672 9.498 9.264 9.016 8.495 8.207 7.893 7.543 7.128 6.659 6.021 3.926 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt deleted file mode 100644 index d3c2b420..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11115 ,KEBNE ,17026308,Wed Dec 22 14:05:11 CET,Wed Dec 22 16:05:17 CET,0.0 2.51 3.305 3.857 4.356 4.796 5.136 5.444 6.041 6.319 6.574 6.806 7.279 7.501 7.926 8.341 8.77 8.988 9.399 9.77 10.265 10.561 10.846 11.27 11.666 12.049 12.43 12.806 13.292 13.752 14.198 14.73 15.237 15.717 16.265 16.868 17.446 18.101 18.803 19.554 20.356 21.223 22.154 23.125 24.289 25.511 26.889 28.333 29.851 31.471 33.13 34.124 34.299 34.047 33.59 33.063 32.56 32.086 31.638 31.098 30.595 30.134 29.684 29.25 28.836 28.437 28.022 27.643 27.293 26.93 26.552 26.239 25.905 25.557 25.301 25.033 24.73 24.41 24.095 23.868 23.628 23.264 23.001 22.703 22.547 22.244 21.908 21.549 21.366 20.943 20.758 20.525 20.27 19.736 19.437 19.071 18.676 18.27 17.776 17.117 15.316 -2 ,9172 ,KEBNE ,17026309,Wed Dec 22 14:06:09 CET,Wed Dec 22 16:08:38 CET,0.0 2.105 2.896 3.498 4.026 4.51 4.953 5.343 6.006 6.29 6.56 6.827 7.302 7.518 7.936 8.347 8.741 8.928 9.291 9.642 10.145 10.46 10.751 11.178 11.598 11.997 12.39 12.775 13.262 13.735 14.203 14.759 15.293 15.824 16.431 17.102 17.708 18.333 19.047 19.854 20.655 21.525 22.542 23.474 24.509 25.717 27.138 28.676 30.368 32.045 33.699 34.623 34.819 34.785 34.539 34.107 33.592 33.068 32.591 32.06 31.588 31.183 30.775 30.375 29.981 29.602 29.207 28.843 28.52 28.163 27.774 27.465 27.144 26.803 26.539 26.251 25.947 25.638 25.321 25.097 24.853 24.438 24.129 23.803 23.637 23.303 22.956 22.572 22.371 21.934 21.733 21.505 21.265 20.715 20.383 20.013 19.621 19.213 18.753 18.132 16.675 -3 ,30666 ,KEBNE ,17026310,Wed Dec 22 14:05:07 CET,Wed Dec 22 16:07:01 CET,0.0 2.023 2.846 3.441 3.913 4.331 4.693 5.019 5.609 5.873 6.123 6.365 6.848 7.07 7.499 7.903 8.279 8.456 8.799 9.138 9.636 9.946 10.249 10.702 11.128 11.529 11.924 12.304 12.774 13.234 13.697 14.242 14.733 15.197 15.749 16.379 16.979 17.627 18.308 19.008 19.749 20.592 21.529 22.438 23.526 24.784 26.175 27.568 29.193 31.031 32.767 33.693 33.831 33.642 33.283 32.837 32.389 31.901 31.431 30.927 30.429 29.96 29.514 29.106 28.709 28.343 27.942 27.561 27.233 26.876 26.5 26.169 25.815 25.464 25.175 24.868 24.561 24.231 23.887 23.656 23.41 23.013 22.732 22.444 22.297 21.994 21.664 21.3 21.112 20.687 20.464 20.21 19.946 19.401 19.118 18.787 18.403 17.957 17.413 16.73 14.532 -4 ,7140 ,KEBNE ,17026311,Wed Dec 22 14:05:07 CET,Wed Dec 22 16:06:52 CET,0.0 2.831 3.553 4.132 4.602 5.042 5.461 5.814 6.429 6.724 6.993 7.211 7.67 7.895 8.324 8.717 9.087 9.264 9.615 9.951 10.427 10.723 11.006 11.424 11.828 12.215 12.584 12.94 13.395 13.832 14.255 14.786 15.286 15.746 16.304 16.913 17.474 18.116 18.805 19.507 20.251 21.111 22.092 23.045 24.104 25.224 26.46 27.805 29.329 30.972 32.487 33.217 33.311 33.024 32.624 32.152 31.619 31.077 30.565 30.029 29.533 29.068 28.623 28.196 27.791 27.413 26.996 26.622 26.296 25.952 25.586 25.269 24.931 24.578 24.297 24.006 23.709 23.407 23.095 22.868 22.615 22.214 21.933 21.628 21.469 21.145 20.806 20.451 20.261 19.823 19.625 19.404 19.168 18.607 18.275 17.914 17.516 17.072 16.537 15.804 12.588 -5 ,12287 ,KEBNE ,17026312,Wed Dec 22 14:05:07 CET,Wed Dec 22 16:07:22 CET,0.0 2.376 3.148 3.733 4.222 4.621 4.983 5.319 5.932 6.218 6.497 6.783 7.283 7.508 7.928 8.327 8.713 8.898 9.251 9.604 10.104 10.417 10.714 11.146 11.566 11.976 12.385 12.765 13.233 13.693 14.127 14.644 15.162 15.64 16.186 16.841 17.479 18.161 18.884 19.65 20.451 21.346 22.353 23.347 24.532 25.825 27.268 28.907 30.599 32.306 34.076 34.874 34.947 34.755 34.313 33.811 33.327 32.847 32.381 31.859 31.379 30.939 30.537 30.145 29.749 29.368 28.958 28.585 28.253 27.903 27.535 27.221 26.883 26.531 26.259 25.979 25.667 25.331 24.993 24.752 24.502 24.1 23.809 23.51 23.35 23.002 22.641 22.252 22.049 21.62 21.404 21.161 20.908 20.357 20.05 19.722 19.34 18.87 18.3 17.511 14.995 -6 ,7080 ,KEBNE ,17026313,Wed Dec 22 14:05:07 CET,Wed Dec 22 16:06:50 CET,0.0 2.661 3.333 3.853 4.31 4.716 5.082 5.437 6.071 6.334 6.583 6.819 7.297 7.509 7.934 8.35 8.731 8.915 9.286 9.637 10.13 10.438 10.736 11.179 11.604 12.012 12.404 12.778 13.252 13.715 14.176 14.727 15.252 15.744 16.306 16.958 17.581 18.249 18.954 19.705 20.534 21.46 22.501 23.535 24.678 25.953 27.355 28.927 30.789 32.662 34.458 35.44 35.71 35.513 35.091 34.636 34.143 33.626 33.15 32.63 32.153 31.704 31.257 30.817 30.379 29.966 29.545 29.163 28.826 28.458 28.06 27.739 27.403 27.044 26.759 26.453 26.131 25.804 25.464 25.221 24.983 24.614 24.334 24.046 23.894 23.586 23.27 22.917 22.722 22.289 22.121 21.9 21.673 21.183 20.899 20.59 20.266 19.857 19.298 18.523 15.813 -7 ,1981 ,KEBNE ,17026314,Wed Dec 22 14:05:07 CET,Wed Dec 22 16:06:27 CET,0.0 2.088 2.833 3.389 3.836 4.261 4.654 5.003 5.607 5.871 6.12 6.344 6.817 7.038 7.446 7.828 8.198 8.383 8.756 9.12 9.619 9.925 10.227 10.671 11.09 11.495 11.871 12.236 12.71 13.158 13.589 14.1 14.595 15.071 15.604 16.206 16.796 17.446 18.157 18.924 19.713 20.591 21.625 22.639 23.816 25.138 26.6 28.134 29.799 31.605 33.568 34.739 35.063 35.018 34.77 34.402 33.991 33.541 33.104 32.638 32.186 31.721 31.262 30.83 30.43 30.059 29.652 29.283 28.957 28.609 28.257 27.955 27.635 27.309 27.046 26.753 26.438 26.106 25.765 25.537 25.298 24.919 24.653 24.369 24.211 23.863 23.502 23.136 22.944 22.505 22.302 22.073 21.838 21.315 21.015 20.706 20.357 19.916 19.356 18.548 15.983 -8 ,20290 ,KEBNE ,17026315,Wed Dec 22 14:05:07 CET,Wed Dec 22 16:06:30 CET,0.0 2.73 3.477 4.037 4.468 4.854 5.193 5.495 6.07 6.346 6.604 6.843 7.307 7.523 7.942 8.343 8.721 8.905 9.26 9.588 10.059 10.372 10.677 11.115 11.53 11.915 12.296 12.683 13.173 13.648 14.1 14.631 15.128 15.607 16.214 16.89 17.503 18.175 18.882 19.62 20.398 21.269 22.246 23.239 24.374 25.577 26.897 28.304 29.914 31.581 33.26 34.128 34.233 34.017 33.604 33.066 32.464 31.926 31.457 30.907 30.412 29.981 29.549 29.106 28.709 28.349 27.934 27.54 27.201 26.861 26.476 26.145 25.819 25.467 25.188 24.887 24.56 24.229 23.891 23.655 23.403 22.996 22.719 22.432 22.281 21.945 21.598 21.239 21.036 20.593 20.387 20.155 19.905 19.333 19.0 18.64 18.252 17.814 17.302 16.609 14.442 -9 ,5504 ,KEBNE ,17026316,Wed Dec 22 14:06:09 CET,Wed Dec 22 16:07:44 CET,0.0 2.765 3.512 4.059 4.502 4.909 5.28 5.621 6.232 6.508 6.772 7.031 7.53 7.796 8.313 8.758 9.161 9.358 9.715 10.046 10.534 10.854 11.157 11.582 12.011 12.427 12.814 13.189 13.669 14.128 14.586 15.139 15.653 16.135 16.702 17.357 17.997 18.686 19.406 20.165 20.959 21.831 22.867 23.884 24.999 26.19 27.525 28.953 30.544 32.326 34.224 35.386 35.601 35.437 35.139 34.767 34.316 33.815 33.357 32.867 32.416 31.975 31.503 31.078 30.697 30.321 29.931 29.576 29.259 28.92 28.555 28.246 27.908 27.518 27.187 26.847 26.513 26.189 25.827 25.539 25.247 24.811 24.503 24.18 24.012 23.66 23.288 22.89 22.689 22.253 22.021 21.766 21.484 20.81 20.454 20.091 19.664 19.147 18.567 17.796 15.842 -10 ,783 ,KEBNE ,17026317,Wed Dec 22 14:06:09 CET,Wed Dec 22 16:08:43 CET,0.0 1.766 2.482 3.033 3.51 3.929 4.293 4.612 5.185 5.455 5.711 5.927 6.386 6.595 7.007 7.387 7.75 7.937 8.304 8.653 9.15 9.455 9.736 10.154 10.568 10.969 11.355 11.724 12.203 12.664 13.106 13.656 14.178 14.679 15.234 15.817 16.411 17.084 17.807 18.566 19.345 20.225 21.202 22.17 23.328 24.593 26.016 27.627 29.399 31.199 32.907 33.716 33.832 33.62 33.253 32.821 32.326 31.803 31.277 30.719 30.222 29.784 29.357 28.905 28.469 28.081 27.654 27.265 26.929 26.585 26.237 25.948 25.648 25.319 25.059 24.784 24.49 24.184 23.87 23.646 23.403 23.024 22.746 22.449 22.3 21.993 21.685 21.352 21.16 20.721 20.49 20.251 20.003 19.436 19.113 18.788 18.442 18.015 17.493 16.79 14.506 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 9bfceb40..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27353 ,KEBNE ,17026318,Wed Dec 22 14:06:09 CET,Wed Dec 22 16:02:29 CET,0.0 0.5 0.884 1.213 1.513 1.789 2.047 2.515 2.73 2.937 3.081 3.534 3.734 4.093 4.427 4.731 4.878 5.177 5.464 5.874 6.144 6.413 6.809 7.183 7.54 7.888 8.225 8.655 9.078 9.494 10.003 10.507 10.974 11.506 12.142 12.772 13.461 14.193 14.972 15.792 16.694 17.749 18.839 20.122 21.555 23.207 25.08 27.293 29.776 32.328 33.832 34.226 34.213 34.018 33.688 33.238 32.67 32.088 31.505 31.033 30.611 30.162 29.709 29.306 28.92 28.463 28.009 27.59 27.151 26.7 26.313 25.879 25.395 25.005 24.61 24.214 23.784 23.308 22.982 22.627 22.05 21.653 21.216 20.986 20.564 20.123 19.648 19.406 18.925 18.582 18.275 17.922 17.116 16.67 16.183 15.612 14.864 13.916 12.571 -2 ,8810 ,KEBNE ,17026319,Wed Dec 22 14:06:09 CET,Wed Dec 22 16:01:31 CET,0.0 0.514 0.927 1.273 1.581 1.893 2.173 2.661 2.882 3.096 3.253 3.683 3.85 4.183 4.518 4.849 5.01 5.315 5.612 6.042 6.313 6.575 6.965 7.345 7.716 8.074 8.413 8.844 9.265 9.694 10.217 10.711 11.192 11.783 12.469 13.119 13.839 14.598 15.389 16.19 17.043 18.032 19.106 20.436 22.0 23.884 25.935 28.065 30.41 33.119 35.008 35.85 36.083 35.992 35.695 35.303 34.882 34.457 33.966 33.433 32.871 32.31 31.788 31.271 30.775 30.256 29.741 29.268 28.798 28.305 27.885 27.464 27.036 26.688 26.292 25.875 25.423 24.937 24.624 24.29 23.744 23.344 22.914 22.689 22.218 21.744 21.2 20.894 20.382 20.03 19.73 19.373 18.478 17.976 17.449 16.853 16.139 15.156 13.681 -3 ,17668 ,KEBNE ,17026320,Wed Dec 22 14:06:13 CET,Wed Dec 22 15:58:24 CET,0.0 0.489 0.876 1.208 1.496 1.765 2.031 2.526 2.745 2.949 3.104 3.55 3.726 4.055 4.385 4.721 4.876 5.164 5.443 5.847 6.12 6.402 6.806 7.179 7.543 7.893 8.234 8.687 9.131 9.57 10.093 10.603 11.102 11.676 12.34 12.979 13.676 14.452 15.261 16.112 17.069 18.142 19.241 20.539 21.965 23.606 25.428 27.462 29.814 32.538 34.221 34.761 34.805 34.506 34.117 33.745 33.314 32.868 32.398 31.94 31.452 30.939 30.427 29.916 29.44 28.969 28.54 28.133 27.686 27.2 26.796 26.39 25.951 25.601 25.248 24.885 24.498 24.059 23.729 23.397 22.915 22.568 22.178 21.971 21.532 21.076 20.592 20.342 19.847 19.431 19.117 18.795 18.021 17.558 17.058 16.517 15.908 14.975 13.546 -4 ,7663 ,KEBNE ,17026321,Wed Dec 22 14:06:09 CET,Wed Dec 22 16:03:05 CET,0.0 0.58 1.016 1.391 1.719 2.005 2.261 2.75 2.973 3.169 3.291 3.72 3.887 4.193 4.498 4.797 4.937 5.207 5.471 5.852 6.111 6.369 6.732 7.081 7.42 7.748 8.064 8.477 8.874 9.266 9.77 10.25 10.696 11.21 11.774 12.315 12.923 13.578 14.281 15.013 15.83 16.809 17.787 18.903 20.134 21.548 23.14 24.981 26.977 29.066 30.393 30.734 30.729 30.514 30.067 29.56 29.034 28.497 27.876 27.31 26.794 26.28 25.756 25.219 24.708 24.178 23.685 23.254 22.827 22.361 21.949 21.524 21.093 20.746 20.365 19.937 19.479 19.033 18.728 18.399 17.875 17.499 17.086 16.877 16.436 15.927 15.388 15.111 14.592 14.138 13.803 13.442 12.636 12.161 11.593 10.949 10.131 9.104 7.676 -5 ,15419 ,KEBNE ,17026322,Wed Dec 22 14:06:09 CET,Wed Dec 22 16:01:10 CET,0.0 0.507 0.87 1.212 1.51 1.777 2.031 2.504 2.73 2.935 3.063 3.496 3.683 4.056 4.405 4.731 4.89 5.197 5.489 5.916 6.191 6.471 6.865 7.219 7.58 7.944 8.285 8.715 9.138 9.534 10.018 10.519 10.993 11.538 12.158 12.744 13.393 14.109 14.86 15.637 16.538 17.609 18.685 19.924 21.349 23.02 24.814 26.791 29.003 31.508 33.083 33.55 33.541 33.262 32.827 32.323 31.793 31.253 30.656 30.058 29.502 29.004 28.495 28.022 27.589 27.11 26.663 26.258 25.842 25.41 25.011 24.589 24.181 23.843 23.48 23.093 22.694 22.277 21.97 21.645 21.068 20.662 20.266 20.051 19.586 19.09 18.549 18.262 17.743 17.307 16.968 16.574 15.655 15.16 14.586 13.888 13.131 12.129 10.513 -6 ,1978 ,KEBNE ,17026323,Wed Dec 22 14:06:09 CET,Wed Dec 22 16:01:03 CET,0.0 0.439 0.767 1.052 1.319 1.565 1.789 2.223 2.426 2.599 2.689 3.099 3.259 3.57 3.87 4.169 4.315 4.587 4.837 5.183 5.405 5.628 5.951 6.28 6.617 6.942 7.248 7.631 7.993 8.329 8.744 9.149 9.53 9.97 10.483 10.973 11.485 12.026 12.629 13.303 14.055 14.911 15.786 16.793 17.87 19.043 20.399 21.862 23.268 24.869 25.678 25.704 25.381 24.892 24.378 23.817 23.219 22.678 22.09 21.545 21.061 20.585 20.123 19.69 19.286 18.85 18.44 18.047 17.629 17.204 16.836 16.407 15.924 15.57 15.21 14.813 14.417 14.011 13.718 13.42 12.956 12.617 12.223 12.004 11.549 11.101 10.592 10.315 9.835 9.427 9.085 8.744 7.953 7.474 6.955 6.424 5.822 5.024 3.831 -7 ,8794 ,KEBNE ,17026324,Wed Dec 22 14:06:09 CET,Wed Dec 22 16:02:50 CET,0.0 0.52 0.947 1.314 1.647 1.939 2.221 2.746 2.967 3.169 3.318 3.773 3.971 4.332 4.655 4.96 5.12 5.442 5.752 6.195 6.477 6.741 7.127 7.518 7.901 8.261 8.604 9.039 9.453 9.857 10.346 10.833 11.303 11.842 12.44 13.014 13.656 14.363 15.118 15.902 16.759 17.772 18.815 19.946 21.188 22.662 24.33 26.31 28.532 30.91 32.451 32.903 32.905 32.722 32.404 32.017 31.597 31.213 30.788 30.389 29.984 29.581 29.204 28.807 28.432 27.957 27.45 27.001 26.494 25.932 25.476 25.026 24.561 24.177 23.771 23.343 22.881 22.398 22.056 21.692 21.117 20.713 20.279 20.058 19.604 19.088 18.524 18.215 17.667 17.256 16.931 16.581 15.823 15.368 14.803 14.158 13.484 12.613 11.256 -8 ,7765 ,KEBNE ,17026325,Wed Dec 22 14:06:09 CET,Wed Dec 22 16:01:48 CET,0.0 0.484 0.875 1.203 1.516 1.808 2.053 2.513 2.745 2.965 3.128 3.571 3.758 4.137 4.503 4.831 4.984 5.283 5.559 5.956 6.214 6.468 6.842 7.201 7.553 7.895 8.222 8.646 9.06 9.466 9.956 10.421 10.871 11.379 11.94 12.513 13.164 13.857 14.553 15.286 16.129 17.095 18.071 19.24 20.56 22.103 23.814 25.61 27.423 29.048 29.811 29.933 29.543 29.024 28.509 27.955 27.421 26.878 26.299 25.788 25.3 24.823 24.341 23.886 23.445 22.941 22.45 22.009 21.589 21.166 20.815 20.416 19.974 19.62 19.258 18.882 18.473 18.05 17.764 17.46 16.976 16.632 16.263 16.07 15.651 15.208 14.749 14.487 13.998 13.665 13.327 12.968 12.212 11.761 11.252 10.663 9.94 9.063 7.822 -9 ,10810 ,KEBNE ,17026326,Wed Dec 22 14:06:09 CET,Wed Dec 22 16:01:41 CET,0.0 0.57 0.991 1.381 1.724 2.006 2.259 2.724 2.945 3.16 3.308 3.751 3.942 4.303 4.645 4.972 5.134 5.435 5.712 6.119 6.372 6.625 7.008 7.371 7.718 8.058 8.398 8.84 9.253 9.649 10.132 10.609 11.067 11.595 12.174 12.739 13.375 14.033 14.73 15.487 16.321 17.288 18.289 19.439 20.718 22.257 23.93 25.65 27.427 29.221 30.075 30.179 29.961 29.559 29.118 28.678 28.182 27.637 26.993 26.456 26.022 25.556 25.072 24.596 24.156 23.669 23.182 22.767 22.348 21.884 21.451 20.982 20.5 20.154 19.802 19.425 19.019 18.56 18.217 17.858 17.305 16.913 16.512 16.307 15.871 15.428 14.919 14.606 14.052 13.559 13.181 12.799 11.878 11.323 10.739 10.052 9.199 8.107 6.645 -10 ,29164 ,KEBNE ,17026327,Wed Dec 22 14:06:10 CET,Wed Dec 22 15:58:49 CET,0.0 0.457 0.849 1.195 1.49 1.763 2.031 2.533 2.753 2.96 3.123 3.574 3.763 4.122 4.454 4.783 4.945 5.26 5.56 5.977 6.262 6.536 6.92 7.293 7.637 7.976 8.319 8.758 9.183 9.605 10.115 10.6 11.071 11.626 12.25 12.853 13.536 14.253 14.994 15.806 16.7 17.722 18.772 20.01 21.367 22.894 24.637 26.627 28.796 31.153 32.581 33.057 33.162 33.074 32.842 32.531 32.172 31.793 31.367 30.949 30.516 30.096 29.595 29.033 28.529 27.972 27.441 26.94 26.421 25.909 25.49 25.019 24.501 24.093 23.652 23.218 22.784 22.295 21.943 21.562 20.95 20.539 20.131 19.921 19.489 19.005 18.425 18.109 17.548 17.027 16.639 16.23 15.327 14.826 14.258 13.579 12.697 11.611 10.179 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index 764bcb8b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9632 ,KEBNE ,16723487,Sun Nov 28 02:34:47 CET,Sun Nov 28 04:36:35 CET,0.0 2.291 2.94 3.439 3.857 4.263 4.669 5.008 5.527 5.772 6.009 6.193 6.634 6.826 7.19 7.53 7.855 8.008 8.288 8.567 8.979 9.24 9.502 9.87 10.212 10.537 10.851 11.154 11.534 11.888 12.22 12.628 13.022 13.39 13.815 14.294 14.752 15.241 15.753 16.3 16.884 17.535 18.213 18.851 19.572 20.344 21.21 22.118 23.089 23.909 24.098 23.466 22.643 21.655 20.668 19.769 18.93 18.078 17.334 16.588 15.915 15.314 14.759 14.205 13.686 13.225 12.702 12.209 11.801 11.385 10.955 10.602 10.228 9.813 9.474 9.135 8.786 8.416 8.024 7.756 7.487 7.085 6.806 6.497 6.339 5.992 5.595 5.164 4.935 4.476 4.237 3.996 3.755 3.245 2.955 2.649 2.324 1.922 1.389 0.764 -0.165 -2 ,18453 ,KEBNE ,16723488,Sun Nov 28 02:34:47 CET,Sun Nov 28 04:35:49 CET,0.0 2.155 2.849 3.387 3.799 4.133 4.441 4.72 5.221 5.454 5.672 5.827 6.253 6.441 6.809 7.146 7.467 7.632 7.955 8.256 8.654 8.903 9.156 9.506 9.832 10.151 10.466 10.765 11.14 11.503 11.837 12.236 12.622 12.99 13.39 13.845 14.288 14.737 15.203 15.706 16.239 16.821 17.484 18.098 18.74 19.433 20.149 20.828 21.491 22.028 22.079 21.339 20.38 19.422 18.476 17.575 16.722 15.893 15.155 14.394 13.723 13.117 12.567 12.064 11.573 11.108 10.607 10.146 9.749 9.33 8.888 8.514 8.128 7.737 7.429 7.085 6.719 6.362 5.991 5.73 5.454 5.018 4.711 4.398 4.244 3.927 3.562 3.171 2.976 2.53 2.329 2.095 1.849 1.301 0.989 0.655 0.286 -0.122 -0.636 -1.481 -4.26 -3 ,4114 ,KEBNE ,16723489,Sun Nov 28 02:34:47 CET,Sun Nov 28 04:34:29 CET,0.0 2.283 2.963 3.512 3.957 4.325 4.661 4.963 5.493 5.729 5.952 6.159 6.605 6.784 7.137 7.477 7.786 7.937 8.248 8.541 8.945 9.201 9.466 9.854 10.194 10.507 10.811 11.111 11.49 11.845 12.19 12.625 13.045 13.43 13.849 14.32 14.775 15.271 15.789 16.317 16.861 17.471 18.156 18.806 19.547 20.323 21.114 21.899 22.728 23.602 24.196 23.796 23.022 22.196 21.356 20.531 19.72 18.92 18.217 17.474 16.809 16.233 15.683 15.14 14.616 14.126 13.628 13.194 12.798 12.354 11.88 11.49 11.073 10.624 10.27 9.911 9.538 9.15 8.744 8.455 8.15 7.683 7.358 7.013 6.831 6.481 6.115 5.707 5.504 5.066 4.86 4.63 4.403 3.898 3.604 3.285 2.896 2.449 1.917 1.219 -0.908 -4 ,26591 ,KEBNE ,16723490,Sun Nov 28 02:34:47 CET,Sun Nov 28 04:34:48 CET,0.0 2.689 3.357 3.834 4.257 4.641 4.984 5.313 5.909 6.156 6.396 6.623 7.08 7.285 7.67 8.023 8.339 8.496 8.795 9.079 9.503 9.771 10.043 10.458 10.84 11.18 11.494 11.804 12.192 12.556 12.912 13.346 13.751 14.122 14.576 15.094 15.57 16.081 16.608 17.2 17.84 18.479 19.143 19.782 20.485 21.235 22.107 23.001 23.875 24.55 24.774 24.346 23.541 22.563 21.648 20.845 20.043 19.236 18.527 17.791 17.126 16.533 15.955 15.386 14.866 14.38 13.827 13.336 12.926 12.502 12.074 11.719 11.338 10.955 10.656 10.328 9.993 9.637 9.253 8.983 8.697 8.258 7.953 7.632 7.477 7.165 6.816 6.441 6.249 5.803 5.576 5.329 5.073 4.54 4.227 3.862 3.46 2.999 2.514 1.888 -0.246 -5 ,5225 ,KEBNE ,16723491,Sun Nov 28 02:35:49 CET,Sun Nov 28 04:36:07 CET,0.0 1.948 2.649 3.207 3.635 3.981 4.311 4.605 5.138 5.401 5.642 5.845 6.298 6.499 6.867 7.223 7.57 7.729 8.022 8.299 8.692 8.949 9.2 9.558 9.897 10.226 10.54 10.825 11.209 11.579 11.928 12.355 12.746 13.115 13.545 14.035 14.485 14.96 15.47 16.009 16.581 17.21 17.919 18.596 19.356 20.145 20.965 21.798 22.692 23.567 24.054 23.612 22.766 21.898 21.039 20.181 19.305 18.444 17.711 16.937 16.206 15.557 14.929 14.344 13.812 13.318 12.805 12.325 11.906 11.473 11.015 10.652 10.27 9.86 9.54 9.205 8.858 8.499 8.123 7.866 7.594 7.152 6.849 6.53 6.36 6.012 5.644 5.253 5.052 4.617 4.435 4.219 3.974 3.437 3.156 2.814 2.413 1.958 1.42 0.763 -1.06 -6 ,6884 ,KEBNE ,16723492,Sun Nov 28 02:35:48 CET,Sun Nov 28 04:35:51 CET,0.0 1.485 2.101 2.597 3.024 3.404 3.736 4.046 4.632 4.902 5.161 5.412 5.893 6.119 6.534 6.929 7.287 7.458 7.803 8.144 8.634 8.94 9.236 9.651 10.015 10.34 10.652 10.95 11.327 11.694 12.032 12.423 12.81 13.199 13.652 14.148 14.608 15.087 15.593 16.146 16.726 17.346 18.05 18.745 19.512 20.308 21.182 22.076 22.931 23.601 23.778 23.167 22.297 21.347 20.397 19.48 18.655 17.877 17.144 16.359 15.647 15.001 14.386 13.805 13.283 12.802 12.294 11.84 11.433 11.005 10.563 10.191 9.805 9.4 9.077 8.758 8.428 8.077 7.701 7.441 7.181 6.769 6.49 6.201 6.052 5.744 5.399 5.031 4.835 4.377 4.149 3.932 3.693 3.135 2.82 2.478 2.105 1.697 1.209 0.537 -1.226 -7 ,30033 ,KEBNE ,16723493,Sun Nov 28 02:36:53 CET,Sun Nov 28 04:36:11 CET,0.0 2.285 2.937 3.363 3.741 4.085 4.399 4.684 5.182 5.414 5.639 5.837 6.282 6.474 6.839 7.172 7.487 7.636 7.932 8.217 8.62 8.874 9.113 9.458 9.788 10.105 10.421 10.723 11.108 11.485 11.839 12.252 12.651 13.027 13.462 13.959 14.409 14.88 15.388 15.929 16.473 17.07 17.782 18.495 19.264 20.095 21.046 22.0 22.812 23.446 23.847 23.543 22.883 22.125 21.362 20.537 19.702 18.924 18.244 17.542 16.924 16.36 15.787 15.205 14.653 14.158 13.635 13.166 12.762 12.345 11.914 11.549 11.156 10.739 10.422 10.092 9.735 9.368 9.0 8.742 8.462 8.001 7.685 7.367 7.198 6.848 6.487 6.116 5.925 5.494 5.308 5.081 4.839 4.3 3.98 3.609 3.247 2.838 2.306 1.656 -0.116 -8 ,20863 ,KEBNE ,16723494,Sun Nov 28 02:36:53 CET,Sun Nov 28 04:37:09 CET,0.0 1.891 2.532 3.015 3.408 3.762 4.103 4.413 4.95 5.184 5.408 5.59 6.027 6.226 6.604 6.955 7.278 7.429 7.736 8.028 8.43 8.69 8.939 9.293 9.637 9.973 10.294 10.595 10.974 11.33 11.657 12.067 12.484 12.877 13.32 13.807 14.269 14.77 15.294 15.853 16.426 17.033 17.726 18.413 19.176 19.963 20.815 21.665 22.478 23.16 23.415 22.969 22.198 21.342 20.443 19.545 18.746 17.969 17.245 16.506 15.845 15.255 14.677 14.093 13.543 13.069 12.565 12.127 11.754 11.33 10.893 10.55 10.196 9.812 9.508 9.198 8.873 8.528 8.168 7.926 7.667 7.236 6.939 6.632 6.476 6.16 5.826 5.472 5.282 4.835 4.63 4.395 4.154 3.639 3.356 3.053 2.705 2.251 1.704 1.003 -0.93 -9 ,15103 ,KEBNE ,16723495,Sun Nov 28 02:53:16 CET,Sun Nov 28 04:52:30 CET,0.0 2.215 2.962 3.502 3.947 4.344 4.697 5.025 5.65 5.938 6.205 6.446 6.921 7.153 7.587 7.977 8.348 8.53 8.894 9.243 9.718 10.033 10.342 10.776 11.2 11.602 11.982 12.352 12.817 13.258 13.693 14.2 14.661 15.104 15.629 16.21 16.764 17.371 18.026 18.649 19.214 19.831 20.51 21.161 21.914 22.719 23.585 24.397 25.133 25.834 26.15 25.782 25.019 24.096 23.183 22.284 21.434 20.583 19.813 19.078 18.445 17.851 17.284 16.708 16.163 15.702 15.181 14.693 14.283 13.865 13.428 13.053 12.644 12.191 11.818 11.439 11.073 10.7 10.327 10.081 9.818 9.375 9.057 8.731 8.567 8.213 7.829 7.393 7.159 6.694 6.443 6.175 5.91 5.389 5.099 4.783 4.441 4.051 3.59 3.01 1.499 -10 ,22210 ,KEBNE ,16723496,Sun Nov 28 02:53:16 CET,Sun Nov 28 04:53:29 CET,0.0 2.34 3.003 3.507 3.889 4.221 4.525 4.784 5.259 5.493 5.716 5.883 6.319 6.512 6.901 7.259 7.588 7.749 8.051 8.351 8.787 9.056 9.311 9.674 10.019 10.347 10.66 10.96 11.341 11.706 12.064 12.471 12.849 13.211 13.631 14.116 14.575 15.081 15.625 16.164 16.711 17.31 18.001 18.711 19.451 20.209 21.084 21.991 22.942 23.887 24.513 24.323 23.77 23.046 22.224 21.412 20.67 19.955 19.289 18.569 17.927 17.388 16.879 16.366 15.87 15.402 14.905 14.456 14.073 13.67 13.233 12.873 12.497 12.099 11.793 11.469 11.125 10.777 10.404 10.144 9.891 9.501 9.225 8.94 8.794 8.482 8.146 7.777 7.58 7.148 6.961 6.743 6.519 6.023 5.728 5.392 5.026 4.597 4.093 3.438 1.216 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index 6fa82cc5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22604 ,KEBNE ,16723497,Sun Nov 28 02:53:16 CET,Sun Nov 28 04:55:46 CET,0.0 1.913 2.679 3.28 3.796 4.231 4.604 4.929 5.524 5.816 6.091 6.377 6.852 7.087 7.552 7.965 8.339 8.527 8.889 9.23 9.726 10.039 10.34 10.781 11.209 11.606 11.987 12.365 12.85 13.312 13.753 14.28 14.77 15.235 15.784 16.405 17.003 17.615 18.229 18.906 19.544 20.111 20.688 21.263 21.921 22.564 23.149 23.687 24.173 24.426 24.036 22.756 21.339 19.925 18.627 17.433 16.365 15.425 14.56 13.662 12.927 12.291 11.665 11.045 10.452 9.911 9.348 8.833 8.386 7.918 7.431 7.023 6.592 6.147 5.794 5.427 5.054 4.673 4.266 3.983 3.698 3.257 2.94 2.591 2.403 2.013 1.635 1.255 1.05 0.588 0.353 0.098 -0.164 -0.742 -1.06 -1.417 -1.847 -2.313 -2.837 -3.568 -5.556 -5 ,7483 ,KEBNE ,16723501,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:56:06 CET,0.0 2.026 2.74 3.294 3.708 4.049 4.372 4.69 5.294 5.556 5.787 5.974 6.408 6.609 6.992 7.35 7.689 7.847 8.142 8.427 8.825 9.065 9.291 9.626 9.962 10.298 10.617 10.913 11.297 11.658 12.002 12.427 12.818 13.185 13.632 14.097 14.498 14.94 15.416 15.935 16.478 17.057 17.715 18.316 18.931 19.517 20.101 20.689 21.227 21.475 21.037 19.741 18.298 16.989 15.771 14.624 13.591 12.601 11.735 10.859 10.116 9.458 8.823 8.225 7.672 7.159 6.593 6.075 5.628 5.163 4.682 4.289 3.88 3.455 3.126 2.782 2.413 2.021 1.629 1.362 1.088 0.65 0.34 0.025 -0.143 -0.506 -0.885 -1.311 -1.534 -1.99 -2.204 -2.464 -2.746 -3.337 -3.67 -4.018 -4.393 -4.851 -5.402 -6.066 -8.244 -6 ,4664 ,KEBNE ,16723502,Sun Nov 28 02:53:15 CET,Sun Nov 28 04:57:00 CET,0.0 3.431 4.145 4.685 5.142 5.512 5.841 6.149 6.732 6.984 7.222 7.426 7.854 8.048 8.417 8.762 9.084 9.236 9.535 9.839 10.256 10.506 10.754 11.115 11.448 11.777 12.109 12.41 12.78 13.132 13.477 13.901 14.302 14.68 15.11 15.598 16.05 16.523 17.022 17.545 18.076 18.631 19.263 19.904 20.6 21.261 21.818 22.307 22.85 23.12 22.672 21.352 19.932 18.611 17.297 15.967 14.821 13.82 12.96 12.09 11.338 10.65 9.998 9.392 8.805 8.257 7.694 7.179 6.695 6.203 5.72 5.312 4.886 4.447 4.108 3.755 3.369 2.971 2.577 2.303 2.022 1.584 1.281 0.967 0.804 0.467 0.11 -0.262 -0.462 -0.916 -1.126 -1.365 -1.623 -2.182 -2.487 -2.859 -3.288 -3.754 -4.342 -5.109 -7.244 -7 ,13292 ,KEBNE ,16723503,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:55:40 CET,0.0 2.62 3.319 3.837 4.282 4.66 4.995 5.313 5.904 6.169 6.4 6.597 7.058 7.282 7.674 8.034 8.363 8.519 8.826 9.126 9.566 9.832 10.077 10.44 10.782 11.108 11.429 11.734 12.104 12.457 12.82 13.265 13.669 14.058 14.482 14.919 15.347 15.808 16.315 16.85 17.372 17.934 18.57 19.18 19.836 20.5 21.207 21.93 22.514 22.854 22.635 21.563 20.263 18.909 17.571 16.319 15.222 14.237 13.395 12.578 11.878 11.203 10.503 9.831 9.215 8.631 8.034 7.516 7.055 6.59 6.113 5.699 5.265 4.813 4.46 4.103 3.733 3.344 2.936 2.656 2.365 1.899 1.586 1.257 1.087 0.744 0.384 0.014 -0.19 -0.642 -0.88 -1.122 -1.382 -1.954 -2.271 -2.628 -3.012 -3.456 -4.011 -4.758 -7.662 -8 ,502 ,KEBNE ,16723504,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:56:05 CET,0.0 2.62 3.371 3.885 4.302 4.658 4.973 5.282 5.849 6.104 6.348 6.561 7.009 7.222 7.613 7.978 8.321 8.477 8.776 9.072 9.499 9.762 10.022 10.395 10.737 11.065 11.373 11.663 12.04 12.395 12.738 13.155 13.538 13.885 14.296 14.778 15.217 15.667 16.137 16.62 17.126 17.669 18.29 18.898 19.553 20.211 20.828 21.405 21.962 22.319 22.006 20.756 19.365 18.004 16.685 15.451 14.412 13.43 12.519 11.63 10.847 10.111 9.414 8.78 8.207 7.679 7.106 6.585 6.131 5.645 5.147 4.741 4.306 3.855 3.513 3.163 2.806 2.43 2.028 1.756 1.48 1.035 0.705 0.351 0.171 -0.194 -0.574 -0.967 -1.168 -1.61 -1.84 -2.105 -2.379 -2.96 -3.303 -3.693 -4.093 -4.548 -5.163 -5.94 -9.117 -9 ,21522 ,KEBNE ,16723505,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:56:40 CET,0.0 2.279 3.127 3.705 4.161 4.531 4.867 5.204 5.793 6.034 6.265 6.472 6.916 7.117 7.497 7.842 8.169 8.326 8.616 8.891 9.283 9.53 9.774 10.143 10.497 10.821 11.124 11.408 11.762 12.091 12.403 12.772 13.126 13.486 13.908 14.358 14.757 15.22 15.715 16.182 16.655 17.17 17.785 18.368 18.955 19.588 20.282 20.961 21.411 21.527 21.174 20.002 18.639 17.327 16.128 15.011 13.985 12.969 12.043 11.1 10.302 9.603 8.919 8.266 7.664 7.118 6.539 6.018 5.558 5.096 4.634 4.238 3.819 3.389 3.052 2.693 2.324 1.94 1.527 1.246 0.957 0.487 0.143 -0.222 -0.398 -0.743 -1.11 -1.504 -1.706 -2.152 -2.391 -2.65 -2.915 -3.459 -3.771 -4.122 -4.509 -4.984 -5.515 -6.283 -8.558 -10 ,6821 ,KEBNE ,16723506,Sun Nov 28 02:53:15 CET,Sun Nov 28 04:55:47 CET,0.0 2.35 3.066 3.604 4.056 4.422 4.76 5.081 5.633 5.881 6.117 6.323 6.774 6.986 7.381 7.736 8.05 8.201 8.498 8.793 9.22 9.492 9.74 10.094 10.444 10.773 11.092 11.41 11.816 12.185 12.534 12.948 13.338 13.72 14.147 14.597 15.028 15.488 15.963 16.453 16.953 17.524 18.2 18.817 19.438 20.061 20.715 21.318 21.769 21.898 21.283 19.906 18.387 16.866 15.559 14.395 13.31 12.279 11.379 10.511 9.775 9.084 8.402 7.778 7.198 6.649 6.078 5.577 5.14 4.671 4.18 3.783 3.377 2.963 2.627 2.273 1.922 1.558 1.177 0.91 0.636 0.203 -0.101 -0.415 -0.588 -0.949 -1.309 -1.691 -1.893 -2.344 -2.56 -2.802 -3.057 -3.614 -3.93 -4.291 -4.685 -5.114 -5.655 -6.348 -8.502 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt deleted file mode 100644 index d9663abd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17208 ,KEBNE ,16723507,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:55:01 CET,0.0 2.123 2.872 3.389 3.809 4.179 4.507 4.785 5.293 5.537 5.768 5.954 6.387 6.571 6.909 7.239 7.551 7.701 7.999 8.285 8.69 8.942 9.181 9.524 9.854 10.167 10.462 10.738 11.093 11.434 11.771 12.166 12.531 12.879 13.283 13.746 14.195 14.669 15.163 15.684 16.199 16.741 17.326 17.872 18.485 19.157 19.858 20.549 21.195 21.632 21.409 20.299 19.039 17.794 16.583 15.449 14.455 13.488 12.613 11.765 11.047 10.387 9.773 9.181 8.587 8.019 7.425 6.919 6.491 6.024 5.529 5.127 4.716 4.288 3.941 3.58 3.224 2.855 2.457 2.184 1.905 1.453 1.124 0.785 0.614 0.261 -0.123 -0.52 -0.727 -1.189 -1.422 -1.679 -1.932 -2.483 -2.791 -3.123 -3.484 -3.925 -4.451 -5.101 -6.938 -2 ,10440 ,KEBNE ,16723508,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:55:56 CET,0.0 2.18 2.85 3.328 3.728 4.084 4.425 4.757 5.354 5.604 5.829 6.025 6.454 6.642 7.011 7.36 7.679 7.828 8.123 8.408 8.8 9.045 9.285 9.632 9.973 10.313 10.627 10.918 11.289 11.638 11.981 12.385 12.753 13.121 13.545 14.005 14.446 14.921 15.435 15.959 16.481 17.079 17.735 18.329 18.961 19.647 20.353 20.923 21.385 21.585 21.153 20.032 18.809 17.604 16.323 15.1 14.066 13.097 12.23 11.348 10.587 9.926 9.306 8.708 8.133 7.599 7.039 6.529 6.093 5.62 5.127 4.726 4.314 3.891 3.556 3.208 2.849 2.478 2.068 1.79 1.512 1.068 0.759 0.438 0.273 -0.054 -0.39 -0.776 -0.987 -1.442 -1.64 -1.883 -2.138 -2.681 -3.009 -3.391 -3.78 -4.209 -4.665 -5.208 -6.258 -3 ,18730 ,KEBNE ,16723509,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:54:41 CET,0.0 1.619 2.318 2.836 3.266 3.675 4.057 4.409 5.051 5.342 5.602 5.82 6.262 6.469 6.841 7.174 7.495 7.647 7.942 8.212 8.594 8.848 9.086 9.427 9.769 10.1 10.404 10.69 11.066 11.432 11.777 12.187 12.571 12.929 13.341 13.826 14.298 14.795 15.3 15.809 16.326 16.895 17.553 18.163 18.825 19.507 20.216 20.91 21.433 21.687 21.5 20.38 18.971 17.585 16.304 15.113 14.017 13.0 12.125 11.248 10.454 9.715 9.031 8.383 7.739 7.155 6.562 6.028 5.572 5.099 4.599 4.173 3.722 3.261 2.897 2.487 2.057 1.631 1.17 0.856 0.543 0.028 -0.321 -0.673 -0.856 -1.242 -1.66 -2.095 -2.317 -2.784 -3.029 -3.287 -3.558 -4.18 -4.528 -4.9 -5.305 -5.757 -6.316 -7.096 -8.66 -4 ,6624 ,KEBNE ,16723510,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:55:17 CET,0.0 1.925 2.574 3.149 3.615 3.959 4.289 4.583 5.107 5.354 5.58 5.766 6.196 6.38 6.716 7.044 7.363 7.51 7.799 8.087 8.488 8.734 8.974 9.327 9.669 9.998 10.31 10.6 10.968 11.322 11.66 12.061 12.445 12.817 13.246 13.718 14.148 14.621 15.129 15.645 16.173 16.749 17.378 17.956 18.559 19.209 19.905 20.443 20.847 21.122 20.8 19.578 18.226 16.959 15.804 14.716 13.711 12.777 11.942 11.081 10.333 9.645 8.971 8.358 7.787 7.265 6.725 6.232 5.803 5.355 4.892 4.491 4.062 3.623 3.285 2.927 2.553 2.176 1.784 1.517 1.248 0.82 0.519 0.201 0.031 -0.324 -0.69 -1.086 -1.301 -1.761 -1.984 -2.226 -2.474 -3.056 -3.373 -3.716 -4.101 -4.537 -5.025 -5.67 -7.555 -5 ,25365 ,KEBNE ,16723511,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:55:52 CET,0.0 1.932 2.577 3.103 3.553 3.927 4.255 4.575 5.167 5.424 5.661 5.843 6.262 6.461 6.857 7.221 7.572 7.733 8.045 8.362 8.785 9.041 9.301 9.706 10.082 10.413 10.708 10.98 11.327 11.685 12.033 12.417 12.786 13.157 13.579 14.026 14.445 14.909 15.414 15.932 16.438 16.981 17.586 18.139 18.71 19.27 19.831 20.38 20.842 21.036 20.526 19.258 17.929 16.662 15.452 14.344 13.396 12.495 11.68 10.831 10.066 9.376 8.723 8.118 7.555 7.035 6.501 6.026 5.608 5.176 4.72 4.331 3.928 3.505 3.179 2.846 2.494 2.126 1.731 1.452 1.176 0.746 0.45 0.141 -0.021 -0.36 -0.717 -1.083 -1.276 -1.71 -1.893 -2.13 -2.378 -2.928 -3.235 -3.563 -3.914 -4.297 -4.787 -5.437 -7.258 -6 ,18654 ,KEBNE ,16723512,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:54:55 CET,0.0 1.194 1.749 2.253 2.685 3.078 3.417 3.718 4.266 4.522 4.772 5.006 5.455 5.654 6.013 6.37 6.717 6.877 7.19 7.499 7.929 8.182 8.421 8.764 9.101 9.44 9.768 10.084 10.475 10.846 11.201 11.618 12.015 12.373 12.771 13.217 13.627 14.081 14.584 15.117 15.63 16.149 16.759 17.365 18.01 18.64 19.199 19.698 20.059 20.1 19.728 18.456 16.859 15.298 13.946 12.661 11.416 10.362 9.504 8.62 7.851 7.13 6.436 5.793 5.192 4.663 4.105 3.583 3.144 2.697 2.21 1.805 1.371 0.89 0.541 0.203 -0.156 -0.521 -0.919 -1.204 -1.494 -1.938 -2.248 -2.574 -2.735 -3.074 -3.449 -3.848 -4.055 -4.518 -4.76 -5.004 -5.249 -5.802 -6.115 -6.458 -6.853 -7.288 -7.8 -8.468 -10.868 -7 ,26903 ,KEBNE ,16723513,Sun Nov 28 02:53:16 CET,Sun Nov 28 04:55:01 CET,0.0 2.101 2.762 3.254 3.697 4.102 4.424 4.711 5.271 5.537 5.781 6.003 6.445 6.649 7.048 7.427 7.761 7.915 8.209 8.477 8.885 9.15 9.395 9.737 10.073 10.392 10.687 10.986 11.378 11.74 12.07 12.472 12.866 13.24 13.663 14.124 14.561 15.039 15.555 16.084 16.629 17.23 17.832 18.396 19.052 19.716 20.398 20.97 21.459 21.768 21.449 20.299 18.98 17.672 16.482 15.365 14.311 13.326 12.449 11.57 10.808 10.109 9.443 8.824 8.253 7.72 7.154 6.64 6.184 5.731 5.283 4.897 4.482 4.045 3.706 3.361 3.013 2.647 2.241 1.962 1.685 1.216 0.88 0.549 0.377 0.033 -0.323 -0.718 -0.924 -1.37 -1.595 -1.845 -2.099 -2.658 -2.965 -3.306 -3.697 -4.12 -4.61 -5.27 -7.174 -8 ,18363 ,KEBNE ,16723514,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:56:14 CET,0.0 2.273 2.927 3.42 3.826 4.173 4.477 4.744 5.209 5.433 5.661 5.872 6.311 6.497 6.841 7.168 7.464 7.614 7.905 8.169 8.548 8.79 9.023 9.356 9.667 9.961 10.248 10.531 10.897 11.248 11.574 11.952 12.316 12.67 13.072 13.514 13.937 14.385 14.844 15.352 15.894 16.477 17.104 17.741 18.448 19.083 19.759 20.43 21.015 21.281 20.815 19.6 18.237 16.927 15.76 14.711 13.759 12.828 11.985 11.116 10.372 9.724 9.102 8.505 7.93 7.388 6.825 6.319 5.876 5.416 4.932 4.528 4.117 3.704 3.373 3.022 2.661 2.291 1.896 1.624 1.347 0.904 0.597 0.273 0.094 -0.273 -0.653 -1.05 -1.251 -1.716 -1.957 -2.206 -2.47 -3.027 -3.346 -3.694 -4.098 -4.571 -5.113 -5.803 -7.98 -9 ,1327 ,KEBNE ,16723515,Sun Nov 28 02:53:15 CET,Sun Nov 28 04:54:47 CET,0.0 2.741 3.363 3.842 4.267 4.66 5.019 5.33 5.865 6.121 6.362 6.564 6.999 7.193 7.546 7.887 8.214 8.368 8.659 8.936 9.339 9.591 9.827 10.166 10.498 10.805 11.092 11.374 11.749 12.109 12.455 12.869 13.243 13.595 14.014 14.501 14.961 15.437 15.929 16.448 16.992 17.578 18.223 18.844 19.564 20.303 21.058 21.843 22.531 22.843 22.427 21.241 19.892 18.558 17.297 16.096 14.969 13.892 13.016 12.158 11.388 10.693 10.041 9.454 8.887 8.357 7.805 7.29 6.848 6.399 5.919 5.509 5.102 4.7 4.375 4.024 3.652 3.277 2.894 2.622 2.346 1.916 1.595 1.251 1.084 0.745 0.371 -0.013 -0.209 -0.655 -0.867 -1.111 -1.361 -1.925 -2.239 -2.59 -2.976 -3.369 -3.832 -4.515 -6.376 -10 ,3230 ,KEBNE ,16723516,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:55:16 CET,0.0 2.155 2.837 3.348 3.752 4.095 4.42 4.705 5.21 5.445 5.661 5.841 6.273 6.46 6.812 7.145 7.453 7.6 7.883 8.159 8.564 8.803 9.027 9.354 9.659 9.969 10.277 10.56 10.915 11.266 11.6 11.998 12.383 12.763 13.169 13.608 14.031 14.487 15.037 15.602 16.156 16.831 17.618 18.329 19.105 19.875 20.64 21.414 22.106 22.671 22.779 21.87 20.681 19.525 18.508 17.439 16.357 15.327 14.412 13.516 12.747 12.051 11.382 10.738 10.132 9.575 9.001 8.493 8.048 7.581 7.085 6.684 6.273 5.828 5.493 5.152 4.785 4.411 4.039 3.786 3.513 3.07 2.756 2.438 2.272 1.911 1.533 1.133 0.923 0.467 0.249 -0.022 -0.306 -0.878 -1.191 -1.552 -1.937 -2.383 -2.967 -3.734 -5.487 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 885d2ed2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6642 ,KEBNE ,16723517,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:46:17 CET,0.0 1.33 1.727 2.071 2.348 2.583 2.806 3.002 3.338 3.483 3.609 3.665 3.987 4.107 4.334 4.536 4.727 4.819 4.977 5.134 5.39 5.544 5.673 5.856 6.043 6.223 6.384 6.534 6.733 6.911 7.079 7.283 7.453 7.611 7.791 7.968 8.141 8.333 8.525 8.723 8.908 9.095 9.292 9.441 9.514 9.538 9.487 9.227 8.742 7.867 6.099 3.84 1.898 0.177 -1.308 -2.619 -3.764 -4.78 -5.668 -6.56 -7.327 -8.003 -8.66 -9.309 -9.89 -10.389 -10.906 -11.382 -11.788 -12.222 -12.665 -13.019 -13.412 -13.836 -14.16 -14.489 -14.826 -15.172 -15.541 -15.796 -16.055 -16.463 -16.747 -17.05 -17.219 -17.567 -17.904 -18.257 -18.448 -18.873 -19.098 -19.334 -19.576 -20.066 -20.353 -20.673 -21.023 -21.434 -21.942 -22.609 -25.312 -2 ,833 ,KEBNE ,16723518,Sun Nov 28 02:53:14 CET,Sun Nov 28 04:44:41 CET,0.0 1.715 2.19 2.567 2.868 3.116 3.362 3.591 3.991 4.168 4.334 4.446 4.784 4.928 5.198 5.46 5.718 5.834 6.048 6.26 6.556 6.748 6.931 7.171 7.404 7.639 7.865 8.076 8.347 8.599 8.814 9.051 9.261 9.486 9.8 10.157 10.477 10.814 11.077 11.247 11.405 11.553 11.704 11.845 11.923 11.904 11.8 11.567 11.061 10.151 8.411 5.905 3.757 1.938 0.345 -1.034 -2.239 -3.349 -4.333 -5.302 -6.09 -6.786 -7.473 -8.127 -8.734 -9.285 -9.838 -10.318 -10.735 -11.177 -11.646 -12.042 -12.458 -12.911 -13.282 -13.681 -14.119 -14.561 -14.994 -15.29 -15.604 -16.103 -16.43 -16.754 -16.924 -17.284 -17.641 -18.025 -18.237 -18.663 -18.904 -19.146 -19.401 -19.979 -20.311 -20.667 -21.043 -21.448 -21.902 -22.541 -25.007 -3 ,28010 ,KEBNE ,16723519,Sun Nov 28 03:01:30 CET,Sun Nov 28 04:46:42 CET,0.0 1.166 1.748 2.177 2.527 2.843 3.107 3.35 3.825 4.048 4.246 4.414 4.795 4.963 5.299 5.632 5.931 6.066 6.33 6.595 6.964 7.197 7.422 7.735 8.009 8.223 8.401 8.556 8.723 8.89 9.046 9.228 9.411 9.588 9.779 9.977 10.137 10.289 10.444 10.588 10.743 10.9 11.016 11.127 11.219 11.192 11.082 10.847 10.321 9.371 7.655 5.421 3.452 1.745 0.255 -1.072 -2.234 -3.319 -4.233 -5.117 -5.891 -6.611 -7.28 -7.875 -8.434 -8.951 -9.501 -9.996 -10.434 -10.898 -11.371 -11.759 -12.166 -12.587 -12.912 -13.253 -13.628 -14.028 -14.452 -14.746 -15.05 -15.523 -15.849 -16.199 -16.383 -16.768 -17.166 -17.6 -17.824 -18.263 -18.535 -18.806 -19.084 -19.682 -20.029 -20.419 -20.859 -21.389 -21.985 -22.73 -24.815 -4 ,19408 ,KEBNE ,16723520,Sun Nov 28 03:01:30 CET,Sun Nov 28 04:46:19 CET,0.0 0.994 1.383 1.718 2.033 2.299 2.507 2.689 3.034 3.185 3.316 3.393 3.725 3.853 4.078 4.28 4.466 4.553 4.735 4.902 5.117 5.257 5.4 5.604 5.79 5.969 6.133 6.28 6.458 6.611 6.756 6.932 7.093 7.266 7.461 7.646 7.819 8.003 8.179 8.346 8.496 8.622 8.724 8.809 8.911 8.963 8.893 8.691 8.239 7.351 5.593 3.215 1.172 -0.55 -1.974 -3.278 -4.445 -5.492 -6.448 -7.416 -8.195 -8.872 -9.511 -10.101 -10.653 -11.173 -11.705 -12.162 -12.579 -13.016 -13.458 -13.838 -14.249 -14.673 -14.979 -15.295 -15.648 -16.019 -16.402 -16.672 -16.936 -17.343 -17.63 -17.928 -18.098 -18.448 -18.796 -19.178 -19.376 -19.796 -20.018 -20.258 -20.491 -20.978 -21.275 -21.613 -21.98 -22.369 -22.827 -23.464 -25.48 -6 ,27 ,KEBNE ,16723522,Sun Nov 28 03:02:31 CET,Sun Nov 28 04:48:34 CET,0.0 1.072 1.432 1.719 1.968 2.188 2.386 2.553 2.844 2.973 3.106 3.182 3.487 3.591 3.808 4.024 4.223 4.307 4.472 4.624 4.822 4.958 5.094 5.287 5.466 5.618 5.757 5.893 6.07 6.238 6.378 6.542 6.723 6.886 7.058 7.244 7.413 7.588 7.749 7.903 8.039 8.154 8.261 8.344 8.369 8.319 8.191 7.907 7.376 6.458 4.641 2.233 0.195 -1.555 -3.051 -4.413 -5.581 -6.604 -7.478 -8.347 -9.096 -9.748 -10.378 -10.988 -11.549 -12.072 -12.627 -13.107 -13.534 -13.997 -14.468 -14.846 -15.236 -15.644 -15.954 -16.26 -16.584 -16.924 -17.292 -17.556 -17.816 -18.197 -18.452 -18.743 -18.898 -19.209 -19.546 -19.908 -20.096 -20.507 -20.717 -20.941 -21.186 -21.77 -22.074 -22.386 -22.729 -23.147 -23.644 -24.293 -26.595 -7 ,5517 ,KEBNE ,16723523,Sun Nov 28 03:04:33 CET,Sun Nov 28 04:55:42 CET,0.0 1.134 1.548 1.848 2.098 2.312 2.502 2.67 2.959 3.101 3.236 3.285 3.602 3.717 3.92 4.111 4.295 4.385 4.558 4.714 4.931 5.073 5.212 5.409 5.595 5.793 5.98 6.139 6.335 6.52 6.69 6.871 7.037 7.201 7.386 7.568 7.722 7.888 8.053 8.176 8.289 8.475 8.669 8.759 8.791 8.749 8.63 8.383 7.891 7.036 5.32 3.045 1.094 -0.615 -2.113 -3.476 -4.669 -5.721 -6.59 -7.467 -8.244 -8.947 -9.599 -10.211 -10.782 -11.275 -11.801 -12.295 -12.702 -13.117 -13.576 -13.962 -14.35 -14.74 -15.045 -15.365 -15.705 -16.073 -16.456 -16.719 -16.992 -17.405 -17.696 -18.021 -18.185 -18.513 -18.84 -19.197 -19.391 -19.806 -20.01 -20.24 -20.474 -21.007 -21.307 -21.649 -22.02 -22.424 -22.899 -23.549 -26.184 -9 ,19498 ,KEBNE ,16723525,Sun Nov 28 03:04:30 CET,Sun Nov 28 04:56:21 CET,0.0 1.349 1.772 2.1 2.378 2.621 2.836 3.034 3.368 3.518 3.655 3.72 4.041 4.156 4.372 4.588 4.783 4.872 5.043 5.208 5.451 5.607 5.755 5.962 6.151 6.328 6.495 6.647 6.829 7.012 7.193 7.394 7.584 7.76 7.938 8.11 8.261 8.418 8.579 8.714 8.833 8.964 9.085 9.178 9.222 9.194 9.085 8.818 8.307 7.344 5.419 3.009 1.041 -0.649 -2.115 -3.423 -4.538 -5.529 -6.397 -7.283 -8.054 -8.712 -9.343 -9.94 -10.479 -10.981 -11.512 -11.987 -12.425 -12.891 -13.353 -13.727 -14.119 -14.541 -14.849 -15.155 -15.482 -15.838 -16.23 -16.498 -16.784 -17.216 -17.492 -17.776 -17.933 -18.295 -18.677 -19.059 -19.253 -19.657 -19.818 -20.036 -20.266 -20.735 -21.009 -21.357 -21.762 -22.207 -22.729 -23.447 -25.59 -10 ,26515 ,KEBNE ,16723526,Sun Nov 28 03:04:31 CET,Sun Nov 28 04:55:32 CET,0.0 1.63 2.075 2.34 2.596 2.838 3.032 3.201 3.52 3.66 3.791 3.837 4.146 4.255 4.465 4.664 4.844 4.931 5.091 5.24 5.458 5.592 5.724 5.919 6.1 6.261 6.411 6.552 6.732 6.903 7.055 7.24 7.416 7.573 7.76 7.95 8.105 8.268 8.426 8.577 8.707 8.821 8.954 9.051 9.082 9.059 8.938 8.655 8.122 7.187 5.429 3.159 1.199 -0.502 -1.953 -3.238 -4.357 -5.371 -6.261 -7.151 -7.917 -8.599 -9.236 -9.843 -10.416 -10.939 -11.501 -12.0 -12.428 -12.882 -13.344 -13.727 -14.133 -14.541 -14.856 -15.188 -15.526 -15.869 -16.233 -16.495 -16.764 -17.191 -17.48 -17.759 -17.908 -18.226 -18.55 -18.9 -19.091 -19.5 -19.668 -19.889 -20.126 -20.635 -20.921 -21.27 -21.62 -21.981 -22.47 -23.147 -25.157 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt deleted file mode 100644 index 8d950d86..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27939 ,KEBNE ,16723527,Sun Nov 28 03:04:30 CET,Sun Nov 28 04:55:39 CET,0.0 1.325 1.812 2.189 2.487 2.773 3.051 3.292 3.702 3.891 4.07 4.168 4.574 4.732 5.049 5.357 5.646 5.786 6.072 6.348 6.732 6.984 7.222 7.554 7.864 8.161 8.459 8.756 9.134 9.51 9.877 10.292 10.685 11.073 11.53 12.045 12.531 13.056 13.641 14.249 14.86 15.541 16.316 17.093 17.977 18.963 20.107 21.349 22.713 24.064 25.314 25.872 25.784 25.478 25.082 24.636 24.176 23.685 23.204 22.696 22.243 21.838 21.452 21.059 20.684 20.33 19.959 19.626 19.314 18.994 18.669 18.394 18.105 17.808 17.571 17.323 17.066 16.786 16.488 16.287 16.083 15.757 15.522 15.28 15.16 14.907 14.635 14.351 14.193 13.788 13.652 13.468 13.28 12.847 12.604 12.339 12.043 11.712 11.285 10.728 9.354 -2 ,32111 ,KEBNE ,16723528,Sun Nov 28 03:04:30 CET,Sun Nov 28 04:55:21 CET,0.0 1.454 1.947 2.329 2.659 2.955 3.207 3.427 3.863 4.065 4.258 4.399 4.825 5.016 5.365 5.679 5.985 6.131 6.417 6.69 7.051 7.284 7.511 7.839 8.162 8.476 8.778 9.083 9.466 9.808 10.139 10.56 10.995 11.417 11.892 12.424 12.936 13.483 14.061 14.68 15.34 16.1 16.96 17.817 18.812 19.842 20.977 22.194 23.446 24.766 25.983 26.261 25.945 25.475 25.028 24.568 24.076 23.564 23.077 22.568 22.116 21.71 21.294 20.901 20.524 20.167 19.805 19.499 19.235 18.929 18.608 18.346 18.064 17.751 17.504 17.261 17.004 16.732 16.454 16.259 16.058 15.733 15.503 15.283 15.168 14.918 14.652 14.37 14.217 13.821 13.705 13.531 13.368 12.999 12.778 12.525 12.229 11.89 11.49 10.941 9.327 -4 ,14465 ,KEBNE ,16723530,Sun Nov 28 03:05:32 CET,Sun Nov 28 04:56:44 CET,0.0 1.377 1.882 2.274 2.608 2.89 3.143 3.383 3.844 4.061 4.265 4.401 4.813 4.981 5.297 5.599 5.892 6.032 6.306 6.58 6.955 7.194 7.435 7.775 8.084 8.376 8.668 8.953 9.326 9.696 10.044 10.476 10.912 11.314 11.773 12.279 12.744 13.278 13.859 14.455 15.09 15.793 16.561 17.313 18.172 19.115 20.182 21.384 22.687 23.927 25.19 25.808 25.734 25.457 25.07 24.587 24.1 23.626 23.181 22.719 22.324 21.947 21.557 21.169 20.801 20.466 20.091 19.749 19.466 19.181 18.878 18.596 18.304 18.01 17.772 17.515 17.245 16.98 16.714 16.518 16.305 15.98 15.752 15.507 15.391 15.151 14.877 14.602 14.457 14.073 13.962 13.773 13.571 13.126 12.876 12.61 12.338 12.006 11.62 11.147 9.401 -5 ,364 ,KEBNE ,16723531,Sun Nov 28 03:05:32 CET,Sun Nov 28 04:56:17 CET,0.0 1.065 1.514 1.906 2.258 2.579 2.857 3.116 3.588 3.802 3.999 4.125 4.54 4.702 4.993 5.268 5.549 5.681 5.936 6.195 6.555 6.778 6.998 7.319 7.637 7.951 8.253 8.556 8.932 9.284 9.638 10.068 10.471 10.855 11.307 11.824 12.314 12.837 13.395 14.004 14.639 15.312 16.109 16.943 17.921 18.973 20.167 21.498 22.931 24.407 25.865 26.453 26.296 25.923 25.499 25.067 24.602 24.112 23.668 23.198 22.777 22.364 21.937 21.54 21.19 20.866 20.485 20.149 19.863 19.555 19.241 18.988 18.718 18.418 18.179 17.93 17.671 17.394 17.099 16.89 16.67 16.326 16.092 15.851 15.725 15.449 15.144 14.823 14.658 14.27 14.164 13.965 13.752 13.338 13.107 12.825 12.517 12.168 11.747 11.204 9.48 -7 ,25298 ,KEBNE ,16723533,Sun Nov 28 03:05:36 CET,Sun Nov 28 04:54:48 CET,0.0 1.121 1.619 2.02 2.385 2.683 2.95 3.203 3.666 3.875 4.066 4.187 4.605 4.775 5.086 5.389 5.685 5.823 6.094 6.356 6.715 6.959 7.193 7.523 7.846 8.148 8.424 8.684 9.038 9.394 9.744 10.177 10.59 10.979 11.419 11.923 12.419 12.974 13.544 14.116 14.735 15.444 16.245 17.051 17.964 18.961 20.129 21.376 22.714 24.109 25.419 25.962 25.836 25.473 25.048 24.589 24.09 23.596 23.118 22.621 22.177 21.755 21.362 20.998 20.642 20.308 19.969 19.653 19.362 19.063 18.765 18.501 18.225 17.952 17.725 17.473 17.219 16.956 16.664 16.456 16.254 15.934 15.696 15.464 15.352 15.119 14.863 14.595 14.441 14.053 13.946 13.775 13.595 13.158 12.918 12.663 12.373 12.064 11.688 11.167 9.904 -10 ,14712 ,KEBNE ,16723536,Sun Nov 28 03:06:33 CET,Sun Nov 28 04:58:43 CET,0.0 1.032 1.574 2.0 2.355 2.671 2.95 3.199 3.664 3.884 4.096 4.269 4.692 4.863 5.202 5.513 5.797 5.934 6.208 6.483 6.88 7.129 7.375 7.736 8.076 8.38 8.671 8.958 9.322 9.675 10.022 10.436 10.839 11.237 11.692 12.192 12.659 13.182 13.746 14.325 14.937 15.631 16.432 17.222 18.086 19.027 20.116 21.278 22.449 23.631 24.675 24.96 24.712 24.223 23.71 23.165 22.617 22.11 21.696 21.273 20.848 20.437 20.029 19.634 19.269 18.928 18.559 18.217 17.905 17.59 17.275 17.019 16.746 16.442 16.192 15.934 15.677 15.415 15.14 14.947 14.742 14.423 14.203 13.967 13.845 13.593 13.325 13.051 12.902 12.509 12.4 12.22 12.037 11.634 11.4 11.143 10.866 10.548 10.169 9.69 8.335 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt deleted file mode 100644 index 581266c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29063 ,KEBNE ,16723537,Sun Nov 28 03:06:37 CET,Sun Nov 28 04:59:24 CET,0.0 1.258 1.845 2.284 2.641 2.975 3.264 3.517 4.016 4.255 4.483 4.682 5.119 5.327 5.714 6.059 6.385 6.537 6.827 7.115 7.524 7.775 8.017 8.381 8.733 9.068 9.399 9.716 10.119 10.516 10.892 11.342 11.78 12.209 12.701 13.244 13.765 14.327 14.919 15.548 16.232 17.002 17.857 18.684 19.611 20.662 21.885 23.211 24.579 25.893 27.08 27.311 26.977 26.498 25.901 25.183 24.447 23.741 23.126 22.501 21.937 21.412 20.897 20.396 19.915 19.507 19.104 18.724 18.386 18.022 17.635 17.32 16.99 16.626 16.339 16.051 15.756 15.457 15.148 14.928 14.69 14.319 14.062 13.785 13.641 13.35 13.042 12.725 12.561 12.165 12.02 11.816 11.588 11.117 10.87 10.595 10.279 9.912 9.48 8.895 7.045 -2 ,14660 ,KEBNE ,16723538,Sun Nov 28 03:06:33 CET,Sun Nov 28 04:57:47 CET,0.0 1.277 1.838 2.292 2.671 2.976 3.257 3.536 4.019 4.229 4.433 4.57 4.967 5.128 5.436 5.736 6.035 6.184 6.467 6.735 7.106 7.344 7.6 7.979 8.323 8.658 8.988 9.302 9.703 10.084 10.457 10.91 11.332 11.729 12.192 12.733 13.247 13.81 14.422 15.063 15.723 16.47 17.371 18.249 19.232 20.308 21.519 22.851 24.222 25.695 27.202 27.491 27.117 26.598 25.937 25.2 24.491 23.787 23.122 22.401 21.753 21.176 20.617 20.081 19.584 19.122 18.635 18.213 17.844 17.472 17.087 16.752 16.409 16.052 15.757 15.445 15.132 14.812 14.49 14.275 14.051 13.707 13.464 13.198 13.057 12.778 12.492 12.183 12.013 11.61 11.454 11.251 11.033 10.568 10.3 9.995 9.691 9.374 9.006 8.511 7.114 -3 ,847 ,KEBNE ,16723539,Sun Nov 28 03:06:33 CET,Sun Nov 28 04:58:44 CET,0.0 1.102 1.586 1.985 2.335 2.665 2.955 3.203 3.683 3.905 4.117 4.304 4.728 4.911 5.264 5.596 5.909 6.061 6.353 6.652 7.081 7.334 7.578 7.938 8.282 8.611 8.941 9.268 9.686 10.089 10.47 10.931 11.37 11.794 12.297 12.863 13.416 14.007 14.634 15.29 15.983 16.753 17.653 18.545 19.545 20.68 21.95 23.288 24.744 26.196 27.515 27.977 27.725 27.143 26.462 25.829 25.255 24.664 24.057 23.419 22.852 22.326 21.82 21.347 20.913 20.525 20.114 19.731 19.388 19.029 18.651 18.327 17.974 17.615 17.343 17.046 16.74 16.438 16.126 15.911 15.697 15.354 15.111 14.844 14.703 14.422 14.122 13.8 13.633 13.235 13.068 12.866 12.658 12.186 11.93 11.665 11.333 10.955 10.586 10.106 8.346 -4 ,8918 ,KEBNE ,16723540,Sun Nov 28 03:06:33 CET,Sun Nov 28 04:58:49 CET,0.0 1.132 1.655 2.075 2.407 2.692 2.959 3.212 3.692 3.908 4.12 4.298 4.712 4.887 5.205 5.506 5.802 5.953 6.251 6.544 6.96 7.214 7.457 7.818 8.164 8.49 8.804 9.117 9.525 9.913 10.284 10.728 11.169 11.598 12.1 12.677 13.22 13.822 14.449 15.07 15.745 16.516 17.373 18.179 19.137 20.252 21.467 22.727 24.056 25.352 26.367 26.671 26.472 26.034 25.427 24.732 24.056 23.417 22.843 22.239 21.703 21.205 20.717 20.213 19.698 19.224 18.746 18.31 17.925 17.515 17.091 16.744 16.387 16.019 15.733 15.456 15.174 14.88 14.573 14.365 14.154 13.806 13.564 13.302 13.16 12.879 12.591 12.287 12.124 11.725 11.574 11.374 11.159 10.718 10.479 10.21 9.919 9.584 9.192 8.674 7.336 -5 ,7930 ,KEBNE ,16723541,Sun Nov 28 03:06:33 CET,Sun Nov 28 04:57:59 CET,0.0 1.206 1.818 2.274 2.621 2.917 3.214 3.5 3.992 4.207 4.432 4.628 5.043 5.222 5.571 5.902 6.224 6.384 6.695 6.996 7.419 7.689 7.955 8.323 8.667 8.998 9.325 9.642 10.037 10.424 10.8 11.252 11.676 12.083 12.574 13.116 13.639 14.199 14.803 15.474 16.161 16.917 17.832 18.742 19.726 20.783 21.893 23.06 24.394 25.766 26.906 27.103 26.752 26.229 25.686 25.063 24.412 23.774 23.17 22.51 21.938 21.452 20.957 20.449 19.964 19.529 19.074 18.664 18.302 17.941 17.57 17.249 16.906 16.559 16.29 16.009 15.725 15.416 15.088 14.868 14.632 14.251 13.994 13.72 13.579 13.279 12.95 12.617 12.444 12.043 11.87 11.653 11.435 10.957 10.677 10.369 10.032 9.628 9.16 8.56 7.007 -6 ,10574 ,KEBNE ,16723542,Sun Nov 28 03:06:33 CET,Sun Nov 28 04:57:24 CET,0.0 1.354 1.884 2.267 2.624 2.969 3.279 3.574 4.13 4.367 4.578 4.764 5.183 5.361 5.711 6.039 6.35 6.506 6.816 7.101 7.499 7.757 8.01 8.367 8.696 8.999 9.299 9.611 10.02 10.41 10.789 11.248 11.677 12.087 12.574 13.119 13.634 14.206 14.803 15.424 16.081 16.817 17.674 18.532 19.493 20.558 21.754 22.997 24.382 25.882 27.352 27.859 27.624 27.18 26.601 26.019 25.484 24.899 24.313 23.688 23.101 22.563 22.063 21.578 21.12 20.692 20.247 19.851 19.498 19.131 18.739 18.409 18.073 17.714 17.436 17.155 16.849 16.52 16.167 15.923 15.674 15.273 14.988 14.699 14.553 14.254 13.952 13.631 13.453 13.057 12.913 12.709 12.489 12.009 11.729 11.41 11.058 10.661 10.214 9.685 7.804 -7 ,32721 ,KEBNE ,16723543,Sun Nov 28 03:07:35 CET,Sun Nov 28 05:02:06 CET,0.0 1.342 1.903 2.3 2.626 2.907 3.169 3.42 3.891 4.106 4.3 4.475 4.883 5.054 5.401 5.734 6.055 6.212 6.513 6.809 7.228 7.486 7.738 8.099 8.443 8.775 9.1 9.421 9.841 10.251 10.654 11.141 11.592 12.012 12.523 13.111 13.644 14.212 14.837 15.485 16.163 16.954 17.854 18.756 19.802 20.884 22.052 23.297 24.627 25.992 27.178 27.673 27.535 27.109 26.561 25.929 25.374 24.797 24.189 23.525 22.948 22.427 21.937 21.476 21.05 20.67 20.243 19.844 19.5 19.152 18.777 18.459 18.142 17.807 17.54 17.267 16.96 16.611 16.24 15.988 15.723 15.292 14.989 14.675 14.512 14.17 13.81 13.424 13.23 12.819 12.607 12.376 12.123 11.573 11.286 10.96 10.6 10.191 9.688 9.046 7.233 -9 ,21701 ,KEBNE ,16723545,Sun Nov 28 03:07:39 CET,Sun Nov 28 04:58:24 CET,0.0 1.083 1.58 2.017 2.369 2.67 2.964 3.234 3.723 3.949 4.167 4.342 4.755 4.94 5.3 5.621 5.925 6.071 6.36 6.649 7.049 7.292 7.524 7.861 8.195 8.542 8.884 9.211 9.629 10.037 10.418 10.859 11.29 11.715 12.203 12.745 13.29 13.871 14.478 15.145 15.86 16.644 17.555 18.465 19.502 20.639 21.82 23.005 24.266 25.558 26.589 26.779 26.376 25.718 25.07 24.41 23.724 23.073 22.499 21.909 21.363 20.871 20.409 19.96 19.524 19.126 18.728 18.343 17.99 17.628 17.237 16.906 16.566 16.207 15.918 15.623 15.32 15.001 14.663 14.433 14.212 13.849 13.572 13.282 13.141 12.849 12.523 12.18 12.002 11.6 11.418 11.204 10.972 10.486 10.228 9.954 9.654 9.283 8.817 8.172 6.415 -10 ,23783 ,KEBNE ,16723546,Sun Nov 28 03:07:34 CET,Sun Nov 28 04:59:14 CET,0.0 1.461 1.991 2.383 2.74 3.046 3.325 3.596 4.059 4.267 4.469 4.623 5.033 5.217 5.574 5.896 6.194 6.341 6.633 6.922 7.345 7.613 7.868 8.227 8.577 8.913 9.228 9.534 9.936 10.326 10.692 11.105 11.507 11.902 12.361 12.889 13.393 13.937 14.523 15.138 15.77 16.499 17.362 18.204 19.129 20.103 21.24 22.453 23.73 25.046 26.116 26.549 26.479 26.136 25.667 25.159 24.655 24.111 23.549 22.926 22.38 21.879 21.379 20.949 20.573 20.204 19.797 19.42 19.08 18.721 18.353 18.046 17.718 17.371 17.107 16.843 16.58 16.278 15.931 15.691 15.449 15.096 14.844 14.565 14.422 14.118 13.786 13.453 13.278 12.872 12.707 12.501 12.283 11.834 11.597 11.324 11.027 10.734 10.392 9.898 8.265 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index 43047197..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11314 ,KEBNE ,16723547,Sun Nov 28 03:07:34 CET,Sun Nov 28 04:59:32 CET,0.0 1.147 1.62 2.018 2.363 2.662 2.915 3.16 3.657 3.89 4.109 4.259 4.702 4.904 5.281 5.631 5.966 6.126 6.451 6.774 7.227 7.515 7.798 8.217 8.635 9.044 9.441 9.832 10.333 10.819 11.297 11.883 12.447 12.983 13.609 14.326 15.036 15.829 16.701 17.666 18.698 19.852 21.188 22.582 24.256 26.168 28.464 31.12 34.154 37.599 41.9 45.456 47.244 48.132 48.644 48.932 49.017 48.935 48.777 48.617 48.443 48.238 47.981 47.643 47.299 47.004 46.691 46.399 46.113 45.792 45.439 45.133 44.844 44.567 44.344 44.111 43.881 43.636 43.373 43.173 42.944 42.562 42.277 41.971 41.815 41.458 41.057 40.647 40.442 40.016 39.742 39.482 39.22 38.681 38.38 38.049 37.655 37.164 36.594 35.766 33.131 -2 ,19380 ,KEBNE ,16723548,Sun Nov 28 03:07:34 CET,Sun Nov 28 04:58:27 CET,0.0 1.254 1.773 2.178 2.531 2.822 3.094 3.366 3.887 4.12 4.344 4.512 4.963 5.163 5.556 5.92 6.255 6.416 6.737 7.061 7.532 7.824 8.113 8.541 8.961 9.374 9.772 10.172 10.695 11.189 11.666 12.248 12.816 13.38 14.051 14.809 15.523 16.309 17.176 18.096 19.062 20.183 21.542 22.926 24.555 26.387 28.597 31.224 34.383 38.2 42.626 46.05 47.913 48.898 49.471 49.819 49.999 50.027 49.945 49.789 49.604 49.403 49.171 48.923 48.679 48.435 48.191 47.977 47.765 47.521 47.261 47.033 46.786 46.528 46.302 46.048 45.787 45.503 45.193 44.979 44.746 44.372 44.099 43.8 43.651 43.336 42.978 42.601 42.416 42.021 41.818 41.6 41.366 40.817 40.509 40.154 39.749 39.293 38.764 38.077 35.871 -3 ,28434 ,KEBNE ,16723549,Sun Nov 28 03:07:34 CET,Sun Nov 28 04:58:27 CET,0.0 1.311 1.817 2.185 2.529 2.831 3.098 3.357 3.838 4.067 4.286 4.456 4.911 5.105 5.485 5.837 6.166 6.326 6.647 6.97 7.43 7.729 8.03 8.469 8.899 9.32 9.727 10.114 10.621 11.124 11.609 12.218 12.804 13.359 14.016 14.753 15.466 16.263 17.153 18.119 19.138 20.285 21.661 23.117 24.823 26.785 29.085 31.68 34.74 38.34 42.742 46.216 48.032 49.049 49.595 49.804 49.807 49.727 49.62 49.478 49.287 49.057 48.779 48.447 48.146 47.915 47.65 47.38 47.159 46.951 46.704 46.462 46.193 45.91 45.688 45.462 45.213 44.933 44.638 44.428 44.226 43.908 43.633 43.318 43.155 42.751 42.268 41.785 41.538 41.095 40.879 40.668 40.439 39.9 39.589 39.257 38.9 38.444 37.884 37.14 34.838 -4 ,17210 ,KEBNE ,16723550,Sun Nov 28 03:07:34 CET,Sun Nov 28 04:57:58 CET,0.0 1.407 1.962 2.391 2.764 3.073 3.351 3.633 4.163 4.39 4.594 4.758 5.204 5.394 5.765 6.134 6.485 6.652 6.981 7.305 7.775 8.078 8.377 8.818 9.237 9.636 10.017 10.402 10.912 11.413 11.903 12.473 13.028 13.6 14.286 15.051 15.78 16.598 17.488 18.412 19.411 20.575 21.983 23.424 25.162 27.159 29.431 31.996 34.972 38.606 43.037 46.511 48.473 49.606 50.179 50.412 50.435 50.3 50.125 49.966 49.746 49.449 49.159 48.88 48.607 48.356 48.1 47.867 47.651 47.408 47.13 46.872 46.602 46.32 46.057 45.763 45.485 45.192 44.881 44.672 44.44 44.055 43.783 43.496 43.346 43.019 42.644 42.21 42.002 41.587 41.302 41.051 40.799 40.203 39.846 39.449 39.029 38.568 38.016 37.216 34.713 -5 ,15638 ,KEBNE ,16723551,Sun Nov 28 03:07:34 CET,Sun Nov 28 04:59:11 CET,0.0 1.405 1.929 2.389 2.788 3.124 3.433 3.735 4.302 4.559 4.809 5.017 5.483 5.689 6.086 6.461 6.823 7.005 7.362 7.713 8.224 8.56 8.884 9.355 9.817 10.253 10.665 11.071 11.602 12.128 12.634 13.224 13.795 14.338 14.987 15.728 16.428 17.2 18.036 18.943 19.948 21.131 22.499 23.852 25.451 27.295 29.481 31.975 34.866 38.409 42.778 46.196 48.057 49.097 49.732 50.129 50.303 50.37 50.389 50.313 50.132 49.922 49.699 49.453 49.228 48.996 48.721 48.486 48.263 47.986 47.65 47.356 47.065 46.771 46.528 46.265 45.985 45.689 45.386 45.167 44.946 44.608 44.357 44.095 43.949 43.633 43.306 42.949 42.765 42.364 42.159 41.939 41.703 41.151 40.854 40.534 40.162 39.723 39.22 38.51 35.852 -6 ,27546 ,KEBNE ,16723552,Sun Nov 28 03:07:34 CET,Sun Nov 28 04:58:07 CET,0.0 1.06 1.555 1.94 2.272 2.562 2.843 3.113 3.633 3.888 4.127 4.325 4.778 4.969 5.342 5.7 6.042 6.212 6.543 6.873 7.361 7.67 7.962 8.383 8.794 9.189 9.569 9.941 10.446 10.935 11.422 12.046 12.641 13.204 13.868 14.632 15.357 16.147 17.025 17.972 18.976 20.141 21.538 22.939 24.574 26.424 28.6 31.103 34.122 37.678 41.839 45.335 47.37 48.542 49.228 49.64 49.864 49.881 49.787 49.683 49.498 49.27 49.059 48.827 48.581 48.321 48.016 47.746 47.519 47.273 46.999 46.763 46.502 46.219 46.001 45.769 45.527 45.275 44.988 44.778 44.567 44.239 43.993 43.743 43.61 43.321 43.003 42.629 42.437 42.036 41.825 41.599 41.352 40.773 40.447 40.084 39.668 39.226 38.711 37.995 35.701 -7 ,23520 ,KEBNE ,16723553,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 04:58:51 CET,0.0 1.147 1.617 1.981 2.298 2.612 2.904 3.17 3.643 3.862 4.077 4.249 4.708 4.903 5.249 5.592 5.919 6.08 6.405 6.715 7.144 7.429 7.718 8.146 8.564 8.969 9.372 9.758 10.263 10.77 11.259 11.849 12.426 12.989 13.632 14.347 15.067 15.884 16.757 17.702 18.71 19.864 21.218 22.606 24.259 26.129 28.285 30.704 33.695 37.205 41.388 44.718 46.463 47.413 47.936 48.252 48.381 48.336 48.218 48.107 47.983 47.793 47.539 47.27 47.001 46.749 46.479 46.2 45.965 45.717 45.421 45.169 44.906 44.605 44.354 44.099 43.825 43.526 43.219 43.021 42.803 42.418 42.15 41.889 41.741 41.391 41.051 40.704 40.512 40.111 39.908 39.681 39.444 38.899 38.579 38.235 37.842 37.391 36.853 36.148 33.988 -8 ,7314 ,KEBNE ,16723554,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 04:59:31 CET,0.0 1.067 1.518 1.867 2.136 2.388 2.621 2.838 3.253 3.456 3.665 3.82 4.261 4.45 4.81 5.163 5.515 5.685 6.011 6.337 6.822 7.128 7.415 7.836 8.234 8.618 9.008 9.395 9.9 10.389 10.879 11.473 12.037 12.589 13.244 13.986 14.701 15.478 16.316 17.221 18.205 19.36 20.765 22.206 23.922 25.856 28.079 30.592 33.533 37.071 41.475 44.925 46.733 47.814 48.309 48.518 48.658 48.66 48.571 48.437 48.278 48.091 47.859 47.605 47.353 47.1 46.774 46.478 46.245 45.963 45.651 45.398 45.133 44.834 44.604 44.369 44.097 43.801 43.487 43.266 43.025 42.63 42.349 42.063 41.92 41.619 41.286 40.933 40.747 40.353 40.173 39.948 39.704 39.189 38.883 38.519 38.107 37.642 37.054 36.257 34.103 -9 ,3253 ,KEBNE ,16723555,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 05:00:32 CET,0.0 1.177 1.67 2.04 2.386 2.7 2.999 3.282 3.761 3.97 4.18 4.363 4.825 5.02 5.417 5.799 6.166 6.35 6.695 7.028 7.512 7.816 8.119 8.558 8.976 9.384 9.785 10.173 10.673 11.178 11.683 12.285 12.874 13.441 14.102 14.859 15.58 16.389 17.277 18.216 19.211 20.352 21.707 23.088 24.751 26.677 28.899 31.403 34.349 37.797 41.966 45.347 47.074 47.917 48.36 48.597 48.642 48.562 48.435 48.253 48.06 47.852 47.632 47.404 47.163 46.915 46.624 46.353 46.129 45.886 45.619 45.405 45.152 44.869 44.644 44.392 44.133 43.847 43.539 43.331 43.115 42.77 42.532 42.297 42.16 41.839 41.511 41.161 40.982 40.589 40.409 40.207 39.989 39.477 39.185 38.83 38.429 37.998 37.497 36.79 34.487 -10 ,6504 ,KEBNE ,16723556,Sun Nov 28 03:08:37 CET,Sun Nov 28 04:59:35 CET,0.0 0.928 1.405 1.787 2.12 2.429 2.723 2.996 3.517 3.759 3.985 4.161 4.617 4.818 5.208 5.572 5.919 6.083 6.401 6.73 7.206 7.509 7.812 8.256 8.672 9.071 9.454 9.826 10.328 10.83 11.334 11.939 12.499 13.054 13.717 14.463 15.202 16.036 16.906 17.811 18.812 19.981 21.376 22.832 24.534 26.397 28.653 31.273 34.21 37.607 41.767 45.207 47.193 48.379 49.017 49.267 49.313 49.308 49.218 49.021 48.795 48.548 48.307 48.04 47.762 47.523 47.265 47.001 46.754 46.494 46.225 45.985 45.69 45.373 45.158 44.946 44.696 44.424 44.125 43.912 43.713 43.416 43.201 42.954 42.808 42.478 42.144 41.813 41.638 41.236 41.02 40.802 40.58 40.077 39.78 39.426 39.039 38.641 38.139 37.365 34.849 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 1d999773..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31707 ,KEBNE ,16723557,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 05:00:21 CET,0.0 1.198 1.657 1.999 2.295 2.593 2.864 3.107 3.568 3.773 3.968 4.092 4.533 4.71 5.022 5.329 5.642 5.791 6.071 6.348 6.749 6.99 7.228 7.584 7.927 8.284 8.629 8.944 9.337 9.717 10.097 10.574 11.02 11.442 11.933 12.506 13.088 13.717 14.387 15.126 15.905 16.772 17.805 18.848 20.054 21.4 22.962 24.699 26.769 29.237 32.204 34.657 35.971 36.645 36.962 37.086 37.046 36.928 36.783 36.576 36.366 36.122 35.838 35.579 35.342 35.101 34.822 34.546 34.301 34.065 33.817 33.583 33.319 33.053 32.858 32.659 32.43 32.156 31.856 31.65 31.446 31.128 30.891 30.645 30.521 30.263 29.986 29.68 29.508 29.114 28.944 28.724 28.504 28.043 27.77 27.462 27.137 26.774 26.345 25.792 23.661 -2 ,3565 ,KEBNE ,16723558,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 05:00:30 CET,0.0 1.321 1.792 2.162 2.454 2.724 2.981 3.223 3.678 3.877 4.059 4.158 4.58 4.748 5.078 5.386 5.683 5.831 6.111 6.381 6.781 7.03 7.263 7.604 7.939 8.274 8.603 8.917 9.33 9.729 10.101 10.551 10.999 11.432 11.929 12.495 13.061 13.684 14.333 15.017 15.756 16.609 17.604 18.611 19.794 21.127 22.694 24.473 26.636 29.244 32.261 34.616 35.89 36.575 36.917 37.049 37.083 37.072 37.013 36.902 36.742 36.551 36.326 36.095 35.884 35.678 35.439 35.22 35.026 34.82 34.596 34.367 34.099 33.82 33.594 33.357 33.139 32.926 32.652 32.439 32.237 31.941 31.728 31.493 31.366 31.09 30.816 30.512 30.333 29.924 29.735 29.533 29.332 28.884 28.617 28.299 27.922 27.483 27.019 26.489 24.615 -3 ,25264 ,KEBNE ,16723559,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 05:00:37 CET,0.0 1.665 2.168 2.516 2.804 3.086 3.347 3.594 4.045 4.252 4.449 4.553 4.973 5.131 5.446 5.755 6.049 6.191 6.459 6.716 7.1 7.353 7.6 7.964 8.311 8.636 8.95 9.253 9.659 10.055 10.424 10.876 11.313 11.739 12.238 12.8 13.341 13.932 14.564 15.241 15.971 16.805 17.801 18.804 19.991 21.353 22.914 24.673 26.771 29.284 32.239 34.595 35.949 36.722 37.087 37.24 37.192 37.046 36.917 36.774 36.599 36.342 36.042 35.748 35.454 35.183 34.898 34.63 34.405 34.135 33.82 33.553 33.272 33.001 32.786 32.545 32.284 32.012 31.715 31.508 31.292 30.95 30.716 30.458 30.322 30.058 29.786 29.477 29.326 28.946 28.791 28.592 28.389 27.93 27.653 27.351 26.999 26.593 26.143 25.492 23.449 -4 ,29876 ,KEBNE ,16723560,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 04:59:16 CET,0.0 1.383 1.856 2.211 2.519 2.777 3.003 3.238 3.712 3.919 4.111 4.232 4.66 4.824 5.141 5.446 5.744 5.889 6.173 6.45 6.839 7.093 7.35 7.731 8.097 8.442 8.765 9.087 9.498 9.891 10.277 10.758 11.233 11.676 12.173 12.741 13.3 13.904 14.545 15.24 16.0 16.853 17.86 18.891 20.081 21.417 22.985 24.801 26.949 29.494 32.581 34.997 36.311 37.063 37.458 37.637 37.686 37.658 37.579 37.452 37.307 37.149 36.947 36.728 36.526 36.332 36.117 35.918 35.729 35.507 35.246 35.016 34.766 34.499 34.274 34.02 33.754 33.489 33.203 32.987 32.763 32.417 32.176 31.925 31.794 31.516 31.224 30.897 30.719 30.309 30.117 29.912 29.693 29.178 28.896 28.616 28.303 27.927 27.469 26.777 24.35 -5 ,1067 ,KEBNE ,16723561,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 05:00:31 CET,0.0 1.447 1.945 2.288 2.601 2.89 3.145 3.371 3.774 3.974 4.178 4.301 4.723 4.901 5.234 5.548 5.843 5.984 6.263 6.532 6.903 7.149 7.402 7.754 8.097 8.439 8.758 9.072 9.479 9.877 10.271 10.742 11.197 11.639 12.169 12.754 13.305 13.924 14.59 15.302 16.073 16.947 17.962 18.976 20.164 21.498 23.041 24.826 26.954 29.49 32.605 35.033 36.329 37.064 37.411 37.54 37.574 37.502 37.345 37.144 36.928 36.731 36.501 36.237 35.976 35.697 35.396 35.134 34.896 34.661 34.433 34.23 33.997 33.747 33.534 33.29 33.007 32.715 32.425 32.228 32.024 31.682 31.447 31.212 31.087 30.82 30.531 30.2 30.026 29.632 29.486 29.296 29.088 28.632 28.367 28.062 27.732 27.34 26.833 26.146 23.607 -6 ,31556 ,KEBNE ,16723562,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 05:00:10 CET,0.0 1.217 1.714 2.102 2.415 2.702 2.985 3.236 3.662 3.871 4.077 4.21 4.642 4.815 5.138 5.447 5.745 5.887 6.165 6.432 6.803 7.048 7.291 7.635 7.973 8.302 8.624 8.94 9.35 9.75 10.13 10.582 11.027 11.456 11.947 12.498 13.04 13.648 14.329 15.068 15.845 16.704 17.684 18.682 19.863 21.2 22.736 24.478 26.598 29.122 32.132 34.588 36.009 36.836 37.245 37.384 37.391 37.333 37.225 37.055 36.865 36.656 36.437 36.208 35.976 35.761 35.529 35.294 35.084 34.864 34.612 34.404 34.195 33.961 33.761 33.544 33.31 33.065 32.81 32.632 32.434 32.092 31.858 31.63 31.518 31.276 31.007 30.712 30.554 30.172 30.03 29.836 29.618 29.063 28.729 28.406 28.081 27.68 27.195 26.563 24.776 -7 ,8488 ,KEBNE ,16723563,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 04:59:33 CET,0.0 1.054 1.541 1.925 2.209 2.472 2.739 2.994 3.448 3.651 3.837 3.919 4.332 4.496 4.81 5.102 5.371 5.512 5.799 6.083 6.498 6.759 7.005 7.357 7.704 8.034 8.346 8.658 9.07 9.458 9.839 10.307 10.741 11.166 11.669 12.228 12.772 13.377 14.03 14.743 15.514 16.358 17.348 18.356 19.554 20.909 22.445 24.205 26.288 28.798 31.777 34.029 35.256 35.961 36.341 36.537 36.599 36.573 36.517 36.414 36.285 36.125 35.928 35.725 35.53 35.323 35.076 34.852 34.644 34.409 34.159 33.945 33.723 33.482 33.283 33.086 32.881 32.657 32.412 32.235 32.055 31.731 31.492 31.25 31.114 30.838 30.578 30.304 30.156 29.766 29.608 29.408 29.18 28.657 28.358 28.028 27.674 27.311 26.851 26.14 24.329 -8 ,22966 ,KEBNE ,16723564,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 05:00:31 CET,0.0 1.45 1.956 2.352 2.677 2.953 3.178 3.382 3.78 3.967 4.154 4.279 4.695 4.863 5.191 5.493 5.776 5.91 6.175 6.429 6.778 7.01 7.239 7.576 7.907 8.227 8.544 8.853 9.243 9.618 9.996 10.467 10.907 11.325 11.805 12.344 12.88 13.469 14.102 14.79 15.535 16.411 17.452 18.469 19.624 20.922 22.483 24.299 26.44 28.911 31.883 34.288 35.524 36.169 36.443 36.536 36.537 36.447 36.307 36.074 35.811 35.574 35.344 35.074 34.795 34.54 34.257 34.0 33.769 33.506 33.213 32.961 32.684 32.39 32.162 31.93 31.691 31.416 31.124 30.927 30.722 30.412 30.188 29.933 29.799 29.519 29.219 28.894 28.714 28.313 28.138 27.922 27.7 27.224 26.949 26.642 26.299 25.895 25.423 24.837 23.186 -9 ,21946 ,KEBNE ,16723565,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 04:59:39 CET,0.0 1.157 1.582 1.928 2.241 2.52 2.768 2.988 3.403 3.596 3.785 3.919 4.347 4.505 4.801 5.103 5.399 5.545 5.832 6.107 6.502 6.748 6.996 7.368 7.713 8.044 8.368 8.679 9.096 9.519 9.917 10.392 10.846 11.273 11.782 12.359 12.907 13.523 14.19 14.894 15.649 16.513 17.509 18.52 19.714 21.06 22.666 24.523 26.668 29.151 32.17 34.664 36.009 36.764 37.155 37.357 37.408 37.347 37.266 37.148 37.024 36.89 36.72 36.518 36.296 36.087 35.841 35.609 35.398 35.152 34.883 34.651 34.411 34.166 33.961 33.725 33.472 33.215 32.962 32.791 32.61 32.324 32.089 31.811 31.662 31.354 31.032 30.704 30.541 30.169 30.049 29.847 29.638 29.173 28.914 28.63 28.283 27.907 27.502 26.968 24.999 -10 ,31788 ,KEBNE ,16723566,Sun Nov 28 03:08:36 CET,Sun Nov 28 05:00:02 CET,0.0 1.271 1.776 2.187 2.514 2.769 3.003 3.246 3.697 3.915 4.121 4.237 4.666 4.83 5.152 5.472 5.781 5.929 6.224 6.515 6.913 7.156 7.383 7.724 8.076 8.416 8.737 9.05 9.469 9.863 10.249 10.725 11.177 11.619 12.13 12.696 13.237 13.847 14.517 15.215 15.964 16.829 17.847 18.889 20.104 21.469 23.034 24.794 26.944 29.518 32.576 34.995 36.299 37.04 37.372 37.468 37.472 37.362 37.196 36.972 36.731 36.53 36.291 36.004 35.714 35.423 35.106 34.802 34.524 34.246 33.956 33.711 33.477 33.25 33.07 32.865 32.621 32.346 32.035 31.809 31.575 31.196 30.927 30.638 30.483 30.157 29.807 29.458 29.274 28.846 28.613 28.377 28.132 27.607 27.3 26.94 26.548 26.097 25.557 24.806 21.772 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt deleted file mode 100644 index 63fe805d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3721 ,KEBNE ,16723567,Sun Nov 28 03:09:38 CET,Sun Nov 28 05:00:16 CET,0.0 1.545 2.032 2.442 2.777 3.055 3.332 3.586 4.024 4.236 4.449 4.602 5.045 5.226 5.568 5.89 6.2 6.352 6.646 6.938 7.356 7.626 7.898 8.282 8.651 9.012 9.364 9.723 10.193 10.628 11.037 11.548 12.047 12.486 12.94 13.441 13.924 14.456 15.019 15.613 16.236 16.927 17.732 18.514 19.402 20.379 21.438 22.556 23.753 24.98 26.127 26.547 26.387 25.964 25.377 24.47 23.481 22.632 21.907 21.161 20.606 20.182 19.732 19.295 18.892 18.506 18.116 17.789 17.481 17.141 16.79 16.476 16.126 15.765 15.502 15.242 14.967 14.673 14.367 14.161 13.94 13.594 13.361 13.108 12.969 12.685 12.392 12.062 11.879 11.443 11.241 10.988 10.717 10.151 9.861 9.564 9.207 8.801 8.339 7.776 5.833 -2 ,2541 ,KEBNE ,16723568,Sun Nov 28 03:09:38 CET,Sun Nov 28 05:01:30 CET,0.0 1.455 2.036 2.488 2.876 3.221 3.521 3.793 4.297 4.541 4.776 4.924 5.346 5.506 5.813 6.103 6.377 6.516 6.779 7.027 7.381 7.6 7.804 8.117 8.429 8.712 8.969 9.218 9.549 9.879 10.192 10.564 10.922 11.255 11.631 12.066 12.502 12.965 13.467 13.997 14.522 15.112 15.812 16.535 17.338 18.201 19.23 20.329 21.452 22.585 23.599 23.938 23.791 23.418 22.888 22.309 21.78 21.303 20.846 20.333 19.908 19.499 19.073 18.687 18.322 17.953 17.553 17.198 16.905 16.597 16.25 15.945 15.623 15.298 15.037 14.76 14.469 14.166 13.856 13.629 13.395 13.043 12.786 12.518 12.382 12.099 11.791 11.462 11.285 10.844 10.65 10.425 10.174 9.603 9.293 8.967 8.614 8.199 7.688 7.018 5.317 -4 ,9878 ,KEBNE ,16723570,Sun Nov 28 03:09:38 CET,Sun Nov 28 05:01:24 CET,0.0 1.532 2.078 2.51 2.854 3.18 3.482 3.742 4.214 4.44 4.653 4.808 5.258 5.443 5.779 6.102 6.42 6.573 6.865 7.15 7.578 7.864 8.128 8.486 8.824 9.147 9.465 9.763 10.138 10.501 10.851 11.276 11.688 12.092 12.552 13.052 13.531 14.068 14.648 15.243 15.872 16.602 17.469 18.299 19.186 20.119 21.14 22.232 23.417 24.625 25.8 26.295 26.086 25.652 25.178 24.628 24.067 23.498 22.954 22.385 21.868 21.376 20.881 20.414 19.965 19.54 19.099 18.695 18.329 17.952 17.568 17.236 16.884 16.489 16.185 15.883 15.554 15.207 14.856 14.606 14.342 13.931 13.639 13.334 13.175 12.852 12.511 12.159 11.971 11.514 11.254 11.011 10.744 10.121 9.794 9.472 9.131 8.721 8.229 7.57 5.312 -5 ,9969 ,KEBNE ,16723571,Sun Nov 28 03:09:38 CET,Sun Nov 28 05:01:06 CET,0.0 1.883 2.343 2.685 2.992 3.316 3.589 3.848 4.357 4.578 4.796 4.967 5.401 5.57 5.891 6.203 6.509 6.672 6.991 7.266 7.642 7.889 8.13 8.477 8.804 9.12 9.431 9.739 10.132 10.506 10.871 11.323 11.753 12.144 12.593 13.093 13.574 14.109 14.698 15.313 15.919 16.607 17.403 18.195 19.109 20.04 21.056 22.144 23.368 24.661 25.84 26.341 26.253 25.904 25.437 24.92 24.393 23.859 23.349 22.819 22.345 21.879 21.401 20.938 20.487 20.067 19.61 19.181 18.795 18.39 17.994 17.678 17.336 16.979 16.707 16.422 16.114 15.781 15.416 15.151 14.886 14.485 14.215 13.938 13.788 13.465 13.118 12.737 12.523 12.054 11.804 11.554 11.309 10.788 10.5 10.178 9.807 9.39 8.876 8.195 6.222 -6 ,4255 ,KEBNE ,16723572,Sun Nov 28 03:09:38 CET,Sun Nov 28 05:01:46 CET,0.0 1.6 2.134 2.559 2.905 3.202 3.474 3.729 4.202 4.415 4.609 4.745 5.197 5.402 5.786 6.119 6.428 6.583 6.877 7.167 7.595 7.858 8.11 8.501 8.881 9.227 9.569 9.921 10.374 10.789 11.186 11.684 12.177 12.659 13.209 13.803 14.363 14.996 15.696 16.384 17.047 17.76 18.567 19.338 20.159 21.073 22.132 23.261 24.451 25.696 26.899 27.422 27.399 27.112 26.64 26.085 25.563 25.039 24.524 23.965 23.432 22.852 22.206 21.57 20.981 20.456 19.896 19.385 18.942 18.464 17.966 17.563 17.148 16.694 16.318 15.915 15.509 15.104 14.663 14.359 14.052 13.577 13.244 12.895 12.714 12.351 11.99 11.6 11.385 10.929 10.707 10.453 10.188 9.655 9.369 9.044 8.69 8.313 7.868 7.204 5.474 -7 ,1855 ,KEBNE ,16723573,Sun Nov 28 03:09:38 CET,Sun Nov 28 05:02:10 CET,0.0 1.515 1.987 2.341 2.639 2.92 3.196 3.445 3.91 4.133 4.332 4.481 4.926 5.117 5.474 5.804 6.123 6.282 6.595 6.899 7.327 7.589 7.846 8.227 8.604 8.973 9.319 9.656 10.105 10.523 10.919 11.407 11.876 12.322 12.791 13.295 13.787 14.309 14.882 15.502 16.13 16.812 17.575 18.313 19.172 20.11 21.107 22.19 23.392 24.695 25.977 26.518 26.421 25.945 25.355 24.751 24.141 23.55 22.993 22.372 21.721 21.066 20.436 19.815 19.198 18.63 18.042 17.532 17.084 16.616 16.126 15.701 15.261 14.819 14.49 14.143 13.772 13.385 12.978 12.691 12.398 11.939 11.604 11.25 11.077 10.741 10.395 10.009 9.8 9.352 9.136 8.881 8.589 7.958 7.624 7.255 6.868 6.427 5.865 5.14 3.048 -8 ,27163 ,KEBNE ,16723574,Sun Nov 28 03:10:39 CET,Sun Nov 28 05:02:02 CET,0.0 2.136 2.64 3.021 3.383 3.702 3.99 4.262 4.757 4.983 5.196 5.358 5.809 6.004 6.374 6.718 7.04 7.194 7.492 7.774 8.178 8.445 8.713 9.094 9.453 9.809 10.153 10.47 10.876 11.263 11.628 12.052 12.465 12.865 13.329 13.862 14.352 14.866 15.41 16.002 16.604 17.266 18.072 18.878 19.805 20.808 21.876 22.955 24.138 25.432 26.674 27.261 27.262 26.956 26.468 25.944 25.404 24.835 24.313 23.722 23.18 22.694 22.225 21.768 21.32 20.896 20.451 20.063 19.725 19.343 18.891 18.502 18.096 17.651 17.29 16.901 16.486 16.063 15.643 15.354 15.066 14.628 14.315 13.978 13.798 13.441 13.086 12.717 12.521 12.072 11.826 11.561 11.292 10.727 10.391 10.031 9.621 9.161 8.665 8.03 5.539 -9 ,28577 ,KEBNE ,16723575,Sun Nov 28 03:10:42 CET,Sun Nov 28 05:02:14 CET,0.0 1.148 1.641 2.054 2.393 2.662 2.912 3.157 3.632 3.862 4.073 4.203 4.631 4.817 5.179 5.513 5.843 6.001 6.309 6.625 7.076 7.352 7.614 7.998 8.373 8.733 9.07 9.397 9.826 10.25 10.678 11.197 11.692 12.177 12.736 13.361 13.977 14.663 15.374 16.113 16.9 17.754 18.629 19.426 20.338 21.304 22.401 23.579 24.873 26.234 27.525 28.097 27.999 27.637 27.135 26.527 25.899 25.285 24.709 24.039 23.411 22.792 22.12 21.457 20.821 20.257 19.67 19.13 18.674 18.187 17.662 17.236 16.785 16.311 15.96 15.594 15.213 14.816 14.387 14.076 13.737 13.19 12.827 12.443 12.245 11.867 11.454 10.994 10.743 10.245 9.927 9.635 9.341 8.703 8.351 7.977 7.575 7.095 6.523 5.8 4.233 -10 ,6575 ,KEBNE ,16723576,Sun Nov 28 03:10:39 CET,Sun Nov 28 05:02:02 CET,0.0 2.214 2.736 3.134 3.499 3.841 4.124 4.365 4.814 5.028 5.25 5.408 5.843 6.024 6.372 6.699 7.024 7.185 7.496 7.79 8.205 8.471 8.712 9.053 9.382 9.709 10.037 10.354 10.75 11.125 11.489 11.916 12.321 12.723 13.178 13.697 14.195 14.724 15.317 15.956 16.614 17.318 18.077 18.833 19.7 20.628 21.651 22.751 23.975 25.258 26.416 26.783 26.572 26.181 25.732 25.213 24.682 24.168 23.635 23.028 22.495 21.998 21.524 21.072 20.606 20.169 19.714 19.309 18.96 18.599 18.219 17.902 17.574 17.218 16.913 16.571 16.214 15.839 15.443 15.176 14.903 14.476 14.178 13.887 13.746 13.448 13.107 12.716 12.51 12.058 11.848 11.618 11.364 10.786 10.489 10.155 9.757 9.278 8.746 8.098 6.285 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt deleted file mode 100644 index e3bbf0c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,414 ,KEBNE ,16723577,Sun Nov 28 03:10:39 CET,Sun Nov 28 05:03:38 CET,0.0 1.825 2.516 3.042 3.44 3.774 4.076 4.35 4.854 5.098 5.33 5.502 5.961 6.175 6.581 6.94 7.268 7.43 7.75 8.06 8.514 8.795 9.057 9.449 9.843 10.231 10.596 10.942 11.398 11.833 12.235 12.728 13.233 13.716 14.255 14.849 15.443 16.1 16.796 17.578 18.46 19.487 20.679 21.883 23.26 24.781 26.508 28.387 30.458 32.657 35.082 36.838 37.58 37.77 37.65 37.396 37.138 36.927 36.747 36.509 36.269 36.044 35.815 35.572 35.316 35.046 34.74 34.463 34.208 33.946 33.655 33.395 33.143 32.888 32.685 32.468 32.237 31.983 31.706 31.514 31.31 30.984 30.761 30.53 30.397 30.102 29.796 29.472 29.306 28.919 28.803 28.622 28.43 28.006 27.738 27.435 27.136 26.781 26.339 25.79 24.319 -7 ,10089 ,KEBNE ,16723583,Sun Nov 28 03:10:39 CET,Sun Nov 28 05:02:46 CET,0.0 1.848 2.527 3.025 3.422 3.769 4.077 4.353 4.831 5.048 5.271 5.449 5.906 6.113 6.487 6.837 7.178 7.34 7.651 7.956 8.389 8.657 8.917 9.301 9.692 10.067 10.423 10.771 11.215 11.645 12.062 12.554 13.022 13.481 14.01 14.634 15.249 15.908 16.6 17.322 18.099 18.982 20.002 21.034 22.237 23.546 25.063 26.745 28.588 30.726 33.12 34.74 35.45 35.658 35.529 35.218 34.84 34.432 34.022 33.586 33.184 32.807 32.437 32.079 31.733 31.398 31.046 30.721 30.417 30.084 29.73 29.416 29.092 28.76 28.493 28.22 27.951 27.683 27.392 27.162 26.904 26.539 26.301 26.032 25.886 25.604 25.316 25.0 24.831 24.42 24.229 24.008 23.777 23.269 22.98 22.655 22.316 21.924 21.411 20.73 19.109 -8 ,17590 ,KEBNE ,16723584,Sun Nov 28 03:10:39 CET,Sun Nov 28 05:02:59 CET,0.0 1.966 2.613 3.096 3.484 3.83 4.161 4.461 4.98 5.213 5.431 5.612 6.059 6.243 6.627 6.991 7.325 7.486 7.799 8.112 8.554 8.824 9.078 9.445 9.811 10.178 10.53 10.862 11.301 11.717 12.107 12.587 13.066 13.515 14.031 14.617 15.172 15.787 16.486 17.218 17.954 18.783 19.768 20.769 21.945 23.32 24.886 26.573 28.461 30.586 33.016 34.77 35.564 35.964 36.16 36.167 36.093 35.98 35.831 35.643 35.428 35.212 34.991 34.755 34.512 34.285 34.03 33.773 33.534 33.269 32.987 32.756 32.504 32.216 31.989 31.73 31.443 31.165 30.877 30.668 30.454 30.131 29.904 29.661 29.529 29.234 28.926 28.63 28.474 28.079 27.953 27.76 27.55 27.055 26.776 26.467 26.115 25.717 25.234 24.6 22.657 -9 ,12846 ,KEBNE ,16723585,Sun Nov 28 03:10:39 CET,Sun Nov 28 05:03:01 CET,0.0 1.696 2.229 2.67 3.023 3.335 3.63 3.919 4.462 4.716 4.947 5.104 5.554 5.755 6.136 6.49 6.808 6.967 7.281 7.573 7.995 8.258 8.521 8.918 9.285 9.642 10.0 10.343 10.789 11.216 11.621 12.113 12.586 13.056 13.585 14.177 14.753 15.374 16.042 16.745 17.501 18.367 19.38 20.404 21.606 22.915 24.396 26.096 28.069 30.301 32.979 34.986 35.95 36.456 36.691 36.743 36.661 36.473 36.253 36.029 35.803 35.587 35.375 35.163 34.948 34.72 34.459 34.217 33.998 33.755 33.498 33.288 33.069 32.834 32.623 32.382 32.136 31.882 31.587 31.37 31.163 30.828 30.576 30.324 30.193 29.902 29.602 29.262 29.077 28.673 28.511 28.296 28.075 27.574 27.296 26.994 26.646 26.257 25.807 25.193 23.576 -10 ,7209 ,KEBNE ,16723586,Sun Nov 28 03:11:40 CET,Sun Nov 28 05:03:46 CET,0.0 1.719 2.27 2.704 3.082 3.409 3.731 4.038 4.555 4.812 5.069 5.274 5.738 5.948 6.356 6.735 7.095 7.275 7.627 7.964 8.444 8.741 9.035 9.47 9.884 10.288 10.682 11.074 11.591 12.078 12.52 13.049 13.562 14.059 14.653 15.305 15.915 16.587 17.301 18.032 18.797 19.662 20.653 21.649 22.849 24.169 25.64 27.264 29.131 31.245 33.699 35.487 36.32 36.709 36.782 36.717 36.548 36.264 35.923 35.538 35.182 34.842 34.504 34.148 33.812 33.506 33.142 32.786 32.48 32.167 31.839 31.556 31.262 30.95 30.703 30.44 30.165 29.886 29.586 29.361 29.132 28.809 28.562 28.285 28.152 27.858 27.534 27.211 27.044 26.637 26.471 26.263 26.037 25.538 25.276 24.985 24.665 24.3 23.848 23.177 21.248 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt deleted file mode 100644 index 745c95de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15117 ,KEBNE ,16723587,Sun Nov 28 03:11:40 CET,Sun Nov 28 05:03:38 CET,0.0 2.108 2.827 3.382 3.865 4.257 4.612 4.946 5.543 5.821 6.086 6.318 6.794 7.01 7.421 7.816 8.183 8.359 8.711 9.061 9.56 9.882 10.191 10.617 11.043 11.478 11.893 12.28 12.776 13.254 13.713 14.288 14.837 15.351 15.959 16.657 17.343 18.09 18.877 19.7 20.554 21.492 22.613 23.741 24.961 26.275 27.78 29.405 31.108 32.934 34.808 35.928 36.116 35.893 35.608 35.256 34.832 34.315 33.802 33.282 32.801 32.361 31.916 31.474 31.053 30.649 30.222 29.856 29.536 29.17 28.782 28.472 28.158 27.822 27.551 27.277 26.988 26.648 26.296 26.077 25.852 25.484 25.214 24.919 24.761 24.444 24.114 23.746 23.553 23.133 22.997 22.795 22.562 22.079 21.805 21.476 21.096 20.66 20.139 19.436 17.461 -3 ,16175 ,KEBNE ,16723589,Sun Nov 28 03:11:41 CET,Sun Nov 28 05:04:44 CET,0.0 3.304 4.046 4.633 5.105 5.485 5.844 6.175 6.776 7.057 7.327 7.582 8.081 8.317 8.753 9.171 9.58 9.768 10.116 10.449 10.913 11.212 11.522 11.976 12.403 12.813 13.219 13.618 14.119 14.599 15.083 15.644 16.178 16.714 17.33 18.009 18.648 19.374 20.15 20.96 21.826 22.792 23.949 25.105 26.399 27.83 29.407 31.128 33.116 35.268 37.644 39.249 39.678 39.564 39.238 38.823 38.379 37.922 37.493 37.025 36.559 36.095 35.619 35.144 34.687 34.258 33.821 33.422 33.068 32.706 32.33 32.011 31.668 31.297 30.994 30.67 30.328 29.967 29.602 29.353 29.093 28.685 28.402 28.113 27.962 27.658 27.344 27.012 26.829 26.393 26.225 26.002 25.753 25.191 24.882 24.544 24.161 23.708 23.187 22.471 19.913 -5 ,2762 ,KEBNE ,16723591,Sun Nov 28 03:11:41 CET,Sun Nov 28 05:05:08 CET,0.0 2.998 3.684 4.209 4.669 5.083 5.458 5.781 6.372 6.658 6.932 7.215 7.712 7.941 8.392 8.823 9.232 9.428 9.793 10.148 10.674 11.002 11.323 11.806 12.269 12.706 13.116 13.516 14.05 14.574 15.076 15.684 16.256 16.804 17.439 18.146 18.854 19.665 20.521 21.374 22.238 23.234 24.39 25.564 26.912 28.284 29.803 31.481 33.394 35.514 37.559 38.635 38.799 38.481 38.05 37.617 37.17 36.704 36.208 35.67 35.214 34.786 34.339 33.895 33.479 33.095 32.67 32.244 31.864 31.482 31.101 30.791 30.442 30.077 29.796 29.478 29.142 28.781 28.406 28.151 27.885 27.457 27.158 26.849 26.683 26.344 25.993 25.626 25.427 24.97 24.754 24.533 24.304 23.773 23.489 23.201 22.858 22.489 22.061 21.485 19.898 -6 ,27608 ,KEBNE ,16723592,Sun Nov 28 03:11:41 CET,Sun Nov 28 05:04:43 CET,0.0 2.411 3.132 3.696 4.167 4.565 4.949 5.317 5.964 6.261 6.536 6.775 7.254 7.48 7.911 8.31 8.699 8.89 9.262 9.618 10.129 10.458 10.783 11.249 11.693 12.129 12.554 12.966 13.494 14.003 14.492 15.077 15.636 16.19 16.841 17.571 18.26 19.004 19.824 20.698 21.6 22.584 23.74 24.853 26.035 27.334 28.846 30.55 32.406 34.29 36.126 37.166 37.379 37.183 36.845 36.418 35.995 35.544 35.06 34.532 34.041 33.598 33.188 32.772 32.362 31.998 31.594 31.193 30.842 30.5 30.163 29.884 29.582 29.23 28.941 28.652 28.359 28.064 27.737 27.487 27.24 26.863 26.585 26.289 26.136 25.808 25.461 25.106 24.924 24.514 24.348 24.125 23.896 23.389 23.093 22.767 22.415 22.025 21.546 20.91 18.746 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index 2d9bbe26..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29290 ,KEBNE ,17026328,Wed Dec 22 14:06:13 CET,Wed Dec 22 15:50:40 CET,0.0 0.861 1.324 1.733 2.098 2.43 2.728 3.015 3.588 3.857 4.113 4.346 4.831 5.056 5.488 5.91 6.328 6.53 6.924 7.311 7.883 8.26 8.624 9.152 9.675 10.189 10.69 11.176 11.808 12.432 13.046 13.805 14.554 15.302 16.176 17.157 18.117 19.188 20.38 21.694 23.119 24.726 26.607 28.57 30.959 33.728 37.038 40.91 45.643 51.596 59.448 66.419 70.893 74.023 76.193 77.822 79.044 79.962 80.632 81.212 81.647 81.949 82.168 82.317 82.402 82.449 82.468 82.432 82.372 82.322 82.255 82.184 82.106 82.008 81.9 81.775 81.641 81.447 81.205 81.044 80.885 80.648 80.481 80.301 80.204 79.986 79.751 79.477 79.327 79.014 78.836 78.645 78.432 77.883 77.582 77.306 77.004 76.631 76.189 75.605 73.64 -2 ,10182 ,KEBNE ,17026329,Wed Dec 22 14:06:13 CET,Wed Dec 22 15:52:57 CET,0.0 1.212 1.76 2.175 2.522 2.864 3.197 3.482 3.993 4.25 4.495 4.679 5.149 5.368 5.798 6.21 6.624 6.828 7.218 7.611 8.192 8.566 8.922 9.443 9.966 10.483 10.99 11.494 12.161 12.82 13.453 14.212 14.966 15.723 16.616 17.628 18.613 19.702 20.876 22.16 23.571 25.197 27.134 29.141 31.578 34.384 37.705 41.627 46.554 52.715 60.488 67.476 72.047 75.239 77.532 79.192 80.379 81.307 82.013 82.643 83.071 83.364 83.598 83.762 83.854 83.893 83.92 83.929 83.919 83.889 83.839 83.792 83.713 83.603 83.507 83.394 83.237 83.024 82.796 82.635 82.461 82.196 82.017 81.828 81.723 81.497 81.254 80.972 80.813 80.479 80.278 80.07 79.855 79.377 79.1 78.812 78.474 78.049 77.518 76.75 74.667 -3 ,6039 ,KEBNE ,17026330,Wed Dec 22 14:07:11 CET,Wed Dec 22 15:58:11 CET,0.0 1.052 1.553 1.946 2.291 2.61 2.913 3.196 3.755 4.024 4.275 4.494 4.976 5.204 5.666 6.101 6.504 6.707 7.112 7.505 8.084 8.452 8.82 9.361 9.876 10.385 10.892 11.397 12.039 12.651 13.249 14.006 14.774 15.532 16.417 17.401 18.35 19.436 20.623 21.882 23.264 24.884 26.795 28.781 31.185 33.967 37.272 41.176 46.111 52.289 60.172 67.168 71.693 74.847 77.067 78.678 79.842 80.746 81.376 81.885 82.287 82.622 82.887 83.035 83.107 83.151 83.167 83.142 83.101 83.066 83.017 82.949 82.855 82.745 82.644 82.53 82.401 82.262 82.109 81.979 81.832 81.589 81.402 81.191 81.075 80.834 80.584 80.327 80.196 79.886 79.686 79.474 79.256 78.743 78.453 78.122 77.756 77.305 76.779 76.108 73.544 -4 ,31524 ,KEBNE ,17026331,Wed Dec 22 14:07:11 CET,Wed Dec 22 15:59:07 CET,0.0 1.185 1.714 2.145 2.489 2.811 3.135 3.451 4.067 4.352 4.612 4.83 5.308 5.532 5.962 6.379 6.782 6.983 7.396 7.783 8.335 8.708 9.07 9.595 10.1 10.59 11.079 11.559 12.18 12.796 13.404 14.151 14.901 15.646 16.509 17.485 18.458 19.552 20.759 22.093 23.528 25.161 27.108 29.073 31.432 34.226 37.563 41.46 46.259 52.276 60.024 67.015 71.611 74.803 77.027 78.66 79.852 80.717 81.323 81.849 82.233 82.538 82.784 82.932 83.004 83.066 83.112 83.092 83.039 82.987 82.923 82.852 82.763 82.639 82.524 82.397 82.259 82.111 81.945 81.826 81.691 81.472 81.321 81.142 81.041 80.831 80.596 80.313 80.152 79.814 79.58 79.36 79.154 78.584 78.226 77.842 77.424 76.977 76.436 75.686 73.671 -5 ,21506 ,KEBNE ,17026332,Wed Dec 22 14:07:11 CET,Wed Dec 22 15:57:12 CET,0.0 1.153 1.637 2.026 2.367 2.679 2.984 3.269 3.794 4.042 4.282 4.489 4.967 5.193 5.628 6.041 6.44 6.635 7.015 7.38 7.911 8.258 8.6 9.107 9.617 10.126 10.624 11.107 11.731 12.347 12.966 13.725 14.451 15.162 15.987 16.93 17.863 18.912 20.073 21.344 22.712 24.273 26.181 28.199 30.581 33.33 36.641 40.507 45.228 51.02 58.48 65.363 69.76 72.69 74.79 76.412 77.608 78.515 79.159 79.702 80.079 80.309 80.464 80.581 80.646 80.683 80.684 80.649 80.603 80.528 80.442 80.381 80.319 80.224 80.134 80.029 79.894 79.733 79.561 79.444 79.318 79.09 78.923 78.746 78.646 78.4 78.137 77.899 77.77 77.461 77.334 77.168 76.974 76.529 76.275 75.985 75.612 75.161 74.621 73.795 71.253 -6 ,14275 ,KEBNE ,17026333,Wed Dec 22 14:07:11 CET,Wed Dec 22 15:58:20 CET,0.0 1.176 1.64 2.012 2.362 2.681 2.982 3.266 3.8 4.063 4.326 4.61 5.108 5.33 5.765 6.168 6.57 6.768 7.143 7.51 8.059 8.427 8.779 9.301 9.824 10.327 10.823 11.314 11.958 12.587 13.19 13.92 14.633 15.338 16.171 17.132 18.066 19.104 20.257 21.514 22.865 24.427 26.304 28.245 30.576 33.239 36.419 40.232 44.886 50.649 58.154 64.721 68.993 72.057 74.243 75.752 76.802 77.598 78.163 78.624 78.947 79.189 79.355 79.431 79.423 79.388 79.372 79.364 79.299 79.172 79.028 78.914 78.817 78.698 78.573 78.417 78.225 78.008 77.785 77.631 77.459 77.179 76.981 76.762 76.639 76.366 76.051 75.716 75.545 75.189 74.967 74.742 74.469 73.837 73.496 73.125 72.719 72.254 71.705 70.982 67.919 -7 ,23805 ,KEBNE ,17026334,Wed Dec 22 14:07:11 CET,Wed Dec 22 15:58:50 CET,0.0 1.039 1.504 1.876 2.231 2.571 2.864 3.132 3.652 3.897 4.134 4.326 4.798 5.019 5.437 5.831 6.226 6.421 6.817 7.21 7.762 8.123 8.471 8.971 9.469 9.959 10.447 10.942 11.591 12.218 12.829 13.583 14.321 15.038 15.891 16.875 17.853 18.973 20.199 21.511 22.9 24.517 26.483 28.507 30.923 33.684 37.011 40.916 45.745 51.885 59.8 66.807 71.224 74.178 76.213 77.734 78.862 79.713 80.348 80.891 81.296 81.57 81.752 81.899 82.01 82.066 82.075 82.063 82.026 81.967 81.901 81.84 81.766 81.668 81.583 81.476 81.342 81.183 81.001 80.894 80.79 80.582 80.427 80.262 80.164 79.934 79.679 79.405 79.259 78.94 78.748 78.555 78.365 77.963 77.719 77.432 77.1 76.713 76.226 75.641 73.573 -8 ,3613 ,KEBNE ,17026335,Wed Dec 22 14:08:13 CET,Wed Dec 22 15:59:36 CET,0.0 0.93 1.377 1.763 2.102 2.403 2.705 2.997 3.528 3.769 4.016 4.258 4.73 4.945 5.358 5.764 6.155 6.344 6.73 7.097 7.62 7.974 8.333 8.875 9.392 9.883 10.369 10.86 11.499 12.112 12.727 13.487 14.222 14.958 15.818 16.786 17.72 18.765 19.929 21.199 22.577 24.157 26.033 27.966 30.311 33.035 36.317 40.208 45.023 51.084 58.993 65.979 70.337 73.288 75.429 76.999 78.098 78.95 79.567 80.061 80.409 80.663 80.836 80.964 81.079 81.143 81.162 81.148 81.124 81.099 81.049 80.981 80.894 80.786 80.685 80.567 80.434 80.272 80.078 79.938 79.776 79.531 79.377 79.173 79.043 78.748 78.421 78.088 77.918 77.584 77.421 77.236 77.038 76.588 76.322 76.006 75.63 75.208 74.655 73.833 71.057 -9 ,229 ,KEBNE ,17026336,Wed Dec 22 14:08:12 CET,Wed Dec 22 15:59:28 CET,0.0 1.099 1.561 1.944 2.315 2.658 2.969 3.252 3.762 3.998 4.234 4.463 4.95 5.17 5.599 6.028 6.434 6.633 7.014 7.383 7.928 8.291 8.653 9.18 9.686 10.175 10.662 11.146 11.782 12.416 13.045 13.807 14.549 15.27 16.12 17.097 18.066 19.153 20.333 21.639 23.073 24.71 26.64 28.626 31.009 33.793 37.175 41.146 45.945 51.87 59.549 66.573 71.141 74.139 76.137 77.621 78.672 79.451 80.026 80.488 80.783 80.997 81.188 81.326 81.413 81.445 81.456 81.452 81.421 81.382 81.322 81.244 81.135 80.998 80.861 80.697 80.538 80.364 80.152 79.997 79.84 79.558 79.353 79.149 79.042 78.822 78.598 78.363 78.227 77.92 77.778 77.591 77.371 76.882 76.62 76.32 75.952 75.518 74.998 74.255 71.817 -10 ,4630 ,KEBNE ,17026337,Wed Dec 22 14:08:13 CET,Wed Dec 22 15:59:07 CET,0.0 0.855 1.325 1.75 2.161 2.512 2.836 3.136 3.664 3.914 4.157 4.356 4.808 5.024 5.455 5.875 6.285 6.483 6.877 7.265 7.834 8.204 8.554 9.065 9.564 10.057 10.561 11.051 11.697 12.332 12.948 13.714 14.46 15.177 16.013 16.966 17.904 18.951 20.1 21.37 22.749 24.367 26.301 28.282 30.644 33.404 36.687 40.521 45.413 51.543 59.554 66.75 71.285 74.405 76.566 78.216 79.434 80.299 80.9 81.389 81.75 82.057 82.306 82.494 82.627 82.696 82.702 82.683 82.693 82.714 82.693 82.646 82.592 82.518 82.441 82.329 82.197 82.068 81.929 81.821 81.696 81.478 81.304 81.112 81.011 80.776 80.54 80.305 80.165 79.835 79.615 79.426 79.236 78.746 78.467 78.181 77.872 77.512 77.027 76.322 74.315 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index f19be214..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18434 ,KEBNE ,16723597,Sun Nov 28 03:11:41 CET,Sun Nov 28 05:03:04 CET,0.0 1.051 1.585 2.013 2.35 2.653 2.949 3.24 3.751 3.975 4.196 4.369 4.817 5.016 5.395 5.758 6.122 6.305 6.649 6.981 7.474 7.796 8.116 8.6 9.067 9.508 9.947 10.387 10.971 11.548 12.11 12.793 13.463 14.123 14.906 15.78 16.611 17.553 18.606 19.765 21.006 22.425 24.138 25.882 27.993 30.461 33.355 36.743 40.972 46.294 52.899 58.602 62.185 64.487 66.046 67.237 68.115 68.763 69.216 69.591 69.858 70.045 70.165 70.222 70.255 70.256 70.235 70.206 70.158 70.086 69.984 69.886 69.778 69.641 69.504 69.348 69.183 68.994 68.795 68.652 68.492 68.238 68.065 67.896 67.806 67.592 67.35 67.096 66.953 66.638 66.518 66.329 66.105 65.626 65.372 65.069 64.712 64.325 63.861 63.117 60.184 -2 ,28757 ,KEBNE ,16723598,Sun Nov 28 03:11:41 CET,Sun Nov 28 05:02:06 CET,0.0 1.164 1.701 2.094 2.418 2.729 3.019 3.266 3.723 3.95 4.174 4.366 4.821 5.012 5.406 5.796 6.172 6.363 6.741 7.1 7.623 7.968 8.302 8.78 9.241 9.709 10.164 10.59 11.16 11.73 12.282 12.965 13.642 14.295 15.06 15.949 16.807 17.755 18.812 19.958 21.186 22.622 24.362 26.16 28.293 30.75 33.714 37.139 41.255 46.281 52.637 58.121 61.456 63.661 65.071 66.01 66.651 67.09 67.389 67.609 67.71 67.774 67.784 67.724 67.604 67.457 67.338 67.206 67.064 66.918 66.765 66.636 66.482 66.292 66.143 65.997 65.833 65.63 65.412 65.25 65.065 64.784 64.6 64.389 64.265 64.028 63.786 63.512 63.356 62.994 62.779 62.547 62.29 61.749 61.436 61.058 60.653 60.217 59.625 58.748 56.537 -3 ,24914 ,KEBNE ,16723599,Sun Nov 28 03:11:41 CET,Sun Nov 28 05:01:32 CET,0.0 1.082 1.598 2.033 2.386 2.718 3.027 3.296 3.812 4.06 4.291 4.485 4.949 5.153 5.535 5.913 6.296 6.479 6.833 7.188 7.713 8.044 8.362 8.834 9.294 9.746 10.186 10.618 11.182 11.727 12.282 12.99 13.675 14.329 15.102 15.996 16.868 17.842 18.924 20.113 21.369 22.788 24.532 26.341 28.489 30.934 33.845 37.286 41.399 46.414 53.017 58.948 62.455 64.72 66.207 67.171 67.851 68.365 68.689 68.922 69.091 69.182 69.197 69.178 69.115 69.023 68.899 68.774 68.678 68.551 68.375 68.199 68.008 67.793 67.613 67.422 67.23 67.044 66.812 66.638 66.47 66.173 65.926 65.649 65.512 65.218 64.877 64.513 64.322 63.949 63.707 63.463 63.207 62.662 62.343 61.971 61.535 61.013 60.407 59.56 56.814 -4 ,6216 ,KEBNE ,16723600,Sun Nov 28 03:11:41 CET,Sun Nov 28 05:03:05 CET,0.0 1.154 1.698 2.126 2.487 2.814 3.108 3.387 3.908 4.143 4.372 4.568 5.033 5.245 5.667 6.082 6.477 6.661 7.011 7.36 7.874 8.218 8.562 9.057 9.531 10.005 10.472 10.916 11.493 12.071 12.629 13.301 13.962 14.611 15.38 16.275 17.141 18.098 19.147 20.267 21.482 22.901 24.586 26.312 28.407 30.812 33.65 36.954 40.999 46.054 52.588 58.298 61.733 63.94 65.418 66.509 67.281 67.797 68.13 68.383 68.517 68.561 68.566 68.579 68.55 68.472 68.356 68.228 68.117 67.995 67.838 67.685 67.515 67.341 67.21 67.048 66.87 66.689 66.476 66.33 66.198 65.973 65.802 65.606 65.499 65.273 65.03 64.759 64.607 64.267 64.138 63.97 63.778 63.329 63.052 62.735 62.4 62.038 61.639 60.989 58.328 -5 ,29955 ,KEBNE ,16723601,Sun Nov 28 03:11:41 CET,Sun Nov 28 05:01:54 CET,0.0 1.085 1.574 1.959 2.303 2.623 2.917 3.188 3.677 3.91 4.149 4.346 4.803 5.002 5.389 5.769 6.152 6.332 6.683 7.033 7.54 7.873 8.198 8.67 9.137 9.591 10.034 10.47 11.044 11.602 12.144 12.822 13.492 14.145 14.903 15.778 16.648 17.618 18.689 19.838 21.076 22.52 24.236 25.999 28.117 30.556 33.4 36.721 40.74 45.551 51.588 56.951 60.391 62.684 64.181 65.248 66.05 66.617 67.009 67.324 67.501 67.601 67.669 67.7 67.674 67.617 67.534 67.435 67.332 67.225 67.108 67.002 66.881 66.726 66.608 66.484 66.336 66.153 65.954 65.817 65.669 65.448 65.294 65.108 65.004 64.796 64.577 64.322 64.183 63.85 63.706 63.511 63.286 62.793 62.516 62.224 61.898 61.477 60.969 60.274 58.043 -6 ,8816 ,KEBNE ,16723602,Sun Nov 28 03:11:40 CET,Sun Nov 28 05:02:36 CET,0.0 1.091 1.575 1.966 2.309 2.606 2.89 3.168 3.7 3.944 4.171 4.346 4.808 5.014 5.416 5.793 6.156 6.335 6.688 7.023 7.51 7.835 8.161 8.651 9.146 9.629 10.084 10.532 11.137 11.722 12.277 12.953 13.636 14.299 15.069 15.949 16.786 17.727 18.787 19.939 21.177 22.568 24.191 25.886 27.924 30.2 32.848 35.947 39.788 44.542 50.565 55.792 58.974 61.117 62.623 63.675 64.412 64.958 65.311 65.578 65.764 65.871 65.934 65.949 65.91 65.85 65.738 65.588 65.429 65.253 65.077 64.889 64.639 64.377 64.195 64.01 63.798 63.564 63.314 63.152 62.964 62.631 62.399 62.158 62.031 61.743 61.432 61.103 60.935 60.576 60.334 60.11 59.858 59.251 58.934 58.62 58.231 57.756 57.114 56.232 53.644 -7 ,31545 ,KEBNE ,16723603,Sun Nov 28 03:11:40 CET,Sun Nov 28 05:02:09 CET,0.0 0.894 1.34 1.71 2.015 2.299 2.564 2.817 3.295 3.514 3.739 3.918 4.36 4.558 4.947 5.305 5.65 5.828 6.184 6.532 7.036 7.367 7.686 8.153 8.629 9.094 9.533 9.952 10.493 11.027 11.547 12.191 12.84 13.484 14.234 15.077 15.899 16.836 17.87 18.971 20.143 21.481 23.103 24.796 26.795 29.104 31.861 35.047 38.957 43.868 50.188 55.655 58.997 61.215 62.722 63.807 64.551 65.037 65.358 65.6 65.717 65.772 65.785 65.77 65.733 65.69 65.623 65.543 65.466 65.366 65.247 65.129 64.975 64.818 64.701 64.58 64.448 64.28 64.076 63.921 63.766 63.535 63.346 63.143 63.054 62.848 62.603 62.345 62.202 61.86 61.689 61.503 61.316 60.872 60.588 60.28 59.952 59.524 58.98 58.293 56.225 -8 ,8793 ,KEBNE ,16723604,Sun Nov 28 03:11:41 CET,Sun Nov 28 05:02:30 CET,0.0 1.322 1.831 2.222 2.575 2.879 3.169 3.436 3.946 4.19 4.414 4.59 5.047 5.251 5.64 6.022 6.398 6.578 6.93 7.279 7.785 8.107 8.425 8.908 9.395 9.852 10.287 10.717 11.272 11.823 12.364 13.029 13.685 14.33 15.071 15.906 16.751 17.706 18.773 19.929 21.163 22.61 24.345 26.1 28.182 30.597 33.455 36.779 40.832 45.812 52.24 57.972 61.494 63.793 65.347 66.46 67.243 67.809 68.17 68.424 68.53 68.57 68.598 68.575 68.519 68.456 68.367 68.229 68.067 67.888 67.702 67.52 67.331 67.151 66.979 66.796 66.611 66.421 66.213 66.048 65.884 65.628 65.448 65.231 65.106 64.855 64.583 64.281 64.125 63.784 63.629 63.428 63.201 62.694 62.42 62.133 61.771 61.322 60.791 60.065 57.451 -9 ,11450 ,KEBNE ,16723605,Sun Nov 28 03:11:41 CET,Sun Nov 28 05:02:45 CET,0.0 1.071 1.532 1.91 2.232 2.508 2.774 3.042 3.588 3.839 4.068 4.258 4.71 4.912 5.318 5.693 6.059 6.24 6.583 6.919 7.424 7.749 8.066 8.532 8.979 9.411 9.834 10.257 10.803 11.346 11.892 12.557 13.204 13.851 14.627 15.521 16.384 17.313 18.319 19.434 20.652 22.033 23.662 25.34 27.367 29.679 32.375 35.526 39.433 44.149 50.012 55.35 58.626 60.705 62.109 63.096 63.751 64.195 64.512 64.788 64.986 65.058 65.065 65.041 64.982 64.892 64.787 64.689 64.587 64.448 64.289 64.176 64.051 63.883 63.716 63.534 63.358 63.182 62.974 62.805 62.623 62.329 62.134 61.933 61.819 61.58 61.312 61.011 60.851 60.514 60.358 60.162 59.957 59.475 59.195 58.901 58.559 58.148 57.652 56.967 54.661 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index e6117e4b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,9590 ,KEBNE ,16723608,Sun Nov 28 03:11:41 CET,Sun Nov 28 05:03:40 CET,0.0 1.098 1.592 2.004 2.368 2.649 2.901 3.152 3.647 3.879 4.093 4.253 4.703 4.904 5.297 5.663 6.015 6.185 6.51 6.824 7.293 7.608 7.915 8.362 8.798 9.218 9.623 10.022 10.549 11.066 11.57 12.201 12.814 13.41 14.129 14.947 15.736 16.626 17.613 18.676 19.822 21.145 22.711 24.3 26.177 28.352 30.934 33.994 37.799 42.471 48.44 53.693 56.98 59.2 60.784 61.961 62.779 63.33 63.723 64.053 64.248 64.364 64.435 64.459 64.442 64.403 64.352 64.288 64.208 64.117 64.017 63.904 63.75 63.576 63.416 63.235 63.077 62.927 62.749 62.623 62.477 62.228 62.048 61.846 61.738 61.507 61.26 60.966 60.8 60.462 60.292 60.094 59.893 59.389 59.091 58.783 58.433 58.032 57.482 56.681 54.25 -3 ,24256 ,KEBNE ,16723609,Sun Nov 28 03:12:42 CET,Sun Nov 28 05:03:43 CET,0.0 1.007 1.444 1.84 2.197 2.506 2.783 3.039 3.508 3.723 3.935 4.091 4.538 4.737 5.11 5.473 5.826 6.001 6.355 6.701 7.196 7.509 7.814 8.27 8.702 9.117 9.53 9.943 10.475 10.992 11.513 12.15 12.756 13.336 14.029 14.836 15.633 16.534 17.521 18.562 19.655 20.934 22.492 24.096 26.018 28.228 30.878 33.96 37.707 42.385 48.269 53.306 56.446 58.6 60.117 61.163 61.891 62.424 62.784 63.073 63.244 63.361 63.46 63.489 63.462 63.426 63.366 63.269 63.154 63.03 62.91 62.815 62.7 62.568 62.459 62.33 62.195 62.045 61.866 61.743 61.624 61.424 61.279 61.118 61.034 60.844 60.606 60.339 60.19 59.859 59.737 59.574 59.408 59.036 58.801 58.496 58.185 57.843 57.415 56.844 54.637 -4 ,17830 ,KEBNE ,16723610,Sun Nov 28 03:12:42 CET,Sun Nov 28 05:04:23 CET,0.0 0.883 1.367 1.772 2.118 2.429 2.726 2.991 3.476 3.716 3.936 4.11 4.561 4.756 5.13 5.49 5.825 5.985 6.311 6.643 7.117 7.419 7.709 8.14 8.579 9.0 9.414 9.821 10.35 10.875 11.391 12.029 12.649 13.255 13.976 14.776 15.547 16.411 17.367 18.397 19.511 20.804 22.337 23.916 25.829 28.027 30.589 33.591 37.266 41.746 47.44 52.401 55.499 57.632 59.115 60.215 61.019 61.64 62.086 62.443 62.651 62.773 62.87 62.942 62.966 62.95 62.898 62.828 62.745 62.615 62.467 62.339 62.195 62.035 61.887 61.714 61.535 61.353 61.14 60.998 60.871 60.67 60.52 60.344 60.245 60.047 59.83 59.538 59.36 59.006 58.843 58.657 58.479 58.089 57.847 57.583 57.269 56.84 56.333 55.685 53.373 -6 ,4232 ,KEBNE ,16723612,Sun Nov 28 03:12:42 CET,Sun Nov 28 05:04:17 CET,0.0 1.172 1.65 2.056 2.41 2.706 2.971 3.225 3.707 3.935 4.157 4.352 4.819 5.028 5.408 5.765 6.126 6.307 6.657 6.992 7.466 7.778 8.098 8.575 9.025 9.465 9.895 10.307 10.845 11.376 11.892 12.527 13.143 13.738 14.449 15.255 16.033 16.925 17.926 19.004 20.158 21.465 23.005 24.614 26.552 28.747 31.377 34.465 38.275 43.036 49.039 54.334 57.604 59.813 61.364 62.516 63.34 63.921 64.315 64.634 64.852 64.985 65.068 65.107 65.11 65.082 65.047 65.025 64.977 64.9 64.787 64.662 64.516 64.348 64.191 63.999 63.784 63.577 63.383 63.248 63.104 62.866 62.694 62.506 62.404 62.204 61.986 61.711 61.553 61.212 61.084 60.926 60.728 60.216 59.932 59.614 59.238 58.807 58.262 57.476 55.135 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index d6da73a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4727 ,KEBNE ,16723617,Sun Nov 28 03:12:41 CET,Sun Nov 28 05:04:21 CET,0.0 1.66 2.161 2.59 2.952 3.283 3.583 3.868 4.416 4.664 4.88 5.069 5.491 5.679 6.061 6.417 6.753 6.911 7.215 7.519 7.949 8.217 8.477 8.873 9.264 9.64 9.996 10.33 10.746 11.148 11.541 12.007 12.465 12.909 13.402 13.954 14.504 15.133 15.812 16.521 17.245 18.039 18.988 19.942 21.047 22.329 23.729 25.178 26.928 28.874 30.776 31.532 31.419 30.979 30.386 29.741 29.117 28.479 27.869 27.236 26.668 26.139 25.622 25.129 24.668 24.256 23.797 23.346 22.957 22.548 22.102 21.728 21.34 20.922 20.59 20.24 19.871 19.507 19.124 18.851 18.572 18.125 17.812 17.494 17.335 16.999 16.619 16.21 15.982 15.538 15.244 14.965 14.674 14.033 13.676 13.279 12.823 12.225 11.421 10.371 6.116 -2 ,7638 ,KEBNE ,16723618,Sun Nov 28 03:12:42 CET,Sun Nov 28 05:03:39 CET,0.0 2.064 2.648 3.095 3.47 3.775 4.071 4.352 4.879 5.119 5.347 5.557 5.98 6.174 6.547 6.895 7.223 7.389 7.707 7.992 8.4 8.662 8.913 9.261 9.584 9.911 10.25 10.581 11.008 11.428 11.826 12.322 12.805 13.258 13.773 14.341 14.905 15.534 16.209 16.914 17.647 18.483 19.46 20.399 21.45 22.637 24.023 25.59 27.404 29.239 30.924 31.796 31.78 31.445 31.003 30.518 30.089 29.588 29.099 28.567 28.059 27.591 27.149 26.725 26.285 25.853 25.411 25.006 24.651 24.296 23.917 23.573 23.195 22.8 22.487 22.169 21.837 21.49 21.138 20.885 20.614 20.219 19.949 19.645 19.478 19.125 18.733 18.314 18.1 17.662 17.404 17.138 16.856 16.253 15.898 15.499 15.059 14.506 13.828 12.96 9.381 -3 ,30987 ,KEBNE ,16723619,Sun Nov 28 03:12:42 CET,Sun Nov 28 05:04:23 CET,0.0 1.844 2.445 2.848 3.2 3.528 3.846 4.15 4.698 4.963 5.21 5.427 5.851 6.036 6.386 6.729 7.063 7.224 7.536 7.831 8.25 8.534 8.814 9.215 9.609 9.979 10.34 10.697 11.15 11.594 12.023 12.532 13.005 13.456 13.996 14.584 15.146 15.801 16.53 17.287 18.075 18.935 19.955 21.021 22.235 23.58 25.038 26.522 28.141 29.768 31.28 32.088 32.161 31.822 31.373 30.823 30.202 29.607 29.043 28.431 27.895 27.421 26.948 26.472 26.014 25.571 25.081 24.648 24.273 23.867 23.433 23.059 22.672 22.263 21.94 21.603 21.268 20.93 20.561 20.297 20.024 19.613 19.308 18.973 18.803 18.441 18.054 17.663 17.454 17.021 16.765 16.519 16.24 15.617 15.287 14.936 14.472 13.888 13.242 12.326 8.841 -4 ,24824 ,KEBNE ,16723620,Sun Nov 28 03:12:42 CET,Sun Nov 28 05:04:28 CET,0.0 1.587 2.167 2.577 2.943 3.294 3.614 3.899 4.424 4.666 4.896 5.127 5.574 5.772 6.141 6.495 6.825 6.989 7.3 7.589 8.021 8.304 8.566 8.937 9.303 9.648 10.003 10.359 10.829 11.293 11.727 12.262 12.786 13.283 13.866 14.551 15.197 15.873 16.593 17.353 18.159 19.099 20.179 21.234 22.47 23.815 25.295 26.805 28.313 29.786 30.966 31.289 31.085 30.65 30.13 29.524 28.838 28.13 27.553 27.02 26.54 26.094 25.648 25.197 24.757 24.316 23.825 23.379 22.991 22.584 22.16 21.819 21.478 21.134 20.848 20.54 20.224 19.862 19.462 19.179 18.896 18.479 18.164 17.829 17.659 17.303 16.924 16.521 16.308 15.874 15.581 15.312 15.026 14.386 13.975 13.483 12.929 12.306 11.54 10.43 6.346 -6 ,18118 ,KEBNE ,16723622,Sun Nov 28 03:12:42 CET,Sun Nov 28 05:04:37 CET,0.0 1.023 1.517 1.938 2.305 2.639 2.92 3.18 3.676 3.903 4.116 4.287 4.686 4.871 5.239 5.561 5.874 6.024 6.291 6.544 6.91 7.148 7.389 7.748 8.091 8.426 8.744 9.048 9.458 9.859 10.233 10.675 11.107 11.522 11.999 12.551 13.087 13.693 14.34 14.986 15.69 16.528 17.452 18.321 19.387 20.59 21.88 23.248 24.844 26.577 28.33 29.365 29.56 29.409 29.075 28.682 28.301 27.902 27.495 27.026 26.594 26.139 25.668 25.238 24.851 24.51 24.12 23.751 23.44 23.104 22.727 22.401 22.055 21.702 21.444 21.19 20.929 20.646 20.333 20.1 19.847 19.436 19.14 18.842 18.691 18.369 18.02 17.646 17.451 17.016 16.736 16.474 16.196 15.596 15.26 14.902 14.517 14.067 13.47 12.602 8.086 -7 ,1442 ,KEBNE ,16723623,Sun Nov 28 03:13:43 CET,Sun Nov 28 05:06:30 CET,0.0 1.485 2.015 2.423 2.772 3.114 3.436 3.715 4.229 4.471 4.692 4.886 5.306 5.498 5.866 6.24 6.588 6.748 7.054 7.352 7.771 8.047 8.333 8.732 9.109 9.469 9.816 10.173 10.629 11.042 11.444 11.95 12.443 12.923 13.461 14.035 14.6 15.23 15.912 16.663 17.478 18.38 19.379 20.348 21.45 22.712 24.246 25.84 27.461 29.302 31.167 32.063 32.221 31.962 31.457 30.81 30.128 29.477 28.89 28.259 27.689 27.211 26.752 26.279 25.798 25.328 24.841 24.416 24.05 23.671 23.265 22.911 22.545 22.152 21.836 21.508 21.154 20.786 20.402 20.126 19.841 19.409 19.106 18.766 18.592 18.234 17.825 17.395 17.165 16.707 16.421 16.147 15.837 15.151 14.764 14.334 13.857 13.33 12.699 11.775 8.078 -8 ,29528 ,KEBNE ,16723624,Sun Nov 28 03:13:42 CET,Sun Nov 28 05:04:23 CET,0.0 1.393 2.019 2.489 2.849 3.16 3.445 3.705 4.204 4.466 4.718 4.939 5.364 5.56 5.935 6.299 6.649 6.811 7.121 7.427 7.884 8.179 8.463 8.872 9.255 9.625 9.992 10.352 10.817 11.264 11.696 12.226 12.745 13.237 13.803 14.424 15.001 15.632 16.323 17.078 17.89 18.792 19.816 20.866 22.108 23.469 24.979 26.542 28.248 30.09 31.953 32.892 32.9 32.605 32.136 31.522 30.939 30.363 29.82 29.25 28.736 28.257 27.764 27.277 26.816 26.401 25.945 25.506 25.136 24.759 24.324 23.941 23.54 23.119 22.794 22.455 22.112 21.755 21.398 21.15 20.87 20.415 20.1 19.777 19.609 19.246 18.869 18.465 18.242 17.79 17.5 17.256 16.99 16.347 15.998 15.634 15.169 14.596 13.884 12.941 9.238 -9 ,19849 ,KEBNE ,16723625,Sun Nov 28 03:13:43 CET,Sun Nov 28 05:05:14 CET,0.0 1.841 2.542 3.086 3.507 3.878 4.233 4.573 5.186 5.453 5.682 5.866 6.285 6.481 6.856 7.192 7.495 7.638 7.915 8.18 8.553 8.8 9.052 9.423 9.782 10.131 10.472 10.799 11.207 11.594 11.974 12.449 12.92 13.385 13.894 14.437 14.978 15.574 16.2 16.875 17.63 18.499 19.494 20.516 21.668 22.842 24.205 25.678 27.34 29.051 30.324 30.73 30.496 30.084 29.62 29.102 28.574 28.034 27.508 26.923 26.403 25.911 25.393 24.871 24.34 23.844 23.359 22.94 22.551 22.129 21.714 21.372 20.984 20.557 20.228 19.905 19.577 19.22 18.841 18.582 18.314 17.895 17.586 17.251 17.076 16.717 16.323 15.893 15.685 15.258 14.955 14.678 14.412 13.811 13.44 13.031 12.596 12.098 11.464 10.499 5.99 -10 ,32436 ,KEBNE ,16723626,Sun Nov 28 03:13:43 CET,Sun Nov 28 05:06:23 CET,0.0 2.104 2.725 3.193 3.578 3.904 4.206 4.504 5.036 5.267 5.494 5.707 6.148 6.354 6.751 7.122 7.444 7.608 7.924 8.208 8.629 8.917 9.215 9.644 10.025 10.365 10.696 11.037 11.494 11.938 12.348 12.822 13.259 13.675 14.197 14.797 15.355 15.959 16.606 17.338 18.107 18.944 19.92 20.894 22.026 23.264 24.631 26.003 27.491 29.294 31.106 31.963 31.925 31.425 30.877 30.335 29.71 29.044 28.462 27.902 27.39 26.886 26.403 25.947 25.513 25.115 24.691 24.295 23.947 23.585 23.196 22.864 22.499 22.103 21.791 21.463 21.127 20.772 20.389 20.123 19.819 19.346 19.058 18.75 18.578 18.227 17.858 17.456 17.243 16.805 16.501 16.233 15.96 15.315 14.918 14.484 14.01 13.408 12.665 11.645 7.837 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 29b92c7a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19161 ,KEBNE ,17026338,Wed Dec 22 14:08:12 CET,Wed Dec 22 15:59:39 CET,0.0 1.39 1.909 2.27 2.568 2.84 3.08 3.287 3.684 3.881 4.058 4.151 4.532 4.679 4.95 5.203 5.46 5.582 5.81 6.026 6.321 6.512 6.708 6.993 7.249 7.481 7.72 7.963 8.266 8.55 8.833 9.165 9.467 9.762 10.111 10.504 10.871 11.267 11.674 12.095 12.536 13.017 13.574 14.134 14.753 15.408 16.111 16.807 17.632 18.617 19.408 19.502 19.229 18.738 18.166 17.577 17.036 16.525 16.042 15.519 15.05 14.623 14.179 13.747 13.348 12.977 12.596 12.237 11.904 11.567 11.22 10.937 10.636 10.302 10.036 9.755 9.458 9.148 8.833 8.608 8.365 7.974 7.707 7.436 7.293 6.993 6.683 6.349 6.154 5.734 5.558 5.337 5.1 4.561 4.244 3.899 3.514 3.074 2.541 1.821 -1.09 -2 ,20998 ,KEBNE ,17026339,Wed Dec 22 14:08:12 CET,Wed Dec 22 15:59:31 CET,0.0 1.405 1.921 2.302 2.587 2.829 3.053 3.279 3.728 3.923 4.096 4.193 4.567 4.711 4.991 5.255 5.516 5.642 5.878 6.107 6.43 6.634 6.833 7.116 7.387 7.649 7.9 8.134 8.443 8.754 9.044 9.4 9.754 10.083 10.458 10.878 11.268 11.694 12.153 12.632 13.111 13.636 14.251 14.844 15.511 16.282 17.153 18.026 18.943 19.9 20.707 20.87 20.529 19.996 19.406 18.792 18.199 17.625 17.117 16.593 16.135 15.703 15.261 14.831 14.412 14.033 13.629 13.249 12.915 12.574 12.214 11.893 11.559 11.2 10.912 10.631 10.338 10.037 9.72 9.491 9.265 8.902 8.627 8.342 8.199 7.898 7.569 7.222 7.039 6.615 6.383 6.128 5.849 5.248 4.892 4.465 3.993 3.483 2.866 2.041 -1.129 -3 ,1196 ,KEBNE ,17026340,Wed Dec 22 14:08:12 CET,Wed Dec 22 15:59:28 CET,0.0 1.371 1.846 2.223 2.522 2.758 2.98 3.184 3.574 3.76 3.931 4.017 4.394 4.533 4.794 5.045 5.274 5.386 5.627 5.857 6.155 6.354 6.549 6.822 7.079 7.325 7.564 7.791 8.089 8.379 8.647 8.967 9.284 9.586 9.926 10.292 10.649 11.042 11.433 11.835 12.276 12.775 13.348 13.892 14.493 15.149 15.869 16.587 17.339 18.124 18.681 18.706 18.424 17.969 17.468 16.92 16.388 15.891 15.433 14.959 14.492 14.071 13.677 13.29 12.922 12.573 12.201 11.855 11.56 11.251 10.925 10.649 10.335 10.001 9.74 9.459 9.182 8.888 8.556 8.331 8.097 7.743 7.491 7.214 7.069 6.777 6.479 6.161 5.986 5.579 5.407 5.198 4.976 4.499 4.221 3.905 3.567 3.173 2.674 1.952 -0.524 -4 ,19300 ,KEBNE ,17026341,Wed Dec 22 14:08:13 CET,Wed Dec 22 15:59:19 CET,0.0 0.987 1.421 1.739 2.026 2.298 2.534 2.742 3.116 3.295 3.46 3.53 3.899 4.042 4.314 4.568 4.821 4.94 5.155 5.354 5.645 5.835 6.015 6.276 6.527 6.785 7.036 7.274 7.582 7.871 8.148 8.484 8.808 9.111 9.457 9.833 10.185 10.588 11.029 11.474 11.93 12.435 13.011 13.596 14.256 14.951 15.695 16.494 17.317 18.102 18.725 18.773 18.455 17.965 17.367 16.758 16.183 15.671 15.21 14.712 14.26 13.833 13.411 13.001 12.615 12.26 11.879 11.523 11.211 10.89 10.558 10.269 9.957 9.643 9.402 9.156 8.894 8.598 8.27 8.039 7.808 7.449 7.197 6.928 6.787 6.49 6.168 5.816 5.635 5.222 5.031 4.819 4.599 4.119 3.834 3.507 3.149 2.729 2.175 1.404 -1.584 -5 ,5373 ,KEBNE ,17026342,Wed Dec 22 14:08:13 CET,Wed Dec 22 15:59:04 CET,0.0 1.524 2.023 2.385 2.691 2.999 3.275 3.525 3.976 4.173 4.359 4.477 4.87 5.026 5.328 5.622 5.894 6.028 6.284 6.527 6.895 7.129 7.345 7.66 7.963 8.259 8.561 8.837 9.159 9.473 9.779 10.14 10.492 10.828 11.218 11.664 12.084 12.52 12.981 13.476 13.992 14.554 15.188 15.818 16.545 17.335 18.201 19.066 19.92 20.718 21.355 21.37 20.907 20.241 19.56 18.888 18.215 17.55 16.972 16.357 15.785 15.269 14.787 14.317 13.855 13.449 13.025 12.619 12.262 11.89 11.471 11.091 10.689 10.263 9.928 9.581 9.208 8.812 8.402 8.125 7.842 7.389 7.065 6.736 6.57 6.223 5.852 5.447 5.238 4.805 4.561 4.321 4.061 3.491 3.188 2.826 2.432 2.021 1.494 0.79 -2.292 -6 ,23880 ,KEBNE ,17026343,Wed Dec 22 14:08:13 CET,Wed Dec 22 16:00:13 CET,0.0 2.054 2.597 2.957 3.278 3.548 3.803 4.053 4.477 4.678 4.867 4.985 5.363 5.497 5.787 6.08 6.327 6.431 6.631 6.834 7.125 7.309 7.489 7.75 8.003 8.24 8.471 8.708 9.013 9.319 9.608 9.934 10.247 10.548 10.881 11.244 11.589 11.959 12.363 12.795 13.233 13.723 14.287 14.822 15.428 16.103 16.866 17.67 18.492 19.316 20.008 20.061 19.689 19.181 18.649 18.09 17.553 17.033 16.558 16.024 15.53 15.077 14.624 14.205 13.826 13.478 13.098 12.745 12.433 12.102 11.75 11.467 11.172 10.851 10.59 10.303 9.999 9.689 9.379 9.157 8.914 8.499 8.215 7.929 7.77 7.432 7.074 6.685 6.483 6.057 5.813 5.559 5.298 4.764 4.459 4.097 3.673 3.128 2.446 1.572 -1.514 -7 ,20495 ,KEBNE ,17026344,Wed Dec 22 14:08:12 CET,Wed Dec 22 15:59:35 CET,0.0 1.143 1.585 1.958 2.256 2.534 2.798 3.038 3.497 3.713 3.913 4.043 4.427 4.586 4.885 5.182 5.479 5.628 5.907 6.166 6.548 6.787 7.023 7.367 7.694 8.012 8.319 8.618 9.013 9.383 9.728 10.111 10.446 10.764 11.135 11.567 11.966 12.389 12.854 13.339 13.853 14.425 15.075 15.722 16.46 17.253 18.074 18.922 19.864 20.781 21.502 21.65 21.244 20.601 19.988 19.418 18.865 18.29 17.729 17.169 16.666 16.184 15.708 15.257 14.836 14.446 14.03 13.642 13.309 12.963 12.594 12.28 11.946 11.578 11.289 11.0 10.699 10.39 10.067 9.838 9.6 9.238 8.989 8.727 8.589 8.277 7.881 7.47 7.281 6.863 6.662 6.434 6.207 5.706 5.418 5.101 4.722 4.274 3.768 3.0 0.184 -8 ,32651 ,KEBNE ,17026345,Wed Dec 22 14:08:13 CET,Wed Dec 22 15:59:02 CET,0.0 1.405 1.912 2.297 2.602 2.865 3.098 3.317 3.721 3.899 4.066 4.168 4.554 4.716 5.002 5.269 5.526 5.641 5.857 6.062 6.355 6.553 6.746 7.003 7.246 7.492 7.734 7.967 8.282 8.58 8.84 9.148 9.457 9.751 10.086 10.455 10.799 11.175 11.564 11.976 12.419 12.921 13.491 14.057 14.694 15.351 16.077 16.865 17.744 18.689 19.477 19.681 19.434 18.969 18.442 17.887 17.368 16.88 16.447 15.982 15.541 15.141 14.728 14.338 13.983 13.652 13.296 12.958 12.665 12.357 12.02 11.748 11.45 11.1 10.829 10.556 10.254 9.908 9.55 9.315 9.066 8.673 8.403 8.125 7.975 7.649 7.31 6.95 6.76 6.348 6.172 5.956 5.714 5.098 4.741 4.39 3.978 3.528 2.996 2.174 -0.633 -9 ,16814 ,KEBNE ,17026346,Wed Dec 22 14:08:13 CET,Wed Dec 22 15:59:31 CET,0.0 1.259 1.741 2.088 2.352 2.605 2.851 3.068 3.434 3.602 3.765 3.853 4.236 4.395 4.704 5.003 5.265 5.382 5.609 5.822 6.137 6.339 6.528 6.8 7.063 7.32 7.573 7.817 8.108 8.377 8.637 8.943 9.245 9.542 9.891 10.28 10.636 11.03 11.474 11.938 12.406 12.909 13.456 14.002 14.618 15.272 15.987 16.722 17.474 18.194 18.777 18.771 18.4 17.932 17.424 16.871 16.295 15.73 15.226 14.675 14.168 13.713 13.276 12.863 12.455 12.063 11.662 11.308 10.988 10.63 10.244 9.918 9.593 9.251 8.981 8.7 8.396 8.094 7.782 7.555 7.316 6.946 6.673 6.384 6.24 5.949 5.625 5.263 5.075 4.66 4.461 4.238 3.994 3.473 3.179 2.838 2.437 1.96 1.384 0.61 -2.046 -10 ,6515 ,KEBNE ,17026347,Wed Dec 22 14:08:13 CET,Wed Dec 22 15:59:13 CET,0.0 1.374 1.892 2.258 2.562 2.829 3.091 3.359 3.858 4.088 4.299 4.472 4.889 5.072 5.393 5.68 5.966 6.11 6.391 6.664 7.062 7.312 7.559 7.909 8.229 8.532 8.833 9.137 9.54 9.915 10.245 10.61 10.963 11.306 11.688 12.127 12.55 12.988 13.447 13.959 14.479 15.025 15.646 16.245 16.946 17.736 18.604 19.491 20.389 21.178 21.746 21.808 21.437 20.874 20.3 19.696 19.065 18.49 18.0 17.484 17.013 16.588 16.137 15.659 15.219 14.818 14.424 14.096 13.793 13.457 13.11 12.822 12.51 12.188 11.946 11.694 11.422 11.132 10.822 10.592 10.352 9.99 9.721 9.424 9.273 8.951 8.608 8.262 8.083 7.668 7.48 7.263 7.03 6.513 6.227 5.896 5.496 5.012 4.441 3.715 1.395 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index 4fe0bb2a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14561 ,KEBNE ,17026348,Wed Dec 22 14:08:13 CET,Wed Dec 22 15:59:48 CET,0.0 0.938 1.367 1.719 2.031 2.312 2.563 2.793 3.195 3.374 3.554 3.676 4.062 4.214 4.512 4.794 5.061 5.189 5.443 5.693 6.055 6.293 6.516 6.835 7.147 7.446 7.746 8.045 8.428 8.792 9.157 9.616 10.062 10.478 10.945 11.481 12.014 12.61 13.254 13.935 14.648 15.468 16.453 17.443 18.577 19.824 21.265 22.898 24.834 27.146 29.834 31.939 33.097 33.655 33.858 33.899 33.773 33.571 33.327 33.002 32.698 32.386 32.088 31.823 31.573 31.34 31.074 30.784 30.523 30.25 29.938 29.673 29.383 29.074 28.838 28.586 28.316 28.029 27.721 27.502 27.27 26.917 26.662 26.383 26.239 25.94 25.593 25.213 25.031 24.632 24.422 24.191 23.937 23.35 23.003 22.615 22.186 21.65 21.001 20.226 16.42 -2 ,14627 ,KEBNE ,17026349,Wed Dec 22 14:08:13 CET,Wed Dec 22 15:59:29 CET,0.0 0.92 1.353 1.725 2.041 2.308 2.547 2.78 3.195 3.401 3.609 3.752 4.161 4.33 4.647 4.948 5.251 5.4 5.679 5.939 6.305 6.549 6.789 7.125 7.443 7.755 8.064 8.365 8.749 9.117 9.472 9.9 10.318 10.721 11.189 11.713 12.214 12.767 13.377 14.054 14.77 15.562 16.486 17.417 18.515 19.732 21.161 22.792 24.65 26.859 29.549 31.641 32.698 33.149 33.316 33.362 33.264 33.07 32.834 32.541 32.254 31.998 31.732 31.436 31.127 30.859 30.596 30.353 30.132 29.851 29.512 29.257 29.002 28.706 28.474 28.191 27.829 27.48 27.162 26.941 26.709 26.316 26.036 25.758 25.611 25.299 24.962 24.612 24.431 24.025 23.779 23.544 23.309 22.689 22.337 22.016 21.686 21.266 20.747 19.979 16.381 -3 ,1067 ,KEBNE ,17026350,Wed Dec 22 14:09:13 CET,Wed Dec 22 16:01:43 CET,0.0 0.858 1.328 1.7 2.031 2.342 2.621 2.882 3.319 3.513 3.701 3.802 4.193 4.348 4.649 4.937 5.221 5.359 5.63 5.899 6.276 6.515 6.746 7.069 7.382 7.689 8.002 8.323 8.733 9.118 9.479 9.899 10.306 10.721 11.216 11.753 12.256 12.823 13.453 14.141 14.851 15.636 16.58 17.517 18.591 19.799 21.181 22.759 24.666 26.892 29.436 31.393 32.406 32.732 32.748 32.709 32.573 32.387 32.194 31.937 31.669 31.43 31.174 30.86 30.529 30.239 29.925 29.638 29.389 29.073 28.715 28.437 28.142 27.796 27.528 27.269 26.995 26.71 26.389 26.144 25.876 25.464 25.186 24.891 24.737 24.432 24.106 23.757 23.578 23.176 22.944 22.706 22.479 21.955 21.661 21.334 20.945 20.478 19.897 19.134 16.441 -4 ,4375 ,KEBNE ,17026351,Wed Dec 22 14:09:14 CET,Wed Dec 22 16:00:36 CET,0.0 0.966 1.374 1.711 1.981 2.223 2.44 2.635 3.0 3.174 3.337 3.444 3.85 4.011 4.32 4.618 4.906 5.039 5.294 5.548 5.911 6.142 6.365 6.703 7.04 7.358 7.67 7.978 8.382 8.763 9.124 9.563 9.977 10.385 10.874 11.42 11.93 12.494 13.124 13.795 14.504 15.328 16.286 17.24 18.363 19.613 21.07 22.763 24.723 26.978 29.63 31.685 32.819 33.435 33.645 33.559 33.356 33.137 32.904 32.656 32.433 32.137 31.772 31.387 31.015 30.699 30.373 30.08 29.796 29.48 29.155 28.867 28.56 28.231 27.975 27.688 27.375 27.048 26.702 26.473 26.245 25.864 25.579 25.292 25.144 24.806 24.43 24.043 23.846 23.428 23.212 22.982 22.718 22.113 21.791 21.43 21.014 20.581 20.067 19.306 15.649 -5 ,28657 ,KEBNE ,17026352,Wed Dec 22 14:09:14 CET,Wed Dec 22 16:00:39 CET,0.0 1.159 1.65 2.038 2.334 2.605 2.872 3.108 3.542 3.739 3.93 4.072 4.494 4.679 5.008 5.31 5.602 5.747 6.041 6.314 6.701 6.949 7.193 7.545 7.875 8.196 8.513 8.811 9.188 9.575 9.952 10.397 10.845 11.281 11.784 12.346 12.879 13.46 14.09 14.775 15.494 16.307 17.264 18.234 19.383 20.649 22.128 23.803 25.715 27.965 30.64 32.678 33.666 34.129 34.323 34.369 34.297 34.12 33.846 33.47 33.103 32.744 32.389 32.025 31.666 31.315 30.939 30.623 30.343 30.015 29.653 29.371 29.082 28.767 28.519 28.252 27.947 27.607 27.244 26.995 26.736 26.326 26.066 25.788 25.623 25.272 24.903 24.52 24.313 23.898 23.668 23.384 23.084 22.448 22.089 21.703 21.232 20.716 20.154 19.412 17.417 -6 ,9219 ,KEBNE ,17026353,Wed Dec 22 14:09:14 CET,Wed Dec 22 16:00:19 CET,0.0 1.016 1.415 1.724 2.016 2.294 2.537 2.767 3.201 3.398 3.585 3.707 4.115 4.276 4.586 4.89 5.191 5.332 5.604 5.863 6.237 6.486 6.731 7.089 7.432 7.762 8.072 8.37 8.761 9.134 9.505 9.959 10.391 10.81 11.29 11.831 12.36 12.934 13.561 14.234 14.945 15.747 16.68 17.647 18.753 19.95 21.355 22.942 24.82 26.978 29.481 31.454 32.35 32.672 32.756 32.682 32.458 32.169 31.889 31.576 31.21 30.845 30.509 30.188 29.856 29.52 29.151 28.835 28.573 28.268 27.933 27.649 27.327 26.98 26.706 26.401 26.065 25.713 25.339 25.082 24.82 24.393 24.098 23.806 23.649 23.317 22.977 22.587 22.372 21.941 21.692 21.429 21.163 20.623 20.298 19.951 19.588 19.129 18.501 17.66 13.825 -7 ,15696 ,KEBNE ,17026354,Wed Dec 22 14:09:14 CET,Wed Dec 22 15:59:57 CET,0.0 1.087 1.558 1.934 2.261 2.536 2.79 3.041 3.493 3.68 3.85 3.962 4.358 4.526 4.845 5.136 5.431 5.576 5.852 6.112 6.484 6.725 6.955 7.293 7.626 7.94 8.243 8.552 8.971 9.37 9.756 10.225 10.665 11.079 11.556 12.095 12.608 13.175 13.806 14.484 15.194 16.011 17.007 17.993 19.1 20.332 21.752 23.384 25.331 27.638 30.297 32.271 33.32 33.851 34.068 34.066 33.944 33.789 33.588 33.272 32.984 32.754 32.494 32.215 31.929 31.656 31.368 31.083 30.814 30.519 30.199 29.933 29.648 29.334 29.067 28.768 28.471 28.182 27.895 27.692 27.457 27.07 26.787 26.473 26.323 26.012 25.662 25.301 25.114 24.719 24.525 24.298 24.044 23.485 23.176 22.815 22.446 22.06 21.568 20.802 17.153 -8 ,6790 ,KEBNE ,17026355,Wed Dec 22 14:09:14 CET,Wed Dec 22 16:01:14 CET,0.0 0.983 1.413 1.725 1.986 2.225 2.456 2.679 3.062 3.241 3.421 3.511 3.901 4.053 4.367 4.663 4.926 5.055 5.301 5.548 5.92 6.145 6.37 6.705 7.029 7.336 7.633 7.929 8.318 8.71 9.082 9.516 9.938 10.347 10.818 11.361 11.88 12.451 13.062 13.705 14.402 15.19 16.111 17.064 18.178 19.414 20.884 22.552 24.526 26.798 29.359 31.245 32.217 32.694 32.92 33.024 32.967 32.728 32.419 32.068 31.731 31.405 31.085 30.732 30.365 30.056 29.73 29.407 29.102 28.815 28.534 28.278 27.979 27.643 27.374 27.086 26.767 26.416 26.052 25.808 25.553 25.126 24.817 24.484 24.312 23.969 23.614 23.222 23.005 22.568 22.298 22.026 21.737 21.121 20.776 20.404 20.013 19.538 18.95 18.198 14.455 -9 ,16959 ,KEBNE ,17026356,Wed Dec 22 14:09:18 CET,Wed Dec 22 15:53:52 CET,0.0 0.788 1.202 1.531 1.786 2.022 2.246 2.452 2.84 3.035 3.217 3.308 3.698 3.853 4.159 4.458 4.742 4.873 5.123 5.376 5.767 6.02 6.256 6.587 6.893 7.191 7.49 7.789 8.172 8.534 8.886 9.313 9.732 10.144 10.631 11.19 11.717 12.303 12.944 13.611 14.32 15.13 16.068 17.026 18.169 19.446 20.921 22.598 24.556 26.784 29.439 31.411 32.367 32.854 32.968 32.901 32.764 32.527 32.239 31.879 31.556 31.28 30.961 30.624 30.299 29.982 29.645 29.334 29.061 28.757 28.411 28.14 27.863 27.555 27.316 27.067 26.782 26.469 26.132 25.905 25.67 25.275 25.012 24.736 24.588 24.288 23.983 23.652 23.466 23.047 22.824 22.599 22.343 21.754 21.43 21.092 20.742 20.35 19.821 19.077 16.421 -10 ,2655 ,KEBNE ,17026357,Wed Dec 22 14:09:14 CET,Wed Dec 22 16:01:15 CET,0.0 1.194 1.65 2.003 2.318 2.595 2.843 3.065 3.501 3.707 3.894 4.026 4.428 4.594 4.889 5.177 5.457 5.591 5.859 6.11 6.462 6.704 6.947 7.284 7.611 7.928 8.227 8.525 8.919 9.292 9.645 10.074 10.511 10.942 11.432 11.985 12.522 13.108 13.737 14.413 15.128 15.944 16.899 17.86 18.994 20.27 21.743 23.408 25.355 27.599 30.253 32.152 33.024 33.404 33.501 33.451 33.304 33.067 32.793 32.499 32.18 31.832 31.49 31.153 30.814 30.482 30.105 29.725 29.395 29.081 28.753 28.474 28.159 27.808 27.546 27.278 26.98 26.673 26.374 26.17 25.951 25.56 25.264 24.948 24.784 24.422 24.008 23.575 23.336 22.887 22.566 22.279 22.01 21.464 21.155 20.802 20.383 19.891 19.301 18.563 17.086 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt deleted file mode 100644 index da71ca4b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17843 ,KEBNE ,16723627,Sun Nov 28 03:13:43 CET,Sun Nov 28 05:05:42 CET,0.0 0.931 1.34 1.664 1.964 2.215 2.422 2.612 2.991 3.161 3.316 3.392 3.774 3.917 4.166 4.404 4.651 4.769 4.995 5.212 5.522 5.728 5.936 6.235 6.499 6.754 7.017 7.27 7.59 7.891 8.177 8.509 8.812 9.116 9.463 9.832 10.198 10.607 11.029 11.479 11.972 12.519 13.122 13.718 14.404 15.124 15.892 16.698 17.538 18.325 18.903 18.914 18.514 17.925 17.31 16.67 16.058 15.473 14.9 14.277 13.717 13.181 12.68 12.209 11.747 11.32 10.877 10.478 10.1 9.69 9.259 8.899 8.545 8.167 7.855 7.523 7.176 6.818 6.452 6.191 5.899 5.448 5.15 4.838 4.676 4.328 3.922 3.486 3.27 2.818 2.542 2.267 1.978 1.373 1.057 0.704 0.297 -0.167 -0.748 -1.488 -3.983 -2 ,5815 ,KEBNE ,16723628,Sun Nov 28 03:13:43 CET,Sun Nov 28 05:06:31 CET,0.0 1.073 1.55 1.889 2.146 2.368 2.568 2.769 3.147 3.311 3.47 3.569 3.959 4.096 4.355 4.611 4.851 4.961 5.176 5.403 5.745 5.954 6.146 6.406 6.669 6.936 7.184 7.423 7.741 8.052 8.336 8.661 8.976 9.288 9.656 10.059 10.44 10.855 11.299 11.778 12.281 12.838 13.47 14.078 14.77 15.503 16.234 17.015 17.844 18.642 19.264 19.275 18.849 18.213 17.563 16.947 16.348 15.76 15.183 14.51 13.897 13.387 12.908 12.411 11.928 11.479 11.02 10.621 10.251 9.863 9.464 9.059 8.624 8.233 7.935 7.615 7.273 6.91 6.532 6.286 6.044 5.636 5.337 5.029 4.872 4.554 4.202 3.797 3.589 3.15 2.923 2.681 2.416 1.861 1.563 1.221 0.82 0.373 -0.129 -0.837 -3.857 -3 ,18263 ,KEBNE ,16723629,Sun Nov 28 03:13:43 CET,Sun Nov 28 05:07:16 CET,0.0 0.844 1.228 1.518 1.784 2.051 2.304 2.548 3.022 3.225 3.409 3.519 3.913 4.066 4.35 4.627 4.886 5.003 5.23 5.44 5.751 5.955 6.142 6.408 6.679 6.948 7.193 7.42 7.717 8.005 8.285 8.62 8.949 9.263 9.624 10.035 10.421 10.834 11.276 11.754 12.229 12.76 13.379 13.966 14.639 15.382 16.174 16.994 17.87 18.691 19.239 19.208 18.718 18.013 17.233 16.482 15.838 15.214 14.643 14.006 13.455 12.99 12.497 12.012 11.535 11.08 10.624 10.189 9.798 9.392 8.98 8.63 8.259 7.891 7.605 7.294 6.963 6.615 6.23 5.965 5.71 5.316 5.044 4.755 4.596 4.245 3.853 3.434 3.211 2.746 2.5 2.263 2.017 1.469 1.151 0.801 0.422 -0.005 -0.525 -1.224 -4.15 -4 ,26962 ,KEBNE ,16723630,Sun Nov 28 03:13:43 CET,Sun Nov 28 05:06:17 CET,0.0 1.146 1.614 1.967 2.247 2.501 2.722 2.919 3.293 3.472 3.637 3.69 4.088 4.24 4.521 4.791 5.055 5.184 5.429 5.669 6.008 6.209 6.413 6.731 7.016 7.286 7.548 7.798 8.121 8.43 8.725 9.088 9.448 9.8 10.183 10.586 10.984 11.435 11.921 12.439 12.974 13.554 14.211 14.835 15.538 16.286 17.08 17.911 18.777 19.562 20.069 19.934 19.358 18.745 18.083 17.291 16.524 15.85 15.26 14.577 13.928 13.309 12.721 12.207 11.739 11.278 10.794 10.354 9.943 9.515 9.078 8.711 8.307 7.887 7.572 7.245 6.901 6.531 6.143 5.882 5.616 5.181 4.873 4.541 4.359 3.996 3.627 3.233 3.035 2.58 2.304 2.044 1.783 1.187 0.84 0.459 0.067 -0.369 -0.93 -1.638 -4.066 -7 ,9851 ,KEBNE ,16723633,Sun Nov 28 03:14:44 CET,Sun Nov 28 05:08:24 CET,0.0 1.117 1.595 1.976 2.275 2.536 2.769 2.99 3.404 3.597 3.771 3.839 4.22 4.362 4.642 4.908 5.176 5.302 5.534 5.755 6.075 6.287 6.486 6.756 7.019 7.272 7.509 7.744 8.057 8.357 8.632 8.957 9.272 9.576 9.921 10.297 10.654 11.06 11.5 11.975 12.483 13.042 13.66 14.241 14.914 15.636 16.396 17.191 18.07 18.966 19.61 19.691 19.355 18.817 18.245 17.631 17.031 16.407 15.817 15.247 14.707 14.158 13.607 13.078 12.596 12.171 11.731 11.344 11.0 10.613 10.178 9.82 9.46 9.088 8.794 8.485 8.17 7.838 7.492 7.258 7.009 6.569 6.253 5.935 5.77 5.445 5.088 4.693 4.494 4.063 3.87 3.639 3.396 2.896 2.614 2.296 1.919 1.465 0.885 0.131 -2.737 -8 ,17051 ,KEBNE ,16723634,Sun Nov 28 03:14:44 CET,Sun Nov 28 05:09:44 CET,0.0 1.036 1.6 2.008 2.352 2.637 2.913 3.195 3.718 3.956 4.193 4.418 4.862 5.069 5.463 5.836 6.206 6.385 6.716 7.024 7.483 7.784 8.069 8.481 8.875 9.218 9.525 9.819 10.188 10.52 10.813 11.163 11.508 11.842 12.234 12.667 13.064 13.505 13.972 14.444 14.947 15.528 16.191 16.834 17.56 18.364 19.232 20.052 20.85 21.61 22.197 22.166 21.72 21.109 20.421 19.72 19.06 18.35 17.705 17.078 16.477 15.905 15.348 14.797 14.278 13.798 13.276 12.787 12.343 11.872 11.388 11.003 10.612 10.191 9.857 9.522 9.184 8.808 8.42 8.171 7.908 7.491 7.205 6.89 6.717 6.341 5.924 5.514 5.318 4.87 4.679 4.452 4.199 3.629 3.324 2.981 2.576 2.145 1.618 0.844 -1.822 -10 ,19872 ,KEBNE ,16723636,Sun Nov 28 03:15:45 CET,Sun Nov 28 05:07:37 CET,0.0 1.206 1.673 2.016 2.303 2.559 2.784 2.992 3.4 3.589 3.765 3.84 4.226 4.366 4.653 4.932 5.204 5.331 5.578 5.818 6.153 6.371 6.584 6.884 7.167 7.453 7.732 7.99 8.329 8.658 8.965 9.332 9.674 9.987 10.356 10.802 11.224 11.666 12.135 12.613 13.1 13.637 14.26 14.872 15.542 16.254 17.008 17.81 18.66 19.465 20.046 19.954 19.488 18.897 18.202 17.445 16.743 15.982 15.315 14.716 14.151 13.574 12.999 12.453 11.938 11.466 10.94 10.469 10.075 9.651 9.201 8.818 8.414 7.983 7.647 7.289 6.895 6.496 6.097 5.829 5.542 5.059 4.719 4.379 4.206 3.825 3.413 2.979 2.755 2.292 2.033 1.774 1.517 0.935 0.594 0.213 -0.215 -0.68 -1.197 -1.839 -3.241 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt deleted file mode 100644 index 2dff821b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10423 ,KEBNE ,16723637,Sun Nov 28 03:15:45 CET,Sun Nov 28 05:07:33 CET,0.0 1.584 2.151 2.564 2.937 3.29 3.594 3.871 4.369 4.593 4.8 4.959 5.381 5.557 5.895 6.222 6.533 6.685 6.984 7.258 7.63 7.881 8.125 8.464 8.802 9.137 9.448 9.748 10.144 10.518 10.87 11.307 11.728 12.125 12.594 13.126 13.637 14.197 14.786 15.398 16.035 16.764 17.645 18.529 19.539 20.631 21.878 23.28 24.884 26.59 28.416 29.659 30.071 30.152 30.064 29.868 29.564 29.174 28.756 28.286 27.886 27.55 27.194 26.798 26.415 26.035 25.625 25.292 25.001 24.683 24.345 24.067 23.764 23.428 23.167 22.893 22.603 22.319 22.013 21.789 21.56 21.174 20.902 20.623 20.476 20.165 19.813 19.436 19.244 18.828 18.614 18.373 18.118 17.57 17.26 16.943 16.6 16.167 15.625 14.9 12.808 -2 ,17501 ,KEBNE ,16723638,Sun Nov 28 03:15:45 CET,Sun Nov 28 05:09:06 CET,0.0 1.5 2.028 2.428 2.787 3.101 3.373 3.627 4.08 4.294 4.497 4.67 5.111 5.291 5.632 5.96 6.27 6.416 6.711 6.997 7.39 7.645 7.881 8.234 8.591 8.927 9.249 9.57 9.991 10.399 10.795 11.254 11.679 12.1 12.594 13.14 13.654 14.219 14.83 15.457 16.135 16.902 17.736 18.558 19.517 20.575 21.785 23.124 24.601 26.266 28.011 29.131 29.515 29.515 29.345 29.094 28.789 28.409 28.022 27.56 27.119 26.677 26.254 25.877 25.525 25.195 24.815 24.452 24.117 23.749 23.37 23.055 22.752 22.44 22.174 21.891 21.59 21.289 20.97 20.732 20.469 20.067 19.796 19.509 19.36 19.055 18.744 18.396 18.208 17.794 17.588 17.357 17.121 16.6 16.307 15.996 15.624 15.187 14.656 13.932 11.431 -3 ,21146 ,KEBNE ,16723639,Sun Nov 28 03:15:47 CET,Sun Nov 28 05:03:44 CET,0.0 1.723 2.375 2.872 3.251 3.611 3.926 4.19 4.674 4.89 5.107 5.293 5.722 5.904 6.26 6.613 6.958 7.119 7.429 7.723 8.132 8.382 8.636 9.019 9.391 9.742 10.071 10.394 10.809 11.209 11.571 12.002 12.426 12.84 13.334 13.879 14.405 14.989 15.611 16.262 16.938 17.699 18.598 19.494 20.508 21.593 22.744 24.019 25.491 27.078 28.727 29.668 29.89 29.709 29.361 28.993 28.61 28.194 27.78 27.312 26.887 26.507 26.091 25.661 25.255 24.888 24.506 24.144 23.83 23.511 23.166 22.869 22.57 22.248 21.99 21.728 21.444 21.138 20.815 20.589 20.36 19.988 19.719 19.432 19.285 18.987 18.687 18.38 18.209 17.811 17.64 17.422 17.191 16.688 16.409 16.112 15.759 15.347 14.833 14.137 11.555 -4 ,8227 ,KEBNE ,16723640,Sun Nov 28 03:16:47 CET,Sun Nov 28 05:10:37 CET,0.0 1.399 2.0 2.493 2.903 3.261 3.57 3.83 4.296 4.522 4.74 4.915 5.355 5.557 5.951 6.315 6.65 6.81 7.101 7.378 7.8 8.071 8.329 8.698 9.04 9.361 9.683 10.013 10.469 10.875 11.242 11.707 12.162 12.602 13.103 13.676 14.24 14.824 15.418 16.035 16.688 17.499 18.459 19.345 20.385 21.527 22.719 23.966 25.428 27.048 28.664 29.484 29.596 29.445 29.139 28.745 28.302 27.817 27.344 26.861 26.438 26.039 25.648 25.271 24.895 24.524 24.112 23.74 23.423 23.08 22.732 22.449 22.124 21.766 21.494 21.216 20.916 20.591 20.266 20.021 19.729 19.256 18.934 18.611 18.437 18.071 17.692 17.271 17.051 16.611 16.341 16.078 15.812 15.235 14.915 14.569 14.191 13.755 13.249 12.577 9.972 -5 ,29779 ,KEBNE ,16723641,Sun Nov 28 03:16:47 CET,Sun Nov 28 05:09:18 CET,0.0 1.567 2.212 2.691 3.095 3.459 3.783 4.088 4.651 4.911 5.157 5.375 5.819 6.028 6.437 6.81 7.173 7.35 7.696 8.042 8.53 8.839 9.136 9.565 9.979 10.374 10.761 11.137 11.62 12.077 12.512 13.071 13.621 14.126 14.703 15.362 16.023 16.742 17.413 18.088 18.843 19.677 20.58 21.458 22.503 23.677 24.991 26.374 27.889 29.502 31.188 32.204 32.493 32.446 32.208 31.862 31.492 31.122 30.764 30.332 29.923 29.556 29.184 28.782 28.368 27.98 27.559 27.174 26.848 26.49 26.102 25.792 25.473 25.111 24.818 24.534 24.24 23.923 23.6 23.37 23.128 22.758 22.501 22.226 22.083 21.8 21.494 21.161 20.986 20.583 20.346 20.074 19.786 19.198 18.87 18.501 18.125 17.706 17.201 16.525 14.167 -6 ,25494 ,KEBNE ,16723642,Sun Nov 28 03:17:48 CET,Sun Nov 28 05:09:34 CET,0.0 1.863 2.464 2.908 3.291 3.652 3.974 4.264 4.787 5.017 5.225 5.378 5.808 5.995 6.355 6.708 7.037 7.191 7.503 7.805 8.226 8.488 8.74 9.11 9.47 9.821 10.161 10.477 10.868 11.251 11.637 12.099 12.533 12.947 13.428 13.976 14.484 15.033 15.624 16.245 16.901 17.653 18.52 19.392 20.413 21.524 22.747 24.044 25.5 27.248 29.298 30.544 30.89 30.854 30.592 30.144 29.645 29.172 28.737 28.202 27.698 27.228 26.776 26.346 25.937 25.567 25.159 24.771 24.406 24.011 23.587 23.228 22.854 22.457 22.153 21.856 21.547 21.205 20.837 20.585 20.328 19.932 19.642 19.326 19.165 18.828 18.493 18.141 17.948 17.531 17.344 17.117 16.878 16.352 16.041 15.683 15.31 14.88 14.338 13.626 9.983 -7 ,29964 ,KEBNE ,16723643,Sun Nov 28 03:17:47 CET,Sun Nov 28 05:09:33 CET,0.0 1.759 2.314 2.716 3.089 3.425 3.722 3.988 4.472 4.701 4.93 5.147 5.588 5.776 6.128 6.448 6.758 6.912 7.203 7.492 7.905 8.161 8.409 8.772 9.118 9.457 9.798 10.122 10.534 10.925 11.295 11.747 12.176 12.58 13.047 13.587 14.094 14.65 15.263 15.887 16.562 17.343 18.226 19.093 20.056 21.146 22.414 23.809 25.369 27.05 28.733 29.894 30.42 30.512 30.372 30.068 29.689 29.349 29.036 28.652 28.275 27.919 27.562 27.213 26.87 26.527 26.154 25.791 25.459 25.12 24.768 24.474 24.154 23.807 23.546 23.28 22.996 22.703 22.403 22.196 21.98 21.611 21.347 21.075 20.933 20.637 20.321 19.975 19.781 19.37 19.222 19.029 18.818 18.335 18.053 17.741 17.4 17.004 16.529 15.86 13.793 -8 ,18892 ,KEBNE ,16723644,Sun Nov 28 03:17:52 CET,Sun Nov 28 05:06:33 CET,0.0 1.933 2.526 2.965 3.31 3.62 3.923 4.215 4.726 4.951 5.165 5.324 5.743 5.934 6.297 6.633 6.954 7.11 7.411 7.705 8.114 8.374 8.622 8.978 9.334 9.678 10.016 10.343 10.758 11.147 11.535 12.011 12.447 12.867 13.352 13.897 14.429 15.0 15.602 16.253 16.924 17.658 18.53 19.403 20.404 21.463 22.667 24.047 25.575 27.26 28.972 29.951 30.311 30.338 30.112 29.761 29.38 29.012 28.658 28.261 27.899 27.54 27.172 26.793 26.41 26.046 25.635 25.27 24.956 24.616 24.256 23.958 23.656 23.346 23.104 22.845 22.575 22.276 21.952 21.725 21.48 21.066 20.774 20.495 20.357 20.055 19.717 19.346 19.151 18.73 18.48 18.232 17.993 17.46 17.116 16.746 16.37 15.915 15.375 14.657 12.521 -9 ,26139 ,KEBNE ,16723645,Sun Nov 28 03:18:49 CET,Sun Nov 28 05:10:10 CET,0.0 1.479 2.038 2.47 2.804 3.134 3.453 3.718 4.205 4.449 4.682 4.878 5.316 5.53 5.945 6.307 6.643 6.811 7.142 7.446 7.878 8.158 8.419 8.788 9.138 9.5 9.843 10.165 10.61 11.035 11.438 11.933 12.409 12.837 13.321 13.871 14.411 15.003 15.63 16.308 17.0 17.746 18.61 19.471 20.457 21.557 22.812 24.15 25.592 27.196 28.893 29.905 30.211 30.164 29.886 29.536 29.161 28.73 28.296 27.854 27.44 27.021 26.609 26.198 25.795 25.407 24.994 24.639 24.314 23.97 23.615 23.324 23.03 22.689 22.407 22.123 21.824 21.494 21.144 20.897 20.63 20.222 19.948 19.643 19.485 19.176 18.832 18.45 18.255 17.828 17.594 17.33 17.05 16.447 16.14 15.813 15.431 14.961 14.404 13.711 9.445 -10 ,14741 ,KEBNE ,16723646,Sun Nov 28 03:19:53 CET,Sun Nov 28 05:07:29 CET,0.0 1.676 2.278 2.71 3.057 3.371 3.664 3.935 4.414 4.627 4.84 5.024 5.459 5.654 6.02 6.355 6.665 6.813 7.101 7.392 7.83 8.102 8.351 8.702 9.045 9.382 9.711 10.033 10.45 10.843 11.215 11.665 12.109 12.532 13.024 13.569 14.074 14.637 15.248 15.898 16.574 17.333 18.23 19.112 20.133 21.247 22.457 23.801 25.323 26.927 28.66 29.867 30.348 30.473 30.356 30.079 29.725 29.364 29.026 28.663 28.328 27.966 27.559 27.177 26.828 26.495 26.122 25.748 25.409 25.061 24.698 24.393 24.081 23.768 23.523 23.253 22.969 22.691 22.386 22.158 21.914 21.517 21.233 20.92 20.761 20.424 20.077 19.735 19.549 19.149 18.952 18.739 18.529 18.06 17.791 17.47 17.12 16.713 16.192 15.533 12.75 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index 97f28286..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26990 ,KEBNE ,16723647,Sun Nov 28 03:19:55 CET,Sun Nov 28 05:07:29 CET,0.0 1.001 1.472 1.848 2.171 2.473 2.754 3.014 3.504 3.724 3.932 4.106 4.519 4.694 5.014 5.321 5.633 5.785 6.078 6.37 6.79 7.05 7.307 7.687 8.052 8.41 8.749 9.068 9.474 9.865 10.257 10.741 11.182 11.597 12.089 12.644 13.187 13.806 14.482 15.199 15.978 16.839 17.802 18.747 19.78 20.853 21.976 23.146 24.415 25.712 26.863 27.28 26.944 26.297 25.676 25.042 24.397 23.802 23.276 22.664 22.075 21.533 21.004 20.488 19.971 19.498 19.034 18.61 18.239 17.86 17.451 17.108 16.757 16.384 16.09 15.786 15.462 15.125 14.797 14.569 14.321 13.922 13.639 13.335 13.176 12.847 12.497 12.127 11.936 11.519 11.27 11.021 10.748 10.158 9.841 9.503 9.112 8.688 8.175 7.428 4.83 -2 ,24357 ,KEBNE ,16723648,Sun Nov 28 03:20:53 CET,Sun Nov 28 05:12:13 CET,0.0 1.019 1.501 1.907 2.199 2.478 2.772 3.04 3.494 3.698 3.885 4.03 4.437 4.614 4.964 5.296 5.616 5.77 6.046 6.316 6.723 6.99 7.252 7.619 7.97 8.307 8.627 8.937 9.358 9.784 10.187 10.655 11.119 11.567 12.068 12.631 13.155 13.711 14.336 15.023 15.732 16.528 17.42 18.291 19.316 20.468 21.735 23.035 24.422 25.911 27.338 27.823 27.61 27.229 26.667 25.942 25.254 24.59 23.993 23.389 22.823 22.298 21.796 21.325 20.876 20.452 20.008 19.582 19.201 18.79 18.331 17.963 17.579 17.171 16.853 16.522 16.194 15.838 15.452 15.197 14.931 14.505 14.204 13.902 13.749 13.412 13.051 12.683 12.486 12.073 11.833 11.581 11.328 10.768 10.453 10.097 9.69 9.21 8.634 7.891 5.387 -5 ,24911 ,KEBNE ,16723651,Sun Nov 28 03:21:54 CET,Sun Nov 28 05:13:24 CET,0.0 0.931 1.324 1.654 1.94 2.21 2.45 2.652 3.021 3.206 3.388 3.492 3.858 4.008 4.308 4.589 4.849 4.979 5.237 5.484 5.829 6.04 6.233 6.516 6.799 7.082 7.344 7.589 7.898 8.178 8.461 8.81 9.145 9.475 9.833 10.237 10.627 11.046 11.513 12.007 12.521 13.096 13.768 14.43 15.167 15.966 16.852 17.803 18.851 19.961 21.064 21.627 21.652 21.448 21.165 20.831 20.441 20.021 19.605 19.14 18.728 18.342 17.93 17.524 17.144 16.807 16.444 16.1 15.787 15.438 15.044 14.704 14.343 13.962 13.662 13.345 13.016 12.662 12.292 12.035 11.752 11.292 10.972 10.653 10.483 10.144 9.805 9.404 9.196 8.771 8.526 8.273 7.994 7.381 7.049 6.686 6.248 5.759 5.207 4.409 1.998 -6 ,10077 ,KEBNE ,16723652,Sun Nov 28 03:21:54 CET,Sun Nov 28 05:12:40 CET,0.0 1.076 1.62 2.045 2.368 2.646 2.904 3.144 3.573 3.773 3.962 4.091 4.47 4.63 4.953 5.242 5.501 5.624 5.862 6.097 6.448 6.667 6.876 7.168 7.438 7.72 7.988 8.241 8.57 8.875 9.17 9.527 9.88 10.225 10.603 11.019 11.435 11.89 12.368 12.87 13.386 13.954 14.617 15.284 16.045 16.873 17.815 18.823 19.902 21.002 22.027 22.156 21.642 21.039 20.415 19.73 18.98 18.263 17.687 17.077 16.485 15.924 15.369 14.843 14.353 13.906 13.446 13.038 12.68 12.296 11.878 11.534 11.171 10.777 10.464 10.129 9.771 9.405 9.025 8.752 8.476 8.039 7.72 7.388 7.223 6.875 6.483 6.072 5.852 5.419 5.176 4.934 4.68 4.116 3.781 3.408 3.006 2.558 2.031 1.326 -0.876 -7 ,26892 ,KEBNE ,16723653,Sun Nov 28 03:22:55 CET,Sun Nov 28 05:14:38 CET,0.0 1.182 1.677 2.04 2.345 2.635 2.906 3.161 3.632 3.848 4.053 4.214 4.604 4.773 5.101 5.389 5.642 5.775 6.034 6.266 6.603 6.82 7.026 7.327 7.618 7.898 8.168 8.422 8.737 9.047 9.344 9.7 10.044 10.37 10.751 11.166 11.552 11.979 12.45 12.957 13.488 14.067 14.734 15.407 16.172 16.987 17.899 18.867 19.979 21.263 22.471 22.918 22.757 22.292 21.751 21.172 20.543 19.913 19.311 18.682 18.101 17.537 16.992 16.455 15.931 15.46 14.966 14.524 14.133 13.695 13.218 12.828 12.413 11.968 11.629 11.274 10.903 10.52 10.121 9.843 9.549 9.083 8.755 8.402 8.221 7.854 7.458 7.039 6.819 6.374 6.112 5.856 5.583 5.02 4.698 4.32 3.921 3.488 2.947 2.187 -0.177 -8 ,2545 ,KEBNE ,16723654,Sun Nov 28 03:23:57 CET,Sun Nov 28 05:16:00 CET,0.0 1.001 1.396 1.723 2.053 2.357 2.617 2.836 3.218 3.388 3.562 3.655 4.006 4.148 4.428 4.682 4.919 5.035 5.258 5.476 5.806 6.017 6.218 6.505 6.773 7.024 7.276 7.524 7.822 8.109 8.392 8.732 9.05 9.361 9.729 10.147 10.548 10.986 11.449 11.949 12.468 13.034 13.697 14.353 15.104 15.91 16.803 17.781 18.864 20.013 21.122 21.621 21.617 21.359 20.996 20.593 20.165 19.749 19.36 18.925 18.524 18.163 17.823 17.473 17.123 16.795 16.441 16.13 15.853 15.552 15.231 14.956 14.67 14.367 14.13 13.891 13.627 13.341 13.03 12.798 12.562 12.206 11.929 11.614 11.448 11.104 10.751 10.378 10.176 9.756 9.542 9.305 9.038 8.434 8.095 7.719 7.307 6.846 6.27 5.493 3.061 -9 ,21121 ,KEBNE ,16723655,Sun Nov 28 03:23:56 CET,Sun Nov 28 05:15:33 CET,0.0 1.297 1.743 2.096 2.431 2.723 2.971 3.183 3.57 3.768 3.962 4.086 4.462 4.614 4.897 5.162 5.417 5.539 5.789 6.032 6.364 6.571 6.771 7.067 7.361 7.646 7.915 8.164 8.5 8.817 9.113 9.465 9.796 10.122 10.49 10.9 11.299 11.732 12.18 12.661 13.167 13.717 14.373 15.034 15.764 16.588 17.539 18.549 19.632 20.83 22.07 22.484 22.187 21.629 20.905 20.099 19.331 18.622 18.006 17.318 16.661 16.072 15.544 15.036 14.524 14.051 13.549 13.099 12.717 12.31 11.855 11.479 11.105 10.705 10.379 10.037 9.685 9.319 8.948 8.694 8.422 7.982 7.664 7.33 7.157 6.807 6.446 6.048 5.83 5.389 5.154 4.908 4.629 4.047 3.723 3.343 2.912 2.421 1.831 0.966 -2.109 -10 ,16132 ,KEBNE ,16723656,Sun Nov 28 03:23:57 CET,Sun Nov 28 05:14:50 CET,0.0 1.217 1.714 2.089 2.415 2.706 2.973 3.22 3.685 3.903 4.111 4.3 4.717 4.893 5.226 5.539 5.845 6.003 6.3 6.574 6.964 7.219 7.472 7.848 8.208 8.559 8.913 9.261 9.702 10.115 10.495 10.955 11.425 11.891 12.414 12.979 13.519 14.11 14.747 15.403 16.105 16.894 17.806 18.749 19.791 20.865 21.975 23.129 24.526 26.05 27.452 27.961 27.73 27.323 26.784 26.123 25.465 24.824 24.232 23.603 23.002 22.435 21.866 21.302 20.769 20.293 19.792 19.344 18.969 18.581 18.168 17.807 17.423 17.018 16.71 16.387 16.043 15.701 15.334 15.071 14.808 14.413 14.14 13.842 13.685 13.366 13.005 12.581 12.358 11.916 11.617 11.336 11.03 10.378 10.028 9.657 9.256 8.781 8.166 7.366 4.732 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt deleted file mode 100644 index 752c596e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29948 ,KEBNE ,16723657,Sun Nov 28 03:24:59 CET,Sun Nov 28 05:17:43 CET,0.0 3.378 4.226 4.762 5.181 5.529 5.856 6.166 6.72 6.981 7.227 7.419 7.821 8.007 8.35 8.697 9.017 9.164 9.468 9.759 10.137 10.38 10.62 10.957 11.272 11.571 11.868 12.151 12.497 12.817 13.128 13.509 13.867 14.219 14.638 15.105 15.523 15.962 16.436 16.928 17.403 17.904 18.522 19.127 19.75 20.398 21.119 21.877 22.571 23.073 23.055 22.353 21.468 20.49 19.345 18.172 17.139 16.175 15.343 14.507 13.766 13.101 12.477 11.887 11.341 10.839 10.298 9.79 9.36 8.929 8.476 8.097 7.702 7.282 6.95 6.61 6.261 5.891 5.522 5.266 4.99 4.568 4.269 3.947 3.775 3.413 3.041 2.655 2.447 2.001 1.773 1.533 1.269 0.672 0.332 -0.048 -0.494 -0.983 -1.535 -2.278 -4.894 -2 ,1855 ,KEBNE ,16723658,Sun Nov 28 03:24:58 CET,Sun Nov 28 05:18:03 CET,0.0 2.773 3.66 4.29 4.756 5.16 5.527 5.849 6.426 6.695 6.949 7.206 7.645 7.849 8.246 8.626 8.954 9.112 9.443 9.763 10.211 10.486 10.742 11.12 11.488 11.823 12.141 12.464 12.863 13.223 13.564 13.981 14.374 14.739 15.168 15.632 16.063 16.522 16.988 17.479 18.006 18.561 19.164 19.771 20.438 21.083 21.772 22.396 22.985 23.472 23.522 22.801 21.754 20.709 19.653 18.601 17.675 16.821 16.08 15.332 14.663 14.028 13.433 12.877 12.357 11.887 11.356 10.856 10.423 9.974 9.483 9.077 8.678 8.265 7.942 7.612 7.262 6.89 6.495 6.222 5.947 5.5 5.175 4.838 4.666 4.32 3.96 3.558 3.343 2.9 2.641 2.373 2.091 1.473 1.124 0.719 0.301 -0.156 -0.719 -1.487 -4.697 -4 ,25519 ,KEBNE ,16723660,Sun Nov 28 03:27:01 CET,Sun Nov 28 05:19:26 CET,0.0 4.028 4.831 5.365 5.804 6.189 6.515 6.817 7.388 7.646 7.881 8.085 8.501 8.71 9.092 9.422 9.724 9.877 10.175 10.439 10.813 11.057 11.295 11.631 11.953 12.264 12.559 12.836 13.183 13.514 13.833 14.205 14.54 14.858 15.229 15.639 16.035 16.468 16.899 17.329 17.789 18.313 18.916 19.53 20.191 20.824 21.485 22.108 22.652 23.078 23.07 22.16 21.0 19.946 19.003 18.065 17.166 16.334 15.601 14.883 14.261 13.709 13.168 12.622 12.115 11.632 11.123 10.687 10.299 9.895 9.48 9.125 8.769 8.389 8.073 7.741 7.392 7.029 6.655 6.386 6.109 5.7 5.408 5.104 4.939 4.561 4.165 3.773 3.573 3.122 2.843 2.595 2.331 1.691 1.342 0.966 0.534 0.032 -0.567 -1.399 -4.616 -5 ,16665 ,KEBNE ,16723661,Sun Nov 28 03:28:03 CET,Sun Nov 28 05:19:30 CET,0.0 3.098 3.943 4.52 4.994 5.4 5.755 6.086 6.669 6.935 7.183 7.408 7.829 8.02 8.368 8.693 9.018 9.179 9.486 9.768 10.183 10.45 10.709 11.077 11.417 11.76 12.096 12.4 12.767 13.117 13.462 13.886 14.314 14.714 15.142 15.613 16.075 16.552 17.049 17.588 18.165 18.802 19.509 20.202 20.933 21.623 22.238 22.814 23.396 23.763 23.695 23.005 22.025 20.992 19.994 19.031 18.12 17.295 16.606 15.897 15.262 14.67 14.1 13.579 13.067 12.577 12.068 11.616 11.218 10.798 10.37 10.018 9.642 9.232 8.911 8.587 8.245 7.879 7.518 7.274 7.011 6.609 6.33 6.039 5.885 5.541 5.172 4.796 4.605 4.169 3.929 3.682 3.409 2.803 2.477 2.132 1.739 1.277 0.721 -0.051 -2.884 -6 ,28244 ,KEBNE ,16723662,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:20:57 CET,0.0 2.923 3.641 4.13 4.575 4.961 5.281 5.578 6.113 6.353 6.582 6.786 7.204 7.397 7.747 8.078 8.389 8.54 8.838 9.105 9.477 9.719 9.954 10.279 10.581 10.882 11.185 11.471 11.829 12.165 12.489 12.88 13.247 13.593 13.994 14.44 14.863 15.326 15.837 16.367 16.89 17.463 18.11 18.751 19.45 20.106 20.786 21.46 22.035 22.418 22.197 21.235 20.128 19.013 17.978 16.946 15.971 15.124 14.375 13.605 12.985 12.408 11.788 11.17 10.601 10.084 9.537 9.042 8.61 8.171 7.712 7.337 6.961 6.57 6.267 5.941 5.589 5.222 4.824 4.547 4.252 3.786 3.478 3.163 2.997 2.628 2.231 1.823 1.615 1.164 0.884 0.613 0.327 -0.299 -0.653 -1.039 -1.467 -1.941 -2.508 -3.345 -6.135 -7 ,30931 ,KEBNE ,16723663,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:20:51 CET,0.0 2.812 3.566 4.068 4.491 4.86 5.197 5.5 6.009 6.242 6.469 6.683 7.102 7.307 7.687 8.034 8.361 8.515 8.801 9.075 9.489 9.749 9.991 10.326 10.634 10.935 11.239 11.549 11.932 12.28 12.596 12.957 13.308 13.662 14.076 14.511 14.935 15.394 15.857 16.326 16.809 17.362 17.991 18.588 19.219 19.859 20.557 21.288 21.981 22.566 22.678 21.969 21.007 19.942 18.952 18.076 17.276 16.433 15.622 14.795 14.088 13.444 12.8 12.193 11.651 11.18 10.678 10.219 9.833 9.421 8.981 8.614 8.232 7.832 7.521 7.186 6.833 6.464 6.08 5.817 5.531 5.099 4.806 4.476 4.301 3.943 3.561 3.153 2.943 2.501 2.274 2.019 1.738 1.134 0.804 0.409 -0.04 -0.503 -1.064 -1.867 -5.05 -8 ,18982 ,KEBNE ,16723664,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:21:25 CET,0.0 3.285 4.078 4.642 5.128 5.566 5.931 6.249 6.818 7.063 7.288 7.497 7.929 8.127 8.502 8.848 9.172 9.335 9.655 9.953 10.353 10.613 10.866 11.213 11.545 11.868 12.177 12.464 12.829 13.173 13.497 13.879 14.247 14.61 15.014 15.461 15.884 16.317 16.76 17.225 17.717 18.271 18.897 19.45 20.031 20.658 21.332 21.991 22.59 23.007 22.87 22.084 21.067 19.928 18.863 17.856 16.977 16.207 15.486 14.747 14.131 13.576 13.016 12.448 11.911 11.424 10.904 10.408 9.969 9.518 9.05 8.653 8.233 7.789 7.431 7.058 6.698 6.345 5.953 5.677 5.392 4.952 4.65 4.325 4.144 3.765 3.405 3.026 2.814 2.351 2.073 1.801 1.511 0.908 0.562 0.187 -0.229 -0.748 -1.373 -2.157 -5.065 -9 ,18122 ,KEBNE ,16723665,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:20:26 CET,0.0 2.532 3.34 3.906 4.348 4.754 5.126 5.46 6.091 6.375 6.638 6.891 7.327 7.533 7.914 8.269 8.579 8.727 9.015 9.287 9.672 9.903 10.133 10.472 10.788 11.093 11.382 11.66 12.026 12.376 12.703 13.085 13.448 13.8 14.192 14.619 15.012 15.435 15.907 16.409 16.891 17.402 18.014 18.594 19.205 19.829 20.528 21.229 21.796 22.104 21.914 21.071 20.038 18.96 17.925 16.943 16.056 15.218 14.474 13.717 13.069 12.51 11.975 11.462 10.961 10.494 10.016 9.584 9.2 8.8 8.381 8.024 7.652 7.271 6.976 6.663 6.341 6.009 5.65 5.379 5.09 4.618 4.283 3.963 3.793 3.404 3.011 2.607 2.385 1.926 1.67 1.419 1.152 0.557 0.237 -0.097 -0.524 -1.039 -1.677 -2.53 -5.556 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt deleted file mode 100644 index bffe8627..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,26011 ,KEBNE ,16723668,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:20:08 CET,0.0 1.401 1.901 2.273 2.589 2.856 3.094 3.317 3.736 3.916 4.073 4.197 4.518 4.644 4.87 5.099 5.324 5.427 5.625 5.798 6.031 6.187 6.344 6.578 6.789 6.992 7.183 7.351 7.558 7.769 7.976 8.209 8.428 8.628 8.85 9.088 9.312 9.542 9.775 10.014 10.264 10.515 10.783 11.05 11.315 11.539 11.729 11.842 11.802 11.454 10.407 8.815 7.32 5.911 4.686 3.59 2.582 1.665 0.877 0.073 -0.625 -1.246 -1.829 -2.392 -2.935 -3.415 -3.916 -4.364 -4.748 -5.135 -5.533 -5.88 -6.274 -6.698 -6.997 -7.304 -7.636 -7.972 -8.314 -8.549 -8.793 -9.175 -9.448 -9.741 -9.889 -10.194 -10.524 -10.84 -11.001 -11.387 -11.56 -11.765 -11.989 -12.488 -12.769 -13.061 -13.35 -13.697 -14.112 -14.685 -16.395 -3 ,23867 ,KEBNE ,16723669,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:19:15 CET,0.0 1.376 1.709 1.981 2.224 2.461 2.685 2.873 3.185 3.335 3.489 3.6 3.905 4.024 4.254 4.482 4.692 4.788 4.971 5.148 5.399 5.558 5.706 5.893 6.071 6.254 6.449 6.63 6.846 7.06 7.264 7.513 7.748 7.972 8.215 8.471 8.717 8.981 9.252 9.52 9.782 10.08 10.408 10.697 10.992 11.252 11.462 11.6 11.613 11.315 10.306 8.731 7.29 5.943 4.726 3.634 2.672 1.748 0.93 0.124 -0.569 -1.168 -1.721 -2.26 -2.766 -3.267 -3.798 -4.234 -4.614 -5.01 -5.415 -5.743 -6.088 -6.463 -6.747 -7.029 -7.317 -7.624 -7.977 -8.236 -8.487 -8.892 -9.195 -9.497 -9.648 -9.963 -10.293 -10.634 -10.814 -11.193 -11.379 -11.592 -11.816 -12.314 -12.592 -12.893 -13.21 -13.571 -14.047 -14.726 -16.826 -4 ,32187 ,KEBNE ,16723670,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:19:53 CET,0.0 1.531 2.083 2.493 2.782 3.029 3.256 3.473 3.855 4.041 4.214 4.336 4.647 4.775 5.01 5.247 5.487 5.601 5.804 5.979 6.24 6.418 6.589 6.817 7.02 7.225 7.442 7.652 7.901 8.135 8.36 8.615 8.833 9.04 9.282 9.553 9.825 10.108 10.396 10.695 10.966 11.242 11.561 11.839 12.125 12.398 12.605 12.716 12.692 12.423 11.561 10.141 8.68 7.28 6.061 4.93 3.925 3.041 2.314 1.584 0.924 0.324 -0.252 -0.796 -1.324 -1.821 -2.331 -2.784 -3.179 -3.579 -3.981 -4.318 -4.673 -5.044 -5.325 -5.607 -5.902 -6.208 -6.548 -6.771 -6.989 -7.341 -7.593 -7.878 -8.028 -8.341 -8.669 -9.014 -9.199 -9.583 -9.75 -9.929 -10.131 -10.601 -10.867 -11.145 -11.448 -11.818 -12.276 -12.87 -14.558 -5 ,17318 ,KEBNE ,16723671,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:19:04 CET,0.0 1.509 1.924 2.244 2.533 2.779 2.996 3.215 3.621 3.798 3.957 4.072 4.379 4.503 4.734 4.953 5.16 5.261 5.452 5.626 5.883 6.059 6.225 6.452 6.671 6.884 7.08 7.258 7.478 7.683 7.876 8.111 8.336 8.547 8.785 9.033 9.29 9.578 9.834 10.092 10.362 10.637 10.916 11.152 11.402 11.636 11.878 12.059 12.081 11.827 10.934 9.606 8.278 6.952 5.797 4.824 3.92 3.04 2.294 1.545 0.89 0.317 -0.198 -0.68 -1.16 -1.646 -2.13 -2.533 -2.887 -3.273 -3.689 -4.04 -4.408 -4.766 -5.035 -5.312 -5.595 -5.909 -6.252 -6.488 -6.73 -7.113 -7.378 -7.641 -7.774 -8.054 -8.356 -8.678 -8.843 -9.2 -9.387 -9.59 -9.796 -10.252 -10.507 -10.779 -11.086 -11.454 -11.868 -12.42 -13.763 -10 ,15781 ,KEBNE ,16723676,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:19:40 CET,0.0 1.128 1.537 1.849 2.137 2.417 2.667 2.876 3.25 3.42 3.587 3.739 4.073 4.201 4.434 4.674 4.907 5.015 5.218 5.414 5.696 5.869 6.023 6.239 6.442 6.632 6.821 6.999 7.218 7.425 7.618 7.854 8.074 8.271 8.504 8.751 8.96 9.178 9.41 9.639 9.858 10.106 10.364 10.591 10.841 11.079 11.28 11.371 11.246 10.74 9.604 8.017 6.507 5.042 3.75 2.588 1.546 0.617 -0.202 -1.041 -1.759 -2.403 -3.03 -3.608 -4.149 -4.638 -5.134 -5.597 -6.023 -6.461 -6.892 -7.247 -7.634 -8.018 -8.307 -8.623 -8.967 -9.323 -9.656 -9.885 -10.133 -10.533 -10.808 -11.097 -11.255 -11.571 -11.885 -12.219 -12.398 -12.788 -12.994 -13.201 -13.428 -13.966 -14.262 -14.572 -14.916 -15.328 -15.812 -16.467 -18.508 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 89954c6c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,26801 ,KEBNE ,16723677,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:18:59 CET,0.0 1.605 2.077 2.42 2.7 2.958 3.181 3.397 3.792 3.951 4.106 4.232 4.536 4.662 4.897 5.128 5.345 5.454 5.671 5.859 6.119 6.285 6.437 6.643 6.847 7.055 7.26 7.461 7.718 7.952 8.187 8.452 8.682 8.906 9.164 9.438 9.679 9.944 10.21 10.492 10.799 11.094 11.382 11.634 11.911 12.175 12.384 12.513 12.482 12.122 11.093 9.47 7.935 6.506 5.199 4.0 2.967 2.041 1.25 0.472 -0.182 -0.761 -1.308 -1.832 -2.351 -2.852 -3.372 -3.816 -4.193 -4.569 -4.97 -5.317 -5.686 -6.062 -6.352 -6.648 -6.948 -7.271 -7.595 -7.818 -8.058 -8.442 -8.721 -9.0 -9.137 -9.437 -9.754 -10.076 -10.243 -10.603 -10.793 -10.992 -11.217 -11.703 -11.949 -12.218 -12.51 -12.851 -13.26 -13.756 -14.981 -2 ,230 ,KEBNE ,16723678,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:19:23 CET,0.0 1.126 1.606 1.935 2.219 2.465 2.661 2.871 3.297 3.468 3.619 3.733 4.041 4.167 4.424 4.661 4.875 4.981 5.183 5.374 5.639 5.806 5.974 6.198 6.405 6.615 6.823 7.015 7.27 7.521 7.736 7.966 8.181 8.392 8.646 8.932 9.198 9.472 9.774 10.092 10.369 10.663 10.98 11.26 11.557 11.823 12.083 12.247 12.149 11.747 10.72 9.036 7.467 6.063 4.793 3.616 2.564 1.616 0.818 0.041 -0.65 -1.269 -1.851 -2.413 -2.944 -3.436 -3.929 -4.358 -4.74 -5.141 -5.557 -5.906 -6.268 -6.643 -6.929 -7.21 -7.501 -7.816 -8.142 -8.359 -8.59 -8.956 -9.208 -9.474 -9.609 -9.884 -10.175 -10.491 -10.666 -11.021 -11.188 -11.376 -11.563 -11.989 -12.219 -12.464 -12.739 -13.062 -13.478 -14.005 -15.187 -3 ,21722 ,KEBNE ,16723679,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:18:33 CET,0.0 1.058 1.484 1.76 1.986 2.207 2.397 2.579 2.933 3.102 3.272 3.385 3.676 3.795 4.001 4.197 4.385 4.483 4.671 4.847 5.103 5.264 5.414 5.631 5.863 6.085 6.277 6.456 6.689 6.914 7.135 7.4 7.651 7.889 8.145 8.418 8.675 8.945 9.22 9.487 9.728 9.972 10.237 10.505 10.795 11.037 11.285 11.477 11.468 11.203 10.334 8.942 7.617 6.349 5.194 4.106 3.151 2.31 1.572 0.865 0.254 -0.32 -0.876 -1.412 -1.907 -2.374 -2.878 -3.322 -3.697 -4.084 -4.477 -4.797 -5.129 -5.48 -5.759 -6.059 -6.38 -6.699 -7.023 -7.251 -7.496 -7.883 -8.142 -8.407 -8.548 -8.853 -9.172 -9.514 -9.69 -10.06 -10.226 -10.415 -10.629 -11.105 -11.363 -11.638 -11.923 -12.239 -12.66 -13.15 -14.557 -4 ,6361 ,KEBNE ,16723680,Sun Nov 28 03:29:05 CET,Sun Nov 28 05:19:04 CET,0.0 1.233 1.723 2.034 2.306 2.536 2.729 2.91 3.257 3.432 3.618 3.768 4.067 4.197 4.438 4.671 4.88 4.978 5.163 5.34 5.596 5.755 5.918 6.168 6.399 6.598 6.79 6.978 7.219 7.457 7.674 7.929 8.181 8.409 8.659 8.925 9.171 9.434 9.703 9.973 10.253 10.584 10.929 11.222 11.527 11.816 12.031 12.164 12.218 12.024 11.149 9.535 7.934 6.53 5.334 4.275 3.329 2.417 1.623 0.871 0.235 -0.362 -0.928 -1.451 -1.94 -2.381 -2.85 -3.264 -3.609 -3.977 -4.379 -4.709 -5.046 -5.391 -5.649 -5.927 -6.218 -6.518 -6.834 -7.048 -7.278 -7.67 -7.943 -8.215 -8.353 -8.634 -8.92 -9.237 -9.413 -9.773 -9.953 -10.153 -10.36 -10.805 -11.053 -11.328 -11.644 -11.966 -12.31 -12.824 -14.136 -5 ,26664 ,KEBNE ,16723681,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:20:00 CET,0.0 1.062 1.478 1.81 2.1 2.366 2.606 2.81 3.171 3.322 3.463 3.569 3.872 4.001 4.226 4.438 4.655 4.766 4.983 5.179 5.436 5.589 5.74 5.959 6.17 6.373 6.569 6.765 7.021 7.266 7.483 7.705 7.926 8.142 8.362 8.586 8.796 9.022 9.258 9.522 9.802 10.093 10.396 10.667 10.946 11.18 11.387 11.529 11.45 11.045 9.969 8.316 6.753 5.312 4.038 2.87 1.813 0.875 0.074 -0.738 -1.407 -1.996 -2.562 -3.096 -3.594 -4.044 -4.508 -4.94 -5.334 -5.739 -6.162 -6.514 -6.874 -7.247 -7.534 -7.827 -8.13 -8.442 -8.768 -9.001 -9.231 -9.585 -9.848 -10.132 -10.27 -10.539 -10.851 -11.187 -11.352 -11.706 -11.876 -12.064 -12.26 -12.699 -12.939 -13.195 -13.476 -13.772 -14.095 -14.528 -15.709 -6 ,11972 ,KEBNE ,16723682,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:19:44 CET,0.0 1.146 1.603 1.952 2.242 2.502 2.739 2.951 3.334 3.498 3.652 3.782 4.083 4.21 4.445 4.651 4.851 4.955 5.163 5.343 5.585 5.738 5.888 6.106 6.312 6.511 6.702 6.885 7.111 7.325 7.532 7.771 8.002 8.223 8.473 8.75 8.995 9.254 9.53 9.805 10.078 10.377 10.707 11.005 11.294 11.599 11.91 12.1 12.087 11.808 11.009 9.556 8.122 6.808 5.656 4.634 3.718 2.878 2.154 1.434 0.803 0.211 -0.367 -0.915 -1.413 -1.853 -2.319 -2.748 -3.136 -3.541 -3.954 -4.293 -4.649 -5.033 -5.318 -5.617 -5.933 -6.25 -6.577 -6.807 -7.053 -7.434 -7.689 -7.956 -8.104 -8.411 -8.717 -9.043 -9.209 -9.569 -9.797 -10.005 -10.212 -10.669 -10.918 -11.189 -11.477 -11.782 -12.148 -12.666 -14.244 -7 ,1508 ,KEBNE ,16723683,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:20:21 CET,0.0 1.516 2.014 2.329 2.602 2.84 3.05 3.24 3.603 3.775 3.927 4.055 4.362 4.489 4.744 4.977 5.186 5.283 5.464 5.637 5.896 6.057 6.216 6.444 6.665 6.873 7.068 7.26 7.485 7.699 7.906 8.145 8.376 8.612 8.871 9.133 9.37 9.618 9.872 10.142 10.429 10.727 11.033 11.285 11.551 11.84 12.095 12.198 12.131 11.79 10.721 8.869 7.077 5.637 4.454 3.385 2.451 1.548 0.735 -0.074 -0.765 -1.379 -1.969 -2.526 -3.018 -3.469 -3.966 -4.411 -4.798 -5.202 -5.601 -5.924 -6.264 -6.617 -6.892 -7.175 -7.467 -7.763 -8.087 -8.322 -8.556 -8.911 -9.162 -9.421 -9.552 -9.845 -10.165 -10.507 -10.687 -11.064 -11.292 -11.514 -11.739 -12.208 -12.471 -12.743 -13.034 -13.368 -13.782 -14.314 -15.459 -8 ,23771 ,KEBNE ,16723684,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:21:16 CET,0.0 1.005 1.434 1.75 2.004 2.247 2.48 2.689 3.058 3.226 3.383 3.506 3.817 3.954 4.202 4.419 4.628 4.736 4.939 5.122 5.39 5.559 5.726 5.959 6.167 6.369 6.573 6.764 6.999 7.222 7.44 7.688 7.907 8.119 8.358 8.631 8.902 9.177 9.45 9.733 10.03 10.341 10.651 10.916 11.178 11.413 11.618 11.748 11.704 11.32 10.318 8.827 7.354 5.959 4.734 3.629 2.607 1.674 0.915 0.148 -0.538 -1.139 -1.702 -2.256 -2.777 -3.241 -3.722 -4.16 -4.55 -4.958 -5.362 -5.698 -6.062 -6.42 -6.692 -6.986 -7.29 -7.607 -7.948 -8.184 -8.427 -8.796 -9.044 -9.308 -9.451 -9.751 -10.062 -10.374 -10.541 -10.907 -11.104 -11.308 -11.51 -11.97 -12.24 -12.527 -12.83 -13.2 -13.648 -14.184 -15.837 -9 ,25665 ,KEBNE ,16723685,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:20:19 CET,0.0 1.09 1.513 1.876 2.172 2.391 2.591 2.805 3.212 3.388 3.564 3.773 4.132 4.303 4.62 4.927 5.207 5.345 5.616 5.86 6.202 6.419 6.617 6.897 7.162 7.389 7.591 7.778 8.016 8.249 8.469 8.721 8.955 9.189 9.464 9.755 10.012 10.279 10.56 10.823 11.075 11.348 11.647 11.937 12.245 12.539 12.772 12.876 12.74 12.305 11.235 9.534 8.052 6.732 5.504 4.362 3.368 2.52 1.786 1.047 0.426 -0.141 -0.715 -1.262 -1.76 -2.212 -2.683 -3.115 -3.495 -3.876 -4.256 -4.575 -4.903 -5.237 -5.508 -5.789 -6.081 -6.382 -6.702 -6.928 -7.156 -7.509 -7.742 -7.986 -8.113 -8.385 -8.681 -9.004 -9.171 -9.523 -9.721 -9.927 -10.131 -10.576 -10.829 -11.116 -11.448 -11.805 -12.204 -12.718 -14.101 -10 ,21686 ,KEBNE ,16723686,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:20:36 CET,0.0 1.028 1.461 1.826 2.122 2.347 2.548 2.739 3.121 3.286 3.452 3.604 3.913 4.043 4.287 4.513 4.711 4.804 4.988 5.178 5.444 5.605 5.759 5.968 6.183 6.396 6.594 6.784 7.024 7.238 7.439 7.678 7.898 8.116 8.376 8.665 8.921 9.176 9.441 9.724 10.031 10.349 10.673 10.949 11.209 11.453 11.689 11.882 11.955 11.753 10.94 9.56 8.229 6.913 5.659 4.522 3.51 2.619 1.849 1.078 0.415 -0.196 -0.764 -1.295 -1.785 -2.228 -2.715 -3.149 -3.518 -3.909 -4.31 -4.628 -4.959 -5.322 -5.612 -5.911 -6.219 -6.535 -6.865 -7.098 -7.338 -7.709 -7.971 -8.249 -8.388 -8.664 -8.954 -9.259 -9.422 -9.763 -9.916 -10.098 -10.294 -10.749 -10.995 -11.273 -11.588 -11.918 -12.291 -12.807 -14.138 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 02aea178..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10211 ,KEBNE ,16723687,Sun Nov 28 03:30:06 CET,Sun Nov 28 05:20:31 CET,0.0 0.964 1.354 1.635 1.887 2.121 2.327 2.508 2.841 2.991 3.137 3.25 3.551 3.685 3.941 4.161 4.355 4.446 4.625 4.796 5.03 5.196 5.357 5.569 5.768 5.951 6.12 6.284 6.506 6.712 6.899 7.118 7.328 7.528 7.757 8.0 8.213 8.429 8.64 8.83 9.028 9.24 9.451 9.616 9.77 9.88 9.878 9.758 9.481 8.79 7.214 5.076 3.219 1.57 0.141 -1.11 -2.17 -3.098 -3.913 -4.725 -5.414 -6.044 -6.635 -7.18 -7.694 -8.164 -8.67 -9.124 -9.494 -9.872 -10.28 -10.614 -10.944 -11.287 -11.554 -11.824 -12.108 -12.406 -12.722 -12.94 -13.162 -13.501 -13.73 -13.979 -14.111 -14.37 -14.642 -14.947 -15.1 -15.431 -15.567 -15.744 -15.923 -16.311 -16.525 -16.781 -17.062 -17.342 -17.656 -18.057 -19.122 -2 ,6904 ,KEBNE ,16723688,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:20:26 CET,0.0 1.256 1.711 2.033 2.324 2.609 2.871 3.079 3.424 3.581 3.737 3.863 4.168 4.294 4.515 4.723 4.955 5.064 5.255 5.447 5.717 5.879 6.033 6.261 6.488 6.708 6.905 7.08 7.304 7.52 7.743 8.008 8.242 8.449 8.645 8.86 9.078 9.305 9.541 9.785 10.042 10.299 10.57 10.823 11.058 11.278 11.415 11.365 11.051 10.358 8.862 6.678 4.802 3.242 1.872 0.639 -0.455 -1.439 -2.276 -3.108 -3.802 -4.429 -5.033 -5.603 -6.125 -6.583 -7.07 -7.518 -7.893 -8.282 -8.691 -9.013 -9.343 -9.684 -9.948 -10.236 -10.562 -10.888 -11.195 -11.407 -11.629 -11.983 -12.235 -12.492 -12.622 -12.896 -13.164 -13.435 -13.578 -13.908 -14.056 -14.227 -14.401 -14.806 -15.015 -15.243 -15.508 -15.781 -16.091 -16.493 -17.517 -5 ,16212 ,KEBNE ,16723691,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:20:50 CET,0.0 0.85 1.235 1.543 1.791 2.0 2.202 2.391 2.727 2.893 3.049 3.162 3.463 3.59 3.817 4.041 4.24 4.334 4.524 4.693 4.931 5.092 5.241 5.444 5.638 5.825 6.012 6.199 6.444 6.651 6.829 7.06 7.26 7.438 7.661 7.912 8.129 8.354 8.585 8.815 9.038 9.251 9.471 9.652 9.83 9.975 9.989 9.873 9.552 8.849 7.384 5.277 3.387 1.755 0.403 -0.791 -1.889 -2.861 -3.647 -4.442 -5.148 -5.775 -6.358 -6.897 -7.398 -7.848 -8.321 -8.758 -9.14 -9.527 -9.922 -10.263 -10.619 -10.97 -11.23 -11.504 -11.814 -12.147 -12.49 -12.72 -12.946 -13.286 -13.519 -13.764 -13.893 -14.148 -14.418 -14.718 -14.878 -15.224 -15.366 -15.543 -15.732 -16.145 -16.372 -16.622 -16.894 -17.18 -17.471 -17.877 -18.851 -7 ,11872 ,KEBNE ,16723693,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:21:39 CET,0.0 1.114 1.515 1.841 2.115 2.37 2.606 2.82 3.185 3.34 3.487 3.597 3.891 4.011 4.242 4.463 4.67 4.776 4.981 5.169 5.432 5.588 5.735 5.952 6.165 6.367 6.541 6.704 6.918 7.105 7.27 7.475 7.671 7.856 8.075 8.317 8.549 8.796 9.031 9.255 9.452 9.626 9.806 9.972 10.109 10.202 10.21 10.058 9.71 8.931 7.284 5.076 3.099 1.393 -0.055 -1.284 -2.326 -3.274 -4.108 -4.95 -5.676 -6.314 -6.915 -7.479 -7.986 -8.443 -8.922 -9.352 -9.733 -10.121 -10.516 -10.836 -11.163 -11.499 -11.755 -12.034 -12.325 -12.617 -12.909 -13.107 -13.32 -13.646 -13.867 -14.104 -14.237 -14.519 -14.794 -15.081 -15.23 -15.569 -15.706 -15.877 -16.064 -16.467 -16.676 -16.888 -17.127 -17.427 -17.755 -18.183 -19.33 -10 ,23132 ,KEBNE ,16723696,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:20:15 CET,0.0 1.337 1.814 2.137 2.42 2.667 2.9 3.107 3.452 3.61 3.764 3.875 4.187 4.327 4.565 4.772 4.975 5.075 5.256 5.422 5.646 5.799 5.951 6.165 6.371 6.568 6.771 6.958 7.174 7.38 7.571 7.785 7.984 8.186 8.417 8.638 8.84 9.062 9.277 9.47 9.658 9.869 10.101 10.288 10.426 10.511 10.525 10.45 10.185 9.408 7.761 5.725 3.897 2.251 0.858 -0.371 -1.441 -2.448 -3.317 -4.165 -4.91 -5.545 -6.133 -6.708 -7.235 -7.717 -8.21 -8.633 -9.006 -9.398 -9.804 -10.134 -10.469 -10.829 -11.103 -11.365 -11.643 -11.953 -12.274 -12.493 -12.726 -13.081 -13.324 -13.587 -13.721 -13.991 -14.264 -14.554 -14.708 -15.057 -15.238 -15.434 -15.635 -16.053 -16.283 -16.552 -16.872 -17.214 -17.576 -18.031 -19.296 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt deleted file mode 100644 index 7b70bd25..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -7 ,32014 ,KEBNE ,16723703,Sun Nov 28 03:30:06 CET,Sun Nov 28 05:20:35 CET,0.0 1.09 1.614 1.945 2.212 2.474 2.7 2.888 3.256 3.428 3.582 3.691 3.993 4.125 4.372 4.596 4.805 4.911 5.113 5.302 5.568 5.727 5.875 6.104 6.331 6.527 6.715 6.904 7.136 7.357 7.569 7.818 8.046 8.267 8.516 8.772 9.017 9.271 9.52 9.773 10.048 10.363 10.679 10.956 11.268 11.582 11.887 12.13 12.288 12.187 11.44 10.266 9.178 8.145 7.176 6.278 5.489 4.797 4.164 3.514 2.961 2.466 2.001 1.556 1.152 0.776 0.366 -0.001 -0.317 -0.657 -1.023 -1.326 -1.643 -1.962 -2.211 -2.475 -2.746 -3.025 -3.312 -3.504 -3.701 -4.017 -4.229 -4.448 -4.561 -4.797 -5.054 -5.317 -5.447 -5.766 -5.898 -6.065 -6.244 -6.6 -6.784 -7.007 -7.275 -7.559 -7.901 -8.345 -9.266 -8 ,27616 ,KEBNE ,16723704,Sun Nov 28 03:30:06 CET,Sun Nov 28 05:19:43 CET,0.0 0.956 1.349 1.644 1.925 2.199 2.434 2.617 2.974 3.148 3.297 3.401 3.702 3.822 4.045 4.251 4.442 4.54 4.728 4.904 5.166 5.333 5.488 5.705 5.911 6.091 6.264 6.43 6.637 6.849 7.051 7.3 7.532 7.74 7.994 8.276 8.532 8.808 9.098 9.39 9.67 9.958 10.28 10.582 10.909 11.232 11.541 11.793 11.875 11.646 10.971 9.694 8.355 7.134 6.049 5.057 4.184 3.417 2.761 2.094 1.518 0.992 0.471 -0.014 -0.448 -0.852 -1.281 -1.663 -1.99 -2.322 -2.672 -2.96 -3.26 -3.576 -3.824 -4.072 -4.326 -4.607 -4.908 -5.113 -5.316 -5.63 -5.854 -6.081 -6.198 -6.441 -6.679 -6.949 -7.098 -7.424 -7.552 -7.71 -7.879 -8.261 -8.473 -8.691 -8.917 -9.182 -9.509 -9.965 -11.309 -9 ,5083 ,KEBNE ,16723705,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:20:28 CET,0.0 0.968 1.416 1.759 2.022 2.236 2.435 2.626 2.984 3.154 3.305 3.417 3.713 3.829 4.041 4.249 4.45 4.547 4.736 4.916 5.175 5.338 5.498 5.724 5.929 6.132 6.32 6.494 6.727 6.958 7.164 7.384 7.607 7.818 8.059 8.339 8.59 8.861 9.151 9.43 9.687 9.944 10.233 10.511 10.794 11.059 11.315 11.5 11.581 11.498 10.907 9.808 8.648 7.576 6.666 5.846 5.083 4.371 3.763 3.14 2.585 2.087 1.608 1.152 0.732 0.338 -0.079 -0.46 -0.782 -1.104 -1.449 -1.74 -2.031 -2.332 -2.579 -2.844 -3.102 -3.37 -3.661 -3.851 -4.047 -4.353 -4.561 -4.782 -4.903 -5.158 -5.424 -5.7 -5.846 -6.18 -6.34 -6.521 -6.716 -7.142 -7.359 -7.595 -7.862 -8.183 -8.569 -9.027 -9.877 -10 ,13305 ,KEBNE ,16723706,Sun Nov 28 03:30:06 CET,Sun Nov 28 05:20:01 CET,0.0 0.931 1.282 1.555 1.805 2.039 2.228 2.405 2.761 2.922 3.076 3.201 3.503 3.635 3.875 4.08 4.274 4.365 4.55 4.734 4.988 5.139 5.288 5.506 5.708 5.914 6.111 6.293 6.517 6.733 6.933 7.166 7.39 7.603 7.852 8.123 8.375 8.644 8.911 9.165 9.416 9.712 10.029 10.298 10.613 10.895 11.132 11.326 11.377 11.193 10.551 9.412 8.242 7.137 6.144 5.193 4.353 3.576 2.88 2.183 1.6 1.085 0.593 0.136 -0.3 -0.713 -1.147 -1.526 -1.847 -2.162 -2.492 -2.779 -3.072 -3.386 -3.634 -3.884 -4.147 -4.435 -4.749 -4.966 -5.181 -5.507 -5.724 -5.943 -6.058 -6.298 -6.549 -6.813 -6.954 -7.277 -7.432 -7.605 -7.778 -8.16 -8.371 -8.601 -8.852 -9.124 -9.429 -9.825 -10.893 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt deleted file mode 100644 index 40d7aeb3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3720 ,KEBNE ,16723707,Sun Nov 28 03:30:06 CET,Sun Nov 28 05:19:27 CET,0.0 0.468 0.707 0.887 1.068 1.256 1.421 1.559 1.81 1.936 2.061 2.123 2.4 2.499 2.69 2.889 3.081 3.176 3.356 3.521 3.759 3.905 4.05 4.268 4.472 4.663 4.842 5.019 5.24 5.448 5.652 5.891 6.112 6.323 6.577 6.863 7.132 7.436 7.758 8.08 8.418 8.794 9.217 9.617 10.038 10.454 10.921 11.428 11.987 12.483 12.7 12.46 11.987 11.474 10.938 10.375 9.845 9.325 8.851 8.356 7.938 7.559 7.184 6.825 6.475 6.165 5.833 5.51 5.235 4.964 4.662 4.389 4.093 3.785 3.555 3.312 3.054 2.774 2.44 2.202 1.98 1.666 1.447 1.21 1.081 0.817 0.563 0.289 0.14 -0.192 -0.394 -0.584 -0.78 -1.19 -1.453 -1.779 -2.119 -2.474 -2.909 -3.509 -5.304 -2 ,25961 ,KEBNE ,16723708,Sun Nov 28 03:30:06 CET,Sun Nov 28 05:19:17 CET,0.0 0.396 0.624 0.847 1.053 1.235 1.401 1.553 1.834 1.954 2.066 2.133 2.402 2.508 2.728 2.937 3.123 3.212 3.392 3.572 3.826 3.984 4.132 4.34 4.54 4.732 4.924 5.108 5.333 5.554 5.767 6.015 6.255 6.499 6.777 7.081 7.368 7.667 7.981 8.321 8.676 9.046 9.488 9.907 10.344 10.819 11.34 11.898 12.524 13.177 13.763 13.998 13.859 13.509 13.1 12.638 12.127 11.636 11.218 10.776 10.336 9.947 9.62 9.276 8.916 8.58 8.214 7.875 7.584 7.308 7.002 6.719 6.434 6.143 5.933 5.723 5.484 5.209 4.917 4.726 4.531 4.219 3.993 3.753 3.631 3.39 3.135 2.843 2.701 2.394 2.227 2.064 1.87 1.417 1.174 0.921 0.666 0.359 -0.011 -0.427 -1.62 -3 ,5846 ,KEBNE ,16723709,Sun Nov 28 03:30:06 CET,Sun Nov 28 05:19:20 CET,0.0 0.36 0.611 0.825 1.03 1.205 1.37 1.526 1.816 1.947 2.07 2.128 2.4 2.495 2.685 2.862 3.035 3.126 3.292 3.446 3.68 3.82 3.952 4.15 4.342 4.548 4.737 4.911 5.145 5.379 5.598 5.858 6.105 6.343 6.62 6.915 7.199 7.517 7.851 8.189 8.524 8.878 9.306 9.756 10.256 10.753 11.269 11.825 12.428 13.077 13.591 13.59 13.256 12.757 12.223 11.725 11.23 10.741 10.335 9.903 9.483 9.078 8.667 8.289 7.944 7.613 7.263 6.938 6.629 6.294 5.951 5.671 5.35 4.997 4.739 4.468 4.184 3.884 3.558 3.329 3.086 2.694 2.425 2.15 2.006 1.693 1.364 1.029 0.846 0.483 0.231 0.011 -0.232 -0.778 -1.077 -1.404 -1.791 -2.258 -2.774 -3.481 -6.365 -4 ,31350 ,KEBNE ,16723710,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:19:01 CET,0.0 0.516 0.823 1.036 1.217 1.403 1.584 1.748 2.06 2.199 2.326 2.381 2.654 2.765 2.967 3.148 3.315 3.4 3.586 3.777 4.031 4.179 4.322 4.533 4.741 4.939 5.133 5.326 5.557 5.776 5.995 6.25 6.481 6.712 6.974 7.248 7.52 7.822 8.138 8.466 8.796 9.151 9.561 9.991 10.489 10.96 11.463 12.043 12.63 13.132 13.462 13.307 12.911 12.362 11.783 11.278 10.805 10.289 9.784 9.282 8.85 8.451 8.058 7.686 7.344 7.013 6.673 6.387 6.116 5.836 5.558 5.304 5.023 4.738 4.501 4.235 3.952 3.667 3.383 3.174 2.965 2.652 2.414 2.151 2.012 1.731 1.454 1.142 0.972 0.627 0.414 0.23 0.009 -0.547 -0.843 -1.17 -1.544 -1.947 -2.386 -2.931 -4.453 -5 ,28428 ,KEBNE ,16723711,Sun Nov 28 03:30:07 CET,Sun Nov 28 05:19:02 CET,0.0 0.417 0.665 0.872 1.032 1.19 1.338 1.48 1.753 1.875 1.99 2.05 2.334 2.437 2.618 2.8 2.977 3.06 3.228 3.394 3.63 3.782 3.929 4.141 4.338 4.528 4.706 4.884 5.126 5.353 5.57 5.838 6.086 6.321 6.589 6.881 7.16 7.476 7.821 8.186 8.562 8.968 9.43 9.862 10.343 10.874 11.453 12.105 12.832 13.588 14.137 14.008 13.626 13.15 12.646 12.148 11.681 11.218 10.787 10.322 9.907 9.501 9.121 8.79 8.476 8.195 7.875 7.581 7.319 7.032 6.731 6.482 6.231 5.962 5.739 5.517 5.278 5.011 4.736 4.545 4.346 4.036 3.807 3.569 3.452 3.19 2.889 2.574 2.413 2.08 1.896 1.721 1.534 1.144 0.941 0.685 0.381 0.039 -0.37 -0.879 -2.157 -6 ,458 ,KEBNE ,16723712,Sun Nov 28 03:30:06 CET,Sun Nov 28 05:18:58 CET,0.0 0.433 0.683 0.919 1.114 1.269 1.429 1.594 1.866 1.996 2.134 2.224 2.51 2.614 2.812 3.021 3.217 3.312 3.505 3.684 3.936 4.092 4.235 4.451 4.661 4.858 5.048 5.236 5.481 5.709 5.923 6.179 6.416 6.647 6.906 7.183 7.442 7.727 8.034 8.344 8.668 9.022 9.418 9.798 10.223 10.677 11.177 11.702 12.263 12.82 13.244 13.286 13.021 12.582 12.094 11.626 11.126 10.643 10.202 9.716 9.3 8.913 8.542 8.184 7.838 7.522 7.178 6.869 6.604 6.318 6.02 5.769 5.51 5.242 5.025 4.804 4.572 4.317 4.054 3.868 3.659 3.339 3.112 2.88 2.763 2.52 2.283 2.019 1.877 1.567 1.405 1.243 1.079 0.702 0.483 0.232 -0.077 -0.398 -0.806 -1.507 -3.514 -7 ,13631 ,KEBNE ,16723713,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:21:19 CET,0.0 0.308 0.545 0.753 0.937 1.109 1.278 1.435 1.716 1.856 1.984 2.051 2.333 2.44 2.637 2.827 3.005 3.092 3.267 3.433 3.655 3.801 3.945 4.149 4.36 4.576 4.771 4.95 5.175 5.39 5.609 5.869 6.122 6.365 6.617 6.892 7.17 7.486 7.829 8.186 8.555 8.973 9.446 9.861 10.317 10.812 11.361 11.929 12.482 13.046 13.469 13.343 12.882 12.37 11.867 11.32 10.789 10.299 9.852 9.382 8.964 8.583 8.205 7.828 7.478 7.16 6.813 6.507 6.252 5.969 5.663 5.401 5.129 4.841 4.617 4.387 4.139 3.869 3.589 3.4 3.199 2.882 2.661 2.427 2.302 2.041 1.761 1.44 1.261 0.91 0.7 0.515 0.335 -0.062 -0.29 -0.529 -0.815 -1.146 -1.514 -2.03 -4.093 -9 ,32291 ,KEBNE ,16723715,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:20:46 CET,0.0 0.561 0.837 1.062 1.245 1.434 1.629 1.795 2.103 2.24 2.375 2.461 2.74 2.855 3.063 3.246 3.43 3.525 3.699 3.86 4.1 4.264 4.415 4.625 4.829 5.03 5.234 5.429 5.665 5.879 6.085 6.341 6.59 6.835 7.114 7.43 7.729 8.028 8.341 8.701 9.09 9.48 9.906 10.337 10.837 11.369 11.961 12.579 13.167 13.774 14.412 14.547 14.211 13.789 13.381 12.954 12.528 12.088 11.669 11.236 10.82 10.419 10.038 9.678 9.342 9.027 8.683 8.386 8.128 7.846 7.539 7.287 7.028 6.74 6.519 6.302 6.084 5.849 5.6 5.418 5.218 4.909 4.693 4.459 4.335 4.09 3.847 3.586 3.432 3.117 2.964 2.801 2.626 2.217 1.985 1.721 1.42 1.088 0.695 0.115 -1.378 -10 ,19725 ,KEBNE ,16723716,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:20:13 CET,0.0 0.481 0.741 0.963 1.162 1.349 1.511 1.655 1.925 2.05 2.159 2.207 2.494 2.603 2.809 3.008 3.186 3.273 3.441 3.603 3.837 3.979 4.115 4.324 4.528 4.731 4.924 5.103 5.33 5.548 5.751 5.998 6.25 6.491 6.762 7.054 7.33 7.614 7.92 8.263 8.616 8.997 9.434 9.863 10.331 10.85 11.44 12.059 12.728 13.377 13.79 13.793 13.377 12.798 12.283 11.778 11.204 10.569 9.982 9.411 8.94 8.496 8.067 7.659 7.262 6.884 6.491 6.143 5.827 5.483 5.129 4.848 4.557 4.24 3.989 3.729 3.456 3.178 2.89 2.696 2.504 2.173 1.932 1.698 1.572 1.307 1.019 0.711 0.561 0.24 0.077 -0.097 -0.294 -0.731 -0.982 -1.268 -1.577 -1.904 -2.291 -2.851 -4.441 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 647944cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21814 ,KEBNE ,16723717,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:20:50 CET,0.0 1.144 1.549 1.829 2.079 2.321 2.541 2.752 3.126 3.293 3.456 3.562 3.903 4.036 4.307 4.561 4.797 4.916 5.142 5.356 5.669 5.877 6.079 6.372 6.664 6.937 7.182 7.429 7.754 8.051 8.35 8.715 9.048 9.36 9.739 10.173 10.579 11.002 11.451 11.945 12.473 13.085 13.82 14.561 15.382 16.241 17.192 18.247 19.47 20.838 22.355 23.33 23.662 23.684 23.558 23.378 23.154 22.91 22.678 22.436 22.188 21.95 21.731 21.513 21.289 21.069 20.829 20.618 20.449 20.263 20.055 19.863 19.658 19.454 19.286 19.109 18.926 18.729 18.522 18.385 18.238 18.004 17.842 17.672 17.588 17.407 17.202 16.969 16.838 16.529 16.47 16.338 16.203 15.867 15.67 15.452 15.204 14.938 14.638 14.246 13.236 -2 ,1747 ,KEBNE ,16723718,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:22:37 CET,0.0 0.806 1.271 1.647 1.95 2.218 2.47 2.682 3.073 3.248 3.413 3.532 3.885 4.04 4.349 4.641 4.907 5.032 5.275 5.519 5.847 6.042 6.241 6.535 6.822 7.099 7.363 7.616 7.944 8.258 8.562 8.927 9.281 9.62 10.01 10.451 10.888 11.36 11.865 12.408 12.961 13.571 14.272 14.975 15.798 16.702 17.728 18.864 20.141 21.563 23.083 24.1 24.495 24.579 24.517 24.348 24.11 23.861 23.625 23.365 23.104 22.828 22.578 22.334 22.082 21.856 21.589 21.335 21.13 20.919 20.693 20.502 20.291 20.079 19.91 19.723 19.519 19.303 19.091 18.947 18.792 18.546 18.377 18.187 18.084 17.864 17.633 17.394 17.263 16.941 16.849 16.706 16.56 16.199 15.993 15.788 15.548 15.297 15.0 14.576 13.551 -3 ,23636 ,KEBNE ,16723719,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:22:08 CET,0.0 1.033 1.427 1.713 1.955 2.178 2.392 2.585 2.943 3.117 3.291 3.426 3.777 3.915 4.171 4.422 4.689 4.816 5.03 5.228 5.521 5.716 5.902 6.16 6.409 6.659 6.906 7.142 7.479 7.83 8.185 8.608 8.988 9.346 9.761 10.229 10.684 11.156 11.636 12.141 12.657 13.23 13.902 14.589 15.406 16.279 17.226 18.307 19.564 20.979 22.547 23.583 23.982 24.128 24.124 23.973 23.755 23.51 23.264 23.013 22.771 22.535 22.293 22.049 21.814 21.589 21.348 21.127 20.928 20.711 20.473 20.281 20.084 19.877 19.712 19.532 19.335 19.131 18.909 18.747 18.586 18.327 18.147 17.972 17.882 17.697 17.507 17.291 17.173 16.869 16.8 16.669 16.516 16.191 16.021 15.82 15.595 15.338 15.038 14.641 13.441 -4 ,5689 ,KEBNE ,16723720,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:22:08 CET,0.0 0.966 1.309 1.581 1.847 2.081 2.285 2.489 2.868 3.037 3.198 3.284 3.612 3.753 4.033 4.304 4.565 4.69 4.925 5.152 5.479 5.686 5.887 6.185 6.473 6.744 7.0 7.252 7.586 7.903 8.205 8.562 8.91 9.25 9.628 10.045 10.445 10.893 11.377 11.89 12.45 13.099 13.85 14.604 15.481 16.452 17.547 18.716 20.048 21.55 23.19 24.349 24.795 24.874 24.784 24.639 24.453 24.231 24.002 23.735 23.457 23.195 22.944 22.692 22.461 22.247 22.017 21.805 21.62 21.426 21.204 21.01 20.8 20.582 20.405 20.219 20.031 19.833 19.629 19.491 19.348 19.108 18.941 18.767 18.671 18.467 18.252 18.025 17.914 17.625 17.527 17.388 17.262 16.968 16.8 16.606 16.373 16.144 15.873 15.451 14.44 -5 ,22348 ,KEBNE ,16723721,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:21:25 CET,0.0 0.933 1.324 1.636 1.906 2.163 2.4 2.619 3.021 3.188 3.344 3.442 3.779 3.916 4.189 4.451 4.693 4.813 5.045 5.259 5.575 5.782 5.982 6.281 6.56 6.822 7.084 7.337 7.657 7.96 8.252 8.606 8.956 9.294 9.679 10.099 10.487 10.922 11.412 11.925 12.455 13.051 13.737 14.434 15.233 16.081 17.016 18.09 19.38 20.88 22.599 23.716 24.07 24.129 24.03 23.847 23.607 23.364 23.148 22.902 22.687 22.49 22.277 22.047 21.818 21.602 21.368 21.157 20.969 20.768 20.548 20.361 20.167 19.959 19.802 19.635 19.456 19.273 19.065 18.911 18.753 18.512 18.354 18.189 18.1 17.899 17.678 17.456 17.35 17.06 17.012 16.88 16.74 16.456 16.28 16.081 15.855 15.582 15.273 14.873 13.881 -6 ,31037 ,KEBNE ,16723722,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:21:53 CET,0.0 1.042 1.455 1.79 2.104 2.392 2.649 2.886 3.31 3.5 3.678 3.804 4.155 4.29 4.539 4.777 5.022 5.143 5.372 5.593 5.917 6.12 6.318 6.622 6.91 7.181 7.442 7.688 8.007 8.317 8.62 8.987 9.341 9.681 10.06 10.476 10.871 11.306 11.781 12.278 12.809 13.434 14.155 14.848 15.647 16.535 17.506 18.576 19.819 21.2 22.714 23.761 24.154 24.196 24.058 23.832 23.604 23.364 23.113 22.825 22.573 22.356 22.121 21.85 21.598 21.389 21.152 20.925 20.725 20.514 20.29 20.097 19.883 19.66 19.489 19.309 19.122 18.93 18.734 18.588 18.424 18.187 18.029 17.849 17.756 17.573 17.363 17.135 17.02 16.719 16.639 16.494 16.347 16.021 15.822 15.596 15.351 15.099 14.837 14.486 13.512 -8 ,12164 ,KEBNE ,16723724,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:20:38 CET,0.0 0.89 1.282 1.627 1.945 2.213 2.461 2.666 3.019 3.186 3.343 3.442 3.779 3.911 4.166 4.415 4.674 4.804 5.066 5.346 5.734 5.954 6.157 6.441 6.723 6.999 7.257 7.501 7.801 8.098 8.4 8.76 9.096 9.426 9.805 10.23 10.628 11.052 11.533 12.048 12.568 13.149 13.845 14.536 15.322 16.204 17.222 18.353 19.592 20.935 22.349 23.193 23.485 23.551 23.471 23.283 23.052 22.795 22.563 22.31 22.053 21.806 21.558 21.297 21.053 20.836 20.587 20.364 20.163 19.951 19.736 19.538 19.331 19.116 18.942 18.754 18.558 18.36 18.147 17.99 17.831 17.588 17.401 17.205 17.112 16.901 16.667 16.428 16.298 15.986 15.896 15.744 15.59 15.252 15.061 14.859 14.649 14.412 14.109 13.708 12.683 -9 ,31129 ,KEBNE ,16723725,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:21:18 CET,0.0 0.947 1.335 1.631 1.906 2.16 2.375 2.572 2.929 3.089 3.242 3.351 3.693 3.826 4.096 4.355 4.597 4.713 4.936 5.161 5.482 5.683 5.875 6.142 6.4 6.656 6.899 7.132 7.44 7.748 8.05 8.415 8.765 9.094 9.476 9.912 10.327 10.773 11.257 11.774 12.326 12.935 13.631 14.338 15.168 16.085 17.126 18.3 19.615 21.05 22.616 23.689 24.062 24.088 23.961 23.766 23.556 23.308 23.049 22.756 22.476 22.211 21.946 21.698 21.451 21.21 20.938 20.689 20.478 20.236 19.988 19.797 19.598 19.388 19.215 19.034 18.849 18.66 18.461 18.318 18.164 17.924 17.758 17.582 17.488 17.285 17.061 16.831 16.715 16.409 16.326 16.173 16.003 15.649 15.456 15.244 15.012 14.739 14.413 14.034 13.354 -10 ,27858 ,KEBNE ,16723726,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:20:24 CET,0.0 1.0 1.419 1.735 2.016 2.263 2.459 2.649 3.04 3.213 3.381 3.518 3.867 4.018 4.286 4.54 4.782 4.899 5.125 5.352 5.673 5.878 6.08 6.368 6.647 6.912 7.178 7.445 7.792 8.132 8.458 8.846 9.209 9.548 9.943 10.391 10.808 11.249 11.716 12.211 12.735 13.332 14.029 14.727 15.529 16.365 17.343 18.488 19.739 21.128 22.706 23.737 24.156 24.311 24.258 24.108 23.95 23.718 23.47 23.207 22.941 22.701 22.457 22.207 21.969 21.741 21.497 21.266 21.069 20.865 20.644 20.451 20.24 20.027 19.857 19.668 19.473 19.273 19.056 18.905 18.75 18.504 18.328 18.143 18.047 17.839 17.617 17.378 17.251 16.935 16.847 16.697 16.541 16.191 15.989 15.777 15.536 15.264 14.975 14.591 13.537 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index e108d43b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,1603 ,KEBNE ,16723729,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:21:46 CET,0.0 0.942 1.411 1.763 2.088 2.374 2.629 2.863 3.281 3.477 3.662 3.788 4.115 4.261 4.538 4.805 5.052 5.171 5.412 5.634 5.936 6.127 6.31 6.568 6.809 7.053 7.29 7.525 7.842 8.132 8.42 8.769 9.091 9.398 9.755 10.158 10.529 10.924 11.338 11.777 12.25 12.777 13.365 13.931 14.583 15.287 16.103 16.997 17.933 18.945 19.93 20.357 20.325 20.073 19.717 19.347 18.97 18.591 18.239 17.854 17.515 17.216 16.924 16.618 16.327 16.069 15.792 15.534 15.288 15.034 14.787 14.568 14.34 14.117 13.945 13.761 13.557 13.342 13.122 12.969 12.804 12.528 12.329 12.122 12.01 11.787 11.562 11.314 11.176 10.857 10.729 10.558 10.376 10.012 9.81 9.571 9.334 9.069 8.755 8.356 7.333 -7 ,23640 ,KEBNE ,16723733,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:22:37 CET,0.0 0.747 1.124 1.446 1.714 1.948 2.167 2.383 2.779 2.963 3.135 3.271 3.594 3.731 4.0 4.253 4.481 4.593 4.805 4.994 5.263 5.444 5.618 5.869 6.108 6.343 6.57 6.798 7.092 7.364 7.643 7.987 8.305 8.605 8.944 9.33 9.707 10.104 10.515 10.947 11.396 11.881 12.458 13.033 13.677 14.386 15.148 15.978 16.918 17.934 18.929 19.357 19.332 19.128 18.85 18.507 18.129 17.79 17.49 17.127 16.78 16.462 16.144 15.827 15.549 15.303 15.022 14.767 14.546 14.308 14.055 13.831 13.597 13.353 13.159 12.964 12.768 12.545 12.306 12.142 11.97 11.72 11.544 11.349 11.246 11.028 10.808 10.585 10.465 10.152 10.03 9.874 9.718 9.346 9.141 8.927 8.691 8.44 8.115 7.637 6.57 -8 ,18095 ,KEBNE ,16723734,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:22:20 CET,0.0 1.057 1.569 1.922 2.211 2.452 2.66 2.847 3.203 3.378 3.552 3.702 4.036 4.179 4.455 4.704 4.941 5.056 5.273 5.48 5.792 5.999 6.194 6.472 6.747 7.013 7.264 7.502 7.803 8.093 8.366 8.687 9.006 9.313 9.657 10.037 10.384 10.758 11.186 11.625 12.066 12.581 13.161 13.718 14.36 15.053 15.797 16.597 17.473 18.416 19.346 19.82 19.879 19.714 19.404 19.011 18.604 18.174 17.777 17.402 17.073 16.772 16.498 16.2 15.899 15.643 15.371 15.111 14.875 14.614 14.334 14.105 13.872 13.636 13.451 13.255 13.044 12.823 12.596 12.438 12.269 11.977 11.761 11.558 11.456 11.248 11.028 10.786 10.668 10.369 10.253 10.089 9.922 9.575 9.376 9.168 8.965 8.746 8.461 8.072 6.81 -9 ,21088 ,KEBNE ,16723735,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:21:36 CET,0.0 1.082 1.523 1.838 2.099 2.355 2.594 2.808 3.196 3.373 3.527 3.637 3.978 4.13 4.406 4.657 4.893 5.007 5.226 5.422 5.698 5.89 6.076 6.332 6.591 6.844 7.092 7.33 7.63 7.918 8.186 8.505 8.805 9.103 9.458 9.866 10.25 10.631 11.034 11.466 11.916 12.412 12.976 13.527 14.163 14.87 15.643 16.475 17.41 18.371 19.248 19.684 19.64 19.355 18.942 18.513 18.144 17.766 17.386 16.991 16.64 16.315 15.999 15.697 15.423 15.153 14.845 14.574 14.347 14.119 13.874 13.661 13.44 13.211 13.033 12.837 12.627 12.413 12.185 12.019 11.857 11.607 11.429 11.247 11.145 10.931 10.711 10.474 10.351 10.051 9.952 9.796 9.644 9.325 9.135 8.929 8.714 8.459 8.173 7.776 6.685 -10 ,10481 ,KEBNE ,16723736,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:22:39 CET,0.0 1.13 1.546 1.852 2.118 2.357 2.58 2.793 3.181 3.353 3.524 3.663 3.995 4.143 4.42 4.669 4.906 5.018 5.232 5.441 5.751 5.948 6.136 6.415 6.679 6.928 7.171 7.411 7.715 7.997 8.269 8.604 8.929 9.226 9.569 9.969 10.356 10.769 11.192 11.625 12.076 12.58 13.141 13.696 14.35 15.067 15.831 16.602 17.485 18.427 19.287 19.703 19.688 19.443 19.07 18.677 18.293 17.913 17.591 17.243 16.907 16.577 16.263 15.976 15.682 15.401 15.107 14.848 14.629 14.402 14.168 13.967 13.747 13.513 13.317 13.113 12.893 12.655 12.428 12.269 12.101 11.831 11.635 11.431 11.331 11.119 10.881 10.633 10.498 10.165 10.017 9.852 9.681 9.307 9.101 8.891 8.672 8.417 8.119 7.712 6.511 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index ee87c124..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25616 ,KEBNE ,16723737,Sun Nov 28 03:31:08 CET,Sun Nov 28 05:22:24 CET,0.0 0.893 1.3 1.625 1.912 2.149 2.37 2.575 2.925 3.076 3.224 3.327 3.625 3.742 3.966 4.172 4.361 4.454 4.642 4.827 5.087 5.255 5.418 5.644 5.859 6.063 6.253 6.429 6.653 6.862 7.062 7.305 7.545 7.782 8.03 8.286 8.534 8.797 9.078 9.381 9.69 10.015 10.367 10.706 11.063 11.354 11.591 11.794 11.952 11.875 11.271 10.222 9.137 8.12 7.205 6.346 5.576 4.859 4.228 3.602 3.057 2.572 2.12 1.684 1.277 0.894 0.48 0.129 -0.171 -0.477 -0.791 -1.059 -1.34 -1.63 -1.847 -2.076 -2.318 -2.562 -2.804 -2.979 -3.17 -3.448 -3.633 -3.84 -3.952 -4.185 -4.441 -4.703 -4.831 -5.152 -5.277 -5.434 -5.595 -5.933 -6.122 -6.341 -6.585 -6.857 -7.184 -7.62 -8.519 -3 ,14696 ,KEBNE ,16723739,Sun Nov 28 03:32:09 CET,Sun Nov 28 05:23:46 CET,0.0 0.97 1.334 1.628 1.883 2.112 2.318 2.5 2.841 3.008 3.163 3.271 3.583 3.711 3.968 4.207 4.419 4.523 4.729 4.915 5.167 5.337 5.499 5.733 5.951 6.156 6.358 6.549 6.788 7.016 7.226 7.467 7.696 7.909 8.154 8.428 8.681 8.954 9.245 9.558 9.869 10.173 10.494 10.792 11.111 11.436 11.726 11.921 12.035 11.928 11.268 10.129 8.98 7.917 6.962 6.088 5.316 4.619 4.007 3.389 2.875 2.404 1.923 1.467 1.055 0.683 0.291 -0.073 -0.384 -0.695 -1.011 -1.281 -1.578 -1.895 -2.141 -2.385 -2.623 -2.877 -3.153 -3.339 -3.519 -3.795 -3.994 -4.198 -4.303 -4.53 -4.782 -5.056 -5.192 -5.503 -5.591 -5.742 -5.904 -6.264 -6.464 -6.693 -6.935 -7.184 -7.508 -7.955 -8.975 -4 ,9066 ,KEBNE ,16723740,Sun Nov 28 03:32:09 CET,Sun Nov 28 05:23:34 CET,0.0 0.959 1.377 1.721 2.014 2.261 2.495 2.702 3.045 3.203 3.358 3.5 3.841 3.984 4.252 4.512 4.746 4.857 5.071 5.274 5.55 5.732 5.906 6.141 6.375 6.611 6.828 7.021 7.264 7.51 7.749 8.03 8.304 8.557 8.844 9.172 9.479 9.79 10.093 10.381 10.68 11.002 11.318 11.627 11.98 12.292 12.568 12.801 12.912 12.797 12.211 11.044 9.889 8.874 7.97 7.122 6.345 5.658 5.062 4.433 3.884 3.401 2.943 2.503 2.096 1.717 1.322 0.979 0.679 0.368 0.049 -0.206 -0.478 -0.775 -1.001 -1.234 -1.479 -1.72 -1.968 -2.149 -2.333 -2.635 -2.849 -3.067 -3.182 -3.405 -3.631 -3.886 -4.019 -4.346 -4.467 -4.623 -4.776 -5.117 -5.329 -5.56 -5.822 -6.099 -6.423 -6.843 -7.639 -5 ,9604 ,KEBNE ,16723741,Sun Nov 28 03:32:09 CET,Sun Nov 28 05:23:07 CET,0.0 1.012 1.413 1.733 2.019 2.275 2.485 2.686 3.051 3.209 3.357 3.469 3.782 3.912 4.151 4.365 4.564 4.657 4.845 5.04 5.312 5.48 5.65 5.882 6.096 6.298 6.499 6.692 6.941 7.192 7.424 7.682 7.908 8.121 8.366 8.638 8.889 9.148 9.404 9.669 9.948 10.251 10.596 10.899 11.209 11.497 11.746 11.903 11.944 11.844 11.237 10.057 8.89 7.821 6.883 6.016 5.24 4.523 3.875 3.222 2.685 2.207 1.751 1.317 0.906 0.533 0.15 -0.188 -0.47 -0.76 -1.077 -1.344 -1.622 -1.906 -2.126 -2.357 -2.606 -2.876 -3.156 -3.348 -3.537 -3.826 -4.028 -4.231 -4.334 -4.554 -4.8 -5.077 -5.225 -5.556 -5.672 -5.827 -5.99 -6.335 -6.505 -6.692 -6.933 -7.187 -7.462 -7.83 -8.818 -6 ,12902 ,KEBNE ,16723742,Sun Nov 28 03:32:09 CET,Sun Nov 28 05:23:28 CET,0.0 0.886 1.309 1.633 1.909 2.155 2.362 2.538 2.851 3.006 3.149 3.227 3.535 3.662 3.888 4.105 4.31 4.408 4.602 4.804 5.078 5.239 5.401 5.626 5.829 6.023 6.211 6.397 6.639 6.871 7.083 7.332 7.572 7.792 8.038 8.307 8.564 8.824 9.1 9.385 9.663 9.974 10.298 10.595 10.914 11.221 11.496 11.734 11.878 11.8 11.257 10.167 9.054 8.04 7.141 6.281 5.492 4.77 4.154 3.541 2.997 2.497 2.014 1.569 1.167 0.797 0.414 0.058 -0.244 -0.551 -0.878 -1.151 -1.444 -1.746 -1.975 -2.214 -2.464 -2.712 -2.963 -3.147 -3.347 -3.649 -3.856 -4.079 -4.19 -4.417 -4.664 -4.92 -5.051 -5.358 -5.418 -5.56 -5.723 -6.068 -6.241 -6.429 -6.649 -6.891 -7.173 -7.571 -8.901 -8 ,22428 ,KEBNE ,16723744,Sun Nov 28 03:32:09 CET,Sun Nov 28 05:23:24 CET,0.0 0.95 1.367 1.704 1.978 2.203 2.392 2.574 2.951 3.103 3.246 3.345 3.648 3.781 4.019 4.231 4.428 4.523 4.717 4.905 5.175 5.35 5.521 5.759 5.974 6.171 6.351 6.531 6.769 6.993 7.203 7.435 7.651 7.874 8.126 8.394 8.644 8.913 9.195 9.47 9.744 10.045 10.379 10.686 11.02 11.384 11.726 11.937 11.996 11.855 11.218 10.063 8.929 7.904 6.991 6.125 5.316 4.583 3.983 3.376 2.828 2.353 1.914 1.484 1.082 0.723 0.339 -0.01 -0.311 -0.613 -0.926 -1.198 -1.481 -1.766 -1.984 -2.211 -2.447 -2.704 -2.971 -3.152 -3.344 -3.641 -3.849 -4.074 -4.19 -4.424 -4.667 -4.926 -5.058 -5.374 -5.489 -5.641 -5.812 -6.183 -6.379 -6.598 -6.836 -7.116 -7.456 -7.928 -9.017 -9 ,7905 ,KEBNE ,16723745,Sun Nov 28 03:32:09 CET,Sun Nov 28 05:22:21 CET,0.0 0.982 1.409 1.75 2.02 2.232 2.437 2.634 2.968 3.126 3.281 3.387 3.693 3.821 4.066 4.286 4.493 4.595 4.793 4.978 5.237 5.393 5.541 5.767 5.983 6.181 6.376 6.565 6.807 7.035 7.25 7.513 7.766 8.013 8.282 8.573 8.849 9.164 9.496 9.811 10.148 10.52 10.9 11.218 11.559 11.94 12.299 12.541 12.624 12.48 11.849 10.7 9.578 8.482 7.49 6.633 5.855 5.139 4.534 3.948 3.431 2.939 2.465 2.024 1.635 1.294 0.924 0.569 0.254 -0.067 -0.392 -0.654 -0.917 -1.183 -1.398 -1.626 -1.858 -2.101 -2.345 -2.511 -2.694 -2.997 -3.21 -3.429 -3.541 -3.771 -4.016 -4.272 -4.412 -4.737 -4.838 -4.995 -5.171 -5.551 -5.745 -5.937 -6.167 -6.435 -6.707 -7.066 -8.077 -10 ,13389 ,KEBNE ,16723746,Sun Nov 28 03:32:09 CET,Sun Nov 28 05:23:16 CET,0.0 0.805 1.192 1.519 1.81 2.058 2.281 2.494 2.845 2.993 3.137 3.226 3.536 3.665 3.893 4.102 4.31 4.416 4.621 4.808 5.074 5.241 5.403 5.634 5.855 6.069 6.271 6.472 6.722 6.954 7.183 7.449 7.696 7.942 8.219 8.515 8.789 9.087 9.398 9.691 9.982 10.299 10.635 10.973 11.35 11.695 12.02 12.266 12.393 12.312 11.808 10.752 9.619 8.555 7.604 6.727 5.947 5.229 4.604 3.972 3.393 2.882 2.408 1.962 1.564 1.187 0.785 0.428 0.122 -0.193 -0.516 -0.784 -1.073 -1.358 -1.57 -1.797 -2.034 -2.28 -2.536 -2.711 -2.895 -3.188 -3.386 -3.588 -3.691 -3.91 -4.153 -4.403 -4.538 -4.864 -4.979 -5.14 -5.295 -5.646 -5.849 -6.058 -6.294 -6.572 -6.893 -7.312 -8.513 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index bff3ab4f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6340 ,KEBNE ,16723747,Sun Nov 28 03:32:09 CET,Sun Nov 28 05:21:50 CET,0.0 0.915 1.284 1.576 1.825 2.051 2.256 2.436 2.775 2.934 3.084 3.192 3.492 3.62 3.872 4.109 4.329 4.437 4.644 4.845 5.133 5.316 5.493 5.75 6.018 6.266 6.494 6.729 7.025 7.295 7.558 7.875 8.183 8.484 8.834 9.239 9.628 10.056 10.521 10.992 11.481 12.046 12.685 13.322 14.08 14.911 15.82 16.809 17.956 19.247 20.645 21.581 21.906 21.953 21.902 21.764 21.524 21.25 20.97 20.659 20.408 20.155 19.864 19.598 19.353 19.096 18.793 18.512 18.275 18.045 17.814 17.578 17.302 17.009 16.768 16.529 16.307 16.087 15.822 15.619 15.406 15.083 14.865 14.628 14.511 14.278 14.02 13.743 13.589 13.27 13.068 12.862 12.656 12.214 11.97 11.709 11.404 11.022 10.527 9.837 7.187 -2 ,3341 ,KEBNE ,16723748,Sun Nov 28 03:32:09 CET,Sun Nov 28 05:22:08 CET,0.0 0.911 1.262 1.53 1.775 2.009 2.216 2.409 2.764 2.922 3.074 3.192 3.499 3.633 3.899 4.148 4.382 4.496 4.721 4.936 5.229 5.418 5.602 5.864 6.118 6.358 6.59 6.825 7.14 7.435 7.699 8.02 8.343 8.654 9.024 9.446 9.835 10.238 10.666 11.127 11.621 12.185 12.831 13.477 14.226 15.044 15.949 16.932 18.1 19.458 20.914 21.847 22.206 22.284 22.161 21.952 21.726 21.478 21.219 20.894 20.608 20.349 20.089 19.845 19.594 19.335 19.049 18.806 18.604 18.391 18.154 17.959 17.755 17.501 17.271 17.035 16.791 16.523 16.238 16.036 15.855 15.547 15.31 15.073 14.947 14.694 14.441 14.156 13.991 13.652 13.437 13.213 12.961 12.423 12.16 11.897 11.597 11.239 10.77 10.009 8.033 -3 ,16312 ,KEBNE ,16723749,Sun Nov 28 03:32:09 CET,Sun Nov 28 05:22:39 CET,0.0 0.803 1.201 1.54 1.8 2.014 2.217 2.402 2.739 2.905 3.069 3.186 3.506 3.647 3.908 4.16 4.399 4.521 4.759 4.978 5.283 5.472 5.659 5.937 6.203 6.458 6.706 6.946 7.246 7.526 7.796 8.134 8.479 8.815 9.191 9.609 10.011 10.472 10.967 11.462 11.971 12.527 13.169 13.804 14.515 15.313 16.245 17.258 18.402 19.699 21.056 21.911 22.204 22.199 22.091 21.853 21.543 21.228 20.891 20.493 20.152 19.858 19.565 19.278 19.014 18.771 18.492 18.212 17.97 17.734 17.464 17.217 16.961 16.691 16.488 16.275 16.045 15.821 15.587 15.415 15.217 14.867 14.607 14.337 14.184 13.847 13.511 13.147 12.961 12.625 12.457 12.284 12.097 11.675 11.447 11.176 10.851 10.477 9.989 9.305 6.994 -4 ,3539 ,KEBNE ,16723750,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:24:35 CET,0.0 0.757 1.101 1.39 1.647 1.879 2.08 2.253 2.586 2.744 2.893 3.001 3.314 3.438 3.681 3.921 4.146 4.256 4.469 4.676 4.976 5.158 5.337 5.609 5.869 6.117 6.358 6.589 6.883 7.161 7.434 7.761 8.08 8.385 8.712 9.073 9.432 9.838 10.276 10.747 11.228 11.753 12.365 12.999 13.721 14.521 15.481 16.516 17.642 18.865 20.138 20.992 21.342 21.422 21.342 21.15 20.894 20.603 20.337 20.057 19.806 19.57 19.283 18.953 18.628 18.353 18.064 17.776 17.499 17.193 16.877 16.618 16.361 16.099 15.892 15.658 15.388 15.104 14.813 14.602 14.383 13.993 13.694 13.369 13.192 12.821 12.443 12.054 11.838 11.439 11.101 10.848 10.581 9.984 9.627 9.243 8.84 8.373 7.808 7.054 4.781 -5 ,15098 ,KEBNE ,16723751,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:23:41 CET,0.0 0.763 1.148 1.442 1.677 1.878 2.079 2.275 2.621 2.781 2.936 3.06 3.364 3.49 3.729 3.953 4.177 4.282 4.486 4.686 4.972 5.155 5.334 5.592 5.839 6.078 6.323 6.569 6.884 7.184 7.46 7.78 8.091 8.392 8.733 9.119 9.497 9.911 10.342 10.804 11.291 11.823 12.459 13.099 13.825 14.623 15.531 16.539 17.65 18.859 20.237 21.178 21.522 21.635 21.611 21.491 21.315 21.11 20.869 20.551 20.256 19.96 19.671 19.417 19.164 18.919 18.623 18.319 18.068 17.819 17.554 17.327 17.059 16.752 16.524 16.298 16.053 15.793 15.531 15.358 15.177 14.87 14.643 14.39 14.25 13.941 13.607 13.259 13.08 12.724 12.485 12.26 12.01 11.488 11.203 10.889 10.551 10.162 9.705 9.085 7.163 -6 ,26573 ,KEBNE ,16723752,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:24:19 CET,0.0 0.878 1.255 1.554 1.804 2.038 2.253 2.437 2.806 2.976 3.131 3.26 3.579 3.714 3.965 4.21 4.453 4.573 4.795 4.996 5.278 5.466 5.651 5.917 6.185 6.446 6.695 6.925 7.218 7.507 7.793 8.129 8.437 8.733 9.087 9.475 9.83 10.229 10.65 11.109 11.63 12.192 12.81 13.43 14.157 14.958 15.87 16.899 18.074 19.399 20.801 21.666 22.01 22.081 22.014 21.86 21.635 21.388 21.121 20.794 20.522 20.273 20.024 19.773 19.476 19.198 18.941 18.689 18.461 18.225 17.964 17.756 17.508 17.232 17.021 16.788 16.547 16.283 15.97 15.739 15.506 15.115 14.833 14.571 14.433 14.125 13.789 13.397 13.189 12.842 12.616 12.388 12.139 11.548 11.222 10.86 10.384 9.818 9.119 8.253 6.126 -7 ,28790 ,KEBNE ,16723753,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:23:21 CET,0.0 0.92 1.343 1.685 1.979 2.244 2.462 2.677 3.084 3.25 3.407 3.523 3.833 3.97 4.238 4.486 4.715 4.825 5.044 5.263 5.57 5.764 5.958 6.248 6.532 6.795 7.053 7.306 7.61 7.901 8.189 8.538 8.881 9.21 9.584 10.012 10.42 10.845 11.31 11.798 12.286 12.85 13.545 14.232 15.011 15.892 16.866 17.891 19.029 20.296 21.679 22.553 22.842 22.838 22.721 22.543 22.35 22.142 21.904 21.605 21.293 20.967 20.673 20.424 20.168 19.888 19.532 19.169 18.866 18.57 18.244 17.963 17.654 17.31 17.041 16.79 16.552 16.282 15.975 15.763 15.555 15.241 15.021 14.791 14.667 14.397 14.082 13.739 13.566 13.213 12.979 12.779 12.56 12.055 11.783 11.493 11.144 10.702 10.163 9.448 7.325 -8 ,1346 ,KEBNE ,16723754,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:23:28 CET,0.0 0.791 1.098 1.365 1.629 1.85 2.048 2.254 2.624 2.803 2.975 3.111 3.424 3.561 3.824 4.064 4.281 4.389 4.604 4.811 5.106 5.296 5.476 5.742 6.006 6.25 6.478 6.692 6.963 7.243 7.521 7.847 8.167 8.494 8.866 9.261 9.645 10.051 10.476 10.932 11.401 11.936 12.57 13.203 13.922 14.697 15.592 16.584 17.699 18.989 20.458 21.381 21.658 21.701 21.595 21.407 21.164 20.885 20.624 20.313 20.005 19.74 19.48 19.214 18.927 18.657 18.384 18.121 17.887 17.628 17.328 17.064 16.794 16.516 16.292 16.046 15.773 15.481 15.172 14.961 14.744 14.367 14.09 13.828 13.709 13.468 13.202 12.904 12.746 12.419 12.243 12.057 11.848 11.351 11.104 10.858 10.567 10.198 9.776 9.209 7.114 -9 ,13357 ,KEBNE ,16723755,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:23:41 CET,0.0 0.949 1.394 1.731 2.015 2.246 2.441 2.633 3.006 3.184 3.365 3.522 3.84 3.972 4.226 4.468 4.693 4.807 5.029 5.232 5.515 5.693 5.872 6.141 6.391 6.626 6.855 7.079 7.367 7.655 7.935 8.259 8.587 8.912 9.272 9.671 10.046 10.468 10.924 11.398 11.907 12.473 13.125 13.764 14.495 15.301 16.216 17.237 18.395 19.646 20.945 21.784 22.037 22.022 21.863 21.598 21.338 21.12 20.895 20.637 20.373 20.092 19.798 19.5 19.247 19.002 18.72 18.465 18.225 17.966 17.688 17.445 17.173 16.874 16.657 16.441 16.2 15.939 15.659 15.464 15.254 14.895 14.641 14.371 14.236 13.973 13.682 13.372 13.197 12.83 12.589 12.39 12.185 11.727 11.46 11.168 10.842 10.486 10.012 9.257 6.724 -10 ,31123 ,KEBNE ,16723756,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:24:13 CET,0.0 0.838 1.222 1.553 1.845 2.098 2.318 2.52 2.881 3.036 3.192 3.324 3.639 3.775 4.034 4.277 4.501 4.613 4.834 5.044 5.33 5.514 5.703 5.975 6.235 6.486 6.725 6.953 7.24 7.526 7.805 8.164 8.506 8.828 9.204 9.608 9.996 10.422 10.874 11.353 11.867 12.441 13.117 13.771 14.52 15.374 16.339 17.414 18.655 20.08 21.626 22.585 22.953 22.941 22.681 22.407 22.09 21.677 21.263 20.875 20.555 20.25 19.929 19.595 19.293 19.018 18.707 18.412 18.147 17.877 17.606 17.357 17.066 16.768 16.527 16.258 15.983 15.713 15.442 15.252 15.052 14.718 14.481 14.253 14.137 13.879 13.593 13.291 13.133 12.794 12.565 12.34 12.136 11.707 11.456 11.172 10.85 10.469 9.96 9.303 6.826 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt deleted file mode 100644 index 79fe5012..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28973 ,KEBNE ,16723757,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:23:17 CET,0.0 1.05 1.49 1.835 2.108 2.346 2.563 2.787 3.193 3.361 3.522 3.652 3.997 4.143 4.403 4.638 4.876 4.99 5.204 5.424 5.729 5.93 6.13 6.397 6.649 6.891 7.116 7.338 7.638 7.921 8.183 8.515 8.838 9.136 9.472 9.851 10.219 10.623 11.056 11.521 12.009 12.549 13.167 13.787 14.499 15.266 16.131 17.108 18.234 19.519 20.977 21.907 22.274 22.356 22.294 22.164 21.962 21.691 21.397 21.092 20.82 20.565 20.277 19.969 19.707 19.473 19.187 18.894 18.645 18.383 18.1 17.866 17.616 17.353 17.147 16.917 16.661 16.385 16.114 15.941 15.758 15.448 15.211 14.969 14.836 14.556 14.28 13.965 13.792 13.435 13.232 13.032 12.832 12.418 12.172 11.874 11.511 11.127 10.689 10.025 8.202 -2 ,26274 ,KEBNE ,16723758,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:23:28 CET,0.0 0.742 1.095 1.438 1.717 1.956 2.166 2.35 2.713 2.892 3.059 3.159 3.477 3.611 3.878 4.118 4.336 4.443 4.653 4.86 5.154 5.354 5.556 5.841 6.096 6.347 6.602 6.837 7.138 7.438 7.722 8.061 8.394 8.708 9.074 9.473 9.851 10.294 10.749 11.207 11.697 12.252 12.889 13.527 14.265 15.077 15.973 16.923 18.03 19.313 20.738 21.716 22.097 22.099 21.892 21.678 21.457 21.22 20.963 20.618 20.318 20.071 19.799 19.519 19.278 19.049 18.776 18.523 18.296 18.035 17.761 17.537 17.28 16.995 16.782 16.575 16.362 16.128 15.853 15.657 15.457 15.132 14.903 14.662 14.539 14.286 13.996 13.658 13.495 13.17 13.015 12.814 12.577 12.032 11.763 11.467 11.086 10.683 10.243 9.595 7.643 -3 ,24886 ,KEBNE ,16723759,Sun Nov 28 03:33:11 CET,Sun Nov 28 05:24:15 CET,0.0 0.991 1.385 1.679 1.931 2.167 2.396 2.606 2.997 3.173 3.333 3.447 3.778 3.915 4.167 4.414 4.659 4.771 4.988 5.211 5.526 5.719 5.903 6.174 6.437 6.689 6.932 7.171 7.466 7.749 8.015 8.331 8.65 8.95 9.299 9.684 10.048 10.447 10.88 11.343 11.831 12.376 13.004 13.643 14.361 15.148 16.073 17.105 18.249 19.492 20.865 21.784 22.071 22.104 22.061 21.872 21.562 21.244 20.968 20.658 20.372 20.121 19.858 19.593 19.326 19.069 18.794 18.54 18.304 18.057 17.807 17.567 17.31 17.056 16.836 16.595 16.347 16.096 15.837 15.65 15.451 15.126 14.887 14.635 14.513 14.268 14.011 13.733 13.576 13.249 13.099 12.908 12.696 12.255 12.002 11.727 11.428 11.089 10.682 10.101 8.212 -4 ,18118 ,KEBNE ,16723760,Sun Nov 28 03:33:12 CET,Sun Nov 28 05:22:44 CET,0.0 0.737 1.11 1.418 1.674 1.893 2.092 2.292 2.671 2.843 2.999 3.096 3.407 3.529 3.771 4.004 4.223 4.326 4.527 4.728 5.018 5.195 5.368 5.626 5.869 6.107 6.343 6.576 6.883 7.165 7.431 7.757 8.074 8.383 8.735 9.124 9.494 9.9 10.337 10.795 11.29 11.847 12.474 13.095 13.823 14.62 15.512 16.497 17.648 18.927 20.255 21.153 21.492 21.512 21.408 21.234 20.982 20.726 20.488 20.177 19.877 19.597 19.342 19.088 18.814 18.563 18.292 18.044 17.829 17.579 17.292 17.046 16.793 16.531 16.328 16.132 15.927 15.692 15.438 15.257 15.07 14.757 14.539 14.318 14.201 13.963 13.688 13.398 13.247 12.912 12.745 12.561 12.342 11.863 11.622 11.353 11.065 10.728 10.262 9.622 7.864 -5 ,1215 ,KEBNE ,16723761,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:24:16 CET,0.0 1.009 1.372 1.649 1.903 2.135 2.359 2.583 2.974 3.155 3.34 3.479 3.804 3.939 4.189 4.427 4.65 4.758 4.966 5.16 5.443 5.628 5.807 6.067 6.319 6.568 6.801 7.018 7.305 7.578 7.842 8.154 8.459 8.774 9.127 9.503 9.885 10.319 10.776 11.259 11.755 12.309 12.934 13.541 14.25 15.017 15.88 16.851 17.961 19.181 20.582 21.6 21.995 22.079 21.988 21.771 21.546 21.297 20.999 20.674 20.378 20.074 19.783 19.504 19.235 18.973 18.68 18.432 18.205 17.949 17.687 17.463 17.217 16.952 16.749 16.532 16.282 16.038 15.781 15.585 15.379 15.053 14.835 14.599 14.476 14.202 13.904 13.602 13.443 13.111 12.938 12.742 12.542 12.07 11.805 11.539 11.207 10.823 10.395 9.786 8.051 -6 ,18631 ,KEBNE ,16723762,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:24:38 CET,0.0 1.026 1.416 1.717 1.98 2.221 2.448 2.644 2.997 3.168 3.334 3.441 3.763 3.894 4.144 4.382 4.603 4.711 4.934 5.152 5.456 5.644 5.829 6.092 6.331 6.565 6.791 7.014 7.312 7.595 7.87 8.195 8.494 8.792 9.139 9.533 9.908 10.31 10.753 11.225 11.724 12.272 12.892 13.514 14.24 15.05 15.956 16.947 18.059 19.264 20.559 21.463 21.792 21.822 21.656 21.394 21.141 20.871 20.598 20.288 19.989 19.714 19.416 19.099 18.802 18.526 18.222 17.925 17.664 17.385 17.063 16.775 16.497 16.23 16.003 15.763 15.526 15.27 14.999 14.808 14.607 14.301 14.081 13.853 13.734 13.459 13.17 12.863 12.693 12.342 12.138 11.936 11.716 11.241 10.977 10.67 10.341 9.971 9.505 8.87 7.13 -7 ,130 ,KEBNE ,16723763,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:22:58 CET,0.0 0.905 1.289 1.594 1.873 2.129 2.367 2.58 2.931 3.092 3.255 3.375 3.708 3.843 4.086 4.324 4.569 4.695 4.929 5.138 5.427 5.611 5.795 6.064 6.321 6.562 6.789 7.012 7.3 7.579 7.855 8.195 8.513 8.813 9.163 9.557 9.941 10.367 10.822 11.309 11.815 12.383 13.03 13.659 14.378 15.151 15.996 16.944 18.075 19.413 20.866 21.768 22.059 22.079 21.973 21.77 21.511 21.22 20.94 20.655 20.381 20.092 19.799 19.512 19.237 18.967 18.66 18.382 18.127 17.87 17.616 17.392 17.161 16.9 16.686 16.472 16.257 16.036 15.777 15.595 15.417 15.134 14.923 14.689 14.568 14.305 14.0 13.665 13.493 13.145 12.944 12.743 12.527 12.049 11.802 11.536 11.21 10.818 10.313 9.569 7.525 -8 ,19194 ,KEBNE ,16723764,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:24:07 CET,0.0 1.482 2.075 2.51 2.874 3.194 3.48 3.759 4.264 4.472 4.659 4.839 5.207 5.398 5.734 6.023 6.308 6.453 6.741 7.018 7.398 7.635 7.868 8.207 8.529 8.812 9.063 9.309 9.626 9.914 10.176 10.504 10.84 11.164 11.53 11.929 12.307 12.725 13.166 13.619 14.096 14.639 15.28 15.929 16.673 17.481 18.4 19.419 20.545 21.78 23.157 24.153 24.564 24.709 24.665 24.455 24.173 23.869 23.561 23.207 22.856 22.533 22.262 21.984 21.678 21.407 21.118 20.833 20.567 20.272 19.96 19.71 19.465 19.195 18.971 18.741 18.489 18.21 17.927 17.734 17.529 17.199 16.97 16.736 16.616 16.373 16.109 15.817 15.663 15.314 15.14 14.958 14.748 14.27 14.007 13.729 13.435 13.072 12.612 11.975 10.214 -9 ,18190 ,KEBNE ,16723765,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:22:50 CET,0.0 1.074 1.512 1.793 2.029 2.242 2.452 2.665 3.07 3.258 3.43 3.552 3.888 4.034 4.306 4.57 4.816 4.934 5.174 5.413 5.742 5.946 6.13 6.383 6.625 6.859 7.086 7.304 7.591 7.871 8.139 8.453 8.757 9.067 9.431 9.838 10.238 10.683 11.154 11.632 12.129 12.67 13.301 13.947 14.662 15.458 16.386 17.393 18.541 19.853 21.306 22.378 22.851 22.947 22.884 22.769 22.614 22.418 22.222 22.011 21.808 21.61 21.379 21.133 20.911 20.7 20.463 20.255 20.057 19.813 19.523 19.27 19.002 18.719 18.505 18.274 18.017 17.742 17.449 17.247 17.054 16.776 16.569 16.337 16.214 15.956 15.673 15.368 15.209 14.875 14.717 14.536 14.339 13.876 13.602 13.321 13.002 12.601 12.12 11.453 9.59 -10 ,12057 ,KEBNE ,16723766,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:23:29 CET,0.0 0.819 1.195 1.474 1.736 1.96 2.17 2.359 2.703 2.869 3.028 3.146 3.471 3.605 3.856 4.101 4.328 4.43 4.637 4.85 5.142 5.325 5.508 5.773 6.033 6.281 6.514 6.732 7.022 7.313 7.578 7.889 8.202 8.508 8.861 9.248 9.615 10.021 10.467 10.934 11.405 11.943 12.577 13.209 13.945 14.749 15.656 16.649 17.781 19.071 20.437 21.33 21.706 21.776 21.69 21.543 21.343 21.098 20.85 20.54 20.166 19.832 19.563 19.278 18.996 18.746 18.486 18.25 18.04 17.809 17.563 17.347 17.11 16.869 16.662 16.431 16.193 15.945 15.708 15.536 15.348 15.06 14.849 14.628 14.518 14.286 14.01 13.714 13.562 13.218 13.013 12.841 12.649 12.152 11.868 11.573 11.264 10.901 10.486 9.938 8.169 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt deleted file mode 100644 index d2b525ab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29991 ,KEBNE ,16723767,Sun Nov 28 03:33:14 CET,Sun Nov 28 05:24:20 CET,0.0 1.934 2.502 2.899 3.244 3.55 3.802 4.035 4.445 4.647 4.851 5.041 5.393 5.553 5.865 6.145 6.418 6.55 6.803 7.051 7.391 7.601 7.804 8.088 8.367 8.645 8.919 9.184 9.526 9.852 10.152 10.519 10.868 11.19 11.565 11.988 12.379 12.809 13.271 13.755 14.266 14.846 15.5 16.13 16.864 17.685 18.578 19.487 20.514 21.643 22.72 23.259 23.408 23.372 23.169 22.849 22.475 22.12 21.81 21.472 21.177 20.92 20.65 20.379 20.124 19.879 19.619 19.371 19.158 18.935 18.695 18.491 18.275 18.042 17.843 17.639 17.446 17.237 17.013 16.862 16.688 16.422 16.234 16.022 15.916 15.706 15.461 15.181 15.049 14.755 14.643 14.487 14.336 13.977 13.758 13.529 13.288 12.992 12.625 12.149 11.024 -6 ,6942 ,KEBNE ,16723772,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:25:42 CET,0.0 1.511 2.084 2.507 2.871 3.193 3.47 3.709 4.132 4.333 4.529 4.705 5.069 5.248 5.586 5.896 6.172 6.309 6.587 6.857 7.226 7.445 7.65 7.964 8.271 8.549 8.806 9.054 9.385 9.71 10.015 10.371 10.705 11.025 11.403 11.819 12.21 12.635 13.103 13.594 14.096 14.662 15.316 15.973 16.707 17.477 18.354 19.342 20.492 21.728 23.003 23.788 24.013 23.991 23.791 23.524 23.255 22.976 22.689 22.394 22.143 21.903 21.643 21.379 21.104 20.841 20.582 20.341 20.115 19.877 19.623 19.418 19.21 18.988 18.796 18.594 18.399 18.178 17.942 17.792 17.641 17.395 17.209 17.02 16.924 16.703 16.452 16.199 16.077 15.776 15.648 15.483 15.311 14.931 14.704 14.435 14.175 13.899 13.549 13.064 12.134 -7 ,4977 ,KEBNE ,16723773,Sun Nov 28 03:34:11 CET,Sun Nov 28 05:25:42 CET,0.0 1.832 2.457 2.947 3.326 3.637 3.899 4.128 4.55 4.752 4.946 5.143 5.49 5.644 5.946 6.217 6.482 6.608 6.863 7.123 7.488 7.713 7.917 8.199 8.466 8.744 9.017 9.277 9.606 9.916 10.22 10.599 10.959 11.292 11.682 12.141 12.576 13.029 13.503 13.997 14.511 15.083 15.764 16.413 17.132 17.919 18.789 19.793 21.019 22.293 23.591 24.442 24.621 24.531 24.324 24.032 23.694 23.368 23.088 22.779 22.497 22.231 21.98 21.751 21.51 21.266 20.98 20.718 20.505 20.279 20.046 19.833 19.592 19.35 19.159 18.965 18.76 18.54 18.295 18.125 17.962 17.698 17.508 17.3 17.189 16.976 16.765 16.529 16.39 16.072 15.928 15.774 15.605 15.239 15.038 14.816 14.57 14.284 13.931 13.536 12.448 -8 ,29420 ,KEBNE ,16723774,Sun Nov 28 03:34:11 CET,Sun Nov 28 05:26:01 CET,0.0 2.095 2.652 3.072 3.438 3.757 4.027 4.27 4.73 4.93 5.119 5.301 5.654 5.823 6.161 6.476 6.757 6.891 7.159 7.416 7.767 7.992 8.212 8.519 8.802 9.076 9.341 9.589 9.908 10.222 10.532 10.892 11.237 11.57 11.953 12.383 12.785 13.208 13.656 14.124 14.62 15.204 15.852 16.467 17.183 17.957 18.819 19.792 20.849 21.987 23.181 23.884 24.098 24.119 24.0 23.754 23.473 23.18 22.916 22.617 22.315 22.032 21.752 21.472 21.183 20.919 20.643 20.39 20.162 19.915 19.653 19.429 19.191 18.948 18.76 18.562 18.359 18.142 17.908 17.748 17.588 17.335 17.148 16.944 16.832 16.607 16.376 16.123 15.989 15.68 15.577 15.414 15.236 14.878 14.682 14.437 14.179 13.886 13.484 12.995 11.811 -9 ,31597 ,KEBNE ,16723775,Sun Nov 28 03:34:11 CET,Sun Nov 28 05:25:15 CET,0.0 1.605 2.161 2.596 2.978 3.284 3.559 3.811 4.267 4.493 4.711 4.912 5.268 5.432 5.768 6.069 6.334 6.464 6.717 6.965 7.323 7.555 7.778 8.071 8.353 8.639 8.924 9.196 9.548 9.884 10.183 10.551 10.921 11.287 11.691 12.106 12.489 12.901 13.363 13.831 14.286 14.814 15.446 16.07 16.773 17.555 18.419 19.351 20.379 21.505 22.678 23.41 23.651 23.627 23.471 23.238 22.966 22.663 22.384 22.066 21.755 21.442 21.097 20.773 20.478 20.212 19.931 19.654 19.4 19.142 18.885 18.661 18.427 18.189 17.993 17.776 17.539 17.288 17.032 16.861 16.691 16.426 16.233 16.026 15.919 15.688 15.448 15.186 15.043 14.728 14.601 14.442 14.273 13.892 13.694 13.501 13.244 12.933 12.56 12.036 10.78 -10 ,5615 ,KEBNE ,16723776,Sun Nov 28 03:34:13 CET,Sun Nov 28 05:29:34 CET,0.0 2.419 2.977 3.375 3.721 4.019 4.283 4.515 4.919 5.098 5.267 5.425 5.765 5.924 6.23 6.503 6.767 6.9 7.161 7.407 7.748 7.961 8.172 8.473 8.753 9.029 9.294 9.548 9.878 10.196 10.501 10.856 11.187 11.504 11.878 12.304 12.71 13.152 13.624 14.111 14.61 15.169 15.827 16.471 17.174 17.942 18.83 19.82 20.928 22.165 23.487 24.263 24.489 24.472 24.346 24.156 23.933 23.7 23.467 23.187 22.926 22.667 22.396 22.141 21.895 21.65 21.363 21.101 20.869 20.612 20.354 20.148 19.908 19.658 19.477 19.297 19.117 18.927 18.714 18.559 18.392 18.107 17.91 17.724 17.623 17.402 17.197 16.967 16.834 16.534 16.43 16.274 16.104 15.722 15.521 15.306 15.057 14.764 14.428 13.925 12.34 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index d7799558..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13404 ,KEBNE ,16723777,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:23:34 CET,0.0 0.932 1.33 1.65 1.925 2.169 2.379 2.579 2.934 3.1 3.27 3.383 3.716 3.854 4.109 4.365 4.629 4.755 4.999 5.237 5.584 5.814 6.039 6.367 6.678 6.968 7.252 7.528 7.885 8.236 8.567 8.965 9.36 9.745 10.192 10.682 11.138 11.644 12.192 12.787 13.418 14.097 14.921 15.734 16.642 17.668 18.811 20.097 21.567 23.212 25.015 26.125 26.48 26.447 26.217 25.922 25.625 25.316 25.002 24.654 24.354 24.077 23.767 23.448 23.148 22.863 22.564 22.304 22.07 21.824 21.573 21.363 21.136 20.891 20.695 20.477 20.252 20.017 19.767 19.599 19.421 19.136 18.931 18.711 18.591 18.349 18.116 17.868 17.74 17.434 17.294 17.118 16.952 16.585 16.364 16.141 15.917 15.649 15.305 14.862 13.927 -6 ,15699 ,KEBNE ,16723782,Sun Nov 28 03:35:13 CET,Sun Nov 28 05:25:29 CET,0.0 1.09 1.534 1.871 2.188 2.457 2.68 2.895 3.277 3.447 3.614 3.745 4.094 4.241 4.52 4.789 5.046 5.161 5.385 5.616 5.961 6.175 6.382 6.683 6.97 7.256 7.536 7.807 8.153 8.478 8.79 9.171 9.534 9.887 10.299 10.769 11.229 11.728 12.255 12.826 13.417 14.056 14.827 15.624 16.509 17.424 18.489 19.748 21.178 22.664 24.288 25.294 25.597 25.597 25.391 25.11 24.813 24.483 24.145 23.748 23.376 23.054 22.745 22.424 22.088 21.778 21.473 21.197 20.942 20.681 20.417 20.177 19.912 19.656 19.459 19.252 19.03 18.779 18.511 18.322 18.128 17.849 17.661 17.465 17.367 17.17 16.95 16.662 16.512 16.195 16.089 15.938 15.762 15.38 15.183 14.968 14.71 14.425 14.107 13.648 12.732 -10 ,20130 ,KEBNE ,16723786,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:24:00 CET,0.0 1.113 1.562 1.932 2.258 2.533 2.765 2.984 3.395 3.581 3.758 3.917 4.281 4.438 4.737 5.015 5.28 5.412 5.673 5.924 6.276 6.497 6.722 7.05 7.356 7.648 7.933 8.222 8.601 8.951 9.27 9.665 10.059 10.448 10.892 11.382 11.88 12.423 13.011 13.659 14.33 15.091 15.985 16.874 17.865 18.96 20.244 21.633 23.214 24.951 26.836 28.116 28.592 28.695 28.607 28.362 28.044 27.728 27.428 27.107 26.776 26.448 26.129 25.821 25.535 25.265 24.972 24.698 24.459 24.205 23.926 23.701 23.459 23.195 22.985 22.758 22.536 22.321 22.09 21.915 21.724 21.419 21.199 20.964 20.849 20.608 20.339 20.058 19.91 19.579 19.443 19.288 19.101 18.648 18.424 18.194 17.939 17.647 17.293 16.788 15.254 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt deleted file mode 100644 index 7b53f075..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,20338 ,KEBNE ,16723789,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:24:25 CET,0.0 1.266 1.81 2.177 2.469 2.745 3.016 3.265 3.703 3.899 4.078 4.232 4.606 4.764 5.05 5.317 5.569 5.693 5.927 6.145 6.456 6.66 6.866 7.158 7.429 7.689 7.942 8.192 8.518 8.835 9.121 9.454 9.789 10.12 10.511 10.942 11.357 11.809 12.271 12.745 13.255 13.828 14.481 15.114 15.759 16.408 17.142 17.902 18.556 18.929 18.659 17.674 16.585 15.505 14.44 13.397 12.498 11.678 10.952 10.229 9.615 9.069 8.529 8.016 7.513 7.049 6.574 6.138 5.773 5.4 5.008 4.697 4.377 4.032 3.754 3.467 3.171 2.867 2.566 2.359 2.146 1.806 1.571 1.332 1.207 0.948 0.669 0.379 0.23 -0.126 -0.26 -0.436 -0.618 -1.008 -1.217 -1.458 -1.721 -2.025 -2.411 -2.896 -4.006 -4 ,6174 ,KEBNE ,16723790,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:24:45 CET,0.0 1.418 1.988 2.423 2.806 3.156 3.457 3.732 4.24 4.489 4.737 4.979 5.382 5.585 5.954 6.256 6.511 6.639 6.902 7.155 7.514 7.736 7.943 8.232 8.507 8.777 9.038 9.284 9.594 9.907 10.211 10.568 10.907 11.228 11.614 12.043 12.44 12.872 13.331 13.794 14.26 14.748 15.263 15.773 16.348 16.946 17.572 18.16 18.636 18.849 18.613 17.716 16.584 15.452 14.454 13.532 12.671 11.845 11.124 10.394 9.763 9.198 8.631 8.107 7.616 7.165 6.7 6.271 5.897 5.525 5.139 4.818 4.483 4.126 3.865 3.596 3.3 2.995 2.682 2.457 2.219 1.866 1.625 1.367 1.234 0.963 0.666 0.353 0.189 -0.189 -0.343 -0.531 -0.731 -1.152 -1.39 -1.652 -1.926 -2.236 -2.591 -3.031 -4.198 -5 ,3123 ,KEBNE ,16723791,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:24:54 CET,0.0 0.848 1.252 1.592 1.852 2.106 2.36 2.574 2.943 3.109 3.271 3.39 3.74 3.89 4.169 4.421 4.661 4.781 5.025 5.262 5.594 5.816 6.025 6.305 6.574 6.828 7.072 7.315 7.629 7.927 8.215 8.57 8.908 9.225 9.578 9.957 10.313 10.707 11.134 11.585 12.051 12.569 13.162 13.725 14.364 15.043 15.74 16.349 16.879 17.326 17.215 16.256 15.155 13.979 12.865 11.868 11.025 10.254 9.526 8.782 8.141 7.55 6.964 6.411 5.905 5.446 4.979 4.561 4.193 3.809 3.408 3.081 2.74 2.379 2.107 1.828 1.546 1.27 0.959 0.731 0.504 0.162 -0.076 -0.333 -0.467 -0.726 -0.991 -1.289 -1.447 -1.805 -1.927 -2.1 -2.286 -2.728 -2.96 -3.208 -3.48 -3.768 -4.081 -4.456 -5.458 -6 ,951 ,KEBNE ,16723792,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:24:25 CET,0.0 0.744 1.139 1.477 1.745 1.991 2.232 2.451 2.859 3.054 3.239 3.389 3.754 3.906 4.174 4.436 4.673 4.789 5.02 5.239 5.56 5.764 5.957 6.243 6.524 6.793 7.045 7.291 7.605 7.899 8.174 8.503 8.823 9.128 9.46 9.82 10.18 10.58 11.001 11.455 11.935 12.461 13.034 13.577 14.184 14.814 15.502 16.237 16.901 17.388 17.394 16.621 15.671 14.637 13.623 12.674 11.809 10.999 10.268 9.53 8.9 8.347 7.834 7.336 6.862 6.426 5.96 5.552 5.201 4.833 4.445 4.12 3.791 3.439 3.157 2.862 2.564 2.268 1.95 1.737 1.536 1.207 0.96 0.702 0.574 0.303 0.015 -0.291 -0.45 -0.808 -0.961 -1.14 -1.323 -1.696 -1.897 -2.11 -2.337 -2.605 -2.95 -3.408 -4.431 -7 ,5705 ,KEBNE ,16723793,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:24:49 CET,0.0 1.058 1.479 1.818 2.109 2.367 2.589 2.806 3.223 3.409 3.583 3.718 4.077 4.243 4.555 4.819 5.061 5.173 5.384 5.598 5.914 6.114 6.303 6.573 6.834 7.08 7.317 7.559 7.87 8.158 8.439 8.776 9.087 9.388 9.743 10.143 10.53 10.94 11.358 11.798 12.235 12.71 13.275 13.868 14.524 15.161 15.843 16.516 17.152 17.585 17.593 16.945 16.133 15.214 14.21 13.231 12.331 11.508 10.799 10.063 9.41 8.825 8.277 7.76 7.263 6.803 6.337 5.929 5.569 5.19 4.78 4.441 4.101 3.757 3.485 3.212 2.936 2.632 2.317 2.101 1.877 1.525 1.283 1.031 0.899 0.63 0.353 0.058 -0.1 -0.457 -0.597 -0.785 -0.986 -1.418 -1.659 -1.909 -2.181 -2.47 -2.792 -3.236 -4.311 -8 ,97 ,KEBNE ,16723794,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:24:29 CET,0.0 1.254 1.751 2.114 2.403 2.658 2.892 3.109 3.51 3.697 3.884 4.022 4.384 4.54 4.805 5.055 5.307 5.426 5.653 5.866 6.181 6.39 6.609 6.936 7.231 7.506 7.784 8.057 8.408 8.75 9.069 9.445 9.81 10.146 10.513 10.926 11.334 11.783 12.234 12.695 13.165 13.667 14.225 14.773 15.421 16.082 16.669 17.277 18.004 18.434 18.371 17.558 16.396 15.228 14.11 13.069 12.132 11.287 10.553 9.801 9.167 8.587 8.006 7.475 6.992 6.541 6.06 5.624 5.254 4.88 4.471 4.129 3.779 3.422 3.155 2.875 2.582 2.284 1.969 1.754 1.533 1.195 0.961 0.708 0.576 0.31 0.041 -0.251 -0.406 -0.763 -0.885 -1.06 -1.25 -1.647 -1.851 -2.07 -2.313 -2.589 -2.911 -3.348 -4.417 -9 ,17177 ,KEBNE ,16723795,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:24:51 CET,0.0 1.302 1.823 2.202 2.486 2.732 2.968 3.187 3.573 3.75 3.933 4.099 4.467 4.628 4.935 5.219 5.485 5.612 5.848 6.058 6.377 6.594 6.806 7.123 7.417 7.706 8.006 8.288 8.621 8.94 9.261 9.658 10.033 10.377 10.765 11.189 11.601 12.057 12.527 13.018 13.538 14.086 14.685 15.277 15.905 16.517 17.15 17.775 18.297 18.583 18.253 17.226 16.111 14.991 13.916 12.931 12.072 11.261 10.532 9.795 9.153 8.563 8.015 7.486 6.97 6.512 6.051 5.642 5.289 4.92 4.541 4.224 3.88 3.529 3.269 3.0 2.707 2.404 2.095 1.887 1.674 1.336 1.106 0.875 0.749 0.481 0.2 -0.091 -0.23 -0.589 -0.755 -0.952 -1.149 -1.557 -1.791 -2.059 -2.359 -2.669 -3.007 -3.444 -4.506 -10 ,20442 ,KEBNE ,16723796,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:24:16 CET,0.0 1.281 1.827 2.246 2.595 2.916 3.225 3.531 4.077 4.314 4.529 4.74 5.148 5.346 5.713 6.051 6.37 6.527 6.824 7.108 7.518 7.782 8.045 8.407 8.754 9.092 9.409 9.726 10.12 10.489 10.858 11.292 11.705 12.112 12.552 13.016 13.455 13.908 14.384 14.862 15.334 15.872 16.492 17.097 17.758 18.441 19.128 19.814 20.426 20.899 21.001 20.109 18.956 17.842 16.765 15.747 14.847 14.023 13.321 12.622 11.997 11.428 10.888 10.371 9.877 9.438 8.968 8.547 8.198 7.836 7.467 7.165 6.839 6.491 6.227 5.951 5.66 5.359 5.053 4.839 4.612 4.258 4.005 3.752 3.621 3.347 3.065 2.772 2.622 2.267 2.14 1.962 1.786 1.384 1.135 0.893 0.638 0.331 -0.035 -0.521 -1.607 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt deleted file mode 100644 index 324f2adb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6308 ,KEBNE ,16723797,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:24:45 CET,0.0 0.776 1.186 1.513 1.79 2.045 2.288 2.512 2.912 3.116 3.322 3.503 3.868 4.031 4.352 4.654 4.938 5.081 5.363 5.636 6.035 6.285 6.522 6.875 7.217 7.543 7.857 8.166 8.576 8.979 9.369 9.831 10.282 10.737 11.266 11.847 12.407 13.01 13.658 14.38 15.172 16.056 17.087 18.143 19.388 20.785 22.404 24.257 26.407 28.911 31.962 34.341 35.589 36.314 36.722 36.936 37.029 37.025 36.986 36.886 36.744 36.618 36.485 36.323 36.165 36.002 35.807 35.632 35.475 35.3 35.108 34.949 34.788 34.614 34.466 34.309 34.142 33.964 33.766 33.627 33.484 33.241 33.077 32.904 32.816 32.642 32.452 32.25 32.138 31.848 31.734 31.605 31.465 31.135 30.955 30.76 30.534 30.27 29.938 29.534 28.723 -2 ,9498 ,KEBNE ,16723798,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:26:16 CET,0.0 1.053 1.534 1.902 2.229 2.513 2.777 3.04 3.519 3.73 3.929 4.107 4.478 4.644 4.961 5.268 5.564 5.713 6.001 6.273 6.67 6.919 7.159 7.524 7.881 8.224 8.55 8.869 9.29 9.694 10.093 10.579 11.041 11.482 12.001 12.595 13.16 13.763 14.431 15.164 15.956 16.86 17.897 18.938 20.165 21.551 23.191 25.085 27.243 29.709 32.713 35.088 36.428 37.251 37.692 37.906 37.997 38.007 37.965 37.873 37.76 37.641 37.514 37.39 37.253 37.111 36.952 36.812 36.689 36.547 36.376 36.225 36.059 35.881 35.752 35.604 35.445 35.296 35.12 34.983 34.841 34.625 34.485 34.332 34.244 34.056 33.875 33.686 33.579 33.31 33.259 33.12 32.962 32.668 32.513 32.335 32.147 31.918 31.629 31.264 30.198 -3 ,1051 ,KEBNE ,16723799,Sun Nov 28 03:34:13 CET,Sun Nov 28 05:25:50 CET,0.0 0.967 1.441 1.822 2.135 2.412 2.653 2.897 3.357 3.567 3.771 3.964 4.347 4.522 4.861 5.174 5.466 5.604 5.875 6.155 6.573 6.847 7.11 7.494 7.88 8.263 8.619 8.957 9.405 9.838 10.246 10.74 11.227 11.709 12.289 12.92 13.51 14.167 14.9 15.685 16.509 17.446 18.547 19.674 20.98 22.422 24.065 25.901 28.124 30.801 34.0 36.399 37.654 38.3 38.614 38.761 38.792 38.756 38.669 38.543 38.404 38.25 38.087 37.912 37.721 37.544 37.353 37.175 37.014 36.848 36.679 36.521 36.341 36.157 36.014 35.854 35.671 35.474 35.272 35.132 34.994 34.782 34.623 34.445 34.353 34.172 33.98 33.779 33.669 33.382 33.284 33.141 32.985 32.637 32.454 32.258 32.025 31.765 31.432 30.959 29.902 -4 ,16242 ,KEBNE ,16723800,Sun Nov 28 03:34:12 CET,Sun Nov 28 05:26:08 CET,0.0 0.937 1.381 1.739 2.021 2.277 2.506 2.718 3.123 3.318 3.512 3.679 4.045 4.205 4.508 4.806 5.106 5.255 5.53 5.792 6.163 6.4 6.635 6.978 7.318 7.652 7.977 8.298 8.714 9.109 9.495 9.963 10.418 10.867 11.381 11.982 12.575 13.225 13.933 14.681 15.466 16.344 17.415 18.509 19.75 21.138 22.746 24.598 26.785 29.46 32.666 35.029 36.312 37.074 37.523 37.77 37.889 37.935 37.935 37.882 37.773 37.645 37.485 37.314 37.151 36.991 36.817 36.65 36.488 36.321 36.16 36.01 35.84 35.662 35.522 35.368 35.208 35.041 34.855 34.729 34.586 34.342 34.168 33.986 33.891 33.702 33.518 33.318 33.214 32.944 32.873 32.733 32.591 32.31 32.141 31.949 31.733 31.481 31.182 30.819 29.885 -7 ,17325 ,KEBNE ,16723803,Sun Nov 28 03:34:13 CET,Sun Nov 28 05:25:58 CET,0.0 0.772 1.176 1.507 1.794 2.062 2.3 2.516 2.953 3.171 3.362 3.52 3.883 4.045 4.359 4.679 4.983 5.128 5.423 5.698 6.08 6.332 6.588 6.963 7.324 7.674 8.012 8.346 8.788 9.204 9.602 10.087 10.548 11.002 11.53 12.124 12.707 13.333 14.002 14.724 15.491 16.362 17.402 18.461 19.704 21.12 22.788 24.661 26.804 29.322 32.363 34.696 35.975 36.757 37.205 37.44 37.553 37.556 37.476 37.366 37.252 37.133 36.995 36.835 36.67 36.496 36.309 36.146 35.964 35.752 35.545 35.364 35.175 34.985 34.828 34.65 34.47 34.294 34.093 33.952 33.815 33.585 33.419 33.24 33.145 32.956 32.762 32.534 32.414 32.126 32.018 31.878 31.739 31.436 31.255 31.034 30.786 30.516 30.221 29.834 28.903 -8 ,21671 ,KEBNE ,16723804,Sun Nov 28 03:34:13 CET,Sun Nov 28 05:25:12 CET,0.0 1.026 1.443 1.796 2.124 2.407 2.658 2.893 3.321 3.523 3.717 3.886 4.26 4.429 4.77 5.124 5.468 5.619 5.896 6.16 6.55 6.805 7.06 7.44 7.805 8.175 8.533 8.883 9.356 9.798 10.208 10.698 11.176 11.642 12.182 12.798 13.394 14.031 14.723 15.49 16.317 17.251 18.373 19.507 20.789 22.219 23.874 25.731 27.912 30.494 33.434 35.58 36.682 37.306 37.667 37.887 37.962 37.933 37.845 37.726 37.605 37.466 37.304 37.14 36.976 36.809 36.618 36.445 36.297 36.121 35.926 35.765 35.596 35.418 35.273 35.122 34.959 34.785 34.584 34.425 34.271 34.048 33.886 33.716 33.627 33.438 33.229 33.008 32.894 32.6 32.489 32.342 32.191 31.859 31.677 31.475 31.244 30.992 30.713 30.349 29.39 -9 ,8432 ,KEBNE ,16723805,Sun Nov 28 03:35:13 CET,Sun Nov 28 05:25:59 CET,0.0 0.931 1.37 1.72 2.031 2.32 2.568 2.803 3.25 3.449 3.642 3.814 4.191 4.365 4.696 4.998 5.277 5.419 5.708 5.992 6.395 6.659 6.916 7.276 7.633 7.996 8.346 8.682 9.118 9.538 9.951 10.448 10.928 11.4 11.961 12.589 13.186 13.84 14.553 15.302 16.119 17.059 18.123 19.16 20.366 21.746 23.348 25.173 27.317 29.89 33.112 35.637 36.945 37.68 38.11 38.394 38.526 38.561 38.522 38.418 38.298 38.179 38.057 37.942 37.801 37.644 37.47 37.307 37.165 37.005 36.836 36.696 36.527 36.331 36.181 36.025 35.863 35.704 35.531 35.404 35.273 35.064 34.914 34.756 34.668 34.473 34.274 34.064 33.952 33.669 33.577 33.455 33.326 33.028 32.853 32.655 32.422 32.145 31.816 31.352 29.969 -10 ,13500 ,KEBNE ,16723806,Sun Nov 28 03:35:13 CET,Sun Nov 28 05:26:53 CET,0.0 0.9 1.362 1.691 1.988 2.251 2.485 2.719 3.156 3.349 3.535 3.701 4.065 4.23 4.55 4.858 5.147 5.284 5.553 5.812 6.2 6.461 6.717 7.09 7.445 7.781 8.102 8.423 8.847 9.266 9.678 10.168 10.63 11.087 11.628 12.218 12.78 13.416 14.114 14.867 15.658 16.545 17.608 18.667 19.888 21.291 22.935 24.752 26.886 29.454 32.489 34.753 36.033 36.759 37.154 37.412 37.547 37.574 37.52 37.436 37.325 37.194 37.045 36.872 36.702 36.533 36.361 36.219 36.087 35.927 35.746 35.6 35.439 35.255 35.107 34.959 34.8 34.629 34.433 34.288 34.145 33.927 33.774 33.604 33.507 33.309 33.114 32.893 32.778 32.496 32.41 32.278 32.139 31.827 31.644 31.44 31.223 30.983 30.695 30.332 29.533 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt deleted file mode 100644 index 187a7e8e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2126 ,KEBNE ,16723807,Sun Nov 28 03:35:13 CET,Sun Nov 28 05:27:00 CET,0.0 1.149 1.581 1.944 2.266 2.544 2.815 3.083 3.569 3.798 4.013 4.189 4.579 4.764 5.104 5.418 5.713 5.86 6.152 6.447 6.884 7.16 7.425 7.798 8.151 8.509 8.864 9.21 9.646 10.066 10.493 11.008 11.5 11.988 12.554 13.18 13.806 14.497 15.221 15.989 16.792 17.71 18.81 19.962 21.352 22.885 24.629 26.669 29.193 32.203 35.718 38.566 40.245 41.261 41.873 42.285 42.572 42.73 42.777 42.735 42.662 42.593 42.523 42.449 42.333 42.201 42.054 41.895 41.736 41.566 41.385 41.243 41.071 40.863 40.697 40.525 40.353 40.166 39.97 39.831 39.682 39.437 39.253 39.061 38.965 38.744 38.519 38.277 38.138 37.83 37.703 37.548 37.393 37.029 36.818 36.59 36.35 36.084 35.752 35.281 34.133 -2 ,24362 ,KEBNE ,16723808,Sun Nov 28 03:35:13 CET,Sun Nov 28 05:26:25 CET,0.0 0.878 1.292 1.651 1.957 2.204 2.442 2.677 3.09 3.289 3.48 3.629 4.004 4.173 4.501 4.824 5.124 5.273 5.574 5.864 6.282 6.541 6.799 7.184 7.547 7.889 8.226 8.559 8.986 9.397 9.787 10.267 10.76 11.237 11.783 12.404 13.008 13.68 14.393 15.165 16.029 17.013 18.133 19.247 20.59 22.15 23.945 25.981 28.411 31.323 34.934 37.812 39.347 40.244 40.823 41.189 41.387 41.484 41.528 41.521 41.486 41.449 41.384 41.273 41.148 41.041 40.916 40.773 40.636 40.488 40.33 40.2 40.057 39.886 39.752 39.626 39.486 39.32 39.148 39.029 38.899 38.7 38.555 38.394 38.307 38.117 37.891 37.656 37.544 37.266 37.179 37.041 36.898 36.591 36.437 36.251 36.023 35.786 35.501 35.097 33.909 -3 ,4437 ,KEBNE ,16723809,Sun Nov 28 03:35:13 CET,Sun Nov 28 05:26:52 CET,0.0 1.016 1.522 1.914 2.242 2.523 2.788 3.049 3.541 3.763 3.972 4.174 4.561 4.729 5.051 5.369 5.687 5.842 6.139 6.432 6.858 7.128 7.392 7.783 8.157 8.522 8.89 9.241 9.693 10.145 10.576 11.089 11.596 12.082 12.649 13.292 13.921 14.632 15.388 16.18 17.053 18.056 19.206 20.403 21.854 23.518 25.387 27.464 29.98 32.984 36.721 39.701 41.312 42.306 42.899 43.246 43.421 43.479 43.454 43.379 43.295 43.229 43.158 43.054 42.942 42.835 42.704 42.549 42.402 42.236 42.047 41.878 41.703 41.518 41.369 41.221 41.058 40.864 40.656 40.517 40.38 40.155 39.979 39.798 39.706 39.51 39.321 39.115 38.998 38.715 38.616 38.475 38.328 37.96 37.744 37.539 37.311 37.048 36.722 36.26 35.03 -6 ,26969 ,KEBNE ,16723812,Sun Nov 28 03:35:13 CET,Sun Nov 28 05:26:11 CET,0.0 1.061 1.51 1.891 2.233 2.519 2.778 3.029 3.485 3.688 3.878 4.063 4.443 4.615 4.946 5.262 5.549 5.696 5.999 6.287 6.705 6.971 7.227 7.609 7.986 8.358 8.724 9.075 9.526 9.962 10.394 10.914 11.402 11.88 12.444 13.082 13.697 14.381 15.13 15.94 16.798 17.774 18.927 20.096 21.479 23.047 24.891 27.024 29.603 32.646 36.336 39.458 41.281 42.339 42.954 43.354 43.574 43.685 43.735 43.734 43.679 43.601 43.505 43.387 43.259 43.121 42.957 42.809 42.67 42.505 42.337 42.199 42.039 41.849 41.695 41.54 41.391 41.222 41.03 40.898 40.758 40.524 40.352 40.173 40.077 39.882 39.689 39.495 39.38 39.085 38.992 38.861 38.709 38.362 38.17 37.951 37.707 37.446 37.099 36.68 35.918 -7 ,2322 ,KEBNE ,16723813,Sun Nov 28 03:35:13 CET,Sun Nov 28 05:25:41 CET,0.0 1.276 1.789 2.192 2.506 2.774 3.044 3.302 3.779 4.012 4.229 4.402 4.781 4.955 5.3 5.636 5.947 6.101 6.404 6.692 7.121 7.404 7.675 8.056 8.428 8.794 9.147 9.492 9.95 10.39 10.819 11.345 11.842 12.325 12.888 13.54 14.181 14.877 15.63 16.45 17.324 18.297 19.43 20.6 22.016 23.627 25.528 27.667 30.099 33.046 36.699 39.602 41.196 42.155 42.79 43.174 43.359 43.457 43.462 43.392 43.275 43.133 43.001 42.881 42.741 42.592 42.418 42.256 42.115 41.951 41.748 41.567 41.375 41.173 41.02 40.864 40.692 40.501 40.316 40.19 40.038 39.793 39.633 39.479 39.394 39.194 38.975 38.759 38.658 38.377 38.261 38.1 37.928 37.574 37.386 37.171 36.936 36.674 36.328 35.893 34.786 -8 ,28833 ,KEBNE ,16723814,Sun Nov 28 03:35:13 CET,Sun Nov 28 05:25:46 CET,0.0 0.964 1.383 1.712 2.009 2.286 2.525 2.765 3.222 3.418 3.598 3.765 4.149 4.324 4.64 4.958 5.273 5.423 5.734 6.032 6.44 6.702 6.948 7.313 7.678 8.044 8.403 8.745 9.176 9.59 10.004 10.519 11.023 11.529 12.114 12.767 13.395 14.07 14.813 15.624 16.494 17.482 18.619 19.741 21.097 22.676 24.511 26.649 29.201 32.211 35.866 38.815 40.435 41.425 42.037 42.427 42.638 42.734 42.792 42.801 42.735 42.626 42.5 42.364 42.215 42.069 41.9 41.714 41.534 41.349 41.151 40.985 40.814 40.618 40.454 40.281 40.113 39.946 39.746 39.594 39.435 39.174 39.003 38.84 38.754 38.583 38.405 38.194 38.074 37.786 37.667 37.511 37.35 36.964 36.752 36.555 36.331 36.07 35.727 35.248 34.064 -10 ,6986 ,KEBNE ,16723816,Sun Nov 28 03:35:13 CET,Sun Nov 28 05:26:44 CET,0.0 1.154 1.724 2.165 2.522 2.834 3.115 3.368 3.837 4.054 4.265 4.477 4.875 5.057 5.419 5.746 6.047 6.196 6.49 6.775 7.194 7.462 7.713 8.068 8.411 8.768 9.127 9.47 9.905 10.33 10.757 11.268 11.752 12.226 12.772 13.389 13.988 14.646 15.384 16.189 17.041 18.023 19.173 20.305 21.646 23.22 25.076 27.181 29.613 32.481 36.109 39.162 40.801 41.758 42.367 42.769 43.007 43.126 43.18 43.16 43.084 43.016 42.933 42.815 42.683 42.555 42.42 42.288 42.144 41.987 41.825 41.675 41.515 41.342 41.202 41.06 40.901 40.725 40.532 40.397 40.257 40.048 39.904 39.761 39.681 39.504 39.325 39.126 39.014 38.73 38.644 38.513 38.372 38.051 37.857 37.656 37.444 37.167 36.853 36.394 35.173 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index bdaf8b97..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9165 ,KEBNE ,16723817,Sun Nov 28 03:36:14 CET,Sun Nov 28 05:27:21 CET,0.0 1.065 1.436 1.727 1.972 2.201 2.417 2.606 2.918 3.051 3.192 3.309 3.596 3.706 3.915 4.112 4.293 4.384 4.564 4.734 4.983 5.139 5.283 5.495 5.697 5.882 6.05 6.2 6.389 6.569 6.741 6.954 7.152 7.331 7.527 7.737 7.945 8.165 8.406 8.662 8.895 9.144 9.399 9.605 9.804 9.954 10.062 10.084 9.872 9.289 8.03 6.272 4.764 3.46 2.309 1.263 0.375 -0.455 -1.205 -1.948 -2.585 -3.15 -3.716 -4.25 -4.734 -5.168 -5.61 -6.015 -6.362 -6.714 -7.086 -7.407 -7.747 -8.09 -8.353 -8.63 -8.914 -9.201 -9.498 -9.705 -9.921 -10.269 -10.512 -10.768 -10.895 -11.15 -11.432 -11.735 -11.89 -12.23 -12.399 -12.582 -12.774 -13.19 -13.429 -13.717 -14.038 -14.362 -14.714 -15.2 -16.468 -2 ,13294 ,KEBNE ,16723818,Sun Nov 28 03:36:14 CET,Sun Nov 28 05:27:22 CET,0.0 1.064 1.458 1.717 1.96 2.18 2.38 2.562 2.886 3.036 3.169 3.235 3.508 3.623 3.828 4.001 4.171 4.26 4.428 4.594 4.83 4.972 5.105 5.286 5.462 5.633 5.798 5.958 6.163 6.348 6.511 6.704 6.882 7.042 7.232 7.446 7.642 7.848 8.055 8.269 8.469 8.68 8.907 9.092 9.29 9.472 9.622 9.687 9.61 9.205 8.016 6.344 4.902 3.602 2.459 1.436 0.538 -0.265 -0.985 -1.717 -2.332 -2.872 -3.369 -3.865 -4.358 -4.818 -5.299 -5.69 -6.019 -6.378 -6.764 -7.081 -7.408 -7.767 -8.041 -8.307 -8.583 -8.881 -9.209 -9.43 -9.651 -10.018 -10.27 -10.521 -10.652 -10.907 -11.172 -11.465 -11.614 -11.944 -12.106 -12.289 -12.474 -12.882 -13.093 -13.329 -13.602 -13.891 -14.23 -14.69 -15.78 -5 ,32431 ,KEBNE ,16723821,Sun Nov 28 03:36:14 CET,Sun Nov 28 05:27:29 CET,0.0 1.07 1.437 1.738 1.969 2.18 2.364 2.529 2.834 2.974 3.109 3.194 3.466 3.574 3.787 3.974 4.147 4.234 4.399 4.565 4.801 4.954 5.096 5.286 5.471 5.646 5.812 5.967 6.179 6.374 6.542 6.745 6.94 7.129 7.354 7.595 7.796 7.987 8.194 8.409 8.619 8.832 9.031 9.204 9.37 9.495 9.543 9.492 9.313 8.85 7.726 6.061 4.561 3.217 2.006 0.898 -0.026 -0.84 -1.557 -2.297 -2.961 -3.534 -4.061 -4.559 -5.013 -5.432 -5.891 -6.308 -6.673 -7.078 -7.488 -7.815 -8.152 -8.501 -8.784 -9.072 -9.361 -9.668 -9.994 -10.211 -10.422 -10.762 -11.012 -11.28 -11.412 -11.69 -11.992 -12.317 -12.488 -12.834 -12.988 -13.17 -13.371 -13.829 -14.085 -14.336 -14.621 -14.954 -15.344 -15.86 -17.055 -9 ,16180 ,KEBNE ,16723825,Sun Nov 28 03:46:30 CET,Sun Nov 28 05:37:23 CET,0.0 1.044 1.455 1.772 2.038 2.26 2.466 2.651 3.002 3.181 3.329 3.419 3.708 3.831 4.046 4.236 4.435 4.532 4.715 4.896 5.147 5.302 5.444 5.639 5.825 6.004 6.178 6.343 6.548 6.744 6.956 7.23 7.494 7.729 7.963 8.207 8.417 8.644 8.91 9.17 9.394 9.623 9.851 10.034 10.208 10.359 10.429 10.361 10.129 9.525 8.211 6.537 5.067 3.745 2.57 1.523 0.597 -0.251 -0.978 -1.709 -2.332 -2.859 -3.361 -3.861 -4.337 -4.769 -5.206 -5.592 -5.931 -6.277 -6.65 -6.973 -7.296 -7.623 -7.878 -8.141 -8.424 -8.716 -9.011 -9.215 -9.426 -9.762 -10.002 -10.253 -10.383 -10.671 -10.965 -11.262 -11.426 -11.775 -11.96 -12.159 -12.366 -12.778 -12.998 -13.247 -13.545 -13.854 -14.187 -14.648 -15.931 -10 ,2757 ,KEBNE ,16723826,Sun Nov 28 03:46:30 CET,Sun Nov 28 05:37:53 CET,0.0 0.931 1.325 1.624 1.881 2.103 2.289 2.458 2.782 2.929 3.061 3.147 3.436 3.55 3.786 4.019 4.232 4.325 4.499 4.667 4.895 5.036 5.169 5.367 5.558 5.742 5.918 6.085 6.289 6.47 6.638 6.827 7.007 7.177 7.375 7.607 7.814 8.021 8.218 8.424 8.643 8.867 9.091 9.286 9.472 9.59 9.723 9.811 9.695 9.23 8.02 6.343 4.858 3.542 2.411 1.393 0.492 -0.314 -1.001 -1.694 -2.303 -2.845 -3.358 -3.844 -4.311 -4.756 -5.222 -5.635 -5.994 -6.377 -6.785 -7.134 -7.491 -7.835 -8.101 -8.373 -8.646 -8.93 -9.232 -9.444 -9.654 -9.989 -10.223 -10.461 -10.59 -10.852 -11.13 -11.434 -11.592 -11.93 -12.068 -12.235 -12.42 -12.864 -13.124 -13.394 -13.654 -13.951 -14.285 -14.715 -15.904 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 52488c92..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12468 ,KEBNE ,17026358,Wed Dec 22 14:09:14 CET,Wed Dec 22 15:59:47 CET,0.0 0.718 1.066 1.341 1.589 1.806 1.984 2.15 2.472 2.617 2.755 2.857 3.145 3.262 3.493 3.714 3.911 4.003 4.181 4.345 4.569 4.712 4.851 5.049 5.226 5.399 5.567 5.732 5.947 6.141 6.324 6.54 6.754 6.954 7.174 7.413 7.61 7.803 7.995 8.187 8.376 8.558 8.72 8.818 8.862 8.836 8.681 8.388 7.897 7.052 5.286 2.915 0.902 -0.858 -2.415 -3.764 -4.914 -5.957 -6.83 -7.677 -8.392 -9.041 -9.664 -10.244 -10.779 -11.267 -11.782 -12.246 -12.655 -13.085 -13.508 -13.849 -14.205 -14.573 -14.873 -15.179 -15.49 -15.81 -16.13 -16.35 -16.585 -16.963 -17.225 -17.497 -17.639 -17.927 -18.221 -18.55 -18.722 -19.079 -19.264 -19.44 -19.623 -20.041 -20.258 -20.479 -20.733 -21.051 -21.461 -21.95 -23.003 -2 ,10535 ,KEBNE ,17026359,Wed Dec 22 14:09:14 CET,Wed Dec 22 15:59:59 CET,0.0 1.15 1.527 1.815 2.07 2.292 2.488 2.666 2.988 3.127 3.257 3.343 3.621 3.73 3.96 4.175 4.355 4.436 4.592 4.747 4.977 5.115 5.251 5.439 5.604 5.774 5.948 6.109 6.302 6.479 6.639 6.834 7.02 7.189 7.383 7.596 7.797 8.001 8.21 8.42 8.601 8.763 8.932 9.094 9.215 9.228 9.09 8.791 8.258 7.301 5.57 3.204 1.124 -0.593 -2.144 -3.557 -4.731 -5.779 -6.689 -7.579 -8.348 -9.024 -9.668 -10.277 -10.836 -11.362 -11.901 -12.374 -12.789 -13.216 -13.648 -14.002 -14.376 -14.755 -15.033 -15.322 -15.633 -15.96 -16.291 -16.521 -16.747 -17.105 -17.383 -17.66 -17.797 -18.084 -18.395 -18.711 -18.878 -19.235 -19.393 -19.579 -19.777 -20.213 -20.445 -20.681 -20.952 -21.292 -21.694 -22.161 -23.209 -3 ,10877 ,KEBNE ,17026360,Wed Dec 22 14:09:14 CET,Wed Dec 22 15:59:29 CET,0.0 0.941 1.301 1.578 1.808 2.002 2.19 2.369 2.677 2.823 2.95 3.017 3.292 3.406 3.613 3.81 3.99 4.071 4.242 4.406 4.622 4.765 4.903 5.085 5.257 5.422 5.579 5.724 5.898 6.062 6.211 6.398 6.576 6.722 6.888 7.073 7.215 7.367 7.531 7.691 7.859 8.011 8.125 8.193 8.241 8.226 8.117 7.881 7.435 6.555 4.765 2.308 0.195 -1.643 -3.224 -4.584 -5.761 -6.787 -7.684 -8.579 -9.313 -9.967 -10.608 -11.195 -11.744 -12.248 -12.76 -13.225 -13.629 -14.046 -14.464 -14.806 -15.171 -15.557 -15.86 -16.168 -16.477 -16.796 -17.123 -17.347 -17.583 -17.957 -18.216 -18.487 -18.638 -18.937 -19.235 -19.553 -19.715 -20.069 -20.239 -20.424 -20.625 -21.064 -21.304 -21.568 -21.851 -22.172 -22.546 -22.98 -23.951 -4 ,10978 ,KEBNE ,17026361,Wed Dec 22 14:10:16 CET,Wed Dec 22 16:01:22 CET,0.0 0.848 1.223 1.531 1.806 2.026 2.222 2.403 2.691 2.827 2.97 3.075 3.356 3.469 3.693 3.895 4.077 4.162 4.327 4.492 4.73 4.873 5.006 5.198 5.375 5.545 5.721 5.898 6.103 6.283 6.453 6.642 6.812 6.962 7.133 7.326 7.486 7.644 7.828 7.995 8.133 8.291 8.456 8.562 8.638 8.69 8.625 8.403 7.944 7.087 5.417 3.095 0.948 -0.851 -2.329 -3.654 -4.797 -5.825 -6.739 -7.654 -8.415 -9.078 -9.701 -10.275 -10.813 -11.304 -11.822 -12.288 -12.69 -13.101 -13.53 -13.896 -14.268 -14.649 -14.943 -15.256 -15.576 -15.896 -16.238 -16.477 -16.722 -17.109 -17.374 -17.649 -17.789 -18.095 -18.42 -18.745 -18.917 -19.275 -19.444 -19.636 -19.846 -20.309 -20.542 -20.781 -21.045 -21.324 -21.696 -22.206 -23.509 -5 ,7321 ,KEBNE ,17026362,Wed Dec 22 14:10:16 CET,Wed Dec 22 16:01:51 CET,0.0 0.878 1.272 1.57 1.804 1.998 2.176 2.363 2.704 2.835 2.957 3.038 3.299 3.4 3.595 3.763 3.922 4.005 4.165 4.307 4.508 4.637 4.761 4.95 5.122 5.274 5.429 5.584 5.775 5.952 6.12 6.302 6.466 6.618 6.777 6.954 7.111 7.268 7.425 7.564 7.675 7.78 7.864 7.91 7.941 7.922 7.832 7.591 7.063 6.139 4.474 2.168 0.125 -1.58 -3.107 -4.459 -5.58 -6.574 -7.433 -8.287 -9.002 -9.649 -10.28 -10.878 -11.443 -11.966 -12.491 -12.95 -13.357 -13.773 -14.188 -14.541 -14.911 -15.299 -15.615 -15.939 -16.26 -16.578 -16.906 -17.138 -17.381 -17.778 -18.043 -18.315 -18.456 -18.736 -19.028 -19.333 -19.49 -19.842 -20.013 -20.196 -20.397 -20.847 -21.098 -21.362 -21.633 -21.963 -22.338 -22.827 -23.855 -6 ,496 ,KEBNE ,17026363,Wed Dec 22 14:10:16 CET,Wed Dec 22 16:02:15 CET,0.0 0.937 1.312 1.587 1.817 2.029 2.232 2.412 2.72 2.869 3.011 3.082 3.353 3.469 3.684 3.879 4.055 4.135 4.298 4.467 4.698 4.841 4.979 5.169 5.35 5.525 5.696 5.86 6.067 6.259 6.429 6.617 6.798 6.973 7.179 7.412 7.616 7.836 8.059 8.265 8.461 8.656 8.832 8.978 9.126 9.21 9.182 9.01 8.669 7.889 6.224 4.028 2.04 0.272 -1.225 -2.568 -3.729 -4.737 -5.607 -6.483 -7.216 -7.876 -8.522 -9.134 -9.708 -10.234 -10.779 -11.25 -11.661 -12.085 -12.512 -12.86 -13.207 -13.568 -13.849 -14.141 -14.457 -14.79 -15.14 -15.372 -15.605 -15.976 -16.232 -16.515 -16.665 -16.953 -17.261 -17.591 -17.755 -18.107 -18.273 -18.468 -18.667 -19.079 -19.298 -19.529 -19.804 -20.114 -20.452 -20.895 -22.081 -7 ,16220 ,KEBNE ,17026364,Wed Dec 22 14:10:16 CET,Wed Dec 22 16:01:32 CET,0.0 0.858 1.218 1.496 1.725 1.933 2.115 2.285 2.602 2.742 2.869 2.927 3.196 3.298 3.499 3.689 3.872 3.962 4.122 4.279 4.514 4.652 4.775 4.947 5.114 5.27 5.415 5.562 5.757 5.937 6.092 6.275 6.442 6.588 6.754 6.965 7.166 7.344 7.508 7.669 7.812 7.939 8.065 8.139 8.177 8.127 7.95 7.659 7.077 6.109 4.342 1.977 -0.023 -1.791 -3.349 -4.754 -5.965 -7.035 -7.96 -8.868 -9.64 -10.345 -11.025 -11.661 -12.259 -12.793 -13.319 -13.772 -14.165 -14.58 -15.013 -15.375 -15.749 -16.132 -16.431 -16.734 -17.041 -17.352 -17.669 -17.89 -18.122 -18.486 -18.725 -18.966 -19.096 -19.362 -19.645 -19.964 -20.128 -20.478 -20.651 -20.863 -21.082 -21.514 -21.733 -21.982 -22.267 -22.573 -22.946 -23.427 -24.663 -8 ,10012 ,KEBNE ,17026365,Wed Dec 22 14:10:20 CET,Wed Dec 22 15:53:47 CET,0.0 0.86 1.206 1.461 1.687 1.899 2.08 2.241 2.536 2.658 2.772 2.842 3.113 3.22 3.429 3.624 3.792 3.874 4.031 4.18 4.411 4.564 4.704 4.89 5.053 5.209 5.372 5.527 5.717 5.891 6.05 6.233 6.409 6.581 6.769 6.964 7.16 7.382 7.577 7.735 7.874 7.999 8.12 8.215 8.281 8.328 8.335 8.21 7.784 6.973 5.372 3.142 1.212 -0.469 -1.921 -3.221 -4.3 -5.272 -6.156 -7.063 -7.837 -8.506 -9.134 -9.728 -10.277 -10.763 -11.272 -11.74 -12.144 -12.561 -12.99 -13.34 -13.703 -14.089 -14.389 -14.693 -15.011 -15.342 -15.687 -15.926 -16.167 -16.528 -16.795 -17.091 -17.234 -17.524 -17.836 -18.16 -18.315 -18.659 -18.837 -19.03 -19.234 -19.681 -19.931 -20.211 -20.509 -20.835 -21.209 -21.727 -22.903 -9 ,6843 ,KEBNE ,17026366,Wed Dec 22 14:10:16 CET,Wed Dec 22 16:01:49 CET,0.0 1.074 1.492 1.801 2.056 2.273 2.45 2.613 2.929 3.069 3.196 3.288 3.572 3.68 3.881 4.074 4.251 4.334 4.491 4.639 4.849 4.996 5.132 5.311 5.488 5.649 5.791 5.936 6.122 6.297 6.485 6.695 6.879 7.048 7.241 7.464 7.652 7.828 8.005 8.18 8.358 8.521 8.633 8.702 8.757 8.778 8.701 8.455 7.905 6.939 5.165 2.854 0.854 -0.862 -2.314 -3.599 -4.715 -5.723 -6.586 -7.446 -8.194 -8.856 -9.47 -10.069 -10.658 -11.195 -11.759 -12.246 -12.647 -13.063 -13.494 -13.853 -14.232 -14.618 -14.912 -15.215 -15.519 -15.83 -16.168 -16.404 -16.645 -17.023 -17.295 -17.575 -17.715 -18.003 -18.301 -18.614 -18.77 -19.105 -19.253 -19.445 -19.664 -20.12 -20.354 -20.588 -20.848 -21.133 -21.449 -21.88 -22.829 -10 ,2966 ,KEBNE ,17026367,Wed Dec 22 14:10:16 CET,Wed Dec 22 16:01:18 CET,0.0 0.862 1.229 1.546 1.818 2.034 2.212 2.373 2.67 2.809 2.934 2.989 3.248 3.347 3.537 3.733 3.917 4.003 4.179 4.343 4.556 4.682 4.798 4.974 5.15 5.325 5.495 5.635 5.807 5.983 6.151 6.328 6.485 6.642 6.836 7.033 7.2 7.377 7.556 7.715 7.851 7.977 8.095 8.193 8.243 8.208 8.064 7.767 7.206 6.222 4.419 2.028 0.011 -1.659 -3.059 -4.299 -5.403 -6.439 -7.365 -8.276 -9.029 -9.712 -10.37 -10.98 -11.543 -12.061 -12.576 -13.03 -13.439 -13.839 -14.252 -14.598 -14.958 -15.347 -15.644 -15.947 -16.267 -16.599 -16.944 -17.173 -17.396 -17.772 -18.05 -18.324 -18.468 -18.796 -19.113 -19.426 -19.595 -19.953 -20.146 -20.349 -20.552 -21.01 -21.279 -21.549 -21.839 -22.151 -22.527 -23.027 -24.157 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index 5e439dae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12512 ,KEBNE ,16723827,Sun Nov 28 03:46:30 CET,Sun Nov 28 05:33:08 CET,0.0 0.391 0.605 0.79 0.968 1.12 1.266 1.407 1.672 1.799 1.921 1.977 2.279 2.397 2.62 2.823 3.019 3.117 3.305 3.491 3.775 3.96 4.137 4.401 4.653 4.887 5.117 5.346 5.648 5.939 6.211 6.533 6.849 7.163 7.534 7.938 8.331 8.777 9.256 9.754 10.282 10.914 11.663 12.407 13.289 14.301 15.502 16.921 18.587 20.562 23.054 25.211 26.54 27.395 27.943 28.302 28.51 28.62 28.664 28.69 28.684 28.641 28.573 28.505 28.457 28.399 28.287 28.154 28.033 27.9 27.763 27.661 27.545 27.402 27.279 27.137 26.997 26.859 26.704 26.596 26.486 26.315 26.188 26.049 25.98 25.828 25.663 25.5 25.405 25.154 25.103 24.993 24.87 24.581 24.403 24.192 23.945 23.681 23.386 22.98 21.812 -2 ,19180 ,KEBNE ,16723828,Sun Nov 28 03:47:31 CET,Sun Nov 28 05:34:12 CET,0.0 0.259 0.481 0.692 0.871 1.026 1.17 1.31 1.57 1.686 1.805 1.865 2.168 2.284 2.49 2.69 2.888 2.986 3.174 3.354 3.628 3.8 3.959 4.196 4.43 4.658 4.876 5.087 5.372 5.656 5.933 6.264 6.582 6.898 7.277 7.705 8.109 8.563 9.065 9.605 10.175 10.812 11.566 12.343 13.261 14.32 15.562 16.997 18.717 20.852 23.539 25.763 27.104 27.95 28.476 28.813 29.047 29.175 29.21 29.22 29.21 29.179 29.132 29.046 28.946 28.853 28.739 28.628 28.524 28.392 28.255 28.149 28.023 27.891 27.776 27.635 27.492 27.346 27.197 27.097 26.994 26.824 26.677 26.513 26.43 26.259 26.078 25.871 25.768 25.505 25.418 25.272 25.114 24.807 24.649 24.488 24.273 24.033 23.77 23.374 21.904 -3 ,16587 ,KEBNE ,16723829,Sun Nov 28 03:47:31 CET,Sun Nov 28 05:34:43 CET,0.0 0.445 0.673 0.873 1.04 1.198 1.351 1.499 1.78 1.912 2.039 2.094 2.4 2.515 2.749 2.971 3.179 3.283 3.477 3.658 3.93 4.106 4.273 4.521 4.753 4.978 5.202 5.412 5.689 5.978 6.262 6.594 6.926 7.252 7.615 8.007 8.383 8.812 9.293 9.817 10.379 11.029 11.793 12.564 13.475 14.493 15.706 17.146 18.886 20.976 23.646 25.972 27.281 28.044 28.476 28.741 28.898 28.963 28.969 28.956 28.921 28.871 28.808 28.735 28.658 28.564 28.424 28.297 28.205 28.099 27.959 27.805 27.633 27.474 27.347 27.227 27.102 26.958 26.772 26.62 26.469 26.241 26.079 25.913 25.829 25.664 25.484 25.275 25.153 24.859 24.74 24.591 24.417 24.045 23.858 23.653 23.428 23.131 22.77 22.287 20.451 -5 ,13232 ,KEBNE ,16723831,Sun Nov 28 03:49:38 CET,Sun Nov 28 05:29:24 CET,0.0 0.274 0.513 0.741 0.931 1.073 1.215 1.369 1.644 1.76 1.877 1.933 2.236 2.347 2.553 2.751 2.942 3.038 3.231 3.416 3.68 3.844 4.004 4.238 4.468 4.69 4.907 5.119 5.383 5.645 5.911 6.239 6.55 6.858 7.226 7.644 8.057 8.498 8.984 9.515 10.058 10.676 11.422 12.186 13.066 14.052 15.251 16.654 18.339 20.429 23.09 25.357 26.701 27.553 28.093 28.481 28.766 28.949 29.028 29.052 29.042 29.002 28.952 28.877 28.776 28.678 28.569 28.461 28.371 28.267 28.126 28.011 27.875 27.709 27.588 27.451 27.302 27.148 26.986 26.871 26.75 26.558 26.421 26.273 26.188 26.011 25.844 25.645 25.526 25.258 25.166 25.021 24.864 24.517 24.312 24.084 23.819 23.467 23.077 22.665 21.588 -7 ,1448 ,KEBNE ,16723833,Sun Nov 28 03:50:35 CET,Sun Nov 28 05:37:24 CET,0.0 0.277 0.474 0.664 0.855 1.024 1.177 1.317 1.58 1.702 1.824 1.88 2.188 2.308 2.537 2.753 2.957 3.049 3.227 3.402 3.655 3.825 3.997 4.247 4.5 4.754 4.99 5.214 5.512 5.8 6.067 6.391 6.713 7.026 7.382 7.792 8.206 8.662 9.152 9.68 10.235 10.874 11.631 12.403 13.318 14.359 15.583 16.992 18.722 20.864 23.571 25.803 27.061 27.839 28.328 28.627 28.797 28.898 28.951 28.958 28.917 28.855 28.781 28.709 28.619 28.511 28.368 28.249 28.131 27.982 27.845 27.73 27.612 27.471 27.341 27.202 27.056 26.912 26.747 26.616 26.481 26.296 26.163 26.01 25.93 25.753 25.565 25.363 25.255 24.985 24.889 24.753 24.61 24.251 24.051 23.87 23.678 23.446 23.132 22.737 21.571 -8 ,12687 ,KEBNE ,16723834,Sun Nov 28 03:50:35 CET,Sun Nov 28 05:37:09 CET,0.0 0.319 0.539 0.716 0.883 1.035 1.179 1.319 1.578 1.696 1.812 1.863 2.169 2.287 2.51 2.708 2.887 2.974 3.146 3.318 3.584 3.755 3.924 4.177 4.431 4.692 4.93 5.149 5.441 5.713 5.979 6.314 6.636 6.955 7.325 7.729 8.117 8.564 9.06 9.589 10.157 10.784 11.515 12.268 13.134 14.132 15.321 16.692 18.385 20.443 23.078 25.384 26.715 27.555 28.093 28.456 28.659 28.734 28.751 28.757 28.748 28.707 28.635 28.556 28.458 28.355 28.239 28.108 27.979 27.844 27.694 27.556 27.418 27.279 27.169 27.043 26.898 26.738 26.572 26.447 26.311 26.086 25.914 25.732 25.641 25.461 25.276 25.082 24.987 24.741 24.678 24.563 24.443 24.146 23.96 23.756 23.511 23.206 22.841 22.313 20.755 -9 ,30084 ,KEBNE ,16723835,Sun Nov 28 03:50:36 CET,Sun Nov 28 05:37:52 CET,0.0 0.291 0.534 0.739 0.907 1.059 1.199 1.344 1.605 1.715 1.842 1.907 2.199 2.309 2.526 2.726 2.907 2.993 3.17 3.35 3.601 3.765 3.933 4.178 4.413 4.642 4.858 5.068 5.346 5.617 5.878 6.207 6.528 6.832 7.185 7.576 7.96 8.396 8.863 9.366 9.91 10.551 11.295 12.034 12.925 13.957 15.194 16.608 18.309 20.351 22.859 25.047 26.31 27.084 27.597 27.888 28.039 28.124 28.154 28.142 28.091 28.007 27.907 27.791 27.683 27.592 27.481 27.375 27.266 27.12 26.95 26.825 26.703 26.559 26.428 26.278 26.121 25.956 25.786 25.672 25.557 25.354 25.203 25.045 24.958 24.768 24.573 24.353 24.236 23.963 23.849 23.694 23.527 23.162 22.977 22.747 22.456 22.141 21.823 21.351 19.505 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index 92fe03dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2978 ,KEBNE ,16723837,Sun Nov 28 03:51:37 CET,Sun Nov 28 05:40:10 CET,0.0 0.21 0.397 0.582 0.742 0.883 1.006 1.116 1.322 1.423 1.525 1.549 1.803 1.898 2.071 2.237 2.399 2.474 2.63 2.77 2.962 3.093 3.222 3.404 3.571 3.74 3.9 4.05 4.245 4.436 4.623 4.838 5.05 5.257 5.486 5.744 5.997 6.266 6.539 6.836 7.149 7.476 7.854 8.247 8.707 9.228 9.83 10.518 11.258 11.997 12.718 12.996 12.942 12.702 12.403 12.14 11.863 11.517 11.176 10.815 10.467 10.154 9.869 9.587 9.313 9.063 8.773 8.516 8.306 8.073 7.815 7.586 7.365 7.133 6.944 6.749 6.537 6.317 6.102 5.941 5.76 5.498 5.309 5.104 5.005 4.805 4.565 4.296 4.164 3.878 3.775 3.632 3.467 3.114 2.929 2.729 2.486 2.214 1.868 1.442 0.616 -2 ,11518 ,KEBNE ,16723838,Sun Nov 28 03:54:41 CET,Sun Nov 28 05:42:11 CET,0.0 0.369 0.608 0.786 0.943 1.087 1.218 1.34 1.564 1.672 1.779 1.8 2.052 2.145 2.319 2.472 2.616 2.69 2.835 2.977 3.181 3.307 3.428 3.595 3.763 3.941 4.114 4.275 4.467 4.647 4.836 5.055 5.26 5.47 5.714 5.976 6.214 6.481 6.764 7.058 7.375 7.729 8.13 8.512 8.962 9.459 10.035 10.633 11.229 11.882 12.448 12.475 12.197 11.871 11.54 11.161 10.779 10.428 10.113 9.75 9.421 9.131 8.822 8.533 8.266 8.011 7.747 7.512 7.291 7.058 6.812 6.602 6.389 6.163 5.978 5.786 5.594 5.385 5.155 4.991 4.836 4.597 4.429 4.241 4.136 3.927 3.709 3.482 3.352 3.056 2.923 2.768 2.602 2.255 2.084 1.899 1.675 1.394 1.059 0.639 -0.352 -3 ,16835 ,KEBNE ,16723839,Sun Nov 28 03:54:41 CET,Sun Nov 28 05:42:06 CET,0.0 0.433 0.695 0.898 1.05 1.196 1.346 1.479 1.716 1.834 1.941 1.976 2.225 2.305 2.459 2.613 2.765 2.834 2.972 3.12 3.324 3.451 3.578 3.758 3.925 4.091 4.261 4.42 4.63 4.829 5.012 5.229 5.44 5.635 5.859 6.115 6.367 6.645 6.931 7.212 7.51 7.862 8.267 8.662 9.114 9.606 10.136 10.71 11.357 12.019 12.65 12.845 12.725 12.524 12.234 11.933 11.662 11.367 11.062 10.723 10.417 10.144 9.871 9.58 9.296 9.042 8.759 8.501 8.276 8.029 7.766 7.567 7.356 7.134 6.966 6.774 6.577 6.377 6.156 5.994 5.828 5.582 5.401 5.215 5.11 4.878 4.645 4.393 4.265 3.965 3.804 3.646 3.456 3.061 2.874 2.659 2.427 2.184 1.907 1.53 0.484 -4 ,15762 ,KEBNE ,16723840,Sun Nov 28 03:54:41 CET,Sun Nov 28 05:41:54 CET,0.0 0.348 0.625 0.815 0.98 1.131 1.26 1.381 1.606 1.707 1.807 1.846 2.107 2.198 2.367 2.52 2.665 2.738 2.881 3.018 3.214 3.344 3.469 3.65 3.828 3.998 4.152 4.302 4.506 4.709 4.9 5.117 5.322 5.527 5.765 6.033 6.289 6.554 6.838 7.143 7.456 7.775 8.156 8.568 9.035 9.537 10.113 10.74 11.364 11.935 12.505 12.757 12.618 12.348 12.055 11.742 11.397 11.074 10.798 10.483 10.188 9.922 9.66 9.392 9.143 8.912 8.653 8.412 8.209 7.986 7.75 7.556 7.336 7.097 6.903 6.702 6.5 6.295 6.068 5.907 5.749 5.483 5.282 5.077 4.969 4.742 4.51 4.26 4.127 3.828 3.69 3.549 3.394 3.036 2.842 2.623 2.374 2.145 1.831 1.362 0.584 -5 ,20618 ,KEBNE ,16723841,Sun Nov 28 03:55:43 CET,Sun Nov 28 05:44:32 CET,0.0 0.387 0.578 0.736 0.878 1.015 1.161 1.288 1.508 1.603 1.703 1.739 1.987 2.071 2.231 2.387 2.55 2.626 2.774 2.916 3.113 3.246 3.371 3.54 3.712 3.879 4.039 4.194 4.393 4.578 4.758 4.978 5.181 5.377 5.613 5.888 6.163 6.464 6.774 7.088 7.409 7.75 8.143 8.551 9.015 9.521 10.039 10.577 11.205 11.854 12.39 12.519 12.377 12.108 11.792 11.418 11.045 10.706 10.401 10.062 9.735 9.425 9.119 8.822 8.553 8.306 8.026 7.77 7.543 7.297 7.041 6.827 6.592 6.338 6.146 5.944 5.732 5.519 5.304 5.147 4.969 4.686 4.504 4.323 4.225 4.025 3.787 3.518 3.391 3.106 2.98 2.825 2.658 2.293 2.118 1.907 1.641 1.353 1.031 0.64 -0.681 -6 ,6921 ,KEBNE ,16723842,Sun Nov 28 03:55:43 CET,Sun Nov 28 05:43:07 CET,0.0 0.368 0.648 0.855 1.026 1.177 1.301 1.431 1.672 1.78 1.881 1.911 2.156 2.239 2.419 2.581 2.721 2.796 2.942 3.081 3.29 3.419 3.546 3.727 3.893 4.048 4.206 4.365 4.55 4.733 4.922 5.15 5.38 5.59 5.809 6.046 6.284 6.558 6.844 7.162 7.494 7.833 8.214 8.61 9.079 9.59 10.158 10.767 11.391 11.967 12.479 12.646 12.442 12.075 11.687 11.302 10.952 10.6 10.259 9.866 9.511 9.205 8.906 8.62 8.349 8.098 7.822 7.577 7.36 7.136 6.916 6.72 6.515 6.295 6.116 5.937 5.755 5.553 5.342 5.202 5.046 4.811 4.655 4.48 4.379 4.172 3.954 3.701 3.568 3.28 3.133 2.963 2.803 2.466 2.272 2.058 1.814 1.563 1.237 0.752 -0.384 -7 ,7416 ,KEBNE ,16723843,Sun Nov 28 03:55:43 CET,Sun Nov 28 05:43:28 CET,0.0 0.253 0.435 0.586 0.734 0.858 0.976 1.099 1.313 1.411 1.509 1.537 1.789 1.871 2.042 2.208 2.365 2.438 2.574 2.703 2.892 3.016 3.132 3.303 3.467 3.627 3.791 3.951 4.159 4.356 4.536 4.752 4.959 5.15 5.376 5.636 5.873 6.123 6.409 6.718 7.039 7.398 7.793 8.183 8.617 9.075 9.589 10.142 10.739 11.37 11.966 12.135 11.926 11.597 11.251 10.888 10.549 10.205 9.89 9.562 9.256 8.973 8.693 8.43 8.198 7.975 7.719 7.476 7.262 7.014 6.748 6.552 6.355 6.124 5.941 5.756 5.567 5.368 5.149 5.0 4.843 4.576 4.373 4.156 4.053 3.869 3.662 3.419 3.274 2.967 2.823 2.66 2.492 2.127 1.927 1.7 1.451 1.177 0.866 0.475 -0.334 -8 ,19689 ,KEBNE ,16723844,Sun Nov 28 03:56:44 CET,Sun Nov 28 05:44:43 CET,0.0 0.347 0.561 0.72 0.865 1.006 1.139 1.264 1.484 1.589 1.685 1.695 1.952 2.041 2.206 2.357 2.502 2.572 2.708 2.845 3.035 3.163 3.287 3.461 3.635 3.795 3.951 4.108 4.308 4.496 4.681 4.917 5.138 5.345 5.594 5.872 6.117 6.373 6.652 6.942 7.24 7.589 8.008 8.405 8.877 9.379 9.908 10.512 11.175 11.9 12.642 12.953 12.894 12.697 12.393 12.016 11.651 11.317 11.01 10.681 10.379 10.089 9.797 9.515 9.268 9.026 8.746 8.497 8.287 8.065 7.813 7.595 7.371 7.131 6.938 6.73 6.532 6.343 6.136 5.981 5.812 5.542 5.35 5.166 5.067 4.848 4.624 4.375 4.25 3.968 3.833 3.673 3.499 3.147 2.945 2.712 2.466 2.168 1.803 1.37 0.204 -9 ,2202 ,KEBNE ,16723845,Sun Nov 28 03:57:45 CET,Sun Nov 28 05:45:19 CET,0.0 0.274 0.484 0.659 0.819 0.95 1.077 1.191 1.441 1.567 1.674 1.707 1.963 2.051 2.213 2.366 2.525 2.604 2.745 2.876 3.073 3.197 3.32 3.516 3.694 3.856 4.023 4.183 4.38 4.567 4.747 4.967 5.187 5.397 5.629 5.884 6.119 6.38 6.671 6.984 7.306 7.648 8.031 8.426 8.873 9.343 9.877 10.458 11.093 11.754 12.372 12.592 12.477 12.221 11.931 11.609 11.256 10.907 10.594 10.272 9.978 9.685 9.38 9.076 8.787 8.536 8.286 8.058 7.854 7.639 7.405 7.2 6.985 6.75 6.564 6.378 6.171 5.966 5.762 5.607 5.452 5.207 5.035 4.856 4.762 4.568 4.349 4.125 4.005 3.708 3.551 3.391 3.224 2.837 2.611 2.378 2.156 1.887 1.524 1.085 -0.312 -10 ,26089 ,KEBNE ,16723846,Sun Nov 28 03:57:45 CET,Sun Nov 28 05:45:19 CET,0.0 0.317 0.526 0.693 0.832 0.966 1.097 1.208 1.432 1.541 1.645 1.678 1.929 2.016 2.177 2.327 2.483 2.552 2.679 2.809 3.005 3.134 3.255 3.419 3.576 3.731 3.889 4.042 4.227 4.398 4.565 4.771 4.969 5.163 5.392 5.651 5.895 6.161 6.447 6.747 7.061 7.411 7.82 8.232 8.706 9.213 9.744 10.309 10.933 11.589 12.206 12.403 12.217 11.859 11.487 11.087 10.71 10.376 10.047 9.682 9.354 9.076 8.77 8.447 8.169 7.905 7.631 7.384 7.16 6.907 6.649 6.45 6.231 6.008 5.837 5.653 5.458 5.252 5.031 4.878 4.72 4.466 4.288 4.103 4.005 3.792 3.567 3.341 3.218 2.934 2.854 2.724 2.568 2.212 2.02 1.796 1.546 1.274 0.954 0.526 -0.329 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt deleted file mode 100644 index 66122460..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32048 ,KEBNE ,16723847,Sun Nov 28 03:57:45 CET,Sun Nov 28 05:46:20 CET,0.0 1.446 1.885 2.182 2.437 2.643 2.814 2.978 3.266 3.395 3.517 3.6 3.879 3.991 4.186 4.357 4.523 4.607 4.771 4.916 5.126 5.266 5.398 5.571 5.721 5.869 6.013 6.133 6.28 6.433 6.572 6.723 6.86 6.996 7.149 7.298 7.43 7.582 7.724 7.844 7.962 8.077 8.171 8.214 8.196 8.12 7.972 7.709 7.172 6.082 4.218 1.903 -0.064 -1.69 -3.1 -4.362 -5.413 -6.35 -7.156 -7.942 -8.617 -9.19 -9.716 -10.226 -10.721 -11.172 -11.623 -12.026 -12.378 -12.738 -13.115 -13.422 -13.734 -14.065 -14.315 -14.575 -14.863 -15.166 -15.482 -15.703 -15.926 -16.28 -16.529 -16.786 -16.919 -17.19 -17.482 -17.799 -17.973 -18.327 -18.492 -18.675 -18.856 -19.278 -19.521 -19.77 -20.045 -20.387 -20.752 -21.186 -22.285 -4 ,23813 ,KEBNE ,16723850,Sun Nov 28 03:58:46 CET,Sun Nov 28 05:47:29 CET,0.0 1.162 1.564 1.862 2.131 2.386 2.589 2.758 3.041 3.166 3.292 3.346 3.597 3.691 3.889 4.083 4.261 4.345 4.503 4.645 4.854 4.977 5.083 5.244 5.405 5.556 5.693 5.821 5.981 6.137 6.291 6.461 6.599 6.726 6.874 7.035 7.179 7.318 7.451 7.568 7.674 7.774 7.848 7.906 7.932 7.896 7.754 7.519 7.093 6.101 4.258 2.019 0.154 -1.452 -2.763 -3.92 -4.949 -5.866 -6.64 -7.408 -8.085 -8.684 -9.226 -9.731 -10.221 -10.681 -11.154 -11.552 -11.889 -12.243 -12.634 -12.962 -13.3 -13.646 -13.917 -14.189 -14.458 -14.75 -15.067 -15.283 -15.49 -15.822 -16.067 -16.311 -16.436 -16.707 -16.984 -17.285 -17.447 -17.79 -17.953 -18.132 -18.304 -18.667 -18.865 -19.097 -19.366 -19.652 -20.031 -20.531 -21.706 -5 ,20597 ,KEBNE ,16723851,Sun Nov 28 03:58:46 CET,Sun Nov 28 05:47:11 CET,0.0 1.12 1.475 1.713 1.931 2.157 2.359 2.517 2.788 2.922 3.052 3.116 3.395 3.506 3.697 3.881 4.06 4.143 4.299 4.443 4.652 4.781 4.895 5.062 5.224 5.367 5.501 5.63 5.779 5.917 6.054 6.217 6.371 6.514 6.678 6.852 7.005 7.165 7.32 7.455 7.594 7.715 7.789 7.852 7.893 7.837 7.67 7.413 6.928 5.968 4.244 2.046 0.163 -1.472 -2.897 -4.126 -5.178 -6.12 -6.912 -7.707 -8.386 -8.991 -9.588 -10.152 -10.664 -11.116 -11.592 -12.034 -12.413 -12.794 -13.162 -13.461 -13.788 -14.138 -14.411 -14.686 -14.965 -15.25 -15.546 -15.749 -15.963 -16.291 -16.514 -16.75 -16.866 -17.101 -17.369 -17.655 -17.798 -18.144 -18.288 -18.439 -18.598 -18.979 -19.191 -19.415 -19.652 -19.908 -20.178 -20.571 -21.938 -7 ,6779 ,KEBNE ,16723853,Sun Nov 28 03:58:46 CET,Sun Nov 28 05:47:59 CET,0.0 1.778 2.293 2.678 2.937 3.168 3.387 3.591 3.99 4.167 4.317 4.438 4.74 4.869 5.082 5.275 5.457 5.538 5.684 5.818 6.004 6.126 6.241 6.411 6.592 6.765 6.931 7.094 7.277 7.466 7.663 7.87 8.065 8.262 8.471 8.691 8.886 9.069 9.247 9.416 9.589 9.76 9.87 9.9 9.884 9.853 9.752 9.465 8.953 8.014 6.182 3.893 1.986 0.339 -1.056 -2.293 -3.38 -4.361 -5.204 -6.029 -6.714 -7.335 -7.924 -8.468 -8.979 -9.457 -9.951 -10.371 -10.724 -11.101 -11.486 -11.802 -12.152 -12.507 -12.768 -13.04 -13.327 -13.618 -13.92 -14.132 -14.353 -14.691 -14.927 -15.174 -15.299 -15.567 -15.865 -16.184 -16.34 -16.683 -16.845 -17.024 -17.214 -17.638 -17.873 -18.138 -18.399 -18.671 -18.989 -19.419 -20.954 -8 ,10015 ,KEBNE ,16723854,Sun Nov 28 03:58:46 CET,Sun Nov 28 05:48:18 CET,0.0 2.229 2.661 2.989 3.291 3.556 3.767 3.956 4.265 4.386 4.506 4.607 4.894 5.014 5.242 5.454 5.64 5.722 5.898 6.063 6.304 6.462 6.606 6.8 6.988 7.175 7.334 7.463 7.632 7.79 7.923 8.102 8.282 8.435 8.601 8.772 8.934 9.091 9.226 9.342 9.444 9.603 9.786 9.865 9.86 9.792 9.645 9.373 8.841 7.903 6.23 4.049 2.211 0.647 -0.721 -1.952 -3.008 -3.965 -4.779 -5.584 -6.25 -6.83 -7.413 -7.95 -8.442 -8.895 -9.352 -9.768 -10.142 -10.54 -10.933 -11.252 -11.599 -11.953 -12.222 -12.511 -12.808 -13.101 -13.414 -13.637 -13.875 -14.246 -14.489 -14.75 -14.887 -15.165 -15.472 -15.782 -15.938 -16.285 -16.462 -16.673 -16.897 -17.362 -17.605 -17.856 -18.132 -18.469 -18.848 -19.315 -20.624 -9 ,26329 ,KEBNE ,16723855,Sun Nov 28 03:58:46 CET,Sun Nov 28 05:49:07 CET,0.0 1.532 2.105 2.438 2.701 2.934 3.15 3.354 3.741 3.912 4.059 4.168 4.457 4.567 4.767 4.943 5.102 5.182 5.331 5.469 5.657 5.786 5.919 6.104 6.278 6.446 6.606 6.754 6.927 7.068 7.208 7.391 7.582 7.775 7.99 8.212 8.388 8.551 8.704 8.835 8.943 9.042 9.131 9.2 9.223 9.114 8.899 8.635 8.192 7.327 5.56 3.31 1.44 -0.158 -1.523 -2.704 -3.728 -4.672 -5.462 -6.219 -6.878 -7.492 -8.081 -8.618 -9.093 -9.528 -10.003 -10.433 -10.805 -11.178 -11.558 -11.868 -12.177 -12.514 -12.784 -13.067 -13.376 -13.702 -14.021 -14.232 -14.449 -14.81 -15.067 -15.317 -15.448 -15.722 -15.982 -16.262 -16.42 -16.755 -16.895 -17.079 -17.274 -17.709 -17.92 -18.138 -18.403 -18.682 -18.959 -19.343 -20.271 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt deleted file mode 100644 index b70adc2e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18634 ,KEBNE ,17026368,Wed Dec 22 14:10:16 CET,Wed Dec 22 16:00:55 CET,0.0 2.269 2.692 3.026 3.319 3.577 3.797 4.005 4.389 4.553 4.711 4.826 5.159 5.317 5.625 5.912 6.175 6.298 6.536 6.763 7.118 7.35 7.557 7.87 8.17 8.449 8.699 8.93 9.237 9.54 9.827 10.166 10.478 10.784 11.163 11.592 12.003 12.467 12.94 13.397 13.91 14.5 15.168 15.838 16.605 17.445 18.375 19.317 20.349 21.456 22.471 22.966 22.955 22.713 22.37 21.994 21.644 21.286 20.93 20.512 20.096 19.733 19.398 19.071 18.751 18.454 18.133 17.83 17.571 17.317 17.05 16.82 16.577 16.32 16.134 15.94 15.728 15.506 15.283 15.128 14.959 14.68 14.477 14.278 14.173 13.945 13.698 13.409 13.259 12.949 12.856 12.717 12.575 12.263 12.083 11.888 11.675 11.448 11.184 10.856 9.96 -2 ,15776 ,KEBNE ,17026369,Wed Dec 22 14:10:16 CET,Wed Dec 22 16:00:27 CET,0.0 1.172 1.639 2.015 2.335 2.603 2.862 3.109 3.559 3.769 3.954 4.114 4.446 4.59 4.866 5.114 5.358 5.483 5.716 5.937 6.251 6.446 6.647 6.946 7.228 7.493 7.76 8.009 8.311 8.609 8.907 9.267 9.612 9.961 10.356 10.767 11.144 11.563 12.034 12.525 13.023 13.594 14.258 14.894 15.66 16.547 17.497 18.446 19.403 20.396 21.32 21.385 20.916 20.312 19.778 19.369 18.941 18.456 18.03 17.599 17.18 16.773 16.386 16.014 15.696 15.422 15.095 14.796 14.548 14.288 14.027 13.816 13.603 13.388 13.212 13.003 12.77 12.54 12.301 12.12 11.936 11.675 11.498 11.321 11.225 11.01 10.784 10.559 10.442 10.148 10.058 9.917 9.768 9.454 9.288 9.107 8.878 8.612 8.329 7.983 7.312 -3 ,20839 ,KEBNE ,17026370,Wed Dec 22 14:11:17 CET,Wed Dec 22 16:01:11 CET,0.0 1.52 1.92 2.23 2.53 2.8 3.033 3.23 3.581 3.751 3.924 4.086 4.419 4.57 4.862 5.122 5.357 5.469 5.693 5.911 6.234 6.449 6.658 6.965 7.26 7.541 7.81 8.065 8.394 8.712 9.017 9.388 9.739 10.054 10.419 10.84 11.231 11.664 12.13 12.627 13.177 13.806 14.531 15.237 16.025 16.872 17.779 18.642 19.504 20.367 21.099 21.363 21.201 20.833 20.364 19.926 19.541 19.146 18.77 18.395 18.09 17.789 17.447 17.084 16.719 16.385 16.058 15.767 15.509 15.244 14.968 14.746 14.507 14.255 14.061 13.856 13.639 13.411 13.181 13.009 12.819 12.553 12.372 12.16 12.046 11.8 11.533 11.271 11.129 10.801 10.663 10.503 10.339 9.975 9.764 9.521 9.25 8.945 8.586 8.201 6.962 -4 ,32172 ,KEBNE ,17026371,Wed Dec 22 14:11:17 CET,Wed Dec 22 16:01:17 CET,0.0 1.334 1.747 2.069 2.351 2.611 2.862 3.1 3.483 3.649 3.806 3.934 4.268 4.418 4.712 4.985 5.242 5.367 5.609 5.85 6.195 6.404 6.603 6.907 7.194 7.471 7.741 7.997 8.328 8.636 8.925 9.268 9.614 9.951 10.336 10.754 11.128 11.512 11.924 12.369 12.878 13.452 14.046 14.636 15.318 16.057 16.941 17.906 18.875 19.778 20.479 20.69 20.553 20.187 19.71 19.321 18.972 18.564 18.187 17.755 17.347 17.036 16.772 16.48 16.184 15.906 15.622 15.377 15.145 14.897 14.635 14.412 14.175 13.924 13.72 13.509 13.294 13.073 12.84 12.665 12.487 12.209 12.012 11.8 11.693 11.487 11.265 11.014 10.882 10.581 10.476 10.337 10.186 9.848 9.663 9.453 9.248 9.02 8.726 8.406 7.444 -5 ,16982 ,KEBNE ,17026372,Wed Dec 22 14:11:18 CET,Wed Dec 22 16:01:23 CET,0.0 1.722 2.15 2.443 2.682 2.896 3.103 3.303 3.675 3.865 4.05 4.204 4.536 4.676 4.947 5.215 5.483 5.614 5.862 6.11 6.464 6.688 6.903 7.213 7.502 7.765 8.014 8.267 8.597 8.909 9.212 9.589 9.955 10.292 10.689 11.117 11.514 11.992 12.495 13.0 13.546 14.172 14.895 15.592 16.336 17.075 17.825 18.644 19.672 20.723 21.577 21.856 21.574 21.134 20.717 20.253 19.796 19.345 18.921 18.488 18.093 17.736 17.398 17.066 16.73 16.398 16.061 15.768 15.518 15.26 15.002 14.78 14.542 14.296 14.094 13.887 13.672 13.433 13.19 13.038 12.877 12.596 12.394 12.18 12.066 11.841 11.605 11.338 11.195 10.88 10.755 10.595 10.434 10.078 9.869 9.642 9.392 9.134 8.867 8.549 7.872 -6 ,25509 ,KEBNE ,17026373,Wed Dec 22 14:11:17 CET,Wed Dec 22 16:01:10 CET,0.0 1.527 2.024 2.392 2.688 2.93 3.153 3.375 3.769 3.938 4.098 4.242 4.576 4.725 5.02 5.293 5.539 5.658 5.883 6.105 6.425 6.622 6.808 7.082 7.353 7.612 7.862 8.112 8.427 8.72 9.027 9.403 9.74 10.066 10.41 10.755 11.112 11.512 11.927 12.363 12.849 13.436 14.149 14.821 15.566 16.402 17.304 18.288 19.25 20.165 21.077 21.366 21.248 20.989 20.693 20.375 19.993 19.56 19.145 18.714 18.325 17.944 17.575 17.236 16.915 16.63 16.304 16.0 15.757 15.516 15.258 15.042 14.82 14.575 14.396 14.211 14.002 13.799 13.585 13.423 13.246 12.964 12.775 12.583 12.494 12.306 12.104 11.886 11.766 11.471 11.377 11.244 11.094 10.715 10.514 10.305 10.071 9.804 9.496 9.132 8.009 -7 ,24983 ,KEBNE ,17026374,Wed Dec 22 14:11:17 CET,Wed Dec 22 16:00:42 CET,0.0 1.09 1.538 1.902 2.19 2.44 2.695 2.917 3.303 3.487 3.657 3.815 4.146 4.289 4.569 4.834 5.094 5.223 5.47 5.703 6.034 6.239 6.44 6.722 6.988 7.244 7.501 7.767 8.094 8.397 8.687 9.032 9.367 9.702 10.093 10.53 10.955 11.401 11.877 12.399 12.94 13.511 14.115 14.733 15.496 16.346 17.249 18.128 19.0 19.816 20.358 20.335 19.994 19.537 19.052 18.591 18.216 17.849 17.469 17.095 16.784 16.477 16.156 15.846 15.574 15.328 15.055 14.778 14.524 14.262 13.992 13.764 13.521 13.271 13.088 12.901 12.692 12.48 12.266 12.115 11.959 11.699 11.51 11.327 11.232 11.033 10.826 10.609 10.495 10.208 10.12 9.971 9.8 9.445 9.259 9.056 8.813 8.538 8.211 7.771 6.469 -8 ,32642 ,KEBNE ,17026375,Wed Dec 22 14:11:21 CET,Wed Dec 22 15:55:55 CET,0.0 2.512 2.967 3.303 3.606 3.877 4.111 4.333 4.742 4.93 5.102 5.252 5.589 5.744 6.015 6.263 6.52 6.647 6.887 7.116 7.449 7.657 7.854 8.139 8.411 8.69 8.958 9.209 9.546 9.883 10.2 10.572 10.912 11.213 11.568 11.981 12.376 12.818 13.292 13.768 14.281 14.92 15.677 16.374 17.138 17.947 18.79 19.684 20.662 21.706 22.726 23.055 22.822 22.403 21.973 21.561 21.091 20.632 20.268 19.832 19.404 19.058 18.731 18.408 18.113 17.839 17.568 17.317 17.083 16.837 16.582 16.367 16.122 15.875 15.687 15.499 15.31 15.096 14.866 14.704 14.526 14.262 14.064 13.837 13.724 13.493 13.277 13.041 12.909 12.602 12.493 12.362 12.214 11.889 11.715 11.518 11.314 11.064 10.703 10.165 8.122 -9 ,28141 ,KEBNE ,17026376,Wed Dec 22 14:12:20 CET,Wed Dec 22 16:02:15 CET,0.0 1.797 2.188 2.526 2.796 3.056 3.317 3.543 3.932 4.113 4.286 4.438 4.776 4.918 5.208 5.478 5.724 5.849 6.101 6.337 6.66 6.881 7.102 7.403 7.692 7.976 8.25 8.511 8.848 9.181 9.499 9.872 10.201 10.507 10.893 11.348 11.766 12.206 12.681 13.164 13.64 14.135 14.742 15.383 16.089 16.888 17.802 18.723 19.659 20.701 21.706 22.168 22.155 21.842 21.406 20.988 20.612 20.189 19.771 19.338 18.926 18.532 18.159 17.829 17.521 17.229 16.918 16.633 16.378 16.105 15.823 15.582 15.321 15.062 14.856 14.632 14.413 14.199 13.979 13.836 13.665 13.378 13.192 13.006 12.914 12.701 12.466 12.206 12.065 11.751 11.632 11.47 11.299 10.947 10.755 10.535 10.289 10.015 9.716 9.345 8.219 -10 ,32184 ,KEBNE ,17026377,Wed Dec 22 14:12:20 CET,Wed Dec 22 16:02:23 CET,0.0 1.004 1.469 1.869 2.192 2.466 2.694 2.899 3.262 3.439 3.613 3.744 4.075 4.235 4.533 4.805 5.065 5.188 5.436 5.681 6.016 6.214 6.414 6.707 6.982 7.258 7.523 7.772 8.088 8.395 8.701 9.062 9.404 9.756 10.16 10.585 10.991 11.451 11.932 12.422 12.938 13.474 14.069 14.674 15.344 16.106 16.984 17.907 18.938 19.944 20.793 21.079 20.879 20.495 20.045 19.556 19.047 18.562 18.132 17.634 17.209 16.857 16.496 16.113 15.757 15.43 15.082 14.791 14.543 14.276 13.977 13.728 13.483 13.216 13.007 12.79 12.556 12.313 12.058 11.889 11.716 11.435 11.244 11.045 10.939 10.728 10.516 10.269 10.135 9.839 9.78 9.657 9.523 9.2 9.022 8.853 8.638 8.365 7.991 7.488 6.206 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt deleted file mode 100644 index fbb5442a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,655 ,KEBNE ,16723857,Sun Nov 28 03:58:46 CET,Sun Nov 28 05:51:45 CET,0.0 0.306 0.528 0.753 0.967 1.17 1.371 1.555 1.905 2.074 2.248 2.356 2.732 2.892 3.196 3.482 3.736 3.855 4.104 4.357 4.719 4.948 5.171 5.493 5.818 6.144 6.459 6.753 7.141 7.53 7.917 8.389 8.819 9.238 9.744 10.324 10.88 11.496 12.186 12.947 13.766 14.69 15.757 16.868 18.221 19.757 21.576 23.703 26.297 29.401 33.251 36.624 38.709 40.071 40.99 41.605 41.979 42.218 42.403 42.554 42.62 42.624 42.588 42.512 42.408 42.309 42.179 42.059 41.939 41.8 41.66 41.542 41.415 41.275 41.142 40.987 40.82 40.632 40.451 40.327 40.187 39.945 39.764 39.574 39.468 39.236 39.008 38.777 38.655 38.344 38.241 38.1 37.95 37.601 37.407 37.187 36.927 36.623 36.273 35.845 34.638 -2 ,6803 ,KEBNE ,16723858,Sun Nov 28 03:58:46 CET,Sun Nov 28 05:51:32 CET,0.0 0.349 0.605 0.855 1.062 1.234 1.406 1.577 1.901 2.048 2.199 2.279 2.63 2.766 3.025 3.261 3.507 3.63 3.884 4.122 4.453 4.676 4.89 5.197 5.497 5.786 6.075 6.373 6.749 7.102 7.455 7.901 8.341 8.758 9.235 9.802 10.357 10.95 11.598 12.307 13.069 13.961 15.056 16.171 17.442 18.883 20.606 22.597 25.041 27.969 31.56 34.766 36.713 37.967 38.783 39.38 39.743 39.948 40.078 40.123 40.069 39.977 39.893 39.815 39.726 39.63 39.502 39.348 39.198 39.053 38.898 38.737 38.583 38.43 38.285 38.127 37.963 37.793 37.627 37.504 37.366 37.139 36.975 36.808 36.722 36.547 36.355 36.139 36.013 35.698 35.6 35.442 35.282 34.951 34.76 34.543 34.305 34.054 33.756 33.327 32.34 -3 ,24269 ,KEBNE ,16723859,Sun Nov 28 03:58:47 CET,Sun Nov 28 05:51:41 CET,0.0 0.392 0.669 0.909 1.114 1.297 1.477 1.655 2.006 2.172 2.33 2.425 2.796 2.937 3.205 3.471 3.724 3.848 4.095 4.34 4.707 4.94 5.158 5.467 5.771 6.069 6.361 6.65 7.02 7.375 7.737 8.184 8.616 9.047 9.555 10.121 10.668 11.291 11.975 12.692 13.474 14.383 15.463 16.599 17.931 19.395 21.122 23.143 25.667 28.789 32.668 36.114 38.243 39.632 40.549 41.19 41.63 41.949 42.15 42.267 42.293 42.272 42.242 42.194 42.132 42.043 41.899 41.746 41.596 41.431 41.282 41.165 41.015 40.82 40.664 40.498 40.304 40.085 39.869 39.724 39.555 39.291 39.122 38.947 38.852 38.647 38.437 38.214 38.097 37.791 37.68 37.518 37.359 37.056 36.88 36.666 36.412 36.146 35.839 35.403 34.287 -4 ,28152 ,KEBNE ,16723860,Sun Nov 28 03:59:48 CET,Sun Nov 28 05:52:40 CET,0.0 0.527 0.848 1.095 1.324 1.551 1.761 1.956 2.305 2.46 2.607 2.678 3.039 3.185 3.487 3.768 4.018 4.145 4.409 4.655 5.009 5.239 5.451 5.768 6.088 6.39 6.674 6.954 7.331 7.715 8.102 8.547 8.958 9.376 9.868 10.437 10.99 11.594 12.262 12.994 13.811 14.742 15.838 16.938 18.203 19.669 21.42 23.462 25.974 28.987 32.522 35.373 37.141 38.234 38.911 39.404 39.717 39.912 39.996 40.046 40.083 40.075 40.017 39.905 39.785 39.654 39.52 39.427 39.322 39.199 39.062 38.921 38.772 38.625 38.495 38.359 38.211 38.037 37.854 37.715 37.574 37.375 37.218 37.047 36.964 36.794 36.578 36.338 36.223 35.916 35.808 35.655 35.495 35.157 34.968 34.762 34.534 34.308 34.043 33.67 32.903 -5 ,27818 ,KEBNE ,16723861,Sun Nov 28 03:59:52 CET,Sun Nov 28 05:46:22 CET,0.0 0.43 0.691 0.908 1.118 1.322 1.524 1.703 2.024 2.179 2.328 2.406 2.772 2.91 3.167 3.419 3.67 3.798 4.054 4.293 4.612 4.82 5.029 5.345 5.662 5.972 6.274 6.57 6.977 7.374 7.746 8.198 8.628 9.045 9.553 10.111 10.631 11.232 11.893 12.593 13.346 14.217 15.254 16.335 17.635 19.128 20.892 22.867 25.264 28.363 32.386 35.94 38.156 39.573 40.548 41.224 41.52 41.635 41.716 41.749 41.752 41.721 41.686 41.657 41.604 41.51 41.37 41.234 41.128 41.027 40.901 40.769 40.624 40.476 40.355 40.235 40.094 39.93 39.762 39.641 39.52 39.312 39.147 38.979 38.894 38.704 38.498 38.277 38.165 37.874 37.806 37.666 37.523 37.186 36.985 36.776 36.556 36.335 36.072 35.738 35.226 -6 ,28231 ,KEBNE ,16723862,Sun Nov 28 03:59:48 CET,Sun Nov 28 05:52:58 CET,0.0 0.799 1.063 1.277 1.533 1.776 1.965 2.144 2.501 2.685 2.851 2.942 3.305 3.458 3.776 4.068 4.356 4.494 4.745 5.001 5.378 5.619 5.847 6.169 6.499 6.831 7.138 7.442 7.83 8.206 8.587 9.059 9.519 9.951 10.452 11.015 11.57 12.2 12.873 13.596 14.377 15.261 16.261 17.318 18.617 20.053 21.799 23.923 26.445 29.553 33.541 36.963 39.058 40.443 41.391 42.067 42.493 42.713 42.834 42.926 42.963 42.95 42.887 42.823 42.76 42.68 42.592 42.483 42.367 42.25 42.121 41.99 41.834 41.654 41.511 41.372 41.226 41.072 40.893 40.768 40.639 40.429 40.283 40.118 40.03 39.867 39.686 39.486 39.392 39.113 39.055 38.925 38.779 38.441 38.258 38.079 37.893 37.658 37.397 37.063 36.161 -7 ,21064 ,KEBNE ,16723863,Sun Nov 28 03:59:48 CET,Sun Nov 28 05:52:55 CET,0.0 0.44 0.773 1.069 1.301 1.498 1.689 1.88 2.268 2.449 2.615 2.726 3.113 3.274 3.575 3.86 4.135 4.269 4.539 4.81 5.214 5.465 5.696 6.039 6.386 6.733 7.063 7.378 7.8 8.215 8.619 9.123 9.619 10.082 10.632 11.298 11.943 12.606 13.266 13.981 14.769 15.68 16.759 17.857 19.15 20.631 22.369 24.348 26.786 29.79 33.547 36.766 38.622 39.795 40.595 41.174 41.573 41.841 41.975 42.011 42.008 41.985 41.937 41.865 41.761 41.633 41.501 41.388 41.27 41.138 40.968 40.8 40.643 40.497 40.39 40.273 40.116 39.935 39.75 39.626 39.495 39.272 39.092 38.885 38.787 38.592 38.391 38.192 38.088 37.793 37.71 37.584 37.448 37.122 36.947 36.746 36.503 36.236 35.946 35.555 34.718 -8 ,29243 ,KEBNE ,16723864,Sun Nov 28 03:59:48 CET,Sun Nov 28 05:51:57 CET,0.0 0.394 0.685 0.94 1.155 1.355 1.53 1.695 2.021 2.186 2.353 2.445 2.814 2.959 3.223 3.485 3.746 3.871 4.114 4.352 4.693 4.918 5.148 5.481 5.807 6.126 6.431 6.74 7.161 7.574 7.966 8.432 8.878 9.287 9.778 10.374 10.951 11.576 12.256 13.01 13.808 14.734 15.835 16.917 18.217 19.746 21.55 23.611 26.076 29.065 32.875 36.272 38.314 39.606 40.447 41.011 41.365 41.583 41.705 41.789 41.815 41.79 41.743 41.705 41.675 41.627 41.539 41.431 41.324 41.196 41.026 40.861 40.691 40.531 40.399 40.239 40.053 39.858 39.672 39.551 39.419 39.193 39.031 38.853 38.757 38.567 38.386 38.182 38.063 37.755 37.652 37.506 37.359 37.045 36.876 36.685 36.459 36.211 35.937 35.553 34.681 -9 ,4680 ,KEBNE ,16723865,Sun Nov 28 03:59:48 CET,Sun Nov 28 05:53:20 CET,0.0 0.335 0.616 0.858 1.08 1.282 1.46 1.633 1.963 2.108 2.251 2.317 2.667 2.798 3.077 3.33 3.562 3.684 3.926 4.166 4.532 4.754 4.956 5.267 5.583 5.891 6.201 6.504 6.892 7.276 7.674 8.151 8.586 9.018 9.525 10.103 10.666 11.305 11.994 12.739 13.563 14.472 15.515 16.587 17.934 19.513 21.356 23.47 25.987 29.03 32.915 36.258 38.235 39.535 40.423 41.013 41.338 41.517 41.656 41.774 41.817 41.784 41.733 41.664 41.563 41.447 41.295 41.14 40.999 40.854 40.69 40.56 40.431 40.284 40.165 40.011 39.832 39.66 39.49 39.367 39.233 39.025 38.883 38.72 38.633 38.459 38.267 38.047 37.936 37.636 37.543 37.397 37.227 36.831 36.592 36.329 36.047 35.734 35.363 34.874 33.596 -10 ,8064 ,KEBNE ,16723866,Sun Nov 28 03:59:48 CET,Sun Nov 28 05:52:15 CET,0.0 0.842 1.263 1.59 1.854 2.071 2.287 2.506 2.883 3.048 3.205 3.276 3.644 3.791 4.065 4.338 4.598 4.715 4.946 5.175 5.531 5.769 5.991 6.302 6.61 6.919 7.22 7.504 7.865 8.222 8.569 8.998 9.421 9.825 10.306 10.871 11.415 12.017 12.694 13.404 14.147 15.038 16.102 17.177 18.455 19.907 21.618 23.585 25.946 28.9 32.766 36.04 37.979 39.243 40.017 40.538 40.888 41.077 41.2 41.287 41.321 41.311 41.269 41.22 41.15 41.064 40.948 40.823 40.716 40.593 40.414 40.263 40.119 39.946 39.804 39.657 39.497 39.311 39.103 38.95 38.793 38.565 38.412 38.255 38.167 37.969 37.774 37.574 37.471 37.18 37.111 36.977 36.848 36.57 36.397 36.202 35.98 35.715 35.38 34.91 33.458 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 2c7de2dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2080 ,KEBNE ,16723867,Sun Nov 28 03:59:48 CET,Sun Nov 28 05:53:04 CET,0.0 0.667 0.986 1.283 1.55 1.79 2.019 2.23 2.616 2.807 2.995 3.13 3.538 3.717 4.059 4.39 4.701 4.857 5.162 5.449 5.864 6.134 6.408 6.824 7.232 7.63 8.009 8.366 8.841 9.32 9.787 10.341 10.879 11.41 12.047 12.786 13.503 14.306 15.2 16.17 17.215 18.407 19.813 21.281 23.056 25.084 27.449 30.238 33.72 38.006 43.725 49.08 52.492 54.838 56.488 57.686 58.589 59.281 59.767 60.164 60.432 60.631 60.813 60.946 61.028 61.082 61.113 61.117 61.111 61.094 61.053 61.005 60.946 60.884 60.836 60.769 60.687 60.589 60.459 60.364 60.267 60.112 60.002 59.882 59.817 59.666 59.506 59.326 59.232 58.967 58.873 58.743 58.617 58.317 58.131 57.933 57.707 57.432 57.101 56.646 55.569 -2 ,14998 ,KEBNE ,16723868,Sun Nov 28 03:59:48 CET,Sun Nov 28 05:52:54 CET,0.0 0.614 0.969 1.248 1.501 1.732 1.94 2.15 2.544 2.731 2.921 3.057 3.455 3.631 3.971 4.288 4.583 4.73 5.027 5.326 5.771 6.056 6.339 6.752 7.151 7.554 7.938 8.308 8.808 9.3 9.78 10.374 10.967 11.535 12.189 12.937 13.659 14.471 15.372 16.361 17.441 18.674 20.119 21.601 23.356 25.375 27.796 30.72 34.372 38.862 44.652 49.885 53.22 55.402 56.891 58.025 58.881 59.565 60.073 60.469 60.741 60.959 61.137 61.271 61.354 61.404 61.435 61.432 61.396 61.35 61.3 61.248 61.184 61.102 61.037 60.952 60.846 60.729 60.605 60.507 60.384 60.18 60.034 59.876 59.79 59.598 59.409 59.197 59.066 58.785 58.714 58.599 58.47 58.142 57.952 57.745 57.538 57.32 57.019 56.564 55.109 -3 ,19115 ,KEBNE ,16723869,Sun Nov 28 03:59:48 CET,Sun Nov 28 05:52:41 CET,0.0 0.37 0.665 0.95 1.23 1.474 1.703 1.93 2.353 2.544 2.731 2.873 3.27 3.449 3.776 4.103 4.415 4.566 4.871 5.18 5.628 5.907 6.179 6.592 7.002 7.391 7.77 8.133 8.593 9.061 9.533 10.098 10.642 11.189 11.824 12.546 13.265 14.075 14.978 15.96 17.021 18.242 19.671 21.146 22.958 25.034 27.449 30.265 33.704 37.901 43.449 48.6 51.8 53.947 55.477 56.602 57.425 58.05 58.48 58.831 59.12 59.345 59.499 59.614 59.678 59.714 59.718 59.698 59.693 59.677 59.626 59.583 59.53 59.433 59.348 59.253 59.154 59.044 58.915 58.815 58.696 58.507 58.374 58.228 58.144 57.978 57.793 57.574 57.469 57.202 57.123 56.993 56.845 56.522 56.337 56.128 55.873 55.556 55.195 54.739 53.302 -4 ,14279 ,KEBNE ,16723870,Sun Nov 28 03:59:48 CET,Sun Nov 28 05:52:49 CET,0.0 0.569 0.901 1.194 1.469 1.708 1.93 2.134 2.508 2.697 2.881 3.007 3.401 3.577 3.912 4.236 4.542 4.694 4.996 5.286 5.71 5.989 6.263 6.663 7.051 7.424 7.794 8.176 8.686 9.161 9.614 10.171 10.734 11.287 11.925 12.677 13.431 14.273 15.185 16.167 17.218 18.419 19.858 21.327 23.089 25.141 27.595 30.482 33.979 38.241 43.763 48.77 52.071 54.333 55.901 57.104 58.015 58.691 59.186 59.599 59.894 60.114 60.267 60.389 60.481 60.526 60.546 60.558 60.567 60.561 60.534 60.508 60.456 60.38 60.331 60.265 60.176 60.089 59.993 59.906 59.799 59.604 59.478 59.357 59.286 59.138 58.959 58.77 58.679 58.404 58.277 58.129 57.989 57.668 57.474 57.262 57.009 56.74 56.459 55.991 54.37 -5 ,10965 ,KEBNE ,16723871,Sun Nov 28 03:59:48 CET,Sun Nov 28 05:53:13 CET,0.0 0.49 0.867 1.162 1.429 1.675 1.887 2.087 2.482 2.676 2.873 3.04 3.434 3.605 3.936 4.263 4.588 4.744 5.05 5.36 5.807 6.087 6.356 6.766 7.176 7.579 7.979 8.363 8.857 9.343 9.823 10.414 10.995 11.559 12.213 12.961 13.685 14.483 15.365 16.325 17.377 18.625 20.122 21.638 23.419 25.459 27.925 30.851 34.475 38.996 44.755 49.869 53.118 55.371 56.922 58.091 59.0 59.684 60.179 60.593 60.869 61.08 61.247 61.348 61.404 61.458 61.487 61.471 61.457 61.463 61.446 61.419 61.375 61.291 61.229 61.164 61.062 60.949 60.84 60.758 60.656 60.477 60.341 60.199 60.132 59.982 59.818 59.627 59.519 59.251 59.157 59.009 58.852 58.485 58.259 58.018 57.788 57.535 57.188 56.754 55.464 -6 ,19704 ,KEBNE ,16723872,Sun Nov 28 03:59:48 CET,Sun Nov 28 05:52:15 CET,0.0 0.409 0.696 0.945 1.174 1.391 1.594 1.795 2.2 2.394 2.572 2.702 3.094 3.277 3.647 3.995 4.334 4.495 4.779 5.061 5.5 5.772 6.039 6.445 6.842 7.234 7.624 8.006 8.49 8.966 9.441 10.027 10.587 11.124 11.756 12.474 13.171 13.949 14.819 15.769 16.791 17.981 19.409 20.884 22.679 24.726 27.16 30.07 33.584 37.859 43.426 48.531 51.817 54.054 55.64 56.878 57.775 58.44 58.948 59.377 59.671 59.893 60.069 60.178 60.247 60.306 60.34 60.332 60.306 60.256 60.187 60.128 60.055 59.983 59.924 59.844 59.757 59.672 59.559 59.476 59.393 59.247 59.133 59.008 58.941 58.781 58.607 58.422 58.314 58.047 57.962 57.831 57.688 57.347 57.149 56.927 56.686 56.399 56.054 55.592 53.784 -7 ,14587 ,KEBNE ,16723873,Sun Nov 28 04:00:49 CET,Sun Nov 28 05:54:10 CET,0.0 0.656 1.011 1.338 1.601 1.83 2.048 2.269 2.705 2.914 3.116 3.283 3.686 3.861 4.215 4.546 4.853 5.005 5.311 5.607 6.022 6.294 6.567 6.978 7.379 7.764 8.142 8.513 8.992 9.467 9.942 10.512 11.06 11.601 12.231 12.938 13.634 14.432 15.319 16.278 17.308 18.494 19.908 21.364 23.075 25.032 27.405 30.226 33.721 38.091 43.738 48.786 51.967 54.182 55.802 56.964 57.803 58.439 58.907 59.306 59.534 59.662 59.784 59.889 59.948 59.969 59.953 59.918 59.893 59.851 59.762 59.678 59.581 59.452 59.351 59.246 59.121 58.995 58.853 58.745 58.645 58.49 58.363 58.21 58.135 57.983 57.805 57.6 57.495 57.24 57.159 57.01 56.853 56.484 56.306 56.099 55.841 55.549 55.18 54.742 53.947 -8 ,19902 ,KEBNE ,16723874,Sun Nov 28 04:00:49 CET,Sun Nov 28 05:54:51 CET,0.0 0.498 0.82 1.071 1.305 1.537 1.75 1.956 2.364 2.549 2.72 2.834 3.219 3.382 3.712 4.051 4.38 4.532 4.819 5.11 5.54 5.818 6.089 6.487 6.881 7.258 7.622 7.992 8.484 8.965 9.437 10.028 10.607 11.155 11.812 12.569 13.294 14.113 15.012 15.982 17.03 18.23 19.705 21.237 23.046 25.172 27.678 30.576 34.126 38.531 44.303 49.473 52.718 54.958 56.57 57.794 58.702 59.344 59.75 60.092 60.374 60.567 60.693 60.793 60.867 60.92 60.932 60.923 60.901 60.841 60.77 60.707 60.62 60.51 60.429 60.353 60.246 60.115 59.997 59.909 59.805 59.625 59.49 59.364 59.305 59.168 58.993 58.799 58.701 58.443 58.377 58.242 58.084 57.728 57.526 57.307 57.069 56.808 56.473 56.011 54.974 -9 ,907 ,KEBNE ,16723875,Sun Nov 28 04:00:49 CET,Sun Nov 28 05:54:33 CET,0.0 0.366 0.664 0.923 1.163 1.393 1.626 1.847 2.243 2.431 2.615 2.75 3.149 3.322 3.654 3.975 4.288 4.446 4.754 5.054 5.493 5.777 6.051 6.446 6.837 7.222 7.597 7.953 8.415 8.879 9.333 9.883 10.43 10.972 11.618 12.353 13.081 13.91 14.802 15.769 16.805 17.986 19.415 20.882 22.607 24.653 27.159 30.071 33.704 38.307 44.205 49.566 52.98 55.203 56.765 57.991 58.922 59.634 60.112 60.482 60.732 60.912 61.057 61.154 61.228 61.278 61.32 61.333 61.309 61.265 61.211 61.153 61.081 60.974 60.888 60.82 60.736 60.628 60.495 60.393 60.289 60.12 59.998 59.875 59.808 59.659 59.486 59.304 59.215 58.962 58.887 58.751 58.604 58.271 58.078 57.861 57.62 57.344 57.036 56.609 55.502 -10 ,7229 ,KEBNE ,16723876,Sun Nov 28 04:00:49 CET,Sun Nov 28 05:54:55 CET,0.0 0.493 0.794 1.062 1.299 1.521 1.732 1.923 2.315 2.516 2.717 2.866 3.246 3.415 3.759 4.088 4.393 4.54 4.834 5.129 5.57 5.848 6.115 6.508 6.898 7.282 7.665 8.049 8.549 9.03 9.499 10.06 10.613 11.153 11.766 12.475 13.178 13.981 14.891 15.869 16.92 18.161 19.653 21.179 23.012 25.081 27.51 30.365 33.815 38.131 43.857 49.037 52.305 54.539 56.11 57.263 58.056 58.635 59.05 59.399 59.675 59.894 60.079 60.214 60.286 60.31 60.285 60.256 60.235 60.192 60.131 60.065 59.972 59.85 59.758 59.665 59.547 59.42 59.283 59.18 59.076 58.936 58.829 58.68 58.603 58.448 58.263 58.063 57.966 57.698 57.604 57.464 57.312 56.975 56.801 56.619 56.401 56.107 55.756 55.305 54.088 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt deleted file mode 100644 index f23bd060..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31638 ,KEBNE ,16723877,Sun Nov 28 04:00:49 CET,Sun Nov 28 05:51:22 CET,0.0 1.291 1.587 1.83 2.057 2.294 2.518 2.705 3.031 3.188 3.329 3.4 3.675 3.791 4.005 4.218 4.427 4.52 4.698 4.865 5.096 5.235 5.359 5.535 5.706 5.867 6.014 6.164 6.372 6.567 6.747 6.947 7.111 7.248 7.401 7.557 7.67 7.767 7.881 8.018 8.167 8.332 8.483 8.585 8.669 8.693 8.586 8.318 7.787 6.717 4.744 2.179 -0.018 -1.859 -3.432 -4.761 -5.868 -6.921 -7.873 -8.76 -9.49 -10.142 -10.749 -11.317 -11.835 -12.288 -12.751 -13.156 -13.516 -13.892 -14.275 -14.599 -14.933 -15.279 -15.555 -15.835 -16.114 -16.417 -16.744 -16.958 -17.166 -17.489 -17.716 -17.953 -18.076 -18.333 -18.609 -18.912 -19.064 -19.397 -19.538 -19.704 -19.876 -20.252 -20.461 -20.69 -20.91 -21.145 -21.446 -21.81 -22.335 -2 ,24992 ,KEBNE ,16723878,Sun Nov 28 04:00:49 CET,Sun Nov 28 05:51:01 CET,0.0 0.739 1.03 1.285 1.544 1.749 1.925 2.108 2.431 2.58 2.725 2.825 3.099 3.209 3.404 3.562 3.72 3.802 3.958 4.099 4.302 4.429 4.557 4.739 4.909 5.076 5.232 5.379 5.586 5.789 5.965 6.183 6.403 6.605 6.827 7.073 7.267 7.451 7.643 7.842 8.049 8.223 8.39 8.556 8.709 8.839 8.931 8.925 8.725 8.12 6.641 4.658 2.877 1.2 -0.276 -1.597 -2.704 -3.711 -4.593 -5.452 -6.144 -6.759 -7.359 -7.913 -8.426 -8.918 -9.451 -9.899 -10.274 -10.666 -11.078 -11.422 -11.788 -12.163 -12.443 -12.744 -13.056 -13.36 -13.666 -13.874 -14.087 -14.447 -14.699 -14.949 -15.088 -15.382 -15.671 -15.966 -16.116 -16.45 -16.614 -16.805 -17.011 -17.438 -17.652 -17.901 -18.199 -18.496 -18.847 -19.312 -20.445 -3 ,21193 ,KEBNE ,16723879,Sun Nov 28 04:01:51 CET,Sun Nov 28 05:52:25 CET,0.0 1.163 1.55 1.812 2.044 2.242 2.429 2.607 2.908 3.031 3.146 3.206 3.47 3.577 3.772 3.957 4.155 4.257 4.446 4.623 4.856 4.988 5.102 5.271 5.432 5.589 5.753 5.905 6.089 6.258 6.413 6.591 6.76 6.918 7.102 7.302 7.497 7.676 7.797 7.888 7.979 8.044 8.068 8.083 8.084 8.024 7.822 7.499 6.995 6.009 4.159 1.769 -0.31 -2.057 -3.492 -4.738 -5.809 -6.805 -7.667 -8.49 -9.21 -9.865 -10.472 -11.012 -11.505 -11.956 -12.437 -12.862 -13.23 -13.618 -14.01 -14.323 -14.643 -14.988 -15.253 -15.519 -15.793 -16.067 -16.356 -16.553 -16.749 -17.068 -17.287 -17.51 -17.632 -17.885 -18.142 -18.402 -18.538 -18.87 -19.03 -19.201 -19.375 -19.742 -19.928 -20.133 -20.364 -20.616 -20.902 -21.225 -21.848 -4 ,22710 ,KEBNE ,16723880,Sun Nov 28 04:01:51 CET,Sun Nov 28 05:51:22 CET,0.0 0.921 1.254 1.468 1.665 1.867 2.063 2.238 2.535 2.655 2.771 2.863 3.142 3.257 3.48 3.683 3.851 3.93 4.101 4.274 4.521 4.662 4.797 5.016 5.213 5.392 5.557 5.701 5.869 6.043 6.251 6.492 6.693 6.885 7.115 7.365 7.591 7.82 8.044 8.287 8.529 8.764 8.963 9.106 9.264 9.389 9.445 9.368 9.06 8.431 7.305 5.779 4.327 2.944 1.673 0.525 -0.513 -1.486 -2.335 -3.193 -3.918 -4.562 -5.181 -5.769 -6.323 -6.82 -7.316 -7.742 -8.116 -8.512 -8.928 -9.277 -9.632 -10.008 -10.302 -10.595 -10.893 -11.201 -11.516 -11.732 -11.968 -12.342 -12.593 -12.848 -12.978 -13.257 -13.556 -13.868 -14.024 -14.36 -14.522 -14.697 -14.891 -15.291 -15.487 -15.695 -15.921 -16.185 -16.509 -16.867 -17.501 -5 ,12438 ,KEBNE ,16723881,Sun Nov 28 04:02:52 CET,Sun Nov 28 05:52:51 CET,0.0 0.79 1.115 1.381 1.602 1.789 1.952 2.125 2.459 2.605 2.743 2.819 3.079 3.186 3.417 3.631 3.823 3.915 4.077 4.222 4.425 4.564 4.701 4.882 5.044 5.2 5.359 5.502 5.676 5.851 6.024 6.245 6.441 6.608 6.796 6.994 7.162 7.329 7.498 7.672 7.858 8.037 8.25 8.411 8.474 8.49 8.435 8.308 7.97 7.182 5.59 3.515 1.697 0.107 -1.287 -2.542 -3.585 -4.535 -5.395 -6.265 -6.996 -7.598 -8.151 -8.712 -9.26 -9.751 -10.255 -10.7 -11.075 -11.46 -11.863 -12.207 -12.551 -12.89 -13.149 -13.407 -13.693 -13.996 -14.292 -14.496 -14.712 -15.041 -15.272 -15.516 -15.644 -15.899 -16.164 -16.447 -16.591 -16.925 -17.086 -17.264 -17.448 -17.853 -18.072 -18.295 -18.527 -18.791 -19.124 -19.54 -20.726 -6 ,3865 ,KEBNE ,16723882,Sun Nov 28 04:02:52 CET,Sun Nov 28 05:52:32 CET,0.0 1.207 1.603 1.871 2.08 2.259 2.423 2.577 2.864 2.994 3.111 3.181 3.45 3.549 3.749 3.95 4.132 4.214 4.371 4.528 4.739 4.881 5.034 5.254 5.441 5.601 5.748 5.888 6.06 6.221 6.366 6.527 6.689 6.839 6.996 7.174 7.358 7.542 7.701 7.87 8.047 8.243 8.468 8.631 8.747 8.788 8.744 8.621 8.312 7.708 6.403 4.426 2.594 1.036 -0.278 -1.507 -2.599 -3.578 -4.422 -5.242 -5.98 -6.681 -7.34 -7.948 -8.482 -8.948 -9.448 -9.911 -10.311 -10.71 -11.11 -11.448 -11.814 -12.192 -12.469 -12.76 -13.089 -13.412 -13.723 -13.94 -14.16 -14.513 -14.768 -15.041 -15.187 -15.489 -15.79 -16.098 -16.253 -16.588 -16.748 -16.926 -17.11 -17.535 -17.767 -18.01 -18.285 -18.594 -18.928 -19.295 -20.048 -7 ,14252 ,KEBNE ,16723883,Sun Nov 28 04:03:53 CET,Sun Nov 28 05:53:52 CET,0.0 0.888 1.265 1.52 1.74 1.944 2.121 2.294 2.605 2.739 2.869 2.951 3.233 3.341 3.548 3.758 3.942 4.027 4.189 4.33 4.511 4.625 4.735 4.907 5.071 5.209 5.343 5.486 5.663 5.827 5.98 6.151 6.327 6.483 6.668 6.868 7.038 7.231 7.432 7.638 7.841 8.053 8.253 8.395 8.478 8.501 8.522 8.39 7.948 7.072 5.313 2.995 1.094 -0.504 -1.861 -3.07 -4.114 -5.046 -5.872 -6.701 -7.384 -7.982 -8.566 -9.132 -9.66 -10.138 -10.645 -11.092 -11.489 -11.894 -12.298 -12.619 -12.949 -13.303 -13.577 -13.86 -14.151 -14.461 -14.784 -14.999 -15.22 -15.566 -15.81 -16.059 -16.187 -16.444 -16.708 -16.998 -17.156 -17.492 -17.641 -17.829 -18.017 -18.386 -18.593 -18.836 -19.1 -19.384 -19.694 -20.081 -21.185 -8 ,7805 ,KEBNE ,16723884,Sun Nov 28 04:04:55 CET,Sun Nov 28 05:55:33 CET,0.0 0.788 1.12 1.364 1.563 1.732 1.875 2.008 2.263 2.378 2.484 2.522 2.769 2.856 3.049 3.244 3.418 3.496 3.641 3.787 4.004 4.137 4.272 4.466 4.635 4.793 4.943 5.094 5.279 5.453 5.629 5.838 6.024 6.186 6.361 6.558 6.743 6.922 7.101 7.309 7.5 7.66 7.831 7.97 8.085 8.13 8.131 8.064 7.798 7.143 5.557 3.416 1.586 -0.063 -1.506 -2.747 -3.834 -4.854 -5.729 -6.575 -7.318 -7.987 -8.604 -9.212 -9.803 -10.322 -10.83 -11.267 -11.634 -12.007 -12.396 -12.722 -13.071 -13.433 -13.716 -14.012 -14.329 -14.684 -15.03 -15.253 -15.485 -15.848 -16.105 -16.364 -16.497 -16.786 -17.074 -17.377 -17.54 -17.879 -18.051 -18.232 -18.416 -18.83 -19.053 -19.273 -19.532 -19.845 -20.192 -20.571 -21.795 -9 ,5060 ,KEBNE ,16723885,Sun Nov 28 04:04:55 CET,Sun Nov 28 05:55:42 CET,0.0 0.7 1.009 1.241 1.482 1.694 1.871 2.039 2.344 2.467 2.597 2.692 2.962 3.079 3.302 3.497 3.665 3.738 3.87 3.996 4.17 4.277 4.385 4.531 4.671 4.81 4.946 5.074 5.217 5.338 5.462 5.634 5.806 5.953 6.093 6.245 6.415 6.591 6.771 6.947 7.105 7.273 7.449 7.59 7.726 7.846 7.911 7.842 7.582 6.985 5.518 3.395 1.62 0.092 -1.309 -2.609 -3.768 -4.813 -5.691 -6.557 -7.288 -7.913 -8.475 -9.016 -9.538 -10.014 -10.511 -10.96 -11.335 -11.714 -12.117 -12.459 -12.818 -13.174 -13.435 -13.711 -14.001 -14.291 -14.599 -14.807 -15.018 -15.366 -15.601 -15.836 -15.956 -16.2 -16.456 -16.73 -16.87 -17.197 -17.327 -17.486 -17.655 -18.042 -18.242 -18.462 -18.697 -18.957 -19.286 -19.696 -20.307 -10 ,25709 ,KEBNE ,16723886,Sun Nov 28 04:04:55 CET,Sun Nov 28 05:55:50 CET,0.0 0.85 1.162 1.421 1.631 1.802 1.943 2.071 2.369 2.509 2.625 2.694 2.952 3.05 3.229 3.389 3.566 3.658 3.82 3.966 4.178 4.313 4.446 4.64 4.815 4.966 5.118 5.266 5.451 5.643 5.821 6.022 6.232 6.438 6.659 6.901 7.117 7.332 7.559 7.787 8.012 8.235 8.459 8.641 8.79 8.896 8.925 8.851 8.563 7.914 6.458 4.358 2.509 0.933 -0.481 -1.799 -2.924 -3.946 -4.799 -5.654 -6.359 -6.96 -7.561 -8.125 -8.655 -9.146 -9.647 -10.085 -10.478 -10.891 -11.318 -11.664 -12.017 -12.393 -12.679 -12.969 -13.275 -13.593 -13.926 -14.16 -14.401 -14.756 -14.996 -15.252 -15.38 -15.644 -15.929 -16.231 -16.393 -16.733 -16.909 -17.109 -17.313 -17.731 -17.969 -18.21 -18.455 -18.745 -19.077 -19.494 -20.457 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt deleted file mode 100644 index 90dcceb1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,8093 ,KEBNE ,16723888,Sun Nov 28 04:06:58 CET,Sun Nov 28 05:57:55 CET,0.0 0.551 0.792 0.976 1.155 1.348 1.513 1.651 1.911 2.018 2.115 2.15 2.384 2.457 2.608 2.772 2.927 3.0 3.142 3.272 3.449 3.557 3.664 3.811 3.952 4.089 4.21 4.327 4.482 4.634 4.774 4.929 5.08 5.23 5.397 5.566 5.722 5.884 6.026 6.165 6.3 6.405 6.498 6.608 6.696 6.685 6.616 6.419 5.984 5.164 3.593 1.615 -0.073 -1.536 -2.813 -3.957 -4.941 -5.828 -6.587 -7.34 -7.987 -8.553 -9.096 -9.608 -10.073 -10.493 -10.928 -11.304 -11.628 -11.97 -12.315 -12.6 -12.9 -13.202 -13.44 -13.693 -13.948 -14.208 -14.484 -14.668 -14.855 -15.148 -15.361 -15.586 -15.695 -15.921 -16.168 -16.424 -16.554 -16.864 -16.995 -17.154 -17.322 -17.661 -17.832 -18.026 -18.243 -18.461 -18.697 -18.977 -19.524 -7 ,6472 ,KEBNE ,16723893,Sun Nov 28 04:08:59 CET,Sun Nov 28 05:59:45 CET,0.0 0.764 1.138 1.392 1.605 1.781 1.925 2.051 2.295 2.402 2.494 2.542 2.794 2.887 3.074 3.258 3.429 3.506 3.657 3.795 3.983 4.098 4.2 4.347 4.492 4.618 4.736 4.855 5.013 5.17 5.318 5.487 5.64 5.792 5.939 6.06 6.177 6.307 6.455 6.61 6.742 6.859 6.956 7.022 7.101 7.103 6.97 6.752 6.344 5.567 4.075 1.979 0.107 -1.432 -2.797 -4.009 -4.994 -5.866 -6.599 -7.358 -8.025 -8.606 -9.158 -9.67 -10.161 -10.608 -11.066 -11.474 -11.814 -12.157 -12.526 -12.839 -13.157 -13.475 -13.727 -13.999 -14.283 -14.571 -14.875 -15.08 -15.282 -15.588 -15.799 -16.024 -16.144 -16.392 -16.641 -16.891 -17.024 -17.344 -17.492 -17.668 -17.848 -18.201 -18.391 -18.599 -18.827 -19.062 -19.307 -19.59 -20.25 -9 ,6698 ,KEBNE ,16723895,Sun Nov 28 04:09:00 CET,Sun Nov 28 05:59:30 CET,0.0 0.372 0.592 0.82 1.035 1.2 1.321 1.441 1.69 1.801 1.909 1.954 2.199 2.301 2.488 2.651 2.808 2.881 3.016 3.133 3.317 3.44 3.558 3.717 3.855 3.992 4.123 4.247 4.394 4.537 4.685 4.875 5.053 5.199 5.347 5.489 5.64 5.801 5.957 6.11 6.239 6.367 6.474 6.564 6.613 6.649 6.605 6.321 5.805 4.982 3.441 1.393 -0.426 -2.056 -3.444 -4.67 -5.737 -6.708 -7.558 -8.417 -9.156 -9.795 -10.393 -10.949 -11.466 -11.942 -12.425 -12.859 -13.243 -13.63 -14.02 -14.336 -14.654 -14.981 -15.232 -15.504 -15.783 -16.058 -16.349 -16.556 -16.773 -17.114 -17.343 -17.584 -17.717 -17.982 -18.251 -18.549 -18.703 -19.023 -19.157 -19.33 -19.517 -19.907 -20.103 -20.314 -20.566 -20.834 -21.132 -21.462 -22.077 -10 ,17245 ,KEBNE ,16723896,Sun Nov 28 04:09:08 CET,Sun Nov 28 05:58:45 CET,0.0 0.478 0.71 0.921 1.123 1.327 1.516 1.677 1.994 2.145 2.269 2.341 2.607 2.699 2.879 3.038 3.186 3.262 3.409 3.549 3.743 3.866 3.98 4.143 4.298 4.434 4.572 4.722 4.921 5.099 5.262 5.442 5.599 5.749 5.92 6.099 6.281 6.484 6.658 6.828 6.994 7.166 7.331 7.404 7.462 7.464 7.342 7.146 6.768 6.072 4.627 2.649 0.984 -0.462 -1.717 -2.859 -3.884 -4.791 -5.572 -6.342 -6.981 -7.578 -8.149 -8.662 -9.128 -9.556 -10.018 -10.436 -10.804 -11.169 -11.523 -11.813 -12.125 -12.464 -12.713 -12.956 -13.206 -13.462 -13.738 -13.932 -14.123 -14.416 -14.634 -14.862 -14.979 -15.229 -15.501 -15.786 -15.924 -16.241 -16.368 -16.52 -16.671 -16.997 -17.183 -17.379 -17.58 -17.819 -18.085 -18.386 -18.905 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt deleted file mode 100644 index 2e666ee0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21979 ,KEBNE ,16723897,Sun Nov 28 04:09:08 CET,Sun Nov 28 05:59:56 CET,0.0 0.61 1.08 1.511 1.888 2.232 2.569 2.88 3.461 3.754 4.042 4.222 4.826 5.091 5.623 6.14 6.633 6.873 7.335 7.78 8.437 8.865 9.288 9.917 10.536 11.153 11.765 12.368 13.155 13.926 14.698 15.651 16.57 17.473 18.544 19.769 20.99 22.373 23.879 25.54 27.352 29.449 31.951 34.555 37.726 41.423 45.966 51.381 58.057 66.669 78.25 88.997 96.315 101.635 105.529 108.523 110.892 112.848 114.365 115.754 116.881 117.773 118.522 119.198 119.806 120.335 120.83 121.225 121.534 121.84 122.141 122.366 122.574 122.772 122.909 123.034 123.14 123.232 123.33 123.399 123.455 123.524 123.561 123.574 123.576 123.586 123.587 123.565 123.553 123.321 123.504 123.477 123.45 123.371 123.294 123.21 123.109 122.987 122.856 122.677 122.382 -2 ,25685 ,KEBNE ,16723898,Sun Nov 28 04:10:02 CET,Sun Nov 28 06:03:43 CET,0.0 0.661 1.117 1.489 1.844 2.182 2.503 2.82 3.422 3.707 3.987 4.186 4.79 5.044 5.545 6.045 6.534 6.769 7.229 7.685 8.357 8.802 9.236 9.878 10.516 11.14 11.758 12.385 13.219 14.037 14.825 15.766 16.707 17.632 18.714 19.97 21.209 22.603 24.161 25.878 27.751 29.917 32.467 35.074 38.232 41.983 46.55 51.986 58.831 67.547 79.09 89.877 97.095 102.297 106.199 109.264 111.603 113.498 114.988 116.326 117.372 118.219 118.964 119.625 120.177 120.632 121.077 121.455 121.758 122.044 122.305 122.505 122.7 122.868 122.987 123.099 123.196 123.272 123.339 123.385 123.429 123.483 123.505 123.523 123.526 123.512 123.502 123.475 123.449 123.196 123.341 123.294 123.242 123.113 123.021 122.92 122.803 122.655 122.496 122.323 121.867 -4 ,1219 ,KEBNE ,16723900,Sun Nov 28 04:10:05 CET,Sun Nov 28 06:01:42 CET,0.0 0.664 1.072 1.453 1.817 2.161 2.492 2.804 3.404 3.691 3.967 4.166 4.771 5.022 5.52 6.02 6.516 6.754 7.214 7.673 8.365 8.813 9.258 9.925 10.568 11.208 11.837 12.435 13.213 13.982 14.737 15.674 16.59 17.485 18.561 19.814 21.052 22.418 23.934 25.604 27.388 29.456 31.985 34.646 37.842 41.567 46.089 51.474 58.208 66.775 78.242 89.156 96.476 101.703 105.685 108.826 111.293 113.325 114.898 116.304 117.377 118.253 119.007 119.681 120.284 120.776 121.269 121.678 121.981 122.284 122.581 122.79 122.968 123.131 123.248 123.364 123.488 123.611 123.729 123.799 123.855 123.928 123.967 123.982 123.988 124.013 124.027 124.031 124.031 123.807 124.01 123.985 123.951 123.866 123.814 123.738 123.658 123.573 123.453 123.257 122.897 -5 ,20228 ,KEBNE ,16723901,Sun Nov 28 04:10:01 CET,Sun Nov 28 06:02:21 CET,0.0 0.706 1.138 1.509 1.881 2.232 2.556 2.864 3.453 3.739 4.017 4.211 4.824 5.101 5.637 6.147 6.631 6.868 7.348 7.828 8.538 9.005 9.474 10.156 10.819 11.484 12.128 12.753 13.571 14.369 15.149 16.111 17.062 17.996 19.078 20.295 21.506 22.873 24.395 26.067 27.863 29.952 32.478 35.116 38.288 41.973 46.497 51.925 58.65 67.219 78.877 89.931 97.262 102.561 106.547 109.703 112.116 114.07 115.616 117.024 118.166 119.087 119.884 120.585 121.197 121.729 122.224 122.623 122.948 123.266 123.555 123.774 123.99 124.199 124.357 124.494 124.612 124.703 124.788 124.851 124.901 124.975 125.024 125.063 125.077 125.086 125.081 125.074 125.07 124.842 125.029 125.007 124.987 124.935 124.89 124.831 124.763 124.678 124.571 124.437 124.16 -6 ,4946 ,KEBNE ,16723902,Sun Nov 28 04:10:01 CET,Sun Nov 28 06:02:00 CET,0.0 0.787 1.311 1.703 2.063 2.39 2.701 3.003 3.593 3.882 4.164 4.353 4.956 5.218 5.723 6.198 6.661 6.893 7.349 7.794 8.447 8.878 9.313 9.951 10.564 11.164 11.77 12.379 13.19 13.997 14.776 15.719 16.631 17.532 18.61 19.874 21.138 22.537 24.101 25.837 27.681 29.785 32.338 34.997 38.19 41.916 46.464 51.898 58.624 67.151 78.661 89.647 97.044 102.41 106.419 109.505 111.916 113.959 115.579 117.012 118.104 118.974 119.746 120.427 121.044 121.594 122.126 122.551 122.886 123.193 123.471 123.7 123.905 124.068 124.169 124.284 124.408 124.527 124.639 124.693 124.746 124.832 124.883 124.921 124.934 124.953 124.945 124.922 124.91 124.667 124.821 124.792 124.754 124.665 124.609 124.545 124.475 124.393 124.283 124.081 123.727 -8 ,15793 ,KEBNE ,16723904,Sun Nov 28 04:11:03 CET,Sun Nov 28 06:03:07 CET,0.0 0.595 1.034 1.414 1.762 2.105 2.441 2.768 3.4 3.686 3.961 4.174 4.789 5.054 5.591 6.111 6.615 6.865 7.352 7.822 8.515 8.971 9.407 10.033 10.662 11.279 11.878 12.488 13.278 14.041 14.813 15.779 16.729 17.654 18.744 20.01 21.247 22.615 24.148 25.844 27.674 29.786 32.314 34.935 38.12 41.869 46.402 51.771 58.454 66.963 78.537 89.451 96.75 102.067 106.047 109.144 111.562 113.567 115.13 116.523 117.591 118.486 119.282 119.965 120.565 121.084 121.577 121.968 122.303 122.618 122.907 123.123 123.324 123.53 123.677 123.81 123.932 124.05 124.172 124.253 124.32 124.403 124.444 124.474 124.489 124.522 124.556 124.56 124.553 124.319 124.486 124.458 124.429 124.341 124.278 124.216 124.137 124.038 123.886 123.691 123.292 -9 ,10247 ,KEBNE ,16723905,Sun Nov 28 04:11:03 CET,Sun Nov 28 06:03:08 CET,0.0 0.516 0.961 1.357 1.702 2.034 2.356 2.671 3.268 3.547 3.821 4.01 4.62 4.871 5.381 5.892 6.378 6.614 7.074 7.533 8.196 8.621 9.044 9.681 10.321 10.958 11.588 12.19 12.969 13.752 14.519 15.461 16.382 17.291 18.374 19.616 20.85 22.247 23.79 25.467 27.277 29.359 31.862 34.491 37.688 41.431 45.992 51.388 58.148 66.837 78.495 89.542 96.841 102.026 105.855 108.899 111.332 113.326 114.901 116.306 117.394 118.306 119.104 119.784 120.353 120.829 121.303 121.707 122.018 122.299 122.578 122.805 123.024 123.224 123.361 123.499 123.616 123.711 123.813 123.871 123.92 123.989 124.03 124.049 124.051 124.054 124.05 124.043 124.03 123.791 123.927 123.871 123.816 123.704 123.629 123.531 123.415 123.293 123.125 122.884 122.57 -10 ,20716 ,KEBNE ,16723906,Sun Nov 28 04:11:07 CET,Sun Nov 28 06:01:17 CET,0.0 0.582 0.984 1.36 1.737 2.116 2.462 2.786 3.399 3.695 3.979 4.18 4.799 5.074 5.628 6.144 6.616 6.846 7.307 7.778 8.459 8.9 9.348 10.007 10.641 11.251 11.855 12.463 13.265 14.046 14.802 15.732 16.658 17.555 18.6 19.819 21.03 22.408 23.947 25.634 27.442 29.546 32.112 34.774 37.995 41.727 46.264 51.666 58.275 66.848 78.544 89.465 96.834 102.074 105.908 108.971 111.357 113.29 114.771 116.084 117.169 118.053 118.802 119.484 120.063 120.53 120.99 121.369 121.666 121.937 122.192 122.392 122.573 122.743 122.873 123.007 123.129 123.218 123.283 123.31 123.328 123.356 123.367 123.364 123.36 123.359 123.362 123.352 123.344 123.112 123.279 123.229 123.178 123.086 123.024 122.934 122.823 122.707 122.553 122.354 122.034 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index b84ba5fd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7070 ,KEBNE ,16723907,Sun Nov 28 04:12:04 CET,Sun Nov 28 06:01:37 CET,0.0 0.535 0.949 1.355 1.743 2.108 2.463 2.804 3.464 3.788 4.109 4.367 4.999 5.288 5.887 6.476 7.045 7.319 7.856 8.396 9.199 9.725 10.246 11.023 11.794 12.561 13.324 14.078 15.078 16.075 17.057 18.276 19.484 20.671 22.067 23.683 25.278 27.07 29.079 31.322 33.77 36.61 40.053 43.697 48.157 53.349 59.665 67.253 76.813 89.24 106.343 122.75 133.884 142.087 148.286 153.184 157.078 160.289 162.842 165.194 167.025 168.527 169.884 171.093 172.144 173.033 173.872 174.57 175.178 175.776 176.339 176.765 177.178 177.593 177.894 178.192 178.47 178.712 178.945 179.113 179.273 179.478 179.599 179.701 179.749 179.835 179.923 179.995 180.012 179.865 180.01 179.988 179.97 179.906 179.869 179.822 179.738 179.635 179.481 179.226 178.587 -2 ,5567 ,KEBNE ,16723908,Sun Nov 28 04:12:04 CET,Sun Nov 28 06:02:19 CET,0.0 0.514 0.934 1.332 1.718 2.081 2.438 2.782 3.418 3.735 4.051 4.304 4.94 5.234 5.83 6.411 6.973 7.252 7.806 8.355 9.177 9.721 10.257 11.035 11.801 12.571 13.34 14.092 15.084 16.064 17.031 18.245 19.445 20.616 22.001 23.595 25.173 26.967 28.974 31.199 33.621 36.42 39.806 43.368 47.725 52.835 59.129 66.779 76.397 88.829 105.888 122.39 133.717 141.988 148.184 153.114 157.018 160.208 162.732 165.059 166.904 168.452 169.842 171.062 172.131 173.041 173.904 174.612 175.204 175.78 176.343 176.796 177.227 177.631 177.916 178.198 178.473 178.722 178.961 179.113 179.23 179.393 179.512 179.604 179.646 179.735 179.81 179.858 179.874 179.73 179.861 179.834 179.819 179.741 179.65 179.547 179.439 179.298 179.135 178.889 178.039 -3 ,2886 ,KEBNE ,16723909,Sun Nov 28 04:13:05 CET,Sun Nov 28 06:02:23 CET,0.0 0.613 1.039 1.416 1.761 2.102 2.435 2.765 3.419 3.739 4.052 4.32 4.963 5.256 5.834 6.404 6.966 7.246 7.809 8.365 9.179 9.715 10.244 11.024 11.798 12.568 13.328 14.081 15.079 16.066 17.036 18.239 19.427 20.603 22.001 23.603 25.201 27.022 29.037 31.231 33.616 36.421 39.837 43.406 47.754 52.878 59.137 66.662 76.248 88.68 105.611 121.93 133.101 141.302 147.476 152.378 156.267 159.445 161.951 164.301 166.181 167.735 169.101 170.293 171.321 172.189 173.042 173.772 174.374 174.954 175.51 175.935 176.352 176.753 177.046 177.333 177.606 177.851 178.064 178.21 178.352 178.556 178.689 178.786 178.827 178.909 178.982 179.048 179.076 178.938 179.109 179.111 179.091 178.989 178.922 178.851 178.752 178.622 178.434 178.11 177.253 -4 ,6704 ,KEBNE ,16723910,Sun Nov 28 04:13:06 CET,Sun Nov 28 06:04:09 CET,0.0 0.565 1.021 1.419 1.793 2.157 2.51 2.842 3.486 3.795 4.113 4.419 5.082 5.394 6.02 6.62 7.197 7.478 8.018 8.551 9.354 9.877 10.393 11.175 11.959 12.732 13.493 14.25 15.263 16.256 17.229 18.437 19.628 20.809 22.219 23.847 25.456 27.273 29.301 31.52 33.916 36.72 40.132 43.72 48.084 53.199 59.438 66.939 76.377 88.581 105.415 121.718 132.813 140.94 147.162 152.134 156.054 159.289 161.859 164.207 166.049 167.553 168.892 170.068 171.08 171.952 172.808 173.52 174.096 174.672 175.233 175.652 176.068 176.489 176.778 177.053 177.327 177.587 177.849 178.014 178.157 178.35 178.461 178.54 178.577 178.657 178.699 178.719 178.736 178.588 178.737 178.71 178.672 178.568 178.516 178.444 178.307 178.113 177.875 177.587 176.7 -7 ,15973 ,KEBNE ,16723913,Sun Nov 28 04:13:05 CET,Sun Nov 28 06:03:24 CET,0.0 0.541 0.972 1.352 1.701 2.048 2.392 2.722 3.374 3.694 4.003 4.272 4.912 5.202 5.775 6.337 6.899 7.175 7.714 8.259 9.06 9.572 10.082 10.852 11.618 12.385 13.153 13.919 14.924 15.911 16.886 18.081 19.269 20.444 21.83 23.427 25.001 26.779 28.768 30.96 33.348 36.132 39.527 43.12 47.462 52.517 58.737 66.226 75.692 88.018 104.994 121.33 132.488 140.701 146.923 151.869 155.761 158.98 161.519 163.876 165.778 167.33 168.7 169.925 170.991 171.892 172.77 173.503 174.095 174.668 175.231 175.667 176.077 176.477 176.775 177.062 177.338 177.616 177.889 178.06 178.221 178.448 178.587 178.709 178.769 178.875 178.945 179.009 179.034 178.897 179.076 179.088 179.089 179.049 179.0 178.922 178.844 178.723 178.522 178.215 177.373 -8 ,30317 ,KEBNE ,16723914,Sun Nov 28 04:13:05 CET,Sun Nov 28 06:03:16 CET,0.0 0.575 1.018 1.428 1.811 2.165 2.512 2.852 3.509 3.831 4.151 4.423 5.07 5.366 5.945 6.521 7.079 7.356 7.909 8.451 9.256 9.792 10.323 11.121 11.915 12.691 13.444 14.187 15.174 16.151 17.119 18.325 19.53 20.714 22.111 23.715 25.299 27.102 29.1 31.277 33.667 36.485 39.897 43.446 47.778 52.904 59.151 66.653 76.179 88.544 105.422 121.672 132.76 140.883 147.023 151.928 155.804 158.963 161.466 163.767 165.613 167.157 168.527 169.743 170.805 171.734 172.64 173.381 173.992 174.589 175.159 175.599 176.041 176.467 176.777 177.083 177.387 177.686 177.953 178.117 178.269 178.466 178.588 178.713 178.77 178.85 178.898 178.92 178.936 178.796 178.986 178.981 178.949 178.858 178.786 178.734 178.661 178.497 178.28 178.031 177.285 -9 ,20953 ,KEBNE ,16723915,Sun Nov 28 04:13:05 CET,Sun Nov 28 06:02:07 CET,0.0 0.653 1.152 1.586 1.986 2.34 2.678 3.019 3.667 3.979 4.289 4.55 5.193 5.486 6.055 6.616 7.184 7.463 8.01 8.553 9.351 9.883 10.408 11.178 11.944 12.696 13.448 14.199 15.182 16.148 17.101 18.287 19.466 20.645 22.058 23.676 25.269 27.084 29.099 31.297 33.695 36.51 39.965 43.642 48.128 53.291 59.524 67.032 76.49 88.842 105.898 122.226 133.304 141.377 147.451 152.33 156.209 159.372 161.837 164.101 165.93 167.445 168.788 169.972 171.004 171.895 172.763 173.5 174.109 174.702 175.271 175.705 176.128 176.536 176.81 177.069 177.33 177.587 177.849 178.007 178.157 178.371 178.487 178.591 178.643 178.735 178.8 178.84 178.86 178.719 178.859 178.839 178.838 178.818 178.771 178.688 178.583 178.388 178.108 177.766 176.623 -10 ,18361 ,KEBNE ,16723916,Sun Nov 28 04:13:05 CET,Sun Nov 28 06:03:00 CET,0.0 0.508 0.932 1.333 1.709 2.079 2.423 2.749 3.392 3.709 4.017 4.278 4.926 5.231 5.838 6.41 6.97 7.25 7.801 8.344 9.159 9.688 10.211 10.993 11.759 12.518 13.272 14.017 14.999 15.965 16.924 18.124 19.309 20.486 21.895 23.505 25.103 26.909 28.927 31.148 33.537 36.319 39.706 43.252 47.599 52.696 58.881 66.37 75.853 88.162 105.124 121.446 132.542 140.672 146.833 151.731 155.6 158.799 161.339 163.67 165.539 167.111 168.509 169.725 170.764 171.662 172.537 173.277 173.891 174.483 175.056 175.499 175.929 176.354 176.663 176.96 177.251 177.524 177.787 177.956 178.11 178.321 178.461 178.59 178.645 178.741 178.835 178.919 178.948 178.809 178.99 178.999 179.0 178.97 178.9 178.807 178.698 178.532 178.287 177.952 176.843 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt deleted file mode 100644 index 42b5cd4c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14751 ,KEBNE ,16723917,Sun Nov 28 04:13:05 CET,Sun Nov 28 06:03:46 CET,0.0 0.815 1.289 1.738 2.156 2.556 2.94 3.305 4.024 4.374 4.707 4.998 5.662 5.97 6.573 7.151 7.714 8.0 8.575 9.133 9.951 10.473 10.979 11.754 12.523 13.265 14.0 14.745 15.734 16.718 17.675 18.843 20.024 21.18 22.539 24.114 25.646 27.357 29.268 31.377 33.669 36.329 39.549 42.916 46.961 51.699 57.477 64.426 73.21 84.503 99.682 114.122 124.07 131.376 136.86 141.195 144.622 147.427 149.595 151.579 153.18 154.511 155.699 156.731 157.623 158.402 159.154 159.758 160.237 160.709 161.157 161.513 161.88 162.227 162.48 162.723 162.952 163.167 163.353 163.475 163.599 163.772 163.876 163.973 164.016 164.087 164.149 164.213 164.227 164.045 164.233 164.228 164.213 164.156 164.114 164.05 163.976 163.874 163.724 163.498 162.433 -3 ,5755 ,KEBNE ,16723919,Sun Nov 28 04:14:06 CET,Sun Nov 28 06:05:58 CET,0.0 1.125 1.722 2.214 2.681 3.116 3.538 3.944 4.697 5.07 5.439 5.79 6.471 6.799 7.434 8.051 8.661 8.95 9.497 10.028 10.804 11.31 11.805 12.542 13.273 13.999 14.722 15.43 16.364 17.296 18.221 19.357 20.483 21.597 22.903 24.401 25.875 27.549 29.418 31.453 33.662 36.288 39.462 42.751 46.733 51.339 56.978 63.775 72.347 83.494 98.711 113.24 123.115 130.354 135.844 140.187 143.604 146.382 148.566 150.611 152.255 153.608 154.791 155.839 156.763 157.557 158.34 158.978 159.476 159.967 160.448 160.802 161.148 161.481 161.708 161.927 162.124 162.297 162.46 162.56 162.656 162.801 162.868 162.91 162.93 162.94 162.942 162.949 162.939 162.746 162.906 162.886 162.857 162.763 162.704 162.634 162.538 162.443 162.293 162.049 161.249 -4 ,32003 ,KEBNE ,16723920,Sun Nov 28 04:14:07 CET,Sun Nov 28 06:05:43 CET,0.0 0.857 1.378 1.83 2.257 2.676 3.066 3.429 4.182 4.535 4.869 5.174 5.834 6.155 6.791 7.407 8.012 8.306 8.876 9.429 10.224 10.728 11.219 11.967 12.715 13.45 14.175 14.879 15.813 16.75 17.661 18.784 19.904 21.009 22.331 23.845 25.321 26.983 28.844 30.914 33.155 35.746 38.925 42.262 46.237 50.861 56.525 63.343 71.993 83.126 98.283 112.845 122.773 130.03 135.455 139.753 143.144 145.923 148.112 150.125 151.733 153.07 154.262 155.329 156.24 156.989 157.717 158.342 158.862 159.362 159.833 160.197 160.56 160.907 161.148 161.376 161.592 161.796 161.994 162.118 162.235 162.396 162.495 162.601 162.648 162.734 162.809 162.863 162.882 162.711 162.9 162.9 162.896 162.845 162.825 162.776 162.661 162.517 162.299 161.983 161.433 -5 ,21747 ,KEBNE ,16723921,Sun Nov 28 04:14:07 CET,Sun Nov 28 06:04:42 CET,0.0 0.795 1.249 1.659 2.024 2.37 2.713 3.048 3.724 4.055 4.36 4.587 5.22 5.508 6.079 6.619 7.154 7.422 7.945 8.46 9.213 9.702 10.184 10.922 11.65 12.353 13.055 13.76 14.685 15.601 16.506 17.614 18.721 19.824 21.111 22.597 24.092 25.766 27.614 29.651 31.884 34.493 37.645 40.931 44.885 49.545 55.306 62.244 70.919 82.064 97.311 112.006 122.02 129.301 134.777 139.107 142.515 145.323 147.525 149.531 151.136 152.465 153.635 154.65 155.536 156.31 157.065 157.695 158.194 158.682 159.147 159.507 159.874 160.233 160.502 160.761 160.998 161.225 161.447 161.585 161.72 161.884 161.982 162.075 162.11 162.181 162.248 162.308 162.331 162.173 162.364 162.358 162.359 162.33 162.273 162.2 162.134 162.022 161.875 161.638 160.979 -6 ,11511 ,KEBNE ,16723922,Sun Nov 28 04:14:07 CET,Sun Nov 28 06:05:42 CET,0.0 0.61 1.076 1.501 1.919 2.312 2.7 3.063 3.727 4.06 4.378 4.639 5.287 5.576 6.144 6.711 7.285 7.567 8.114 8.65 9.441 9.961 10.468 11.214 11.971 12.709 13.415 14.108 15.02 15.924 16.821 17.931 19.016 20.088 21.367 22.856 24.341 26.015 27.879 29.915 32.123 34.702 37.831 41.127 45.191 49.937 55.681 62.576 71.267 82.477 97.703 112.334 122.246 129.474 134.962 139.308 142.695 145.473 147.696 149.777 151.402 152.722 153.911 154.952 155.858 156.635 157.387 158.024 158.545 159.054 159.558 159.942 160.294 160.632 160.883 161.142 161.408 161.662 161.901 162.055 162.199 162.392 162.507 162.607 162.66 162.768 162.852 162.921 162.954 162.809 163.037 163.053 163.059 163.03 162.982 162.919 162.868 162.765 162.585 162.365 161.603 -8 ,27049 ,KEBNE ,16723924,Sun Nov 28 04:15:08 CET,Sun Nov 28 06:06:12 CET,0.0 1.09 1.645 2.115 2.522 2.895 3.262 3.631 4.323 4.638 4.947 5.207 5.854 6.15 6.721 7.282 7.837 8.109 8.638 9.157 9.922 10.437 10.952 11.7 12.44 13.174 13.905 14.63 15.585 16.51 17.418 18.539 19.638 20.739 22.053 23.576 25.084 26.789 28.671 30.727 32.972 35.612 38.827 42.163 46.22 50.976 56.765 63.664 72.289 83.407 98.641 113.304 123.213 130.434 135.861 140.145 143.507 146.269 148.478 150.492 152.039 153.329 154.476 155.47 156.318 157.052 157.787 158.38 158.867 159.342 159.791 160.137 160.466 160.782 161.016 161.245 161.458 161.66 161.858 161.984 162.087 162.215 162.29 162.367 162.409 162.476 162.519 162.547 162.567 162.412 162.6 162.595 162.58 162.5 162.45 162.393 162.33 162.253 162.121 161.918 161.424 -9 ,20909 ,KEBNE ,16723925,Sun Nov 28 04:18:13 CET,Sun Nov 28 06:09:03 CET,0.0 0.799 1.368 1.85 2.303 2.715 3.076 3.421 4.093 4.401 4.697 4.943 5.579 5.872 6.45 7.005 7.557 7.835 8.374 8.9 9.69 10.208 10.71 11.46 12.193 12.916 13.638 14.34 15.275 16.192 17.098 18.219 19.311 20.399 21.695 23.2 24.702 26.381 28.256 30.32 32.541 35.119 38.227 41.486 45.466 50.153 55.863 62.723 71.365 82.454 97.632 112.152 121.96 129.114 134.541 138.881 142.304 145.126 147.348 149.369 150.984 152.337 153.518 154.535 155.407 156.156 156.882 157.491 158.012 158.53 159.035 159.432 159.815 160.191 160.463 160.72 160.961 161.184 161.391 161.527 161.66 161.859 161.987 162.099 162.145 162.222 162.29 162.354 162.381 162.222 162.438 162.454 162.458 162.437 162.41 162.375 162.319 162.229 162.094 161.867 161.194 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index 5ef2545c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18915 ,KEBNE ,16723927,Sun Nov 28 04:19:14 CET,Sun Nov 28 06:05:55 CET,0.0 0.27 0.485 0.66 0.815 0.958 1.093 1.234 1.5 1.613 1.714 1.731 2.001 2.092 2.27 2.448 2.628 2.716 2.87 3.019 3.241 3.387 3.54 3.755 3.947 4.135 4.311 4.483 4.72 4.936 5.149 5.417 5.673 5.929 6.208 6.517 6.834 7.175 7.534 7.933 8.368 8.859 9.406 9.909 10.492 11.194 12.006 12.899 13.835 14.743 15.483 15.74 15.643 15.319 14.928 14.526 14.092 13.639 13.235 12.766 12.344 11.981 11.608 11.231 10.883 10.587 10.271 9.969 9.707 9.399 9.047 8.772 8.492 8.171 7.901 7.646 7.387 7.105 6.826 6.644 6.475 6.167 5.946 5.714 5.586 5.338 5.053 4.727 4.548 4.195 3.912 3.695 3.502 3.056 2.776 2.447 2.05 1.638 1.199 0.643 -2.525 -2 ,16108 ,KEBNE ,16723928,Sun Nov 28 04:19:14 CET,Sun Nov 28 06:05:57 CET,0.0 0.379 0.635 0.809 0.964 1.119 1.262 1.388 1.636 1.756 1.863 1.898 2.174 2.273 2.46 2.64 2.816 2.902 3.059 3.211 3.435 3.571 3.708 3.918 4.114 4.308 4.498 4.674 4.897 5.11 5.315 5.58 5.839 6.083 6.364 6.673 6.984 7.319 7.667 8.036 8.422 8.855 9.382 9.918 10.516 11.174 11.963 12.808 13.732 14.747 15.798 16.379 16.32 15.973 15.536 15.14 14.74 14.326 13.973 13.576 13.167 12.791 12.44 12.128 11.846 11.56 11.244 10.946 10.662 10.362 10.057 9.8 9.533 9.237 8.991 8.742 8.483 8.236 7.988 7.813 7.62 7.267 7.041 6.831 6.713 6.46 6.149 5.808 5.639 5.301 5.105 4.915 4.706 4.229 3.934 3.609 3.273 2.826 2.225 1.481 -2.062 -3 ,27396 ,KEBNE ,16723929,Sun Nov 28 04:21:17 CET,Sun Nov 28 06:08:13 CET,0.0 0.375 0.619 0.853 1.047 1.199 1.328 1.457 1.683 1.786 1.894 1.928 2.198 2.293 2.486 2.673 2.837 2.918 3.07 3.215 3.433 3.568 3.707 3.923 4.131 4.327 4.512 4.695 4.932 5.153 5.366 5.623 5.864 6.103 6.385 6.695 7.006 7.341 7.692 8.09 8.503 8.963 9.502 10.007 10.616 11.346 12.187 13.068 13.929 14.848 15.771 16.22 16.189 15.816 15.434 15.045 14.6 14.187 13.786 13.357 12.963 12.573 12.191 11.809 11.459 11.125 10.768 10.477 10.202 9.878 9.54 9.279 9.017 8.732 8.502 8.276 8.033 7.774 7.499 7.289 7.072 6.737 6.506 6.255 6.133 5.88 5.576 5.252 5.079 4.73 4.462 4.254 4.033 3.586 3.357 3.046 2.686 2.292 1.699 0.878 -3.098 -4 ,23323 ,KEBNE ,16723930,Sun Nov 28 04:22:19 CET,Sun Nov 28 06:09:02 CET,0.0 0.538 0.748 0.923 1.099 1.254 1.392 1.534 1.799 1.913 2.029 2.078 2.36 2.466 2.661 2.848 3.024 3.106 3.266 3.424 3.664 3.819 3.969 4.185 4.39 4.59 4.781 4.965 5.206 5.427 5.638 5.908 6.176 6.429 6.711 7.029 7.333 7.659 8.007 8.383 8.796 9.267 9.801 10.318 10.933 11.658 12.465 13.31 14.269 15.249 15.926 16.072 15.919 15.565 15.165 14.746 14.369 13.95 13.532 13.134 12.787 12.5 12.196 11.872 11.529 11.173 10.817 10.486 10.166 9.836 9.525 9.257 8.972 8.688 8.466 8.244 8.015 7.772 7.49 7.279 7.064 6.735 6.493 6.235 6.105 5.819 5.484 5.136 4.977 4.655 4.381 4.138 3.905 3.417 3.134 2.852 2.543 2.103 1.537 0.746 -2.859 -6 ,16480 ,KEBNE ,16723932,Sun Nov 28 04:23:20 CET,Sun Nov 28 06:09:20 CET,0.0 0.328 0.575 0.754 0.897 1.026 1.151 1.282 1.532 1.65 1.764 1.813 2.09 2.179 2.348 2.518 2.692 2.777 2.949 3.113 3.339 3.483 3.63 3.852 4.055 4.25 4.437 4.615 4.855 5.086 5.303 5.571 5.819 6.049 6.337 6.659 6.958 7.313 7.704 8.113 8.521 8.964 9.465 9.966 10.61 11.293 11.998 12.812 13.763 14.77 15.639 15.929 15.74 15.364 14.927 14.481 14.055 13.58 13.141 12.717 12.342 11.999 11.666 11.326 11.01 10.729 10.429 10.124 9.838 9.528 9.195 8.939 8.672 8.396 8.153 7.889 7.635 7.356 7.042 6.828 6.623 6.279 6.041 5.779 5.643 5.372 5.092 4.808 4.634 4.282 4.075 3.892 3.678 3.195 2.943 2.673 2.346 1.991 1.575 0.776 -4.186 -8 ,28272 ,KEBNE ,16723934,Sun Nov 28 04:23:20 CET,Sun Nov 28 06:09:55 CET,0.0 0.458 0.757 0.976 1.162 1.339 1.503 1.646 1.906 2.036 2.153 2.179 2.446 2.535 2.714 2.903 3.075 3.157 3.333 3.493 3.713 3.861 4.003 4.202 4.392 4.587 4.782 4.976 5.228 5.455 5.677 5.943 6.2 6.443 6.726 7.053 7.364 7.7 8.051 8.428 8.843 9.324 9.876 10.414 11.069 11.789 12.509 13.278 14.199 15.18 15.988 16.294 16.153 15.868 15.583 15.248 14.907 14.549 14.209 13.802 13.363 12.912 12.496 12.144 11.812 11.503 11.192 10.91 10.654 10.377 10.073 9.808 9.515 9.22 9.008 8.805 8.571 8.307 8.02 7.807 7.599 7.276 7.034 6.776 6.645 6.372 6.07 5.769 5.616 5.288 5.101 4.911 4.7 4.259 3.991 3.674 3.345 2.984 2.493 1.746 -4.692 -9 ,32188 ,KEBNE ,16723935,Sun Nov 28 04:24:21 CET,Sun Nov 28 06:10:23 CET,0.0 0.299 0.49 0.666 0.818 0.953 1.088 1.217 1.459 1.568 1.676 1.719 1.989 2.088 2.271 2.433 2.593 2.668 2.815 2.966 3.182 3.327 3.472 3.676 3.867 4.055 4.236 4.416 4.648 4.872 5.086 5.339 5.585 5.821 6.1 6.421 6.727 7.065 7.419 7.786 8.177 8.601 9.095 9.604 10.168 10.762 11.456 12.267 13.182 14.084 14.844 15.065 14.823 14.496 14.14 13.72 13.3 12.867 12.455 11.994 11.617 11.313 10.989 10.659 10.351 10.078 9.766 9.483 9.252 8.989 8.688 8.432 8.173 7.89 7.663 7.414 7.162 6.937 6.671 6.473 6.279 5.957 5.722 5.478 5.344 5.039 4.711 4.356 4.167 3.824 3.578 3.371 3.16 2.699 2.417 2.105 1.76 1.349 0.863 0.149 -4.167 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt deleted file mode 100644 index 7e5b9774..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15991 ,KEBNE ,16723937,Sun Nov 28 04:24:21 CET,Sun Nov 28 06:11:56 CET,0.0 0.427 0.737 0.99 1.193 1.363 1.529 1.695 1.985 2.121 2.257 2.334 2.636 2.75 2.949 3.148 3.334 3.422 3.593 3.758 3.99 4.142 4.292 4.504 4.708 4.909 5.107 5.293 5.54 5.784 6.011 6.285 6.567 6.845 7.146 7.481 7.799 8.139 8.501 8.893 9.324 9.802 10.331 10.84 11.408 12.009 12.655 13.359 14.167 14.995 15.598 15.741 15.56 15.211 14.825 14.331 13.78 13.355 13.027 12.618 12.194 11.811 11.437 11.06 10.745 10.462 10.133 9.826 9.562 9.299 9.019 8.763 8.49 8.205 7.978 7.731 7.479 7.209 6.912 6.699 6.481 6.166 5.935 5.682 5.551 5.273 4.957 4.608 4.435 4.096 3.902 3.717 3.504 3.05 2.794 2.484 2.144 1.797 1.413 0.867 -1.742 -2 ,3042 ,KEBNE ,16723938,Sun Nov 28 04:24:21 CET,Sun Nov 28 06:13:03 CET,0.0 0.859 1.219 1.498 1.721 1.925 2.13 2.323 2.638 2.782 2.92 2.996 3.297 3.427 3.673 3.895 4.111 4.215 4.415 4.603 4.858 5.017 5.177 5.42 5.648 5.857 6.053 6.254 6.524 6.772 7.005 7.277 7.545 7.805 8.108 8.442 8.753 9.077 9.425 9.808 10.197 10.635 11.15 11.643 12.225 12.897 13.636 14.42 15.218 15.944 16.452 16.508 16.213 15.758 15.304 14.831 14.384 13.952 13.505 13.031 12.617 12.226 11.852 11.467 11.086 10.761 10.421 10.089 9.786 9.471 9.148 8.87 8.558 8.227 7.969 7.674 7.384 7.112 6.811 6.586 6.357 6.011 5.771 5.509 5.374 5.109 4.825 4.518 4.363 4.038 3.827 3.614 3.378 2.904 2.664 2.382 2.095 1.791 1.392 0.849 -1.519 -3 ,27753 ,KEBNE ,16723939,Sun Nov 28 04:24:22 CET,Sun Nov 28 06:11:55 CET,0.0 0.425 0.686 0.912 1.113 1.286 1.436 1.59 1.888 2.033 2.174 2.273 2.582 2.707 2.934 3.142 3.342 3.437 3.62 3.804 4.064 4.225 4.374 4.602 4.825 5.042 5.253 5.441 5.683 5.928 6.164 6.44 6.7 6.957 7.264 7.593 7.904 8.25 8.616 9.009 9.412 9.845 10.364 10.886 11.486 12.12 12.785 13.482 14.258 15.07 15.766 15.95 15.756 15.404 14.959 14.479 13.981 13.49 13.059 12.619 12.226 11.857 11.516 11.197 10.871 10.546 10.2 9.875 9.58 9.302 9.034 8.779 8.483 8.176 7.935 7.678 7.418 7.176 6.923 6.739 6.543 6.219 6.0 5.773 5.655 5.402 5.125 4.833 4.674 4.342 4.163 3.982 3.786 3.336 3.067 2.752 2.402 2.018 1.597 1.051 -2.335 -4 ,18530 ,KEBNE ,16723940,Sun Nov 28 04:25:23 CET,Sun Nov 28 06:14:08 CET,0.0 0.508 0.83 1.091 1.317 1.513 1.682 1.835 2.104 2.23 2.359 2.443 2.741 2.86 3.08 3.286 3.494 3.595 3.772 3.941 4.2 4.37 4.535 4.761 4.98 5.194 5.388 5.569 5.819 6.069 6.305 6.587 6.857 7.118 7.424 7.775 8.11 8.468 8.829 9.225 9.651 10.101 10.64 11.19 11.822 12.501 13.251 14.015 14.762 15.41 15.866 15.768 15.402 14.997 14.529 13.99 13.427 12.932 12.443 11.906 11.487 11.108 10.734 10.372 9.994 9.637 9.258 8.887 8.56 8.239 7.918 7.641 7.366 7.069 6.809 6.548 6.291 6.025 5.754 5.568 5.382 5.106 4.899 4.659 4.515 4.213 3.924 3.62 3.462 3.125 2.912 2.705 2.498 2.072 1.842 1.612 1.358 1.053 0.644 0.142 -2.181 -5 ,18400 ,KEBNE ,16723941,Sun Nov 28 04:25:23 CET,Sun Nov 28 06:13:05 CET,0.0 0.5 0.794 1.044 1.256 1.457 1.655 1.832 2.145 2.292 2.421 2.476 2.77 2.885 3.114 3.329 3.54 3.644 3.835 4.021 4.279 4.438 4.598 4.832 5.046 5.245 5.445 5.64 5.888 6.123 6.355 6.66 6.959 7.234 7.551 7.907 8.241 8.598 8.962 9.331 9.725 10.178 10.701 11.194 11.792 12.493 13.258 14.096 14.942 15.676 16.293 16.448 16.175 15.748 15.241 14.751 14.242 13.696 13.216 12.734 12.284 11.853 11.448 11.064 10.74 10.421 10.071 9.77 9.498 9.212 8.916 8.648 8.367 8.085 7.858 7.608 7.353 7.101 6.832 6.64 6.439 6.103 5.846 5.565 5.422 5.129 4.824 4.521 4.364 4.036 3.881 3.709 3.513 3.067 2.81 2.528 2.238 1.91 1.497 0.913 -1.071 -7 ,30663 ,KEBNE ,16723943,Sun Nov 28 04:25:22 CET,Sun Nov 28 06:13:49 CET,0.0 0.479 0.726 0.964 1.196 1.403 1.573 1.74 2.071 2.215 2.346 2.433 2.734 2.848 3.071 3.287 3.482 3.575 3.761 3.937 4.188 4.349 4.507 4.736 4.953 5.161 5.372 5.574 5.816 6.057 6.305 6.595 6.868 7.126 7.416 7.756 8.089 8.453 8.849 9.265 9.679 10.118 10.649 11.189 11.788 12.424 13.135 13.887 14.705 15.563 16.243 16.359 16.083 15.602 15.043 14.478 13.969 13.525 13.089 12.547 12.049 11.616 11.203 10.804 10.434 10.107 9.739 9.389 9.075 8.759 8.463 8.203 7.907 7.599 7.343 7.08 6.835 6.58 6.317 6.123 5.911 5.593 5.363 5.129 5.014 4.759 4.492 4.198 4.031 3.691 3.488 3.298 3.103 2.659 2.405 2.128 1.824 1.474 1.082 0.562 -1.44 -8 ,24214 ,KEBNE ,16723944,Sun Nov 28 04:25:22 CET,Sun Nov 28 06:13:34 CET,0.0 0.536 0.834 1.106 1.366 1.575 1.755 1.914 2.199 2.338 2.469 2.539 2.824 2.935 3.163 3.37 3.563 3.658 3.853 4.048 4.316 4.483 4.643 4.876 5.093 5.294 5.494 5.695 5.965 6.216 6.453 6.744 7.019 7.277 7.584 7.929 8.242 8.583 8.96 9.366 9.791 10.242 10.732 11.236 11.852 12.51 13.232 14.008 14.835 15.706 16.465 16.504 16.151 15.664 15.139 14.586 14.076 13.607 13.158 12.685 12.272 11.896 11.511 11.087 10.655 10.284 9.888 9.523 9.217 8.892 8.531 8.228 7.924 7.612 7.366 7.11 6.858 6.591 6.302 6.099 5.889 5.547 5.294 5.026 4.892 4.622 4.352 4.079 3.93 3.613 3.449 3.262 3.058 2.557 2.267 1.977 1.64 1.242 0.802 0.191 -2.416 -9 ,5660 ,KEBNE ,16723945,Sun Nov 28 04:25:22 CET,Sun Nov 28 06:12:49 CET,0.0 0.939 1.31 1.578 1.793 1.97 2.138 2.321 2.655 2.787 2.911 2.979 3.269 3.378 3.586 3.786 3.981 4.075 4.257 4.43 4.704 4.884 5.041 5.264 5.474 5.678 5.877 6.074 6.337 6.585 6.821 7.103 7.378 7.651 7.967 8.313 8.636 8.994 9.365 9.732 10.11 10.557 11.074 11.565 12.135 12.736 13.401 14.124 14.907 15.721 16.304 16.186 15.752 15.241 14.685 14.092 13.556 13.052 12.612 12.171 11.728 11.31 10.899 10.503 10.144 9.806 9.42 9.075 8.807 8.521 8.21 7.955 7.668 7.35 7.117 6.893 6.646 6.398 6.149 5.969 5.781 5.451 5.21 4.964 4.837 4.574 4.298 4.02 3.852 3.501 3.304 3.119 2.91 2.4 2.113 1.819 1.514 1.153 0.701 0.15 -1.72 -10 ,12632 ,KEBNE ,16723946,Sun Nov 28 04:27:24 CET,Sun Nov 28 06:15:59 CET,0.0 0.529 0.817 1.045 1.231 1.412 1.581 1.734 2.016 2.146 2.27 2.327 2.612 2.726 2.952 3.162 3.359 3.452 3.639 3.823 4.078 4.239 4.393 4.622 4.848 5.065 5.286 5.491 5.737 5.973 6.216 6.521 6.804 7.072 7.382 7.721 8.041 8.397 8.774 9.175 9.598 10.066 10.591 11.09 11.657 12.311 13.092 13.885 14.696 15.616 16.594 16.995 16.949 16.677 16.285 15.852 15.393 14.906 14.396 13.843 13.376 12.976 12.577 12.217 11.875 11.535 11.162 10.812 10.534 10.247 9.938 9.682 9.416 9.153 8.937 8.702 8.471 8.198 7.894 7.691 7.487 7.18 6.938 6.685 6.565 6.316 6.045 5.726 5.556 5.216 5.024 4.841 4.643 4.213 3.947 3.651 3.321 2.92 2.454 1.777 -0.388 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 59f0ef2e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2468 ,KEBNE ,16723947,Sun Nov 28 04:27:25 CET,Sun Nov 28 06:18:34 CET,0.0 0.727 1.074 1.333 1.581 1.818 2.021 2.198 2.544 2.713 2.879 3.03 3.368 3.515 3.793 4.055 4.313 4.444 4.702 4.951 5.312 5.544 5.762 6.09 6.405 6.695 6.976 7.252 7.605 7.935 8.25 8.635 9.015 9.377 9.794 10.28 10.745 11.233 11.76 12.335 12.93 13.584 14.322 15.07 15.963 16.947 18.11 19.467 21.018 22.791 24.866 26.353 27.089 27.471 27.557 27.515 27.449 27.279 27.068 26.83 26.609 26.395 26.164 25.908 25.649 25.423 25.167 24.931 24.722 24.501 24.252 24.028 23.804 23.564 23.383 23.189 22.982 22.759 22.519 22.364 22.204 21.946 21.771 21.585 21.478 21.249 21.008 20.743 20.6 20.297 20.125 19.952 19.781 19.398 19.192 18.985 18.738 18.437 18.085 17.665 16.55 -2 ,4530 ,KEBNE ,16723948,Sun Nov 28 04:27:24 CET,Sun Nov 28 06:18:44 CET,0.0 0.469 0.753 1.037 1.288 1.492 1.681 1.865 2.219 2.371 2.503 2.604 2.925 3.065 3.343 3.615 3.864 3.98 4.206 4.429 4.742 4.943 5.152 5.451 5.737 6.022 6.288 6.551 6.888 7.207 7.523 7.904 8.268 8.625 9.05 9.52 9.972 10.484 11.019 11.597 12.216 12.916 13.75 14.556 15.498 16.579 17.801 19.152 20.665 22.29 24.129 25.546 26.266 26.624 26.794 26.818 26.745 26.661 26.53 26.35 26.175 25.972 25.751 25.513 25.28 25.069 24.849 24.662 24.479 24.246 23.992 23.768 23.511 23.255 23.066 22.859 22.634 22.4 22.153 21.983 21.807 21.528 21.343 21.137 21.015 20.773 20.535 20.27 20.126 19.82 19.659 19.489 19.328 19.002 18.828 18.624 18.419 18.217 17.966 17.659 17.116 -3 ,10733 ,KEBNE ,16723949,Sun Nov 28 04:27:24 CET,Sun Nov 28 06:17:19 CET,0.0 0.475 0.772 1.035 1.246 1.429 1.615 1.796 2.142 2.31 2.48 2.627 2.959 3.115 3.418 3.701 3.97 4.096 4.335 4.572 4.91 5.126 5.335 5.646 5.957 6.245 6.511 6.764 7.102 7.444 7.759 8.124 8.48 8.835 9.259 9.723 10.164 10.634 11.135 11.676 12.249 12.903 13.683 14.479 15.375 16.369 17.501 18.718 20.085 21.702 23.661 25.032 25.693 26.043 26.184 26.205 26.133 25.986 25.81 25.621 25.428 25.218 25.018 24.815 24.601 24.402 24.169 23.943 23.736 23.518 23.292 23.086 22.859 22.622 22.443 22.253 22.058 21.859 21.647 21.497 21.341 21.098 20.916 20.721 20.621 20.419 20.216 20.018 19.909 19.622 19.526 19.381 19.224 18.86 18.651 18.435 18.201 17.945 17.661 17.33 16.362 -4 ,32718 ,KEBNE ,16723950,Sun Nov 28 04:27:25 CET,Sun Nov 28 06:17:56 CET,0.0 0.381 0.592 0.773 0.953 1.138 1.31 1.467 1.782 1.935 2.086 2.199 2.514 2.648 2.894 3.138 3.383 3.504 3.74 3.955 4.254 4.45 4.654 4.949 5.226 5.493 5.762 6.033 6.375 6.7 7.009 7.378 7.752 8.114 8.525 8.988 9.427 9.911 10.452 11.042 11.67 12.361 13.157 13.967 14.934 16.005 17.216 18.622 20.261 22.117 24.297 25.867 26.599 26.927 27.058 27.091 27.016 26.852 26.604 26.323 26.082 25.84 25.59 25.34 25.096 24.875 24.636 24.405 24.204 23.984 23.74 23.531 23.309 23.084 22.914 22.734 22.529 22.299 22.053 21.887 21.721 21.475 21.304 21.11 21.011 20.814 20.594 20.353 20.231 19.948 19.846 19.704 19.553 19.233 19.06 18.855 18.628 18.381 18.098 17.754 17.134 -5 ,634 ,KEBNE ,16723951,Sun Nov 28 04:27:25 CET,Sun Nov 28 06:18:42 CET,0.0 0.343 0.597 0.818 1.036 1.253 1.457 1.649 2.005 2.173 2.33 2.437 2.751 2.879 3.133 3.383 3.625 3.747 3.981 4.207 4.533 4.741 4.949 5.245 5.516 5.787 6.046 6.288 6.61 6.917 7.207 7.561 7.91 8.268 8.701 9.176 9.617 10.112 10.641 11.199 11.798 12.451 13.2 13.959 14.832 15.771 16.838 18.086 19.578 21.278 23.258 24.75 25.471 25.87 26.039 26.028 25.917 25.747 25.577 25.367 25.125 24.873 24.626 24.372 24.115 23.887 23.628 23.388 23.186 22.955 22.694 22.461 22.227 21.993 21.804 21.609 21.398 21.166 20.92 20.751 20.582 20.322 20.146 19.966 19.875 19.678 19.46 19.218 19.092 18.802 18.686 18.553 18.423 18.149 17.995 17.796 17.575 17.359 17.125 16.835 15.77 -6 ,17602 ,KEBNE ,16723952,Sun Nov 28 04:27:25 CET,Sun Nov 28 06:19:31 CET,0.0 0.652 0.935 1.192 1.415 1.609 1.805 1.998 2.344 2.51 2.669 2.799 3.123 3.259 3.537 3.798 4.043 4.162 4.39 4.619 4.956 5.163 5.361 5.661 5.963 6.24 6.508 6.769 7.109 7.452 7.782 8.181 8.556 8.917 9.347 9.822 10.275 10.766 11.299 11.864 12.471 13.148 13.901 14.651 15.541 16.523 17.584 18.747 20.152 21.792 23.698 25.12 25.803 26.135 26.233 26.227 26.153 25.995 25.825 25.645 25.454 25.246 25.0 24.754 24.538 24.322 24.087 23.885 23.709 23.518 23.312 23.132 22.945 22.745 22.579 22.388 22.166 21.944 21.71 21.537 21.348 21.045 20.838 20.63 20.521 20.286 20.029 19.758 19.615 19.304 19.133 18.954 18.756 18.343 18.131 17.883 17.617 17.345 17.012 16.595 15.77 -7 ,16698 ,KEBNE ,16723953,Sun Nov 28 04:27:25 CET,Sun Nov 28 06:18:03 CET,0.0 0.355 0.609 0.867 1.127 1.342 1.53 1.714 2.057 2.208 2.353 2.467 2.787 2.93 3.204 3.439 3.646 3.754 3.972 4.18 4.485 4.686 4.887 5.173 5.446 5.72 5.982 6.241 6.586 6.921 7.239 7.591 7.92 8.257 8.662 9.109 9.538 10.003 10.511 11.038 11.608 12.263 12.988 13.732 14.623 15.593 16.671 17.891 19.338 20.991 22.845 24.209 24.881 25.233 25.378 25.372 25.276 25.144 25.0 24.79 24.578 24.4 24.223 24.04 23.853 23.663 23.441 23.244 23.073 22.89 22.665 22.471 22.299 22.118 21.964 21.801 21.622 21.42 21.204 21.052 20.894 20.639 20.459 20.273 20.169 19.958 19.737 19.48 19.346 19.054 18.938 18.797 18.649 18.323 18.14 17.946 17.742 17.508 17.208 16.843 16.033 -8 ,12407 ,KEBNE ,16723954,Sun Nov 28 04:27:25 CET,Sun Nov 28 06:18:37 CET,0.0 0.464 0.787 1.013 1.195 1.37 1.547 1.714 2.024 2.17 2.316 2.43 2.75 2.884 3.136 3.391 3.634 3.749 3.973 4.183 4.497 4.699 4.885 5.164 5.444 5.696 5.936 6.175 6.489 6.802 7.108 7.492 7.869 8.232 8.665 9.138 9.592 10.098 10.638 11.217 11.836 12.543 13.359 14.185 15.159 16.261 17.556 18.98 20.514 22.32 24.39 25.855 26.533 26.781 26.831 26.73 26.55 26.319 26.087 25.829 25.575 25.339 25.098 24.839 24.583 24.339 24.077 23.839 23.633 23.422 23.182 22.976 22.757 22.515 22.331 22.146 21.95 21.748 21.538 21.385 21.221 20.966 20.8 20.628 20.532 20.326 20.119 19.9 19.776 19.473 19.326 19.173 19.01 18.69 18.526 18.337 18.104 17.861 17.618 17.285 16.603 -9 ,21665 ,KEBNE ,16723955,Sun Nov 28 04:27:25 CET,Sun Nov 28 06:19:36 CET,0.0 0.539 0.842 1.083 1.324 1.564 1.771 1.954 2.31 2.491 2.661 2.795 3.116 3.265 3.551 3.803 4.056 4.187 4.432 4.661 4.979 5.184 5.381 5.666 5.949 6.222 6.484 6.73 7.039 7.344 7.663 8.054 8.414 8.752 9.154 9.623 10.065 10.554 11.095 11.679 12.284 12.953 13.744 14.545 15.513 16.616 17.882 19.296 20.913 22.71 24.72 26.107 26.665 26.846 26.882 26.877 26.789 26.629 26.412 26.134 25.889 25.656 25.403 25.14 24.888 24.659 24.431 24.224 24.029 23.801 23.546 23.34 23.123 22.9 22.736 22.572 22.386 22.176 21.956 21.801 21.647 21.415 21.243 21.051 20.952 20.741 20.507 20.272 20.156 19.876 19.766 19.617 19.459 19.094 18.881 18.654 18.448 18.237 17.952 17.555 16.867 -10 ,29516 ,KEBNE ,16723956,Sun Nov 28 04:27:26 CET,Sun Nov 28 06:24:23 CET,0.0 0.566 0.859 1.102 1.312 1.516 1.718 1.908 2.252 2.402 2.561 2.684 3.0 3.133 3.397 3.648 3.878 3.991 4.213 4.428 4.732 4.929 5.12 5.407 5.694 5.962 6.219 6.466 6.78 7.093 7.396 7.754 8.094 8.432 8.828 9.264 9.704 10.182 10.701 11.287 11.899 12.585 13.366 14.16 15.136 16.182 17.332 18.646 20.173 21.901 23.871 25.326 26.027 26.369 26.537 26.571 26.459 26.305 26.148 25.946 25.731 25.526 25.288 25.023 24.781 24.541 24.283 24.059 23.85 23.627 23.392 23.187 22.97 22.755 22.592 22.416 22.217 21.998 21.772 21.622 21.464 21.207 21.039 20.867 20.776 20.583 20.347 20.089 19.969 19.694 19.616 19.48 19.33 19.003 18.809 18.602 18.399 18.173 17.895 17.573 16.723 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt deleted file mode 100644 index e068af1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,467 ,KEBNE ,16723957,Sun Nov 28 04:27:25 CET,Sun Nov 28 06:23:22 CET,0.0 1.157 1.458 1.703 1.936 2.147 2.354 2.553 2.871 3.004 3.137 3.218 3.529 3.647 3.861 4.083 4.286 4.386 4.603 4.804 5.053 5.208 5.368 5.592 5.813 6.03 6.227 6.422 6.689 6.952 7.181 7.45 7.706 7.964 8.283 8.621 8.922 9.237 9.568 9.904 10.251 10.661 11.124 11.559 12.019 12.46 12.941 13.475 14.062 14.6 14.881 14.466 13.769 13.061 12.362 11.699 11.09 10.503 10.0 9.502 9.048 8.628 8.221 7.797 7.376 6.988 6.59 6.235 5.926 5.626 5.321 5.052 4.759 4.45 4.192 3.919 3.642 3.372 3.111 2.927 2.729 2.4 2.187 1.966 1.839 1.566 1.276 0.982 0.836 0.511 0.365 0.193 0.009 -0.392 -0.622 -0.882 -1.141 -1.451 -1.828 -2.245 -3.324 -2 ,2631 ,KEBNE ,16723958,Sun Nov 28 04:28:27 CET,Sun Nov 28 06:20:01 CET,0.0 1.237 1.648 1.896 2.118 2.318 2.513 2.692 2.996 3.14 3.291 3.402 3.704 3.823 4.065 4.32 4.554 4.66 4.845 5.008 5.251 5.412 5.558 5.79 6.027 6.24 6.439 6.636 6.895 7.132 7.355 7.629 7.888 8.126 8.42 8.749 9.041 9.366 9.727 10.09 10.43 10.801 11.239 11.677 12.171 12.682 13.233 13.84 14.491 15.025 15.219 14.814 14.116 13.437 12.829 12.244 11.704 11.179 10.682 10.143 9.686 9.28 8.881 8.497 8.139 7.825 7.492 7.181 6.897 6.605 6.279 6.014 5.762 5.484 5.266 5.048 4.827 4.585 4.313 4.12 3.93 3.618 3.395 3.165 3.038 2.767 2.476 2.182 2.026 1.683 1.537 1.362 1.163 0.727 0.483 0.219 -0.056 -0.372 -0.737 -1.179 -2.561 -3 ,3989 ,KEBNE ,16723959,Sun Nov 28 04:28:27 CET,Sun Nov 28 06:20:21 CET,0.0 1.42 1.778 2.058 2.304 2.527 2.721 2.909 3.277 3.446 3.601 3.702 4.022 4.146 4.379 4.61 4.819 4.915 5.113 5.314 5.61 5.791 5.957 6.204 6.441 6.646 6.825 7.012 7.265 7.509 7.736 8.007 8.261 8.493 8.769 9.055 9.319 9.624 9.962 10.318 10.669 11.066 11.549 12.009 12.526 13.094 13.674 14.216 14.693 15.05 15.179 14.766 14.118 13.377 12.684 12.093 11.561 11.049 10.586 10.099 9.666 9.216 8.75 8.31 7.906 7.541 7.161 6.817 6.481 6.105 5.723 5.408 5.078 4.731 4.458 4.186 3.907 3.608 3.312 3.119 2.903 2.553 2.315 2.069 1.952 1.707 1.427 1.127 0.971 0.637 0.472 0.295 0.109 -0.3 -0.53 -0.766 -1.002 -1.295 -1.659 -2.138 -3.259 -4 ,628 ,KEBNE ,16723960,Sun Nov 28 04:28:27 CET,Sun Nov 28 06:21:18 CET,0.0 1.427 1.822 2.123 2.388 2.621 2.808 2.984 3.308 3.461 3.609 3.691 3.99 4.108 4.347 4.581 4.807 4.915 5.121 5.294 5.536 5.694 5.842 6.056 6.286 6.525 6.755 6.976 7.277 7.566 7.83 8.142 8.427 8.684 8.971 9.295 9.595 9.894 10.216 10.552 10.885 11.271 11.671 12.023 12.413 12.845 13.369 13.842 14.272 14.7 14.928 14.621 14.09 13.533 12.969 12.391 11.824 11.243 10.666 10.094 9.61 9.134 8.68 8.282 7.923 7.593 7.226 6.849 6.506 6.155 5.789 5.489 5.174 4.849 4.605 4.345 4.073 3.798 3.496 3.268 3.038 2.696 2.452 2.185 2.043 1.767 1.472 1.158 1.01 0.679 0.498 0.3 0.087 -0.371 -0.636 -0.904 -1.172 -1.476 -1.835 -2.343 -4.947 -5 ,25428 ,KEBNE ,16723961,Sun Nov 28 04:28:27 CET,Sun Nov 28 06:20:36 CET,0.0 0.857 1.136 1.42 1.683 1.889 2.064 2.227 2.558 2.725 2.876 2.969 3.3 3.434 3.664 3.878 4.081 4.186 4.385 4.559 4.799 4.966 5.145 5.384 5.585 5.787 5.996 6.21 6.483 6.72 6.941 7.2 7.439 7.674 7.943 8.247 8.546 8.864 9.211 9.59 9.987 10.441 10.931 11.385 11.898 12.379 12.832 13.282 13.752 14.126 14.268 13.764 13.034 12.393 11.757 11.092 10.458 9.859 9.312 8.747 8.237 7.766 7.312 6.874 6.463 6.082 5.676 5.326 5.02 4.689 4.343 4.055 3.767 3.479 3.252 3.007 2.748 2.485 2.208 2.008 1.806 1.513 1.3 1.068 0.945 0.679 0.4 0.103 -0.046 -0.377 -0.533 -0.696 -0.866 -1.253 -1.451 -1.669 -1.92 -2.202 -2.552 -3.01 -5.027 -6 ,27415 ,KEBNE ,16723962,Sun Nov 28 04:28:27 CET,Sun Nov 28 06:21:18 CET,0.0 0.864 1.208 1.507 1.745 1.937 2.12 2.304 2.625 2.771 2.909 2.969 3.261 3.385 3.645 3.87 4.073 4.173 4.373 4.566 4.831 4.992 5.15 5.392 5.621 5.822 6.026 6.228 6.476 6.708 6.927 7.183 7.412 7.624 7.89 8.221 8.519 8.827 9.169 9.527 9.871 10.222 10.627 11.013 11.418 11.854 12.34 12.882 13.459 13.945 14.209 14.026 13.633 13.047 12.345 11.655 11.019 10.43 9.918 9.377 8.899 8.477 8.026 7.567 7.156 6.79 6.4 6.037 5.697 5.327 4.949 4.65 4.327 3.967 3.685 3.412 3.135 2.849 2.54 2.318 2.096 1.75 1.516 1.27 1.139 0.875 0.601 0.309 0.153 -0.18 -0.339 -0.524 -0.712 -1.12 -1.342 -1.586 -1.867 -2.185 -2.543 -2.975 -4.397 -7 ,4893 ,KEBNE ,16723963,Sun Nov 28 04:30:29 CET,Sun Nov 28 06:21:39 CET,0.0 0.818 1.126 1.393 1.635 1.839 2.015 2.177 2.455 2.597 2.743 2.845 3.148 3.257 3.463 3.666 3.877 3.976 4.173 4.373 4.653 4.827 5.0 5.238 5.451 5.665 5.868 6.052 6.3 6.557 6.799 7.066 7.32 7.557 7.809 8.086 8.36 8.661 8.965 9.279 9.602 9.966 10.398 10.831 11.306 11.806 12.376 12.933 13.43 13.753 13.728 13.299 12.647 11.932 11.218 10.539 9.921 9.314 8.783 8.247 7.773 7.339 6.885 6.456 6.088 5.735 5.334 4.974 4.654 4.309 3.948 3.644 3.325 3.007 2.769 2.514 2.237 1.963 1.696 1.498 1.281 0.939 0.703 0.464 0.338 0.053 -0.245 -0.54 -0.693 -1.023 -1.163 -1.339 -1.534 -1.947 -2.184 -2.436 -2.702 -2.986 -3.297 -3.707 -4.855 -8 ,12858 ,KEBNE ,16723964,Sun Nov 28 04:31:31 CET,Sun Nov 28 06:23:33 CET,0.0 1.136 1.492 1.771 1.995 2.221 2.416 2.601 2.957 3.111 3.254 3.343 3.659 3.797 4.046 4.251 4.455 4.56 4.759 4.937 5.165 5.306 5.454 5.674 5.889 6.089 6.277 6.466 6.716 6.969 7.198 7.458 7.704 7.917 8.165 8.459 8.737 9.027 9.318 9.624 9.936 10.29 10.72 11.122 11.531 11.967 12.45 12.978 13.494 13.9 14.093 13.885 13.336 12.559 11.841 11.246 10.732 10.21 9.705 9.183 8.697 8.236 7.78 7.366 7.012 6.683 6.332 6.016 5.72 5.394 5.067 4.804 4.531 4.246 4.028 3.818 3.599 3.352 3.085 2.898 2.687 2.345 2.116 1.875 1.747 1.485 1.208 0.919 0.772 0.457 0.335 0.174 0.005 -0.384 -0.628 -0.906 -1.202 -1.55 -1.97 -2.493 -4.08 -9 ,10055 ,KEBNE ,16723965,Sun Nov 28 04:31:31 CET,Sun Nov 28 06:22:41 CET,0.0 1.149 1.439 1.639 1.818 1.994 2.151 2.293 2.577 2.715 2.842 2.904 3.194 3.31 3.528 3.732 3.92 4.003 4.168 4.335 4.595 4.767 4.929 5.14 5.326 5.519 5.716 5.902 6.144 6.375 6.591 6.863 7.112 7.341 7.608 7.912 8.198 8.514 8.856 9.179 9.501 9.88 10.291 10.673 11.122 11.607 12.172 12.745 13.248 13.686 13.924 13.46 12.716 12.025 11.37 10.765 10.226 9.701 9.167 8.55 8.01 7.547 7.076 6.595 6.163 5.773 5.333 4.935 4.613 4.266 3.902 3.616 3.304 2.951 2.667 2.386 2.106 1.817 1.522 1.305 1.068 0.692 0.442 0.199 0.068 -0.204 -0.499 -0.821 -0.991 -1.34 -1.503 -1.685 -1.872 -2.254 -2.474 -2.722 -2.998 -3.307 -3.66 -4.162 -5.422 -10 ,24352 ,KEBNE ,16723966,Sun Nov 28 04:31:31 CET,Sun Nov 28 06:23:11 CET,0.0 1.282 1.736 2.016 2.255 2.478 2.672 2.85 3.162 3.308 3.458 3.536 3.837 3.961 4.188 4.406 4.618 4.72 4.912 5.101 5.378 5.561 5.734 5.975 6.194 6.398 6.606 6.794 7.039 7.277 7.48 7.722 7.963 8.198 8.449 8.717 8.986 9.31 9.652 9.959 10.266 10.616 11.016 11.431 11.897 12.384 12.881 13.371 13.959 14.473 14.68 14.286 13.663 12.998 12.369 11.783 11.177 10.552 9.99 9.428 8.912 8.448 8.024 7.607 7.186 6.78 6.341 5.944 5.617 5.27 4.886 4.563 4.223 3.879 3.603 3.318 3.046 2.771 2.481 2.283 2.087 1.782 1.561 1.329 1.205 0.951 0.688 0.404 0.255 -0.07 -0.214 -0.387 -0.567 -0.986 -1.2 -1.423 -1.689 -1.963 -2.259 -2.594 -3.76 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index bdd2d8b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23545 ,KEBNE ,16723967,Sun Nov 28 04:31:31 CET,Sun Nov 28 06:18:48 CET,0.0 0.904 1.251 1.514 1.763 2.005 2.206 2.393 2.699 2.828 2.969 3.095 3.388 3.513 3.761 4.001 4.236 4.349 4.567 4.759 5.011 5.172 5.328 5.553 5.77 5.979 6.172 6.353 6.601 6.842 7.067 7.336 7.585 7.819 8.082 8.373 8.653 8.958 9.304 9.654 9.992 10.371 10.801 11.185 11.561 11.966 12.404 12.878 13.292 13.476 13.338 12.488 11.485 10.526 9.602 8.721 7.889 7.089 6.387 5.685 5.022 4.428 3.87 3.336 2.819 2.317 1.793 1.322 0.902 0.437 -0.1 -0.535 -0.953 -1.413 -1.801 -2.197 -2.61 -3.033 -3.471 -3.773 -4.098 -4.642 -4.993 -5.34 -5.518 -5.9 -6.312 -6.735 -6.962 -7.378 -7.742 -8.028 -8.322 -8.943 -9.273 -9.634 -10.047 -10.519 -11.114 -11.95 -14.701 -2 ,30087 ,KEBNE ,16723968,Sun Nov 28 04:31:31 CET,Sun Nov 28 06:20:39 CET,0.0 1.135 1.556 1.881 2.155 2.393 2.607 2.802 3.164 3.32 3.461 3.561 3.842 3.955 4.169 4.389 4.608 4.71 4.901 5.077 5.331 5.485 5.628 5.846 6.059 6.265 6.458 6.643 6.899 7.149 7.379 7.655 7.926 8.176 8.453 8.758 9.034 9.325 9.653 10.0 10.347 10.744 11.18 11.564 11.987 12.431 12.891 13.263 13.557 13.715 13.305 12.223 11.11 10.068 9.079 8.151 7.328 6.545 5.845 5.124 4.502 3.931 3.372 2.811 2.266 1.776 1.244 0.769 0.369 -0.057 -0.513 -0.89 -1.313 -1.771 -2.12 -2.476 -2.836 -3.215 -3.627 -3.92 -4.223 -4.691 -5.011 -5.354 -5.536 -5.891 -6.274 -6.701 -6.926 -7.319 -7.636 -7.91 -8.191 -8.802 -9.153 -9.559 -10.031 -10.549 -11.184 -11.996 -14.112 -3 ,25875 ,KEBNE ,16723969,Sun Nov 28 04:32:32 CET,Sun Nov 28 06:21:10 CET,0.0 1.187 1.603 1.93 2.189 2.426 2.666 2.882 3.224 3.379 3.544 3.7 4.002 4.126 4.365 4.588 4.791 4.895 5.107 5.307 5.583 5.759 5.929 6.171 6.402 6.614 6.816 7.012 7.267 7.513 7.738 8.019 8.303 8.579 8.883 9.198 9.496 9.826 10.174 10.508 10.846 11.237 11.664 12.042 12.456 12.923 13.395 13.793 14.125 14.317 14.064 13.123 12.067 10.958 9.786 8.63 7.625 6.739 5.925 5.062 4.269 3.606 3.04 2.466 1.905 1.385 0.809 0.282 -0.155 -0.615 -1.102 -1.501 -1.935 -2.4 -2.731 -3.06 -3.422 -3.81 -4.218 -4.504 -4.794 -5.258 -5.607 -5.962 -6.143 -6.552 -6.987 -7.435 -7.68 -8.101 -8.47 -8.737 -9.04 -9.709 -10.058 -10.456 -10.896 -11.412 -12.041 -12.851 -16.764 -4 ,14447 ,KEBNE ,16723970,Sun Nov 28 04:32:33 CET,Sun Nov 28 06:21:14 CET,0.0 1.023 1.458 1.794 2.057 2.27 2.47 2.656 2.986 3.144 3.295 3.41 3.707 3.837 4.079 4.3 4.513 4.614 4.813 5.001 5.267 5.435 5.593 5.816 6.035 6.263 6.48 6.676 6.925 7.168 7.388 7.638 7.878 8.12 8.398 8.706 9.002 9.318 9.659 10.001 10.328 10.671 11.064 11.457 11.906 12.353 12.805 13.269 13.684 13.887 13.659 12.85 11.844 10.809 9.86 8.971 8.165 7.415 6.702 5.976 5.361 4.759 4.169 3.619 3.073 2.564 2.005 1.504 1.096 0.668 0.198 -0.214 -0.649 -1.089 -1.434 -1.807 -2.192 -2.599 -3.034 -3.328 -3.627 -4.101 -4.432 -4.778 -4.962 -5.366 -5.786 -6.203 -6.431 -6.847 -7.201 -7.474 -7.759 -8.382 -8.734 -9.129 -9.573 -10.035 -10.626 -11.466 -14.245 -5 ,9378 ,KEBNE ,16723971,Sun Nov 28 04:32:33 CET,Sun Nov 28 06:21:27 CET,0.0 1.122 1.557 1.915 2.223 2.447 2.632 2.813 3.143 3.296 3.449 3.561 3.85 3.975 4.209 4.413 4.61 4.708 4.888 5.06 5.317 5.484 5.644 5.875 6.092 6.297 6.489 6.675 6.924 7.158 7.37 7.635 7.895 8.14 8.419 8.708 8.973 9.259 9.564 9.892 10.238 10.614 11.032 11.43 11.88 12.352 12.842 13.264 13.539 13.671 13.375 12.463 11.425 10.441 9.518 8.66 7.905 7.167 6.428 5.615 4.914 4.309 3.731 3.171 2.633 2.107 1.586 1.168 0.777 0.346 -0.125 -0.52 -0.924 -1.364 -1.719 -2.089 -2.47 -2.878 -3.319 -3.612 -3.925 -4.433 -4.767 -5.115 -5.304 -5.7 -6.114 -6.573 -6.802 -7.192 -7.506 -7.767 -8.045 -8.684 -9.049 -9.443 -9.869 -10.314 -10.837 -11.648 -14.628 -6 ,26038 ,KEBNE ,16723972,Sun Nov 28 04:32:32 CET,Sun Nov 28 06:21:43 CET,0.0 1.164 1.582 1.897 2.161 2.38 2.569 2.744 3.065 3.214 3.36 3.451 3.73 3.85 4.093 4.325 4.531 4.632 4.824 5.002 5.258 5.414 5.565 5.797 6.029 6.249 6.457 6.653 6.896 7.123 7.341 7.597 7.833 8.057 8.31 8.587 8.862 9.158 9.463 9.786 10.121 10.471 10.838 11.219 11.667 12.127 12.574 13.008 13.364 13.483 13.243 12.523 11.586 10.617 9.69 8.799 8.018 7.264 6.608 5.966 5.371 4.82 4.272 3.713 3.144 2.584 1.998 1.464 0.987 0.51 0.036 -0.37 -0.814 -1.273 -1.647 -2.025 -2.39 -2.782 -3.197 -3.477 -3.768 -4.251 -4.607 -4.986 -5.18 -5.548 -5.932 -6.371 -6.61 -7.008 -7.391 -7.696 -8.0 -8.663 -9.035 -9.476 -9.938 -10.414 -11.016 -11.884 -15.025 -7 ,2511 ,KEBNE ,16723973,Sun Nov 28 04:32:33 CET,Sun Nov 28 06:20:37 CET,0.0 0.869 1.266 1.587 1.85 2.076 2.271 2.46 2.817 2.986 3.138 3.237 3.529 3.648 3.867 4.084 4.287 4.383 4.574 4.759 5.021 5.185 5.337 5.569 5.802 6.011 6.212 6.414 6.666 6.901 7.136 7.421 7.672 7.896 8.16 8.464 8.745 9.049 9.374 9.722 10.083 10.457 10.881 11.273 11.683 12.111 12.576 13.025 13.369 13.506 13.208 12.398 11.372 10.308 9.321 8.393 7.547 6.727 6.005 5.27 4.589 3.953 3.343 2.742 2.179 1.691 1.174 0.721 0.305 -0.149 -0.597 -0.966 -1.367 -1.796 -2.156 -2.533 -2.89 -3.299 -3.759 -4.063 -4.373 -4.855 -5.183 -5.51 -5.677 -6.075 -6.516 -6.965 -7.202 -7.618 -7.969 -8.234 -8.524 -9.157 -9.507 -9.892 -10.325 -10.847 -11.464 -12.243 -14.599 -8 ,16002 ,KEBNE ,16723974,Sun Nov 28 04:34:35 CET,Sun Nov 28 06:22:57 CET,0.0 1.087 1.494 1.803 2.043 2.261 2.461 2.643 2.988 3.153 3.296 3.401 3.689 3.806 4.035 4.243 4.429 4.521 4.717 4.915 5.201 5.38 5.538 5.759 5.972 6.168 6.348 6.525 6.751 6.972 7.189 7.44 7.667 7.884 8.148 8.444 8.724 9.024 9.332 9.65 9.971 10.321 10.71 11.095 11.535 11.969 12.402 12.762 13.101 13.296 12.894 11.819 10.768 9.744 8.755 7.865 7.006 6.192 5.514 4.809 4.177 3.589 3.026 2.488 1.966 1.497 0.995 0.534 0.111 -0.364 -0.835 -1.217 -1.632 -2.084 -2.435 -2.798 -3.171 -3.539 -3.954 -4.259 -4.564 -5.051 -5.393 -5.752 -5.935 -6.291 -6.678 -7.112 -7.346 -7.747 -8.067 -8.34 -8.638 -9.258 -9.563 -9.891 -10.313 -10.801 -11.385 -12.222 -16.051 -9 ,30400 ,KEBNE ,16723975,Sun Nov 28 04:34:35 CET,Sun Nov 28 06:23:29 CET,0.0 0.87 1.204 1.452 1.686 1.916 2.129 2.323 2.679 2.843 2.988 3.089 3.371 3.483 3.696 3.91 4.12 4.223 4.422 4.61 4.87 5.034 5.194 5.416 5.631 5.834 6.025 6.215 6.464 6.703 6.923 7.196 7.46 7.693 7.948 8.236 8.515 8.822 9.156 9.494 9.855 10.251 10.655 11.025 11.438 11.888 12.361 12.784 13.128 13.332 13.218 12.501 11.577 10.619 9.733 8.903 8.108 7.346 6.649 5.934 5.266 4.654 4.094 3.555 3.051 2.596 2.106 1.623 1.196 0.789 0.381 0.026 -0.373 -0.803 -1.133 -1.496 -1.89 -2.297 -2.705 -2.976 -3.286 -3.788 -4.115 -4.471 -4.666 -5.065 -5.464 -5.906 -6.151 -6.552 -6.847 -7.094 -7.391 -8.0 -8.333 -8.759 -9.231 -9.747 -10.363 -11.165 -13.076 -10 ,18048 ,KEBNE ,16723976,Sun Nov 28 04:34:35 CET,Sun Nov 28 06:21:53 CET,0.0 0.953 1.349 1.647 1.897 2.117 2.308 2.484 2.84 3.006 3.148 3.235 3.523 3.641 3.869 4.086 4.299 4.397 4.582 4.77 5.035 5.194 5.356 5.591 5.82 6.038 6.24 6.437 6.679 6.902 7.124 7.388 7.63 7.863 8.124 8.434 8.762 9.109 9.434 9.764 10.092 10.42 10.784 11.132 11.524 11.912 12.302 12.696 13.009 13.13 12.824 11.943 10.941 9.924 8.922 7.986 7.163 6.41 5.733 4.99 4.31 3.705 3.102 2.53 2.014 1.488 0.931 0.459 0.011 -0.493 -1.005 -1.413 -1.833 -2.266 -2.633 -3.021 -3.403 -3.797 -4.238 -4.565 -4.885 -5.373 -5.734 -6.104 -6.294 -6.719 -7.158 -7.643 -7.898 -8.309 -8.643 -8.919 -9.21 -9.828 -10.184 -10.578 -11.016 -11.522 -12.074 -12.833 -15.102 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 955de211..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/protein/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16401 ,KEBNE ,16723977,Sun Nov 28 04:34:35 CET,Sun Nov 28 06:24:46 CET,0.0 0.413 0.67 0.892 1.098 1.278 1.446 1.604 1.903 2.043 2.185 2.288 2.572 2.696 2.932 3.144 3.341 3.437 3.619 3.799 4.075 4.253 4.419 4.658 4.885 5.094 5.306 5.518 5.778 6.014 6.241 6.517 6.788 7.044 7.342 7.693 8.019 8.366 8.727 9.083 9.438 9.847 10.342 10.809 11.319 11.849 12.384 12.936 13.498 14.024 14.383 14.246 13.686 13.049 12.464 11.865 11.297 10.75 10.225 9.659 9.188 8.768 8.334 7.913 7.518 7.143 6.74 6.385 6.08 5.739 5.361 5.066 4.77 4.447 4.186 3.905 3.603 3.294 2.969 2.748 2.513 2.13 1.855 1.554 1.402 1.102 0.762 0.39 0.193 -0.178 -0.469 -0.689 -0.928 -1.483 -1.787 -2.102 -2.43 -2.818 -3.3 -3.935 -5.557 -2 ,23995 ,KEBNE ,16723978,Sun Nov 28 04:35:37 CET,Sun Nov 28 06:26:21 CET,0.0 0.316 0.555 0.782 0.981 1.174 1.362 1.552 1.91 2.069 2.207 2.294 2.57 2.693 2.92 3.127 3.319 3.413 3.605 3.797 4.074 4.246 4.42 4.673 4.918 5.147 5.358 5.558 5.821 6.076 6.318 6.61 6.885 7.141 7.433 7.764 8.073 8.409 8.762 9.125 9.505 9.904 10.361 10.803 11.293 11.843 12.4 12.889 13.372 13.807 13.99 13.676 13.118 12.54 11.961 11.373 10.803 10.191 9.637 9.052 8.484 7.982 7.512 7.055 6.617 6.215 5.789 5.412 5.073 4.7 4.313 3.971 3.603 3.227 2.937 2.639 2.332 1.994 1.648 1.426 1.194 0.815 0.524 0.202 0.047 -0.267 -0.596 -0.931 -1.109 -1.458 -1.727 -1.962 -2.216 -2.79 -3.1 -3.395 -3.727 -4.156 -4.638 -5.286 -7.038 -3 ,27815 ,KEBNE ,16723979,Sun Nov 28 04:36:37 CET,Sun Nov 28 06:26:38 CET,0.0 0.551 0.832 1.054 1.263 1.463 1.627 1.781 2.073 2.202 2.331 2.404 2.68 2.788 2.983 3.187 3.395 3.499 3.698 3.883 4.154 4.315 4.469 4.714 4.949 5.163 5.357 5.545 5.799 6.041 6.278 6.56 6.822 7.08 7.382 7.712 8.022 8.35 8.703 9.079 9.47 9.919 10.456 11.017 11.643 12.319 13.063 13.783 14.496 15.165 15.686 15.629 15.176 14.601 14.0 13.375 12.781 12.176 11.629 11.071 10.574 10.116 9.642 9.166 8.698 8.276 7.822 7.407 7.045 6.672 6.304 5.985 5.646 5.309 5.03 4.726 4.416 4.097 3.76 3.522 3.275 2.863 2.575 2.272 2.114 1.808 1.484 1.131 0.94 0.576 0.307 0.084 -0.16 -0.707 -1.011 -1.332 -1.701 -2.126 -2.612 -3.266 -4.634 -4 ,25095 ,KEBNE ,16723980,Sun Nov 28 04:36:38 CET,Sun Nov 28 06:27:39 CET,0.0 0.432 0.715 0.945 1.152 1.328 1.485 1.638 1.927 2.062 2.192 2.29 2.577 2.7 2.941 3.156 3.346 3.439 3.632 3.822 4.097 4.279 4.449 4.691 4.923 5.146 5.36 5.561 5.826 6.076 6.322 6.624 6.911 7.178 7.491 7.856 8.203 8.585 8.998 9.428 9.878 10.38 10.906 11.378 11.934 12.495 13.007 13.571 14.177 14.644 14.856 14.442 13.753 12.982 12.189 11.45 10.76 10.134 9.584 8.987 8.469 7.997 7.549 7.122 6.715 6.345 5.939 5.536 5.181 4.813 4.411 4.09 3.758 3.375 3.06 2.752 2.444 2.109 1.764 1.535 1.291 0.904 0.644 0.383 0.246 -0.048 -0.383 -0.761 -0.962 -1.328 -1.61 -1.846 -2.106 -2.732 -3.073 -3.409 -3.767 -4.211 -4.789 -5.461 -7.246 -5 ,14491 ,KEBNE ,16723981,Sun Nov 28 04:36:38 CET,Sun Nov 28 06:27:19 CET,0.0 0.301 0.599 0.834 1.028 1.199 1.367 1.531 1.822 1.963 2.101 2.195 2.476 2.593 2.834 3.053 3.251 3.353 3.55 3.736 4.01 4.195 4.369 4.606 4.843 5.074 5.287 5.493 5.756 6.012 6.262 6.55 6.825 7.104 7.431 7.795 8.136 8.52 8.948 9.391 9.849 10.357 10.964 11.542 12.147 12.783 13.462 14.12 14.736 15.179 15.415 15.309 14.935 14.444 13.861 13.231 12.605 11.984 11.435 10.888 10.406 9.963 9.515 9.088 8.685 8.282 7.839 7.452 7.122 6.767 6.389 6.085 5.781 5.47 5.206 4.911 4.607 4.273 3.926 3.696 3.455 3.076 2.818 2.545 2.397 2.099 1.793 1.46 1.283 0.942 0.689 0.475 0.242 -0.308 -0.623 -0.949 -1.313 -1.74 -2.229 -2.897 -4.486 -6 ,18704 ,KEBNE ,16723982,Sun Nov 28 04:36:38 CET,Sun Nov 28 06:27:43 CET,0.0 0.349 0.593 0.808 1.002 1.198 1.38 1.537 1.822 1.956 2.083 2.158 2.433 2.543 2.77 2.989 3.193 3.29 3.482 3.659 3.93 4.118 4.29 4.525 4.751 4.975 5.185 5.383 5.627 5.864 6.1 6.381 6.649 6.91 7.215 7.555 7.884 8.27 8.697 9.122 9.555 10.03 10.548 11.068 11.636 12.21 12.839 13.505 14.219 14.866 15.175 14.852 14.25 13.638 13.022 12.348 11.71 11.086 10.499 9.905 9.403 8.941 8.447 7.967 7.528 7.124 6.684 6.28 5.943 5.589 5.21 4.891 4.569 4.259 3.996 3.714 3.428 3.123 2.817 2.594 2.346 1.962 1.691 1.403 1.256 0.939 0.603 0.246 0.053 -0.308 -0.57 -0.78 -1.003 -1.513 -1.797 -2.137 -2.533 -2.946 -3.381 -3.924 -5.946 -7 ,11046 ,KEBNE ,16723983,Sun Nov 28 04:37:39 CET,Sun Nov 28 06:29:10 CET,0.0 0.458 0.737 0.98 1.178 1.345 1.519 1.695 1.997 2.133 2.26 2.328 2.599 2.713 2.942 3.161 3.363 3.455 3.646 3.835 4.104 4.277 4.438 4.669 4.905 5.14 5.36 5.569 5.833 6.078 6.32 6.625 6.908 7.173 7.494 7.851 8.189 8.54 8.89 9.272 9.679 10.145 10.685 11.19 11.744 12.307 12.941 13.623 14.264 14.839 15.247 15.175 14.724 14.167 13.639 13.047 12.452 11.922 11.407 10.825 10.312 9.825 9.318 8.821 8.357 7.936 7.497 7.11 6.767 6.396 6.004 5.678 5.352 5.005 4.735 4.463 4.169 3.876 3.576 3.349 3.114 2.759 2.508 2.239 2.091 1.776 1.445 1.091 0.907 0.562 0.297 0.064 -0.179 -0.695 -0.999 -1.341 -1.717 -2.181 -2.726 -3.392 -4.966 -8 ,23425 ,KEBNE ,16723984,Sun Nov 28 04:37:39 CET,Sun Nov 28 06:28:27 CET,0.0 0.423 0.702 0.929 1.134 1.337 1.52 1.68 1.973 2.112 2.236 2.304 2.575 2.69 2.912 3.117 3.323 3.428 3.619 3.803 4.08 4.248 4.406 4.638 4.867 5.096 5.312 5.515 5.786 6.053 6.305 6.613 6.902 7.163 7.468 7.811 8.136 8.506 8.881 9.244 9.614 10.023 10.511 10.991 11.499 12.017 12.586 13.131 13.659 14.206 14.568 14.456 14.027 13.479 12.928 12.374 11.843 11.293 10.77 10.226 9.737 9.261 8.775 8.339 7.941 7.564 7.142 6.761 6.442 6.104 5.709 5.363 5.032 4.704 4.439 4.147 3.825 3.468 3.111 2.867 2.615 2.223 1.952 1.668 1.512 1.167 0.802 0.446 0.271 -0.052 -0.282 -0.486 -0.709 -1.241 -1.546 -1.9 -2.337 -2.825 -3.328 -3.93 -5.595 -9 ,31441 ,KEBNE ,16723985,Sun Nov 28 04:44:50 CET,Sun Nov 28 06:34:23 CET,0.0 0.459 0.748 0.972 1.185 1.381 1.555 1.716 2.018 2.172 2.312 2.399 2.679 2.793 3.01 3.214 3.424 3.531 3.724 3.905 4.172 4.348 4.52 4.763 4.998 5.218 5.423 5.627 5.891 6.145 6.393 6.689 6.964 7.233 7.544 7.881 8.196 8.541 8.913 9.297 9.694 10.145 10.651 11.132 11.673 12.292 12.981 13.691 14.406 15.019 15.496 15.428 14.995 14.383 13.772 13.152 12.537 11.946 11.394 10.843 10.388 9.984 9.556 9.133 8.744 8.38 7.991 7.601 7.251 6.913 6.565 6.261 5.938 5.603 5.345 5.087 4.806 4.503 4.167 3.932 3.704 3.348 3.097 2.842 2.703 2.389 2.059 1.711 1.513 1.141 0.874 0.657 0.419 -0.125 -0.432 -0.753 -1.087 -1.458 -1.91 -2.516 -3.992 -10 ,12799 ,KEBNE ,16723986,Sun Nov 28 04:46:53 CET,Sun Nov 28 06:36:53 CET,0.0 0.553 0.816 1.09 1.315 1.51 1.709 1.901 2.254 2.428 2.598 2.737 3.035 3.184 3.463 3.711 3.939 4.045 4.242 4.443 4.738 4.924 5.102 5.359 5.607 5.838 6.058 6.278 6.562 6.817 7.053 7.353 7.639 7.911 8.232 8.58 8.908 9.266 9.64 10.016 10.411 10.866 11.413 11.953 12.517 13.138 13.809 14.382 14.899 15.357 15.623 15.402 14.878 14.261 13.597 12.909 12.28 11.701 11.182 10.656 10.211 9.789 9.358 8.946 8.558 8.193 7.782 7.388 7.042 6.673 6.267 5.925 5.572 5.201 4.898 4.6 4.307 3.985 3.645 3.416 3.177 2.782 2.502 2.223 2.078 1.758 1.443 1.139 0.965 0.626 0.409 0.185 -0.055 -0.582 -0.898 -1.261 -1.659 -2.061 -2.499 -3.113 -4.687 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index e75287b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25186 ,KEBNE ,16723987,Sun Nov 28 04:46:56 CET,Sun Nov 28 06:15:31 CET,0.0 1.64 2.203 2.648 3.001 3.302 3.577 3.846 4.359 4.594 4.8 5.008 5.415 5.621 6.003 6.327 6.601 6.74 7.005 7.256 7.621 7.837 8.058 8.409 8.717 8.992 9.257 9.498 9.82 10.139 10.429 10.777 11.106 11.422 11.802 12.208 12.592 13.006 13.425 13.861 14.304 14.793 15.332 15.844 16.39 16.946 17.529 18.095 18.563 18.73 18.269 16.826 15.149 13.575 12.153 10.837 9.662 8.613 7.708 6.751 5.932 5.219 4.556 3.933 3.317 2.768 2.188 1.676 1.252 0.809 0.349 -0.038 -0.446 -0.875 -1.212 -1.564 -1.904 -2.25 -2.626 -2.892 -3.165 -3.579 -3.882 -4.194 -4.35 -4.672 -5.006 -5.358 -5.542 -5.938 -6.142 -6.372 -6.614 -7.114 -7.401 -7.739 -8.11 -8.533 -9.005 -9.607 -11.025 -2 ,8869 ,KEBNE ,16723988,Sun Nov 28 04:46:56 CET,Sun Nov 28 06:15:28 CET,0.0 1.988 2.608 3.048 3.437 3.795 4.127 4.423 4.904 5.127 5.346 5.542 5.916 6.092 6.422 6.727 7.012 7.144 7.407 7.652 7.999 8.231 8.465 8.812 9.13 9.413 9.682 9.947 10.276 10.58 10.873 11.235 11.579 11.899 12.26 12.672 13.063 13.477 13.909 14.355 14.813 15.333 15.925 16.476 17.046 17.585 18.132 18.632 19.062 19.17 18.534 17.101 15.518 13.959 12.58 11.354 10.231 9.232 8.357 7.443 6.668 5.98 5.309 4.653 4.056 3.517 2.948 2.453 2.019 1.575 1.119 0.722 0.313 -0.111 -0.447 -0.781 -1.116 -1.46 -1.826 -2.079 -2.337 -2.751 -3.044 -3.357 -3.524 -3.863 -4.209 -4.577 -4.783 -5.219 -5.518 -5.793 -6.076 -6.708 -7.05 -7.403 -7.806 -8.289 -8.88 -9.651 -11.389 -4 ,1644 ,KEBNE ,16723990,Sun Nov 28 04:49:00 CET,Sun Nov 28 06:18:04 CET,0.0 2.106 2.753 3.184 3.545 3.882 4.162 4.423 4.902 5.108 5.316 5.523 5.901 6.073 6.402 6.695 6.967 7.101 7.358 7.609 7.967 8.195 8.417 8.725 9.008 9.284 9.546 9.789 10.11 10.421 10.71 11.059 11.397 11.72 12.086 12.496 12.901 13.339 13.78 14.216 14.659 15.159 15.727 16.275 16.866 17.427 17.975 18.46 18.846 18.948 18.324 16.813 15.237 13.721 12.305 11.016 9.877 8.821 7.88 6.934 6.163 5.481 4.807 4.168 3.573 3.03 2.472 1.975 1.537 1.073 0.604 0.216 -0.193 -0.615 -0.933 -1.261 -1.605 -1.967 -2.351 -2.612 -2.883 -3.308 -3.614 -3.93 -4.092 -4.434 -4.791 -5.162 -5.353 -5.763 -5.991 -6.222 -6.472 -7.008 -7.318 -7.659 -8.016 -8.412 -8.89 -9.451 -10.934 -6 ,4660 ,KEBNE ,16723992,Sun Nov 28 04:53:03 CET,Sun Nov 28 06:28:23 CET,0.0 2.327 3.005 3.559 4.013 4.381 4.715 5.045 5.668 5.947 6.21 6.479 6.874 7.076 7.477 7.838 8.191 8.362 8.673 8.963 9.387 9.644 9.862 10.169 10.454 10.726 11.002 11.274 11.607 11.918 12.218 12.575 12.93 13.264 13.627 14.041 14.443 14.853 15.285 15.757 16.219 16.703 17.271 17.796 18.33 18.86 19.385 19.859 20.236 20.405 19.938 18.673 17.126 15.55 14.095 12.802 11.626 10.515 9.605 8.673 7.865 7.166 6.504 5.887 5.305 4.755 4.17 3.662 3.223 2.761 2.29 1.904 1.498 1.07 0.742 0.397 0.035 -0.34 -0.728 -0.987 -1.255 -1.681 -1.976 -2.295 -2.464 -2.802 -3.15 -3.56 -3.797 -4.245 -4.558 -4.833 -5.111 -5.742 -6.113 -6.511 -6.922 -7.397 -7.981 -8.794 -10.856 -7 ,18259 ,KEBNE ,16723993,Sun Nov 28 04:54:05 CET,Sun Nov 28 06:30:55 CET,0.0 2.203 2.875 3.329 3.717 4.065 4.368 4.644 5.145 5.361 5.565 5.752 6.114 6.276 6.593 6.872 7.143 7.277 7.54 7.79 8.135 8.355 8.567 8.868 9.148 9.432 9.726 10.024 10.43 10.821 11.191 11.599 11.937 12.267 12.632 13.002 13.361 13.766 14.208 14.665 15.115 15.613 16.181 16.715 17.318 17.897 18.453 18.975 19.339 19.419 18.773 17.248 15.664 14.195 12.819 11.504 10.322 9.243 8.311 7.363 6.548 5.83 5.157 4.527 3.93 3.346 2.711 2.147 1.667 1.197 0.717 0.326 -0.059 -0.467 -0.786 -1.111 -1.461 -1.837 -2.216 -2.474 -2.739 -3.161 -3.464 -3.775 -3.949 -4.344 -4.765 -5.21 -5.444 -5.896 -6.217 -6.492 -6.78 -7.423 -7.771 -8.134 -8.533 -8.998 -9.575 -10.351 -12.357 -8 ,12623 ,KEBNE ,16723994,Sun Nov 28 04:55:07 CET,Sun Nov 28 06:30:36 CET,0.0 2.323 2.931 3.368 3.746 4.068 4.36 4.635 5.128 5.355 5.563 5.725 6.079 6.244 6.568 6.867 7.143 7.278 7.543 7.777 8.115 8.341 8.567 8.884 9.173 9.452 9.722 10.009 10.416 10.771 11.074 11.437 11.773 12.112 12.494 12.886 13.251 13.655 14.082 14.509 14.968 15.471 16.032 16.57 17.129 17.692 18.265 18.782 19.255 19.506 18.961 17.486 15.931 14.42 13.056 11.802 10.683 9.675 8.793 7.889 7.091 6.4 5.757 5.144 4.564 4.027 3.474 2.972 2.53 2.068 1.59 1.204 0.807 0.389 0.061 -0.27 -0.603 -0.965 -1.353 -1.617 -1.891 -2.319 -2.62 -2.934 -3.096 -3.418 -3.754 -4.117 -4.304 -4.702 -4.914 -5.143 -5.379 -5.865 -6.17 -6.549 -6.976 -7.454 -8.01 -8.736 -10.596 -9 ,12969 ,KEBNE ,16723995,Sun Nov 28 04:55:07 CET,Sun Nov 28 06:30:37 CET,0.0 2.271 2.92 3.389 3.799 4.14 4.421 4.675 5.154 5.377 5.586 5.78 6.153 6.324 6.643 6.928 7.203 7.342 7.608 7.861 8.222 8.448 8.671 8.992 9.299 9.579 9.837 10.096 10.431 10.745 11.045 11.403 11.74 12.065 12.441 12.844 13.221 13.632 14.058 14.487 14.928 15.427 15.975 16.526 17.126 17.681 18.229 18.737 19.13 19.279 18.786 17.234 15.541 13.991 12.615 11.384 10.266 9.239 8.349 7.427 6.618 5.885 5.199 4.572 3.973 3.416 2.843 2.341 1.909 1.457 0.983 0.588 0.173 -0.258 -0.586 -0.923 -1.269 -1.62 -1.992 -2.266 -2.534 -2.932 -3.219 -3.514 -3.669 -3.983 -4.318 -4.686 -4.877 -5.289 -5.519 -5.748 -5.987 -6.507 -6.81 -7.167 -7.557 -7.967 -8.459 -9.091 -10.465 -10 ,13988 ,KEBNE ,16723996,Sun Nov 28 04:55:07 CET,Sun Nov 28 06:30:46 CET,0.0 2.292 3.191 3.841 4.33 4.724 5.078 5.406 5.996 6.257 6.503 6.776 7.181 7.378 7.75 8.088 8.371 8.505 8.781 9.039 9.37 9.6 9.853 10.201 10.502 10.79 11.073 11.338 11.655 11.956 12.252 12.614 12.984 13.324 13.68 14.065 14.436 14.862 15.319 15.789 16.263 16.774 17.329 17.862 18.419 18.962 19.503 20.023 20.457 20.552 19.931 18.461 16.876 15.342 13.974 12.676 11.53 10.518 9.605 8.699 7.907 7.184 6.503 5.853 5.264 4.735 4.184 3.695 3.256 2.777 2.287 1.891 1.487 1.081 0.767 0.444 0.107 -0.249 -0.619 -0.88 -1.16 -1.605 -1.916 -2.246 -2.41 -2.744 -3.09 -3.446 -3.634 -4.031 -4.247 -4.47 -4.694 -5.174 -5.464 -5.822 -6.223 -6.65 -7.139 -7.784 -9.477 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt deleted file mode 100644 index 94136014..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29216 ,KEBNE ,16723997,Sun Nov 28 04:55:07 CET,Sun Nov 28 06:35:05 CET,0.0 2.52 3.517 4.188 4.681 5.127 5.527 5.893 6.561 6.869 7.163 7.382 7.942 8.182 8.619 9.027 9.397 9.581 9.955 10.299 10.784 11.101 11.399 11.828 12.238 12.629 13.007 13.372 13.855 14.322 14.77 15.292 15.764 16.207 16.738 17.349 17.924 18.539 19.193 19.876 20.542 21.286 22.191 23.047 23.989 24.985 26.083 27.252 28.459 29.544 30.24 30.215 29.581 28.711 27.836 26.954 26.078 25.247 24.488 23.716 23.037 22.414 21.82 21.249 20.687 20.161 19.62 19.145 18.723 18.261 17.754 17.337 16.908 16.442 16.088 15.728 15.319 14.876 14.458 14.169 13.845 13.351 13.012 12.658 12.483 12.11 11.687 11.25 11.024 10.494 10.26 9.987 9.695 8.994 8.6 8.18 7.727 7.174 6.539 5.673 2.215 -2 ,5648 ,KEBNE ,16723998,Sun Nov 28 04:55:07 CET,Sun Nov 28 06:35:14 CET,0.0 3.452 4.429 5.172 5.753 6.253 6.699 7.088 7.779 8.09 8.371 8.606 9.175 9.432 9.929 10.427 10.903 11.125 11.541 11.932 12.516 12.896 13.25 13.754 14.226 14.668 15.134 15.597 16.121 16.575 17.005 17.523 18.025 18.488 19.014 19.633 20.232 20.891 21.674 22.531 23.408 24.459 25.655 26.699 27.844 29.115 30.503 31.914 33.416 34.788 35.693 35.692 35.143 34.361 33.506 32.625 31.745 30.883 30.102 29.292 28.553 27.882 27.252 26.607 25.986 25.418 24.796 24.227 23.723 23.186 22.618 22.138 21.64 21.145 20.769 20.372 19.942 19.488 19.012 18.687 18.335 17.779 17.406 17.008 16.793 16.346 15.887 15.376 15.091 14.499 14.14 13.794 13.428 12.651 12.235 11.785 11.28 10.694 9.993 9.166 7.086 -3 ,7045 ,KEBNE ,16723999,Sun Nov 28 04:55:11 CET,Sun Nov 28 06:33:06 CET,0.0 2.245 3.107 3.782 4.372 4.884 5.328 5.741 6.493 6.847 7.164 7.419 7.991 8.248 8.742 9.218 9.668 9.89 10.331 10.74 11.305 11.66 12.017 12.571 13.091 13.585 14.072 14.562 15.194 15.778 16.346 17.018 17.615 18.179 18.858 19.627 20.331 21.069 21.868 22.737 23.65 24.681 25.817 26.896 28.081 29.249 30.581 32.062 33.538 35.001 36.015 35.741 34.795 33.637 32.451 31.286 30.2 29.101 28.168 27.245 26.366 25.567 24.805 24.107 23.427 22.743 22.032 21.396 20.845 20.29 19.706 19.226 18.722 18.174 17.762 17.344 16.902 16.44 15.949 15.606 15.251 14.684 14.282 13.857 13.638 13.2 12.727 12.195 11.925 11.36 11.04 10.708 10.357 9.568 9.116 8.646 8.136 7.564 6.822 5.782 1.832 -5 ,157 ,KEBNE ,16724001,Sun Nov 28 04:56:09 CET,Sun Nov 28 06:36:25 CET,0.0 2.473 3.283 3.805 4.252 4.678 5.055 5.404 6.064 6.362 6.638 6.823 7.362 7.59 8.006 8.387 8.769 8.983 9.416 9.827 10.417 10.783 11.143 11.703 12.246 12.742 13.243 13.723 14.318 14.903 15.482 16.173 16.805 17.433 18.156 18.963 19.752 20.561 21.384 22.308 23.313 24.395 25.553 26.613 27.803 29.047 30.454 31.927 33.357 34.688 35.423 34.801 33.729 32.585 31.405 30.252 29.113 28.028 27.006 25.981 25.133 24.336 23.567 22.774 22.014 21.379 20.723 20.1 19.53 19.007 18.526 18.111 17.685 17.262 16.92 16.546 16.16 15.749 15.313 15.019 14.71 14.194 13.828 13.453 13.251 12.836 12.408 11.943 11.698 11.158 10.951 10.674 10.376 9.708 9.335 8.936 8.471 7.933 7.209 6.216 1.16 -6 ,28476 ,KEBNE ,16724002,Sun Nov 28 04:56:09 CET,Sun Nov 28 06:36:06 CET,0.0 1.926 2.737 3.289 3.775 4.208 4.597 4.953 5.58 5.855 6.137 6.4 6.952 7.188 7.63 8.024 8.413 8.606 8.957 9.294 9.804 10.131 10.437 10.864 11.27 11.662 12.043 12.395 12.838 13.293 13.751 14.299 14.797 15.253 15.784 16.39 16.961 17.582 18.215 18.845 19.512 20.248 21.118 21.996 22.958 23.978 25.075 26.198 27.38 28.578 29.578 29.534 28.861 28.036 27.166 26.328 25.528 24.71 23.951 23.16 22.493 21.897 21.276 20.681 20.115 19.586 19.02 18.52 18.082 17.607 17.128 16.722 16.283 15.82 15.46 15.07 14.657 14.248 13.814 13.511 13.199 12.674 12.279 11.849 11.63 11.185 10.676 10.151 9.907 9.354 9.042 8.72 8.385 7.627 7.177 6.735 6.282 5.687 4.968 4.035 0.285 -7 ,16330 ,KEBNE ,16724003,Sun Nov 28 04:56:09 CET,Sun Nov 28 06:36:49 CET,0.0 2.348 3.194 3.89 4.531 5.096 5.55 5.971 6.715 7.06 7.41 7.734 8.318 8.579 9.068 9.558 10.047 10.279 10.719 11.154 11.796 12.205 12.579 13.124 13.649 14.124 14.55 14.94 15.421 15.879 16.319 16.825 17.301 17.75 18.271 18.875 19.447 20.049 20.694 21.398 22.127 22.918 23.778 24.635 25.671 26.735 27.811 28.958 30.148 31.198 31.904 31.802 31.094 30.19 29.271 28.306 27.424 26.574 25.761 24.932 24.23 23.604 22.987 22.373 21.792 21.239 20.62 20.072 19.627 19.165 18.632 18.18 17.701 17.183 16.785 16.381 15.97 15.518 15.019 14.678 14.321 13.753 13.369 12.969 12.75 12.303 11.87 11.409 11.151 10.585 10.306 9.997 9.67 8.92 8.489 8.039 7.536 6.986 6.327 5.437 3.11 -8 ,21955 ,KEBNE ,16724004,Sun Nov 28 04:56:09 CET,Sun Nov 28 06:36:00 CET,0.0 2.549 3.336 4.011 4.608 5.121 5.594 6.021 6.777 7.118 7.431 7.685 8.25 8.509 9.004 9.459 9.876 10.077 10.482 10.895 11.464 11.812 12.144 12.62 13.085 13.536 13.973 14.39 14.936 15.438 15.899 16.481 17.057 17.642 18.319 19.097 19.858 20.627 21.464 22.314 23.171 24.137 25.228 26.306 27.461 28.735 30.155 31.641 33.193 34.543 35.471 35.211 34.354 33.254 32.091 30.929 29.794 28.686 27.653 26.576 25.695 24.981 24.332 23.743 23.188 22.673 22.137 21.627 21.172 20.688 20.147 19.685 19.215 18.73 18.381 18.027 17.631 17.214 16.769 16.451 16.126 15.62 15.264 14.887 14.684 14.263 13.843 13.412 13.185 12.666 12.442 12.15 11.857 11.238 10.867 10.448 9.959 9.426 8.858 8.086 5.49 -9 ,30030 ,KEBNE ,16724005,Sun Nov 28 04:56:09 CET,Sun Nov 28 06:36:03 CET,0.0 2.383 3.259 3.966 4.561 5.105 5.591 6.026 6.754 7.09 7.389 7.556 8.102 8.323 8.75 9.161 9.541 9.717 10.053 10.377 10.833 11.128 11.428 11.869 12.285 12.67 13.052 13.437 13.91 14.354 14.793 15.312 15.786 16.25 16.774 17.347 17.896 18.494 19.122 19.783 20.492 21.311 22.245 23.158 24.191 25.24 26.367 27.537 28.696 29.646 30.317 30.211 29.55 28.703 27.789 26.832 25.917 25.045 24.247 23.411 22.674 21.969 21.287 20.654 20.043 19.478 18.898 18.366 17.886 17.385 16.861 16.418 15.947 15.458 15.071 14.662 14.235 13.783 13.301 12.968 12.627 12.08 11.716 11.364 11.177 10.77 10.306 9.813 9.571 9.017 8.713 8.406 8.076 7.358 6.959 6.508 6.017 5.463 4.788 3.831 0.176 -10 ,30949 ,KEBNE ,16724006,Sun Nov 28 04:56:10 CET,Sun Nov 28 06:36:25 CET,0.0 2.48 3.296 3.91 4.416 4.843 5.236 5.616 6.328 6.653 6.939 7.161 7.723 7.963 8.426 8.86 9.264 9.457 9.837 10.189 10.696 11.035 11.347 11.807 12.252 12.672 13.07 13.441 13.915 14.374 14.808 15.328 15.84 16.313 16.84 17.443 18.008 18.607 19.243 19.899 20.576 21.325 22.164 22.991 23.98 25.009 26.095 27.249 28.472 29.583 30.293 30.302 29.733 28.973 28.152 27.243 26.401 25.613 24.866 24.087 23.393 22.774 22.155 21.509 20.919 20.415 19.887 19.386 18.934 18.453 17.958 17.566 17.142 16.701 16.355 15.975 15.586 15.188 14.753 14.423 14.08 13.555 13.169 12.757 12.551 12.118 11.665 11.195 10.947 10.407 10.116 9.798 9.469 8.73 8.284 7.8 7.316 6.772 6.101 5.213 2.915 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt deleted file mode 100644 index 78212a34..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31569 ,KEBNE ,16724007,Sun Nov 28 04:56:10 CET,Sun Nov 28 06:35:37 CET,0.0 2.401 3.17 3.754 4.268 4.734 5.16 5.552 6.235 6.538 6.831 7.093 7.666 7.937 8.463 8.938 9.377 9.587 10.006 10.418 10.997 11.364 11.726 12.243 12.748 13.242 13.702 14.154 14.727 15.26 15.793 16.448 17.076 17.681 18.372 19.126 19.828 20.586 21.417 22.289 23.197 24.224 25.419 26.592 27.891 29.286 30.825 32.484 34.165 35.698 36.862 36.832 35.823 34.541 33.227 31.867 30.578 29.395 28.351 27.267 26.321 25.492 24.712 23.964 23.256 22.585 21.857 21.227 20.703 20.13 19.521 19.039 18.549 18.024 17.615 17.2 16.755 16.286 15.81 15.488 15.159 14.644 14.279 13.883 13.686 13.285 12.842 12.385 12.149 11.605 11.364 11.079 10.786 10.15 9.774 9.354 8.907 8.417 7.862 7.131 5.51 -3 ,30200 ,KEBNE ,16724009,Sun Nov 28 04:56:09 CET,Sun Nov 28 06:37:01 CET,0.0 2.516 3.52 4.235 4.838 5.378 5.861 6.306 7.119 7.505 7.882 8.264 8.885 9.197 9.777 10.307 10.821 11.071 11.568 12.039 12.707 13.152 13.573 14.165 14.691 15.159 15.619 16.067 16.642 17.203 17.729 18.347 18.937 19.527 20.229 20.981 21.726 22.559 23.412 24.308 25.226 26.228 27.423 28.58 29.896 31.362 32.976 34.681 36.386 37.911 38.887 38.547 37.432 36.142 34.823 33.482 32.239 31.074 30.018 28.939 28.001 27.158 26.335 25.559 24.833 24.187 23.516 22.893 22.36 21.81 21.224 20.736 20.253 19.718 19.286 18.852 18.405 17.948 17.472 17.141 16.795 16.271 15.915 15.539 15.343 14.932 14.506 14.05 13.806 13.249 13.009 12.733 12.446 11.836 11.476 11.062 10.62 10.078 9.429 8.67 6.493 -4 ,18505 ,KEBNE ,16724010,Sun Nov 28 04:56:09 CET,Sun Nov 28 06:35:42 CET,0.0 2.118 2.908 3.504 4.01 4.463 4.877 5.256 5.944 6.257 6.556 6.832 7.421 7.687 8.171 8.639 9.095 9.311 9.729 10.122 10.681 11.047 11.397 11.906 12.397 12.886 13.352 13.784 14.342 14.888 15.42 16.064 16.692 17.295 17.982 18.735 19.452 20.243 21.08 21.972 22.926 23.964 25.114 26.274 27.598 29.008 30.582 32.273 34.028 35.68 36.74 36.433 35.442 34.216 32.915 31.599 30.362 29.249 28.266 27.214 26.299 25.473 24.671 23.898 23.155 22.476 21.814 21.219 20.682 20.124 19.562 19.096 18.594 18.074 17.675 17.26 16.828 16.388 15.927 15.603 15.266 14.733 14.366 13.979 13.78 13.354 12.898 12.437 12.192 11.642 11.428 11.141 10.82 10.077 9.679 9.266 8.805 8.29 7.684 6.924 5.193 -5 ,24201 ,KEBNE ,16724011,Sun Nov 28 04:56:09 CET,Sun Nov 28 06:36:50 CET,0.0 2.428 3.269 3.905 4.416 4.877 5.286 5.654 6.357 6.675 6.976 7.226 7.786 8.052 8.588 9.06 9.491 9.704 10.129 10.538 11.139 11.521 11.885 12.408 12.884 13.353 13.829 14.289 14.858 15.395 15.933 16.577 17.182 17.783 18.482 19.256 20.004 20.811 21.66 22.557 23.502 24.527 25.676 26.832 28.168 29.6 31.187 32.854 34.587 36.205 37.042 36.64 35.721 34.451 33.161 31.894 30.658 29.458 28.4 27.385 26.48 25.618 24.802 24.044 23.333 22.679 21.982 21.347 20.798 20.226 19.622 19.121 18.611 18.092 17.684 17.251 16.773 16.259 15.753 15.42 15.072 14.505 14.115 13.725 13.525 13.119 12.681 12.205 11.953 11.391 11.158 10.867 10.564 9.928 9.579 9.193 8.77 8.297 7.701 6.823 4.34 -6 ,3135 ,KEBNE ,16724012,Sun Nov 28 04:56:13 CET,Sun Nov 28 06:32:27 CET,0.0 2.399 3.183 3.76 4.257 4.722 5.152 5.533 6.211 6.529 6.831 7.074 7.658 7.931 8.434 8.916 9.379 9.6 10.023 10.427 11.001 11.369 11.73 12.249 12.744 13.214 13.684 14.134 14.687 15.209 15.704 16.318 16.924 17.521 18.211 18.961 19.666 20.475 21.374 22.306 23.251 24.276 25.458 26.641 28.045 29.518 31.062 32.653 34.209 35.731 36.885 36.623 35.53 34.218 32.954 31.643 30.395 29.255 28.248 27.22 26.326 25.521 24.734 23.966 23.245 22.606 21.947 21.317 20.762 20.205 19.624 19.139 18.644 18.134 17.728 17.311 16.869 16.407 15.935 15.605 15.257 14.656 14.249 13.863 13.659 13.24 12.792 12.317 12.078 11.522 11.269 10.97 10.662 9.928 9.467 8.984 8.471 7.874 7.205 6.373 4.268 -8 ,20828 ,KEBNE ,16724014,Sun Nov 28 04:57:10 CET,Sun Nov 28 06:36:32 CET,0.0 2.444 3.28 3.916 4.456 4.913 5.343 5.734 6.415 6.72 7.016 7.281 7.855 8.115 8.6 9.066 9.495 9.699 10.107 10.506 11.074 11.448 11.809 12.318 12.821 13.315 13.796 14.259 14.849 15.415 15.961 16.634 17.279 17.884 18.568 19.334 20.088 20.904 21.758 22.632 23.56 24.62 25.83 27.001 28.312 29.738 31.3 32.944 34.697 36.426 37.557 37.431 36.528 35.243 33.932 32.621 31.397 30.262 29.199 28.122 27.224 26.399 25.601 24.829 24.125 23.508 22.832 22.197 21.637 21.057 20.468 19.985 19.482 18.976 18.571 18.15 17.729 17.28 16.803 16.476 16.13 15.576 15.199 14.809 14.608 14.19 13.76 13.319 13.077 12.527 12.32 12.042 11.748 11.114 10.763 10.375 9.955 9.469 8.88 8.145 6.321 -9 ,23094 ,KEBNE ,16724015,Sun Nov 28 04:57:10 CET,Sun Nov 28 06:37:59 CET,0.0 2.159 2.913 3.47 3.938 4.395 4.807 5.173 5.84 6.152 6.451 6.717 7.296 7.556 8.046 8.518 8.965 9.188 9.621 10.028 10.602 10.962 11.324 11.869 12.375 12.864 13.354 13.816 14.375 14.914 15.454 16.113 16.724 17.3 17.97 18.711 19.436 20.232 21.081 21.978 22.945 24.028 25.19 26.346 27.699 29.13 30.699 32.369 34.097 35.687 36.84 36.619 35.54 34.207 32.845 31.54 30.337 29.168 28.137 27.11 26.187 25.37 24.573 23.786 23.082 22.445 21.759 21.132 20.583 20.021 19.448 18.983 18.496 17.996 17.61 17.193 16.747 16.277 15.806 15.489 15.15 14.614 14.251 13.879 13.677 13.247 12.819 12.368 12.125 11.588 11.385 11.105 10.81 10.16 9.786 9.368 8.908 8.353 7.619 6.674 4.0 -10 ,10273 ,KEBNE ,16724016,Sun Nov 28 04:57:10 CET,Sun Nov 28 06:36:37 CET,0.0 2.02 2.9 3.609 4.163 4.634 5.065 5.457 6.171 6.491 6.799 7.066 7.634 7.893 8.389 8.851 9.295 9.51 9.92 10.324 10.922 11.3 11.659 12.18 12.686 13.172 13.637 14.079 14.643 15.186 15.716 16.349 16.955 17.542 18.22 18.994 19.744 20.545 21.402 22.287 23.175 24.183 25.346 26.465 27.75 29.152 30.703 32.411 34.057 35.513 36.646 36.489 35.497 34.168 32.836 31.517 30.293 29.13 28.081 27.002 26.061 25.219 24.402 23.643 22.936 22.278 21.56 20.906 20.339 19.753 19.173 18.689 18.181 17.638 17.21 16.782 16.352 15.905 15.437 15.104 14.755 14.23 13.872 13.502 13.306 12.88 12.427 11.956 11.712 11.159 10.941 10.654 10.338 9.625 9.229 8.831 8.404 7.9 7.289 6.482 4.376 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt deleted file mode 100644 index e9929f68..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13741 ,KEBNE ,16724017,Sun Nov 28 04:57:11 CET,Sun Nov 28 06:39:03 CET,0.0 1.631 2.33 2.887 3.335 3.704 4.002 4.264 4.733 4.937 5.13 5.284 5.665 5.818 6.108 6.375 6.623 6.744 6.966 7.172 7.458 7.65 7.852 8.137 8.423 8.71 8.957 9.175 9.437 9.66 9.875 10.137 10.375 10.586 10.822 11.075 11.29 11.515 11.749 11.982 12.197 12.388 12.581 12.72 12.79 12.762 12.598 12.186 11.305 9.66 6.512 2.436 -0.967 -3.868 -6.347 -8.52 -10.38 -12.05 -13.456 -14.825 -16.019 -17.08 -18.079 -19.008 -19.861 -20.639 -21.446 -22.171 -22.802 -23.45 -24.123 -24.695 -25.278 -25.877 -26.338 -26.801 -27.282 -27.782 -28.306 -28.674 -29.061 -29.649 -30.061 -30.506 -30.724 -31.15 -31.618 -32.113 -32.369 -32.902 -33.249 -33.553 -33.861 -34.585 -34.981 -35.393 -35.854 -36.384 -37.007 -37.822 -40.065 -2 ,13158 ,KEBNE ,16724018,Sun Nov 28 04:57:11 CET,Sun Nov 28 06:37:49 CET,0.0 1.387 1.985 2.408 2.77 3.086 3.356 3.613 4.085 4.292 4.484 4.632 5.012 5.174 5.469 5.73 5.986 6.13 6.387 6.592 6.896 7.09 7.284 7.565 7.813 8.039 8.255 8.461 8.716 8.945 9.148 9.392 9.638 9.861 10.087 10.349 10.607 10.843 11.049 11.264 11.465 11.653 11.85 11.986 12.064 12.034 11.808 11.306 10.315 8.602 5.52 1.64 -1.615 -4.476 -6.924 -9.063 -10.94 -12.618 -14.027 -15.42 -16.613 -17.665 -18.654 -19.575 -20.42 -21.195 -22.016 -22.73 -23.339 -23.986 -24.654 -25.2 -25.766 -26.341 -26.802 -27.282 -27.773 -28.281 -28.802 -29.164 -29.529 -30.103 -30.508 -30.934 -31.161 -31.612 -32.077 -32.573 -32.838 -33.379 -33.7 -34.008 -34.361 -35.082 -35.448 -35.861 -36.331 -36.867 -37.519 -38.392 -40.744 -3 ,28366 ,KEBNE ,16724019,Sun Nov 28 04:57:10 CET,Sun Nov 28 06:39:02 CET,0.0 1.445 2.002 2.421 2.764 3.056 3.328 3.584 4.027 4.224 4.413 4.559 4.936 5.095 5.383 5.643 5.899 6.02 6.245 6.454 6.741 6.93 7.118 7.392 7.643 7.87 8.099 8.334 8.597 8.828 9.048 9.3 9.538 9.771 10.017 10.263 10.487 10.727 10.97 11.205 11.413 11.605 11.777 11.875 11.911 11.899 11.752 11.322 10.444 8.782 5.715 1.856 -1.432 -4.296 -6.771 -8.894 -10.744 -12.423 -13.823 -15.228 -16.455 -17.524 -18.497 -19.422 -20.295 -21.083 -21.89 -22.612 -23.227 -23.858 -24.523 -25.072 -25.631 -26.213 -26.666 -27.125 -27.611 -28.113 -28.617 -28.975 -29.356 -29.952 -30.364 -30.792 -31.007 -31.445 -31.946 -32.505 -32.803 -33.376 -33.797 -34.149 -34.521 -35.341 -35.812 -36.34 -36.923 -37.576 -38.286 -39.256 -41.946 -4 ,32491 ,KEBNE ,16724020,Sun Nov 28 04:57:10 CET,Sun Nov 28 06:38:36 CET,0.0 1.429 2.023 2.414 2.744 3.066 3.364 3.623 4.084 4.28 4.469 4.602 4.959 5.094 5.345 5.588 5.823 5.929 6.126 6.312 6.56 6.714 6.885 7.136 7.354 7.555 7.737 7.904 8.134 8.358 8.548 8.754 8.943 9.113 9.299 9.492 9.659 9.817 9.953 10.083 10.208 10.296 10.333 10.33 10.245 10.133 9.976 9.505 8.625 7.151 4.239 0.336 -2.974 -5.753 -8.146 -10.296 -12.163 -13.866 -15.317 -16.723 -17.893 -18.927 -19.937 -20.864 -21.706 -22.496 -23.315 -24.026 -24.651 -25.316 -25.984 -26.529 -27.088 -27.665 -28.117 -28.583 -29.058 -29.559 -30.091 -30.455 -30.828 -31.414 -31.823 -32.231 -32.44 -32.914 -33.444 -33.958 -34.219 -34.741 -35.051 -35.363 -35.692 -36.416 -36.786 -37.172 -37.61 -38.119 -38.773 -39.658 -41.976 -5 ,31419 ,KEBNE ,16724021,Sun Nov 28 04:57:10 CET,Sun Nov 28 06:37:53 CET,0.0 2.176 2.936 3.526 3.975 4.357 4.696 5.009 5.569 5.817 6.058 6.294 6.714 6.901 7.279 7.627 7.949 8.103 8.391 8.665 9.073 9.334 9.54 9.793 10.041 10.27 10.476 10.668 10.913 11.141 11.348 11.599 11.851 12.072 12.308 12.573 12.812 13.039 13.26 13.471 13.671 13.866 14.033 14.161 14.247 14.248 14.067 13.566 12.663 11.115 8.134 4.212 0.87 -2.035 -4.514 -6.664 -8.545 -10.223 -11.633 -13.03 -14.26 -15.361 -16.368 -17.286 -18.153 -18.939 -19.746 -20.463 -21.081 -21.714 -22.379 -22.941 -23.525 -24.123 -24.57 -25.038 -25.525 -26.013 -26.517 -26.891 -27.276 -27.872 -28.298 -28.716 -28.926 -29.373 -29.861 -30.353 -30.609 -31.142 -31.476 -31.788 -32.107 -32.797 -33.177 -33.591 -34.034 -34.537 -35.113 -35.87 -37.944 -7 ,14171 ,KEBNE ,16724023,Sun Nov 28 04:58:12 CET,Sun Nov 28 06:38:44 CET,0.0 1.584 2.141 2.573 2.946 3.274 3.559 3.829 4.318 4.53 4.718 4.824 5.191 5.351 5.649 5.926 6.197 6.324 6.561 6.782 7.071 7.258 7.447 7.718 7.962 8.196 8.424 8.62 8.858 9.091 9.312 9.571 9.816 10.041 10.291 10.559 10.794 11.032 11.27 11.494 11.707 11.931 12.098 12.188 12.262 12.203 11.962 11.501 10.6 9.007 5.955 2.008 -1.292 -4.079 -6.477 -8.611 -10.45 -12.099 -13.511 -14.891 -16.083 -17.146 -18.16 -19.113 -19.988 -20.79 -21.63 -22.379 -23.018 -23.682 -24.358 -24.901 -25.473 -26.066 -26.512 -26.973 -27.473 -27.976 -28.481 -28.84 -29.216 -29.803 -30.215 -30.648 -30.867 -31.307 -31.756 -32.244 -32.507 -33.028 -33.331 -33.647 -33.979 -34.663 -35.034 -35.424 -35.853 -36.364 -36.943 -37.68 -39.96 -8 ,10524 ,KEBNE ,16724024,Sun Nov 28 04:58:12 CET,Sun Nov 28 06:38:37 CET,0.0 1.413 1.962 2.372 2.717 3.019 3.282 3.528 3.964 4.149 4.326 4.465 4.837 5.0 5.311 5.597 5.87 5.989 6.213 6.428 6.729 6.919 7.094 7.344 7.602 7.862 8.086 8.287 8.544 8.788 9.015 9.262 9.482 9.69 9.924 10.17 10.409 10.675 10.936 11.173 11.407 11.631 11.806 11.921 12.002 11.976 11.765 11.296 10.451 8.893 5.877 1.915 -1.44 -4.225 -6.659 -8.841 -10.693 -12.334 -13.752 -15.181 -16.398 -17.461 -18.448 -19.372 -20.225 -21.012 -21.839 -22.569 -23.198 -23.846 -24.515 -25.077 -25.651 -26.237 -26.699 -27.171 -27.659 -28.157 -28.669 -29.02 -29.383 -29.944 -30.349 -30.777 -30.99 -31.422 -31.893 -32.399 -32.654 -33.173 -33.487 -33.804 -34.129 -34.844 -35.249 -35.706 -36.195 -36.724 -37.335 -38.15 -40.697 -9 ,18333 ,KEBNE ,16724025,Sun Nov 28 04:58:12 CET,Sun Nov 28 06:38:54 CET,0.0 1.472 2.011 2.449 2.812 3.107 3.384 3.639 4.071 4.284 4.512 4.745 5.169 5.363 5.725 6.067 6.392 6.54 6.815 7.059 7.375 7.561 7.741 8.0 8.249 8.491 8.713 8.922 9.18 9.426 9.656 9.913 10.147 10.371 10.621 10.88 11.112 11.331 11.541 11.753 11.968 12.16 12.305 12.405 12.465 12.453 12.303 11.904 10.995 9.279 6.278 2.395 -0.962 -3.791 -6.25 -8.44 -10.317 -11.99 -13.431 -14.855 -16.052 -17.12 -18.141 -19.092 -19.958 -20.745 -21.577 -22.314 -22.946 -23.602 -24.273 -24.835 -25.418 -26.018 -26.49 -26.985 -27.485 -27.991 -28.514 -28.878 -29.262 -29.847 -30.249 -30.675 -30.892 -31.337 -31.808 -32.302 -32.561 -33.083 -33.405 -33.715 -34.033 -34.705 -35.084 -35.511 -35.981 -36.492 -37.061 -37.836 -40.171 -10 ,2122 ,KEBNE ,16724026,Sun Nov 28 04:58:12 CET,Sun Nov 28 06:38:48 CET,0.0 1.423 1.984 2.42 2.762 3.059 3.328 3.571 4.004 4.19 4.361 4.467 4.829 4.977 5.274 5.557 5.853 6.012 6.314 6.601 6.999 7.239 7.465 7.783 8.055 8.286 8.498 8.69 8.93 9.164 9.387 9.641 9.875 10.096 10.348 10.637 10.887 11.128 11.365 11.579 11.769 11.969 12.149 12.241 12.275 12.226 12.041 11.593 10.707 9.113 6.085 2.232 -1.019 -3.855 -6.286 -8.429 -10.298 -11.969 -13.396 -14.794 -15.974 -17.046 -18.076 -19.031 -19.924 -20.728 -21.562 -22.303 -22.93 -23.571 -24.232 -24.789 -25.369 -25.971 -26.437 -26.907 -27.4 -27.924 -28.477 -28.84 -29.196 -29.779 -30.186 -30.613 -30.836 -31.31 -31.822 -32.362 -32.648 -33.207 -33.615 -33.96 -34.293 -34.972 -35.335 -35.755 -36.233 -36.767 -37.449 -38.327 -40.799 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 28d7970a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8606 ,KEBNE ,16724027,Sun Nov 28 04:59:14 CET,Sun Nov 28 06:37:49 CET,0.0 0.563 0.987 1.352 1.682 1.976 2.24 2.705 2.926 3.139 3.292 3.678 3.853 4.186 4.486 4.777 4.918 5.183 5.44 5.817 6.064 6.306 6.647 6.97 7.299 7.623 7.937 8.347 8.736 9.107 9.547 9.962 10.366 10.84 11.376 11.882 12.435 13.054 13.688 14.362 15.175 16.091 16.978 18.004 19.064 20.19 21.415 22.725 24.04 25.058 24.97 24.292 23.5 22.597 21.663 20.82 20.027 19.304 18.529 17.838 17.191 16.552 15.912 15.293 14.748 14.162 13.604 13.123 12.635 12.103 11.663 11.224 10.743 10.348 9.928 9.506 9.07 8.564 8.194 7.81 7.216 6.805 6.395 6.195 5.769 5.303 4.784 4.501 4.017 3.667 3.368 3.034 2.25 1.79 1.307 0.78 0.074 -0.82 -1.921 -2 ,3900 ,KEBNE ,16724028,Sun Nov 28 04:59:14 CET,Sun Nov 28 06:39:54 CET,0.0 0.601 1.058 1.477 1.846 2.19 2.508 3.048 3.303 3.553 3.793 4.231 4.443 4.842 5.209 5.538 5.694 6.016 6.317 6.696 6.922 7.146 7.482 7.795 8.075 8.357 8.632 8.971 9.308 9.635 10.022 10.39 10.739 11.136 11.579 12.017 12.503 13.033 13.596 14.186 14.845 15.588 16.307 17.11 17.967 18.905 19.918 21.009 22.109 22.994 23.115 22.641 21.962 21.268 20.531 19.793 19.077 18.419 17.725 17.098 16.539 15.988 15.435 14.916 14.438 13.923 13.442 13.033 12.61 12.142 11.746 11.341 10.925 10.593 10.228 9.833 9.416 8.966 8.651 8.328 7.827 7.478 7.1 6.893 6.477 6.03 5.518 5.243 4.771 4.426 4.079 3.694 2.905 2.459 1.955 1.378 0.666 -0.265 -1.541 -3 ,29272 ,KEBNE ,16724029,Sun Nov 28 04:59:14 CET,Sun Nov 28 06:38:57 CET,0.0 0.598 1.07 1.494 1.87 2.217 2.539 3.105 3.363 3.621 3.881 4.293 4.47 4.803 5.111 5.398 5.538 5.827 6.11 6.511 6.766 7.013 7.383 7.734 8.091 8.454 8.811 9.246 9.624 9.979 10.401 10.814 11.224 11.718 12.284 12.804 13.377 13.992 14.615 15.277 16.031 16.882 17.725 18.731 19.8 20.95 22.255 23.663 25.015 26.038 26.061 25.473 24.703 23.836 22.967 22.117 21.271 20.491 19.646 18.874 18.168 17.498 16.867 16.28 15.718 15.098 14.538 14.067 13.58 13.059 12.616 12.143 11.647 11.247 10.834 10.402 9.958 9.469 9.104 8.748 8.196 7.81 7.413 7.18 6.698 6.208 5.675 5.385 4.872 4.409 4.048 3.677 2.804 2.293 1.726 1.114 0.414 -0.52 -1.998 -4 ,16167 ,KEBNE ,16724030,Sun Nov 28 04:59:18 CET,Sun Nov 28 06:37:07 CET,0.0 0.501 0.921 1.287 1.614 1.908 2.158 2.587 2.791 2.979 3.109 3.493 3.648 3.952 4.243 4.513 4.645 4.915 5.179 5.555 5.798 6.032 6.379 6.719 7.051 7.374 7.669 8.044 8.412 8.762 9.189 9.604 10.008 10.483 11.029 11.561 12.131 12.746 13.399 14.075 14.814 15.66 16.54 17.534 18.591 19.812 21.102 22.429 23.706 24.667 24.728 24.2 23.412 22.542 21.607 20.733 19.879 19.053 18.223 17.5 16.835 16.186 15.562 14.984 14.449 13.851 13.309 12.838 12.306 11.772 11.348 10.875 10.378 10.003 9.605 9.187 8.738 8.268 7.949 7.599 7.059 6.678 6.259 6.053 5.615 5.127 4.634 4.369 3.866 3.43 3.081 2.711 1.926 1.463 0.898 0.266 -0.457 -1.437 -2.813 -5 ,17019 ,KEBNE ,16724031,Sun Nov 28 04:59:14 CET,Sun Nov 28 06:37:44 CET,0.0 0.598 1.077 1.49 1.829 2.125 2.398 2.885 3.09 3.268 3.397 3.777 3.933 4.226 4.5 4.764 4.889 5.131 5.375 5.719 5.944 6.168 6.521 6.884 7.225 7.537 7.807 8.137 8.466 8.783 9.168 9.536 9.879 10.28 10.752 11.238 11.75 12.264 12.814 13.403 14.05 14.769 15.468 16.283 17.209 18.328 19.665 21.044 22.26 23.387 23.527 22.834 21.982 21.125 20.213 19.341 18.5 17.688 16.835 16.094 15.418 14.755 14.133 13.55 13.02 12.459 11.939 11.478 10.961 10.407 9.955 9.469 8.954 8.54 8.098 7.66 7.236 6.776 6.442 6.096 5.536 5.127 4.686 4.466 4.038 3.567 3.05 2.766 2.253 1.828 1.509 1.172 0.406 -0.049 -0.576 -1.259 -2.155 -3.162 -4.435 -6 ,11830 ,KEBNE ,16724032,Sun Nov 28 04:59:14 CET,Sun Nov 28 06:37:10 CET,0.0 0.538 0.964 1.329 1.638 1.907 2.155 2.602 2.813 3.013 3.158 3.541 3.719 4.063 4.383 4.673 4.808 5.06 5.302 5.64 5.85 6.064 6.379 6.68 6.97 7.254 7.538 7.92 8.287 8.634 9.041 9.434 9.792 10.197 10.667 11.122 11.614 12.127 12.677 13.233 13.845 14.557 15.249 16.055 16.974 17.966 19.008 20.096 21.135 22.039 22.181 21.702 21.027 20.3 19.507 18.751 18.027 17.345 16.643 16.034 15.448 14.886 14.357 13.838 13.364 12.855 12.383 11.956 11.487 10.99 10.587 10.173 9.724 9.371 9.007 8.62 8.213 7.775 7.46 7.121 6.566 6.198 5.837 5.647 5.237 4.774 4.238 3.945 3.437 2.96 2.588 2.181 1.254 0.74 0.16 -0.462 -1.242 -2.318 -3.901 -7 ,15940 ,KEBNE ,16724033,Sun Nov 28 04:59:14 CET,Sun Nov 28 06:37:34 CET,0.0 0.453 0.813 1.128 1.407 1.67 1.911 2.365 2.588 2.81 2.999 3.398 3.577 3.921 4.256 4.574 4.717 5.0 5.27 5.654 5.915 6.167 6.51 6.833 7.15 7.457 7.757 8.142 8.502 8.863 9.293 9.703 10.12 10.618 11.174 11.691 12.243 12.861 13.538 14.226 14.981 15.844 16.717 17.705 18.755 19.934 21.176 22.411 23.574 24.428 24.422 23.971 23.233 22.384 21.521 20.655 19.805 19.043 18.225 17.463 16.785 16.101 15.415 14.779 14.195 13.606 13.074 12.595 12.113 11.605 11.151 10.632 10.075 9.641 9.198 8.762 8.314 7.838 7.505 7.135 6.543 6.15 5.743 5.544 5.138 4.655 4.12 3.83 3.335 2.961 2.633 2.268 1.43 0.93 0.387 -0.244 -1.05 -2.091 -3.512 -8 ,27297 ,KEBNE ,16724034,Sun Nov 28 04:59:14 CET,Sun Nov 28 06:37:09 CET,0.0 0.668 1.211 1.619 1.987 2.308 2.598 3.157 3.411 3.651 3.888 4.33 4.556 4.972 5.328 5.651 5.806 6.114 6.406 6.826 7.067 7.276 7.584 7.878 8.163 8.435 8.702 9.055 9.378 9.7 10.093 10.46 10.825 11.24 11.715 12.175 12.669 13.182 13.7 14.247 14.891 15.649 16.375 17.181 18.075 19.105 20.196 21.319 22.435 23.318 23.474 23.178 22.613 21.945 21.264 20.573 19.886 19.265 18.581 17.972 17.425 16.903 16.406 15.909 15.433 14.934 14.472 14.04 13.594 13.134 12.744 12.329 11.881 11.52 11.123 10.697 10.257 9.787 9.448 9.101 8.562 8.178 7.773 7.57 7.135 6.634 6.091 5.805 5.295 4.844 4.513 4.144 3.315 2.901 2.428 1.888 1.232 0.308 -1.101 -9 ,29573 ,KEBNE ,16724035,Sun Nov 28 05:00:15 CET,Sun Nov 28 06:37:53 CET,0.0 0.503 0.89 1.247 1.54 1.774 1.996 2.415 2.614 2.802 2.936 3.321 3.474 3.774 4.07 4.355 4.491 4.749 5.009 5.369 5.591 5.802 6.086 6.364 6.641 6.923 7.207 7.557 7.882 8.177 8.531 8.904 9.272 9.692 10.162 10.607 11.098 11.613 12.14 12.685 13.302 14.039 14.847 15.835 16.883 18.008 19.223 20.549 21.843 22.854 22.852 22.376 21.75 21.059 20.348 19.678 19.019 18.381 17.71 17.105 16.54 15.989 15.458 14.967 14.506 14.008 13.538 13.111 12.684 12.246 11.857 11.412 10.924 10.568 10.223 9.849 9.427 8.971 8.657 8.322 7.802 7.455 7.09 6.885 6.448 5.983 5.44 5.149 4.653 4.221 3.867 3.477 2.639 2.195 1.667 1.031 0.289 -0.595 -1.929 -10 ,16 ,KEBNE ,16724036,Sun Nov 28 05:00:16 CET,Sun Nov 28 06:38:12 CET,0.0 0.47 0.85 1.141 1.411 1.656 1.894 2.343 2.548 2.744 2.875 3.251 3.407 3.72 4.012 4.293 4.419 4.664 4.91 5.249 5.478 5.706 6.018 6.325 6.622 6.9 7.164 7.491 7.808 8.12 8.491 8.858 9.233 9.665 10.13 10.565 11.029 11.524 12.063 12.638 13.293 14.071 14.829 15.652 16.524 17.499 18.693 20.147 21.598 22.738 22.742 22.23 21.409 20.451 19.552 18.647 17.75 17.014 16.257 15.533 14.869 14.208 13.573 12.987 12.421 11.793 11.237 10.767 10.268 9.735 9.28 8.801 8.304 7.921 7.54 7.156 6.748 6.288 5.957 5.611 5.081 4.712 4.303 4.079 3.633 3.204 2.741 2.474 1.975 1.59 1.285 0.943 0.125 -0.37 -0.885 -1.446 -2.126 -3.075 -4.403 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt deleted file mode 100644 index ef1821b4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22946 ,KEBNE ,16724037,Sun Nov 28 05:00:19 CET,Sun Nov 28 06:38:42 CET,0.0 2.784 3.629 4.285 4.841 5.335 5.779 6.207 6.96 7.299 7.64 7.99 8.592 8.882 9.424 9.924 10.403 10.634 11.081 11.505 12.102 12.505 12.906 13.457 13.983 14.489 14.973 15.456 16.063 16.627 17.181 17.86 18.502 19.128 19.824 20.559 21.297 22.133 22.995 23.878 24.792 25.821 26.993 28.113 29.316 30.576 31.96 33.403 34.946 36.297 36.865 36.035 34.622 33.038 31.407 29.785 28.34 26.951 25.706 24.471 23.392 22.396 21.411 20.503 19.694 18.928 18.115 17.412 16.803 16.15 15.45 14.86 14.243 13.629 13.172 12.69 12.172 11.629 11.066 10.675 10.259 9.609 9.175 8.692 8.438 7.941 7.408 6.821 6.526 5.939 5.604 5.276 4.919 4.1 3.623 3.106 2.583 1.992 1.239 0.184 -4.046 -3 ,28862 ,KEBNE ,16724039,Sun Nov 28 05:00:16 CET,Sun Nov 28 06:40:34 CET,0.0 2.722 3.655 4.323 4.876 5.367 5.829 6.265 7.05 7.419 7.774 8.142 8.744 9.033 9.575 10.067 10.563 10.803 11.26 11.693 12.295 12.679 13.053 13.597 14.125 14.636 15.142 15.625 16.24 16.828 17.379 18.046 18.703 19.325 20.026 20.784 21.502 22.295 23.117 23.971 24.847 25.867 27.068 28.227 29.537 30.866 32.251 33.666 35.048 36.269 36.874 36.11 34.73 33.304 31.914 30.447 29.038 27.745 26.555 25.292 24.186 23.202 22.263 21.394 20.598 19.839 19.015 18.286 17.666 17.019 16.339 15.766 15.165 14.537 14.046 13.527 12.987 12.427 11.841 11.436 11.021 10.374 9.929 9.473 9.238 8.76 8.227 7.639 7.325 6.705 6.305 5.927 5.536 4.707 4.233 3.709 3.121 2.402 1.521 0.507 -2.685 -4 ,15186 ,KEBNE ,16724040,Sun Nov 28 05:00:16 CET,Sun Nov 28 06:41:41 CET,0.0 2.603 3.58 4.389 5.034 5.573 6.066 6.495 7.237 7.571 7.907 8.26 8.877 9.161 9.711 10.235 10.738 10.978 11.442 11.936 12.651 13.077 13.482 14.059 14.604 15.118 15.602 16.076 16.705 17.317 17.888 18.586 19.263 19.899 20.614 21.399 22.155 22.993 23.888 24.778 25.675 26.662 27.737 28.731 29.853 30.995 32.077 33.05 33.952 34.652 34.535 33.488 32.179 30.721 29.234 27.748 26.324 24.99 23.887 22.73 21.653 20.737 19.797 18.781 17.828 16.992 16.129 15.373 14.745 14.112 13.468 12.938 12.375 11.773 11.301 10.819 10.322 9.816 9.288 8.902 8.505 7.901 7.477 7.016 6.785 6.311 5.795 5.26 4.975 4.376 3.984 3.622 3.25 2.486 2.09 1.642 1.103 0.471 -0.293 -1.373 -5.043 -5 ,3628 ,KEBNE ,16724041,Sun Nov 28 05:00:16 CET,Sun Nov 28 06:40:29 CET,0.0 2.218 3.118 3.835 4.428 4.94 5.428 5.883 6.647 6.987 7.329 7.679 8.281 8.562 9.101 9.639 10.138 10.368 10.829 11.276 11.905 12.304 12.692 13.256 13.78 14.281 14.789 15.272 15.863 16.443 17.013 17.675 18.309 18.919 19.587 20.343 21.099 21.913 22.764 23.649 24.557 25.546 26.616 27.647 28.848 30.162 31.511 32.857 34.224 35.385 36.15 35.547 34.072 32.387 30.759 29.205 27.773 26.428 25.228 23.998 22.886 21.858 20.904 19.999 19.137 18.326 17.478 16.732 16.085 15.407 14.681 14.071 13.441 12.773 12.251 11.723 11.179 10.635 10.089 9.713 9.319 8.673 8.198 7.709 7.457 6.911 6.333 5.74 5.426 4.812 4.437 4.058 3.641 2.729 2.239 1.745 1.2 0.59 -0.147 -1.202 -5.247 -6 ,22124 ,KEBNE ,16724042,Sun Nov 28 05:00:16 CET,Sun Nov 28 06:41:12 CET,0.0 2.115 3.034 3.729 4.35 4.89 5.337 5.749 6.486 6.814 7.137 7.468 8.059 8.33 8.865 9.359 9.819 10.05 10.51 10.955 11.581 11.971 12.353 12.918 13.448 13.945 14.422 14.893 15.528 16.143 16.716 17.37 17.964 18.542 19.229 19.99 20.713 21.518 22.405 23.339 24.275 25.279 26.425 27.589 28.852 30.101 31.455 32.889 34.349 35.661 36.246 35.395 33.979 32.326 30.715 29.215 27.807 26.486 25.32 24.123 23.053 22.081 21.137 20.249 19.406 18.64 17.87 17.184 16.558 15.89 15.219 14.674 14.099 13.499 13.037 12.543 12.032 11.51 10.971 10.608 10.235 9.609 9.174 8.731 8.49 7.993 7.485 6.948 6.656 6.043 5.662 5.312 4.937 4.145 3.709 3.213 2.661 2.077 1.359 0.325 -2.595 -7 ,29969 ,KEBNE ,16724043,Sun Nov 28 05:00:16 CET,Sun Nov 28 06:40:19 CET,0.0 2.757 3.876 4.656 5.309 5.84 6.267 6.67 7.447 7.81 8.146 8.448 9.033 9.314 9.851 10.362 10.859 11.095 11.536 11.963 12.563 12.937 13.304 13.824 14.325 14.823 15.316 15.797 16.404 16.999 17.574 18.225 18.855 19.484 20.202 20.978 21.691 22.487 23.349 24.263 25.197 26.187 27.332 28.476 29.704 30.993 32.431 33.851 35.139 36.182 36.733 35.994 34.534 32.959 31.475 29.98 28.524 27.206 26.073 24.866 23.802 22.797 21.798 20.865 19.996 19.201 18.376 17.63 17.005 16.343 15.614 15.003 14.395 13.784 13.291 12.78 12.251 11.689 11.117 10.733 10.337 9.726 9.292 8.827 8.582 8.076 7.541 6.936 6.618 6.007 5.606 5.222 4.827 3.974 3.487 2.947 2.381 1.773 1.066 0.092 -2.678 -8 ,32449 ,KEBNE ,16724044,Sun Nov 28 05:00:16 CET,Sun Nov 28 06:40:30 CET,0.0 3.551 4.398 5.022 5.617 6.128 6.563 6.965 7.717 8.078 8.416 8.74 9.335 9.62 10.168 10.685 11.168 11.403 11.878 12.324 12.954 13.352 13.735 14.304 14.836 15.334 15.804 16.271 16.894 17.504 18.074 18.705 19.319 19.931 20.601 21.359 22.101 22.875 23.718 24.594 25.485 26.516 27.689 28.797 30.018 31.293 32.688 34.172 35.631 36.86 37.414 36.583 35.251 33.779 32.319 30.877 29.463 28.094 26.9 25.683 24.601 23.609 22.677 21.788 20.965 20.228 19.437 18.694 18.055 17.418 16.738 16.161 15.575 14.946 14.447 13.935 13.406 12.846 12.247 11.834 11.408 10.741 10.276 9.79 9.533 8.988 8.425 7.863 7.568 6.951 6.57 6.233 5.875 5.078 4.652 4.186 3.65 3.046 2.372 1.349 -2.315 -9 ,27078 ,KEBNE ,16724045,Sun Nov 28 05:00:16 CET,Sun Nov 28 06:40:26 CET,0.0 3.718 4.659 5.351 5.928 6.441 6.912 7.368 8.16 8.523 8.871 9.189 9.803 10.11 10.674 11.195 11.687 11.911 12.343 12.782 13.418 13.826 14.212 14.766 15.303 15.795 16.259 16.716 17.323 17.887 18.422 19.068 19.706 20.342 21.065 21.865 22.598 23.361 24.193 25.06 25.914 26.899 28.055 29.163 30.415 31.746 33.172 34.629 36.091 37.357 37.906 37.099 35.711 34.197 32.683 31.111 29.617 28.257 27.071 25.817 24.742 23.778 22.861 22.021 21.223 20.462 19.639 18.907 18.292 17.67 16.981 16.353 15.705 15.052 14.562 14.05 13.519 12.966 12.377 11.97 11.569 10.971 10.537 10.078 9.849 9.377 8.906 8.401 8.114 7.501 7.118 6.768 6.415 5.667 5.233 4.772 4.264 3.631 2.901 1.919 -1.407 -10 ,12240 ,KEBNE ,16724046,Sun Nov 28 05:00:16 CET,Sun Nov 28 06:40:53 CET,0.0 2.891 3.792 4.498 5.103 5.654 6.164 6.626 7.487 7.868 8.197 8.534 9.149 9.441 10.003 10.533 11.023 11.262 11.715 12.134 12.732 13.14 13.537 14.065 14.568 15.065 15.548 16.013 16.607 17.178 17.717 18.353 18.975 19.584 20.277 21.077 21.83 22.638 23.507 24.404 25.344 26.39 27.573 28.756 30.065 31.402 32.871 34.338 35.732 36.841 37.326 36.585 35.277 33.734 32.175 30.705 29.25 27.876 26.691 25.437 24.35 23.383 22.46 21.57 20.716 19.949 19.155 18.447 17.837 17.212 16.568 16.012 15.45 14.84 14.327 13.812 13.275 12.718 12.174 11.804 11.417 10.796 10.335 9.834 9.567 9.046 8.512 7.934 7.627 7.006 6.629 6.28 5.902 5.051 4.58 4.059 3.492 2.877 2.128 1.123 -2.334 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index 9c497d3a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2433 ,KEBNE ,16724047,Sun Nov 28 05:01:17 CET,Sun Nov 28 06:41:42 CET,0.0 1.605 2.408 3.018 3.571 4.082 4.552 4.983 5.766 6.125 6.47 6.776 7.427 7.738 8.269 8.734 9.171 9.375 9.786 10.2 10.775 11.143 11.506 12.036 12.53 13.0 13.47 13.921 14.501 15.079 15.636 16.29 16.941 17.568 18.297 19.141 19.915 20.752 21.66 22.615 23.638 24.788 26.114 27.403 28.867 30.502 32.415 34.531 36.906 39.633 42.713 44.918 45.952 46.466 46.581 46.426 46.177 45.851 45.475 45.087 44.704 44.289 43.887 43.449 42.988 42.522 42.003 41.537 41.109 40.673 40.239 39.859 39.432 38.969 38.629 38.289 37.9 37.495 37.082 36.785 36.476 35.978 35.639 35.292 35.108 34.723 34.31 33.857 33.619 33.076 32.843 32.538 32.227 31.562 31.173 30.733 30.263 29.725 29.008 28.069 25.599 -2 ,4372 ,KEBNE ,16724048,Sun Nov 28 05:01:17 CET,Sun Nov 28 06:41:32 CET,0.0 1.53 2.327 2.985 3.535 4.053 4.521 4.93 5.668 6.01 6.343 6.639 7.257 7.543 8.114 8.654 9.134 9.364 9.815 10.219 10.791 11.163 11.523 12.039 12.55 13.024 13.483 13.948 14.542 15.124 15.687 16.362 17.022 17.651 18.368 19.169 19.964 20.839 21.719 22.632 23.618 24.735 26.039 27.365 28.914 30.614 32.502 34.55 36.878 39.554 42.695 45.055 46.134 46.542 46.588 46.488 46.283 45.961 45.565 45.109 44.72 44.352 43.932 43.444 42.929 42.48 42.032 41.573 41.174 40.803 40.399 40.021 39.593 39.13 38.768 38.404 38.03 37.626 37.192 36.891 36.576 36.077 35.726 35.349 35.151 34.746 34.318 33.866 33.626 33.061 32.806 32.515 32.226 31.577 31.182 30.753 30.241 29.597 28.811 27.702 24.555 -3 ,21179 ,KEBNE ,16724049,Sun Nov 28 05:01:17 CET,Sun Nov 28 06:42:33 CET,0.0 1.721 2.584 3.226 3.782 4.295 4.755 5.19 5.972 6.331 6.689 7.035 7.684 7.957 8.456 8.983 9.494 9.738 10.216 10.664 11.305 11.707 12.074 12.595 13.1 13.593 14.064 14.521 15.107 15.672 16.229 16.9 17.546 18.164 18.9 19.723 20.501 21.349 22.284 23.266 24.268 25.373 26.639 27.922 29.464 31.197 33.104 35.225 37.635 40.348 43.408 45.615 46.579 47.031 47.228 47.237 47.031 46.669 46.329 45.963 45.543 45.076 44.552 44.022 43.563 43.158 42.706 42.264 41.86 41.415 40.928 40.53 40.125 39.68 39.324 38.962 38.571 38.137 37.686 37.396 37.093 36.579 36.21 35.814 35.605 35.176 34.735 34.265 34.016 33.463 33.202 32.89 32.567 31.879 31.486 31.054 30.571 30.019 29.345 28.458 25.503 -4 ,28060 ,KEBNE ,16724050,Sun Nov 28 05:01:17 CET,Sun Nov 28 06:41:19 CET,0.0 1.722 2.494 3.103 3.591 4.013 4.39 4.743 5.372 5.66 5.946 6.133 6.72 6.968 7.45 7.917 8.374 8.601 9.035 9.447 10.049 10.441 10.822 11.359 11.873 12.377 12.844 13.295 13.894 14.477 15.033 15.68 16.312 16.924 17.646 18.479 19.247 20.081 20.991 21.95 22.939 24.042 25.325 26.642 28.186 29.819 31.7 33.827 36.257 39.061 42.232 44.544 45.682 46.256 46.429 46.329 46.104 45.825 45.503 45.088 44.654 44.235 43.826 43.411 42.992 42.549 42.068 41.66 41.279 40.875 40.439 40.025 39.563 39.063 38.67 38.277 37.883 37.459 36.997 36.677 36.352 35.868 35.521 35.153 34.965 34.553 34.1 33.628 33.384 32.818 32.581 32.29 31.978 31.299 30.927 30.501 30.038 29.503 28.805 27.88 25.373 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt deleted file mode 100644 index 980de62c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8555 ,KEBNE ,16724057,Sun Nov 28 05:01:17 CET,Sun Nov 28 06:42:28 CET,0.0 2.952 3.784 4.428 4.992 5.478 5.918 6.351 7.144 7.504 7.86 8.202 8.832 9.107 9.648 10.18 10.695 10.95 11.465 11.939 12.588 13.002 13.415 14.032 14.642 15.225 15.754 16.262 16.932 17.62 18.295 19.096 19.888 20.642 21.511 22.471 23.372 24.372 25.453 26.612 27.828 29.195 30.827 32.487 34.43 36.578 38.966 41.676 44.833 48.243 51.866 54.218 54.953 55.071 54.866 54.419 53.88 53.31 52.725 52.039 51.422 50.856 50.293 49.731 49.209 48.74 48.212 47.72 47.296 46.847 46.374 45.97 45.532 45.077 44.73 44.335 43.897 43.466 42.999 42.643 42.284 41.713 41.295 40.857 40.631 40.182 39.7 39.202 38.95 38.382 38.092 37.762 37.399 36.587 36.128 35.652 35.165 34.599 33.908 32.897 29.776 -2 ,27078 ,KEBNE ,16724058,Sun Nov 28 05:01:18 CET,Sun Nov 28 06:42:45 CET,0.0 2.61 3.494 4.179 4.785 5.35 5.88 6.35 7.161 7.526 7.868 8.209 8.868 9.176 9.772 10.338 10.891 11.145 11.642 12.166 12.946 13.443 13.906 14.587 15.241 15.867 16.465 17.044 17.789 18.492 19.143 19.91 20.684 21.454 22.372 23.395 24.352 25.391 26.487 27.699 29.019 30.458 32.112 33.729 35.585 37.728 40.262 43.048 46.069 49.385 52.864 54.935 55.784 55.999 55.713 55.189 54.624 54.025 53.411 52.754 52.15 51.565 51.012 50.46 49.906 49.365 48.797 48.306 47.866 47.386 46.878 46.467 46.049 45.6 45.238 44.84 44.379 43.874 43.368 43.014 42.658 42.108 41.711 41.3 41.093 40.68 40.226 39.725 39.464 38.883 38.589 38.259 37.908 37.163 36.754 36.297 35.78 35.165 34.433 33.52 30.231 -3 ,12030 ,KEBNE ,16724059,Sun Nov 28 05:01:17 CET,Sun Nov 28 06:42:48 CET,0.0 2.415 3.255 3.933 4.492 4.99 5.424 5.809 6.537 6.894 7.233 7.525 8.17 8.465 9.037 9.595 10.133 10.388 10.868 11.339 12.05 12.499 12.912 13.498 14.073 14.665 15.255 15.805 16.496 17.155 17.778 18.543 19.29 20.027 20.889 21.875 22.824 23.842 24.991 26.244 27.492 28.858 30.499 32.163 34.079 36.172 38.643 41.35 44.293 47.634 51.089 53.185 53.966 54.114 53.955 53.588 53.072 52.494 51.946 51.33 50.739 50.183 49.591 49.005 48.452 47.936 47.395 46.905 46.482 46.019 45.486 45.023 44.562 44.086 43.706 43.303 42.854 42.403 41.954 41.624 41.292 40.798 40.439 40.052 39.846 39.418 38.967 38.476 38.213 37.632 37.339 37.017 36.671 35.933 35.526 35.088 34.605 34.012 33.292 32.35 29.471 -4 ,27549 ,KEBNE ,16724060,Sun Nov 28 05:01:17 CET,Sun Nov 28 06:42:46 CET,0.0 2.381 3.175 3.781 4.329 4.813 5.237 5.67 6.544 6.955 7.307 7.58 8.203 8.482 9.048 9.588 10.101 10.347 10.824 11.269 11.882 12.309 12.744 13.356 13.942 14.505 15.044 15.565 16.282 16.981 17.612 18.369 19.138 19.879 20.704 21.653 22.584 23.603 24.697 25.881 27.155 28.585 30.213 31.873 33.83 36.006 38.514 41.228 44.262 47.59 51.05 53.404 54.335 54.473 54.214 53.712 53.156 52.598 52.048 51.452 50.883 50.304 49.741 49.211 48.693 48.19 47.648 47.15 46.696 46.218 45.724 45.302 44.849 44.353 43.947 43.488 43.023 42.54 41.999 41.644 41.298 40.777 40.403 40.003 39.803 39.363 38.895 38.419 38.155 37.566 37.276 36.971 36.638 35.92 35.521 35.064 34.509 33.816 32.995 32.013 29.033 -5 ,796 ,KEBNE ,16724061,Sun Nov 28 05:01:18 CET,Sun Nov 28 06:42:52 CET,0.0 2.325 3.1 3.73 4.241 4.714 5.173 5.582 6.324 6.676 7.01 7.31 7.953 8.244 8.776 9.256 9.754 10.007 10.485 10.932 11.559 11.967 12.368 12.966 13.539 14.078 14.615 15.146 15.839 16.524 17.186 17.954 18.741 19.531 20.378 21.331 22.251 23.249 24.346 25.529 26.758 28.136 29.805 31.52 33.505 35.656 38.059 40.793 43.968 47.402 51.068 53.412 54.107 54.101 53.809 53.39 52.844 52.22 51.616 50.955 50.362 49.811 49.261 48.704 48.158 47.609 47.038 46.511 46.037 45.58 45.106 44.685 44.242 43.807 43.454 43.046 42.593 42.135 41.658 41.317 40.973 40.414 40.028 39.639 39.422 38.967 38.494 38.005 37.749 37.171 36.861 36.511 36.16 35.425 35.001 34.558 34.075 33.464 32.706 31.798 29.413 -6 ,30667 ,KEBNE ,16724062,Sun Nov 28 05:01:18 CET,Sun Nov 28 06:42:10 CET,0.0 2.449 3.243 3.851 4.378 4.852 5.298 5.742 6.551 6.895 7.22 7.487 8.105 8.39 8.947 9.519 10.063 10.323 10.855 11.333 11.991 12.424 12.858 13.493 14.084 14.677 15.223 15.734 16.42 17.07 17.692 18.479 19.274 20.055 20.939 21.927 22.865 23.865 24.969 26.171 27.424 28.838 30.5 32.138 34.057 36.255 38.744 41.445 44.389 47.636 51.072 53.041 53.7 53.754 53.431 52.995 52.539 51.997 51.443 50.825 50.225 49.633 49.044 48.468 47.925 47.431 46.893 46.397 45.938 45.409 44.817 44.363 43.912 43.411 43.019 42.593 42.177 41.751 41.279 40.952 40.619 40.111 39.754 39.379 39.165 38.672 38.179 37.69 37.434 36.844 36.528 36.192 35.826 35.083 34.693 34.255 33.743 33.145 32.403 31.415 28.285 -7 ,25480 ,KEBNE ,16724063,Sun Nov 28 05:01:17 CET,Sun Nov 28 06:41:53 CET,0.0 1.961 2.862 3.503 4.024 4.498 4.931 5.339 6.087 6.428 6.761 7.082 7.728 8.034 8.617 9.156 9.685 9.942 10.45 10.968 11.709 12.167 12.609 13.235 13.839 14.449 15.025 15.561 16.234 16.897 17.556 18.341 19.092 19.816 20.667 21.632 22.553 23.616 24.768 25.999 27.304 28.702 30.308 31.939 33.866 35.972 38.332 40.904 43.861 47.19 50.694 52.84 53.598 53.705 53.485 53.064 52.54 51.98 51.443 50.845 50.268 49.701 49.103 48.539 48.017 47.508 46.955 46.462 45.993 45.5 45.016 44.613 44.172 43.688 43.307 42.895 42.478 42.028 41.498 41.137 40.778 40.204 39.784 39.356 39.146 38.714 38.238 37.715 37.45 36.885 36.626 36.309 35.933 35.075 34.607 34.088 33.494 32.768 31.948 30.882 26.901 -8 ,19528 ,KEBNE ,16724064,Sun Nov 28 05:02:19 CET,Sun Nov 28 06:42:34 CET,0.0 1.994 2.815 3.466 4.051 4.565 5.009 5.407 6.152 6.519 6.871 7.199 7.843 8.131 8.69 9.232 9.762 10.018 10.505 10.972 11.624 12.031 12.449 13.096 13.705 14.271 14.811 15.326 16.016 16.72 17.433 18.253 18.979 19.717 20.589 21.538 22.455 23.503 24.62 25.831 27.118 28.507 30.156 31.825 33.795 36.028 38.58 41.394 44.524 47.953 51.545 53.689 54.577 54.812 54.603 54.114 53.471 52.805 52.188 51.559 51.005 50.485 49.957 49.429 48.884 48.371 47.849 47.346 46.899 46.41 45.879 45.459 45.027 44.565 44.208 43.835 43.421 42.967 42.508 42.197 41.873 41.367 40.987 40.557 40.323 39.849 39.346 38.801 38.529 37.949 37.636 37.32 36.963 36.094 35.626 35.112 34.533 33.877 33.079 32.034 29.124 -9 ,4791 ,KEBNE ,16724065,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:24 CET,0.0 1.98 2.904 3.611 4.214 4.746 5.218 5.653 6.447 6.825 7.193 7.542 8.187 8.477 9.035 9.566 10.083 10.346 10.828 11.299 12.006 12.451 12.864 13.441 14.015 14.587 15.136 15.644 16.318 16.987 17.612 18.369 19.115 19.837 20.686 21.681 22.647 23.705 24.838 26.019 27.267 28.67 30.303 31.996 33.944 36.071 38.473 41.075 44.104 47.458 50.969 53.182 53.956 54.184 54.044 53.656 53.16 52.584 52.002 51.354 50.753 50.205 49.638 49.055 48.484 47.956 47.415 46.908 46.439 45.98 45.49 45.01 44.529 44.028 43.624 43.237 42.809 42.356 41.904 41.596 41.255 40.698 40.322 39.913 39.704 39.247 38.781 38.289 38.022 37.452 37.157 36.853 36.535 35.804 35.407 34.962 34.431 33.802 33.087 32.132 29.244 -10 ,3703 ,KEBNE ,16724066,Sun Nov 28 05:02:18 CET,Sun Nov 28 06:42:49 CET,0.0 2.065 2.874 3.508 4.019 4.479 4.912 5.33 6.111 6.457 6.791 7.081 7.72 8.023 8.609 9.136 9.634 9.883 10.376 10.852 11.507 11.923 12.354 12.99 13.588 14.192 14.776 15.33 16.031 16.708 17.349 18.115 18.88 19.613 20.444 21.384 22.305 23.302 24.429 25.667 26.916 28.311 29.967 31.623 33.553 35.743 38.257 40.857 43.752 47.098 50.651 52.914 53.687 53.827 53.574 53.098 52.566 51.971 51.38 50.742 50.145 49.566 48.985 48.456 47.959 47.465 46.9 46.397 45.939 45.425 44.867 44.38 43.881 43.36 42.97 42.587 42.168 41.713 41.256 40.948 40.629 40.108 39.718 39.285 39.068 38.63 38.14 37.617 37.355 36.782 36.505 36.206 35.893 35.155 34.739 34.284 33.772 33.151 32.409 31.448 28.705 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 5202a4ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21917 ,KEBNE ,16724067,Sun Nov 28 05:02:18 CET,Sun Nov 28 06:40:32 CET,0.0 1.585 2.244 2.746 3.196 3.632 4.028 4.365 4.977 5.26 5.537 5.787 6.275 6.486 6.883 7.263 7.627 7.803 8.153 8.49 8.975 9.287 9.586 10.02 10.449 10.879 11.294 11.718 12.302 12.839 13.329 13.921 14.505 15.075 15.734 16.486 17.226 18.057 18.965 19.941 20.963 22.128 23.477 24.869 26.541 28.448 30.715 33.318 36.421 40.107 44.592 48.244 50.174 51.089 51.606 51.967 52.146 52.238 52.252 52.159 52.028 51.877 51.686 51.483 51.274 51.07 50.853 50.646 50.445 50.191 49.927 49.707 49.46 49.191 48.967 48.716 48.449 48.178 47.873 47.66 47.441 47.074 46.819 46.544 46.396 46.096 45.751 45.329 45.096 44.666 44.374 44.079 43.762 43.062 42.651 42.183 41.617 40.904 40.033 38.732 32.357 -4 ,30550 ,KEBNE ,16724070,Sun Nov 28 05:02:19 CET,Sun Nov 28 06:40:31 CET,0.0 1.629 2.354 2.904 3.34 3.741 4.1 4.407 4.953 5.192 5.426 5.616 6.093 6.303 6.702 7.099 7.479 7.655 8.001 8.335 8.823 9.151 9.465 9.9 10.327 10.752 11.154 11.537 12.048 12.542 13.026 13.629 14.26 14.913 15.687 16.557 17.384 18.287 19.258 20.329 21.49 22.797 24.301 25.844 27.695 29.787 32.235 34.972 38.163 41.964 46.52 50.226 52.395 53.687 54.442 54.904 55.114 55.205 55.198 55.096 54.983 54.862 54.718 54.551 54.384 54.176 53.938 53.73 53.509 53.282 53.056 52.835 52.577 52.291 52.061 51.804 51.516 51.229 50.918 50.684 50.443 50.057 49.779 49.481 49.325 49.009 48.636 48.21 47.98 47.541 47.252 46.983 46.693 46.035 45.634 45.215 44.739 44.168 43.504 42.373 32.349 -7 ,1442 ,KEBNE ,16724073,Sun Nov 28 05:02:19 CET,Sun Nov 28 06:41:42 CET,0.0 1.587 2.186 2.62 3.0 3.354 3.701 4.007 4.532 4.778 5.021 5.204 5.679 5.881 6.26 6.638 6.998 7.176 7.561 7.968 8.515 8.821 9.124 9.619 10.139 10.642 11.119 11.563 12.111 12.624 13.117 13.729 14.328 14.908 15.594 16.382 17.133 17.934 18.812 19.762 20.775 21.95 23.339 24.758 26.43 28.356 30.597 33.171 36.476 40.56 45.228 48.665 50.345 51.21 51.658 51.844 51.864 51.778 51.637 51.362 51.077 50.772 50.464 50.177 49.86 49.56 49.254 48.953 48.654 48.326 47.997 47.715 47.37 46.967 46.65 46.36 46.081 45.774 45.419 45.157 44.904 44.464 44.125 43.785 43.609 43.244 42.86 42.429 42.191 41.752 41.452 41.166 40.87 40.242 39.836 39.331 38.742 38.017 37.204 35.945 24.479 -8 ,23736 ,KEBNE ,16724074,Sun Nov 28 05:02:18 CET,Sun Nov 28 06:41:39 CET,0.0 1.429 2.032 2.547 3.007 3.382 3.693 4.016 4.613 4.87 5.103 5.259 5.726 5.939 6.364 6.759 7.15 7.342 7.712 8.067 8.575 8.902 9.228 9.704 10.167 10.615 11.045 11.479 12.046 12.592 13.137 13.81 14.449 15.071 15.816 16.66 17.499 18.427 19.418 20.507 21.659 22.983 24.544 26.141 28.064 30.219 32.708 35.57 38.942 42.766 47.231 50.667 52.472 53.638 54.391 54.852 55.102 55.201 55.204 55.148 55.053 54.926 54.795 54.645 54.453 54.239 53.986 53.748 53.547 53.329 53.075 52.84 52.584 52.319 52.105 51.865 51.624 51.372 51.083 50.866 50.597 50.179 49.917 49.628 49.481 49.18 48.834 48.415 48.183 47.751 47.487 47.224 46.937 46.336 45.975 45.497 44.949 44.3 43.471 42.232 36.476 -10 ,29788 ,KEBNE ,16724076,Sun Nov 28 05:02:19 CET,Sun Nov 28 06:40:15 CET,0.0 1.692 2.305 2.792 3.206 3.56 3.852 4.113 4.605 4.841 5.067 5.25 5.737 5.952 6.36 6.75 7.125 7.298 7.641 7.979 8.472 8.788 9.096 9.557 9.987 10.395 10.795 11.213 11.765 12.267 12.75 13.366 13.972 14.535 15.187 15.934 16.661 17.453 18.329 19.302 20.343 21.528 22.941 24.408 26.132 28.062 30.317 32.888 35.936 39.557 43.948 47.486 49.393 50.489 51.155 51.533 51.72 51.8 51.803 51.73 51.599 51.427 51.242 51.049 50.826 50.602 50.344 50.096 49.87 49.596 49.303 49.072 48.809 48.52 48.291 48.038 47.763 47.466 47.145 46.913 46.676 46.3 46.022 45.712 45.54 45.208 44.823 44.402 44.196 43.765 43.461 43.18 42.867 42.174 41.814 41.373 40.806 40.183 39.447 38.365 31.668 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt deleted file mode 100644 index d9af0748..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21776 ,KEBNE ,16724077,Sun Nov 28 05:02:19 CET,Sun Nov 28 06:40:31 CET,0.0 1.434 2.137 2.699 3.176 3.601 3.977 4.339 5.017 5.325 5.62 5.902 6.412 6.644 7.056 7.456 7.843 8.029 8.396 8.769 9.326 9.686 10.031 10.531 11.022 11.5 11.967 12.419 13.005 13.587 14.163 14.849 15.528 16.196 16.973 17.861 18.728 19.711 20.796 21.989 23.273 24.74 26.505 28.328 30.512 33.023 35.977 39.434 43.655 48.869 55.574 61.336 64.887 67.254 68.845 69.945 70.709 71.295 71.709 72.023 72.223 72.336 72.395 72.413 72.402 72.377 72.329 72.26 72.168 72.057 71.945 71.831 71.684 71.509 71.365 71.222 71.052 70.862 70.666 70.518 70.349 70.057 69.844 69.607 69.48 69.221 68.929 68.593 68.417 68.058 67.855 67.64 67.394 66.883 66.574 66.154 65.662 65.099 64.367 63.283 57.043 -2 ,25654 ,KEBNE ,16724078,Sun Nov 28 05:04:21 CET,Sun Nov 28 06:42:44 CET,0.0 1.579 2.183 2.698 3.156 3.566 3.956 4.327 4.928 5.182 5.43 5.64 6.122 6.337 6.768 7.187 7.575 7.765 8.136 8.5 9.029 9.382 9.734 10.237 10.72 11.19 11.665 12.14 12.737 13.305 13.864 14.565 15.253 15.923 16.711 17.615 18.51 19.499 20.592 21.797 23.07 24.517 26.262 28.067 30.213 32.722 35.704 39.136 43.413 48.675 55.181 60.848 64.306 66.553 68.092 69.254 70.086 70.7 71.125 71.4 71.532 71.618 71.687 71.704 71.677 71.617 71.525 71.423 71.332 71.226 71.058 70.909 70.741 70.555 70.421 70.274 70.095 69.888 69.685 69.549 69.388 69.096 68.882 68.624 68.473 68.133 67.756 67.344 67.12 66.701 66.365 66.109 65.87 65.311 64.962 64.517 63.989 63.44 62.789 61.892 56.938 -3 ,2983 ,KEBNE ,16724079,Sun Nov 28 05:04:21 CET,Sun Nov 28 06:43:02 CET,0.0 1.209 1.737 2.213 2.645 3.043 3.401 3.711 4.257 4.514 4.765 4.977 5.454 5.671 6.106 6.521 6.915 7.105 7.48 7.86 8.405 8.755 9.102 9.619 10.138 10.639 11.118 11.577 12.169 12.752 13.312 14.002 14.692 15.362 16.148 17.072 17.982 19.014 20.159 21.349 22.625 24.109 25.834 27.606 29.769 32.223 35.084 38.498 42.718 47.894 54.42 60.147 63.707 66.042 67.592 68.742 69.556 70.062 70.404 70.703 70.881 70.978 71.026 71.062 71.092 71.084 70.996 70.878 70.786 70.698 70.591 70.485 70.359 70.198 70.036 69.86 69.664 69.433 69.199 69.053 68.889 68.587 68.365 68.137 68.023 67.788 67.496 67.142 66.96 66.582 66.31 66.066 65.822 65.296 64.982 64.61 64.165 63.632 62.922 61.83 57.225 -6 ,23853 ,KEBNE ,16724082,Sun Nov 28 05:04:23 CET,Sun Nov 28 06:38:28 CET,0.0 0.922 1.279 1.591 1.877 2.14 2.396 2.643 3.105 3.321 3.541 3.728 4.209 4.424 4.843 5.255 5.65 5.847 6.248 6.628 7.165 7.509 7.852 8.364 8.859 9.335 9.804 10.276 10.89 11.466 12.025 12.718 13.401 14.082 14.876 15.779 16.667 17.644 18.732 19.916 21.169 22.637 24.398 26.236 28.417 30.84 33.729 37.172 41.415 46.622 53.277 59.023 62.504 64.878 66.512 67.698 68.522 69.092 69.514 69.824 70.012 70.131 70.176 70.19 70.186 70.152 70.067 69.965 69.89 69.794 69.675 69.561 69.428 69.27 69.13 68.979 68.809 68.622 68.413 68.255 68.085 67.821 67.615 67.365 67.236 66.966 66.641 66.274 66.092 65.731 65.513 65.288 65.031 64.455 64.098 63.675 63.237 62.75 62.06 60.979 53.873 -7 ,20577 ,KEBNE ,16724083,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:43:28 CET,0.0 1.063 1.489 1.834 2.146 2.428 2.672 2.897 3.355 3.572 3.779 3.929 4.385 4.588 4.983 5.373 5.771 5.964 6.332 6.696 7.23 7.575 7.91 8.395 8.867 9.333 9.797 10.247 10.827 11.399 11.969 12.672 13.35 14.006 14.792 15.703 16.584 17.572 18.667 19.853 21.122 22.591 24.348 26.15 28.335 30.843 33.798 37.262 41.489 46.674 53.243 58.948 62.434 64.714 66.303 67.497 68.372 68.997 69.414 69.697 69.823 69.867 69.857 69.839 69.817 69.762 69.686 69.602 69.499 69.38 69.247 69.115 68.959 68.781 68.645 68.499 68.334 68.157 67.953 67.806 67.637 67.349 67.149 66.932 66.816 66.57 66.281 65.937 65.759 65.375 65.121 64.905 64.65 64.086 63.79 63.423 62.962 62.429 61.731 60.746 55.965 -8 ,19193 ,KEBNE ,16724084,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:44:19 CET,0.0 1.226 1.639 1.99 2.308 2.593 2.873 3.149 3.649 3.883 4.116 4.295 4.77 4.969 5.35 5.739 6.112 6.286 6.623 6.958 7.449 7.773 8.097 8.564 9.024 9.476 9.923 10.375 10.974 11.558 12.124 12.82 13.528 14.232 15.045 15.959 16.856 17.841 18.898 20.055 21.307 22.759 24.48 26.24 28.379 30.859 33.823 37.327 41.539 46.643 53.141 58.825 62.356 64.706 66.28 67.425 68.268 68.894 69.312 69.633 69.852 69.974 70.047 70.095 70.088 70.037 69.946 69.839 69.737 69.616 69.485 69.358 69.197 69.001 68.836 68.652 68.461 68.283 68.08 67.917 67.722 67.403 67.21 67.004 66.886 66.625 66.347 66.044 65.862 65.49 65.252 65.011 64.763 64.171 63.814 63.447 63.006 62.409 61.641 60.585 50.286 -9 ,7226 ,KEBNE ,16724085,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:44:04 CET,0.0 1.233 1.647 1.983 2.313 2.647 2.962 3.244 3.772 4.026 4.281 4.532 5.034 5.261 5.696 6.114 6.497 6.684 7.057 7.422 7.961 8.314 8.644 9.127 9.624 10.111 10.579 11.037 11.642 12.236 12.816 13.538 14.241 14.909 15.703 16.626 17.528 18.519 19.608 20.806 22.075 23.509 25.233 27.014 29.127 31.555 34.464 37.88 42.021 47.133 53.695 59.537 63.083 65.437 67.051 68.159 68.926 69.52 69.94 70.228 70.376 70.455 70.502 70.508 70.501 70.484 70.434 70.366 70.299 70.183 70.021 69.893 69.75 69.588 69.454 69.292 69.125 68.929 68.689 68.532 68.352 68.043 67.83 67.605 67.484 67.237 66.968 66.644 66.462 66.092 65.843 65.604 65.337 64.724 64.399 64.075 63.676 63.137 62.476 61.536 53.692 -10 ,20465 ,KEBNE ,16724086,Sun Nov 28 05:05:24 CET,Sun Nov 28 06:43:46 CET,0.0 1.388 1.923 2.336 2.703 3.044 3.389 3.7 4.256 4.533 4.808 5.092 5.61 5.855 6.338 6.798 7.249 7.468 7.89 8.294 8.88 9.249 9.597 10.11 10.612 11.099 11.568 12.021 12.606 13.179 13.745 14.432 15.094 15.756 16.554 17.453 18.322 19.297 20.382 21.571 22.838 24.3 26.03 27.793 29.918 32.354 35.235 38.65 42.855 47.992 54.568 60.31 63.826 66.167 67.778 68.972 69.787 70.36 70.763 71.077 71.268 71.39 71.474 71.512 71.511 71.484 71.42 71.338 71.257 71.142 71.003 70.874 70.708 70.512 70.355 70.182 69.987 69.787 69.571 69.396 69.218 68.929 68.692 68.448 68.322 68.043 67.76 67.491 67.342 66.984 66.723 66.487 66.248 65.671 65.335 64.953 64.475 63.929 63.16 61.899 56.545 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index 62869f0d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8419 ,KEBNE ,16724087,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:10 CET,0.0 0.711 1.321 1.869 2.39 2.872 3.326 4.188 4.613 5.026 5.357 6.231 6.606 7.337 8.044 8.737 9.073 9.713 10.349 11.295 11.907 12.524 13.432 14.329 15.218 16.072 16.914 18.021 19.113 20.189 21.515 22.822 24.108 25.653 27.432 29.187 31.175 33.366 35.758 38.357 41.364 45.02 48.818 53.382 58.714 65.164 72.83 82.296 94.361 110.517 125.513 135.435 142.529 147.78 151.851 155.027 157.572 159.515 161.258 162.584 163.627 164.515 165.27 165.916 166.451 166.934 167.315 167.605 167.883 168.116 168.282 168.442 168.576 168.649 168.701 168.744 168.757 168.736 168.704 168.658 168.559 168.462 168.329 168.254 168.075 167.873 167.646 167.511 167.062 166.984 166.764 166.504 165.816 165.389 164.913 164.341 163.601 162.636 161.308 -2 ,25000 ,KEBNE ,16724088,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:46:19 CET,0.0 0.753 1.411 2.007 2.541 3.027 3.494 4.381 4.791 5.188 5.493 6.343 6.705 7.426 8.13 8.823 9.161 9.819 10.469 11.439 12.076 12.7 13.61 14.5 15.387 16.265 17.148 18.324 19.454 20.549 21.898 23.229 24.537 26.076 27.844 29.599 31.575 33.742 36.117 38.703 41.696 45.312 49.093 53.662 58.96 65.343 72.985 82.524 94.634 110.92 126.14 136.198 143.25 148.455 152.595 155.755 158.233 160.097 161.752 163.06 164.125 165.026 165.779 166.422 166.949 167.421 167.792 168.074 168.341 168.581 168.737 168.88 169.017 169.099 169.149 169.154 169.098 169.027 168.976 168.901 168.752 168.656 168.558 168.486 168.305 168.068 167.783 167.645 167.216 167.165 166.939 166.718 166.214 165.892 165.489 164.954 164.29 163.403 162.023 -3 ,13526 ,KEBNE ,16724089,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:16 CET,0.0 0.77 1.425 2.002 2.527 3.023 3.495 4.372 4.783 5.185 5.482 6.338 6.716 7.455 8.162 8.845 9.181 9.847 10.499 11.441 12.059 12.677 13.587 14.471 15.33 16.179 17.027 18.139 19.24 20.334 21.664 22.959 24.248 25.783 27.554 29.314 31.297 33.479 35.867 38.423 41.384 44.999 48.758 53.293 58.627 65.114 72.779 82.288 94.449 110.724 125.883 135.966 143.168 148.479 152.577 155.614 157.978 159.87 161.629 162.959 164.003 164.927 165.735 166.406 166.948 167.429 167.795 168.092 168.392 168.657 168.796 168.906 169.04 169.114 169.143 169.15 169.146 169.115 169.072 169.017 168.913 168.808 168.677 168.607 168.435 168.188 167.894 167.754 167.307 167.251 167.032 166.788 166.175 165.802 165.344 164.789 164.118 163.177 161.815 -4 ,26499 ,KEBNE ,16724090,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:44:58 CET,0.0 0.822 1.483 2.053 2.569 3.062 3.537 4.431 4.855 5.267 5.588 6.445 6.817 7.577 8.294 8.975 9.317 9.989 10.635 11.589 12.22 12.853 13.777 14.662 15.542 16.406 17.255 18.374 19.471 20.556 21.909 23.237 24.533 26.057 27.818 29.572 31.538 33.698 36.088 38.691 41.684 45.294 49.077 53.642 58.941 65.322 72.923 82.439 94.536 110.788 125.921 135.886 142.969 148.146 152.17 155.223 157.629 159.536 161.271 162.585 163.638 164.559 165.328 165.943 166.467 166.985 167.364 167.652 167.912 168.141 168.316 168.48 168.601 168.632 168.643 168.648 168.619 168.547 168.479 168.398 168.27 168.174 168.041 167.947 167.707 167.457 167.173 167.022 166.558 166.385 166.118 165.861 165.24 164.867 164.442 163.956 163.396 162.608 161.317 -5 ,17851 ,KEBNE ,16724091,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:14 CET,0.0 0.783 1.448 2.043 2.56 3.046 3.511 4.401 4.826 5.245 5.578 6.448 6.828 7.569 8.276 8.956 9.292 9.955 10.603 11.551 12.175 12.793 13.686 14.557 15.431 16.296 17.149 18.268 19.369 20.459 21.802 23.124 24.43 25.959 27.709 29.442 31.385 33.562 35.959 38.535 41.527 45.157 48.924 53.468 58.78 65.206 72.887 82.482 94.731 111.033 126.196 136.251 143.25 148.313 152.297 155.352 157.779 159.674 161.358 162.624 163.646 164.506 165.212 165.806 166.303 166.767 167.126 167.392 167.645 167.872 168.043 168.192 168.291 168.349 168.383 168.417 168.434 168.391 168.34 168.265 168.146 168.054 167.93 167.858 167.691 167.489 167.253 167.129 166.677 166.639 166.432 166.185 165.582 165.197 164.775 164.238 163.552 162.648 161.204 -6 ,30053 ,KEBNE ,16724092,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:02 CET,0.0 0.792 1.453 2.014 2.53 3.023 3.501 4.421 4.853 5.266 5.605 6.469 6.841 7.579 8.281 8.957 9.301 9.982 10.634 11.599 12.233 12.862 13.792 14.686 15.564 16.431 17.281 18.399 19.516 20.595 21.922 23.254 24.553 26.082 27.841 29.569 31.519 33.674 36.02 38.581 41.58 45.187 48.96 53.536 58.839 65.313 73.0 82.594 94.854 111.128 126.26 136.251 143.303 148.425 152.417 155.524 157.983 159.859 161.592 162.922 163.947 164.862 165.649 166.282 166.793 167.28 167.68 167.963 168.197 168.426 168.592 168.717 168.833 168.905 168.961 168.998 169.009 168.98 168.923 168.858 168.756 168.666 168.537 168.467 168.311 168.092 167.831 167.662 167.185 167.123 166.944 166.752 166.215 165.877 165.466 164.926 164.204 163.2 161.719 -7 ,5804 ,KEBNE ,16724093,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:20 CET,0.0 0.777 1.407 1.945 2.44 2.922 3.391 4.293 4.72 5.125 5.426 6.281 6.651 7.369 8.059 8.744 9.087 9.749 10.406 11.385 12.018 12.644 13.573 14.48 15.366 16.241 17.116 18.263 19.379 20.469 21.823 23.172 24.503 26.07 27.853 29.61 31.584 33.753 36.128 38.701 41.697 45.349 49.155 53.784 59.156 65.584 73.25 82.906 95.223 111.731 127.113 137.293 144.548 149.799 153.78 156.781 159.197 161.06 162.781 164.148 165.249 166.171 166.95 167.628 168.179 168.711 169.14 169.44 169.686 169.882 170.017 170.117 170.157 170.157 170.16 170.149 170.107 170.027 169.939 169.797 169.52 169.352 169.176 169.083 168.89 168.682 168.443 168.31 167.865 167.851 167.662 167.44 166.886 166.557 166.176 165.681 165.059 164.302 163.135 -8 ,17312 ,KEBNE ,16724094,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:11 CET,0.0 0.805 1.426 1.997 2.532 3.051 3.533 4.441 4.885 5.311 5.629 6.487 6.875 7.623 8.318 9.007 9.361 10.071 10.749 11.724 12.36 12.98 13.904 14.817 15.719 16.607 17.47 18.613 19.739 20.861 22.268 23.627 24.929 26.473 28.223 29.945 31.929 34.135 36.531 39.131 42.129 45.692 49.434 53.975 59.284 65.756 73.408 82.873 94.938 111.231 126.482 136.503 143.649 148.947 153.036 156.164 158.661 160.525 162.179 163.465 164.48 165.4 166.185 166.797 167.283 167.733 168.101 168.394 168.663 168.897 169.057 169.181 169.27 169.311 169.33 169.33 169.305 169.264 169.203 169.104 168.968 168.875 168.721 168.635 168.459 168.228 167.975 167.843 167.382 167.294 167.07 166.83 166.275 165.911 165.491 164.975 164.315 163.529 162.394 -9 ,32336 ,KEBNE ,16724095,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:20 CET,0.0 0.738 1.353 1.906 2.421 2.899 3.363 4.236 4.649 5.051 5.321 6.168 6.546 7.285 7.974 8.647 8.988 9.668 10.341 11.326 11.962 12.596 13.518 14.404 15.275 16.135 16.998 18.138 19.258 20.368 21.725 23.045 24.335 25.87 27.628 29.358 31.316 33.486 35.844 38.388 41.37 44.98 48.74 53.317 58.646 65.064 72.739 82.326 94.574 110.985 126.363 136.57 143.757 148.992 153.003 156.019 158.476 160.424 162.186 163.531 164.546 165.443 166.235 166.906 167.459 167.958 168.341 168.616 168.853 169.074 169.234 169.354 169.416 169.438 169.458 169.476 169.466 169.419 169.366 169.312 169.216 169.12 168.998 168.914 168.728 168.53 168.269 168.109 167.639 167.584 167.366 167.091 166.451 166.076 165.652 165.133 164.446 163.554 162.28 -10 ,29340 ,KEBNE ,16724096,Sun Nov 28 05:04:21 CET,Sun Nov 28 06:45:05 CET,0.0 0.75 1.421 2.017 2.52 3.0 3.469 4.359 4.765 5.165 5.468 6.324 6.688 7.406 8.102 8.761 9.089 9.745 10.387 11.337 11.959 12.566 13.467 14.355 15.237 16.104 16.959 18.098 19.215 20.307 21.639 22.947 24.239 25.782 27.549 29.281 31.231 33.39 35.762 38.327 41.302 44.92 48.708 53.274 58.54 64.94 72.608 82.194 94.486 110.981 126.179 136.283 143.444 148.521 152.466 155.504 157.957 159.878 161.566 162.871 163.915 164.81 165.563 166.213 166.776 167.292 167.665 167.939 168.219 168.453 168.621 168.751 168.829 168.886 168.939 168.956 168.938 168.925 168.899 168.841 168.706 168.58 168.446 168.367 168.166 167.926 167.614 167.458 166.992 166.926 166.715 166.454 165.814 165.406 164.935 164.408 163.79 162.95 161.61 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt deleted file mode 100644 index 7a3da9dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3643 ,KEBNE ,16724097,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:53 CET,0.0 1.985 2.823 3.51 4.138 4.726 5.233 5.714 6.644 7.094 7.535 7.855 8.706 9.093 9.848 10.566 11.253 11.595 12.261 12.907 13.88 14.509 15.115 16.016 16.911 17.783 18.63 19.47 20.582 21.671 22.732 24.048 25.347 26.596 28.043 29.718 31.374 33.266 35.344 37.586 40.03 42.875 46.333 49.884 54.086 58.92 64.653 71.462 79.845 90.191 103.774 116.198 124.108 129.572 133.51 136.466 138.623 140.249 141.474 142.55 143.345 143.966 144.484 144.873 145.177 145.397 145.553 145.667 145.735 145.786 145.83 145.839 145.813 145.752 145.688 145.597 145.478 145.326 145.143 145.003 144.875 144.675 144.502 144.322 144.238 144.037 143.75 143.417 143.242 142.731 142.672 142.428 142.158 141.51 141.156 140.78 140.319 139.771 139.035 138.07 134.552 -2 ,26646 ,KEBNE ,16724098,Sun Nov 28 05:04:21 CET,Sun Nov 28 06:46:05 CET,0.0 1.854 2.715 3.432 4.071 4.656 5.198 5.702 6.654 7.105 7.543 7.896 8.773 9.166 9.922 10.631 11.319 11.663 12.341 13.003 13.97 14.612 15.249 16.185 17.104 17.988 18.859 19.72 20.853 21.971 23.07 24.435 25.747 26.995 28.454 30.184 31.945 33.915 36.022 38.249 40.704 43.524 46.776 50.132 54.204 58.915 64.554 71.328 79.73 90.168 103.813 116.142 123.993 129.45 133.363 136.309 138.559 140.31 141.582 142.64 143.398 144.019 144.534 144.956 145.284 145.53 145.74 145.883 145.957 145.983 145.99 145.977 145.952 145.869 145.77 145.674 145.522 145.334 145.135 144.973 144.802 144.482 144.262 144.053 143.943 143.712 143.431 143.108 142.954 142.468 142.427 142.212 141.965 141.404 141.101 140.796 140.441 139.924 139.229 138.215 133.492 -3 ,6730 ,KEBNE ,16724099,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:52 CET,0.0 2.153 3.06 3.839 4.503 5.108 5.645 6.131 7.06 7.502 7.927 8.242 9.096 9.476 10.227 10.948 11.655 12.002 12.673 13.334 14.31 14.953 15.576 16.494 17.388 18.261 19.128 19.981 21.099 22.176 23.228 24.533 25.82 27.089 28.584 30.266 31.907 33.755 35.812 38.076 40.497 43.265 46.569 49.995 54.129 58.909 64.615 71.293 79.465 89.719 103.181 115.601 123.731 129.319 133.239 136.122 138.276 139.922 141.126 142.177 142.947 143.56 144.088 144.491 144.773 145.02 145.259 145.409 145.514 145.601 145.629 145.605 145.526 145.417 145.3 145.179 145.085 144.95 144.765 144.625 144.491 144.292 144.142 143.981 143.886 143.652 143.388 143.08 142.894 142.362 142.231 141.946 141.666 141.053 140.67 140.244 139.76 139.223 138.555 137.502 132.365 -4 ,12839 ,KEBNE ,16724100,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:44 CET,0.0 3.043 3.986 4.701 5.328 5.896 6.415 6.919 7.88 8.324 8.754 9.142 10.035 10.43 11.172 11.878 12.581 12.928 13.605 14.273 15.259 15.904 16.525 17.425 18.315 19.194 20.062 20.916 22.031 23.115 24.181 25.5 26.779 28.024 29.502 31.218 32.93 34.891 37.052 39.361 41.836 44.681 48.048 51.522 55.698 60.527 66.349 73.127 81.422 91.913 105.637 117.973 125.778 131.129 134.822 137.699 139.991 141.715 142.941 144.032 144.886 145.502 145.98 146.37 146.664 146.914 147.128 147.262 147.348 147.409 147.458 147.474 147.451 147.393 147.313 147.22 147.118 146.995 146.828 146.7 146.551 146.261 146.046 145.828 145.716 145.438 145.12 144.782 144.605 144.092 144.021 143.773 143.478 142.859 142.499 142.059 141.559 140.989 140.301 139.328 132.541 -5 ,22753 ,KEBNE ,16724101,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:46 CET,0.0 1.945 2.84 3.57 4.221 4.829 5.373 5.872 6.775 7.208 7.637 7.969 8.849 9.24 9.984 10.701 11.397 11.738 12.397 13.043 13.994 14.618 15.24 16.146 17.015 17.877 18.726 19.549 20.641 21.727 22.808 24.144 25.459 26.728 28.203 29.891 31.534 33.382 35.425 37.709 40.171 42.971 46.349 49.87 54.025 58.74 64.413 71.133 79.349 89.61 103.298 115.83 123.79 129.276 133.213 136.087 138.148 139.776 141.045 142.158 142.952 143.564 144.074 144.475 144.741 144.922 145.077 145.18 145.288 145.356 145.355 145.338 145.304 145.253 145.204 145.137 145.05 144.962 144.832 144.693 144.536 144.294 144.118 143.918 143.795 143.519 143.211 142.854 142.669 142.152 142.084 141.84 141.571 140.98 140.647 140.249 139.781 139.168 138.383 137.392 133.578 -6 ,16428 ,KEBNE ,16724102,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:45:46 CET,0.0 1.865 2.71 3.418 4.088 4.706 5.262 5.766 6.727 7.176 7.593 7.918 8.794 9.184 9.948 10.694 11.404 11.744 12.412 13.073 14.087 14.748 15.365 16.268 17.166 18.039 18.888 19.746 20.884 21.976 23.038 24.303 25.57 26.839 28.32 30.021 31.719 33.642 35.716 37.95 40.367 43.198 46.625 50.134 54.342 59.277 65.248 72.17 80.552 90.958 104.494 116.777 124.604 129.933 133.742 136.668 138.787 140.378 141.618 142.672 143.425 144.018 144.493 144.878 145.179 145.397 145.555 145.657 145.75 145.782 145.718 145.633 145.516 145.403 145.348 145.303 145.213 145.091 144.947 144.83 144.685 144.364 144.105 143.814 143.653 143.313 142.939 142.492 142.267 141.711 141.562 141.314 141.061 140.464 140.094 139.691 139.199 138.596 137.819 136.72 132.076 -8 ,32562 ,KEBNE ,16724104,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:47:43 CET,0.0 2.256 3.06 3.738 4.362 4.948 5.497 5.984 6.869 7.312 7.749 8.09 8.975 9.374 10.126 10.847 11.532 11.88 12.589 13.276 14.254 14.88 15.499 16.425 17.331 18.206 19.081 19.949 21.052 22.117 23.16 24.459 25.772 27.067 28.57 30.293 32.004 33.938 36.064 38.365 40.799 43.562 46.931 50.383 54.409 59.137 64.898 71.712 80.123 90.553 104.161 116.57 124.58 130.042 133.952 136.888 139.098 140.826 142.08 143.173 144.01 144.607 145.079 145.485 145.822 146.08 146.255 146.377 146.471 146.55 146.599 146.601 146.572 146.504 146.447 146.386 146.314 146.239 146.148 146.052 145.932 145.752 145.615 145.447 145.349 145.098 144.778 144.397 144.177 143.594 143.289 142.952 142.673 142.111 141.762 141.379 140.944 140.454 139.779 138.703 134.834 -9 ,23342 ,KEBNE ,16724105,Sun Nov 28 05:04:22 CET,Sun Nov 28 06:48:20 CET,0.0 2.261 3.145 3.801 4.416 5.01 5.535 6.03 6.966 7.405 7.841 8.194 9.064 9.451 10.204 10.959 11.688 12.037 12.749 13.435 14.388 15.0 15.608 16.505 17.394 18.277 19.142 20.003 21.134 22.25 23.342 24.672 25.979 27.281 28.828 30.553 32.186 34.038 36.129 38.392 40.804 43.638 47.084 50.61 54.862 59.79 65.641 72.471 81.002 91.808 105.958 118.727 126.77 132.325 136.271 139.245 141.502 143.194 144.435 145.511 146.304 146.9 147.38 147.774 148.061 148.274 148.455 148.603 148.692 148.701 148.665 148.614 148.513 148.358 148.252 148.178 148.107 147.995 147.835 147.719 147.563 147.279 147.101 146.885 146.761 146.515 146.252 145.946 145.761 145.232 145.152 144.907 144.633 144.008 143.654 143.27 142.788 142.171 141.379 140.317 136.161 -10 ,9255 ,KEBNE ,16724106,Sun Nov 28 05:05:24 CET,Sun Nov 28 06:47:44 CET,0.0 2.161 3.061 3.807 4.495 5.067 5.574 6.048 6.978 7.432 7.865 8.206 9.067 9.456 10.225 10.972 11.685 12.029 12.708 13.37 14.343 14.988 15.616 16.527 17.42 18.301 19.163 20.015 21.127 22.209 23.26 24.549 25.831 27.102 28.612 30.339 32.035 33.93 36.017 38.266 40.707 43.57 46.993 50.574 54.814 59.644 65.385 72.068 80.365 90.814 104.641 117.134 125.134 130.595 134.49 137.481 139.667 141.306 142.533 143.54 144.282 144.906 145.401 145.802 146.116 146.353 146.557 146.623 146.61 146.563 146.503 146.478 146.464 146.407 146.323 146.226 146.121 146.03 145.921 145.809 145.668 145.431 145.262 145.051 144.935 144.71 144.464 144.145 143.951 143.422 143.357 143.125 142.877 142.313 141.952 141.499 140.972 140.397 139.732 138.772 135.24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt deleted file mode 100644 index 1415e358..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25541 ,KEBNE ,17026378,Wed Dec 22 14:12:20 CET,Wed Dec 22 15:54:14 CET,0.0 3.456 4.605 5.486 6.205 6.877 7.5 8.059 9.104 9.572 10.007 10.351 11.207 11.582 12.323 13.041 13.733 14.076 14.749 15.405 16.373 17.0 17.608 18.517 19.411 20.28 21.141 21.99 23.112 24.213 25.297 26.645 27.96 29.255 30.783 32.551 34.304 36.258 38.418 40.799 43.376 46.349 49.94 53.685 58.231 63.526 69.931 77.545 86.994 99.074 115.15 130.099 140.124 147.292 152.5 156.449 159.449 161.838 163.699 165.374 166.665 167.719 168.638 169.393 169.966 170.42 170.856 171.229 171.496 171.715 171.934 172.063 172.161 172.247 172.275 172.268 172.246 172.198 172.112 172.046 171.975 171.841 171.716 171.577 171.491 171.268 170.981 170.654 170.491 170.016 169.875 169.621 169.336 168.602 168.201 167.772 167.28 166.756 166.086 165.093 161.569 -2 ,17784 ,KEBNE ,17026379,Wed Dec 22 14:12:19 CET,Wed Dec 22 15:55:43 CET,0.0 2.678 3.644 4.37 5.031 5.609 6.124 6.626 7.564 7.999 8.422 8.755 9.611 9.987 10.713 11.425 12.108 12.445 13.123 13.774 14.732 15.374 16.006 16.921 17.823 18.722 19.602 20.457 21.586 22.699 23.787 25.119 26.436 27.76 29.328 31.124 32.894 34.859 37.025 39.416 41.993 44.991 48.627 52.408 57.026 62.403 68.899 76.676 86.24 98.32 114.726 130.057 140.013 147.121 152.326 156.274 159.358 161.861 163.751 165.423 166.731 167.762 168.614 169.34 169.973 170.497 170.988 171.365 171.633 171.884 172.101 172.24 172.361 172.455 172.496 172.518 172.526 172.492 172.41 172.341 172.271 172.125 171.99 171.868 171.811 171.656 171.461 171.235 171.111 170.689 170.659 170.49 170.307 169.836 169.55 169.21 168.833 168.394 167.819 166.951 163.971 -3 ,13733 ,KEBNE ,17026380,Wed Dec 22 14:12:20 CET,Wed Dec 22 15:56:26 CET,0.0 2.312 3.291 4.12 4.846 5.496 6.106 6.662 7.694 8.181 8.664 9.125 10.028 10.446 11.232 11.963 12.676 13.026 13.701 14.362 15.351 16.0 16.625 17.537 18.434 19.313 20.196 21.076 22.206 23.312 24.412 25.769 27.088 28.367 29.893 31.661 33.417 35.405 37.579 39.935 42.492 45.475 49.067 52.807 57.32 62.574 68.948 76.531 85.981 98.015 114.107 129.1 138.923 145.907 151.068 155.026 158.02 160.448 162.337 164.002 165.282 166.31 167.168 167.908 168.562 169.08 169.572 169.979 170.274 170.546 170.795 170.946 171.066 171.15 171.187 171.213 171.216 171.182 171.109 171.043 170.98 170.869 170.762 170.63 170.565 170.394 170.169 169.931 169.797 169.345 169.29 169.09 168.865 168.351 168.018 167.609 167.112 166.498 165.703 164.561 160.939 -4 ,6583 ,KEBNE ,17026381,Wed Dec 22 14:12:24 CET,Wed Dec 22 15:46:23 CET,0.0 1.965 2.855 3.597 4.224 4.768 5.27 5.76 6.7 7.144 7.568 7.903 8.787 9.193 9.937 10.641 11.358 11.722 12.433 13.113 14.083 14.719 15.356 16.302 17.22 18.116 19.004 19.879 21.023 22.146 23.256 24.622 25.941 27.237 28.763 30.498 32.22 34.168 36.316 38.661 41.238 44.236 47.862 51.649 56.198 61.463 67.802 75.41 84.95 97.134 113.179 127.993 137.728 144.544 149.52 153.45 156.552 158.995 160.873 162.542 163.834 164.901 165.848 166.647 167.296 167.816 168.281 168.648 168.914 169.175 169.403 169.538 169.664 169.764 169.811 169.834 169.85 169.857 169.842 169.826 169.784 169.648 169.542 169.436 169.374 169.199 168.968 168.706 168.562 168.114 168.064 167.864 167.64 167.12 166.811 166.45 166.012 165.457 164.769 163.789 160.677 -5 ,26380 ,KEBNE ,17026382,Wed Dec 22 14:12:23 CET,Wed Dec 22 15:46:26 CET,0.0 2.715 3.719 4.449 5.067 5.655 6.209 6.713 7.654 8.096 8.509 8.835 9.702 10.091 10.849 11.563 12.252 12.595 13.288 13.971 14.966 15.618 16.267 17.221 18.14 19.011 19.864 20.714 21.821 22.926 24.018 25.366 26.727 28.091 29.701 31.505 33.258 35.249 37.466 39.886 42.506 45.532 49.156 52.878 57.416 62.716 69.053 76.673 86.205 98.337 114.539 129.831 140.021 147.141 152.326 156.311 159.385 161.815 163.656 165.305 166.605 167.664 168.531 169.256 169.842 170.314 170.773 171.138 171.418 171.648 171.843 171.991 172.132 172.258 172.326 172.35 172.346 172.324 172.254 172.19 172.13 172.007 171.891 171.739 171.658 171.478 171.233 170.957 170.807 170.347 170.25 170.032 169.8 169.261 168.935 168.58 168.171 167.666 167.071 166.292 162.55 -6 ,9374 ,KEBNE ,17026383,Wed Dec 22 14:12:19 CET,Wed Dec 22 15:55:47 CET,0.0 2.757 3.84 4.68 5.382 5.977 6.493 6.981 7.878 8.298 8.725 9.071 9.949 10.336 11.089 11.829 12.522 12.855 13.532 14.194 15.153 15.782 16.398 17.323 18.249 19.155 20.043 20.911 22.031 23.112 24.193 25.56 26.881 28.164 29.684 31.435 33.166 35.109 37.257 39.604 42.133 45.06 48.585 52.277 56.761 61.985 68.326 75.871 85.258 97.286 113.582 128.875 138.776 145.695 150.743 154.648 157.698 160.139 162.009 163.66 164.892 165.882 166.722 167.414 167.985 168.47 168.949 169.341 169.637 169.886 170.114 170.273 170.411 170.539 170.609 170.653 170.68 170.681 170.651 170.613 170.557 170.436 170.334 170.216 170.147 169.963 169.764 169.534 169.392 168.948 168.883 168.676 168.444 167.902 167.586 167.252 166.846 166.344 165.768 164.913 161.818 -7 ,26788 ,KEBNE ,17026384,Wed Dec 22 14:12:20 CET,Wed Dec 22 15:53:58 CET,0.0 1.924 2.794 3.487 4.105 4.673 5.186 5.657 6.561 7.003 7.428 7.761 8.624 9.02 9.823 10.628 11.362 11.708 12.392 13.044 14.004 14.634 15.256 16.177 17.09 17.989 18.874 19.741 20.875 22.001 23.11 24.46 25.785 27.085 28.596 30.35 32.097 34.043 36.2 38.568 41.125 44.085 47.681 51.418 55.914 61.181 67.563 75.153 84.684 96.788 113.036 128.245 138.015 144.767 149.785 153.688 156.713 159.167 161.037 162.704 163.976 164.974 165.787 166.449 167.05 167.565 167.987 168.296 168.539 168.782 169.01 169.172 169.324 169.46 169.516 169.521 169.51 169.483 169.404 169.346 169.276 169.115 168.985 168.826 168.736 168.542 168.334 168.097 167.943 167.464 167.393 167.179 166.934 166.41 166.101 165.725 165.282 164.737 164.049 163.106 159.722 -8 ,5178 ,KEBNE ,17026385,Wed Dec 22 14:13:22 CET,Wed Dec 22 15:56:03 CET,0.0 2.267 3.154 3.838 4.453 5.024 5.555 6.044 6.97 7.403 7.814 8.125 8.991 9.376 10.161 10.956 11.727 12.088 12.764 13.414 14.373 15.013 15.64 16.544 17.446 18.337 19.207 20.053 21.172 22.295 23.394 24.74 26.056 27.347 28.873 30.639 32.389 34.351 36.507 38.859 41.382 44.31 47.89 51.623 56.11 61.361 67.806 75.512 84.988 97.008 113.205 128.435 138.337 145.263 150.38 154.399 157.48 159.865 161.687 163.321 164.579 165.588 166.428 167.103 167.694 168.201 168.639 168.983 169.251 169.498 169.709 169.837 169.971 170.086 170.155 170.218 170.263 170.267 170.212 170.167 170.115 169.991 169.881 169.747 169.662 169.467 169.243 168.973 168.831 168.378 168.295 168.094 167.881 167.359 167.028 166.641 166.189 165.686 165.048 164.092 160.55 -9 ,14645 ,KEBNE ,17026386,Wed Dec 22 14:13:22 CET,Wed Dec 22 15:56:03 CET,0.0 1.716 2.622 3.348 3.967 4.505 5.018 5.51 6.445 6.895 7.316 7.627 8.489 8.87 9.606 10.331 11.04 11.388 12.082 12.763 13.752 14.387 15.001 15.916 16.825 17.723 18.627 19.517 20.668 21.81 22.91 24.241 25.582 26.918 28.505 30.371 32.199 34.18 36.361 38.739 41.304 44.294 47.903 51.674 56.219 61.527 67.985 75.631 85.107 97.171 113.528 128.865 138.886 146.054 151.317 155.304 158.336 160.747 162.6 164.334 165.692 166.743 167.589 168.276 168.856 169.334 169.795 170.184 170.482 170.735 170.958 171.138 171.286 171.396 171.461 171.507 171.544 171.55 171.537 171.517 171.478 171.376 171.278 171.158 171.078 170.896 170.677 170.393 170.229 169.76 169.66 169.421 169.164 168.618 168.309 167.975 167.631 167.225 166.61 165.689 162.201 -10 ,28169 ,KEBNE ,17026387,Wed Dec 22 14:13:22 CET,Wed Dec 22 15:55:18 CET,0.0 2.157 3.215 4.031 4.735 5.363 5.909 6.39 7.281 7.701 8.123 8.487 9.37 9.755 10.494 11.222 11.929 12.275 12.956 13.616 14.568 15.188 15.812 16.724 17.609 18.485 19.361 20.223 21.347 22.46 23.544 24.872 26.191 27.496 29.025 30.792 32.525 34.461 36.61 38.973 41.533 44.475 48.042 51.811 56.391 61.65 67.995 75.586 85.035 97.196 113.498 128.558 138.489 145.507 150.598 154.51 157.501 159.882 161.703 163.326 164.645 165.761 166.675 167.407 168.009 168.495 168.957 169.331 169.612 169.881 170.112 170.256 170.371 170.441 170.483 170.505 170.48 170.43 170.365 170.305 170.236 170.084 169.927 169.751 169.656 169.407 169.09 168.731 168.543 168.058 167.895 167.643 167.378 166.818 166.507 166.144 165.706 165.145 164.474 163.569 160.68 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt deleted file mode 100644 index 977e50c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,8807 ,KEBNE ,16724108,Sun Nov 28 05:05:24 CET,Sun Nov 28 06:46:34 CET,0.0 1.549 2.171 2.665 3.034 3.344 3.655 3.957 4.49 4.728 4.941 5.06 5.558 5.749 6.114 6.444 6.756 6.91 7.214 7.528 7.966 8.231 8.497 8.862 9.227 9.612 9.957 10.266 10.659 11.036 11.397 11.83 12.232 12.603 13.039 13.531 13.996 14.501 15.038 15.615 16.21 16.84 17.549 18.248 19.048 19.898 20.826 21.81 22.809 23.683 24.3 24.122 23.466 22.648 21.825 21.027 20.241 19.456 18.747 17.991 17.308 16.693 16.074 15.455 14.885 14.378 13.836 13.336 12.874 12.405 11.928 11.507 11.076 10.623 10.259 9.888 9.496 9.083 8.657 8.355 8.025 7.513 7.167 6.808 6.613 6.189 5.769 5.313 5.068 4.511 4.225 3.908 3.591 2.879 2.485 2.059 1.59 1.027 0.342 -0.552 -3.234 -3 ,14966 ,KEBNE ,16724109,Sun Nov 28 05:05:24 CET,Sun Nov 28 06:47:05 CET,0.0 1.557 2.141 2.581 2.976 3.347 3.684 3.98 4.488 4.725 4.956 5.1 5.614 5.82 6.181 6.502 6.808 6.962 7.272 7.562 7.968 8.233 8.491 8.873 9.232 9.561 9.867 10.169 10.567 10.945 11.299 11.727 12.149 12.551 13.016 13.535 14.014 14.517 15.031 15.583 16.168 16.813 17.545 18.254 19.084 19.968 20.929 21.927 22.909 23.79 24.312 24.067 23.428 22.65 21.807 20.957 20.173 19.429 18.749 18.032 17.372 16.753 16.162 15.594 15.033 14.514 13.987 13.495 13.043 12.577 12.096 11.694 11.273 10.824 10.478 10.116 9.724 9.311 8.878 8.573 8.254 7.745 7.383 7.02 6.836 6.429 5.983 5.511 5.26 4.697 4.473 4.196 3.883 3.171 2.788 2.371 1.901 1.336 0.647 -0.216 -2.733 -4 ,18330 ,KEBNE ,16724110,Sun Nov 28 05:05:24 CET,Sun Nov 28 06:45:47 CET,0.0 1.443 2.032 2.492 2.872 3.222 3.548 3.842 4.328 4.548 4.764 4.877 5.371 5.567 5.934 6.272 6.591 6.749 7.054 7.34 7.739 7.994 8.249 8.629 8.984 9.323 9.651 9.971 10.375 10.736 11.087 11.522 11.928 12.311 12.779 13.32 13.815 14.32 14.84 15.407 16.003 16.664 17.404 18.099 18.924 19.802 20.732 21.724 22.72 23.658 24.288 24.102 23.45 22.627 21.777 20.919 20.121 19.361 18.676 17.94 17.267 16.649 16.027 15.429 14.895 14.381 13.793 13.273 12.843 12.394 11.903 11.485 11.061 10.616 10.256 9.877 9.475 9.049 8.604 8.303 7.988 7.461 7.086 6.712 6.52 6.119 5.689 5.223 4.976 4.415 4.098 3.746 3.382 2.577 2.111 1.612 1.048 0.351 -0.489 -1.621 -4.665 -6 ,13502 ,KEBNE ,16724112,Sun Nov 28 05:05:24 CET,Sun Nov 28 06:47:08 CET,0.0 1.462 2.144 2.642 3.035 3.38 3.709 4.024 4.57 4.816 5.055 5.191 5.704 5.912 6.278 6.626 6.959 7.112 7.407 7.697 8.122 8.386 8.636 8.99 9.329 9.661 9.977 10.294 10.691 11.064 11.427 11.856 12.259 12.634 13.076 13.573 14.046 14.566 15.13 15.703 16.289 16.932 17.673 18.418 19.228 20.113 21.036 21.957 22.914 23.805 24.438 24.286 23.683 22.935 22.163 21.34 20.529 19.732 19.021 18.307 17.662 17.064 16.481 15.919 15.358 14.823 14.29 13.818 13.374 12.896 12.407 12.0 11.571 11.114 10.759 10.393 10.003 9.585 9.136 8.819 8.495 7.989 7.612 7.215 7.02 6.609 6.169 5.708 5.46 4.895 4.634 4.32 3.987 3.251 2.854 2.418 1.923 1.344 0.62 -0.407 -3.336 -7 ,7618 ,KEBNE ,16724113,Sun Nov 28 05:05:24 CET,Sun Nov 28 06:45:29 CET,0.0 2.152 2.997 3.586 4.056 4.479 4.895 5.271 5.922 6.213 6.488 6.715 7.252 7.487 7.935 8.315 8.642 8.803 9.107 9.396 9.809 10.064 10.313 10.674 11.021 11.353 11.669 11.98 12.362 12.728 13.09 13.525 13.931 14.318 14.769 15.275 15.748 16.252 16.79 17.36 17.949 18.602 19.319 20.012 20.821 21.685 22.651 23.627 24.598 25.537 26.171 25.896 25.214 24.446 23.61 22.723 21.861 21.058 20.359 19.634 18.966 18.334 17.703 17.116 16.585 16.072 15.51 14.999 14.552 14.102 13.623 13.215 12.786 12.314 11.942 11.562 11.17 10.757 10.322 10.013 9.691 9.208 8.859 8.484 8.296 7.901 7.472 7.011 6.768 6.194 5.919 5.607 5.271 4.539 4.134 3.703 3.218 2.642 1.936 1.005 -2.243 -8 ,20992 ,KEBNE ,16724114,Sun Nov 28 05:05:24 CET,Sun Nov 28 06:46:33 CET,0.0 1.581 2.256 2.767 3.206 3.605 3.925 4.215 4.755 4.997 5.223 5.359 5.863 6.062 6.446 6.797 7.127 7.282 7.571 7.843 8.249 8.513 8.759 9.117 9.47 9.808 10.134 10.445 10.837 11.206 11.557 11.983 12.398 12.79 13.23 13.725 14.192 14.703 15.252 15.816 16.394 17.014 17.725 18.424 19.222 20.07 20.992 21.96 22.942 23.882 24.442 24.172 23.516 22.707 21.872 21.017 20.153 19.384 18.734 18.001 17.333 16.727 16.123 15.521 14.936 14.419 13.909 13.432 12.999 12.539 12.087 11.719 11.291 10.812 10.44 10.052 9.635 9.201 8.742 8.426 8.106 7.604 7.264 6.914 6.723 6.305 5.868 5.41 5.167 4.602 4.364 4.083 3.778 3.09 2.688 2.24 1.743 1.17 0.423 -0.558 -2.98 -9 ,15804 ,KEBNE ,16724115,Sun Nov 28 05:05:24 CET,Sun Nov 28 06:46:47 CET,0.0 1.532 2.223 2.711 3.123 3.475 3.795 4.095 4.628 4.867 5.087 5.189 5.677 5.869 6.228 6.562 6.887 7.045 7.342 7.63 8.045 8.29 8.522 8.871 9.207 9.525 9.841 10.158 10.566 10.933 11.272 11.693 12.097 12.476 12.907 13.384 13.842 14.343 14.874 15.427 15.992 16.627 17.357 18.061 18.861 19.7 20.579 21.515 22.516 23.462 24.072 23.87 23.18 22.395 21.61 20.786 20.002 19.217 18.514 17.792 17.143 16.539 15.937 15.353 14.789 14.267 13.715 13.223 12.799 12.356 11.882 11.493 11.094 10.654 10.299 9.916 9.516 9.116 8.693 8.385 8.062 7.564 7.215 6.847 6.661 6.258 5.83 5.378 5.131 4.574 4.335 4.04 3.725 3.06 2.692 2.275 1.785 1.194 0.458 -0.469 -2.664 -10 ,30103 ,KEBNE ,16724116,Sun Nov 28 05:05:24 CET,Sun Nov 28 06:46:19 CET,0.0 1.424 2.092 2.681 3.203 3.631 4.017 4.386 5.012 5.294 5.569 5.75 6.245 6.434 6.795 7.137 7.461 7.621 7.938 8.236 8.636 8.883 9.123 9.468 9.804 10.135 10.456 10.764 11.153 11.518 11.869 12.291 12.682 13.06 13.509 14.009 14.472 14.963 15.508 16.081 16.653 17.302 18.051 18.773 19.561 20.391 21.291 22.227 23.19 24.122 24.801 24.658 24.062 23.269 22.438 21.583 20.747 19.969 19.255 18.527 17.881 17.289 16.721 16.162 15.618 15.096 14.556 14.065 13.638 13.178 12.689 12.284 11.845 11.387 11.041 10.674 10.262 9.822 9.369 9.067 8.76 8.272 7.916 7.54 7.348 6.936 6.476 5.989 5.744 5.189 4.945 4.645 4.324 3.591 3.174 2.74 2.246 1.662 0.962 0.067 -2.244 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt deleted file mode 100644 index 69ffcae7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,30406 ,KEBNE ,16724118,Sun Nov 28 05:05:24 CET,Sun Nov 28 06:48:53 CET,0.0 2.034 2.814 3.42 3.936 4.338 4.698 5.041 5.637 5.9 6.16 6.37 6.892 7.113 7.528 7.895 8.246 8.416 8.739 9.065 9.522 9.78 10.03 10.409 10.768 11.098 11.406 11.69 12.063 12.435 12.771 13.165 13.554 13.914 14.308 14.732 15.113 15.526 15.931 16.316 16.727 17.175 17.618 17.97 18.301 18.613 18.832 18.871 18.566 17.582 15.327 12.15 9.36 6.956 4.818 2.873 1.155 -0.404 -1.734 -3.078 -4.251 -5.282 -6.24 -7.168 -8.03 -8.793 -9.617 -10.35 -10.964 -11.6 -12.258 -12.811 -13.396 -13.998 -14.462 -14.932 -15.412 -15.923 -16.464 -16.834 -17.201 -17.768 -18.173 -18.628 -18.865 -19.308 -19.801 -20.375 -20.672 -21.301 -21.579 -21.892 -22.215 -22.942 -23.335 -23.748 -24.193 -24.68 -25.27 -26.061 -27.84 -3 ,9542 ,KEBNE ,16724119,Sun Nov 28 05:06:25 CET,Sun Nov 28 06:48:10 CET,0.0 2.137 2.899 3.476 3.93 4.341 4.731 5.081 5.705 5.993 6.264 6.469 7.001 7.214 7.62 7.994 8.363 8.541 8.856 9.164 9.608 9.886 10.154 10.538 10.903 11.246 11.571 11.865 12.212 12.542 12.872 13.29 13.681 14.019 14.392 14.839 15.246 15.66 16.095 16.532 16.934 17.32 17.759 18.13 18.471 18.76 18.927 18.905 18.562 17.609 15.354 12.128 9.334 6.896 4.673 2.679 0.976 -0.6 -1.982 -3.295 -4.394 -5.394 -6.361 -7.285 -8.15 -8.933 -9.748 -10.461 -11.072 -11.72 -12.394 -12.944 -13.515 -14.117 -14.578 -15.035 -15.506 -16.018 -16.556 -16.934 -17.316 -17.89 -18.307 -18.741 -18.965 -19.427 -19.891 -20.424 -20.719 -21.372 -21.71 -22.069 -22.442 -23.23 -23.661 -24.153 -24.705 -25.299 -26.005 -26.943 -29.093 -4 ,27399 ,KEBNE ,16724120,Sun Nov 28 05:06:25 CET,Sun Nov 28 06:48:06 CET,0.0 2.174 2.954 3.505 3.981 4.411 4.79 5.127 5.73 6.019 6.284 6.469 6.997 7.222 7.628 8.014 8.381 8.548 8.879 9.198 9.647 9.929 10.209 10.599 10.949 11.289 11.62 11.933 12.325 12.697 13.047 13.445 13.802 14.138 14.528 14.946 15.34 15.774 16.21 16.645 17.096 17.535 17.973 18.36 18.732 19.068 19.371 19.447 19.118 18.209 16.121 13.171 10.365 7.816 5.634 3.75 2.096 0.53 -0.859 -2.245 -3.414 -4.442 -5.43 -6.346 -7.181 -7.977 -8.854 -9.637 -10.287 -10.948 -11.637 -12.199 -12.761 -13.343 -13.795 -14.256 -14.738 -15.241 -15.748 -16.098 -16.473 -17.054 -17.45 -17.856 -18.072 -18.567 -19.111 -19.695 -19.994 -20.631 -20.934 -21.274 -21.625 -22.384 -22.831 -23.317 -23.837 -24.451 -25.203 -26.18 -28.788 -7 ,11310 ,KEBNE ,16724123,Sun Nov 28 05:07:27 CET,Sun Nov 28 06:51:58 CET,0.0 1.905 2.643 3.209 3.681 4.102 4.48 4.824 5.461 5.735 5.991 6.19 6.716 6.937 7.347 7.723 8.072 8.239 8.555 8.854 9.29 9.566 9.818 10.182 10.546 10.902 11.254 11.583 11.97 12.325 12.647 13.047 13.463 13.857 14.29 14.748 15.175 15.615 16.057 16.521 16.951 17.347 17.783 18.183 18.59 18.884 19.026 19.053 18.79 17.936 15.711 12.445 9.566 7.043 4.795 2.758 1.0 -0.548 -1.86 -3.218 -4.391 -5.392 -6.348 -7.294 -8.164 -8.939 -9.746 -10.453 -11.058 -11.694 -12.382 -12.963 -13.552 -14.146 -14.615 -15.101 -15.587 -16.082 -16.611 -16.99 -17.381 -17.986 -18.388 -18.795 -19.006 -19.45 -19.922 -20.4 -20.644 -21.245 -21.482 -21.782 -22.084 -22.749 -23.137 -23.567 -24.04 -24.603 -25.311 -26.286 -28.554 -8 ,9598 ,KEBNE ,16724124,Sun Nov 28 05:07:26 CET,Sun Nov 28 06:51:34 CET,0.0 3.262 4.12 4.704 5.188 5.624 6.002 6.347 6.991 7.284 7.542 7.733 8.268 8.486 8.886 9.258 9.608 9.779 10.1 10.411 10.851 11.114 11.37 11.74 12.093 12.436 12.773 13.092 13.485 13.857 14.203 14.592 14.958 15.315 15.714 16.143 16.52 16.903 17.317 17.751 18.169 18.604 19.045 19.385 19.692 19.97 20.149 20.111 19.728 18.67 16.365 13.276 10.587 8.208 6.065 4.158 2.41 0.787 -0.549 -1.886 -3.047 -4.039 -4.976 -5.881 -6.732 -7.536 -8.371 -9.098 -9.712 -10.337 -10.997 -11.541 -12.106 -12.692 -13.136 -13.602 -14.096 -14.609 -15.13 -15.484 -15.864 -16.475 -16.891 -17.318 -17.541 -18.003 -18.472 -18.976 -19.24 -19.841 -20.067 -20.365 -20.69 -21.367 -21.759 -22.173 -22.61 -23.136 -23.716 -24.45 -26.375 -9 ,17069 ,KEBNE ,16724125,Sun Nov 28 05:07:27 CET,Sun Nov 28 06:49:13 CET,0.0 2.52 3.304 3.909 4.428 4.849 5.218 5.551 6.134 6.409 6.666 6.858 7.384 7.6 8.0 8.383 8.746 8.912 9.239 9.557 9.989 10.259 10.522 10.902 11.257 11.589 11.9 12.215 12.636 13.033 13.391 13.789 14.162 14.516 14.906 15.344 15.766 16.218 16.667 17.088 17.484 17.885 18.307 18.684 19.071 19.354 19.511 19.5 19.11 18.085 15.949 12.827 10.022 7.589 5.486 3.583 1.909 0.383 -0.984 -2.331 -3.506 -4.556 -5.53 -6.453 -7.286 -8.036 -8.823 -9.533 -10.135 -10.765 -11.428 -11.972 -12.532 -13.105 -13.576 -14.063 -14.578 -15.125 -15.684 -16.068 -16.462 -17.065 -17.471 -17.903 -18.136 -18.617 -19.095 -19.578 -19.828 -20.436 -20.707 -21.012 -21.328 -22.034 -22.414 -22.812 -23.229 -23.745 -24.345 -25.107 -27.311 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index 8347e397..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24205 ,KEBNE ,16724127,Sun Nov 28 05:07:27 CET,Sun Nov 28 06:50:22 CET,0.0 1.475 2.07 2.542 2.97 3.338 3.664 3.968 4.499 4.746 4.981 5.172 5.589 5.784 6.157 6.508 6.831 6.984 7.292 7.594 8.017 8.277 8.532 8.898 9.23 9.553 9.873 10.188 10.598 10.989 11.355 11.799 12.224 12.61 13.052 13.543 14.007 14.527 15.073 15.634 16.227 16.882 17.603 18.32 19.137 20.014 20.977 21.973 23.016 23.948 24.583 24.547 24.124 23.562 22.964 22.308 21.607 20.942 20.362 19.774 19.244 18.749 18.268 17.816 17.398 17.0 16.584 16.212 15.856 15.478 15.094 14.751 14.382 14.021 13.755 13.466 13.16 12.846 12.511 12.277 12.034 11.646 11.36 11.07 10.929 10.633 10.312 9.969 9.777 9.353 9.148 8.926 8.695 8.201 7.915 7.595 7.253 6.884 6.393 5.728 4.02 -2 ,17455 ,KEBNE ,16724128,Sun Nov 28 05:07:30 CET,Sun Nov 28 06:44:13 CET,0.0 1.286 1.793 2.208 2.563 2.906 3.235 3.533 4.056 4.311 4.574 4.865 5.344 5.593 6.066 6.496 6.892 7.093 7.487 7.846 8.347 8.671 8.987 9.447 9.865 10.226 10.551 10.862 11.254 11.622 11.974 12.402 12.823 13.217 13.667 14.19 14.677 15.188 15.732 16.313 16.914 17.558 18.289 19.012 19.837 20.752 21.751 22.756 23.764 24.733 25.547 25.591 25.179 24.633 23.992 23.293 22.616 22.006 21.456 20.874 20.358 19.884 19.413 18.949 18.519 18.119 17.684 17.294 16.964 16.616 16.233 15.908 15.574 15.224 14.945 14.652 14.348 14.029 13.701 13.477 13.249 12.89 12.617 12.304 12.151 11.863 11.554 11.199 11.01 10.595 10.379 10.165 9.942 9.413 9.137 8.848 8.533 8.162 7.691 7.073 5.367 -3 ,28781 ,KEBNE ,16724129,Sun Nov 28 05:08:28 CET,Sun Nov 28 06:51:11 CET,0.0 1.601 2.243 2.707 3.154 3.562 3.936 4.274 4.835 5.081 5.302 5.506 5.935 6.131 6.507 6.883 7.246 7.41 7.709 8.0 8.417 8.68 8.939 9.301 9.641 9.968 10.283 10.603 11.012 11.379 11.737 12.173 12.584 12.988 13.457 13.96 14.446 14.968 15.51 16.091 16.695 17.361 18.132 18.9 19.748 20.636 21.595 22.598 23.686 24.708 25.475 25.545 25.052 24.395 23.707 22.969 22.292 21.652 21.072 20.47 19.927 19.446 18.978 18.509 18.068 17.668 17.235 16.834 16.479 16.106 15.71 15.383 15.049 14.716 14.459 14.168 13.859 13.539 13.186 12.95 12.716 12.334 12.063 11.782 11.634 11.342 11.032 10.704 10.539 10.135 9.933 9.711 9.481 9.002 8.73 8.438 8.132 7.759 7.272 6.587 4.886 -4 ,11227 ,KEBNE ,16724130,Sun Nov 28 05:08:29 CET,Sun Nov 28 06:50:02 CET,0.0 1.777 2.542 3.134 3.591 3.986 4.332 4.643 5.186 5.436 5.671 5.867 6.283 6.478 6.847 7.192 7.523 7.684 7.993 8.299 8.731 8.997 9.257 9.633 9.993 10.324 10.65 10.97 11.372 11.764 12.129 12.54 12.926 13.31 13.775 14.283 14.763 15.291 15.836 16.398 16.988 17.647 18.419 19.187 20.043 20.944 21.902 22.889 23.907 24.902 25.687 25.696 25.276 24.708 24.017 23.336 22.717 22.084 21.502 20.892 20.354 19.856 19.355 18.884 18.449 18.054 17.628 17.226 16.882 16.517 16.123 15.795 15.459 15.113 14.834 14.543 14.237 13.902 13.543 13.303 13.061 12.685 12.425 12.144 11.993 11.691 11.356 10.986 10.801 10.396 10.197 9.978 9.752 9.269 8.985 8.672 8.345 7.968 7.479 6.861 5.033 -5 ,17024 ,KEBNE ,16724131,Sun Nov 28 05:08:31 CET,Sun Nov 28 06:46:01 CET,0.0 1.739 2.444 2.947 3.34 3.668 3.989 4.293 4.82 5.065 5.299 5.503 5.93 6.124 6.511 6.876 7.197 7.345 7.646 7.95 8.372 8.647 8.917 9.288 9.624 9.939 10.251 10.556 10.95 11.347 11.722 12.157 12.561 12.96 13.426 13.908 14.364 14.872 15.415 15.974 16.572 17.263 18.041 18.785 19.602 20.477 21.444 22.451 23.457 24.429 25.225 25.249 24.78 24.175 23.522 22.852 22.175 21.511 20.929 20.322 19.774 19.284 18.809 18.336 17.88 17.457 17.005 16.595 16.235 15.85 15.434 15.101 14.77 14.416 14.134 13.843 13.552 13.231 12.886 12.655 12.421 12.059 11.793 11.511 11.363 11.052 10.738 10.401 10.206 9.806 9.65 9.442 9.218 8.744 8.475 8.179 7.855 7.49 7.082 6.491 5.087 -6 ,32387 ,KEBNE ,16724132,Sun Nov 28 05:08:32 CET,Sun Nov 28 06:46:15 CET,0.0 1.504 2.117 2.586 3.0 3.368 3.702 4.007 4.581 4.826 5.045 5.255 5.678 5.868 6.234 6.589 6.926 7.086 7.389 7.665 8.074 8.346 8.597 8.956 9.313 9.655 9.979 10.282 10.664 11.039 11.404 11.838 12.242 12.634 13.085 13.588 14.07 14.587 15.134 15.704 16.292 16.936 17.686 18.417 19.246 20.128 21.067 22.013 22.962 23.937 24.729 24.748 24.306 23.719 23.038 22.334 21.708 21.132 20.598 20.025 19.5 19.017 18.548 18.094 17.668 17.257 16.793 16.394 16.068 15.715 15.334 15.017 14.677 14.316 14.034 13.748 13.453 13.152 12.828 12.592 12.355 11.987 11.711 11.393 11.237 10.922 10.573 10.198 9.991 9.56 9.307 9.056 8.801 8.278 7.997 7.687 7.327 6.935 6.483 5.85 4.248 -7 ,31462 ,KEBNE ,16724133,Sun Nov 28 05:09:30 CET,Sun Nov 28 06:56:07 CET,0.0 1.558 2.051 2.433 2.788 3.107 3.387 3.656 4.154 4.388 4.622 4.832 5.256 5.455 5.826 6.154 6.467 6.621 6.918 7.202 7.604 7.867 8.133 8.513 8.864 9.203 9.53 9.842 10.253 10.633 10.993 11.429 11.839 12.232 12.678 13.19 13.681 14.195 14.732 15.302 15.913 16.578 17.319 18.059 18.885 19.747 20.711 21.729 22.743 23.701 24.504 24.601 24.167 23.57 22.924 22.284 21.665 21.043 20.485 19.898 19.358 18.845 18.34 17.883 17.477 17.094 16.663 16.284 15.967 15.61 15.231 14.926 14.599 14.252 13.982 13.695 13.394 13.07 12.722 12.492 12.253 11.858 11.591 11.321 11.176 10.862 10.534 10.189 10.005 9.608 9.437 9.224 9.0 8.532 8.266 7.935 7.558 7.165 6.69 6.08 4.549 -8 ,3085 ,KEBNE ,16724134,Sun Nov 28 05:09:30 CET,Sun Nov 28 06:52:17 CET,0.0 1.797 2.431 2.917 3.319 3.658 3.975 4.283 4.852 5.099 5.326 5.549 5.983 6.178 6.531 6.872 7.211 7.37 7.674 7.977 8.408 8.683 8.943 9.351 9.742 10.075 10.406 10.726 11.129 11.51 11.873 12.302 12.71 13.118 13.571 14.07 14.541 15.025 15.557 16.132 16.731 17.414 18.213 18.974 19.786 20.68 21.655 22.662 23.763 24.825 25.543 25.52 25.086 24.427 23.719 23.006 22.305 21.668 21.089 20.474 19.941 19.453 18.974 18.493 18.033 17.614 17.172 16.767 16.415 16.053 15.675 15.355 15.021 14.654 14.367 14.068 13.76 13.448 13.122 12.896 12.645 12.256 12.0 11.729 11.586 11.294 10.984 10.645 10.461 10.049 9.843 9.617 9.381 8.892 8.63 8.346 8.019 7.613 7.063 6.337 4.833 -9 ,868 ,KEBNE ,16724135,Sun Nov 28 05:09:30 CET,Sun Nov 28 06:54:38 CET,0.0 1.331 1.911 2.402 2.798 3.131 3.426 3.712 4.254 4.492 4.718 4.93 5.354 5.553 5.953 6.324 6.659 6.823 7.154 7.456 7.86 8.125 8.388 8.755 9.095 9.433 9.763 10.073 10.47 10.851 11.221 11.673 12.099 12.501 12.967 13.468 13.937 14.456 15.01 15.595 16.187 16.834 17.55 18.241 19.06 19.961 20.915 21.873 22.867 23.886 24.694 24.752 24.372 23.783 23.127 22.439 21.751 21.104 20.554 19.987 19.465 18.966 18.486 18.035 17.604 17.196 16.768 16.38 16.034 15.68 15.318 15.003 14.669 14.329 14.055 13.763 13.466 13.155 12.824 12.587 12.341 11.984 11.74 11.472 11.323 11.011 10.681 10.324 10.134 9.726 9.542 9.311 9.037 8.429 8.109 7.788 7.444 7.057 6.613 6.035 4.454 -10 ,31526 ,KEBNE ,16724136,Sun Nov 28 05:10:35 CET,Sun Nov 28 06:51:53 CET,0.0 1.86 2.491 2.968 3.358 3.7 4.034 4.332 4.837 5.07 5.308 5.531 5.955 6.154 6.542 6.909 7.233 7.39 7.719 8.033 8.486 8.772 9.032 9.408 9.785 10.147 10.49 10.82 11.221 11.598 11.966 12.415 12.841 13.251 13.717 14.2 14.657 15.175 15.759 16.369 16.974 17.628 18.386 19.137 19.975 20.851 21.807 22.808 23.831 24.836 25.602 25.635 25.215 24.627 24.002 23.394 22.783 22.164 21.581 20.956 20.422 19.944 19.471 18.999 18.548 18.131 17.701 17.324 16.975 16.599 16.221 15.913 15.584 15.244 14.976 14.692 14.393 14.064 13.727 13.504 13.265 12.876 12.603 12.311 12.161 11.846 11.515 11.162 10.982 10.599 10.404 10.167 9.938 9.466 9.194 8.889 8.532 8.135 7.673 7.055 5.304 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt deleted file mode 100644 index a3546de2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12008 ,KEBNE ,16724137,Sun Nov 28 05:10:35 CET,Sun Nov 28 06:51:47 CET,0.0 1.523 2.115 2.552 2.924 3.267 3.585 3.843 4.277 4.495 4.708 4.874 5.28 5.462 5.81 6.115 6.375 6.499 6.75 6.994 7.323 7.538 7.75 8.033 8.295 8.559 8.819 9.063 9.355 9.636 9.917 10.245 10.538 10.809 11.106 11.435 11.764 12.113 12.445 12.765 13.086 13.384 13.674 13.938 14.166 14.329 14.41 14.254 13.689 12.499 10.071 6.493 3.272 0.46 -1.944 -4.03 -5.811 -7.394 -8.782 -10.185 -11.376 -12.422 -13.414 -14.333 -15.181 -15.964 -16.78 -17.535 -18.187 -18.84 -19.522 -20.101 -20.708 -21.314 -21.767 -22.234 -22.717 -23.227 -23.752 -24.116 -24.502 -25.09 -25.509 -25.946 -26.158 -26.602 -27.069 -27.551 -27.811 -28.34 -28.666 -28.979 -29.308 -30.021 -30.43 -30.907 -31.423 -31.978 -32.616 -33.55 -36.553 -2 ,8783 ,KEBNE ,16724138,Sun Nov 28 05:10:35 CET,Sun Nov 28 06:51:44 CET,0.0 1.564 2.152 2.578 2.96 3.309 3.636 3.967 4.561 4.829 5.08 5.308 5.738 5.947 6.345 6.711 7.069 7.238 7.556 7.829 8.181 8.404 8.615 8.922 9.208 9.482 9.744 9.998 10.32 10.617 10.897 11.232 11.524 11.791 12.122 12.485 12.808 13.136 13.443 13.75 14.067 14.4 14.75 15.027 15.238 15.354 15.35 15.116 14.506 13.216 10.51 6.927 3.842 1.174 -1.149 -3.288 -5.134 -6.763 -8.191 -9.605 -10.818 -11.895 -12.892 -13.801 -14.661 -15.465 -16.317 -17.079 -17.725 -18.379 -19.049 -19.619 -20.214 -20.798 -21.234 -21.693 -22.179 -22.692 -23.246 -23.634 -24.022 -24.617 -25.017 -25.418 -25.634 -26.107 -26.6 -27.128 -27.407 -27.934 -28.218 -28.496 -28.789 -29.42 -29.798 -30.203 -30.619 -31.108 -31.697 -32.445 -34.377 -3 ,1130 ,KEBNE ,16724139,Sun Nov 28 05:10:36 CET,Sun Nov 28 06:56:17 CET,0.0 2.316 3.085 3.638 4.133 4.555 4.912 5.209 5.633 5.83 6.016 6.137 6.534 6.698 7.012 7.307 7.574 7.697 7.931 8.152 8.445 8.621 8.789 9.018 9.231 9.424 9.604 9.783 10.02 10.26 10.489 10.745 10.975 11.183 11.409 11.648 11.848 12.041 12.253 12.499 12.784 13.107 13.429 13.67 13.881 14.029 14.026 13.784 13.112 11.75 9.062 5.385 2.149 -0.596 -2.964 -5.09 -6.869 -8.502 -9.955 -11.37 -12.564 -13.596 -14.57 -15.508 -16.393 -17.209 -18.033 -18.761 -19.396 -20.041 -20.709 -21.262 -21.844 -22.454 -22.925 -23.409 -23.901 -24.404 -24.941 -25.32 -25.707 -26.311 -26.716 -27.121 -27.332 -27.788 -28.272 -28.773 -29.032 -29.549 -29.884 -30.192 -30.522 -31.308 -31.735 -32.163 -32.636 -33.186 -33.815 -34.64 -37.403 -4 ,20154 ,KEBNE ,16724140,Sun Nov 28 05:11:33 CET,Sun Nov 28 06:59:14 CET,0.0 1.489 2.094 2.543 2.93 3.269 3.586 3.871 4.343 4.563 4.767 4.92 5.326 5.501 5.823 6.133 6.415 6.542 6.797 7.054 7.413 7.639 7.85 8.131 8.397 8.658 8.917 9.169 9.486 9.775 10.04 10.359 10.666 10.947 11.251 11.582 11.893 12.229 12.566 12.887 13.195 13.519 13.839 14.087 14.353 14.547 14.569 14.382 13.79 12.53 9.896 6.308 3.342 0.842 -1.307 -3.161 -4.771 -6.203 -7.414 -8.635 -9.693 -10.631 -11.523 -12.36 -13.132 -13.837 -14.568 -15.222 -15.787 -16.372 -16.968 -17.456 -17.968 -18.494 -18.894 -19.314 -19.766 -20.23 -20.701 -21.035 -21.375 -21.89 -22.275 -22.685 -22.887 -23.319 -23.765 -24.217 -24.465 -24.984 -25.306 -25.614 -25.919 -26.576 -26.947 -27.35 -27.801 -28.325 -28.973 -29.822 -32.449 -5 ,25904 ,KEBNE ,16724141,Sun Nov 28 05:12:35 CET,Sun Nov 28 06:53:26 CET,0.0 1.587 2.334 2.907 3.391 3.828 4.217 4.56 5.182 5.467 5.732 5.998 6.441 6.63 6.955 7.248 7.513 7.641 7.897 8.136 8.482 8.713 8.938 9.245 9.528 9.809 10.064 10.29 10.6 10.891 11.152 11.463 11.763 12.041 12.332 12.647 12.965 13.31 13.658 14.001 14.317 14.636 14.952 15.219 15.442 15.547 15.575 15.43 14.885 13.65 10.985 7.32 4.134 1.354 -1.026 -3.111 -4.89 -6.511 -7.938 -9.362 -10.537 -11.5 -12.39 -13.22 -13.98 -14.685 -15.411 -16.059 -16.612 -17.163 -17.774 -18.281 -18.782 -19.351 -19.822 -20.315 -20.824 -21.311 -21.804 -22.143 -22.473 -22.989 -23.362 -23.761 -23.961 -24.363 -24.812 -25.279 -25.525 -26.057 -26.369 -26.658 -26.953 -27.603 -27.988 -28.42 -28.886 -29.417 -30.091 -31.003 -33.205 -7 ,15191 ,KEBNE ,16724143,Sun Nov 28 05:13:37 CET,Sun Nov 28 06:54:24 CET,0.0 1.387 1.95 2.373 2.734 3.063 3.348 3.619 4.112 4.327 4.54 4.714 5.114 5.289 5.61 5.93 6.24 6.38 6.648 6.9 7.243 7.447 7.645 7.937 8.219 8.483 8.725 8.951 9.235 9.514 9.791 10.122 10.403 10.672 11.005 11.361 11.676 12.008 12.369 12.723 13.05 13.353 13.672 13.987 14.228 14.361 14.381 14.222 13.787 12.622 9.996 6.421 3.311 0.681 -1.631 -3.739 -5.516 -6.982 -8.185 -9.405 -10.455 -11.359 -12.228 -13.062 -13.823 -14.517 -15.242 -15.893 -16.474 -17.086 -17.703 -18.216 -18.749 -19.29 -19.705 -20.135 -20.594 -21.064 -21.544 -21.885 -22.247 -22.823 -23.214 -23.611 -23.811 -24.218 -24.644 -25.091 -25.335 -25.866 -26.252 -26.606 -26.969 -27.715 -28.109 -28.511 -28.942 -29.468 -30.082 -30.87 -33.523 -8 ,24891 ,KEBNE ,16724144,Sun Nov 28 05:13:36 CET,Sun Nov 28 06:54:21 CET,0.0 1.701 2.322 2.791 3.151 3.445 3.702 3.945 4.393 4.598 4.786 4.913 5.306 5.473 5.796 6.087 6.342 6.465 6.71 6.954 7.315 7.538 7.748 8.03 8.28 8.498 8.697 8.896 9.139 9.35 9.547 9.809 10.096 10.377 10.691 11.036 11.339 11.67 12.053 12.43 12.775 13.112 13.417 13.673 13.931 14.123 14.191 14.011 13.439 12.15 9.411 5.822 2.704 -0.026 -2.386 -4.53 -6.397 -8.048 -9.482 -10.858 -11.935 -12.884 -13.787 -14.615 -15.402 -16.127 -16.858 -17.494 -18.047 -18.613 -19.199 -19.688 -20.193 -20.73 -21.156 -21.603 -22.061 -22.53 -23.03 -23.369 -23.712 -24.256 -24.643 -25.057 -25.271 -25.705 -26.148 -26.607 -26.857 -27.383 -27.692 -27.973 -28.28 -28.978 -29.357 -29.747 -30.169 -30.648 -31.235 -32.091 -35.082 -10 ,4306 ,KEBNE ,16724146,Sun Nov 28 05:15:41 CET,Sun Nov 28 06:57:47 CET,0.0 1.675 2.323 2.795 3.167 3.494 3.79 4.05 4.525 4.745 4.946 5.104 5.506 5.678 6.001 6.303 6.583 6.719 6.988 7.254 7.62 7.842 8.057 8.357 8.642 8.902 9.135 9.375 9.691 9.991 10.269 10.587 10.895 11.174 11.473 11.802 12.103 12.413 12.756 13.103 13.394 13.699 14.04 14.312 14.529 14.678 14.772 14.658 14.12 12.969 10.405 6.781 3.681 1.014 -1.252 -3.309 -5.121 -6.734 -8.119 -9.474 -10.632 -11.684 -12.67 -13.622 -14.502 -15.284 -16.116 -16.849 -17.475 -18.13 -18.8 -19.351 -19.909 -20.489 -20.973 -21.486 -21.983 -22.477 -22.999 -23.368 -23.739 -24.298 -24.691 -25.11 -25.329 -25.781 -26.259 -26.758 -27.02 -27.556 -27.918 -28.244 -28.557 -29.24 -29.637 -30.073 -30.549 -31.089 -31.756 -32.652 -35.263 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt deleted file mode 100644 index a3960d59..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23822 ,KEBNE ,17026388,Wed Dec 22 14:13:22 CET,Wed Dec 22 15:54:53 CET,0.0 1.778 2.465 2.99 3.42 3.806 4.163 4.48 5.047 5.313 5.558 5.793 6.234 6.441 6.846 7.231 7.597 7.77 8.102 8.421 8.872 9.173 9.468 9.868 10.248 10.613 10.962 11.307 11.749 12.178 12.583 13.054 13.507 13.943 14.439 14.987 15.521 16.101 16.714 17.371 18.069 18.833 19.651 20.471 21.416 22.439 23.572 24.704 25.86 27.042 27.954 27.918 27.371 26.637 25.876 25.085 24.357 23.689 23.062 22.382 21.766 21.228 20.714 20.212 19.725 19.261 18.783 18.346 17.956 17.564 17.148 16.802 16.44 16.054 15.75 15.443 15.124 14.791 14.436 14.181 13.915 13.446 13.11 12.775 12.613 12.29 11.955 11.605 11.415 11.001 10.794 10.566 10.333 9.824 9.528 9.206 8.862 8.45 7.945 7.254 5.409 -2 ,18238 ,KEBNE ,17026389,Wed Dec 22 14:13:22 CET,Wed Dec 22 15:55:52 CET,0.0 1.538 2.255 2.741 3.117 3.468 3.81 4.129 4.713 4.984 5.242 5.49 5.936 6.146 6.549 6.923 7.263 7.426 7.746 8.063 8.519 8.803 9.07 9.451 9.824 10.185 10.525 10.862 11.299 11.715 12.11 12.594 13.086 13.547 14.07 14.662 15.202 15.78 16.412 17.09 17.777 18.523 19.379 20.233 21.229 22.271 23.354 24.459 25.645 26.834 27.757 27.847 27.357 26.595 25.78 24.991 24.225 23.469 22.817 22.15 21.565 21.028 20.491 19.966 19.466 19.021 18.574 18.164 17.801 17.407 16.975 16.626 16.261 15.869 15.567 15.252 14.922 14.591 14.239 13.984 13.729 13.311 12.998 12.678 12.518 12.203 11.884 11.542 11.36 10.954 10.765 10.533 10.274 9.709 9.404 9.075 8.724 8.328 7.851 7.25 5.75 -3 ,12296 ,KEBNE ,17026390,Wed Dec 22 14:13:22 CET,Wed Dec 22 15:55:48 CET,0.0 1.465 2.103 2.615 3.056 3.434 3.773 4.082 4.638 4.893 5.129 5.354 5.787 5.986 6.386 6.774 7.125 7.296 7.634 7.955 8.419 8.712 8.983 9.373 9.751 10.117 10.469 10.797 11.226 11.657 12.071 12.562 13.026 13.46 13.966 14.536 15.063 15.629 16.268 16.948 17.62 18.38 19.249 20.104 21.047 22.019 23.083 24.174 25.359 26.485 27.274 27.372 26.978 26.327 25.603 24.869 24.138 23.436 22.814 22.195 21.643 21.105 20.581 20.079 19.603 19.164 18.694 18.255 17.882 17.492 17.089 16.754 16.39 15.997 15.679 15.336 14.963 14.595 14.242 13.992 13.731 13.305 12.976 12.633 12.462 12.092 11.677 11.222 10.996 10.579 10.403 10.193 9.966 9.458 9.185 8.876 8.504 8.071 7.543 6.855 5.282 -4 ,2243 ,KEBNE ,17026391,Wed Dec 22 14:14:23 CET,Wed Dec 22 15:58:08 CET,0.0 1.642 2.425 2.987 3.483 3.933 4.347 4.725 5.361 5.631 5.874 6.105 6.546 6.772 7.184 7.556 7.912 8.081 8.406 8.708 9.136 9.418 9.703 10.115 10.511 10.884 11.233 11.571 12.016 12.452 12.857 13.336 13.801 14.249 14.763 15.336 15.87 16.439 17.075 17.745 18.403 19.173 20.048 20.842 21.749 22.721 23.784 24.879 26.046 27.264 28.227 28.318 27.918 27.333 26.64 25.907 25.181 24.467 23.821 23.134 22.55 22.035 21.524 21.018 20.533 20.094 19.645 19.237 18.875 18.489 18.079 17.736 17.37 16.996 16.703 16.393 16.077 15.735 15.391 15.163 14.921 14.53 14.241 13.932 13.777 13.462 13.136 12.797 12.607 12.186 11.987 11.765 11.532 10.981 10.681 10.365 9.987 9.591 9.175 8.6 7.273 -5 ,30683 ,KEBNE ,17026392,Wed Dec 22 14:14:24 CET,Wed Dec 22 15:56:44 CET,0.0 1.305 1.992 2.532 2.956 3.335 3.686 4.007 4.59 4.844 5.079 5.316 5.754 5.954 6.337 6.702 7.052 7.224 7.56 7.884 8.349 8.651 8.962 9.422 9.862 10.281 10.68 11.069 11.546 11.964 12.362 12.852 13.316 13.756 14.287 14.887 15.449 16.048 16.682 17.362 18.037 18.78 19.64 20.493 21.439 22.433 23.529 24.628 25.776 27.004 27.982 28.073 27.62 26.948 26.221 25.469 24.712 23.97 23.289 22.586 21.979 21.416 20.866 20.337 19.843 19.381 18.884 18.441 18.065 17.676 17.271 16.922 16.551 16.16 15.861 15.562 15.245 14.924 14.589 14.344 14.088 13.674 13.389 13.103 12.949 12.63 12.294 11.938 11.752 11.344 11.144 10.907 10.657 10.149 9.874 9.559 9.207 8.815 8.337 7.7 6.025 -6 ,27507 ,KEBNE ,17026393,Wed Dec 22 14:14:23 CET,Wed Dec 22 15:55:47 CET,0.0 1.661 2.375 2.988 3.444 3.802 4.155 4.481 5.02 5.274 5.53 5.763 6.187 6.391 6.784 7.149 7.498 7.666 7.989 8.301 8.733 9.017 9.3 9.689 10.069 10.45 10.807 11.147 11.625 12.116 12.57 13.085 13.566 14.023 14.534 15.094 15.622 16.212 16.848 17.495 18.164 18.918 19.801 20.671 21.623 22.634 23.736 24.875 26.098 27.256 28.166 28.216 27.685 26.997 26.248 25.452 24.682 23.944 23.299 22.642 22.048 21.518 21.01 20.501 19.992 19.541 19.084 18.671 18.307 17.918 17.51 17.147 16.74 16.345 16.057 15.746 15.423 15.092 14.745 14.505 14.253 13.86 13.584 13.278 13.114 12.788 12.443 12.066 11.875 11.461 11.235 10.999 10.758 10.217 9.927 9.621 9.24 8.762 8.185 7.429 5.672 -7 ,4833 ,KEBNE ,17026394,Wed Dec 22 14:14:23 CET,Wed Dec 22 15:56:00 CET,0.0 1.644 2.313 2.842 3.27 3.66 3.996 4.296 4.856 5.113 5.372 5.628 6.06 6.255 6.636 7.005 7.369 7.554 7.92 8.272 8.762 9.046 9.309 9.704 10.079 10.441 10.789 11.129 11.582 12.003 12.392 12.881 13.368 13.835 14.364 14.952 15.511 16.103 16.696 17.352 18.048 18.776 19.622 20.458 21.376 22.354 23.421 24.559 25.789 26.99 27.882 27.883 27.373 26.725 25.986 25.232 24.527 23.807 23.133 22.469 21.916 21.371 20.808 20.279 19.782 19.325 18.84 18.398 18.021 17.634 17.227 16.884 16.524 16.144 15.845 15.542 15.216 14.864 14.502 14.256 14.005 13.62 13.348 13.057 12.905 12.591 12.238 11.861 11.676 11.257 11.026 10.792 10.551 10.03 9.731 9.407 9.019 8.518 7.903 7.117 4.846 -8 ,4552 ,KEBNE ,17026395,Wed Dec 22 14:14:24 CET,Wed Dec 22 15:55:44 CET,0.0 1.508 2.146 2.623 3.017 3.367 3.708 4.039 4.627 4.887 5.133 5.365 5.794 6.002 6.382 6.739 7.106 7.283 7.626 7.959 8.411 8.691 8.982 9.437 9.882 10.307 10.683 11.026 11.456 11.877 12.311 12.813 13.259 13.692 14.189 14.736 15.253 15.842 16.495 17.168 17.844 18.584 19.428 20.25 21.161 22.121 23.162 24.306 25.554 26.699 27.593 27.658 27.19 26.52 25.782 25.036 24.294 23.57 22.929 22.293 21.745 21.236 20.727 20.225 19.749 19.287 18.802 18.372 17.98 17.589 17.179 16.826 16.468 16.088 15.782 15.467 15.143 14.803 14.451 14.213 13.957 13.548 13.258 12.965 12.818 12.505 12.188 11.839 11.649 11.238 11.027 10.805 10.58 10.084 9.814 9.516 9.148 8.719 8.227 7.63 6.16 -9 ,1776 ,KEBNE ,17026396,Wed Dec 22 14:14:24 CET,Wed Dec 22 15:58:16 CET,0.0 1.512 2.14 2.613 3.013 3.373 3.702 4.002 4.593 4.864 5.098 5.308 5.732 5.933 6.323 6.691 7.038 7.203 7.526 7.843 8.287 8.566 8.845 9.249 9.624 9.981 10.333 10.678 11.111 11.538 11.952 12.458 12.943 13.389 13.892 14.452 15.009 15.618 16.249 16.894 17.559 18.305 19.142 19.964 20.924 22.003 23.166 24.309 25.521 26.686 27.583 27.66 27.087 26.311 25.53 24.777 24.04 23.323 22.67 21.981 21.373 20.815 20.289 19.802 19.322 18.875 18.389 17.952 17.581 17.194 16.776 16.419 16.05 15.671 15.382 15.088 14.777 14.442 14.108 13.88 13.635 13.236 12.956 12.667 12.517 12.203 11.867 11.517 11.337 10.935 10.75 10.54 10.319 9.822 9.535 9.208 8.837 8.44 8.002 7.408 5.78 -10 ,27712 ,KEBNE ,17026397,Wed Dec 22 14:15:25 CET,Wed Dec 22 15:57:10 CET,0.0 1.239 1.86 2.386 2.822 3.18 3.502 3.805 4.35 4.603 4.854 5.079 5.508 5.72 6.131 6.523 6.894 7.073 7.42 7.736 8.187 8.48 8.763 9.175 9.574 9.959 10.331 10.68 11.11 11.52 11.918 12.41 12.889 13.343 13.845 14.412 14.955 15.528 16.144 16.813 17.512 18.304 19.197 20.079 21.064 22.067 23.134 24.238 25.4 26.623 27.568 27.486 26.988 26.289 25.55 24.787 24.017 23.284 22.634 21.989 21.415 20.885 20.367 19.872 19.402 18.974 18.532 18.117 17.748 17.355 16.928 16.575 16.211 15.835 15.556 15.25 14.924 14.588 14.235 13.99 13.736 13.318 13.014 12.707 12.544 12.201 11.862 11.507 11.318 10.912 10.723 10.5 10.261 9.746 9.462 9.133 8.751 8.342 7.889 7.288 5.98 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt deleted file mode 100644 index 13e202f9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25061 ,KEBNE ,17026398,Wed Dec 22 14:15:25 CET,Wed Dec 22 15:57:02 CET,0.0 2.206 2.866 3.34 3.768 4.145 4.503 4.815 5.377 5.635 5.887 6.168 6.613 6.831 7.279 7.697 8.09 8.282 8.645 8.986 9.458 9.759 10.059 10.496 10.898 11.283 11.654 12.017 12.483 12.916 13.345 13.876 14.385 14.879 15.464 16.116 16.735 17.395 18.091 18.846 19.647 20.538 21.531 22.514 23.671 24.918 26.295 27.775 29.367 31.106 32.81 33.58 33.568 33.275 32.856 32.358 31.833 31.276 30.759 30.225 29.726 29.26 28.805 28.342 27.89 27.469 27.025 26.617 26.256 25.881 25.497 25.181 24.851 24.492 24.211 23.927 23.614 23.284 22.941 22.702 22.456 22.068 21.796 21.516 21.364 21.04 20.702 20.336 20.155 19.761 19.55 19.32 19.07 18.52 18.229 17.92 17.556 17.137 16.617 15.939 13.714 -2 ,10429 ,KEBNE ,17026399,Wed Dec 22 14:15:26 CET,Wed Dec 22 15:56:55 CET,0.0 1.654 2.342 2.891 3.324 3.708 4.049 4.359 4.942 5.213 5.465 5.719 6.172 6.394 6.812 7.204 7.572 7.752 8.113 8.467 8.964 9.273 9.567 9.999 10.398 10.775 11.15 11.519 11.989 12.442 12.893 13.453 13.985 14.479 15.051 15.696 16.322 16.998 17.694 18.44 19.204 20.058 21.053 22.006 23.16 24.462 25.86 27.306 28.9 30.59 32.178 32.9 32.833 32.484 32.029 31.459 30.859 30.3 29.794 29.221 28.668 28.186 27.745 27.312 26.883 26.475 26.045 25.659 25.308 24.939 24.559 24.231 23.88 23.532 23.264 22.97 22.656 22.334 22.006 21.768 21.503 21.078 20.796 20.525 20.381 20.059 19.731 19.377 19.18 18.77 18.534 18.293 18.046 17.489 17.177 16.834 16.461 16.072 15.644 15.06 13.34 -3 ,31638 ,KEBNE ,17026400,Wed Dec 22 14:15:25 CET,Wed Dec 22 15:57:08 CET,0.0 1.573 2.206 2.733 3.227 3.654 4.017 4.363 4.966 5.237 5.51 5.796 6.256 6.483 6.9 7.291 7.657 7.844 8.213 8.548 9.033 9.355 9.666 10.099 10.492 10.87 11.256 11.634 12.113 12.573 13.015 13.534 14.03 14.519 15.103 15.748 16.351 17.008 17.703 18.448 19.236 20.1 21.083 22.033 23.13 24.381 25.804 27.329 28.965 30.675 32.252 32.967 32.926 32.556 32.04 31.444 30.864 30.261 29.698 29.131 28.614 28.147 27.696 27.27 26.847 26.42 25.977 25.549 25.172 24.816 24.43 24.098 23.761 23.414 23.141 22.859 22.556 22.227 21.878 21.628 21.37 20.967 20.692 20.403 20.255 19.952 19.626 19.273 19.087 18.686 18.473 18.254 18.025 17.506 17.237 16.941 16.583 16.158 15.675 15.02 12.546 -4 ,24872 ,KEBNE ,17026401,Wed Dec 22 14:15:25 CET,Wed Dec 22 15:58:24 CET,0.0 1.802 2.489 2.99 3.429 3.835 4.197 4.536 5.108 5.376 5.633 5.89 6.335 6.555 6.975 7.373 7.748 7.923 8.262 8.599 9.098 9.404 9.697 10.126 10.535 10.918 11.298 11.682 12.172 12.639 13.094 13.656 14.185 14.68 15.226 15.816 16.406 17.05 17.752 18.491 19.276 20.177 21.213 22.204 23.316 24.549 25.902 27.38 29.086 30.842 32.446 33.197 33.202 32.89 32.412 31.898 31.384 30.833 30.32 29.741 29.204 28.728 28.231 27.749 27.317 26.923 26.495 26.099 25.737 25.352 24.96 24.64 24.313 23.961 23.691 23.412 23.11 22.797 22.467 22.232 21.989 21.606 21.341 21.054 20.9 20.589 20.252 19.893 19.708 19.305 19.104 18.885 18.64 18.1 17.804 17.471 17.104 16.687 16.185 15.447 13.154 -5 ,26803 ,KEBNE ,17026402,Wed Dec 22 14:15:29 CET,Wed Dec 22 15:53:29 CET,0.0 1.73 2.42 2.947 3.392 3.811 4.16 4.482 5.143 5.437 5.684 5.937 6.392 6.611 7.032 7.423 7.784 7.96 8.306 8.646 9.148 9.472 9.786 10.228 10.637 11.026 11.401 11.761 12.227 12.684 13.124 13.647 14.151 14.646 15.22 15.856 16.462 17.111 17.813 18.554 19.344 20.253 21.281 22.298 23.5 24.788 26.175 27.731 29.465 31.254 32.968 33.807 33.824 33.484 33.019 32.471 31.917 31.374 30.873 30.314 29.8 29.347 28.874 28.414 27.991 27.59 27.173 26.798 26.448 26.042 25.624 25.295 24.951 24.586 24.29 23.963 23.61 23.255 22.9 22.656 22.407 22.032 21.768 21.484 21.334 21.024 20.693 20.343 20.154 19.745 19.523 19.292 19.052 18.519 18.232 17.934 17.601 17.207 16.723 16.02 14.181 -6 ,11842 ,KEBNE ,17026403,Wed Dec 22 14:16:26 CET,Wed Dec 22 15:59:25 CET,0.0 2.115 2.831 3.357 3.803 4.194 4.562 4.887 5.453 5.731 5.991 6.24 6.691 6.913 7.325 7.712 8.085 8.264 8.602 8.928 9.419 9.772 10.133 10.641 11.11 11.556 12.014 12.46 13.017 13.521 13.981 14.54 15.081 15.588 16.146 16.771 17.374 18.023 18.722 19.447 20.222 21.102 22.099 23.069 24.161 25.377 26.734 28.23 29.89 31.564 33.205 34.094 34.133 33.806 33.351 32.816 32.253 31.682 31.166 30.612 30.098 29.635 29.185 28.74 28.296 27.89 27.472 27.083 26.748 26.392 25.998 25.661 25.313 24.954 24.685 24.396 24.077 23.747 23.411 23.177 22.928 22.539 22.269 21.987 21.845 21.538 21.214 20.886 20.706 20.31 20.13 19.912 19.68 19.189 18.902 18.579 18.223 17.795 17.307 16.696 15.148 -7 ,27916 ,KEBNE ,17026404,Wed Dec 22 14:16:26 CET,Wed Dec 22 15:57:45 CET,0.0 2.207 2.845 3.358 3.791 4.163 4.507 4.843 5.48 5.758 6.006 6.238 6.677 6.892 7.31 7.707 8.081 8.262 8.611 8.931 9.386 9.686 9.987 10.41 10.803 11.199 11.584 11.94 12.404 12.842 13.245 13.742 14.222 14.67 15.191 15.789 16.359 16.989 17.671 18.399 19.161 20.025 21.037 22.039 23.19 24.457 25.84 27.301 28.977 30.728 32.414 33.15 33.075 32.697 32.217 31.691 31.138 30.58 30.063 29.518 29.002 28.524 28.071 27.638 27.211 26.801 26.371 25.992 25.656 25.275 24.866 24.534 24.18 23.813 23.542 23.25 22.934 22.593 22.236 21.998 21.761 21.382 21.105 20.804 20.646 20.333 20.005 19.65 19.446 19.011 18.7 18.418 18.138 17.523 17.156 16.751 16.337 15.919 15.384 14.715 12.793 -8 ,12046 ,KEBNE ,17026405,Wed Dec 22 14:16:30 CET,Wed Dec 22 15:54:26 CET,0.0 2.143 2.948 3.555 4.057 4.524 4.966 5.377 6.124 6.446 6.75 7.113 7.604 7.863 8.35 8.803 9.241 9.45 9.84 10.224 10.762 11.08 11.389 11.848 12.271 12.674 13.048 13.412 13.882 14.325 14.755 15.292 15.839 16.365 16.943 17.577 18.192 18.855 19.528 20.239 21.032 21.934 22.935 23.906 25.034 26.262 27.645 29.172 30.858 32.682 34.507 35.379 35.38 35.047 34.601 34.081 33.569 33.021 32.495 31.94 31.433 30.956 30.476 30.02 29.58 29.162 28.737 28.354 28.004 27.644 27.267 26.941 26.593 26.215 25.905 25.566 25.203 24.856 24.516 24.271 24.018 23.634 23.365 23.067 22.915 22.614 22.271 21.907 21.727 21.334 21.119 20.891 20.657 20.15 19.874 19.559 19.198 18.793 18.263 17.55 15.571 -9 ,5614 ,KEBNE ,17026406,Wed Dec 22 14:16:27 CET,Wed Dec 22 15:57:59 CET,0.0 1.818 2.547 3.063 3.513 3.937 4.305 4.615 5.165 5.434 5.697 5.975 6.436 6.665 7.092 7.489 7.868 8.054 8.421 8.776 9.268 9.574 9.869 10.295 10.703 11.109 11.5 11.871 12.341 12.786 13.221 13.745 14.234 14.699 15.256 15.88 16.462 17.111 17.826 18.584 19.37 20.243 21.219 22.18 23.313 24.523 25.888 27.42 29.089 30.845 32.541 33.36 33.381 33.012 32.499 31.962 31.398 30.823 30.316 29.757 29.234 28.768 28.307 27.846 27.422 27.03 26.605 26.21 25.865 25.511 25.139 24.831 24.507 24.167 23.903 23.615 23.304 22.985 22.645 22.399 22.149 21.751 21.465 21.181 21.036 20.715 20.373 19.998 19.799 19.404 19.223 19.005 18.768 18.239 17.929 17.588 17.221 16.818 16.335 15.713 13.917 -10 ,8342 ,KEBNE ,17026407,Wed Dec 22 14:16:27 CET,Wed Dec 22 15:58:00 CET,0.0 1.646 2.37 2.952 3.426 3.836 4.19 4.5 5.058 5.31 5.556 5.805 6.251 6.473 6.898 7.315 7.709 7.892 8.235 8.576 9.058 9.355 9.653 10.076 10.478 10.883 11.273 11.642 12.104 12.54 12.955 13.455 13.967 14.477 15.038 15.654 16.256 16.899 17.591 18.346 19.122 19.972 20.944 21.926 23.094 24.368 25.767 27.208 28.791 30.51 32.161 32.971 33.064 32.824 32.383 31.84 31.281 30.675 30.093 29.503 28.993 28.52 28.048 27.579 27.126 26.728 26.318 25.941 25.599 25.233 24.848 24.513 24.166 23.814 23.536 23.246 22.942 22.615 22.285 22.059 21.815 21.422 21.138 20.85 20.707 20.415 20.096 19.749 19.572 19.174 18.958 18.735 18.507 17.998 17.696 17.373 17.007 16.556 15.99 15.197 12.889 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 258a0883..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21529 ,KEBNE ,17026408,Wed Dec 22 14:17:29 CET,Wed Dec 22 15:58:02 CET,0.0 0.538 0.949 1.275 1.573 1.816 2.04 2.473 2.668 2.86 2.992 3.381 3.54 3.855 4.158 4.444 4.576 4.832 5.095 5.483 5.722 5.96 6.3 6.623 6.938 7.239 7.538 7.927 8.295 8.643 9.061 9.467 9.866 10.311 10.799 11.301 11.848 12.42 13.033 13.687 14.416 15.256 16.136 17.128 18.166 19.362 20.667 22.067 23.462 24.733 25.194 24.92 24.423 23.883 23.278 22.643 22.023 21.464 20.877 20.346 19.822 19.285 18.763 18.254 17.79 17.331 16.908 16.522 16.097 15.635 15.254 14.857 14.443 14.133 13.794 13.412 13.015 12.571 12.257 11.943 11.443 11.08 10.664 10.441 9.986 9.524 9.063 8.8 8.317 7.92 7.594 7.261 6.413 5.889 5.369 4.764 4.009 3.188 1.912 -2 ,21651 ,KEBNE ,17026409,Wed Dec 22 14:17:29 CET,Wed Dec 22 15:56:05 CET,0.0 0.617 1.074 1.422 1.717 1.988 2.236 2.675 2.879 3.072 3.201 3.596 3.754 4.057 4.339 4.615 4.753 5.031 5.316 5.706 5.938 6.166 6.505 6.818 7.118 7.425 7.721 8.104 8.476 8.828 9.231 9.629 10.041 10.508 11.006 11.5 12.04 12.606 13.19 13.814 14.513 15.297 16.155 17.161 18.179 19.327 20.627 22.085 23.597 24.936 25.425 25.257 24.822 24.201 23.49 22.827 22.208 21.619 20.965 20.405 19.888 19.358 18.851 18.374 17.918 17.41 16.965 16.587 16.177 15.727 15.338 14.926 14.489 14.16 13.823 13.462 13.067 12.649 12.364 12.064 11.563 11.209 10.865 10.684 10.281 9.822 9.314 9.046 8.57 8.207 7.896 7.536 6.772 6.366 5.884 5.322 4.616 3.639 2.308 -3 ,31803 ,KEBNE ,17026410,Wed Dec 22 14:17:29 CET,Wed Dec 22 15:56:31 CET,0.0 0.506 0.916 1.271 1.565 1.832 2.069 2.495 2.701 2.898 3.04 3.449 3.617 3.927 4.228 4.513 4.654 4.927 5.177 5.54 5.781 6.028 6.371 6.701 7.037 7.348 7.643 8.027 8.391 8.748 9.186 9.607 10.003 10.439 10.935 11.421 11.948 12.526 13.143 13.816 14.564 15.396 16.246 17.241 18.305 19.474 20.799 22.244 23.631 24.932 25.436 25.234 24.737 24.107 23.419 22.777 22.178 21.6 20.988 20.41 19.853 19.316 18.798 18.316 17.858 17.345 16.896 16.507 16.082 15.631 15.253 14.833 14.348 13.954 13.545 13.113 12.647 12.145 11.792 11.427 10.854 10.459 10.018 9.785 9.315 8.792 8.238 7.956 7.465 7.085 6.772 6.43 5.656 5.227 4.74 4.143 3.444 2.455 0.809 -4 ,30281 ,KEBNE ,17026411,Wed Dec 22 14:17:29 CET,Wed Dec 22 15:56:34 CET,0.0 0.456 0.823 1.159 1.472 1.757 2.013 2.497 2.732 2.944 3.1 3.516 3.696 4.036 4.336 4.613 4.752 5.022 5.289 5.665 5.902 6.143 6.483 6.83 7.194 7.529 7.824 8.195 8.554 8.888 9.303 9.714 10.106 10.548 11.062 11.546 12.061 12.645 13.27 13.914 14.624 15.46 16.321 17.284 18.319 19.527 20.854 22.301 23.731 24.988 25.445 25.198 24.655 24.053 23.43 22.811 22.207 21.629 20.99 20.42 19.898 19.385 18.874 18.393 17.949 17.476 17.051 16.677 16.28 15.829 15.433 15.044 14.661 14.351 14.002 13.621 13.231 12.827 12.534 12.214 11.676 11.298 10.887 10.671 10.194 9.674 9.18 8.917 8.429 7.998 7.642 7.25 6.414 5.931 5.399 4.83 4.111 3.137 1.695 -5 ,19698 ,KEBNE ,17026412,Wed Dec 22 14:17:28 CET,Wed Dec 22 15:56:20 CET,0.0 0.637 1.065 1.373 1.655 1.928 2.189 2.674 2.886 3.076 3.213 3.633 3.83 4.186 4.504 4.79 4.929 5.212 5.485 5.871 6.104 6.331 6.672 6.999 7.323 7.641 7.929 8.292 8.661 9.023 9.448 9.853 10.236 10.676 11.182 11.675 12.216 12.807 13.435 14.077 14.803 15.64 16.465 17.431 18.459 19.561 20.786 22.229 23.78 25.16 25.69 25.485 24.988 24.415 23.766 23.11 22.482 21.928 21.337 20.804 20.283 19.728 19.205 18.73 18.286 17.806 17.369 16.993 16.561 16.037 15.59 15.173 14.715 14.309 13.898 13.46 12.993 12.52 12.215 11.91 11.424 11.071 10.695 10.508 10.093 9.642 9.151 8.888 8.397 8.001 7.71 7.375 6.586 6.124 5.608 5.024 4.327 3.462 2.047 -6 ,7008 ,KEBNE ,17026413,Wed Dec 22 14:17:28 CET,Wed Dec 22 15:55:36 CET,0.0 0.57 1.011 1.358 1.675 1.947 2.182 2.624 2.836 3.032 3.16 3.561 3.727 4.063 4.387 4.71 4.864 5.136 5.401 5.796 6.038 6.269 6.6 6.923 7.233 7.531 7.822 8.204 8.575 8.98 9.48 9.911 10.317 10.765 11.258 11.752 12.304 12.893 13.518 14.182 14.922 15.748 16.585 17.56 18.595 19.765 21.072 22.496 23.938 25.294 25.831 25.626 25.157 24.592 23.978 23.364 22.727 22.11 21.491 20.962 20.475 19.987 19.499 19.025 18.566 18.076 17.629 17.23 16.808 16.368 16.002 15.603 15.189 14.867 14.514 14.142 13.76 13.347 13.043 12.733 12.26 11.921 11.571 11.395 10.972 10.446 9.885 9.574 9.053 8.593 8.208 7.811 6.945 6.402 5.762 5.064 4.246 3.273 1.856 -7 ,1406 ,KEBNE ,17026414,Wed Dec 22 14:17:29 CET,Wed Dec 22 15:56:44 CET,0.0 0.633 1.119 1.533 1.896 2.223 2.513 3.033 3.278 3.515 3.695 4.099 4.266 4.578 4.866 5.141 5.277 5.532 5.779 6.137 6.367 6.594 6.925 7.249 7.558 7.861 8.161 8.542 8.907 9.263 9.689 10.116 10.536 11.01 11.575 12.128 12.713 13.347 13.998 14.699 15.531 16.471 17.376 18.451 19.623 20.891 22.252 23.734 25.268 26.711 27.158 26.8 26.157 25.376 24.562 23.749 22.962 22.25 21.521 20.889 20.261 19.6 18.982 18.41 17.87 17.283 16.752 16.285 15.79 15.295 14.867 14.393 13.91 13.549 13.158 12.736 12.29 11.808 11.474 11.137 10.63 10.267 9.861 9.642 9.167 8.685 8.16 7.877 7.385 6.97 6.636 6.262 5.437 4.988 4.456 3.862 3.176 2.305 1.042 -8 ,6482 ,KEBNE ,17026415,Wed Dec 22 14:17:29 CET,Wed Dec 22 15:56:18 CET,0.0 0.489 0.9 1.236 1.519 1.787 2.039 2.475 2.678 2.891 3.071 3.492 3.668 4.007 4.322 4.605 4.743 5.034 5.321 5.702 5.937 6.158 6.483 6.794 7.09 7.396 7.708 8.104 8.461 8.807 9.236 9.645 10.033 10.471 10.958 11.435 11.959 12.528 13.127 13.76 14.505 15.374 16.219 17.292 18.535 19.876 21.355 23.115 24.941 26.308 26.633 26.262 25.574 24.753 23.885 23.082 22.328 21.595 20.804 20.105 19.442 18.75 18.111 17.554 17.008 16.389 15.848 15.394 14.912 14.408 13.988 13.531 13.022 12.617 12.215 11.787 11.336 10.888 10.594 10.283 9.72 9.311 8.911 8.7 8.242 7.754 7.256 6.989 6.495 6.053 5.7 5.335 4.498 4.004 3.447 2.83 2.108 1.21 -0.1 -9 ,6048 ,KEBNE ,17026416,Wed Dec 22 14:17:29 CET,Wed Dec 22 15:56:36 CET,0.0 0.463 0.826 1.129 1.428 1.681 1.92 2.431 2.672 2.914 3.14 3.571 3.748 4.052 4.342 4.62 4.754 5.018 5.28 5.647 5.886 6.126 6.467 6.793 7.117 7.443 7.756 8.172 8.569 8.926 9.336 9.733 10.113 10.564 11.098 11.638 12.21 12.795 13.428 14.079 14.833 15.688 16.506 17.47 18.479 19.629 20.906 22.277 23.655 24.939 25.471 25.315 24.931 24.402 23.766 23.145 22.526 21.924 21.25 20.647 20.144 19.634 19.121 18.64 18.18 17.667 17.191 16.787 16.367 15.906 15.513 15.115 14.685 14.346 13.997 13.643 13.272 12.854 12.565 12.268 11.781 11.432 11.088 10.9 10.489 10.056 9.562 9.3 8.829 8.468 8.154 7.802 6.995 6.522 5.996 5.402 4.685 3.741 2.162 -10 ,7478 ,KEBNE ,17026417,Wed Dec 22 14:17:29 CET,Wed Dec 22 15:57:42 CET,0.0 0.513 0.934 1.294 1.595 1.863 2.103 2.519 2.721 2.914 3.062 3.467 3.626 3.946 4.257 4.561 4.715 5.007 5.286 5.688 5.937 6.162 6.49 6.824 7.148 7.463 7.775 8.155 8.509 8.875 9.316 9.735 10.146 10.624 11.158 11.667 12.227 12.837 13.473 14.129 14.85 15.697 16.548 17.493 18.516 19.646 20.907 22.333 23.699 24.912 25.441 25.326 24.911 24.373 23.704 23.031 22.412 21.816 21.176 20.591 20.059 19.525 19.018 18.537 18.082 17.605 17.145 16.737 16.307 15.87 15.506 15.111 14.683 14.344 13.997 13.614 13.208 12.785 12.471 12.147 11.678 11.333 10.962 10.774 10.366 9.918 9.446 9.197 8.721 8.308 7.985 7.657 6.892 6.439 5.928 5.363 4.622 3.666 2.44 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index 2e26cb8e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6865 ,KEBNE ,16724147,Sun Nov 28 05:15:41 CET,Sun Nov 28 06:56:45 CET,0.0 1.891 2.51 2.972 3.381 3.728 4.042 4.345 4.895 5.132 5.36 5.594 6.018 6.22 6.608 6.968 7.31 7.47 7.764 8.041 8.433 8.693 8.969 9.379 9.749 10.085 10.395 10.698 11.096 11.489 11.86 12.263 12.661 13.061 13.518 14.033 14.502 15.005 15.551 16.116 16.696 17.343 18.087 18.823 19.638 20.492 21.443 22.392 23.284 24.013 24.283 23.724 22.832 21.842 20.859 19.895 18.988 18.121 17.35 16.566 15.889 15.263 14.635 14.063 13.545 13.046 12.508 12.035 11.618 11.178 10.724 10.357 9.97 9.553 9.218 8.868 8.514 8.138 7.739 7.452 7.155 6.703 6.373 6.034 5.87 5.519 5.15 4.779 4.585 4.161 3.916 3.671 3.429 2.901 2.6 2.282 1.935 1.52 1.026 0.418 -1.118 -2 ,210 ,KEBNE ,16724148,Sun Nov 28 05:15:41 CET,Sun Nov 28 06:56:37 CET,0.0 1.602 2.305 2.796 3.208 3.565 3.883 4.194 4.737 4.971 5.197 5.44 5.902 6.134 6.541 6.903 7.244 7.408 7.717 8.01 8.42 8.688 8.95 9.327 9.688 10.015 10.316 10.62 11.018 11.377 11.718 12.135 12.535 12.916 13.364 13.87 14.342 14.839 15.372 15.929 16.5 17.168 17.925 18.622 19.419 20.309 21.241 22.072 22.858 23.493 23.658 23.115 22.267 21.286 20.289 19.309 18.408 17.576 16.829 16.044 15.357 14.739 14.141 13.586 13.05 12.551 12.045 11.565 11.143 10.722 10.274 9.88 9.47 9.068 8.736 8.388 8.059 7.713 7.335 7.067 6.783 6.352 6.064 5.753 5.592 5.251 4.881 4.508 4.319 3.913 3.712 3.486 3.242 2.695 2.374 1.984 1.539 1.044 0.464 -0.334 -2.558 -3 ,7869 ,KEBNE ,16724149,Sun Nov 28 05:16:43 CET,Sun Nov 28 06:58:59 CET,0.0 1.463 1.924 2.313 2.663 2.974 3.252 3.508 4.018 4.261 4.488 4.699 5.114 5.306 5.669 5.99 6.292 6.449 6.757 7.046 7.459 7.717 7.964 8.322 8.674 9.015 9.335 9.639 10.029 10.405 10.769 11.21 11.634 12.031 12.474 12.972 13.443 13.944 14.492 15.078 15.659 16.291 17.025 17.735 18.547 19.425 20.354 21.238 22.081 22.756 22.855 22.28 21.386 20.377 19.422 18.427 17.476 16.613 15.826 15.012 14.332 13.725 13.146 12.588 12.043 11.554 11.038 10.55 10.121 9.693 9.237 8.841 8.437 8.021 7.692 7.34 6.972 6.603 6.223 5.954 5.67 5.231 4.937 4.627 4.461 4.117 3.768 3.413 3.231 2.822 2.599 2.359 2.108 1.568 1.259 0.931 0.58 0.168 -0.358 -1.041 -2.81 -4 ,22101 ,KEBNE ,16724150,Sun Nov 28 05:18:47 CET,Sun Nov 28 06:59:43 CET,0.0 1.699 2.38 2.878 3.291 3.652 3.966 4.262 4.824 5.078 5.308 5.501 5.913 6.103 6.462 6.808 7.125 7.281 7.594 7.885 8.294 8.557 8.813 9.185 9.535 9.873 10.188 10.485 10.873 11.245 11.605 12.043 12.453 12.846 13.302 13.796 14.253 14.762 15.311 15.885 16.486 17.142 17.877 18.56 19.315 20.107 20.938 21.817 22.695 23.428 23.669 23.074 22.15 21.137 20.155 19.222 18.33 17.478 16.731 15.994 15.337 14.724 14.133 13.569 13.034 12.535 11.991 11.51 11.098 10.656 10.212 9.848 9.445 9.026 8.706 8.373 8.023 7.654 7.264 6.994 6.715 6.263 5.961 5.644 5.473 5.141 4.802 4.43 4.234 3.825 3.614 3.394 3.152 2.602 2.315 2.023 1.699 1.297 0.797 0.1 -1.681 -5 ,5597 ,KEBNE ,16724151,Sun Nov 28 05:18:47 CET,Sun Nov 28 07:00:57 CET,0.0 1.268 1.874 2.369 2.778 3.115 3.421 3.713 4.228 4.462 4.694 4.924 5.341 5.526 5.874 6.212 6.537 6.694 6.992 7.279 7.701 7.97 8.221 8.571 8.914 9.236 9.537 9.841 10.241 10.635 11.021 11.457 11.876 12.279 12.743 13.261 13.731 14.247 14.785 15.338 15.916 16.544 17.296 18.061 18.882 19.715 20.599 21.5 22.375 23.13 23.477 22.985 22.139 21.185 20.268 19.326 18.374 17.5 16.77 15.979 15.23 14.58 13.993 13.429 12.893 12.393 11.861 11.389 10.992 10.584 10.141 9.765 9.366 8.93 8.586 8.238 7.877 7.507 7.137 6.876 6.591 6.141 5.835 5.524 5.363 5.026 4.67 4.294 4.099 3.684 3.486 3.27 3.027 2.505 2.217 1.879 1.516 1.094 0.583 -0.1 -1.943 -6 ,3186 ,KEBNE ,16724152,Sun Nov 28 05:18:47 CET,Sun Nov 28 07:00:58 CET,0.0 1.334 1.925 2.394 2.782 3.129 3.446 3.729 4.243 4.484 4.719 4.94 5.356 5.552 5.936 6.271 6.572 6.722 7.018 7.31 7.733 7.994 8.246 8.619 8.972 9.317 9.646 9.949 10.341 10.721 11.08 11.516 11.936 12.355 12.818 13.306 13.78 14.305 14.856 15.402 15.99 16.66 17.417 18.13 18.932 19.802 20.701 21.56 22.403 23.161 23.51 23.001 22.152 21.173 20.171 19.201 18.31 17.485 16.741 15.979 15.301 14.687 14.105 13.538 13.016 12.553 12.044 11.567 11.159 10.739 10.303 9.937 9.544 9.141 8.828 8.497 8.169 7.827 7.445 7.174 6.902 6.469 6.158 5.844 5.685 5.336 4.935 4.487 4.246 3.775 3.456 3.175 2.866 2.19 1.825 1.444 1.03 0.531 -0.082 -0.877 -3.282 -7 ,7171 ,KEBNE ,16724153,Sun Nov 28 05:19:48 CET,Sun Nov 28 07:01:18 CET,0.0 1.733 2.374 2.834 3.196 3.518 3.821 4.097 4.606 4.85 5.081 5.3 5.718 5.916 6.319 6.699 7.031 7.181 7.472 7.749 8.148 8.401 8.651 9.017 9.37 9.708 10.03 10.354 10.767 11.15 11.509 11.926 12.336 12.727 13.155 13.62 14.093 14.63 15.172 15.735 16.308 16.94 17.685 18.421 19.233 20.088 21.036 21.977 22.845 23.624 23.959 23.347 22.407 21.43 20.458 19.499 18.639 17.838 17.101 16.327 15.621 14.984 14.369 13.798 13.267 12.766 12.237 11.752 11.333 10.893 10.42 10.016 9.595 9.159 8.822 8.473 8.097 7.673 7.221 6.903 6.564 6.043 5.679 5.297 5.101 4.698 4.265 3.815 3.58 3.123 2.807 2.522 2.219 1.545 1.167 0.774 0.362 -0.145 -0.77 -1.557 -3.787 -8 ,18214 ,KEBNE ,16724154,Sun Nov 28 05:19:48 CET,Sun Nov 28 07:02:06 CET,0.0 1.712 2.377 2.86 3.261 3.613 3.929 4.243 4.839 5.098 5.344 5.585 6.004 6.192 6.549 6.892 7.219 7.383 7.701 7.996 8.406 8.665 8.922 9.283 9.628 9.967 10.294 10.614 11.029 11.423 11.811 12.285 12.725 13.142 13.614 14.108 14.565 15.075 15.634 16.204 16.772 17.415 18.189 18.907 19.678 20.544 21.473 22.373 23.202 23.848 24.155 23.669 22.739 21.738 20.788 19.838 18.917 18.057 17.266 16.463 15.776 15.141 14.514 13.925 13.391 12.881 12.328 11.841 11.431 11.014 10.573 10.193 9.785 9.374 9.052 8.709 8.351 7.986 7.622 7.367 7.1 6.656 6.338 6.025 5.866 5.525 5.143 4.755 4.566 4.161 3.943 3.714 3.462 2.895 2.592 2.262 1.911 1.536 1.057 0.389 -1.188 -9 ,4769 ,KEBNE ,16724155,Sun Nov 28 05:19:48 CET,Sun Nov 28 07:00:55 CET,0.0 2.201 2.931 3.469 3.938 4.355 4.719 5.035 5.57 5.81 6.039 6.25 6.663 6.855 7.223 7.573 7.905 8.068 8.376 8.664 9.083 9.349 9.606 9.971 10.316 10.65 10.978 11.283 11.659 12.032 12.395 12.824 13.233 13.619 14.06 14.557 15.032 15.54 16.084 16.664 17.252 17.878 18.598 19.289 20.068 20.944 21.921 22.886 23.81 24.501 24.664 24.023 23.124 22.205 21.276 20.337 19.48 18.643 17.868 17.108 16.459 15.844 15.244 14.69 14.167 13.679 13.153 12.67 12.256 11.826 11.37 11.002 10.611 10.186 9.855 9.515 9.173 8.819 8.446 8.191 7.921 7.485 7.187 6.886 6.726 6.387 6.037 5.67 5.478 5.065 4.863 4.634 4.371 3.815 3.521 3.186 2.794 2.388 1.943 1.291 -0.453 -10 ,10843 ,KEBNE ,16724156,Sun Nov 28 05:19:48 CET,Sun Nov 28 07:01:09 CET,0.0 1.672 2.394 3.013 3.516 3.945 4.353 4.744 5.391 5.678 5.933 6.165 6.598 6.789 7.141 7.491 7.819 7.978 8.291 8.585 9.001 9.27 9.536 9.923 10.285 10.617 10.934 11.247 11.659 12.049 12.408 12.833 13.254 13.649 14.084 14.57 15.057 15.591 16.128 16.697 17.269 17.898 18.642 19.347 20.15 21.0 21.841 22.693 23.573 24.292 24.568 23.99 23.086 22.097 21.084 20.115 19.252 18.442 17.695 16.896 16.185 15.564 14.964 14.383 13.837 13.326 12.788 12.301 11.878 11.461 11.015 10.629 10.239 9.822 9.499 9.17 8.818 8.45 8.069 7.809 7.528 7.091 6.786 6.451 6.284 5.959 5.603 5.225 5.027 4.606 4.409 4.178 3.916 3.329 3.016 2.695 2.349 1.946 1.449 0.839 -0.786 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt deleted file mode 100644 index 51e8a2fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27502 ,KEBNE ,16724157,Sun Nov 28 05:19:48 CET,Sun Nov 28 07:01:02 CET,0.0 1.732 2.349 2.839 3.281 3.632 3.928 4.225 4.799 5.053 5.272 5.465 5.866 6.06 6.433 6.779 7.108 7.263 7.557 7.837 8.241 8.505 8.762 9.128 9.484 9.837 10.172 10.492 10.908 11.29 11.638 12.04 12.425 12.8 13.223 13.693 14.143 14.633 15.13 15.633 16.165 16.745 17.392 18.038 18.727 19.387 20.121 20.841 21.425 21.708 21.227 19.882 18.436 16.963 15.604 14.352 13.214 12.186 11.263 10.311 9.495 8.761 8.069 7.423 6.811 6.244 5.65 5.113 4.647 4.15 3.644 3.22 2.774 2.3 1.909 1.495 1.065 0.617 0.134 -0.195 -0.527 -1.032 -1.363 -1.699 -1.871 -2.23 -2.614 -3.018 -3.236 -3.668 -3.908 -4.145 -4.387 -4.965 -5.286 -5.621 -5.991 -6.408 -6.891 -7.537 -9.361 -2 ,10560 ,KEBNE ,16724158,Sun Nov 28 05:19:48 CET,Sun Nov 28 07:01:03 CET,0.0 1.658 2.307 2.78 3.211 3.597 3.928 4.225 4.75 4.998 5.225 5.436 5.847 6.048 6.431 6.777 7.098 7.247 7.537 7.825 8.243 8.502 8.763 9.14 9.488 9.821 10.144 10.453 10.84 11.206 11.555 11.957 12.347 12.742 13.188 13.661 14.105 14.599 15.118 15.647 16.189 16.752 17.371 17.97 18.602 19.258 19.936 20.624 21.23 21.489 21.071 19.779 18.319 16.903 15.608 14.415 13.273 12.2 11.291 10.368 9.546 8.813 8.133 7.48 6.866 6.318 5.73 5.199 4.743 4.265 3.755 3.338 2.9 2.434 2.077 1.708 1.318 0.921 0.526 0.245 -0.044 -0.502 -0.839 -1.198 -1.382 -1.753 -2.129 -2.53 -2.747 -3.192 -3.493 -3.782 -4.107 -4.812 -5.195 -5.611 -6.07 -6.608 -7.218 -8.015 -10.2 -3 ,19246 ,KEBNE ,16724159,Sun Nov 28 05:19:48 CET,Sun Nov 28 07:00:42 CET,0.0 1.612 2.267 2.775 3.183 3.516 3.827 4.11 4.624 4.861 5.089 5.32 5.736 5.925 6.276 6.613 6.926 7.08 7.381 7.669 8.089 8.361 8.617 8.972 9.322 9.659 9.969 10.276 10.67 11.031 11.377 11.796 12.184 12.557 13.0 13.473 13.897 14.364 14.873 15.409 15.935 16.478 17.103 17.721 18.418 19.113 19.789 20.456 21.04 21.287 20.876 19.687 18.229 16.76 15.367 14.055 12.873 11.795 10.892 9.984 9.164 8.425 7.731 7.056 6.427 5.868 5.286 4.767 4.311 3.824 3.321 2.916 2.495 2.057 1.719 1.356 0.973 0.579 0.168 -0.122 -0.41 -0.856 -1.187 -1.525 -1.697 -2.043 -2.407 -2.819 -3.034 -3.467 -3.732 -3.984 -4.254 -4.887 -5.23 -5.576 -5.943 -6.361 -6.877 -7.523 -9.199 -4 ,13313 ,KEBNE ,16724160,Sun Nov 28 05:19:48 CET,Sun Nov 28 07:00:58 CET,0.0 1.974 2.64 3.177 3.622 3.98 4.284 4.566 5.102 5.347 5.575 5.788 6.195 6.388 6.757 7.096 7.426 7.59 7.899 8.183 8.6 8.861 9.111 9.476 9.813 10.144 10.466 10.773 11.173 11.55 11.907 12.337 12.745 13.117 13.534 14.006 14.458 14.933 15.429 15.948 16.481 17.068 17.715 18.308 18.959 19.61 20.277 20.905 21.389 21.665 21.306 19.964 18.463 16.959 15.592 14.301 13.138 12.099 11.178 10.228 9.402 8.67 7.964 7.284 6.653 6.08 5.464 4.913 4.435 3.937 3.409 2.962 2.502 2.028 1.667 1.296 0.92 0.539 0.132 -0.158 -0.459 -0.924 -1.238 -1.572 -1.747 -2.106 -2.482 -2.888 -3.099 -3.519 -3.742 -3.975 -4.225 -4.767 -5.054 -5.369 -5.741 -6.176 -6.676 -7.336 -9.307 -5 ,27020 ,KEBNE ,16724161,Sun Nov 28 05:19:48 CET,Sun Nov 28 07:00:52 CET,0.0 2.089 2.865 3.474 4.005 4.476 4.891 5.254 5.902 6.209 6.492 6.783 7.236 7.468 7.916 8.327 8.704 8.89 9.243 9.59 10.066 10.367 10.669 11.104 11.492 11.835 12.16 12.473 12.867 13.238 13.585 13.994 14.387 14.767 15.19 15.653 16.094 16.55 17.036 17.559 18.087 18.681 19.353 19.963 20.641 21.304 21.94 22.583 23.159 23.396 22.884 21.507 20.03 18.617 17.272 16.017 14.918 13.883 12.974 12.07 11.269 10.548 9.855 9.19 8.568 8.011 7.429 6.901 6.442 5.956 5.45 5.026 4.586 4.126 3.763 3.393 3.003 2.596 2.181 1.9 1.614 1.17 0.858 0.525 0.35 -0.019 -0.409 -0.841 -1.066 -1.516 -1.807 -2.057 -2.307 -2.849 -3.158 -3.525 -3.929 -4.349 -4.837 -5.455 -6.871 -7 ,9494 ,KEBNE ,16724163,Sun Nov 28 05:19:49 CET,Sun Nov 28 07:00:44 CET,0.0 1.639 2.315 2.808 3.215 3.569 3.871 4.169 4.756 5.018 5.263 5.497 5.907 6.101 6.52 6.95 7.347 7.528 7.865 8.198 8.672 8.971 9.269 9.655 9.989 10.31 10.613 10.896 11.263 11.632 11.987 12.4 12.793 13.154 13.561 14.036 14.497 14.989 15.497 16.025 16.587 17.16 17.771 18.389 19.05 19.729 20.46 21.12 21.595 21.842 21.424 20.038 18.508 17.026 15.673 14.421 13.295 12.274 11.369 10.466 9.66 8.894 8.183 7.524 6.902 6.346 5.763 5.245 4.801 4.35 3.897 3.519 3.109 2.669 2.338 1.99 1.61 1.229 0.829 0.552 0.269 -0.189 -0.498 -0.812 -0.975 -1.326 -1.707 -2.099 -2.314 -2.747 -2.994 -3.247 -3.523 -4.119 -4.443 -4.802 -5.213 -5.697 -6.262 -6.925 -8.741 -8 ,20075 ,KEBNE ,16724164,Sun Nov 28 05:19:48 CET,Sun Nov 28 07:00:59 CET,0.0 1.72 2.375 2.855 3.25 3.618 3.949 4.248 4.797 5.046 5.282 5.524 5.945 6.148 6.535 6.882 7.201 7.363 7.675 7.998 8.496 8.812 9.105 9.511 9.917 10.295 10.632 10.93 11.308 11.686 12.028 12.434 12.826 13.189 13.611 14.094 14.539 15.016 15.514 16.014 16.54 17.108 17.7 18.276 18.963 19.673 20.367 21.003 21.512 21.774 21.351 20.039 18.629 17.206 15.889 14.63 13.447 12.382 11.444 10.46 9.62 8.89 8.195 7.545 6.938 6.372 5.772 5.247 4.785 4.293 3.807 3.394 2.952 2.496 2.141 1.774 1.403 1.024 0.619 0.337 0.047 -0.42 -0.754 -1.101 -1.273 -1.65 -2.071 -2.516 -2.759 -3.223 -3.508 -3.752 -4.005 -4.546 -4.848 -5.19 -5.564 -5.983 -6.507 -7.186 -9.171 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt deleted file mode 100644 index 30fe878c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,1469 ,KEBNE ,16724169,Sun Nov 28 05:19:48 CET,Sun Nov 28 07:01:20 CET,0.0 2.043 2.775 3.358 3.858 4.295 4.672 5.019 5.645 5.936 6.218 6.515 6.966 7.189 7.606 8.026 8.435 8.624 8.983 9.301 9.702 9.949 10.199 10.568 10.914 11.254 11.572 11.866 12.236 12.58 12.915 13.324 13.714 14.076 14.489 14.947 15.37 15.844 16.347 16.878 17.418 17.975 18.596 19.187 19.835 20.474 21.145 21.84 22.452 22.808 22.509 21.306 19.947 18.601 17.3 16.159 15.196 14.259 13.415 12.535 11.753 11.047 10.367 9.72 9.093 8.526 7.965 7.464 7.02 6.557 6.061 5.644 5.219 4.776 4.422 4.058 3.684 3.302 2.919 2.639 2.345 1.865 1.512 1.156 0.981 0.624 0.241 -0.141 -0.337 -0.766 -0.997 -1.25 -1.52 -2.052 -2.342 -2.668 -3.049 -3.47 -3.948 -4.608 -6.016 -4 ,23352 ,KEBNE ,16724170,Sun Nov 28 05:19:48 CET,Sun Nov 28 07:01:07 CET,0.0 1.64 2.399 2.98 3.484 3.945 4.358 4.711 5.341 5.636 5.914 6.23 6.678 6.889 7.245 7.575 7.9 8.054 8.347 8.63 9.021 9.268 9.513 9.895 10.27 10.628 10.949 11.231 11.603 11.966 12.317 12.737 13.119 13.48 13.891 14.335 14.758 15.214 15.691 16.168 16.663 17.233 17.863 18.47 19.13 19.79 20.481 21.113 21.67 22.085 21.924 20.849 19.575 18.287 17.048 15.841 14.719 13.709 12.847 11.972 11.218 10.51 9.803 9.152 8.55 7.997 7.414 6.884 6.428 5.957 5.472 5.061 4.62 4.17 3.841 3.498 3.135 2.754 2.348 2.073 1.786 1.35 1.055 0.734 0.568 0.217 -0.162 -0.562 -0.775 -1.213 -1.471 -1.713 -1.968 -2.543 -2.839 -3.176 -3.576 -3.997 -4.462 -5.096 -6.678 -5 ,4283 ,KEBNE ,16724171,Sun Nov 28 05:19:49 CET,Sun Nov 28 07:01:18 CET,0.0 1.882 2.621 3.205 3.7 4.122 4.488 4.831 5.448 5.736 5.998 6.236 6.641 6.828 7.175 7.494 7.796 7.938 8.222 8.509 8.889 9.126 9.367 9.73 10.078 10.391 10.694 10.993 11.36 11.713 12.059 12.457 12.841 13.215 13.632 14.097 14.529 14.982 15.484 16.01 16.534 17.087 17.689 18.268 18.944 19.662 20.416 21.131 21.752 22.168 22.105 21.221 19.955 18.671 17.423 16.207 15.141 14.13 13.224 12.306 11.518 10.819 10.15 9.514 8.907 8.348 7.779 7.274 6.824 6.371 5.893 5.489 5.071 4.621 4.269 3.902 3.522 3.141 2.749 2.475 2.187 1.749 1.446 1.129 0.964 0.606 0.236 -0.139 -0.34 -0.766 -0.995 -1.227 -1.473 -2.041 -2.361 -2.695 -3.045 -3.458 -3.95 -4.535 -5.988 -6 ,734 ,KEBNE ,16724172,Sun Nov 28 05:19:49 CET,Sun Nov 28 07:01:18 CET,0.0 1.312 1.876 2.308 2.671 3.022 3.345 3.65 4.215 4.461 4.693 4.915 5.315 5.493 5.83 6.147 6.447 6.594 6.888 7.172 7.594 7.865 8.108 8.46 8.811 9.165 9.512 9.841 10.244 10.613 10.951 11.34 11.717 12.068 12.476 12.954 13.415 13.877 14.36 14.889 15.409 15.962 16.609 17.222 17.894 18.619 19.328 19.988 20.61 20.998 20.751 19.725 18.474 17.122 15.884 14.731 13.639 12.621 11.73 10.808 10.007 9.313 8.656 7.999 7.373 6.82 6.241 5.711 5.252 4.766 4.257 3.85 3.436 2.993 2.647 2.306 1.943 1.551 1.148 0.859 0.558 0.105 -0.206 -0.52 -0.684 -1.021 -1.368 -1.741 -1.938 -2.365 -2.598 -2.848 -3.11 -3.651 -3.963 -4.317 -4.69 -5.075 -5.526 -6.169 -8.001 -7 ,3626 ,KEBNE ,16724173,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 07:02:07 CET,0.0 1.276 1.997 2.624 3.138 3.546 3.898 4.225 4.854 5.136 5.402 5.708 6.16 6.39 6.832 7.254 7.65 7.84 8.205 8.55 9.021 9.309 9.597 10.001 10.38 10.725 11.026 11.316 11.677 12.008 12.329 12.738 13.15 13.541 13.974 14.433 14.854 15.308 15.799 16.308 16.819 17.377 18.01 18.639 19.335 20.057 20.778 21.458 22.063 22.442 22.284 21.229 19.933 18.622 17.372 16.172 15.088 14.057 13.158 12.301 11.532 10.82 10.152 9.526 8.935 8.38 7.786 7.26 6.811 6.345 5.852 5.445 5.03 4.599 4.263 3.901 3.53 3.142 2.741 2.472 2.179 1.692 1.352 1.012 0.838 0.48 0.103 -0.292 -0.496 -0.927 -1.16 -1.398 -1.648 -2.19 -2.5 -2.841 -3.227 -3.658 -4.166 -4.83 -6.471 -8 ,7718 ,KEBNE ,16724174,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 07:02:13 CET,0.0 1.744 2.534 3.171 3.662 4.05 4.37 4.644 5.115 5.325 5.543 5.751 6.161 6.346 6.676 6.997 7.299 7.446 7.733 8.012 8.418 8.673 8.919 9.275 9.62 9.954 10.261 10.549 10.914 11.257 11.595 12.013 12.407 12.76 13.151 13.598 14.033 14.533 15.063 15.591 16.129 16.708 17.345 17.96 18.653 19.363 20.096 20.793 21.375 21.787 21.606 20.497 19.167 17.819 16.612 15.514 14.508 13.558 12.651 11.73 10.942 10.227 9.546 8.897 8.28 7.707 7.136 6.637 6.204 5.749 5.267 4.862 4.42 3.966 3.617 3.253 2.879 2.491 2.108 1.843 1.556 1.097 0.776 0.439 0.264 -0.105 -0.49 -0.883 -1.091 -1.529 -1.773 -2.01 -2.266 -2.831 -3.147 -3.486 -3.84 -4.247 -4.712 -5.312 -6.826 -10 ,1911 ,KEBNE ,16724176,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 07:02:30 CET,0.0 1.41 2.035 2.57 3.04 3.451 3.815 4.179 4.822 5.113 5.4 5.718 6.163 6.381 6.806 7.202 7.576 7.757 8.106 8.457 8.926 9.186 9.432 9.78 10.097 10.406 10.71 11.011 11.397 11.751 12.082 12.494 12.897 13.272 13.685 14.137 14.581 15.07 15.586 16.115 16.644 17.218 17.829 18.415 19.104 19.816 20.575 21.3 21.884 22.191 21.873 20.837 19.581 18.324 17.074 15.801 14.696 13.748 12.865 11.929 11.137 10.434 9.763 9.135 8.559 8.017 7.445 6.942 6.483 6.002 5.521 5.112 4.691 4.249 3.903 3.551 3.19 2.802 2.389 2.105 1.8 1.314 0.984 0.654 0.486 0.129 -0.256 -0.671 -0.882 -1.316 -1.555 -1.803 -2.06 -2.562 -2.853 -3.21 -3.595 -4.005 -4.495 -5.129 -6.463 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 0fec9587..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19975 ,KEBNE ,16724177,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:58:18 CET,0.0 1.241 1.732 2.105 2.402 2.694 2.936 3.147 3.563 3.752 3.93 4.088 4.426 4.577 4.857 5.103 5.343 5.455 5.643 5.815 6.058 6.207 6.364 6.58 6.771 6.97 7.166 7.344 7.569 7.774 7.941 8.137 8.315 8.466 8.641 8.831 9.008 9.189 9.384 9.563 9.708 9.864 10.042 10.174 10.24 10.25 10.189 9.991 9.514 8.572 6.779 4.451 2.459 0.727 -0.781 -2.134 -3.282 -4.299 -5.187 -6.091 -6.867 -7.545 -8.181 -8.797 -9.379 -9.898 -10.432 -10.903 -11.31 -11.755 -12.224 -12.615 -13.039 -13.493 -13.863 -14.224 -14.579 -14.945 -15.312 -15.577 -15.858 -16.285 -16.577 -16.88 -17.045 -17.387 -17.74 -18.11 -18.29 -18.692 -18.913 -19.15 -19.435 -20.057 -20.401 -20.786 -21.22 -21.702 -22.317 -23.134 -25.48 -2 ,16218 ,KEBNE ,16724178,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:56:48 CET,0.0 1.378 1.969 2.444 2.842 3.175 3.472 3.72 4.157 4.357 4.561 4.772 5.106 5.24 5.499 5.725 5.922 6.01 6.195 6.398 6.665 6.811 6.945 7.13 7.301 7.479 7.661 7.825 8.016 8.185 8.343 8.522 8.701 8.872 9.056 9.274 9.476 9.655 9.819 9.988 10.149 10.305 10.454 10.579 10.685 10.759 10.711 10.466 10.005 9.147 7.405 5.04 3.021 1.313 -0.13 -1.444 -2.607 -3.649 -4.55 -5.434 -6.165 -6.821 -7.469 -8.076 -8.625 -9.129 -9.678 -10.157 -10.583 -11.032 -11.483 -11.846 -12.213 -12.615 -12.942 -13.288 -13.651 -14.03 -14.412 -14.663 -14.923 -15.348 -15.648 -15.94 -16.09 -16.423 -16.766 -17.116 -17.306 -17.705 -17.911 -18.136 -18.374 -18.884 -19.164 -19.49 -19.853 -20.237 -20.777 -21.55 -23.611 -4 ,9262 ,KEBNE ,16724180,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:57:00 CET,0.0 1.356 1.817 2.152 2.422 2.682 2.915 3.132 3.518 3.69 3.842 3.908 4.206 4.319 4.546 4.758 4.959 5.059 5.245 5.42 5.658 5.805 5.954 6.168 6.362 6.539 6.703 6.857 7.056 7.244 7.418 7.614 7.792 7.947 8.102 8.27 8.432 8.61 8.794 8.96 9.115 9.258 9.394 9.511 9.618 9.646 9.554 9.307 8.808 7.914 6.161 3.843 1.828 0.098 -1.402 -2.741 -3.911 -4.972 -5.896 -6.819 -7.605 -8.298 -8.951 -9.577 -10.168 -10.708 -11.259 -11.751 -12.196 -12.641 -13.08 -13.453 -13.838 -14.239 -14.557 -14.888 -15.228 -15.57 -15.929 -16.182 -16.439 -16.832 -17.114 -17.421 -17.577 -17.892 -18.244 -18.618 -18.8 -19.197 -19.409 -19.626 -19.845 -20.339 -20.619 -20.936 -21.29 -21.708 -22.221 -22.83 -24.914 -5 ,19482 ,KEBNE ,16724181,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:57:03 CET,0.0 1.205 1.73 2.1 2.399 2.655 2.876 3.069 3.421 3.592 3.75 3.899 4.26 4.419 4.726 5.004 5.21 5.309 5.515 5.695 5.916 6.052 6.187 6.396 6.602 6.793 6.958 7.108 7.312 7.494 7.662 7.866 8.031 8.198 8.409 8.617 8.803 8.994 9.196 9.376 9.529 9.699 9.854 9.953 10.03 10.067 10.005 9.772 9.264 8.328 6.546 4.23 2.222 0.458 -1.026 -2.363 -3.545 -4.609 -5.525 -6.424 -7.195 -7.878 -8.542 -9.173 -9.749 -10.269 -10.798 -11.289 -11.718 -12.15 -12.611 -12.996 -13.39 -13.793 -14.105 -14.432 -14.766 -15.116 -15.492 -15.748 -16.005 -16.417 -16.716 -17.031 -17.193 -17.519 -17.865 -18.243 -18.437 -18.84 -19.054 -19.291 -19.533 -20.082 -20.413 -20.752 -21.103 -21.541 -22.082 -22.777 -25.171 -6 ,13047 ,KEBNE ,16724182,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:57:06 CET,0.0 1.442 2.07 2.522 2.899 3.239 3.531 3.794 4.264 4.484 4.693 4.903 5.26 5.406 5.66 5.89 6.087 6.183 6.379 6.554 6.791 6.947 7.088 7.275 7.471 7.656 7.806 7.956 8.143 8.302 8.462 8.641 8.809 8.986 9.182 9.383 9.562 9.735 9.895 10.058 10.243 10.439 10.613 10.748 10.825 10.806 10.698 10.465 9.981 9.04 7.234 4.849 2.78 1.019 -0.499 -1.835 -3.005 -4.083 -4.993 -5.88 -6.652 -7.341 -8.008 -8.653 -9.235 -9.752 -10.296 -10.775 -11.189 -11.618 -12.075 -12.458 -12.847 -13.281 -13.624 -13.971 -14.328 -14.713 -15.133 -15.422 -15.695 -16.108 -16.399 -16.69 -16.842 -17.16 -17.516 -17.904 -18.102 -18.503 -18.706 -18.934 -19.172 -19.712 -20.006 -20.302 -20.653 -21.076 -21.572 -22.289 -24.657 -7 ,4895 ,KEBNE ,16724183,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:57:10 CET,0.0 1.339 1.814 2.2 2.554 2.874 3.189 3.471 3.931 4.141 4.342 4.502 4.856 5.006 5.225 5.429 5.637 5.74 5.942 6.126 6.365 6.511 6.649 6.851 7.045 7.209 7.353 7.491 7.66 7.821 7.992 8.208 8.398 8.568 8.767 8.953 9.107 9.281 9.469 9.655 9.806 9.952 10.133 10.252 10.302 10.324 10.243 10.027 9.581 8.642 6.82 4.499 2.467 0.713 -0.785 -2.127 -3.287 -4.324 -5.215 -6.118 -6.886 -7.554 -8.197 -8.808 -9.36 -9.853 -10.395 -10.898 -11.334 -11.775 -12.218 -12.583 -12.954 -13.341 -13.648 -13.971 -14.302 -14.645 -15.013 -15.275 -15.537 -15.925 -16.212 -16.524 -16.684 -17.017 -17.366 -17.728 -17.922 -18.333 -18.559 -18.776 -19.002 -19.517 -19.806 -20.131 -20.47 -20.864 -21.357 -21.976 -24.093 -9 ,19058 ,KEBNE ,16724185,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:56:55 CET,0.0 1.427 1.923 2.329 2.682 2.979 3.228 3.468 3.882 4.063 4.24 4.37 4.703 4.845 5.101 5.354 5.605 5.723 5.949 6.172 6.474 6.663 6.84 7.096 7.357 7.601 7.828 8.056 8.319 8.513 8.675 8.866 9.048 9.21 9.406 9.621 9.795 9.975 10.161 10.358 10.543 10.705 10.876 11.013 11.101 11.124 11.053 10.852 10.422 9.553 7.828 5.608 3.674 1.969 0.499 -0.844 -2.0 -3.009 -3.893 -4.777 -5.527 -6.194 -6.838 -7.46 -8.037 -8.552 -9.101 -9.597 -10.012 -10.438 -10.89 -11.261 -11.628 -12.012 -12.328 -12.661 -12.994 -13.342 -13.711 -13.968 -14.234 -14.636 -14.923 -15.234 -15.387 -15.701 -16.032 -16.371 -16.56 -16.971 -17.198 -17.421 -17.662 -18.21 -18.519 -18.845 -19.193 -19.594 -20.089 -20.832 -23.131 -10 ,15909 ,KEBNE ,16724186,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:57:11 CET,0.0 1.251 1.75 2.108 2.394 2.662 2.906 3.112 3.464 3.62 3.76 3.839 4.144 4.267 4.512 4.734 4.94 5.037 5.221 5.396 5.643 5.784 5.92 6.106 6.275 6.444 6.596 6.739 6.924 7.097 7.272 7.481 7.67 7.844 8.03 8.239 8.428 8.625 8.822 8.994 9.159 9.321 9.475 9.608 9.697 9.699 9.609 9.322 8.783 7.841 6.042 3.709 1.661 -0.123 -1.635 -2.984 -4.183 -5.223 -6.106 -6.99 -7.72 -8.389 -9.051 -9.675 -10.259 -10.773 -11.304 -11.78 -12.198 -12.645 -13.094 -13.457 -13.844 -14.269 -14.601 -14.928 -15.27 -15.622 -15.97 -16.218 -16.487 -16.912 -17.202 -17.498 -17.65 -17.961 -18.293 -18.657 -18.861 -19.283 -19.533 -19.767 -20.012 -20.555 -20.844 -21.164 -21.55 -21.995 -22.567 -23.322 -25.398 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt deleted file mode 100644 index 6a557c90..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24025 ,KEBNE ,16724187,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:56:08 CET,0.0 1.535 2.187 2.748 3.217 3.604 3.979 4.333 4.927 5.199 5.467 5.743 6.197 6.419 6.842 7.233 7.577 7.736 8.038 8.312 8.689 8.929 9.169 9.52 9.868 10.205 10.525 10.834 11.22 11.597 11.965 12.396 12.824 13.254 13.725 14.236 14.734 15.283 15.883 16.501 17.127 17.841 18.665 19.47 20.386 21.377 22.497 23.684 24.991 26.411 27.732 28.191 27.981 27.599 27.121 26.576 26.027 25.496 25.001 24.48 24.008 23.571 23.154 22.752 22.376 22.022 21.64 21.302 21.009 20.697 20.357 20.083 19.792 19.477 19.232 18.976 18.717 18.443 18.146 17.949 17.743 17.412 17.188 16.948 16.824 16.573 16.306 16.013 15.859 15.491 15.371 15.188 14.978 14.534 14.3 14.028 13.705 13.343 12.92 12.387 10.936 -3 ,19542 ,KEBNE ,16724189,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:55:50 CET,0.0 1.432 2.006 2.476 2.877 3.205 3.506 3.773 4.238 4.458 4.682 4.883 5.296 5.481 5.825 6.163 6.487 6.629 6.913 7.201 7.601 7.849 8.092 8.449 8.791 9.112 9.426 9.739 10.135 10.521 10.892 11.334 11.757 12.163 12.629 13.143 13.643 14.191 14.772 15.412 16.074 16.797 17.641 18.442 19.35 20.345 21.474 22.719 24.069 25.454 26.76 27.367 27.275 26.897 26.42 25.875 25.317 24.745 24.227 23.724 23.269 22.838 22.378 21.924 21.479 21.069 20.655 20.264 19.921 19.574 19.223 18.917 18.582 18.255 18.014 17.765 17.503 17.231 16.93 16.713 16.5 16.173 15.938 15.696 15.572 15.304 15.02 14.736 14.575 14.19 14.023 13.822 13.622 13.182 12.93 12.646 12.328 11.954 11.525 10.973 9.543 -4 ,14960 ,KEBNE ,16724190,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:56:06 CET,0.0 1.369 1.928 2.381 2.744 3.086 3.387 3.649 4.146 4.372 4.575 4.733 5.136 5.312 5.651 5.98 6.3 6.456 6.741 7.013 7.405 7.654 7.904 8.272 8.622 8.947 9.259 9.571 9.97 10.332 10.68 11.132 11.564 11.959 12.419 12.935 13.418 13.939 14.508 15.124 15.769 16.476 17.305 18.128 19.079 20.103 21.233 22.487 23.876 25.28 26.522 26.93 26.72 26.288 25.767 25.243 24.73 24.189 23.674 23.143 22.685 22.252 21.794 21.354 20.956 20.594 20.217 19.872 19.57 19.248 18.894 18.606 18.314 18.01 17.768 17.512 17.251 16.977 16.671 16.445 16.215 15.887 15.664 15.43 15.309 15.03 14.734 14.435 14.279 13.89 13.729 13.549 13.346 12.893 12.656 12.401 12.105 11.741 11.268 10.65 8.958 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt deleted file mode 100644 index 810cf608..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28983 ,KEBNE ,16724197,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:57:25 CET,0.0 1.997 2.818 3.39 3.838 4.205 4.528 4.816 5.339 5.585 5.832 6.07 6.482 6.674 7.056 7.415 7.753 7.91 8.204 8.492 8.907 9.179 9.445 9.829 10.208 10.567 10.915 11.253 11.682 12.086 12.478 12.968 13.432 13.877 14.379 14.934 15.479 16.049 16.643 17.274 17.935 18.664 19.515 20.379 21.332 22.341 23.447 24.611 25.859 27.182 28.364 28.656 28.356 27.818 27.205 26.571 25.916 25.276 24.682 24.054 23.539 23.088 22.609 22.142 21.721 21.317 20.864 20.441 20.085 19.734 19.376 19.071 18.75 18.402 18.107 17.815 17.522 17.197 16.838 16.578 16.295 15.835 15.517 15.197 15.03 14.668 14.277 13.852 13.635 13.207 12.946 12.697 12.422 11.813 11.482 11.119 10.7 10.235 9.673 8.955 7.487 -2 ,1297 ,KEBNE ,16724198,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:57:38 CET,0.0 1.695 2.397 2.948 3.425 3.852 4.247 4.618 5.274 5.567 5.843 6.134 6.579 6.788 7.163 7.512 7.827 7.986 8.308 8.623 9.051 9.323 9.597 9.977 10.333 10.673 11.01 11.342 11.753 12.145 12.539 13.027 13.491 13.926 14.433 15.008 15.547 16.11 16.704 17.329 17.976 18.712 19.551 20.33 21.214 22.213 23.373 24.65 25.941 27.223 28.357 28.532 28.163 27.668 27.073 26.38 25.737 25.115 24.533 23.943 23.418 22.923 22.413 21.936 21.508 21.102 20.665 20.274 19.933 19.573 19.202 18.892 18.555 18.196 17.914 17.62 17.334 17.04 16.697 16.456 16.211 15.832 15.569 15.281 15.135 14.812 14.438 14.042 13.836 13.419 13.178 12.941 12.678 12.088 11.755 11.4 11.023 10.598 10.052 9.325 7.732 -3 ,6993 ,KEBNE ,16724199,Sun Nov 28 05:20:50 CET,Sun Nov 28 06:57:23 CET,0.0 1.716 2.486 3.081 3.552 3.96 4.32 4.626 5.188 5.434 5.656 5.868 6.29 6.488 6.862 7.217 7.543 7.694 7.985 8.29 8.735 9.005 9.271 9.659 10.035 10.397 10.743 11.073 11.499 11.916 12.309 12.756 13.178 13.595 14.09 14.67 15.216 15.82 16.489 17.128 17.748 18.452 19.273 20.079 20.986 21.999 23.109 24.287 25.569 26.846 27.942 28.177 27.763 27.217 26.663 25.959 25.171 24.468 23.884 23.266 22.72 22.179 21.643 21.172 20.714 20.279 19.828 19.435 19.086 18.719 18.342 18.017 17.665 17.3 17.024 16.74 16.449 16.126 15.77 15.509 15.22 14.759 14.423 14.076 13.907 13.559 13.179 12.763 12.55 12.136 11.884 11.626 11.353 10.777 10.443 10.078 9.671 9.177 8.624 7.958 6.242 -4 ,13472 ,KEBNE ,16724200,Sun Nov 28 05:21:51 CET,Sun Nov 28 06:59:40 CET,0.0 1.542 2.177 2.66 3.05 3.396 3.725 4.008 4.514 4.748 4.97 5.169 5.569 5.759 6.14 6.493 6.83 6.991 7.305 7.612 8.058 8.337 8.601 8.985 9.361 9.707 10.033 10.363 10.777 11.186 11.595 12.089 12.541 12.958 13.467 14.027 14.539 15.093 15.678 16.307 16.966 17.703 18.526 19.334 20.26 21.244 22.313 23.425 24.642 25.907 26.979 27.14 26.752 26.133 25.453 24.799 24.203 23.622 23.078 22.519 21.998 21.488 21.001 20.544 20.083 19.644 19.178 18.766 18.414 18.056 17.686 17.368 17.048 16.724 16.461 16.187 15.902 15.606 15.286 15.056 14.829 14.471 14.215 13.954 13.81 13.504 13.192 12.849 12.668 12.265 12.048 11.823 11.567 10.972 10.622 10.24 9.834 9.386 8.868 8.137 6.376 -5 ,20557 ,KEBNE ,16724201,Sun Nov 28 05:21:51 CET,Sun Nov 28 06:58:25 CET,0.0 1.449 2.114 2.597 3.011 3.37 3.697 3.985 4.541 4.805 5.022 5.221 5.638 5.837 6.21 6.571 6.915 7.075 7.387 7.687 8.118 8.4 8.683 9.086 9.457 9.799 10.128 10.445 10.858 11.257 11.631 12.109 12.582 13.027 13.548 14.12 14.664 15.24 15.862 16.533 17.211 17.982 18.847 19.663 20.588 21.61 22.752 23.985 25.306 26.567 27.583 27.804 27.436 26.833 26.187 25.525 24.863 24.228 23.668 23.04 22.479 21.997 21.513 21.041 20.578 20.162 19.74 19.326 18.961 18.586 18.198 17.882 17.555 17.205 16.924 16.637 16.359 16.057 15.708 15.467 15.226 14.839 14.551 14.253 14.107 13.814 13.495 13.167 12.997 12.595 12.389 12.188 11.97 11.495 11.215 10.858 10.461 10.004 9.423 8.586 6.544 -6 ,22415 ,KEBNE ,16724202,Sun Nov 28 05:21:51 CET,Sun Nov 28 06:59:32 CET,0.0 1.534 2.242 2.77 3.212 3.586 3.905 4.202 4.739 4.985 5.215 5.418 5.836 6.042 6.425 6.779 7.106 7.268 7.587 7.881 8.292 8.561 8.822 9.201 9.566 9.907 10.236 10.554 10.973 11.389 11.778 12.228 12.674 13.134 13.67 14.242 14.779 15.367 15.988 16.669 17.362 18.118 18.997 19.826 20.759 21.807 22.993 24.199 25.427 26.673 27.717 27.93 27.637 27.118 26.441 25.652 24.908 24.26 23.704 23.143 22.624 22.128 21.629 21.149 20.687 20.232 19.744 19.301 18.924 18.528 18.102 17.746 17.384 17.014 16.715 16.4 16.08 15.716 15.3 15.005 14.702 14.225 13.88 13.518 13.34 13.009 12.687 12.354 12.171 11.763 11.56 11.345 11.11 10.588 10.31 9.997 9.645 9.263 8.783 8.012 5.867 -7 ,12451 ,KEBNE ,16724203,Sun Nov 28 05:21:51 CET,Sun Nov 28 06:58:24 CET,0.0 1.363 1.973 2.422 2.811 3.149 3.46 3.75 4.267 4.512 4.746 4.969 5.377 5.571 5.961 6.319 6.653 6.812 7.127 7.436 7.878 8.181 8.478 8.871 9.225 9.554 9.873 10.18 10.573 10.974 11.366 11.828 12.271 12.717 13.239 13.816 14.346 14.901 15.538 16.228 16.936 17.675 18.525 19.4 20.361 21.399 22.51 23.669 24.954 26.225 27.216 27.409 27.089 26.499 25.848 25.158 24.496 23.863 23.287 22.716 22.163 21.624 21.152 20.729 20.319 19.924 19.499 19.116 18.776 18.414 18.021 17.673 17.271 16.837 16.505 16.168 15.826 15.465 15.074 14.789 14.496 14.041 13.726 13.405 13.235 12.882 12.514 12.116 11.898 11.46 11.179 10.923 10.664 10.12 9.805 9.451 9.06 8.62 8.148 7.54 5.995 -8 ,17764 ,KEBNE ,16724204,Sun Nov 28 05:21:51 CET,Sun Nov 28 06:58:46 CET,0.0 1.395 2.008 2.452 2.844 3.189 3.498 3.785 4.305 4.543 4.761 4.966 5.386 5.588 5.962 6.312 6.641 6.799 7.113 7.427 7.859 8.122 8.382 8.77 9.152 9.523 9.862 10.178 10.59 10.999 11.393 11.848 12.297 12.731 13.207 13.772 14.357 14.959 15.572 16.218 16.847 17.535 18.385 19.246 20.199 21.229 22.373 23.566 24.823 26.072 27.046 27.182 26.76 26.201 25.561 24.86 24.211 23.571 22.942 22.286 21.747 21.246 20.732 20.23 19.768 19.356 18.914 18.509 18.167 17.827 17.462 17.14 16.796 16.428 16.147 15.857 15.548 15.233 14.896 14.65 14.397 14.019 13.762 13.485 13.344 13.068 12.777 12.461 12.292 11.921 11.728 11.485 11.214 10.593 10.256 9.888 9.474 8.998 8.443 7.69 5.609 -9 ,4135 ,KEBNE ,16724205,Sun Nov 28 05:21:51 CET,Sun Nov 28 06:59:47 CET,0.0 1.305 1.872 2.307 2.684 3.017 3.321 3.61 4.163 4.423 4.66 4.853 5.246 5.433 5.791 6.138 6.48 6.641 6.954 7.269 7.717 7.992 8.251 8.623 8.977 9.315 9.649 9.975 10.382 10.778 11.163 11.623 12.079 12.523 13.031 13.603 14.121 14.672 15.265 15.857 16.485 17.203 18.036 18.89 19.882 20.9 22.061 23.413 24.732 25.934 26.935 27.129 26.798 26.271 25.666 25.046 24.427 23.801 23.233 22.65 22.109 21.587 21.068 20.595 20.163 19.753 19.311 18.926 18.6 18.235 17.826 17.492 17.176 16.834 16.559 16.285 15.997 15.694 15.38 15.155 14.915 14.537 14.277 14.014 13.875 13.568 13.25 12.919 12.74 12.349 12.126 11.903 11.679 11.197 10.924 10.618 10.279 9.885 9.443 8.813 7.069 -10 ,27090 ,KEBNE ,16724206,Sun Nov 28 05:21:51 CET,Sun Nov 28 06:58:15 CET,0.0 1.359 2.025 2.561 3.04 3.484 3.863 4.206 4.835 5.132 5.43 5.75 6.197 6.433 6.876 7.284 7.664 7.846 8.194 8.518 8.996 9.304 9.588 9.974 10.326 10.666 11.015 11.36 11.79 12.183 12.555 13.03 13.492 13.928 14.416 14.945 15.456 16.009 16.607 17.251 17.896 18.615 19.476 20.316 21.264 22.311 23.437 24.59 25.819 27.103 28.185 28.322 27.914 27.303 26.703 26.084 25.45 24.817 24.271 23.702 23.18 22.703 22.227 21.773 21.339 20.935 20.486 20.041 19.672 19.311 18.923 18.591 18.237 17.875 17.594 17.295 16.986 16.661 16.313 16.062 15.801 15.402 15.128 14.842 14.693 14.389 14.061 13.71 13.532 13.145 12.953 12.746 12.547 12.116 11.854 11.54 11.176 10.783 10.291 9.563 7.405 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index aace87be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3757 ,KEBNE ,16724207,Sun Nov 28 05:21:51 CET,Sun Nov 28 06:57:48 CET,0.0 1.227 1.787 2.234 2.585 2.896 3.192 3.492 4.061 4.309 4.54 4.735 5.181 5.381 5.76 6.124 6.475 6.65 6.985 7.317 7.818 8.128 8.423 8.859 9.292 9.724 10.139 10.533 11.035 11.52 12.011 12.616 13.204 13.764 14.426 15.2 15.93 16.738 17.633 18.592 19.612 20.793 22.188 23.58 25.24 27.13 29.339 31.872 34.88 38.407 42.522 45.863 47.647 48.524 48.949 49.14 49.211 49.177 49.038 48.8 48.557 48.327 48.059 47.778 47.488 47.215 46.917 46.622 46.363 46.094 45.789 45.52 45.24 44.93 44.686 44.444 44.186 43.904 43.599 43.372 43.137 42.788 42.525 42.226 42.075 41.771 41.43 41.058 40.854 40.448 40.196 39.953 39.699 39.153 38.856 38.553 38.204 37.763 37.218 36.461 34.08 -4 ,11326 ,KEBNE ,16724210,Sun Nov 28 05:21:51 CET,Sun Nov 28 06:59:01 CET,0.0 1.476 2.121 2.623 3.082 3.52 3.906 4.25 4.848 5.096 5.329 5.526 5.965 6.164 6.559 6.938 7.296 7.476 7.822 8.144 8.613 8.922 9.226 9.678 10.127 10.557 10.97 11.363 11.867 12.369 12.868 13.475 14.064 14.631 15.279 16.014 16.744 17.558 18.453 19.424 20.435 21.59 22.976 24.397 26.043 27.919 30.208 32.808 35.845 39.473 43.66 46.821 48.539 49.478 49.904 50.083 50.161 50.098 49.959 49.752 49.485 49.218 48.968 48.713 48.445 48.175 47.873 47.583 47.325 47.051 46.745 46.495 46.234 45.938 45.692 45.433 45.17 44.89 44.573 44.338 44.113 43.764 43.511 43.234 43.09 42.799 42.466 42.084 41.877 41.482 41.252 41.0 40.712 40.01 39.618 39.222 38.764 38.246 37.617 36.791 34.134 -6 ,13672 ,KEBNE ,16724212,Sun Nov 28 05:21:51 CET,Sun Nov 28 06:59:03 CET,0.0 1.192 1.715 2.14 2.519 2.849 3.159 3.46 4.007 4.258 4.492 4.674 5.121 5.335 5.722 6.095 6.465 6.642 6.985 7.325 7.819 8.154 8.482 8.933 9.359 9.775 10.193 10.589 11.097 11.607 12.104 12.708 13.299 13.868 14.526 15.27 15.996 16.795 17.674 18.632 19.655 20.83 22.198 23.607 25.28 27.153 29.386 31.966 34.977 38.584 42.905 46.19 47.771 48.588 49.045 49.218 49.195 49.087 48.949 48.742 48.501 48.23 47.941 47.647 47.353 47.101 46.824 46.541 46.281 46.002 45.695 45.427 45.145 44.846 44.621 44.394 44.121 43.822 43.496 43.263 43.04 42.675 42.4 42.123 41.983 41.676 41.331 40.978 40.795 40.404 40.165 39.913 39.641 39.081 38.765 38.419 38.031 37.55 36.976 36.179 33.766 -8 ,21003 ,KEBNE ,16724214,Sun Nov 28 05:21:51 CET,Sun Nov 28 06:58:03 CET,0.0 0.969 1.477 1.898 2.25 2.577 2.899 3.205 3.733 3.972 4.195 4.378 4.821 5.026 5.423 5.805 6.168 6.348 6.693 7.022 7.51 7.822 8.123 8.568 9.002 9.415 9.808 10.203 10.718 11.214 11.713 12.324 12.904 13.473 14.139 14.882 15.606 16.416 17.3 18.256 19.286 20.463 21.835 23.243 24.913 26.774 28.953 31.468 34.493 38.092 42.251 45.456 47.123 48.004 48.364 48.532 48.614 48.575 48.483 48.324 48.146 47.939 47.693 47.43 47.162 46.92 46.654 46.391 46.151 45.902 45.646 45.421 45.166 44.892 44.677 44.447 44.198 43.932 43.609 43.362 43.122 42.737 42.489 42.257 42.132 41.855 41.551 41.244 41.076 40.701 40.51 40.308 40.094 39.544 39.229 38.881 38.466 37.984 37.395 36.59 33.743 -9 ,21632 ,KEBNE ,16724215,Sun Nov 28 05:21:51 CET,Sun Nov 28 06:58:10 CET,0.0 1.188 1.73 2.162 2.536 2.86 3.161 3.44 3.935 4.162 4.389 4.597 5.053 5.262 5.671 6.078 6.453 6.626 6.966 7.297 7.766 8.068 8.373 8.809 9.229 9.65 10.057 10.443 10.94 11.453 11.952 12.548 13.133 13.696 14.359 15.107 15.842 16.672 17.568 18.527 19.54 20.706 22.089 23.486 25.193 27.12 29.35 31.916 34.91 38.505 42.751 45.987 47.692 48.596 49.048 49.284 49.349 49.265 49.138 48.93 48.678 48.413 48.147 47.888 47.62 47.379 47.113 46.836 46.576 46.285 45.982 45.722 45.436 45.13 44.858 44.575 44.307 44.006 43.685 43.471 43.245 42.879 42.616 42.342 42.201 41.888 41.537 41.172 40.981 40.587 40.361 40.135 39.898 39.39 39.082 38.733 38.35 37.915 37.364 36.549 34.242 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index 93817f70..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18862 ,KEBNE ,16724217,Sun Nov 28 05:22:53 CET,Sun Nov 28 07:00:26 CET,0.0 1.446 2.006 2.436 2.786 3.087 3.359 3.607 4.099 4.324 4.542 4.734 5.163 5.363 5.771 6.147 6.49 6.656 6.993 7.312 7.773 8.075 8.365 8.792 9.167 9.491 9.805 10.107 10.509 10.909 11.279 11.722 12.152 12.563 13.053 13.619 14.171 14.773 15.418 16.138 16.916 17.771 18.759 19.779 20.994 22.337 23.899 25.687 27.763 30.181 33.054 35.318 36.496 37.103 37.399 37.503 37.458 37.342 37.192 36.993 36.802 36.594 36.365 36.123 35.862 35.618 35.342 35.077 34.854 34.632 34.369 34.13 33.897 33.651 33.448 33.228 32.979 32.711 32.45 32.262 32.056 31.704 31.455 31.211 31.085 30.802 30.481 30.151 29.978 29.6 29.43 29.204 28.982 28.473 28.184 27.881 27.522 27.087 26.547 25.843 23.767 -2 ,20333 ,KEBNE ,16724218,Sun Nov 28 05:22:53 CET,Sun Nov 28 06:58:53 CET,0.0 1.316 1.847 2.257 2.617 2.931 3.191 3.446 3.953 4.176 4.377 4.524 4.939 5.113 5.449 5.775 6.093 6.242 6.529 6.812 7.21 7.462 7.712 8.089 8.454 8.803 9.141 9.458 9.861 10.25 10.636 11.099 11.537 11.963 12.467 13.041 13.577 14.164 14.818 15.526 16.269 17.126 18.138 19.151 20.351 21.702 23.269 25.017 27.096 29.599 32.538 34.766 35.936 36.567 36.858 36.936 36.918 36.835 36.694 36.521 36.333 36.116 35.891 35.648 35.384 35.122 34.838 34.594 34.374 34.138 33.875 33.647 33.395 33.111 32.892 32.672 32.435 32.181 31.925 31.744 31.538 31.211 30.984 30.727 30.59 30.304 29.995 29.671 29.496 29.111 28.931 28.715 28.502 27.969 27.666 27.342 26.956 26.469 25.83 25.009 22.71 -3 ,17891 ,KEBNE ,16724219,Sun Nov 28 05:22:52 CET,Sun Nov 28 07:00:03 CET,0.0 1.375 1.916 2.324 2.686 3.014 3.305 3.584 4.086 4.3 4.502 4.639 5.056 5.24 5.599 5.935 6.241 6.383 6.656 6.917 7.295 7.547 7.788 8.135 8.471 8.79 9.103 9.414 9.81 10.195 10.579 11.043 11.503 11.952 12.443 12.996 13.545 14.153 14.807 15.496 16.224 17.055 18.047 19.074 20.265 21.573 23.097 24.864 26.982 29.429 32.262 34.532 35.736 36.397 36.717 36.819 36.793 36.685 36.505 36.27 36.033 35.798 35.546 35.274 35.024 34.791 34.539 34.297 34.073 33.819 33.542 33.305 33.064 32.817 32.606 32.389 32.142 31.873 31.59 31.385 31.173 30.833 30.598 30.356 30.224 29.912 29.563 29.208 29.03 28.639 28.416 28.188 27.957 27.465 27.186 26.868 26.522 26.109 25.559 24.778 22.54 -4 ,16745 ,KEBNE ,16724220,Sun Nov 28 05:22:52 CET,Sun Nov 28 07:00:20 CET,0.0 1.585 2.306 2.881 3.334 3.685 3.958 4.202 4.647 4.861 5.069 5.227 5.65 5.831 6.173 6.502 6.796 6.937 7.219 7.492 7.897 8.161 8.41 8.766 9.11 9.438 9.757 10.078 10.482 10.863 11.244 11.702 12.148 12.583 13.078 13.656 14.218 14.809 15.447 16.154 16.913 17.767 18.78 19.788 20.959 22.278 23.817 25.552 27.57 29.969 32.85 35.066 36.213 36.844 37.172 37.301 37.277 37.147 36.997 36.806 36.604 36.382 36.135 35.881 35.603 35.355 35.108 34.864 34.639 34.391 34.128 33.895 33.638 33.355 33.134 32.898 32.65 32.401 32.121 31.928 31.723 31.387 31.157 30.922 30.796 30.527 30.232 29.907 29.73 29.333 29.112 28.878 28.659 28.17 27.874 27.56 27.199 26.791 26.317 25.628 23.515 -5 ,21823 ,KEBNE ,16724221,Sun Nov 28 05:22:53 CET,Sun Nov 28 07:00:11 CET,0.0 1.199 1.708 2.097 2.417 2.721 3.008 3.277 3.766 3.998 4.217 4.38 4.794 4.975 5.337 5.659 5.958 6.096 6.371 6.656 7.055 7.311 7.555 7.891 8.228 8.557 8.873 9.183 9.596 10.005 10.394 10.842 11.283 11.72 12.219 12.791 13.357 13.981 14.659 15.379 16.14 17.008 18.005 19.019 20.205 21.526 23.072 24.843 26.953 29.384 32.203 34.404 35.538 36.149 36.412 36.489 36.466 36.327 36.172 35.991 35.769 35.543 35.317 35.084 34.857 34.632 34.376 34.149 33.931 33.695 33.444 33.197 32.903 32.581 32.328 32.051 31.741 31.407 31.09 30.888 30.671 30.327 30.102 29.86 29.727 29.458 29.169 28.852 28.681 28.291 28.086 27.861 27.625 27.115 26.818 26.497 26.135 25.693 25.146 24.334 22.22 -8 ,22601 ,KEBNE ,16724224,Sun Nov 28 05:22:53 CET,Sun Nov 28 06:58:59 CET,0.0 1.354 1.981 2.547 3.012 3.385 3.718 4.003 4.464 4.679 4.877 5.013 5.429 5.601 5.925 6.241 6.548 6.69 6.972 7.249 7.641 7.891 8.139 8.494 8.829 9.153 9.471 9.787 10.185 10.576 10.99 11.502 11.973 12.419 12.936 13.51 14.057 14.66 15.311 16.006 16.738 17.575 18.585 19.616 20.811 22.118 23.629 25.374 27.446 29.942 32.916 35.192 36.395 37.07 37.367 37.465 37.465 37.38 37.251 37.067 36.878 36.686 36.466 36.252 36.015 35.756 35.487 35.25 35.026 34.762 34.488 34.26 34.015 33.747 33.524 33.293 33.064 32.813 32.539 32.343 32.12 31.739 31.488 31.235 31.092 30.775 30.434 30.079 29.887 29.477 29.226 28.953 28.657 28.015 27.632 27.24 26.8 26.266 25.63 24.797 22.737 -9 ,21022 ,KEBNE ,16724225,Sun Nov 28 05:22:53 CET,Sun Nov 28 06:59:00 CET,0.0 1.434 1.941 2.332 2.669 2.987 3.269 3.55 4.048 4.263 4.478 4.641 5.065 5.248 5.603 5.94 6.259 6.409 6.693 6.984 7.4 7.658 7.902 8.247 8.577 8.906 9.239 9.57 9.99 10.385 10.776 11.284 11.773 12.204 12.699 13.257 13.806 14.396 15.04 15.76 16.514 17.359 18.336 19.34 20.565 21.905 23.418 25.173 27.258 29.674 32.517 34.696 35.831 36.452 36.738 36.837 36.815 36.698 36.548 36.362 36.148 35.932 35.718 35.482 35.235 35.001 34.749 34.489 34.245 33.983 33.703 33.468 33.23 32.989 32.781 32.565 32.339 32.082 31.804 31.608 31.394 31.058 30.794 30.513 30.377 30.092 29.803 29.484 29.307 28.925 28.753 28.534 28.301 27.791 27.493 27.139 26.748 26.324 25.813 25.072 23.169 -10 ,5791 ,KEBNE ,16724226,Sun Nov 28 05:22:53 CET,Sun Nov 28 06:58:57 CET,0.0 1.258 1.815 2.228 2.546 2.825 3.093 3.336 3.767 3.976 4.18 4.321 4.738 4.907 5.259 5.637 6.004 6.182 6.524 6.856 7.338 7.644 7.939 8.37 8.772 9.116 9.424 9.741 10.162 10.556 10.952 11.427 11.873 12.313 12.812 13.376 13.926 14.521 15.179 15.889 16.641 17.504 18.488 19.489 20.671 21.993 23.525 25.25 27.294 29.695 32.524 34.672 35.76 36.334 36.643 36.755 36.743 36.643 36.473 36.265 36.062 35.851 35.623 35.368 35.113 34.881 34.613 34.356 34.138 33.903 33.633 33.408 33.174 32.912 32.704 32.48 32.242 31.986 31.701 31.494 31.285 30.958 30.722 30.479 30.345 30.052 29.745 29.418 29.241 28.852 28.655 28.428 28.187 27.688 27.402 27.061 26.693 26.292 25.793 25.062 22.511 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt deleted file mode 100644 index 851e7f9a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6664 ,KEBNE ,16724227,Sun Nov 28 05:22:53 CET,Sun Nov 28 06:58:59 CET,0.0 1.921 2.55 3.073 3.544 3.948 4.296 4.594 5.104 5.369 5.634 5.875 6.338 6.565 7.002 7.402 7.779 7.962 8.314 8.629 9.057 9.337 9.617 10.031 10.403 10.727 11.015 11.279 11.643 12.007 12.342 12.75 13.148 13.531 13.969 14.448 14.905 15.389 15.897 16.456 17.059 17.7 18.412 19.13 19.96 20.86 21.818 22.864 24.029 25.171 26.13 26.367 26.137 25.672 25.078 24.466 23.886 23.337 22.819 22.216 21.682 21.231 20.795 20.368 19.954 19.559 19.133 18.747 18.397 18.026 17.635 17.301 16.969 16.611 16.329 16.048 15.728 15.38 15.006 14.732 14.449 13.974 13.645 13.326 13.157 12.78 12.389 11.991 11.785 11.349 11.113 10.864 10.596 10.009 9.696 9.343 8.946 8.513 7.969 7.269 5.289 -2 ,7678 ,KEBNE ,16724228,Sun Nov 28 05:22:53 CET,Sun Nov 28 06:58:46 CET,0.0 1.34 1.903 2.332 2.707 3.015 3.275 3.528 4.014 4.242 4.45 4.589 5.004 5.178 5.527 5.861 6.172 6.324 6.62 6.897 7.3 7.578 7.846 8.216 8.551 8.854 9.144 9.418 9.791 10.197 10.605 11.091 11.554 11.989 12.434 12.894 13.333 13.854 14.503 15.216 15.882 16.506 17.218 17.928 18.744 19.647 20.59 21.57 22.647 23.771 24.786 25.173 24.973 24.507 23.973 23.383 22.798 22.239 21.714 21.167 20.669 20.206 19.743 19.278 18.815 18.363 17.902 17.518 17.186 16.819 16.43 16.111 15.77 15.425 15.158 14.84 14.483 14.132 13.748 13.452 13.155 12.701 12.382 12.059 11.893 11.545 11.174 10.768 10.555 10.113 9.863 9.613 9.355 8.773 8.429 8.056 7.66 7.199 6.609 5.882 3.799 -6 ,11221 ,KEBNE ,16724232,Sun Nov 28 05:22:53 CET,Sun Nov 28 07:00:28 CET,0.0 1.377 2.024 2.519 2.938 3.308 3.643 3.972 4.585 4.867 5.129 5.366 5.824 6.041 6.47 6.887 7.281 7.464 7.801 8.105 8.523 8.787 9.04 9.409 9.778 10.14 10.485 10.81 11.244 11.66 12.063 12.572 13.025 13.399 13.816 14.286 14.737 15.223 15.735 16.289 16.876 17.517 18.24 18.969 19.774 20.624 21.577 22.54 23.576 24.675 25.618 25.9 25.639 25.17 24.65 24.074 23.493 22.906 22.357 21.808 21.33 20.872 20.412 19.973 19.571 19.191 18.773 18.394 18.04 17.66 17.284 16.975 16.652 16.293 15.995 15.67 15.331 14.985 14.598 14.328 14.035 13.557 13.233 12.888 12.707 12.326 11.918 11.518 11.318 10.879 10.632 10.369 10.087 9.502 9.183 8.804 8.397 7.982 7.474 6.762 4.528 -7 ,11076 ,KEBNE ,16724233,Sun Nov 28 05:22:53 CET,Sun Nov 28 07:00:16 CET,0.0 1.279 1.823 2.235 2.57 2.889 3.183 3.454 3.947 4.17 4.383 4.528 4.943 5.13 5.481 5.802 6.109 6.263 6.56 6.847 7.277 7.553 7.813 8.184 8.57 8.941 9.275 9.598 10.026 10.455 10.858 11.337 11.8 12.227 12.733 13.313 13.853 14.451 15.124 15.854 16.538 17.207 17.96 18.699 19.541 20.429 21.396 22.432 23.521 24.626 25.642 25.977 25.73 25.25 24.706 24.109 23.535 22.99 22.469 21.913 21.409 20.943 20.441 19.871 19.279 18.715 18.145 17.639 17.187 16.726 16.296 15.971 15.619 15.259 14.997 14.721 14.419 14.097 13.763 13.528 13.289 12.911 12.627 12.332 12.185 11.865 11.529 11.175 10.989 10.578 10.381 10.152 9.908 9.361 9.067 8.738 8.324 7.827 7.201 6.299 4.265 -8 ,2381 ,KEBNE ,16724234,Sun Nov 28 05:22:53 CET,Sun Nov 28 07:00:29 CET,0.0 1.224 1.732 2.122 2.472 2.795 3.077 3.336 3.813 4.043 4.259 4.401 4.824 5.011 5.367 5.706 6.016 6.166 6.486 6.806 7.228 7.493 7.761 8.142 8.505 8.862 9.202 9.529 9.964 10.347 10.677 11.063 11.428 11.797 12.239 12.733 13.269 13.862 14.393 14.953 15.554 16.219 16.971 17.69 18.51 19.42 20.416 21.457 22.593 23.71 24.692 24.968 24.704 24.273 23.739 23.121 22.475 21.885 21.375 20.835 20.345 19.867 19.402 18.945 18.43 17.886 17.309 16.805 16.374 15.918 15.461 15.128 14.798 14.449 14.185 13.914 13.636 13.341 13.01 12.778 12.551 12.2 11.936 11.651 11.508 11.215 10.889 10.54 10.368 9.961 9.725 9.463 9.175 8.506 8.121 7.71 7.268 6.789 6.183 5.335 3.495 -9 ,14294 ,KEBNE ,16724235,Sun Nov 28 05:22:53 CET,Sun Nov 28 07:00:09 CET,0.0 2.011 2.612 3.051 3.427 3.751 4.03 4.28 4.745 4.975 5.205 5.388 5.821 6.008 6.352 6.7 7.026 7.174 7.464 7.746 8.159 8.428 8.684 9.055 9.395 9.739 10.115 10.494 10.975 11.368 11.7 12.097 12.478 12.856 13.291 13.77 14.228 14.74 15.277 15.827 16.4 17.051 17.821 18.559 19.375 20.256 21.223 22.22 23.274 24.42 25.42 25.717 25.477 24.993 24.403 23.797 23.215 22.634 22.101 21.544 21.043 20.556 20.059 19.589 19.151 18.731 18.294 17.901 17.553 17.184 16.783 16.449 16.112 15.756 15.465 15.153 14.832 14.477 14.071 13.792 13.514 13.078 12.763 12.433 12.244 11.811 11.353 10.892 10.645 10.156 9.825 9.537 9.228 8.566 8.239 7.914 7.531 7.021 6.378 5.513 3.238 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt deleted file mode 100644 index 4e2157d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32539 ,KEBNE ,16724237,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:00:38 CET,0.0 1.903 2.547 3.033 3.427 3.772 4.106 4.417 4.957 5.206 5.446 5.658 6.1 6.297 6.692 7.067 7.404 7.568 7.886 8.193 8.641 8.924 9.198 9.588 9.969 10.338 10.691 11.036 11.479 11.9 12.293 12.763 13.232 13.682 14.206 14.806 15.387 16.015 16.681 17.398 18.146 18.992 19.987 21.025 22.375 23.931 25.556 27.219 29.047 31.111 33.424 35.043 35.72 35.979 35.975 35.775 35.504 35.178 34.853 34.513 34.179 33.811 33.424 33.047 32.707 32.417 32.112 31.808 31.514 31.214 30.897 30.615 30.311 29.978 29.692 29.383 29.062 28.716 28.359 28.108 27.845 27.414 27.104 26.79 26.628 26.283 25.931 25.548 25.326 24.882 24.592 24.328 24.056 23.464 23.137 22.746 22.304 21.804 21.213 20.483 18.745 -2 ,11841 ,KEBNE ,16724238,Sun Nov 28 05:23:53 CET,Sun Nov 28 07:00:30 CET,0.0 1.534 2.302 2.904 3.404 3.837 4.207 4.566 5.218 5.51 5.774 5.98 6.417 6.621 7.022 7.424 7.815 7.993 8.335 8.662 9.138 9.449 9.753 10.197 10.625 11.036 11.435 11.832 12.349 12.831 13.275 13.797 14.295 14.758 15.292 15.918 16.542 17.205 17.883 18.61 19.371 20.238 21.241 22.235 23.422 24.756 26.268 27.955 29.87 31.947 34.204 35.806 36.487 36.691 36.64 36.46 36.249 35.986 35.658 35.281 34.943 34.62 34.295 33.972 33.648 33.306 32.925 32.585 32.286 31.986 31.672 31.399 31.104 30.777 30.516 30.24 29.959 29.679 29.378 29.164 28.943 28.602 28.362 28.095 27.95 27.638 27.303 26.954 26.761 26.347 26.173 25.965 25.737 25.213 24.918 24.601 24.249 23.847 23.383 22.748 20.749 -3 ,30486 ,KEBNE ,16724239,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:00:34 CET,0.0 1.579 2.207 2.702 3.113 3.484 3.838 4.167 4.736 4.989 5.231 5.47 5.933 6.144 6.551 6.938 7.297 7.475 7.827 8.164 8.656 8.961 9.257 9.697 10.118 10.524 10.917 11.31 11.821 12.304 12.759 13.293 13.812 14.336 14.98 15.679 16.287 16.928 17.611 18.346 19.109 19.994 21.011 22.01 23.194 24.482 25.944 27.602 29.512 31.604 33.861 35.457 36.115 36.278 36.254 36.066 35.781 35.508 35.234 34.891 34.56 34.246 33.916 33.589 33.268 32.949 32.618 32.301 32.019 31.717 31.385 31.114 30.826 30.517 30.272 30.019 29.757 29.437 29.066 28.804 28.527 28.08 27.764 27.452 27.301 27.008 26.706 26.379 26.195 25.786 25.567 25.345 25.119 24.614 24.323 23.986 23.612 23.211 22.714 22.047 20.302 -4 ,25500 ,KEBNE ,16724240,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:00:30 CET,0.0 1.848 2.662 3.287 3.801 4.249 4.631 4.983 5.607 5.897 6.181 6.477 6.972 7.219 7.641 8.025 8.397 8.579 8.93 9.266 9.73 10.008 10.285 10.714 11.131 11.541 11.95 12.339 12.829 13.328 13.831 14.443 15.028 15.57 16.198 16.873 17.473 18.125 18.82 19.559 20.334 21.199 22.212 23.214 24.357 25.623 27.025 28.58 30.476 32.652 34.972 36.504 37.134 37.354 37.322 37.16 36.866 36.519 36.209 35.835 35.486 35.168 34.828 34.471 34.13 33.818 33.458 33.123 32.844 32.522 32.165 31.868 31.567 31.264 31.026 30.775 30.496 30.187 29.877 29.677 29.471 29.118 28.855 28.577 28.441 28.171 27.868 27.528 27.346 26.944 26.735 26.485 26.228 25.737 25.449 25.124 24.778 24.386 23.906 23.25 21.43 -5 ,8644 ,KEBNE ,16724241,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:00:44 CET,0.0 2.088 2.81 3.327 3.775 4.163 4.5 4.815 5.364 5.595 5.824 6.047 6.501 6.713 7.109 7.487 7.852 8.014 8.33 8.647 9.09 9.368 9.64 10.036 10.43 10.803 11.149 11.5 11.952 12.375 12.793 13.303 13.78 14.235 14.757 15.344 15.905 16.534 17.217 17.939 18.707 19.557 20.539 21.54 22.709 23.978 25.423 27.088 29.054 31.248 33.745 35.609 36.457 36.803 36.872 36.801 36.646 36.409 36.154 35.88 35.607 35.338 35.064 34.772 34.465 34.191 33.903 33.62 33.351 33.057 32.756 32.505 32.22 31.904 31.648 31.367 31.064 30.768 30.472 30.266 30.048 29.674 29.394 29.124 28.995 28.713 28.376 28.023 27.846 27.447 27.262 27.042 26.807 26.314 26.052 25.741 25.35 24.911 24.444 23.784 22.205 -6 ,1492 ,KEBNE ,16724242,Sun Nov 28 05:23:53 CET,Sun Nov 28 07:00:42 CET,0.0 1.552 2.137 2.613 3.024 3.372 3.686 3.983 4.544 4.81 5.063 5.294 5.744 5.948 6.343 6.716 7.068 7.243 7.581 7.9 8.369 8.673 8.968 9.379 9.754 10.134 10.515 10.903 11.452 11.986 12.499 13.108 13.698 14.245 14.846 15.521 16.158 16.87 17.639 18.402 19.165 20.014 21.0 22.015 23.196 24.49 25.959 27.572 29.461 31.644 34.011 35.651 36.304 36.507 36.468 36.279 36.001 35.676 35.388 35.059 34.709 34.368 34.027 33.704 33.386 33.067 32.733 32.426 32.114 31.795 31.511 31.264 30.982 30.671 30.419 30.152 29.867 29.574 29.269 29.051 28.826 28.476 28.236 27.98 27.839 27.55 27.245 26.883 26.692 26.268 25.97 25.681 25.382 24.803 24.495 24.162 23.821 23.433 22.922 22.131 19.671 -7 ,19301 ,KEBNE ,16724243,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:00:29 CET,0.0 1.991 2.625 3.122 3.583 3.986 4.312 4.616 5.176 5.43 5.663 5.864 6.301 6.498 6.88 7.241 7.597 7.766 8.081 8.386 8.818 9.089 9.356 9.753 10.151 10.528 10.887 11.238 11.675 12.096 12.499 12.985 13.461 13.911 14.446 15.07 15.688 16.362 17.054 17.786 18.58 19.459 20.45 21.444 22.6 23.901 25.42 27.104 29.033 31.253 33.769 35.537 36.325 36.703 36.786 36.684 36.517 36.293 36.035 35.714 35.404 35.12 34.843 34.555 34.25 33.966 33.652 33.34 33.038 32.698 32.34 32.073 31.807 31.507 31.259 30.992 30.712 30.418 30.117 29.913 29.689 29.342 29.113 28.865 28.735 28.452 28.147 27.798 27.606 27.201 27.017 26.806 26.566 26.06 25.792 25.469 25.099 24.697 24.212 23.582 22.001 -8 ,25776 ,KEBNE ,16724244,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:01:55 CET,0.0 1.749 2.427 2.958 3.395 3.751 4.09 4.424 5.023 5.295 5.548 5.795 6.248 6.458 6.877 7.278 7.654 7.835 8.177 8.502 8.994 9.33 9.653 10.104 10.534 10.958 11.394 11.818 12.336 12.817 13.274 13.836 14.392 14.928 15.534 16.198 16.819 17.451 18.122 18.848 19.618 20.492 21.496 22.501 23.746 25.248 26.973 28.859 30.861 32.979 35.341 36.97 37.678 37.864 37.811 37.645 37.423 37.138 36.827 36.48 36.143 35.8 35.461 35.139 34.79 34.433 34.083 33.783 33.513 33.222 32.884 32.559 32.237 31.938 31.69 31.419 31.119 30.783 30.435 30.198 29.959 29.589 29.334 29.056 28.908 28.591 28.275 27.959 27.791 27.406 27.233 27.033 26.811 26.299 26.012 25.695 25.361 24.949 24.404 23.744 22.188 -9 ,30631 ,KEBNE ,16724245,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:01:47 CET,0.0 2.107 2.822 3.334 3.754 4.146 4.512 4.827 5.365 5.593 5.818 6.031 6.475 6.673 7.049 7.409 7.751 7.916 8.242 8.56 8.993 9.27 9.543 9.926 10.301 10.673 11.027 11.362 11.801 12.247 12.703 13.281 13.832 14.356 14.969 15.645 16.305 17.051 17.85 18.694 19.553 20.437 21.422 22.394 23.517 24.8 26.305 27.997 29.899 32.019 34.363 35.966 36.649 36.879 36.801 36.584 36.33 36.04 35.739 35.397 35.062 34.728 34.391 34.064 33.745 33.428 33.085 32.768 32.44 32.098 31.782 31.526 31.247 30.93 30.678 30.402 30.11 29.813 29.507 29.284 29.049 28.697 28.442 28.168 28.026 27.712 27.37 27.003 26.812 26.406 26.199 25.97 25.721 25.132 24.799 24.462 24.091 23.682 23.224 22.606 21.051 -10 ,7931 ,KEBNE ,16724246,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:00:39 CET,0.0 1.59 2.241 2.738 3.159 3.52 3.826 4.109 4.634 4.873 5.119 5.356 5.821 6.051 6.463 6.842 7.213 7.395 7.739 8.068 8.55 8.864 9.169 9.594 10.008 10.425 10.821 11.193 11.676 12.163 12.645 13.187 13.68 14.151 14.709 15.379 16.043 16.779 17.568 18.396 19.23 20.107 21.099 22.092 23.244 24.51 25.982 27.652 29.536 31.605 33.86 35.489 36.214 36.41 36.373 36.266 36.087 35.847 35.592 35.296 35.01 34.73 34.417 34.074 33.716 33.4 33.11 32.817 32.544 32.241 31.898 31.633 31.363 31.065 30.827 30.582 30.324 30.044 29.736 29.511 29.278 28.926 28.676 28.419 28.282 27.993 27.699 27.388 27.227 26.84 26.681 26.484 26.262 25.718 25.416 25.095 24.745 24.326 23.775 23.034 21.353 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt deleted file mode 100644 index 34a56a2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11572 ,KEBNE ,16724247,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:00:27 CET,0.0 1.962 2.764 3.356 3.848 4.287 4.67 4.994 5.583 5.857 6.113 6.378 6.867 7.108 7.552 7.967 8.36 8.551 8.912 9.248 9.743 10.086 10.433 10.926 11.403 11.87 12.335 12.796 13.376 13.901 14.385 14.969 15.541 16.095 16.726 17.443 18.136 18.868 19.636 20.457 21.337 22.34 23.513 24.693 26.06 27.541 29.132 30.783 32.579 34.484 36.391 37.378 37.482 37.27 36.859 36.369 35.858 35.326 34.832 34.293 33.804 33.359 32.928 32.47 32.026 31.64 31.235 30.843 30.489 30.125 29.751 29.442 29.098 28.699 28.376 28.062 27.742 27.388 27.01 26.745 26.474 26.05 25.743 25.426 25.269 24.941 24.591 24.227 24.04 23.62 23.389 23.157 22.919 22.418 22.138 21.801 21.421 21.03 20.579 19.891 18.076 -2 ,21013 ,KEBNE ,16724248,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:00:46 CET,0.0 1.96 2.711 3.321 3.834 4.275 4.694 5.116 5.833 6.149 6.471 6.839 7.359 7.621 8.073 8.466 8.821 8.992 9.34 9.68 10.152 10.467 10.791 11.25 11.678 12.098 12.514 12.923 13.44 13.929 14.401 14.97 15.528 16.092 16.759 17.474 18.147 18.896 19.696 20.548 21.453 22.462 23.637 24.837 26.211 27.603 29.083 30.717 32.496 34.418 36.41 37.531 37.728 37.502 37.098 36.584 36.07 35.573 35.102 34.594 34.1 33.643 33.212 32.764 32.291 31.823 31.305 30.849 30.464 30.052 29.615 29.233 28.794 28.341 28.01 27.667 27.319 26.961 26.576 26.311 26.049 25.644 25.351 25.044 24.889 24.56 24.203 23.834 23.641 23.219 22.998 22.732 22.438 21.828 21.474 21.062 20.616 20.14 19.588 18.882 17.112 -3 ,29989 ,KEBNE ,16724249,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:01:45 CET,0.0 2.112 2.956 3.531 3.984 4.413 4.804 5.141 5.757 6.05 6.346 6.704 7.211 7.476 7.969 8.437 8.891 9.118 9.565 9.959 10.499 10.831 11.141 11.594 12.029 12.445 12.853 13.261 13.791 14.289 14.763 15.347 15.926 16.483 17.102 17.789 18.478 19.247 20.07 20.927 21.824 22.812 23.892 24.951 26.147 27.427 28.924 30.539 32.29 34.183 36.027 37.092 37.304 37.069 36.669 36.172 35.616 35.054 34.534 33.983 33.471 32.997 32.552 32.116 31.691 31.299 30.895 30.528 30.197 29.845 29.479 29.147 28.776 28.375 28.058 27.738 27.4 27.046 26.671 26.411 26.142 25.728 25.446 25.15 24.986 24.641 24.298 23.917 23.716 23.302 23.105 22.882 22.644 22.135 21.841 21.493 21.103 20.678 20.165 19.429 16.515 -4 ,30801 ,KEBNE ,16724250,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:01:56 CET,0.0 2.114 2.805 3.334 3.767 4.152 4.487 4.803 5.381 5.645 5.9 6.15 6.609 6.831 7.26 7.666 8.065 8.252 8.598 8.932 9.424 9.746 10.055 10.514 10.963 11.388 11.798 12.208 12.741 13.234 13.701 14.271 14.83 15.38 16.003 16.684 17.35 18.094 18.895 19.756 20.708 21.766 22.955 24.135 25.416 26.712 28.153 29.729 31.492 33.453 35.348 36.32 36.485 36.253 35.865 35.356 34.802 34.254 33.702 33.076 32.56 32.119 31.627 31.08 30.577 30.167 29.716 29.265 28.866 28.457 28.033 27.689 27.328 26.925 26.603 26.263 25.919 25.566 25.186 24.939 24.692 24.31 24.049 23.769 23.623 23.318 22.982 22.596 22.395 21.976 21.753 21.51 21.247 20.699 20.408 20.085 19.706 19.267 18.744 18.047 16.147 -6 ,19302 ,KEBNE ,16724252,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:01:58 CET,0.0 2.185 2.967 3.568 4.093 4.563 4.985 5.38 6.087 6.411 6.724 7.065 7.567 7.833 8.345 8.818 9.269 9.483 9.906 10.313 10.89 11.242 11.558 12.015 12.451 12.872 13.291 13.683 14.197 14.703 15.188 15.783 16.366 16.912 17.503 18.141 18.763 19.462 20.239 21.088 21.933 22.852 23.928 24.987 26.201 27.5 28.971 30.618 32.382 34.17 36.037 37.093 37.251 37.006 36.44 35.691 34.988 34.374 33.858 33.327 32.841 32.39 31.932 31.489 31.085 30.686 30.246 29.872 29.536 29.172 28.785 28.426 28.032 27.625 27.316 26.989 26.651 26.308 25.942 25.686 25.429 25.023 24.725 24.397 24.225 23.867 23.491 23.128 22.949 22.531 22.312 22.081 21.825 21.269 20.951 20.606 20.275 19.87 19.33 18.658 16.75 -7 ,25660 ,KEBNE ,16724253,Sun Nov 28 05:23:54 CET,Sun Nov 28 07:00:44 CET,0.0 1.771 2.555 3.194 3.697 4.174 4.609 5.007 5.715 6.038 6.334 6.638 7.138 7.394 7.911 8.392 8.827 9.043 9.469 9.89 10.472 10.835 11.193 11.72 12.228 12.712 13.169 13.611 14.179 14.685 15.155 15.734 16.298 16.854 17.496 18.188 18.822 19.505 20.229 20.999 21.82 22.719 23.751 24.872 26.225 27.631 29.135 30.723 32.548 34.594 36.502 37.516 37.677 37.434 37.065 36.615 36.119 35.591 35.092 34.553 34.072 33.646 33.206 32.77 32.36 31.965 31.54 31.142 30.76 30.348 29.918 29.555 29.175 28.771 28.45 28.126 27.785 27.388 26.95 26.651 26.339 25.835 25.471 25.118 24.953 24.616 24.282 23.931 23.743 23.33 23.13 22.911 22.674 22.182 21.895 21.559 21.187 20.784 20.33 19.677 18.074 -8 ,8932 ,KEBNE ,16724254,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:02:45 CET,0.0 2.017 2.859 3.447 3.96 4.434 4.847 5.232 5.914 6.228 6.539 6.875 7.378 7.645 8.155 8.641 9.094 9.308 9.715 10.078 10.587 10.918 11.24 11.712 12.163 12.588 13.002 13.406 13.93 14.442 14.941 15.53 16.093 16.643 17.287 18.008 18.688 19.436 20.25 21.1 22.004 23.041 24.24 25.413 26.76 28.212 29.857 31.727 33.747 35.789 37.79 38.86 38.996 38.766 38.387 37.901 37.379 36.829 36.301 35.769 35.278 34.792 34.316 33.888 33.49 33.103 32.679 32.279 31.897 31.475 31.037 30.671 30.292 29.893 29.56 29.184 28.785 28.374 27.943 27.642 27.332 26.877 26.592 26.308 26.155 25.829 25.486 25.109 24.903 24.468 24.24 24.006 23.761 23.235 22.933 22.602 22.236 21.808 21.322 20.702 19.022 -9 ,5577 ,KEBNE ,16724255,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:03:05 CET,0.0 3.096 3.986 4.648 5.166 5.587 5.96 6.293 6.881 7.155 7.413 7.652 8.111 8.337 8.767 9.17 9.555 9.745 10.12 10.482 11.012 11.349 11.657 12.108 12.558 13.002 13.427 13.837 14.362 14.865 15.349 15.935 16.492 17.029 17.658 18.358 19.034 19.78 20.587 21.463 22.379 23.38 24.561 25.771 27.169 28.653 30.239 31.972 33.946 36.112 38.217 39.24 39.369 39.084 38.618 38.08 37.55 37.025 36.521 35.95 35.446 34.989 34.523 34.021 33.508 33.022 32.497 32.058 31.716 31.365 30.967 30.623 30.277 29.905 29.618 29.334 29.038 28.716 28.384 28.141 27.846 27.345 26.997 26.634 26.45 26.069 25.662 25.222 24.992 24.534 24.225 23.948 23.662 23.012 22.653 22.28 21.904 21.466 20.915 20.225 18.28 -10 ,23331 ,KEBNE ,16724256,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:02:43 CET,0.0 2.299 3.01 3.557 3.967 4.322 4.672 5.006 5.599 5.865 6.129 6.394 6.861 7.087 7.509 7.916 8.314 8.506 8.879 9.239 9.748 10.075 10.399 10.874 11.323 11.755 12.17 12.566 13.087 13.589 14.081 14.674 15.226 15.762 16.4 17.119 17.816 18.565 19.366 20.269 21.227 22.287 23.508 24.713 26.059 27.538 29.226 31.003 32.908 34.936 36.877 37.795 37.949 37.75 37.325 36.797 36.265 35.736 35.238 34.674 34.161 33.694 33.199 32.669 32.159 31.656 31.095 30.616 30.201 29.77 29.331 28.976 28.598 28.204 27.892 27.558 27.215 26.86 26.497 26.242 25.974 25.551 25.26 24.947 24.776 24.396 23.978 23.537 23.304 22.842 22.559 22.29 21.997 21.334 20.968 20.555 20.132 19.715 19.211 18.538 16.49 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index 1288d10e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27130 ,KEBNE ,17026418,Wed Dec 22 14:17:29 CET,Wed Dec 22 15:54:11 CET,0.0 1.307 1.867 2.289 2.679 3.046 3.376 3.682 4.251 4.523 4.79 5.04 5.507 5.738 6.197 6.649 7.078 7.28 7.675 8.067 8.629 8.997 9.368 9.899 10.418 10.93 11.424 11.914 12.563 13.202 13.837 14.61 15.352 16.078 16.943 17.943 18.913 19.977 21.146 22.41 23.78 25.385 27.322 29.308 31.679 34.419 37.703 41.551 46.26 52.132 59.662 66.4 70.616 73.414 75.371 76.808 77.875 78.685 79.248 79.74 80.08 80.272 80.396 80.493 80.553 80.558 80.512 80.476 80.428 80.347 80.272 80.207 80.101 79.953 79.831 79.708 79.571 79.405 79.222 79.092 78.951 78.715 78.53 78.328 78.227 78.001 77.74 77.438 77.269 76.938 76.694 76.49 76.292 75.844 75.58 75.284 74.911 74.462 73.921 73.102 70.987 -2 ,8523 ,KEBNE ,17026419,Wed Dec 22 14:17:29 CET,Wed Dec 22 15:53:53 CET,0.0 1.295 1.827 2.284 2.684 3.022 3.353 3.676 4.244 4.508 4.771 5.059 5.535 5.767 6.221 6.654 7.081 7.293 7.701 8.104 8.685 9.048 9.406 9.929 10.447 10.962 11.467 11.967 12.617 13.25 13.875 14.62 15.352 16.074 16.917 17.876 18.821 19.888 21.046 22.327 23.736 25.347 27.282 29.285 31.686 34.44 37.734 41.579 46.238 52.073 59.656 66.335 70.548 73.462 75.44 76.866 77.908 78.643 79.134 79.6 79.957 80.174 80.299 80.386 80.47 80.533 80.541 80.505 80.446 80.351 80.262 80.184 80.077 79.947 79.824 79.678 79.524 79.359 79.171 79.036 78.89 78.635 78.439 78.234 78.131 77.897 77.645 77.393 77.257 76.948 76.738 76.538 76.326 75.835 75.562 75.26 74.901 74.449 73.817 72.93 70.559 -3 ,21183 ,KEBNE ,17026420,Wed Dec 22 14:18:30 CET,Wed Dec 22 15:55:02 CET,0.0 1.438 2.167 2.733 3.225 3.654 4.052 4.42 5.09 5.409 5.71 6.047 6.549 6.821 7.356 7.844 8.279 8.479 8.866 9.248 9.824 10.194 10.555 11.104 11.631 12.127 12.628 13.12 13.754 14.372 14.98 15.73 16.478 17.223 18.072 19.039 19.988 21.037 22.21 23.509 24.908 26.495 28.4 30.379 32.74 35.474 38.753 42.587 47.182 52.842 60.296 66.99 71.206 74.063 76.047 77.472 78.458 79.19 79.741 80.196 80.512 80.754 80.932 81.063 81.145 81.191 81.214 81.201 81.138 81.039 80.941 80.863 80.761 80.639 80.527 80.389 80.25 80.099 79.928 79.808 79.673 79.439 79.238 78.986 78.855 78.584 78.273 77.935 77.759 77.424 77.171 76.926 76.669 76.114 75.788 75.406 74.98 74.509 73.942 73.125 70.126 -4 ,13707 ,KEBNE ,17026421,Wed Dec 22 14:18:31 CET,Wed Dec 22 15:55:52 CET,0.0 1.279 1.824 2.271 2.649 2.989 3.324 3.65 4.24 4.511 4.778 5.042 5.515 5.747 6.189 6.612 7.007 7.207 7.615 8.014 8.584 8.957 9.323 9.847 10.358 10.864 11.359 11.841 12.484 13.117 13.731 14.49 15.227 15.95 16.806 17.782 18.74 19.807 20.98 22.254 23.621 25.197 27.087 29.066 31.475 34.211 37.38 41.081 45.64 51.292 58.681 65.212 69.234 72.011 73.948 75.348 76.373 77.158 77.732 78.17 78.491 78.751 78.936 79.053 79.113 79.137 79.154 79.148 79.112 79.047 78.966 78.885 78.783 78.667 78.561 78.44 78.305 78.15 77.955 77.811 77.669 77.439 77.273 77.082 76.973 76.729 76.463 76.178 76.029 75.716 75.513 75.329 75.13 74.665 74.389 74.085 73.74 73.316 72.801 72.066 69.375 -5 ,12314 ,KEBNE ,17026422,Wed Dec 22 14:18:30 CET,Wed Dec 22 15:56:18 CET,0.0 1.158 1.688 2.165 2.586 2.942 3.267 3.57 4.137 4.415 4.696 4.973 5.45 5.68 6.106 6.52 6.929 7.128 7.519 7.903 8.463 8.828 9.189 9.724 10.245 10.753 11.251 11.74 12.378 13.008 13.625 14.376 15.11 15.832 16.696 17.682 18.643 19.72 20.874 22.139 23.518 25.095 27.009 29.023 31.455 34.209 37.473 41.314 45.967 51.609 58.837 65.39 69.523 72.32 74.261 75.697 76.751 77.507 78.039 78.498 78.796 78.985 79.119 79.205 79.258 79.288 79.275 79.225 79.184 79.135 79.054 78.972 78.864 78.73 78.608 78.48 78.343 78.154 77.903 77.716 77.523 77.204 76.981 76.752 76.629 76.355 76.046 75.704 75.508 75.154 74.911 74.686 74.444 73.874 73.54 73.146 72.707 72.22 71.582 70.753 68.439 -6 ,20412 ,KEBNE ,17026423,Wed Dec 22 14:18:31 CET,Wed Dec 22 15:54:26 CET,0.0 1.053 1.574 2.014 2.414 2.781 3.112 3.422 3.998 4.258 4.507 4.757 5.23 5.461 5.904 6.333 6.751 6.954 7.359 7.758 8.324 8.679 9.035 9.57 10.089 10.6 11.103 11.583 12.209 12.828 13.445 14.213 14.956 15.689 16.554 17.528 18.48 19.551 20.732 22.02 23.406 25.007 26.928 28.903 31.276 34.009 37.254 41.095 45.872 51.693 59.015 65.514 69.623 72.39 74.312 75.766 76.787 77.554 78.122 78.57 78.882 79.096 79.243 79.337 79.394 79.422 79.41 79.377 79.332 79.261 79.179 79.085 78.963 78.828 78.72 78.606 78.479 78.347 78.16 77.989 77.794 77.484 77.263 77.011 76.89 76.663 76.415 76.149 75.994 75.676 75.478 75.283 75.071 74.593 74.31 74.0 73.654 73.227 72.674 71.874 69.363 -7 ,17457 ,KEBNE ,17026424,Wed Dec 22 14:18:30 CET,Wed Dec 22 15:55:44 CET,0.0 1.151 1.675 2.109 2.483 2.829 3.163 3.49 4.084 4.346 4.596 4.86 5.346 5.604 6.116 6.607 7.092 7.329 7.783 8.221 8.827 9.213 9.579 10.099 10.631 11.149 11.642 12.146 12.846 13.513 14.13 14.883 15.615 16.335 17.183 18.157 19.118 20.193 21.387 22.675 24.045 25.642 27.577 29.578 31.988 34.764 38.051 41.942 46.757 52.693 60.133 66.649 70.771 73.515 75.453 76.872 77.904 78.699 79.255 79.687 79.979 80.197 80.372 80.492 80.542 80.55 80.551 80.536 80.5 80.454 80.381 80.299 80.192 80.053 79.933 79.794 79.64 79.486 79.325 79.206 79.079 78.846 78.669 78.474 78.361 78.127 77.88 77.617 77.474 77.16 76.953 76.762 76.544 76.062 75.787 75.447 75.022 74.5 73.848 72.939 70.105 -8 ,32024 ,KEBNE ,17026425,Wed Dec 22 14:18:30 CET,Wed Dec 22 15:56:49 CET,0.0 1.266 1.829 2.257 2.663 3.041 3.373 3.679 4.237 4.499 4.755 5.02 5.49 5.715 6.152 6.592 7.03 7.235 7.621 8.012 8.592 8.955 9.315 9.86 10.37 10.872 11.391 11.908 12.592 13.235 13.846 14.606 15.354 16.092 16.949 17.911 18.858 19.918 21.103 22.411 23.792 25.354 27.213 29.112 31.371 33.998 37.195 40.938 45.476 51.193 58.652 65.205 69.371 72.207 74.162 75.629 76.71 77.516 78.072 78.512 78.817 79.025 79.177 79.274 79.327 79.341 79.331 79.302 79.261 79.193 79.107 79.034 78.94 78.823 78.716 78.59 78.449 78.298 78.127 77.981 77.794 77.496 77.297 77.072 76.946 76.673 76.377 76.033 75.848 75.506 75.244 75.024 74.78 74.192 73.854 73.478 73.073 72.577 71.897 71.077 68.608 -9 ,24282 ,KEBNE ,17026426,Wed Dec 22 14:18:31 CET,Wed Dec 22 15:55:06 CET,0.0 1.246 1.775 2.217 2.595 2.921 3.228 3.519 4.072 4.335 4.582 4.832 5.305 5.527 5.951 6.383 6.796 6.997 7.404 7.8 8.371 8.75 9.116 9.645 10.174 10.691 11.187 11.676 12.325 12.948 13.552 14.313 15.068 15.808 16.676 17.647 18.595 19.66 20.859 22.173 23.563 25.147 27.038 28.998 31.384 34.141 37.376 41.159 45.831 51.659 59.193 65.916 70.126 72.922 74.934 76.427 77.486 78.256 78.832 79.317 79.623 79.852 80.036 80.159 80.231 80.281 80.282 80.248 80.202 80.128 80.034 79.924 79.775 79.629 79.522 79.412 79.288 79.129 78.948 78.815 78.674 78.44 78.254 78.041 77.929 77.7 77.454 77.18 77.024 76.712 76.518 76.318 76.114 75.652 75.36 75.033 74.68 74.256 73.679 72.776 69.916 -10 ,19476 ,KEBNE ,17026427,Wed Dec 22 14:18:31 CET,Wed Dec 22 15:54:37 CET,0.0 1.239 1.845 2.343 2.753 3.095 3.411 3.724 4.332 4.619 4.882 5.154 5.626 5.851 6.294 6.739 7.164 7.365 7.772 8.175 8.738 9.099 9.451 9.978 10.498 11.007 11.513 12.004 12.641 13.273 13.892 14.641 15.377 16.113 16.973 17.943 18.902 19.978 21.162 22.453 23.852 25.449 27.361 29.352 31.72 34.445 37.72 41.573 46.273 52.066 59.352 65.769 69.84 72.61 74.581 76.034 77.083 77.865 78.38 78.79 79.106 79.342 79.494 79.599 79.672 79.709 79.715 79.684 79.623 79.539 79.408 79.265 79.1 78.905 78.744 78.56 78.345 78.113 77.926 77.81 77.668 77.42 77.237 77.037 76.931 76.715 76.438 76.081 75.895 75.551 75.285 75.043 74.784 74.199 73.844 73.485 73.097 72.59 71.911 71.026 68.379 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 70c7fae7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,12520 ,KEBNE ,16724258,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:02:58 CET,0.0 1.361 2.076 2.657 3.1 3.438 3.745 4.041 4.599 4.858 5.107 5.337 5.792 6.008 6.437 6.865 7.279 7.477 7.859 8.223 8.747 9.091 9.436 9.942 10.42 10.885 11.344 11.787 12.364 12.93 13.482 14.15 14.817 15.463 16.215 17.101 17.962 18.94 20.021 21.164 22.384 23.784 25.464 27.211 29.302 31.69 34.523 37.807 41.782 46.637 52.64 57.676 60.71 62.721 64.055 64.916 65.492 65.927 66.222 66.424 66.543 66.599 66.61 66.582 66.531 66.476 66.382 66.269 66.159 66.036 65.894 65.753 65.591 65.404 65.243 65.069 64.875 64.654 64.43 64.266 64.089 63.832 63.642 63.433 63.322 63.093 62.853 62.559 62.406 62.089 61.888 61.699 61.497 61.01 60.745 60.441 60.101 59.732 59.254 58.596 56.251 -3 ,10122 ,KEBNE ,16724259,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:01:40 CET,0.0 1.768 2.46 3.002 3.481 3.896 4.274 4.638 5.307 5.607 5.885 6.138 6.592 6.809 7.226 7.636 8.041 8.238 8.619 8.988 9.518 9.869 10.216 10.714 11.194 11.652 12.096 12.526 13.086 13.641 14.196 14.876 15.523 16.156 16.92 17.798 18.662 19.637 20.697 21.81 23.001 24.392 26.047 27.764 29.868 32.267 35.078 38.338 42.271 47.044 53.058 58.258 61.338 63.338 64.672 65.591 66.183 66.584 66.868 67.054 67.136 67.169 67.154 67.115 67.049 66.968 66.849 66.686 66.55 66.423 66.274 66.139 65.985 65.781 65.615 65.459 65.284 65.099 64.893 64.735 64.572 64.314 64.118 63.901 63.787 63.546 63.3 63.02 62.872 62.543 62.342 62.148 61.947 61.479 61.2 60.897 60.564 60.181 59.687 58.942 56.791 -4 ,15348 ,KEBNE ,16724260,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:01:56 CET,0.0 1.357 1.948 2.385 2.766 3.118 3.432 3.715 4.262 4.514 4.741 4.941 5.394 5.613 6.035 6.435 6.82 7.006 7.373 7.727 8.244 8.588 8.931 9.429 9.909 10.378 10.829 11.266 11.835 12.378 12.912 13.58 14.243 14.895 15.685 16.594 17.449 18.401 19.455 20.55 21.72 23.109 24.758 26.449 28.509 30.89 33.722 37.002 40.911 45.691 51.827 57.158 60.394 62.569 64.009 64.972 65.643 66.103 66.422 66.668 66.794 66.868 66.901 66.899 66.858 66.783 66.689 66.563 66.428 66.285 66.129 65.988 65.832 65.653 65.496 65.326 65.147 64.964 64.775 64.637 64.471 64.193 64.002 63.795 63.692 63.473 63.216 62.935 62.79 62.462 62.242 62.03 61.821 61.348 61.074 60.787 60.461 60.06 59.575 58.907 56.05 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 66c57822..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6014 ,KEBNE ,16724267,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:00:57 CET,0.0 1.438 1.991 2.424 2.789 3.11 3.41 3.687 4.205 4.446 4.677 4.881 5.335 5.549 5.969 6.366 6.734 6.913 7.274 7.641 8.168 8.493 8.81 9.268 9.71 10.14 10.556 10.963 11.496 12.034 12.567 13.204 13.827 14.437 15.143 15.939 16.724 17.608 18.569 19.604 20.722 22.028 23.587 25.169 27.067 29.266 31.863 34.869 38.491 43.018 48.863 53.803 56.802 58.779 60.106 61.048 61.711 62.176 62.48 62.704 62.83 62.898 62.908 62.879 62.854 62.81 62.715 62.614 62.501 62.355 62.2 62.064 61.91 61.751 61.619 61.449 61.265 61.066 60.847 60.696 60.549 60.315 60.134 59.939 59.825 59.588 59.312 58.943 58.743 58.367 58.091 57.843 57.582 56.988 56.646 56.256 55.809 55.328 54.748 53.916 51.692 -3 ,30623 ,KEBNE ,16724269,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:01:11 CET,0.0 1.157 1.656 2.064 2.433 2.762 3.057 3.33 3.852 4.114 4.364 4.584 5.038 5.246 5.655 6.052 6.421 6.595 6.95 7.332 7.913 8.286 8.646 9.143 9.605 10.049 10.486 10.908 11.462 12.0 12.531 13.194 13.821 14.417 15.118 15.925 16.693 17.54 18.492 19.549 20.677 21.958 23.506 25.104 26.992 29.144 31.752 34.776 38.466 43.016 48.746 53.731 56.778 58.813 60.144 61.049 61.72 62.217 62.548 62.782 62.913 62.996 63.021 63.006 62.973 62.911 62.804 62.692 62.591 62.47 62.308 62.154 62.002 61.83 61.678 61.515 61.328 61.135 60.927 60.769 60.607 60.327 60.125 59.923 59.816 59.575 59.313 59.05 58.907 58.575 58.385 58.191 57.969 57.447 57.167 56.861 56.504 56.071 55.445 54.556 52.164 -4 ,13446 ,KEBNE ,16724270,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:00:59 CET,0.0 1.354 2.037 2.566 3.001 3.354 3.642 3.911 4.445 4.693 4.928 5.154 5.614 5.825 6.226 6.603 6.967 7.155 7.519 7.863 8.355 8.673 8.989 9.467 9.921 10.348 10.769 11.176 11.711 12.243 12.764 13.41 14.036 14.645 15.355 16.155 16.948 17.835 18.796 19.836 20.977 22.298 23.829 25.398 27.321 29.509 32.104 35.166 38.838 43.378 49.144 54.193 57.209 59.131 60.477 61.423 62.076 62.522 62.789 62.993 63.109 63.165 63.191 63.167 63.103 63.039 62.953 62.857 62.777 62.67 62.534 62.404 62.249 62.066 61.917 61.759 61.569 61.376 61.192 61.05 60.891 60.642 60.456 60.247 60.134 59.898 59.646 59.356 59.202 58.874 58.67 58.464 58.249 57.764 57.499 57.187 56.812 56.366 55.806 55.013 52.885 -5 ,9378 ,KEBNE ,16724271,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:01:13 CET,0.0 1.378 2.013 2.514 2.902 3.216 3.503 3.771 4.281 4.529 4.775 4.983 5.422 5.618 5.999 6.376 6.747 6.927 7.28 7.621 8.119 8.445 8.758 9.207 9.649 10.075 10.495 10.917 11.463 11.994 12.51 13.132 13.756 14.376 15.075 15.883 16.68 17.562 18.513 19.556 20.697 21.988 23.512 25.062 26.951 29.151 31.733 34.732 38.415 42.904 48.615 53.589 56.645 58.664 60.034 61.005 61.661 62.11 62.398 62.602 62.71 62.763 62.777 62.764 62.739 62.693 62.621 62.521 62.407 62.281 62.126 61.962 61.78 61.596 61.447 61.28 61.087 60.87 60.647 60.495 60.333 60.07 59.874 59.657 59.543 59.298 59.027 58.724 58.542 58.175 57.928 57.669 57.379 56.772 56.44 56.058 55.622 55.136 54.54 53.726 51.025 -6 ,13065 ,KEBNE ,16724272,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:01:12 CET,0.0 1.467 2.044 2.485 2.864 3.197 3.493 3.775 4.319 4.557 4.786 5.017 5.468 5.675 6.076 6.45 6.839 7.035 7.391 7.735 8.231 8.55 8.862 9.312 9.76 10.218 10.655 11.058 11.622 12.193 12.717 13.35 13.973 14.569 15.272 16.088 16.897 17.775 18.711 19.756 20.88 22.162 23.696 25.275 27.165 29.339 31.923 34.936 38.579 43.045 48.786 53.777 56.778 58.782 60.107 61.011 61.66 62.112 62.4 62.614 62.727 62.788 62.822 62.82 62.788 62.724 62.633 62.522 62.417 62.297 62.139 62.005 61.85 61.664 61.514 61.364 61.205 61.003 60.779 60.627 60.467 60.219 60.02 59.804 59.696 59.464 59.203 58.925 58.779 58.434 58.227 58.029 57.822 57.361 57.075 56.748 56.391 55.96 55.399 54.639 52.445 -7 ,5946 ,KEBNE ,16724273,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:01:12 CET,0.0 1.541 2.203 2.727 3.171 3.557 3.872 4.146 4.644 4.873 5.111 5.334 5.775 5.98 6.386 6.78 7.155 7.333 7.678 8.021 8.532 8.864 9.187 9.653 10.11 10.557 10.991 11.42 11.961 12.477 13.0 13.649 14.287 14.9 15.597 16.399 17.197 18.08 19.029 20.06 21.18 22.475 24.023 25.628 27.544 29.719 32.272 35.23 38.844 43.288 48.947 53.925 56.868 58.791 60.073 60.947 61.56 61.999 62.28 62.478 62.604 62.659 62.656 62.638 62.606 62.539 62.448 62.365 62.27 62.145 61.996 61.85 61.678 61.503 61.361 61.21 61.044 60.856 60.659 60.52 60.368 60.108 59.919 59.714 59.601 59.364 59.099 58.816 58.666 58.31 58.009 57.755 57.478 56.861 56.517 56.14 55.73 55.222 54.56 53.733 51.708 -8 ,13683 ,KEBNE ,16724274,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:01:27 CET,0.0 1.095 1.631 2.078 2.461 2.78 3.085 3.383 3.929 4.178 4.41 4.618 5.061 5.268 5.669 6.047 6.417 6.598 6.947 7.288 7.758 8.069 8.385 8.844 9.291 9.733 10.166 10.587 11.131 11.66 12.188 12.832 13.448 14.049 14.745 15.54 16.33 17.199 18.163 19.226 20.369 21.686 23.236 24.812 26.692 28.875 31.46 34.457 38.14 42.639 48.153 52.964 56.032 57.989 59.292 60.234 60.886 61.353 61.692 61.964 62.11 62.185 62.23 62.227 62.203 62.161 62.067 61.964 61.86 61.732 61.592 61.458 61.304 61.13 60.994 60.853 60.695 60.514 60.3 60.153 59.992 59.706 59.508 59.311 59.206 58.972 58.712 58.431 58.292 57.968 57.772 57.574 57.367 56.886 56.585 56.265 55.906 55.471 54.912 54.114 52.144 -9 ,16622 ,KEBNE ,16724275,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:01:14 CET,0.0 1.158 1.689 2.137 2.552 2.952 3.305 3.606 4.141 4.391 4.632 4.855 5.298 5.506 5.912 6.299 6.678 6.866 7.226 7.563 8.05 8.369 8.68 9.141 9.597 10.046 10.484 10.909 11.449 11.97 12.489 13.126 13.739 14.336 15.038 15.852 16.664 17.594 18.619 19.683 20.805 22.099 23.625 25.232 27.182 29.342 31.902 34.949 38.619 43.111 48.83 53.677 56.564 58.463 59.768 60.708 61.361 61.868 62.21 62.459 62.604 62.657 62.669 62.654 62.607 62.549 62.457 62.354 62.243 62.107 61.952 61.815 61.66 61.486 61.365 61.216 61.037 60.848 60.634 60.486 60.327 60.053 59.859 59.654 59.542 59.318 59.086 58.804 58.651 58.325 58.127 57.929 57.715 57.247 56.985 56.671 56.341 55.934 55.367 54.639 52.533 -10 ,5099 ,KEBNE ,16724276,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:01:03 CET,0.0 1.459 2.167 2.672 3.138 3.57 3.938 4.232 4.75 4.99 5.224 5.418 5.868 6.082 6.47 6.853 7.219 7.397 7.757 8.098 8.591 8.932 9.264 9.72 10.16 10.597 11.033 11.46 12.009 12.539 13.058 13.703 14.334 14.944 15.648 16.448 17.233 18.097 19.045 20.091 21.215 22.493 24.019 25.595 27.486 29.658 32.255 35.263 38.872 43.332 49.126 54.149 57.201 59.192 60.501 61.437 62.095 62.568 62.884 63.113 63.255 63.344 63.372 63.357 63.32 63.257 63.165 63.065 62.961 62.832 62.683 62.554 62.405 62.247 62.126 61.993 61.825 61.624 61.432 61.288 61.121 60.855 60.653 60.442 60.343 60.111 59.854 59.582 59.429 59.102 58.914 58.705 58.487 58.009 57.728 57.422 57.097 56.721 56.221 55.514 53.333 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index 9edff948..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3170 ,KEBNE ,16724277,Sun Nov 28 05:24:55 CET,Sun Nov 28 07:00:54 CET,0.0 1.886 2.71 3.322 3.869 4.338 4.77 5.157 5.854 6.17 6.441 6.704 7.138 7.343 7.732 8.116 8.474 8.641 8.96 9.269 9.731 10.032 10.327 10.753 11.165 11.553 11.928 12.298 12.766 13.218 13.668 14.216 14.734 15.232 15.806 16.429 17.031 17.714 18.452 19.237 20.052 20.965 22.061 23.167 24.413 25.747 27.268 28.917 30.7 32.585 34.426 35.282 35.329 35.076 34.643 34.111 33.563 33.02 32.494 31.864 31.305 30.829 30.344 29.849 29.386 28.967 28.512 28.098 27.736 27.359 26.963 26.618 26.255 25.866 25.55 25.222 24.877 24.507 24.138 23.894 23.639 23.233 22.935 22.617 22.457 22.12 21.763 21.385 21.178 20.761 20.458 20.187 19.907 19.28 18.931 18.543 18.102 17.537 16.787 15.78 12.241 -7 ,20133 ,KEBNE ,16724283,Sun Nov 28 05:25:56 CET,Sun Nov 28 07:02:01 CET,0.0 2.226 2.901 3.401 3.803 4.162 4.481 4.779 5.366 5.634 5.883 6.142 6.576 6.795 7.214 7.59 7.934 8.108 8.442 8.766 9.216 9.495 9.79 10.223 10.628 11.016 11.388 11.748 12.215 12.658 13.065 13.564 14.054 14.524 15.096 15.754 16.37 17.046 17.785 18.557 19.343 20.248 21.324 22.364 23.589 24.952 26.467 28.154 30.044 32.016 33.879 34.814 34.886 34.616 34.163 33.609 33.004 32.387 31.849 31.282 30.768 30.275 29.806 29.368 28.924 28.496 28.036 27.631 27.27 26.865 26.445 26.094 25.719 25.331 25.015 24.677 24.338 23.982 23.588 23.309 23.027 22.584 22.263 21.916 21.737 21.378 21.001 20.574 20.345 19.913 19.582 19.295 18.994 18.344 17.978 17.571 17.066 16.458 15.727 14.702 11.24 -8 ,30489 ,KEBNE ,16724284,Sun Nov 28 05:25:56 CET,Sun Nov 28 07:01:58 CET,0.0 2.475 3.311 3.945 4.491 4.966 5.368 5.73 6.406 6.718 7.023 7.385 7.848 8.066 8.48 8.875 9.244 9.424 9.769 10.089 10.546 10.838 11.124 11.536 11.931 12.323 12.694 13.05 13.519 13.97 14.4 14.939 15.463 15.967 16.558 17.199 17.805 18.472 19.18 19.942 20.778 21.724 22.776 23.815 25.032 26.352 27.848 29.543 31.418 33.463 35.554 36.679 36.899 36.741 36.33 35.792 35.225 34.621 34.052 33.466 32.945 32.477 32.006 31.534 31.053 30.599 30.13 29.689 29.314 28.931 28.523 28.169 27.784 27.385 27.081 26.764 26.425 26.064 25.68 25.406 25.136 24.711 24.388 24.032 23.848 23.456 23.036 22.611 22.358 21.876 21.46 21.12 20.768 19.997 19.533 19.009 18.434 17.795 17.047 15.978 12.236 -9 ,9111 ,KEBNE ,16724285,Sun Nov 28 05:25:56 CET,Sun Nov 28 07:02:56 CET,0.0 2.184 2.881 3.379 3.796 4.169 4.506 4.823 5.406 5.669 5.905 6.145 6.573 6.775 7.165 7.537 7.884 8.052 8.386 8.721 9.197 9.501 9.788 10.199 10.595 10.976 11.355 11.715 12.168 12.608 13.044 13.581 14.103 14.597 15.158 15.811 16.434 17.093 17.826 18.606 19.401 20.34 21.461 22.536 23.782 25.179 26.69 28.332 30.195 32.173 34.099 35.018 35.097 34.844 34.394 33.824 33.257 32.689 32.223 31.781 31.387 31.026 30.623 30.213 29.831 29.48 29.101 28.725 28.379 28.038 27.679 27.37 27.04 26.676 26.397 26.092 25.772 25.449 25.082 24.823 24.566 24.151 23.857 23.561 23.396 23.039 22.676 22.294 22.087 21.662 21.364 21.099 20.81 20.143 19.778 19.389 18.907 18.332 17.627 16.618 12.953 -10 ,17815 ,KEBNE ,16724286,Sun Nov 28 05:25:56 CET,Sun Nov 28 07:03:26 CET,0.0 1.977 2.702 3.234 3.647 4.009 4.368 4.682 5.248 5.527 5.79 6.037 6.463 6.665 7.06 7.439 7.791 7.951 8.264 8.581 9.043 9.34 9.624 10.03 10.423 10.796 11.153 11.511 11.977 12.416 12.836 13.354 13.857 14.34 14.912 15.554 16.179 16.86 17.587 18.36 19.156 20.048 21.103 22.215 23.481 24.833 26.361 27.982 29.752 31.716 33.536 34.491 34.678 34.416 33.979 33.449 32.911 32.357 31.81 31.187 30.649 30.173 29.706 29.242 28.804 28.379 27.894 27.471 27.118 26.736 26.327 25.972 25.586 25.19 24.89 24.576 24.232 23.861 23.468 23.201 22.909 22.448 22.127 21.775 21.576 21.149 20.72 20.273 20.034 19.596 19.278 18.982 18.633 17.818 17.362 16.889 16.33 15.637 14.759 13.614 10.275 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt deleted file mode 100644 index f348e31c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1176 ,KEBNE ,17026428,Wed Dec 22 14:18:31 CET,Wed Dec 22 15:56:40 CET,0.0 1.777 2.427 2.843 3.225 3.578 3.889 4.166 4.66 4.871 5.063 5.203 5.578 5.747 6.067 6.359 6.632 6.768 7.021 7.247 7.594 7.845 8.111 8.501 8.854 9.156 9.426 9.682 10.013 10.331 10.634 10.998 11.349 11.669 12.028 12.443 12.846 13.283 13.744 14.226 14.728 15.276 15.904 16.521 17.191 17.914 18.716 19.566 20.469 21.358 22.076 22.188 21.909 21.491 20.983 20.397 19.818 19.283 18.797 18.277 17.811 17.388 16.979 16.588 16.188 15.817 15.419 15.034 14.709 14.375 14.006 13.685 13.358 13.024 12.745 12.445 12.133 11.817 11.492 11.258 11.012 10.615 10.329 10.032 9.883 9.581 9.233 8.846 8.652 8.236 7.977 7.73 7.479 6.908 6.568 6.181 5.74 5.267 4.716 3.877 0.878 -2 ,10316 ,KEBNE ,17026429,Wed Dec 22 14:18:30 CET,Wed Dec 22 15:56:00 CET,0.0 1.818 2.416 2.839 3.217 3.534 3.823 4.094 4.606 4.824 5.018 5.176 5.549 5.705 6.008 6.3 6.572 6.701 6.941 7.164 7.493 7.709 7.912 8.207 8.498 8.782 9.049 9.305 9.627 9.966 10.313 10.692 11.024 11.341 11.704 12.114 12.516 12.946 13.387 13.862 14.378 14.939 15.552 16.169 16.887 17.623 18.427 19.304 20.227 21.132 21.854 22.028 21.748 21.231 20.677 20.098 19.572 19.081 18.577 18.006 17.471 16.976 16.496 16.059 15.649 15.257 14.85 14.461 14.121 13.782 13.423 13.119 12.782 12.429 12.166 11.853 11.488 11.103 10.721 10.473 10.218 9.811 9.527 9.219 9.061 8.745 8.392 8.018 7.819 7.394 7.134 6.891 6.618 6.001 5.648 5.245 4.82 4.357 3.779 2.929 0.038 -3 ,9387 ,KEBNE ,17026430,Wed Dec 22 14:18:30 CET,Wed Dec 22 15:56:47 CET,0.0 1.876 2.437 2.865 3.231 3.557 3.86 4.128 4.596 4.8 5.001 5.172 5.55 5.704 6.001 6.31 6.601 6.728 6.97 7.198 7.515 7.725 7.937 8.224 8.487 8.758 9.025 9.284 9.612 9.912 10.214 10.576 10.914 11.238 11.602 12.007 12.39 12.805 13.249 13.713 14.187 14.716 15.325 15.923 16.596 17.32 18.111 18.953 19.861 20.746 21.373 21.403 21.099 20.613 20.074 19.518 18.971 18.433 17.953 17.429 16.942 16.498 16.036 15.598 15.192 14.805 14.409 14.047 13.716 13.361 12.983 12.682 12.363 12.013 11.737 11.449 11.135 10.803 10.467 10.226 9.974 9.579 9.3 8.996 8.84 8.531 8.193 7.815 7.612 7.178 6.843 6.538 6.224 5.52 5.127 4.72 4.222 3.635 2.934 1.965 -0.915 -4 ,27358 ,KEBNE ,17026431,Wed Dec 22 14:19:32 CET,Wed Dec 22 15:55:58 CET,0.0 1.67 2.269 2.744 3.185 3.564 3.914 4.229 4.783 5.033 5.245 5.399 5.776 5.93 6.241 6.526 6.793 6.92 7.166 7.403 7.729 7.943 8.151 8.445 8.729 9.01 9.28 9.54 9.883 10.213 10.518 10.876 11.21 11.528 11.894 12.298 12.691 13.124 13.582 14.064 14.563 15.092 15.668 16.266 16.968 17.709 18.531 19.392 20.293 21.218 21.99 22.171 21.936 21.49 20.938 20.397 19.859 19.306 18.806 18.265 17.791 17.355 16.912 16.487 16.067 15.684 15.281 14.912 14.587 14.225 13.85 13.536 13.198 12.835 12.548 12.254 11.953 11.628 11.281 11.041 10.781 10.353 10.018 9.662 9.483 9.107 8.699 8.253 8.023 7.577 7.274 7.005 6.716 6.061 5.657 5.157 4.579 3.954 3.219 2.179 -0.617 -5 ,23458 ,KEBNE ,17026432,Wed Dec 22 14:19:32 CET,Wed Dec 22 15:57:35 CET,0.0 1.767 2.425 2.894 3.267 3.574 3.825 4.055 4.477 4.667 4.866 5.076 5.501 5.7 6.06 6.41 6.753 6.904 7.191 7.492 7.925 8.195 8.452 8.818 9.157 9.441 9.692 9.946 10.271 10.577 10.87 11.221 11.546 11.865 12.241 12.65 13.042 13.48 13.945 14.429 14.934 15.489 16.115 16.739 17.43 18.144 18.95 19.801 20.73 21.672 22.426 22.557 22.307 21.916 21.399 20.813 20.269 19.714 19.214 18.69 18.195 17.763 17.345 16.929 16.532 16.152 15.742 15.381 15.06 14.715 14.349 14.037 13.694 13.332 13.059 12.779 12.492 12.178 11.824 11.582 11.332 10.911 10.588 10.227 10.032 9.635 9.218 8.766 8.537 8.117 7.879 7.622 7.347 6.762 6.456 6.116 5.696 5.191 4.568 3.724 0.944 -6 ,260 ,KEBNE ,17026433,Wed Dec 22 14:19:32 CET,Wed Dec 22 15:58:19 CET,0.0 1.727 2.403 2.913 3.317 3.691 3.997 4.231 4.66 4.871 5.084 5.292 5.712 5.919 6.324 6.706 7.05 7.206 7.499 7.788 8.193 8.451 8.69 9.032 9.372 9.693 9.976 10.239 10.582 10.891 11.174 11.516 11.856 12.184 12.563 12.979 13.363 13.773 14.207 14.671 15.17 15.728 16.363 16.995 17.705 18.453 19.272 20.152 21.093 22.025 22.708 22.722 22.43 22.007 21.471 20.928 20.443 19.92 19.417 18.888 18.423 17.985 17.547 17.108 16.689 16.313 15.911 15.544 15.217 14.879 14.513 14.19 13.853 13.513 13.246 12.96 12.661 12.36 12.049 11.818 11.552 11.079 10.722 10.357 10.173 9.782 9.357 8.919 8.707 8.288 8.02 7.775 7.519 6.935 6.601 6.232 5.824 5.347 4.754 3.886 0.684 -7 ,5095 ,KEBNE ,17026434,Wed Dec 22 14:19:32 CET,Wed Dec 22 15:55:55 CET,0.0 1.455 2.041 2.486 2.84 3.169 3.457 3.711 4.163 4.366 4.543 4.662 5.039 5.198 5.491 5.769 6.039 6.169 6.435 6.685 7.026 7.242 7.45 7.749 8.026 8.295 8.559 8.81 9.145 9.464 9.762 10.115 10.448 10.772 11.153 11.58 11.975 12.41 12.866 13.342 13.845 14.395 15.024 15.623 16.284 17.024 17.867 18.734 19.605 20.48 21.221 21.438 21.235 20.766 20.259 19.734 19.176 18.605 18.109 17.615 17.146 16.691 16.216 15.754 15.321 14.915 14.488 14.115 13.776 13.384 12.951 12.568 12.177 11.764 11.455 11.171 10.859 10.528 10.177 9.93 9.674 9.284 9.017 8.73 8.58 8.259 7.911 7.523 7.314 6.894 6.657 6.421 6.163 5.568 5.224 4.84 4.416 3.926 3.309 2.457 -0.167 -8 ,28286 ,KEBNE ,17026435,Wed Dec 22 14:19:32 CET,Wed Dec 22 15:55:58 CET,0.0 1.73 2.342 2.811 3.203 3.557 3.852 4.113 4.606 4.836 5.044 5.191 5.561 5.717 6.022 6.305 6.563 6.687 6.93 7.164 7.501 7.725 7.935 8.223 8.511 8.816 9.085 9.332 9.656 9.961 10.251 10.626 10.982 11.29 11.656 12.072 12.453 12.86 13.306 13.794 14.311 14.883 15.527 16.139 16.839 17.586 18.393 19.278 20.18 21.013 21.698 21.841 21.574 21.086 20.565 20.006 19.459 18.937 18.451 17.916 17.409 16.957 16.522 16.101 15.699 15.312 14.899 14.513 14.169 13.814 13.441 13.1 12.741 12.382 12.106 11.819 11.512 11.178 10.788 10.492 10.182 9.707 9.378 9.028 8.847 8.478 8.08 7.641 7.41 6.97 6.684 6.417 6.137 5.493 5.118 4.701 4.252 3.763 3.166 2.329 -0.644 -9 ,29114 ,KEBNE ,17026436,Wed Dec 22 14:19:32 CET,Wed Dec 22 15:55:40 CET,0.0 1.532 2.094 2.511 2.848 3.15 3.422 3.688 4.149 4.354 4.552 4.687 5.067 5.223 5.509 5.797 6.071 6.199 6.435 6.664 7.005 7.224 7.429 7.721 7.997 8.271 8.551 8.822 9.159 9.465 9.759 10.117 10.475 10.808 11.172 11.583 11.972 12.383 12.801 13.248 13.735 14.282 14.905 15.53 16.228 16.965 17.772 18.603 19.446 20.302 21.058 21.186 20.904 20.494 20.041 19.491 18.933 18.433 17.957 17.427 16.94 16.509 16.112 15.7 15.291 14.913 14.492 14.111 13.792 13.462 13.096 12.774 12.436 12.083 11.813 11.52 11.208 10.871 10.514 10.276 10.031 9.635 9.354 9.053 8.892 8.556 8.202 7.813 7.602 7.182 6.919 6.667 6.411 5.814 5.48 5.102 4.661 4.161 3.544 2.686 -0.273 -10 ,10846 ,KEBNE ,17026437,Wed Dec 22 14:20:33 CET,Wed Dec 22 15:58:20 CET,0.0 1.439 1.999 2.422 2.775 3.05 3.308 3.559 4.001 4.193 4.375 4.52 4.897 5.061 5.374 5.656 5.94 6.071 6.31 6.549 6.878 7.079 7.283 7.58 7.863 8.141 8.419 8.684 9.001 9.3 9.594 9.95 10.279 10.589 10.946 11.347 11.731 12.15 12.602 13.069 13.544 14.057 14.66 15.263 15.934 16.653 17.426 18.241 19.124 20.048 20.794 20.974 20.728 20.24 19.674 19.112 18.573 18.019 17.503 16.972 16.502 16.043 15.59 15.172 14.772 14.39 13.986 13.6 13.237 12.869 12.506 12.208 11.876 11.506 11.219 10.915 10.598 10.281 9.948 9.711 9.459 9.062 8.769 8.458 8.301 7.97 7.611 7.229 7.037 6.63 6.338 6.059 5.789 5.201 4.865 4.51 4.098 3.61 3.019 2.165 -0.542 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index f3f4e448..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12258 ,KEBNE ,17026438,Wed Dec 22 14:20:33 CET,Wed Dec 22 15:58:19 CET,0.0 1.115 1.607 1.964 2.309 2.622 2.898 3.158 3.621 3.827 4.03 4.215 4.624 4.796 5.122 5.453 5.758 5.899 6.182 6.458 6.854 7.108 7.35 7.718 8.078 8.411 8.732 9.036 9.426 9.806 10.174 10.624 11.084 11.532 12.024 12.567 13.093 13.672 14.292 14.956 15.685 16.51 17.438 18.38 19.505 20.746 22.174 23.806 25.71 27.825 30.233 32.061 32.889 33.229 33.319 33.272 33.099 32.848 32.588 32.285 32.017 31.764 31.504 31.232 30.933 30.647 30.354 30.064 29.789 29.494 29.179 28.902 28.614 28.324 28.1 27.872 27.613 27.298 26.94 26.688 26.423 25.984 25.681 25.384 25.242 24.944 24.605 24.254 24.08 23.703 23.496 23.259 23.015 22.491 22.185 21.842 21.431 20.927 20.301 19.416 15.901 -2 ,20243 ,KEBNE ,17026439,Wed Dec 22 14:20:33 CET,Wed Dec 22 15:56:47 CET,0.0 1.226 1.737 2.14 2.497 2.817 3.109 3.374 3.822 4.033 4.248 4.429 4.839 5.012 5.331 5.644 5.946 6.089 6.363 6.628 7.019 7.269 7.512 7.868 8.206 8.544 8.876 9.191 9.594 9.986 10.365 10.812 11.258 11.691 12.172 12.705 13.231 13.829 14.461 15.154 15.901 16.718 17.654 18.618 19.741 20.968 22.418 24.032 25.871 28.055 30.611 32.379 33.199 33.622 33.777 33.73 33.573 33.328 33.032 32.701 32.412 32.136 31.851 31.554 31.244 30.946 30.646 30.375 30.112 29.821 29.513 29.272 29.015 28.713 28.479 28.237 27.989 27.719 27.381 27.123 26.861 26.446 26.135 25.804 25.629 25.284 24.951 24.604 24.422 24.044 23.851 23.631 23.391 22.858 22.553 22.218 21.847 21.391 20.783 19.995 17.429 -3 ,21829 ,KEBNE ,17026440,Wed Dec 22 14:21:34 CET,Wed Dec 22 15:57:47 CET,0.0 1.098 1.579 1.976 2.32 2.609 2.879 3.141 3.605 3.814 4.021 4.184 4.58 4.758 5.096 5.405 5.701 5.845 6.127 6.402 6.791 7.058 7.343 7.761 8.151 8.51 8.854 9.174 9.561 9.93 10.3 10.764 11.196 11.604 12.077 12.612 13.142 13.741 14.385 15.052 15.755 16.575 17.545 18.487 19.592 20.859 22.311 23.919 25.771 27.938 30.43 32.306 33.212 33.604 33.694 33.615 33.466 33.29 33.064 32.755 32.453 32.171 31.891 31.608 31.329 31.055 30.751 30.473 30.228 29.966 29.682 29.435 29.173 28.893 28.667 28.428 28.17 27.905 27.644 27.448 27.228 26.847 26.547 26.217 26.047 25.697 25.332 24.918 24.688 24.263 23.979 23.723 23.446 22.827 22.473 22.066 21.61 21.079 20.428 19.581 17.609 -4 ,26957 ,KEBNE ,17026441,Wed Dec 22 14:21:34 CET,Wed Dec 22 15:58:46 CET,0.0 1.148 1.681 2.085 2.412 2.715 2.996 3.265 3.762 3.988 4.203 4.377 4.779 4.951 5.282 5.59 5.877 6.021 6.295 6.562 6.966 7.221 7.466 7.828 8.179 8.509 8.821 9.123 9.504 9.878 10.246 10.705 11.142 11.555 12.044 12.599 13.137 13.724 14.355 15.015 15.696 16.47 17.381 18.317 19.431 20.675 22.063 23.66 25.565 27.751 30.259 32.165 33.014 33.349 33.458 33.425 33.27 33.066 32.83 32.546 32.272 31.989 31.709 31.403 31.087 30.799 30.48 30.189 29.939 29.676 29.366 29.077 28.791 28.495 28.251 28.004 27.753 27.48 27.185 26.982 26.769 26.425 26.174 25.91 25.77 25.484 25.194 24.876 24.694 24.304 24.108 23.895 23.648 23.112 22.817 22.495 22.139 21.731 21.175 20.437 17.883 -5 ,31139 ,KEBNE ,17026442,Wed Dec 22 14:21:35 CET,Wed Dec 22 15:58:04 CET,0.0 1.135 1.639 2.03 2.392 2.708 2.989 3.241 3.694 3.911 4.12 4.292 4.689 4.863 5.192 5.506 5.818 5.964 6.236 6.502 6.895 7.153 7.394 7.724 8.048 8.362 8.663 8.956 9.34 9.718 10.07 10.501 10.927 11.33 11.812 12.375 12.918 13.5 14.113 14.775 15.472 16.255 17.183 18.123 19.253 20.506 21.907 23.49 25.381 27.569 30.034 31.817 32.637 32.965 33.048 32.996 32.842 32.634 32.4 32.124 31.849 31.562 31.274 30.986 30.688 30.412 30.114 29.821 29.553 29.267 28.98 28.744 28.478 28.183 27.958 27.727 27.467 27.193 26.9 26.694 26.464 26.094 25.82 25.477 25.301 24.993 24.69 24.353 24.162 23.765 23.516 23.268 23.02 22.517 22.229 21.889 21.513 21.058 20.492 19.714 17.072 -6 ,12414 ,KEBNE ,17026443,Wed Dec 22 14:21:35 CET,Wed Dec 22 15:57:47 CET,0.0 1.123 1.647 2.072 2.432 2.73 2.99 3.228 3.664 3.869 4.063 4.227 4.628 4.793 5.108 5.418 5.726 5.874 6.157 6.431 6.837 7.095 7.341 7.701 8.039 8.355 8.655 8.966 9.391 9.8 10.186 10.646 11.092 11.518 12.002 12.55 13.093 13.701 14.342 15.008 15.722 16.529 17.47 18.415 19.514 20.728 22.132 23.732 25.579 27.73 30.197 31.955 32.771 33.133 33.225 33.133 32.957 32.764 32.521 32.216 31.936 31.668 31.395 31.105 30.813 30.536 30.233 29.955 29.717 29.465 29.184 28.942 28.689 28.414 28.185 27.94 27.665 27.377 27.098 26.902 26.687 26.327 26.056 25.78 25.65 25.369 25.053 24.728 24.559 24.179 23.971 23.755 23.529 23.022 22.726 22.43 22.067 21.586 21.001 20.256 17.444 -7 ,12129 ,KEBNE ,17026444,Wed Dec 22 14:21:35 CET,Wed Dec 22 15:57:44 CET,0.0 1.721 2.334 2.79 3.216 3.602 3.936 4.255 4.847 5.111 5.356 5.599 6.029 6.233 6.626 7.004 7.375 7.551 7.877 8.175 8.585 8.84 9.085 9.435 9.769 10.096 10.416 10.741 11.177 11.564 11.911 12.339 12.761 13.17 13.661 14.231 14.767 15.363 16.017 16.677 17.359 18.175 19.127 20.067 21.159 22.378 23.829 25.477 27.377 29.532 31.962 33.777 34.636 35.052 35.167 35.105 34.974 34.793 34.607 34.367 34.093 33.821 33.534 33.243 32.954 32.662 32.361 32.096 31.842 31.566 31.274 31.008 30.721 30.43 30.208 29.968 29.701 29.425 29.13 28.924 28.703 28.291 27.984 27.671 27.505 27.157 26.785 26.354 26.123 25.695 25.429 25.181 24.894 24.217 23.853 23.475 23.048 22.532 21.944 21.14 19.077 -8 ,18894 ,KEBNE ,17026445,Wed Dec 22 14:21:35 CET,Wed Dec 22 15:58:04 CET,0.0 1.187 1.68 2.068 2.417 2.724 3.003 3.269 3.746 3.961 4.171 4.334 4.729 4.901 5.239 5.562 5.87 6.017 6.298 6.581 6.98 7.235 7.481 7.823 8.156 8.481 8.805 9.117 9.538 9.976 10.412 10.9 11.334 11.759 12.261 12.822 13.35 13.944 14.574 15.259 16.017 16.832 17.748 18.682 19.774 20.999 22.437 24.061 25.929 28.067 30.519 32.378 33.298 33.69 33.801 33.762 33.625 33.414 33.177 32.901 32.625 32.349 32.053 31.757 31.46 31.177 30.88 30.604 30.357 30.081 29.777 29.529 29.237 28.889 28.614 28.31 27.996 27.661 27.299 27.067 26.822 26.421 26.132 25.816 25.663 25.378 25.085 24.77 24.591 24.186 23.895 23.629 23.345 22.697 22.331 21.945 21.512 20.965 20.26 19.397 17.065 -9 ,3694 ,KEBNE ,17026446,Wed Dec 22 14:21:34 CET,Wed Dec 22 15:58:02 CET,0.0 1.082 1.584 2.005 2.331 2.62 2.902 3.156 3.589 3.787 3.979 4.137 4.525 4.695 5.072 5.461 5.822 5.995 6.331 6.651 7.113 7.41 7.693 8.105 8.505 8.874 9.22 9.543 9.938 10.332 10.714 11.153 11.582 12.009 12.501 13.046 13.57 14.144 14.767 15.426 16.124 16.938 17.894 18.892 20.034 21.277 22.771 24.395 26.253 28.379 30.761 32.607 33.513 33.916 34.005 33.899 33.733 33.525 33.293 33.019 32.737 32.464 32.17 31.877 31.569 31.267 30.96 30.676 30.423 30.139 29.835 29.583 29.316 29.03 28.808 28.551 28.261 27.987 27.684 27.459 27.202 26.763 26.459 26.133 25.962 25.6 25.223 24.834 24.628 24.214 23.929 23.662 23.39 22.788 22.428 22.007 21.551 21.059 20.447 19.67 17.4 -10 ,7861 ,KEBNE ,17026447,Wed Dec 22 14:22:37 CET,Wed Dec 22 15:59:55 CET,0.0 1.464 2.091 2.555 2.961 3.315 3.631 3.926 4.468 4.73 4.991 5.224 5.629 5.809 6.185 6.552 6.91 7.087 7.413 7.733 8.196 8.491 8.769 9.145 9.5 9.828 10.14 10.436 10.813 11.189 11.558 12.003 12.426 12.832 13.318 13.874 14.409 14.993 15.621 16.287 17.011 17.85 18.793 19.725 20.803 21.997 23.403 24.987 26.804 29.008 31.578 33.425 34.248 34.591 34.698 34.646 34.518 34.325 34.098 33.821 33.54 33.262 32.981 32.699 32.412 32.142 31.853 31.559 31.289 30.999 30.684 30.432 30.167 29.873 29.633 29.373 29.108 28.832 28.541 28.345 28.106 27.669 27.372 27.045 26.863 26.493 26.095 25.678 25.453 25.022 24.711 24.449 24.188 23.551 23.175 22.774 22.324 21.813 21.252 20.489 18.241 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt deleted file mode 100644 index acc19a67..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29734 ,KEBNE ,16724287,Sun Nov 28 05:25:56 CET,Sun Nov 28 07:01:58 CET,0.0 1.061 1.559 1.96 2.287 2.563 2.799 3.01 3.394 3.569 3.743 3.869 4.261 4.425 4.719 4.993 5.254 5.378 5.626 5.899 6.263 6.471 6.675 6.95 7.224 7.494 7.751 8.001 8.32 8.616 8.89 9.231 9.57 9.888 10.239 10.62 10.993 11.41 11.834 12.267 12.741 13.271 13.86 14.437 15.115 15.846 16.599 17.337 18.11 18.836 19.307 19.162 18.598 17.884 17.14 16.401 15.726 15.102 14.52 13.903 13.35 12.838 12.343 11.874 11.412 10.983 10.544 10.143 9.783 9.407 9.013 8.684 8.359 8.004 7.709 7.395 7.074 6.747 6.385 6.113 5.815 5.34 5.017 4.682 4.5 4.117 3.706 3.267 3.042 2.588 2.29 2.027 1.752 1.133 0.773 0.387 -0.039 -0.545 -1.169 -1.945 -3.528 -2 ,12592 ,KEBNE ,16724288,Sun Nov 28 05:25:56 CET,Sun Nov 28 07:01:52 CET,0.0 1.238 1.774 2.141 2.438 2.719 2.99 3.243 3.682 3.882 4.073 4.206 4.596 4.757 5.067 5.354 5.606 5.727 5.973 6.211 6.548 6.767 6.983 7.297 7.594 7.869 8.133 8.382 8.699 9.015 9.318 9.67 9.996 10.313 10.68 11.091 11.475 11.879 12.307 12.761 13.256 13.804 14.393 14.965 15.612 16.33 17.11 17.909 18.704 19.388 19.819 19.534 18.883 18.159 17.456 16.753 16.084 15.437 14.818 14.187 13.631 13.117 12.636 12.156 11.703 11.302 10.856 10.455 10.107 9.727 9.334 8.983 8.595 8.207 7.917 7.604 7.263 6.917 6.574 6.344 6.104 5.716 5.42 5.104 4.945 4.594 4.19 3.758 3.537 3.087 2.781 2.502 2.214 1.587 1.234 0.844 0.412 -0.084 -0.665 -1.381 -3.402 -4 ,10668 ,KEBNE ,16724290,Sun Nov 28 05:25:56 CET,Sun Nov 28 07:02:01 CET,0.0 1.356 1.967 2.469 2.883 3.268 3.598 3.883 4.42 4.662 4.88 5.072 5.488 5.669 5.995 6.302 6.592 6.717 6.952 7.18 7.511 7.729 7.946 8.252 8.539 8.815 9.078 9.333 9.662 9.987 10.284 10.639 10.98 11.291 11.639 12.034 12.422 12.845 13.289 13.747 14.224 14.739 15.309 15.879 16.537 17.242 18.011 18.825 19.659 20.403 20.889 20.677 20.089 19.398 18.698 18.0 17.318 16.646 16.042 15.437 14.905 14.421 13.942 13.464 13.001 12.571 12.133 11.741 11.382 10.961 10.49 10.11 9.73 9.323 8.987 8.632 8.255 7.865 7.469 7.195 6.905 6.438 6.143 5.857 5.705 5.391 5.056 4.692 4.494 4.078 3.856 3.623 3.377 2.835 2.525 2.169 1.767 1.273 0.672 -0.082 -2.018 -5 ,29792 ,KEBNE ,16724291,Sun Nov 28 05:25:56 CET,Sun Nov 28 07:02:11 CET,0.0 1.477 2.12 2.599 2.984 3.314 3.634 3.939 4.494 4.737 4.973 5.184 5.604 5.804 6.166 6.503 6.837 6.982 7.221 7.45 7.788 8.01 8.223 8.517 8.803 9.066 9.316 9.562 9.868 10.16 10.444 10.798 11.137 11.455 11.809 12.21 12.615 13.045 13.485 13.935 14.413 14.944 15.552 16.15 16.806 17.48 18.208 18.997 19.802 20.529 20.961 20.768 20.232 19.539 18.844 18.171 17.498 16.839 16.247 15.606 15.046 14.549 14.061 13.593 13.144 12.721 12.28 11.88 11.501 11.075 10.616 10.23 9.853 9.487 9.191 8.871 8.569 8.263 7.924 7.679 7.426 7.035 6.73 6.371 6.186 5.802 5.395 4.97 4.736 4.27 3.975 3.717 3.434 2.792 2.432 2.033 1.584 1.008 0.328 -0.479 -2.535 -6 ,7577 ,KEBNE ,16724292,Sun Nov 28 05:25:56 CET,Sun Nov 28 07:03:05 CET,0.0 1.233 1.813 2.211 2.541 2.835 3.111 3.355 3.79 3.985 4.165 4.291 4.672 4.819 5.093 5.364 5.62 5.744 5.983 6.207 6.529 6.735 6.94 7.245 7.542 7.819 8.084 8.335 8.662 8.986 9.288 9.645 9.975 10.285 10.657 11.077 11.46 11.86 12.296 12.751 13.197 13.697 14.286 14.854 15.501 16.229 17.003 17.792 18.573 19.253 19.755 19.588 19.014 18.299 17.548 16.78 16.053 15.389 14.794 14.18 13.613 13.108 12.619 12.132 11.675 11.241 10.747 10.312 9.952 9.571 9.162 8.817 8.464 8.107 7.823 7.517 7.207 6.889 6.55 6.306 6.056 5.66 5.395 5.111 4.958 4.651 4.32 3.948 3.745 3.329 3.124 2.899 2.665 2.13 1.821 1.503 1.151 0.758 0.257 -0.475 -4.644 -7 ,1949 ,KEBNE ,16724293,Sun Nov 28 05:25:56 CET,Sun Nov 28 07:01:59 CET,0.0 1.291 1.825 2.233 2.544 2.798 3.038 3.26 3.664 3.844 4.009 4.106 4.473 4.62 4.916 5.19 5.446 5.577 5.822 6.053 6.38 6.587 6.795 7.088 7.371 7.652 7.917 8.176 8.515 8.831 9.131 9.476 9.806 10.122 10.475 10.886 11.282 11.695 12.149 12.622 13.1 13.653 14.273 14.85 15.503 16.189 16.898 17.662 18.477 19.251 19.821 19.643 19.014 18.275 17.56 16.845 16.144 15.459 14.839 14.214 13.671 13.172 12.691 12.235 11.805 11.395 10.942 10.545 10.208 9.833 9.424 9.091 8.761 8.412 8.12 7.81 7.487 7.134 6.766 6.514 6.24 5.814 5.519 5.23 5.083 4.757 4.378 3.945 3.736 3.319 3.087 2.862 2.634 2.135 1.852 1.527 1.173 0.775 0.284 -0.467 -5.165 -8 ,7842 ,KEBNE ,16724294,Sun Nov 28 05:26:57 CET,Sun Nov 28 07:03:56 CET,0.0 1.06 1.528 1.879 2.196 2.493 2.77 3.023 3.467 3.664 3.851 3.98 4.369 4.545 4.86 5.129 5.386 5.512 5.754 5.991 6.322 6.528 6.724 6.997 7.265 7.543 7.821 8.083 8.409 8.727 9.032 9.374 9.685 9.992 10.354 10.778 11.175 11.582 12.023 12.477 12.936 13.446 14.037 14.616 15.268 15.949 16.669 17.42 18.221 18.957 19.395 19.196 18.616 17.917 17.192 16.459 15.755 15.089 14.49 13.875 13.339 12.843 12.354 11.897 11.457 11.032 10.605 10.217 9.866 9.477 9.071 8.749 8.41 8.059 7.785 7.487 7.164 6.835 6.498 6.246 5.959 5.487 5.161 4.861 4.719 4.412 4.076 3.714 3.522 3.101 2.85 2.593 2.311 1.666 1.302 0.906 0.446 -0.079 -0.643 -1.406 -3.215 -9 ,8233 ,KEBNE ,16724295,Sun Nov 28 05:26:57 CET,Sun Nov 28 07:03:05 CET,0.0 1.243 1.712 2.058 2.377 2.688 2.974 3.221 3.65 3.845 4.032 4.16 4.541 4.697 4.98 5.24 5.494 5.622 5.885 6.173 6.597 6.859 7.083 7.372 7.644 7.916 8.18 8.428 8.749 9.046 9.337 9.692 10.029 10.349 10.708 11.102 11.484 11.901 12.357 12.854 13.38 13.959 14.594 15.181 15.844 16.574 17.323 18.07 18.847 19.548 19.96 19.721 19.147 18.437 17.703 17.012 16.354 15.691 15.07 14.423 13.858 13.347 12.863 12.398 11.952 11.531 11.098 10.716 10.351 9.953 9.548 9.21 8.858 8.469 8.16 7.863 7.545 7.171 6.753 6.458 6.156 5.689 5.358 5.022 4.863 4.548 4.213 3.846 3.648 3.237 3.023 2.794 2.563 2.059 1.754 1.396 1.016 0.61 0.071 -0.695 -3.44 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt deleted file mode 100644 index fa140820..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,2038 ,KEBNE ,16724298,Sun Nov 28 05:26:57 CET,Sun Nov 28 07:03:39 CET,0.0 1.448 2.144 2.627 3.017 3.359 3.682 3.982 4.523 4.775 5.01 5.239 5.679 5.901 6.316 6.704 7.059 7.228 7.564 7.875 8.332 8.63 8.916 9.333 9.741 10.136 10.514 10.882 11.354 11.813 12.258 12.796 13.322 13.832 14.419 15.101 15.757 16.462 17.218 17.971 18.697 19.47 20.338 21.189 22.163 23.209 24.387 25.688 27.133 28.691 30.275 31.063 31.133 30.893 30.535 30.084 29.588 29.093 28.626 28.113 27.651 27.225 26.741 26.24 25.791 25.396 24.981 24.607 24.277 23.901 23.524 23.237 22.928 22.609 22.355 22.071 21.775 21.466 21.13 20.895 20.649 20.251 19.964 19.676 19.536 19.221 18.873 18.496 18.282 17.871 17.665 17.444 17.2 16.659 16.389 16.093 15.745 15.351 14.856 14.16 12.061 -3 ,30612 ,KEBNE ,16724299,Sun Nov 28 05:26:57 CET,Sun Nov 28 07:04:51 CET,0.0 1.662 2.268 2.715 3.111 3.462 3.777 4.063 4.615 4.876 5.12 5.331 5.758 5.964 6.343 6.693 7.021 7.182 7.49 7.779 8.209 8.476 8.72 9.077 9.42 9.751 10.072 10.383 10.792 11.183 11.57 12.061 12.536 12.987 13.487 14.023 14.529 15.073 15.656 16.278 16.919 17.634 18.481 19.327 20.319 21.42 22.625 23.933 25.428 27.08 28.729 29.688 29.949 29.901 29.669 29.314 28.905 28.474 28.076 27.627 27.22 26.857 26.491 26.118 25.759 25.371 24.902 24.506 24.181 23.856 23.523 23.238 22.942 22.594 22.292 21.981 21.659 21.325 20.997 20.782 20.555 20.202 19.942 19.652 19.506 19.165 18.757 18.33 18.095 17.648 17.38 17.133 16.889 16.348 16.032 15.684 15.313 14.886 14.363 13.629 11.33 -4 ,28899 ,KEBNE ,16724300,Sun Nov 28 05:26:57 CET,Sun Nov 28 07:04:39 CET,0.0 1.705 2.46 3.058 3.569 4.037 4.432 4.785 5.414 5.7 5.984 6.28 6.732 6.945 7.319 7.658 7.987 8.155 8.475 8.77 9.172 9.432 9.688 10.065 10.422 10.766 11.109 11.43 11.837 12.227 12.589 13.029 13.468 13.894 14.378 14.926 15.461 16.02 16.594 17.211 17.867 18.597 19.469 20.339 21.335 22.425 23.634 24.948 26.386 27.954 29.609 30.642 30.929 30.84 30.558 30.175 29.781 29.364 28.966 28.543 28.14 27.754 27.382 27.038 26.646 26.262 25.909 25.583 25.278 24.963 24.638 24.359 24.05 23.727 23.462 23.158 22.817 22.453 22.067 21.785 21.484 21.032 20.729 20.439 20.305 20.026 19.715 19.356 19.163 18.771 18.59 18.377 18.132 17.627 17.355 17.052 16.715 16.316 15.809 15.119 12.612 -5 ,2336 ,KEBNE ,16724301,Sun Nov 28 05:26:57 CET,Sun Nov 28 07:04:55 CET,0.0 1.817 2.632 3.265 3.726 4.102 4.417 4.69 5.224 5.475 5.7 5.887 6.298 6.49 6.87 7.218 7.537 7.691 7.998 8.296 8.715 8.98 9.24 9.612 9.955 10.287 10.615 10.927 11.334 11.728 12.101 12.548 12.979 13.382 13.86 14.407 14.918 15.478 16.085 16.726 17.393 18.128 18.991 19.897 20.901 21.97 23.187 24.475 25.902 27.525 29.246 30.237 30.531 30.423 30.05 29.56 29.128 28.759 28.397 27.98 27.588 27.218 26.84 26.463 26.103 25.761 25.394 25.054 24.75 24.418 24.059 23.733 23.384 23.053 22.808 22.536 22.239 21.937 21.621 21.404 21.17 20.782 20.497 20.181 20.012 19.661 19.256 18.833 18.634 18.221 17.942 17.68 17.397 16.76 16.417 16.032 15.59 15.112 14.532 13.792 12.089 -6 ,1186 ,KEBNE ,16724302,Sun Nov 28 05:26:57 CET,Sun Nov 28 07:04:56 CET,0.0 2.125 2.879 3.478 3.984 4.397 4.759 5.128 5.814 6.116 6.389 6.694 7.166 7.4 7.83 8.192 8.53 8.71 9.037 9.32 9.722 9.975 10.222 10.593 10.958 11.301 11.623 11.929 12.325 12.707 13.079 13.521 13.935 14.347 14.84 15.379 15.893 16.482 17.105 17.742 18.414 19.174 20.052 20.91 21.865 22.922 24.149 25.481 26.979 28.601 30.325 31.377 31.631 31.492 31.21 30.863 30.478 30.075 29.681 29.257 28.877 28.493 28.092 27.717 27.329 26.929 26.533 26.21 25.92 25.606 25.258 24.977 24.691 24.374 24.103 23.801 23.506 23.212 22.907 22.682 22.424 22.007 21.736 21.452 21.297 20.999 20.698 20.368 20.202 19.821 19.599 19.376 19.154 18.663 18.382 18.058 17.699 17.288 16.765 16.011 14.423 -8 ,19311 ,KEBNE ,16724304,Sun Nov 28 05:28:01 CET,Sun Nov 28 07:06:16 CET,0.0 1.676 2.391 2.949 3.418 3.837 4.2 4.544 5.167 5.442 5.706 5.993 6.456 6.686 7.086 7.431 7.76 7.921 8.226 8.507 8.902 9.162 9.421 9.804 10.154 10.469 10.785 11.108 11.53 11.919 12.298 12.752 13.172 13.58 14.071 14.656 15.208 15.791 16.413 17.047 17.693 18.414 19.242 20.092 21.093 22.178 23.396 24.731 26.23 27.859 29.538 30.566 30.768 30.686 30.502 30.167 29.779 29.401 29.037 28.607 28.204 27.815 27.418 27.034 26.67 26.319 25.936 25.595 25.303 24.983 24.634 24.342 24.039 23.734 23.494 23.216 22.901 22.601 22.307 22.097 21.863 21.45 21.166 20.889 20.754 20.469 20.151 19.81 19.617 19.207 18.981 18.741 18.5 17.99 17.688 17.356 16.995 16.582 16.073 15.356 13.44 -9 ,5796 ,KEBNE ,16724305,Sun Nov 28 05:28:01 CET,Sun Nov 28 07:05:57 CET,0.0 1.558 2.226 2.722 3.158 3.541 3.854 4.14 4.635 4.872 5.11 5.324 5.74 5.926 6.297 6.664 7.008 7.165 7.46 7.748 8.171 8.44 8.692 9.073 9.435 9.763 10.081 10.401 10.811 11.194 11.57 12.037 12.49 12.922 13.397 13.938 14.469 15.03 15.635 16.284 16.937 17.68 18.561 19.414 20.395 21.467 22.727 24.097 25.565 27.16 28.806 29.772 30.017 29.96 29.762 29.449 29.063 28.663 28.271 27.759 27.274 26.882 26.506 26.137 25.791 25.45 25.066 24.732 24.456 24.155 23.789 23.457 23.126 22.761 22.46 22.158 21.838 21.498 21.127 20.855 20.558 20.076 19.74 19.394 19.217 18.838 18.418 17.996 17.779 17.339 17.056 16.791 16.506 15.867 15.515 15.144 14.725 14.251 13.687 12.924 11.127 -10 ,2797 ,KEBNE ,16724306,Sun Nov 28 05:28:00 CET,Sun Nov 28 07:05:45 CET,0.0 1.353 2.079 2.73 3.277 3.714 4.081 4.419 5.058 5.365 5.663 6.01 6.493 6.728 7.144 7.533 7.895 8.07 8.414 8.754 9.244 9.537 9.815 10.229 10.634 11.029 11.415 11.791 12.254 12.694 13.115 13.616 14.068 14.469 14.956 15.521 16.043 16.601 17.214 17.847 18.481 19.208 20.08 20.964 21.959 23.039 24.311 25.707 27.22 28.843 30.507 31.506 31.806 31.736 31.505 31.17 30.716 30.247 29.837 29.388 28.994 28.618 28.239 27.876 27.517 27.175 26.818 26.498 26.2 25.874 25.532 25.249 24.924 24.56 24.289 24.019 23.739 23.437 23.118 22.909 22.696 22.272 21.94 21.627 21.475 21.138 20.766 20.403 20.226 19.81 19.517 19.26 18.977 18.375 18.094 17.787 17.424 17.003 16.483 15.803 13.929 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt deleted file mode 100644 index 31ba8fcf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3940 ,KEBNE ,16724307,Sun Nov 28 05:28:01 CET,Sun Nov 28 07:04:00 CET,0.0 1.688 2.31 2.745 3.097 3.425 3.72 3.984 4.449 4.652 4.844 5.016 5.399 5.575 5.908 6.209 6.513 6.662 6.935 7.19 7.537 7.765 7.995 8.311 8.62 8.933 9.224 9.5 9.853 10.192 10.526 10.919 11.281 11.631 12.05 12.514 12.956 13.42 13.909 14.447 15.012 15.665 16.438 17.167 17.988 18.882 19.872 20.918 22.057 23.265 24.465 25.118 25.219 25.011 24.677 24.281 23.862 23.388 22.933 22.46 22.017 21.621 21.243 20.863 20.482 20.123 19.745 19.395 19.066 18.725 18.372 18.063 17.745 17.406 17.137 16.849 16.545 16.231 15.909 15.68 15.436 15.024 14.714 14.4 14.238 13.911 13.575 13.207 13.019 12.619 12.363 12.113 11.84 11.25 10.936 10.6 10.185 9.687 9.087 8.25 5.579 -2 ,6704 ,KEBNE ,16724308,Sun Nov 28 05:28:00 CET,Sun Nov 28 07:05:15 CET,0.0 1.491 2.044 2.467 2.822 3.131 3.408 3.664 4.109 4.304 4.493 4.664 5.045 5.208 5.523 5.818 6.1 6.236 6.506 6.774 7.143 7.373 7.609 7.957 8.275 8.604 8.954 9.276 9.64 9.983 10.318 10.714 11.085 11.439 11.854 12.309 12.75 13.234 13.756 14.299 14.858 15.475 16.178 16.883 17.696 18.588 19.587 20.663 21.851 23.107 24.335 24.997 25.082 24.923 24.609 24.207 23.805 23.383 22.966 22.517 22.101 21.695 21.296 20.908 20.537 20.181 19.808 19.476 19.163 18.812 18.449 18.152 17.838 17.5 17.23 16.941 16.646 16.331 15.979 15.738 15.485 15.082 14.803 14.501 14.34 14.016 13.678 13.306 13.109 12.705 12.432 12.173 11.908 11.326 10.996 10.633 10.185 9.667 9.079 8.295 6.18 -3 ,32317 ,KEBNE ,16724309,Sun Nov 28 05:28:01 CET,Sun Nov 28 07:05:27 CET,0.0 1.202 1.727 2.168 2.55 2.881 3.186 3.475 3.961 4.178 4.399 4.633 5.06 5.29 5.702 6.082 6.438 6.593 6.878 7.165 7.584 7.848 8.11 8.483 8.844 9.198 9.544 9.876 10.287 10.692 11.071 11.513 11.949 12.387 12.914 13.489 14.027 14.612 15.247 15.936 16.661 17.48 18.427 19.361 20.417 21.568 22.894 24.316 25.826 27.31 28.577 29.083 29.003 28.54 27.818 27.033 26.271 25.561 24.942 24.281 23.668 23.153 22.738 22.346 21.962 21.601 21.223 20.887 20.575 20.244 19.898 19.59 19.245 18.88 18.592 18.307 18.017 17.687 17.336 17.1 16.85 16.445 16.167 15.87 15.698 15.319 14.924 14.498 14.277 13.845 13.518 13.25 12.961 12.313 11.956 11.558 11.11 10.608 9.991 9.143 6.433 -6 ,24032 ,KEBNE ,16724312,Sun Nov 28 05:28:01 CET,Sun Nov 28 07:05:10 CET,0.0 1.648 2.345 2.875 3.315 3.717 4.078 4.406 4.984 5.245 5.485 5.673 6.058 6.237 6.567 6.871 7.16 7.301 7.56 7.803 8.155 8.384 8.608 8.916 9.203 9.495 9.784 10.06 10.418 10.757 11.074 11.45 11.802 12.156 12.574 13.03 13.47 13.957 14.467 14.992 15.544 16.162 16.867 17.548 18.33 19.219 20.241 21.31 22.445 23.658 24.87 25.471 25.461 25.225 24.872 24.446 24.016 23.57 23.149 22.684 22.251 21.841 21.434 21.044 20.68 20.337 19.956 19.605 19.3 18.979 18.621 18.298 17.97 17.644 17.387 17.109 16.813 16.509 16.189 15.955 15.699 15.302 15.031 14.733 14.575 14.25 13.881 13.482 13.273 12.86 12.592 12.326 12.036 11.395 11.04 10.649 10.222 9.745 9.161 8.368 6.073 -8 ,32193 ,KEBNE ,16724314,Sun Nov 28 05:30:01 CET,Sun Nov 28 07:13:22 CET,0.0 1.713 2.302 2.726 3.113 3.438 3.734 4.01 4.482 4.701 4.909 5.074 5.466 5.648 5.963 6.247 6.529 6.671 6.943 7.196 7.552 7.774 7.997 8.324 8.631 8.937 9.233 9.51 9.858 10.19 10.512 10.908 11.284 11.64 12.046 12.492 12.928 13.41 13.921 14.436 14.98 15.605 16.326 17.063 17.913 18.822 19.817 20.905 22.097 23.373 24.671 25.355 25.428 25.228 24.945 24.575 24.151 23.714 23.306 22.843 22.411 22.023 21.632 21.25 20.894 20.567 20.217 19.893 19.592 19.256 18.905 18.599 18.274 17.936 17.672 17.397 17.104 16.784 16.446 16.206 15.947 15.549 15.283 14.963 14.773 14.39 14.004 13.619 13.42 13.01 12.739 12.484 12.222 11.66 11.328 10.934 10.503 10.002 9.376 8.576 6.093 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt deleted file mode 100644 index 54877d19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16532 ,KEBNE ,16724317,Sun Nov 28 05:30:05 CET,Sun Nov 28 06:59:44 CET,0.0 3.254 4.107 4.722 5.237 5.671 6.032 6.349 6.92 7.175 7.411 7.64 8.046 8.235 8.589 8.928 9.25 9.404 9.697 9.968 10.348 10.599 10.85 11.239 11.629 11.966 12.262 12.537 12.885 13.208 13.515 13.884 14.223 14.553 14.954 15.392 15.793 16.234 16.697 17.146 17.586 18.111 18.699 19.233 19.815 20.379 20.984 21.625 22.204 22.531 22.35 21.457 20.44 19.415 18.385 17.41 16.537 15.733 15.018 14.269 13.593 12.993 12.41 11.83 11.294 10.807 10.306 9.858 9.456 9.03 8.585 8.216 7.826 7.417 7.104 6.783 6.441 6.088 5.711 5.433 5.145 4.71 4.414 4.092 3.919 3.57 3.2 2.816 2.619 2.192 1.939 1.686 1.417 0.826 0.501 0.133 -0.277 -0.748 -1.369 -2.258 -5.183 -3 ,29126 ,KEBNE ,16724319,Sun Nov 28 05:34:06 CET,Sun Nov 28 07:10:36 CET,0.0 3.712 4.621 5.267 5.786 6.209 6.583 6.934 7.476 7.717 7.955 8.18 8.584 8.772 9.118 9.446 9.755 9.903 10.184 10.454 10.848 11.095 11.335 11.672 11.988 12.303 12.59 12.851 13.188 13.514 13.828 14.189 14.529 14.85 15.23 15.645 16.02 16.419 16.834 17.276 17.734 18.236 18.799 19.343 19.926 20.539 21.176 21.794 22.372 22.726 22.558 21.643 20.586 19.492 18.484 17.557 16.679 15.85 15.129 14.402 13.749 13.151 12.569 12.007 11.483 11.001 10.503 10.055 9.646 9.211 8.764 8.382 7.992 7.589 7.244 6.887 6.546 6.192 5.811 5.548 5.28 4.861 4.565 4.249 4.075 3.715 3.357 2.983 2.773 2.336 2.076 1.823 1.561 0.958 0.612 0.231 -0.21 -0.74 -1.405 -2.29 -5.339 -4 ,2652 ,KEBNE ,16724320,Sun Nov 28 05:35:07 CET,Sun Nov 28 07:12:05 CET,0.0 2.613 3.49 4.13 4.603 5.003 5.368 5.704 6.305 6.565 6.798 7.027 7.445 7.651 8.02 8.348 8.656 8.808 9.092 9.359 9.736 9.973 10.209 10.546 10.861 11.165 11.459 11.74 12.087 12.404 12.699 13.043 13.375 13.702 14.073 14.481 14.875 15.282 15.696 16.137 16.608 17.111 17.668 18.211 18.804 19.421 20.09 20.68 21.171 21.534 21.363 20.489 19.43 18.328 17.257 16.268 15.383 14.573 13.823 13.061 12.427 11.833 11.265 10.716 10.2 9.731 9.206 8.737 8.338 7.916 7.466 7.083 6.689 6.281 5.967 5.637 5.296 4.945 4.571 4.311 4.041 3.614 3.323 2.992 2.816 2.457 2.065 1.662 1.452 1.017 0.745 0.479 0.221 -0.351 -0.711 -1.112 -1.564 -2.063 -2.694 -3.603 -6.508 -5 ,25552 ,KEBNE ,16724321,Sun Nov 28 05:35:07 CET,Sun Nov 28 07:13:39 CET,0.0 3.765 4.633 5.272 5.773 6.162 6.513 6.828 7.383 7.635 7.871 8.112 8.527 8.732 9.123 9.473 9.797 9.947 10.231 10.501 10.885 11.134 11.373 11.725 12.058 12.356 12.632 12.894 13.238 13.588 13.936 14.331 14.691 15.046 15.431 15.864 16.279 16.698 17.133 17.584 18.051 18.541 19.084 19.61 20.178 20.767 21.404 22.003 22.511 22.85 22.645 21.778 20.783 19.708 18.658 17.676 16.791 15.982 15.266 14.516 13.849 13.256 12.674 12.11 11.587 11.106 10.608 10.152 9.75 9.337 8.9 8.533 8.153 7.722 7.34 6.937 6.533 6.115 5.673 5.379 5.082 4.608 4.289 3.958 3.78 3.4 3.0 2.582 2.365 1.927 1.63 1.354 1.063 0.433 0.067 -0.351 -0.792 -1.304 -1.956 -2.831 -5.681 -8 ,7184 ,KEBNE ,16724324,Sun Nov 28 05:38:12 CET,Sun Nov 28 07:14:41 CET,0.0 3.013 3.843 4.417 4.893 5.302 5.669 6.008 6.594 6.857 7.105 7.339 7.741 7.929 8.307 8.649 8.962 9.116 9.424 9.712 10.115 10.371 10.617 10.964 11.28 11.578 11.861 12.131 12.481 12.796 13.09 13.445 13.791 14.129 14.508 14.916 15.298 15.716 16.154 16.596 17.041 17.531 18.096 18.64 19.222 19.829 20.448 21.003 21.519 21.877 21.617 20.566 19.44 18.349 17.291 16.267 15.34 14.499 13.766 13.0 12.337 11.756 11.173 10.602 10.077 9.584 9.065 8.601 8.193 7.775 7.336 6.961 6.572 6.173 5.856 5.518 5.162 4.79 4.393 4.109 3.803 3.309 2.96 2.598 2.421 2.069 1.7 1.297 1.082 0.649 0.371 0.109 -0.168 -0.808 -1.157 -1.519 -1.931 -2.432 -3.009 -3.879 -6.849 -9 ,27089 ,KEBNE ,16724325,Sun Nov 28 05:38:12 CET,Sun Nov 28 07:15:45 CET,0.0 3.524 4.359 4.978 5.5 5.947 6.315 6.645 7.248 7.508 7.757 8.056 8.495 8.716 9.142 9.554 9.956 10.129 10.418 10.688 11.067 11.31 11.541 11.86 12.18 12.497 12.791 13.059 13.397 13.737 14.096 14.545 14.959 15.315 15.694 16.117 16.505 16.914 17.353 17.806 18.268 18.759 19.314 19.86 20.435 21.04 21.683 22.263 22.755 23.082 22.918 22.049 20.937 19.798 18.762 17.8 16.922 16.099 15.361 14.591 13.905 13.261 12.647 12.092 11.581 11.113 10.602 10.11 9.668 9.231 8.802 8.448 8.083 7.709 7.408 7.079 6.732 6.376 6.028 5.783 5.513 5.074 4.777 4.482 4.326 3.994 3.631 3.231 3.018 2.584 2.298 2.025 1.758 1.16 0.806 0.416 -0.023 -0.551 -1.201 -2.099 -5.034 -10 ,24902 ,KEBNE ,16724326,Sun Nov 28 05:38:12 CET,Sun Nov 28 07:14:39 CET,0.0 3.707 4.547 5.112 5.596 6.012 6.371 6.699 7.268 7.526 7.778 8.037 8.483 8.722 9.164 9.591 9.991 10.18 10.532 10.858 11.327 11.632 11.928 12.358 12.767 13.132 13.439 13.722 14.076 14.406 14.725 15.1 15.457 15.79 16.159 16.571 16.954 17.357 17.779 18.227 18.699 19.22 19.786 20.299 20.856 21.446 22.058 22.626 23.091 23.372 23.205 22.298 21.193 20.123 19.143 18.17 17.281 16.457 15.714 14.955 14.287 13.696 13.129 12.58 12.06 11.568 11.045 10.574 10.157 9.723 9.276 8.913 8.534 8.135 7.831 7.502 7.156 6.805 6.439 6.181 5.913 5.49 5.188 4.839 4.639 4.22 3.77 3.29 3.041 2.572 2.201 1.883 1.548 0.845 0.476 0.078 -0.381 -0.899 -1.524 -2.388 -5.254 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt deleted file mode 100644 index f1b05904..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,255 ,KEBNE ,16724327,Sun Nov 28 05:38:12 CET,Sun Nov 28 07:13:22 CET,0.0 1.293 1.863 2.27 2.592 2.865 3.1 3.305 3.695 3.886 4.065 4.213 4.515 4.658 4.926 5.151 5.365 5.471 5.682 5.882 6.14 6.3 6.461 6.692 6.919 7.132 7.321 7.496 7.721 7.938 8.144 8.386 8.618 8.837 9.088 9.366 9.62 9.883 10.149 10.427 10.706 10.995 11.301 11.562 11.823 12.093 12.336 12.509 12.516 12.221 11.282 9.705 8.204 6.867 5.673 4.561 3.558 2.631 1.852 1.07 0.382 -0.222 -0.805 -1.357 -1.861 -2.328 -2.824 -3.276 -3.674 -4.099 -4.549 -4.912 -5.29 -5.689 -5.989 -6.286 -6.583 -6.902 -7.257 -7.515 -7.768 -8.139 -8.397 -8.671 -8.82 -9.138 -9.462 -9.792 -9.96 -10.318 -10.514 -10.725 -10.944 -11.434 -11.723 -12.031 -12.378 -12.762 -13.183 -13.769 -15.313 -2 ,31058 ,KEBNE ,16724328,Sun Nov 28 05:38:12 CET,Sun Nov 28 07:13:23 CET,0.0 1.252 1.77 2.155 2.482 2.777 3.039 3.265 3.649 3.832 4.005 4.153 4.461 4.587 4.837 5.084 5.313 5.425 5.644 5.838 6.112 6.293 6.464 6.689 6.895 7.094 7.28 7.472 7.716 7.941 8.169 8.434 8.679 8.916 9.176 9.441 9.691 9.967 10.251 10.535 10.816 11.118 11.442 11.75 12.064 12.306 12.514 12.679 12.669 12.367 11.371 9.722 8.217 6.879 5.664 4.585 3.626 2.712 1.918 1.12 0.439 -0.176 -0.765 -1.318 -1.853 -2.338 -2.812 -3.244 -3.644 -4.039 -4.428 -4.762 -5.114 -5.481 -5.766 -6.075 -6.4 -6.733 -7.076 -7.311 -7.562 -7.954 -8.231 -8.52 -8.667 -8.966 -9.274 -9.612 -9.787 -10.158 -10.4 -10.619 -10.844 -11.376 -11.661 -11.941 -12.253 -12.615 -13.04 -13.601 -15.551 -4 ,10348 ,KEBNE ,16724330,Sun Nov 28 05:41:16 CET,Sun Nov 28 07:17:37 CET,0.0 1.196 1.741 2.167 2.505 2.793 3.034 3.265 3.669 3.834 3.989 4.107 4.416 4.561 4.827 5.069 5.291 5.397 5.603 5.798 6.077 6.255 6.425 6.671 6.897 7.113 7.316 7.502 7.755 8.004 8.229 8.481 8.723 8.954 9.218 9.513 9.775 10.031 10.271 10.525 10.796 11.09 11.427 11.73 12.037 12.354 12.621 12.773 12.801 12.511 11.461 9.851 8.34 6.923 5.698 4.592 3.556 2.625 1.836 1.052 0.365 -0.259 -0.831 -1.363 -1.876 -2.344 -2.835 -3.269 -3.649 -4.045 -4.455 -4.808 -5.163 -5.539 -5.831 -6.122 -6.442 -6.773 -7.104 -7.339 -7.58 -7.955 -8.225 -8.499 -8.644 -8.943 -9.255 -9.598 -9.784 -10.153 -10.364 -10.582 -10.802 -11.267 -11.524 -11.811 -12.134 -12.498 -12.966 -13.619 -15.641 -5 ,24500 ,KEBNE ,16724331,Sun Nov 28 05:42:18 CET,Sun Nov 28 07:17:37 CET,0.0 2.235 2.905 3.317 3.649 3.956 4.233 4.482 4.905 5.09 5.257 5.392 5.694 5.822 6.077 6.336 6.571 6.673 6.873 7.069 7.337 7.503 7.677 7.934 8.165 8.368 8.556 8.739 8.975 9.193 9.398 9.653 9.894 10.126 10.381 10.649 10.892 11.135 11.396 11.662 11.941 12.258 12.589 12.864 13.14 13.402 13.646 13.811 13.848 13.531 12.503 10.909 9.351 7.92 6.661 5.492 4.494 3.635 2.882 2.112 1.425 0.821 0.262 -0.287 -0.813 -1.285 -1.768 -2.195 -2.567 -2.963 -3.409 -3.786 -4.17 -4.558 -4.85 -5.163 -5.479 -5.804 -6.155 -6.395 -6.639 -7.015 -7.285 -7.579 -7.729 -8.045 -8.388 -8.75 -8.943 -9.321 -9.561 -9.785 -10.02 -10.527 -10.795 -11.095 -11.451 -11.873 -12.352 -12.992 -14.93 -6 ,32318 ,KEBNE ,16724332,Sun Nov 28 05:42:21 CET,Sun Nov 28 07:17:40 CET,0.0 1.799 2.41 2.847 3.215 3.51 3.757 3.987 4.403 4.587 4.765 4.915 5.219 5.352 5.617 5.859 6.079 6.184 6.378 6.566 6.837 7.01 7.176 7.401 7.615 7.816 8.007 8.198 8.444 8.67 8.88 9.139 9.367 9.565 9.801 10.068 10.312 10.581 10.869 11.148 11.401 11.657 11.96 12.253 12.533 12.771 12.969 13.071 13.026 12.692 11.723 10.125 8.633 7.373 6.179 5.009 3.994 3.119 2.357 1.589 0.922 0.312 -0.273 -0.82 -1.33 -1.805 -2.298 -2.735 -3.111 -3.512 -3.94 -4.282 -4.637 -5.023 -5.314 -5.621 -5.948 -6.274 -6.619 -6.866 -7.119 -7.508 -7.78 -8.06 -8.203 -8.519 -8.841 -9.161 -9.349 -9.734 -9.962 -10.179 -10.427 -10.977 -11.272 -11.577 -11.907 -12.34 -12.838 -13.458 -15.27 -7 ,30595 ,KEBNE ,16724333,Sun Nov 28 05:42:18 CET,Sun Nov 28 07:17:22 CET,0.0 1.594 2.255 2.809 3.265 3.608 3.904 4.192 4.717 4.955 5.15 5.293 5.605 5.754 6.029 6.27 6.498 6.604 6.804 7.008 7.293 7.458 7.616 7.846 8.066 8.277 8.504 8.748 9.028 9.26 9.472 9.716 9.939 10.153 10.402 10.681 10.941 11.204 11.467 11.745 12.03 12.309 12.612 12.907 13.25 13.554 13.761 13.909 13.936 13.672 12.659 10.94 9.389 8.018 6.836 5.76 4.809 3.947 3.199 2.451 1.757 1.11 0.522 -0.019 -0.533 -1.005 -1.497 -1.95 -2.335 -2.73 -3.159 -3.517 -3.88 -4.256 -4.553 -4.867 -5.193 -5.521 -5.856 -6.086 -6.333 -6.726 -6.984 -7.241 -7.382 -7.68 -7.996 -8.352 -8.538 -8.917 -9.14 -9.35 -9.578 -10.092 -10.377 -10.686 -11.017 -11.405 -11.89 -12.514 -14.274 -8 ,1215 ,KEBNE ,16724334,Sun Nov 28 05:42:23 CET,Sun Nov 28 07:14:46 CET,0.0 1.263 1.747 2.129 2.448 2.72 2.961 3.178 3.562 3.73 3.895 4.044 4.349 4.486 4.746 4.978 5.203 5.31 5.511 5.707 5.976 6.144 6.307 6.535 6.748 6.953 7.151 7.332 7.553 7.784 8.006 8.245 8.484 8.706 8.937 9.185 9.444 9.724 9.987 10.258 10.537 10.822 11.139 11.443 11.733 12.005 12.245 12.408 12.384 12.043 10.999 9.39 7.91 6.563 5.355 4.235 3.231 2.298 1.479 0.662 -0.015 -0.598 -1.161 -1.716 -2.249 -2.734 -3.24 -3.681 -4.054 -4.443 -4.848 -5.188 -5.545 -5.927 -6.234 -6.551 -6.876 -7.207 -7.554 -7.799 -8.041 -8.418 -8.684 -8.968 -9.113 -9.416 -9.743 -10.079 -10.253 -10.622 -10.856 -11.089 -11.334 -11.855 -12.135 -12.431 -12.76 -13.148 -13.608 -14.263 -16.294 -10 ,12172 ,KEBNE ,16724336,Sun Nov 28 05:43:20 CET,Sun Nov 28 07:18:22 CET,0.0 1.548 2.073 2.479 2.811 3.09 3.328 3.543 3.926 4.115 4.295 4.44 4.746 4.883 5.13 5.361 5.585 5.691 5.88 6.07 6.366 6.543 6.714 6.958 7.179 7.389 7.587 7.772 8.017 8.276 8.507 8.761 9.012 9.237 9.476 9.744 9.989 10.238 10.489 10.736 10.987 11.269 11.612 11.941 12.239 12.484 12.707 12.874 12.876 12.572 11.617 10.039 8.637 7.328 6.088 4.971 3.968 3.074 2.294 1.476 0.781 0.195 -0.349 -0.891 -1.405 -1.875 -2.372 -2.841 -3.238 -3.645 -4.119 -4.522 -4.901 -5.259 -5.553 -5.861 -6.175 -6.505 -6.842 -7.085 -7.34 -7.718 -7.994 -8.293 -8.445 -8.752 -9.074 -9.428 -9.609 -9.975 -10.176 -10.386 -10.616 -11.147 -11.461 -11.788 -12.13 -12.518 -12.997 -13.596 -15.215 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index b9dbfbb9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25740 ,KEBNE ,16724337,Sun Nov 28 05:44:22 CET,Sun Nov 28 07:19:10 CET,0.0 1.438 2.002 2.462 2.831 3.11 3.344 3.57 3.961 4.13 4.292 4.43 4.724 4.862 5.127 5.381 5.62 5.731 5.941 6.131 6.411 6.594 6.771 7.014 7.24 7.45 7.65 7.849 8.087 8.302 8.516 8.778 9.026 9.251 9.522 9.818 10.081 10.369 10.658 10.953 11.258 11.577 11.924 12.251 12.571 12.863 13.138 13.338 13.402 13.201 12.328 10.793 9.393 8.117 6.972 5.917 4.947 4.071 3.316 2.543 1.861 1.257 0.693 0.147 -0.368 -0.835 -1.319 -1.74 -2.115 -2.519 -2.931 -3.267 -3.618 -3.979 -4.258 -4.551 -4.857 -5.171 -5.495 -5.728 -5.961 -6.317 -6.576 -6.847 -6.987 -7.281 -7.605 -7.946 -8.124 -8.478 -8.691 -8.894 -9.109 -9.565 -9.816 -10.09 -10.411 -10.791 -11.216 -11.76 -13.427 -2 ,1930 ,KEBNE ,16724338,Sun Nov 28 05:45:24 CET,Sun Nov 28 07:21:30 CET,0.0 1.582 2.149 2.553 2.851 3.13 3.399 3.651 4.066 4.241 4.405 4.582 4.892 5.033 5.28 5.507 5.744 5.855 6.068 6.275 6.562 6.739 6.91 7.161 7.411 7.649 7.853 8.045 8.29 8.532 8.758 9.003 9.247 9.477 9.748 10.074 10.387 10.696 10.978 11.266 11.565 11.869 12.202 12.515 12.829 13.147 13.415 13.57 13.617 13.403 12.522 10.993 9.565 8.226 6.992 5.864 4.856 3.943 3.141 2.337 1.642 1.014 0.435 -0.105 -0.607 -1.056 -1.547 -1.985 -2.359 -2.752 -3.146 -3.468 -3.816 -4.193 -4.48 -4.755 -5.043 -5.362 -5.679 -5.896 -6.139 -6.518 -6.771 -7.042 -7.183 -7.456 -7.74 -8.053 -8.226 -8.581 -8.81 -9.019 -9.243 -9.719 -9.978 -10.293 -10.657 -11.072 -11.595 -12.33 -14.441 -3 ,13766 ,KEBNE ,16724339,Sun Nov 28 05:45:24 CET,Sun Nov 28 07:20:35 CET,0.0 1.68 2.353 2.833 3.227 3.602 3.948 4.223 4.642 4.843 5.031 5.174 5.47 5.611 5.875 6.122 6.339 6.444 6.655 6.857 7.168 7.399 7.611 7.857 8.079 8.288 8.487 8.672 8.904 9.132 9.352 9.614 9.879 10.127 10.368 10.631 10.888 11.159 11.455 11.767 12.069 12.372 12.72 13.05 13.385 13.719 14.034 14.252 14.331 14.154 13.281 11.721 10.251 8.891 7.652 6.571 5.631 4.754 3.977 3.189 2.524 1.937 1.365 0.808 0.289 -0.175 -0.658 -1.09 -1.471 -1.863 -2.264 -2.612 -2.973 -3.327 -3.6 -3.896 -4.212 -4.528 -4.845 -5.071 -5.311 -5.696 -5.963 -6.229 -6.365 -6.65 -6.954 -7.284 -7.462 -7.815 -8.014 -8.204 -8.411 -8.886 -9.16 -9.449 -9.755 -10.128 -10.61 -11.278 -12.765 -4 ,28821 ,KEBNE ,16724340,Sun Nov 28 05:45:24 CET,Sun Nov 28 07:19:59 CET,0.0 1.452 2.063 2.543 2.958 3.282 3.536 3.754 4.124 4.306 4.484 4.639 4.949 5.097 5.369 5.633 5.874 5.989 6.207 6.401 6.666 6.835 7.005 7.257 7.488 7.708 7.92 8.123 8.381 8.611 8.82 9.066 9.301 9.53 9.801 10.094 10.372 10.679 10.979 11.27 11.571 11.888 12.212 12.487 12.759 13.033 13.284 13.441 13.504 13.346 12.521 11.071 9.621 8.24 7.054 5.978 4.993 4.098 3.322 2.517 1.83 1.24 0.681 0.132 -0.378 -0.834 -1.31 -1.747 -2.13 -2.516 -2.916 -3.248 -3.579 -3.941 -4.232 -4.517 -4.814 -5.158 -5.531 -5.765 -5.998 -6.374 -6.645 -6.928 -7.072 -7.38 -7.732 -8.119 -8.332 -8.732 -8.981 -9.18 -9.397 -9.883 -10.161 -10.489 -10.821 -11.181 -11.613 -12.199 -13.624 -5 ,32197 ,KEBNE ,16724341,Sun Nov 28 05:45:24 CET,Sun Nov 28 07:21:20 CET,0.0 1.174 1.658 2.041 2.364 2.644 2.898 3.128 3.534 3.718 3.897 4.061 4.356 4.489 4.742 5.0 5.247 5.359 5.575 5.781 6.059 6.227 6.398 6.643 6.865 7.083 7.292 7.487 7.738 7.978 8.185 8.428 8.678 8.923 9.205 9.508 9.777 10.05 10.337 10.64 10.931 11.244 11.588 11.884 12.186 12.461 12.734 12.967 13.019 12.8 11.962 10.47 9.054 7.726 6.515 5.401 4.413 3.505 2.717 1.935 1.247 0.639 0.079 -0.455 -0.954 -1.408 -1.905 -2.347 -2.711 -3.095 -3.513 -3.853 -4.194 -4.568 -4.862 -5.158 -5.466 -5.771 -6.092 -6.32 -6.549 -6.937 -7.209 -7.478 -7.621 -7.913 -8.213 -8.552 -8.732 -9.087 -9.323 -9.525 -9.738 -10.202 -10.459 -10.742 -11.036 -11.391 -11.791 -12.315 -13.696 -6 ,24583 ,KEBNE ,16724342,Sun Nov 28 05:46:25 CET,Sun Nov 28 07:21:10 CET,0.0 1.279 1.922 2.423 2.828 3.19 3.508 3.796 4.309 4.538 4.755 5.021 5.365 5.537 5.872 6.195 6.503 6.654 6.946 7.204 7.558 7.758 7.922 8.163 8.389 8.601 8.802 8.999 9.255 9.492 9.705 9.944 10.171 10.39 10.632 10.899 11.16 11.457 11.765 12.072 12.372 12.676 13.008 13.313 13.605 13.873 14.099 14.247 14.332 14.153 13.222 11.625 10.08 8.679 7.481 6.405 5.442 4.562 3.789 3.005 2.34 1.735 1.143 0.593 0.095 -0.354 -0.829 -1.265 -1.658 -2.073 -2.485 -2.824 -3.183 -3.554 -3.848 -4.155 -4.461 -4.762 -5.087 -5.322 -5.565 -5.952 -6.217 -6.49 -6.633 -6.934 -7.245 -7.563 -7.74 -8.091 -8.295 -8.487 -8.691 -9.168 -9.432 -9.708 -10.013 -10.369 -10.818 -11.408 -12.775 -7 ,8658 ,KEBNE ,16724343,Sun Nov 28 05:47:26 CET,Sun Nov 28 07:21:59 CET,0.0 1.134 1.611 1.977 2.264 2.53 2.785 3.004 3.389 3.572 3.736 3.887 4.181 4.32 4.585 4.83 5.064 5.179 5.397 5.589 5.856 6.029 6.194 6.425 6.653 6.866 7.067 7.263 7.517 7.766 7.996 8.248 8.483 8.714 8.976 9.257 9.518 9.789 10.073 10.371 10.66 10.966 11.3 11.594 11.895 12.175 12.406 12.577 12.624 12.378 11.437 9.989 8.599 7.224 5.959 4.835 3.821 2.918 2.141 1.331 0.67 0.074 -0.5 -1.025 -1.507 -1.948 -2.422 -2.864 -3.243 -3.629 -4.042 -4.381 -4.734 -5.109 -5.394 -5.688 -5.985 -6.289 -6.626 -6.872 -7.116 -7.484 -7.753 -8.047 -8.196 -8.502 -8.819 -9.147 -9.317 -9.668 -9.887 -10.089 -10.312 -10.805 -11.062 -11.337 -11.654 -12.027 -12.485 -13.098 -14.78 -10 ,25003 ,KEBNE ,16724346,Sun Nov 28 05:47:30 CET,Sun Nov 28 07:15:19 CET,0.0 1.289 1.912 2.374 2.726 3.029 3.279 3.501 3.894 4.073 4.25 4.423 4.722 4.855 5.114 5.368 5.607 5.722 5.942 6.145 6.409 6.576 6.741 6.994 7.234 7.449 7.652 7.849 8.113 8.348 8.563 8.808 9.037 9.272 9.536 9.81 10.077 10.359 10.644 10.932 11.218 11.533 11.859 12.15 12.493 12.84 13.109 13.282 13.317 13.086 12.225 10.74 9.327 7.941 6.687 5.573 4.584 3.705 2.948 2.19 1.528 0.935 0.37 -0.19 -0.703 -1.171 -1.663 -2.09 -2.468 -2.853 -3.244 -3.574 -3.927 -4.295 -4.578 -4.869 -5.171 -5.483 -5.827 -6.064 -6.297 -6.678 -6.942 -7.227 -7.374 -7.675 -8.026 -8.424 -8.638 -9.008 -9.231 -9.432 -9.651 -10.15 -10.426 -10.722 -11.05 -11.439 -11.881 -12.452 -13.906 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index eb46ec1c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31101 ,KEBNE ,16724347,Sun Nov 28 05:48:28 CET,Sun Nov 28 07:23:33 CET,0.0 1.56 2.134 2.551 2.9 3.208 3.461 3.663 4.036 4.221 4.397 4.54 4.832 4.961 5.22 5.49 5.727 5.837 6.06 6.259 6.539 6.717 6.88 7.111 7.324 7.523 7.721 7.911 8.148 8.365 8.557 8.779 9.0 9.207 9.44 9.72 9.972 10.204 10.443 10.684 10.907 11.13 11.358 11.551 11.739 11.876 11.93 11.82 11.481 10.787 9.26 7.186 5.303 3.64 2.23 0.964 -0.153 -1.167 -2.026 -2.866 -3.61 -4.271 -4.88 -5.454 -5.996 -6.479 -6.962 -7.404 -7.779 -8.16 -8.567 -8.918 -9.28 -9.64 -9.915 -10.204 -10.511 -10.822 -11.154 -11.392 -11.632 -12.0 -12.286 -12.615 -12.783 -13.134 -13.513 -13.913 -14.095 -14.44 -14.673 -14.912 -15.166 -15.72 -16.003 -16.277 -16.576 -16.921 -17.338 -17.855 -19.079 -2 ,30067 ,KEBNE ,16724348,Sun Nov 28 05:48:28 CET,Sun Nov 28 07:23:34 CET,0.0 1.369 1.931 2.358 2.7 2.977 3.216 3.435 3.832 4.016 4.188 4.353 4.647 4.78 5.035 5.276 5.507 5.615 5.818 6.014 6.278 6.437 6.59 6.812 7.041 7.258 7.452 7.632 7.862 8.075 8.259 8.483 8.704 8.927 9.179 9.419 9.64 9.876 10.111 10.349 10.585 10.821 11.058 11.242 11.438 11.595 11.653 11.592 11.291 10.523 8.953 6.86 4.983 3.369 1.977 0.71 -0.396 -1.387 -2.225 -3.063 -3.778 -4.415 -5.023 -5.587 -6.116 -6.589 -7.083 -7.53 -7.916 -8.315 -8.735 -9.087 -9.442 -9.807 -10.095 -10.386 -10.693 -11.025 -11.35 -11.574 -11.81 -12.199 -12.463 -12.721 -12.859 -13.146 -13.455 -13.78 -13.951 -14.292 -14.48 -14.676 -14.881 -15.319 -15.564 -15.832 -16.135 -16.477 -16.861 -17.388 -19.004 -3 ,28800 ,KEBNE ,16724349,Sun Nov 28 05:48:28 CET,Sun Nov 28 07:23:49 CET,0.0 1.573 2.163 2.593 2.932 3.228 3.47 3.685 4.079 4.265 4.442 4.602 4.898 5.04 5.305 5.543 5.769 5.878 6.087 6.289 6.571 6.751 6.918 7.149 7.374 7.585 7.777 7.955 8.172 8.38 8.584 8.84 9.078 9.288 9.512 9.748 9.973 10.202 10.453 10.723 10.978 11.255 11.52 11.71 11.897 12.035 12.047 11.915 11.604 10.861 9.169 6.88 4.93 3.276 1.849 0.591 -0.505 -1.509 -2.353 -3.178 -3.918 -4.574 -5.192 -5.757 -6.267 -6.746 -7.253 -7.713 -8.114 -8.532 -8.942 -9.273 -9.613 -9.963 -10.248 -10.547 -10.855 -11.172 -11.5 -11.73 -11.967 -12.333 -12.587 -12.856 -12.996 -13.286 -13.585 -13.897 -14.066 -14.418 -14.624 -14.828 -15.047 -15.486 -15.728 -16.002 -16.289 -16.636 -17.082 -17.654 -18.916 -4 ,30587 ,KEBNE ,16724350,Sun Nov 28 05:49:29 CET,Sun Nov 28 07:25:56 CET,0.0 1.596 2.139 2.541 2.891 3.194 3.44 3.657 4.033 4.198 4.362 4.526 4.836 4.982 5.242 5.49 5.709 5.811 6.01 6.194 6.447 6.605 6.759 6.973 7.171 7.368 7.56 7.737 7.961 8.179 8.371 8.581 8.782 8.981 9.215 9.475 9.712 9.935 10.153 10.37 10.591 10.852 11.117 11.307 11.471 11.626 11.718 11.622 11.28 10.539 9.02 6.873 4.974 3.335 1.929 0.668 -0.447 -1.42 -2.258 -3.104 -3.817 -4.446 -5.041 -5.609 -6.137 -6.625 -7.135 -7.575 -7.961 -8.368 -8.786 -9.133 -9.492 -9.868 -10.154 -10.433 -10.72 -11.016 -11.328 -11.552 -11.79 -12.169 -12.426 -12.695 -12.835 -13.121 -13.423 -13.737 -13.895 -14.229 -14.411 -14.611 -14.836 -15.289 -15.519 -15.762 -16.039 -16.385 -16.809 -17.386 -18.751 -6 ,19324 ,KEBNE ,16724352,Sun Nov 28 05:51:33 CET,Sun Nov 28 07:26:28 CET,0.0 1.283 1.831 2.243 2.578 2.852 3.093 3.327 3.751 3.932 4.092 4.22 4.509 4.646 4.908 5.156 5.379 5.483 5.687 5.88 6.153 6.332 6.51 6.744 6.938 7.123 7.311 7.494 7.718 7.924 8.117 8.36 8.586 8.8 9.041 9.276 9.49 9.725 9.942 10.152 10.381 10.593 10.819 11.042 11.225 11.337 11.387 11.281 10.931 10.198 8.609 6.438 4.509 2.834 1.427 0.168 -0.942 -1.935 -2.786 -3.605 -4.308 -4.963 -5.589 -6.161 -6.664 -7.123 -7.609 -8.055 -8.44 -8.837 -9.26 -9.604 -9.943 -10.296 -10.576 -10.862 -11.168 -11.497 -11.837 -12.068 -12.3 -12.661 -12.923 -13.185 -13.318 -13.615 -13.925 -14.238 -14.4 -14.741 -14.943 -15.151 -15.367 -15.825 -16.078 -16.346 -16.642 -16.978 -17.37 -17.851 -19.012 -7 ,7554 ,KEBNE ,16724353,Sun Nov 28 05:51:32 CET,Sun Nov 28 07:28:06 CET,0.0 1.455 2.004 2.439 2.788 3.084 3.351 3.576 3.951 4.122 4.3 4.468 4.753 4.879 5.168 5.469 5.727 5.837 6.029 6.214 6.481 6.652 6.824 7.096 7.378 7.647 7.879 8.07 8.317 8.548 8.75 8.987 9.212 9.418 9.642 9.87 10.088 10.314 10.53 10.768 11.021 11.261 11.476 11.652 11.81 11.922 12.014 11.978 11.639 10.89 9.27 7.06 5.123 3.448 2.049 0.789 -0.35 -1.381 -2.252 -3.102 -3.831 -4.472 -5.081 -5.648 -6.152 -6.61 -7.102 -7.555 -7.934 -8.304 -8.71 -9.065 -9.423 -9.788 -10.079 -10.375 -10.673 -10.994 -11.333 -11.563 -11.801 -12.169 -12.419 -12.679 -12.821 -13.121 -13.43 -13.743 -13.906 -14.252 -14.461 -14.67 -14.891 -15.363 -15.616 -15.891 -16.205 -16.555 -17.014 -17.628 -19.159 -8 ,26910 ,KEBNE ,16724354,Sun Nov 28 05:51:32 CET,Sun Nov 28 07:27:48 CET,0.0 1.261 1.732 2.086 2.418 2.711 2.97 3.245 3.776 4.005 4.217 4.433 4.749 4.888 5.144 5.396 5.629 5.735 5.931 6.13 6.418 6.592 6.751 6.985 7.225 7.466 7.701 7.902 8.127 8.351 8.571 8.816 9.042 9.255 9.504 9.763 9.983 10.242 10.519 10.775 11.02 11.263 11.502 11.71 11.89 12.029 12.101 12.064 11.797 11.066 9.497 7.377 5.489 3.866 2.464 1.185 0.091 -0.87 -1.704 -2.547 -3.251 -3.882 -4.486 -5.056 -5.591 -6.078 -6.579 -7.01 -7.391 -7.79 -8.184 -8.515 -8.872 -9.247 -9.528 -9.814 -10.11 -10.422 -10.758 -10.993 -11.23 -11.602 -11.854 -12.108 -12.238 -12.513 -12.812 -13.139 -13.306 -13.638 -13.815 -14.009 -14.213 -14.672 -14.937 -15.214 -15.521 -15.892 -16.338 -16.871 -17.983 -9 ,23182 ,KEBNE ,16724355,Sun Nov 28 05:52:33 CET,Sun Nov 28 07:27:48 CET,0.0 1.504 2.202 2.695 3.106 3.48 3.804 4.089 4.59 4.809 5.021 5.276 5.613 5.783 6.109 6.409 6.689 6.825 7.091 7.364 7.746 7.934 8.092 8.333 8.564 8.775 8.957 9.141 9.38 9.592 9.797 10.026 10.246 10.451 10.672 10.92 11.128 11.342 11.572 11.806 12.036 12.275 12.519 12.714 12.882 12.981 13.007 12.921 12.571 11.838 10.379 8.292 6.392 4.708 3.286 2.063 0.996 0.002 -0.869 -1.706 -2.418 -3.078 -3.694 -4.243 -4.759 -5.238 -5.72 -6.146 -6.514 -6.897 -7.313 -7.664 -8.03 -8.412 -8.691 -8.977 -9.278 -9.61 -9.983 -10.255 -10.543 -10.972 -11.259 -11.566 -11.725 -12.049 -12.395 -12.762 -12.961 -13.345 -13.583 -13.785 -14.004 -14.491 -14.749 -15.009 -15.317 -15.695 -16.137 -16.739 -18.302 -10 ,6322 ,KEBNE ,16724356,Sun Nov 28 05:52:33 CET,Sun Nov 28 07:27:49 CET,0.0 1.368 1.901 2.323 2.672 2.957 3.206 3.425 3.821 4.0 4.171 4.328 4.623 4.773 5.049 5.287 5.515 5.62 5.82 6.013 6.277 6.442 6.594 6.805 7.02 7.241 7.436 7.607 7.869 8.126 8.341 8.581 8.805 9.02 9.249 9.49 9.71 9.95 10.184 10.403 10.621 10.877 11.165 11.374 11.557 11.71 11.759 11.643 11.314 10.622 9.133 7.049 5.143 3.459 2.002 0.731 -0.349 -1.31 -2.153 -2.98 -3.672 -4.296 -4.907 -5.477 -5.98 -6.438 -6.936 -7.382 -7.767 -8.16 -8.558 -8.9 -9.259 -9.615 -9.887 -10.179 -10.486 -10.797 -11.122 -11.353 -11.599 -11.979 -12.237 -12.511 -12.652 -12.939 -13.238 -13.542 -13.7 -14.038 -14.22 -14.417 -14.624 -15.062 -15.315 -15.585 -15.888 -16.237 -16.641 -17.129 -18.214 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt deleted file mode 100644 index 273991ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15790 ,KEBNE ,16724357,Sun Nov 28 05:52:34 CET,Sun Nov 28 07:27:41 CET,0.0 1.591 2.135 2.576 2.969 3.265 3.507 3.737 4.157 4.339 4.502 4.663 4.975 5.116 5.365 5.594 5.828 5.943 6.158 6.356 6.625 6.792 6.954 7.189 7.412 7.629 7.84 8.048 8.308 8.545 8.774 9.035 9.27 9.504 9.763 10.032 10.295 10.567 10.843 11.149 11.442 11.752 12.1 12.398 12.699 12.988 13.268 13.516 13.666 13.565 12.858 11.576 10.411 9.33 8.331 7.411 6.603 5.895 5.285 4.63 4.043 3.53 3.032 2.554 2.12 1.732 1.311 0.918 0.578 0.229 -0.122 -0.411 -0.726 -1.046 -1.284 -1.541 -1.819 -2.104 -2.399 -2.61 -2.825 -3.15 -3.383 -3.627 -3.754 -4.023 -4.302 -4.605 -4.767 -5.094 -5.296 -5.501 -5.709 -6.148 -6.387 -6.676 -7.0 -7.343 -7.783 -8.375 -9.713 -2 ,32047 ,KEBNE ,16724358,Sun Nov 28 05:52:33 CET,Sun Nov 28 07:27:44 CET,0.0 1.556 2.152 2.647 3.052 3.401 3.716 4.001 4.5 4.717 4.936 5.209 5.556 5.736 6.074 6.394 6.688 6.823 7.09 7.341 7.683 7.895 8.107 8.423 8.689 8.909 9.115 9.308 9.554 9.776 9.985 10.256 10.492 10.696 10.943 11.223 11.482 11.756 12.028 12.312 12.594 12.886 13.201 13.534 13.909 14.209 14.471 14.725 14.852 14.664 13.987 12.836 11.653 10.551 9.565 8.663 7.867 7.114 6.449 5.796 5.241 4.732 4.223 3.745 3.303 2.898 2.485 2.12 1.795 1.459 1.092 0.777 0.474 0.157 -0.098 -0.362 -0.633 -0.912 -1.203 -1.406 -1.618 -1.955 -2.186 -2.427 -2.553 -2.807 -3.083 -3.393 -3.554 -3.887 -4.093 -4.279 -4.473 -4.918 -5.167 -5.417 -5.684 -5.999 -6.39 -6.89 -8.059 -3 ,6047 ,KEBNE ,16724359,Sun Nov 28 05:52:33 CET,Sun Nov 28 07:27:46 CET,0.0 1.607 2.171 2.578 2.904 3.188 3.452 3.696 4.097 4.275 4.441 4.579 4.888 5.039 5.308 5.554 5.777 5.887 6.095 6.29 6.566 6.734 6.898 7.14 7.367 7.585 7.791 7.995 8.247 8.474 8.694 8.943 9.171 9.394 9.651 9.927 10.183 10.463 10.763 11.074 11.37 11.676 12.007 12.326 12.658 12.945 13.249 13.535 13.694 13.6 12.96 11.798 10.651 9.575 8.607 7.694 6.849 6.085 5.431 4.773 4.193 3.678 3.184 2.706 2.268 1.863 1.425 1.024 0.67 0.321 -0.037 -0.365 -0.692 -0.999 -1.24 -1.507 -1.783 -2.062 -2.35 -2.559 -2.783 -3.135 -3.383 -3.638 -3.781 -4.068 -4.339 -4.63 -4.792 -5.126 -5.304 -5.488 -5.675 -6.071 -6.309 -6.587 -6.887 -7.227 -7.65 -8.237 -9.853 -4 ,23045 ,KEBNE ,16724360,Sun Nov 28 05:52:34 CET,Sun Nov 28 07:27:34 CET,0.0 1.287 1.792 2.156 2.473 2.749 3.002 3.241 3.654 3.836 4.0 4.13 4.424 4.562 4.823 5.072 5.295 5.399 5.601 5.797 6.079 6.25 6.41 6.638 6.844 7.045 7.25 7.448 7.682 7.906 8.134 8.397 8.636 8.864 9.115 9.392 9.669 9.964 10.262 10.548 10.816 11.118 11.456 11.761 12.062 12.353 12.657 12.908 13.02 12.904 12.227 11.017 9.859 8.76 7.76 6.868 6.076 5.356 4.716 4.066 3.487 2.974 2.502 2.058 1.63 1.225 0.809 0.433 0.11 -0.226 -0.598 -0.913 -1.237 -1.572 -1.819 -2.076 -2.371 -2.675 -2.971 -3.186 -3.407 -3.745 -3.991 -4.248 -4.378 -4.648 -4.938 -5.231 -5.38 -5.7 -5.875 -6.061 -6.261 -6.726 -6.99 -7.268 -7.561 -7.9 -8.334 -8.932 -10.13 -5 ,1177 ,KEBNE ,16724361,Sun Nov 28 05:52:33 CET,Sun Nov 28 07:27:36 CET,0.0 1.466 2.045 2.46 2.819 3.108 3.356 3.574 3.96 4.14 4.308 4.469 4.776 4.916 5.185 5.448 5.687 5.802 6.016 6.205 6.475 6.65 6.813 7.048 7.28 7.507 7.726 7.93 8.17 8.387 8.606 8.883 9.138 9.377 9.657 9.976 10.284 10.579 10.851 11.123 11.405 11.718 12.054 12.367 12.705 13.038 13.346 13.555 13.671 13.626 12.982 11.76 10.545 9.431 8.433 7.507 6.678 5.91 5.257 4.593 4.006 3.489 3.004 2.538 2.087 1.692 1.279 0.895 0.573 0.246 -0.099 -0.401 -0.725 -1.05 -1.303 -1.571 -1.835 -2.106 -2.409 -2.63 -2.848 -3.173 -3.405 -3.653 -3.779 -4.04 -4.326 -4.644 -4.808 -5.138 -5.322 -5.51 -5.727 -6.192 -6.447 -6.725 -7.021 -7.396 -7.914 -8.618 -10.466 -6 ,30826 ,KEBNE ,16724362,Sun Nov 28 05:53:35 CET,Sun Nov 28 07:28:33 CET,0.0 1.211 1.759 2.179 2.526 2.797 3.039 3.271 3.721 3.913 4.086 4.254 4.543 4.673 4.925 5.168 5.387 5.49 5.683 5.858 6.119 6.286 6.457 6.704 6.927 7.137 7.338 7.548 7.818 8.057 8.264 8.519 8.763 8.975 9.221 9.504 9.766 10.038 10.327 10.63 10.921 11.22 11.529 11.811 12.136 12.453 12.723 12.915 13.02 12.926 12.288 11.051 9.853 8.787 7.825 6.937 6.14 5.382 4.716 4.037 3.444 2.927 2.444 1.997 1.586 1.196 0.771 0.381 0.044 -0.31 -0.671 -0.965 -1.271 -1.6 -1.861 -2.137 -2.424 -2.717 -3.023 -3.223 -3.432 -3.763 -3.999 -4.249 -4.378 -4.652 -4.938 -5.233 -5.392 -5.74 -5.956 -6.147 -6.349 -6.78 -7.027 -7.296 -7.635 -8.088 -8.601 -9.264 -10.694 -7 ,10752 ,KEBNE ,16724363,Sun Nov 28 05:53:35 CET,Sun Nov 28 07:28:39 CET,0.0 1.344 1.878 2.291 2.625 2.9 3.127 3.333 3.718 3.905 4.082 4.258 4.56 4.694 4.959 5.22 5.461 5.565 5.766 5.963 6.243 6.424 6.596 6.849 7.087 7.306 7.513 7.709 7.948 8.174 8.395 8.664 8.916 9.143 9.395 9.682 9.963 10.274 10.601 10.905 11.207 11.543 11.898 12.214 12.53 12.868 13.203 13.454 13.63 13.556 12.926 11.828 10.689 9.625 8.659 7.767 6.971 6.211 5.538 4.866 4.288 3.77 3.292 2.838 2.41 2.032 1.619 1.234 0.907 0.57 0.215 -0.081 -0.396 -0.734 -1.003 -1.277 -1.54 -1.809 -2.103 -2.304 -2.515 -2.869 -3.119 -3.381 -3.516 -3.79 -4.086 -4.391 -4.543 -4.873 -5.06 -5.238 -5.431 -5.924 -6.195 -6.449 -6.748 -7.096 -7.471 -7.914 -8.989 -8 ,1547 ,KEBNE ,16724364,Sun Nov 28 05:53:35 CET,Sun Nov 28 07:28:31 CET,0.0 1.188 1.714 2.125 2.434 2.69 2.917 3.116 3.472 3.64 3.811 3.989 4.294 4.43 4.69 4.948 5.186 5.294 5.506 5.709 5.998 6.18 6.346 6.593 6.827 7.042 7.238 7.417 7.664 7.908 8.124 8.367 8.6 8.832 9.091 9.372 9.638 9.925 10.217 10.514 10.847 11.195 11.539 11.87 12.22 12.55 12.867 13.101 13.204 13.118 12.571 11.502 10.377 9.307 8.364 7.463 6.622 5.862 5.208 4.546 3.964 3.423 2.914 2.461 2.036 1.635 1.22 0.852 0.533 0.205 -0.138 -0.426 -0.74 -1.071 -1.33 -1.6 -1.875 -2.161 -2.461 -2.668 -2.888 -3.237 -3.472 -3.71 -3.836 -4.106 -4.381 -4.668 -4.821 -5.144 -5.353 -5.549 -5.747 -6.207 -6.458 -6.715 -7.006 -7.356 -7.778 -8.311 -9.724 -9 ,19463 ,KEBNE ,16724365,Sun Nov 28 05:53:35 CET,Sun Nov 28 07:28:36 CET,0.0 1.259 1.725 2.079 2.382 2.655 2.901 3.143 3.603 3.803 3.985 4.167 4.471 4.605 4.859 5.115 5.351 5.461 5.675 5.868 6.132 6.301 6.469 6.709 6.937 7.157 7.357 7.544 7.788 8.018 8.242 8.506 8.748 8.99 9.286 9.591 9.854 10.142 10.444 10.746 11.044 11.39 11.753 12.068 12.411 12.736 13.039 13.292 13.431 13.316 12.687 11.543 10.368 9.248 8.284 7.421 6.653 5.936 5.295 4.651 4.079 3.57 3.073 2.596 2.166 1.756 1.305 0.905 0.57 0.224 -0.142 -0.439 -0.748 -1.079 -1.336 -1.606 -1.892 -2.177 -2.461 -2.681 -2.918 -3.254 -3.487 -3.741 -3.868 -4.136 -4.419 -4.716 -4.875 -5.205 -5.41 -5.6 -5.797 -6.23 -6.463 -6.727 -7.026 -7.363 -7.788 -8.352 -9.861 -10 ,12111 ,KEBNE ,16724366,Sun Nov 28 05:53:36 CET,Sun Nov 28 07:28:42 CET,0.0 1.296 1.84 2.275 2.627 2.93 3.232 3.525 4.036 4.252 4.47 4.698 5.005 5.149 5.405 5.643 5.879 5.988 6.183 6.367 6.647 6.826 6.995 7.246 7.487 7.711 7.914 8.109 8.361 8.595 8.811 9.059 9.299 9.529 9.786 10.059 10.309 10.585 10.87 11.156 11.455 11.777 12.135 12.461 12.806 13.168 13.489 13.743 13.909 13.829 13.222 12.055 10.858 9.759 8.79 7.888 7.077 6.335 5.679 5.013 4.435 3.927 3.438 2.968 2.525 2.123 1.706 1.325 0.992 0.647 0.288 -0.011 -0.32 -0.656 -0.919 -1.181 -1.465 -1.76 -2.065 -2.279 -2.501 -2.848 -3.091 -3.349 -3.481 -3.743 -4.025 -4.341 -4.499 -4.815 -5.004 -5.204 -5.409 -5.85 -6.094 -6.368 -6.694 -7.075 -7.532 -8.063 -9.175 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt deleted file mode 100644 index 7078bd0b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13237 ,KEBNE ,16724367,Sun Nov 28 05:53:35 CET,Sun Nov 28 07:28:17 CET,0.0 0.875 1.381 1.754 2.057 2.328 2.57 2.776 3.145 3.318 3.483 3.624 3.91 4.03 4.253 4.471 4.667 4.763 4.963 5.153 5.423 5.592 5.755 5.988 6.215 6.43 6.625 6.817 7.063 7.301 7.526 7.79 8.054 8.307 8.58 8.879 9.171 9.488 9.825 10.189 10.577 10.998 11.452 11.874 12.339 12.849 13.407 13.974 14.524 14.969 15.241 15.038 14.558 14.006 13.426 12.869 12.358 11.848 11.393 10.91 10.48 10.089 9.686 9.298 8.941 8.613 8.269 7.956 7.676 7.373 7.057 6.811 6.555 6.257 6.015 5.772 5.504 5.239 4.968 4.768 4.569 4.225 3.969 3.697 3.559 3.296 3.016 2.713 2.553 2.24 2.008 1.79 1.572 1.068 0.775 0.458 0.103 -0.304 -0.829 -1.494 -3.808 -2 ,6678 ,KEBNE ,16724368,Sun Nov 28 05:53:35 CET,Sun Nov 28 07:29:14 CET,0.0 1.068 1.509 1.825 2.071 2.31 2.536 2.747 3.112 3.268 3.42 3.571 3.861 3.982 4.217 4.464 4.695 4.798 5.015 5.217 5.46 5.611 5.764 5.986 6.201 6.412 6.616 6.807 7.045 7.273 7.489 7.741 7.987 8.223 8.488 8.795 9.086 9.384 9.697 10.032 10.367 10.731 11.177 11.597 12.057 12.557 13.08 13.615 14.148 14.622 14.958 14.772 14.311 13.779 13.199 12.629 12.134 11.658 11.192 10.702 10.259 9.839 9.43 9.044 8.669 8.303 7.906 7.515 7.17 6.861 6.556 6.284 6.003 5.718 5.492 5.245 4.989 4.723 4.427 4.224 4.027 3.714 3.487 3.249 3.115 2.832 2.546 2.207 2.013 1.651 1.341 1.093 0.822 0.229 -0.085 -0.412 -0.775 -1.224 -1.8 -2.617 -5.106 -3 ,14703 ,KEBNE ,16724369,Sun Nov 28 05:53:35 CET,Sun Nov 28 07:28:12 CET,0.0 0.737 1.161 1.495 1.778 2.02 2.211 2.381 2.71 2.855 2.995 3.128 3.417 3.546 3.776 3.986 4.197 4.3 4.496 4.688 4.961 5.12 5.279 5.526 5.74 5.936 6.131 6.321 6.573 6.812 7.027 7.295 7.551 7.774 8.029 8.328 8.613 8.909 9.243 9.582 9.92 10.298 10.716 11.127 11.593 12.076 12.626 13.191 13.694 14.187 14.458 14.186 13.675 13.089 12.509 11.93 11.394 10.872 10.409 9.934 9.497 9.114 8.753 8.375 8.002 7.641 7.246 6.892 6.588 6.266 5.923 5.623 5.308 4.966 4.699 4.421 4.127 3.84 3.527 3.293 3.057 2.669 2.379 2.083 1.926 1.604 1.263 0.91 0.73 0.376 0.115 -0.082 -0.308 -0.786 -1.037 -1.349 -1.702 -2.09 -2.561 -3.205 -5.236 -4 ,22937 ,KEBNE ,16724370,Sun Nov 28 05:53:35 CET,Sun Nov 28 07:28:01 CET,0.0 1.069 1.53 1.868 2.163 2.429 2.653 2.841 3.167 3.32 3.471 3.586 3.864 3.98 4.205 4.421 4.626 4.723 4.906 5.081 5.347 5.523 5.689 5.919 6.138 6.338 6.526 6.712 6.95 7.187 7.405 7.659 7.91 8.16 8.437 8.717 8.991 9.305 9.639 9.99 10.353 10.747 11.169 11.567 12.0 12.455 12.971 13.492 13.987 14.437 14.603 14.264 13.77 13.216 12.647 12.087 11.57 11.069 10.62 10.16 9.744 9.355 8.949 8.565 8.212 7.871 7.506 7.17 6.872 6.576 6.282 6.026 5.745 5.45 5.219 4.976 4.711 4.431 4.132 3.918 3.705 3.356 3.111 2.86 2.726 2.446 2.161 1.866 1.694 1.363 1.138 0.935 0.719 0.201 -0.086 -0.38 -0.693 -1.064 -1.495 -2.137 -4.141 -5 ,10585 ,KEBNE ,16724371,Sun Nov 28 05:53:35 CET,Sun Nov 28 07:28:00 CET,0.0 0.895 1.335 1.683 1.983 2.225 2.437 2.642 2.99 3.148 3.295 3.414 3.699 3.833 4.091 4.314 4.53 4.636 4.828 5.014 5.287 5.454 5.607 5.832 6.056 6.273 6.478 6.668 6.909 7.135 7.354 7.622 7.883 8.122 8.389 8.682 8.953 9.25 9.572 9.913 10.247 10.625 11.088 11.526 11.986 12.489 13.037 13.567 14.111 14.609 14.84 14.609 14.17 13.639 13.07 12.508 11.963 11.429 10.979 10.498 10.051 9.653 9.27 8.897 8.543 8.191 7.811 7.474 7.19 6.913 6.621 6.374 6.095 5.793 5.564 5.323 5.07 4.805 4.511 4.298 4.082 3.75 3.523 3.287 3.155 2.881 2.609 2.319 2.158 1.825 1.607 1.42 1.208 0.753 0.499 0.194 -0.158 -0.559 -1.063 -1.771 -3.913 -6 ,1954 ,KEBNE ,16724372,Sun Nov 28 05:53:35 CET,Sun Nov 28 07:29:14 CET,0.0 0.906 1.343 1.704 1.992 2.233 2.449 2.631 2.972 3.136 3.292 3.428 3.724 3.859 4.095 4.31 4.522 4.626 4.816 4.989 5.24 5.401 5.561 5.793 6.015 6.228 6.435 6.632 6.893 7.132 7.345 7.599 7.858 8.117 8.416 8.756 9.05 9.332 9.644 9.979 10.324 10.724 11.164 11.596 12.066 12.523 13.024 13.561 14.145 14.698 14.99 14.75 14.271 13.741 13.217 12.669 12.16 11.674 11.191 10.695 10.292 9.913 9.535 9.176 8.836 8.522 8.194 7.883 7.604 7.321 7.025 6.775 6.505 6.206 5.976 5.757 5.523 5.254 4.965 4.769 4.564 4.235 4.012 3.767 3.634 3.367 3.074 2.758 2.596 2.27 2.028 1.815 1.591 1.103 0.844 0.572 0.247 -0.104 -0.526 -1.113 -2.974 -7 ,14647 ,KEBNE ,16724373,Sun Nov 28 05:54:37 CET,Sun Nov 28 07:30:16 CET,0.0 1.018 1.41 1.754 2.031 2.265 2.481 2.677 3.047 3.201 3.35 3.505 3.794 3.915 4.131 4.338 4.55 4.656 4.85 5.033 5.294 5.453 5.605 5.833 6.043 6.239 6.434 6.618 6.85 7.09 7.323 7.602 7.869 8.107 8.377 8.675 8.955 9.261 9.595 9.947 10.292 10.66 11.082 11.498 11.968 12.462 12.989 13.54 14.057 14.484 14.717 14.457 13.938 13.366 12.772 12.13 11.547 11.023 10.568 10.104 9.686 9.31 8.923 8.541 8.195 7.864 7.518 7.223 6.961 6.672 6.353 6.077 5.799 5.523 5.294 5.045 4.787 4.507 4.21 3.994 3.771 3.435 3.186 2.926 2.799 2.538 2.235 1.912 1.76 1.449 1.258 1.069 0.861 0.402 0.131 -0.19 -0.541 -0.938 -1.409 -2.076 -4.416 -8 ,27062 ,KEBNE ,16724374,Sun Nov 28 05:54:37 CET,Sun Nov 28 07:29:24 CET,0.0 0.774 1.195 1.561 1.863 2.115 2.335 2.537 2.886 3.05 3.214 3.37 3.657 3.784 4.022 4.244 4.451 4.548 4.746 4.932 5.18 5.342 5.51 5.748 5.962 6.172 6.37 6.562 6.804 7.031 7.242 7.481 7.721 7.959 8.237 8.544 8.824 9.133 9.458 9.786 10.131 10.525 10.999 11.443 11.893 12.381 12.906 13.433 13.998 14.5 14.767 14.523 13.993 13.424 12.85 12.298 11.775 11.268 10.807 10.314 9.885 9.479 9.06 8.655 8.299 7.986 7.642 7.302 6.995 6.666 6.325 6.059 5.792 5.524 5.31 5.073 4.823 4.557 4.267 4.066 3.869 3.547 3.311 3.076 2.953 2.681 2.373 2.038 1.866 1.538 1.279 1.068 0.859 0.367 0.065 -0.252 -0.616 -1.105 -1.666 -2.444 -5.385 -9 ,213 ,KEBNE ,16724375,Sun Nov 28 05:54:38 CET,Sun Nov 28 07:30:16 CET,0.0 1.184 1.654 1.989 2.27 2.526 2.739 2.931 3.3 3.457 3.603 3.73 4.015 4.14 4.367 4.582 4.785 4.885 5.081 5.261 5.513 5.667 5.811 6.018 6.223 6.424 6.618 6.804 7.037 7.259 7.474 7.732 7.985 8.226 8.494 8.791 9.088 9.399 9.705 10.037 10.41 10.816 11.252 11.674 12.139 12.629 13.144 13.655 14.18 14.662 14.935 14.683 14.192 13.66 13.1 12.546 12.0 11.456 10.98 10.471 10.024 9.637 9.253 8.856 8.477 8.135 7.773 7.451 7.146 6.799 6.459 6.179 5.88 5.583 5.352 5.098 4.827 4.533 4.229 4.03 3.825 3.5 3.273 3.041 2.914 2.639 2.348 2.046 1.871 1.515 1.252 1.026 0.78 0.232 -0.083 -0.432 -0.813 -1.231 -1.79 -2.599 -5.173 -10 ,13690 ,KEBNE ,16724376,Sun Nov 28 05:54:38 CET,Sun Nov 28 07:28:58 CET,0.0 0.803 1.229 1.536 1.822 2.097 2.326 2.516 2.868 3.024 3.171 3.304 3.586 3.707 3.944 4.185 4.408 4.509 4.703 4.888 5.163 5.329 5.492 5.748 5.982 6.193 6.388 6.583 6.836 7.06 7.275 7.542 7.795 8.035 8.314 8.622 8.9 9.196 9.506 9.829 10.172 10.554 10.981 11.403 11.89 12.393 12.923 13.464 14.004 14.45 14.657 14.43 13.962 13.421 12.856 12.278 11.716 11.191 10.747 10.292 9.89 9.496 9.108 8.731 8.374 8.051 7.671 7.345 7.068 6.75 6.418 6.145 5.874 5.591 5.363 5.126 4.877 4.623 4.357 4.167 3.963 3.616 3.358 3.108 2.982 2.725 2.455 2.153 1.997 1.68 1.47 1.276 1.059 0.599 0.322 -0.008 -0.367 -0.768 -1.269 -1.975 -4.053 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt deleted file mode 100644 index 7cfeb2ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17421 ,KEBNE ,16724377,Sun Nov 28 05:54:37 CET,Sun Nov 28 07:30:44 CET,0.0 1.231 1.767 2.143 2.477 2.789 3.05 3.273 3.703 3.905 4.088 4.246 4.589 4.751 5.073 5.353 5.61 5.736 5.976 6.216 6.582 6.806 7.016 7.316 7.605 7.916 8.231 8.54 8.914 9.238 9.544 9.922 10.279 10.61 10.998 11.438 11.856 12.309 12.814 13.365 13.933 14.578 15.334 16.066 16.904 17.832 18.861 19.971 21.205 22.635 24.285 25.306 25.645 25.708 25.594 25.372 25.136 24.878 24.607 24.314 24.054 23.808 23.548 23.298 23.047 22.81 22.551 22.3 22.088 21.879 21.655 21.458 21.251 21.03 20.856 20.662 20.454 20.227 19.97 19.788 19.606 19.343 19.162 18.97 18.869 18.649 18.404 18.142 18.004 17.693 17.54 17.379 17.207 16.828 16.63 16.421 16.185 15.876 15.478 14.937 13.414 -3 ,21653 ,KEBNE ,16724379,Sun Nov 28 05:55:39 CET,Sun Nov 28 07:31:44 CET,0.0 1.279 1.896 2.316 2.642 2.933 3.193 3.445 3.89 4.084 4.259 4.398 4.736 4.893 5.194 5.474 5.735 5.864 6.113 6.356 6.707 6.919 7.12 7.422 7.718 7.998 8.263 8.518 8.852 9.176 9.489 9.869 10.232 10.568 10.947 11.393 11.829 12.3 12.797 13.324 13.88 14.492 15.193 15.912 16.755 17.671 18.709 19.885 21.219 22.699 24.321 25.432 25.928 26.074 26.007 25.843 25.643 25.414 25.172 24.913 24.663 24.404 24.148 23.908 23.667 23.412 23.126 22.879 22.666 22.446 22.231 22.041 21.828 21.592 21.396 21.191 20.995 20.795 20.581 20.429 20.27 20.022 19.837 19.648 19.547 19.328 19.091 18.839 18.705 18.392 18.245 18.075 17.903 17.495 17.245 16.969 16.677 16.35 15.959 15.416 13.858 -5 ,30800 ,KEBNE ,16724381,Sun Nov 28 05:55:39 CET,Sun Nov 28 07:31:50 CET,0.0 1.411 1.965 2.359 2.696 3.003 3.273 3.521 3.96 4.149 4.336 4.5 4.835 4.986 5.293 5.585 5.84 5.966 6.227 6.469 6.809 7.029 7.252 7.571 7.862 8.134 8.404 8.664 8.985 9.292 9.592 9.962 10.327 10.668 11.035 11.465 11.895 12.363 12.853 13.359 13.905 14.503 15.194 15.893 16.698 17.584 18.587 19.7 20.973 22.393 23.884 24.921 25.4 25.527 25.433 25.25 25.044 24.803 24.562 24.278 24.003 23.74 23.493 23.259 23.022 22.792 22.54 22.318 22.108 21.883 21.655 21.46 21.255 21.034 20.859 20.672 20.47 20.263 20.048 19.886 19.714 19.455 19.266 19.063 18.959 18.745 18.506 18.263 18.129 17.806 17.662 17.504 17.343 16.979 16.768 16.533 16.253 15.917 15.57 15.103 13.691 -6 ,8245 ,KEBNE ,16724382,Sun Nov 28 05:55:39 CET,Sun Nov 28 07:31:46 CET,0.0 1.102 1.675 2.148 2.515 2.839 3.127 3.392 3.849 4.049 4.234 4.376 4.714 4.857 5.146 5.421 5.676 5.802 6.05 6.294 6.644 6.863 7.069 7.376 7.688 7.978 8.239 8.499 8.833 9.149 9.461 9.83 10.173 10.503 10.904 11.356 11.785 12.24 12.723 13.245 13.774 14.373 15.087 15.808 16.659 17.577 18.602 19.721 20.984 22.451 23.98 24.894 25.259 25.367 25.306 25.135 24.916 24.66 24.401 24.114 23.844 23.581 23.307 23.042 22.801 22.572 22.316 22.087 21.887 21.667 21.426 21.219 21.009 20.784 20.587 20.382 20.18 19.967 19.724 19.545 19.375 19.109 18.911 18.701 18.591 18.356 18.105 17.846 17.711 17.409 17.281 17.109 16.919 16.518 16.302 16.035 15.732 15.395 14.966 14.363 12.919 -7 ,14191 ,KEBNE ,16724383,Sun Nov 28 05:55:39 CET,Sun Nov 28 07:31:50 CET,0.0 1.296 2.014 2.516 2.929 3.295 3.628 3.938 4.433 4.626 4.818 5.0 5.352 5.517 5.844 6.18 6.505 6.657 6.948 7.221 7.588 7.815 8.029 8.348 8.658 8.935 9.198 9.467 9.814 10.139 10.445 10.819 11.184 11.536 11.934 12.372 12.785 13.238 13.721 14.239 14.799 15.426 16.158 16.89 17.726 18.601 19.573 20.702 21.985 23.446 25.163 26.233 26.589 26.652 26.519 26.308 26.069 25.781 25.516 25.262 25.018 24.748 24.485 24.236 23.963 23.707 23.451 23.215 23.007 22.789 22.559 22.364 22.161 21.939 21.748 21.56 21.372 21.162 20.946 20.795 20.633 20.365 20.172 19.974 19.867 19.644 19.415 19.18 19.056 18.757 18.62 18.446 18.267 17.88 17.654 17.419 17.17 16.898 16.547 15.988 14.601 -8 ,12116 ,KEBNE ,16724384,Sun Nov 28 05:56:40 CET,Sun Nov 28 07:32:48 CET,0.0 1.737 2.387 2.842 3.209 3.536 3.817 4.065 4.532 4.74 4.928 5.099 5.458 5.627 5.93 6.207 6.477 6.609 6.854 7.077 7.388 7.596 7.806 8.119 8.421 8.692 8.956 9.218 9.544 9.864 10.19 10.574 10.925 11.273 11.668 12.097 12.509 12.962 13.457 13.992 14.546 15.152 15.863 16.572 17.423 18.339 19.326 20.464 21.734 23.134 24.721 25.762 26.106 26.139 26.067 25.908 25.68 25.444 25.199 24.88 24.597 24.357 24.102 23.842 23.588 23.353 23.106 22.872 22.663 22.438 22.199 22.014 21.818 21.57 21.363 21.163 20.965 20.757 20.525 20.368 20.211 19.954 19.779 19.584 19.479 19.266 19.01 18.733 18.59 18.274 18.137 17.966 17.771 17.328 17.088 16.819 16.494 16.13 15.731 15.18 13.651 -9 ,15425 ,KEBNE ,16724385,Sun Nov 28 05:56:40 CET,Sun Nov 28 07:32:48 CET,0.0 1.262 1.83 2.238 2.545 2.812 3.06 3.277 3.661 3.839 4.012 4.162 4.506 4.663 4.983 5.284 5.557 5.684 5.931 6.163 6.487 6.704 6.918 7.226 7.517 7.794 8.061 8.312 8.635 8.955 9.259 9.624 9.982 10.324 10.735 11.218 11.667 12.132 12.63 13.179 13.746 14.368 15.099 15.807 16.635 17.561 18.565 19.677 20.972 22.41 23.936 24.962 25.334 25.38 25.31 25.169 24.935 24.66 24.406 24.141 23.881 23.624 23.368 23.103 22.838 22.586 22.336 22.11 21.908 21.703 21.472 21.273 21.073 20.853 20.672 20.495 20.31 20.113 19.895 19.732 19.562 19.297 19.113 18.926 18.826 18.615 18.386 18.127 17.991 17.675 17.523 17.357 17.187 16.822 16.605 16.361 16.104 15.795 15.428 14.949 13.866 -10 ,14542 ,KEBNE ,16724386,Sun Nov 28 05:58:43 CET,Sun Nov 28 07:33:42 CET,0.0 1.582 2.237 2.755 3.156 3.467 3.725 3.964 4.388 4.582 4.775 4.94 5.28 5.438 5.753 6.038 6.307 6.435 6.681 6.923 7.261 7.47 7.677 7.985 8.275 8.545 8.807 9.058 9.384 9.705 10.014 10.38 10.733 11.076 11.474 11.915 12.34 12.812 13.316 13.837 14.38 14.981 15.692 16.407 17.231 18.152 19.19 20.326 21.639 23.095 24.614 25.651 26.042 26.162 26.093 25.883 25.656 25.427 25.194 24.928 24.662 24.408 24.169 23.942 23.692 23.411 23.121 22.89 22.679 22.45 22.214 21.984 21.742 21.517 21.342 21.157 20.965 20.771 20.557 20.392 20.218 19.946 19.753 19.549 19.44 19.204 18.959 18.704 18.572 18.274 18.146 17.977 17.785 17.315 17.043 16.741 16.401 16.027 15.564 14.956 13.43 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index 84be451c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -3 ,25573 ,KEBNE ,16724389,Sun Nov 28 05:59:45 CET,Sun Nov 28 07:35:30 CET,0.0 1.399 1.924 2.354 2.695 2.967 3.222 3.469 3.948 4.181 4.402 4.65 5.022 5.21 5.527 5.799 6.057 6.174 6.394 6.617 6.948 7.146 7.334 7.615 7.883 8.126 8.362 8.585 8.869 9.15 9.427 9.758 10.058 10.343 10.68 11.049 11.405 11.799 12.214 12.657 13.122 13.662 14.264 14.842 15.516 16.215 16.981 17.78 18.652 19.588 20.449 20.742 20.608 20.294 19.92 19.535 19.153 18.768 18.412 18.014 17.664 17.337 17.002 16.684 16.385 16.119 15.825 15.549 15.312 15.059 14.8 14.574 14.339 14.1 13.906 13.7 13.477 13.233 12.981 12.808 12.62 12.311 12.107 11.908 11.799 11.566 11.324 11.067 10.922 10.599 10.414 10.206 9.974 9.478 9.203 8.893 8.558 8.192 7.77 7.291 6.068 -4 ,26445 ,KEBNE ,16724390,Sun Nov 28 05:59:49 CET,Sun Nov 28 07:31:38 CET,0.0 1.147 1.629 1.995 2.312 2.602 2.864 3.095 3.478 3.661 3.846 4.012 4.34 4.495 4.785 5.051 5.332 5.469 5.709 5.931 6.249 6.448 6.642 6.927 7.187 7.444 7.702 7.948 8.25 8.529 8.811 9.157 9.478 9.776 10.12 10.503 10.867 11.279 11.722 12.173 12.621 13.095 13.653 14.241 14.889 15.583 16.407 17.28 18.175 19.032 19.785 20.12 20.064 19.787 19.42 19.047 18.679 18.308 17.961 17.591 17.264 16.951 16.634 16.328 16.032 15.755 15.456 15.182 14.949 14.713 14.454 14.23 13.992 13.744 13.539 13.31 13.078 12.844 12.593 12.419 12.236 11.953 11.75 11.541 11.437 11.215 10.972 10.706 10.561 10.244 10.092 9.925 9.758 9.381 9.16 8.899 8.594 8.236 7.792 7.181 5.374 -5 ,19638 ,KEBNE ,16724391,Sun Nov 28 06:00:45 CET,Sun Nov 28 07:36:15 CET,0.0 1.215 1.725 2.133 2.485 2.769 3.02 3.253 3.651 3.838 4.022 4.172 4.497 4.65 4.938 5.213 5.481 5.604 5.83 6.059 6.393 6.599 6.8 7.087 7.358 7.609 7.851 8.09 8.403 8.707 8.991 9.333 9.659 9.97 10.326 10.714 11.084 11.491 11.924 12.372 12.829 13.335 13.94 14.534 15.182 15.879 16.66 17.51 18.441 19.425 20.344 20.694 20.591 20.349 20.008 19.643 19.264 18.876 18.522 18.143 17.808 17.496 17.192 16.895 16.613 16.355 16.079 15.819 15.579 15.32 15.041 14.807 14.571 14.315 14.111 13.9 13.677 13.436 13.186 12.998 12.781 12.431 12.181 11.908 11.767 11.469 11.161 10.852 10.674 10.314 10.072 9.845 9.6 9.08 8.777 8.436 8.073 7.66 7.135 6.442 4.862 -7 ,9413 ,KEBNE ,16724393,Sun Nov 28 06:00:49 CET,Sun Nov 28 07:33:36 CET,0.0 1.107 1.523 1.887 2.232 2.518 2.784 3.026 3.446 3.637 3.819 3.991 4.316 4.464 4.748 5.017 5.274 5.393 5.609 5.83 6.152 6.347 6.542 6.821 7.088 7.342 7.578 7.811 8.118 8.42 8.705 9.029 9.332 9.622 9.973 10.359 10.73 11.149 11.584 12.033 12.474 12.968 13.56 14.149 14.793 15.469 16.212 17.013 17.938 18.913 19.753 20.072 19.951 19.673 19.34 18.964 18.577 18.201 17.843 17.456 17.126 16.802 16.476 16.181 15.901 15.618 15.316 15.047 14.808 14.562 14.294 14.067 13.827 13.572 13.377 13.17 12.944 12.702 12.438 12.256 12.077 11.791 11.584 11.36 11.247 11.011 10.742 10.455 10.305 9.984 9.824 9.648 9.474 9.104 8.903 8.683 8.408 8.088 7.682 7.107 5.782 -9 ,235 ,KEBNE ,16724395,Sun Nov 28 06:01:47 CET,Sun Nov 28 07:37:22 CET,0.0 1.377 1.866 2.261 2.593 2.872 3.127 3.364 3.785 3.973 4.152 4.325 4.657 4.804 5.088 5.362 5.632 5.755 5.983 6.217 6.546 6.765 7.006 7.343 7.635 7.889 8.133 8.381 8.68 8.952 9.214 9.54 9.861 10.159 10.511 10.911 11.265 11.64 12.051 12.477 12.933 13.455 14.048 14.634 15.288 15.971 16.736 17.539 18.408 19.314 20.141 20.457 20.37 20.142 19.857 19.512 19.159 18.811 18.478 18.097 17.735 17.401 17.072 16.761 16.442 16.153 15.858 15.577 15.32 15.059 14.801 14.586 14.355 14.112 13.919 13.721 13.509 13.269 13.009 12.826 12.647 12.37 12.165 11.947 11.836 11.605 11.362 11.097 10.958 10.651 10.501 10.33 10.148 9.765 9.548 9.286 8.995 8.681 8.302 7.703 6.137 -10 ,15962 ,KEBNE ,16724396,Sun Nov 28 06:02:49 CET,Sun Nov 28 07:38:28 CET,0.0 1.282 1.815 2.232 2.611 2.897 3.134 3.356 3.755 3.936 4.122 4.306 4.637 4.792 5.083 5.348 5.599 5.722 5.966 6.199 6.509 6.704 6.899 7.188 7.462 7.716 7.954 8.188 8.489 8.778 9.062 9.407 9.739 10.045 10.391 10.782 11.16 11.562 11.993 12.453 12.927 13.465 14.069 14.648 15.308 16.019 16.813 17.674 18.593 19.508 20.336 20.696 20.636 20.383 20.063 19.734 19.397 19.019 18.67 18.309 17.973 17.658 17.34 17.028 16.728 16.443 16.148 15.89 15.654 15.388 15.109 14.865 14.594 14.321 14.122 13.927 13.721 13.49 13.242 13.069 12.898 12.628 12.434 12.231 12.119 11.88 11.627 11.362 11.23 10.92 10.757 10.592 10.407 9.911 9.614 9.291 8.926 8.526 8.022 7.338 5.216 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 4c3fa6d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27842 ,KEBNE ,16724397,Sun Nov 28 06:02:49 CET,Sun Nov 28 07:38:00 CET,0.0 1.954 2.668 3.158 3.585 3.944 4.258 4.557 5.105 5.351 5.575 5.815 6.165 6.349 6.699 7.025 7.341 7.488 7.759 7.989 8.273 8.461 8.64 8.879 9.108 9.321 9.521 9.714 9.965 10.207 10.426 10.682 10.93 11.168 11.448 11.756 12.023 12.301 12.608 12.943 13.253 13.574 13.964 14.308 14.677 15.065 15.418 15.692 15.84 15.767 15.162 13.962 12.766 11.676 10.68 9.765 8.98 8.261 7.608 6.938 6.371 5.872 5.402 4.966 4.542 4.134 3.708 3.336 3.018 2.696 2.36 2.078 1.781 1.467 1.232 0.954 0.618 0.301 0.008 -0.19 -0.395 -0.72 -0.946 -1.188 -1.306 -1.559 -1.846 -2.134 -2.28 -2.6 -2.761 -2.949 -3.143 -3.588 -3.838 -4.102 -4.409 -4.776 -5.196 -5.744 -7.204 -2 ,14174 ,KEBNE ,16724398,Sun Nov 28 06:02:49 CET,Sun Nov 28 07:38:17 CET,0.0 1.443 2.037 2.447 2.79 3.086 3.33 3.535 3.932 4.124 4.3 4.446 4.751 4.898 5.173 5.421 5.647 5.759 5.982 6.19 6.482 6.661 6.829 7.081 7.324 7.538 7.743 7.95 8.211 8.46 8.691 8.962 9.222 9.453 9.71 9.997 10.269 10.542 10.833 11.168 11.501 11.813 12.179 12.543 12.885 13.229 13.581 13.849 13.975 13.921 13.375 12.222 11.063 10.001 9.03 8.134 7.33 6.597 5.954 5.306 4.763 4.272 3.797 3.339 2.9 2.509 2.109 1.741 1.422 1.092 0.749 0.462 0.165 -0.136 -0.371 -0.62 -0.882 -1.161 -1.447 -1.648 -1.867 -2.204 -2.427 -2.668 -2.8 -3.058 -3.317 -3.612 -3.775 -4.114 -4.299 -4.494 -4.701 -5.114 -5.328 -5.589 -5.903 -6.238 -6.636 -7.221 -8.732 -4 ,8692 ,KEBNE ,16724400,Sun Nov 28 06:02:57 CET,Sun Nov 28 07:34:04 CET,0.0 1.406 1.888 2.24 2.548 2.833 3.099 3.357 3.806 3.988 4.153 4.304 4.623 4.774 5.039 5.278 5.503 5.614 5.814 6.008 6.292 6.5 6.723 7.026 7.275 7.488 7.691 7.883 8.128 8.364 8.594 8.855 9.11 9.339 9.59 9.877 10.141 10.431 10.738 11.058 11.374 11.675 11.998 12.339 12.718 13.056 13.364 13.602 13.688 13.516 12.824 11.651 10.479 9.343 8.348 7.463 6.674 5.963 5.337 4.702 4.141 3.63 3.156 2.71 2.283 1.878 1.443 1.055 0.725 0.388 0.04 -0.244 -0.55 -0.866 -1.107 -1.356 -1.614 -1.898 -2.189 -2.393 -2.609 -2.939 -3.168 -3.431 -3.584 -3.905 -4.256 -4.636 -4.835 -5.213 -5.49 -5.726 -5.967 -6.503 -6.799 -7.131 -7.506 -7.919 -8.416 -9.042 -10.452 -5 ,232 ,KEBNE ,16724401,Sun Nov 28 06:02:57 CET,Sun Nov 28 07:34:55 CET,0.0 1.317 1.793 2.15 2.437 2.699 2.947 3.17 3.573 3.755 3.928 4.072 4.373 4.505 4.76 5.002 5.226 5.332 5.534 5.75 6.07 6.25 6.414 6.659 6.895 7.116 7.327 7.523 7.773 8.014 8.242 8.519 8.768 9.007 9.287 9.583 9.862 10.133 10.416 10.741 11.058 11.391 11.775 12.114 12.46 12.808 13.116 13.341 13.434 13.296 12.617 11.438 10.256 9.136 8.136 7.261 6.47 5.693 5.035 4.406 3.862 3.358 2.862 2.408 1.985 1.595 1.179 0.81 0.498 0.173 -0.184 -0.485 -0.794 -1.112 -1.358 -1.61 -1.891 -2.185 -2.478 -2.708 -2.957 -3.35 -3.636 -3.939 -4.094 -4.422 -4.76 -5.111 -5.301 -5.673 -5.918 -6.121 -6.336 -6.872 -7.181 -7.51 -7.852 -8.272 -8.822 -9.464 -10.647 -6 ,25995 ,KEBNE ,16724402,Sun Nov 28 06:02:49 CET,Sun Nov 28 07:38:01 CET,0.0 1.243 1.798 2.169 2.437 2.696 2.955 3.193 3.591 3.764 3.928 4.085 4.408 4.562 4.829 5.071 5.304 5.418 5.648 5.867 6.158 6.338 6.527 6.793 7.032 7.259 7.477 7.675 7.919 8.164 8.413 8.694 8.943 9.17 9.421 9.715 9.983 10.283 10.598 10.885 11.203 11.556 11.911 12.242 12.607 12.986 13.322 13.577 13.73 13.627 13.014 11.883 10.797 9.785 8.816 7.912 7.116 6.391 5.747 5.091 4.548 4.067 3.596 3.143 2.717 2.334 1.936 1.582 1.265 0.931 0.579 0.287 -0.016 -0.334 -0.583 -0.836 -1.095 -1.362 -1.655 -1.876 -2.122 -2.541 -2.827 -3.096 -3.228 -3.492 -3.762 -4.05 -4.211 -4.549 -4.722 -4.916 -5.125 -5.568 -5.79 -6.04 -6.342 -6.667 -7.083 -7.654 -8.954 -7 ,21473 ,KEBNE ,16724403,Sun Nov 28 06:02:49 CET,Sun Nov 28 07:37:59 CET,0.0 1.531 2.133 2.564 2.923 3.223 3.483 3.717 4.124 4.306 4.475 4.631 4.94 5.07 5.322 5.561 5.773 5.879 6.084 6.288 6.588 6.768 6.937 7.181 7.412 7.628 7.838 8.047 8.309 8.563 8.798 9.054 9.313 9.57 9.845 10.142 10.425 10.715 11.02 11.355 11.691 12.039 12.417 12.757 13.092 13.413 13.735 14.0 14.139 14.002 13.328 12.123 10.918 9.806 8.823 7.928 7.133 6.418 5.775 5.127 4.573 4.067 3.599 3.16 2.727 2.332 1.924 1.569 1.27 0.952 0.602 0.308 -0.008 -0.347 -0.602 -0.861 -1.123 -1.392 -1.674 -1.869 -2.08 -2.408 -2.63 -2.862 -2.99 -3.27 -3.556 -3.846 -3.996 -4.323 -4.508 -4.687 -4.859 -5.312 -5.584 -5.861 -6.158 -6.485 -6.877 -7.457 -8.717 -8 ,21494 ,KEBNE ,16724404,Sun Nov 28 06:03:51 CET,Sun Nov 28 07:38:58 CET,0.0 1.574 2.15 2.559 2.877 3.155 3.418 3.646 4.065 4.264 4.436 4.574 4.88 5.015 5.269 5.503 5.719 5.83 6.044 6.252 6.541 6.723 6.901 7.139 7.367 7.596 7.814 8.017 8.272 8.518 8.748 9.016 9.264 9.495 9.767 10.068 10.351 10.641 10.94 11.249 11.557 11.88 12.21 12.503 12.818 13.141 13.448 13.718 13.889 13.78 13.14 11.957 10.757 9.655 8.666 7.75 6.943 6.215 5.562 4.89 4.329 3.839 3.37 2.92 2.475 2.083 1.698 1.338 1.021 0.678 0.323 0.045 -0.238 -0.544 -0.794 -1.051 -1.32 -1.613 -1.912 -2.115 -2.325 -2.657 -2.889 -3.129 -3.253 -3.506 -3.783 -4.086 -4.247 -4.585 -4.752 -4.929 -5.111 -5.525 -5.768 -6.038 -6.323 -6.678 -7.134 -7.777 -9.385 -10 ,26525 ,KEBNE ,16724406,Sun Nov 28 06:03:50 CET,Sun Nov 28 07:39:05 CET,0.0 1.394 1.91 2.273 2.593 2.858 3.085 3.31 3.696 3.87 4.044 4.2 4.518 4.67 4.949 5.209 5.44 5.55 5.765 5.956 6.239 6.414 6.58 6.827 7.063 7.279 7.481 7.678 7.931 8.169 8.39 8.645 8.891 9.132 9.392 9.692 9.981 10.271 10.564 10.863 11.165 11.509 11.882 12.198 12.525 12.84 13.098 13.317 13.491 13.394 12.774 11.601 10.403 9.328 8.368 7.448 6.649 5.928 5.293 4.65 4.094 3.597 3.109 2.665 2.239 1.832 1.403 1.032 0.731 0.415 0.08 -0.201 -0.502 -0.823 -1.074 -1.333 -1.597 -1.864 -2.148 -2.351 -2.563 -2.894 -3.118 -3.355 -3.475 -3.73 -4.017 -4.319 -4.474 -4.807 -4.977 -5.158 -5.358 -5.813 -6.073 -6.361 -6.676 -7.031 -7.481 -8.079 -9.559 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index d2a1238a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,660 ,KEBNE ,16724408,Sun Nov 28 06:03:51 CET,Sun Nov 28 07:39:28 CET,0.0 1.435 1.951 2.346 2.686 2.966 3.21 3.44 3.862 4.044 4.221 4.41 4.726 4.881 5.159 5.426 5.686 5.807 6.039 6.253 6.552 6.754 6.974 7.291 7.58 7.851 8.099 8.35 8.669 8.96 9.233 9.558 9.894 10.226 10.595 11.005 11.392 11.815 12.271 12.771 13.29 13.85 14.516 15.179 15.935 16.748 17.679 18.731 19.893 21.212 22.733 23.787 24.165 24.231 24.138 23.917 23.669 23.421 23.163 22.883 22.627 22.357 22.073 21.813 21.549 21.304 21.056 20.8 20.565 20.306 20.028 19.777 19.521 19.267 19.036 18.767 18.477 18.17 17.846 17.613 17.374 17.003 16.738 16.455 16.305 15.997 15.678 15.325 15.141 14.825 14.636 14.434 14.227 13.76 13.49 13.197 12.885 12.502 12.031 11.375 9.313 -3 ,537 ,KEBNE ,16724409,Sun Nov 28 06:03:51 CET,Sun Nov 28 07:40:50 CET,0.0 1.483 2.046 2.47 2.83 3.142 3.408 3.648 4.086 4.286 4.473 4.648 4.96 5.107 5.385 5.648 5.885 5.997 6.225 6.448 6.76 6.968 7.178 7.47 7.736 8.029 8.353 8.656 9.024 9.367 9.67 10.016 10.34 10.653 11.023 11.416 11.787 12.2 12.645 13.139 13.671 14.258 14.938 15.612 16.378 17.197 18.127 19.148 20.279 21.527 22.952 23.968 24.335 24.389 24.265 24.035 23.789 23.528 23.246 22.931 22.672 22.429 22.151 21.832 21.495 21.176 20.866 20.596 20.365 20.128 19.857 19.619 19.375 19.112 18.902 18.678 18.442 18.192 17.927 17.74 17.533 17.208 16.992 16.754 16.633 16.399 16.142 15.856 15.702 15.39 15.183 14.978 14.754 14.256 13.967 13.638 13.295 12.922 12.427 11.728 9.117 -4 ,29162 ,KEBNE ,16724410,Sun Nov 28 06:03:50 CET,Sun Nov 28 07:39:33 CET,0.0 1.481 2.037 2.52 2.937 3.273 3.579 3.879 4.428 4.662 4.874 5.092 5.416 5.571 5.866 6.138 6.386 6.519 6.807 7.089 7.487 7.741 7.988 8.303 8.566 8.816 9.058 9.304 9.618 9.907 10.192 10.54 10.875 11.18 11.525 11.915 12.301 12.724 13.158 13.626 14.117 14.673 15.323 15.965 16.731 17.576 18.511 19.54 20.712 22.023 23.495 24.48 24.858 24.946 24.867 24.726 24.516 24.255 23.989 23.686 23.421 23.173 22.922 22.657 22.384 22.143 21.873 21.614 21.382 21.129 20.859 20.625 20.384 20.123 19.919 19.696 19.464 19.231 18.963 18.77 18.577 18.272 18.04 17.793 17.672 17.435 17.178 16.881 16.73 16.42 16.202 16.0 15.779 15.256 14.975 14.677 14.326 13.903 13.352 12.612 10.412 -5 ,23176 ,KEBNE ,16724411,Sun Nov 28 06:03:51 CET,Sun Nov 28 07:40:43 CET,0.0 1.137 1.773 2.282 2.702 3.057 3.359 3.647 4.137 4.327 4.507 4.674 4.982 5.128 5.405 5.673 5.926 6.046 6.281 6.505 6.809 6.996 7.186 7.483 7.768 8.043 8.299 8.526 8.818 9.128 9.436 9.793 10.13 10.449 10.81 11.208 11.588 12.019 12.487 12.98 13.483 14.039 14.69 15.34 16.095 16.93 17.866 18.901 20.067 21.357 22.765 23.66 23.928 23.945 23.856 23.682 23.436 23.168 22.898 22.558 22.248 21.969 21.689 21.382 21.08 20.803 20.511 20.269 20.029 19.762 19.493 19.258 19.02 18.767 18.56 18.344 18.104 17.853 17.601 17.422 17.227 16.92 16.691 16.441 16.313 16.045 15.771 15.484 15.331 15.01 14.804 14.615 14.402 13.915 13.645 13.341 13.005 12.606 12.115 11.46 9.232 -6 ,17250 ,KEBNE ,16724412,Sun Nov 28 06:04:52 CET,Sun Nov 28 07:40:27 CET,0.0 1.283 1.879 2.395 2.831 3.182 3.49 3.766 4.249 4.467 4.684 4.908 5.221 5.368 5.655 5.924 6.173 6.291 6.513 6.731 7.068 7.293 7.499 7.776 8.044 8.31 8.574 8.831 9.157 9.469 9.756 10.097 10.438 10.755 11.105 11.508 11.905 12.338 12.789 13.271 13.792 14.381 15.044 15.69 16.443 17.259 18.165 19.173 20.317 21.639 23.128 24.032 24.332 24.401 24.307 24.137 23.93 23.667 23.416 23.125 22.848 22.572 22.274 21.973 21.684 21.434 21.17 20.909 20.673 20.413 20.135 19.901 19.643 19.379 19.167 18.941 18.721 18.485 18.21 18.01 17.801 17.476 17.248 16.995 16.864 16.604 16.327 16.028 15.875 15.566 15.339 15.108 14.883 14.452 14.208 13.942 13.618 13.217 12.716 12.033 9.593 -7 ,8636 ,KEBNE ,16724413,Sun Nov 28 06:04:52 CET,Sun Nov 28 07:40:39 CET,0.0 1.646 2.188 2.655 3.086 3.455 3.774 4.059 4.547 4.763 4.966 5.199 5.556 5.746 6.098 6.435 6.721 6.84 7.079 7.303 7.615 7.811 7.999 8.279 8.55 8.808 9.054 9.303 9.627 9.924 10.2 10.54 10.878 11.191 11.564 11.979 12.355 12.774 13.237 13.713 14.22 14.805 15.456 16.104 16.85 17.68 18.637 19.691 20.87 22.142 23.535 24.492 24.858 24.896 24.763 24.573 24.337 24.07 23.816 23.542 23.277 23.014 22.748 22.487 22.21 21.932 21.673 21.424 21.184 20.939 20.68 20.46 20.216 19.934 19.718 19.514 19.286 19.039 18.789 18.613 18.424 18.102 17.864 17.622 17.505 17.25 16.971 16.69 16.542 16.222 16.003 15.81 15.601 15.092 14.789 14.451 14.061 13.605 13.086 12.38 9.704 -8 ,15197 ,KEBNE ,16724414,Sun Nov 28 06:04:52 CET,Sun Nov 28 07:40:09 CET,0.0 1.537 2.134 2.544 2.884 3.2 3.498 3.758 4.169 4.346 4.515 4.668 4.973 5.113 5.376 5.636 5.89 6.012 6.246 6.469 6.789 6.995 7.192 7.465 7.754 8.068 8.382 8.68 9.05 9.381 9.671 10.008 10.34 10.657 11.024 11.44 11.834 12.266 12.728 13.208 13.715 14.284 14.93 15.572 16.316 17.14 18.091 19.135 20.315 21.638 23.06 24.012 24.363 24.424 24.34 24.161 23.94 23.695 23.454 23.162 22.857 22.576 22.301 22.018 21.76 21.518 21.228 20.972 20.746 20.5 20.245 20.016 19.776 19.525 19.309 19.085 18.873 18.645 18.353 18.121 17.886 17.529 17.275 17.0 16.858 16.557 16.215 15.849 15.662 15.313 15.054 14.859 14.656 14.169 13.905 13.621 13.285 12.89 12.391 11.733 9.548 -9 ,32096 ,KEBNE ,16724415,Sun Nov 28 06:05:54 CET,Sun Nov 28 07:42:44 CET,0.0 1.154 1.667 2.081 2.41 2.671 2.914 3.135 3.554 3.765 3.972 4.182 4.508 4.657 4.93 5.185 5.436 5.564 5.822 6.062 6.372 6.563 6.753 7.024 7.295 7.562 7.806 8.046 8.377 8.691 8.971 9.308 9.642 9.955 10.31 10.714 11.093 11.507 11.952 12.428 12.943 13.521 14.183 14.824 15.573 16.419 17.369 18.429 19.575 20.83 22.248 23.138 23.406 23.399 23.269 23.057 22.813 22.554 22.288 21.981 21.711 21.446 21.142 20.861 20.605 20.361 20.096 19.853 19.614 19.341 19.068 18.834 18.583 18.323 18.117 17.909 17.694 17.452 17.185 16.999 16.805 16.489 16.265 16.034 15.906 15.628 15.337 15.046 14.893 14.573 14.381 14.192 13.988 13.53 13.262 12.972 12.652 12.272 11.757 11.023 8.647 -10 ,22605 ,KEBNE ,16724416,Sun Nov 28 06:05:54 CET,Sun Nov 28 07:42:28 CET,0.0 1.211 1.783 2.207 2.539 2.823 3.069 3.301 3.733 3.93 4.115 4.301 4.625 4.775 5.046 5.304 5.55 5.675 5.924 6.159 6.494 6.708 6.914 7.192 7.455 7.713 7.96 8.198 8.501 8.798 9.088 9.425 9.747 10.056 10.414 10.812 11.189 11.612 12.098 12.615 13.142 13.732 14.397 15.047 15.781 16.636 17.615 18.68 19.872 21.132 22.564 23.522 23.857 23.912 23.837 23.686 23.489 23.258 23.009 22.733 22.468 22.199 21.924 21.639 21.357 21.082 20.772 20.499 20.268 20.028 19.769 19.529 19.278 19.015 18.797 18.57 18.338 18.075 17.782 17.576 17.347 17.003 16.792 16.574 16.454 16.203 15.924 15.614 15.436 15.101 14.887 14.69 14.468 13.987 13.724 13.433 13.099 12.648 12.133 11.498 9.506 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt deleted file mode 100644 index 44ce8cda..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,16079 ,KEBNE ,16724418,Sun Nov 28 06:06:55 CET,Sun Nov 28 07:43:33 CET,0.0 1.421 1.988 2.413 2.752 3.056 3.346 3.608 4.058 4.252 4.431 4.613 4.945 5.09 5.377 5.642 5.896 6.015 6.248 6.471 6.791 7.001 7.2 7.471 7.734 8.006 8.256 8.501 8.818 9.098 9.375 9.723 10.058 10.384 10.749 11.157 11.557 11.986 12.449 12.964 13.483 14.053 14.737 15.398 16.136 16.951 17.847 18.847 20.001 21.241 22.525 23.315 23.579 23.562 23.413 23.209 22.989 22.735 22.431 22.062 21.757 21.484 21.199 20.928 20.658 20.391 20.077 19.764 19.506 19.24 18.934 18.687 18.437 18.175 17.967 17.736 17.496 17.25 16.992 16.813 16.621 16.286 16.028 15.755 15.618 15.368 15.1 14.769 14.588 14.234 13.991 13.778 13.563 13.077 12.785 12.439 12.053 11.635 11.134 10.476 8.357 -3 ,18955 ,KEBNE ,16724419,Sun Nov 28 06:06:55 CET,Sun Nov 28 07:43:35 CET,0.0 1.21 1.782 2.234 2.574 2.874 3.155 3.405 3.792 3.964 4.132 4.311 4.649 4.812 5.119 5.397 5.661 5.787 6.023 6.252 6.592 6.809 7.008 7.31 7.603 7.856 8.095 8.334 8.63 8.919 9.216 9.562 9.899 10.228 10.592 10.995 11.399 11.828 12.279 12.761 13.252 13.79 14.423 15.049 15.787 16.634 17.547 18.541 19.662 20.853 22.143 22.952 23.25 23.296 23.194 23.012 22.76 22.491 22.225 21.917 21.636 21.357 21.053 20.773 20.497 20.215 19.915 19.65 19.43 19.182 18.891 18.637 18.368 18.084 17.867 17.651 17.428 17.185 16.884 16.654 16.4 15.975 15.681 15.39 15.257 14.989 14.687 14.364 14.192 13.86 13.656 13.453 13.245 12.781 12.499 12.171 11.827 11.436 10.909 10.098 7.88 -5 ,19281 ,KEBNE ,16724421,Sun Nov 28 06:06:55 CET,Sun Nov 28 07:42:33 CET,0.0 1.568 2.263 2.76 3.123 3.422 3.687 3.92 4.353 4.537 4.705 4.849 5.17 5.317 5.592 5.863 6.117 6.235 6.464 6.69 7.009 7.213 7.403 7.674 7.947 8.21 8.467 8.712 9.008 9.29 9.566 9.915 10.239 10.54 10.903 11.316 11.706 12.128 12.591 13.087 13.601 14.16 14.784 15.409 16.152 16.961 17.885 18.915 20.027 21.236 22.535 23.372 23.608 23.587 23.465 23.257 22.994 22.677 22.36 22.036 21.746 21.472 21.189 20.905 20.631 20.352 20.048 19.763 19.506 19.235 18.954 18.719 18.466 18.212 17.996 17.744 17.483 17.231 16.97 16.772 16.552 16.216 16.007 15.786 15.642 15.316 14.971 14.587 14.374 13.993 13.714 13.471 13.203 12.587 12.248 11.871 11.443 10.956 10.318 9.44 7.174 -6 ,9200 ,KEBNE ,16724422,Sun Nov 28 06:06:55 CET,Sun Nov 28 07:42:30 CET,0.0 1.573 2.155 2.553 2.886 3.204 3.504 3.779 4.228 4.421 4.6 4.77 5.102 5.256 5.556 5.826 6.075 6.2 6.443 6.677 7.01 7.217 7.416 7.691 7.953 8.208 8.446 8.682 9.002 9.305 9.587 9.923 10.253 10.583 10.961 11.382 11.787 12.219 12.668 13.133 13.63 14.194 14.835 15.461 16.157 16.933 17.817 18.807 19.928 21.164 22.471 23.251 23.464 23.406 23.255 23.044 22.804 22.525 22.24 21.939 21.652 21.358 21.061 20.796 20.504 20.202 19.886 19.605 19.37 19.135 18.871 18.629 18.384 18.118 17.902 17.686 17.444 17.177 16.905 16.714 16.51 16.183 15.954 15.716 15.585 15.304 15.002 14.661 14.482 14.144 13.938 13.719 13.493 13.036 12.761 12.456 12.118 11.685 11.153 10.433 8.434 -7 ,18768 ,KEBNE ,16724423,Sun Nov 28 06:09:01 CET,Sun Nov 28 07:45:45 CET,0.0 1.251 1.822 2.248 2.575 2.865 3.133 3.366 3.77 3.941 4.108 4.28 4.607 4.756 5.034 5.292 5.544 5.67 5.908 6.126 6.437 6.651 6.861 7.156 7.448 7.73 7.989 8.22 8.516 8.806 9.082 9.411 9.723 10.032 10.398 10.805 11.19 11.613 12.092 12.612 13.133 13.689 14.322 14.97 15.726 16.535 17.453 18.474 19.602 20.787 22.062 22.924 23.202 23.159 23.011 22.788 22.509 22.209 21.923 21.608 21.298 21.008 20.717 20.427 20.138 19.856 19.572 19.315 19.078 18.816 18.557 18.344 18.103 17.856 17.658 17.44 17.211 16.963 16.699 16.513 16.319 16.009 15.795 15.567 15.439 15.169 14.875 14.579 14.419 14.074 13.854 13.626 13.359 12.755 12.404 12.013 11.584 11.084 10.499 9.646 7.032 -8 ,4104 ,KEBNE ,16724424,Sun Nov 28 06:09:59 CET,Sun Nov 28 07:45:54 CET,0.0 1.047 1.553 1.926 2.291 2.601 2.85 3.08 3.528 3.731 3.912 4.08 4.407 4.56 4.886 5.212 5.507 5.645 5.917 6.177 6.541 6.772 6.972 7.243 7.504 7.741 7.968 8.202 8.511 8.812 9.105 9.456 9.775 10.09 10.463 10.872 11.264 11.67 12.109 12.579 13.059 13.619 14.295 14.972 15.719 16.51 17.417 18.439 19.592 20.865 22.199 23.029 23.34 23.36 23.224 23.013 22.761 22.472 22.179 21.867 21.58 21.287 20.995 20.717 20.443 20.187 19.908 19.635 19.392 19.134 18.86 18.633 18.388 18.121 17.903 17.67 17.441 17.19 16.884 16.683 16.498 16.187 15.945 15.693 15.56 15.292 15.018 14.709 14.538 14.2 14.0 13.806 13.588 13.068 12.758 12.402 12.016 11.567 10.939 10.091 8.001 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt deleted file mode 100644 index 3f106e2e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6875 ,KEBNE ,16724427,Sun Nov 28 06:09:59 CET,Sun Nov 28 07:46:14 CET,0.0 1.657 2.366 2.866 3.301 3.688 4.033 4.372 4.932 5.173 5.411 5.697 6.073 6.266 6.629 6.972 7.299 7.452 7.753 8.045 8.429 8.65 8.855 9.143 9.407 9.671 9.929 10.173 10.503 10.817 11.105 11.447 11.766 12.07 12.415 12.803 13.185 13.612 14.071 14.535 15.018 15.575 16.203 16.804 17.511 18.287 19.148 20.082 21.097 22.137 23.221 23.848 23.9 23.735 23.513 23.214 22.88 22.549 22.243 21.916 21.611 21.326 21.05 20.769 20.493 20.238 19.959 19.701 19.465 19.205 18.933 18.694 18.437 18.191 18.004 17.795 17.563 17.329 17.097 16.928 16.733 16.434 16.233 16.01 15.89 15.654 15.42 15.172 15.048 14.762 14.593 14.406 14.216 13.807 13.58 13.331 13.05 12.722 12.355 11.854 10.263 -2 ,15177 ,KEBNE ,16724428,Sun Nov 28 06:09:59 CET,Sun Nov 28 07:46:05 CET,0.0 1.829 2.459 2.927 3.271 3.574 3.869 4.146 4.647 4.856 5.044 5.265 5.631 5.825 6.199 6.555 6.846 6.967 7.204 7.429 7.754 7.968 8.176 8.469 8.754 9.032 9.282 9.527 9.862 10.17 10.456 10.8 11.127 11.445 11.813 12.209 12.585 13.007 13.456 13.925 14.428 14.98 15.598 16.198 16.885 17.655 18.553 19.498 20.515 21.624 22.685 23.19 23.217 23.043 22.791 22.467 22.13 21.795 21.476 21.138 20.834 20.554 20.27 19.991 19.725 19.466 19.201 18.969 18.748 18.491 18.206 17.978 17.706 17.393 17.154 16.896 16.613 16.333 16.081 15.915 15.734 15.437 15.231 15.016 14.899 14.659 14.405 14.129 13.986 13.68 13.511 13.33 13.15 12.757 12.519 12.262 11.962 11.625 11.221 10.647 9.389 -4 ,19357 ,KEBNE ,16724430,Sun Nov 28 06:11:01 CET,Sun Nov 28 07:47:23 CET,0.0 1.839 2.435 2.857 3.218 3.545 3.827 4.076 4.504 4.712 4.907 5.09 5.424 5.573 5.875 6.163 6.438 6.574 6.825 7.06 7.39 7.605 7.821 8.114 8.39 8.655 8.908 9.164 9.485 9.788 10.076 10.417 10.754 11.078 11.442 11.833 12.223 12.673 13.135 13.612 14.106 14.641 15.253 15.853 16.524 17.268 18.134 19.043 20.028 21.081 22.161 22.749 22.837 22.7 22.422 22.075 21.742 21.412 21.083 20.761 20.452 20.15 19.87 19.576 19.281 19.015 18.734 18.478 18.261 18.036 17.793 17.581 17.357 17.111 16.912 16.713 16.488 16.238 15.998 15.837 15.659 15.37 15.178 14.982 14.875 14.652 14.416 14.145 13.996 13.678 13.516 13.341 13.157 12.763 12.541 12.302 12.013 11.68 11.313 10.82 9.657 -6 ,3245 ,KEBNE ,16724432,Sun Nov 28 06:11:01 CET,Sun Nov 28 07:47:02 CET,0.0 1.796 2.382 2.817 3.163 3.503 3.799 4.044 4.496 4.707 4.893 5.055 5.385 5.543 5.849 6.132 6.4 6.529 6.77 7.005 7.325 7.518 7.708 7.992 8.263 8.512 8.746 8.991 9.311 9.609 9.901 10.244 10.562 10.871 11.24 11.666 12.097 12.547 12.989 13.446 13.924 14.464 15.087 15.695 16.384 17.118 17.952 18.863 19.845 20.837 21.82 22.394 22.468 22.316 22.05 21.755 21.449 21.124 20.825 20.493 20.181 19.883 19.596 19.307 19.028 18.761 18.471 18.214 17.987 17.757 17.513 17.309 17.085 16.838 16.642 16.453 16.259 16.038 15.809 15.646 15.465 15.18 14.984 14.782 14.682 14.468 14.22 13.952 13.813 13.511 13.37 13.2 13.01 12.601 12.372 12.102 11.799 11.468 11.079 10.516 9.283 -7 ,21650 ,KEBNE ,16724433,Sun Nov 28 06:12:02 CET,Sun Nov 28 07:48:08 CET,0.0 1.816 2.51 3.004 3.399 3.699 3.956 4.198 4.641 4.843 5.021 5.186 5.532 5.701 6.033 6.37 6.693 6.849 7.146 7.434 7.831 8.059 8.267 8.562 8.839 9.105 9.383 9.669 10.04 10.398 10.719 11.072 11.404 11.755 12.185 12.653 13.067 13.484 13.927 14.39 14.875 15.418 16.062 16.705 17.41 18.156 18.988 19.886 20.882 21.949 23.027 23.615 23.749 23.643 23.413 23.119 22.798 22.472 22.164 21.825 21.506 21.215 20.918 20.624 20.345 20.083 19.802 19.543 19.31 19.057 18.784 18.557 18.322 18.079 17.892 17.692 17.483 17.263 17.019 16.85 16.672 16.393 16.196 15.999 15.891 15.644 15.401 15.139 14.993 14.686 14.518 14.333 14.153 13.781 13.574 13.323 13.017 12.684 12.264 11.71 10.356 -8 ,6745 ,KEBNE ,16724434,Sun Nov 28 06:12:02 CET,Sun Nov 28 07:48:27 CET,0.0 1.655 2.253 2.757 3.117 3.413 3.69 3.904 4.297 4.49 4.687 4.898 5.233 5.388 5.706 5.999 6.265 6.394 6.643 6.884 7.214 7.418 7.622 7.917 8.191 8.457 8.717 8.965 9.285 9.595 9.884 10.217 10.541 10.861 11.23 11.622 11.995 12.427 12.877 13.326 13.823 14.383 14.991 15.599 16.303 17.076 17.919 18.807 19.779 20.83 21.915 22.482 22.515 22.379 22.121 21.812 21.498 21.172 20.857 20.495 20.183 19.904 19.617 19.327 19.051 18.774 18.463 18.188 17.939 17.686 17.432 17.218 16.975 16.718 16.528 16.329 16.118 15.885 15.635 15.466 15.298 15.022 14.809 14.586 14.476 14.253 14.011 13.74 13.594 13.285 13.108 12.92 12.728 12.305 12.064 11.777 11.457 11.142 10.796 10.316 9.111 -9 ,777 ,KEBNE ,16724435,Sun Nov 28 06:13:04 CET,Sun Nov 28 07:49:00 CET,0.0 1.932 2.545 2.99 3.311 3.593 3.871 4.121 4.572 4.782 4.976 5.193 5.545 5.697 5.993 6.279 6.541 6.666 6.899 7.127 7.462 7.676 7.886 8.192 8.476 8.755 9.023 9.265 9.57 9.867 10.156 10.497 10.837 11.18 11.559 11.954 12.334 12.751 13.179 13.635 14.12 14.648 15.249 15.859 16.539 17.267 18.099 18.985 19.935 20.96 22.044 22.601 22.637 22.471 22.201 21.858 21.53 21.202 20.886 20.546 20.234 19.944 19.627 19.306 19.033 18.782 18.502 18.235 17.996 17.762 17.516 17.289 17.054 16.819 16.623 16.409 16.186 15.948 15.708 15.537 15.345 15.051 14.853 14.64 14.529 14.298 14.052 13.773 13.627 13.316 13.171 13.011 12.834 12.415 12.179 11.926 11.639 11.307 10.888 10.251 8.798 -10 ,15384 ,KEBNE ,16724436,Sun Nov 28 06:14:05 CET,Sun Nov 28 07:51:28 CET,0.0 1.476 2.065 2.548 2.92 3.209 3.483 3.722 4.158 4.37 4.561 4.737 5.07 5.224 5.522 5.802 6.076 6.21 6.493 6.785 7.177 7.41 7.629 7.935 8.212 8.501 8.821 9.138 9.536 9.91 10.249 10.622 10.955 11.274 11.646 12.052 12.441 12.862 13.302 13.771 14.263 14.804 15.424 16.034 16.724 17.501 18.361 19.213 20.157 21.181 22.14 22.643 22.748 22.594 22.352 22.092 21.788 21.47 21.161 20.804 20.482 20.182 19.891 19.587 19.289 19.043 18.761 18.476 18.214 17.937 17.664 17.442 17.209 16.97 16.781 16.572 16.353 16.124 15.873 15.704 15.528 15.248 15.05 14.83 14.712 14.468 14.215 13.945 13.796 13.489 13.334 13.159 12.975 12.596 12.386 12.124 11.807 11.462 11.068 10.501 9.033 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index 4eec83e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3848 ,KEBNE ,16724437,Sun Nov 28 06:14:05 CET,Sun Nov 28 07:49:59 CET,0.0 1.544 2.158 2.587 2.977 3.341 3.669 3.975 4.518 4.757 4.992 5.258 5.647 5.836 6.165 6.457 6.715 6.844 7.101 7.347 7.69 7.91 8.139 8.479 8.795 9.102 9.394 9.668 10.038 10.399 10.741 11.157 11.541 11.91 12.357 12.857 13.336 13.861 14.446 15.071 15.707 16.421 17.263 18.111 19.099 20.203 21.433 22.726 24.161 25.713 27.345 28.322 28.565 28.459 28.202 27.902 27.57 27.195 26.822 26.398 25.984 25.637 25.328 25.01 24.684 24.376 24.053 23.763 23.507 23.239 22.952 22.714 22.458 22.183 21.975 21.754 21.532 21.292 21.029 20.842 20.65 20.344 20.107 19.85 19.728 19.489 19.23 18.964 18.808 18.472 18.283 18.095 17.899 17.482 17.256 17.005 16.724 16.357 15.851 15.122 13.271 -2 ,8038 ,KEBNE ,16724438,Sun Nov 28 06:14:05 CET,Sun Nov 28 07:51:21 CET,0.0 1.04 1.554 1.973 2.304 2.607 2.883 3.13 3.58 3.78 3.964 4.12 4.467 4.627 4.935 5.238 5.545 5.706 6.016 6.292 6.661 6.903 7.125 7.439 7.741 8.023 8.308 8.585 8.944 9.295 9.638 10.074 10.489 10.875 11.313 11.788 12.249 12.753 13.291 13.875 14.489 15.174 15.975 16.825 17.851 18.942 20.124 21.366 22.74 24.274 25.87 26.822 27.079 27.033 26.813 26.513 26.155 25.762 25.42 25.048 24.691 24.383 24.075 23.75 23.435 23.143 22.822 22.519 22.257 21.988 21.694 21.449 21.201 20.934 20.731 20.51 20.279 20.054 19.798 19.619 19.439 19.135 18.919 18.693 18.574 18.335 18.033 17.665 17.476 17.115 16.856 16.621 16.369 15.801 15.494 15.145 14.74 14.264 13.694 12.982 11.05 -3 ,31714 ,KEBNE ,16724439,Sun Nov 28 06:14:05 CET,Sun Nov 28 07:49:56 CET,0.0 1.207 1.724 2.118 2.435 2.715 2.969 3.201 3.641 3.836 4.023 4.225 4.591 4.788 5.162 5.474 5.753 5.889 6.152 6.401 6.762 6.995 7.219 7.546 7.851 8.146 8.442 8.736 9.109 9.454 9.788 10.193 10.599 10.991 11.436 11.936 12.4 12.917 13.485 14.075 14.711 15.407 16.192 17.003 17.928 18.95 20.136 21.414 22.866 24.458 26.094 27.091 27.339 27.227 26.945 26.591 26.248 25.913 25.576 25.181 24.84 24.532 24.207 23.882 23.578 23.313 23.023 22.745 22.49 22.221 21.937 21.66 21.376 21.109 20.9 20.689 20.46 20.205 19.936 19.755 19.567 19.259 19.056 18.849 18.729 18.476 18.236 17.983 17.837 17.52 17.357 17.182 16.988 16.526 16.279 16.034 15.742 15.396 14.931 14.204 12.368 -5 ,21753 ,KEBNE ,16724441,Sun Nov 28 06:15:06 CET,Sun Nov 28 07:51:58 CET,0.0 1.376 1.888 2.274 2.62 2.933 3.198 3.451 3.977 4.225 4.463 4.734 5.123 5.3 5.617 5.92 6.197 6.328 6.574 6.809 7.16 7.393 7.622 7.948 8.261 8.57 8.858 9.134 9.507 9.848 10.174 10.585 10.978 11.356 11.801 12.304 12.779 13.282 13.816 14.407 15.03 15.717 16.534 17.354 18.286 19.322 20.491 21.792 23.287 24.967 26.742 27.723 27.91 27.84 27.623 27.317 26.977 26.595 26.227 25.814 25.439 25.113 24.792 24.466 24.14 23.836 23.524 23.24 22.988 22.7 22.395 22.146 21.887 21.607 21.385 21.164 20.927 20.674 20.406 20.223 20.033 19.74 19.531 19.315 19.203 18.963 18.714 18.434 18.295 17.983 17.795 17.599 17.394 16.967 16.73 16.488 16.188 15.82 15.383 14.77 13.259 -6 ,14960 ,KEBNE ,16724442,Sun Nov 28 06:16:07 CET,Sun Nov 28 07:53:23 CET,0.0 1.722 2.349 2.86 3.292 3.693 4.062 4.378 4.893 5.122 5.35 5.6 5.993 6.197 6.569 6.941 7.287 7.443 7.759 8.067 8.516 8.782 9.01 9.335 9.637 9.921 10.21 10.49 10.836 11.177 11.502 11.903 12.301 12.674 13.106 13.6 14.067 14.566 15.126 15.72 16.314 17.022 17.873 18.689 19.614 20.642 21.84 23.18 24.666 26.251 27.958 28.961 29.174 29.098 28.889 28.6 28.216 27.833 27.526 27.165 26.798 26.433 26.087 25.771 25.459 25.173 24.873 24.583 24.327 24.052 23.754 23.5 23.248 22.993 22.788 22.577 22.358 22.13 21.879 21.696 21.5 21.18 20.958 20.716 20.589 20.337 20.063 19.774 19.629 19.312 19.151 18.987 18.808 18.398 18.168 17.914 17.637 17.316 16.938 16.406 14.938 -7 ,19931 ,KEBNE ,16724443,Sun Nov 28 06:16:11 CET,Sun Nov 28 07:44:49 CET,0.0 1.194 1.677 2.094 2.443 2.736 3.004 3.24 3.68 3.887 4.082 4.257 4.612 4.774 5.071 5.368 5.654 5.791 6.062 6.323 6.695 6.927 7.146 7.46 7.768 8.07 8.366 8.647 9.013 9.376 9.713 10.098 10.475 10.864 11.306 11.795 12.273 12.778 13.326 13.926 14.555 15.258 16.05 16.832 17.758 18.751 19.865 21.125 22.566 24.136 25.711 26.54 26.758 26.692 26.426 26.103 25.754 25.376 25.026 24.649 24.294 23.971 23.652 23.329 23.021 22.729 22.401 22.095 21.828 21.56 21.28 21.037 20.774 20.498 20.29 20.076 19.842 19.593 19.342 19.154 18.945 18.613 18.396 18.16 18.033 17.789 17.518 17.205 17.039 16.702 16.505 16.313 16.116 15.685 15.448 15.204 14.927 14.547 14.091 13.515 11.972 -8 ,9885 ,KEBNE ,16724444,Sun Nov 28 06:16:11 CET,Sun Nov 28 07:44:56 CET,0.0 1.369 1.976 2.491 2.926 3.295 3.625 3.923 4.473 4.72 4.934 5.108 5.452 5.612 5.912 6.19 6.463 6.599 6.861 7.115 7.475 7.71 7.945 8.277 8.592 8.893 9.176 9.447 9.803 10.144 10.462 10.861 11.251 11.631 12.082 12.575 13.032 13.537 14.09 14.691 15.326 16.022 16.85 17.661 18.568 19.603 20.793 22.058 23.485 25.097 26.663 27.565 27.787 27.681 27.445 27.127 26.805 26.465 26.124 25.761 25.405 25.061 24.71 24.373 24.061 23.745 23.407 23.103 22.842 22.564 22.278 22.05 21.803 21.533 21.299 21.051 20.819 20.581 20.324 20.131 19.932 19.627 19.399 19.165 19.052 18.812 18.549 18.277 18.13 17.814 17.653 17.467 17.267 16.831 16.59 16.336 16.04 15.709 15.303 14.619 12.476 -10 ,8997 ,KEBNE ,16724446,Sun Nov 28 06:18:11 CET,Sun Nov 28 07:53:46 CET,0.0 1.672 2.212 2.59 2.918 3.218 3.486 3.718 4.13 4.32 4.5 4.669 5.017 5.18 5.489 5.778 6.06 6.198 6.461 6.716 7.092 7.339 7.578 7.905 8.208 8.494 8.772 9.042 9.386 9.726 10.066 10.5 10.91 11.28 11.691 12.16 12.621 13.132 13.691 14.291 14.931 15.636 16.442 17.243 18.196 19.258 20.466 21.829 23.325 24.896 26.496 27.425 27.671 27.636 27.413 27.098 26.747 26.384 26.037 25.645 25.307 24.993 24.68 24.347 24.016 23.723 23.403 23.107 22.86 22.611 22.34 22.099 21.834 21.546 21.324 21.089 20.835 20.574 20.302 20.122 19.939 19.631 19.413 19.188 19.067 18.816 18.557 18.273 18.109 17.756 17.502 17.291 17.071 16.574 16.295 15.99 15.654 15.234 14.735 14.082 12.223 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt deleted file mode 100644 index fd4dd5a0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20292 ,KEBNE ,16724447,Sun Nov 28 06:18:11 CET,Sun Nov 28 07:54:17 CET,0.0 1.149 1.696 2.112 2.442 2.737 3.004 3.247 3.674 3.869 4.06 4.261 4.621 4.781 5.082 5.364 5.615 5.735 5.977 6.218 6.574 6.809 7.053 7.422 7.769 8.098 8.422 8.706 9.025 9.344 9.658 10.027 10.362 10.68 11.068 11.511 11.917 12.329 12.763 13.222 13.708 14.25 14.864 15.467 16.133 16.81 17.57 18.383 19.122 19.6 19.581 18.87 17.846 16.73 15.713 14.737 13.83 12.993 12.275 11.572 10.954 10.389 9.843 9.307 8.779 8.3 7.822 7.402 7.035 6.655 6.265 5.933 5.588 5.231 4.95 4.667 4.375 4.071 3.763 3.55 3.322 2.961 2.719 2.453 2.309 2.011 1.709 1.382 1.205 0.841 0.646 0.447 0.24 -0.233 -0.497 -0.783 -1.088 -1.423 -1.792 -2.276 -3.577 -2 ,31189 ,KEBNE ,16724448,Sun Nov 28 06:18:10 CET,Sun Nov 28 07:54:34 CET,0.0 1.409 1.995 2.411 2.742 3.03 3.286 3.518 3.953 4.158 4.344 4.515 4.866 5.026 5.337 5.62 5.889 6.025 6.275 6.502 6.832 7.044 7.249 7.565 7.854 8.128 8.407 8.675 9.024 9.337 9.627 9.971 10.289 10.612 10.999 11.439 11.858 12.305 12.774 13.259 13.756 14.307 14.959 15.604 16.254 16.891 17.578 18.278 18.974 19.575 19.678 18.917 17.891 16.805 15.747 14.724 13.836 13.018 12.309 11.58 10.919 10.344 9.807 9.282 8.773 8.311 7.839 7.416 7.053 6.687 6.306 5.981 5.643 5.293 5.012 4.721 4.423 4.105 3.793 3.578 3.344 2.981 2.731 2.471 2.338 2.063 1.772 1.456 1.286 0.927 0.741 0.533 0.309 -0.131 -0.371 -0.633 -0.935 -1.274 -1.652 -2.147 -3.271 -3 ,4279 ,KEBNE ,16724449,Sun Nov 28 06:19:15 CET,Sun Nov 28 07:56:49 CET,0.0 1.423 2.162 2.716 3.149 3.511 3.831 4.124 4.639 4.88 5.111 5.388 5.785 5.986 6.357 6.716 7.062 7.224 7.541 7.821 8.166 8.382 8.592 8.896 9.199 9.48 9.74 9.994 10.313 10.607 10.9 11.26 11.619 11.963 12.348 12.77 13.155 13.571 14.032 14.516 15.018 15.571 16.18 16.762 17.413 18.124 18.892 19.645 20.347 20.884 20.951 20.157 19.106 18.08 17.025 15.994 15.082 14.232 13.505 12.782 12.155 11.587 11.026 10.494 10.005 9.544 9.04 8.59 8.226 7.855 7.457 7.094 6.716 6.352 6.072 5.787 5.493 5.182 4.855 4.632 4.403 4.038 3.789 3.542 3.41 3.117 2.813 2.497 2.33 1.967 1.785 1.595 1.383 0.928 0.687 0.423 0.127 -0.19 -0.551 -1.045 -2.344 -4 ,30167 ,KEBNE ,16724450,Sun Nov 28 06:19:16 CET,Sun Nov 28 07:55:27 CET,0.0 1.193 1.738 2.166 2.498 2.782 3.041 3.28 3.716 3.911 4.086 4.228 4.57 4.728 5.036 5.326 5.598 5.73 5.989 6.226 6.578 6.807 7.017 7.327 7.625 7.905 8.17 8.421 8.759 9.083 9.377 9.732 10.078 10.41 10.784 11.192 11.578 11.992 12.445 12.932 13.435 13.989 14.616 15.233 15.904 16.609 17.33 18.011 18.712 19.247 19.231 18.46 17.41 16.323 15.231 14.203 13.349 12.562 11.853 11.102 10.448 9.888 9.333 8.801 8.314 7.867 7.416 7.012 6.653 6.279 5.87 5.506 5.143 4.774 4.462 4.132 3.779 3.413 3.052 2.798 2.521 2.085 1.782 1.468 1.309 0.981 0.673 0.366 0.19 -0.183 -0.382 -0.579 -0.779 -1.209 -1.456 -1.724 -2.021 -2.371 -2.777 -3.352 -4.636 -5 ,9423 ,KEBNE ,16724451,Sun Nov 28 06:19:16 CET,Sun Nov 28 07:56:51 CET,0.0 1.534 2.289 2.819 3.189 3.476 3.73 3.953 4.391 4.588 4.77 4.955 5.323 5.516 5.899 6.244 6.542 6.668 6.903 7.142 7.489 7.708 7.924 8.239 8.563 8.866 9.13 9.384 9.725 10.044 10.346 10.709 11.062 11.39 11.76 12.203 12.609 13.035 13.491 13.958 14.45 15.02 15.639 16.226 16.905 17.591 18.308 19.045 19.76 20.301 20.354 19.587 18.534 17.445 16.415 15.457 14.584 13.776 13.054 12.302 11.656 11.082 10.537 10.008 9.502 9.05 8.583 8.163 7.792 7.41 7.017 6.69 6.344 5.974 5.695 5.414 5.121 4.812 4.503 4.275 4.025 3.64 3.38 3.126 2.993 2.712 2.41 2.083 1.906 1.534 1.311 1.103 0.899 0.463 0.217 -0.053 -0.371 -0.776 -1.279 -1.933 -3.37 -6 ,18064 ,KEBNE ,16724452,Sun Nov 28 06:19:16 CET,Sun Nov 28 07:55:35 CET,0.0 1.357 1.884 2.234 2.556 2.863 3.121 3.358 3.796 3.988 4.181 4.365 4.718 4.887 5.201 5.496 5.77 5.898 6.144 6.381 6.712 6.929 7.151 7.466 7.758 8.041 8.308 8.565 8.897 9.202 9.496 9.86 10.209 10.525 10.885 11.297 11.68 12.091 12.545 13.03 13.522 14.079 14.724 15.313 15.953 16.658 17.445 18.228 18.873 19.362 19.395 18.594 17.541 16.471 15.448 14.464 13.585 12.772 12.037 11.277 10.633 10.066 9.507 8.971 8.471 8.015 7.553 7.131 6.755 6.371 5.974 5.637 5.29 4.944 4.675 4.404 4.114 3.791 3.459 3.24 3.013 2.652 2.396 2.128 1.996 1.722 1.425 1.115 0.941 0.573 0.377 0.171 -0.041 -0.475 -0.711 -0.983 -1.286 -1.648 -2.075 -2.59 -3.906 -7 ,19120 ,KEBNE ,16724453,Sun Nov 28 06:19:15 CET,Sun Nov 28 07:55:22 CET,0.0 1.931 2.565 3.067 3.499 3.863 4.155 4.394 4.828 5.03 5.227 5.401 5.744 5.905 6.23 6.523 6.787 6.918 7.168 7.408 7.772 8.008 8.226 8.525 8.804 9.076 9.35 9.619 9.951 10.265 10.581 10.957 11.308 11.638 11.997 12.397 12.795 13.233 13.684 14.168 14.663 15.195 15.791 16.397 17.131 17.877 18.604 19.3 19.963 20.454 20.445 19.57 18.493 17.483 16.49 15.506 14.609 13.779 13.033 12.296 11.669 11.092 10.532 10.011 9.525 9.076 8.601 8.181 7.829 7.452 7.042 6.702 6.355 6.0 5.725 5.439 5.137 4.828 4.503 4.271 4.044 3.691 3.442 3.188 3.049 2.748 2.449 2.11 1.921 1.557 1.388 1.189 0.987 0.578 0.344 0.084 -0.201 -0.541 -0.976 -1.559 -2.852 -8 ,18018 ,KEBNE ,16724454,Sun Nov 28 06:19:17 CET,Sun Nov 28 07:49:05 CET,0.0 1.22 1.778 2.236 2.581 2.882 3.151 3.379 3.809 4.005 4.192 4.377 4.725 4.886 5.184 5.472 5.746 5.876 6.125 6.363 6.721 6.951 7.166 7.476 7.773 8.05 8.31 8.562 8.901 9.216 9.506 9.858 10.204 10.528 10.895 11.325 11.723 12.143 12.586 13.065 13.545 14.06 14.678 15.287 15.964 16.678 17.402 18.105 18.851 19.467 19.498 18.646 17.576 16.544 15.604 14.664 13.767 12.956 12.272 11.565 10.939 10.36 9.794 9.259 8.755 8.29 7.808 7.392 7.022 6.643 6.267 5.947 5.613 5.255 4.969 4.678 4.379 4.081 3.776 3.55 3.319 2.963 2.723 2.471 2.332 2.042 1.739 1.42 1.254 0.896 0.692 0.49 0.286 -0.14 -0.382 -0.678 -1.055 -1.496 -2.008 -2.662 -4.209 -9 ,813 ,KEBNE ,16724455,Sun Nov 28 06:20:14 CET,Sun Nov 28 07:57:35 CET,0.0 1.246 1.798 2.212 2.547 2.841 3.104 3.337 3.734 3.912 4.094 4.281 4.631 4.796 5.108 5.413 5.688 5.817 6.076 6.312 6.651 6.878 7.091 7.396 7.688 7.964 8.222 8.473 8.798 9.108 9.407 9.76 10.101 10.434 10.811 11.223 11.619 12.051 12.506 12.976 13.463 13.988 14.568 15.168 15.874 16.59 17.358 18.119 18.801 19.313 19.359 18.604 17.513 16.428 15.428 14.426 13.498 12.698 11.996 11.262 10.606 10.011 9.468 8.959 8.476 8.029 7.553 7.12 6.748 6.365 5.962 5.632 5.303 4.959 4.675 4.376 4.069 3.755 3.429 3.205 2.98 2.605 2.343 2.071 1.929 1.65 1.357 1.046 0.88 0.528 0.362 0.172 -0.025 -0.473 -0.722 -0.981 -1.281 -1.618 -1.971 -2.454 -3.718 -10 ,6548 ,KEBNE ,16724456,Sun Nov 28 06:20:14 CET,Sun Nov 28 07:57:16 CET,0.0 1.191 1.727 2.11 2.446 2.741 2.99 3.221 3.658 3.859 4.041 4.209 4.559 4.716 5.004 5.281 5.548 5.674 5.911 6.137 6.484 6.707 6.912 7.224 7.526 7.8 8.064 8.317 8.633 8.947 9.25 9.598 9.921 10.239 10.601 11.01 11.42 11.858 12.32 12.791 13.275 13.823 14.455 15.053 15.719 16.438 17.188 17.888 18.562 19.13 19.087 18.283 17.289 16.199 15.141 14.178 13.331 12.514 11.788 11.037 10.375 9.788 9.228 8.704 8.208 7.751 7.265 6.849 6.497 6.115 5.724 5.406 5.044 4.653 4.369 4.084 3.776 3.453 3.124 2.887 2.653 2.306 2.059 1.802 1.666 1.387 1.084 0.754 0.586 0.219 0.016 -0.185 -0.396 -0.883 -1.143 -1.39 -1.664 -2.029 -2.491 -3.042 -4.264 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt deleted file mode 100644 index 463ccda9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22005 ,KEBNE ,16724457,Sun Nov 28 06:20:14 CET,Sun Nov 28 07:57:54 CET,0.0 1.463 2.08 2.576 2.948 3.236 3.503 3.76 4.231 4.449 4.653 4.849 5.211 5.384 5.718 6.055 6.367 6.515 6.811 7.092 7.483 7.736 7.999 8.37 8.714 9.053 9.378 9.705 10.146 10.559 10.946 11.431 11.906 12.361 12.901 13.509 14.086 14.729 15.422 16.17 16.979 17.882 18.941 19.993 21.245 22.709 24.401 26.263 28.394 30.982 34.144 36.669 37.978 38.724 39.133 39.315 39.383 39.365 39.29 39.164 39.043 38.932 38.784 38.608 38.429 38.269 38.106 37.928 37.743 37.548 37.346 37.18 36.998 36.806 36.657 36.506 36.342 36.159 35.971 35.831 35.661 35.395 35.215 35.027 34.931 34.725 34.494 34.235 34.103 33.828 33.696 33.531 33.359 32.973 32.773 32.577 32.331 32.037 31.678 31.157 29.834 -2 ,32305 ,KEBNE ,16724458,Sun Nov 28 06:21:16 CET,Sun Nov 28 07:58:53 CET,0.0 1.216 1.846 2.299 2.651 2.965 3.249 3.502 3.963 4.194 4.412 4.624 5.009 5.204 5.559 5.888 6.193 6.345 6.642 6.912 7.292 7.545 7.787 8.146 8.511 8.871 9.217 9.549 9.989 10.43 10.856 11.367 11.868 12.35 12.89 13.492 14.08 14.741 15.457 16.212 17.014 17.932 18.989 20.055 21.323 22.724 24.347 26.228 28.464 31.08 34.113 36.489 37.8 38.495 38.864 39.036 39.065 39.039 38.972 38.856 38.712 38.572 38.439 38.262 38.08 37.909 37.711 37.533 37.379 37.211 37.024 36.855 36.667 36.471 36.314 36.145 35.974 35.778 35.564 35.419 35.267 35.025 34.848 34.654 34.554 34.359 34.152 33.916 33.787 33.497 33.347 33.192 33.035 32.682 32.46 32.213 31.955 31.644 31.239 30.684 29.478 -3 ,20714 ,KEBNE ,16724459,Sun Nov 28 06:21:16 CET,Sun Nov 28 07:59:17 CET,0.0 1.3 1.835 2.203 2.544 2.866 3.156 3.421 3.89 4.105 4.307 4.504 4.86 5.035 5.385 5.711 6.02 6.177 6.479 6.764 7.179 7.447 7.708 8.085 8.433 8.765 9.098 9.415 9.82 10.226 10.65 11.17 11.649 12.105 12.645 13.254 13.819 14.445 15.137 15.871 16.647 17.543 18.618 19.707 21.006 22.466 24.142 26.01 28.16 30.776 34.013 36.482 37.731 38.437 38.822 38.986 38.99 38.944 38.855 38.733 38.602 38.434 38.275 38.125 37.973 37.821 37.618 37.409 37.227 37.041 36.844 36.669 36.484 36.294 36.139 35.972 35.797 35.607 35.4 35.254 35.096 34.845 34.675 34.499 34.411 34.226 34.015 33.757 33.62 33.335 33.197 33.04 32.871 32.496 32.275 32.032 31.753 31.438 31.072 30.559 29.368 -4 ,10691 ,KEBNE ,16724460,Sun Nov 28 06:21:16 CET,Sun Nov 28 07:58:54 CET,0.0 1.353 1.909 2.354 2.755 3.095 3.384 3.657 4.148 4.373 4.593 4.809 5.183 5.364 5.69 6.002 6.303 6.457 6.761 7.05 7.481 7.75 8.014 8.405 8.773 9.123 9.47 9.798 10.223 10.646 11.046 11.516 11.97 12.418 12.943 13.537 14.097 14.715 15.401 16.113 16.869 17.756 18.82 19.912 21.157 22.581 24.275 26.157 28.366 30.966 34.072 36.469 37.691 38.369 38.751 38.93 38.969 38.965 38.915 38.816 38.685 38.525 38.346 38.119 37.908 37.748 37.574 37.403 37.244 37.076 36.887 36.713 36.526 36.321 36.161 36.001 35.802 35.582 35.365 35.22 35.073 34.831 34.664 34.489 34.395 34.206 34.006 33.773 33.646 33.373 33.258 33.109 32.943 32.587 32.391 32.147 31.854 31.528 31.13 30.585 29.234 -6 ,32194 ,KEBNE ,16724462,Sun Nov 28 06:21:16 CET,Sun Nov 28 07:59:17 CET,0.0 1.182 1.677 2.074 2.45 2.786 3.069 3.343 3.846 4.072 4.285 4.505 4.878 5.063 5.418 5.75 6.05 6.194 6.487 6.779 7.218 7.49 7.761 8.189 8.607 9.012 9.416 9.818 10.322 10.798 11.26 11.781 12.242 12.686 13.218 13.819 14.387 15.02 15.717 16.484 17.293 18.18 19.221 20.286 21.564 23.02 24.689 26.538 28.769 31.468 34.586 36.959 38.199 38.873 39.207 39.362 39.415 39.398 39.327 39.217 39.091 38.933 38.774 38.603 38.415 38.255 38.085 37.912 37.747 37.575 37.389 37.212 37.024 36.832 36.672 36.512 36.357 36.178 35.979 35.831 35.674 35.436 35.266 35.084 34.988 34.782 34.549 34.292 34.159 33.874 33.756 33.612 33.446 33.09 32.895 32.656 32.374 32.017 31.567 30.904 29.17 -7 ,23118 ,KEBNE ,16724463,Sun Nov 28 06:21:16 CET,Sun Nov 28 07:58:48 CET,0.0 1.312 1.854 2.308 2.705 3.081 3.443 3.77 4.351 4.625 4.891 5.182 5.558 5.738 6.072 6.385 6.695 6.844 7.136 7.412 7.805 8.06 8.304 8.665 9.022 9.362 9.7 10.019 10.424 10.835 11.243 11.728 12.199 12.661 13.196 13.789 14.361 14.996 15.68 16.439 17.237 18.129 19.178 20.236 21.485 22.877 24.551 26.5 28.732 31.33 34.549 37.193 38.555 39.244 39.599 39.834 39.938 39.916 39.852 39.738 39.624 39.503 39.349 39.181 38.993 38.802 38.61 38.442 38.279 38.094 37.904 37.736 37.551 37.35 37.187 37.025 36.854 36.673 36.451 36.262 36.062 35.749 35.53 35.3 35.178 34.947 34.714 34.479 34.361 34.078 33.945 33.798 33.631 33.239 33.04 32.836 32.576 32.236 31.796 31.193 29.794 -8 ,24890 ,KEBNE ,16724464,Sun Nov 28 06:22:18 CET,Sun Nov 28 07:58:44 CET,0.0 1.401 2.045 2.504 2.852 3.168 3.456 3.718 4.191 4.415 4.626 4.845 5.217 5.393 5.729 6.057 6.367 6.522 6.828 7.124 7.556 7.825 8.086 8.454 8.821 9.206 9.576 9.917 10.36 10.781 11.166 11.638 12.112 12.571 13.088 13.675 14.25 14.873 15.542 16.26 17.034 17.898 18.916 19.968 21.231 22.68 24.327 26.142 28.269 30.815 33.9 36.277 37.464 38.109 38.466 38.637 38.685 38.652 38.575 38.454 38.32 38.194 38.057 37.91 37.749 37.577 37.377 37.196 37.037 36.851 36.646 36.475 36.296 36.089 35.889 35.673 35.452 35.199 34.924 34.745 34.582 34.337 34.164 33.987 33.893 33.657 33.369 33.046 32.874 32.548 32.339 32.133 31.921 31.441 31.183 30.903 30.539 30.127 29.63 28.95 27.332 -9 ,7550 ,KEBNE ,16724465,Sun Nov 28 06:22:18 CET,Sun Nov 28 07:59:41 CET,0.0 1.265 1.807 2.212 2.557 2.863 3.136 3.392 3.864 4.083 4.294 4.515 4.885 5.058 5.394 5.716 6.008 6.155 6.443 6.72 7.131 7.398 7.663 8.028 8.371 8.724 9.078 9.411 9.838 10.259 10.666 11.145 11.616 12.103 12.675 13.28 13.843 14.493 15.217 15.994 16.817 17.731 18.802 19.882 21.153 22.612 24.266 26.106 28.27 30.894 33.981 36.281 37.492 38.163 38.475 38.585 38.624 38.606 38.531 38.388 38.254 38.14 37.997 37.833 37.663 37.491 37.306 37.14 36.991 36.819 36.612 36.436 36.255 36.062 35.907 35.736 35.55 35.35 35.129 34.982 34.837 34.594 34.418 34.233 34.139 33.931 33.709 33.482 33.36 33.075 32.932 32.778 32.62 32.267 32.05 31.82 31.559 31.23 30.822 30.295 29.026 -10 ,22269 ,KEBNE ,16724466,Sun Nov 28 06:22:18 CET,Sun Nov 28 07:58:29 CET,0.0 1.631 2.263 2.761 3.196 3.594 3.92 4.182 4.645 4.86 5.059 5.243 5.601 5.776 6.127 6.456 6.781 6.938 7.234 7.527 7.941 8.202 8.454 8.824 9.193 9.554 9.896 10.229 10.665 11.081 11.487 11.973 12.449 12.901 13.414 14.017 14.608 15.238 15.923 16.678 17.48 18.395 19.476 20.565 21.834 23.254 24.872 26.728 28.938 31.434 34.425 36.847 38.121 38.781 39.163 39.41 39.514 39.519 39.439 39.308 39.174 39.007 38.832 38.669 38.506 38.338 38.15 37.949 37.723 37.495 37.26 37.06 36.873 36.667 36.472 36.244 36.013 35.792 35.584 35.447 35.303 35.065 34.888 34.698 34.594 34.378 34.166 33.939 33.811 33.534 33.402 33.238 33.065 32.659 32.439 32.221 31.963 31.654 31.262 30.666 29.29 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt deleted file mode 100644 index fb7cd001..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4996 ,KEBNE ,16724467,Sun Nov 28 06:22:17 CET,Sun Nov 28 08:00:03 CET,0.0 1.137 1.706 2.136 2.477 2.795 3.104 3.387 3.867 4.088 4.311 4.556 4.943 5.128 5.489 5.839 6.168 6.333 6.644 6.94 7.367 7.646 7.909 8.29 8.675 9.055 9.413 9.755 10.21 10.663 11.106 11.632 12.136 12.621 13.2 13.894 14.549 15.238 15.978 16.778 17.631 18.593 19.735 20.902 22.293 23.867 25.709 27.817 30.297 33.204 36.684 39.45 40.843 41.627 42.128 42.399 42.462 42.455 42.431 42.35 42.232 42.097 41.941 41.798 41.667 41.523 41.343 41.162 41.002 40.821 40.631 40.473 40.303 40.117 39.964 39.798 39.624 39.444 39.24 39.093 38.939 38.689 38.507 38.316 38.213 37.989 37.763 37.517 37.39 37.122 37.0 36.85 36.675 36.293 36.091 35.852 35.562 35.219 34.845 34.333 33.104 -2 ,16711 ,KEBNE ,16724468,Sun Nov 28 06:22:18 CET,Sun Nov 28 08:00:02 CET,0.0 1.333 1.911 2.347 2.707 3.04 3.344 3.611 4.077 4.292 4.495 4.683 5.06 5.247 5.599 5.94 6.27 6.43 6.729 7.017 7.441 7.717 7.994 8.394 8.784 9.18 9.553 9.901 10.363 10.811 11.237 11.753 12.264 12.764 13.342 13.988 14.609 15.299 16.052 16.871 17.727 18.696 19.858 21.049 22.453 24.017 25.838 27.909 30.294 33.116 36.542 39.256 40.755 41.627 42.09 42.33 42.435 42.448 42.41 42.337 42.242 42.12 41.95 41.766 41.598 41.439 41.267 41.08 40.901 40.718 40.517 40.351 40.178 39.985 39.832 39.669 39.497 39.316 39.119 38.973 38.811 38.566 38.4 38.215 38.11 37.887 37.669 37.443 37.318 37.04 36.912 36.755 36.582 36.216 36.001 35.737 35.443 35.135 34.784 34.286 33.099 -3 ,2512 ,KEBNE ,16724469,Sun Nov 28 06:22:17 CET,Sun Nov 28 07:59:49 CET,0.0 1.404 1.946 2.388 2.766 3.089 3.367 3.64 4.164 4.397 4.611 4.824 5.196 5.38 5.749 6.098 6.423 6.582 6.909 7.256 7.765 8.081 8.375 8.772 9.145 9.521 9.89 10.246 10.698 11.14 11.588 12.123 12.628 13.111 13.668 14.308 14.938 15.621 16.346 17.145 18.014 19.002 20.14 21.316 22.731 24.322 26.198 28.28 30.68 33.533 36.926 39.622 41.121 41.954 42.43 42.702 42.769 42.746 42.712 42.63 42.504 42.339 42.157 41.99 41.832 41.668 41.477 41.293 41.113 40.914 40.708 40.543 40.363 40.167 40.022 39.861 39.677 39.487 39.285 39.141 38.987 38.735 38.563 38.384 38.293 38.082 37.848 37.605 37.473 37.187 37.049 36.898 36.731 36.348 36.129 35.865 35.569 35.239 34.844 34.298 32.899 -4 ,4641 ,KEBNE ,16724470,Sun Nov 28 06:22:17 CET,Sun Nov 28 07:58:26 CET,0.0 1.284 1.816 2.214 2.543 2.851 3.142 3.413 3.924 4.176 4.4 4.609 4.982 5.155 5.493 5.829 6.141 6.294 6.598 6.902 7.346 7.631 7.909 8.297 8.666 9.027 9.369 9.704 10.157 10.601 11.021 11.541 12.045 12.523 13.101 13.752 14.357 15.05 15.837 16.641 17.463 18.435 19.613 20.818 22.229 23.793 25.6 27.647 30.054 32.903 36.338 39.082 40.542 41.364 41.815 42.103 42.267 42.288 42.205 42.073 41.923 41.771 41.626 41.467 41.308 41.156 40.971 40.771 40.592 40.418 40.231 40.052 39.869 39.669 39.493 39.327 39.162 38.97 38.76 38.614 38.467 38.239 38.059 37.865 37.766 37.561 37.344 37.116 36.99 36.712 36.576 36.411 36.235 35.838 35.616 35.393 35.158 34.849 34.475 34.041 32.906 -5 ,31699 ,KEBNE ,16724471,Sun Nov 28 06:23:19 CET,Sun Nov 28 08:00:22 CET,0.0 1.25 1.846 2.275 2.627 2.937 3.213 3.466 3.936 4.158 4.37 4.595 4.976 5.175 5.558 5.905 6.242 6.406 6.717 7.007 7.432 7.719 7.99 8.38 8.759 9.131 9.5 9.861 10.33 10.782 11.215 11.731 12.243 12.741 13.314 13.973 14.615 15.302 16.063 16.874 17.722 18.701 19.851 21.028 22.44 24.027 25.848 27.9 30.315 33.233 36.831 39.614 41.084 41.896 42.364 42.613 42.704 42.719 42.67 42.587 42.483 42.368 42.24 42.091 41.933 41.779 41.601 41.436 41.286 41.116 40.929 40.762 40.579 40.387 40.233 40.069 39.891 39.679 39.45 39.299 39.145 38.89 38.716 38.542 38.445 38.232 37.999 37.743 37.614 37.336 37.198 37.037 36.871 36.499 36.277 36.024 35.759 35.467 35.127 34.64 33.301 -6 ,31511 ,KEBNE ,16724472,Sun Nov 28 06:23:18 CET,Sun Nov 28 08:01:16 CET,0.0 1.202 1.746 2.187 2.538 2.856 3.156 3.435 3.928 4.153 4.372 4.598 4.976 5.161 5.516 5.868 6.201 6.357 6.67 6.986 7.436 7.715 8.0 8.431 8.828 9.191 9.549 9.904 10.348 10.775 11.198 11.708 12.202 12.679 13.24 13.887 14.519 15.225 15.976 16.788 17.663 18.638 19.787 20.982 22.403 23.978 25.849 27.973 30.39 33.282 36.815 39.623 41.136 42.009 42.511 42.782 42.897 42.9 42.845 42.747 42.63 42.513 42.385 42.238 42.085 41.938 41.772 41.594 41.421 41.242 41.049 40.883 40.701 40.504 40.35 40.183 40.015 39.834 39.634 39.494 39.336 39.069 38.889 38.696 38.589 38.381 38.162 37.917 37.787 37.5 37.375 37.217 37.045 36.657 36.437 36.213 35.954 35.638 35.275 34.751 33.275 -7 ,15375 ,KEBNE ,16724473,Sun Nov 28 06:23:18 CET,Sun Nov 28 08:00:45 CET,0.0 1.41 1.952 2.383 2.741 3.048 3.317 3.573 4.098 4.349 4.574 4.789 5.162 5.342 5.694 6.039 6.37 6.531 6.838 7.127 7.551 7.839 8.129 8.536 8.914 9.289 9.658 10.016 10.482 10.929 11.366 11.891 12.387 12.874 13.443 14.087 14.693 15.369 16.121 16.918 17.772 18.757 19.906 21.074 22.452 23.979 25.783 27.859 30.322 33.213 36.678 39.44 40.966 41.784 42.251 42.531 42.66 42.708 42.672 42.587 42.467 42.324 42.18 42.012 41.836 41.672 41.478 41.286 41.122 40.962 40.787 40.628 40.452 40.249 40.082 39.913 39.739 39.552 39.357 39.213 39.049 38.804 38.641 38.46 38.362 38.165 37.952 37.713 37.577 37.291 37.113 36.911 36.704 36.252 35.986 35.687 35.348 34.956 34.513 33.92 32.177 -8 ,22768 ,KEBNE ,16724474,Sun Nov 28 06:24:20 CET,Sun Nov 28 08:01:56 CET,0.0 1.436 2.026 2.463 2.834 3.142 3.425 3.691 4.183 4.408 4.613 4.819 5.199 5.389 5.752 6.116 6.449 6.604 6.905 7.201 7.654 7.942 8.213 8.606 8.988 9.356 9.718 10.073 10.522 10.97 11.402 11.924 12.427 12.909 13.481 14.127 14.743 15.433 16.19 17.002 17.851 18.82 19.992 21.17 22.594 24.221 26.015 28.031 30.424 33.345 36.879 39.665 41.169 42.052 42.555 42.803 42.92 42.964 42.954 42.884 42.774 42.65 42.518 42.362 42.196 42.03 41.829 41.636 41.477 41.299 41.098 40.939 40.773 40.576 40.404 40.231 40.052 39.856 39.65 39.513 39.367 39.117 38.933 38.747 38.654 38.445 38.223 37.983 37.847 37.549 37.344 37.137 36.918 36.45 36.183 35.889 35.553 35.164 34.683 34.036 32.462 -9 ,25975 ,KEBNE ,16724475,Sun Nov 28 06:24:20 CET,Sun Nov 28 08:01:50 CET,0.0 1.54 2.085 2.484 2.822 3.127 3.414 3.674 4.18 4.42 4.64 4.867 5.235 5.422 5.8 6.146 6.466 6.623 6.934 7.235 7.681 7.97 8.249 8.656 9.038 9.41 9.777 10.137 10.603 11.03 11.441 11.946 12.44 12.927 13.486 14.106 14.726 15.434 16.202 17.019 17.886 18.911 20.09 21.241 22.616 24.156 25.988 28.11 30.625 33.593 37.102 39.809 41.337 42.263 42.801 43.106 43.218 43.227 43.19 43.112 42.994 42.845 42.689 42.537 42.391 42.239 42.034 41.838 41.667 41.478 41.27 41.103 40.935 40.746 40.593 40.431 40.257 40.069 39.86 39.719 39.574 39.328 39.152 38.971 38.875 38.669 38.437 38.185 38.053 37.768 37.605 37.402 37.168 36.639 36.356 36.051 35.714 35.324 34.826 34.148 32.806 -10 ,32580 ,KEBNE ,16724476,Sun Nov 28 06:24:20 CET,Sun Nov 28 08:03:24 CET,0.0 1.351 1.888 2.303 2.672 2.996 3.286 3.564 4.076 4.313 4.536 4.765 5.142 5.332 5.711 6.057 6.372 6.535 6.87 7.172 7.584 7.869 8.147 8.545 8.929 9.291 9.653 9.999 10.435 10.879 11.311 11.823 12.328 12.831 13.4 14.032 14.668 15.37 16.101 16.896 17.754 18.737 19.888 21.034 22.367 23.876 25.671 27.724 30.161 33.066 36.472 39.267 40.792 41.667 42.143 42.392 42.519 42.532 42.476 42.373 42.282 42.184 42.039 41.878 41.711 41.534 41.338 41.164 41.01 40.843 40.651 40.483 40.3 40.101 39.944 39.773 39.595 39.394 39.184 39.04 38.887 38.656 38.487 38.292 38.195 37.993 37.774 37.54 37.411 37.13 36.992 36.826 36.65 36.252 36.022 35.777 35.526 35.227 34.829 34.304 33.105 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt deleted file mode 100644 index f356d333..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15496 ,KEBNE ,16724477,Sun Nov 28 06:25:21 CET,Sun Nov 28 08:01:11 CET,0.0 1.263 1.759 2.102 2.386 2.635 2.873 3.103 3.489 3.657 3.814 3.953 4.227 4.344 4.571 4.786 5.002 5.109 5.303 5.483 5.748 5.918 6.078 6.288 6.474 6.651 6.818 6.982 7.183 7.377 7.577 7.813 8.02 8.216 8.437 8.669 8.874 9.08 9.314 9.55 9.776 10.023 10.294 10.518 10.729 10.913 11.007 10.986 10.816 10.342 9.143 7.399 5.857 4.481 3.257 2.15 1.192 0.336 -0.423 -1.193 -1.849 -2.408 -2.94 -3.461 -3.951 -4.407 -4.885 -5.311 -5.677 -6.049 -6.424 -6.733 -7.058 -7.399 -7.675 -7.972 -8.272 -8.573 -8.887 -9.111 -9.334 -9.683 -9.94 -10.212 -10.351 -10.635 -10.922 -11.23 -11.393 -11.723 -11.917 -12.112 -12.327 -12.827 -13.109 -13.421 -13.76 -14.122 -14.553 -15.124 -16.44 -2 ,29444 ,KEBNE ,16724478,Sun Nov 28 06:25:26 CET,Sun Nov 28 08:03:55 CET,0.0 1.314 1.855 2.263 2.591 2.874 3.123 3.325 3.657 3.826 3.993 4.153 4.446 4.574 4.816 5.029 5.23 5.333 5.528 5.698 5.936 6.095 6.24 6.442 6.641 6.829 7.009 7.185 7.408 7.616 7.805 8.018 8.215 8.406 8.628 8.858 9.072 9.302 9.522 9.74 9.97 10.223 10.475 10.696 10.91 11.105 11.235 11.229 11.046 10.564 9.394 7.698 6.181 4.848 3.705 2.639 1.664 0.775 0.026 -0.721 -1.384 -1.979 -2.539 -3.059 -3.538 -3.973 -4.416 -4.825 -5.197 -5.581 -5.982 -6.317 -6.646 -6.987 -7.264 -7.547 -7.835 -8.131 -8.446 -8.668 -8.903 -9.323 -9.64 -9.957 -10.123 -10.467 -10.787 -11.092 -11.251 -11.588 -11.808 -12.009 -12.231 -12.769 -13.105 -13.45 -13.808 -14.242 -14.704 -15.302 -16.876 -3 ,9378 ,KEBNE ,16724479,Sun Nov 28 06:27:24 CET,Sun Nov 28 08:03:07 CET,0.0 1.732 2.4 2.865 3.184 3.438 3.654 3.859 4.223 4.387 4.537 4.675 4.961 5.091 5.324 5.534 5.738 5.84 6.04 6.215 6.464 6.618 6.756 6.963 7.171 7.37 7.562 7.745 7.978 8.19 8.38 8.596 8.801 9.0 9.225 9.469 9.679 9.893 10.134 10.369 10.579 10.799 11.05 11.264 11.479 11.699 11.824 11.786 11.593 11.109 9.902 8.245 6.719 5.321 4.103 2.986 2.012 1.168 0.429 -0.33 -0.965 -1.525 -2.075 -2.593 -3.078 -3.54 -4.023 -4.442 -4.792 -5.161 -5.558 -5.885 -6.226 -6.575 -6.843 -7.13 -7.429 -7.73 -8.053 -8.279 -8.52 -8.899 -9.147 -9.4 -9.535 -9.82 -10.112 -10.412 -10.576 -10.915 -11.123 -11.334 -11.557 -12.029 -12.294 -12.579 -12.91 -13.306 -13.732 -14.253 -15.597 -4 ,7917 ,KEBNE ,16724480,Sun Nov 28 06:27:24 CET,Sun Nov 28 08:03:36 CET,0.0 1.261 1.694 2.027 2.328 2.603 2.844 3.059 3.428 3.594 3.747 3.874 4.16 4.309 4.607 4.886 5.144 5.267 5.481 5.663 5.929 6.096 6.248 6.463 6.661 6.84 7.015 7.189 7.4 7.581 7.751 7.964 8.172 8.358 8.57 8.801 9.008 9.234 9.456 9.672 9.91 10.16 10.396 10.611 10.822 10.991 11.127 11.148 10.975 10.495 9.293 7.548 6.018 4.666 3.484 2.402 1.441 0.547 -0.244 -1.009 -1.644 -2.236 -2.814 -3.341 -3.819 -4.25 -4.704 -5.121 -5.495 -5.875 -6.269 -6.602 -6.929 -7.267 -7.543 -7.834 -8.129 -8.432 -8.737 -8.938 -9.151 -9.502 -9.753 -10.01 -10.145 -10.421 -10.71 -11.037 -11.213 -11.555 -11.746 -11.946 -12.176 -12.726 -13.039 -13.361 -13.681 -14.007 -14.402 -14.992 -16.567 -5 ,14090 ,KEBNE ,16724481,Sun Nov 28 06:27:24 CET,Sun Nov 28 08:04:20 CET,0.0 1.071 1.505 1.87 2.18 2.452 2.687 2.9 3.263 3.417 3.578 3.731 4.013 4.139 4.379 4.594 4.802 4.905 5.102 5.288 5.55 5.73 5.907 6.135 6.34 6.528 6.706 6.878 7.094 7.291 7.469 7.689 7.893 8.068 8.271 8.509 8.732 8.946 9.158 9.378 9.598 9.832 10.065 10.273 10.508 10.691 10.779 10.788 10.646 10.146 8.982 7.242 5.634 4.251 3.047 1.933 0.957 0.084 -0.685 -1.461 -2.117 -2.702 -3.267 -3.801 -4.293 -4.746 -5.218 -5.646 -6.015 -6.394 -6.789 -7.113 -7.451 -7.795 -8.058 -8.348 -8.662 -8.979 -9.297 -9.511 -9.74 -10.106 -10.36 -10.641 -10.783 -11.055 -11.339 -11.656 -11.826 -12.17 -12.399 -12.602 -12.8 -13.214 -13.452 -13.727 -14.054 -14.455 -14.925 -15.583 -17.264 -6 ,18563 ,KEBNE ,16724482,Sun Nov 28 06:28:25 CET,Sun Nov 28 08:06:30 CET,0.0 1.437 1.979 2.382 2.698 2.954 3.178 3.392 3.766 3.933 4.086 4.207 4.483 4.613 4.861 5.081 5.284 5.38 5.556 5.72 5.956 6.103 6.259 6.534 6.803 7.059 7.292 7.477 7.681 7.865 8.051 8.282 8.487 8.683 8.901 9.132 9.346 9.555 9.775 9.999 10.202 10.411 10.634 10.844 11.075 11.268 11.386 11.403 11.223 10.718 9.559 7.928 6.407 5.036 3.844 2.767 1.818 0.956 0.226 -0.503 -1.152 -1.738 -2.323 -2.872 -3.346 -3.773 -4.241 -4.666 -5.021 -5.392 -5.794 -6.122 -6.436 -6.762 -7.038 -7.326 -7.607 -7.897 -8.213 -8.435 -8.66 -9.025 -9.284 -9.548 -9.679 -9.963 -10.262 -10.574 -10.738 -11.079 -11.297 -11.487 -11.695 -12.17 -12.439 -12.73 -13.067 -13.449 -13.874 -14.465 -15.836 -7 ,10813 ,KEBNE ,16724483,Sun Nov 28 06:28:26 CET,Sun Nov 28 08:05:24 CET,0.0 1.123 1.584 1.914 2.181 2.434 2.681 2.91 3.28 3.447 3.61 3.77 4.064 4.199 4.45 4.673 4.879 4.977 5.164 5.357 5.628 5.793 5.946 6.153 6.349 6.526 6.696 6.871 7.075 7.253 7.436 7.653 7.848 8.044 8.263 8.505 8.722 8.928 9.134 9.344 9.558 9.778 10.022 10.258 10.47 10.624 10.763 10.855 10.729 10.261 9.227 7.601 6.059 4.639 3.395 2.295 1.353 0.512 -0.237 -0.998 -1.633 -2.206 -2.767 -3.284 -3.771 -4.231 -4.708 -5.124 -5.493 -5.875 -6.272 -6.609 -6.973 -7.351 -7.632 -7.915 -8.207 -8.521 -8.833 -9.053 -9.279 -9.613 -9.866 -10.145 -10.289 -10.575 -10.878 -11.192 -11.359 -11.701 -11.888 -12.09 -12.307 -12.761 -13.006 -13.263 -13.563 -13.911 -14.329 -14.905 -16.408 -8 ,18624 ,KEBNE ,16724484,Sun Nov 28 06:29:28 CET,Sun Nov 28 08:07:13 CET,0.0 1.171 1.746 2.174 2.519 2.811 3.082 3.301 3.679 3.855 4.01 4.159 4.45 4.573 4.804 5.034 5.254 5.36 5.559 5.746 6.001 6.149 6.296 6.516 6.718 6.915 7.113 7.288 7.498 7.694 7.885 8.129 8.342 8.531 8.756 8.996 9.207 9.422 9.649 9.881 10.109 10.342 10.595 10.807 11.005 11.156 11.262 11.334 11.257 10.803 9.658 7.972 6.405 5.007 3.802 2.725 1.774 0.92 0.16 -0.598 -1.25 -1.822 -2.367 -2.894 -3.374 -3.825 -4.295 -4.711 -5.069 -5.442 -5.844 -6.177 -6.516 -6.862 -7.136 -7.42 -7.704 -7.996 -8.286 -8.492 -8.719 -9.073 -9.319 -9.585 -9.727 -10.01 -10.303 -10.607 -10.762 -11.1 -11.325 -11.535 -11.755 -12.205 -12.439 -12.693 -13.013 -13.458 -13.985 -14.649 -16.272 -9 ,18651 ,KEBNE ,16724485,Sun Nov 28 06:29:28 CET,Sun Nov 28 08:05:18 CET,0.0 1.205 1.682 2.029 2.348 2.618 2.831 3.024 3.405 3.584 3.748 3.892 4.176 4.305 4.544 4.769 4.982 5.082 5.266 5.451 5.718 5.873 6.017 6.227 6.414 6.597 6.783 6.956 7.165 7.351 7.527 7.754 7.967 8.151 8.356 8.595 8.82 9.06 9.326 9.579 9.802 10.036 10.306 10.547 10.772 10.945 11.035 11.03 10.888 10.438 9.252 7.569 6.045 4.671 3.49 2.423 1.459 0.56 -0.213 -0.958 -1.579 -2.138 -2.681 -3.207 -3.689 -4.129 -4.619 -5.054 -5.413 -5.785 -6.177 -6.498 -6.835 -7.188 -7.464 -7.752 -8.049 -8.357 -8.689 -8.925 -9.159 -9.512 -9.758 -10.016 -10.15 -10.438 -10.738 -11.046 -11.208 -11.54 -11.745 -11.946 -12.157 -12.62 -12.875 -13.161 -13.465 -13.785 -14.169 -14.73 -16.164 -10 ,29041 ,KEBNE ,16724486,Sun Nov 28 06:29:28 CET,Sun Nov 28 08:06:20 CET,0.0 1.581 2.318 2.843 3.247 3.574 3.843 4.101 4.571 4.791 5.008 5.236 5.558 5.724 6.03 6.33 6.617 6.749 6.995 7.232 7.567 7.769 7.952 8.187 8.394 8.579 8.754 8.927 9.144 9.346 9.52 9.715 9.902 10.09 10.31 10.534 10.755 10.99 11.237 11.473 11.701 11.934 12.162 12.378 12.585 12.738 12.825 12.819 12.649 12.206 11.073 9.363 7.85 6.481 5.241 4.151 3.206 2.344 1.579 0.807 0.173 -0.401 -0.955 -1.458 -1.935 -2.379 -2.847 -3.264 -3.623 -4.01 -4.411 -4.742 -5.079 -5.434 -5.71 -5.994 -6.296 -6.597 -6.908 -7.14 -7.368 -7.707 -7.961 -8.232 -8.369 -8.648 -8.944 -9.298 -9.505 -9.882 -10.15 -10.388 -10.658 -11.255 -11.589 -11.939 -12.307 -12.673 -13.084 -13.664 -15.066 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt deleted file mode 100644 index 1ee322c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11402 ,KEBNE ,17026448,Wed Dec 22 14:22:37 CET,Wed Dec 22 15:58:46 CET,0.0 1.146 1.642 1.997 2.268 2.498 2.729 2.952 3.334 3.5 3.646 3.777 4.06 4.178 4.403 4.621 4.831 4.932 5.119 5.294 5.545 5.701 5.844 6.036 6.211 6.387 6.565 6.724 6.91 7.082 7.254 7.475 7.678 7.857 8.043 8.227 8.394 8.565 8.748 8.937 9.119 9.28 9.423 9.545 9.639 9.674 9.635 9.462 9.014 8.184 6.455 4.121 2.111 0.379 -1.126 -2.476 -3.606 -4.64 -5.547 -6.436 -7.19 -7.868 -8.513 -9.116 -9.671 -10.17 -10.696 -11.17 -11.591 -12.03 -12.474 -12.849 -13.23 -13.603 -13.897 -14.224 -14.559 -14.905 -15.268 -15.506 -15.749 -16.138 -16.413 -16.701 -16.852 -17.16 -17.484 -17.819 -18.004 -18.376 -18.594 -18.792 -19.016 -19.518 -19.78 -20.057 -20.36 -20.734 -21.173 -21.735 -23.309 -2 ,27635 ,KEBNE ,17026449,Wed Dec 22 14:22:37 CET,Wed Dec 22 16:00:31 CET,0.0 1.385 1.854 2.161 2.464 2.754 2.977 3.16 3.503 3.669 3.817 3.933 4.221 4.354 4.604 4.824 5.015 5.106 5.297 5.487 5.743 5.904 6.049 6.249 6.437 6.617 6.793 6.95 7.151 7.341 7.51 7.698 7.861 8.019 8.203 8.414 8.609 8.807 9.006 9.201 9.384 9.538 9.665 9.756 9.836 9.88 9.835 9.651 9.243 8.36 6.523 4.225 2.231 0.453 -1.058 -2.422 -3.61 -4.646 -5.526 -6.411 -7.187 -7.867 -8.509 -9.116 -9.665 -10.161 -10.686 -11.16 -11.577 -12.009 -12.447 -12.811 -13.216 -13.677 -14.032 -14.388 -14.74 -15.074 -15.41 -15.639 -15.882 -16.273 -16.531 -16.81 -16.957 -17.26 -17.573 -17.91 -18.095 -18.451 -18.661 -18.858 -19.075 -19.569 -19.846 -20.166 -20.545 -20.996 -21.531 -22.152 -23.386 -3 ,28650 ,KEBNE ,17026450,Wed Dec 22 14:23:42 CET,Wed Dec 22 15:56:11 CET,0.0 1.168 1.64 2.009 2.298 2.54 2.776 2.973 3.285 3.433 3.591 3.746 4.026 4.151 4.385 4.589 4.775 4.871 5.072 5.256 5.513 5.701 5.893 6.144 6.345 6.524 6.695 6.863 7.072 7.264 7.434 7.628 7.82 7.991 8.17 8.367 8.561 8.785 9.006 9.204 9.38 9.543 9.7 9.816 9.915 9.975 9.913 9.686 9.267 8.454 6.7 4.371 2.364 0.624 -0.903 -2.267 -3.443 -4.489 -5.365 -6.234 -6.993 -7.673 -8.319 -8.932 -9.498 -10.006 -10.53 -10.998 -11.414 -11.855 -12.304 -12.666 -13.042 -13.428 -13.722 -14.057 -14.44 -14.814 -15.167 -15.41 -15.662 -16.048 -16.321 -16.601 -16.739 -17.044 -17.367 -17.71 -17.897 -18.256 -18.517 -18.772 -19.03 -19.577 -19.898 -20.253 -20.637 -21.072 -21.586 -22.261 -23.74 -4 ,29400 ,KEBNE ,17026451,Wed Dec 22 14:24:41 CET,Wed Dec 22 16:02:12 CET,0.0 1.342 1.857 2.214 2.489 2.728 2.969 3.184 3.569 3.743 3.895 4.014 4.291 4.413 4.658 4.875 5.058 5.148 5.329 5.502 5.753 5.913 6.063 6.277 6.474 6.661 6.83 6.981 7.175 7.365 7.551 7.755 7.933 8.11 8.321 8.55 8.749 8.948 9.144 9.321 9.504 9.702 9.87 9.985 10.1 10.162 10.087 9.868 9.453 8.547 6.737 4.415 2.416 0.675 -0.843 -2.194 -3.376 -4.428 -5.336 -6.236 -6.988 -7.669 -8.322 -8.918 -9.469 -9.978 -10.507 -10.969 -11.35 -11.755 -12.2 -12.567 -12.921 -13.283 -13.58 -13.886 -14.214 -14.574 -14.938 -15.176 -15.421 -15.802 -16.072 -16.363 -16.512 -16.805 -17.128 -17.502 -17.689 -18.043 -18.238 -18.439 -18.675 -19.168 -19.428 -19.701 -20.005 -20.36 -20.766 -21.302 -22.581 -5 ,12720 ,KEBNE ,17026452,Wed Dec 22 14:24:40 CET,Wed Dec 22 16:03:11 CET,0.0 1.248 1.772 2.17 2.487 2.747 2.968 3.155 3.504 3.673 3.833 3.983 4.275 4.399 4.634 4.848 5.046 5.14 5.33 5.541 5.861 6.051 6.233 6.503 6.725 6.899 7.058 7.221 7.43 7.616 7.779 7.972 8.157 8.327 8.533 8.759 8.939 9.114 9.294 9.471 9.641 9.809 9.98 10.103 10.176 10.219 10.205 10.019 9.511 8.557 6.765 4.364 2.316 0.603 -0.912 -2.272 -3.458 -4.539 -5.445 -6.322 -7.093 -7.791 -8.464 -9.092 -9.655 -10.168 -10.706 -11.191 -11.605 -12.029 -12.462 -12.813 -13.181 -13.571 -13.883 -14.197 -14.511 -14.85 -15.204 -15.441 -15.686 -16.089 -16.364 -16.638 -16.783 -17.077 -17.397 -17.742 -17.913 -18.254 -18.468 -18.678 -18.885 -19.334 -19.595 -19.909 -20.263 -20.627 -21.038 -21.635 -23.054 -6 ,28139 ,KEBNE ,17026453,Wed Dec 22 14:27:46 CET,Wed Dec 22 16:06:19 CET,0.0 1.37 1.869 2.223 2.527 2.767 3.017 3.289 3.709 3.872 4.018 4.166 4.453 4.576 4.806 5.022 5.227 5.326 5.51 5.673 5.889 6.024 6.166 6.386 6.587 6.762 6.934 7.105 7.317 7.507 7.679 7.871 8.055 8.238 8.444 8.66 8.849 9.036 9.227 9.407 9.579 9.758 9.919 10.032 10.113 10.148 10.093 9.908 9.485 8.594 6.848 4.574 2.582 0.833 -0.672 -2.008 -3.163 -4.186 -5.044 -5.918 -6.678 -7.347 -7.996 -8.587 -9.131 -9.626 -10.12 -10.568 -10.985 -11.415 -11.84 -12.185 -12.546 -12.938 -13.241 -13.551 -13.868 -14.198 -14.56 -14.806 -15.047 -15.419 -15.688 -15.978 -16.126 -16.419 -16.723 -17.053 -17.228 -17.584 -17.786 -17.98 -18.191 -18.669 -18.954 -19.259 -19.568 -19.908 -20.318 -20.91 -22.466 -7 ,4124 ,KEBNE ,17026454,Wed Dec 22 14:28:48 CET,Wed Dec 22 16:07:08 CET,0.0 1.375 1.887 2.279 2.607 2.896 3.152 3.366 3.729 3.888 4.03 4.135 4.409 4.53 4.746 4.959 5.162 5.256 5.442 5.616 5.854 5.999 6.144 6.342 6.522 6.714 6.9 7.061 7.254 7.439 7.615 7.816 8.0 8.176 8.371 8.583 8.761 8.94 9.159 9.375 9.566 9.778 9.957 10.074 10.173 10.198 10.161 10.002 9.552 8.635 6.85 4.526 2.529 0.807 -0.681 -2.018 -3.188 -4.239 -5.132 -6.028 -6.814 -7.495 -8.128 -8.715 -9.259 -9.763 -10.294 -10.759 -11.15 -11.576 -12.032 -12.393 -12.761 -13.167 -13.472 -13.771 -14.097 -14.437 -14.796 -15.048 -15.301 -15.67 -15.928 -16.211 -16.36 -16.672 -17.002 -17.355 -17.529 -17.881 -18.125 -18.336 -18.545 -19.006 -19.273 -19.561 -19.872 -20.249 -20.688 -21.23 -22.632 -8 ,18150 ,KEBNE ,17026455,Wed Dec 22 14:28:52 CET,Wed Dec 22 16:01:23 CET,0.0 1.42 1.975 2.324 2.63 2.909 3.152 3.359 3.749 3.924 4.086 4.241 4.522 4.638 4.846 5.064 5.277 5.373 5.547 5.7 5.939 6.095 6.235 6.428 6.612 6.799 6.967 7.119 7.315 7.489 7.654 7.844 8.017 8.188 8.373 8.573 8.772 8.981 9.18 9.362 9.53 9.682 9.824 9.953 10.04 10.049 9.998 9.821 9.399 8.534 6.79 4.487 2.483 0.755 -0.727 -2.043 -3.201 -4.239 -5.102 -5.956 -6.711 -7.381 -8.027 -8.647 -9.207 -9.72 -10.252 -10.718 -11.127 -11.548 -11.979 -12.337 -12.706 -13.087 -13.406 -13.736 -14.048 -14.379 -14.738 -14.983 -15.227 -15.612 -15.882 -16.16 -16.31 -16.633 -16.958 -17.28 -17.463 -17.824 -18.058 -18.273 -18.489 -18.979 -19.262 -19.578 -19.926 -20.312 -20.797 -21.533 -23.204 -9 ,507 ,KEBNE ,17026456,Wed Dec 22 14:29:50 CET,Wed Dec 22 16:02:59 CET,0.0 1.758 2.398 2.862 3.249 3.561 3.852 4.137 4.609 4.803 4.962 5.087 5.367 5.491 5.729 5.943 6.134 6.223 6.391 6.563 6.806 6.957 7.105 7.318 7.501 7.677 7.856 8.018 8.212 8.391 8.556 8.747 8.932 9.112 9.294 9.486 9.677 9.859 10.036 10.21 10.386 10.557 10.729 10.843 10.92 10.964 10.926 10.746 10.296 9.404 7.532 5.077 3.029 1.288 -0.217 -1.571 -2.744 -3.802 -4.707 -5.626 -6.424 -7.094 -7.71 -8.298 -8.849 -9.346 -9.863 -10.326 -10.744 -11.178 -11.611 -11.976 -12.359 -12.748 -13.041 -13.343 -13.671 -14.015 -14.366 -14.608 -14.848 -15.225 -15.499 -15.793 -15.944 -16.255 -16.574 -16.916 -17.097 -17.454 -17.672 -17.878 -18.093 -18.559 -18.825 -19.129 -19.479 -19.884 -20.362 -20.949 -22.436 -10 ,11712 ,KEBNE ,17026457,Wed Dec 22 14:31:54 CET,Wed Dec 22 16:07:48 CET,0.0 1.22 1.707 2.107 2.447 2.715 2.957 3.157 3.514 3.693 3.854 3.967 4.238 4.358 4.588 4.804 5.014 5.109 5.292 5.466 5.698 5.842 5.978 6.173 6.355 6.527 6.691 6.844 7.052 7.256 7.436 7.631 7.802 7.979 8.21 8.465 8.67 8.866 9.057 9.259 9.444 9.613 9.802 9.939 10.032 10.079 10.014 9.798 9.398 8.596 6.878 4.609 2.647 0.953 -0.488 -1.804 -2.953 -3.983 -4.9 -5.808 -6.593 -7.287 -7.949 -8.561 -9.115 -9.622 -10.151 -10.62 -11.022 -11.441 -11.878 -12.252 -12.633 -13.037 -13.353 -13.661 -13.97 -14.291 -14.638 -14.88 -15.127 -15.51 -15.782 -16.069 -16.214 -16.519 -16.84 -17.179 -17.354 -17.7 -17.896 -18.094 -18.308 -18.777 -19.044 -19.334 -19.657 -20.018 -20.463 -21.066 -22.799 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index 4956edb7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30130 ,KEBNE ,16724487,Sun Nov 28 06:31:31 CET,Sun Nov 28 08:06:19 CET,0.0 0.911 1.322 1.633 1.893 2.123 2.337 2.525 2.842 2.987 3.136 3.253 3.555 3.683 3.936 4.165 4.373 4.471 4.668 4.86 5.129 5.31 5.491 5.749 5.994 6.235 6.468 6.691 6.981 7.271 7.548 7.881 8.212 8.542 8.929 9.339 9.721 10.149 10.63 11.155 11.709 12.344 13.099 13.856 14.748 15.756 16.915 18.264 19.944 21.978 24.479 26.585 27.817 28.588 29.036 29.299 29.452 29.535 29.565 29.535 29.474 29.402 29.324 29.239 29.125 29.016 28.88 28.738 28.616 28.488 28.351 28.219 28.065 27.907 27.782 27.629 27.472 27.31 27.116 26.989 26.856 26.628 26.472 26.313 26.225 26.041 25.853 25.651 25.548 25.29 25.171 25.026 24.872 24.518 24.321 24.106 23.871 23.588 23.21 22.713 20.837 -2 ,7918 ,KEBNE ,16724488,Sun Nov 28 06:31:31 CET,Sun Nov 28 08:04:58 CET,0.0 0.884 1.319 1.64 1.908 2.166 2.383 2.56 2.876 3.018 3.166 3.269 3.572 3.691 3.918 4.147 4.365 4.47 4.671 4.869 5.163 5.353 5.531 5.788 6.041 6.279 6.515 6.748 7.031 7.306 7.578 7.908 8.229 8.532 8.887 9.294 9.68 10.108 10.575 11.089 11.655 12.282 13.024 13.8 14.696 15.685 16.866 18.225 19.88 21.954 24.445 26.5 27.723 28.486 28.957 29.274 29.449 29.54 29.591 29.603 29.578 29.505 29.413 29.326 29.229 29.128 28.997 28.878 28.763 28.614 28.473 28.357 28.212 28.053 27.926 27.793 27.652 27.501 27.335 27.22 27.088 26.856 26.701 26.533 26.447 26.269 26.069 25.836 25.718 25.459 25.338 25.187 25.025 24.677 24.471 24.216 23.921 23.593 23.212 22.638 20.208 -3 ,10066 ,KEBNE ,16724489,Sun Nov 28 06:31:31 CET,Sun Nov 28 08:05:10 CET,0.0 0.922 1.349 1.656 1.939 2.22 2.464 2.654 2.981 3.14 3.296 3.398 3.7 3.826 4.051 4.265 4.476 4.58 4.786 4.991 5.286 5.471 5.647 5.899 6.14 6.376 6.606 6.829 7.121 7.407 7.678 7.993 8.303 8.612 8.974 9.385 9.774 10.191 10.656 11.169 11.714 12.332 13.072 13.83 14.73 15.77 16.977 18.36 20.032 22.074 24.607 26.657 27.815 28.483 28.913 29.237 29.427 29.53 29.575 29.583 29.55 29.478 29.393 29.29 29.176 29.07 28.952 28.832 28.715 28.585 28.439 28.301 28.151 28.004 27.899 27.776 27.629 27.479 27.308 27.175 27.041 26.823 26.662 26.492 26.408 26.238 26.043 25.827 25.707 25.431 25.321 25.198 25.057 24.723 24.524 24.299 24.046 23.73 23.315 22.811 21.369 -4 ,6740 ,KEBNE ,16724490,Sun Nov 28 06:31:31 CET,Sun Nov 28 08:04:50 CET,0.0 1.011 1.464 1.819 2.109 2.349 2.565 2.753 3.112 3.271 3.424 3.53 3.83 3.955 4.189 4.418 4.652 4.759 4.951 5.144 5.44 5.631 5.811 6.061 6.302 6.548 6.79 7.017 7.313 7.594 7.857 8.182 8.508 8.821 9.186 9.605 10.003 10.44 10.918 11.44 11.979 12.588 13.343 14.125 15.048 16.085 17.295 18.652 20.275 22.288 24.79 26.893 28.075 28.806 29.247 29.506 29.664 29.743 29.778 29.763 29.714 29.654 29.559 29.436 29.319 29.218 29.102 28.98 28.869 28.749 28.604 28.472 28.34 28.202 28.085 27.957 27.81 27.646 27.464 27.338 27.211 27.001 26.854 26.705 26.631 26.48 26.297 26.1 25.998 25.732 25.592 25.426 25.242 24.867 24.672 24.457 24.202 23.865 23.475 22.965 21.29 -5 ,15502 ,KEBNE ,16724491,Sun Nov 28 06:33:42 CET,Sun Nov 28 08:03:46 CET,0.0 0.909 1.37 1.679 1.913 2.123 2.326 2.518 2.86 3.013 3.161 3.265 3.56 3.684 3.929 4.16 4.382 4.49 4.689 4.884 5.172 5.357 5.545 5.807 6.051 6.289 6.529 6.764 7.06 7.34 7.612 7.943 8.261 8.58 8.959 9.384 9.788 10.235 10.721 11.229 11.768 12.392 13.131 13.882 14.762 15.777 16.981 18.35 19.995 21.976 24.424 26.492 27.726 28.455 28.913 29.213 29.394 29.508 29.544 29.547 29.529 29.467 29.38 29.286 29.182 29.079 28.958 28.831 28.715 28.589 28.454 28.34 28.21 28.069 27.945 27.804 27.657 27.504 27.352 27.246 27.122 26.921 26.783 26.619 26.528 26.336 26.134 25.931 25.823 25.559 25.447 25.309 25.164 24.834 24.632 24.395 24.132 23.814 23.405 22.88 20.77 -7 ,5512 ,KEBNE ,16724493,Sun Nov 28 06:33:42 CET,Sun Nov 28 08:04:50 CET,0.0 0.867 1.276 1.556 1.8 2.042 2.262 2.46 2.815 2.976 3.13 3.257 3.575 3.713 3.957 4.182 4.392 4.495 4.702 4.896 5.177 5.365 5.553 5.811 6.049 6.303 6.553 6.797 7.104 7.386 7.667 8.0 8.317 8.631 9.0 9.401 9.782 10.207 10.661 11.152 11.691 12.316 13.053 13.792 14.669 15.683 16.911 18.313 19.952 21.989 24.516 26.651 27.873 28.596 29.06 29.365 29.526 29.61 29.646 29.618 29.533 29.444 29.347 29.24 29.128 29.009 28.863 28.723 28.612 28.485 28.334 28.2 28.059 27.911 27.788 27.654 27.504 27.34 27.159 27.033 26.905 26.689 26.535 26.376 26.287 26.089 25.887 25.659 25.531 25.246 25.095 24.938 24.775 24.436 24.236 23.984 23.688 23.333 22.923 22.398 20.685 -9 ,20063 ,KEBNE ,16724495,Sun Nov 28 06:34:36 CET,Sun Nov 28 08:07:45 CET,0.0 0.697 1.117 1.422 1.638 1.841 2.035 2.217 2.578 2.755 2.923 3.038 3.334 3.45 3.684 3.912 4.119 4.219 4.431 4.632 4.91 5.091 5.27 5.535 5.787 6.022 6.246 6.468 6.757 7.042 7.31 7.621 7.922 8.223 8.593 9.022 9.433 9.872 10.357 10.885 11.435 12.05 12.792 13.567 14.466 15.464 16.645 18.007 19.685 21.727 24.162 26.214 27.409 28.13 28.547 28.804 28.959 29.036 29.066 29.039 28.985 28.915 28.834 28.741 28.629 28.499 28.344 28.194 28.06 27.93 27.781 27.649 27.519 27.369 27.246 27.123 26.984 26.831 26.663 26.534 26.396 26.167 26.004 25.831 25.741 25.56 25.356 25.14 25.024 24.763 24.632 24.471 24.31 23.958 23.763 23.541 23.279 22.974 22.616 22.084 20.354 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index 8c7b519e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31620 ,KEBNE ,16724497,Sun Nov 28 06:35:37 CET,Sun Nov 28 08:08:38 CET,0.0 0.496 0.779 1.045 1.275 1.486 1.687 1.862 2.155 2.284 2.411 2.502 2.764 2.864 3.063 3.263 3.439 3.521 3.677 3.826 4.056 4.198 4.325 4.505 4.688 4.865 5.031 5.182 5.379 5.575 5.759 5.982 6.188 6.386 6.616 6.879 7.135 7.397 7.672 7.973 8.301 8.658 9.046 9.432 9.87 10.345 10.853 11.364 11.927 12.469 12.866 12.882 12.683 12.364 11.982 11.588 11.205 10.826 10.476 10.102 9.763 9.448 9.161 8.892 8.621 8.373 8.096 7.836 7.621 7.393 7.144 6.931 6.707 6.471 6.279 6.08 5.878 5.65 5.398 5.23 5.062 4.792 4.589 4.375 4.264 4.038 3.797 3.522 3.38 3.097 2.916 2.738 2.562 2.152 1.94 1.724 1.439 1.091 0.675 0.189 -1.262 -2 ,11085 ,KEBNE ,16724498,Sun Nov 28 06:35:37 CET,Sun Nov 28 08:08:38 CET,0.0 0.776 1.119 1.392 1.639 1.832 1.997 2.147 2.422 2.549 2.674 2.756 3.009 3.103 3.284 3.461 3.634 3.716 3.874 4.026 4.247 4.386 4.521 4.711 4.884 5.053 5.223 5.38 5.581 5.78 5.965 6.193 6.418 6.619 6.836 7.085 7.329 7.603 7.885 8.171 8.462 8.78 9.152 9.539 9.977 10.417 10.903 11.443 12.016 12.602 13.065 13.097 12.894 12.582 12.225 11.853 11.471 11.082 10.708 10.32 9.985 9.666 9.349 9.029 8.727 8.459 8.184 7.93 7.701 7.468 7.221 7.006 6.783 6.546 6.359 6.156 5.937 5.713 5.474 5.305 5.129 4.869 4.686 4.489 4.384 4.161 3.916 3.649 3.518 3.241 3.067 2.883 2.7 2.305 2.078 1.85 1.595 1.276 0.879 0.369 -1.117 -3 ,5993 ,KEBNE ,16724499,Sun Nov 28 06:36:39 CET,Sun Nov 28 08:09:59 CET,0.0 1.002 1.38 1.656 1.877 2.057 2.208 2.355 2.643 2.779 2.903 2.974 3.227 3.321 3.507 3.677 3.83 3.908 4.065 4.219 4.442 4.58 4.721 4.919 5.1 5.283 5.451 5.602 5.811 6.014 6.199 6.418 6.632 6.838 7.071 7.334 7.589 7.847 8.111 8.402 8.706 9.041 9.432 9.803 10.217 10.666 11.164 11.721 12.318 12.859 13.25 13.323 13.126 12.8 12.432 12.029 11.626 11.229 10.885 10.532 10.215 9.93 9.643 9.356 9.076 8.803 8.509 8.239 8.001 7.762 7.515 7.293 7.054 6.817 6.62 6.411 6.201 5.969 5.714 5.543 5.372 5.087 4.886 4.676 4.566 4.338 4.09 3.812 3.658 3.349 3.17 3.002 2.819 2.429 2.202 1.953 1.668 1.333 0.969 0.502 -1.379 -4 ,28907 ,KEBNE ,16724500,Sun Nov 28 06:36:39 CET,Sun Nov 28 08:09:40 CET,0.0 0.869 1.258 1.566 1.83 2.053 2.239 2.409 2.705 2.83 2.952 3.035 3.288 3.383 3.569 3.752 3.924 4.005 4.159 4.316 4.539 4.676 4.815 5.012 5.199 5.375 5.541 5.707 5.918 6.108 6.296 6.532 6.743 6.93 7.153 7.41 7.663 7.946 8.236 8.538 8.846 9.182 9.569 9.95 10.383 10.847 11.346 11.909 12.545 13.132 13.572 13.591 13.338 12.983 12.607 12.204 11.825 11.466 11.121 10.772 10.466 10.163 9.845 9.552 9.276 9.016 8.762 8.52 8.293 8.044 7.781 7.564 7.333 7.096 6.899 6.694 6.497 6.288 6.052 5.885 5.702 5.397 5.203 5.019 4.92 4.698 4.437 4.15 4.0 3.701 3.521 3.359 3.18 2.772 2.546 2.296 2.03 1.729 1.324 0.775 -1.061 -5 ,12190 ,KEBNE ,16724501,Sun Nov 28 06:36:39 CET,Sun Nov 28 08:09:36 CET,0.0 0.589 0.944 1.214 1.451 1.647 1.826 1.981 2.246 2.371 2.488 2.569 2.825 2.924 3.115 3.303 3.484 3.566 3.715 3.856 4.056 4.193 4.328 4.525 4.709 4.882 5.055 5.214 5.408 5.602 5.792 6.006 6.217 6.424 6.66 6.912 7.145 7.414 7.697 7.981 8.278 8.61 8.989 9.376 9.799 10.224 10.723 11.252 11.829 12.476 13.019 13.114 12.881 12.54 12.169 11.767 11.353 10.971 10.638 10.258 9.911 9.617 9.328 9.028 8.752 8.493 8.208 7.938 7.697 7.457 7.197 6.973 6.733 6.477 6.28 6.078 5.872 5.655 5.428 5.267 5.097 4.839 4.655 4.444 4.333 4.11 3.876 3.612 3.474 3.192 3.031 2.873 2.713 2.34 2.118 1.855 1.569 1.264 0.891 0.377 -1.012 -6 ,17951 ,KEBNE ,16724502,Sun Nov 28 06:36:39 CET,Sun Nov 28 08:09:54 CET,0.0 0.793 1.144 1.418 1.666 1.888 2.085 2.267 2.566 2.689 2.806 2.885 3.147 3.255 3.456 3.648 3.837 3.927 4.088 4.237 4.462 4.608 4.744 4.926 5.099 5.273 5.435 5.589 5.793 5.992 6.185 6.412 6.624 6.832 7.075 7.338 7.573 7.826 8.116 8.42 8.73 9.077 9.463 9.837 10.26 10.727 11.254 11.784 12.309 12.831 13.269 13.271 12.964 12.585 12.191 11.795 11.402 11.017 10.695 10.332 9.997 9.694 9.392 9.108 8.826 8.558 8.28 8.032 7.81 7.573 7.332 7.129 6.906 6.655 6.465 6.276 6.076 5.867 5.641 5.476 5.294 5.021 4.843 4.641 4.534 4.313 4.065 3.785 3.638 3.346 3.174 3.005 2.828 2.441 2.226 1.985 1.718 1.411 1.006 0.459 -1.012 -7 ,31940 ,KEBNE ,16724503,Sun Nov 28 06:36:39 CET,Sun Nov 28 08:09:36 CET,0.0 0.478 0.828 1.119 1.338 1.529 1.702 1.856 2.106 2.219 2.337 2.415 2.67 2.769 2.967 3.157 3.332 3.413 3.569 3.717 3.939 4.075 4.204 4.396 4.579 4.753 4.923 5.082 5.287 5.485 5.674 5.899 6.121 6.326 6.555 6.827 7.074 7.333 7.631 7.933 8.239 8.586 8.965 9.342 9.773 10.228 10.734 11.273 11.833 12.382 12.817 12.838 12.648 12.329 11.956 11.565 11.156 10.755 10.408 10.038 9.693 9.387 9.079 8.779 8.498 8.231 7.955 7.706 7.479 7.231 6.971 6.756 6.523 6.266 6.067 5.863 5.644 5.416 5.174 5.004 4.832 4.564 4.374 4.169 4.063 3.835 3.565 3.268 3.122 2.833 2.661 2.499 2.33 1.933 1.711 1.484 1.215 0.882 0.488 -0.027 -1.211 -8 ,11893 ,KEBNE ,16724504,Sun Nov 28 06:36:39 CET,Sun Nov 28 08:09:28 CET,0.0 0.663 1.003 1.286 1.526 1.723 1.889 2.038 2.306 2.436 2.557 2.639 2.899 3.0 3.189 3.37 3.541 3.624 3.787 3.947 4.17 4.299 4.423 4.608 4.785 4.946 5.104 5.264 5.467 5.661 5.85 6.071 6.288 6.499 6.721 6.958 7.194 7.464 7.743 8.031 8.334 8.658 9.036 9.425 9.857 10.323 10.857 11.413 11.987 12.57 13.017 13.057 12.826 12.476 12.078 11.666 11.29 10.931 10.593 10.238 9.933 9.632 9.315 8.99 8.691 8.421 8.127 7.858 7.616 7.365 7.107 6.889 6.66 6.427 6.244 6.04 5.821 5.604 5.372 5.215 5.055 4.792 4.602 4.402 4.3 4.085 3.837 3.579 3.44 3.147 2.994 2.826 2.654 2.265 2.043 1.818 1.566 1.264 0.923 0.468 -0.997 -9 ,31051 ,KEBNE ,16724505,Sun Nov 28 06:36:38 CET,Sun Nov 28 08:09:37 CET,0.0 0.792 1.132 1.43 1.655 1.833 2.005 2.161 2.448 2.577 2.7 2.784 3.048 3.152 3.357 3.562 3.744 3.831 3.993 4.147 4.368 4.509 4.648 4.837 5.011 5.179 5.337 5.49 5.693 5.894 6.086 6.314 6.527 6.72 6.94 7.201 7.444 7.7 7.982 8.281 8.591 8.937 9.332 9.707 10.108 10.551 11.078 11.649 12.204 12.722 13.181 13.236 13.001 12.666 12.299 11.901 11.509 11.134 10.783 10.417 10.082 9.771 9.475 9.179 8.899 8.642 8.362 8.101 7.877 7.623 7.355 7.148 6.927 6.689 6.491 6.286 6.087 5.857 5.618 5.456 5.286 5.014 4.831 4.648 4.546 4.314 4.055 3.777 3.634 3.336 3.168 3.001 2.803 2.375 2.155 1.899 1.59 1.247 0.82 0.268 -1.157 -10 ,6704 ,KEBNE ,16724506,Sun Nov 28 06:36:39 CET,Sun Nov 28 08:09:39 CET,0.0 0.654 0.987 1.289 1.53 1.736 1.92 2.082 2.383 2.506 2.612 2.686 2.949 3.05 3.233 3.408 3.574 3.658 3.819 3.975 4.195 4.321 4.452 4.643 4.816 4.981 5.137 5.294 5.5 5.703 5.897 6.12 6.325 6.521 6.748 7.0 7.244 7.516 7.827 8.155 8.464 8.79 9.155 9.521 9.943 10.383 10.871 11.426 12.008 12.513 12.916 12.989 12.738 12.376 12.018 11.613 11.205 10.842 10.526 10.166 9.833 9.538 9.238 8.942 8.661 8.399 8.135 7.885 7.662 7.432 7.19 6.982 6.75 6.506 6.318 6.117 5.905 5.681 5.446 5.285 5.117 4.855 4.663 4.453 4.337 4.094 3.855 3.596 3.455 3.176 3.028 2.861 2.681 2.306 2.106 1.874 1.604 1.299 0.942 0.468 -0.888 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt deleted file mode 100644 index e46eb74f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16521 ,KEBNE ,16724507,Sun Nov 28 06:37:40 CET,Sun Nov 28 08:11:23 CET,0.0 1.448 1.883 2.211 2.486 2.736 2.972 3.192 3.577 3.743 3.883 3.967 4.228 4.345 4.573 4.777 4.976 5.072 5.25 5.41 5.622 5.748 5.864 6.043 6.208 6.355 6.5 6.643 6.825 6.98 7.118 7.276 7.419 7.552 7.7 7.862 8.019 8.167 8.304 8.447 8.585 8.696 8.778 8.825 8.83 8.78 8.657 8.393 7.858 6.864 5.022 2.741 0.812 -0.851 -2.28 -3.524 -4.571 -5.519 -6.335 -7.127 -7.823 -8.459 -9.047 -9.597 -10.104 -10.566 -11.043 -11.461 -11.818 -12.185 -12.582 -12.917 -13.26 -13.605 -13.86 -14.133 -14.419 -14.695 -14.991 -15.21 -15.425 -15.752 -15.998 -16.258 -16.392 -16.667 -16.949 -17.239 -17.393 -17.732 -17.922 -18.113 -18.3 -18.688 -18.917 -19.195 -19.493 -19.81 -20.222 -20.722 -22.034 -2 ,5583 ,KEBNE ,16724508,Sun Nov 28 06:37:41 CET,Sun Nov 28 08:11:37 CET,0.0 1.525 2.067 2.46 2.778 3.039 3.274 3.485 3.827 3.979 4.116 4.213 4.481 4.588 4.778 4.964 5.143 5.232 5.401 5.557 5.767 5.89 6.009 6.176 6.331 6.475 6.614 6.746 6.919 7.081 7.22 7.38 7.534 7.673 7.834 8.001 8.152 8.308 8.45 8.577 8.693 8.814 8.918 8.985 8.999 8.917 8.747 8.444 7.91 6.929 5.073 2.754 0.801 -0.877 -2.268 -3.501 -4.588 -5.551 -6.376 -7.189 -7.871 -8.47 -9.048 -9.585 -10.075 -10.527 -11.002 -11.418 -11.781 -12.168 -12.556 -12.874 -13.216 -13.566 -13.832 -14.112 -14.403 -14.689 -14.987 -15.198 -15.412 -15.75 -15.996 -16.24 -16.36 -16.613 -16.88 -17.167 -17.329 -17.668 -17.846 -18.036 -18.227 -18.678 -18.924 -19.163 -19.434 -19.733 -20.117 -20.62 -21.743 -3 ,14762 ,KEBNE ,16724509,Sun Nov 28 06:37:41 CET,Sun Nov 28 08:12:45 CET,0.0 1.582 2.108 2.451 2.737 3.006 3.232 3.425 3.771 3.927 4.083 4.203 4.474 4.591 4.799 4.991 5.179 5.268 5.436 5.599 5.828 5.961 6.081 6.256 6.429 6.584 6.73 6.883 7.066 7.222 7.381 7.58 7.749 7.881 8.027 8.212 8.383 8.534 8.671 8.789 8.896 8.999 9.092 9.149 9.153 9.089 8.951 8.66 8.066 7.035 5.268 3.061 1.128 -0.542 -1.954 -3.252 -4.367 -5.327 -6.142 -6.931 -7.607 -8.204 -8.769 -9.304 -9.801 -10.252 -10.721 -11.141 -11.5 -11.878 -12.276 -12.593 -12.904 -13.237 -13.508 -13.792 -14.084 -14.379 -14.68 -14.898 -15.137 -15.5 -15.75 -16.007 -16.133 -16.392 -16.661 -16.968 -17.137 -17.477 -17.674 -17.869 -18.071 -18.515 -18.755 -19.009 -19.307 -19.665 -20.073 -20.621 -22.13 -4 ,31522 ,KEBNE ,16724510,Sun Nov 28 06:37:45 CET,Sun Nov 28 08:10:49 CET,0.0 1.028 1.548 1.955 2.235 2.486 2.708 2.893 3.246 3.41 3.563 3.695 3.973 4.094 4.323 4.527 4.705 4.794 4.964 5.112 5.321 5.456 5.58 5.746 5.921 6.098 6.247 6.382 6.549 6.701 6.855 7.03 7.183 7.325 7.47 7.636 7.799 7.97 8.131 8.272 8.4 8.527 8.652 8.731 8.747 8.684 8.521 8.229 7.689 6.722 4.955 2.691 0.766 -0.911 -2.32 -3.577 -4.669 -5.611 -6.423 -7.239 -7.949 -8.572 -9.148 -9.695 -10.199 -10.658 -11.144 -11.586 -11.964 -12.342 -12.729 -13.047 -13.38 -13.729 -13.997 -14.28 -14.579 -14.888 -15.201 -15.425 -15.655 -16.016 -16.27 -16.531 -16.663 -16.923 -17.212 -17.533 -17.694 -18.033 -18.209 -18.4 -18.62 -19.091 -19.333 -19.596 -19.886 -20.218 -20.623 -21.167 -23.133 -7 ,9565 ,KEBNE ,16724513,Sun Nov 28 06:37:41 CET,Sun Nov 28 08:12:42 CET,0.0 1.798 2.318 2.688 2.968 3.209 3.444 3.654 3.987 4.132 4.264 4.365 4.634 4.753 4.977 5.181 5.363 5.445 5.608 5.772 5.987 6.13 6.274 6.461 6.641 6.813 6.963 7.106 7.288 7.458 7.624 7.823 7.994 8.139 8.309 8.495 8.653 8.8 8.939 9.08 9.205 9.305 9.381 9.448 9.469 9.385 9.201 8.877 8.298 7.287 5.425 3.101 1.159 -0.513 -1.906 -3.125 -4.204 -5.16 -5.968 -6.762 -7.429 -8.017 -8.572 -9.105 -9.602 -10.051 -10.529 -10.955 -11.32 -11.688 -12.072 -12.393 -12.735 -13.105 -13.373 -13.642 -13.931 -14.223 -14.519 -14.734 -14.961 -15.316 -15.562 -15.834 -15.973 -16.239 -16.523 -16.834 -16.996 -17.33 -17.492 -17.666 -17.854 -18.292 -18.533 -18.801 -19.073 -19.342 -19.672 -20.112 -21.136 -8 ,1025 ,KEBNE ,16724514,Sun Nov 28 06:37:41 CET,Sun Nov 28 08:12:38 CET,0.0 1.312 1.822 2.208 2.481 2.696 2.905 3.095 3.423 3.572 3.713 3.827 4.11 4.229 4.436 4.624 4.81 4.9 5.052 5.199 5.417 5.552 5.676 5.839 6.004 6.163 6.311 6.455 6.627 6.791 6.95 7.135 7.297 7.436 7.589 7.754 7.896 8.032 8.165 8.285 8.404 8.521 8.614 8.655 8.661 8.627 8.474 8.169 7.663 6.715 4.868 2.543 0.56 -1.151 -2.577 -3.835 -4.928 -5.862 -6.657 -7.462 -8.144 -8.741 -9.322 -9.864 -10.352 -10.807 -11.293 -11.72 -12.084 -12.469 -12.866 -13.184 -13.513 -13.844 -14.099 -14.38 -14.674 -14.986 -15.31 -15.522 -15.739 -16.093 -16.34 -16.582 -16.718 -17.021 -17.32 -17.614 -17.772 -18.117 -18.298 -18.472 -18.647 -19.056 -19.282 -19.517 -19.774 -20.069 -20.436 -20.961 -22.414 -9 ,424 ,KEBNE ,16724515,Sun Nov 28 06:37:40 CET,Sun Nov 28 08:11:16 CET,0.0 1.545 1.984 2.303 2.566 2.782 2.973 3.153 3.493 3.65 3.795 3.906 4.181 4.296 4.5 4.695 4.874 4.962 5.132 5.299 5.528 5.664 5.794 5.979 6.157 6.317 6.454 6.582 6.74 6.881 7.023 7.211 7.382 7.525 7.697 7.872 8.006 8.156 8.292 8.415 8.535 8.658 8.773 8.856 8.919 8.902 8.766 8.478 7.936 6.946 5.124 2.789 0.888 -0.713 -2.096 -3.355 -4.466 -5.427 -6.242 -7.06 -7.768 -8.404 -9.002 -9.55 -10.05 -10.498 -10.974 -11.405 -11.763 -12.127 -12.508 -12.828 -13.168 -13.518 -13.785 -14.07 -14.372 -14.666 -14.967 -15.184 -15.408 -15.744 -15.976 -16.227 -16.361 -16.619 -16.888 -17.186 -17.339 -17.675 -17.85 -18.04 -18.246 -18.678 -18.906 -19.138 -19.411 -19.745 -20.143 -20.673 -21.975 -10 ,24148 ,KEBNE ,16724516,Sun Nov 28 06:37:41 CET,Sun Nov 28 08:11:47 CET,0.0 2.137 2.69 3.106 3.434 3.703 3.933 4.141 4.491 4.641 4.788 4.909 5.178 5.295 5.51 5.701 5.907 6.007 6.176 6.316 6.512 6.645 6.78 6.974 7.146 7.304 7.448 7.578 7.74 7.9 8.058 8.23 8.375 8.521 8.679 8.822 8.941 9.066 9.203 9.36 9.485 9.584 9.696 9.741 9.734 9.667 9.48 9.13 8.531 7.558 5.791 3.527 1.6 -0.061 -1.476 -2.725 -3.812 -4.772 -5.587 -6.382 -7.068 -7.682 -8.26 -8.801 -9.301 -9.759 -10.231 -10.656 -11.027 -11.405 -11.802 -12.128 -12.455 -12.797 -13.07 -13.362 -13.652 -13.932 -14.243 -14.475 -14.698 -15.032 -15.28 -15.542 -15.673 -15.943 -16.219 -16.498 -16.653 -16.991 -17.175 -17.362 -17.545 -17.95 -18.181 -18.44 -18.723 -19.028 -19.355 -19.773 -21.158 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt deleted file mode 100644 index 435f9951..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14184 ,KEBNE ,17026458,Wed Dec 22 14:31:54 CET,Wed Dec 22 16:09:18 CET,0.0 1.238 1.768 2.175 2.506 2.81 3.075 3.315 3.755 3.953 4.142 4.343 4.679 4.84 5.119 5.387 5.659 5.784 6.03 6.286 6.63 6.839 7.056 7.373 7.672 7.959 8.234 8.505 8.856 9.198 9.533 9.919 10.283 10.629 11.004 11.423 11.823 12.243 12.717 13.225 13.723 14.293 14.969 15.612 16.33 17.137 18.016 18.954 20.007 21.031 21.968 22.211 22.07 21.852 21.46 20.998 20.565 20.097 19.656 19.176 18.726 18.339 18.005 17.66 17.316 17.004 16.672 16.389 16.133 15.855 15.577 15.348 15.105 14.845 14.633 14.422 14.21 13.979 13.734 13.563 13.388 13.119 12.929 12.718 12.605 12.373 12.116 11.834 11.683 11.36 11.179 10.998 10.83 10.503 10.309 10.072 9.779 9.449 9.02 8.476 7.12 -2 ,15106 ,KEBNE ,17026459,Wed Dec 22 14:31:54 CET,Wed Dec 22 16:08:42 CET,0.0 1.757 2.252 2.649 2.978 3.282 3.57 3.821 4.26 4.46 4.641 4.826 5.168 5.341 5.662 5.955 6.241 6.376 6.631 6.878 7.215 7.425 7.633 7.94 8.227 8.5 8.783 9.06 9.403 9.729 10.045 10.431 10.793 11.138 11.534 11.983 12.421 12.894 13.391 13.904 14.456 15.073 15.778 16.456 17.191 18.013 18.971 19.999 21.087 22.113 22.972 23.383 23.215 22.82 22.447 22.004 21.518 21.063 20.638 20.219 19.838 19.448 19.081 18.742 18.429 18.143 17.841 17.558 17.288 16.989 16.685 16.448 16.215 15.993 15.812 15.605 15.385 15.159 14.913 14.746 14.579 14.287 14.071 13.856 13.75 13.542 13.321 13.045 12.892 12.585 12.434 12.261 12.075 11.635 11.399 11.148 10.864 10.549 10.209 9.71 8.15 -3 ,8308 ,KEBNE ,17026460,Wed Dec 22 14:31:54 CET,Wed Dec 22 16:08:45 CET,0.0 1.835 2.416 2.814 3.163 3.485 3.745 3.968 4.419 4.622 4.807 4.996 5.335 5.497 5.812 6.115 6.389 6.524 6.784 7.03 7.398 7.616 7.827 8.146 8.442 8.728 9.0 9.267 9.608 9.923 10.225 10.597 10.973 11.353 11.778 12.235 12.675 13.136 13.624 14.148 14.699 15.306 15.966 16.622 17.397 18.209 19.101 20.093 21.117 22.21 23.287 23.68 23.579 23.313 22.989 22.586 22.144 21.706 21.306 20.902 20.519 20.189 19.862 19.531 19.227 18.949 18.669 18.388 18.136 17.883 17.587 17.321 17.059 16.788 16.567 16.345 16.116 15.88 15.641 15.478 15.297 14.999 14.803 14.606 14.501 14.277 14.022 13.725 13.572 13.253 13.092 12.925 12.742 12.36 12.142 11.885 11.609 11.306 10.933 10.426 9.091 -4 ,8871 ,KEBNE ,17026461,Wed Dec 22 14:31:54 CET,Wed Dec 22 16:08:38 CET,0.0 1.64 2.224 2.632 2.952 3.218 3.484 3.73 4.145 4.338 4.53 4.718 5.048 5.209 5.519 5.813 6.098 6.228 6.477 6.722 7.072 7.293 7.504 7.807 8.106 8.393 8.661 8.916 9.256 9.592 9.906 10.279 10.632 10.965 11.352 11.797 12.233 12.708 13.212 13.721 14.268 14.909 15.615 16.284 16.995 17.757 18.677 19.759 20.907 21.905 22.752 23.069 22.916 22.612 22.217 21.756 21.295 20.874 20.458 19.974 19.549 19.179 18.825 18.472 18.135 17.84 17.537 17.273 17.031 16.775 16.501 16.269 16.033 15.78 15.581 15.359 15.125 14.892 14.651 14.474 14.291 14.027 13.837 13.616 13.501 13.263 13.001 12.747 12.619 12.318 12.163 12.003 11.836 11.417 11.17 10.902 10.604 10.284 9.896 9.38 7.549 -5 ,24574 ,KEBNE ,17026462,Wed Dec 22 14:32:55 CET,Wed Dec 22 16:09:19 CET,0.0 1.492 2.013 2.406 2.722 3.009 3.267 3.508 3.948 4.156 4.362 4.576 4.913 5.077 5.385 5.656 5.92 6.05 6.302 6.547 6.897 7.122 7.339 7.651 7.942 8.217 8.483 8.742 9.071 9.388 9.707 10.091 10.442 10.778 11.168 11.617 12.046 12.494 12.996 13.511 14.045 14.656 15.338 16.027 16.814 17.65 18.553 19.471 20.439 21.437 22.326 22.7 22.626 22.397 22.081 21.604 21.096 20.633 20.211 19.781 19.407 19.069 18.74 18.401 18.075 17.769 17.43 17.129 16.864 16.575 16.274 16.031 15.788 15.539 15.336 15.114 14.891 14.664 14.418 14.252 14.092 13.825 13.611 13.378 13.263 13.027 12.764 12.479 12.329 12.016 11.858 11.687 11.504 11.104 10.873 10.612 10.34 10.065 9.738 9.28 8.241 -6 ,32243 ,KEBNE ,17026463,Wed Dec 22 14:32:55 CET,Wed Dec 22 16:09:41 CET,0.0 1.757 2.28 2.677 3.014 3.318 3.589 3.819 4.24 4.45 4.645 4.832 5.173 5.338 5.652 5.943 6.2 6.326 6.584 6.819 7.157 7.383 7.596 7.902 8.203 8.494 8.771 9.047 9.392 9.711 10.032 10.433 10.822 11.185 11.582 12.014 12.437 12.908 13.386 13.896 14.443 15.048 15.731 16.385 17.135 17.948 18.874 19.852 20.949 22.034 22.978 23.228 23.012 22.765 22.468 22.063 21.631 21.155 20.716 20.289 19.871 19.493 19.151 18.828 18.505 18.198 17.878 17.576 17.309 17.047 16.768 16.521 16.271 16.015 15.798 15.578 15.374 15.143 14.892 14.726 14.541 14.237 14.022 13.808 13.711 13.519 13.301 13.058 12.92 12.619 12.479 12.309 12.127 11.738 11.52 11.295 11.049 10.746 10.366 9.913 8.568 -7 ,21726 ,KEBNE ,17026464,Wed Dec 22 14:32:55 CET,Wed Dec 22 16:11:25 CET,0.0 1.728 2.249 2.643 2.982 3.259 3.511 3.754 4.221 4.432 4.617 4.783 5.116 5.28 5.57 5.85 6.116 6.238 6.493 6.745 7.072 7.28 7.496 7.814 8.108 8.385 8.657 8.927 9.277 9.617 9.934 10.308 10.679 11.047 11.46 11.907 12.344 12.826 13.317 13.81 14.338 14.945 15.646 16.293 17.029 17.877 18.773 19.726 20.776 21.793 22.623 22.91 22.784 22.481 22.109 21.705 21.306 20.901 20.5 20.073 19.724 19.404 19.055 18.713 18.401 18.116 17.824 17.539 17.283 17.008 16.706 16.458 16.205 15.942 15.732 15.521 15.294 15.044 14.793 14.623 14.445 14.148 13.941 13.736 13.627 13.394 13.153 12.891 12.752 12.452 12.288 12.117 11.946 11.583 11.363 11.095 10.814 10.548 10.217 9.733 8.606 -8 ,31241 ,KEBNE ,17026465,Wed Dec 22 14:32:55 CET,Wed Dec 22 16:09:36 CET,0.0 1.464 1.99 2.387 2.699 2.97 3.226 3.461 3.872 4.071 4.261 4.444 4.78 4.946 5.267 5.559 5.837 5.969 6.219 6.463 6.801 7.017 7.231 7.548 7.847 8.136 8.429 8.712 9.052 9.373 9.682 10.052 10.424 10.772 11.163 11.605 12.039 12.497 12.954 13.461 14.02 14.632 15.344 16.028 16.772 17.611 18.602 19.669 20.803 21.944 22.961 23.278 23.024 22.626 22.251 21.884 21.452 20.966 20.53 20.086 19.705 19.346 18.986 18.647 18.34 18.053 17.728 17.427 17.182 16.932 16.667 16.436 16.173 15.902 15.702 15.489 15.262 15.032 14.794 14.61 14.423 14.147 13.945 13.739 13.631 13.4 13.168 12.919 12.776 12.464 12.284 12.105 11.931 11.534 11.313 11.052 10.755 10.442 10.087 9.643 8.419 -9 ,9741 ,KEBNE ,17026466,Wed Dec 22 14:32:55 CET,Wed Dec 22 16:11:00 CET,0.0 1.92 2.548 2.966 3.3 3.582 3.834 4.065 4.494 4.694 4.882 5.076 5.408 5.578 5.909 6.209 6.48 6.609 6.85 7.082 7.438 7.664 7.884 8.193 8.481 8.775 9.061 9.332 9.681 10.03 10.363 10.748 11.111 11.451 11.831 12.247 12.657 13.114 13.616 14.15 14.703 15.321 16.0 16.677 17.478 18.342 19.302 20.239 21.157 22.122 23.013 23.453 23.457 23.205 22.902 22.534 22.11 21.7 21.316 20.908 20.538 20.196 19.839 19.502 19.206 18.93 18.629 18.344 18.092 17.833 17.55 17.316 17.077 16.805 16.604 16.415 16.196 15.962 15.733 15.583 15.421 15.154 14.966 14.762 14.656 14.435 14.195 13.941 13.806 13.503 13.338 13.163 12.977 12.54 12.309 12.078 11.829 11.53 11.163 10.666 8.927 -10 ,24790 ,KEBNE ,17026467,Wed Dec 22 14:32:55 CET,Wed Dec 22 16:09:46 CET,0.0 1.727 2.222 2.643 3.016 3.324 3.595 3.837 4.28 4.48 4.675 4.891 5.233 5.4 5.718 6.007 6.283 6.418 6.676 6.919 7.267 7.495 7.712 8.027 8.344 8.643 8.922 9.196 9.547 9.881 10.195 10.564 10.926 11.275 11.652 12.066 12.47 12.898 13.361 13.851 14.369 14.969 15.677 16.383 17.158 17.995 18.888 19.815 20.86 21.944 22.861 23.157 23.033 22.731 22.36 21.921 21.456 20.985 20.531 20.062 19.659 19.301 18.92 18.549 18.196 17.886 17.589 17.314 17.079 16.821 16.532 16.275 16.015 15.749 15.54 15.334 15.123 14.921 14.681 14.491 14.308 14.004 13.793 13.576 13.457 13.212 12.954 12.674 12.53 12.237 12.128 11.986 11.812 11.401 11.167 10.891 10.607 10.301 9.928 9.468 7.96 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt deleted file mode 100644 index 863b9606..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21107 ,KEBNE ,16724517,Sun Nov 28 06:37:41 CET,Sun Nov 28 08:15:34 CET,0.0 0.645 0.994 1.292 1.547 1.795 2.019 2.213 2.6 2.791 2.98 3.135 3.502 3.654 3.948 4.23 4.514 4.659 4.943 5.209 5.582 5.819 6.05 6.396 6.739 7.067 7.384 7.695 8.117 8.525 8.909 9.379 9.841 10.306 10.842 11.423 12.001 12.643 13.316 14.051 14.868 15.799 16.883 18.018 19.369 20.87 22.637 24.713 27.231 30.33 34.201 37.48 39.407 40.593 41.342 41.848 42.152 42.294 42.379 42.431 42.396 42.337 42.267 42.175 42.061 41.932 41.779 41.633 41.514 41.387 41.231 41.086 40.939 40.772 40.629 40.468 40.278 40.049 39.808 39.659 39.514 39.279 39.097 38.903 38.804 38.606 38.392 38.147 38.011 37.697 37.564 37.413 37.237 36.8 36.552 36.284 36.009 35.69 35.285 34.762 33.416 -2 ,24587 ,KEBNE ,16724518,Sun Nov 28 06:38:42 CET,Sun Nov 28 08:16:49 CET,0.0 0.793 1.145 1.454 1.741 2.0 2.243 2.48 2.9 3.097 3.298 3.474 3.859 4.023 4.328 4.62 4.909 5.045 5.309 5.579 5.993 6.245 6.479 6.834 7.177 7.504 7.809 8.106 8.508 8.899 9.28 9.74 10.194 10.642 11.168 11.755 12.318 12.963 13.702 14.503 15.331 16.262 17.365 18.478 19.762 21.221 22.996 25.03 27.462 30.543 34.463 37.767 39.714 40.869 41.602 42.129 42.491 42.736 42.887 42.93 42.903 42.854 42.784 42.716 42.628 42.534 42.391 42.255 42.142 42.005 41.84 41.683 41.511 41.333 41.196 41.035 40.843 40.651 40.465 40.333 40.194 39.941 39.756 39.57 39.472 39.262 39.032 38.775 38.635 38.323 38.189 38.029 37.859 37.46 37.237 37.007 36.759 36.486 36.147 35.698 34.354 -3 ,22335 ,KEBNE ,16724519,Sun Nov 28 06:38:42 CET,Sun Nov 28 08:16:31 CET,0.0 0.824 1.204 1.537 1.823 2.101 2.344 2.563 2.975 3.17 3.357 3.507 3.874 4.027 4.321 4.614 4.9 5.036 5.305 5.581 5.996 6.246 6.473 6.82 7.174 7.513 7.848 8.173 8.601 9.007 9.38 9.872 10.35 10.778 11.277 11.849 12.416 13.042 13.719 14.454 15.229 16.131 17.203 18.318 19.666 21.188 22.937 24.901 27.336 30.352 34.169 37.509 39.425 40.621 41.399 41.935 42.283 42.486 42.579 42.631 42.656 42.646 42.585 42.504 42.409 42.303 42.176 42.047 41.918 41.769 41.604 41.45 41.292 41.109 40.962 40.828 40.685 40.514 40.325 40.186 40.043 39.807 39.632 39.457 39.36 39.144 38.921 38.681 38.54 38.235 38.106 37.944 37.783 37.413 37.189 36.928 36.627 36.303 35.929 35.45 34.085 -4 ,5559 ,KEBNE ,16724520,Sun Nov 28 06:38:42 CET,Sun Nov 28 08:16:18 CET,0.0 0.679 1.107 1.425 1.717 1.981 2.212 2.443 2.892 3.096 3.278 3.408 3.773 3.931 4.243 4.537 4.815 4.955 5.23 5.506 5.909 6.164 6.422 6.788 7.139 7.477 7.792 8.102 8.52 8.93 9.31 9.762 10.219 10.668 11.186 11.79 12.383 13.054 13.789 14.587 15.43 16.367 17.533 18.696 19.979 21.433 23.191 25.257 27.734 30.691 34.355 37.645 39.652 40.947 41.777 42.296 42.659 42.891 42.988 43.004 42.963 42.914 42.865 42.809 42.726 42.627 42.516 42.402 42.282 42.12 41.925 41.776 41.625 41.451 41.312 41.157 40.984 40.81 40.628 40.492 40.347 40.115 39.948 39.764 39.669 39.477 39.257 39.018 38.896 38.599 38.489 38.341 38.179 37.811 37.606 37.378 37.11 36.776 36.361 35.872 33.625 -5 ,27558 ,KEBNE ,16724521,Sun Nov 28 06:38:42 CET,Sun Nov 28 08:16:39 CET,0.0 0.854 1.269 1.55 1.818 2.079 2.32 2.559 2.983 3.17 3.349 3.49 3.865 4.026 4.346 4.664 4.965 5.104 5.361 5.61 5.986 6.233 6.47 6.81 7.134 7.463 7.796 8.123 8.526 8.914 9.312 9.798 10.265 10.713 11.242 11.849 12.431 13.073 13.768 14.512 15.301 16.204 17.294 18.403 19.703 21.197 22.948 24.961 27.463 30.632 34.572 37.808 39.726 40.906 41.633 42.142 42.486 42.711 42.849 42.899 42.87 42.831 42.792 42.74 42.641 42.517 42.395 42.27 42.134 41.963 41.76 41.601 41.449 41.272 41.115 40.959 40.804 40.629 40.43 40.283 40.137 39.903 39.719 39.529 39.436 39.23 38.999 38.746 38.609 38.301 38.157 37.976 37.782 37.345 37.112 36.876 36.601 36.283 35.918 35.393 34.034 -6 ,5726 ,KEBNE ,16724522,Sun Nov 28 06:38:42 CET,Sun Nov 28 08:17:57 CET,0.0 0.771 1.136 1.434 1.674 1.901 2.13 2.344 2.742 2.936 3.13 3.288 3.656 3.81 4.124 4.405 4.667 4.802 5.066 5.324 5.704 5.949 6.189 6.527 6.852 7.179 7.501 7.82 8.231 8.623 9.004 9.48 9.942 10.381 10.896 11.493 12.088 12.739 13.439 14.193 14.998 15.914 17.007 18.113 19.387 20.855 22.566 24.507 26.844 29.683 33.331 36.462 38.295 39.498 40.322 40.939 41.328 41.55 41.667 41.748 41.788 41.777 41.74 41.65 41.527 41.429 41.312 41.172 41.037 40.884 40.709 40.571 40.424 40.248 40.113 39.973 39.811 39.647 39.475 39.338 39.188 38.949 38.774 38.574 38.47 38.259 38.025 37.773 37.647 37.354 37.227 37.071 36.918 36.552 36.327 36.078 35.793 35.466 35.08 34.568 32.968 -7 ,1777 ,KEBNE ,16724523,Sun Nov 28 06:38:44 CET,Sun Nov 28 08:12:03 CET,0.0 0.77 1.201 1.508 1.778 2.013 2.237 2.441 2.793 2.961 3.143 3.302 3.673 3.825 4.122 4.416 4.692 4.823 5.078 5.331 5.705 5.943 6.173 6.51 6.846 7.182 7.523 7.851 8.249 8.626 9.003 9.468 9.91 10.34 10.86 11.463 12.07 12.73 13.399 14.15 14.973 15.883 16.982 18.099 19.392 20.894 22.651 24.677 27.088 29.976 33.67 36.79 38.64 39.869 40.666 41.232 41.592 41.789 41.903 41.953 41.94 41.91 41.833 41.705 41.589 41.481 41.363 41.25 41.123 40.981 40.83 40.683 40.528 40.367 40.236 40.089 39.929 39.769 39.599 39.458 39.311 39.111 38.961 38.776 38.674 38.47 38.25 38.016 37.9 37.608 37.484 37.312 37.145 36.796 36.569 36.316 36.05 35.766 35.382 34.834 33.845 -8 ,31337 ,KEBNE ,16724524,Sun Nov 28 06:38:42 CET,Sun Nov 28 08:17:06 CET,0.0 0.609 1.022 1.352 1.637 1.897 2.138 2.354 2.737 2.928 3.108 3.242 3.621 3.789 4.1 4.395 4.672 4.807 5.077 5.337 5.707 5.952 6.19 6.527 6.855 7.185 7.512 7.824 8.221 8.601 8.983 9.456 9.922 10.359 10.86 11.456 12.052 12.717 13.432 14.168 14.965 15.896 16.982 18.116 19.44 20.932 22.696 24.73 27.3 30.478 34.292 37.446 39.281 40.47 41.25 41.725 42.043 42.281 42.392 42.391 42.36 42.317 42.23 42.129 42.015 41.883 41.74 41.609 41.479 41.325 41.177 41.042 40.88 40.706 40.563 40.416 40.248 40.057 39.855 39.704 39.546 39.308 39.136 38.962 38.874 38.682 38.465 38.217 38.076 37.763 37.646 37.508 37.351 36.961 36.725 36.463 36.197 35.906 35.582 35.123 33.723 -9 ,15717 ,KEBNE ,16724525,Sun Nov 28 06:38:42 CET,Sun Nov 28 08:17:03 CET,0.0 0.621 1.065 1.454 1.782 2.061 2.32 2.561 3.02 3.238 3.447 3.641 4.021 4.194 4.511 4.796 5.071 5.203 5.468 5.732 6.111 6.348 6.59 6.946 7.297 7.645 7.97 8.272 8.662 9.049 9.429 9.889 10.35 10.806 11.332 11.928 12.521 13.174 13.873 14.642 15.475 16.392 17.492 18.64 19.947 21.41 23.182 25.244 27.758 30.911 34.84 38.107 40.069 41.305 42.122 42.666 42.974 43.162 43.279 43.363 43.374 43.343 43.276 43.161 43.02 42.876 42.74 42.613 42.471 42.313 42.157 42.026 41.867 41.678 41.519 41.351 41.16 40.949 40.739 40.578 40.403 40.137 39.957 39.766 39.652 39.397 39.141 38.869 38.72 38.401 38.246 38.077 37.887 37.454 37.224 36.982 36.713 36.414 36.021 35.386 33.659 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 37e81760..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15584 ,KEBNE ,16724527,Sun Nov 28 06:38:42 CET,Sun Nov 28 08:16:21 CET,0.0 0.797 1.236 1.598 1.907 2.184 2.428 2.672 3.185 3.428 3.638 3.841 4.247 4.434 4.803 5.173 5.533 5.705 6.026 6.338 6.804 7.108 7.406 7.838 8.25 8.66 9.063 9.446 9.938 10.412 10.885 11.483 12.064 12.625 13.294 14.059 14.813 15.667 16.601 17.632 18.741 19.98 21.449 22.967 24.784 26.863 29.32 32.194 35.652 39.976 45.605 50.626 53.877 56.152 57.738 58.879 59.685 60.298 60.777 61.16 61.415 61.613 61.761 61.851 61.9 61.914 61.915 61.901 61.888 61.86 61.8 61.738 61.657 61.567 61.483 61.377 61.277 61.168 61.035 60.952 60.858 60.683 60.562 60.422 60.345 60.192 60.02 59.838 59.734 59.468 59.313 59.141 58.965 58.572 58.35 58.104 57.84 57.526 57.109 56.567 55.369 -2 ,18989 ,KEBNE ,16724528,Sun Nov 28 06:38:43 CET,Sun Nov 28 08:16:52 CET,0.0 0.706 1.105 1.422 1.722 1.997 2.256 2.508 2.969 3.185 3.393 3.586 3.991 4.185 4.55 4.899 5.243 5.411 5.729 6.037 6.494 6.792 7.084 7.517 7.932 8.333 8.725 9.114 9.624 10.111 10.586 11.176 11.745 12.287 12.921 13.649 14.395 15.253 16.178 17.181 18.237 19.433 20.874 22.382 24.199 26.274 28.738 31.597 35.066 39.374 45.01 50.079 53.238 55.408 56.948 58.089 58.935 59.559 60.013 60.385 60.635 60.828 60.969 61.065 61.113 61.138 61.15 61.148 61.131 61.09 61.038 60.984 60.924 60.848 60.778 60.691 60.583 60.452 60.313 60.22 60.117 59.942 59.793 59.627 59.548 59.372 59.173 58.976 58.866 58.598 58.479 58.335 58.181 57.83 57.623 57.41 57.186 56.904 56.521 56.014 54.695 -3 ,7497 ,KEBNE ,16724529,Sun Nov 28 06:39:48 CET,Sun Nov 28 08:15:58 CET,0.0 0.629 1.001 1.33 1.64 1.901 2.141 2.406 2.915 3.136 3.34 3.509 3.9 4.081 4.45 4.81 5.146 5.309 5.631 5.952 6.425 6.726 7.026 7.468 7.888 8.301 8.716 9.12 9.635 10.147 10.63 11.21 11.794 12.371 13.037 13.798 14.552 15.387 16.295 17.262 18.296 19.53 21.044 22.593 24.433 26.514 28.976 31.878 35.416 39.877 45.694 50.727 53.874 56.062 57.612 58.793 59.648 60.259 60.685 61.026 61.253 61.4 61.512 61.6 61.657 61.694 61.704 61.671 61.627 61.569 61.505 61.444 61.368 61.299 61.229 61.134 61.041 60.935 60.776 60.664 60.569 60.4 60.257 60.09 60.005 59.812 59.594 59.353 59.223 58.946 58.814 58.674 58.52 58.177 57.984 57.765 57.531 57.244 56.885 56.38 54.699 -4 ,41 ,KEBNE ,16724530,Sun Nov 28 06:39:44 CET,Sun Nov 28 08:17:37 CET,0.0 0.642 1.039 1.381 1.695 1.985 2.259 2.503 2.945 3.149 3.341 3.52 3.917 4.104 4.474 4.817 5.151 5.318 5.649 5.966 6.414 6.705 6.991 7.424 7.845 8.252 8.658 9.062 9.587 10.084 10.578 11.19 11.778 12.358 13.038 13.791 14.522 15.344 16.241 17.223 18.282 19.516 20.993 22.487 24.279 26.333 28.772 31.622 35.156 39.589 45.281 50.324 53.57 55.796 57.335 58.48 59.31 59.968 60.463 60.866 61.126 61.285 61.385 61.476 61.566 61.606 61.606 61.598 61.575 61.54 61.491 61.44 61.368 61.27 61.186 61.101 61.007 60.881 60.751 60.656 60.541 60.366 60.243 60.093 60.01 59.836 59.649 59.437 59.307 59.032 58.885 58.729 58.572 58.192 57.971 57.753 57.519 57.205 56.824 56.366 54.972 -5 ,19089 ,KEBNE ,16724531,Sun Nov 28 06:39:44 CET,Sun Nov 28 08:17:33 CET,0.0 0.516 0.946 1.304 1.619 1.921 2.193 2.442 2.917 3.138 3.346 3.528 3.921 4.107 4.471 4.821 5.157 5.327 5.656 5.961 6.405 6.695 6.983 7.408 7.821 8.231 8.625 9.004 9.511 10.012 10.497 11.064 11.61 12.155 12.821 13.604 14.367 15.195 16.085 17.057 18.122 19.361 20.829 22.331 24.123 26.185 28.613 31.452 35.024 39.526 45.193 50.234 53.413 55.587 57.141 58.275 59.063 59.653 60.094 60.449 60.701 60.888 61.013 61.094 61.16 61.202 61.214 61.2 61.176 61.147 61.09 61.019 60.947 60.859 60.774 60.684 60.584 60.47 60.338 60.248 60.156 59.998 59.863 59.711 59.631 59.471 59.287 59.078 58.974 58.71 58.601 58.469 58.326 58.035 57.851 57.622 57.341 57.009 56.613 56.032 54.746 -6 ,2911 ,KEBNE ,16724532,Sun Nov 28 06:39:44 CET,Sun Nov 28 08:18:49 CET,0.0 0.923 1.404 1.754 2.071 2.349 2.613 2.858 3.298 3.514 3.719 3.9 4.296 4.484 4.865 5.237 5.584 5.747 6.062 6.372 6.82 7.116 7.413 7.834 8.241 8.638 9.023 9.415 9.934 10.419 10.886 11.472 12.059 12.631 13.307 14.072 14.817 15.642 16.543 17.542 18.592 19.757 21.153 22.617 24.394 26.422 28.832 31.684 35.164 39.479 45.072 50.071 53.195 55.371 56.938 58.089 58.922 59.544 59.998 60.386 60.657 60.854 60.99 61.058 61.092 61.108 61.115 61.114 61.105 61.085 61.04 60.988 60.912 60.82 60.741 60.651 60.538 60.403 60.255 60.149 60.042 59.848 59.697 59.553 59.478 59.302 59.123 58.941 58.833 58.56 58.41 58.244 58.062 57.668 57.458 57.226 56.96 56.681 56.347 55.823 54.465 -7 ,15762 ,KEBNE ,16724533,Sun Nov 28 06:39:44 CET,Sun Nov 28 08:18:45 CET,0.0 0.95 1.381 1.676 1.956 2.238 2.496 2.735 3.2 3.425 3.634 3.82 4.213 4.397 4.739 5.063 5.387 5.548 5.868 6.178 6.625 6.927 7.231 7.67 8.092 8.493 8.893 9.286 9.78 10.263 10.751 11.359 11.935 12.48 13.136 13.901 14.648 15.489 16.4 17.368 18.422 19.636 21.087 22.549 24.283 26.36 28.861 31.757 35.299 39.681 45.324 50.407 53.698 55.926 57.458 58.583 59.378 59.977 60.414 60.789 61.042 61.229 61.403 61.533 61.605 61.625 61.623 61.603 61.576 61.536 61.471 61.398 61.306 61.195 61.101 61.002 60.899 60.79 60.658 60.561 60.457 60.274 60.131 59.971 59.889 59.714 59.527 59.33 59.228 58.96 58.818 58.674 58.521 58.197 58.007 57.78 57.509 57.209 56.857 56.323 55.109 -8 ,30116 ,KEBNE ,16724534,Sun Nov 28 06:39:44 CET,Sun Nov 28 08:18:48 CET,0.0 0.684 1.099 1.451 1.745 2.007 2.263 2.507 2.979 3.202 3.416 3.629 4.037 4.229 4.612 4.986 5.336 5.504 5.84 6.169 6.623 6.914 7.202 7.624 8.052 8.47 8.874 9.272 9.798 10.306 10.804 11.401 11.971 12.541 13.216 13.977 14.711 15.547 16.483 17.496 18.55 19.75 21.211 22.708 24.499 26.534 28.948 31.799 35.306 39.714 45.428 50.512 53.725 55.932 57.518 58.656 59.461 60.118 60.587 60.959 61.243 61.445 61.565 61.635 61.692 61.733 61.754 61.748 61.718 61.67 61.615 61.565 61.485 61.391 61.324 61.244 61.124 60.988 60.867 60.777 60.674 60.488 60.343 60.187 60.105 59.918 59.727 59.539 59.44 59.186 59.056 58.898 58.735 58.399 58.212 58.005 57.753 57.443 57.066 56.573 55.391 -9 ,22938 ,KEBNE ,16724535,Sun Nov 28 06:39:44 CET,Sun Nov 28 08:17:37 CET,0.0 0.599 0.977 1.29 1.553 1.803 2.053 2.305 2.763 2.973 3.189 3.407 3.815 4.0 4.349 4.689 5.018 5.182 5.506 5.815 6.278 6.588 6.888 7.312 7.725 8.136 8.534 8.919 9.417 9.901 10.377 10.971 11.546 12.092 12.732 13.474 14.202 15.025 15.956 16.953 18.008 19.241 20.718 22.218 24.041 26.183 28.669 31.512 34.986 39.304 44.854 49.817 53.017 55.27 56.847 57.958 58.78 59.42 59.9 60.286 60.545 60.724 60.864 60.983 61.046 61.069 61.084 61.079 61.062 61.037 60.978 60.914 60.83 60.729 60.656 60.581 60.498 60.392 60.258 60.159 60.042 59.857 59.742 59.605 59.525 59.369 59.182 58.952 58.825 58.559 58.462 58.318 58.165 57.828 57.624 57.402 57.191 56.926 56.569 56.054 54.417 -10 ,32180 ,KEBNE ,16724536,Sun Nov 28 06:40:45 CET,Sun Nov 28 08:18:54 CET,0.0 0.99 1.489 1.875 2.195 2.477 2.733 2.97 3.406 3.612 3.816 4.01 4.409 4.603 4.989 5.368 5.732 5.905 6.24 6.565 7.008 7.29 7.581 8.007 8.42 8.819 9.217 9.615 10.132 10.64 11.136 11.747 12.327 12.888 13.564 14.321 15.064 15.892 16.793 17.778 18.816 20.014 21.459 22.929 24.694 26.752 29.19 32.005 35.478 39.795 45.418 50.526 53.793 56.019 57.6 58.8 59.663 60.307 60.752 61.101 61.351 61.515 61.645 61.746 61.805 61.842 61.862 61.85 61.812 61.763 61.706 61.642 61.564 61.461 61.381 61.283 61.16 61.039 60.903 60.798 60.687 60.511 60.376 60.242 60.175 60.01 59.821 59.628 59.518 59.246 59.108 58.957 58.801 58.447 58.253 58.012 57.737 57.423 57.038 56.579 54.88 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt deleted file mode 100644 index d93ad267..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,3239 ,KEBNE ,16724538,Sun Nov 28 06:40:45 CET,Sun Nov 28 08:18:59 CET,0.0 1.016 1.467 1.8 2.048 2.248 2.431 2.609 2.921 3.061 3.197 3.312 3.575 3.693 3.907 4.101 4.289 4.379 4.55 4.705 4.938 5.082 5.207 5.39 5.558 5.723 5.885 6.033 6.219 6.391 6.552 6.74 6.918 7.082 7.259 7.453 7.644 7.842 8.03 8.219 8.408 8.601 8.826 9.035 9.164 9.186 9.176 9.122 8.89 8.117 6.401 4.317 2.461 0.792 -0.668 -1.935 -3.028 -3.999 -4.801 -5.624 -6.354 -6.993 -7.612 -8.201 -8.733 -9.222 -9.74 -10.198 -10.578 -10.969 -11.388 -11.736 -12.092 -12.441 -12.712 -13.005 -13.316 -13.638 -13.967 -14.204 -14.446 -14.812 -15.058 -15.301 -15.428 -15.689 -15.977 -16.292 -16.447 -16.78 -16.966 -17.143 -17.335 -17.747 -17.977 -18.23 -18.54 -18.879 -19.218 -19.664 -20.761 -3 ,19918 ,KEBNE ,16724539,Sun Nov 28 06:40:45 CET,Sun Nov 28 08:18:06 CET,0.0 0.773 1.138 1.458 1.709 1.896 2.07 2.245 2.583 2.747 2.894 3.028 3.294 3.401 3.615 3.822 4.009 4.089 4.241 4.392 4.594 4.719 4.848 5.038 5.207 5.358 5.518 5.678 5.874 6.069 6.262 6.481 6.67 6.847 7.037 7.219 7.395 7.591 7.774 7.939 8.122 8.313 8.478 8.629 8.746 8.836 8.894 8.808 8.504 7.756 6.152 4.012 2.203 0.582 -0.833 -2.019 -3.056 -3.987 -4.79 -5.595 -6.287 -6.901 -7.481 -8.048 -8.572 -9.036 -9.535 -9.988 -10.371 -10.776 -11.198 -11.535 -11.888 -12.259 -12.545 -12.853 -13.179 -13.508 -13.847 -14.077 -14.301 -14.646 -14.904 -15.177 -15.319 -15.614 -15.909 -16.227 -16.391 -16.712 -16.872 -17.052 -17.247 -17.662 -17.882 -18.127 -18.409 -18.745 -19.144 -19.587 -20.493 -4 ,5714 ,KEBNE ,16724540,Sun Nov 28 06:40:45 CET,Sun Nov 28 08:17:55 CET,0.0 1.062 1.477 1.744 1.978 2.21 2.415 2.581 2.894 3.04 3.173 3.258 3.523 3.651 3.887 4.094 4.281 4.378 4.552 4.707 4.925 5.067 5.208 5.395 5.565 5.727 5.888 6.041 6.224 6.385 6.527 6.7 6.867 7.022 7.19 7.385 7.574 7.752 7.929 8.1 8.293 8.51 8.701 8.848 8.964 9.024 9.027 8.928 8.587 7.946 6.587 4.596 2.87 1.337 -0.037 -1.243 -2.306 -3.295 -4.138 -4.966 -5.686 -6.318 -6.911 -7.455 -7.962 -8.443 -8.933 -9.375 -9.771 -10.185 -10.615 -10.965 -11.326 -11.709 -12.009 -12.305 -12.595 -12.897 -13.222 -13.442 -13.664 -14.015 -14.266 -14.515 -14.64 -14.908 -15.193 -15.513 -15.69 -16.03 -16.21 -16.396 -16.598 -17.049 -17.284 -17.525 -17.79 -18.095 -18.464 -18.942 -20.06 -5 ,24565 ,KEBNE ,16724541,Sun Nov 28 06:40:45 CET,Sun Nov 28 08:17:49 CET,0.0 0.927 1.268 1.552 1.8 2.035 2.268 2.463 2.761 2.902 3.036 3.147 3.409 3.521 3.727 3.92 4.098 4.188 4.364 4.521 4.746 4.885 5.006 5.181 5.363 5.543 5.712 5.861 6.056 6.26 6.454 6.677 6.88 7.061 7.251 7.441 7.631 7.828 7.995 8.149 8.315 8.49 8.636 8.758 8.883 8.955 8.938 8.761 8.366 7.594 6.018 3.864 1.966 0.382 -0.974 -2.247 -3.384 -4.396 -5.234 -6.069 -6.817 -7.472 -8.073 -8.634 -9.15 -9.626 -10.139 -10.595 -10.981 -11.389 -11.817 -12.151 -12.506 -12.893 -13.181 -13.46 -13.758 -14.083 -14.423 -14.661 -14.904 -15.282 -15.545 -15.819 -15.957 -16.247 -16.548 -16.868 -17.038 -17.369 -17.56 -17.75 -17.951 -18.41 -18.665 -18.93 -19.229 -19.558 -19.915 -20.375 -21.583 -6 ,13742 ,KEBNE ,16724542,Sun Nov 28 06:40:45 CET,Sun Nov 28 08:17:37 CET,0.0 1.036 1.454 1.756 1.996 2.22 2.427 2.62 2.964 3.108 3.248 3.374 3.639 3.759 3.982 4.167 4.337 4.431 4.613 4.783 5.026 5.17 5.308 5.514 5.706 5.876 6.037 6.192 6.39 6.589 6.792 7.024 7.216 7.389 7.589 7.805 7.996 8.188 8.396 8.616 8.816 8.983 9.152 9.318 9.442 9.52 9.568 9.478 9.171 8.486 7.003 4.958 3.136 1.539 0.133 -1.117 -2.194 -3.174 -4.022 -4.85 -5.565 -6.221 -6.844 -7.415 -7.934 -8.388 -8.857 -9.29 -9.669 -10.056 -10.452 -10.788 -11.147 -11.52 -11.805 -12.104 -12.416 -12.724 -13.057 -13.294 -13.541 -13.927 -14.18 -14.438 -14.572 -14.843 -15.119 -15.417 -15.575 -15.907 -16.095 -16.293 -16.509 -16.95 -17.19 -17.449 -17.741 -18.08 -18.462 -18.951 -20.277 -8 ,8710 ,KEBNE ,16724544,Sun Nov 28 06:40:45 CET,Sun Nov 28 08:17:43 CET,0.0 1.067 1.46 1.743 2.0 2.226 2.416 2.601 2.934 3.08 3.221 3.347 3.616 3.73 3.935 4.115 4.292 4.38 4.556 4.723 4.949 5.098 5.246 5.45 5.634 5.796 5.957 6.116 6.308 6.49 6.675 6.894 7.081 7.252 7.43 7.619 7.8 7.992 8.195 8.395 8.586 8.766 8.946 9.146 9.342 9.505 9.613 9.537 9.207 8.505 7.147 5.245 3.435 1.816 0.42 -0.815 -1.848 -2.799 -3.631 -4.476 -5.225 -5.876 -6.47 -7.026 -7.552 -8.027 -8.515 -8.949 -9.333 -9.727 -10.127 -10.466 -10.817 -11.176 -11.454 -11.749 -12.057 -12.364 -12.673 -12.887 -13.111 -13.458 -13.709 -13.972 -14.107 -14.395 -14.711 -15.055 -15.218 -15.539 -15.713 -15.898 -16.097 -16.492 -16.692 -16.92 -17.176 -17.476 -17.845 -18.315 -19.284 -9 ,11993 ,KEBNE ,16724545,Sun Nov 28 06:40:45 CET,Sun Nov 28 08:17:54 CET,0.0 1.079 1.506 1.839 2.111 2.352 2.566 2.742 3.047 3.208 3.367 3.49 3.757 3.872 4.08 4.274 4.47 4.565 4.746 4.923 5.166 5.304 5.43 5.629 5.823 6.007 6.18 6.337 6.522 6.69 6.856 7.054 7.236 7.411 7.61 7.819 8.025 8.229 8.413 8.574 8.726 8.91 9.103 9.224 9.281 9.305 9.288 9.172 8.882 8.257 6.822 4.725 2.899 1.325 -0.033 -1.24 -2.278 -3.241 -4.064 -4.885 -5.616 -6.254 -6.868 -7.468 -8.037 -8.558 -9.112 -9.601 -10.013 -10.421 -10.833 -11.182 -11.544 -11.905 -12.177 -12.467 -12.769 -13.083 -13.417 -13.641 -13.859 -14.193 -14.437 -14.705 -14.843 -15.121 -15.412 -15.713 -15.864 -16.19 -16.372 -16.558 -16.756 -17.167 -17.389 -17.633 -17.915 -18.239 -18.613 -19.055 -20.217 -10 ,3565 ,KEBNE ,16724546,Sun Nov 28 06:40:45 CET,Sun Nov 28 08:17:48 CET,0.0 1.502 1.986 2.312 2.566 2.772 2.952 3.136 3.469 3.607 3.745 3.877 4.154 4.277 4.49 4.682 4.868 4.958 5.124 5.29 5.522 5.663 5.791 5.973 6.159 6.334 6.491 6.652 6.844 7.01 7.178 7.377 7.566 7.747 7.944 8.162 8.344 8.508 8.666 8.811 8.972 9.157 9.352 9.507 9.64 9.739 9.775 9.666 9.307 8.556 7.026 4.943 3.116 1.53 0.159 -1.058 -2.159 -3.149 -3.991 -4.83 -5.55 -6.184 -6.765 -7.305 -7.818 -8.299 -8.817 -9.288 -9.678 -10.066 -10.474 -10.805 -11.152 -11.514 -11.787 -12.072 -12.379 -12.705 -13.035 -13.26 -13.5 -13.87 -14.133 -14.409 -14.544 -14.82 -15.124 -15.441 -15.607 -15.933 -16.116 -16.312 -16.509 -16.935 -17.171 -17.403 -17.667 -18.0 -18.359 -18.799 -19.793 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt deleted file mode 100644 index 1d0331cc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31577 ,KEBNE ,16724547,Sun Nov 28 06:40:45 CET,Sun Nov 28 08:17:49 CET,0.0 0.854 1.173 1.45 1.723 1.952 2.152 2.336 2.631 2.767 2.9 3.012 3.273 3.381 3.574 3.77 3.956 4.037 4.197 4.345 4.556 4.683 4.794 4.955 5.108 5.241 5.363 5.487 5.647 5.787 5.917 6.08 6.223 6.353 6.5 6.639 6.773 6.907 7.024 7.146 7.268 7.398 7.485 7.522 7.547 7.506 7.37 7.091 6.559 5.565 3.68 1.419 -0.436 -2.038 -3.398 -4.604 -5.686 -6.64 -7.43 -8.232 -8.927 -9.53 -10.105 -10.641 -11.134 -11.598 -12.087 -12.516 -12.886 -13.248 -13.629 -13.967 -14.308 -14.649 -14.906 -15.164 -15.442 -15.74 -16.063 -16.282 -16.488 -16.806 -17.03 -17.272 -17.4 -17.668 -17.961 -18.276 -18.436 -18.747 -18.911 -19.101 -19.288 -19.666 -19.884 -20.128 -20.387 -20.654 -20.959 -21.356 -22.197 -2 ,14209 ,KEBNE ,16724548,Sun Nov 28 06:40:45 CET,Sun Nov 28 08:17:41 CET,0.0 0.856 1.222 1.454 1.658 1.851 2.029 2.189 2.489 2.622 2.744 2.82 3.063 3.165 3.384 3.586 3.758 3.834 3.978 4.122 4.317 4.438 4.56 4.741 4.91 5.072 5.221 5.353 5.513 5.667 5.81 5.979 6.144 6.288 6.437 6.587 6.733 6.903 7.051 7.167 7.277 7.412 7.572 7.686 7.707 7.664 7.57 7.347 6.937 6.179 4.578 2.445 0.625 -0.923 -2.276 -3.519 -4.582 -5.516 -6.326 -7.144 -7.838 -8.477 -9.076 -9.614 -10.122 -10.588 -11.084 -11.503 -11.845 -12.215 -12.598 -12.917 -13.248 -13.587 -13.858 -14.141 -14.431 -14.736 -15.059 -15.279 -15.504 -15.858 -16.087 -16.316 -16.437 -16.694 -16.968 -17.25 -17.402 -17.733 -17.941 -18.131 -18.308 -18.689 -18.908 -19.139 -19.393 -19.668 -19.946 -20.321 -21.085 -3 ,20695 ,KEBNE ,16724549,Sun Nov 28 06:40:45 CET,Sun Nov 28 08:17:52 CET,0.0 0.891 1.262 1.533 1.776 2.01 2.209 2.388 2.706 2.843 2.977 3.084 3.325 3.422 3.615 3.793 3.961 4.041 4.208 4.366 4.574 4.704 4.828 5.013 5.19 5.349 5.49 5.623 5.802 5.964 6.106 6.27 6.406 6.539 6.705 6.88 7.041 7.201 7.352 7.492 7.625 7.756 7.888 7.967 7.986 7.967 7.878 7.67 7.224 6.382 4.792 2.718 0.937 -0.619 -1.976 -3.192 -4.272 -5.261 -6.086 -6.891 -7.583 -8.189 -8.771 -9.332 -9.846 -10.307 -10.799 -11.236 -11.618 -12.005 -12.403 -12.745 -13.101 -13.438 -13.694 -13.97 -14.244 -14.531 -14.837 -15.049 -15.271 -15.623 -15.868 -16.117 -16.24 -16.505 -16.799 -17.1 -17.246 -17.556 -17.718 -17.891 -18.078 -18.49 -18.714 -18.945 -19.183 -19.459 -19.794 -20.178 -20.928 -4 ,5692 ,KEBNE ,16724550,Sun Nov 28 06:41:47 CET,Sun Nov 28 08:18:44 CET,0.0 0.787 1.164 1.451 1.721 1.941 2.134 2.319 2.643 2.789 2.918 3.011 3.264 3.36 3.555 3.75 3.937 4.018 4.165 4.313 4.518 4.642 4.759 4.927 5.091 5.247 5.389 5.521 5.682 5.828 5.959 6.118 6.275 6.421 6.586 6.764 6.917 7.063 7.209 7.356 7.48 7.587 7.654 7.673 7.679 7.672 7.583 7.355 6.929 6.116 4.495 2.408 0.599 -0.979 -2.339 -3.536 -4.568 -5.499 -6.273 -7.051 -7.734 -8.33 -8.886 -9.419 -9.903 -10.331 -10.793 -11.218 -11.583 -11.964 -12.348 -12.673 -13.015 -13.363 -13.629 -13.901 -14.19 -14.488 -14.795 -15.009 -15.224 -15.549 -15.791 -16.048 -16.175 -16.441 -16.719 -17.014 -17.169 -17.497 -17.692 -17.874 -18.072 -18.518 -18.742 -18.986 -19.255 -19.527 -19.839 -20.26 -21.113 -5 ,10879 ,KEBNE ,16724551,Sun Nov 28 06:41:47 CET,Sun Nov 28 08:20:08 CET,0.0 0.895 1.269 1.559 1.797 2.005 2.201 2.371 2.662 2.799 2.936 3.032 3.284 3.392 3.582 3.754 3.93 4.014 4.169 4.313 4.509 4.628 4.737 4.89 5.042 5.193 5.334 5.462 5.63 5.8 5.945 6.105 6.262 6.409 6.575 6.745 6.895 7.054 7.232 7.379 7.489 7.624 7.767 7.879 7.947 7.91 7.79 7.543 7.035 6.148 4.551 2.589 0.871 -0.706 -2.083 -3.285 -4.355 -5.314 -6.116 -6.929 -7.638 -8.269 -8.871 -9.45 -9.989 -10.461 -10.926 -11.34 -11.705 -12.077 -12.474 -12.799 -13.121 -13.457 -13.722 -13.999 -14.285 -14.586 -14.904 -15.123 -15.349 -15.674 -15.898 -16.139 -16.264 -16.522 -16.802 -17.107 -17.261 -17.58 -17.753 -17.91 -18.079 -18.455 -18.655 -18.865 -19.094 -19.373 -19.695 -20.129 -21.075 -6 ,30705 ,KEBNE ,16724552,Sun Nov 28 06:41:47 CET,Sun Nov 28 08:18:55 CET,0.0 0.784 1.119 1.392 1.655 1.885 2.083 2.258 2.573 2.714 2.847 2.935 3.184 3.292 3.495 3.675 3.842 3.928 4.092 4.234 4.433 4.56 4.686 4.873 5.041 5.207 5.364 5.5 5.659 5.798 5.928 6.106 6.275 6.421 6.59 6.755 6.897 7.052 7.213 7.368 7.496 7.593 7.674 7.729 7.736 7.71 7.631 7.368 6.861 6.02 4.371 2.274 0.46 -1.185 -2.567 -3.756 -4.778 -5.721 -6.543 -7.35 -8.048 -8.655 -9.217 -9.731 -10.204 -10.671 -11.162 -11.587 -11.955 -12.333 -12.708 -13.012 -13.338 -13.679 -13.952 -14.238 -14.545 -14.869 -15.191 -15.405 -15.622 -15.979 -16.217 -16.462 -16.593 -16.852 -17.117 -17.397 -17.542 -17.865 -18.079 -18.27 -18.452 -18.851 -19.083 -19.332 -19.596 -19.892 -20.213 -20.594 -21.381 -7 ,19933 ,KEBNE ,16724553,Sun Nov 28 06:41:47 CET,Sun Nov 28 08:18:55 CET,0.0 1.011 1.395 1.698 1.947 2.154 2.326 2.489 2.794 2.924 3.042 3.126 3.375 3.477 3.695 3.898 4.071 4.153 4.308 4.45 4.641 4.763 4.881 5.048 5.201 5.359 5.522 5.663 5.828 5.977 6.117 6.285 6.449 6.592 6.738 6.897 7.044 7.194 7.338 7.49 7.626 7.755 7.893 7.993 8.053 8.047 7.96 7.744 7.3 6.463 4.86 2.811 1.095 -0.461 -1.806 -2.98 -4.033 -4.992 -5.821 -6.652 -7.37 -8.003 -8.605 -9.174 -9.696 -10.156 -10.642 -11.078 -11.442 -11.818 -12.224 -12.555 -12.895 -13.242 -13.508 -13.785 -14.07 -14.363 -14.659 -14.869 -15.095 -15.444 -15.697 -15.946 -16.065 -16.327 -16.61 -16.904 -17.06 -17.381 -17.548 -17.718 -17.894 -18.304 -18.53 -18.757 -19.015 -19.291 -19.604 -20.023 -20.87 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt deleted file mode 100644 index 1efc39e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3176 ,KEBNE ,16724557,Sun Nov 28 06:41:47 CET,Sun Nov 28 08:20:13 CET,0.0 0.865 1.343 1.789 2.24 2.656 3.032 3.382 4.042 4.361 4.676 4.957 5.587 5.872 6.412 6.932 7.448 7.706 8.217 8.708 9.421 9.893 10.359 11.039 11.71 12.368 13.013 13.647 14.464 15.261 16.052 17.039 17.998 18.924 20.018 21.304 22.584 24.005 25.586 27.319 29.158 31.253 33.768 36.395 39.583 43.313 47.82 53.194 59.932 68.486 80.014 90.946 98.261 103.545 107.377 110.367 112.766 114.743 116.306 117.702 118.756 119.6 120.332 120.968 121.524 121.979 122.404 122.787 123.121 123.431 123.692 123.858 124.027 124.209 124.334 124.444 124.543 124.637 124.708 124.745 124.783 124.846 124.873 124.868 124.865 124.848 124.806 124.756 124.717 124.466 124.573 124.513 124.451 124.302 124.21 124.083 123.922 123.741 123.532 123.266 122.661 -2 ,10219 ,KEBNE ,16724558,Sun Nov 28 06:41:47 CET,Sun Nov 28 08:20:53 CET,0.0 0.724 1.215 1.642 2.047 2.448 2.844 3.21 3.867 4.176 4.477 4.726 5.339 5.622 6.185 6.718 7.223 7.468 7.95 8.43 9.166 9.655 10.12 10.795 11.455 12.106 12.756 13.382 14.185 14.983 15.774 16.752 17.718 18.656 19.764 21.035 22.279 23.715 25.311 27.043 28.899 31.011 33.57 36.244 39.451 43.198 47.724 53.077 59.806 68.396 79.982 90.885 98.042 103.11 106.968 110.029 112.379 114.272 115.771 117.124 118.167 119.026 119.784 120.438 120.981 121.447 121.916 122.295 122.573 122.83 123.081 123.271 123.443 123.6 123.714 123.829 123.934 124.023 124.11 124.165 124.203 124.235 124.243 124.243 124.238 124.205 124.157 124.101 124.067 123.83 123.958 123.893 123.811 123.632 123.527 123.39 123.209 122.99 122.75 122.454 121.666 -3 ,24254 ,KEBNE ,16724559,Sun Nov 28 06:41:47 CET,Sun Nov 28 08:21:16 CET,0.0 0.912 1.445 1.934 2.359 2.748 3.132 3.5 4.19 4.523 4.841 5.127 5.755 6.038 6.579 7.1 7.605 7.851 8.353 8.84 9.532 9.983 10.423 11.065 11.719 12.378 13.017 13.646 14.48 15.301 16.101 17.061 18.022 18.985 20.099 21.367 22.636 24.065 25.637 27.332 29.139 31.229 33.747 36.385 39.614 43.382 47.908 53.217 59.942 68.751 80.461 91.246 98.518 103.865 107.855 111.02 113.481 115.412 116.892 118.283 119.41 120.333 121.143 121.798 122.323 122.76 123.178 123.535 123.817 124.09 124.36 124.553 124.736 124.908 125.016 125.108 125.194 125.285 125.359 125.399 125.428 125.446 125.454 125.461 125.463 125.448 125.408 125.364 125.345 125.108 125.22 125.164 125.101 124.938 124.837 124.737 124.587 124.378 124.136 123.83 123.178 -4 ,5943 ,KEBNE ,16724560,Sun Nov 28 06:41:47 CET,Sun Nov 28 08:20:10 CET,0.0 0.823 1.288 1.721 2.143 2.529 2.892 3.259 3.959 4.283 4.59 4.856 5.471 5.744 6.299 6.832 7.33 7.578 8.074 8.571 9.308 9.787 10.252 10.928 11.604 12.274 12.921 13.556 14.385 15.185 15.967 16.931 17.883 18.827 19.947 21.233 22.514 23.954 25.523 27.234 29.06 31.173 33.732 36.397 39.629 43.369 47.921 53.358 60.148 68.82 80.471 91.405 98.761 104.09 108.064 111.131 113.451 115.362 116.847 118.182 119.23 120.076 120.823 121.449 121.982 122.451 122.925 123.31 123.592 123.846 124.089 124.286 124.471 124.634 124.739 124.847 124.965 125.068 125.147 125.182 125.216 125.26 125.271 125.281 125.286 125.274 125.23 125.171 125.137 124.882 124.982 124.93 124.861 124.727 124.645 124.519 124.363 124.187 123.971 123.704 123.223 -5 ,27318 ,KEBNE ,16724561,Sun Nov 28 06:42:48 CET,Sun Nov 28 08:21:19 CET,0.0 0.866 1.377 1.851 2.298 2.689 3.044 3.384 4.042 4.364 4.68 4.964 5.589 5.881 6.44 6.967 7.485 7.741 8.242 8.732 9.438 9.89 10.34 11.008 11.664 12.322 12.972 13.617 14.473 15.298 16.098 17.085 18.054 18.996 20.078 21.306 22.565 24.014 25.59 27.307 29.157 31.307 33.891 36.525 39.715 43.461 47.988 53.364 60.149 68.814 80.282 91.084 98.369 103.605 107.504 110.521 112.879 114.832 116.316 117.661 118.716 119.557 120.301 120.961 121.514 121.972 122.401 122.751 123.042 123.305 123.55 123.748 123.938 124.106 124.215 124.314 124.403 124.498 124.568 124.59 124.62 124.656 124.654 124.635 124.625 124.601 124.56 124.498 124.457 124.208 124.312 124.225 124.135 123.976 123.868 123.76 123.615 123.438 123.223 122.913 122.22 -6 ,5230 ,KEBNE ,16724562,Sun Nov 28 06:43:50 CET,Sun Nov 28 08:22:01 CET,0.0 0.807 1.391 1.921 2.378 2.775 3.14 3.489 4.171 4.504 4.829 5.112 5.722 5.988 6.514 7.044 7.556 7.812 8.321 8.803 9.505 9.975 10.445 11.124 11.789 12.443 13.098 13.746 14.569 15.361 16.138 17.123 18.122 19.1 20.227 21.511 22.771 24.158 25.699 27.399 29.233 31.368 33.96 36.661 39.891 43.637 48.185 53.583 60.269 68.885 80.52 91.389 98.618 103.772 107.596 110.625 113.015 114.953 116.46 117.858 118.965 119.841 120.59 121.268 121.852 122.318 122.742 123.092 123.389 123.666 123.925 124.126 124.303 124.46 124.57 124.666 124.76 124.847 124.924 124.969 125.018 125.091 125.123 125.147 125.154 125.139 125.103 125.058 125.021 124.774 124.884 124.823 124.748 124.564 124.453 124.318 124.185 124.029 123.801 123.402 122.725 -8 ,14833 ,KEBNE ,16724564,Sun Nov 28 06:42:48 CET,Sun Nov 28 08:22:11 CET,0.0 1.103 1.738 2.229 2.65 3.026 3.37 3.692 4.301 4.603 4.903 5.145 5.762 6.041 6.581 7.1 7.619 7.88 8.381 8.877 9.596 10.055 10.506 11.159 11.802 12.443 13.074 13.699 14.54 15.351 16.135 17.099 18.04 18.98 20.105 21.399 22.663 24.069 25.606 27.286 29.127 31.273 33.863 36.586 39.868 43.665 48.263 53.668 60.359 68.935 80.392 91.249 98.522 103.706 107.623 110.759 113.209 115.132 116.625 117.975 118.991 119.822 120.553 121.17 121.688 122.12 122.538 122.887 123.161 123.431 123.703 123.902 124.078 124.234 124.344 124.451 124.558 124.657 124.725 124.771 124.817 124.844 124.843 124.828 124.811 124.77 124.727 124.683 124.649 124.402 124.517 124.456 124.387 124.239 124.134 123.991 123.834 123.661 123.425 123.08 122.524 -10 ,7054 ,KEBNE ,16724566,Sun Nov 28 06:42:48 CET,Sun Nov 28 08:22:11 CET,0.0 0.76 1.318 1.777 2.218 2.626 3.002 3.372 4.054 4.366 4.678 4.96 5.587 5.876 6.424 6.947 7.446 7.692 8.202 8.708 9.448 9.921 10.375 11.06 11.726 12.374 13.018 13.643 14.471 15.308 16.109 17.069 18.013 18.955 20.09 21.376 22.61 24.014 25.592 27.311 29.195 31.365 33.925 36.615 39.853 43.598 48.128 53.526 60.317 68.941 80.475 91.389 98.701 103.93 107.782 110.789 113.18 115.167 116.69 118.018 119.053 119.921 120.69 121.344 121.905 122.383 122.834 123.227 123.559 123.86 124.122 124.305 124.476 124.629 124.733 124.837 124.943 125.042 125.122 125.163 125.195 125.249 125.286 125.309 125.304 125.264 125.22 125.165 125.139 124.903 125.032 124.985 124.924 124.761 124.658 124.542 124.41 124.241 123.989 123.681 123.125 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index d0f65bde..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,27358 ,KEBNE ,16724568,Sun Nov 28 06:42:48 CET,Sun Nov 28 08:20:30 CET,0.0 0.929 1.488 1.991 2.446 2.845 3.229 3.598 4.293 4.625 4.947 5.27 5.922 6.233 6.849 7.448 8.035 8.328 8.908 9.468 10.299 10.844 11.374 12.172 12.964 13.746 14.524 15.293 16.305 17.303 18.287 19.507 20.708 21.899 23.303 24.91 26.51 28.333 30.387 32.649 35.096 37.933 41.372 44.985 49.39 54.543 60.839 68.424 78.008 90.357 107.191 123.432 134.567 142.78 149.0 153.905 157.715 160.849 163.362 165.668 167.498 169.02 170.367 171.531 172.54 173.416 174.288 175.016 175.592 176.143 176.679 177.086 177.485 177.876 178.163 178.444 178.709 178.957 179.169 179.282 179.402 179.601 179.721 179.825 179.865 179.937 179.996 180.022 180.026 179.884 180.012 179.998 179.959 179.838 179.769 179.673 179.526 179.326 179.052 178.603 176.871 -3 ,4929 ,KEBNE ,16724570,Sun Nov 28 06:42:48 CET,Sun Nov 28 08:20:10 CET,0.0 0.692 1.195 1.675 2.114 2.495 2.863 3.242 3.99 4.342 4.678 5.001 5.672 5.993 6.597 7.2 7.796 8.085 8.66 9.226 10.059 10.605 11.142 11.943 12.745 13.546 14.328 15.098 16.116 17.111 18.101 19.347 20.564 21.759 23.168 24.804 26.44 28.264 30.278 32.506 34.95 37.772 41.173 44.75 49.121 54.254 60.515 68.068 77.632 90.008 106.963 123.321 134.469 142.647 148.778 153.612 157.459 160.632 163.097 165.382 167.247 168.791 170.169 171.389 172.419 173.299 174.161 174.866 175.448 176.022 176.563 176.983 177.411 177.832 178.131 178.409 178.658 178.887 179.105 179.247 179.372 179.529 179.625 179.702 179.737 179.805 179.849 179.87 179.877 179.732 179.856 179.84 179.807 179.685 179.606 179.507 179.367 179.182 178.954 178.631 177.806 -4 ,16344 ,KEBNE ,16724571,Sun Nov 28 06:43:50 CET,Sun Nov 28 08:21:16 CET,0.0 0.686 1.161 1.604 2.017 2.416 2.817 3.194 3.893 4.226 4.561 4.891 5.533 5.836 6.446 7.039 7.611 7.897 8.475 9.037 9.866 10.416 10.955 11.762 12.56 13.335 14.105 14.871 15.874 16.864 17.85 19.065 20.267 21.464 22.875 24.494 26.107 27.933 29.957 32.18 34.6 37.396 40.783 44.353 48.704 53.858 60.141 67.639 77.105 89.395 106.342 122.684 133.862 142.049 148.197 153.045 156.872 160.007 162.479 164.788 166.633 168.157 169.518 170.725 171.757 172.629 173.5 174.229 174.797 175.355 175.903 176.33 176.737 177.125 177.408 177.677 177.941 178.178 178.383 178.518 178.662 178.85 178.964 179.075 179.119 179.196 179.25 179.292 179.315 179.187 179.32 179.293 179.251 179.135 179.063 178.956 178.817 178.639 178.35 177.972 177.004 -5 ,15574 ,KEBNE ,16724572,Sun Nov 28 06:43:50 CET,Sun Nov 28 08:22:15 CET,0.0 0.876 1.453 1.899 2.312 2.716 3.118 3.508 4.23 4.572 4.908 5.245 5.911 6.225 6.829 7.424 8.007 8.301 8.889 9.456 10.282 10.833 11.391 12.201 12.998 13.788 14.571 15.342 16.347 17.347 18.327 19.526 20.724 21.933 23.356 24.989 26.615 28.439 30.458 32.697 35.141 37.99 41.439 45.035 49.398 54.506 60.72 68.224 77.838 90.256 107.098 123.332 134.429 142.584 148.754 153.649 157.536 160.756 163.29 165.579 167.408 168.951 170.318 171.521 172.537 173.415 174.298 175.024 175.608 176.18 176.744 177.168 177.564 177.968 178.257 178.522 178.787 179.049 179.293 179.447 179.591 179.781 179.884 179.973 180.017 180.086 180.128 180.157 180.163 180.015 180.119 180.08 180.039 179.948 179.86 179.722 179.546 179.344 179.082 178.693 177.574 -7 ,1103 ,KEBNE ,16724574,Sun Nov 28 06:43:50 CET,Sun Nov 28 08:21:17 CET,0.0 0.803 1.3 1.767 2.215 2.613 2.994 3.366 4.085 4.428 4.766 5.093 5.74 6.056 6.679 7.286 7.882 8.174 8.747 9.312 10.163 10.718 11.251 12.038 12.831 13.619 14.399 15.175 16.2 17.2 18.174 19.386 20.593 21.791 23.219 24.87 26.499 28.322 30.338 32.558 34.981 37.814 41.278 44.929 49.352 54.54 60.867 68.455 78.062 90.45 107.353 123.664 134.821 143.002 149.156 154.039 157.879 161.033 163.534 165.81 167.639 169.16 170.504 171.694 172.712 173.578 174.431 175.145 175.712 176.266 176.811 177.238 177.654 178.042 178.316 178.597 178.88 179.141 179.375 179.517 179.655 179.854 179.97 180.061 180.095 180.157 180.222 180.272 180.284 180.135 180.256 180.238 180.207 180.089 180.013 179.921 179.812 179.653 179.442 179.097 178.096 -8 ,24058 ,KEBNE ,16724575,Sun Nov 28 06:43:50 CET,Sun Nov 28 08:20:57 CET,0.0 0.743 1.257 1.717 2.17 2.593 2.966 3.319 3.996 4.334 4.663 4.956 5.604 5.913 6.532 7.134 7.718 8.011 8.598 9.168 10.0 10.55 11.09 11.889 12.695 13.484 14.246 15.003 16.011 17.011 17.999 19.213 20.408 21.603 23.038 24.694 26.346 28.214 30.274 32.52 34.946 37.77 41.208 44.825 49.261 54.486 60.761 68.284 77.887 90.277 107.171 123.433 134.543 142.682 148.86 153.781 157.661 160.843 163.349 165.648 167.464 168.961 170.29 171.482 172.518 173.386 174.23 174.934 175.51 176.066 176.606 177.031 177.438 177.824 178.101 178.376 178.634 178.874 179.11 179.247 179.371 179.55 179.652 179.746 179.793 179.865 179.904 179.942 179.952 179.804 179.928 179.901 179.854 179.717 179.638 179.553 179.433 179.233 178.923 178.537 177.627 -9 ,8451 ,KEBNE ,16724576,Sun Nov 28 06:43:50 CET,Sun Nov 28 08:22:28 CET,0.0 0.787 1.307 1.77 2.192 2.577 2.952 3.321 4.026 4.369 4.705 5.012 5.652 5.954 6.554 7.142 7.724 8.016 8.586 9.142 9.966 10.508 11.051 11.863 12.659 13.439 14.207 14.966 15.97 16.977 17.984 19.22 20.436 21.643 23.069 24.703 26.328 28.167 30.193 32.41 34.829 37.65 41.078 44.681 49.067 54.204 60.439 67.97 77.544 89.954 106.978 123.345 134.457 142.582 148.754 153.653 157.494 160.628 163.104 165.411 167.251 168.773 170.128 171.329 172.372 173.243 174.096 174.817 175.379 175.925 176.457 176.873 177.289 177.693 177.97 178.213 178.446 178.681 178.908 179.05 179.193 179.393 179.497 179.573 179.606 179.67 179.73 179.759 179.771 179.635 179.756 179.735 179.691 179.557 179.481 179.387 179.236 179.021 178.778 178.435 176.737 -10 ,1650 ,KEBNE ,16724577,Sun Nov 28 06:43:50 CET,Sun Nov 28 08:22:22 CET,0.0 0.733 1.29 1.782 2.219 2.609 2.988 3.355 4.044 4.381 4.716 5.023 5.671 5.983 6.593 7.192 7.779 8.072 8.66 9.24 10.084 10.63 11.166 11.962 12.755 13.547 14.319 15.075 16.079 17.074 18.054 19.264 20.47 21.663 23.076 24.713 26.328 28.153 30.178 32.382 34.791 37.632 41.066 44.648 49.022 54.134 60.388 67.942 77.447 89.769 106.733 123.016 134.105 142.199 148.313 153.206 157.068 160.25 162.773 165.057 166.845 168.356 169.715 170.897 171.906 172.764 173.618 174.34 174.923 175.493 176.042 176.469 176.901 177.316 177.607 177.884 178.143 178.382 178.602 178.742 178.88 179.064 179.155 179.241 179.281 179.331 179.368 179.403 179.412 179.266 179.365 179.337 179.311 179.226 179.167 179.076 178.927 178.74 178.471 178.135 177.045 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt deleted file mode 100644 index f296be3d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6091 ,KEBNE ,16724578,Sun Nov 28 06:43:50 CET,Sun Nov 28 08:22:29 CET,0.0 1.039 1.698 2.246 2.741 3.213 3.657 4.079 4.864 5.225 5.574 5.94 6.618 6.958 7.618 8.246 8.848 9.135 9.691 10.252 11.083 11.612 12.138 12.926 13.691 14.438 15.176 15.912 16.885 17.858 18.823 19.979 21.121 22.269 23.634 25.205 26.733 28.465 30.389 32.473 34.727 37.328 40.456 43.724 47.715 52.377 58.043 64.829 73.39 84.531 99.705 114.237 124.092 131.268 136.702 141.01 144.394 147.168 149.334 151.275 152.828 154.128 155.267 156.272 157.12 157.815 158.499 159.066 159.52 159.958 160.396 160.742 161.048 161.324 161.526 161.721 161.916 162.1 162.263 162.353 162.431 162.544 162.613 162.67 162.693 162.738 162.789 162.806 162.794 162.61 162.73 162.696 162.651 162.542 162.457 162.335 162.19 162.024 161.809 161.475 160.693 -2 ,7871 ,KEBNE ,16724579,Sun Nov 28 06:44:51 CET,Sun Nov 28 08:22:27 CET,0.0 0.939 1.47 1.97 2.429 2.844 3.262 3.653 4.385 4.732 5.073 5.421 6.081 6.402 7.023 7.62 8.213 8.506 9.067 9.621 10.462 11.023 11.593 12.426 13.227 14.015 14.792 15.561 16.576 17.552 18.486 19.637 20.811 21.988 23.367 24.962 26.529 28.253 30.132 32.199 34.45 37.064 40.221 43.537 47.56 52.218 57.89 64.721 73.351 84.552 99.851 114.297 124.05 131.25 136.631 140.86 144.187 146.888 149.018 150.973 152.507 153.787 154.929 155.913 156.755 157.488 158.2 158.768 159.225 159.676 160.124 160.477 160.799 161.088 161.294 161.495 161.677 161.858 162.038 162.141 162.232 162.35 162.417 162.468 162.49 162.521 162.532 162.528 162.512 162.337 162.457 162.412 162.359 162.248 162.159 162.039 161.911 161.76 161.584 161.338 160.159 -3 ,29869 ,KEBNE ,16724580,Sun Nov 28 06:44:51 CET,Sun Nov 28 08:25:26 CET,0.0 1.062 1.655 2.154 2.596 3.01 3.404 3.78 4.5 4.832 5.16 5.477 6.12 6.441 7.077 7.676 8.259 8.54 9.086 9.635 10.452 10.988 11.513 12.284 13.045 13.798 14.536 15.256 16.209 17.159 18.096 19.25 20.389 21.517 22.857 24.389 25.901 27.613 29.5 31.589 33.853 36.455 39.626 42.941 46.965 51.673 57.403 64.32 72.96 84.053 99.195 113.696 123.576 130.764 136.15 140.443 143.822 146.579 148.755 150.765 152.361 153.677 154.823 155.83 156.715 157.463 158.205 158.819 159.307 159.776 160.225 160.578 160.925 161.25 161.468 161.673 161.877 162.07 162.242 162.356 162.475 162.657 162.764 162.844 162.872 162.919 162.962 162.989 162.983 162.817 162.986 162.964 162.913 162.783 162.711 162.628 162.504 162.315 162.073 161.686 161.08 -4 ,29034 ,KEBNE ,16724581,Sun Nov 28 06:44:55 CET,Sun Nov 28 08:18:07 CET,0.0 1.018 1.634 2.165 2.63 3.02 3.397 3.782 4.504 4.84 5.178 5.527 6.182 6.505 7.138 7.746 8.345 8.636 9.2 9.754 10.564 11.092 11.624 12.411 13.175 13.941 14.694 15.428 16.397 17.359 18.326 19.518 20.672 21.81 23.165 24.728 26.28 28.018 29.94 32.056 34.35 37.045 40.323 43.713 47.805 52.571 58.325 65.206 73.844 84.999 100.217 114.716 124.5 131.617 137.014 141.286 144.606 147.297 149.427 151.362 152.895 154.206 155.378 156.382 157.264 158.039 158.774 159.379 159.883 160.38 160.858 161.215 161.545 161.864 162.092 162.306 162.495 162.672 162.846 162.957 163.068 163.23 163.322 163.404 163.442 163.488 163.519 163.549 163.555 163.39 163.526 163.507 163.485 163.388 163.311 163.198 163.059 162.898 162.662 162.287 161.185 -5 ,13740 ,KEBNE ,16724582,Sun Nov 28 06:44:52 CET,Sun Nov 28 08:23:15 CET,0.0 0.999 1.589 2.117 2.586 2.992 3.376 3.734 4.47 4.836 5.179 5.491 6.127 6.433 7.049 7.653 8.238 8.522 9.084 9.636 10.451 10.992 11.532 12.339 13.144 13.942 14.733 15.51 16.507 17.474 18.422 19.604 20.766 21.906 23.259 24.827 26.374 28.102 29.998 32.073 34.316 36.909 40.07 43.416 47.5 52.277 58.131 65.105 73.908 85.205 100.456 114.999 124.792 131.822 137.101 141.335 144.653 147.354 149.507 151.476 153.014 154.284 155.39 156.358 157.187 157.904 158.599 159.164 159.637 160.089 160.53 160.884 161.216 161.522 161.74 161.951 162.151 162.338 162.508 162.612 162.71 162.824 162.881 162.936 162.957 162.981 163.006 163.017 163.016 162.846 162.954 162.921 162.89 162.785 162.702 162.594 162.46 162.305 162.074 161.676 160.577 -6 ,25979 ,KEBNE ,16724583,Sun Nov 28 06:44:51 CET,Sun Nov 28 08:23:16 CET,0.0 0.848 1.421 1.913 2.358 2.766 3.162 3.554 4.291 4.644 4.987 5.322 5.971 6.275 6.874 7.476 8.06 8.341 8.901 9.448 10.258 10.799 11.334 12.118 12.89 13.644 14.39 15.13 16.099 17.058 18.011 19.187 20.333 21.456 22.783 24.308 25.841 27.584 29.486 31.549 33.824 36.521 39.718 42.992 47.013 51.733 57.465 64.316 72.921 84.08 99.32 113.879 123.751 130.945 136.33 140.607 143.997 146.761 148.938 150.93 152.499 153.777 154.929 155.961 156.853 157.614 158.349 158.953 159.448 159.938 160.407 160.771 161.135 161.481 161.71 161.915 162.112 162.309 162.496 162.607 162.711 162.843 162.915 162.982 163.011 163.068 163.12 163.151 163.168 163.023 163.162 163.118 163.07 162.953 162.872 162.757 162.619 162.464 162.277 161.99 161.274 -7 ,26646 ,KEBNE ,16724584,Sun Nov 28 06:45:53 CET,Sun Nov 28 08:23:51 CET,0.0 0.764 1.321 1.816 2.283 2.735 3.148 3.535 4.29 4.652 5.0 5.34 5.997 6.306 6.914 7.512 8.097 8.389 8.966 9.523 10.338 10.881 11.421 12.216 12.988 13.745 14.492 15.243 16.236 17.201 18.158 19.347 20.512 21.655 23.005 24.553 26.094 27.851 29.805 31.938 34.217 36.876 40.122 43.504 47.604 52.356 58.113 65.003 73.667 84.842 100.116 114.719 124.576 131.762 137.201 141.516 144.872 147.583 149.727 151.699 153.241 154.53 155.675 156.67 157.535 158.279 159.019 159.643 160.123 160.58 161.043 161.404 161.745 162.071 162.303 162.517 162.721 162.9 163.059 163.158 163.245 163.356 163.426 163.493 163.517 163.555 163.592 163.595 163.576 163.384 163.509 163.483 163.446 163.305 163.208 163.101 162.968 162.793 162.554 162.185 161.469 -8 ,18387 ,KEBNE ,16724585,Sun Nov 28 06:45:53 CET,Sun Nov 28 08:23:49 CET,0.0 0.917 1.49 2.001 2.479 2.923 3.332 3.705 4.411 4.761 5.103 5.436 6.095 6.414 7.036 7.636 8.216 8.505 9.077 9.627 10.443 10.979 11.506 12.286 13.06 13.828 14.58 15.319 16.281 17.23 18.173 19.349 20.508 21.647 22.999 24.553 26.098 27.846 29.766 31.873 34.145 36.776 39.995 43.376 47.473 52.243 58.046 65.042 73.821 85.033 100.278 114.766 124.527 131.661 137.003 141.221 144.539 147.246 149.358 151.276 152.792 154.055 155.2 156.2 157.055 157.791 158.483 159.052 159.518 159.951 160.36 160.688 161.006 161.303 161.513 161.716 161.908 162.088 162.26 162.366 162.454 162.56 162.629 162.702 162.735 162.781 162.805 162.808 162.797 162.615 162.758 162.737 162.691 162.559 162.476 162.376 162.246 162.1 161.925 161.639 160.737 -9 ,15464 ,KEBNE ,16724586,Sun Nov 28 06:45:53 CET,Sun Nov 28 08:23:22 CET,0.0 1.274 1.928 2.5 3.025 3.467 3.871 4.276 5.055 5.42 5.773 6.102 6.749 7.058 7.68 8.317 8.933 9.236 9.838 10.428 11.293 11.859 12.411 13.222 14.023 14.821 15.62 16.4 17.398 18.369 19.331 20.511 21.667 22.797 24.14 25.699 27.242 29.005 30.975 33.111 35.404 38.079 41.332 44.696 48.749 53.523 59.374 66.336 75.1 86.395 101.698 116.273 126.118 133.22 138.565 142.848 146.207 148.952 151.086 153.004 154.559 155.872 157.006 157.982 158.833 159.559 160.253 160.824 161.29 161.743 162.178 162.518 162.852 163.167 163.386 163.599 163.797 163.978 164.147 164.25 164.341 164.456 164.519 164.583 164.606 164.635 164.66 164.663 164.654 164.469 164.564 164.522 164.483 164.375 164.291 164.183 164.042 163.858 163.611 163.282 162.06 -10 ,23124 ,KEBNE ,16724587,Sun Nov 28 06:45:53 CET,Sun Nov 28 08:23:21 CET,0.0 1.122 1.762 2.29 2.744 3.163 3.569 3.949 4.63 4.961 5.293 5.603 6.245 6.554 7.16 7.752 8.336 8.627 9.215 9.793 10.638 11.193 11.741 12.563 13.367 14.141 14.889 15.639 16.628 17.596 18.528 19.663 20.796 21.934 23.292 24.855 26.41 28.154 30.063 32.153 34.444 37.131 40.387 43.758 47.837 52.601 58.389 65.294 73.975 85.199 100.381 114.812 124.659 131.87 137.27 141.546 144.94 147.703 149.883 151.889 153.474 154.776 155.922 156.921 157.79 158.524 159.234 159.83 160.313 160.782 161.227 161.57 161.899 162.22 162.46 162.688 162.897 163.086 163.257 163.356 163.456 163.608 163.69 163.763 163.796 163.846 163.888 163.91 163.901 163.722 163.848 163.82 163.776 163.631 163.554 163.459 163.331 163.182 162.978 162.646 161.896 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt deleted file mode 100644 index 989e8a02..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32317 ,KEBNE ,16724588,Sun Nov 28 06:45:53 CET,Sun Nov 28 08:20:06 CET,0.0 0.56 0.873 1.118 1.335 1.533 1.708 1.877 2.219 2.368 2.501 2.597 2.876 2.991 3.204 3.4 3.586 3.674 3.843 4.012 4.268 4.433 4.586 4.791 4.997 5.192 5.37 5.546 5.773 5.997 6.21 6.462 6.717 6.963 7.239 7.555 7.851 8.165 8.505 8.874 9.265 9.694 10.198 10.678 11.223 11.903 12.619 13.334 14.127 14.928 15.597 15.725 15.476 15.04 14.511 13.983 13.523 13.082 12.655 12.19 11.777 11.4 11.031 10.657 10.295 9.949 9.567 9.224 8.933 8.612 8.272 7.989 7.688 7.376 7.139 6.9 6.648 6.373 6.063 5.858 5.664 5.333 5.091 4.846 4.713 4.429 4.135 3.833 3.665 3.328 3.083 2.879 2.657 2.126 1.825 1.51 1.142 0.702 0.196 -0.559 -4.896 -3 ,6770 ,KEBNE ,16724590,Sun Nov 28 06:45:53 CET,Sun Nov 28 08:20:21 CET,0.0 0.726 1.088 1.357 1.562 1.755 1.946 2.123 2.45 2.597 2.722 2.797 3.066 3.168 3.368 3.565 3.761 3.851 4.018 4.186 4.433 4.59 4.737 4.951 5.15 5.341 5.529 5.71 5.955 6.2 6.419 6.672 6.927 7.172 7.45 7.762 8.049 8.387 8.778 9.179 9.601 10.072 10.607 11.128 11.691 12.294 13.032 13.811 14.563 15.321 15.959 16.064 15.835 15.487 15.058 14.564 14.095 13.645 13.223 12.773 12.373 12.004 11.655 11.323 10.951 10.581 10.229 9.927 9.653 9.376 9.079 8.807 8.518 8.209 7.969 7.724 7.475 7.197 6.881 6.677 6.451 6.064 5.819 5.571 5.434 5.153 4.844 4.504 4.326 4.002 3.756 3.539 3.311 2.768 2.456 2.113 1.736 1.331 0.783 -0.061 -4.656 -4 ,5133 ,KEBNE ,16724591,Sun Nov 28 06:45:53 CET,Sun Nov 28 08:20:38 CET,0.0 0.797 1.163 1.443 1.7 1.898 2.063 2.218 2.513 2.662 2.8 2.892 3.161 3.269 3.483 3.671 3.855 3.947 4.118 4.276 4.519 4.674 4.817 5.032 5.24 5.434 5.618 5.797 6.022 6.243 6.457 6.707 6.959 7.212 7.5 7.819 8.121 8.454 8.833 9.249 9.645 10.074 10.587 11.09 11.687 12.335 12.999 13.63 14.33 15.17 15.983 16.152 15.875 15.485 15.027 14.508 14.055 13.642 13.234 12.759 12.347 11.977 11.586 11.215 10.876 10.547 10.188 9.864 9.568 9.271 8.963 8.68 8.369 8.061 7.824 7.574 7.316 7.055 6.776 6.566 6.342 5.982 5.742 5.494 5.357 5.066 4.756 4.423 4.243 3.899 3.637 3.412 3.164 2.659 2.36 2.033 1.685 1.287 0.796 0.056 -3.792 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt deleted file mode 100644 index 11a45628..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -2 ,28662 ,KEBNE ,16724599,Sun Nov 28 06:46:54 CET,Sun Nov 28 08:23:43 CET,0.0 0.969 1.438 1.775 2.06 2.314 2.538 2.735 3.076 3.231 3.378 3.499 3.794 3.928 4.177 4.409 4.628 4.73 4.926 5.126 5.403 5.568 5.734 5.981 6.222 6.454 6.663 6.856 7.108 7.36 7.612 7.911 8.19 8.457 8.776 9.13 9.469 9.843 10.221 10.609 11.024 11.464 11.963 12.461 13.043 13.676 14.336 15.061 15.834 16.533 17.06 17.17 16.808 16.207 15.612 15.0 14.406 13.86 13.367 12.835 12.376 11.968 11.569 11.189 10.82 10.469 10.094 9.736 9.409 9.076 8.727 8.447 8.162 7.863 7.617 7.346 7.062 6.763 6.455 6.253 6.052 5.709 5.449 5.187 5.064 4.796 4.488 4.162 3.987 3.644 3.394 3.184 2.962 2.512 2.258 1.966 1.643 1.251 0.795 0.203 -1.902 -4 ,11289 ,KEBNE ,16724601,Sun Nov 28 06:46:54 CET,Sun Nov 28 08:23:22 CET,0.0 0.709 1.101 1.449 1.725 1.975 2.191 2.376 2.739 2.906 3.053 3.183 3.483 3.619 3.878 4.119 4.347 4.454 4.661 4.853 5.132 5.316 5.489 5.742 5.989 6.223 6.457 6.68 6.943 7.191 7.434 7.732 8.013 8.271 8.569 8.916 9.243 9.595 9.963 10.333 10.723 11.146 11.634 12.135 12.717 13.328 14.024 14.789 15.544 16.172 16.591 16.599 16.22 15.665 15.043 14.387 13.817 13.289 12.781 12.271 11.815 11.387 10.969 10.562 10.188 9.841 9.443 9.096 8.802 8.478 8.148 7.892 7.605 7.292 7.056 6.8 6.528 6.257 5.963 5.744 5.519 5.178 4.951 4.709 4.584 4.318 4.007 3.686 3.525 3.208 2.981 2.778 2.563 2.062 1.785 1.51 1.19 0.778 0.298 -0.29 -2.412 -8 ,25038 ,KEBNE ,16724605,Sun Nov 28 06:47:00 CET,Sun Nov 28 08:18:36 CET,0.0 0.755 1.108 1.392 1.646 1.889 2.108 2.294 2.63 2.791 2.949 3.084 3.37 3.49 3.729 3.961 4.175 4.279 4.489 4.687 4.964 5.146 5.314 5.552 5.79 6.011 6.22 6.436 6.713 6.96 7.208 7.526 7.811 8.07 8.378 8.709 9.014 9.352 9.718 10.116 10.536 10.985 11.493 11.995 12.575 13.201 13.855 14.519 15.216 15.814 16.134 16.116 15.796 15.275 14.659 14.016 13.417 12.858 12.383 11.868 11.41 10.992 10.567 10.156 9.753 9.383 9.009 8.669 8.375 8.058 7.719 7.439 7.136 6.825 6.58 6.324 6.058 5.78 5.466 5.234 4.993 4.637 4.403 4.145 4.006 3.719 3.414 3.087 2.92 2.584 2.326 2.116 1.886 1.378 1.104 0.793 0.462 0.078 -0.435 -1.151 -3.117 -9 ,30355 ,KEBNE ,16724606,Sun Nov 28 06:47:02 CET,Sun Nov 28 08:18:56 CET,0.0 1.13 1.59 1.901 2.15 2.406 2.632 2.822 3.179 3.346 3.498 3.601 3.888 4.019 4.265 4.489 4.717 4.827 5.026 5.211 5.478 5.654 5.82 6.064 6.307 6.533 6.735 6.934 7.195 7.439 7.676 7.967 8.239 8.494 8.782 9.104 9.427 9.78 10.139 10.508 10.904 11.361 11.869 12.356 12.921 13.536 14.193 14.852 15.526 16.15 16.525 16.419 15.952 15.361 14.818 14.276 13.708 13.115 12.586 12.038 11.571 11.177 10.808 10.435 10.055 9.679 9.292 8.974 8.678 8.356 8.022 7.739 7.423 7.076 6.822 6.561 6.276 5.988 5.684 5.473 5.267 4.949 4.719 4.467 4.33 4.03 3.711 3.386 3.216 2.871 2.614 2.402 2.181 1.681 1.395 1.082 0.733 0.34 -0.138 -0.785 -2.965 -10 ,13598 ,KEBNE ,16724607,Sun Nov 28 06:46:54 CET,Sun Nov 28 08:21:57 CET,0.0 0.967 1.342 1.671 1.946 2.167 2.376 2.569 2.92 3.084 3.235 3.356 3.661 3.792 4.031 4.257 4.463 4.567 4.768 4.952 5.22 5.402 5.58 5.83 6.059 6.273 6.483 6.686 6.939 7.178 7.409 7.693 7.971 8.239 8.544 8.887 9.209 9.545 9.903 10.297 10.709 11.165 11.679 12.178 12.741 13.327 13.975 14.659 15.37 15.987 16.337 16.172 15.724 15.198 14.613 14.011 13.452 12.928 12.438 11.874 11.397 10.978 10.549 10.144 9.777 9.437 9.063 8.71 8.4 8.087 7.773 7.496 7.189 6.864 6.617 6.356 6.078 5.808 5.519 5.312 5.103 4.755 4.492 4.221 4.088 3.821 3.52 3.174 2.997 2.669 2.419 2.2 1.977 1.509 1.255 0.952 0.61 0.233 -0.216 -0.785 -2.709 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index 57f436f6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1360 ,KEBNE ,16724608,Sun Nov 28 06:46:54 CET,Sun Nov 28 08:25:44 CET,0.0 0.647 1.002 1.265 1.504 1.767 1.991 2.174 2.52 2.689 2.855 3.01 3.331 3.482 3.767 4.03 4.283 4.411 4.655 4.874 5.195 5.414 5.621 5.925 6.225 6.504 6.782 7.058 7.407 7.736 8.066 8.467 8.841 9.201 9.617 10.076 10.516 11.018 11.572 12.172 12.8 13.498 14.332 15.162 16.103 17.131 18.301 19.636 21.195 23.039 25.206 26.644 27.209 27.445 27.463 27.371 27.204 26.983 26.759 26.486 26.212 25.97 25.711 25.449 25.228 25.018 24.77 24.539 24.333 24.111 23.865 23.638 23.395 23.124 22.915 22.701 22.468 22.229 21.975 21.793 21.605 21.304 21.091 20.873 20.753 20.518 20.293 20.052 19.926 19.646 19.491 19.325 19.152 18.752 18.504 18.245 17.983 17.645 17.24 16.78 15.806 -2 ,26497 ,KEBNE ,16724609,Sun Nov 28 06:46:54 CET,Sun Nov 28 08:24:29 CET,0.0 0.744 1.079 1.372 1.644 1.89 2.101 2.281 2.638 2.815 2.986 3.142 3.466 3.626 3.915 4.188 4.464 4.6 4.861 5.113 5.458 5.67 5.874 6.176 6.475 6.761 7.035 7.295 7.636 7.968 8.298 8.696 9.075 9.448 9.889 10.372 10.831 11.33 11.855 12.42 13.021 13.722 14.584 15.443 16.401 17.487 18.751 20.193 21.901 23.795 25.928 27.444 28.151 28.371 28.377 28.351 28.233 28.034 27.845 27.645 27.417 27.185 26.952 26.711 26.448 26.183 25.894 25.62 25.37 25.107 24.84 24.617 24.393 24.18 24.012 23.827 23.637 23.433 23.178 22.987 22.808 22.519 22.308 22.098 21.986 21.723 21.46 21.205 21.062 20.78 20.638 20.464 20.29 19.922 19.713 19.486 19.246 18.977 18.646 18.231 16.992 -3 ,26384 ,KEBNE ,16724610,Sun Nov 28 06:46:54 CET,Sun Nov 28 08:25:43 CET,0.0 0.736 1.143 1.488 1.795 2.071 2.314 2.525 2.898 3.079 3.256 3.41 3.731 3.888 4.16 4.425 4.687 4.809 5.046 5.285 5.628 5.848 6.068 6.39 6.69 6.972 7.252 7.525 7.871 8.2 8.521 8.915 9.303 9.664 10.081 10.572 11.038 11.548 12.111 12.713 13.336 14.039 14.866 15.7 16.665 17.767 19.016 20.374 22.005 23.964 26.076 27.536 28.182 28.442 28.574 28.567 28.451 28.246 28.006 27.768 27.553 27.303 27.014 26.736 26.478 26.243 26.0 25.772 25.567 25.341 25.079 24.852 24.626 24.404 24.222 24.01 23.778 23.552 23.324 23.148 22.965 22.693 22.499 22.288 22.182 21.974 21.739 21.477 21.329 21.021 20.813 20.627 20.431 19.978 19.754 19.511 19.23 18.926 18.533 18.023 16.875 -4 ,10168 ,KEBNE ,16724611,Sun Nov 28 06:46:54 CET,Sun Nov 28 08:24:34 CET,0.0 0.705 1.098 1.434 1.691 1.922 2.165 2.394 2.803 3.004 3.192 3.37 3.686 3.839 4.131 4.393 4.655 4.786 5.04 5.287 5.626 5.83 6.02 6.315 6.617 6.908 7.188 7.451 7.772 8.084 8.404 8.778 9.154 9.537 9.97 10.452 10.915 11.398 11.928 12.508 13.107 13.779 14.577 15.396 16.36 17.424 18.585 19.853 21.336 23.072 25.085 26.58 27.282 27.557 27.648 27.597 27.464 27.307 27.113 26.871 26.654 26.446 26.211 25.965 25.737 25.532 25.294 25.073 24.87 24.653 24.413 24.201 23.989 23.768 23.575 23.377 23.185 22.967 22.74 22.583 22.404 22.109 21.92 21.721 21.606 21.378 21.142 20.863 20.716 20.418 20.23 20.058 19.864 19.439 19.193 18.912 18.602 18.288 17.889 17.353 16.138 -5 ,3086 ,KEBNE ,16724612,Sun Nov 28 06:47:55 CET,Sun Nov 28 08:26:32 CET,0.0 0.739 1.089 1.392 1.684 1.958 2.197 2.408 2.781 2.947 3.103 3.24 3.552 3.701 4.001 4.273 4.533 4.665 4.906 5.137 5.47 5.675 5.887 6.195 6.471 6.733 6.991 7.252 7.592 7.917 8.235 8.621 8.998 9.352 9.762 10.238 10.708 11.223 11.782 12.376 12.979 13.683 14.535 15.372 16.349 17.463 18.75 20.172 21.818 23.742 25.93 27.552 28.35 28.692 28.756 28.717 28.6 28.443 28.272 28.052 27.813 27.55 27.304 27.06 26.796 26.547 26.276 26.037 25.819 25.582 25.333 25.111 24.889 24.651 24.468 24.286 24.095 23.881 23.647 23.49 23.314 23.023 22.827 22.624 22.514 22.284 22.047 21.794 21.664 21.392 21.26 21.1 20.924 20.564 20.367 20.134 19.867 19.568 19.193 18.646 17.166 -6 ,19190 ,KEBNE ,16724613,Sun Nov 28 06:47:55 CET,Sun Nov 28 08:26:38 CET,0.0 0.624 1.009 1.328 1.604 1.837 2.058 2.276 2.649 2.828 3.016 3.182 3.497 3.645 3.933 4.205 4.459 4.583 4.831 5.069 5.402 5.622 5.838 6.142 6.44 6.726 6.989 7.242 7.584 7.924 8.247 8.624 9.002 9.384 9.831 10.319 10.783 11.298 11.835 12.405 13.026 13.73 14.556 15.4 16.394 17.499 18.746 20.138 21.747 23.607 25.717 27.313 28.048 28.337 28.426 28.391 28.254 28.077 27.904 27.686 27.444 27.204 26.974 26.744 26.513 26.283 26.025 25.77 25.547 25.329 25.101 24.898 24.666 24.426 24.236 24.028 23.816 23.59 23.349 23.191 23.037 22.795 22.625 22.425 22.301 22.046 21.782 21.497 21.357 21.074 20.943 20.798 20.622 20.2 19.968 19.717 19.423 19.079 18.639 18.125 17.078 -7 ,27797 ,KEBNE ,16724614,Sun Nov 28 06:47:55 CET,Sun Nov 28 08:26:47 CET,0.0 0.758 1.11 1.426 1.715 1.976 2.205 2.416 2.782 2.951 3.119 3.286 3.606 3.751 4.035 4.302 4.562 4.689 4.934 5.167 5.509 5.733 5.942 6.251 6.544 6.817 7.089 7.358 7.697 8.019 8.333 8.711 9.055 9.385 9.782 10.236 10.669 11.158 11.713 12.304 12.899 13.54 14.293 15.07 15.996 17.058 18.259 19.616 21.25 23.098 25.142 26.591 27.281 27.595 27.69 27.719 27.675 27.541 27.371 27.148 26.941 26.726 26.499 26.264 26.016 25.768 25.494 25.242 25.019 24.804 24.568 24.357 24.136 23.896 23.705 23.513 23.308 23.081 22.833 22.648 22.44 22.122 21.911 21.694 21.575 21.321 21.059 20.78 20.632 20.331 20.151 19.977 19.795 19.418 19.196 18.956 18.708 18.425 18.055 17.576 16.326 -9 ,13583 ,KEBNE ,16724616,Sun Nov 28 06:47:56 CET,Sun Nov 28 08:26:58 CET,0.0 0.837 1.22 1.516 1.76 1.967 2.175 2.382 2.748 2.926 3.103 3.269 3.587 3.744 4.04 4.301 4.557 4.685 4.949 5.207 5.574 5.81 6.033 6.345 6.644 6.935 7.21 7.469 7.798 8.128 8.452 8.836 9.214 9.581 9.997 10.466 10.899 11.381 11.934 12.526 13.128 13.807 14.615 15.43 16.399 17.499 18.769 20.167 21.751 23.563 25.605 27.084 27.788 28.069 28.061 27.9 27.724 27.519 27.295 27.015 26.726 26.475 26.229 25.966 25.712 25.469 25.226 24.985 24.755 24.509 24.255 24.054 23.829 23.577 23.371 23.156 22.945 22.729 22.474 22.278 22.082 21.781 21.568 21.362 21.258 21.031 20.777 20.486 20.339 20.059 19.916 19.756 19.587 19.223 19.002 18.76 18.501 18.194 17.822 17.381 15.942 -10 ,17665 ,KEBNE ,16724617,Sun Nov 28 06:48:57 CET,Sun Nov 28 08:27:30 CET,0.0 0.74 1.088 1.363 1.603 1.844 2.072 2.288 2.665 2.832 3.009 3.195 3.512 3.669 3.957 4.211 4.472 4.602 4.835 5.059 5.392 5.607 5.821 6.131 6.423 6.703 6.974 7.231 7.578 7.917 8.237 8.633 9.013 9.379 9.816 10.299 10.758 11.277 11.839 12.44 13.065 13.749 14.563 15.387 16.347 17.405 18.605 19.991 21.626 23.507 25.576 27.002 27.655 27.939 27.954 27.829 27.655 27.43 27.202 26.924 26.67 26.44 26.179 25.909 25.654 25.418 25.169 24.94 24.738 24.501 24.238 24.025 23.803 23.562 23.375 23.183 22.977 22.763 22.538 22.378 22.211 21.943 21.753 21.562 21.459 21.229 20.998 20.762 20.622 20.328 20.158 19.969 19.774 19.372 19.136 18.884 18.617 18.313 17.948 17.495 16.144 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt deleted file mode 100644 index 41ae346f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25825 ,KEBNE ,16724618,Sun Nov 28 06:48:57 CET,Sun Nov 28 08:27:26 CET,0.0 0.853 1.229 1.555 1.814 2.014 2.208 2.405 2.743 2.906 3.062 3.186 3.491 3.627 3.891 4.121 4.334 4.434 4.633 4.83 5.099 5.279 5.457 5.706 5.936 6.155 6.375 6.583 6.838 7.076 7.299 7.563 7.819 8.066 8.35 8.656 8.952 9.306 9.662 9.985 10.294 10.651 11.074 11.472 11.938 12.453 12.985 13.508 14.049 14.474 14.595 14.151 13.407 12.609 11.736 10.917 10.227 9.604 9.025 8.401 7.862 7.358 6.852 6.353 5.905 5.521 5.123 4.759 4.416 4.053 3.69 3.39 3.068 2.725 2.457 2.186 1.907 1.621 1.321 1.102 0.874 0.525 0.264 -0.002 -0.129 -0.398 -0.688 -0.992 -1.155 -1.497 -1.704 -1.887 -2.072 -2.472 -2.703 -2.959 -3.25 -3.604 -3.995 -4.503 -5.627 -2 ,17518 ,KEBNE ,16724619,Sun Nov 28 06:48:58 CET,Sun Nov 28 08:28:57 CET,0.0 1.41 1.867 2.208 2.494 2.744 2.963 3.174 3.551 3.714 3.863 3.959 4.255 4.379 4.617 4.839 5.041 5.144 5.337 5.515 5.767 5.933 6.089 6.319 6.546 6.764 6.97 7.158 7.403 7.636 7.855 8.119 8.368 8.615 8.905 9.217 9.526 9.86 10.196 10.533 10.898 11.312 11.766 12.195 12.63 13.068 13.566 14.085 14.584 15.053 15.282 14.937 14.307 13.515 12.757 12.059 11.379 10.776 10.232 9.631 9.111 8.653 8.199 7.742 7.302 6.903 6.489 6.105 5.764 5.413 5.038 4.72 4.39 4.048 3.787 3.514 3.23 2.952 2.66 2.449 2.225 1.868 1.626 1.364 1.221 0.923 0.603 0.254 0.08 -0.253 -0.454 -0.645 -0.84 -1.291 -1.545 -1.841 -2.189 -2.538 -2.91 -3.393 -5.08 -5 ,24007 ,KEBNE ,16724622,Sun Nov 28 06:49:59 CET,Sun Nov 28 08:30:19 CET,0.0 1.41 1.821 2.172 2.453 2.702 2.937 3.15 3.509 3.664 3.805 3.913 4.205 4.321 4.555 4.785 5.012 5.123 5.33 5.517 5.787 5.966 6.135 6.383 6.62 6.839 7.037 7.222 7.467 7.696 7.92 8.196 8.44 8.667 8.953 9.29 9.609 9.947 10.282 10.625 10.988 11.387 11.853 12.279 12.693 13.13 13.619 14.133 14.613 14.949 15.011 14.565 13.867 13.071 12.318 11.623 10.97 10.261 9.592 8.927 8.332 7.804 7.308 6.837 6.401 6.0 5.59 5.221 4.888 4.545 4.196 3.914 3.6 3.256 2.998 2.731 2.451 2.164 1.859 1.638 1.41 1.07 0.842 0.604 0.477 0.194 -0.116 -0.454 -0.634 -0.984 -1.204 -1.387 -1.593 -2.047 -2.291 -2.574 -2.873 -3.211 -3.638 -4.145 -5.763 -6 ,28419 ,KEBNE ,16724623,Sun Nov 28 06:49:59 CET,Sun Nov 28 08:28:39 CET,0.0 1.185 1.596 1.894 2.148 2.385 2.605 2.809 3.16 3.309 3.452 3.56 3.853 3.985 4.247 4.486 4.712 4.826 5.046 5.251 5.536 5.709 5.875 6.111 6.333 6.542 6.748 6.949 7.202 7.425 7.638 7.904 8.162 8.421 8.711 9.026 9.325 9.659 10.02 10.39 10.763 11.168 11.632 12.074 12.601 13.182 13.729 14.199 14.69 15.12 15.268 14.925 14.265 13.472 12.671 11.895 11.208 10.544 9.922 9.284 8.756 8.289 7.827 7.405 7.011 6.642 6.254 5.891 5.577 5.241 4.905 4.639 4.338 4.021 3.778 3.524 3.271 3.01 2.717 2.508 2.301 1.976 1.737 1.477 1.336 1.067 0.795 0.487 0.32 -0.028 -0.264 -0.447 -0.632 -1.079 -1.348 -1.651 -1.979 -2.325 -2.716 -3.179 -4.531 -8 ,22783 ,KEBNE ,16724625,Sun Nov 28 06:51:01 CET,Sun Nov 28 08:28:38 CET,0.0 1.087 1.482 1.808 2.07 2.288 2.493 2.679 3.026 3.198 3.359 3.487 3.787 3.922 4.168 4.39 4.605 4.709 4.903 5.083 5.337 5.503 5.67 5.915 6.143 6.368 6.585 6.784 7.032 7.27 7.503 7.784 8.041 8.279 8.57 8.896 9.188 9.5 9.836 10.195 10.545 10.916 11.313 11.685 12.13 12.629 13.199 13.742 14.227 14.66 14.858 14.485 13.824 13.079 12.31 11.543 10.826 10.152 9.584 9.022 8.53 8.086 7.649 7.199 6.766 6.372 5.933 5.519 5.162 4.801 4.419 4.109 3.796 3.488 3.255 3.017 2.781 2.512 2.22 2.018 1.807 1.477 1.254 1.006 0.858 0.554 0.251 -0.078 -0.242 -0.577 -0.822 -1.032 -1.245 -1.715 -1.978 -2.262 -2.564 -2.889 -3.264 -3.816 -5.472 -9 ,9736 ,KEBNE ,16724626,Sun Nov 28 06:51:01 CET,Sun Nov 28 08:30:00 CET,0.0 1.811 2.193 2.481 2.751 3.0 3.215 3.407 3.753 3.911 4.055 4.186 4.492 4.627 4.875 5.105 5.315 5.416 5.624 5.823 6.094 6.263 6.424 6.663 6.908 7.132 7.333 7.531 7.806 8.065 8.284 8.557 8.821 9.062 9.361 9.708 10.016 10.329 10.655 11.009 11.402 11.839 12.281 12.678 13.129 13.623 14.184 14.767 15.307 15.771 16.042 15.574 14.828 14.143 13.49 12.837 12.239 11.646 11.078 10.448 9.896 9.424 8.967 8.498 8.058 7.685 7.296 6.929 6.6 6.245 5.88 5.592 5.264 4.926 4.686 4.43 4.156 3.844 3.514 3.303 3.086 2.732 2.488 2.24 2.111 1.842 1.547 1.215 1.038 0.7 0.482 0.268 0.043 -0.434 -0.702 -0.984 -1.27 -1.612 -2.013 -2.483 -4.221 -10 ,11308 ,KEBNE ,16724627,Sun Nov 28 06:52:02 CET,Sun Nov 28 08:29:41 CET,0.0 0.824 1.274 1.625 1.898 2.182 2.438 2.626 2.938 3.095 3.252 3.375 3.674 3.805 4.054 4.294 4.509 4.609 4.798 4.966 5.21 5.372 5.541 5.791 6.015 6.231 6.439 6.636 6.882 7.106 7.325 7.614 7.888 8.133 8.415 8.712 9.001 9.324 9.67 10.028 10.383 10.763 11.171 11.572 12.051 12.536 13.023 13.542 14.054 14.514 14.788 14.436 13.748 12.986 12.265 11.614 11.003 10.383 9.79 9.155 8.609 8.142 7.691 7.272 6.88 6.49 6.064 5.686 5.346 4.988 4.629 4.333 4.018 3.692 3.429 3.151 2.864 2.548 2.215 1.985 1.75 1.379 1.131 0.864 0.722 0.428 0.113 -0.214 -0.389 -0.73 -0.935 -1.141 -1.361 -1.831 -2.084 -2.348 -2.663 -3.006 -3.369 -3.832 -6.102 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt deleted file mode 100644 index 75acad38..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5534 ,KEBNE ,16724628,Sun Nov 28 06:52:01 CET,Sun Nov 28 08:29:05 CET,0.0 1.218 1.681 2.022 2.313 2.572 2.805 3.036 3.453 3.629 3.796 3.972 4.264 4.399 4.662 4.888 5.111 5.225 5.441 5.638 5.917 6.09 6.246 6.466 6.685 6.899 7.108 7.308 7.548 7.772 7.988 8.256 8.516 8.752 9.015 9.317 9.591 9.865 10.159 10.49 10.835 11.203 11.604 11.944 12.31 12.691 13.031 13.343 13.597 13.672 13.282 12.208 11.051 9.931 8.859 7.833 6.927 6.044 5.222 4.405 3.688 3.048 2.429 1.848 1.287 0.751 0.192 -0.306 -0.735 -1.183 -1.662 -2.071 -2.495 -2.943 -3.316 -3.704 -4.076 -4.465 -4.884 -5.174 -5.474 -5.935 -6.261 -6.615 -6.792 -7.154 -7.568 -8.016 -8.238 -8.622 -8.987 -9.274 -9.582 -10.215 -10.561 -10.968 -11.466 -12.017 -12.637 -13.486 -17.612 -2 ,2996 ,KEBNE ,16724629,Sun Nov 28 06:52:01 CET,Sun Nov 28 08:28:46 CET,0.0 1.012 1.476 1.856 2.194 2.483 2.727 2.949 3.343 3.509 3.667 3.831 4.133 4.28 4.558 4.795 5.002 5.103 5.315 5.518 5.8 5.986 6.164 6.41 6.629 6.828 7.032 7.229 7.474 7.707 7.926 8.183 8.422 8.652 8.923 9.221 9.517 9.83 10.117 10.42 10.736 11.081 11.459 11.815 12.227 12.628 13.042 13.414 13.634 13.648 13.161 12.027 10.828 9.707 8.659 7.673 6.815 5.972 5.152 4.294 3.536 2.841 2.194 1.605 1.03 0.491 -0.047 -0.538 -0.988 -1.454 -1.932 -2.341 -2.772 -3.217 -3.565 -3.928 -4.313 -4.702 -5.116 -5.41 -5.703 -6.186 -6.542 -6.888 -7.06 -7.439 -7.859 -8.3 -8.517 -8.901 -9.261 -9.531 -9.83 -10.501 -10.857 -11.26 -11.705 -12.213 -12.832 -13.616 -16.168 -3 ,25891 ,KEBNE ,16724630,Sun Nov 28 06:52:02 CET,Sun Nov 28 08:30:44 CET,0.0 1.16 1.651 1.994 2.259 2.521 2.794 3.028 3.396 3.56 3.716 3.862 4.151 4.28 4.52 4.746 4.969 5.076 5.291 5.507 5.793 5.967 6.137 6.4 6.644 6.858 7.059 7.259 7.527 7.773 8.018 8.31 8.555 8.793 9.079 9.376 9.646 9.944 10.251 10.562 10.891 11.249 11.62 11.945 12.31 12.686 13.04 13.328 13.553 13.622 13.151 12.13 11.079 10.006 8.952 7.948 7.038 6.178 5.383 4.553 3.827 3.154 2.507 1.918 1.352 0.841 0.33 -0.143 -0.567 -1.033 -1.512 -1.912 -2.345 -2.79 -3.146 -3.529 -3.924 -4.321 -4.724 -5.01 -5.301 -5.759 -6.09 -6.454 -6.645 -7.039 -7.446 -7.875 -8.118 -8.53 -8.914 -9.203 -9.517 -10.181 -10.539 -10.932 -11.391 -11.916 -12.509 -13.354 -15.961 -4 ,6725 ,KEBNE ,16724631,Sun Nov 28 06:52:02 CET,Sun Nov 28 08:31:49 CET,0.0 1.512 2.07 2.481 2.83 3.115 3.384 3.637 4.044 4.245 4.445 4.652 4.973 5.14 5.408 5.632 5.871 5.982 6.189 6.387 6.699 6.9 7.068 7.31 7.547 7.772 7.986 8.19 8.442 8.673 8.9 9.169 9.428 9.677 9.955 10.258 10.543 10.846 11.158 11.468 11.764 12.078 12.426 12.754 13.106 13.465 13.823 14.14 14.331 14.318 13.869 12.823 11.666 10.512 9.454 8.468 7.505 6.564 5.76 4.937 4.221 3.566 2.923 2.319 1.742 1.222 0.668 0.152 -0.304 -0.759 -1.214 -1.615 -2.031 -2.454 -2.81 -3.188 -3.567 -3.962 -4.376 -4.67 -4.977 -5.464 -5.806 -6.166 -6.358 -6.762 -7.193 -7.638 -7.864 -8.253 -8.595 -8.854 -9.144 -9.779 -10.126 -10.519 -10.957 -11.442 -12.036 -12.857 -15.411 -5 ,28629 ,KEBNE ,16724632,Sun Nov 28 06:53:04 CET,Sun Nov 28 08:33:54 CET,0.0 1.03 1.479 1.795 2.074 2.32 2.544 2.763 3.147 3.311 3.481 3.65 3.942 4.077 4.327 4.562 4.781 4.878 5.074 5.275 5.55 5.713 5.875 6.11 6.327 6.533 6.731 6.933 7.218 7.509 7.787 8.105 8.398 8.678 8.978 9.265 9.536 9.839 10.156 10.476 10.8 11.16 11.567 11.945 12.343 12.75 13.16 13.519 13.817 13.915 13.472 12.428 11.238 10.073 8.994 7.98 7.032 6.117 5.263 4.413 3.71 3.035 2.382 1.789 1.244 0.722 0.134 -0.372 -0.781 -1.225 -1.71 -2.113 -2.534 -2.979 -3.326 -3.687 -4.047 -4.439 -4.848 -5.124 -5.426 -5.943 -6.306 -6.677 -6.873 -7.262 -7.653 -8.08 -8.318 -8.716 -9.055 -9.329 -9.615 -10.234 -10.592 -10.995 -11.428 -11.863 -12.417 -13.24 -16.197 -6 ,23734 ,KEBNE ,16724633,Sun Nov 28 06:53:04 CET,Sun Nov 28 08:31:47 CET,0.0 1.111 1.567 1.92 2.279 2.608 2.892 3.16 3.645 3.86 4.067 4.284 4.603 4.776 5.111 5.42 5.709 5.836 6.056 6.259 6.553 6.727 6.891 7.13 7.364 7.584 7.781 7.974 8.219 8.456 8.698 8.973 9.228 9.474 9.741 10.03 10.311 10.596 10.877 11.173 11.483 11.848 12.256 12.596 12.959 13.349 13.712 14.041 14.315 14.358 13.881 12.81 11.647 10.457 9.35 8.345 7.419 6.525 5.688 4.861 4.169 3.53 2.891 2.255 1.662 1.136 0.602 0.104 -0.349 -0.815 -1.287 -1.686 -2.117 -2.592 -2.96 -3.321 -3.701 -4.087 -4.494 -4.779 -5.069 -5.538 -5.874 -6.219 -6.395 -6.776 -7.201 -7.658 -7.885 -8.276 -8.641 -8.916 -9.227 -9.902 -10.254 -10.643 -11.094 -11.623 -12.268 -13.04 -15.467 -7 ,16676 ,KEBNE ,16724634,Sun Nov 28 06:54:05 CET,Sun Nov 28 08:30:56 CET,0.0 1.256 1.729 2.087 2.382 2.643 2.896 3.128 3.523 3.7 3.871 4.046 4.344 4.48 4.733 4.974 5.21 5.326 5.532 5.713 5.973 6.135 6.298 6.539 6.766 6.995 7.211 7.401 7.642 7.877 8.109 8.389 8.643 8.88 9.165 9.486 9.775 10.059 10.348 10.66 10.983 11.345 11.749 12.089 12.408 12.724 13.039 13.31 13.554 13.653 13.237 12.184 11.005 9.843 8.768 7.749 6.791 5.906 5.156 4.322 3.545 2.898 2.276 1.65 1.058 0.525 -0.015 -0.525 -0.973 -1.435 -1.916 -2.328 -2.772 -3.239 -3.589 -3.932 -4.277 -4.647 -5.036 -5.31 -5.622 -6.13 -6.475 -6.835 -7.02 -7.402 -7.808 -8.223 -8.438 -8.816 -9.161 -9.439 -9.743 -10.405 -10.765 -11.181 -11.689 -12.237 -12.859 -13.706 -16.132 -9 ,31752 ,KEBNE ,16724636,Sun Nov 28 06:55:07 CET,Sun Nov 28 08:32:05 CET,0.0 1.052 1.542 1.938 2.251 2.52 2.757 2.96 3.331 3.507 3.665 3.793 4.087 4.234 4.495 4.738 4.955 5.056 5.262 5.454 5.727 5.9 6.073 6.343 6.592 6.823 7.044 7.243 7.487 7.727 7.967 8.239 8.49 8.719 8.982 9.284 9.566 9.867 10.161 10.468 10.788 11.149 11.555 11.896 12.256 12.621 13.003 13.392 13.702 13.76 13.263 12.167 10.975 9.798 8.714 7.694 6.785 5.917 5.115 4.305 3.607 2.967 2.323 1.7 1.111 0.558 -0.021 -0.536 -0.988 -1.437 -1.889 -2.285 -2.716 -3.178 -3.532 -3.889 -4.273 -4.673 -5.105 -5.417 -5.73 -6.207 -6.543 -6.906 -7.095 -7.461 -7.837 -8.257 -8.492 -8.894 -9.268 -9.54 -9.821 -10.469 -10.837 -11.246 -11.713 -12.211 -12.817 -13.691 -16.063 -10 ,27974 ,KEBNE ,16724637,Sun Nov 28 06:55:07 CET,Sun Nov 28 08:32:02 CET,0.0 1.206 1.695 2.042 2.332 2.596 2.829 3.024 3.391 3.555 3.706 3.853 4.147 4.283 4.542 4.781 5.01 5.117 5.327 5.531 5.804 5.972 6.144 6.385 6.595 6.81 7.024 7.224 7.481 7.723 7.959 8.236 8.498 8.748 9.031 9.349 9.635 9.931 10.268 10.615 10.96 11.328 11.7 12.072 12.472 12.865 13.285 13.651 13.878 13.894 13.363 12.253 11.169 10.109 9.085 8.095 7.133 6.164 5.367 4.631 3.942 3.28 2.621 1.994 1.434 0.898 0.338 -0.163 -0.62 -1.089 -1.57 -1.975 -2.409 -2.859 -3.197 -3.546 -3.9 -4.262 -4.685 -4.995 -5.312 -5.802 -6.136 -6.476 -6.654 -7.035 -7.431 -7.845 -8.062 -8.446 -8.822 -9.105 -9.388 -9.99 -10.33 -10.711 -11.137 -11.632 -12.233 -13.026 -16.256 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt deleted file mode 100644 index e2ad4864..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/syk/water/Summary_FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12835 ,KEBNE ,16724638,Sun Nov 28 06:55:08 CET,Sun Nov 28 08:36:38 CET,0.0 0.721 1.126 1.438 1.717 1.972 2.199 2.416 2.793 2.969 3.133 3.272 3.554 3.686 3.928 4.161 4.385 4.496 4.727 4.944 5.249 5.447 5.633 5.891 6.125 6.349 6.574 6.797 7.087 7.363 7.625 7.946 8.245 8.528 8.859 9.239 9.575 9.897 10.241 10.627 11.035 11.479 12.02 12.566 13.167 13.768 14.39 15.056 15.757 16.353 16.692 16.464 15.897 15.234 14.534 13.846 13.229 12.64 12.106 11.522 10.951 10.419 9.903 9.404 8.934 8.501 8.04 7.599 7.215 6.853 6.478 6.134 5.774 5.43 5.158 4.862 4.553 4.222 3.864 3.607 3.334 2.905 2.602 2.278 2.12 1.794 1.447 1.079 0.877 0.522 0.211 -0.028 -0.274 -0.825 -1.148 -1.5 -1.895 -2.326 -2.806 -3.572 -5.438 -3 ,2469 ,KEBNE ,16724640,Sun Nov 28 06:56:08 CET,Sun Nov 28 08:33:42 CET,0.0 0.844 1.325 1.64 1.884 2.117 2.34 2.538 2.927 3.105 3.258 3.414 3.703 3.835 4.096 4.325 4.54 4.649 4.866 5.091 5.416 5.609 5.789 6.045 6.287 6.523 6.744 6.952 7.213 7.459 7.698 7.977 8.241 8.514 8.844 9.193 9.518 9.876 10.264 10.675 11.109 11.601 12.15 12.694 13.314 13.921 14.57 15.253 15.9 16.4 16.518 16.073 15.488 14.794 13.977 13.191 12.487 11.796 11.207 10.622 10.087 9.597 9.172 8.762 8.317 7.894 7.423 6.972 6.589 6.194 5.769 5.415 5.041 4.637 4.326 4.011 3.694 3.354 2.966 2.7 2.429 1.998 1.701 1.406 1.256 0.928 0.591 0.204 -0.016 -0.373 -0.666 -0.903 -1.164 -1.74 -2.053 -2.395 -2.754 -3.168 -3.711 -4.442 -6.485 -5 ,13766 ,KEBNE ,16724642,Sun Nov 28 06:57:10 CET,Sun Nov 28 08:34:40 CET,0.0 0.777 1.132 1.395 1.61 1.823 2.037 2.246 2.615 2.766 2.913 3.049 3.325 3.449 3.7 3.954 4.194 4.307 4.524 4.737 5.028 5.224 5.415 5.678 5.936 6.186 6.424 6.647 6.943 7.226 7.489 7.809 8.122 8.424 8.764 9.123 9.474 9.868 10.253 10.641 11.029 11.446 11.924 12.406 12.993 13.607 14.226 14.833 15.451 15.978 16.233 15.908 15.288 14.615 13.945 13.239 12.57 11.949 11.335 10.683 10.105 9.577 9.062 8.599 8.18 7.768 7.297 6.863 6.493 6.084 5.677 5.37 5.039 4.664 4.366 4.068 3.758 3.423 3.066 2.815 2.566 2.167 1.872 1.562 1.398 1.038 0.663 0.264 0.044 -0.322 -0.628 -0.873 -1.128 -1.634 -1.926 -2.264 -2.667 -3.151 -3.716 -4.42 -6.52 -7 ,25747 ,KEBNE ,16724644,Sun Nov 28 06:57:10 CET,Sun Nov 28 08:39:42 CET,0.0 0.843 1.201 1.472 1.721 1.956 2.16 2.342 2.672 2.825 2.984 3.134 3.42 3.554 3.799 4.031 4.258 4.376 4.6 4.808 5.095 5.271 5.45 5.72 5.96 6.184 6.408 6.625 6.904 7.164 7.403 7.685 7.953 8.226 8.565 8.924 9.246 9.622 10.036 10.455 10.894 11.376 11.9 12.399 12.94 13.504 14.098 14.731 15.426 15.995 16.342 16.091 15.47 14.792 14.049 13.301 12.665 12.079 11.536 10.957 10.405 9.857 9.34 8.854 8.37 7.917 7.436 7.022 6.663 6.287 5.876 5.522 5.171 4.801 4.51 4.204 3.875 3.527 3.164 2.913 2.664 2.266 1.962 1.636 1.471 1.146 0.784 0.373 0.172 -0.175 -0.474 -0.734 -1.019 -1.61 -1.937 -2.289 -2.689 -3.14 -3.676 -4.417 -6.274 -8 ,2101 ,KEBNE ,16724645,Sun Nov 28 06:57:09 CET,Sun Nov 28 08:34:47 CET,0.0 0.792 1.173 1.489 1.748 1.979 2.178 2.354 2.657 2.801 2.95 3.1 3.388 3.529 3.802 4.067 4.311 4.421 4.62 4.81 5.094 5.267 5.428 5.667 5.901 6.134 6.372 6.603 6.894 7.162 7.407 7.702 7.991 8.278 8.6 8.958 9.313 9.701 10.097 10.495 10.908 11.361 11.867 12.388 12.954 13.485 14.065 14.695 15.327 15.849 16.108 15.829 15.278 14.613 13.901 13.154 12.469 11.825 11.245 10.631 10.113 9.65 9.134 8.607 8.136 7.704 7.227 6.814 6.48 6.127 5.738 5.402 5.04 4.656 4.354 4.035 3.707 3.351 2.959 2.704 2.452 2.066 1.8 1.509 1.355 1.018 0.655 0.28 0.07 -0.293 -0.589 -0.839 -1.11 -1.676 -1.994 -2.343 -2.725 -3.164 -3.702 -4.422 -6.762 -9 ,12595 ,KEBNE ,16724646,Sun Nov 28 06:57:09 CET,Sun Nov 28 08:34:29 CET,0.0 0.783 1.224 1.542 1.805 2.037 2.259 2.472 2.837 3.002 3.169 3.329 3.617 3.756 4.028 4.279 4.494 4.602 4.835 5.059 5.37 5.57 5.76 6.022 6.282 6.53 6.752 6.97 7.242 7.484 7.729 8.049 8.369 8.667 9.001 9.375 9.714 10.095 10.491 10.893 11.344 11.836 12.399 12.945 13.553 14.184 14.88 15.67 16.449 17.046 17.236 16.861 16.327 15.69 14.988 14.31 13.654 13.027 12.507 11.965 11.418 10.907 10.413 9.889 9.4 8.978 8.534 8.125 7.759 7.375 6.982 6.641 6.26 5.874 5.578 5.259 4.931 4.589 4.208 3.944 3.688 3.295 3.006 2.68 2.513 2.173 1.815 1.434 1.219 0.86 0.574 0.341 0.096 -0.472 -0.798 -1.165 -1.551 -1.991 -2.562 -3.278 -5.054 -10 ,9185 ,KEBNE ,16724647,Sun Nov 28 06:57:10 CET,Sun Nov 28 08:40:05 CET,0.0 0.522 0.839 1.103 1.335 1.556 1.75 1.931 2.275 2.441 2.6 2.76 3.061 3.207 3.481 3.725 3.944 4.048 4.253 4.459 4.742 4.923 5.103 5.363 5.611 5.849 6.079 6.312 6.643 6.944 7.199 7.504 7.797 8.089 8.439 8.808 9.155 9.534 9.931 10.336 10.739 11.219 11.79 12.329 12.932 13.576 14.276 14.934 15.576 16.129 16.279 15.915 15.369 14.705 13.984 13.238 12.524 11.88 11.281 10.649 10.093 9.576 9.068 8.561 8.096 7.668 7.184 6.756 6.403 6.028 5.626 5.293 4.943 4.571 4.269 3.952 3.627 3.282 2.921 2.664 2.382 1.943 1.644 1.339 1.179 0.844 0.48 0.091 -0.106 -0.459 -0.763 -0.995 -1.246 -1.806 -2.098 -2.395 -2.742 -3.149 -3.641 -4.327 -6.174 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt deleted file mode 100644 index 92781f0e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_1b_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18947 ,TETRA ,17698832,Sat Dec 4 16:42:54 CET,Sat Dec 4 18:38:19 CET,0.0 0.32 0.432 0.511 0.588 0.665 0.752 0.833 0.967 1.036 1.105 1.036 1.28 1.35 1.47 1.586 1.706 1.761 1.874 1.995 2.163 2.269 2.38 2.538 2.679 2.818 2.952 3.088 3.266 3.442 3.61 3.812 4.017 4.215 4.445 4.717 4.989 5.294 5.629 5.988 6.378 6.826 7.343 7.883 8.589 9.42 10.347 11.377 12.648 14.212 16.159 17.857 18.873 19.572 20.035 20.315 20.51 20.662 20.769 20.863 20.909 20.918 20.903 20.863 20.827 20.798 20.774 20.747 20.695 20.623 20.548 20.481 20.396 20.32 20.261 20.19 20.113 20.026 19.936 19.873 19.812 19.712 19.636 19.554 19.51 19.41 19.31 19.206 19.149 18.924 18.957 18.898 18.84 18.72 18.628 18.51 18.385 18.262 18.106 17.824 17.049 -2 ,7903 ,TETRA ,17698833,Sat Dec 4 16:42:57 CET,Sat Dec 4 18:38:17 CET,0.0 0.271 0.376 0.472 0.56 0.639 0.72 0.793 0.93 1.002 1.069 1.009 1.25 1.306 1.416 1.528 1.642 1.698 1.801 1.895 2.042 2.145 2.248 2.398 2.546 2.69 2.825 2.96 3.138 3.315 3.492 3.712 3.925 4.129 4.359 4.629 4.91 5.205 5.52 5.856 6.216 6.631 7.135 7.677 8.323 9.084 10.003 11.033 12.288 13.833 15.756 17.411 18.403 19.041 19.417 19.678 19.866 19.973 20.047 20.111 20.134 20.114 20.077 20.049 20.022 19.994 19.944 19.884 19.836 19.786 19.72 19.655 19.596 19.533 19.459 19.368 19.293 19.213 19.106 19.041 18.978 18.851 18.767 18.684 18.635 18.519 18.387 18.247 18.177 17.951 17.945 17.859 17.775 17.543 17.415 17.3 17.164 16.977 16.688 16.38 15.699 -3 ,30805 ,TETRA ,17698834,Sat Dec 4 16:42:59 CET,Sat Dec 4 18:37:58 CET,0.0 0.291 0.407 0.521 0.63 0.719 0.787 0.854 0.992 1.063 1.124 1.06 1.304 1.362 1.483 1.604 1.722 1.778 1.888 1.987 2.14 2.248 2.357 2.511 2.655 2.795 2.932 3.07 3.251 3.43 3.605 3.821 4.031 4.236 4.474 4.731 4.979 5.272 5.602 5.958 6.343 6.785 7.311 7.863 8.538 9.317 10.253 11.342 12.617 14.169 16.229 18.026 19.078 19.796 20.265 20.564 20.791 20.947 21.032 21.085 21.101 21.112 21.124 21.125 21.109 21.071 21.016 20.971 20.925 20.874 20.827 20.788 20.731 20.657 20.598 20.536 20.472 20.404 20.321 20.261 20.199 20.089 20.026 19.965 19.921 19.84 19.752 19.63 19.571 19.355 19.381 19.3 19.218 19.019 18.885 18.735 18.561 18.366 18.146 17.812 16.729 -4 ,9931 ,TETRA ,17698835,Sat Dec 4 16:42:55 CET,Sat Dec 4 18:38:26 CET,0.0 0.139 0.269 0.395 0.494 0.582 0.646 0.719 0.871 0.933 0.99 0.927 1.173 1.24 1.369 1.477 1.569 1.616 1.721 1.821 1.965 2.064 2.162 2.313 2.468 2.62 2.765 2.897 3.072 3.254 3.43 3.632 3.826 4.037 4.293 4.571 4.848 5.161 5.497 5.869 6.281 6.742 7.264 7.808 8.459 9.225 10.156 11.188 12.394 13.865 15.777 17.475 18.442 19.079 19.55 19.889 20.109 20.253 20.335 20.381 20.401 20.415 20.41 20.392 20.352 20.293 20.241 20.195 20.153 20.107 20.031 19.956 19.891 19.808 19.73 19.653 19.57 19.496 19.404 19.328 19.258 19.139 19.055 18.98 18.944 18.859 18.759 18.651 18.596 18.373 18.401 18.323 18.249 18.083 17.987 17.868 17.698 17.527 17.309 16.992 15.807 -5 ,433 ,TETRA ,17698836,Sat Dec 4 16:42:57 CET,Sat Dec 4 18:38:44 CET,0.0 0.13 0.257 0.367 0.463 0.552 0.628 0.698 0.839 0.911 0.984 0.932 1.175 1.239 1.359 1.471 1.582 1.64 1.755 1.871 2.032 2.132 2.236 2.392 2.543 2.688 2.823 2.957 3.136 3.313 3.49 3.71 3.918 4.118 4.357 4.626 4.897 5.198 5.528 5.893 6.278 6.706 7.228 7.788 8.438 9.169 10.066 11.12 12.448 14.119 16.183 17.905 18.92 19.549 19.961 20.26 20.474 20.642 20.731 20.782 20.831 20.847 20.831 20.792 20.738 20.684 20.606 20.523 20.447 20.382 20.304 20.22 20.124 20.017 19.939 19.86 19.778 19.679 19.58 19.518 19.449 19.334 19.247 19.156 19.108 19.009 18.887 18.747 18.674 18.443 18.458 18.371 18.284 18.082 17.973 17.845 17.698 17.529 17.333 17.076 16.296 -6 ,19223 ,TETRA ,17698837,Sat Dec 4 16:42:59 CET,Sat Dec 4 18:38:31 CET,0.0 0.276 0.397 0.528 0.645 0.725 0.796 0.874 1.04 1.116 1.186 1.141 1.394 1.457 1.57 1.699 1.823 1.879 1.987 2.093 2.257 2.365 2.472 2.624 2.769 2.921 3.068 3.217 3.405 3.579 3.755 3.959 4.156 4.351 4.587 4.871 5.138 5.418 5.741 6.109 6.501 6.94 7.454 7.992 8.646 9.398 10.294 11.334 12.603 14.163 16.089 17.658 18.601 19.236 19.651 19.951 20.163 20.3 20.378 20.416 20.438 20.444 20.422 20.384 20.349 20.309 20.259 20.217 20.177 20.12 20.055 19.992 19.923 19.85 19.796 19.74 19.676 19.606 19.525 19.463 19.394 19.282 19.212 19.146 19.108 19.027 18.936 18.818 18.755 18.537 18.572 18.497 18.403 18.196 18.089 17.979 17.854 17.694 17.491 17.224 16.381 -7 ,16269 ,TETRA ,17698838,Sat Dec 4 16:42:56 CET,Sat Dec 4 18:37:35 CET,0.0 0.169 0.315 0.429 0.535 0.611 0.678 0.745 0.891 0.959 1.025 0.982 1.232 1.295 1.402 1.51 1.621 1.677 1.794 1.902 2.058 2.159 2.26 2.405 2.547 2.687 2.82 2.951 3.118 3.287 3.461 3.671 3.878 4.081 4.31 4.568 4.822 5.122 5.457 5.806 6.181 6.619 7.147 7.696 8.338 9.092 10.002 11.037 12.323 13.93 16.015 17.806 18.821 19.474 19.921 20.21 20.373 20.453 20.516 20.585 20.607 20.6 20.592 20.564 20.505 20.453 20.396 20.335 20.283 20.223 20.145 20.08 20.02 19.965 19.923 19.874 19.812 19.741 19.668 19.616 19.551 19.445 19.368 19.278 19.232 19.132 19.016 18.906 18.854 18.624 18.608 18.54 18.467 18.267 18.147 18.024 17.912 17.772 17.581 17.346 16.568 -8 ,27317 ,TETRA ,17698839,Sat Dec 4 16:42:56 CET,Sat Dec 4 18:38:33 CET,0.0 0.221 0.353 0.456 0.544 0.641 0.724 0.81 0.99 1.066 1.135 1.084 1.326 1.379 1.489 1.598 1.709 1.766 1.876 1.983 2.142 2.249 2.352 2.501 2.656 2.814 2.964 3.11 3.286 3.462 3.642 3.859 4.072 4.276 4.509 4.772 5.032 5.326 5.649 5.995 6.381 6.834 7.386 7.964 8.632 9.379 10.266 11.315 12.605 14.195 16.173 17.898 18.948 19.583 19.983 20.269 20.443 20.528 20.587 20.653 20.697 20.7 20.683 20.656 20.613 20.567 20.518 20.459 20.389 20.318 20.229 20.149 20.071 19.994 19.933 19.858 19.769 19.675 19.596 19.54 19.472 19.353 19.248 19.151 19.108 19.008 18.889 18.756 18.689 18.458 18.476 18.394 18.302 18.124 18.023 17.917 17.799 17.636 17.406 17.08 16.248 -9 ,16859 ,TETRA ,17698840,Sat Dec 4 16:41:47 CET,Sat Dec 4 18:34:22 CET,0.0 0.078 0.152 0.236 0.333 0.444 0.543 0.627 0.779 0.842 0.907 0.848 1.096 1.163 1.282 1.4 1.519 1.574 1.675 1.776 1.93 2.031 2.131 2.279 2.421 2.552 2.691 2.825 2.992 3.178 3.361 3.568 3.771 3.971 4.212 4.493 4.764 5.079 5.433 5.807 6.188 6.618 7.152 7.699 8.338 9.104 10.062 11.177 12.507 14.134 16.172 17.908 18.916 19.517 19.887 20.18 20.381 20.509 20.59 20.628 20.644 20.641 20.603 20.54 20.48 20.43 20.379 20.334 20.291 20.234 20.162 20.096 20.017 19.938 19.877 19.809 19.731 19.642 19.549 19.495 19.444 19.339 19.265 19.187 19.145 19.064 18.985 18.878 18.812 18.584 18.6 18.534 18.469 18.296 18.178 18.057 17.933 17.764 17.562 17.273 16.557 -10 ,478 ,TETRA ,17698841,Sat Dec 4 16:42:57 CET,Sat Dec 4 18:38:07 CET,0.0 0.244 0.375 0.483 0.573 0.655 0.74 0.823 0.974 1.048 1.122 1.076 1.323 1.381 1.498 1.61 1.721 1.776 1.878 1.978 2.13 2.233 2.335 2.477 2.616 2.763 2.907 3.044 3.232 3.4 3.553 3.758 3.968 4.173 4.422 4.715 5.004 5.321 5.651 6.018 6.418 6.874 7.415 7.965 8.632 9.387 10.303 11.382 12.678 14.22 16.12 17.775 18.753 19.384 19.826 20.173 20.427 20.55 20.586 20.59 20.593 20.581 20.549 20.522 20.475 20.426 20.368 20.29 20.228 20.18 20.115 20.04 19.959 19.872 19.804 19.736 19.661 19.572 19.49 19.43 19.357 19.246 19.16 19.061 19.009 18.916 18.819 18.708 18.657 18.448 18.469 18.385 18.293 18.093 17.985 17.869 17.764 17.627 17.413 17.139 16.615 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1a.txt deleted file mode 100644 index 0db1eb29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21329 ,TETRA ,17698842,Sat Dec 4 16:43:00 CET,Sat Dec 4 18:45:23 CET,0.0 0.116 0.23 0.339 0.44 0.519 0.607 0.688 0.812 0.87 0.937 0.9 1.13 1.178 1.261 1.34 1.422 1.463 1.546 1.623 1.742 1.82 1.893 2.011 2.126 2.236 2.35 2.462 2.608 2.753 2.885 3.046 3.2 3.349 3.533 3.737 3.921 4.138 4.381 4.63 4.9 5.197 5.569 5.976 6.427 6.923 7.516 8.167 8.924 9.849 10.911 11.784 12.178 12.339 12.387 12.352 12.243 12.111 11.995 11.845 11.698 11.537 11.389 11.257 11.112 10.975 10.804 10.628 10.47 10.317 10.172 10.033 9.893 9.753 9.629 9.5 9.377 9.259 9.128 9.025 8.929 8.777 8.665 8.545 8.478 8.323 8.172 8.027 7.936 7.67 7.597 7.466 7.325 7.026 6.843 6.608 6.364 6.091 5.777 5.295 3.514 -2 ,24272 ,TETRA ,17698843,Sat Dec 4 16:43:02 CET,Sat Dec 4 18:44:51 CET,0.0 0.198 0.305 0.391 0.463 0.527 0.588 0.652 0.77 0.817 0.857 0.782 1.011 1.07 1.171 1.265 1.35 1.39 1.485 1.568 1.68 1.765 1.846 1.953 2.063 2.172 2.271 2.372 2.507 2.645 2.777 2.927 3.073 3.214 3.382 3.586 3.778 3.987 4.229 4.5 4.775 5.071 5.431 5.806 6.218 6.67 7.226 7.894 8.66 9.509 10.551 11.389 11.773 11.924 11.922 11.853 11.769 11.679 11.583 11.473 11.355 11.226 11.098 10.953 10.797 10.641 10.471 10.312 10.171 10.008 9.809 9.672 9.555 9.397 9.262 9.121 8.991 8.864 8.712 8.617 8.504 8.311 8.186 8.049 7.972 7.81 7.646 7.458 7.36 7.103 7.034 6.903 6.77 6.499 6.353 6.17 5.96 5.727 5.361 4.803 2.083 -3 ,26333 ,TETRA ,17698844,Sat Dec 4 16:42:56 CET,Sat Dec 4 18:41:48 CET,0.0 0.157 0.243 0.344 0.43 0.509 0.586 0.655 0.784 0.84 0.892 0.828 1.054 1.1 1.192 1.287 1.371 1.407 1.485 1.574 1.708 1.788 1.87 1.99 2.091 2.19 2.292 2.393 2.521 2.647 2.78 2.94 3.083 3.225 3.401 3.603 3.793 3.991 4.208 4.463 4.726 5.008 5.352 5.727 6.167 6.642 7.24 7.95 8.765 9.702 10.768 11.529 11.857 11.99 12.045 12.035 11.937 11.791 11.66 11.493 11.324 11.164 11.001 10.84 10.664 10.507 10.331 10.17 10.029 9.881 9.724 9.59 9.456 9.301 9.175 9.041 8.898 8.76 8.608 8.483 8.358 8.173 8.036 7.896 7.824 7.675 7.527 7.35 7.258 7.006 6.951 6.826 6.687 6.394 6.218 6.021 5.824 5.581 5.19 4.597 2.231 -4 ,5825 ,TETRA ,17698845,Sat Dec 4 16:42:56 CET,Sat Dec 4 18:41:40 CET,0.0 0.222 0.372 0.509 0.618 0.702 0.774 0.831 0.943 1.0 1.055 0.985 1.206 1.258 1.363 1.463 1.55 1.589 1.672 1.757 1.879 1.952 2.021 2.133 2.252 2.354 2.448 2.54 2.66 2.783 2.905 3.049 3.197 3.358 3.538 3.742 3.943 4.158 4.394 4.65 4.921 5.236 5.604 5.969 6.41 6.913 7.502 8.154 8.923 9.838 10.947 11.8 12.211 12.392 12.419 12.39 12.321 12.213 12.124 12.05 11.946 11.809 11.676 11.557 11.429 11.301 11.164 11.027 10.89 10.736 10.582 10.449 10.294 10.15 10.041 9.92 9.801 9.683 9.53 9.42 9.322 9.148 9.016 8.87 8.796 8.655 8.466 8.244 8.144 7.901 7.851 7.724 7.591 7.292 7.137 6.961 6.774 6.595 6.295 5.853 4.018 -5 ,17587 ,TETRA ,17698846,Sat Dec 4 16:42:57 CET,Sat Dec 4 18:42:04 CET,0.0 0.206 0.314 0.406 0.497 0.569 0.624 0.696 0.822 0.868 0.919 0.858 1.089 1.15 1.259 1.351 1.433 1.474 1.56 1.637 1.746 1.825 1.902 2.019 2.144 2.257 2.361 2.46 2.588 2.719 2.844 3.004 3.162 3.314 3.49 3.698 3.899 4.118 4.367 4.643 4.929 5.242 5.609 5.986 6.427 6.905 7.48 8.142 8.874 9.748 10.832 11.614 11.966 12.09 12.116 12.084 12.027 11.979 11.906 11.811 11.703 11.59 11.47 11.336 11.208 11.081 10.96 10.855 10.74 10.611 10.483 10.377 10.252 10.114 10.011 9.902 9.781 9.653 9.52 9.42 9.324 9.201 9.111 8.988 8.917 8.751 8.57 8.422 8.346 8.103 8.029 7.88 7.74 7.465 7.319 7.12 6.869 6.589 6.198 5.75 4.311 -6 ,15978 ,TETRA ,17698847,Sat Dec 4 16:43:00 CET,Sat Dec 4 18:41:35 CET,0.0 0.184 0.287 0.358 0.419 0.483 0.548 0.61 0.728 0.781 0.831 0.746 0.964 1.015 1.111 1.204 1.293 1.335 1.411 1.491 1.611 1.685 1.761 1.877 1.987 2.101 2.208 2.311 2.449 2.579 2.714 2.88 3.031 3.178 3.353 3.54 3.714 3.916 4.143 4.408 4.69 4.989 5.342 5.711 6.151 6.648 7.237 7.893 8.678 9.597 10.684 11.522 11.911 12.056 12.043 12.001 11.936 11.838 11.743 11.627 11.481 11.32 11.181 11.068 10.958 10.842 10.712 10.598 10.491 10.352 10.209 10.08 9.935 9.804 9.705 9.587 9.455 9.305 9.144 9.04 8.93 8.733 8.589 8.442 8.359 8.167 7.983 7.812 7.717 7.456 7.399 7.27 7.135 6.827 6.651 6.448 6.206 5.896 5.537 5.093 3.709 -7 ,17626 ,TETRA ,17698848,Sat Dec 4 16:42:57 CET,Sat Dec 4 18:41:08 CET,0.0 0.125 0.252 0.342 0.434 0.503 0.572 0.644 0.767 0.822 0.873 0.803 1.02 1.062 1.148 1.236 1.314 1.35 1.43 1.504 1.618 1.701 1.776 1.883 1.996 2.097 2.197 2.301 2.431 2.551 2.666 2.813 2.955 3.093 3.258 3.453 3.648 3.857 4.075 4.31 4.565 4.863 5.222 5.594 6.042 6.544 7.118 7.756 8.533 9.469 10.609 11.481 11.897 12.082 12.116 12.088 12.012 11.93 11.862 11.786 11.689 11.562 11.426 11.289 11.151 11.035 10.919 10.801 10.688 10.555 10.404 10.275 10.151 10.018 9.893 9.753 9.611 9.47 9.33 9.227 9.119 8.973 8.856 8.721 8.658 8.521 8.362 8.192 8.105 7.853 7.844 7.75 7.626 7.363 7.204 7.01 6.794 6.512 6.082 5.531 4.15 -8 ,16177 ,TETRA ,17698849,Sat Dec 4 16:42:59 CET,Sat Dec 4 18:41:07 CET,0.0 0.095 0.228 0.357 0.447 0.52 0.596 0.694 0.852 0.913 0.969 0.895 1.117 1.161 1.247 1.337 1.43 1.477 1.568 1.658 1.772 1.837 1.905 2.013 2.124 2.233 2.338 2.443 2.582 2.712 2.834 2.988 3.154 3.305 3.462 3.657 3.848 4.06 4.296 4.545 4.81 5.107 5.465 5.834 6.277 6.787 7.372 8.026 8.816 9.774 10.859 11.599 11.921 12.036 12.076 12.063 11.999 11.904 11.8 11.669 11.538 11.426 11.289 11.145 11.031 10.903 10.749 10.62 10.516 10.383 10.223 10.087 9.932 9.762 9.635 9.495 9.337 9.164 8.998 8.897 8.793 8.614 8.468 8.326 8.252 8.07 7.903 7.752 7.663 7.398 7.349 7.23 7.096 6.818 6.636 6.429 6.209 5.921 5.558 5.012 2.643 -9 ,23778 ,TETRA ,17698850,Sat Dec 4 16:43:00 CET,Sat Dec 4 18:44:56 CET,0.0 0.218 0.348 0.423 0.477 0.543 0.6 0.649 0.75 0.799 0.848 0.762 0.98 1.03 1.127 1.217 1.304 1.345 1.423 1.502 1.614 1.692 1.768 1.876 1.984 2.094 2.21 2.328 2.471 2.6 2.72 2.868 3.017 3.165 3.337 3.528 3.715 3.922 4.144 4.392 4.666 4.959 5.306 5.659 6.078 6.575 7.164 7.836 8.623 9.559 10.666 11.449 11.841 12.042 12.085 12.027 11.946 11.88 11.801 11.65 11.535 11.439 11.316 11.179 11.027 10.905 10.769 10.65 10.55 10.434 10.324 10.229 10.099 9.94 9.818 9.692 9.552 9.419 9.292 9.185 9.066 8.89 8.764 8.621 8.552 8.407 8.243 8.09 8.018 7.786 7.768 7.654 7.546 7.325 7.184 6.985 6.75 6.522 6.226 5.792 4.347 -10 ,22149 ,TETRA ,17698851,Sat Dec 4 16:43:02 CET,Sat Dec 4 18:44:24 CET,0.0 0.093 0.179 0.29 0.401 0.492 0.573 0.64 0.769 0.828 0.879 0.812 1.038 1.088 1.183 1.274 1.359 1.397 1.474 1.548 1.66 1.739 1.811 1.909 2.007 2.115 2.231 2.335 2.459 2.596 2.73 2.877 3.03 3.19 3.362 3.548 3.734 3.951 4.194 4.454 4.722 5.023 5.383 5.763 6.193 6.659 7.219 7.873 8.651 9.507 10.496 11.167 11.403 11.512 11.574 11.585 11.523 11.455 11.397 11.287 11.129 10.978 10.845 10.728 10.612 10.482 10.319 10.173 10.057 9.946 9.825 9.703 9.572 9.418 9.293 9.171 9.058 8.961 8.837 8.74 8.639 8.454 8.325 8.193 8.122 7.974 7.824 7.659 7.571 7.323 7.283 7.185 7.081 6.818 6.663 6.492 6.252 5.954 5.584 5.095 3.611 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1b.txt deleted file mode 100644 index 9c475616..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_3a_1b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3795 ,TETRA ,17698852,Sat Dec 4 16:42:57 CET,Sat Dec 4 18:41:57 CET,0.0 0.27 0.433 0.554 0.659 0.76 0.846 0.929 1.082 1.155 1.222 1.185 1.42 1.479 1.587 1.67 1.749 1.79 1.865 1.931 2.032 2.104 2.173 2.265 2.361 2.445 2.511 2.584 2.682 2.769 2.848 2.943 3.032 3.115 3.213 3.322 3.413 3.503 3.606 3.719 3.822 3.913 4.004 4.072 4.136 4.186 4.198 4.127 3.94 3.601 2.888 1.859 0.857 -0.031 -0.805 -1.519 -2.12 -2.688 -3.218 -3.746 -4.159 -4.48 -4.806 -5.14 -5.431 -5.696 -5.987 -6.269 -6.516 -6.766 -7.013 -7.2 -7.406 -7.635 -7.811 -8.009 -8.227 -8.441 -8.665 -8.822 -8.975 -9.219 -9.401 -9.587 -9.68 -9.88 -10.077 -10.267 -10.377 -10.699 -10.787 -10.917 -11.062 -11.359 -11.532 -11.743 -12.0 -12.275 -12.545 -12.986 -14.239 -2 ,22153 ,TETRA ,17698853,Sat Dec 4 16:43:00 CET,Sat Dec 4 18:41:30 CET,0.0 0.235 0.394 0.531 0.63 0.706 0.788 0.873 1.033 1.089 1.14 1.082 1.309 1.36 1.464 1.56 1.629 1.663 1.735 1.804 1.914 1.989 2.059 2.152 2.239 2.326 2.399 2.458 2.534 2.619 2.706 2.8 2.883 2.969 3.08 3.19 3.278 3.373 3.476 3.577 3.681 3.777 3.869 3.98 4.072 4.137 4.189 4.193 4.099 3.785 3.094 2.16 1.264 0.378 -0.379 -1.037 -1.622 -2.154 -2.64 -3.134 -3.536 -3.901 -4.249 -4.552 -4.855 -5.133 -5.405 -5.647 -5.86 -6.106 -6.359 -6.57 -6.787 -7.016 -7.219 -7.417 -7.612 -7.815 -8.015 -8.158 -8.305 -8.519 -8.663 -8.824 -8.911 -9.084 -9.275 -9.485 -9.597 -9.891 -9.924 -10.046 -10.183 -10.473 -10.655 -10.877 -11.099 -11.325 -11.609 -11.94 -13.095 -3 ,29767 ,TETRA ,17698854,Sat Dec 4 16:43:01 CET,Sat Dec 4 18:44:56 CET,0.0 0.372 0.525 0.62 0.708 0.815 0.922 1.015 1.158 1.228 1.294 1.244 1.473 1.523 1.618 1.704 1.782 1.827 1.911 1.978 2.083 2.154 2.222 2.315 2.403 2.48 2.554 2.633 2.729 2.831 2.928 3.042 3.145 3.238 3.349 3.473 3.577 3.677 3.783 3.892 3.984 4.077 4.198 4.305 4.392 4.457 4.502 4.48 4.366 3.986 3.124 2.026 1.011 0.077 -0.733 -1.43 -2.036 -2.598 -3.091 -3.573 -4.002 -4.4 -4.753 -5.068 -5.37 -5.662 -5.968 -6.225 -6.447 -6.689 -6.948 -7.163 -7.39 -7.623 -7.803 -7.987 -8.173 -8.376 -8.575 -8.702 -8.845 -9.066 -9.2 -9.337 -9.426 -9.633 -9.837 -10.035 -10.143 -10.443 -10.504 -10.641 -10.788 -11.1 -11.279 -11.489 -11.702 -11.925 -12.175 -12.557 -14.142 -4 ,28713 ,TETRA ,17698855,Sat Dec 4 16:43:04 CET,Sat Dec 4 18:44:39 CET,0.0 0.197 0.331 0.447 0.552 0.641 0.716 0.788 0.922 0.994 1.069 1.009 1.224 1.267 1.352 1.439 1.53 1.568 1.637 1.702 1.8 1.868 1.928 2.009 2.09 2.181 2.265 2.33 2.417 2.501 2.576 2.665 2.752 2.827 2.911 3.003 3.091 3.193 3.299 3.398 3.501 3.602 3.687 3.772 3.856 3.915 3.939 3.917 3.789 3.416 2.574 1.432 0.445 -0.451 -1.19 -1.843 -2.482 -3.045 -3.511 -3.976 -4.375 -4.733 -5.071 -5.397 -5.705 -5.979 -6.263 -6.532 -6.767 -6.998 -7.245 -7.455 -7.658 -7.849 -7.996 -8.166 -8.353 -8.529 -8.705 -8.837 -8.965 -9.19 -9.345 -9.491 -9.561 -9.717 -9.904 -10.08 -10.171 -10.461 -10.497 -10.607 -10.722 -10.988 -11.142 -11.306 -11.505 -11.738 -12.01 -12.366 -13.258 -5 ,27572 ,TETRA ,17698856,Sat Dec 4 16:42:58 CET,Sat Dec 4 18:42:30 CET,0.0 0.249 0.391 0.493 0.579 0.671 0.746 0.803 0.922 0.986 1.049 0.992 1.218 1.27 1.36 1.447 1.524 1.559 1.632 1.711 1.83 1.899 1.965 2.064 2.159 2.238 2.308 2.378 2.466 2.546 2.626 2.717 2.803 2.88 2.961 3.054 3.144 3.24 3.345 3.453 3.553 3.648 3.77 3.883 3.97 4.035 4.04 3.948 3.78 3.411 2.571 1.449 0.452 -0.454 -1.223 -1.864 -2.398 -2.893 -3.318 -3.757 -4.142 -4.49 -4.825 -5.119 -5.387 -5.647 -5.938 -6.198 -6.436 -6.684 -6.948 -7.187 -7.434 -7.676 -7.855 -8.05 -8.247 -8.443 -8.633 -8.763 -8.919 -9.177 -9.353 -9.543 -9.638 -9.818 -10.0 -10.191 -10.292 -10.592 -10.685 -10.83 -10.986 -11.332 -11.499 -11.663 -11.835 -12.063 -12.379 -12.72 -13.744 -6 ,345 ,TETRA ,17698857,Sat Dec 4 16:43:01 CET,Sat Dec 4 18:42:36 CET,0.0 0.216 0.382 0.562 0.715 0.813 0.909 0.998 1.118 1.179 1.243 1.179 1.399 1.444 1.536 1.624 1.694 1.723 1.786 1.857 1.966 2.029 2.088 2.177 2.263 2.353 2.443 2.523 2.617 2.708 2.786 2.868 2.944 3.025 3.127 3.233 3.324 3.42 3.512 3.594 3.685 3.794 3.901 3.985 4.056 4.076 4.048 3.962 3.783 3.431 2.682 1.619 0.685 -0.103 -0.826 -1.516 -2.09 -2.6 -3.073 -3.543 -3.979 -4.362 -4.698 -5.005 -5.283 -5.546 -5.824 -6.091 -6.317 -6.523 -6.734 -6.927 -7.135 -7.357 -7.529 -7.698 -7.881 -8.076 -8.294 -8.432 -8.554 -8.766 -8.914 -9.059 -9.148 -9.34 -9.512 -9.68 -9.781 -10.079 -10.112 -10.231 -10.383 -10.715 -10.901 -11.098 -11.304 -11.584 -11.906 -12.257 -13.449 -7 ,5407 ,TETRA ,17698858,Sat Dec 4 16:43:00 CET,Sat Dec 4 18:42:01 CET,0.0 0.473 0.622 0.726 0.821 0.914 0.995 1.066 1.207 1.277 1.338 1.261 1.472 1.512 1.591 1.66 1.734 1.768 1.838 1.904 1.999 2.072 2.135 2.222 2.301 2.375 2.45 2.522 2.615 2.7 2.779 2.868 2.954 3.037 3.118 3.212 3.309 3.408 3.512 3.622 3.725 3.81 3.937 4.056 4.132 4.202 4.245 4.225 4.09 3.741 2.954 1.921 0.999 0.162 -0.547 -1.205 -1.831 -2.412 -2.853 -3.289 -3.699 -4.046 -4.383 -4.712 -5.018 -5.298 -5.576 -5.811 -6.01 -6.217 -6.432 -6.614 -6.798 -6.986 -7.13 -7.305 -7.501 -7.689 -7.87 -7.987 -8.13 -8.37 -8.521 -8.672 -8.755 -8.942 -9.129 -9.303 -9.397 -9.689 -9.743 -9.86 -9.994 -10.284 -10.429 -10.569 -10.722 -10.892 -11.079 -11.345 -12.306 -8 ,15783 ,TETRA ,17698859,Sat Dec 4 16:42:59 CET,Sat Dec 4 18:42:08 CET,0.0 0.446 0.661 0.806 0.903 1.01 1.107 1.192 1.345 1.408 1.463 1.391 1.616 1.666 1.77 1.87 1.948 1.989 2.07 2.148 2.255 2.316 2.383 2.491 2.594 2.687 2.77 2.841 2.926 3.0 3.065 3.15 3.231 3.307 3.39 3.487 3.583 3.671 3.749 3.826 3.9 3.978 4.051 4.123 4.192 4.221 4.209 4.131 3.96 3.581 2.764 1.688 0.68 -0.216 -0.978 -1.68 -2.282 -2.799 -3.231 -3.69 -4.116 -4.513 -4.885 -5.248 -5.615 -5.913 -6.198 -6.461 -6.681 -6.903 -7.132 -7.316 -7.513 -7.741 -7.922 -8.098 -8.275 -8.457 -8.652 -8.791 -8.933 -9.161 -9.323 -9.487 -9.573 -9.749 -9.932 -10.131 -10.232 -10.522 -10.614 -10.748 -10.855 -11.116 -11.269 -11.429 -11.625 -11.844 -12.095 -12.396 -13.442 -9 ,2380 ,TETRA ,17698860,Sat Dec 4 16:43:41 CET,Sat Dec 4 18:42:49 CET,0.0 0.492 0.695 0.811 0.91 1.008 1.115 1.216 1.393 1.459 1.514 1.444 1.66 1.705 1.787 1.866 1.956 2.003 2.084 2.157 2.253 2.311 2.367 2.458 2.545 2.612 2.678 2.742 2.824 2.912 2.993 3.084 3.165 3.251 3.358 3.479 3.585 3.674 3.764 3.869 3.965 4.058 4.161 4.26 4.351 4.42 4.456 4.419 4.291 3.94 3.14 2.038 1.045 0.142 -0.614 -1.275 -1.862 -2.401 -2.894 -3.377 -3.804 -4.187 -4.527 -4.851 -5.14 -5.407 -5.713 -6.013 -6.272 -6.538 -6.81 -7.021 -7.236 -7.462 -7.639 -7.813 -8.003 -8.187 -8.375 -8.515 -8.663 -8.899 -9.054 -9.212 -9.301 -9.492 -9.692 -9.91 -10.022 -10.323 -10.369 -10.497 -10.636 -10.91 -11.081 -11.291 -11.511 -11.754 -12.018 -12.377 -13.801 -10 ,2816 ,TETRA ,17698861,Sat Dec 4 16:43:44 CET,Sat Dec 4 18:42:28 CET,0.0 0.209 0.333 0.456 0.599 0.732 0.826 0.897 1.039 1.1 1.151 1.076 1.301 1.353 1.464 1.563 1.643 1.678 1.752 1.833 1.94 2.003 2.065 2.155 2.237 2.325 2.412 2.482 2.575 2.672 2.765 2.862 2.943 3.021 3.114 3.21 3.299 3.393 3.477 3.55 3.631 3.743 3.844 3.919 3.984 4.025 4.059 4.026 3.874 3.517 2.762 1.682 0.699 -0.169 -0.939 -1.693 -2.331 -2.865 -3.37 -3.88 -4.304 -4.69 -5.063 -5.414 -5.718 -5.993 -6.296 -6.586 -6.852 -7.145 -7.446 -7.683 -7.924 -8.192 -8.415 -8.634 -8.845 -9.071 -9.305 -9.457 -9.617 -9.872 -10.048 -10.207 -10.279 -10.438 -10.623 -10.826 -10.915 -11.186 -11.227 -11.357 -11.497 -11.794 -11.958 -12.139 -12.333 -12.587 -12.908 -13.333 -14.417 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt deleted file mode 100644 index 317eea07..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8104 ,KEBNE ,17026473,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:16:12 CET,0.0 0.269 0.392 0.501 0.591 0.669 0.763 0.859 1.002 1.061 1.124 1.075 1.297 1.348 1.475 1.591 1.682 1.722 1.805 1.887 2.011 2.099 2.187 2.305 2.412 2.512 2.602 2.693 2.814 2.928 3.034 3.171 3.316 3.447 3.59 3.755 3.917 4.097 4.288 4.493 4.703 4.924 5.162 5.4 5.658 5.899 6.177 6.483 6.773 7.019 7.078 6.825 6.443 6.007 5.593 5.169 4.785 4.438 4.155 3.881 3.618 3.38 3.155 2.938 2.73 2.543 2.343 2.164 2.013 1.859 1.709 1.577 1.428 1.278 1.152 1.026 0.919 0.807 0.679 0.586 0.494 0.351 0.251 0.147 0.094 -0.025 -0.154 -0.286 -0.353 -0.584 -0.537 -0.613 -0.693 -0.852 -0.944 -1.045 -1.151 -1.265 -1.382 -1.521 -1.892 -2 ,1552 ,KEBNE ,17026474,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:17:06 CET,0.0 0.267 0.444 0.566 0.657 0.745 0.842 0.935 1.114 1.195 1.269 1.232 1.464 1.529 1.655 1.76 1.865 1.922 2.022 2.112 2.255 2.34 2.421 2.543 2.664 2.775 2.881 2.992 3.135 3.262 3.38 3.528 3.662 3.79 3.935 4.094 4.249 4.401 4.561 4.718 4.897 5.115 5.339 5.555 5.819 6.104 6.39 6.677 7.011 7.297 7.395 7.187 6.843 6.468 6.083 5.715 5.392 5.09 4.803 4.502 4.235 3.996 3.767 3.544 3.328 3.12 2.899 2.695 2.525 2.346 2.168 2.042 1.914 1.773 1.662 1.552 1.441 1.324 1.194 1.1 1.008 0.878 0.78 0.676 0.625 0.524 0.409 0.288 0.227 -0.02 -0.008 -0.094 -0.179 -0.359 -0.465 -0.594 -0.732 -0.872 -1.027 -1.165 -1.33 -3 ,24551 ,KEBNE ,17026475,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:16:04 CET,0.0 0.317 0.449 0.576 0.686 0.778 0.87 0.963 1.119 1.179 1.23 1.17 1.392 1.442 1.537 1.64 1.754 1.807 1.901 1.986 2.106 2.181 2.253 2.356 2.454 2.554 2.652 2.742 2.867 2.994 3.106 3.236 3.374 3.509 3.653 3.811 3.964 4.126 4.31 4.508 4.7 4.912 5.147 5.367 5.619 5.898 6.176 6.425 6.669 6.834 6.722 6.305 5.817 5.328 4.891 4.504 4.141 3.778 3.463 3.172 2.92 2.695 2.483 2.257 2.034 1.842 1.636 1.453 1.301 1.141 0.968 0.822 0.668 0.508 0.388 0.263 0.138 0.01 -0.117 -0.211 -0.308 -0.448 -0.553 -0.669 -0.733 -0.866 -0.99 -1.135 -1.218 -1.466 -1.451 -1.533 -1.618 -1.803 -1.919 -2.033 -2.127 -2.228 -2.374 -2.559 -2.871 -4 ,32165 ,KEBNE ,17026476,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:16:33 CET,0.0 0.265 0.418 0.564 0.703 0.819 0.911 0.995 1.157 1.248 1.335 1.297 1.521 1.57 1.669 1.772 1.881 1.935 2.04 2.134 2.265 2.347 2.432 2.561 2.681 2.795 2.896 2.997 3.129 3.244 3.366 3.529 3.675 3.819 3.969 4.114 4.257 4.434 4.617 4.8 5.011 5.224 5.439 5.668 5.933 6.198 6.475 6.753 7.059 7.292 7.314 7.026 6.591 6.157 5.711 5.266 4.864 4.491 4.164 3.83 3.532 3.27 3.024 2.795 2.592 2.394 2.191 2.017 1.86 1.7 1.539 1.406 1.27 1.119 0.991 0.861 0.734 0.599 0.449 0.35 0.254 0.097 -0.016 -0.128 -0.188 -0.314 -0.438 -0.559 -0.625 -0.869 -0.855 -0.941 -1.032 -1.216 -1.314 -1.433 -1.593 -1.767 -1.927 -2.11 -2.583 -5 ,9066 ,KEBNE ,17026477,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:17:29 CET,0.0 0.442 0.633 0.747 0.845 0.932 1.02 1.1 1.222 1.287 1.353 1.308 1.542 1.605 1.729 1.841 1.951 2.001 2.102 2.197 2.337 2.433 2.517 2.635 2.76 2.877 2.986 3.089 3.22 3.345 3.462 3.593 3.72 3.849 3.996 4.174 4.332 4.492 4.675 4.857 5.029 5.23 5.473 5.724 6.023 6.303 6.583 6.911 7.24 7.523 7.655 7.37 6.946 6.477 6.026 5.66 5.316 4.981 4.671 4.347 4.06 3.816 3.591 3.379 3.184 3.002 2.823 2.648 2.494 2.334 2.163 2.023 1.874 1.731 1.623 1.514 1.399 1.271 1.143 1.057 0.959 0.8 0.688 0.574 0.518 0.401 0.287 0.164 0.099 -0.131 -0.073 -0.148 -0.233 -0.403 -0.505 -0.62 -0.758 -0.9 -1.047 -1.206 -1.717 -6 ,29329 ,KEBNE ,17026478,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:16:56 CET,0.0 0.391 0.532 0.641 0.746 0.837 0.924 1.012 1.167 1.232 1.306 1.277 1.502 1.562 1.677 1.793 1.899 1.942 2.031 2.119 2.243 2.32 2.405 2.53 2.63 2.727 2.823 2.918 3.046 3.171 3.291 3.435 3.571 3.701 3.864 4.045 4.201 4.367 4.557 4.757 4.949 5.158 5.405 5.656 5.937 6.244 6.58 6.915 7.239 7.548 7.723 7.555 7.26 6.916 6.544 6.157 5.824 5.515 5.216 4.931 4.672 4.421 4.191 3.985 3.795 3.606 3.394 3.221 3.076 2.906 2.735 2.584 2.432 2.282 2.161 2.042 1.908 1.769 1.629 1.532 1.433 1.274 1.163 1.046 0.985 0.86 0.725 0.576 0.499 0.255 0.284 0.211 0.126 -0.072 -0.185 -0.292 -0.386 -0.486 -0.62 -0.792 -1.259 -7 ,22335 ,KEBNE ,17026479,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:16:16 CET,0.0 0.217 0.346 0.461 0.591 0.716 0.825 0.912 1.046 1.121 1.204 1.169 1.401 1.459 1.567 1.67 1.773 1.824 1.919 2.01 2.133 2.214 2.291 2.401 2.513 2.634 2.75 2.851 2.976 3.099 3.22 3.364 3.508 3.644 3.805 3.992 4.145 4.311 4.501 4.709 4.92 5.136 5.389 5.65 5.959 6.265 6.568 6.863 7.141 7.325 7.293 7.007 6.627 6.221 5.882 5.55 5.201 4.892 4.628 4.359 4.125 3.91 3.693 3.463 3.255 3.074 2.86 2.67 2.513 2.343 2.157 1.997 1.842 1.69 1.572 1.444 1.31 1.168 1.018 0.916 0.821 0.669 0.547 0.427 0.369 0.247 0.127 0.006 -0.06 -0.299 -0.266 -0.339 -0.414 -0.57 -0.655 -0.741 -0.844 -0.97 -1.124 -1.299 -1.804 -8 ,10139 ,KEBNE ,17026480,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:16:47 CET,0.0 0.344 0.488 0.638 0.763 0.847 0.926 0.999 1.127 1.187 1.251 1.214 1.445 1.51 1.63 1.732 1.828 1.874 1.971 2.064 2.19 2.265 2.343 2.47 2.588 2.695 2.799 2.899 3.028 3.149 3.268 3.423 3.568 3.687 3.818 3.991 4.168 4.339 4.504 4.696 4.902 5.106 5.345 5.591 5.851 6.122 6.412 6.674 6.902 7.133 7.209 6.883 6.408 5.928 5.497 5.062 4.654 4.27 3.938 3.609 3.322 3.061 2.819 2.616 2.436 2.255 2.052 1.871 1.709 1.543 1.38 1.247 1.112 0.967 0.846 0.728 0.608 0.474 0.342 0.248 0.145 -0.005 -0.097 -0.189 -0.241 -0.361 -0.48 -0.596 -0.669 -0.921 -0.9 -0.971 -1.051 -1.247 -1.38 -1.519 -1.643 -1.764 -1.894 -2.065 -2.72 -9 ,18899 ,KEBNE ,17026481,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:16:54 CET,0.0 0.267 0.443 0.579 0.704 0.798 0.872 0.95 1.083 1.149 1.213 1.18 1.418 1.467 1.561 1.665 1.773 1.819 1.906 1.998 2.128 2.22 2.31 2.434 2.546 2.653 2.748 2.838 2.962 3.084 3.208 3.352 3.477 3.605 3.765 3.946 4.114 4.279 4.469 4.675 4.882 5.107 5.367 5.619 5.876 6.151 6.469 6.822 7.163 7.388 7.419 7.122 6.708 6.239 5.77 5.384 5.046 4.702 4.424 4.131 3.855 3.634 3.42 3.201 2.997 2.813 2.621 2.453 2.308 2.153 1.995 1.868 1.728 1.57 1.453 1.344 1.229 1.106 0.979 0.883 0.784 0.634 0.525 0.406 0.347 0.223 0.079 -0.06 -0.125 -0.366 -0.357 -0.446 -0.539 -0.742 -0.845 -0.948 -1.064 -1.192 -1.318 -1.488 -1.717 -10 ,13936 ,KEBNE ,17026482,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:16:53 CET,0.0 0.318 0.51 0.656 0.788 0.88 0.955 1.041 1.21 1.282 1.359 1.328 1.566 1.636 1.756 1.873 1.987 2.038 2.134 2.226 2.367 2.47 2.57 2.693 2.806 2.922 3.039 3.147 3.283 3.413 3.532 3.685 3.825 3.946 4.086 4.248 4.405 4.571 4.754 4.953 5.189 5.452 5.713 5.965 6.257 6.589 6.917 7.17 7.454 7.785 7.924 7.665 7.302 6.894 6.481 6.102 5.748 5.394 5.093 4.79 4.534 4.333 4.138 3.939 3.744 3.564 3.373 3.202 3.044 2.863 2.681 2.541 2.395 2.241 2.118 1.973 1.829 1.69 1.535 1.43 1.326 1.166 1.058 0.946 0.89 0.775 0.643 0.516 0.449 0.202 0.193 0.1 0.008 -0.169 -0.258 -0.363 -0.477 -0.589 -0.719 -0.89 -1.239 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_7.txt deleted file mode 100644 index c8339a27..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_3b_7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8573 ,TETRA ,17698862,Sat Dec 4 16:43:46 CET,Sat Dec 4 18:46:11 CET,0.0 0.165 0.269 0.354 0.438 0.517 0.599 0.673 0.804 0.877 0.954 0.914 1.144 1.201 1.319 1.446 1.564 1.619 1.717 1.811 1.954 2.044 2.123 2.239 2.37 2.515 2.655 2.78 2.946 3.112 3.273 3.469 3.662 3.845 4.059 4.31 4.574 4.874 5.177 5.497 5.828 6.207 6.669 7.148 7.717 8.344 9.078 9.904 10.843 11.964 13.177 14.017 14.39 14.503 14.538 14.539 14.548 14.465 14.299 14.157 14.028 13.877 13.703 13.506 13.297 13.093 12.9 12.732 12.576 12.422 12.263 12.114 11.959 11.81 11.685 11.544 11.388 11.221 11.06 10.966 10.86 10.67 10.544 10.401 10.321 10.171 10.034 9.871 9.777 9.519 9.484 9.385 9.295 9.102 8.997 8.883 8.747 8.581 8.378 8.115 7.699 -2 ,32620 ,TETRA ,17698863,Sat Dec 4 16:43:43 CET,Sat Dec 4 18:45:42 CET,0.0 0.143 0.238 0.32 0.404 0.498 0.601 0.694 0.84 0.911 0.981 0.946 1.178 1.232 1.348 1.454 1.547 1.595 1.692 1.785 1.934 2.035 2.125 2.259 2.389 2.505 2.631 2.771 2.948 3.109 3.279 3.487 3.672 3.853 4.075 4.342 4.603 4.886 5.193 5.511 5.847 6.251 6.709 7.154 7.69 8.283 8.935 9.717 10.626 11.649 12.878 13.638 13.889 13.958 13.888 13.771 13.64 13.464 13.306 13.141 12.945 12.752 12.566 12.373 12.187 12.002 11.795 11.618 11.478 11.333 11.165 11.019 10.876 10.716 10.583 10.44 10.297 10.16 10.01 9.901 9.789 9.599 9.469 9.338 9.269 9.133 8.987 8.825 8.743 8.495 8.464 8.347 8.23 7.963 7.821 7.685 7.53 7.362 7.179 6.976 6.543 -3 ,20223 ,TETRA ,17698864,Sat Dec 4 16:43:43 CET,Sat Dec 4 18:42:30 CET,0.0 0.113 0.231 0.321 0.395 0.477 0.552 0.622 0.772 0.844 0.914 0.876 1.107 1.164 1.288 1.412 1.522 1.575 1.684 1.789 1.936 2.038 2.143 2.288 2.427 2.559 2.689 2.827 3.007 3.17 3.325 3.523 3.721 3.904 4.121 4.379 4.615 4.875 5.158 5.446 5.753 6.129 6.573 7.021 7.553 8.139 8.801 9.52 10.386 11.507 12.954 13.941 14.347 14.571 14.636 14.594 14.511 14.397 14.269 14.119 13.982 13.837 13.695 13.572 13.442 13.287 13.095 12.892 12.718 12.554 12.391 12.276 12.148 11.984 11.862 11.734 11.59 11.447 11.307 11.208 11.092 10.911 10.787 10.648 10.576 10.428 10.273 10.106 10.018 9.763 9.744 9.645 9.535 9.304 9.171 9.024 8.865 8.694 8.499 8.191 7.628 -4 ,8962 ,TETRA ,17698865,Sat Dec 4 16:43:42 CET,Sat Dec 4 18:43:37 CET,0.0 0.21 0.366 0.471 0.574 0.66 0.741 0.822 0.992 1.071 1.145 1.115 1.348 1.409 1.522 1.63 1.736 1.789 1.893 1.998 2.163 2.264 2.36 2.508 2.65 2.785 2.921 3.044 3.193 3.344 3.494 3.687 3.879 4.062 4.269 4.518 4.761 5.024 5.318 5.61 5.898 6.242 6.669 7.103 7.621 8.236 8.997 9.886 10.92 12.093 13.425 14.489 15.04 15.317 15.438 15.324 15.12 14.959 14.799 14.607 14.422 14.239 14.063 13.87 13.658 13.477 13.306 13.157 13.022 12.869 12.719 12.576 12.408 12.255 12.126 11.985 11.848 11.7 11.533 11.419 11.311 11.14 11.012 10.872 10.804 10.664 10.512 10.351 10.267 10.028 10.049 9.972 9.904 9.737 9.627 9.501 9.377 9.232 9.067 8.86 8.346 -5 ,23022 ,TETRA ,17698866,Sat Dec 4 16:43:44 CET,Sat Dec 4 18:43:19 CET,0.0 0.188 0.294 0.381 0.474 0.568 0.659 0.73 0.856 0.925 0.997 0.961 1.196 1.263 1.385 1.496 1.613 1.668 1.779 1.884 2.023 2.116 2.208 2.334 2.46 2.589 2.716 2.845 3.009 3.17 3.332 3.532 3.727 3.912 4.143 4.417 4.668 4.938 5.232 5.526 5.827 6.196 6.654 7.14 7.705 8.294 8.977 9.774 10.725 11.809 12.984 13.845 14.246 14.319 14.276 14.208 14.091 13.968 13.841 13.666 13.485 13.28 13.082 12.918 12.744 12.573 12.4 12.235 12.067 11.881 11.701 11.558 11.401 11.233 11.107 10.973 10.827 10.678 10.517 10.396 10.276 10.11 9.994 9.865 9.79 9.63 9.499 9.373 9.292 9.034 9.018 8.924 8.823 8.619 8.495 8.335 8.179 8.01 7.824 7.601 7.054 -6 ,30169 ,TETRA ,17698867,Sat Dec 4 16:43:46 CET,Sat Dec 4 18:44:37 CET,0.0 0.292 0.416 0.505 0.602 0.7 0.787 0.866 1.011 1.083 1.152 1.112 1.347 1.409 1.53 1.655 1.778 1.834 1.95 2.07 2.239 2.347 2.449 2.596 2.733 2.872 3.015 3.144 3.301 3.452 3.605 3.798 3.986 4.168 4.383 4.641 4.883 5.145 5.445 5.774 6.129 6.528 6.985 7.433 7.946 8.532 9.246 10.053 10.954 11.991 13.195 14.022 14.381 14.528 14.515 14.421 14.248 14.011 13.806 13.61 13.408 13.178 12.932 12.711 12.525 12.33 12.103 11.908 11.741 11.581 11.42 11.3 11.176 11.026 10.908 10.789 10.661 10.516 10.363 10.253 10.132 9.942 9.814 9.668 9.595 9.459 9.3 9.14 9.068 8.813 8.767 8.666 8.556 8.273 8.125 7.991 7.871 7.718 7.52 7.333 7.047 -7 ,8247 ,TETRA ,17698868,Sat Dec 4 16:43:47 CET,Sat Dec 4 18:44:15 CET,0.0 0.171 0.274 0.395 0.513 0.613 0.703 0.791 0.963 1.043 1.107 1.072 1.304 1.361 1.479 1.586 1.691 1.744 1.852 1.96 2.116 2.212 2.303 2.436 2.566 2.696 2.821 2.945 3.117 3.294 3.467 3.676 3.873 4.056 4.267 4.52 4.785 5.078 5.385 5.715 6.058 6.443 6.913 7.398 7.964 8.577 9.268 10.09 11.052 12.104 13.277 14.149 14.532 14.606 14.479 14.339 14.216 14.042 13.855 13.614 13.399 13.185 12.961 12.758 12.57 12.402 12.202 12.021 11.902 11.791 11.682 11.593 11.482 11.361 11.268 11.149 11.012 10.868 10.723 10.628 10.53 10.375 10.259 10.14 10.081 9.951 9.812 9.656 9.573 9.323 9.318 9.232 9.134 8.916 8.791 8.661 8.529 8.398 8.236 7.999 7.636 -8 ,18421 ,TETRA ,17698869,Sat Dec 4 16:43:43 CET,Sat Dec 4 18:46:16 CET,0.0 0.478 0.62 0.723 0.816 0.913 1.017 1.107 1.26 1.329 1.395 1.342 1.57 1.629 1.734 1.835 1.94 1.991 2.092 2.188 2.321 2.41 2.503 2.643 2.781 2.905 3.025 3.145 3.3 3.456 3.607 3.79 3.969 4.141 4.346 4.59 4.834 5.102 5.381 5.673 5.988 6.333 6.751 7.194 7.735 8.337 8.972 9.683 10.548 11.553 12.592 13.419 13.823 13.961 13.987 13.859 13.687 13.555 13.398 13.191 13.001 12.818 12.612 12.424 12.241 12.045 11.849 11.658 11.494 11.332 11.146 10.991 10.839 10.685 10.553 10.413 10.273 10.127 9.983 9.886 9.777 9.591 9.461 9.328 9.262 9.119 8.953 8.783 8.697 8.449 8.429 8.33 8.236 8.043 7.941 7.808 7.656 7.509 7.344 7.15 6.637 -9 ,22514 ,TETRA ,17698870,Sat Dec 4 16:43:44 CET,Sat Dec 4 18:46:06 CET,0.0 0.11 0.218 0.314 0.395 0.478 0.573 0.671 0.836 0.905 0.966 0.92 1.152 1.215 1.336 1.454 1.57 1.624 1.732 1.842 2.005 2.101 2.196 2.353 2.49 2.612 2.728 2.845 2.995 3.133 3.275 3.448 3.618 3.789 4.004 4.253 4.488 4.755 5.04 5.355 5.7 6.09 6.546 7.029 7.614 8.242 8.957 9.772 10.713 11.783 13.061 14.058 14.49 14.577 14.544 14.459 14.324 14.172 14.036 13.892 13.748 13.598 13.439 13.282 13.101 12.913 12.719 12.547 12.393 12.216 12.044 11.91 11.756 11.571 11.422 11.268 11.102 10.931 10.762 10.662 10.555 10.384 10.266 10.14 10.078 9.949 9.793 9.621 9.536 9.269 9.229 9.134 9.019 8.762 8.631 8.486 8.329 8.137 7.925 7.581 6.942 -10 ,28327 ,TETRA ,17698871,Sat Dec 4 16:43:46 CET,Sat Dec 4 18:43:45 CET,0.0 0.17 0.295 0.401 0.496 0.571 0.642 0.714 0.845 0.913 0.996 0.981 1.209 1.27 1.401 1.518 1.624 1.673 1.767 1.856 1.994 2.087 2.178 2.304 2.438 2.585 2.722 2.852 3.015 3.161 3.309 3.502 3.698 3.889 4.106 4.357 4.598 4.856 5.149 5.466 5.799 6.197 6.671 7.12 7.638 8.213 8.882 9.682 10.656 11.791 13.108 14.089 14.509 14.698 14.789 14.783 14.72 14.659 14.572 14.443 14.315 14.141 13.943 13.774 13.621 13.473 13.317 13.181 13.045 12.891 12.736 12.604 12.456 12.295 12.173 12.045 11.903 11.734 11.558 11.433 11.302 11.121 10.987 10.847 10.774 10.633 10.492 10.329 10.237 9.978 9.967 9.875 9.785 9.593 9.488 9.359 9.204 9.037 8.832 8.57 7.907 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_3a.txt deleted file mode 100644 index 97981234..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1482 ,TETRA ,17698872,Sat Dec 4 16:43:47 CET,Sat Dec 4 18:44:09 CET,0.0 0.702 0.923 1.136 1.326 1.485 1.629 1.768 2.037 2.157 2.26 2.253 2.544 2.648 2.849 3.041 3.234 3.324 3.502 3.678 3.907 4.052 4.209 4.443 4.662 4.868 5.067 5.263 5.511 5.763 6.014 6.305 6.593 6.893 7.245 7.626 7.995 8.402 8.838 9.311 9.783 10.308 10.955 11.633 12.414 13.233 14.155 15.201 16.414 17.887 19.726 21.227 22.083 22.659 23.062 23.292 23.41 23.477 23.49 23.482 23.475 23.463 23.433 23.4 23.367 23.331 23.294 23.265 23.234 23.189 23.134 23.077 23.02 22.965 22.919 22.876 22.837 22.784 22.718 22.677 22.636 22.565 22.506 22.443 22.415 22.353 22.274 22.185 22.143 21.935 22.0 21.935 21.881 21.78 21.716 21.633 21.548 21.459 21.371 21.264 21.008 -2 ,8062 ,TETRA ,17698873,Sat Dec 4 16:43:43 CET,Sat Dec 4 18:43:53 CET,0.0 0.526 0.761 0.996 1.182 1.338 1.5 1.65 1.898 2.018 2.147 2.179 2.472 2.571 2.76 2.935 3.104 3.188 3.36 3.519 3.755 3.919 4.072 4.307 4.534 4.729 4.925 5.127 5.38 5.628 5.868 6.18 6.487 6.768 7.094 7.472 7.834 8.224 8.657 9.119 9.576 10.079 10.663 11.28 12.088 13.016 14.035 15.076 16.322 17.998 19.923 21.441 22.341 22.85 23.172 23.383 23.518 23.612 23.677 23.715 23.705 23.69 23.688 23.668 23.63 23.599 23.566 23.52 23.468 23.398 23.323 23.274 23.238 23.199 23.154 23.113 23.068 23.016 22.955 22.903 22.85 22.77 22.714 22.665 22.642 22.58 22.507 22.427 22.385 22.175 22.26 22.21 22.161 22.073 22.012 21.944 21.868 21.771 21.674 21.563 21.167 -3 ,2682 ,TETRA ,17698874,Sat Dec 4 16:43:47 CET,Sat Dec 4 18:44:05 CET,0.0 0.547 0.763 0.957 1.138 1.305 1.453 1.579 1.813 1.946 2.075 2.104 2.409 2.516 2.718 2.925 3.121 3.215 3.386 3.557 3.823 3.983 4.135 4.371 4.617 4.849 5.059 5.255 5.517 5.772 6.025 6.346 6.65 6.937 7.262 7.623 7.988 8.402 8.848 9.286 9.712 10.196 10.786 11.397 12.082 12.866 13.815 14.856 16.13 17.634 19.322 20.633 21.369 21.865 22.179 22.359 22.488 22.579 22.624 22.65 22.642 22.617 22.599 22.583 22.546 22.506 22.477 22.439 22.396 22.348 22.293 22.251 22.208 22.164 22.125 22.077 22.023 21.97 21.925 21.886 21.838 21.77 21.717 21.665 21.638 21.57 21.493 21.411 21.375 21.176 21.284 21.239 21.194 21.106 21.046 20.966 20.884 20.807 20.74 20.677 20.524 -4 ,4218 ,TETRA ,17698875,Sat Dec 4 16:43:43 CET,Sat Dec 4 18:45:32 CET,0.0 0.577 0.787 1.004 1.219 1.399 1.549 1.68 1.93 2.047 2.156 2.16 2.456 2.552 2.741 2.929 3.104 3.189 3.364 3.555 3.811 3.969 4.138 4.392 4.627 4.847 5.061 5.261 5.512 5.758 6.004 6.316 6.607 6.892 7.231 7.586 7.936 8.346 8.782 9.229 9.72 10.29 10.919 11.55 12.306 13.134 14.125 15.271 16.63 18.298 20.399 21.975 22.789 23.316 23.63 23.803 23.939 24.024 24.077 24.114 24.145 24.156 24.139 24.123 24.088 24.035 23.972 23.92 23.877 23.833 23.79 23.748 23.708 23.672 23.635 23.583 23.523 23.473 23.421 23.377 23.33 23.26 23.228 23.192 23.17 23.121 23.057 22.996 22.958 22.74 22.821 22.77 22.721 22.633 22.579 22.505 22.434 22.353 22.228 22.088 21.807 -5 ,20274 ,TETRA ,17698876,Sat Dec 4 16:43:46 CET,Sat Dec 4 18:45:13 CET,0.0 0.464 0.724 0.955 1.118 1.255 1.396 1.525 1.749 1.849 1.948 1.952 2.242 2.337 2.532 2.714 2.887 2.972 3.141 3.306 3.544 3.706 3.86 4.087 4.307 4.52 4.728 4.941 5.201 5.433 5.67 5.942 6.202 6.466 6.774 7.129 7.485 7.882 8.301 8.759 9.233 9.755 10.404 11.044 11.76 12.603 13.533 14.525 15.774 17.311 19.142 20.585 21.363 21.875 22.223 22.453 22.584 22.66 22.715 22.779 22.816 22.818 22.801 22.752 22.701 22.664 22.622 22.585 22.549 22.5 22.444 22.397 22.346 22.304 22.274 22.227 22.18 22.129 22.067 22.029 21.994 21.926 21.873 21.816 21.785 21.717 21.649 21.583 21.549 21.343 21.427 21.379 21.316 21.194 21.132 21.064 20.986 20.898 20.815 20.704 20.487 -6 ,26144 ,TETRA ,17698877,Sat Dec 4 16:43:44 CET,Sat Dec 4 18:44:24 CET,0.0 0.584 0.821 1.003 1.175 1.341 1.504 1.648 1.897 2.014 2.13 2.162 2.469 2.578 2.772 2.955 3.156 3.252 3.432 3.601 3.832 3.969 4.112 4.346 4.582 4.793 4.976 5.157 5.429 5.709 5.964 6.258 6.557 6.854 7.183 7.558 7.917 8.293 8.704 9.145 9.631 10.203 10.88 11.527 12.288 13.14 14.064 15.152 16.461 17.915 19.631 21.155 22.107 22.684 23.004 23.195 23.323 23.422 23.486 23.508 23.483 23.443 23.403 23.361 23.32 23.289 23.245 23.198 23.158 23.101 23.035 22.987 22.945 22.897 22.86 22.824 22.772 22.705 22.642 22.596 22.547 22.479 22.431 22.373 22.343 22.288 22.227 22.153 22.105 21.88 21.946 21.893 21.839 21.716 21.645 21.575 21.504 21.419 21.307 21.163 20.947 -7 ,26717 ,TETRA ,17698878,Sat Dec 4 16:43:46 CET,Sat Dec 4 18:44:32 CET,0.0 0.536 0.733 0.904 1.094 1.251 1.384 1.512 1.767 1.883 1.996 2.002 2.292 2.396 2.594 2.771 2.939 3.021 3.179 3.337 3.571 3.717 3.857 4.06 4.253 4.443 4.634 4.808 5.037 5.275 5.501 5.761 6.009 6.246 6.539 6.898 7.237 7.597 7.983 8.413 8.861 9.358 9.967 10.567 11.246 12.028 12.99 14.086 15.383 16.934 18.712 20.167 21.005 21.532 21.87 22.061 22.174 22.269 22.317 22.349 22.363 22.355 22.339 22.315 22.264 22.215 22.169 22.107 22.051 22.0 21.952 21.907 21.859 21.811 21.764 21.703 21.648 21.595 21.536 21.495 21.451 21.374 21.319 21.267 21.233 21.158 21.095 21.032 20.999 20.787 20.863 20.812 20.768 20.682 20.628 20.564 20.499 20.414 20.327 20.222 19.921 -8 ,5262 ,TETRA ,17698879,Sat Dec 4 16:43:48 CET,Sat Dec 4 18:44:02 CET,0.0 0.331 0.593 0.83 1.038 1.221 1.381 1.54 1.815 1.945 2.078 2.138 2.454 2.562 2.774 2.962 3.142 3.233 3.406 3.579 3.834 3.997 4.147 4.359 4.584 4.812 5.037 5.246 5.502 5.771 6.029 6.329 6.62 6.903 7.231 7.599 7.951 8.36 8.79 9.25 9.781 10.35 10.979 11.616 12.384 13.286 14.307 15.407 16.674 18.132 19.967 21.419 22.259 22.795 23.066 23.22 23.309 23.38 23.431 23.465 23.489 23.478 23.443 23.416 23.373 23.321 23.272 23.241 23.221 23.181 23.11 23.045 22.982 22.927 22.883 22.834 22.782 22.726 22.666 22.628 22.595 22.536 22.48 22.411 22.376 22.308 22.236 22.161 22.116 21.896 21.963 21.905 21.853 21.745 21.687 21.638 21.588 21.511 21.401 21.263 20.956 -9 ,15999 ,TETRA ,17698880,Sat Dec 4 16:43:49 CET,Sat Dec 4 18:43:39 CET,0.0 0.586 0.892 1.117 1.3 1.479 1.633 1.758 1.994 2.12 2.253 2.297 2.59 2.688 2.89 3.072 3.245 3.336 3.519 3.695 3.956 4.121 4.272 4.489 4.687 4.884 5.092 5.297 5.562 5.817 6.059 6.352 6.642 6.923 7.235 7.594 7.954 8.342 8.771 9.213 9.681 10.245 10.9 11.576 12.414 13.314 14.33 15.5 16.837 18.41 20.218 21.663 22.509 23.034 23.357 23.566 23.727 23.828 23.854 23.839 23.831 23.819 23.789 23.767 23.739 23.705 23.649 23.584 23.534 23.478 23.401 23.333 23.267 23.206 23.161 23.113 23.064 23.009 22.948 22.907 22.865 22.798 22.751 22.701 22.678 22.627 22.55 22.47 22.439 22.232 22.323 22.287 22.246 22.129 22.064 21.996 21.93 21.873 21.798 21.649 21.429 -10 ,30864 ,TETRA ,17698881,Sat Dec 4 16:44:49 CET,Sat Dec 4 18:46:26 CET,0.0 0.392 0.692 0.924 1.122 1.329 1.507 1.647 1.888 1.994 2.098 2.116 2.406 2.491 2.658 2.82 2.99 3.08 3.258 3.438 3.696 3.857 4.008 4.249 4.491 4.704 4.906 5.1 5.346 5.611 5.878 6.194 6.5 6.795 7.138 7.521 7.884 8.294 8.763 9.232 9.733 10.318 10.973 11.658 12.471 13.361 14.34 15.428 16.726 18.165 19.875 21.285 22.021 22.476 22.788 22.965 23.058 23.121 23.139 23.138 23.121 23.094 23.077 23.062 23.037 23.003 22.966 22.93 22.882 22.825 22.751 22.69 22.636 22.578 22.535 22.494 22.449 22.393 22.321 22.265 22.215 22.146 22.092 22.033 22.002 21.934 21.869 21.787 21.739 21.532 21.655 21.61 21.555 21.463 21.414 21.363 21.304 21.245 21.154 21.039 20.878 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_5b.txt deleted file mode 100644 index bc8ed5bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5a_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,4222 ,KEBNE ,16838852,Sun Dec 5 21:18:20 CET,Sun Dec 5 23:02:25 CET,0.0 0.234 0.407 0.516 0.596 0.68 0.757 0.804 0.901 0.965 1.02 0.913 1.158 1.203 1.265 1.322 1.379 1.406 1.457 1.504 1.559 1.585 1.617 1.659 1.69 1.726 1.767 1.802 1.839 1.878 1.917 1.967 2.0 2.028 2.058 2.077 2.093 2.096 2.072 2.021 1.955 1.88 1.819 1.763 1.628 1.383 0.952 0.322 -0.587 -1.948 -4.209 -6.812 -8.81 -10.44 -11.82 -12.993 -13.978 -14.844 -15.584 -16.307 -16.898 -17.407 -17.894 -18.34 -18.741 -19.115 -19.508 -19.847 -20.155 -20.458 -20.753 -21.002 -21.259 -21.53 -21.731 -21.936 -22.147 -22.36 -22.57 -22.705 -22.842 -23.077 -23.249 -23.416 -23.503 -23.665 -23.823 -24.0 -24.093 -24.417 -24.39 -24.487 -24.583 -24.762 -24.868 -24.985 -25.114 -25.251 -25.393 -25.562 -25.973 -2 ,24413 ,KEBNE ,16838853,Sun Dec 5 21:18:20 CET,Sun Dec 5 23:01:07 CET,0.0 0.274 0.426 0.528 0.604 0.671 0.753 0.825 0.97 1.034 1.095 1.033 1.275 1.312 1.389 1.455 1.509 1.536 1.576 1.615 1.687 1.736 1.775 1.838 1.896 1.95 2.005 2.054 2.112 2.148 2.172 2.191 2.212 2.254 2.301 2.319 2.311 2.297 2.282 2.249 2.185 2.103 1.985 1.811 1.581 1.268 0.803 0.154 -0.789 -2.207 -4.578 -7.299 -9.374 -11.066 -12.471 -13.634 -14.627 -15.506 -16.237 -16.954 -17.578 -18.115 -18.61 -19.069 -19.469 -19.816 -20.166 -20.479 -20.756 -21.068 -21.381 -21.62 -21.876 -22.135 -22.336 -22.539 -22.73 -22.918 -23.124 -23.282 -23.434 -23.658 -23.804 -23.954 -24.033 -24.183 -24.345 -24.508 -24.59 -24.904 -24.884 -24.988 -25.095 -25.342 -25.466 -25.598 -25.749 -25.891 -26.014 -26.161 -26.374 -3 ,19726 ,KEBNE ,16838854,Sun Dec 5 21:18:20 CET,Sun Dec 5 23:00:48 CET,0.0 0.33 0.469 0.576 0.661 0.747 0.825 0.897 1.012 1.065 1.121 1.051 1.315 1.371 1.459 1.539 1.609 1.644 1.72 1.782 1.864 1.909 1.943 2.009 2.078 2.136 2.18 2.213 2.252 2.279 2.298 2.305 2.315 2.35 2.384 2.392 2.393 2.384 2.353 2.329 2.311 2.255 2.137 1.979 1.75 1.388 0.916 0.308 -0.649 -2.173 -4.675 -7.462 -9.618 -11.353 -12.759 -14.0 -15.039 -15.902 -16.623 -17.342 -17.945 -18.45 -18.921 -19.377 -19.819 -20.235 -20.638 -20.962 -21.252 -21.55 -21.861 -22.128 -22.386 -22.654 -22.867 -23.085 -23.302 -23.511 -23.736 -23.896 -24.061 -24.299 -24.443 -24.597 -24.678 -24.84 -24.998 -25.152 -25.237 -25.548 -25.508 -25.612 -25.722 -25.947 -26.058 -26.163 -26.271 -26.439 -26.6 -26.711 -26.894 -6 ,17558 ,KEBNE ,16838857,Sun Dec 5 21:18:24 CET,Sun Dec 5 22:56:59 CET,0.0 0.209 0.352 0.468 0.553 0.591 0.628 0.674 0.756 0.795 0.838 0.745 0.993 1.037 1.124 1.199 1.259 1.285 1.329 1.379 1.445 1.481 1.515 1.566 1.617 1.669 1.725 1.769 1.798 1.826 1.863 1.911 1.958 1.991 2.003 2.01 2.024 2.012 1.996 1.989 1.937 1.865 1.751 1.568 1.333 0.993 0.482 -0.227 -1.258 -2.739 -5.1 -7.771 -9.889 -11.635 -13.057 -14.246 -15.214 -16.075 -16.806 -17.52 -18.149 -18.682 -19.175 -19.664 -20.116 -20.524 -20.926 -21.265 -21.552 -21.85 -22.172 -22.436 -22.685 -22.926 -23.112 -23.296 -23.479 -23.678 -23.886 -24.019 -24.152 -24.354 -24.493 -24.655 -24.739 -24.904 -25.076 -25.254 -25.344 -25.659 -25.625 -25.717 -25.816 -26.036 -26.143 -26.242 -26.352 -26.473 -26.595 -26.73 -26.95 -7 ,11619 ,KEBNE ,16838858,Sun Dec 5 21:18:20 CET,Sun Dec 5 23:01:49 CET,0.0 0.144 0.257 0.347 0.434 0.508 0.561 0.629 0.779 0.835 0.884 0.786 1.033 1.087 1.178 1.253 1.326 1.36 1.414 1.466 1.543 1.587 1.632 1.69 1.747 1.801 1.841 1.888 1.948 1.99 2.029 2.081 2.115 2.134 2.149 2.154 2.153 2.143 2.108 2.053 1.969 1.842 1.672 1.48 1.247 0.926 0.447 -0.214 -1.204 -2.625 -4.855 -7.518 -9.584 -11.211 -12.557 -13.728 -14.714 -15.58 -16.292 -16.976 -17.55 -18.05 -18.559 -19.04 -19.472 -19.864 -20.265 -20.615 -20.908 -21.21 -21.506 -21.743 -21.991 -22.235 -22.416 -22.597 -22.781 -22.977 -23.182 -23.321 -23.468 -23.697 -23.851 -24.009 -24.091 -24.25 -24.42 -24.616 -24.709 -25.017 -24.984 -25.084 -25.182 -25.408 -25.539 -25.66 -25.789 -25.919 -26.043 -26.276 -26.614 -8 ,29905 ,KEBNE ,16838859,Sun Dec 5 21:18:20 CET,Sun Dec 5 23:01:58 CET,0.0 0.284 0.432 0.531 0.626 0.706 0.772 0.847 0.976 1.031 1.095 0.998 1.238 1.285 1.364 1.44 1.521 1.559 1.623 1.678 1.76 1.807 1.843 1.892 1.943 1.991 2.032 2.063 2.103 2.154 2.199 2.233 2.237 2.239 2.253 2.275 2.309 2.308 2.274 2.237 2.178 2.074 1.941 1.822 1.622 1.344 0.944 0.3 -0.637 -2.01 -4.272 -6.931 -9.023 -10.738 -12.136 -13.314 -14.31 -15.162 -15.88 -16.575 -17.125 -17.616 -18.106 -18.565 -18.997 -19.377 -19.735 -20.033 -20.291 -20.563 -20.842 -21.065 -21.309 -21.57 -21.754 -21.95 -22.165 -22.372 -22.571 -22.706 -22.843 -23.064 -23.226 -23.401 -23.488 -23.661 -23.838 -24.0 -24.09 -24.415 -24.378 -24.47 -24.558 -24.752 -24.852 -24.97 -25.091 -25.219 -25.356 -25.496 -25.846 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5c.txt deleted file mode 100644 index a5ee90eb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5b_5c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24282 ,TETRA ,17698882,Sat Dec 4 16:44:45 CET,Sat Dec 4 18:45:58 CET,0.0 0.246 0.404 0.533 0.663 0.789 0.909 1.03 1.254 1.349 1.44 1.402 1.721 1.817 1.998 2.188 2.375 2.457 2.607 2.747 2.966 3.121 3.273 3.475 3.68 3.894 4.088 4.265 4.499 4.732 4.962 5.245 5.502 5.743 6.016 6.331 6.654 7.007 7.391 7.837 8.312 8.812 9.4 9.999 10.7 11.513 12.43 13.468 14.727 16.197 17.994 19.373 20.072 20.469 20.704 20.793 20.817 20.837 20.832 20.817 20.784 20.738 20.681 20.615 20.536 20.451 20.369 20.288 20.198 20.09 19.977 19.874 19.769 19.693 19.641 19.575 19.508 19.447 19.386 19.331 19.269 19.168 19.093 19.027 18.997 18.923 18.84 18.757 18.703 18.433 18.523 18.46 18.39 18.253 18.174 18.085 18.007 17.929 17.807 17.65 17.382 -2 ,5894 ,TETRA ,17698883,Sat Dec 4 16:44:48 CET,Sat Dec 4 18:44:21 CET,0.0 0.41 0.633 0.783 0.95 1.108 1.238 1.359 1.599 1.704 1.802 1.777 2.093 2.18 2.365 2.554 2.727 2.816 2.993 3.163 3.395 3.541 3.694 3.932 4.163 4.375 4.569 4.741 4.959 5.2 5.431 5.708 5.989 6.259 6.58 6.934 7.268 7.648 8.052 8.474 8.915 9.437 10.026 10.614 11.318 12.087 12.991 14.035 15.276 16.722 18.425 19.816 20.632 21.079 21.343 21.53 21.645 21.698 21.703 21.678 21.639 21.577 21.519 21.466 21.389 21.302 21.213 21.127 21.043 20.948 20.838 20.736 20.632 20.55 20.491 20.426 20.361 20.287 20.205 20.157 20.107 20.003 19.926 19.839 19.801 19.744 19.664 19.568 19.525 19.271 19.368 19.322 19.277 19.13 19.046 18.975 18.895 18.804 18.686 18.512 18.195 -3 ,1417 ,TETRA ,17698884,Sat Dec 4 16:44:50 CET,Sat Dec 4 18:43:56 CET,0.0 0.357 0.525 0.704 0.868 1.007 1.127 1.259 1.527 1.646 1.753 1.713 2.028 2.122 2.292 2.468 2.635 2.706 2.838 2.987 3.22 3.366 3.523 3.749 3.967 4.175 4.369 4.568 4.826 5.068 5.301 5.602 5.894 6.154 6.458 6.825 7.175 7.554 7.982 8.443 8.944 9.483 10.064 10.669 11.351 12.117 13.036 14.074 15.332 16.788 18.54 20.012 20.79 21.183 21.424 21.581 21.657 21.688 21.676 21.626 21.569 21.518 21.46 21.363 21.273 21.204 21.107 21.01 20.923 20.844 20.774 20.721 20.658 20.57 20.504 20.455 20.411 20.359 20.298 20.248 20.186 20.083 20.013 19.946 19.909 19.834 19.759 19.659 19.601 19.341 19.452 19.395 19.332 19.189 19.112 19.04 18.973 18.879 18.751 18.54 18.147 -4 ,8138 ,TETRA ,17698885,Sat Dec 4 16:44:46 CET,Sat Dec 4 18:46:41 CET,0.0 0.548 0.847 1.022 1.167 1.319 1.442 1.562 1.809 1.917 2.026 2.029 2.359 2.456 2.64 2.815 2.971 3.044 3.187 3.328 3.538 3.678 3.811 3.999 4.189 4.384 4.567 4.749 4.988 5.211 5.434 5.738 6.036 6.303 6.628 7.026 7.395 7.785 8.2 8.617 9.047 9.54 10.147 10.777 11.517 12.344 13.28 14.319 15.518 16.924 18.665 20.042 20.761 21.174 21.425 21.57 21.621 21.624 21.624 21.624 21.594 21.558 21.529 21.486 21.419 21.325 21.203 21.113 21.055 20.996 20.928 20.868 20.794 20.726 20.675 20.6 20.514 20.404 20.295 20.239 20.189 20.108 20.051 19.993 19.963 19.886 19.794 19.702 19.656 19.397 19.496 19.449 19.387 19.227 19.149 19.089 19.035 18.959 18.888 18.785 18.421 -5 ,20201 ,TETRA ,17698886,Sat Dec 4 16:44:48 CET,Sat Dec 4 18:46:18 CET,0.0 0.558 0.745 0.922 1.056 1.178 1.296 1.416 1.617 1.71 1.807 1.756 2.066 2.152 2.331 2.517 2.697 2.786 2.943 3.088 3.304 3.447 3.582 3.789 3.991 4.179 4.38 4.574 4.813 5.08 5.326 5.585 5.842 6.098 6.42 6.789 7.139 7.5 7.882 8.313 8.756 9.267 9.874 10.471 11.152 11.984 12.947 13.916 15.1 16.546 18.263 19.651 20.414 20.867 21.114 21.256 21.338 21.355 21.358 21.36 21.343 21.306 21.25 21.157 21.053 20.981 20.93 20.878 20.806 20.726 20.637 20.555 20.485 20.402 20.34 20.268 20.192 20.126 20.025 19.956 19.888 19.768 19.689 19.606 19.56 19.455 19.347 19.257 19.215 18.963 19.073 19.016 18.939 18.778 18.695 18.608 18.515 18.416 18.32 18.225 18.138 -6 ,4789 ,TETRA ,17698887,Sat Dec 4 16:44:50 CET,Sat Dec 4 18:44:46 CET,0.0 0.267 0.449 0.636 0.808 0.93 1.041 1.157 1.391 1.501 1.601 1.577 1.891 1.969 2.14 2.314 2.474 2.554 2.705 2.844 3.046 3.173 3.306 3.522 3.734 3.934 4.125 4.302 4.538 4.769 4.994 5.27 5.551 5.844 6.176 6.522 6.855 7.226 7.61 8.01 8.447 8.977 9.573 10.171 10.91 11.717 12.655 13.761 15.042 16.522 18.328 19.744 20.523 20.974 21.24 21.409 21.518 21.548 21.545 21.501 21.403 21.332 21.284 21.229 21.179 21.113 21.026 20.938 20.852 20.759 20.669 20.597 20.503 20.398 20.328 20.262 20.184 20.106 20.022 19.961 19.91 19.827 19.76 19.691 19.657 19.588 19.499 19.408 19.37 19.12 19.222 19.17 19.118 18.972 18.893 18.825 18.766 18.702 18.627 18.545 18.427 -7 ,13541 ,TETRA ,17698888,Sat Dec 4 16:44:47 CET,Sat Dec 4 18:44:30 CET,0.0 0.297 0.479 0.643 0.774 0.906 1.038 1.151 1.347 1.436 1.531 1.494 1.817 1.926 2.111 2.283 2.453 2.538 2.713 2.88 3.119 3.276 3.414 3.609 3.814 4.017 4.213 4.395 4.639 4.89 5.12 5.389 5.656 5.937 6.258 6.59 6.937 7.309 7.686 8.12 8.579 9.108 9.737 10.38 11.137 11.958 12.916 13.978 15.199 16.684 18.482 19.872 20.698 21.166 21.395 21.528 21.609 21.655 21.635 21.604 21.589 21.569 21.546 21.508 21.44 21.357 21.281 21.211 21.15 21.09 21.0 20.914 20.839 20.769 20.703 20.624 20.55 20.477 20.382 20.314 20.247 20.142 20.061 19.969 19.929 19.867 19.802 19.73 19.691 19.436 19.553 19.505 19.442 19.311 19.251 19.171 19.066 18.972 18.855 18.682 18.515 -8 ,10844 ,TETRA ,17698889,Sat Dec 4 16:44:46 CET,Sat Dec 4 18:44:36 CET,0.0 0.334 0.491 0.617 0.725 0.847 0.983 1.101 1.312 1.418 1.519 1.493 1.821 1.916 2.093 2.271 2.438 2.517 2.68 2.834 3.054 3.207 3.345 3.536 3.742 3.955 4.155 4.344 4.6 4.837 5.055 5.319 5.57 5.823 6.127 6.464 6.804 7.191 7.621 8.078 8.541 9.073 9.679 10.264 10.949 11.722 12.62 13.629 14.838 16.278 17.987 19.361 20.112 20.546 20.799 20.922 20.988 21.007 21.001 20.997 20.976 20.942 20.869 20.79 20.722 20.664 20.606 20.512 20.412 20.313 20.195 20.102 20.018 19.931 19.865 19.794 19.717 19.634 19.543 19.486 19.429 19.333 19.249 19.144 19.093 18.997 18.898 18.811 18.767 18.509 18.587 18.523 18.466 18.357 18.3 18.225 18.127 18.043 17.966 17.865 17.648 -9 ,15736 ,TETRA ,17698890,Sat Dec 4 16:44:48 CET,Sat Dec 4 18:44:04 CET,0.0 0.397 0.571 0.751 0.913 1.045 1.188 1.313 1.541 1.649 1.753 1.719 2.037 2.133 2.313 2.484 2.664 2.761 2.938 3.103 3.328 3.464 3.596 3.788 3.985 4.191 4.389 4.578 4.832 5.073 5.3 5.567 5.814 6.076 6.399 6.724 7.01 7.336 7.71 8.135 8.599 9.126 9.74 10.355 11.056 11.857 12.81 13.834 15.055 16.538 18.34 19.847 20.661 21.086 21.192 21.232 21.321 21.392 21.421 21.415 21.392 21.329 21.272 21.231 21.152 21.075 21.01 20.94 20.853 20.778 20.718 20.647 20.554 20.447 20.364 20.277 20.197 20.125 20.05 20.003 19.943 19.837 19.766 19.682 19.641 19.573 19.497 19.408 19.356 19.097 19.198 19.139 19.079 18.956 18.895 18.823 18.748 18.68 18.597 18.452 18.023 -10 ,16858 ,TETRA ,17698891,Sat Dec 4 16:44:50 CET,Sat Dec 4 18:44:54 CET,0.0 0.326 0.552 0.746 0.924 1.065 1.184 1.293 1.494 1.608 1.726 1.714 2.031 2.121 2.3 2.472 2.638 2.723 2.895 3.045 3.249 3.39 3.536 3.755 3.97 4.18 4.363 4.536 4.771 5.008 5.24 5.504 5.744 5.968 6.239 6.55 6.847 7.185 7.569 7.965 8.392 8.912 9.505 10.097 10.822 11.626 12.55 13.591 14.832 16.35 18.148 19.519 20.257 20.694 20.96 21.113 21.192 21.208 21.189 21.158 21.115 21.071 21.026 20.973 20.878 20.788 20.714 20.629 20.542 20.468 20.407 20.351 20.287 20.202 20.118 20.029 19.946 19.871 19.781 19.705 19.634 19.526 19.449 19.382 19.353 19.278 19.2 19.133 19.095 18.845 18.943 18.89 18.84 18.725 18.657 18.571 18.492 18.411 18.318 18.214 17.999 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_3b.txt deleted file mode 100644 index 3f9c8883..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17105 ,TETRA ,17698892,Sat Dec 4 16:44:52 CET,Sat Dec 4 18:45:22 CET,0.0 0.533 0.805 1.043 1.202 1.34 1.482 1.631 1.897 2.012 2.128 2.152 2.461 2.576 2.792 2.982 3.151 3.239 3.422 3.601 3.855 4.019 4.174 4.389 4.599 4.817 5.031 5.238 5.507 5.766 6.027 6.334 6.631 6.92 7.244 7.619 8.003 8.411 8.848 9.306 9.773 10.352 11.033 11.701 12.408 13.119 13.963 14.941 16.106 17.477 19.09 20.427 21.199 21.675 22.003 22.215 22.338 22.413 22.447 22.461 22.459 22.451 22.423 22.38 22.343 22.302 22.265 22.224 22.171 22.115 22.063 22.021 21.967 21.912 21.87 21.824 21.777 21.73 21.689 21.656 21.612 21.541 21.499 21.452 21.423 21.367 21.305 21.23 21.193 20.988 21.084 21.045 21.005 20.929 20.886 20.826 20.755 20.692 20.604 20.495 20.361 -2 ,12367 ,TETRA ,17698893,Sat Dec 4 16:44:48 CET,Sat Dec 4 18:44:57 CET,0.0 0.728 1.023 1.238 1.411 1.562 1.709 1.855 2.111 2.23 2.345 2.386 2.698 2.809 3.018 3.199 3.367 3.45 3.608 3.763 4.011 4.176 4.333 4.553 4.77 4.985 5.185 5.375 5.611 5.861 6.11 6.415 6.717 7.009 7.355 7.734 8.089 8.476 8.904 9.377 9.862 10.396 11.031 11.712 12.519 13.408 14.486 15.663 16.944 18.504 20.393 21.81 22.584 23.04 23.34 23.56 23.664 23.715 23.734 23.723 23.708 23.686 23.639 23.588 23.548 23.523 23.485 23.434 23.386 23.33 23.269 23.218 23.17 23.112 23.059 23.014 22.963 22.902 22.833 22.786 22.736 22.659 22.618 22.563 22.525 22.459 22.393 22.322 22.29 22.092 22.206 22.171 22.135 22.055 22.011 21.965 21.91 21.844 21.769 21.669 21.505 -3 ,4633 ,TETRA ,17698894,Sat Dec 4 16:44:52 CET,Sat Dec 4 18:44:54 CET,0.0 0.405 0.634 0.849 1.038 1.189 1.335 1.476 1.747 1.865 1.972 1.976 2.254 2.354 2.538 2.707 2.881 2.967 3.137 3.309 3.561 3.712 3.874 4.118 4.343 4.558 4.763 4.966 5.225 5.48 5.731 6.016 6.284 6.553 6.866 7.209 7.544 7.928 8.328 8.753 9.233 9.783 10.402 11.025 11.727 12.503 13.443 14.519 15.784 17.352 19.26 20.739 21.571 22.112 22.451 22.659 22.782 22.854 22.892 22.911 22.93 22.938 22.932 22.926 22.912 22.889 22.84 22.787 22.737 22.674 22.606 22.554 22.5 22.447 22.39 22.328 22.282 22.218 22.153 22.116 22.076 22.018 21.975 21.925 21.895 21.833 21.764 21.691 21.653 21.441 21.53 21.49 21.453 21.394 21.35 21.284 21.213 21.128 21.03 20.92 20.745 -4 ,28312 ,TETRA ,17698895,Sat Dec 4 16:44:48 CET,Sat Dec 4 18:44:42 CET,0.0 0.555 0.836 1.068 1.268 1.422 1.556 1.696 1.952 2.063 2.178 2.192 2.49 2.604 2.818 3.011 3.186 3.276 3.461 3.639 3.904 4.077 4.235 4.459 4.672 4.879 5.083 5.278 5.527 5.776 6.028 6.326 6.601 6.886 7.221 7.583 7.947 8.353 8.766 9.209 9.71 10.271 10.888 11.51 12.255 13.078 14.027 15.099 16.39 17.901 19.728 21.278 22.127 22.629 22.944 23.116 23.222 23.291 23.325 23.337 23.336 23.329 23.304 23.259 23.211 23.162 23.086 23.019 22.98 22.946 22.898 22.853 22.804 22.752 22.708 22.657 22.607 22.554 22.496 22.455 22.414 22.343 22.29 22.241 22.214 22.151 22.08 22.018 21.991 21.781 21.863 21.819 21.773 21.648 21.573 21.494 21.415 21.319 21.214 21.06 20.789 -5 ,3865 ,TETRA ,17698896,Sat Dec 4 16:44:49 CET,Sat Dec 4 18:44:06 CET,0.0 0.71 0.976 1.174 1.359 1.526 1.684 1.839 2.135 2.27 2.394 2.441 2.737 2.831 3.01 3.188 3.383 3.476 3.652 3.825 4.063 4.214 4.362 4.567 4.768 4.977 5.187 5.388 5.637 5.879 6.114 6.404 6.695 6.965 7.285 7.67 8.054 8.469 8.904 9.368 9.885 10.456 11.11 11.781 12.502 13.282 14.282 15.455 16.728 18.213 20.008 21.379 22.123 22.583 22.891 23.081 23.175 23.227 23.262 23.273 23.269 23.255 23.227 23.199 23.165 23.127 23.085 23.028 22.972 22.936 22.902 22.863 22.812 22.745 22.692 22.648 22.602 22.542 22.473 22.427 22.384 22.31 22.259 22.202 22.172 22.11 22.032 21.948 21.911 21.708 21.797 21.748 21.693 21.602 21.56 21.501 21.437 21.37 21.271 21.139 20.931 -6 ,9589 ,TETRA ,17698897,Sat Dec 4 16:44:48 CET,Sat Dec 4 18:45:33 CET,0.0 0.348 0.612 0.785 0.937 1.079 1.209 1.348 1.619 1.742 1.842 1.834 2.119 2.217 2.416 2.606 2.779 2.864 3.052 3.24 3.48 3.622 3.761 3.975 4.2 4.413 4.614 4.832 5.118 5.359 5.583 5.872 6.156 6.421 6.72 7.07 7.414 7.798 8.197 8.615 9.095 9.644 10.258 10.861 11.56 12.356 13.312 14.437 15.731 17.208 18.929 20.221 20.927 21.396 21.672 21.839 21.953 22.016 22.048 22.044 22.035 22.042 22.042 22.026 21.992 21.955 21.915 21.871 21.841 21.807 21.742 21.684 21.636 21.584 21.541 21.498 21.452 21.39 21.319 21.275 21.241 21.189 21.145 21.086 21.058 21.015 20.961 20.888 20.859 20.663 20.748 20.704 20.658 20.559 20.511 20.467 20.422 20.358 20.261 20.133 19.927 -7 ,1349 ,TETRA ,17698898,Sat Dec 4 16:44:48 CET,Sat Dec 4 18:44:53 CET,0.0 0.494 0.746 0.921 1.076 1.228 1.371 1.503 1.75 1.876 1.988 2.002 2.303 2.402 2.602 2.81 3.009 3.104 3.282 3.455 3.707 3.876 4.047 4.276 4.48 4.685 4.889 5.076 5.32 5.569 5.806 6.093 6.372 6.641 6.972 7.368 7.731 8.115 8.551 9.02 9.494 10.036 10.701 11.382 12.117 12.92 13.936 15.132 16.438 17.851 19.55 20.931 21.692 22.165 22.47 22.663 22.774 22.839 22.865 22.859 22.838 22.818 22.794 22.768 22.734 22.691 22.643 22.603 22.569 22.525 22.477 22.437 22.389 22.339 22.3 22.247 22.203 22.168 22.117 22.079 22.039 21.974 21.928 21.879 21.852 21.798 21.738 21.67 21.642 21.445 21.541 21.501 21.463 21.383 21.334 21.282 21.214 21.143 21.057 20.928 20.63 -8 ,922 ,TETRA ,17698899,Sat Dec 4 16:44:50 CET,Sat Dec 4 18:44:29 CET,0.0 0.697 0.892 1.049 1.226 1.402 1.546 1.694 1.989 2.119 2.221 2.215 2.506 2.606 2.777 2.942 3.106 3.188 3.348 3.492 3.691 3.823 3.96 4.163 4.363 4.559 4.736 4.906 5.134 5.338 5.544 5.817 6.07 6.317 6.613 6.924 7.239 7.61 7.996 8.398 8.814 9.312 9.926 10.513 11.189 11.989 12.945 14.038 15.304 16.783 18.544 19.964 20.813 21.287 21.539 21.73 21.869 21.947 21.982 22.003 21.987 21.963 21.936 21.911 21.899 21.876 21.837 21.788 21.747 21.702 21.648 21.611 21.561 21.494 21.445 21.4 21.354 21.304 21.247 21.196 21.147 21.07 21.02 20.973 20.948 20.883 20.811 20.754 20.719 20.503 20.58 20.528 20.467 20.35 20.296 20.239 20.172 20.108 20.027 19.91 19.715 -9 ,14515 ,TETRA ,17698900,Sat Dec 4 16:44:53 CET,Sat Dec 4 18:48:18 CET,0.0 0.605 0.821 0.988 1.163 1.334 1.496 1.64 1.873 1.98 2.095 2.145 2.443 2.544 2.742 2.921 3.093 3.173 3.328 3.488 3.734 3.894 4.049 4.268 4.477 4.683 4.881 5.074 5.33 5.578 5.816 6.107 6.39 6.675 7.025 7.405 7.753 8.136 8.559 9.024 9.513 10.072 10.722 11.359 12.081 12.89 13.811 14.854 16.1 17.584 19.388 20.778 21.565 22.06 22.374 22.555 22.653 22.736 22.766 22.768 22.765 22.754 22.728 22.677 22.621 22.575 22.531 22.474 22.408 22.342 22.294 22.259 22.207 22.151 22.11 22.06 22.013 21.969 21.895 21.839 21.794 21.719 21.671 21.622 21.596 21.552 21.504 21.436 21.4 21.19 21.252 21.2 21.146 20.991 20.917 20.85 20.765 20.667 20.55 20.408 19.969 -10 ,11836 ,TETRA ,17698901,Sat Dec 4 16:44:48 CET,Sat Dec 4 18:47:44 CET,0.0 0.38 0.58 0.759 0.922 1.072 1.202 1.318 1.561 1.69 1.817 1.839 2.131 2.224 2.419 2.62 2.809 2.896 3.053 3.211 3.455 3.613 3.762 3.986 4.216 4.427 4.628 4.825 5.076 5.33 5.584 5.877 6.145 6.417 6.745 7.106 7.466 7.886 8.343 8.802 9.281 9.825 10.438 11.056 11.789 12.621 13.599 14.707 16.047 17.562 19.253 20.588 21.343 21.855 22.172 22.38 22.518 22.585 22.606 22.594 22.572 22.548 22.524 22.506 22.478 22.433 22.383 22.333 22.286 22.235 22.176 22.128 22.082 22.03 21.979 21.924 21.876 21.825 21.761 21.715 21.671 21.598 21.544 21.489 21.465 21.41 21.354 21.293 21.254 21.043 21.141 21.108 21.07 20.985 20.933 20.871 20.808 20.736 20.641 20.529 20.396 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5a.txt deleted file mode 100644 index a4c562c3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28555 ,TETRA ,17698902,Sat Dec 4 16:45:46 CET,Sat Dec 4 18:46:41 CET,0.0 0.19 0.328 0.445 0.539 0.641 0.736 0.831 0.999 1.077 1.153 1.091 1.345 1.395 1.497 1.59 1.669 1.714 1.806 1.905 2.046 2.134 2.229 2.363 2.48 2.585 2.687 2.78 2.893 3.004 3.115 3.244 3.373 3.519 3.683 3.86 4.034 4.221 4.411 4.606 4.798 4.999 5.221 5.417 5.665 5.954 6.261 6.567 6.846 7.086 7.174 6.815 6.278 5.75 5.284 4.868 4.487 4.126 3.776 3.418 3.121 2.875 2.657 2.44 2.246 2.07 1.853 1.651 1.484 1.318 1.135 0.971 0.808 0.619 0.481 0.364 0.234 0.094 -0.051 -0.15 -0.253 -0.423 -0.552 -0.688 -0.746 -0.852 -0.968 -1.101 -1.183 -1.448 -1.384 -1.466 -1.549 -1.713 -1.814 -1.924 -2.048 -2.2 -2.377 -2.565 -2.914 -2 ,27525 ,TETRA ,17698903,Sat Dec 4 16:47:40 CET,Sat Dec 4 18:48:11 CET,0.0 0.203 0.31 0.429 0.542 0.643 0.743 0.829 0.965 1.026 1.091 1.039 1.296 1.355 1.47 1.572 1.673 1.725 1.817 1.918 2.056 2.124 2.188 2.287 2.393 2.492 2.586 2.673 2.789 2.916 3.034 3.153 3.292 3.434 3.598 3.779 3.943 4.114 4.29 4.518 4.737 4.987 5.263 5.474 5.766 6.106 6.42 6.713 7.029 7.281 7.362 7.185 6.865 6.458 6.051 5.679 5.34 5.012 4.69 4.334 4.045 3.806 3.558 3.308 3.081 2.888 2.683 2.487 2.317 2.135 1.921 1.726 1.539 1.355 1.209 1.059 0.913 0.768 0.615 0.509 0.412 0.27 0.162 0.044 -0.018 -0.146 -0.279 -0.408 -0.477 -0.767 -0.741 -0.83 -0.936 -1.143 -1.256 -1.373 -1.505 -1.654 -1.819 -2.01 -2.387 -3 ,7556 ,TETRA ,17698904,Sat Dec 4 16:45:46 CET,Sat Dec 4 18:45:26 CET,0.0 0.225 0.366 0.469 0.552 0.644 0.715 0.784 0.968 1.063 1.143 1.084 1.34 1.402 1.519 1.639 1.759 1.812 1.909 2.004 2.129 2.202 2.284 2.417 2.546 2.671 2.785 2.879 2.988 3.12 3.258 3.401 3.542 3.684 3.844 4.033 4.21 4.385 4.575 4.775 4.975 5.224 5.513 5.768 6.027 6.274 6.579 6.88 7.117 7.315 7.362 7.045 6.604 6.186 5.808 5.436 5.087 4.762 4.46 4.145 3.862 3.604 3.354 3.117 2.887 2.681 2.466 2.272 2.114 1.946 1.761 1.596 1.411 1.226 1.092 0.95 0.806 0.661 0.514 0.422 0.323 0.162 0.053 -0.061 -0.123 -0.251 -0.388 -0.544 -0.635 -0.919 -0.887 -0.979 -1.072 -1.254 -1.346 -1.452 -1.56 -1.665 -1.827 -2.044 -2.456 -4 ,9258 ,TETRA ,17698905,Sat Dec 4 16:45:50 CET,Sat Dec 4 18:45:28 CET,0.0 0.269 0.376 0.472 0.571 0.697 0.817 0.914 1.071 1.132 1.181 1.108 1.362 1.414 1.502 1.591 1.696 1.753 1.864 1.966 2.108 2.205 2.3 2.435 2.568 2.686 2.795 2.893 3.009 3.116 3.236 3.378 3.497 3.62 3.766 3.957 4.14 4.302 4.468 4.641 4.818 5.01 5.224 5.43 5.66 5.892 6.164 6.473 6.747 6.935 6.87 6.545 6.099 5.611 5.185 4.765 4.379 4.032 3.724 3.361 3.051 2.819 2.598 2.386 2.181 1.99 1.78 1.576 1.397 1.198 0.984 0.81 0.619 0.449 0.343 0.231 0.101 -0.046 -0.187 -0.288 -0.394 -0.531 -0.62 -0.738 -0.8 -0.896 -1.006 -1.153 -1.231 -1.509 -1.476 -1.567 -1.661 -1.844 -1.935 -2.024 -2.137 -2.28 -2.455 -2.685 -3.01 -5 ,1578 ,TETRA ,17698906,Sat Dec 4 16:45:48 CET,Sat Dec 4 18:47:35 CET,0.0 0.32 0.47 0.575 0.673 0.753 0.825 0.905 1.077 1.163 1.246 1.186 1.443 1.509 1.638 1.772 1.884 1.933 2.038 2.143 2.305 2.411 2.501 2.621 2.75 2.874 2.984 3.098 3.25 3.383 3.49 3.628 3.773 3.9 4.061 4.258 4.437 4.617 4.795 4.979 5.168 5.375 5.609 5.835 6.139 6.458 6.768 7.104 7.347 7.489 7.468 7.228 6.909 6.543 6.166 5.783 5.413 5.051 4.733 4.371 4.013 3.71 3.42 3.149 2.903 2.666 2.427 2.241 2.089 1.903 1.71 1.545 1.367 1.21 1.085 0.956 0.83 0.695 0.538 0.421 0.309 0.122 -0.011 -0.134 -0.198 -0.319 -0.425 -0.539 -0.599 -0.871 -0.833 -0.911 -0.992 -1.156 -1.257 -1.365 -1.482 -1.63 -1.783 -1.975 -2.344 -6 ,2306 ,TETRA ,17698907,Sat Dec 4 16:45:46 CET,Sat Dec 4 18:47:19 CET,0.0 0.144 0.278 0.434 0.56 0.64 0.72 0.806 0.993 1.085 1.171 1.107 1.355 1.413 1.531 1.639 1.735 1.784 1.885 1.978 2.104 2.193 2.28 2.418 2.559 2.674 2.768 2.86 2.98 3.101 3.217 3.359 3.489 3.61 3.769 3.956 4.129 4.295 4.449 4.631 4.853 5.089 5.331 5.568 5.827 6.109 6.406 6.682 6.952 7.177 7.26 7.025 6.615 6.168 5.745 5.335 4.925 4.526 4.193 3.861 3.585 3.32 3.064 2.833 2.627 2.436 2.199 2.007 1.849 1.668 1.496 1.36 1.221 1.066 0.94 0.819 0.69 0.556 0.427 0.331 0.234 0.096 -0.003 -0.1 -0.151 -0.261 -0.391 -0.538 -0.603 -0.861 -0.806 -0.891 -0.98 -1.165 -1.266 -1.366 -1.486 -1.642 -1.805 -1.97 -2.306 -7 ,25331 ,TETRA ,17698908,Sat Dec 4 16:47:40 CET,Sat Dec 4 18:45:25 CET,0.0 0.342 0.459 0.55 0.638 0.719 0.793 0.875 1.028 1.1 1.165 1.082 1.331 1.382 1.486 1.6 1.699 1.742 1.823 1.9 2.01 2.086 2.163 2.276 2.389 2.491 2.598 2.698 2.819 2.937 3.053 3.205 3.352 3.501 3.665 3.815 3.953 4.131 4.334 4.539 4.743 4.962 5.25 5.537 5.772 5.978 6.219 6.421 6.541 6.622 6.49 6.009 5.476 4.96 4.524 4.128 3.739 3.358 3.03 2.702 2.434 2.181 1.932 1.716 1.514 1.317 1.099 0.917 0.752 0.579 0.399 0.24 0.091 -0.06 -0.179 -0.305 -0.426 -0.56 -0.712 -0.807 -0.897 -1.029 -1.136 -1.251 -1.309 -1.429 -1.539 -1.656 -1.717 -1.979 -1.919 -1.99 -2.068 -2.231 -2.334 -2.445 -2.569 -2.701 -2.851 -3.052 -3.428 -8 ,30467 ,TETRA ,17698909,Sat Dec 4 16:49:37 CET,Sat Dec 4 18:51:29 CET,0.0 0.246 0.396 0.487 0.579 0.667 0.761 0.859 1.013 1.089 1.179 1.147 1.412 1.479 1.603 1.732 1.87 1.925 2.014 2.098 2.229 2.312 2.399 2.533 2.658 2.774 2.878 2.993 3.14 3.26 3.383 3.538 3.681 3.807 3.951 4.129 4.294 4.464 4.631 4.82 5.046 5.284 5.537 5.786 6.052 6.333 6.62 6.899 7.162 7.31 7.284 6.989 6.523 6.036 5.605 5.214 4.846 4.483 4.167 3.845 3.572 3.286 2.979 2.72 2.507 2.297 2.073 1.887 1.73 1.564 1.388 1.257 1.116 0.958 0.837 0.706 0.566 0.415 0.262 0.17 0.074 -0.092 -0.218 -0.36 -0.431 -0.566 -0.701 -0.847 -0.927 -1.205 -1.157 -1.237 -1.332 -1.543 -1.658 -1.783 -1.927 -2.07 -2.226 -2.463 -2.863 -9 ,5037 ,TETRA ,17698910,Sat Dec 4 16:48:46 CET,Sat Dec 4 18:36:34 CET,0.0 0.118 0.264 0.402 0.516 0.624 0.704 0.789 0.944 1.01 1.074 1.008 1.27 1.342 1.474 1.585 1.681 1.725 1.811 1.899 2.046 2.141 2.219 2.345 2.469 2.579 2.702 2.826 2.974 3.126 3.256 3.38 3.501 3.63 3.798 3.973 4.115 4.266 4.451 4.69 4.937 5.172 5.411 5.662 5.976 6.258 6.53 6.801 7.023 7.209 7.149 6.714 6.239 5.789 5.38 4.971 4.585 4.21 3.878 3.565 3.265 2.99 2.744 2.497 2.268 2.064 1.85 1.653 1.485 1.321 1.161 1.024 0.86 0.68 0.553 0.418 0.288 0.166 0.014 -0.091 -0.199 -0.379 -0.489 -0.587 -0.646 -0.778 -0.903 -1.035 -1.113 -1.397 -1.367 -1.449 -1.533 -1.712 -1.813 -1.931 -2.048 -2.161 -2.303 -2.491 -2.754 -10 ,20473 ,TETRA ,17698911,Sat Dec 4 16:48:46 CET,Sat Dec 4 18:36:39 CET,0.0 0.336 0.493 0.63 0.758 0.862 0.947 1.048 1.242 1.306 1.362 1.28 1.53 1.594 1.709 1.808 1.934 1.994 2.099 2.197 2.34 2.431 2.52 2.658 2.794 2.915 3.011 3.096 3.22 3.348 3.492 3.68 3.831 3.966 4.109 4.263 4.421 4.596 4.766 4.943 5.158 5.402 5.636 5.841 6.119 6.422 6.726 7.032 7.314 7.471 7.346 6.978 6.56 6.135 5.721 5.323 4.96 4.616 4.303 4.017 3.787 3.575 3.365 3.145 2.936 2.723 2.47 2.25 2.073 1.898 1.712 1.558 1.409 1.248 1.119 0.987 0.834 0.669 0.523 0.413 0.288 0.112 -0.01 -0.139 -0.213 -0.361 -0.486 -0.603 -0.67 -0.939 -0.88 -0.964 -1.057 -1.22 -1.308 -1.403 -1.5 -1.611 -1.758 -1.944 -2.299 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5e.txt deleted file mode 100644 index 17817c2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_5e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1764 ,TETRA ,17698912,Sat Dec 4 16:48:48 CET,Sat Dec 4 18:36:20 CET,0.0 0.404 0.547 0.644 0.753 0.864 0.976 1.084 1.272 1.359 1.444 1.375 1.632 1.706 1.835 1.948 2.056 2.109 2.217 2.31 2.428 2.51 2.595 2.727 2.85 2.971 3.082 3.182 3.326 3.457 3.579 3.742 3.899 4.052 4.236 4.42 4.586 4.767 4.94 5.104 5.285 5.493 5.725 5.948 6.153 6.369 6.567 6.707 6.784 6.713 6.339 5.663 4.989 4.372 3.858 3.403 2.999 2.613 2.268 1.921 1.599 1.325 1.08 0.836 0.619 0.436 0.241 0.046 -0.133 -0.322 -0.492 -0.622 -0.779 -0.96 -1.093 -1.207 -1.329 -1.469 -1.607 -1.699 -1.783 -1.924 -2.035 -2.154 -2.215 -2.339 -2.47 -2.595 -2.669 -2.947 -2.916 -3.003 -3.08 -3.217 -3.291 -3.4 -3.535 -3.671 -3.812 -3.992 -4.253 -2 ,16938 ,TETRA ,17698913,Sat Dec 4 16:48:49 CET,Sat Dec 4 18:47:46 CET,0.0 0.428 0.62 0.775 0.885 0.985 1.09 1.174 1.316 1.393 1.468 1.416 1.681 1.75 1.887 2.012 2.12 2.171 2.277 2.378 2.512 2.607 2.698 2.81 2.927 3.062 3.183 3.291 3.424 3.547 3.661 3.791 3.924 4.048 4.19 4.349 4.49 4.66 4.855 5.033 5.215 5.404 5.639 5.894 6.143 6.369 6.548 6.706 6.845 6.86 6.573 5.878 5.166 4.546 4.03 3.568 3.133 2.75 2.438 2.124 1.853 1.596 1.341 1.094 0.863 0.656 0.428 0.238 0.091 -0.067 -0.242 -0.398 -0.564 -0.735 -0.868 -1.007 -1.144 -1.282 -1.432 -1.529 -1.618 -1.76 -1.871 -1.992 -2.053 -2.167 -2.287 -2.425 -2.495 -2.768 -2.724 -2.809 -2.898 -3.102 -3.206 -3.302 -3.419 -3.539 -3.652 -3.817 -4.115 -3 ,378 ,TETRA ,17698914,Sat Dec 4 16:48:49 CET,Sat Dec 4 18:47:45 CET,0.0 0.472 0.739 0.881 1.004 1.129 1.237 1.328 1.506 1.594 1.664 1.592 1.852 1.919 2.042 2.161 2.272 2.325 2.435 2.543 2.707 2.818 2.913 3.038 3.167 3.296 3.42 3.533 3.657 3.772 3.902 4.063 4.205 4.334 4.503 4.697 4.847 4.986 5.135 5.337 5.582 5.819 6.048 6.254 6.494 6.744 6.949 7.1 7.219 7.232 6.884 6.183 5.494 4.811 4.186 3.697 3.272 2.882 2.547 2.181 1.876 1.625 1.372 1.123 0.903 0.66 0.398 0.186 0.014 -0.158 -0.37 -0.551 -0.726 -0.905 -1.029 -1.151 -1.285 -1.415 -1.542 -1.625 -1.72 -1.875 -1.974 -2.079 -2.13 -2.229 -2.34 -2.454 -2.514 -2.776 -2.697 -2.78 -2.871 -3.04 -3.124 -3.2 -3.282 -3.365 -3.484 -3.636 -3.916 -4 ,19072 ,TETRA ,17698915,Sat Dec 4 16:48:50 CET,Sat Dec 4 18:48:17 CET,0.0 0.214 0.351 0.459 0.541 0.631 0.733 0.83 0.994 1.067 1.136 1.085 1.332 1.386 1.509 1.63 1.748 1.804 1.919 2.032 2.186 2.284 2.371 2.498 2.624 2.748 2.87 2.971 3.096 3.23 3.367 3.526 3.667 3.791 3.944 4.114 4.253 4.394 4.547 4.71 4.868 5.036 5.237 5.462 5.719 5.928 6.104 6.246 6.335 6.329 6.085 5.504 4.872 4.326 3.825 3.324 2.893 2.534 2.221 1.875 1.518 1.218 0.981 0.759 0.557 0.381 0.186 -0.012 -0.178 -0.353 -0.544 -0.701 -0.846 -0.988 -1.111 -1.242 -1.375 -1.507 -1.634 -1.724 -1.822 -1.953 -2.031 -2.127 -2.175 -2.271 -2.382 -2.509 -2.577 -2.841 -2.785 -2.868 -2.95 -3.107 -3.179 -3.252 -3.35 -3.473 -3.588 -3.742 -3.969 -5 ,7021 ,TETRA ,17698916,Sat Dec 4 16:48:49 CET,Sat Dec 4 18:48:22 CET,0.0 0.329 0.549 0.72 0.892 1.014 1.099 1.196 1.391 1.461 1.519 1.445 1.709 1.775 1.898 2.033 2.161 2.224 2.338 2.443 2.613 2.719 2.811 2.955 3.097 3.23 3.353 3.457 3.585 3.719 3.858 4.043 4.193 4.315 4.459 4.616 4.782 4.97 5.157 5.345 5.553 5.768 5.984 6.163 6.393 6.641 6.818 6.973 7.092 7.063 6.654 5.948 5.295 4.669 4.123 3.603 3.159 2.787 2.464 2.127 1.797 1.486 1.204 0.954 0.719 0.503 0.272 0.056 -0.11 -0.302 -0.528 -0.692 -0.846 -1.007 -1.129 -1.247 -1.361 -1.494 -1.646 -1.741 -1.834 -1.976 -2.067 -2.172 -2.238 -2.378 -2.516 -2.662 -2.74 -3.012 -2.966 -3.044 -3.118 -3.295 -3.399 -3.494 -3.58 -3.677 -3.792 -3.923 -4.08 -6 ,10551 ,TETRA ,17698917,Sat Dec 4 16:48:49 CET,Sat Dec 4 18:48:23 CET,0.0 0.317 0.503 0.672 0.809 0.911 0.993 1.082 1.243 1.319 1.397 1.349 1.607 1.674 1.812 1.946 2.063 2.115 2.222 2.332 2.473 2.562 2.663 2.792 2.893 3.0 3.106 3.22 3.372 3.51 3.632 3.78 3.94 4.092 4.275 4.465 4.612 4.759 4.926 5.098 5.267 5.46 5.655 5.829 6.055 6.289 6.501 6.711 6.893 6.878 6.56 5.996 5.404 4.798 4.239 3.74 3.277 2.828 2.439 2.046 1.719 1.432 1.132 0.86 0.635 0.439 0.241 0.061 -0.104 -0.274 -0.435 -0.564 -0.701 -0.853 -0.973 -1.102 -1.243 -1.398 -1.541 -1.626 -1.725 -1.887 -2.002 -2.13 -2.19 -2.308 -2.443 -2.575 -2.641 -2.909 -2.847 -2.926 -3.006 -3.156 -3.239 -3.343 -3.471 -3.601 -3.751 -3.943 -4.222 -7 ,27956 ,TETRA ,17698918,Sat Dec 4 16:49:39 CET,Sat Dec 4 18:51:29 CET,0.0 0.364 0.573 0.717 0.841 0.944 1.04 1.136 1.293 1.361 1.433 1.381 1.652 1.725 1.841 1.962 2.092 2.157 2.284 2.404 2.575 2.677 2.782 2.935 3.065 3.181 3.294 3.401 3.52 3.622 3.731 3.883 4.042 4.179 4.311 4.458 4.624 4.824 5.011 5.187 5.355 5.519 5.72 5.931 6.156 6.389 6.584 6.755 6.946 7.011 6.753 6.269 5.736 5.21 4.726 4.261 3.845 3.456 3.107 2.771 2.49 2.229 1.945 1.661 1.412 1.191 0.943 0.721 0.549 0.378 0.209 0.059 -0.124 -0.311 -0.437 -0.557 -0.688 -0.835 -0.993 -1.096 -1.214 -1.416 -1.54 -1.652 -1.708 -1.834 -1.96 -2.092 -2.16 -2.423 -2.361 -2.443 -2.536 -2.709 -2.787 -2.876 -2.981 -3.086 -3.205 -3.393 -3.892 -8 ,28813 ,TETRA ,17698919,Sat Dec 4 16:49:40 CET,Sat Dec 4 18:49:41 CET,0.0 0.296 0.522 0.676 0.804 0.922 1.027 1.126 1.317 1.398 1.466 1.415 1.69 1.759 1.87 1.992 2.112 2.167 2.279 2.39 2.545 2.646 2.735 2.866 2.985 3.095 3.202 3.313 3.459 3.581 3.703 3.848 3.988 4.121 4.258 4.402 4.547 4.702 4.843 5.018 5.204 5.412 5.647 5.82 5.995 6.184 6.353 6.486 6.617 6.677 6.441 5.794 5.116 4.467 3.879 3.382 2.981 2.614 2.269 1.916 1.597 1.289 1.005 0.761 0.53 0.302 0.056 -0.145 -0.311 -0.479 -0.632 -0.759 -0.923 -1.106 -1.228 -1.351 -1.476 -1.603 -1.733 -1.825 -1.928 -2.077 -2.18 -2.278 -2.328 -2.438 -2.545 -2.663 -2.724 -2.985 -2.93 -3.007 -3.084 -3.25 -3.338 -3.426 -3.517 -3.634 -3.747 -3.89 -4.433 -9 ,17932 ,TETRA ,17698920,Sat Dec 4 16:49:43 CET,Sat Dec 4 18:48:43 CET,0.0 0.325 0.459 0.594 0.722 0.835 0.945 1.038 1.201 1.28 1.361 1.323 1.586 1.653 1.783 1.904 2.021 2.082 2.208 2.331 2.491 2.587 2.684 2.815 2.937 3.063 3.178 3.269 3.37 3.478 3.587 3.718 3.842 3.961 4.135 4.345 4.539 4.73 4.895 5.068 5.257 5.478 5.738 5.991 6.245 6.47 6.654 6.8 6.905 6.863 6.513 5.957 5.371 4.782 4.266 3.775 3.347 2.985 2.651 2.301 2.001 1.723 1.421 1.15 0.93 0.748 0.539 0.3 0.102 -0.072 -0.253 -0.412 -0.57 -0.713 -0.822 -0.952 -1.09 -1.216 -1.333 -1.416 -1.508 -1.668 -1.775 -1.873 -1.923 -2.029 -2.154 -2.306 -2.388 -2.665 -2.615 -2.698 -2.788 -2.977 -3.063 -3.144 -3.233 -3.342 -3.455 -3.552 -3.771 -10 ,11023 ,TETRA ,17698921,Sat Dec 4 16:49:38 CET,Sat Dec 4 18:48:22 CET,0.0 0.468 0.649 0.795 0.921 1.025 1.109 1.184 1.338 1.402 1.463 1.412 1.678 1.753 1.898 2.03 2.154 2.215 2.337 2.436 2.563 2.651 2.736 2.864 2.989 3.112 3.242 3.373 3.536 3.663 3.781 3.929 4.059 4.178 4.336 4.526 4.686 4.851 5.021 5.209 5.388 5.554 5.751 5.94 6.133 6.329 6.526 6.703 6.824 6.803 6.464 5.776 5.126 4.537 3.977 3.492 3.098 2.735 2.404 2.055 1.735 1.453 1.206 0.985 0.745 0.518 0.294 0.074 -0.104 -0.299 -0.496 -0.638 -0.785 -0.931 -1.051 -1.184 -1.335 -1.499 -1.648 -1.746 -1.852 -1.989 -2.082 -2.192 -2.259 -2.406 -2.53 -2.647 -2.715 -2.991 -2.948 -3.024 -3.103 -3.254 -3.342 -3.444 -3.562 -3.695 -3.834 -4.01 -4.264 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_7.txt deleted file mode 100644 index 28547775..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5d_7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16877 ,TETRA ,17698922,Sat Dec 4 16:49:42 CET,Sat Dec 4 18:48:32 CET,0.0 0.179 0.33 0.462 0.591 0.709 0.826 0.948 1.176 1.271 1.358 1.334 1.623 1.712 1.867 2.033 2.202 2.283 2.437 2.599 2.835 2.977 3.12 3.342 3.551 3.751 3.962 4.182 4.467 4.728 4.969 5.246 5.533 5.84 6.178 6.551 6.93 7.361 7.839 8.368 8.921 9.515 10.228 10.971 11.848 12.817 13.98 15.391 17.107 19.166 21.841 24.231 25.669 26.62 27.331 27.835 28.139 28.372 28.54 28.662 28.745 28.795 28.825 28.854 28.892 28.919 28.925 28.914 28.902 28.89 28.868 28.841 28.786 28.725 28.69 28.665 28.645 28.608 28.569 28.54 28.498 28.418 28.365 28.303 28.268 28.203 28.138 28.049 28.004 27.807 27.912 27.876 27.835 27.704 27.62 27.559 27.516 27.455 27.37 27.264 27.155 -2 ,807 ,TETRA ,17698923,Sat Dec 4 16:49:39 CET,Sat Dec 4 18:49:02 CET,0.0 0.183 0.305 0.443 0.56 0.658 0.749 0.841 1.012 1.102 1.201 1.196 1.476 1.555 1.708 1.876 2.052 2.133 2.288 2.448 2.685 2.841 2.995 3.212 3.427 3.648 3.854 4.048 4.308 4.573 4.828 5.136 5.449 5.739 6.073 6.462 6.826 7.254 7.75 8.265 8.784 9.383 10.103 10.857 11.78 12.824 14.017 15.415 17.108 19.214 22.036 24.535 26.065 27.108 27.85 28.389 28.744 29.011 29.203 29.31 29.391 29.464 29.51 29.543 29.592 29.641 29.666 29.666 29.64 29.6 29.554 29.516 29.476 29.421 29.394 29.361 29.304 29.255 29.209 29.173 29.138 29.078 29.013 28.945 28.918 28.857 28.771 28.685 28.649 28.448 28.524 28.458 28.386 28.27 28.218 28.155 28.058 27.932 27.81 27.698 27.452 -3 ,17385 ,TETRA ,17698924,Sat Dec 4 16:49:40 CET,Sat Dec 4 18:49:21 CET,0.0 0.213 0.395 0.525 0.641 0.766 0.88 0.99 1.206 1.306 1.396 1.356 1.632 1.721 1.878 2.022 2.165 2.239 2.391 2.536 2.762 2.907 3.039 3.233 3.416 3.594 3.774 3.952 4.189 4.42 4.649 4.965 5.278 5.552 5.872 6.246 6.634 7.095 7.567 8.033 8.56 9.21 9.963 10.694 11.58 12.609 13.811 15.206 16.939 19.097 21.838 24.252 25.745 26.673 27.322 27.861 28.238 28.533 28.744 28.857 28.919 28.979 29.011 29.009 29.016 29.025 29.006 28.991 28.982 28.982 28.979 28.951 28.913 28.866 28.828 28.783 28.712 28.651 28.59 28.541 28.498 28.427 28.362 28.292 28.263 28.207 28.145 28.065 28.017 27.801 27.859 27.801 27.74 27.611 27.539 27.441 27.323 27.206 27.09 26.974 26.831 -4 ,2510 ,TETRA ,17698925,Sat Dec 4 16:49:38 CET,Sat Dec 4 18:45:55 CET,0.0 0.336 0.451 0.572 0.7 0.822 0.931 1.024 1.21 1.301 1.385 1.368 1.658 1.753 1.927 2.1 2.27 2.348 2.5 2.653 2.873 3.027 3.17 3.366 3.579 3.804 4.019 4.219 4.472 4.707 4.957 5.263 5.55 5.849 6.182 6.535 6.879 7.283 7.731 8.219 8.783 9.419 10.127 10.899 11.817 12.821 14.03 15.397 17.067 19.129 21.76 24.146 25.555 26.486 27.1 27.55 27.906 28.152 28.296 28.382 28.465 28.536 28.574 28.57 28.566 28.572 28.545 28.505 28.459 28.402 28.348 28.299 28.239 28.18 28.134 28.085 28.032 27.978 27.913 27.859 27.805 27.72 27.656 27.593 27.561 27.495 27.4 27.298 27.261 27.059 27.137 27.078 27.013 26.864 26.776 26.679 26.591 26.514 26.416 26.303 26.158 -5 ,27578 ,TETRA ,17698926,Sat Dec 4 16:50:37 CET,Sat Dec 4 18:53:27 CET,0.0 0.256 0.439 0.631 0.765 0.881 0.993 1.096 1.281 1.36 1.446 1.446 1.728 1.803 1.944 2.074 2.217 2.302 2.46 2.609 2.84 2.993 3.148 3.373 3.588 3.79 3.988 4.184 4.431 4.664 4.89 5.168 5.444 5.727 6.038 6.396 6.757 7.147 7.617 8.13 8.643 9.23 9.928 10.665 11.554 12.568 13.768 15.163 16.855 18.912 21.634 24.13 25.681 26.727 27.486 28.031 28.42 28.693 28.859 29.009 29.119 29.188 29.239 29.277 29.317 29.345 29.367 29.349 29.312 29.3 29.295 29.288 29.268 29.239 29.222 29.186 29.139 29.078 29.003 28.953 28.902 28.813 28.737 28.66 28.63 28.566 28.485 28.406 28.368 28.155 28.213 28.155 28.098 27.965 27.892 27.817 27.728 27.619 27.508 27.397 27.141 -6 ,25570 ,TETRA ,17698927,Sat Dec 4 16:50:39 CET,Sat Dec 4 18:53:14 CET,0.0 0.459 0.648 0.784 0.913 1.043 1.175 1.287 1.47 1.558 1.658 1.667 1.959 2.051 2.225 2.39 2.555 2.638 2.804 2.96 3.166 3.294 3.418 3.61 3.793 3.978 4.167 4.353 4.593 4.824 5.072 5.389 5.697 6.004 6.359 6.763 7.152 7.551 7.973 8.455 8.967 9.553 10.248 10.956 11.828 12.826 14.004 15.398 17.092 19.212 21.978 24.471 26.068 27.126 27.875 28.443 28.823 29.077 29.27 29.439 29.541 29.612 29.653 29.681 29.709 29.727 29.756 29.758 29.725 29.681 29.643 29.614 29.56 29.48 29.433 29.396 29.353 29.299 29.241 29.211 29.19 29.159 29.116 29.065 29.036 28.972 28.9 28.819 28.769 28.544 28.599 28.549 28.496 28.375 28.307 28.243 28.172 28.096 27.989 27.841 27.563 -7 ,25864 ,TETRA ,17698928,Sat Dec 4 16:50:41 CET,Sat Dec 4 18:51:09 CET,0.0 0.279 0.496 0.703 0.865 1.007 1.12 1.211 1.396 1.489 1.584 1.581 1.861 1.948 2.125 2.288 2.452 2.536 2.7 2.86 3.089 3.233 3.361 3.567 3.784 3.985 4.185 4.383 4.647 4.897 5.138 5.422 5.683 5.945 6.261 6.634 6.986 7.376 7.835 8.349 8.882 9.474 10.171 10.906 11.802 12.797 14.009 15.457 17.157 19.286 22.127 24.643 26.172 27.161 27.849 28.35 28.709 28.99 29.199 29.389 29.516 29.595 29.659 29.7 29.715 29.727 29.713 29.67 29.621 29.587 29.576 29.568 29.551 29.509 29.47 29.423 29.368 29.321 29.273 29.233 29.194 29.126 29.067 28.988 28.953 28.894 28.824 28.739 28.688 28.466 28.512 28.454 28.409 28.294 28.217 28.13 28.048 27.961 27.835 27.712 27.612 -8 ,18335 ,TETRA ,17698929,Sat Dec 4 16:50:43 CET,Sat Dec 4 18:51:19 CET,0.0 0.137 0.278 0.409 0.551 0.68 0.79 0.895 1.107 1.214 1.317 1.317 1.594 1.669 1.818 1.969 2.108 2.184 2.357 2.516 2.739 2.879 3.008 3.204 3.418 3.649 3.869 4.075 4.338 4.606 4.854 5.138 5.417 5.685 6.0 6.362 6.714 7.112 7.56 8.064 8.633 9.283 10.04 10.812 11.699 12.707 13.912 15.286 16.994 19.159 21.962 24.451 25.997 27.001 27.671 28.162 28.521 28.799 28.975 29.113 29.201 29.244 29.268 29.289 29.316 29.331 29.334 29.316 29.273 29.235 29.19 29.147 29.106 29.038 28.989 28.949 28.902 28.861 28.8 28.753 28.713 28.64 28.584 28.517 28.484 28.426 28.361 28.276 28.23 28.018 28.078 28.028 27.982 27.844 27.773 27.712 27.638 27.577 27.507 27.353 27.097 -9 ,27055 ,TETRA ,17698930,Sat Dec 4 16:50:37 CET,Sat Dec 4 18:51:23 CET,0.0 0.159 0.315 0.482 0.611 0.728 0.861 0.977 1.179 1.281 1.387 1.4 1.695 1.797 1.983 2.141 2.292 2.37 2.527 2.684 2.938 3.095 3.229 3.425 3.617 3.815 4.023 4.234 4.521 4.787 5.024 5.327 5.638 5.938 6.286 6.68 7.081 7.535 8.031 8.553 9.078 9.676 10.388 11.122 12.012 13.049 14.298 15.724 17.458 19.634 22.401 24.821 26.391 27.488 28.208 28.745 29.154 29.452 29.668 29.852 29.961 30.025 30.084 30.113 30.124 30.14 30.151 30.14 30.108 30.049 29.994 29.94 29.87 29.831 29.816 29.795 29.764 29.731 29.706 29.68 29.634 29.553 29.502 29.459 29.439 29.39 29.332 29.251 29.197 28.978 29.019 28.955 28.897 28.758 28.692 28.631 28.551 28.465 28.337 28.168 27.996 -10 ,7770 ,TETRA ,17698931,Sat Dec 4 16:50:39 CET,Sat Dec 4 18:50:30 CET,0.0 0.241 0.403 0.539 0.665 0.779 0.889 1.008 1.227 1.324 1.425 1.414 1.695 1.782 1.953 2.125 2.303 2.383 2.541 2.713 2.95 3.094 3.235 3.431 3.625 3.813 4.017 4.227 4.487 4.737 4.976 5.28 5.576 5.846 6.157 6.509 6.847 7.237 7.682 8.187 8.727 9.311 10.003 10.75 11.634 12.625 13.847 15.264 16.962 19.031 21.697 24.048 25.456 26.445 27.134 27.595 27.911 28.123 28.302 28.479 28.597 28.69 28.758 28.79 28.808 28.807 28.803 28.798 28.791 28.768 28.73 28.697 28.654 28.61 28.581 28.545 28.49 28.442 28.406 28.383 28.347 28.261 28.189 28.117 28.08 27.995 27.912 27.829 27.793 27.588 27.622 27.549 27.493 27.376 27.298 27.221 27.133 27.049 26.966 26.825 26.537 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5e_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5e_5a.txt deleted file mode 100644 index a51a1429..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5e_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11289 ,TETRA ,17698932,Sat Dec 4 16:50:41 CET,Sat Dec 4 18:51:10 CET,0.0 0.129 0.26 0.356 0.445 0.549 0.651 0.732 0.894 0.977 1.051 0.977 1.237 1.301 1.426 1.545 1.67 1.733 1.858 1.973 2.122 2.215 2.308 2.453 2.604 2.75 2.893 3.025 3.169 3.31 3.457 3.65 3.828 4.0 4.211 4.423 4.626 4.843 5.067 5.324 5.599 5.905 6.277 6.613 6.997 7.444 7.981 8.533 9.118 9.753 10.328 10.604 10.537 10.318 10.052 9.794 9.527 9.209 8.909 8.583 8.314 8.088 7.846 7.615 7.383 7.14 6.897 6.717 6.583 6.427 6.257 6.107 5.949 5.779 5.645 5.515 5.38 5.237 5.084 4.979 4.867 4.704 4.592 4.464 4.402 4.266 4.112 3.944 3.854 3.572 3.577 3.457 3.341 3.108 2.974 2.839 2.704 2.527 2.322 2.1 1.655 -2 ,11423 ,TETRA ,17698933,Sat Dec 4 16:50:43 CET,Sat Dec 4 18:51:09 CET,0.0 0.235 0.364 0.495 0.602 0.676 0.763 0.87 1.085 1.184 1.262 1.202 1.473 1.532 1.642 1.754 1.859 1.91 2.006 2.096 2.227 2.323 2.43 2.594 2.742 2.869 2.994 3.121 3.272 3.43 3.599 3.798 3.98 4.147 4.335 4.534 4.721 4.95 5.19 5.426 5.698 6.011 6.356 6.696 7.065 7.457 7.892 8.369 8.929 9.531 10.07 10.231 10.099 9.843 9.548 9.209 8.814 8.435 8.126 7.827 7.574 7.302 7.069 6.881 6.658 6.432 6.22 6.033 5.854 5.666 5.489 5.325 5.128 4.939 4.797 4.643 4.486 4.325 4.15 4.032 3.922 3.752 3.633 3.506 3.439 3.293 3.128 2.96 2.875 2.58 2.551 2.438 2.317 2.047 1.91 1.768 1.594 1.393 1.152 0.828 0.247 -3 ,28917 ,TETRA ,17698934,Sat Dec 4 16:51:48 CET,Sat Dec 4 18:42:39 CET,0.0 0.206 0.363 0.477 0.584 0.681 0.762 0.845 1.029 1.119 1.199 1.159 1.43 1.489 1.618 1.75 1.869 1.92 2.015 2.108 2.239 2.324 2.403 2.517 2.634 2.769 2.919 3.05 3.203 3.36 3.513 3.69 3.877 4.061 4.242 4.451 4.668 4.887 5.126 5.397 5.684 5.995 6.369 6.73 7.116 7.541 8.035 8.567 9.114 9.725 10.346 10.567 10.444 10.265 10.083 9.868 9.637 9.418 9.212 8.978 8.753 8.519 8.287 8.071 7.87 7.699 7.49 7.265 7.085 6.919 6.741 6.576 6.415 6.275 6.165 6.043 5.913 5.753 5.578 5.469 5.351 5.171 5.054 4.927 4.854 4.695 4.544 4.384 4.296 4.014 4.044 3.957 3.863 3.637 3.492 3.35 3.2 3.004 2.799 2.551 2.196 -4 ,13044 ,TETRA ,17698935,Sat Dec 4 16:52:41 CET,Sat Dec 4 18:52:45 CET,0.0 0.152 0.266 0.358 0.453 0.545 0.622 0.694 0.865 0.958 1.042 0.964 1.226 1.289 1.429 1.561 1.671 1.736 1.87 1.98 2.141 2.246 2.353 2.516 2.665 2.805 2.93 3.06 3.237 3.394 3.539 3.723 3.914 4.101 4.315 4.531 4.719 4.934 5.171 5.449 5.742 6.019 6.341 6.687 7.067 7.481 7.954 8.438 8.941 9.38 9.85 9.975 9.792 9.583 9.331 9.027 8.725 8.424 8.151 7.866 7.588 7.307 7.033 6.795 6.572 6.354 6.125 5.9 5.689 5.472 5.254 5.066 4.861 4.643 4.486 4.343 4.197 4.026 3.847 3.723 3.596 3.397 3.253 3.108 3.033 2.886 2.74 2.589 2.516 2.238 2.265 2.163 2.048 1.805 1.673 1.549 1.405 1.247 1.089 0.893 0.338 -5 ,20113 ,TETRA ,17698936,Sat Dec 4 16:52:41 CET,Sat Dec 4 18:46:45 CET,0.0 0.354 0.464 0.58 0.68 0.776 0.866 0.954 1.141 1.23 1.308 1.253 1.525 1.597 1.736 1.866 1.974 2.026 2.136 2.247 2.408 2.502 2.589 2.729 2.88 3.029 3.176 3.302 3.45 3.599 3.728 3.876 4.027 4.179 4.358 4.565 4.769 4.996 5.243 5.506 5.78 6.082 6.401 6.741 7.158 7.628 8.158 8.713 9.299 9.845 10.357 10.635 10.585 10.385 10.135 9.879 9.637 9.382 9.14 8.905 8.68 8.451 8.23 8.0 7.786 7.606 7.411 7.195 7.017 6.858 6.664 6.474 6.289 6.126 6.002 5.866 5.713 5.558 5.398 5.279 5.164 5.001 4.882 4.752 4.683 4.539 4.375 4.183 4.081 3.782 3.788 3.686 3.573 3.296 3.137 2.983 2.802 2.614 2.422 2.149 1.63 -6 ,25811 ,TETRA ,17698937,Sat Dec 4 16:52:41 CET,Sat Dec 4 18:39:54 CET,0.0 0.179 0.344 0.472 0.579 0.689 0.789 0.881 1.056 1.13 1.2 1.144 1.411 1.479 1.624 1.753 1.859 1.913 2.013 2.103 2.245 2.339 2.428 2.57 2.713 2.837 2.966 3.091 3.23 3.363 3.515 3.718 3.896 4.056 4.241 4.437 4.629 4.845 5.071 5.315 5.593 5.882 6.195 6.528 6.894 7.321 7.809 8.342 8.937 9.481 9.906 10.017 9.871 9.607 9.281 8.978 8.652 8.291 7.997 7.708 7.45 7.196 6.939 6.702 6.497 6.327 6.141 5.974 5.814 5.65 5.483 5.338 5.193 5.028 4.888 4.742 4.591 4.449 4.3 4.184 4.071 3.91 3.782 3.626 3.544 3.375 3.216 3.063 2.972 2.67 2.653 2.543 2.434 2.212 2.086 1.927 1.758 1.586 1.326 1.005 -0.051 -7 ,31053 ,TETRA ,17698938,Sat Dec 4 16:52:41 CET,Sat Dec 4 18:41:05 CET,0.0 0.258 0.366 0.494 0.627 0.721 0.798 0.878 1.04 1.12 1.186 1.129 1.405 1.48 1.612 1.727 1.834 1.888 2.002 2.123 2.288 2.377 2.467 2.6 2.717 2.841 2.968 3.085 3.248 3.428 3.6 3.796 3.992 4.182 4.389 4.609 4.823 5.075 5.34 5.586 5.833 6.129 6.49 6.827 7.209 7.645 8.123 8.639 9.204 9.751 10.19 10.366 10.329 10.177 9.959 9.695 9.379 9.039 8.737 8.449 8.22 7.981 7.735 7.486 7.27 7.088 6.858 6.63 6.428 6.232 6.038 5.873 5.691 5.506 5.38 5.245 5.11 4.974 4.81 4.687 4.559 4.371 4.239 4.114 4.05 3.904 3.734 3.567 3.488 3.199 3.204 3.114 3.022 2.821 2.709 2.562 2.381 2.195 1.996 1.771 1.011 -8 ,19793 ,TETRA ,17698939,Sat Dec 4 16:52:43 CET,Sat Dec 4 18:39:55 CET,0.0 0.204 0.338 0.463 0.543 0.617 0.717 0.813 0.955 1.03 1.109 1.041 1.309 1.389 1.533 1.665 1.8 1.853 1.941 2.037 2.191 2.289 2.384 2.52 2.633 2.746 2.86 2.967 3.127 3.305 3.482 3.703 3.898 4.065 4.277 4.513 4.723 4.949 5.207 5.469 5.743 6.056 6.396 6.755 7.208 7.706 8.252 8.82 9.433 10.076 10.598 10.713 10.647 10.529 10.351 10.158 9.95 9.698 9.454 9.189 8.97 8.795 8.622 8.443 8.266 8.077 7.873 7.672 7.48 7.298 7.119 6.965 6.81 6.647 6.51 6.366 6.22 6.07 5.915 5.809 5.701 5.531 5.419 5.308 5.248 5.126 4.993 4.855 4.784 4.507 4.519 4.404 4.286 4.073 3.931 3.768 3.622 3.46 3.268 2.979 2.327 -9 ,8246 ,TETRA ,17698940,Sat Dec 4 16:52:42 CET,Sat Dec 4 18:51:33 CET,0.0 0.197 0.332 0.449 0.558 0.671 0.774 0.867 1.037 1.112 1.188 1.143 1.416 1.475 1.582 1.697 1.81 1.862 1.965 2.07 2.226 2.326 2.432 2.579 2.706 2.835 2.977 3.131 3.307 3.454 3.597 3.756 3.905 4.064 4.247 4.447 4.64 4.865 5.12 5.384 5.64 5.916 6.243 6.583 6.962 7.367 7.858 8.441 9.022 9.591 10.156 10.302 10.18 9.956 9.643 9.324 8.98 8.649 8.348 8.046 7.775 7.486 7.227 6.982 6.715 6.476 6.219 5.978 5.764 5.536 5.332 5.18 5.019 4.85 4.707 4.547 4.363 4.169 3.991 3.874 3.751 3.553 3.411 3.267 3.184 3.012 2.845 2.66 2.565 2.286 2.294 2.19 2.079 1.811 1.667 1.528 1.378 1.206 0.998 0.68 -0.008 -10 ,6618 ,TETRA ,17698941,Sat Dec 4 16:52:42 CET,Sat Dec 4 18:51:31 CET,0.0 0.262 0.417 0.523 0.619 0.708 0.809 0.893 1.039 1.12 1.199 1.137 1.401 1.468 1.594 1.705 1.807 1.857 1.968 2.081 2.229 2.333 2.43 2.543 2.651 2.761 2.878 3.012 3.186 3.332 3.477 3.669 3.85 4.038 4.252 4.467 4.676 4.913 5.167 5.408 5.671 6.009 6.423 6.796 7.168 7.596 8.087 8.617 9.175 9.732 10.299 10.56 10.499 10.244 9.927 9.64 9.378 9.137 8.9 8.622 8.366 8.131 7.904 7.673 7.457 7.263 7.021 6.805 6.623 6.426 6.233 6.064 5.883 5.696 5.552 5.411 5.273 5.137 4.997 4.892 4.764 4.574 4.444 4.294 4.214 4.036 3.86 3.686 3.592 3.3 3.307 3.206 3.097 2.857 2.718 2.597 2.454 2.247 2.029 1.804 1.187 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5g.txt deleted file mode 100644 index 6f619e38..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,32674 ,TETRA ,17698942,Sat Dec 4 16:52:41 CET,Sat Dec 4 18:51:49 CET,0.0 0.118 0.27 0.388 0.501 0.621 0.726 0.814 0.954 1.027 1.106 1.071 1.312 1.378 1.491 1.589 1.684 1.735 1.84 1.936 2.06 2.142 2.228 2.351 2.455 2.547 2.639 2.734 2.877 3.011 3.107 3.212 3.326 3.441 3.555 3.658 3.759 3.856 3.929 4.003 4.067 4.122 4.196 4.247 4.254 4.281 4.29 4.161 3.88 3.363 2.339 1.016 -0.128 -1.153 -2.013 -2.716 -3.351 -3.942 -4.435 -4.92 -5.314 -5.672 -6.032 -6.369 -6.697 -6.969 -7.236 -7.482 -7.683 -7.904 -8.156 -8.354 -8.536 -8.726 -8.876 -9.035 -9.199 -9.364 -9.531 -9.645 -9.762 -9.937 -10.054 -10.18 -10.247 -10.375 -10.521 -10.679 -10.751 -11.009 -10.999 -11.085 -11.168 -11.33 -11.417 -11.525 -11.649 -11.779 -11.917 -12.099 -12.413 -2 ,23013 ,TETRA ,17698943,Sat Dec 4 16:53:42 CET,Sat Dec 4 18:51:00 CET,0.0 0.543 0.735 0.902 1.072 1.191 1.273 1.366 1.518 1.582 1.645 1.56 1.777 1.817 1.892 1.965 2.046 2.091 2.182 2.267 2.38 2.455 2.524 2.623 2.717 2.805 2.894 2.984 3.086 3.182 3.277 3.39 3.485 3.57 3.676 3.79 3.89 3.978 4.078 4.174 4.251 4.353 4.481 4.58 4.641 4.66 4.637 4.516 4.211 3.653 2.597 1.223 0.027 -0.947 -1.757 -2.508 -3.145 -3.738 -4.24 -4.694 -5.084 -5.451 -5.819 -6.147 -6.455 -6.747 -7.033 -7.286 -7.51 -7.736 -7.96 -8.132 -8.309 -8.51 -8.668 -8.815 -8.975 -9.143 -9.31 -9.418 -9.528 -9.701 -9.821 -9.968 -10.04 -10.167 -10.308 -10.464 -10.54 -10.792 -10.739 -10.807 -10.876 -11.026 -11.1 -11.175 -11.271 -11.394 -11.52 -11.644 -11.825 -3 ,13623 ,TETRA ,17698944,Sat Dec 4 16:53:42 CET,Sat Dec 4 18:41:23 CET,0.0 0.126 0.251 0.38 0.526 0.643 0.736 0.817 0.966 1.034 1.092 1.024 1.254 1.306 1.393 1.469 1.538 1.569 1.645 1.718 1.809 1.862 1.904 1.975 2.06 2.145 2.224 2.298 2.398 2.506 2.61 2.713 2.81 2.908 3.015 3.122 3.233 3.349 3.452 3.542 3.624 3.699 3.771 3.833 3.861 3.841 3.746 3.58 3.254 2.7 1.684 0.282 -0.885 -1.855 -2.713 -3.497 -4.16 -4.752 -5.28 -5.763 -6.156 -6.517 -6.863 -7.188 -7.494 -7.766 -8.045 -8.292 -8.496 -8.701 -8.916 -9.096 -9.284 -9.481 -9.635 -9.802 -9.971 -10.135 -10.296 -10.408 -10.525 -10.709 -10.835 -10.949 -11.008 -11.13 -11.268 -11.429 -11.508 -11.775 -11.751 -11.845 -11.941 -12.127 -12.222 -12.31 -12.428 -12.56 -12.683 -12.803 -12.914 -4 ,8709 ,TETRA ,17698945,Sat Dec 4 16:55:41 CET,Sat Dec 4 18:47:57 CET,0.0 0.298 0.404 0.507 0.607 0.697 0.786 0.868 1.003 1.064 1.127 1.065 1.297 1.357 1.463 1.548 1.636 1.68 1.773 1.856 1.977 2.062 2.148 2.281 2.406 2.505 2.588 2.67 2.768 2.847 2.907 3.001 3.103 3.169 3.236 3.333 3.441 3.567 3.681 3.77 3.852 3.934 4.027 4.121 4.182 4.152 4.064 3.896 3.576 3.018 1.925 0.476 -0.74 -1.792 -2.682 -3.427 -4.036 -4.597 -5.09 -5.561 -5.979 -6.34 -6.671 -6.991 -7.318 -7.598 -7.842 -8.067 -8.266 -8.464 -8.666 -8.851 -9.039 -9.216 -9.353 -9.49 -9.63 -9.798 -9.98 -10.091 -10.193 -10.346 -10.451 -10.557 -10.606 -10.712 -10.859 -11.006 -11.063 -11.311 -11.272 -11.35 -11.43 -11.604 -11.697 -11.801 -11.898 -11.993 -12.103 -12.21 -12.328 -5 ,3092 ,TETRA ,17698946,Sat Dec 4 16:54:42 CET,Sat Dec 4 18:51:56 CET,0.0 0.448 0.563 0.684 0.802 0.9 1.003 1.113 1.294 1.38 1.457 1.404 1.634 1.69 1.802 1.911 2.011 2.06 2.151 2.247 2.396 2.481 2.561 2.662 2.743 2.819 2.899 2.975 3.09 3.209 3.313 3.431 3.534 3.622 3.713 3.817 3.929 4.04 4.13 4.209 4.284 4.364 4.437 4.473 4.534 4.595 4.585 4.473 4.206 3.674 2.597 1.18 -0.044 -1.112 -1.977 -2.745 -3.421 -3.976 -4.44 -4.909 -5.303 -5.647 -5.971 -6.265 -6.552 -6.848 -7.152 -7.389 -7.573 -7.773 -7.988 -8.157 -8.335 -8.526 -8.665 -8.808 -8.967 -9.14 -9.316 -9.428 -9.538 -9.718 -9.836 -9.941 -9.999 -10.131 -10.268 -10.4 -10.465 -10.716 -10.658 -10.733 -10.82 -11.031 -11.132 -11.222 -11.314 -11.41 -11.51 -11.642 -11.901 -6 ,15460 ,TETRA ,17698947,Sat Dec 4 16:54:45 CET,Sat Dec 4 18:48:35 CET,0.0 0.241 0.359 0.472 0.563 0.635 0.712 0.8 0.955 1.023 1.092 1.053 1.294 1.355 1.474 1.57 1.639 1.672 1.73 1.798 1.907 1.97 2.024 2.089 2.145 2.217 2.304 2.382 2.488 2.602 2.71 2.857 2.983 3.09 3.204 3.299 3.384 3.486 3.583 3.674 3.766 3.851 3.915 3.951 3.971 3.997 4.014 3.871 3.521 2.945 1.881 0.543 -0.611 -1.591 -2.397 -3.096 -3.709 -4.261 -4.759 -5.268 -5.667 -6.006 -6.337 -6.671 -6.981 -7.258 -7.541 -7.782 -7.984 -8.178 -8.379 -8.556 -8.746 -8.933 -9.066 -9.202 -9.347 -9.493 -9.638 -9.74 -9.852 -10.042 -10.191 -10.332 -10.396 -10.532 -10.686 -10.844 -10.919 -11.173 -11.123 -11.203 -11.299 -11.516 -11.614 -11.715 -11.821 -11.929 -12.045 -12.162 -12.295 -7 ,27702 ,TETRA ,17698948,Sat Dec 4 16:55:41 CET,Sat Dec 4 18:47:13 CET,0.0 0.331 0.501 0.657 0.835 0.977 1.077 1.159 1.301 1.377 1.449 1.409 1.643 1.696 1.804 1.901 1.987 2.028 2.104 2.182 2.308 2.386 2.456 2.57 2.685 2.79 2.893 2.984 3.091 3.182 3.267 3.375 3.492 3.6 3.697 3.793 3.873 3.972 4.096 4.2 4.261 4.33 4.42 4.485 4.529 4.51 4.435 4.281 4.005 3.519 2.482 1.113 -0.071 -1.163 -2.142 -2.953 -3.616 -4.192 -4.659 -5.1 -5.478 -5.828 -6.146 -6.468 -6.786 -7.064 -7.344 -7.58 -7.778 -7.966 -8.167 -8.359 -8.549 -8.728 -8.872 -9.025 -9.179 -9.337 -9.508 -9.624 -9.738 -9.926 -10.054 -10.18 -10.248 -10.387 -10.544 -10.723 -10.809 -11.071 -11.051 -11.147 -11.238 -11.422 -11.529 -11.655 -11.795 -11.928 -12.049 -12.165 -12.407 -8 ,14480 ,TETRA ,17698949,Sat Dec 4 16:55:41 CET,Sat Dec 4 18:43:12 CET,0.0 0.343 0.486 0.654 0.8 0.89 0.963 1.051 1.246 1.331 1.405 1.361 1.587 1.637 1.721 1.815 1.912 1.958 2.051 2.134 2.252 2.331 2.417 2.548 2.665 2.769 2.866 2.961 3.057 3.134 3.221 3.326 3.425 3.52 3.608 3.694 3.782 3.861 3.958 4.053 4.159 4.261 4.328 4.384 4.408 4.444 4.423 4.301 4.029 3.468 2.42 1.087 -0.036 -1.0 -1.854 -2.641 -3.305 -3.902 -4.401 -4.846 -5.237 -5.633 -6.022 -6.374 -6.69 -6.964 -7.228 -7.472 -7.699 -7.928 -8.151 -8.313 -8.483 -8.667 -8.798 -8.937 -9.095 -9.244 -9.382 -9.483 -9.594 -9.768 -9.886 -10.016 -10.087 -10.236 -10.383 -10.525 -10.609 -10.877 -10.841 -10.916 -10.994 -11.153 -11.234 -11.332 -11.44 -11.567 -11.699 -11.843 -12.228 -9 ,31337 ,TETRA ,17698950,Sat Dec 4 16:56:47 CET,Sat Dec 4 18:54:05 CET,0.0 0.264 0.388 0.515 0.605 0.68 0.767 0.852 1.002 1.074 1.132 1.058 1.278 1.325 1.422 1.517 1.622 1.676 1.76 1.837 1.952 2.03 2.105 2.199 2.289 2.384 2.473 2.556 2.663 2.753 2.836 2.948 3.05 3.143 3.245 3.338 3.448 3.585 3.708 3.833 3.938 4.033 4.121 4.178 4.194 4.19 4.187 4.098 3.864 3.339 2.4 1.14 -0.004 -0.962 -1.825 -2.599 -3.22 -3.768 -4.263 -4.764 -5.191 -5.536 -5.862 -6.169 -6.437 -6.682 -6.954 -7.192 -7.402 -7.644 -7.879 -8.056 -8.235 -8.422 -8.585 -8.767 -8.935 -9.091 -9.269 -9.39 -9.511 -9.694 -9.809 -9.927 -9.991 -10.129 -10.275 -10.42 -10.482 -10.729 -10.689 -10.769 -10.858 -11.034 -11.131 -11.25 -11.363 -11.464 -11.571 -11.709 -11.969 -10 ,18123 ,TETRA ,17698951,Sat Dec 4 16:57:42 CET,Sat Dec 4 18:58:37 CET,0.0 0.365 0.539 0.671 0.803 0.92 1.024 1.12 1.28 1.341 1.401 1.339 1.58 1.65 1.765 1.86 1.95 1.994 2.075 2.152 2.273 2.359 2.439 2.532 2.613 2.689 2.748 2.809 2.916 3.019 3.117 3.238 3.341 3.418 3.5 3.6 3.678 3.767 3.873 3.98 4.102 4.214 4.294 4.34 4.356 4.358 4.303 4.138 3.856 3.343 2.315 1.027 -0.08 -1.047 -1.908 -2.668 -3.323 -3.909 -4.402 -4.9 -5.364 -5.779 -6.13 -6.449 -6.735 -6.993 -7.265 -7.502 -7.707 -7.935 -8.182 -8.385 -8.59 -8.782 -8.921 -9.064 -9.206 -9.364 -9.534 -9.655 -9.793 -9.985 -10.11 -10.234 -10.298 -10.434 -10.565 -10.693 -10.76 -11.019 -10.993 -11.082 -11.178 -11.373 -11.475 -11.6 -11.727 -11.855 -12.029 -12.234 -12.538 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5i.txt deleted file mode 100644 index cf8469c9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5f_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31198 ,TETRA ,17698952,Sat Dec 4 16:57:44 CET,Sat Dec 4 19:00:09 CET,0.0 0.506 0.72 0.887 1.025 1.128 1.232 1.328 1.458 1.523 1.596 1.556 1.781 1.834 1.936 2.051 2.154 2.193 2.265 2.336 2.429 2.48 2.54 2.629 2.701 2.801 2.903 2.984 3.086 3.174 3.247 3.319 3.385 3.456 3.539 3.647 3.739 3.82 3.91 4.009 4.07 4.069 4.083 4.068 3.997 3.915 3.781 3.545 3.099 2.328 0.945 -0.801 -2.237 -3.413 -4.383 -5.255 -6.031 -6.764 -7.386 -7.949 -8.416 -8.812 -9.188 -9.551 -9.898 -10.205 -10.521 -10.832 -11.097 -11.333 -11.564 -11.754 -11.96 -12.182 -12.349 -12.525 -12.703 -12.876 -13.065 -13.201 -13.331 -13.522 -13.654 -13.784 -13.851 -14.003 -14.159 -14.32 -14.4 -14.674 -14.631 -14.707 -14.802 -15.004 -15.101 -15.209 -15.326 -15.433 -15.533 -15.644 -15.805 -2 ,12947 ,TETRA ,17698953,Sat Dec 4 16:58:42 CET,Sat Dec 4 18:58:35 CET,0.0 0.657 0.85 0.984 1.103 1.21 1.282 1.338 1.45 1.507 1.563 1.493 1.717 1.767 1.865 1.951 2.04 2.087 2.167 2.24 2.335 2.39 2.453 2.555 2.647 2.737 2.828 2.927 3.059 3.17 3.268 3.385 3.509 3.613 3.724 3.855 3.948 4.041 4.128 4.196 4.265 4.325 4.355 4.342 4.314 4.231 4.024 3.712 3.224 2.47 1.114 -0.629 -2.068 -3.263 -4.243 -5.107 -5.878 -6.548 -7.1 -7.682 -8.175 -8.584 -8.957 -9.306 -9.627 -9.909 -10.216 -10.486 -10.709 -10.937 -11.173 -11.37 -11.569 -11.768 -11.931 -12.111 -12.282 -12.444 -12.618 -12.736 -12.862 -13.057 -13.178 -13.296 -13.358 -13.487 -13.626 -13.773 -13.843 -14.11 -14.091 -14.18 -14.27 -14.467 -14.58 -14.712 -14.864 -15.013 -15.169 -15.34 -15.508 -3 ,1648 ,TETRA ,17698954,Sat Dec 4 16:58:42 CET,Sat Dec 4 18:54:42 CET,0.0 0.391 0.637 0.812 0.939 1.071 1.196 1.3 1.438 1.497 1.56 1.493 1.716 1.77 1.896 2.016 2.113 2.156 2.238 2.316 2.405 2.461 2.518 2.59 2.671 2.744 2.817 2.901 2.995 3.07 3.153 3.235 3.283 3.354 3.447 3.522 3.586 3.654 3.726 3.782 3.815 3.832 3.792 3.74 3.672 3.566 3.414 3.192 2.746 1.855 0.318 -1.45 -2.877 -4.12 -5.173 -6.105 -6.876 -7.527 -8.164 -8.802 -9.279 -9.686 -10.066 -10.413 -10.736 -11.028 -11.347 -11.645 -11.886 -12.134 -12.411 -12.631 -12.838 -13.043 -13.209 -13.385 -13.551 -13.732 -13.919 -14.036 -14.156 -14.349 -14.481 -14.614 -14.685 -14.82 -14.96 -15.105 -15.184 -15.471 -15.448 -15.519 -15.598 -15.807 -15.923 -16.022 -16.127 -16.264 -16.419 -16.563 -16.898 -4 ,26623 ,TETRA ,17698955,Sat Dec 4 16:58:42 CET,Sat Dec 4 18:58:36 CET,0.0 0.329 0.537 0.683 0.81 0.911 1.015 1.125 1.324 1.394 1.449 1.389 1.625 1.689 1.804 1.903 1.995 2.045 2.134 2.209 2.319 2.385 2.459 2.578 2.677 2.761 2.842 2.917 3.017 3.119 3.207 3.314 3.436 3.547 3.655 3.75 3.831 3.94 4.017 4.053 4.112 4.178 4.201 4.198 4.15 4.014 3.815 3.509 3.015 2.264 0.947 -0.783 -2.209 -3.389 -4.374 -5.235 -5.991 -6.665 -7.227 -7.753 -8.237 -8.674 -9.053 -9.397 -9.742 -10.042 -10.312 -10.554 -10.779 -11.013 -11.239 -11.423 -11.612 -11.799 -11.953 -12.117 -12.298 -12.489 -12.665 -12.793 -12.935 -13.127 -13.247 -13.363 -13.418 -13.542 -13.672 -13.805 -13.881 -14.15 -14.121 -14.203 -14.28 -14.452 -14.553 -14.665 -14.801 -14.948 -15.097 -15.289 -15.516 -5 ,6537 ,TETRA ,17698956,Sat Dec 4 16:59:38 CET,Sat Dec 4 19:00:20 CET,0.0 0.262 0.474 0.66 0.791 0.889 0.989 1.075 1.228 1.302 1.368 1.314 1.549 1.606 1.718 1.82 1.905 1.938 1.995 2.076 2.227 2.313 2.38 2.468 2.549 2.634 2.73 2.82 2.909 3.002 3.097 3.195 3.282 3.35 3.429 3.523 3.605 3.694 3.783 3.843 3.889 3.941 3.973 3.97 3.905 3.788 3.64 3.376 2.843 1.964 0.514 -1.268 -2.71 -3.949 -4.986 -5.866 -6.638 -7.311 -7.873 -8.403 -8.887 -9.321 -9.687 -10.051 -10.382 -10.658 -10.985 -11.277 -11.508 -11.759 -12.021 -12.219 -12.416 -12.625 -12.797 -12.986 -13.167 -13.345 -13.532 -13.645 -13.759 -13.959 -14.088 -14.207 -14.275 -14.437 -14.59 -14.729 -14.805 -15.078 -15.048 -15.129 -15.225 -15.445 -15.546 -15.652 -15.767 -15.884 -16.034 -16.196 -16.617 -6 ,8977 ,TETRA ,17698957,Sat Dec 4 16:59:40 CET,Sat Dec 4 19:00:12 CET,0.0 0.293 0.457 0.621 0.741 0.833 0.915 1.0 1.147 1.216 1.282 1.231 1.469 1.534 1.657 1.761 1.857 1.914 2.026 2.104 2.219 2.301 2.369 2.455 2.532 2.608 2.677 2.748 2.842 2.937 3.052 3.171 3.247 3.318 3.401 3.492 3.591 3.701 3.797 3.867 3.945 4.017 4.076 4.132 4.164 4.155 4.023 3.737 3.312 2.56 1.115 -0.708 -2.184 -3.399 -4.441 -5.349 -6.13 -6.809 -7.42 -8.005 -8.449 -8.844 -9.224 -9.575 -9.89 -10.173 -10.459 -10.712 -10.931 -11.161 -11.411 -11.621 -11.834 -12.047 -12.218 -12.396 -12.568 -12.753 -12.943 -13.061 -13.19 -13.4 -13.535 -13.677 -13.756 -13.903 -14.039 -14.19 -14.264 -14.52 -14.462 -14.54 -14.621 -14.804 -14.899 -14.993 -15.088 -15.198 -15.335 -15.455 -15.607 -7 ,29145 ,TETRA ,17698958,Sat Dec 4 16:59:41 CET,Sat Dec 4 19:00:53 CET,0.0 0.408 0.558 0.692 0.813 0.912 0.996 1.069 1.216 1.285 1.354 1.322 1.564 1.617 1.718 1.83 1.935 1.987 2.076 2.154 2.285 2.374 2.454 2.564 2.66 2.744 2.833 2.922 3.029 3.133 3.224 3.311 3.392 3.492 3.597 3.695 3.818 3.95 4.036 4.094 4.159 4.217 4.247 4.248 4.207 4.109 3.933 3.66 3.238 2.471 1.043 -0.711 -2.178 -3.36 -4.336 -5.218 -5.946 -6.578 -7.123 -7.646 -8.079 -8.48 -8.867 -9.228 -9.585 -9.919 -10.273 -10.598 -10.86 -11.107 -11.372 -11.605 -11.842 -12.065 -12.243 -12.421 -12.587 -12.765 -12.934 -13.055 -13.179 -13.352 -13.487 -13.642 -13.712 -13.838 -13.986 -14.139 -14.215 -14.481 -14.45 -14.535 -14.615 -14.766 -14.861 -14.968 -15.064 -15.171 -15.316 -15.509 -15.771 -8 ,26074 ,TETRA ,17698959,Sat Dec 4 16:59:44 CET,Sat Dec 4 19:00:28 CET,0.0 0.506 0.661 0.756 0.861 0.934 1.005 1.093 1.237 1.308 1.385 1.371 1.619 1.685 1.815 1.932 2.038 2.089 2.193 2.291 2.397 2.467 2.544 2.645 2.753 2.855 2.929 2.979 3.054 3.143 3.238 3.343 3.423 3.498 3.583 3.671 3.733 3.781 3.835 3.878 3.922 3.972 3.998 3.977 3.923 3.844 3.675 3.395 2.986 2.27 0.895 -0.763 -2.113 -3.289 -4.423 -5.417 -6.216 -6.929 -7.516 -8.109 -8.622 -9.038 -9.405 -9.757 -10.082 -10.383 -10.704 -10.998 -11.234 -11.473 -11.722 -11.911 -12.109 -12.314 -12.474 -12.635 -12.796 -12.96 -13.134 -13.262 -13.403 -13.603 -13.722 -13.854 -13.928 -14.066 -14.219 -14.378 -14.444 -14.703 -14.675 -14.756 -14.838 -15.039 -15.159 -15.289 -15.41 -15.523 -15.635 -15.739 -15.881 -9 ,6751 ,TETRA ,17698960,Sat Dec 4 16:59:39 CET,Sat Dec 4 19:00:01 CET,0.0 0.524 0.778 0.914 1.013 1.105 1.186 1.268 1.429 1.508 1.578 1.515 1.75 1.809 1.897 1.988 2.077 2.123 2.213 2.29 2.387 2.457 2.517 2.591 2.673 2.748 2.82 2.902 3.008 3.101 3.191 3.277 3.356 3.424 3.484 3.564 3.635 3.705 3.792 3.887 3.958 3.999 4.0 3.97 3.913 3.816 3.66 3.38 2.901 2.092 0.663 -1.135 -2.657 -3.908 -4.913 -5.786 -6.554 -7.243 -7.799 -8.337 -8.809 -9.222 -9.607 -9.958 -10.266 -10.566 -10.908 -11.192 -11.431 -11.702 -11.976 -12.187 -12.398 -12.61 -12.784 -12.966 -13.138 -13.305 -13.473 -13.587 -13.706 -13.887 -14.0 -14.127 -14.201 -14.343 -14.478 -14.635 -14.726 -15.009 -14.993 -15.083 -15.186 -15.388 -15.477 -15.563 -15.663 -15.776 -15.921 -16.094 -16.362 -10 ,2251 ,TETRA ,17698961,Sat Dec 4 16:59:43 CET,Sat Dec 4 19:00:13 CET,0.0 0.269 0.474 0.624 0.757 0.892 0.993 1.074 1.227 1.301 1.383 1.356 1.593 1.651 1.755 1.851 1.936 1.98 2.065 2.137 2.25 2.324 2.398 2.497 2.583 2.67 2.761 2.845 2.945 3.04 3.132 3.25 3.357 3.454 3.553 3.66 3.766 3.885 3.994 4.079 4.154 4.211 4.239 4.238 4.203 4.122 3.979 3.712 3.244 2.463 1.01 -0.739 -2.153 -3.342 -4.343 -5.223 -5.968 -6.635 -7.203 -7.756 -8.273 -8.745 -9.142 -9.49 -9.82 -10.128 -10.445 -10.729 -10.968 -11.224 -11.5 -11.721 -11.955 -12.173 -12.33 -12.508 -12.685 -12.849 -13.005 -13.113 -13.233 -13.422 -13.556 -13.697 -13.762 -13.881 -14.035 -14.215 -14.302 -14.586 -14.569 -14.656 -14.752 -14.957 -15.064 -15.153 -15.247 -15.359 -15.476 -15.629 -15.817 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5g_5c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5g_5c.txt deleted file mode 100644 index e780179c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5g_5c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12680 ,TETRA ,17698962,Sat Dec 4 16:59:42 CET,Sat Dec 4 18:59:47 CET,0.0 0.378 0.624 0.839 0.995 1.133 1.256 1.361 1.551 1.636 1.729 1.716 1.969 2.032 2.162 2.295 2.42 2.474 2.566 2.661 2.807 2.885 2.96 3.082 3.195 3.305 3.398 3.463 3.555 3.637 3.699 3.806 3.933 4.035 4.125 4.211 4.308 4.42 4.524 4.622 4.671 4.711 4.802 4.858 4.807 4.678 4.46 4.096 3.492 2.481 0.795 -1.257 -2.963 -4.347 -5.483 -6.537 -7.455 -8.193 -8.817 -9.453 -9.972 -10.41 -10.832 -11.236 -11.616 -11.944 -12.272 -12.565 -12.822 -13.088 -13.344 -13.567 -13.808 -14.048 -14.236 -14.428 -14.637 -14.857 -15.069 -15.217 -15.367 -15.617 -15.81 -16.002 -16.096 -16.271 -16.452 -16.63 -16.72 -17.022 -17.015 -17.116 -17.227 -17.493 -17.63 -17.765 -17.893 -18.031 -18.192 -18.368 -18.807 -2 ,13773 ,TETRA ,17698963,Sat Dec 4 16:59:42 CET,Sat Dec 4 18:59:22 CET,0.0 0.281 0.511 0.69 0.831 0.949 1.046 1.119 1.229 1.296 1.371 1.325 1.56 1.608 1.698 1.772 1.85 1.898 2.008 2.1 2.206 2.269 2.327 2.41 2.495 2.568 2.64 2.719 2.809 2.886 2.95 3.043 3.138 3.192 3.266 3.388 3.478 3.539 3.584 3.605 3.601 3.58 3.532 3.512 3.478 3.33 3.085 2.719 2.128 1.117 -0.658 -2.75 -4.489 -5.934 -7.076 -8.067 -8.925 -9.689 -10.39 -11.073 -11.652 -12.205 -12.687 -13.093 -13.47 -13.811 -14.148 -14.47 -14.777 -15.08 -15.383 -15.628 -15.86 -16.103 -16.313 -16.53 -16.74 -16.949 -17.148 -17.275 -17.404 -17.602 -17.758 -17.947 -18.046 -18.224 -18.403 -18.603 -18.707 -19.006 -18.985 -19.104 -19.242 -19.511 -19.647 -19.777 -19.916 -20.069 -20.205 -20.359 -20.835 -3 ,24181 ,TETRA ,17698964,Sat Dec 4 16:59:42 CET,Sat Dec 4 18:59:38 CET,0.0 0.373 0.551 0.707 0.841 0.951 1.069 1.188 1.388 1.474 1.554 1.516 1.779 1.856 2.007 2.15 2.279 2.334 2.44 2.536 2.668 2.767 2.865 2.997 3.115 3.209 3.282 3.362 3.466 3.544 3.609 3.689 3.786 3.866 3.922 3.989 4.068 4.136 4.201 4.242 4.236 4.262 4.301 4.281 4.189 4.023 3.773 3.448 2.898 1.873 0.107 -1.955 -3.609 -4.981 -6.133 -7.133 -8.005 -8.778 -9.419 -10.043 -10.59 -11.064 -11.494 -11.923 -12.331 -12.675 -13.006 -13.297 -13.556 -13.818 -14.076 -14.286 -14.5 -14.748 -14.949 -15.143 -15.325 -15.509 -15.717 -15.854 -15.994 -16.226 -16.377 -16.52 -16.591 -16.757 -16.949 -17.131 -17.22 -17.53 -17.535 -17.625 -17.729 -17.994 -18.134 -18.253 -18.372 -18.527 -18.7 -18.891 -19.43 -4 ,10529 ,TETRA ,17698965,Sat Dec 4 16:59:42 CET,Sat Dec 4 18:59:07 CET,0.0 0.459 0.624 0.725 0.833 0.94 1.026 1.103 1.252 1.339 1.423 1.381 1.626 1.679 1.766 1.858 1.953 1.998 2.089 2.178 2.301 2.384 2.447 2.519 2.596 2.673 2.754 2.835 2.925 2.99 3.049 3.121 3.204 3.295 3.35 3.387 3.45 3.516 3.559 3.593 3.612 3.605 3.566 3.513 3.437 3.291 3.015 2.61 1.984 0.925 -0.901 -3.073 -4.848 -6.293 -7.475 -8.478 -9.332 -10.134 -10.819 -11.474 -12.043 -12.547 -13.022 -13.484 -13.888 -14.223 -14.567 -14.883 -15.163 -15.473 -15.778 -16.019 -16.277 -16.533 -16.724 -16.926 -17.127 -17.311 -17.519 -17.669 -17.82 -18.048 -18.203 -18.369 -18.453 -18.625 -18.8 -18.997 -19.097 -19.384 -19.359 -19.458 -19.56 -19.803 -19.927 -20.049 -20.198 -20.378 -20.605 -20.895 -21.356 -5 ,2191 ,TETRA ,17698966,Sat Dec 4 16:59:43 CET,Sat Dec 4 18:59:25 CET,0.0 0.145 0.274 0.374 0.443 0.513 0.577 0.656 0.838 0.906 0.967 0.897 1.152 1.226 1.358 1.48 1.588 1.633 1.713 1.785 1.883 1.955 2.032 2.144 2.239 2.313 2.375 2.437 2.529 2.613 2.687 2.801 2.904 2.982 3.1 3.231 3.316 3.397 3.475 3.529 3.603 3.709 3.776 3.765 3.7 3.592 3.377 3.03 2.439 1.387 -0.338 -2.362 -4.036 -5.434 -6.588 -7.578 -8.478 -9.307 -9.985 -10.634 -11.179 -11.636 -12.059 -12.449 -12.821 -13.173 -13.541 -13.857 -14.114 -14.378 -14.644 -14.868 -15.103 -15.33 -15.506 -15.693 -15.873 -16.054 -16.26 -16.405 -16.564 -16.814 -16.974 -17.138 -17.215 -17.385 -17.577 -17.782 -17.891 -18.204 -18.214 -18.327 -18.443 -18.66 -18.789 -18.97 -19.134 -19.269 -19.407 -19.574 -20.003 -6 ,29905 ,TETRA ,17698967,Sat Dec 4 16:59:45 CET,Sat Dec 4 18:58:47 CET,0.0 0.229 0.417 0.549 0.639 0.72 0.823 0.923 1.055 1.11 1.164 1.09 1.323 1.378 1.489 1.577 1.669 1.717 1.798 1.876 1.992 2.073 2.135 2.209 2.298 2.387 2.465 2.523 2.582 2.639 2.7 2.765 2.825 2.879 2.953 3.052 3.145 3.23 3.295 3.362 3.401 3.43 3.472 3.514 3.493 3.356 3.124 2.776 2.231 1.332 -0.26 -2.239 -3.843 -5.229 -6.43 -7.485 -8.367 -9.104 -9.731 -10.373 -10.935 -11.428 -11.865 -12.284 -12.673 -13.015 -13.373 -13.706 -14.004 -14.288 -14.578 -14.824 -15.054 -15.294 -15.494 -15.688 -15.867 -16.051 -16.256 -16.412 -16.572 -16.819 -16.989 -17.172 -17.264 -17.441 -17.634 -17.841 -17.951 -18.266 -18.276 -18.38 -18.497 -18.77 -18.916 -19.089 -19.244 -19.404 -19.579 -19.762 -20.102 -7 ,7203 ,TETRA ,17698968,Sat Dec 4 16:59:42 CET,Sat Dec 4 19:00:37 CET,0.0 0.283 0.439 0.595 0.732 0.865 0.978 1.069 1.22 1.292 1.368 1.316 1.563 1.633 1.76 1.869 1.966 2.027 2.171 2.295 2.457 2.555 2.633 2.727 2.836 2.951 3.062 3.172 3.292 3.406 3.523 3.642 3.74 3.833 3.943 4.069 4.194 4.305 4.395 4.467 4.518 4.55 4.532 4.503 4.445 4.28 4.031 3.666 3.077 2.107 0.398 -1.656 -3.323 -4.711 -5.912 -6.997 -7.897 -8.685 -9.352 -10.008 -10.566 -11.041 -11.474 -11.888 -12.294 -12.636 -12.978 -13.294 -13.565 -13.844 -14.116 -14.346 -14.614 -14.889 -15.106 -15.338 -15.561 -15.779 -15.995 -16.13 -16.274 -16.512 -16.662 -16.827 -16.92 -17.102 -17.297 -17.519 -17.63 -17.945 -17.982 -18.111 -18.248 -18.528 -18.653 -18.796 -18.976 -19.176 -19.443 -19.726 -20.073 -8 ,11714 ,TETRA ,17698969,Sat Dec 4 16:59:42 CET,Sat Dec 4 19:00:10 CET,0.0 0.381 0.61 0.785 0.941 1.07 1.171 1.267 1.438 1.515 1.588 1.546 1.803 1.861 1.944 2.034 2.14 2.189 2.268 2.339 2.444 2.523 2.604 2.724 2.829 2.92 3.024 3.127 3.23 3.325 3.407 3.509 3.614 3.69 3.791 3.91 3.986 4.035 4.112 4.203 4.316 4.413 4.412 4.396 4.376 4.32 4.195 3.924 3.39 2.475 0.794 -1.224 -2.851 -4.257 -5.45 -6.484 -7.402 -8.23 -8.891 -9.531 -10.084 -10.565 -11.012 -11.461 -11.86 -12.189 -12.537 -12.838 -13.083 -13.332 -13.593 -13.818 -14.066 -14.315 -14.498 -14.67 -14.852 -15.058 -15.286 -15.441 -15.588 -15.84 -16.007 -16.149 -16.22 -16.383 -16.576 -16.762 -16.863 -17.169 -17.14 -17.238 -17.354 -17.613 -17.738 -17.872 -18.023 -18.204 -18.429 -18.726 -19.103 -9 ,5794 ,TETRA ,17698970,Sat Dec 4 16:59:43 CET,Sat Dec 4 18:59:40 CET,0.0 0.584 0.769 0.931 1.06 1.188 1.298 1.396 1.565 1.654 1.731 1.668 1.92 1.988 2.107 2.212 2.311 2.357 2.459 2.561 2.69 2.771 2.844 2.938 3.022 3.094 3.158 3.221 3.316 3.421 3.531 3.647 3.745 3.849 3.957 4.077 4.172 4.258 4.363 4.444 4.496 4.528 4.525 4.501 4.456 4.333 4.142 3.81 3.216 2.231 0.489 -1.577 -3.269 -4.622 -5.74 -6.796 -7.754 -8.563 -9.255 -9.943 -10.482 -10.953 -11.42 -11.865 -12.274 -12.644 -13.008 -13.333 -13.608 -13.88 -14.166 -14.4 -14.644 -14.89 -15.083 -15.287 -15.5 -15.741 -15.979 -16.128 -16.289 -16.544 -16.723 -16.907 -16.997 -17.181 -17.363 -17.542 -17.636 -17.933 -17.922 -18.028 -18.134 -18.377 -18.525 -18.671 -18.818 -18.973 -19.135 -19.338 -19.753 -10 ,17213 ,TETRA ,17698971,Sat Dec 4 16:59:45 CET,Sat Dec 4 18:59:24 CET,0.0 0.404 0.587 0.723 0.837 0.923 1.0 1.079 1.23 1.296 1.36 1.305 1.554 1.613 1.718 1.813 1.911 1.962 2.06 2.149 2.267 2.342 2.412 2.507 2.586 2.672 2.771 2.854 2.941 3.035 3.138 3.256 3.357 3.448 3.539 3.614 3.663 3.732 3.822 3.91 3.961 4.004 4.066 4.065 3.996 3.835 3.564 3.213 2.664 1.741 0.158 -1.736 -3.386 -4.778 -5.901 -6.89 -7.727 -8.471 -9.13 -9.77 -10.291 -10.724 -11.15 -11.612 -12.028 -12.366 -12.709 -13.009 -13.275 -13.558 -13.831 -14.05 -14.283 -14.546 -14.754 -14.937 -15.122 -15.328 -15.529 -15.667 -15.824 -16.07 -16.245 -16.424 -16.509 -16.696 -16.893 -17.08 -17.18 -17.481 -17.472 -17.579 -17.694 -17.941 -18.054 -18.173 -18.326 -18.485 -18.67 -18.927 -19.489 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5f.txt deleted file mode 100644 index 997affee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21464 ,TETRA ,17698972,Sat Dec 4 16:59:42 CET,Sat Dec 4 19:00:20 CET,0.0 0.352 0.577 0.74 0.881 0.979 1.05 1.131 1.281 1.345 1.412 1.37 1.608 1.679 1.812 1.918 2.005 2.054 2.157 2.25 2.411 2.514 2.599 2.713 2.814 2.916 3.022 3.123 3.251 3.369 3.47 3.59 3.726 3.882 4.071 4.272 4.471 4.661 4.83 5.014 5.24 5.534 5.833 6.085 6.353 6.633 6.902 7.151 7.374 7.528 7.346 6.746 6.077 5.38 4.743 4.143 3.604 3.093 2.622 2.184 1.832 1.514 1.197 0.859 0.537 0.239 -0.082 -0.383 -0.648 -0.922 -1.204 -1.425 -1.655 -1.898 -2.088 -2.288 -2.495 -2.705 -2.923 -3.074 -3.223 -3.476 -3.648 -3.819 -3.91 -4.088 -4.284 -4.483 -4.586 -4.886 -4.993 -5.12 -5.258 -5.582 -5.744 -5.904 -6.07 -6.268 -6.522 -6.825 -7.432 -2 ,7529 ,TETRA ,17698973,Sat Dec 4 16:59:43 CET,Sat Dec 4 19:00:12 CET,0.0 0.43 0.579 0.691 0.802 0.914 1.016 1.114 1.277 1.341 1.407 1.377 1.612 1.669 1.777 1.862 1.955 2.015 2.133 2.243 2.38 2.451 2.519 2.624 2.734 2.848 2.973 3.09 3.223 3.349 3.47 3.635 3.79 3.924 4.105 4.295 4.451 4.611 4.77 4.943 5.156 5.443 5.755 5.996 6.202 6.399 6.621 6.827 7.061 7.165 6.825 6.086 5.295 4.514 3.781 3.139 2.622 2.125 1.648 1.168 0.776 0.425 0.064 -0.281 -0.596 -0.873 -1.166 -1.432 -1.662 -1.905 -2.158 -2.38 -2.615 -2.844 -3.012 -3.176 -3.35 -3.554 -3.757 -3.892 -4.031 -4.242 -4.402 -4.583 -4.67 -4.833 -5.017 -5.217 -5.32 -5.608 -5.699 -5.842 -6.0 -6.356 -6.533 -6.718 -6.936 -7.164 -7.434 -7.81 -8.651 -3 ,18543 ,TETRA ,17698974,Sat Dec 4 16:59:45 CET,Sat Dec 4 19:00:29 CET,0.0 0.262 0.436 0.554 0.637 0.735 0.83 0.915 1.08 1.163 1.24 1.193 1.424 1.481 1.594 1.705 1.806 1.859 1.972 2.079 2.213 2.295 2.378 2.499 2.617 2.724 2.824 2.915 3.024 3.144 3.269 3.421 3.569 3.706 3.866 4.047 4.228 4.428 4.626 4.81 4.992 5.203 5.464 5.706 5.968 6.265 6.593 6.875 7.038 7.1 6.954 6.373 5.728 5.121 4.459 3.843 3.329 2.844 2.42 1.944 1.521 1.182 0.867 0.565 0.298 0.056 -0.227 -0.495 -0.732 -1.001 -1.285 -1.513 -1.744 -1.975 -2.168 -2.37 -2.556 -2.74 -2.951 -3.087 -3.223 -3.454 -3.608 -3.758 -3.837 -4.006 -4.187 -4.383 -4.481 -4.77 -4.85 -4.97 -5.099 -5.391 -5.554 -5.729 -5.89 -6.064 -6.25 -6.486 -7.233 -4 ,22203 ,TETRA ,17698975,Sat Dec 4 16:59:46 CET,Sat Dec 4 18:59:54 CET,0.0 0.413 0.609 0.726 0.871 1.005 1.103 1.194 1.351 1.419 1.486 1.439 1.668 1.72 1.828 1.934 2.046 2.103 2.213 2.318 2.446 2.525 2.613 2.733 2.844 2.969 3.089 3.195 3.327 3.445 3.562 3.715 3.851 3.965 4.087 4.241 4.397 4.57 4.761 4.965 5.162 5.358 5.56 5.759 5.972 6.173 6.443 6.73 6.914 6.944 6.686 6.084 5.383 4.73 4.148 3.574 2.998 2.465 2.01 1.549 1.139 0.772 0.443 0.14 -0.137 -0.398 -0.672 -0.916 -1.153 -1.423 -1.697 -1.9 -2.104 -2.341 -2.538 -2.745 -2.95 -3.161 -3.377 -3.523 -3.677 -3.895 -4.032 -4.175 -4.249 -4.417 -4.61 -4.82 -4.927 -5.216 -5.312 -5.451 -5.58 -5.868 -6.036 -6.208 -6.392 -6.574 -6.805 -7.108 -8.058 -5 ,15884 ,TETRA ,17698976,Sat Dec 4 16:59:42 CET,Sat Dec 4 19:00:28 CET,0.0 0.146 0.286 0.422 0.521 0.602 0.679 0.746 0.883 0.948 1.014 0.986 1.22 1.273 1.395 1.511 1.603 1.646 1.737 1.834 1.982 2.082 2.181 2.328 2.466 2.6 2.731 2.857 3.007 3.133 3.247 3.393 3.528 3.639 3.769 3.931 4.09 4.247 4.414 4.594 4.785 4.972 5.165 5.38 5.641 5.899 6.138 6.376 6.591 6.703 6.539 5.931 5.238 4.638 4.065 3.458 2.929 2.459 2.055 1.655 1.282 0.945 0.642 0.353 0.039 -0.259 -0.553 -0.83 -1.086 -1.361 -1.642 -1.855 -2.068 -2.313 -2.505 -2.694 -2.904 -3.14 -3.388 -3.542 -3.699 -3.953 -4.131 -4.319 -4.408 -4.592 -4.799 -5.012 -5.112 -5.39 -5.484 -5.632 -5.782 -6.063 -6.209 -6.377 -6.581 -6.839 -7.11 -7.41 -7.935 -6 ,28220 ,TETRA ,17698977,Sat Dec 4 16:59:43 CET,Sat Dec 4 18:59:44 CET,0.0 0.18 0.301 0.42 0.522 0.598 0.668 0.742 0.911 0.986 1.047 0.993 1.227 1.292 1.426 1.541 1.646 1.701 1.804 1.898 2.046 2.146 2.23 2.339 2.444 2.551 2.651 2.744 2.874 3.0 3.13 3.306 3.459 3.588 3.739 3.924 4.124 4.315 4.491 4.684 4.864 5.031 5.22 5.436 5.714 5.998 6.323 6.685 6.938 7.034 6.852 6.321 5.657 4.998 4.376 3.781 3.19 2.621 2.152 1.679 1.277 0.888 0.508 0.171 -0.173 -0.496 -0.804 -1.085 -1.334 -1.568 -1.803 -2.007 -2.202 -2.399 -2.57 -2.76 -2.943 -3.118 -3.302 -3.433 -3.576 -3.826 -4.003 -4.17 -4.247 -4.405 -4.576 -4.738 -4.814 -5.078 -5.158 -5.293 -5.42 -5.716 -5.877 -6.051 -6.228 -6.413 -6.621 -6.92 -7.731 -7 ,9614 ,TETRA ,17698978,Sat Dec 4 16:59:45 CET,Sat Dec 4 19:00:03 CET,0.0 0.202 0.348 0.5 0.595 0.659 0.735 0.807 0.935 1.006 1.079 1.026 1.253 1.304 1.398 1.481 1.569 1.618 1.722 1.815 1.938 2.02 2.098 2.21 2.323 2.45 2.571 2.678 2.81 2.93 3.044 3.186 3.324 3.472 3.646 3.8 3.939 4.102 4.288 4.472 4.652 4.859 5.066 5.257 5.484 5.746 6.009 6.202 6.331 6.387 6.184 5.564 4.894 4.25 3.66 3.047 2.462 1.92 1.412 0.904 0.496 0.136 -0.198 -0.5 -0.81 -1.083 -1.351 -1.606 -1.845 -2.094 -2.357 -2.582 -2.82 -3.071 -3.256 -3.463 -3.685 -3.901 -4.104 -4.238 -4.382 -4.608 -4.783 -4.971 -5.063 -5.25 -5.436 -5.646 -5.758 -6.034 -6.11 -6.239 -6.367 -6.673 -6.834 -7.006 -7.169 -7.337 -7.591 -7.95 -8.703 -8 ,27165 ,TETRA ,17698979,Sat Dec 4 16:59:47 CET,Sat Dec 4 18:59:53 CET,0.0 0.238 0.384 0.511 0.634 0.748 0.852 0.942 1.097 1.167 1.248 1.228 1.458 1.514 1.627 1.75 1.86 1.914 2.023 2.114 2.252 2.341 2.429 2.55 2.669 2.793 2.903 3.004 3.126 3.241 3.356 3.483 3.619 3.756 3.888 4.042 4.177 4.305 4.461 4.665 4.901 5.138 5.373 5.596 5.833 6.055 6.259 6.467 6.642 6.674 6.561 6.04 5.328 4.669 4.056 3.408 2.85 2.322 1.788 1.288 0.875 0.491 0.137 -0.192 -0.514 -0.825 -1.144 -1.417 -1.656 -1.903 -2.172 -2.4 -2.641 -2.894 -3.089 -3.29 -3.497 -3.736 -3.99 -4.152 -4.318 -4.578 -4.755 -4.948 -5.052 -5.254 -5.456 -5.676 -5.793 -6.081 -6.155 -6.294 -6.441 -6.733 -6.88 -7.05 -7.25 -7.504 -7.76 -8.06 -8.782 -9 ,27582 ,TETRA ,17698980,Sat Dec 4 16:59:42 CET,Sat Dec 4 18:59:48 CET,0.0 0.156 0.268 0.384 0.484 0.577 0.657 0.746 0.917 0.983 1.042 0.983 1.208 1.267 1.38 1.482 1.586 1.638 1.729 1.815 1.957 2.044 2.123 2.241 2.356 2.468 2.584 2.697 2.828 2.962 3.103 3.263 3.412 3.556 3.732 3.924 4.086 4.274 4.48 4.702 4.921 5.122 5.353 5.559 5.77 5.985 6.162 6.374 6.619 6.735 6.552 5.946 5.259 4.568 3.932 3.341 2.798 2.283 1.84 1.405 0.997 0.62 0.281 -0.044 -0.348 -0.607 -0.898 -1.176 -1.405 -1.638 -1.884 -2.116 -2.373 -2.628 -2.813 -2.994 -3.186 -3.378 -3.589 -3.74 -3.9 -4.154 -4.321 -4.492 -4.585 -4.843 -5.162 -5.501 -5.671 -6.005 -6.158 -6.338 -6.532 -6.992 -7.258 -7.539 -7.845 -8.195 -8.606 -9.139 -10.735 -10 ,5657 ,TETRA ,17698981,Sat Dec 4 16:59:47 CET,Sat Dec 4 18:59:22 CET,0.0 0.176 0.315 0.415 0.5 0.566 0.642 0.733 0.888 0.952 1.017 0.966 1.192 1.253 1.379 1.488 1.591 1.64 1.736 1.823 1.961 2.062 2.151 2.266 2.357 2.45 2.556 2.663 2.803 2.935 3.065 3.223 3.375 3.519 3.664 3.813 3.961 4.103 4.273 4.484 4.715 4.987 5.277 5.53 5.8 6.111 6.416 6.644 6.866 6.956 6.684 6.078 5.436 4.785 4.141 3.565 3.043 2.501 2.017 1.567 1.187 0.843 0.498 0.167 -0.13 -0.406 -0.721 -1.012 -1.273 -1.528 -1.776 -2.01 -2.252 -2.496 -2.685 -2.87 -3.058 -3.259 -3.474 -3.62 -3.779 -4.026 -4.187 -4.346 -4.433 -4.629 -4.826 -5.019 -5.123 -5.418 -5.489 -5.607 -5.735 -6.032 -6.196 -6.359 -6.532 -6.737 -7.016 -7.332 -8.013 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5i.txt deleted file mode 100644 index c3b7e5d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5h_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10569 ,TETRA ,17698982,Sat Dec 4 16:59:43 CET,Sat Dec 4 19:01:54 CET,0.0 0.438 0.564 0.666 0.758 0.849 0.946 1.012 1.127 1.2 1.262 1.19 1.403 1.442 1.504 1.57 1.631 1.659 1.715 1.77 1.866 1.924 1.98 2.066 2.128 2.176 2.224 2.279 2.365 2.447 2.5 2.549 2.605 2.649 2.708 2.784 2.846 2.907 2.943 2.946 2.951 2.946 2.899 2.802 2.634 2.399 2.071 1.628 0.913 -0.22 -2.034 -4.236 -6.014 -7.444 -8.7 -9.835 -10.804 -11.675 -12.447 -13.237 -13.906 -14.445 -14.929 -15.396 -15.816 -16.207 -16.617 -16.991 -17.32 -17.644 -17.96 -18.222 -18.527 -18.858 -19.103 -19.34 -19.579 -19.849 -20.118 -20.289 -20.481 -20.771 -20.964 -21.171 -21.276 -21.482 -21.71 -21.961 -22.092 -22.416 -22.488 -22.619 -22.752 -23.068 -23.241 -23.406 -23.58 -23.784 -24.019 -24.317 -24.845 -2 ,13621 ,TETRA ,17698983,Sat Dec 4 16:59:44 CET,Sat Dec 4 19:01:43 CET,0.0 0.311 0.403 0.509 0.618 0.721 0.799 0.864 0.992 1.046 1.1 1.036 1.251 1.283 1.358 1.436 1.511 1.548 1.615 1.669 1.73 1.768 1.813 1.881 1.943 2.009 2.071 2.126 2.205 2.277 2.336 2.401 2.456 2.519 2.587 2.629 2.652 2.663 2.672 2.67 2.646 2.611 2.566 2.471 2.332 2.166 1.893 1.496 0.842 -0.27 -2.161 -4.408 -6.193 -7.755 -9.088 -10.289 -11.327 -12.227 -13.011 -13.766 -14.377 -14.923 -15.45 -15.96 -16.411 -16.786 -17.207 -17.603 -17.922 -18.251 -18.591 -18.853 -19.124 -19.418 -19.649 -19.888 -20.148 -20.398 -20.642 -20.824 -21.008 -21.294 -21.494 -21.689 -21.793 -22.002 -22.203 -22.43 -22.544 -22.847 -22.898 -23.027 -23.171 -23.507 -23.672 -23.838 -24.031 -24.246 -24.509 -24.83 -25.266 -3 ,19325 ,TETRA ,17698984,Sat Dec 4 16:59:43 CET,Sat Dec 4 18:56:58 CET,0.0 0.558 0.698 0.842 0.976 1.093 1.187 1.27 1.421 1.499 1.569 1.498 1.728 1.779 1.871 1.963 2.059 2.105 2.186 2.255 2.371 2.451 2.514 2.589 2.655 2.722 2.782 2.841 2.93 3.015 3.097 3.19 3.256 3.314 3.382 3.45 3.495 3.521 3.556 3.576 3.571 3.53 3.446 3.347 3.238 3.076 2.752 2.283 1.586 0.487 -1.352 -3.527 -5.305 -6.763 -8.016 -9.133 -10.088 -10.969 -11.708 -12.43 -13.047 -13.57 -14.049 -14.499 -14.932 -15.327 -15.713 -16.05 -16.355 -16.667 -16.973 -17.226 -17.493 -17.781 -18.015 -18.245 -18.481 -18.725 -18.986 -19.172 -19.357 -19.65 -19.854 -20.064 -20.172 -20.378 -20.583 -20.828 -20.961 -21.281 -21.364 -21.506 -21.66 -21.997 -22.161 -22.333 -22.534 -22.759 -23.017 -23.369 -24.428 -4 ,16410 ,TETRA ,17698985,Sat Dec 4 17:00:28 CET,Sat Dec 4 19:02:27 CET,0.0 0.393 0.544 0.647 0.734 0.85 0.944 1.002 1.108 1.156 1.204 1.114 1.324 1.366 1.472 1.569 1.634 1.668 1.746 1.804 1.871 1.922 1.979 2.049 2.102 2.148 2.193 2.255 2.34 2.405 2.456 2.505 2.561 2.613 2.674 2.744 2.796 2.846 2.879 2.904 2.897 2.858 2.797 2.707 2.589 2.401 2.095 1.706 1.175 0.197 -1.617 -3.814 -5.63 -7.218 -8.578 -9.704 -10.656 -11.505 -12.216 -12.909 -13.54 -14.12 -14.654 -15.141 -15.599 -16.028 -16.457 -16.827 -17.155 -17.491 -17.83 -18.115 -18.407 -18.71 -18.942 -19.174 -19.414 -19.667 -19.935 -20.112 -20.276 -20.522 -20.705 -20.914 -21.012 -21.206 -21.41 -21.622 -21.739 -22.056 -22.152 -22.302 -22.444 -22.762 -22.938 -23.122 -23.324 -23.558 -23.827 -24.13 -24.643 -5 ,16 ,TETRA ,17698986,Sat Dec 4 17:00:30 CET,Sat Dec 4 19:01:07 CET,0.0 0.36 0.512 0.657 0.759 0.823 0.871 0.92 1.051 1.115 1.169 1.107 1.334 1.38 1.467 1.549 1.613 1.644 1.697 1.74 1.814 1.87 1.919 1.976 2.021 2.069 2.128 2.199 2.281 2.344 2.41 2.484 2.531 2.55 2.595 2.68 2.729 2.753 2.78 2.808 2.806 2.756 2.664 2.54 2.389 2.187 1.864 1.422 0.83 -0.162 -2.021 -4.292 -6.133 -7.667 -8.936 -10.014 -10.951 -11.801 -12.575 -13.312 -13.895 -14.413 -14.936 -15.467 -15.946 -16.362 -16.775 -17.145 -17.468 -17.783 -18.124 -18.423 -18.726 -19.032 -19.265 -19.486 -19.707 -19.967 -20.244 -20.412 -20.58 -20.862 -21.054 -21.242 -21.337 -21.532 -21.748 -21.97 -22.083 -22.399 -22.488 -22.629 -22.766 -23.074 -23.23 -23.398 -23.594 -23.804 -24.026 -24.358 -25.415 -6 ,6746 ,TETRA ,17698987,Sat Dec 4 17:00:28 CET,Sat Dec 4 19:02:39 CET,0.0 0.148 0.279 0.418 0.553 0.658 0.729 0.794 0.926 0.988 1.059 1.019 1.24 1.289 1.387 1.463 1.521 1.551 1.607 1.668 1.768 1.835 1.885 1.945 2.015 2.082 2.149 2.199 2.251 2.303 2.357 2.423 2.477 2.514 2.543 2.586 2.623 2.634 2.64 2.664 2.665 2.629 2.586 2.523 2.426 2.269 2.037 1.645 0.938 -0.163 -1.97 -4.17 -5.995 -7.568 -8.897 -10.024 -10.982 -11.832 -12.534 -13.247 -13.884 -14.451 -14.982 -15.463 -15.906 -16.314 -16.749 -17.139 -17.474 -17.807 -18.149 -18.422 -18.692 -18.98 -19.198 -19.429 -19.674 -19.921 -20.19 -20.378 -20.563 -20.857 -21.064 -21.261 -21.362 -21.56 -21.762 -21.98 -22.089 -22.397 -22.447 -22.566 -22.709 -23.027 -23.184 -23.348 -23.52 -23.71 -23.946 -24.273 -25.217 -7 ,19891 ,TETRA ,17698988,Sat Dec 4 17:00:30 CET,Sat Dec 4 19:02:38 CET,0.0 0.481 0.598 0.723 0.818 0.894 0.966 1.027 1.175 1.246 1.295 1.201 1.419 1.459 1.521 1.585 1.642 1.672 1.731 1.789 1.871 1.917 1.968 2.056 2.144 2.229 2.301 2.351 2.414 2.488 2.553 2.631 2.69 2.734 2.8 2.869 2.898 2.931 2.974 2.993 3.007 3.021 3.008 2.959 2.839 2.657 2.407 1.962 1.287 0.326 -1.459 -3.723 -5.597 -7.191 -8.516 -9.688 -10.677 -11.585 -12.381 -13.124 -13.754 -14.303 -14.828 -15.327 -15.755 -16.145 -16.551 -16.894 -17.188 -17.503 -17.834 -18.098 -18.379 -18.679 -18.906 -19.14 -19.371 -19.613 -19.879 -20.069 -20.253 -20.513 -20.687 -20.865 -20.96 -21.175 -21.399 -21.635 -21.754 -22.063 -22.132 -22.269 -22.399 -22.656 -22.798 -22.946 -23.113 -23.335 -23.61 -23.96 -24.618 -8 ,9912 ,TETRA ,17698989,Sat Dec 4 17:00:32 CET,Sat Dec 4 19:04:27 CET,0.0 0.351 0.51 0.648 0.737 0.815 0.875 0.943 1.073 1.128 1.194 1.139 1.364 1.423 1.521 1.598 1.661 1.687 1.746 1.82 1.923 1.995 2.068 2.146 2.205 2.267 2.35 2.429 2.512 2.596 2.673 2.737 2.787 2.842 2.905 2.96 2.994 3.021 3.048 3.081 3.112 3.124 3.092 3.016 2.894 2.755 2.548 2.121 1.42 0.349 -1.439 -3.589 -5.454 -7.022 -8.344 -9.51 -10.503 -11.378 -12.097 -12.811 -13.427 -13.95 -14.435 -14.898 -15.31 -15.681 -16.078 -16.433 -16.742 -17.069 -17.419 -17.713 -18.026 -18.35 -18.594 -18.84 -19.071 -19.287 -19.521 -19.692 -19.861 -20.124 -20.314 -20.512 -20.616 -20.841 -21.077 -21.305 -21.424 -21.741 -21.81 -21.948 -22.102 -22.436 -22.605 -22.769 -22.954 -23.175 -23.484 -23.904 -25.099 -9 ,15778 ,TETRA ,17698990,Sat Dec 4 17:00:34 CET,Sat Dec 4 19:03:41 CET,0.0 0.21 0.323 0.431 0.528 0.614 0.686 0.745 0.86 0.915 0.974 0.911 1.128 1.173 1.272 1.356 1.418 1.451 1.518 1.577 1.662 1.726 1.785 1.85 1.936 2.035 2.108 2.169 2.257 2.338 2.397 2.459 2.512 2.552 2.593 2.638 2.692 2.756 2.81 2.839 2.856 2.839 2.766 2.689 2.608 2.486 2.255 1.85 1.152 0.037 -1.878 -4.142 -5.975 -7.55 -8.862 -9.996 -10.955 -11.795 -12.529 -13.266 -13.893 -14.458 -15.001 -15.5 -15.96 -16.373 -16.778 -17.135 -17.454 -17.775 -18.105 -18.376 -18.644 -18.931 -19.165 -19.408 -19.66 -19.909 -20.141 -20.306 -20.482 -20.761 -20.949 -21.139 -21.24 -21.444 -21.663 -21.888 -22.0 -22.315 -22.37 -22.499 -22.636 -22.928 -23.08 -23.249 -23.427 -23.602 -23.795 -24.072 -25.247 -10 ,13072 ,TETRA ,17698991,Sat Dec 4 17:00:29 CET,Sat Dec 4 19:03:04 CET,0.0 0.536 0.67 0.771 0.854 0.938 1.012 1.075 1.177 1.231 1.291 1.213 1.424 1.457 1.52 1.593 1.679 1.724 1.801 1.865 1.961 2.017 2.067 2.138 2.193 2.245 2.289 2.339 2.418 2.483 2.541 2.597 2.643 2.681 2.717 2.771 2.809 2.822 2.83 2.859 2.87 2.839 2.782 2.684 2.536 2.329 2.014 1.503 0.744 -0.401 -2.329 -4.57 -6.374 -7.86 -9.134 -10.284 -11.264 -12.177 -12.949 -13.654 -14.253 -14.841 -15.4 -15.883 -16.316 -16.71 -17.129 -17.516 -17.856 -18.195 -18.55 -18.849 -19.142 -19.429 -19.657 -19.883 -20.116 -20.367 -20.619 -20.792 -20.967 -21.236 -21.439 -21.644 -21.752 -21.99 -22.232 -22.491 -22.623 -22.939 -22.994 -23.119 -23.264 -23.58 -23.736 -23.897 -24.059 -24.255 -24.492 -24.772 -25.288 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5a.txt deleted file mode 100644 index cc1489c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3147 ,KEBNE ,17026483,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:17:03 CET,0.0 0.125 0.255 0.378 0.471 0.545 0.609 0.673 0.797 0.862 0.934 0.871 1.116 1.173 1.292 1.404 1.517 1.568 1.665 1.753 1.87 1.945 2.013 2.099 2.187 2.296 2.404 2.498 2.618 2.738 2.843 2.953 3.065 3.176 3.299 3.458 3.621 3.794 3.977 4.129 4.273 4.433 4.629 4.817 5.012 5.215 5.389 5.546 5.67 5.681 5.452 4.892 4.278 3.69 3.148 2.62 2.175 1.788 1.432 1.051 0.689 0.335 0.008 -0.264 -0.509 -0.748 -0.999 -1.212 -1.393 -1.579 -1.782 -1.951 -2.109 -2.291 -2.433 -2.579 -2.75 -2.918 -3.088 -3.212 -3.339 -3.526 -3.653 -3.799 -3.874 -4.014 -4.165 -4.317 -4.403 -4.687 -4.672 -4.769 -4.859 -5.06 -5.176 -5.302 -5.433 -5.587 -5.776 -6.01 -6.672 -2 ,12579 ,KEBNE ,17026484,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:17:24 CET,0.0 0.192 0.288 0.366 0.437 0.508 0.571 0.629 0.753 0.807 0.864 0.798 1.047 1.094 1.176 1.268 1.37 1.414 1.495 1.581 1.704 1.781 1.858 1.971 2.092 2.213 2.321 2.414 2.544 2.67 2.782 2.902 3.029 3.159 3.308 3.488 3.646 3.801 3.971 4.158 4.329 4.494 4.699 4.888 5.088 5.363 5.707 6.036 6.282 6.35 6.137 5.58 4.889 4.289 3.787 3.287 2.785 2.314 1.958 1.558 1.176 0.877 0.597 0.305 0.021 -0.249 -0.523 -0.748 -0.955 -1.204 -1.459 -1.642 -1.847 -2.065 -2.217 -2.371 -2.527 -2.691 -2.875 -3.004 -3.134 -3.331 -3.459 -3.595 -3.664 -3.8 -3.962 -4.136 -4.217 -4.492 -4.476 -4.573 -4.679 -4.912 -5.038 -5.175 -5.312 -5.459 -5.632 -5.883 -6.697 -3 ,152 ,KEBNE ,17026485,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:17:31 CET,0.0 0.173 0.277 0.373 0.477 0.578 0.665 0.751 0.907 0.982 1.061 1.016 1.269 1.322 1.424 1.533 1.642 1.684 1.774 1.875 2.021 2.115 2.204 2.318 2.443 2.568 2.664 2.767 2.917 3.069 3.207 3.357 3.484 3.593 3.746 3.937 4.118 4.307 4.479 4.657 4.849 5.048 5.258 5.438 5.659 5.901 6.151 6.356 6.479 6.506 6.251 5.658 5.078 4.497 3.878 3.327 2.84 2.391 2.007 1.63 1.277 0.931 0.62 0.348 0.082 -0.174 -0.439 -0.657 -0.838 -1.024 -1.212 -1.378 -1.556 -1.759 -1.914 -2.062 -2.22 -2.399 -2.584 -2.703 -2.829 -3.033 -3.189 -3.343 -3.41 -3.56 -3.723 -3.888 -3.986 -4.283 -4.285 -4.388 -4.494 -4.736 -4.876 -5.029 -5.18 -5.35 -5.531 -5.768 -6.333 -4 ,542 ,KEBNE ,17026486,Wed Dec 22 14:32:56 CET,Wed Dec 22 16:17:05 CET,0.0 0.191 0.319 0.427 0.523 0.596 0.648 0.709 0.835 0.897 0.963 0.892 1.133 1.181 1.283 1.394 1.493 1.538 1.635 1.731 1.87 1.952 2.024 2.134 2.235 2.339 2.446 2.547 2.666 2.777 2.888 3.002 3.117 3.233 3.366 3.509 3.639 3.814 3.995 4.177 4.394 4.629 4.849 5.032 5.212 5.407 5.653 5.882 6.03 6.049 5.814 5.25 4.629 3.993 3.411 2.905 2.434 1.991 1.608 1.203 0.847 0.52 0.209 -0.044 -0.26 -0.48 -0.746 -0.966 -1.148 -1.358 -1.59 -1.787 -1.989 -2.201 -2.344 -2.475 -2.601 -2.725 -2.858 -2.968 -3.087 -3.251 -3.367 -3.498 -3.571 -3.723 -3.882 -4.076 -4.165 -4.444 -4.457 -4.572 -4.693 -4.943 -5.074 -5.203 -5.332 -5.46 -5.627 -5.847 -6.538 -5 ,1595 ,KEBNE ,17026487,Wed Dec 22 14:33:57 CET,Wed Dec 22 16:17:39 CET,0.0 0.168 0.255 0.348 0.44 0.529 0.636 0.725 0.872 0.942 1.0 0.92 1.165 1.212 1.302 1.395 1.498 1.547 1.63 1.723 1.874 1.958 2.035 2.154 2.277 2.387 2.486 2.587 2.714 2.832 2.937 3.067 3.195 3.321 3.47 3.624 3.778 3.957 4.126 4.271 4.423 4.62 4.818 4.977 5.174 5.377 5.553 5.734 5.957 6.057 5.821 5.292 4.595 3.945 3.368 2.81 2.307 1.853 1.455 1.031 0.64 0.287 -0.045 -0.362 -0.631 -0.898 -1.211 -1.476 -1.688 -1.901 -2.122 -2.308 -2.506 -2.706 -2.853 -3.004 -3.159 -3.325 -3.501 -3.612 -3.71 -3.885 -4.016 -4.151 -4.223 -4.369 -4.526 -4.71 -4.809 -5.1 -5.104 -5.201 -5.297 -5.49 -5.587 -5.701 -5.823 -5.957 -6.136 -6.414 -6.997 -6 ,28441 ,KEBNE ,17026488,Wed Dec 22 14:33:57 CET,Wed Dec 22 16:17:41 CET,0.0 0.212 0.334 0.449 0.556 0.636 0.704 0.775 0.935 1.008 1.065 0.969 1.204 1.248 1.35 1.444 1.528 1.57 1.651 1.724 1.826 1.897 1.97 2.081 2.185 2.273 2.353 2.446 2.578 2.692 2.811 2.954 3.072 3.185 3.315 3.466 3.615 3.777 3.926 4.048 4.183 4.351 4.567 4.772 4.967 5.221 5.49 5.667 5.767 5.737 5.444 4.883 4.378 3.861 3.319 2.744 2.238 1.8 1.364 0.924 0.571 0.262 -0.025 -0.33 -0.618 -0.842 -1.08 -1.317 -1.526 -1.749 -1.967 -2.141 -2.333 -2.525 -2.673 -2.829 -2.998 -3.169 -3.331 -3.443 -3.555 -3.74 -3.895 -4.051 -4.125 -4.274 -4.427 -4.589 -4.662 -4.932 -4.924 -5.027 -5.133 -5.365 -5.493 -5.619 -5.753 -5.911 -6.085 -6.295 -6.693 -7 ,6272 ,KEBNE ,17026489,Wed Dec 22 14:33:57 CET,Wed Dec 22 16:17:57 CET,0.0 0.166 0.277 0.384 0.481 0.549 0.615 0.677 0.788 0.845 0.9 0.806 1.052 1.116 1.223 1.325 1.437 1.485 1.558 1.635 1.763 1.852 1.938 2.047 2.152 2.256 2.343 2.428 2.53 2.627 2.733 2.848 2.97 3.103 3.252 3.412 3.569 3.712 3.852 4.029 4.2 4.403 4.633 4.847 5.128 5.365 5.545 5.702 5.829 5.86 5.592 4.965 4.327 3.745 3.181 2.669 2.246 1.828 1.456 1.102 0.782 0.485 0.205 -0.061 -0.312 -0.557 -0.839 -1.063 -1.24 -1.446 -1.642 -1.816 -2.012 -2.19 -2.317 -2.45 -2.611 -2.786 -2.932 -3.011 -3.104 -3.282 -3.416 -3.569 -3.646 -3.789 -3.932 -4.083 -4.17 -4.458 -4.426 -4.506 -4.594 -4.792 -4.903 -5.021 -5.15 -5.325 -5.531 -5.747 -6.001 -8 ,19503 ,KEBNE ,17026490,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:17:34 CET,0.0 0.225 0.414 0.557 0.673 0.789 0.88 0.952 1.09 1.166 1.242 1.181 1.432 1.486 1.582 1.654 1.72 1.764 1.856 1.929 2.032 2.098 2.163 2.27 2.377 2.473 2.57 2.665 2.784 2.892 2.994 3.127 3.275 3.427 3.575 3.714 3.842 3.976 4.142 4.327 4.5 4.716 4.954 5.17 5.394 5.599 5.827 6.012 6.114 6.152 5.944 5.329 4.684 4.081 3.473 2.932 2.463 2.022 1.638 1.254 0.904 0.563 0.267 -0.002 -0.254 -0.465 -0.684 -0.906 -1.098 -1.274 -1.457 -1.632 -1.808 -1.981 -2.137 -2.305 -2.471 -2.642 -2.832 -2.964 -3.079 -3.252 -3.39 -3.537 -3.606 -3.742 -3.896 -4.072 -4.161 -4.44 -4.425 -4.515 -4.613 -4.846 -4.97 -5.089 -5.215 -5.37 -5.561 -5.821 -6.81 -9 ,789 ,KEBNE ,17026491,Wed Dec 22 14:33:57 CET,Wed Dec 22 16:17:47 CET,0.0 0.402 0.596 0.736 0.845 0.942 1.022 1.1 1.223 1.278 1.335 1.238 1.494 1.55 1.634 1.729 1.825 1.869 1.956 2.045 2.175 2.261 2.35 2.46 2.54 2.612 2.688 2.773 2.885 2.999 3.122 3.271 3.396 3.503 3.621 3.744 3.893 4.065 4.212 4.363 4.51 4.675 4.847 4.984 5.155 5.324 5.484 5.651 5.83 5.89 5.643 5.03 4.37 3.729 3.154 2.648 2.193 1.79 1.406 0.975 0.608 0.28 -0.055 -0.354 -0.616 -0.86 -1.108 -1.335 -1.541 -1.765 -2.01 -2.228 -2.435 -2.598 -2.727 -2.88 -3.05 -3.243 -3.439 -3.575 -3.707 -3.895 -4.031 -4.175 -4.249 -4.399 -4.548 -4.704 -4.786 -5.067 -5.063 -5.147 -5.231 -5.413 -5.506 -5.608 -5.717 -5.864 -6.069 -6.285 -6.75 -10 ,29770 ,KEBNE ,17026492,Wed Dec 22 14:35:00 CET,Wed Dec 22 16:19:22 CET,0.0 0.195 0.348 0.47 0.557 0.638 0.718 0.808 0.973 1.053 1.123 1.05 1.297 1.346 1.439 1.528 1.622 1.674 1.767 1.845 1.963 2.047 2.125 2.218 2.302 2.381 2.468 2.561 2.674 2.785 2.906 3.036 3.145 3.259 3.384 3.531 3.681 3.841 4.03 4.221 4.403 4.596 4.796 4.988 5.193 5.422 5.616 5.726 5.833 5.873 5.633 5.063 4.438 3.835 3.304 2.806 2.36 1.954 1.583 1.222 0.91 0.637 0.39 0.162 -0.053 -0.28 -0.524 -0.738 -0.918 -1.091 -1.293 -1.478 -1.661 -1.848 -1.986 -2.121 -2.277 -2.432 -2.583 -2.694 -2.802 -2.969 -3.086 -3.209 -3.281 -3.436 -3.597 -3.756 -3.839 -4.129 -4.121 -4.209 -4.308 -4.56 -4.698 -4.848 -5.034 -5.236 -5.45 -5.722 -6.361 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5g.txt deleted file mode 100644 index 8b591028..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5i_5g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,120 ,TETRA ,17698992,Sat Dec 4 17:00:33 CET,Sat Dec 4 19:02:08 CET,0.0 0.145 0.309 0.458 0.577 0.674 0.775 0.877 1.068 1.159 1.234 1.195 1.469 1.542 1.658 1.768 1.895 1.959 2.066 2.174 2.337 2.43 2.519 2.651 2.779 2.904 3.023 3.155 3.323 3.482 3.639 3.818 4.015 4.212 4.422 4.642 4.849 5.101 5.358 5.61 5.873 6.156 6.497 6.831 7.206 7.612 8.086 8.638 9.27 9.949 10.526 10.786 10.769 10.597 10.383 10.188 9.977 9.724 9.491 9.261 9.064 8.888 8.729 8.56 8.393 8.249 8.082 7.928 7.814 7.684 7.534 7.416 7.302 7.191 7.096 6.982 6.86 6.749 6.635 6.551 6.466 6.32 6.218 6.123 6.073 5.978 5.875 5.756 5.693 5.435 5.457 5.376 5.289 5.087 4.975 4.864 4.767 4.667 4.547 4.379 4.055 -2 ,18903 ,TETRA ,17698993,Sat Dec 4 17:00:31 CET,Sat Dec 4 19:02:49 CET,0.0 0.484 0.637 0.739 0.828 0.908 1.001 1.1 1.29 1.385 1.462 1.397 1.647 1.71 1.843 1.975 2.101 2.163 2.267 2.369 2.527 2.63 2.725 2.838 2.95 3.065 3.177 3.286 3.429 3.561 3.713 3.898 4.054 4.219 4.407 4.612 4.82 5.039 5.256 5.496 5.757 6.052 6.4 6.736 7.136 7.574 8.052 8.534 9.023 9.561 10.036 10.177 10.125 9.966 9.725 9.503 9.282 9.053 8.842 8.632 8.459 8.273 8.066 7.864 7.682 7.531 7.367 7.209 7.092 6.979 6.844 6.716 6.592 6.468 6.375 6.295 6.209 6.097 5.979 5.909 5.834 5.704 5.617 5.526 5.473 5.365 5.263 5.163 5.109 4.866 4.942 4.88 4.804 4.648 4.564 4.461 4.358 4.265 4.166 4.015 3.771 -3 ,28572 ,TETRA ,17674879,Sat Dec 4 15:21:21 CET,Sat Dec 4 17:25:04 CET,0.0 0.188 0.361 0.499 0.605 0.715 0.821 0.918 1.083 1.156 1.242 1.206 1.465 1.537 1.669 1.795 1.915 1.972 2.096 2.21 2.36 2.466 2.559 2.688 2.83 2.972 3.116 3.252 3.409 3.557 3.703 3.911 4.125 4.307 4.489 4.674 4.864 5.08 5.317 5.593 5.891 6.214 6.566 6.922 7.363 7.812 8.27 8.736 9.299 9.886 10.363 10.555 10.519 10.378 10.211 10.013 9.78 9.554 9.351 9.139 8.942 8.741 8.543 8.368 8.188 8.012 7.828 7.662 7.526 7.388 7.246 7.13 7.005 6.855 6.745 6.655 6.559 6.447 6.321 6.218 6.116 5.964 5.857 5.746 5.69 5.585 5.482 5.382 5.323 5.052 5.058 4.977 4.901 4.732 4.624 4.521 4.437 4.304 4.14 4.008 3.787 -4 ,20190 ,TETRA ,17674880,Sat Dec 4 15:21:23 CET,Sat Dec 4 17:10:35 CET,0.0 0.217 0.348 0.459 0.569 0.666 0.763 0.868 1.067 1.16 1.247 1.211 1.484 1.561 1.69 1.796 1.91 1.971 2.101 2.232 2.415 2.529 2.638 2.804 2.941 3.075 3.225 3.355 3.512 3.673 3.831 4.016 4.181 4.343 4.555 4.799 5.004 5.21 5.445 5.717 6.019 6.314 6.619 6.96 7.339 7.765 8.263 8.741 9.275 9.895 10.449 10.659 10.642 10.496 10.265 10.015 9.781 9.577 9.392 9.179 8.968 8.759 8.568 8.401 8.251 8.121 7.954 7.795 7.648 7.51 7.365 7.227 7.081 6.931 6.832 6.728 6.608 6.493 6.365 6.258 6.15 5.998 5.892 5.783 5.725 5.613 5.497 5.363 5.291 5.027 5.057 4.99 4.928 4.744 4.642 4.545 4.446 4.361 4.254 4.094 3.828 -5 ,5966 ,TETRA ,17698996,Sat Dec 4 17:00:31 CET,Sat Dec 4 17:18:55 CET,0.0 0.462 0.604 0.724 0.851 0.964 1.058 1.146 1.321 1.413 1.499 1.46 1.713 1.771 1.887 2.005 2.131 2.197 2.316 2.427 2.588 2.684 2.784 2.953 3.107 3.244 3.385 3.524 3.71 3.881 4.021 4.203 4.399 4.59 4.789 5.001 5.244 5.532 5.839 6.143 6.438 6.739 7.071 7.445 7.923 8.431 8.96 9.503 10.044 10.65 11.241 11.428 11.387 11.297 11.18 11.003 10.761 10.519 10.305 10.05 9.838 9.688 9.544 9.407 9.262 9.086 8.904 8.749 8.601 8.437 8.269 8.143 8.032 7.915 7.813 7.714 7.597 7.455 7.323 7.238 7.148 7.017 6.925 6.836 6.791 6.689 6.583 6.466 6.406 6.16 6.227 6.172 6.117 5.989 5.917 5.854 5.791 5.701 5.596 5.459 5.234 -6 ,6637 ,TETRA ,17698997,Sat Dec 4 17:00:32 CET,Sat Dec 4 17:19:47 CET,0.0 0.165 0.328 0.454 0.555 0.644 0.733 0.823 0.962 1.027 1.089 1.012 1.269 1.343 1.472 1.589 1.71 1.767 1.891 2.026 2.209 2.322 2.432 2.599 2.744 2.864 3.0 3.147 3.333 3.511 3.665 3.828 3.984 4.151 4.361 4.601 4.828 5.044 5.274 5.537 5.824 6.152 6.542 6.919 7.338 7.812 8.311 8.855 9.479 10.131 10.705 10.888 10.822 10.651 10.42 10.147 9.853 9.563 9.309 9.066 8.877 8.709 8.536 8.347 8.156 7.976 7.785 7.623 7.491 7.36 7.223 7.107 6.989 6.874 6.788 6.694 6.572 6.441 6.324 6.238 6.149 6.027 5.936 5.845 5.803 5.704 5.588 5.476 5.423 5.188 5.253 5.192 5.129 5.01 4.954 4.89 4.805 4.706 4.603 4.44 3.878 -7 ,32198 ,TETRA ,17674883,Sat Dec 4 15:21:21 CET,Sat Dec 4 17:10:06 CET,0.0 0.233 0.39 0.488 0.568 0.653 0.738 0.812 0.951 1.02 1.09 1.028 1.282 1.352 1.494 1.629 1.757 1.815 1.928 2.039 2.169 2.245 2.327 2.46 2.603 2.746 2.886 3.021 3.186 3.342 3.482 3.643 3.801 3.97 4.177 4.4 4.611 4.843 5.083 5.329 5.606 5.935 6.291 6.607 6.98 7.388 7.85 8.361 8.863 9.385 9.912 10.079 10.037 9.942 9.734 9.448 9.211 9.021 8.843 8.627 8.442 8.27 8.083 7.915 7.773 7.637 7.484 7.342 7.211 7.072 6.933 6.821 6.697 6.569 6.468 6.35 6.228 6.098 5.959 5.87 5.778 5.633 5.537 5.434 5.38 5.261 5.148 5.022 4.947 4.689 4.742 4.678 4.609 4.438 4.348 4.256 4.143 4.038 3.908 3.744 3.339 -8 ,17642 ,TETRA ,17698999,Sat Dec 4 17:00:35 CET,Sat Dec 4 17:19:06 CET,0.0 0.336 0.536 0.664 0.764 0.872 0.968 1.054 1.227 1.314 1.384 1.325 1.581 1.636 1.744 1.848 1.948 1.999 2.107 2.218 2.363 2.453 2.544 2.677 2.813 2.934 3.048 3.163 3.305 3.441 3.575 3.731 3.892 4.075 4.305 4.565 4.807 5.037 5.258 5.499 5.767 6.091 6.461 6.795 7.162 7.578 8.037 8.517 9.061 9.643 10.172 10.36 10.325 10.2 10.015 9.812 9.566 9.313 9.083 8.82 8.604 8.435 8.261 8.07 7.887 7.718 7.54 7.391 7.272 7.148 7.008 6.882 6.747 6.599 6.478 6.355 6.243 6.142 6.044 5.97 5.883 5.751 5.66 5.569 5.523 5.421 5.319 5.209 5.144 4.892 4.923 4.825 4.738 4.57 4.486 4.404 4.301 4.171 4.017 3.824 3.458 -9 ,12783 ,TETRA ,17699000,Sat Dec 4 17:00:31 CET,Sat Dec 4 17:16:40 CET,0.0 0.244 0.419 0.566 0.688 0.814 0.923 1.019 1.2 1.289 1.378 1.364 1.631 1.693 1.832 1.964 2.073 2.123 2.218 2.311 2.464 2.566 2.663 2.809 2.943 3.088 3.245 3.39 3.554 3.696 3.84 4.013 4.183 4.366 4.591 4.85 5.064 5.277 5.519 5.791 6.083 6.41 6.801 7.16 7.544 7.994 8.562 9.149 9.688 10.263 10.865 11.14 11.142 11.022 10.793 10.581 10.413 10.208 9.99 9.764 9.554 9.373 9.23 9.107 8.968 8.814 8.662 8.531 8.406 8.266 8.113 7.989 7.849 7.703 7.594 7.484 7.373 7.269 7.177 7.105 7.019 6.896 6.816 6.727 6.681 6.589 6.502 6.414 6.363 6.119 6.164 6.089 6.015 5.855 5.766 5.671 5.566 5.454 5.323 5.205 4.922 -10 ,7060 ,TETRA ,17699001,Sat Dec 4 17:00:31 CET,Sat Dec 4 17:16:23 CET,0.0 0.28 0.474 0.608 0.707 0.804 0.902 1.004 1.188 1.289 1.373 1.324 1.596 1.665 1.781 1.884 2.008 2.071 2.174 2.271 2.444 2.561 2.662 2.804 2.944 3.096 3.244 3.374 3.547 3.706 3.857 4.039 4.207 4.375 4.602 4.876 5.111 5.359 5.64 5.913 6.169 6.465 6.82 7.163 7.577 8.026 8.495 9.001 9.587 10.201 10.758 11.003 10.888 10.703 10.529 10.318 10.114 9.918 9.729 9.477 9.263 9.098 8.93 8.736 8.531 8.341 8.154 8.009 7.872 7.71 7.548 7.412 7.264 7.121 7.014 6.908 6.796 6.673 6.544 6.46 6.366 6.232 6.149 6.06 6.016 5.916 5.806 5.695 5.629 5.373 5.427 5.366 5.296 5.126 5.039 4.953 4.859 4.738 4.585 4.397 4.158 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5j_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5j_5b.txt deleted file mode 100644 index 8c63ce17..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5j_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13548 ,TETRA ,17699002,Sat Dec 4 17:01:29 CET,Sat Dec 4 18:49:27 CET,0.0 0.235 0.35 0.464 0.561 0.622 0.691 0.771 0.926 0.997 1.065 0.992 1.269 1.327 1.428 1.525 1.625 1.676 1.779 1.873 1.988 2.062 2.138 2.253 2.349 2.42 2.5 2.587 2.698 2.812 2.919 3.031 3.129 3.213 3.307 3.409 3.512 3.624 3.754 3.902 4.014 4.115 4.241 4.34 4.434 4.538 4.623 4.642 4.486 4.058 3.239 2.04 0.891 -0.071 -0.858 -1.611 -2.26 -2.801 -3.311 -3.808 -4.208 -4.615 -5.003 -5.346 -5.664 -5.93 -6.208 -6.47 -6.706 -6.967 -7.24 -7.444 -7.646 -7.838 -7.969 -8.115 -8.272 -8.438 -8.623 -8.738 -8.852 -9.045 -9.175 -9.319 -9.392 -9.534 -9.683 -9.839 -9.928 -10.248 -10.205 -10.291 -10.381 -10.552 -10.641 -10.743 -10.851 -10.996 -11.164 -11.326 -11.528 -2 ,29764 ,TETRA ,17699003,Sat Dec 4 17:01:29 CET,Sat Dec 4 17:16:51 CET,0.0 0.26 0.39 0.512 0.615 0.709 0.789 0.848 0.973 1.035 1.091 0.982 1.242 1.289 1.381 1.471 1.547 1.578 1.642 1.703 1.808 1.88 1.939 2.038 2.139 2.226 2.312 2.398 2.501 2.597 2.686 2.784 2.885 2.983 3.089 3.207 3.332 3.446 3.537 3.67 3.806 3.898 3.986 4.059 4.099 4.125 4.116 4.033 3.877 3.471 2.548 1.364 0.333 -0.566 -1.365 -2.1 -2.708 -3.229 -3.674 -4.162 -4.571 -4.912 -5.233 -5.537 -5.817 -6.056 -6.308 -6.541 -6.761 -6.985 -7.194 -7.368 -7.549 -7.742 -7.889 -8.029 -8.193 -8.373 -8.544 -8.655 -8.775 -8.985 -9.131 -9.279 -9.347 -9.484 -9.633 -9.785 -9.864 -10.171 -10.111 -10.197 -10.292 -10.495 -10.614 -10.736 -10.855 -10.984 -11.122 -11.263 -11.5 -3 ,11649 ,TETRA ,17674889,Sat Dec 4 15:21:22 CET,Sat Dec 4 17:09:04 CET,0.0 0.206 0.316 0.404 0.498 0.588 0.664 0.741 0.889 0.942 1.0 0.919 1.191 1.254 1.377 1.487 1.581 1.622 1.701 1.779 1.896 1.975 2.06 2.183 2.297 2.404 2.497 2.574 2.662 2.752 2.84 2.935 3.023 3.119 3.24 3.359 3.462 3.596 3.725 3.831 3.919 4.003 4.094 4.169 4.268 4.334 4.347 4.288 4.152 3.797 2.916 1.738 0.706 -0.181 -0.95 -1.672 -2.382 -2.989 -3.467 -3.938 -4.33 -4.713 -5.067 -5.405 -5.746 -6.04 -6.306 -6.523 -6.711 -6.907 -7.127 -7.32 -7.509 -7.71 -7.874 -8.042 -8.217 -8.403 -8.593 -8.713 -8.839 -9.034 -9.168 -9.313 -9.386 -9.539 -9.686 -9.835 -9.917 -10.224 -10.181 -10.276 -10.363 -10.549 -10.658 -10.76 -10.871 -11.014 -11.182 -11.367 -11.619 -4 ,2914 ,TETRA ,17674890,Sat Dec 4 15:21:22 CET,Sat Dec 4 17:08:50 CET,0.0 0.137 0.239 0.34 0.426 0.506 0.576 0.641 0.801 0.871 0.915 0.803 1.071 1.136 1.259 1.357 1.429 1.464 1.534 1.596 1.681 1.728 1.775 1.859 1.944 2.027 2.1 2.166 2.255 2.36 2.47 2.597 2.716 2.815 2.914 3.04 3.185 3.337 3.478 3.615 3.737 3.867 4.001 4.095 4.19 4.282 4.396 4.428 4.291 3.979 3.251 2.063 0.989 0.035 -0.808 -1.513 -2.134 -2.746 -3.261 -3.738 -4.138 -4.487 -4.817 -5.139 -5.438 -5.713 -5.988 -6.241 -6.468 -6.681 -6.903 -7.104 -7.305 -7.52 -7.695 -7.865 -8.028 -8.189 -8.367 -8.493 -8.628 -8.824 -8.952 -9.085 -9.15 -9.28 -9.416 -9.57 -9.656 -9.96 -9.91 -10.012 -10.108 -10.318 -10.43 -10.534 -10.657 -10.794 -10.931 -11.178 -11.702 -5 ,11627 ,TETRA ,17699006,Sat Dec 4 17:01:30 CET,Sat Dec 4 17:18:41 CET,0.0 0.382 0.55 0.646 0.721 0.8 0.885 0.989 1.145 1.215 1.296 1.221 1.491 1.548 1.664 1.764 1.86 1.91 2.002 2.08 2.183 2.261 2.334 2.434 2.547 2.651 2.729 2.804 2.919 3.039 3.153 3.284 3.379 3.467 3.579 3.686 3.788 3.914 4.052 4.178 4.292 4.432 4.58 4.691 4.785 4.86 4.912 4.85 4.707 4.393 3.561 2.398 1.364 0.437 -0.342 -1.064 -1.708 -2.264 -2.744 -3.227 -3.629 -3.991 -4.333 -4.648 -4.928 -5.18 -5.456 -5.698 -5.916 -6.136 -6.354 -6.536 -6.742 -6.994 -7.189 -7.367 -7.522 -7.67 -7.835 -7.96 -8.094 -8.284 -8.412 -8.541 -8.61 -8.76 -8.903 -9.065 -9.165 -9.485 -9.451 -9.541 -9.64 -9.862 -9.962 -10.07 -10.189 -10.31 -10.48 -10.694 -11.055 -6 ,17736 ,TETRA ,17699007,Sat Dec 4 17:02:32 CET,Sat Dec 4 17:18:35 CET,0.0 0.162 0.292 0.417 0.519 0.607 0.678 0.76 0.916 0.972 1.019 0.914 1.171 1.206 1.285 1.354 1.418 1.452 1.527 1.611 1.727 1.795 1.869 1.974 2.099 2.221 2.301 2.362 2.455 2.57 2.674 2.774 2.849 2.915 2.996 3.086 3.17 3.276 3.387 3.485 3.581 3.697 3.824 3.919 4.024 4.098 4.065 3.942 3.703 3.204 2.281 0.998 -0.128 -1.044 -1.842 -2.542 -3.153 -3.745 -4.249 -4.724 -5.182 -5.616 -6.012 -6.385 -6.728 -7.02 -7.331 -7.622 -7.853 -8.075 -8.292 -8.479 -8.678 -8.881 -9.05 -9.225 -9.39 -9.551 -9.716 -9.828 -9.945 -10.139 -10.279 -10.425 -10.498 -10.632 -10.758 -10.891 -10.978 -11.309 -11.31 -11.42 -11.529 -11.729 -11.821 -11.925 -12.055 -12.195 -12.339 -12.534 -12.992 -8 ,31006 ,TETRA ,17674894,Sat Dec 4 15:21:22 CET,Sat Dec 4 17:18:49 CET,0.0 0.165 0.309 0.424 0.509 0.587 0.66 0.724 0.849 0.924 1.002 0.928 1.203 1.266 1.386 1.484 1.56 1.594 1.671 1.757 1.885 1.974 2.06 2.157 2.224 2.293 2.384 2.48 2.574 2.665 2.78 2.928 3.045 3.134 3.25 3.381 3.514 3.666 3.785 3.918 4.066 4.182 4.291 4.39 4.497 4.572 4.581 4.564 4.429 4.041 3.247 2.052 0.987 0.049 -0.791 -1.555 -2.226 -2.796 -3.262 -3.738 -4.161 -4.523 -4.873 -5.205 -5.507 -5.793 -6.077 -6.32 -6.555 -6.815 -7.094 -7.304 -7.503 -7.706 -7.852 -8.011 -8.185 -8.364 -8.543 -8.669 -8.799 -8.985 -9.101 -9.23 -9.303 -9.444 -9.587 -9.726 -9.793 -10.092 -10.068 -10.181 -10.292 -10.51 -10.619 -10.738 -10.853 -10.959 -11.105 -11.268 -11.543 -9 ,19979 ,TETRA ,17674895,Sat Dec 4 15:21:22 CET,Sat Dec 4 17:08:50 CET,0.0 0.166 0.28 0.407 0.502 0.592 0.673 0.745 0.895 0.957 1.017 0.943 1.216 1.272 1.379 1.48 1.582 1.628 1.703 1.763 1.864 1.94 2.015 2.13 2.235 2.33 2.433 2.54 2.673 2.777 2.88 3.012 3.112 3.187 3.288 3.435 3.561 3.662 3.776 3.919 4.035 4.105 4.175 4.249 4.31 4.343 4.305 4.185 3.981 3.498 2.463 1.166 0.068 -0.87 -1.671 -2.405 -3.057 -3.643 -4.148 -4.627 -5.017 -5.367 -5.703 -6.014 -6.315 -6.596 -6.887 -7.152 -7.379 -7.608 -7.83 -8.004 -8.213 -8.457 -8.636 -8.808 -8.995 -9.175 -9.344 -9.46 -9.588 -9.789 -9.921 -10.052 -10.12 -10.26 -10.396 -10.558 -10.64 -10.941 -10.889 -10.984 -11.081 -11.286 -11.402 -11.541 -11.699 -11.858 -11.996 -12.145 -12.507 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5d.txt deleted file mode 100644 index 4f625350..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,19985 ,TETRA ,17674897,Sat Dec 4 15:21:24 CET,Sat Dec 4 17:09:01 CET,0.0 0.27 0.394 0.467 0.557 0.643 0.728 0.8 0.919 0.982 1.046 0.998 1.232 1.282 1.373 1.449 1.538 1.581 1.649 1.715 1.807 1.864 1.923 2.017 2.105 2.176 2.243 2.309 2.378 2.437 2.487 2.556 2.627 2.697 2.773 2.86 2.958 3.039 3.097 3.149 3.216 3.261 3.286 3.297 3.276 3.226 3.082 2.829 2.419 1.76 0.662 -0.748 -1.931 -2.937 -3.771 -4.536 -5.229 -5.889 -6.464 -6.977 -7.388 -7.758 -8.146 -8.501 -8.801 -9.059 -9.316 -9.539 -9.731 -9.943 -10.193 -10.412 -10.621 -10.81 -10.953 -11.117 -11.292 -11.465 -11.639 -11.76 -11.885 -12.085 -12.217 -12.343 -12.404 -12.526 -12.66 -12.819 -12.894 -13.156 -13.147 -13.247 -13.342 -13.544 -13.638 -13.732 -13.851 -13.985 -14.122 -14.303 -14.667 -3 ,1275 ,TETRA ,17674899,Sat Dec 4 15:21:24 CET,Sat Dec 4 17:21:12 CET,0.0 0.224 0.335 0.454 0.55 0.622 0.696 0.76 0.852 0.896 0.954 0.881 1.117 1.169 1.254 1.344 1.437 1.478 1.55 1.628 1.747 1.823 1.884 1.982 2.087 2.166 2.236 2.303 2.397 2.494 2.577 2.645 2.692 2.75 2.824 2.886 2.926 2.971 3.032 3.083 3.127 3.174 3.198 3.195 3.193 3.186 3.108 2.965 2.698 2.09 0.89 -0.615 -1.864 -2.894 -3.8 -4.589 -5.279 -5.907 -6.441 -6.965 -7.423 -7.846 -8.236 -8.576 -8.871 -9.141 -9.432 -9.704 -9.943 -10.194 -10.439 -10.623 -10.799 -11.006 -11.175 -11.336 -11.515 -11.704 -11.899 -12.035 -12.173 -12.387 -12.526 -12.667 -12.74 -12.877 -13.016 -13.176 -13.267 -13.54 -13.512 -13.608 -13.691 -13.845 -13.949 -14.069 -14.198 -14.33 -14.445 -14.554 -14.822 -4 ,29032 ,TETRA ,17674900,Sat Dec 4 15:21:24 CET,Sat Dec 4 17:08:53 CET,0.0 0.221 0.331 0.415 0.478 0.547 0.603 0.651 0.749 0.79 0.841 0.776 1.006 1.055 1.133 1.212 1.277 1.303 1.369 1.436 1.533 1.599 1.657 1.743 1.824 1.882 1.935 1.991 2.055 2.115 2.172 2.246 2.34 2.436 2.516 2.582 2.656 2.719 2.776 2.85 2.903 2.924 2.925 2.931 2.911 2.847 2.784 2.613 2.216 1.513 0.253 -1.247 -2.5 -3.525 -4.355 -5.135 -5.807 -6.369 -6.844 -7.31 -7.731 -8.104 -8.466 -8.833 -9.184 -9.499 -9.792 -10.053 -10.266 -10.469 -10.69 -10.876 -11.09 -11.338 -11.534 -11.717 -11.878 -12.053 -12.235 -12.361 -12.487 -12.681 -12.833 -12.984 -13.063 -13.231 -13.38 -13.536 -13.618 -13.894 -13.869 -13.954 -14.054 -14.288 -14.393 -14.481 -14.585 -14.721 -14.889 -15.131 -15.724 -5 ,2359 ,TETRA ,17699016,Sat Dec 4 17:04:27 CET,Sat Dec 4 19:02:43 CET,0.0 0.188 0.346 0.462 0.557 0.653 0.733 0.795 0.886 0.93 0.989 0.926 1.144 1.192 1.281 1.354 1.437 1.472 1.525 1.572 1.647 1.708 1.762 1.836 1.913 2.012 2.104 2.171 2.251 2.322 2.381 2.469 2.583 2.685 2.77 2.829 2.897 3.009 3.111 3.181 3.246 3.3 3.323 3.33 3.299 3.254 3.175 2.999 2.61 1.89 0.793 -0.635 -1.896 -2.942 -3.844 -4.683 -5.394 -6.013 -6.547 -7.118 -7.614 -7.996 -8.352 -8.718 -9.063 -9.352 -9.625 -9.858 -10.069 -10.321 -10.558 -10.719 -10.883 -11.061 -11.217 -11.377 -11.533 -11.692 -11.853 -11.975 -12.106 -12.295 -12.423 -12.557 -12.625 -12.764 -12.916 -13.084 -13.165 -13.443 -13.445 -13.547 -13.647 -13.848 -13.943 -14.054 -14.191 -14.305 -14.445 -14.593 -14.794 -6 ,14759 ,TETRA ,17699017,Sat Dec 4 17:03:26 CET,Sat Dec 4 17:19:10 CET,0.0 0.143 0.244 0.343 0.449 0.532 0.602 0.67 0.794 0.85 0.907 0.842 1.076 1.124 1.218 1.308 1.382 1.416 1.495 1.576 1.682 1.742 1.793 1.861 1.918 1.999 2.1 2.188 2.271 2.344 2.42 2.501 2.573 2.635 2.701 2.796 2.906 3.014 3.093 3.14 3.204 3.273 3.296 3.28 3.233 3.184 3.084 2.86 2.46 1.835 0.689 -0.869 -2.126 -3.164 -4.076 -4.889 -5.612 -6.242 -6.749 -7.245 -7.66 -8.022 -8.375 -8.721 -9.035 -9.315 -9.605 -9.866 -10.093 -10.323 -10.579 -10.79 -10.989 -11.188 -11.339 -11.493 -11.66 -11.836 -12.008 -12.143 -12.301 -12.512 -12.632 -12.768 -12.845 -12.992 -13.135 -13.281 -13.347 -13.607 -13.577 -13.659 -13.743 -13.918 -14.0 -14.092 -14.19 -14.291 -14.424 -14.624 -14.903 -7 ,24086 ,TETRA ,17699018,Sat Dec 4 17:03:26 CET,Sat Dec 4 17:10:50 CET,0.0 0.274 0.45 0.541 0.635 0.736 0.807 0.867 0.984 1.046 1.105 1.022 1.251 1.302 1.402 1.489 1.569 1.606 1.671 1.742 1.86 1.922 1.969 2.026 2.092 2.171 2.237 2.286 2.343 2.419 2.506 2.608 2.703 2.78 2.844 2.907 2.989 3.081 3.159 3.233 3.322 3.426 3.485 3.514 3.545 3.538 3.442 3.275 2.974 2.366 1.191 -0.307 -1.572 -2.622 -3.519 -4.287 -4.937 -5.571 -6.128 -6.684 -7.129 -7.489 -7.829 -8.157 -8.481 -8.801 -9.122 -9.382 -9.61 -9.865 -10.136 -10.345 -10.531 -10.709 -10.852 -11.001 -11.159 -11.328 -11.491 -11.601 -11.718 -11.93 -12.068 -12.19 -12.259 -12.407 -12.565 -12.734 -12.829 -13.124 -13.114 -13.205 -13.301 -13.515 -13.627 -13.743 -13.872 -14.047 -14.219 -14.402 -14.665 -8 ,19423 ,TETRA ,17699019,Sat Dec 4 17:03:26 CET,Sat Dec 4 17:20:25 CET,0.0 0.219 0.341 0.451 0.558 0.64 0.728 0.817 0.951 1.007 1.056 0.973 1.203 1.262 1.358 1.422 1.482 1.514 1.572 1.632 1.713 1.763 1.814 1.883 1.96 2.036 2.093 2.138 2.2 2.258 2.318 2.402 2.479 2.564 2.678 2.781 2.844 2.912 2.995 3.053 3.091 3.134 3.142 3.144 3.119 3.035 2.904 2.721 2.431 1.839 0.695 -0.747 -1.964 -3.01 -3.926 -4.741 -5.429 -6.02 -6.513 -7.005 -7.433 -7.818 -8.179 -8.506 -8.81 -9.102 -9.412 -9.69 -9.916 -10.125 -10.353 -10.566 -10.785 -11.01 -11.188 -11.36 -11.534 -11.72 -11.91 -12.031 -12.144 -12.341 -12.477 -12.595 -12.663 -12.802 -12.94 -13.096 -13.185 -13.465 -13.427 -13.512 -13.602 -13.823 -13.926 -14.019 -14.138 -14.307 -14.477 -14.696 -15.205 -9 ,22694 ,TETRA ,17699020,Sat Dec 4 17:03:26 CET,Sat Dec 4 17:10:43 CET,0.0 0.305 0.414 0.51 0.605 0.668 0.721 0.783 0.921 0.99 1.045 0.954 1.176 1.225 1.337 1.449 1.535 1.568 1.636 1.702 1.801 1.861 1.912 1.982 2.047 2.118 2.201 2.267 2.336 2.405 2.473 2.566 2.666 2.739 2.79 2.85 2.929 3.024 3.102 3.182 3.247 3.285 3.322 3.343 3.388 3.441 3.41 3.226 2.818 2.163 1.099 -0.322 -1.615 -2.674 -3.545 -4.33 -4.994 -5.582 -6.088 -6.57 -6.982 -7.361 -7.722 -8.052 -8.34 -8.606 -8.886 -9.126 -9.34 -9.568 -9.792 -9.992 -10.205 -10.406 -10.561 -10.718 -10.884 -11.081 -11.284 -11.415 -11.559 -11.784 -11.928 -12.07 -12.148 -12.305 -12.45 -12.6 -12.682 -12.961 -12.937 -13.013 -13.094 -13.283 -13.383 -13.476 -13.57 -13.672 -13.81 -13.955 -14.131 -10 ,20600 ,TETRA ,17699021,Sat Dec 4 17:03:26 CET,Sat Dec 4 17:20:45 CET,0.0 0.17 0.272 0.35 0.427 0.524 0.615 0.695 0.849 0.93 0.994 0.888 1.115 1.163 1.242 1.323 1.41 1.46 1.548 1.626 1.745 1.828 1.901 1.987 2.086 2.181 2.267 2.346 2.438 2.529 2.617 2.71 2.801 2.882 2.97 3.067 3.126 3.203 3.295 3.376 3.452 3.574 3.715 3.776 3.779 3.733 3.619 3.423 3.082 2.383 1.132 -0.392 -1.716 -2.804 -3.727 -4.546 -5.276 -5.914 -6.43 -6.952 -7.387 -7.774 -8.138 -8.456 -8.738 -9.008 -9.302 -9.552 -9.754 -9.963 -10.186 -10.368 -10.577 -10.791 -10.927 -11.075 -11.248 -11.433 -11.616 -11.732 -11.857 -12.047 -12.171 -12.303 -12.373 -12.514 -12.649 -12.787 -12.858 -13.128 -13.106 -13.197 -13.289 -13.478 -13.596 -13.715 -13.827 -13.951 -14.061 -14.179 -14.357 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5f.txt deleted file mode 100644 index 3013d3c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5k_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12638 ,TETRA ,17674907,Sat Dec 4 15:21:24 CET,Sat Dec 4 17:08:41 CET,0.0 0.333 0.481 0.591 0.687 0.789 0.892 0.98 1.138 1.213 1.292 1.264 1.513 1.585 1.723 1.839 1.939 1.992 2.099 2.202 2.354 2.459 2.562 2.702 2.824 2.947 3.089 3.227 3.396 3.559 3.705 3.868 4.03 4.193 4.387 4.606 4.832 5.095 5.365 5.645 5.929 6.261 6.662 7.064 7.536 8.023 8.558 9.159 9.8 10.46 11.141 11.509 11.591 11.526 11.315 11.123 10.97 10.78 10.589 10.386 10.217 10.06 9.89 9.711 9.545 9.41 9.278 9.15 9.018 8.867 8.717 8.611 8.503 8.375 8.268 8.15 8.033 7.922 7.799 7.717 7.648 7.539 7.459 7.379 7.337 7.24 7.134 7.022 6.97 6.741 6.786 6.723 6.657 6.464 6.365 6.258 6.099 5.949 5.831 5.685 5.384 -2 ,5167 ,TETRA ,17699023,Sat Dec 4 17:04:27 CET,Sat Dec 4 17:23:05 CET,0.0 0.16 0.305 0.443 0.555 0.651 0.727 0.805 0.981 1.074 1.159 1.137 1.385 1.448 1.567 1.671 1.776 1.832 1.939 2.036 2.192 2.296 2.388 2.528 2.673 2.808 2.921 3.027 3.172 3.319 3.473 3.68 3.878 4.065 4.282 4.523 4.761 5.025 5.306 5.602 5.916 6.286 6.723 7.135 7.614 8.163 8.818 9.507 10.135 10.867 11.708 12.221 12.316 12.216 12.073 11.885 11.707 11.531 11.341 11.083 10.859 10.688 10.515 10.322 10.132 9.986 9.837 9.699 9.583 9.466 9.342 9.225 9.113 9.006 8.908 8.808 8.711 8.602 8.485 8.397 8.303 8.151 8.043 7.939 7.88 7.746 7.608 7.48 7.416 7.16 7.177 7.096 7.019 6.864 6.771 6.676 6.569 6.428 6.299 6.185 5.831 -3 ,4243 ,TETRA ,17674909,Sat Dec 4 15:21:26 CET,Sat Dec 4 17:21:18 CET,0.0 0.339 0.527 0.665 0.795 0.91 0.991 1.062 1.193 1.274 1.357 1.304 1.544 1.604 1.72 1.834 1.948 2.0 2.096 2.202 2.352 2.446 2.546 2.699 2.847 2.984 3.12 3.258 3.436 3.612 3.782 3.985 4.155 4.314 4.53 4.772 4.996 5.234 5.486 5.77 6.055 6.372 6.759 7.154 7.59 8.04 8.555 9.143 9.762 10.422 11.046 11.376 11.413 11.231 11.017 10.839 10.656 10.462 10.289 10.089 9.923 9.803 9.658 9.505 9.373 9.239 9.071 8.899 8.748 8.601 8.462 8.348 8.201 8.023 7.884 7.745 7.609 7.452 7.291 7.202 7.117 6.988 6.897 6.8 6.747 6.632 6.511 6.389 6.321 6.071 6.085 6.011 5.929 5.735 5.631 5.536 5.418 5.286 5.14 4.974 4.771 -4 ,915 ,TETRA ,17674910,Sat Dec 4 15:22:09 CET,Sat Dec 4 17:22:38 CET,0.0 0.198 0.343 0.481 0.591 0.681 0.77 0.863 1.051 1.133 1.201 1.146 1.381 1.437 1.584 1.725 1.857 1.917 2.018 2.126 2.271 2.368 2.469 2.608 2.737 2.868 3.018 3.151 3.307 3.464 3.624 3.833 4.023 4.187 4.397 4.642 4.868 5.138 5.43 5.737 6.082 6.443 6.813 7.169 7.574 8.026 8.539 9.076 9.675 10.353 11.027 11.356 11.351 11.238 11.101 10.936 10.749 10.58 10.449 10.304 10.146 9.967 9.805 9.653 9.501 9.347 9.168 9.0 8.864 8.737 8.599 8.478 8.335 8.188 8.086 7.983 7.886 7.781 7.649 7.56 7.481 7.345 7.242 7.145 7.097 6.991 6.884 6.773 6.709 6.46 6.453 6.369 6.299 6.163 6.099 6.017 5.918 5.807 5.678 5.435 4.91 -5 ,11374 ,TETRA ,17674911,Sat Dec 4 15:22:11 CET,Sat Dec 4 17:22:31 CET,0.0 0.25 0.385 0.507 0.617 0.731 0.837 0.94 1.143 1.227 1.307 1.282 1.535 1.606 1.742 1.856 1.953 2.005 2.116 2.226 2.388 2.495 2.604 2.765 2.938 3.098 3.235 3.367 3.535 3.709 3.881 4.091 4.297 4.49 4.706 4.914 5.111 5.372 5.69 6.015 6.336 6.71 7.136 7.539 8.012 8.519 9.055 9.677 10.371 11.105 11.866 12.269 12.327 12.198 12.026 11.902 11.776 11.63 11.471 11.281 11.078 10.89 10.736 10.579 10.403 10.24 10.087 9.969 9.867 9.743 9.609 9.503 9.391 9.269 9.18 9.099 9.0 8.885 8.766 8.68 8.593 8.443 8.335 8.232 8.178 8.057 7.943 7.847 7.786 7.544 7.573 7.493 7.403 7.189 7.069 6.959 6.846 6.732 6.64 6.5 5.966 -6 ,25133 ,TETRA ,17674912,Sat Dec 4 15:22:11 CET,Sat Dec 4 17:09:34 CET,0.0 0.174 0.297 0.442 0.581 0.701 0.809 0.897 1.071 1.156 1.236 1.213 1.459 1.519 1.629 1.733 1.851 1.916 2.042 2.147 2.309 2.413 2.507 2.646 2.786 2.936 3.083 3.213 3.37 3.513 3.653 3.828 3.998 4.168 4.353 4.559 4.774 5.006 5.248 5.505 5.781 6.089 6.461 6.816 7.218 7.707 8.277 8.878 9.491 10.126 10.782 11.185 11.26 11.174 11.007 10.766 10.552 10.376 10.21 9.999 9.791 9.612 9.418 9.203 9.031 8.886 8.718 8.573 8.45 8.311 8.165 8.043 7.907 7.771 7.676 7.579 7.463 7.344 7.223 7.123 7.011 6.852 6.745 6.635 6.582 6.47 6.341 6.197 6.124 5.873 5.875 5.79 5.706 5.508 5.411 5.323 5.221 5.117 4.998 4.837 4.492 -8 ,7902 ,TETRA ,17699029,Sat Dec 4 17:05:33 CET,Sat Dec 4 17:12:39 CET,0.0 0.217 0.379 0.498 0.579 0.661 0.731 0.797 0.944 1.017 1.089 1.058 1.298 1.358 1.48 1.594 1.701 1.753 1.869 1.987 2.143 2.241 2.335 2.467 2.603 2.736 2.85 2.966 3.124 3.266 3.402 3.56 3.709 3.862 4.052 4.292 4.54 4.788 5.041 5.318 5.594 5.887 6.231 6.59 7.023 7.512 8.058 8.628 9.246 9.865 10.399 10.631 10.645 10.538 10.34 10.105 9.89 9.713 9.56 9.381 9.206 9.058 8.913 8.756 8.607 8.499 8.38 8.252 8.126 7.984 7.838 7.714 7.582 7.431 7.334 7.24 7.124 7.007 6.883 6.795 6.704 6.561 6.464 6.372 6.324 6.214 6.093 5.991 5.941 5.714 5.782 5.717 5.64 5.47 5.38 5.292 5.196 5.095 4.97 4.817 4.586 -9 ,10192 ,TETRA ,17674915,Sat Dec 4 15:22:11 CET,Sat Dec 4 17:09:35 CET,0.0 0.217 0.358 0.476 0.576 0.664 0.745 0.82 0.952 1.022 1.097 1.064 1.304 1.357 1.47 1.573 1.668 1.716 1.816 1.929 2.081 2.18 2.271 2.396 2.523 2.646 2.767 2.881 3.032 3.193 3.364 3.556 3.742 3.908 4.102 4.336 4.559 4.792 5.036 5.293 5.561 5.871 6.223 6.592 7.021 7.479 8.02 8.582 9.155 9.903 10.67 11.006 11.087 10.984 10.828 10.675 10.501 10.33 10.172 9.983 9.796 9.619 9.429 9.237 9.08 8.955 8.822 8.686 8.561 8.43 8.278 8.15 8.018 7.875 7.771 7.655 7.519 7.373 7.223 7.125 7.023 6.867 6.768 6.665 6.605 6.469 6.332 6.207 6.137 5.89 5.923 5.845 5.764 5.579 5.47 5.364 5.251 5.132 5.006 4.857 4.442 -10 ,31555 ,TETRA ,17674916,Sat Dec 4 15:22:11 CET,Sat Dec 4 17:09:46 CET,0.0 0.177 0.335 0.458 0.568 0.68 0.795 0.896 1.053 1.126 1.207 1.178 1.418 1.479 1.606 1.734 1.85 1.911 2.035 2.154 2.328 2.43 2.526 2.666 2.8 2.938 3.071 3.196 3.371 3.541 3.692 3.882 4.074 4.253 4.451 4.696 4.946 5.185 5.442 5.715 5.991 6.315 6.694 7.047 7.434 7.887 8.41 8.959 9.543 10.126 10.658 10.907 10.851 10.7 10.557 10.391 10.17 9.95 9.751 9.527 9.339 9.177 9.011 8.826 8.628 8.467 8.326 8.193 8.081 7.951 7.813 7.705 7.588 7.437 7.322 7.217 7.096 6.962 6.826 6.737 6.64 6.505 6.416 6.316 6.26 6.147 6.041 5.903 5.827 5.582 5.576 5.486 5.409 5.227 5.126 5.025 4.902 4.775 4.612 4.404 4.045 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5b.txt deleted file mode 100644 index 6641cc75..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10945 ,TETRA ,17674917,Sat Dec 4 15:22:13 CET,Sat Dec 4 17:10:27 CET,0.0 0.182 0.283 0.342 0.395 0.448 0.501 0.555 0.662 0.706 0.758 0.668 0.907 0.946 1.022 1.088 1.141 1.167 1.222 1.266 1.318 1.349 1.381 1.43 1.488 1.549 1.601 1.638 1.674 1.699 1.714 1.744 1.782 1.816 1.843 1.843 1.85 1.864 1.848 1.82 1.775 1.738 1.675 1.532 1.301 1.001 0.572 -0.083 -1.03 -2.393 -4.537 -6.943 -8.888 -10.486 -11.781 -12.887 -13.805 -14.64 -15.355 -16.076 -16.693 -17.193 -17.653 -18.069 -18.451 -18.818 -19.2 -19.539 -19.824 -20.115 -20.415 -20.652 -20.896 -21.142 -21.328 -21.527 -21.723 -21.924 -22.141 -22.301 -22.463 -22.69 -22.842 -23.007 -23.094 -23.28 -23.473 -23.662 -23.762 -24.092 -24.076 -24.187 -24.301 -24.524 -24.645 -24.772 -24.902 -25.043 -25.193 -25.384 -25.683 -2 ,15924 ,TETRA ,17699033,Sat Dec 4 17:05:34 CET,Sat Dec 4 17:21:41 CET,0.0 0.207 0.323 0.431 0.509 0.571 0.623 0.66 0.741 0.787 0.825 0.707 0.952 0.991 1.067 1.153 1.238 1.276 1.342 1.399 1.465 1.5 1.534 1.576 1.612 1.658 1.695 1.727 1.787 1.851 1.914 1.961 1.967 1.956 1.957 1.961 1.956 1.942 1.898 1.841 1.762 1.644 1.487 1.314 1.057 0.714 0.261 -0.373 -1.276 -2.642 -4.865 -7.416 -9.494 -11.188 -12.535 -13.671 -14.657 -15.517 -16.223 -16.912 -17.486 -17.98 -18.453 -18.903 -19.318 -19.694 -20.092 -20.454 -20.772 -21.082 -21.379 -21.629 -21.884 -22.155 -22.362 -22.562 -22.784 -23.006 -23.207 -23.354 -23.511 -23.76 -23.93 -24.083 -24.159 -24.32 -24.483 -24.651 -24.739 -25.058 -25.04 -25.147 -25.257 -25.489 -25.612 -25.729 -25.852 -25.981 -26.157 -26.416 -26.803 -3 ,14910 ,TETRA ,17699034,Sat Dec 4 17:05:34 CET,Sat Dec 4 17:12:35 CET,0.0 0.266 0.415 0.526 0.637 0.71 0.757 0.8 0.879 0.919 0.947 0.808 1.047 1.088 1.157 1.22 1.285 1.316 1.377 1.439 1.524 1.574 1.619 1.674 1.736 1.791 1.839 1.889 1.936 1.971 2.001 2.028 2.068 2.102 2.109 2.101 2.086 2.066 2.038 2.007 1.97 1.899 1.769 1.619 1.41 1.088 0.613 -0.056 -0.99 -2.299 -4.458 -7.067 -9.11 -10.716 -12.082 -13.281 -14.294 -15.167 -15.872 -16.571 -17.177 -17.698 -18.159 -18.582 -18.981 -19.346 -19.743 -20.099 -20.393 -20.684 -20.979 -21.232 -21.49 -21.748 -21.931 -22.13 -22.354 -22.566 -22.767 -22.904 -23.052 -23.285 -23.436 -23.574 -23.644 -23.797 -23.951 -24.132 -24.228 -24.539 -24.499 -24.603 -24.723 -24.952 -25.047 -25.144 -25.266 -25.412 -25.572 -25.726 -25.992 -5 ,18549 ,TETRA ,17674921,Sat Dec 4 15:22:13 CET,Sat Dec 4 17:10:08 CET,0.0 0.219 0.35 0.469 0.552 0.612 0.665 0.719 0.84 0.893 0.933 0.819 1.061 1.106 1.184 1.246 1.296 1.316 1.35 1.387 1.456 1.502 1.542 1.604 1.659 1.693 1.712 1.736 1.768 1.808 1.856 1.905 1.95 1.994 2.028 2.05 2.056 2.027 1.981 1.925 1.852 1.758 1.628 1.481 1.287 1.034 0.629 -0.018 -0.956 -2.339 -4.53 -7.079 -9.098 -10.726 -12.049 -13.166 -14.121 -14.953 -15.676 -16.409 -17.018 -17.526 -17.994 -18.458 -18.897 -19.285 -19.686 -20.042 -20.332 -20.612 -20.897 -21.142 -21.401 -21.67 -21.867 -22.05 -22.237 -22.441 -22.661 -22.813 -22.962 -23.176 -23.323 -23.483 -23.573 -23.759 -23.941 -24.129 -24.222 -24.536 -24.512 -24.611 -24.711 -24.927 -25.039 -25.15 -25.262 -25.401 -25.567 -25.714 -25.942 -6 ,10033 ,TETRA ,17699037,Sat Dec 4 17:05:35 CET,Sat Dec 4 17:13:04 CET,0.0 0.412 0.517 0.599 0.658 0.717 0.78 0.833 0.931 0.972 1.002 0.879 1.12 1.16 1.248 1.32 1.384 1.419 1.47 1.512 1.572 1.605 1.634 1.677 1.734 1.793 1.834 1.866 1.916 1.974 2.031 2.068 2.086 2.111 2.16 2.233 2.252 2.214 2.2 2.191 2.141 2.074 1.975 1.838 1.622 1.329 0.954 0.379 -0.536 -1.924 -4.171 -6.679 -8.627 -10.215 -11.507 -12.615 -13.594 -14.48 -15.242 -15.956 -16.53 -17.064 -17.566 -18.005 -18.409 -18.791 -19.211 -19.591 -19.899 -20.211 -20.526 -20.775 -21.032 -21.303 -21.52 -21.74 -21.979 -22.238 -22.491 -22.653 -22.812 -23.049 -23.216 -23.387 -23.474 -23.644 -23.797 -23.968 -24.064 -24.38 -24.33 -24.427 -24.538 -24.726 -24.829 -24.961 -25.102 -25.252 -25.408 -25.615 -25.884 -7 ,13263 ,TETRA ,17699038,Sat Dec 4 17:05:36 CET,Sat Dec 4 17:13:04 CET,0.0 0.169 0.297 0.434 0.544 0.619 0.679 0.73 0.833 0.871 0.907 0.798 1.039 1.073 1.143 1.219 1.283 1.313 1.36 1.415 1.498 1.534 1.573 1.629 1.674 1.717 1.75 1.784 1.84 1.887 1.928 1.985 2.017 2.041 2.08 2.11 2.113 2.092 2.065 2.014 1.939 1.85 1.705 1.536 1.316 0.996 0.533 -0.077 -0.933 -2.236 -4.414 -6.923 -8.886 -10.515 -11.864 -13.006 -14.001 -14.859 -15.561 -16.293 -16.908 -17.442 -17.96 -18.442 -18.843 -19.197 -19.592 -19.918 -20.18 -20.468 -20.764 -21.004 -21.256 -21.516 -21.71 -21.916 -22.159 -22.403 -22.619 -22.762 -22.909 -23.132 -23.287 -23.441 -23.518 -23.686 -23.865 -24.041 -24.129 -24.447 -24.414 -24.505 -24.609 -24.836 -24.958 -25.092 -25.228 -25.366 -25.52 -25.706 -26.059 -8 ,27666 ,TETRA ,17674924,Sat Dec 4 15:22:13 CET,Sat Dec 4 17:10:15 CET,0.0 0.098 0.168 0.223 0.287 0.371 0.451 0.521 0.65 0.708 0.754 0.658 0.906 0.943 1.03 1.113 1.174 1.197 1.257 1.325 1.417 1.47 1.514 1.589 1.655 1.701 1.737 1.775 1.825 1.862 1.887 1.907 1.925 1.933 1.944 1.982 1.994 1.978 1.962 1.92 1.833 1.732 1.604 1.451 1.264 0.988 0.574 -0.014 -0.897 -2.24 -4.409 -6.907 -8.911 -10.527 -11.876 -13.039 -14.063 -14.985 -15.749 -16.507 -17.17 -17.729 -18.206 -18.637 -19.039 -19.41 -19.775 -20.109 -20.399 -20.693 -21.014 -21.263 -21.523 -21.806 -22.014 -22.219 -22.425 -22.637 -22.849 -22.984 -23.126 -23.363 -23.519 -23.672 -23.756 -23.929 -24.103 -24.291 -24.385 -24.701 -24.689 -24.794 -24.902 -25.124 -25.222 -25.34 -25.488 -25.628 -25.743 -25.9 -26.208 -10 ,17694 ,TETRA ,17699041,Sat Dec 4 17:08:34 CET,Sat Dec 4 19:06:59 CET,0.0 0.12 0.196 0.284 0.373 0.43 0.494 0.564 0.684 0.722 0.754 0.624 0.86 0.885 0.915 0.951 0.995 1.015 1.052 1.095 1.154 1.195 1.239 1.291 1.332 1.357 1.372 1.408 1.456 1.468 1.481 1.503 1.52 1.538 1.551 1.576 1.609 1.618 1.591 1.554 1.532 1.507 1.42 1.278 1.053 0.741 0.334 -0.255 -1.106 -2.433 -4.674 -7.197 -9.158 -10.776 -12.128 -13.313 -14.322 -15.175 -15.875 -16.587 -17.193 -17.727 -18.232 -18.681 -19.07 -19.418 -19.782 -20.097 -20.365 -20.639 -20.931 -21.166 -21.396 -21.666 -21.885 -22.103 -22.322 -22.533 -22.75 -22.906 -23.07 -23.313 -23.481 -23.655 -23.733 -23.891 -24.064 -24.245 -24.345 -24.669 -24.65 -24.755 -24.842 -25.022 -25.128 -25.246 -25.37 -25.497 -25.64 -25.808 -26.024 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5f.txt deleted file mode 100644 index 63ccb6d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,120 ,TETRA ,17699042,Sat Dec 4 17:08:35 CET,Sat Dec 4 17:24:07 CET,0.0 0.416 0.61 0.76 0.905 1.042 1.165 1.289 1.513 1.61 1.701 1.673 1.954 2.043 2.216 2.391 2.562 2.644 2.796 2.949 3.171 3.311 3.462 3.684 3.895 4.094 4.287 4.47 4.706 4.951 5.212 5.537 5.821 6.077 6.395 6.783 7.169 7.564 7.97 8.437 8.93 9.474 10.132 10.808 11.623 12.562 13.681 14.942 16.387 18.214 20.551 22.499 23.711 24.506 25.045 25.454 25.754 25.946 26.043 26.095 26.116 26.113 26.093 26.075 26.05 26.018 25.976 25.925 25.876 25.827 25.762 25.679 25.577 25.487 25.422 25.353 25.283 25.199 25.105 25.037 24.968 24.879 24.82 24.754 24.723 24.648 24.562 24.477 24.43 24.209 24.285 24.228 24.173 24.069 23.992 23.907 23.83 23.743 23.64 23.541 23.288 -2 ,8631 ,TETRA ,17699043,Sat Dec 4 17:08:35 CET,Sat Dec 4 17:12:23 CET,0.0 0.213 0.347 0.461 0.583 0.692 0.79 0.879 1.048 1.128 1.202 1.161 1.441 1.529 1.693 1.837 1.988 2.06 2.199 2.349 2.559 2.701 2.846 3.063 3.274 3.458 3.643 3.84 4.08 4.3 4.528 4.815 5.081 5.326 5.606 5.944 6.289 6.665 7.077 7.532 8.035 8.616 9.284 9.969 10.784 11.704 12.773 13.997 15.487 17.337 19.699 21.773 23.007 23.775 24.298 24.688 24.929 25.034 25.113 25.19 25.238 25.284 25.286 25.272 25.286 25.301 25.27 25.203 25.144 25.088 25.014 24.944 24.887 24.833 24.791 24.739 24.67 24.615 24.569 24.52 24.474 24.42 24.366 24.312 24.285 24.214 24.141 24.061 24.011 23.792 23.879 23.825 23.77 23.632 23.544 23.443 23.351 23.27 23.173 23.059 22.899 -3 ,9698 ,TETRA ,17699044,Sat Dec 4 17:08:35 CET,Sat Dec 4 17:26:17 CET,0.0 0.399 0.593 0.719 0.861 1.008 1.139 1.246 1.452 1.562 1.666 1.652 1.936 2.032 2.208 2.356 2.504 2.579 2.721 2.878 3.115 3.253 3.389 3.591 3.774 3.952 4.136 4.313 4.556 4.813 5.063 5.373 5.68 5.972 6.289 6.623 6.967 7.364 7.776 8.204 8.665 9.209 9.861 10.536 11.397 12.404 13.579 14.887 16.377 18.197 20.532 22.53 23.677 24.435 24.972 25.35 25.593 25.727 25.811 25.855 25.873 25.892 25.907 25.901 25.875 25.842 25.805 25.761 25.711 25.665 25.622 25.584 25.532 25.463 25.409 25.348 25.293 25.247 25.195 25.163 25.116 25.02 24.964 24.901 24.862 24.783 24.7 24.617 24.581 24.381 24.473 24.418 24.364 24.25 24.176 24.082 23.986 23.904 23.818 23.711 23.541 -4 ,31635 ,TETRA ,17699045,Sat Dec 4 17:08:35 CET,Sat Dec 4 17:12:41 CET,0.0 0.213 0.388 0.523 0.65 0.772 0.884 0.99 1.21 1.314 1.412 1.399 1.676 1.757 1.921 2.093 2.244 2.317 2.471 2.615 2.823 2.958 3.092 3.287 3.479 3.676 3.883 4.092 4.36 4.607 4.84 5.124 5.397 5.674 5.991 6.336 6.692 7.108 7.546 7.999 8.49 9.071 9.791 10.522 11.341 12.29 13.43 14.668 16.097 17.865 20.127 22.089 23.272 24.042 24.58 24.952 25.193 25.373 25.501 25.582 25.615 25.633 25.631 25.621 25.6 25.565 25.54 25.517 25.492 25.448 25.384 25.324 25.273 25.222 25.165 25.11 25.049 24.982 24.921 24.878 24.825 24.749 24.696 24.625 24.586 24.518 24.467 24.412 24.369 24.153 24.252 24.207 24.157 24.052 23.994 23.92 23.831 23.756 23.677 23.51 23.214 -5 ,16416 ,TETRA ,17699046,Sat Dec 4 17:08:36 CET,Sat Dec 4 17:13:21 CET,0.0 0.221 0.385 0.51 0.62 0.726 0.817 0.898 1.065 1.143 1.224 1.192 1.475 1.561 1.731 1.899 2.053 2.13 2.307 2.487 2.729 2.876 3.01 3.219 3.421 3.604 3.789 3.965 4.189 4.43 4.682 4.979 5.244 5.493 5.802 6.182 6.551 6.956 7.415 7.892 8.371 8.927 9.616 10.312 11.123 12.078 13.198 14.497 16.078 18.014 20.37 22.251 23.424 24.162 24.663 25.041 25.28 25.447 25.572 25.644 25.661 25.658 25.652 25.637 25.61 25.595 25.582 25.561 25.515 25.442 25.37 25.326 25.295 25.242 25.18 25.11 25.055 24.998 24.918 24.856 24.797 24.708 24.655 24.597 24.563 24.488 24.399 24.316 24.279 24.062 24.143 24.093 24.036 23.902 23.826 23.742 23.65 23.576 23.479 23.343 23.157 -6 ,1428 ,TETRA ,17699047,Sat Dec 4 17:08:36 CET,Sat Dec 4 17:12:28 CET,0.0 0.258 0.424 0.594 0.752 0.871 0.979 1.084 1.303 1.399 1.484 1.443 1.724 1.808 1.954 2.094 2.233 2.306 2.455 2.612 2.836 2.977 3.117 3.309 3.49 3.674 3.855 4.012 4.234 4.48 4.714 5.0 5.288 5.574 5.904 6.244 6.566 6.942 7.349 7.79 8.284 8.85 9.501 10.181 10.99 11.919 12.992 14.209 15.733 17.607 19.87 21.734 22.88 23.636 24.163 24.522 24.757 24.915 24.989 25.06 25.12 25.163 25.17 25.157 25.145 25.129 25.108 25.077 25.045 25.002 24.952 24.905 24.854 24.815 24.767 24.707 24.66 24.608 24.535 24.486 24.434 24.351 24.302 24.247 24.22 24.152 24.063 23.98 23.939 23.72 23.804 23.755 23.706 23.579 23.498 23.429 23.356 23.259 23.151 23.007 22.753 -7 ,5123 ,TETRA ,17674933,Sat Dec 4 15:22:14 CET,Sat Dec 4 17:09:59 CET,0.0 0.186 0.336 0.469 0.591 0.693 0.796 0.913 1.108 1.187 1.277 1.261 1.538 1.628 1.8 1.953 2.118 2.191 2.312 2.445 2.656 2.787 2.908 3.084 3.291 3.494 3.672 3.846 4.075 4.307 4.522 4.778 5.03 5.275 5.576 5.909 6.235 6.621 7.029 7.461 7.927 8.474 9.145 9.829 10.613 11.517 12.601 13.827 15.314 17.103 19.292 21.143 22.267 23.023 23.521 23.86 24.069 24.232 24.312 24.336 24.378 24.42 24.448 24.462 24.465 24.461 24.424 24.371 24.34 24.307 24.246 24.182 24.097 24.004 23.948 23.893 23.84 23.782 23.727 23.694 23.658 23.592 23.525 23.443 23.402 23.325 23.247 23.155 23.104 22.884 22.962 22.905 22.844 22.73 22.673 22.612 22.546 22.467 22.372 22.255 22.082 -8 ,24269 ,TETRA ,17674934,Sat Dec 4 15:22:14 CET,Sat Dec 4 17:16:06 CET,0.0 0.614 0.797 0.911 1.034 1.179 1.321 1.452 1.691 1.799 1.896 1.873 2.141 2.211 2.364 2.523 2.677 2.75 2.89 3.029 3.238 3.368 3.491 3.676 3.864 4.044 4.23 4.417 4.638 4.839 5.037 5.303 5.574 5.828 6.119 6.47 6.838 7.234 7.645 8.095 8.581 9.121 9.767 10.432 11.211 12.119 13.231 14.511 16.023 17.842 20.111 22.051 23.214 23.996 24.491 24.836 25.063 25.206 25.333 25.434 25.506 25.548 25.561 25.549 25.511 25.474 25.427 25.382 25.332 25.266 25.194 25.14 25.063 24.976 24.917 24.858 24.796 24.722 24.653 24.604 24.545 24.455 24.399 24.344 24.31 24.236 24.162 24.079 24.035 23.811 23.872 23.825 23.78 23.656 23.585 23.527 23.456 23.357 23.237 23.119 22.95 -9 ,12474 ,TETRA ,17674935,Sat Dec 4 15:22:14 CET,Sat Dec 4 17:18:47 CET,0.0 0.175 0.291 0.388 0.489 0.593 0.691 0.788 0.958 1.038 1.12 1.093 1.37 1.457 1.623 1.777 1.932 2.004 2.149 2.285 2.465 2.585 2.703 2.876 3.051 3.225 3.402 3.58 3.8 4.016 4.237 4.513 4.781 5.037 5.329 5.683 6.056 6.438 6.81 7.232 7.708 8.269 8.933 9.598 10.393 11.307 12.366 13.59 15.126 17.018 19.367 21.381 22.571 23.362 23.893 24.23 24.457 24.618 24.682 24.734 24.798 24.846 24.849 24.823 24.824 24.828 24.805 24.754 24.701 24.66 24.624 24.581 24.528 24.474 24.424 24.365 24.296 24.227 24.16 24.106 24.048 23.95 23.878 23.814 23.784 23.711 23.645 23.574 23.538 23.326 23.404 23.357 23.317 23.237 23.194 23.145 23.087 23.022 22.953 22.875 22.714 -10 ,1878 ,TETRA ,17674936,Sat Dec 4 15:22:14 CET,Sat Dec 4 17:10:24 CET,0.0 0.283 0.395 0.503 0.613 0.726 0.836 0.935 1.124 1.221 1.312 1.287 1.576 1.664 1.854 2.051 2.215 2.296 2.45 2.589 2.811 2.97 3.12 3.317 3.504 3.702 3.895 4.066 4.286 4.508 4.745 5.038 5.312 5.576 5.899 6.265 6.588 6.939 7.334 7.769 8.249 8.785 9.437 10.13 10.922 11.835 12.933 14.18 15.699 17.562 19.891 21.895 23.075 23.851 24.364 24.714 24.976 25.137 25.228 25.33 25.406 25.419 25.402 25.39 25.376 25.347 25.323 25.289 25.229 25.175 25.135 25.104 25.06 24.994 24.947 24.911 24.874 24.807 24.728 24.685 24.632 24.554 24.515 24.474 24.449 24.387 24.33 24.28 24.239 24.006 24.062 24.004 23.949 23.829 23.748 23.669 23.595 23.516 23.423 23.301 23.033 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5j.txt deleted file mode 100644 index be0f1dd9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5l_5j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5777 ,TETRA ,17674937,Sat Dec 4 15:22:13 CET,Sat Dec 4 17:27:28 CET,0.0 0.227 0.354 0.46 0.558 0.656 0.752 0.839 1.013 1.081 1.149 1.106 1.365 1.41 1.514 1.614 1.7 1.74 1.82 1.909 2.047 2.127 2.196 2.29 2.367 2.435 2.504 2.568 2.653 2.746 2.846 2.963 3.068 3.156 3.253 3.357 3.433 3.497 3.569 3.677 3.817 3.969 4.099 4.143 4.142 4.162 4.165 4.089 3.842 3.277 2.186 0.747 -0.486 -1.539 -2.453 -3.246 -3.914 -4.536 -5.076 -5.587 -6.023 -6.409 -6.767 -7.105 -7.419 -7.715 -8.036 -8.308 -8.53 -8.777 -9.049 -9.279 -9.517 -9.742 -9.892 -10.052 -10.229 -10.414 -10.611 -10.748 -10.875 -11.063 -11.207 -11.349 -11.427 -11.579 -11.717 -11.876 -11.975 -12.297 -12.282 -12.363 -12.441 -12.617 -12.711 -12.81 -12.939 -13.086 -13.229 -13.393 -13.656 -2 ,32290 ,TETRA ,17674938,Sat Dec 4 15:22:15 CET,Sat Dec 4 17:28:32 CET,0.0 0.453 0.637 0.756 0.833 0.916 1.003 1.077 1.219 1.287 1.351 1.27 1.516 1.573 1.674 1.779 1.895 1.943 2.028 2.113 2.249 2.328 2.387 2.479 2.581 2.672 2.755 2.824 2.899 2.984 3.076 3.203 3.335 3.43 3.524 3.632 3.724 3.836 3.94 4.035 4.138 4.231 4.334 4.397 4.43 4.466 4.447 4.317 4.117 3.703 2.6 1.115 -0.079 -1.145 -2.093 -2.908 -3.608 -4.239 -4.806 -5.369 -5.818 -6.22 -6.604 -6.974 -7.317 -7.622 -7.956 -8.23 -8.438 -8.664 -8.911 -9.111 -9.324 -9.566 -9.757 -9.936 -10.112 -10.297 -10.477 -10.596 -10.719 -10.928 -11.071 -11.227 -11.308 -11.446 -11.572 -11.713 -11.795 -12.09 -12.068 -12.175 -12.277 -12.494 -12.609 -12.731 -12.869 -13.027 -13.206 -13.395 -13.63 -3 ,7867 ,TETRA ,17674939,Sat Dec 4 15:22:15 CET,Sat Dec 4 17:10:14 CET,0.0 0.213 0.379 0.507 0.623 0.711 0.778 0.852 0.997 1.061 1.118 1.039 1.291 1.347 1.447 1.543 1.647 1.696 1.774 1.846 1.954 2.027 2.107 2.216 2.304 2.376 2.458 2.533 2.611 2.709 2.805 2.894 2.982 3.077 3.185 3.281 3.371 3.463 3.541 3.621 3.698 3.796 3.873 3.898 3.911 3.914 3.863 3.753 3.502 2.957 1.813 0.354 -0.931 -2.042 -2.923 -3.746 -4.462 -5.088 -5.665 -6.219 -6.634 -7.016 -7.407 -7.765 -8.093 -8.388 -8.69 -8.945 -9.167 -9.406 -9.658 -9.855 -10.068 -10.306 -10.48 -10.641 -10.803 -10.999 -11.214 -11.353 -11.482 -11.669 -11.813 -11.969 -12.043 -12.182 -12.329 -12.473 -12.55 -12.844 -12.8 -12.892 -12.993 -13.229 -13.35 -13.459 -13.563 -13.653 -13.773 -13.992 -14.21 -4 ,19638 ,TETRA ,17674940,Sat Dec 4 15:22:15 CET,Sat Dec 4 17:10:12 CET,0.0 0.2 0.366 0.526 0.651 0.731 0.802 0.882 1.019 1.081 1.156 1.092 1.349 1.403 1.486 1.564 1.639 1.673 1.741 1.805 1.894 1.963 2.043 2.15 2.245 2.333 2.414 2.496 2.603 2.707 2.813 2.924 3.026 3.126 3.225 3.328 3.433 3.552 3.659 3.774 3.874 3.969 4.081 4.14 4.18 4.202 4.147 4.016 3.704 3.103 2.077 0.773 -0.413 -1.548 -2.513 -3.377 -4.138 -4.786 -5.365 -5.924 -6.382 -6.789 -7.172 -7.533 -7.881 -8.204 -8.519 -8.778 -9.001 -9.254 -9.508 -9.702 -9.9 -10.096 -10.257 -10.42 -10.567 -10.736 -10.934 -11.074 -11.208 -11.396 -11.527 -11.678 -11.755 -11.909 -12.072 -12.237 -12.324 -12.625 -12.592 -12.674 -12.77 -12.986 -13.091 -13.214 -13.345 -13.507 -13.681 -13.88 -14.136 -5 ,16517 ,TETRA ,17699056,Sat Dec 4 17:08:38 CET,Sat Dec 4 17:12:32 CET,0.0 0.412 0.595 0.748 0.88 0.96 1.029 1.102 1.234 1.298 1.361 1.281 1.525 1.573 1.685 1.797 1.902 1.95 2.043 2.136 2.267 2.349 2.422 2.526 2.619 2.697 2.773 2.86 2.962 3.056 3.171 3.292 3.369 3.447 3.547 3.669 3.777 3.856 3.948 4.039 4.087 4.158 4.24 4.285 4.321 4.306 4.232 4.082 3.794 3.286 2.244 0.769 -0.563 -1.725 -2.714 -3.556 -4.299 -4.974 -5.513 -6.041 -6.506 -6.931 -7.326 -7.692 -8.031 -8.339 -8.676 -8.973 -9.203 -9.445 -9.701 -9.897 -10.086 -10.293 -10.46 -10.616 -10.78 -10.955 -11.123 -11.244 -11.37 -11.544 -11.668 -11.798 -11.87 -12.02 -12.159 -12.305 -12.383 -12.682 -12.663 -12.754 -12.848 -13.064 -13.174 -13.29 -13.409 -13.535 -13.683 -13.841 -14.015 -6 ,5347 ,TETRA ,17699057,Sat Dec 4 17:08:37 CET,Sat Dec 4 17:29:19 CET,0.0 0.364 0.512 0.631 0.745 0.851 0.941 1.026 1.187 1.255 1.334 1.295 1.546 1.591 1.685 1.776 1.869 1.911 1.988 2.072 2.197 2.271 2.339 2.426 2.508 2.604 2.697 2.786 2.895 2.978 3.044 3.151 3.272 3.383 3.518 3.669 3.803 3.939 4.055 4.144 4.263 4.424 4.55 4.604 4.618 4.615 4.557 4.354 4.048 3.581 2.569 1.296 0.122 -1.042 -2.021 -2.853 -3.583 -4.225 -4.757 -5.314 -5.833 -6.262 -6.637 -7.027 -7.38 -7.678 -8.01 -8.316 -8.578 -8.826 -9.071 -9.271 -9.477 -9.713 -9.899 -10.085 -10.272 -10.459 -10.652 -10.789 -10.926 -11.122 -11.267 -11.421 -11.499 -11.663 -11.824 -11.997 -12.086 -12.399 -12.398 -12.493 -12.588 -12.794 -12.907 -13.027 -13.178 -13.36 -13.512 -13.657 -13.992 -7 ,5171 ,TETRA ,17674943,Sat Dec 4 15:23:04 CET,Sat Dec 4 17:26:22 CET,0.0 0.188 0.328 0.424 0.539 0.64 0.722 0.809 0.971 1.035 1.09 1.021 1.289 1.352 1.468 1.57 1.659 1.704 1.793 1.882 2.012 2.088 2.159 2.266 2.368 2.474 2.586 2.678 2.772 2.849 2.923 3.014 3.111 3.201 3.293 3.396 3.502 3.6 3.709 3.831 3.923 4.045 4.199 4.281 4.358 4.417 4.355 4.242 3.987 3.357 2.107 0.561 -0.689 -1.781 -2.768 -3.632 -4.336 -4.953 -5.479 -6.008 -6.461 -6.855 -7.232 -7.583 -7.925 -8.249 -8.567 -8.841 -9.079 -9.31 -9.528 -9.711 -9.931 -10.175 -10.354 -10.527 -10.695 -10.865 -11.031 -11.16 -11.299 -11.51 -11.657 -11.8 -11.874 -12.02 -12.164 -12.315 -12.39 -12.685 -12.673 -12.777 -12.882 -13.101 -13.214 -13.335 -13.462 -13.585 -13.717 -13.871 -14.124 -8 ,25843 ,TETRA ,17674944,Sat Dec 4 15:23:02 CET,Sat Dec 4 17:22:04 CET,0.0 0.267 0.391 0.497 0.604 0.707 0.791 0.869 1.017 1.083 1.145 1.066 1.319 1.377 1.495 1.605 1.719 1.772 1.867 1.949 2.068 2.148 2.216 2.312 2.415 2.518 2.626 2.721 2.827 2.926 3.016 3.111 3.189 3.261 3.344 3.455 3.568 3.679 3.832 3.958 4.012 4.068 4.161 4.284 4.399 4.476 4.422 4.234 3.96 3.328 2.065 0.527 -0.805 -1.946 -2.893 -3.747 -4.48 -5.107 -5.645 -6.187 -6.679 -7.106 -7.495 -7.855 -8.199 -8.522 -8.83 -9.099 -9.325 -9.566 -9.825 -10.031 -10.227 -10.433 -10.588 -10.739 -10.895 -11.056 -11.224 -11.348 -11.473 -11.65 -11.783 -11.936 -12.018 -12.165 -12.306 -12.456 -12.524 -12.804 -12.732 -12.811 -12.898 -13.078 -13.169 -13.268 -13.386 -13.506 -13.653 -13.869 -14.179 -9 ,8561 ,TETRA ,17674945,Sat Dec 4 15:23:04 CET,Sat Dec 4 17:11:07 CET,0.0 0.197 0.35 0.455 0.552 0.638 0.706 0.77 0.898 0.96 1.019 0.913 1.15 1.194 1.275 1.355 1.427 1.463 1.541 1.615 1.735 1.825 1.909 2.022 2.118 2.207 2.298 2.38 2.467 2.545 2.624 2.712 2.811 2.924 3.031 3.126 3.226 3.338 3.458 3.566 3.646 3.738 3.833 3.9 3.924 3.924 3.891 3.751 3.429 2.817 1.689 0.237 -0.979 -2.052 -2.962 -3.749 -4.443 -5.047 -5.543 -6.05 -6.478 -6.86 -7.24 -7.606 -7.959 -8.282 -8.598 -8.861 -9.089 -9.337 -9.607 -9.82 -10.023 -10.219 -10.381 -10.551 -10.707 -10.88 -11.068 -11.201 -11.345 -11.556 -11.685 -11.821 -11.895 -12.049 -12.207 -12.366 -12.45 -12.739 -12.681 -12.765 -12.863 -13.09 -13.228 -13.375 -13.52 -13.655 -13.793 -13.962 -14.31 -10 ,30904 ,TETRA ,17674946,Sat Dec 4 15:23:04 CET,Sat Dec 4 17:11:21 CET,0.0 0.331 0.547 0.706 0.805 0.924 1.047 1.139 1.278 1.338 1.404 1.339 1.606 1.675 1.791 1.894 2.011 2.066 2.163 2.258 2.388 2.469 2.547 2.649 2.743 2.822 2.9 2.996 3.12 3.241 3.37 3.517 3.643 3.774 3.902 4.013 4.129 4.266 4.404 4.503 4.572 4.65 4.77 4.877 4.925 4.937 4.911 4.828 4.584 4.097 3.129 1.737 0.505 -0.611 -1.518 -2.297 -3.015 -3.675 -4.268 -4.841 -5.296 -5.687 -6.079 -6.473 -6.827 -7.132 -7.461 -7.764 -8.01 -8.262 -8.51 -8.695 -8.876 -9.083 -9.248 -9.41 -9.569 -9.732 -9.912 -10.036 -10.159 -10.346 -10.489 -10.629 -10.698 -10.849 -11.013 -11.184 -11.267 -11.562 -11.503 -11.591 -11.685 -11.863 -11.968 -12.085 -12.187 -12.291 -12.419 -12.536 -12.679 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5d.txt deleted file mode 100644 index 0577a29d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30133 ,KEBNE ,17070536,Fri Dec 24 19:04:59 CET,Fri Dec 24 20:49:01 CET,0.0 0.269 0.408 0.519 0.597 0.668 0.753 0.838 0.976 1.053 1.124 1.063 1.328 1.393 1.511 1.62 1.723 1.769 1.853 1.929 2.029 2.099 2.175 2.289 2.411 2.542 2.659 2.758 2.884 3.002 3.108 3.232 3.351 3.461 3.6 3.789 3.971 4.149 4.34 4.544 4.734 4.941 5.176 5.402 5.658 5.913 6.143 6.376 6.596 6.699 6.647 6.285 5.686 5.121 4.643 4.155 3.731 3.332 2.938 2.54 2.218 1.922 1.631 1.344 1.051 0.807 0.567 0.318 0.085 -0.159 -0.399 -0.581 -0.768 -0.967 -1.125 -1.281 -1.44 -1.604 -1.761 -1.882 -2.007 -2.205 -2.341 -2.466 -2.533 -2.671 -2.825 -3.005 -3.09 -3.367 -3.369 -3.481 -3.593 -3.854 -4.006 -4.141 -4.267 -4.422 -4.605 -4.855 -5.315 -2 ,18917 ,KEBNE ,17070537,Fri Dec 24 19:03:56 CET,Fri Dec 24 20:48:46 CET,0.0 0.261 0.425 0.533 0.631 0.731 0.828 0.917 1.082 1.16 1.241 1.193 1.445 1.501 1.601 1.703 1.795 1.839 1.929 2.02 2.154 2.239 2.318 2.432 2.548 2.661 2.77 2.883 3.011 3.124 3.241 3.38 3.51 3.641 3.801 3.978 4.135 4.304 4.478 4.645 4.809 5.002 5.234 5.481 5.751 5.971 6.183 6.411 6.64 6.835 6.875 6.588 6.128 5.668 5.271 4.869 4.46 4.081 3.756 3.438 3.158 2.916 2.683 2.427 2.191 1.977 1.748 1.554 1.379 1.209 1.015 0.829 0.639 0.441 0.285 0.136 -0.019 -0.186 -0.374 -0.514 -0.654 -0.872 -1.019 -1.162 -1.23 -1.375 -1.549 -1.709 -1.779 -2.053 -2.067 -2.18 -2.288 -2.513 -2.647 -2.794 -2.925 -3.069 -3.289 -3.564 -4.025 -3 ,12092 ,KEBNE ,17070538,Fri Dec 24 19:03:56 CET,Fri Dec 24 20:47:41 CET,0.0 0.229 0.358 0.484 0.584 0.671 0.769 0.85 0.977 1.041 1.107 1.058 1.312 1.366 1.475 1.589 1.698 1.757 1.864 1.941 2.044 2.124 2.213 2.343 2.458 2.567 2.683 2.796 2.93 3.056 3.185 3.327 3.473 3.623 3.765 3.926 4.091 4.254 4.427 4.61 4.802 5.016 5.264 5.497 5.746 6.053 6.393 6.648 6.852 7.012 6.948 6.501 5.961 5.423 4.881 4.382 3.948 3.512 3.128 2.765 2.46 2.163 1.859 1.577 1.316 1.08 0.825 0.576 0.356 0.132 -0.092 -0.269 -0.454 -0.648 -0.807 -0.967 -1.119 -1.276 -1.447 -1.57 -1.695 -1.882 -2.015 -2.159 -2.231 -2.36 -2.484 -2.627 -2.703 -2.989 -2.998 -3.101 -3.212 -3.43 -3.537 -3.66 -3.832 -4.017 -4.238 -4.509 -4.801 -4 ,12709 ,KEBNE ,17070539,Fri Dec 24 19:04:59 CET,Fri Dec 24 20:50:07 CET,0.0 0.24 0.352 0.45 0.536 0.621 0.706 0.788 0.957 1.033 1.102 1.035 1.284 1.342 1.45 1.547 1.644 1.688 1.762 1.842 1.964 2.045 2.12 2.226 2.349 2.477 2.582 2.679 2.81 2.935 3.057 3.208 3.351 3.493 3.671 3.874 4.066 4.268 4.466 4.66 4.859 5.095 5.359 5.592 5.853 6.102 6.346 6.589 6.811 7.007 6.95 6.504 5.947 5.349 4.848 4.404 3.966 3.531 3.144 2.776 2.485 2.189 1.879 1.576 1.284 1.007 0.709 0.47 0.293 0.121 -0.072 -0.237 -0.407 -0.587 -0.735 -0.882 -1.029 -1.187 -1.353 -1.479 -1.611 -1.818 -1.963 -2.11 -2.183 -2.317 -2.455 -2.614 -2.703 -2.99 -2.987 -3.094 -3.205 -3.419 -3.521 -3.642 -3.793 -3.951 -4.114 -4.313 -4.921 -5 ,25255 ,KEBNE ,17070540,Fri Dec 24 19:04:59 CET,Fri Dec 24 20:49:51 CET,0.0 0.17 0.315 0.423 0.513 0.603 0.684 0.76 0.914 0.995 1.069 1.017 1.269 1.316 1.42 1.542 1.649 1.696 1.795 1.881 1.999 2.079 2.161 2.273 2.386 2.502 2.605 2.706 2.84 2.958 3.077 3.243 3.395 3.529 3.678 3.831 3.979 4.137 4.312 4.497 4.683 4.897 5.126 5.331 5.561 5.847 6.181 6.462 6.701 6.846 6.721 6.319 5.853 5.397 4.971 4.518 4.05 3.62 3.261 2.896 2.598 2.322 2.029 1.752 1.512 1.268 0.997 0.785 0.6 0.399 0.169 -0.035 -0.236 -0.429 -0.575 -0.716 -0.861 -1.023 -1.194 -1.32 -1.451 -1.644 -1.772 -1.899 -1.959 -2.086 -2.235 -2.391 -2.482 -2.771 -2.771 -2.886 -3.012 -3.269 -3.379 -3.491 -3.62 -3.758 -3.9 -4.063 -4.643 -6 ,32756 ,KEBNE ,17070541,Fri Dec 24 19:04:59 CET,Fri Dec 24 20:49:48 CET,0.0 0.29 0.38 0.487 0.601 0.704 0.795 0.865 1.011 1.085 1.154 1.085 1.325 1.369 1.467 1.554 1.637 1.681 1.763 1.85 2.007 2.105 2.187 2.293 2.4 2.507 2.62 2.738 2.873 2.995 3.102 3.213 3.325 3.451 3.598 3.75 3.899 4.066 4.24 4.418 4.573 4.76 4.98 5.169 5.389 5.644 5.909 6.154 6.379 6.531 6.486 6.111 5.67 5.16 4.657 4.222 3.808 3.381 3.0 2.647 2.356 2.081 1.803 1.543 1.304 1.067 0.807 0.599 0.408 0.174 -0.056 -0.232 -0.411 -0.589 -0.749 -0.923 -1.08 -1.259 -1.452 -1.577 -1.693 -1.891 -2.044 -2.198 -2.269 -2.401 -2.563 -2.744 -2.831 -3.111 -3.11 -3.215 -3.31 -3.555 -3.692 -3.842 -4.007 -4.167 -4.351 -4.654 -5.408 -7 ,1435 ,KEBNE ,17070542,Fri Dec 24 19:04:59 CET,Fri Dec 24 20:48:52 CET,0.0 0.23 0.359 0.466 0.559 0.641 0.703 0.77 0.935 1.008 1.076 1.014 1.262 1.319 1.441 1.546 1.625 1.666 1.764 1.852 1.966 2.048 2.128 2.239 2.334 2.415 2.503 2.593 2.715 2.829 2.939 3.07 3.204 3.359 3.525 3.685 3.836 3.999 4.161 4.317 4.496 4.688 4.888 5.098 5.337 5.568 5.811 6.075 6.291 6.431 6.444 6.178 5.733 5.222 4.781 4.362 3.892 3.466 3.141 2.798 2.492 2.226 1.981 1.73 1.457 1.192 0.943 0.712 0.506 0.289 0.065 -0.111 -0.3 -0.492 -0.637 -0.793 -0.96 -1.143 -1.323 -1.439 -1.565 -1.768 -1.907 -2.045 -2.116 -2.256 -2.4 -2.561 -2.658 -2.953 -2.976 -3.086 -3.19 -3.393 -3.508 -3.627 -3.748 -3.893 -4.043 -4.288 -4.918 -8 ,9306 ,KEBNE ,17070543,Fri Dec 24 19:04:59 CET,Fri Dec 24 20:49:09 CET,0.0 0.393 0.535 0.64 0.742 0.849 0.937 1.006 1.164 1.266 1.358 1.285 1.527 1.581 1.708 1.831 1.94 1.992 2.1 2.213 2.371 2.476 2.565 2.672 2.803 2.93 3.025 3.132 3.285 3.431 3.574 3.73 3.867 3.984 4.114 4.264 4.398 4.553 4.734 4.916 5.094 5.286 5.517 5.744 5.997 6.256 6.506 6.76 6.989 7.094 6.948 6.516 6.029 5.511 5.018 4.56 4.147 3.785 3.439 3.066 2.755 2.473 2.188 1.924 1.681 1.453 1.23 1.035 0.852 0.65 0.448 0.284 0.103 -0.09 -0.247 -0.42 -0.582 -0.74 -0.897 -1.0 -1.119 -1.305 -1.425 -1.561 -1.631 -1.787 -1.953 -2.106 -2.186 -2.46 -2.444 -2.544 -2.653 -2.877 -2.994 -3.113 -3.259 -3.449 -3.654 -3.888 -4.661 -9 ,9338 ,KEBNE ,17070544,Fri Dec 24 19:06:03 CET,Fri Dec 24 20:51:05 CET,0.0 0.266 0.38 0.482 0.587 0.662 0.723 0.794 0.924 0.988 1.056 0.977 1.231 1.288 1.404 1.531 1.634 1.682 1.781 1.875 2.006 2.082 2.153 2.262 2.371 2.471 2.561 2.65 2.779 2.903 3.007 3.128 3.245 3.36 3.504 3.659 3.805 3.966 4.129 4.301 4.477 4.668 4.916 5.176 5.46 5.741 6.028 6.319 6.594 6.732 6.603 6.203 5.627 5.063 4.574 4.114 3.707 3.331 2.98 2.634 2.325 2.036 1.76 1.488 1.261 1.06 0.825 0.624 0.464 0.303 0.118 -0.036 -0.195 -0.369 -0.495 -0.627 -0.775 -0.94 -1.116 -1.244 -1.377 -1.578 -1.71 -1.845 -1.922 -2.068 -2.227 -2.407 -2.499 -2.786 -2.77 -2.884 -3.01 -3.244 -3.362 -3.497 -3.648 -3.809 -3.983 -4.191 -4.543 -10 ,11966 ,KEBNE ,17070545,Fri Dec 24 19:07:06 CET,Fri Dec 24 20:52:41 CET,0.0 0.106 0.195 0.288 0.378 0.476 0.567 0.64 0.784 0.849 0.911 0.821 1.064 1.114 1.217 1.322 1.436 1.496 1.601 1.691 1.817 1.894 1.965 2.082 2.206 2.343 2.464 2.553 2.668 2.792 2.899 3.05 3.214 3.345 3.492 3.655 3.793 3.938 4.099 4.259 4.456 4.671 4.889 5.117 5.375 5.633 5.865 6.134 6.404 6.542 6.445 6.055 5.61 5.117 4.637 4.17 3.672 3.203 2.814 2.446 2.143 1.874 1.612 1.356 1.111 0.877 0.618 0.367 0.139 -0.075 -0.259 -0.417 -0.61 -0.811 -0.952 -1.094 -1.244 -1.41 -1.595 -1.707 -1.809 -1.99 -2.114 -2.232 -2.294 -2.415 -2.548 -2.687 -2.758 -3.035 -3.009 -3.096 -3.192 -3.406 -3.523 -3.661 -3.811 -3.936 -4.071 -4.304 -5.12 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5i.txt deleted file mode 100644 index 9f6acb7a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11092 ,KEBNE ,17070546,Fri Dec 24 19:09:11 CET,Fri Dec 24 20:53:02 CET,0.0 0.261 0.392 0.506 0.606 0.692 0.779 0.856 0.996 1.066 1.129 1.072 1.327 1.387 1.515 1.636 1.752 1.801 1.895 1.993 2.119 2.199 2.285 2.423 2.562 2.685 2.804 2.91 3.033 3.152 3.267 3.436 3.617 3.772 3.959 4.2 4.411 4.615 4.824 5.033 5.244 5.484 5.762 6.03 6.314 6.658 7.029 7.33 7.665 8.081 8.269 7.986 7.611 7.149 6.699 6.33 5.935 5.558 5.218 4.839 4.534 4.278 4.035 3.816 3.593 3.39 3.207 3.034 2.878 2.703 2.505 2.336 2.163 1.997 1.882 1.762 1.632 1.503 1.361 1.263 1.166 1.016 0.904 0.779 0.722 0.608 0.492 0.381 0.321 0.067 0.141 0.077 -0.001 -0.16 -0.247 -0.373 -0.5 -0.618 -0.758 -0.903 -1.243 -2 ,20672 ,KEBNE ,17070547,Fri Dec 24 19:11:17 CET,Fri Dec 24 20:56:37 CET,0.0 0.206 0.404 0.577 0.682 0.779 0.862 0.933 1.065 1.128 1.195 1.135 1.388 1.45 1.567 1.688 1.801 1.856 1.972 2.078 2.22 2.322 2.429 2.557 2.677 2.801 2.912 3.029 3.179 3.308 3.434 3.576 3.703 3.833 4.001 4.186 4.341 4.519 4.714 4.923 5.157 5.411 5.687 5.97 6.302 6.67 7.065 7.411 7.709 7.937 8.018 7.834 7.455 7.072 6.712 6.353 6.008 5.687 5.404 5.122 4.874 4.619 4.383 4.178 3.969 3.748 3.522 3.336 3.174 2.996 2.785 2.616 2.451 2.281 2.161 2.029 1.891 1.758 1.597 1.473 1.357 1.193 1.084 0.972 0.912 0.773 0.619 0.471 0.401 0.138 0.163 0.077 -0.013 -0.224 -0.339 -0.469 -0.602 -0.732 -0.856 -1.08 -1.606 -3 ,18884 ,KEBNE ,17070548,Fri Dec 24 19:12:21 CET,Fri Dec 24 20:52:11 CET,0.0 0.207 0.341 0.453 0.536 0.616 0.698 0.779 0.924 0.987 1.057 1.024 1.291 1.358 1.483 1.591 1.692 1.753 1.874 1.968 2.092 2.174 2.254 2.383 2.512 2.621 2.722 2.825 2.974 3.123 3.262 3.434 3.59 3.747 3.923 4.1 4.272 4.503 4.766 5.011 5.268 5.565 5.873 6.146 6.45 6.807 7.194 7.534 7.914 8.321 8.559 8.392 8.089 7.76 7.393 7.014 6.655 6.318 6.026 5.699 5.396 5.126 4.878 4.62 4.359 4.14 3.936 3.77 3.63 3.458 3.276 3.135 2.972 2.8 2.66 2.519 2.386 2.254 2.128 2.035 1.939 1.79 1.676 1.566 1.515 1.406 1.297 1.195 1.136 0.88 0.934 0.857 0.759 0.526 0.41 0.295 0.167 0.033 -0.125 -0.31 -0.651 -4 ,15709 ,KEBNE ,17070549,Fri Dec 24 19:17:36 CET,Fri Dec 24 21:02:30 CET,0.0 0.207 0.327 0.458 0.593 0.708 0.796 0.879 1.055 1.133 1.201 1.143 1.403 1.468 1.606 1.733 1.85 1.908 2.015 2.118 2.272 2.385 2.491 2.614 2.724 2.84 2.96 3.07 3.218 3.374 3.518 3.678 3.824 3.978 4.156 4.336 4.503 4.685 4.882 5.081 5.322 5.609 5.898 6.158 6.432 6.746 7.118 7.495 7.851 8.184 8.37 8.178 7.854 7.49 7.091 6.694 6.348 6.006 5.65 5.287 5.001 4.763 4.52 4.29 4.074 3.867 3.666 3.469 3.279 3.103 2.932 2.786 2.633 2.467 2.345 2.224 2.096 1.963 1.815 1.71 1.606 1.443 1.325 1.199 1.134 1.003 0.875 0.731 0.649 0.365 0.353 0.265 0.192 0.035 -0.053 -0.141 -0.231 -0.365 -0.512 -0.668 -1.231 -5 ,2540 ,KEBNE ,17070550,Fri Dec 24 19:17:36 CET,Fri Dec 24 21:03:44 CET,0.0 0.302 0.473 0.598 0.7 0.781 0.85 0.926 1.084 1.15 1.214 1.137 1.381 1.439 1.559 1.669 1.78 1.838 1.945 2.041 2.179 2.277 2.378 2.528 2.67 2.789 2.894 3.003 3.166 3.316 3.43 3.572 3.729 3.878 4.048 4.254 4.467 4.694 4.916 5.141 5.359 5.584 5.883 6.209 6.542 6.887 7.259 7.626 7.994 8.318 8.439 8.189 7.802 7.432 7.059 6.668 6.326 6.038 5.782 5.463 5.162 4.885 4.614 4.389 4.185 3.998 3.785 3.573 3.387 3.202 3.023 2.88 2.73 2.566 2.436 2.316 2.199 2.081 1.95 1.847 1.732 1.549 1.432 1.31 1.247 1.138 1.042 0.928 0.86 0.591 0.592 0.497 0.412 0.238 0.156 0.064 -0.051 -0.18 -0.307 -0.461 -0.826 -6 ,17530 ,KEBNE ,17070551,Fri Dec 24 19:18:40 CET,Fri Dec 24 21:02:31 CET,0.0 0.238 0.37 0.484 0.572 0.659 0.769 0.875 1.039 1.127 1.218 1.174 1.432 1.497 1.63 1.768 1.888 1.948 2.067 2.166 2.314 2.405 2.495 2.647 2.784 2.91 3.038 3.157 3.3 3.443 3.583 3.743 3.886 4.022 4.182 4.402 4.629 4.842 5.068 5.295 5.532 5.829 6.143 6.472 6.914 7.382 7.814 8.244 8.749 9.172 9.318 9.14 8.762 8.284 7.851 7.49 7.176 6.888 6.631 6.348 6.102 5.887 5.667 5.439 5.21 4.994 4.77 4.57 4.407 4.248 4.066 3.898 3.743 3.597 3.478 3.339 3.185 3.033 2.879 2.776 2.663 2.472 2.342 2.216 2.148 2.009 1.882 1.751 1.686 1.431 1.47 1.392 1.313 1.143 1.053 0.959 0.852 0.737 0.554 0.324 0.138 -7 ,790 ,KEBNE ,17070552,Fri Dec 24 19:26:01 CET,Fri Dec 24 21:10:26 CET,0.0 0.334 0.484 0.611 0.725 0.823 0.927 1.047 1.253 1.329 1.395 1.323 1.575 1.631 1.76 1.884 1.992 2.046 2.147 2.242 2.393 2.489 2.57 2.692 2.814 2.937 3.064 3.198 3.365 3.522 3.658 3.821 3.969 4.1 4.262 4.45 4.629 4.821 5.029 5.259 5.499 5.739 5.998 6.252 6.536 6.844 7.166 7.496 7.861 8.187 8.324 8.12 7.8 7.405 7.0 6.617 6.267 5.907 5.592 5.265 4.973 4.707 4.442 4.203 3.997 3.803 3.574 3.373 3.207 3.036 2.871 2.733 2.58 2.425 2.307 2.181 2.059 1.926 1.785 1.695 1.604 1.461 1.352 1.231 1.169 1.044 0.9 0.741 0.665 0.389 0.397 0.307 0.216 -0.002 -0.119 -0.238 -0.367 -0.507 -0.656 -0.837 -1.241 -8 ,30550 ,KEBNE ,17070553,Fri Dec 24 19:26:01 CET,Fri Dec 24 21:10:33 CET,0.0 0.14 0.267 0.392 0.501 0.607 0.706 0.789 0.943 1.028 1.104 1.02 1.272 1.331 1.445 1.559 1.677 1.736 1.843 1.945 2.095 2.181 2.267 2.392 2.502 2.603 2.705 2.827 3.0 3.15 3.287 3.479 3.658 3.802 3.972 4.186 4.386 4.605 4.849 5.083 5.311 5.578 5.907 6.203 6.515 6.838 7.18 7.544 7.893 8.131 8.199 7.952 7.59 7.209 6.814 6.457 6.127 5.8 5.519 5.197 4.909 4.655 4.417 4.187 3.958 3.748 3.508 3.31 3.147 2.972 2.797 2.639 2.481 2.332 2.204 2.057 1.917 1.778 1.637 1.536 1.43 1.261 1.145 1.02 0.949 0.807 0.663 0.534 0.468 0.198 0.23 0.133 0.028 -0.141 -0.238 -0.348 -0.448 -0.561 -0.681 -0.851 -1.331 -9 ,24944 ,KEBNE ,17070554,Fri Dec 24 19:26:01 CET,Fri Dec 24 21:10:32 CET,0.0 0.202 0.328 0.446 0.552 0.653 0.754 0.843 0.992 1.061 1.127 1.057 1.315 1.38 1.501 1.624 1.754 1.81 1.905 2.023 2.191 2.278 2.363 2.494 2.637 2.783 2.91 3.02 3.159 3.311 3.459 3.626 3.782 3.941 4.127 4.32 4.502 4.702 4.921 5.155 5.399 5.651 5.923 6.215 6.562 6.898 7.258 7.676 8.109 8.453 8.657 8.57 8.252 7.846 7.471 7.086 6.704 6.339 6.027 5.707 5.41 5.169 4.948 4.716 4.508 4.325 4.099 3.873 3.7 3.55 3.399 3.261 3.096 2.91 2.771 2.65 2.532 2.401 2.266 2.168 2.071 1.94 1.845 1.727 1.658 1.512 1.372 1.238 1.163 0.896 0.945 0.866 0.787 0.646 0.579 0.499 0.389 0.261 0.106 -0.098 -0.482 -10 ,18454 ,KEBNE ,17070555,Fri Dec 24 19:26:02 CET,Fri Dec 24 21:11:16 CET,0.0 0.299 0.457 0.581 0.68 0.759 0.846 0.94 1.116 1.201 1.28 1.231 1.489 1.546 1.649 1.752 1.849 1.895 1.988 2.076 2.193 2.27 2.351 2.483 2.632 2.775 2.896 3.01 3.149 3.282 3.429 3.595 3.742 3.892 4.082 4.283 4.457 4.645 4.871 5.124 5.371 5.632 5.923 6.217 6.553 6.905 7.291 7.716 8.149 8.498 8.596 8.247 7.858 7.507 7.142 6.804 6.474 6.152 5.843 5.519 5.25 4.975 4.719 4.502 4.283 4.073 3.867 3.677 3.495 3.301 3.103 2.944 2.777 2.601 2.475 2.351 2.222 2.098 1.962 1.864 1.765 1.612 1.509 1.394 1.329 1.197 1.073 0.952 0.881 0.613 0.641 0.563 0.484 0.284 0.18 0.091 -0.013 -0.13 -0.269 -0.455 -0.864 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5k.txt deleted file mode 100644 index 85074fbd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5m_5k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29410 ,TETRA ,17699062,Sat Dec 4 17:08:42 CET,Sat Dec 4 17:15:56 CET,0.0 0.482 0.719 0.865 0.984 1.08 1.185 1.3 1.527 1.63 1.716 1.686 1.954 2.032 2.192 2.333 2.466 2.531 2.663 2.791 2.958 3.062 3.168 3.325 3.489 3.659 3.812 3.945 4.111 4.287 4.473 4.705 4.922 5.131 5.39 5.673 5.924 6.225 6.568 6.938 7.321 7.716 8.183 8.645 9.208 9.851 10.518 11.3 12.256 13.357 14.601 15.464 15.896 16.093 16.121 16.063 15.962 15.863 15.751 15.558 15.347 15.188 15.048 14.877 14.735 14.586 14.362 14.165 14.025 13.902 13.763 13.629 13.508 13.406 13.335 13.251 13.147 13.028 12.889 12.793 12.707 12.566 12.464 12.381 12.335 12.219 12.085 11.945 11.879 11.631 11.687 11.627 11.56 11.367 11.256 11.16 11.07 10.95 10.803 10.654 10.421 -2 ,29577 ,TETRA ,17699063,Sat Dec 4 17:08:39 CET,Sat Dec 4 17:15:23 CET,0.0 0.345 0.557 0.692 0.826 0.935 1.037 1.15 1.344 1.419 1.496 1.463 1.73 1.805 1.953 2.096 2.24 2.302 2.424 2.556 2.746 2.868 2.99 3.177 3.347 3.494 3.63 3.767 3.97 4.17 4.34 4.556 4.771 4.972 5.203 5.469 5.729 6.027 6.364 6.689 7.016 7.39 7.84 8.306 8.836 9.422 10.104 10.889 11.817 12.937 14.19 15.037 15.392 15.476 15.487 15.499 15.482 15.406 15.312 15.199 15.074 14.96 14.854 14.723 14.586 14.463 14.328 14.196 14.075 13.959 13.82 13.694 13.584 13.48 13.386 13.28 13.182 13.089 12.979 12.885 12.787 12.634 12.522 12.405 12.35 12.245 12.146 12.052 12.006 11.77 11.815 11.733 11.647 11.502 11.418 11.316 11.218 11.094 10.941 10.743 10.372 -3 ,22158 ,TETRA ,17674949,Sat Dec 4 15:23:06 CET,Sat Dec 4 17:12:07 CET,0.0 0.373 0.598 0.802 0.927 1.055 1.176 1.268 1.465 1.557 1.641 1.61 1.871 1.948 2.118 2.273 2.406 2.465 2.589 2.712 2.898 3.026 3.137 3.286 3.433 3.596 3.756 3.897 4.065 4.225 4.4 4.613 4.816 5.015 5.245 5.521 5.788 6.098 6.428 6.746 7.087 7.462 7.933 8.427 8.953 9.526 10.213 10.982 11.858 12.945 14.205 15.074 15.486 15.644 15.658 15.573 15.463 15.384 15.297 15.183 15.075 14.953 14.803 14.669 14.541 14.389 14.248 14.139 14.033 13.911 13.767 13.654 13.547 13.442 13.361 13.262 13.158 13.064 12.972 12.904 12.835 12.721 12.628 12.523 12.472 12.368 12.261 12.142 12.08 11.844 11.893 11.826 11.756 11.595 11.5 11.391 11.289 11.195 11.074 10.912 10.61 -4 ,6699 ,TETRA ,17674950,Sat Dec 4 15:23:07 CET,Sat Dec 4 17:12:18 CET,0.0 0.688 0.909 1.036 1.143 1.235 1.336 1.43 1.589 1.671 1.752 1.708 1.986 2.063 2.184 2.307 2.415 2.469 2.591 2.705 2.875 2.991 3.098 3.262 3.424 3.598 3.77 3.931 4.127 4.313 4.491 4.69 4.886 5.091 5.338 5.603 5.857 6.153 6.495 6.87 7.238 7.623 8.109 8.589 9.125 9.709 10.344 11.083 12.018 13.143 14.383 15.231 15.604 15.768 15.848 15.841 15.747 15.567 15.393 15.232 15.105 14.968 14.792 14.65 14.533 14.422 14.298 14.173 14.083 14.002 13.904 13.829 13.742 13.627 13.539 13.453 13.349 13.229 13.102 13.025 12.946 12.823 12.739 12.647 12.605 12.519 12.436 12.349 12.292 12.049 12.08 11.989 11.895 11.714 11.629 11.551 11.457 11.361 11.237 11.081 10.809 -5 ,10537 ,TETRA ,17699066,Sat Dec 4 17:13:25 CET,Sat Dec 4 19:15:07 CET,0.0 0.188 0.299 0.419 0.531 0.629 0.73 0.824 1.001 1.088 1.172 1.142 1.404 1.472 1.606 1.741 1.88 1.946 2.078 2.201 2.36 2.47 2.578 2.737 2.904 3.071 3.244 3.404 3.578 3.743 3.92 4.14 4.331 4.536 4.793 5.063 5.315 5.573 5.864 6.198 6.538 6.911 7.349 7.811 8.374 9.012 9.751 10.547 11.429 12.497 13.761 14.716 15.139 15.301 15.355 15.328 15.252 15.15 15.011 14.837 14.696 14.595 14.489 14.384 14.288 14.173 14.054 13.938 13.817 13.684 13.552 13.448 13.324 13.196 13.104 13.01 12.907 12.783 12.64 12.534 12.434 12.305 12.217 12.132 12.089 11.989 11.883 11.777 11.708 11.45 11.478 11.393 11.3 11.101 11.0 10.911 10.802 10.68 10.522 10.285 9.93 -6 ,24118 ,TETRA ,17674952,Sat Dec 4 15:23:07 CET,Sat Dec 4 17:12:27 CET,0.0 0.217 0.342 0.45 0.578 0.686 0.786 0.909 1.147 1.251 1.35 1.342 1.616 1.697 1.835 1.954 2.092 2.166 2.305 2.437 2.625 2.736 2.847 3.003 3.139 3.29 3.458 3.613 3.813 4.014 4.204 4.442 4.657 4.86 5.113 5.413 5.71 6.03 6.364 6.728 7.128 7.547 8.018 8.492 9.029 9.64 10.364 11.153 12.059 13.124 14.311 15.179 15.58 15.729 15.745 15.668 15.556 15.445 15.331 15.207 15.091 14.958 14.814 14.665 14.51 14.37 14.232 14.124 14.03 13.909 13.777 13.664 13.54 13.411 13.311 13.227 13.14 13.034 12.924 12.848 12.774 12.657 12.569 12.481 12.429 12.305 12.177 12.048 11.987 11.752 11.806 11.729 11.649 11.481 11.388 11.272 11.148 11.025 10.863 10.646 10.37 -7 ,17116 ,TETRA ,17674953,Sat Dec 4 15:23:07 CET,Sat Dec 4 17:12:08 CET,0.0 0.374 0.549 0.673 0.772 0.883 0.993 1.077 1.26 1.361 1.457 1.444 1.714 1.794 1.95 2.086 2.216 2.284 2.411 2.547 2.763 2.892 3.01 3.166 3.312 3.454 3.586 3.715 3.887 4.051 4.226 4.461 4.694 4.905 5.124 5.373 5.622 5.939 6.274 6.575 6.925 7.335 7.766 8.205 8.736 9.326 9.989 10.783 11.736 12.811 14.068 15.05 15.544 15.702 15.716 15.683 15.603 15.527 15.446 15.353 15.247 15.125 14.995 14.849 14.726 14.62 14.48 14.339 14.222 14.108 13.994 13.903 13.781 13.629 13.521 13.411 13.279 13.139 13.03 12.962 12.873 12.712 12.609 12.524 12.474 12.352 12.23 12.098 12.035 11.804 11.848 11.772 11.698 11.516 11.411 11.304 11.196 11.065 10.929 10.772 10.453 -8 ,2144 ,TETRA ,17699069,Sat Dec 4 17:13:30 CET,Sat Dec 4 19:14:29 CET,0.0 0.285 0.419 0.551 0.676 0.78 0.866 0.946 1.123 1.213 1.298 1.252 1.513 1.582 1.71 1.834 1.956 2.013 2.129 2.248 2.41 2.508 2.606 2.767 2.927 3.07 3.224 3.381 3.56 3.731 3.903 4.112 4.343 4.578 4.819 5.077 5.327 5.604 5.934 6.271 6.638 7.104 7.627 8.156 8.767 9.397 10.105 10.909 11.819 12.85 14.032 14.829 15.219 15.358 15.342 15.32 15.288 15.191 15.073 14.953 14.843 14.722 14.594 14.46 14.32 14.2 14.074 13.958 13.859 13.759 13.654 13.539 13.409 13.299 13.215 13.122 13.031 12.928 12.809 12.722 12.631 12.483 12.391 12.308 12.268 12.19 12.113 12.014 11.961 11.719 11.774 11.707 11.625 11.45 11.356 11.238 11.128 11.026 10.896 10.762 10.502 -9 ,10364 ,TETRA ,17674955,Sat Dec 4 15:23:07 CET,Sat Dec 4 17:11:57 CET,0.0 0.159 0.294 0.418 0.543 0.644 0.73 0.829 1.013 1.094 1.169 1.123 1.392 1.472 1.64 1.79 1.915 1.977 2.106 2.234 2.411 2.513 2.615 2.776 2.919 3.051 3.184 3.321 3.507 3.687 3.862 4.064 4.272 4.474 4.713 4.978 5.208 5.484 5.795 6.133 6.508 6.901 7.341 7.838 8.425 9.044 9.85 10.738 11.668 12.783 14.041 14.892 15.289 15.511 15.578 15.515 15.405 15.299 15.195 15.067 14.954 14.84 14.694 14.554 14.423 14.308 14.204 14.086 13.964 13.839 13.695 13.573 13.46 13.331 13.214 13.099 12.991 12.883 12.774 12.692 12.596 12.433 12.325 12.217 12.158 12.023 11.882 11.736 11.655 11.404 11.45 11.377 11.299 11.119 11.015 10.908 10.787 10.661 10.533 10.36 9.92 -10 ,30952 ,TETRA ,17674956,Sat Dec 4 15:23:07 CET,Sat Dec 4 17:12:29 CET,0.0 0.088 0.204 0.321 0.437 0.558 0.645 0.721 0.896 0.978 1.064 1.056 1.331 1.406 1.555 1.712 1.847 1.91 2.036 2.151 2.304 2.405 2.507 2.672 2.841 2.988 3.131 3.282 3.466 3.636 3.797 3.993 4.187 4.387 4.645 4.935 5.195 5.478 5.772 6.074 6.424 6.866 7.376 7.87 8.438 9.06 9.772 10.541 11.42 12.441 13.658 14.563 14.898 15.005 15.08 15.078 15.022 14.932 14.813 14.657 14.508 14.383 14.259 14.134 14.016 13.878 13.712 13.59 13.5 13.406 13.297 13.185 13.053 12.922 12.821 12.715 12.629 12.547 12.435 12.35 12.269 12.145 12.06 11.967 11.916 11.822 11.716 11.597 11.544 11.313 11.362 11.297 11.23 11.059 10.964 10.86 10.757 10.663 10.52 10.294 9.889 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5n_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5n_5d.txt deleted file mode 100644 index f61e17de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5n_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30186 ,KEBNE ,17026493,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:17:04 CET,0.0 0.155 0.305 0.412 0.491 0.568 0.635 0.691 0.791 0.839 0.883 0.791 1.022 1.067 1.154 1.243 1.337 1.376 1.445 1.518 1.619 1.681 1.74 1.821 1.91 1.995 2.082 2.17 2.276 2.379 2.484 2.602 2.711 2.814 2.925 3.047 3.154 3.279 3.429 3.587 3.762 3.955 4.138 4.29 4.439 4.621 4.825 4.942 5.003 4.865 4.099 2.859 1.825 0.775 -0.244 -1.166 -2.005 -2.799 -3.517 -4.218 -4.781 -5.293 -5.846 -6.383 -6.878 -7.329 -7.771 -8.16 -8.499 -8.855 -9.244 -9.555 -9.868 -10.215 -10.471 -10.716 -10.994 -11.309 -11.614 -11.808 -12.008 -12.332 -12.575 -12.833 -12.96 -13.223 -13.478 -13.726 -13.865 -14.212 -14.416 -14.648 -14.897 -15.451 -15.748 -16.104 -16.479 -16.866 -17.37 -18.081 -21.053 -2 ,29310 ,KEBNE ,17026494,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:17:08 CET,0.0 0.128 0.218 0.302 0.393 0.474 0.542 0.606 0.738 0.793 0.839 0.744 0.977 1.025 1.121 1.211 1.298 1.34 1.418 1.489 1.583 1.641 1.702 1.791 1.88 1.969 2.053 2.138 2.241 2.327 2.405 2.513 2.615 2.704 2.825 2.958 3.076 3.212 3.352 3.485 3.621 3.758 3.907 4.055 4.214 4.351 4.433 4.443 4.293 3.85 2.877 1.283 -0.306 -1.647 -2.812 -3.906 -4.788 -5.566 -6.268 -6.944 -7.5 -8.018 -8.535 -9.027 -9.495 -9.951 -10.409 -10.8 -11.147 -11.496 -11.875 -12.217 -12.571 -12.932 -13.205 -13.494 -13.785 -14.094 -14.429 -14.639 -14.848 -15.213 -15.479 -15.73 -15.865 -16.164 -16.456 -16.753 -16.908 -17.264 -17.44 -17.632 -17.833 -18.303 -18.574 -18.881 -19.205 -19.54 -20.053 -20.833 -24.209 -3 ,7360 ,KEBNE ,17026495,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:16:38 CET,0.0 0.157 0.257 0.35 0.421 0.481 0.554 0.64 0.794 0.852 0.908 0.831 1.072 1.129 1.239 1.339 1.419 1.456 1.534 1.605 1.709 1.786 1.854 1.961 2.062 2.154 2.246 2.329 2.441 2.553 2.667 2.811 2.937 3.034 3.14 3.264 3.398 3.555 3.688 3.816 3.959 4.117 4.311 4.471 4.623 4.791 4.953 5.051 5.061 4.895 4.233 3.065 1.887 0.774 -0.336 -1.313 -2.083 -2.875 -3.618 -4.362 -5.008 -5.577 -6.105 -6.615 -7.093 -7.51 -7.944 -8.362 -8.725 -9.091 -9.497 -9.838 -10.174 -10.502 -10.741 -10.987 -11.249 -11.507 -11.811 -12.03 -12.241 -12.555 -12.768 -13.024 -13.168 -13.487 -13.848 -14.217 -14.392 -14.747 -14.872 -15.038 -15.232 -15.714 -15.979 -16.269 -16.62 -17.029 -17.624 -18.411 -22.963 -4 ,11390 ,KEBNE ,17026496,Wed Dec 22 14:33:57 CET,Wed Dec 22 16:17:12 CET,0.0 0.123 0.193 0.272 0.342 0.416 0.486 0.558 0.705 0.768 0.831 0.751 0.988 1.044 1.134 1.217 1.309 1.353 1.426 1.497 1.6 1.667 1.738 1.844 1.94 2.034 2.121 2.194 2.297 2.403 2.502 2.62 2.74 2.849 2.976 3.142 3.288 3.417 3.546 3.677 3.818 3.988 4.158 4.33 4.482 4.548 4.643 4.782 4.82 4.623 3.984 2.643 1.168 0.016 -0.872 -1.604 -2.317 -3.046 -3.696 -4.377 -4.948 -5.451 -5.926 -6.428 -6.916 -7.312 -7.757 -8.158 -8.444 -8.747 -9.079 -9.366 -9.674 -10.032 -10.327 -10.598 -10.867 -11.175 -11.512 -11.722 -11.935 -12.337 -12.635 -12.926 -13.078 -13.388 -13.705 -13.998 -14.147 -14.508 -14.642 -14.818 -15.024 -15.54 -15.837 -16.158 -16.498 -16.846 -17.36 -18.157 -22.1 -5 ,25633 ,KEBNE ,17026497,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:16:25 CET,0.0 0.143 0.234 0.33 0.435 0.528 0.602 0.668 0.788 0.856 0.928 0.863 1.09 1.136 1.239 1.337 1.427 1.474 1.578 1.669 1.782 1.857 1.931 2.028 2.122 2.222 2.324 2.42 2.529 2.637 2.748 2.883 3.022 3.153 3.285 3.42 3.538 3.663 3.809 3.967 4.115 4.294 4.516 4.727 4.926 5.111 5.288 5.454 5.588 5.411 4.601 3.323 2.012 0.762 -0.405 -1.507 -2.459 -3.254 -3.91 -4.593 -5.21 -5.737 -6.281 -6.805 -7.211 -7.583 -8.024 -8.418 -8.738 -9.091 -9.467 -9.795 -10.15 -10.489 -10.759 -11.055 -11.356 -11.656 -11.986 -12.232 -12.487 -12.88 -13.15 -13.444 -13.61 -13.963 -14.306 -14.628 -14.804 -15.188 -15.452 -15.701 -15.935 -16.465 -16.744 -17.071 -17.501 -17.914 -18.296 -18.786 -21.052 -6 ,19038 ,KEBNE ,17026498,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:16:56 CET,0.0 0.433 0.586 0.684 0.761 0.826 0.898 0.976 1.097 1.152 1.206 1.11 1.33 1.375 1.463 1.54 1.617 1.656 1.73 1.793 1.883 1.945 2.006 2.093 2.179 2.258 2.34 2.419 2.522 2.628 2.728 2.847 2.95 3.049 3.166 3.294 3.429 3.58 3.732 3.897 4.062 4.237 4.431 4.623 4.827 4.979 5.062 5.078 5.015 4.731 4.074 3.107 2.148 1.198 0.366 -0.451 -1.232 -1.933 -2.526 -3.157 -3.735 -4.25 -4.759 -5.189 -5.589 -5.995 -6.389 -6.733 -7.035 -7.378 -7.759 -8.052 -8.345 -8.635 -8.869 -9.13 -9.398 -9.656 -9.927 -10.128 -10.326 -10.613 -10.817 -11.057 -11.193 -11.454 -11.707 -11.997 -12.169 -12.548 -12.753 -12.999 -13.256 -13.762 -14.022 -14.317 -14.626 -14.953 -15.284 -15.79 -17.951 -7 ,7794 ,KEBNE ,17026499,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:17:07 CET,0.0 0.113 0.195 0.305 0.437 0.529 0.593 0.645 0.75 0.803 0.853 0.76 0.988 1.032 1.106 1.179 1.253 1.289 1.367 1.445 1.539 1.596 1.659 1.752 1.839 1.933 2.032 2.119 2.218 2.318 2.428 2.555 2.663 2.766 2.882 3.007 3.129 3.268 3.41 3.547 3.667 3.809 4.004 4.19 4.346 4.462 4.564 4.615 4.595 4.395 3.585 2.235 1.078 0.099 -0.813 -1.708 -2.539 -3.306 -3.944 -4.567 -5.111 -5.61 -6.133 -6.652 -7.12 -7.552 -7.992 -8.355 -8.716 -9.118 -9.516 -9.854 -10.195 -10.531 -10.797 -11.072 -11.344 -11.62 -11.902 -12.1 -12.308 -12.636 -12.864 -13.131 -13.286 -13.603 -13.914 -14.246 -14.421 -14.779 -14.904 -15.075 -15.281 -15.754 -15.988 -16.257 -16.632 -17.101 -17.642 -18.306 -20.45 -8 ,5245 ,KEBNE ,17026500,Wed Dec 22 14:33:57 CET,Wed Dec 22 16:16:33 CET,0.0 0.22 0.361 0.467 0.56 0.636 0.703 0.764 0.878 0.93 0.982 0.9 1.137 1.188 1.271 1.351 1.436 1.48 1.562 1.639 1.745 1.808 1.874 1.976 2.067 2.147 2.224 2.303 2.411 2.518 2.623 2.746 2.862 2.977 3.093 3.213 3.326 3.448 3.585 3.717 3.856 4.026 4.196 4.342 4.486 4.616 4.722 4.772 4.675 4.336 3.42 1.874 0.375 -0.915 -1.959 -2.879 -3.672 -4.379 -5.025 -5.724 -6.348 -6.9 -7.434 -7.931 -8.364 -8.763 -9.194 -9.567 -9.891 -10.232 -10.597 -10.922 -11.26 -11.622 -11.92 -12.203 -12.471 -12.756 -13.048 -13.246 -13.454 -13.799 -14.049 -14.299 -14.424 -14.691 -14.985 -15.33 -15.491 -15.849 -16.086 -16.274 -16.512 -17.065 -17.298 -17.559 -17.856 -18.222 -18.757 -19.56 -22.993 -9 ,7933 ,KEBNE ,17026501,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:15:58 CET,0.0 0.319 0.418 0.514 0.598 0.657 0.702 0.759 0.863 0.91 0.971 0.901 1.136 1.19 1.279 1.354 1.427 1.465 1.534 1.603 1.702 1.765 1.831 1.933 2.032 2.126 2.219 2.309 2.41 2.507 2.615 2.731 2.828 2.933 3.063 3.211 3.344 3.488 3.645 3.787 3.932 4.092 4.256 4.413 4.576 4.74 4.89 4.971 4.937 4.717 4.164 3.168 2.155 1.154 0.221 -0.585 -1.309 -2.026 -2.615 -3.215 -3.817 -4.349 -4.831 -5.292 -5.748 -6.193 -6.652 -7.062 -7.405 -7.775 -8.178 -8.513 -8.849 -9.167 -9.42 -9.683 -9.945 -10.209 -10.512 -10.755 -11.005 -11.364 -11.606 -11.868 -12.006 -12.285 -12.603 -12.938 -13.112 -13.491 -13.687 -13.891 -14.121 -14.57 -14.802 -15.113 -15.453 -15.838 -16.396 -17.271 -21.112 -10 ,14178 ,KEBNE ,17026502,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:16:39 CET,0.0 0.572 0.723 0.811 0.899 0.969 1.042 1.111 1.224 1.279 1.342 1.276 1.504 1.556 1.654 1.744 1.839 1.882 1.964 2.039 2.163 2.249 2.328 2.433 2.531 2.636 2.732 2.824 2.946 3.063 3.161 3.281 3.394 3.505 3.653 3.816 3.955 4.095 4.226 4.364 4.496 4.608 4.757 4.913 5.063 5.202 5.351 5.41 5.234 4.852 3.97 2.567 1.318 0.116 -1.002 -1.924 -2.712 -3.512 -4.238 -4.96 -5.593 -6.16 -6.682 -7.139 -7.556 -7.956 -8.37 -8.719 -9.016 -9.337 -9.683 -9.979 -10.302 -10.627 -10.863 -11.119 -11.431 -11.764 -12.087 -12.309 -12.537 -12.911 -13.187 -13.49 -13.644 -13.945 -14.264 -14.599 -14.76 -15.111 -15.288 -15.485 -15.664 -16.037 -16.255 -16.526 -16.85 -17.211 -17.648 -18.335 -21.698 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5m.txt deleted file mode 100644 index 636d8237..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28297 ,TETRA ,17699072,Sat Dec 4 17:13:25 CET,Sat Dec 4 17:17:30 CET,0.0 0.344 0.49 0.623 0.714 0.796 0.869 0.943 1.097 1.176 1.251 1.184 1.426 1.484 1.585 1.685 1.782 1.831 1.925 2.012 2.14 2.221 2.292 2.394 2.5 2.59 2.677 2.771 2.892 2.998 3.101 3.24 3.367 3.485 3.633 3.803 3.954 4.113 4.292 4.473 4.644 4.818 5.015 5.221 5.425 5.567 5.71 5.85 5.826 5.63 4.961 3.7 2.527 1.465 0.54 -0.281 -1.03 -1.76 -2.416 -3.102 -3.681 -4.191 -4.684 -5.139 -5.551 -5.936 -6.364 -6.752 -7.074 -7.395 -7.73 -8.016 -8.309 -8.621 -8.87 -9.131 -9.403 -9.681 -9.987 -10.222 -10.469 -10.836 -11.101 -11.36 -11.483 -11.739 -12.023 -12.345 -12.522 -12.895 -13.106 -13.329 -13.577 -14.114 -14.409 -14.749 -15.075 -15.431 -15.862 -16.518 -19.81 -2 ,8001 ,TETRA ,17699073,Sat Dec 4 17:13:25 CET,Sat Dec 4 17:17:40 CET,0.0 0.423 0.574 0.681 0.768 0.848 0.918 0.985 1.125 1.191 1.251 1.187 1.431 1.483 1.579 1.686 1.785 1.828 1.924 2.016 2.128 2.207 2.286 2.399 2.507 2.606 2.697 2.793 2.925 3.043 3.149 3.278 3.413 3.53 3.66 3.816 3.964 4.116 4.283 4.462 4.641 4.834 5.039 5.22 5.412 5.609 5.794 5.93 5.96 5.854 5.397 4.455 3.419 2.338 1.407 0.603 -0.139 -0.841 -1.496 -2.212 -2.817 -3.312 -3.779 -4.233 -4.693 -5.144 -5.622 -6.039 -6.378 -6.706 -7.046 -7.345 -7.657 -7.96 -8.204 -8.48 -8.757 -9.034 -9.316 -9.521 -9.743 -10.084 -10.313 -10.557 -10.696 -10.989 -11.275 -11.584 -11.755 -12.113 -12.301 -12.491 -12.688 -13.147 -13.394 -13.663 -13.993 -14.365 -14.846 -15.586 -18.926 -3 ,3816 ,TETRA ,17699074,Sat Dec 4 17:13:25 CET,Sat Dec 4 17:18:25 CET,0.0 0.175 0.304 0.384 0.452 0.527 0.603 0.676 0.799 0.861 0.922 0.861 1.102 1.155 1.256 1.353 1.444 1.487 1.568 1.646 1.749 1.816 1.881 1.983 2.081 2.167 2.25 2.334 2.456 2.564 2.665 2.795 2.909 3.017 3.144 3.304 3.46 3.617 3.778 3.936 4.116 4.334 4.552 4.766 5.0 5.199 5.399 5.538 5.553 5.401 4.726 3.635 2.656 1.723 0.865 0.064 -0.654 -1.368 -2.024 -2.679 -3.266 -3.813 -4.336 -4.858 -5.333 -5.734 -6.141 -6.502 -6.837 -7.193 -7.574 -7.889 -8.211 -8.569 -8.838 -9.094 -9.368 -9.656 -9.969 -10.201 -10.437 -10.787 -11.022 -11.26 -11.379 -11.622 -11.894 -12.199 -12.359 -12.718 -12.923 -13.134 -13.359 -13.83 -14.092 -14.369 -14.658 -15.018 -15.51 -16.127 -19.407 -4 ,29637 ,TETRA ,17699075,Sat Dec 4 17:13:30 CET,Sat Dec 4 17:18:26 CET,0.0 0.126 0.264 0.384 0.475 0.535 0.606 0.683 0.783 0.831 0.89 0.831 1.068 1.117 1.212 1.312 1.401 1.444 1.534 1.617 1.736 1.814 1.892 1.996 2.091 2.192 2.295 2.396 2.529 2.646 2.745 2.859 2.981 3.121 3.278 3.433 3.588 3.751 3.913 4.089 4.253 4.43 4.643 4.83 5.054 5.272 5.413 5.466 5.435 5.188 4.504 3.26 1.995 0.954 -0.049 -1.138 -2.104 -2.931 -3.631 -4.309 -4.834 -5.293 -5.774 -6.249 -6.686 -7.086 -7.502 -7.843 -8.132 -8.469 -8.849 -9.174 -9.507 -9.871 -10.173 -10.464 -10.73 -10.996 -11.298 -11.517 -11.732 -12.066 -12.311 -12.582 -12.724 -13.034 -13.355 -13.679 -13.85 -14.201 -14.335 -14.518 -14.717 -15.103 -15.348 -15.658 -15.961 -16.383 -16.914 -17.617 -20.769 -5 ,7658 ,TETRA ,17699076,Sat Dec 4 17:13:25 CET,Sat Dec 4 19:13:59 CET,0.0 0.377 0.533 0.65 0.728 0.828 0.922 1.002 1.135 1.19 1.251 1.179 1.411 1.467 1.579 1.677 1.77 1.814 1.897 1.978 2.1 2.181 2.253 2.364 2.484 2.593 2.687 2.779 2.892 2.999 3.104 3.236 3.367 3.482 3.621 3.785 3.927 4.081 4.259 4.452 4.64 4.796 4.928 5.072 5.217 5.348 5.501 5.644 5.74 5.666 5.131 4.082 2.911 1.706 0.593 -0.341 -1.185 -1.965 -2.615 -3.312 -3.907 -4.415 -4.873 -5.347 -5.845 -6.28 -6.687 -7.04 -7.383 -7.764 -8.146 -8.451 -8.784 -9.15 -9.4 -9.641 -9.915 -10.233 -10.597 -10.832 -11.06 -11.395 -11.621 -11.858 -11.98 -12.236 -12.52 -12.851 -13.027 -13.391 -13.552 -13.751 -13.97 -14.446 -14.71 -15.044 -15.446 -15.865 -16.404 -17.16 -20.214 -6 ,18 ,TETRA ,17699077,Sat Dec 4 17:13:27 CET,Sat Dec 4 17:18:03 CET,0.0 0.102 0.183 0.279 0.389 0.469 0.524 0.603 0.768 0.836 0.899 0.813 1.045 1.098 1.198 1.284 1.378 1.43 1.527 1.607 1.712 1.79 1.87 1.978 2.078 2.166 2.247 2.337 2.463 2.582 2.681 2.787 2.898 3.012 3.143 3.281 3.409 3.552 3.722 3.901 4.084 4.293 4.511 4.713 4.914 5.074 5.281 5.46 5.524 5.439 4.742 3.445 2.324 1.381 0.475 -0.391 -1.156 -1.871 -2.479 -3.072 -3.593 -4.068 -4.578 -5.068 -5.478 -5.846 -6.249 -6.609 -6.907 -7.237 -7.604 -7.907 -8.221 -8.546 -8.811 -9.094 -9.384 -9.713 -10.088 -10.331 -10.548 -10.876 -11.128 -11.394 -11.524 -11.82 -12.157 -12.469 -12.616 -12.961 -13.115 -13.322 -13.55 -14.071 -14.363 -14.672 -15.003 -15.374 -15.884 -16.683 -20.109 -7 ,21825 ,TETRA ,17699078,Sat Dec 4 17:13:25 CET,Sat Dec 4 19:15:37 CET,0.0 0.371 0.551 0.681 0.789 0.908 1.016 1.106 1.246 1.314 1.4 1.376 1.62 1.67 1.781 1.885 1.985 2.033 2.119 2.209 2.348 2.427 2.502 2.612 2.722 2.828 2.927 3.019 3.133 3.246 3.354 3.469 3.576 3.687 3.822 3.972 4.112 4.274 4.449 4.633 4.817 5.013 5.244 5.45 5.664 5.865 6.069 6.196 6.235 6.118 5.703 4.767 3.597 2.584 1.678 0.792 -0.033 -0.807 -1.481 -2.141 -2.691 -3.184 -3.666 -4.109 -4.523 -4.921 -5.334 -5.721 -6.084 -6.437 -6.759 -7.028 -7.321 -7.657 -7.946 -8.243 -8.551 -8.877 -9.218 -9.471 -9.722 -10.092 -10.348 -10.624 -10.78 -11.113 -11.461 -11.833 -12.028 -12.426 -12.677 -12.891 -13.105 -13.568 -13.827 -14.128 -14.476 -14.913 -15.424 -16.127 -19.745 -8 ,20533 ,TETRA ,17674964,Sat Dec 4 15:23:06 CET,Sat Dec 4 17:17:30 CET,0.0 0.303 0.425 0.559 0.682 0.765 0.825 0.887 1.033 1.093 1.154 1.112 1.368 1.429 1.54 1.642 1.74 1.783 1.872 1.955 2.068 2.136 2.204 2.304 2.398 2.491 2.592 2.694 2.822 2.954 3.073 3.199 3.328 3.447 3.582 3.736 3.877 4.012 4.15 4.312 4.486 4.685 4.92 5.145 5.386 5.607 5.762 5.853 5.921 5.78 5.093 3.992 2.897 1.918 1.047 0.137 -0.785 -1.598 -2.24 -2.903 -3.501 -4.04 -4.544 -5.038 -5.497 -5.879 -6.264 -6.633 -6.974 -7.315 -7.689 -8.029 -8.372 -8.712 -8.964 -9.222 -9.486 -9.762 -10.077 -10.298 -10.514 -10.843 -11.078 -11.348 -11.505 -11.834 -12.142 -12.464 -12.642 -13.032 -13.232 -13.429 -13.651 -14.142 -14.456 -14.782 -15.112 -15.507 -15.968 -16.595 -19.642 -9 ,1571 ,TETRA ,17699080,Sat Dec 4 17:13:27 CET,Sat Dec 4 19:03:43 CET,0.0 0.21 0.304 0.372 0.455 0.538 0.61 0.677 0.794 0.852 0.907 0.825 1.06 1.108 1.211 1.309 1.401 1.447 1.535 1.627 1.741 1.809 1.888 2.004 2.102 2.193 2.284 2.373 2.486 2.611 2.737 2.873 2.999 3.116 3.247 3.395 3.562 3.736 3.912 4.096 4.262 4.421 4.588 4.751 4.907 5.036 5.148 5.204 5.259 5.183 4.562 3.619 2.654 1.636 0.735 -0.122 -0.903 -1.682 -2.385 -2.989 -3.532 -4.071 -4.568 -5.02 -5.475 -5.9 -6.348 -6.76 -7.117 -7.493 -7.859 -8.163 -8.49 -8.831 -9.094 -9.357 -9.625 -9.902 -10.193 -10.401 -10.612 -10.934 -11.146 -11.36 -11.482 -11.746 -12.012 -12.295 -12.449 -12.806 -12.986 -13.171 -13.384 -13.891 -14.141 -14.437 -14.814 -15.222 -15.704 -16.391 -19.031 -10 ,12016 ,TETRA ,17674966,Sat Dec 4 15:23:06 CET,Sat Dec 4 17:14:38 CET,0.0 0.194 0.337 0.459 0.571 0.665 0.747 0.818 0.949 1.013 1.065 0.979 1.208 1.249 1.33 1.414 1.498 1.542 1.623 1.685 1.775 1.844 1.92 2.016 2.095 2.186 2.272 2.358 2.472 2.597 2.715 2.828 2.932 3.033 3.162 3.326 3.469 3.604 3.753 3.915 4.092 4.289 4.519 4.7 4.854 5.074 5.297 5.396 5.341 5.075 4.375 3.163 1.921 0.804 -0.284 -1.252 -2.073 -2.817 -3.412 -4.036 -4.59 -5.062 -5.523 -5.986 -6.411 -6.822 -7.267 -7.673 -8.042 -8.418 -8.793 -9.076 -9.357 -9.673 -9.956 -10.277 -10.588 -10.871 -11.142 -11.323 -11.514 -11.836 -12.093 -12.359 -12.479 -12.719 -12.967 -13.242 -13.4 -13.756 -13.957 -14.156 -14.381 -14.936 -15.264 -15.62 -16.0 -16.451 -17.004 -17.686 -22.03 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5n.txt deleted file mode 100644 index d2aa6043..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5o_5n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8411 ,TETRA ,17674967,Sat Dec 4 15:23:07 CET,Sat Dec 4 17:14:13 CET,0.0 1.687 1.901 2.087 2.295 2.491 2.619 2.72 2.935 3.03 3.117 3.109 3.375 3.463 3.646 3.797 3.942 4.017 4.171 4.31 4.513 4.655 4.793 4.969 5.119 5.279 5.437 5.581 5.775 5.968 6.142 6.34 6.53 6.714 6.942 7.212 7.465 7.737 8.003 8.272 8.585 8.967 9.394 9.806 10.312 10.872 11.495 12.068 12.519 12.853 12.91 12.501 11.961 11.361 10.687 10.031 9.49 9.02 8.577 8.118 7.694 7.29 6.887 6.487 6.142 5.837 5.51 5.211 4.942 4.673 4.416 4.188 3.947 3.709 3.52 3.328 3.125 2.902 2.658 2.472 2.272 1.957 1.737 1.525 1.421 1.197 0.973 0.751 0.629 0.319 0.235 0.091 -0.056 -0.392 -0.571 -0.754 -1.002 -1.318 -1.692 -2.096 -3.849 -2 ,9827 ,TETRA ,17699083,Sat Dec 4 17:13:28 CET,Sat Dec 4 19:16:51 CET,0.0 0.379 0.617 0.817 0.961 1.099 1.224 1.345 1.598 1.71 1.803 1.796 2.064 2.161 2.357 2.526 2.672 2.742 2.888 3.028 3.251 3.396 3.523 3.701 3.866 4.035 4.205 4.36 4.552 4.743 4.948 5.19 5.395 5.604 5.837 6.051 6.253 6.5 6.762 7.035 7.342 7.675 8.022 8.405 8.957 9.525 10.005 10.485 10.941 11.232 11.317 10.892 10.269 9.587 8.941 8.418 7.959 7.47 6.968 6.432 5.971 5.551 5.165 4.81 4.473 4.167 3.829 3.529 3.277 3.001 2.707 2.466 2.229 1.986 1.793 1.595 1.401 1.193 0.966 0.817 0.68 0.477 0.32 0.152 0.064 -0.119 -0.307 -0.499 -0.598 -0.889 -0.974 -1.117 -1.253 -1.573 -1.739 -1.911 -2.129 -2.377 -2.668 -3.056 -4.442 -3 ,13243 ,TETRA ,17699084,Sat Dec 4 17:13:30 CET,Sat Dec 4 17:31:17 CET,0.0 2.684 2.995 3.175 3.331 3.494 3.646 3.779 4.023 4.142 4.261 4.324 4.617 4.703 4.859 5.014 5.171 5.244 5.388 5.536 5.726 5.84 5.966 6.154 6.336 6.508 6.652 6.794 7.002 7.21 7.402 7.614 7.82 8.029 8.277 8.545 8.802 9.079 9.364 9.712 10.049 10.382 10.782 11.155 11.577 12.083 12.68 13.219 13.71 14.101 13.989 13.456 12.842 12.193 11.534 10.861 10.238 9.684 9.161 8.611 8.12 7.691 7.301 6.914 6.542 6.207 5.861 5.562 5.295 5.008 4.702 4.427 4.166 3.907 3.686 3.456 3.237 3.014 2.767 2.603 2.44 2.186 2.005 1.803 1.699 1.487 1.261 1.033 0.914 0.609 0.55 0.423 0.294 0.005 -0.179 -0.378 -0.587 -0.826 -1.142 -1.565 -3.373 -4 ,24712 ,TETRA ,17674970,Sat Dec 4 15:23:52 CET,Sat Dec 4 17:26:36 CET,0.0 1.556 1.83 2.045 2.276 2.465 2.619 2.747 2.954 3.053 3.149 3.161 3.445 3.534 3.704 3.855 3.992 4.064 4.206 4.344 4.531 4.656 4.79 4.99 5.166 5.322 5.463 5.607 5.805 5.978 6.164 6.404 6.621 6.844 7.101 7.377 7.629 7.892 8.185 8.471 8.769 9.103 9.476 9.868 10.323 10.77 11.177 11.626 12.108 12.484 12.549 12.169 11.615 11.035 10.506 9.991 9.47 8.971 8.525 8.046 7.626 7.248 6.878 6.517 6.156 5.819 5.48 5.191 4.942 4.673 4.396 4.153 3.899 3.651 3.452 3.227 3.0 2.778 2.533 2.375 2.239 2.017 1.86 1.675 1.565 1.354 1.145 0.931 0.827 0.533 0.45 0.315 0.187 -0.086 -0.244 -0.442 -0.672 -0.943 -1.205 -1.601 -3.349 -5 ,4161 ,TETRA ,17674971,Sat Dec 4 15:23:52 CET,Sat Dec 4 17:20:42 CET,0.0 0.831 1.152 1.362 1.536 1.704 1.831 1.953 2.193 2.313 2.43 2.435 2.713 2.8 2.949 3.103 3.26 3.339 3.494 3.64 3.843 3.972 4.106 4.291 4.48 4.667 4.836 4.998 5.206 5.4 5.58 5.799 5.996 6.186 6.421 6.694 6.97 7.262 7.563 7.886 8.224 8.586 8.991 9.397 9.825 10.246 10.739 11.264 11.781 12.169 12.189 11.798 11.253 10.676 10.101 9.522 9.004 8.493 8.023 7.59 7.233 6.904 6.578 6.262 5.956 5.669 5.37 5.096 4.863 4.621 4.351 4.119 3.892 3.679 3.511 3.325 3.129 2.918 2.702 2.545 2.378 2.143 1.99 1.814 1.722 1.532 1.337 1.147 1.04 0.731 0.661 0.536 0.405 0.117 -0.045 -0.221 -0.432 -0.694 -1.041 -1.482 -3.505 -6 ,386 ,TETRA ,17699087,Sat Dec 4 17:13:30 CET,Sat Dec 4 19:05:42 CET,0.0 0.408 0.707 0.872 1.007 1.156 1.287 1.413 1.643 1.747 1.849 1.844 2.11 2.193 2.36 2.514 2.666 2.752 2.922 3.076 3.299 3.447 3.591 3.788 3.98 4.163 4.332 4.497 4.717 4.94 5.143 5.377 5.618 5.841 6.074 6.333 6.597 6.893 7.22 7.577 7.939 8.327 8.745 9.149 9.593 10.025 10.49 11.015 11.527 11.919 12.076 11.611 10.911 10.268 9.643 8.963 8.291 7.674 7.141 6.608 6.134 5.704 5.295 4.895 4.515 4.17 3.817 3.497 3.216 2.931 2.639 2.406 2.16 1.9 1.701 1.485 1.255 1.021 0.78 0.599 0.417 0.155 -0.03 -0.226 -0.323 -0.544 -0.782 -1.03 -1.157 -1.46 -1.529 -1.681 -1.836 -2.127 -2.289 -2.484 -2.7 -2.911 -3.114 -3.475 -5.605 -7 ,9863 ,TETRA ,17699088,Sat Dec 4 17:13:32 CET,Sat Dec 4 17:17:35 CET,0.0 1.115 1.333 1.478 1.647 1.839 1.987 2.101 2.309 2.406 2.499 2.509 2.802 2.904 3.078 3.245 3.4 3.473 3.61 3.744 3.934 4.06 4.178 4.341 4.507 4.67 4.828 4.979 5.162 5.325 5.486 5.695 5.895 6.095 6.326 6.569 6.8 7.068 7.34 7.63 7.973 8.369 8.823 9.279 9.807 10.342 10.854 11.317 11.758 12.103 12.172 11.634 10.939 10.303 9.641 8.953 8.368 7.864 7.399 6.907 6.474 6.082 5.732 5.39 5.054 4.766 4.454 4.179 3.936 3.675 3.391 3.141 2.895 2.644 2.449 2.234 2.019 1.804 1.575 1.423 1.263 1.006 0.831 0.651 0.554 0.342 0.138 -0.062 -0.164 -0.457 -0.533 -0.671 -0.813 -1.115 -1.263 -1.422 -1.594 -1.793 -2.104 -2.536 -4.596 -8 ,776 ,TETRA ,17674974,Sat Dec 4 15:23:53 CET,Sat Dec 4 17:15:13 CET,0.0 0.462 0.679 0.839 1.01 1.2 1.383 1.52 1.758 1.887 2.014 2.023 2.297 2.397 2.573 2.728 2.874 2.952 3.105 3.256 3.461 3.582 3.707 3.907 4.101 4.284 4.46 4.617 4.816 5.023 5.214 5.452 5.695 5.928 6.188 6.447 6.671 6.944 7.247 7.568 7.912 8.297 8.723 9.078 9.46 9.88 10.323 10.709 11.041 11.325 11.385 11.033 10.47 9.808 9.125 8.476 7.932 7.447 6.991 6.531 6.105 5.72 5.375 5.037 4.703 4.404 4.082 3.793 3.551 3.292 3.018 2.779 2.528 2.279 2.072 1.856 1.633 1.402 1.176 1.022 0.858 0.605 0.434 0.262 0.17 -0.018 -0.22 -0.452 -0.572 -0.873 -0.945 -1.081 -1.218 -1.499 -1.656 -1.854 -2.088 -2.362 -2.685 -3.077 -4.432 -9 ,15104 ,TETRA ,17674975,Sat Dec 4 15:23:53 CET,Sat Dec 4 17:14:57 CET,0.0 1.279 1.512 1.707 1.893 2.066 2.212 2.342 2.57 2.68 2.793 2.82 3.104 3.195 3.378 3.556 3.727 3.807 3.958 4.121 4.367 4.506 4.626 4.812 4.98 5.144 5.328 5.493 5.697 5.898 6.069 6.287 6.496 6.71 6.978 7.229 7.438 7.669 7.933 8.233 8.59 8.954 9.304 9.647 10.027 10.457 10.953 11.509 12.048 12.393 12.444 12.055 11.35 10.55 9.791 9.07 8.389 7.769 7.243 6.712 6.263 5.867 5.467 5.101 4.775 4.458 4.102 3.784 3.521 3.23 2.93 2.693 2.453 2.207 1.991 1.773 1.57 1.349 1.109 0.939 0.765 0.505 0.323 0.126 0.019 -0.193 -0.411 -0.656 -0.789 -1.112 -1.205 -1.348 -1.494 -1.834 -2.022 -2.193 -2.377 -2.626 -2.946 -3.455 -5.864 -10 ,12532 ,TETRA ,17674976,Sat Dec 4 15:23:53 CET,Sat Dec 4 17:14:29 CET,0.0 2.144 2.433 2.652 2.83 2.984 3.103 3.22 3.451 3.564 3.673 3.692 3.966 4.056 4.224 4.377 4.529 4.609 4.756 4.89 5.071 5.197 5.329 5.522 5.714 5.919 6.119 6.275 6.458 6.641 6.824 7.043 7.265 7.488 7.71 7.931 8.151 8.389 8.643 8.93 9.272 9.706 10.143 10.474 10.806 11.152 11.582 12.072 12.609 13.029 13.165 12.809 12.172 11.543 10.889 10.112 9.415 8.817 8.296 7.774 7.31 6.879 6.453 6.052 5.668 5.299 4.916 4.579 4.294 4.02 3.74 3.494 3.242 2.993 2.789 2.548 2.303 2.08 1.859 1.705 1.535 1.248 1.056 0.862 0.766 0.571 0.354 0.095 -0.041 -0.343 -0.385 -0.511 -0.665 -1.023 -1.22 -1.423 -1.647 -1.904 -2.18 -2.531 -5.452 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_3b.txt deleted file mode 100644 index d2f48b70..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18464 ,TETRA ,17674977,Sat Dec 4 15:23:54 CET,Sat Dec 4 17:10:44 CET,0.0 0.258 0.446 0.601 0.73 0.856 0.973 1.085 1.283 1.38 1.479 1.458 1.728 1.814 1.96 2.103 2.244 2.309 2.431 2.551 2.731 2.857 2.979 3.15 3.31 3.463 3.614 3.766 3.968 4.163 4.356 4.593 4.815 5.028 5.281 5.586 5.885 6.205 6.538 6.909 7.3 7.72 8.229 8.756 9.368 10.083 10.912 11.777 12.816 14.028 15.238 15.885 16.033 15.934 15.632 15.253 14.872 14.478 14.125 13.741 13.388 13.068 12.772 12.486 12.169 11.864 11.541 11.231 10.988 10.753 10.505 10.309 10.103 9.89 9.709 9.525 9.329 9.097 8.882 8.716 8.513 8.22 8.022 7.806 7.69 7.434 7.175 6.913 6.773 6.448 6.269 6.093 5.904 5.455 5.183 4.888 4.553 4.125 3.564 2.794 -0.535 -2 ,23376 ,TETRA ,17699093,Sat Dec 4 17:13:28 CET,Sat Dec 4 19:11:42 CET,0.0 0.195 0.35 0.494 0.646 0.792 0.893 0.981 1.173 1.284 1.386 1.356 1.619 1.704 1.864 2.0 2.117 2.183 2.341 2.478 2.644 2.759 2.878 3.046 3.186 3.326 3.469 3.594 3.76 3.945 4.123 4.326 4.528 4.729 4.962 5.232 5.481 5.75 6.049 6.352 6.685 7.067 7.527 7.99 8.492 9.001 9.539 10.181 10.994 11.8 12.449 12.689 12.563 12.284 11.95 11.57 11.168 10.732 10.316 9.898 9.553 9.262 8.948 8.625 8.336 8.052 7.747 7.469 7.2 6.897 6.582 6.338 6.108 5.866 5.669 5.45 5.202 4.958 4.741 4.579 4.399 4.12 3.924 3.716 3.616 3.408 3.161 2.917 2.783 2.456 2.291 2.116 1.942 1.555 1.313 1.032 0.729 0.332 -0.139 -0.858 -4.816 -3 ,12312 ,TETRA ,17699094,Sat Dec 4 17:13:30 CET,Sat Dec 4 19:12:10 CET,0.0 0.279 0.456 0.627 0.78 0.917 1.046 1.17 1.373 1.462 1.552 1.539 1.815 1.897 2.057 2.216 2.367 2.44 2.583 2.73 2.938 3.072 3.207 3.394 3.577 3.752 3.923 4.085 4.292 4.496 4.69 4.921 5.145 5.365 5.628 5.92 6.194 6.494 6.822 7.165 7.52 7.928 8.351 8.754 9.249 9.798 10.377 11.013 11.815 12.643 13.3 13.452 13.295 13.115 12.843 12.502 12.124 11.72 11.366 11.009 10.68 10.4 10.137 9.857 9.583 9.316 9.043 8.796 8.553 8.294 8.024 7.796 7.546 7.302 7.126 6.941 6.725 6.471 6.22 6.05 5.879 5.598 5.39 5.171 5.057 4.818 4.544 4.265 4.135 3.806 3.576 3.368 3.172 2.745 2.462 2.149 1.843 1.508 1.047 0.436 -2.26 -4 ,15294 ,TETRA ,17699095,Sat Dec 4 17:13:28 CET,Sat Dec 4 17:28:56 CET,0.0 0.434 0.637 0.786 0.918 1.048 1.164 1.274 1.494 1.59 1.67 1.636 1.894 1.973 2.136 2.296 2.433 2.499 2.628 2.751 2.938 3.061 3.186 3.375 3.547 3.712 3.87 4.021 4.229 4.436 4.624 4.83 5.02 5.215 5.448 5.704 5.947 6.219 6.509 6.804 7.112 7.482 7.919 8.344 8.829 9.336 9.883 10.472 11.09 11.747 12.359 12.562 12.419 12.073 11.66 11.237 10.832 10.452 10.123 9.781 9.451 9.126 8.806 8.5 8.221 7.98 7.712 7.473 7.28 7.074 6.822 6.611 6.41 6.188 6.024 5.836 5.624 5.384 5.144 5.0 4.835 4.589 4.422 4.216 4.109 3.903 3.67 3.42 3.28 2.956 2.808 2.626 2.432 2.042 1.818 1.549 1.219 0.862 0.402 -0.276 -11.646 -5 ,24506 ,TETRA ,17699096,Sat Dec 4 17:21:20 CET,Sat Dec 4 17:26:40 CET,0.0 0.261 0.473 0.643 0.765 0.86 0.964 1.061 1.238 1.336 1.425 1.4 1.669 1.746 1.898 2.052 2.194 2.263 2.401 2.54 2.737 2.86 2.974 3.119 3.263 3.414 3.568 3.725 3.937 4.15 4.345 4.565 4.778 4.979 5.231 5.515 5.762 6.05 6.383 6.74 7.099 7.502 7.974 8.451 9.028 9.622 10.269 11.047 11.939 12.818 13.548 13.831 13.82 13.647 13.37 13.074 12.796 12.5 12.212 11.882 11.582 11.334 11.095 10.835 10.59 10.374 10.128 9.888 9.663 9.408 9.128 8.904 8.671 8.411 8.215 8.013 7.806 7.612 7.397 7.215 7.026 6.754 6.567 6.368 6.26 6.034 5.79 5.504 5.357 5.041 4.908 4.751 4.59 4.228 4.027 3.82 3.521 3.124 2.645 1.963 -1.435 -6 ,23269 ,TETRA ,17674982,Sat Dec 4 15:24:59 CET,Sat Dec 4 17:22:55 CET,0.0 0.28 0.457 0.6 0.729 0.85 0.96 1.064 1.237 1.32 1.404 1.359 1.609 1.682 1.826 1.962 2.093 2.157 2.284 2.406 2.576 2.689 2.8 2.967 3.126 3.268 3.408 3.547 3.738 3.92 4.081 4.274 4.475 4.674 4.902 5.18 5.456 5.754 6.08 6.424 6.806 7.244 7.732 8.22 8.791 9.442 10.174 10.922 11.767 12.533 12.983 13.022 12.77 12.368 11.969 11.605 11.219 10.85 10.524 10.153 9.796 9.472 9.151 8.83 8.524 8.242 7.934 7.686 7.488 7.265 7.025 6.801 6.558 6.315 6.125 5.941 5.735 5.471 5.196 5.006 4.818 4.536 4.34 4.143 4.042 3.843 3.613 3.36 3.219 2.885 2.72 2.539 2.345 1.85 1.548 1.241 0.87 0.474 0.053 -0.528 -4.485 -7 ,23750 ,TETRA ,17674983,Sat Dec 4 15:25:01 CET,Sat Dec 4 17:22:47 CET,0.0 0.283 0.432 0.565 0.702 0.821 0.918 1.018 1.202 1.286 1.377 1.364 1.622 1.693 1.835 1.97 2.098 2.169 2.301 2.42 2.603 2.728 2.851 3.017 3.179 3.33 3.472 3.614 3.804 3.987 4.167 4.39 4.605 4.814 5.038 5.285 5.535 5.811 6.104 6.382 6.661 6.974 7.341 7.749 8.221 8.706 9.247 9.852 10.445 10.992 11.567 11.742 11.512 11.133 10.733 10.371 9.996 9.587 9.244 8.884 8.539 8.235 7.935 7.619 7.301 7.015 6.725 6.454 6.184 5.899 5.613 5.385 5.152 4.907 4.724 4.539 4.324 4.065 3.783 3.58 3.371 3.052 2.814 2.554 2.419 2.144 1.888 1.611 1.455 1.141 1.048 0.891 0.704 0.284 0.038 -0.215 -0.487 -0.836 -1.233 -1.918 -6.571 -8 ,515 ,TETRA ,17674984,Sat Dec 4 15:24:56 CET,Sat Dec 4 17:29:15 CET,0.0 0.285 0.421 0.548 0.666 0.785 0.893 0.988 1.163 1.24 1.318 1.286 1.545 1.628 1.78 1.918 2.056 2.127 2.266 2.392 2.568 2.69 2.81 2.978 3.157 3.308 3.44 3.584 3.763 3.93 4.092 4.287 4.48 4.663 4.877 5.131 5.373 5.619 5.909 6.234 6.551 6.894 7.253 7.608 8.057 8.605 9.255 9.894 10.546 11.248 11.846 12.052 11.861 11.503 11.135 10.752 10.383 9.982 9.603 9.2 8.844 8.533 8.214 7.927 7.666 7.429 7.178 6.931 6.708 6.497 6.267 6.036 5.818 5.602 5.409 5.2 4.975 4.739 4.478 4.279 4.061 3.747 3.573 3.417 3.324 3.109 2.891 2.68 2.563 2.258 2.114 1.939 1.746 1.333 1.109 0.845 0.561 0.208 -0.242 -0.809 -3.676 -9 ,6254 ,TETRA ,17699100,Sat Dec 4 17:21:20 CET,Sat Dec 4 17:38:56 CET,0.0 0.328 0.477 0.634 0.812 0.954 1.058 1.155 1.361 1.449 1.526 1.498 1.754 1.835 1.988 2.127 2.28 2.352 2.474 2.6 2.795 2.919 3.04 3.216 3.383 3.537 3.693 3.853 4.05 4.235 4.421 4.63 4.809 4.988 5.216 5.478 5.717 5.976 6.257 6.542 6.866 7.233 7.658 8.086 8.559 9.055 9.603 10.223 10.885 11.627 12.307 12.408 12.236 11.929 11.542 11.145 10.787 10.463 10.126 9.774 9.497 9.249 8.967 8.682 8.413 8.155 7.883 7.627 7.398 7.174 6.947 6.755 6.549 6.304 6.126 5.948 5.727 5.503 5.276 5.118 4.956 4.695 4.505 4.303 4.204 3.982 3.727 3.451 3.31 2.976 2.783 2.601 2.394 1.961 1.725 1.469 1.193 0.828 0.365 -0.295 -7.257 -10 ,19061 ,TETRA ,17674986,Sat Dec 4 15:24:57 CET,Sat Dec 4 17:23:10 CET,0.0 0.57 0.771 0.898 1.043 1.197 1.331 1.449 1.631 1.712 1.797 1.776 2.045 2.135 2.299 2.441 2.583 2.652 2.795 2.933 3.129 3.25 3.361 3.531 3.707 3.868 4.02 4.168 4.357 4.533 4.702 4.903 5.081 5.246 5.458 5.725 5.981 6.254 6.549 6.855 7.167 7.534 7.936 8.311 8.727 9.196 9.751 10.313 10.948 11.584 12.047 12.14 11.976 11.66 11.207 10.715 10.301 9.91 9.542 9.159 8.817 8.525 8.237 7.922 7.621 7.362 7.099 6.835 6.612 6.392 6.142 5.925 5.703 5.479 5.29 5.085 4.879 4.672 4.439 4.261 4.08 3.812 3.621 3.424 3.329 3.093 2.828 2.546 2.386 2.061 1.914 1.733 1.555 1.168 0.96 0.726 0.405 -0.016 -0.495 -1.256 -5.904 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_5n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_5n.txt deleted file mode 100644 index 9541984c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_5p_5n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24622 ,TETRA ,17699102,Sat Dec 4 17:21:22 CET,Sat Dec 4 17:26:38 CET,0.0 0.265 0.442 0.596 0.758 0.924 1.078 1.2 1.417 1.522 1.609 1.592 1.864 1.956 2.124 2.274 2.427 2.506 2.651 2.785 2.998 3.136 3.265 3.451 3.627 3.798 3.957 4.103 4.298 4.496 4.7 4.942 5.184 5.436 5.715 6.014 6.278 6.558 6.863 7.162 7.465 7.83 8.254 8.666 9.142 9.652 10.207 10.793 11.422 12.039 12.543 12.646 12.347 11.927 11.541 11.122 10.72 10.385 10.053 9.644 9.289 8.971 8.617 8.26 7.936 7.638 7.333 7.075 6.835 6.578 6.3 6.042 5.762 5.456 5.223 4.986 4.731 4.487 4.254 4.094 3.916 3.619 3.432 3.248 3.148 2.935 2.693 2.454 2.342 2.045 1.932 1.77 1.622 1.32 1.145 0.958 0.765 0.524 0.231 -0.228 -1.308 -2 ,9390 ,TETRA ,17674988,Sat Dec 4 15:25:53 CET,Sat Dec 4 17:25:17 CET,0.0 0.45 0.641 0.793 0.958 1.118 1.254 1.381 1.597 1.699 1.801 1.809 2.093 2.19 2.393 2.593 2.773 2.865 3.055 3.236 3.49 3.656 3.818 4.039 4.261 4.474 4.651 4.809 5.004 5.187 5.366 5.59 5.801 6.005 6.231 6.483 6.734 7.005 7.3 7.609 7.959 8.391 8.893 9.373 9.914 10.521 11.144 11.766 12.441 13.078 13.581 13.646 13.458 13.179 12.764 12.301 11.829 11.368 11.019 10.659 10.304 9.95 9.596 9.243 8.917 8.623 8.316 8.043 7.783 7.484 7.166 6.897 6.609 6.338 6.153 5.958 5.75 5.512 5.275 5.132 4.978 4.738 4.57 4.383 4.285 4.092 3.892 3.677 3.561 3.243 3.159 3.008 2.849 2.585 2.425 2.23 2.024 1.784 1.486 1.082 -0.564 -3 ,32575 ,TETRA ,17699104,Sat Dec 4 17:21:22 CET,Sat Dec 4 17:28:34 CET,0.0 0.345 0.514 0.665 0.8 0.93 1.062 1.186 1.387 1.485 1.592 1.625 1.92 2.029 2.22 2.409 2.604 2.69 2.831 2.969 3.168 3.294 3.422 3.609 3.789 3.961 4.131 4.296 4.504 4.712 4.909 5.131 5.344 5.554 5.811 6.094 6.354 6.678 6.999 7.293 7.635 8.028 8.509 8.991 9.495 9.987 10.551 11.199 11.87 12.543 13.11 13.164 12.961 12.665 12.251 11.835 11.474 11.111 10.756 10.317 9.946 9.638 9.335 9.049 8.77 8.534 8.253 7.941 7.673 7.419 7.178 6.939 6.656 6.396 6.217 6.013 5.795 5.567 5.335 5.195 5.053 4.818 4.634 4.443 4.351 4.159 3.96 3.755 3.639 3.338 3.276 3.132 2.98 2.638 2.467 2.287 2.076 1.826 1.505 1.115 -0.7 -4 ,29986 ,TETRA ,17699105,Sat Dec 4 17:21:21 CET,Sat Dec 4 19:16:34 CET,0.0 0.452 0.709 0.906 1.074 1.236 1.37 1.486 1.706 1.816 1.923 1.948 2.237 2.34 2.524 2.687 2.841 2.921 3.059 3.188 3.371 3.485 3.603 3.779 3.949 4.11 4.264 4.413 4.607 4.792 4.952 5.139 5.339 5.532 5.743 5.982 6.219 6.474 6.753 7.047 7.333 7.642 8.032 8.446 8.905 9.4 9.961 10.544 11.17 11.762 12.211 12.267 12.004 11.598 11.075 10.543 10.011 9.525 9.149 8.716 8.304 7.921 7.549 7.203 6.896 6.623 6.336 6.094 5.885 5.656 5.417 5.197 4.961 4.717 4.519 4.302 4.085 3.853 3.62 3.474 3.315 3.069 2.899 2.726 2.639 2.446 2.224 2.0 1.884 1.572 1.471 1.334 1.176 0.81 0.593 0.343 0.086 -0.201 -0.526 -0.956 -2.286 -5 ,23334 ,TETRA ,17699106,Sat Dec 4 17:21:21 CET,Sat Dec 4 17:28:29 CET,0.0 0.451 0.668 0.833 0.971 1.094 1.186 1.281 1.476 1.561 1.639 1.608 1.879 1.969 2.132 2.286 2.437 2.507 2.631 2.744 2.924 3.049 3.173 3.359 3.531 3.7 3.867 4.026 4.242 4.441 4.628 4.847 5.062 5.274 5.496 5.733 5.963 6.216 6.49 6.782 7.086 7.428 7.818 8.21 8.663 9.13 9.623 10.19 10.831 11.532 12.161 12.347 12.143 11.742 11.232 10.707 10.264 9.834 9.393 8.912 8.53 8.201 7.863 7.527 7.216 6.932 6.636 6.378 6.153 5.895 5.62 5.388 5.147 4.908 4.727 4.551 4.379 4.181 3.954 3.795 3.63 3.368 3.19 3.01 2.909 2.689 2.481 2.27 2.152 1.854 1.776 1.643 1.487 1.125 0.94 0.747 0.539 0.259 -0.11 -0.591 -2.103 -6 ,23297 ,TETRA ,17699107,Sat Dec 4 17:21:21 CET,Sat Dec 4 17:38:56 CET,0.0 0.312 0.485 0.636 0.791 0.929 1.052 1.18 1.394 1.494 1.588 1.583 1.852 1.938 2.111 2.282 2.457 2.546 2.705 2.853 3.076 3.226 3.363 3.557 3.771 3.957 4.112 4.274 4.498 4.718 4.914 5.151 5.398 5.63 5.875 6.133 6.375 6.619 6.891 7.209 7.522 7.872 8.283 8.685 9.17 9.694 10.26 10.851 11.518 12.17 12.587 12.585 12.323 11.95 11.523 11.06 10.634 10.24 9.852 9.394 8.988 8.656 8.347 8.028 7.715 7.439 7.157 6.888 6.647 6.39 6.119 5.885 5.635 5.389 5.196 5.0 4.809 4.614 4.392 4.227 4.067 3.819 3.64 3.451 3.357 3.179 2.972 2.733 2.602 2.281 2.167 2.026 1.883 1.562 1.39 1.205 0.999 0.762 0.513 0.163 -1.358 -7 ,545 ,TETRA ,17699108,Sat Dec 4 17:21:23 CET,Sat Dec 4 17:39:05 CET,0.0 0.304 0.448 0.562 0.704 0.858 0.995 1.118 1.34 1.438 1.524 1.505 1.77 1.847 2.01 2.188 2.345 2.424 2.57 2.715 2.943 3.086 3.212 3.387 3.548 3.712 3.891 4.056 4.265 4.485 4.712 4.962 5.209 5.476 5.765 6.074 6.382 6.739 7.107 7.442 7.748 8.105 8.522 8.941 9.409 9.924 10.536 11.159 11.852 12.568 13.193 13.422 13.218 12.808 12.383 11.977 11.501 10.962 10.495 10.061 9.691 9.365 9.052 8.749 8.446 8.172 7.893 7.637 7.409 7.156 6.914 6.738 6.543 6.306 6.113 5.914 5.712 5.494 5.257 5.097 4.943 4.698 4.534 4.363 4.268 4.074 3.863 3.641 3.509 3.182 3.061 2.888 2.688 2.239 2.007 1.762 1.483 1.194 0.87 0.453 -0.974 -8 ,8733 ,TETRA ,17699109,Sat Dec 4 17:21:21 CET,Sat Dec 4 17:27:32 CET,0.0 0.262 0.473 0.622 0.729 0.843 0.975 1.101 1.318 1.423 1.524 1.533 1.805 1.883 2.038 2.191 2.321 2.382 2.516 2.65 2.829 2.945 3.079 3.277 3.455 3.618 3.77 3.912 4.093 4.283 4.467 4.692 4.928 5.15 5.388 5.652 5.915 6.203 6.499 6.792 7.096 7.487 7.918 8.294 8.811 9.39 10.01 10.621 11.131 11.69 12.199 12.159 11.711 11.243 10.752 10.207 9.685 9.197 8.786 8.359 7.965 7.563 7.152 6.79 6.468 6.167 5.832 5.521 5.262 4.995 4.718 4.488 4.256 4.03 3.849 3.637 3.409 3.188 2.97 2.813 2.649 2.381 2.186 1.963 1.846 1.62 1.376 1.133 1.009 0.68 0.582 0.418 0.225 -0.185 -0.392 -0.628 -0.914 -1.206 -1.569 -2.034 -3.459 -9 ,21449 ,TETRA ,17699110,Sat Dec 4 17:21:23 CET,Sat Dec 4 17:27:50 CET,0.0 0.253 0.399 0.521 0.645 0.763 0.867 0.963 1.147 1.235 1.333 1.353 1.623 1.699 1.852 2.006 2.164 2.244 2.393 2.525 2.704 2.83 2.953 3.128 3.309 3.486 3.659 3.825 4.024 4.207 4.391 4.622 4.838 5.035 5.267 5.529 5.778 6.047 6.34 6.667 7.001 7.368 7.798 8.196 8.634 9.167 9.773 10.36 10.966 11.519 11.957 12.056 11.784 11.359 10.88 10.383 9.932 9.441 8.961 8.498 8.102 7.769 7.457 7.144 6.836 6.535 6.245 5.962 5.693 5.419 5.135 4.885 4.613 4.362 4.173 3.962 3.738 3.479 3.209 3.036 2.851 2.583 2.393 2.179 2.075 1.861 1.611 1.349 1.218 0.9 0.8 0.642 0.487 0.108 -0.128 -0.35 -0.576 -0.815 -1.104 -1.517 -2.899 -10 ,28869 ,TETRA ,17674996,Sat Dec 4 15:30:56 CET,Sat Dec 4 17:29:35 CET,0.0 0.404 0.612 0.789 0.936 1.05 1.18 1.313 1.532 1.632 1.729 1.738 2.012 2.102 2.281 2.434 2.564 2.629 2.757 2.875 3.07 3.203 3.325 3.509 3.69 3.863 4.03 4.185 4.387 4.587 4.769 5.0 5.228 5.441 5.691 5.983 6.258 6.553 6.898 7.269 7.624 8.022 8.512 9.0 9.548 10.109 10.727 11.384 12.113 12.833 13.409 13.521 13.154 12.627 12.178 11.825 11.422 11.006 10.65 10.25 9.872 9.534 9.207 8.885 8.587 8.309 8.028 7.782 7.551 7.302 7.027 6.794 6.577 6.345 6.148 5.939 5.721 5.515 5.301 5.137 4.955 4.681 4.498 4.291 4.185 3.989 3.788 3.564 3.449 3.148 3.035 2.877 2.717 2.364 2.159 1.954 1.731 1.451 1.121 0.703 -0.855 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8b_8a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8b_8a.txt deleted file mode 100644 index 6cb30ec0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8b_8a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6832 ,TETRA ,17674997,Sat Dec 4 15:32:50 CET,Sat Dec 4 17:36:28 CET,0.0 0.452 0.622 0.773 0.902 1.032 1.161 1.276 1.483 1.588 1.695 1.815 1.974 2.05 2.201 2.35 2.493 2.558 2.689 2.822 3.008 3.123 3.233 3.397 3.544 3.688 3.831 3.969 4.161 4.344 4.508 4.696 4.873 5.043 5.23 5.454 5.696 5.955 6.223 6.492 6.747 7.031 7.372 7.687 8.03 8.418 8.822 9.196 9.538 9.828 9.922 9.563 9.051 8.527 8.011 7.468 6.907 6.401 5.982 5.544 5.154 4.798 4.449 4.113 3.802 3.52 3.235 2.967 2.738 2.508 2.265 2.063 1.853 1.64 1.474 1.293 1.105 0.933 0.756 0.62 0.482 0.279 0.132 -0.023 -0.101 -0.278 -0.476 -0.68 -0.784 -0.967 -1.111 -1.225 -1.346 -1.623 -1.765 -1.904 -2.067 -2.277 -2.531 -2.779 -3.288 -2 ,22815 ,TETRA ,17674998,Sat Dec 4 15:34:48 CET,Sat Dec 4 17:31:56 CET,0.0 0.276 0.432 0.562 0.697 0.824 0.942 1.065 1.273 1.363 1.452 1.562 1.742 1.829 1.983 2.138 2.292 2.362 2.502 2.638 2.819 2.928 3.028 3.186 3.352 3.505 3.645 3.78 3.95 4.1 4.255 4.457 4.645 4.82 5.023 5.25 5.464 5.69 5.926 6.174 6.423 6.688 7.002 7.311 7.659 8.037 8.41 8.775 9.141 9.394 9.431 9.083 8.563 7.999 7.463 6.954 6.444 5.967 5.561 5.158 4.819 4.502 4.176 3.866 3.578 3.318 3.04 2.789 2.581 2.368 2.144 1.955 1.74 1.518 1.342 1.155 0.968 0.771 0.57 0.425 0.27 0.041 -0.115 -0.284 -0.373 -0.561 -0.745 -0.929 -1.03 -1.213 -1.343 -1.461 -1.586 -1.834 -1.974 -2.14 -2.312 -2.514 -2.766 -3.036 -3.567 -3 ,23717 ,TETRA ,17674999,Sat Dec 4 15:38:52 CET,Sat Dec 4 17:39:20 CET,0.0 0.242 0.385 0.525 0.669 0.811 0.928 1.035 1.224 1.312 1.401 1.497 1.663 1.736 1.897 2.057 2.21 2.287 2.426 2.556 2.734 2.84 2.954 3.129 3.287 3.429 3.559 3.684 3.857 4.027 4.182 4.363 4.543 4.721 4.913 5.114 5.307 5.519 5.75 5.995 6.253 6.522 6.803 7.092 7.415 7.747 8.111 8.47 8.805 9.076 9.212 9.019 8.583 8.062 7.555 7.067 6.651 6.254 5.845 5.421 5.049 4.719 4.424 4.142 3.869 3.615 3.353 3.105 2.894 2.695 2.481 2.289 2.083 1.865 1.696 1.53 1.367 1.189 0.998 0.866 0.719 0.485 0.317 0.149 0.064 -0.124 -0.304 -0.483 -0.583 -0.774 -0.92 -1.036 -1.159 -1.433 -1.599 -1.784 -1.968 -2.177 -2.412 -2.708 -3.497 -4 ,23933 ,TETRA ,17699115,Sat Dec 4 17:21:23 CET,Sat Dec 4 17:38:58 CET,0.0 0.31 0.504 0.689 0.857 0.998 1.111 1.223 1.45 1.549 1.64 1.736 1.906 1.99 2.146 2.3 2.449 2.52 2.648 2.768 2.949 3.067 3.181 3.334 3.486 3.641 3.791 3.927 4.105 4.269 4.414 4.602 4.791 4.968 5.165 5.38 5.586 5.82 6.067 6.316 6.574 6.834 7.114 7.405 7.744 8.103 8.5 8.897 9.273 9.569 9.57 9.165 8.654 8.108 7.569 7.067 6.589 6.141 5.759 5.349 4.984 4.641 4.324 4.029 3.721 3.428 3.146 2.898 2.672 2.437 2.182 1.957 1.717 1.472 1.285 1.079 0.859 0.634 0.401 0.243 0.085 -0.175 -0.362 -0.549 -0.649 -0.855 -1.057 -1.279 -1.392 -1.571 -1.721 -1.85 -1.968 -2.215 -2.356 -2.513 -2.666 -2.83 -3.072 -3.353 -3.966 -5 ,5526 ,TETRA ,17675001,Sat Dec 4 15:39:50 CET,Sat Dec 4 17:44:21 CET,0.0 0.237 0.419 0.568 0.711 0.841 0.949 1.039 1.233 1.333 1.418 1.509 1.672 1.743 1.87 1.992 2.107 2.17 2.294 2.405 2.568 2.669 2.769 2.924 3.07 3.214 3.356 3.494 3.676 3.851 4.003 4.185 4.368 4.535 4.739 4.963 5.163 5.382 5.617 5.85 6.084 6.363 6.69 7.002 7.351 7.712 8.093 8.461 8.787 9.026 9.097 8.802 8.318 7.809 7.303 6.776 6.283 5.834 5.413 4.971 4.578 4.216 3.883 3.594 3.307 3.018 2.709 2.443 2.215 1.98 1.744 1.53 1.315 1.099 0.928 0.75 0.555 0.346 0.148 0.02 -0.12 -0.344 -0.503 -0.672 -0.76 -0.93 -1.104 -1.293 -1.389 -1.569 -1.701 -1.815 -1.94 -2.188 -2.319 -2.484 -2.684 -2.921 -3.16 -3.408 -4.06 -6 ,25491 ,TETRA ,17675002,Sat Dec 4 15:39:50 CET,Sat Dec 4 17:43:47 CET,0.0 0.493 0.659 0.795 0.925 1.037 1.141 1.257 1.491 1.592 1.687 1.794 1.959 2.048 2.231 2.392 2.542 2.613 2.744 2.873 3.057 3.173 3.28 3.432 3.575 3.721 3.868 4.006 4.186 4.349 4.505 4.701 4.895 5.077 5.274 5.49 5.693 5.914 6.161 6.398 6.622 6.888 7.168 7.435 7.764 8.106 8.451 8.843 9.239 9.519 9.598 9.296 8.788 8.221 7.676 7.148 6.669 6.237 5.881 5.502 5.137 4.821 4.515 4.202 3.917 3.672 3.427 3.195 2.99 2.772 2.529 2.324 2.122 1.926 1.768 1.594 1.418 1.241 1.052 0.918 0.771 0.521 0.351 0.182 0.089 -0.112 -0.305 -0.496 -0.604 -0.805 -0.984 -1.12 -1.255 -1.569 -1.727 -1.883 -2.038 -2.207 -2.43 -2.692 -3.297 -7 ,1796 ,TETRA ,17699118,Sat Dec 4 17:21:23 CET,Sat Dec 4 17:46:05 CET,0.0 0.351 0.488 0.619 0.739 0.857 0.973 1.077 1.293 1.397 1.496 1.601 1.771 1.857 2.017 2.16 2.298 2.367 2.498 2.615 2.787 2.899 3.0 3.149 3.3 3.455 3.608 3.75 3.926 4.084 4.234 4.434 4.632 4.822 5.043 5.276 5.486 5.703 5.941 6.185 6.445 6.731 7.044 7.365 7.727 8.107 8.475 8.809 9.143 9.419 9.495 9.186 8.707 8.195 7.704 7.24 6.773 6.311 5.909 5.519 5.199 4.895 4.581 4.279 3.991 3.716 3.441 3.189 2.974 2.768 2.523 2.307 2.09 1.854 1.686 1.515 1.317 1.103 0.874 0.717 0.565 0.345 0.198 0.044 -0.032 -0.177 -0.341 -0.525 -0.621 -0.806 -0.962 -1.083 -1.215 -1.489 -1.619 -1.794 -1.993 -2.205 -2.453 -2.746 -3.365 -8 ,9359 ,TETRA ,17699119,Sat Dec 4 17:21:23 CET,Sat Dec 4 19:24:18 CET,0.0 0.286 0.438 0.561 0.697 0.831 0.958 1.07 1.259 1.343 1.435 1.518 1.668 1.747 1.887 2.022 2.161 2.226 2.351 2.472 2.633 2.742 2.852 3.014 3.163 3.303 3.446 3.574 3.721 3.864 4.018 4.212 4.396 4.57 4.774 5.007 5.214 5.426 5.654 5.899 6.15 6.425 6.735 7.032 7.362 7.691 8.052 8.419 8.768 9.08 9.21 8.953 8.547 8.094 7.619 7.1 6.639 6.226 5.843 5.445 5.081 4.763 4.467 4.187 3.922 3.673 3.398 3.151 2.937 2.718 2.488 2.296 2.104 1.9 1.729 1.545 1.353 1.171 0.994 0.869 0.738 0.523 0.37 0.215 0.139 -0.02 -0.188 -0.37 -0.483 -0.676 -0.805 -0.919 -1.031 -1.3 -1.457 -1.617 -1.79 -1.983 -2.234 -2.512 -3.176 -9 ,9547 ,TETRA ,17699120,Sat Dec 4 17:21:23 CET,Sat Dec 4 17:43:36 CET,0.0 0.283 0.448 0.591 0.718 0.844 0.958 1.053 1.245 1.341 1.426 1.509 1.677 1.764 1.932 2.079 2.216 2.285 2.414 2.529 2.685 2.791 2.904 3.074 3.224 3.373 3.527 3.666 3.843 4.023 4.186 4.379 4.578 4.765 4.978 5.22 5.435 5.669 5.94 6.229 6.516 6.837 7.182 7.489 7.808 8.111 8.44 8.77 9.111 9.347 9.349 9.026 8.561 8.057 7.579 7.105 6.625 6.185 5.807 5.406 5.052 4.738 4.432 4.142 3.881 3.624 3.337 3.092 2.878 2.644 2.39 2.175 1.967 1.748 1.569 1.385 1.198 0.997 0.781 0.633 0.486 0.261 0.108 -0.048 -0.142 -0.339 -0.523 -0.715 -0.818 -1.009 -1.159 -1.291 -1.422 -1.699 -1.86 -2.036 -2.238 -2.443 -2.687 -2.955 -3.586 -10 ,4932 ,TETRA ,17699121,Sat Dec 4 17:21:23 CET,Sat Dec 4 17:43:10 CET,0.0 0.379 0.633 0.841 1.017 1.163 1.298 1.418 1.628 1.724 1.814 1.898 2.053 2.134 2.298 2.44 2.582 2.655 2.789 2.917 3.104 3.215 3.328 3.499 3.659 3.811 3.96 4.106 4.286 4.448 4.6 4.803 4.996 5.169 5.372 5.602 5.815 6.042 6.289 6.551 6.818 7.108 7.416 7.717 8.065 8.405 8.783 9.166 9.543 9.833 9.82 9.381 8.826 8.281 7.789 7.331 6.889 6.471 6.092 5.707 5.371 5.05 4.744 4.444 4.143 3.874 3.603 3.353 3.134 2.91 2.677 2.491 2.284 2.053 1.879 1.692 1.49 1.269 1.042 0.9 0.761 0.521 0.342 0.164 0.074 -0.104 -0.272 -0.446 -0.543 -0.743 -0.902 -1.026 -1.159 -1.409 -1.535 -1.676 -1.829 -1.996 -2.163 -2.436 -3.257 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8d_8c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8d_8c.txt deleted file mode 100644 index 05190ea9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8d_8c.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,5354 ,KEBNE ,16838653,Sun Dec 5 19:17:13 CET,Sun Dec 5 21:03:20 CET,0.0 1.012 1.312 1.499 1.681 1.845 2.0 2.138 2.364 2.477 2.579 2.643 2.87 2.969 3.151 3.31 3.463 3.544 3.708 3.867 4.083 4.215 4.336 4.517 4.699 4.883 5.061 5.222 5.424 5.62 5.809 6.042 6.272 6.496 6.764 7.062 7.325 7.633 7.976 8.351 8.773 9.227 9.732 10.231 10.816 11.538 12.427 13.349 14.349 15.534 16.912 17.904 18.236 18.245 18.121 17.912 17.701 17.465 17.263 17.056 16.831 16.609 16.413 16.249 16.071 15.885 15.694 15.53 15.39 15.239 15.059 14.902 14.751 14.604 14.482 14.354 14.213 14.066 13.926 13.819 13.704 13.521 13.407 13.294 13.224 13.082 12.947 12.801 12.724 12.521 12.456 12.355 12.241 11.998 11.861 11.716 11.564 11.363 11.108 10.791 10.129 -2 ,13927 ,KEBNE ,16838654,Sun Dec 5 19:17:13 CET,Sun Dec 5 21:01:51 CET,0.0 0.623 0.843 1.041 1.217 1.358 1.479 1.601 1.852 1.971 2.082 2.142 2.361 2.46 2.666 2.854 3.019 3.099 3.247 3.39 3.62 3.775 3.918 4.106 4.298 4.489 4.673 4.863 5.092 5.285 5.461 5.671 5.876 6.115 6.411 6.733 7.057 7.404 7.768 8.154 8.576 9.097 9.708 10.31 11.036 11.842 12.801 13.843 15.014 16.416 17.985 18.901 19.051 18.981 18.879 18.74 18.519 18.309 18.122 17.898 17.719 17.524 17.312 17.126 16.931 16.766 16.599 16.418 16.24 16.062 15.895 15.757 15.607 15.445 15.326 15.203 15.061 14.906 14.756 14.662 14.565 14.416 14.299 14.171 14.11 13.975 13.829 13.688 13.616 13.419 13.353 13.264 13.177 12.962 12.832 12.691 12.52 12.337 12.149 11.889 11.046 -3 ,10496 ,KEBNE ,16838655,Sun Dec 5 19:17:13 CET,Sun Dec 5 21:01:38 CET,0.0 0.575 0.822 0.995 1.15 1.293 1.42 1.532 1.742 1.845 1.948 1.988 2.189 2.275 2.462 2.622 2.781 2.862 3.014 3.159 3.375 3.517 3.649 3.838 4.032 4.22 4.399 4.566 4.771 4.975 5.189 5.454 5.685 5.906 6.167 6.48 6.787 7.081 7.398 7.752 8.113 8.519 9.006 9.472 9.992 10.579 11.297 12.122 13.105 14.192 15.342 16.208 16.601 16.785 16.858 16.859 16.825 16.765 16.685 16.561 16.437 16.347 16.253 16.144 16.031 15.915 15.787 15.64 15.49 15.342 15.178 15.028 14.886 14.757 14.64 14.51 14.38 14.255 14.118 14.023 13.927 13.764 13.645 13.52 13.457 13.321 13.174 13.029 12.953 12.74 12.66 12.573 12.48 12.271 12.15 12.027 11.895 11.709 11.459 11.118 9.687 -4 ,6833 ,KEBNE ,16838656,Sun Dec 5 19:17:16 CET,Sun Dec 5 20:57:03 CET,0.0 0.62 0.84 1.046 1.231 1.383 1.514 1.644 1.883 2.001 2.112 2.197 2.435 2.532 2.699 2.872 3.048 3.128 3.284 3.431 3.666 3.825 3.963 4.161 4.379 4.583 4.76 4.934 5.158 5.373 5.565 5.789 6.019 6.262 6.539 6.86 7.157 7.47 7.834 8.24 8.684 9.174 9.735 10.296 10.987 11.793 12.667 13.592 14.731 16.065 17.584 18.486 18.676 18.681 18.551 18.31 18.101 17.917 17.699 17.454 17.25 17.028 16.797 16.605 16.414 16.214 15.999 15.817 15.657 15.482 15.308 15.163 15.007 14.839 14.702 14.565 14.433 14.283 14.126 14.027 13.924 13.761 13.618 13.464 13.395 13.261 13.117 12.947 12.866 12.674 12.609 12.518 12.424 12.204 12.094 11.969 11.82 11.646 11.431 11.173 10.502 -7 ,3253 ,KEBNE ,16838659,Sun Dec 5 19:17:12 CET,Sun Dec 5 21:00:25 CET,0.0 0.903 1.098 1.256 1.412 1.565 1.69 1.813 2.06 2.17 2.277 2.35 2.564 2.653 2.827 2.985 3.136 3.215 3.38 3.543 3.766 3.904 4.057 4.27 4.445 4.625 4.799 4.963 5.182 5.403 5.614 5.856 6.102 6.368 6.682 7.022 7.319 7.638 8.015 8.44 8.89 9.377 9.921 10.463 11.1 11.814 12.626 13.529 14.625 15.935 17.33 18.087 18.173 18.045 17.855 17.599 17.317 17.045 16.787 16.502 16.268 16.057 15.836 15.627 15.439 15.246 15.03 14.85 14.672 14.483 14.311 14.163 13.995 13.834 13.725 13.599 13.453 13.299 13.143 13.035 12.925 12.733 12.587 12.449 12.375 12.215 12.044 11.867 11.783 11.579 11.517 11.409 11.289 11.055 10.922 10.765 10.615 10.448 10.206 9.895 8.886 -8 ,18481 ,KEBNE ,16838660,Sun Dec 5 19:17:12 CET,Sun Dec 5 21:02:39 CET,0.0 0.928 1.212 1.429 1.607 1.767 1.905 2.034 2.267 2.384 2.497 2.571 2.799 2.886 3.048 3.219 3.391 3.468 3.612 3.749 3.97 4.127 4.265 4.463 4.645 4.814 4.985 5.148 5.355 5.55 5.726 5.942 6.188 6.447 6.744 7.069 7.389 7.751 8.141 8.555 8.991 9.486 10.08 10.648 11.3 12.04 12.931 13.908 14.897 16.025 17.227 17.868 18.011 17.926 17.712 17.489 17.261 17.006 16.76 16.485 16.252 16.054 15.842 15.629 15.418 15.234 15.054 14.894 14.74 14.564 14.386 14.237 14.082 13.926 13.795 13.66 13.516 13.363 13.214 13.099 12.977 12.789 12.664 12.537 12.469 12.32 12.172 12.025 11.946 11.746 11.671 11.567 11.464 11.253 11.118 10.971 10.822 10.644 10.424 10.133 9.427 -9 ,16714 ,KEBNE ,16838661,Sun Dec 5 19:17:12 CET,Sun Dec 5 21:02:09 CET,0.0 0.696 0.967 1.171 1.323 1.445 1.567 1.7 1.95 2.057 2.162 2.232 2.446 2.525 2.688 2.848 3.018 3.095 3.247 3.405 3.601 3.723 3.848 4.042 4.232 4.417 4.603 4.777 4.988 5.201 5.419 5.676 5.912 6.151 6.445 6.759 7.063 7.417 7.805 8.221 8.649 9.127 9.686 10.248 10.917 11.695 12.621 13.62 14.754 16.107 17.648 18.823 19.241 19.211 19.073 18.951 18.838 18.692 18.493 18.241 18.009 17.781 17.546 17.338 17.142 16.949 16.73 16.542 16.401 16.248 16.079 15.939 15.783 15.615 15.48 15.329 15.188 15.047 14.889 14.782 14.672 14.507 14.382 14.247 14.183 14.045 13.884 13.72 13.639 13.429 13.352 13.262 13.161 12.923 12.806 12.687 12.536 12.382 12.214 11.919 11.025 -10 ,28952 ,KEBNE ,16838662,Sun Dec 5 19:17:12 CET,Sun Dec 5 21:02:49 CET,0.0 0.738 0.986 1.172 1.324 1.471 1.622 1.771 2.024 2.134 2.234 2.302 2.517 2.611 2.803 2.979 3.145 3.221 3.371 3.53 3.752 3.877 4.005 4.203 4.39 4.574 4.76 4.936 5.165 5.4 5.626 5.902 6.166 6.42 6.72 7.05 7.373 7.725 8.073 8.463 8.911 9.386 9.946 10.55 11.243 11.982 12.891 13.956 15.088 16.315 17.818 18.853 19.254 19.394 19.309 19.133 18.921 18.634 18.413 18.251 18.115 17.968 17.795 17.625 17.478 17.364 17.234 17.087 16.96 16.829 16.68 16.552 16.417 16.269 16.145 16.022 15.9 15.762 15.606 15.502 15.39 15.214 15.098 14.963 14.891 14.748 14.617 14.462 14.377 14.188 14.114 14.015 13.92 13.714 13.62 13.507 13.354 13.181 12.966 12.683 11.913 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8a.txt deleted file mode 100644 index c659d824..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7474 ,TETRA ,17675018,Sat Dec 4 15:45:49 CET,Sat Dec 4 17:43:29 CET,0.0 0.376 0.593 0.813 0.998 1.162 1.315 1.441 1.674 1.79 1.894 1.973 2.154 2.237 2.4 2.558 2.708 2.78 2.918 3.054 3.253 3.394 3.537 3.737 3.932 4.114 4.282 4.455 4.687 4.907 5.122 5.369 5.594 5.825 6.093 6.386 6.669 6.984 7.337 7.719 8.127 8.577 9.09 9.606 10.225 10.915 11.674 12.496 13.433 14.541 15.786 16.536 16.762 16.795 16.766 16.7 16.594 16.428 16.279 16.139 16.001 15.878 15.743 15.574 15.387 15.227 15.092 14.965 14.85 14.726 14.585 14.477 14.377 14.273 14.184 14.09 13.993 13.903 13.817 13.743 13.65 13.506 13.426 13.34 13.285 13.168 13.038 12.907 12.84 12.675 12.597 12.515 12.426 12.235 12.13 11.985 11.837 11.703 11.527 11.232 10.155 -2 ,28490 ,TETRA ,17675019,Sat Dec 4 15:45:49 CET,Sat Dec 4 17:44:52 CET,0.0 0.874 1.173 1.405 1.611 1.769 1.907 2.057 2.342 2.477 2.599 2.723 2.906 3.009 3.223 3.436 3.638 3.733 3.908 4.063 4.272 4.422 4.576 4.789 4.99 5.183 5.366 5.537 5.746 5.958 6.192 6.474 6.746 6.999 7.282 7.618 7.941 8.293 8.673 9.066 9.493 9.974 10.502 11.029 11.636 12.315 13.064 13.886 14.867 15.978 17.174 17.986 18.362 18.518 18.536 18.503 18.433 18.321 18.2 18.07 17.941 17.816 17.683 17.535 17.403 17.289 17.173 17.075 16.982 16.888 16.793 16.705 16.607 16.506 16.42 16.327 16.249 16.161 16.062 15.998 15.923 15.811 15.725 15.62 15.565 15.442 15.32 15.208 15.155 15.015 14.98 14.919 14.836 14.633 14.54 14.454 14.354 14.223 14.036 13.819 13.289 -3 ,29920 ,TETRA ,17699134,Sat Dec 4 17:22:06 CET,Sat Dec 4 17:48:06 CET,0.0 0.634 0.855 1.05 1.217 1.365 1.492 1.608 1.83 1.936 2.04 2.153 2.335 2.431 2.635 2.836 3.021 3.108 3.276 3.438 3.665 3.817 3.973 4.196 4.394 4.583 4.764 4.941 5.179 5.411 5.645 5.917 6.163 6.405 6.692 7.029 7.36 7.726 8.134 8.548 8.97 9.484 10.079 10.633 11.255 11.939 12.713 13.598 14.615 15.69 16.879 17.74 18.141 18.295 18.306 18.224 18.104 17.976 17.841 17.705 17.599 17.47 17.313 17.175 17.048 16.939 16.822 16.699 16.59 16.475 16.348 16.251 16.151 16.041 15.96 15.874 15.778 15.676 15.568 15.489 15.415 15.317 15.252 15.178 15.137 15.048 14.945 14.836 14.781 14.64 14.599 14.537 14.464 14.298 14.217 14.125 13.997 13.874 13.771 13.631 13.366 -4 ,8059 ,TETRA ,17699135,Sat Dec 4 17:22:02 CET,Sat Dec 4 17:45:57 CET,0.0 0.509 0.748 0.91 1.076 1.24 1.392 1.54 1.831 1.957 2.059 2.153 2.338 2.426 2.596 2.773 2.936 3.012 3.159 3.31 3.534 3.674 3.815 4.023 4.226 4.417 4.586 4.752 4.964 5.166 5.369 5.643 5.907 6.161 6.461 6.784 7.104 7.454 7.836 8.245 8.671 9.148 9.697 10.244 10.893 11.61 12.403 13.218 14.073 15.131 16.326 17.047 17.424 17.576 17.578 17.538 17.444 17.322 17.2 17.056 16.932 16.802 16.658 16.529 16.409 16.296 16.179 16.07 15.969 15.866 15.758 15.665 15.557 15.449 15.38 15.298 15.201 15.097 15.001 14.93 14.846 14.728 14.653 14.569 14.518 14.405 14.289 14.177 14.124 13.984 13.937 13.869 13.799 13.669 13.603 13.514 13.4 13.263 13.12 12.958 12.756 -5 ,31402 ,TETRA ,17675022,Sat Dec 4 15:45:49 CET,Sat Dec 4 17:44:13 CET,0.0 0.405 0.658 0.912 1.13 1.285 1.413 1.548 1.818 1.945 2.066 2.212 2.41 2.509 2.686 2.868 3.06 3.142 3.282 3.435 3.657 3.793 3.927 4.115 4.305 4.491 4.665 4.832 5.048 5.264 5.465 5.716 5.985 6.251 6.55 6.883 7.214 7.581 7.962 8.376 8.799 9.246 9.776 10.307 10.918 11.602 12.388 13.236 14.098 15.058 16.197 16.911 17.178 17.297 17.341 17.321 17.274 17.201 17.102 16.999 16.915 16.831 16.733 16.623 16.512 16.397 16.258 16.137 16.042 15.94 15.832 15.746 15.651 15.549 15.481 15.405 15.314 15.223 15.13 15.065 15.003 14.902 14.815 14.716 14.667 14.56 14.465 14.357 14.297 14.159 14.116 14.048 13.984 13.837 13.746 13.639 13.521 13.352 13.168 12.995 12.694 -6 ,7947 ,TETRA ,17699137,Sat Dec 4 17:22:02 CET,Sat Dec 4 17:48:15 CET,0.0 0.573 0.813 1.036 1.264 1.463 1.635 1.799 2.113 2.245 2.362 2.49 2.672 2.763 2.948 3.141 3.304 3.38 3.533 3.683 3.906 4.051 4.191 4.386 4.563 4.738 4.916 5.094 5.332 5.566 5.788 6.065 6.332 6.577 6.853 7.173 7.497 7.852 8.226 8.618 9.031 9.504 10.057 10.591 11.181 11.807 12.514 13.309 14.195 15.198 16.338 17.107 17.399 17.445 17.414 17.398 17.33 17.221 17.118 16.973 16.819 16.68 16.542 16.415 16.303 16.207 16.099 16.001 15.916 15.821 15.718 15.631 15.542 15.444 15.358 15.265 15.173 15.08 14.986 14.922 14.861 14.752 14.662 14.568 14.525 14.434 14.328 14.204 14.137 13.997 13.957 13.881 13.801 13.64 13.546 13.442 13.331 13.215 13.087 12.933 12.713 -7 ,17994 ,TETRA ,17699138,Sat Dec 4 17:22:03 CET,Sat Dec 4 17:41:06 CET,0.0 0.637 0.942 1.154 1.339 1.509 1.65 1.769 1.997 2.106 2.207 2.3 2.487 2.591 2.795 2.982 3.149 3.231 3.391 3.537 3.747 3.886 4.031 4.254 4.465 4.673 4.872 5.058 5.3 5.528 5.747 6.013 6.272 6.517 6.784 7.07 7.343 7.648 7.972 8.34 8.723 9.139 9.647 10.142 10.71 11.348 12.057 12.86 13.905 15.123 16.427 17.39 17.8 17.962 17.994 17.945 17.89 17.813 17.712 17.623 17.531 17.414 17.283 17.167 17.059 16.947 16.827 16.716 16.621 16.523 16.411 16.331 16.249 16.15 16.074 15.996 15.909 15.819 15.725 15.65 15.558 15.419 15.342 15.263 15.214 15.093 14.968 14.866 14.818 14.685 14.639 14.553 14.464 14.286 14.179 14.058 13.944 13.821 13.666 13.487 12.937 -8 ,26875 ,TETRA ,17675025,Sat Dec 4 15:47:50 CET,Sat Dec 4 17:35:48 CET,0.0 0.362 0.59 0.78 0.935 1.084 1.243 1.396 1.668 1.792 1.902 2.008 2.194 2.288 2.472 2.648 2.823 2.919 3.089 3.234 3.459 3.604 3.733 3.916 4.102 4.282 4.45 4.628 4.873 5.09 5.298 5.552 5.807 6.068 6.365 6.692 7.01 7.357 7.722 8.102 8.499 8.961 9.51 10.064 10.692 11.365 12.121 12.911 13.794 14.754 15.803 16.503 16.741 16.837 16.858 16.815 16.734 16.642 16.554 16.46 16.342 16.189 16.056 15.945 15.817 15.705 15.578 15.462 15.376 15.281 15.18 15.084 14.978 14.878 14.795 14.705 14.606 14.505 14.389 14.309 14.239 14.126 14.039 13.956 13.915 13.818 13.709 13.582 13.512 13.362 13.303 13.23 13.149 13.014 12.94 12.845 12.75 12.645 12.517 12.368 12.112 -9 ,27247 ,TETRA ,17699140,Sat Dec 4 17:22:03 CET,Sat Dec 4 17:47:04 CET,0.0 0.304 0.469 0.592 0.715 0.828 0.94 1.046 1.256 1.356 1.447 1.531 1.694 1.769 1.923 2.08 2.243 2.324 2.486 2.644 2.87 3.008 3.147 3.365 3.558 3.737 3.91 4.07 4.295 4.522 4.738 4.997 5.23 5.447 5.715 6.033 6.348 6.687 7.023 7.38 7.785 8.246 8.765 9.277 9.873 10.534 11.256 12.063 12.917 13.748 14.672 15.247 15.498 15.627 15.653 15.626 15.557 15.456 15.349 15.215 15.086 14.982 14.873 14.748 14.623 14.501 14.354 14.23 14.145 14.053 13.949 13.859 13.752 13.645 13.57 13.492 13.4 13.289 13.175 13.097 13.006 12.865 12.773 12.673 12.619 12.503 12.382 12.266 12.205 12.06 12.011 11.945 11.874 11.728 11.655 11.569 11.477 11.366 11.221 11.023 10.734 -10 ,32578 ,TETRA ,17699141,Sat Dec 4 17:22:03 CET,Sat Dec 4 17:38:46 CET,0.0 0.527 0.783 0.986 1.13 1.243 1.366 1.49 1.73 1.854 1.972 2.106 2.291 2.394 2.604 2.792 2.968 3.048 3.2 3.366 3.608 3.748 3.882 4.079 4.284 4.496 4.693 4.879 5.113 5.343 5.572 5.836 6.091 6.352 6.658 7.011 7.349 7.712 8.098 8.493 8.905 9.373 9.934 10.503 11.158 11.834 12.563 13.438 14.425 15.412 16.457 17.09 17.317 17.384 17.332 17.225 17.096 16.945 16.804 16.67 16.541 16.423 16.311 16.195 16.076 15.953 15.817 15.694 15.586 15.472 15.361 15.266 15.166 15.069 14.988 14.906 14.817 14.719 14.618 14.549 14.481 14.375 14.297 14.213 14.174 14.085 13.984 13.856 13.782 13.629 13.568 13.487 13.385 13.179 13.079 12.977 12.859 12.727 12.549 12.271 11.476 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8c.txt deleted file mode 100644 index 9eb9ffd9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8e_8c.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21509 ,KEBNE ,16838663,Sun Dec 5 19:17:12 CET,Sun Dec 5 20:59:50 CET,0.0 0.454 0.659 0.85 1.015 1.145 1.261 1.371 1.541 1.615 1.693 1.773 1.94 2.0 2.111 2.229 2.347 2.398 2.491 2.599 2.756 2.84 2.92 3.022 3.123 3.235 3.338 3.419 3.506 3.6 3.69 3.791 3.896 3.995 4.076 4.173 4.3 4.436 4.572 4.714 4.863 4.979 5.067 5.189 5.344 5.431 5.434 5.389 5.277 4.835 3.768 2.313 0.811 -0.534 -1.656 -2.737 -3.701 -4.485 -5.157 -5.844 -6.473 -7.054 -7.599 -8.103 -8.569 -9.004 -9.457 -9.845 -10.178 -10.52 -10.883 -11.199 -11.51 -11.807 -12.04 -12.286 -12.538 -12.803 -13.073 -13.256 -13.437 -13.715 -13.923 -14.137 -14.246 -14.477 -14.723 -14.977 -15.104 -15.345 -15.51 -15.663 -15.813 -16.107 -16.277 -16.476 -16.714 -16.977 -17.274 -17.74 -19.367 -4 ,19498 ,KEBNE ,16838666,Sun Dec 5 19:17:12 CET,Sun Dec 5 21:00:46 CET,0.0 0.83 1.04 1.211 1.331 1.439 1.535 1.615 1.777 1.87 1.955 2.013 2.174 2.24 2.357 2.47 2.569 2.612 2.699 2.779 2.887 2.963 3.04 3.151 3.26 3.357 3.439 3.515 3.609 3.692 3.766 3.857 3.953 4.04 4.142 4.275 4.378 4.456 4.532 4.596 4.652 4.707 4.756 4.814 4.916 4.964 4.952 4.924 4.647 3.958 2.807 1.162 -0.421 -1.874 -3.168 -4.274 -5.171 -5.972 -6.707 -7.489 -8.176 -8.781 -9.326 -9.812 -10.287 -10.73 -11.152 -11.516 -11.861 -12.222 -12.578 -12.868 -13.171 -13.465 -13.687 -13.918 -14.16 -14.417 -14.685 -14.867 -15.058 -15.347 -15.548 -15.761 -15.877 -16.124 -16.37 -16.604 -16.719 -16.956 -17.13 -17.277 -17.427 -17.737 -17.909 -18.12 -18.377 -18.665 -18.994 -19.423 -21.106 -5 ,5213 ,KEBNE ,16838667,Sun Dec 5 19:17:12 CET,Sun Dec 5 20:59:41 CET,0.0 0.481 0.655 0.78 0.881 0.985 1.08 1.184 1.388 1.46 1.531 1.602 1.759 1.821 1.936 2.027 2.11 2.153 2.233 2.312 2.428 2.494 2.56 2.671 2.783 2.889 2.989 3.081 3.2 3.313 3.412 3.517 3.595 3.666 3.764 3.877 3.982 4.085 4.192 4.308 4.427 4.55 4.663 4.76 4.84 4.898 4.955 4.934 4.787 4.475 3.587 1.979 0.538 -0.606 -1.611 -2.581 -3.496 -4.375 -5.159 -5.954 -6.597 -7.125 -7.65 -8.146 -8.585 -8.981 -9.391 -9.766 -10.099 -10.433 -10.776 -11.064 -11.364 -11.679 -11.914 -12.15 -12.396 -12.644 -12.901 -13.079 -13.263 -13.558 -13.765 -13.965 -14.072 -14.31 -14.536 -14.765 -14.88 -15.114 -15.285 -15.433 -15.595 -15.937 -16.12 -16.34 -16.569 -16.823 -17.123 -17.489 -18.878 -6 ,25404 ,KEBNE ,16838668,Sun Dec 5 19:17:12 CET,Sun Dec 5 20:58:48 CET,0.0 0.604 0.821 0.982 1.095 1.194 1.3 1.388 1.532 1.61 1.691 1.745 1.884 1.945 2.064 2.171 2.277 2.328 2.443 2.543 2.661 2.742 2.832 2.956 3.064 3.164 3.249 3.333 3.435 3.529 3.632 3.741 3.847 3.936 4.026 4.126 4.215 4.296 4.376 4.451 4.506 4.575 4.624 4.633 4.609 4.556 4.458 4.279 3.895 3.226 1.992 0.432 -0.87 -2.089 -3.149 -4.122 -5.042 -5.882 -6.631 -7.397 -8.047 -8.578 -9.045 -9.497 -9.934 -10.361 -10.796 -11.144 -11.448 -11.771 -12.083 -12.338 -12.642 -12.987 -13.243 -13.487 -13.739 -14.003 -14.271 -14.451 -14.636 -14.946 -15.17 -15.39 -15.498 -15.719 -15.965 -16.228 -16.356 -16.613 -16.819 -16.968 -17.12 -17.458 -17.651 -17.873 -18.118 -18.397 -18.738 -19.199 -21.085 -7 ,26983 ,KEBNE ,16838669,Sun Dec 5 19:17:12 CET,Sun Dec 5 20:58:48 CET,0.0 0.593 0.817 0.973 1.108 1.253 1.383 1.496 1.676 1.756 1.826 1.861 2.008 2.062 2.182 2.299 2.408 2.463 2.557 2.631 2.752 2.835 2.916 3.037 3.145 3.249 3.342 3.425 3.554 3.661 3.726 3.83 3.95 4.032 4.107 4.172 4.232 4.312 4.405 4.498 4.588 4.665 4.739 4.803 4.848 4.842 4.753 4.581 4.224 3.569 2.294 0.591 -0.998 -2.335 -3.401 -4.386 -5.33 -6.197 -6.869 -7.491 -8.044 -8.58 -9.096 -9.587 -10.067 -10.5 -10.93 -11.313 -11.651 -12.002 -12.37 -12.658 -12.938 -13.237 -13.475 -13.722 -13.979 -14.239 -14.508 -14.69 -14.881 -15.185 -15.388 -15.588 -15.695 -15.921 -16.164 -16.425 -16.56 -16.798 -16.949 -17.092 -17.245 -17.573 -17.748 -17.968 -18.214 -18.458 -18.749 -19.159 -20.426 -8 ,16425 ,KEBNE ,16838670,Sun Dec 5 19:17:12 CET,Sun Dec 5 21:00:01 CET,0.0 0.816 1.077 1.259 1.421 1.558 1.671 1.77 1.93 2.006 2.088 2.163 2.326 2.388 2.502 2.613 2.738 2.797 2.888 2.963 3.084 3.173 3.243 3.343 3.445 3.539 3.641 3.733 3.827 3.923 4.02 4.131 4.25 4.378 4.508 4.629 4.741 4.862 5.012 5.171 5.313 5.448 5.548 5.633 5.755 5.853 5.851 5.747 5.574 5.232 4.458 3.169 1.701 0.205 -1.037 -1.993 -2.926 -3.811 -4.475 -5.198 -5.874 -6.463 -7.019 -7.536 -8.013 -8.435 -8.886 -9.279 -9.604 -9.941 -10.292 -10.576 -10.855 -11.149 -11.384 -11.633 -11.908 -12.193 -12.467 -12.641 -12.811 -13.089 -13.291 -13.517 -13.636 -13.871 -14.119 -14.374 -14.503 -14.74 -14.91 -15.068 -15.221 -15.562 -15.75 -15.94 -16.141 -16.391 -16.711 -17.129 -18.341 -9 ,30694 ,KEBNE ,16838671,Sun Dec 5 19:17:12 CET,Sun Dec 5 21:00:58 CET,0.0 0.864 1.049 1.181 1.288 1.4 1.512 1.605 1.769 1.846 1.928 1.999 2.162 2.23 2.334 2.42 2.511 2.562 2.665 2.756 2.899 2.988 3.061 3.171 3.284 3.38 3.477 3.571 3.679 3.77 3.853 3.965 4.083 4.187 4.296 4.418 4.527 4.648 4.781 4.901 5.008 5.139 5.275 5.358 5.411 5.447 5.468 5.423 5.098 4.346 2.959 1.043 -0.725 -2.202 -3.441 -4.585 -5.585 -6.477 -7.235 -7.987 -8.638 -9.167 -9.671 -10.188 -10.659 -11.094 -11.534 -11.894 -12.22 -12.575 -12.93 -13.227 -13.537 -13.855 -14.098 -14.35 -14.603 -14.854 -15.106 -15.28 -15.469 -15.772 -15.968 -16.179 -16.296 -16.523 -16.767 -17.018 -17.149 -17.403 -17.609 -17.771 -17.915 -18.223 -18.409 -18.631 -18.885 -19.16 -19.511 -19.98 -21.415 -10 ,28269 ,KEBNE ,16838672,Sun Dec 5 19:17:12 CET,Sun Dec 5 20:59:21 CET,0.0 0.634 0.86 1.068 1.211 1.324 1.429 1.52 1.702 1.784 1.859 1.92 2.079 2.148 2.273 2.396 2.51 2.558 2.646 2.728 2.862 2.953 3.036 3.153 3.264 3.355 3.438 3.531 3.643 3.74 3.828 3.917 4.002 4.083 4.168 4.262 4.348 4.483 4.646 4.782 4.909 5.052 5.203 5.363 5.536 5.629 5.658 5.584 5.383 5.01 3.992 2.475 1.133 -0.088 -1.186 -2.185 -3.134 -4.026 -4.75 -5.455 -6.065 -6.608 -7.127 -7.625 -8.092 -8.516 -8.962 -9.343 -9.652 -9.97 -10.301 -10.578 -10.864 -11.167 -11.401 -11.639 -11.885 -12.136 -12.386 -12.557 -12.748 -13.042 -13.244 -13.453 -13.556 -13.778 -14.007 -14.255 -14.392 -14.64 -14.806 -14.947 -15.094 -15.447 -15.644 -15.821 -16.011 -16.255 -16.597 -17.05 -18.378 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8b.txt deleted file mode 100644 index 0f56ec33..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,18979 ,TETRA ,17699152,Sat Dec 4 17:22:06 CET,Sat Dec 4 17:54:20 CET,0.0 0.775 1.057 1.289 1.483 1.644 1.798 1.948 2.24 2.39 2.53 2.679 2.882 2.985 3.217 3.452 3.675 3.775 3.963 4.152 4.433 4.616 4.801 5.064 5.301 5.536 5.777 6.012 6.32 6.617 6.898 7.239 7.575 7.893 8.265 8.705 9.133 9.602 10.097 10.614 11.163 11.802 12.55 13.307 14.215 15.225 16.371 17.686 19.272 21.143 23.411 25.332 26.441 27.14 27.625 27.957 28.163 28.292 28.365 28.415 28.431 28.442 28.429 28.39 28.358 28.325 28.282 28.244 28.209 28.161 28.1 28.04 27.97 27.913 27.88 27.841 27.796 27.737 27.671 27.628 27.575 27.485 27.431 27.374 27.338 27.265 27.196 27.122 27.074 26.94 26.917 26.862 26.806 26.659 26.579 26.509 26.431 26.328 26.217 26.061 25.807 -2 ,712 ,TETRA ,17675039,Sat Dec 4 15:51:43 CET,Sat Dec 4 17:50:59 CET,0.0 0.33 0.508 0.67 0.819 0.952 1.096 1.234 1.474 1.589 1.711 1.875 2.093 2.209 2.415 2.607 2.788 2.881 3.074 3.256 3.517 3.678 3.834 4.072 4.321 4.561 4.787 4.999 5.285 5.576 5.847 6.161 6.462 6.764 7.123 7.525 7.915 8.376 8.878 9.397 9.945 10.558 11.278 11.999 12.855 13.851 15.035 16.38 17.928 19.754 22.071 24.02 25.185 25.948 26.445 26.772 26.983 27.126 27.224 27.292 27.307 27.304 27.284 27.26 27.242 27.222 27.184 27.149 27.125 27.094 27.054 27.008 26.953 26.904 26.862 26.821 26.772 26.698 26.623 26.577 26.524 26.44 26.39 26.341 26.316 26.243 26.156 26.084 26.052 25.939 25.916 25.86 25.796 25.638 25.566 25.506 25.439 25.348 25.233 25.058 24.486 -3 ,3118 ,TETRA ,17699154,Sat Dec 4 17:22:08 CET,Sat Dec 4 17:51:49 CET,0.0 0.435 0.664 0.857 1.041 1.218 1.37 1.492 1.736 1.862 1.98 2.098 2.301 2.414 2.634 2.824 3.012 3.103 3.284 3.477 3.749 3.91 4.079 4.332 4.561 4.77 4.98 5.196 5.483 5.763 6.023 6.329 6.63 6.931 7.281 7.678 8.065 8.497 8.977 9.477 10.005 10.622 11.351 12.077 12.942 13.916 15.054 16.379 17.925 19.695 21.77 23.503 24.513 25.135 25.547 25.838 26.037 26.19 26.294 26.37 26.392 26.398 26.405 26.404 26.393 26.362 26.326 26.281 26.239 26.199 26.151 26.106 26.049 25.983 25.94 25.893 25.839 25.79 25.72 25.672 25.631 25.558 25.497 25.436 25.402 25.327 25.255 25.173 25.133 25.011 24.992 24.943 24.889 24.784 24.715 24.624 24.544 24.454 24.353 24.201 23.859 -4 ,11116 ,TETRA ,17675041,Sat Dec 4 15:53:46 CET,Sat Dec 4 17:56:00 CET,0.0 0.615 0.933 1.167 1.363 1.547 1.73 1.874 2.109 2.246 2.387 2.539 2.763 2.893 3.133 3.347 3.562 3.664 3.841 4.015 4.277 4.443 4.606 4.85 5.097 5.348 5.597 5.841 6.143 6.425 6.701 7.041 7.376 7.694 8.059 8.468 8.876 9.34 9.83 10.36 10.939 11.61 12.389 13.135 14.031 15.044 16.18 17.463 18.987 20.83 23.107 25.021 26.12 26.813 27.316 27.674 27.913 28.07 28.145 28.208 28.262 28.284 28.29 28.284 28.27 28.247 28.203 28.159 28.133 28.097 28.051 28.013 27.96 27.904 27.86 27.816 27.766 27.71 27.657 27.62 27.57 27.481 27.422 27.366 27.338 27.282 27.218 27.136 27.093 26.968 26.948 26.904 26.848 26.74 26.679 26.596 26.494 26.398 26.272 26.146 25.892 -5 ,9159 ,TETRA ,17675042,Sat Dec 4 15:53:47 CET,Sat Dec 4 17:44:21 CET,0.0 0.41 0.648 0.826 0.992 1.134 1.278 1.416 1.641 1.757 1.878 2.004 2.207 2.313 2.51 2.696 2.889 2.987 3.174 3.352 3.596 3.765 3.938 4.174 4.401 4.623 4.839 5.046 5.311 5.57 5.828 6.144 6.437 6.721 7.068 7.467 7.85 8.28 8.76 9.255 9.771 10.381 11.112 11.856 12.703 13.657 14.794 16.096 17.64 19.452 21.689 23.579 24.669 25.338 25.783 26.1 26.334 26.512 26.616 26.673 26.707 26.722 26.717 26.699 26.672 26.642 26.61 26.572 26.535 26.509 26.483 26.438 26.38 26.329 26.287 26.237 26.192 26.146 26.092 26.045 25.993 25.92 25.869 25.805 25.769 25.709 25.635 25.539 25.49 25.355 25.319 25.262 25.197 25.055 24.984 24.909 24.808 24.696 24.586 24.441 24.075 -6 ,15895 ,TETRA ,17699157,Sat Dec 4 17:22:51 CET,Sat Dec 4 19:24:03 CET,0.0 0.525 0.765 0.957 1.16 1.376 1.559 1.724 2.043 2.181 2.316 2.469 2.66 2.746 2.928 3.112 3.293 3.385 3.584 3.769 4.003 4.152 4.3 4.528 4.752 4.978 5.2 5.415 5.694 5.957 6.219 6.565 6.903 7.217 7.58 7.975 8.349 8.763 9.211 9.699 10.237 10.849 11.567 12.33 13.252 14.261 15.392 16.709 18.315 20.199 22.492 24.539 25.78 26.587 27.117 27.46 27.679 27.809 27.872 27.889 27.897 27.899 27.883 27.873 27.851 27.812 27.771 27.711 27.645 27.579 27.515 27.462 27.405 27.34 27.279 27.208 27.142 27.081 27.013 26.961 26.909 26.833 26.778 26.724 26.693 26.625 26.556 26.469 26.425 26.303 26.249 26.176 26.104 25.943 25.854 25.775 25.667 25.528 25.393 25.193 24.821 -7 ,6640 ,TETRA ,17699158,Sat Dec 4 17:22:53 CET,Sat Dec 4 17:45:32 CET,0.0 0.439 0.627 0.806 0.983 1.125 1.271 1.421 1.692 1.814 1.928 2.044 2.24 2.334 2.519 2.708 2.888 2.976 3.154 3.323 3.562 3.714 3.866 4.09 4.311 4.533 4.756 4.974 5.246 5.503 5.752 6.055 6.36 6.657 6.995 7.384 7.764 8.18 8.634 9.117 9.635 10.237 10.939 11.647 12.502 13.451 14.568 15.829 17.317 19.206 21.586 23.551 24.669 25.368 25.795 26.07 26.234 26.357 26.459 26.551 26.59 26.586 26.589 26.58 26.559 26.534 26.495 26.45 26.405 26.355 26.309 26.266 26.207 26.152 26.113 26.064 26.015 25.966 25.916 25.883 25.849 25.785 25.734 25.689 25.665 25.599 25.522 25.434 25.393 25.265 25.231 25.175 25.117 24.989 24.893 24.764 24.637 24.519 24.357 24.142 23.769 -8 ,24653 ,TETRA ,17699159,Sat Dec 4 17:22:54 CET,Sat Dec 4 17:54:27 CET,0.0 0.583 0.856 1.074 1.255 1.41 1.551 1.692 1.987 2.128 2.257 2.405 2.626 2.742 2.963 3.156 3.343 3.432 3.6 3.76 4.003 4.173 4.331 4.569 4.811 5.039 5.252 5.466 5.755 6.033 6.3 6.619 6.94 7.257 7.623 8.028 8.406 8.821 9.27 9.76 10.297 10.907 11.632 12.373 13.227 14.194 15.326 16.643 18.27 20.205 22.51 24.419 25.578 26.358 26.865 27.184 27.378 27.519 27.657 27.77 27.818 27.839 27.836 27.822 27.806 27.784 27.743 27.689 27.642 27.596 27.532 27.473 27.42 27.355 27.302 27.248 27.192 27.14 27.076 27.03 26.983 26.902 26.843 26.773 26.737 26.671 26.599 26.522 26.481 26.354 26.322 26.258 26.19 26.055 25.993 25.913 25.816 25.692 25.52 25.31 24.817 -9 ,25108 ,TETRA ,17675046,Sat Dec 4 15:53:47 CET,Sat Dec 4 17:58:27 CET,0.0 0.769 1.014 1.192 1.369 1.548 1.729 1.901 2.198 2.329 2.453 2.599 2.807 2.92 3.151 3.358 3.564 3.661 3.844 4.031 4.291 4.45 4.616 4.871 5.112 5.349 5.583 5.806 6.112 6.415 6.69 7.01 7.335 7.654 8.0 8.4 8.814 9.257 9.721 10.224 10.764 11.376 12.126 12.916 13.834 14.88 16.09 17.458 19.1 21.075 23.437 25.347 26.46 27.101 27.521 27.838 28.077 28.247 28.362 28.435 28.481 28.519 28.53 28.528 28.515 28.507 28.495 28.465 28.437 28.411 28.378 28.344 28.303 28.244 28.192 28.143 28.096 28.053 28.001 27.958 27.899 27.803 27.75 27.688 27.649 27.571 27.494 27.421 27.386 27.259 27.229 27.176 27.131 27.026 26.957 26.891 26.807 26.709 26.587 26.411 26.131 -10 ,21288 ,TETRA ,17675047,Sat Dec 4 15:54:42 CET,Sat Dec 4 17:58:23 CET,0.0 0.433 0.65 0.854 1.064 1.257 1.424 1.584 1.88 2.002 2.115 2.26 2.477 2.591 2.807 3.014 3.2 3.293 3.486 3.675 3.944 4.117 4.29 4.553 4.799 5.043 5.292 5.517 5.797 6.063 6.32 6.641 6.947 7.238 7.606 8.029 8.415 8.837 9.309 9.827 10.367 10.972 11.696 12.465 13.357 14.345 15.558 16.965 18.596 20.434 22.618 24.492 25.558 26.239 26.678 26.948 27.124 27.272 27.372 27.441 27.48 27.494 27.5 27.495 27.479 27.456 27.431 27.41 27.369 27.313 27.264 27.227 27.176 27.118 27.076 27.026 26.967 26.903 26.833 26.792 26.742 26.641 26.584 26.531 26.502 26.431 26.344 26.247 26.194 26.063 26.041 25.98 25.914 25.775 25.709 25.64 25.556 25.459 25.321 25.143 24.827 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8d.txt deleted file mode 100644 index 6c48c0b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8d.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25527 ,TETRA ,17675048,Sat Dec 4 15:54:42 CET,Sat Dec 4 17:49:04 CET,0.0 0.163 0.271 0.349 0.418 0.484 0.552 0.611 0.705 0.755 0.808 0.815 0.952 0.975 1.038 1.111 1.176 1.207 1.274 1.338 1.422 1.478 1.523 1.582 1.646 1.704 1.756 1.803 1.855 1.907 1.959 2.016 2.071 2.126 2.174 2.214 2.246 2.293 2.351 2.383 2.414 2.433 2.398 2.342 2.281 2.2 2.041 1.775 1.378 0.706 -0.553 -2.167 -3.527 -4.663 -5.688 -6.655 -7.482 -8.201 -8.821 -9.444 -9.964 -10.422 -10.878 -11.31 -11.706 -12.096 -12.503 -12.845 -13.14 -13.428 -13.732 -13.993 -14.269 -14.574 -14.811 -15.042 -15.276 -15.53 -15.776 -15.933 -16.114 -16.404 -16.586 -16.775 -16.878 -17.099 -17.347 -17.593 -17.716 -17.978 -18.137 -18.286 -18.463 -18.794 -18.981 -19.213 -19.439 -19.705 -20.024 -20.405 -21.671 -2 ,15817 ,TETRA ,17675049,Sat Dec 4 15:54:42 CET,Sat Dec 4 17:53:07 CET,0.0 0.134 0.265 0.36 0.425 0.477 0.532 0.585 0.674 0.725 0.777 0.766 0.904 0.943 1.022 1.102 1.172 1.203 1.259 1.304 1.367 1.417 1.452 1.499 1.56 1.612 1.669 1.717 1.764 1.807 1.853 1.915 1.973 2.022 2.072 2.112 2.137 2.164 2.197 2.242 2.284 2.302 2.292 2.263 2.243 2.175 2.009 1.72 1.233 0.505 -0.718 -2.278 -3.63 -4.782 -5.773 -6.686 -7.484 -8.17 -8.745 -9.349 -9.879 -10.337 -10.783 -11.226 -11.625 -11.967 -12.328 -12.653 -12.931 -13.224 -13.513 -13.753 -14.022 -14.29 -14.484 -14.681 -14.898 -15.131 -15.374 -15.547 -15.723 -15.985 -16.18 -16.386 -16.487 -16.709 -16.932 -17.153 -17.273 -17.53 -17.695 -17.854 -18.016 -18.353 -18.578 -18.808 -19.024 -19.276 -19.579 -20.024 -21.289 -3 ,13968 ,TETRA ,17699164,Sat Dec 4 17:22:52 CET,Sat Dec 4 17:58:50 CET,0.0 0.07 0.155 0.253 0.338 0.429 0.513 0.565 0.635 0.672 0.709 0.683 0.818 0.846 0.904 0.965 1.029 1.062 1.113 1.158 1.234 1.285 1.33 1.391 1.452 1.512 1.561 1.605 1.669 1.733 1.789 1.842 1.901 1.957 2.01 2.071 2.131 2.179 2.223 2.262 2.299 2.326 2.316 2.272 2.177 2.031 1.851 1.623 1.207 0.497 -0.789 -2.462 -3.882 -5.085 -6.116 -7.011 -7.787 -8.488 -9.076 -9.682 -10.206 -10.624 -11.058 -11.532 -11.938 -12.3 -12.71 -13.072 -13.363 -13.658 -13.96 -14.227 -14.511 -14.784 -15.001 -15.216 -15.435 -15.675 -15.926 -16.092 -16.265 -16.542 -16.731 -16.933 -17.04 -17.27 -17.514 -17.747 -17.869 -18.122 -18.289 -18.436 -18.587 -18.913 -19.106 -19.316 -19.535 -19.767 -20.064 -20.47 -21.977 -4 ,2887 ,TETRA ,17699165,Sat Dec 4 17:22:53 CET,Sat Dec 4 17:56:13 CET,0.0 0.146 0.274 0.381 0.489 0.573 0.625 0.68 0.766 0.8 0.845 0.835 0.972 1.005 1.087 1.162 1.231 1.263 1.314 1.367 1.447 1.499 1.555 1.624 1.673 1.727 1.783 1.84 1.902 1.952 2.005 2.065 2.117 2.167 2.22 2.275 2.319 2.359 2.397 2.445 2.482 2.49 2.482 2.453 2.415 2.331 2.141 1.873 1.453 0.77 -0.455 -2.105 -3.528 -4.686 -5.672 -6.56 -7.317 -8.02 -8.649 -9.295 -9.852 -10.315 -10.731 -11.156 -11.585 -11.977 -12.365 -12.702 -12.994 -13.297 -13.624 -13.893 -14.163 -14.437 -14.647 -14.855 -15.089 -15.339 -15.609 -15.802 -15.988 -16.272 -16.477 -16.694 -16.805 -17.028 -17.247 -17.482 -17.611 -17.871 -18.023 -18.169 -18.321 -18.634 -18.817 -19.02 -19.258 -19.566 -19.908 -20.334 -21.466 -5 ,9605 ,TETRA ,17699166,Sat Dec 4 17:22:53 CET,Sat Dec 4 17:57:01 CET,0.0 0.148 0.264 0.361 0.435 0.511 0.595 0.666 0.772 0.82 0.857 0.835 0.981 1.021 1.086 1.137 1.192 1.223 1.269 1.315 1.402 1.451 1.5 1.577 1.65 1.725 1.797 1.854 1.919 1.991 2.057 2.122 2.188 2.24 2.284 2.344 2.399 2.442 2.486 2.553 2.603 2.617 2.598 2.577 2.531 2.419 2.25 1.99 1.532 0.792 -0.494 -2.095 -3.482 -4.658 -5.632 -6.524 -7.319 -8.028 -8.626 -9.228 -9.737 -10.205 -10.672 -11.1 -11.499 -11.887 -12.284 -12.591 -12.856 -13.148 -13.44 -13.673 -13.924 -14.194 -14.406 -14.624 -14.862 -15.112 -15.342 -15.503 -15.681 -15.968 -16.177 -16.388 -16.489 -16.695 -16.927 -17.17 -17.302 -17.572 -17.748 -17.903 -18.065 -18.397 -18.584 -18.795 -19.021 -19.28 -19.605 -20.049 -21.441 -6 ,14213 ,TETRA ,17675053,Sat Dec 4 15:55:43 CET,Sat Dec 4 17:56:21 CET,0.0 0.28 0.396 0.479 0.549 0.607 0.671 0.729 0.83 0.889 0.941 0.923 1.061 1.106 1.185 1.255 1.307 1.337 1.403 1.463 1.538 1.579 1.613 1.664 1.717 1.766 1.821 1.869 1.923 1.978 2.029 2.088 2.14 2.181 2.224 2.277 2.329 2.369 2.409 2.454 2.478 2.478 2.485 2.491 2.467 2.415 2.296 2.054 1.642 0.93 -0.374 -2.031 -3.411 -4.524 -5.506 -6.405 -7.23 -7.987 -8.614 -9.246 -9.781 -10.26 -10.703 -11.118 -11.519 -11.879 -12.231 -12.518 -12.773 -13.062 -13.36 -13.615 -13.873 -14.134 -14.353 -14.584 -14.821 -15.05 -15.284 -15.457 -15.636 -15.903 -16.084 -16.284 -16.4 -16.646 -16.885 -17.126 -17.255 -17.514 -17.673 -17.822 -17.975 -18.315 -18.514 -18.726 -18.946 -19.201 -19.514 -19.913 -21.17 -7 ,7424 ,TETRA ,17675054,Sat Dec 4 15:57:53 CET,Sat Dec 4 17:49:56 CET,0.0 0.14 0.246 0.38 0.475 0.539 0.606 0.664 0.757 0.81 0.851 0.813 0.947 0.985 1.062 1.127 1.188 1.222 1.285 1.346 1.433 1.488 1.541 1.612 1.668 1.719 1.774 1.832 1.905 1.967 2.025 2.082 2.132 2.175 2.217 2.267 2.312 2.35 2.381 2.406 2.426 2.435 2.471 2.486 2.44 2.342 2.151 1.879 1.474 0.754 -0.522 -2.117 -3.492 -4.64 -5.62 -6.523 -7.317 -8.086 -8.761 -9.405 -9.927 -10.357 -10.775 -11.176 -11.56 -11.912 -12.282 -12.599 -12.872 -13.177 -13.486 -13.747 -14.016 -14.294 -14.512 -14.73 -14.954 -15.182 -15.408 -15.567 -15.73 -15.986 -16.177 -16.368 -16.465 -16.659 -16.87 -17.117 -17.242 -17.491 -17.65 -17.791 -17.945 -18.286 -18.483 -18.702 -18.922 -19.199 -19.539 -20.013 -21.395 -9 ,27445 ,TETRA ,17699170,Sat Dec 4 17:22:53 CET,Sat Dec 4 17:48:39 CET,0.0 0.201 0.336 0.437 0.517 0.585 0.649 0.72 0.845 0.884 0.923 0.896 1.036 1.084 1.164 1.227 1.285 1.319 1.385 1.429 1.502 1.551 1.594 1.654 1.71 1.773 1.841 1.903 1.969 2.02 2.069 2.134 2.194 2.25 2.308 2.357 2.407 2.458 2.501 2.536 2.559 2.563 2.559 2.538 2.49 2.4 2.239 1.98 1.547 0.858 -0.371 -1.906 -3.222 -4.387 -5.406 -6.302 -7.13 -7.868 -8.453 -9.034 -9.555 -10.028 -10.489 -10.926 -11.286 -11.607 -11.954 -12.278 -12.566 -12.852 -13.131 -13.365 -13.634 -13.922 -14.133 -14.348 -14.58 -14.821 -15.079 -15.257 -15.452 -15.74 -15.932 -16.137 -16.239 -16.459 -16.681 -16.915 -17.051 -17.31 -17.476 -17.632 -17.793 -18.123 -18.298 -18.493 -18.708 -18.952 -19.259 -19.641 -20.832 -10 ,5660 ,TETRA ,17675057,Sat Dec 4 15:57:53 CET,Sat Dec 4 17:52:33 CET,0.0 0.396 0.554 0.664 0.754 0.839 0.913 0.973 1.081 1.131 1.182 1.179 1.315 1.353 1.423 1.482 1.526 1.555 1.61 1.654 1.721 1.768 1.819 1.887 1.957 2.034 2.09 2.134 2.194 2.251 2.305 2.361 2.408 2.452 2.505 2.559 2.601 2.642 2.688 2.726 2.756 2.796 2.824 2.812 2.768 2.696 2.558 2.283 1.792 0.986 -0.394 -2.046 -3.432 -4.618 -5.64 -6.539 -7.334 -8.052 -8.641 -9.241 -9.774 -10.262 -10.699 -11.108 -11.521 -11.895 -12.274 -12.594 -12.861 -13.148 -13.453 -13.71 -13.979 -14.261 -14.471 -14.691 -14.923 -15.178 -15.434 -15.588 -15.749 -16.012 -16.192 -16.371 -16.465 -16.678 -16.912 -17.16 -17.28 -17.539 -17.7 -17.855 -18.021 -18.372 -18.571 -18.783 -19.008 -19.279 -19.615 -20.086 -21.525 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8e.txt deleted file mode 100644 index fd88fa72..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/protein/Summary_FEP_8f_8e.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31144 ,TETRA ,17675058,Sat Dec 4 15:57:53 CET,Sat Dec 4 17:58:22 CET,0.0 0.234 0.385 0.511 0.611 0.701 0.785 0.874 1.055 1.129 1.201 1.247 1.412 1.477 1.608 1.734 1.86 1.918 2.033 2.14 2.296 2.397 2.49 2.628 2.755 2.877 2.993 3.104 3.265 3.426 3.57 3.747 3.927 4.106 4.327 4.572 4.8 5.036 5.287 5.567 5.865 6.197 6.579 6.968 7.436 7.97 8.625 9.318 10.115 11.075 12.108 12.821 13.131 13.246 13.283 13.294 13.258 13.194 13.129 13.011 12.895 12.792 12.685 12.588 12.481 12.368 12.241 12.133 12.024 11.909 11.799 11.706 11.621 11.531 11.46 11.381 11.307 11.232 11.148 11.084 11.005 10.873 10.778 10.687 10.646 10.56 10.47 10.369 10.311 10.164 10.128 10.065 10.005 9.856 9.771 9.697 9.609 9.463 9.311 9.152 8.894 -2 ,28381 ,TETRA ,17675059,Sat Dec 4 15:58:52 CET,Sat Dec 4 17:48:16 CET,0.0 0.182 0.355 0.509 0.631 0.731 0.826 0.905 1.027 1.09 1.155 1.18 1.348 1.414 1.526 1.636 1.744 1.794 1.9 2.008 2.153 2.239 2.322 2.451 2.583 2.709 2.834 2.963 3.116 3.267 3.424 3.608 3.777 3.949 4.156 4.369 4.583 4.837 5.108 5.396 5.71 6.075 6.5 6.922 7.421 7.971 8.617 9.344 10.174 11.125 12.224 13.04 13.392 13.516 13.521 13.473 13.407 13.316 13.22 13.107 12.988 12.871 12.753 12.642 12.539 12.437 12.324 12.223 12.124 12.018 11.903 11.804 11.695 11.577 11.493 11.406 11.326 11.241 11.146 11.082 11.018 10.914 10.825 10.734 10.69 10.598 10.502 10.392 10.332 10.18 10.133 10.064 9.994 9.841 9.756 9.662 9.55 9.426 9.283 9.087 8.526 -3 ,14506 ,TETRA ,17675060,Sat Dec 4 15:59:50 CET,Sat Dec 4 17:48:58 CET,0.0 0.163 0.274 0.37 0.48 0.611 0.725 0.815 0.971 1.046 1.116 1.143 1.307 1.371 1.494 1.618 1.735 1.789 1.89 1.995 2.167 2.269 2.367 2.52 2.661 2.792 2.928 3.065 3.244 3.415 3.56 3.734 3.921 4.096 4.289 4.504 4.712 4.955 5.229 5.522 5.837 6.2 6.61 7.041 7.574 8.166 8.827 9.542 10.361 11.268 12.314 13.089 13.429 13.504 13.49 13.44 13.349 13.243 13.113 12.961 12.821 12.692 12.555 12.404 12.266 12.148 12.019 11.915 11.839 11.737 11.605 11.505 11.416 11.325 11.26 11.185 11.094 11.012 10.916 10.842 10.769 10.641 10.555 10.477 10.436 10.335 10.214 10.097 10.04 9.898 9.879 9.812 9.744 9.593 9.507 9.415 9.322 9.216 9.074 8.921 8.607 -4 ,16466 ,TETRA ,17699175,Sat Dec 4 17:22:54 CET,Sat Dec 4 17:51:26 CET,0.0 0.185 0.313 0.414 0.513 0.599 0.664 0.726 0.863 0.935 1.011 1.07 1.241 1.31 1.424 1.536 1.643 1.696 1.812 1.926 2.068 2.158 2.263 2.411 2.546 2.678 2.803 2.92 3.074 3.229 3.372 3.564 3.761 3.946 4.157 4.392 4.616 4.872 5.161 5.456 5.76 6.109 6.541 6.978 7.462 8.014 8.623 9.299 10.127 11.102 12.197 12.959 13.305 13.457 13.492 13.451 13.398 13.338 13.256 13.14 13.038 12.934 12.814 12.694 12.577 12.477 12.375 12.266 12.162 12.04 11.919 11.843 11.766 11.673 11.59 11.509 11.42 11.318 11.213 11.142 11.072 10.965 10.897 10.822 10.779 10.686 10.569 10.442 10.383 10.241 10.23 10.171 10.099 9.935 9.846 9.755 9.667 9.538 9.323 9.063 8.645 -5 ,1259 ,TETRA ,17675062,Sat Dec 4 16:02:51 CET,Sat Dec 4 17:52:35 CET,0.0 0.21 0.344 0.447 0.548 0.649 0.724 0.793 0.943 1.022 1.102 1.136 1.293 1.354 1.47 1.574 1.674 1.728 1.841 1.948 2.089 2.174 2.263 2.401 2.535 2.668 2.806 2.945 3.101 3.243 3.39 3.575 3.758 3.938 4.141 4.367 4.593 4.829 5.101 5.415 5.752 6.114 6.509 6.929 7.429 7.981 8.574 9.232 10.044 11.025 12.138 12.936 13.335 13.504 13.567 13.585 13.533 13.453 13.385 13.295 13.185 13.067 12.949 12.832 12.717 12.608 12.5 12.407 12.31 12.197 12.084 12.0 11.924 11.84 11.766 11.681 11.58 11.47 11.367 11.306 11.237 11.118 11.04 10.951 10.902 10.809 10.711 10.585 10.52 10.372 10.352 10.296 10.237 10.112 10.046 9.95 9.824 9.689 9.533 9.33 8.792 -6 ,25658 ,TETRA ,17675063,Sat Dec 4 16:01:51 CET,Sat Dec 4 17:52:41 CET,0.0 0.257 0.391 0.512 0.646 0.761 0.847 0.939 1.094 1.157 1.233 1.288 1.461 1.528 1.639 1.753 1.859 1.913 2.03 2.146 2.291 2.379 2.464 2.591 2.731 2.87 3.004 3.135 3.298 3.452 3.608 3.811 4.001 4.162 4.353 4.586 4.815 5.059 5.31 5.594 5.9 6.244 6.679 7.118 7.609 8.148 8.776 9.515 10.382 11.409 12.557 13.347 13.733 13.925 14.024 14.041 14.004 13.935 13.834 13.74 13.668 13.588 13.486 13.369 13.247 13.133 13.012 12.901 12.795 12.665 12.528 12.422 12.311 12.208 12.125 12.042 11.955 11.855 11.755 11.681 11.607 11.486 11.396 11.3 11.254 11.158 11.04 10.918 10.861 10.716 10.676 10.604 10.533 10.363 10.254 10.15 10.049 9.913 9.765 9.614 9.109 -7 ,28423 ,TETRA ,17675064,Sat Dec 4 16:02:51 CET,Sat Dec 4 17:51:25 CET,0.0 0.287 0.443 0.559 0.661 0.76 0.858 0.947 1.122 1.211 1.294 1.337 1.503 1.564 1.68 1.796 1.906 1.96 2.065 2.171 2.325 2.425 2.52 2.656 2.792 2.936 3.083 3.21 3.358 3.501 3.647 3.823 3.996 4.166 4.352 4.562 4.779 5.03 5.307 5.593 5.897 6.253 6.676 7.121 7.623 8.155 8.785 9.495 10.329 11.313 12.433 13.278 13.661 13.798 13.822 13.803 13.737 13.643 13.544 13.419 13.309 13.2 13.084 12.968 12.847 12.739 12.626 12.511 12.418 12.329 12.224 12.132 12.043 11.956 11.88 11.798 11.699 11.593 11.507 11.443 11.366 11.252 11.172 11.068 11.009 10.904 10.804 10.678 10.606 10.45 10.394 10.319 10.246 10.106 10.024 9.936 9.851 9.743 9.611 9.427 9.026 -8 ,23799 ,TETRA ,17675065,Sat Dec 4 16:02:51 CET,Sat Dec 4 18:00:38 CET,0.0 0.235 0.356 0.473 0.566 0.644 0.727 0.813 0.974 1.051 1.124 1.183 1.348 1.411 1.537 1.652 1.76 1.814 1.921 2.025 2.188 2.298 2.389 2.523 2.668 2.813 2.941 3.059 3.234 3.406 3.559 3.744 3.928 4.108 4.324 4.559 4.773 5.027 5.322 5.626 5.927 6.27 6.693 7.114 7.61 8.159 8.775 9.467 10.281 11.202 12.222 12.958 13.319 13.481 13.501 13.456 13.347 13.213 13.132 13.038 12.914 12.796 12.691 12.602 12.504 12.401 12.304 12.215 12.126 12.039 11.936 11.838 11.741 11.624 11.535 11.45 11.354 11.257 11.169 11.108 11.043 10.942 10.869 10.787 10.736 10.622 10.513 10.411 10.356 10.202 10.182 10.117 10.037 9.854 9.75 9.642 9.531 9.421 9.29 9.116 8.794 -10 ,20384 ,TETRA ,17699181,Sat Dec 4 17:22:54 CET,Sat Dec 4 17:53:20 CET,0.0 0.271 0.408 0.536 0.635 0.72 0.795 0.874 1.02 1.09 1.157 1.183 1.342 1.399 1.52 1.641 1.761 1.818 1.932 2.039 2.183 2.278 2.373 2.509 2.638 2.761 2.88 2.993 3.133 3.276 3.426 3.619 3.813 4.001 4.224 4.474 4.697 4.942 5.227 5.53 5.841 6.193 6.592 6.99 7.468 8.016 8.663 9.36 10.135 10.999 11.934 12.487 12.709 12.831 12.88 12.884 12.837 12.769 12.69 12.605 12.505 12.391 12.305 12.232 12.13 12.005 11.873 11.757 11.659 11.577 11.492 11.409 11.315 11.193 11.102 11.017 10.927 10.829 10.721 10.634 10.54 10.423 10.345 10.248 10.195 10.095 10.001 9.901 9.847 9.699 9.647 9.578 9.51 9.365 9.268 9.173 9.064 8.921 8.738 8.534 8.197 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_1b_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_1b_1a.txt deleted file mode 100644 index 91d6156a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_1b_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,2511 ,TETRA ,17665296,Thu Dec 2 20:31:12 CET,Thu Dec 2 22:16:28 CET,0.0 0.515 0.723 0.874 0.999 1.103 1.189 1.276 1.463 1.55 1.638 1.644 1.882 1.96 2.102 2.228 2.351 2.41 2.529 2.646 2.822 2.934 3.039 3.193 3.341 3.483 3.625 3.757 3.928 4.102 4.272 4.489 4.699 4.901 5.143 5.417 5.681 5.978 6.301 6.646 7.012 7.438 7.953 8.471 9.093 9.818 10.682 11.649 12.809 14.283 16.158 17.759 18.703 19.286 19.654 19.928 20.082 20.14 20.176 20.184 20.153 20.103 20.059 20.015 19.965 19.918 19.856 19.784 19.722 19.652 19.573 19.493 19.41 19.332 19.266 19.2 19.125 19.036 18.94 18.866 18.789 18.666 18.573 18.482 18.428 18.306 18.192 18.066 17.991 17.772 17.749 17.657 17.547 17.269 17.128 16.96 16.764 16.556 16.303 15.963 14.912 -2 ,23551 ,TETRA ,17665297,Thu Dec 2 20:31:12 CET,Thu Dec 2 22:16:14 CET,0.0 0.31 0.518 0.658 0.776 0.901 1.011 1.112 1.295 1.372 1.449 1.444 1.678 1.746 1.878 1.998 2.113 2.175 2.3 2.415 2.575 2.68 2.787 2.941 3.096 3.256 3.403 3.536 3.71 3.892 4.076 4.285 4.48 4.676 4.904 5.159 5.414 5.707 6.037 6.389 6.764 7.197 7.696 8.215 8.852 9.581 10.465 11.476 12.674 14.143 15.922 17.463 18.408 19.001 19.39 19.631 19.758 19.81 19.814 19.815 19.807 19.795 19.767 19.717 19.672 19.611 19.533 19.471 19.409 19.327 19.225 19.138 19.058 18.979 18.915 18.841 18.758 18.661 18.544 18.463 18.378 18.243 18.156 18.064 18.016 17.913 17.788 17.656 17.594 17.387 17.356 17.252 17.151 16.938 16.823 16.687 16.52 16.299 15.989 15.546 14.254 -3 ,32581 ,TETRA ,17665298,Thu Dec 2 20:33:12 CET,Thu Dec 2 22:01:54 CET,0.0 0.929 1.184 1.371 1.511 1.629 1.741 1.832 1.995 2.08 2.167 2.163 2.402 2.48 2.631 2.761 2.877 2.939 3.069 3.18 3.33 3.433 3.542 3.697 3.844 3.983 4.114 4.252 4.44 4.615 4.783 4.998 5.209 5.409 5.641 5.915 6.178 6.458 6.76 7.101 7.478 7.898 8.396 8.91 9.543 10.262 11.108 12.108 13.337 14.868 16.784 18.422 19.376 19.948 20.309 20.53 20.66 20.769 20.838 20.856 20.834 20.8 20.776 20.749 20.694 20.622 20.551 20.478 20.401 20.315 20.208 20.117 20.034 19.958 19.895 19.821 19.732 19.64 19.541 19.461 19.382 19.243 19.143 19.044 18.992 18.891 18.769 18.634 18.557 18.335 18.314 18.215 18.118 17.897 17.755 17.621 17.475 17.273 16.999 16.616 15.026 -4 ,19605 ,TETRA ,17665299,Thu Dec 2 20:33:12 CET,Thu Dec 2 22:01:45 CET,0.0 0.716 0.956 1.14 1.283 1.396 1.482 1.558 1.724 1.803 1.884 1.891 2.131 2.205 2.344 2.478 2.604 2.665 2.783 2.901 3.069 3.168 3.271 3.431 3.584 3.731 3.878 4.014 4.186 4.359 4.53 4.743 4.942 5.131 5.354 5.615 5.877 6.166 6.487 6.849 7.228 7.65 8.155 8.689 9.34 10.078 10.942 11.927 13.118 14.566 16.39 17.956 18.906 19.522 19.911 20.133 20.26 20.347 20.383 20.397 20.386 20.354 20.313 20.261 20.206 20.159 20.093 20.026 19.961 19.881 19.797 19.729 19.648 19.559 19.482 19.398 19.308 19.2 19.088 19.016 18.937 18.805 18.694 18.581 18.532 18.428 18.304 18.166 18.09 17.862 17.827 17.731 17.618 17.331 17.161 16.986 16.79 16.581 16.342 15.948 14.282 -5 ,30567 ,TETRA ,17665300,Thu Dec 2 20:33:13 CET,Thu Dec 2 22:01:53 CET,0.0 0.692 0.945 1.141 1.279 1.4 1.521 1.629 1.803 1.877 1.949 1.936 2.173 2.242 2.377 2.517 2.646 2.703 2.825 2.948 3.123 3.234 3.344 3.507 3.662 3.811 3.958 4.106 4.308 4.492 4.671 4.891 5.104 5.309 5.542 5.809 6.071 6.36 6.684 7.032 7.405 7.832 8.334 8.853 9.472 10.186 11.041 12.043 13.245 14.698 16.515 18.091 18.944 19.455 19.792 20.02 20.185 20.281 20.34 20.37 20.363 20.351 20.324 20.27 20.208 20.151 20.082 20.012 19.958 19.908 19.831 19.751 19.657 19.556 19.491 19.416 19.327 19.237 19.137 19.066 18.99 18.863 18.771 18.675 18.621 18.5 18.371 18.231 18.155 17.933 17.891 17.787 17.682 17.442 17.311 17.18 17.035 16.853 16.622 16.257 15.16 -6 ,22989 ,TETRA ,17665301,Thu Dec 2 21:22:50 CET,Thu Dec 2 23:06:30 CET,0.0 0.443 0.679 0.874 1.043 1.177 1.292 1.395 1.563 1.644 1.726 1.729 1.963 2.029 2.163 2.291 2.422 2.487 2.603 2.72 2.896 3.003 3.109 3.265 3.412 3.556 3.699 3.837 4.013 4.186 4.354 4.563 4.769 4.969 5.206 5.47 5.722 6.007 6.315 6.647 7.004 7.416 7.921 8.441 9.059 9.773 10.614 11.605 12.83 14.317 16.188 17.748 18.681 19.301 19.672 19.894 20.055 20.158 20.196 20.203 20.167 20.114 20.076 20.04 19.999 19.939 19.86 19.785 19.716 19.643 19.556 19.476 19.391 19.292 19.216 19.142 19.067 18.974 18.86 18.789 18.717 18.599 18.515 18.414 18.356 18.236 18.124 17.988 17.91 17.691 17.67 17.583 17.479 17.22 17.084 16.937 16.76 16.525 16.204 15.78 13.936 -7 ,4355 ,TETRA ,17665302,Thu Dec 2 21:22:50 CET,Thu Dec 2 23:01:43 CET,0.0 0.485 0.714 0.85 0.974 1.083 1.189 1.297 1.492 1.575 1.647 1.628 1.864 1.944 2.096 2.23 2.357 2.419 2.535 2.65 2.823 2.938 3.05 3.207 3.354 3.498 3.64 3.775 3.956 4.126 4.291 4.507 4.709 4.898 5.13 5.396 5.66 5.955 6.269 6.617 6.996 7.424 7.939 8.47 9.127 9.855 10.674 11.651 12.844 14.315 16.205 17.829 18.726 19.292 19.689 19.945 20.098 20.199 20.27 20.295 20.285 20.262 20.23 20.193 20.16 20.118 20.044 19.962 19.89 19.818 19.733 19.653 19.559 19.456 19.384 19.306 19.224 19.137 19.043 18.979 18.906 18.782 18.687 18.58 18.527 18.426 18.307 18.161 18.088 17.864 17.81 17.712 17.607 17.381 17.239 17.083 16.901 16.678 16.378 15.936 14.441 -8 ,8311 ,TETRA ,17665303,Thu Dec 2 22:03:14 CET,Thu Dec 2 23:31:54 CET,0.0 0.849 1.108 1.314 1.443 1.56 1.693 1.797 1.976 2.07 2.154 2.15 2.392 2.466 2.609 2.743 2.868 2.925 3.029 3.132 3.284 3.386 3.485 3.632 3.774 3.913 4.06 4.201 4.381 4.555 4.726 4.933 5.128 5.319 5.549 5.821 6.092 6.396 6.728 7.075 7.437 7.852 8.354 8.876 9.501 10.224 11.099 12.111 13.294 14.774 16.654 18.243 19.195 19.805 20.196 20.459 20.629 20.732 20.794 20.834 20.82 20.797 20.78 20.73 20.678 20.631 20.566 20.494 20.426 20.367 20.279 20.196 20.108 20.01 19.932 19.848 19.768 19.664 19.545 19.465 19.387 19.259 19.164 19.064 19.011 18.905 18.788 18.659 18.584 18.361 18.344 18.256 18.146 17.895 17.752 17.599 17.426 17.22 16.961 16.552 15.464 -9 ,30611 ,TETRA ,17665304,Thu Dec 2 22:03:14 CET,Thu Dec 2 23:31:43 CET,0.0 0.605 0.923 1.131 1.262 1.382 1.492 1.595 1.766 1.839 1.911 1.898 2.136 2.204 2.335 2.467 2.586 2.644 2.759 2.877 3.041 3.147 3.247 3.395 3.546 3.685 3.822 3.96 4.132 4.303 4.489 4.716 4.922 5.116 5.356 5.636 5.904 6.208 6.54 6.902 7.281 7.714 8.23 8.744 9.357 10.07 10.92 11.922 13.119 14.633 16.53 18.059 18.967 19.532 19.913 20.161 20.297 20.368 20.407 20.43 20.43 20.418 20.389 20.346 20.282 20.219 20.143 20.062 19.982 19.893 19.81 19.74 19.66 19.571 19.501 19.419 19.329 19.235 19.137 19.066 18.987 18.864 18.769 18.662 18.611 18.511 18.385 18.242 18.169 17.952 17.926 17.837 17.736 17.489 17.358 17.21 17.04 16.825 16.546 16.173 14.714 -10 ,6382 ,TETRA ,17665305,Thu Dec 2 22:03:14 CET,Thu Dec 2 23:31:34 CET,0.0 0.455 0.588 0.704 0.841 0.963 1.061 1.175 1.385 1.466 1.545 1.528 1.757 1.826 1.971 2.116 2.244 2.301 2.414 2.518 2.672 2.783 2.892 3.04 3.186 3.327 3.46 3.6 3.787 3.969 4.149 4.363 4.573 4.776 5.005 5.265 5.531 5.841 6.172 6.516 6.879 7.295 7.808 8.326 8.947 9.658 10.486 11.462 12.637 14.081 15.925 17.464 18.373 18.975 19.369 19.608 19.743 19.815 19.846 19.875 19.88 19.854 19.81 19.759 19.708 19.668 19.614 19.545 19.475 19.395 19.313 19.242 19.148 19.045 18.97 18.889 18.811 18.733 18.645 18.574 18.495 18.369 18.272 18.167 18.108 17.981 17.846 17.707 17.638 17.429 17.427 17.342 17.24 16.986 16.857 16.723 16.555 16.334 16.047 15.634 14.219 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1a.txt deleted file mode 100644 index 0f838e1b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9491 ,TETRA ,17665306,Thu Dec 2 22:07:51 CET,Thu Dec 2 23:54:17 CET,0.0 0.478 0.655 0.752 0.872 0.979 1.073 1.15 1.283 1.34 1.396 1.375 1.579 1.632 1.74 1.841 1.934 1.977 2.052 2.128 2.247 2.319 2.391 2.501 2.602 2.696 2.799 2.898 3.021 3.149 3.266 3.402 3.541 3.676 3.835 4.001 4.155 4.34 4.555 4.786 5.019 5.273 5.573 5.882 6.235 6.634 7.09 7.594 8.194 8.883 9.617 10.113 10.31 10.343 10.294 10.183 10.043 9.875 9.688 9.502 9.347 9.179 9.017 8.853 8.687 8.537 8.367 8.216 8.075 7.92 7.762 7.637 7.5 7.338 7.206 7.072 6.94 6.806 6.662 6.555 6.441 6.259 6.131 5.994 5.914 5.757 5.571 5.345 5.239 4.996 4.892 4.73 4.578 4.261 4.073 3.863 3.594 3.222 2.824 2.301 -0.909 -2 ,17407 ,TETRA ,17665307,Thu Dec 2 22:11:57 CET,Thu Dec 2 23:58:59 CET,0.0 0.434 0.586 0.694 0.776 0.851 0.926 1.009 1.175 1.248 1.314 1.28 1.481 1.535 1.636 1.729 1.83 1.873 1.952 2.04 2.163 2.244 2.329 2.448 2.551 2.659 2.767 2.863 2.981 3.098 3.218 3.362 3.505 3.64 3.79 3.957 4.116 4.293 4.5 4.714 4.926 5.192 5.517 5.821 6.17 6.563 7.016 7.543 8.148 8.809 9.537 10.039 10.239 10.258 10.182 10.054 9.883 9.725 9.573 9.389 9.221 9.071 8.923 8.759 8.593 8.436 8.266 8.103 7.962 7.822 7.675 7.551 7.421 7.278 7.147 6.999 6.845 6.693 6.537 6.423 6.313 6.129 5.987 5.843 5.771 5.614 5.421 5.209 5.1 4.846 4.772 4.637 4.48 4.124 3.929 3.709 3.438 3.102 2.72 2.136 -0.467 -3 ,32069 ,TETRA ,17665308,Thu Dec 2 22:18:02 CET,Fri Dec 3 00:04:27 CET,0.0 0.394 0.59 0.725 0.829 0.928 1.015 1.09 1.234 1.309 1.375 1.33 1.537 1.592 1.684 1.779 1.88 1.924 2.007 2.094 2.211 2.285 2.368 2.492 2.608 2.721 2.818 2.907 3.027 3.143 3.256 3.407 3.55 3.681 3.829 4.002 4.169 4.349 4.546 4.751 4.973 5.234 5.533 5.838 6.187 6.584 7.068 7.615 8.226 8.909 9.678 10.172 10.325 10.337 10.259 10.129 9.981 9.81 9.643 9.463 9.288 9.119 8.942 8.764 8.606 8.455 8.301 8.157 8.023 7.882 7.723 7.576 7.431 7.282 7.153 7.004 6.855 6.707 6.55 6.448 6.346 6.177 6.05 5.903 5.822 5.652 5.466 5.224 5.098 4.847 4.762 4.638 4.477 4.119 3.923 3.706 3.5 3.209 2.771 2.194 -0.582 -4 ,29110 ,TETRA ,17665309,Thu Dec 2 22:18:02 CET,Fri Dec 3 00:04:16 CET,0.0 0.295 0.45 0.588 0.694 0.792 0.891 0.974 1.095 1.15 1.209 1.168 1.368 1.415 1.509 1.605 1.704 1.754 1.846 1.936 2.071 2.152 2.221 2.33 2.435 2.53 2.63 2.723 2.841 2.963 3.088 3.234 3.375 3.516 3.672 3.838 4.001 4.186 4.385 4.594 4.813 5.067 5.362 5.645 5.987 6.385 6.826 7.328 7.927 8.607 9.336 9.808 9.949 9.949 9.886 9.781 9.632 9.455 9.285 9.086 8.899 8.743 8.594 8.441 8.273 8.112 7.971 7.843 7.708 7.555 7.403 7.268 7.107 6.949 6.837 6.716 6.586 6.454 6.298 6.174 6.048 5.861 5.713 5.549 5.465 5.302 5.122 4.906 4.797 4.55 4.469 4.341 4.198 3.86 3.676 3.498 3.269 2.98 2.619 2.14 -0.181 -5 ,21924 ,TETRA ,17665310,Thu Dec 2 23:10:12 CET,Fri Dec 3 00:48:17 CET,0.0 0.458 0.605 0.725 0.834 0.928 1.005 1.09 1.252 1.32 1.372 1.33 1.544 1.601 1.698 1.788 1.869 1.913 1.999 2.071 2.179 2.261 2.341 2.444 2.543 2.641 2.746 2.848 2.974 3.085 3.201 3.352 3.498 3.633 3.774 3.934 4.091 4.268 4.477 4.719 4.96 5.214 5.515 5.83 6.214 6.647 7.12 7.635 8.229 8.877 9.604 10.094 10.281 10.308 10.231 10.109 9.954 9.769 9.595 9.407 9.239 9.087 8.934 8.789 8.656 8.513 8.343 8.186 8.066 7.933 7.769 7.623 7.464 7.306 7.179 7.041 6.904 6.76 6.617 6.514 6.387 6.187 6.053 5.912 5.839 5.679 5.502 5.312 5.215 4.977 4.909 4.783 4.645 4.318 4.126 3.934 3.689 3.386 3.036 2.506 0.254 -6 ,22722 ,TETRA ,17665311,Thu Dec 2 23:32:10 CET,Fri Dec 3 01:01:51 CET,0.0 0.407 0.571 0.697 0.817 0.92 1.004 1.081 1.232 1.3 1.359 1.323 1.534 1.592 1.704 1.813 1.908 1.951 2.038 2.12 2.233 2.312 2.394 2.508 2.614 2.721 2.817 2.906 3.041 3.17 3.283 3.425 3.564 3.694 3.843 4.006 4.165 4.346 4.537 4.744 4.975 5.243 5.545 5.847 6.218 6.617 7.076 7.597 8.172 8.858 9.603 10.043 10.199 10.222 10.149 10.023 9.873 9.7 9.544 9.376 9.204 9.04 8.884 8.721 8.565 8.421 8.261 8.108 7.971 7.813 7.644 7.507 7.355 7.207 7.099 6.974 6.834 6.675 6.509 6.404 6.302 6.132 5.998 5.854 5.779 5.613 5.427 5.234 5.133 4.884 4.793 4.671 4.531 4.182 3.989 3.766 3.518 3.221 2.819 2.31 -1.296 -7 ,9330 ,TETRA ,17665312,Thu Dec 2 23:34:11 CET,Fri Dec 3 01:04:03 CET,0.0 0.571 0.746 0.892 1.001 1.091 1.165 1.232 1.355 1.407 1.458 1.421 1.625 1.68 1.784 1.874 1.961 2.004 2.089 2.174 2.287 2.363 2.441 2.541 2.637 2.741 2.841 2.942 3.07 3.19 3.301 3.431 3.561 3.693 3.852 4.032 4.21 4.399 4.592 4.802 5.033 5.305 5.622 5.939 6.31 6.723 7.181 7.686 8.27 8.923 9.666 10.158 10.35 10.365 10.28 10.162 10.021 9.843 9.657 9.459 9.288 9.145 8.999 8.834 8.678 8.535 8.377 8.239 8.106 7.976 7.838 7.693 7.529 7.382 7.268 7.144 7.01 6.861 6.7 6.571 6.44 6.257 6.13 5.995 5.916 5.723 5.523 5.325 5.219 4.955 4.833 4.704 4.574 4.281 4.088 3.856 3.627 3.372 2.999 2.547 -0.441 -8 ,7359 ,TETRA ,17665313,Thu Dec 2 23:35:09 CET,Fri Dec 3 01:05:09 CET,0.0 0.57 0.746 0.858 0.967 1.059 1.14 1.223 1.374 1.443 1.506 1.478 1.679 1.732 1.838 1.925 2.005 2.049 2.148 2.238 2.356 2.436 2.513 2.616 2.713 2.805 2.897 2.988 3.105 3.22 3.337 3.477 3.608 3.733 3.879 4.045 4.203 4.378 4.583 4.794 5.024 5.298 5.609 5.909 6.248 6.636 7.098 7.612 8.191 8.847 9.594 10.061 10.203 10.21 10.18 10.084 9.934 9.783 9.629 9.468 9.303 9.136 8.974 8.82 8.689 8.557 8.397 8.243 8.092 7.936 7.775 7.628 7.463 7.287 7.162 7.029 6.888 6.73 6.56 6.452 6.338 6.139 5.999 5.854 5.776 5.607 5.429 5.251 5.148 4.892 4.803 4.67 4.532 4.255 4.092 3.894 3.644 3.366 2.994 2.403 -0.618 -9 ,2124 ,TETRA ,17665314,Thu Dec 2 23:55:02 CET,Fri Dec 3 01:40:47 CET,0.0 0.25 0.428 0.549 0.658 0.759 0.851 0.925 1.072 1.139 1.191 1.147 1.355 1.413 1.513 1.603 1.686 1.725 1.812 1.889 2.002 2.081 2.154 2.258 2.358 2.455 2.554 2.658 2.789 2.905 3.021 3.161 3.299 3.442 3.604 3.78 3.945 4.12 4.313 4.528 4.747 4.995 5.299 5.615 5.991 6.404 6.868 7.372 7.949 8.628 9.36 9.846 10.028 10.028 9.923 9.782 9.624 9.468 9.337 9.175 8.989 8.821 8.661 8.501 8.351 8.207 8.045 7.899 7.764 7.608 7.448 7.301 7.144 6.993 6.864 6.727 6.585 6.423 6.244 6.127 6.005 5.801 5.655 5.516 5.449 5.287 5.097 4.904 4.802 4.561 4.494 4.382 4.257 3.95 3.757 3.553 3.322 3.03 2.667 2.046 -0.684 -10 ,14906 ,TETRA ,17665315,Fri Dec 3 00:26:15 CET,Fri Dec 3 02:12:51 CET,0.0 0.262 0.396 0.494 0.586 0.672 0.758 0.837 0.974 1.04 1.105 1.088 1.298 1.354 1.468 1.571 1.667 1.715 1.814 1.91 2.042 2.119 2.185 2.281 2.374 2.468 2.579 2.693 2.824 2.947 3.059 3.195 3.328 3.461 3.614 3.784 3.953 4.14 4.334 4.543 4.764 5.017 5.329 5.647 6.026 6.439 6.895 7.398 7.98 8.678 9.451 9.941 10.105 10.128 10.073 9.932 9.766 9.615 9.474 9.315 9.164 9.005 8.845 8.684 8.523 8.366 8.198 8.054 7.925 7.779 7.624 7.482 7.321 7.152 7.021 6.887 6.746 6.605 6.455 6.339 6.209 6.014 5.873 5.728 5.654 5.488 5.309 5.127 5.033 4.793 4.696 4.556 4.418 4.157 3.997 3.781 3.512 3.248 2.869 2.247 -0.984 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1b.txt deleted file mode 100644 index 31ef2b8f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_3a_1b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,11490 ,TETRA ,17665316,Fri Dec 3 00:26:15 CET,Fri Dec 3 02:14:12 CET,0.0 0.603 0.819 0.978 1.116 1.242 1.353 1.455 1.618 1.683 1.756 1.737 1.946 2.002 2.113 2.224 2.322 2.365 2.443 2.515 2.627 2.699 2.764 2.85 2.933 3.015 3.089 3.165 3.27 3.37 3.453 3.535 3.617 3.696 3.779 3.872 3.966 4.073 4.177 4.261 4.332 4.4 4.478 4.541 4.579 4.583 4.533 4.42 4.165 3.685 2.753 1.563 0.509 -0.435 -1.261 -2.008 -2.645 -3.209 -3.695 -4.179 -4.587 -4.948 -5.297 -5.632 -5.957 -6.256 -6.559 -6.817 -7.039 -7.279 -7.522 -7.721 -7.945 -8.173 -8.35 -8.55 -8.757 -8.968 -9.199 -9.363 -9.525 -9.771 -9.948 -10.134 -10.228 -10.427 -10.639 -10.871 -10.987 -11.267 -11.342 -11.474 -11.621 -11.926 -12.107 -12.297 -12.525 -12.807 -13.115 -13.59 -15.168 -2 ,24017 ,TETRA ,17665317,Fri Dec 3 00:26:16 CET,Fri Dec 3 02:12:19 CET,0.0 0.592 0.844 1.028 1.169 1.274 1.381 1.485 1.633 1.704 1.776 1.758 1.972 2.033 2.136 2.226 2.316 2.359 2.449 2.533 2.649 2.716 2.784 2.885 2.965 3.049 3.135 3.203 3.284 3.377 3.46 3.541 3.635 3.733 3.829 3.929 4.023 4.114 4.208 4.284 4.339 4.401 4.474 4.539 4.583 4.599 4.581 4.469 4.203 3.695 2.708 1.464 0.401 -0.544 -1.354 -2.104 -2.766 -3.327 -3.812 -4.306 -4.723 -5.105 -5.476 -5.804 -6.107 -6.387 -6.679 -6.945 -7.176 -7.416 -7.674 -7.899 -8.125 -8.345 -8.53 -8.723 -8.925 -9.135 -9.343 -9.497 -9.649 -9.897 -10.08 -10.28 -10.392 -10.614 -10.819 -11.017 -11.12 -11.402 -11.505 -11.631 -11.761 -12.056 -12.223 -12.422 -12.638 -12.86 -13.122 -13.555 -15.025 -3 ,28574 ,TETRA ,17665318,Fri Dec 3 00:51:16 CET,Fri Dec 3 02:39:54 CET,0.0 0.556 0.79 0.984 1.126 1.242 1.351 1.448 1.61 1.683 1.751 1.727 1.933 1.991 2.109 2.213 2.299 2.34 2.416 2.49 2.601 2.672 2.743 2.844 2.94 3.031 3.119 3.194 3.285 3.377 3.459 3.548 3.634 3.713 3.805 3.911 4.005 4.087 4.152 4.22 4.294 4.37 4.441 4.48 4.494 4.485 4.434 4.322 4.078 3.662 2.801 1.52 0.441 -0.496 -1.285 -1.964 -2.587 -3.155 -3.652 -4.158 -4.576 -4.95 -5.31 -5.655 -5.969 -6.255 -6.56 -6.83 -7.077 -7.326 -7.574 -7.786 -8.013 -8.258 -8.438 -8.625 -8.819 -9.016 -9.24 -9.395 -9.54 -9.764 -9.938 -10.125 -10.222 -10.42 -10.635 -10.873 -10.995 -11.285 -11.384 -11.528 -11.675 -11.971 -12.135 -12.327 -12.551 -12.779 -13.045 -13.48 -15.384 -4 ,5989 ,TETRA ,17665319,Fri Dec 3 00:58:12 CET,Fri Dec 3 02:45:45 CET,0.0 0.404 0.678 0.884 1.039 1.159 1.253 1.338 1.513 1.593 1.672 1.667 1.872 1.928 2.034 2.132 2.23 2.276 2.36 2.435 2.535 2.597 2.663 2.764 2.855 2.939 3.023 3.097 3.184 3.269 3.352 3.448 3.53 3.603 3.689 3.778 3.854 3.945 4.042 4.137 4.217 4.289 4.374 4.438 4.481 4.513 4.493 4.412 4.23 3.779 2.819 1.521 0.446 -0.502 -1.347 -2.083 -2.723 -3.3 -3.794 -4.281 -4.696 -5.044 -5.384 -5.731 -6.06 -6.369 -6.692 -6.97 -7.204 -7.455 -7.721 -7.937 -8.145 -8.361 -8.547 -8.753 -8.962 -9.166 -9.376 -9.518 -9.674 -9.932 -10.11 -10.296 -10.393 -10.583 -10.78 -11.001 -11.119 -11.411 -11.535 -11.687 -11.839 -12.137 -12.311 -12.523 -12.77 -13.041 -13.41 -13.868 -15.324 -5 ,28297 ,TETRA ,17665320,Fri Dec 3 01:03:08 CET,Fri Dec 3 02:51:50 CET,0.0 0.555 0.798 0.989 1.123 1.244 1.35 1.433 1.568 1.637 1.707 1.691 1.907 1.968 2.081 2.186 2.277 2.32 2.412 2.496 2.608 2.683 2.75 2.835 2.925 3.018 3.099 3.178 3.278 3.366 3.45 3.551 3.638 3.72 3.818 3.921 4.016 4.105 4.185 4.265 4.348 4.431 4.502 4.552 4.57 4.549 4.501 4.404 4.175 3.679 2.691 1.408 0.286 -0.672 -1.489 -2.237 -2.874 -3.454 -3.96 -4.44 -4.871 -5.247 -5.597 -5.938 -6.253 -6.547 -6.862 -7.138 -7.374 -7.619 -7.879 -8.097 -8.316 -8.55 -8.725 -8.905 -9.108 -9.318 -9.535 -9.68 -9.824 -10.056 -10.217 -10.377 -10.466 -10.664 -10.872 -11.1 -11.217 -11.492 -11.6 -11.751 -11.899 -12.235 -12.423 -12.622 -12.833 -13.08 -13.397 -13.823 -15.269 -6 ,30206 ,TETRA ,17665321,Fri Dec 3 01:03:08 CET,Fri Dec 3 02:33:37 CET,0.0 0.509 0.759 0.912 1.045 1.172 1.285 1.389 1.567 1.645 1.713 1.697 1.911 1.969 2.068 2.16 2.251 2.297 2.392 2.483 2.601 2.664 2.726 2.827 2.917 3.004 3.098 3.183 3.288 3.383 3.465 3.554 3.639 3.723 3.816 3.906 3.99 4.075 4.16 4.253 4.33 4.407 4.494 4.554 4.594 4.607 4.57 4.461 4.188 3.707 2.851 1.622 0.506 -0.42 -1.173 -1.873 -2.512 -3.1 -3.607 -4.116 -4.543 -4.911 -5.265 -5.6 -5.906 -6.186 -6.486 -6.75 -6.974 -7.218 -7.485 -7.708 -7.929 -8.151 -8.331 -8.506 -8.688 -8.887 -9.081 -9.216 -9.357 -9.584 -9.753 -9.937 -10.032 -10.237 -10.459 -10.684 -10.798 -11.08 -11.178 -11.324 -11.468 -11.761 -11.942 -12.151 -12.383 -12.665 -13.012 -13.455 -14.864 -7 ,6230 ,TETRA ,17665322,Fri Dec 3 01:05:02 CET,Fri Dec 3 02:35:54 CET,0.0 0.454 0.688 0.839 0.971 1.095 1.205 1.298 1.455 1.522 1.595 1.587 1.797 1.86 1.978 2.085 2.19 2.237 2.324 2.417 2.555 2.632 2.697 2.797 2.889 2.972 3.052 3.133 3.241 3.334 3.415 3.514 3.603 3.684 3.773 3.865 3.95 4.043 4.133 4.207 4.29 4.374 4.438 4.493 4.548 4.562 4.524 4.405 4.157 3.717 2.854 1.675 0.627 -0.284 -1.074 -1.808 -2.437 -3.0 -3.486 -3.945 -4.354 -4.736 -5.091 -5.426 -5.745 -6.024 -6.312 -6.582 -6.824 -7.056 -7.31 -7.536 -7.755 -7.987 -8.18 -8.379 -8.582 -8.777 -8.96 -9.106 -9.271 -9.524 -9.705 -9.883 -9.971 -10.148 -10.35 -10.591 -10.702 -10.972 -11.056 -11.182 -11.314 -11.612 -11.773 -11.955 -12.187 -12.464 -12.767 -13.141 -14.54 -8 ,29195 ,TETRA ,17665323,Fri Dec 3 01:06:02 CET,Fri Dec 3 02:37:13 CET,0.0 0.698 0.925 1.062 1.188 1.316 1.433 1.535 1.717 1.793 1.86 1.83 2.036 2.089 2.183 2.276 2.364 2.409 2.503 2.589 2.693 2.762 2.836 2.932 3.016 3.096 3.174 3.251 3.342 3.425 3.508 3.597 3.688 3.778 3.864 3.958 4.04 4.121 4.202 4.29 4.376 4.449 4.523 4.594 4.659 4.679 4.631 4.552 4.384 3.933 2.972 1.759 0.738 -0.194 -1.02 -1.742 -2.371 -2.945 -3.456 -3.965 -4.363 -4.724 -5.102 -5.458 -5.775 -6.056 -6.359 -6.627 -6.852 -7.102 -7.36 -7.57 -7.801 -8.041 -8.221 -8.409 -8.6 -8.796 -9.0 -9.147 -9.3 -9.537 -9.716 -9.901 -9.99 -10.182 -10.388 -10.593 -10.698 -10.981 -11.092 -11.227 -11.367 -11.675 -11.853 -12.068 -12.315 -12.573 -12.878 -13.288 -14.862 -9 ,14850 ,TETRA ,17665324,Fri Dec 3 01:13:02 CET,Fri Dec 3 02:53:58 CET,0.0 0.387 0.611 0.785 0.915 1.023 1.136 1.227 1.374 1.445 1.513 1.488 1.698 1.755 1.873 1.982 2.08 2.124 2.207 2.281 2.38 2.445 2.51 2.609 2.702 2.796 2.888 2.971 3.065 3.146 3.224 3.318 3.407 3.482 3.56 3.638 3.709 3.79 3.876 3.967 4.055 4.145 4.231 4.298 4.342 4.362 4.316 4.156 3.89 3.43 2.506 1.301 0.222 -0.739 -1.544 -2.28 -2.923 -3.476 -3.959 -4.438 -4.859 -5.241 -5.59 -5.923 -6.248 -6.543 -6.854 -7.151 -7.394 -7.645 -7.906 -8.101 -8.313 -8.538 -8.709 -8.898 -9.096 -9.303 -9.508 -9.643 -9.795 -10.037 -10.189 -10.357 -10.457 -10.668 -10.871 -11.082 -11.202 -11.485 -11.557 -11.685 -11.818 -12.101 -12.273 -12.461 -12.667 -12.929 -13.276 -13.761 -15.185 -10 ,29912 ,TETRA ,17665325,Fri Dec 3 01:13:00 CET,Fri Dec 3 02:59:10 CET,0.0 0.715 0.965 1.125 1.26 1.386 1.494 1.584 1.738 1.809 1.87 1.852 2.067 2.122 2.23 2.329 2.424 2.476 2.568 2.642 2.751 2.824 2.892 2.989 3.083 3.169 3.253 3.335 3.435 3.524 3.601 3.693 3.787 3.879 3.981 4.077 4.153 4.232 4.317 4.413 4.508 4.595 4.689 4.754 4.785 4.803 4.786 4.682 4.444 3.988 3.016 1.749 0.736 -0.16 -0.941 -1.668 -2.329 -2.923 -3.423 -3.912 -4.333 -4.723 -5.1 -5.445 -5.762 -6.044 -6.346 -6.614 -6.844 -7.091 -7.332 -7.528 -7.736 -7.95 -8.129 -8.323 -8.515 -8.717 -8.942 -9.102 -9.265 -9.515 -9.688 -9.854 -9.941 -10.133 -10.327 -10.523 -10.627 -10.911 -11.03 -11.173 -11.32 -11.649 -11.829 -12.039 -12.26 -12.529 -12.869 -13.295 -14.767 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_3b_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_3b_3a.txt deleted file mode 100644 index 15b3dbcd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_3b_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28275 ,KEBNE ,17026503,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:07:16 CET,0.0 0.789 1.045 1.217 1.349 1.474 1.592 1.705 1.92 2.02 2.118 2.133 2.348 2.42 2.552 2.688 2.814 2.87 2.978 3.088 3.243 3.333 3.42 3.542 3.679 3.81 3.916 4.015 4.143 4.27 4.395 4.543 4.679 4.802 4.943 5.106 5.271 5.459 5.662 5.867 6.062 6.27 6.505 6.733 6.989 7.274 7.579 7.853 8.105 8.284 8.237 7.859 7.423 7.007 6.581 6.141 5.743 5.405 5.119 4.828 4.572 4.326 4.084 3.868 3.661 3.453 3.235 3.051 2.888 2.716 2.548 2.395 2.225 2.055 1.938 1.82 1.686 1.544 1.403 1.302 1.195 1.04 0.93 0.816 0.757 0.626 0.492 0.356 0.282 0.049 0.029 -0.054 -0.137 -0.339 -0.454 -0.581 -0.714 -0.873 -1.119 -1.436 -1.967 -2 ,2205 ,KEBNE ,17026504,Wed Dec 22 14:33:57 CET,Wed Dec 22 16:06:37 CET,0.0 0.555 0.828 1.038 1.179 1.317 1.446 1.549 1.743 1.843 1.945 1.96 2.168 2.231 2.363 2.488 2.607 2.663 2.776 2.883 3.012 3.093 3.176 3.301 3.427 3.554 3.677 3.787 3.928 4.072 4.198 4.342 4.482 4.612 4.777 4.965 5.122 5.293 5.483 5.681 5.875 6.084 6.344 6.586 6.853 7.143 7.418 7.698 7.989 8.216 8.26 7.969 7.545 7.118 6.725 6.353 6.009 5.681 5.389 5.076 4.815 4.601 4.386 4.167 3.957 3.764 3.554 3.359 3.19 3.015 2.836 2.689 2.544 2.388 2.262 2.134 2.008 1.882 1.75 1.653 1.547 1.384 1.272 1.149 1.088 0.966 0.828 0.662 0.574 0.344 0.32 0.23 0.14 -0.063 -0.179 -0.314 -0.455 -0.608 -0.82 -1.089 -1.673 -3 ,26952 ,KEBNE ,17026505,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:06:42 CET,0.0 0.849 1.116 1.278 1.434 1.567 1.671 1.764 1.941 2.029 2.12 2.14 2.358 2.429 2.563 2.697 2.825 2.884 2.99 3.083 3.218 3.311 3.405 3.532 3.647 3.763 3.877 3.987 4.128 4.255 4.367 4.503 4.629 4.75 4.898 5.067 5.228 5.393 5.564 5.747 5.94 6.164 6.424 6.671 6.953 7.226 7.482 7.757 8.017 8.238 8.287 7.956 7.568 7.161 6.736 6.345 5.978 5.626 5.334 5.051 4.774 4.519 4.27 4.033 3.816 3.616 3.413 3.234 3.081 2.917 2.749 2.61 2.463 2.299 2.174 2.044 1.912 1.778 1.623 1.515 1.405 1.249 1.142 1.016 0.953 0.825 0.687 0.547 0.476 0.244 0.222 0.13 0.03 -0.183 -0.293 -0.421 -0.57 -0.735 -0.917 -1.144 -1.736 -4 ,15788 ,KEBNE ,17026506,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:06:23 CET,0.0 0.425 0.672 0.851 0.976 1.08 1.172 1.259 1.428 1.517 1.603 1.6 1.813 1.883 2.026 2.158 2.273 2.327 2.43 2.532 2.675 2.758 2.843 2.967 3.084 3.193 3.302 3.418 3.553 3.68 3.796 3.936 4.081 4.211 4.368 4.542 4.698 4.865 5.046 5.238 5.427 5.64 5.866 6.062 6.304 6.558 6.826 7.082 7.306 7.494 7.483 7.173 6.734 6.265 5.82 5.409 5.027 4.649 4.327 4.017 3.732 3.482 3.25 3.031 2.822 2.622 2.415 2.233 2.077 1.919 1.754 1.614 1.471 1.318 1.195 1.069 0.94 0.805 0.655 0.554 0.453 0.291 0.177 0.068 0.011 -0.121 -0.257 -0.387 -0.456 -0.682 -0.708 -0.803 -0.9 -1.113 -1.246 -1.394 -1.541 -1.698 -1.906 -2.163 -2.901 -5 ,24964 ,KEBNE ,17026507,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:06:25 CET,0.0 0.603 0.816 0.972 1.112 1.24 1.362 1.464 1.641 1.728 1.811 1.812 2.03 2.098 2.219 2.345 2.461 2.513 2.614 2.721 2.875 2.969 3.065 3.203 3.325 3.44 3.553 3.665 3.808 3.939 4.061 4.209 4.353 4.489 4.641 4.806 4.961 5.129 5.3 5.471 5.66 5.871 6.106 6.335 6.593 6.89 7.203 7.487 7.724 7.882 7.855 7.52 7.082 6.655 6.246 5.85 5.496 5.131 4.814 4.54 4.273 4.025 3.805 3.582 3.359 3.153 2.946 2.763 2.597 2.419 2.236 2.097 1.959 1.813 1.697 1.577 1.453 1.315 1.155 1.044 0.936 0.754 0.625 0.499 0.434 0.298 0.157 0.011 -0.063 -0.29 -0.321 -0.42 -0.513 -0.7 -0.803 -0.914 -1.034 -1.158 -1.329 -1.569 -2.174 -6 ,6756 ,KEBNE ,17026508,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:06:22 CET,0.0 0.492 0.717 0.886 1.039 1.148 1.247 1.35 1.538 1.628 1.714 1.724 1.943 2.01 2.137 2.263 2.388 2.452 2.573 2.681 2.826 2.91 2.991 3.125 3.249 3.35 3.45 3.554 3.7 3.829 3.941 4.082 4.218 4.348 4.494 4.652 4.809 4.986 5.168 5.355 5.551 5.76 5.98 6.195 6.445 6.718 7.004 7.291 7.581 7.798 7.847 7.585 7.207 6.812 6.393 6.001 5.649 5.333 5.064 4.761 4.487 4.245 4.015 3.79 3.58 3.386 3.168 2.967 2.797 2.623 2.438 2.284 2.131 1.984 1.874 1.748 1.607 1.468 1.317 1.213 1.109 0.952 0.847 0.73 0.67 0.56 0.44 0.301 0.223 -0.005 -0.021 -0.118 -0.219 -0.409 -0.514 -0.638 -0.778 -0.944 -1.162 -1.459 -2.298 -7 ,4265 ,KEBNE ,17026509,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:06:31 CET,0.0 0.569 0.849 1.023 1.18 1.319 1.438 1.546 1.756 1.855 1.933 1.927 2.142 2.213 2.341 2.453 2.556 2.612 2.724 2.838 3.007 3.102 3.188 3.306 3.429 3.549 3.663 3.78 3.913 4.032 4.153 4.293 4.431 4.565 4.724 4.905 5.074 5.25 5.433 5.634 5.813 6.008 6.242 6.467 6.742 7.025 7.29 7.54 7.808 8.037 8.029 7.673 7.289 6.899 6.52 6.141 5.768 5.434 5.142 4.828 4.554 4.319 4.099 3.879 3.663 3.459 3.24 3.056 2.895 2.732 2.563 2.417 2.267 2.113 1.99 1.847 1.706 1.573 1.43 1.329 1.219 1.057 0.955 0.848 0.788 0.653 0.515 0.371 0.289 0.059 0.04 -0.05 -0.153 -0.388 -0.511 -0.65 -0.808 -0.965 -1.125 -1.344 -1.926 -8 ,12318 ,KEBNE ,17026510,Wed Dec 22 14:33:57 CET,Wed Dec 22 16:07:17 CET,0.0 0.406 0.663 0.856 0.992 1.108 1.222 1.342 1.553 1.643 1.73 1.736 1.951 2.019 2.155 2.29 2.414 2.471 2.583 2.69 2.828 2.92 3.009 3.129 3.249 3.361 3.464 3.572 3.711 3.839 3.962 4.112 4.256 4.391 4.529 4.69 4.85 5.014 5.195 5.382 5.574 5.796 6.04 6.281 6.553 6.818 7.097 7.36 7.596 7.781 7.774 7.463 7.028 6.597 6.217 5.844 5.474 5.131 4.818 4.49 4.203 3.941 3.708 3.49 3.272 3.067 2.854 2.678 2.533 2.382 2.217 2.066 1.909 1.746 1.614 1.486 1.367 1.24 1.094 0.984 0.872 0.722 0.618 0.499 0.44 0.317 0.178 0.022 -0.054 -0.28 -0.303 -0.39 -0.482 -0.679 -0.782 -0.909 -1.049 -1.2 -1.424 -1.739 -2.315 -9 ,10493 ,KEBNE ,17026511,Wed Dec 22 14:33:57 CET,Wed Dec 22 16:06:26 CET,0.0 0.476 0.752 0.924 1.091 1.244 1.368 1.49 1.689 1.766 1.838 1.842 2.062 2.123 2.24 2.376 2.514 2.574 2.683 2.788 2.935 3.029 3.112 3.225 3.339 3.453 3.566 3.662 3.778 3.896 4.011 4.154 4.3 4.44 4.583 4.741 4.897 5.079 5.276 5.468 5.672 5.888 6.139 6.386 6.654 6.932 7.228 7.538 7.804 7.955 7.902 7.572 7.159 6.707 6.263 5.855 5.482 5.14 4.856 4.539 4.257 4.026 3.782 3.54 3.328 3.144 2.953 2.777 2.622 2.452 2.267 2.122 1.975 1.819 1.705 1.585 1.453 1.321 1.182 1.078 0.96 0.781 0.666 0.548 0.488 0.371 0.246 0.106 0.029 -0.197 -0.225 -0.317 -0.397 -0.603 -0.724 -0.831 -0.971 -1.144 -1.32 -1.562 -2.114 -10 ,3403 ,KEBNE ,17026512,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:06:26 CET,0.0 0.652 0.909 1.109 1.284 1.403 1.527 1.65 1.842 1.921 2.002 2.024 2.248 2.318 2.449 2.564 2.673 2.729 2.84 2.95 3.113 3.215 3.305 3.439 3.563 3.679 3.796 3.915 4.06 4.193 4.331 4.49 4.639 4.78 4.942 5.118 5.286 5.474 5.663 5.856 6.059 6.283 6.537 6.776 7.036 7.297 7.561 7.831 8.096 8.287 8.262 7.941 7.528 7.086 6.668 6.283 5.932 5.601 5.287 4.972 4.724 4.501 4.274 4.053 3.835 3.641 3.436 3.236 3.057 2.874 2.681 2.535 2.404 2.256 2.133 2.011 1.885 1.745 1.584 1.473 1.369 1.21 1.097 0.978 0.916 0.786 0.649 0.504 0.428 0.202 0.177 0.082 -0.004 -0.179 -0.285 -0.403 -0.519 -0.65 -0.803 -1.002 -1.488 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_3b_7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_3b_7.txt deleted file mode 100644 index f3b9e7c7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_3b_7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17600 ,TETRA ,17665326,Fri Dec 3 01:20:58 CET,Fri Dec 3 03:09:32 CET,0.0 0.424 0.654 0.85 1.018 1.161 1.303 1.415 1.597 1.686 1.776 1.793 2.009 2.085 2.228 2.367 2.501 2.561 2.681 2.796 2.952 3.061 3.163 3.304 3.454 3.594 3.73 3.879 4.066 4.241 4.407 4.603 4.786 4.973 5.199 5.437 5.669 5.931 6.21 6.496 6.797 7.154 7.555 7.952 8.448 9.009 9.619 10.247 10.95 11.779 12.698 13.265 13.402 13.336 13.137 12.852 12.531 12.199 11.93 11.653 11.374 11.119 10.881 10.663 10.426 10.193 9.97 9.77 9.594 9.419 9.222 9.041 8.862 8.7 8.57 8.416 8.262 8.113 7.952 7.826 7.699 7.494 7.337 7.174 7.093 6.934 6.765 6.594 6.501 6.257 6.197 6.084 5.966 5.735 5.603 5.446 5.276 5.078 4.815 4.483 3.586 -2 ,12072 ,TETRA ,17665327,Fri Dec 3 01:52:05 CET,Fri Dec 3 03:50:31 CET,0.0 0.68 0.981 1.162 1.294 1.416 1.528 1.626 1.817 1.912 2.0 2.019 2.243 2.309 2.439 2.582 2.722 2.786 2.911 3.036 3.212 3.317 3.414 3.559 3.698 3.83 3.964 4.104 4.283 4.454 4.617 4.815 5.01 5.186 5.385 5.627 5.863 6.116 6.408 6.718 7.025 7.382 7.819 8.263 8.768 9.308 9.932 10.66 11.468 12.389 13.293 13.687 13.814 13.769 13.604 13.414 13.176 12.869 12.596 12.347 12.091 11.83 11.586 11.363 11.164 10.978 10.767 10.571 10.403 10.228 10.039 9.875 9.709 9.518 9.354 9.201 9.049 8.887 8.71 8.59 8.472 8.284 8.136 7.976 7.903 7.755 7.597 7.44 7.349 7.102 7.047 6.944 6.836 6.606 6.47 6.316 6.146 5.951 5.726 5.422 4.644 -3 ,3143 ,TETRA ,17665328,Fri Dec 3 02:13:53 CET,Fri Dec 3 04:01:38 CET,0.0 0.6 0.831 1.012 1.145 1.267 1.388 1.485 1.698 1.799 1.884 1.904 2.127 2.205 2.346 2.469 2.588 2.648 2.77 2.887 3.056 3.168 3.278 3.437 3.583 3.722 3.86 3.99 4.158 4.313 4.456 4.632 4.815 4.995 5.205 5.455 5.698 5.964 6.244 6.531 6.827 7.165 7.574 7.974 8.439 8.96 9.568 10.263 11.046 11.868 12.7 13.109 13.118 13.019 12.89 12.704 12.478 12.235 11.984 11.713 11.438 11.169 10.923 10.688 10.477 10.281 10.071 9.886 9.713 9.518 9.317 9.155 8.968 8.776 8.635 8.481 8.318 8.15 7.982 7.875 7.758 7.565 7.419 7.26 7.185 7.036 6.871 6.685 6.591 6.355 6.305 6.188 6.065 5.806 5.651 5.492 5.317 5.135 4.937 4.604 3.829 -4 ,20700 ,TETRA ,17665329,Fri Dec 3 02:33:53 CET,Fri Dec 3 04:15:12 CET,0.0 0.479 0.735 0.94 1.092 1.239 1.366 1.465 1.668 1.762 1.85 1.856 2.076 2.159 2.314 2.442 2.56 2.621 2.738 2.851 3.027 3.14 3.242 3.381 3.515 3.663 3.814 3.952 4.135 4.315 4.488 4.691 4.873 5.051 5.277 5.525 5.752 6.014 6.308 6.622 6.944 7.305 7.716 8.128 8.594 9.116 9.727 10.429 11.272 12.2 13.135 13.527 13.592 13.478 13.211 12.935 12.689 12.427 12.186 11.913 11.647 11.419 11.182 10.943 10.709 10.495 10.296 10.089 9.884 9.678 9.477 9.32 9.145 8.957 8.805 8.648 8.498 8.343 8.185 8.072 7.954 7.772 7.648 7.523 7.454 7.292 7.117 6.937 6.844 6.607 6.555 6.452 6.346 6.092 5.95 5.802 5.625 5.423 5.195 4.853 4.067 -5 ,23377 ,TETRA ,17665330,Fri Dec 3 02:36:53 CET,Fri Dec 3 04:18:36 CET,0.0 0.531 0.796 1.008 1.176 1.326 1.453 1.545 1.72 1.818 1.912 1.922 2.134 2.201 2.341 2.472 2.597 2.659 2.776 2.89 3.045 3.141 3.245 3.392 3.526 3.668 3.823 3.972 4.163 4.343 4.502 4.704 4.908 5.1 5.325 5.577 5.818 6.082 6.359 6.655 6.968 7.299 7.686 8.096 8.571 9.131 9.764 10.458 11.284 12.121 12.967 13.397 13.482 13.392 13.195 12.935 12.631 12.349 12.087 11.801 11.539 11.3 11.051 10.794 10.581 10.398 10.177 9.977 9.811 9.641 9.461 9.292 9.122 8.946 8.805 8.657 8.49 8.308 8.124 8.011 7.899 7.698 7.557 7.413 7.333 7.162 6.993 6.823 6.73 6.484 6.422 6.317 6.194 5.931 5.798 5.652 5.478 5.271 5.059 4.781 4.152 -6 ,4078 ,TETRA ,17665331,Fri Dec 3 02:37:53 CET,Fri Dec 3 04:20:31 CET,0.0 0.777 1.039 1.224 1.372 1.487 1.592 1.69 1.872 1.966 2.062 2.09 2.314 2.393 2.539 2.673 2.798 2.858 2.971 3.086 3.268 3.381 3.49 3.65 3.801 3.948 4.09 4.233 4.413 4.58 4.743 4.942 5.139 5.325 5.54 5.782 6.002 6.243 6.511 6.799 7.108 7.461 7.888 8.319 8.812 9.375 10.002 10.656 11.434 12.365 13.385 14.028 14.178 14.087 13.918 13.667 13.384 13.135 12.934 12.688 12.427 12.199 11.983 11.753 11.538 11.338 11.124 10.927 10.744 10.566 10.379 10.21 10.026 9.845 9.706 9.547 9.383 9.213 9.038 8.92 8.784 8.559 8.406 8.259 8.186 8.031 7.866 7.688 7.599 7.371 7.322 7.21 7.091 6.828 6.688 6.529 6.358 6.18 5.945 5.613 4.832 -7 ,6482 ,TETRA ,17665332,Fri Dec 3 02:40:51 CET,Fri Dec 3 04:29:10 CET,0.0 0.529 0.764 0.926 1.072 1.199 1.314 1.423 1.6 1.678 1.754 1.752 1.972 2.043 2.171 2.301 2.433 2.497 2.609 2.722 2.903 3.022 3.134 3.296 3.454 3.599 3.746 3.886 4.053 4.215 4.366 4.555 4.76 4.963 5.183 5.418 5.648 5.906 6.186 6.497 6.815 7.172 7.581 7.962 8.44 8.994 9.614 10.308 11.129 12.01 12.867 13.339 13.455 13.396 13.177 12.913 12.67 12.437 12.205 11.929 11.687 11.461 11.22 11.003 10.797 10.588 10.36 10.165 9.993 9.807 9.617 9.46 9.302 9.134 8.989 8.831 8.677 8.524 8.368 8.26 8.144 7.959 7.829 7.69 7.62 7.474 7.308 7.123 7.033 6.803 6.743 6.624 6.488 6.191 6.039 5.878 5.69 5.477 5.235 4.907 3.964 -8 ,4743 ,TETRA ,17665333,Fri Dec 3 02:46:52 CET,Fri Dec 3 04:28:50 CET,0.0 0.434 0.677 0.846 0.997 1.154 1.296 1.41 1.59 1.678 1.764 1.788 2.02 2.101 2.255 2.401 2.534 2.592 2.704 2.817 2.977 3.075 3.175 3.336 3.493 3.628 3.757 3.893 4.076 4.232 4.386 4.592 4.79 4.977 5.192 5.435 5.667 5.93 6.22 6.522 6.83 7.172 7.578 7.979 8.453 8.989 9.588 10.269 11.074 11.937 12.825 13.382 13.516 13.415 13.208 12.944 12.682 12.392 12.098 11.825 11.591 11.367 11.132 10.873 10.628 10.425 10.211 10.016 9.849 9.667 9.463 9.293 9.122 8.926 8.759 8.589 8.411 8.236 8.056 7.931 7.804 7.607 7.477 7.338 7.265 7.097 6.917 6.732 6.64 6.403 6.32 6.202 6.083 5.829 5.675 5.517 5.338 5.123 4.885 4.558 3.742 -9 ,29508 ,TETRA ,17665334,Fri Dec 3 02:52:52 CET,Fri Dec 3 04:44:35 CET,0.0 0.359 0.553 0.718 0.852 0.974 1.101 1.222 1.43 1.519 1.605 1.625 1.842 1.917 2.072 2.212 2.338 2.396 2.508 2.627 2.803 2.917 3.029 3.187 3.338 3.482 3.618 3.753 3.931 4.109 4.279 4.471 4.66 4.849 5.066 5.318 5.564 5.834 6.133 6.448 6.769 7.142 7.588 8.018 8.53 9.116 9.753 10.431 11.19 12.025 12.875 13.315 13.34 13.174 12.975 12.746 12.516 12.273 11.992 11.661 11.37 11.122 10.906 10.686 10.46 10.248 10.02 9.823 9.645 9.452 9.255 9.084 8.9 8.724 8.597 8.448 8.296 8.148 7.979 7.853 7.727 7.531 7.398 7.267 7.195 7.047 6.885 6.699 6.604 6.359 6.275 6.162 6.056 5.832 5.705 5.562 5.397 5.192 4.947 4.626 3.827 -10 ,22994 ,TETRA ,17665335,Fri Dec 3 03:06:25 CET,Fri Dec 3 04:54:27 CET,0.0 0.605 0.888 1.082 1.244 1.385 1.5 1.603 1.792 1.878 1.959 1.959 2.174 2.239 2.373 2.512 2.639 2.697 2.812 2.928 3.098 3.207 3.312 3.466 3.61 3.741 3.868 3.998 4.173 4.334 4.487 4.686 4.887 5.074 5.279 5.514 5.746 6.01 6.296 6.595 6.919 7.284 7.713 8.161 8.675 9.218 9.827 10.515 11.31 12.194 13.104 13.6 13.626 13.516 13.346 13.136 12.873 12.56 12.255 11.929 11.66 11.405 11.168 10.954 10.747 10.554 10.341 10.145 9.957 9.762 9.576 9.412 9.232 9.051 8.914 8.768 8.606 8.44 8.26 8.131 8.005 7.812 7.666 7.507 7.431 7.275 7.119 6.944 6.845 6.606 6.539 6.427 6.312 6.067 5.938 5.79 5.622 5.415 5.157 4.826 3.762 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5a_3a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5a_3a.txt deleted file mode 100644 index c28022ac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5a_3a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,20114 ,TETRA ,17665336,Fri Dec 3 03:09:53 CET,Fri Dec 3 04:58:44 CET,0.0 0.933 1.301 1.604 1.841 2.034 2.189 2.332 2.618 2.754 2.885 2.95 3.239 3.348 3.554 3.755 3.956 4.058 4.252 4.43 4.688 4.849 5.002 5.228 5.452 5.656 5.856 6.068 6.339 6.587 6.837 7.154 7.462 7.751 8.082 8.457 8.809 9.203 9.648 10.129 10.6 11.117 11.772 12.445 13.212 14.074 15.064 16.16 17.418 18.876 20.678 22.195 23.034 23.515 23.839 24.026 24.129 24.209 24.241 24.253 24.269 24.268 24.25 24.215 24.168 24.116 24.059 24.007 23.956 23.901 23.844 23.796 23.725 23.646 23.591 23.529 23.466 23.405 23.34 23.292 23.235 23.15 23.092 23.02 22.984 22.911 22.822 22.723 22.675 22.487 22.553 22.5 22.441 22.319 22.248 22.156 22.048 21.924 21.765 21.556 21.202 -2 ,6308 ,TETRA ,17665337,Fri Dec 3 03:21:54 CET,Fri Dec 3 05:04:32 CET,0.0 1.021 1.396 1.66 1.896 2.106 2.278 2.446 2.771 2.905 3.031 3.096 3.382 3.491 3.702 3.899 4.091 4.189 4.375 4.56 4.824 4.982 5.135 5.363 5.587 5.799 6.001 6.201 6.478 6.739 6.982 7.287 7.586 7.88 8.229 8.614 8.978 9.389 9.857 10.338 10.825 11.386 12.068 12.754 13.542 14.412 15.384 16.532 17.897 19.411 21.199 22.631 23.458 23.979 24.304 24.506 24.628 24.695 24.722 24.723 24.701 24.686 24.662 24.632 24.606 24.567 24.505 24.448 24.404 24.342 24.273 24.213 24.149 24.077 24.016 23.958 23.896 23.83 23.766 23.719 23.666 23.579 23.516 23.455 23.423 23.353 23.277 23.205 23.166 22.97 23.011 22.95 22.894 22.758 22.679 22.587 22.488 22.369 22.198 22.018 21.7 -3 ,27797 ,TETRA ,17665338,Fri Dec 3 03:24:55 CET,Fri Dec 3 05:14:11 CET,0.0 0.855 1.23 1.477 1.689 1.895 2.082 2.24 2.542 2.687 2.812 2.87 3.166 3.28 3.482 3.678 3.871 3.958 4.127 4.313 4.571 4.726 4.889 5.128 5.358 5.579 5.794 6.002 6.275 6.538 6.792 7.104 7.409 7.697 8.03 8.392 8.735 9.129 9.567 10.028 10.505 11.057 11.698 12.348 13.147 14.083 15.131 16.264 17.531 19.021 20.883 22.394 23.21 23.69 24.01 24.211 24.336 24.412 24.454 24.476 24.464 24.43 24.395 24.349 24.3 24.25 24.192 24.141 24.098 24.05 23.992 23.939 23.879 23.821 23.768 23.706 23.644 23.567 23.488 23.438 23.375 23.272 23.198 23.115 23.074 22.999 22.922 22.827 22.786 22.599 22.656 22.602 22.54 22.401 22.321 22.216 22.096 21.978 21.842 21.618 21.196 -4 ,29679 ,TETRA ,17665339,Fri Dec 3 03:24:55 CET,Fri Dec 3 05:13:47 CET,0.0 0.95 1.312 1.61 1.839 2.031 2.217 2.376 2.636 2.76 2.873 2.932 3.223 3.331 3.542 3.765 3.983 4.084 4.269 4.441 4.682 4.834 4.999 5.255 5.493 5.718 5.929 6.127 6.393 6.652 6.898 7.205 7.501 7.775 8.107 8.489 8.849 9.258 9.694 10.17 10.688 11.273 11.967 12.665 13.457 14.308 15.273 16.366 17.688 19.31 21.202 22.629 23.436 23.911 24.182 24.373 24.48 24.548 24.598 24.615 24.618 24.612 24.584 24.549 24.514 24.465 24.419 24.373 24.321 24.261 24.202 24.149 24.074 23.993 23.934 23.87 23.812 23.752 23.679 23.635 23.597 23.513 23.443 23.377 23.34 23.26 23.175 23.088 23.048 22.85 22.89 22.829 22.756 22.613 22.534 22.437 22.335 22.22 22.087 21.949 21.606 -5 ,21480 ,TETRA ,17665340,Fri Dec 3 03:31:53 CET,Fri Dec 3 05:20:27 CET,0.0 0.796 1.127 1.382 1.61 1.791 1.939 2.091 2.397 2.53 2.649 2.704 2.993 3.108 3.33 3.539 3.736 3.829 4.008 4.187 4.448 4.611 4.772 5.009 5.239 5.461 5.659 5.856 6.125 6.373 6.62 6.927 7.213 7.494 7.818 8.183 8.546 8.958 9.405 9.864 10.36 10.909 11.534 12.207 13.017 13.866 14.802 15.883 17.254 18.872 20.706 22.151 22.933 23.411 23.713 23.921 24.054 24.14 24.175 24.176 24.173 24.154 24.101 24.046 24.015 23.974 23.91 23.862 23.82 23.763 23.691 23.631 23.575 23.508 23.448 23.387 23.322 23.254 23.183 23.137 23.087 22.994 22.929 22.859 22.819 22.735 22.648 22.562 22.518 22.319 22.37 22.324 22.275 22.16 22.088 22.004 21.901 21.768 21.61 21.437 20.945 -6 ,955 ,TETRA ,17665341,Fri Dec 3 03:33:53 CET,Fri Dec 3 05:22:57 CET,0.0 0.86 1.223 1.451 1.641 1.819 1.982 2.139 2.425 2.555 2.687 2.769 3.061 3.168 3.383 3.592 3.782 3.871 4.046 4.226 4.484 4.653 4.827 5.071 5.293 5.511 5.721 5.922 6.188 6.458 6.711 7.007 7.294 7.568 7.903 8.308 8.687 9.087 9.523 9.992 10.492 11.051 11.679 12.311 13.066 13.912 14.921 16.031 17.332 18.848 20.634 22.128 22.988 23.493 23.792 23.958 24.053 24.115 24.169 24.204 24.206 24.176 24.121 24.07 24.014 23.968 23.913 23.85 23.796 23.746 23.692 23.633 23.565 23.488 23.426 23.362 23.295 23.232 23.157 23.103 23.055 22.962 22.885 22.815 22.776 22.684 22.601 22.517 22.471 22.269 22.298 22.226 22.153 22.0 21.914 21.824 21.722 21.598 21.459 21.258 20.732 -7 ,30638 ,TETRA ,17665342,Fri Dec 3 03:35:55 CET,Fri Dec 3 05:24:59 CET,0.0 0.776 1.103 1.359 1.589 1.802 1.991 2.16 2.455 2.586 2.712 2.77 3.061 3.176 3.402 3.608 3.803 3.901 4.084 4.256 4.51 4.674 4.833 5.065 5.294 5.518 5.736 5.949 6.221 6.482 6.721 7.002 7.283 7.565 7.903 8.282 8.643 9.037 9.463 9.936 10.437 10.979 11.616 12.274 13.047 13.923 14.921 16.071 17.406 18.971 20.863 22.37 23.21 23.693 23.972 24.15 24.294 24.388 24.423 24.448 24.458 24.453 24.428 24.384 24.334 24.285 24.235 24.182 24.127 24.067 24.003 23.951 23.895 23.833 23.783 23.732 23.671 23.597 23.517 23.468 23.413 23.325 23.255 23.174 23.133 23.046 22.95 22.845 22.798 22.602 22.645 22.585 22.5 22.319 22.244 22.172 22.083 21.979 21.855 21.683 21.321 -8 ,24636 ,TETRA ,17665343,Fri Dec 3 03:35:56 CET,Fri Dec 3 05:24:37 CET,0.0 0.713 1.051 1.309 1.533 1.741 1.928 2.088 2.369 2.51 2.641 2.693 2.982 3.094 3.309 3.515 3.712 3.805 3.985 4.161 4.412 4.568 4.721 4.954 5.181 5.4 5.613 5.821 6.086 6.338 6.58 6.868 7.145 7.426 7.765 8.157 8.522 8.909 9.35 9.813 10.285 10.833 11.488 12.156 12.91 13.755 14.769 15.93 17.259 18.813 20.688 22.085 22.815 23.28 23.596 23.814 23.943 24.0 24.019 24.046 24.058 24.034 23.987 23.942 23.915 23.883 23.836 23.784 23.732 23.663 23.593 23.546 23.482 23.402 23.344 23.293 23.242 23.178 23.108 23.064 23.016 22.928 22.861 22.789 22.754 22.681 22.598 22.502 22.454 22.258 22.3 22.243 22.188 22.067 21.993 21.914 21.815 21.678 21.516 21.356 20.896 -9 ,27729 ,TETRA ,17665344,Fri Dec 3 03:37:54 CET,Fri Dec 3 05:26:59 CET,0.0 0.807 1.118 1.38 1.603 1.778 1.943 2.112 2.426 2.567 2.692 2.745 3.03 3.134 3.334 3.529 3.714 3.806 3.98 4.142 4.396 4.564 4.726 4.961 5.192 5.411 5.611 5.8 6.054 6.303 6.553 6.871 7.174 7.46 7.788 8.15 8.504 8.92 9.368 9.835 10.348 10.906 11.547 12.223 12.994 13.848 14.835 15.945 17.233 18.723 20.507 21.955 22.758 23.278 23.599 23.816 23.966 24.045 24.078 24.092 24.092 24.074 24.041 23.998 23.95 23.896 23.825 23.766 23.713 23.652 23.574 23.516 23.455 23.381 23.326 23.269 23.207 23.138 23.062 23.014 22.965 22.892 22.842 22.775 22.734 22.656 22.568 22.472 22.425 22.224 22.274 22.222 22.165 22.038 21.951 21.843 21.726 21.583 21.384 21.136 20.653 -10 ,8779 ,TETRA ,17665345,Fri Dec 3 03:38:56 CET,Fri Dec 3 05:27:35 CET,0.0 0.945 1.296 1.528 1.724 1.918 2.089 2.25 2.546 2.681 2.809 2.872 3.165 3.286 3.521 3.738 3.944 4.039 4.216 4.39 4.641 4.795 4.948 5.192 5.428 5.652 5.863 6.063 6.322 6.59 6.858 7.173 7.469 7.744 8.064 8.424 8.779 9.171 9.606 10.08 10.573 11.143 11.81 12.481 13.269 14.113 15.084 16.223 17.586 19.159 20.941 22.349 23.146 23.656 23.975 24.171 24.306 24.372 24.388 24.41 24.404 24.367 24.343 24.327 24.293 24.252 24.196 24.148 24.101 24.041 23.984 23.936 23.879 23.817 23.758 23.695 23.636 23.562 23.472 23.409 23.35 23.26 23.195 23.123 23.092 23.016 22.923 22.825 22.769 22.561 22.594 22.534 22.471 22.343 22.273 22.183 22.07 21.961 21.825 21.622 21.256 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5a_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5a_5b.txt deleted file mode 100644 index ec9923b5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5a_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21712 ,KEBNE ,16838862,Sun Dec 5 21:18:20 CET,Sun Dec 5 22:50:17 CET,0.0 0.574 0.812 1.009 1.169 1.302 1.427 1.547 1.719 1.798 1.881 1.854 2.093 2.145 2.241 2.337 2.416 2.453 2.54 2.62 2.724 2.787 2.845 2.91 2.978 3.055 3.115 3.173 3.25 3.311 3.348 3.385 3.428 3.481 3.524 3.57 3.608 3.602 3.579 3.54 3.472 3.379 3.239 3.064 2.835 2.527 2.077 1.442 0.52 -0.898 -3.191 -5.756 -7.748 -9.401 -10.779 -11.949 -12.924 -13.803 -14.543 -15.247 -15.844 -16.392 -16.896 -17.325 -17.723 -18.106 -18.498 -18.826 -19.104 -19.411 -19.736 -20.002 -20.267 -20.54 -20.757 -20.986 -21.219 -21.442 -21.669 -21.822 -21.972 -22.22 -22.386 -22.546 -22.63 -22.808 -22.998 -23.214 -23.324 -23.638 -23.677 -23.787 -23.9 -24.164 -24.314 -24.472 -24.636 -24.822 -25.067 -25.391 -26.056 -2 ,32090 ,KEBNE ,16838863,Sun Dec 5 21:18:20 CET,Sun Dec 5 22:51:55 CET,0.0 0.557 0.833 1.017 1.149 1.261 1.37 1.465 1.648 1.725 1.791 1.764 2.007 2.067 2.175 2.28 2.373 2.415 2.5 2.581 2.682 2.744 2.804 2.88 2.965 3.042 3.097 3.151 3.221 3.3 3.386 3.461 3.522 3.58 3.629 3.657 3.67 3.677 3.657 3.618 3.564 3.466 3.315 3.138 2.917 2.62 2.167 1.521 0.608 -0.772 -3.052 -5.664 -7.688 -9.323 -10.71 -11.909 -12.908 -13.785 -14.536 -15.252 -15.831 -16.327 -16.792 -17.225 -17.63 -18.019 -18.408 -18.739 -19.031 -19.349 -19.666 -19.906 -20.153 -20.408 -20.605 -20.821 -21.054 -21.291 -21.53 -21.685 -21.822 -22.024 -22.182 -22.354 -22.444 -22.62 -22.803 -23.001 -23.105 -23.411 -23.438 -23.565 -23.69 -23.962 -24.113 -24.268 -24.432 -24.645 -24.916 -25.243 -26.134 -3 ,6478 ,KEBNE ,16838864,Sun Dec 5 21:18:19 CET,Sun Dec 5 22:50:31 CET,0.0 0.677 0.931 1.118 1.266 1.374 1.478 1.569 1.723 1.796 1.871 1.83 2.061 2.124 2.248 2.35 2.433 2.47 2.54 2.62 2.745 2.807 2.865 2.946 3.007 3.077 3.139 3.187 3.252 3.305 3.35 3.399 3.43 3.44 3.438 3.443 3.452 3.445 3.425 3.386 3.348 3.296 3.177 3.035 2.832 2.527 2.08 1.472 0.573 -0.82 -3.125 -5.821 -7.909 -9.584 -10.974 -12.157 -13.193 -14.117 -14.876 -15.599 -16.199 -16.717 -17.2 -17.658 -18.089 -18.473 -18.852 -19.172 -19.443 -19.752 -20.075 -20.313 -20.554 -20.812 -21.012 -21.204 -21.405 -21.627 -21.867 -22.031 -22.197 -22.451 -22.616 -22.795 -22.886 -23.061 -23.246 -23.438 -23.54 -23.85 -23.874 -23.999 -24.131 -24.398 -24.536 -24.687 -24.856 -25.062 -25.306 -25.604 -26.358 -4 ,26669 ,KEBNE ,16838865,Sun Dec 5 21:18:19 CET,Sun Dec 5 22:51:34 CET,0.0 0.706 0.957 1.129 1.285 1.421 1.518 1.599 1.765 1.846 1.919 1.881 2.117 2.174 2.291 2.387 2.457 2.498 2.593 2.676 2.773 2.831 2.893 2.995 3.073 3.123 3.181 3.242 3.328 3.398 3.445 3.512 3.569 3.599 3.624 3.654 3.681 3.711 3.731 3.713 3.67 3.619 3.519 3.368 3.144 2.825 2.414 1.839 0.912 -0.489 -2.723 -5.301 -7.365 -9.083 -10.468 -11.623 -12.596 -13.441 -14.165 -14.889 -15.485 -15.991 -16.462 -16.897 -17.286 -17.639 -18.017 -18.363 -18.663 -18.955 -19.244 -19.477 -19.736 -20.008 -20.202 -20.399 -20.6 -20.812 -21.05 -21.213 -21.376 -21.622 -21.784 -21.957 -22.046 -22.216 -22.394 -22.598 -22.703 -23.014 -23.041 -23.152 -23.261 -23.491 -23.617 -23.766 -23.932 -24.103 -24.286 -24.506 -25.1 -5 ,11554 ,KEBNE ,16838866,Sun Dec 5 21:18:19 CET,Sun Dec 5 22:50:33 CET,0.0 0.733 1.022 1.199 1.334 1.451 1.571 1.682 1.853 1.931 1.997 1.929 2.158 2.216 2.331 2.431 2.52 2.561 2.628 2.69 2.799 2.869 2.93 2.998 3.061 3.146 3.214 3.259 3.318 3.393 3.466 3.544 3.629 3.693 3.738 3.788 3.83 3.844 3.853 3.84 3.804 3.741 3.62 3.461 3.232 2.912 2.44 1.771 0.797 -0.617 -2.853 -5.443 -7.487 -9.183 -10.602 -11.797 -12.77 -13.698 -14.499 -15.237 -15.84 -16.336 -16.819 -17.276 -17.713 -18.108 -18.502 -18.851 -19.14 -19.426 -19.723 -19.985 -20.251 -20.508 -20.704 -20.907 -21.125 -21.349 -21.573 -21.737 -21.898 -22.136 -22.304 -22.473 -22.56 -22.749 -22.95 -23.161 -23.261 -23.559 -23.569 -23.682 -23.802 -24.075 -24.221 -24.378 -24.543 -24.722 -24.931 -25.19 -25.882 -8 ,4062 ,KEBNE ,16838869,Sun Dec 5 21:18:20 CET,Sun Dec 5 22:51:09 CET,0.0 0.544 0.845 1.03 1.189 1.333 1.454 1.553 1.696 1.756 1.82 1.778 2.016 2.064 2.169 2.283 2.384 2.428 2.5 2.567 2.681 2.756 2.816 2.893 2.953 3.013 3.07 3.117 3.18 3.238 3.28 3.329 3.372 3.406 3.466 3.523 3.559 3.58 3.57 3.539 3.515 3.451 3.326 3.188 2.98 2.682 2.241 1.584 0.655 -0.714 -2.953 -5.538 -7.593 -9.24 -10.603 -11.818 -12.872 -13.764 -14.483 -15.185 -15.762 -16.268 -16.744 -17.18 -17.578 -17.942 -18.311 -18.642 -18.928 -19.228 -19.533 -19.767 -20.022 -20.29 -20.498 -20.714 -20.913 -21.124 -21.351 -21.506 -21.676 -21.943 -22.113 -22.27 -22.356 -22.551 -22.749 -22.964 -23.069 -23.37 -23.408 -23.528 -23.645 -23.881 -24.011 -24.159 -24.326 -24.509 -24.735 -24.999 -25.698 -9 ,32036 ,KEBNE ,16838870,Sun Dec 5 21:18:19 CET,Sun Dec 5 22:50:36 CET,0.0 0.675 0.94 1.149 1.305 1.445 1.567 1.665 1.823 1.901 1.967 1.901 2.134 2.192 2.281 2.376 2.478 2.532 2.623 2.682 2.775 2.841 2.9 2.977 3.041 3.11 3.184 3.236 3.286 3.357 3.426 3.472 3.52 3.568 3.619 3.648 3.659 3.673 3.694 3.709 3.649 3.555 3.414 3.275 3.097 2.784 2.347 1.711 0.739 -0.647 -2.851 -5.364 -7.406 -9.103 -10.47 -11.688 -12.709 -13.566 -14.299 -15.022 -15.641 -16.228 -16.778 -17.244 -17.637 -17.985 -18.359 -18.688 -18.976 -19.283 -19.606 -19.863 -20.113 -20.372 -20.578 -20.792 -21.008 -21.22 -21.443 -21.604 -21.769 -22.024 -22.18 -22.333 -22.415 -22.591 -22.788 -22.992 -23.1 -23.408 -23.422 -23.533 -23.641 -23.884 -24.024 -24.166 -24.313 -24.492 -24.729 -25.063 -25.832 -10 ,8612 ,KEBNE ,16838871,Sun Dec 5 21:18:19 CET,Sun Dec 5 22:50:08 CET,0.0 0.473 0.698 0.874 1.009 1.132 1.245 1.345 1.495 1.559 1.626 1.578 1.818 1.881 1.999 2.097 2.19 2.234 2.299 2.353 2.425 2.492 2.57 2.669 2.765 2.843 2.912 2.971 3.022 3.061 3.099 3.151 3.189 3.229 3.28 3.303 3.331 3.362 3.361 3.373 3.353 3.275 3.147 2.984 2.779 2.501 2.097 1.457 0.538 -0.828 -3.122 -5.739 -7.772 -9.419 -10.766 -11.934 -12.919 -13.773 -14.501 -15.237 -15.9 -16.461 -16.959 -17.427 -17.874 -18.272 -18.661 -19.013 -19.309 -19.605 -19.892 -20.119 -20.354 -20.609 -20.822 -21.041 -21.252 -21.47 -21.699 -21.844 -21.988 -22.225 -22.389 -22.556 -22.64 -22.824 -23.011 -23.208 -23.318 -23.621 -23.621 -23.729 -23.843 -24.105 -24.251 -24.415 -24.607 -24.812 -25.068 -25.42 -26.066 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5c.txt deleted file mode 100644 index e02f6a5c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5b_5c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14889 ,TETRA ,17665346,Fri Dec 3 03:50:57 CET,Fri Dec 3 05:52:15 CET,0.0 0.731 1.022 1.262 1.46 1.627 1.767 1.895 2.17 2.306 2.435 2.465 2.767 2.867 3.067 3.263 3.447 3.533 3.713 3.887 4.115 4.254 4.388 4.595 4.808 5.008 5.198 5.391 5.633 5.855 6.098 6.404 6.698 6.995 7.321 7.678 8.019 8.387 8.775 9.219 9.695 10.187 10.76 11.383 12.126 12.934 13.822 14.838 16.069 17.495 19.209 20.57 21.337 21.769 22.002 22.158 22.258 22.291 22.28 22.238 22.178 22.119 22.032 21.938 21.853 21.774 21.664 21.546 21.464 21.385 21.29 21.2 21.116 21.03 20.963 20.893 20.813 20.728 20.623 20.546 20.468 20.339 20.235 20.133 20.081 19.953 19.837 19.718 19.648 19.391 19.403 19.314 19.235 19.086 19.018 18.932 18.812 18.662 18.469 18.243 17.853 -2 ,23222 ,TETRA ,17665347,Fri Dec 3 03:51:57 CET,Fri Dec 3 05:39:11 CET,0.0 0.858 1.163 1.374 1.544 1.717 1.881 2.031 2.303 2.423 2.535 2.55 2.86 2.966 3.166 3.361 3.552 3.647 3.836 4.017 4.266 4.419 4.569 4.792 5.002 5.206 5.405 5.596 5.858 6.108 6.344 6.629 6.892 7.148 7.446 7.792 8.118 8.487 8.927 9.374 9.829 10.368 10.981 11.573 12.303 13.113 14.02 15.038 16.273 17.735 19.399 20.74 21.511 21.946 22.146 22.25 22.299 22.305 22.253 22.191 22.128 22.043 21.953 21.849 21.726 21.614 21.526 21.443 21.365 21.279 21.174 21.075 20.96 20.834 20.732 20.624 20.514 20.395 20.272 20.194 20.11 19.969 19.871 19.772 19.72 19.615 19.507 19.403 19.343 19.085 19.134 19.057 18.971 18.797 18.698 18.581 18.446 18.266 18.066 17.856 17.344 -3 ,2588 ,TETRA ,17665348,Fri Dec 3 03:51:59 CET,Fri Dec 3 05:37:57 CET,0.0 0.838 1.136 1.408 1.622 1.797 1.971 2.133 2.433 2.579 2.713 2.745 3.056 3.165 3.37 3.553 3.725 3.817 4.001 4.17 4.399 4.548 4.703 4.917 5.102 5.285 5.472 5.656 5.912 6.164 6.397 6.685 6.968 7.234 7.53 7.866 8.216 8.605 9.035 9.488 9.954 10.499 11.1 11.681 12.359 13.132 14.038 15.052 16.265 17.705 19.386 20.721 21.444 21.872 22.141 22.286 22.364 22.394 22.389 22.344 22.288 22.243 22.135 22.022 21.945 21.853 21.756 21.669 21.596 21.513 21.411 21.323 21.238 21.139 21.051 20.967 20.88 20.786 20.671 20.585 20.508 20.391 20.299 20.217 20.176 20.07 19.949 19.831 19.777 19.531 19.559 19.48 19.404 19.234 19.124 18.987 18.844 18.712 18.568 18.322 17.936 -4 ,14595 ,TETRA ,17665349,Fri Dec 3 03:55:58 CET,Fri Dec 3 05:44:40 CET,0.0 0.922 1.291 1.531 1.735 1.907 2.048 2.186 2.465 2.596 2.712 2.734 3.038 3.14 3.344 3.536 3.724 3.813 3.973 4.129 4.358 4.497 4.638 4.856 5.075 5.293 5.512 5.72 5.992 6.246 6.479 6.781 7.061 7.322 7.635 7.975 8.292 8.645 9.051 9.486 9.923 10.399 10.985 11.6 12.295 13.062 13.947 14.969 16.198 17.629 19.307 20.629 21.367 21.806 22.064 22.235 22.327 22.345 22.331 22.293 22.23 22.184 22.144 22.073 21.995 21.909 21.784 21.684 21.608 21.528 21.445 21.366 21.272 21.153 21.045 20.954 20.873 20.784 20.696 20.625 20.543 20.415 20.33 20.238 20.187 20.109 20.031 19.92 19.854 19.604 19.647 19.569 19.493 19.313 19.203 19.091 18.966 18.813 18.639 18.43 17.904 -5 ,23393 ,TETRA ,17665350,Fri Dec 3 03:56:59 CET,Fri Dec 3 05:45:31 CET,0.0 1.002 1.364 1.611 1.82 1.992 2.161 2.331 2.616 2.73 2.845 2.878 3.196 3.309 3.513 3.722 3.919 4.008 4.192 4.384 4.654 4.819 4.97 5.179 5.399 5.626 5.84 6.047 6.319 6.573 6.837 7.157 7.425 7.67 7.98 8.323 8.644 9.002 9.387 9.821 10.318 10.861 11.447 12.041 12.772 13.561 14.431 15.432 16.608 17.998 19.63 20.977 21.743 22.177 22.443 22.603 22.671 22.689 22.692 22.682 22.625 22.551 22.479 22.399 22.295 22.188 22.103 22.032 21.961 21.884 21.804 21.735 21.637 21.504 21.416 21.354 21.263 21.147 21.024 20.939 20.86 20.734 20.638 20.538 20.487 20.373 20.26 20.149 20.083 19.818 19.84 19.754 19.673 19.516 19.414 19.294 19.169 19.016 18.823 18.621 18.249 -6 ,20477 ,TETRA ,17665351,Fri Dec 3 03:57:59 CET,Fri Dec 3 05:45:51 CET,0.0 0.706 1.069 1.337 1.554 1.735 1.898 2.038 2.292 2.404 2.518 2.557 2.879 2.982 3.177 3.381 3.584 3.679 3.845 4.017 4.292 4.451 4.601 4.825 5.033 5.243 5.458 5.67 5.919 6.152 6.379 6.673 6.969 7.233 7.542 7.898 8.238 8.613 9.008 9.399 9.807 10.298 10.883 11.467 12.153 12.933 13.837 14.855 16.058 17.501 19.198 20.521 21.273 21.728 22.008 22.163 22.2 22.199 22.198 22.165 22.1 22.033 21.974 21.901 21.799 21.695 21.608 21.514 21.42 21.325 21.203 21.105 21.009 20.919 20.847 20.765 20.693 20.61 20.514 20.443 20.361 20.232 20.15 20.058 20.003 19.906 19.8 19.676 19.608 19.348 19.392 19.317 19.224 19.043 18.957 18.849 18.72 18.577 18.408 18.163 17.393 -7 ,28282 ,TETRA ,17665352,Fri Dec 3 03:58:58 CET,Fri Dec 3 05:46:50 CET,0.0 0.632 0.906 1.171 1.393 1.57 1.744 1.894 2.169 2.3 2.425 2.46 2.778 2.895 3.098 3.284 3.474 3.566 3.741 3.914 4.16 4.32 4.476 4.71 4.946 5.166 5.364 5.543 5.789 6.044 6.282 6.551 6.811 7.086 7.403 7.742 8.062 8.427 8.845 9.278 9.721 10.223 10.818 11.416 12.095 12.847 13.725 14.741 15.943 17.356 19.084 20.473 21.188 21.603 21.826 21.948 22.036 22.049 22.014 21.979 21.949 21.893 21.797 21.709 21.64 21.572 21.472 21.361 21.273 21.193 21.113 21.038 20.936 20.821 20.733 20.636 20.551 20.463 20.371 20.319 20.24 20.089 19.99 19.887 19.835 19.744 19.654 19.549 19.483 19.231 19.29 19.214 19.132 18.971 18.875 18.751 18.618 18.474 18.296 18.067 17.56 -8 ,24818 ,TETRA ,17665353,Fri Dec 3 03:58:59 CET,Fri Dec 3 05:47:54 CET,0.0 0.427 0.715 0.935 1.142 1.336 1.5 1.652 1.912 2.028 2.142 2.163 2.477 2.579 2.778 2.976 3.162 3.258 3.443 3.609 3.85 4.008 4.154 4.361 4.56 4.747 4.928 5.111 5.355 5.626 5.9 6.185 6.46 6.745 7.069 7.408 7.73 8.072 8.459 8.906 9.364 9.858 10.438 11.05 11.8 12.6 13.498 14.527 15.736 17.19 18.905 20.204 20.907 21.329 21.558 21.725 21.816 21.821 21.789 21.744 21.687 21.608 21.525 21.441 21.353 21.254 21.146 21.053 20.952 20.848 20.75 20.665 20.584 20.485 20.4 20.308 20.209 20.111 20.005 19.925 19.844 19.732 19.655 19.583 19.547 19.458 19.346 19.204 19.138 18.886 18.94 18.882 18.818 18.649 18.538 18.413 18.274 18.128 17.985 17.775 17.305 -9 ,12250 ,TETRA ,17665354,Fri Dec 3 04:00:57 CET,Fri Dec 3 05:48:18 CET,0.0 0.601 0.87 1.081 1.279 1.461 1.628 1.787 2.081 2.218 2.338 2.375 2.686 2.785 2.984 3.174 3.358 3.45 3.631 3.795 4.037 4.198 4.356 4.602 4.835 5.055 5.257 5.441 5.678 5.896 6.109 6.379 6.663 6.944 7.267 7.631 7.96 8.314 8.698 9.126 9.599 10.164 10.826 11.435 12.139 12.928 13.854 14.898 16.113 17.591 19.337 20.713 21.459 21.877 22.115 22.241 22.28 22.285 22.258 22.194 22.126 22.052 21.963 21.864 21.761 21.669 21.564 21.437 21.322 21.203 21.084 21.01 20.924 20.802 20.71 20.63 20.542 20.435 20.317 20.242 20.17 20.045 19.961 19.875 19.825 19.722 19.606 19.486 19.426 19.161 19.173 19.095 19.015 18.828 18.73 18.622 18.51 18.365 18.193 17.989 17.651 -10 ,9996 ,TETRA ,17665355,Fri Dec 3 04:06:57 CET,Fri Dec 3 05:55:46 CET,0.0 0.691 0.988 1.226 1.43 1.611 1.771 1.924 2.217 2.354 2.479 2.503 2.817 2.935 3.158 3.368 3.572 3.659 3.811 3.981 4.237 4.393 4.536 4.752 4.986 5.193 5.38 5.56 5.805 6.064 6.305 6.593 6.874 7.136 7.442 7.778 8.098 8.459 8.858 9.276 9.734 10.252 10.828 11.436 12.155 12.933 13.835 14.862 16.101 17.567 19.303 20.679 21.442 21.918 22.203 22.321 22.369 22.399 22.334 22.222 22.135 22.07 22.013 21.942 21.883 21.805 21.689 21.603 21.536 21.438 21.34 21.257 21.16 21.06 20.973 20.891 20.807 20.708 20.595 20.512 20.435 20.324 20.233 20.128 20.075 19.97 19.846 19.7 19.635 19.387 19.424 19.346 19.267 19.103 19.009 18.884 18.749 18.605 18.429 18.148 17.445 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5d_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5d_3b.txt deleted file mode 100644 index a0a842c7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5d_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,3647 ,TETRA ,17665356,Fri Dec 3 04:06:57 CET,Fri Dec 3 05:55:52 CET,0.0 1.027 1.336 1.558 1.765 1.952 2.121 2.298 2.591 2.716 2.836 2.889 3.172 3.282 3.496 3.706 3.896 3.987 4.169 4.351 4.61 4.772 4.934 5.169 5.387 5.599 5.805 5.999 6.256 6.514 6.752 7.03 7.296 7.566 7.904 8.277 8.611 8.995 9.431 9.874 10.322 10.863 11.513 12.17 12.941 13.796 14.787 15.869 17.148 18.729 20.618 22.092 22.907 23.416 23.738 23.928 24.04 24.11 24.153 24.174 24.171 24.157 24.135 24.099 24.065 24.029 23.977 23.927 23.876 23.824 23.772 23.725 23.67 23.608 23.559 23.51 23.461 23.403 23.337 23.297 23.245 23.139 23.068 22.997 22.964 22.904 22.833 22.743 22.693 22.499 22.536 22.484 22.432 22.322 22.258 22.186 22.087 21.964 21.78 21.536 20.89 -2 ,26995 ,TETRA ,17665357,Fri Dec 3 04:12:01 CET,Fri Dec 3 05:58:53 CET,0.0 0.76 1.107 1.354 1.545 1.724 1.9 2.067 2.35 2.471 2.595 2.672 2.954 3.064 3.279 3.477 3.673 3.768 3.947 4.116 4.348 4.505 4.662 4.881 5.103 5.321 5.524 5.717 5.971 6.221 6.468 6.78 7.068 7.338 7.667 8.043 8.417 8.834 9.273 9.75 10.264 10.825 11.463 12.123 12.857 13.677 14.698 15.848 17.148 18.62 20.401 21.85 22.681 23.214 23.569 23.77 23.873 23.938 23.96 23.983 23.999 23.993 23.979 23.959 23.931 23.894 23.835 23.779 23.736 23.691 23.637 23.586 23.529 23.476 23.434 23.378 23.312 23.235 23.168 23.123 23.067 22.981 22.92 22.859 22.828 22.768 22.693 22.6 22.555 22.355 22.379 22.315 22.246 22.085 22.014 21.943 21.841 21.731 21.614 21.42 20.863 -3 ,11128 ,TETRA ,17665358,Fri Dec 3 04:12:00 CET,Fri Dec 3 05:59:05 CET,0.0 0.782 1.134 1.407 1.63 1.821 1.973 2.112 2.392 2.539 2.676 2.727 3.015 3.127 3.329 3.53 3.72 3.809 3.984 4.15 4.4 4.562 4.711 4.937 5.166 5.385 5.596 5.806 6.075 6.324 6.569 6.867 7.148 7.438 7.789 8.164 8.515 8.913 9.358 9.811 10.285 10.819 11.446 12.115 12.877 13.749 14.815 15.926 17.163 18.656 20.486 21.986 22.828 23.372 23.718 23.912 24.025 24.093 24.124 24.135 24.12 24.096 24.079 24.056 24.019 23.986 23.938 23.88 23.834 23.795 23.751 23.704 23.651 23.582 23.525 23.464 23.395 23.322 23.257 23.209 23.145 23.055 22.998 22.934 22.899 22.819 22.73 22.646 22.609 22.424 22.464 22.4 22.339 22.201 22.114 22.006 21.898 21.8 21.674 21.494 20.998 -4 ,381 ,TETRA ,17665359,Fri Dec 3 04:12:03 CET,Fri Dec 3 05:58:47 CET,0.0 0.778 1.147 1.435 1.66 1.848 2.006 2.144 2.42 2.553 2.679 2.74 3.025 3.131 3.343 3.546 3.739 3.835 4.016 4.188 4.442 4.611 4.768 4.99 5.219 5.441 5.65 5.852 6.114 6.368 6.613 6.915 7.216 7.499 7.831 8.214 8.584 8.992 9.438 9.919 10.416 10.989 11.67 12.35 13.123 13.977 14.991 16.156 17.503 19.053 20.848 22.266 23.074 23.582 23.912 24.128 24.263 24.343 24.393 24.42 24.416 24.391 24.362 24.33 24.294 24.248 24.195 24.16 24.114 24.041 23.966 23.909 23.842 23.788 23.744 23.682 23.618 23.544 23.475 23.436 23.389 23.308 23.248 23.19 23.16 23.091 23.024 22.946 22.9 22.709 22.753 22.695 22.628 22.481 22.408 22.326 22.234 22.123 21.943 21.706 21.166 -5 ,23274 ,TETRA ,17665360,Fri Dec 3 04:12:06 CET,Fri Dec 3 05:59:00 CET,0.0 0.803 1.172 1.449 1.666 1.863 2.043 2.218 2.533 2.67 2.794 2.861 3.142 3.254 3.476 3.667 3.843 3.935 4.123 4.293 4.532 4.698 4.857 5.083 5.312 5.53 5.729 5.923 6.175 6.42 6.666 6.972 7.266 7.552 7.899 8.289 8.643 9.041 9.476 9.943 10.462 11.05 11.701 12.322 13.085 13.96 14.891 15.905 17.138 18.634 20.45 21.874 22.648 23.152 23.482 23.689 23.791 23.851 23.894 23.911 23.912 23.894 23.864 23.821 23.766 23.724 23.674 23.622 23.58 23.533 23.477 23.425 23.37 23.304 23.257 23.211 23.157 23.095 23.028 22.983 22.932 22.853 22.794 22.727 22.692 22.624 22.553 22.47 22.426 22.235 22.279 22.219 22.147 22.002 21.922 21.838 21.733 21.601 21.441 21.213 20.722 -6 ,20669 ,TETRA ,17665361,Fri Dec 3 04:12:00 CET,Fri Dec 3 05:59:10 CET,0.0 0.809 1.169 1.446 1.646 1.827 1.991 2.151 2.46 2.6 2.741 2.833 3.126 3.238 3.447 3.647 3.828 3.917 4.101 4.271 4.507 4.663 4.824 5.053 5.283 5.518 5.727 5.924 6.186 6.431 6.67 6.968 7.266 7.559 7.902 8.294 8.668 9.051 9.457 9.924 10.429 11.007 11.686 12.339 13.099 13.98 14.986 16.08 17.344 18.88 20.692 22.145 22.968 23.455 23.78 23.997 24.111 24.183 24.231 24.247 24.255 24.237 24.201 24.164 24.119 24.077 24.034 23.982 23.932 23.874 23.793 23.729 23.664 23.587 23.53 23.465 23.399 23.337 23.26 23.205 23.156 23.071 23.003 22.922 22.883 22.818 22.751 22.676 22.632 22.427 22.441 22.376 22.311 22.154 22.072 21.991 21.891 21.748 21.56 21.332 20.907 -7 ,20499 ,TETRA ,17665362,Fri Dec 3 04:12:01 CET,Fri Dec 3 05:58:49 CET,0.0 0.962 1.272 1.492 1.68 1.839 1.995 2.147 2.444 2.582 2.709 2.785 3.069 3.175 3.383 3.6 3.804 3.895 4.073 4.25 4.502 4.664 4.828 5.057 5.28 5.511 5.732 5.951 6.235 6.501 6.741 7.021 7.309 7.601 7.926 8.278 8.612 8.991 9.423 9.883 10.367 10.924 11.598 12.294 13.101 13.971 14.994 16.184 17.54 19.105 20.976 22.495 23.327 23.806 24.126 24.348 24.486 24.578 24.616 24.619 24.608 24.592 24.568 24.54 24.491 24.426 24.365 24.306 24.245 24.188 24.126 24.071 24.008 23.939 23.892 23.832 23.761 23.694 23.63 23.585 23.534 23.44 23.37 23.298 23.259 23.171 23.085 23.005 22.955 22.761 22.822 22.764 22.701 22.576 22.502 22.423 22.329 22.212 22.086 21.901 21.201 -8 ,25219 ,TETRA ,17665363,Fri Dec 3 04:12:03 CET,Fri Dec 3 05:59:28 CET,0.0 0.724 1.067 1.306 1.512 1.699 1.862 2.02 2.312 2.436 2.557 2.624 2.904 3.01 3.226 3.421 3.604 3.693 3.864 4.037 4.301 4.458 4.608 4.841 5.076 5.304 5.527 5.741 6.022 6.296 6.551 6.849 7.135 7.421 7.756 8.131 8.498 8.91 9.354 9.816 10.29 10.84 11.472 12.118 12.907 13.785 14.78 15.848 17.1 18.607 20.4 21.813 22.602 23.103 23.453 23.665 23.799 23.896 23.928 23.927 23.928 23.913 23.877 23.838 23.792 23.749 23.696 23.645 23.598 23.551 23.51 23.465 23.41 23.341 23.279 23.215 23.151 23.07 22.996 22.957 22.9 22.807 22.752 22.693 22.658 22.577 22.494 22.413 22.365 22.168 22.207 22.141 22.073 21.941 21.862 21.76 21.638 21.5 21.349 21.138 20.69 -9 ,23201 ,TETRA ,17665364,Fri Dec 3 04:12:06 CET,Fri Dec 3 05:59:16 CET,0.0 0.765 1.119 1.401 1.643 1.846 2.015 2.161 2.453 2.591 2.716 2.776 3.051 3.155 3.362 3.562 3.757 3.852 4.037 4.213 4.466 4.635 4.805 5.04 5.258 5.46 5.653 5.854 6.141 6.408 6.643 6.928 7.229 7.529 7.853 8.209 8.578 8.985 9.409 9.879 10.39 10.941 11.573 12.232 12.992 13.821 14.833 16.026 17.374 18.887 20.712 22.204 23.066 23.619 23.958 24.154 24.267 24.338 24.382 24.415 24.425 24.396 24.363 24.337 24.298 24.251 24.183 24.112 24.054 23.991 23.932 23.885 23.834 23.781 23.731 23.67 23.606 23.542 23.475 23.424 23.371 23.295 23.239 23.174 23.135 23.057 22.98 22.897 22.849 22.651 22.685 22.626 22.561 22.416 22.339 22.256 22.165 22.053 21.882 21.615 21.03 -10 ,14634 ,TETRA ,17665365,Fri Dec 3 04:12:01 CET,Fri Dec 3 05:59:00 CET,0.0 0.844 1.18 1.442 1.654 1.842 2.011 2.174 2.479 2.612 2.745 2.821 3.101 3.212 3.419 3.613 3.812 3.911 4.093 4.26 4.51 4.669 4.82 5.043 5.265 5.484 5.694 5.89 6.158 6.426 6.667 6.949 7.242 7.532 7.863 8.226 8.574 8.96 9.396 9.863 10.328 10.871 11.531 12.236 13.07 13.955 14.964 16.102 17.421 18.94 20.763 22.24 23.057 23.54 23.839 24.031 24.135 24.187 24.207 24.213 24.203 24.181 24.155 24.117 24.075 24.036 23.994 23.95 23.906 23.848 23.771 23.703 23.64 23.572 23.518 23.461 23.396 23.333 23.267 23.213 23.162 23.084 23.014 22.938 22.901 22.821 22.726 22.628 22.58 22.384 22.419 22.36 22.295 22.152 22.083 22.003 21.903 21.768 21.594 21.382 20.932 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5a.txt deleted file mode 100644 index e24aa5ef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13063 ,TETRA ,17665366,Fri Dec 3 04:12:00 CET,Fri Dec 3 05:58:12 CET,0.0 0.692 0.893 1.084 1.242 1.36 1.47 1.571 1.723 1.802 1.881 1.853 2.1 2.179 2.338 2.485 2.617 2.68 2.803 2.909 3.053 3.153 3.255 3.398 3.527 3.656 3.795 3.936 4.103 4.243 4.374 4.546 4.71 4.871 5.035 5.199 5.365 5.533 5.709 5.914 6.141 6.39 6.667 6.929 7.188 7.458 7.78 8.096 8.354 8.571 8.615 8.302 7.895 7.468 7.049 6.614 6.215 5.857 5.559 5.264 4.999 4.75 4.516 4.259 4.012 3.794 3.542 3.339 3.166 2.977 2.782 2.604 2.418 2.249 2.118 1.975 1.823 1.66 1.504 1.4 1.29 1.103 0.964 0.821 0.743 0.584 0.426 0.261 0.174 -0.088 -0.083 -0.171 -0.273 -0.497 -0.615 -0.74 -0.908 -1.113 -1.38 -1.726 -2.407 -2 ,16635 ,TETRA ,17665367,Fri Dec 3 04:12:01 CET,Fri Dec 3 05:58:31 CET,0.0 0.742 1.024 1.234 1.377 1.52 1.656 1.773 1.992 2.094 2.191 2.21 2.466 2.544 2.696 2.824 2.944 3.012 3.147 3.266 3.419 3.517 3.62 3.779 3.92 4.051 4.184 4.307 4.45 4.595 4.733 4.884 5.038 5.194 5.366 5.558 5.737 5.925 6.115 6.315 6.558 6.826 7.085 7.289 7.507 7.774 8.062 8.324 8.574 8.77 8.808 8.537 8.078 7.629 7.218 6.801 6.431 6.09 5.801 5.489 5.17 4.894 4.636 4.384 4.136 3.881 3.643 3.439 3.239 3.033 2.847 2.696 2.532 2.383 2.266 2.125 1.969 1.817 1.658 1.541 1.422 1.255 1.148 1.026 0.965 0.847 0.707 0.55 0.46 0.197 0.211 0.107 -0.006 -0.236 -0.368 -0.496 -0.635 -0.803 -1.03 -1.398 -2.473 -3 ,4500 ,TETRA ,17665368,Fri Dec 3 04:12:02 CET,Fri Dec 3 05:58:26 CET,0.0 0.858 1.211 1.403 1.563 1.706 1.835 1.944 2.135 2.237 2.337 2.35 2.607 2.677 2.803 2.921 3.033 3.095 3.22 3.338 3.499 3.595 3.694 3.844 3.991 4.137 4.266 4.387 4.561 4.732 4.897 5.077 5.212 5.336 5.501 5.679 5.837 6.017 6.202 6.4 6.64 6.906 7.191 7.477 7.825 8.193 8.51 8.8 9.063 9.277 9.284 8.948 8.522 8.085 7.66 7.24 6.895 6.58 6.278 5.942 5.653 5.42 5.197 4.978 4.759 4.535 4.311 4.109 3.927 3.743 3.553 3.387 3.231 3.079 2.961 2.844 2.711 2.572 2.426 2.315 2.188 1.995 1.874 1.747 1.677 1.54 1.397 1.243 1.166 0.913 0.914 0.828 0.742 0.529 0.402 0.261 0.107 -0.063 -0.276 -0.563 -1.425 -4 ,15679 ,TETRA ,17665369,Fri Dec 3 04:12:01 CET,Fri Dec 3 05:58:16 CET,0.0 0.592 0.841 1.011 1.163 1.313 1.454 1.577 1.787 1.891 1.995 1.996 2.254 2.338 2.502 2.648 2.772 2.833 2.948 3.06 3.224 3.325 3.413 3.548 3.691 3.814 3.924 4.041 4.187 4.319 4.453 4.606 4.745 4.887 5.061 5.289 5.503 5.689 5.882 6.087 6.287 6.5 6.751 7.016 7.309 7.623 7.949 8.236 8.505 8.733 8.765 8.433 8.023 7.592 7.132 6.692 6.31 5.978 5.675 5.34 5.062 4.799 4.535 4.3 4.082 3.853 3.606 3.397 3.212 3.026 2.842 2.681 2.519 2.363 2.246 2.116 1.968 1.808 1.634 1.518 1.409 1.232 1.107 0.971 0.901 0.749 0.587 0.439 0.365 0.113 0.122 0.029 -0.079 -0.334 -0.462 -0.591 -0.739 -0.91 -1.113 -1.356 -2.017 -5 ,3287 ,TETRA ,17665370,Fri Dec 3 04:12:02 CET,Fri Dec 3 05:58:24 CET,0.0 0.586 0.873 1.088 1.248 1.383 1.5 1.622 1.827 1.908 1.995 2.001 2.255 2.343 2.507 2.649 2.769 2.818 2.924 3.041 3.209 3.307 3.396 3.53 3.657 3.762 3.86 3.977 4.145 4.302 4.453 4.646 4.824 4.975 5.15 5.338 5.518 5.719 5.922 6.134 6.35 6.6 6.862 7.106 7.407 7.739 8.041 8.364 8.694 8.896 8.929 8.662 8.274 7.836 7.417 7.031 6.67 6.334 6.021 5.691 5.408 5.161 4.897 4.632 4.405 4.214 4.007 3.792 3.603 3.431 3.248 3.087 2.92 2.757 2.626 2.491 2.343 2.188 2.042 1.927 1.809 1.644 1.524 1.385 1.313 1.165 1.015 0.852 0.772 0.516 0.516 0.42 0.311 0.087 -0.033 -0.163 -0.306 -0.476 -0.699 -0.964 -1.414 -6 ,30885 ,TETRA ,17665371,Fri Dec 3 04:12:04 CET,Fri Dec 3 05:58:18 CET,0.0 0.625 0.9 1.093 1.266 1.406 1.543 1.664 1.876 1.978 2.068 2.061 2.312 2.398 2.558 2.702 2.824 2.882 3.011 3.147 3.314 3.398 3.483 3.627 3.771 3.892 4.004 4.122 4.273 4.401 4.521 4.685 4.858 5.032 5.241 5.452 5.65 5.854 6.034 6.25 6.522 6.798 7.056 7.314 7.602 7.866 8.138 8.432 8.734 8.962 8.955 8.672 8.298 7.845 7.416 7.001 6.63 6.284 5.974 5.646 5.358 5.105 4.848 4.609 4.391 4.167 3.92 3.726 3.559 3.396 3.238 3.09 2.93 2.766 2.644 2.505 2.338 2.178 2.037 1.934 1.825 1.655 1.525 1.393 1.324 1.179 1.032 0.876 0.794 0.531 0.526 0.425 0.313 0.095 -0.026 -0.182 -0.35 -0.53 -0.796 -1.181 -2.098 -7 ,11187 ,TETRA ,17665372,Fri Dec 3 04:12:06 CET,Fri Dec 3 05:58:21 CET,0.0 0.797 1.089 1.284 1.459 1.632 1.767 1.872 2.03 2.106 2.195 2.188 2.445 2.527 2.68 2.832 2.984 3.054 3.169 3.276 3.415 3.508 3.617 3.779 3.922 4.056 4.18 4.293 4.447 4.596 4.741 4.922 5.084 5.247 5.436 5.618 5.792 5.98 6.16 6.38 6.621 6.874 7.168 7.422 7.681 7.945 8.244 8.53 8.758 8.942 8.968 8.691 8.301 7.916 7.517 7.097 6.728 6.4 6.096 5.77 5.477 5.201 4.943 4.701 4.466 4.27 4.067 3.869 3.698 3.52 3.326 3.148 2.965 2.798 2.672 2.531 2.38 2.219 2.046 1.929 1.811 1.639 1.517 1.378 1.306 1.146 0.979 0.818 0.735 0.467 0.458 0.365 0.267 0.066 -0.055 -0.203 -0.356 -0.522 -0.732 -0.984 -1.805 -8 ,23777 ,TETRA ,17665373,Fri Dec 3 04:12:01 CET,Fri Dec 3 05:58:36 CET,0.0 0.628 0.879 1.04 1.176 1.3 1.43 1.543 1.761 1.866 1.959 1.971 2.226 2.305 2.451 2.582 2.714 2.777 2.895 3.005 3.158 3.254 3.343 3.485 3.633 3.774 3.901 4.027 4.194 4.339 4.468 4.619 4.765 4.909 5.082 5.29 5.465 5.625 5.802 6.005 6.234 6.49 6.763 7.011 7.296 7.594 7.898 8.187 8.465 8.654 8.591 8.289 7.879 7.45 7.048 6.635 6.261 5.904 5.574 5.25 4.97 4.707 4.458 4.237 4.051 3.875 3.637 3.421 3.258 3.1 2.922 2.768 2.6 2.405 2.265 2.134 1.998 1.868 1.719 1.598 1.479 1.291 1.152 1.021 0.953 0.806 0.661 0.503 0.419 0.167 0.186 0.095 -0.014 -0.248 -0.372 -0.512 -0.663 -0.833 -1.009 -1.255 -1.939 -9 ,30490 ,TETRA ,17665374,Fri Dec 3 04:12:03 CET,Fri Dec 3 05:58:43 CET,0.0 0.73 1.008 1.213 1.395 1.534 1.645 1.755 1.964 2.069 2.172 2.164 2.412 2.489 2.638 2.777 2.899 2.963 3.083 3.191 3.358 3.463 3.558 3.703 3.854 3.985 4.114 4.243 4.391 4.529 4.674 4.854 5.022 5.17 5.328 5.507 5.694 5.901 6.103 6.309 6.505 6.702 6.938 7.176 7.444 7.719 8.022 8.335 8.627 8.865 8.952 8.709 8.333 7.905 7.455 6.994 6.599 6.241 5.922 5.608 5.333 5.086 4.827 4.591 4.371 4.151 3.921 3.726 3.562 3.385 3.211 3.068 2.914 2.741 2.602 2.463 2.32 2.16 1.987 1.866 1.748 1.585 1.462 1.338 1.275 1.138 0.986 0.815 0.724 0.454 0.438 0.335 0.225 -0.015 -0.142 -0.28 -0.444 -0.633 -0.849 -1.109 -1.694 -10 ,18366 ,TETRA ,17665375,Fri Dec 3 04:12:04 CET,Fri Dec 3 05:58:47 CET,0.0 0.557 0.81 0.988 1.114 1.242 1.364 1.475 1.678 1.771 1.86 1.853 2.097 2.176 2.336 2.485 2.623 2.689 2.816 2.938 3.11 3.214 3.309 3.446 3.579 3.701 3.808 3.931 4.084 4.235 4.39 4.549 4.703 4.848 5.025 5.245 5.426 5.617 5.856 6.083 6.276 6.489 6.723 6.936 7.17 7.447 7.757 8.04 8.325 8.554 8.617 8.338 7.915 7.484 7.013 6.567 6.204 5.861 5.551 5.244 4.959 4.685 4.445 4.228 4.03 3.85 3.66 3.472 3.287 3.096 2.88 2.695 2.52 2.353 2.236 2.111 1.959 1.803 1.64 1.517 1.389 1.194 1.071 0.948 0.882 0.737 0.58 0.418 0.33 0.061 0.048 -0.054 -0.158 -0.398 -0.545 -0.702 -0.852 -1.019 -1.209 -1.434 -2.188 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5e.txt deleted file mode 100644 index 8a7fd34c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5d_5e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15434 ,TETRA ,17665376,Fri Dec 3 04:12:07 CET,Fri Dec 3 05:58:27 CET,0.0 0.682 0.936 1.122 1.277 1.403 1.538 1.666 1.86 1.959 2.059 2.076 2.341 2.418 2.564 2.704 2.841 2.911 3.034 3.15 3.313 3.407 3.501 3.654 3.795 3.917 4.034 4.148 4.282 4.416 4.56 4.726 4.877 5.019 5.172 5.332 5.477 5.629 5.795 5.957 6.109 6.288 6.488 6.689 6.903 7.098 7.293 7.447 7.572 7.566 7.214 6.533 5.857 5.271 4.751 4.264 3.828 3.446 3.122 2.783 2.469 2.185 1.924 1.671 1.437 1.208 0.965 0.745 0.557 0.358 0.129 -0.053 -0.217 -0.377 -0.507 -0.636 -0.776 -0.927 -1.075 -1.181 -1.298 -1.475 -1.599 -1.721 -1.783 -1.925 -2.078 -2.251 -2.342 -2.608 -2.629 -2.736 -2.843 -3.074 -3.192 -3.305 -3.43 -3.597 -3.822 -4.053 -4.533 -2 ,22265 ,TETRA ,17665377,Fri Dec 3 04:12:01 CET,Fri Dec 3 05:59:32 CET,0.0 0.586 0.858 1.067 1.226 1.363 1.495 1.614 1.815 1.906 1.998 1.999 2.244 2.313 2.456 2.597 2.733 2.794 2.912 3.019 3.163 3.26 3.357 3.49 3.607 3.73 3.867 3.991 4.118 4.236 4.369 4.54 4.673 4.784 4.94 5.119 5.279 5.436 5.589 5.768 5.959 6.165 6.377 6.592 6.819 7.025 7.222 7.352 7.439 7.458 7.195 6.521 5.831 5.235 4.741 4.275 3.837 3.456 3.12 2.769 2.468 2.207 1.96 1.688 1.414 1.197 0.997 0.82 0.664 0.499 0.318 0.154 -0.008 -0.163 -0.286 -0.425 -0.577 -0.739 -0.914 -1.035 -1.149 -1.319 -1.454 -1.601 -1.674 -1.831 -1.99 -2.163 -2.256 -2.521 -2.509 -2.592 -2.683 -2.896 -3.01 -3.13 -3.282 -3.463 -3.654 -3.879 -4.375 -3 ,13921 ,TETRA ,17665378,Fri Dec 3 04:12:03 CET,Fri Dec 3 05:59:35 CET,0.0 0.765 1.02 1.205 1.358 1.498 1.619 1.725 1.944 2.04 2.119 2.1 2.348 2.426 2.582 2.726 2.864 2.938 3.069 3.183 3.344 3.445 3.54 3.664 3.774 3.887 4.004 4.119 4.282 4.437 4.565 4.711 4.858 5.001 5.165 5.322 5.463 5.615 5.779 5.953 6.125 6.308 6.516 6.703 6.894 7.074 7.224 7.347 7.435 7.424 7.106 6.496 5.859 5.246 4.677 4.14 3.69 3.279 2.89 2.516 2.223 1.927 1.626 1.369 1.126 0.901 0.651 0.428 0.251 0.048 -0.175 -0.354 -0.53 -0.71 -0.845 -0.984 -1.13 -1.277 -1.439 -1.561 -1.678 -1.849 -1.972 -2.092 -2.153 -2.287 -2.444 -2.605 -2.684 -2.941 -2.93 -3.028 -3.127 -3.34 -3.455 -3.572 -3.706 -3.859 -4.034 -4.275 -4.729 -4 ,9138 ,TETRA ,17665379,Fri Dec 3 04:12:05 CET,Fri Dec 3 05:59:03 CET,0.0 0.384 0.597 0.8 0.979 1.109 1.215 1.311 1.491 1.585 1.683 1.685 1.932 2.0 2.144 2.29 2.417 2.477 2.593 2.696 2.847 2.942 3.036 3.181 3.312 3.438 3.56 3.673 3.823 3.96 4.088 4.23 4.352 4.468 4.586 4.733 4.886 5.035 5.187 5.37 5.56 5.724 5.877 6.053 6.265 6.443 6.591 6.72 6.803 6.81 6.561 5.947 5.306 4.686 4.17 3.693 3.243 2.848 2.492 2.109 1.777 1.495 1.236 0.98 0.74 0.548 0.351 0.152 -0.034 -0.212 -0.398 -0.558 -0.725 -0.919 -1.064 -1.199 -1.337 -1.486 -1.64 -1.744 -1.856 -2.033 -2.158 -2.283 -2.353 -2.508 -2.663 -2.81 -2.875 -3.133 -3.141 -3.238 -3.345 -3.579 -3.703 -3.83 -3.979 -4.171 -4.371 -4.629 -5.056 -5 ,26029 ,TETRA ,17665380,Fri Dec 3 04:12:07 CET,Fri Dec 3 05:58:32 CET,0.0 0.57 0.813 0.979 1.14 1.304 1.456 1.578 1.787 1.888 1.988 2.004 2.259 2.335 2.483 2.623 2.752 2.809 2.925 3.042 3.187 3.282 3.388 3.535 3.659 3.771 3.876 3.981 4.137 4.283 4.419 4.596 4.742 4.867 5.002 5.151 5.309 5.477 5.645 5.825 5.994 6.193 6.42 6.601 6.784 6.969 7.122 7.278 7.449 7.416 7.086 6.44 5.773 5.203 4.682 4.131 3.662 3.276 2.927 2.575 2.272 1.962 1.648 1.391 1.179 0.984 0.761 0.541 0.355 0.167 -0.035 -0.199 -0.36 -0.522 -0.649 -0.778 -0.917 -1.078 -1.258 -1.373 -1.486 -1.669 -1.793 -1.928 -2.001 -2.142 -2.291 -2.454 -2.54 -2.8 -2.788 -2.884 -2.983 -3.184 -3.301 -3.421 -3.547 -3.688 -3.863 -4.112 -4.571 -6 ,25891 ,TETRA ,17665381,Fri Dec 3 04:12:01 CET,Fri Dec 3 05:58:44 CET,0.0 0.649 0.89 1.065 1.207 1.344 1.466 1.57 1.769 1.865 1.961 1.975 2.233 2.314 2.472 2.617 2.748 2.813 2.933 3.043 3.198 3.291 3.381 3.507 3.629 3.739 3.847 3.969 4.123 4.241 4.359 4.515 4.657 4.787 4.934 5.096 5.266 5.448 5.627 5.789 5.949 6.151 6.4 6.607 6.82 7.044 7.242 7.406 7.495 7.476 7.171 6.514 5.872 5.271 4.757 4.303 3.885 3.482 3.115 2.757 2.461 2.176 1.862 1.58 1.323 1.081 0.854 0.646 0.463 0.272 0.054 -0.124 -0.295 -0.476 -0.627 -0.778 -0.916 -1.071 -1.24 -1.353 -1.471 -1.638 -1.758 -1.894 -1.963 -2.106 -2.262 -2.419 -2.5 -2.764 -2.751 -2.841 -2.938 -3.149 -3.252 -3.363 -3.501 -3.668 -3.867 -4.128 -4.65 -7 ,6069 ,TETRA ,17665382,Fri Dec 3 04:12:02 CET,Fri Dec 3 05:58:39 CET,0.0 0.454 0.729 0.92 1.067 1.212 1.361 1.498 1.715 1.814 1.911 1.924 2.176 2.249 2.385 2.507 2.624 2.682 2.801 2.915 3.061 3.155 3.252 3.391 3.525 3.651 3.777 3.898 4.051 4.198 4.337 4.5 4.665 4.832 5.02 5.226 5.39 5.564 5.775 5.975 6.168 6.363 6.569 6.749 6.947 7.152 7.324 7.465 7.542 7.48 7.148 6.492 5.833 5.283 4.822 4.374 3.92 3.505 3.163 2.804 2.476 2.188 1.915 1.625 1.373 1.166 0.933 0.715 0.546 0.382 0.198 0.052 -0.108 -0.275 -0.401 -0.542 -0.698 -0.863 -1.035 -1.15 -1.264 -1.455 -1.585 -1.719 -1.796 -1.954 -2.107 -2.251 -2.33 -2.598 -2.609 -2.706 -2.81 -3.044 -3.175 -3.327 -3.497 -3.671 -3.846 -4.05 -4.485 -8 ,13515 ,TETRA ,17665383,Fri Dec 3 04:12:03 CET,Fri Dec 3 05:58:29 CET,0.0 0.439 0.639 0.854 1.051 1.211 1.341 1.462 1.677 1.768 1.866 1.897 2.154 2.236 2.399 2.558 2.705 2.764 2.883 2.994 3.147 3.254 3.358 3.504 3.634 3.747 3.861 3.976 4.121 4.267 4.415 4.587 4.724 4.854 5.013 5.169 5.303 5.442 5.605 5.791 5.986 6.209 6.447 6.622 6.815 7.016 7.166 7.289 7.347 7.302 7.04 6.41 5.749 5.135 4.566 4.07 3.641 3.194 2.8 2.44 2.116 1.834 1.562 1.303 1.063 0.844 0.627 0.409 0.217 0.023 -0.177 -0.339 -0.501 -0.665 -0.804 -0.957 -1.104 -1.242 -1.395 -1.507 -1.625 -1.802 -1.928 -2.056 -2.124 -2.268 -2.424 -2.588 -2.67 -2.936 -2.932 -3.029 -3.133 -3.365 -3.495 -3.62 -3.751 -3.908 -4.09 -4.274 -4.802 -9 ,4974 ,TETRA ,17665384,Fri Dec 3 04:12:05 CET,Fri Dec 3 05:58:37 CET,0.0 0.553 0.808 0.989 1.144 1.291 1.4 1.521 1.758 1.853 1.94 1.92 2.167 2.237 2.382 2.539 2.675 2.733 2.835 2.94 3.115 3.229 3.338 3.49 3.638 3.781 3.915 4.052 4.201 4.339 4.475 4.629 4.777 4.905 5.047 5.24 5.437 5.634 5.814 5.978 6.125 6.278 6.46 6.616 6.784 6.958 7.114 7.275 7.371 7.35 7.036 6.391 5.756 5.179 4.659 4.169 3.724 3.303 2.909 2.511 2.187 1.907 1.636 1.377 1.14 0.937 0.719 0.513 0.338 0.136 -0.057 -0.197 -0.352 -0.528 -0.662 -0.795 -0.933 -1.081 -1.263 -1.393 -1.514 -1.675 -1.782 -1.905 -1.971 -2.096 -2.23 -2.38 -2.459 -2.72 -2.717 -2.823 -2.924 -3.119 -3.239 -3.377 -3.531 -3.685 -3.867 -4.108 -4.725 -10 ,20132 ,TETRA ,17665385,Fri Dec 3 04:12:36 CET,Fri Dec 3 06:00:07 CET,0.0 0.696 1.012 1.203 1.377 1.519 1.643 1.758 1.955 2.048 2.136 2.121 2.365 2.433 2.555 2.677 2.798 2.857 2.973 3.083 3.241 3.332 3.416 3.554 3.693 3.806 3.912 4.019 4.148 4.287 4.436 4.619 4.782 4.929 5.094 5.268 5.443 5.633 5.8 5.966 6.141 6.33 6.529 6.717 6.928 7.115 7.296 7.477 7.572 7.5 7.173 6.586 5.966 5.351 4.802 4.317 3.872 3.471 3.128 2.755 2.422 2.104 1.807 1.547 1.291 1.044 0.801 0.596 0.407 0.226 0.034 -0.154 -0.344 -0.519 -0.65 -0.798 -0.951 -1.115 -1.299 -1.414 -1.525 -1.691 -1.806 -1.932 -1.996 -2.134 -2.297 -2.476 -2.566 -2.837 -2.855 -2.949 -3.048 -3.262 -3.394 -3.552 -3.712 -3.886 -4.086 -4.335 -4.794 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5d_7.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5d_7.txt deleted file mode 100644 index 3065e0e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5d_7.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22030 ,TETRA ,17665386,Fri Dec 3 04:12:02 CET,Fri Dec 3 05:58:19 CET,0.0 0.78 1.078 1.301 1.475 1.647 1.819 1.967 2.25 2.389 2.518 2.583 2.858 2.973 3.192 3.372 3.555 3.651 3.836 3.999 4.222 4.376 4.547 4.789 5.003 5.206 5.407 5.606 5.892 6.176 6.426 6.726 7.027 7.321 7.646 8.023 8.384 8.788 9.263 9.756 10.26 10.852 11.556 12.277 13.127 14.091 15.257 16.624 18.271 20.237 22.721 24.797 26.068 26.929 27.504 27.918 28.222 28.451 28.607 28.698 28.747 28.772 28.794 28.785 28.752 28.732 28.717 28.675 28.612 28.55 28.481 28.43 28.379 28.315 28.262 28.188 28.097 28.019 27.942 27.894 27.834 27.719 27.652 27.585 27.539 27.434 27.332 27.232 27.177 26.975 26.984 26.914 26.851 26.692 26.61 26.516 26.387 26.238 26.044 25.748 25.007 -2 ,8341 ,TETRA ,17665387,Fri Dec 3 04:12:03 CET,Fri Dec 3 05:58:21 CET,0.0 0.732 0.999 1.198 1.373 1.533 1.676 1.815 2.08 2.204 2.329 2.364 2.639 2.753 2.974 3.174 3.35 3.432 3.591 3.742 3.979 4.146 4.3 4.512 4.719 4.933 5.159 5.368 5.621 5.863 6.112 6.422 6.71 6.989 7.301 7.658 8.02 8.436 8.918 9.418 9.935 10.531 11.242 11.979 12.832 13.795 14.974 16.356 17.995 20.008 22.54 24.698 26.061 26.946 27.537 27.968 28.257 28.452 28.569 28.664 28.723 28.739 28.763 28.784 28.761 28.729 28.69 28.639 28.587 28.527 28.458 28.398 28.34 28.262 28.18 28.101 28.034 27.961 27.899 27.851 27.788 27.702 27.633 27.55 27.506 27.408 27.295 27.185 27.133 26.932 26.94 26.869 26.796 26.623 26.519 26.39 26.246 26.076 25.854 25.539 24.782 -3 ,29045 ,TETRA ,17665388,Fri Dec 3 04:12:36 CET,Fri Dec 3 05:59:54 CET,0.0 0.685 0.953 1.159 1.351 1.522 1.66 1.8 2.076 2.195 2.312 2.366 2.643 2.745 2.949 3.157 3.343 3.426 3.589 3.754 4.019 4.202 4.372 4.609 4.839 5.051 5.254 5.457 5.726 5.975 6.21 6.521 6.819 7.093 7.409 7.795 8.194 8.629 9.083 9.545 10.04 10.624 11.334 12.053 12.895 13.871 15.042 16.393 18.023 20.03 22.563 24.716 26.059 26.996 27.607 28.029 28.319 28.519 28.646 28.717 28.765 28.802 28.794 28.758 28.73 28.708 28.654 28.587 28.517 28.436 28.371 28.322 28.27 28.223 28.177 28.105 28.022 27.935 27.834 27.771 27.718 27.632 27.564 27.484 27.445 27.367 27.268 27.156 27.099 26.895 26.927 26.851 26.76 26.59 26.5 26.395 26.294 26.171 25.992 25.692 24.819 -4 ,5755 ,TETRA ,17665389,Fri Dec 3 04:12:39 CET,Fri Dec 3 05:59:22 CET,0.0 0.766 1.069 1.265 1.452 1.621 1.756 1.891 2.155 2.281 2.406 2.471 2.749 2.849 3.046 3.239 3.413 3.503 3.684 3.85 4.101 4.273 4.438 4.654 4.872 5.101 5.304 5.493 5.752 6.012 6.281 6.616 6.905 7.188 7.539 7.921 8.273 8.644 9.05 9.523 10.038 10.641 11.338 12.028 12.882 13.885 15.072 16.399 18.014 20.016 22.533 24.691 26.009 26.884 27.499 27.968 28.274 28.461 28.581 28.659 28.699 28.74 28.738 28.694 28.657 28.629 28.606 28.582 28.537 28.478 28.427 28.39 28.348 28.284 28.226 28.168 28.102 28.022 27.938 27.88 27.827 27.722 27.629 27.538 27.489 27.391 27.29 27.168 27.106 26.897 26.9 26.829 26.759 26.601 26.514 26.399 26.264 26.102 25.899 25.604 24.672 -5 ,28061 ,TETRA ,17665390,Fri Dec 3 04:12:40 CET,Fri Dec 3 05:58:51 CET,0.0 0.752 1.07 1.357 1.564 1.713 1.873 2.019 2.266 2.389 2.507 2.556 2.838 2.944 3.149 3.347 3.526 3.61 3.772 3.927 4.161 4.313 4.469 4.711 4.93 5.141 5.351 5.543 5.795 6.045 6.295 6.615 6.915 7.208 7.583 7.993 8.358 8.755 9.19 9.67 10.186 10.787 11.512 12.233 13.058 14.003 15.121 16.409 18.002 19.959 22.455 24.579 25.819 26.68 27.285 27.728 28.046 28.239 28.345 28.438 28.512 28.566 28.553 28.534 28.536 28.506 28.43 28.369 28.33 28.285 28.221 28.151 28.084 28.015 27.96 27.899 27.833 27.759 27.661 27.599 27.53 27.413 27.336 27.26 27.223 27.13 27.028 26.919 26.858 26.65 26.663 26.59 26.511 26.323 26.218 26.118 26.011 25.878 25.687 25.421 24.553 -6 ,15769 ,TETRA ,17665391,Fri Dec 3 04:12:39 CET,Fri Dec 3 05:58:57 CET,0.0 0.898 1.22 1.444 1.624 1.787 1.933 2.079 2.351 2.478 2.6 2.659 2.943 3.056 3.283 3.5 3.713 3.813 3.992 4.161 4.414 4.571 4.72 4.941 5.146 5.34 5.536 5.737 6.001 6.251 6.489 6.783 7.085 7.377 7.717 8.1 8.474 8.882 9.308 9.795 10.332 10.913 11.606 12.311 13.136 14.102 15.234 16.55 18.166 20.165 22.719 24.965 26.327 27.19 27.767 28.204 28.512 28.721 28.874 28.983 29.063 29.094 29.069 29.062 29.022 28.97 28.938 28.87 28.807 28.743 28.642 28.574 28.514 28.459 28.419 28.371 28.324 28.264 28.172 28.101 28.031 27.923 27.843 27.761 27.721 27.623 27.516 27.394 27.327 27.121 27.147 27.082 27.016 26.844 26.741 26.629 26.49 26.347 26.168 25.943 25.284 -7 ,13537 ,TETRA ,17665392,Fri Dec 3 04:12:37 CET,Fri Dec 3 05:58:34 CET,0.0 0.607 0.881 1.107 1.3 1.469 1.631 1.757 2.0 2.124 2.23 2.259 2.537 2.645 2.86 3.062 3.247 3.333 3.516 3.694 3.942 4.108 4.261 4.478 4.691 4.898 5.108 5.315 5.585 5.839 6.078 6.377 6.673 6.965 7.327 7.725 8.098 8.534 8.999 9.467 9.978 10.555 11.247 11.976 12.818 13.779 14.961 16.38 18.05 20.026 22.505 24.625 25.877 26.691 27.266 27.672 27.96 28.167 28.304 28.4 28.446 28.465 28.485 28.466 28.441 28.423 28.392 28.357 28.307 28.232 28.157 28.1 28.041 27.971 27.911 27.846 27.777 27.708 27.62 27.555 27.486 27.377 27.315 27.241 27.191 27.087 26.974 26.857 26.798 26.592 26.596 26.525 26.458 26.305 26.224 26.119 25.983 25.839 25.639 25.385 24.762 -8 ,17866 ,TETRA ,17665393,Fri Dec 3 04:12:40 CET,Fri Dec 3 05:59:17 CET,0.0 0.809 1.138 1.351 1.544 1.72 1.87 2.014 2.307 2.439 2.551 2.579 2.856 2.97 3.178 3.374 3.567 3.655 3.818 3.97 4.205 4.371 4.521 4.735 4.959 5.179 5.398 5.603 5.852 6.102 6.354 6.657 6.961 7.254 7.588 7.965 8.322 8.718 9.143 9.607 10.137 10.76 11.475 12.184 13.062 14.084 15.27 16.609 18.221 20.248 22.826 25.072 26.436 27.335 27.905 28.282 28.548 28.753 28.886 28.976 29.033 29.069 29.096 29.095 29.061 29.016 28.965 28.917 28.873 28.82 28.762 28.716 28.672 28.62 28.559 28.48 28.407 28.335 28.244 28.181 28.117 27.988 27.906 27.843 27.808 27.723 27.627 27.518 27.451 27.232 27.253 27.183 27.103 26.935 26.837 26.736 26.619 26.479 26.321 26.076 25.449 -9 ,1342 ,TETRA ,17665394,Fri Dec 3 04:12:43 CET,Fri Dec 3 05:59:00 CET,0.0 0.685 0.962 1.172 1.367 1.528 1.664 1.803 2.072 2.195 2.309 2.369 2.658 2.77 2.975 3.157 3.327 3.42 3.606 3.786 4.034 4.182 4.327 4.546 4.758 4.966 5.168 5.374 5.646 5.901 6.167 6.483 6.77 7.056 7.389 7.748 8.104 8.512 8.943 9.4 9.92 10.52 11.214 11.929 12.766 13.741 14.928 16.276 17.895 19.978 22.643 24.858 26.198 27.077 27.675 28.056 28.32 28.544 28.693 28.811 28.859 28.878 28.898 28.91 28.911 28.875 28.822 28.775 28.705 28.633 28.557 28.476 28.398 28.324 28.269 28.203 28.124 28.04 27.935 27.854 27.784 27.702 27.64 27.564 27.513 27.41 27.325 27.239 27.195 26.998 27.026 26.961 26.883 26.678 26.569 26.449 26.301 26.133 25.964 25.725 24.84 -10 ,1587 ,TETRA ,17665395,Fri Dec 3 04:12:37 CET,Fri Dec 3 05:59:03 CET,0.0 0.905 1.228 1.477 1.655 1.8 1.958 2.102 2.344 2.453 2.552 2.566 2.846 2.961 3.169 3.355 3.542 3.641 3.838 4.021 4.266 4.431 4.593 4.829 5.049 5.264 5.491 5.708 5.978 6.234 6.487 6.795 7.093 7.382 7.708 8.09 8.465 8.866 9.332 9.833 10.33 10.903 11.597 12.328 13.224 14.227 15.395 16.715 18.299 20.288 22.865 24.989 26.252 27.105 27.663 28.036 28.303 28.509 28.66 28.774 28.835 28.889 28.886 28.85 28.814 28.742 28.671 28.626 28.562 28.48 28.391 28.31 28.227 28.145 28.083 28.017 27.947 27.89 27.825 27.776 27.72 27.613 27.534 27.453 27.407 27.307 27.218 27.12 27.062 26.858 26.873 26.798 26.715 26.568 26.489 26.374 26.253 26.135 25.986 25.809 25.237 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5e_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5e_5a.txt deleted file mode 100644 index e5010f51..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5e_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8517 ,TETRA ,17665396,Fri Dec 3 04:12:40 CET,Fri Dec 3 05:58:48 CET,0.0 0.715 0.969 1.14 1.289 1.416 1.547 1.677 1.901 2.002 2.088 2.06 2.317 2.403 2.573 2.728 2.866 2.936 3.07 3.186 3.365 3.481 3.593 3.758 3.924 4.076 4.221 4.362 4.533 4.699 4.848 5.039 5.248 5.44 5.649 5.886 6.102 6.324 6.561 6.818 7.092 7.4 7.743 8.07 8.448 8.836 9.262 9.744 10.296 10.845 11.323 11.501 11.428 11.239 10.989 10.719 10.443 10.178 9.944 9.707 9.507 9.306 9.099 8.907 8.712 8.528 8.347 8.191 8.059 7.906 7.743 7.609 7.465 7.309 7.182 7.039 6.88 6.727 6.565 6.459 6.359 6.188 6.071 5.939 5.869 5.741 5.583 5.415 5.334 5.069 5.064 4.959 4.844 4.598 4.477 4.351 4.195 4.013 3.761 3.417 2.649 -2 ,25085 ,TETRA ,17665397,Fri Dec 3 04:13:35 CET,Fri Dec 3 06:00:28 CET,0.0 0.432 0.693 0.911 1.103 1.252 1.375 1.493 1.718 1.827 1.925 1.919 2.177 2.257 2.408 2.554 2.668 2.726 2.874 3.015 3.2 3.324 3.43 3.573 3.717 3.852 3.981 4.113 4.296 4.453 4.594 4.778 4.965 5.147 5.36 5.6 5.833 6.084 6.334 6.592 6.845 7.132 7.478 7.805 8.19 8.6 9.053 9.586 10.159 10.746 11.338 11.539 11.444 11.274 11.053 10.794 10.513 10.243 10.008 9.765 9.531 9.318 9.116 8.908 8.719 8.547 8.364 8.177 8.01 7.836 7.657 7.52 7.375 7.222 7.097 6.949 6.775 6.606 6.458 6.358 6.251 6.081 5.962 5.832 5.759 5.61 5.458 5.27 5.177 4.916 4.892 4.788 4.68 4.425 4.301 4.165 3.996 3.815 3.579 3.227 2.296 -3 ,9372 ,TETRA ,17665398,Fri Dec 3 04:13:37 CET,Fri Dec 3 06:01:07 CET,0.0 0.686 0.969 1.188 1.363 1.516 1.65 1.77 1.998 2.104 2.191 2.197 2.476 2.558 2.693 2.826 2.954 3.019 3.142 3.268 3.459 3.559 3.656 3.811 3.968 4.122 4.25 4.367 4.545 4.737 4.918 5.13 5.324 5.498 5.695 5.931 6.149 6.366 6.595 6.852 7.106 7.383 7.713 8.034 8.428 8.876 9.348 9.841 10.364 10.928 11.458 11.619 11.553 11.367 11.133 10.891 10.642 10.4 10.148 9.859 9.621 9.405 9.192 8.987 8.782 8.595 8.403 8.247 8.11 7.955 7.784 7.64 7.495 7.338 7.216 7.1 6.96 6.801 6.657 6.568 6.472 6.312 6.19 6.056 5.99 5.849 5.691 5.537 5.461 5.201 5.181 5.08 4.974 4.713 4.56 4.382 4.181 3.983 3.775 3.442 2.639 -4 ,29225 ,TETRA ,17665399,Fri Dec 3 04:13:38 CET,Fri Dec 3 05:59:36 CET,0.0 0.723 0.969 1.15 1.297 1.453 1.601 1.71 1.896 1.99 2.085 2.096 2.363 2.447 2.6 2.743 2.875 2.936 3.058 3.18 3.354 3.461 3.564 3.72 3.869 4.005 4.133 4.26 4.429 4.597 4.757 4.938 5.125 5.307 5.497 5.714 5.919 6.155 6.431 6.71 6.964 7.262 7.618 7.929 8.319 8.774 9.253 9.749 10.274 10.815 11.357 11.571 11.503 11.342 11.131 10.909 10.634 10.307 10.008 9.735 9.526 9.313 9.098 8.913 8.751 8.581 8.383 8.199 8.04 7.894 7.737 7.59 7.445 7.3 7.176 7.048 6.92 6.776 6.62 6.513 6.394 6.194 6.062 5.93 5.864 5.735 5.588 5.411 5.318 5.051 5.038 4.928 4.803 4.558 4.428 4.266 4.086 3.888 3.659 3.364 2.763 -5 ,14325 ,TETRA ,17665400,Fri Dec 3 04:13:35 CET,Fri Dec 3 06:00:09 CET,0.0 0.679 0.921 1.136 1.307 1.447 1.581 1.697 1.909 2.004 2.085 2.076 2.342 2.428 2.582 2.737 2.885 2.947 3.067 3.189 3.369 3.485 3.591 3.749 3.906 4.056 4.197 4.332 4.505 4.66 4.811 4.994 5.172 5.368 5.596 5.837 6.08 6.323 6.557 6.81 7.119 7.458 7.783 8.097 8.469 8.876 9.365 9.931 10.464 10.998 11.528 11.698 11.641 11.482 11.288 11.071 10.833 10.597 10.375 10.118 9.897 9.696 9.486 9.288 9.087 8.892 8.695 8.537 8.399 8.249 8.09 7.946 7.802 7.663 7.555 7.424 7.273 7.117 6.943 6.829 6.715 6.533 6.408 6.266 6.195 6.055 5.897 5.718 5.627 5.367 5.357 5.251 5.141 4.904 4.769 4.625 4.455 4.273 4.051 3.723 2.847 -6 ,6603 ,TETRA ,17665401,Fri Dec 3 04:13:37 CET,Fri Dec 3 05:59:55 CET,0.0 0.479 0.772 0.992 1.161 1.295 1.432 1.562 1.763 1.858 1.956 1.954 2.228 2.315 2.462 2.612 2.763 2.836 2.968 3.093 3.286 3.405 3.511 3.662 3.813 3.959 4.109 4.251 4.405 4.568 4.746 4.966 5.175 5.359 5.563 5.819 6.069 6.317 6.565 6.82 7.091 7.391 7.735 8.062 8.41 8.846 9.356 9.856 10.433 11.049 11.584 11.804 11.787 11.637 11.419 11.167 10.896 10.598 10.334 10.094 9.888 9.694 9.477 9.268 9.086 8.919 8.748 8.568 8.407 8.257 8.074 7.911 7.752 7.577 7.444 7.321 7.19 7.055 6.9 6.783 6.677 6.504 6.364 6.21 6.135 5.995 5.859 5.701 5.606 5.343 5.333 5.232 5.124 4.883 4.751 4.604 4.447 4.255 3.99 3.687 3.006 -7 ,31526 ,TETRA ,17665402,Fri Dec 3 04:13:38 CET,Fri Dec 3 06:02:30 CET,0.0 0.531 0.79 0.969 1.125 1.269 1.398 1.512 1.739 1.849 1.954 1.964 2.235 2.324 2.479 2.615 2.756 2.829 2.964 3.086 3.253 3.361 3.455 3.599 3.755 3.892 4.026 4.167 4.328 4.473 4.627 4.818 4.988 5.143 5.321 5.525 5.727 5.953 6.206 6.47 6.754 7.073 7.417 7.734 8.095 8.501 8.958 9.471 10.034 10.646 11.252 11.457 11.396 11.25 11.048 10.797 10.567 10.366 10.157 9.927 9.703 9.488 9.292 9.102 8.917 8.752 8.571 8.396 8.235 8.053 7.853 7.7 7.544 7.361 7.22 7.077 6.928 6.789 6.642 6.523 6.413 6.259 6.146 6.03 5.969 5.835 5.679 5.504 5.419 5.16 5.139 5.03 4.913 4.647 4.494 4.346 4.193 3.988 3.761 3.483 2.795 -8 ,27430 ,TETRA ,17665403,Fri Dec 3 04:13:40 CET,Fri Dec 3 06:02:28 CET,0.0 0.547 0.795 0.959 1.081 1.209 1.339 1.441 1.638 1.757 1.859 1.839 2.093 2.175 2.316 2.444 2.58 2.648 2.766 2.889 3.097 3.223 3.339 3.498 3.633 3.765 3.891 4.027 4.208 4.367 4.513 4.688 4.865 5.047 5.262 5.46 5.645 5.878 6.115 6.374 6.698 7.048 7.408 7.735 8.075 8.474 8.944 9.434 9.937 10.494 11.027 11.19 11.116 10.98 10.765 10.49 10.256 10.036 9.801 9.492 9.246 9.074 8.885 8.691 8.496 8.307 8.087 7.904 7.757 7.572 7.373 7.229 7.056 6.875 6.743 6.592 6.448 6.31 6.167 6.06 5.944 5.77 5.656 5.52 5.446 5.303 5.143 4.981 4.894 4.631 4.608 4.499 4.385 4.129 3.988 3.838 3.671 3.478 3.195 2.806 2.026 -9 ,10996 ,TETRA ,17665404,Fri Dec 3 04:13:37 CET,Fri Dec 3 05:59:48 CET,0.0 0.565 0.83 1.032 1.204 1.342 1.465 1.562 1.731 1.814 1.903 1.898 2.157 2.238 2.389 2.551 2.697 2.76 2.882 3.0 3.163 3.264 3.371 3.543 3.701 3.845 3.987 4.127 4.298 4.468 4.645 4.849 5.038 5.212 5.426 5.665 5.877 6.108 6.349 6.625 6.911 7.215 7.583 7.915 8.274 8.694 9.185 9.701 10.274 10.874 11.412 11.602 11.515 11.341 11.153 10.95 10.734 10.498 10.244 9.975 9.708 9.456 9.255 9.078 8.893 8.709 8.506 8.293 8.112 7.953 7.798 7.668 7.515 7.339 7.204 7.066 6.921 6.785 6.643 6.538 6.431 6.257 6.119 5.971 5.898 5.748 5.597 5.424 5.337 5.08 5.048 4.933 4.831 4.599 4.455 4.295 4.122 3.931 3.668 3.346 2.625 -10 ,7666 ,TETRA ,17665405,Fri Dec 3 04:13:35 CET,Fri Dec 3 05:59:58 CET,0.0 0.435 0.622 0.755 0.892 1.036 1.169 1.294 1.51 1.593 1.673 1.666 1.924 2.005 2.158 2.296 2.43 2.497 2.631 2.76 2.935 3.048 3.158 3.3 3.444 3.592 3.735 3.87 4.051 4.239 4.402 4.567 4.724 4.886 5.076 5.307 5.542 5.808 6.078 6.357 6.665 6.977 7.316 7.659 8.046 8.458 8.915 9.418 9.965 10.528 11.038 11.231 11.156 10.967 10.712 10.44 10.195 9.962 9.738 9.495 9.27 9.062 8.843 8.635 8.439 8.254 8.069 7.894 7.725 7.54 7.366 7.212 7.041 6.882 6.754 6.624 6.489 6.345 6.183 6.071 5.97 5.806 5.684 5.56 5.493 5.356 5.202 5.02 4.937 4.68 4.672 4.57 4.466 4.252 4.125 3.952 3.774 3.591 3.318 2.935 1.92 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5g.txt deleted file mode 100644 index 06f8fd16..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,10101 ,TETRA ,17665406,Fri Dec 3 04:13:36 CET,Fri Dec 3 06:00:32 CET,0.0 0.885 1.136 1.343 1.515 1.672 1.824 1.948 2.128 2.234 2.34 2.353 2.578 2.653 2.799 2.933 3.049 3.107 3.221 3.333 3.5 3.597 3.688 3.816 3.923 4.015 4.095 4.183 4.299 4.4 4.508 4.618 4.716 4.814 4.914 5.046 5.188 5.323 5.455 5.601 5.733 5.841 5.928 5.979 6.018 6.072 6.081 5.976 5.717 5.219 4.232 2.94 1.809 0.874 0.076 -0.666 -1.284 -1.855 -2.324 -2.757 -3.139 -3.485 -3.804 -4.124 -4.432 -4.699 -5.0 -5.267 -5.487 -5.722 -5.966 -6.179 -6.399 -6.616 -6.779 -6.934 -7.086 -7.256 -7.437 -7.564 -7.699 -7.907 -8.056 -8.202 -8.274 -8.406 -8.546 -8.725 -8.819 -9.072 -9.084 -9.191 -9.307 -9.561 -9.706 -9.853 -10.018 -10.197 -10.37 -10.65 -11.186 -2 ,26570 ,TETRA ,17665407,Fri Dec 3 04:13:38 CET,Fri Dec 3 06:00:11 CET,0.0 1.001 1.271 1.456 1.608 1.751 1.886 2.019 2.247 2.335 2.408 2.4 2.626 2.698 2.836 2.966 3.096 3.156 3.259 3.348 3.487 3.585 3.678 3.803 3.896 3.998 4.106 4.193 4.294 4.385 4.484 4.599 4.704 4.823 4.958 5.102 5.219 5.333 5.463 5.572 5.67 5.778 5.888 5.984 6.066 6.107 6.072 5.945 5.648 5.127 4.106 2.776 1.655 0.687 -0.113 -0.799 -1.391 -1.906 -2.362 -2.83 -3.22 -3.571 -3.906 -4.216 -4.498 -4.758 -5.026 -5.257 -5.463 -5.668 -5.867 -6.043 -6.237 -6.443 -6.606 -6.777 -6.937 -7.094 -7.282 -7.418 -7.557 -7.775 -7.917 -8.068 -8.146 -8.303 -8.476 -8.646 -8.734 -8.988 -8.99 -9.071 -9.16 -9.372 -9.489 -9.623 -9.782 -9.957 -10.14 -10.355 -10.922 -3 ,19723 ,TETRA ,17665408,Fri Dec 3 04:13:36 CET,Fri Dec 3 06:00:48 CET,0.0 0.754 0.998 1.173 1.334 1.454 1.574 1.689 1.872 1.957 2.048 2.057 2.279 2.342 2.471 2.584 2.681 2.734 2.858 2.963 3.1 3.189 3.269 3.39 3.506 3.611 3.708 3.795 3.919 4.05 4.159 4.261 4.374 4.492 4.612 4.766 4.901 4.993 5.068 5.151 5.248 5.333 5.425 5.516 5.58 5.587 5.538 5.407 5.127 4.616 3.624 2.322 1.188 0.211 -0.636 -1.393 -2.02 -2.585 -3.06 -3.545 -3.99 -4.351 -4.685 -5.01 -5.333 -5.623 -5.904 -6.149 -6.346 -6.572 -6.82 -6.991 -7.17 -7.376 -7.531 -7.683 -7.84 -8.013 -8.212 -8.346 -8.49 -8.706 -8.84 -8.982 -9.054 -9.218 -9.409 -9.591 -9.673 -9.925 -9.961 -10.059 -10.151 -10.379 -10.515 -10.651 -10.788 -10.934 -11.132 -11.399 -12.033 -4 ,3965 ,TETRA ,17665409,Fri Dec 3 04:13:37 CET,Fri Dec 3 06:01:00 CET,0.0 1.01 1.389 1.611 1.785 1.934 2.086 2.223 2.431 2.516 2.59 2.575 2.811 2.895 3.048 3.185 3.295 3.345 3.454 3.546 3.69 3.786 3.869 3.995 4.12 4.22 4.317 4.429 4.569 4.701 4.827 4.968 5.092 5.195 5.32 5.455 5.557 5.662 5.785 5.88 5.944 6.056 6.172 6.232 6.277 6.299 6.304 6.246 6.054 5.572 4.58 3.272 2.103 1.127 0.321 -0.379 -0.995 -1.54 -2.014 -2.491 -2.891 -3.238 -3.579 -3.919 -4.214 -4.459 -4.715 -4.953 -5.158 -5.373 -5.612 -5.802 -5.991 -6.204 -6.364 -6.518 -6.692 -6.887 -7.074 -7.189 -7.305 -7.492 -7.628 -7.771 -7.843 -8.001 -8.165 -8.334 -8.416 -8.662 -8.671 -8.782 -8.898 -9.112 -9.228 -9.366 -9.516 -9.671 -9.835 -10.096 -10.795 -5 ,28322 ,TETRA ,17665410,Fri Dec 3 04:13:40 CET,Fri Dec 3 06:01:19 CET,0.0 0.511 0.785 1.019 1.2 1.356 1.487 1.597 1.802 1.894 1.974 1.969 2.195 2.263 2.387 2.495 2.606 2.666 2.764 2.862 3.007 3.093 3.177 3.295 3.396 3.49 3.583 3.668 3.772 3.883 4.01 4.147 4.238 4.315 4.402 4.491 4.589 4.699 4.819 4.953 5.055 5.126 5.233 5.333 5.409 5.468 5.457 5.364 5.121 4.653 3.728 2.51 1.435 0.485 -0.339 -1.063 -1.706 -2.274 -2.736 -3.205 -3.615 -4.018 -4.419 -4.753 -5.058 -5.328 -5.597 -5.85 -6.066 -6.303 -6.565 -6.77 -6.969 -7.172 -7.339 -7.517 -7.69 -7.85 -8.021 -8.151 -8.282 -8.479 -8.63 -8.787 -8.866 -9.034 -9.206 -9.375 -9.453 -9.702 -9.729 -9.827 -9.934 -10.16 -10.285 -10.425 -10.576 -10.739 -10.929 -11.23 -11.949 -6 ,13789 ,TETRA ,17665411,Fri Dec 3 04:13:42 CET,Fri Dec 3 06:01:14 CET,0.0 0.668 0.915 1.079 1.215 1.342 1.447 1.541 1.729 1.827 1.923 1.943 2.171 2.238 2.36 2.488 2.607 2.661 2.76 2.853 3.005 3.105 3.186 3.299 3.415 3.525 3.636 3.747 3.87 3.975 4.081 4.199 4.295 4.403 4.538 4.692 4.827 4.936 5.036 5.134 5.243 5.352 5.436 5.486 5.574 5.651 5.651 5.557 5.279 4.765 3.761 2.469 1.367 0.415 -0.413 -1.148 -1.784 -2.341 -2.807 -3.287 -3.711 -4.069 -4.421 -4.777 -5.088 -5.356 -5.633 -5.894 -6.107 -6.315 -6.527 -6.703 -6.903 -7.106 -7.266 -7.433 -7.598 -7.773 -7.96 -8.09 -8.228 -8.441 -8.59 -8.741 -8.808 -8.955 -9.126 -9.299 -9.387 -9.643 -9.678 -9.777 -9.879 -10.092 -10.203 -10.346 -10.504 -10.653 -10.822 -11.075 -11.864 -7 ,30727 ,TETRA ,17665412,Fri Dec 3 04:13:36 CET,Fri Dec 3 06:00:20 CET,0.0 0.541 0.873 1.088 1.241 1.396 1.518 1.622 1.839 1.93 2.012 2.029 2.262 2.324 2.439 2.565 2.684 2.743 2.868 2.968 3.105 3.199 3.285 3.401 3.493 3.568 3.669 3.777 3.905 4.027 4.144 4.279 4.386 4.479 4.574 4.678 4.797 4.92 5.053 5.205 5.313 5.418 5.503 5.535 5.557 5.557 5.539 5.423 5.143 4.643 3.67 2.419 1.332 0.373 -0.46 -1.19 -1.824 -2.421 -2.908 -3.355 -3.76 -4.139 -4.476 -4.78 -5.065 -5.331 -5.62 -5.906 -6.143 -6.363 -6.61 -6.814 -7.015 -7.217 -7.366 -7.538 -7.731 -7.93 -8.122 -8.24 -8.368 -8.57 -8.703 -8.843 -8.916 -9.068 -9.238 -9.421 -9.52 -9.784 -9.814 -9.919 -10.029 -10.253 -10.369 -10.487 -10.623 -10.794 -10.982 -11.197 -11.589 -8 ,4239 ,TETRA ,17665413,Fri Dec 3 04:13:37 CET,Fri Dec 3 06:00:09 CET,0.0 0.839 1.123 1.366 1.563 1.74 1.889 2.0 2.194 2.298 2.396 2.417 2.655 2.731 2.866 2.996 3.102 3.152 3.258 3.357 3.49 3.57 3.66 3.792 3.911 4.017 4.111 4.205 4.309 4.402 4.486 4.594 4.692 4.799 4.937 5.059 5.162 5.254 5.33 5.419 5.533 5.639 5.724 5.794 5.835 5.821 5.759 5.635 5.389 4.909 3.898 2.613 1.517 0.585 -0.191 -0.892 -1.515 -2.064 -2.544 -3.027 -3.416 -3.773 -4.104 -4.406 -4.708 -4.982 -5.286 -5.565 -5.779 -5.988 -6.219 -6.412 -6.614 -6.838 -6.999 -7.171 -7.345 -7.513 -7.704 -7.837 -7.968 -8.143 -8.269 -8.434 -8.52 -8.683 -8.843 -9.009 -9.092 -9.345 -9.369 -9.473 -9.592 -9.824 -9.932 -10.061 -10.201 -10.322 -10.498 -10.762 -11.357 -9 ,21915 ,TETRA ,17665414,Fri Dec 3 04:13:40 CET,Fri Dec 3 06:00:17 CET,0.0 0.667 0.943 1.159 1.35 1.539 1.703 1.829 2.046 2.143 2.23 2.25 2.488 2.568 2.7 2.821 2.929 2.97 3.058 3.157 3.309 3.403 3.488 3.609 3.722 3.837 3.937 4.032 4.162 4.272 4.373 4.5 4.618 4.711 4.817 4.916 4.988 5.095 5.203 5.279 5.352 5.419 5.519 5.602 5.68 5.748 5.708 5.597 5.354 4.874 3.929 2.632 1.44 0.42 -0.433 -1.17 -1.789 -2.348 -2.83 -3.321 -3.727 -4.068 -4.393 -4.71 -5.01 -5.293 -5.59 -5.845 -6.073 -6.321 -6.574 -6.769 -6.973 -7.19 -7.341 -7.493 -7.656 -7.841 -8.038 -8.171 -8.3 -8.495 -8.645 -8.797 -8.878 -9.036 -9.183 -9.346 -9.437 -9.702 -9.767 -9.88 -9.977 -10.193 -10.32 -10.449 -10.58 -10.739 -10.954 -11.249 -11.681 -10 ,15834 ,TETRA ,17665415,Fri Dec 3 04:13:42 CET,Fri Dec 3 05:59:57 CET,0.0 0.797 1.026 1.235 1.423 1.562 1.67 1.785 1.993 2.086 2.179 2.189 2.415 2.483 2.605 2.727 2.838 2.885 2.973 3.069 3.204 3.288 3.373 3.497 3.62 3.752 3.872 3.979 4.121 4.241 4.326 4.442 4.58 4.701 4.839 4.979 5.084 5.18 5.292 5.405 5.489 5.553 5.634 5.723 5.762 5.73 5.642 5.471 5.16 4.637 3.691 2.455 1.383 0.45 -0.355 -1.058 -1.684 -2.258 -2.75 -3.233 -3.647 -4.013 -4.362 -4.678 -4.963 -5.235 -5.523 -5.776 -5.98 -6.197 -6.421 -6.604 -6.811 -7.03 -7.186 -7.346 -7.509 -7.668 -7.841 -7.968 -8.101 -8.31 -8.455 -8.588 -8.654 -8.801 -8.95 -9.099 -9.184 -9.45 -9.502 -9.608 -9.72 -9.958 -10.087 -10.224 -10.362 -10.516 -10.692 -10.918 -11.674 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5i.txt deleted file mode 100644 index 14b9dba6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5f_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,21667 ,TETRA ,17665416,Fri Dec 3 04:13:36 CET,Fri Dec 3 06:00:51 CET,0.0 0.899 1.133 1.293 1.44 1.569 1.696 1.821 2.028 2.112 2.202 2.216 2.448 2.526 2.663 2.785 2.891 2.948 3.058 3.155 3.292 3.368 3.443 3.567 3.689 3.809 3.918 4.008 4.134 4.243 4.328 4.445 4.559 4.648 4.729 4.82 4.91 4.996 5.08 5.171 5.259 5.313 5.347 5.362 5.33 5.274 5.195 4.983 4.552 3.766 2.368 0.64 -0.813 -2.022 -3.022 -3.894 -4.653 -5.322 -5.88 -6.467 -6.985 -7.415 -7.785 -8.129 -8.461 -8.774 -9.094 -9.362 -9.593 -9.833 -10.081 -10.292 -10.503 -10.724 -10.9 -11.079 -11.261 -11.44 -11.627 -11.765 -11.915 -12.119 -12.251 -12.403 -12.481 -12.651 -12.836 -13.023 -13.124 -13.394 -13.422 -13.529 -13.636 -13.889 -14.044 -14.187 -14.34 -14.53 -14.762 -15.108 -15.962 -2 ,12563 ,TETRA ,17665417,Fri Dec 3 04:13:38 CET,Fri Dec 3 06:00:34 CET,0.0 0.583 0.862 1.081 1.269 1.417 1.547 1.656 1.865 1.963 2.045 2.061 2.285 2.347 2.471 2.593 2.723 2.783 2.892 3.003 3.161 3.255 3.338 3.456 3.561 3.676 3.782 3.854 3.96 4.08 4.178 4.289 4.39 4.462 4.535 4.644 4.744 4.819 4.885 4.937 5.005 5.105 5.164 5.152 5.127 5.063 4.924 4.693 4.266 3.501 2.064 0.298 -1.117 -2.278 -3.265 -4.127 -4.887 -5.563 -6.14 -6.718 -7.188 -7.596 -7.974 -8.318 -8.648 -8.945 -9.236 -9.492 -9.715 -9.952 -10.216 -10.435 -10.653 -10.881 -11.051 -11.232 -11.429 -11.634 -11.841 -11.985 -12.129 -12.351 -12.51 -12.669 -12.749 -12.911 -13.085 -13.287 -13.383 -13.643 -13.655 -13.756 -13.882 -14.181 -14.34 -14.487 -14.638 -14.81 -15.033 -15.334 -16.19 -3 ,17618 ,TETRA ,17665418,Fri Dec 3 04:13:40 CET,Fri Dec 3 06:00:33 CET,0.0 1.028 1.339 1.568 1.737 1.868 1.996 2.111 2.302 2.392 2.481 2.481 2.705 2.768 2.882 3.005 3.126 3.175 3.268 3.363 3.494 3.574 3.651 3.767 3.882 3.992 4.101 4.207 4.332 4.447 4.556 4.668 4.764 4.854 4.955 5.081 5.213 5.349 5.446 5.504 5.56 5.632 5.691 5.719 5.708 5.634 5.462 5.163 4.698 3.93 2.567 0.837 -0.569 -1.733 -2.728 -3.587 -4.323 -5.003 -5.578 -6.128 -6.588 -7.029 -7.467 -7.847 -8.187 -8.502 -8.816 -9.082 -9.305 -9.525 -9.76 -9.972 -10.19 -10.406 -10.575 -10.751 -10.942 -11.136 -11.341 -11.48 -11.611 -11.828 -11.981 -12.136 -12.219 -12.387 -12.562 -12.755 -12.847 -13.11 -13.147 -13.254 -13.369 -13.617 -13.749 -13.887 -14.043 -14.222 -14.443 -14.767 -15.397 -4 ,15237 ,TETRA ,17665419,Fri Dec 3 04:13:39 CET,Fri Dec 3 06:00:41 CET,0.0 0.688 0.956 1.173 1.348 1.485 1.604 1.71 1.922 2.022 2.109 2.12 2.35 2.43 2.574 2.702 2.821 2.875 2.982 3.088 3.241 3.344 3.443 3.568 3.667 3.763 3.858 3.939 4.026 4.109 4.193 4.278 4.351 4.428 4.51 4.61 4.721 4.838 4.927 4.992 5.065 5.131 5.224 5.278 5.273 5.253 5.127 4.849 4.345 3.536 2.206 0.537 -0.895 -2.094 -3.108 -3.997 -4.752 -5.439 -6.016 -6.555 -7.01 -7.438 -7.844 -8.195 -8.541 -8.876 -9.193 -9.458 -9.691 -9.928 -10.192 -10.41 -10.609 -10.806 -10.959 -11.121 -11.3 -11.509 -11.721 -11.861 -12.012 -12.245 -12.395 -12.538 -12.61 -12.765 -12.94 -13.123 -13.223 -13.498 -13.512 -13.609 -13.725 -13.971 -14.089 -14.23 -14.394 -14.58 -14.806 -15.066 -15.723 -5 ,21999 ,TETRA ,17665420,Fri Dec 3 04:13:37 CET,Fri Dec 3 06:00:56 CET,0.0 0.899 1.188 1.397 1.567 1.709 1.83 1.951 2.131 2.204 2.283 2.265 2.484 2.55 2.682 2.819 2.937 2.987 3.086 3.177 3.312 3.4 3.475 3.573 3.682 3.803 3.91 4.003 4.117 4.224 4.329 4.464 4.592 4.684 4.773 4.877 4.965 5.064 5.157 5.237 5.318 5.383 5.421 5.439 5.453 5.419 5.249 4.965 4.531 3.775 2.386 0.677 -0.751 -1.93 -2.905 -3.757 -4.507 -5.196 -5.782 -6.35 -6.857 -7.301 -7.68 -8.038 -8.373 -8.679 -8.992 -9.276 -9.536 -9.797 -10.055 -10.252 -10.454 -10.683 -10.854 -11.018 -11.184 -11.372 -11.573 -11.703 -11.84 -12.057 -12.2 -12.345 -12.425 -12.605 -12.771 -12.929 -13.016 -13.283 -13.325 -13.427 -13.531 -13.768 -13.894 -14.035 -14.206 -14.404 -14.625 -14.874 -15.45 -6 ,23939 ,TETRA ,17665421,Fri Dec 3 04:13:36 CET,Fri Dec 3 06:00:41 CET,0.0 0.753 1.064 1.289 1.474 1.656 1.792 1.911 2.132 2.226 2.322 2.339 2.562 2.633 2.774 2.89 2.997 3.053 3.167 3.269 3.393 3.459 3.528 3.639 3.732 3.831 3.937 4.028 4.117 4.189 4.278 4.41 4.537 4.648 4.76 4.856 4.938 5.043 5.159 5.248 5.302 5.36 5.429 5.459 5.434 5.358 5.213 4.985 4.603 3.888 2.52 0.764 -0.668 -1.845 -2.86 -3.795 -4.604 -5.316 -5.899 -6.435 -6.892 -7.299 -7.699 -8.087 -8.446 -8.768 -9.097 -9.392 -9.642 -9.887 -10.136 -10.35 -10.562 -10.769 -10.94 -11.124 -11.306 -11.494 -11.698 -11.836 -11.973 -12.18 -12.322 -12.469 -12.55 -12.713 -12.869 -13.041 -13.136 -13.405 -13.467 -13.585 -13.702 -13.935 -14.053 -14.192 -14.357 -14.559 -14.779 -14.978 -15.54 -7 ,6941 ,TETRA ,17665422,Fri Dec 3 04:13:39 CET,Fri Dec 3 06:01:02 CET,0.0 0.736 1.04 1.248 1.413 1.565 1.705 1.818 2.027 2.12 2.208 2.232 2.456 2.522 2.652 2.776 2.892 2.942 3.035 3.126 3.249 3.33 3.417 3.545 3.668 3.772 3.86 3.949 4.066 4.173 4.277 4.414 4.531 4.617 4.72 4.841 4.945 5.047 5.131 5.215 5.29 5.335 5.383 5.404 5.378 5.307 5.145 4.86 4.416 3.647 2.224 0.486 -0.939 -2.105 -3.092 -3.969 -4.734 -5.421 -6.003 -6.567 -7.02 -7.411 -7.812 -8.195 -8.519 -8.8 -9.105 -9.389 -9.646 -9.912 -10.171 -10.376 -10.593 -10.836 -11.022 -11.205 -11.389 -11.571 -11.746 -11.865 -12.0 -12.216 -12.36 -12.505 -12.575 -12.737 -12.936 -13.128 -13.217 -13.479 -13.503 -13.618 -13.736 -13.962 -14.09 -14.237 -14.402 -14.576 -14.77 -15.059 -15.777 -8 ,11215 ,TETRA ,17665423,Fri Dec 3 04:13:40 CET,Fri Dec 3 06:00:35 CET,0.0 0.924 1.179 1.345 1.497 1.618 1.736 1.852 2.066 2.158 2.243 2.272 2.508 2.57 2.712 2.852 2.969 3.027 3.139 3.253 3.421 3.526 3.612 3.73 3.841 3.925 4.004 4.086 4.195 4.305 4.414 4.525 4.637 4.752 4.867 4.998 5.113 5.221 5.323 5.403 5.469 5.516 5.549 5.589 5.596 5.517 5.356 5.067 4.581 3.834 2.567 0.896 -0.536 -1.725 -2.728 -3.579 -4.317 -4.994 -5.56 -6.133 -6.609 -7.013 -7.411 -7.791 -8.139 -8.452 -8.768 -9.036 -9.273 -9.522 -9.771 -9.971 -10.182 -10.405 -10.571 -10.747 -10.931 -11.118 -11.304 -11.423 -11.553 -11.776 -11.925 -12.071 -12.152 -12.323 -12.483 -12.659 -12.768 -13.042 -13.066 -13.181 -13.309 -13.593 -13.729 -13.856 -14.008 -14.193 -14.418 -14.821 -15.537 -9 ,14419 ,TETRA ,17665424,Fri Dec 3 04:14:10 CET,Fri Dec 3 06:01:26 CET,0.0 1.163 1.452 1.679 1.893 2.06 2.179 2.266 2.44 2.533 2.62 2.63 2.865 2.947 3.092 3.217 3.328 3.381 3.483 3.58 3.703 3.778 3.862 3.987 4.094 4.199 4.313 4.415 4.526 4.642 4.756 4.864 4.954 5.043 5.164 5.29 5.375 5.438 5.503 5.578 5.635 5.72 5.79 5.785 5.77 5.706 5.566 5.295 4.82 4.018 2.588 0.836 -0.606 -1.794 -2.762 -3.658 -4.451 -5.153 -5.753 -6.371 -6.904 -7.337 -7.716 -8.078 -8.415 -8.708 -9.026 -9.304 -9.533 -9.776 -10.029 -10.242 -10.462 -10.699 -10.871 -11.048 -11.249 -11.451 -11.638 -11.767 -11.904 -12.102 -12.235 -12.375 -12.454 -12.631 -12.808 -13.002 -13.107 -13.373 -13.418 -13.53 -13.634 -13.884 -14.043 -14.211 -14.384 -14.577 -14.768 -14.995 -15.428 -10 ,31430 ,TETRA ,17665425,Fri Dec 3 04:14:12 CET,Fri Dec 3 06:01:36 CET,0.0 0.544 0.843 1.096 1.275 1.417 1.555 1.668 1.888 1.992 2.09 2.118 2.345 2.408 2.53 2.65 2.761 2.809 2.907 3.012 3.147 3.222 3.297 3.411 3.524 3.62 3.717 3.805 3.904 4.027 4.15 4.279 4.377 4.463 4.564 4.692 4.836 4.955 5.032 5.097 5.177 5.223 5.226 5.238 5.245 5.202 5.072 4.815 4.379 3.624 2.239 0.543 -0.847 -2.059 -3.076 -3.934 -4.684 -5.363 -5.954 -6.526 -7.021 -7.449 -7.838 -8.195 -8.516 -8.817 -9.131 -9.423 -9.695 -9.978 -10.254 -10.481 -10.728 -10.963 -11.137 -11.337 -11.537 -11.745 -11.96 -12.102 -12.246 -12.47 -12.62 -12.773 -12.85 -12.999 -13.155 -13.326 -13.417 -13.674 -13.69 -13.796 -13.907 -14.127 -14.25 -14.39 -14.549 -14.727 -14.92 -15.202 -15.704 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5g_5c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5g_5c.txt deleted file mode 100644 index a9c3aa20..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5g_5c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,24652 ,TETRA ,17665426,Fri Dec 3 04:14:16 CET,Fri Dec 3 06:00:56 CET,0.0 0.858 1.182 1.393 1.554 1.697 1.839 1.969 2.192 2.293 2.391 2.417 2.668 2.741 2.883 3.032 3.154 3.209 3.329 3.428 3.549 3.63 3.718 3.857 3.976 4.079 4.174 4.257 4.369 4.477 4.569 4.675 4.776 4.872 4.972 5.06 5.13 5.188 5.225 5.278 5.335 5.36 5.368 5.362 5.322 5.208 4.988 4.682 4.175 3.219 1.517 -0.536 -2.217 -3.596 -4.757 -5.77 -6.637 -7.404 -8.096 -8.811 -9.391 -9.892 -10.359 -10.776 -11.169 -11.528 -11.872 -12.186 -12.474 -12.76 -13.039 -13.26 -13.49 -13.742 -13.947 -14.168 -14.411 -14.648 -14.875 -15.049 -15.236 -15.502 -15.677 -15.85 -15.945 -16.154 -16.368 -16.58 -16.684 -16.972 -17.006 -17.124 -17.252 -17.565 -17.746 -17.922 -18.104 -18.32 -18.577 -18.949 -19.996 -2 ,20306 ,TETRA ,17665427,Fri Dec 3 04:14:14 CET,Fri Dec 3 06:00:37 CET,0.0 0.79 1.052 1.243 1.413 1.583 1.738 1.869 2.099 2.193 2.284 2.287 2.526 2.598 2.732 2.858 2.979 3.032 3.129 3.219 3.363 3.456 3.541 3.655 3.766 3.878 3.97 4.053 4.165 4.265 4.364 4.509 4.639 4.758 4.895 5.028 5.136 5.22 5.308 5.392 5.446 5.485 5.491 5.469 5.434 5.367 5.179 4.809 4.232 3.29 1.587 -0.451 -2.059 -3.387 -4.54 -5.558 -6.416 -7.164 -7.824 -8.471 -9.007 -9.512 -10.014 -10.463 -10.836 -11.165 -11.524 -11.854 -12.132 -12.408 -12.701 -12.946 -13.207 -13.491 -13.696 -13.892 -14.095 -14.311 -14.535 -14.693 -14.854 -15.105 -15.283 -15.468 -15.561 -15.759 -15.975 -16.199 -16.323 -16.632 -16.696 -16.823 -16.959 -17.285 -17.447 -17.614 -17.818 -18.027 -18.257 -18.616 -19.413 -3 ,19190 ,TETRA ,17665428,Fri Dec 3 04:14:10 CET,Fri Dec 3 06:00:47 CET,0.0 0.752 1.093 1.363 1.573 1.732 1.866 1.976 2.192 2.296 2.393 2.395 2.626 2.703 2.847 2.969 3.106 3.178 3.294 3.402 3.567 3.67 3.753 3.861 3.982 4.099 4.2 4.291 4.403 4.515 4.627 4.74 4.816 4.887 4.988 5.115 5.235 5.332 5.402 5.468 5.524 5.571 5.608 5.618 5.554 5.422 5.212 4.867 4.316 3.391 1.675 -0.362 -2.009 -3.413 -4.605 -5.646 -6.546 -7.33 -7.981 -8.639 -9.21 -9.714 -10.167 -10.562 -10.941 -11.295 -11.648 -11.975 -12.26 -12.565 -12.866 -13.092 -13.323 -13.566 -13.773 -13.985 -14.195 -14.408 -14.624 -14.786 -14.948 -15.18 -15.347 -15.525 -15.617 -15.813 -16.02 -16.217 -16.314 -16.601 -16.657 -16.791 -16.934 -17.246 -17.409 -17.577 -17.753 -17.974 -18.243 -18.637 -19.517 -4 ,3181 ,TETRA ,17665429,Fri Dec 3 04:14:11 CET,Fri Dec 3 06:00:35 CET,0.0 0.878 1.211 1.423 1.615 1.782 1.92 2.037 2.242 2.333 2.422 2.424 2.658 2.729 2.885 3.032 3.149 3.208 3.318 3.425 3.587 3.691 3.8 3.932 4.045 4.143 4.237 4.342 4.476 4.587 4.681 4.792 4.89 4.978 5.082 5.182 5.253 5.331 5.424 5.514 5.594 5.664 5.69 5.648 5.575 5.458 5.233 4.894 4.357 3.436 1.788 -0.226 -1.904 -3.316 -4.5 -5.528 -6.385 -7.127 -7.747 -8.385 -8.919 -9.388 -9.84 -10.276 -10.703 -11.087 -11.474 -11.814 -12.106 -12.395 -12.681 -12.916 -13.177 -13.451 -13.666 -13.897 -14.131 -14.378 -14.626 -14.78 -14.941 -15.217 -15.413 -15.615 -15.717 -15.923 -16.127 -16.327 -16.44 -16.739 -16.783 -16.911 -17.046 -17.331 -17.484 -17.656 -17.849 -18.065 -18.301 -18.637 -19.276 -5 ,1438 ,TETRA ,17665430,Fri Dec 3 04:14:12 CET,Fri Dec 3 06:00:48 CET,0.0 0.621 0.86 1.049 1.194 1.322 1.453 1.571 1.766 1.857 1.944 1.938 2.185 2.257 2.399 2.537 2.665 2.724 2.821 2.918 3.066 3.163 3.258 3.393 3.512 3.612 3.721 3.827 3.948 4.052 4.139 4.254 4.377 4.486 4.596 4.714 4.812 4.894 4.961 5.044 5.129 5.176 5.198 5.195 5.13 4.989 4.791 4.516 4.011 3.056 1.356 -0.626 -2.264 -3.668 -4.825 -5.819 -6.679 -7.447 -8.087 -8.712 -9.262 -9.751 -10.19 -10.624 -11.027 -11.379 -11.756 -12.098 -12.389 -12.667 -12.949 -13.192 -13.447 -13.726 -13.934 -14.134 -14.334 -14.538 -14.75 -14.905 -15.074 -15.32 -15.499 -15.693 -15.785 -15.971 -16.178 -16.396 -16.506 -16.807 -16.864 -16.992 -17.131 -17.425 -17.586 -17.771 -17.961 -18.157 -18.407 -18.734 -19.543 -6 ,31102 ,TETRA ,17665431,Fri Dec 3 04:14:14 CET,Fri Dec 3 06:00:31 CET,0.0 0.533 0.785 0.957 1.1 1.247 1.388 1.5 1.683 1.779 1.879 1.895 2.145 2.221 2.351 2.466 2.583 2.637 2.732 2.826 2.963 3.04 3.115 3.252 3.367 3.466 3.564 3.644 3.746 3.846 3.94 4.066 4.184 4.282 4.376 4.51 4.633 4.712 4.792 4.881 5.0 5.086 5.151 5.195 5.176 5.095 4.897 4.598 4.084 3.152 1.48 -0.565 -2.193 -3.567 -4.732 -5.738 -6.567 -7.329 -8.033 -8.745 -9.347 -9.863 -10.349 -10.805 -11.2 -11.571 -11.944 -12.247 -12.512 -12.787 -13.085 -13.345 -13.599 -13.86 -14.057 -14.253 -14.471 -14.68 -14.898 -15.058 -15.227 -15.477 -15.641 -15.811 -15.899 -16.086 -16.286 -16.509 -16.627 -16.936 -16.978 -17.083 -17.214 -17.505 -17.653 -17.806 -17.977 -18.198 -18.43 -18.693 -19.518 -7 ,3516 ,TETRA ,17665432,Fri Dec 3 04:14:14 CET,Fri Dec 3 06:00:50 CET,0.0 0.636 0.9 1.106 1.298 1.443 1.576 1.688 1.879 1.973 2.072 2.088 2.345 2.434 2.578 2.703 2.818 2.87 2.97 3.078 3.233 3.313 3.383 3.493 3.608 3.726 3.843 3.949 4.074 4.186 4.274 4.361 4.444 4.557 4.688 4.807 4.911 4.992 5.092 5.183 5.225 5.283 5.378 5.418 5.397 5.346 5.181 4.854 4.274 3.351 1.704 -0.304 -1.912 -3.295 -4.462 -5.473 -6.351 -7.199 -7.892 -8.504 -9.022 -9.486 -9.943 -10.368 -10.755 -11.104 -11.474 -11.789 -12.064 -12.372 -12.67 -12.903 -13.159 -13.439 -13.653 -13.867 -14.084 -14.309 -14.542 -14.696 -14.85 -15.094 -15.261 -15.444 -15.54 -15.731 -15.931 -16.122 -16.229 -16.534 -16.596 -16.725 -16.859 -17.142 -17.295 -17.458 -17.649 -17.869 -18.117 -18.449 -19.276 -8 ,21694 ,TETRA ,17665433,Fri Dec 3 04:14:12 CET,Fri Dec 3 06:00:41 CET,0.0 0.953 1.229 1.413 1.579 1.746 1.89 2.016 2.25 2.347 2.443 2.447 2.689 2.769 2.916 3.035 3.147 3.2 3.304 3.393 3.516 3.6 3.679 3.791 3.913 4.037 4.148 4.254 4.38 4.504 4.616 4.722 4.826 4.94 5.073 5.191 5.28 5.372 5.455 5.537 5.611 5.657 5.727 5.786 5.769 5.7 5.523 5.213 4.712 3.851 2.238 0.18 -1.46 -2.82 -3.987 -5.01 -5.852 -6.584 -7.243 -7.907 -8.464 -8.975 -9.445 -9.862 -10.254 -10.61 -10.986 -11.323 -11.608 -11.906 -12.23 -12.492 -12.754 -13.013 -13.211 -13.432 -13.657 -13.882 -14.132 -14.304 -14.478 -14.746 -14.927 -15.124 -15.214 -15.395 -15.594 -15.794 -15.906 -16.199 -16.234 -16.362 -16.497 -16.807 -16.979 -17.174 -17.401 -17.623 -17.855 -18.183 -18.803 -9 ,12868 ,TETRA ,17665434,Fri Dec 3 04:14:15 CET,Fri Dec 3 06:01:05 CET,0.0 0.557 0.876 1.11 1.256 1.387 1.52 1.647 1.873 1.971 2.065 2.072 2.32 2.399 2.526 2.646 2.775 2.83 2.943 3.065 3.218 3.31 3.395 3.519 3.637 3.752 3.854 3.94 4.078 4.201 4.29 4.395 4.522 4.642 4.775 4.908 4.986 5.055 5.114 5.162 5.21 5.246 5.278 5.282 5.232 5.119 4.929 4.63 4.088 3.138 1.423 -0.657 -2.326 -3.72 -4.94 -5.957 -6.8 -7.574 -8.225 -8.887 -9.464 -9.984 -10.456 -10.854 -11.249 -11.642 -12.018 -12.334 -12.619 -12.894 -13.162 -13.409 -13.672 -13.91 -14.101 -14.306 -14.515 -14.736 -14.968 -15.124 -15.284 -15.539 -15.704 -15.864 -15.949 -16.137 -16.331 -16.522 -16.625 -16.917 -16.959 -17.073 -17.193 -17.47 -17.607 -17.754 -17.931 -18.13 -18.377 -18.723 -19.874 -10 ,14725 ,TETRA ,17665435,Fri Dec 3 04:14:17 CET,Fri Dec 3 06:00:30 CET,0.0 0.788 1.074 1.277 1.451 1.59 1.716 1.839 2.043 2.138 2.245 2.277 2.532 2.611 2.747 2.864 2.969 3.026 3.139 3.251 3.397 3.472 3.551 3.66 3.77 3.894 4.005 4.107 4.233 4.34 4.448 4.579 4.686 4.762 4.854 4.954 5.048 5.163 5.279 5.403 5.519 5.584 5.616 5.623 5.599 5.524 5.348 5.018 4.463 3.554 1.917 -0.093 -1.746 -3.148 -4.322 -5.322 -6.192 -6.964 -7.605 -8.242 -8.808 -9.319 -9.779 -10.192 -10.587 -10.959 -11.344 -11.679 -11.975 -12.289 -12.604 -12.855 -13.098 -13.349 -13.548 -13.755 -13.981 -14.222 -14.468 -14.632 -14.792 -15.028 -15.2 -15.379 -15.466 -15.669 -15.88 -16.071 -16.176 -16.473 -16.539 -16.668 -16.798 -17.103 -17.261 -17.427 -17.624 -17.846 -18.117 -18.481 -19.202 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5f.txt deleted file mode 100644 index 1127abc4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,6291 ,TETRA ,17665436,Fri Dec 3 04:14:12 CET,Fri Dec 3 06:01:49 CET,0.0 0.831 1.176 1.409 1.575 1.729 1.864 1.986 2.204 2.297 2.385 2.391 2.626 2.71 2.868 3.02 3.167 3.241 3.377 3.507 3.694 3.797 3.896 4.055 4.194 4.314 4.426 4.55 4.702 4.838 4.975 5.13 5.266 5.391 5.564 5.774 5.959 6.163 6.371 6.578 6.792 7.061 7.359 7.606 7.87 8.131 8.398 8.661 8.882 8.982 8.848 8.362 7.738 7.132 6.523 5.921 5.419 4.954 4.568 4.175 3.796 3.442 3.078 2.733 2.448 2.162 1.858 1.593 1.375 1.153 0.895 0.667 0.409 0.151 -0.037 -0.233 -0.427 -0.619 -0.831 -0.985 -1.145 -1.399 -1.591 -1.786 -1.877 -2.067 -2.278 -2.499 -2.611 -2.887 -2.986 -3.124 -3.272 -3.597 -3.778 -3.978 -4.2 -4.442 -4.726 -5.145 -6.595 -2 ,13923 ,TETRA ,17665437,Fri Dec 3 04:14:13 CET,Fri Dec 3 06:01:43 CET,0.0 0.534 0.732 0.919 1.08 1.227 1.357 1.481 1.68 1.76 1.847 1.895 2.138 2.213 2.368 2.502 2.626 2.694 2.829 2.947 3.1 3.201 3.308 3.455 3.582 3.715 3.855 3.985 4.163 4.336 4.493 4.654 4.789 4.93 5.1 5.292 5.46 5.637 5.858 6.084 6.289 6.522 6.773 6.986 7.224 7.476 7.758 8.067 8.353 8.517 8.404 7.836 7.168 6.54 5.947 5.363 4.791 4.303 3.917 3.481 3.093 2.773 2.443 2.084 1.765 1.502 1.207 0.916 0.664 0.426 0.193 -0.018 -0.261 -0.503 -0.679 -0.869 -1.077 -1.289 -1.509 -1.663 -1.822 -2.059 -2.213 -2.391 -2.493 -2.697 -2.894 -3.1 -3.211 -3.483 -3.622 -3.801 -3.995 -4.46 -4.723 -5.006 -5.321 -5.671 -6.1 -6.704 -8.534 -3 ,7948 ,TETRA ,17665438,Fri Dec 3 04:14:14 CET,Fri Dec 3 06:02:19 CET,0.0 0.537 0.765 0.956 1.13 1.282 1.408 1.528 1.741 1.83 1.92 1.938 2.17 2.241 2.357 2.483 2.623 2.689 2.809 2.913 3.076 3.196 3.307 3.441 3.567 3.694 3.813 3.941 4.105 4.257 4.397 4.542 4.67 4.803 4.966 5.147 5.333 5.528 5.706 5.899 6.092 6.305 6.585 6.84 7.104 7.365 7.618 7.872 8.075 8.189 8.067 7.575 6.974 6.396 5.858 5.343 4.839 4.38 3.986 3.577 3.225 2.89 2.543 2.216 1.926 1.67 1.379 1.09 0.854 0.633 0.408 0.209 -0.007 -0.235 -0.419 -0.615 -0.829 -1.046 -1.286 -1.454 -1.612 -1.862 -2.039 -2.226 -2.321 -2.526 -2.747 -2.988 -3.114 -3.398 -3.553 -3.706 -3.873 -4.266 -4.459 -4.65 -4.902 -5.174 -5.451 -5.883 -6.837 -4 ,19996 ,TETRA ,17665439,Fri Dec 3 04:14:17 CET,Fri Dec 3 06:02:05 CET,0.0 0.694 1.001 1.21 1.353 1.478 1.59 1.704 1.916 2.014 2.105 2.133 2.371 2.451 2.601 2.741 2.873 2.938 3.059 3.165 3.311 3.406 3.505 3.654 3.792 3.912 4.022 4.147 4.309 4.462 4.615 4.797 4.966 5.115 5.287 5.489 5.686 5.887 6.086 6.304 6.539 6.812 7.153 7.447 7.717 8.022 8.338 8.643 8.886 8.97 8.813 8.307 7.688 7.097 6.541 5.971 5.448 4.989 4.573 4.154 3.774 3.422 3.108 2.786 2.466 2.175 1.857 1.552 1.292 1.054 0.819 0.602 0.377 0.157 -0.032 -0.238 -0.461 -0.696 -0.92 -1.066 -1.207 -1.419 -1.579 -1.764 -1.86 -2.058 -2.265 -2.489 -2.617 -2.907 -3.027 -3.175 -3.339 -3.677 -3.866 -4.086 -4.33 -4.62 -4.941 -5.39 -6.856 -5 ,20499 ,TETRA ,17665440,Fri Dec 3 04:16:07 CET,Fri Dec 3 06:02:39 CET,0.0 0.572 0.813 0.98 1.131 1.266 1.38 1.491 1.725 1.837 1.929 1.937 2.164 2.233 2.364 2.506 2.639 2.701 2.827 2.949 3.123 3.231 3.331 3.472 3.61 3.737 3.857 3.973 4.139 4.294 4.409 4.565 4.739 4.898 5.071 5.279 5.468 5.656 5.859 6.067 6.264 6.462 6.673 6.876 7.157 7.478 7.785 8.05 8.259 8.4 8.257 7.725 7.087 6.457 5.894 5.39 4.9 4.393 3.959 3.511 3.113 2.777 2.457 2.135 1.843 1.589 1.31 1.048 0.825 0.602 0.358 0.143 -0.092 -0.322 -0.492 -0.68 -0.878 -1.086 -1.306 -1.458 -1.621 -1.882 -2.062 -2.257 -2.359 -2.554 -2.756 -2.971 -3.085 -3.36 -3.465 -3.604 -3.751 -4.086 -4.272 -4.462 -4.661 -4.89 -5.205 -5.637 -6.858 -6 ,1741 ,TETRA ,17665441,Fri Dec 3 04:19:11 CET,Fri Dec 3 06:05:54 CET,0.0 0.634 0.873 1.052 1.185 1.308 1.444 1.566 1.753 1.853 1.955 1.969 2.201 2.28 2.428 2.565 2.694 2.755 2.876 2.995 3.165 3.284 3.393 3.54 3.683 3.808 3.932 4.052 4.206 4.359 4.508 4.689 4.851 4.989 5.14 5.315 5.491 5.685 5.891 6.089 6.278 6.52 6.833 7.174 7.543 7.855 8.128 8.37 8.6 8.741 8.618 8.105 7.505 6.904 6.331 5.786 5.315 4.875 4.438 3.963 3.572 3.232 2.909 2.59 2.259 1.965 1.674 1.418 1.183 0.911 0.635 0.432 0.211 -0.05 -0.245 -0.451 -0.692 -0.951 -1.199 -1.35 -1.509 -1.766 -1.949 -2.154 -2.256 -2.467 -2.689 -2.916 -3.039 -3.321 -3.41 -3.533 -3.675 -3.989 -4.164 -4.374 -4.607 -4.859 -5.171 -5.56 -6.709 -7 ,24588 ,TETRA ,17665442,Fri Dec 3 04:19:12 CET,Fri Dec 3 06:00:21 CET,0.0 0.716 1.009 1.188 1.333 1.469 1.587 1.701 1.938 2.041 2.133 2.164 2.402 2.476 2.624 2.763 2.882 2.937 3.061 3.182 3.349 3.459 3.556 3.693 3.835 3.96 4.069 4.175 4.316 4.45 4.581 4.741 4.894 5.044 5.205 5.366 5.531 5.707 5.892 6.078 6.263 6.504 6.763 7.009 7.36 7.7 7.99 8.271 8.475 8.542 8.377 7.906 7.314 6.736 6.216 5.692 5.182 4.707 4.298 3.905 3.552 3.237 2.907 2.592 2.301 2.023 1.732 1.483 1.268 1.023 0.76 0.541 0.315 0.094 -0.073 -0.258 -0.455 -0.662 -0.874 -1.016 -1.18 -1.448 -1.639 -1.852 -1.96 -2.169 -2.387 -2.633 -2.758 -3.032 -3.144 -3.279 -3.421 -3.735 -3.932 -4.158 -4.375 -4.613 -4.866 -5.143 -6.298 -8 ,4565 ,TETRA ,17665443,Fri Dec 3 04:20:12 CET,Fri Dec 3 06:08:07 CET,0.0 0.514 0.747 0.926 1.073 1.213 1.331 1.446 1.649 1.74 1.83 1.844 2.071 2.146 2.303 2.451 2.577 2.638 2.758 2.867 3.028 3.135 3.24 3.389 3.516 3.626 3.737 3.85 4.008 4.174 4.328 4.512 4.696 4.851 5.004 5.169 5.345 5.541 5.727 5.923 6.141 6.364 6.607 6.845 7.106 7.404 7.702 7.951 8.215 8.406 8.262 7.715 7.144 6.604 6.045 5.468 4.953 4.499 4.081 3.636 3.267 2.95 2.625 2.279 1.945 1.675 1.413 1.142 0.899 0.66 0.404 0.199 0.003 -0.204 -0.385 -0.586 -0.785 -0.985 -1.204 -1.355 -1.512 -1.763 -1.923 -2.086 -2.18 -2.391 -2.613 -2.831 -2.935 -3.208 -3.345 -3.49 -3.634 -3.958 -4.148 -4.353 -4.588 -4.86 -5.176 -5.616 -6.864 -9 ,12695 ,TETRA ,17665444,Fri Dec 3 04:20:14 CET,Fri Dec 3 06:07:49 CET,0.0 0.471 0.724 0.933 1.114 1.26 1.375 1.481 1.682 1.774 1.861 1.88 2.116 2.198 2.358 2.492 2.607 2.663 2.785 2.903 3.049 3.147 3.253 3.424 3.569 3.689 3.793 3.891 4.041 4.195 4.325 4.46 4.591 4.735 4.911 5.103 5.268 5.459 5.702 5.95 6.178 6.414 6.708 6.987 7.267 7.57 7.871 8.147 8.42 8.614 8.436 7.872 7.266 6.654 6.071 5.497 4.97 4.495 4.089 3.663 3.284 2.901 2.527 2.221 1.934 1.653 1.351 1.072 0.835 0.585 0.317 0.094 -0.146 -0.399 -0.582 -0.765 -0.956 -1.162 -1.392 -1.55 -1.715 -1.969 -2.146 -2.337 -2.432 -2.615 -2.8 -3.01 -3.128 -3.409 -3.533 -3.669 -3.809 -4.105 -4.284 -4.487 -4.727 -5.008 -5.306 -5.673 -6.791 -10 ,13861 ,TETRA ,17665445,Fri Dec 3 04:20:17 CET,Fri Dec 3 06:07:49 CET,0.0 0.407 0.621 0.793 0.935 1.074 1.2 1.302 1.507 1.608 1.702 1.718 1.947 2.018 2.155 2.303 2.439 2.492 2.6 2.715 2.863 2.952 3.05 3.196 3.339 3.482 3.618 3.743 3.902 4.056 4.194 4.341 4.48 4.629 4.831 5.057 5.235 5.416 5.593 5.79 6.01 6.24 6.514 6.775 7.02 7.276 7.58 7.869 8.086 8.193 7.966 7.435 6.864 6.234 5.644 5.116 4.607 4.118 3.674 3.213 2.841 2.478 2.116 1.814 1.521 1.228 0.919 0.639 0.375 0.102 -0.162 -0.372 -0.601 -0.826 -0.984 -1.152 -1.343 -1.552 -1.765 -1.92 -2.089 -2.355 -2.534 -2.749 -2.871 -3.12 -3.388 -3.672 -3.829 -4.148 -4.339 -4.496 -4.656 -5.071 -5.319 -5.603 -5.945 -6.303 -6.749 -7.306 -8.9 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5i.txt deleted file mode 100644 index 5f3e547e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5h_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,9398 ,TETRA ,17665446,Fri Dec 3 04:20:16 CET,Fri Dec 3 06:08:16 CET,0.0 0.344 0.606 0.802 0.954 1.1 1.23 1.356 1.578 1.656 1.715 1.683 1.904 1.959 2.055 2.173 2.289 2.343 2.45 2.535 2.655 2.736 2.807 2.899 2.987 3.082 3.166 3.248 3.359 3.447 3.515 3.599 3.667 3.713 3.768 3.864 3.955 4.033 4.1 4.122 4.161 4.231 4.255 4.215 4.15 4.008 3.776 3.449 2.899 1.974 0.317 -1.725 -3.458 -4.891 -6.062 -7.12 -8.082 -8.919 -9.608 -10.298 -10.878 -11.392 -11.884 -12.345 -12.774 -13.171 -13.58 -13.946 -14.272 -14.592 -14.922 -15.209 -15.512 -15.829 -16.073 -16.317 -16.56 -16.799 -17.046 -17.225 -17.415 -17.71 -17.91 -18.126 -18.249 -18.521 -18.79 -19.033 -19.157 -19.464 -19.595 -19.763 -19.931 -20.25 -20.442 -20.645 -20.829 -21.058 -21.362 -21.748 -22.529 -2 ,18868 ,TETRA ,17665447,Fri Dec 3 04:20:12 CET,Fri Dec 3 06:08:09 CET,0.0 0.417 0.641 0.825 0.97 1.115 1.253 1.367 1.537 1.612 1.684 1.674 1.897 1.968 2.095 2.211 2.331 2.386 2.493 2.588 2.718 2.792 2.859 2.952 3.043 3.121 3.188 3.258 3.341 3.43 3.519 3.64 3.757 3.848 3.93 4.018 4.088 4.15 4.219 4.284 4.336 4.363 4.403 4.422 4.356 4.221 4.007 3.69 3.107 2.109 0.388 -1.715 -3.436 -4.888 -6.11 -7.204 -8.188 -9.037 -9.734 -10.442 -11.042 -11.569 -12.055 -12.497 -12.924 -13.333 -13.77 -14.145 -14.445 -14.762 -15.109 -15.393 -15.69 -16.004 -16.244 -16.487 -16.739 -17.005 -17.265 -17.44 -17.622 -17.914 -18.111 -18.318 -18.431 -18.65 -18.869 -19.098 -19.226 -19.535 -19.637 -19.78 -19.933 -20.267 -20.435 -20.616 -20.821 -21.069 -21.369 -21.787 -22.837 -3 ,11737 ,TETRA ,17665448,Fri Dec 3 04:20:14 CET,Fri Dec 3 06:08:07 CET,0.0 0.425 0.693 0.839 0.967 1.103 1.234 1.341 1.534 1.619 1.703 1.705 1.921 1.973 2.075 2.174 2.283 2.34 2.43 2.508 2.618 2.692 2.769 2.877 2.974 3.057 3.14 3.219 3.327 3.432 3.522 3.628 3.722 3.794 3.873 3.947 4.0 4.054 4.086 4.101 4.116 4.151 4.169 4.141 4.076 3.932 3.699 3.358 2.798 1.87 0.214 -1.876 -3.643 -5.085 -6.276 -7.36 -8.326 -9.173 -9.878 -10.601 -11.214 -11.756 -12.273 -12.751 -13.2 -13.622 -14.062 -14.463 -14.805 -15.13 -15.469 -15.761 -16.07 -16.387 -16.613 -16.844 -17.09 -17.345 -17.617 -17.812 -18.017 -18.328 -18.549 -18.773 -18.889 -19.119 -19.356 -19.626 -19.769 -20.079 -20.198 -20.349 -20.498 -20.8 -20.973 -21.168 -21.394 -21.679 -22.0 -22.404 -23.345 -4 ,10695 ,TETRA ,17665449,Fri Dec 3 04:20:16 CET,Fri Dec 3 06:08:20 CET,0.0 0.443 0.568 0.669 0.777 0.9 1.013 1.104 1.249 1.318 1.376 1.321 1.524 1.575 1.682 1.778 1.87 1.913 1.987 2.039 2.103 2.154 2.203 2.262 2.318 2.374 2.439 2.519 2.611 2.684 2.731 2.781 2.843 2.903 2.965 3.026 3.081 3.12 3.146 3.158 3.215 3.291 3.29 3.269 3.237 3.142 2.971 2.654 2.055 1.076 -0.587 -2.55 -4.205 -5.602 -6.859 -7.989 -8.889 -9.697 -10.416 -11.111 -11.694 -12.205 -12.689 -13.156 -13.59 -13.978 -14.367 -14.716 -15.033 -15.368 -15.711 -15.999 -16.288 -16.569 -16.785 -17.014 -17.251 -17.5 -17.761 -17.947 -18.135 -18.417 -18.618 -18.834 -18.946 -19.186 -19.443 -19.703 -19.836 -20.147 -20.265 -20.427 -20.595 -20.927 -21.105 -21.308 -21.539 -21.778 -22.059 -22.465 -23.337 -5 ,26920 ,TETRA ,17665450,Fri Dec 3 04:20:18 CET,Fri Dec 3 06:08:03 CET,0.0 0.318 0.484 0.62 0.745 0.896 1.019 1.126 1.326 1.409 1.489 1.477 1.684 1.742 1.856 1.96 2.06 2.106 2.205 2.308 2.433 2.503 2.574 2.668 2.757 2.855 2.954 3.032 3.112 3.185 3.254 3.35 3.445 3.546 3.656 3.729 3.782 3.865 3.943 3.986 4.021 4.046 4.062 4.048 3.991 3.868 3.632 3.281 2.714 1.748 0.062 -2.018 -3.757 -5.22 -6.431 -7.484 -8.415 -9.252 -9.96 -10.644 -11.249 -11.775 -12.252 -12.716 -13.134 -13.513 -13.935 -14.334 -14.676 -15.005 -15.332 -15.598 -15.888 -16.189 -16.414 -16.641 -16.863 -17.112 -17.384 -17.569 -17.764 -18.073 -18.279 -18.481 -18.585 -18.8 -19.028 -19.285 -19.412 -19.71 -19.847 -19.998 -20.139 -20.445 -20.614 -20.796 -21.003 -21.243 -21.559 -21.987 -23.257 -6 ,3150 ,TETRA ,17665451,Fri Dec 3 04:20:12 CET,Fri Dec 3 06:08:19 CET,0.0 0.591 0.833 1.01 1.153 1.308 1.446 1.559 1.78 1.877 1.962 1.958 2.179 2.24 2.352 2.474 2.579 2.619 2.692 2.77 2.894 2.976 3.054 3.158 3.256 3.351 3.441 3.524 3.626 3.713 3.788 3.887 3.996 4.102 4.198 4.295 4.38 4.431 4.476 4.54 4.586 4.618 4.627 4.578 4.52 4.414 4.162 3.791 3.218 2.261 0.582 -1.537 -3.299 -4.767 -5.99 -7.061 -7.98 -8.808 -9.539 -10.25 -10.833 -11.342 -11.821 -12.28 -12.727 -13.147 -13.555 -13.908 -14.221 -14.538 -14.866 -15.147 -15.432 -15.735 -15.976 -16.215 -16.459 -16.707 -16.964 -17.14 -17.32 -17.6 -17.798 -18.006 -18.115 -18.34 -18.577 -18.827 -18.959 -19.266 -19.387 -19.548 -19.712 -20.047 -20.235 -20.443 -20.675 -20.959 -21.299 -21.694 -22.62 -7 ,17426 ,TETRA ,17665452,Fri Dec 3 04:20:14 CET,Fri Dec 3 06:08:29 CET,0.0 0.646 0.912 1.134 1.306 1.432 1.533 1.63 1.794 1.872 1.952 1.942 2.158 2.218 2.34 2.456 2.56 2.612 2.704 2.793 2.932 3.006 3.075 3.182 3.275 3.384 3.498 3.591 3.693 3.79 3.882 3.994 4.083 4.143 4.208 4.279 4.337 4.39 4.459 4.523 4.552 4.562 4.576 4.559 4.476 4.357 4.159 3.83 3.298 2.364 0.679 -1.429 -3.178 -4.623 -5.87 -6.975 -7.912 -8.751 -9.449 -10.154 -10.756 -11.286 -11.795 -12.246 -12.682 -13.082 -13.482 -13.875 -14.217 -14.565 -14.938 -15.214 -15.496 -15.804 -16.038 -16.272 -16.496 -16.728 -16.97 -17.151 -17.349 -17.645 -17.849 -18.055 -18.159 -18.376 -18.613 -18.879 -19.018 -19.324 -19.44 -19.593 -19.744 -20.056 -20.246 -20.462 -20.684 -20.911 -21.192 -21.641 -22.98 -8 ,7274 ,TETRA ,17665453,Fri Dec 3 04:20:14 CET,Fri Dec 3 06:08:22 CET,0.0 0.554 0.788 0.965 1.123 1.245 1.361 1.471 1.684 1.763 1.83 1.821 2.042 2.107 2.22 2.319 2.409 2.461 2.563 2.642 2.775 2.861 2.929 3.025 3.126 3.214 3.296 3.367 3.459 3.545 3.623 3.714 3.794 3.876 3.954 4.028 4.099 4.162 4.213 4.275 4.321 4.338 4.347 4.342 4.288 4.137 3.902 3.574 2.993 2.019 0.354 -1.733 -3.444 -4.92 -6.227 -7.381 -8.327 -9.173 -9.894 -10.584 -11.187 -11.734 -12.254 -12.723 -13.172 -13.582 -13.991 -14.376 -14.69 -14.99 -15.326 -15.626 -15.924 -16.223 -16.463 -16.711 -16.956 -17.2 -17.455 -17.625 -17.802 -18.081 -18.285 -18.491 -18.597 -18.829 -19.062 -19.295 -19.413 -19.707 -19.82 -19.966 -20.111 -20.451 -20.642 -20.834 -21.041 -21.294 -21.61 -21.997 -22.763 -9 ,28795 ,TETRA ,17665454,Fri Dec 3 04:20:14 CET,Fri Dec 3 06:08:01 CET,0.0 0.492 0.642 0.77 0.874 0.966 1.071 1.181 1.363 1.443 1.51 1.455 1.662 1.724 1.838 1.943 2.038 2.082 2.182 2.29 2.448 2.533 2.597 2.694 2.804 2.901 2.968 3.043 3.17 3.281 3.367 3.482 3.586 3.655 3.728 3.815 3.881 3.932 4.007 4.075 4.116 4.182 4.209 4.205 4.192 4.077 3.847 3.508 2.963 2.056 0.398 -1.743 -3.486 -4.904 -6.101 -7.157 -8.064 -8.869 -9.541 -10.254 -10.881 -11.415 -11.908 -12.371 -12.806 -13.194 -13.589 -13.943 -14.253 -14.584 -14.931 -15.228 -15.55 -15.865 -16.116 -16.366 -16.607 -16.864 -17.124 -17.308 -17.504 -17.795 -17.997 -18.211 -18.316 -18.516 -18.742 -18.999 -19.137 -19.444 -19.562 -19.703 -19.847 -20.182 -20.355 -20.549 -20.776 -21.043 -21.336 -21.7 -22.706 -10 ,22450 ,TETRA ,17665455,Fri Dec 3 04:20:14 CET,Fri Dec 3 06:08:21 CET,0.0 0.493 0.704 0.845 0.956 1.033 1.117 1.209 1.368 1.433 1.499 1.488 1.71 1.776 1.903 1.999 2.081 2.127 2.24 2.343 2.459 2.537 2.61 2.712 2.825 2.921 2.995 3.06 3.143 3.228 3.318 3.42 3.498 3.554 3.625 3.701 3.771 3.834 3.861 3.897 3.932 3.95 3.96 3.951 3.902 3.807 3.606 3.259 2.688 1.734 0.048 -2.008 -3.705 -5.132 -6.385 -7.489 -8.444 -9.301 -10.021 -10.721 -11.307 -11.852 -12.36 -12.814 -13.243 -13.633 -14.03 -14.374 -14.676 -14.999 -15.327 -15.604 -15.9 -16.193 -16.417 -16.644 -16.879 -17.125 -17.376 -17.553 -17.749 -18.065 -18.275 -18.489 -18.602 -18.824 -19.049 -19.295 -19.427 -19.729 -19.838 -19.991 -20.14 -20.449 -20.644 -20.855 -21.084 -21.36 -21.659 -22.046 -23.155 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5a.txt deleted file mode 100644 index 82296a90..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,13912 ,KEBNE ,17026513,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:07:27 CET,0.0 0.391 0.596 0.771 0.92 1.05 1.168 1.263 1.445 1.53 1.602 1.584 1.831 1.905 2.04 2.148 2.242 2.293 2.397 2.501 2.652 2.745 2.827 2.936 3.055 3.187 3.312 3.413 3.531 3.642 3.735 3.851 3.979 4.107 4.261 4.42 4.55 4.696 4.843 4.996 5.148 5.314 5.505 5.671 5.857 6.066 6.273 6.408 6.458 6.398 6.035 5.381 4.737 4.146 3.574 3.024 2.539 2.108 1.741 1.345 0.997 0.7 0.431 0.132 -0.172 -0.434 -0.699 -0.935 -1.134 -1.333 -1.528 -1.699 -1.898 -2.115 -2.28 -2.445 -2.604 -2.759 -2.942 -3.088 -3.239 -3.459 -3.611 -3.765 -3.846 -4.022 -4.196 -4.375 -4.475 -4.757 -4.821 -4.949 -5.059 -5.278 -5.427 -5.61 -5.803 -6.044 -6.335 -6.672 -7.465 -2 ,21311 ,KEBNE ,17026514,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:06:49 CET,0.0 0.462 0.672 0.876 1.049 1.175 1.285 1.392 1.596 1.681 1.752 1.723 1.958 2.021 2.155 2.278 2.397 2.451 2.555 2.67 2.831 2.916 2.997 3.116 3.24 3.355 3.458 3.566 3.701 3.832 3.96 4.097 4.246 4.387 4.53 4.679 4.801 4.928 5.068 5.222 5.369 5.517 5.699 5.876 6.082 6.299 6.483 6.631 6.701 6.635 6.328 5.669 4.989 4.346 3.773 3.262 2.789 2.328 1.936 1.531 1.158 0.844 0.564 0.297 0.027 -0.233 -0.486 -0.709 -0.92 -1.143 -1.38 -1.573 -1.762 -1.97 -2.154 -2.339 -2.517 -2.708 -2.896 -3.02 -3.145 -3.35 -3.51 -3.672 -3.75 -3.902 -4.066 -4.266 -4.371 -4.644 -4.686 -4.812 -4.941 -5.221 -5.378 -5.546 -5.723 -5.912 -6.145 -6.433 -7.282 -3 ,21427 ,KEBNE ,17026515,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:06:49 CET,0.0 0.482 0.735 0.949 1.101 1.203 1.312 1.417 1.602 1.695 1.783 1.779 2.023 2.087 2.2 2.313 2.42 2.477 2.591 2.693 2.832 2.924 3.013 3.142 3.277 3.399 3.496 3.599 3.753 3.879 3.976 4.092 4.208 4.323 4.47 4.64 4.779 4.918 5.076 5.242 5.4 5.57 5.755 5.935 6.15 6.357 6.54 6.694 6.802 6.787 6.429 5.781 5.146 4.512 3.938 3.412 2.903 2.428 2.009 1.603 1.262 0.943 0.61 0.301 0.031 -0.235 -0.527 -0.802 -1.045 -1.271 -1.476 -1.642 -1.819 -2.011 -2.172 -2.341 -2.526 -2.727 -2.919 -3.059 -3.207 -3.42 -3.571 -3.714 -3.79 -3.97 -4.144 -4.334 -4.44 -4.718 -4.755 -4.869 -5.004 -5.323 -5.491 -5.665 -5.864 -6.102 -6.365 -6.712 -7.505 -4 ,17591 ,KEBNE ,17026516,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:08:16 CET,0.0 0.932 1.259 1.445 1.599 1.764 1.899 2.009 2.213 2.305 2.391 2.368 2.609 2.687 2.825 2.953 3.074 3.126 3.236 3.351 3.492 3.576 3.666 3.8 3.924 4.032 4.138 4.247 4.39 4.514 4.629 4.783 4.932 5.053 5.174 5.338 5.5 5.656 5.785 5.92 6.085 6.263 6.453 6.649 6.86 7.042 7.218 7.362 7.441 7.377 7.019 6.336 5.648 5.028 4.441 3.91 3.471 3.037 2.657 2.29 1.962 1.658 1.377 1.114 0.863 0.618 0.359 0.125 -0.081 -0.282 -0.508 -0.694 -0.875 -1.084 -1.239 -1.4 -1.582 -1.765 -1.949 -2.068 -2.177 -2.371 -2.528 -2.697 -2.781 -2.938 -3.12 -3.33 -3.441 -3.732 -3.796 -3.913 -4.037 -4.3 -4.444 -4.601 -4.788 -5.029 -5.317 -5.664 -6.544 -5 ,4788 ,KEBNE ,17026517,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:06:54 CET,0.0 0.682 0.964 1.185 1.326 1.456 1.589 1.695 1.874 1.953 2.025 2.0 2.248 2.319 2.454 2.567 2.683 2.743 2.847 2.949 3.101 3.195 3.275 3.386 3.5 3.634 3.757 3.859 3.998 4.127 4.233 4.357 4.476 4.591 4.73 4.896 5.049 5.182 5.325 5.476 5.617 5.794 5.986 6.153 6.325 6.487 6.682 6.853 6.959 6.921 6.531 5.833 5.129 4.502 3.924 3.378 2.899 2.45 2.037 1.61 1.232 0.898 0.588 0.309 0.056 -0.181 -0.429 -0.666 -0.879 -1.094 -1.317 -1.508 -1.701 -1.888 -2.035 -2.185 -2.35 -2.54 -2.716 -2.827 -2.958 -3.181 -3.329 -3.476 -3.558 -3.736 -3.911 -4.101 -4.211 -4.501 -4.573 -4.688 -4.803 -5.091 -5.247 -5.401 -5.559 -5.746 -5.993 -6.3 -7.576 -6 ,23844 ,KEBNE ,17026518,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:06:33 CET,0.0 0.716 0.986 1.202 1.354 1.484 1.613 1.729 1.914 1.99 2.066 2.053 2.298 2.379 2.525 2.652 2.777 2.832 2.945 3.061 3.203 3.296 3.378 3.486 3.603 3.734 3.868 3.976 4.092 4.231 4.376 4.519 4.64 4.76 4.897 5.043 5.171 5.299 5.436 5.566 5.705 5.874 6.084 6.305 6.543 6.757 6.912 7.004 7.033 6.96 6.642 6.025 5.383 4.786 4.243 3.725 3.256 2.853 2.473 2.074 1.749 1.456 1.141 0.841 0.585 0.358 0.131 -0.098 -0.312 -0.513 -0.734 -0.938 -1.155 -1.39 -1.557 -1.706 -1.879 -2.079 -2.28 -2.41 -2.546 -2.766 -2.925 -3.093 -3.18 -3.354 -3.535 -3.731 -3.834 -4.106 -4.145 -4.253 -4.347 -4.59 -4.731 -4.883 -5.044 -5.221 -5.432 -5.667 -6.25 -7 ,7241 ,KEBNE ,17026519,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:08:20 CET,0.0 0.865 1.141 1.334 1.476 1.602 1.728 1.848 2.043 2.135 2.23 2.224 2.464 2.528 2.656 2.788 2.907 2.967 3.084 3.196 3.383 3.488 3.567 3.696 3.829 3.94 4.053 4.156 4.288 4.432 4.565 4.705 4.84 4.967 5.094 5.237 5.376 5.519 5.659 5.796 5.948 6.111 6.273 6.438 6.621 6.802 6.952 7.04 7.11 7.119 6.868 6.254 5.64 5.096 4.557 4.018 3.565 3.152 2.777 2.384 2.039 1.694 1.363 1.086 0.833 0.609 0.367 0.125 -0.096 -0.315 -0.541 -0.724 -0.916 -1.138 -1.316 -1.501 -1.683 -1.86 -2.059 -2.21 -2.366 -2.583 -2.724 -2.882 -2.968 -3.147 -3.332 -3.516 -3.611 -3.893 -3.949 -4.067 -4.191 -4.444 -4.588 -4.752 -4.942 -5.151 -5.406 -5.779 -6.68 -8 ,23992 ,KEBNE ,17026520,Wed Dec 22 14:33:58 CET,Wed Dec 22 16:07:06 CET,0.0 0.812 1.159 1.377 1.549 1.695 1.825 1.939 2.148 2.243 2.32 2.302 2.552 2.626 2.76 2.881 2.988 3.047 3.15 3.243 3.389 3.485 3.588 3.737 3.876 3.991 4.098 4.207 4.333 4.446 4.552 4.686 4.832 4.98 5.133 5.281 5.432 5.604 5.756 5.882 6.016 6.169 6.35 6.556 6.763 6.941 7.115 7.249 7.339 7.312 6.99 6.402 5.796 5.195 4.645 4.139 3.647 3.157 2.741 2.357 2.009 1.697 1.41 1.135 0.875 0.641 0.384 0.122 -0.081 -0.277 -0.501 -0.69 -0.9 -1.12 -1.284 -1.451 -1.605 -1.765 -1.954 -2.086 -2.221 -2.438 -2.583 -2.74 -2.821 -2.967 -3.15 -3.372 -3.48 -3.759 -3.805 -3.925 -4.054 -4.337 -4.495 -4.662 -4.877 -5.12 -5.385 -5.767 -7.034 -9 ,5120 ,KEBNE ,17026521,Wed Dec 22 14:33:59 CET,Wed Dec 22 16:06:33 CET,0.0 0.672 0.911 1.136 1.31 1.43 1.533 1.626 1.802 1.887 1.962 1.928 2.161 2.227 2.368 2.492 2.593 2.643 2.74 2.842 3.004 3.108 3.207 3.346 3.479 3.603 3.72 3.838 3.987 4.116 4.227 4.342 4.476 4.599 4.72 4.861 4.999 5.142 5.291 5.463 5.627 5.82 6.056 6.225 6.391 6.556 6.715 6.871 6.992 6.994 6.681 6.002 5.322 4.731 4.206 3.696 3.241 2.815 2.447 2.075 1.733 1.434 1.151 0.844 0.559 0.302 0.021 -0.216 -0.413 -0.632 -0.87 -1.057 -1.258 -1.476 -1.623 -1.766 -1.942 -2.13 -2.317 -2.436 -2.547 -2.722 -2.844 -2.974 -3.039 -3.177 -3.331 -3.504 -3.596 -3.867 -3.883 -3.984 -4.105 -4.37 -4.518 -4.704 -4.914 -5.138 -5.394 -5.707 -6.622 -10 ,19177 ,KEBNE ,17026522,Wed Dec 22 14:35:00 CET,Wed Dec 22 16:09:01 CET,0.0 0.94 1.249 1.475 1.659 1.791 1.902 2.001 2.182 2.284 2.383 2.379 2.625 2.693 2.825 2.958 3.085 3.145 3.258 3.371 3.539 3.639 3.731 3.85 3.964 4.075 4.173 4.279 4.414 4.53 4.639 4.772 4.911 5.053 5.194 5.336 5.5 5.674 5.812 5.956 6.131 6.317 6.516 6.695 6.857 7.023 7.21 7.363 7.463 7.477 7.177 6.528 5.894 5.305 4.748 4.243 3.792 3.336 2.911 2.491 2.147 1.836 1.552 1.289 1.024 0.775 0.495 0.254 0.048 -0.172 -0.394 -0.575 -0.778 -1.013 -1.184 -1.343 -1.515 -1.697 -1.897 -2.042 -2.183 -2.408 -2.556 -2.705 -2.783 -2.944 -3.124 -3.308 -3.391 -3.655 -3.706 -3.838 -3.977 -4.256 -4.417 -4.586 -4.765 -4.999 -5.324 -5.744 -6.698 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5g.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5g.txt deleted file mode 100644 index dc4bb37c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5i_5g.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16742 ,TETRA ,17665456,Fri Dec 3 04:20:14 CET,Fri Dec 3 06:07:23 CET,0.0 0.593 0.87 1.112 1.329 1.495 1.611 1.73 1.962 2.062 2.154 2.158 2.41 2.498 2.652 2.79 2.93 2.996 3.124 3.25 3.441 3.562 3.671 3.826 3.999 4.16 4.296 4.438 4.627 4.8 4.96 5.137 5.321 5.509 5.726 5.968 6.171 6.387 6.626 6.874 7.124 7.43 7.811 8.149 8.521 8.927 9.399 9.927 10.491 11.086 11.648 11.888 11.818 11.598 11.394 11.209 10.998 10.779 10.582 10.365 10.165 9.981 9.75 9.515 9.347 9.22 9.081 8.949 8.826 8.674 8.531 8.432 8.325 8.222 8.15 8.074 7.981 7.886 7.786 7.69 7.592 7.469 7.387 7.305 7.261 7.157 7.039 6.919 6.853 6.62 6.669 6.611 6.55 6.411 6.335 6.251 6.15 6.044 5.936 5.816 5.558 -2 ,20543 ,TETRA ,17665457,Fri Dec 3 04:20:17 CET,Fri Dec 3 06:08:46 CET,0.0 1.107 1.438 1.671 1.847 1.993 2.13 2.241 2.44 2.535 2.626 2.655 2.917 2.999 3.155 3.299 3.451 3.523 3.648 3.777 3.98 4.11 4.228 4.38 4.519 4.663 4.801 4.944 5.138 5.303 5.469 5.674 5.868 6.052 6.258 6.493 6.742 7.029 7.288 7.541 7.809 8.123 8.486 8.827 9.233 9.685 10.174 10.699 11.258 11.857 12.445 12.681 12.627 12.457 12.262 12.053 11.82 11.598 11.392 11.179 10.994 10.813 10.636 10.457 10.295 10.127 9.916 9.732 9.578 9.433 9.295 9.18 9.063 8.945 8.845 8.724 8.59 8.472 8.351 8.254 8.163 8.029 7.926 7.84 7.804 7.721 7.63 7.526 7.468 7.236 7.256 7.18 7.101 6.921 6.83 6.732 6.635 6.546 6.46 6.346 6.033 -3 ,6083 ,TETRA ,17665458,Fri Dec 3 04:20:18 CET,Fri Dec 3 06:08:25 CET,0.0 0.531 0.7 0.856 1.009 1.172 1.329 1.457 1.708 1.825 1.924 1.934 2.19 2.284 2.475 2.652 2.798 2.857 2.974 3.087 3.257 3.382 3.497 3.655 3.814 3.966 4.12 4.268 4.434 4.605 4.79 5.009 5.22 5.401 5.59 5.799 6.01 6.265 6.529 6.799 7.088 7.397 7.79 8.188 8.584 9.014 9.475 9.951 10.474 11.05 11.629 11.885 11.868 11.738 11.537 11.282 11.03 10.771 10.545 10.326 10.128 9.939 9.739 9.544 9.367 9.197 8.988 8.793 8.637 8.487 8.333 8.206 8.089 7.953 7.83 7.706 7.571 7.431 7.295 7.2 7.096 6.919 6.793 6.67 6.61 6.501 6.411 6.32 6.27 6.054 6.117 6.065 6.001 5.853 5.783 5.711 5.63 5.54 5.425 5.274 5.043 -4 ,6671 ,TETRA ,17665459,Fri Dec 3 04:20:13 CET,Fri Dec 3 06:07:09 CET,0.0 0.681 0.983 1.21 1.39 1.562 1.717 1.843 2.074 2.171 2.269 2.294 2.547 2.633 2.8 2.943 3.077 3.141 3.268 3.395 3.571 3.681 3.796 3.968 4.137 4.293 4.446 4.593 4.773 4.944 5.097 5.286 5.488 5.674 5.866 6.069 6.271 6.502 6.743 7.007 7.296 7.619 7.982 8.338 8.769 9.216 9.696 10.205 10.746 11.325 11.833 12.051 12.016 11.844 11.628 11.416 11.198 10.937 10.677 10.412 10.198 9.999 9.795 9.618 9.447 9.282 9.107 8.927 8.774 8.631 8.467 8.321 8.179 8.035 7.92 7.789 7.663 7.543 7.426 7.353 7.283 7.163 7.067 6.981 6.938 6.846 6.745 6.626 6.565 6.337 6.384 6.32 6.251 6.112 6.034 5.936 5.828 5.721 5.598 5.439 5.217 -5 ,25986 ,TETRA ,17665460,Fri Dec 3 04:20:14 CET,Fri Dec 3 06:06:52 CET,0.0 0.924 1.245 1.472 1.654 1.827 1.985 2.11 2.323 2.435 2.54 2.567 2.829 2.906 3.049 3.191 3.321 3.388 3.533 3.678 3.852 3.961 4.078 4.232 4.38 4.542 4.699 4.848 5.051 5.229 5.382 5.587 5.777 5.933 6.124 6.352 6.567 6.796 7.048 7.336 7.627 7.952 8.331 8.663 9.055 9.493 9.954 10.469 11.029 11.636 12.256 12.506 12.457 12.275 12.069 11.876 11.678 11.439 11.205 10.991 10.813 10.634 10.43 10.227 10.036 9.859 9.694 9.545 9.399 9.249 9.101 8.968 8.818 8.65 8.535 8.429 8.297 8.158 8.013 7.911 7.803 7.629 7.506 7.382 7.317 7.173 7.028 6.885 6.816 6.575 6.563 6.476 6.375 6.138 6.009 5.877 5.74 5.572 5.392 5.102 4.499 -6 ,2255 ,TETRA ,17665461,Fri Dec 3 04:20:17 CET,Fri Dec 3 06:07:35 CET,0.0 0.623 0.93 1.159 1.338 1.49 1.615 1.738 1.977 2.081 2.182 2.223 2.487 2.566 2.735 2.908 3.054 3.119 3.259 3.389 3.557 3.678 3.792 3.95 4.111 4.277 4.422 4.543 4.716 4.899 5.082 5.296 5.486 5.674 5.891 6.124 6.355 6.604 6.87 7.152 7.431 7.739 8.101 8.442 8.821 9.257 9.757 10.242 10.801 11.457 12.043 12.231 12.119 11.902 11.682 11.449 11.198 10.965 10.761 10.525 10.329 10.146 9.934 9.74 9.559 9.387 9.22 9.08 8.963 8.832 8.676 8.541 8.385 8.224 8.106 7.996 7.875 7.728 7.576 7.469 7.362 7.202 7.088 6.974 6.914 6.79 6.659 6.514 6.438 6.194 6.187 6.095 5.994 5.774 5.651 5.517 5.381 5.206 5.021 4.869 4.479 -7 ,18672 ,TETRA ,17665462,Fri Dec 3 04:20:19 CET,Fri Dec 3 06:07:09 CET,0.0 0.873 1.181 1.411 1.568 1.719 1.861 1.975 2.196 2.309 2.413 2.445 2.698 2.778 2.937 3.072 3.206 3.28 3.426 3.553 3.746 3.874 3.991 4.164 4.324 4.474 4.615 4.744 4.905 5.079 5.26 5.46 5.653 5.843 6.054 6.284 6.513 6.753 6.99 7.244 7.521 7.82 8.182 8.553 8.952 9.382 9.847 10.351 10.947 11.613 12.19 12.381 12.351 12.215 12.013 11.781 11.563 11.358 11.166 10.967 10.789 10.623 10.439 10.249 10.067 9.907 9.751 9.595 9.443 9.284 9.124 8.992 8.856 8.716 8.605 8.482 8.354 8.21 8.051 7.947 7.839 7.674 7.563 7.434 7.362 7.228 7.096 6.951 6.875 6.637 6.631 6.529 6.41 6.167 6.048 5.916 5.776 5.609 5.413 5.167 4.62 -8 ,1207 ,TETRA ,17665463,Fri Dec 3 04:21:12 CET,Fri Dec 3 06:08:29 CET,0.0 0.563 0.821 1.014 1.17 1.319 1.433 1.538 1.755 1.858 1.955 1.974 2.235 2.323 2.492 2.646 2.794 2.869 2.999 3.113 3.295 3.42 3.539 3.703 3.861 4.016 4.159 4.285 4.445 4.613 4.769 4.945 5.117 5.286 5.485 5.705 5.944 6.214 6.475 6.75 7.039 7.352 7.705 8.053 8.434 8.85 9.329 9.843 10.386 10.934 11.454 11.716 11.718 11.55 11.322 11.066 10.786 10.542 10.345 10.153 9.966 9.777 9.581 9.378 9.207 9.044 8.859 8.7 8.571 8.44 8.284 8.151 8.017 7.869 7.756 7.648 7.526 7.394 7.265 7.177 7.088 6.957 6.871 6.792 6.753 6.675 6.597 6.488 6.428 6.208 6.261 6.195 6.134 6.018 5.945 5.866 5.786 5.694 5.599 5.479 5.253 -9 ,18968 ,TETRA ,17665464,Fri Dec 3 04:21:13 CET,Fri Dec 3 06:08:05 CET,0.0 0.885 1.225 1.415 1.575 1.714 1.837 1.96 2.163 2.257 2.359 2.388 2.644 2.728 2.895 3.059 3.213 3.284 3.415 3.55 3.748 3.871 3.988 4.145 4.3 4.451 4.59 4.717 4.889 5.076 5.259 5.471 5.678 5.876 6.101 6.339 6.55 6.789 7.068 7.386 7.703 8.03 8.382 8.715 9.131 9.61 10.107 10.616 11.204 11.819 12.405 12.668 12.641 12.52 12.35 12.12 11.902 11.686 11.483 11.269 11.065 10.868 10.693 10.528 10.365 10.209 10.01 9.817 9.665 9.514 9.334 9.195 9.065 8.906 8.778 8.642 8.498 8.363 8.214 8.101 7.988 7.83 7.729 7.624 7.557 7.403 7.25 7.086 6.995 6.74 6.72 6.623 6.526 6.321 6.224 6.133 6.03 5.896 5.734 5.524 5.222 -10 ,24849 ,TETRA ,17665465,Fri Dec 3 04:21:12 CET,Fri Dec 3 06:08:26 CET,0.0 0.935 1.28 1.472 1.639 1.789 1.913 2.044 2.295 2.406 2.512 2.53 2.781 2.852 2.995 3.146 3.284 3.356 3.498 3.629 3.818 3.934 4.04 4.186 4.33 4.479 4.631 4.783 4.986 5.168 5.33 5.527 5.727 5.921 6.121 6.339 6.561 6.805 7.065 7.329 7.604 7.91 8.25 8.62 9.036 9.459 9.937 10.457 11.046 11.676 12.262 12.504 12.44 12.256 12.067 11.866 11.653 11.427 11.195 10.945 10.728 10.521 10.316 10.145 9.987 9.824 9.659 9.501 9.341 9.197 9.056 8.909 8.757 8.601 8.479 8.357 8.236 8.101 7.959 7.867 7.773 7.621 7.513 7.394 7.325 7.192 7.049 6.887 6.82 6.597 6.639 6.571 6.501 6.357 6.274 6.182 6.086 5.989 5.886 5.769 5.554 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5j_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5j_5b.txt deleted file mode 100644 index 0301c600..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5j_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,16266 ,TETRA ,17665466,Fri Dec 3 04:21:15 CET,Fri Dec 3 06:07:20 CET,0.0 0.426 0.656 0.844 0.991 1.098 1.213 1.329 1.537 1.623 1.701 1.663 1.923 1.991 2.107 2.22 2.331 2.38 2.483 2.585 2.723 2.818 2.919 3.063 3.187 3.299 3.409 3.508 3.62 3.732 3.833 3.942 4.053 4.153 4.261 4.403 4.544 4.677 4.812 4.94 5.078 5.217 5.314 5.385 5.469 5.569 5.611 5.554 5.399 4.981 4.062 2.81 1.73 0.793 -0.034 -0.786 -1.445 -2.065 -2.601 -3.095 -3.549 -3.963 -4.333 -4.679 -5.01 -5.312 -5.596 -5.863 -6.12 -6.365 -6.602 -6.815 -7.04 -7.297 -7.507 -7.694 -7.875 -8.073 -8.288 -8.435 -8.574 -8.805 -8.98 -9.155 -9.238 -9.406 -9.592 -9.78 -9.872 -10.174 -10.2 -10.312 -10.418 -10.656 -10.814 -10.98 -11.138 -11.324 -11.52 -11.751 -12.33 -2 ,28923 ,TETRA ,17665467,Fri Dec 3 04:21:13 CET,Fri Dec 3 06:07:23 CET,0.0 0.427 0.651 0.806 0.944 1.071 1.195 1.302 1.473 1.549 1.623 1.588 1.85 1.92 2.049 2.18 2.305 2.363 2.474 2.567 2.689 2.765 2.84 2.955 3.075 3.192 3.291 3.391 3.54 3.671 3.796 3.931 4.033 4.141 4.27 4.412 4.531 4.65 4.785 4.906 5.043 5.203 5.371 5.517 5.608 5.664 5.693 5.637 5.406 4.965 4.104 2.871 1.744 0.748 -0.094 -0.839 -1.496 -2.075 -2.553 -3.022 -3.432 -3.794 -4.14 -4.463 -4.76 -5.048 -5.359 -5.641 -5.888 -6.127 -6.352 -6.539 -6.741 -6.952 -7.115 -7.289 -7.467 -7.645 -7.828 -7.952 -8.086 -8.297 -8.447 -8.607 -8.687 -8.854 -9.054 -9.254 -9.346 -9.647 -9.645 -9.756 -9.873 -10.113 -10.249 -10.403 -10.556 -10.725 -10.942 -11.176 -11.612 -3 ,22100 ,TETRA ,17665468,Fri Dec 3 04:21:15 CET,Fri Dec 3 06:07:43 CET,0.0 0.439 0.694 0.86 0.976 1.095 1.197 1.287 1.451 1.52 1.592 1.533 1.789 1.859 1.996 2.115 2.221 2.279 2.392 2.487 2.607 2.683 2.774 2.896 3.009 3.134 3.24 3.324 3.43 3.53 3.624 3.737 3.849 3.955 4.074 4.201 4.311 4.416 4.548 4.686 4.783 4.9 5.041 5.128 5.198 5.218 5.208 5.167 4.98 4.571 3.679 2.388 1.236 0.223 -0.624 -1.344 -1.987 -2.589 -3.111 -3.635 -4.06 -4.427 -4.796 -5.152 -5.475 -5.762 -6.066 -6.358 -6.605 -6.849 -7.124 -7.343 -7.55 -7.775 -7.94 -8.106 -8.292 -8.489 -8.713 -8.864 -8.999 -9.207 -9.357 -9.513 -9.587 -9.748 -9.929 -10.114 -10.207 -10.511 -10.516 -10.624 -10.746 -11.031 -11.172 -11.325 -11.51 -11.693 -11.878 -12.121 -12.688 -4 ,25030 ,TETRA ,17665469,Fri Dec 3 04:21:17 CET,Fri Dec 3 06:07:54 CET,0.0 0.529 0.837 1.104 1.27 1.404 1.527 1.641 1.852 1.946 2.028 1.98 2.239 2.304 2.419 2.542 2.659 2.711 2.817 2.915 3.045 3.126 3.207 3.331 3.448 3.562 3.664 3.758 3.89 4.015 4.118 4.253 4.384 4.509 4.653 4.784 4.906 5.023 5.138 5.269 5.393 5.529 5.678 5.798 5.871 5.906 5.921 5.885 5.702 5.239 4.327 3.079 1.968 0.993 0.128 -0.642 -1.287 -1.866 -2.38 -2.882 -3.301 -3.673 -4.062 -4.424 -4.731 -5.018 -5.32 -5.598 -5.848 -6.09 -6.345 -6.554 -6.768 -6.999 -7.187 -7.374 -7.552 -7.758 -7.973 -8.112 -8.241 -8.424 -8.579 -8.758 -8.846 -9.019 -9.192 -9.379 -9.481 -9.778 -9.782 -9.902 -10.011 -10.233 -10.369 -10.52 -10.685 -10.855 -11.059 -11.417 -12.144 -5 ,29965 ,TETRA ,17665470,Fri Dec 3 04:21:19 CET,Fri Dec 3 06:07:40 CET,0.0 0.777 1.053 1.223 1.367 1.501 1.61 1.706 1.889 1.977 2.054 2.0 2.252 2.311 2.428 2.551 2.673 2.731 2.842 2.948 3.098 3.192 3.284 3.42 3.545 3.663 3.777 3.882 4.022 4.161 4.287 4.413 4.522 4.627 4.74 4.859 4.953 5.071 5.222 5.369 5.498 5.612 5.718 5.807 5.883 5.938 5.966 5.931 5.756 5.368 4.488 3.215 2.124 1.199 0.38 -0.389 -1.079 -1.683 -2.187 -2.684 -3.108 -3.483 -3.849 -4.215 -4.565 -4.89 -5.223 -5.502 -5.744 -5.997 -6.236 -6.425 -6.64 -6.873 -7.046 -7.229 -7.425 -7.625 -7.84 -7.99 -8.123 -8.328 -8.485 -8.646 -8.729 -8.907 -9.089 -9.272 -9.379 -9.685 -9.685 -9.793 -9.9 -10.148 -10.293 -10.437 -10.604 -10.805 -11.03 -11.32 -11.871 -6 ,22628 ,TETRA ,17665471,Fri Dec 3 04:21:12 CET,Fri Dec 3 06:07:12 CET,0.0 0.355 0.573 0.731 0.863 0.991 1.108 1.209 1.381 1.461 1.543 1.516 1.786 1.861 1.99 2.11 2.233 2.293 2.4 2.487 2.619 2.717 2.812 2.945 3.06 3.155 3.24 3.334 3.455 3.555 3.656 3.778 3.902 4.011 4.122 4.25 4.375 4.523 4.667 4.772 4.882 4.998 5.093 5.198 5.297 5.33 5.336 5.296 5.122 4.675 3.735 2.474 1.364 0.374 -0.53 -1.309 -1.986 -2.581 -3.081 -3.601 -4.028 -4.412 -4.788 -5.138 -5.481 -5.788 -6.075 -6.315 -6.517 -6.756 -7.039 -7.269 -7.503 -7.736 -7.895 -8.061 -8.251 -8.454 -8.663 -8.805 -8.94 -9.143 -9.298 -9.449 -9.518 -9.671 -9.841 -10.023 -10.113 -10.407 -10.414 -10.533 -10.66 -10.914 -11.057 -11.204 -11.354 -11.536 -11.768 -12.039 -12.73 -7 ,8763 ,TETRA ,17665472,Fri Dec 3 04:21:13 CET,Fri Dec 3 06:07:38 CET,0.0 0.686 0.954 1.137 1.265 1.365 1.469 1.567 1.757 1.851 1.932 1.887 2.149 2.221 2.357 2.496 2.622 2.675 2.779 2.879 3.017 3.101 3.181 3.3 3.416 3.536 3.66 3.759 3.886 4.013 4.125 4.262 4.39 4.498 4.641 4.798 4.903 5.016 5.136 5.261 5.373 5.491 5.635 5.736 5.816 5.847 5.844 5.797 5.611 5.208 4.302 3.028 1.946 1.034 0.241 -0.479 -1.11 -1.677 -2.168 -2.675 -3.098 -3.447 -3.798 -4.171 -4.527 -4.827 -5.138 -5.41 -5.637 -5.884 -6.135 -6.338 -6.538 -6.735 -6.896 -7.069 -7.245 -7.424 -7.617 -7.762 -7.908 -8.123 -8.266 -8.425 -8.514 -8.692 -8.87 -9.06 -9.166 -9.478 -9.473 -9.574 -9.687 -9.941 -10.083 -10.242 -10.415 -10.594 -10.793 -11.032 -11.513 -8 ,2680 ,TETRA ,17665473,Fri Dec 3 04:21:15 CET,Fri Dec 3 06:07:21 CET,0.0 0.929 1.234 1.414 1.566 1.704 1.826 1.934 2.106 2.182 2.257 2.209 2.465 2.537 2.667 2.781 2.905 2.97 3.076 3.162 3.279 3.361 3.444 3.562 3.685 3.812 3.922 4.009 4.119 4.225 4.318 4.448 4.592 4.724 4.868 4.994 5.093 5.224 5.355 5.476 5.623 5.782 5.903 5.981 6.068 6.122 6.11 6.038 5.825 5.389 4.503 3.26 2.096 1.105 0.295 -0.456 -1.095 -1.675 -2.174 -2.692 -3.166 -3.556 -3.92 -4.271 -4.593 -4.894 -5.21 -5.481 -5.707 -5.958 -6.234 -6.447 -6.671 -6.911 -7.084 -7.259 -7.437 -7.622 -7.822 -7.965 -8.117 -8.334 -8.475 -8.624 -8.705 -8.889 -9.064 -9.243 -9.341 -9.635 -9.616 -9.719 -9.832 -10.078 -10.211 -10.359 -10.537 -10.758 -11.015 -11.353 -12.265 -9 ,6821 ,TETRA ,17665474,Fri Dec 3 04:21:17 CET,Fri Dec 3 06:07:39 CET,0.0 0.351 0.485 0.605 0.71 0.823 0.947 1.055 1.241 1.329 1.403 1.349 1.608 1.674 1.81 1.935 2.035 2.081 2.171 2.257 2.405 2.508 2.597 2.715 2.821 2.925 3.039 3.138 3.26 3.387 3.502 3.633 3.759 3.898 4.039 4.179 4.331 4.474 4.621 4.825 5.003 5.124 5.245 5.349 5.464 5.538 5.534 5.485 5.29 4.791 3.842 2.578 1.427 0.459 -0.344 -1.108 -1.796 -2.419 -2.945 -3.46 -3.9 -4.306 -4.704 -5.072 -5.393 -5.673 -5.987 -6.269 -6.506 -6.747 -6.995 -7.201 -7.42 -7.654 -7.821 -7.995 -8.186 -8.376 -8.567 -8.703 -8.834 -9.028 -9.162 -9.306 -9.391 -9.566 -9.732 -9.899 -9.994 -10.299 -10.31 -10.428 -10.562 -10.831 -10.954 -11.097 -11.288 -11.493 -11.752 -12.125 -12.906 -10 ,21561 ,TETRA ,17665475,Fri Dec 3 04:21:19 CET,Fri Dec 3 06:07:18 CET,0.0 0.725 0.988 1.186 1.351 1.476 1.59 1.697 1.884 1.969 2.052 2.018 2.285 2.36 2.503 2.637 2.756 2.81 2.912 3.003 3.125 3.218 3.307 3.424 3.549 3.668 3.778 3.876 3.994 4.096 4.193 4.319 4.442 4.551 4.684 4.839 4.972 5.104 5.235 5.36 5.474 5.588 5.708 5.829 5.951 6.012 6.012 5.959 5.783 5.355 4.471 3.245 2.098 1.113 0.29 -0.435 -1.063 -1.626 -2.103 -2.585 -3.021 -3.416 -3.795 -4.124 -4.428 -4.712 -4.997 -5.257 -5.49 -5.728 -5.973 -6.183 -6.387 -6.611 -6.781 -6.946 -7.131 -7.316 -7.495 -7.623 -7.754 -7.968 -8.128 -8.295 -8.376 -8.54 -8.717 -8.9 -8.991 -9.284 -9.294 -9.412 -9.538 -9.836 -9.997 -10.158 -10.336 -10.547 -10.784 -11.014 -11.364 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5d.txt deleted file mode 100644 index e0c7bfa3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23423 ,TETRA ,17665476,Fri Dec 3 04:21:13 CET,Fri Dec 3 06:11:38 CET,0.0 0.572 0.777 0.936 1.069 1.192 1.301 1.397 1.573 1.642 1.707 1.681 1.899 1.956 2.078 2.185 2.272 2.313 2.39 2.462 2.575 2.649 2.715 2.795 2.867 2.947 3.024 3.097 3.183 3.257 3.324 3.402 3.47 3.534 3.621 3.707 3.777 3.858 3.967 4.051 4.087 4.121 4.157 4.174 4.153 4.104 4.008 3.84 3.499 2.863 1.679 0.185 -1.089 -2.246 -3.219 -4.042 -4.766 -5.406 -5.924 -6.439 -6.887 -7.288 -7.673 -8.04 -8.375 -8.677 -8.99 -9.25 -9.476 -9.737 -10.003 -10.212 -10.444 -10.697 -10.889 -11.07 -11.25 -11.457 -11.672 -11.815 -11.973 -12.207 -12.355 -12.515 -12.6 -12.773 -12.958 -13.154 -13.254 -13.539 -13.598 -13.702 -13.811 -14.05 -14.193 -14.347 -14.515 -14.706 -14.941 -15.23 -15.927 -2 ,29144 ,TETRA ,17665477,Fri Dec 3 04:21:15 CET,Fri Dec 3 06:11:48 CET,0.0 0.592 0.861 1.021 1.185 1.327 1.443 1.546 1.736 1.823 1.895 1.856 2.081 2.149 2.249 2.344 2.438 2.483 2.582 2.674 2.795 2.868 2.941 3.056 3.165 3.257 3.337 3.421 3.518 3.609 3.701 3.829 3.939 4.032 4.139 4.237 4.322 4.41 4.493 4.575 4.641 4.679 4.725 4.773 4.813 4.819 4.775 4.616 4.273 3.653 2.465 1.0 -0.234 -1.299 -2.192 -2.997 -3.722 -4.388 -4.934 -5.442 -5.881 -6.271 -6.647 -7.003 -7.312 -7.578 -7.88 -8.169 -8.402 -8.649 -8.912 -9.117 -9.32 -9.539 -9.709 -9.88 -10.063 -10.25 -10.458 -10.604 -10.745 -10.958 -11.102 -11.266 -11.346 -11.493 -11.661 -11.825 -11.901 -12.15 -12.176 -12.29 -12.405 -12.663 -12.812 -12.959 -13.123 -13.308 -13.516 -13.855 -14.576 -3 ,4570 ,TETRA ,17665478,Fri Dec 3 04:21:16 CET,Fri Dec 3 06:08:37 CET,0.0 0.552 0.727 0.881 1.029 1.152 1.253 1.357 1.531 1.597 1.663 1.643 1.866 1.932 2.05 2.161 2.275 2.321 2.394 2.465 2.565 2.632 2.699 2.802 2.904 2.987 3.058 3.137 3.238 3.323 3.408 3.497 3.582 3.669 3.761 3.869 3.971 4.059 4.123 4.181 4.242 4.309 4.374 4.387 4.348 4.259 4.112 3.887 3.515 2.856 1.637 0.117 -1.138 -2.216 -3.144 -3.925 -4.596 -5.233 -5.795 -6.333 -6.815 -7.25 -7.629 -7.977 -8.324 -8.645 -8.962 -9.255 -9.506 -9.759 -10.011 -10.218 -10.424 -10.622 -10.792 -10.984 -11.173 -11.365 -11.571 -11.711 -11.858 -12.074 -12.208 -12.347 -12.428 -12.592 -12.757 -12.943 -13.046 -13.324 -13.345 -13.447 -13.565 -13.818 -13.949 -14.097 -14.26 -14.448 -14.654 -14.974 -15.669 -4 ,24072 ,TETRA ,17665479,Fri Dec 3 04:21:18 CET,Fri Dec 3 06:08:21 CET,0.0 0.566 0.827 1.02 1.168 1.298 1.424 1.521 1.671 1.744 1.818 1.801 2.02 2.078 2.184 2.288 2.393 2.441 2.52 2.59 2.71 2.801 2.89 2.993 3.079 3.162 3.237 3.314 3.414 3.502 3.587 3.696 3.803 3.886 3.965 4.045 4.134 4.219 4.305 4.433 4.528 4.583 4.634 4.654 4.616 4.541 4.407 4.19 3.833 3.183 2.01 0.55 -0.705 -1.757 -2.687 -3.546 -4.26 -4.87 -5.379 -5.875 -6.339 -6.761 -7.149 -7.523 -7.868 -8.206 -8.562 -8.844 -9.079 -9.33 -9.602 -9.812 -10.002 -10.218 -10.382 -10.546 -10.738 -10.95 -11.166 -11.296 -11.423 -11.652 -11.812 -11.962 -12.037 -12.196 -12.378 -12.584 -12.693 -12.969 -12.992 -13.104 -13.224 -13.477 -13.612 -13.754 -13.92 -14.11 -14.318 -14.625 -15.408 -5 ,2062 ,TETRA ,17665480,Fri Dec 3 04:21:13 CET,Fri Dec 3 06:07:56 CET,0.0 0.695 0.945 1.066 1.186 1.306 1.415 1.503 1.664 1.744 1.812 1.768 1.977 2.041 2.16 2.247 2.335 2.382 2.475 2.568 2.711 2.794 2.868 2.98 3.081 3.155 3.224 3.304 3.403 3.486 3.555 3.646 3.732 3.816 3.92 4.015 4.095 4.159 4.22 4.311 4.386 4.441 4.476 4.521 4.56 4.51 4.379 4.136 3.73 3.078 1.914 0.36 -0.928 -2.031 -2.985 -3.812 -4.52 -5.145 -5.679 -6.226 -6.706 -7.115 -7.495 -7.825 -8.151 -8.469 -8.777 -9.045 -9.281 -9.529 -9.8 -10.032 -10.247 -10.458 -10.628 -10.809 -10.998 -11.184 -11.395 -11.547 -11.697 -11.918 -12.067 -12.226 -12.303 -12.463 -12.641 -12.828 -12.925 -13.2 -13.255 -13.367 -13.488 -13.736 -13.868 -14.024 -14.195 -14.375 -14.579 -14.858 -15.469 -6 ,32065 ,TETRA ,17665481,Fri Dec 3 04:21:15 CET,Fri Dec 3 06:07:45 CET,0.0 0.417 0.601 0.759 0.922 1.076 1.193 1.287 1.469 1.553 1.635 1.624 1.839 1.898 2.025 2.122 2.204 2.25 2.353 2.446 2.569 2.654 2.737 2.863 2.965 3.033 3.097 3.157 3.249 3.363 3.473 3.583 3.68 3.772 3.876 3.983 4.06 4.147 4.241 4.299 4.374 4.455 4.509 4.566 4.587 4.552 4.443 4.241 3.874 3.192 1.992 0.463 -0.843 -1.94 -2.88 -3.705 -4.417 -5.041 -5.554 -6.066 -6.508 -6.895 -7.264 -7.607 -7.92 -8.204 -8.486 -8.748 -8.991 -9.243 -9.502 -9.699 -9.909 -10.149 -10.325 -10.501 -10.684 -10.873 -11.076 -11.209 -11.353 -11.591 -11.74 -11.898 -11.984 -12.146 -12.305 -12.498 -12.601 -12.878 -12.936 -13.045 -13.159 -13.422 -13.56 -13.694 -13.853 -14.041 -14.232 -14.47 -15.131 -7 ,9292 ,TETRA ,17665482,Fri Dec 3 04:21:15 CET,Fri Dec 3 06:08:08 CET,0.0 0.617 0.865 1.04 1.179 1.301 1.431 1.554 1.764 1.857 1.929 1.886 2.093 2.143 2.258 2.37 2.463 2.51 2.598 2.68 2.807 2.88 2.948 3.063 3.175 3.272 3.355 3.439 3.531 3.606 3.699 3.8 3.874 3.947 4.045 4.148 4.238 4.329 4.394 4.485 4.583 4.645 4.689 4.708 4.703 4.673 4.602 4.436 4.084 3.458 2.303 0.774 -0.472 -1.521 -2.434 -3.243 -3.963 -4.607 -5.13 -5.642 -6.097 -6.484 -6.856 -7.225 -7.545 -7.831 -8.14 -8.411 -8.657 -8.916 -9.192 -9.427 -9.644 -9.84 -9.987 -10.153 -10.341 -10.53 -10.722 -10.864 -11.019 -11.242 -11.392 -11.542 -11.616 -11.792 -11.974 -12.151 -12.239 -12.503 -12.534 -12.635 -12.749 -13.018 -13.164 -13.314 -13.478 -13.668 -13.892 -14.193 -15.065 -8 ,11341 ,TETRA ,17665483,Fri Dec 3 04:21:15 CET,Fri Dec 3 06:07:45 CET,0.0 0.717 0.976 1.135 1.27 1.386 1.473 1.559 1.731 1.805 1.87 1.838 2.05 2.102 2.219 2.34 2.45 2.499 2.586 2.671 2.793 2.874 2.949 3.044 3.138 3.228 3.319 3.396 3.494 3.597 3.673 3.767 3.86 3.961 4.07 4.161 4.236 4.303 4.362 4.413 4.48 4.54 4.561 4.563 4.547 4.484 4.355 4.167 3.814 3.143 1.93 0.407 -0.875 -1.954 -2.883 -3.702 -4.396 -5.022 -5.572 -6.099 -6.548 -6.969 -7.338 -7.671 -8.025 -8.344 -8.658 -8.936 -9.171 -9.419 -9.677 -9.878 -10.079 -10.304 -10.481 -10.669 -10.872 -11.086 -11.317 -11.458 -11.59 -11.794 -11.936 -12.096 -12.178 -12.355 -12.546 -12.733 -12.831 -13.103 -13.125 -13.237 -13.352 -13.604 -13.75 -13.91 -14.099 -14.301 -14.554 -14.874 -15.631 -9 ,10036 ,TETRA ,17665485,Fri Dec 3 04:23:11 CET,Fri Dec 3 06:11:08 CET,0.0 0.475 0.662 0.809 0.942 1.078 1.203 1.305 1.475 1.564 1.647 1.631 1.852 1.904 2.003 2.11 2.21 2.255 2.341 2.431 2.553 2.631 2.707 2.816 2.922 3.012 3.097 3.186 3.308 3.404 3.485 3.594 3.686 3.764 3.839 3.909 3.983 4.055 4.136 4.216 4.272 4.318 4.357 4.404 4.412 4.373 4.287 4.073 3.671 3.056 1.895 0.394 -0.82 -1.849 -2.726 -3.512 -4.209 -4.836 -5.378 -5.93 -6.407 -6.819 -7.185 -7.516 -7.808 -8.068 -8.356 -8.635 -8.891 -9.134 -9.37 -9.573 -9.799 -10.026 -10.189 -10.367 -10.559 -10.753 -10.965 -11.11 -11.259 -11.499 -11.65 -11.811 -11.9 -12.08 -12.27 -12.462 -12.564 -12.839 -12.876 -12.987 -13.108 -13.389 -13.536 -13.672 -13.831 -14.037 -14.301 -14.684 -15.588 -10 ,11422 ,TETRA ,17665486,Fri Dec 3 04:25:13 CET,Fri Dec 3 06:12:40 CET,0.0 0.557 0.757 0.924 1.083 1.234 1.36 1.462 1.629 1.704 1.773 1.749 1.971 2.034 2.138 2.229 2.321 2.365 2.46 2.547 2.643 2.718 2.804 2.921 3.048 3.169 3.27 3.353 3.437 3.518 3.611 3.707 3.793 3.886 3.979 4.064 4.147 4.228 4.326 4.431 4.514 4.587 4.621 4.624 4.595 4.553 4.454 4.247 3.897 3.272 2.094 0.601 -0.664 -1.744 -2.66 -3.467 -4.172 -4.812 -5.35 -5.882 -6.33 -6.734 -7.118 -7.461 -7.782 -8.068 -8.365 -8.644 -8.884 -9.113 -9.36 -9.573 -9.788 -9.995 -10.145 -10.315 -10.499 -10.686 -10.883 -11.02 -11.162 -11.4 -11.572 -11.735 -11.814 -11.983 -12.151 -12.335 -12.435 -12.711 -12.754 -12.863 -12.967 -13.181 -13.309 -13.476 -13.656 -13.83 -14.019 -14.291 -15.073 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5f.txt deleted file mode 100644 index 5d9944b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5k_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22900 ,TETRA ,17665487,Fri Dec 3 04:25:13 CET,Fri Dec 3 06:12:32 CET,0.0 0.452 0.678 0.849 0.989 1.141 1.293 1.423 1.632 1.731 1.832 1.868 2.113 2.186 2.329 2.5 2.671 2.755 2.902 3.036 3.222 3.343 3.466 3.637 3.805 3.961 4.1 4.235 4.409 4.584 4.764 4.982 5.201 5.422 5.684 5.94 6.148 6.385 6.654 6.934 7.247 7.596 7.956 8.312 8.744 9.22 9.74 10.325 10.983 11.713 12.434 12.804 12.883 12.816 12.658 12.474 12.263 12.037 11.859 11.634 11.418 11.22 11.034 10.873 10.703 10.525 10.342 10.171 10.031 9.907 9.763 9.645 9.531 9.395 9.287 9.166 9.033 8.901 8.759 8.671 8.588 8.452 8.358 8.255 8.2 8.085 7.961 7.829 7.75 7.498 7.427 7.325 7.223 6.984 6.852 6.724 6.585 6.405 6.181 5.844 4.958 -2 ,21686 ,TETRA ,17665488,Fri Dec 3 04:25:15 CET,Fri Dec 3 06:12:06 CET,0.0 0.281 0.5 0.714 0.877 1.028 1.167 1.283 1.508 1.623 1.728 1.759 2.005 2.085 2.24 2.409 2.561 2.634 2.776 2.891 3.059 3.18 3.3 3.463 3.622 3.78 3.933 4.08 4.263 4.431 4.584 4.774 4.963 5.163 5.385 5.609 5.831 6.076 6.329 6.598 6.887 7.194 7.552 7.938 8.387 8.856 9.389 9.987 10.626 11.343 12.142 12.547 12.585 12.539 12.384 12.175 11.996 11.819 11.649 11.446 11.228 11.033 10.837 10.625 10.444 10.306 10.138 9.961 9.82 9.666 9.499 9.381 9.252 9.092 8.965 8.837 8.704 8.56 8.403 8.302 8.204 8.062 7.967 7.864 7.81 7.687 7.562 7.427 7.35 7.108 7.079 6.992 6.903 6.7 6.591 6.482 6.37 6.244 6.064 5.793 4.996 -3 ,30154 ,TETRA ,17665489,Fri Dec 3 04:25:17 CET,Fri Dec 3 06:11:35 CET,0.0 0.546 0.863 1.066 1.216 1.358 1.499 1.613 1.793 1.89 1.983 1.999 2.236 2.311 2.468 2.612 2.743 2.81 2.951 3.092 3.273 3.388 3.508 3.672 3.817 3.96 4.114 4.276 4.465 4.654 4.853 5.09 5.303 5.495 5.734 5.997 6.252 6.505 6.76 7.047 7.334 7.679 8.066 8.441 8.904 9.392 9.961 10.591 11.267 11.984 12.688 13.025 13.036 12.891 12.725 12.585 12.377 12.153 11.984 11.79 11.577 11.377 11.194 11.034 10.857 10.67 10.49 10.337 10.207 10.072 9.935 9.817 9.692 9.559 9.443 9.3 9.159 9.038 8.892 8.789 8.694 8.522 8.392 8.274 8.219 8.098 7.959 7.806 7.733 7.506 7.507 7.432 7.345 7.147 7.037 6.909 6.784 6.65 6.451 6.165 5.34 -4 ,27853 ,TETRA ,17665490,Fri Dec 3 04:25:17 CET,Fri Dec 3 06:12:13 CET,0.0 0.715 0.996 1.187 1.341 1.479 1.593 1.714 1.933 2.028 2.125 2.152 2.388 2.464 2.619 2.767 2.9 2.976 3.131 3.273 3.467 3.585 3.692 3.837 3.98 4.119 4.253 4.376 4.53 4.7 4.877 5.077 5.264 5.438 5.642 5.889 6.127 6.389 6.681 6.977 7.272 7.607 7.986 8.368 8.831 9.325 9.865 10.465 11.114 11.816 12.496 12.875 12.958 12.907 12.786 12.597 12.39 12.202 12.048 11.867 11.7 11.533 11.338 11.163 11.006 10.832 10.62 10.453 10.323 10.186 10.059 9.948 9.802 9.639 9.5 9.354 9.223 9.099 8.984 8.897 8.797 8.647 8.544 8.44 8.382 8.246 8.108 7.967 7.891 7.655 7.635 7.54 7.441 7.228 7.117 6.998 6.842 6.646 6.423 6.158 5.507 -5 ,5899 ,TETRA ,17665491,Fri Dec 3 04:25:13 CET,Fri Dec 3 06:11:59 CET,0.0 0.823 1.065 1.256 1.433 1.591 1.727 1.852 2.098 2.214 2.318 2.354 2.601 2.687 2.845 2.994 3.137 3.2 3.328 3.463 3.664 3.786 3.895 4.056 4.21 4.368 4.535 4.674 4.84 5.018 5.19 5.384 5.577 5.762 5.961 6.184 6.407 6.68 6.988 7.312 7.641 7.966 8.313 8.67 9.106 9.599 10.131 10.698 11.318 11.986 12.731 13.183 13.27 13.201 13.076 12.915 12.734 12.523 12.321 12.12 11.914 11.736 11.582 11.414 11.227 11.039 10.851 10.709 10.583 10.422 10.255 10.137 10.012 9.873 9.772 9.666 9.541 9.409 9.27 9.166 9.072 8.941 8.834 8.71 8.649 8.532 8.41 8.282 8.205 7.965 7.942 7.843 7.742 7.526 7.406 7.294 7.154 6.971 6.762 6.472 5.74 -6 ,4625 ,TETRA ,17665492,Fri Dec 3 04:25:14 CET,Fri Dec 3 06:11:46 CET,0.0 0.542 0.805 1.005 1.169 1.308 1.439 1.562 1.775 1.873 1.976 2.009 2.262 2.359 2.533 2.693 2.853 2.93 3.073 3.204 3.37 3.468 3.577 3.757 3.921 4.07 4.213 4.357 4.546 4.716 4.87 5.064 5.259 5.453 5.688 5.949 6.185 6.437 6.704 6.987 7.288 7.623 8.01 8.369 8.789 9.272 9.837 10.443 11.103 11.807 12.504 12.876 12.97 12.87 12.711 12.529 12.325 12.127 11.927 11.719 11.539 11.376 11.212 11.009 10.805 10.63 10.457 10.308 10.174 10.022 9.864 9.74 9.624 9.492 9.373 9.252 9.113 8.968 8.828 8.724 8.621 8.474 8.37 8.262 8.195 8.048 7.912 7.767 7.691 7.458 7.446 7.358 7.26 7.036 6.907 6.776 6.646 6.466 6.258 6.006 5.46 -7 ,4360 ,TETRA ,17665493,Fri Dec 3 04:25:13 CET,Fri Dec 3 06:11:23 CET,0.0 0.768 1.011 1.169 1.328 1.471 1.609 1.744 1.985 2.089 2.179 2.18 2.415 2.492 2.641 2.793 2.94 3.007 3.133 3.268 3.463 3.583 3.693 3.854 4.014 4.161 4.309 4.458 4.644 4.823 5.005 5.227 5.442 5.651 5.896 6.163 6.387 6.637 6.916 7.188 7.471 7.811 8.193 8.56 8.991 9.477 9.991 10.534 11.186 11.89 12.593 13.049 13.163 13.114 12.984 12.77 12.555 12.365 12.199 11.989 11.755 11.533 11.336 11.153 10.983 10.834 10.661 10.513 10.395 10.245 10.08 9.935 9.786 9.639 9.516 9.388 9.266 9.143 9.015 8.926 8.827 8.666 8.548 8.424 8.362 8.244 8.114 7.961 7.879 7.641 7.617 7.522 7.423 7.21 7.09 6.961 6.824 6.668 6.481 6.272 5.546 -8 ,27350 ,TETRA ,17665494,Fri Dec 3 04:26:12 CET,Fri Dec 3 06:14:46 CET,0.0 0.631 0.937 1.162 1.337 1.481 1.624 1.753 1.974 2.073 2.163 2.196 2.446 2.536 2.705 2.842 2.975 3.044 3.172 3.291 3.494 3.614 3.711 3.869 4.025 4.173 4.31 4.453 4.652 4.835 5.0 5.189 5.375 5.553 5.752 5.971 6.194 6.473 6.756 7.021 7.308 7.66 8.061 8.44 8.872 9.376 9.97 10.563 11.218 11.909 12.603 12.998 13.084 12.999 12.843 12.631 12.379 12.17 11.992 11.787 11.608 11.444 11.269 11.082 10.915 10.77 10.621 10.467 10.327 10.186 10.042 9.922 9.793 9.661 9.553 9.442 9.324 9.19 9.032 8.938 8.852 8.694 8.567 8.445 8.39 8.269 8.145 8.007 7.928 7.691 7.672 7.593 7.505 7.3 7.18 7.061 6.946 6.81 6.62 6.295 5.338 -9 ,3987 ,TETRA ,17665495,Fri Dec 3 04:26:15 CET,Fri Dec 3 06:14:51 CET,0.0 0.779 1.043 1.236 1.403 1.555 1.681 1.795 2.027 2.142 2.237 2.255 2.504 2.598 2.767 2.906 3.037 3.099 3.23 3.363 3.553 3.675 3.791 3.954 4.095 4.245 4.399 4.542 4.724 4.898 5.07 5.269 5.458 5.638 5.844 6.063 6.266 6.487 6.735 7.023 7.323 7.641 8.009 8.386 8.829 9.323 9.879 10.477 11.152 11.901 12.62 12.976 13.054 12.957 12.794 12.605 12.404 12.201 12.034 11.847 11.667 11.509 11.336 11.181 11.042 10.881 10.694 10.531 10.398 10.249 10.083 9.956 9.823 9.683 9.576 9.459 9.32 9.179 9.052 8.961 8.85 8.678 8.581 8.473 8.411 8.295 8.164 8.011 7.927 7.697 7.693 7.604 7.516 7.331 7.221 7.092 6.941 6.754 6.548 6.274 5.233 -10 ,3365 ,TETRA ,17665496,Fri Dec 3 04:26:16 CET,Fri Dec 3 06:12:59 CET,0.0 0.78 1.032 1.218 1.383 1.513 1.64 1.766 2.003 2.105 2.202 2.247 2.495 2.579 2.724 2.859 3.001 3.067 3.181 3.295 3.476 3.585 3.687 3.841 3.992 4.137 4.287 4.439 4.626 4.795 4.964 5.185 5.385 5.567 5.789 6.039 6.261 6.496 6.765 7.061 7.372 7.725 8.139 8.545 8.991 9.487 10.023 10.588 11.236 11.918 12.6 12.984 13.027 12.964 12.889 12.77 12.614 12.452 12.276 12.086 11.894 11.706 11.543 11.378 11.23 11.098 10.935 10.769 10.62 10.465 10.319 10.204 10.078 9.935 9.824 9.712 9.587 9.46 9.318 9.206 9.096 8.931 8.816 8.695 8.625 8.487 8.35 8.219 8.15 7.924 7.92 7.831 7.738 7.541 7.436 7.308 7.15 6.984 6.777 6.487 5.643 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5b.txt deleted file mode 100644 index b56edf25..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22498 ,TETRA ,17665497,Fri Dec 3 04:26:13 CET,Fri Dec 3 06:12:53 CET,0.0 0.7 0.923 1.063 1.184 1.283 1.375 1.463 1.66 1.753 1.824 1.768 1.993 2.045 2.138 2.233 2.333 2.376 2.467 2.556 2.676 2.753 2.817 2.893 2.965 3.046 3.137 3.207 3.272 3.314 3.35 3.419 3.489 3.529 3.542 3.569 3.588 3.601 3.627 3.645 3.622 3.54 3.416 3.269 3.063 2.769 2.324 1.67 0.713 -0.7 -3.016 -5.689 -7.765 -9.433 -10.824 -12.033 -13.048 -13.929 -14.677 -15.433 -16.086 -16.65 -17.164 -17.651 -18.106 -18.497 -18.881 -19.224 -19.524 -19.833 -20.16 -20.434 -20.711 -20.98 -21.189 -21.414 -21.646 -21.894 -22.16 -22.335 -22.506 -22.785 -22.984 -23.184 -23.282 -23.471 -23.683 -23.906 -24.012 -24.325 -24.34 -24.46 -24.592 -24.868 -25.009 -25.156 -25.346 -25.564 -25.774 -26.059 -26.574 -2 ,17921 ,TETRA ,17665498,Fri Dec 3 04:26:12 CET,Fri Dec 3 06:12:58 CET,0.0 0.619 0.861 1.071 1.209 1.323 1.424 1.518 1.682 1.758 1.836 1.802 2.038 2.095 2.192 2.283 2.36 2.394 2.467 2.534 2.628 2.695 2.757 2.833 2.898 2.955 3.008 3.054 3.111 3.157 3.192 3.228 3.256 3.287 3.314 3.338 3.346 3.338 3.306 3.294 3.311 3.267 3.133 2.989 2.797 2.491 2.053 1.419 0.478 -0.897 -3.165 -5.755 -7.789 -9.473 -10.861 -12.065 -13.092 -13.98 -14.748 -15.493 -16.092 -16.616 -17.11 -17.579 -18.014 -18.406 -18.82 -19.19 -19.495 -19.806 -20.139 -20.403 -20.662 -20.925 -21.131 -21.35 -21.577 -21.814 -22.063 -22.224 -22.378 -22.611 -22.793 -22.983 -23.079 -23.275 -23.464 -23.667 -23.78 -24.097 -24.135 -24.264 -24.401 -24.683 -24.832 -24.983 -25.144 -25.34 -25.59 -25.895 -26.578 -3 ,15337 ,TETRA ,17665499,Fri Dec 3 04:26:14 CET,Fri Dec 3 06:12:42 CET,0.0 0.554 0.793 0.976 1.12 1.23 1.316 1.403 1.554 1.619 1.685 1.638 1.873 1.926 2.014 2.1 2.189 2.229 2.296 2.36 2.444 2.494 2.547 2.633 2.716 2.783 2.845 2.897 2.956 3.014 3.071 3.138 3.192 3.231 3.263 3.29 3.309 3.327 3.336 3.351 3.367 3.327 3.22 3.08 2.889 2.636 2.213 1.617 0.743 -0.633 -2.907 -5.462 -7.519 -9.2 -10.6 -11.857 -12.903 -13.787 -14.542 -15.292 -15.931 -16.49 -16.985 -17.444 -17.886 -18.288 -18.701 -19.06 -19.366 -19.675 -19.993 -20.258 -20.518 -20.787 -21.001 -21.224 -21.45 -21.668 -21.891 -22.049 -22.214 -22.474 -22.655 -22.849 -22.948 -23.129 -23.314 -23.514 -23.619 -23.935 -23.971 -24.106 -24.252 -24.538 -24.693 -24.87 -25.053 -25.252 -25.482 -25.824 -26.636 -4 ,9405 ,TETRA ,17665500,Fri Dec 3 04:26:13 CET,Fri Dec 3 06:12:43 CET,0.0 0.451 0.697 0.894 1.06 1.204 1.309 1.396 1.553 1.622 1.687 1.632 1.858 1.896 1.973 2.058 2.133 2.171 2.246 2.309 2.389 2.436 2.488 2.581 2.667 2.743 2.801 2.859 2.925 2.967 3.013 3.068 3.121 3.159 3.174 3.201 3.203 3.192 3.193 3.172 3.157 3.107 2.985 2.877 2.718 2.414 1.956 1.334 0.437 -0.947 -3.243 -5.913 -8.024 -9.727 -11.136 -12.327 -13.33 -14.219 -14.991 -15.731 -16.338 -16.903 -17.412 -17.856 -18.293 -18.699 -19.087 -19.411 -19.706 -20.03 -20.358 -20.619 -20.894 -21.183 -21.407 -21.642 -21.885 -22.14 -22.407 -22.584 -22.755 -23.021 -23.216 -23.422 -23.523 -23.724 -23.947 -24.192 -24.322 -24.646 -24.677 -24.8 -24.928 -25.209 -25.361 -25.514 -25.685 -25.919 -26.203 -26.559 -27.217 -5 ,11757 ,TETRA ,17665501,Fri Dec 3 04:26:16 CET,Fri Dec 3 06:12:35 CET,0.0 0.814 1.083 1.275 1.431 1.552 1.657 1.75 1.933 2.016 2.097 2.062 2.298 2.355 2.455 2.56 2.656 2.698 2.766 2.836 2.948 3.007 3.047 3.103 3.164 3.213 3.258 3.301 3.368 3.437 3.489 3.559 3.615 3.634 3.652 3.671 3.688 3.704 3.69 3.675 3.655 3.602 3.488 3.294 3.041 2.732 2.28 1.66 0.752 -0.639 -2.893 -5.457 -7.505 -9.195 -10.585 -11.781 -12.807 -13.71 -14.454 -15.186 -15.804 -16.371 -16.912 -17.402 -17.864 -18.276 -18.692 -19.045 -19.351 -19.666 -19.978 -20.236 -20.501 -20.772 -20.974 -21.181 -21.405 -21.649 -21.901 -22.071 -22.243 -22.516 -22.71 -22.896 -22.985 -23.167 -23.345 -23.546 -23.659 -23.979 -24.042 -24.178 -24.318 -24.643 -24.819 -25.001 -25.193 -25.412 -25.671 -25.956 -26.417 -6 ,18997 ,TETRA ,17665502,Fri Dec 3 04:27:16 CET,Fri Dec 3 06:14:07 CET,0.0 0.951 1.245 1.468 1.638 1.748 1.842 1.932 2.09 2.16 2.219 2.144 2.372 2.421 2.526 2.635 2.723 2.763 2.835 2.901 2.978 3.019 3.065 3.132 3.206 3.277 3.335 3.386 3.452 3.508 3.552 3.626 3.69 3.719 3.752 3.806 3.841 3.849 3.834 3.793 3.734 3.66 3.544 3.391 3.161 2.839 2.372 1.758 0.86 -0.547 -2.802 -5.432 -7.509 -9.19 -10.581 -11.759 -12.737 -13.641 -14.433 -15.214 -15.841 -16.385 -16.918 -17.385 -17.808 -18.211 -18.628 -18.981 -19.278 -19.603 -19.934 -20.202 -20.47 -20.746 -20.96 -21.171 -21.4 -21.638 -21.882 -22.043 -22.202 -22.463 -22.651 -22.848 -22.95 -23.156 -23.357 -23.567 -23.681 -24.008 -24.061 -24.192 -24.335 -24.628 -24.774 -24.943 -25.149 -25.361 -25.584 -25.889 -26.717 -7 ,28570 ,TETRA ,17665503,Fri Dec 3 04:27:14 CET,Fri Dec 3 06:15:03 CET,0.0 0.478 0.713 0.875 0.999 1.114 1.238 1.343 1.496 1.57 1.642 1.61 1.855 1.916 2.014 2.103 2.192 2.238 2.327 2.405 2.51 2.571 2.617 2.683 2.756 2.813 2.873 2.932 2.982 3.028 3.08 3.127 3.168 3.223 3.265 3.288 3.282 3.262 3.237 3.201 3.148 3.087 2.992 2.834 2.608 2.276 1.807 1.14 0.192 -1.201 -3.46 -6.052 -8.113 -9.833 -11.26 -12.509 -13.555 -14.444 -15.214 -15.977 -16.602 -17.14 -17.637 -18.095 -18.53 -18.94 -19.347 -19.711 -20.037 -20.349 -20.679 -20.951 -21.22 -21.506 -21.729 -21.97 -22.23 -22.485 -22.75 -22.933 -23.112 -23.369 -23.55 -23.748 -23.845 -24.049 -24.258 -24.472 -24.581 -24.892 -24.925 -25.057 -25.2 -25.487 -25.648 -25.838 -26.02 -26.202 -26.434 -26.802 -27.62 -8 ,13261 ,TETRA ,17665504,Fri Dec 3 04:27:17 CET,Fri Dec 3 06:13:17 CET,0.0 0.592 0.867 1.04 1.175 1.289 1.386 1.485 1.672 1.753 1.821 1.783 2.02 2.072 2.177 2.28 2.364 2.399 2.481 2.561 2.676 2.743 2.8 2.879 2.931 2.981 3.034 3.087 3.154 3.208 3.255 3.293 3.321 3.351 3.377 3.404 3.417 3.41 3.408 3.383 3.336 3.299 3.194 3.019 2.778 2.498 2.108 1.509 0.62 -0.768 -3.093 -5.747 -7.832 -9.518 -10.89 -12.092 -13.142 -14.064 -14.857 -15.635 -16.255 -16.79 -17.291 -17.778 -18.222 -18.603 -19.007 -19.351 -19.635 -19.934 -20.245 -20.505 -20.776 -21.05 -21.268 -21.499 -21.732 -21.972 -22.226 -22.401 -22.579 -22.837 -23.016 -23.211 -23.308 -23.495 -23.692 -23.903 -24.013 -24.329 -24.383 -24.519 -24.645 -24.924 -25.091 -25.26 -25.447 -25.663 -25.929 -26.268 -27.064 -9 ,17931 ,TETRA ,17665505,Fri Dec 3 04:27:14 CET,Fri Dec 3 06:13:49 CET,0.0 0.517 0.772 0.941 1.071 1.188 1.278 1.364 1.528 1.604 1.686 1.669 1.91 1.965 2.066 2.155 2.234 2.27 2.322 2.376 2.481 2.548 2.609 2.696 2.78 2.846 2.892 2.947 3.033 3.112 3.178 3.243 3.293 3.342 3.379 3.401 3.443 3.477 3.486 3.482 3.449 3.363 3.239 3.119 2.91 2.583 2.147 1.534 0.631 -0.742 -2.98 -5.516 -7.53 -9.192 -10.579 -11.799 -12.843 -13.747 -14.502 -15.267 -15.908 -16.468 -16.986 -17.445 -17.881 -18.282 -18.689 -19.049 -19.347 -19.652 -19.984 -20.249 -20.518 -20.792 -20.993 -21.211 -21.446 -21.691 -21.939 -22.116 -22.291 -22.53 -22.699 -22.886 -22.982 -23.166 -23.353 -23.553 -23.65 -23.957 -23.991 -24.114 -24.241 -24.5 -24.635 -24.795 -24.981 -25.164 -25.353 -25.653 -26.394 -10 ,10714 ,TETRA ,17665506,Fri Dec 3 04:27:16 CET,Fri Dec 3 06:13:38 CET,0.0 0.556 0.771 0.908 1.019 1.119 1.204 1.295 1.465 1.535 1.603 1.538 1.761 1.809 1.905 1.992 2.076 2.122 2.203 2.264 2.343 2.402 2.468 2.564 2.648 2.715 2.771 2.82 2.888 2.944 2.99 3.063 3.121 3.145 3.155 3.151 3.143 3.119 3.072 3.045 3.015 2.935 2.807 2.657 2.446 2.152 1.748 1.183 0.317 -1.048 -3.304 -5.895 -7.943 -9.631 -11.014 -12.173 -13.154 -14.039 -14.796 -15.546 -16.174 -16.721 -17.239 -17.732 -18.182 -18.591 -18.997 -19.333 -19.625 -19.924 -20.241 -20.522 -20.793 -21.056 -21.27 -21.499 -21.725 -21.958 -22.198 -22.361 -22.532 -22.795 -22.98 -23.173 -23.271 -23.469 -23.679 -23.891 -24.0 -24.312 -24.335 -24.465 -24.598 -24.861 -25.013 -25.177 -25.361 -25.562 -25.831 -26.179 -26.933 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5f.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5f.txt deleted file mode 100644 index 7103c103..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5f.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17377 ,TETRA ,17665507,Fri Dec 3 04:27:17 CET,Fri Dec 3 06:13:51 CET,0.0 0.497 0.724 0.901 1.079 1.261 1.426 1.568 1.811 1.923 2.039 2.081 2.359 2.454 2.655 2.858 3.046 3.126 3.272 3.434 3.682 3.836 3.977 4.179 4.386 4.581 4.774 4.98 5.255 5.514 5.748 6.026 6.302 6.562 6.866 7.208 7.525 7.873 8.252 8.704 9.21 9.756 10.451 11.18 11.957 12.821 13.868 15.08 16.52 18.299 20.528 22.393 23.532 24.276 24.784 25.129 25.351 25.507 25.599 25.638 25.652 25.653 25.653 25.648 25.609 25.558 25.497 25.426 25.361 25.302 25.239 25.173 25.077 24.962 24.893 24.829 24.758 24.683 24.601 24.544 24.487 24.36 24.258 24.162 24.111 24.003 23.911 23.802 23.732 23.522 23.549 23.468 23.387 23.212 23.099 22.981 22.848 22.641 22.363 22.049 21.418 -2 ,25425 ,TETRA ,17665508,Fri Dec 3 04:27:19 CET,Fri Dec 3 06:13:48 CET,0.0 0.603 0.866 1.061 1.219 1.377 1.53 1.666 1.914 2.035 2.152 2.183 2.457 2.562 2.79 3.009 3.191 3.271 3.439 3.601 3.816 3.96 4.112 4.321 4.524 4.738 4.947 5.146 5.404 5.643 5.882 6.182 6.464 6.747 7.056 7.393 7.733 8.125 8.571 9.046 9.538 10.073 10.71 11.376 12.15 13.048 14.136 15.359 16.805 18.592 20.83 22.713 23.85 24.57 25.047 25.374 25.584 25.735 25.815 25.854 25.865 25.849 25.817 25.742 25.67 25.623 25.553 25.451 25.352 25.275 25.21 25.133 25.043 24.969 24.907 24.835 24.76 24.669 24.583 24.522 24.446 24.323 24.241 24.156 24.11 24.004 23.895 23.786 23.724 23.516 23.54 23.468 23.4 23.246 23.15 23.043 22.929 22.803 22.639 22.367 21.924 -3 ,23255 ,TETRA ,17665509,Fri Dec 3 04:27:14 CET,Fri Dec 3 06:13:20 CET,0.0 0.642 0.886 1.093 1.278 1.464 1.643 1.794 2.031 2.153 2.268 2.287 2.559 2.653 2.831 3.007 3.183 3.272 3.447 3.606 3.839 3.996 4.145 4.351 4.547 4.747 4.95 5.143 5.385 5.623 5.854 6.141 6.431 6.698 7.004 7.353 7.703 8.114 8.558 9.024 9.513 10.057 10.688 11.326 12.095 13.007 14.113 15.363 16.843 18.655 20.884 22.802 23.902 24.588 25.084 25.386 25.558 25.658 25.711 25.773 25.787 25.769 25.767 25.741 25.686 25.637 25.568 25.511 25.467 25.395 25.304 25.233 25.151 25.053 24.981 24.922 24.862 24.794 24.719 24.663 24.607 24.502 24.42 24.345 24.299 24.192 24.094 23.977 23.911 23.684 23.687 23.616 23.537 23.331 23.221 23.103 22.966 22.808 22.622 22.382 21.844 -4 ,18932 ,TETRA ,17665510,Fri Dec 3 04:27:15 CET,Fri Dec 3 06:13:29 CET,0.0 0.703 0.999 1.223 1.392 1.537 1.68 1.825 2.1 2.216 2.317 2.339 2.615 2.716 2.901 3.077 3.248 3.336 3.518 3.699 3.946 4.099 4.258 4.487 4.712 4.93 5.124 5.307 5.548 5.795 6.04 6.317 6.58 6.85 7.178 7.534 7.87 8.243 8.662 9.149 9.666 10.247 10.949 11.65 12.455 13.329 14.354 15.552 17.017 18.823 21.043 22.935 24.04 24.728 25.185 25.485 25.687 25.851 25.974 26.054 26.073 26.074 26.054 26.019 25.971 25.899 25.829 25.762 25.701 25.629 25.537 25.461 25.374 25.269 25.184 25.104 25.034 24.941 24.827 24.757 24.683 24.568 24.489 24.407 24.364 24.28 24.183 24.053 23.98 23.753 23.756 23.679 23.607 23.436 23.346 23.258 23.148 22.992 22.756 22.443 21.773 -5 ,15822 ,TETRA ,17665511,Fri Dec 3 04:27:17 CET,Fri Dec 3 06:13:39 CET,0.0 0.543 0.766 0.955 1.128 1.296 1.454 1.585 1.844 1.975 2.09 2.122 2.398 2.499 2.703 2.912 3.099 3.18 3.347 3.514 3.735 3.873 4.007 4.203 4.401 4.619 4.842 5.053 5.31 5.526 5.75 6.063 6.351 6.61 6.921 7.28 7.643 8.041 8.474 8.931 9.408 9.978 10.638 11.301 12.102 13.018 14.06 15.274 16.753 18.533 20.766 22.708 23.864 24.603 25.041 25.338 25.569 25.723 25.829 25.884 25.886 25.875 25.832 25.779 25.746 25.693 25.622 25.58 25.525 25.443 25.367 25.298 25.241 25.188 25.133 25.066 24.979 24.882 24.777 24.702 24.624 24.51 24.427 24.329 24.278 24.185 24.073 23.936 23.866 23.644 23.672 23.607 23.521 23.336 23.244 23.144 23.023 22.882 22.682 22.394 21.788 -6 ,21011 ,TETRA ,17665512,Fri Dec 3 04:27:17 CET,Fri Dec 3 06:13:18 CET,0.0 0.462 0.721 0.947 1.13 1.299 1.429 1.548 1.795 1.909 2.021 2.051 2.326 2.419 2.609 2.802 2.972 3.056 3.225 3.394 3.651 3.813 3.966 4.194 4.409 4.614 4.815 5.007 5.25 5.485 5.728 6.022 6.291 6.559 6.873 7.229 7.569 7.955 8.379 8.821 9.289 9.82 10.475 11.178 11.998 12.903 13.966 15.193 16.646 18.423 20.677 22.572 23.682 24.416 24.916 25.243 25.48 25.631 25.723 25.806 25.854 25.873 25.836 25.796 25.774 25.73 25.679 25.627 25.563 25.497 25.431 25.363 25.285 25.184 25.094 25.013 24.924 24.838 24.753 24.682 24.611 24.507 24.435 24.347 24.301 24.2 24.082 23.965 23.897 23.667 23.676 23.597 23.513 23.325 23.198 23.053 22.935 22.806 22.628 22.353 21.357 -7 ,32167 ,TETRA ,17665513,Fri Dec 3 04:27:15 CET,Fri Dec 3 06:13:19 CET,0.0 0.555 0.825 1.035 1.199 1.362 1.523 1.656 1.898 2.025 2.15 2.188 2.464 2.573 2.778 2.964 3.142 3.229 3.402 3.574 3.815 3.966 4.111 4.323 4.541 4.763 4.97 5.162 5.424 5.688 5.943 6.237 6.521 6.802 7.123 7.49 7.835 8.205 8.624 9.07 9.533 10.074 10.732 11.4 12.174 13.049 14.064 15.273 16.773 18.589 20.877 22.827 23.965 24.682 25.13 25.437 25.673 25.79 25.852 25.914 25.953 25.96 25.936 25.91 25.882 25.849 25.803 25.731 25.649 25.58 25.508 25.439 25.375 25.302 25.233 25.148 25.068 25.006 24.932 24.858 24.774 24.661 24.572 24.472 24.425 24.343 24.253 24.149 24.088 23.861 23.849 23.757 23.673 23.495 23.394 23.277 23.158 23.031 22.866 22.615 21.873 -8 ,9416 ,TETRA ,17665514,Fri Dec 3 04:27:17 CET,Fri Dec 3 06:13:23 CET,0.0 0.61 0.869 1.109 1.311 1.468 1.616 1.75 1.98 2.09 2.197 2.241 2.518 2.618 2.808 2.994 3.172 3.256 3.424 3.586 3.818 3.965 4.111 4.33 4.532 4.729 4.934 5.13 5.371 5.602 5.838 6.13 6.404 6.669 6.993 7.37 7.731 8.114 8.513 8.947 9.428 9.979 10.646 11.345 12.133 13.004 14.04 15.276 16.731 18.453 20.657 22.587 23.707 24.381 24.825 25.138 25.355 25.492 25.57 25.619 25.627 25.599 25.572 25.547 25.493 25.435 25.361 25.275 25.206 25.14 25.045 24.957 24.879 24.809 24.757 24.7 24.624 24.533 24.435 24.372 24.319 24.214 24.127 24.035 23.988 23.895 23.793 23.672 23.609 23.386 23.395 23.328 23.256 23.085 22.983 22.858 22.724 22.57 22.364 22.047 20.779 -9 ,5288 ,TETRA ,17665515,Fri Dec 3 04:27:19 CET,Fri Dec 3 06:15:24 CET,0.0 0.535 0.829 1.039 1.222 1.372 1.513 1.658 1.924 2.048 2.167 2.225 2.51 2.615 2.809 3.013 3.21 3.299 3.485 3.647 3.879 4.022 4.152 4.359 4.561 4.748 4.953 5.158 5.392 5.63 5.865 6.152 6.439 6.715 7.015 7.341 7.673 8.053 8.476 8.928 9.417 9.989 10.653 11.292 12.069 12.979 14.037 15.249 16.712 18.522 20.774 22.714 23.885 24.625 25.092 25.399 25.589 25.719 25.778 25.791 25.806 25.775 25.734 25.702 25.665 25.625 25.568 25.49 25.424 25.375 25.302 25.231 25.147 25.046 24.972 24.89 24.803 24.732 24.654 24.584 24.516 24.407 24.334 24.262 24.221 24.133 24.028 23.92 23.866 23.657 23.702 23.643 23.555 23.354 23.251 23.151 23.026 22.867 22.692 22.454 21.823 -10 ,11519 ,TETRA ,17665516,Fri Dec 3 04:27:21 CET,Fri Dec 3 06:14:54 CET,0.0 0.687 0.971 1.211 1.414 1.586 1.73 1.882 2.196 2.33 2.443 2.464 2.742 2.857 3.084 3.271 3.439 3.527 3.705 3.87 4.098 4.248 4.394 4.621 4.848 5.047 5.238 5.438 5.709 5.962 6.197 6.484 6.77 7.057 7.382 7.735 8.08 8.457 8.877 9.376 9.91 10.491 11.157 11.807 12.571 13.47 14.513 15.714 17.182 18.974 21.219 23.106 24.277 25.028 25.498 25.814 26.02 26.148 26.22 26.226 26.203 26.203 26.189 26.155 26.122 26.077 26.016 25.959 25.91 25.853 25.777 25.719 25.648 25.561 25.503 25.444 25.381 25.306 25.208 25.133 25.062 24.948 24.873 24.797 24.754 24.671 24.567 24.44 24.381 24.163 24.157 24.077 23.992 23.8 23.688 23.565 23.42 23.254 23.073 22.79 22.031 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5j.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5j.txt deleted file mode 100644 index cf331906..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5l_5j.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,1428 ,TETRA ,17665517,Fri Dec 3 04:28:12 CET,Fri Dec 3 06:14:04 CET,0.0 0.643 0.936 1.186 1.362 1.493 1.614 1.728 1.917 2.016 2.117 2.129 2.389 2.459 2.59 2.713 2.829 2.892 3.011 3.117 3.264 3.348 3.419 3.544 3.689 3.818 3.925 4.022 4.164 4.306 4.431 4.553 4.657 4.771 4.913 5.058 5.176 5.302 5.45 5.603 5.741 5.847 5.91 5.959 6.008 6.068 6.103 5.985 5.685 5.09 3.917 2.355 1.059 -0.022 -0.994 -1.884 -2.647 -3.336 -3.92 -4.477 -4.978 -5.421 -5.822 -6.192 -6.528 -6.84 -7.179 -7.485 -7.736 -7.989 -8.252 -8.485 -8.74 -9.003 -9.187 -9.373 -9.572 -9.765 -9.955 -10.104 -10.274 -10.526 -10.694 -10.875 -10.971 -11.162 -11.353 -11.552 -11.657 -11.958 -12.006 -12.136 -12.275 -12.544 -12.678 -12.816 -12.974 -13.163 -13.388 -13.674 -14.235 -2 ,5600 ,TETRA ,17665518,Fri Dec 3 04:28:14 CET,Fri Dec 3 06:14:17 CET,0.0 0.732 0.972 1.144 1.29 1.408 1.525 1.637 1.828 1.917 2.001 1.975 2.215 2.286 2.436 2.569 2.689 2.746 2.855 2.955 3.104 3.2 3.289 3.425 3.545 3.663 3.776 3.876 3.998 4.099 4.196 4.319 4.424 4.513 4.63 4.781 4.907 5.024 5.158 5.281 5.374 5.468 5.56 5.627 5.68 5.716 5.702 5.581 5.27 4.681 3.558 1.975 0.63 -0.44 -1.347 -2.186 -2.916 -3.584 -4.153 -4.698 -5.177 -5.612 -6.022 -6.427 -6.805 -7.13 -7.469 -7.768 -8.007 -8.255 -8.527 -8.751 -8.972 -9.216 -9.408 -9.589 -9.779 -9.975 -10.175 -10.313 -10.455 -10.689 -10.864 -11.032 -11.11 -11.277 -11.464 -11.659 -11.752 -12.043 -12.089 -12.205 -12.329 -12.62 -12.768 -12.913 -13.069 -13.228 -13.407 -13.704 -14.479 -3 ,6776 ,TETRA ,17665519,Fri Dec 3 04:28:16 CET,Fri Dec 3 06:14:54 CET,0.0 0.428 0.678 0.868 0.997 1.112 1.23 1.35 1.556 1.642 1.721 1.686 1.923 1.986 2.108 2.231 2.359 2.416 2.53 2.644 2.802 2.905 3.0 3.124 3.235 3.348 3.452 3.535 3.645 3.752 3.865 3.996 4.095 4.191 4.313 4.446 4.581 4.724 4.852 4.972 5.083 5.18 5.274 5.343 5.392 5.402 5.375 5.244 4.943 4.395 3.279 1.797 0.508 -0.624 -1.569 -2.377 -3.096 -3.751 -4.294 -4.841 -5.33 -5.753 -6.136 -6.51 -6.855 -7.155 -7.495 -7.806 -8.079 -8.347 -8.611 -8.835 -9.07 -9.304 -9.48 -9.667 -9.862 -10.053 -10.246 -10.391 -10.537 -10.76 -10.927 -11.11 -11.202 -11.39 -11.578 -11.755 -11.851 -12.144 -12.174 -12.297 -12.429 -12.714 -12.852 -12.999 -13.176 -13.389 -13.639 -13.942 -14.612 -4 ,31407 ,TETRA ,17665520,Fri Dec 3 04:28:17 CET,Fri Dec 3 06:14:38 CET,0.0 0.543 0.805 1.017 1.187 1.343 1.495 1.622 1.824 1.927 2.023 2.005 2.253 2.317 2.448 2.59 2.717 2.774 2.879 2.971 3.102 3.184 3.251 3.366 3.492 3.611 3.728 3.82 3.94 4.07 4.17 4.274 4.376 4.476 4.578 4.685 4.808 4.941 5.054 5.155 5.296 5.454 5.565 5.641 5.683 5.684 5.638 5.514 5.243 4.687 3.536 2.043 0.74 -0.391 -1.381 -2.232 -2.94 -3.594 -4.164 -4.732 -5.215 -5.64 -6.05 -6.427 -6.778 -7.1 -7.43 -7.723 -7.985 -8.257 -8.529 -8.746 -8.962 -9.198 -9.39 -9.579 -9.774 -9.989 -10.202 -10.34 -10.482 -10.704 -10.849 -11.008 -11.093 -11.265 -11.456 -11.655 -11.752 -12.035 -12.053 -12.166 -12.283 -12.546 -12.698 -12.854 -13.021 -13.208 -13.436 -13.747 -14.457 -5 ,23795 ,TETRA ,17665521,Fri Dec 3 04:28:12 CET,Fri Dec 3 06:14:35 CET,0.0 0.479 0.713 0.898 1.048 1.182 1.283 1.379 1.573 1.665 1.745 1.711 1.959 2.03 2.161 2.273 2.374 2.425 2.523 2.626 2.783 2.88 2.962 3.081 3.194 3.306 3.409 3.489 3.596 3.695 3.779 3.9 4.009 4.093 4.199 4.32 4.423 4.526 4.622 4.712 4.807 4.916 5.015 5.089 5.162 5.182 5.111 4.961 4.688 4.113 2.952 1.485 0.243 -0.859 -1.823 -2.7 -3.478 -4.144 -4.671 -5.215 -5.71 -6.154 -6.565 -6.928 -7.259 -7.587 -7.945 -8.242 -8.518 -8.821 -9.101 -9.33 -9.58 -9.834 -10.027 -10.233 -10.437 -10.637 -10.847 -10.986 -11.134 -11.376 -11.534 -11.693 -11.776 -11.951 -12.127 -12.325 -12.429 -12.711 -12.731 -12.842 -12.955 -13.218 -13.352 -13.491 -13.652 -13.842 -14.054 -14.347 -15.055 -6 ,4000 ,TETRA ,17665522,Fri Dec 3 04:28:14 CET,Fri Dec 3 06:14:27 CET,0.0 0.562 0.825 0.991 1.122 1.233 1.351 1.463 1.661 1.754 1.844 1.836 2.091 2.171 2.334 2.467 2.583 2.643 2.748 2.822 2.939 3.028 3.111 3.234 3.356 3.466 3.571 3.672 3.79 3.903 4.02 4.158 4.292 4.408 4.509 4.631 4.763 4.897 5.014 5.119 5.239 5.368 5.487 5.597 5.69 5.711 5.667 5.535 5.269 4.691 3.504 1.989 0.675 -0.467 -1.44 -2.281 -3.016 -3.688 -4.262 -4.849 -5.349 -5.775 -6.18 -6.556 -6.907 -7.225 -7.543 -7.83 -8.096 -8.366 -8.644 -8.87 -9.098 -9.338 -9.523 -9.711 -9.907 -10.11 -10.306 -10.449 -10.6 -10.844 -11.004 -11.151 -11.227 -11.407 -11.589 -11.779 -11.88 -12.172 -12.204 -12.31 -12.421 -12.691 -12.844 -12.993 -13.164 -13.376 -13.58 -13.806 -14.266 -7 ,20320 ,TETRA ,17665523,Fri Dec 3 04:28:16 CET,Fri Dec 3 06:14:15 CET,0.0 0.744 0.996 1.188 1.343 1.498 1.637 1.751 1.958 2.064 2.153 2.151 2.405 2.477 2.599 2.706 2.808 2.861 2.958 3.041 3.166 3.255 3.337 3.455 3.575 3.668 3.757 3.861 3.986 4.109 4.23 4.344 4.451 4.552 4.656 4.776 4.881 4.991 5.123 5.283 5.433 5.559 5.656 5.75 5.826 5.823 5.794 5.677 5.401 4.853 3.7 2.105 0.733 -0.425 -1.404 -2.294 -3.078 -3.759 -4.325 -4.887 -5.38 -5.825 -6.231 -6.582 -6.913 -7.235 -7.565 -7.874 -8.136 -8.39 -8.658 -8.879 -9.115 -9.37 -9.558 -9.74 -9.921 -10.117 -10.334 -10.475 -10.623 -10.874 -11.05 -11.225 -11.311 -11.492 -11.69 -11.886 -11.99 -12.284 -12.307 -12.424 -12.541 -12.804 -12.952 -13.102 -13.26 -13.441 -13.653 -13.933 -14.657 -8 ,30466 ,TETRA ,17665524,Fri Dec 3 04:28:17 CET,Fri Dec 3 06:14:23 CET,0.0 0.63 0.852 1.03 1.186 1.337 1.46 1.566 1.753 1.836 1.921 1.909 2.157 2.224 2.338 2.459 2.585 2.645 2.744 2.831 2.96 3.052 3.149 3.272 3.38 3.497 3.612 3.711 3.828 3.932 4.045 4.173 4.283 4.392 4.498 4.613 4.724 4.827 4.934 5.057 5.169 5.266 5.369 5.45 5.499 5.499 5.446 5.325 5.031 4.445 3.265 1.734 0.481 -0.611 -1.598 -2.467 -3.202 -3.885 -4.482 -5.059 -5.534 -5.957 -6.352 -6.719 -7.059 -7.37 -7.693 -7.978 -8.242 -8.51 -8.773 -8.998 -9.216 -9.425 -9.591 -9.772 -9.955 -10.134 -10.344 -10.498 -10.655 -10.882 -11.026 -11.191 -11.283 -11.468 -11.643 -11.826 -11.923 -12.216 -12.247 -12.357 -12.473 -12.734 -12.863 -13.011 -13.185 -13.355 -13.529 -13.762 -14.263 -9 ,24907 ,TETRA ,17665525,Fri Dec 3 04:29:11 CET,Fri Dec 3 06:13:37 CET,0.0 0.749 1.042 1.231 1.377 1.505 1.612 1.723 1.924 2.003 2.085 2.082 2.341 2.418 2.555 2.671 2.777 2.826 2.926 3.03 3.172 3.256 3.331 3.443 3.558 3.658 3.755 3.84 3.943 4.039 4.143 4.288 4.412 4.522 4.639 4.786 4.91 5.013 5.127 5.231 5.312 5.402 5.534 5.626 5.675 5.695 5.639 5.494 5.173 4.531 3.351 1.819 0.497 -0.595 -1.541 -2.384 -3.102 -3.747 -4.28 -4.84 -5.331 -5.767 -6.169 -6.522 -6.853 -7.169 -7.508 -7.799 -8.058 -8.323 -8.578 -8.793 -9.031 -9.264 -9.44 -9.633 -9.831 -10.043 -10.254 -10.391 -10.536 -10.762 -10.92 -11.086 -11.171 -11.355 -11.547 -11.728 -11.826 -12.12 -12.13 -12.243 -12.375 -12.629 -12.761 -12.91 -13.08 -13.258 -13.443 -13.703 -14.224 -10 ,1583 ,TETRA ,17665526,Fri Dec 3 04:30:12 CET,Fri Dec 3 06:15:52 CET,0.0 0.619 0.908 1.077 1.228 1.355 1.465 1.582 1.788 1.875 1.957 1.924 2.162 2.229 2.362 2.487 2.592 2.646 2.756 2.853 2.99 3.085 3.181 3.294 3.39 3.502 3.621 3.738 3.87 3.982 4.084 4.191 4.28 4.371 4.505 4.679 4.826 4.963 5.094 5.265 5.428 5.535 5.662 5.753 5.805 5.818 5.774 5.667 5.43 4.861 3.688 2.175 0.843 -0.326 -1.299 -2.145 -2.866 -3.537 -4.161 -4.762 -5.254 -5.686 -6.077 -6.434 -6.769 -7.08 -7.396 -7.682 -7.946 -8.219 -8.491 -8.715 -8.946 -9.184 -9.376 -9.575 -9.777 -9.98 -10.179 -10.312 -10.459 -10.693 -10.859 -11.039 -11.124 -11.296 -11.482 -11.674 -11.776 -12.08 -12.131 -12.248 -12.365 -12.606 -12.738 -12.895 -13.064 -13.261 -13.511 -13.814 -14.608 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5d.txt deleted file mode 100644 index ee19d9fc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,12532 ,KEBNE ,17070556,Fri Dec 24 19:26:02 CET,Fri Dec 24 20:58:16 CET,0.0 0.409 0.653 0.827 0.965 1.085 1.193 1.29 1.465 1.548 1.624 1.594 1.833 1.903 2.046 2.192 2.325 2.387 2.492 2.593 2.733 2.816 2.905 3.032 3.153 3.284 3.41 3.525 3.667 3.796 3.91 4.065 4.232 4.384 4.542 4.7 4.867 5.068 5.259 5.452 5.64 5.829 6.038 6.26 6.534 6.796 7.089 7.344 7.542 7.658 7.504 6.972 6.395 5.888 5.437 5.003 4.614 4.256 3.911 3.545 3.204 2.9 2.635 2.373 2.123 1.896 1.643 1.409 1.208 1.018 0.817 0.64 0.452 0.238 0.058 -0.104 -0.25 -0.423 -0.595 -0.723 -0.866 -1.079 -1.234 -1.393 -1.471 -1.629 -1.787 -1.95 -2.044 -2.309 -2.341 -2.448 -2.561 -2.821 -2.951 -3.093 -3.279 -3.511 -3.842 -4.264 -5.173 -2 ,8007 ,KEBNE ,17070557,Fri Dec 24 19:26:01 CET,Fri Dec 24 21:00:00 CET,0.0 0.632 0.903 1.081 1.228 1.349 1.453 1.557 1.743 1.824 1.911 1.914 2.16 2.234 2.364 2.49 2.606 2.658 2.767 2.886 3.034 3.12 3.223 3.393 3.548 3.672 3.785 3.895 4.037 4.183 4.315 4.464 4.597 4.718 4.867 5.042 5.206 5.372 5.571 5.799 5.996 6.183 6.387 6.58 6.813 7.048 7.271 7.502 7.716 7.827 7.708 7.276 6.782 6.276 5.784 5.314 4.894 4.493 4.129 3.78 3.435 3.116 2.808 2.504 2.224 1.983 1.745 1.524 1.345 1.16 0.965 0.795 0.595 0.392 0.232 0.066 -0.093 -0.25 -0.416 -0.543 -0.679 -0.88 -1.026 -1.191 -1.272 -1.436 -1.62 -1.808 -1.901 -2.176 -2.229 -2.351 -2.469 -2.707 -2.844 -3.001 -3.171 -3.386 -3.662 -3.999 -4.863 -3 ,30895 ,KEBNE ,17070558,Fri Dec 24 19:27:04 CET,Fri Dec 24 20:59:32 CET,0.0 0.355 0.573 0.774 0.926 1.052 1.181 1.296 1.498 1.59 1.671 1.644 1.884 1.96 2.103 2.231 2.352 2.416 2.534 2.649 2.821 2.933 3.036 3.152 3.268 3.388 3.513 3.635 3.761 3.88 4.003 4.146 4.289 4.449 4.609 4.763 4.914 5.083 5.294 5.502 5.689 5.89 6.108 6.303 6.509 6.738 6.992 7.273 7.503 7.587 7.463 7.047 6.546 6.054 5.566 5.113 4.715 4.323 3.961 3.584 3.255 2.962 2.671 2.399 2.157 1.944 1.721 1.482 1.26 1.051 0.858 0.688 0.5 0.3 0.156 0.012 -0.16 -0.333 -0.494 -0.61 -0.734 -0.937 -1.092 -1.246 -1.319 -1.459 -1.618 -1.795 -1.882 -2.139 -2.148 -2.258 -2.393 -2.675 -2.826 -2.986 -3.146 -3.364 -3.662 -4.089 -5.137 -4 ,30101 ,KEBNE ,17070559,Fri Dec 24 19:27:04 CET,Fri Dec 24 21:01:01 CET,0.0 0.456 0.726 0.89 1.017 1.129 1.23 1.335 1.54 1.627 1.709 1.688 1.933 2.008 2.126 2.233 2.359 2.423 2.534 2.64 2.799 2.9 2.991 3.119 3.248 3.385 3.524 3.656 3.817 3.957 4.068 4.195 4.351 4.515 4.681 4.869 5.052 5.234 5.449 5.652 5.869 6.098 6.304 6.517 6.748 6.971 7.189 7.435 7.644 7.728 7.643 7.176 6.621 6.105 5.634 5.166 4.744 4.374 4.028 3.666 3.365 3.102 2.846 2.579 2.29 2.054 1.828 1.607 1.424 1.249 1.05 0.881 0.713 0.522 0.377 0.213 0.038 -0.135 -0.323 -0.449 -0.571 -0.772 -0.921 -1.064 -1.138 -1.309 -1.491 -1.675 -1.771 -2.052 -2.112 -2.239 -2.384 -2.665 -2.804 -2.957 -3.118 -3.303 -3.547 -3.933 -4.958 -5 ,24992 ,KEBNE ,17070560,Fri Dec 24 19:27:04 CET,Fri Dec 24 21:00:05 CET,0.0 0.388 0.607 0.769 0.893 1.022 1.152 1.269 1.463 1.557 1.664 1.674 1.921 2.004 2.152 2.299 2.452 2.518 2.615 2.708 2.852 2.94 3.027 3.155 3.267 3.381 3.505 3.626 3.769 3.903 4.036 4.21 4.371 4.51 4.681 4.891 5.084 5.262 5.427 5.579 5.744 5.971 6.217 6.441 6.715 6.964 7.2 7.413 7.592 7.67 7.505 7.044 6.5 5.983 5.525 5.097 4.684 4.284 3.905 3.51 3.196 2.918 2.638 2.368 2.124 1.907 1.667 1.418 1.207 1.008 0.794 0.606 0.415 0.228 0.068 -0.113 -0.299 -0.479 -0.662 -0.795 -0.936 -1.162 -1.32 -1.487 -1.568 -1.715 -1.883 -2.07 -2.171 -2.445 -2.469 -2.576 -2.696 -2.952 -3.089 -3.248 -3.441 -3.675 -3.948 -4.25 -5.297 -6 ,18991 ,KEBNE ,17070561,Fri Dec 24 19:27:04 CET,Fri Dec 24 21:00:53 CET,0.0 0.457 0.67 0.869 1.027 1.165 1.285 1.387 1.595 1.696 1.784 1.76 2.009 2.088 2.226 2.348 2.461 2.521 2.641 2.759 2.928 3.029 3.131 3.279 3.408 3.533 3.647 3.753 3.9 4.06 4.205 4.366 4.508 4.632 4.776 4.938 5.089 5.248 5.417 5.602 5.789 5.984 6.208 6.423 6.672 6.907 7.147 7.378 7.575 7.701 7.614 7.195 6.676 6.173 5.696 5.252 4.861 4.484 4.154 3.81 3.506 3.252 2.997 2.719 2.445 2.192 1.94 1.741 1.565 1.363 1.157 0.978 0.787 0.596 0.448 0.287 0.13 -0.029 -0.222 -0.36 -0.501 -0.716 -0.865 -1.019 -1.1 -1.253 -1.408 -1.589 -1.69 -1.957 -1.988 -2.102 -2.217 -2.494 -2.649 -2.81 -2.981 -3.161 -3.38 -3.738 -4.861 -7 ,15640 ,KEBNE ,17070562,Fri Dec 24 19:27:04 CET,Fri Dec 24 21:01:40 CET,0.0 0.66 0.929 1.095 1.235 1.394 1.538 1.643 1.846 1.943 2.035 2.028 2.269 2.346 2.475 2.583 2.69 2.743 2.864 2.994 3.157 3.244 3.331 3.467 3.593 3.705 3.818 3.928 4.064 4.211 4.358 4.515 4.655 4.801 4.971 5.16 5.343 5.522 5.689 5.884 6.13 6.384 6.615 6.822 7.053 7.286 7.531 7.752 7.926 8.055 7.959 7.54 7.072 6.593 6.132 5.686 5.267 4.883 4.553 4.205 3.876 3.592 3.324 3.062 2.814 2.588 2.358 2.136 1.918 1.677 1.436 1.248 1.059 0.877 0.739 0.595 0.432 0.242 0.065 -0.044 -0.164 -0.374 -0.513 -0.653 -0.732 -0.887 -1.052 -1.238 -1.346 -1.633 -1.704 -1.834 -1.96 -2.228 -2.371 -2.532 -2.735 -2.946 -3.193 -3.511 -4.426 -8 ,4871 ,KEBNE ,17070563,Fri Dec 24 19:27:04 CET,Fri Dec 24 20:59:25 CET,0.0 0.814 1.105 1.299 1.475 1.62 1.747 1.863 2.09 2.202 2.308 2.315 2.559 2.637 2.786 2.919 3.054 3.125 3.255 3.365 3.515 3.607 3.689 3.819 3.943 4.071 4.212 4.34 4.497 4.634 4.77 4.938 5.084 5.232 5.401 5.575 5.75 5.934 6.142 6.361 6.56 6.771 7.008 7.23 7.47 7.768 8.059 8.282 8.474 8.598 8.502 8.057 7.575 7.086 6.587 6.109 5.646 5.234 4.899 4.56 4.243 3.949 3.674 3.421 3.185 2.951 2.712 2.477 2.262 2.033 1.794 1.615 1.441 1.253 1.095 0.924 0.741 0.544 0.353 0.235 0.116 -0.097 -0.257 -0.403 -0.469 -0.622 -0.797 -0.98 -1.079 -1.351 -1.381 -1.494 -1.613 -1.881 -2.034 -2.194 -2.359 -2.565 -2.823 -3.151 -4.11 -9 ,17583 ,KEBNE ,17070564,Fri Dec 24 19:27:04 CET,Fri Dec 24 21:01:22 CET,0.0 0.414 0.669 0.92 1.111 1.25 1.353 1.445 1.634 1.736 1.822 1.8 2.039 2.102 2.224 2.351 2.475 2.532 2.648 2.766 2.934 3.037 3.127 3.261 3.406 3.545 3.67 3.788 3.92 4.042 4.162 4.311 4.458 4.584 4.726 4.905 5.085 5.255 5.428 5.605 5.774 5.947 6.132 6.331 6.583 6.83 7.067 7.284 7.491 7.631 7.478 7.063 6.574 6.065 5.587 5.118 4.692 4.282 3.892 3.517 3.203 2.927 2.654 2.384 2.108 1.846 1.561 1.301 1.119 0.941 0.738 0.57 0.399 0.2 0.048 -0.095 -0.249 -0.421 -0.617 -0.738 -0.858 -1.068 -1.21 -1.365 -1.445 -1.607 -1.804 -2.024 -2.129 -2.398 -2.449 -2.571 -2.689 -2.949 -3.088 -3.243 -3.412 -3.594 -3.804 -4.127 -5.078 -10 ,18765 ,KEBNE ,17070565,Fri Dec 24 19:28:08 CET,Fri Dec 24 21:00:08 CET,0.0 0.542 0.842 1.046 1.202 1.349 1.468 1.567 1.759 1.856 1.947 1.946 2.191 2.257 2.388 2.531 2.665 2.726 2.828 2.92 3.059 3.16 3.255 3.38 3.495 3.61 3.74 3.866 4.003 4.129 4.265 4.416 4.549 4.668 4.801 4.959 5.116 5.279 5.448 5.631 5.828 6.054 6.296 6.531 6.797 7.037 7.282 7.525 7.733 7.882 7.824 7.395 6.881 6.36 5.878 5.396 4.947 4.537 4.172 3.831 3.534 3.255 2.996 2.735 2.464 2.222 1.991 1.776 1.583 1.374 1.16 0.991 0.808 0.625 0.483 0.324 0.145 -0.027 -0.179 -0.295 -0.425 -0.618 -0.76 -0.924 -1.011 -1.178 -1.34 -1.507 -1.603 -1.879 -1.909 -2.016 -2.136 -2.431 -2.582 -2.722 -2.909 -3.138 -3.376 -3.718 -4.6 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5i.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5i.txt deleted file mode 100644 index 3d911a66..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5i.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22027 ,KEBNE ,17070566,Fri Dec 24 19:28:08 CET,Fri Dec 24 21:02:14 CET,0.0 0.24 0.364 0.466 0.56 0.629 0.702 0.78 0.93 1.002 1.075 1.048 1.288 1.346 1.446 1.535 1.624 1.667 1.753 1.837 1.947 2.017 2.09 2.196 2.314 2.449 2.581 2.708 2.853 2.974 3.077 3.198 3.324 3.452 3.602 3.769 3.931 4.115 4.307 4.507 4.723 4.948 5.209 5.475 5.79 6.15 6.542 6.922 7.325 7.698 7.876 7.797 7.51 7.151 6.774 6.41 6.102 5.763 5.442 5.153 4.887 4.632 4.39 4.167 3.939 3.725 3.521 3.343 3.186 3.027 2.857 2.723 2.609 2.486 2.369 2.232 2.084 1.933 1.79 1.69 1.586 1.432 1.323 1.227 1.186 1.102 1.015 0.908 0.852 0.625 0.673 0.608 0.541 0.405 0.334 0.256 0.155 0.045 -0.076 -0.22 -0.601 -2 ,11463 ,KEBNE ,17070567,Fri Dec 24 19:28:08 CET,Fri Dec 24 21:02:29 CET,0.0 0.19 0.297 0.403 0.499 0.579 0.656 0.73 0.873 0.939 1.003 0.955 1.183 1.235 1.337 1.434 1.54 1.593 1.689 1.777 1.897 1.969 2.045 2.177 2.33 2.473 2.602 2.728 2.891 3.05 3.2 3.366 3.534 3.682 3.843 4.047 4.26 4.496 4.709 4.932 5.196 5.482 5.774 6.055 6.38 6.735 7.12 7.49 7.853 8.186 8.388 8.283 8.013 7.684 7.339 6.985 6.656 6.355 6.076 5.771 5.489 5.253 5.041 4.82 4.6 4.392 4.183 3.997 3.826 3.637 3.44 3.288 3.132 2.958 2.827 2.697 2.561 2.423 2.272 2.167 2.074 1.933 1.842 1.757 1.712 1.607 1.495 1.383 1.316 1.069 1.1 1.037 0.981 0.868 0.797 0.699 0.59 0.488 0.361 0.213 -0.015 -3 ,686 ,KEBNE ,17070568,Fri Dec 24 19:28:08 CET,Fri Dec 24 21:01:57 CET,0.0 0.284 0.427 0.541 0.644 0.745 0.827 0.903 1.059 1.13 1.196 1.148 1.378 1.43 1.533 1.637 1.74 1.796 1.908 2.005 2.135 2.22 2.307 2.431 2.57 2.73 2.884 3.026 3.204 3.366 3.515 3.703 3.889 4.054 4.257 4.494 4.698 4.903 5.113 5.325 5.556 5.835 6.147 6.443 6.788 7.166 7.598 8.002 8.403 8.797 9.027 8.917 8.631 8.306 7.982 7.646 7.303 6.972 6.686 6.379 6.123 5.901 5.671 5.464 5.284 5.108 4.909 4.723 4.567 4.405 4.222 4.067 3.922 3.784 3.677 3.553 3.41 3.26 3.102 3.004 2.897 2.736 2.639 2.546 2.494 2.387 2.29 2.172 2.097 1.851 1.864 1.786 1.709 1.538 1.455 1.368 1.259 1.143 1.018 0.877 0.545 -4 ,16098 ,KEBNE ,17070569,Fri Dec 24 19:28:07 CET,Fri Dec 24 21:02:03 CET,0.0 0.269 0.427 0.543 0.623 0.697 0.767 0.836 0.982 1.056 1.135 1.114 1.349 1.414 1.544 1.673 1.812 1.885 2.021 2.147 2.321 2.427 2.525 2.674 2.817 2.95 3.083 3.22 3.393 3.546 3.678 3.842 3.996 4.138 4.327 4.532 4.716 4.918 5.124 5.357 5.593 5.841 6.162 6.484 6.855 7.26 7.658 8.048 8.45 8.811 8.979 8.837 8.527 8.17 7.81 7.471 7.148 6.828 6.552 6.252 5.979 5.735 5.471 5.227 5.022 4.823 4.618 4.445 4.304 4.155 3.976 3.806 3.633 3.477 3.36 3.236 3.103 2.983 2.872 2.797 2.721 2.599 2.511 2.424 2.381 2.282 2.172 2.056 1.996 1.759 1.778 1.704 1.637 1.486 1.411 1.335 1.234 1.119 0.996 0.862 0.674 -5 ,12659 ,KEBNE ,17070570,Fri Dec 24 19:28:07 CET,Fri Dec 24 21:01:31 CET,0.0 0.167 0.279 0.382 0.466 0.539 0.614 0.691 0.827 0.887 0.945 0.878 1.103 1.161 1.263 1.366 1.487 1.551 1.669 1.781 1.945 2.044 2.136 2.278 2.43 2.591 2.745 2.87 3.026 3.186 3.338 3.539 3.741 3.922 4.114 4.326 4.526 4.735 4.979 5.245 5.505 5.791 6.117 6.425 6.758 7.109 7.475 7.837 8.196 8.511 8.731 8.628 8.328 7.941 7.553 7.21 6.895 6.574 6.277 5.988 5.739 5.508 5.281 5.064 4.869 4.694 4.497 4.3 4.14 3.976 3.796 3.646 3.5 3.356 3.246 3.148 3.039 2.919 2.809 2.73 2.644 2.49 2.373 2.249 2.192 2.087 1.97 1.857 1.809 1.577 1.606 1.544 1.475 1.32 1.241 1.158 1.071 0.973 0.861 0.713 0.398 -6 ,5968 ,KEBNE ,17070571,Fri Dec 24 19:29:11 CET,Fri Dec 24 21:03:14 CET,0.0 0.205 0.369 0.498 0.605 0.697 0.77 0.847 0.99 1.046 1.104 1.04 1.264 1.314 1.406 1.497 1.593 1.652 1.788 1.915 2.07 2.163 2.254 2.399 2.556 2.705 2.854 2.996 3.16 3.317 3.457 3.618 3.776 3.925 4.099 4.312 4.525 4.722 4.917 5.124 5.359 5.643 5.995 6.331 6.65 6.986 7.355 7.713 8.069 8.409 8.592 8.437 8.152 7.826 7.485 7.117 6.772 6.466 6.198 5.935 5.685 5.419 5.134 4.876 4.641 4.429 4.233 4.057 3.906 3.753 3.589 3.452 3.3 3.144 3.022 2.884 2.738 2.598 2.467 2.376 2.276 2.124 2.013 1.884 1.815 1.671 1.527 1.382 1.305 1.047 1.022 0.931 0.832 0.626 0.538 0.45 0.342 0.231 0.122 -0.002 -0.344 -7 ,5497 ,KEBNE ,17070572,Fri Dec 24 19:29:12 CET,Fri Dec 24 21:04:26 CET,0.0 0.273 0.439 0.556 0.645 0.731 0.811 0.887 1.035 1.099 1.17 1.128 1.351 1.401 1.49 1.573 1.656 1.696 1.79 1.883 1.997 2.072 2.151 2.276 2.416 2.561 2.707 2.828 2.975 3.134 3.29 3.486 3.666 3.817 3.98 4.166 4.35 4.556 4.774 5.01 5.283 5.602 5.936 6.232 6.59 6.961 7.349 7.798 8.255 8.689 8.984 8.878 8.597 8.249 7.895 7.566 7.251 6.93 6.604 6.268 5.999 5.739 5.492 5.268 5.055 4.853 4.638 4.446 4.277 4.092 3.89 3.736 3.582 3.423 3.297 3.159 3.013 2.865 2.717 2.614 2.514 2.372 2.279 2.187 2.132 2.001 1.876 1.755 1.689 1.448 1.476 1.405 1.336 1.196 1.109 1.012 0.914 0.803 0.669 0.539 0.303 -8 ,13197 ,KEBNE ,17070573,Fri Dec 24 19:29:11 CET,Fri Dec 24 21:02:09 CET,0.0 0.244 0.364 0.47 0.562 0.652 0.748 0.828 0.968 1.042 1.108 1.063 1.302 1.37 1.506 1.631 1.745 1.8 1.909 2.012 2.16 2.255 2.353 2.5 2.631 2.747 2.854 2.96 3.111 3.274 3.431 3.619 3.809 3.997 4.207 4.43 4.634 4.854 5.092 5.318 5.573 5.876 6.173 6.443 6.754 7.094 7.442 7.801 8.171 8.506 8.724 8.591 8.241 7.832 7.462 7.108 6.783 6.466 6.163 5.837 5.566 5.344 5.13 4.883 4.629 4.41 4.183 3.987 3.83 3.669 3.473 3.292 3.107 2.919 2.776 2.647 2.527 2.392 2.244 2.133 2.018 1.855 1.751 1.647 1.591 1.474 1.359 1.233 1.166 0.925 0.959 0.887 0.801 0.604 0.509 0.417 0.317 0.202 0.075 -0.041 -0.194 -9 ,28883 ,KEBNE ,17070574,Fri Dec 24 19:34:28 CET,Fri Dec 24 21:08:59 CET,0.0 0.223 0.354 0.443 0.526 0.598 0.675 0.755 0.885 0.935 0.987 0.916 1.139 1.19 1.297 1.402 1.501 1.547 1.637 1.719 1.837 1.933 2.022 2.123 2.241 2.39 2.527 2.644 2.81 2.978 3.135 3.317 3.485 3.638 3.809 4.003 4.19 4.399 4.64 4.914 5.177 5.436 5.731 6.013 6.334 6.668 7.012 7.382 7.774 8.121 8.335 8.244 7.96 7.62 7.271 6.919 6.617 6.328 6.028 5.725 5.484 5.253 5.021 4.808 4.596 4.372 4.129 3.935 3.76 3.558 3.35 3.194 3.071 2.949 2.846 2.743 2.641 2.543 2.432 2.333 2.218 2.047 1.933 1.839 1.789 1.67 1.556 1.451 1.403 1.185 1.246 1.18 1.114 0.958 0.87 0.773 0.663 0.544 0.432 0.31 0.111 -10 ,31157 ,KEBNE ,17070575,Fri Dec 24 19:34:30 CET,Fri Dec 24 20:59:53 CET,0.0 0.178 0.322 0.441 0.546 0.645 0.737 0.826 0.982 1.049 1.116 1.074 1.307 1.372 1.503 1.625 1.726 1.776 1.865 1.941 2.06 2.138 2.213 2.328 2.435 2.538 2.645 2.742 2.877 3.027 3.18 3.354 3.509 3.663 3.841 4.039 4.235 4.456 4.675 4.895 5.155 5.466 5.78 6.079 6.424 6.774 7.144 7.531 7.953 8.362 8.631 8.546 8.226 7.875 7.541 7.194 6.855 6.532 6.251 5.976 5.734 5.506 5.271 5.044 4.843 4.658 4.464 4.287 4.127 3.951 3.766 3.611 3.433 3.252 3.138 3.034 2.92 2.783 2.617 2.506 2.415 2.276 2.178 2.084 2.028 1.916 1.818 1.71 1.652 1.425 1.486 1.43 1.37 1.234 1.154 1.055 0.928 0.795 0.653 0.509 0.282 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5k.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5k.txt deleted file mode 100644 index dfcd34dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5m_5k.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,28409 ,TETRA ,17665527,Fri Dec 3 04:30:14 CET,Fri Dec 3 06:17:10 CET,0.0 0.567 0.82 1.006 1.161 1.301 1.447 1.581 1.806 1.908 2.011 2.04 2.299 2.387 2.556 2.71 2.861 2.932 3.062 3.201 3.42 3.55 3.668 3.846 4.027 4.206 4.37 4.518 4.7 4.897 5.107 5.347 5.559 5.754 5.978 6.229 6.474 6.753 7.06 7.397 7.757 8.148 8.602 9.073 9.619 10.222 10.947 11.804 12.744 13.778 14.982 15.833 16.207 16.37 16.416 16.405 16.335 16.179 16.003 15.865 15.748 15.609 15.465 15.336 15.225 15.117 15.004 14.895 14.788 14.67 14.545 14.434 14.302 14.155 14.047 13.949 13.842 13.707 13.574 13.501 13.421 13.274 13.166 13.043 12.985 12.867 12.727 12.573 12.49 12.251 12.213 12.101 11.994 11.762 11.65 11.561 11.469 11.356 11.238 11.096 10.752 -2 ,1331 ,TETRA ,17665528,Fri Dec 3 04:30:12 CET,Fri Dec 3 06:17:19 CET,0.0 0.7 0.966 1.155 1.308 1.458 1.615 1.754 1.973 2.075 2.177 2.2 2.461 2.545 2.716 2.889 3.043 3.11 3.248 3.378 3.558 3.685 3.805 3.977 4.143 4.301 4.461 4.627 4.839 5.038 5.238 5.469 5.698 5.92 6.175 6.473 6.742 7.021 7.346 7.707 8.065 8.475 8.97 9.458 10.032 10.663 11.364 12.159 13.117 14.202 15.404 16.312 16.722 16.872 16.906 16.898 16.793 16.64 16.521 16.365 16.202 16.072 15.944 15.813 15.696 15.595 15.455 15.285 15.144 15.017 14.881 14.747 14.588 14.433 14.337 14.237 14.125 14.007 13.874 13.77 13.658 13.494 13.385 13.26 13.195 13.065 12.926 12.776 12.696 12.458 12.427 12.326 12.217 11.978 11.861 11.734 11.573 11.413 11.261 11.019 10.36 -3 ,29459 ,TETRA ,17665529,Fri Dec 3 04:30:16 CET,Fri Dec 3 06:17:30 CET,0.0 0.494 0.749 0.926 1.084 1.238 1.375 1.491 1.687 1.789 1.898 1.928 2.182 2.257 2.404 2.556 2.711 2.788 2.924 3.046 3.232 3.368 3.495 3.655 3.817 3.99 4.169 4.34 4.554 4.763 4.956 5.175 5.396 5.605 5.84 6.121 6.396 6.685 6.989 7.324 7.684 8.098 8.571 9.048 9.623 10.27 11.022 11.88 12.836 13.867 15.018 15.872 16.276 16.452 16.504 16.466 16.368 16.265 16.13 15.952 15.795 15.652 15.517 15.391 15.267 15.15 15.009 14.886 14.776 14.638 14.49 14.376 14.267 14.144 14.042 13.936 13.818 13.688 13.559 13.47 13.387 13.257 13.145 13.025 12.966 12.834 12.693 12.545 12.454 12.206 12.189 12.095 12.009 11.837 11.739 11.609 11.468 11.317 11.116 10.806 10.127 -4 ,5544 ,TETRA ,17665530,Fri Dec 3 04:30:18 CET,Fri Dec 3 06:17:02 CET,0.0 0.567 0.84 1.05 1.206 1.344 1.479 1.616 1.853 1.951 2.044 2.068 2.331 2.412 2.573 2.739 2.906 2.987 3.127 3.264 3.473 3.604 3.721 3.895 4.069 4.237 4.396 4.535 4.719 4.935 5.152 5.395 5.601 5.787 6.028 6.316 6.594 6.89 7.212 7.558 7.909 8.294 8.752 9.227 9.81 10.454 11.167 11.962 12.894 13.945 15.144 16.036 16.431 16.587 16.654 16.634 16.581 16.507 16.393 16.25 16.117 15.984 15.851 15.714 15.567 15.438 15.303 15.175 15.059 14.926 14.784 14.663 14.548 14.424 14.317 14.209 14.104 13.977 13.839 13.756 13.66 13.5 13.397 13.289 13.233 13.129 13.003 12.845 12.759 12.521 12.521 12.435 12.33 12.101 11.977 11.836 11.697 11.539 11.35 11.099 10.43 -5 ,10125 ,TETRA ,17665531,Fri Dec 3 04:31:11 CET,Fri Dec 3 06:18:27 CET,0.0 0.505 0.756 0.952 1.116 1.259 1.394 1.527 1.767 1.867 1.969 2.029 2.299 2.388 2.572 2.747 2.907 2.985 3.142 3.286 3.482 3.609 3.735 3.916 4.089 4.252 4.402 4.565 4.8 5.012 5.201 5.435 5.659 5.875 6.129 6.405 6.65 6.926 7.24 7.566 7.92 8.325 8.786 9.255 9.792 10.4 11.12 11.938 12.848 13.875 15.043 15.908 16.3 16.457 16.488 16.439 16.354 16.261 16.154 15.968 15.801 15.679 15.555 15.428 15.298 15.16 14.985 14.825 14.686 14.527 14.382 14.271 14.142 14.014 13.912 13.812 13.705 13.579 13.462 13.377 13.286 13.153 13.051 12.93 12.867 12.738 12.596 12.444 12.372 12.146 12.134 12.038 11.933 11.724 11.605 11.46 11.284 11.062 10.814 10.555 9.832 -6 ,28731 ,TETRA ,17665532,Fri Dec 3 04:31:13 CET,Fri Dec 3 06:18:06 CET,0.0 0.658 0.972 1.16 1.314 1.45 1.582 1.711 1.941 2.046 2.141 2.153 2.413 2.506 2.706 2.876 3.02 3.094 3.238 3.368 3.546 3.676 3.806 3.987 4.162 4.332 4.511 4.68 4.907 5.114 5.295 5.529 5.763 5.977 6.211 6.491 6.753 7.021 7.323 7.656 8.003 8.401 8.86 9.309 9.843 10.455 11.191 12.048 12.992 14.041 15.271 16.158 16.592 16.811 16.852 16.776 16.665 16.575 16.47 16.347 16.244 16.121 15.966 15.812 15.664 15.518 15.36 15.209 15.087 14.95 14.783 14.651 14.518 14.371 14.252 14.133 13.993 13.832 13.699 13.616 13.506 13.328 13.212 13.089 13.029 12.908 12.767 12.631 12.563 12.326 12.32 12.226 12.125 11.906 11.767 11.618 11.462 11.279 11.09 10.892 10.349 -7 ,27008 ,TETRA ,17665533,Fri Dec 3 04:31:15 CET,Fri Dec 3 06:18:16 CET,0.0 0.582 0.808 0.992 1.176 1.349 1.489 1.605 1.826 1.93 2.027 2.057 2.329 2.424 2.593 2.739 2.876 2.946 3.084 3.224 3.429 3.564 3.681 3.852 4.018 4.177 4.35 4.502 4.693 4.891 5.095 5.345 5.576 5.794 6.034 6.291 6.532 6.799 7.094 7.413 7.756 8.155 8.651 9.185 9.792 10.402 11.128 11.955 12.871 13.932 15.144 16.016 16.44 16.651 16.679 16.584 16.461 16.377 16.297 16.176 16.015 15.84 15.705 15.578 15.454 15.338 15.198 15.046 14.919 14.803 14.678 14.568 14.447 14.307 14.207 14.115 14.003 13.885 13.758 13.673 13.58 13.404 13.282 13.17 13.117 12.993 12.846 12.683 12.603 12.365 12.344 12.254 12.162 11.975 11.866 11.732 11.599 11.437 11.184 10.927 10.213 -8 ,21271 ,TETRA ,17665534,Fri Dec 3 04:31:12 CET,Fri Dec 3 06:18:01 CET,0.0 0.356 0.535 0.7 0.869 1.029 1.178 1.318 1.564 1.665 1.764 1.781 2.04 2.132 2.307 2.465 2.622 2.699 2.844 2.988 3.178 3.304 3.437 3.611 3.766 3.927 4.09 4.254 4.46 4.653 4.838 5.06 5.305 5.537 5.784 6.061 6.317 6.616 6.962 7.319 7.675 8.076 8.559 9.044 9.571 10.159 10.848 11.628 12.553 13.65 14.855 15.71 16.131 16.282 16.311 16.261 16.17 16.082 15.981 15.86 15.753 15.628 15.507 15.403 15.283 15.155 15.012 14.878 14.764 14.655 14.528 14.416 14.301 14.169 14.074 13.985 13.876 13.763 13.637 13.549 13.46 13.294 13.191 13.099 13.041 12.916 12.785 12.633 12.56 12.331 12.339 12.26 12.164 11.956 11.832 11.673 11.512 11.348 11.129 10.719 9.861 -9 ,18881 ,TETRA ,17665535,Fri Dec 3 04:32:12 CET,Fri Dec 3 06:19:42 CET,0.0 0.605 0.862 1.046 1.201 1.359 1.496 1.613 1.801 1.895 1.995 2.019 2.277 2.359 2.512 2.655 2.818 2.898 3.029 3.163 3.366 3.5 3.629 3.803 3.963 4.129 4.299 4.459 4.664 4.869 5.07 5.305 5.534 5.75 6.01 6.29 6.546 6.829 7.13 7.456 7.798 8.199 8.671 9.116 9.648 10.288 11.003 11.748 12.618 13.672 14.873 15.688 16.077 16.251 16.307 16.31 16.247 16.155 16.071 15.969 15.866 15.763 15.653 15.534 15.397 15.269 15.144 15.012 14.886 14.76 14.622 14.505 14.381 14.245 14.157 14.075 13.974 13.855 13.73 13.649 13.564 13.422 13.313 13.203 13.157 13.052 12.92 12.789 12.715 12.477 12.46 12.37 12.284 12.117 12.034 11.943 11.848 11.725 11.59 11.45 11.15 -10 ,32570 ,TETRA ,17665536,Fri Dec 3 04:32:14 CET,Fri Dec 3 06:20:31 CET,0.0 0.621 0.889 1.103 1.279 1.453 1.59 1.707 1.942 2.045 2.142 2.157 2.426 2.519 2.685 2.848 2.996 3.069 3.209 3.341 3.522 3.643 3.776 3.959 4.13 4.305 4.486 4.655 4.867 5.078 5.273 5.498 5.734 5.968 6.257 6.576 6.831 7.144 7.499 7.83 8.165 8.562 9.028 9.491 10.043 10.661 11.368 12.147 13.034 14.03 15.191 16.045 16.422 16.631 16.716 16.737 16.651 16.528 16.444 16.314 16.176 16.059 15.912 15.742 15.581 15.437 15.31 15.182 15.055 14.924 14.789 14.669 14.533 14.377 14.254 14.133 14.022 13.905 13.77 13.678 13.583 13.43 13.313 13.184 13.131 13.035 12.907 12.765 12.687 12.445 12.428 12.339 12.242 11.991 11.857 11.724 11.556 11.371 11.168 10.919 10.363 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5n_5d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5n_5d.txt deleted file mode 100644 index 160f3457..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5n_5d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,31181 ,KEBNE ,17026523,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:10:18 CET,0.0 0.298 0.446 0.598 0.735 0.861 0.982 1.09 1.278 1.36 1.43 1.398 1.622 1.68 1.805 1.924 2.02 2.064 2.157 2.251 2.371 2.449 2.526 2.638 2.759 2.869 2.964 3.057 3.176 3.291 3.389 3.505 3.623 3.729 3.842 3.985 4.127 4.26 4.399 4.538 4.677 4.836 4.996 5.124 5.247 5.392 5.518 5.532 5.4 5.041 4.129 2.721 1.451 0.382 -0.589 -1.551 -2.407 -3.155 -3.811 -4.482 -5.031 -5.482 -5.932 -6.379 -6.802 -7.204 -7.633 -8.01 -8.342 -8.686 -9.047 -9.35 -9.661 -9.999 -10.263 -10.551 -10.841 -11.119 -11.434 -11.664 -11.887 -12.213 -12.443 -12.7 -12.839 -13.141 -13.444 -13.752 -13.92 -14.267 -14.502 -14.706 -14.905 -15.353 -15.617 -15.928 -16.296 -16.713 -17.199 -17.892 -20.846 -2 ,5816 ,KEBNE ,17026524,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:09:56 CET,0.0 0.495 0.728 0.912 1.056 1.159 1.264 1.352 1.508 1.591 1.664 1.624 1.847 1.901 2.007 2.118 2.219 2.261 2.34 2.423 2.544 2.621 2.706 2.831 2.946 3.051 3.145 3.236 3.362 3.475 3.575 3.688 3.799 3.909 4.018 4.143 4.276 4.399 4.518 4.669 4.816 4.959 5.14 5.296 5.438 5.574 5.678 5.674 5.555 5.163 4.067 2.55 1.312 0.275 -0.645 -1.532 -2.336 -3.086 -3.737 -4.362 -4.895 -5.418 -5.941 -6.411 -6.846 -7.257 -7.689 -8.051 -8.369 -8.719 -9.076 -9.364 -9.669 -9.995 -10.255 -10.51 -10.766 -11.054 -11.347 -11.554 -11.784 -12.124 -12.359 -12.607 -12.736 -13.031 -13.349 -13.671 -13.833 -14.18 -14.385 -14.57 -14.778 -15.255 -15.511 -15.794 -16.129 -16.484 -16.913 -17.631 -20.667 -3 ,17332 ,KEBNE ,17026525,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:09:33 CET,0.0 0.378 0.561 0.752 0.913 1.044 1.161 1.257 1.42 1.498 1.578 1.55 1.771 1.83 1.932 2.036 2.137 2.186 2.28 2.361 2.483 2.565 2.635 2.732 2.834 2.936 3.03 3.114 3.226 3.345 3.473 3.62 3.737 3.847 3.983 4.129 4.252 4.387 4.531 4.675 4.819 4.973 5.118 5.234 5.357 5.468 5.555 5.55 5.408 5.054 4.197 2.946 1.734 0.549 -0.519 -1.486 -2.368 -3.177 -3.856 -4.552 -5.167 -5.702 -6.245 -6.8 -7.285 -7.69 -8.122 -8.5 -8.807 -9.137 -9.492 -9.785 -10.103 -10.424 -10.663 -10.925 -11.198 -11.484 -11.79 -11.982 -12.187 -12.535 -12.776 -13.031 -13.163 -13.44 -13.72 -14.018 -14.187 -14.539 -14.788 -15.008 -15.209 -15.626 -15.86 -16.162 -16.573 -17.027 -17.552 -18.288 -20.806 -4 ,20676 ,KEBNE ,17026526,Wed Dec 22 14:35:00 CET,Wed Dec 22 16:09:26 CET,0.0 0.622 0.835 0.995 1.113 1.216 1.31 1.397 1.549 1.631 1.709 1.672 1.887 1.945 2.053 2.155 2.264 2.313 2.413 2.506 2.629 2.705 2.777 2.89 2.984 3.072 3.159 3.236 3.352 3.462 3.554 3.683 3.811 3.919 4.036 4.168 4.316 4.475 4.624 4.759 4.873 5.008 5.155 5.302 5.493 5.662 5.771 5.78 5.657 5.315 4.367 2.864 1.586 0.496 -0.549 -1.535 -2.432 -3.24 -3.895 -4.567 -5.176 -5.677 -6.128 -6.567 -6.987 -7.394 -7.84 -8.233 -8.547 -8.865 -9.208 -9.505 -9.83 -10.159 -10.422 -10.701 -10.971 -11.247 -11.542 -11.747 -11.967 -12.307 -12.54 -12.797 -12.92 -13.152 -13.422 -13.731 -13.889 -14.226 -14.414 -14.623 -14.844 -15.323 -15.621 -15.943 -16.268 -16.643 -17.135 -17.815 -19.809 -5 ,8613 ,KEBNE ,17026527,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:08:29 CET,0.0 0.672 0.917 1.094 1.21 1.308 1.406 1.497 1.662 1.726 1.784 1.739 1.949 2.005 2.137 2.257 2.359 2.416 2.521 2.612 2.735 2.805 2.875 3.0 3.119 3.216 3.304 3.399 3.524 3.622 3.713 3.833 3.955 4.068 4.195 4.331 4.461 4.611 4.747 4.858 4.971 5.115 5.287 5.443 5.593 5.71 5.759 5.718 5.564 5.253 4.417 3.051 1.766 0.606 -0.445 -1.391 -2.197 -2.973 -3.665 -4.322 -4.872 -5.399 -5.929 -6.411 -6.83 -7.21 -7.62 -7.969 -8.27 -8.589 -8.925 -9.214 -9.537 -9.9 -10.179 -10.452 -10.729 -11.032 -11.355 -11.567 -11.776 -12.122 -12.372 -12.633 -12.761 -13.027 -13.321 -13.619 -13.783 -14.127 -14.307 -14.511 -14.734 -15.187 -15.449 -15.735 -16.03 -16.369 -16.784 -17.458 -21.446 -6 ,22589 ,KEBNE ,17026528,Wed Dec 22 14:35:00 CET,Wed Dec 22 16:08:03 CET,0.0 0.505 0.793 1.027 1.219 1.375 1.5 1.588 1.728 1.807 1.892 1.86 2.081 2.145 2.274 2.389 2.479 2.521 2.609 2.702 2.84 2.927 3.008 3.122 3.237 3.34 3.435 3.527 3.632 3.746 3.861 3.979 4.088 4.205 4.344 4.476 4.599 4.731 4.866 5.005 5.123 5.234 5.361 5.506 5.634 5.734 5.804 5.793 5.669 5.28 4.322 2.912 1.656 0.535 -0.486 -1.467 -2.326 -3.049 -3.65 -4.26 -4.805 -5.295 -5.745 -6.164 -6.574 -6.988 -7.432 -7.825 -8.164 -8.506 -8.868 -9.173 -9.497 -9.835 -10.091 -10.344 -10.609 -10.895 -11.202 -11.417 -11.633 -11.969 -12.196 -12.435 -12.556 -12.805 -13.099 -13.416 -13.57 -13.893 -14.08 -14.292 -14.513 -14.949 -15.204 -15.521 -15.852 -16.19 -16.615 -17.232 -19.593 -7 ,23819 ,KEBNE ,17026529,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:09:29 CET,0.0 0.267 0.409 0.509 0.633 0.775 0.893 0.999 1.179 1.252 1.323 1.295 1.517 1.578 1.693 1.79 1.891 1.94 2.027 2.116 2.253 2.34 2.428 2.553 2.66 2.748 2.838 2.93 3.046 3.162 3.276 3.4 3.499 3.598 3.72 3.849 3.979 4.125 4.274 4.414 4.526 4.653 4.816 4.981 5.152 5.275 5.332 5.293 5.116 4.718 3.744 2.306 1.018 -0.101 -1.108 -2.037 -2.852 -3.645 -4.378 -5.122 -5.708 -6.215 -6.704 -7.185 -7.654 -8.093 -8.534 -8.908 -9.237 -9.585 -9.94 -10.223 -10.518 -10.829 -11.087 -11.365 -11.635 -11.894 -12.187 -12.423 -12.655 -13.002 -13.243 -13.496 -13.625 -13.875 -14.161 -14.475 -14.631 -14.971 -15.168 -15.352 -15.536 -15.925 -16.194 -16.497 -16.806 -17.19 -17.687 -18.444 -21.926 -8 ,13620 ,KEBNE ,17026530,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:09:47 CET,0.0 0.356 0.578 0.742 0.866 0.971 1.086 1.187 1.355 1.427 1.492 1.452 1.67 1.733 1.851 1.949 2.036 2.082 2.18 2.276 2.401 2.476 2.548 2.648 2.746 2.853 2.96 3.052 3.154 3.244 3.332 3.463 3.595 3.714 3.843 3.973 4.09 4.207 4.346 4.489 4.596 4.699 4.815 4.935 5.045 5.146 5.257 5.276 5.139 4.734 3.725 2.363 1.072 -0.112 -1.109 -2.027 -2.861 -3.613 -4.247 -4.885 -5.439 -5.922 -6.394 -6.864 -7.299 -7.686 -8.093 -8.446 -8.751 -9.087 -9.471 -9.801 -10.111 -10.43 -10.672 -10.907 -11.177 -11.472 -11.764 -11.967 -12.175 -12.505 -12.749 -12.994 -13.114 -13.368 -13.626 -13.919 -14.093 -14.446 -14.665 -14.869 -15.085 -15.602 -15.88 -16.159 -16.473 -16.904 -17.51 -18.304 -21.279 -9 ,19697 ,KEBNE ,17026531,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:09:09 CET,0.0 0.827 1.102 1.274 1.41 1.528 1.625 1.715 1.877 1.95 2.024 2.001 2.222 2.278 2.385 2.489 2.589 2.641 2.737 2.82 2.938 3.013 3.096 3.223 3.327 3.41 3.495 3.584 3.703 3.811 3.913 4.04 4.148 4.249 4.365 4.497 4.618 4.739 4.862 4.978 5.111 5.272 5.44 5.583 5.737 5.877 5.985 6.005 5.856 5.474 4.578 3.168 1.86 0.705 -0.307 -1.265 -2.162 -2.995 -3.713 -4.404 -5.01 -5.548 -6.039 -6.506 -6.969 -7.399 -7.802 -8.165 -8.483 -8.805 -9.163 -9.458 -9.762 -10.1 -10.368 -10.623 -10.861 -11.123 -11.43 -11.644 -11.85 -12.159 -12.395 -12.65 -12.77 -13.028 -13.303 -13.61 -13.792 -14.132 -14.312 -14.526 -14.773 -15.282 -15.538 -15.849 -16.202 -16.558 -16.99 -17.643 -21.27 -10 ,30993 ,KEBNE ,17026532,Wed Dec 22 14:34:59 CET,Wed Dec 22 16:08:31 CET,0.0 0.342 0.549 0.715 0.845 0.958 1.069 1.174 1.344 1.409 1.471 1.431 1.651 1.713 1.833 1.962 2.082 2.13 2.207 2.279 2.393 2.472 2.553 2.665 2.765 2.861 2.957 3.042 3.144 3.256 3.369 3.497 3.619 3.738 3.869 4.001 4.116 4.235 4.369 4.516 4.655 4.794 4.957 5.087 5.185 5.262 5.325 5.264 5.038 4.615 3.616 2.081 0.725 -0.452 -1.543 -2.526 -3.365 -4.109 -4.751 -5.398 -5.997 -6.545 -7.063 -7.528 -7.929 -8.333 -8.794 -9.19 -9.524 -9.883 -10.266 -10.559 -10.846 -11.175 -11.448 -11.746 -12.035 -12.307 -12.6 -12.805 -13.022 -13.355 -13.603 -13.875 -14.009 -14.295 -14.591 -14.897 -15.066 -15.416 -15.633 -15.851 -16.067 -16.471 -16.709 -16.999 -17.343 -17.767 -18.236 -18.941 -22.618 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5m.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5m.txt deleted file mode 100644 index a37ab5e9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5m.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,30810 ,TETRA ,17665537,Fri Dec 3 04:32:15 CET,Fri Dec 3 06:19:56 CET,0.0 0.136 0.263 0.36 0.444 0.511 0.569 0.623 0.733 0.789 0.842 0.783 0.983 1.021 1.103 1.178 1.258 1.296 1.361 1.429 1.529 1.601 1.676 1.781 1.887 1.99 2.086 2.179 2.307 2.438 2.565 2.696 2.809 2.921 3.042 3.171 3.309 3.457 3.605 3.77 3.944 4.118 4.308 4.482 4.646 4.793 4.901 4.936 4.879 4.661 3.845 2.399 1.009 -0.239 -1.291 -2.27 -3.137 -3.923 -4.597 -5.249 -5.833 -6.376 -6.911 -7.424 -7.879 -8.28 -8.726 -9.13 -9.441 -9.757 -10.121 -10.441 -10.773 -11.098 -11.333 -11.574 -11.814 -12.055 -12.343 -12.556 -12.761 -13.049 -13.236 -13.44 -13.56 -13.842 -14.127 -14.386 -14.519 -14.839 -15.0 -15.176 -15.37 -15.805 -16.041 -16.27 -16.492 -16.793 -17.19 -17.719 -20.062 -2 ,11751 ,TETRA ,17665538,Fri Dec 3 04:33:13 CET,Fri Dec 3 06:22:25 CET,0.0 0.174 0.25 0.315 0.379 0.435 0.484 0.541 0.661 0.717 0.777 0.75 0.975 1.039 1.173 1.277 1.365 1.411 1.507 1.607 1.752 1.834 1.903 2.008 2.117 2.216 2.308 2.401 2.516 2.624 2.733 2.862 2.976 3.078 3.203 3.362 3.5 3.616 3.739 3.884 4.018 4.157 4.322 4.47 4.628 4.748 4.817 4.861 4.792 4.479 3.699 2.4 1.077 -0.201 -1.271 -2.265 -3.207 -4.024 -4.711 -5.39 -5.99 -6.533 -7.034 -7.516 -7.988 -8.413 -8.846 -9.223 -9.541 -9.877 -10.231 -10.536 -10.86 -11.188 -11.429 -11.684 -11.954 -12.223 -12.523 -12.737 -12.958 -13.315 -13.574 -13.848 -13.987 -14.281 -14.564 -14.834 -14.987 -15.323 -15.508 -15.695 -15.879 -16.273 -16.474 -16.717 -17.023 -17.357 -17.807 -18.412 -20.745 -3 ,11330 ,TETRA ,17665539,Fri Dec 3 04:33:11 CET,Fri Dec 3 06:22:11 CET,0.0 0.138 0.22 0.297 0.371 0.437 0.497 0.559 0.685 0.735 0.783 0.724 0.937 0.978 1.046 1.123 1.194 1.227 1.29 1.358 1.464 1.524 1.588 1.682 1.766 1.849 1.917 1.984 2.097 2.218 2.324 2.451 2.582 2.713 2.85 2.999 3.149 3.311 3.477 3.629 3.806 4.014 4.212 4.39 4.579 4.706 4.798 4.858 4.74 4.39 3.556 2.172 0.897 -0.267 -1.372 -2.374 -3.197 -3.915 -4.541 -5.154 -5.674 -6.143 -6.612 -7.08 -7.504 -7.87 -8.279 -8.654 -8.974 -9.304 -9.633 -9.902 -10.191 -10.49 -10.728 -10.98 -11.232 -11.487 -11.739 -11.915 -12.118 -12.44 -12.645 -12.853 -12.965 -13.228 -13.494 -13.752 -13.904 -14.242 -14.411 -14.583 -14.768 -15.169 -15.417 -15.679 -15.958 -16.322 -16.805 -17.433 -19.922 -4 ,26182 ,TETRA ,17665540,Fri Dec 3 04:33:17 CET,Fri Dec 3 06:22:10 CET,0.0 0.171 0.256 0.34 0.409 0.463 0.522 0.58 0.692 0.749 0.805 0.742 0.951 0.996 1.088 1.173 1.259 1.304 1.385 1.456 1.565 1.634 1.7 1.803 1.904 2.0 2.095 2.185 2.292 2.394 2.495 2.61 2.724 2.852 2.996 3.128 3.257 3.404 3.573 3.755 3.914 4.076 4.24 4.369 4.503 4.642 4.761 4.84 4.749 4.29 3.271 1.823 0.486 -0.694 -1.688 -2.605 -3.457 -4.232 -4.917 -5.621 -6.235 -6.821 -7.367 -7.85 -8.284 -8.665 -9.077 -9.47 -9.835 -10.21 -10.573 -10.861 -11.15 -11.47 -11.731 -11.988 -12.254 -12.545 -12.845 -13.043 -13.267 -13.633 -13.866 -14.096 -14.213 -14.444 -14.724 -15.013 -15.144 -15.451 -15.592 -15.775 -15.971 -16.395 -16.623 -16.821 -17.08 -17.413 -17.779 -18.299 -21.602 -5 ,2690 ,TETRA ,17665541,Fri Dec 3 04:33:14 CET,Fri Dec 3 06:22:08 CET,0.0 0.116 0.202 0.289 0.377 0.453 0.513 0.578 0.703 0.75 0.796 0.731 0.946 0.998 1.09 1.179 1.268 1.307 1.385 1.467 1.592 1.672 1.744 1.843 1.943 2.034 2.12 2.21 2.314 2.422 2.531 2.662 2.803 2.922 3.036 3.194 3.342 3.491 3.663 3.821 3.988 4.175 4.358 4.504 4.651 4.813 4.953 5.021 4.939 4.588 3.663 2.285 1.025 -0.139 -1.138 -2.036 -2.881 -3.658 -4.298 -4.907 -5.431 -5.927 -6.428 -6.9 -7.342 -7.754 -8.156 -8.516 -8.827 -9.139 -9.459 -9.72 -9.992 -10.298 -10.55 -10.81 -11.062 -11.323 -11.594 -11.766 -11.951 -12.273 -12.497 -12.719 -12.84 -13.078 -13.302 -13.592 -13.766 -14.118 -14.349 -14.55 -14.753 -15.222 -15.479 -15.757 -16.062 -16.411 -16.872 -17.476 -20.141 -6 ,23341 ,TETRA ,17665542,Fri Dec 3 04:34:11 CET,Fri Dec 3 06:23:20 CET,0.0 0.184 0.279 0.359 0.432 0.495 0.557 0.621 0.741 0.798 0.863 0.827 1.042 1.099 1.208 1.323 1.433 1.481 1.572 1.655 1.774 1.852 1.924 2.03 2.145 2.261 2.368 2.472 2.602 2.722 2.843 2.998 3.159 3.298 3.442 3.603 3.74 3.886 4.045 4.219 4.384 4.534 4.7 4.862 5.036 5.152 5.254 5.334 5.251 4.999 4.166 2.756 1.433 0.208 -0.816 -1.741 -2.605 -3.369 -4.08 -4.844 -5.466 -5.978 -6.451 -6.933 -7.381 -7.751 -8.17 -8.555 -8.849 -9.156 -9.467 -9.723 -10.004 -10.307 -10.545 -10.79 -11.055 -11.323 -11.583 -11.77 -11.984 -12.315 -12.54 -12.774 -12.891 -13.121 -13.347 -13.611 -13.76 -14.087 -14.24 -14.412 -14.605 -15.017 -15.269 -15.549 -15.838 -16.151 -16.543 -17.061 -19.385 -7 ,19005 ,TETRA ,17665543,Fri Dec 3 04:34:13 CET,Fri Dec 3 06:22:59 CET,0.0 0.113 0.196 0.277 0.351 0.419 0.48 0.539 0.644 0.696 0.748 0.685 0.894 0.94 1.034 1.126 1.211 1.249 1.313 1.379 1.48 1.545 1.606 1.704 1.808 1.902 2.01 2.124 2.258 2.387 2.511 2.647 2.774 2.905 3.056 3.183 3.307 3.472 3.641 3.809 3.987 4.177 4.385 4.566 4.745 4.929 5.073 5.143 5.064 4.687 3.758 2.357 1.062 -0.086 -1.097 -2.022 -2.841 -3.585 -4.291 -4.973 -5.53 -6.07 -6.576 -7.071 -7.556 -7.993 -8.422 -8.805 -9.16 -9.502 -9.842 -10.159 -10.51 -10.857 -11.104 -11.36 -11.639 -11.927 -12.197 -12.372 -12.551 -12.831 -13.042 -13.278 -13.408 -13.669 -13.93 -14.224 -14.386 -14.717 -14.855 -15.026 -15.215 -15.593 -15.816 -16.094 -16.376 -16.674 -17.103 -17.832 -21.051 -8 ,8541 ,TETRA ,17665544,Fri Dec 3 04:34:15 CET,Fri Dec 3 06:23:26 CET,0.0 0.119 0.208 0.271 0.325 0.381 0.439 0.5 0.621 0.672 0.72 0.655 0.856 0.898 0.99 1.064 1.13 1.168 1.249 1.321 1.413 1.473 1.534 1.634 1.73 1.818 1.908 2.005 2.129 2.241 2.352 2.49 2.616 2.723 2.852 3.004 3.14 3.285 3.453 3.624 3.801 4.001 4.209 4.426 4.607 4.725 4.845 4.818 4.618 4.254 3.407 1.943 0.524 -0.691 -1.708 -2.596 -3.355 -4.074 -4.745 -5.408 -5.968 -6.504 -7.031 -7.531 -7.974 -8.361 -8.795 -9.167 -9.473 -9.814 -10.186 -10.487 -10.786 -11.085 -11.297 -11.527 -11.8 -12.076 -12.355 -12.541 -12.736 -13.051 -13.25 -13.453 -13.565 -13.819 -14.097 -14.407 -14.561 -14.877 -15.007 -15.157 -15.329 -15.728 -15.971 -16.232 -16.51 -16.855 -17.287 -17.858 -21.655 -9 ,3714 ,TETRA ,17665545,Fri Dec 3 04:34:17 CET,Fri Dec 3 06:23:11 CET,0.0 0.21 0.315 0.405 0.466 0.525 0.593 0.665 0.8 0.854 0.9 0.829 1.033 1.08 1.166 1.237 1.313 1.35 1.414 1.477 1.585 1.652 1.716 1.828 1.945 2.058 2.163 2.258 2.381 2.507 2.633 2.774 2.885 2.997 3.127 3.263 3.405 3.568 3.737 3.902 4.062 4.224 4.376 4.488 4.614 4.752 4.857 4.877 4.798 4.525 3.703 2.351 1.032 -0.168 -1.205 -2.13 -2.951 -3.692 -4.367 -5.05 -5.61 -6.098 -6.578 -7.031 -7.438 -7.815 -8.244 -8.631 -8.963 -9.321 -9.699 -10.022 -10.341 -10.667 -10.926 -11.193 -11.471 -11.75 -12.041 -12.237 -12.436 -12.783 -13.042 -13.31 -13.45 -13.725 -13.99 -14.284 -14.444 -14.771 -14.926 -15.107 -15.281 -15.673 -15.906 -16.126 -16.368 -16.659 -16.978 -17.47 -22.216 -10 ,24041 ,TETRA ,17665546,Fri Dec 3 04:34:11 CET,Fri Dec 3 06:24:18 CET,0.0 0.128 0.211 0.282 0.358 0.424 0.488 0.554 0.673 0.722 0.766 0.688 0.891 0.932 1.021 1.105 1.188 1.229 1.308 1.384 1.499 1.579 1.659 1.768 1.874 1.986 2.088 2.192 2.333 2.456 2.576 2.722 2.863 2.986 3.117 3.277 3.422 3.545 3.669 3.816 3.985 4.167 4.367 4.528 4.684 4.827 4.923 4.988 4.885 4.496 3.564 2.141 0.844 -0.287 -1.258 -2.173 -3.041 -3.832 -4.509 -5.156 -5.674 -6.152 -6.632 -7.088 -7.511 -7.897 -8.328 -8.728 -9.082 -9.441 -9.811 -10.119 -10.445 -10.794 -11.07 -11.353 -11.633 -11.922 -12.241 -12.469 -12.702 -13.063 -13.304 -13.566 -13.708 -13.994 -14.301 -14.634 -14.806 -15.147 -15.354 -15.57 -15.797 -16.298 -16.543 -16.803 -17.15 -17.524 -17.979 -18.748 -23.334 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5n.txt deleted file mode 100644 index a82c174b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5o_5n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,14136 ,TETRA ,17665547,Fri Dec 3 04:34:12 CET,Fri Dec 3 06:25:00 CET,0.0 1.794 2.178 2.462 2.693 2.91 3.095 3.244 3.566 3.724 3.862 3.963 4.237 4.343 4.546 4.742 4.922 5.01 5.17 5.331 5.57 5.703 5.836 6.021 6.192 6.366 6.541 6.714 6.933 7.162 7.389 7.638 7.878 8.116 8.371 8.64 8.904 9.188 9.486 9.822 10.162 10.516 10.942 11.355 11.747 12.098 12.519 12.961 13.292 13.548 13.581 13.16 12.588 11.991 11.378 10.756 10.206 9.699 9.254 8.801 8.386 8.013 7.634 7.261 6.899 6.535 6.154 5.821 5.543 5.269 4.984 4.736 4.456 4.159 3.946 3.737 3.483 3.206 2.953 2.772 2.587 2.3 2.097 1.894 1.786 1.544 1.268 1.017 0.888 0.572 0.414 0.253 0.069 -0.328 -0.523 -0.769 -1.083 -1.394 -1.763 -2.248 -4.07 -2 ,31185 ,TETRA ,17665548,Fri Dec 3 04:34:15 CET,Fri Dec 3 06:24:48 CET,0.0 2.356 2.779 3.127 3.445 3.655 3.824 4.0 4.325 4.461 4.603 4.722 4.998 5.106 5.345 5.582 5.801 5.901 6.081 6.248 6.469 6.615 6.772 6.997 7.196 7.398 7.587 7.751 7.959 8.161 8.35 8.58 8.806 9.009 9.259 9.543 9.78 10.022 10.262 10.536 10.848 11.199 11.624 12.048 12.507 12.931 13.312 13.685 14.034 14.224 14.143 13.634 12.962 12.287 11.685 11.09 10.515 9.995 9.568 9.095 8.641 8.228 7.835 7.425 7.033 6.736 6.427 6.13 5.876 5.606 5.328 5.091 4.835 4.579 4.377 4.167 3.939 3.695 3.432 3.247 3.069 2.769 2.552 2.331 2.225 2.003 1.752 1.49 1.361 1.063 0.895 0.719 0.551 0.188 -0.033 -0.257 -0.481 -0.768 -1.131 -1.681 -3.754 -3 ,27220 ,TETRA ,17665549,Fri Dec 3 04:34:12 CET,Fri Dec 3 06:24:24 CET,0.0 1.744 2.089 2.323 2.519 2.711 2.905 3.069 3.337 3.487 3.628 3.732 4.008 4.117 4.342 4.548 4.735 4.824 4.987 5.146 5.37 5.52 5.668 5.872 6.066 6.256 6.443 6.625 6.861 7.083 7.29 7.546 7.781 8.019 8.288 8.565 8.8 9.036 9.289 9.568 9.879 10.244 10.674 11.076 11.561 12.056 12.511 12.903 13.214 13.431 13.393 12.856 12.161 11.455 10.81 10.212 9.679 9.201 8.746 8.216 7.712 7.239 6.784 6.397 6.065 5.768 5.451 5.143 4.859 4.564 4.27 4.021 3.767 3.511 3.319 3.108 2.874 2.64 2.398 2.225 2.024 1.703 1.5 1.294 1.19 0.956 0.693 0.421 0.29 0.0 -0.127 -0.287 -0.458 -0.816 -1.019 -1.24 -1.489 -1.794 -2.16 -2.601 -4.569 -4 ,18137 ,TETRA ,17665550,Fri Dec 3 04:34:12 CET,Fri Dec 3 06:23:37 CET,0.0 2.049 2.494 2.851 3.109 3.29 3.466 3.651 3.934 4.05 4.179 4.267 4.542 4.653 4.843 5.021 5.198 5.288 5.458 5.604 5.811 5.968 6.115 6.302 6.483 6.663 6.848 7.019 7.227 7.434 7.643 7.872 8.084 8.308 8.549 8.8 9.05 9.323 9.6 9.869 10.162 10.484 10.831 11.221 11.626 11.975 12.346 12.702 13.018 13.207 13.189 12.746 12.096 11.365 10.688 10.079 9.493 8.919 8.436 7.943 7.474 7.045 6.638 6.248 5.876 5.54 5.201 4.886 4.582 4.245 3.9 3.618 3.35 3.104 2.902 2.687 2.469 2.24 2.003 1.836 1.657 1.346 1.13 0.915 0.806 0.593 0.36 0.107 -0.021 -0.31 -0.433 -0.589 -0.756 -1.165 -1.387 -1.602 -1.868 -2.223 -2.652 -3.158 -4.959 -5 ,29800 ,TETRA ,17665551,Fri Dec 3 04:34:15 CET,Fri Dec 3 06:23:34 CET,0.0 1.687 2.041 2.305 2.534 2.732 2.923 3.111 3.438 3.578 3.704 3.763 4.025 4.133 4.361 4.565 4.759 4.861 5.044 5.201 5.431 5.583 5.728 5.933 6.129 6.321 6.498 6.661 6.886 7.11 7.333 7.597 7.845 8.081 8.333 8.593 8.848 9.135 9.418 9.704 10.015 10.38 10.811 11.188 11.567 11.989 12.441 12.859 13.299 13.65 13.584 13.054 12.395 11.705 11.088 10.476 9.85 9.221 8.661 8.133 7.64 7.19 6.785 6.404 6.042 5.689 5.329 5.009 4.722 4.419 4.118 3.885 3.647 3.399 3.203 2.996 2.772 2.547 2.318 2.153 1.977 1.713 1.514 1.289 1.18 0.943 0.693 0.47 0.357 0.064 -0.083 -0.258 -0.453 -0.856 -1.064 -1.286 -1.568 -1.847 -2.194 -2.716 -5.557 -6 ,28063 ,TETRA ,17665552,Fri Dec 3 04:34:16 CET,Fri Dec 3 06:23:57 CET,0.0 1.328 1.715 2.021 2.254 2.439 2.625 2.8 3.085 3.221 3.366 3.465 3.741 3.851 4.031 4.189 4.34 4.412 4.547 4.699 4.929 5.06 5.184 5.371 5.564 5.76 5.943 6.111 6.319 6.511 6.699 6.947 7.208 7.449 7.715 8.0 8.251 8.534 8.836 9.158 9.49 9.835 10.218 10.557 10.947 11.322 11.689 12.108 12.501 12.743 12.651 12.09 11.36 10.547 9.806 9.138 8.558 8.037 7.543 7.066 6.672 6.302 5.903 5.507 5.142 4.816 4.494 4.184 3.888 3.599 3.308 3.056 2.802 2.553 2.352 2.136 1.921 1.672 1.393 1.201 0.992 0.69 0.499 0.319 0.227 -0.005 -0.261 -0.509 -0.644 -0.951 -1.073 -1.23 -1.41 -1.847 -2.091 -2.347 -2.637 -2.941 -3.339 -3.865 -6.521 -7 ,30458 ,TETRA ,17665553,Fri Dec 3 04:34:18 CET,Fri Dec 3 06:23:44 CET,0.0 1.87 2.243 2.519 2.746 2.906 3.076 3.233 3.512 3.665 3.806 3.876 4.16 4.284 4.525 4.765 4.96 5.043 5.215 5.382 5.598 5.733 5.874 6.072 6.252 6.421 6.585 6.748 6.966 7.187 7.385 7.594 7.806 8.023 8.277 8.55 8.793 9.068 9.351 9.635 9.963 10.329 10.684 11.012 11.421 11.84 12.273 12.71 13.031 13.203 13.097 12.626 12.082 11.469 10.865 10.317 9.751 9.153 8.636 8.099 7.628 7.219 6.824 6.452 6.083 5.726 5.349 5.023 4.75 4.468 4.152 3.88 3.61 3.342 3.141 2.925 2.691 2.456 2.208 2.032 1.838 1.522 1.29 1.049 0.941 0.715 0.47 0.211 0.085 -0.202 -0.337 -0.495 -0.664 -1.089 -1.325 -1.535 -1.791 -2.124 -2.476 -2.94 -5.515 -8 ,20552 ,TETRA ,17665554,Fri Dec 3 04:34:13 CET,Fri Dec 3 06:23:54 CET,0.0 1.857 2.305 2.563 2.779 2.971 3.137 3.285 3.559 3.706 3.853 3.931 4.199 4.315 4.51 4.673 4.835 4.925 5.109 5.268 5.478 5.612 5.751 5.929 6.092 6.277 6.459 6.621 6.828 7.034 7.235 7.468 7.682 7.886 8.132 8.394 8.618 8.875 9.173 9.481 9.78 10.098 10.461 10.819 11.23 11.613 11.969 12.336 12.709 12.958 12.935 12.488 11.807 11.152 10.501 9.801 9.155 8.617 8.178 7.683 7.232 6.825 6.426 6.012 5.605 5.261 4.885 4.528 4.239 3.949 3.657 3.413 3.153 2.884 2.683 2.473 2.248 2.016 1.767 1.595 1.413 1.099 0.888 0.671 0.557 0.344 0.11 -0.147 -0.282 -0.596 -0.75 -0.926 -1.111 -1.506 -1.73 -1.969 -2.235 -2.517 -2.881 -3.474 -5.824 -9 ,19401 ,TETRA ,17665555,Fri Dec 3 04:34:15 CET,Fri Dec 3 06:23:47 CET,0.0 2.453 3.001 3.444 3.762 3.962 4.122 4.285 4.616 4.758 4.884 4.972 5.245 5.377 5.645 5.87 6.082 6.178 6.359 6.538 6.808 6.971 7.107 7.316 7.522 7.707 7.877 8.057 8.307 8.519 8.698 8.909 9.112 9.309 9.537 9.772 10.003 10.275 10.568 10.909 11.249 11.593 11.99 12.379 12.816 13.214 13.605 13.977 14.315 14.569 14.535 13.996 13.343 12.693 11.989 11.245 10.597 10.027 9.54 9.084 8.662 8.267 7.885 7.505 7.149 6.828 6.494 6.176 5.9 5.623 5.341 5.101 4.831 4.541 4.334 4.133 3.911 3.653 3.376 3.187 2.981 2.655 2.452 2.256 2.144 1.915 1.689 1.458 1.334 1.038 0.929 0.783 0.616 0.277 0.082 -0.161 -0.436 -0.788 -1.174 -1.613 -3.344 -10 ,28067 ,TETRA ,17665556,Fri Dec 3 04:34:16 CET,Fri Dec 3 06:27:59 CET,0.0 1.771 2.166 2.449 2.714 2.961 3.144 3.289 3.566 3.698 3.827 3.91 4.175 4.277 4.479 4.668 4.837 4.919 5.08 5.222 5.429 5.568 5.707 5.92 6.105 6.286 6.472 6.64 6.849 7.05 7.256 7.505 7.742 7.972 8.216 8.487 8.749 9.026 9.312 9.604 9.921 10.306 10.744 11.113 11.499 11.856 12.212 12.561 12.887 13.115 13.084 12.686 12.11 11.464 10.857 10.318 9.789 9.222 8.692 8.171 7.75 7.371 6.968 6.578 6.224 5.895 5.558 5.245 4.957 4.634 4.296 4.04 3.801 3.568 3.37 3.137 2.905 2.675 2.418 2.243 2.067 1.791 1.587 1.369 1.261 1.023 0.78 0.531 0.395 0.101 -0.044 -0.227 -0.39 -0.682 -0.847 -1.06 -1.311 -1.639 -2.102 -2.727 -4.914 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5p_3b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5p_3b.txt deleted file mode 100644 index dcc8589f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5p_3b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,15895 ,TETRA ,17665557,Fri Dec 3 04:34:18 CET,Fri Dec 3 06:26:54 CET,0.0 0.376 0.611 0.79 0.935 1.059 1.179 1.289 1.491 1.589 1.683 1.705 1.962 2.054 2.21 2.361 2.51 2.581 2.728 2.858 3.017 3.125 3.245 3.422 3.595 3.765 3.941 4.113 4.324 4.521 4.705 4.93 5.146 5.359 5.597 5.87 6.141 6.411 6.697 7.008 7.347 7.743 8.159 8.575 9.085 9.626 10.229 10.861 11.606 12.424 13.028 13.214 13.079 12.746 12.378 12.031 11.719 11.384 11.061 10.726 10.404 10.095 9.776 9.467 9.202 8.959 8.676 8.411 8.197 7.98 7.745 7.525 7.294 7.056 6.872 6.693 6.498 6.287 6.062 5.892 5.708 5.42 5.224 5.04 4.942 4.722 4.486 4.237 4.109 3.832 3.684 3.52 3.363 2.998 2.777 2.529 2.202 1.786 1.328 0.683 -1.868 -2 ,1947 ,TETRA ,17665558,Fri Dec 3 04:36:11 CET,Fri Dec 3 06:24:13 CET,0.0 0.376 0.611 0.789 0.962 1.115 1.237 1.348 1.567 1.671 1.764 1.769 2.015 2.106 2.266 2.409 2.556 2.63 2.776 2.915 3.124 3.253 3.367 3.53 3.692 3.851 4.01 4.166 4.368 4.576 4.778 5.007 5.227 5.444 5.688 5.962 6.223 6.513 6.833 7.171 7.529 7.924 8.344 8.754 9.22 9.782 10.494 11.265 12.047 12.767 13.429 13.576 13.395 13.19 12.912 12.563 12.233 11.917 11.613 11.286 10.966 10.674 10.392 10.102 9.84 9.594 9.307 9.056 8.83 8.584 8.356 8.159 7.947 7.723 7.539 7.336 7.138 6.947 6.736 6.578 6.416 6.161 5.96 5.752 5.653 5.435 5.184 4.906 4.762 4.475 4.294 4.103 3.915 3.502 3.272 3.011 2.692 2.307 1.814 1.141 -2.473 -3 ,23219 ,TETRA ,17665559,Fri Dec 3 04:36:13 CET,Fri Dec 3 06:25:36 CET,0.0 0.499 0.778 0.992 1.159 1.307 1.447 1.563 1.777 1.879 1.976 1.991 2.235 2.319 2.472 2.626 2.784 2.861 3.005 3.145 3.342 3.468 3.592 3.767 3.925 4.078 4.226 4.375 4.586 4.782 4.969 5.199 5.415 5.626 5.874 6.135 6.387 6.689 7.019 7.341 7.667 8.063 8.554 9.028 9.536 10.089 10.738 11.468 12.263 13.049 13.775 14.096 13.973 13.681 13.399 13.075 12.693 12.341 12.009 11.65 11.356 11.084 10.785 10.511 10.261 10.029 9.778 9.54 9.332 9.105 8.853 8.646 8.443 8.22 8.024 7.833 7.642 7.419 7.179 7.015 6.858 6.611 6.424 6.223 6.121 5.901 5.66 5.387 5.233 4.926 4.717 4.536 4.357 3.934 3.677 3.414 3.126 2.745 2.266 1.639 -1.508 -4 ,23669 ,TETRA ,17665560,Fri Dec 3 04:36:15 CET,Fri Dec 3 06:24:23 CET,0.0 0.328 0.567 0.758 0.907 1.05 1.188 1.319 1.539 1.642 1.744 1.764 2.007 2.086 2.243 2.402 2.557 2.632 2.782 2.927 3.124 3.241 3.351 3.515 3.682 3.849 3.997 4.137 4.328 4.527 4.723 4.953 5.179 5.393 5.637 5.912 6.197 6.517 6.834 7.162 7.508 7.899 8.389 8.883 9.412 9.987 10.582 11.244 12.004 12.75 13.466 13.725 13.633 13.408 13.103 12.758 12.435 12.101 11.744 11.362 11.049 10.763 10.463 10.178 9.886 9.592 9.296 9.047 8.829 8.585 8.326 8.103 7.875 7.637 7.441 7.247 7.044 6.836 6.614 6.456 6.294 6.022 5.825 5.621 5.511 5.284 5.053 4.814 4.676 4.375 4.217 4.03 3.824 3.378 3.138 2.902 2.608 2.266 1.805 1.099 -2.012 -5 ,11459 ,TETRA ,17665561,Fri Dec 3 04:40:10 CET,Fri Dec 3 06:28:45 CET,0.0 0.718 1.002 1.171 1.3 1.439 1.582 1.717 1.936 2.025 2.112 2.113 2.355 2.441 2.602 2.757 2.905 2.981 3.128 3.262 3.451 3.571 3.689 3.855 4.018 4.18 4.331 4.485 4.7 4.918 5.122 5.347 5.57 5.785 6.023 6.316 6.585 6.861 7.18 7.522 7.866 8.244 8.693 9.154 9.683 10.214 10.815 11.477 12.189 12.974 13.69 13.978 13.844 13.584 13.326 13.002 12.645 12.298 11.979 11.647 11.355 11.085 10.815 10.544 10.267 9.981 9.681 9.422 9.208 8.968 8.715 8.527 8.324 8.097 7.92 7.721 7.5 7.293 7.078 6.91 6.726 6.447 6.26 6.075 5.983 5.769 5.52 5.24 5.101 4.825 4.693 4.539 4.366 3.931 3.7 3.442 3.138 2.796 2.322 1.632 -0.896 -6 ,2771 ,TETRA ,17665562,Fri Dec 3 04:40:12 CET,Fri Dec 3 06:30:15 CET,0.0 0.481 0.723 0.931 1.079 1.209 1.358 1.488 1.696 1.795 1.892 1.913 2.16 2.243 2.396 2.545 2.687 2.755 2.89 3.024 3.216 3.336 3.45 3.616 3.782 3.94 4.077 4.198 4.374 4.568 4.762 4.991 5.21 5.437 5.699 5.984 6.253 6.55 6.864 7.217 7.611 8.019 8.458 8.924 9.465 10.049 10.753 11.524 12.381 13.278 14.05 14.356 14.31 14.073 13.716 13.349 13.007 12.626 12.248 11.879 11.55 11.256 10.984 10.711 10.467 10.236 9.94 9.66 9.434 9.207 8.972 8.768 8.545 8.306 8.126 7.941 7.746 7.546 7.335 7.184 7.023 6.757 6.563 6.361 6.25 6.032 5.815 5.549 5.404 5.11 4.937 4.76 4.561 4.11 3.86 3.577 3.259 2.897 2.424 1.738 -0.845 -7 ,27955 ,TETRA ,17665563,Fri Dec 3 04:40:11 CET,Fri Dec 3 06:28:30 CET,0.0 0.53 0.729 0.897 1.048 1.168 1.288 1.414 1.624 1.729 1.827 1.837 2.08 2.164 2.311 2.442 2.579 2.654 2.807 2.95 3.145 3.267 3.394 3.575 3.745 3.904 4.062 4.218 4.421 4.618 4.805 5.025 5.226 5.436 5.688 5.949 6.189 6.457 6.748 7.069 7.435 7.858 8.306 8.717 9.223 9.827 10.565 11.282 11.958 12.754 13.566 13.8 13.633 13.373 13.068 12.742 12.372 11.982 11.634 11.276 10.942 10.623 10.316 9.999 9.711 9.478 9.233 9.017 8.823 8.594 8.335 8.112 7.879 7.655 7.481 7.282 7.079 6.857 6.6 6.421 6.244 5.985 5.795 5.585 5.476 5.23 4.981 4.728 4.601 4.324 4.153 3.992 3.827 3.409 3.163 2.896 2.601 2.246 1.795 1.167 -1.897 -8 ,28760 ,TETRA ,17665564,Fri Dec 3 04:43:14 CET,Fri Dec 3 06:31:48 CET,0.0 0.613 0.877 1.059 1.201 1.315 1.434 1.558 1.776 1.872 1.957 1.971 2.222 2.3 2.444 2.592 2.736 2.805 2.941 3.073 3.262 3.376 3.492 3.664 3.817 3.983 4.155 4.315 4.513 4.706 4.893 5.11 5.325 5.543 5.795 6.075 6.353 6.665 7.012 7.368 7.695 8.083 8.564 9.008 9.528 10.125 10.798 11.557 12.381 13.301 14.182 14.461 14.386 14.14 13.832 13.483 13.129 12.779 12.446 12.093 11.763 11.467 11.179 10.878 10.614 10.388 10.129 9.872 9.643 9.414 9.177 8.964 8.724 8.472 8.28 8.084 7.878 7.661 7.431 7.273 7.112 6.85 6.661 6.472 6.367 6.148 5.925 5.677 5.548 5.268 5.11 4.942 4.763 4.345 4.109 3.849 3.556 3.182 2.683 2.008 -1.499 -9 ,25580 ,TETRA ,17665565,Fri Dec 3 04:43:15 CET,Fri Dec 3 06:32:44 CET,0.0 0.303 0.526 0.746 0.897 1.036 1.161 1.258 1.467 1.578 1.68 1.703 1.954 2.04 2.188 2.333 2.473 2.538 2.675 2.808 3.002 3.127 3.238 3.412 3.58 3.741 3.906 4.056 4.232 4.407 4.583 4.791 4.988 5.182 5.412 5.653 5.891 6.184 6.497 6.8 7.128 7.514 7.972 8.456 8.984 9.522 10.189 10.91 11.598 12.337 13.009 13.201 13.057 12.703 12.282 11.866 11.443 11.051 10.707 10.344 10.027 9.723 9.434 9.156 8.882 8.63 8.35 8.09 7.87 7.636 7.401 7.203 6.995 6.789 6.616 6.426 6.228 6.016 5.777 5.602 5.435 5.177 4.998 4.81 4.702 4.47 4.236 3.972 3.826 3.538 3.362 3.18 3.007 2.616 2.38 2.119 1.826 1.437 0.915 0.285 -1.929 -10 ,24945 ,TETRA ,17665566,Fri Dec 3 04:43:15 CET,Fri Dec 3 06:30:28 CET,0.0 0.485 0.663 0.813 0.948 1.064 1.171 1.271 1.474 1.576 1.68 1.709 1.949 2.038 2.217 2.376 2.53 2.607 2.743 2.873 3.064 3.191 3.315 3.501 3.689 3.87 4.043 4.21 4.423 4.616 4.8 5.019 5.243 5.474 5.732 6.012 6.266 6.54 6.847 7.184 7.529 7.931 8.411 8.883 9.445 10.035 10.657 11.286 11.973 12.74 13.374 13.596 13.521 13.302 13.0 12.652 12.33 11.99 11.665 11.323 11.013 10.735 10.467 10.194 9.915 9.668 9.401 9.149 8.949 8.719 8.458 8.246 8.021 7.801 7.622 7.432 7.239 7.028 6.811 6.656 6.5 6.252 6.069 5.869 5.763 5.559 5.329 5.066 4.928 4.648 4.482 4.31 4.151 3.743 3.506 3.263 2.954 2.598 2.197 1.631 -1.607 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5p_5n.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5p_5n.txt deleted file mode 100644 index a9543da2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_5p_5n.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,23817 ,TETRA ,17665567,Fri Dec 3 04:45:13 CET,Fri Dec 3 06:39:31 CET,0.0 0.85 1.167 1.392 1.633 1.833 1.996 2.156 2.452 2.586 2.704 2.75 3.013 3.108 3.282 3.448 3.603 3.677 3.827 3.983 4.206 4.332 4.448 4.624 4.789 4.949 5.109 5.261 5.459 5.651 5.841 6.07 6.283 6.476 6.698 6.989 7.263 7.525 7.795 8.079 8.393 8.746 9.142 9.554 10.015 10.489 11.016 11.54 12.081 12.641 13.111 13.044 12.674 12.303 11.869 11.387 10.953 10.502 10.103 9.688 9.251 8.849 8.489 8.15 7.821 7.525 7.221 6.948 6.713 6.46 6.178 5.955 5.739 5.501 5.311 5.115 4.907 4.691 4.471 4.313 4.142 3.876 3.676 3.463 3.361 3.145 2.909 2.658 2.52 2.213 2.057 1.906 1.754 1.387 1.17 0.912 0.636 0.356 0.016 -0.44 -1.789 -2 ,29068 ,TETRA ,17665568,Fri Dec 3 04:45:13 CET,Fri Dec 3 06:35:16 CET,0.0 0.701 1.006 1.239 1.452 1.651 1.824 1.975 2.278 2.408 2.515 2.557 2.813 2.913 3.116 3.328 3.509 3.586 3.75 3.906 4.13 4.269 4.394 4.589 4.769 4.932 5.082 5.226 5.429 5.627 5.813 6.044 6.273 6.49 6.73 7.002 7.268 7.566 7.891 8.222 8.549 8.905 9.323 9.751 10.233 10.712 11.252 11.831 12.425 13.035 13.47 13.453 13.169 12.729 12.237 11.684 11.168 10.703 10.274 9.802 9.381 9.03 8.714 8.405 8.104 7.835 7.552 7.301 7.063 6.822 6.589 6.375 6.135 5.876 5.688 5.486 5.267 5.058 4.836 4.677 4.509 4.237 4.042 3.85 3.751 3.527 3.305 3.072 2.947 2.663 2.566 2.421 2.269 1.958 1.769 1.547 1.288 0.992 0.639 0.175 -1.399 -3 ,30252 ,TETRA ,17665569,Fri Dec 3 04:45:15 CET,Fri Dec 3 06:35:25 CET,0.0 0.969 1.441 1.746 1.989 2.18 2.375 2.555 2.818 2.942 3.061 3.121 3.381 3.48 3.673 3.862 4.049 4.143 4.325 4.491 4.705 4.836 4.971 5.163 5.351 5.532 5.699 5.865 6.076 6.273 6.463 6.689 6.908 7.116 7.353 7.631 7.906 8.194 8.495 8.828 9.168 9.533 9.956 10.382 10.867 11.351 11.877 12.452 13.059 13.616 14.089 14.075 13.76 13.304 12.734 12.169 11.672 11.202 10.767 10.324 9.959 9.629 9.286 8.966 8.658 8.378 8.072 7.79 7.556 7.303 7.037 6.81 6.557 6.302 6.114 5.925 5.731 5.527 5.31 5.155 4.996 4.722 4.53 4.347 4.25 4.031 3.811 3.593 3.467 3.17 3.051 2.909 2.757 2.42 2.223 1.986 1.721 1.412 1.029 0.611 -0.624 -4 ,6619 ,TETRA ,17665570,Fri Dec 3 04:45:14 CET,Fri Dec 3 06:35:47 CET,0.0 0.911 1.238 1.463 1.67 1.887 2.073 2.237 2.526 2.644 2.752 2.796 3.047 3.14 3.325 3.492 3.649 3.725 3.881 4.026 4.222 4.354 4.486 4.671 4.848 5.017 5.189 5.353 5.543 5.719 5.885 6.093 6.303 6.509 6.733 6.986 7.244 7.525 7.834 8.152 8.508 8.923 9.384 9.844 10.349 10.882 11.427 11.966 12.526 13.055 13.349 13.225 12.847 12.23 11.679 11.21 10.765 10.328 9.896 9.46 9.066 8.708 8.394 8.087 7.793 7.525 7.229 6.945 6.698 6.453 6.189 5.951 5.691 5.418 5.224 5.038 4.83 4.613 4.373 4.199 4.026 3.727 3.49 3.253 3.14 2.9 2.662 2.419 2.286 1.988 1.858 1.692 1.516 1.148 0.925 0.693 0.423 0.112 -0.259 -0.782 -1.683 -5 ,23023 ,TETRA ,17665571,Fri Dec 3 04:45:16 CET,Fri Dec 3 06:35:24 CET,0.0 1.113 1.501 1.805 2.044 2.227 2.382 2.523 2.779 2.896 3.007 3.067 3.323 3.413 3.585 3.743 3.892 3.966 4.127 4.285 4.503 4.644 4.777 4.945 5.105 5.278 5.454 5.62 5.82 6.007 6.195 6.416 6.632 6.841 7.076 7.342 7.589 7.852 8.137 8.448 8.774 9.148 9.59 10.015 10.485 11.003 11.538 12.048 12.581 13.065 13.358 13.316 12.996 12.528 12.084 11.68 11.27 10.851 10.435 9.991 9.595 9.208 8.841 8.466 8.089 7.768 7.462 7.191 6.955 6.7 6.435 6.22 5.976 5.715 5.512 5.314 5.125 4.916 4.689 4.518 4.336 4.073 3.895 3.704 3.593 3.364 3.145 2.905 2.771 2.475 2.335 2.173 1.995 1.625 1.424 1.201 0.985 0.73 0.397 -0.051 -1.867 -6 ,28490 ,TETRA ,17665572,Fri Dec 3 04:45:13 CET,Fri Dec 3 06:36:39 CET,0.0 0.833 1.152 1.383 1.547 1.705 1.857 2.018 2.311 2.441 2.568 2.631 2.899 3.002 3.189 3.376 3.558 3.64 3.811 3.981 4.203 4.336 4.48 4.681 4.852 5.018 5.174 5.322 5.521 5.711 5.891 6.12 6.333 6.523 6.74 7.001 7.246 7.506 7.79 8.08 8.409 8.77 9.125 9.49 9.936 10.43 10.962 11.518 12.098 12.629 13.053 12.971 12.542 12.02 11.48 10.982 10.527 10.103 9.71 9.279 8.925 8.611 8.297 7.972 7.666 7.398 7.116 6.861 6.608 6.347 6.085 5.86 5.645 5.403 5.194 4.986 4.783 4.581 4.374 4.23 4.07 3.811 3.625 3.42 3.313 3.099 2.885 2.63 2.494 2.189 2.039 1.883 1.711 1.347 1.155 0.913 0.634 0.343 0.031 -0.453 -1.918 -7 ,16890 ,TETRA ,17665573,Fri Dec 3 04:46:13 CET,Fri Dec 3 06:36:55 CET,0.0 0.756 1.111 1.324 1.521 1.706 1.878 2.038 2.326 2.447 2.564 2.635 2.892 2.986 3.187 3.361 3.523 3.601 3.751 3.894 4.102 4.238 4.368 4.552 4.715 4.871 5.038 5.214 5.441 5.651 5.848 6.087 6.332 6.566 6.803 7.06 7.325 7.614 7.914 8.225 8.534 8.89 9.328 9.735 10.184 10.677 11.229 11.828 12.449 13.047 13.435 13.295 12.913 12.417 11.886 11.363 10.875 10.404 9.981 9.546 9.137 8.768 8.433 8.119 7.826 7.558 7.276 7.0 6.759 6.525 6.256 6.017 5.779 5.532 5.346 5.146 4.918 4.684 4.458 4.303 4.133 3.887 3.719 3.52 3.417 3.224 3.017 2.786 2.661 2.372 2.228 2.058 1.897 1.57 1.375 1.145 0.878 0.567 0.22 -0.227 -2.001 -8 ,18884 ,TETRA ,17665574,Fri Dec 3 04:46:16 CET,Fri Dec 3 06:36:52 CET,0.0 0.881 1.167 1.399 1.617 1.796 1.938 2.078 2.329 2.449 2.57 2.631 2.898 3.002 3.195 3.361 3.518 3.597 3.75 3.902 4.106 4.233 4.363 4.539 4.7 4.862 5.023 5.176 5.373 5.579 5.796 6.071 6.32 6.532 6.761 6.999 7.23 7.497 7.79 8.112 8.438 8.779 9.161 9.521 9.946 10.434 10.993 11.55 12.11 12.706 13.243 13.272 12.975 12.543 12.023 11.51 11.083 10.711 10.352 9.938 9.575 9.245 8.907 8.555 8.191 7.856 7.55 7.306 7.073 6.813 6.554 6.349 6.134 5.891 5.688 5.471 5.252 5.02 4.796 4.652 4.485 4.234 4.061 3.867 3.77 3.568 3.339 3.091 2.957 2.656 2.513 2.345 2.169 1.792 1.587 1.34 1.066 0.767 0.402 -0.119 -1.761 -9 ,30491 ,TETRA ,17665575,Fri Dec 3 04:46:17 CET,Fri Dec 3 06:37:29 CET,0.0 0.806 1.14 1.408 1.62 1.789 1.949 2.105 2.384 2.496 2.617 2.711 2.978 3.076 3.273 3.467 3.64 3.718 3.876 4.019 4.202 4.33 4.455 4.626 4.802 4.975 5.14 5.297 5.504 5.71 5.913 6.143 6.355 6.561 6.79 7.051 7.309 7.581 7.854 8.143 8.452 8.805 9.233 9.705 10.265 10.788 11.33 11.918 12.513 13.024 13.384 13.26 12.863 12.404 11.943 11.531 11.135 10.768 10.417 9.98 9.586 9.226 8.859 8.514 8.215 7.948 7.646 7.357 7.108 6.865 6.591 6.351 6.123 5.879 5.675 5.476 5.267 5.03 4.783 4.617 4.445 4.163 3.961 3.744 3.638 3.428 3.213 2.988 2.863 2.572 2.452 2.304 2.127 1.718 1.505 1.266 0.993 0.677 0.318 -0.154 -1.778 -10 ,14958 ,TETRA ,17665576,Fri Dec 3 04:46:14 CET,Fri Dec 3 06:37:09 CET,0.0 0.696 0.953 1.156 1.368 1.553 1.7 1.834 2.118 2.276 2.425 2.495 2.754 2.845 3.007 3.185 3.362 3.439 3.585 3.738 3.972 4.112 4.234 4.416 4.592 4.751 4.897 5.043 5.237 5.442 5.645 5.881 6.107 6.313 6.545 6.809 7.058 7.315 7.576 7.866 8.183 8.53 8.908 9.263 9.723 10.235 10.77 11.334 11.92 12.459 12.865 12.882 12.615 12.26 11.857 11.417 10.991 10.554 10.139 9.716 9.347 9.021 8.679 8.336 8.045 7.743 7.39 7.114 6.895 6.657 6.414 6.194 5.949 5.709 5.518 5.317 5.098 4.863 4.623 4.456 4.291 4.044 3.877 3.688 3.587 3.393 3.191 2.957 2.826 2.53 2.378 2.211 2.053 1.709 1.499 1.255 0.968 0.641 0.288 -0.171 -1.783 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8b_8a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8b_8a.txt deleted file mode 100644 index b868ae35..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8b_8a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,8121 ,TETRA ,17665577,Fri Dec 3 04:46:13 CET,Fri Dec 3 06:37:03 CET,0.0 0.418 0.645 0.843 1.015 1.153 1.282 1.398 1.614 1.729 1.836 1.881 2.102 2.186 2.358 2.515 2.655 2.723 2.865 3.013 3.221 3.351 3.47 3.629 3.775 3.919 4.062 4.198 4.371 4.532 4.692 4.888 5.06 5.231 5.431 5.641 5.843 6.074 6.313 6.566 6.835 7.111 7.403 7.687 8.003 8.316 8.668 8.997 9.273 9.492 9.477 9.095 8.555 7.98 7.415 6.862 6.359 5.905 5.502 5.075 4.709 4.379 4.025 3.69 3.404 3.141 2.855 2.58 2.334 2.094 1.854 1.651 1.442 1.225 1.043 0.847 0.643 0.429 0.211 0.063 -0.091 -0.327 -0.489 -0.655 -0.742 -0.921 -1.108 -1.323 -1.442 -1.708 -1.807 -1.936 -2.079 -2.367 -2.533 -2.718 -2.928 -3.184 -3.459 -3.805 -4.528 -2 ,8922 ,TETRA ,17665578,Fri Dec 3 04:46:13 CET,Fri Dec 3 06:37:03 CET,0.0 0.321 0.51 0.661 0.795 0.906 0.995 1.082 1.246 1.324 1.399 1.408 1.623 1.693 1.825 1.951 2.078 2.139 2.256 2.369 2.515 2.611 2.713 2.858 2.998 3.128 3.245 3.362 3.506 3.655 3.8 3.969 4.126 4.276 4.443 4.636 4.84 5.071 5.317 5.556 5.794 6.047 6.341 6.628 6.915 7.221 7.55 7.858 8.158 8.377 8.297 7.855 7.335 6.773 6.219 5.679 5.177 4.718 4.309 3.9 3.531 3.196 2.891 2.596 2.309 2.034 1.742 1.49 1.277 1.05 0.815 0.626 0.434 0.224 0.047 -0.125 -0.295 -0.471 -0.654 -0.789 -0.933 -1.161 -1.306 -1.45 -1.531 -1.704 -1.889 -2.087 -2.188 -2.431 -2.48 -2.589 -2.712 -2.986 -3.12 -3.251 -3.417 -3.607 -3.796 -4.05 -4.685 -3 ,954 ,TETRA ,17665579,Fri Dec 3 04:46:17 CET,Fri Dec 3 06:36:52 CET,0.0 1.069 1.385 1.595 1.741 1.872 2.02 2.151 2.384 2.495 2.601 2.662 2.889 2.966 3.129 3.288 3.428 3.496 3.642 3.778 3.96 4.078 4.185 4.344 4.498 4.649 4.801 4.936 5.097 5.252 5.398 5.575 5.757 5.933 6.129 6.336 6.526 6.738 6.971 7.208 7.443 7.727 8.052 8.342 8.657 9.002 9.368 9.699 10.003 10.231 10.158 9.69 9.11 8.543 8.022 7.515 7.027 6.555 6.157 5.746 5.357 5.01 4.704 4.405 4.118 3.843 3.557 3.305 3.063 2.806 2.537 2.319 2.106 1.865 1.679 1.503 1.322 1.134 0.931 0.791 0.644 0.42 0.274 0.112 0.026 -0.149 -0.332 -0.512 -0.609 -0.856 -0.922 -1.04 -1.154 -1.386 -1.547 -1.749 -1.949 -2.155 -2.368 -2.634 -3.146 -4 ,23080 ,TETRA ,17665580,Fri Dec 3 04:46:18 CET,Fri Dec 3 06:36:52 CET,0.0 0.305 0.482 0.618 0.741 0.851 0.959 1.053 1.213 1.295 1.373 1.37 1.572 1.631 1.76 1.878 1.984 2.037 2.143 2.256 2.422 2.526 2.638 2.806 2.957 3.103 3.248 3.371 3.532 3.695 3.846 4.024 4.193 4.352 4.538 4.753 4.953 5.169 5.404 5.653 5.907 6.191 6.49 6.751 7.046 7.367 7.66 7.926 8.191 8.369 8.32 7.798 7.181 6.615 6.065 5.514 5.028 4.624 4.244 3.817 3.45 3.106 2.745 2.387 2.077 1.817 1.527 1.263 1.045 0.808 0.557 0.352 0.144 -0.056 -0.21 -0.374 -0.544 -0.725 -0.91 -1.026 -1.143 -1.356 -1.515 -1.676 -1.759 -1.938 -2.11 -2.283 -2.38 -2.629 -2.716 -2.839 -2.953 -3.205 -3.363 -3.536 -3.703 -3.872 -4.077 -4.362 -4.841 -5 ,22481 ,TETRA ,17665581,Fri Dec 3 04:46:17 CET,Fri Dec 3 06:40:55 CET,0.0 0.722 0.963 1.163 1.343 1.51 1.655 1.78 2.021 2.128 2.222 2.246 2.466 2.538 2.689 2.852 3.002 3.069 3.193 3.309 3.478 3.598 3.714 3.864 4.004 4.15 4.301 4.439 4.61 4.764 4.913 5.114 5.312 5.485 5.676 5.891 6.09 6.305 6.537 6.782 7.008 7.259 7.573 7.866 8.181 8.51 8.875 9.235 9.526 9.721 9.655 9.237 8.672 7.981 7.307 6.744 6.26 5.812 5.38 4.937 4.563 4.217 3.881 3.569 3.275 2.987 2.679 2.42 2.194 1.952 1.716 1.516 1.289 1.057 0.882 0.701 0.521 0.312 0.079 -0.068 -0.215 -0.447 -0.605 -0.765 -0.853 -1.035 -1.227 -1.439 -1.548 -1.799 -1.851 -1.952 -2.066 -2.319 -2.467 -2.635 -2.826 -3.022 -3.239 -3.561 -4.249 -6 ,13740 ,TETRA ,17665582,Fri Dec 3 04:46:14 CET,Fri Dec 3 06:40:51 CET,0.0 0.98 1.297 1.522 1.749 1.961 2.14 2.306 2.58 2.7 2.833 2.938 3.186 3.286 3.445 3.589 3.729 3.796 3.926 4.056 4.246 4.366 4.488 4.652 4.787 4.916 5.046 5.179 5.345 5.493 5.638 5.823 6.012 6.189 6.38 6.586 6.781 7.009 7.254 7.48 7.711 7.957 8.249 8.553 8.866 9.175 9.49 9.788 10.05 10.23 10.165 9.682 9.056 8.418 7.829 7.31 6.838 6.387 5.971 5.544 5.178 4.868 4.574 4.293 4.014 3.739 3.473 3.237 3.032 2.82 2.59 2.405 2.211 2.004 1.846 1.67 1.484 1.302 1.122 0.991 0.855 0.659 0.51 0.353 0.278 0.115 -0.075 -0.269 -0.367 -0.621 -0.696 -0.805 -0.922 -1.163 -1.302 -1.458 -1.626 -1.814 -2.011 -2.288 -2.924 -7 ,12993 ,TETRA ,17665583,Fri Dec 3 04:46:18 CET,Fri Dec 3 06:39:27 CET,0.0 0.617 0.846 1.032 1.213 1.366 1.498 1.622 1.847 1.949 2.054 2.118 2.347 2.423 2.575 2.718 2.854 2.921 3.052 3.181 3.36 3.48 3.595 3.743 3.897 4.059 4.208 4.341 4.515 4.677 4.829 5.006 5.179 5.353 5.553 5.77 5.98 6.227 6.492 6.743 6.969 7.216 7.502 7.769 8.08 8.407 8.747 9.083 9.386 9.57 9.438 8.924 8.341 7.728 7.141 6.582 6.08 5.63 5.226 4.801 4.42 4.069 3.731 3.405 3.112 2.866 2.612 2.378 2.158 1.928 1.703 1.52 1.321 1.117 0.966 0.803 0.627 0.45 0.266 0.14 0.006 -0.215 -0.367 -0.522 -0.602 -0.77 -0.953 -1.139 -1.234 -1.488 -1.562 -1.666 -1.785 -2.054 -2.194 -2.354 -2.536 -2.709 -2.909 -3.182 -3.835 -8 ,19658 ,TETRA ,17665584,Fri Dec 3 04:46:20 CET,Fri Dec 3 06:39:07 CET,0.0 0.226 0.37 0.482 0.584 0.679 0.773 0.861 1.017 1.093 1.162 1.162 1.374 1.447 1.591 1.718 1.839 1.897 2.014 2.134 2.299 2.405 2.508 2.639 2.766 2.895 3.018 3.133 3.281 3.425 3.561 3.728 3.885 4.041 4.226 4.425 4.624 4.828 5.049 5.297 5.557 5.856 6.191 6.518 6.863 7.216 7.593 7.933 8.207 8.353 8.291 7.882 7.361 6.804 6.278 5.763 5.289 4.846 4.422 3.982 3.589 3.248 2.925 2.608 2.319 2.041 1.746 1.475 1.245 1.021 0.796 0.616 0.426 0.22 0.061 -0.108 -0.287 -0.464 -0.656 -0.791 -0.922 -1.117 -1.261 -1.419 -1.499 -1.674 -1.853 -2.026 -2.126 -2.374 -2.439 -2.549 -2.661 -2.908 -3.05 -3.224 -3.405 -3.589 -3.83 -4.162 -4.903 -9 ,28241 ,TETRA ,17665585,Fri Dec 3 04:46:17 CET,Fri Dec 3 06:38:10 CET,0.0 0.204 0.329 0.449 0.577 0.688 0.772 0.848 1.011 1.096 1.177 1.18 1.399 1.475 1.611 1.732 1.86 1.928 2.055 2.171 2.327 2.428 2.527 2.666 2.795 2.923 3.05 3.168 3.324 3.482 3.639 3.837 4.02 4.19 4.397 4.606 4.789 4.997 5.226 5.466 5.699 5.953 6.257 6.558 6.887 7.203 7.508 7.801 8.057 8.294 8.316 7.826 7.221 6.63 6.1 5.609 5.129 4.663 4.25 3.821 3.451 3.12 2.787 2.474 2.194 1.942 1.659 1.387 1.156 0.919 0.646 0.417 0.205 -0.012 -0.182 -0.36 -0.551 -0.757 -0.965 -1.106 -1.246 -1.469 -1.627 -1.797 -1.887 -2.067 -2.248 -2.447 -2.554 -2.807 -2.904 -3.036 -3.174 -3.451 -3.605 -3.776 -3.967 -4.21 -4.491 -4.848 -5.998 -10 ,20582 ,TETRA ,17665586,Fri Dec 3 04:46:14 CET,Fri Dec 3 06:38:26 CET,0.0 0.583 0.868 1.121 1.297 1.437 1.555 1.677 1.915 2.011 2.097 2.14 2.372 2.466 2.646 2.793 2.934 3.001 3.123 3.246 3.427 3.548 3.66 3.819 3.975 4.128 4.281 4.422 4.591 4.756 4.915 5.105 5.284 5.447 5.641 5.863 6.064 6.295 6.541 6.787 7.045 7.314 7.607 7.902 8.224 8.52 8.836 9.157 9.451 9.674 9.629 9.213 8.662 8.092 7.514 6.944 6.438 5.977 5.561 5.124 4.752 4.42 4.097 3.788 3.478 3.202 2.928 2.675 2.449 2.206 1.959 1.75 1.526 1.296 1.111 0.919 0.724 0.513 0.299 0.155 0.001 -0.243 -0.42 -0.601 -0.693 -0.888 -1.083 -1.282 -1.392 -1.657 -1.765 -1.893 -2.032 -2.337 -2.502 -2.675 -2.858 -3.103 -3.453 -3.917 -4.967 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8d_8c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8d_8c.txt deleted file mode 100644 index 20f758dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8d_8c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,7842 ,TETRA ,17665587,Fri Dec 3 04:46:17 CET,Fri Dec 3 06:35:57 CET,0.0 1.176 1.48 1.701 1.873 2.026 2.172 2.31 2.569 2.692 2.819 2.859 3.14 3.227 3.403 3.583 3.759 3.842 4.0 4.158 4.389 4.538 4.674 4.868 5.06 5.256 5.447 5.62 5.842 6.076 6.31 6.579 6.826 7.065 7.34 7.654 7.957 8.286 8.614 8.971 9.375 9.834 10.417 10.994 11.606 12.294 13.127 14.027 15.053 16.196 17.382 18.148 18.322 18.235 18.108 17.944 17.742 17.529 17.353 17.145 16.916 16.706 16.507 16.323 16.174 16.016 15.833 15.663 15.502 15.327 15.141 14.994 14.827 14.648 14.508 14.36 14.212 14.057 13.888 13.78 13.666 13.488 13.371 13.229 13.155 13.009 12.85 12.67 12.578 12.315 12.3 12.191 12.071 11.819 11.692 11.555 11.389 11.181 10.89 10.551 9.76 -2 ,23277 ,TETRA ,17665588,Fri Dec 3 04:46:19 CET,Fri Dec 3 06:35:35 CET,0.0 0.681 0.997 1.227 1.424 1.593 1.745 1.896 2.179 2.3 2.413 2.46 2.753 2.853 3.044 3.233 3.401 3.48 3.643 3.795 4.009 4.142 4.273 4.464 4.641 4.827 5.02 5.21 5.458 5.687 5.895 6.135 6.367 6.62 6.926 7.261 7.561 7.861 8.174 8.511 8.862 9.245 9.697 10.154 10.711 11.314 11.99 12.777 13.718 14.894 16.149 16.927 17.21 17.186 17.067 16.894 16.73 16.528 16.31 16.06 15.816 15.603 15.391 15.189 15.0 14.846 14.71 14.579 14.425 14.257 14.078 13.906 13.733 13.559 13.431 13.291 13.128 12.964 12.812 12.702 12.579 12.39 12.262 12.131 12.061 11.908 11.755 11.589 11.497 11.234 11.215 11.102 10.976 10.699 10.558 10.401 10.22 10.034 9.785 9.416 8.402 -3 ,19140 ,TETRA ,17665589,Fri Dec 3 04:46:14 CET,Fri Dec 3 06:38:41 CET,0.0 0.854 1.166 1.402 1.595 1.752 1.904 2.061 2.325 2.444 2.556 2.579 2.868 2.967 3.152 3.33 3.494 3.574 3.737 3.889 4.109 4.255 4.395 4.602 4.803 5.001 5.194 5.376 5.604 5.819 6.021 6.259 6.506 6.74 7.005 7.331 7.625 7.948 8.31 8.67 9.048 9.504 10.027 10.55 11.157 11.82 12.621 13.53 14.528 15.615 16.772 17.5 17.754 17.74 17.586 17.366 17.161 16.958 16.729 16.465 16.235 16.019 15.803 15.588 15.369 15.16 14.938 14.747 14.586 14.411 14.238 14.095 13.943 13.779 13.647 13.512 13.37 13.21 13.036 12.92 12.797 12.602 12.463 12.319 12.245 12.085 11.926 11.768 11.682 11.414 11.407 11.302 11.181 10.914 10.775 10.646 10.487 10.274 10.02 9.685 8.869 -4 ,4011 ,TETRA ,17665590,Fri Dec 3 04:46:15 CET,Fri Dec 3 06:38:53 CET,0.0 0.668 0.925 1.116 1.302 1.465 1.603 1.73 1.949 2.055 2.159 2.183 2.471 2.568 2.754 2.923 3.087 3.168 3.323 3.482 3.715 3.858 3.997 4.196 4.383 4.565 4.758 4.94 5.155 5.367 5.575 5.827 6.06 6.278 6.539 6.843 7.144 7.49 7.858 8.241 8.608 8.977 9.463 10.018 10.673 11.376 12.157 13.001 13.986 15.111 16.227 16.898 17.136 17.145 17.059 16.885 16.667 16.482 16.3 16.077 15.871 15.683 15.515 15.323 15.12 14.948 14.763 14.579 14.397 14.206 14.026 13.871 13.715 13.569 13.451 13.32 13.176 13.043 12.91 12.808 12.704 12.53 12.405 12.282 12.207 12.045 11.887 11.704 11.612 11.355 11.315 11.202 11.092 10.863 10.725 10.563 10.405 10.2 9.92 9.541 8.644 -5 ,27199 ,TETRA ,17665591,Fri Dec 3 04:46:17 CET,Fri Dec 3 06:36:01 CET,0.0 0.682 0.975 1.205 1.385 1.532 1.672 1.81 2.058 2.17 2.278 2.293 2.573 2.662 2.831 3.004 3.187 3.275 3.426 3.575 3.787 3.917 4.055 4.26 4.453 4.634 4.804 4.98 5.22 5.444 5.644 5.892 6.141 6.375 6.655 6.98 7.284 7.607 7.976 8.402 8.843 9.306 9.834 10.391 11.037 11.736 12.569 13.49 14.471 15.562 16.814 17.542 17.809 17.923 17.854 17.656 17.442 17.231 17.036 16.806 16.58 16.38 16.169 15.954 15.76 15.574 15.379 15.198 15.04 14.902 14.761 14.638 14.505 14.328 14.186 14.057 13.923 13.783 13.63 13.518 13.408 13.239 13.109 12.965 12.894 12.749 12.592 12.422 12.33 12.056 12.004 11.901 11.804 11.559 11.415 11.262 11.106 10.913 10.648 10.337 9.59 -6 ,19714 ,TETRA ,17665592,Fri Dec 3 04:46:16 CET,Fri Dec 3 06:35:50 CET,0.0 0.871 1.239 1.495 1.68 1.82 1.962 2.104 2.356 2.473 2.587 2.623 2.923 3.03 3.221 3.396 3.563 3.65 3.805 3.944 4.157 4.297 4.437 4.643 4.842 5.031 5.22 5.405 5.624 5.838 6.045 6.307 6.564 6.815 7.112 7.422 7.696 7.965 8.291 8.67 9.078 9.544 10.085 10.633 11.275 12.013 12.85 13.765 14.793 15.924 17.175 18.017 18.261 18.284 18.233 18.078 17.858 17.616 17.383 17.142 16.932 16.724 16.485 16.256 16.064 15.898 15.709 15.527 15.38 15.217 15.045 14.899 14.726 14.549 14.409 14.257 14.111 13.952 13.779 13.664 13.555 13.374 13.25 13.12 13.046 12.906 12.75 12.568 12.472 12.195 12.146 12.041 11.944 11.724 11.615 11.506 11.361 11.186 10.993 10.737 9.722 -7 ,26643 ,TETRA ,17665593,Fri Dec 3 04:47:11 CET,Fri Dec 3 06:37:20 CET,0.0 0.829 1.107 1.315 1.505 1.705 1.868 1.997 2.251 2.37 2.479 2.493 2.777 2.876 3.065 3.235 3.399 3.483 3.636 3.784 3.995 4.129 4.27 4.47 4.655 4.837 5.016 5.188 5.408 5.615 5.814 6.062 6.313 6.563 6.858 7.178 7.472 7.804 8.177 8.558 8.919 9.353 9.886 10.432 11.101 11.809 12.609 13.512 14.519 15.551 16.534 17.23 17.508 17.517 17.399 17.197 16.989 16.782 16.565 16.337 16.121 15.908 15.72 15.52 15.298 15.095 14.886 14.709 14.55 14.38 14.2 14.051 13.899 13.741 13.627 13.49 13.337 13.189 13.038 12.941 12.833 12.646 12.516 12.379 12.31 12.163 12.004 11.857 11.777 11.512 11.489 11.368 11.233 10.977 10.854 10.72 10.555 10.341 10.098 9.787 8.865 -8 ,10033 ,TETRA ,17665594,Fri Dec 3 04:48:12 CET,Fri Dec 3 06:40:22 CET,0.0 0.681 0.98 1.206 1.412 1.588 1.756 1.908 2.151 2.26 2.371 2.401 2.684 2.769 2.94 3.113 3.278 3.364 3.524 3.675 3.911 4.057 4.19 4.39 4.585 4.773 4.959 5.137 5.364 5.583 5.79 6.034 6.275 6.508 6.766 7.061 7.338 7.622 7.947 8.309 8.673 9.066 9.543 10.072 10.708 11.419 12.218 13.103 14.112 15.221 16.396 17.156 17.368 17.405 17.372 17.216 16.991 16.74 16.511 16.271 16.042 15.835 15.63 15.416 15.208 15.024 14.832 14.627 14.453 14.288 14.115 13.961 13.807 13.649 13.511 13.374 13.235 13.079 12.912 12.798 12.679 12.487 12.348 12.207 12.143 12.007 11.843 11.661 11.572 11.311 11.293 11.176 11.039 10.773 10.635 10.485 10.332 10.148 9.916 9.638 8.636 -9 ,9181 ,TETRA ,17665595,Fri Dec 3 04:48:14 CET,Fri Dec 3 06:39:57 CET,0.0 0.671 0.986 1.197 1.376 1.545 1.708 1.854 2.1 2.22 2.337 2.377 2.663 2.756 2.949 3.128 3.285 3.363 3.521 3.671 3.899 4.041 4.182 4.387 4.567 4.742 4.908 5.074 5.29 5.509 5.732 5.99 6.233 6.473 6.749 7.061 7.368 7.711 8.078 8.46 8.863 9.332 9.882 10.428 11.089 11.805 12.578 13.49 14.525 15.608 16.8 17.481 17.592 17.533 17.418 17.237 17.027 16.788 16.554 16.327 16.115 15.946 15.798 15.64 15.455 15.257 15.068 14.894 14.735 14.56 14.365 14.202 14.043 13.878 13.735 13.592 13.445 13.294 13.138 13.022 12.909 12.73 12.6 12.462 12.39 12.244 12.091 11.921 11.837 11.57 11.54 11.431 11.315 11.057 10.909 10.76 10.574 10.339 10.08 9.801 8.631 -10 ,19350 ,TETRA ,17665596,Fri Dec 3 04:48:15 CET,Fri Dec 3 06:37:48 CET,0.0 1.052 1.411 1.661 1.854 2.01 2.148 2.276 2.522 2.648 2.776 2.81 3.091 3.186 3.38 3.567 3.745 3.829 3.984 4.14 4.348 4.485 4.624 4.811 4.999 5.189 5.365 5.521 5.725 5.947 6.167 6.431 6.672 6.896 7.181 7.504 7.797 8.127 8.498 8.882 9.277 9.73 10.267 10.783 11.379 12.036 12.825 13.755 14.748 15.779 16.913 17.701 17.97 17.933 17.744 17.518 17.288 17.06 16.854 16.614 16.374 16.153 15.962 15.773 15.58 15.407 15.217 15.051 14.896 14.722 14.543 14.384 14.211 14.056 13.939 13.789 13.617 13.441 13.273 13.155 13.031 12.844 12.713 12.59 12.525 12.384 12.239 12.087 12.001 11.73 11.715 11.612 11.506 11.279 11.153 11.019 10.859 10.664 10.415 10.065 8.991 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8a.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8a.txt deleted file mode 100644 index 55ae2b93..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8a.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,25355 ,TETRA ,17665597,Fri Dec 3 04:48:17 CET,Fri Dec 3 06:38:07 CET,0.0 0.495 0.685 0.852 1.021 1.175 1.316 1.444 1.656 1.746 1.835 1.878 2.126 2.22 2.39 2.552 2.706 2.783 2.934 3.067 3.261 3.385 3.505 3.692 3.871 4.04 4.21 4.381 4.604 4.819 5.028 5.282 5.536 5.781 6.077 6.411 6.708 7.044 7.414 7.806 8.221 8.687 9.228 9.769 10.394 11.077 11.848 12.65 13.546 14.579 15.698 16.458 16.776 16.864 16.848 16.78 16.689 16.573 16.44 16.277 16.125 15.994 15.858 15.71 15.562 15.414 15.256 15.123 15.01 14.89 14.762 14.649 14.521 14.39 14.29 14.178 14.058 13.939 13.809 13.707 13.6 13.446 13.34 13.222 13.163 13.029 12.888 12.75 12.672 12.442 12.39 12.288 12.201 12.023 11.912 11.797 11.655 11.497 11.337 11.123 10.587 -2 ,14222 ,TETRA ,17665598,Fri Dec 3 04:50:11 CET,Fri Dec 3 06:42:25 CET,0.0 0.362 0.534 0.683 0.854 1.023 1.172 1.313 1.573 1.7 1.829 1.898 2.144 2.249 2.444 2.623 2.8 2.881 3.033 3.186 3.398 3.532 3.666 3.875 4.073 4.26 4.452 4.633 4.845 5.062 5.284 5.533 5.777 6.025 6.299 6.622 6.937 7.27 7.635 8.017 8.422 8.872 9.389 9.913 10.515 11.181 11.989 12.876 13.81 14.919 16.137 16.959 17.304 17.427 17.44 17.374 17.293 17.188 17.068 16.913 16.755 16.617 16.477 16.336 16.204 16.085 15.953 15.82 15.706 15.576 15.428 15.31 15.192 15.082 15.004 14.913 14.807 14.703 14.592 14.514 14.433 14.293 14.198 14.109 14.063 13.954 13.849 13.741 13.674 13.463 13.478 13.402 13.322 13.156 13.062 12.967 12.852 12.701 12.517 12.284 11.683 -3 ,2772 ,TETRA ,17665599,Fri Dec 3 04:50:17 CET,Fri Dec 3 06:40:27 CET,0.0 0.815 1.154 1.422 1.635 1.793 1.962 2.134 2.419 2.54 2.653 2.717 2.968 3.07 3.287 3.483 3.655 3.738 3.894 4.043 4.274 4.428 4.58 4.789 4.98 5.167 5.355 5.535 5.771 6.001 6.226 6.499 6.764 7.019 7.31 7.652 7.98 8.311 8.651 9.022 9.4 9.834 10.354 10.877 11.528 12.211 12.915 13.735 14.765 15.923 17.131 17.9 18.19 18.326 18.357 18.342 18.28 18.155 18.006 17.837 17.679 17.537 17.405 17.271 17.158 17.053 16.934 16.818 16.705 16.592 16.487 16.394 16.283 16.172 16.09 15.994 15.887 15.787 15.678 15.588 15.498 15.348 15.24 15.135 15.082 14.972 14.853 14.716 14.639 14.418 14.409 14.322 14.219 13.98 13.851 13.698 13.53 13.361 13.146 12.84 11.84 -4 ,4483 ,TETRA ,17665600,Fri Dec 3 04:50:12 CET,Fri Dec 3 06:40:17 CET,0.0 0.427 0.684 0.903 1.073 1.204 1.32 1.426 1.639 1.757 1.874 1.933 2.18 2.266 2.439 2.606 2.757 2.834 2.983 3.133 3.357 3.497 3.638 3.845 4.046 4.236 4.419 4.587 4.808 5.031 5.232 5.477 5.725 5.974 6.255 6.561 6.869 7.215 7.601 8.019 8.445 8.907 9.434 9.952 10.572 11.254 12.014 12.887 13.843 14.889 16.093 16.881 17.209 17.351 17.388 17.309 17.18 17.047 16.913 16.773 16.617 16.468 16.328 16.18 16.033 15.897 15.756 15.634 15.518 15.388 15.255 15.123 14.969 14.825 14.73 14.628 14.514 14.403 14.287 14.209 14.136 14.019 13.936 13.854 13.812 13.718 13.605 13.478 13.417 13.21 13.204 13.124 13.034 12.857 12.771 12.676 12.556 12.41 12.226 11.969 11.334 -5 ,4593 ,TETRA ,17665601,Fri Dec 3 04:50:14 CET,Fri Dec 3 06:40:44 CET,0.0 0.368 0.622 0.837 0.996 1.156 1.3 1.427 1.675 1.795 1.918 1.997 2.254 2.357 2.541 2.735 2.926 3.006 3.163 3.33 3.575 3.726 3.872 4.074 4.264 4.461 4.66 4.843 5.073 5.298 5.512 5.781 6.037 6.278 6.566 6.899 7.226 7.587 7.965 8.347 8.751 9.201 9.722 10.24 10.842 11.536 12.326 13.217 14.253 15.409 16.615 17.361 17.659 17.772 17.779 17.718 17.615 17.488 17.377 17.231 17.084 16.95 16.798 16.655 16.519 16.381 16.234 16.095 15.968 15.842 15.724 15.622 15.505 15.364 15.257 15.157 15.043 14.913 14.767 14.665 14.563 14.408 14.308 14.204 14.146 14.025 13.9 13.775 13.714 13.505 13.502 13.429 13.343 13.13 13.015 12.896 12.763 12.613 12.417 12.186 11.706 -6 ,19418 ,TETRA ,17665602,Fri Dec 3 04:50:15 CET,Fri Dec 3 06:40:50 CET,0.0 0.445 0.649 0.813 0.947 1.07 1.184 1.306 1.546 1.647 1.76 1.82 2.06 2.14 2.303 2.466 2.617 2.688 2.834 2.988 3.208 3.342 3.467 3.642 3.817 4.004 4.187 4.361 4.58 4.78 4.976 5.217 5.447 5.681 5.965 6.298 6.64 6.983 7.326 7.688 8.079 8.54 9.069 9.584 10.178 10.851 11.634 12.493 13.503 14.654 15.916 16.796 17.194 17.355 17.364 17.285 17.186 17.073 16.932 16.749 16.585 16.433 16.269 16.114 15.968 15.839 15.699 15.56 15.443 15.318 15.184 15.064 14.931 14.79 14.692 14.591 14.482 14.37 14.232 14.134 14.042 13.892 13.781 13.657 13.597 13.481 13.36 13.24 13.177 12.97 12.986 12.906 12.825 12.663 12.572 12.468 12.348 12.191 12.011 11.715 10.914 -7 ,30220 ,TETRA ,17665603,Fri Dec 3 04:50:12 CET,Fri Dec 3 06:40:14 CET,0.0 0.436 0.674 0.864 1.014 1.166 1.297 1.423 1.669 1.789 1.902 1.932 2.174 2.267 2.448 2.631 2.799 2.875 3.037 3.18 3.366 3.492 3.614 3.796 3.971 4.135 4.301 4.475 4.699 4.917 5.131 5.389 5.646 5.895 6.183 6.507 6.817 7.158 7.522 7.911 8.311 8.763 9.3 9.827 10.448 11.16 11.987 12.868 13.854 15.068 16.358 17.123 17.477 17.616 17.606 17.555 17.479 17.352 17.241 17.113 16.972 16.847 16.723 16.597 16.471 16.346 16.204 16.068 15.958 15.843 15.709 15.598 15.474 15.336 15.227 15.109 14.996 14.882 14.75 14.663 14.585 14.442 14.343 14.247 14.201 14.11 13.985 13.849 13.787 13.577 13.576 13.492 13.398 13.198 13.1 12.994 12.879 12.756 12.582 12.345 11.94 -8 ,4935 ,TETRA ,17665604,Fri Dec 3 04:50:14 CET,Fri Dec 3 06:40:29 CET,0.0 0.386 0.62 0.776 0.906 1.02 1.125 1.241 1.505 1.645 1.778 1.869 2.136 2.248 2.442 2.62 2.791 2.871 3.029 3.181 3.393 3.532 3.665 3.879 4.098 4.295 4.48 4.67 4.921 5.142 5.355 5.614 5.873 6.133 6.431 6.77 7.075 7.391 7.741 8.098 8.474 8.934 9.495 10.067 10.714 11.411 12.223 13.088 14.041 15.126 16.376 17.253 17.611 17.761 17.793 17.729 17.635 17.545 17.422 17.282 17.171 17.048 16.898 16.744 16.608 16.486 16.36 16.236 16.108 15.974 15.84 15.722 15.595 15.46 15.351 15.237 15.121 15.004 14.873 14.777 14.681 14.538 14.424 14.295 14.232 14.101 13.954 13.803 13.721 13.489 13.451 13.35 13.251 13.026 12.881 12.734 12.59 12.42 12.182 11.799 10.676 -9 ,30506 ,TETRA ,17665605,Fri Dec 3 04:50:17 CET,Fri Dec 3 06:40:45 CET,0.0 0.866 1.17 1.378 1.572 1.769 1.931 2.062 2.332 2.466 2.589 2.674 2.935 3.036 3.224 3.407 3.574 3.655 3.829 4.0 4.23 4.387 4.533 4.737 4.943 5.142 5.338 5.53 5.766 5.99 6.207 6.455 6.698 6.941 7.221 7.533 7.837 8.173 8.53 8.92 9.325 9.781 10.328 10.863 11.474 12.15 12.939 13.805 14.75 15.88 17.212 18.1 18.428 18.51 18.497 18.447 18.346 18.196 18.06 17.919 17.754 17.596 17.462 17.332 17.207 17.095 16.964 16.821 16.69 16.562 16.418 16.303 16.202 16.085 15.984 15.888 15.795 15.697 15.594 15.522 15.448 15.33 15.236 15.133 15.081 14.981 14.876 14.765 14.709 14.498 14.493 14.415 14.33 14.139 14.048 13.953 13.833 13.69 13.498 13.249 12.691 -10 ,3046 ,TETRA ,17665606,Fri Dec 3 04:50:16 CET,Fri Dec 3 06:40:38 CET,0.0 0.455 0.65 0.834 1.005 1.154 1.294 1.428 1.68 1.794 1.895 1.937 2.186 2.288 2.499 2.693 2.861 2.946 3.119 3.285 3.517 3.656 3.79 3.994 4.194 4.386 4.573 4.758 4.99 5.21 5.429 5.688 5.938 6.186 6.465 6.783 7.085 7.428 7.803 8.175 8.57 9.004 9.511 10.042 10.667 11.356 12.152 13.032 13.989 15.057 16.235 17.038 17.385 17.522 17.543 17.471 17.352 17.233 17.119 16.985 16.848 16.705 16.566 16.428 16.284 16.157 16.032 15.903 15.787 15.669 15.538 15.42 15.299 15.177 15.071 14.951 14.829 14.708 14.592 14.507 14.409 14.24 14.114 13.99 13.926 13.806 13.69 13.561 13.48 13.251 13.227 13.141 13.043 12.81 12.681 12.539 12.406 12.274 12.124 11.885 11.437 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8c.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8c.txt deleted file mode 100644 index 18598da9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8e_8c.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,22418 ,TETRA ,17665607,Fri Dec 3 04:50:11 CET,Fri Dec 3 06:38:25 CET,0.0 0.611 0.841 1.008 1.206 1.391 1.51 1.605 1.783 1.866 1.95 1.942 2.155 2.22 2.337 2.428 2.516 2.565 2.662 2.75 2.881 2.967 3.043 3.157 3.268 3.352 3.42 3.497 3.61 3.708 3.785 3.882 3.983 4.088 4.213 4.337 4.442 4.557 4.668 4.764 4.857 4.933 4.976 5.009 5.048 5.055 4.989 4.807 4.499 3.836 2.431 0.668 -0.938 -2.366 -3.559 -4.658 -5.6 -6.415 -7.13 -7.88 -8.531 -9.092 -9.61 -10.074 -10.523 -10.936 -11.336 -11.69 -12.016 -12.356 -12.689 -12.963 -13.247 -13.544 -13.769 -14.006 -14.247 -14.5 -14.783 -14.963 -15.143 -15.416 -15.598 -15.81 -15.925 -16.162 -16.422 -16.674 -16.796 -17.108 -17.214 -17.361 -17.524 -17.892 -18.094 -18.314 -18.557 -18.854 -19.193 -19.636 -21.474 -2 ,8093 ,TETRA ,17665608,Fri Dec 3 04:51:15 CET,Fri Dec 3 06:41:04 CET,0.0 0.71 0.998 1.223 1.387 1.502 1.62 1.734 1.913 1.989 2.063 2.049 2.262 2.328 2.456 2.583 2.699 2.753 2.856 2.945 3.056 3.132 3.205 3.309 3.411 3.499 3.593 3.679 3.767 3.857 3.949 4.063 4.176 4.272 4.365 4.467 4.568 4.664 4.751 4.843 4.95 5.045 5.116 5.177 5.205 5.173 5.111 4.97 4.619 3.943 2.585 0.682 -0.88 -2.257 -3.512 -4.638 -5.6 -6.46 -7.227 -7.99 -8.614 -9.159 -9.683 -10.176 -10.62 -11.013 -11.429 -11.804 -12.113 -12.424 -12.75 -13.027 -13.327 -13.632 -13.856 -14.099 -14.358 -14.628 -14.913 -15.101 -15.288 -15.563 -15.754 -15.955 -16.056 -16.278 -16.521 -16.771 -16.906 -17.222 -17.329 -17.483 -17.655 -18.032 -18.246 -18.473 -18.72 -19.025 -19.387 -19.879 -21.915 -3 ,18670 ,TETRA ,17665609,Fri Dec 3 04:52:15 CET,Fri Dec 3 06:41:33 CET,0.0 0.81 1.049 1.226 1.402 1.546 1.681 1.814 2.041 2.133 2.209 2.21 2.434 2.498 2.608 2.708 2.814 2.864 2.947 3.034 3.174 3.251 3.322 3.437 3.545 3.642 3.731 3.819 3.931 4.035 4.131 4.257 4.37 4.454 4.548 4.65 4.744 4.839 4.954 5.08 5.174 5.269 5.381 5.46 5.504 5.508 5.455 5.315 4.976 4.246 2.898 1.181 -0.439 -1.885 -3.032 -4.066 -5.068 -5.941 -6.644 -7.342 -7.896 -8.383 -8.891 -9.373 -9.812 -10.221 -10.65 -11.031 -11.355 -11.668 -11.984 -12.259 -12.537 -12.815 -13.038 -13.28 -13.54 -13.798 -14.056 -14.244 -14.44 -14.73 -14.928 -15.141 -15.253 -15.476 -15.706 -15.966 -16.106 -16.425 -16.545 -16.693 -16.842 -17.175 -17.369 -17.569 -17.785 -18.057 -18.364 -18.776 -20.176 -4 ,31692 ,TETRA ,17665610,Fri Dec 3 04:52:15 CET,Fri Dec 3 06:41:24 CET,0.0 0.983 1.25 1.45 1.617 1.763 1.891 1.995 2.178 2.258 2.34 2.349 2.563 2.622 2.748 2.867 2.969 3.017 3.11 3.194 3.311 3.382 3.449 3.56 3.669 3.774 3.873 3.957 4.057 4.148 4.244 4.369 4.486 4.589 4.694 4.816 4.933 5.046 5.149 5.254 5.341 5.399 5.466 5.527 5.577 5.579 5.528 5.421 5.087 4.386 2.965 1.02 -0.614 -2.02 -3.258 -4.355 -5.301 -6.136 -6.857 -7.579 -8.179 -8.689 -9.171 -9.646 -10.092 -10.476 -10.852 -11.196 -11.529 -11.869 -12.197 -12.469 -12.752 -13.046 -13.273 -13.509 -13.761 -14.021 -14.279 -14.452 -14.63 -14.899 -15.091 -15.307 -15.423 -15.672 -15.932 -16.177 -16.288 -16.588 -16.703 -16.849 -17.003 -17.375 -17.6 -17.841 -18.08 -18.339 -18.651 -19.035 -20.468 -5 ,19612 ,TETRA ,17665611,Fri Dec 3 04:52:14 CET,Fri Dec 3 06:42:46 CET,0.0 0.699 0.93 1.097 1.236 1.377 1.506 1.609 1.779 1.863 1.95 1.946 2.152 2.21 2.328 2.444 2.549 2.594 2.681 2.76 2.883 2.974 3.053 3.146 3.236 3.321 3.402 3.495 3.614 3.722 3.815 3.92 4.008 4.091 4.197 4.303 4.405 4.527 4.635 4.739 4.849 4.948 5.027 5.092 5.137 5.123 5.071 4.931 4.603 3.945 2.654 0.931 -0.683 -2.097 -3.318 -4.387 -5.319 -6.133 -6.82 -7.511 -8.074 -8.569 -9.067 -9.554 -10.002 -10.402 -10.821 -11.182 -11.49 -11.814 -12.144 -12.424 -12.711 -13.008 -13.244 -13.487 -13.735 -13.99 -14.249 -14.43 -14.62 -14.917 -15.126 -15.342 -15.448 -15.663 -15.879 -16.123 -16.262 -16.584 -16.684 -16.82 -16.977 -17.34 -17.535 -17.737 -17.955 -18.206 -18.518 -18.98 -20.439 -6 ,30185 ,TETRA ,17665612,Fri Dec 3 04:52:18 CET,Fri Dec 3 06:42:24 CET,0.0 0.886 1.134 1.322 1.48 1.64 1.769 1.868 2.049 2.128 2.204 2.209 2.432 2.496 2.601 2.689 2.78 2.826 2.918 3.014 3.135 3.207 3.281 3.394 3.497 3.578 3.663 3.751 3.857 3.956 4.041 4.141 4.247 4.351 4.45 4.53 4.616 4.716 4.815 4.91 4.989 5.085 5.186 5.267 5.316 5.289 5.217 5.057 4.696 4.034 2.793 1.061 -0.54 -1.946 -3.175 -4.26 -5.201 -6.07 -6.811 -7.541 -8.163 -8.735 -9.278 -9.783 -10.244 -10.64 -11.058 -11.437 -11.765 -12.101 -12.441 -12.712 -13.0 -13.309 -13.554 -13.797 -14.04 -14.295 -14.565 -14.756 -14.935 -15.211 -15.427 -15.647 -15.757 -15.998 -16.241 -16.478 -16.609 -16.929 -17.041 -17.192 -17.362 -17.728 -17.915 -18.149 -18.393 -18.652 -18.99 -19.448 -20.724 -7 ,8242 ,TETRA ,17665613,Fri Dec 3 04:52:13 CET,Fri Dec 3 06:42:42 CET,0.0 0.718 0.93 1.098 1.237 1.376 1.501 1.613 1.825 1.912 1.993 2.007 2.231 2.295 2.406 2.515 2.625 2.681 2.785 2.873 2.988 3.062 3.143 3.26 3.362 3.455 3.554 3.64 3.751 3.856 3.95 4.062 4.159 4.259 4.367 4.466 4.558 4.653 4.745 4.837 4.929 5.033 5.144 5.227 5.283 5.285 5.203 5.014 4.643 3.982 2.72 0.878 -0.717 -2.075 -3.301 -4.414 -5.378 -6.206 -6.922 -7.675 -8.293 -8.824 -9.324 -9.779 -10.204 -10.608 -11.029 -11.425 -11.765 -12.095 -12.445 -12.739 -13.043 -13.35 -13.591 -13.829 -14.073 -14.325 -14.565 -14.735 -14.921 -15.218 -15.431 -15.651 -15.759 -15.991 -16.236 -16.485 -16.618 -16.931 -17.045 -17.21 -17.383 -17.742 -17.941 -18.16 -18.4 -18.667 -18.989 -19.409 -21.003 -8 ,26051 ,TETRA ,17665614,Fri Dec 3 04:55:15 CET,Fri Dec 3 06:45:44 CET,0.0 0.814 1.077 1.262 1.418 1.564 1.696 1.809 1.998 2.089 2.175 2.17 2.386 2.451 2.568 2.662 2.768 2.82 2.913 3.005 3.14 3.227 3.3 3.397 3.499 3.599 3.689 3.769 3.865 3.965 4.058 4.156 4.251 4.347 4.449 4.545 4.624 4.705 4.796 4.882 4.966 5.061 5.138 5.201 5.272 5.29 5.25 5.124 4.809 4.217 2.885 1.032 -0.619 -2.025 -3.186 -4.254 -5.156 -6.008 -6.793 -7.522 -8.134 -8.68 -9.189 -9.669 -10.12 -10.545 -10.974 -11.341 -11.653 -11.969 -12.315 -12.605 -12.887 -13.174 -13.404 -13.642 -13.883 -14.144 -14.413 -14.584 -14.762 -15.052 -15.257 -15.467 -15.577 -15.812 -16.043 -16.274 -16.396 -16.703 -16.818 -16.979 -17.153 -17.514 -17.711 -17.928 -18.174 -18.434 -18.783 -19.274 -20.953 -9 ,12940 ,TETRA ,17665615,Fri Dec 3 04:56:13 CET,Fri Dec 3 06:45:41 CET,0.0 0.776 1.104 1.328 1.484 1.608 1.722 1.832 2.015 2.101 2.187 2.189 2.407 2.463 2.583 2.711 2.824 2.876 2.97 3.05 3.164 3.244 3.324 3.433 3.539 3.653 3.756 3.844 3.95 4.032 4.108 4.219 4.328 4.424 4.517 4.61 4.691 4.764 4.828 4.908 4.963 4.972 4.983 4.973 4.936 4.914 4.858 4.665 4.289 3.655 2.482 0.811 -0.843 -2.241 -3.37 -4.488 -5.502 -6.392 -7.148 -7.874 -8.471 -9.009 -9.529 -10.002 -10.435 -10.849 -11.291 -11.668 -11.982 -12.289 -12.621 -12.916 -13.219 -13.537 -13.791 -14.034 -14.27 -14.527 -14.798 -14.977 -15.168 -15.471 -15.674 -15.885 -15.99 -16.21 -16.445 -16.683 -16.816 -17.143 -17.274 -17.422 -17.577 -17.888 -18.07 -18.282 -18.498 -18.746 -19.069 -19.54 -21.21 -10 ,28672 ,TETRA ,17665616,Fri Dec 3 04:56:14 CET,Fri Dec 3 06:45:25 CET,0.0 0.889 1.124 1.286 1.409 1.533 1.638 1.733 1.906 1.989 2.07 2.084 2.321 2.394 2.528 2.641 2.736 2.783 2.875 2.966 3.106 3.195 3.272 3.382 3.494 3.597 3.69 3.777 3.886 3.973 4.046 4.138 4.22 4.294 4.389 4.497 4.587 4.679 4.782 4.891 4.997 5.109 5.202 5.248 5.275 5.246 5.127 4.939 4.581 3.903 2.538 0.731 -0.844 -2.248 -3.496 -4.606 -5.61 -6.535 -7.27 -7.997 -8.629 -9.154 -9.668 -10.152 -10.588 -11.0 -11.422 -11.78 -12.075 -12.401 -12.752 -13.031 -13.32 -13.616 -13.844 -14.082 -14.334 -14.59 -14.859 -15.044 -15.234 -15.54 -15.757 -15.975 -16.084 -16.317 -16.553 -16.799 -16.924 -17.229 -17.353 -17.504 -17.662 -18.04 -18.244 -18.459 -18.704 -18.999 -19.37 -19.813 -21.339 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8b.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8b.txt deleted file mode 100644 index 09496d6d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8b.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,17621 ,TETRA ,17665617,Fri Dec 3 04:56:17 CET,Fri Dec 3 06:47:36 CET,0.0 0.43 0.625 0.764 0.899 1.042 1.172 1.288 1.498 1.612 1.721 1.773 2.04 2.142 2.333 2.521 2.718 2.812 2.996 3.179 3.455 3.63 3.804 4.056 4.291 4.533 4.776 4.997 5.273 5.553 5.836 6.169 6.507 6.83 7.186 7.598 8.014 8.483 8.99 9.515 10.085 10.74 11.491 12.276 13.167 14.167 15.347 16.693 18.3 20.216 22.642 24.657 25.834 26.608 27.15 27.545 27.802 27.973 28.08 28.167 28.185 28.157 28.137 28.122 28.093 28.047 27.997 27.947 27.901 27.852 27.789 27.741 27.69 27.63 27.588 27.548 27.503 27.453 27.395 27.342 27.283 27.198 27.144 27.083 27.045 26.963 26.863 26.754 26.707 26.518 26.539 26.474 26.415 26.265 26.184 26.096 25.998 25.906 25.781 25.575 25.123 -2 ,28063 ,TETRA ,17665618,Fri Dec 3 04:56:19 CET,Fri Dec 3 06:47:30 CET,0.0 0.465 0.709 0.908 1.062 1.205 1.347 1.486 1.733 1.847 1.97 2.035 2.296 2.405 2.619 2.802 2.977 3.06 3.223 3.389 3.634 3.786 3.945 4.186 4.4 4.603 4.796 4.995 5.267 5.525 5.78 6.103 6.416 6.708 7.044 7.434 7.83 8.28 8.765 9.279 9.834 10.458 11.175 11.923 12.813 13.822 14.989 16.336 17.995 19.943 22.361 24.386 25.561 26.327 26.837 27.188 27.425 27.597 27.71 27.763 27.796 27.829 27.825 27.802 27.778 27.751 27.709 27.656 27.614 27.572 27.517 27.451 27.379 27.306 27.249 27.187 27.119 27.062 27.007 26.967 26.923 26.846 26.798 26.744 26.711 26.64 26.553 26.465 26.422 26.231 26.246 26.188 26.14 25.998 25.921 25.839 25.733 25.6 25.46 25.306 24.985 -3 ,1490 ,TETRA ,17665619,Fri Dec 3 04:56:13 CET,Fri Dec 3 06:50:06 CET,0.0 0.423 0.685 0.911 1.106 1.275 1.425 1.553 1.791 1.902 2.004 2.069 2.346 2.452 2.655 2.853 3.05 3.144 3.32 3.485 3.721 3.866 4.013 4.237 4.459 4.679 4.882 5.078 5.348 5.614 5.869 6.179 6.493 6.807 7.164 7.573 7.996 8.47 8.962 9.466 10.005 10.645 11.419 12.212 13.154 14.193 15.352 16.667 18.289 20.26 22.626 24.644 25.882 26.651 27.172 27.541 27.795 27.961 28.069 28.154 28.203 28.225 28.226 28.214 28.185 28.152 28.105 28.049 28.009 27.96 27.889 27.826 27.755 27.682 27.627 27.566 27.495 27.416 27.331 27.275 27.217 27.105 27.022 26.928 26.879 26.794 26.707 26.62 26.577 26.393 26.47 26.43 26.372 26.23 26.144 26.052 25.947 25.823 25.679 25.413 25.002 -4 ,11485 ,TETRA ,17665620,Fri Dec 3 04:56:17 CET,Fri Dec 3 06:50:01 CET,0.0 0.374 0.602 0.765 0.92 1.072 1.212 1.337 1.581 1.693 1.8 1.848 2.113 2.213 2.406 2.585 2.76 2.847 3.029 3.213 3.464 3.616 3.764 3.984 4.204 4.412 4.614 4.819 5.087 5.344 5.601 5.925 6.229 6.527 6.894 7.31 7.707 8.154 8.652 9.179 9.73 10.364 11.127 11.882 12.75 13.753 14.962 16.322 17.913 19.866 22.262 24.281 25.495 26.24 26.755 27.141 27.395 27.56 27.67 27.764 27.825 27.846 27.847 27.849 27.83 27.785 27.73 27.681 27.639 27.584 27.525 27.476 27.417 27.35 27.301 27.247 27.184 27.133 27.069 27.019 26.972 26.9 26.844 26.787 26.758 26.687 26.615 26.545 26.51 26.328 26.361 26.302 26.237 26.079 25.994 25.894 25.788 25.689 25.554 25.385 24.915 -5 ,30354 ,TETRA ,17665621,Fri Dec 3 04:56:14 CET,Fri Dec 3 06:48:48 CET,0.0 0.529 0.747 0.9 1.039 1.168 1.287 1.413 1.658 1.771 1.884 1.939 2.207 2.309 2.511 2.703 2.885 2.982 3.18 3.374 3.665 3.842 4.007 4.259 4.508 4.746 4.97 5.194 5.489 5.775 6.044 6.364 6.69 7.011 7.374 7.79 8.188 8.624 9.114 9.636 10.193 10.823 11.572 12.337 13.212 14.184 15.343 16.728 18.376 20.29 22.705 24.789 26.017 26.812 27.321 27.661 27.871 28.028 28.147 28.23 28.273 28.295 28.3 28.285 28.254 28.221 28.17 28.12 28.083 28.036 27.984 27.929 27.862 27.789 27.73 27.671 27.596 27.505 27.414 27.357 27.301 27.225 27.172 27.102 27.065 26.992 26.911 26.812 26.756 26.561 26.6 26.55 26.496 26.374 26.304 26.237 26.164 26.066 25.922 25.759 25.509 -6 ,29350 ,TETRA ,17665622,Fri Dec 3 04:56:15 CET,Fri Dec 3 06:48:21 CET,0.0 0.547 0.747 0.921 1.107 1.268 1.413 1.558 1.843 1.981 2.108 2.175 2.442 2.542 2.73 2.91 3.083 3.172 3.342 3.505 3.744 3.896 4.05 4.291 4.515 4.722 4.934 5.146 5.42 5.693 5.963 6.298 6.612 6.91 7.271 7.68 8.081 8.522 9.0 9.495 10.023 10.641 11.36 12.108 13.012 14.036 15.251 16.654 18.285 20.243 22.694 24.726 25.943 26.766 27.334 27.701 27.92 28.088 28.208 28.263 28.283 28.287 28.272 28.264 28.25 28.22 28.187 28.144 28.091 28.034 27.983 27.944 27.906 27.853 27.802 27.751 27.698 27.631 27.562 27.512 27.453 27.376 27.326 27.263 27.227 27.159 27.078 26.979 26.93 26.738 26.778 26.719 26.661 26.528 26.453 26.368 26.269 26.155 26.018 25.817 25.355 -7 ,1204 ,TETRA ,17665623,Fri Dec 3 04:59:13 CET,Fri Dec 3 06:48:43 CET,0.0 0.553 0.743 0.91 1.065 1.225 1.378 1.515 1.758 1.872 1.989 2.06 2.328 2.43 2.646 2.841 3.005 3.093 3.266 3.428 3.685 3.859 4.041 4.304 4.534 4.758 4.989 5.212 5.497 5.781 6.057 6.385 6.712 7.017 7.362 7.768 8.155 8.575 9.052 9.572 10.122 10.758 11.523 12.297 13.202 14.194 15.325 16.644 18.244 20.178 22.571 24.607 25.812 26.576 27.085 27.443 27.677 27.826 27.913 27.959 27.967 27.971 27.968 27.942 27.903 27.872 27.823 27.772 27.739 27.69 27.632 27.587 27.531 27.453 27.383 27.324 27.271 27.214 27.157 27.113 27.063 26.97 26.904 26.841 26.807 26.741 26.661 26.567 26.522 26.327 26.361 26.311 26.249 26.115 26.052 25.971 25.877 25.773 25.636 25.458 25.024 -8 ,17088 ,TETRA ,17665624,Fri Dec 3 04:59:15 CET,Fri Dec 3 06:51:10 CET,0.0 0.407 0.597 0.776 0.94 1.081 1.227 1.373 1.624 1.743 1.86 1.913 2.18 2.291 2.501 2.693 2.87 2.957 3.125 3.28 3.504 3.66 3.82 4.062 4.294 4.518 4.739 4.948 5.227 5.508 5.778 6.098 6.41 6.711 7.057 7.46 7.85 8.303 8.809 9.332 9.897 10.532 11.272 12.028 12.903 13.904 15.105 16.514 18.158 20.113 22.504 24.578 25.849 26.625 27.138 27.508 27.747 27.911 28.027 28.114 28.168 28.21 28.233 28.215 28.17 28.115 28.078 28.045 27.992 27.925 27.86 27.804 27.737 27.664 27.598 27.523 27.444 27.364 27.28 27.216 27.139 27.03 26.961 26.883 26.848 26.773 26.688 26.608 26.568 26.374 26.41 26.36 26.296 26.145 26.053 25.948 25.836 25.714 25.577 25.382 24.947 -9 ,13161 ,TETRA ,17665625,Fri Dec 3 04:59:14 CET,Fri Dec 3 06:51:03 CET,0.0 0.447 0.72 0.931 1.106 1.26 1.402 1.543 1.803 1.925 2.047 2.114 2.389 2.492 2.686 2.873 3.055 3.14 3.31 3.484 3.732 3.89 4.047 4.282 4.511 4.73 4.946 5.167 5.457 5.743 6.028 6.368 6.683 6.989 7.35 7.757 8.162 8.62 9.111 9.632 10.182 10.804 11.524 12.269 13.183 14.211 15.425 16.779 18.372 20.332 22.785 24.871 26.091 26.844 27.331 27.648 27.852 28.005 28.099 28.17 28.214 28.231 28.234 28.218 28.189 28.16 28.124 28.07 28.013 27.967 27.92 27.864 27.799 27.736 27.683 27.609 27.531 27.462 27.386 27.323 27.253 27.145 27.078 27.012 26.971 26.885 26.802 26.722 26.674 26.477 26.52 26.458 26.394 26.26 26.187 26.109 26.011 25.878 25.735 25.563 24.999 -10 ,3247 ,TETRA ,17665626,Fri Dec 3 04:59:17 CET,Fri Dec 3 06:51:11 CET,0.0 0.381 0.613 0.835 1.015 1.135 1.266 1.392 1.624 1.748 1.87 1.946 2.217 2.322 2.521 2.724 2.913 3.002 3.176 3.348 3.607 3.766 3.92 4.141 4.362 4.592 4.797 4.986 5.243 5.495 5.743 6.053 6.344 6.623 6.955 7.331 7.708 8.144 8.623 9.141 9.708 10.367 11.145 11.912 12.793 13.799 14.979 16.353 18.006 19.977 22.378 24.38 25.578 26.351 26.871 27.232 27.474 27.638 27.706 27.745 27.786 27.807 27.813 27.819 27.798 27.756 27.703 27.643 27.588 27.536 27.484 27.446 27.395 27.334 27.293 27.253 27.21 27.171 27.113 27.059 27.016 26.95 26.897 26.836 26.804 26.733 26.653 26.564 26.515 26.313 26.343 26.285 26.22 26.076 26.006 25.949 25.871 25.773 25.637 25.48 25.105 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8d.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8d.txt deleted file mode 100644 index eedf1e73..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8d.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,29029 ,TETRA ,17665627,Fri Dec 3 04:59:18 CET,Fri Dec 3 06:50:18 CET,0.0 0.131 0.198 0.259 0.325 0.386 0.435 0.476 0.535 0.563 0.599 0.506 0.704 0.735 0.784 0.834 0.891 0.917 0.955 0.995 1.053 1.091 1.132 1.194 1.241 1.285 1.338 1.389 1.454 1.52 1.585 1.662 1.724 1.779 1.844 1.919 1.988 2.042 2.084 2.114 2.138 2.155 2.149 2.136 2.094 2.014 1.848 1.579 1.145 0.424 -0.875 -2.597 -4.036 -5.238 -6.268 -7.178 -7.972 -8.67 -9.281 -9.897 -10.407 -10.866 -11.3 -11.683 -12.033 -12.374 -12.739 -13.058 -13.34 -13.612 -13.899 -14.17 -14.443 -14.695 -14.887 -15.096 -15.321 -15.558 -15.802 -15.971 -16.142 -16.409 -16.58 -16.756 -16.855 -17.064 -17.291 -17.524 -17.642 -17.951 -18.033 -18.179 -18.325 -18.657 -18.833 -19.025 -19.259 -19.518 -19.812 -20.223 -21.523 -2 ,7288 ,TETRA ,17665628,Fri Dec 3 04:59:15 CET,Fri Dec 3 06:50:27 CET,0.0 0.202 0.332 0.431 0.48 0.537 0.612 0.677 0.791 0.843 0.88 0.779 0.976 1.013 1.085 1.142 1.191 1.217 1.264 1.323 1.422 1.485 1.549 1.648 1.738 1.814 1.882 1.943 2.031 2.111 2.176 2.252 2.317 2.371 2.434 2.504 2.567 2.631 2.687 2.737 2.8 2.845 2.836 2.807 2.77 2.687 2.51 2.236 1.797 1.074 -0.286 -2.032 -3.434 -4.622 -5.636 -6.511 -7.273 -7.988 -8.601 -9.187 -9.695 -10.166 -10.625 -11.05 -11.432 -11.786 -12.168 -12.503 -12.796 -13.106 -13.419 -13.672 -13.931 -14.209 -14.429 -14.654 -14.891 -15.124 -15.367 -15.532 -15.703 -15.976 -16.163 -16.366 -16.472 -16.686 -16.916 -17.153 -17.278 -17.588 -17.659 -17.793 -17.953 -18.304 -18.496 -18.719 -18.952 -19.202 -19.486 -19.828 -20.861 -3 ,10272 ,TETRA ,17665629,Fri Dec 3 04:59:13 CET,Fri Dec 3 06:50:12 CET,0.0 0.22 0.3 0.364 0.427 0.503 0.559 0.6 0.699 0.744 0.784 0.691 0.887 0.922 0.991 1.048 1.099 1.124 1.177 1.234 1.335 1.41 1.48 1.558 1.622 1.699 1.765 1.825 1.905 1.975 2.035 2.095 2.166 2.229 2.283 2.336 2.38 2.43 2.475 2.515 2.546 2.574 2.596 2.586 2.523 2.402 2.227 1.966 1.499 0.714 -0.657 -2.399 -3.813 -5.018 -6.01 -6.867 -7.629 -8.335 -8.982 -9.594 -10.101 -10.557 -11.002 -11.428 -11.823 -12.19 -12.546 -12.845 -13.102 -13.386 -13.688 -13.924 -14.161 -14.413 -14.606 -14.811 -15.029 -15.248 -15.475 -15.629 -15.794 -16.073 -16.263 -16.435 -16.523 -16.713 -16.897 -17.098 -17.213 -17.522 -17.583 -17.718 -17.869 -18.186 -18.356 -18.538 -18.758 -19.009 -19.276 -19.665 -21.168 -4 ,15375 ,TETRA ,17665630,Fri Dec 3 04:59:17 CET,Fri Dec 3 06:50:39 CET,0.0 0.144 0.227 0.292 0.355 0.413 0.47 0.526 0.625 0.658 0.688 0.593 0.796 0.837 0.901 0.957 1.015 1.04 1.083 1.123 1.182 1.224 1.269 1.337 1.394 1.435 1.478 1.518 1.568 1.62 1.663 1.712 1.755 1.799 1.863 1.927 1.963 2.008 2.047 2.078 2.114 2.133 2.134 2.128 2.114 2.024 1.843 1.586 1.149 0.391 -0.973 -2.633 -4.017 -5.228 -6.28 -7.217 -8.067 -8.807 -9.408 -10.012 -10.546 -11.026 -11.496 -11.931 -12.319 -12.678 -13.035 -13.35 -13.631 -13.933 -14.256 -14.516 -14.773 -15.055 -15.271 -15.475 -15.687 -15.895 -16.112 -16.271 -16.441 -16.705 -16.881 -17.068 -17.166 -17.375 -17.593 -17.799 -17.91 -18.213 -18.276 -18.398 -18.533 -18.854 -19.032 -19.218 -19.408 -19.642 -19.915 -20.295 -21.726 -5 ,6957 ,TETRA ,17665631,Fri Dec 3 04:59:18 CET,Fri Dec 3 06:50:07 CET,0.0 0.126 0.23 0.298 0.348 0.404 0.458 0.505 0.59 0.631 0.667 0.577 0.775 0.803 0.862 0.926 0.978 1.002 1.051 1.098 1.16 1.195 1.231 1.29 1.349 1.403 1.465 1.531 1.609 1.681 1.747 1.825 1.897 1.958 2.017 2.086 2.152 2.219 2.278 2.32 2.345 2.36 2.37 2.356 2.304 2.215 2.073 1.825 1.401 0.67 -0.673 -2.306 -3.632 -4.843 -5.919 -6.869 -7.711 -8.432 -9.041 -9.663 -10.191 -10.653 -11.11 -11.535 -11.932 -12.298 -12.667 -12.999 -13.296 -13.596 -13.898 -14.148 -14.403 -14.683 -14.892 -15.108 -15.345 -15.581 -15.82 -15.986 -16.164 -16.427 -16.603 -16.792 -16.892 -17.092 -17.306 -17.536 -17.645 -17.953 -18.043 -18.192 -18.344 -18.633 -18.788 -18.966 -19.174 -19.413 -19.712 -20.088 -21.275 -6 ,19884 ,TETRA ,17665632,Fri Dec 3 04:59:13 CET,Fri Dec 3 06:51:10 CET,0.0 0.302 0.414 0.489 0.557 0.617 0.662 0.702 0.777 0.822 0.867 0.766 0.962 1.002 1.06 1.104 1.153 1.178 1.227 1.27 1.321 1.358 1.4 1.461 1.514 1.56 1.61 1.655 1.706 1.753 1.798 1.853 1.909 1.962 2.022 2.086 2.133 2.175 2.233 2.277 2.305 2.315 2.311 2.284 2.206 2.096 1.928 1.629 1.152 0.414 -0.894 -2.567 -4.047 -5.281 -6.313 -7.219 -8.003 -8.7 -9.301 -9.929 -10.458 -10.911 -11.333 -11.753 -12.171 -12.521 -12.878 -13.193 -13.474 -13.767 -14.077 -14.35 -14.611 -14.863 -15.072 -15.296 -15.511 -15.738 -15.983 -16.149 -16.319 -16.572 -16.758 -16.972 -17.081 -17.307 -17.544 -17.791 -17.924 -18.245 -18.3 -18.431 -18.575 -18.882 -19.05 -19.226 -19.424 -19.651 -19.923 -20.292 -21.47 -7 ,12889 ,TETRA ,17665633,Fri Dec 3 04:59:13 CET,Fri Dec 3 06:51:10 CET,0.0 0.27 0.395 0.466 0.544 0.634 0.705 0.756 0.847 0.893 0.942 0.857 1.05 1.087 1.161 1.229 1.291 1.316 1.367 1.416 1.478 1.514 1.559 1.615 1.654 1.696 1.73 1.757 1.798 1.854 1.933 2.026 2.084 2.135 2.198 2.253 2.297 2.357 2.413 2.453 2.484 2.509 2.51 2.48 2.448 2.384 2.236 1.981 1.531 0.774 -0.517 -2.133 -3.549 -4.722 -5.716 -6.659 -7.478 -8.175 -8.787 -9.402 -9.925 -10.401 -10.86 -11.291 -11.693 -12.055 -12.434 -12.763 -13.023 -13.301 -13.614 -13.864 -14.122 -14.38 -14.58 -14.793 -15.018 -15.27 -15.522 -15.678 -15.829 -16.096 -16.294 -16.496 -16.595 -16.785 -16.984 -17.203 -17.312 -17.606 -17.672 -17.807 -17.943 -18.252 -18.427 -18.604 -18.811 -19.071 -19.35 -19.717 -20.83 -8 ,16908 ,TETRA ,17665634,Fri Dec 3 04:59:15 CET,Fri Dec 3 06:51:02 CET,0.0 0.172 0.29 0.366 0.423 0.492 0.558 0.611 0.724 0.774 0.817 0.732 0.93 0.961 1.021 1.085 1.144 1.167 1.21 1.258 1.327 1.368 1.411 1.477 1.546 1.615 1.667 1.718 1.792 1.862 1.928 2.0 2.066 2.128 2.206 2.286 2.335 2.373 2.43 2.481 2.519 2.573 2.602 2.577 2.521 2.443 2.289 1.999 1.548 0.792 -0.616 -2.377 -3.8 -4.988 -6.01 -6.88 -7.685 -8.438 -9.035 -9.643 -10.183 -10.642 -11.052 -11.438 -11.813 -12.162 -12.531 -12.856 -13.138 -13.431 -13.727 -13.974 -14.25 -14.541 -14.751 -14.954 -15.166 -15.385 -15.615 -15.781 -15.966 -16.259 -16.449 -16.648 -16.754 -16.976 -17.188 -17.416 -17.546 -17.856 -17.918 -18.057 -18.203 -18.506 -18.673 -18.862 -19.071 -19.311 -19.586 -19.951 -21.28 -9 ,23467 ,TETRA ,17665635,Fri Dec 3 04:59:16 CET,Fri Dec 3 06:50:30 CET,0.0 0.233 0.319 0.403 0.49 0.553 0.604 0.655 0.749 0.792 0.834 0.747 0.944 0.977 1.044 1.099 1.15 1.179 1.229 1.278 1.35 1.397 1.444 1.516 1.583 1.646 1.71 1.769 1.837 1.908 1.967 2.023 2.086 2.153 2.223 2.297 2.364 2.409 2.439 2.476 2.505 2.521 2.528 2.528 2.495 2.411 2.242 1.936 1.471 0.74 -0.615 -2.334 -3.75 -4.92 -5.929 -6.847 -7.631 -8.345 -8.965 -9.599 -10.161 -10.641 -11.081 -11.501 -11.893 -12.25 -12.631 -12.976 -13.278 -13.606 -13.949 -14.216 -14.484 -14.768 -14.985 -15.216 -15.449 -15.681 -15.929 -16.101 -16.274 -16.547 -16.738 -16.932 -17.027 -17.213 -17.422 -17.639 -17.745 -18.044 -18.107 -18.24 -18.387 -18.699 -18.878 -19.09 -19.309 -19.547 -19.83 -20.213 -21.534 -10 ,31955 ,TETRA ,17665636,Fri Dec 3 04:59:16 CET,Fri Dec 3 06:51:09 CET,0.0 0.177 0.28 0.358 0.429 0.493 0.552 0.603 0.696 0.741 0.779 0.676 0.867 0.9 0.966 1.013 1.067 1.098 1.155 1.21 1.28 1.315 1.359 1.424 1.472 1.524 1.572 1.626 1.697 1.759 1.815 1.872 1.927 1.98 2.038 2.096 2.133 2.161 2.194 2.218 2.244 2.267 2.259 2.238 2.192 2.093 1.952 1.734 1.311 0.539 -0.837 -2.549 -3.985 -5.188 -6.224 -7.158 -7.953 -8.655 -9.282 -9.904 -10.408 -10.857 -11.282 -11.689 -12.083 -12.445 -12.828 -13.153 -13.419 -13.71 -14.028 -14.291 -14.555 -14.821 -15.016 -15.215 -15.427 -15.64 -15.852 -16.005 -16.164 -16.393 -16.559 -16.743 -16.837 -17.039 -17.258 -17.476 -17.592 -17.901 -17.976 -18.117 -18.259 -18.567 -18.739 -18.927 -19.137 -19.364 -19.644 -20.002 -21.026 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8e.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8e.txt deleted file mode 100644 index d66d64de..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/processed/summary_files/openFF2/tnks2/water/Summary_FEP_8f_8e.txt +++ /dev/null @@ -1,11 +0,0 @@ -Replicate no.,seed ,server ,jobid ,starting time,ending time,lambda_energies -1 ,27468 ,TETRA ,17665637,Fri Dec 3 04:59:15 CET,Fri Dec 3 06:51:03 CET,0.0 0.176 0.304 0.432 0.53 0.613 0.696 0.764 0.91 0.985 1.054 1.02 1.245 1.306 1.42 1.526 1.637 1.686 1.778 1.876 2.011 2.103 2.21 2.363 2.52 2.685 2.832 2.966 3.144 3.323 3.501 3.704 3.899 4.085 4.302 4.558 4.801 5.051 5.315 5.608 5.938 6.307 6.733 7.161 7.651 8.199 8.818 9.516 10.351 11.311 12.375 13.121 13.444 13.555 13.573 13.551 13.484 13.401 13.309 13.193 13.074 12.96 12.828 12.689 12.562 12.451 12.332 12.217 12.116 12.004 11.875 11.775 11.674 11.548 11.449 11.349 11.233 11.116 11.006 10.927 10.842 10.709 10.612 10.504 10.445 10.329 10.212 10.093 10.03 9.81 9.818 9.742 9.656 9.448 9.331 9.202 9.057 8.887 8.639 8.354 7.826 -2 ,10515 ,TETRA ,17665638,Fri Dec 3 04:59:18 CET,Fri Dec 3 06:50:44 CET,0.0 0.309 0.438 0.531 0.617 0.703 0.794 0.88 1.042 1.118 1.194 1.186 1.422 1.483 1.587 1.692 1.791 1.835 1.923 2.015 2.16 2.254 2.343 2.467 2.594 2.726 2.862 2.995 3.158 3.322 3.488 3.689 3.885 4.074 4.285 4.525 4.76 5.019 5.321 5.633 5.924 6.26 6.675 7.092 7.588 8.147 8.772 9.477 10.28 11.201 12.291 13.023 13.358 13.518 13.558 13.531 13.477 13.382 13.274 13.158 13.045 12.91 12.767 12.639 12.525 12.424 12.312 12.206 12.1 11.995 11.891 11.791 11.684 11.579 11.498 11.395 11.275 11.161 11.055 10.974 10.891 10.773 10.693 10.621 10.583 10.5 10.415 10.312 10.251 10.042 10.094 10.034 9.967 9.829 9.753 9.67 9.592 9.494 9.363 9.222 8.857 -3 ,24859 ,TETRA ,17665639,Fri Dec 3 04:59:20 CET,Fri Dec 3 06:50:30 CET,0.0 0.458 0.641 0.822 0.977 1.091 1.192 1.294 1.494 1.601 1.713 1.74 1.977 2.055 2.21 2.348 2.483 2.547 2.672 2.798 2.975 3.077 3.179 3.339 3.494 3.635 3.767 3.894 4.053 4.208 4.366 4.561 4.761 4.957 5.174 5.406 5.633 5.885 6.149 6.449 6.759 7.104 7.545 7.961 8.432 9.013 9.662 10.368 11.193 12.127 13.163 13.868 14.199 14.351 14.364 14.307 14.2 14.085 13.991 13.873 13.75 13.631 13.514 13.394 13.277 13.165 13.034 12.908 12.801 12.697 12.579 12.469 12.354 12.23 12.13 12.026 11.925 11.819 11.694 11.614 11.532 11.387 11.289 11.194 11.145 11.037 10.923 10.8 10.732 10.512 10.519 10.436 10.348 10.161 10.043 9.899 9.736 9.58 9.392 9.109 8.644 -4 ,9696 ,TETRA ,17665640,Fri Dec 3 04:59:14 CET,Fri Dec 3 06:50:28 CET,0.0 0.183 0.298 0.409 0.504 0.597 0.693 0.782 0.948 1.028 1.111 1.118 1.361 1.442 1.6 1.759 1.889 1.947 2.077 2.211 2.403 2.511 2.619 2.786 2.937 3.077 3.214 3.349 3.521 3.688 3.853 4.06 4.251 4.437 4.65 4.879 5.108 5.357 5.627 5.936 6.253 6.625 7.073 7.493 7.973 8.506 9.156 9.9 10.738 11.701 12.825 13.578 13.881 14.028 14.069 14.041 13.982 13.903 13.801 13.677 13.581 13.498 13.39 13.256 13.113 12.99 12.866 12.737 12.629 12.525 12.4 12.296 12.204 12.1 12.017 11.926 11.816 11.706 11.593 11.509 11.42 11.279 11.177 11.077 11.032 10.926 10.807 10.693 10.63 10.409 10.409 10.329 10.237 10.029 9.916 9.796 9.659 9.526 9.355 9.101 8.505 -5 ,18610 ,TETRA ,17665641,Fri Dec 3 04:59:18 CET,Fri Dec 3 06:50:22 CET,0.0 0.207 0.335 0.443 0.543 0.629 0.718 0.818 0.996 1.072 1.152 1.14 1.374 1.462 1.624 1.752 1.874 1.936 2.05 2.166 2.345 2.455 2.558 2.718 2.882 3.033 3.167 3.298 3.483 3.659 3.822 4.027 4.234 4.43 4.656 4.916 5.158 5.415 5.693 5.991 6.3 6.648 7.052 7.474 7.963 8.505 9.142 9.87 10.695 11.606 12.662 13.416 13.775 13.951 14.002 13.95 13.867 13.787 13.687 13.575 13.452 13.31 13.172 13.039 12.926 12.828 12.72 12.616 12.515 12.398 12.276 12.181 12.075 11.965 11.875 11.775 11.683 11.587 11.494 11.422 11.329 11.184 11.088 10.983 10.928 10.823 10.724 10.629 10.575 10.364 10.42 10.375 10.312 10.138 10.055 9.963 9.848 9.734 9.61 9.462 9.16 -6 ,9149 ,TETRA ,17665642,Fri Dec 3 04:59:15 CET,Fri Dec 3 06:50:16 CET,0.0 0.28 0.392 0.487 0.59 0.69 0.778 0.862 1.009 1.076 1.139 1.099 1.321 1.381 1.499 1.608 1.715 1.769 1.874 1.974 2.113 2.205 2.301 2.449 2.592 2.745 2.903 3.045 3.222 3.392 3.551 3.751 3.956 4.16 4.392 4.644 4.882 5.149 5.447 5.768 6.098 6.47 6.897 7.319 7.823 8.369 8.989 9.678 10.455 11.364 12.467 13.224 13.55 13.717 13.753 13.714 13.647 13.54 13.432 13.324 13.218 13.098 12.956 12.804 12.666 12.55 12.433 12.32 12.213 12.107 11.996 11.9 11.802 11.683 11.579 11.473 11.366 11.26 11.158 11.089 11.012 10.876 10.783 10.69 10.64 10.538 10.42 10.295 10.24 10.033 10.063 9.996 9.932 9.784 9.706 9.629 9.529 9.397 9.259 9.108 8.848 -7 ,5037 ,TETRA ,17665643,Fri Dec 3 04:59:20 CET,Fri Dec 3 06:50:15 CET,0.0 0.24 0.374 0.483 0.581 0.663 0.747 0.828 0.968 1.029 1.09 1.052 1.268 1.324 1.451 1.579 1.695 1.751 1.876 1.997 2.158 2.271 2.384 2.538 2.689 2.841 2.99 3.121 3.291 3.463 3.631 3.835 4.026 4.214 4.434 4.672 4.899 5.143 5.419 5.71 6.006 6.371 6.792 7.191 7.669 8.214 8.835 9.539 10.389 11.352 12.409 13.158 13.504 13.631 13.65 13.667 13.631 13.535 13.44 13.321 13.188 13.077 12.977 12.857 12.73 12.616 12.489 12.368 12.256 12.136 12.012 11.903 11.779 11.663 11.576 11.473 11.366 11.258 11.149 11.075 10.99 10.856 10.768 10.675 10.626 10.511 10.395 10.291 10.232 10.02 10.018 9.928 9.864 9.732 9.638 9.537 9.434 9.309 9.174 9.008 8.681 -8 ,6202 ,TETRA ,17665644,Fri Dec 3 04:59:13 CET,Fri Dec 3 06:51:49 CET,0.0 0.229 0.353 0.467 0.592 0.697 0.78 0.865 1.014 1.08 1.141 1.111 1.342 1.403 1.519 1.643 1.77 1.83 1.941 2.052 2.222 2.335 2.444 2.605 2.769 2.928 3.077 3.22 3.409 3.583 3.746 3.958 4.163 4.353 4.564 4.8 5.033 5.289 5.572 5.889 6.216 6.571 6.987 7.394 7.873 8.415 9.022 9.707 10.531 11.45 12.459 13.217 13.579 13.725 13.739 13.697 13.608 13.491 13.392 13.283 13.171 13.052 12.923 12.805 12.704 12.608 12.479 12.348 12.238 12.125 12.016 11.927 11.828 11.713 11.625 11.543 11.45 11.344 11.235 11.165 11.088 10.949 10.857 10.76 10.705 10.584 10.453 10.301 10.226 10.007 10.0 9.923 9.839 9.638 9.519 9.402 9.29 9.156 8.992 8.827 8.282 -9 ,9813 ,TETRA ,17665645,Fri Dec 3 05:00:14 CET,Fri Dec 3 06:51:24 CET,0.0 0.178 0.293 0.4 0.51 0.61 0.694 0.769 0.918 0.987 1.051 1.014 1.231 1.287 1.4 1.515 1.626 1.679 1.783 1.885 2.037 2.127 2.201 2.326 2.466 2.587 2.705 2.828 2.975 3.11 3.257 3.437 3.611 3.78 3.97 4.185 4.395 4.647 4.936 5.222 5.514 5.841 6.234 6.637 7.105 7.658 8.291 8.961 9.77 10.759 11.899 12.788 13.178 13.336 13.391 13.39 13.38 13.327 13.228 13.1 12.995 12.885 12.755 12.632 12.517 12.413 12.297 12.192 12.101 12.001 11.882 11.77 11.659 11.547 11.457 11.359 11.258 11.155 11.046 10.969 10.884 10.742 10.639 10.53 10.477 10.37 10.255 10.135 10.071 9.848 9.856 9.784 9.704 9.519 9.412 9.294 9.17 9.034 8.854 8.629 8.177 -10 ,12484 ,TETRA ,17665646,Fri Dec 3 05:00:16 CET,Fri Dec 3 06:51:00 CET,0.0 0.354 0.543 0.68 0.824 0.965 1.079 1.171 1.352 1.45 1.545 1.55 1.795 1.877 2.023 2.16 2.289 2.353 2.482 2.605 2.765 2.87 2.981 3.141 3.291 3.439 3.583 3.722 3.896 4.06 4.231 4.433 4.617 4.805 5.03 5.282 5.527 5.795 6.091 6.397 6.717 7.081 7.488 7.891 8.362 8.91 9.546 10.272 11.154 12.128 13.133 13.868 14.208 14.318 14.317 14.269 14.16 14.038 13.947 13.844 13.74 13.635 13.53 13.423 13.311 13.208 13.096 12.99 12.888 12.774 12.66 12.563 12.453 12.326 12.225 12.127 12.024 11.924 11.823 11.756 11.695 11.589 11.51 11.427 11.388 11.307 11.221 11.119 11.064 10.861 10.903 10.838 10.764 10.605 10.52 10.429 10.31 10.185 10.084 9.97 9.649 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/FEP+/dGs/avg_path_ref_275.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/FEP+/dGs/avg_path_ref_275.txt deleted file mode 100755 index 01721611..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/FEP+/dGs/avg_path_ref_275.txt +++ /dev/null @@ -1,252 +0,0 @@ -Regression metrics for dG for BACE target -r2 0.61 -r2 CI 0.371 - 0.78 -MAE 0.666 -RMSE 0.85 -slope 1.327 -intercept 3.046 -p_value 0.0 -std_error 0.182 -kendall_tau 0.566 -spearman_rho 0.737 -n 36 -Regression metrics for dG for ccc_BACE target -r2 0.004 -r2 CI 0.074 - 0.147 -MAE 1.245 -RMSE 1.478 -slope 0.107 -intercept -8.334 -p_value 0.633 -std_error 0.294 -kendall_tau 0.056 -spearman_rho 0.076 -n 36 -Regression metrics for dG for ccc_CDK2 target -r2 0.224 -r2 CI 0.001 - 0.616 -MAE 0.882 -RMSE 1.042 -slope 0.265 -intercept -6.689 -p_value 0.139 -std_error 0.132 -kendall_tau 0.283 -spearman_rho 0.415 -n 16 -Regression metrics for dG for ccc_JNK1 target -r2 0.213 -r2 CI 0.001 - 0.555 -MAE 1.449 -RMSE 1.821 -slope 0.843 -intercept -0.226 -p_value 0.014 -std_error 0.371 -kendall_tau 0.388 -spearman_rho 0.497 -n 21 -Regression metrics for dG for ccc_MCL1 target -r2 0.014 -r2 CI 0.165 - 0.038 -MAE 2.343 -RMSE 2.777 -slope -0.186 -intercept -7.743 -p_value 0.116 -std_error 0.25 -kendall_tau -0.169 -spearman_rho -0.24 -n 42 -Regression metrics for dG for ccc_p38 target -r2 0.03 -r2 CI 0.234 - 0.03 -MAE 1.604 -RMSE 2.275 -slope -0.33 -intercept -14.18 -p_value 0.514 -std_error 0.33 -kendall_tau -0.079 -spearman_rho -0.103 -n 34 -Regression metrics for dG for ccc_PTP1B target -r2 0.644 -r2 CI 0.341 - 0.833 -MAE 0.603 -RMSE 0.798 -slope 0.782 -intercept -1.968 -p_value 0.0 -std_error 0.127 -kendall_tau 0.695 -spearman_rho 0.824 -n 23 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_BACE target -r2 0.002 -r2 CI 0.084 - 0.134 -MAE 1.45 -RMSE 1.723 -slope 0.08 -intercept -7.936 -p_value 0.156 -std_error 0.32 -kendall_tau 0.166 -spearman_rho 0.215 -n 36 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_CDK2 target -r2 0.187 -r2 CI 0.584 - 0.006 -MAE 1.834 -RMSE 2.353 -slope -0.408 -intercept -11.483 -p_value 0.195 -std_error 0.227 -kendall_tau -0.25 -spearman_rho -0.465 -n 16 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_JNK1 target -r2 0.098 -r2 CI 0.019 - 0.431 -MAE 1.116 -RMSE 1.562 -slope 0.453 -intercept -4.027 -p_value 0.091 -std_error 0.315 -kendall_tau 0.268 -spearman_rho 0.422 -n 21 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_Thrombin target -r2 0.548 -r2 CI 0.861 - 0.064 -MAE 1.544 -RMSE 1.885 -slope -1.879 -intercept -23.274 -p_value 0.003 -std_error 0.569 -kendall_tau -0.673 -spearman_rho -0.809 -n 11 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_Tyk2 target -r2 0.304 -r2 CI 0.676 - 0.006 -MAE 1.718 -RMSE 2.029 -slope -0.431 -intercept -14.402 -p_value 0.033 -std_error 0.174 -kendall_tau -0.4 -spearman_rho -0.541 -n 16 -Regression metrics for dG for ccc_Thrombin target -r2 0.5 -r2 CI 0.035 - 0.842 -MAE 0.417 -RMSE 0.538 -slope 1.036 -intercept 0.297 -p_value 0.06 -std_error 0.345 -kendall_tau 0.455 -spearman_rho 0.618 -n 11 -Regression metrics for dG for ccc_Tyk2 target -r2 0.794 -r2 CI 0.501 - 0.925 -MAE 0.445 -RMSE 0.571 -slope 0.796 -intercept -1.987 -p_value 0.0 -std_error 0.108 -kendall_tau 0.7 -spearman_rho 0.868 -n 16 -Regression metrics for dG for CDK2 target -r2 0.227 -r2 CI 0.001 - 0.618 -MAE 0.882 -RMSE 1.039 -slope 0.267 -intercept -6.671 -p_value 0.139 -std_error 0.132 -kendall_tau 0.283 -spearman_rho 0.415 -n 16 -Regression metrics for dG for JNK1 target -r2 0.715 -r2 CI 0.425 - 0.876 -MAE 1.055 -RMSE 1.143 -slope 1.775 -intercept 7.053 -p_value 0.0 -std_error 0.257 -kendall_tau 0.756 -spearman_rho 0.898 -n 21 -Regression metrics for dG for MCL1 target -r2 0.596 -r2 CI 0.374 - 0.759 -MAE 0.843 -RMSE 1.043 -slope 1.183 -intercept 1.474 -p_value 0.0 -std_error 0.154 -kendall_tau 0.602 -spearman_rho 0.779 -n 42 -Regression metrics for dG for p38 target -r2 0.426 -r2 CI 0.163 - 0.659 -MAE 0.859 -RMSE 0.967 -slope 0.824 -intercept -1.874 -p_value 0.0 -std_error 0.169 -kendall_tau 0.462 -spearman_rho 0.638 -n 34 -Regression metrics for dG for PTP1B target -r2 0.644 -r2 CI 0.34 - 0.833 -MAE 0.606 -RMSE 0.8 -slope 0.785 -intercept -1.932 -p_value 0.0 -std_error 0.127 -kendall_tau 0.695 -spearman_rho 0.824 -n 23 -Regression metrics for dG for Thrombin target -r2 0.499 -r2 CI 0.034 - 0.842 -MAE 0.417 -RMSE 0.538 -slope 1.034 -intercept 0.284 -p_value 0.06 -std_error 0.345 -kendall_tau 0.455 -spearman_rho 0.618 -n 11 -Regression metrics for dG for Tyk2 target -r2 0.794 -r2 CI 0.501 - 0.925 -MAE 0.446 -RMSE 0.571 -slope 0.796 -intercept -1.982 -p_value 0.0 -std_error 0.108 -kendall_tau 0.7 -spearman_rho 0.868 -n 16 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/FEP+/dGs/avg_path_ref_300.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/FEP+/dGs/avg_path_ref_300.txt deleted file mode 100755 index 277b6d5a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/FEP+/dGs/avg_path_ref_300.txt +++ /dev/null @@ -1,252 +0,0 @@ -Regression metrics for dG for BACE target -r2 0.61 -r2 CI 0.371 - 0.78 -MAE 0.666 -RMSE 0.85 -slope 1.327 -intercept 3.046 -p_value 0.0 -std_error 0.182 -kendall_tau 0.566 -spearman_rho 0.737 -n 36 -Regression metrics for dG for ccc_BACE target -r2 0.004 -r2 CI 0.074 - 0.147 -MAE 1.245 -RMSE 1.478 -slope 0.107 -intercept -8.334 -p_value 0.633 -std_error 0.294 -kendall_tau 0.056 -spearman_rho 0.076 -n 36 -Regression metrics for dG for ccc_CDK2 target -r2 0.224 -r2 CI 0.001 - 0.616 -MAE 0.882 -RMSE 1.042 -slope 0.265 -intercept -6.689 -p_value 0.139 -std_error 0.132 -kendall_tau 0.283 -spearman_rho 0.415 -n 16 -Regression metrics for dG for ccc_JNK1 target -r2 0.213 -r2 CI 0.001 - 0.555 -MAE 1.449 -RMSE 1.821 -slope 0.843 -intercept -0.226 -p_value 0.014 -std_error 0.371 -kendall_tau 0.388 -spearman_rho 0.497 -n 21 -Regression metrics for dG for ccc_MCL1 target -r2 0.014 -r2 CI 0.165 - 0.038 -MAE 2.343 -RMSE 2.777 -slope -0.186 -intercept -7.743 -p_value 0.116 -std_error 0.25 -kendall_tau -0.169 -spearman_rho -0.24 -n 42 -Regression metrics for dG for ccc_p38 target -r2 0.03 -r2 CI 0.234 - 0.03 -MAE 1.604 -RMSE 2.275 -slope -0.33 -intercept -14.18 -p_value 0.514 -std_error 0.33 -kendall_tau -0.079 -spearman_rho -0.103 -n 34 -Regression metrics for dG for ccc_PTP1B target -r2 0.644 -r2 CI 0.341 - 0.833 -MAE 0.603 -RMSE 0.798 -slope 0.782 -intercept -1.968 -p_value 0.0 -std_error 0.127 -kendall_tau 0.695 -spearman_rho 0.824 -n 23 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_BACE target -r2 0.065 -r2 CI 0.007 - 0.29 -MAE 1.289 -RMSE 1.591 -slope 0.501 -intercept -4.145 -p_value 0.19 -std_error 0.326 -kendall_tau 0.154 -spearman_rho 0.252 -n 36 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_CDK2 target -r2 0.294 -r2 CI 0.004 - 0.669 -MAE 0.911 -RMSE 1.186 -slope 0.441 -intercept -4.515 -p_value 0.116 -std_error 0.183 -kendall_tau 0.3 -spearman_rho 0.456 -n 16 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_JNK1 target -r2 0.299 -r2 CI 0.023 - 0.626 -MAE 1.137 -RMSE 1.426 -slope 1.084 -intercept 0.481 -p_value 0.005 -std_error 0.381 -kendall_tau 0.44 -spearman_rho 0.652 -n 21 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_Thrombin target -r2 0.244 -r2 CI 0.023 - 0.712 -MAE 1.411 -RMSE 1.793 -slope 1.773 -intercept 7.096 -p_value 0.445 -std_error 1.041 -kendall_tau 0.2 -spearman_rho 0.4 -n 11 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_Tyk2 target -r2 0.054 -r2 CI 0.088 - 0.427 -MAE 1.171 -RMSE 1.343 -slope 0.157 -intercept -8.196 -p_value 0.228 -std_error 0.175 -kendall_tau 0.233 -spearman_rho 0.382 -n 16 -Regression metrics for dG for ccc_Thrombin target -r2 0.5 -r2 CI 0.035 - 0.842 -MAE 0.417 -RMSE 0.538 -slope 1.036 -intercept 0.297 -p_value 0.06 -std_error 0.345 -kendall_tau 0.455 -spearman_rho 0.618 -n 11 -Regression metrics for dG for ccc_Tyk2 target -r2 0.794 -r2 CI 0.501 - 0.925 -MAE 0.445 -RMSE 0.571 -slope 0.796 -intercept -1.987 -p_value 0.0 -std_error 0.108 -kendall_tau 0.7 -spearman_rho 0.868 -n 16 -Regression metrics for dG for CDK2 target -r2 0.227 -r2 CI 0.001 - 0.618 -MAE 0.882 -RMSE 1.039 -slope 0.267 -intercept -6.671 -p_value 0.139 -std_error 0.132 -kendall_tau 0.283 -spearman_rho 0.415 -n 16 -Regression metrics for dG for JNK1 target -r2 0.715 -r2 CI 0.425 - 0.876 -MAE 1.055 -RMSE 1.143 -slope 1.775 -intercept 7.053 -p_value 0.0 -std_error 0.257 -kendall_tau 0.756 -spearman_rho 0.898 -n 21 -Regression metrics for dG for MCL1 target -r2 0.596 -r2 CI 0.374 - 0.759 -MAE 0.843 -RMSE 1.043 -slope 1.183 -intercept 1.474 -p_value 0.0 -std_error 0.154 -kendall_tau 0.602 -spearman_rho 0.779 -n 42 -Regression metrics for dG for p38 target -r2 0.426 -r2 CI 0.163 - 0.659 -MAE 0.859 -RMSE 0.967 -slope 0.824 -intercept -1.874 -p_value 0.0 -std_error 0.169 -kendall_tau 0.462 -spearman_rho 0.638 -n 34 -Regression metrics for dG for PTP1B target -r2 0.644 -r2 CI 0.34 - 0.833 -MAE 0.606 -RMSE 0.8 -slope 0.785 -intercept -1.932 -p_value 0.0 -std_error 0.127 -kendall_tau 0.695 -spearman_rho 0.824 -n 23 -Regression metrics for dG for Thrombin target -r2 0.499 -r2 CI 0.034 - 0.842 -MAE 0.417 -RMSE 0.538 -slope 1.034 -intercept 0.284 -p_value 0.06 -std_error 0.345 -kendall_tau 0.455 -spearman_rho 0.618 -n 11 -Regression metrics for dG for Tyk2 target -r2 0.794 -r2 CI 0.501 - 0.925 -MAE 0.446 -RMSE 0.571 -slope 0.796 -intercept -1.982 -p_value 0.0 -std_error 0.108 -kendall_tau 0.7 -spearman_rho 0.868 -n 16 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/FEP+/dGs/avg_path_ref_325.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/FEP+/dGs/avg_path_ref_325.txt deleted file mode 100755 index 35764867..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/FEP+/dGs/avg_path_ref_325.txt +++ /dev/null @@ -1,348 +0,0 @@ -Regression metrics for dG for BACE target -r2 0.61 -r2 CI 0.371 - 0.78 -MAE 0.666 -RMSE 0.85 -slope 1.327 -intercept 3.046 -p_value 0.0 -std_error 0.182 -kendall_tau 0.566 -spearman_rho 0.737 -n 36 -Regression metrics for dG for ccc_BACE target -r2 0.004 -r2 CI 0.074 - 0.147 -MAE 1.245 -RMSE 1.478 -slope 0.107 -intercept -8.334 -p_value 0.633 -std_error 0.294 -kendall_tau 0.056 -spearman_rho 0.076 -n 36 -Regression metrics for dG for ccc_CDK2 target -r2 0.224 -r2 CI 0.001 - 0.616 -MAE 0.882 -RMSE 1.042 -slope 0.265 -intercept -6.689 -p_value 0.139 -std_error 0.132 -kendall_tau 0.283 -spearman_rho 0.415 -n 16 -Regression metrics for dG for ccc_JNK1 target -r2 0.213 -r2 CI 0.001 - 0.555 -MAE 1.449 -RMSE 1.821 -slope 0.843 -intercept -0.226 -p_value 0.014 -std_error 0.371 -kendall_tau 0.388 -spearman_rho 0.497 -n 21 -Regression metrics for dG for ccc_MCL1 target -r2 0.014 -r2 CI 0.165 - 0.038 -MAE 2.343 -RMSE 2.777 -slope -0.186 -intercept -7.743 -p_value 0.116 -std_error 0.25 -kendall_tau -0.169 -spearman_rho -0.24 -n 42 -Regression metrics for dG for ccc_p38 target -r2 0.03 -r2 CI 0.234 - 0.03 -MAE 1.604 -RMSE 2.275 -slope -0.33 -intercept -14.18 -p_value 0.514 -std_error 0.33 -kendall_tau -0.079 -spearman_rho -0.103 -n 34 -Regression metrics for dG for ccc_PTP1B target -r2 0.644 -r2 CI 0.341 - 0.833 -MAE 0.603 -RMSE 0.798 -slope 0.782 -intercept -1.968 -p_value 0.0 -std_error 0.127 -kendall_tau 0.695 -spearman_rho 0.824 -n 23 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_BACE target -r2 0.065 -r2 CI 0.007 - 0.29 -MAE 1.289 -RMSE 1.591 -slope 0.501 -intercept -4.145 -p_value 0.19 -std_error 0.326 -kendall_tau 0.154 -spearman_rho 0.252 -n 36 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_CDK2 target -r2 0.674 -r2 CI 0.876 - 0.3 -MAE 2.58 -RMSE 2.895 -slope -1.116 -intercept -18.103 -p_value 0.001 -std_error 0.208 -kendall_tau -0.6 -spearman_rho -0.824 -n 16 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_JNK1 target -r2 0.359 -r2 CI 0.671 - 0.051 -MAE 1.984 -RMSE 2.317 -slope -1.219 -intercept -20.019 -p_value 0.003 -std_error 0.374 -kendall_tau -0.469 -spearman_rho -0.683 -n 21 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_Thrombin target -r2 0.351 -r2 CI 0.0 - 0.774 -MAE 1.752 -RMSE 2.013 -slope 1.973 -intercept 9.471 -p_value 0.218 -std_error 0.895 -kendall_tau 0.309 -spearman_rho 0.436 -n 11 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP3_Tyk2 target -r2 0.054 -r2 CI 0.088 - 0.427 -MAE 1.171 -RMSE 1.343 -slope 0.157 -intercept -8.196 -p_value 0.228 -std_error 0.175 -kendall_tau 0.233 -spearman_rho 0.382 -n 16 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP_BACE target -r2 0.313 -r2 CI 0.08 - 0.563 -MAE 3.559 -RMSE 4.194 -slope 2.186 -intercept 7.817 -p_value 0.003 -std_error 0.555 -kendall_tau 0.352 -spearman_rho 0.551 -n 36 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP_CDK2 target -r2 0.407 -r2 CI 0.742 - 0.043 -MAE 2.592 -RMSE 3.189 -slope -0.809 -intercept -14.398 -p_value 0.009 -std_error 0.261 -kendall_tau -0.483 -spearman_rho -0.615 -n 16 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP_JNK1 target -r2 0.258 -r2 CI 0.594 - 0.01 -MAE 2.808 -RMSE 3.01 -slope -0.758 -intercept -18.394 -p_value 0.075 -std_error 0.295 -kendall_tau -0.282 -spearman_rho -0.398 -n 21 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP_MCL1 target -r2 0.162 -r2 CI 0.013 - 0.396 -MAE 3.272 -RMSE 4.375 -slope 1.617 -intercept 3.054 -p_value 0.009 -std_error 0.582 -kendall_tau 0.28 -spearman_rho 0.429 -n 42 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP_p38 target -r2 0.004 -r2 CI 0.08 - 0.153 -MAE 3.134 -RMSE 3.566 -slope 0.11 -intercept -6.541 -p_value 0.812 -std_error 0.321 -kendall_tau 0.029 -spearman_rho 0.036 -n 34 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP_PTP1B target -r2 0.635 -r2 CI 0.828 - 0.328 -MAE 2.847 -RMSE 3.388 -slope -1.407 -intercept -21.63 -p_value 0.0 -std_error 0.233 -kendall_tau -0.647 -spearman_rho -0.825 -n 23 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP_Thrombin target -r2 0.313 -r2 CI 0.004 - 0.753 -MAE 1.206 -RMSE 1.568 -slope 1.935 -intercept 7.857 -p_value 0.542 -std_error 0.956 -kendall_tau 0.164 -spearman_rho 0.318 -n 11 -Regression metrics for dG for ccc_QligFEP_Tyk2 target -r2 0.069 -r2 CI 0.072 - 0.451 -MAE 1.012 -RMSE 1.247 -slope 0.115 -intercept -8.438 -p_value 0.392 -std_error 0.113 -kendall_tau 0.159 -spearman_rho 0.206 -n 16 -Regression metrics for dG for ccc_Thrombin target -r2 0.5 -r2 CI 0.035 - 0.842 -MAE 0.417 -RMSE 0.538 -slope 1.036 -intercept 0.297 -p_value 0.06 -std_error 0.345 -kendall_tau 0.455 -spearman_rho 0.618 -n 11 -Regression metrics for dG for ccc_Tyk2 target -r2 0.794 -r2 CI 0.501 - 0.925 -MAE 0.445 -RMSE 0.571 -slope 0.796 -intercept -1.987 -p_value 0.0 -std_error 0.108 -kendall_tau 0.7 -spearman_rho 0.868 -n 16 -Regression metrics for dG for CDK2 target -r2 0.227 -r2 CI 0.001 - 0.618 -MAE 0.882 -RMSE 1.039 -slope 0.267 -intercept -6.671 -p_value 0.139 -std_error 0.132 -kendall_tau 0.283 -spearman_rho 0.415 -n 16 -Regression metrics for dG for JNK1 target -r2 0.715 -r2 CI 0.425 - 0.876 -MAE 1.055 -RMSE 1.143 -slope 1.775 -intercept 7.053 -p_value 0.0 -std_error 0.257 -kendall_tau 0.756 -spearman_rho 0.898 -n 21 -Regression metrics for dG for MCL1 target -r2 0.596 -r2 CI 0.374 - 0.759 -MAE 0.843 -RMSE 1.043 -slope 1.183 -intercept 1.474 -p_value 0.0 -std_error 0.154 -kendall_tau 0.602 -spearman_rho 0.779 -n 42 -Regression metrics for dG for p38 target -r2 0.426 -r2 CI 0.163 - 0.659 -MAE 0.859 -RMSE 0.967 -slope 0.824 -intercept -1.874 -p_value 0.0 -std_error 0.169 -kendall_tau 0.462 -spearman_rho 0.638 -n 34 -Regression metrics for dG for PTP1B target -r2 0.644 -r2 CI 0.34 - 0.833 -MAE 0.606 -RMSE 0.8 -slope 0.785 -intercept -1.932 -p_value 0.0 -std_error 0.127 -kendall_tau 0.695 -spearman_rho 0.824 -n 23 -Regression metrics for dG for Thrombin target -r2 0.499 -r2 CI 0.034 - 0.842 -MAE 0.417 -RMSE 0.538 -slope 1.034 -intercept 0.284 -p_value 0.06 -std_error 0.345 -kendall_tau 0.455 -spearman_rho 0.618 -n 11 -Regression metrics for dG for Tyk2 target -r2 0.794 -r2 CI 0.501 - 0.925 -MAE 0.446 -RMSE 0.571 -slope 0.796 -intercept -1.982 -p_value 0.0 -std_error 0.108 -kendall_tau 0.7 -spearman_rho 0.868 -n 16 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/FEP+/dGs/reg_metrics.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/FEP+/dGs/reg_metrics.py deleted file mode 100755 index fd12060f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/FEP+/dGs/reg_metrics.py +++ /dev/null @@ -1,89 +0,0 @@ -import numpy as np -import glob -from scipy import stats -import matplotlib.pyplot as plt -from sklearn.metrics import mean_absolute_error -from sklearn.metrics import matthews_corrcoef - -ddG = [] -categorised = {} - -def rmse(predictions, targets): - return np.sqrt(((predictions - targets) ** 2).mean()) - -def pearsonr_ci(x,y,alpha=0.05): - ''' calculate Pearson correlation along with the confidence interval using scipy and numpy - Parameters - ---------- - x, y : iterable object such as a list or np.array - Input for correlation calculation - alpha : float - Significance level. 0.05 by default - Returns - ------- - r : float - Pearson's correlation coefficient - pval : float - The corresponding p value - lo, hi : float - The lower and upper bound of confidence intervals - ''' - - r, p = stats.pearsonr(x,y) - r_z = np.arctanh(r) - se = 1/np.sqrt(x.size-3) - z = stats.norm.ppf(1-alpha/2) - lo_z, hi_z = r_z-z*se, r_z+z*se - lo, hi = np.tanh((lo_z, hi_z)) - return r, p, lo, hi - -def read_csv(input_file): - exp = [] - calc = [] - with open(input_file, 'r', encoding='utf-8-sig') as infile: - for line in infile: - line = line.split(',') - if line[0] == 'Exp. dG': - continue - exp.append(float(line[0])) - calc.append(float(line[1])) - infile.close - return exp, calc - - -def analyse(experiment, calculated): - x = np.array([float(i) for i in experiment]) - y = np.array([float(i) for i in calculated]) - x2 = np.sign(x) - y2 = np.sign(y) - slope, intercept, r_value, p_value, std_err = stats.linregress(x,y) - MAE = mean_absolute_error(x, y) - RMSE = rmse(x,y) - #MCC = matthews_corrcoef(x2,y2) - tau, p_value = stats.kendalltau(x, y) - rho, pval = stats.spearmanr(x,y) - r, p, lo, hi = pearsonr_ci(x,y) - lo = lo**2 - hi = hi**2 - print("r2", round(r**2, 3)) - print("r2 CI", round(lo, 3), "-", round(hi, 3)) - print("MAE", round(MAE, 3)) - print("RMSE", round(RMSE, 3)) - #print("MCC", round(MCC, 3)) - print("slope", round(slope, 3)) - print("intercept", round(intercept, 3)) - print("p_value", round(p_value, 3)) - print("std_error", round(std_err, 3)) - print("kendall_tau", round(tau, 3)) - print("spearman_rho", round(rho, 3)) - print("n", len(x)) - -csvfiles = glob.glob('*.csv') -for csv in csvfiles: - name = csv[:-4] - print('Regression metrics for dG for {} target'.format(name)) - exp, calc = read_csv(csv) - analyse(exp, calc) - -#print(csvfiles) - diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/1st_half/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/1st_half/protein.txt deleted file mode 100755 index bba21a12..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/1st_half/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,316 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_CAT-13d-CAT-13b -3.88 0.49 -FEP_CAT-13o-CAT-13e 5.29 0.33 -FEP_CAT-13f-CAT-13e -2.14 0.30 -FEP_CAT-4a-CAT-13d -11.24 0.46 -FEP_CAT-4m-CAT-13d 19.71 0.59 -FEP_CAT-13g-CAT-13c -0.37 0.86 -FEP_CAT-13i-CAT-13b -1.76 0.49 -FEP_CAT-13h-CAT-13a -21.14 0.80 -FEP_CAT-13m-CAT-13a 94.53 0.93 -FEP_CAT-13j-CAT-13e 29.12 0.69 -FEP_CAT-13h-CAT-13c -8.31 1.26 -FEP_CAT-17g-CAT-13f 17.71 0.29 -FEP_CAT-4o-CAT-13e 7.30 0.56 -FEP_CAT-4i-CAT-13f 29.47 0.72 -FEP_CAT-24-CAT-13a 16.52 0.55 -FEP_CAT-4p-CAT-13a -2.09 0.94 -FEP_CAT-13g-CAT-13b -9.51 0.83 -FEP_CAT-4k-CAT-13c 35.43 0.49 -FEP_CAT-4i-CAT-13a 14.98 1.04 -FEP_CAT-4i-CAT-13b 24.32 0.45 -FEP_CAT-17f-CAT-13e 26.59 0.58 -FEP_CAT-4b-CAT-13c -4.17 0.81 -FEP_CAT-17i-CAT-13a 16.24 0.46 -FEP_CAT-17f-CAT-13a 14.56 0.18 -FEP_CAT-13e-CAT-13d -0.17 0.61 -FEP_CAT-17c-CAT-13f 0.28 0.71 -FEP_CAT-4l-CAT-13a -46.76 0.76 -FEP_CAT-4j-CAT-13f 20.47 0.64 -FEP_CAT-4c-CAT-13c -8.05 0.82 -FEP_CAT-17b-CAT-13c 1.52 1.01 -FEP_CAT-24-CAT-13d 26.31 0.38 -FEP_CAT-17e-CAT-13b 12.61 0.40 -FEP_CAT-13g-CAT-13e -4.80 0.47 -FEP_CAT-13o-CAT-13b 1.52 0.66 -FEP_CAT-13e-CAT-13b -4.13 0.68 -FEP_CAT-13i-CAT-13c 7.19 0.54 -FEP_CAT-4c-CAT-13b -14.89 1.08 -FEP_CAT-17i-CAT-13f 29.11 0.52 -FEP_CAT-17a-CAT-13c 7.95 0.53 -FEP_CAT-4b-CAT-13d -8.67 0.69 -FEP_CAT-13f-CAT-13b -4.19 0.64 -FEP_CAT-4b-CAT-13e -8.65 0.67 -FEP_CAT-17d-CAT-13a 14.96 0.35 -FEP_CAT-4m-CAT-13b 16.26 0.52 -FEP_CAT-13j-CAT-13d 29.79 0.51 -FEP_CAT-17e-CAT-13c 19.59 1.17 -FEP_CAT-4o-CAT-13b 5.89 0.25 -FEP_CAT-13k-CAT-13a 22.10 0.80 -FEP_CAT-13n-CAT-13f 100.69 0.60 -FEP_CAT-4c-CAT-13e -11.82 0.98 -FEP_CAT-13i-CAT-13f 2.78 0.34 -FEP_CAT-4a-CAT-13c -5.64 0.59 -FEP_CAT-17g-CAT-13e 16.28 0.49 -FEP_CAT-13o-CAT-13a -7.47 0.73 -FEP_CAT-4n-CAT-13d 17.90 0.81 -FEP_CAT-17d-CAT-13b 23.76 0.27 -FEP_CAT-4d-CAT-13a -24.46 0.01 -FEP_CAT-17b-CAT-13e -2.34 0.63 -FEP_CAT-4b-CAT-13a -21.13 0.71 -FEP_CAT-13b-CAT-13a -8.82 0.44 -FEP_CAT-13h-CAT-13b -17.80 1.22 -FEP_CAT-13h-CAT-13f -8.12 0.67 -FEP_CAT-17e-CAT-13f 16.71 0.70 -FEP_CAT-4n-CAT-13e 19.16 0.48 -FEP_CAT-13h-CAT-13e -11.28 1.22 -FEP_CAT-4c-CAT-13f -11.28 1.47 -FEP_CAT-4l-CAT-13d -34.91 0.47 -FEP_CAT-13k-CAT-13b 31.64 0.81 -FEP_CAT-13d-CAT-13c 5.16 0.70 -FEP_CAT-4p-CAT-13c 17.22 0.37 -FEP_CAT-13n-CAT-13c 103.74 0.56 -FEP_CAT-17g-CAT-13d 15.96 0.25 -FEP_CAT-4o-CAT-13d 6.78 0.67 -FEP_CAT-17c-CAT-13a -13.50 0.32 -FEP_CAT-4d-CAT-13e -10.46 0.77 -FEP_CAT-24-CAT-13c 32.07 0.78 -FEP_CAT-4m-CAT-13e 19.55 0.53 -FEP_CAT-17f-CAT-13d 25.95 0.41 -FEP_CAT-17b-CAT-13d -1.92 0.44 -FEP_CAT-4a-CAT-13f -10.55 0.49 -FEP_CAT-17h-CAT-13a 6.95 0.34 -FEP_CAT-13d-CAT-13a -11.11 0.46 -FEP_CAT-4o-CAT-13c 13.12 0.76 -FEP_CAT-13m-CAT-13b 105.25 0.40 -FEP_CAT-17h-CAT-13c 25.61 0.44 -FEP_CAT-4j-CAT-13e 19.72 0.32 -FEP_CAT-4j-CAT-13b 16.33 0.47 -FEP_CAT-17d-CAT-13e 27.21 0.33 -FEP_CAT-4d-CAT-13f -7.85 0.77 -FEP_CAT-4a-CAT-13e -12.16 0.62 -FEP_CAT-4l-CAT-13c -27.97 0.64 -FEP_CAT-4k-CAT-13a 17.62 0.95 -FEP_CAT-4p-CAT-13d 9.86 0.53 -FEP_CAT-13k-CAT-13d 35.23 1.01 -FEP_CAT-17c-CAT-13c 4.16 0.50 -FEP_CAT-17h-CAT-13d 18.44 0.21 -FEP_CAT-17h-CAT-13f 20.71 0.42 -FEP_CAT-13n-CAT-13b 94.63 0.40 -FEP_CAT-4i-CAT-13e 27.61 0.48 -FEP_CAT-4a-CAT-13b -15.51 1.01 -FEP_CAT-17a-CAT-13f 7.48 0.69 -FEP_CAT-13f-CAT-13c 4.95 0.53 -FEP_CAT-4j-CAT-13c 23.98 0.73 -FEP_CAT-17g-CAT-13c 21.71 0.50 -FEP_CAT-17a-CAT-13e 5.35 0.71 -FEP_CAT-13g-CAT-13f -3.61 0.30 -FEP_CAT-4m-CAT-13a 7.54 0.68 -FEP_CAT-4k-CAT-13e 29.15 0.46 -FEP_CAT-4l-CAT-13b -37.57 0.78 -FEP_CAT-4j-CAT-13d 18.52 0.37 -FEP_CAT-17i-CAT-13c 31.94 0.64 -FEP_CAT-17i-CAT-13e 27.32 0.56 -FEP_CAT-17h-CAT-13e 18.72 0.49 -FEP_CAT-4c-CAT-13a -24.85 0.96 -FEP_CAT-17i-CAT-13b 23.97 0.39 -FEP_CAT-13g-CAT-13d -4.65 0.93 -FEP_CAT-4m-CAT-13c 26.19 0.55 -FEP_CAT-4i-CAT-13c 32.58 0.57 -FEP_CAT-4k-CAT-13b 25.73 0.62 -FEP_CAT-17e-CAT-13e 16.03 0.56 -FEP_CAT-13m-CAT-13d 106.20 0.74 -FEP_CAT-13k-CAT-13f 35.57 nan -FEP_CAT-13k-CAT-13e 33.87 0.50 -FEP_CAT-13o-CAT-13d 3.17 0.61 -FEP_CAT-13m-CAT-13e 106.82 0.61 -FEP_CAT-17c-CAT-13e -2.84 0.43 -FEP_CAT-4i-CAT-13d 26.67 0.58 -FEP_CAT-17f-CAT-13b 23.63 0.24 -FEP_CAT-4d-CAT-13b -12.82 0.96 -FEP_CAT-13i-CAT-13a -11.10 1.07 -FEP_CAT-17b-CAT-13f 0.49 0.69 -FEP_CAT-13e-CAT-13c 6.94 0.37 -FEP_CAT-13m-CAT-13f 107.97 0.63 -FEP_CAT-17g-CAT-13a 2.55 0.57 -FEP_CAT-4p-CAT-13e 9.67 0.73 -FEP_CAT-4n-CAT-13c 24.61 0.39 -FEP_CAT-4j-CAT-13a nan nan -FEP_CAT-13j-CAT-13a 18.26 0.99 -FEP_CAT-17g-CAT-13b 13.16 0.31 -FEP_CAT-4n-CAT-13a 7.46 0.26 -FEP_CAT-4b-CAT-13f -8.19 0.62 -FEP_CAT-4d-CAT-13c -5.57 1.06 -FEP_CAT-17i-CAT-13d 26.81 0.41 -FEP_CAT-17h-CAT-13b 16.68 0.18 -FEP_CAT-13o-CAT-13c 10.46 0.41 -FEP_CAT-4n-CAT-13b 14.70 0.63 -FEP_CAT-13j-CAT-13b 26.47 1.33 -FEP_CAT-13f-CAT-13d -2.32 0.77 -FEP_CAT-4c-CAT-13d -13.12 0.53 -FEP_CAT-17d-CAT-13d 27.10 0.44 -FEP_CAT-17c-CAT-13b -5.20 0.58 -FEP_CAT-17a-CAT-13b 2.09 0.40 -FEP_CAT-4b-CAT-13b -11.23 0.43 -FEP_CAT-13k-CAT-13c 41.40 0.60 -FEP_CAT-13h-CAT-13d -9.74 0.48 -FEP_CAT-17e-CAT-13d 14.82 0.64 -FEP_CAT-24-CAT-13f 28.66 1.01 -FEP_CAT-13f-CAT-13a -13.78 1.03 -FEP_CAT-13g-CAT-13a -16.70 0.86 -FEP_CAT-4o-CAT-13a -3.77 1.16 -FEP_CAT-17f-CAT-13f 28.84 0.64 -FEP_CAT-13n-CAT-13e 96.21 0.57 -FEP_CAT-13e-CAT-13a -10.96 0.78 -FEP_CAT-13o-CAT-13f 4.54 0.44 -FEP_CAT-4l-CAT-13e -34.28 0.58 -FEP_CAT-13i-CAT-13d 1.58 0.51 -FEP_CAT-4a-CAT-13a -23.13 0.45 -FEP_CAT-13c-CAT-13b -8.52 0.29 -FEP_CAT-24-CAT-13b 23.74 0.72 -FEP_CAT-17d-CAT-13c 33.82 0.58 -FEP_CAT-17f-CAT-13c 32.89 0.42 -FEP_CAT-17e-CAT-13a 5.68 0.57 -FEP_CAT-24-CAT-13e 26.23 0.57 -FEP_CAT-13n-CAT-13a 84.94 0.57 -FEP_CAT-17c-CAT-13d -0.66 0.32 -FEP_CAT-17b-CAT-13b -5.01 0.51 -FEP_CAT-13j-CAT-13c 36.31 1.16 -FEP_CAT-13n-CAT-13d 98.05 0.63 -FEP_CAT-13i-CAT-13e 1.98 0.32 -FEP_CAT-4k-CAT-13d 27.36 0.78 -FEP_CAT-4d-CAT-13d -6.40 1.63 -FEP_CAT-13c-CAT-13a -17.25 0.63 -FEP_CAT-17a-CAT-13d 4.39 0.19 -FEP_CAT-17d-CAT-13f 29.01 0.60 -FEP_CAT-13m-CAT-13c 113.70 0.49 -FEP_CAT-4p-CAT-13b 8.46 1.22 -FEP_CAT-17a-CAT-13a -5.57 0.46 -FEP_CAT-13j-CAT-13f 32.02 0.66 -FEP_CAT-17b-CAT-13a -12.97 0.73 -FEP_CAT-17e-CAT-13i 13.96 0.72 -FEP_CAT-17e-CAT-13g 21.51 0.89 -FEP_CAT-4n-CAT-13f 18.94 0.49 -FEP_CAT-13o-CAT-13j -26.50 0.15 -FEP_CAT-4n-CAT-13g 23.85 0.51 -FEP_CAT-4j-CAT-13g 24.58 0.73 -FEP_CAT-24-CAT-13i 24.05 0.47 -FEP_CAT-17g-CAT-13h 28.28 0.94 -FEP_CAT-17g-CAT-13j -13.56 0.34 -FEP_CAT-13o-CAT-13k -31.26 0.36 -FEP_CAT-4k-CAT-13h 39.23 1.51 -FEP_CAT-4k-CAT-13i 28.52 0.41 -FEP_CAT-4p-CAT-13i 10.24 0.58 -FEP_CAT-17h-CAT-13i 18.72 0.76 -FEP_CAT-4p-CAT-13f 13.60 0.73 -FEP_CAT-17g-CAT-13k -19.66 0.41 -FEP_CAT-13h-CAT-13g -5.67 1.09 -FEP_CAT-4c-CAT-13g -7.39 0.85 -FEP_CAT-17f-CAT-13i 25.92 0.20 -FEP_CAT-4a-CAT-13j -41.67 0.33 -FEP_CAT-4j-CAT-13j -11.55 0.31 -FEP_CAT-17b-CAT-13j -32.16 0.58 -FEP_CAT-17a-CAT-13i 3.64 0.37 -FEP_CAT-4m-CAT-13i 19.18 0.54 -FEP_CAT-17i-CAT-13g 33.13 1.08 -FEP_CAT-4c-CAT-13h -3.69 0.91 -FEP_CAT-13n-CAT-13k 62.13 0.27 -FEP_CAT-17b-CAT-13h 6.85 0.50 -FEP_CAT-17f-CAT-13g 33.07 1.09 -FEP_CAT-17b-CAT-13i -3.21 0.43 -FEP_CAT-17e-CAT-13k -18.86 0.90 -FEP_CAT-4o-CAT-13i 7.51 0.39 -FEP_CAT-4a-CAT-13g -6.72 0.61 -FEP_CAT-13j-CAT-13g 35.85 0.46 -FEP_CAT-17a-CAT-13h 13.42 0.27 -FEP_CAT-13m-CAT-13i 106.15 0.18 -FEP_CAT-17f-CAT-13h 40.01 0.97 -FEP_CAT-13n-CAT-13i 96.66 0.35 -FEP_CAT-17f-CAT-13j -2.94 0.43 -FEP_CAT-4d-CAT-13g -4.76 0.80 -FEP_CAT-4d-CAT-13j -39.64 0.46 -FEP_CAT-17g-CAT-13i 14.66 0.35 -FEP_CAT-4p-CAT-13j -19.29 0.28 -FEP_CAT-4k-CAT-13j -1.14 0.24 -FEP_CAT-4i-CAT-13i 26.01 0.36 -FEP_CAT-4l-CAT-13f -33.85 0.83 -FEP_CAT-4d-CAT-13i -11.66 0.98 -FEP_CAT-13k-CAT-13g 40.00 0.36 -FEP_CAT-4c-CAT-13i -11.83 1.15 -FEP_CAT-4b-CAT-13j -39.13 0.38 -FEP_CAT-17i-CAT-13i 26.39 0.43 -FEP_CAT-4p-CAT-13h 18.94 0.85 -FEP_CAT-4m-CAT-13j -9.79 0.25 -FEP_CAT-13k-CAT-13j 5.45 0.38 -FEP_CAT-4l-CAT-13h -23.67 1.13 -FEP_CAT-13m-CAT-13k 72.77 0.24 -FEP_CAT-17f-CAT-13k -8.78 0.46 -FEP_CAT-17h-CAT-13h 32.18 0.91 -FEP_CAT-17d-CAT-13j -2.82 0.43 -FEP_CAT-24-CAT-13j -2.77 0.68 -FEP_CAT-17e-CAT-13h 24.20 0.35 -FEP_CAT-4j-CAT-13i 18.65 0.39 -FEP_CAT-24-CAT-13g 31.26 0.55 -FEP_CAT-17h-CAT-13g 24.33 0.31 -FEP_CAT-4n-CAT-13h 29.66 1.21 -FEP_CAT-4o-CAT-13h 16.64 1.09 -FEP_CAT-13k-CAT-13h 45.69 1.11 -FEP_CAT-4o-CAT-13f 10.22 0.53 -FEP_CAT-13n-CAT-13g 102.98 0.67 -FEP_CAT-13m-CAT-13g 111.63 0.46 -FEP_CAT-4m-CAT-13f 21.20 0.69 -FEP_CAT-4n-CAT-13i 17.79 0.34 -FEP_CAT-13i-CAT-13g 5.67 0.78 -FEP_CAT-17g-CAT-13g 21.39 0.89 -FEP_CAT-4l-CAT-13j -64.70 0.33 -FEP_CAT-4j-CAT-13h 28.86 1.03 -FEP_CAT-13o-CAT-13g 10.26 0.49 -FEP_CAT-17d-CAT-13h 38.35 0.90 -FEP_CAT-13n-CAT-13j 67.94 0.34 -FEP_CAT-4c-CAT-13j -44.42 0.87 -FEP_CAT-13o-CAT-13i 3.57 0.31 -FEP_CAT-17c-CAT-13i -2.93 0.40 -FEP_CAT-13m-CAT-13h 116.16 0.55 -FEP_CAT-17d-CAT-13i 25.62 0.39 -FEP_CAT-24-CAT-13h 35.68 0.55 -FEP_CAT-17c-CAT-13h 9.12 1.34 -FEP_CAT-4m-CAT-13g 24.08 0.49 -FEP_CAT-17d-CAT-13k -8.02 0.68 -FEP_CAT-17d-CAT-13g 33.93 0.63 -FEP_CAT-4o-CAT-13j -22.65 0.30 -FEP_CAT-17h-CAT-13j -11.98 0.51 -FEP_CAT-13k-CAT-13i 35.18 0.32 -FEP_CAT-17i-CAT-13h 35.69 0.64 -FEP_CAT-17c-CAT-13j -31.46 0.42 -FEP_CAT-4k-CAT-13g 34.36 1.15 -FEP_CAT-13i-CAT-13h 14.04 1.50 -FEP_CAT-4l-CAT-13g -27.85 0.94 -FEP_CAT-4i-CAT-13j -2.75 0.29 -FEP_CAT-4p-CAT-13g 15.76 0.64 -FEP_CAT-17a-CAT-13g 10.06 0.66 -FEP_CAT-13j-CAT-13h 39.24 1.13 -FEP_CAT-17b-CAT-13k -37.57 0.71 -FEP_CAT-13o-CAT-13h 16.18 1.15 -FEP_CAT-4b-CAT-13i -10.18 0.34 -FEP_CAT-17a-CAT-13j -24.20 0.52 -FEP_CAT-17a-CAT-13k -31.42 0.60 -FEP_CAT-4k-CAT-13f 29.63 0.69 -FEP_CAT-13j-CAT-13i 28.23 0.37 -FEP_CAT-4i-CAT-13g 31.94 0.45 -FEP_CAT-13m-CAT-13j 77.57 0.41 -FEP_CAT-4b-CAT-13g -3.46 0.66 -FEP_CAT-4d-CAT-13h 5.45 0.62 -FEP_CAT-4a-CAT-13h -0.78 1.45 -FEP_CAT-13n-CAT-13h 109.05 1.06 -FEP_CAT-4m-CAT-13h 33.41 1.28 -FEP_CAT-4a-CAT-13i -12.28 0.54 -FEP_CAT-4i-CAT-13h 36.00 0.98 -FEP_CAT-17e-CAT-13j -14.58 0.62 -FEP_CAT-17b-CAT-13g 3.52 0.57 -FEP_CAT-4b-CAT-13h 2.28 1.64 -FEP_CAT-4n-CAT-13j -11.20 0.29 -FEP_CAT-17c-CAT-13g 4.89 0.89 -FEP_CAT-17c-CAT-13k -36.70 0.36 -FEP_CAT-4o-CAT-13g 12.06 0.59 -FEP_CAT-17i-CAT-13j -3.39 0.79 -FEP_CAT-4l-CAT-13i -34.71 0.33 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/1st_half/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/1st_half/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 3240b302..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/1st_half/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,316 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_CAT-13b-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-13g-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13d/ 1 -FEP_CAT-13g-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13a/ 3 -FEP_CAT-4a-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13a/ 2 -FEP_CAT-4b-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13c/ 1 -FEP_CAT-4b-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13a/ 2 -FEP_CAT-4c-CAT-13b/ 1 -FEP_CAT-4c-CAT-13c/ 2 -FEP_CAT-4c-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13e/ 1 -FEP_CAT-4c-CAT-13f/ 1 -FEP_CAT-4d-CAT-13a/ 3 -FEP_CAT-4d-CAT-13b/ 6 -FEP_CAT-4d-CAT-13c/ 4 -FEP_CAT-4d-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13f/ 1 -FEP_CAT-4i-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13a/ 2 -FEP_CAT-4j-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4k-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4l-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13a/ 2 -FEP_CAT-4m-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4n-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13j/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/1st_half/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/1st_half/water.txt deleted file mode 100755 index 97c716dc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/1st_half/water.txt +++ /dev/null @@ -1,316 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_CAT-13d-CAT-13b -3.76 0.31 -FEP_CAT-4a-CAT-13d -11.01 0.09 -FEP_CAT-13g-CAT-13c -0.81 0.98 -FEP_CAT-13i-CAT-13b -2.39 0.58 -FEP_CAT-13h-CAT-13a -20.47 0.80 -FEP_CAT-13m-CAT-13a 93.22 0.92 -FEP_CAT-13h-CAT-13c -3.74 0.55 -FEP_CAT-24-CAT-13a 12.05 1.66 -FEP_CAT-4p-CAT-13a -6.45 1.10 -FEP_CAT-13g-CAT-13b -8.65 0.42 -FEP_CAT-4k-CAT-13c 35.44 0.29 -FEP_CAT-4i-CAT-13a 15.63 1.27 -FEP_CAT-4i-CAT-13b 23.24 0.82 -FEP_CAT-4b-CAT-13c -7.88 0.12 -FEP_CAT-17i-CAT-13a 15.19 0.67 -FEP_CAT-17f-CAT-13a 15.25 0.19 -FEP_CAT-13e-CAT-13d 0.06 0.00 -FEP_CAT-4l-CAT-13a -46.07 0.72 -FEP_CAT-4c-CAT-13c -5.19 0.42 -FEP_CAT-17b-CAT-13c 1.56 0.21 -FEP_CAT-24-CAT-13d 23.36 1.07 -FEP_CAT-17e-CAT-13b 10.83 0.01 -FEP_CAT-13o-CAT-13b 0.66 0.67 -FEP_CAT-13e-CAT-13b -5.06 0.56 -FEP_CAT-13i-CAT-13c 5.44 0.23 -FEP_CAT-4c-CAT-13b -18.42 nan -FEP_CAT-17a-CAT-13c 8.46 0.14 -FEP_CAT-4b-CAT-13d -12.18 0.29 -FEP_CAT-13f-CAT-13b -4.45 0.56 -FEP_CAT-17d-CAT-13a 15.85 0.49 -FEP_CAT-4m-CAT-13b 14.43 0.34 -FEP_CAT-13j-CAT-13d 30.03 0.22 -FEP_CAT-17e-CAT-13c 18.54 0.19 -FEP_CAT-4o-CAT-13b 3.48 0.34 -FEP_CAT-13k-CAT-13a 20.25 0.98 -FEP_CAT-4a-CAT-13c -7.62 0.44 -FEP_CAT-13o-CAT-13a -7.11 0.72 -FEP_CAT-17d-CAT-13b 24.56 0.06 -FEP_CAT-4d-CAT-13a -21.47 nan -FEP_CAT-4b-CAT-13a -22.22 nan -FEP_CAT-13b-CAT-13a -7.97 0.61 -FEP_CAT-13h-CAT-13b -11.47 0.14 -FEP_CAT-13k-CAT-13b 31.23 0.45 -FEP_CAT-13d-CAT-13c 3.68 0.20 -FEP_CAT-4p-CAT-13c 12.32 0.41 -FEP_CAT-13n-CAT-13c 101.40 0.58 -FEP_CAT-17g-CAT-13d 17.53 0.14 -FEP_CAT-17c-CAT-13a -13.81 0.50 -FEP_CAT-24-CAT-13c 29.57 0.25 -FEP_CAT-17f-CAT-13d 27.22 0.15 -FEP_CAT-17b-CAT-13d -2.54 0.18 -FEP_CAT-17h-CAT-13a 6.33 0.17 -FEP_CAT-13d-CAT-13a -12.62 0.18 -FEP_CAT-4o-CAT-13c 11.89 0.60 -FEP_CAT-13m-CAT-13b 100.10 0.55 -FEP_CAT-17h-CAT-13c 22.52 0.10 -FEP_CAT-4j-CAT-13b 16.39 0.47 -FEP_CAT-4l-CAT-13c -29.61 0.28 -FEP_CAT-4k-CAT-13a 14.42 1.22 -FEP_CAT-13k-CAT-13d 35.55 0.24 -FEP_CAT-17c-CAT-13c 2.04 0.26 -FEP_CAT-17h-CAT-13d 19.01 0.13 -FEP_CAT-13n-CAT-13b 95.33 0.87 -FEP_CAT-4a-CAT-13b -14.94 0.69 -FEP_CAT-13f-CAT-13c 2.28 0.21 -FEP_CAT-4j-CAT-13c 23.60 0.28 -FEP_CAT-17g-CAT-13c 21.25 0.16 -FEP_CAT-4m-CAT-13a 3.24 2.94 -FEP_CAT-4l-CAT-13b -38.07 0.33 -FEP_CAT-17i-CAT-13c 31.34 0.13 -FEP_CAT-4c-CAT-13a -25.80 1.48 -FEP_CAT-17i-CAT-13b 22.98 0.08 -FEP_CAT-13g-CAT-13d -4.32 0.35 -FEP_CAT-4m-CAT-13c 21.80 0.66 -FEP_CAT-4i-CAT-13c 31.88 0.25 -FEP_CAT-4k-CAT-13b 27.30 0.26 -FEP_CAT-13m-CAT-13d 105.85 0.20 -FEP_CAT-13o-CAT-13d 5.69 0.20 -FEP_CAT-17f-CAT-13b 23.48 0.93 -FEP_CAT-4d-CAT-13b -16.45 3.78 -FEP_CAT-13i-CAT-13a -9.96 0.75 -FEP_CAT-13e-CAT-13c 3.81 0.32 -FEP_CAT-17g-CAT-13a 4.24 0.24 -FEP_CAT-4n-CAT-13c 21.56 0.48 -FEP_CAT-4j-CAT-13a 5.64 nan -FEP_CAT-13j-CAT-13a 16.11 1.30 -FEP_CAT-17g-CAT-13b 13.22 0.26 -FEP_CAT-4n-CAT-13a 6.07 0.37 -FEP_CAT-4d-CAT-13c -8.66 0.52 -FEP_CAT-17i-CAT-13d 27.79 0.09 -FEP_CAT-17h-CAT-13b 14.22 0.04 -FEP_CAT-13o-CAT-13c 9.54 0.24 -FEP_CAT-4n-CAT-13b 12.44 0.51 -FEP_CAT-13j-CAT-13b 24.48 0.92 -FEP_CAT-13f-CAT-13d -0.94 0.20 -FEP_CAT-4c-CAT-13d -11.18 0.54 -FEP_CAT-17d-CAT-13d 28.51 0.13 -FEP_CAT-17c-CAT-13b -5.42 0.14 -FEP_CAT-17a-CAT-13b -0.45 1.28 -FEP_CAT-4b-CAT-13b -16.46 2.18 -FEP_CAT-13k-CAT-13c 39.15 0.31 -FEP_CAT-13h-CAT-13d -7.21 0.22 -FEP_CAT-17e-CAT-13d 14.36 0.12 -FEP_CAT-13f-CAT-13a -15.41 2.97 -FEP_CAT-13g-CAT-13a -18.14 0.55 -FEP_CAT-4o-CAT-13a -4.56 1.56 -FEP_CAT-13e-CAT-13a -15.04 0.63 -FEP_CAT-13i-CAT-13d 1.77 0.14 -FEP_CAT-4a-CAT-13a -23.89 0.10 -FEP_CAT-13c-CAT-13b -8.05 0.99 -FEP_CAT-24-CAT-13b 20.26 0.11 -FEP_CAT-17d-CAT-13c 32.41 0.11 -FEP_CAT-17f-CAT-13c 31.15 0.13 -FEP_CAT-17e-CAT-13a 2.03 0.63 -FEP_CAT-13n-CAT-13a 86.28 0.07 -FEP_CAT-17c-CAT-13d -1.49 0.12 -FEP_CAT-17b-CAT-13b -7.56 0.57 -FEP_CAT-13j-CAT-13c 34.14 0.17 -FEP_CAT-13n-CAT-13d 98.59 0.23 -FEP_CAT-4d-CAT-13d -12.45 0.69 -FEP_CAT-13c-CAT-13a -16.70 0.10 -FEP_CAT-17a-CAT-13d 4.49 0.09 -FEP_CAT-13m-CAT-13c 109.28 0.36 -FEP_CAT-4p-CAT-13b 4.27 0.41 -FEP_CAT-17a-CAT-13a -8.10 0.22 -FEP_CAT-17b-CAT-13a -15.16 0.24 -FEP_CAT-17c-CAT-13f -0.80 0.20 -FEP_CAT-17e-CAT-13i 12.29 0.15 -FEP_CAT-17e-CAT-13g 19.59 0.88 -FEP_CAT-4l-CAT-13d -33.08 0.29 -FEP_CAT-17i-CAT-13e 28.28 0.52 -FEP_CAT-13k-CAT-13f 36.14 0.27 -FEP_CAT-4n-CAT-13f 19.27 0.23 -FEP_CAT-24-CAT-13f 25.66 0.70 -FEP_CAT-4a-CAT-13f -10.41 0.48 -FEP_CAT-13o-CAT-13j -24.48 0.16 -FEP_CAT-4n-CAT-13g 21.81 0.32 -FEP_CAT-4j-CAT-13g 23.23 0.48 -FEP_CAT-24-CAT-13i 22.56 0.69 -FEP_CAT-4i-CAT-13f 28.79 0.15 -FEP_CAT-17g-CAT-13h 24.48 0.30 -FEP_CAT-17g-CAT-13j -12.58 0.22 -FEP_CAT-13o-CAT-13k -29.77 0.16 -FEP_CAT-4k-CAT-13h 38.87 0.42 -FEP_CAT-4k-CAT-13i 29.68 0.13 -FEP_CAT-13i-CAT-13e 3.18 0.37 -FEP_CAT-13j-CAT-13f 30.97 0.36 -FEP_CAT-17g-CAT-13f 18.53 0.43 -FEP_CAT-4p-CAT-13i 7.17 0.31 -FEP_CAT-17h-CAT-13i 17.19 0.26 -FEP_CAT-13m-CAT-13f 106.53 0.29 -FEP_CAT-4p-CAT-13f 10.66 0.16 -FEP_CAT-17g-CAT-13k -17.70 0.51 -FEP_CAT-13h-CAT-13g -3.99 0.24 -FEP_CAT-24-CAT-13e 25.92 0.57 -FEP_CAT-4c-CAT-13g -6.35 0.47 -FEP_CAT-4i-CAT-13e 28.19 0.36 -FEP_CAT-17f-CAT-13i 25.91 0.32 -FEP_CAT-4a-CAT-13j -41.51 0.21 -FEP_CAT-4j-CAT-13j -10.51 0.27 -FEP_CAT-4m-CAT-13d 18.44 0.25 -FEP_CAT-17b-CAT-13j -32.70 0.22 -FEP_CAT-13g-CAT-13f -2.75 0.12 -FEP_CAT-13g-CAT-13e -4.20 0.24 -FEP_CAT-17a-CAT-13i 2.80 0.15 -FEP_CAT-4m-CAT-13i 16.68 0.24 -FEP_CAT-17i-CAT-13g 31.21 0.31 -FEP_CAT-4c-CAT-13h -2.48 0.65 -FEP_CAT-4c-CAT-13e -8.96 0.55 -FEP_CAT-13n-CAT-13k 63.31 0.24 -FEP_CAT-13m-CAT-13e 106.97 0.22 -FEP_CAT-17b-CAT-13h 5.28 0.14 -FEP_CAT-17f-CAT-13g 31.47 0.46 -FEP_CAT-17b-CAT-13i -4.44 0.20 -FEP_CAT-17e-CAT-13k -20.83 0.17 -FEP_CAT-4o-CAT-13i 6.43 0.26 -FEP_CAT-17b-CAT-13f -1.69 0.25 -FEP_CAT-4a-CAT-13g -7.55 0.18 -FEP_CAT-13j-CAT-13g 32.78 0.08 -FEP_CAT-17e-CAT-13e 15.53 0.41 -FEP_CAT-17a-CAT-13h 12.04 0.20 -FEP_CAT-13m-CAT-13i 103.64 0.16 -FEP_CAT-17f-CAT-13h 34.63 0.24 -FEP_CAT-13n-CAT-13i 96.25 0.35 -FEP_CAT-17f-CAT-13j -2.84 0.21 -FEP_CAT-4d-CAT-13g -7.93 0.33 -FEP_CAT-4d-CAT-13j -40.48 0.39 -FEP_CAT-17g-CAT-13i 15.61 0.16 -FEP_CAT-17h-CAT-13e 19.51 0.31 -FEP_CAT-4p-CAT-13e 10.71 0.33 -FEP_CAT-4p-CAT-13j -20.29 0.27 -FEP_CAT-4k-CAT-13j 1.82 0.29 -FEP_CAT-4i-CAT-13i 25.49 0.26 -FEP_CAT-4l-CAT-13f -32.00 0.35 -FEP_CAT-4d-CAT-13i -13.72 0.53 -FEP_CAT-4b-CAT-13e -11.05 0.74 -FEP_CAT-13k-CAT-13g 39.42 0.21 -FEP_CAT-4c-CAT-13i -12.83 0.61 -FEP_CAT-4b-CAT-13j -41.35 0.26 -FEP_CAT-17i-CAT-13i 25.94 0.18 -FEP_CAT-4p-CAT-13h 17.07 0.20 -FEP_CAT-13o-CAT-13e 7.29 0.37 -FEP_CAT-4m-CAT-13j -11.40 0.22 -FEP_CAT-4o-CAT-13d 7.85 0.21 -FEP_CAT-13k-CAT-13j 5.33 0.19 -FEP_CAT-17c-CAT-13e -1.30 0.25 -FEP_CAT-4l-CAT-13h -26.02 0.33 -FEP_CAT-4i-CAT-13d 27.56 0.09 -FEP_CAT-17e-CAT-13f 15.93 0.36 -FEP_CAT-13h-CAT-13e -7.15 0.43 -FEP_CAT-13m-CAT-13k 71.11 0.22 -FEP_CAT-17f-CAT-13k -7.49 0.36 -FEP_CAT-17h-CAT-13h 25.92 0.14 -FEP_CAT-17a-CAT-13f 5.98 0.24 -FEP_CAT-17d-CAT-13j -1.57 0.28 -FEP_CAT-13h-CAT-13f -6.44 0.19 -FEP_CAT-24-CAT-13j -5.12 0.19 -FEP_CAT-17e-CAT-13h 22.39 0.30 -FEP_CAT-4j-CAT-13d 19.37 0.22 -FEP_CAT-4j-CAT-13i 17.78 0.30 -FEP_CAT-4c-CAT-13f -9.21 0.28 -FEP_CAT-24-CAT-13g 28.97 0.41 -FEP_CAT-17h-CAT-13g 22.52 0.28 -FEP_CAT-4n-CAT-13h 25.03 0.23 -FEP_CAT-4o-CAT-13h 15.39 0.43 -FEP_CAT-4j-CAT-13f 20.42 0.36 -FEP_CAT-4o-CAT-13e 8.66 0.40 -FEP_CAT-4p-CAT-13d 9.13 0.33 -FEP_CAT-13k-CAT-13h 42.14 0.20 -FEP_CAT-4n-CAT-13e 19.23 0.30 -FEP_CAT-4o-CAT-13f 8.95 0.23 -FEP_CAT-13n-CAT-13g 102.28 0.10 -FEP_CAT-13m-CAT-13g 109.57 0.25 -FEP_CAT-4m-CAT-13f 19.47 0.28 -FEP_CAT-4n-CAT-13i 16.17 0.13 -FEP_CAT-13i-CAT-13g 6.58 0.46 -FEP_CAT-17g-CAT-13g 21.18 0.43 -FEP_CAT-4l-CAT-13j -63.38 0.20 -FEP_CAT-4j-CAT-13h 26.03 0.28 -FEP_CAT-13o-CAT-13g 8.77 0.24 -FEP_CAT-17a-CAT-13e 5.25 0.28 -FEP_CAT-17d-CAT-13h 35.41 0.22 -FEP_CAT-13n-CAT-13j 68.58 0.25 -FEP_CAT-4c-CAT-13j -40.70 0.59 -FEP_CAT-13o-CAT-13i 3.94 0.16 -FEP_CAT-17c-CAT-13i -3.06 0.24 -FEP_CAT-13o-CAT-13f 6.74 0.20 -FEP_CAT-13n-CAT-13e 100.09 0.47 -FEP_CAT-17g-CAT-13e 17.72 0.42 -FEP_CAT-13m-CAT-13h 112.85 0.24 -FEP_CAT-17d-CAT-13i 26.55 0.21 -FEP_CAT-24-CAT-13h 32.95 0.41 -FEP_CAT-17c-CAT-13h 5.70 0.27 -FEP_CAT-4m-CAT-13g 22.35 0.26 -FEP_CAT-4n-CAT-13d 18.04 0.25 -FEP_CAT-17d-CAT-13k -6.33 0.22 -FEP_CAT-17d-CAT-13g 32.29 0.51 -FEP_CAT-4o-CAT-13j -21.96 0.23 -FEP_CAT-17h-CAT-13j -11.63 0.14 -FEP_CAT-13k-CAT-13i 32.76 0.19 -FEP_CAT-17i-CAT-13h 35.09 0.16 -FEP_CAT-17c-CAT-13j -31.64 0.25 -FEP_CAT-4k-CAT-13g 35.67 0.23 -FEP_CAT-13i-CAT-13h 8.43 0.25 -FEP_CAT-4l-CAT-13g -29.47 0.42 -FEP_CAT-4b-CAT-13f -10.86 0.36 -FEP_CAT-4d-CAT-13e -11.88 0.79 -FEP_CAT-4i-CAT-13j -2.24 0.32 -FEP_CAT-4a-CAT-13e -9.34 0.40 -FEP_CAT-17f-CAT-13e 28.14 0.40 -FEP_CAT-13f-CAT-13e -1.60 0.10 -FEP_CAT-4p-CAT-13g 13.55 0.20 -FEP_CAT-17a-CAT-13g 8.46 0.23 -FEP_CAT-13j-CAT-13h 36.71 0.23 -FEP_CAT-17b-CAT-13k -36.88 0.26 -FEP_CAT-13o-CAT-13h 12.99 0.34 -FEP_CAT-4b-CAT-13i -13.60 0.32 -FEP_CAT-17a-CAT-13j -25.70 0.18 -FEP_CAT-13i-CAT-13f 3.98 0.24 -FEP_CAT-17a-CAT-13k -30.30 0.30 -FEP_CAT-17i-CAT-13f 29.84 0.43 -FEP_CAT-17d-CAT-13e 29.16 0.39 -FEP_CAT-4k-CAT-13f 32.18 0.22 -FEP_CAT-13j-CAT-13i 28.74 0.15 -FEP_CAT-4i-CAT-13g 31.41 0.28 -FEP_CAT-13m-CAT-13j 75.53 0.22 -FEP_CAT-4b-CAT-13g -7.95 0.29 -FEP_CAT-4d-CAT-13h -5.96 0.93 -FEP_CAT-4k-CAT-13d 31.57 0.36 -FEP_CAT-4k-CAT-13e 32.71 0.44 -FEP_CAT-4a-CAT-13h -4.05 0.27 -FEP_CAT-13k-CAT-13e 35.48 0.33 -FEP_CAT-13n-CAT-13h 105.91 0.25 -FEP_CAT-4l-CAT-13e -32.10 0.44 -FEP_CAT-4m-CAT-13h 25.89 0.17 -FEP_CAT-4a-CAT-13i -13.46 0.22 -FEP_CAT-17f-CAT-13f 28.45 0.23 -FEP_CAT-4i-CAT-13h 34.95 0.28 -FEP_CAT-13n-CAT-13f 99.69 0.15 -FEP_CAT-17e-CAT-13j -15.74 0.15 -FEP_CAT-13j-CAT-13e 30.52 0.29 -FEP_CAT-17b-CAT-13g 2.07 0.33 -FEP_CAT-4m-CAT-13e 19.82 0.40 -FEP_CAT-17h-CAT-13f 19.90 0.23 -FEP_CAT-4b-CAT-13h -4.83 0.29 -FEP_CAT-4d-CAT-13f -9.82 0.60 -FEP_CAT-4j-CAT-13e 20.12 0.32 -FEP_CAT-4n-CAT-13j -11.79 0.21 -FEP_CAT-17d-CAT-13f 29.80 0.58 -FEP_CAT-17c-CAT-13g 2.45 0.33 -FEP_CAT-17c-CAT-13k -36.39 0.14 -FEP_CAT-17b-CAT-13e -2.10 0.33 -FEP_CAT-4o-CAT-13g 11.58 0.16 -FEP_CAT-17i-CAT-13j -2.42 0.34 -FEP_CAT-4l-CAT-13i -35.03 0.24 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/1st_half/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/1st_half/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index a8af0054..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/1st_half/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,316 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_CAT-13b-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4b-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13b/ 1 -FEP_CAT-4c-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13d/ 2 -FEP_CAT-4i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4k-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13j/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/jobid-prot-missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/jobid-prot-missing.txt deleted file mode 100755 index 25b64ae0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/jobid-prot-missing.txt +++ /dev/null @@ -1,198 +0,0 @@ -Submitted batch job 47287009 -Submitted batch job 47287010 -Submitted batch job 47287011 -Submitted batch job 47287012 -Submitted batch job 47287013 -Submitted batch job 47287014 -Submitted batch job 47287015 -Submitted batch job 47287016 -Submitted batch job 47287017 -Submitted batch job 47287018 -Submitted batch job 47287019 -Submitted batch job 47287020 -Submitted batch job 47287021 -Submitted batch job 47287022 -Submitted batch job 47287023 -Submitted batch job 47287024 -Submitted batch job 47287025 -Submitted batch job 47287026 -Submitted batch job 47287027 -Submitted batch job 47287028 -Submitted batch job 47287029 -Submitted batch job 47287030 -Submitted batch job 47287031 -Submitted batch job 47287032 -Submitted batch job 47287033 -Submitted batch job 47287034 -Submitted batch job 47287035 -Submitted batch job 47287036 -Submitted batch job 47287037 -Submitted batch job 47287038 -Submitted batch job 47287039 -Submitted batch job 47287040 -Submitted batch job 47287041 -Submitted batch job 47287042 -Submitted batch job 47287043 -Submitted batch job 47287044 -Submitted batch job 47287045 -Submitted batch job 47287046 -Submitted batch job 47287047 -Submitted batch job 47287048 -Submitted batch job 47287049 -Submitted batch job 47287050 -Submitted batch job 47287051 -Submitted batch job 47287052 -Submitted batch job 47287053 -Submitted batch job 47287054 -Submitted batch job 47287055 -Submitted batch job 47287056 -Submitted batch job 47287057 -Submitted batch job 47287058 -Submitted batch job 47287059 -Submitted batch job 47287060 -Submitted batch job 47287061 -Submitted batch job 47287062 -Submitted batch job 47287063 -Submitted batch job 47287064 -Submitted batch job 47287065 -Submitted batch job 47287066 -Submitted batch job 47287067 -Submitted batch job 47287068 -Submitted batch job 47287069 -Submitted batch job 47287070 -Submitted batch job 47287071 -Submitted batch job 47287072 -Submitted batch job 47287073 -Submitted batch job 47287074 -Submitted batch job 47287075 -Submitted batch job 47287076 -Submitted batch job 47287077 -Submitted batch job 47287078 -Submitted batch job 47287079 -Submitted batch job 47287080 -Submitted batch job 47287081 -Submitted batch job 47287082 -Submitted batch job 47287083 -Submitted batch job 47287084 -Submitted batch job 47287085 -Submitted batch job 47287086 -Submitted batch job 47287087 -Submitted batch job 47287088 -Submitted batch job 47287089 -Submitted batch job 47287090 -Submitted batch job 47287091 -Submitted batch job 47287092 -Submitted batch job 47287093 -Submitted batch job 47287094 -Submitted batch job 47287095 -Submitted batch job 47287096 -Submitted batch job 47287097 -Submitted batch job 47287098 -Submitted batch job 47287099 -Submitted batch job 47287100 -Submitted batch job 47287101 -Submitted batch job 47287102 -Submitted batch job 47287103 -Submitted batch job 47287104 -Submitted batch job 47287105 -Submitted batch job 47287106 -Submitted batch job 47287107 -Submitted batch job 47287108 -Submitted batch job 47287109 -Submitted batch job 47287110 -Submitted batch job 47287111 -Submitted batch job 47287112 -Submitted batch job 47287113 -Submitted batch job 47287114 -Submitted batch job 47287115 -Submitted batch job 47287116 -Submitted batch job 47287117 -Submitted batch job 47287118 -Submitted batch job 47287119 -Submitted batch job 47287120 -Submitted batch job 47287121 -Submitted batch job 47287122 -Submitted batch job 47287123 -Submitted batch job 47287124 -Submitted batch job 47287125 -Submitted batch job 47287126 -Submitted batch job 47287127 -Submitted batch job 47287128 -Submitted batch job 47287129 -Submitted batch job 47287130 -Submitted batch job 47287131 -Submitted batch job 47287132 -Submitted batch job 47287133 -Submitted batch job 47287134 -Submitted batch job 47287135 -Submitted batch job 47287136 -Submitted batch job 47287137 -Submitted batch job 47287138 -Submitted batch job 47287139 -Submitted batch job 47287140 -Submitted batch job 47287141 -Submitted batch job 47287142 -Submitted batch job 47287143 -Submitted batch job 47287144 -Submitted batch job 47287145 -Submitted batch job 47287146 -Submitted batch job 47287147 -Submitted batch job 47287148 -Submitted batch job 47287149 -Submitted batch job 47287150 -Submitted batch job 47287151 -Submitted batch job 47287152 -Submitted batch job 47287153 -Submitted batch job 47287154 -Submitted batch job 47287155 -Submitted batch job 47287156 -Submitted batch job 47287157 -Submitted batch job 47287158 -Submitted batch job 47287332 -Submitted batch job 47287333 -Submitted batch job 47287334 -Submitted batch job 47287335 -Submitted batch job 47287336 -Submitted batch job 47287337 -Submitted batch job 47287338 -Submitted batch job 47287339 -Submitted batch job 47287340 -Submitted batch job 47287341 -Submitted batch job 47287342 -Submitted batch job 47287343 -Submitted batch job 47287344 -Submitted batch job 47287345 -Submitted batch job 47287346 -Submitted batch job 47287347 -Submitted batch job 47287348 -Submitted batch job 47287349 -Submitted batch job 47287350 -Submitted batch job 47287351 -Submitted batch job 47287352 -Submitted batch job 47287353 -Submitted batch job 47287354 -Submitted batch job 47287355 -Submitted batch job 47287356 -Submitted batch job 47287357 -Submitted batch job 47287358 -Submitted batch job 47287359 -Submitted batch job 47287360 -Submitted batch job 47287361 -FEP_CAT-4o-CAT-24 -FEP_CAT-4p-CAT-17b -FEP_CAT-4n-CAT-4a -FEP_CAT-4d-CAT-17d -FEP_CAT-4o-CAT-17g -FEP_CAT-17h-CAT-17b -FEP_CAT-4m-CAT-4k -FEP_CAT-4i-CAT-17e -FEP_CAT-17g-CAT-17f -FEP_CAT-4b-CAT-13k -FEP_CAT-17d-CAT-13o -FEP_CAT-17f-CAT-17b -FEP_CAT-4l-CAT-17g -FEP_CAT-17h-CAT-13k -FEP_CAT-4l-CAT-17c -FEP_CAT-17d-CAT-13m -FEP_CAT-17i-CAT-17a -FEP_CAT-4m-CAT-4d diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/jobid-prot-missing2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/jobid-prot-missing2.txt deleted file mode 100755 index d28c89b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/jobid-prot-missing2.txt +++ /dev/null @@ -1,150 +0,0 @@ -Submitted batch job 47288655 -Submitted batch job 47288656 -Submitted batch job 47288657 -Submitted batch job 47288658 -Submitted batch job 47288659 -Submitted batch job 47288660 -Submitted batch job 47288661 -Submitted batch job 47288662 -Submitted batch job 47288663 -Submitted batch job 47288664 -Submitted batch job 47288665 -Submitted batch job 47288666 -Submitted batch job 47288667 -Submitted batch job 47288668 -Submitted batch job 47288669 -Submitted batch job 47288670 -Submitted batch job 47288671 -Submitted batch job 47288672 -Submitted batch job 47288673 -Submitted batch job 47288674 -Submitted batch job 47288675 -Submitted batch job 47288676 -Submitted batch job 47288677 -Submitted batch job 47288678 -Submitted batch job 47288679 -Submitted batch job 47288680 -Submitted batch job 47288681 -Submitted batch job 47288682 -Submitted batch job 47288683 -Submitted batch job 47288684 -Submitted batch job 47288685 -Submitted batch job 47288686 -Submitted batch job 47288687 -Submitted batch job 47288688 -Submitted batch job 47288689 -Submitted batch job 47288690 -Submitted batch job 47288691 -Submitted batch job 47288692 -Submitted batch job 47288693 -Submitted batch job 47288694 -Submitted batch job 47288695 -Submitted batch job 47288696 -Submitted batch job 47288697 -Submitted batch job 47288698 -Submitted batch job 47288699 -Submitted batch job 47288700 -Submitted batch job 47288701 -Submitted batch job 47288702 -Submitted batch job 47288703 -Submitted batch job 47288704 -Submitted batch job 47288705 -Submitted batch job 47288706 -Submitted batch job 47288707 -Submitted batch job 47288708 -Submitted batch job 47288709 -Submitted batch job 47288710 -Submitted batch job 47288711 -Submitted batch job 47288712 -Submitted batch job 47288713 -Submitted batch job 47288714 -Submitted batch job 47288715 -Submitted batch job 47288716 -Submitted batch job 47288717 -Submitted batch job 47288718 -Submitted batch job 47288719 -Submitted batch job 47288720 -Submitted batch job 47288721 -Submitted batch job 47288722 -Submitted batch job 47288723 -Submitted batch job 47288724 -Submitted batch job 47288725 -Submitted batch job 47288726 -Submitted batch job 47288727 -Submitted batch job 47288728 -Submitted batch job 47288729 -Submitted batch job 47288730 -Submitted batch job 47288731 -Submitted batch job 47288732 -Submitted batch job 47288733 -Submitted batch job 47288734 -Submitted batch job 47288735 -Submitted batch job 47288736 -Submitted batch job 47288737 -Submitted batch job 47288738 -Submitted batch job 47288739 -Submitted batch job 47288740 -Submitted batch job 47288741 -Submitted batch job 47288742 -Submitted batch job 47288743 -Submitted batch job 47288744 -Submitted batch job 47288745 -Submitted batch job 47288746 -Submitted batch job 47288747 -Submitted batch job 47288748 -Submitted batch job 47288749 -Submitted batch job 47288750 -Submitted batch job 47288751 -Submitted batch job 47288752 -Submitted batch job 47288753 -Submitted batch job 47288754 -Submitted batch job 47288755 -Submitted batch job 47288756 -Submitted batch job 47288757 -Submitted batch job 47288758 -Submitted batch job 47288759 -Submitted batch job 47288760 -Submitted batch job 47288761 -Submitted batch job 47288762 -Submitted batch job 47288763 -Submitted batch job 47288764 -Submitted batch job 47288765 -Submitted batch job 47288766 -Submitted batch job 47288767 -Submitted batch job 47288768 -Submitted batch job 47288769 -Submitted batch job 47288770 -Submitted batch job 47288771 -Submitted batch job 47288772 -Submitted batch job 47288773 -Submitted batch job 47288774 -Submitted batch job 47288775 -Submitted batch job 47288776 -Submitted batch job 47288777 -Submitted batch job 47288778 -Submitted batch job 47288779 -Submitted batch job 47288780 -Submitted batch job 47288781 -Submitted batch job 47288782 -Submitted batch job 47288783 -Submitted batch job 47288784 -Submitted batch job 47288785 -Submitted batch job 47288786 -Submitted batch job 47288787 -Submitted batch job 47288788 -Submitted batch job 47288789 -Submitted batch job 47288790 -Submitted batch job 47288791 -Submitted batch job 47288792 -Submitted batch job 47288793 -Submitted batch job 47288794 -Submitted batch job 47288795 -Submitted batch job 47288796 -Submitted batch job 47288797 -Submitted batch job 47288798 -Submitted batch job 47288799 -Submitted batch job 47288800 -Submitted batch job 47288801 -Submitted batch job 47288802 -Submitted batch job 47288803 -Submitted batch job 47288804 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/jobid-water-2hlf.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/jobid-water-2hlf.txt deleted file mode 100755 index c5c1be46..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/jobid-water-2hlf.txt +++ /dev/null @@ -1,3140 +0,0 @@ -Submitted batch job 47271851 -Submitted batch job 47271852 -Submitted batch job 47271853 -Submitted batch job 47271854 -Submitted batch job 47271855 -Submitted batch job 47271856 -Submitted batch job 47271857 -Submitted batch job 47271858 -Submitted batch job 47271859 -Submitted batch job 47271860 -Submitted batch job 47271861 -Submitted batch job 47271862 -Submitted batch job 47271863 -Submitted batch job 47271864 -Submitted batch job 47271865 -Submitted batch job 47271866 -Submitted batch job 47271867 -Submitted batch job 47271868 -Submitted batch job 47271869 -Submitted batch job 47271870 -Submitted batch job 47271871 -Submitted batch job 47271872 -Submitted batch job 47271873 -Submitted batch job 47271874 -Submitted batch job 47271875 -Submitted batch job 47271876 -Submitted batch job 47271877 -Submitted batch job 47271878 -Submitted batch job 47271879 -Submitted batch job 47271880 -Submitted batch job 47271881 -Submitted batch job 47271882 -Submitted batch job 47271883 -Submitted batch job 47271884 -Submitted batch job 47271885 -Submitted batch job 47271886 -Submitted batch job 47271887 -Submitted batch job 47271888 -Submitted batch job 47271889 -Submitted batch job 47271890 -Submitted batch job 47271891 -Submitted batch job 47271892 -Submitted batch job 47271893 -Submitted batch job 47271894 -Submitted batch job 47271895 -Submitted batch job 47271896 -Submitted batch job 47271897 -Submitted batch job 47271898 -Submitted batch job 47271899 -Submitted batch job 47271900 -Submitted batch job 47271901 -Submitted batch job 47271902 -Submitted batch job 47271903 -Submitted batch job 47271904 -Submitted batch job 47271905 -Submitted batch job 47271906 -Submitted batch job 47271907 -Submitted batch job 47271908 -Submitted batch job 47271909 -Submitted batch job 47271910 -Submitted batch job 47271911 -Submitted batch job 47271912 -Submitted batch job 47271913 -Submitted batch job 47271914 -Submitted batch job 47271915 -Submitted batch job 47271916 -Submitted batch job 47271917 -Submitted batch job 47271918 -Submitted batch job 47271919 -Submitted batch job 47271920 -Submitted batch job 47271921 -Submitted batch job 47271922 -Submitted batch job 47271923 -Submitted batch job 47271924 -Submitted batch job 47271925 -Submitted batch job 47271926 -Submitted batch job 47271927 -Submitted batch job 47271928 -Submitted batch job 47271929 -Submitted batch job 47271930 -Submitted batch job 47271931 -Submitted batch job 47271932 -Submitted batch job 47271933 -Submitted batch job 47271934 -Submitted batch job 47271935 -Submitted batch job 47271936 -Submitted batch job 47271937 -Submitted batch job 47271938 -Submitted batch job 47271939 -Submitted batch job 47271940 -Submitted batch job 47271942 -Submitted batch job 47271943 -Submitted batch job 47271944 -Submitted batch job 47271945 -Submitted batch job 47271946 -Submitted batch job 47271947 -Submitted batch job 47271948 -Submitted batch job 47271949 -Submitted batch job 47271950 -Submitted batch job 47271951 -Submitted batch job 47271952 -Submitted batch job 47271953 -Submitted batch job 47271954 -Submitted batch job 47271955 -Submitted batch job 47271956 -Submitted batch job 47271957 -Submitted batch job 47271958 -Submitted batch job 47271959 -Submitted batch job 47271960 -Submitted batch job 47271961 -Submitted batch job 47271962 -Submitted batch job 47271963 -Submitted batch job 47271964 -Submitted batch job 47271965 -Submitted batch job 47271966 -Submitted batch job 47271967 -Submitted batch job 47271968 -Submitted batch job 47271969 -Submitted batch job 47271970 -Submitted batch job 47271971 -Submitted batch job 47271972 -Submitted batch job 47271973 -Submitted batch job 47271974 -Submitted batch job 47271975 -Submitted batch job 47271976 -Submitted batch job 47271977 -Submitted batch job 47271978 -Submitted batch job 47271979 -Submitted batch job 47271980 -Submitted batch job 47271981 -Submitted batch job 47271982 -Submitted batch job 47271983 -Submitted batch job 47271984 -Submitted batch job 47271985 -Submitted batch job 47271986 -Submitted batch job 47271987 -Submitted batch job 47271988 -Submitted batch job 47271989 -Submitted batch job 47271990 -Submitted batch job 47271991 -Submitted batch job 47272001 -Submitted batch job 47272002 -Submitted batch job 47272003 -Submitted batch job 47272004 -Submitted batch job 47272005 -Submitted batch job 47272006 -Submitted batch job 47272007 -Submitted batch job 47272008 -Submitted batch job 47272009 -Submitted batch job 47272010 -Submitted batch job 47272012 -Submitted batch job 47272013 -Submitted batch job 47272014 -Submitted batch job 47272015 -Submitted batch job 47272016 -Submitted batch job 47272017 -Submitted batch job 47272018 -Submitted batch job 47272019 -Submitted batch job 47272020 -Submitted batch job 47272021 -Submitted batch job 47272027 -Submitted batch job 47272028 -Submitted batch job 47272029 -Submitted batch job 47272030 -Submitted batch job 47272031 -Submitted batch job 47272032 -Submitted batch job 47272033 -Submitted batch job 47272034 -Submitted batch job 47272035 -Submitted batch job 47272036 -Submitted batch job 47272042 -Submitted batch job 47272043 -Submitted batch job 47272044 -Submitted batch job 47272045 -Submitted batch job 47272046 -Submitted batch job 47272047 -Submitted batch job 47272048 -Submitted batch job 47272049 -Submitted batch job 47272050 -Submitted batch job 47272051 -Submitted batch job 47272056 -Submitted batch job 47272057 -Submitted batch job 47272058 -Submitted batch job 47272059 -Submitted batch job 47272060 -Submitted batch job 47272061 -Submitted batch job 47272062 -Submitted batch job 47272063 -Submitted batch job 47272064 -Submitted batch job 47272065 -Submitted batch job 47272087 -Submitted batch job 47272088 -Submitted batch job 47272089 -Submitted batch job 47272090 -Submitted batch job 47272091 -Submitted batch job 47272092 -Submitted batch job 47272093 -Submitted batch job 47272094 -Submitted batch job 47272095 -Submitted batch job 47272096 -Submitted batch job 47272107 -Submitted batch job 47272108 -Submitted batch job 47272109 -Submitted batch job 47272110 -Submitted batch job 47272111 -Submitted batch job 47272112 -Submitted batch job 47272113 -Submitted batch job 47272114 -Submitted batch job 47272115 -Submitted batch job 47272116 -Submitted batch job 47272162 -Submitted batch job 47272163 -Submitted batch job 47272164 -Submitted batch job 47272165 -Submitted batch job 47272166 -Submitted batch job 47272167 -Submitted batch job 47272168 -Submitted batch job 47272169 -Submitted batch job 47272170 -Submitted batch job 47272171 -Submitted batch job 47272189 -Submitted batch job 47272190 -Submitted batch job 47272191 -Submitted batch job 47272192 -Submitted batch job 47272193 -Submitted batch job 47272194 -Submitted batch job 47272195 -Submitted batch job 47272196 -Submitted batch job 47272197 -Submitted batch job 47272198 -Submitted batch job 47272223 -Submitted batch job 47272224 -Submitted batch job 47272225 -Submitted batch job 47272226 -Submitted batch job 47272227 -Submitted batch job 47272228 -Submitted batch job 47272229 -Submitted batch job 47272230 -Submitted batch job 47272231 -Submitted batch job 47272232 -Submitted batch job 47272254 -Submitted batch job 47272255 -Submitted batch job 47272256 -Submitted batch job 47272257 -Submitted batch job 47272258 -Submitted batch job 47272259 -Submitted batch job 47272260 -Submitted batch job 47272261 -Submitted batch job 47272262 -Submitted batch job 47272263 -Submitted batch job 47272268 -Submitted batch job 47272269 -Submitted batch job 47272270 -Submitted batch job 47272271 -Submitted batch job 47272272 -Submitted batch job 47272273 -Submitted batch job 47272274 -Submitted batch job 47272275 -Submitted batch job 47272276 -Submitted batch job 47272277 -Submitted batch job 47272296 -Submitted batch job 47272297 -Submitted batch job 47272298 -Submitted batch job 47272299 -Submitted batch job 47272300 -Submitted batch job 47272301 -Submitted batch job 47272302 -Submitted batch job 47272303 -Submitted batch job 47272304 -Submitted batch job 47272305 -Submitted batch job 47272323 -Submitted batch job 47272324 -Submitted batch job 47272325 -Submitted batch job 47272326 -Submitted batch job 47272327 -Submitted batch job 47272328 -Submitted batch job 47272329 -Submitted batch job 47272330 -Submitted batch job 47272331 -Submitted batch job 47272332 -Submitted batch job 47272369 -Submitted batch job 47272370 -Submitted batch job 47272371 -Submitted batch job 47272372 -Submitted batch job 47272373 -Submitted batch job 47272374 -Submitted batch job 47272375 -Submitted batch job 47272376 -Submitted batch job 47272377 -Submitted batch job 47272378 -Submitted batch job 47272386 -Submitted batch job 47272387 -Submitted batch job 47272388 -Submitted batch job 47272389 -Submitted batch job 47272390 -Submitted batch job 47272391 -Submitted batch job 47272392 -Submitted batch job 47272393 -Submitted batch job 47272394 -Submitted batch job 47272395 -Submitted batch job 47272416 -Submitted batch job 47272417 -Submitted batch job 47272418 -Submitted batch job 47272419 -Submitted batch job 47272420 -Submitted batch job 47272421 -Submitted batch job 47272422 -Submitted batch job 47272423 -Submitted batch job 47272424 -Submitted batch job 47272425 -Submitted batch job 47272427 -Submitted batch job 47272428 -Submitted batch job 47272429 -Submitted batch job 47272430 -Submitted batch job 47272431 -Submitted batch job 47272432 -Submitted batch job 47272433 -Submitted batch job 47272434 -Submitted batch job 47272435 -Submitted batch job 47272436 -Submitted batch job 47272437 -Submitted batch job 47272438 -Submitted batch job 47272439 -Submitted batch job 47272440 -Submitted batch job 47272441 -Submitted batch job 47272442 -Submitted batch job 47272443 -Submitted batch job 47272444 -Submitted batch job 47272445 -Submitted batch job 47272446 -Submitted batch job 47272447 -Submitted batch job 47272448 -Submitted batch job 47272449 -Submitted batch job 47272450 -Submitted batch job 47272451 -Submitted batch job 47272452 -Submitted batch job 47272453 -Submitted batch job 47272454 -Submitted batch job 47272455 -Submitted batch job 47272456 -Submitted batch job 47272458 -Submitted batch job 47272459 -Submitted batch job 47272460 -Submitted batch job 47272461 -Submitted batch job 47272462 -Submitted batch job 47272463 -Submitted batch job 47272464 -Submitted batch job 47272465 -Submitted batch job 47272466 -Submitted batch job 47272467 -Submitted batch job 47272468 -Submitted batch job 47272469 -Submitted batch job 47272470 -Submitted batch job 47272471 -Submitted batch job 47272472 -Submitted batch job 47272473 -Submitted batch job 47272474 -Submitted batch job 47272475 -Submitted batch job 47272476 -Submitted batch job 47272477 -Submitted batch job 47272478 -Submitted batch job 47272479 -Submitted batch job 47272480 -Submitted batch job 47272481 -Submitted batch job 47272482 -Submitted batch job 47272483 -Submitted batch job 47272484 -Submitted batch job 47272485 -Submitted batch job 47272486 -Submitted batch job 47272487 -Submitted batch job 47272491 -Submitted batch job 47272492 -Submitted batch job 47272493 -Submitted batch job 47272494 -Submitted batch job 47272495 -Submitted batch job 47272496 -Submitted batch job 47272497 -Submitted batch job 47272498 -Submitted batch job 47272499 -Submitted batch job 47272500 -Submitted batch job 47272508 -Submitted batch job 47272509 -Submitted batch job 47272510 -Submitted batch job 47272511 -Submitted batch job 47272512 -Submitted batch job 47272513 -Submitted batch job 47272514 -Submitted batch job 47272515 -Submitted batch job 47272516 -Submitted batch job 47272517 -Submitted batch job 47272521 -Submitted batch job 47272522 -Submitted batch job 47272523 -Submitted batch job 47272524 -Submitted batch job 47272525 -Submitted batch job 47272526 -Submitted batch job 47272527 -Submitted batch job 47272528 -Submitted batch job 47272529 -Submitted batch job 47272530 -Submitted batch job 47272534 -Submitted batch job 47272535 -Submitted batch job 47272536 -Submitted batch job 47272537 -Submitted batch job 47272538 -Submitted batch job 47272539 -Submitted batch job 47272540 -Submitted batch job 47272541 -Submitted batch job 47272542 -Submitted batch job 47272543 -Submitted batch job 47272547 -Submitted batch job 47272548 -Submitted batch job 47272549 -Submitted batch job 47272550 -Submitted batch job 47272551 -Submitted batch job 47272552 -Submitted batch job 47272553 -Submitted batch job 47272554 -Submitted batch job 47272555 -Submitted batch job 47272556 -Submitted batch job 47272557 -Submitted batch job 47272558 -Submitted batch job 47272559 -Submitted batch job 47272560 -Submitted batch job 47272561 -Submitted batch job 47272562 -Submitted batch job 47272563 -Submitted batch job 47272564 -Submitted batch job 47272565 -Submitted batch job 47272566 -Submitted batch job 47272568 -Submitted batch job 47272569 -Submitted batch job 47272570 -Submitted batch job 47272571 -Submitted batch job 47272572 -Submitted batch job 47272573 -Submitted batch job 47272574 -Submitted batch job 47272575 -Submitted batch job 47272576 -Submitted batch job 47272577 -Submitted batch job 47272581 -Submitted batch job 47272582 -Submitted batch job 47272583 -Submitted batch job 47272584 -Submitted batch job 47272585 -Submitted batch job 47272586 -Submitted batch job 47272587 -Submitted batch job 47272588 -Submitted batch job 47272589 -Submitted batch job 47272590 -Submitted batch job 47272595 -Submitted batch job 47272596 -Submitted batch job 47272597 -Submitted batch job 47272598 -Submitted batch job 47272599 -Submitted batch job 47272600 -Submitted batch job 47272601 -Submitted batch job 47272602 -Submitted batch job 47272603 -Submitted batch job 47272604 -Submitted batch job 47272611 -Submitted batch job 47272612 -Submitted batch job 47272613 -Submitted batch job 47272614 -Submitted batch job 47272615 -Submitted batch job 47272616 -Submitted batch job 47272617 -Submitted batch job 47272618 -Submitted batch job 47272619 -Submitted batch job 47272620 -Submitted batch job 47272622 -Submitted batch job 47272623 -Submitted batch job 47272624 -Submitted batch job 47272625 -Submitted batch job 47272626 -Submitted batch job 47272627 -Submitted batch job 47272628 -Submitted batch job 47272629 -Submitted batch job 47272630 -Submitted batch job 47272631 -Submitted batch job 47272638 -Submitted batch job 47272639 -Submitted batch job 47272640 -Submitted batch job 47272641 -Submitted batch job 47272642 -Submitted batch job 47272643 -Submitted batch job 47272644 -Submitted batch job 47272645 -Submitted batch job 47272646 -Submitted batch job 47272647 -Submitted batch job 47272649 -Submitted batch job 47272650 -Submitted batch job 47272651 -Submitted batch job 47272652 -Submitted batch job 47272653 -Submitted batch job 47272654 -Submitted batch job 47272655 -Submitted batch job 47272656 -Submitted batch job 47272657 -Submitted batch job 47272658 -Submitted batch job 47272659 -Submitted batch job 47272660 -Submitted batch job 47272661 -Submitted batch job 47272662 -Submitted batch job 47272663 -Submitted batch job 47272664 -Submitted batch job 47272665 -Submitted batch job 47272666 -Submitted batch job 47272667 -Submitted batch job 47272668 -Submitted batch job 47272669 -Submitted batch job 47272670 -Submitted batch job 47272671 -Submitted batch job 47272672 -Submitted batch job 47272673 -Submitted batch job 47272674 -Submitted batch job 47272675 -Submitted batch job 47272676 -Submitted batch job 47272677 -Submitted batch job 47272678 -Submitted batch job 47272679 -Submitted batch job 47272680 -Submitted batch job 47272681 -Submitted batch job 47272682 -Submitted batch job 47272683 -Submitted batch job 47272684 -Submitted batch job 47272685 -Submitted batch job 47272686 -Submitted batch job 47272687 -Submitted batch job 47272688 -Submitted batch job 47272689 -Submitted batch job 47272690 -Submitted batch job 47272691 -Submitted batch job 47272692 -Submitted batch job 47272693 -Submitted batch job 47272694 -Submitted batch job 47272695 -Submitted batch job 47272696 -Submitted batch job 47272697 -Submitted batch job 47272698 -Submitted batch job 47272739 -Submitted batch job 47272740 -Submitted batch job 47272741 -Submitted batch job 47272742 -Submitted batch job 47272743 -Submitted batch job 47272744 -Submitted batch job 47272745 -Submitted batch job 47272746 -Submitted batch job 47272747 -Submitted batch job 47272748 -Submitted batch job 47272749 -Submitted batch job 47272750 -Submitted batch job 47272751 -Submitted batch job 47272752 -Submitted batch job 47272753 -Submitted batch job 47272754 -Submitted batch job 47272755 -Submitted batch job 47272756 -Submitted batch job 47272757 -Submitted batch job 47272758 -Submitted batch job 47272759 -Submitted batch job 47272760 -Submitted batch job 47272761 -Submitted batch job 47272762 -Submitted batch job 47272763 -Submitted batch job 47272764 -Submitted batch job 47272765 -Submitted batch job 47272766 -Submitted batch job 47272767 -Submitted batch job 47272768 -Submitted batch job 47272769 -Submitted batch job 47272770 -Submitted batch job 47272771 -Submitted batch job 47272772 -Submitted batch job 47272773 -Submitted batch job 47272774 -Submitted batch job 47272775 -Submitted batch job 47272776 -Submitted batch job 47272777 -Submitted batch job 47272778 -Submitted batch job 47272782 -Submitted batch job 47272783 -Submitted batch job 47272784 -Submitted batch job 47272785 -Submitted batch job 47272786 -Submitted batch job 47272787 -Submitted batch job 47272788 -Submitted batch job 47272789 -Submitted batch job 47272790 -Submitted batch job 47272791 -Submitted batch job 47272792 -Submitted batch job 47272793 -Submitted batch job 47272794 -Submitted batch job 47272795 -Submitted batch job 47272796 -Submitted batch job 47272797 -Submitted batch job 47272798 -Submitted batch job 47272799 -Submitted batch job 47272800 -Submitted batch job 47272801 -Submitted batch job 47272802 -Submitted batch job 47272803 -Submitted batch job 47272804 -Submitted batch job 47272805 -Submitted batch job 47272806 -Submitted batch job 47272807 -Submitted batch job 47272808 -Submitted batch job 47272809 -Submitted batch job 47272810 -Submitted batch job 47272811 -Submitted batch job 47272848 -Submitted batch job 47272849 -Submitted batch job 47272850 -Submitted batch job 47272851 -Submitted batch job 47272852 -Submitted batch job 47272853 -Submitted batch job 47272854 -Submitted batch job 47272855 -Submitted batch job 47272856 -Submitted batch job 47272857 -Submitted batch job 47272899 -Submitted batch job 47272900 -Submitted batch job 47272901 -Submitted batch job 47272902 -Submitted batch job 47272903 -Submitted batch job 47272904 -Submitted batch job 47272905 -Submitted batch job 47272906 -Submitted batch job 47272907 -Submitted batch job 47272908 -Submitted batch job 47272909 -Submitted batch job 47272910 -Submitted batch job 47272911 -Submitted batch job 47272912 -Submitted batch job 47272913 -Submitted batch job 47272914 -Submitted batch job 47272915 -Submitted batch job 47272916 -Submitted batch job 47272917 -Submitted batch job 47272918 -Submitted batch job 47272919 -Submitted batch job 47272920 -Submitted batch job 47272921 -Submitted batch job 47272922 -Submitted batch job 47272923 -Submitted batch job 47272924 -Submitted batch job 47272925 -Submitted batch job 47272926 -Submitted batch job 47272927 -Submitted batch job 47272928 -Submitted batch job 47272929 -Submitted batch job 47272930 -Submitted batch job 47272931 -Submitted batch job 47272932 -Submitted batch job 47272933 -Submitted batch job 47272934 -Submitted batch job 47272935 -Submitted batch job 47272936 -Submitted batch job 47272937 -Submitted batch job 47272938 -Submitted batch job 47272939 -Submitted batch job 47272940 -Submitted batch job 47272941 -Submitted batch job 47272942 -Submitted batch job 47272943 -Submitted batch job 47272944 -Submitted batch job 47272945 -Submitted batch job 47272946 -Submitted batch job 47272947 -Submitted batch job 47272948 -Submitted batch job 47272949 -Submitted batch job 47272950 -Submitted batch job 47272951 -Submitted batch job 47272952 -Submitted batch job 47272953 -Submitted batch job 47272954 -Submitted batch job 47272955 -Submitted batch job 47272956 -Submitted batch job 47272957 -Submitted batch job 47272958 -Submitted batch job 47272959 -Submitted batch job 47272960 -Submitted batch job 47272961 -Submitted batch job 47272962 -Submitted batch job 47272963 -Submitted batch job 47272964 -Submitted batch job 47272965 -Submitted batch job 47272966 -Submitted batch job 47272967 -Submitted batch job 47272968 -Submitted batch job 47272969 -Submitted batch job 47272970 -Submitted batch job 47272971 -Submitted batch job 47272972 -Submitted batch job 47272973 -Submitted batch job 47272974 -Submitted batch job 47272975 -Submitted batch job 47272976 -Submitted batch job 47272977 -Submitted batch job 47272978 -Submitted batch job 47272979 -Submitted batch job 47272980 -Submitted batch job 47272981 -Submitted batch job 47272982 -Submitted batch job 47272983 -Submitted batch job 47272984 -Submitted batch job 47272985 -Submitted batch job 47272986 -Submitted batch job 47272987 -Submitted batch job 47272988 -Submitted batch job 47272989 -Submitted batch job 47272990 -Submitted batch job 47272991 -Submitted batch job 47272992 -Submitted batch job 47272993 -Submitted batch job 47272994 -Submitted batch job 47272995 -Submitted batch job 47272996 -Submitted batch job 47272997 -Submitted batch job 47272998 -Submitted batch job 47272999 -Submitted batch job 47273000 -Submitted batch job 47273001 -Submitted batch job 47273002 -Submitted batch job 47273003 -Submitted batch job 47273004 -Submitted batch job 47273005 -Submitted batch job 47273006 -Submitted batch job 47273007 -Submitted batch job 47273008 -Submitted batch job 47273009 -Submitted batch job 47273010 -Submitted batch job 47273011 -Submitted batch job 47273012 -Submitted batch job 47273013 -Submitted batch job 47273014 -Submitted batch job 47273015 -Submitted batch job 47273016 -Submitted batch job 47273017 -Submitted batch job 47273018 -Submitted batch job 47273019 -Submitted batch job 47273020 -Submitted batch job 47273021 -Submitted batch job 47273022 -Submitted batch job 47273023 -Submitted batch job 47273024 -Submitted batch job 47273025 -Submitted batch job 47273026 -Submitted batch job 47273027 -Submitted batch job 47273028 -Submitted batch job 47273029 -Submitted batch job 47273030 -Submitted batch job 47273031 -Submitted batch job 47273032 -Submitted batch job 47273033 -Submitted batch job 47273034 -Submitted batch job 47273035 -Submitted batch job 47273036 -Submitted batch job 47273037 -Submitted batch job 47273038 -Submitted batch job 47273039 -Submitted batch job 47273040 -Submitted batch job 47273041 -Submitted batch job 47273042 -Submitted batch job 47273043 -Submitted batch job 47273044 -Submitted batch job 47273045 -Submitted batch job 47273046 -Submitted batch job 47273047 -Submitted batch job 47273048 -Submitted batch job 47273049 -Submitted batch job 47273050 -Submitted batch job 47273051 -Submitted batch job 47273052 -Submitted batch job 47273053 -Submitted batch job 47273054 -Submitted batch job 47273055 -Submitted batch job 47273056 -Submitted batch job 47273057 -Submitted batch job 47273058 -Submitted batch job 47273059 -Submitted batch job 47273060 -Submitted batch job 47273061 -Submitted batch job 47273062 -Submitted batch job 47273063 -Submitted batch job 47273064 -Submitted batch job 47273065 -Submitted batch job 47273066 -Submitted batch job 47273067 -Submitted batch job 47273068 -Submitted batch job 47273069 -Submitted batch job 47273070 -Submitted batch job 47273071 -Submitted batch job 47273072 -Submitted batch job 47273073 -Submitted batch job 47273074 -Submitted batch job 47273075 -Submitted batch job 47273076 -Submitted batch job 47273077 -Submitted batch job 47273078 -Submitted batch job 47273079 -Submitted batch job 47273080 -Submitted batch job 47273081 -Submitted batch job 47273082 -Submitted batch job 47273083 -Submitted batch job 47273084 -Submitted batch job 47273085 -Submitted batch job 47273086 -Submitted batch job 47273087 -Submitted batch job 47273088 -Submitted batch job 47273089 -Submitted batch job 47273090 -Submitted batch job 47273091 -Submitted batch job 47273092 -Submitted batch job 47273093 -Submitted batch job 47273094 -Submitted batch job 47273095 -Submitted batch job 47273096 -Submitted batch job 47273097 -Submitted batch job 47273098 -Submitted batch job 47273099 -Submitted batch job 47273100 -Submitted batch job 47273101 -Submitted batch job 47273102 -Submitted batch job 47273103 -Submitted batch job 47273104 -Submitted batch job 47273105 -Submitted batch job 47273106 -Submitted batch job 47273107 -Submitted batch job 47273108 -Submitted batch job 47273111 -Submitted batch job 47273112 -Submitted batch job 47273113 -Submitted batch job 47273114 -Submitted batch job 47273115 -Submitted batch job 47273116 -Submitted batch job 47273117 -Submitted batch job 47273118 -Submitted batch job 47273119 -Submitted batch job 47273120 -Submitted batch job 47273121 -Submitted batch job 47273122 -Submitted batch job 47273123 -Submitted batch job 47273124 -Submitted batch job 47273125 -Submitted batch job 47273126 -Submitted batch job 47273127 -Submitted batch job 47273128 -Submitted batch job 47273129 -Submitted batch job 47273130 -Submitted batch job 47273131 -Submitted batch job 47273132 -Submitted batch job 47273133 -Submitted batch job 47273134 -Submitted batch job 47273135 -Submitted batch job 47273136 -Submitted batch job 47273137 -Submitted batch job 47273138 -Submitted batch job 47273139 -Submitted batch job 47273140 -Submitted batch job 47273141 -Submitted batch job 47273142 -Submitted batch job 47273143 -Submitted batch job 47273144 -Submitted batch job 47273145 -Submitted batch job 47273146 -Submitted batch job 47273147 -Submitted batch job 47273148 -Submitted batch job 47273149 -Submitted batch job 47273150 -Submitted batch job 47273151 -Submitted batch job 47273152 -Submitted batch job 47273153 -Submitted batch job 47273154 -Submitted batch job 47273155 -Submitted batch job 47273156 -Submitted batch job 47273157 -Submitted batch job 47273158 -Submitted batch job 47273159 -Submitted batch job 47273160 -Submitted batch job 47273162 -Submitted batch job 47273163 -Submitted batch job 47273164 -Submitted batch job 47273165 -Submitted batch job 47273166 -Submitted batch job 47273167 -Submitted batch job 47273168 -Submitted batch job 47273169 -Submitted batch job 47273170 -Submitted batch job 47273171 -Submitted batch job 47273192 -Submitted batch job 47273193 -Submitted batch job 47273194 -Submitted batch job 47273195 -Submitted batch job 47273196 -Submitted batch job 47273197 -Submitted batch job 47273198 -Submitted batch job 47273199 -Submitted batch job 47273200 -Submitted batch job 47273201 -Submitted batch job 47273258 -Submitted batch job 47273259 -Submitted batch job 47273260 -Submitted batch job 47273261 -Submitted batch job 47273262 -Submitted batch job 47273263 -Submitted batch job 47273264 -Submitted batch job 47273265 -Submitted batch job 47273266 -Submitted batch job 47273267 -Submitted batch job 47273276 -Submitted batch job 47273277 -Submitted batch job 47273278 -Submitted batch job 47273279 -Submitted batch job 47273280 -Submitted batch job 47273281 -Submitted batch job 47273282 -Submitted batch job 47273283 -Submitted batch job 47273284 -Submitted batch job 47273285 -Submitted batch job 47273290 -Submitted batch job 47273291 -Submitted batch job 47273292 -Submitted batch job 47273293 -Submitted batch job 47273294 -Submitted batch job 47273295 -Submitted batch job 47273296 -Submitted batch job 47273297 -Submitted batch job 47273298 -Submitted batch job 47273299 -Submitted batch job 47273301 -Submitted batch job 47273302 -Submitted batch job 47273303 -Submitted batch job 47273304 -Submitted batch job 47273305 -Submitted batch job 47273306 -Submitted batch job 47273307 -Submitted batch job 47273308 -Submitted batch job 47273309 -Submitted batch job 47273310 -Submitted batch job 47273314 -Submitted batch job 47273315 -Submitted batch job 47273316 -Submitted batch job 47273317 -Submitted batch job 47273318 -Submitted batch job 47273319 -Submitted batch job 47273320 -Submitted batch job 47273321 -Submitted batch job 47273322 -Submitted batch job 47273323 -Submitted batch job 47273329 -Submitted batch job 47273330 -Submitted batch job 47273331 -Submitted batch job 47273332 -Submitted batch job 47273333 -Submitted batch job 47273334 -Submitted batch job 47273335 -Submitted batch job 47273336 -Submitted batch job 47273337 -Submitted batch job 47273338 -Submitted batch job 47273389 -Submitted batch job 47273390 -Submitted batch job 47273391 -Submitted batch job 47273392 -Submitted batch job 47273393 -Submitted batch job 47273394 -Submitted batch job 47273395 -Submitted batch job 47273396 -Submitted batch job 47273397 -Submitted batch job 47273398 -Submitted batch job 47273400 -Submitted batch job 47273401 -Submitted batch job 47273402 -Submitted batch job 47273403 -Submitted batch job 47273404 -Submitted batch job 47273405 -Submitted batch job 47273406 -Submitted batch job 47273407 -Submitted batch job 47273408 -Submitted batch job 47273409 -Submitted batch job 47273411 -Submitted batch job 47273412 -Submitted batch job 47273413 -Submitted batch job 47273414 -Submitted batch job 47273415 -Submitted batch job 47273416 -Submitted batch job 47273417 -Submitted batch job 47273418 -Submitted batch job 47273419 -Submitted batch job 47273420 -Submitted batch job 47273424 -Submitted batch job 47273425 -Submitted batch job 47273426 -Submitted batch job 47273427 -Submitted batch job 47273428 -Submitted batch job 47273429 -Submitted batch job 47273430 -Submitted batch job 47273431 -Submitted batch job 47273432 -Submitted batch job 47273433 -Submitted batch job 47273468 -Submitted batch job 47273469 -Submitted batch job 47273470 -Submitted batch job 47273471 -Submitted batch job 47273472 -Submitted batch job 47273473 -Submitted batch job 47273474 -Submitted batch job 47273475 -Submitted batch job 47273476 -Submitted batch job 47273477 -Submitted batch job 47274540 -Submitted batch job 47274541 -Submitted batch job 47274542 -Submitted batch job 47274543 -Submitted batch job 47274544 -Submitted batch job 47274545 -Submitted batch job 47274546 -Submitted batch job 47274547 -Submitted batch job 47274548 -Submitted batch job 47274549 -Submitted batch job 47274552 -Submitted batch job 47274553 -Submitted batch job 47274554 -Submitted batch job 47274555 -Submitted batch job 47274556 -Submitted batch job 47274557 -Submitted batch job 47274558 -Submitted batch job 47274559 -Submitted batch job 47274560 -Submitted batch job 47274561 -Submitted batch job 47274566 -Submitted batch job 47274567 -Submitted batch job 47274568 -Submitted batch job 47274569 -Submitted batch job 47274570 -Submitted batch job 47274571 -Submitted batch job 47274572 -Submitted batch job 47274573 -Submitted batch job 47274574 -Submitted batch job 47274575 -Submitted batch job 47275664 -Submitted batch job 47275665 -Submitted batch job 47275666 -Submitted batch job 47275667 -Submitted batch job 47275668 -Submitted batch job 47275669 -Submitted batch job 47275670 -Submitted batch job 47275671 -Submitted batch job 47275672 -Submitted batch job 47275673 -Submitted batch job 47275674 -Submitted batch job 47275675 -Submitted batch job 47275676 -Submitted batch job 47275677 -Submitted batch job 47275678 -Submitted batch job 47275679 -Submitted batch job 47275680 -Submitted batch job 47275681 -Submitted batch job 47275682 -Submitted batch job 47275683 -Submitted batch job 47275686 -Submitted batch job 47275687 -Submitted batch job 47275688 -Submitted batch job 47275689 -Submitted batch job 47275690 -Submitted batch job 47275691 -Submitted batch job 47275692 -Submitted batch job 47275693 -Submitted batch job 47275694 -Submitted batch job 47275695 -Submitted batch job 47275699 -Submitted batch job 47275700 -Submitted batch job 47275701 -Submitted batch job 47275702 -Submitted batch job 47275703 -Submitted batch job 47275704 -Submitted batch job 47275705 -Submitted batch job 47275706 -Submitted batch job 47275707 -Submitted batch job 47275708 -Submitted batch job 47275715 -Submitted batch job 47275716 -Submitted batch job 47275717 -Submitted batch job 47275718 -Submitted batch job 47275719 -Submitted batch job 47275720 -Submitted batch job 47275721 -Submitted batch job 47275722 -Submitted batch job 47275723 -Submitted batch job 47275724 -Submitted batch job 47275726 -Submitted batch job 47275727 -Submitted batch job 47275728 -Submitted batch job 47275729 -Submitted batch job 47275730 -Submitted batch job 47275731 -Submitted batch job 47275732 -Submitted batch job 47275733 -Submitted batch job 47275734 -Submitted batch job 47275735 -Submitted batch job 47275741 -Submitted batch job 47275742 -Submitted batch job 47275743 -Submitted batch job 47275744 -Submitted batch job 47275745 -Submitted batch job 47275746 -Submitted batch job 47275747 -Submitted batch job 47275748 -Submitted batch job 47275749 -Submitted batch job 47275750 -Submitted batch job 47275758 -Submitted batch job 47275759 -Submitted batch job 47275760 -Submitted batch job 47275761 -Submitted batch job 47275762 -Submitted batch job 47275763 -Submitted batch job 47275764 -Submitted batch job 47275765 -Submitted batch job 47275766 -Submitted batch job 47275767 -Submitted batch job 47275777 -Submitted batch job 47275778 -Submitted batch job 47275779 -Submitted batch job 47275780 -Submitted batch job 47275781 -Submitted batch job 47275782 -Submitted batch job 47275783 -Submitted batch job 47275784 -Submitted batch job 47275785 -Submitted batch job 47275786 -Submitted batch job 47275791 -Submitted batch job 47275792 -Submitted batch job 47275793 -Submitted batch job 47275794 -Submitted batch job 47275795 -Submitted batch job 47275796 -Submitted batch job 47275797 -Submitted batch job 47275798 -Submitted batch job 47275799 -Submitted batch job 47275800 -Submitted batch job 47275807 -Submitted batch job 47275808 -Submitted batch job 47275809 -Submitted batch job 47275810 -Submitted batch job 47275811 -Submitted batch job 47275812 -Submitted batch job 47275813 -Submitted batch job 47275814 -Submitted batch job 47275815 -Submitted batch job 47275816 -Submitted batch job 47275820 -Submitted batch job 47275821 -Submitted batch job 47275822 -Submitted batch job 47275823 -Submitted batch job 47275824 -Submitted batch job 47275825 -Submitted batch job 47275826 -Submitted batch job 47275827 -Submitted batch job 47275828 -Submitted batch job 47275829 -Submitted batch job 47275835 -Submitted batch job 47275836 -Submitted batch job 47275837 -Submitted batch job 47275838 -Submitted batch job 47275839 -Submitted batch job 47275840 -Submitted batch job 47275841 -Submitted batch job 47275842 -Submitted batch job 47275843 -Submitted batch job 47275844 -Submitted batch job 47275847 -Submitted batch job 47275848 -Submitted batch job 47275849 -Submitted batch job 47275850 -Submitted batch job 47275851 -Submitted batch job 47275852 -Submitted batch job 47275853 -Submitted batch job 47275854 -Submitted batch job 47275855 -Submitted batch job 47275856 -Submitted batch job 47275858 -Submitted batch job 47275859 -Submitted batch job 47275860 -Submitted batch job 47275861 -Submitted batch job 47275862 -Submitted batch job 47275863 -Submitted batch job 47275864 -Submitted batch job 47275865 -Submitted batch job 47275866 -Submitted batch job 47275867 -Submitted batch job 47275870 -Submitted batch job 47275871 -Submitted batch job 47275872 -Submitted batch job 47275873 -Submitted batch job 47275874 -Submitted batch job 47275875 -Submitted batch job 47275876 -Submitted batch job 47275877 -Submitted batch job 47275878 -Submitted batch job 47275879 -Submitted batch job 47275935 -Submitted batch job 47275936 -Submitted batch job 47275937 -Submitted batch job 47275938 -Submitted batch job 47275939 -Submitted batch job 47275940 -Submitted batch job 47275941 -Submitted batch job 47275942 -Submitted batch job 47275943 -Submitted batch job 47275944 -Submitted batch job 47275990 -Submitted batch job 47275991 -Submitted batch job 47275992 -Submitted batch job 47275993 -Submitted batch job 47275994 -Submitted batch job 47275995 -Submitted batch job 47275996 -Submitted batch job 47275997 -Submitted batch job 47275998 -Submitted batch job 47275999 -Submitted batch job 47276040 -Submitted batch job 47276041 -Submitted batch job 47276042 -Submitted batch job 47276043 -Submitted batch job 47276044 -Submitted batch job 47276045 -Submitted batch job 47276046 -Submitted batch job 47276047 -Submitted batch job 47276048 -Submitted batch job 47276049 -Submitted batch job 47276053 -Submitted batch job 47276054 -Submitted batch job 47276055 -Submitted batch job 47276056 -Submitted batch job 47276057 -Submitted batch job 47276058 -Submitted batch job 47276059 -Submitted batch job 47276060 -Submitted batch job 47276061 -Submitted batch job 47276062 -Submitted batch job 47276065 -Submitted batch job 47276066 -Submitted batch job 47276067 -Submitted batch job 47276068 -Submitted batch job 47276069 -Submitted batch job 47276070 -Submitted batch job 47276071 -Submitted batch job 47276072 -Submitted batch job 47276073 -Submitted batch job 47276074 -Submitted batch job 47276082 -Submitted batch job 47276083 -Submitted batch job 47276084 -Submitted batch job 47276085 -Submitted batch job 47276086 -Submitted batch job 47276087 -Submitted batch job 47276088 -Submitted batch job 47276089 -Submitted batch job 47276090 -Submitted batch job 47276091 -Submitted batch job 47276093 -Submitted batch job 47276094 -Submitted batch job 47276095 -Submitted batch job 47276096 -Submitted batch job 47276097 -Submitted batch job 47276098 -Submitted batch job 47276099 -Submitted batch job 47276100 -Submitted batch job 47276101 -Submitted batch job 47276102 -Submitted batch job 47276128 -Submitted batch job 47276129 -Submitted batch job 47276130 -Submitted batch job 47276131 -Submitted batch job 47276132 -Submitted batch job 47276133 -Submitted batch job 47276134 -Submitted batch job 47276135 -Submitted batch job 47276136 -Submitted batch job 47276137 -Submitted batch job 47276164 -Submitted batch job 47276165 -Submitted batch job 47276166 -Submitted batch job 47276167 -Submitted batch job 47276168 -Submitted batch job 47276169 -Submitted batch job 47276170 -Submitted batch job 47276171 -Submitted batch job 47276172 -Submitted batch job 47276173 -Submitted batch job 47276179 -Submitted batch job 47276180 -Submitted batch job 47276181 -Submitted batch job 47276182 -Submitted batch job 47276183 -Submitted batch job 47276184 -Submitted batch job 47276185 -Submitted batch job 47276186 -Submitted batch job 47276187 -Submitted batch job 47276188 -Submitted batch job 47276194 -Submitted batch job 47276195 -Submitted batch job 47276196 -Submitted batch job 47276197 -Submitted batch job 47276198 -Submitted batch job 47276199 -Submitted batch job 47276200 -Submitted batch job 47276201 -Submitted batch job 47276202 -Submitted batch job 47276203 -Submitted batch job 47276208 -Submitted batch job 47276209 -Submitted batch job 47276210 -Submitted batch job 47276211 -Submitted batch job 47276212 -Submitted batch job 47276213 -Submitted batch job 47276214 -Submitted batch job 47276215 -Submitted batch job 47276216 -Submitted batch job 47276217 -Submitted batch job 47276221 -Submitted batch job 47276222 -Submitted batch job 47276223 -Submitted batch job 47276224 -Submitted batch job 47276225 -Submitted batch job 47276226 -Submitted batch job 47276227 -Submitted batch job 47276228 -Submitted batch job 47276229 -Submitted batch job 47276230 -Submitted batch job 47276234 -Submitted batch job 47276235 -Submitted batch job 47276236 -Submitted batch job 47276237 -Submitted batch job 47276238 -Submitted batch job 47276239 -Submitted batch job 47276240 -Submitted batch job 47276241 -Submitted batch job 47276242 -Submitted batch job 47276243 -Submitted batch job 47276325 -Submitted batch job 47276326 -Submitted batch job 47276327 -Submitted batch job 47276328 -Submitted batch job 47276329 -Submitted batch job 47276330 -Submitted batch job 47276331 -Submitted batch job 47276332 -Submitted batch job 47276333 -Submitted batch job 47276334 -Submitted batch job 47276336 -Submitted batch job 47276337 -Submitted batch job 47276338 -Submitted batch job 47276339 -Submitted batch job 47276340 -Submitted batch job 47276341 -Submitted batch job 47276342 -Submitted batch job 47276343 -Submitted batch job 47276344 -Submitted batch job 47276345 -Submitted batch job 47276346 -Submitted batch job 47276347 -Submitted batch job 47276348 -Submitted batch job 47276349 -Submitted batch job 47276350 -Submitted batch job 47276351 -Submitted batch job 47276352 -Submitted batch job 47276353 -Submitted batch job 47276354 -Submitted batch job 47276355 -Submitted batch job 47276356 -Submitted batch job 47276357 -Submitted batch job 47276358 -Submitted batch job 47276359 -Submitted batch job 47276360 -Submitted batch job 47276361 -Submitted batch job 47276362 -Submitted batch job 47276363 -Submitted batch job 47276364 -Submitted batch job 47276365 -Submitted batch job 47276408 -Submitted batch job 47276409 -Submitted batch job 47276410 -Submitted batch job 47276411 -Submitted batch job 47276412 -Submitted batch job 47276413 -Submitted batch job 47276414 -Submitted batch job 47276415 -Submitted batch job 47276416 -Submitted batch job 47276417 -Submitted batch job 47276420 -Submitted batch job 47276421 -Submitted batch job 47276422 -Submitted batch job 47276423 -Submitted batch job 47276424 -Submitted batch job 47276425 -Submitted batch job 47276426 -Submitted batch job 47276427 -Submitted batch job 47276428 -Submitted batch job 47276429 -Submitted batch job 47276442 -Submitted batch job 47276443 -Submitted batch job 47276444 -Submitted batch job 47276445 -Submitted batch job 47276446 -Submitted batch job 47276447 -Submitted batch job 47276448 -Submitted batch job 47276449 -Submitted batch job 47276450 -Submitted batch job 47276451 -Submitted batch job 47276453 -Submitted batch job 47276454 -Submitted batch job 47276455 -Submitted batch job 47276456 -Submitted batch job 47276457 -Submitted batch job 47276458 -Submitted batch job 47276459 -Submitted batch job 47276460 -Submitted batch job 47276461 -Submitted batch job 47276462 -Submitted batch job 47276463 -Submitted batch job 47276464 -Submitted batch job 47276465 -Submitted batch job 47276466 -Submitted batch job 47276467 -Submitted batch job 47276468 -Submitted batch job 47276469 -Submitted batch job 47276470 -Submitted batch job 47276471 -Submitted batch job 47276472 -Submitted batch job 47276473 -Submitted batch job 47276474 -Submitted batch job 47276475 -Submitted batch job 47276476 -Submitted batch job 47276477 -Submitted batch job 47276478 -Submitted batch job 47276479 -Submitted batch job 47276480 -Submitted batch job 47276481 -Submitted batch job 47276482 -Submitted batch job 47276495 -Submitted batch job 47276496 -Submitted batch job 47276497 -Submitted batch job 47276498 -Submitted batch job 47276499 -Submitted batch job 47276500 -Submitted batch job 47276501 -Submitted batch job 47276502 -Submitted batch job 47276503 -Submitted batch job 47276504 -Submitted batch job 47276506 -Submitted batch job 47276507 -Submitted batch job 47276508 -Submitted batch job 47276509 -Submitted batch job 47276510 -Submitted batch job 47276511 -Submitted batch job 47276512 -Submitted batch job 47276513 -Submitted batch job 47276514 -Submitted batch job 47276515 -Submitted batch job 47276516 -Submitted batch job 47276517 -Submitted batch job 47276518 -Submitted batch job 47276519 -Submitted batch job 47276520 -Submitted batch job 47276521 -Submitted batch job 47276522 -Submitted batch job 47276523 -Submitted batch job 47276524 -Submitted batch job 47276525 -Submitted batch job 47276526 -Submitted batch job 47276527 -Submitted batch job 47276528 -Submitted batch job 47276529 -Submitted batch job 47276530 -Submitted batch job 47276531 -Submitted batch job 47276532 -Submitted batch job 47276533 -Submitted batch job 47276534 -Submitted batch job 47276535 -Submitted batch job 47276536 -Submitted batch job 47276537 -Submitted batch job 47276538 -Submitted batch job 47276539 -Submitted batch job 47276540 -Submitted batch job 47276541 -Submitted batch job 47276542 -Submitted batch job 47276543 -Submitted batch job 47276544 -Submitted batch job 47276545 -Submitted batch job 47276546 -Submitted batch job 47276547 -Submitted batch job 47276548 -Submitted batch job 47276549 -Submitted batch job 47276550 -Submitted batch job 47276551 -Submitted batch job 47276552 -Submitted batch job 47276553 -Submitted batch job 47276554 -Submitted batch job 47276555 -Submitted batch job 47276556 -Submitted batch job 47276557 -Submitted batch job 47276558 -Submitted batch job 47276559 -Submitted batch job 47276560 -Submitted batch job 47276561 -Submitted batch job 47276562 -Submitted batch job 47276563 -Submitted batch job 47276564 -Submitted batch job 47276565 -Submitted batch job 47276567 -Submitted batch job 47276568 -Submitted batch job 47276569 -Submitted batch job 47276570 -Submitted batch job 47276571 -Submitted batch job 47276572 -Submitted batch job 47276573 -Submitted batch job 47276574 -Submitted batch job 47276575 -Submitted batch job 47276576 -Submitted batch job 47276580 -Submitted batch job 47276581 -Submitted batch job 47276582 -Submitted batch job 47276583 -Submitted batch job 47276584 -Submitted batch job 47276585 -Submitted batch job 47276586 -Submitted batch job 47276587 -Submitted batch job 47276588 -Submitted batch job 47276589 -Submitted batch job 47276590 -Submitted batch job 47276591 -Submitted batch job 47276592 -Submitted batch job 47276593 -Submitted batch job 47276594 -Submitted batch job 47276595 -Submitted batch job 47276596 -Submitted batch job 47276597 -Submitted batch job 47276598 -Submitted batch job 47276599 -Submitted batch job 47276600 -Submitted batch job 47276601 -Submitted batch job 47276602 -Submitted batch job 47276603 -Submitted batch job 47276604 -Submitted batch job 47276605 -Submitted batch job 47276606 -Submitted batch job 47276607 -Submitted batch job 47276608 -Submitted batch job 47276609 -Submitted batch job 47276610 -Submitted batch job 47276611 -Submitted batch job 47276612 -Submitted batch job 47276613 -Submitted batch job 47276614 -Submitted batch job 47276615 -Submitted batch job 47276616 -Submitted batch job 47276617 -Submitted batch job 47276618 -Submitted batch job 47276619 -Submitted batch job 47276620 -Submitted batch job 47276621 -Submitted batch job 47276622 -Submitted batch job 47276623 -Submitted batch job 47276624 -Submitted batch job 47276625 -Submitted batch job 47276626 -Submitted batch job 47276627 -Submitted batch job 47276628 -Submitted batch job 47276629 -Submitted batch job 47276672 -Submitted batch job 47276673 -Submitted batch job 47276674 -Submitted batch job 47276675 -Submitted batch job 47276676 -Submitted batch job 47276677 -Submitted batch job 47276678 -Submitted batch job 47276679 -Submitted batch job 47276680 -Submitted batch job 47276681 -Submitted batch job 47276682 -Submitted batch job 47276683 -Submitted batch job 47276684 -Submitted batch job 47276685 -Submitted batch job 47276686 -Submitted batch job 47276687 -Submitted batch job 47276688 -Submitted batch job 47276689 -Submitted batch job 47276690 -Submitted batch job 47276691 -Submitted batch job 47276692 -Submitted batch job 47276693 -Submitted batch job 47276694 -Submitted batch job 47276695 -Submitted batch job 47276696 -Submitted batch job 47276697 -Submitted batch job 47276698 -Submitted batch job 47276699 -Submitted batch job 47276700 -Submitted batch job 47276701 -Submitted batch job 47276702 -Submitted batch job 47276703 -Submitted batch job 47276704 -Submitted batch job 47276705 -Submitted batch job 47276706 -Submitted batch job 47276707 -Submitted batch job 47276708 -Submitted batch job 47276709 -Submitted batch job 47276710 -Submitted batch job 47276711 -Submitted batch job 47276712 -Submitted batch job 47276713 -Submitted batch job 47276714 -Submitted batch job 47276715 -Submitted batch job 47276716 -Submitted batch job 47276717 -Submitted batch job 47276718 -Submitted batch job 47276719 -Submitted batch job 47276720 -Submitted batch job 47276721 -Submitted batch job 47276722 -Submitted batch job 47276723 -Submitted batch job 47276724 -Submitted batch job 47276725 -Submitted batch job 47276726 -Submitted batch job 47276727 -Submitted batch job 47276728 -Submitted batch job 47276729 -Submitted batch job 47276730 -Submitted batch job 47276731 -Submitted batch job 47276732 -Submitted batch job 47276733 -Submitted batch job 47276734 -Submitted batch job 47276735 -Submitted batch job 47276736 -Submitted batch job 47276737 -Submitted batch job 47276738 -Submitted batch job 47276739 -Submitted batch job 47276740 -Submitted batch job 47276741 -Submitted batch job 47276744 -Submitted batch job 47276745 -Submitted batch job 47276746 -Submitted batch job 47276747 -Submitted batch job 47276748 -Submitted batch job 47276749 -Submitted batch job 47276750 -Submitted batch job 47276751 -Submitted batch job 47276752 -Submitted batch job 47276753 -Submitted batch job 47276755 -Submitted batch job 47276756 -Submitted batch job 47276757 -Submitted batch job 47276758 -Submitted batch job 47276759 -Submitted batch job 47276760 -Submitted batch job 47276761 -Submitted batch job 47276762 -Submitted batch job 47276763 -Submitted batch job 47276764 -Submitted batch job 47276768 -Submitted batch job 47276769 -Submitted batch job 47276770 -Submitted batch job 47276771 -Submitted batch job 47276772 -Submitted batch job 47276773 -Submitted batch job 47276774 -Submitted batch job 47276775 -Submitted batch job 47276776 -Submitted batch job 47276777 -Submitted batch job 47276778 -Submitted batch job 47276779 -Submitted batch job 47276780 -Submitted batch job 47276781 -Submitted batch job 47276782 -Submitted batch job 47276783 -Submitted batch job 47276784 -Submitted batch job 47276785 -Submitted batch job 47276786 -Submitted batch job 47276787 -Submitted batch job 47276788 -Submitted batch job 47276789 -Submitted batch job 47276790 -Submitted batch job 47276791 -Submitted batch job 47276792 -Submitted batch job 47276793 -Submitted batch job 47276794 -Submitted batch job 47276795 -Submitted batch job 47276796 -Submitted batch job 47276797 -Submitted batch job 47276798 -Submitted batch job 47276799 -Submitted batch job 47276800 -Submitted batch job 47276801 -Submitted batch job 47276802 -Submitted batch job 47276803 -Submitted batch job 47276804 -Submitted batch job 47276805 -Submitted batch job 47276806 -Submitted batch job 47276807 -Submitted batch job 47276808 -Submitted batch job 47276809 -Submitted batch job 47276810 -Submitted batch job 47276811 -Submitted batch job 47276812 -Submitted batch job 47276813 -Submitted batch job 47276814 -Submitted batch job 47276815 -Submitted batch job 47276816 -Submitted batch job 47276817 -Submitted batch job 47276877 -Submitted batch job 47276878 -Submitted batch job 47276879 -Submitted batch job 47276880 -Submitted batch job 47276881 -Submitted batch job 47276882 -Submitted batch job 47276883 -Submitted batch job 47276884 -Submitted batch job 47276885 -Submitted batch job 47276886 -Submitted batch job 47276887 -Submitted batch job 47276888 -Submitted batch job 47276889 -Submitted batch job 47276890 -Submitted batch job 47276891 -Submitted batch job 47276892 -Submitted batch job 47276893 -Submitted batch job 47276894 -Submitted batch job 47276895 -Submitted batch job 47276896 -Submitted batch job 47276898 -Submitted batch job 47276899 -Submitted batch job 47276900 -Submitted batch job 47276901 -Submitted batch job 47276902 -Submitted batch job 47276903 -Submitted batch job 47276904 -Submitted batch job 47276905 -Submitted batch job 47276906 -Submitted batch job 47276907 -Submitted batch job 47276908 -Submitted batch job 47276909 -Submitted batch job 47276910 -Submitted batch job 47276911 -Submitted batch job 47276912 -Submitted batch job 47276913 -Submitted batch job 47276914 -Submitted batch job 47276915 -Submitted batch job 47276916 -Submitted batch job 47276917 -Submitted batch job 47276918 -Submitted batch job 47276919 -Submitted batch job 47276920 -Submitted batch job 47276921 -Submitted batch job 47276922 -Submitted batch job 47276923 -Submitted batch job 47276924 -Submitted batch job 47276925 -Submitted batch job 47276926 -Submitted batch job 47276927 -Submitted batch job 47276928 -Submitted batch job 47276929 -Submitted batch job 47276930 -Submitted batch job 47276931 -Submitted batch job 47276932 -Submitted batch job 47276933 -Submitted batch job 47276934 -Submitted batch job 47276935 -Submitted batch job 47276936 -Submitted batch job 47276937 -Submitted batch job 47276938 -Submitted batch job 47276939 -Submitted batch job 47276940 -Submitted batch job 47276941 -Submitted batch job 47276942 -Submitted batch job 47276943 -Submitted batch job 47276944 -Submitted batch job 47276945 -Submitted batch job 47276946 -Submitted batch job 47276947 -Submitted batch job 47276948 -Submitted batch job 47276949 -Submitted batch job 47276950 -Submitted batch job 47276951 -Submitted batch job 47276952 -Submitted batch job 47276953 -Submitted batch job 47276954 -Submitted batch job 47276955 -Submitted batch job 47276956 -Submitted batch job 47276957 -Submitted batch job 47276958 -Submitted batch job 47276959 -Submitted batch job 47276960 -Submitted batch job 47276961 -Submitted batch job 47276962 -Submitted batch job 47276963 -Submitted batch job 47276964 -Submitted batch job 47276965 -Submitted batch job 47276966 -Submitted batch job 47276967 -Submitted batch job 47276968 -Submitted batch job 47276969 -Submitted batch job 47276970 -Submitted batch job 47276971 -Submitted batch job 47276972 -Submitted batch job 47276973 -Submitted batch job 47276974 -Submitted batch job 47276975 -Submitted batch job 47276976 -Submitted batch job 47276977 -Submitted batch job 47276978 -Submitted batch job 47276979 -Submitted batch job 47276980 -Submitted batch job 47276981 -Submitted batch job 47276982 -Submitted batch job 47276983 -Submitted batch job 47276984 -Submitted batch job 47276985 -Submitted batch job 47276986 -Submitted batch job 47276987 -Submitted batch job 47276988 -Submitted batch job 47276989 -Submitted batch job 47276990 -Submitted batch job 47276991 -Submitted batch job 47276992 -Submitted batch job 47276993 -Submitted batch job 47276994 -Submitted batch job 47276995 -Submitted batch job 47276996 -Submitted batch job 47276997 -Submitted batch job 47276998 -Submitted batch job 47276999 -Submitted batch job 47277000 -Submitted batch job 47277001 -Submitted batch job 47277002 -Submitted batch job 47277003 -Submitted batch job 47277004 -Submitted batch job 47277005 -Submitted batch job 47277006 -Submitted batch job 47277007 -Submitted batch job 47277008 -Submitted batch job 47277009 -Submitted batch job 47277010 -Submitted batch job 47277011 -Submitted batch job 47277012 -Submitted batch job 47277013 -Submitted batch job 47277014 -Submitted batch job 47277015 -Submitted batch job 47277016 -Submitted batch job 47277017 -Submitted batch job 47277019 -Submitted batch job 47277020 -Submitted batch job 47277021 -Submitted batch job 47277022 -Submitted batch job 47277023 -Submitted batch job 47277024 -Submitted batch job 47277025 -Submitted batch job 47277026 -Submitted batch job 47277027 -Submitted batch job 47277028 -Submitted batch job 47277029 -Submitted batch job 47277030 -Submitted batch job 47277031 -Submitted batch job 47277032 -Submitted batch job 47277033 -Submitted batch job 47277034 -Submitted batch job 47277035 -Submitted batch job 47277036 -Submitted batch job 47277037 -Submitted batch job 47277038 -Submitted batch job 47277288 -Submitted batch job 47277289 -Submitted batch job 47277290 -Submitted batch job 47277291 -Submitted batch job 47277292 -Submitted batch job 47277293 -Submitted batch job 47277294 -Submitted batch job 47277295 -Submitted batch job 47277296 -Submitted batch job 47277297 -Submitted batch job 47277302 -Submitted batch job 47277303 -Submitted batch job 47277304 -Submitted batch job 47277305 -Submitted batch job 47277306 -Submitted batch job 47277307 -Submitted batch job 47277308 -Submitted batch job 47277309 -Submitted batch job 47277310 -Submitted batch job 47277311 -Submitted batch job 47277312 -Submitted batch job 47277313 -Submitted batch job 47277314 -Submitted batch job 47277315 -Submitted batch job 47277316 -Submitted batch job 47277317 -Submitted batch job 47277318 -Submitted batch job 47277319 -Submitted batch job 47277320 -Submitted batch job 47277321 -Submitted batch job 47277322 -Submitted batch job 47277323 -Submitted batch job 47277324 -Submitted batch job 47277325 -Submitted batch job 47277326 -Submitted batch job 47277327 -Submitted batch job 47277328 -Submitted batch job 47277329 -Submitted batch job 47277330 -Submitted batch job 47277331 -Submitted batch job 47277332 -Submitted batch job 47277333 -Submitted batch job 47277334 -Submitted batch job 47277335 -Submitted batch job 47277336 -Submitted batch job 47277337 -Submitted batch job 47277338 -Submitted batch job 47277339 -Submitted batch job 47277340 -Submitted batch job 47277341 -Submitted batch job 47277342 -Submitted batch job 47277343 -Submitted batch job 47277344 -Submitted batch job 47277345 -Submitted batch job 47277346 -Submitted batch job 47277347 -Submitted batch job 47277348 -Submitted batch job 47277349 -Submitted batch job 47277350 -Submitted batch job 47277351 -Submitted batch job 47277352 -Submitted batch job 47277353 -Submitted batch job 47277354 -Submitted batch job 47277355 -Submitted batch job 47277356 -Submitted batch job 47277357 -Submitted batch job 47277358 -Submitted batch job 47277359 -Submitted batch job 47277360 -Submitted batch job 47277361 -Submitted batch job 47277365 -Submitted batch job 47277366 -Submitted batch job 47277367 -Submitted batch job 47277368 -Submitted batch job 47277369 -Submitted batch job 47277370 -Submitted batch job 47277371 -Submitted batch job 47277372 -Submitted batch job 47277373 -Submitted batch job 47277374 -Submitted batch job 47277375 -Submitted batch job 47277376 -Submitted batch job 47277377 -Submitted batch job 47277378 -Submitted batch job 47277379 -Submitted batch job 47277380 -Submitted batch job 47277381 -Submitted batch job 47277382 -Submitted batch job 47277383 -Submitted batch job 47277384 -Submitted batch job 47277385 -Submitted batch job 47277386 -Submitted batch job 47277387 -Submitted batch job 47277388 -Submitted batch job 47277389 -Submitted batch job 47277390 -Submitted batch job 47277391 -Submitted batch job 47277392 -Submitted batch job 47277393 -Submitted batch job 47277394 -Submitted batch job 47277395 -Submitted batch job 47277396 -Submitted batch job 47277397 -Submitted batch job 47277398 -Submitted batch job 47277399 -Submitted batch job 47277400 -Submitted batch job 47277401 -Submitted batch job 47277402 -Submitted batch job 47277403 -Submitted batch job 47277404 -Submitted batch job 47277405 -Submitted batch job 47277406 -Submitted batch job 47277407 -Submitted batch job 47277408 -Submitted batch job 47277409 -Submitted batch job 47277410 -Submitted batch job 47277411 -Submitted batch job 47277412 -Submitted batch job 47277413 -Submitted batch job 47277414 -Submitted batch job 47277415 -Submitted batch job 47277416 -Submitted batch job 47277417 -Submitted batch job 47277418 -Submitted batch job 47277419 -Submitted batch job 47277420 -Submitted batch job 47277421 -Submitted batch job 47277422 -Submitted batch job 47277423 -Submitted batch job 47277424 -Submitted batch job 47277425 -Submitted batch job 47277426 -Submitted batch job 47277427 -Submitted batch job 47277428 -Submitted batch job 47277429 -Submitted batch job 47277430 -Submitted batch job 47277431 -Submitted batch job 47277432 -Submitted batch job 47277433 -Submitted batch job 47277434 -Submitted batch job 47277435 -Submitted batch job 47277436 -Submitted batch job 47277437 -Submitted batch job 47277438 -Submitted batch job 47277439 -Submitted batch job 47277440 -Submitted batch job 47277441 -Submitted batch job 47277442 -Submitted batch job 47277443 -Submitted batch job 47277444 -Submitted batch job 47277445 -Submitted batch job 47277446 -Submitted batch job 47277447 -Submitted batch job 47277448 -Submitted batch job 47277449 -Submitted batch job 47277450 -Submitted batch job 47277451 -Submitted batch job 47277452 -Submitted batch job 47277453 -Submitted batch job 47277454 -Submitted batch job 47277455 -Submitted batch job 47277456 -Submitted batch job 47277457 -Submitted batch job 47277458 -Submitted batch job 47277459 -Submitted batch job 47277460 -Submitted batch job 47277461 -Submitted batch job 47277462 -Submitted batch job 47277463 -Submitted batch job 47277464 -Submitted batch job 47277465 -Submitted batch job 47277466 -Submitted batch job 47277467 -Submitted batch job 47277468 -Submitted batch job 47277469 -Submitted batch job 47277470 -Submitted batch job 47277471 -Submitted batch job 47277472 -Submitted batch job 47277473 -Submitted batch job 47277474 -Submitted batch job 47277475 -Submitted batch job 47277476 -Submitted batch job 47277477 -Submitted batch job 47277478 -Submitted batch job 47277479 -Submitted batch job 47277480 -Submitted batch job 47277481 -Submitted batch job 47277482 -Submitted batch job 47277483 -Submitted batch job 47277484 -Submitted batch job 47277485 -Submitted batch job 47277486 -Submitted batch job 47277487 -Submitted batch job 47277488 -Submitted batch job 47277489 -Submitted batch job 47277490 -Submitted batch job 47277491 -Submitted batch job 47277492 -Submitted batch job 47277493 -Submitted batch job 47277494 -Submitted batch job 47277495 -Submitted batch job 47277496 -Submitted batch job 47277497 -Submitted batch job 47277498 -Submitted batch job 47277499 -Submitted batch job 47277500 -Submitted batch job 47277501 -Submitted batch job 47277502 -Submitted batch job 47277503 -Submitted batch job 47277504 -Submitted batch job 47277505 -Submitted batch job 47277506 -Submitted batch job 47277507 -Submitted batch job 47277508 -Submitted batch job 47277509 -Submitted batch job 47277510 -Submitted batch job 47277511 -Submitted batch job 47277512 -Submitted batch job 47277513 -Submitted batch job 47277514 -Submitted batch job 47277515 -Submitted batch job 47277516 -Submitted batch job 47277517 -Submitted batch job 47277518 -Submitted batch job 47277519 -Submitted batch job 47277520 -Submitted batch job 47277521 -Submitted batch job 47277522 -Submitted batch job 47277523 -Submitted batch job 47277524 -Submitted batch job 47277525 -Submitted batch job 47277526 -Submitted batch job 47277527 -Submitted batch job 47277528 -Submitted batch job 47277529 -Submitted batch job 47277530 -Submitted batch job 47277531 -Submitted batch job 47277532 -Submitted batch job 47277533 -Submitted batch job 47277534 -Submitted batch job 47277535 -Submitted batch job 47277536 -Submitted batch job 47277537 -Submitted batch job 47277538 -Submitted batch job 47277539 -Submitted batch job 47277540 -Submitted batch job 47277541 -Submitted batch job 47277542 -Submitted batch job 47277543 -Submitted batch job 47277544 -Submitted batch job 47277548 -Submitted batch job 47277549 -Submitted batch job 47277550 -Submitted batch job 47277551 -Submitted batch job 47277552 -Submitted batch job 47277553 -Submitted batch job 47277554 -Submitted batch job 47277555 -Submitted batch job 47277556 -Submitted batch job 47277557 -Submitted batch job 47277558 -Submitted batch job 47277559 -Submitted batch job 47277560 -Submitted batch job 47277561 -Submitted batch job 47277562 -Submitted batch job 47277563 -Submitted batch job 47277564 -Submitted batch job 47277565 -Submitted batch job 47277566 -Submitted batch job 47277567 -Submitted batch job 47277568 -Submitted batch job 47277569 -Submitted batch job 47277570 -Submitted batch job 47277571 -Submitted batch job 47277572 -Submitted batch job 47277573 -Submitted batch job 47277574 -Submitted batch job 47277575 -Submitted batch job 47277576 -Submitted batch job 47277577 -Submitted batch job 47277579 -Submitted batch job 47277580 -Submitted batch job 47277581 -Submitted batch job 47277582 -Submitted batch job 47277583 -Submitted batch job 47277584 -Submitted batch job 47277585 -Submitted batch job 47277586 -Submitted batch job 47277587 -Submitted batch job 47277588 -Submitted batch job 47277590 -Submitted batch job 47277591 -Submitted batch job 47277592 -Submitted batch job 47277593 -Submitted batch job 47277594 -Submitted batch job 47277595 -Submitted batch job 47277596 -Submitted batch job 47277597 -Submitted batch job 47277598 -Submitted batch job 47277599 -Submitted batch job 47277601 -Submitted batch job 47277602 -Submitted batch job 47277603 -Submitted batch job 47277604 -Submitted batch job 47277605 -Submitted batch job 47277606 -Submitted batch job 47277607 -Submitted batch job 47277608 -Submitted batch job 47277609 -Submitted batch job 47277610 -Submitted batch job 47277611 -Submitted batch job 47277612 -Submitted batch job 47277613 -Submitted batch job 47277614 -Submitted batch job 47277615 -Submitted batch job 47277616 -Submitted batch job 47277617 -Submitted batch job 47277618 -Submitted batch job 47277619 -Submitted batch job 47277620 -Submitted batch job 47277621 -Submitted batch job 47277622 -Submitted batch job 47277623 -Submitted batch job 47277624 -Submitted batch job 47277625 -Submitted batch job 47277626 -Submitted batch job 47277627 -Submitted batch job 47277628 -Submitted batch job 47277629 -Submitted batch job 47277630 -Submitted batch job 47277631 -Submitted batch job 47277632 -Submitted batch job 47277633 -Submitted batch job 47277634 -Submitted batch job 47277635 -Submitted batch job 47277636 -Submitted batch job 47277637 -Submitted batch job 47277638 -Submitted batch job 47277639 -Submitted batch job 47277640 -Submitted batch job 47277646 -Submitted batch job 47277647 -Submitted batch job 47277648 -Submitted batch job 47277649 -Submitted batch job 47277650 -Submitted batch job 47277651 -Submitted batch job 47277652 -Submitted batch job 47277653 -Submitted batch job 47277654 -Submitted batch job 47277655 -Submitted batch job 47277660 -Submitted batch job 47277661 -Submitted batch job 47277662 -Submitted batch job 47277663 -Submitted batch job 47277664 -Submitted batch job 47277665 -Submitted batch job 47277666 -Submitted batch job 47277667 -Submitted batch job 47277668 -Submitted batch job 47277669 -Submitted batch job 47277671 -Submitted batch job 47277672 -Submitted batch job 47277673 -Submitted batch job 47277674 -Submitted batch job 47277675 -Submitted batch job 47277676 -Submitted batch job 47277677 -Submitted batch job 47277678 -Submitted batch job 47277679 -Submitted batch job 47277680 -Submitted batch job 47278642 -Submitted batch job 47278643 -Submitted batch job 47278644 -Submitted batch job 47278645 -Submitted batch job 47278646 -Submitted batch job 47278647 -Submitted batch job 47278648 -Submitted batch job 47278649 -Submitted batch job 47278650 -Submitted batch job 47278651 -Submitted batch job 47278652 -Submitted batch job 47278653 -Submitted batch job 47278654 -Submitted batch job 47278655 -Submitted batch job 47278656 -Submitted batch job 47278657 -Submitted batch job 47278658 -Submitted batch job 47278659 -Submitted batch job 47278660 -Submitted batch job 47278661 -Submitted batch job 47278663 -Submitted batch job 47278664 -Submitted batch job 47278665 -Submitted batch job 47278666 -Submitted batch job 47278667 -Submitted batch job 47278668 -Submitted batch job 47278669 -Submitted batch job 47278670 -Submitted batch job 47278671 -Submitted batch job 47278672 -Submitted batch job 47278674 -Submitted batch job 47278675 -Submitted batch job 47278676 -Submitted batch job 47278677 -Submitted batch job 47278678 -Submitted batch job 47278679 -Submitted batch job 47278680 -Submitted batch job 47278681 -Submitted batch job 47278682 -Submitted batch job 47278683 -Submitted batch job 47278684 -Submitted batch job 47278685 -Submitted batch job 47278686 -Submitted batch job 47278687 -Submitted batch job 47278688 -Submitted batch job 47278689 -Submitted batch job 47278690 -Submitted batch job 47278691 -Submitted batch job 47278692 -Submitted batch job 47278693 -Submitted batch job 47278694 -Submitted batch job 47278695 -Submitted batch job 47278696 -Submitted batch job 47278697 -Submitted batch job 47278698 -Submitted batch job 47278699 -Submitted batch job 47278700 -Submitted batch job 47278701 -Submitted batch job 47278702 -Submitted batch job 47278703 -Submitted batch job 47278704 -Submitted batch job 47278705 -Submitted batch job 47278706 -Submitted batch job 47278707 -Submitted batch job 47278708 -Submitted batch job 47278709 -Submitted batch job 47278710 -Submitted batch job 47278711 -Submitted batch job 47278712 -Submitted batch job 47278713 -Submitted batch job 47278718 -Submitted batch job 47278719 -Submitted batch job 47278720 -Submitted batch job 47278721 -Submitted batch job 47278722 -Submitted batch job 47278723 -Submitted batch job 47278724 -Submitted batch job 47278725 -Submitted batch job 47278726 -Submitted batch job 47278728 -Submitted batch job 47278749 -Submitted batch job 47278750 -Submitted batch job 47278751 -Submitted batch job 47278752 -Submitted batch job 47278753 -Submitted batch job 47278754 -Submitted batch job 47278755 -Submitted batch job 47278756 -Submitted batch job 47278757 -Submitted batch job 47278758 -Submitted batch job 47278763 -Submitted batch job 47278764 -Submitted batch job 47278765 -Submitted batch job 47278766 -Submitted batch job 47278767 -Submitted batch job 47278768 -Submitted batch job 47278769 -Submitted batch job 47278770 -Submitted batch job 47278771 -Submitted batch job 47278772 -Submitted batch job 47278784 -Submitted batch job 47278785 -Submitted batch job 47278786 -Submitted batch job 47278787 -Submitted batch job 47278788 -Submitted batch job 47278789 -Submitted batch job 47278790 -Submitted batch job 47278791 -Submitted batch job 47278792 -Submitted batch job 47278793 -Submitted batch job 47278794 -Submitted batch job 47278795 -Submitted batch job 47278796 -Submitted batch job 47278797 -Submitted batch job 47278798 -Submitted batch job 47278799 -Submitted batch job 47278800 -Submitted batch job 47278801 -Submitted batch job 47278802 -Submitted batch job 47278803 -Submitted batch job 47278805 -Submitted batch job 47278806 -Submitted batch job 47278807 -Submitted batch job 47278808 -Submitted batch job 47278809 -Submitted batch job 47278810 -Submitted batch job 47278811 -Submitted batch job 47278812 -Submitted batch job 47278813 -Submitted batch job 47278814 -Submitted batch job 47278833 -Submitted batch job 47278834 -Submitted batch job 47278835 -Submitted batch job 47278836 -Submitted batch job 47278837 -Submitted batch job 47278838 -Submitted batch job 47278839 -Submitted batch job 47278840 -Submitted batch job 47278841 -Submitted batch job 47278842 -Submitted batch job 47278862 -Submitted batch job 47278863 -Submitted batch job 47278864 -Submitted batch job 47278865 -Submitted batch job 47278866 -Submitted batch job 47278867 -Submitted batch job 47278868 -Submitted batch job 47278869 -Submitted batch job 47278870 -Submitted batch job 47278871 -Submitted batch job 47278872 -Submitted batch job 47278873 -Submitted batch job 47278874 -Submitted batch job 47278875 -Submitted batch job 47278876 -Submitted batch job 47278877 -Submitted batch job 47278878 -Submitted batch job 47278879 -Submitted batch job 47278880 -Submitted batch job 47278881 -Submitted batch job 47278882 -Submitted batch job 47278883 -Submitted batch job 47278884 -Submitted batch job 47278885 -Submitted batch job 47278886 -Submitted batch job 47278887 -Submitted batch job 47278888 -Submitted batch job 47278889 -Submitted batch job 47278890 -Submitted batch job 47278891 -Submitted batch job 47278930 -Submitted batch job 47278931 -Submitted batch job 47278932 -Submitted batch job 47278933 -Submitted batch job 47278934 -Submitted batch job 47278935 -Submitted batch job 47278936 -Submitted batch job 47278937 -Submitted batch job 47278938 -Submitted batch job 47278939 -Submitted batch job 47278960 -Submitted batch job 47278961 -Submitted batch job 47278962 -Submitted batch job 47278963 -Submitted batch job 47278964 -Submitted batch job 47278965 -Submitted batch job 47278966 -Submitted batch job 47278967 -Submitted batch job 47278968 -Submitted batch job 47278969 -Submitted batch job 47278970 -Submitted batch job 47278971 -Submitted batch job 47278972 -Submitted batch job 47278973 -Submitted batch job 47278974 -Submitted batch job 47278975 -Submitted batch job 47278976 -Submitted batch job 47278977 -Submitted batch job 47278978 -Submitted batch job 47278979 -Submitted batch job 47278980 -Submitted batch job 47278981 -Submitted batch job 47278982 -Submitted batch job 47278983 -Submitted batch job 47278984 -Submitted batch job 47278985 -Submitted batch job 47278986 -Submitted batch job 47278987 -Submitted batch job 47278988 -Submitted batch job 47278989 -Submitted batch job 47278993 -Submitted batch job 47278994 -Submitted batch job 47278995 -Submitted batch job 47278996 -Submitted batch job 47278997 -Submitted batch job 47278998 -Submitted batch job 47278999 -Submitted batch job 47279000 -Submitted batch job 47279001 -Submitted batch job 47279002 -Submitted batch job 47279323 -Submitted batch job 47279324 -Submitted batch job 47279325 -Submitted batch job 47279326 -Submitted batch job 47279327 -Submitted batch job 47279328 -Submitted batch job 47279329 -Submitted batch job 47279330 -Submitted batch job 47279331 -Submitted batch job 47279332 -Submitted batch job 47279653 -Submitted batch job 47279654 -Submitted batch job 47279655 -Submitted batch job 47279656 -Submitted batch job 47279657 -Submitted batch job 47279658 -Submitted batch job 47279659 -Submitted batch job 47279660 -Submitted batch job 47279661 -Submitted batch job 47279662 -Submitted batch job 47279664 -Submitted batch job 47279665 -Submitted batch job 47279666 -Submitted batch job 47279667 -Submitted batch job 47279668 -Submitted batch job 47279669 -Submitted batch job 47279670 -Submitted batch job 47279671 -Submitted batch job 47279672 -Submitted batch job 47279673 -Submitted batch job 47279674 -Submitted batch job 47279675 -Submitted batch job 47279676 -Submitted batch job 47279677 -Submitted batch job 47279678 -Submitted batch job 47279679 -Submitted batch job 47279680 -Submitted batch job 47279681 -Submitted batch job 47279682 -Submitted batch job 47279683 -Submitted batch job 47279703 -Submitted batch job 47279704 -Submitted batch job 47279705 -Submitted batch job 47279706 -Submitted batch job 47279707 -Submitted batch job 47279708 -Submitted batch job 47279709 -Submitted batch job 47279710 -Submitted batch job 47279711 -Submitted batch job 47279712 -Submitted batch job 47279817 -Submitted batch job 47279818 -Submitted batch job 47279819 -Submitted batch job 47279820 -Submitted batch job 47279821 -Submitted batch job 47279822 -Submitted batch job 47279823 -Submitted batch job 47279824 -Submitted batch job 47279825 -Submitted batch job 47279826 -Submitted batch job 47279831 -Submitted batch job 47279832 -Submitted batch job 47279833 -Submitted batch job 47279834 -Submitted batch job 47279835 -Submitted batch job 47279836 -Submitted batch job 47279837 -Submitted batch job 47279838 -Submitted batch job 47279839 -Submitted batch job 47279840 -Submitted batch job 47279844 -Submitted batch job 47279845 -Submitted batch job 47279846 -Submitted batch job 47279847 -Submitted batch job 47279848 -Submitted batch job 47279849 -Submitted batch job 47279850 -Submitted batch job 47279851 -Submitted batch job 47279852 -Submitted batch job 47279853 -Submitted batch job 47279865 -Submitted batch job 47279866 -Submitted batch job 47279867 -Submitted batch job 47279868 -Submitted batch job 47279869 -Submitted batch job 47279870 -Submitted batch job 47279871 -Submitted batch job 47279872 -Submitted batch job 47279873 -Submitted batch job 47279874 -Submitted batch job 47279876 -Submitted batch job 47279877 -Submitted batch job 47279878 -Submitted batch job 47279879 -Submitted batch job 47279880 -Submitted batch job 47279881 -Submitted batch job 47279882 -Submitted batch job 47279883 -Submitted batch job 47279884 -Submitted batch job 47279885 -Submitted batch job 47279888 -Submitted batch job 47279889 -Submitted batch job 47279890 -Submitted batch job 47279891 -Submitted batch job 47279892 -Submitted batch job 47279893 -Submitted batch job 47279894 -Submitted batch job 47279895 -Submitted batch job 47279896 -Submitted batch job 47279897 -Submitted batch job 47279904 -Submitted batch job 47279905 -Submitted batch job 47279906 -Submitted batch job 47279907 -Submitted batch job 47279908 -Submitted batch job 47279909 -Submitted batch job 47279910 -Submitted batch job 47279911 -Submitted batch job 47279912 -Submitted batch job 47279913 -Submitted batch job 47279915 -Submitted batch job 47279916 -Submitted batch job 47279917 -Submitted batch job 47279918 -Submitted batch job 47279919 -Submitted batch job 47279920 -Submitted batch job 47279921 -Submitted batch job 47279922 -Submitted batch job 47279923 -Submitted batch job 47279924 -Submitted batch job 47279927 -Submitted batch job 47279928 -Submitted batch job 47279929 -Submitted batch job 47279930 -Submitted batch job 47279931 -Submitted batch job 47279932 -Submitted batch job 47279933 -Submitted batch job 47279934 -Submitted batch job 47279935 -Submitted batch job 47279936 -Submitted batch job 47279938 -Submitted batch job 47279939 -Submitted batch job 47279940 -Submitted batch job 47279941 -Submitted batch job 47279942 -Submitted batch job 47279943 -Submitted batch job 47279944 -Submitted batch job 47279945 -Submitted batch job 47279946 -Submitted batch job 47279947 -Submitted batch job 47279969 -Submitted batch job 47279970 -Submitted batch job 47279971 -Submitted batch job 47279972 -Submitted batch job 47279973 -Submitted batch job 47279974 -Submitted batch job 47279975 -Submitted batch job 47279976 -Submitted batch job 47279977 -Submitted batch job 47279978 -Submitted batch job 47279989 -Submitted batch job 47279990 -Submitted batch job 47279991 -Submitted batch job 47279992 -Submitted batch job 47279993 -Submitted batch job 47279994 -Submitted batch job 47279995 -Submitted batch job 47279996 -Submitted batch job 47279997 -Submitted batch job 47279998 -Submitted batch job 47280001 -Submitted batch job 47280002 -Submitted batch job 47280003 -Submitted batch job 47280004 -Submitted batch job 47280005 -Submitted batch job 47280006 -Submitted batch job 47280007 -Submitted batch job 47280008 -Submitted batch job 47280009 -Submitted batch job 47280010 -Submitted batch job 47280012 -Submitted batch job 47280013 -Submitted batch job 47280014 -Submitted batch job 47280015 -Submitted batch job 47280016 -Submitted batch job 47280017 -Submitted batch job 47280018 -Submitted batch job 47280019 -Submitted batch job 47280020 -Submitted batch job 47280021 -Submitted batch job 47280023 -Submitted batch job 47280024 -Submitted batch job 47280025 -Submitted batch job 47280026 -Submitted batch job 47280027 -Submitted batch job 47280028 -Submitted batch job 47280029 -Submitted batch job 47280030 -Submitted batch job 47280031 -Submitted batch job 47280032 -Submitted batch job 47280158 -Submitted batch job 47280159 -Submitted batch job 47280160 -Submitted batch job 47280161 -Submitted batch job 47280162 -Submitted batch job 47280163 -Submitted batch job 47280164 -Submitted batch job 47280165 -Submitted batch job 47280166 -Submitted batch job 47280167 -Submitted batch job 47280168 -Submitted batch job 47280169 -Submitted batch job 47280170 -Submitted batch job 47280171 -Submitted batch job 47280172 -Submitted batch job 47280173 -Submitted batch job 47280174 -Submitted batch job 47280175 -Submitted batch job 47280176 -Submitted batch job 47280177 -Submitted batch job 47280178 -Submitted batch job 47280179 -Submitted batch job 47280180 -Submitted batch job 47280181 -Submitted batch job 47280182 -Submitted batch job 47280183 -Submitted batch job 47280184 -Submitted batch job 47280185 -Submitted batch job 47280186 -Submitted batch job 47280187 -Submitted batch job 47280188 -Submitted batch job 47280189 -Submitted batch job 47280190 -Submitted batch job 47280191 -Submitted batch job 47280192 -Submitted batch job 47280193 -Submitted batch job 47280194 -Submitted batch job 47280195 -Submitted batch job 47280196 -Submitted batch job 47280197 -Submitted batch job 47280198 -Submitted batch job 47280199 -Submitted batch job 47280200 -Submitted batch job 47280201 -Submitted batch job 47280202 -Submitted batch job 47280203 -Submitted batch job 47280204 -Submitted batch job 47280205 -Submitted batch job 47280206 -Submitted batch job 47280207 -Submitted batch job 47280208 -Submitted batch job 47280209 -Submitted batch job 47280210 -Submitted batch job 47280211 -Submitted batch job 47280212 -Submitted batch job 47280213 -Submitted batch job 47280214 -Submitted batch job 47280215 -Submitted batch job 47280216 -Submitted batch job 47280217 -Submitted batch job 47280218 -Submitted batch job 47280219 -Submitted batch job 47280220 -Submitted batch job 47280221 -Submitted batch job 47280222 -Submitted batch job 47280223 -Submitted batch job 47280224 -Submitted batch job 47280225 -Submitted batch job 47280226 -Submitted batch job 47280227 -Submitted batch job 47280228 -Submitted batch job 47280229 -Submitted batch job 47280230 -Submitted batch job 47280231 -Submitted batch job 47280232 -Submitted batch job 47280233 -Submitted batch job 47280234 -Submitted batch job 47280235 -Submitted batch job 47280236 -Submitted batch job 47280237 -Submitted batch job 47280238 -Submitted batch job 47280239 -Submitted batch job 47280240 -Submitted batch job 47280241 -Submitted batch job 47280242 -Submitted batch job 47280243 -Submitted batch job 47280244 -Submitted batch job 47280245 -Submitted batch job 47280246 -Submitted batch job 47280247 -Submitted batch job 47280248 -Submitted batch job 47280249 -Submitted batch job 47280250 -Submitted batch job 47280251 -Submitted batch job 47280252 -Submitted batch job 47280253 -Submitted batch job 47280254 -Submitted batch job 47280255 -Submitted batch job 47280256 -Submitted batch job 47280257 -Submitted batch job 47280258 -Submitted batch job 47280259 -Submitted batch job 47280260 -Submitted batch job 47280261 -Submitted batch job 47280262 -Submitted batch job 47280263 -Submitted batch job 47280264 -Submitted batch job 47280265 -Submitted batch job 47280266 -Submitted batch job 47280267 -Submitted batch job 47280269 -Submitted batch job 47280270 -Submitted batch job 47280271 -Submitted batch job 47280272 -Submitted batch job 47280273 -Submitted batch job 47280274 -Submitted batch job 47280275 -Submitted batch job 47280276 -Submitted batch job 47280277 -Submitted batch job 47280278 -Submitted batch job 47280279 -Submitted batch job 47280280 -Submitted batch job 47280281 -Submitted batch job 47280282 -Submitted batch job 47280283 -Submitted batch job 47280284 -Submitted batch job 47280285 -Submitted batch job 47280286 -Submitted batch job 47280287 -Submitted batch job 47280288 -Submitted batch job 47280289 -Submitted batch job 47280290 -Submitted batch job 47280291 -Submitted batch job 47280292 -Submitted batch job 47280293 -Submitted batch job 47280294 -Submitted batch job 47280295 -Submitted batch job 47280296 -Submitted batch job 47280297 -Submitted batch job 47280298 -Submitted batch job 47280299 -Submitted batch job 47280300 -Submitted batch job 47280301 -Submitted batch job 47280302 -Submitted batch job 47280303 -Submitted batch job 47280304 -Submitted batch job 47280305 -Submitted batch job 47280306 -Submitted batch job 47280307 -Submitted batch job 47280308 -Submitted batch job 47280309 -Submitted batch job 47280310 -Submitted batch job 47280311 -Submitted batch job 47280312 -Submitted batch job 47280313 -Submitted batch job 47280314 -Submitted batch job 47280315 -Submitted batch job 47280316 -Submitted batch job 47280317 -Submitted batch job 47280318 -Submitted batch job 47280535 -Submitted batch job 47280536 -Submitted batch job 47280537 -Submitted batch job 47280538 -Submitted batch job 47280539 -Submitted batch job 47280540 -Submitted batch job 47280541 -Submitted batch job 47280542 -Submitted batch job 47280543 -Submitted batch job 47280544 -Submitted batch job 47284345 -Submitted batch job 47284346 -Submitted batch job 47284347 -Submitted batch job 47284348 -Submitted batch job 47284349 -Submitted batch job 47284350 -Submitted batch job 47284351 -Submitted batch job 47284352 -Submitted batch job 47284353 -Submitted batch job 47284354 -Submitted batch job 47285654 -Submitted batch job 47285655 -Submitted batch job 47285656 -Submitted batch job 47285657 -Submitted batch job 47285658 -Submitted batch job 47285659 -Submitted batch job 47285660 -Submitted batch job 47285661 -Submitted batch job 47285662 -Submitted batch job 47285663 -Submitted batch job 47285665 -Submitted batch job 47285666 -Submitted batch job 47285667 -Submitted batch job 47285668 -Submitted batch job 47285669 -Submitted batch job 47285670 -Submitted batch job 47285671 -Submitted batch job 47285672 -Submitted batch job 47285673 -Submitted batch job 47285674 -Submitted batch job 47285675 -Submitted batch job 47285676 -Submitted batch job 47285677 -Submitted batch job 47285678 -Submitted batch job 47285679 -Submitted batch job 47285680 -Submitted batch job 47285681 -Submitted batch job 47285682 -Submitted batch job 47285683 -Submitted batch job 47285684 -Submitted batch job 47285719 -Submitted batch job 47285720 -Submitted batch job 47285721 -Submitted batch job 47285722 -Submitted batch job 47285723 -Submitted batch job 47285724 -Submitted batch job 47285725 -Submitted batch job 47285726 -Submitted batch job 47285727 -Submitted batch job 47285728 -Submitted batch job 47285732 -Submitted batch job 47285733 -Submitted batch job 47285734 -Submitted batch job 47285735 -Submitted batch job 47285736 -Submitted batch job 47285737 -Submitted batch job 47285738 -Submitted batch job 47285739 -Submitted batch job 47285740 -Submitted batch job 47285741 -Submitted batch job 47285743 -Submitted batch job 47285744 -Submitted batch job 47285745 -Submitted batch job 47285746 -Submitted batch job 47285747 -Submitted batch job 47285748 -Submitted batch job 47285749 -Submitted batch job 47285750 -Submitted batch job 47285751 -Submitted batch job 47285752 -Submitted batch job 47285754 -Submitted batch job 47285755 -Submitted batch job 47285756 -Submitted batch job 47285757 -Submitted batch job 47285758 -Submitted batch job 47285759 -Submitted batch job 47285760 -Submitted batch job 47285761 -Submitted batch job 47285762 -Submitted batch job 47285763 -Submitted batch job 47285765 -Submitted batch job 47285766 -Submitted batch job 47285767 -Submitted batch job 47285768 -Submitted batch job 47285769 -Submitted batch job 47285770 -Submitted batch job 47285771 -Submitted batch job 47285772 -Submitted batch job 47285773 -Submitted batch job 47285774 -Submitted batch job 47285776 -Submitted batch job 47285777 -Submitted batch job 47285778 -Submitted batch job 47285779 -Submitted batch job 47285780 -Submitted batch job 47285781 -Submitted batch job 47285782 -Submitted batch job 47285783 -Submitted batch job 47285784 -Submitted batch job 47285785 -Submitted batch job 47285787 -Submitted batch job 47285788 -Submitted batch job 47285789 -Submitted batch job 47285790 -Submitted batch job 47285791 -Submitted batch job 47285792 -Submitted batch job 47285793 -Submitted batch job 47285794 -Submitted batch job 47285795 -Submitted batch job 47285796 -Submitted batch job 47285798 -Submitted batch job 47285799 -Submitted batch job 47285800 -Submitted batch job 47285801 -Submitted batch job 47285802 -Submitted batch job 47285803 -Submitted batch job 47285804 -Submitted batch job 47285805 -Submitted batch job 47285806 -Submitted batch job 47285807 -Submitted batch job 47285810 -Submitted batch job 47285811 -Submitted batch job 47285812 -Submitted batch job 47285813 -Submitted batch job 47285814 -Submitted batch job 47285815 -Submitted batch job 47285816 -Submitted batch job 47285817 -Submitted batch job 47285818 -Submitted batch job 47285819 -Submitted batch job 47285829 -Submitted batch job 47285830 -Submitted batch job 47285831 -Submitted batch job 47285832 -Submitted batch job 47285833 -Submitted batch job 47285834 -Submitted batch job 47285835 -Submitted batch job 47285836 -Submitted batch job 47285837 -Submitted batch job 47285838 -Submitted batch job 47285843 -Submitted batch job 47285844 -Submitted batch job 47285845 -Submitted batch job 47285846 -Submitted batch job 47285847 -Submitted batch job 47285848 -Submitted batch job 47285849 -Submitted batch job 47285850 -Submitted batch job 47285851 -Submitted batch job 47285852 -Submitted batch job 47285854 -Submitted batch job 47285855 -Submitted batch job 47285856 -Submitted batch job 47285857 -Submitted batch job 47285858 -Submitted batch job 47285859 -Submitted batch job 47285860 -Submitted batch job 47285861 -Submitted batch job 47285862 -Submitted batch job 47285863 -Submitted batch job 47285864 -Submitted batch job 47285865 -Submitted batch job 47285866 -Submitted batch job 47285867 -Submitted batch job 47285868 -Submitted batch job 47285869 -Submitted batch job 47285870 -Submitted batch job 47285871 -Submitted batch job 47285872 -Submitted batch job 47285873 -Submitted batch job 47285874 -Submitted batch job 47285875 -Submitted batch job 47285876 -Submitted batch job 47285877 -Submitted batch job 47285878 -Submitted batch job 47285879 -Submitted batch job 47285880 -Submitted batch job 47285881 -Submitted batch job 47285882 -Submitted batch job 47285883 -Submitted batch job 47285884 -Submitted batch job 47285885 -Submitted batch job 47285886 -Submitted batch job 47285887 -Submitted batch job 47285888 -Submitted batch job 47285889 -Submitted batch job 47285890 -Submitted batch job 47285891 -Submitted batch job 47285892 -Submitted batch job 47285893 -Submitted batch job 47285894 -Submitted batch job 47285895 -Submitted batch job 47285896 -Submitted batch job 47285897 -Submitted batch job 47285898 -Submitted batch job 47285899 -Submitted batch job 47285900 -Submitted batch job 47285901 -Submitted batch job 47285902 -Submitted batch job 47285903 -Submitted batch job 47285904 -Submitted batch job 47285905 -Submitted batch job 47285906 -Submitted batch job 47285907 -Submitted batch job 47285908 -Submitted batch job 47285909 -Submitted batch job 47285910 -Submitted batch job 47285911 -Submitted batch job 47285912 -Submitted batch job 47285913 -Submitted batch job 47285916 -Submitted batch job 47285917 -Submitted batch job 47285918 -Submitted batch job 47285919 -Submitted batch job 47285920 -Submitted batch job 47285921 -Submitted batch job 47285922 -Submitted batch job 47285923 -Submitted batch job 47285924 -Submitted batch job 47285925 -Submitted batch job 47285926 -Submitted batch job 47285927 -Submitted batch job 47285928 -Submitted batch job 47285929 -Submitted batch job 47285930 -Submitted batch job 47285931 -Submitted batch job 47285932 -Submitted batch job 47285933 -Submitted batch job 47285934 -Submitted batch job 47285935 -Submitted batch job 47285936 -Submitted batch job 47285937 -Submitted batch job 47285938 -Submitted batch job 47285939 -Submitted batch job 47285940 -Submitted batch job 47285941 -Submitted batch job 47285942 -Submitted batch job 47285943 -Submitted batch job 47285944 -Submitted batch job 47285945 -Submitted batch job 47285946 -Submitted batch job 47285947 -Submitted batch job 47285948 -Submitted batch job 47285949 -Submitted batch job 47285950 -Submitted batch job 47285951 -Submitted batch job 47285952 -Submitted batch job 47285953 -Submitted batch job 47285954 -Submitted batch job 47285955 -Submitted batch job 47285977 -Submitted batch job 47285978 -Submitted batch job 47285979 -Submitted batch job 47285980 -Submitted batch job 47285981 -Submitted batch job 47285982 -Submitted batch job 47285983 -Submitted batch job 47285984 -Submitted batch job 47285985 -Submitted batch job 47285986 -Submitted batch job 47285989 -Submitted batch job 47285990 -Submitted batch job 47285991 -Submitted batch job 47285992 -Submitted batch job 47285993 -Submitted batch job 47285994 -Submitted batch job 47285995 -Submitted batch job 47285996 -Submitted batch job 47285997 -Submitted batch job 47285998 -Submitted batch job 47285999 -Submitted batch job 47286000 -Submitted batch job 47286001 -Submitted batch job 47286002 -Submitted batch job 47286003 -Submitted batch job 47286004 -Submitted batch job 47286005 -Submitted batch job 47286006 -Submitted batch job 47286007 -Submitted batch job 47286008 -Submitted batch job 47286009 -Submitted batch job 47286010 -Submitted batch job 47286011 -Submitted batch job 47286012 -Submitted batch job 47286013 -Submitted batch job 47286014 -Submitted batch job 47286015 -Submitted batch job 47286016 -Submitted batch job 47286017 -Submitted batch job 47286018 -Submitted batch job 47286019 -Submitted batch job 47286020 -Submitted batch job 47286021 -Submitted batch job 47286022 -Submitted batch job 47286023 -Submitted batch job 47286024 -Submitted batch job 47286025 -Submitted batch job 47286026 -Submitted batch job 47286027 -Submitted batch job 47286028 -Submitted batch job 47286029 -Submitted batch job 47286030 -Submitted batch job 47286031 -Submitted batch job 47286032 -Submitted batch job 47286033 -Submitted batch job 47286034 -Submitted batch job 47286035 -Submitted batch job 47286036 -Submitted batch job 47286037 -Submitted batch job 47286038 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/prot_miss_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/prot_miss_replicates.txt deleted file mode 100755 index b84c7e88..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/prot_miss_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,33 +0,0 @@ -FEP crashes -FEP_CAT-17d-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17b/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/protein.txt deleted file mode 100755 index 702d0090..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,284 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_CAT-4c-CAT-17h -31.54 0.75 -FEP_CAT-24-CAT-17g 11.44 0.62 -FEP_CAT-4i-CAT-4d 36.45 0.70 -FEP_CAT-4k-CAT-17i 4.21 0.69 -FEP_CAT-4d-CAT-4b -0.50 0.35 -FEP_CAT-17i-CAT-13o 23.11 0.83 -FEP_CAT-4k-CAT-17a 24.27 0.80 -FEP_CAT-4d-CAT-17i -36.07 1.02 -FEP_CAT-4i-CAT-13n -70.44 0.29 -FEP_CAT-4b-CAT-17c -7.26 0.50 -FEP_CAT-4a-CAT-17d -38.43 0.56 -FEP_CAT-4j-CAT-17e 3.24 0.85 -FEP_CAT-24-CAT-13k -9.69 0.65 -FEP_CAT-17g-CAT-13o 10.39 0.44 -FEP_CAT-4n-CAT-13n -78.63 0.19 -FEP_CAT-4k-CAT-13n -68.79 0.37 -FEP_CAT-4k-CAT-4j 10.11 0.23 -FEP_CAT-4n-CAT-4d 28.89 0.85 -FEP_CAT-4j-CAT-13n -79.09 0.64 -FEP_CAT-4d-CAT-13n -107.47 0.58 -FEP_CAT-4n-CAT-4i -8.58 0.44 -FEP_CAT-4o-CAT-4l 41.87 0.30 -FEP_CAT-4m-CAT-4j 1.64 0.29 -FEP_CAT-4n-CAT-4k -9.59 0.14 -FEP_CAT-4c-CAT-17a -20.05 0.80 -FEP_CAT-4n-CAT-4j -0.38 0.42 -FEP_CAT-4c-CAT-17f -40.28 0.74 -FEP_CAT-4p-CAT-17f -15.58 0.30 -FEP_CAT-4b-CAT-17h -28.83 0.49 -FEP_CAT-17g-CAT-13n -82.18 0.49 -FEP_CAT-17e-CAT-17a 10.35 0.42 -FEP_CAT-4a-CAT-17e -27.83 0.92 -FEP_CAT-4p-CAT-13n -86.54 0.23 -FEP_CAT-17h-CAT-17e 3.07 0.37 -FEP_CAT-4k-CAT-17c 31.03 0.65 -FEP_CAT-4c-CAT-17d -40.94 0.67 -FEP_CAT-4p-CAT-17c 13.64 0.44 -FEP_CAT-4j-CAT-4a 30.89 0.24 -FEP_CAT-4j-CAT-17g 3.21 0.43 -FEP_CAT-4i-CAT-17g 11.08 0.46 -FEP_CAT-4o-CAT-4n -11.16 0.30 -FEP_CAT-4m-CAT-4c 32.60 0.83 -FEP_CAT-4p-CAT-24 -15.86 0.89 -FEP_CAT-4b-CAT-17f -36.02 0.69 -FEP_CAT-17h-CAT-13n -77.48 0.32 -FEP_CAT-17b-CAT-17a -7.21 0.21 -FEP_CAT-17i-CAT-17e 11.44 0.30 -FEP_CAT-4n-CAT-13k -16.17 0.34 -FEP_CAT-4c-CAT-13o -16.10 1.21 -FEP_CAT-17g-CAT-17a 9.88 0.53 -FEP_CAT-17b-CAT-13n -99.15 0.74 -FEP_CAT-13o-CAT-13m -102.75 0.48 -FEP_CAT-4d-CAT-17c -8.47 1.44 -FEP_CAT-4n-CAT-24 -8.44 1.24 -FEP_CAT-4j-CAT-17c 20.66 0.44 -FEP_CAT-4l-CAT-17h -53.77 0.50 -FEP_CAT-4d-CAT-17b -9.99 1.03 -FEP_CAT-17i-CAT-13k -7.78 0.66 -FEP_CAT-4j-CAT-17h -0.17 0.49 -FEP_CAT-4p-CAT-4m -8.92 0.21 -FEP_CAT-17f-CAT-17e 11.21 0.33 -FEP_CAT-4o-CAT-4j -11.47 0.20 -FEP_CAT-4k-CAT-4b 38.09 0.35 -FEP_CAT-4b-CAT-17i -36.76 1.18 -FEP_CAT-4n-CAT-17h -0.81 0.57 -FEP_CAT-4l-CAT-13m -141.44 0.25 -FEP_CAT-4d-CAT-17h -29.90 0.65 -FEP_CAT-17e-CAT-17c 18.24 0.32 -FEP_CAT-17b-CAT-13m -108.72 0.72 -FEP_CAT-4m-CAT-13k -15.58 0.20 -FEP_CAT-4m-CAT-17i -6.57 0.73 -FEP_CAT-4m-CAT-13o 16.05 0.34 -FEP_CAT-17i-CAT-17d 0.42 0.47 -FEP_CAT-4k-CAT-17f 2.43 0.69 -FEP_CAT-4b-CAT-17e -23.77 0.52 -FEP_CAT-17f-CAT-13o 21.26 0.43 -FEP_CAT-4p-CAT-17i -16.50 0.81 -FEP_CAT-4m-CAT-4l 53.43 0.36 -FEP_CAT-4o-CAT-13o 3.67 0.33 -FEP_CAT-4n-CAT-17b 21.48 0.62 -FEP_CAT-4n-CAT-17i -9.05 0.64 -FEP_CAT-4k-CAT-13m -77.80 0.58 -FEP_CAT-4p-CAT-4i -15.85 0.30 -FEP_CAT-4o-CAT-17h -12.18 0.59 -FEP_CAT-4i-CAT-13k -8.04 0.38 -FEP_CAT-4n-CAT-17g 2.98 0.35 -FEP_CAT-4a-CAT-13k -46.68 0.38 -FEP_CAT-17i-CAT-13n -69.50 0.49 -FEP_CAT-4j-CAT-13m -88.99 0.43 -FEP_CAT-4k-CAT-17g 13.34 0.28 -FEP_CAT-4o-CAT-4k -21.19 0.29 -FEP_CAT-4c-CAT-4b -3.40 0.64 -FEP_CAT-4m-CAT-17h 1.77 0.50 -FEP_CAT-4n-CAT-4m -1.05 0.25 -FEP_CAT-13o-CAT-13n -93.56 0.30 -FEP_CAT-17h-CAT-17g 2.97 0.28 -FEP_CAT-17a-CAT-13n -92.63 0.55 -FEP_CAT-17b-CAT-13o -5.26 0.60 -FEP_CAT-4a-CAT-24 -38.21 0.48 -FEP_CAT-17g-CAT-17b 16.85 0.16 -FEP_CAT-4i-CAT-17f -0.82 0.38 -FEP_CAT-4j-CAT-13k -16.89 0.36 -FEP_CAT-4c-CAT-13k -47.70 1.67 -FEP_CAT-24-CAT-17e 11.87 0.23 -FEP_CAT-4m-CAT-17b 23.08 0.84 -FEP_CAT-4k-CAT-17b 31.02 0.67 -FEP_CAT-4c-CAT-17e -29.81 0.61 -FEP_CAT-4d-CAT-24 -33.67 0.60 -FEP_CAT-4o-CAT-4i -19.40 0.39 -FEP_CAT-4i-CAT-24 1.15 1.10 -FEP_CAT-4n-CAT-13m -88.84 0.41 -FEP_CAT-4k-CAT-4i 1.75 0.19 -FEP_CAT-17c-CAT-17a -6.66 0.72 -FEP_CAT-24-CAT-13n -69.92 0.93 -FEP_CAT-4l-CAT-4c -22.30 0.61 -FEP_CAT-4b-CAT-17b -6.84 0.50 -FEP_CAT-4d-CAT-17a -16.18 0.87 -FEP_CAT-4c-CAT-17i -39.61 0.93 -FEP_CAT-4i-CAT-17i -0.60 0.64 -FEP_CAT-4d-CAT-13k -44.49 0.73 -FEP_CAT-17d-CAT-17b 27.82 0.40 -FEP_CAT-4o-CAT-17c 10.41 0.39 -FEP_CAT-4o-CAT-17b 10.08 0.57 -FEP_CAT-17i-CAT-17h 8.67 0.35 -FEP_CAT-4n-CAT-13o 15.49 0.28 -FEP_CAT-4i-CAT-17b 27.59 0.46 -FEP_CAT-4m-CAT-17e 4.38 0.93 -FEP_CAT-4p-CAT-4c 22.84 0.82 -FEP_CAT-4c-CAT-17c -10.12 0.79 -FEP_CAT-4d-CAT-17f -35.37 0.75 -FEP_CAT-17g-CAT-13m -91.57 0.54 -FEP_CAT-4m-CAT-13m -87.39 0.36 -FEP_CAT-17i-CAT-17b 28.44 0.82 -FEP_CAT-4l-CAT-24 -59.24 1.24 -FEP_CAT-4b-CAT-13m -116.64 0.34 -FEP_CAT-4k-CAT-13k -6.39 0.39 -FEP_CAT-4d-CAT-13o -16.14 1.16 -FEP_CAT-17d-CAT-17c 29.37 0.34 -FEP_CAT-4p-CAT-17h -7.62 0.39 -FEP_CAT-4p-CAT-4b 20.27 0.34 -FEP_CAT-24-CAT-17i 0.47 0.42 -FEP_CAT-4j-CAT-13o 14.10 0.46 -FEP_CAT-4l-CAT-17a -39.00 0.73 -FEP_CAT-4l-CAT-13n -132.34 0.26 -FEP_CAT-13n-CAT-13m -9.69 0.30 -FEP_CAT-4l-CAT-17f -60.50 0.65 -FEP_CAT-4p-CAT-17e -4.66 0.81 -FEP_CAT-4m-CAT-17a 15.42 0.74 -FEP_CAT-4l-CAT-13o -38.53 0.43 -FEP_CAT-4i-CAT-4b 35.83 0.42 -FEP_CAT-17e-CAT-17d -10.67 0.71 -FEP_CAT-17f-CAT-17a 21.39 0.36 -FEP_CAT-4o-CAT-17d -19.26 0.32 -FEP_CAT-24-CAT-17b 28.83 0.34 -FEP_CAT-4b-CAT-13n -107.28 0.51 -FEP_CAT-4a-CAT-17a -16.87 0.56 -FEP_CAT-4k-CAT-17h 10.41 0.37 -FEP_CAT-4l-CAT-4b -25.54 0.29 -FEP_CAT-17c-CAT-13m -109.73 0.42 -FEP_CAT-24-CAT-17c 28.63 0.65 -FEP_CAT-4l-CAT-4j -52.79 0.31 -FEP_CAT-4o-CAT-17f -17.90 0.65 -FEP_CAT-4i-CAT-17d -0.93 0.67 -FEP_CAT-17h-CAT-13o 13.53 0.36 -FEP_CAT-17c-CAT-13n -98.11 0.47 -FEP_CAT-4k-CAT-13o 24.78 0.27 -FEP_CAT-17d-CAT-13n -69.97 0.38 -FEP_CAT-4m-CAT-4b 28.97 0.45 -FEP_CAT-4l-CAT-17e -50.19 0.70 -FEP_CAT-4l-CAT-4d -26.21 0.28 -FEP_CAT-4b-CAT-24 -35.14 1.02 -FEP_CAT-4d-CAT-4a 2.21 0.47 -FEP_CAT-4j-CAT-17f -7.82 0.67 -FEP_CAT-4o-CAT-13k -27.85 0.35 -FEP_CAT-4m-CAT-4i -7.86 0.34 -FEP_CAT-4k-CAT-4c 42.04 0.43 -FEP_CAT-4m-CAT-17d -7.95 0.68 -FEP_CAT-4a-CAT-13n -108.82 0.28 -FEP_CAT-4c-CAT-13m -120.73 0.75 -FEP_CAT-4c-CAT-17g -28.62 0.69 -FEP_CAT-4b-CAT-4a 2.47 0.55 -FEP_CAT-4c-CAT-13n -110.13 0.68 -FEP_CAT-4j-CAT-4d 27.09 0.49 -FEP_CAT-4o-CAT-17i -18.31 0.66 -FEP_CAT-4j-CAT-17d -8.95 0.48 -FEP_CAT-4l-CAT-4i -60.96 0.20 -FEP_CAT-4p-CAT-4o 3.74 0.23 -FEP_CAT-4p-CAT-13k -24.57 0.46 -FEP_CAT-4l-CAT-4a -22.13 0.18 -FEP_CAT-4a-CAT-17b -11.14 0.44 -FEP_CAT-17f-CAT-17d -0.10 0.45 -FEP_CAT-4d-CAT-17g -25.73 1.38 -FEP_CAT-17i-CAT-17c 28.65 0.44 -FEP_CAT-17h-CAT-17f -7.56 0.21 -FEP_CAT-4o-CAT-13n -90.36 0.33 -FEP_CAT-4p-CAT-13o 7.49 0.38 -FEP_CAT-4o-CAT-4b 16.89 0.26 -FEP_CAT-4a-CAT-13o -16.27 0.30 -FEP_CAT-4p-CAT-17g -4.99 0.57 -FEP_CAT-17e-CAT-13o 12.54 0.76 -FEP_CAT-4k-CAT-4d 38.08 0.79 -FEP_CAT-4b-CAT-17d -36.49 1.14 -FEP_CAT-17e-CAT-13m -92.16 0.71 -FEP_CAT-17d-CAT-17a 21.49 0.50 -FEP_CAT-24-CAT-17a 21.71 0.41 -FEP_CAT-24-CAT-13o 23.15 0.82 -FEP_CAT-4m-CAT-4a 31.92 0.34 -FEP_CAT-24-CAT-17h 7.90 0.22 -FEP_CAT-17f-CAT-13n -69.97 1.17 -FEP_CAT-17h-CAT-17a 13.00 0.44 -FEP_CAT-4l-CAT-17d -60.76 0.42 -FEP_CAT-4a-CAT-17h -29.08 0.58 -FEP_CAT-17g-CAT-17e -0.06 0.30 -FEP_CAT-17g-CAT-17d -11.05 0.22 -FEP_CAT-17a-CAT-13o 1.01 0.89 -FEP_CAT-4n-CAT-17f -8.31 0.69 -FEP_CAT-4i-CAT-17a 20.82 0.62 -FEP_CAT-4k-CAT-24 2.21 1.05 -FEP_CAT-4n-CAT-17c 20.96 0.23 -FEP_CAT-17f-CAT-13m -81.37 nan -FEP_CAT-4j-CAT-4b 27.85 0.81 -FEP_CAT-4k-CAT-4a 41.15 nan -FEP_CAT-17h-CAT-17d -7.64 0.32 -FEP_CAT-4o-CAT-4c 20.29 0.49 -FEP_CAT-4i-CAT-4c 39.37 0.76 -FEP_CAT-4j-CAT-4c 31.81 0.73 -FEP_CAT-17f-CAT-17c 28.12 0.16 -FEP_CAT-4c-CAT-24 -39.31 0.95 -FEP_CAT-4i-CAT-13o 22.88 0.39 -FEP_CAT-17i-CAT-17g 11.12 0.42 -FEP_CAT-4a-CAT-17i -38.05 0.74 -FEP_CAT-4a-CAT-17g -27.38 0.48 -FEP_CAT-4d-CAT-17e -24.27 1.01 -FEP_CAT-4n-CAT-4b 27.45 0.26 -FEP_CAT-4p-CAT-17d -15.86 0.78 -FEP_CAT-4j-CAT-17b 20.03 0.40 -FEP_CAT-17h-CAT-17c 20.94 0.25 -FEP_CAT-4p-CAT-4j -7.42 0.24 -FEP_CAT-4l-CAT-17i -59.36 0.89 -FEP_CAT-24-CAT-17d 0.52 0.82 -FEP_CAT-4n-CAT-4l 52.47 0.77 -FEP_CAT-17c-CAT-13o -7.19 0.42 -FEP_CAT-4i-CAT-17h 7.86 0.36 -FEP_CAT-4o-CAT-17a 1.74 0.60 -FEP_CAT-17e-CAT-17b 17.26 0.20 -FEP_CAT-4o-CAT-4d 16.89 0.33 -FEP_CAT-4l-CAT-13k -70.15 0.17 -FEP_CAT-4c-CAT-4a -0.03 0.51 -FEP_CAT-4p-CAT-4n -7.47 0.17 -FEP_CAT-4j-CAT-4i -8.46 0.22 -FEP_CAT-4a-CAT-17c -10.17 0.43 -FEP_CAT-4i-CAT-4a 39.02 0.37 -FEP_CAT-4o-CAT-4m -11.96 0.35 -FEP_CAT-17i-CAT-13m -79.60 0.55 -FEP_CAT-4b-CAT-17g -25.64 0.80 -FEP_CAT-17a-CAT-13m -101.74 0.79 -FEP_CAT-17i-CAT-17f 0.86 0.62 -FEP_CAT-4d-CAT-4c 3.70 0.68 -FEP_CAT-17c-CAT-17b -0.58 0.50 -FEP_CAT-4o-CAT-13m -99.67 0.39 -FEP_CAT-4c-CAT-17b -10.63 0.72 -FEP_CAT-4m-CAT-17g 3.25 0.57 -FEP_CAT-17e-CAT-13n -81.90 0.65 -FEP_CAT-4n-CAT-17d -8.15 0.50 -FEP_CAT-4n-CAT-17e 2.89 0.60 -FEP_CAT-4m-CAT-17c 21.77 0.46 -FEP_CAT-24-CAT-13m -80.38 1.01 -FEP_CAT-4b-CAT-17a -14.33 1.43 -FEP_CAT-4p-CAT-13m -96.18 0.39 -FEP_CAT-4o-CAT-4a 19.86 0.26 -FEP_CAT-4m-CAT-13n -78.34 0.34 -FEP_CAT-4k-CAT-17d 1.92 0.56 -FEP_CAT-4n-CAT-4c 30.30 0.61 -FEP_CAT-4a-CAT-17f -38.41 0.53 -FEP_CAT-4i-CAT-13m -80.37 0.53 -FEP_CAT-4b-CAT-13o -12.60 0.38 -FEP_CAT-4p-CAT-4d 21.07 0.62 -FEP_CAT-4k-CAT-17e 12.68 0.56 -FEP_CAT-4p-CAT-4a 22.62 0.24 -FEP_CAT-4p-CAT-4k -17.80 0.36 -FEP_CAT-4j-CAT-17i -7.20 0.68 -FEP_CAT-24-CAT-17f 0.87 0.48 -FEP_CAT-4p-CAT-4l 45.02 0.41 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/protein_missing.txt deleted file mode 100755 index 7ced5086..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,33 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_CAT-4d-CAT-13m -115.40 0.64 -FEP_CAT-4p-CAT-17b 13.69 0.59 -FEP_CAT-4n-CAT-4a 30.59 0.29 -FEP_CAT-17h-CAT-13m -88.76 0.25 -FEP_CAT-4l-CAT-4k -62.82 0.38 -FEP_CAT-4d-CAT-17d -37.61 0.78 -FEP_CAT-4i-CAT-17c 28.79 0.38 -FEP_CAT-4n-CAT-17a 13.95 0.55 -FEP_CAT-4o-CAT-17g -8.75 0.46 -FEP_CAT-4m-CAT-24 -6.83 0.72 -FEP_CAT-4a-CAT-13m -119.39 0.42 -FEP_CAT-17h-CAT-17b 20.79 0.56 -FEP_CAT-4m-CAT-17f -6.70 0.62 -FEP_CAT-4m-CAT-4k -8.72 0.20 -FEP_CAT-4i-CAT-17e 9.41 0.60 -FEP_CAT-17g-CAT-17f -10.44 0.28 -FEP_CAT-4b-CAT-13k -44.77 0.51 -FEP_CAT-17d-CAT-13o 21.35 0.59 -FEP_CAT-17f-CAT-17b 28.23 0.61 -FEP_CAT-4l-CAT-17g -50.04 0.40 -FEP_CAT-4j-CAT-17a 15.32 0.67 -FEP_CAT-17h-CAT-13k -15.87 0.62 -FEP_CAT-4j-CAT-24 -7.26 0.57 -FEP_CAT-4l-CAT-17b -32.51 0.56 -FEP_CAT-17g-CAT-17c 18.01 0.17 -FEP_CAT-4p-CAT-17a 4.75 1.02 -FEP_CAT-4l-CAT-17c -31.78 0.34 -FEP_CAT-17d-CAT-13m -80.50 0.44 -FEP_CAT-17i-CAT-17a 21.49 0.27 -FEP_CAT-4o-CAT-17e -8.30 0.56 -FEP_CAT-4m-CAT-4d 29.55 0.94 -FEP_CAT-4o-CAT-24 -18.92 0.71 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 3e84b26c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,284 +0,0 @@ -FEP crashes -FEP_CAT-13n-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4b/ 3 -FEP_CAT-4j-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-24/ 1 -FEP_CAT-4k-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13k/ 1 -FEP_CAT-4p-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4o/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/water.txt deleted file mode 100755 index c77f6ae2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/water.txt +++ /dev/null @@ -1,316 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_CAT-4d-CAT-13m -118.05 0.43 -FEP_CAT-4c-CAT-17g -28.21 0.61 -FEP_CAT-4c-CAT-4a 0.86 0.21 -FEP_CAT-4k-CAT-17g 14.77 0.16 -FEP_CAT-4p-CAT-13o 3.94 0.14 -FEP_CAT-4p-CAT-17b 11.80 0.24 -FEP_CAT-24-CAT-13n -74.67 0.52 -FEP_CAT-24-CAT-13k -10.46 0.50 -FEP_CAT-4c-CAT-17f -38.32 0.67 -FEP_CAT-4k-CAT-4d 43.53 0.65 -FEP_CAT-4n-CAT-4a 29.17 0.14 -FEP_CAT-4a-CAT-17g -28.36 0.15 -FEP_CAT-17b-CAT-13n -100.94 0.30 -FEP_CAT-17h-CAT-13m -87.05 0.15 -FEP_CAT-24-CAT-17d -4.57 0.43 -FEP_CAT-4p-CAT-17h -9.00 0.34 -FEP_CAT-4a-CAT-17i -38.93 0.27 -FEP_CAT-13n-CAT-13m -7.18 0.14 -FEP_CAT-4j-CAT-17f -8.28 0.32 -FEP_CAT-4o-CAT-13m -98.05 0.20 -FEP_CAT-4i-CAT-17f 0.52 0.30 -FEP_CAT-4k-CAT-4a 42.79 0.15 -FEP_CAT-4l-CAT-4k -65.18 0.16 -FEP_CAT-4a-CAT-13k -45.77 0.27 -FEP_CAT-4b-CAT-17a -16.67 0.33 -FEP_CAT-4d-CAT-17d -41.42 0.74 -FEP_CAT-4d-CAT-4b 0.40 0.13 -FEP_CAT-17e-CAT-17a 9.91 0.24 -FEP_CAT-4j-CAT-4b 31.00 0.16 -FEP_CAT-17f-CAT-13o 21.44 0.22 -FEP_CAT-4l-CAT-13m -139.16 0.24 -FEP_CAT-4l-CAT-4b -21.89 0.20 -FEP_CAT-4d-CAT-24 -36.00 0.41 -FEP_CAT-4o-CAT-13k -27.12 0.42 -FEP_CAT-17e-CAT-13m -91.40 0.18 -FEP_CAT-4b-CAT-13n -110.37 0.08 -FEP_CAT-4i-CAT-17c 29.45 0.18 -FEP_CAT-4m-CAT-4l 52.36 0.29 -FEP_CAT-4a-CAT-13o -16.60 0.15 -FEP_CAT-4l-CAT-24 -58.01 0.56 -FEP_CAT-4l-CAT-17i -60.85 0.35 -FEP_CAT-4c-CAT-4b 0.80 0.33 -FEP_CAT-4b-CAT-17e -26.04 0.18 -FEP_CAT-17f-CAT-13m -79.00 0.18 -FEP_CAT-17d-CAT-13n -70.52 0.20 -FEP_CAT-4o-CAT-4n -9.93 0.32 -FEP_CAT-4d-CAT-17i -39.99 0.39 -FEP_CAT-17h-CAT-17e 4.33 0.33 -FEP_CAT-4l-CAT-4j -52.83 0.13 -FEP_CAT-4d-CAT-13n -110.12 0.35 -FEP_CAT-4p-CAT-4k -22.42 0.22 -FEP_CAT-4n-CAT-4i -9.74 0.16 -FEP_CAT-4n-CAT-17a 13.39 0.33 -FEP_CAT-4o-CAT-17g -9.31 0.17 -FEP_CAT-4i-CAT-13m -78.39 0.13 -FEP_CAT-17a-CAT-13o -0.51 0.20 -FEP_CAT-13o-CAT-13m -100.41 0.13 -FEP_CAT-4p-CAT-13n -89.46 0.16 -FEP_CAT-4n-CAT-4d 29.44 0.31 -FEP_CAT-4n-CAT-13o 12.12 0.20 -FEP_CAT-4k-CAT-13k -3.52 0.28 -FEP_CAT-17g-CAT-17b 19.51 0.24 -FEP_CAT-4a-CAT-17c -9.35 0.21 -FEP_CAT-4b-CAT-17h -30.68 0.24 -FEP_CAT-4d-CAT-17h -31.67 0.98 -FEP_CAT-17h-CAT-17f -8.76 0.15 -FEP_CAT-4n-CAT-17i -9.25 0.17 -FEP_CAT-17i-CAT-13o 22.37 0.17 -FEP_CAT-4p-CAT-4m -9.14 0.18 -FEP_CAT-4b-CAT-17i -39.23 0.25 -FEP_CAT-13o-CAT-13n -93.31 0.17 -FEP_CAT-4m-CAT-24 -5.91 0.65 -FEP_CAT-4d-CAT-17g -28.24 0.56 -FEP_CAT-4m-CAT-13n -80.01 0.18 -FEP_CAT-4a-CAT-13m -116.93 0.17 -FEP_CAT-24-CAT-17i -2.57 0.14 -FEP_CAT-4a-CAT-17f -37.60 0.42 -FEP_CAT-4c-CAT-13o -16.27 0.37 -FEP_CAT-4j-CAT-17e 5.43 0.31 -FEP_CAT-17g-CAT-17e 2.55 0.19 -FEP_CAT-4a-CAT-17h -29.60 0.12 -FEP_CAT-4m-CAT-13k -16.87 0.29 -FEP_CAT-17f-CAT-17a 23.01 0.23 -FEP_CAT-4o-CAT-17b 10.88 0.26 -FEP_CAT-17a-CAT-13n -94.10 0.20 -FEP_CAT-4i-CAT-13n -71.20 0.13 -FEP_CAT-24-CAT-17g 7.43 0.53 -FEP_CAT-4k-CAT-17c 33.15 0.18 -FEP_CAT-4i-CAT-4a 38.80 0.14 -FEP_CAT-4k-CAT-13o 26.18 0.19 -FEP_CAT-4l-CAT-4i -60.79 0.20 -FEP_CAT-4j-CAT-4i -8.19 0.16 -FEP_CAT-4b-CAT-17c -10.23 0.31 -FEP_CAT-17d-CAT-17b 31.45 0.30 -FEP_CAT-4m-CAT-4a 29.43 0.19 -FEP_CAT-17h-CAT-17b 21.26 0.35 -FEP_CAT-17d-CAT-17c 29.84 0.17 -FEP_CAT-17a-CAT-13m -101.40 0.19 -FEP_CAT-4j-CAT-13n -79.49 0.19 -FEP_CAT-4m-CAT-17f -8.29 0.37 -FEP_CAT-4d-CAT-17a -16.32 0.31 -FEP_CAT-17h-CAT-17c 20.23 0.21 -FEP_CAT-4k-CAT-17h 13.12 0.40 -FEP_CAT-4l-CAT-17f -60.78 0.31 -FEP_CAT-4c-CAT-17h -29.16 0.66 -FEP_CAT-4c-CAT-13k -45.29 0.32 -FEP_CAT-4n-CAT-17e 3.81 0.20 -FEP_CAT-4i-CAT-4b 39.24 0.29 -FEP_CAT-17h-CAT-17d -9.76 0.16 -FEP_CAT-4n-CAT-4l 51.00 0.42 -FEP_CAT-17i-CAT-17g 10.24 0.28 -FEP_CAT-24-CAT-17f -2.16 0.46 -FEP_CAT-4p-CAT-17f -17.50 0.32 -FEP_CAT-24-CAT-17a 20.08 0.34 -FEP_CAT-4j-CAT-13k -16.27 0.24 -FEP_CAT-4o-CAT-17c 9.44 0.24 -FEP_CAT-4o-CAT-4a 19.22 0.16 -FEP_CAT-4n-CAT-13n -81.00 0.18 -FEP_CAT-17g-CAT-13o 11.60 0.30 -FEP_CAT-4d-CAT-13k -46.08 0.30 -FEP_CAT-24-CAT-17h 5.65 0.84 -FEP_CAT-17f-CAT-17c 28.42 0.07 -FEP_CAT-4m-CAT-13o 12.88 0.23 -FEP_CAT-4m-CAT-4k -12.97 0.16 -FEP_CAT-4i-CAT-17e 12.90 0.23 -FEP_CAT-17d-CAT-17a 23.67 0.29 -FEP_CAT-4i-CAT-17h 8.99 0.13 -FEP_CAT-17c-CAT-13n -100.28 0.13 -FEP_CAT-4d-CAT-17b -8.53 0.27 -FEP_CAT-4d-CAT-17e -25.58 0.26 -FEP_CAT-4i-CAT-4c 37.34 0.34 -FEP_CAT-4p-CAT-4b 21.02 0.25 -FEP_CAT-4j-CAT-13m -86.54 0.16 -FEP_CAT-17g-CAT-17f -9.97 0.11 -FEP_CAT-4d-CAT-17c -9.46 0.36 -FEP_CAT-4m-CAT-17b 21.03 0.30 -FEP_CAT-17e-CAT-17c 15.63 0.23 -FEP_CAT-17e-CAT-13o 8.92 0.20 -FEP_CAT-17h-CAT-17g 1.32 0.07 -FEP_CAT-4j-CAT-17h 0.65 0.15 -FEP_CAT-4k-CAT-17f 4.45 0.30 -FEP_CAT-4a-CAT-17e -25.02 0.33 -FEP_CAT-4n-CAT-24 -7.13 0.18 -FEP_CAT-4j-CAT-4c 29.52 0.19 -FEP_CAT-17f-CAT-17d -1.40 0.12 -FEP_CAT-4l-CAT-13k -68.70 0.20 -FEP_CAT-4b-CAT-13k -46.70 0.31 -FEP_CAT-17f-CAT-13n -71.56 0.20 -FEP_CAT-4o-CAT-17h -10.40 0.24 -FEP_CAT-4i-CAT-17i -0.51 0.18 -FEP_CAT-4o-CAT-17i -19.43 0.23 -FEP_CAT-17d-CAT-13o 22.58 0.19 -FEP_CAT-24-CAT-17e 10.55 0.22 -FEP_CAT-4i-CAT-17b 30.51 0.36 -FEP_CAT-4n-CAT-4j -1.56 0.27 -FEP_CAT-17c-CAT-17b 0.77 0.13 -FEP_CAT-17g-CAT-13m -88.78 0.19 -FEP_CAT-17f-CAT-17b 29.71 0.16 -FEP_CAT-24-CAT-13o 18.56 0.38 -FEP_CAT-4p-CAT-4j -9.58 0.11 -FEP_CAT-4l-CAT-17g -50.93 0.24 -FEP_CAT-17i-CAT-17e 13.30 0.14 -FEP_CAT-4k-CAT-17d 3.17 0.27 -FEP_CAT-4k-CAT-17b 34.97 0.42 -FEP_CAT-4j-CAT-17a 15.55 0.44 -FEP_CAT-4n-CAT-4k -13.48 0.20 -FEP_CAT-4i-CAT-17g 10.43 0.18 -FEP_CAT-4p-CAT-17g -7.50 0.19 -FEP_CAT-17h-CAT-13o 12.68 0.20 -FEP_CAT-4o-CAT-17f -18.61 0.13 -FEP_CAT-4m-CAT-17g 1.85 0.17 -FEP_CAT-4c-CAT-17a -14.71 0.42 -FEP_CAT-4l-CAT-4d -22.04 0.52 -FEP_CAT-4k-CAT-17i 4.15 0.32 -FEP_CAT-17h-CAT-13k -16.38 0.22 -FEP_CAT-4k-CAT-4b 43.24 0.21 -FEP_CAT-4i-CAT-4d 39.30 0.68 -FEP_CAT-4a-CAT-17b -8.54 0.17 -FEP_CAT-4n-CAT-17g 0.10 0.52 -FEP_CAT-4m-CAT-17a 14.28 0.29 -FEP_CAT-17f-CAT-17e 12.87 0.13 -FEP_CAT-4o-CAT-13n -90.61 0.18 -FEP_CAT-17h-CAT-13n -80.20 0.25 -FEP_CAT-4j-CAT-17i -8.85 0.16 -FEP_CAT-4o-CAT-4b 19.40 0.17 -FEP_CAT-4j-CAT-24 -3.95 0.95 -FEP_CAT-4p-CAT-24 -15.38 0.70 -FEP_CAT-4o-CAT-4j -11.14 0.11 -FEP_CAT-4p-CAT-4a 20.33 0.32 -FEP_CAT-4c-CAT-17e -25.57 0.45 -FEP_CAT-17i-CAT-13m -78.39 0.20 -FEP_CAT-17i-CAT-17d -1.10 0.20 -FEP_CAT-4l-CAT-4a -22.30 0.13 -FEP_CAT-4o-CAT-4l 41.50 0.18 -FEP_CAT-4b-CAT-17f -38.28 0.33 -FEP_CAT-4l-CAT-17b -30.85 0.49 -FEP_CAT-4i-CAT-13k -7.65 0.25 -FEP_CAT-4j-CAT-17b 21.25 0.38 -FEP_CAT-4c-CAT-17d -39.64 0.97 -FEP_CAT-4p-CAT-4n -8.55 0.11 -FEP_CAT-4o-CAT-17d -20.14 0.24 -FEP_CAT-4j-CAT-17g 2.10 0.15 -FEP_CAT-4n-CAT-13k -17.48 0.22 -FEP_CAT-17e-CAT-17d -14.01 0.20 -FEP_CAT-4k-CAT-4i 3.93 0.23 -FEP_CAT-4n-CAT-4b 29.71 0.23 -FEP_CAT-4n-CAT-17b 20.36 0.17 -FEP_CAT-4j-CAT-17c 20.93 0.28 -FEP_CAT-4p-CAT-4d 21.15 0.48 -FEP_CAT-17b-CAT-17a -7.00 0.27 -FEP_CAT-4b-CAT-13m -117.51 0.24 -FEP_CAT-4l-CAT-4c -23.05 0.26 -FEP_CAT-17e-CAT-13n -84.03 0.17 -FEP_CAT-4m-CAT-4i -8.84 0.24 -FEP_CAT-4o-CAT-17a 3.41 0.26 -FEP_CAT-4n-CAT-17h -0.95 0.37 -FEP_CAT-17i-CAT-17c 28.95 0.12 -FEP_CAT-4d-CAT-4a -2.08 1.01 -FEP_CAT-4j-CAT-4a 30.24 0.13 -FEP_CAT-4b-CAT-24 -36.56 0.39 -FEP_CAT-4l-CAT-17a -37.68 0.56 -FEP_CAT-4c-CAT-13m -115.42 0.31 -FEP_CAT-17g-CAT-17c 18.61 0.21 -FEP_CAT-17g-CAT-13n -81.40 0.30 -FEP_CAT-4n-CAT-17d -10.12 0.24 -FEP_CAT-4c-CAT-17c -8.82 0.27 -FEP_CAT-17b-CAT-13o -8.06 0.30 -FEP_CAT-4o-CAT-13o 2.11 0.14 -FEP_CAT-4a-CAT-17d -40.07 0.32 -FEP_CAT-4p-CAT-17d -18.91 0.22 -FEP_CAT-4a-CAT-17a -15.89 0.26 -FEP_CAT-4k-CAT-13m -73.85 0.14 -FEP_CAT-4i-CAT-17d -0.39 0.15 -FEP_CAT-4k-CAT-17a 26.61 0.41 -FEP_CAT-4o-CAT-4i -19.67 0.24 -FEP_CAT-17i-CAT-13k -7.09 0.26 -FEP_CAT-4b-CAT-4a -0.87 0.13 -FEP_CAT-4o-CAT-4c 18.44 0.25 -FEP_CAT-4l-CAT-17d -62.20 0.42 -FEP_CAT-4p-CAT-13m -96.24 0.24 -FEP_CAT-4k-CAT-17e 17.94 0.30 -FEP_CAT-4k-CAT-4j 12.17 0.17 -FEP_CAT-4o-CAT-4k -23.66 0.11 -FEP_CAT-17i-CAT-17b 30.35 0.14 -FEP_CAT-4j-CAT-13o 13.80 0.19 -FEP_CAT-17h-CAT-17a 14.13 0.20 -FEP_CAT-17c-CAT-13m -107.43 0.18 -FEP_CAT-4n-CAT-4c 28.36 0.27 -FEP_CAT-4o-CAT-4m -10.47 0.14 -FEP_CAT-4l-CAT-17h -51.62 0.31 -FEP_CAT-4n-CAT-17f -9.34 0.15 -FEP_CAT-17g-CAT-17d -11.35 0.10 -FEP_CAT-17e-CAT-17b 16.94 0.17 -FEP_CAT-4i-CAT-17a 23.26 0.21 -FEP_CAT-4p-CAT-17a 5.25 0.15 -FEP_CAT-4l-CAT-17c -32.23 0.21 -FEP_CAT-4k-CAT-4c 41.94 0.27 -FEP_CAT-4p-CAT-17i -18.39 0.23 -FEP_CAT-4m-CAT-4j -0.84 0.11 -FEP_CAT-4j-CAT-4d 32.19 0.63 -FEP_CAT-4m-CAT-17d -10.07 0.22 -FEP_CAT-4c-CAT-17i -39.21 0.97 -FEP_CAT-4m-CAT-17h 0.24 0.20 -FEP_CAT-4i-CAT-24 2.87 0.63 -FEP_CAT-4m-CAT-4b 30.05 0.14 -FEP_CAT-4k-CAT-24 6.83 0.60 -FEP_CAT-4n-CAT-4m -0.61 0.17 -FEP_CAT-24-CAT-17c 26.18 0.35 -FEP_CAT-4l-CAT-17e -47.04 0.53 -FEP_CAT-4c-CAT-24 -35.25 0.86 -FEP_CAT-4k-CAT-13n -66.69 0.24 -FEP_CAT-4m-CAT-13m -87.64 0.13 -FEP_CAT-17d-CAT-13m -77.40 0.20 -FEP_CAT-17i-CAT-17h 8.85 0.19 -FEP_CAT-4l-CAT-13o -38.98 0.22 -FEP_CAT-4p-CAT-4c 19.41 0.32 -FEP_CAT-4b-CAT-17b -9.10 0.14 -FEP_CAT-17i-CAT-17f 0.55 0.16 -FEP_CAT-17c-CAT-13o -7.16 0.19 -FEP_CAT-4d-CAT-4c 0.59 0.16 -FEP_CAT-24-CAT-13m -81.20 0.51 -FEP_CAT-4p-CAT-17c 10.81 0.30 -FEP_CAT-4d-CAT-13o -17.37 0.57 -FEP_CAT-4p-CAT-4o 1.66 0.15 -FEP_CAT-17c-CAT-17a -6.21 0.20 -FEP_CAT-4j-CAT-17d -9.12 0.07 -FEP_CAT-4n-CAT-17c 19.79 0.18 -FEP_CAT-4m-CAT-4c 29.22 0.29 -FEP_CAT-4b-CAT-13o -17.20 0.17 -FEP_CAT-4c-CAT-17b -8.30 0.33 -FEP_CAT-4d-CAT-17f -38.74 0.75 -FEP_CAT-24-CAT-17b 27.54 0.13 -FEP_CAT-17i-CAT-17a 23.07 0.19 -FEP_CAT-4o-CAT-17e -5.92 0.33 -FEP_CAT-4m-CAT-17i -8.90 0.14 -FEP_CAT-4c-CAT-13n -108.90 0.37 -FEP_CAT-4a-CAT-13n -109.78 0.16 -FEP_CAT-4b-CAT-17d -41.07 0.33 -FEP_CAT-17i-CAT-13n -71.33 0.22 -FEP_CAT-4l-CAT-13n -132.14 0.21 -FEP_CAT-4i-CAT-13o 22.22 0.20 -FEP_CAT-4b-CAT-17g -29.25 0.43 -FEP_CAT-4n-CAT-13m -87.68 0.15 -FEP_CAT-17g-CAT-17a 13.35 0.55 -FEP_CAT-4m-CAT-4d 29.87 0.35 -FEP_CAT-4p-CAT-4i -17.96 0.13 -FEP_CAT-4o-CAT-24 -16.03 0.78 -FEP_CAT-4a-CAT-24 -35.01 0.90 -FEP_CAT-4o-CAT-4d 19.47 0.36 -FEP_CAT-17b-CAT-13m -108.71 0.22 -FEP_CAT-4p-CAT-13k -25.97 0.37 -FEP_CAT-4m-CAT-17e 3.89 0.19 -FEP_CAT-4p-CAT-4l 42.61 0.28 -FEP_CAT-4p-CAT-17e -5.06 0.19 -FEP_CAT-4m-CAT-17c 20.01 0.16 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index 9d6abc76..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/back_up/2nd_half/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,316 +0,0 @@ -FEP crashes -FEP_CAT-13n-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4o/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index 16ab3e7e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_CAT-13d-CAT-13b -3.88 0.49 -FEP_CAT-13o-CAT-13e 5.29 0.33 -FEP_CAT-13f-CAT-13e -2.14 0.30 -FEP_CAT-4a-CAT-13d -11.24 0.46 -FEP_CAT-4m-CAT-13d 19.71 0.59 -FEP_CAT-13g-CAT-13c -0.37 0.86 -FEP_CAT-13i-CAT-13b -1.76 0.49 -FEP_CAT-13h-CAT-13a -21.14 0.80 -FEP_CAT-13m-CAT-13a 94.53 0.93 -FEP_CAT-13j-CAT-13e 29.12 0.69 -FEP_CAT-13h-CAT-13c -8.31 1.26 -FEP_CAT-17g-CAT-13f 17.71 0.29 -FEP_CAT-4o-CAT-13e 7.30 0.56 -FEP_CAT-4i-CAT-13f 29.47 0.72 -FEP_CAT-24-CAT-13a 16.52 0.55 -FEP_CAT-4p-CAT-13a -2.09 0.94 -FEP_CAT-13g-CAT-13b -9.51 0.83 -FEP_CAT-4k-CAT-13c 35.43 0.49 -FEP_CAT-4i-CAT-13a 14.98 1.04 -FEP_CAT-4i-CAT-13b 24.32 0.45 -FEP_CAT-17f-CAT-13e 26.59 0.58 -FEP_CAT-4b-CAT-13c -4.17 0.81 -FEP_CAT-17i-CAT-13a 16.24 0.46 -FEP_CAT-17f-CAT-13a 14.56 0.18 -FEP_CAT-13e-CAT-13d -0.17 0.61 -FEP_CAT-17c-CAT-13f 0.28 0.71 -FEP_CAT-4l-CAT-13a -46.76 0.76 -FEP_CAT-4j-CAT-13f 20.47 0.64 -FEP_CAT-4c-CAT-13c -8.05 0.82 -FEP_CAT-17b-CAT-13c 1.52 1.01 -FEP_CAT-24-CAT-13d 26.31 0.38 -FEP_CAT-17e-CAT-13b 12.61 0.40 -FEP_CAT-13g-CAT-13e -4.80 0.47 -FEP_CAT-13o-CAT-13b 1.52 0.66 -FEP_CAT-13e-CAT-13b -4.13 0.68 -FEP_CAT-13i-CAT-13c 7.19 0.54 -FEP_CAT-4c-CAT-13b -14.89 1.08 -FEP_CAT-17i-CAT-13f 29.11 0.52 -FEP_CAT-17a-CAT-13c 7.95 0.53 -FEP_CAT-4b-CAT-13d -8.67 0.69 -FEP_CAT-13f-CAT-13b -4.19 0.64 -FEP_CAT-4b-CAT-13e -8.65 0.67 -FEP_CAT-17d-CAT-13a 14.96 0.35 -FEP_CAT-4m-CAT-13b 16.26 0.52 -FEP_CAT-13j-CAT-13d 29.79 0.51 -FEP_CAT-17e-CAT-13c 19.59 1.17 -FEP_CAT-4o-CAT-13b 5.89 0.25 -FEP_CAT-13k-CAT-13a 22.10 0.80 -FEP_CAT-13n-CAT-13f 100.69 0.60 -FEP_CAT-4c-CAT-13e -11.82 0.98 -FEP_CAT-13i-CAT-13f 2.78 0.34 -FEP_CAT-4a-CAT-13c -5.64 0.59 -FEP_CAT-17g-CAT-13e 16.28 0.49 -FEP_CAT-13o-CAT-13a -7.47 0.73 -FEP_CAT-4n-CAT-13d 17.90 0.81 -FEP_CAT-17d-CAT-13b 23.76 0.27 -FEP_CAT-4d-CAT-13a -24.46 0.01 -FEP_CAT-17b-CAT-13e -2.34 0.63 -FEP_CAT-4b-CAT-13a -21.13 0.71 -FEP_CAT-13b-CAT-13a -8.82 0.44 -FEP_CAT-13h-CAT-13b -17.80 1.22 -FEP_CAT-13h-CAT-13f -8.12 0.67 -FEP_CAT-17e-CAT-13f 16.71 0.70 -FEP_CAT-4n-CAT-13e 19.16 0.48 -FEP_CAT-13h-CAT-13e -11.28 1.22 -FEP_CAT-4c-CAT-13f -11.28 1.47 -FEP_CAT-4l-CAT-13d -34.91 0.47 -FEP_CAT-13k-CAT-13b 31.64 0.81 -FEP_CAT-13d-CAT-13c 5.16 0.70 -FEP_CAT-4p-CAT-13c 17.22 0.37 -FEP_CAT-13n-CAT-13c 103.74 0.56 -FEP_CAT-17g-CAT-13d 15.96 0.25 -FEP_CAT-4o-CAT-13d 6.78 0.67 -FEP_CAT-17c-CAT-13a -13.50 0.32 -FEP_CAT-4d-CAT-13e -10.46 0.77 -FEP_CAT-24-CAT-13c 32.07 0.78 -FEP_CAT-4m-CAT-13e 19.55 0.53 -FEP_CAT-17f-CAT-13d 25.95 0.41 -FEP_CAT-17b-CAT-13d -1.92 0.44 -FEP_CAT-4a-CAT-13f -10.55 0.49 -FEP_CAT-17h-CAT-13a 6.95 0.34 -FEP_CAT-13d-CAT-13a -11.11 0.46 -FEP_CAT-4o-CAT-13c 13.12 0.76 -FEP_CAT-13m-CAT-13b 105.25 0.40 -FEP_CAT-17h-CAT-13c 25.61 0.44 -FEP_CAT-4j-CAT-13e 19.72 0.32 -FEP_CAT-4j-CAT-13b 16.33 0.47 -FEP_CAT-17d-CAT-13e 27.21 0.33 -FEP_CAT-4d-CAT-13f -7.85 0.77 -FEP_CAT-4a-CAT-13e -12.16 0.62 -FEP_CAT-4l-CAT-13c -27.97 0.64 -FEP_CAT-4k-CAT-13a 17.62 0.95 -FEP_CAT-4p-CAT-13d 9.86 0.53 -FEP_CAT-13k-CAT-13d 35.23 1.01 -FEP_CAT-17c-CAT-13c 4.16 0.50 -FEP_CAT-17h-CAT-13d 18.44 0.21 -FEP_CAT-17h-CAT-13f 20.71 0.42 -FEP_CAT-13n-CAT-13b 94.63 0.40 -FEP_CAT-4i-CAT-13e 27.61 0.48 -FEP_CAT-4a-CAT-13b -15.51 1.01 -FEP_CAT-17a-CAT-13f 7.48 0.69 -FEP_CAT-13f-CAT-13c 4.95 0.53 -FEP_CAT-4j-CAT-13c 23.98 0.73 -FEP_CAT-17g-CAT-13c 21.71 0.50 -FEP_CAT-17a-CAT-13e 5.35 0.71 -FEP_CAT-13g-CAT-13f -3.61 0.30 -FEP_CAT-4m-CAT-13a 7.54 0.68 -FEP_CAT-4k-CAT-13e 29.15 0.46 -FEP_CAT-4l-CAT-13b -37.57 0.78 -FEP_CAT-4j-CAT-13d 18.52 0.37 -FEP_CAT-17i-CAT-13c 31.94 0.64 -FEP_CAT-17i-CAT-13e 27.32 0.56 -FEP_CAT-17h-CAT-13e 18.72 0.49 -FEP_CAT-4c-CAT-13a -24.85 0.96 -FEP_CAT-17i-CAT-13b 23.97 0.39 -FEP_CAT-13g-CAT-13d -4.65 0.93 -FEP_CAT-4m-CAT-13c 26.19 0.55 -FEP_CAT-4i-CAT-13c 32.58 0.57 -FEP_CAT-4k-CAT-13b 25.73 0.62 -FEP_CAT-17e-CAT-13e 16.03 0.56 -FEP_CAT-13m-CAT-13d 106.20 0.74 -FEP_CAT-13k-CAT-13f 35.57 nan -FEP_CAT-13k-CAT-13e 33.87 0.50 -FEP_CAT-13o-CAT-13d 3.17 0.61 -FEP_CAT-13m-CAT-13e 106.82 0.61 -FEP_CAT-17c-CAT-13e -2.84 0.43 -FEP_CAT-4i-CAT-13d 26.67 0.58 -FEP_CAT-17f-CAT-13b 23.63 0.24 -FEP_CAT-4d-CAT-13b -12.82 0.96 -FEP_CAT-13i-CAT-13a -11.10 1.07 -FEP_CAT-17b-CAT-13f 0.49 0.69 -FEP_CAT-13e-CAT-13c 6.94 0.37 -FEP_CAT-13m-CAT-13f 107.97 0.63 -FEP_CAT-17g-CAT-13a 2.55 0.57 -FEP_CAT-4p-CAT-13e 9.67 0.73 -FEP_CAT-4n-CAT-13c 24.61 0.39 -FEP_CAT-4j-CAT-13a nan nan -FEP_CAT-13j-CAT-13a 18.26 0.99 -FEP_CAT-17g-CAT-13b 13.16 0.31 -FEP_CAT-4n-CAT-13a 7.46 0.26 -FEP_CAT-4b-CAT-13f -8.19 0.62 -FEP_CAT-4d-CAT-13c -5.57 1.06 -FEP_CAT-17i-CAT-13d 26.81 0.41 -FEP_CAT-17h-CAT-13b 16.68 0.18 -FEP_CAT-13o-CAT-13c 10.46 0.41 -FEP_CAT-4n-CAT-13b 14.70 0.63 -FEP_CAT-13j-CAT-13b 26.47 1.33 -FEP_CAT-13f-CAT-13d -2.32 0.77 -FEP_CAT-4c-CAT-13d -13.12 0.53 -FEP_CAT-17d-CAT-13d 27.10 0.44 -FEP_CAT-17c-CAT-13b -5.20 0.58 -FEP_CAT-17a-CAT-13b 2.09 0.40 -FEP_CAT-4b-CAT-13b -11.23 0.43 -FEP_CAT-13k-CAT-13c 41.40 0.60 -FEP_CAT-13h-CAT-13d -9.74 0.48 -FEP_CAT-17e-CAT-13d 14.82 0.64 -FEP_CAT-24-CAT-13f 28.66 1.01 -FEP_CAT-13f-CAT-13a -13.78 1.03 -FEP_CAT-13g-CAT-13a -16.70 0.86 -FEP_CAT-4o-CAT-13a -3.77 1.16 -FEP_CAT-17f-CAT-13f 28.84 0.64 -FEP_CAT-13n-CAT-13e 96.21 0.57 -FEP_CAT-13e-CAT-13a -10.96 0.78 -FEP_CAT-13o-CAT-13f 4.54 0.44 -FEP_CAT-4l-CAT-13e -34.28 0.58 -FEP_CAT-13i-CAT-13d 1.58 0.51 -FEP_CAT-4a-CAT-13a -23.13 0.45 -FEP_CAT-13c-CAT-13b -8.52 0.29 -FEP_CAT-24-CAT-13b 23.74 0.72 -FEP_CAT-17d-CAT-13c 33.82 0.58 -FEP_CAT-17f-CAT-13c 32.89 0.42 -FEP_CAT-17e-CAT-13a 5.68 0.57 -FEP_CAT-24-CAT-13e 26.23 0.57 -FEP_CAT-13n-CAT-13a 84.94 0.57 -FEP_CAT-17c-CAT-13d -0.66 0.32 -FEP_CAT-17b-CAT-13b -5.01 0.51 -FEP_CAT-13j-CAT-13c 36.31 1.16 -FEP_CAT-13n-CAT-13d 98.05 0.63 -FEP_CAT-13i-CAT-13e 1.98 0.32 -FEP_CAT-4k-CAT-13d 27.36 0.78 -FEP_CAT-4d-CAT-13d -6.40 1.63 -FEP_CAT-13c-CAT-13a -17.25 0.63 -FEP_CAT-17a-CAT-13d 4.39 0.19 -FEP_CAT-17d-CAT-13f 29.01 0.60 -FEP_CAT-13m-CAT-13c 113.70 0.49 -FEP_CAT-4p-CAT-13b 8.46 1.22 -FEP_CAT-17a-CAT-13a -5.57 0.46 -FEP_CAT-13j-CAT-13f 32.02 0.66 -FEP_CAT-17b-CAT-13a -12.97 0.73 -FEP_CAT-17e-CAT-13i 13.96 0.72 -FEP_CAT-17e-CAT-13g 21.51 0.89 -FEP_CAT-4n-CAT-13f 18.94 0.49 -FEP_CAT-13o-CAT-13j -26.50 0.15 -FEP_CAT-4n-CAT-13g 23.85 0.51 -FEP_CAT-4j-CAT-13g 24.58 0.73 -FEP_CAT-24-CAT-13i 24.05 0.47 -FEP_CAT-17g-CAT-13h 28.28 0.94 -FEP_CAT-17g-CAT-13j -13.56 0.34 -FEP_CAT-13o-CAT-13k -31.26 0.36 -FEP_CAT-4k-CAT-13h 39.23 1.51 -FEP_CAT-4k-CAT-13i 28.52 0.41 -FEP_CAT-4p-CAT-13i 10.24 0.58 -FEP_CAT-17h-CAT-13i 18.72 0.76 -FEP_CAT-4p-CAT-13f 13.60 0.73 -FEP_CAT-17g-CAT-13k -19.66 0.41 -FEP_CAT-13h-CAT-13g -5.67 1.09 -FEP_CAT-4c-CAT-13g -7.39 0.85 -FEP_CAT-17f-CAT-13i 25.92 0.20 -FEP_CAT-4a-CAT-13j -41.67 0.33 -FEP_CAT-4j-CAT-13j -11.55 0.31 -FEP_CAT-17b-CAT-13j -32.16 0.58 -FEP_CAT-17a-CAT-13i 3.64 0.37 -FEP_CAT-4m-CAT-13i 19.18 0.54 -FEP_CAT-17i-CAT-13g 33.13 1.08 -FEP_CAT-4c-CAT-13h -3.69 0.91 -FEP_CAT-13n-CAT-13k 62.13 0.27 -FEP_CAT-17b-CAT-13h 6.85 0.50 -FEP_CAT-17f-CAT-13g 33.07 1.09 -FEP_CAT-17b-CAT-13i -3.21 0.43 -FEP_CAT-17e-CAT-13k -18.86 0.90 -FEP_CAT-4o-CAT-13i 7.51 0.39 -FEP_CAT-4a-CAT-13g -6.72 0.61 -FEP_CAT-13j-CAT-13g 35.85 0.46 -FEP_CAT-17a-CAT-13h 13.42 0.27 -FEP_CAT-13m-CAT-13i 106.15 0.18 -FEP_CAT-17f-CAT-13h 40.01 0.97 -FEP_CAT-13n-CAT-13i 96.66 0.35 -FEP_CAT-17f-CAT-13j -2.94 0.43 -FEP_CAT-4d-CAT-13g -4.76 0.80 -FEP_CAT-4d-CAT-13j -39.64 0.46 -FEP_CAT-17g-CAT-13i 14.66 0.35 -FEP_CAT-4p-CAT-13j -19.29 0.28 -FEP_CAT-4k-CAT-13j -1.14 0.24 -FEP_CAT-4i-CAT-13i 26.01 0.36 -FEP_CAT-4l-CAT-13f -33.85 0.83 -FEP_CAT-4d-CAT-13i -11.66 0.98 -FEP_CAT-13k-CAT-13g 40.00 0.36 -FEP_CAT-4c-CAT-13i -11.83 1.15 -FEP_CAT-4b-CAT-13j -39.13 0.38 -FEP_CAT-17i-CAT-13i 26.39 0.43 -FEP_CAT-4p-CAT-13h 18.94 0.85 -FEP_CAT-4m-CAT-13j -9.79 0.25 -FEP_CAT-13k-CAT-13j 5.45 0.38 -FEP_CAT-4l-CAT-13h -23.67 1.13 -FEP_CAT-13m-CAT-13k 72.77 0.24 -FEP_CAT-17f-CAT-13k -8.78 0.46 -FEP_CAT-17h-CAT-13h 32.18 0.91 -FEP_CAT-17d-CAT-13j -2.82 0.43 -FEP_CAT-24-CAT-13j -2.77 0.68 -FEP_CAT-17e-CAT-13h 24.20 0.35 -FEP_CAT-4j-CAT-13i 18.65 0.39 -FEP_CAT-24-CAT-13g 31.26 0.55 -FEP_CAT-17h-CAT-13g 24.33 0.31 -FEP_CAT-4n-CAT-13h 29.66 1.21 -FEP_CAT-4o-CAT-13h 16.64 1.09 -FEP_CAT-13k-CAT-13h 45.69 1.11 -FEP_CAT-4o-CAT-13f 10.22 0.53 -FEP_CAT-13n-CAT-13g 102.98 0.67 -FEP_CAT-13m-CAT-13g 111.63 0.46 -FEP_CAT-4m-CAT-13f 21.20 0.69 -FEP_CAT-4n-CAT-13i 17.79 0.34 -FEP_CAT-13i-CAT-13g 5.67 0.78 -FEP_CAT-17g-CAT-13g 21.39 0.89 -FEP_CAT-4l-CAT-13j -64.70 0.33 -FEP_CAT-4j-CAT-13h 28.86 1.03 -FEP_CAT-13o-CAT-13g 10.26 0.49 -FEP_CAT-17d-CAT-13h 38.35 0.90 -FEP_CAT-13n-CAT-13j 67.94 0.34 -FEP_CAT-4c-CAT-13j -44.42 0.87 -FEP_CAT-13o-CAT-13i 3.57 0.31 -FEP_CAT-17c-CAT-13i -2.93 0.40 -FEP_CAT-13m-CAT-13h 116.16 0.55 -FEP_CAT-17d-CAT-13i 25.62 0.39 -FEP_CAT-24-CAT-13h 35.68 0.55 -FEP_CAT-17c-CAT-13h 9.12 1.34 -FEP_CAT-4m-CAT-13g 24.08 0.49 -FEP_CAT-17d-CAT-13k -8.02 0.68 -FEP_CAT-17d-CAT-13g 33.93 0.63 -FEP_CAT-4o-CAT-13j -22.65 0.30 -FEP_CAT-17h-CAT-13j -11.98 0.51 -FEP_CAT-13k-CAT-13i 35.18 0.32 -FEP_CAT-17i-CAT-13h 35.69 0.64 -FEP_CAT-17c-CAT-13j -31.46 0.42 -FEP_CAT-4k-CAT-13g 34.36 1.15 -FEP_CAT-13i-CAT-13h 14.04 1.50 -FEP_CAT-4l-CAT-13g -27.85 0.94 -FEP_CAT-4i-CAT-13j -2.75 0.29 -FEP_CAT-4p-CAT-13g 15.76 0.64 -FEP_CAT-17a-CAT-13g 10.06 0.66 -FEP_CAT-13j-CAT-13h 39.24 1.13 -FEP_CAT-17b-CAT-13k -37.57 0.71 -FEP_CAT-13o-CAT-13h 16.18 1.15 -FEP_CAT-4b-CAT-13i -10.18 0.34 -FEP_CAT-17a-CAT-13j -24.20 0.52 -FEP_CAT-17a-CAT-13k -31.42 0.60 -FEP_CAT-4k-CAT-13f 29.63 0.69 -FEP_CAT-13j-CAT-13i 28.23 0.37 -FEP_CAT-4i-CAT-13g 31.94 0.45 -FEP_CAT-13m-CAT-13j 77.57 0.41 -FEP_CAT-4b-CAT-13g -3.46 0.66 -FEP_CAT-4d-CAT-13h 5.45 0.62 -FEP_CAT-4a-CAT-13h -0.78 1.45 -FEP_CAT-13n-CAT-13h 109.05 1.06 -FEP_CAT-4m-CAT-13h 33.41 1.28 -FEP_CAT-4a-CAT-13i -12.28 0.54 -FEP_CAT-4i-CAT-13h 36.00 0.98 -FEP_CAT-17e-CAT-13j -14.58 0.62 -FEP_CAT-17b-CAT-13g 3.52 0.57 -FEP_CAT-4b-CAT-13h 2.28 1.64 -FEP_CAT-4n-CAT-13j -11.20 0.29 -FEP_CAT-17c-CAT-13g 4.89 0.89 -FEP_CAT-17c-CAT-13k -36.70 0.36 -FEP_CAT-4o-CAT-13g 12.06 0.59 -FEP_CAT-17i-CAT-13j -3.39 0.79 -FEP_CAT-4l-CAT-13i -34.71 0.33 -FEP_CAT-4c-CAT-17h -31.54 0.75 -FEP_CAT-24-CAT-17g 11.44 0.62 -FEP_CAT-4i-CAT-4d 36.45 0.70 -FEP_CAT-4k-CAT-17i 4.21 0.69 -FEP_CAT-4d-CAT-4b -0.50 0.35 -FEP_CAT-17i-CAT-13o 23.11 0.83 -FEP_CAT-4k-CAT-17a 24.27 0.80 -FEP_CAT-4d-CAT-17i -36.07 1.02 -FEP_CAT-4i-CAT-13n -70.44 0.29 -FEP_CAT-4b-CAT-17c -7.26 0.50 -FEP_CAT-4a-CAT-17d -38.43 0.56 -FEP_CAT-4j-CAT-17e 3.24 0.85 -FEP_CAT-24-CAT-13k -9.69 0.65 -FEP_CAT-17g-CAT-13o 10.39 0.44 -FEP_CAT-4n-CAT-13n -78.63 0.19 -FEP_CAT-4k-CAT-13n -68.79 0.37 -FEP_CAT-4k-CAT-4j 10.11 0.23 -FEP_CAT-4n-CAT-4d 28.89 0.85 -FEP_CAT-4j-CAT-13n -79.09 0.64 -FEP_CAT-4d-CAT-13n -107.47 0.58 -FEP_CAT-4n-CAT-4i -8.58 0.44 -FEP_CAT-4o-CAT-4l 41.87 0.30 -FEP_CAT-4m-CAT-4j 1.64 0.29 -FEP_CAT-4n-CAT-4k -9.59 0.14 -FEP_CAT-4c-CAT-17a -20.05 0.80 -FEP_CAT-4n-CAT-4j -0.38 0.42 -FEP_CAT-4c-CAT-17f -40.28 0.74 -FEP_CAT-4p-CAT-17f -15.58 0.30 -FEP_CAT-4b-CAT-17h -28.83 0.49 -FEP_CAT-17g-CAT-13n -82.18 0.49 -FEP_CAT-17e-CAT-17a 10.35 0.42 -FEP_CAT-4a-CAT-17e -27.83 0.92 -FEP_CAT-4p-CAT-13n -86.54 0.23 -FEP_CAT-17h-CAT-17e 3.07 0.37 -FEP_CAT-4k-CAT-17c 31.03 0.65 -FEP_CAT-4c-CAT-17d -40.94 0.67 -FEP_CAT-4p-CAT-17c 13.64 0.44 -FEP_CAT-4j-CAT-4a 30.89 0.24 -FEP_CAT-4j-CAT-17g 3.21 0.43 -FEP_CAT-4i-CAT-17g 11.08 0.46 -FEP_CAT-4o-CAT-4n -11.16 0.30 -FEP_CAT-4m-CAT-4c 32.60 0.83 -FEP_CAT-4p-CAT-24 -15.86 0.89 -FEP_CAT-4b-CAT-17f -36.02 0.69 -FEP_CAT-17h-CAT-13n -77.48 0.32 -FEP_CAT-17b-CAT-17a -7.21 0.21 -FEP_CAT-17i-CAT-17e 11.44 0.30 -FEP_CAT-4n-CAT-13k -16.17 0.34 -FEP_CAT-4c-CAT-13o -16.10 1.21 -FEP_CAT-17g-CAT-17a 9.88 0.53 -FEP_CAT-17b-CAT-13n -99.15 0.74 -FEP_CAT-13o-CAT-13m -102.75 0.48 -FEP_CAT-4d-CAT-17c -8.47 1.44 -FEP_CAT-4n-CAT-24 -8.44 1.24 -FEP_CAT-4j-CAT-17c 20.66 0.44 -FEP_CAT-4l-CAT-17h -53.77 0.50 -FEP_CAT-4d-CAT-17b -9.99 1.03 -FEP_CAT-17i-CAT-13k -7.78 0.66 -FEP_CAT-4j-CAT-17h -0.17 0.49 -FEP_CAT-4p-CAT-4m -8.92 0.21 -FEP_CAT-17f-CAT-17e 11.21 0.33 -FEP_CAT-4o-CAT-4j -11.47 0.20 -FEP_CAT-4k-CAT-4b 38.09 0.35 -FEP_CAT-4b-CAT-17i -36.76 1.18 -FEP_CAT-4n-CAT-17h -0.81 0.57 -FEP_CAT-4l-CAT-13m -141.44 0.25 -FEP_CAT-4d-CAT-17h -29.90 0.65 -FEP_CAT-17e-CAT-17c 18.24 0.32 -FEP_CAT-17b-CAT-13m -108.72 0.72 -FEP_CAT-4m-CAT-13k -15.58 0.20 -FEP_CAT-4m-CAT-17i -6.57 0.73 -FEP_CAT-4m-CAT-13o 16.05 0.34 -FEP_CAT-17i-CAT-17d 0.42 0.47 -FEP_CAT-4k-CAT-17f 2.43 0.69 -FEP_CAT-4b-CAT-17e -23.77 0.52 -FEP_CAT-17f-CAT-13o 21.26 0.43 -FEP_CAT-4p-CAT-17i -16.50 0.81 -FEP_CAT-4m-CAT-4l 53.43 0.36 -FEP_CAT-4o-CAT-13o 3.67 0.33 -FEP_CAT-4n-CAT-17b 21.48 0.62 -FEP_CAT-4n-CAT-17i -9.05 0.64 -FEP_CAT-4k-CAT-13m -77.80 0.58 -FEP_CAT-4p-CAT-4i -15.85 0.30 -FEP_CAT-4o-CAT-17h -12.18 0.59 -FEP_CAT-4i-CAT-13k -8.04 0.38 -FEP_CAT-4n-CAT-17g 2.98 0.35 -FEP_CAT-4a-CAT-13k -46.68 0.38 -FEP_CAT-17i-CAT-13n -69.50 0.49 -FEP_CAT-4j-CAT-13m -88.99 0.43 -FEP_CAT-4k-CAT-17g 13.34 0.28 -FEP_CAT-4o-CAT-4k -21.19 0.29 -FEP_CAT-4c-CAT-4b -3.40 0.64 -FEP_CAT-4m-CAT-17h 1.77 0.50 -FEP_CAT-4n-CAT-4m -1.05 0.25 -FEP_CAT-13o-CAT-13n -93.56 0.30 -FEP_CAT-17h-CAT-17g 2.97 0.28 -FEP_CAT-17a-CAT-13n -92.63 0.55 -FEP_CAT-17b-CAT-13o -5.26 0.60 -FEP_CAT-4a-CAT-24 -38.21 0.48 -FEP_CAT-17g-CAT-17b 16.85 0.16 -FEP_CAT-4i-CAT-17f -0.82 0.38 -FEP_CAT-4j-CAT-13k -16.89 0.36 -FEP_CAT-4c-CAT-13k -47.70 1.67 -FEP_CAT-24-CAT-17e 11.87 0.23 -FEP_CAT-4m-CAT-17b 23.08 0.84 -FEP_CAT-4k-CAT-17b 31.02 0.67 -FEP_CAT-4c-CAT-17e -29.81 0.61 -FEP_CAT-4d-CAT-24 -33.67 0.60 -FEP_CAT-4o-CAT-4i -19.40 0.39 -FEP_CAT-4i-CAT-24 1.15 1.10 -FEP_CAT-4n-CAT-13m -88.84 0.41 -FEP_CAT-4k-CAT-4i 1.75 0.19 -FEP_CAT-17c-CAT-17a -6.66 0.72 -FEP_CAT-24-CAT-13n -69.92 0.93 -FEP_CAT-4l-CAT-4c -22.30 0.61 -FEP_CAT-4b-CAT-17b -6.84 0.50 -FEP_CAT-4d-CAT-17a -16.18 0.87 -FEP_CAT-4c-CAT-17i -39.61 0.93 -FEP_CAT-4i-CAT-17i -0.60 0.64 -FEP_CAT-4d-CAT-13k -44.49 0.73 -FEP_CAT-17d-CAT-17b 27.82 0.40 -FEP_CAT-4o-CAT-17c 10.41 0.39 -FEP_CAT-4o-CAT-17b 10.08 0.57 -FEP_CAT-17i-CAT-17h 8.67 0.35 -FEP_CAT-4n-CAT-13o 15.49 0.28 -FEP_CAT-4i-CAT-17b 27.59 0.46 -FEP_CAT-4m-CAT-17e 4.38 0.93 -FEP_CAT-4p-CAT-4c 22.84 0.82 -FEP_CAT-4c-CAT-17c -10.12 0.79 -FEP_CAT-4d-CAT-17f -35.37 0.75 -FEP_CAT-17g-CAT-13m -91.57 0.54 -FEP_CAT-4m-CAT-13m -87.39 0.36 -FEP_CAT-17i-CAT-17b 28.44 0.82 -FEP_CAT-4l-CAT-24 -59.24 1.24 -FEP_CAT-4b-CAT-13m -116.64 0.34 -FEP_CAT-4k-CAT-13k -6.39 0.39 -FEP_CAT-4d-CAT-13o -16.14 1.16 -FEP_CAT-17d-CAT-17c 29.37 0.34 -FEP_CAT-4p-CAT-17h -7.62 0.39 -FEP_CAT-4p-CAT-4b 20.27 0.34 -FEP_CAT-24-CAT-17i 0.47 0.42 -FEP_CAT-4j-CAT-13o 14.10 0.46 -FEP_CAT-4l-CAT-17a -39.00 0.73 -FEP_CAT-4l-CAT-13n -132.34 0.26 -FEP_CAT-13n-CAT-13m -9.69 0.30 -FEP_CAT-4l-CAT-17f -60.50 0.65 -FEP_CAT-4p-CAT-17e -4.66 0.81 -FEP_CAT-4m-CAT-17a 15.42 0.74 -FEP_CAT-4l-CAT-13o -38.53 0.43 -FEP_CAT-4i-CAT-4b 35.83 0.42 -FEP_CAT-17e-CAT-17d -10.67 0.71 -FEP_CAT-17f-CAT-17a 21.39 0.36 -FEP_CAT-4o-CAT-17d -19.26 0.32 -FEP_CAT-24-CAT-17b 28.83 0.34 -FEP_CAT-4b-CAT-13n -107.28 0.51 -FEP_CAT-4a-CAT-17a -16.87 0.56 -FEP_CAT-4k-CAT-17h 10.41 0.37 -FEP_CAT-4l-CAT-4b -25.54 0.29 -FEP_CAT-17c-CAT-13m -109.73 0.42 -FEP_CAT-24-CAT-17c 28.63 0.65 -FEP_CAT-4l-CAT-4j -52.79 0.31 -FEP_CAT-4o-CAT-17f -17.90 0.65 -FEP_CAT-4i-CAT-17d -0.93 0.67 -FEP_CAT-17h-CAT-13o 13.53 0.36 -FEP_CAT-17c-CAT-13n -98.11 0.47 -FEP_CAT-4k-CAT-13o 24.78 0.27 -FEP_CAT-17d-CAT-13n -69.97 0.38 -FEP_CAT-4m-CAT-4b 28.97 0.45 -FEP_CAT-4l-CAT-17e -50.19 0.70 -FEP_CAT-4l-CAT-4d -26.21 0.28 -FEP_CAT-4b-CAT-24 -35.14 1.02 -FEP_CAT-4d-CAT-4a 2.21 0.47 -FEP_CAT-4j-CAT-17f -7.82 0.67 -FEP_CAT-4o-CAT-13k -27.85 0.35 -FEP_CAT-4m-CAT-4i -7.86 0.34 -FEP_CAT-4k-CAT-4c 42.04 0.43 -FEP_CAT-4m-CAT-17d -7.95 0.68 -FEP_CAT-4a-CAT-13n -108.82 0.28 -FEP_CAT-4c-CAT-13m -120.73 0.75 -FEP_CAT-4c-CAT-17g -28.62 0.69 -FEP_CAT-4b-CAT-4a 2.47 0.55 -FEP_CAT-4c-CAT-13n -110.13 0.68 -FEP_CAT-4j-CAT-4d 27.09 0.49 -FEP_CAT-4o-CAT-17i -18.31 0.66 -FEP_CAT-4j-CAT-17d -8.95 0.48 -FEP_CAT-4l-CAT-4i -60.96 0.20 -FEP_CAT-4p-CAT-4o 3.74 0.23 -FEP_CAT-4p-CAT-13k -24.57 0.46 -FEP_CAT-4l-CAT-4a -22.13 0.18 -FEP_CAT-4a-CAT-17b -11.14 0.44 -FEP_CAT-17f-CAT-17d -0.10 0.45 -FEP_CAT-4d-CAT-17g -25.73 1.38 -FEP_CAT-17i-CAT-17c 28.65 0.44 -FEP_CAT-17h-CAT-17f -7.56 0.21 -FEP_CAT-4o-CAT-13n -90.36 0.33 -FEP_CAT-4p-CAT-13o 7.49 0.38 -FEP_CAT-4o-CAT-4b 16.89 0.26 -FEP_CAT-4a-CAT-13o -16.27 0.30 -FEP_CAT-4p-CAT-17g -4.99 0.57 -FEP_CAT-17e-CAT-13o 12.54 0.76 -FEP_CAT-4k-CAT-4d 38.08 0.79 -FEP_CAT-4b-CAT-17d -36.49 1.14 -FEP_CAT-17e-CAT-13m -92.16 0.71 -FEP_CAT-17d-CAT-17a 21.49 0.50 -FEP_CAT-24-CAT-17a 21.71 0.41 -FEP_CAT-24-CAT-13o 23.15 0.82 -FEP_CAT-4m-CAT-4a 31.92 0.34 -FEP_CAT-24-CAT-17h 7.90 0.22 -FEP_CAT-17f-CAT-13n -69.97 1.17 -FEP_CAT-17h-CAT-17a 13.00 0.44 -FEP_CAT-4l-CAT-17d -60.76 0.42 -FEP_CAT-4a-CAT-17h -29.08 0.58 -FEP_CAT-17g-CAT-17e -0.06 0.30 -FEP_CAT-17g-CAT-17d -11.05 0.22 -FEP_CAT-17a-CAT-13o 1.01 0.89 -FEP_CAT-4n-CAT-17f -8.31 0.69 -FEP_CAT-4i-CAT-17a 20.82 0.62 -FEP_CAT-4k-CAT-24 2.21 1.05 -FEP_CAT-4n-CAT-17c 20.96 0.23 -FEP_CAT-17f-CAT-13m -81.37 nan -FEP_CAT-4j-CAT-4b 27.85 0.81 -FEP_CAT-4k-CAT-4a 41.15 nan -FEP_CAT-17h-CAT-17d -7.64 0.32 -FEP_CAT-4o-CAT-4c 20.29 0.49 -FEP_CAT-4i-CAT-4c 39.37 0.76 -FEP_CAT-4j-CAT-4c 31.81 0.73 -FEP_CAT-17f-CAT-17c 28.12 0.16 -FEP_CAT-4c-CAT-24 -39.31 0.95 -FEP_CAT-4i-CAT-13o 22.88 0.39 -FEP_CAT-17i-CAT-17g 11.12 0.42 -FEP_CAT-4a-CAT-17i -38.05 0.74 -FEP_CAT-4a-CAT-17g -27.38 0.48 -FEP_CAT-4d-CAT-17e -24.27 1.01 -FEP_CAT-4n-CAT-4b 27.45 0.26 -FEP_CAT-4p-CAT-17d -15.86 0.78 -FEP_CAT-4j-CAT-17b 20.03 0.40 -FEP_CAT-17h-CAT-17c 20.94 0.25 -FEP_CAT-4p-CAT-4j -7.42 0.24 -FEP_CAT-4l-CAT-17i -59.36 0.89 -FEP_CAT-24-CAT-17d 0.52 0.82 -FEP_CAT-4n-CAT-4l 52.47 0.77 -FEP_CAT-17c-CAT-13o -7.19 0.42 -FEP_CAT-4i-CAT-17h 7.86 0.36 -FEP_CAT-4o-CAT-17a 1.74 0.60 -FEP_CAT-17e-CAT-17b 17.26 0.20 -FEP_CAT-4o-CAT-4d 16.89 0.33 -FEP_CAT-4l-CAT-13k -70.15 0.17 -FEP_CAT-4c-CAT-4a -0.03 0.51 -FEP_CAT-4p-CAT-4n -7.47 0.17 -FEP_CAT-4j-CAT-4i -8.46 0.22 -FEP_CAT-4a-CAT-17c -10.17 0.43 -FEP_CAT-4i-CAT-4a 39.02 0.37 -FEP_CAT-4o-CAT-4m -11.96 0.35 -FEP_CAT-17i-CAT-13m -79.60 0.55 -FEP_CAT-4b-CAT-17g -25.64 0.80 -FEP_CAT-17a-CAT-13m -101.74 0.79 -FEP_CAT-17i-CAT-17f 0.86 0.62 -FEP_CAT-4d-CAT-4c 3.70 0.68 -FEP_CAT-17c-CAT-17b -0.58 0.50 -FEP_CAT-4o-CAT-13m -99.67 0.39 -FEP_CAT-4c-CAT-17b -10.63 0.72 -FEP_CAT-4m-CAT-17g 3.25 0.57 -FEP_CAT-17e-CAT-13n -81.90 0.65 -FEP_CAT-4n-CAT-17d -8.15 0.50 -FEP_CAT-4n-CAT-17e 2.89 0.60 -FEP_CAT-4m-CAT-17c 21.77 0.46 -FEP_CAT-24-CAT-13m -80.38 1.01 -FEP_CAT-4b-CAT-17a -14.33 1.43 -FEP_CAT-4p-CAT-13m -96.18 0.39 -FEP_CAT-4o-CAT-4a 19.86 0.26 -FEP_CAT-4m-CAT-13n -78.34 0.34 -FEP_CAT-4k-CAT-17d 1.92 0.56 -FEP_CAT-4n-CAT-4c 30.30 0.61 -FEP_CAT-4a-CAT-17f -38.41 0.53 -FEP_CAT-4i-CAT-13m -80.37 0.53 -FEP_CAT-4b-CAT-13o -12.60 0.38 -FEP_CAT-4p-CAT-4d 21.07 0.62 -FEP_CAT-4k-CAT-17e 12.68 0.56 -FEP_CAT-4p-CAT-4a 22.62 0.24 -FEP_CAT-4p-CAT-4k -17.80 0.36 -FEP_CAT-4j-CAT-17i -7.20 0.68 -FEP_CAT-24-CAT-17f 0.87 0.48 -FEP_CAT-4p-CAT-4l 45.02 0.41 -FEP_CAT-4d-CAT-13m -115.40 0.64 -FEP_CAT-4p-CAT-17b 13.69 0.59 -FEP_CAT-4n-CAT-4a 30.59 0.29 -FEP_CAT-17h-CAT-13m -88.76 0.25 -FEP_CAT-4l-CAT-4k -62.82 0.38 -FEP_CAT-4d-CAT-17d -37.61 0.78 -FEP_CAT-4i-CAT-17c 28.79 0.38 -FEP_CAT-4n-CAT-17a 13.95 0.55 -FEP_CAT-4o-CAT-17g -8.75 0.46 -FEP_CAT-4m-CAT-24 -6.83 0.72 -FEP_CAT-4a-CAT-13m -119.39 0.42 -FEP_CAT-17h-CAT-17b 20.79 0.56 -FEP_CAT-4m-CAT-17f -6.70 0.62 -FEP_CAT-4m-CAT-4k -8.72 0.20 -FEP_CAT-4i-CAT-17e 9.41 0.60 -FEP_CAT-17g-CAT-17f -10.44 0.28 -FEP_CAT-4b-CAT-13k -44.77 0.51 -FEP_CAT-17d-CAT-13o 21.35 0.59 -FEP_CAT-17f-CAT-17b 28.23 0.61 -FEP_CAT-4l-CAT-17g -50.04 0.40 -FEP_CAT-4j-CAT-17a 15.32 0.67 -FEP_CAT-17h-CAT-13k -15.87 0.62 -FEP_CAT-4j-CAT-24 -7.26 0.57 -FEP_CAT-4l-CAT-17b -32.51 0.56 -FEP_CAT-17g-CAT-17c 18.01 0.17 -FEP_CAT-4p-CAT-17a 4.75 1.02 -FEP_CAT-4l-CAT-17c -31.78 0.34 -FEP_CAT-17d-CAT-13m -80.50 0.44 -FEP_CAT-17i-CAT-17a 21.49 0.27 -FEP_CAT-4o-CAT-17e -8.30 0.56 -FEP_CAT-4m-CAT-4d 29.55 0.94 -FEP_CAT-4o-CAT-24 -18.92 0.71 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/lineal/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/lineal/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index c2d5b9cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/lineal/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_CAT-13b-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-13g-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13d/ 1 -FEP_CAT-13g-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13a/ 3 -FEP_CAT-4a-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13a/ 2 -FEP_CAT-4b-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13c/ 1 -FEP_CAT-4b-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13a/ 2 -FEP_CAT-4c-CAT-13b/ 1 -FEP_CAT-4c-CAT-13c/ 2 -FEP_CAT-4c-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13e/ 1 -FEP_CAT-4c-CAT-13f/ 1 -FEP_CAT-4d-CAT-13a/ 3 -FEP_CAT-4d-CAT-13b/ 6 -FEP_CAT-4d-CAT-13c/ 4 -FEP_CAT-4d-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13f/ 1 -FEP_CAT-4i-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13a/ 2 -FEP_CAT-4j-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4k-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4l-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13a/ 2 -FEP_CAT-4m-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4n-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4b/ 3 -FEP_CAT-4j-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-24/ 1 -FEP_CAT-4k-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13k/ 1 -FEP_CAT-4p-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4o/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index 78530356..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_CAT-13d-CAT-13b -3.76 0.31 -FEP_CAT-4a-CAT-13d -11.01 0.09 -FEP_CAT-13g-CAT-13c -0.81 0.98 -FEP_CAT-13i-CAT-13b -2.39 0.58 -FEP_CAT-13h-CAT-13a -20.47 0.80 -FEP_CAT-13m-CAT-13a 93.22 0.92 -FEP_CAT-13h-CAT-13c -3.74 0.55 -FEP_CAT-24-CAT-13a 12.05 1.66 -FEP_CAT-4p-CAT-13a -6.45 1.10 -FEP_CAT-13g-CAT-13b -8.65 0.42 -FEP_CAT-4k-CAT-13c 35.44 0.29 -FEP_CAT-4i-CAT-13a 15.63 1.27 -FEP_CAT-4i-CAT-13b 23.24 0.82 -FEP_CAT-4b-CAT-13c -7.88 0.12 -FEP_CAT-17i-CAT-13a 15.19 0.67 -FEP_CAT-17f-CAT-13a 15.25 0.19 -FEP_CAT-13e-CAT-13d 0.06 0.00 -FEP_CAT-4l-CAT-13a -46.07 0.72 -FEP_CAT-4c-CAT-13c -5.19 0.42 -FEP_CAT-17b-CAT-13c 1.56 0.21 -FEP_CAT-24-CAT-13d 23.36 1.07 -FEP_CAT-17e-CAT-13b 10.83 0.01 -FEP_CAT-13o-CAT-13b 0.66 0.67 -FEP_CAT-13e-CAT-13b -5.06 0.56 -FEP_CAT-13i-CAT-13c 5.44 0.23 -FEP_CAT-4c-CAT-13b -18.42 nan -FEP_CAT-17a-CAT-13c 8.46 0.14 -FEP_CAT-4b-CAT-13d -12.18 0.29 -FEP_CAT-13f-CAT-13b -4.45 0.56 -FEP_CAT-17d-CAT-13a 15.85 0.49 -FEP_CAT-4m-CAT-13b 14.43 0.34 -FEP_CAT-13j-CAT-13d 30.03 0.22 -FEP_CAT-17e-CAT-13c 18.54 0.19 -FEP_CAT-4o-CAT-13b 3.48 0.34 -FEP_CAT-13k-CAT-13a 20.25 0.98 -FEP_CAT-4a-CAT-13c -7.62 0.44 -FEP_CAT-13o-CAT-13a -7.11 0.72 -FEP_CAT-17d-CAT-13b 24.56 0.06 -FEP_CAT-4d-CAT-13a -21.47 nan -FEP_CAT-4b-CAT-13a -22.22 nan -FEP_CAT-13b-CAT-13a -7.97 0.61 -FEP_CAT-13h-CAT-13b -11.47 0.14 -FEP_CAT-13k-CAT-13b 31.23 0.45 -FEP_CAT-13d-CAT-13c 3.68 0.20 -FEP_CAT-4p-CAT-13c 12.32 0.41 -FEP_CAT-13n-CAT-13c 101.40 0.58 -FEP_CAT-17g-CAT-13d 17.53 0.14 -FEP_CAT-17c-CAT-13a -13.81 0.50 -FEP_CAT-24-CAT-13c 29.57 0.25 -FEP_CAT-17f-CAT-13d 27.22 0.15 -FEP_CAT-17b-CAT-13d -2.54 0.18 -FEP_CAT-17h-CAT-13a 6.33 0.17 -FEP_CAT-13d-CAT-13a -12.62 0.18 -FEP_CAT-4o-CAT-13c 11.89 0.60 -FEP_CAT-13m-CAT-13b 100.10 0.55 -FEP_CAT-17h-CAT-13c 22.52 0.10 -FEP_CAT-4j-CAT-13b 16.39 0.47 -FEP_CAT-4l-CAT-13c -29.61 0.28 -FEP_CAT-4k-CAT-13a 14.42 1.22 -FEP_CAT-13k-CAT-13d 35.55 0.24 -FEP_CAT-17c-CAT-13c 2.04 0.26 -FEP_CAT-17h-CAT-13d 19.01 0.13 -FEP_CAT-13n-CAT-13b 95.33 0.87 -FEP_CAT-4a-CAT-13b -14.94 0.69 -FEP_CAT-13f-CAT-13c 2.28 0.21 -FEP_CAT-4j-CAT-13c 23.60 0.28 -FEP_CAT-17g-CAT-13c 21.25 0.16 -FEP_CAT-4m-CAT-13a 3.24 2.94 -FEP_CAT-4l-CAT-13b -38.07 0.33 -FEP_CAT-17i-CAT-13c 31.34 0.13 -FEP_CAT-4c-CAT-13a -25.80 1.48 -FEP_CAT-17i-CAT-13b 22.98 0.08 -FEP_CAT-13g-CAT-13d -4.32 0.35 -FEP_CAT-4m-CAT-13c 21.80 0.66 -FEP_CAT-4i-CAT-13c 31.88 0.25 -FEP_CAT-4k-CAT-13b 27.30 0.26 -FEP_CAT-13m-CAT-13d 105.85 0.20 -FEP_CAT-13o-CAT-13d 5.69 0.20 -FEP_CAT-17f-CAT-13b 23.48 0.93 -FEP_CAT-4d-CAT-13b -16.45 3.78 -FEP_CAT-13i-CAT-13a -9.96 0.75 -FEP_CAT-13e-CAT-13c 3.81 0.32 -FEP_CAT-17g-CAT-13a 4.24 0.24 -FEP_CAT-4n-CAT-13c 21.56 0.48 -FEP_CAT-4j-CAT-13a 5.64 nan -FEP_CAT-13j-CAT-13a 16.11 1.30 -FEP_CAT-17g-CAT-13b 13.22 0.26 -FEP_CAT-4n-CAT-13a 6.07 0.37 -FEP_CAT-4d-CAT-13c -8.66 0.52 -FEP_CAT-17i-CAT-13d 27.79 0.09 -FEP_CAT-17h-CAT-13b 14.22 0.04 -FEP_CAT-13o-CAT-13c 9.54 0.24 -FEP_CAT-4n-CAT-13b 12.44 0.51 -FEP_CAT-13j-CAT-13b 24.48 0.92 -FEP_CAT-13f-CAT-13d -0.94 0.20 -FEP_CAT-4c-CAT-13d -11.18 0.54 -FEP_CAT-17d-CAT-13d 28.51 0.13 -FEP_CAT-17c-CAT-13b -5.42 0.14 -FEP_CAT-17a-CAT-13b -0.45 1.28 -FEP_CAT-4b-CAT-13b -16.46 2.18 -FEP_CAT-13k-CAT-13c 39.15 0.31 -FEP_CAT-13h-CAT-13d -7.21 0.22 -FEP_CAT-17e-CAT-13d 14.36 0.12 -FEP_CAT-13f-CAT-13a -15.41 2.97 -FEP_CAT-13g-CAT-13a -18.14 0.55 -FEP_CAT-4o-CAT-13a -4.56 1.56 -FEP_CAT-13e-CAT-13a -15.04 0.63 -FEP_CAT-13i-CAT-13d 1.77 0.14 -FEP_CAT-4a-CAT-13a -23.89 0.10 -FEP_CAT-13c-CAT-13b -8.05 0.99 -FEP_CAT-24-CAT-13b 20.26 0.11 -FEP_CAT-17d-CAT-13c 32.41 0.11 -FEP_CAT-17f-CAT-13c 31.15 0.13 -FEP_CAT-17e-CAT-13a 2.03 0.63 -FEP_CAT-13n-CAT-13a 86.28 0.07 -FEP_CAT-17c-CAT-13d -1.49 0.12 -FEP_CAT-17b-CAT-13b -7.56 0.57 -FEP_CAT-13j-CAT-13c 34.14 0.17 -FEP_CAT-13n-CAT-13d 98.59 0.23 -FEP_CAT-4d-CAT-13d -12.45 0.69 -FEP_CAT-13c-CAT-13a -16.70 0.10 -FEP_CAT-17a-CAT-13d 4.49 0.09 -FEP_CAT-13m-CAT-13c 109.28 0.36 -FEP_CAT-4p-CAT-13b 4.27 0.41 -FEP_CAT-17a-CAT-13a -8.10 0.22 -FEP_CAT-17b-CAT-13a -15.16 0.24 -FEP_CAT-17c-CAT-13f -0.80 0.20 -FEP_CAT-17e-CAT-13i 12.29 0.15 -FEP_CAT-17e-CAT-13g 19.59 0.88 -FEP_CAT-4l-CAT-13d -33.08 0.29 -FEP_CAT-17i-CAT-13e 28.28 0.52 -FEP_CAT-13k-CAT-13f 36.14 0.27 -FEP_CAT-4n-CAT-13f 19.27 0.23 -FEP_CAT-24-CAT-13f 25.66 0.70 -FEP_CAT-4a-CAT-13f -10.41 0.48 -FEP_CAT-13o-CAT-13j -24.48 0.16 -FEP_CAT-4n-CAT-13g 21.81 0.32 -FEP_CAT-4j-CAT-13g 23.23 0.48 -FEP_CAT-24-CAT-13i 22.56 0.69 -FEP_CAT-4i-CAT-13f 28.79 0.15 -FEP_CAT-17g-CAT-13h 24.48 0.30 -FEP_CAT-17g-CAT-13j -12.58 0.22 -FEP_CAT-13o-CAT-13k -29.77 0.16 -FEP_CAT-4k-CAT-13h 38.87 0.42 -FEP_CAT-4k-CAT-13i 29.68 0.13 -FEP_CAT-13i-CAT-13e 3.18 0.37 -FEP_CAT-13j-CAT-13f 30.97 0.36 -FEP_CAT-17g-CAT-13f 18.53 0.43 -FEP_CAT-4p-CAT-13i 7.17 0.31 -FEP_CAT-17h-CAT-13i 17.19 0.26 -FEP_CAT-13m-CAT-13f 106.53 0.29 -FEP_CAT-4p-CAT-13f 10.66 0.16 -FEP_CAT-17g-CAT-13k -17.70 0.51 -FEP_CAT-13h-CAT-13g -3.99 0.24 -FEP_CAT-24-CAT-13e 25.92 0.57 -FEP_CAT-4c-CAT-13g -6.35 0.47 -FEP_CAT-4i-CAT-13e 28.19 0.36 -FEP_CAT-17f-CAT-13i 25.91 0.32 -FEP_CAT-4a-CAT-13j -41.51 0.21 -FEP_CAT-4j-CAT-13j -10.51 0.27 -FEP_CAT-4m-CAT-13d 18.44 0.25 -FEP_CAT-17b-CAT-13j -32.70 0.22 -FEP_CAT-13g-CAT-13f -2.75 0.12 -FEP_CAT-13g-CAT-13e -4.20 0.24 -FEP_CAT-17a-CAT-13i 2.80 0.15 -FEP_CAT-4m-CAT-13i 16.68 0.24 -FEP_CAT-17i-CAT-13g 31.21 0.31 -FEP_CAT-4c-CAT-13h -2.48 0.65 -FEP_CAT-4c-CAT-13e -8.96 0.55 -FEP_CAT-13n-CAT-13k 63.31 0.24 -FEP_CAT-13m-CAT-13e 106.97 0.22 -FEP_CAT-17b-CAT-13h 5.28 0.14 -FEP_CAT-17f-CAT-13g 31.47 0.46 -FEP_CAT-17b-CAT-13i -4.44 0.20 -FEP_CAT-17e-CAT-13k -20.83 0.17 -FEP_CAT-4o-CAT-13i 6.43 0.26 -FEP_CAT-17b-CAT-13f -1.69 0.25 -FEP_CAT-4a-CAT-13g -7.55 0.18 -FEP_CAT-13j-CAT-13g 32.78 0.08 -FEP_CAT-17e-CAT-13e 15.53 0.41 -FEP_CAT-17a-CAT-13h 12.04 0.20 -FEP_CAT-13m-CAT-13i 103.64 0.16 -FEP_CAT-17f-CAT-13h 34.63 0.24 -FEP_CAT-13n-CAT-13i 96.25 0.35 -FEP_CAT-17f-CAT-13j -2.84 0.21 -FEP_CAT-4d-CAT-13g -7.93 0.33 -FEP_CAT-4d-CAT-13j -40.48 0.39 -FEP_CAT-17g-CAT-13i 15.61 0.16 -FEP_CAT-17h-CAT-13e 19.51 0.31 -FEP_CAT-4p-CAT-13e 10.71 0.33 -FEP_CAT-4p-CAT-13j -20.29 0.27 -FEP_CAT-4k-CAT-13j 1.82 0.29 -FEP_CAT-4i-CAT-13i 25.49 0.26 -FEP_CAT-4l-CAT-13f -32.00 0.35 -FEP_CAT-4d-CAT-13i -13.72 0.53 -FEP_CAT-4b-CAT-13e -11.05 0.74 -FEP_CAT-13k-CAT-13g 39.42 0.21 -FEP_CAT-4c-CAT-13i -12.83 0.61 -FEP_CAT-4b-CAT-13j -41.35 0.26 -FEP_CAT-17i-CAT-13i 25.94 0.18 -FEP_CAT-4p-CAT-13h 17.07 0.20 -FEP_CAT-13o-CAT-13e 7.29 0.37 -FEP_CAT-4m-CAT-13j -11.40 0.22 -FEP_CAT-4o-CAT-13d 7.85 0.21 -FEP_CAT-13k-CAT-13j 5.33 0.19 -FEP_CAT-17c-CAT-13e -1.30 0.25 -FEP_CAT-4l-CAT-13h -26.02 0.33 -FEP_CAT-4i-CAT-13d 27.56 0.09 -FEP_CAT-17e-CAT-13f 15.93 0.36 -FEP_CAT-13h-CAT-13e -7.15 0.43 -FEP_CAT-13m-CAT-13k 71.11 0.22 -FEP_CAT-17f-CAT-13k -7.49 0.36 -FEP_CAT-17h-CAT-13h 25.92 0.14 -FEP_CAT-17a-CAT-13f 5.98 0.24 -FEP_CAT-17d-CAT-13j -1.57 0.28 -FEP_CAT-13h-CAT-13f -6.44 0.19 -FEP_CAT-24-CAT-13j -5.12 0.19 -FEP_CAT-17e-CAT-13h 22.39 0.30 -FEP_CAT-4j-CAT-13d 19.37 0.22 -FEP_CAT-4j-CAT-13i 17.78 0.30 -FEP_CAT-4c-CAT-13f -9.21 0.28 -FEP_CAT-24-CAT-13g 28.97 0.41 -FEP_CAT-17h-CAT-13g 22.52 0.28 -FEP_CAT-4n-CAT-13h 25.03 0.23 -FEP_CAT-4o-CAT-13h 15.39 0.43 -FEP_CAT-4j-CAT-13f 20.42 0.36 -FEP_CAT-4o-CAT-13e 8.66 0.40 -FEP_CAT-4p-CAT-13d 9.13 0.33 -FEP_CAT-13k-CAT-13h 42.14 0.20 -FEP_CAT-4n-CAT-13e 19.23 0.30 -FEP_CAT-4o-CAT-13f 8.95 0.23 -FEP_CAT-13n-CAT-13g 102.28 0.10 -FEP_CAT-13m-CAT-13g 109.57 0.25 -FEP_CAT-4m-CAT-13f 19.47 0.28 -FEP_CAT-4n-CAT-13i 16.17 0.13 -FEP_CAT-13i-CAT-13g 6.58 0.46 -FEP_CAT-17g-CAT-13g 21.18 0.43 -FEP_CAT-4l-CAT-13j -63.38 0.20 -FEP_CAT-4j-CAT-13h 26.03 0.28 -FEP_CAT-13o-CAT-13g 8.77 0.24 -FEP_CAT-17a-CAT-13e 5.25 0.28 -FEP_CAT-17d-CAT-13h 35.41 0.22 -FEP_CAT-13n-CAT-13j 68.58 0.25 -FEP_CAT-4c-CAT-13j -40.70 0.59 -FEP_CAT-13o-CAT-13i 3.94 0.16 -FEP_CAT-17c-CAT-13i -3.06 0.24 -FEP_CAT-13o-CAT-13f 6.74 0.20 -FEP_CAT-13n-CAT-13e 100.09 0.47 -FEP_CAT-17g-CAT-13e 17.72 0.42 -FEP_CAT-13m-CAT-13h 112.85 0.24 -FEP_CAT-17d-CAT-13i 26.55 0.21 -FEP_CAT-24-CAT-13h 32.95 0.41 -FEP_CAT-17c-CAT-13h 5.70 0.27 -FEP_CAT-4m-CAT-13g 22.35 0.26 -FEP_CAT-4n-CAT-13d 18.04 0.25 -FEP_CAT-17d-CAT-13k -6.33 0.22 -FEP_CAT-17d-CAT-13g 32.29 0.51 -FEP_CAT-4o-CAT-13j -21.96 0.23 -FEP_CAT-17h-CAT-13j -11.63 0.14 -FEP_CAT-13k-CAT-13i 32.76 0.19 -FEP_CAT-17i-CAT-13h 35.09 0.16 -FEP_CAT-17c-CAT-13j -31.64 0.25 -FEP_CAT-4k-CAT-13g 35.67 0.23 -FEP_CAT-13i-CAT-13h 8.43 0.25 -FEP_CAT-4l-CAT-13g -29.47 0.42 -FEP_CAT-4b-CAT-13f -10.86 0.36 -FEP_CAT-4d-CAT-13e -11.88 0.79 -FEP_CAT-4i-CAT-13j -2.24 0.32 -FEP_CAT-4a-CAT-13e -9.34 0.40 -FEP_CAT-17f-CAT-13e 28.14 0.40 -FEP_CAT-13f-CAT-13e -1.60 0.10 -FEP_CAT-4p-CAT-13g 13.55 0.20 -FEP_CAT-17a-CAT-13g 8.46 0.23 -FEP_CAT-13j-CAT-13h 36.71 0.23 -FEP_CAT-17b-CAT-13k -36.88 0.26 -FEP_CAT-13o-CAT-13h 12.99 0.34 -FEP_CAT-4b-CAT-13i -13.60 0.32 -FEP_CAT-17a-CAT-13j -25.70 0.18 -FEP_CAT-13i-CAT-13f 3.98 0.24 -FEP_CAT-17a-CAT-13k -30.30 0.30 -FEP_CAT-17i-CAT-13f 29.84 0.43 -FEP_CAT-17d-CAT-13e 29.16 0.39 -FEP_CAT-4k-CAT-13f 32.18 0.22 -FEP_CAT-13j-CAT-13i 28.74 0.15 -FEP_CAT-4i-CAT-13g 31.41 0.28 -FEP_CAT-13m-CAT-13j 75.53 0.22 -FEP_CAT-4b-CAT-13g -7.95 0.29 -FEP_CAT-4d-CAT-13h -5.96 0.93 -FEP_CAT-4k-CAT-13d 31.57 0.36 -FEP_CAT-4k-CAT-13e 32.71 0.44 -FEP_CAT-4a-CAT-13h -4.05 0.27 -FEP_CAT-13k-CAT-13e 35.48 0.33 -FEP_CAT-13n-CAT-13h 105.91 0.25 -FEP_CAT-4l-CAT-13e -32.10 0.44 -FEP_CAT-4m-CAT-13h 25.89 0.17 -FEP_CAT-4a-CAT-13i -13.46 0.22 -FEP_CAT-17f-CAT-13f 28.45 0.23 -FEP_CAT-4i-CAT-13h 34.95 0.28 -FEP_CAT-13n-CAT-13f 99.69 0.15 -FEP_CAT-17e-CAT-13j -15.74 0.15 -FEP_CAT-13j-CAT-13e 30.52 0.29 -FEP_CAT-17b-CAT-13g 2.07 0.33 -FEP_CAT-4m-CAT-13e 19.82 0.40 -FEP_CAT-17h-CAT-13f 19.90 0.23 -FEP_CAT-4b-CAT-13h -4.83 0.29 -FEP_CAT-4d-CAT-13f -9.82 0.60 -FEP_CAT-4j-CAT-13e 20.12 0.32 -FEP_CAT-4n-CAT-13j -11.79 0.21 -FEP_CAT-17d-CAT-13f 29.80 0.58 -FEP_CAT-17c-CAT-13g 2.45 0.33 -FEP_CAT-17c-CAT-13k -36.39 0.14 -FEP_CAT-17b-CAT-13e -2.10 0.33 -FEP_CAT-4o-CAT-13g 11.58 0.16 -FEP_CAT-17i-CAT-13j -2.42 0.34 -FEP_CAT-4l-CAT-13i -35.03 0.24 -FEP_CAT-4d-CAT-13m -118.05 0.43 -FEP_CAT-4c-CAT-17g -28.21 0.61 -FEP_CAT-4c-CAT-4a 0.86 0.21 -FEP_CAT-4k-CAT-17g 14.77 0.16 -FEP_CAT-4p-CAT-13o 3.94 0.14 -FEP_CAT-4p-CAT-17b 11.80 0.24 -FEP_CAT-24-CAT-13n -74.67 0.52 -FEP_CAT-24-CAT-13k -10.46 0.50 -FEP_CAT-4c-CAT-17f -38.32 0.67 -FEP_CAT-4k-CAT-4d 43.53 0.65 -FEP_CAT-4n-CAT-4a 29.17 0.14 -FEP_CAT-4a-CAT-17g -28.36 0.15 -FEP_CAT-17b-CAT-13n -100.94 0.30 -FEP_CAT-17h-CAT-13m -87.05 0.15 -FEP_CAT-24-CAT-17d -4.57 0.43 -FEP_CAT-4p-CAT-17h -9.00 0.34 -FEP_CAT-4a-CAT-17i -38.93 0.27 -FEP_CAT-13n-CAT-13m -7.18 0.14 -FEP_CAT-4j-CAT-17f -8.28 0.32 -FEP_CAT-4o-CAT-13m -98.05 0.20 -FEP_CAT-4i-CAT-17f 0.52 0.30 -FEP_CAT-4k-CAT-4a 42.79 0.15 -FEP_CAT-4l-CAT-4k -65.18 0.16 -FEP_CAT-4a-CAT-13k -45.77 0.27 -FEP_CAT-4b-CAT-17a -16.67 0.33 -FEP_CAT-4d-CAT-17d -41.42 0.74 -FEP_CAT-4d-CAT-4b 0.40 0.13 -FEP_CAT-17e-CAT-17a 9.91 0.24 -FEP_CAT-4j-CAT-4b 31.00 0.16 -FEP_CAT-17f-CAT-13o 21.44 0.22 -FEP_CAT-4l-CAT-13m -139.16 0.24 -FEP_CAT-4l-CAT-4b -21.89 0.20 -FEP_CAT-4d-CAT-24 -36.00 0.41 -FEP_CAT-4o-CAT-13k -27.12 0.42 -FEP_CAT-17e-CAT-13m -91.40 0.18 -FEP_CAT-4b-CAT-13n -110.37 0.08 -FEP_CAT-4i-CAT-17c 29.45 0.18 -FEP_CAT-4m-CAT-4l 52.36 0.29 -FEP_CAT-4a-CAT-13o -16.60 0.15 -FEP_CAT-4l-CAT-24 -58.01 0.56 -FEP_CAT-4l-CAT-17i -60.85 0.35 -FEP_CAT-4c-CAT-4b 0.80 0.33 -FEP_CAT-4b-CAT-17e -26.04 0.18 -FEP_CAT-17f-CAT-13m -79.00 0.18 -FEP_CAT-17d-CAT-13n -70.52 0.20 -FEP_CAT-4o-CAT-4n -9.93 0.32 -FEP_CAT-4d-CAT-17i -39.99 0.39 -FEP_CAT-17h-CAT-17e 4.33 0.33 -FEP_CAT-4l-CAT-4j -52.83 0.13 -FEP_CAT-4d-CAT-13n -110.12 0.35 -FEP_CAT-4p-CAT-4k -22.42 0.22 -FEP_CAT-4n-CAT-4i -9.74 0.16 -FEP_CAT-4n-CAT-17a 13.39 0.33 -FEP_CAT-4o-CAT-17g -9.31 0.17 -FEP_CAT-4i-CAT-13m -78.39 0.13 -FEP_CAT-17a-CAT-13o -0.51 0.20 -FEP_CAT-13o-CAT-13m -100.41 0.13 -FEP_CAT-4p-CAT-13n -89.46 0.16 -FEP_CAT-4n-CAT-4d 29.44 0.31 -FEP_CAT-4n-CAT-13o 12.12 0.20 -FEP_CAT-4k-CAT-13k -3.52 0.28 -FEP_CAT-17g-CAT-17b 19.51 0.24 -FEP_CAT-4a-CAT-17c -9.35 0.21 -FEP_CAT-4b-CAT-17h -30.68 0.24 -FEP_CAT-4d-CAT-17h -31.67 0.98 -FEP_CAT-17h-CAT-17f -8.76 0.15 -FEP_CAT-4n-CAT-17i -9.25 0.17 -FEP_CAT-17i-CAT-13o 22.37 0.17 -FEP_CAT-4p-CAT-4m -9.14 0.18 -FEP_CAT-4b-CAT-17i -39.23 0.25 -FEP_CAT-13o-CAT-13n -93.31 0.17 -FEP_CAT-4m-CAT-24 -5.91 0.65 -FEP_CAT-4d-CAT-17g -28.24 0.56 -FEP_CAT-4m-CAT-13n -80.01 0.18 -FEP_CAT-4a-CAT-13m -116.93 0.17 -FEP_CAT-24-CAT-17i -2.57 0.14 -FEP_CAT-4a-CAT-17f -37.60 0.42 -FEP_CAT-4c-CAT-13o -16.27 0.37 -FEP_CAT-4j-CAT-17e 5.43 0.31 -FEP_CAT-17g-CAT-17e 2.55 0.19 -FEP_CAT-4a-CAT-17h -29.60 0.12 -FEP_CAT-4m-CAT-13k -16.87 0.29 -FEP_CAT-17f-CAT-17a 23.01 0.23 -FEP_CAT-4o-CAT-17b 10.88 0.26 -FEP_CAT-17a-CAT-13n -94.10 0.20 -FEP_CAT-4i-CAT-13n -71.20 0.13 -FEP_CAT-24-CAT-17g 7.43 0.53 -FEP_CAT-4k-CAT-17c 33.15 0.18 -FEP_CAT-4i-CAT-4a 38.80 0.14 -FEP_CAT-4k-CAT-13o 26.18 0.19 -FEP_CAT-4l-CAT-4i -60.79 0.20 -FEP_CAT-4j-CAT-4i -8.19 0.16 -FEP_CAT-4b-CAT-17c -10.23 0.31 -FEP_CAT-17d-CAT-17b 31.45 0.30 -FEP_CAT-4m-CAT-4a 29.43 0.19 -FEP_CAT-17h-CAT-17b 21.26 0.35 -FEP_CAT-17d-CAT-17c 29.84 0.17 -FEP_CAT-17a-CAT-13m -101.40 0.19 -FEP_CAT-4j-CAT-13n -79.49 0.19 -FEP_CAT-4m-CAT-17f -8.29 0.37 -FEP_CAT-4d-CAT-17a -16.32 0.31 -FEP_CAT-17h-CAT-17c 20.23 0.21 -FEP_CAT-4k-CAT-17h 13.12 0.40 -FEP_CAT-4l-CAT-17f -60.78 0.31 -FEP_CAT-4c-CAT-17h -29.16 0.66 -FEP_CAT-4c-CAT-13k -45.29 0.32 -FEP_CAT-4n-CAT-17e 3.81 0.20 -FEP_CAT-4i-CAT-4b 39.24 0.29 -FEP_CAT-17h-CAT-17d -9.76 0.16 -FEP_CAT-4n-CAT-4l 51.00 0.42 -FEP_CAT-17i-CAT-17g 10.24 0.28 -FEP_CAT-24-CAT-17f -2.16 0.46 -FEP_CAT-4p-CAT-17f -17.50 0.32 -FEP_CAT-24-CAT-17a 20.08 0.34 -FEP_CAT-4j-CAT-13k -16.27 0.24 -FEP_CAT-4o-CAT-17c 9.44 0.24 -FEP_CAT-4o-CAT-4a 19.22 0.16 -FEP_CAT-4n-CAT-13n -81.00 0.18 -FEP_CAT-17g-CAT-13o 11.60 0.30 -FEP_CAT-4d-CAT-13k -46.08 0.30 -FEP_CAT-24-CAT-17h 5.65 0.84 -FEP_CAT-17f-CAT-17c 28.42 0.07 -FEP_CAT-4m-CAT-13o 12.88 0.23 -FEP_CAT-4m-CAT-4k -12.97 0.16 -FEP_CAT-4i-CAT-17e 12.90 0.23 -FEP_CAT-17d-CAT-17a 23.67 0.29 -FEP_CAT-4i-CAT-17h 8.99 0.13 -FEP_CAT-17c-CAT-13n -100.28 0.13 -FEP_CAT-4d-CAT-17b -8.53 0.27 -FEP_CAT-4d-CAT-17e -25.58 0.26 -FEP_CAT-4i-CAT-4c 37.34 0.34 -FEP_CAT-4p-CAT-4b 21.02 0.25 -FEP_CAT-4j-CAT-13m -86.54 0.16 -FEP_CAT-17g-CAT-17f -9.97 0.11 -FEP_CAT-4d-CAT-17c -9.46 0.36 -FEP_CAT-4m-CAT-17b 21.03 0.30 -FEP_CAT-17e-CAT-17c 15.63 0.23 -FEP_CAT-17e-CAT-13o 8.92 0.20 -FEP_CAT-17h-CAT-17g 1.32 0.07 -FEP_CAT-4j-CAT-17h 0.65 0.15 -FEP_CAT-4k-CAT-17f 4.45 0.30 -FEP_CAT-4a-CAT-17e -25.02 0.33 -FEP_CAT-4n-CAT-24 -7.13 0.18 -FEP_CAT-4j-CAT-4c 29.52 0.19 -FEP_CAT-17f-CAT-17d -1.40 0.12 -FEP_CAT-4l-CAT-13k -68.70 0.20 -FEP_CAT-4b-CAT-13k -46.70 0.31 -FEP_CAT-17f-CAT-13n -71.56 0.20 -FEP_CAT-4o-CAT-17h -10.40 0.24 -FEP_CAT-4i-CAT-17i -0.51 0.18 -FEP_CAT-4o-CAT-17i -19.43 0.23 -FEP_CAT-17d-CAT-13o 22.58 0.19 -FEP_CAT-24-CAT-17e 10.55 0.22 -FEP_CAT-4i-CAT-17b 30.51 0.36 -FEP_CAT-4n-CAT-4j -1.56 0.27 -FEP_CAT-17c-CAT-17b 0.77 0.13 -FEP_CAT-17g-CAT-13m -88.78 0.19 -FEP_CAT-17f-CAT-17b 29.71 0.16 -FEP_CAT-24-CAT-13o 18.56 0.38 -FEP_CAT-4p-CAT-4j -9.58 0.11 -FEP_CAT-4l-CAT-17g -50.93 0.24 -FEP_CAT-17i-CAT-17e 13.30 0.14 -FEP_CAT-4k-CAT-17d 3.17 0.27 -FEP_CAT-4k-CAT-17b 34.97 0.42 -FEP_CAT-4j-CAT-17a 15.55 0.44 -FEP_CAT-4n-CAT-4k -13.48 0.20 -FEP_CAT-4i-CAT-17g 10.43 0.18 -FEP_CAT-4p-CAT-17g -7.50 0.19 -FEP_CAT-17h-CAT-13o 12.68 0.20 -FEP_CAT-4o-CAT-17f -18.61 0.13 -FEP_CAT-4m-CAT-17g 1.85 0.17 -FEP_CAT-4c-CAT-17a -14.71 0.42 -FEP_CAT-4l-CAT-4d -22.04 0.52 -FEP_CAT-4k-CAT-17i 4.15 0.32 -FEP_CAT-17h-CAT-13k -16.38 0.22 -FEP_CAT-4k-CAT-4b 43.24 0.21 -FEP_CAT-4i-CAT-4d 39.30 0.68 -FEP_CAT-4a-CAT-17b -8.54 0.17 -FEP_CAT-4n-CAT-17g 0.10 0.52 -FEP_CAT-4m-CAT-17a 14.28 0.29 -FEP_CAT-17f-CAT-17e 12.87 0.13 -FEP_CAT-4o-CAT-13n -90.61 0.18 -FEP_CAT-17h-CAT-13n -80.20 0.25 -FEP_CAT-4j-CAT-17i -8.85 0.16 -FEP_CAT-4o-CAT-4b 19.40 0.17 -FEP_CAT-4j-CAT-24 -3.95 0.95 -FEP_CAT-4p-CAT-24 -15.38 0.70 -FEP_CAT-4o-CAT-4j -11.14 0.11 -FEP_CAT-4p-CAT-4a 20.33 0.32 -FEP_CAT-4c-CAT-17e -25.57 0.45 -FEP_CAT-17i-CAT-13m -78.39 0.20 -FEP_CAT-17i-CAT-17d -1.10 0.20 -FEP_CAT-4l-CAT-4a -22.30 0.13 -FEP_CAT-4o-CAT-4l 41.50 0.18 -FEP_CAT-4b-CAT-17f -38.28 0.33 -FEP_CAT-4l-CAT-17b -30.85 0.49 -FEP_CAT-4i-CAT-13k -7.65 0.25 -FEP_CAT-4j-CAT-17b 21.25 0.38 -FEP_CAT-4c-CAT-17d -39.64 0.97 -FEP_CAT-4p-CAT-4n -8.55 0.11 -FEP_CAT-4o-CAT-17d -20.14 0.24 -FEP_CAT-4j-CAT-17g 2.10 0.15 -FEP_CAT-4n-CAT-13k -17.48 0.22 -FEP_CAT-17e-CAT-17d -14.01 0.20 -FEP_CAT-4k-CAT-4i 3.93 0.23 -FEP_CAT-4n-CAT-4b 29.71 0.23 -FEP_CAT-4n-CAT-17b 20.36 0.17 -FEP_CAT-4j-CAT-17c 20.93 0.28 -FEP_CAT-4p-CAT-4d 21.15 0.48 -FEP_CAT-17b-CAT-17a -7.00 0.27 -FEP_CAT-4b-CAT-13m -117.51 0.24 -FEP_CAT-4l-CAT-4c -23.05 0.26 -FEP_CAT-17e-CAT-13n -84.03 0.17 -FEP_CAT-4m-CAT-4i -8.84 0.24 -FEP_CAT-4o-CAT-17a 3.41 0.26 -FEP_CAT-4n-CAT-17h -0.95 0.37 -FEP_CAT-17i-CAT-17c 28.95 0.12 -FEP_CAT-4d-CAT-4a -2.08 1.01 -FEP_CAT-4j-CAT-4a 30.24 0.13 -FEP_CAT-4b-CAT-24 -36.56 0.39 -FEP_CAT-4l-CAT-17a -37.68 0.56 -FEP_CAT-4c-CAT-13m -115.42 0.31 -FEP_CAT-17g-CAT-17c 18.61 0.21 -FEP_CAT-17g-CAT-13n -81.40 0.30 -FEP_CAT-4n-CAT-17d -10.12 0.24 -FEP_CAT-4c-CAT-17c -8.82 0.27 -FEP_CAT-17b-CAT-13o -8.06 0.30 -FEP_CAT-4o-CAT-13o 2.11 0.14 -FEP_CAT-4a-CAT-17d -40.07 0.32 -FEP_CAT-4p-CAT-17d -18.91 0.22 -FEP_CAT-4a-CAT-17a -15.89 0.26 -FEP_CAT-4k-CAT-13m -73.85 0.14 -FEP_CAT-4i-CAT-17d -0.39 0.15 -FEP_CAT-4k-CAT-17a 26.61 0.41 -FEP_CAT-4o-CAT-4i -19.67 0.24 -FEP_CAT-17i-CAT-13k -7.09 0.26 -FEP_CAT-4b-CAT-4a -0.87 0.13 -FEP_CAT-4o-CAT-4c 18.44 0.25 -FEP_CAT-4l-CAT-17d -62.20 0.42 -FEP_CAT-4p-CAT-13m -96.24 0.24 -FEP_CAT-4k-CAT-17e 17.94 0.30 -FEP_CAT-4k-CAT-4j 12.17 0.17 -FEP_CAT-4o-CAT-4k -23.66 0.11 -FEP_CAT-17i-CAT-17b 30.35 0.14 -FEP_CAT-4j-CAT-13o 13.80 0.19 -FEP_CAT-17h-CAT-17a 14.13 0.20 -FEP_CAT-17c-CAT-13m -107.43 0.18 -FEP_CAT-4n-CAT-4c 28.36 0.27 -FEP_CAT-4o-CAT-4m -10.47 0.14 -FEP_CAT-4l-CAT-17h -51.62 0.31 -FEP_CAT-4n-CAT-17f -9.34 0.15 -FEP_CAT-17g-CAT-17d -11.35 0.10 -FEP_CAT-17e-CAT-17b 16.94 0.17 -FEP_CAT-4i-CAT-17a 23.26 0.21 -FEP_CAT-4p-CAT-17a 5.25 0.15 -FEP_CAT-4l-CAT-17c -32.23 0.21 -FEP_CAT-4k-CAT-4c 41.94 0.27 -FEP_CAT-4p-CAT-17i -18.39 0.23 -FEP_CAT-4m-CAT-4j -0.84 0.11 -FEP_CAT-4j-CAT-4d 32.19 0.63 -FEP_CAT-4m-CAT-17d -10.07 0.22 -FEP_CAT-4c-CAT-17i -39.21 0.97 -FEP_CAT-4m-CAT-17h 0.24 0.20 -FEP_CAT-4i-CAT-24 2.87 0.63 -FEP_CAT-4m-CAT-4b 30.05 0.14 -FEP_CAT-4k-CAT-24 6.83 0.60 -FEP_CAT-4n-CAT-4m -0.61 0.17 -FEP_CAT-24-CAT-17c 26.18 0.35 -FEP_CAT-4l-CAT-17e -47.04 0.53 -FEP_CAT-4c-CAT-24 -35.25 0.86 -FEP_CAT-4k-CAT-13n -66.69 0.24 -FEP_CAT-4m-CAT-13m -87.64 0.13 -FEP_CAT-17d-CAT-13m -77.40 0.20 -FEP_CAT-17i-CAT-17h 8.85 0.19 -FEP_CAT-4l-CAT-13o -38.98 0.22 -FEP_CAT-4p-CAT-4c 19.41 0.32 -FEP_CAT-4b-CAT-17b -9.10 0.14 -FEP_CAT-17i-CAT-17f 0.55 0.16 -FEP_CAT-17c-CAT-13o -7.16 0.19 -FEP_CAT-4d-CAT-4c 0.59 0.16 -FEP_CAT-24-CAT-13m -81.20 0.51 -FEP_CAT-4p-CAT-17c 10.81 0.30 -FEP_CAT-4d-CAT-13o -17.37 0.57 -FEP_CAT-4p-CAT-4o 1.66 0.15 -FEP_CAT-17c-CAT-17a -6.21 0.20 -FEP_CAT-4j-CAT-17d -9.12 0.07 -FEP_CAT-4n-CAT-17c 19.79 0.18 -FEP_CAT-4m-CAT-4c 29.22 0.29 -FEP_CAT-4b-CAT-13o -17.20 0.17 -FEP_CAT-4c-CAT-17b -8.30 0.33 -FEP_CAT-4d-CAT-17f -38.74 0.75 -FEP_CAT-24-CAT-17b 27.54 0.13 -FEP_CAT-17i-CAT-17a 23.07 0.19 -FEP_CAT-4o-CAT-17e -5.92 0.33 -FEP_CAT-4m-CAT-17i -8.90 0.14 -FEP_CAT-4c-CAT-13n -108.90 0.37 -FEP_CAT-4a-CAT-13n -109.78 0.16 -FEP_CAT-4b-CAT-17d -41.07 0.33 -FEP_CAT-17i-CAT-13n -71.33 0.22 -FEP_CAT-4l-CAT-13n -132.14 0.21 -FEP_CAT-4i-CAT-13o 22.22 0.20 -FEP_CAT-4b-CAT-17g -29.25 0.43 -FEP_CAT-4n-CAT-13m -87.68 0.15 -FEP_CAT-17g-CAT-17a 13.35 0.55 -FEP_CAT-4m-CAT-4d 29.87 0.35 -FEP_CAT-4p-CAT-4i -17.96 0.13 -FEP_CAT-4o-CAT-24 -16.03 0.78 -FEP_CAT-4a-CAT-24 -35.01 0.90 -FEP_CAT-4o-CAT-4d 19.47 0.36 -FEP_CAT-17b-CAT-13m -108.71 0.22 -FEP_CAT-4p-CAT-13k -25.97 0.37 -FEP_CAT-4m-CAT-17e 3.89 0.19 -FEP_CAT-4p-CAT-4l 42.61 0.28 -FEP_CAT-4p-CAT-17e -5.06 0.19 -FEP_CAT-4m-CAT-17c 20.01 0.16 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/lineal/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/lineal/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index e66087b1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/lineal/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_CAT-13b-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4b-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13b/ 1 -FEP_CAT-4c-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13d/ 2 -FEP_CAT-4i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4k-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4o/ 0 \ No newline at end of file diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/missing.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/missing.py deleted file mode 100755 index 1f8bdb76..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/missing.py +++ /dev/null @@ -1,18 +0,0 @@ -list1 = [] -with open('protein.txt', 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - list1.append(line[0]) - -list2 = [] -with open('water.txt', 'r') as infile2: - for line in infile2: - line = line.split() - list2.append(line[0]) - -nl = [i for i in list1 if i not in list2] - -for i in nl: - print('{}\n'.format(i)) - -print(set([x for x in list2 if list2.count(x) > 1])) diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100755 index 29d03c39..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-4c_CAT-17h -31.21 0.74 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13i 7.26 0.31 0 -FEP_CAT-24_CAT-17g 11.96 0.36 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13j -26.35 0.16 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13b -3.90 0.27 0 -FEP_CAT-4i_CAT-4d 35.71 0.21 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17i 2.83 0.26 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4b -0.14 0.13 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13o 23.71 0.55 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13e 4.74 0.30 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17a 25.50 0.53 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13h 36.60 0.64 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -0.83 0.53 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13d -12.37 0.65 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17i -36.01 0.58 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13n -71.40 0.43 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13f 10.13 0.53 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17c -7.56 0.25 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13j -10.93 0.27 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17d -38.65 0.24 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13d 21.09 0.59 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17e 2.80 0.42 0 -FEP_CAT-24_CAT-13k -10.61 0.70 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13o 10.71 0.48 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13n -78.71 0.23 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13n -68.65 0.35 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4j 10.01 0.16 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4d 27.55 0.33 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13h 39.16 0.98 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13g -6.75 0.57 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13c 1.27 0.30 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13b -2.18 0.26 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13a -22.78 1.08 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13a 95.03 0.37 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13e 30.02 0.58 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13n -79.42 0.35 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13c -7.30 1.22 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13g -5.03 0.49 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13f 18.25 0.46 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13j -42.03 0.23 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13n -106.72 0.40 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13e 7.80 0.58 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13h 9.85 1.07 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4i -8.08 0.34 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4l 41.77 0.22 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j 1.03 0.23 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4k -10.49 0.45 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17a -17.89 0.74 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4j 0.53 0.22 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17f -39.03 0.50 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17f -15.39 0.31 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17h -27.82 0.43 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13j -39.11 0.12 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13n -80.96 0.42 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17a 10.46 0.32 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13i 10.44 0.29 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17e -27.46 0.33 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13f 30.22 0.64 0 -FEP_CAT-24_CAT-13a 16.23 0.42 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13n -86.76 0.11 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17e 2.32 0.36 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13a -1.71 0.22 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13b -8.78 0.65 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13i -13.16 0.51 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17c 30.43 0.38 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13c 35.16 0.50 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13k -37.12 0.41 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13i 14.45 0.46 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17d -39.19 0.38 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13a 15.21 0.36 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13f 13.65 0.66 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13b 24.37 0.51 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17c 13.68 0.35 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4a 30.53 0.16 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17g 3.05 0.25 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17g 11.20 0.39 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13h 32.25 0.82 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13g 24.81 0.34 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4n -11.28 0.21 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4c 32.65 0.56 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13e 25.93 0.40 0 -FEP_CAT-4p_CAT-24 -14.58 0.69 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13g 36.47 0.42 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17f -35.38 0.29 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13n -77.91 0.30 0 -FEP_CAT-17b_CAT-17a -6.99 0.50 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17e 11.41 0.12 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13h 29.26 1.12 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13k -16.33 0.29 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13g -1.58 0.40 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13o -15.35 0.74 0 -FEP_CAT-17g_CAT-17a 10.46 0.48 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13c -2.90 0.46 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13a 15.18 0.49 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13g 104.30 0.46 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13a 15.02 0.17 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13n -98.51 0.44 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13d 0.46 0.72 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13m -103.46 0.39 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13i -9.75 0.45 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17c -6.72 0.31 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13f 0.56 0.23 0 -FEP_CAT-4n_CAT-24 -7.04 0.32 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13h 19.75 0.75 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13a -46.60 0.24 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13f 22.18 0.27 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13c -6.82 0.38 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17c 20.85 0.26 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17h -52.64 0.40 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17b -6.77 0.46 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13k -8.73 0.36 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17h -0.53 0.23 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13c 3.46 0.84 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4m -8.65 0.12 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17e 10.52 0.32 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13g -4.74 0.38 1 -FEP_CAT-24_CAT-13d 27.35 0.31 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13b 12.02 0.28 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13j -14.53 0.37 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -4.86 0.45 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13b 1.81 0.52 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4j -11.19 0.12 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13i 26.60 0.41 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4b 37.83 0.12 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17i -34.75 0.52 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17h -0.49 0.32 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13m -141.37 0.33 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13b -3.30 0.35 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13c 6.85 0.21 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13g 33.37 0.52 1 -FEP_CAT-17b_CAT-13i -2.99 0.48 1 -FEP_CAT-4c_CAT-13b -15.12 0.73 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13h 13.56 0.51 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17h -27.87 0.29 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13f 30.02 0.52 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17c 17.49 0.58 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13m -108.29 0.48 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13c 10.38 0.55 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13i -35.30 0.15 1 -FEP_CAT-4m_CAT-13k -15.51 0.27 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17i -5.77 0.40 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13d -9.96 0.53 1 -FEP_CAT-4m_CAT-13o 15.98 0.16 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13k -19.47 0.34 1 -FEP_CAT-4a_CAT-13h 1.42 0.82 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17d 0.76 0.45 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13b -5.58 0.39 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13f -31.33 0.48 1 -FEP_CAT-4k_CAT-17f 2.43 0.33 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17e -23.22 0.30 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13o 21.49 0.41 1 -FEP_CAT-4p_CAT-17i -16.57 0.46 1 -FEP_CAT-4b_CAT-13e -7.76 0.52 4 -FEP_CAT-17d_CAT-13a 15.18 0.30 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4l 54.62 0.33 1 -FEP_CAT-13m_CAT-13h 118.07 0.74 2 -FEP_CAT-4m_CAT-13b 17.24 0.39 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13o 3.36 0.28 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17b 21.21 0.28 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17i -7.96 0.63 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13k -8.19 0.31 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13d 30.09 0.73 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13m -78.29 0.25 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13c 21.13 0.45 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4i -15.67 0.22 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13j -30.86 0.22 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17h -11.04 0.44 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13k -7.96 0.38 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13h 30.99 0.78 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13h 24.05 0.51 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17g 3.02 0.34 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13j -39.05 0.41 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13b 5.14 0.26 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13a 23.40 0.59 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13f 100.62 0.56 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13e -12.33 0.68 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13k -46.83 0.18 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13f 3.27 0.18 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13h 35.97 0.65 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13n -69.85 0.58 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13m -88.29 0.38 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13h 48.88 0.78 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13h 14.65 1.04 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13h 5.14 0.73 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13c -5.42 0.34 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17g 13.28 0.28 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4k -21.71 0.19 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b -4.08 0.47 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13e 15.22 0.29 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17h 1.10 0.37 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m -0.91 0.24 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13n -93.45 0.33 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 3.46 0.15 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13g 34.21 0.35 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13n -92.01 0.49 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13o -5.84 0.67 0 -FEP_CAT-4a_CAT-24 -39.03 0.46 0 -FEP_CAT-17g_CAT-17b 17.14 0.43 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17f 0.57 0.40 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13i 28.21 0.25 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13k -16.61 0.30 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13k -48.62 0.45 0 -FEP_CAT-24_CAT-17e 11.36 0.29 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13a -8.34 0.67 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17b 22.26 0.52 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13i 17.93 0.25 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17b 30.67 0.50 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17e -27.61 0.67 0 -FEP_CAT-4d_CAT-24 -34.31 0.45 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13g -27.22 0.56 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4i -18.94 0.31 0 -FEP_CAT-4i_CAT-24 0.05 0.39 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13j -3.87 0.67 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13j -18.85 0.30 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13m -88.41 0.37 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4i 1.71 0.23 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13d 19.35 0.69 0 -FEP_CAT-17c_CAT-17a -6.77 0.37 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4c -21.50 0.55 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13g 17.41 0.47 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17c 9.23 0.33 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17b 9.14 0.49 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13o 14.61 0.26 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13g 35.52 0.38 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17e 4.87 0.44 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4c 24.65 0.39 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13m -87.62 0.17 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13e 19.00 0.21 0 -FEP_CAT-4l_CAT-24 -60.22 0.34 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13d -34.13 0.68 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13k -5.87 0.25 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13c 17.17 0.73 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17h -7.81 0.33 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4b 20.13 0.21 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13d 7.35 0.73 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17a -38.76 0.52 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13n -132.16 0.31 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13e 19.82 0.62 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17f -61.02 0.35 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17e -4.22 0.57 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17a 14.93 0.43 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13o -38.47 0.16 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13c 14.18 0.27 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17d -18.75 0.39 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13i 17.97 0.34 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17h 9.95 0.33 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13g 25.98 0.43 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4b -25.68 0.20 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4j -53.04 0.22 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17f -19.16 0.24 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13o 25.07 0.30 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4b 29.28 0.36 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13f 22.09 0.49 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17e -49.78 0.70 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4d -26.12 0.33 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13c -28.29 0.23 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13k -28.22 0.17 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13a 17.98 0.29 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13d 11.94 0.70 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4i -7.16 0.27 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4c 41.72 0.41 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17d -7.51 0.29 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13j -9.92 0.39 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17i -18.46 0.40 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -60.71 0.12 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 3.59 0.19 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13k -23.88 0.29 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17e -7.71 0.42 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17a 13.47 0.85 0 -FEP_CAT-4m_CAT-24 -6.28 0.50 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17b -31.48 0.44 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13a 7.98 0.42 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13e 29.89 0.39 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17f -6.52 0.40 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13b -36.00 0.23 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4a -22.09 0.24 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13h 20.41 0.94 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13n -89.80 0.34 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13c 25.94 0.52 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13o 7.70 0.18 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4b 16.74 0.18 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13b 26.83 0.23 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17g -4.50 0.29 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4d 37.67 0.40 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13i 19.32 0.27 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4a 31.43 0.14 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13f 32.26 0.31 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13f 20.59 0.39 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17d -60.76 0.36 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13j -0.92 0.28 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17f -7.79 0.39 0 -FEP_CAT-4k_CAT-24 1.71 0.42 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17c 20.91 0.18 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17a 5.74 0.69 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13e 10.34 0.27 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4k -63.15 0.39 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 41.05 0.16 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13c 25.48 0.38 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4c 20.22 0.38 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13j -22.47 0.21 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13a 6.96 0.22 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4b 27.92 0.30 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17d -16.06 0.23 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4j -7.16 0.25 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13j -64.53 0.33 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13b 16.66 0.36 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17i -60.20 0.54 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4l 53.13 0.36 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17a 3.87 0.27 1 -FEP_CAT-4o_CAT-4d 16.16 0.20 1 -FEP_CAT-4l_CAT-13k -69.75 0.38 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4n -7.80 0.13 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13g 13.69 0.50 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4m -12.00 0.13 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13a -4.45 0.38 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13h 31.15 1.01 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13m -99.13 0.37 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13e -33.35 0.45 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17g 3.96 0.29 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13h 41.30 0.90 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17d -8.56 0.43 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17e 3.20 0.22 2 -FEP_CAT-4m_CAT-17c 22.08 0.24 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13m -96.40 0.24 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4a 19.43 0.17 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13n -77.83 0.26 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13h 40.28 0.93 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17d 1.56 0.42 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4c 31.82 0.82 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17f -37.80 0.25 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13m -80.76 0.21 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13a 84.96 0.21 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13o -13.04 0.25 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4d 20.65 0.23 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13d -1.86 0.23 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13b -4.95 0.30 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13c 35.66 0.49 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13d 98.18 0.74 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13e 1.51 0.32 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17e 12.83 0.56 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13h -21.38 1.00 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4a 23.08 0.22 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13g 25.20 0.29 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4k -18.08 0.26 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13d 28.74 0.55 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13d -9.57 0.84 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17i -7.03 0.40 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13a -18.86 0.29 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13d 5.34 0.20 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f 0.13 0.52 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13f 29.82 0.63 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13c 113.69 0.27 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4l 45.21 0.27 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4a 30.29 0.29 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17b 20.62 0.50 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13j -42.38 0.49 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17a 21.55 0.09 0 -FEP_CAT-17g_CAT-17f -10.76 0.28 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13b 8.60 0.30 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13o 22.02 0.52 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13j -31.45 0.41 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13m -80.49 0.48 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13k -16.38 0.35 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13a -5.34 0.62 0 -FEP_CAT-4o_CAT-24 -19.94 0.57 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13f 32.22 0.31 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17g -7.96 0.31 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13j -3.04 0.24 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17d -36.91 0.52 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17g -49.50 0.30 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13a -11.96 0.51 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17b 28.85 0.39 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17b 13.50 0.55 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13g 112.93 0.24 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4d 28.46 0.26 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13k 62.03 0.34 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4k -9.12 0.28 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13k -31.38 0.38 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13k -44.64 0.39 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17e 10.66 0.30 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17c -32.09 0.42 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13i 15.52 0.29 0 -FEP_CAT-24_CAT-13n -70.30 0.70 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13i 25.98 0.47 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13b 24.25 0.24 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17b -6.61 0.52 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13a -22.13 0.75 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17a -13.02 0.56 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17i -38.94 0.62 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13e -0.66 0.60 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13a -21.61 0.55 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17i -0.60 0.68 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13k -45.10 0.17 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13a -9.16 0.28 0 -FEP_CAT-17d_CAT-17b 28.46 0.61 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13b -17.22 0.66 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17h 8.42 0.42 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17b 29.62 0.41 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13f -9.54 0.77 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13f 19.34 0.38 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17c -10.58 0.62 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13j -3.09 0.25 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17f -35.63 0.35 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13m -91.15 0.42 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17b 28.38 0.31 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13e -14.23 0.86 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13f -10.47 0.23 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13b 33.32 0.48 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13m -116.78 0.27 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13c 5.35 0.47 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13o -12.84 0.45 0 -FEP_CAT-17d_CAT-17c 28.90 0.27 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13c 102.78 0.43 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13d 15.77 0.56 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13g 21.50 0.45 0 -FEP_CAT-24_CAT-17i 0.18 0.29 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13o 15.20 0.40 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13a -13.71 0.26 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13g 7.48 0.35 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13e -9.52 0.31 0 -FEP_CAT-24_CAT-13c 32.64 0.44 0 -FEP_CAT-24_CAT-13g 34.25 0.69 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 27.00 0.28 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13d -1.68 0.27 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13g 21.30 0.57 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13f -9.09 0.83 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13m -9.92 0.27 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13a 6.63 0.22 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j 5.38 0.21 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13j -11.07 0.19 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -10.35 0.70 0 -FEP_CAT-4i_CAT-4b 36.06 0.22 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17d -11.14 0.24 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17a 22.10 0.51 0 -FEP_CAT-24_CAT-17b 28.98 0.28 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13n -106.82 0.27 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17a -16.20 0.61 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13m -108.83 0.48 0 -FEP_CAT-24_CAT-17c 29.21 0.72 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13b 105.12 0.32 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13i -12.69 0.32 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17d -0.33 0.33 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13c 25.40 0.30 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13o 14.08 0.40 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13e 19.44 0.37 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13b 16.71 0.53 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13k 72.26 0.14 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13n -99.27 0.33 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13n -71.20 0.40 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13e 26.85 0.47 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13i -3.01 0.18 0 -FEP_CAT-4b_CAT-24 -35.97 0.69 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4a 2.20 0.33 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 67.46 0.28 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13f -6.23 0.56 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13e -11.31 0.39 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17f -7.85 0.34 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13d 35.23 0.53 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13n -109.94 0.22 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13m -119.59 0.56 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13c 4.01 0.20 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17g -27.11 0.40 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a 2.94 0.13 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13n -109.90 0.39 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13d 19.46 0.40 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13j -2.84 0.42 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4d 27.72 0.22 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13f 20.78 0.35 0 -FEP_CAT-24_CAT-13h 36.98 0.60 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13h 40.24 0.86 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13k -18.77 0.44 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17d -7.98 0.25 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13b 94.28 0.24 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13e 27.82 0.58 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13b -14.07 0.27 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13i 96.25 0.26 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13f 8.25 0.77 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13c 4.58 0.60 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13k -30.10 0.55 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13i 3.94 0.38 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13j -13.17 0.67 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13c 25.03 0.34 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13c 22.31 0.29 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13j -10.42 0.39 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13e 4.29 0.52 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13g 25.53 0.54 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13m -116.29 0.31 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13h 14.56 0.95 0 -FEP_CAT-17g_CAT-17c 17.87 0.21 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13m -118.84 0.34 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13m -87.79 0.33 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13g -1.89 0.44 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13h 107.70 1.13 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -3.60 0.23 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13g 4.07 0.15 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17a 14.47 0.47 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13d 18.14 0.72 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13c 32.93 0.24 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13e 26.69 0.76 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17b -9.78 0.55 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17d 0.02 0.26 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17g -25.21 0.30 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17c 29.14 0.46 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13e 18.90 0.18 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17f -7.69 0.14 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13a -24.64 0.68 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13i -9.98 0.41 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13b 23.11 0.46 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13d -6.75 0.77 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13c 32.64 0.32 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13i 34.95 0.43 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13i 25.75 0.45 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13e 17.06 0.52 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13i 25.64 0.21 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13h 4.32 0.71 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13i 106.29 0.33 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13o -15.89 0.28 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13o 12.74 0.57 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13d 107.69 0.43 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13f 35.74 0.70 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17d -35.29 0.30 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13m -90.27 0.45 0 -FEP_CAT-17d_CAT-17a 22.05 0.42 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13e 34.42 0.39 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13d 3.43 0.48 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13e 106.26 0.41 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13e -2.39 0.31 0 -FEP_CAT-24_CAT-17a 22.34 0.50 0 -FEP_CAT-24_CAT-13o 22.25 0.67 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13d 26.76 0.55 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13g 34.16 0.52 0 -FEP_CAT-24_CAT-17h 8.94 0.31 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13b 24.24 0.25 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13n -70.97 0.43 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17a 13.32 0.61 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13g 3.91 0.51 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17h -31.06 0.24 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13k -36.98 0.40 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13b -11.10 0.35 0 -FEP_CAT-17g_CAT-17e -0.40 0.33 0 -FEP_CAT-17g_CAT-17d -11.12 0.17 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13i 28.49 0.37 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13a -12.01 0.44 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13o 0.63 0.43 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17a 21.07 0.61 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17c 29.00 0.33 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13f 1.44 0.75 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13m -80.77 0.36 0 -FEP_CAT-24_CAT-13i 25.32 0.43 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13h 28.67 0.82 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13c 7.19 0.23 0 -FEP_CAT-24_CAT-13j -2.93 0.73 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13f 109.02 0.38 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13a 3.60 0.34 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4b 28.05 0.22 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13h 7.83 0.40 0 -FEP_CAT-4j_CAT-24 -8.86 0.75 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13j 77.31 0.39 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -7.60 0.19 0 -FEP_CAT-4i_CAT-4c 39.16 0.52 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4c 31.15 0.41 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 28.40 0.25 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13a 6.99 0.29 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13a 17.44 0.19 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13b 12.89 0.28 0 -FEP_CAT-4c_CAT-24 -37.76 0.79 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13o 23.22 0.13 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13j -24.02 0.83 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 12.04 0.62 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17i -38.93 0.56 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13g 11.74 0.38 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17g -27.25 0.13 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17e -24.07 0.54 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13f -6.40 0.69 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13c -3.54 0.59 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17b 20.93 0.58 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13d 26.95 0.26 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13b 16.31 0.15 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13k -9.06 0.27 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13c 10.64 0.35 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17c 21.13 0.20 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13g 32.47 0.31 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13b 27.24 0.24 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13d -3.01 0.70 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13d -14.47 0.68 0 -FEP_CAT-24_CAT-17d -0.32 0.59 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13d 27.13 0.33 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13o -6.92 0.37 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17h 7.95 0.27 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b 17.44 0.13 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13b -4.51 0.16 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13b 1.13 0.41 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13b -11.22 0.33 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13i 2.51 0.27 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13g 12.32 0.83 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13c 41.29 0.38 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13d -10.09 0.48 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4a 0.49 0.27 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4i -8.45 0.23 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17c -9.64 0.48 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13d 15.48 0.28 0 -FEP_CAT-24_CAT-13f 29.88 0.95 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13a -14.27 0.64 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13a -16.80 0.50 0 -FEP_CAT-4i_CAT-4a 38.78 0.23 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13m -79.95 0.63 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17g -24.66 0.35 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13g 40.63 0.47 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13m -102.03 0.58 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13f 28.83 0.13 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13e 97.60 0.43 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17f 0.62 0.28 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13a -12.12 0.43 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4c 4.72 0.34 0 -FEP_CAT-17c_CAT-17b -0.58 0.58 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13f 6.01 0.65 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17b -9.28 0.58 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13d 1.70 0.40 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13a -24.13 0.22 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13h -1.52 1.05 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13n -80.88 0.54 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13b -8.74 0.26 0 -FEP_CAT-24_CAT-13b 24.07 0.47 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13c 33.10 0.37 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13c 32.98 0.20 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13i 17.96 0.37 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13a 4.13 0.64 0 -FEP_CAT-24_CAT-13e 25.69 0.53 0 -FEP_CAT-24_CAT-13m -79.36 0.75 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17a -13.00 0.66 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index c2d5b9cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_CAT-13b-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-13g-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13d/ 1 -FEP_CAT-13g-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13a/ 3 -FEP_CAT-4a-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13a/ 2 -FEP_CAT-4b-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13c/ 1 -FEP_CAT-4b-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13a/ 2 -FEP_CAT-4c-CAT-13b/ 1 -FEP_CAT-4c-CAT-13c/ 2 -FEP_CAT-4c-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13e/ 1 -FEP_CAT-4c-CAT-13f/ 1 -FEP_CAT-4d-CAT-13a/ 3 -FEP_CAT-4d-CAT-13b/ 6 -FEP_CAT-4d-CAT-13c/ 4 -FEP_CAT-4d-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13f/ 1 -FEP_CAT-4i-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13a/ 2 -FEP_CAT-4j-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4k-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4l-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13a/ 2 -FEP_CAT-4m-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4n-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4b/ 3 -FEP_CAT-4j-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-24/ 1 -FEP_CAT-4k-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13k/ 1 -FEP_CAT-4p-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4o/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt deleted file mode 100755 index bb347e1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-4c-CAT-17h -31.21 0.74 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13i 7.26 0.31 0 -FEP_CAT-24-CAT-17g 11.96 0.36 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13j -26.35 0.16 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13b -3.90 0.27 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4d 35.71 0.21 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17i 2.83 0.26 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4b -0.14 0.13 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13o 23.71 0.55 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13e 4.74 0.30 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17a 25.50 0.53 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13h 36.60 0.64 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13e -0.83 0.53 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13d -12.37 0.65 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17i -36.01 0.58 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13n -71.40 0.43 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13f 10.13 0.53 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17c -7.56 0.25 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13j -10.93 0.27 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17d -38.65 0.24 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13d 21.09 0.59 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17e 2.80 0.42 0 -FEP_CAT-24-CAT-13k -10.61 0.70 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13o 10.71 0.48 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13n -78.71 0.23 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13n -68.65 0.35 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4j 10.01 0.16 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4d 27.55 0.33 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13h 39.16 0.98 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13g -6.75 0.57 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13c 1.27 0.30 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13b -2.18 0.26 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13a -22.78 1.08 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13a 95.03 0.37 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13e 30.02 0.58 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13n -79.42 0.35 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13c -7.30 1.22 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13g -5.03 0.49 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13f 18.25 0.46 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13j -42.03 0.23 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13n -106.72 0.40 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13e 7.80 0.58 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13h 9.85 1.07 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4i -8.08 0.34 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4l 41.77 0.22 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4j 1.03 0.23 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4k -10.49 0.45 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17a -17.89 0.74 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4j 0.53 0.22 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17f -39.03 0.50 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17f -15.39 0.31 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17h -27.82 0.43 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13j -39.11 0.12 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13n -80.96 0.42 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17a 10.46 0.32 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13i 10.44 0.29 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17e -27.46 0.33 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13f 30.22 0.64 0 -FEP_CAT-24-CAT-13a 16.23 0.42 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13n -86.76 0.11 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17e 2.32 0.36 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13a -1.71 0.22 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13b -8.78 0.65 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13i -13.16 0.51 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17c 30.43 0.38 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13c 35.16 0.50 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13k -37.12 0.41 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13i 14.45 0.46 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17d -39.19 0.38 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13a 15.21 0.36 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13f 13.65 0.66 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13b 24.37 0.51 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17c 13.68 0.35 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4a 30.53 0.16 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17g 3.05 0.25 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17g 11.20 0.39 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13h 32.25 0.82 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13g 24.81 0.34 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4n -11.28 0.21 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4c 32.65 0.56 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13e 25.93 0.40 0 -FEP_CAT-4p-CAT-24 -14.58 0.69 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13g 36.47 0.42 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17f -35.38 0.29 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13n -77.91 0.30 0 -FEP_CAT-17b-CAT-17a -6.99 0.50 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17e 11.41 0.12 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13h 29.26 1.12 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13k -16.33 0.29 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13g -1.58 0.40 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13o -15.35 0.74 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17a 10.46 0.48 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13c -2.90 0.46 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13a 15.18 0.49 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13g 104.30 0.46 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13a 15.02 0.17 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13n -98.51 0.44 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13d 0.46 0.72 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13m -103.46 0.39 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13i -9.75 0.45 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17c -6.72 0.31 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13f 0.56 0.23 0 -FEP_CAT-4n-CAT-24 -7.04 0.32 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13h 19.75 0.75 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13a -46.60 0.24 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13f 22.18 0.27 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13c -6.82 0.38 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17c 20.85 0.26 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17h -52.64 0.40 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17b -6.77 0.46 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13k -8.73 0.36 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17h -0.53 0.23 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13c 3.46 0.84 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4m -8.65 0.12 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17e 10.52 0.32 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13g -4.74 0.38 1 -FEP_CAT-24-CAT-13d 27.35 0.31 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13b 12.02 0.28 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13j -14.53 0.37 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13e -4.86 0.45 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13b 1.81 0.52 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4j -11.19 0.12 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13i 26.60 0.41 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4b 37.83 0.12 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17i -34.75 0.52 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17h -0.49 0.32 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13m -141.37 0.33 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13b -3.30 0.35 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13c 6.85 0.21 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13g 33.37 0.52 1 -FEP_CAT-17b-CAT-13i -2.99 0.48 1 -FEP_CAT-4c-CAT-13b -15.12 0.73 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13h 13.56 0.51 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17h -27.87 0.29 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13f 30.02 0.52 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17c 17.49 0.58 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13m -108.29 0.48 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13c 10.38 0.55 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13i -35.30 0.15 1 -FEP_CAT-4m-CAT-13k -15.51 0.27 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17i -5.77 0.40 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13d -9.96 0.53 1 -FEP_CAT-4m-CAT-13o 15.98 0.16 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13k -19.47 0.34 1 -FEP_CAT-4a-CAT-13h 1.42 0.82 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17d 0.76 0.45 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13b -5.58 0.39 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13f -31.33 0.48 1 -FEP_CAT-4k-CAT-17f 2.43 0.33 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17e -23.22 0.30 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13o 21.49 0.41 1 -FEP_CAT-4p-CAT-17i -16.57 0.46 1 -FEP_CAT-4b-CAT-13e -7.76 0.52 4 -FEP_CAT-17d-CAT-13a 15.18 0.30 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4l 54.62 0.33 1 -FEP_CAT-13m-CAT-13h 118.07 0.74 2 -FEP_CAT-4m-CAT-13b 17.24 0.39 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13o 3.36 0.28 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17b 21.21 0.28 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17i -7.96 0.63 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13k -8.19 0.31 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13d 30.09 0.73 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13m -78.29 0.25 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13c 21.13 0.45 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4i -15.67 0.22 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13j -30.86 0.22 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17h -11.04 0.44 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13k -7.96 0.38 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13h 30.99 0.78 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13h 24.05 0.51 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17g 3.02 0.34 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13j -39.05 0.41 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13b 5.14 0.26 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13a 23.40 0.59 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13f 100.62 0.56 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13e -12.33 0.68 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13k -46.83 0.18 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13f 3.27 0.18 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13h 35.97 0.65 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13n -69.85 0.58 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13m -88.29 0.38 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13h 48.88 0.78 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13h 14.65 1.04 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13h 5.14 0.73 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13c -5.42 0.34 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17g 13.28 0.28 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4k -21.71 0.19 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4b -4.08 0.47 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13e 15.22 0.29 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17h 1.10 0.37 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4m -0.91 0.24 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13n -93.45 0.33 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17g 3.46 0.15 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13g 34.21 0.35 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13n -92.01 0.49 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13o -5.84 0.67 0 -FEP_CAT-4a-CAT-24 -39.03 0.46 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17b 17.14 0.43 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17f 0.57 0.40 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13i 28.21 0.25 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13k -16.61 0.30 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13k -48.62 0.45 0 -FEP_CAT-24-CAT-17e 11.36 0.29 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13a -8.34 0.67 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17b 22.26 0.52 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13i 17.93 0.25 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17b 30.67 0.50 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17e -27.61 0.67 0 -FEP_CAT-4d-CAT-24 -34.31 0.45 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13g -27.22 0.56 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4i -18.94 0.31 0 -FEP_CAT-4i-CAT-24 0.05 0.39 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13j -3.87 0.67 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13j -18.85 0.30 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13m -88.41 0.37 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4i 1.71 0.23 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13d 19.35 0.69 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17a -6.77 0.37 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4c -21.50 0.55 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13g 17.41 0.47 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17c 9.23 0.33 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17b 9.14 0.49 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13o 14.61 0.26 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13g 35.52 0.38 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17e 4.87 0.44 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4c 24.65 0.39 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13m -87.62 0.17 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13e 19.00 0.21 0 -FEP_CAT-4l-CAT-24 -60.22 0.34 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13d -34.13 0.68 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13k -5.87 0.25 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13c 17.17 0.73 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17h -7.81 0.33 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4b 20.13 0.21 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13d 7.35 0.73 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17a -38.76 0.52 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13n -132.16 0.31 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13e 19.82 0.62 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17f -61.02 0.35 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17e -4.22 0.57 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17a 14.93 0.43 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13o -38.47 0.16 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13c 14.18 0.27 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17d -18.75 0.39 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13i 17.97 0.34 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17h 9.95 0.33 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13g 25.98 0.43 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4b -25.68 0.20 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4j -53.04 0.22 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17f -19.16 0.24 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13o 25.07 0.30 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4b 29.28 0.36 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13f 22.09 0.49 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17e -49.78 0.70 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4d -26.12 0.33 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13c -28.29 0.23 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13k -28.22 0.17 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13a 17.98 0.29 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13d 11.94 0.70 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4i -7.16 0.27 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4c 41.72 0.41 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17d -7.51 0.29 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13j -9.92 0.39 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17i -18.46 0.40 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4i -60.71 0.12 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4o 3.59 0.19 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13k -23.88 0.29 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17e -7.71 0.42 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17a 13.47 0.85 0 -FEP_CAT-4m-CAT-24 -6.28 0.50 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17b -31.48 0.44 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13a 7.98 0.42 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13e 29.89 0.39 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17f -6.52 0.40 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13b -36.00 0.23 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4a -22.09 0.24 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13h 20.41 0.94 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13n -89.80 0.34 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13c 25.94 0.52 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13o 7.70 0.18 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4b 16.74 0.18 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13b 26.83 0.23 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17g -4.50 0.29 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4d 37.67 0.40 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13i 19.32 0.27 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4a 31.43 0.14 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13f 32.26 0.31 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13f 20.59 0.39 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17d -60.76 0.36 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13j -0.92 0.28 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17f -7.79 0.39 0 -FEP_CAT-4k-CAT-24 1.71 0.42 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17c 20.91 0.18 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17a 5.74 0.69 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13e 10.34 0.27 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4k -63.15 0.39 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4a 41.05 0.16 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13c 25.48 0.38 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4c 20.22 0.38 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13j -22.47 0.21 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13a 6.96 0.22 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4b 27.92 0.30 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17d -16.06 0.23 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4j -7.16 0.25 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13j -64.53 0.33 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13b 16.66 0.36 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17i -60.20 0.54 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4l 53.13 0.36 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17a 3.87 0.27 1 -FEP_CAT-4o-CAT-4d 16.16 0.20 1 -FEP_CAT-4l-CAT-13k -69.75 0.38 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4n -7.80 0.13 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13g 13.69 0.50 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4m -12.00 0.13 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13a -4.45 0.38 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13h 31.15 1.01 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13m -99.13 0.37 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13e -33.35 0.45 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17g 3.96 0.29 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13h 41.30 0.90 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17d -8.56 0.43 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17e 3.20 0.22 2 -FEP_CAT-4m-CAT-17c 22.08 0.24 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13m -96.40 0.24 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4a 19.43 0.17 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13n -77.83 0.26 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13h 40.28 0.93 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17d 1.56 0.42 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4c 31.82 0.82 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17f -37.80 0.25 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13m -80.76 0.21 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13a 84.96 0.21 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13o -13.04 0.25 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4d 20.65 0.23 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13d -1.86 0.23 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13b -4.95 0.30 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13c 35.66 0.49 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13d 98.18 0.74 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13e 1.51 0.32 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17e 12.83 0.56 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13h -21.38 1.00 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4a 23.08 0.22 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13g 25.20 0.29 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4k -18.08 0.26 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13d 28.74 0.55 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13d -9.57 0.84 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17i -7.03 0.40 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13a -18.86 0.29 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13d 5.34 0.20 0 -FEP_CAT-24-CAT-17f 0.13 0.52 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13f 29.82 0.63 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13c 113.69 0.27 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4l 45.21 0.27 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4a 30.29 0.29 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17b 20.62 0.50 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13j -42.38 0.49 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17a 21.55 0.09 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17f -10.76 0.28 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13b 8.60 0.30 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13o 22.02 0.52 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13j -31.45 0.41 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13m -80.49 0.48 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13k -16.38 0.35 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13a -5.34 0.62 0 -FEP_CAT-4o-CAT-24 -19.94 0.57 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13f 32.22 0.31 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17g -7.96 0.31 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13j -3.04 0.24 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17d -36.91 0.52 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17g -49.50 0.30 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13a -11.96 0.51 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17b 28.85 0.39 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17b 13.50 0.55 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13g 112.93 0.24 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4d 28.46 0.26 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13k 62.03 0.34 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4k -9.12 0.28 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13k -31.38 0.38 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13k -44.64 0.39 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17e 10.66 0.30 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17c -32.09 0.42 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13i 15.52 0.29 0 -FEP_CAT-24-CAT-13n -70.30 0.70 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13i 25.98 0.47 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13b 24.25 0.24 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17b -6.61 0.52 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13a -22.13 0.75 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17a -13.02 0.56 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17i -38.94 0.62 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13e -0.66 0.60 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13a -21.61 0.55 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17i -0.60 0.68 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13k -45.10 0.17 0 -FEP_CAT-13b-CAT-13a -9.16 0.28 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17b 28.46 0.61 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13b -17.22 0.66 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17h 8.42 0.42 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17b 29.62 0.41 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13f -9.54 0.77 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13f 19.34 0.38 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17c -10.58 0.62 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13j -3.09 0.25 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17f -35.63 0.35 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13m -91.15 0.42 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17b 28.38 0.31 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13e -14.23 0.86 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13f -10.47 0.23 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13b 33.32 0.48 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13m -116.78 0.27 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13c 5.35 0.47 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13o -12.84 0.45 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17c 28.90 0.27 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13c 102.78 0.43 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13d 15.77 0.56 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13g 21.50 0.45 0 -FEP_CAT-24-CAT-17i 0.18 0.29 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13o 15.20 0.40 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13a -13.71 0.26 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13g 7.48 0.35 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13e -9.52 0.31 0 -FEP_CAT-24-CAT-13c 32.64 0.44 0 -FEP_CAT-24-CAT-13g 34.25 0.69 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13d 27.00 0.28 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13d -1.68 0.27 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13g 21.30 0.57 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13f -9.09 0.83 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13m -9.92 0.27 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13a 6.63 0.22 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13j 5.38 0.21 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13j -11.07 0.19 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13a -10.35 0.70 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4b 36.06 0.22 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17d -11.14 0.24 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17a 22.10 0.51 0 -FEP_CAT-24-CAT-17b 28.98 0.28 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13n -106.82 0.27 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17a -16.20 0.61 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13m -108.83 0.48 0 -FEP_CAT-24-CAT-17c 29.21 0.72 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13b 105.12 0.32 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13i -12.69 0.32 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17d -0.33 0.33 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13c 25.40 0.30 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13o 14.08 0.40 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13e 19.44 0.37 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13b 16.71 0.53 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13k 72.26 0.14 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13n -99.27 0.33 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13n -71.20 0.40 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13e 26.85 0.47 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13i -3.01 0.18 0 -FEP_CAT-4b-CAT-24 -35.97 0.69 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4a 2.20 0.33 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13j 67.46 0.28 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13f -6.23 0.56 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13e -11.31 0.39 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17f -7.85 0.34 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13d 35.23 0.53 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13n -109.94 0.22 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13m -119.59 0.56 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13c 4.01 0.20 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17g -27.11 0.40 0 -FEP_CAT-4b-CAT-4a 2.94 0.13 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13n -109.90 0.39 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13d 19.46 0.40 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13j -2.84 0.42 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4d 27.72 0.22 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13f 20.78 0.35 0 -FEP_CAT-24-CAT-13h 36.98 0.60 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13h 40.24 0.86 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13k -18.77 0.44 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17d -7.98 0.25 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13b 94.28 0.24 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13e 27.82 0.58 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13b -14.07 0.27 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13i 96.25 0.26 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13f 8.25 0.77 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13c 4.58 0.60 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13k -30.10 0.55 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13i 3.94 0.38 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13j -13.17 0.67 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13c 25.03 0.34 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13c 22.31 0.29 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13j -10.42 0.39 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13e 4.29 0.52 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13g 25.53 0.54 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13m -116.29 0.31 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13h 14.56 0.95 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17c 17.87 0.21 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13m -118.84 0.34 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13m -87.79 0.33 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13g -1.89 0.44 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13h 107.70 1.13 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13f -3.60 0.23 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13g 4.07 0.15 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17a 14.47 0.47 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13d 18.14 0.72 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13c 32.93 0.24 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13e 26.69 0.76 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17b -9.78 0.55 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17d 0.02 0.26 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17g -25.21 0.30 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17c 29.14 0.46 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13e 18.90 0.18 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17f -7.69 0.14 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13a -24.64 0.68 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13i -9.98 0.41 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13b 23.11 0.46 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13d -6.75 0.77 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13c 32.64 0.32 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13i 34.95 0.43 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13i 25.75 0.45 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13e 17.06 0.52 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13i 25.64 0.21 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13h 4.32 0.71 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13i 106.29 0.33 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13o -15.89 0.28 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13o 12.74 0.57 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13d 107.69 0.43 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13f 35.74 0.70 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17d -35.29 0.30 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13m -90.27 0.45 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17a 22.05 0.42 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13e 34.42 0.39 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13d 3.43 0.48 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13e 106.26 0.41 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13e -2.39 0.31 0 -FEP_CAT-24-CAT-17a 22.34 0.50 0 -FEP_CAT-24-CAT-13o 22.25 0.67 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13d 26.76 0.55 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13g 34.16 0.52 0 -FEP_CAT-24-CAT-17h 8.94 0.31 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13b 24.24 0.25 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13n -70.97 0.43 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17a 13.32 0.61 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13g 3.91 0.51 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17h -31.06 0.24 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13k -36.98 0.40 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13b -11.10 0.35 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17e -0.40 0.33 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17d -11.12 0.17 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13i 28.49 0.37 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13a -12.01 0.44 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13o 0.63 0.43 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17a 21.07 0.61 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17c 29.00 0.33 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13f 1.44 0.75 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13m -80.77 0.36 0 -FEP_CAT-24-CAT-13i 25.32 0.43 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13h 28.67 0.82 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13c 7.19 0.23 0 -FEP_CAT-24-CAT-13j -2.93 0.73 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13f 109.02 0.38 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13a 3.60 0.34 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4b 28.05 0.22 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13h 7.83 0.40 0 -FEP_CAT-4j-CAT-24 -8.86 0.75 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13j 77.31 0.39 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17d -7.60 0.19 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4c 39.16 0.52 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4c 31.15 0.41 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17c 28.40 0.25 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13a 6.99 0.29 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13a 17.44 0.19 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13b 12.89 0.28 0 -FEP_CAT-4c-CAT-24 -37.76 0.79 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13o 23.22 0.13 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13j -24.02 0.83 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17g 12.04 0.62 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17i -38.93 0.56 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13g 11.74 0.38 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17g -27.25 0.13 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17e -24.07 0.54 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13f -6.40 0.69 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13c -3.54 0.59 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17b 20.93 0.58 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13d 26.95 0.26 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13b 16.31 0.15 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13k -9.06 0.27 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13c 10.64 0.35 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17c 21.13 0.20 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13g 32.47 0.31 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13b 27.24 0.24 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13d -3.01 0.70 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13d -14.47 0.68 0 -FEP_CAT-24-CAT-17d -0.32 0.59 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13d 27.13 0.33 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13o -6.92 0.37 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17h 7.95 0.27 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17b 17.44 0.13 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13b -4.51 0.16 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13b 1.13 0.41 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13b -11.22 0.33 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13i 2.51 0.27 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13g 12.32 0.83 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13c 41.29 0.38 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13d -10.09 0.48 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4a 0.49 0.27 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4i -8.45 0.23 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17c -9.64 0.48 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13d 15.48 0.28 0 -FEP_CAT-24-CAT-13f 29.88 0.95 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13a -14.27 0.64 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13a -16.80 0.50 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4a 38.78 0.23 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13m -79.95 0.63 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17g -24.66 0.35 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13g 40.63 0.47 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13m -102.03 0.58 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13f 28.83 0.13 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13e 97.60 0.43 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17f 0.62 0.28 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13a -12.12 0.43 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4c 4.72 0.34 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17b -0.58 0.58 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13f 6.01 0.65 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17b -9.28 0.58 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13d 1.70 0.40 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13a -24.13 0.22 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13h -1.52 1.05 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13n -80.88 0.54 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13b -8.74 0.26 0 -FEP_CAT-24-CAT-13b 24.07 0.47 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13c 33.10 0.37 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13c 32.98 0.20 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13i 17.96 0.37 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13a 4.13 0.64 0 -FEP_CAT-24-CAT-13e 25.69 0.53 0 -FEP_CAT-24-CAT-13m -79.36 0.75 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17a -13.00 0.66 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt deleted file mode 100755 index cb757570..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-4l-CAT-17a -37.58 0.27 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17f -38.15 0.21 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13a -12.44 0.14 0 -FEP_CAT-24-CAT-13e 26.28 0.34 0 -FEP_CAT-24-CAT-13m -80.87 0.13 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13m -7.04 0.13 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17e -24.84 0.30 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13n -80.78 0.13 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13f 31.21 0.15 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13i -11.53 0.18 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4c 19.91 0.15 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13m -78.82 0.11 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17a -16.37 0.17 0 -FEP_CAT-4l-CAT-24 -58.76 0.20 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4j -11.18 0.07 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17d -0.71 0.13 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17b 21.81 0.10 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13g -3.94 0.17 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13a -19.38 0.22 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13k -68.70 0.23 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17a 22.90 0.08 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13n -108.75 0.16 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13e 99.80 0.38 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13e -32.48 0.23 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17c 21.06 0.15 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13k -7.03 0.12 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17h -28.51 0.15 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13j -32.64 0.16 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13h -3.32 0.33 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13n -94.09 0.10 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13k -46.41 0.34 0 -FEP_CAT-24-CAT-13h 32.65 0.20 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17c 19.72 0.13 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13a 17.59 0.19 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17d -39.76 0.26 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4a 28.95 0.20 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17g 1.54 0.13 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13o -0.99 0.13 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17f -18.85 0.25 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13h 12.09 0.09 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13f 20.90 0.19 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4i -8.47 0.11 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13d 35.34 0.12 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13g 30.77 0.21 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4a -0.30 0.12 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17a 26.96 0.14 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17b 20.91 0.09 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13h 35.06 0.14 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13i 12.84 0.19 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13b -11.14 0.18 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13j -1.75 0.12 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13f 29.20 0.13 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13a -23.62 0.30 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4b 19.39 0.10 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13i -12.76 0.15 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17i 0.18 0.19 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13h 14.99 0.13 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17b 20.91 0.13 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4l 51.64 0.18 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13m -91.35 0.13 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17d -18.78 0.12 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13f 9.59 0.19 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4d -22.11 0.19 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13k 71.16 0.31 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13b 23.15 0.20 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13b 14.17 0.26 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17c 15.79 0.14 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13b 12.88 0.18 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17h -10.25 0.10 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17f -38.31 0.18 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13n -71.00 0.16 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17c 10.79 0.13 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13n -79.27 0.12 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13j -10.65 0.16 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13d 105.79 0.11 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13i 103.82 0.20 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13m -77.67 0.13 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13k -44.87 0.32 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13j 68.74 0.17 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13h 41.68 0.25 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17h -52.31 0.13 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13c 9.17 0.20 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13g 22.69 0.19 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13e -3.95 0.19 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17i 4.26 0.20 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13b -5.26 0.11 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4b 30.21 0.12 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13c -6.46 0.21 0 -FEP_CAT-4j-CAT-24 -5.68 0.21 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13e 32.73 0.34 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13a -4.17 0.21 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13h 25.58 0.09 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17a 13.51 0.13 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17c -10.09 0.25 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13g 102.72 0.11 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13f 16.14 0.24 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13o 25.98 0.08 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13h 112.86 0.15 0 -FEP_CAT-24-CAT-17h 6.63 0.14 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13j -11.79 0.27 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17b 19.78 0.19 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13n -100.73 0.12 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13n -109.71 0.14 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17a -16.11 0.26 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17b 20.65 0.20 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4b 43.46 0.15 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13h 5.51 0.11 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17i -8.38 0.13 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4d 43.01 0.20 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13n -89.25 0.13 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13m -96.57 0.08 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13c 31.42 0.22 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13a 15.15 0.09 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17c -10.00 0.15 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17b -8.59 0.14 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13d 17.17 0.09 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17d -38.37 0.20 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13d 27.63 0.14 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13c 39.32 0.15 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17f -37.52 0.23 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13o 21.69 0.12 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13j 75.90 0.20 0 -FEP_CAT-4d-CAT-24 -35.48 0.17 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13a 15.00 0.13 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13e -10.42 0.31 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13a 93.87 0.20 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17a -14.65 0.15 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13e -1.04 0.22 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13n -71.02 0.09 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13c 31.65 0.13 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13i -12.94 0.22 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13j -31.46 0.12 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4d 38.58 0.18 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17g -7.52 0.15 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17f -8.36 0.10 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13d 98.66 0.12 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4k -23.69 0.06 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13a -16.20 0.21 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13m -101.14 0.14 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13a 5.90 0.16 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13b 10.26 0.09 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17e -25.49 0.10 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13b 5.18 0.30 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13m -88.61 0.20 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17f 4.69 0.15 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17e -5.35 0.20 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13i -4.05 0.12 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13h -3.91 0.24 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13g -7.32 0.15 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13a 4.62 0.12 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13f 33.35 0.13 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17a 3.36 0.13 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17f -17.85 0.10 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13f -0.72 0.18 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13k -36.68 0.18 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17e 4.17 0.15 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13f 19.65 0.16 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13e -10.34 0.25 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13n -110.18 0.12 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17e 3.43 0.15 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17d -20.07 0.11 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13d -10.87 0.11 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13i 2.68 0.15 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13o 12.22 0.16 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13f 19.90 0.10 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17c 28.66 0.03 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13f 29.26 0.24 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13f -0.17 0.13 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17i -8.87 0.13 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13o -17.21 0.17 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13b -8.12 0.15 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4b 29.53 0.12 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13k -29.59 0.18 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13c 4.66 0.29 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17e -26.03 0.10 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17h -0.07 0.14 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13a 15.78 0.15 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13d 1.40 0.11 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13n -80.11 0.11 0 -FEP_CAT-4c-CAT-24 -35.56 0.18 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4k -13.02 0.17 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17g -28.67 0.12 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13k -6.56 0.15 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17i -19.67 0.11 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13a -23.45 0.25 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4o 1.40 0.14 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13b -15.19 0.16 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13b 94.04 0.26 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17d -11.20 0.08 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17a 10.22 0.08 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4c 18.07 0.20 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13h 37.03 0.10 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17e 12.91 0.12 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13f 36.45 0.21 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17d -9.62 0.09 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13i -2.93 0.12 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13d -1.17 0.07 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17c -31.87 0.11 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13a -24.47 0.13 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13k -17.77 0.15 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13e 19.23 0.29 0 -FEP_CAT-24-CAT-13i 23.55 0.15 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13i 25.68 0.12 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13g 2.18 0.20 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13f -9.58 0.36 0 -FEP_CAT-4a-CAT-24 -36.08 0.20 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4n -8.60 0.08 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4k -13.90 0.14 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13k -7.19 0.35 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4j -1.54 0.15 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13m -116.99 0.10 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17g 1.02 0.18 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17g -28.10 0.13 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4m -10.62 0.06 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4a 38.57 0.07 0 -FEP_CAT-24-CAT-17b 27.45 0.13 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17e 4.05 0.11 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13k -20.27 0.19 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13a -22.64 0.21 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13d 28.28 0.10 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17f -60.60 0.15 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13b -38.13 0.21 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4a -22.29 0.09 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13o -16.83 0.23 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13c 13.17 0.12 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4i 4.36 0.10 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17i -38.62 0.15 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17d -61.67 0.10 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13b -6.49 0.11 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13a 19.34 0.16 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13e 20.77 0.30 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13g -6.61 0.45 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4c -23.36 0.14 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13h 33.89 0.29 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13j -63.20 0.22 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13b 14.38 0.22 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13g 33.84 0.22 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17d -10.31 0.15 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13c 23.09 0.27 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4i -61.14 0.08 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13d -2.62 0.10 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13b 0.50 0.18 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13f -2.73 0.14 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13i 26.23 0.24 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13c 8.76 0.17 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17h -9.12 0.12 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13i 16.28 0.18 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13c 12.07 0.18 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13n -92.82 0.11 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13f 10.98 0.17 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13e 107.35 0.32 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4c 0.01 0.31 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13g 8.57 0.17 1 -FEP_CAT-4j-CAT-13i 17.32 0.16 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13b 13.06 0.25 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4i -19.55 0.08 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17b 10.69 0.20 0 -FEP_CAT-4m-CAT-24 -6.75 0.11 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4b 38.90 0.15 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13b -15.64 0.33 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13n -66.91 0.16 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13g 22.57 0.17 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13j -2.42 0.10 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17a 22.90 0.14 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17e -25.64 0.24 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4d 29.61 0.11 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17i -9.51 0.07 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13m -115.94 0.21 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13k -16.81 0.24 0 -FEP_CAT-4i-CAT-24 2.29 0.18 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13e 28.65 0.26 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4a 42.68 0.09 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4j -9.85 0.16 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17h 13.34 0.16 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13d 18.36 0.09 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13b -15.81 0.27 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13b 22.80 0.30 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13c 21.66 0.22 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4d 29.44 0.22 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13m -97.79 0.11 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13d 19.46 0.09 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17e -6.41 0.14 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17h 0.77 0.11 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13i 29.97 0.18 0 -FEP_CAT-4b-CAT-24 -36.65 0.10 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4d 19.38 0.12 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17d -9.05 0.10 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13g -29.65 0.20 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13d 18.00 0.09 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17f -7.93 0.15 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17i -39.07 0.18 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13k -16.04 0.31 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17a 13.86 0.21 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17i -17.94 0.19 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13f -9.66 0.18 0 -FEP_CAT-4b-CAT-4a -0.41 0.09 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4a 29.56 0.09 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17b -30.77 0.14 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4k -65.12 0.09 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13g 36.25 0.24 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13m -74.07 0.13 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13f -9.86 0.17 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13i 25.43 0.17 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4l 42.82 0.09 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13m -139.24 0.15 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13g -5.32 0.29 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13f -32.06 0.09 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13j -39.90 0.30 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17g -28.25 0.23 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17e 17.49 0.19 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13m -87.56 0.14 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13d -33.56 0.15 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13i -35.21 0.07 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13k -25.66 0.15 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17b 11.74 0.13 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13m -116.95 0.13 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13o 2.42 0.09 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17g -8.89 0.14 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4d 30.96 0.23 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13b 4.16 0.33 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4i -18.01 0.08 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17a 4.65 0.11 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13e 8.63 0.28 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4m -9.23 0.09 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13a -2.62 0.16 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4n -10.01 0.09 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17f -8.89 0.11 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13o 4.12 0.37 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13d 7.92 0.15 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4m -0.47 0.15 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13e 10.30 0.21 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4i -9.70 0.11 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4d 20.71 0.12 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13k -27.12 0.27 0 -FEP_CAT-4o-CAT-24 -17.07 0.13 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13h 16.82 0.17 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4a 20.46 0.15 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17c 9.59 0.12 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13m -87.85 0.12 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13g 12.19 0.19 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13n -90.70 0.11 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4a 19.08 0.07 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13h 25.23 0.22 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4l 41.48 0.09 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13j -21.79 0.22 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13i 6.17 0.17 0 -FEP_CAT-4n-CAT-24 -7.28 0.10 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4c 28.25 0.12 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13d 9.65 0.12 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4k -22.42 0.12 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13j -19.70 0.28 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13a 5.63 0.37 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13i 7.92 0.21 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17h -0.36 0.08 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17i -39.19 0.19 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4b 21.02 0.07 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13c -3.54 0.05 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17a 14.04 0.16 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13a 6.18 0.11 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13b -4.22 0.12 0 -FEP_CAT-24-CAT-13b 20.78 0.26 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13a -13.83 0.31 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17c 20.11 0.08 0 -FEP_CAT-24-CAT-17a 20.84 0.16 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13d 4.53 0.06 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13e 28.21 0.42 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13e 35.69 0.37 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13f -6.32 0.22 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13h 106.05 0.17 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13d 27.42 0.10 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13c 2.67 0.11 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13a -7.74 0.14 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13b -6.04 0.25 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13d -4.52 0.14 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17c 29.90 0.14 0 -FEP_CAT-24-CAT-13g 29.44 0.21 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17f -9.90 0.09 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13e 6.89 0.35 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13j -2.46 0.08 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13g 20.99 0.14 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13e 19.44 0.31 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13m -108.47 0.14 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13d 30.41 0.11 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13b -7.91 0.26 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13o 11.77 0.12 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13o 22.62 0.12 0 -FEP_CAT-24-CAT-17g 8.15 0.21 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13b -5.24 0.32 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17e 13.05 0.13 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13d -1.23 0.15 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17a 23.77 0.16 0 -FEP_CAT-13b-CAT-13a -7.45 0.20 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13i 3.67 0.22 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17d -0.90 0.14 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13e -1.59 0.24 0 -FEP_CAT-17b-CAT-17a -7.11 0.09 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13f 29.69 0.12 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13c 2.13 0.11 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13n -80.44 0.12 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13n -100.24 0.12 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13n -71.66 0.17 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13j 5.34 0.18 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13m -78.41 0.23 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13b 0.71 0.25 0 -FEP_CAT-24-CAT-13c 29.04 0.17 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13a 14.75 0.08 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13e -1.15 0.16 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13j -12.95 0.16 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13f 107.23 0.17 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13g 23.50 0.39 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13b -14.37 0.23 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4b -21.69 0.18 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13d -11.90 0.17 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17e 2.41 0.14 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13n -84.17 0.08 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17c 33.15 0.23 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13h 24.09 0.15 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13d 27.23 0.08 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13h 21.79 0.14 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4c 28.90 0.16 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13d -10.80 0.16 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13d -1.04 0.36 0 -FEP_CAT-24-CAT-13k -9.72 0.20 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13j -25.67 0.10 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17h 9.21 0.10 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17b -8.38 0.22 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13j -41.14 0.30 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13g 6.53 0.26 0 -FEP_CAT-24-CAT-13o 19.18 0.20 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17d -13.97 0.10 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13b 25.82 0.21 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13b 24.16 0.18 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17f -8.58 0.06 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17b 16.98 0.11 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13h 38.74 0.14 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13b 27.72 0.26 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13g -7.38 0.25 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17c -8.55 0.20 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17f 0.41 0.17 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13i 15.48 0.11 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17d 3.41 0.16 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13a 22.94 0.10 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4b 30.98 0.12 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13c 109.79 0.16 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13e 15.16 0.22 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4l 52.07 0.14 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13g 31.82 0.20 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13i 28.38 0.20 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13a -10.72 0.19 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13o -6.90 0.15 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13j -40.71 0.25 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4b 1.24 0.21 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13h 12.11 0.15 0 -FEP_CAT-4k-CAT-24 6.68 0.15 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13e 19.59 0.24 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13o 12.87 0.14 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17g 10.37 0.12 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13m -117.45 0.08 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13c 22.12 0.46 0 -FEP_CAT-24-CAT-13n -73.14 0.11 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17f 0.57 0.16 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13e 30.86 0.33 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13k -36.96 0.16 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13g 18.85 0.19 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13f 100.34 0.20 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13j -11.08 0.23 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4j -0.76 0.11 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17h -30.06 0.18 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13i 16.81 0.16 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13d 31.91 0.11 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13g 1.86 0.18 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13c -30.05 0.42 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13n -131.87 0.11 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13c 3.86 0.23 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13h -26.38 0.13 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13c 102.77 0.11 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13j 1.82 0.18 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17g -27.21 0.18 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17g 10.50 0.08 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17c 29.14 0.09 0 -FEP_CAT-24-CAT-17c 26.81 0.16 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13g 109.82 0.14 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13a -16.83 0.29 1 -FEP_CAT-17h-CAT-13c 22.35 0.13 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17b 1.15 0.18 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13n -70.58 0.08 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13f 6.52 0.13 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13i 27.07 0.27 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13b -2.44 0.14 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17d -1.19 0.09 0 -FEP_CAT-24-CAT-17f -2.24 0.17 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17h 9.04 0.16 0 -FEP_CAT-24-CAT-13d 24.90 0.17 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13d 5.28 0.18 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13a -14.83 0.16 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13o 12.91 0.11 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13m -107.49 0.17 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13g 40.00 0.24 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4a 1.01 0.10 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17e -48.05 0.16 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13f 6.09 0.19 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13k -45.89 0.29 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13b 23.30 0.24 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13j -24.41 0.08 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13d -7.08 0.17 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13d -10.53 0.20 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13a -7.11 0.09 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13g 31.83 0.16 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17b -9.20 0.12 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17g 14.70 0.19 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13k -16.52 0.10 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4c 42.01 0.11 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13m -87.29 0.12 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13c 20.88 0.16 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13o 21.98 0.13 0 -FEP_CAT-24-CAT-17e 10.46 0.09 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13d 14.28 0.10 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13c 1.38 0.15 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4b 0.39 0.14 0 -FEP_CAT-24-CAT-13a 12.75 0.21 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13c 18.66 0.16 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17a 22.72 0.14 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13k -3.08 0.35 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13e 3.66 0.33 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17c 18.71 0.07 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13o -39.27 0.16 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17d -40.23 0.15 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17a 14.49 0.13 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13c 34.05 0.12 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17f -38.56 0.21 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13b 101.10 0.23 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17g 1.24 0.08 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13a 2.21 0.13 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13a 7.01 0.20 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13o 21.52 0.18 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17d -9.69 0.13 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13o -8.09 0.12 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13f 28.50 0.10 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13j -11.26 0.16 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13d 18.36 0.12 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17b 30.96 0.15 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13a 86.13 0.14 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13h 25.59 0.27 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17b 34.39 0.21 0 -FEP_CAT-24-CAT-13j -5.24 0.19 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13b 30.29 0.10 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13o -16.51 0.16 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13h 34.94 0.21 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4j 12.61 0.07 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13a -13.93 0.10 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17a 12.42 0.16 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13a -14.64 0.29 0 -FEP_CAT-24-CAT-17i -2.45 0.07 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13h -4.18 0.22 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13a -45.79 0.24 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13k 63.38 0.10 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17b 29.73 0.15 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13e 4.86 0.20 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17c -9.41 0.08 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13i 16.92 0.10 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13j -41.15 0.19 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13j -16.07 0.15 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13e 28.31 0.41 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13i 96.51 0.10 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17a -6.13 0.10 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13h 8.58 0.16 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13c -0.06 0.20 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17c 20.09 0.22 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17g -50.66 0.12 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13m -86.72 0.17 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13g 32.55 0.25 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13e -9.42 0.22 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13o 8.81 0.11 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13f 3.85 0.23 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13m -78.28 0.13 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13i 32.82 0.12 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13g 9.73 0.18 0 -FEP_CAT-24-CAT-17d -3.27 0.22 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13f 20.10 0.24 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13c -7.58 0.46 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17b 30.12 0.14 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13c 35.02 0.49 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4c 37.52 0.11 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4i -8.84 0.19 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13c 32.29 0.07 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13e 28.91 0.27 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13h 26.22 0.11 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13m -100.48 0.09 0 -FEP_CAT-4p-CAT-24 -15.90 0.17 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13h -4.72 0.20 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13n -110.13 0.13 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13e -7.46 0.12 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13e -10.35 0.35 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13c -7.55 0.16 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4j -52.88 0.05 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13k -46.13 0.22 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13g 22.21 0.19 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17b 29.99 0.09 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13h 35.40 0.14 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13f -8.46 0.41 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13f 18.20 0.21 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4c 29.60 0.11 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13c 30.75 0.15 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13c -7.31 0.09 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17d -39.31 0.17 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13j -2.82 0.21 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4a 30.41 0.09 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13o -15.61 0.12 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17i -37.55 0.22 0 -FEP_CAT-24-CAT-13f 26.79 0.20 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17a -15.69 0.13 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17b -9.02 0.22 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13n -81.70 0.08 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13h 5.20 0.08 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13k -7.43 0.18 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13c 4.01 0.10 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13g 13.83 0.11 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13k -30.27 0.21 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13e 17.92 0.36 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17e 4.73 0.20 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17g 2.19 0.12 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13i -13.08 0.21 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17h -29.53 0.20 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13k -15.16 0.24 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17i -61.18 0.11 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17e 13.07 0.10 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13o 13.61 0.11 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13b 14.51 0.42 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17h -29.53 0.13 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17c 29.29 0.08 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100755 index a09c3bde..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-4l_CAT-17a -37.58 0.27 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17f -38.15 0.21 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -12.44 0.14 0 -FEP_CAT-24_CAT-13e 26.28 0.34 0 -FEP_CAT-24_CAT-13m -80.87 0.13 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13m -7.04 0.13 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17e -24.84 0.30 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13n -80.78 0.13 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13f 31.21 0.15 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13i -11.53 0.18 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4c 19.91 0.15 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13m -78.82 0.11 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17a -16.37 0.17 0 -FEP_CAT-4l_CAT-24 -58.76 0.20 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4j -11.18 0.07 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17d -0.71 0.13 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17b 21.81 0.10 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13g -3.94 0.17 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13a -19.38 0.22 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13k -68.70 0.23 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17a 22.90 0.08 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13n -108.75 0.16 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13e 99.80 0.38 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13e -32.48 0.23 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17c 21.06 0.15 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13k -7.03 0.12 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17h -28.51 0.15 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13j -32.64 0.16 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13h -3.32 0.33 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13n -94.09 0.10 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13k -46.41 0.34 0 -FEP_CAT-24_CAT-13h 32.65 0.20 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17c 19.72 0.13 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13a 17.59 0.19 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17d -39.76 0.26 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4a 28.95 0.20 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17g 1.54 0.13 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13o -0.99 0.13 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17f -18.85 0.25 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13h 12.09 0.09 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13f 20.90 0.19 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4i -8.47 0.11 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13d 35.34 0.12 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13g 30.77 0.21 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4a -0.30 0.12 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17a 26.96 0.14 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17b 20.91 0.09 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13h 35.06 0.14 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13i 12.84 0.19 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13b -11.14 0.18 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13j -1.75 0.12 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13f 29.20 0.13 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13a -23.62 0.30 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4b 19.39 0.10 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13i -12.76 0.15 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17i 0.18 0.19 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13h 14.99 0.13 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17b 20.91 0.13 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4l 51.64 0.18 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13m -91.35 0.13 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17d -18.78 0.12 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13f 9.59 0.19 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4d -22.11 0.19 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13k 71.16 0.31 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13b 23.15 0.20 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13b 14.17 0.26 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17c 15.79 0.14 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13b 12.88 0.18 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17h -10.25 0.10 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17f -38.31 0.18 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13n -71.00 0.16 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17c 10.79 0.13 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13n -79.27 0.12 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13j -10.65 0.16 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13d 105.79 0.11 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13i 103.82 0.20 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13m -77.67 0.13 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13k -44.87 0.32 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 68.74 0.17 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13h 41.68 0.25 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17h -52.31 0.13 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13c 9.17 0.20 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13g 22.69 0.19 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -3.95 0.19 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17i 4.26 0.20 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13b -5.26 0.11 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4b 30.21 0.12 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13c -6.46 0.21 0 -FEP_CAT-4j_CAT-24 -5.68 0.21 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13e 32.73 0.34 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13a -4.17 0.21 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13h 25.58 0.09 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17a 13.51 0.13 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17c -10.09 0.25 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13g 102.72 0.11 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13f 16.14 0.24 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13o 25.98 0.08 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13h 112.86 0.15 0 -FEP_CAT-24_CAT-17h 6.63 0.14 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13j -11.79 0.27 0 -FEP_CAT-17g_CAT-17b 19.78 0.19 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13n -100.73 0.12 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13n -109.71 0.14 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17a -16.11 0.26 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17b 20.65 0.20 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4b 43.46 0.15 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13h 5.51 0.11 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17i -8.38 0.13 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4d 43.01 0.20 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13n -89.25 0.13 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13m -96.57 0.08 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13c 31.42 0.22 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13a 15.15 0.09 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17c -10.00 0.15 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17b -8.59 0.14 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13d 17.17 0.09 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17d -38.37 0.20 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13d 27.63 0.14 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13c 39.32 0.15 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17f -37.52 0.23 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13o 21.69 0.12 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13j 75.90 0.20 0 -FEP_CAT-4d_CAT-24 -35.48 0.17 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13a 15.00 0.13 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13e -10.42 0.31 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13a 93.87 0.20 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17a -14.65 0.15 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13e -1.04 0.22 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13n -71.02 0.09 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13c 31.65 0.13 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13i -12.94 0.22 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13j -31.46 0.12 0 -FEP_CAT-4i_CAT-4d 38.58 0.18 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17g -7.52 0.15 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17f -8.36 0.10 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13d 98.66 0.12 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4k -23.69 0.06 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13a -16.20 0.21 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13m -101.14 0.14 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13a 5.90 0.16 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13b 10.26 0.09 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17e -25.49 0.10 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13b 5.18 0.30 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13m -88.61 0.20 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17f 4.69 0.15 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17e -5.35 0.20 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13i -4.05 0.12 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13h -3.91 0.24 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13g -7.32 0.15 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13a 4.62 0.12 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13f 33.35 0.13 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17a 3.36 0.13 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17f -17.85 0.10 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13f -0.72 0.18 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13k -36.68 0.18 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17e 4.17 0.15 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13f 19.65 0.16 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13e -10.34 0.25 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13n -110.18 0.12 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17e 3.43 0.15 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17d -20.07 0.11 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13d -10.87 0.11 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13i 2.68 0.15 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13o 12.22 0.16 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13f 19.90 0.10 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 28.66 0.03 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13f 29.26 0.24 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13f -0.17 0.13 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17i -8.87 0.13 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13o -17.21 0.17 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13b -8.12 0.15 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4b 29.53 0.12 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13k -29.59 0.18 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13c 4.66 0.29 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17e -26.03 0.10 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17h -0.07 0.14 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13a 15.78 0.15 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13d 1.40 0.11 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13n -80.11 0.11 0 -FEP_CAT-4c_CAT-24 -35.56 0.18 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4k -13.02 0.17 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17g -28.67 0.12 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13k -6.56 0.15 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17i -19.67 0.11 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13a -23.45 0.25 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 1.40 0.14 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13b -15.19 0.16 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13b 94.04 0.26 0 -FEP_CAT-17g_CAT-17d -11.20 0.08 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17a 10.22 0.08 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4c 18.07 0.20 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13h 37.03 0.10 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17e 12.91 0.12 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13f 36.45 0.21 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -9.62 0.09 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13i -2.93 0.12 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13d -1.17 0.07 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17c -31.87 0.11 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13a -24.47 0.13 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13k -17.77 0.15 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13e 19.23 0.29 0 -FEP_CAT-24_CAT-13i 23.55 0.15 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13i 25.68 0.12 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13g 2.18 0.20 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13f -9.58 0.36 0 -FEP_CAT-4a_CAT-24 -36.08 0.20 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4n -8.60 0.08 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4k -13.90 0.14 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13k -7.19 0.35 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4j -1.54 0.15 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13m -116.99 0.10 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17g 1.02 0.18 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17g -28.10 0.13 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4m -10.62 0.06 0 -FEP_CAT-4i_CAT-4a 38.57 0.07 0 -FEP_CAT-24_CAT-17b 27.45 0.13 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17e 4.05 0.11 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13k -20.27 0.19 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13a -22.64 0.21 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13d 28.28 0.10 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17f -60.60 0.15 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13b -38.13 0.21 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4a -22.29 0.09 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13o -16.83 0.23 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13c 13.17 0.12 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4i 4.36 0.10 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17i -38.62 0.15 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17d -61.67 0.10 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13b -6.49 0.11 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13a 19.34 0.16 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13e 20.77 0.30 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13g -6.61 0.45 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4c -23.36 0.14 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13h 33.89 0.29 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13j -63.20 0.22 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13b 14.38 0.22 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13g 33.84 0.22 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17d -10.31 0.15 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13c 23.09 0.27 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -61.14 0.08 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13d -2.62 0.10 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13b 0.50 0.18 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -2.73 0.14 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13i 26.23 0.24 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13c 8.76 0.17 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17h -9.12 0.12 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13i 16.28 0.18 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13c 12.07 0.18 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13n -92.82 0.11 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13f 10.98 0.17 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13e 107.35 0.32 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4c 0.01 0.31 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13g 8.57 0.17 1 -FEP_CAT-4j_CAT-13i 17.32 0.16 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13b 13.06 0.25 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4i -19.55 0.08 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17b 10.69 0.20 0 -FEP_CAT-4m_CAT-24 -6.75 0.11 0 -FEP_CAT-4i_CAT-4b 38.90 0.15 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13b -15.64 0.33 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13n -66.91 0.16 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13g 22.57 0.17 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13j -2.42 0.10 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17a 22.90 0.14 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17e -25.64 0.24 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4d 29.61 0.11 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17i -9.51 0.07 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13m -115.94 0.21 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13k -16.81 0.24 0 -FEP_CAT-4i_CAT-24 2.29 0.18 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13e 28.65 0.26 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 42.68 0.09 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4j -9.85 0.16 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17h 13.34 0.16 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13d 18.36 0.09 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13b -15.81 0.27 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13b 22.80 0.30 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13c 21.66 0.22 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4d 29.44 0.22 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13m -97.79 0.11 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13d 19.46 0.09 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17e -6.41 0.14 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17h 0.77 0.11 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13i 29.97 0.18 0 -FEP_CAT-4b_CAT-24 -36.65 0.10 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4d 19.38 0.12 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17d -9.05 0.10 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13g -29.65 0.20 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13d 18.00 0.09 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17f -7.93 0.15 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17i -39.07 0.18 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13k -16.04 0.31 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17a 13.86 0.21 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17i -17.94 0.19 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13f -9.66 0.18 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a -0.41 0.09 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4a 29.56 0.09 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17b -30.77 0.14 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4k -65.12 0.09 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13g 36.25 0.24 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13m -74.07 0.13 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13f -9.86 0.17 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13i 25.43 0.17 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4l 42.82 0.09 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13m -139.24 0.15 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13g -5.32 0.29 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13f -32.06 0.09 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13j -39.90 0.30 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17g -28.25 0.23 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17e 17.49 0.19 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13m -87.56 0.14 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13d -33.56 0.15 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13i -35.21 0.07 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13k -25.66 0.15 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17b 11.74 0.13 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13m -116.95 0.13 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13o 2.42 0.09 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17g -8.89 0.14 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4d 30.96 0.23 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13b 4.16 0.33 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4i -18.01 0.08 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17a 4.65 0.11 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13e 8.63 0.28 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4m -9.23 0.09 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13a -2.62 0.16 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4n -10.01 0.09 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17f -8.89 0.11 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13o 4.12 0.37 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13d 7.92 0.15 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m -0.47 0.15 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13e 10.30 0.21 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4i -9.70 0.11 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4d 20.71 0.12 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13k -27.12 0.27 0 -FEP_CAT-4o_CAT-24 -17.07 0.13 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13h 16.82 0.17 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4a 20.46 0.15 0 -FEP_CAT-4o_CAT-17c 9.59 0.12 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13m -87.85 0.12 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13g 12.19 0.19 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13n -90.70 0.11 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4a 19.08 0.07 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13h 25.23 0.22 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4l 41.48 0.09 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13j -21.79 0.22 0 -FEP_CAT-4o_CAT-13i 6.17 0.17 0 -FEP_CAT-4n_CAT-24 -7.28 0.10 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4c 28.25 0.12 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13d 9.65 0.12 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4k -22.42 0.12 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13j -19.70 0.28 0 -FEP_CAT-4n_CAT-13a 5.63 0.37 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13i 7.92 0.21 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17h -0.36 0.08 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17i -39.19 0.19 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4b 21.02 0.07 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13c -3.54 0.05 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17a 14.04 0.16 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13a 6.18 0.11 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13b -4.22 0.12 0 -FEP_CAT-24_CAT-13b 20.78 0.26 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13a -13.83 0.31 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17c 20.11 0.08 0 -FEP_CAT-24_CAT-17a 20.84 0.16 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13d 4.53 0.06 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13e 28.21 0.42 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13e 35.69 0.37 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13f -6.32 0.22 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13h 106.05 0.17 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13d 27.42 0.10 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13c 2.67 0.11 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13a -7.74 0.14 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13b -6.04 0.25 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13d -4.52 0.14 0 -FEP_CAT-17d_CAT-17c 29.90 0.14 0 -FEP_CAT-24_CAT-13g 29.44 0.21 0 -FEP_CAT-17g_CAT-17f -9.90 0.09 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13e 6.89 0.35 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13j -2.46 0.08 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13g 20.99 0.14 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13e 19.44 0.31 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13m -108.47 0.14 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13d 30.41 0.11 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13b -7.91 0.26 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13o 11.77 0.12 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13o 22.62 0.12 0 -FEP_CAT-24_CAT-17g 8.15 0.21 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13b -5.24 0.32 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17e 13.05 0.13 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13d -1.23 0.15 0 -FEP_CAT-17d_CAT-17a 23.77 0.16 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13a -7.45 0.20 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13i 3.67 0.22 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -0.90 0.14 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13e -1.59 0.24 0 -FEP_CAT-17b_CAT-17a -7.11 0.09 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13f 29.69 0.12 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13c 2.13 0.11 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13n -80.44 0.12 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13n -100.24 0.12 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13n -71.66 0.17 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j 5.34 0.18 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13m -78.41 0.23 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13b 0.71 0.25 0 -FEP_CAT-24_CAT-13c 29.04 0.17 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13a 14.75 0.08 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -1.15 0.16 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13j -12.95 0.16 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13f 107.23 0.17 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13g 23.50 0.39 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13b -14.37 0.23 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4b -21.69 0.18 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13d -11.90 0.17 0 -FEP_CAT-17g_CAT-17e 2.41 0.14 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13n -84.17 0.08 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17c 33.15 0.23 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13h 24.09 0.15 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 27.23 0.08 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13h 21.79 0.14 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4c 28.90 0.16 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13d -10.80 0.16 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13d -1.04 0.36 0 -FEP_CAT-24_CAT-13k -9.72 0.20 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13j -25.67 0.10 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17h 9.21 0.10 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17b -8.38 0.22 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13j -41.14 0.30 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13g 6.53 0.26 0 -FEP_CAT-24_CAT-13o 19.18 0.20 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17d -13.97 0.10 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13b 25.82 0.21 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13b 24.16 0.18 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17f -8.58 0.06 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b 16.98 0.11 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13h 38.74 0.14 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13b 27.72 0.26 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13g -7.38 0.25 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17c -8.55 0.20 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17f 0.41 0.17 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13i 15.48 0.11 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17d 3.41 0.16 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13a 22.94 0.10 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4b 30.98 0.12 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13c 109.79 0.16 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13e 15.16 0.22 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4l 52.07 0.14 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13g 31.82 0.20 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13i 28.38 0.20 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13a -10.72 0.19 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13o -6.90 0.15 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13j -40.71 0.25 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b 1.24 0.21 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13h 12.11 0.15 0 -FEP_CAT-4k_CAT-24 6.68 0.15 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13e 19.59 0.24 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13o 12.87 0.14 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 10.37 0.12 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13m -117.45 0.08 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13c 22.12 0.46 0 -FEP_CAT-24_CAT-13n -73.14 0.11 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17f 0.57 0.16 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13e 30.86 0.33 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13k -36.96 0.16 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13g 18.85 0.19 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13f 100.34 0.20 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13j -11.08 0.23 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -0.76 0.11 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17h -30.06 0.18 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13i 16.81 0.16 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13d 31.91 0.11 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13g 1.86 0.18 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13c -30.05 0.42 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13n -131.87 0.11 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13c 3.86 0.23 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13h -26.38 0.13 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13c 102.77 0.11 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13j 1.82 0.18 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17g -27.21 0.18 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17g 10.50 0.08 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17c 29.14 0.09 0 -FEP_CAT-24_CAT-17c 26.81 0.16 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13g 109.82 0.14 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13a -16.83 0.29 1 -FEP_CAT-17h_CAT-13c 22.35 0.13 0 -FEP_CAT-17c_CAT-17b 1.15 0.18 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13n -70.58 0.08 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13f 6.52 0.13 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13i 27.07 0.27 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13b -2.44 0.14 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17d -1.19 0.09 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -2.24 0.17 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17h 9.04 0.16 0 -FEP_CAT-24_CAT-13d 24.90 0.17 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13d 5.28 0.18 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13a -14.83 0.16 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13o 12.91 0.11 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13m -107.49 0.17 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13g 40.00 0.24 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4a 1.01 0.10 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17e -48.05 0.16 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13f 6.09 0.19 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13k -45.89 0.29 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13b 23.30 0.24 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13j -24.41 0.08 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13d -7.08 0.17 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13d -10.53 0.20 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13a -7.11 0.09 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13g 31.83 0.16 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17b -9.20 0.12 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17g 14.70 0.19 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13k -16.52 0.10 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4c 42.01 0.11 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13m -87.29 0.12 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13c 20.88 0.16 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13o 21.98 0.13 0 -FEP_CAT-24_CAT-17e 10.46 0.09 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13d 14.28 0.10 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13c 1.38 0.15 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4b 0.39 0.14 0 -FEP_CAT-24_CAT-13a 12.75 0.21 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13c 18.66 0.16 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17a 22.72 0.14 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13k -3.08 0.35 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13e 3.66 0.33 0 -FEP_CAT-17g_CAT-17c 18.71 0.07 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13o -39.27 0.16 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17d -40.23 0.15 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17a 14.49 0.13 0 -FEP_CAT-13j_CAT-13c 34.05 0.12 0 -FEP_CAT-4b_CAT-17f -38.56 0.21 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13b 101.10 0.23 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 1.24 0.08 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13a 2.21 0.13 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13a 7.01 0.20 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13o 21.52 0.18 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17d -9.69 0.13 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13o -8.09 0.12 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13f 28.50 0.10 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13j -11.26 0.16 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13d 18.36 0.12 0 -FEP_CAT-17d_CAT-17b 30.96 0.15 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13a 86.13 0.14 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13h 25.59 0.27 0 -FEP_CAT-4k_CAT-17b 34.39 0.21 0 -FEP_CAT-24_CAT-13j -5.24 0.19 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13b 30.29 0.10 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13o -16.51 0.16 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13h 34.94 0.21 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4j 12.61 0.07 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13a -13.93 0.10 0 -FEP_CAT-17g_CAT-17a 12.42 0.16 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13a -14.64 0.29 0 -FEP_CAT-24_CAT-17i -2.45 0.07 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13h -4.18 0.22 0 -FEP_CAT-4l_CAT-13a -45.79 0.24 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13k 63.38 0.10 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17b 29.73 0.15 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13e 4.86 0.20 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17c -9.41 0.08 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13i 16.92 0.10 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13j -41.15 0.19 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13j -16.07 0.15 0 -FEP_CAT-17i_CAT-13e 28.31 0.41 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13i 96.51 0.10 0 -FEP_CAT-17c_CAT-17a -6.13 0.10 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13h 8.58 0.16 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13c -0.06 0.20 0 -FEP_CAT-4m_CAT-17c 20.09 0.22 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17g -50.66 0.12 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13m -86.72 0.17 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13g 32.55 0.25 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13e -9.42 0.22 0 -FEP_CAT-17e_CAT-13o 8.81 0.11 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13f 3.85 0.23 0 -FEP_CAT-4i_CAT-13m -78.28 0.13 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13i 32.82 0.12 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13g 9.73 0.18 0 -FEP_CAT-24_CAT-17d -3.27 0.22 0 -FEP_CAT-4m_CAT-13f 20.10 0.24 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13c -7.58 0.46 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17b 30.12 0.14 0 -FEP_CAT-4k_CAT-13c 35.02 0.49 0 -FEP_CAT-4i_CAT-4c 37.52 0.11 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4i -8.84 0.19 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13c 32.29 0.07 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13e 28.91 0.27 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13h 26.22 0.11 0 -FEP_CAT-13o_CAT-13m -100.48 0.09 0 -FEP_CAT-4p_CAT-24 -15.90 0.17 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13h -4.72 0.20 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13n -110.13 0.13 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13e -7.46 0.12 0 -FEP_CAT-4d_CAT-13e -10.35 0.35 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13c -7.55 0.16 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4j -52.88 0.05 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13k -46.13 0.22 0 -FEP_CAT-17h_CAT-13g 22.21 0.19 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17b 29.99 0.09 0 -FEP_CAT-17d_CAT-13h 35.40 0.14 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13f -8.46 0.41 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13f 18.20 0.21 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4c 29.60 0.11 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13c 30.75 0.15 0 -FEP_CAT-4a_CAT-13c -7.31 0.09 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17d -39.31 0.17 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13j -2.82 0.21 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4a 30.41 0.09 0 -FEP_CAT-4c_CAT-13o -15.61 0.12 0 -FEP_CAT-4c_CAT-17i -37.55 0.22 0 -FEP_CAT-24_CAT-13f 26.79 0.20 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17a -15.69 0.13 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17b -9.02 0.22 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13n -81.70 0.08 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13h 5.20 0.08 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13k -7.43 0.18 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13c 4.01 0.10 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13g 13.83 0.11 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13k -30.27 0.21 0 -FEP_CAT-17g_CAT-13e 17.92 0.36 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17e 4.73 0.20 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17g 2.19 0.12 0 -FEP_CAT-4b_CAT-13i -13.08 0.21 0 -FEP_CAT-4d_CAT-17h -29.53 0.20 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13k -15.16 0.24 0 -FEP_CAT-4l_CAT-17i -61.18 0.11 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17e 13.07 0.10 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13o 13.61 0.11 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13b 14.51 0.42 0 -FEP_CAT-4a_CAT-17h -29.53 0.13 0 -FEP_CAT-4i_CAT-17c 29.29 0.08 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index e66087b1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/no-vs/2fs/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_CAT-13b-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4b-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13b/ 1 -FEP_CAT-4c-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4d-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13d/ 2 -FEP_CAT-4i-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13a/ 1 -FEP_CAT-4k-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13c/ 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13e/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13f/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13g/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13h/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13j/ 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17b-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-24-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4a-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4b-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13k/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13m/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13o/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17e/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17f/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17g/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17h/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-24/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4a/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4b/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4c/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4d/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4i/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4j/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4k/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4l/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4m/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4n/ 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4o/ 0 \ No newline at end of file diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/protein.txt deleted file mode 100755 index bb347e1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-4c-CAT-17h -31.21 0.74 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13i 7.26 0.31 0 -FEP_CAT-24-CAT-17g 11.96 0.36 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13j -26.35 0.16 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13b -3.90 0.27 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4d 35.71 0.21 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17i 2.83 0.26 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4b -0.14 0.13 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13o 23.71 0.55 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13e 4.74 0.30 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17a 25.50 0.53 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13h 36.60 0.64 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13e -0.83 0.53 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13d -12.37 0.65 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17i -36.01 0.58 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13n -71.40 0.43 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13f 10.13 0.53 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17c -7.56 0.25 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13j -10.93 0.27 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17d -38.65 0.24 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13d 21.09 0.59 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17e 2.80 0.42 0 -FEP_CAT-24-CAT-13k -10.61 0.70 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13o 10.71 0.48 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13n -78.71 0.23 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13n -68.65 0.35 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4j 10.01 0.16 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4d 27.55 0.33 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13h 39.16 0.98 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13g -6.75 0.57 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13c 1.27 0.30 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13b -2.18 0.26 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13a -22.78 1.08 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13a 95.03 0.37 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13e 30.02 0.58 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13n -79.42 0.35 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13c -7.30 1.22 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13g -5.03 0.49 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13f 18.25 0.46 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13j -42.03 0.23 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13n -106.72 0.40 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13e 7.80 0.58 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13h 9.85 1.07 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4i -8.08 0.34 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4l 41.77 0.22 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4j 1.03 0.23 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4k -10.49 0.45 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17a -17.89 0.74 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4j 0.53 0.22 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17f -39.03 0.50 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17f -15.39 0.31 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17h -27.82 0.43 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13j -39.11 0.12 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13n -80.96 0.42 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17a 10.46 0.32 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13i 10.44 0.29 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17e -27.46 0.33 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13f 30.22 0.64 0 -FEP_CAT-24-CAT-13a 16.23 0.42 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13n -86.76 0.11 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17e 2.32 0.36 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13a -1.71 0.22 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13b -8.78 0.65 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13i -13.16 0.51 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17c 30.43 0.38 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13c 35.16 0.50 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13k -37.12 0.41 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13i 14.45 0.46 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17d -39.19 0.38 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13a 15.21 0.36 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13f 13.65 0.66 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13b 24.37 0.51 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17c 13.68 0.35 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4a 30.53 0.16 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17g 3.05 0.25 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17g 11.20 0.39 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13h 32.25 0.82 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13g 24.81 0.34 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4n -11.28 0.21 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4c 32.65 0.56 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13e 25.93 0.40 0 -FEP_CAT-4p-CAT-24 -14.58 0.69 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13g 36.47 0.42 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17f -35.38 0.29 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13n -77.91 0.30 0 -FEP_CAT-17b-CAT-17a -6.99 0.50 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17e 11.41 0.12 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13h 29.26 1.12 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13k -16.33 0.29 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13g -1.58 0.40 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13o -15.35 0.74 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17a 10.46 0.48 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13c -2.90 0.46 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13a 15.18 0.49 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13g 104.30 0.46 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13a 15.02 0.17 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13n -98.51 0.44 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13d 0.46 0.72 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13m -103.46 0.39 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13i -9.75 0.45 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17c -6.72 0.31 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13f 0.56 0.23 0 -FEP_CAT-4n-CAT-24 -7.04 0.32 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13h 19.75 0.75 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13a -46.60 0.24 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13f 22.18 0.27 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13c -6.82 0.38 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17c 20.85 0.26 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17h -52.64 0.40 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17b -6.77 0.46 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13k -8.73 0.36 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17h -0.53 0.23 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13c 3.46 0.84 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4m -8.65 0.12 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17e 10.52 0.32 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13g -4.74 0.38 1 -FEP_CAT-24-CAT-13d 27.35 0.31 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13b 12.02 0.28 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13j -14.53 0.37 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13e -4.86 0.45 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13b 1.81 0.52 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4j -11.19 0.12 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13i 26.60 0.41 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4b 37.83 0.12 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17i -34.75 0.52 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17h -0.49 0.32 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13m -141.37 0.33 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13b -3.30 0.35 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13c 6.85 0.21 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13g 33.37 0.52 1 -FEP_CAT-17b-CAT-13i -2.99 0.48 1 -FEP_CAT-4c-CAT-13b -15.12 0.73 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13h 13.56 0.51 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17h -27.87 0.29 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13f 30.02 0.52 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17c 17.49 0.58 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13m -108.29 0.48 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13c 10.38 0.55 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13i -35.30 0.15 1 -FEP_CAT-4m-CAT-13k -15.51 0.27 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17i -5.77 0.40 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13d -9.96 0.53 1 -FEP_CAT-4m-CAT-13o 15.98 0.16 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13k -19.47 0.34 1 -FEP_CAT-4a-CAT-13h 1.42 0.82 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17d 0.76 0.45 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13b -5.58 0.39 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13f -31.33 0.48 1 -FEP_CAT-4k-CAT-17f 2.43 0.33 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17e -23.22 0.30 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13o 21.49 0.41 1 -FEP_CAT-4p-CAT-17i -16.57 0.46 1 -FEP_CAT-4b-CAT-13e -7.76 0.52 4 -FEP_CAT-17d-CAT-13a 15.18 0.30 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4l 54.62 0.33 1 -FEP_CAT-13m-CAT-13h 118.07 0.74 2 -FEP_CAT-4m-CAT-13b 17.24 0.39 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13o 3.36 0.28 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17b 21.21 0.28 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17i -7.96 0.63 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13k -8.19 0.31 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13d 30.09 0.73 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13m -78.29 0.25 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13c 21.13 0.45 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4i -15.67 0.22 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13j -30.86 0.22 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17h -11.04 0.44 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13k -7.96 0.38 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13h 30.99 0.78 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13h 24.05 0.51 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17g 3.02 0.34 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13j -39.05 0.41 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13b 5.14 0.26 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13a 23.40 0.59 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13f 100.62 0.56 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13e -12.33 0.68 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13k -46.83 0.18 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13f 3.27 0.18 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13h 35.97 0.65 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13n -69.85 0.58 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13m -88.29 0.38 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13h 48.88 0.78 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13h 14.65 1.04 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13h 5.14 0.73 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13c -5.42 0.34 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17g 13.28 0.28 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4k -21.71 0.19 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4b -4.08 0.47 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13e 15.22 0.29 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17h 1.10 0.37 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4m -0.91 0.24 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13n -93.45 0.33 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17g 3.46 0.15 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13g 34.21 0.35 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13n -92.01 0.49 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13o -5.84 0.67 0 -FEP_CAT-4a-CAT-24 -39.03 0.46 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17b 17.14 0.43 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17f 0.57 0.40 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13i 28.21 0.25 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13k -16.61 0.30 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13k -48.62 0.45 0 -FEP_CAT-24-CAT-17e 11.36 0.29 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13a -8.34 0.67 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17b 22.26 0.52 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13i 17.93 0.25 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17b 30.67 0.50 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17e -27.61 0.67 0 -FEP_CAT-4d-CAT-24 -34.31 0.45 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13g -27.22 0.56 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4i -18.94 0.31 0 -FEP_CAT-4i-CAT-24 0.05 0.39 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13j -3.87 0.67 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13j -18.85 0.30 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13m -88.41 0.37 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4i 1.71 0.23 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13d 19.35 0.69 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17a -6.77 0.37 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4c -21.50 0.55 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13g 17.41 0.47 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17c 9.23 0.33 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17b 9.14 0.49 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13o 14.61 0.26 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13g 35.52 0.38 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17e 4.87 0.44 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4c 24.65 0.39 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13m -87.62 0.17 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13e 19.00 0.21 0 -FEP_CAT-4l-CAT-24 -60.22 0.34 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13d -34.13 0.68 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13k -5.87 0.25 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13c 17.17 0.73 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17h -7.81 0.33 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4b 20.13 0.21 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13d 7.35 0.73 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17a -38.76 0.52 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13n -132.16 0.31 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13e 19.82 0.62 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17f -61.02 0.35 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17e -4.22 0.57 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17a 14.93 0.43 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13o -38.47 0.16 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13c 14.18 0.27 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17d -18.75 0.39 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13i 17.97 0.34 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17h 9.95 0.33 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13g 25.98 0.43 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4b -25.68 0.20 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4j -53.04 0.22 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17f -19.16 0.24 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13o 25.07 0.30 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4b 29.28 0.36 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13f 22.09 0.49 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17e -49.78 0.70 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4d -26.12 0.33 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13c -28.29 0.23 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13k -28.22 0.17 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13a 17.98 0.29 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13d 11.94 0.70 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4i -7.16 0.27 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4c 41.72 0.41 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17d -7.51 0.29 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13j -9.92 0.39 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17i -18.46 0.40 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4i -60.71 0.12 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4o 3.59 0.19 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13k -23.88 0.29 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17e -7.71 0.42 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17a 13.47 0.85 0 -FEP_CAT-4m-CAT-24 -6.28 0.50 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17b -31.48 0.44 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13a 7.98 0.42 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13e 29.89 0.39 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17f -6.52 0.40 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13b -36.00 0.23 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4a -22.09 0.24 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13h 20.41 0.94 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13n -89.80 0.34 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13c 25.94 0.52 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13o 7.70 0.18 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4b 16.74 0.18 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13b 26.83 0.23 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17g -4.50 0.29 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4d 37.67 0.40 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13i 19.32 0.27 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4a 31.43 0.14 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13f 32.26 0.31 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13f 20.59 0.39 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17d -60.76 0.36 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13j -0.92 0.28 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17f -7.79 0.39 0 -FEP_CAT-4k-CAT-24 1.71 0.42 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17c 20.91 0.18 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17a 5.74 0.69 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13e 10.34 0.27 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4k -63.15 0.39 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4a 41.05 0.16 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13c 25.48 0.38 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4c 20.22 0.38 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13j -22.47 0.21 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13a 6.96 0.22 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4b 27.92 0.30 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17d -16.06 0.23 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4j -7.16 0.25 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13j -64.53 0.33 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13b 16.66 0.36 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17i -60.20 0.54 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4l 53.13 0.36 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17a 3.87 0.27 1 -FEP_CAT-4o-CAT-4d 16.16 0.20 1 -FEP_CAT-4l-CAT-13k -69.75 0.38 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4n -7.80 0.13 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13g 13.69 0.50 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4m -12.00 0.13 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13a -4.45 0.38 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13h 31.15 1.01 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13m -99.13 0.37 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13e -33.35 0.45 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17g 3.96 0.29 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13h 41.30 0.90 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17d -8.56 0.43 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17e 3.20 0.22 2 -FEP_CAT-4m-CAT-17c 22.08 0.24 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13m -96.40 0.24 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4a 19.43 0.17 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13n -77.83 0.26 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13h 40.28 0.93 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17d 1.56 0.42 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4c 31.82 0.82 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17f -37.80 0.25 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13m -80.76 0.21 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13a 84.96 0.21 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13o -13.04 0.25 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4d 20.65 0.23 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13d -1.86 0.23 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13b -4.95 0.30 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13c 35.66 0.49 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13d 98.18 0.74 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13e 1.51 0.32 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17e 12.83 0.56 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13h -21.38 1.00 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4a 23.08 0.22 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13g 25.20 0.29 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4k -18.08 0.26 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13d 28.74 0.55 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13d -9.57 0.84 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17i -7.03 0.40 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13a -18.86 0.29 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13d 5.34 0.20 0 -FEP_CAT-24-CAT-17f 0.13 0.52 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13f 29.82 0.63 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13c 113.69 0.27 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4l 45.21 0.27 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4a 30.29 0.29 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17b 20.62 0.50 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13j -42.38 0.49 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17a 21.55 0.09 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17f -10.76 0.28 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13b 8.60 0.30 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13o 22.02 0.52 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13j -31.45 0.41 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13m -80.49 0.48 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13k -16.38 0.35 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13a -5.34 0.62 0 -FEP_CAT-4o-CAT-24 -19.94 0.57 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13f 32.22 0.31 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17g -7.96 0.31 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13j -3.04 0.24 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17d -36.91 0.52 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17g -49.50 0.30 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13a -11.96 0.51 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17b 28.85 0.39 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17b 13.50 0.55 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13g 112.93 0.24 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4d 28.46 0.26 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13k 62.03 0.34 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4k -9.12 0.28 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13k -31.38 0.38 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13k -44.64 0.39 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17e 10.66 0.30 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17c -32.09 0.42 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13i 15.52 0.29 0 -FEP_CAT-24-CAT-13n -70.30 0.70 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13i 25.98 0.47 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13b 24.25 0.24 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17b -6.61 0.52 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13a -22.13 0.75 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17a -13.02 0.56 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17i -38.94 0.62 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13e -0.66 0.60 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13a -21.61 0.55 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17i -0.60 0.68 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13k -45.10 0.17 0 -FEP_CAT-13b-CAT-13a -9.16 0.28 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17b 28.46 0.61 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13b -17.22 0.66 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17h 8.42 0.42 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17b 29.62 0.41 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13f -9.54 0.77 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13f 19.34 0.38 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17c -10.58 0.62 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13j -3.09 0.25 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17f -35.63 0.35 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13m -91.15 0.42 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17b 28.38 0.31 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13e -14.23 0.86 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13f -10.47 0.23 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13b 33.32 0.48 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13m -116.78 0.27 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13c 5.35 0.47 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13o -12.84 0.45 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17c 28.90 0.27 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13c 102.78 0.43 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13d 15.77 0.56 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13g 21.50 0.45 0 -FEP_CAT-24-CAT-17i 0.18 0.29 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13o 15.20 0.40 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13a -13.71 0.26 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13g 7.48 0.35 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13e -9.52 0.31 0 -FEP_CAT-24-CAT-13c 32.64 0.44 0 -FEP_CAT-24-CAT-13g 34.25 0.69 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13d 27.00 0.28 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13d -1.68 0.27 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13g 21.30 0.57 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13f -9.09 0.83 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13m -9.92 0.27 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13a 6.63 0.22 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13j 5.38 0.21 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13j -11.07 0.19 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13a -10.35 0.70 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4b 36.06 0.22 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17d -11.14 0.24 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17a 22.10 0.51 0 -FEP_CAT-24-CAT-17b 28.98 0.28 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13n -106.82 0.27 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17a -16.20 0.61 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13m -108.83 0.48 0 -FEP_CAT-24-CAT-17c 29.21 0.72 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13b 105.12 0.32 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13i -12.69 0.32 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17d -0.33 0.33 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13c 25.40 0.30 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13o 14.08 0.40 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13e 19.44 0.37 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13b 16.71 0.53 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13k 72.26 0.14 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13n -99.27 0.33 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13n -71.20 0.40 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13e 26.85 0.47 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13i -3.01 0.18 0 -FEP_CAT-4b-CAT-24 -35.97 0.69 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4a 2.20 0.33 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13j 67.46 0.28 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13f -6.23 0.56 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13e -11.31 0.39 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17f -7.85 0.34 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13d 35.23 0.53 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13n -109.94 0.22 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13m -119.59 0.56 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13c 4.01 0.20 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17g -27.11 0.40 0 -FEP_CAT-4b-CAT-4a 2.94 0.13 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13n -109.90 0.39 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13d 19.46 0.40 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13j -2.84 0.42 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4d 27.72 0.22 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13f 20.78 0.35 0 -FEP_CAT-24-CAT-13h 36.98 0.60 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13h 40.24 0.86 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13k -18.77 0.44 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17d -7.98 0.25 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13b 94.28 0.24 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13e 27.82 0.58 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13b -14.07 0.27 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13i 96.25 0.26 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13f 8.25 0.77 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13c 4.58 0.60 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13k -30.10 0.55 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13i 3.94 0.38 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13j -13.17 0.67 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13c 25.03 0.34 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13c 22.31 0.29 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13j -10.42 0.39 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13e 4.29 0.52 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13g 25.53 0.54 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13m -116.29 0.31 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13h 14.56 0.95 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17c 17.87 0.21 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13m -118.84 0.34 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13m -87.79 0.33 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13g -1.89 0.44 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13h 107.70 1.13 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13f -3.60 0.23 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13g 4.07 0.15 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17a 14.47 0.47 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13d 18.14 0.72 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13c 32.93 0.24 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13e 26.69 0.76 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17b -9.78 0.55 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17d 0.02 0.26 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17g -25.21 0.30 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17c 29.14 0.46 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13e 18.90 0.18 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17f -7.69 0.14 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13a -24.64 0.68 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13i -9.98 0.41 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13b 23.11 0.46 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13d -6.75 0.77 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13c 32.64 0.32 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13i 34.95 0.43 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13i 25.75 0.45 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13e 17.06 0.52 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13i 25.64 0.21 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13h 4.32 0.71 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13i 106.29 0.33 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13o -15.89 0.28 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13o 12.74 0.57 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13d 107.69 0.43 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13f 35.74 0.70 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17d -35.29 0.30 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13m -90.27 0.45 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17a 22.05 0.42 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13e 34.42 0.39 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13d 3.43 0.48 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13e 106.26 0.41 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13e -2.39 0.31 0 -FEP_CAT-24-CAT-17a 22.34 0.50 0 -FEP_CAT-24-CAT-13o 22.25 0.67 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13d 26.76 0.55 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13g 34.16 0.52 0 -FEP_CAT-24-CAT-17h 8.94 0.31 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13b 24.24 0.25 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13n -70.97 0.43 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17a 13.32 0.61 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13g 3.91 0.51 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17h -31.06 0.24 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13k -36.98 0.40 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13b -11.10 0.35 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17e -0.40 0.33 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17d -11.12 0.17 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13i 28.49 0.37 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13a -12.01 0.44 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13o 0.63 0.43 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17a 21.07 0.61 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17c 29.00 0.33 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13f 1.44 0.75 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13m -80.77 0.36 0 -FEP_CAT-24-CAT-13i 25.32 0.43 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13h 28.67 0.82 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13c 7.19 0.23 0 -FEP_CAT-24-CAT-13j -2.93 0.73 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13f 109.02 0.38 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13a 3.60 0.34 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4b 28.05 0.22 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13h 7.83 0.40 0 -FEP_CAT-4j-CAT-24 -8.86 0.75 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13j 77.31 0.39 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17d -7.60 0.19 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4c 39.16 0.52 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4c 31.15 0.41 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17c 28.40 0.25 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13a 6.99 0.29 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13a 17.44 0.19 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13b 12.89 0.28 0 -FEP_CAT-4c-CAT-24 -37.76 0.79 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13o 23.22 0.13 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13j -24.02 0.83 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17g 12.04 0.62 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17i -38.93 0.56 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13g 11.74 0.38 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17g -27.25 0.13 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17e -24.07 0.54 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13f -6.40 0.69 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13c -3.54 0.59 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17b 20.93 0.58 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13d 26.95 0.26 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13b 16.31 0.15 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13k -9.06 0.27 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13c 10.64 0.35 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17c 21.13 0.20 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13g 32.47 0.31 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13b 27.24 0.24 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13d -3.01 0.70 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13d -14.47 0.68 0 -FEP_CAT-24-CAT-17d -0.32 0.59 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13d 27.13 0.33 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13o -6.92 0.37 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17h 7.95 0.27 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17b 17.44 0.13 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13b -4.51 0.16 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13b 1.13 0.41 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13b -11.22 0.33 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13i 2.51 0.27 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13g 12.32 0.83 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13c 41.29 0.38 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13d -10.09 0.48 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4a 0.49 0.27 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4i -8.45 0.23 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17c -9.64 0.48 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13d 15.48 0.28 0 -FEP_CAT-24-CAT-13f 29.88 0.95 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13a -14.27 0.64 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13a -16.80 0.50 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4a 38.78 0.23 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13m -79.95 0.63 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17g -24.66 0.35 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13g 40.63 0.47 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13m -102.03 0.58 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13f 28.83 0.13 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13e 97.60 0.43 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17f 0.62 0.28 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13a -12.12 0.43 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4c 4.72 0.34 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17b -0.58 0.58 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13f 6.01 0.65 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17b -9.28 0.58 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13d 1.70 0.40 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13a -24.13 0.22 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13h -1.52 1.05 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13n -80.88 0.54 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13b -8.74 0.26 0 -FEP_CAT-24-CAT-13b 24.07 0.47 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13c 33.10 0.37 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13c 32.98 0.20 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13i 17.96 0.37 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13a 4.13 0.64 0 -FEP_CAT-24-CAT-13e 25.69 0.53 0 -FEP_CAT-24-CAT-13m -79.36 0.75 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17a -13.00 0.66 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/water.txt deleted file mode 100755 index cb757570..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/1.BACE/water.txt +++ /dev/null @@ -1,631 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-4l-CAT-17a -37.58 0.27 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17f -38.15 0.21 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13a -12.44 0.14 0 -FEP_CAT-24-CAT-13e 26.28 0.34 0 -FEP_CAT-24-CAT-13m -80.87 0.13 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13m -7.04 0.13 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17e -24.84 0.30 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13n -80.78 0.13 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13f 31.21 0.15 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13i -11.53 0.18 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4c 19.91 0.15 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13m -78.82 0.11 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17a -16.37 0.17 0 -FEP_CAT-4l-CAT-24 -58.76 0.20 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4j -11.18 0.07 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17d -0.71 0.13 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17b 21.81 0.10 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13g -3.94 0.17 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13a -19.38 0.22 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13k -68.70 0.23 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17a 22.90 0.08 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13n -108.75 0.16 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13e 99.80 0.38 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13e -32.48 0.23 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17c 21.06 0.15 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13k -7.03 0.12 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17h -28.51 0.15 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13j -32.64 0.16 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13h -3.32 0.33 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13n -94.09 0.10 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13k -46.41 0.34 0 -FEP_CAT-24-CAT-13h 32.65 0.20 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17c 19.72 0.13 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13a 17.59 0.19 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17d -39.76 0.26 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4a 28.95 0.20 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17g 1.54 0.13 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13o -0.99 0.13 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17f -18.85 0.25 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13h 12.09 0.09 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13f 20.90 0.19 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4i -8.47 0.11 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13d 35.34 0.12 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13g 30.77 0.21 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4a -0.30 0.12 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17a 26.96 0.14 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17b 20.91 0.09 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13h 35.06 0.14 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13i 12.84 0.19 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13b -11.14 0.18 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13j -1.75 0.12 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13f 29.20 0.13 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13a -23.62 0.30 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4b 19.39 0.10 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13i -12.76 0.15 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17i 0.18 0.19 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13h 14.99 0.13 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17b 20.91 0.13 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4l 51.64 0.18 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13m -91.35 0.13 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17d -18.78 0.12 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13f 9.59 0.19 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4d -22.11 0.19 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13k 71.16 0.31 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13b 23.15 0.20 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13b 14.17 0.26 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17c 15.79 0.14 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13b 12.88 0.18 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17h -10.25 0.10 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17f -38.31 0.18 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13n -71.00 0.16 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17c 10.79 0.13 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13n -79.27 0.12 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13j -10.65 0.16 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13d 105.79 0.11 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13i 103.82 0.20 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13m -77.67 0.13 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13k -44.87 0.32 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13j 68.74 0.17 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13h 41.68 0.25 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17h -52.31 0.13 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13c 9.17 0.20 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13g 22.69 0.19 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13e -3.95 0.19 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17i 4.26 0.20 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13b -5.26 0.11 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4b 30.21 0.12 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13c -6.46 0.21 0 -FEP_CAT-4j-CAT-24 -5.68 0.21 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13e 32.73 0.34 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13a -4.17 0.21 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13h 25.58 0.09 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17a 13.51 0.13 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17c -10.09 0.25 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13g 102.72 0.11 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13f 16.14 0.24 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13o 25.98 0.08 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13h 112.86 0.15 0 -FEP_CAT-24-CAT-17h 6.63 0.14 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13j -11.79 0.27 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17b 19.78 0.19 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13n -100.73 0.12 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13n -109.71 0.14 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17a -16.11 0.26 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17b 20.65 0.20 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4b 43.46 0.15 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13h 5.51 0.11 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17i -8.38 0.13 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4d 43.01 0.20 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13n -89.25 0.13 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13m -96.57 0.08 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13c 31.42 0.22 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13a 15.15 0.09 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17c -10.00 0.15 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17b -8.59 0.14 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13d 17.17 0.09 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17d -38.37 0.20 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13d 27.63 0.14 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13c 39.32 0.15 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17f -37.52 0.23 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13o 21.69 0.12 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13j 75.90 0.20 0 -FEP_CAT-4d-CAT-24 -35.48 0.17 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13a 15.00 0.13 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13e -10.42 0.31 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13a 93.87 0.20 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17a -14.65 0.15 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13e -1.04 0.22 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13n -71.02 0.09 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13c 31.65 0.13 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13i -12.94 0.22 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13j -31.46 0.12 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4d 38.58 0.18 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17g -7.52 0.15 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17f -8.36 0.10 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13d 98.66 0.12 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4k -23.69 0.06 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13a -16.20 0.21 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13m -101.14 0.14 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13a 5.90 0.16 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13b 10.26 0.09 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17e -25.49 0.10 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13b 5.18 0.30 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13m -88.61 0.20 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17f 4.69 0.15 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17e -5.35 0.20 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13i -4.05 0.12 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13h -3.91 0.24 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13g -7.32 0.15 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13a 4.62 0.12 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13f 33.35 0.13 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17a 3.36 0.13 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17f -17.85 0.10 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13f -0.72 0.18 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13k -36.68 0.18 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17e 4.17 0.15 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13f 19.65 0.16 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13e -10.34 0.25 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13n -110.18 0.12 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17e 3.43 0.15 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17d -20.07 0.11 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13d -10.87 0.11 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13i 2.68 0.15 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13o 12.22 0.16 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13f 19.90 0.10 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17c 28.66 0.03 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13f 29.26 0.24 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13f -0.17 0.13 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17i -8.87 0.13 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13o -17.21 0.17 0 -FEP_CAT-13c-CAT-13b -8.12 0.15 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4b 29.53 0.12 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13k -29.59 0.18 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13c 4.66 0.29 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17e -26.03 0.10 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17h -0.07 0.14 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13a 15.78 0.15 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13d 1.40 0.11 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13n -80.11 0.11 0 -FEP_CAT-4c-CAT-24 -35.56 0.18 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4k -13.02 0.17 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17g -28.67 0.12 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13k -6.56 0.15 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17i -19.67 0.11 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13a -23.45 0.25 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4o 1.40 0.14 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13b -15.19 0.16 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13b 94.04 0.26 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17d -11.20 0.08 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17a 10.22 0.08 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4c 18.07 0.20 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13h 37.03 0.10 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17e 12.91 0.12 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13f 36.45 0.21 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17d -9.62 0.09 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13i -2.93 0.12 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13d -1.17 0.07 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17c -31.87 0.11 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13a -24.47 0.13 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13k -17.77 0.15 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13e 19.23 0.29 0 -FEP_CAT-24-CAT-13i 23.55 0.15 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13i 25.68 0.12 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13g 2.18 0.20 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13f -9.58 0.36 0 -FEP_CAT-4a-CAT-24 -36.08 0.20 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4n -8.60 0.08 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4k -13.90 0.14 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13k -7.19 0.35 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4j -1.54 0.15 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13m -116.99 0.10 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17g 1.02 0.18 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17g -28.10 0.13 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4m -10.62 0.06 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4a 38.57 0.07 0 -FEP_CAT-24-CAT-17b 27.45 0.13 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17e 4.05 0.11 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13k -20.27 0.19 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13a -22.64 0.21 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13d 28.28 0.10 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17f -60.60 0.15 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13b -38.13 0.21 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4a -22.29 0.09 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13o -16.83 0.23 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13c 13.17 0.12 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4i 4.36 0.10 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17i -38.62 0.15 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17d -61.67 0.10 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13b -6.49 0.11 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13a 19.34 0.16 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13e 20.77 0.30 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13g -6.61 0.45 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4c -23.36 0.14 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13h 33.89 0.29 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13j -63.20 0.22 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13b 14.38 0.22 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13g 33.84 0.22 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17d -10.31 0.15 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13c 23.09 0.27 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4i -61.14 0.08 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13d -2.62 0.10 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13b 0.50 0.18 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13f -2.73 0.14 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13i 26.23 0.24 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13c 8.76 0.17 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17h -9.12 0.12 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13i 16.28 0.18 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13c 12.07 0.18 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13n -92.82 0.11 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13f 10.98 0.17 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13e 107.35 0.32 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4c 0.01 0.31 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13g 8.57 0.17 1 -FEP_CAT-4j-CAT-13i 17.32 0.16 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13b 13.06 0.25 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4i -19.55 0.08 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17b 10.69 0.20 0 -FEP_CAT-4m-CAT-24 -6.75 0.11 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4b 38.90 0.15 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13b -15.64 0.33 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13n -66.91 0.16 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13g 22.57 0.17 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13j -2.42 0.10 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17a 22.90 0.14 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17e -25.64 0.24 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4d 29.61 0.11 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17i -9.51 0.07 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13m -115.94 0.21 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13k -16.81 0.24 0 -FEP_CAT-4i-CAT-24 2.29 0.18 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13e 28.65 0.26 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4a 42.68 0.09 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4j -9.85 0.16 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17h 13.34 0.16 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13d 18.36 0.09 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13b -15.81 0.27 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13b 22.80 0.30 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13c 21.66 0.22 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4d 29.44 0.22 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13m -97.79 0.11 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13d 19.46 0.09 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17e -6.41 0.14 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17h 0.77 0.11 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13i 29.97 0.18 0 -FEP_CAT-4b-CAT-24 -36.65 0.10 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4d 19.38 0.12 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17d -9.05 0.10 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13g -29.65 0.20 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13d 18.00 0.09 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17f -7.93 0.15 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17i -39.07 0.18 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13k -16.04 0.31 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17a 13.86 0.21 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17i -17.94 0.19 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13f -9.66 0.18 0 -FEP_CAT-4b-CAT-4a -0.41 0.09 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4a 29.56 0.09 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17b -30.77 0.14 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4k -65.12 0.09 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13g 36.25 0.24 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13m -74.07 0.13 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13f -9.86 0.17 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13i 25.43 0.17 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4l 42.82 0.09 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13m -139.24 0.15 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13g -5.32 0.29 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13f -32.06 0.09 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13j -39.90 0.30 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17g -28.25 0.23 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17e 17.49 0.19 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13m -87.56 0.14 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13d -33.56 0.15 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13i -35.21 0.07 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13k -25.66 0.15 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17b 11.74 0.13 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13m -116.95 0.13 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13o 2.42 0.09 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17g -8.89 0.14 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4d 30.96 0.23 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13b 4.16 0.33 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4i -18.01 0.08 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17a 4.65 0.11 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13e 8.63 0.28 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4m -9.23 0.09 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13a -2.62 0.16 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4n -10.01 0.09 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17f -8.89 0.11 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13o 4.12 0.37 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13d 7.92 0.15 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4m -0.47 0.15 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13e 10.30 0.21 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4i -9.70 0.11 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4d 20.71 0.12 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13k -27.12 0.27 0 -FEP_CAT-4o-CAT-24 -17.07 0.13 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13h 16.82 0.17 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4a 20.46 0.15 0 -FEP_CAT-4o-CAT-17c 9.59 0.12 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13m -87.85 0.12 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13g 12.19 0.19 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13n -90.70 0.11 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4a 19.08 0.07 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13h 25.23 0.22 0 -FEP_CAT-4o-CAT-4l 41.48 0.09 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13j -21.79 0.22 0 -FEP_CAT-4o-CAT-13i 6.17 0.17 0 -FEP_CAT-4n-CAT-24 -7.28 0.10 0 -FEP_CAT-4n-CAT-4c 28.25 0.12 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13d 9.65 0.12 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4k -22.42 0.12 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13j -19.70 0.28 0 -FEP_CAT-4n-CAT-13a 5.63 0.37 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13i 7.92 0.21 0 -FEP_CAT-4n-CAT-17h -0.36 0.08 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17i -39.19 0.19 0 -FEP_CAT-4p-CAT-4b 21.02 0.07 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13c -3.54 0.05 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17a 14.04 0.16 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13a 6.18 0.11 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13b -4.22 0.12 0 -FEP_CAT-24-CAT-13b 20.78 0.26 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13a -13.83 0.31 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17c 20.11 0.08 0 -FEP_CAT-24-CAT-17a 20.84 0.16 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13d 4.53 0.06 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13e 28.21 0.42 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13e 35.69 0.37 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13f -6.32 0.22 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13h 106.05 0.17 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13d 27.42 0.10 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13c 2.67 0.11 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13a -7.74 0.14 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13b -6.04 0.25 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13d -4.52 0.14 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17c 29.90 0.14 0 -FEP_CAT-24-CAT-13g 29.44 0.21 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17f -9.90 0.09 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13e 6.89 0.35 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13j -2.46 0.08 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13g 20.99 0.14 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13e 19.44 0.31 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13m -108.47 0.14 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13d 30.41 0.11 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13b -7.91 0.26 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13o 11.77 0.12 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13o 22.62 0.12 0 -FEP_CAT-24-CAT-17g 8.15 0.21 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13b -5.24 0.32 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17e 13.05 0.13 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13d -1.23 0.15 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17a 23.77 0.16 0 -FEP_CAT-13b-CAT-13a -7.45 0.20 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13i 3.67 0.22 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17d -0.90 0.14 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13e -1.59 0.24 0 -FEP_CAT-17b-CAT-17a -7.11 0.09 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13f 29.69 0.12 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13c 2.13 0.11 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13n -80.44 0.12 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13n -100.24 0.12 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13n -71.66 0.17 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13j 5.34 0.18 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13m -78.41 0.23 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13b 0.71 0.25 0 -FEP_CAT-24-CAT-13c 29.04 0.17 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13a 14.75 0.08 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13e -1.15 0.16 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13j -12.95 0.16 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13f 107.23 0.17 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13g 23.50 0.39 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13b -14.37 0.23 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4b -21.69 0.18 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13d -11.90 0.17 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17e 2.41 0.14 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13n -84.17 0.08 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17c 33.15 0.23 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13h 24.09 0.15 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13d 27.23 0.08 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13h 21.79 0.14 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4c 28.90 0.16 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13d -10.80 0.16 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13d -1.04 0.36 0 -FEP_CAT-24-CAT-13k -9.72 0.20 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13j -25.67 0.10 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17h 9.21 0.10 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17b -8.38 0.22 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13j -41.14 0.30 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13g 6.53 0.26 0 -FEP_CAT-24-CAT-13o 19.18 0.20 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17d -13.97 0.10 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13b 25.82 0.21 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13b 24.16 0.18 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17f -8.58 0.06 0 -FEP_CAT-17e-CAT-17b 16.98 0.11 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13h 38.74 0.14 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13b 27.72 0.26 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13g -7.38 0.25 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17c -8.55 0.20 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17f 0.41 0.17 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13i 15.48 0.11 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17d 3.41 0.16 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13a 22.94 0.10 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4b 30.98 0.12 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13c 109.79 0.16 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13e 15.16 0.22 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4l 52.07 0.14 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13g 31.82 0.20 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13i 28.38 0.20 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13a -10.72 0.19 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13o -6.90 0.15 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13j -40.71 0.25 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4b 1.24 0.21 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13h 12.11 0.15 0 -FEP_CAT-4k-CAT-24 6.68 0.15 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13e 19.59 0.24 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13o 12.87 0.14 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17g 10.37 0.12 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13m -117.45 0.08 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13c 22.12 0.46 0 -FEP_CAT-24-CAT-13n -73.14 0.11 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17f 0.57 0.16 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13e 30.86 0.33 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13k -36.96 0.16 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13g 18.85 0.19 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13f 100.34 0.20 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13j -11.08 0.23 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4j -0.76 0.11 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17h -30.06 0.18 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13i 16.81 0.16 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13d 31.91 0.11 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13g 1.86 0.18 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13c -30.05 0.42 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13n -131.87 0.11 0 -FEP_CAT-13e-CAT-13c 3.86 0.23 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13h -26.38 0.13 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13c 102.77 0.11 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13j 1.82 0.18 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17g -27.21 0.18 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17g 10.50 0.08 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17c 29.14 0.09 0 -FEP_CAT-24-CAT-17c 26.81 0.16 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13g 109.82 0.14 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13a -16.83 0.29 1 -FEP_CAT-17h-CAT-13c 22.35 0.13 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17b 1.15 0.18 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13n -70.58 0.08 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13f 6.52 0.13 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13i 27.07 0.27 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13b -2.44 0.14 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17d -1.19 0.09 0 -FEP_CAT-24-CAT-17f -2.24 0.17 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17h 9.04 0.16 0 -FEP_CAT-24-CAT-13d 24.90 0.17 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13d 5.28 0.18 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13a -14.83 0.16 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13o 12.91 0.11 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13m -107.49 0.17 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13g 40.00 0.24 0 -FEP_CAT-4c-CAT-4a 1.01 0.10 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17e -48.05 0.16 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13f 6.09 0.19 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13k -45.89 0.29 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13b 23.30 0.24 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13j -24.41 0.08 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13d -7.08 0.17 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13d -10.53 0.20 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13a -7.11 0.09 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13g 31.83 0.16 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17b -9.20 0.12 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17g 14.70 0.19 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13k -16.52 0.10 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4c 42.01 0.11 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13m -87.29 0.12 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13c 20.88 0.16 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13o 21.98 0.13 0 -FEP_CAT-24-CAT-17e 10.46 0.09 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13d 14.28 0.10 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13c 1.38 0.15 0 -FEP_CAT-4d-CAT-4b 0.39 0.14 0 -FEP_CAT-24-CAT-13a 12.75 0.21 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13c 18.66 0.16 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17a 22.72 0.14 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13k -3.08 0.35 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13e 3.66 0.33 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17c 18.71 0.07 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13o -39.27 0.16 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17d -40.23 0.15 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17a 14.49 0.13 0 -FEP_CAT-13j-CAT-13c 34.05 0.12 0 -FEP_CAT-4b-CAT-17f -38.56 0.21 0 -FEP_CAT-13m-CAT-13b 101.10 0.23 0 -FEP_CAT-17h-CAT-17g 1.24 0.08 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13a 2.21 0.13 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13a 7.01 0.20 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13o 21.52 0.18 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17d -9.69 0.13 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13o -8.09 0.12 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13f 28.50 0.10 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13j -11.26 0.16 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13d 18.36 0.12 0 -FEP_CAT-17d-CAT-17b 30.96 0.15 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13a 86.13 0.14 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13h 25.59 0.27 0 -FEP_CAT-4k-CAT-17b 34.39 0.21 0 -FEP_CAT-24-CAT-13j -5.24 0.19 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13b 30.29 0.10 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13o -16.51 0.16 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13h 34.94 0.21 0 -FEP_CAT-4k-CAT-4j 12.61 0.07 0 -FEP_CAT-17c-CAT-13a -13.93 0.10 0 -FEP_CAT-17g-CAT-17a 12.42 0.16 0 -FEP_CAT-13f-CAT-13a -14.64 0.29 0 -FEP_CAT-24-CAT-17i -2.45 0.07 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13h -4.18 0.22 0 -FEP_CAT-4l-CAT-13a -45.79 0.24 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13k 63.38 0.10 0 -FEP_CAT-17f-CAT-17b 29.73 0.15 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13e 4.86 0.20 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17c -9.41 0.08 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13i 16.92 0.10 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13j -41.15 0.19 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13j -16.07 0.15 0 -FEP_CAT-17i-CAT-13e 28.31 0.41 0 -FEP_CAT-13n-CAT-13i 96.51 0.10 0 -FEP_CAT-17c-CAT-17a -6.13 0.10 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13h 8.58 0.16 0 -FEP_CAT-13g-CAT-13c -0.06 0.20 0 -FEP_CAT-4m-CAT-17c 20.09 0.22 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17g -50.66 0.12 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13m -86.72 0.17 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13g 32.55 0.25 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13e -9.42 0.22 0 -FEP_CAT-17e-CAT-13o 8.81 0.11 0 -FEP_CAT-13i-CAT-13f 3.85 0.23 0 -FEP_CAT-4i-CAT-13m -78.28 0.13 0 -FEP_CAT-13k-CAT-13i 32.82 0.12 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13g 9.73 0.18 0 -FEP_CAT-24-CAT-17d -3.27 0.22 0 -FEP_CAT-4m-CAT-13f 20.10 0.24 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13c -7.58 0.46 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17b 30.12 0.14 0 -FEP_CAT-4k-CAT-13c 35.02 0.49 0 -FEP_CAT-4i-CAT-4c 37.52 0.11 0 -FEP_CAT-4m-CAT-4i -8.84 0.19 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13c 32.29 0.07 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13e 28.91 0.27 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13h 26.22 0.11 0 -FEP_CAT-13o-CAT-13m -100.48 0.09 0 -FEP_CAT-4p-CAT-24 -15.90 0.17 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13h -4.72 0.20 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13n -110.13 0.13 0 -FEP_CAT-13h-CAT-13e -7.46 0.12 0 -FEP_CAT-4d-CAT-13e -10.35 0.35 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13c -7.55 0.16 0 -FEP_CAT-4l-CAT-4j -52.88 0.05 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13k -46.13 0.22 0 -FEP_CAT-17h-CAT-13g 22.21 0.19 0 -FEP_CAT-17i-CAT-17b 29.99 0.09 0 -FEP_CAT-17d-CAT-13h 35.40 0.14 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13f -8.46 0.41 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13f 18.20 0.21 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4c 29.60 0.11 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13c 30.75 0.15 0 -FEP_CAT-4a-CAT-13c -7.31 0.09 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17d -39.31 0.17 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13j -2.82 0.21 0 -FEP_CAT-4j-CAT-4a 30.41 0.09 0 -FEP_CAT-4c-CAT-13o -15.61 0.12 0 -FEP_CAT-4c-CAT-17i -37.55 0.22 0 -FEP_CAT-24-CAT-13f 26.79 0.20 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17a -15.69 0.13 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17b -9.02 0.22 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13n -81.70 0.08 0 -FEP_CAT-17b-CAT-13h 5.20 0.08 0 -FEP_CAT-17f-CAT-13k -7.43 0.18 0 -FEP_CAT-13d-CAT-13c 4.01 0.10 0 -FEP_CAT-4p-CAT-13g 13.83 0.11 0 -FEP_CAT-17a-CAT-13k -30.27 0.21 0 -FEP_CAT-17g-CAT-13e 17.92 0.36 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17e 4.73 0.20 0 -FEP_CAT-4j-CAT-17g 2.19 0.12 0 -FEP_CAT-4b-CAT-13i -13.08 0.21 0 -FEP_CAT-4d-CAT-17h -29.53 0.20 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13k -15.16 0.24 0 -FEP_CAT-4l-CAT-17i -61.18 0.11 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17e 13.07 0.10 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13o 13.61 0.11 0 -FEP_CAT-4j-CAT-13b 14.51 0.42 0 -FEP_CAT-4a-CAT-17h -29.53 0.13 0 -FEP_CAT-4i-CAT-17c 29.29 0.08 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/.ipynb_checkpoints/pairs-checkpoint.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/.ipynb_checkpoints/pairs-checkpoint.txt deleted file mode 100755 index caf277ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/.ipynb_checkpoints/pairs-checkpoint.txt +++ /dev/null @@ -1,120 +0,0 @@ -1h1q 17 -1h1r 17 -1h1s 17 -1oi9 17 -1oiu 17 -1oiy 17 -20 17 -21 17 -22 17 -26 17 -28 17 -29 17 -30 17 -31 17 -32 17 -1h1r 1h1q -1h1s 1h1q -1oi9 1h1q -1oiu 1h1q -1oiy 1h1q -20 1h1q -21 1h1q -22 1h1q -26 1h1q -28 1h1q -29 1h1q -30 1h1q -31 1h1q -32 1h1q -1h1s 1h1r -1oi9 1h1r -1oiu 1h1r -1oiy 1h1r -20 1h1r -21 1h1r -22 1h1r -26 1h1r -28 1h1r -29 1h1r -30 1h1r -31 1h1r -32 1h1r -1oi9 1h1s -1oiu 1h1s -1oiy 1h1s -20 1h1s -21 1h1s -22 1h1s -26 1h1s -28 1h1s -29 1h1s -30 1h1s -31 1h1s -32 1h1s -1oiu 1oi9 -1oiy 1oi9 -20 1oi9 -21 1oi9 -22 1oi9 -26 1oi9 -28 1oi9 -29 1oi9 -30 1oi9 -31 1oi9 -32 1oi9 -1oiy 1oiu -20 1oiu -21 1oiu -22 1oiu -26 1oiu -28 1oiu -29 1oiu -30 1oiu -31 1oiu -32 1oiu -20 1oiy -21 1oiy -22 1oiy -26 1oiy -28 1oiy -29 1oiy -30 1oiy -31 1oiy -32 1oiy -21 20 -22 20 -26 20 -28 20 -29 20 -30 20 -31 20 -32 20 -22 21 -26 21 -28 21 -29 21 -30 21 -31 21 -32 21 -26 22 -28 22 -29 22 -30 22 -31 22 -32 22 -28 26 -29 26 -30 26 -31 26 -32 26 -29 28 -30 28 -31 28 -32 28 -30 29 -31 29 -32 29 -31 30 -32 30 -32 31 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs-sc/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs-sc/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index 4361843c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs-sc/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_1h1q-17 2.87 0.37 -FEP_1h1r-17 -0.46 0.21 -FEP_1h1r-1h1q -2.68 0.24 -FEP_1h1s-17 50.75 0.51 -FEP_1h1s-1h1q 48.26 0.31 -FEP_1h1s-1h1r 53.11 0.5 -FEP_1oi9-17 21.5 0.43 -FEP_1oi9-1h1q 17.68 0.4 -FEP_1oi9-1h1r 21.59 0.49 -FEP_1oi9-1h1s -28.82 0.29 -FEP_1oiu-17 55.63 0.4 -FEP_1oiu-1h1q 51.71 0.25 -FEP_1oiu-1h1r 56.49 0.37 -FEP_1oiu-1h1s 7.82 0.91 -FEP_1oiu-1oi9 35.67 0.23 -FEP_1oiy-17 44.24 0.3 -FEP_1oiy-1h1q 39.28 0.34 -FEP_1oiy-1h1r 44.42 0.51 -FEP_1oiy-1h1s -8.02 0.28 -FEP_1oiy-1oi9 20.87 0.39 -FEP_1oiy-1oiu -12.6 0.76 -FEP_20-17 12.15 0.13 -FEP_20-1h1q 8.33 0.17 -FEP_20-1h1r 12.43 0.33 -FEP_20-1h1s -38.44 0.76 -FEP_20-1oi9 -8.32 0.43 -FEP_20-1oiu -43.61 0.48 -FEP_20-1oiy -30.23 0.65 -FEP_21-17 -2.42 0.26 -FEP_21-1h1q -5.39 0.39 -FEP_21-1h1r -2.11 0.32 -FEP_21-1h1s -49.97 0.82 -FEP_21-1oi9 -21.82 0.6 -FEP_21-1oiu -56.83 0.41 -FEP_21-1oiy -41.36 0.78 -FEP_21-20 -13.04 0.28 -FEP_22-17 -0.79 0.26 -FEP_22-1h1q -2.12 0.35 -FEP_22-1h1r -0.07 0.27 -FEP_22-1h1s -47.36 0.47 -FEP_22-1oi9 -18.87 0.47 -FEP_22-1oiu -55.13 0.42 -FEP_22-1oiy -38.06 0.66 -FEP_22-20 -11.67 0.29 -FEP_22-21 2.53 0.14 -FEP_26-17 6.59 0.33 -FEP_26-1h1q 3.58 0.34 -FEP_26-1h1r 7 0.5 -FEP_26-1h1s -43.49 0.43 -FEP_26-1oi9 -13.84 0.49 -FEP_26-1oiu -47.34 0.59 -FEP_26-1oiy -34.39 0.63 -FEP_26-20 -4.59 0.27 -FEP_26-21 10.38 0.57 -FEP_26-22 8.22 0.56 -FEP_28-17 32.93 0.52 -FEP_28-1h1q 28.92 0.79 -FEP_28-1h1r 32.52 0.56 -FEP_28-1h1s -17.52 0.48 -FEP_28-1oi9 11.62 0.59 -FEP_28-1oiu -21.6 0.75 -FEP_28-1oiy -8.84 0.71 -FEP_28-20 20.32 0.48 -FEP_28-21 33.9 0.96 -FEP_28-22 33.17 1.16 -FEP_28-26 25.61 0.31 -FEP_29-17 18.4 0.78 -FEP_29-1h1q 15.27 0.89 -FEP_29-1h1r 20.69 1.14 -FEP_29-1h1s -31.86 0.82 -FEP_29-1oi9 -2.12 0.93 -FEP_29-1oiu -33.92 0.26 -FEP_29-1oiy -23.54 0.43 -FEP_29-20 7.76 0.56 -FEP_29-21 21.04 1.29 -FEP_29-22 22.5 0.69 -FEP_29-26 11.71 0.18 -FEP_29-28 -13.95 0.36 -FEP_30-17 41.11 0.38 -FEP_30-1h1q 35.96 0.56 -FEP_30-1h1r 41.47 0.35 -FEP_30-1h1s -9.89 0.26 -FEP_30-1oi9 19.49 0.36 -FEP_30-1oiu -15.17 0.75 -FEP_30-1oiy -1.79 0.51 -FEP_30-20 27.63 0.45 -FEP_30-21 42.19 0.49 -FEP_30-22 40.46 0.59 -FEP_30-26 33.97 0.14 -FEP_30-28 8.35 0.27 -FEP_30-29 21.3 0.25 -FEP_31-17 18.02 0.52 -FEP_31-1h1q 14.5 0.68 -FEP_31-1h1r 18.62 0.4 -FEP_31-1h1s -32.95 0.36 -FEP_31-1oi9 -3.9 0.26 -FEP_31-1oiu -37.24 0.5 -FEP_31-1oiy -25.23 0.24 -FEP_31-20 6.54 0.33 -FEP_31-21 20.75 0.25 -FEP_31-22 19.4 0.4 -FEP_31-26 10.37 0.33 -FEP_31-28 -13.34 0.3 -FEP_31-29 -0.24 0.44 -FEP_31-30 -22.25 0.31 -FEP_32-17 22.7 0.49 -FEP_32-1h1q 20.39 0.62 -FEP_32-1h1r 24.18 0.29 -FEP_32-1h1s -26.21 0.39 -FEP_32-1oi9 2.89 0.47 -FEP_32-1oiu -31.13 0.63 -FEP_32-1oiy -17.8 0.65 -FEP_32-20 12.45 0.59 -FEP_32-21 24.27 0.75 -FEP_32-22 23.35 0.51 -FEP_32-26 18.1 0.45 -FEP_32-28 -7.71 0.48 -FEP_32-29 5.94 0.6 -FEP_32-30 -15.99 0.49 -FEP_32-31 7.19 0.32 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs-sc/lineal/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs-sc/lineal/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index afbb14ca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs-sc/lineal/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,199 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_17-1h1r/ 5 -FEP_17-1h1s/ 2 -FEP_17-1oi9/ 2 -FEP_17-1oiu/ 4 -FEP_17-1oiy/ 0 -FEP_17-20/ 1 -FEP_17-21/ 0 -FEP_17-22/ 1 -FEP_17-26/ 0 -FEP_17-28/ 0 -FEP_17-29/ 0 -FEP_17-30/ 5 -FEP_17-31/ 1 -FEP_17-32/ 4 -FEP_1h1q-17/ 2 -FEP_1h1q-1h1r/ 0 -FEP_1h1q-1h1s/ 1 -FEP_1h1q-1oi9/ 0 -FEP_1h1q-1oiu/ 2 -FEP_1h1q-1oiy/ 3 -FEP_1h1q-20/ 3 -FEP_1h1q-21/ 1 -FEP_1h1q-22/ 5 -FEP_1h1q-26/ 2 -FEP_1h1q-28/ 3 -FEP_1h1q-29/ 2 -FEP_1h1q-30/ 0 -FEP_1h1q-31/ 5 -FEP_1h1q-32/ 3 -FEP_1h1r-17/ 0 -FEP_1h1r-1h1q/ 3 -FEP_1h1r-1oi9/ 0 -FEP_1h1r-1oiu/ 1 -FEP_1h1r-1oiy/ 1 -FEP_1h1r-28/ 1 -FEP_1h1r-29/ 0 -FEP_1h1r-30/ 2 -FEP_1h1r-32/ 0 -FEP_1h1s-17/ 0 -FEP_1h1s-1h1q/ 1 -FEP_1h1s-1h1r/ 1 -FEP_1h1s-1oi9/ 2 -FEP_1h1s-1oiu/ 3 -FEP_1h1s-1oiy/ 2 -FEP_1h1s-21/ 2 -FEP_1h1s-26/ 2 -FEP_1h1s-28/ 1 -FEP_1h1s-29/ 1 -FEP_1h1s-30/ 3 -FEP_1h1s-32/ 2 -FEP_1oi9-17/ 2 -FEP_1oi9-1h1q/ 1 -FEP_1oi9-1h1r/ 1 -FEP_1oi9-1h1s/ 2 -FEP_1oi9-1oiy/ 2 -FEP_1oi9-28/ 1 -FEP_1oi9-30/ 0 -FEP_1oiu-17/ 5 -FEP_1oiu-1h1q/ 4 -FEP_1oiu-1h1r/ 3 -FEP_1oiu-1h1s/ 3 -FEP_1oiu-1oi9/ 0 -FEP_1oiu-1oiy/ 2 -FEP_1oiu-28/ 3 -FEP_1oiu-30/ 2 -FEP_1oiu-32/ 2 -FEP_1oiy-17/ 3 -FEP_1oiy-1h1q/ 1 -FEP_1oiy-1h1r/ 1 -FEP_1oiy-1h1s/ 4 -FEP_1oiy-1oi9/ 4 -FEP_1oiy-1oiu/ 2 -FEP_1oiy-28/ 4 -FEP_1oiy-30/ 1 -FEP_20-17/ 1 -FEP_20-1h1q/ 2 -FEP_20-1h1r/ 2 -FEP_20-1h1s/ 4 -FEP_20-1oi9/ 1 -FEP_20-1oiu/ 3 -FEP_20-1oiy/ 3 -FEP_20-21/ 0 -FEP_20-26/ 2 -FEP_20-28/ 4 -FEP_20-29/ 3 -FEP_20-30/ 4 -FEP_20-31/ 3 -FEP_20-32/ 4 -FEP_21-17/ 1 -FEP_21-1h1q/ 2 -FEP_21-1h1r/ 3 -FEP_21-1h1s/ 0 -FEP_21-1oi9/ 3 -FEP_21-1oiu/ 5 -FEP_21-1oiy/ 2 -FEP_21-20/ 1 -FEP_21-28/ 2 -FEP_21-29/ 1 -FEP_21-30/ 3 -FEP_21-32/ 1 -FEP_22-17/ 1 -FEP_22-1h1q/ 1 -FEP_22-1h1r/ 1 -FEP_22-1h1s/ 1 -FEP_22-1oi9/ 2 -FEP_22-1oiu/ 2 -FEP_22-1oiy/ 1 -FEP_22-20/ 1 -FEP_22-21/ 3 -FEP_22-26/ 1 -FEP_22-28/ 3 -FEP_22-29/ 2 -FEP_22-30/ 3 -FEP_22-31/ 2 -FEP_22-32/ 3 -FEP_26-17/ 1 -FEP_26-1h1q/ 2 -FEP_26-1h1r/ 1 -FEP_26-1h1s/ 1 -FEP_26-1oi9/ 1 -FEP_26-1oiu/ 3 -FEP_26-1oiy/ 2 -FEP_26-20/ 0 -FEP_26-21/ 0 -FEP_26-22/ 1 -FEP_26-28/ 1 -FEP_26-29/ 0 -FEP_26-30/ 1 -FEP_26-32/ 5 -FEP_28-17/ 3 -FEP_28-1h1q/ 3 -FEP_28-1h1r/ 1 -FEP_28-1h1s/ 3 -FEP_28-1oi9/ 3 -FEP_28-1oiu/ 2 -FEP_28-1oiy/ 3 -FEP_28-20/ 5 -FEP_28-21/ 4 -FEP_28-22/ 1 -FEP_28-26/ 3 -FEP_28-30/ 3 -FEP_29-17/ 4 -FEP_29-1h1q/ 2 -FEP_29-1h1r/ 8 -FEP_29-1h1s/ 5 -FEP_29-1oi9/ 4 -FEP_29-1oiu/ 6 -FEP_29-1oiy/ 5 -FEP_29-20/ 6 -FEP_29-21/ 6 -FEP_29-22/ 1 -FEP_29-26/ 4 -FEP_29-28/ 5 -FEP_29-30/ 4 -FEP_29-32/ 3 -FEP_30-17/ 3 -FEP_30-1h1q/ 2 -FEP_30-1h1r/ 1 -FEP_30-1h1s/ 1 -FEP_30-1oi9/ 4 -FEP_30-1oiu/ 0 -FEP_30-1oiy/ 1 -FEP_30-20/ 2 -FEP_30-21/ 3 -FEP_30-22/ 2 -FEP_30-26/ 2 -FEP_30-28/ 0 -FEP_30-29/ 3 -FEP_31-17/ 3 -FEP_31-1h1q/ 2 -FEP_31-1h1r/ 3 -FEP_31-1h1s/ 2 -FEP_31-1oi9/ 4 -FEP_31-1oiu/ 0 -FEP_31-1oiy/ 1 -FEP_31-20/ 4 -FEP_31-21/ 3 -FEP_31-22/ 3 -FEP_31-26/ 4 -FEP_31-28/ 2 -FEP_31-29/ 3 -FEP_31-30/ 1 -FEP_31-32/ 3 -FEP_32-17/ 1 -FEP_32-1h1q/ 1 -FEP_32-1h1r/ 1 -FEP_32-1h1s/ 5 -FEP_32-1oi9/ 2 -FEP_32-1oiu/ 1 -FEP_32-1oiy/ 3 -FEP_32-20/ 1 -FEP_32-21/ 1 -FEP_32-22/ 2 -FEP_32-26/ 4 -FEP_32-28/ 0 -FEP_32-29/ 6 -FEP_32-30/ 1 -FEP_32-31/ 3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs-sc/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs-sc/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index d9a6ccef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs-sc/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_1h1q-17 3.69 0.28 -FEP_1h1r-17 0.31 0.22 -FEP_1h1r-1h1q -3.15 0.17 -FEP_1h1s-17 49.17 0.18 -FEP_1h1s-1h1q 45.8 0.26 -FEP_1h1s-1h1r 49.09 0.24 -FEP_1oi9-17 18.69 0.21 -FEP_1oi9-1h1q 15.32 0.13 -FEP_1oi9-1h1r 18.6 0.14 -FEP_1oi9-1h1s -29.98 0.46 -FEP_1oiu-17 52.87 0.31 -FEP_1oiu-1h1q 49.71 0.12 -FEP_1oiu-1h1r 53.65 0.27 -FEP_1oiu-1h1s 4.85 0.36 -FEP_1oiu-1oi9 33.97 0.48 -FEP_1oiy-17 41.22 0.26 -FEP_1oiy-1h1q 37.94 0.22 -FEP_1oiy-1h1r 41.64 0.34 -FEP_1oiy-1h1s -7.21 0.16 -FEP_1oiy-1oi9 22.71 0.22 -FEP_1oiy-1oiu -11 0.17 -FEP_20-17 11.58 0.26 -FEP_20-1h1q 8.55 0.15 -FEP_20-1h1r 11.83 0.21 -FEP_20-1h1s -36.7 0.2 -FEP_20-1oi9 -6.79 0.17 -FEP_20-1oiu -41.16 0.16 -FEP_20-1oiy -29.48 0.22 -FEP_21-17 -2.26 0.21 -FEP_21-1h1q -5.6 0.27 -FEP_21-1h1r -1.84 0.25 -FEP_21-1h1s -51.2 0.37 -FEP_21-1oi9 -20.15 0.25 -FEP_21-1oiu -54.91 0.23 -FEP_21-1oiy -42.97 0.24 -FEP_21-20 -13.4 0.22 -FEP_22-17 1.33 0.22 -FEP_22-1h1q -2.42 0.2 -FEP_22-1h1r 1.19 0.17 -FEP_22-1h1s -47.82 0.28 -FEP_22-1oi9 -17.06 0.31 -FEP_22-1oiu -51.65 0.71 -FEP_22-1oiy -39.72 0.14 -FEP_22-20 -11.1 0.43 -FEP_22-21 3.11 0.2 -FEP_26-17 6.54 0.2 -FEP_26-1h1q 3.36 0.16 -FEP_26-1h1r 6.83 0.25 -FEP_26-1h1s -42.34 0.24 -FEP_26-1oi9 -11.73 0.18 -FEP_26-1oiu -45.87 0.4 -FEP_26-1oiy -34.36 0.28 -FEP_26-20 -4.95 0.17 -FEP_26-21 9.59 0.45 -FEP_26-22 6.63 0.28 -FEP_28-17 31.3 0.43 -FEP_28-1h1q 28.06 0.52 -FEP_28-1h1r 31.94 0.21 -FEP_28-1h1s -17.2 0.16 -FEP_28-1oi9 12.79 0.37 -FEP_28-1oiu -21.26 0.67 -FEP_28-1oiy -9.27 0.14 -FEP_28-20 19.55 0.43 -FEP_28-21 35.57 0.57 -FEP_28-22 31.92 0.3 -FEP_28-26 25.16 0.17 -FEP_29-17 18.75 0.4 -FEP_29-1h1q 15.18 0.74 -FEP_29-1h1r 20.04 0.22 -FEP_29-1h1s -29.62 0.15 -FEP_29-1oi9 -1.59 0.85 -FEP_29-1oiu -34.73 0.57 -FEP_29-1oiy -21.98 0.31 -FEP_29-20 6.96 0.35 -FEP_29-21 22.95 0.47 -FEP_29-22 20.01 0.41 -FEP_29-26 12.06 0.35 -FEP_29-28 -12.82 0.13 -FEP_30-17 40.6 0.25 -FEP_30-1h1q 36.33 0.47 -FEP_30-1h1r 40.26 0.29 -FEP_30-1h1s -8.67 0.21 -FEP_30-1oi9 21.99 0.55 -FEP_30-1oiu -12.44 0.34 -FEP_30-1oiy -0.23 0.15 -FEP_30-20 29.71 0.25 -FEP_30-21 44.39 0.46 -FEP_30-22 40.06 0.31 -FEP_30-26 33.47 0.21 -FEP_30-28 8.56 0.12 -FEP_30-29 21.3 0.1 -FEP_31-17 17.21 0.26 -FEP_31-1h1q 13.81 0.2 -FEP_31-1h1r 17.78 0.27 -FEP_31-1h1s -31.82 0.17 -FEP_31-1oi9 -1.69 0.44 -FEP_31-1oiu -35.04 0.41 -FEP_31-1oiy -23.59 0.28 -FEP_31-20 5.36 0.23 -FEP_31-21 21.76 0.31 -FEP_31-22 17.7 0.46 -FEP_31-26 10.23 0.22 -FEP_31-28 -14.05 0.23 -FEP_31-29 -1.72 0.17 -FEP_31-30 -22.19 0.26 -FEP_32-17 23.13 0.28 -FEP_32-1h1q 19.81 0.36 -FEP_32-1h1r 23.28 0.49 -FEP_32-1h1s -25.82 0.19 -FEP_32-1oi9 4.32 0.68 -FEP_32-1oiu -29.12 0.71 -FEP_32-1oiy -16.79 0.43 -FEP_32-20 11.54 0.41 -FEP_32-21 25.21 0.41 -FEP_32-22 21.78 0.12 -FEP_32-26 16.96 0.25 -FEP_32-28 -7.71 0.31 -FEP_32-29 5.02 0.32 -FEP_32-30 -17.05 0.34 -FEP_32-31 6.17 0.29 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs-sc/lineal/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs-sc/lineal/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index 58cd3060..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs-sc/lineal/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,199 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_17-1h1r/ 0 -FEP_17-1h1s/ 0 -FEP_17-1oi9/ 0 -FEP_17-1oiu/ 0 -FEP_17-1oiy/ 0 -FEP_17-20/ 0 -FEP_17-21/ 0 -FEP_17-22/ 0 -FEP_17-26/ 0 -FEP_17-28/ 0 -FEP_17-29/ 0 -FEP_17-30/ 0 -FEP_17-31/ 0 -FEP_17-32/ 0 -FEP_1h1q-17/ 0 -FEP_1h1q-1h1r/ 0 -FEP_1h1q-1h1s/ 0 -FEP_1h1q-1oi9/ 0 -FEP_1h1q-1oiu/ 0 -FEP_1h1q-1oiy/ 0 -FEP_1h1q-20/ 0 -FEP_1h1q-21/ 0 -FEP_1h1q-22/ 0 -FEP_1h1q-26/ 0 -FEP_1h1q-28/ 0 -FEP_1h1q-29/ 0 -FEP_1h1q-30/ 0 -FEP_1h1q-31/ 0 -FEP_1h1q-32/ 0 -FEP_1h1r-17/ 0 -FEP_1h1r-1h1q/ 0 -FEP_1h1r-1oi9/ 0 -FEP_1h1r-1oiu/ 0 -FEP_1h1r-1oiy/ 0 -FEP_1h1r-28/ 0 -FEP_1h1r-29/ 0 -FEP_1h1r-30/ 0 -FEP_1h1r-32/ 0 -FEP_1h1s-17/ 0 -FEP_1h1s-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-1h1r/ 0 -FEP_1h1s-1oi9/ 0 -FEP_1h1s-1oiu/ 0 -FEP_1h1s-1oiy/ 0 -FEP_1h1s-21/ 0 -FEP_1h1s-26/ 0 -FEP_1h1s-28/ 0 -FEP_1h1s-29/ 0 -FEP_1h1s-30/ 0 -FEP_1h1s-32/ 0 -FEP_1oi9-17/ 0 -FEP_1oi9-1h1q/ 0 -FEP_1oi9-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-1h1s/ 0 -FEP_1oi9-1oiy/ 0 -FEP_1oi9-28/ 0 -FEP_1oi9-30/ 0 -FEP_1oiu-17/ 0 -FEP_1oiu-1h1q/ 0 -FEP_1oiu-1h1r/ 0 -FEP_1oiu-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-1oi9/ 0 -FEP_1oiu-1oiy/ 0 -FEP_1oiu-28/ 0 -FEP_1oiu-30/ 0 -FEP_1oiu-32/ 0 -FEP_1oiy-17/ 0 -FEP_1oiy-1h1q/ 0 -FEP_1oiy-1h1r/ 0 -FEP_1oiy-1h1s/ 0 -FEP_1oiy-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-1oiu/ 0 -FEP_1oiy-28/ 0 -FEP_1oiy-30/ 0 -FEP_20-17/ 0 -FEP_20-1h1q/ 0 -FEP_20-1h1r/ 0 -FEP_20-1h1s/ 0 -FEP_20-1oi9/ 0 -FEP_20-1oiu/ 0 -FEP_20-1oiy/ 0 -FEP_20-21/ 0 -FEP_20-26/ 0 -FEP_20-28/ 0 -FEP_20-29/ 0 -FEP_20-30/ 0 -FEP_20-31/ 0 -FEP_20-32/ 0 -FEP_21-17/ 0 -FEP_21-1h1q/ 0 -FEP_21-1h1r/ 0 -FEP_21-1h1s/ 0 -FEP_21-1oi9/ 0 -FEP_21-1oiu/ 0 -FEP_21-1oiy/ 0 -FEP_21-20/ 0 -FEP_21-28/ 0 -FEP_21-29/ 0 -FEP_21-30/ 0 -FEP_21-32/ 0 -FEP_22-17/ 0 -FEP_22-1h1q/ 0 -FEP_22-1h1r/ 0 -FEP_22-1h1s/ 0 -FEP_22-1oi9/ 0 -FEP_22-1oiu/ 0 -FEP_22-1oiy/ 0 -FEP_22-20/ 0 -FEP_22-21/ 0 -FEP_22-26/ 0 -FEP_22-28/ 0 -FEP_22-29/ 0 -FEP_22-30/ 0 -FEP_22-31/ 0 -FEP_22-32/ 0 -FEP_26-17/ 0 -FEP_26-1h1q/ 0 -FEP_26-1h1r/ 0 -FEP_26-1h1s/ 0 -FEP_26-1oi9/ 0 -FEP_26-1oiu/ 0 -FEP_26-1oiy/ 0 -FEP_26-20/ 0 -FEP_26-21/ 0 -FEP_26-22/ 0 -FEP_26-28/ 0 -FEP_26-29/ 0 -FEP_26-30/ 0 -FEP_26-32/ 0 -FEP_28-17/ 0 -FEP_28-1h1q/ 0 -FEP_28-1h1r/ 0 -FEP_28-1h1s/ 0 -FEP_28-1oi9/ 0 -FEP_28-1oiu/ 0 -FEP_28-1oiy/ 0 -FEP_28-20/ 0 -FEP_28-21/ 0 -FEP_28-22/ 0 -FEP_28-26/ 0 -FEP_28-30/ 0 -FEP_29-17/ 0 -FEP_29-1h1q/ 0 -FEP_29-1h1r/ 0 -FEP_29-1h1s/ 0 -FEP_29-1oi9/ 0 -FEP_29-1oiu/ 0 -FEP_29-1oiy/ 0 -FEP_29-20/ 0 -FEP_29-21/ 0 -FEP_29-22/ 0 -FEP_29-26/ 0 -FEP_29-28/ 0 -FEP_29-30/ 0 -FEP_29-32/ 0 -FEP_30-17/ 0 -FEP_30-1h1q/ 0 -FEP_30-1h1r/ 0 -FEP_30-1h1s/ 0 -FEP_30-1oi9/ 0 -FEP_30-1oiu/ 0 -FEP_30-1oiy/ 0 -FEP_30-20/ 0 -FEP_30-21/ 0 -FEP_30-22/ 0 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-28/ 0 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-17/ 0 -FEP_31-1h1q/ 0 -FEP_31-1h1r/ 0 -FEP_31-1h1s/ 0 -FEP_31-1oi9/ 0 -FEP_31-1oiu/ 0 -FEP_31-1oiy/ 0 -FEP_31-20/ 0 -FEP_31-21/ 0 -FEP_31-22/ 0 -FEP_31-26/ 0 -FEP_31-28/ 0 -FEP_31-29/ 0 -FEP_31-30/ 0 -FEP_31-32/ 0 -FEP_32-17/ 0 -FEP_32-1h1q/ 0 -FEP_32-1h1r/ 0 -FEP_32-1h1s/ 0 -FEP_32-1oi9/ 0 -FEP_32-1oiu/ 0 -FEP_32-1oiy/ 0 -FEP_32-20/ 0 -FEP_32-21/ 0 -FEP_32-22/ 0 -FEP_32-26/ 0 -FEP_32-28/ 0 -FEP_32-29/ 0 -FEP_32-30/ 0 -FEP_32-31/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/.ipynb_checkpoints/pairs-checkpoint.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/.ipynb_checkpoints/pairs-checkpoint.txt deleted file mode 100755 index caf277ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/.ipynb_checkpoints/pairs-checkpoint.txt +++ /dev/null @@ -1,120 +0,0 @@ -1h1q 17 -1h1r 17 -1h1s 17 -1oi9 17 -1oiu 17 -1oiy 17 -20 17 -21 17 -22 17 -26 17 -28 17 -29 17 -30 17 -31 17 -32 17 -1h1r 1h1q -1h1s 1h1q -1oi9 1h1q -1oiu 1h1q -1oiy 1h1q -20 1h1q -21 1h1q -22 1h1q -26 1h1q -28 1h1q -29 1h1q -30 1h1q -31 1h1q -32 1h1q -1h1s 1h1r -1oi9 1h1r -1oiu 1h1r -1oiy 1h1r -20 1h1r -21 1h1r -22 1h1r -26 1h1r -28 1h1r -29 1h1r -30 1h1r -31 1h1r -32 1h1r -1oi9 1h1s -1oiu 1h1s -1oiy 1h1s -20 1h1s -21 1h1s -22 1h1s -26 1h1s -28 1h1s -29 1h1s -30 1h1s -31 1h1s -32 1h1s -1oiu 1oi9 -1oiy 1oi9 -20 1oi9 -21 1oi9 -22 1oi9 -26 1oi9 -28 1oi9 -29 1oi9 -30 1oi9 -31 1oi9 -32 1oi9 -1oiy 1oiu -20 1oiu -21 1oiu -22 1oiu -26 1oiu -28 1oiu -29 1oiu -30 1oiu -31 1oiu -32 1oiu -20 1oiy -21 1oiy -22 1oiy -26 1oiy -28 1oiy -29 1oiy -30 1oiy -31 1oiy -32 1oiy -21 20 -22 20 -26 20 -28 20 -29 20 -30 20 -31 20 -32 20 -22 21 -26 21 -28 21 -29 21 -30 21 -31 21 -32 21 -26 22 -28 22 -29 22 -30 22 -31 22 -32 22 -28 26 -29 26 -30 26 -31 26 -32 26 -29 28 -30 28 -31 28 -32 28 -30 29 -31 29 -32 29 -31 30 -32 30 -32 31 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/.ipynb_checkpoints/protein-checkpoint.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/.ipynb_checkpoints/protein-checkpoint.txt deleted file mode 100755 index 101de7f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/.ipynb_checkpoints/protein-checkpoint.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_1h1s-17 50.61 0.57 -FEP_32-17 21.99 0.56 -FEP_21-17 -2.76 0.32 -FEP_1oiu-17 55.46 0.34 -FEP_26-17 7.24 0.42 -FEP_30-17 41.71 0.51 -FEP_1oiy-17 40.42 0.58 -FEP_20-17 11.25 0.26 -FEP_1oi9-17 19.25 0.39 -FEP_1h1q-17 2.85 0.34 -FEP_22-17 -0.52 0.18 -FEP_28-17 32.45 0.96 -FEP_29-17 20.80 0.67 -FEP_31-17 16.70 0.67 -FEP_1h1r-17 -0.26 0.26 -FEP_30-1h1q 36.73 0.44 -FEP_22-1h1q -3.57 0.39 -FEP_1h1s-1h1r 51.56 0.80 -FEP_1h1r-1h1q -3.14 0.29 -FEP_1oiy-1h1q 39.91 0.42 -FEP_32-1h1q 19.79 1.14 -FEP_21-1h1q -5.03 0.40 -FEP_20-1h1q 8.45 0.30 -FEP_1h1s-1h1q 46.74 0.75 -FEP_26-1h1q 3.59 0.56 -FEP_1oi9-1h1q 17.02 0.33 -FEP_28-1h1q 26.51 1.55 -FEP_29-1h1q 14.91 1.11 -FEP_31-1h1q 14.10 0.75 -FEP_1oiu-1h1q 51.56 0.41 -FEP_21-1h1r -2.32 0.11 -FEP_29-1h1r 17.23 1.02 -FEP_31-1h1r 18.28 0.73 -FEP_30-1h1r 40.01 0.76 -FEP_20-1h1r 12.00 0.39 -FEP_22-1h1r -0.26 0.30 -FEP_32-1h1r 21.80 0.90 -FEP_1oi9-1h1r 20.92 0.85 -FEP_28-1h1r 32.00 0.80 -FEP_1oiu-1h1s 3.08 0.54 -FEP_1oiy-1h1r 41.32 0.52 -FEP_1oi9-1h1s -29.01 1.04 -FEP_1oiy-1h1s -8.30 0.10 -FEP_1oiu-1h1r 55.37 0.63 -FEP_26-1h1r 5.71 0.61 -FEP_30-1h1s -9.92 0.34 -FEP_21-1h1s -54.11 1.02 -FEP_29-1h1s -32.63 0.82 -FEP_20-1oi9 -8.93 0.22 -FEP_21-1oi9 -22.81 0.69 -FEP_26-1h1s -44.65 0.60 -FEP_22-1h1s -49.75 0.46 -FEP_1oiu-1oi9 33.80 0.53 -FEP_22-1oi9 -20.92 0.64 -FEP_1oiy-1oi9 20.94 0.40 -FEP_26-1oi9 -13.08 0.19 -FEP_28-1h1s -16.62 0.72 -FEP_32-1h1s -28.07 0.21 -FEP_31-1h1s -33.63 0.32 -FEP_20-1h1s -39.04 0.41 -FEP_21-1oiu -57.01 0.27 -FEP_32-1oiu -32.52 0.74 -FEP_32-1oi9 2.35 1.23 -FEP_29-1oiu -36.29 0.74 -FEP_30-1oi9 18.24 0.83 -FEP_29-1oi9 nan nan -FEP_28-1oi9 8.65 1.39 -FEP_30-1oiu -13.49 0.55 -FEP_26-1oiu -46.98 0.49 -FEP_28-1oiu -22.55 0.46 -FEP_31-1oi9 -5.10 0.87 -FEP_31-1oiu -35.92 0.68 -FEP_1oiy-1oiu -12.02 0.38 -FEP_22-1oiu -54.97 0.54 -FEP_20-1oiu -43.04 0.27 -FEP_26-1oiy -36.83 0.31 -FEP_30-20 28.26 0.43 -FEP_22-20 -11.20 0.28 -FEP_31-1oiy -25.21 0.34 -FEP_22-1oiy -43.65 0.44 -FEP_21-20 -13.71 0.41 -FEP_29-1oiy -25.43 0.80 -FEP_20-1oiy -31.77 0.52 -FEP_28-20 18.81 0.93 -FEP_29-20 7.39 0.30 -FEP_21-1oiy -43.17 0.64 -FEP_28-1oiy -9.94 0.62 -FEP_32-1oiy -20.54 0.87 -FEP_26-20 -4.82 0.47 -FEP_30-1oiy -2.84 0.40 -FEP_28-22 30.57 1.07 -FEP_30-22 39.33 0.71 -FEP_26-21 9.54 0.87 -FEP_32-21 24.30 0.63 -FEP_30-21 42.93 0.93 -FEP_28-21 34.29 1.07 -FEP_29-21 23.56 0.91 -FEP_31-22 16.36 0.64 -FEP_32-20 9.95 0.79 -FEP_29-22 17.82 0.54 -FEP_31-21 20.06 0.79 -FEP_31-20 6.99 0.46 -FEP_26-22 8.19 0.95 -FEP_22-21 3.07 0.21 -FEP_32-22 22.79 0.38 -FEP_30-29 21.46 0.26 -FEP_32-30 -17.45 0.39 -FEP_30-28 7.67 0.20 -FEP_29-26 12.08 0.65 -FEP_28-26 24.71 0.47 -FEP_31-30 -22.56 0.38 -FEP_32-31 6.02 0.37 -FEP_31-28 -14.21 0.50 -FEP_32-28 -9.44 0.51 -FEP_31-29 0.38 0.34 -FEP_32-26 16.94 0.56 -FEP_30-26 33.80 0.34 -FEP_31-26 11.44 0.39 -FEP_32-29 3.76 0.42 -FEP_29-28 -13.19 0.26 \ No newline at end of file diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/.ipynb_checkpoints/water-checkpoint.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/.ipynb_checkpoints/water-checkpoint.txt deleted file mode 100755 index 6ff2acca..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/.ipynb_checkpoints/water-checkpoint.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_1h1s-17 49.16 0.39 -FEP_32-17 23.44 0.29 -FEP_21-17 -1.60 0.30 -FEP_1oiu-17 52.81 0.18 -FEP_26-17 6.39 0.20 -FEP_30-17 40.55 0.40 -FEP_1oiy-17 40.86 0.14 -FEP_20-17 11.07 0.24 -FEP_1oi9-17 18.53 0.19 -FEP_1h1q-17 2.93 0.17 -FEP_22-17 0.99 0.23 -FEP_28-17 31.90 0.23 -FEP_29-17 17.34 0.50 -FEP_31-17 17.03 0.41 -FEP_1h1r-17 -0.13 0.21 -FEP_30-1h1q 36.28 0.51 -FEP_22-1h1q -2.33 0.48 -FEP_1h1s-1h1r 49.03 0.23 -FEP_1h1r-1h1q -3.32 0.17 -FEP_1oiy-1h1q 37.81 0.13 -FEP_32-1h1q 20.33 0.51 -FEP_21-1h1q -4.96 0.20 -FEP_20-1h1q 8.52 0.20 -FEP_1h1s-1h1q 45.82 0.52 -FEP_26-1h1q 3.65 0.26 -FEP_1oi9-1h1q 15.19 0.17 -FEP_28-1h1q 28.50 0.40 -FEP_29-1h1q 15.26 0.82 -FEP_31-1h1q 13.84 0.53 -FEP_1oiu-1h1q 49.53 0.26 -FEP_21-1h1r -1.73 0.22 -FEP_29-1h1r 19.16 0.41 -FEP_31-1h1r 17.21 0.26 -FEP_30-1h1r 40.45 0.42 -FEP_20-1h1r 11.65 0.17 -FEP_22-1h1r 1.78 0.30 -FEP_32-1h1r 23.39 0.32 -FEP_1oi9-1h1r 18.61 0.10 -FEP_28-1h1r 31.15 0.46 -FEP_1oiu-1h1s 3.75 0.38 -FEP_1oiy-1h1r 40.47 0.25 -FEP_1oi9-1h1s -29.90 0.50 -FEP_1oiy-1h1s -7.82 0.17 -FEP_1oiu-1h1r 53.86 0.15 -FEP_26-1h1r 6.74 0.20 -FEP_30-1h1s -8.78 0.17 -FEP_21-1h1s -51.79 0.36 -FEP_29-1h1s -30.71 0.44 -FEP_20-1oi9 -6.93 0.25 -FEP_21-1oi9 -19.89 0.23 -FEP_26-1h1s -41.91 0.14 -FEP_22-1h1s -47.75 0.34 -FEP_1oiu-1oi9 33.76 0.93 -FEP_22-1oi9 -19.25 0.89 -FEP_1oiy-1oi9 22.34 0.18 -FEP_26-1oi9 -11.63 0.25 -FEP_28-1h1s -17.33 0.14 -FEP_32-1h1s -26.49 0.48 -FEP_31-1h1s -31.71 0.20 -FEP_20-1h1s -37.13 0.23 -FEP_21-1oiu -55.58 0.71 -FEP_32-1oiu -30.48 0.68 -FEP_32-1oi9 5.30 0.37 -FEP_29-1oiu -35.37 0.54 -FEP_30-1oi9 22.27 0.35 -FEP_29-1oi9 1.35 0.70 -FEP_28-1oi9 11.16 0.95 -FEP_30-1oiu -14.05 1.10 -FEP_26-1oiu -46.60 0.24 -FEP_28-1oiu -22.89 0.70 -FEP_31-1oi9 -3.25 0.66 -FEP_31-1oiu -36.21 0.57 -FEP_1oiy-1oiu -11.58 0.21 -FEP_22-1oiu -51.05 0.66 -FEP_20-1oiu -40.98 0.23 -FEP_26-1oiy -34.48 0.13 -FEP_30-20 29.31 0.22 -FEP_22-20 -10.19 0.33 -FEP_31-1oiy -23.79 0.38 -FEP_22-1oiy -40.49 0.21 -FEP_21-20 -13.82 0.36 -FEP_29-1oiy -22.99 0.52 -FEP_20-1oiy -29.67 0.24 -FEP_28-20 20.41 0.58 -FEP_29-20 5.50 0.77 -FEP_21-1oiy -42.90 0.33 -FEP_28-1oiy -9.39 0.22 -FEP_32-1oiy -17.64 0.35 -FEP_26-20 -5.04 0.24 -FEP_30-1oiy -0.27 0.15 -FEP_28-22 31.29 0.75 -FEP_30-22 39.33 0.46 -FEP_26-21 9.15 0.38 -FEP_32-21 24.85 0.33 -FEP_30-21 42.74 0.32 -FEP_28-21 32.42 0.98 -FEP_29-21 20.19 0.90 -FEP_31-22 15.46 0.46 -FEP_32-20 10.51 0.76 -FEP_29-22 16.62 0.98 -FEP_31-21 18.99 0.28 -FEP_31-20 5.69 0.37 -FEP_26-22 5.84 0.23 -FEP_22-21 2.96 0.13 -FEP_32-22 21.84 0.19 -FEP_30-29 21.39 0.16 -FEP_32-30 -16.75 0.27 -FEP_30-28 8.51 0.15 -FEP_29-26 11.66 0.43 -FEP_28-26 24.68 0.38 -FEP_31-30 -23.29 0.26 -FEP_32-31 6.36 0.57 -FEP_31-28 -14.34 0.25 -FEP_32-28 -7.33 0.24 -FEP_31-29 -1.80 0.27 -FEP_32-26 15.96 0.52 -FEP_30-26 33.82 0.18 -FEP_31-26 10.00 0.14 -FEP_32-29 4.54 0.70 -FEP_29-28 -13.11 0.14 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/pairs.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/pairs.txt deleted file mode 100755 index caf277ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/pairs.txt +++ /dev/null @@ -1,120 +0,0 @@ -1h1q 17 -1h1r 17 -1h1s 17 -1oi9 17 -1oiu 17 -1oiy 17 -20 17 -21 17 -22 17 -26 17 -28 17 -29 17 -30 17 -31 17 -32 17 -1h1r 1h1q -1h1s 1h1q -1oi9 1h1q -1oiu 1h1q -1oiy 1h1q -20 1h1q -21 1h1q -22 1h1q -26 1h1q -28 1h1q -29 1h1q -30 1h1q -31 1h1q -32 1h1q -1h1s 1h1r -1oi9 1h1r -1oiu 1h1r -1oiy 1h1r -20 1h1r -21 1h1r -22 1h1r -26 1h1r -28 1h1r -29 1h1r -30 1h1r -31 1h1r -32 1h1r -1oi9 1h1s -1oiu 1h1s -1oiy 1h1s -20 1h1s -21 1h1s -22 1h1s -26 1h1s -28 1h1s -29 1h1s -30 1h1s -31 1h1s -32 1h1s -1oiu 1oi9 -1oiy 1oi9 -20 1oi9 -21 1oi9 -22 1oi9 -26 1oi9 -28 1oi9 -29 1oi9 -30 1oi9 -31 1oi9 -32 1oi9 -1oiy 1oiu -20 1oiu -21 1oiu -22 1oiu -26 1oiu -28 1oiu -29 1oiu -30 1oiu -31 1oiu -32 1oiu -20 1oiy -21 1oiy -22 1oiy -26 1oiy -28 1oiy -29 1oiy -30 1oiy -31 1oiy -32 1oiy -21 20 -22 20 -26 20 -28 20 -29 20 -30 20 -31 20 -32 20 -22 21 -26 21 -28 21 -29 21 -30 21 -31 21 -32 21 -26 22 -28 22 -29 22 -30 22 -31 22 -32 22 -28 26 -29 26 -30 26 -31 26 -32 26 -29 28 -30 28 -31 28 -32 28 -30 29 -31 29 -32 29 -31 30 -32 30 -32 31 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index 4337cb22..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_30-1h1q 36.73 0.44 -FEP_22-1h1q -3.57 0.39 -FEP_21-1h1r -2.32 0.11 -FEP_1h1s-17 50.61 0.57 -FEP_29-1h1r 17.23 1.02 -FEP_31-1h1r 18.28 0.73 -FEP_30-1h1r 40.01 0.76 -FEP_1h1s-1h1r 51.56 0.8 -FEP_1h1r-1h1q -3.14 0.29 -FEP_20-1h1r 12 0.39 -FEP_32-17 21.99 0.56 -FEP_1oiy-1h1q 39.91 0.42 -FEP_32-1h1q 19.79 1.14 -FEP_21-17 -2.76 0.32 -FEP_22-1h1r -0.26 0.3 -FEP_32-1h1r 21.8 0.9 -FEP_1oiu-17 55.46 0.34 -FEP_1oi9-1h1r 20.92 0.85 -FEP_21-1h1q -5.03 0.4 -FEP_26-17 7.24 0.42 -FEP_30-17 41.71 0.51 -FEP_20-1h1q 8.45 0.3 -FEP_1oiy-17 40.42 0.58 -FEP_20-17 11.25 0.26 -FEP_1oi9-17 19.25 0.39 -FEP_28-1h1r 32 0.8 -FEP_1h1s-1h1q 46.74 0.75 -FEP_26-1h1q 3.59 0.56 -FEP_1h1q-17 2.85 0.34 -FEP_1oi9-1h1q 17.02 0.33 -FEP_28-1h1q 26.51 1.55 -FEP_22-17 -0.52 0.18 -FEP_28-17 32.45 0.96 -FEP_29-1h1q 14.91 1.11 -FEP_31-1h1q 14.1 0.75 -FEP_1oiu-1h1s 3.08 0.54 -FEP_1oiy-1h1r 41.32 0.52 -FEP_29-17 20.8 0.67 -FEP_1oi9-1h1s -29.01 1.04 -FEP_1oiy-1h1s -8.3 0.1 -FEP_1oiu-1h1q 51.56 0.41 -FEP_1oiu-1h1r 55.37 0.63 -FEP_26-1h1r 6.07 0.64 -FEP_31-17 16.7 0.67 -FEP_1h1r-17 -0.26 0.26 -FEP_26-1oiy -36.83 0.31 -FEP_28-22 30.57 1.07 -FEP_30-29 21.46 0.26 -FEP_32-30 -17.45 0.39 -FEP_21-1oiu -57.01 0.27 -FEP_30-20 28.26 0.43 -FEP_30-1h1s -9.92 0.34 -FEP_30-22 39.33 0.71 -FEP_30-28 7.67 0.2 -FEP_22-20 -11.2 0.28 -FEP_32-1oiu -32.52 0.74 -FEP_31-1oiy -25.21 0.34 -FEP_22-1oiy -43.65 0.44 -FEP_32-1oi9 2.35 1.23 -FEP_29-26 12.08 0.65 -FEP_28-26 24.71 0.47 -FEP_21-1h1s -54.11 1.02 -FEP_26-21 9.54 0.87 -FEP_32-21 24.3 0.63 -FEP_29-1oiu -36.29 0.74 -FEP_29-1h1s -32.63 0.82 -FEP_20-1oi9 -8.93 0.22 -FEP_30-21 42.93 0.93 -FEP_31-30 -22.56 0.38 -FEP_21-1oi9 -22.81 0.69 -FEP_32-31 6.02 0.37 -FEP_28-21 34.29 1.07 -FEP_26-1h1s -44.65 0.6 -FEP_22-1h1s -49.75 0.46 -FEP_30-1oi9 18.24 0.83 -FEP_31-28 -14.21 0.5 -FEP_21-20 -13.71 0.41 -FEP_32-28 -9.44 0.51 -FEP_31-29 0.38 0.34 -FEP_29-21 23.56 0.91 -FEP_29-1oiy -25.43 0.8 -FEP_29-1oi9 nan nan -FEP_31-22 16.36 0.64 -FEP_28-1oi9 8.65 1.39 -FEP_20-1oiy -31.77 0.52 -FEP_1oiu-1oi9 33.8 0.53 -FEP_32-20 9.95 0.79 -FEP_30-1oiu -13.49 0.55 -FEP_22-1oi9 -20.92 0.64 -FEP_32-26 16.94 0.56 -FEP_30-26 33.8 0.34 -FEP_28-20 18.81 0.93 -FEP_29-22 17.82 0.54 -FEP_29-20 7.39 0.3 -FEP_31-26 11.44 0.39 -FEP_31-21 20.06 0.79 -FEP_21-1oiy -43.17 0.64 -FEP_28-1oiy -9.94 0.62 -FEP_1oiy-1oi9 20.94 0.4 -FEP_26-1oiu -46.98 0.49 -FEP_32-1oiy -20.54 0.87 -FEP_26-1oi9 -13.08 0.19 -FEP_31-20 6.99 0.46 -FEP_28-1h1s -16.62 0.72 -FEP_28-1oiu -22.55 0.46 -FEP_31-1oi9 -5.1 0.87 -FEP_32-1h1s -28.07 0.21 -FEP_26-20 -4.82 0.47 -FEP_26-22 8.19 0.95 -FEP_30-1oiy -2.84 0.4 -FEP_31-1h1s -33.63 0.32 -FEP_22-21 3.07 0.21 -FEP_31-1oiu -35.92 0.68 -FEP_20-1h1s -39.04 0.41 -FEP_1oiy-1oiu -12.02 0.38 -FEP_32-22 22.79 0.38 -FEP_32-29 3.76 0.42 -FEP_22-1oiu -54.97 0.54 -FEP_29-28 -13.19 0.26 -FEP_20-1oiu -43.04 0.27 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 1adb19db..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1h1q-17/ 2 -FEP_1h1r-17/ 1 -FEP_1h1r-1h1q/ 3 -FEP_1h1s-17/ 1 -FEP_1h1s-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-17/ 2 -FEP_1oi9-1h1q/ 1 -FEP_1oi9-1h1r/ 1 -FEP_1oi9-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-17/ 0 -FEP_1oiu-1h1q/ 0 -FEP_1oiu-1h1r/ 2 -FEP_1oiu-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-1oi9/ 3 -FEP_1oiy-17/ 0 -FEP_1oiy-1h1q/ 1 -FEP_1oiy-1h1r/ 0 -FEP_1oiy-1h1s/ 1 -FEP_1oiy-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-1oiu/ 2 -FEP_20-17/ 1 -FEP_20-1h1q/ 1 -FEP_20-1h1r/ 0 -FEP_20-1h1s/ 2 -FEP_20-1oi9/ 2 -FEP_20-1oiu/ 0 -FEP_20-1oiy/ 2 -FEP_21-17/ 0 -FEP_21-1h1q/ 1 -FEP_21-1h1r/ 0 -FEP_21-1h1s/ 1 -FEP_21-1oi9/ 0 -FEP_21-1oiu/ 0 -FEP_21-1oiy/ 3 -FEP_21-20/ 0 -FEP_22-17/ 3 -FEP_22-1h1q/ 1 -FEP_22-1h1r/ 1 -FEP_22-1h1s/ 1 -FEP_22-1oi9/ 0 -FEP_22-1oiu/ 0 -FEP_22-1oiy/ 2 -FEP_22-20/ 0 -FEP_22-21/ 1 -FEP_26-17/ 3 -FEP_26-1h1q/ 1 -FEP_26-1h1r/ 1 -FEP_26-1h1s/ 0 -FEP_26-1oi9/ 1 -FEP_26-1oiu/ 0 -FEP_26-1oiy/ 1 -FEP_26-20/ 0 -FEP_26-21/ 2 -FEP_26-22/ 0 -FEP_28-17/ 1 -FEP_28-1h1q/ 3 -FEP_28-1h1r/ 1 -FEP_28-1h1s/ 1 -FEP_28-1oi9/ 0 -FEP_28-1oiu/ 0 -FEP_28-1oiy/ 0 -FEP_28-20/ 1 -FEP_28-21/ 1 -FEP_28-22/ 0 -FEP_28-26/ 1 -FEP_29-17/ 1 -FEP_29-1h1q/ 1 -FEP_29-1h1r/ 2 -FEP_29-1h1s/ 1 -FEP_29-1oi9/ 2 -FEP_29-1oiu/ 1 -FEP_29-1oiy/ 0 -FEP_29-20/ 2 -FEP_29-21/ 1 -FEP_29-22/ 3 -FEP_29-26/ 2 -FEP_29-28/ 1 -FEP_30-17/ 3 -FEP_30-1h1q/ 0 -FEP_30-1h1r/ 1 -FEP_30-1h1s/ 1 -FEP_30-1oi9/ 1 -FEP_30-1oiu/ 0 -FEP_30-1oiy/ 2 -FEP_30-20/ 1 -FEP_30-21/ 1 -FEP_30-22/ 2 -FEP_30-26/ 3 -FEP_30-28/ 1 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-17/ 0 -FEP_31-1h1q/ 1 -FEP_31-1h1r/ 1 -FEP_31-1h1s/ 1 -FEP_31-1oi9/ 1 -FEP_31-1oiu/ 1 -FEP_31-1oiy/ 2 -FEP_31-20/ 0 -FEP_31-21/ 1 -FEP_31-22/ 2 -FEP_31-26/ 2 -FEP_31-28/ 1 -FEP_31-29/ 1 -FEP_31-30/ 1 -FEP_32-17/ 0 -FEP_32-1h1q/ 3 -FEP_32-1h1r/ 1 -FEP_32-1h1s/ 1 -FEP_32-1oi9/ 2 -FEP_32-1oiu/ 1 -FEP_32-1oiy/ 0 -FEP_32-20/ 0 -FEP_32-21/ 1 -FEP_32-22/ 2 -FEP_32-26/ 1 -FEP_32-28/ 0 -FEP_32-29/ 0 -FEP_32-30/ 2 -FEP_32-31/ 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index e3c48e06..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_30-1h1q 36.28 0.51 -FEP_22-1h1q -2.33 0.48 -FEP_21-1h1r -1.73 0.22 -FEP_1h1s-17 49.16 0.39 -FEP_29-1h1r 19.16 0.41 -FEP_31-1h1r 17.21 0.26 -FEP_30-1h1r 40.45 0.42 -FEP_1h1s-1h1r 49.03 0.23 -FEP_1h1r-1h1q -3.32 0.17 -FEP_20-1h1r 11.65 0.17 -FEP_32-17 23.44 0.29 -FEP_1oiy-1h1q 37.81 0.13 -FEP_32-1h1q 20.33 0.51 -FEP_21-17 -1.6 0.3 -FEP_22-1h1r 1.78 0.3 -FEP_32-1h1r 23.39 0.32 -FEP_1oiu-17 52.81 0.18 -FEP_1oi9-1h1r 18.61 0.1 -FEP_21-1h1q -4.96 0.2 -FEP_26-17 6.39 0.2 -FEP_30-17 40.55 0.4 -FEP_20-1h1q 8.52 0.2 -FEP_1oiy-17 40.86 0.14 -FEP_20-17 11.07 0.24 -FEP_1oi9-17 18.53 0.19 -FEP_28-1h1r 31.15 0.46 -FEP_1h1s-1h1q 45.82 0.52 -FEP_26-1h1q 3.65 0.26 -FEP_1h1q-17 2.93 0.17 -FEP_1oi9-1h1q 15.19 0.17 -FEP_28-1h1q 28.5 0.4 -FEP_22-17 0.99 0.23 -FEP_28-17 31.9 0.23 -FEP_29-1h1q 15.26 0.82 -FEP_31-1h1q 13.84 0.53 -FEP_1oiu-1h1s 3.75 0.38 -FEP_1oiy-1h1r 40.47 0.25 -FEP_29-17 17.34 0.5 -FEP_1oi9-1h1s -29.9 0.5 -FEP_1oiy-1h1s -7.82 0.17 -FEP_1oiu-1h1q 49.53 0.26 -FEP_1oiu-1h1r 53.86 0.15 -FEP_26-1h1r 6.74 0.2 -FEP_31-17 17.03 0.41 -FEP_1h1r-17 -0.13 0.21 -FEP_26-1oiy -34.48 0.13 -FEP_28-22 31.29 0.75 -FEP_30-29 21.39 0.16 -FEP_32-30 -16.75 0.27 -FEP_21-1oiu -55.58 0.71 -FEP_30-20 29.31 0.22 -FEP_30-1h1s -8.78 0.17 -FEP_30-22 39.33 0.46 -FEP_30-28 8.51 0.15 -FEP_22-20 -10.19 0.33 -FEP_32-1oiu -30.48 0.68 -FEP_31-1oiy -23.79 0.38 -FEP_22-1oiy -40.49 0.21 -FEP_32-1oi9 5.3 0.37 -FEP_29-26 11.66 0.43 -FEP_28-26 24.68 0.38 -FEP_21-1h1s -51.79 0.36 -FEP_26-21 9.15 0.38 -FEP_32-21 24.85 0.33 -FEP_29-1oiu -35.37 0.54 -FEP_29-1h1s -30.71 0.44 -FEP_20-1oi9 -6.93 0.25 -FEP_30-21 42.74 0.32 -FEP_31-30 -23.29 0.26 -FEP_21-1oi9 -19.89 0.23 -FEP_32-31 6.36 0.57 -FEP_28-21 32.42 0.98 -FEP_26-1h1s -41.91 0.14 -FEP_22-1h1s -47.75 0.34 -FEP_30-1oi9 22.27 0.35 -FEP_31-28 -14.34 0.25 -FEP_21-20 -13.82 0.36 -FEP_32-28 -7.33 0.24 -FEP_31-29 -1.8 0.27 -FEP_29-21 20.19 0.9 -FEP_29-1oiy -22.99 0.52 -FEP_29-1oi9 1.35 0.7 -FEP_31-22 15.46 0.46 -FEP_28-1oi9 11.16 0.95 -FEP_20-1oiy -29.67 0.24 -FEP_1oiu-1oi9 33.76 0.93 -FEP_32-20 10.51 0.76 -FEP_30-1oiu -14.05 1.1 -FEP_22-1oi9 -19.25 0.89 -FEP_32-26 15.96 0.52 -FEP_30-26 33.82 0.18 -FEP_28-20 20.41 0.58 -FEP_29-22 16.62 0.98 -FEP_29-20 5.5 0.77 -FEP_31-26 10 0.14 -FEP_31-21 18.99 0.28 -FEP_21-1oiy -42.9 0.33 -FEP_28-1oiy -9.39 0.22 -FEP_1oiy-1oi9 22.34 0.18 -FEP_26-1oiu -46.6 0.24 -FEP_32-1oiy -17.64 0.35 -FEP_26-1oi9 -11.63 0.25 -FEP_31-20 5.69 0.37 -FEP_28-1h1s -17.33 0.14 -FEP_28-1oiu -22.89 0.7 -FEP_31-1oi9 -3.25 0.66 -FEP_32-1h1s -26.49 0.48 -FEP_26-20 -5.04 0.24 -FEP_26-22 5.84 0.23 -FEP_30-1oiy -0.27 0.15 -FEP_31-1h1s -31.71 0.2 -FEP_22-21 2.96 0.13 -FEP_31-1oiu -36.21 0.57 -FEP_20-1h1s -37.13 0.23 -FEP_1oiy-1oiu -11.58 0.21 -FEP_32-22 21.84 0.19 -FEP_32-29 4.54 0.7 -FEP_22-1oiu -51.05 0.66 -FEP_29-28 -13.11 0.14 -FEP_20-1oiu -40.98 0.23 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index 6d90c60a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/1fs/lineal/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1h1q-17/ 0 -FEP_1h1r-17/ 0 -FEP_1h1r-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-17/ 0 -FEP_1h1s-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-17/ 0 -FEP_1oi9-1h1q/ 0 -FEP_1oi9-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-17/ 0 -FEP_1oiu-1h1q/ 0 -FEP_1oiu-1h1r/ 0 -FEP_1oiu-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-17/ 0 -FEP_1oiy-1h1q/ 0 -FEP_1oiy-1h1r/ 0 -FEP_1oiy-1h1s/ 0 -FEP_1oiy-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-1oiu/ 0 -FEP_20-17/ 0 -FEP_20-1h1q/ 0 -FEP_20-1h1r/ 0 -FEP_20-1h1s/ 0 -FEP_20-1oi9/ 0 -FEP_20-1oiu/ 0 -FEP_20-1oiy/ 0 -FEP_21-17/ 0 -FEP_21-1h1q/ 0 -FEP_21-1h1r/ 0 -FEP_21-1h1s/ 0 -FEP_21-1oi9/ 0 -FEP_21-1oiu/ 0 -FEP_21-1oiy/ 0 -FEP_21-20/ 0 -FEP_22-17/ 0 -FEP_22-1h1q/ 0 -FEP_22-1h1r/ 0 -FEP_22-1h1s/ 0 -FEP_22-1oi9/ 0 -FEP_22-1oiu/ 0 -FEP_22-1oiy/ 0 -FEP_22-20/ 0 -FEP_22-21/ 0 -FEP_26-17/ 0 -FEP_26-1h1q/ 0 -FEP_26-1h1r/ 0 -FEP_26-1h1s/ 0 -FEP_26-1oi9/ 0 -FEP_26-1oiu/ 0 -FEP_26-1oiy/ 0 -FEP_26-20/ 0 -FEP_26-21/ 0 -FEP_26-22/ 0 -FEP_28-17/ 0 -FEP_28-1h1q/ 0 -FEP_28-1h1r/ 0 -FEP_28-1h1s/ 0 -FEP_28-1oi9/ 0 -FEP_28-1oiu/ 0 -FEP_28-1oiy/ 0 -FEP_28-20/ 0 -FEP_28-21/ 0 -FEP_28-22/ 0 -FEP_28-26/ 0 -FEP_29-17/ 0 -FEP_29-1h1q/ 0 -FEP_29-1h1r/ 0 -FEP_29-1h1s/ 0 -FEP_29-1oi9/ 0 -FEP_29-1oiu/ 0 -FEP_29-1oiy/ 0 -FEP_29-20/ 0 -FEP_29-21/ 0 -FEP_29-22/ 0 -FEP_29-26/ 0 -FEP_29-28/ 0 -FEP_30-17/ 0 -FEP_30-1h1q/ 0 -FEP_30-1h1r/ 0 -FEP_30-1h1s/ 0 -FEP_30-1oi9/ 0 -FEP_30-1oiu/ 0 -FEP_30-1oiy/ 0 -FEP_30-20/ 0 -FEP_30-21/ 0 -FEP_30-22/ 0 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-28/ 0 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-17/ 0 -FEP_31-1h1q/ 0 -FEP_31-1h1r/ 0 -FEP_31-1h1s/ 0 -FEP_31-1oi9/ 0 -FEP_31-1oiu/ 0 -FEP_31-1oiy/ 0 -FEP_31-20/ 0 -FEP_31-21/ 0 -FEP_31-22/ 0 -FEP_31-26/ 0 -FEP_31-28/ 0 -FEP_31-29/ 0 -FEP_31-30/ 0 -FEP_32-17/ 0 -FEP_32-1h1q/ 0 -FEP_32-1h1r/ 0 -FEP_32-1h1s/ 0 -FEP_32-1oi9/ 0 -FEP_32-1oiu/ 0 -FEP_32-1oiy/ 0 -FEP_32-20/ 0 -FEP_32-21/ 0 -FEP_32-22/ 0 -FEP_32-26/ 0 -FEP_32-28/ 0 -FEP_32-29/ 0 -FEP_32-30/ 0 -FEP_32-31/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs-sc/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs-sc/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index b5d66b53..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs-sc/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_26-1oiy -34.46 0.8 -FEP_28-22 33.64 0.84 -FEP_30-29 21.31 0.26 -FEP_21-1h1q -5.06 0.3 -FEP_32-30 -16.12 0.44 -FEP_1h1r-1h1q -3.43 0.4 -FEP_21-1oiu -57.44 0.51 -FEP_30-20 29.48 0.32 -FEP_30-1h1s -9.5 0.64 -FEP_30-22 42.66 0.57 -FEP_30-28 8.37 0.29 -FEP_26-17 7.02 0.62 -FEP_22-20 -11.76 0.16 -FEP_32-1oiu -32.54 0.68 -FEP_31-1oiy -23.95 0.29 -FEP_22-1oiy -39.79 0.66 -FEP_32-1oi9 1.84 0.78 -FEP_29-26 11.57 0.8 -FEP_1h1s-1h1q 47.69 0.29 -FEP_22-1h1r 0.42 0.19 -FEP_21-17 -2.22 0.22 -FEP_28-26 26.78 0.28 -FEP_1h1s-1h1r 53.13 0.56 -FEP_21-1h1s -51.31 0.38 -FEP_22-17 -0.34 0.17 -FEP_26-21 11.94 0.86 -FEP_32-21 25.28 0.34 -FEP_1oiy-1h1q 39.63 0.22 -FEP_32-17 24.07 0.6 -FEP_1h1r-17 -0.74 0.16 -FEP_30-17 41.16 1.04 -FEP_29-1h1q 14.89 0.98 -FEP_21-1h1r -2.17 0.21 -FEP_29-1oiu -35.23 0.44 -FEP_29-1h1s -31.26 0.57 -FEP_28-1h1q 28.45 1.08 -FEP_20-1oi9 -8.05 0.35 -FEP_30-21 44.31 0.51 -FEP_1oiu-1h1s 7.41 1.01 -FEP_31-30 -22.49 0.21 -FEP_21-1oi9 -20.26 0.25 -FEP_32-31 6.04 0.37 -FEP_28-21 36.03 0.77 -FEP_26-1h1s -43.18 0.91 -FEP_22-1h1s -48.16 0.76 -FEP_30-1oi9 21.15 0.68 -FEP_31-17 19.69 0.46 -FEP_30-1h1q 38.89 0.23 -FEP_31-28 -13.72 0.33 -FEP_32-1h1q 20.99 0.49 -FEP_20-1h1q 8.78 0.27 -FEP_21-20 -13.8 0.36 -FEP_28-1h1r 33.88 0.3 -FEP_26-1h1q 3.94 0.26 -FEP_26-1h1r 7.51 0.2 -FEP_32-1h1r 23.46 0.51 -FEP_1oi9-1h1q 17.3 0.39 -FEP_32-28 -9.37 0.45 -FEP_1oi9-1h1r 22.2 0.48 -FEP_1oiy-1h1s -7.69 0.24 -FEP_31-29 -1.49 0.34 -FEP_29-21 23.69 1.19 -FEP_1h1s-17 52.78 0.7 -FEP_29-1oiy -24.21 0.64 -FEP_29-17 19.55 1.48 -FEP_29-1oi9 -2.45 1.13 -FEP_20-1h1r 13.43 0.99 -FEP_31-22 21 1.3 -FEP_28-1oi9 10.49 0.66 -FEP_20-1oiy -30.18 0.42 -FEP_1oiu-1oi9 35.76 0.36 -FEP_32-20 11.19 0.61 -FEP_1oiu-17 55.68 0.33 -FEP_30-1oiu -12.87 0.64 -FEP_20-17 11.82 0.2 -FEP_22-1oi9 -17.92 0.39 -FEP_32-26 18.29 0.71 -FEP_30-26 34.85 0.25 -FEP_22-1h1q -2.08 0.5 -FEP_1oiu-1h1r 56.62 0.42 -FEP_28-20 21.06 0.63 -FEP_29-22 22.37 1.78 -FEP_29-20 6.86 1.1 -FEP_31-26 12.09 0.25 -FEP_1oi9-1h1s -29.11 0.46 -FEP_1oiy-17 42.85 0.46 -FEP_28-17 32.91 0.5 -FEP_1oiy-1h1r 44.67 0.5 -FEP_31-21 21.77 0.58 -FEP_21-1oiy -42.58 0.65 -FEP_28-1oiy -8.34 0.37 -FEP_31-1h1q 15.33 0.26 -FEP_1oiu-1h1q 52.17 0.44 -FEP_1oiy-1oi9 21.45 0.4 -FEP_26-1oiu -48.05 0.56 -FEP_32-1oiy -16.14 0.63 -FEP_26-1oi9 -13.34 0.4 -FEP_31-20 5.61 0.72 -FEP_1h1q-17 3.41 0.51 -FEP_28-1h1s -18.16 0.35 -FEP_28-1oiu -20.71 0.58 -FEP_31-1oi9 -2.27 0.47 -FEP_29-1h1r 21.12 0.69 -FEP_32-1h1s -27.6 0.34 -FEP_26-20 -5.11 0.35 -FEP_26-22 8.85 0.81 -FEP_30-1oiy -0.95 0.36 -FEP_31-1h1r 20.72 0.44 -FEP_31-1h1s -31.97 0.27 -FEP_22-21 3.61 0.25 -FEP_1oi9-17 21.35 0.49 -FEP_31-1oiu -36.27 0.46 -FEP_20-1h1s -38.02 0.56 -FEP_1oiy-1oiu -12.58 0.36 -FEP_32-22 23.1 0.63 -FEP_32-29 4.43 0.77 -FEP_30-1h1r 42.41 0.52 -FEP_22-1oiu -54.83 0.7 -FEP_29-28 -12.77 0.31 -FEP_20-1oiu -43.07 0.26 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs-sc/lineal/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs-sc/lineal/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 9f288222..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs-sc/lineal/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1h1q-17/ 2 -FEP_1h1r-17/ 3 -FEP_1h1r-1h1q/ 6 -FEP_1h1s-17/ 3 -FEP_1h1s-1h1q/ 2 -FEP_1h1s-1h1r/ 3 -FEP_1oi9-17/ 3 -FEP_1oi9-1h1q/ 4 -FEP_1oi9-1h1r/ 3 -FEP_1oi9-1h1s/ 2 -FEP_1oiu-17/ 3 -FEP_1oiu-1h1q/ 4 -FEP_1oiu-1h1r/ 1 -FEP_1oiu-1h1s/ 3 -FEP_1oiu-1oi9/ 1 -FEP_1oiy-17/ 1 -FEP_1oiy-1h1q/ 3 -FEP_1oiy-1h1r/ 4 -FEP_1oiy-1h1s/ 2 -FEP_1oiy-1oi9/ 1 -FEP_1oiy-1oiu/ 4 -FEP_20-17/ 5 -FEP_20-1h1q/ 3 -FEP_20-1h1r/ 4 -FEP_20-1h1s/ 4 -FEP_20-1oi9/ 3 -FEP_20-1oiu/ 4 -FEP_20-1oiy/ 4 -FEP_21-17/ 4 -FEP_21-1h1q/ 3 -FEP_21-1h1r/ 1 -FEP_21-1h1s/ 4 -FEP_21-1oi9/ 3 -FEP_21-1oiu/ 2 -FEP_21-1oiy/ 1 -FEP_21-20/ 0 -FEP_22-17/ 1 -FEP_22-1h1q/ 1 -FEP_22-1h1r/ 4 -FEP_22-1h1s/ 2 -FEP_22-1oi9/ 3 -FEP_22-1oiu/ 2 -FEP_22-1oiy/ 2 -FEP_22-20/ 3 -FEP_22-21/ 5 -FEP_26-17/ 2 -FEP_26-1h1q/ 1 -FEP_26-1h1r/ 6 -FEP_26-1h1s/ 4 -FEP_26-1oi9/ 2 -FEP_26-1oiu/ 1 -FEP_26-1oiy/ 1 -FEP_26-20/ 0 -FEP_26-21/ 1 -FEP_26-22/ 4 -FEP_28-17/ 1 -FEP_28-1h1q/ 4 -FEP_28-1h1r/ 2 -FEP_28-1h1s/ 3 -FEP_28-1oi9/ 0 -FEP_28-1oiu/ 2 -FEP_28-1oiy/ 3 -FEP_28-20/ 3 -FEP_28-21/ 2 -FEP_28-22/ 3 -FEP_28-26/ 1 -FEP_29-17/ 3 -FEP_29-1h1q/ 4 -FEP_29-1h1r/ 3 -FEP_29-1h1s/ 6 -FEP_29-1oi9/ 6 -FEP_29-1oiu/ 5 -FEP_29-1oiy/ 1 -FEP_29-20/ 6 -FEP_29-21/ 1 -FEP_29-22/ 8 -FEP_29-26/ 0 -FEP_29-28/ 3 -FEP_30-17/ 3 -FEP_30-1h1q/ 2 -FEP_30-1h1r/ 2 -FEP_30-1h1s/ 3 -FEP_30-1oi9/ 2 -FEP_30-1oiu/ 2 -FEP_30-1oiy/ 2 -FEP_30-20/ 2 -FEP_30-21/ 3 -FEP_30-22/ 3 -FEP_30-26/ 1 -FEP_30-28/ 2 -FEP_30-29/ 5 -FEP_31-17/ 2 -FEP_31-1h1q/ 1 -FEP_31-1h1r/ 3 -FEP_31-1h1s/ 4 -FEP_31-1oi9/ 3 -FEP_31-1oiu/ 3 -FEP_31-1oiy/ 3 -FEP_31-20/ 4 -FEP_31-21/ 1 -FEP_31-22/ 4 -FEP_31-26/ 4 -FEP_31-28/ 4 -FEP_31-29/ 4 -FEP_31-30/ 3 -FEP_32-17/ 3 -FEP_32-1h1q/ 3 -FEP_32-1h1r/ 5 -FEP_32-1h1s/ 2 -FEP_32-1oi9/ 1 -FEP_32-1oiu/ 5 -FEP_32-1oiy/ 4 -FEP_32-20/ 2 -FEP_32-21/ 1 -FEP_32-22/ 1 -FEP_32-26/ 5 -FEP_32-28/ 4 -FEP_32-29/ 4 -FEP_32-30/ 2 -FEP_32-31/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs-sc/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs-sc/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index e4b1255c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs-sc/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_26-1oiy -33.83 0.34 -FEP_28-22 31.58 0.51 -FEP_30-29 21.69 0.15 -FEP_21-1h1q -5.75 0.24 -FEP_32-30 -18.05 0.35 -FEP_1h1r-1h1q -3.29 0.13 -FEP_21-1oiu -54.87 0.33 -FEP_30-20 28.76 0.21 -FEP_30-1h1s -8.42 0.12 -FEP_30-22 40.34 0.28 -FEP_30-28 8.47 0.18 -FEP_26-17 6.48 0.2 -FEP_22-20 -9.87 0.34 -FEP_32-1oiu -30.46 0.53 -FEP_31-1oiy -22.63 0.41 -FEP_22-1oiy -39.62 0.27 -FEP_32-1oi9 3.72 0.3 -FEP_29-26 12.42 0.21 -FEP_1h1s-1h1q 45.7 0.19 -FEP_22-1h1r 1.6 0.25 -FEP_21-17 -2.22 0.3 -FEP_28-26 25.52 0.22 -FEP_1h1s-1h1r 48.67 0.24 -FEP_21-1h1s -51.18 0.28 -FEP_22-17 0.15 0.25 -FEP_26-21 11.21 0.74 -FEP_32-21 24.66 0.24 -FEP_1oiy-1h1q 37.75 0.15 -FEP_32-17 22.38 0.3 -FEP_1h1r-17 0.38 0.23 -FEP_30-17 40.6 0.4 -FEP_29-1h1q 15.22 0.64 -FEP_21-1h1r -1.56 0.49 -FEP_29-1oiu -34.02 0.77 -FEP_29-1h1s -30.39 0.28 -FEP_28-1h1q 28.44 0.31 -FEP_20-1oi9 -6.78 0.14 -FEP_30-21 44.04 0.62 -FEP_1oiu-1h1s 4.56 0.48 -FEP_31-30 -22.74 0.19 -FEP_21-1oi9 -19.98 0.31 -FEP_32-31 5.17 0.4 -FEP_28-21 35.11 0.31 -FEP_26-1h1s -42.27 0.09 -FEP_22-1h1s -47.38 0.56 -FEP_30-1oi9 21.61 0.26 -FEP_31-17 17.52 0.3 -FEP_30-1h1q 37.07 0.17 -FEP_31-28 -14.11 0.22 -FEP_32-1h1q 18.53 0.74 -FEP_20-1h1q 8.07 0.11 -FEP_21-20 -13.69 0.27 -FEP_28-1h1r 31.1 0.48 -FEP_26-1h1q 3.44 0.19 -FEP_26-1h1r 6.41 0.14 -FEP_32-1h1r 21.88 0.44 -FEP_1oi9-1h1q 14.97 0.07 -FEP_32-28 -8.7 0.39 -FEP_1oi9-1h1r 18.68 0.24 -FEP_1oiy-1h1s -7.55 0.17 -FEP_31-29 -1.44 0.25 -FEP_29-21 19.67 1.08 -FEP_1h1s-17 48.87 0.6 -FEP_29-1oiy -21.88 0.29 -FEP_29-17 17.13 0.54 -FEP_29-1oi9 -0.37 0.59 -FEP_20-1h1r 11.61 0.18 -FEP_31-22 17.54 0.34 -FEP_28-1oi9 13.12 0.25 -FEP_20-1oiy -29.31 0.12 -FEP_1oiu-1oi9 34.03 0.17 -FEP_32-20 10.43 0.4 -FEP_1oiu-17 51.87 0.58 -FEP_30-1oiu -12.52 0.61 -FEP_20-17 11.91 0.25 -FEP_22-1oi9 -16.49 0.24 -FEP_32-26 16.51 0.35 -FEP_30-26 33.66 0.1 -FEP_22-1h1q -2.06 0.31 -FEP_1oiu-1h1r 52.99 0.29 -FEP_28-20 19.42 0.47 -FEP_29-22 18.47 0.92 -FEP_29-20 5.9 0.66 -FEP_31-26 10.84 0.15 -FEP_1oi9-1h1s -29.82 0.43 -FEP_1oiy-17 40.69 0.42 -FEP_28-17 31.46 0.24 -FEP_1oiy-1h1r 41.36 0.2 -FEP_31-21 21.13 0.37 -FEP_21-1oiy -43.49 0.26 -FEP_28-1oiy -8.83 0.2 -FEP_31-1h1q 13.57 0.19 -FEP_1oiu-1h1q 49.41 0.21 -FEP_1oiy-1oi9 22 0.24 -FEP_26-1oiu -46.41 0.25 -FEP_32-1oiy -17.65 0.23 -FEP_26-1oi9 -11.57 0.21 -FEP_31-20 5.34 0.31 -FEP_1h1q-17 3.65 0.26 -FEP_28-1h1s -17.21 0.23 -FEP_28-1oiu -21.32 0.57 -FEP_31-1oi9 -1.47 0.24 -FEP_29-1h1r 18.18 0.64 -FEP_32-1h1s -26.57 0.23 -FEP_26-20 -4.51 0.19 -FEP_26-22 6.73 0.46 -FEP_30-1oiy -0.27 0.21 -FEP_31-1h1r 17.32 0.31 -FEP_31-1h1s -31.62 0.22 -FEP_22-21 3.51 0.19 -FEP_1oi9-17 18.3 0.26 -FEP_31-1oiu -34.96 0.6 -FEP_20-1h1s -37.43 0.39 -FEP_1oiy-1oiu -11.62 0.41 -FEP_32-22 21.15 0.24 -FEP_32-29 3.33 0.36 -FEP_30-1h1r 40.5 0.28 -FEP_22-1oiu -52.31 0.54 -FEP_29-28 -13.09 0.17 -FEP_20-1oiu -41.59 0.21 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs-sc/lineal/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs-sc/lineal/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index 6d90c60a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs-sc/lineal/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1h1q-17/ 0 -FEP_1h1r-17/ 0 -FEP_1h1r-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-17/ 0 -FEP_1h1s-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-17/ 0 -FEP_1oi9-1h1q/ 0 -FEP_1oi9-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-17/ 0 -FEP_1oiu-1h1q/ 0 -FEP_1oiu-1h1r/ 0 -FEP_1oiu-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-17/ 0 -FEP_1oiy-1h1q/ 0 -FEP_1oiy-1h1r/ 0 -FEP_1oiy-1h1s/ 0 -FEP_1oiy-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-1oiu/ 0 -FEP_20-17/ 0 -FEP_20-1h1q/ 0 -FEP_20-1h1r/ 0 -FEP_20-1h1s/ 0 -FEP_20-1oi9/ 0 -FEP_20-1oiu/ 0 -FEP_20-1oiy/ 0 -FEP_21-17/ 0 -FEP_21-1h1q/ 0 -FEP_21-1h1r/ 0 -FEP_21-1h1s/ 0 -FEP_21-1oi9/ 0 -FEP_21-1oiu/ 0 -FEP_21-1oiy/ 0 -FEP_21-20/ 0 -FEP_22-17/ 0 -FEP_22-1h1q/ 0 -FEP_22-1h1r/ 0 -FEP_22-1h1s/ 0 -FEP_22-1oi9/ 0 -FEP_22-1oiu/ 0 -FEP_22-1oiy/ 0 -FEP_22-20/ 0 -FEP_22-21/ 0 -FEP_26-17/ 0 -FEP_26-1h1q/ 0 -FEP_26-1h1r/ 0 -FEP_26-1h1s/ 0 -FEP_26-1oi9/ 0 -FEP_26-1oiu/ 0 -FEP_26-1oiy/ 0 -FEP_26-20/ 0 -FEP_26-21/ 0 -FEP_26-22/ 0 -FEP_28-17/ 0 -FEP_28-1h1q/ 0 -FEP_28-1h1r/ 0 -FEP_28-1h1s/ 0 -FEP_28-1oi9/ 0 -FEP_28-1oiu/ 0 -FEP_28-1oiy/ 0 -FEP_28-20/ 0 -FEP_28-21/ 0 -FEP_28-22/ 0 -FEP_28-26/ 0 -FEP_29-17/ 0 -FEP_29-1h1q/ 0 -FEP_29-1h1r/ 0 -FEP_29-1h1s/ 0 -FEP_29-1oi9/ 0 -FEP_29-1oiu/ 0 -FEP_29-1oiy/ 0 -FEP_29-20/ 0 -FEP_29-21/ 0 -FEP_29-22/ 0 -FEP_29-26/ 0 -FEP_29-28/ 0 -FEP_30-17/ 0 -FEP_30-1h1q/ 0 -FEP_30-1h1r/ 0 -FEP_30-1h1s/ 0 -FEP_30-1oi9/ 0 -FEP_30-1oiu/ 0 -FEP_30-1oiy/ 0 -FEP_30-20/ 0 -FEP_30-21/ 0 -FEP_30-22/ 0 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-28/ 0 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-17/ 0 -FEP_31-1h1q/ 0 -FEP_31-1h1r/ 0 -FEP_31-1h1s/ 0 -FEP_31-1oi9/ 0 -FEP_31-1oiu/ 0 -FEP_31-1oiy/ 0 -FEP_31-20/ 0 -FEP_31-21/ 0 -FEP_31-22/ 0 -FEP_31-26/ 0 -FEP_31-28/ 0 -FEP_31-29/ 0 -FEP_31-30/ 0 -FEP_32-17/ 0 -FEP_32-1h1q/ 0 -FEP_32-1h1r/ 0 -FEP_32-1h1s/ 0 -FEP_32-1oi9/ 0 -FEP_32-1oiu/ 0 -FEP_32-1oiy/ 0 -FEP_32-20/ 0 -FEP_32-21/ 0 -FEP_32-22/ 0 -FEP_32-26/ 0 -FEP_32-28/ 0 -FEP_32-29/ 0 -FEP_32-30/ 0 -FEP_32-31/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/.ipynb_checkpoints/protein-checkpoint.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/.ipynb_checkpoints/protein-checkpoint.txt deleted file mode 100755 index 39337a0d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/.ipynb_checkpoints/protein-checkpoint.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_26-17 7.67 0.27 -FEP_21-17 -3.04 0.21 -FEP_22-17 -0.60 0.32 -FEP_32-17 22.97 0.89 -FEP_1h1r-17 -0.70 0.33 -FEP_30-17 41.52 1.05 -FEP_31-17 17.76 0.60 -FEP_1h1s-17 49.72 0.55 -FEP_29-17 17.65 1.00 -FEP_1oiu-17 55.36 0.43 -FEP_20-17 10.88 0.27 -FEP_1oiy-17 43.90 0.90 -FEP_28-17 33.37 0.67 -FEP_1h1q-17 3.06 0.34 -FEP_1oi9-17 19.47 0.61 -FEP_21-1h1q -5.38 0.33 -FEP_1h1r-1h1q -3.56 0.33 -FEP_1h1s-1h1q 47.64 0.51 -FEP_1h1s-1h1r 51.92 0.69 -FEP_1oiy-1h1q 40.51 0.33 -FEP_29-1h1q 16.17 1.46 -FEP_28-1h1q 29.14 0.75 -FEP_30-1h1q 34.49 0.81 -FEP_32-1h1q 19.15 0.73 -FEP_20-1h1q 9.12 0.28 -FEP_26-1h1q 3.51 0.61 -FEP_1oi9-1h1q 18.41 0.29 -FEP_22-1h1q -2.79 0.53 -FEP_31-1h1q 15.52 0.37 -FEP_1oiu-1h1q 51.14 0.54 -FEP_22-1h1r 0.33 0.25 -FEP_21-1h1r -1.91 0.38 -FEP_1oiu-1h1s 4.61 0.37 -FEP_28-1h1r 31.95 0.71 -FEP_26-1h1r 6.75 0.45 -FEP_32-1h1r 22.14 0.61 -FEP_1oi9-1h1r 20.94 0.62 -FEP_1oiy-1h1s -8.23 0.27 -FEP_20-1h1r 12.18 0.35 -FEP_1oiu-1h1r 56.04 0.39 -FEP_1oi9-1h1s -29.17 0.52 -FEP_1oiy-1h1r 42.52 0.62 -FEP_29-1h1r 20.34 1.07 -FEP_31-1h1r 18.67 0.94 -FEP_30-1h1r 40.71 0.73 -FEP_30-1h1s -10.15 0.18 -FEP_21-1h1s -53.61 0.55 -FEP_29-1h1s -33.66 0.59 -FEP_20-1oi9 -8.89 0.41 -FEP_21-1oi9 -21.92 0.68 -FEP_26-1h1s -43.57 0.70 -FEP_22-1h1s -50.46 0.58 -FEP_1oiu-1oi9 34.77 0.44 -FEP_22-1oi9 -20.31 0.42 -FEP_1oiy-1oi9 21.08 0.45 -FEP_26-1oi9 -13.44 0.44 -FEP_28-1h1s -18.29 0.60 -FEP_32-1h1s -29.08 0.87 -FEP_31-1h1s -33.07 0.28 -FEP_20-1h1s -38.02 0.91 -FEP_21-1oiu -58.02 0.33 -FEP_32-1oiu -34.57 0.60 -FEP_32-1oi9 1.98 0.71 -FEP_29-1oiu -38.69 nan -FEP_30-1oi9 18.16 1.20 -FEP_29-1oi9 nan nan -FEP_28-1oi9 8.74 0.86 -FEP_30-1oiu -16.18 0.99 -FEP_26-1oiu -48.74 0.45 -FEP_28-1oiu -24.19 0.66 -FEP_31-1oi9 -3.47 0.63 -FEP_31-1oiu -36.03 0.47 -FEP_1oiy-1oiu -12.24 0.48 -FEP_22-1oiu -54.87 0.88 -FEP_20-1oiu -42.91 0.29 -FEP_26-1oiy -36.35 0.23 -FEP_30-20 29.89 0.65 -FEP_22-20 -11.55 0.44 -FEP_31-1oiy -23.91 0.16 -FEP_22-1oiy -41.68 0.84 -FEP_21-20 -13.16 0.38 -FEP_29-1oiy -24.51 0.79 -FEP_20-1oiy -30.97 0.43 -FEP_28-20 20.37 0.89 -FEP_29-20 7.91 0.34 -FEP_21-1oiy -46.10 0.87 -FEP_28-1oiy -11.73 0.93 -FEP_32-1oiy -20.18 0.22 -FEP_26-20 -4.77 0.58 -FEP_30-1oiy -1.92 0.18 -FEP_28-22 33.78 0.54 -FEP_30-22 41.51 0.63 -FEP_26-21 9.79 0.62 -FEP_32-21 24.64 0.47 -FEP_30-21 42.31 0.65 -FEP_28-21 34.01 1.00 -FEP_29-21 24.34 0.94 -FEP_31-22 19.65 0.73 -FEP_32-20 10.72 0.81 -FEP_29-22 20.48 1.02 -FEP_31-21 19.72 1.24 -FEP_31-20 5.12 0.88 -FEP_26-22 7.10 0.59 -FEP_22-21 3.10 0.45 -FEP_32-22 23.09 0.40 -FEP_30-29 21.46 0.71 -FEP_32-30 -18.49 0.39 -FEP_30-28 8.16 0.22 -FEP_29-26 11.92 0.77 -FEP_28-26 25.67 0.58 -FEP_31-30 -22.17 0.14 -FEP_32-31 4.90 0.42 -FEP_31-28 -14.01 0.20 -FEP_32-28 -8.59 0.50 -FEP_31-29 -1.31 0.33 -FEP_32-26 16.88 0.75 -FEP_30-26 34.37 0.34 -FEP_31-26 11.69 0.25 -FEP_32-29 3.25 0.39 -FEP_29-28 -12.65 0.22 \ No newline at end of file diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/.ipynb_checkpoints/water-checkpoint.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/.ipynb_checkpoints/water-checkpoint.txt deleted file mode 100755 index 80df78e2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/.ipynb_checkpoints/water-checkpoint.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_26-17 6.71 0.31 -FEP_21-17 -2.45 0.28 -FEP_22-17 1.20 0.22 -FEP_32-17 20.69 1.02 -FEP_1h1r-17 -0.37 0.24 -FEP_30-17 39.94 0.54 -FEP_31-17 16.71 0.40 -FEP_1h1s-17 48.02 0.23 -FEP_29-17 16.75 1.34 -FEP_1oiu-17 52.47 0.41 -FEP_20-17 11.09 0.27 -FEP_1oiy-17 39.69 0.30 -FEP_28-17 31.76 0.51 -FEP_1h1q-17 3.05 0.23 -FEP_1oi9-17 18.30 0.19 -FEP_21-1h1q -6.38 0.59 -FEP_1h1r-1h1q -3.51 0.15 -FEP_1h1s-1h1q 44.53 0.32 -FEP_1h1s-1h1r 49.05 0.30 -FEP_1oiy-1h1q 37.99 0.13 -FEP_29-1h1q 13.11 0.40 -FEP_28-1h1q 28.79 0.34 -FEP_30-1h1q 35.40 0.38 -FEP_32-1h1q 18.16 0.45 -FEP_20-1h1q 8.26 0.12 -FEP_26-1h1q 3.28 0.20 -FEP_1oi9-1h1q 15.20 0.18 -FEP_22-1h1q -2.26 0.22 -FEP_31-1h1q 13.70 0.49 -FEP_1oiu-1h1q 49.41 0.28 -FEP_22-1h1r 0.82 0.33 -FEP_21-1h1r -1.94 0.12 -FEP_1oiu-1h1s 5.00 0.58 -FEP_28-1h1r 29.24 1.15 -FEP_26-1h1r 6.32 0.28 -FEP_32-1h1r 21.84 0.65 -FEP_1oi9-1h1r 18.62 0.18 -FEP_1oiy-1h1s -7.93 0.21 -FEP_20-1h1r 11.07 0.16 -FEP_1oiu-1h1r 52.58 0.35 -FEP_1oi9-1h1s -30.23 0.49 -FEP_1oiy-1h1r 40.10 0.18 -FEP_29-1h1r 18.24 0.99 -FEP_31-1h1r 17.00 0.41 -FEP_30-1h1r 39.96 0.46 -FEP_30-1h1s -8.53 0.14 -FEP_21-1h1s -50.98 0.23 -FEP_29-1h1s -30.30 0.25 -FEP_20-1oi9 -7.07 0.21 -FEP_21-1oi9 -20.42 0.22 -FEP_26-1h1s -42.13 0.25 -FEP_22-1h1s -47.16 0.41 -FEP_1oiu-1oi9 34.06 0.45 -FEP_22-1oi9 -17.63 0.86 -FEP_1oiy-1oi9 21.91 0.21 -FEP_26-1oi9 -11.78 0.36 -FEP_28-1h1s -17.09 0.22 -FEP_32-1h1s -26.38 0.30 -FEP_31-1h1s -31.73 0.15 -FEP_20-1h1s -36.80 0.27 -FEP_21-1oiu -54.82 0.32 -FEP_32-1oiu -31.05 1.11 -FEP_32-1oi9 0.44 0.80 -FEP_29-1oiu -37.00 0.58 -FEP_30-1oi9 20.47 0.78 -FEP_29-1oi9 1.34 0.27 -FEP_28-1oi9 13.99 0.37 -FEP_30-1oiu -13.79 0.62 -FEP_26-1oiu -46.90 0.31 -FEP_28-1oiu -22.49 0.99 -FEP_31-1oi9 -2.10 0.64 -FEP_31-1oiu -37.04 0.77 -FEP_1oiy-1oiu -11.69 0.34 -FEP_22-1oiu -52.53 1.12 -FEP_20-1oiu -41.34 0.28 -FEP_26-1oiy -34.83 0.23 -FEP_30-20 28.47 0.44 -FEP_22-20 -11.15 0.50 -FEP_31-1oiy -23.76 0.19 -FEP_22-1oiy -39.29 0.38 -FEP_21-20 -13.48 0.18 -FEP_29-1oiy -23.30 0.50 -FEP_20-1oiy -29.18 0.16 -FEP_28-20 19.84 0.35 -FEP_29-20 5.25 0.63 -FEP_21-1oiy -43.52 0.39 -FEP_28-1oiy -9.92 0.61 -FEP_32-1oiy -18.39 0.33 -FEP_26-20 -5.66 0.22 -FEP_30-1oiy -0.72 0.33 -FEP_28-22 30.26 0.55 -FEP_30-22 38.37 0.46 -FEP_26-21 10.32 0.76 -FEP_32-21 23.41 0.78 -FEP_30-21 42.60 0.68 -FEP_28-21 32.87 0.46 -FEP_29-21 20.47 0.91 -FEP_31-22 16.68 0.46 -FEP_32-20 10.33 0.57 -FEP_29-22 16.42 0.96 -FEP_31-21 18.55 0.51 -FEP_31-20 5.42 0.29 -FEP_26-22 5.33 0.26 -FEP_22-21 3.32 0.21 -FEP_32-22 21.14 0.30 -FEP_30-29 21.54 0.21 -FEP_32-30 -18.33 0.65 -FEP_30-28 8.53 0.20 -FEP_29-26 12.52 0.32 -FEP_28-26 24.60 0.27 -FEP_31-30 -23.82 0.35 -FEP_32-31 4.97 0.54 -FEP_31-28 -14.27 0.21 -FEP_32-28 -9.24 0.38 -FEP_31-29 -1.62 0.22 -FEP_32-26 16.28 0.32 -FEP_30-26 33.64 0.17 -FEP_31-26 10.41 0.22 -FEP_32-29 5.61 0.46 -FEP_29-28 -13.06 0.24 \ No newline at end of file diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/pairs.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/pairs.txt deleted file mode 100755 index caf277ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/pairs.txt +++ /dev/null @@ -1,120 +0,0 @@ -1h1q 17 -1h1r 17 -1h1s 17 -1oi9 17 -1oiu 17 -1oiy 17 -20 17 -21 17 -22 17 -26 17 -28 17 -29 17 -30 17 -31 17 -32 17 -1h1r 1h1q -1h1s 1h1q -1oi9 1h1q -1oiu 1h1q -1oiy 1h1q -20 1h1q -21 1h1q -22 1h1q -26 1h1q -28 1h1q -29 1h1q -30 1h1q -31 1h1q -32 1h1q -1h1s 1h1r -1oi9 1h1r -1oiu 1h1r -1oiy 1h1r -20 1h1r -21 1h1r -22 1h1r -26 1h1r -28 1h1r -29 1h1r -30 1h1r -31 1h1r -32 1h1r -1oi9 1h1s -1oiu 1h1s -1oiy 1h1s -20 1h1s -21 1h1s -22 1h1s -26 1h1s -28 1h1s -29 1h1s -30 1h1s -31 1h1s -32 1h1s -1oiu 1oi9 -1oiy 1oi9 -20 1oi9 -21 1oi9 -22 1oi9 -26 1oi9 -28 1oi9 -29 1oi9 -30 1oi9 -31 1oi9 -32 1oi9 -1oiy 1oiu -20 1oiu -21 1oiu -22 1oiu -26 1oiu -28 1oiu -29 1oiu -30 1oiu -31 1oiu -32 1oiu -20 1oiy -21 1oiy -22 1oiy -26 1oiy -28 1oiy -29 1oiy -30 1oiy -31 1oiy -32 1oiy -21 20 -22 20 -26 20 -28 20 -29 20 -30 20 -31 20 -32 20 -22 21 -26 21 -28 21 -29 21 -30 21 -31 21 -32 21 -26 22 -28 22 -29 22 -30 22 -31 22 -32 22 -28 26 -29 26 -30 26 -31 26 -32 26 -29 28 -30 28 -31 28 -32 28 -30 29 -31 29 -32 29 -31 30 -32 30 -32 31 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index 45e2745f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_26-1oiy -36.35 0.23 -FEP_28-22 33.78 0.54 -FEP_30-29 21.46 0.71 -FEP_21-1h1q -5.38 0.33 -FEP_32-30 -18.49 0.39 -FEP_1h1r-1h1q -3.56 0.33 -FEP_21-1oiu -58.02 0.33 -FEP_30-20 29.89 0.65 -FEP_30-1h1s -10.15 0.18 -FEP_30-22 41.51 0.63 -FEP_30-28 8.16 0.22 -FEP_26-17 7.67 0.27 -FEP_22-20 -11.55 0.44 -FEP_32-1oiu -34.57 0.6 -FEP_31-1oiy -23.91 0.16 -FEP_22-1oiy -41.68 0.84 -FEP_32-1oi9 1.98 0.71 -FEP_29-26 11.92 0.77 -FEP_1h1s-1h1q 47.64 0.51 -FEP_22-1h1r 0.33 0.25 -FEP_21-17 -3.04 0.21 -FEP_28-26 25.67 0.58 -FEP_1h1s-1h1r 51.92 0.69 -FEP_21-1h1s -53.61 0.55 -FEP_22-17 -0.6 0.32 -FEP_26-21 9.79 0.62 -FEP_32-21 24.64 0.47 -FEP_1oiy-1h1q 40.51 0.33 -FEP_32-17 22.97 0.89 -FEP_1h1r-17 -0.7 0.33 -FEP_30-17 41.52 1.05 -FEP_29-1h1q 16.17 1.46 -FEP_21-1h1r -1.91 0.38 -FEP_29-1oiu -38.69 nan -FEP_29-1h1s -33.66 0.59 -FEP_28-1h1q 29.14 0.75 -FEP_20-1oi9 -8.89 0.41 -FEP_30-21 42.31 0.65 -FEP_1oiu-1h1s 4.61 0.37 -FEP_31-30 -22.17 0.14 -FEP_21-1oi9 -21.92 0.68 -FEP_32-31 4.9 0.42 -FEP_28-21 34.01 1 -FEP_26-1h1s -43.57 0.7 -FEP_22-1h1s -50.46 0.58 -FEP_30-1oi9 18.16 1.2 -FEP_31-17 17.76 0.6 -FEP_30-1h1q 34.49 0.81 -FEP_31-28 -14.01 0.2 -FEP_32-1h1q 19.15 0.73 -FEP_20-1h1q 9.12 0.28 -FEP_21-20 -13.16 0.38 -FEP_28-1h1r 31.95 0.71 -FEP_26-1h1q 3.51 0.61 -FEP_26-1h1r 6.75 0.45 -FEP_32-1h1r 22.14 0.61 -FEP_1oi9-1h1q 18.41 0.29 -FEP_32-28 -8.59 0.5 -FEP_1oi9-1h1r 20.94 0.62 -FEP_1oiy-1h1s -8.23 0.27 -FEP_31-29 -1.31 0.33 -FEP_29-21 24.34 0.94 -FEP_1h1s-17 49.72 0.55 -FEP_29-1oiy -24.51 0.79 -FEP_29-17 17.65 1 -FEP_29-1oi9 0.61 0.38 -FEP_20-1h1r 12.18 0.35 -FEP_31-22 19.65 0.73 -FEP_28-1oi9 8.74 0.86 -FEP_20-1oiy -30.97 0.43 -FEP_1oiu-1oi9 34.77 0.44 -FEP_32-20 10.72 0.81 -FEP_1oiu-17 55.36 0.43 -FEP_30-1oiu -16.18 0.99 -FEP_20-17 10.88 0.27 -FEP_22-1oi9 -20.31 0.42 -FEP_32-26 16.88 0.75 -FEP_30-26 34.37 0.34 -FEP_22-1h1q -2.79 0.53 -FEP_1oiu-1h1r 56.04 0.39 -FEP_28-20 20.37 0.89 -FEP_29-22 20.48 1.02 -FEP_29-20 7.91 0.34 -FEP_31-26 11.69 0.25 -FEP_1oi9-1h1s -29.17 0.52 -FEP_1oiy-17 43.9 0.9 -FEP_28-17 33.37 0.67 -FEP_1oiy-1h1r 42.52 0.62 -FEP_31-21 19.72 1.24 -FEP_21-1oiy -46.1 0.87 -FEP_28-1oiy -11.73 0.93 -FEP_31-1h1q 15.52 0.37 -FEP_1oiu-1h1q 51.14 0.54 -FEP_1oiy-1oi9 21.08 0.45 -FEP_26-1oiu -48.74 0.45 -FEP_32-1oiy -20.18 0.22 -FEP_26-1oi9 -13.44 0.44 -FEP_31-20 5.12 0.88 -FEP_1h1q-17 3.06 0.34 -FEP_28-1h1s -18.29 0.6 -FEP_28-1oiu -24.19 0.66 -FEP_31-1oi9 -3.47 0.63 -FEP_29-1h1r 20.34 1.07 -FEP_32-1h1s -29.08 0.87 -FEP_26-20 -4.77 0.58 -FEP_26-22 7.1 0.59 -FEP_30-1oiy -1.92 0.18 -FEP_31-1h1r 18.67 0.94 -FEP_31-1h1s -33.07 0.28 -FEP_22-21 3.1 0.45 -FEP_1oi9-17 19.47 0.61 -FEP_31-1oiu -36.03 0.47 -FEP_20-1h1s -38.02 0.91 -FEP_1oiy-1oiu -12.24 0.48 -FEP_32-22 23.09 0.4 -FEP_32-29 3.25 0.39 -FEP_30-1h1r 40.71 0.73 -FEP_22-1oiu -54.87 0.88 -FEP_29-28 -12.65 0.22 -FEP_20-1oiu -42.91 0.29 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 0ce71c7d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1h1q-17/ 1 -FEP_1h1r-17/ 2 -FEP_1h1r-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-17/ 1 -FEP_1h1s-1h1q/ 1 -FEP_1h1s-1h1r/ 2 -FEP_1oi9-17/ 0 -FEP_1oi9-1h1q/ 3 -FEP_1oi9-1h1r/ 3 -FEP_1oi9-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-17/ 3 -FEP_1oiu-1h1q/ 2 -FEP_1oiu-1h1r/ 1 -FEP_1oiu-1h1s/ 2 -FEP_1oiu-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-17/ 2 -FEP_1oiy-1h1q/ 4 -FEP_1oiy-1h1r/ 5 -FEP_1oiy-1h1s/ 2 -FEP_1oiy-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-1oiu/ 0 -FEP_20-17/ 4 -FEP_20-1h1q/ 1 -FEP_20-1h1r/ 2 -FEP_20-1h1s/ 1 -FEP_20-1oi9/ 2 -FEP_20-1oiu/ 1 -FEP_20-1oiy/ 0 -FEP_21-17/ 2 -FEP_21-1h1q/ 3 -FEP_21-1h1r/ 2 -FEP_21-1h1s/ 3 -FEP_21-1oi9/ 0 -FEP_21-1oiu/ 0 -FEP_21-1oiy/ 3 -FEP_21-20/ 4 -FEP_22-17/ 3 -FEP_22-1h1q/ 2 -FEP_22-1h1r/ 2 -FEP_22-1h1s/ 1 -FEP_22-1oi9/ 2 -FEP_22-1oiu/ 1 -FEP_22-1oiy/ 1 -FEP_22-20/ 2 -FEP_22-21/ 2 -FEP_26-17/ 2 -FEP_26-1h1q/ 2 -FEP_26-1h1r/ 1 -FEP_26-1h1s/ 3 -FEP_26-1oi9/ 1 -FEP_26-1oiu/ 0 -FEP_26-1oiy/ 5 -FEP_26-20/ 3 -FEP_26-21/ 1 -FEP_26-22/ 1 -FEP_28-17/ 0 -FEP_28-1h1q/ 1 -FEP_28-1h1r/ 1 -FEP_28-1h1s/ 0 -FEP_28-1oi9/ 3 -FEP_28-1oiu/ 1 -FEP_28-1oiy/ 4 -FEP_28-20/ 1 -FEP_28-21/ 1 -FEP_28-22/ 1 -FEP_28-26/ 0 -FEP_29-17/ 3 -FEP_29-1h1q/ 4 -FEP_29-1h1r/ 4 -FEP_29-1h1s/ 6 -FEP_29-1oi9/ 3 -FEP_29-1oiu/ 3 -FEP_29-1oiy/ 3 -FEP_29-20/ 2 -FEP_29-21/ 0 -FEP_29-22/ 0 -FEP_29-26/ 3 -FEP_29-28/ 0 -FEP_30-17/ 3 -FEP_30-1h1q/ 1 -FEP_30-1h1r/ 0 -FEP_30-1h1s/ 2 -FEP_30-1oi9/ 3 -FEP_30-1oiu/ 2 -FEP_30-1oiy/ 4 -FEP_30-20/ 3 -FEP_30-21/ 0 -FEP_30-22/ 2 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-28/ 1 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-17/ 2 -FEP_31-1h1q/ 1 -FEP_31-1h1r/ 0 -FEP_31-1h1s/ 0 -FEP_31-1oi9/ 0 -FEP_31-1oiu/ 3 -FEP_31-1oiy/ 1 -FEP_31-20/ 1 -FEP_31-21/ 2 -FEP_31-22/ 1 -FEP_31-26/ 2 -FEP_31-28/ 1 -FEP_31-29/ 1 -FEP_31-30/ 2 -FEP_32-17/ 2 -FEP_32-1h1q/ 1 -FEP_32-1h1r/ 1 -FEP_32-1h1s/ 2 -FEP_32-1oi9/ 2 -FEP_32-1oiu/ 1 -FEP_32-1oiy/ 2 -FEP_32-20/ 2 -FEP_32-21/ 2 -FEP_32-22/ 4 -FEP_32-26/ 2 -FEP_32-28/ 2 -FEP_32-29/ 2 -FEP_32-30/ 2 -FEP_32-31/ 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index 23e46d86..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_26-1oiy -34.83 0.23 -FEP_28-22 30.26 0.55 -FEP_30-29 21.54 0.21 -FEP_21-1h1q -6.38 0.59 -FEP_32-30 -18.33 0.65 -FEP_1h1r-1h1q -3.51 0.15 -FEP_21-1oiu -54.82 0.32 -FEP_30-20 28.47 0.44 -FEP_30-1h1s -8.53 0.14 -FEP_30-22 38.37 0.46 -FEP_30-28 8.53 0.2 -FEP_26-17 6.71 0.31 -FEP_22-20 -11.15 0.5 -FEP_32-1oiu -31.05 1.11 -FEP_31-1oiy -23.76 0.19 -FEP_22-1oiy -39.29 0.38 -FEP_32-1oi9 0.44 0.8 -FEP_29-26 12.52 0.32 -FEP_1h1s-1h1q 44.53 0.32 -FEP_22-1h1r 0.82 0.33 -FEP_21-17 -2.45 0.28 -FEP_28-26 24.6 0.27 -FEP_1h1s-1h1r 49.05 0.3 -FEP_21-1h1s -50.98 0.23 -FEP_22-17 1.2 0.22 -FEP_26-21 10.32 0.76 -FEP_32-21 23.41 0.78 -FEP_1oiy-1h1q 37.99 0.13 -FEP_32-17 20.69 1.02 -FEP_1h1r-17 -0.37 0.24 -FEP_30-17 39.94 0.54 -FEP_29-1h1q 13.11 0.4 -FEP_21-1h1r -1.94 0.12 -FEP_29-1oiu -37 0.58 -FEP_29-1h1s -30.3 0.25 -FEP_28-1h1q 28.79 0.34 -FEP_20-1oi9 -7.07 0.21 -FEP_30-21 42.6 0.68 -FEP_1oiu-1h1s 5 0.58 -FEP_31-30 -23.82 0.35 -FEP_21-1oi9 -20.42 0.22 -FEP_32-31 4.97 0.54 -FEP_28-21 32.87 0.46 -FEP_26-1h1s -42.13 0.25 -FEP_22-1h1s -47.16 0.41 -FEP_30-1oi9 20.47 0.78 -FEP_31-17 16.71 0.4 -FEP_30-1h1q 35.4 0.38 -FEP_31-28 -14.27 0.21 -FEP_32-1h1q 18.16 0.45 -FEP_20-1h1q 8.26 0.12 -FEP_21-20 -13.48 0.18 -FEP_28-1h1r 29.24 1.15 -FEP_26-1h1q 3.28 0.2 -FEP_26-1h1r 6.32 0.28 -FEP_32-1h1r 21.84 0.65 -FEP_1oi9-1h1q 15.2 0.18 -FEP_32-28 -9.24 0.38 -FEP_1oi9-1h1r 18.62 0.18 -FEP_1oiy-1h1s -7.93 0.21 -FEP_31-29 -1.62 0.22 -FEP_29-21 20.47 0.91 -FEP_1h1s-17 48.02 0.23 -FEP_29-1oiy -23.3 0.5 -FEP_29-17 16.75 1.34 -FEP_29-1oi9 1.34 0.27 -FEP_20-1h1r 11.07 0.16 -FEP_31-22 16.68 0.46 -FEP_28-1oi9 13.99 0.37 -FEP_20-1oiy -29.18 0.16 -FEP_1oiu-1oi9 34.06 0.45 -FEP_32-20 10.33 0.57 -FEP_1oiu-17 52.47 0.41 -FEP_30-1oiu -13.79 0.62 -FEP_20-17 11.09 0.27 -FEP_22-1oi9 -17.63 0.86 -FEP_32-26 16.28 0.32 -FEP_30-26 33.64 0.17 -FEP_22-1h1q -2.26 0.22 -FEP_1oiu-1h1r 52.58 0.35 -FEP_28-20 19.84 0.35 -FEP_29-22 16.42 0.96 -FEP_29-20 5.25 0.63 -FEP_31-26 10.41 0.22 -FEP_1oi9-1h1s -30.23 0.49 -FEP_1oiy-17 39.69 0.3 -FEP_28-17 31.76 0.51 -FEP_1oiy-1h1r 40.1 0.18 -FEP_31-21 18.55 0.51 -FEP_21-1oiy -43.52 0.39 -FEP_28-1oiy -9.92 0.61 -FEP_31-1h1q 13.7 0.49 -FEP_1oiu-1h1q 49.41 0.28 -FEP_1oiy-1oi9 21.91 0.21 -FEP_26-1oiu -46.9 0.31 -FEP_32-1oiy -18.39 0.33 -FEP_26-1oi9 -11.78 0.36 -FEP_31-20 5.42 0.29 -FEP_1h1q-17 3.05 0.23 -FEP_28-1h1s -17.09 0.22 -FEP_28-1oiu -22.49 0.99 -FEP_31-1oi9 -2.1 0.64 -FEP_29-1h1r 18.24 0.99 -FEP_32-1h1s -26.38 0.3 -FEP_26-20 -5.66 0.22 -FEP_26-22 5.33 0.26 -FEP_30-1oiy -0.72 0.33 -FEP_31-1h1r 17 0.41 -FEP_31-1h1s -31.73 0.15 -FEP_22-21 3.32 0.21 -FEP_1oi9-17 18.3 0.19 -FEP_31-1oiu -37.04 0.77 -FEP_20-1h1s -36.8 0.27 -FEP_1oiy-1oiu -11.69 0.34 -FEP_32-22 21.14 0.3 -FEP_32-29 5.61 0.46 -FEP_30-1h1r 39.96 0.46 -FEP_22-1oiu -52.53 1.12 -FEP_29-28 -13.06 0.24 -FEP_20-1oiu -41.34 0.28 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index b166a434..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/lineal/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1h1q-17/ 0 -FEP_1h1r-17/ 0 -FEP_1h1r-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-17/ 0 -FEP_1h1s-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-17/ 0 -FEP_1oi9-1h1q/ 0 -FEP_1oi9-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-17/ 0 -FEP_1oiu-1h1q/ 0 -FEP_1oiu-1h1r/ 0 -FEP_1oiu-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-17/ 0 -FEP_1oiy-1h1q/ 0 -FEP_1oiy-1h1r/ 0 -FEP_1oiy-1h1s/ 0 -FEP_1oiy-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-1oiu/ 0 -FEP_20-17/ 0 -FEP_20-1h1q/ 0 -FEP_20-1h1r/ 0 -FEP_20-1h1s/ 0 -FEP_20-1oi9/ 0 -FEP_20-1oiu/ 0 -FEP_20-1oiy/ 0 -FEP_21-17/ 0 -FEP_21-1h1q/ 0 -FEP_21-1h1r/ 0 -FEP_21-1h1s/ 0 -FEP_21-1oi9/ 0 -FEP_21-1oiu/ 0 -FEP_21-1oiy/ 0 -FEP_21-20/ 0 -FEP_22-17/ 0 -FEP_22-1h1q/ 0 -FEP_22-1h1r/ 0 -FEP_22-1h1s/ 0 -FEP_22-1oi9/ 0 -FEP_22-1oiu/ 0 -FEP_22-1oiy/ 0 -FEP_22-20/ 0 -FEP_22-21/ 0 -FEP_26-17/ 0 -FEP_26-1h1q/ 0 -FEP_26-1h1r/ 0 -FEP_26-1h1s/ 0 -FEP_26-1oi9/ 0 -FEP_26-1oiu/ 0 -FEP_26-1oiy/ 0 -FEP_26-20/ 0 -FEP_26-21/ 0 -FEP_26-22/ 0 -FEP_28-17/ 0 -FEP_28-1h1q/ 0 -FEP_28-1h1r/ 0 -FEP_28-1h1s/ 0 -FEP_28-1oi9/ 0 -FEP_28-1oiu/ 0 -FEP_28-1oiy/ 0 -FEP_28-20/ 0 -FEP_28-21/ 0 -FEP_28-22/ 0 -FEP_28-26/ 0 -FEP_29-17/ 0 -FEP_29-1h1q/ 0 -FEP_29-1h1r/ 0 -FEP_29-1h1s/ 0 -FEP_29-1oi9/ 0 -FEP_29-1oiu/ 0 -FEP_29-1oiy/ 0 -FEP_29-20/ 0 -FEP_29-21/ 0 -FEP_29-22/ 0 -FEP_29-26/ 0 -FEP_29-28/ 0 -FEP_30-17/ 0 -FEP_30-1h1q/ 0 -FEP_30-1h1r/ 0 -FEP_30-1h1s/ 0 -FEP_30-1oi9/ 0 -FEP_30-1oiu/ 0 -FEP_30-1oiy/ 0 -FEP_30-20/ 0 -FEP_30-21/ 0 -FEP_30-22/ 0 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-28/ 0 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-17/ 0 -FEP_31-1h1q/ 0 -FEP_31-1h1r/ 0 -FEP_31-1h1s/ 0 -FEP_31-1oi9/ 0 -FEP_31-1oiu/ 0 -FEP_31-1oiy/ 0 -FEP_31-20/ 0 -FEP_31-21/ 0 -FEP_31-22/ 0 -FEP_31-26/ 0 -FEP_31-28/ 0 -FEP_31-29/ 0 -FEP_31-30/ 0 -FEP_32-17/ 0 -FEP_32-1h1q/ 0 -FEP_32-1h1r/ 0 -FEP_32-1h1s/ 0 -FEP_32-1oi9/ 0 -FEP_32-1oiu/ 0 -FEP_32-1oiy/ 0 -FEP_32-20/ 0 -FEP_32-21/ 0 -FEP_32-22/ 0 -FEP_32-26/ 0 -FEP_32-28/ 0 -FEP_32-29/ 0 -FEP_32-30/ 0 -FEP_32-31/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein-linear.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein-linear.txt deleted file mode 100644 index 5bf8402d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein-linear.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -10.55 0.39 2 -FEP_1oiy-22 42.68 0.47 0 -FEP_30-29 21.93 0.30 0 -FEP_31-26 12.94 0.42 0 -FEP_30-31 24.01 0.42 3 -FEP_26-1oi9 -12.89 0.38 0 -FEP_1oi9-1oiy -20.99 0.58 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.58 0.67 0 -FEP_21-22 -2.52 0.63 0 -FEP_1h1q-1h1r 4.58 0.47 0 -FEP_1oiu-32 32.76 0.54 0 -FEP_1oi9-1h1q 16.95 0.43 0 -FEP_28-29 13.05 0.30 0 -FEP_1h1r-20 -13.13 0.29 0 -FEP_30-28 8.04 0.34 0 -FEP_1h1r-17 -0.65 0.63 0 -FEP_26-21 10.60 0.38 0 -FEP_1h1s-32 29.73 0.70 0 -FEP_17-20 -11.76 0.79 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein.txt deleted file mode 100755 index 7360581f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28_1oi9 12.62 0.57 0 -FEP_26_1h1q 3.73 0.19 0 -FEP_32_31 3.85 0.38 0 -FEP_22_17 -0.64 0.24 0 -FEP_30_1h1s -9.96 0.17 0 -FEP_28_22 34.45 0.37 0 -FEP_30_1oi9 20.55 0.33 0 -FEP_32_1h1s -28.42 0.53 0 -FEP_1oiy_1h1s -8.27 0.08 0 -FEP_31_22 20.20 0.62 0 -FEP_1oiy_17 42.59 0.84 0 -FEP_22_1h1q -3.68 0.23 0 -FEP_1oiy_1h1r 42.95 0.53 0 -FEP_29_1h1r 19.39 0.73 0 -FEP_32_1oiu -32.58 0.42 0 -FEP_31_29 -0.73 0.24 0 -FEP_32_21 25.58 0.38 0 -FEP_29_21 22.83 0.87 0 -FEP_32_20 10.56 0.46 0 -FEP_26_1h1s -44.75 0.36 0 -FEP_31_20 6.73 0.26 0 -FEP_1oiy_1oiu -12.61 0.40 0 -FEP_32_29 2.99 0.36 0 -FEP_31_1oiy -24.24 0.12 0 -FEP_21_1h1q -6.07 0.29 0 -FEP_29_1oiy -23.44 0.37 0 -FEP_30_29 21.13 0.19 0 -FEP_28_1h1s -18.10 0.27 0 -FEP_30_22 41.48 0.23 0 -FEP_29_28 -13.36 0.22 0 -FEP_1oiu_1h1r 56.10 0.29 0 -FEP_21_1h1s -54.75 0.52 0 -FEP_31_26 11.52 0.23 0 -FEP_20_1oiy -30.66 0.28 0 -FEP_31_17 17.63 0.61 0 -FEP_1oiu_1h1s 3.36 0.30 0 -FEP_20_1h1r 12.83 0.27 0 -FEP_22_20 -12.73 0.43 0 -FEP_30_20 29.01 0.23 0 -FEP_32_1oi9 2.15 0.48 0 -FEP_21_1oi9 -22.77 0.40 0 -FEP_20_1h1q 8.95 0.09 0 -FEP_28_1oiu -22.52 0.83 0 -FEP_26_1oi9 -14.81 0.44 0 -FEP_31_28 -14.45 0.34 0 -FEP_30_26 34.09 0.31 0 -FEP_28_1h1r 33.56 0.54 0 -FEP_1oi9_1h1r 20.52 0.52 0 -FEP_1oiy_1h1q 40.40 0.35 0 -FEP_31_1h1s -32.84 0.36 0 -FEP_29_22 22.21 0.43 0 -FEP_31_21 19.66 0.47 0 -FEP_22_1h1r -0.34 0.25 0 -FEP_30_17 41.40 0.44 0 -FEP_29_17 20.35 0.43 0 -FEP_21_1h1r -1.94 0.25 0 -FEP_28_26 26.37 0.16 0 -FEP_21_1oiy -44.63 0.66 0 -FEP_32_1h1r 23.18 0.23 0 -FEP_1h1s_1h1r 52.09 0.60 0 -FEP_26_22 7.08 0.45 0 -FEP_32_1oiy -20.26 0.32 0 -FEP_1oi9_1h1q 17.16 0.35 0 -FEP_28_17 33.12 0.63 0 -FEP_29_1h1s -31.70 0.37 0 -FEP_1h1s_1h1q 47.71 0.47 0 -FEP_1h1s_17 52.38 0.67 0 -FEP_32_28 -10.24 0.34 0 -FEP_30_21 44.70 0.64 0 -FEP_31_30 -21.77 0.17 0 -FEP_21_1oiu -58.15 0.25 0 -FEP_20_1oiu -43.10 0.29 0 -FEP_30_1h1q 37.90 0.24 0 -FEP_1oiu_1oi9 33.91 0.48 0 -FEP_26_1oiu -48.18 0.69 0 -FEP_28_21 36.45 0.38 0 -FEP_20_17 12.17 0.26 0 -FEP_1oi9_1h1s -30.35 0.37 0 -FEP_30_1oiy -1.90 0.22 0 -FEP_22_1h1s -52.25 0.71 0 -FEP_31_1oiu -36.23 0.64 0 -FEP_32_30 -18.96 0.27 0 -FEP_29_26 12.61 0.41 0 -FEP_28_1h1q 29.69 0.25 0 -FEP_1oiy_1oi9 21.49 0.46 0 -FEP_31_1h1r 19.35 0.54 0 -FEP_30_1h1r 42.63 0.28 0 -FEP_31_1h1q 15.53 0.28 0 -FEP_29_1oiu -36.70 0.58 0 -FEP_22_1oiu -56.20 0.53 0 -FEP_30_28 7.95 0.16 0 -FEP_29_1oi9 -2.03 0.93 0 -FEP_22_21 2.00 0.19 0 -FEP_26_1oiy -36.34 0.20 0 -FEP_1h1r_17 -0.23 0.04 0 -FEP_1h1r_1h1q -3.84 0.31 0 -FEP_32_26 15.38 0.46 0 -FEP_32_22 23.60 0.31 0 -FEP_26_20 -5.63 0.50 0 -FEP_29_1h1q 15.33 0.53 0 -FEP_21_17 -2.87 0.29 0 -FEP_32_1h1q 20.06 0.42 0 -FEP_20_1h1s -38.93 0.36 0 -FEP_28_20 20.74 0.74 0 -FEP_26_21 10.94 0.44 0 -FEP_29_20 6.76 0.50 0 -FEP_30_1oiu -13.12 0.23 0 -FEP_20_1oi9 -7.89 0.22 0 -FEP_1oiu_17 55.37 0.21 0 -FEP_1oi9_17 20.37 0.38 0 -FEP_26_1h1r 7.95 0.38 0 -FEP_26_17 6.82 0.58 0 -FEP_21_20 -14.67 0.34 0 -FEP_22_1oi9 -20.85 0.22 0 -FEP_32_17 22.83 0.40 0 -FEP_22_1oiy -43.22 0.49 0 -FEP_28_1oiy -9.95 0.54 0 -FEP_1oiu_1h1q 52.25 0.29 0 -FEP_31_1oi9 -2.86 0.33 0 -FEP_1h1q_17 2.87 0.25 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein_opls_test.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein_opls_test.txt deleted file mode 100644 index 507bf4d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein_opls_test.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28-29 12.83 0.13 0 -FEP_26-21 10.95 0.40 0 -FEP_1h1q-1h1r 4.04 0.30 0 -FEP_26-1oi9 -14.38 0.38 0 -FEP_30-31 21.75 0.16 0 -FEP_1oiu-32 32.44 0.41 0 -FEP_1oi9-1oiy -21.93 0.32 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.74 0.43 0 -FEP_30-1h1s -9.74 0.13 0 -FEP_1oi9-1h1q 18.13 0.35 0 -FEP_21-22 -2.13 0.27 0 -FEP_1oiy-22 43.39 0.60 0 -FEP_30-29 21.30 0.19 0 -FEP_31-26 11.73 0.32 0 -FEP_1h1r-17 -0.29 0.13 0 -FEP_1h1s-32 29.34 0.24 0 -FEP_30-28 8.04 0.17 0 -FEP_1h1r-20 -12.44 0.24 0 -FEP_17-20 -11.98 0.27 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 0ce71c7d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1h1q-17/ 1 -FEP_1h1r-17/ 2 -FEP_1h1r-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-17/ 1 -FEP_1h1s-1h1q/ 1 -FEP_1h1s-1h1r/ 2 -FEP_1oi9-17/ 0 -FEP_1oi9-1h1q/ 3 -FEP_1oi9-1h1r/ 3 -FEP_1oi9-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-17/ 3 -FEP_1oiu-1h1q/ 2 -FEP_1oiu-1h1r/ 1 -FEP_1oiu-1h1s/ 2 -FEP_1oiu-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-17/ 2 -FEP_1oiy-1h1q/ 4 -FEP_1oiy-1h1r/ 5 -FEP_1oiy-1h1s/ 2 -FEP_1oiy-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-1oiu/ 0 -FEP_20-17/ 4 -FEP_20-1h1q/ 1 -FEP_20-1h1r/ 2 -FEP_20-1h1s/ 1 -FEP_20-1oi9/ 2 -FEP_20-1oiu/ 1 -FEP_20-1oiy/ 0 -FEP_21-17/ 2 -FEP_21-1h1q/ 3 -FEP_21-1h1r/ 2 -FEP_21-1h1s/ 3 -FEP_21-1oi9/ 0 -FEP_21-1oiu/ 0 -FEP_21-1oiy/ 3 -FEP_21-20/ 4 -FEP_22-17/ 3 -FEP_22-1h1q/ 2 -FEP_22-1h1r/ 2 -FEP_22-1h1s/ 1 -FEP_22-1oi9/ 2 -FEP_22-1oiu/ 1 -FEP_22-1oiy/ 1 -FEP_22-20/ 2 -FEP_22-21/ 2 -FEP_26-17/ 2 -FEP_26-1h1q/ 2 -FEP_26-1h1r/ 1 -FEP_26-1h1s/ 3 -FEP_26-1oi9/ 1 -FEP_26-1oiu/ 0 -FEP_26-1oiy/ 5 -FEP_26-20/ 3 -FEP_26-21/ 1 -FEP_26-22/ 1 -FEP_28-17/ 0 -FEP_28-1h1q/ 1 -FEP_28-1h1r/ 1 -FEP_28-1h1s/ 0 -FEP_28-1oi9/ 3 -FEP_28-1oiu/ 1 -FEP_28-1oiy/ 4 -FEP_28-20/ 1 -FEP_28-21/ 1 -FEP_28-22/ 1 -FEP_28-26/ 0 -FEP_29-17/ 3 -FEP_29-1h1q/ 4 -FEP_29-1h1r/ 4 -FEP_29-1h1s/ 6 -FEP_29-1oi9/ 3 -FEP_29-1oiu/ 3 -FEP_29-1oiy/ 3 -FEP_29-20/ 2 -FEP_29-21/ 0 -FEP_29-22/ 0 -FEP_29-26/ 3 -FEP_29-28/ 0 -FEP_30-17/ 3 -FEP_30-1h1q/ 1 -FEP_30-1h1r/ 0 -FEP_30-1h1s/ 2 -FEP_30-1oi9/ 3 -FEP_30-1oiu/ 2 -FEP_30-1oiy/ 4 -FEP_30-20/ 3 -FEP_30-21/ 0 -FEP_30-22/ 2 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-28/ 1 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-17/ 2 -FEP_31-1h1q/ 1 -FEP_31-1h1r/ 0 -FEP_31-1h1s/ 0 -FEP_31-1oi9/ 0 -FEP_31-1oiu/ 3 -FEP_31-1oiy/ 1 -FEP_31-20/ 1 -FEP_31-21/ 2 -FEP_31-22/ 1 -FEP_31-26/ 2 -FEP_31-28/ 1 -FEP_31-29/ 1 -FEP_31-30/ 2 -FEP_32-17/ 2 -FEP_32-1h1q/ 1 -FEP_32-1h1r/ 1 -FEP_32-1h1s/ 2 -FEP_32-1oi9/ 2 -FEP_32-1oiu/ 1 -FEP_32-1oiy/ 2 -FEP_32-20/ 2 -FEP_32-21/ 2 -FEP_32-22/ 4 -FEP_32-26/ 2 -FEP_32-28/ 2 -FEP_32-29/ 2 -FEP_32-30/ 2 -FEP_32-31/ 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein_sc.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein_sc.txt deleted file mode 100644 index 83d36535..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/protein_sc.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -9.49 0.57 3 -FEP_1oiy-22 43.48 0.71 1 -FEP_30-29 21.91 0.66 3 -FEP_31-26 13.15 0.57 0 -FEP_30-31 24.89 0.51 0 -FEP_26-1oi9 -12.23 0.60 0 -FEP_1oi9-1oiy -20.11 0.53 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.02 0.69 0 -FEP_21-22 -2.44 0.82 0 -FEP_1h1q-1h1r 5.15 0.28 0 -FEP_1oiu-32 32.71 0.87 0 -FEP_1oi9-1h1q 16.46 0.29 0 -FEP_28-29 13.65 0.68 0 -FEP_1h1r-20 -12.16 0.46 0 -FEP_30-28 8.89 0.54 3 -FEP_1h1r-17 0.32 0.35 2 -FEP_26-21 10.41 0.60 0 -FEP_1h1s-32 30.33 0.72 0 -FEP_17-20 -13.28 0.80 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/sigmoidal-100w/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/sigmoidal-100w/protein.txt deleted file mode 100755 index 72095039..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/sigmoidal-100w/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28-1oi9 12.62 0.57 0 -FEP_26-1h1q 3.73 0.19 0 -FEP_32-31 3.85 0.38 0 -FEP_22-17 -0.64 0.24 0 -FEP_30-1h1s -9.96 0.17 0 -FEP_28-22 34.45 0.37 0 -FEP_30-1oi9 20.55 0.33 0 -FEP_32-1h1s -28.42 0.53 0 -FEP_1oiy-1h1s -8.27 0.08 0 -FEP_31-22 20.20 0.62 0 -FEP_1oiy-17 42.59 0.84 0 -FEP_22-1h1q -3.68 0.23 0 -FEP_1oiy-1h1r 42.95 0.53 0 -FEP_29-1h1r 19.39 0.73 0 -FEP_32-1oiu -32.58 0.42 0 -FEP_31-29 -0.73 0.24 0 -FEP_32-21 25.58 0.38 0 -FEP_29-21 22.83 0.87 0 -FEP_32-20 10.56 0.46 0 -FEP_26-1h1s -44.75 0.36 0 -FEP_31-20 6.73 0.26 0 -FEP_1oiy-1oiu -12.61 0.40 0 -FEP_32-29 2.99 0.36 0 -FEP_31-1oiy -24.24 0.12 0 -FEP_21-1h1q -6.07 0.29 0 -FEP_29-1oiy -23.44 0.37 0 -FEP_30-29 21.13 0.19 0 -FEP_28-1h1s -18.10 0.27 0 -FEP_30-22 41.48 0.23 0 -FEP_29-28 -13.36 0.22 0 -FEP_1oiu-1h1r 56.10 0.29 0 -FEP_21-1h1s -54.75 0.52 0 -FEP_31-26 11.52 0.23 0 -FEP_20-1oiy -30.66 0.28 0 -FEP_31-17 17.63 0.61 0 -FEP_1oiu-1h1s 3.36 0.30 0 -FEP_20-1h1r 12.83 0.27 0 -FEP_22-20 -12.73 0.43 0 -FEP_30-20 29.01 0.23 0 -FEP_32-1oi9 2.15 0.48 0 -FEP_21-1oi9 -22.77 0.40 0 -FEP_20-1h1q 8.95 0.09 0 -FEP_28-1oiu -22.52 0.83 0 -FEP_26-1oi9 -14.81 0.44 0 -FEP_31-28 -14.45 0.34 0 -FEP_30-26 34.09 0.31 0 -FEP_28-1h1r 33.56 0.54 0 -FEP_1oi9-1h1r 20.52 0.52 0 -FEP_1oiy-1h1q 40.40 0.35 0 -FEP_31-1h1s -32.84 0.36 0 -FEP_29-22 22.21 0.43 0 -FEP_31-21 19.66 0.47 0 -FEP_22-1h1r -0.34 0.25 0 -FEP_30-17 41.40 0.44 0 -FEP_29-17 20.35 0.43 0 -FEP_21-1h1r -1.94 0.25 0 -FEP_28-26 26.37 0.16 0 -FEP_21-1oiy -44.63 0.66 0 -FEP_32-1h1r 23.18 0.23 0 -FEP_1h1s-1h1r 52.09 0.60 0 -FEP_26-22 7.08 0.45 0 -FEP_32-1oiy -20.26 0.32 0 -FEP_1oi9-1h1q 17.16 0.35 0 -FEP_28-17 33.12 0.63 0 -FEP_29-1h1s -31.70 0.37 0 -FEP_1h1s-1h1q 47.71 0.47 0 -FEP_1h1s-17 52.38 0.67 0 -FEP_32-28 -10.24 0.34 0 -FEP_30-21 44.70 0.64 0 -FEP_31-30 -21.77 0.17 0 -FEP_21-1oiu -58.15 0.25 0 -FEP_20-1oiu -43.10 0.29 0 -FEP_30-1h1q 37.90 0.24 0 -FEP_1oiu-1oi9 33.91 0.48 0 -FEP_26-1oiu -48.18 0.69 0 -FEP_28-21 36.45 0.38 0 -FEP_20-17 12.17 0.26 0 -FEP_1oi9-1h1s -30.35 0.37 0 -FEP_30-1oiy -1.90 0.22 0 -FEP_22-1h1s -52.25 0.71 0 -FEP_31-1oiu -36.23 0.64 0 -FEP_32-30 -18.96 0.27 0 -FEP_29-26 12.61 0.41 0 -FEP_28-1h1q 29.69 0.25 0 -FEP_1oiy-1oi9 21.49 0.46 0 -FEP_31-1h1r 19.35 0.54 0 -FEP_30-1h1r 42.63 0.28 0 -FEP_31-1h1q 15.53 0.28 0 -FEP_29-1oiu -36.70 0.58 0 -FEP_22-1oiu -56.20 0.53 0 -FEP_30-28 7.95 0.16 0 -FEP_29-1oi9 -2.03 0.93 0 -FEP_22-21 2.00 0.19 0 -FEP_26-1oiy -36.34 0.20 0 -FEP_1h1r-17 -0.23 0.04 0 -FEP_1h1r-1h1q -3.84 0.31 0 -FEP_32-26 15.38 0.46 0 -FEP_32-22 23.60 0.31 0 -FEP_26-20 -5.63 0.50 0 -FEP_29-1h1q 15.33 0.53 0 -FEP_21-17 -2.87 0.29 0 -FEP_32-1h1q 20.06 0.42 0 -FEP_20-1h1s -38.93 0.36 0 -FEP_28-20 20.74 0.74 0 -FEP_26-21 10.94 0.44 0 -FEP_29-20 6.76 0.50 0 -FEP_30-1oiu -13.12 0.23 0 -FEP_20-1oi9 -7.89 0.22 0 -FEP_1oiu-17 55.37 0.21 0 -FEP_1oi9-17 20.37 0.38 0 -FEP_26-1h1r 7.95 0.38 0 -FEP_26-17 6.82 0.58 0 -FEP_21-20 -14.67 0.34 0 -FEP_22-1oi9 -20.85 0.22 0 -FEP_32-17 22.83 0.40 0 -FEP_22-1oiy -43.22 0.49 0 -FEP_28-1oiy -9.95 0.54 0 -FEP_1oiu-1h1q 52.25 0.29 0 -FEP_31-1oi9 -2.86 0.33 0 -FEP_1h1q-17 2.87 0.25 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/sigmoidal-100w/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/sigmoidal-100w/water.txt deleted file mode 100755 index 0c76d409..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/sigmoidal-100w/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28-1oi9 13.53 0.26 0 -FEP_26-1h1q 3.14 0.08 0 -FEP_32-31 4.89 0.29 0 -FEP_22-17 1.15 0.15 0 -FEP_30-1h1s -8.41 0.12 0 -FEP_28-22 30.75 0.32 0 -FEP_30-1oi9 21.87 0.12 0 -FEP_32-1h1s -26.64 0.32 0 -FEP_1oiy-1h1s -7.56 0.10 0 -FEP_31-22 16.13 0.13 0 -FEP_1oiy-17 40.53 0.20 0 -FEP_22-1h1q -2.23 0.17 0 -FEP_1oiy-1h1r 40.51 0.20 0 -FEP_29-1h1r 18.34 0.32 0 -FEP_32-1oiu -30.73 0.25 0 -FEP_31-29 -0.85 0.70 0 -FEP_32-21 24.41 0.21 0 -FEP_29-21 22.01 0.30 0 -FEP_32-20 10.52 0.29 0 -FEP_26-1h1s -41.80 0.17 0 -FEP_31-20 5.56 0.19 0 -FEP_1oiy-1oiu -11.50 0.16 0 -FEP_32-29 4.10 0.29 0 -FEP_31-1oiy -23.83 0.14 0 -FEP_21-1h1q -5.56 0.25 0 -FEP_29-1oiy -21.92 0.18 0 -FEP_30-29 21.67 0.09 0 -FEP_28-1h1s -17.25 0.14 0 -FEP_30-22 39.35 0.16 0 -FEP_1h1q-17 3.43 0.10 0 -FEP_29-28 -13.24 0.11 0 -FEP_1oiu-1h1r 52.78 0.17 0 -FEP_21-1h1s -51.76 0.28 0 -FEP_31-26 10.47 0.17 0 -FEP_20-1oiy -29.81 0.19 0 -FEP_31-17 17.35 0.23 0 -FEP_1oiu-1h1s 3.89 0.27 0 -FEP_20-1h1r 11.57 0.22 0 -FEP_22-20 -10.52 0.19 0 -FEP_30-20 28.68 0.28 0 -FEP_32-1oi9 3.89 0.23 0 -FEP_21-1oi9 -20.67 0.17 0 -FEP_20-1h1q 8.28 0.10 0 -FEP_28-1oiu -21.85 0.29 0 -FEP_26-1oi9 -12.10 0.17 0 -FEP_31-28 -14.17 0.17 0 -FEP_30-26 33.75 0.18 0 -FEP_28-1h1r 31.43 0.17 0 -FEP_1oi9-1h1r 18.49 0.19 0 -FEP_1oiy-1h1q 37.68 0.13 0 -FEP_31-1h1s -31.65 0.14 0 -FEP_29-22 17.19 0.29 0 -FEP_31-21 20.36 0.54 0 -FEP_22-1h1r 1.07 0.21 0 -FEP_30-17 40.10 0.34 0 -FEP_29-17 18.27 0.53 0 -FEP_21-1h1r -2.29 0.27 0 -FEP_28-26 24.83 0.29 0 -FEP_21-1oiy -43.14 0.10 0 -FEP_32-1h1r 21.98 0.30 0 -FEP_1h1s-1h1r 48.63 0.16 0 -FEP_26-22 5.51 0.17 0 -FEP_32-1oiy -18.40 0.40 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.30 0.07 0 -FEP_28-17 31.32 0.22 0 -FEP_29-1h1s -30.16 0.15 0 -FEP_1h1s-1h1q 45.61 0.18 0 -FEP_1h1s-17 48.42 0.16 0 -FEP_32-28 -9.51 0.37 0 -FEP_30-21 43.86 0.86 0 -FEP_31-30 -23.35 0.20 0 -FEP_21-1oiu -54.89 0.23 0 -FEP_20-1oiu -41.20 0.14 0 -FEP_30-1h1q 36.96 0.21 0 -FEP_1oiu-1oi9 34.21 0.13 0 -FEP_26-1oiu -47.02 0.21 0 -FEP_28-21 34.48 0.47 0 -FEP_20-17 11.55 0.17 0 -FEP_1oi9-1h1s -30.62 0.18 0 -FEP_30-1oiy -0.99 0.16 0 -FEP_22-1h1s -47.67 0.35 0 -FEP_31-1oiu -35.52 0.36 0 -FEP_32-30 -18.20 0.25 0 -FEP_29-26 11.52 0.29 0 -FEP_28-1h1q 28.28 0.13 0 -FEP_1oiy-1oi9 22.15 0.12 0 -FEP_31-1h1r 17.65 0.18 0 -FEP_30-1h1r 40.17 0.18 0 -FEP_31-1h1q 13.81 0.15 0 -FEP_29-1oiu -34.26 0.46 1 -FEP_22-1oiu -51.92 0.27 0 -FEP_30-28 8.30 0.19 0 -FEP_29-1oi9 -0.30 0.26 0 -FEP_22-21 3.42 0.17 0 -FEP_26-1oiy -34.43 0.19 0 -FEP_1h1r-17 -0.09 0.13 0 -FEP_1h1r-1h1q -3.39 0.14 0 -FEP_32-26 16.07 0.14 0 -FEP_32-22 21.06 0.16 0 -FEP_26-20 -5.57 0.19 0 -FEP_29-1h1q 15.25 0.29 0 -FEP_21-17 -2.74 0.29 0 -FEP_32-1h1q 19.53 0.24 0 -FEP_20-1h1s -37.05 0.17 0 -FEP_28-20 19.69 0.28 0 -FEP_26-21 9.46 0.30 0 -FEP_29-20 6.58 0.45 0 -FEP_30-1oiu -12.32 0.16 0 -FEP_20-1oi9 -7.06 0.15 0 -FEP_1oiu-17 52.86 0.25 0 -FEP_1oi9-17 18.51 0.14 0 -FEP_26-1h1r 6.52 0.14 0 -FEP_26-17 6.77 0.17 0 -FEP_21-20 -13.76 0.41 0 -FEP_22-1oi9 -17.90 0.46 0 -FEP_32-17 22.02 0.29 0 -FEP_22-1oiy -39.82 0.16 0 -FEP_28-1oiy -9.18 0.19 0 -FEP_1oiu-1h1q 49.18 0.10 0 -FEP_31-1oi9 -1.16 0.20 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/protein-sc05.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/protein-sc05.txt deleted file mode 100644 index 91b20f61..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/protein-sc05.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -9.29 0.44 20 -FEP_1oiy-22 43.71 0.58 0 -FEP_30-29 22.22 0.37 15 -FEP_31-26 9.70 0.59 5 -FEP_30-31 22.89 0.74 10 -FEP_26-1oi9 -13.35 0.42 0 -FEP_1oi9-1oiy -21.48 0.54 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.09 0.55 0 -FEP_21-22 -2.67 0.78 0 -FEP_1h1q-1h1r 4.96 0.47 0 -FEP_1oiu-32 32.65 0.84 0 -FEP_1oi9-1h1q 16.97 0.30 0 -FEP_28-29 13.02 0.71 6 -FEP_1h1r-20 -12.26 0.79 0 -FEP_30-28 6.89 0.60 10 -FEP_1h1r-17 -0.32 0.66 0 -FEP_26-21 9.76 0.86 1 -FEP_1h1s-32 28.42 0.81 0 -FEP_17-20 -11.74 0.61 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/protein-sc1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/protein-sc1.txt deleted file mode 100644 index d6c61968..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/protein-sc1.txt +++ /dev/null @@ -1,19 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -9.33 0.49 1 -FEP_1oiy-22 43.84 0.57 0 -FEP_30-29 22.25 0.91 15 -FEP_30-31 22.32 0.95 20 -FEP_26-1oi9 -13.13 0.46 0 -FEP_1oi9-1oiy -20.96 0.49 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.21 0.67 0 -FEP_21-22 -1.20 0.65 0 -FEP_1h1q-1h1r 4.39 0.54 0 -FEP_1oiu-32 34.30 0.65 0 -FEP_1oi9-1h1q 16.90 0.64 0 -FEP_28-29 13.26 0.61 0 -FEP_1h1r-20 -11.17 0.54 0 -FEP_30-28 8.07 0.23 30 -FEP_1h1r-17 0.59 0.45 0 -FEP_26-21 11.15 0.49 0 -FEP_1h1s-32 29.56 0.65 0 -FEP_17-20 -12.18 0.84 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/water-sc05.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/water-sc05.txt deleted file mode 100644 index db8ca658..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/water-sc05.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -8.21 0.22 0 -FEP_1oiy-22 40.18 0.26 0 -FEP_30-29 21.91 0.09 2 -FEP_31-26 10.54 0.21 1 -FEP_30-31 23.58 0.17 1 -FEP_26-1oi9 -11.61 0.15 2 -FEP_1oi9-1oiy -22.23 0.16 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.93 0.28 1 -FEP_21-22 -3.61 0.26 2 -FEP_1h1q-1h1r 3.42 0.15 0 -FEP_1oiu-32 30.45 0.31 1 -FEP_1oi9-1h1q 15.56 0.10 0 -FEP_28-29 12.86 0.12 0 -FEP_1h1r-20 -11.13 0.13 1 -FEP_30-28 8.68 0.26 0 -FEP_1h1r-17 0.18 0.17 0 -FEP_26-21 9.13 0.33 1 -FEP_1h1s-32 27.67 0.31 1 -FEP_17-20 -10.98 0.16 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/water-sc1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/water-sc1.txt deleted file mode 100644 index ebdc3689..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/water-sc1.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -8.24 0.20 0 -FEP_1oiy-22 41.05 0.27 0 -FEP_30-29 21.74 0.13 0 -FEP_31-26 10.66 0.13 0 -FEP_30-31 23.53 0.23 0 -FEP_26-1oi9 -11.47 0.18 0 -FEP_1oi9-1oiy -22.49 0.09 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.83 0.27 0 -FEP_21-22 -3.16 0.13 0 -FEP_1h1q-1h1r 3.43 0.11 0 -FEP_1oiu-32 30.97 0.23 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.38 0.18 0 -FEP_28-29 13.04 0.17 0 -FEP_1h1r-20 -11.06 0.17 0 -FEP_30-28 8.53 0.09 0 -FEP_1h1r-17 -0.15 0.24 0 -FEP_26-21 10.19 0.28 0 -FEP_1h1s-32 27.21 0.24 0 -FEP_17-20 -11.24 0.14 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water-linear.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water-linear.txt deleted file mode 100644 index 8c475632..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water-linear.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -8.16 0.16 0 -FEP_1oiy-22 39.69 0.21 0 -FEP_30-29 21.55 0.14 0 -FEP_31-26 10.50 0.16 0 -FEP_30-31 23.26 0.17 0 -FEP_26-1oi9 -11.61 0.16 0 -FEP_1oi9-1oiy -22.71 0.13 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.93 0.22 0 -FEP_21-22 -3.09 0.25 0 -FEP_1h1q-1h1r 3.37 0.12 0 -FEP_1oiu-32 30.39 0.37 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.52 0.13 0 -FEP_28-29 13.13 0.18 0 -FEP_1h1r-20 -11.33 0.15 0 -FEP_30-28 8.78 0.22 0 -FEP_1h1r-17 -0.42 0.14 0 -FEP_26-21 9.06 0.34 0 -FEP_1h1s-32 26.98 0.27 0 -FEP_17-20 -11.02 0.20 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water.txt deleted file mode 100755 index 1410522d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28_1oi9 13.53 0.26 0 -FEP_26_1h1q 3.14 0.08 0 -FEP_32_31 4.89 0.29 0 -FEP_22_17 1.15 0.15 0 -FEP_30_1h1s -8.41 0.12 0 -FEP_28_22 30.75 0.32 0 -FEP_30_1oi9 21.87 0.12 0 -FEP_32_1h1s -26.64 0.32 0 -FEP_1oiy_1h1s -7.56 0.10 0 -FEP_31_22 16.13 0.13 0 -FEP_1oiy_17 40.53 0.20 0 -FEP_22_1h1q -2.23 0.17 0 -FEP_1oiy_1h1r 40.51 0.20 0 -FEP_29_1h1r 18.34 0.32 0 -FEP_32_1oiu -30.73 0.25 0 -FEP_31_29 -0.85 0.70 0 -FEP_32_21 24.41 0.21 0 -FEP_29_21 22.01 0.30 0 -FEP_32_20 10.52 0.29 0 -FEP_26_1h1s -41.80 0.17 0 -FEP_31_20 5.56 0.19 0 -FEP_1oiy_1oiu -11.50 0.16 0 -FEP_32_29 4.10 0.29 0 -FEP_31_1oiy -23.83 0.14 0 -FEP_21_1h1q -5.56 0.25 0 -FEP_29_1oiy -21.92 0.18 0 -FEP_30_29 21.67 0.09 0 -FEP_28_1h1s -17.25 0.14 0 -FEP_30_22 39.35 0.16 0 -FEP_1h1q_17 3.43 0.10 0 -FEP_29_28 -13.24 0.11 0 -FEP_1oiu_1h1r 52.78 0.17 0 -FEP_21_1h1s -51.76 0.28 0 -FEP_31_26 10.47 0.17 0 -FEP_20_1oiy -29.81 0.19 0 -FEP_31_17 17.35 0.23 0 -FEP_1oiu_1h1s 3.89 0.27 0 -FEP_20_1h1r 11.57 0.22 0 -FEP_22_20 -10.52 0.19 0 -FEP_30_20 28.68 0.28 0 -FEP_32_1oi9 3.89 0.23 0 -FEP_21_1oi9 -20.67 0.17 0 -FEP_20_1h1q 8.28 0.10 0 -FEP_28_1oiu -21.85 0.29 0 -FEP_26_1oi9 -12.10 0.17 0 -FEP_31_28 -14.17 0.17 0 -FEP_30_26 33.75 0.18 0 -FEP_28_1h1r 31.43 0.17 0 -FEP_1oi9_1h1r 18.49 0.19 0 -FEP_1oiy_1h1q 37.68 0.13 0 -FEP_31_1h1s -31.65 0.14 0 -FEP_29_22 17.19 0.29 0 -FEP_31_21 20.36 0.54 0 -FEP_22_1h1r 1.07 0.21 0 -FEP_30_17 40.10 0.34 0 -FEP_29_17 18.27 0.53 0 -FEP_21_1h1r -2.29 0.27 0 -FEP_28_26 24.83 0.29 0 -FEP_21_1oiy -43.14 0.10 0 -FEP_32_1h1r 21.98 0.30 0 -FEP_1h1s_1h1r 48.63 0.16 0 -FEP_26_22 5.51 0.17 0 -FEP_32_1oiy -18.40 0.40 0 -FEP_1oi9_1h1q 15.30 0.07 0 -FEP_28_17 31.32 0.22 0 -FEP_29_1h1s -30.16 0.15 0 -FEP_1h1s_1h1q 45.61 0.18 0 -FEP_1h1s_17 48.42 0.16 0 -FEP_32_28 -9.51 0.37 0 -FEP_30_21 43.86 0.86 0 -FEP_31_30 -23.35 0.20 0 -FEP_21_1oiu -54.89 0.23 0 -FEP_20_1oiu -41.20 0.14 0 -FEP_30_1h1q 36.96 0.21 0 -FEP_1oiu_1oi9 34.21 0.13 0 -FEP_26_1oiu -47.02 0.21 0 -FEP_28_21 34.48 0.47 0 -FEP_20_17 11.55 0.17 0 -FEP_1oi9_1h1s -30.62 0.18 0 -FEP_30_1oiy -0.99 0.16 0 -FEP_22_1h1s -47.67 0.35 0 -FEP_31_1oiu -35.52 0.36 0 -FEP_32_30 -18.20 0.25 0 -FEP_29_26 11.52 0.29 0 -FEP_28_1h1q 28.28 0.13 0 -FEP_1oiy_1oi9 22.15 0.12 0 -FEP_31_1h1r 17.65 0.18 0 -FEP_30_1h1r 40.17 0.18 0 -FEP_31_1h1q 13.81 0.15 0 -FEP_29_1oiu -34.26 0.46 1 -FEP_22_1oiu -51.92 0.27 0 -FEP_30_28 8.30 0.19 0 -FEP_29_1oi9 -0.30 0.26 0 -FEP_22_21 3.42 0.17 0 -FEP_26_1oiy -34.43 0.19 0 -FEP_1h1r_17 -0.09 0.13 0 -FEP_1h1r_1h1q -3.39 0.14 0 -FEP_32_26 16.07 0.14 0 -FEP_32_22 21.06 0.16 0 -FEP_26_20 -5.57 0.19 0 -FEP_29_1h1q 15.25 0.29 0 -FEP_21_17 -2.74 0.29 0 -FEP_32_1h1q 19.53 0.24 0 -FEP_20_1h1s -37.05 0.17 0 -FEP_28_20 19.69 0.28 0 -FEP_26_21 9.46 0.30 0 -FEP_29_20 6.58 0.45 0 -FEP_30_1oiu -12.32 0.16 0 -FEP_20_1oi9 -7.06 0.15 0 -FEP_1oiu_17 52.86 0.25 0 -FEP_1oi9_17 18.51 0.14 0 -FEP_26_1h1r 6.52 0.14 0 -FEP_26_17 6.77 0.17 0 -FEP_21_20 -13.76 0.41 0 -FEP_22_1oi9 -17.90 0.46 0 -FEP_32_17 22.02 0.29 0 -FEP_22_1oiy -39.82 0.16 0 -FEP_28_1oiy -9.18 0.19 0 -FEP_1oiu_1h1q 49.18 0.10 0 -FEP_31_1oi9 -1.16 0.20 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water_opls_test.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water_opls_test.txt deleted file mode 100644 index 17ff2f29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water_opls_test.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -8.53 0.10 0 -FEP_30-29 21.63 0.10 0 -FEP_1oi9-1oiy -22.39 0.20 0 -FEP_1h1q-1h1r 3.33 0.12 0 -FEP_26-1oi9 -12.05 0.20 0 -FEP_28-29 13.08 0.14 0 -FEP_1oiu-32 31.45 0.48 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.10 0.09 0 -FEP_31-26 10.55 0.20 0 -FEP_1h1r-17 0.02 0.17 0 -FEP_1h1s-32 26.41 0.26 0 -FEP_1h1r-20 -11.41 0.19 0 -FEP_30-28 8.73 0.18 0 -FEP_1oiy-22 39.78 0.29 0 -FEP_26-21 10.04 0.46 0 -FEP_21-22 -3.45 0.23 0 -FEP_30-31 23.01 0.26 0 -FEP_17-20 -11.18 0.14 0 -FEP_1h1s-1oiu -4.07 0.12 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index b166a434..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1h1q-17/ 0 -FEP_1h1r-17/ 0 -FEP_1h1r-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-17/ 0 -FEP_1h1s-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-17/ 0 -FEP_1oi9-1h1q/ 0 -FEP_1oi9-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-17/ 0 -FEP_1oiu-1h1q/ 0 -FEP_1oiu-1h1r/ 0 -FEP_1oiu-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-17/ 0 -FEP_1oiy-1h1q/ 0 -FEP_1oiy-1h1r/ 0 -FEP_1oiy-1h1s/ 0 -FEP_1oiy-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-1oiu/ 0 -FEP_20-17/ 0 -FEP_20-1h1q/ 0 -FEP_20-1h1r/ 0 -FEP_20-1h1s/ 0 -FEP_20-1oi9/ 0 -FEP_20-1oiu/ 0 -FEP_20-1oiy/ 0 -FEP_21-17/ 0 -FEP_21-1h1q/ 0 -FEP_21-1h1r/ 0 -FEP_21-1h1s/ 0 -FEP_21-1oi9/ 0 -FEP_21-1oiu/ 0 -FEP_21-1oiy/ 0 -FEP_21-20/ 0 -FEP_22-17/ 0 -FEP_22-1h1q/ 0 -FEP_22-1h1r/ 0 -FEP_22-1h1s/ 0 -FEP_22-1oi9/ 0 -FEP_22-1oiu/ 0 -FEP_22-1oiy/ 0 -FEP_22-20/ 0 -FEP_22-21/ 0 -FEP_26-17/ 0 -FEP_26-1h1q/ 0 -FEP_26-1h1r/ 0 -FEP_26-1h1s/ 0 -FEP_26-1oi9/ 0 -FEP_26-1oiu/ 0 -FEP_26-1oiy/ 0 -FEP_26-20/ 0 -FEP_26-21/ 0 -FEP_26-22/ 0 -FEP_28-17/ 0 -FEP_28-1h1q/ 0 -FEP_28-1h1r/ 0 -FEP_28-1h1s/ 0 -FEP_28-1oi9/ 0 -FEP_28-1oiu/ 0 -FEP_28-1oiy/ 0 -FEP_28-20/ 0 -FEP_28-21/ 0 -FEP_28-22/ 0 -FEP_28-26/ 0 -FEP_29-17/ 0 -FEP_29-1h1q/ 0 -FEP_29-1h1r/ 0 -FEP_29-1h1s/ 0 -FEP_29-1oi9/ 0 -FEP_29-1oiu/ 0 -FEP_29-1oiy/ 0 -FEP_29-20/ 0 -FEP_29-21/ 0 -FEP_29-22/ 0 -FEP_29-26/ 0 -FEP_29-28/ 0 -FEP_30-17/ 0 -FEP_30-1h1q/ 0 -FEP_30-1h1r/ 0 -FEP_30-1h1s/ 0 -FEP_30-1oi9/ 0 -FEP_30-1oiu/ 0 -FEP_30-1oiy/ 0 -FEP_30-20/ 0 -FEP_30-21/ 0 -FEP_30-22/ 0 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-28/ 0 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-17/ 0 -FEP_31-1h1q/ 0 -FEP_31-1h1r/ 0 -FEP_31-1h1s/ 0 -FEP_31-1oi9/ 0 -FEP_31-1oiu/ 0 -FEP_31-1oiy/ 0 -FEP_31-20/ 0 -FEP_31-21/ 0 -FEP_31-22/ 0 -FEP_31-26/ 0 -FEP_31-28/ 0 -FEP_31-29/ 0 -FEP_31-30/ 0 -FEP_32-17/ 0 -FEP_32-1h1q/ 0 -FEP_32-1h1r/ 0 -FEP_32-1h1s/ 0 -FEP_32-1oi9/ 0 -FEP_32-1oiu/ 0 -FEP_32-1oiy/ 0 -FEP_32-20/ 0 -FEP_32-21/ 0 -FEP_32-22/ 0 -FEP_32-26/ 0 -FEP_32-28/ 0 -FEP_32-29/ 0 -FEP_32-30/ 0 -FEP_32-31/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water_sc.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water_sc.txt deleted file mode 100644 index bcc945bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/QligFEPbenchmarking_data/water_sc.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -8.09 0.28 0 -FEP_1oiy-22 39.98 0.30 0 -FEP_30-29 21.48 0.27 0 -FEP_31-26 10.67 0.18 0 -FEP_30-31 23.61 0.30 0 -FEP_26-1oi9 -11.21 0.27 0 -FEP_1oi9-1oiy -22.44 0.13 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.25 0.27 0 -FEP_21-22 -3.47 0.23 0 -FEP_1h1q-1h1r 2.53 0.13 0 -FEP_1oiu-32 30.98 0.36 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.45 0.16 0 -FEP_28-29 13.24 0.21 0 -FEP_1h1r-20 -11.19 0.15 0 -FEP_30-28 9.10 0.17 0 -FEP_1h1r-17 0.29 0.12 0 -FEP_26-21 9.59 0.29 0 -FEP_1h1s-32 27.36 0.28 0 -FEP_17-20 -10.96 0.28 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/pairs.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/pairs.txt deleted file mode 100755 index caf277ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/pairs.txt +++ /dev/null @@ -1,120 +0,0 @@ -1h1q 17 -1h1r 17 -1h1s 17 -1oi9 17 -1oiu 17 -1oiy 17 -20 17 -21 17 -22 17 -26 17 -28 17 -29 17 -30 17 -31 17 -32 17 -1h1r 1h1q -1h1s 1h1q -1oi9 1h1q -1oiu 1h1q -1oiy 1h1q -20 1h1q -21 1h1q -22 1h1q -26 1h1q -28 1h1q -29 1h1q -30 1h1q -31 1h1q -32 1h1q -1h1s 1h1r -1oi9 1h1r -1oiu 1h1r -1oiy 1h1r -20 1h1r -21 1h1r -22 1h1r -26 1h1r -28 1h1r -29 1h1r -30 1h1r -31 1h1r -32 1h1r -1oi9 1h1s -1oiu 1h1s -1oiy 1h1s -20 1h1s -21 1h1s -22 1h1s -26 1h1s -28 1h1s -29 1h1s -30 1h1s -31 1h1s -32 1h1s -1oiu 1oi9 -1oiy 1oi9 -20 1oi9 -21 1oi9 -22 1oi9 -26 1oi9 -28 1oi9 -29 1oi9 -30 1oi9 -31 1oi9 -32 1oi9 -1oiy 1oiu -20 1oiu -21 1oiu -22 1oiu -26 1oiu -28 1oiu -29 1oiu -30 1oiu -31 1oiu -32 1oiu -20 1oiy -21 1oiy -22 1oiy -26 1oiy -28 1oiy -29 1oiy -30 1oiy -31 1oiy -32 1oiy -21 20 -22 20 -26 20 -28 20 -29 20 -30 20 -31 20 -32 20 -22 21 -26 21 -28 21 -29 21 -30 21 -31 21 -32 21 -26 22 -28 22 -29 22 -30 22 -31 22 -32 22 -28 26 -29 26 -30 26 -31 26 -32 26 -29 28 -30 28 -31 28 -32 28 -30 29 -31 29 -32 29 -31 30 -32 30 -32 31 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index 45e2745f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_26-1oiy -36.35 0.23 -FEP_28-22 33.78 0.54 -FEP_30-29 21.46 0.71 -FEP_21-1h1q -5.38 0.33 -FEP_32-30 -18.49 0.39 -FEP_1h1r-1h1q -3.56 0.33 -FEP_21-1oiu -58.02 0.33 -FEP_30-20 29.89 0.65 -FEP_30-1h1s -10.15 0.18 -FEP_30-22 41.51 0.63 -FEP_30-28 8.16 0.22 -FEP_26-17 7.67 0.27 -FEP_22-20 -11.55 0.44 -FEP_32-1oiu -34.57 0.6 -FEP_31-1oiy -23.91 0.16 -FEP_22-1oiy -41.68 0.84 -FEP_32-1oi9 1.98 0.71 -FEP_29-26 11.92 0.77 -FEP_1h1s-1h1q 47.64 0.51 -FEP_22-1h1r 0.33 0.25 -FEP_21-17 -3.04 0.21 -FEP_28-26 25.67 0.58 -FEP_1h1s-1h1r 51.92 0.69 -FEP_21-1h1s -53.61 0.55 -FEP_22-17 -0.6 0.32 -FEP_26-21 9.79 0.62 -FEP_32-21 24.64 0.47 -FEP_1oiy-1h1q 40.51 0.33 -FEP_32-17 22.97 0.89 -FEP_1h1r-17 -0.7 0.33 -FEP_30-17 41.52 1.05 -FEP_29-1h1q 16.17 1.46 -FEP_21-1h1r -1.91 0.38 -FEP_29-1oiu -38.69 nan -FEP_29-1h1s -33.66 0.59 -FEP_28-1h1q 29.14 0.75 -FEP_20-1oi9 -8.89 0.41 -FEP_30-21 42.31 0.65 -FEP_1oiu-1h1s 4.61 0.37 -FEP_31-30 -22.17 0.14 -FEP_21-1oi9 -21.92 0.68 -FEP_32-31 4.9 0.42 -FEP_28-21 34.01 1 -FEP_26-1h1s -43.57 0.7 -FEP_22-1h1s -50.46 0.58 -FEP_30-1oi9 18.16 1.2 -FEP_31-17 17.76 0.6 -FEP_30-1h1q 34.49 0.81 -FEP_31-28 -14.01 0.2 -FEP_32-1h1q 19.15 0.73 -FEP_20-1h1q 9.12 0.28 -FEP_21-20 -13.16 0.38 -FEP_28-1h1r 31.95 0.71 -FEP_26-1h1q 3.51 0.61 -FEP_26-1h1r 6.75 0.45 -FEP_32-1h1r 22.14 0.61 -FEP_1oi9-1h1q 18.41 0.29 -FEP_32-28 -8.59 0.5 -FEP_1oi9-1h1r 20.94 0.62 -FEP_1oiy-1h1s -8.23 0.27 -FEP_31-29 -1.31 0.33 -FEP_29-21 24.34 0.94 -FEP_1h1s-17 49.72 0.55 -FEP_29-1oiy -24.51 0.79 -FEP_29-17 17.65 1 -FEP_29-1oi9 0.61 0.38 -FEP_20-1h1r 12.18 0.35 -FEP_31-22 19.65 0.73 -FEP_28-1oi9 8.74 0.86 -FEP_20-1oiy -30.97 0.43 -FEP_1oiu-1oi9 34.77 0.44 -FEP_32-20 10.72 0.81 -FEP_1oiu-17 55.36 0.43 -FEP_30-1oiu -16.18 0.99 -FEP_20-17 10.88 0.27 -FEP_22-1oi9 -20.31 0.42 -FEP_32-26 16.88 0.75 -FEP_30-26 34.37 0.34 -FEP_22-1h1q -2.79 0.53 -FEP_1oiu-1h1r 56.04 0.39 -FEP_28-20 20.37 0.89 -FEP_29-22 20.48 1.02 -FEP_29-20 7.91 0.34 -FEP_31-26 11.69 0.25 -FEP_1oi9-1h1s -29.17 0.52 -FEP_1oiy-17 43.9 0.9 -FEP_28-17 33.37 0.67 -FEP_1oiy-1h1r 42.52 0.62 -FEP_31-21 19.72 1.24 -FEP_21-1oiy -46.1 0.87 -FEP_28-1oiy -11.73 0.93 -FEP_31-1h1q 15.52 0.37 -FEP_1oiu-1h1q 51.14 0.54 -FEP_1oiy-1oi9 21.08 0.45 -FEP_26-1oiu -48.74 0.45 -FEP_32-1oiy -20.18 0.22 -FEP_26-1oi9 -13.44 0.44 -FEP_31-20 5.12 0.88 -FEP_1h1q-17 3.06 0.34 -FEP_28-1h1s -18.29 0.6 -FEP_28-1oiu -24.19 0.66 -FEP_31-1oi9 -3.47 0.63 -FEP_29-1h1r 20.34 1.07 -FEP_32-1h1s -29.08 0.87 -FEP_26-20 -4.77 0.58 -FEP_26-22 7.1 0.59 -FEP_30-1oiy -1.92 0.18 -FEP_31-1h1r 18.67 0.94 -FEP_31-1h1s -33.07 0.28 -FEP_22-21 3.1 0.45 -FEP_1oi9-17 19.47 0.61 -FEP_31-1oiu -36.03 0.47 -FEP_20-1h1s -38.02 0.91 -FEP_1oiy-1oiu -12.24 0.48 -FEP_32-22 23.09 0.4 -FEP_32-29 3.25 0.39 -FEP_30-1h1r 40.71 0.73 -FEP_22-1oiu -54.87 0.88 -FEP_29-28 -12.65 0.22 -FEP_20-1oiu -42.91 0.29 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 0ce71c7d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1h1q-17/ 1 -FEP_1h1r-17/ 2 -FEP_1h1r-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-17/ 1 -FEP_1h1s-1h1q/ 1 -FEP_1h1s-1h1r/ 2 -FEP_1oi9-17/ 0 -FEP_1oi9-1h1q/ 3 -FEP_1oi9-1h1r/ 3 -FEP_1oi9-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-17/ 3 -FEP_1oiu-1h1q/ 2 -FEP_1oiu-1h1r/ 1 -FEP_1oiu-1h1s/ 2 -FEP_1oiu-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-17/ 2 -FEP_1oiy-1h1q/ 4 -FEP_1oiy-1h1r/ 5 -FEP_1oiy-1h1s/ 2 -FEP_1oiy-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-1oiu/ 0 -FEP_20-17/ 4 -FEP_20-1h1q/ 1 -FEP_20-1h1r/ 2 -FEP_20-1h1s/ 1 -FEP_20-1oi9/ 2 -FEP_20-1oiu/ 1 -FEP_20-1oiy/ 0 -FEP_21-17/ 2 -FEP_21-1h1q/ 3 -FEP_21-1h1r/ 2 -FEP_21-1h1s/ 3 -FEP_21-1oi9/ 0 -FEP_21-1oiu/ 0 -FEP_21-1oiy/ 3 -FEP_21-20/ 4 -FEP_22-17/ 3 -FEP_22-1h1q/ 2 -FEP_22-1h1r/ 2 -FEP_22-1h1s/ 1 -FEP_22-1oi9/ 2 -FEP_22-1oiu/ 1 -FEP_22-1oiy/ 1 -FEP_22-20/ 2 -FEP_22-21/ 2 -FEP_26-17/ 2 -FEP_26-1h1q/ 2 -FEP_26-1h1r/ 1 -FEP_26-1h1s/ 3 -FEP_26-1oi9/ 1 -FEP_26-1oiu/ 0 -FEP_26-1oiy/ 5 -FEP_26-20/ 3 -FEP_26-21/ 1 -FEP_26-22/ 1 -FEP_28-17/ 0 -FEP_28-1h1q/ 1 -FEP_28-1h1r/ 1 -FEP_28-1h1s/ 0 -FEP_28-1oi9/ 3 -FEP_28-1oiu/ 1 -FEP_28-1oiy/ 4 -FEP_28-20/ 1 -FEP_28-21/ 1 -FEP_28-22/ 1 -FEP_28-26/ 0 -FEP_29-17/ 3 -FEP_29-1h1q/ 4 -FEP_29-1h1r/ 4 -FEP_29-1h1s/ 6 -FEP_29-1oi9/ 3 -FEP_29-1oiu/ 3 -FEP_29-1oiy/ 3 -FEP_29-20/ 2 -FEP_29-21/ 0 -FEP_29-22/ 0 -FEP_29-26/ 3 -FEP_29-28/ 0 -FEP_30-17/ 3 -FEP_30-1h1q/ 1 -FEP_30-1h1r/ 0 -FEP_30-1h1s/ 2 -FEP_30-1oi9/ 3 -FEP_30-1oiu/ 2 -FEP_30-1oiy/ 4 -FEP_30-20/ 3 -FEP_30-21/ 0 -FEP_30-22/ 2 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-28/ 1 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-17/ 2 -FEP_31-1h1q/ 1 -FEP_31-1h1r/ 0 -FEP_31-1h1s/ 0 -FEP_31-1oi9/ 0 -FEP_31-1oiu/ 3 -FEP_31-1oiy/ 1 -FEP_31-20/ 1 -FEP_31-21/ 2 -FEP_31-22/ 1 -FEP_31-26/ 2 -FEP_31-28/ 1 -FEP_31-29/ 1 -FEP_31-30/ 2 -FEP_32-17/ 2 -FEP_32-1h1q/ 1 -FEP_32-1h1r/ 1 -FEP_32-1h1s/ 2 -FEP_32-1oi9/ 2 -FEP_32-1oiu/ 1 -FEP_32-1oiy/ 2 -FEP_32-20/ 2 -FEP_32-21/ 2 -FEP_32-22/ 4 -FEP_32-26/ 2 -FEP_32-28/ 2 -FEP_32-29/ 2 -FEP_32-30/ 2 -FEP_32-31/ 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index 23e46d86..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_26-1oiy -34.83 0.23 -FEP_28-22 30.26 0.55 -FEP_30-29 21.54 0.21 -FEP_21-1h1q -6.38 0.59 -FEP_32-30 -18.33 0.65 -FEP_1h1r-1h1q -3.51 0.15 -FEP_21-1oiu -54.82 0.32 -FEP_30-20 28.47 0.44 -FEP_30-1h1s -8.53 0.14 -FEP_30-22 38.37 0.46 -FEP_30-28 8.53 0.2 -FEP_26-17 6.71 0.31 -FEP_22-20 -11.15 0.5 -FEP_32-1oiu -31.05 1.11 -FEP_31-1oiy -23.76 0.19 -FEP_22-1oiy -39.29 0.38 -FEP_32-1oi9 0.44 0.8 -FEP_29-26 12.52 0.32 -FEP_1h1s-1h1q 44.53 0.32 -FEP_22-1h1r 0.82 0.33 -FEP_21-17 -2.45 0.28 -FEP_28-26 24.6 0.27 -FEP_1h1s-1h1r 49.05 0.3 -FEP_21-1h1s -50.98 0.23 -FEP_22-17 1.2 0.22 -FEP_26-21 10.32 0.76 -FEP_32-21 23.41 0.78 -FEP_1oiy-1h1q 37.99 0.13 -FEP_32-17 20.69 1.02 -FEP_1h1r-17 -0.37 0.24 -FEP_30-17 39.94 0.54 -FEP_29-1h1q 13.11 0.4 -FEP_21-1h1r -1.94 0.12 -FEP_29-1oiu -37 0.58 -FEP_29-1h1s -30.3 0.25 -FEP_28-1h1q 28.79 0.34 -FEP_20-1oi9 -7.07 0.21 -FEP_30-21 42.6 0.68 -FEP_1oiu-1h1s 5 0.58 -FEP_31-30 -23.82 0.35 -FEP_21-1oi9 -20.42 0.22 -FEP_32-31 4.97 0.54 -FEP_28-21 32.87 0.46 -FEP_26-1h1s -42.13 0.25 -FEP_22-1h1s -47.16 0.41 -FEP_30-1oi9 20.47 0.78 -FEP_31-17 16.71 0.4 -FEP_30-1h1q 35.4 0.38 -FEP_31-28 -14.27 0.21 -FEP_32-1h1q 18.16 0.45 -FEP_20-1h1q 8.26 0.12 -FEP_21-20 -13.48 0.18 -FEP_28-1h1r 29.24 1.15 -FEP_26-1h1q 3.28 0.2 -FEP_26-1h1r 6.32 0.28 -FEP_32-1h1r 21.84 0.65 -FEP_1oi9-1h1q 15.2 0.18 -FEP_32-28 -9.24 0.38 -FEP_1oi9-1h1r 18.62 0.18 -FEP_1oiy-1h1s -7.93 0.21 -FEP_31-29 -1.62 0.22 -FEP_29-21 20.47 0.91 -FEP_1h1s-17 48.02 0.23 -FEP_29-1oiy -23.3 0.5 -FEP_29-17 16.75 1.34 -FEP_29-1oi9 1.34 0.27 -FEP_20-1h1r 11.07 0.16 -FEP_31-22 16.68 0.46 -FEP_28-1oi9 13.99 0.37 -FEP_20-1oiy -29.18 0.16 -FEP_1oiu-1oi9 34.06 0.45 -FEP_32-20 10.33 0.57 -FEP_1oiu-17 52.47 0.41 -FEP_30-1oiu -13.79 0.62 -FEP_20-17 11.09 0.27 -FEP_22-1oi9 -17.63 0.86 -FEP_32-26 16.28 0.32 -FEP_30-26 33.64 0.17 -FEP_22-1h1q -2.26 0.22 -FEP_1oiu-1h1r 52.58 0.35 -FEP_28-20 19.84 0.35 -FEP_29-22 16.42 0.96 -FEP_29-20 5.25 0.63 -FEP_31-26 10.41 0.22 -FEP_1oi9-1h1s -30.23 0.49 -FEP_1oiy-17 39.69 0.3 -FEP_28-17 31.76 0.51 -FEP_1oiy-1h1r 40.1 0.18 -FEP_31-21 18.55 0.51 -FEP_21-1oiy -43.52 0.39 -FEP_28-1oiy -9.92 0.61 -FEP_31-1h1q 13.7 0.49 -FEP_1oiu-1h1q 49.41 0.28 -FEP_1oiy-1oi9 21.91 0.21 -FEP_26-1oiu -46.9 0.31 -FEP_32-1oiy -18.39 0.33 -FEP_26-1oi9 -11.78 0.36 -FEP_31-20 5.42 0.29 -FEP_1h1q-17 3.05 0.23 -FEP_28-1h1s -17.09 0.22 -FEP_28-1oiu -22.49 0.99 -FEP_31-1oi9 -2.1 0.64 -FEP_29-1h1r 18.24 0.99 -FEP_32-1h1s -26.38 0.3 -FEP_26-20 -5.66 0.22 -FEP_26-22 5.33 0.26 -FEP_30-1oiy -0.72 0.33 -FEP_31-1h1r 17 0.41 -FEP_31-1h1s -31.73 0.15 -FEP_22-21 3.32 0.21 -FEP_1oi9-17 18.3 0.19 -FEP_31-1oiu -37.04 0.77 -FEP_20-1h1s -36.8 0.27 -FEP_1oiy-1oiu -11.69 0.34 -FEP_32-22 21.14 0.3 -FEP_32-29 5.61 0.46 -FEP_30-1h1r 39.96 0.46 -FEP_22-1oiu -52.53 1.12 -FEP_29-28 -13.06 0.24 -FEP_20-1oiu -41.34 0.28 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index b166a434..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/lineal/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1h1q-17/ 0 -FEP_1h1r-17/ 0 -FEP_1h1r-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-17/ 0 -FEP_1h1s-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-17/ 0 -FEP_1oi9-1h1q/ 0 -FEP_1oi9-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-17/ 0 -FEP_1oiu-1h1q/ 0 -FEP_1oiu-1h1r/ 0 -FEP_1oiu-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-17/ 0 -FEP_1oiy-1h1q/ 0 -FEP_1oiy-1h1r/ 0 -FEP_1oiy-1h1s/ 0 -FEP_1oiy-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-1oiu/ 0 -FEP_20-17/ 0 -FEP_20-1h1q/ 0 -FEP_20-1h1r/ 0 -FEP_20-1h1s/ 0 -FEP_20-1oi9/ 0 -FEP_20-1oiu/ 0 -FEP_20-1oiy/ 0 -FEP_21-17/ 0 -FEP_21-1h1q/ 0 -FEP_21-1h1r/ 0 -FEP_21-1h1s/ 0 -FEP_21-1oi9/ 0 -FEP_21-1oiu/ 0 -FEP_21-1oiy/ 0 -FEP_21-20/ 0 -FEP_22-17/ 0 -FEP_22-1h1q/ 0 -FEP_22-1h1r/ 0 -FEP_22-1h1s/ 0 -FEP_22-1oi9/ 0 -FEP_22-1oiu/ 0 -FEP_22-1oiy/ 0 -FEP_22-20/ 0 -FEP_22-21/ 0 -FEP_26-17/ 0 -FEP_26-1h1q/ 0 -FEP_26-1h1r/ 0 -FEP_26-1h1s/ 0 -FEP_26-1oi9/ 0 -FEP_26-1oiu/ 0 -FEP_26-1oiy/ 0 -FEP_26-20/ 0 -FEP_26-21/ 0 -FEP_26-22/ 0 -FEP_28-17/ 0 -FEP_28-1h1q/ 0 -FEP_28-1h1r/ 0 -FEP_28-1h1s/ 0 -FEP_28-1oi9/ 0 -FEP_28-1oiu/ 0 -FEP_28-1oiy/ 0 -FEP_28-20/ 0 -FEP_28-21/ 0 -FEP_28-22/ 0 -FEP_28-26/ 0 -FEP_29-17/ 0 -FEP_29-1h1q/ 0 -FEP_29-1h1r/ 0 -FEP_29-1h1s/ 0 -FEP_29-1oi9/ 0 -FEP_29-1oiu/ 0 -FEP_29-1oiy/ 0 -FEP_29-20/ 0 -FEP_29-21/ 0 -FEP_29-22/ 0 -FEP_29-26/ 0 -FEP_29-28/ 0 -FEP_30-17/ 0 -FEP_30-1h1q/ 0 -FEP_30-1h1r/ 0 -FEP_30-1h1s/ 0 -FEP_30-1oi9/ 0 -FEP_30-1oiu/ 0 -FEP_30-1oiy/ 0 -FEP_30-20/ 0 -FEP_30-21/ 0 -FEP_30-22/ 0 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-28/ 0 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-17/ 0 -FEP_31-1h1q/ 0 -FEP_31-1h1r/ 0 -FEP_31-1h1s/ 0 -FEP_31-1oi9/ 0 -FEP_31-1oiu/ 0 -FEP_31-1oiy/ 0 -FEP_31-20/ 0 -FEP_31-21/ 0 -FEP_31-22/ 0 -FEP_31-26/ 0 -FEP_31-28/ 0 -FEP_31-29/ 0 -FEP_31-30/ 0 -FEP_32-17/ 0 -FEP_32-1h1q/ 0 -FEP_32-1h1r/ 0 -FEP_32-1h1s/ 0 -FEP_32-1oi9/ 0 -FEP_32-1oiu/ 0 -FEP_32-1oiy/ 0 -FEP_32-20/ 0 -FEP_32-21/ 0 -FEP_32-22/ 0 -FEP_32-26/ 0 -FEP_32-28/ 0 -FEP_32-29/ 0 -FEP_32-30/ 0 -FEP_32-31/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein-linear.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein-linear.txt deleted file mode 100644 index 5bf8402d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein-linear.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -10.55 0.39 2 -FEP_1oiy-22 42.68 0.47 0 -FEP_30-29 21.93 0.30 0 -FEP_31-26 12.94 0.42 0 -FEP_30-31 24.01 0.42 3 -FEP_26-1oi9 -12.89 0.38 0 -FEP_1oi9-1oiy -20.99 0.58 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.58 0.67 0 -FEP_21-22 -2.52 0.63 0 -FEP_1h1q-1h1r 4.58 0.47 0 -FEP_1oiu-32 32.76 0.54 0 -FEP_1oi9-1h1q 16.95 0.43 0 -FEP_28-29 13.05 0.30 0 -FEP_1h1r-20 -13.13 0.29 0 -FEP_30-28 8.04 0.34 0 -FEP_1h1r-17 -0.65 0.63 0 -FEP_26-21 10.60 0.38 0 -FEP_1h1s-32 29.73 0.70 0 -FEP_17-20 -11.76 0.79 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein.txt deleted file mode 100755 index 7360581f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28_1oi9 12.62 0.57 0 -FEP_26_1h1q 3.73 0.19 0 -FEP_32_31 3.85 0.38 0 -FEP_22_17 -0.64 0.24 0 -FEP_30_1h1s -9.96 0.17 0 -FEP_28_22 34.45 0.37 0 -FEP_30_1oi9 20.55 0.33 0 -FEP_32_1h1s -28.42 0.53 0 -FEP_1oiy_1h1s -8.27 0.08 0 -FEP_31_22 20.20 0.62 0 -FEP_1oiy_17 42.59 0.84 0 -FEP_22_1h1q -3.68 0.23 0 -FEP_1oiy_1h1r 42.95 0.53 0 -FEP_29_1h1r 19.39 0.73 0 -FEP_32_1oiu -32.58 0.42 0 -FEP_31_29 -0.73 0.24 0 -FEP_32_21 25.58 0.38 0 -FEP_29_21 22.83 0.87 0 -FEP_32_20 10.56 0.46 0 -FEP_26_1h1s -44.75 0.36 0 -FEP_31_20 6.73 0.26 0 -FEP_1oiy_1oiu -12.61 0.40 0 -FEP_32_29 2.99 0.36 0 -FEP_31_1oiy -24.24 0.12 0 -FEP_21_1h1q -6.07 0.29 0 -FEP_29_1oiy -23.44 0.37 0 -FEP_30_29 21.13 0.19 0 -FEP_28_1h1s -18.10 0.27 0 -FEP_30_22 41.48 0.23 0 -FEP_29_28 -13.36 0.22 0 -FEP_1oiu_1h1r 56.10 0.29 0 -FEP_21_1h1s -54.75 0.52 0 -FEP_31_26 11.52 0.23 0 -FEP_20_1oiy -30.66 0.28 0 -FEP_31_17 17.63 0.61 0 -FEP_1oiu_1h1s 3.36 0.30 0 -FEP_20_1h1r 12.83 0.27 0 -FEP_22_20 -12.73 0.43 0 -FEP_30_20 29.01 0.23 0 -FEP_32_1oi9 2.15 0.48 0 -FEP_21_1oi9 -22.77 0.40 0 -FEP_20_1h1q 8.95 0.09 0 -FEP_28_1oiu -22.52 0.83 0 -FEP_26_1oi9 -14.81 0.44 0 -FEP_31_28 -14.45 0.34 0 -FEP_30_26 34.09 0.31 0 -FEP_28_1h1r 33.56 0.54 0 -FEP_1oi9_1h1r 20.52 0.52 0 -FEP_1oiy_1h1q 40.40 0.35 0 -FEP_31_1h1s -32.84 0.36 0 -FEP_29_22 22.21 0.43 0 -FEP_31_21 19.66 0.47 0 -FEP_22_1h1r -0.34 0.25 0 -FEP_30_17 41.40 0.44 0 -FEP_29_17 20.35 0.43 0 -FEP_21_1h1r -1.94 0.25 0 -FEP_28_26 26.37 0.16 0 -FEP_21_1oiy -44.63 0.66 0 -FEP_32_1h1r 23.18 0.23 0 -FEP_1h1s_1h1r 52.09 0.60 0 -FEP_26_22 7.08 0.45 0 -FEP_32_1oiy -20.26 0.32 0 -FEP_1oi9_1h1q 17.16 0.35 0 -FEP_28_17 33.12 0.63 0 -FEP_29_1h1s -31.70 0.37 0 -FEP_1h1s_1h1q 47.71 0.47 0 -FEP_1h1s_17 52.38 0.67 0 -FEP_32_28 -10.24 0.34 0 -FEP_30_21 44.70 0.64 0 -FEP_31_30 -21.77 0.17 0 -FEP_21_1oiu -58.15 0.25 0 -FEP_20_1oiu -43.10 0.29 0 -FEP_30_1h1q 37.90 0.24 0 -FEP_1oiu_1oi9 33.91 0.48 0 -FEP_26_1oiu -48.18 0.69 0 -FEP_28_21 36.45 0.38 0 -FEP_20_17 12.17 0.26 0 -FEP_1oi9_1h1s -30.35 0.37 0 -FEP_30_1oiy -1.90 0.22 0 -FEP_22_1h1s -52.25 0.71 0 -FEP_31_1oiu -36.23 0.64 0 -FEP_32_30 -18.96 0.27 0 -FEP_29_26 12.61 0.41 0 -FEP_28_1h1q 29.69 0.25 0 -FEP_1oiy_1oi9 21.49 0.46 0 -FEP_31_1h1r 19.35 0.54 0 -FEP_30_1h1r 42.63 0.28 0 -FEP_31_1h1q 15.53 0.28 0 -FEP_29_1oiu -36.70 0.58 0 -FEP_22_1oiu -56.20 0.53 0 -FEP_30_28 7.95 0.16 0 -FEP_29_1oi9 -2.03 0.93 0 -FEP_22_21 2.00 0.19 0 -FEP_26_1oiy -36.34 0.20 0 -FEP_1h1r_17 -0.23 0.04 0 -FEP_1h1r_1h1q -3.84 0.31 0 -FEP_32_26 15.38 0.46 0 -FEP_32_22 23.60 0.31 0 -FEP_26_20 -5.63 0.50 0 -FEP_29_1h1q 15.33 0.53 0 -FEP_21_17 -2.87 0.29 0 -FEP_32_1h1q 20.06 0.42 0 -FEP_20_1h1s -38.93 0.36 0 -FEP_28_20 20.74 0.74 0 -FEP_26_21 10.94 0.44 0 -FEP_29_20 6.76 0.50 0 -FEP_30_1oiu -13.12 0.23 0 -FEP_20_1oi9 -7.89 0.22 0 -FEP_1oiu_17 55.37 0.21 0 -FEP_1oi9_17 20.37 0.38 0 -FEP_26_1h1r 7.95 0.38 0 -FEP_26_17 6.82 0.58 0 -FEP_21_20 -14.67 0.34 0 -FEP_22_1oi9 -20.85 0.22 0 -FEP_32_17 22.83 0.40 0 -FEP_22_1oiy -43.22 0.49 0 -FEP_28_1oiy -9.95 0.54 0 -FEP_1oiu_1h1q 52.25 0.29 0 -FEP_31_1oi9 -2.86 0.33 0 -FEP_1h1q_17 2.87 0.25 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein_opls_test.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein_opls_test.txt deleted file mode 100644 index 507bf4d7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein_opls_test.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28-29 12.83 0.13 0 -FEP_26-21 10.95 0.40 0 -FEP_1h1q-1h1r 4.04 0.30 0 -FEP_26-1oi9 -14.38 0.38 0 -FEP_30-31 21.75 0.16 0 -FEP_1oiu-32 32.44 0.41 0 -FEP_1oi9-1oiy -21.93 0.32 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.74 0.43 0 -FEP_30-1h1s -9.74 0.13 0 -FEP_1oi9-1h1q 18.13 0.35 0 -FEP_21-22 -2.13 0.27 0 -FEP_1oiy-22 43.39 0.60 0 -FEP_30-29 21.30 0.19 0 -FEP_31-26 11.73 0.32 0 -FEP_1h1r-17 -0.29 0.13 0 -FEP_1h1s-32 29.34 0.24 0 -FEP_30-28 8.04 0.17 0 -FEP_1h1r-20 -12.44 0.24 0 -FEP_17-20 -11.98 0.27 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 0ce71c7d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1h1q-17/ 1 -FEP_1h1r-17/ 2 -FEP_1h1r-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-17/ 1 -FEP_1h1s-1h1q/ 1 -FEP_1h1s-1h1r/ 2 -FEP_1oi9-17/ 0 -FEP_1oi9-1h1q/ 3 -FEP_1oi9-1h1r/ 3 -FEP_1oi9-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-17/ 3 -FEP_1oiu-1h1q/ 2 -FEP_1oiu-1h1r/ 1 -FEP_1oiu-1h1s/ 2 -FEP_1oiu-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-17/ 2 -FEP_1oiy-1h1q/ 4 -FEP_1oiy-1h1r/ 5 -FEP_1oiy-1h1s/ 2 -FEP_1oiy-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-1oiu/ 0 -FEP_20-17/ 4 -FEP_20-1h1q/ 1 -FEP_20-1h1r/ 2 -FEP_20-1h1s/ 1 -FEP_20-1oi9/ 2 -FEP_20-1oiu/ 1 -FEP_20-1oiy/ 0 -FEP_21-17/ 2 -FEP_21-1h1q/ 3 -FEP_21-1h1r/ 2 -FEP_21-1h1s/ 3 -FEP_21-1oi9/ 0 -FEP_21-1oiu/ 0 -FEP_21-1oiy/ 3 -FEP_21-20/ 4 -FEP_22-17/ 3 -FEP_22-1h1q/ 2 -FEP_22-1h1r/ 2 -FEP_22-1h1s/ 1 -FEP_22-1oi9/ 2 -FEP_22-1oiu/ 1 -FEP_22-1oiy/ 1 -FEP_22-20/ 2 -FEP_22-21/ 2 -FEP_26-17/ 2 -FEP_26-1h1q/ 2 -FEP_26-1h1r/ 1 -FEP_26-1h1s/ 3 -FEP_26-1oi9/ 1 -FEP_26-1oiu/ 0 -FEP_26-1oiy/ 5 -FEP_26-20/ 3 -FEP_26-21/ 1 -FEP_26-22/ 1 -FEP_28-17/ 0 -FEP_28-1h1q/ 1 -FEP_28-1h1r/ 1 -FEP_28-1h1s/ 0 -FEP_28-1oi9/ 3 -FEP_28-1oiu/ 1 -FEP_28-1oiy/ 4 -FEP_28-20/ 1 -FEP_28-21/ 1 -FEP_28-22/ 1 -FEP_28-26/ 0 -FEP_29-17/ 3 -FEP_29-1h1q/ 4 -FEP_29-1h1r/ 4 -FEP_29-1h1s/ 6 -FEP_29-1oi9/ 3 -FEP_29-1oiu/ 3 -FEP_29-1oiy/ 3 -FEP_29-20/ 2 -FEP_29-21/ 0 -FEP_29-22/ 0 -FEP_29-26/ 3 -FEP_29-28/ 0 -FEP_30-17/ 3 -FEP_30-1h1q/ 1 -FEP_30-1h1r/ 0 -FEP_30-1h1s/ 2 -FEP_30-1oi9/ 3 -FEP_30-1oiu/ 2 -FEP_30-1oiy/ 4 -FEP_30-20/ 3 -FEP_30-21/ 0 -FEP_30-22/ 2 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-28/ 1 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-17/ 2 -FEP_31-1h1q/ 1 -FEP_31-1h1r/ 0 -FEP_31-1h1s/ 0 -FEP_31-1oi9/ 0 -FEP_31-1oiu/ 3 -FEP_31-1oiy/ 1 -FEP_31-20/ 1 -FEP_31-21/ 2 -FEP_31-22/ 1 -FEP_31-26/ 2 -FEP_31-28/ 1 -FEP_31-29/ 1 -FEP_31-30/ 2 -FEP_32-17/ 2 -FEP_32-1h1q/ 1 -FEP_32-1h1r/ 1 -FEP_32-1h1s/ 2 -FEP_32-1oi9/ 2 -FEP_32-1oiu/ 1 -FEP_32-1oiy/ 2 -FEP_32-20/ 2 -FEP_32-21/ 2 -FEP_32-22/ 4 -FEP_32-26/ 2 -FEP_32-28/ 2 -FEP_32-29/ 2 -FEP_32-30/ 2 -FEP_32-31/ 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein_sc.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein_sc.txt deleted file mode 100644 index 83d36535..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/protein_sc.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -9.49 0.57 3 -FEP_1oiy-22 43.48 0.71 1 -FEP_30-29 21.91 0.66 3 -FEP_31-26 13.15 0.57 0 -FEP_30-31 24.89 0.51 0 -FEP_26-1oi9 -12.23 0.60 0 -FEP_1oi9-1oiy -20.11 0.53 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.02 0.69 0 -FEP_21-22 -2.44 0.82 0 -FEP_1h1q-1h1r 5.15 0.28 0 -FEP_1oiu-32 32.71 0.87 0 -FEP_1oi9-1h1q 16.46 0.29 0 -FEP_28-29 13.65 0.68 0 -FEP_1h1r-20 -12.16 0.46 0 -FEP_30-28 8.89 0.54 3 -FEP_1h1r-17 0.32 0.35 2 -FEP_26-21 10.41 0.60 0 -FEP_1h1s-32 30.33 0.72 0 -FEP_17-20 -13.28 0.80 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/sigmoidal-100w/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/sigmoidal-100w/protein.txt deleted file mode 100755 index 72095039..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/sigmoidal-100w/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28-1oi9 12.62 0.57 0 -FEP_26-1h1q 3.73 0.19 0 -FEP_32-31 3.85 0.38 0 -FEP_22-17 -0.64 0.24 0 -FEP_30-1h1s -9.96 0.17 0 -FEP_28-22 34.45 0.37 0 -FEP_30-1oi9 20.55 0.33 0 -FEP_32-1h1s -28.42 0.53 0 -FEP_1oiy-1h1s -8.27 0.08 0 -FEP_31-22 20.20 0.62 0 -FEP_1oiy-17 42.59 0.84 0 -FEP_22-1h1q -3.68 0.23 0 -FEP_1oiy-1h1r 42.95 0.53 0 -FEP_29-1h1r 19.39 0.73 0 -FEP_32-1oiu -32.58 0.42 0 -FEP_31-29 -0.73 0.24 0 -FEP_32-21 25.58 0.38 0 -FEP_29-21 22.83 0.87 0 -FEP_32-20 10.56 0.46 0 -FEP_26-1h1s -44.75 0.36 0 -FEP_31-20 6.73 0.26 0 -FEP_1oiy-1oiu -12.61 0.40 0 -FEP_32-29 2.99 0.36 0 -FEP_31-1oiy -24.24 0.12 0 -FEP_21-1h1q -6.07 0.29 0 -FEP_29-1oiy -23.44 0.37 0 -FEP_30-29 21.13 0.19 0 -FEP_28-1h1s -18.10 0.27 0 -FEP_30-22 41.48 0.23 0 -FEP_29-28 -13.36 0.22 0 -FEP_1oiu-1h1r 56.10 0.29 0 -FEP_21-1h1s -54.75 0.52 0 -FEP_31-26 11.52 0.23 0 -FEP_20-1oiy -30.66 0.28 0 -FEP_31-17 17.63 0.61 0 -FEP_1oiu-1h1s 3.36 0.30 0 -FEP_20-1h1r 12.83 0.27 0 -FEP_22-20 -12.73 0.43 0 -FEP_30-20 29.01 0.23 0 -FEP_32-1oi9 2.15 0.48 0 -FEP_21-1oi9 -22.77 0.40 0 -FEP_20-1h1q 8.95 0.09 0 -FEP_28-1oiu -22.52 0.83 0 -FEP_26-1oi9 -14.81 0.44 0 -FEP_31-28 -14.45 0.34 0 -FEP_30-26 34.09 0.31 0 -FEP_28-1h1r 33.56 0.54 0 -FEP_1oi9-1h1r 20.52 0.52 0 -FEP_1oiy-1h1q 40.40 0.35 0 -FEP_31-1h1s -32.84 0.36 0 -FEP_29-22 22.21 0.43 0 -FEP_31-21 19.66 0.47 0 -FEP_22-1h1r -0.34 0.25 0 -FEP_30-17 41.40 0.44 0 -FEP_29-17 20.35 0.43 0 -FEP_21-1h1r -1.94 0.25 0 -FEP_28-26 26.37 0.16 0 -FEP_21-1oiy -44.63 0.66 0 -FEP_32-1h1r 23.18 0.23 0 -FEP_1h1s-1h1r 52.09 0.60 0 -FEP_26-22 7.08 0.45 0 -FEP_32-1oiy -20.26 0.32 0 -FEP_1oi9-1h1q 17.16 0.35 0 -FEP_28-17 33.12 0.63 0 -FEP_29-1h1s -31.70 0.37 0 -FEP_1h1s-1h1q 47.71 0.47 0 -FEP_1h1s-17 52.38 0.67 0 -FEP_32-28 -10.24 0.34 0 -FEP_30-21 44.70 0.64 0 -FEP_31-30 -21.77 0.17 0 -FEP_21-1oiu -58.15 0.25 0 -FEP_20-1oiu -43.10 0.29 0 -FEP_30-1h1q 37.90 0.24 0 -FEP_1oiu-1oi9 33.91 0.48 0 -FEP_26-1oiu -48.18 0.69 0 -FEP_28-21 36.45 0.38 0 -FEP_20-17 12.17 0.26 0 -FEP_1oi9-1h1s -30.35 0.37 0 -FEP_30-1oiy -1.90 0.22 0 -FEP_22-1h1s -52.25 0.71 0 -FEP_31-1oiu -36.23 0.64 0 -FEP_32-30 -18.96 0.27 0 -FEP_29-26 12.61 0.41 0 -FEP_28-1h1q 29.69 0.25 0 -FEP_1oiy-1oi9 21.49 0.46 0 -FEP_31-1h1r 19.35 0.54 0 -FEP_30-1h1r 42.63 0.28 0 -FEP_31-1h1q 15.53 0.28 0 -FEP_29-1oiu -36.70 0.58 0 -FEP_22-1oiu -56.20 0.53 0 -FEP_30-28 7.95 0.16 0 -FEP_29-1oi9 -2.03 0.93 0 -FEP_22-21 2.00 0.19 0 -FEP_26-1oiy -36.34 0.20 0 -FEP_1h1r-17 -0.23 0.04 0 -FEP_1h1r-1h1q -3.84 0.31 0 -FEP_32-26 15.38 0.46 0 -FEP_32-22 23.60 0.31 0 -FEP_26-20 -5.63 0.50 0 -FEP_29-1h1q 15.33 0.53 0 -FEP_21-17 -2.87 0.29 0 -FEP_32-1h1q 20.06 0.42 0 -FEP_20-1h1s -38.93 0.36 0 -FEP_28-20 20.74 0.74 0 -FEP_26-21 10.94 0.44 0 -FEP_29-20 6.76 0.50 0 -FEP_30-1oiu -13.12 0.23 0 -FEP_20-1oi9 -7.89 0.22 0 -FEP_1oiu-17 55.37 0.21 0 -FEP_1oi9-17 20.37 0.38 0 -FEP_26-1h1r 7.95 0.38 0 -FEP_26-17 6.82 0.58 0 -FEP_21-20 -14.67 0.34 0 -FEP_22-1oi9 -20.85 0.22 0 -FEP_32-17 22.83 0.40 0 -FEP_22-1oiy -43.22 0.49 0 -FEP_28-1oiy -9.95 0.54 0 -FEP_1oiu-1h1q 52.25 0.29 0 -FEP_31-1oi9 -2.86 0.33 0 -FEP_1h1q-17 2.87 0.25 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/sigmoidal-100w/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/sigmoidal-100w/water.txt deleted file mode 100755 index 0c76d409..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/sigmoidal-100w/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28-1oi9 13.53 0.26 0 -FEP_26-1h1q 3.14 0.08 0 -FEP_32-31 4.89 0.29 0 -FEP_22-17 1.15 0.15 0 -FEP_30-1h1s -8.41 0.12 0 -FEP_28-22 30.75 0.32 0 -FEP_30-1oi9 21.87 0.12 0 -FEP_32-1h1s -26.64 0.32 0 -FEP_1oiy-1h1s -7.56 0.10 0 -FEP_31-22 16.13 0.13 0 -FEP_1oiy-17 40.53 0.20 0 -FEP_22-1h1q -2.23 0.17 0 -FEP_1oiy-1h1r 40.51 0.20 0 -FEP_29-1h1r 18.34 0.32 0 -FEP_32-1oiu -30.73 0.25 0 -FEP_31-29 -0.85 0.70 0 -FEP_32-21 24.41 0.21 0 -FEP_29-21 22.01 0.30 0 -FEP_32-20 10.52 0.29 0 -FEP_26-1h1s -41.80 0.17 0 -FEP_31-20 5.56 0.19 0 -FEP_1oiy-1oiu -11.50 0.16 0 -FEP_32-29 4.10 0.29 0 -FEP_31-1oiy -23.83 0.14 0 -FEP_21-1h1q -5.56 0.25 0 -FEP_29-1oiy -21.92 0.18 0 -FEP_30-29 21.67 0.09 0 -FEP_28-1h1s -17.25 0.14 0 -FEP_30-22 39.35 0.16 0 -FEP_1h1q-17 3.43 0.10 0 -FEP_29-28 -13.24 0.11 0 -FEP_1oiu-1h1r 52.78 0.17 0 -FEP_21-1h1s -51.76 0.28 0 -FEP_31-26 10.47 0.17 0 -FEP_20-1oiy -29.81 0.19 0 -FEP_31-17 17.35 0.23 0 -FEP_1oiu-1h1s 3.89 0.27 0 -FEP_20-1h1r 11.57 0.22 0 -FEP_22-20 -10.52 0.19 0 -FEP_30-20 28.68 0.28 0 -FEP_32-1oi9 3.89 0.23 0 -FEP_21-1oi9 -20.67 0.17 0 -FEP_20-1h1q 8.28 0.10 0 -FEP_28-1oiu -21.85 0.29 0 -FEP_26-1oi9 -12.10 0.17 0 -FEP_31-28 -14.17 0.17 0 -FEP_30-26 33.75 0.18 0 -FEP_28-1h1r 31.43 0.17 0 -FEP_1oi9-1h1r 18.49 0.19 0 -FEP_1oiy-1h1q 37.68 0.13 0 -FEP_31-1h1s -31.65 0.14 0 -FEP_29-22 17.19 0.29 0 -FEP_31-21 20.36 0.54 0 -FEP_22-1h1r 1.07 0.21 0 -FEP_30-17 40.10 0.34 0 -FEP_29-17 18.27 0.53 0 -FEP_21-1h1r -2.29 0.27 0 -FEP_28-26 24.83 0.29 0 -FEP_21-1oiy -43.14 0.10 0 -FEP_32-1h1r 21.98 0.30 0 -FEP_1h1s-1h1r 48.63 0.16 0 -FEP_26-22 5.51 0.17 0 -FEP_32-1oiy -18.40 0.40 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.30 0.07 0 -FEP_28-17 31.32 0.22 0 -FEP_29-1h1s -30.16 0.15 0 -FEP_1h1s-1h1q 45.61 0.18 0 -FEP_1h1s-17 48.42 0.16 0 -FEP_32-28 -9.51 0.37 0 -FEP_30-21 43.86 0.86 0 -FEP_31-30 -23.35 0.20 0 -FEP_21-1oiu -54.89 0.23 0 -FEP_20-1oiu -41.20 0.14 0 -FEP_30-1h1q 36.96 0.21 0 -FEP_1oiu-1oi9 34.21 0.13 0 -FEP_26-1oiu -47.02 0.21 0 -FEP_28-21 34.48 0.47 0 -FEP_20-17 11.55 0.17 0 -FEP_1oi9-1h1s -30.62 0.18 0 -FEP_30-1oiy -0.99 0.16 0 -FEP_22-1h1s -47.67 0.35 0 -FEP_31-1oiu -35.52 0.36 0 -FEP_32-30 -18.20 0.25 0 -FEP_29-26 11.52 0.29 0 -FEP_28-1h1q 28.28 0.13 0 -FEP_1oiy-1oi9 22.15 0.12 0 -FEP_31-1h1r 17.65 0.18 0 -FEP_30-1h1r 40.17 0.18 0 -FEP_31-1h1q 13.81 0.15 0 -FEP_29-1oiu -34.26 0.46 1 -FEP_22-1oiu -51.92 0.27 0 -FEP_30-28 8.30 0.19 0 -FEP_29-1oi9 -0.30 0.26 0 -FEP_22-21 3.42 0.17 0 -FEP_26-1oiy -34.43 0.19 0 -FEP_1h1r-17 -0.09 0.13 0 -FEP_1h1r-1h1q -3.39 0.14 0 -FEP_32-26 16.07 0.14 0 -FEP_32-22 21.06 0.16 0 -FEP_26-20 -5.57 0.19 0 -FEP_29-1h1q 15.25 0.29 0 -FEP_21-17 -2.74 0.29 0 -FEP_32-1h1q 19.53 0.24 0 -FEP_20-1h1s -37.05 0.17 0 -FEP_28-20 19.69 0.28 0 -FEP_26-21 9.46 0.30 0 -FEP_29-20 6.58 0.45 0 -FEP_30-1oiu -12.32 0.16 0 -FEP_20-1oi9 -7.06 0.15 0 -FEP_1oiu-17 52.86 0.25 0 -FEP_1oi9-17 18.51 0.14 0 -FEP_26-1h1r 6.52 0.14 0 -FEP_26-17 6.77 0.17 0 -FEP_21-20 -13.76 0.41 0 -FEP_22-1oi9 -17.90 0.46 0 -FEP_32-17 22.02 0.29 0 -FEP_22-1oiy -39.82 0.16 0 -FEP_28-1oiy -9.18 0.19 0 -FEP_1oiu-1h1q 49.18 0.10 0 -FEP_31-1oi9 -1.16 0.20 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/protein-sc05.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/protein-sc05.txt deleted file mode 100644 index 91b20f61..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/protein-sc05.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -9.29 0.44 20 -FEP_1oiy-22 43.71 0.58 0 -FEP_30-29 22.22 0.37 15 -FEP_31-26 9.70 0.59 5 -FEP_30-31 22.89 0.74 10 -FEP_26-1oi9 -13.35 0.42 0 -FEP_1oi9-1oiy -21.48 0.54 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.09 0.55 0 -FEP_21-22 -2.67 0.78 0 -FEP_1h1q-1h1r 4.96 0.47 0 -FEP_1oiu-32 32.65 0.84 0 -FEP_1oi9-1h1q 16.97 0.30 0 -FEP_28-29 13.02 0.71 6 -FEP_1h1r-20 -12.26 0.79 0 -FEP_30-28 6.89 0.60 10 -FEP_1h1r-17 -0.32 0.66 0 -FEP_26-21 9.76 0.86 1 -FEP_1h1s-32 28.42 0.81 0 -FEP_17-20 -11.74 0.61 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/protein-sc1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/protein-sc1.txt deleted file mode 100644 index d6c61968..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/protein-sc1.txt +++ /dev/null @@ -1,19 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -9.33 0.49 1 -FEP_1oiy-22 43.84 0.57 0 -FEP_30-29 22.25 0.91 15 -FEP_30-31 22.32 0.95 20 -FEP_26-1oi9 -13.13 0.46 0 -FEP_1oi9-1oiy -20.96 0.49 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.21 0.67 0 -FEP_21-22 -1.20 0.65 0 -FEP_1h1q-1h1r 4.39 0.54 0 -FEP_1oiu-32 34.30 0.65 0 -FEP_1oi9-1h1q 16.90 0.64 0 -FEP_28-29 13.26 0.61 0 -FEP_1h1r-20 -11.17 0.54 0 -FEP_30-28 8.07 0.23 30 -FEP_1h1r-17 0.59 0.45 0 -FEP_26-21 11.15 0.49 0 -FEP_1h1s-32 29.56 0.65 0 -FEP_17-20 -12.18 0.84 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/water-sc05.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/water-sc05.txt deleted file mode 100644 index db8ca658..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/water-sc05.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -8.21 0.22 0 -FEP_1oiy-22 40.18 0.26 0 -FEP_30-29 21.91 0.09 2 -FEP_31-26 10.54 0.21 1 -FEP_30-31 23.58 0.17 1 -FEP_26-1oi9 -11.61 0.15 2 -FEP_1oi9-1oiy -22.23 0.16 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.93 0.28 1 -FEP_21-22 -3.61 0.26 2 -FEP_1h1q-1h1r 3.42 0.15 0 -FEP_1oiu-32 30.45 0.31 1 -FEP_1oi9-1h1q 15.56 0.10 0 -FEP_28-29 12.86 0.12 0 -FEP_1h1r-20 -11.13 0.13 1 -FEP_30-28 8.68 0.26 0 -FEP_1h1r-17 0.18 0.17 0 -FEP_26-21 9.13 0.33 1 -FEP_1h1s-32 27.67 0.31 1 -FEP_17-20 -10.98 0.16 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/water-sc1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/water-sc1.txt deleted file mode 100644 index ebdc3689..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/softcore-3/water-sc1.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -8.24 0.20 0 -FEP_1oiy-22 41.05 0.27 0 -FEP_30-29 21.74 0.13 0 -FEP_31-26 10.66 0.13 0 -FEP_30-31 23.53 0.23 0 -FEP_26-1oi9 -11.47 0.18 0 -FEP_1oi9-1oiy -22.49 0.09 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.83 0.27 0 -FEP_21-22 -3.16 0.13 0 -FEP_1h1q-1h1r 3.43 0.11 0 -FEP_1oiu-32 30.97 0.23 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.38 0.18 0 -FEP_28-29 13.04 0.17 0 -FEP_1h1r-20 -11.06 0.17 0 -FEP_30-28 8.53 0.09 0 -FEP_1h1r-17 -0.15 0.24 0 -FEP_26-21 10.19 0.28 0 -FEP_1h1s-32 27.21 0.24 0 -FEP_17-20 -11.24 0.14 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water-linear.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water-linear.txt deleted file mode 100644 index 8c475632..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water-linear.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -8.16 0.16 0 -FEP_1oiy-22 39.69 0.21 0 -FEP_30-29 21.55 0.14 0 -FEP_31-26 10.50 0.16 0 -FEP_30-31 23.26 0.17 0 -FEP_26-1oi9 -11.61 0.16 0 -FEP_1oi9-1oiy -22.71 0.13 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.93 0.22 0 -FEP_21-22 -3.09 0.25 0 -FEP_1h1q-1h1r 3.37 0.12 0 -FEP_1oiu-32 30.39 0.37 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.52 0.13 0 -FEP_28-29 13.13 0.18 0 -FEP_1h1r-20 -11.33 0.15 0 -FEP_30-28 8.78 0.22 0 -FEP_1h1r-17 -0.42 0.14 0 -FEP_26-21 9.06 0.34 0 -FEP_1h1s-32 26.98 0.27 0 -FEP_17-20 -11.02 0.20 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water.txt deleted file mode 100755 index 1410522d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28_1oi9 13.53 0.26 0 -FEP_26_1h1q 3.14 0.08 0 -FEP_32_31 4.89 0.29 0 -FEP_22_17 1.15 0.15 0 -FEP_30_1h1s -8.41 0.12 0 -FEP_28_22 30.75 0.32 0 -FEP_30_1oi9 21.87 0.12 0 -FEP_32_1h1s -26.64 0.32 0 -FEP_1oiy_1h1s -7.56 0.10 0 -FEP_31_22 16.13 0.13 0 -FEP_1oiy_17 40.53 0.20 0 -FEP_22_1h1q -2.23 0.17 0 -FEP_1oiy_1h1r 40.51 0.20 0 -FEP_29_1h1r 18.34 0.32 0 -FEP_32_1oiu -30.73 0.25 0 -FEP_31_29 -0.85 0.70 0 -FEP_32_21 24.41 0.21 0 -FEP_29_21 22.01 0.30 0 -FEP_32_20 10.52 0.29 0 -FEP_26_1h1s -41.80 0.17 0 -FEP_31_20 5.56 0.19 0 -FEP_1oiy_1oiu -11.50 0.16 0 -FEP_32_29 4.10 0.29 0 -FEP_31_1oiy -23.83 0.14 0 -FEP_21_1h1q -5.56 0.25 0 -FEP_29_1oiy -21.92 0.18 0 -FEP_30_29 21.67 0.09 0 -FEP_28_1h1s -17.25 0.14 0 -FEP_30_22 39.35 0.16 0 -FEP_1h1q_17 3.43 0.10 0 -FEP_29_28 -13.24 0.11 0 -FEP_1oiu_1h1r 52.78 0.17 0 -FEP_21_1h1s -51.76 0.28 0 -FEP_31_26 10.47 0.17 0 -FEP_20_1oiy -29.81 0.19 0 -FEP_31_17 17.35 0.23 0 -FEP_1oiu_1h1s 3.89 0.27 0 -FEP_20_1h1r 11.57 0.22 0 -FEP_22_20 -10.52 0.19 0 -FEP_30_20 28.68 0.28 0 -FEP_32_1oi9 3.89 0.23 0 -FEP_21_1oi9 -20.67 0.17 0 -FEP_20_1h1q 8.28 0.10 0 -FEP_28_1oiu -21.85 0.29 0 -FEP_26_1oi9 -12.10 0.17 0 -FEP_31_28 -14.17 0.17 0 -FEP_30_26 33.75 0.18 0 -FEP_28_1h1r 31.43 0.17 0 -FEP_1oi9_1h1r 18.49 0.19 0 -FEP_1oiy_1h1q 37.68 0.13 0 -FEP_31_1h1s -31.65 0.14 0 -FEP_29_22 17.19 0.29 0 -FEP_31_21 20.36 0.54 0 -FEP_22_1h1r 1.07 0.21 0 -FEP_30_17 40.10 0.34 0 -FEP_29_17 18.27 0.53 0 -FEP_21_1h1r -2.29 0.27 0 -FEP_28_26 24.83 0.29 0 -FEP_21_1oiy -43.14 0.10 0 -FEP_32_1h1r 21.98 0.30 0 -FEP_1h1s_1h1r 48.63 0.16 0 -FEP_26_22 5.51 0.17 0 -FEP_32_1oiy -18.40 0.40 0 -FEP_1oi9_1h1q 15.30 0.07 0 -FEP_28_17 31.32 0.22 0 -FEP_29_1h1s -30.16 0.15 0 -FEP_1h1s_1h1q 45.61 0.18 0 -FEP_1h1s_17 48.42 0.16 0 -FEP_32_28 -9.51 0.37 0 -FEP_30_21 43.86 0.86 0 -FEP_31_30 -23.35 0.20 0 -FEP_21_1oiu -54.89 0.23 0 -FEP_20_1oiu -41.20 0.14 0 -FEP_30_1h1q 36.96 0.21 0 -FEP_1oiu_1oi9 34.21 0.13 0 -FEP_26_1oiu -47.02 0.21 0 -FEP_28_21 34.48 0.47 0 -FEP_20_17 11.55 0.17 0 -FEP_1oi9_1h1s -30.62 0.18 0 -FEP_30_1oiy -0.99 0.16 0 -FEP_22_1h1s -47.67 0.35 0 -FEP_31_1oiu -35.52 0.36 0 -FEP_32_30 -18.20 0.25 0 -FEP_29_26 11.52 0.29 0 -FEP_28_1h1q 28.28 0.13 0 -FEP_1oiy_1oi9 22.15 0.12 0 -FEP_31_1h1r 17.65 0.18 0 -FEP_30_1h1r 40.17 0.18 0 -FEP_31_1h1q 13.81 0.15 0 -FEP_29_1oiu -34.26 0.46 1 -FEP_22_1oiu -51.92 0.27 0 -FEP_30_28 8.30 0.19 0 -FEP_29_1oi9 -0.30 0.26 0 -FEP_22_21 3.42 0.17 0 -FEP_26_1oiy -34.43 0.19 0 -FEP_1h1r_17 -0.09 0.13 0 -FEP_1h1r_1h1q -3.39 0.14 0 -FEP_32_26 16.07 0.14 0 -FEP_32_22 21.06 0.16 0 -FEP_26_20 -5.57 0.19 0 -FEP_29_1h1q 15.25 0.29 0 -FEP_21_17 -2.74 0.29 0 -FEP_32_1h1q 19.53 0.24 0 -FEP_20_1h1s -37.05 0.17 0 -FEP_28_20 19.69 0.28 0 -FEP_26_21 9.46 0.30 0 -FEP_29_20 6.58 0.45 0 -FEP_30_1oiu -12.32 0.16 0 -FEP_20_1oi9 -7.06 0.15 0 -FEP_1oiu_17 52.86 0.25 0 -FEP_1oi9_17 18.51 0.14 0 -FEP_26_1h1r 6.52 0.14 0 -FEP_26_17 6.77 0.17 0 -FEP_21_20 -13.76 0.41 0 -FEP_22_1oi9 -17.90 0.46 0 -FEP_32_17 22.02 0.29 0 -FEP_22_1oiy -39.82 0.16 0 -FEP_28_1oiy -9.18 0.19 0 -FEP_1oiu_1h1q 49.18 0.10 0 -FEP_31_1oi9 -1.16 0.20 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water_opls_test.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water_opls_test.txt deleted file mode 100644 index 17ff2f29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water_opls_test.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -8.53 0.10 0 -FEP_30-29 21.63 0.10 0 -FEP_1oi9-1oiy -22.39 0.20 0 -FEP_1h1q-1h1r 3.33 0.12 0 -FEP_26-1oi9 -12.05 0.20 0 -FEP_28-29 13.08 0.14 0 -FEP_1oiu-32 31.45 0.48 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.10 0.09 0 -FEP_31-26 10.55 0.20 0 -FEP_1h1r-17 0.02 0.17 0 -FEP_1h1s-32 26.41 0.26 0 -FEP_1h1r-20 -11.41 0.19 0 -FEP_30-28 8.73 0.18 0 -FEP_1oiy-22 39.78 0.29 0 -FEP_26-21 10.04 0.46 0 -FEP_21-22 -3.45 0.23 0 -FEP_30-31 23.01 0.26 0 -FEP_17-20 -11.18 0.14 0 -FEP_1h1s-1oiu -4.07 0.12 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index b166a434..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1h1q-17/ 0 -FEP_1h1r-17/ 0 -FEP_1h1r-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-17/ 0 -FEP_1h1s-1h1q/ 0 -FEP_1h1s-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-17/ 0 -FEP_1oi9-1h1q/ 0 -FEP_1oi9-1h1r/ 0 -FEP_1oi9-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-17/ 0 -FEP_1oiu-1h1q/ 0 -FEP_1oiu-1h1r/ 0 -FEP_1oiu-1h1s/ 0 -FEP_1oiu-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-17/ 0 -FEP_1oiy-1h1q/ 0 -FEP_1oiy-1h1r/ 0 -FEP_1oiy-1h1s/ 0 -FEP_1oiy-1oi9/ 0 -FEP_1oiy-1oiu/ 0 -FEP_20-17/ 0 -FEP_20-1h1q/ 0 -FEP_20-1h1r/ 0 -FEP_20-1h1s/ 0 -FEP_20-1oi9/ 0 -FEP_20-1oiu/ 0 -FEP_20-1oiy/ 0 -FEP_21-17/ 0 -FEP_21-1h1q/ 0 -FEP_21-1h1r/ 0 -FEP_21-1h1s/ 0 -FEP_21-1oi9/ 0 -FEP_21-1oiu/ 0 -FEP_21-1oiy/ 0 -FEP_21-20/ 0 -FEP_22-17/ 0 -FEP_22-1h1q/ 0 -FEP_22-1h1r/ 0 -FEP_22-1h1s/ 0 -FEP_22-1oi9/ 0 -FEP_22-1oiu/ 0 -FEP_22-1oiy/ 0 -FEP_22-20/ 0 -FEP_22-21/ 0 -FEP_26-17/ 0 -FEP_26-1h1q/ 0 -FEP_26-1h1r/ 0 -FEP_26-1h1s/ 0 -FEP_26-1oi9/ 0 -FEP_26-1oiu/ 0 -FEP_26-1oiy/ 0 -FEP_26-20/ 0 -FEP_26-21/ 0 -FEP_26-22/ 0 -FEP_28-17/ 0 -FEP_28-1h1q/ 0 -FEP_28-1h1r/ 0 -FEP_28-1h1s/ 0 -FEP_28-1oi9/ 0 -FEP_28-1oiu/ 0 -FEP_28-1oiy/ 0 -FEP_28-20/ 0 -FEP_28-21/ 0 -FEP_28-22/ 0 -FEP_28-26/ 0 -FEP_29-17/ 0 -FEP_29-1h1q/ 0 -FEP_29-1h1r/ 0 -FEP_29-1h1s/ 0 -FEP_29-1oi9/ 0 -FEP_29-1oiu/ 0 -FEP_29-1oiy/ 0 -FEP_29-20/ 0 -FEP_29-21/ 0 -FEP_29-22/ 0 -FEP_29-26/ 0 -FEP_29-28/ 0 -FEP_30-17/ 0 -FEP_30-1h1q/ 0 -FEP_30-1h1r/ 0 -FEP_30-1h1s/ 0 -FEP_30-1oi9/ 0 -FEP_30-1oiu/ 0 -FEP_30-1oiy/ 0 -FEP_30-20/ 0 -FEP_30-21/ 0 -FEP_30-22/ 0 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-28/ 0 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-17/ 0 -FEP_31-1h1q/ 0 -FEP_31-1h1r/ 0 -FEP_31-1h1s/ 0 -FEP_31-1oi9/ 0 -FEP_31-1oiu/ 0 -FEP_31-1oiy/ 0 -FEP_31-20/ 0 -FEP_31-21/ 0 -FEP_31-22/ 0 -FEP_31-26/ 0 -FEP_31-28/ 0 -FEP_31-29/ 0 -FEP_31-30/ 0 -FEP_32-17/ 0 -FEP_32-1h1q/ 0 -FEP_32-1h1r/ 0 -FEP_32-1h1s/ 0 -FEP_32-1oi9/ 0 -FEP_32-1oiu/ 0 -FEP_32-1oiy/ 0 -FEP_32-20/ 0 -FEP_32-21/ 0 -FEP_32-22/ 0 -FEP_32-26/ 0 -FEP_32-28/ 0 -FEP_32-29/ 0 -FEP_32-30/ 0 -FEP_32-31/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water_sc.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water_sc.txt deleted file mode 100644 index bcc945bc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/QligFEPbenchmarking_data/water_sc.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -8.09 0.28 0 -FEP_1oiy-22 39.98 0.30 0 -FEP_30-29 21.48 0.27 0 -FEP_31-26 10.67 0.18 0 -FEP_30-31 23.61 0.30 0 -FEP_26-1oi9 -11.21 0.27 0 -FEP_1oi9-1oiy -22.44 0.13 0 -FEP_1h1s-1oiu -3.25 0.27 0 -FEP_21-22 -3.47 0.23 0 -FEP_1h1q-1h1r 2.53 0.13 0 -FEP_1oiu-32 30.98 0.36 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.45 0.16 0 -FEP_28-29 13.24 0.21 0 -FEP_1h1r-20 -11.19 0.15 0 -FEP_30-28 9.10 0.17 0 -FEP_1h1r-17 0.29 0.12 0 -FEP_26-21 9.59 0.29 0 -FEP_1h1s-32 27.36 0.28 0 -FEP_17-20 -10.96 0.28 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/custom-sigmoidal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/custom-sigmoidal/protein.txt deleted file mode 100644 index ab90322a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/custom-sigmoidal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28_29 6.53 0.12 0 -FEP_1h1r_22 -1.50 0.19 0 -FEP_30_1h1s -4.56 0.11 0 -FEP_1h1s_1oiy 5.90 0.18 0 -FEP_30_29 11.12 0.13 0 -FEP_28_1h1s -10.03 0.10 0 -FEP_1h1q_17 1.18 0.18 0 -FEP_1oiu_1h1r 19.85 0.21 0 -FEP_31_26 3.78 0.14 0 -FEP_28_30 -4.92 0.16 0 -FEP_30_31 -0.07 0.14 0 -FEP_26_1oi9 -6.89 0.29 0 -FEP_1oi9_1oiy 3.27 0.23 0 -FEP_1h1s_1oiu -3.56 0.17 0 -FEP_21_22 -4.50 0.32 0 -FEP_1h1q_1h1r 2.00 0.20 0 -FEP_1oiu_32 24.36 0.30 0 -FEP_1oi9_1h1q 11.25 0.15 0 -FEP_1h1r_20 -3.53 0.19 0 -FEP_1h1r_17 -0.88 0.13 0 -FEP_26_21 10.58 0.41 0 -FEP_1h1s_32 20.92 0.47 0 -FEP_17_20 -3.00 0.10 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/custom-sigmoidal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/custom-sigmoidal/water.txt deleted file mode 100644 index cbc9b9fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/custom-sigmoidal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -2.51 0.16 0 -FEP_30_1h1s -4.76 0.06 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.38 0.13 1 -FEP_30_29 11.11 0.16 0 -FEP_28_1h1s -9.72 0.12 1 -FEP_1h1q_17 0.53 0.14 0 -FEP_1oiu_1h1r 15.93 0.15 1 -FEP_31_26 2.65 0.13 0 -FEP_28_30 -4.80 0.12 0 -FEP_30_31 0.56 0.16 0 -FEP_26_1oi9 -5.61 0.19 0 -FEP_1oi9_1oiy 3.02 0.17 0 -FEP_1h1s_1oiu -2.95 0.11 1 -FEP_21_22 -5.04 0.10 0 -FEP_1h1q_1h1r 1.04 0.11 1 -FEP_1oiu_32 21.81 0.20 0 -FEP_1oi9_1h1q 9.71 0.09 0 -FEP_28_29 6.35 0.10 0 -FEP_1h1r_20 -1.54 0.09 0 -FEP_1h1r_17 -0.60 0.15 0 -FEP_26_21 7.60 0.16 0 -FEP_1h1s_32 18.87 0.16 0 -FEP_17_20 -0.94 0.14 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/default/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/default/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/default/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/default/protein.txt deleted file mode 100644 index aa388bef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/default/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -1.24 0.21 0 -FEP_30_1h1s -4.66 0.11 0 -FEP_1h1s_1oiy 5.95 0.21 0 -FEP_30_29 11.23 0.16 0 -FEP_28_1h1s -9.85 0.09 0 -FEP_1h1q_17 1.55 0.34 0 -FEP_1oiu_1h1r 19.95 0.21 0 -FEP_31_26 3.69 0.21 0 -FEP_28_30 -4.72 0.15 0 -FEP_30_31 -0.18 0.17 0 -FEP_26_1oi9 -7.24 0.27 0 -FEP_1oi9_1oiy 3.07 0.28 0 -FEP_1h1s_1oiu -3.45 0.21 0 -FEP_21_22 -4.02 0.37 0 -FEP_1h1q_1h1r 2.35 0.26 0 -FEP_1oiu_32 24.24 0.44 0 -FEP_1oi9_1h1q 11.22 0.16 0 -FEP_28_29 6.40 0.16 0 -FEP_1h1r_20 -3.82 0.30 0 -FEP_1h1r_17 -0.62 0.12 0 -FEP_26_21 9.62 0.41 0 -FEP_1h1s_32 21.03 0.53 0 -FEP_17_20 -2.90 0.38 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/default/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/default/water.txt deleted file mode 100644 index 759e9c50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/default/water.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -2.08 0.16 0 -FEP_30_1h1s -5.04 0.09 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.36 0.10 0 -FEP_30_29 11.15 0.14 0 -FEP_28_1h1s -9.98 0.09 0 -FEP_1h1q_17 0.67 0.16 0 -FEP_1oiu_1h1r 15.73 0.18 0 -FEP_31_26 2.45 0.15 0 -FEP_28_30 -4.95 0.13 0 -FEP_30_31 0.78 0.11 0 -FEP_26_1oi9 -5.58 0.24 0 -FEP_1oi9_1oiy 3.23 0.09 0 -FEP_1h1s_1oiu -2.59 0.17 0 -FEP_21_22 -5.13 0.16 0 -FEP_1h1q_1h1r 0.85 0.10 0 -FEP_1oiu_32 21.55 0.26 0 -FEP_1oi9_1h1q 9.55 0.09 0 -FEP_28_29 5.99 0.15 0 -FEP_1h1r_20 -1.62 0.11 0 -FEP_1h1r_17 -0.28 0.11 0 -FEP_26_21 8.04 0.15 0 -FEP_1h1s_32 18.91 0.27 0 -FEP_17_20 -1.14 0.09 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/protein_juju.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/protein_juju.txt deleted file mode 100644 index 860d0731..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/protein_juju.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -1.82 0.71 0 -FEP_30_1h1s -5.00 0.42 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.80 0.44 0 -FEP_30_29 11.31 0.29 0 -FEP_28_1h1s -9.50 0.38 0 -FEP_1h1q_17 1.25 0.67 0 -FEP_1oiu_1h1r 20.09 0.22 0 -FEP_31_26 4.61 0.43 0 -FEP_28_30 -3.47 0.45 0 -FEP_30_31 1.60 0.60 0 -FEP_26_1oi9 -5.58 0.46 0 -FEP_1oi9_1oiy 4.49 0.40 0 -FEP_1h1s_1oiu -3.76 0.40 0 -FEP_21_22 -3.81 0.49 0 -FEP_1h1q_1h1r 1.54 0.91 0 -FEP_1oiu_32 25.01 0.62 0 -FEP_1oi9_1h1q 10.88 0.58 0 -FEP_28_29 7.01 0.29 0 -FEP_1h1r_20 -3.81 0.47 0 -FEP_1h1r_17 -0.92 0.41 0 -FEP_26_21 10.27 0.45 0 -FEP_1h1s_32 19.90 0.72 0 -FEP_17_20 -2.01 0.60 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/sc-2fs-10kcal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/sc-2fs-10kcal/protein.txt deleted file mode 100644 index 6ac50fa7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/sc-2fs-10kcal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -1.16 0.36 0 -FEP_30_1h1s -1.42 2.46 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.01 0.51 0 -FEP_30_29 10.45 0.33 0 -FEP_28_1h1s -8.82 0.56 0 -FEP_1h1q_17 2.12 0.59 0 -FEP_1oiu_1h1r 20.32 0.38 0 -FEP_31_26 3.14 0.60 0 -FEP_28_30 -4.48 0.75 0 -FEP_30_31 1.82 0.36 0 -FEP_26_1oi9 -6.17 0.50 0 -FEP_1oi9_1oiy 4.17 0.59 0 -FEP_1h1s_1oiu -4.32 0.30 0 -FEP_21_22 -4.34 0.58 0 -FEP_1h1q_1h1r 2.69 0.20 0 -FEP_1oiu_32 23.98 0.62 0 -FEP_1oi9_1h1q 11.09 0.42 0 -FEP_28_29 6.66 0.37 0 -FEP_1h1r_20 -2.65 0.40 0 -FEP_1h1r_17 0.44 0.34 0 -FEP_26_21 8.61 0.61 0 -FEP_1h1s_32 20.70 0.46 0 -FEP_17_20 -2.21 0.67 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/sc-2fs-10kcal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/sc-2fs-10kcal/water.txt deleted file mode 100644 index 6b9cc9cf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/sc-2fs-10kcal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -2.14 0.16 0 -FEP_30_1h1s -4.43 0.10 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.40 0.11 0 -FEP_30_29 10.97 0.08 0 -FEP_28_1h1s -9.41 0.13 0 -FEP_1h1q_17 0.29 0.11 0 -FEP_1oiu_1h1r 16.18 0.12 0 -FEP_31_26 2.68 0.11 0 -FEP_28_30 -4.78 0.15 0 -FEP_30_31 0.70 0.19 0 -FEP_26_1oi9 -5.32 0.10 0 -FEP_1oi9_1oiy 2.70 0.18 0 -FEP_1h1s_1oiu -2.48 0.20 0 -FEP_21_22 -5.20 0.10 0 -FEP_1h1q_1h1r 0.84 0.15 0 -FEP_1oiu_32 22.06 0.17 0 -FEP_1oi9_1h1q 9.68 0.11 0 -FEP_28_29 6.21 0.07 0 -FEP_1h1r_20 -1.29 0.19 0 -FEP_1h1r_17 -0.13 0.14 0 -FEP_26_21 8.65 0.20 0 -FEP_1h1s_32 19.26 0.24 0 -FEP_17_20 -1.05 0.12 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/sc-2fs-50kcal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/sc-2fs-50kcal/protein.txt deleted file mode 100644 index 55b31d66..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/sc-2fs-50kcal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -0.72 0.51 0 -FEP_30_1h1s -4.26 0.22 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.59 0.36 0 -FEP_30_29 11.25 0.42 0 -FEP_28_1h1s -10.14 0.25 0 -FEP_1h1q_17 1.05 0.47 0 -FEP_1oiu_1h1r 20.30 0.32 0 -FEP_31_26 4.46 0.40 0 -FEP_28_30 -4.57 0.56 0 -FEP_30_31 0.39 0.39 0 -FEP_26_1oi9 -5.04 0.43 0 -FEP_1oi9_1oiy 4.59 0.49 0 -FEP_1h1s_1oiu -3.93 0.38 0 -FEP_21_22 -3.74 0.73 0 -FEP_1h1q_1h1r 2.57 0.33 0 -FEP_1oiu_32 24.79 0.50 0 -FEP_1oi9_1h1q 10.75 0.43 0 -FEP_28_29 6.74 0.67 0 -FEP_1h1r_20 -3.46 0.42 0 -FEP_1h1r_17 -0.36 0.79 0 -FEP_26_21 10.65 0.57 0 -FEP_1h1s_32 21.37 0.56 0 -FEP_17_20 -1.76 0.55 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/sc-2fs-50kcal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/sc-2fs-50kcal/water.txt deleted file mode 100644 index ebf25deb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/sc-2fs-50kcal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -1.86 0.23 0 -FEP_30_1h1s -4.28 0.12 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.40 0.06 0 -FEP_30_29 11.26 0.11 0 -FEP_28_1h1s -9.54 0.11 0 -FEP_1h1q_17 0.34 0.09 0 -FEP_1oiu_1h1r 16.21 0.10 0 -FEP_31_26 2.46 0.12 0 -FEP_28_30 -4.86 0.06 0 -FEP_30_31 0.84 0.11 0 -FEP_26_1oi9 -5.43 0.11 0 -FEP_1oi9_1oiy 3.00 0.08 0 -FEP_1h1s_1oiu -2.77 0.17 0 -FEP_21_22 -5.06 0.09 0 -FEP_1h1q_1h1r 0.80 0.14 0 -FEP_1oiu_32 22.06 0.13 0 -FEP_1oi9_1h1q 9.65 0.10 0 -FEP_28_29 6.07 0.17 0 -FEP_1h1r_20 -1.56 0.09 0 -FEP_1h1r_17 -0.29 0.10 0 -FEP_26_21 8.59 0.29 0 -FEP_1h1s_32 19.12 0.19 0 -FEP_17_20 -1.10 0.11 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/water_juju.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/water_juju.txt deleted file mode 100644 index 77035ee2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/backup/water_juju.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -1.84 0.11 0 -FEP_30_1h1s -4.69 0.12 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.23 0.14 0 -FEP_30_29 11.15 0.10 0 -FEP_28_1h1s -9.55 0.12 0 -FEP_1h1q_17 0.54 0.16 0 -FEP_1oiu_1h1r 16.16 0.08 0 -FEP_31_26 2.72 0.16 0 -FEP_28_30 -4.77 0.14 0 -FEP_30_31 0.74 0.19 0 -FEP_26_1oi9 -5.25 0.19 0 -FEP_1oi9_1oiy 3.04 0.13 0 -FEP_1h1s_1oiu -2.68 0.15 0 -FEP_21_22 -5.00 0.13 0 -FEP_1h1q_1h1r 0.57 0.10 0 -FEP_1oiu_32 21.86 0.23 0 -FEP_1oi9_1h1q 9.66 0.09 0 -FEP_28_29 6.19 0.12 0 -FEP_1h1r_20 -1.54 0.07 0 -FEP_1h1r_17 -0.32 0.09 0 -FEP_26_21 8.43 0.16 0 -FEP_1h1s_32 18.65 0.25 0 -FEP_17_20 -1.01 0.13 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/custom-sigmoidal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/custom-sigmoidal/protein.txt deleted file mode 100644 index ab90322a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/custom-sigmoidal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28_29 6.53 0.12 0 -FEP_1h1r_22 -1.50 0.19 0 -FEP_30_1h1s -4.56 0.11 0 -FEP_1h1s_1oiy 5.90 0.18 0 -FEP_30_29 11.12 0.13 0 -FEP_28_1h1s -10.03 0.10 0 -FEP_1h1q_17 1.18 0.18 0 -FEP_1oiu_1h1r 19.85 0.21 0 -FEP_31_26 3.78 0.14 0 -FEP_28_30 -4.92 0.16 0 -FEP_30_31 -0.07 0.14 0 -FEP_26_1oi9 -6.89 0.29 0 -FEP_1oi9_1oiy 3.27 0.23 0 -FEP_1h1s_1oiu -3.56 0.17 0 -FEP_21_22 -4.50 0.32 0 -FEP_1h1q_1h1r 2.00 0.20 0 -FEP_1oiu_32 24.36 0.30 0 -FEP_1oi9_1h1q 11.25 0.15 0 -FEP_1h1r_20 -3.53 0.19 0 -FEP_1h1r_17 -0.88 0.13 0 -FEP_26_21 10.58 0.41 0 -FEP_1h1s_32 20.92 0.47 0 -FEP_17_20 -3.00 0.10 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/custom-sigmoidal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/custom-sigmoidal/water.txt deleted file mode 100644 index cbc9b9fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/custom-sigmoidal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -2.51 0.16 0 -FEP_30_1h1s -4.76 0.06 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.38 0.13 1 -FEP_30_29 11.11 0.16 0 -FEP_28_1h1s -9.72 0.12 1 -FEP_1h1q_17 0.53 0.14 0 -FEP_1oiu_1h1r 15.93 0.15 1 -FEP_31_26 2.65 0.13 0 -FEP_28_30 -4.80 0.12 0 -FEP_30_31 0.56 0.16 0 -FEP_26_1oi9 -5.61 0.19 0 -FEP_1oi9_1oiy 3.02 0.17 0 -FEP_1h1s_1oiu -2.95 0.11 1 -FEP_21_22 -5.04 0.10 0 -FEP_1h1q_1h1r 1.04 0.11 1 -FEP_1oiu_32 21.81 0.20 0 -FEP_1oi9_1h1q 9.71 0.09 0 -FEP_28_29 6.35 0.10 0 -FEP_1h1r_20 -1.54 0.09 0 -FEP_1h1r_17 -0.60 0.15 0 -FEP_26_21 7.60 0.16 0 -FEP_1h1s_32 18.87 0.16 0 -FEP_17_20 -0.94 0.14 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/default/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/default/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/default/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/default/protein.txt deleted file mode 100644 index aa388bef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/default/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -1.24 0.21 0 -FEP_30_1h1s -4.66 0.11 0 -FEP_1h1s_1oiy 5.95 0.21 0 -FEP_30_29 11.23 0.16 0 -FEP_28_1h1s -9.85 0.09 0 -FEP_1h1q_17 1.55 0.34 0 -FEP_1oiu_1h1r 19.95 0.21 0 -FEP_31_26 3.69 0.21 0 -FEP_28_30 -4.72 0.15 0 -FEP_30_31 -0.18 0.17 0 -FEP_26_1oi9 -7.24 0.27 0 -FEP_1oi9_1oiy 3.07 0.28 0 -FEP_1h1s_1oiu -3.45 0.21 0 -FEP_21_22 -4.02 0.37 0 -FEP_1h1q_1h1r 2.35 0.26 0 -FEP_1oiu_32 24.24 0.44 0 -FEP_1oi9_1h1q 11.22 0.16 0 -FEP_28_29 6.40 0.16 0 -FEP_1h1r_20 -3.82 0.30 0 -FEP_1h1r_17 -0.62 0.12 0 -FEP_26_21 9.62 0.41 0 -FEP_1h1s_32 21.03 0.53 0 -FEP_17_20 -2.90 0.38 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/default/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/default/water.txt deleted file mode 100644 index 759e9c50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/default/water.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -2.08 0.16 0 -FEP_30_1h1s -5.04 0.09 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.36 0.10 0 -FEP_30_29 11.15 0.14 0 -FEP_28_1h1s -9.98 0.09 0 -FEP_1h1q_17 0.67 0.16 0 -FEP_1oiu_1h1r 15.73 0.18 0 -FEP_31_26 2.45 0.15 0 -FEP_28_30 -4.95 0.13 0 -FEP_30_31 0.78 0.11 0 -FEP_26_1oi9 -5.58 0.24 0 -FEP_1oi9_1oiy 3.23 0.09 0 -FEP_1h1s_1oiu -2.59 0.17 0 -FEP_21_22 -5.13 0.16 0 -FEP_1h1q_1h1r 0.85 0.10 0 -FEP_1oiu_32 21.55 0.26 0 -FEP_1oi9_1h1q 9.55 0.09 0 -FEP_28_29 5.99 0.15 0 -FEP_1h1r_20 -1.62 0.11 0 -FEP_1h1r_17 -0.28 0.11 0 -FEP_26_21 8.04 0.15 0 -FEP_1h1s_32 18.91 0.27 0 -FEP_17_20 -1.14 0.09 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 860d0731..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -1.82 0.71 0 -FEP_30_1h1s -5.00 0.42 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.80 0.44 0 -FEP_30_29 11.31 0.29 0 -FEP_28_1h1s -9.50 0.38 0 -FEP_1h1q_17 1.25 0.67 0 -FEP_1oiu_1h1r 20.09 0.22 0 -FEP_31_26 4.61 0.43 0 -FEP_28_30 -3.47 0.45 0 -FEP_30_31 1.60 0.60 0 -FEP_26_1oi9 -5.58 0.46 0 -FEP_1oi9_1oiy 4.49 0.40 0 -FEP_1h1s_1oiu -3.76 0.40 0 -FEP_21_22 -3.81 0.49 0 -FEP_1h1q_1h1r 1.54 0.91 0 -FEP_1oiu_32 25.01 0.62 0 -FEP_1oi9_1h1q 10.88 0.58 0 -FEP_28_29 7.01 0.29 0 -FEP_1h1r_20 -3.81 0.47 0 -FEP_1h1r_17 -0.92 0.41 0 -FEP_26_21 10.27 0.45 0 -FEP_1h1s_32 19.90 0.72 0 -FEP_17_20 -2.01 0.60 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/protein_whole.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/protein_whole.txt deleted file mode 100755 index 72095039..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/protein_whole.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28-1oi9 12.62 0.57 0 -FEP_26-1h1q 3.73 0.19 0 -FEP_32-31 3.85 0.38 0 -FEP_22-17 -0.64 0.24 0 -FEP_30-1h1s -9.96 0.17 0 -FEP_28-22 34.45 0.37 0 -FEP_30-1oi9 20.55 0.33 0 -FEP_32-1h1s -28.42 0.53 0 -FEP_1oiy-1h1s -8.27 0.08 0 -FEP_31-22 20.20 0.62 0 -FEP_1oiy-17 42.59 0.84 0 -FEP_22-1h1q -3.68 0.23 0 -FEP_1oiy-1h1r 42.95 0.53 0 -FEP_29-1h1r 19.39 0.73 0 -FEP_32-1oiu -32.58 0.42 0 -FEP_31-29 -0.73 0.24 0 -FEP_32-21 25.58 0.38 0 -FEP_29-21 22.83 0.87 0 -FEP_32-20 10.56 0.46 0 -FEP_26-1h1s -44.75 0.36 0 -FEP_31-20 6.73 0.26 0 -FEP_1oiy-1oiu -12.61 0.40 0 -FEP_32-29 2.99 0.36 0 -FEP_31-1oiy -24.24 0.12 0 -FEP_21-1h1q -6.07 0.29 0 -FEP_29-1oiy -23.44 0.37 0 -FEP_30-29 21.13 0.19 0 -FEP_28-1h1s -18.10 0.27 0 -FEP_30-22 41.48 0.23 0 -FEP_29-28 -13.36 0.22 0 -FEP_1oiu-1h1r 56.10 0.29 0 -FEP_21-1h1s -54.75 0.52 0 -FEP_31-26 11.52 0.23 0 -FEP_20-1oiy -30.66 0.28 0 -FEP_31-17 17.63 0.61 0 -FEP_1oiu-1h1s 3.36 0.30 0 -FEP_20-1h1r 12.83 0.27 0 -FEP_22-20 -12.73 0.43 0 -FEP_30-20 29.01 0.23 0 -FEP_32-1oi9 2.15 0.48 0 -FEP_21-1oi9 -22.77 0.40 0 -FEP_20-1h1q 8.95 0.09 0 -FEP_28-1oiu -22.52 0.83 0 -FEP_26-1oi9 -14.81 0.44 0 -FEP_31-28 -14.45 0.34 0 -FEP_30-26 34.09 0.31 0 -FEP_28-1h1r 33.56 0.54 0 -FEP_1oi9-1h1r 20.52 0.52 0 -FEP_1oiy-1h1q 40.40 0.35 0 -FEP_31-1h1s -32.84 0.36 0 -FEP_29-22 22.21 0.43 0 -FEP_31-21 19.66 0.47 0 -FEP_22-1h1r -0.34 0.25 0 -FEP_30-17 41.40 0.44 0 -FEP_29-17 20.35 0.43 0 -FEP_21-1h1r -1.94 0.25 0 -FEP_28-26 26.37 0.16 0 -FEP_21-1oiy -44.63 0.66 0 -FEP_32-1h1r 23.18 0.23 0 -FEP_1h1s-1h1r 52.09 0.60 0 -FEP_26-22 7.08 0.45 0 -FEP_32-1oiy -20.26 0.32 0 -FEP_1oi9-1h1q 17.16 0.35 0 -FEP_28-17 33.12 0.63 0 -FEP_29-1h1s -31.70 0.37 0 -FEP_1h1s-1h1q 47.71 0.47 0 -FEP_1h1s-17 52.38 0.67 0 -FEP_32-28 -10.24 0.34 0 -FEP_30-21 44.70 0.64 0 -FEP_31-30 -21.77 0.17 0 -FEP_21-1oiu -58.15 0.25 0 -FEP_20-1oiu -43.10 0.29 0 -FEP_30-1h1q 37.90 0.24 0 -FEP_1oiu-1oi9 33.91 0.48 0 -FEP_26-1oiu -48.18 0.69 0 -FEP_28-21 36.45 0.38 0 -FEP_20-17 12.17 0.26 0 -FEP_1oi9-1h1s -30.35 0.37 0 -FEP_30-1oiy -1.90 0.22 0 -FEP_22-1h1s -52.25 0.71 0 -FEP_31-1oiu -36.23 0.64 0 -FEP_32-30 -18.96 0.27 0 -FEP_29-26 12.61 0.41 0 -FEP_28-1h1q 29.69 0.25 0 -FEP_1oiy-1oi9 21.49 0.46 0 -FEP_31-1h1r 19.35 0.54 0 -FEP_30-1h1r 42.63 0.28 0 -FEP_31-1h1q 15.53 0.28 0 -FEP_29-1oiu -36.70 0.58 0 -FEP_22-1oiu -56.20 0.53 0 -FEP_30-28 7.95 0.16 0 -FEP_29-1oi9 -2.03 0.93 0 -FEP_22-21 2.00 0.19 0 -FEP_26-1oiy -36.34 0.20 0 -FEP_1h1r-17 -0.23 0.04 0 -FEP_1h1r-1h1q -3.84 0.31 0 -FEP_32-26 15.38 0.46 0 -FEP_32-22 23.60 0.31 0 -FEP_26-20 -5.63 0.50 0 -FEP_29-1h1q 15.33 0.53 0 -FEP_21-17 -2.87 0.29 0 -FEP_32-1h1q 20.06 0.42 0 -FEP_20-1h1s -38.93 0.36 0 -FEP_28-20 20.74 0.74 0 -FEP_26-21 10.94 0.44 0 -FEP_29-20 6.76 0.50 0 -FEP_30-1oiu -13.12 0.23 0 -FEP_20-1oi9 -7.89 0.22 0 -FEP_1oiu-17 55.37 0.21 0 -FEP_1oi9-17 20.37 0.38 0 -FEP_26-1h1r 7.95 0.38 0 -FEP_26-17 6.82 0.58 0 -FEP_21-20 -14.67 0.34 0 -FEP_22-1oi9 -20.85 0.22 0 -FEP_32-17 22.83 0.40 0 -FEP_22-1oiy -43.22 0.49 0 -FEP_28-1oiy -9.95 0.54 0 -FEP_1oiu-1h1q 52.25 0.29 0 -FEP_31-1oi9 -2.86 0.33 0 -FEP_1h1q-17 2.87 0.25 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/sc-2fs-10kcal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/sc-2fs-10kcal/protein.txt deleted file mode 100644 index 6ac50fa7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/sc-2fs-10kcal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -1.16 0.36 0 -FEP_30_1h1s -1.42 2.46 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.01 0.51 0 -FEP_30_29 10.45 0.33 0 -FEP_28_1h1s -8.82 0.56 0 -FEP_1h1q_17 2.12 0.59 0 -FEP_1oiu_1h1r 20.32 0.38 0 -FEP_31_26 3.14 0.60 0 -FEP_28_30 -4.48 0.75 0 -FEP_30_31 1.82 0.36 0 -FEP_26_1oi9 -6.17 0.50 0 -FEP_1oi9_1oiy 4.17 0.59 0 -FEP_1h1s_1oiu -4.32 0.30 0 -FEP_21_22 -4.34 0.58 0 -FEP_1h1q_1h1r 2.69 0.20 0 -FEP_1oiu_32 23.98 0.62 0 -FEP_1oi9_1h1q 11.09 0.42 0 -FEP_28_29 6.66 0.37 0 -FEP_1h1r_20 -2.65 0.40 0 -FEP_1h1r_17 0.44 0.34 0 -FEP_26_21 8.61 0.61 0 -FEP_1h1s_32 20.70 0.46 0 -FEP_17_20 -2.21 0.67 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/sc-2fs-10kcal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/sc-2fs-10kcal/water.txt deleted file mode 100644 index 6b9cc9cf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/sc-2fs-10kcal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -2.14 0.16 0 -FEP_30_1h1s -4.43 0.10 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.40 0.11 0 -FEP_30_29 10.97 0.08 0 -FEP_28_1h1s -9.41 0.13 0 -FEP_1h1q_17 0.29 0.11 0 -FEP_1oiu_1h1r 16.18 0.12 0 -FEP_31_26 2.68 0.11 0 -FEP_28_30 -4.78 0.15 0 -FEP_30_31 0.70 0.19 0 -FEP_26_1oi9 -5.32 0.10 0 -FEP_1oi9_1oiy 2.70 0.18 0 -FEP_1h1s_1oiu -2.48 0.20 0 -FEP_21_22 -5.20 0.10 0 -FEP_1h1q_1h1r 0.84 0.15 0 -FEP_1oiu_32 22.06 0.17 0 -FEP_1oi9_1h1q 9.68 0.11 0 -FEP_28_29 6.21 0.07 0 -FEP_1h1r_20 -1.29 0.19 0 -FEP_1h1r_17 -0.13 0.14 0 -FEP_26_21 8.65 0.20 0 -FEP_1h1s_32 19.26 0.24 0 -FEP_17_20 -1.05 0.12 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/sc-2fs-50kcal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/sc-2fs-50kcal/protein.txt deleted file mode 100644 index 55b31d66..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/sc-2fs-50kcal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -0.72 0.51 0 -FEP_30_1h1s -4.26 0.22 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.59 0.36 0 -FEP_30_29 11.25 0.42 0 -FEP_28_1h1s -10.14 0.25 0 -FEP_1h1q_17 1.05 0.47 0 -FEP_1oiu_1h1r 20.30 0.32 0 -FEP_31_26 4.46 0.40 0 -FEP_28_30 -4.57 0.56 0 -FEP_30_31 0.39 0.39 0 -FEP_26_1oi9 -5.04 0.43 0 -FEP_1oi9_1oiy 4.59 0.49 0 -FEP_1h1s_1oiu -3.93 0.38 0 -FEP_21_22 -3.74 0.73 0 -FEP_1h1q_1h1r 2.57 0.33 0 -FEP_1oiu_32 24.79 0.50 0 -FEP_1oi9_1h1q 10.75 0.43 0 -FEP_28_29 6.74 0.67 0 -FEP_1h1r_20 -3.46 0.42 0 -FEP_1h1r_17 -0.36 0.79 0 -FEP_26_21 10.65 0.57 0 -FEP_1h1s_32 21.37 0.56 0 -FEP_17_20 -1.76 0.55 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/sc-2fs-50kcal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/sc-2fs-50kcal/water.txt deleted file mode 100644 index ebf25deb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/sc-2fs-50kcal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -1.86 0.23 0 -FEP_30_1h1s -4.28 0.12 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.40 0.06 0 -FEP_30_29 11.26 0.11 0 -FEP_28_1h1s -9.54 0.11 0 -FEP_1h1q_17 0.34 0.09 0 -FEP_1oiu_1h1r 16.21 0.10 0 -FEP_31_26 2.46 0.12 0 -FEP_28_30 -4.86 0.06 0 -FEP_30_31 0.84 0.11 0 -FEP_26_1oi9 -5.43 0.11 0 -FEP_1oi9_1oiy 3.00 0.08 0 -FEP_1h1s_1oiu -2.77 0.17 0 -FEP_21_22 -5.06 0.09 0 -FEP_1h1q_1h1r 0.80 0.14 0 -FEP_1oiu_32 22.06 0.13 0 -FEP_1oi9_1h1q 9.65 0.10 0 -FEP_28_29 6.07 0.17 0 -FEP_1h1r_20 -1.56 0.09 0 -FEP_1h1r_17 -0.29 0.10 0 -FEP_26_21 8.59 0.29 0 -FEP_1h1s_32 19.12 0.19 0 -FEP_17_20 -1.10 0.11 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 77035ee2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -1.84 0.11 0 -FEP_30_1h1s -4.69 0.12 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.23 0.14 0 -FEP_30_29 11.15 0.10 0 -FEP_28_1h1s -9.55 0.12 0 -FEP_1h1q_17 0.54 0.16 0 -FEP_1oiu_1h1r 16.16 0.08 0 -FEP_31_26 2.72 0.16 0 -FEP_28_30 -4.77 0.14 0 -FEP_30_31 0.74 0.19 0 -FEP_26_1oi9 -5.25 0.19 0 -FEP_1oi9_1oiy 3.04 0.13 0 -FEP_1h1s_1oiu -2.68 0.15 0 -FEP_21_22 -5.00 0.13 0 -FEP_1h1q_1h1r 0.57 0.10 0 -FEP_1oiu_32 21.86 0.23 0 -FEP_1oi9_1h1q 9.66 0.09 0 -FEP_28_29 6.19 0.12 0 -FEP_1h1r_20 -1.54 0.07 0 -FEP_1h1r_17 -0.32 0.09 0 -FEP_26_21 8.43 0.16 0 -FEP_1h1s_32 18.65 0.25 0 -FEP_17_20 -1.01 0.13 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/water_whole.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/water_whole.txt deleted file mode 100755 index 0c76d409..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/no-vs/2fs/water_whole.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28-1oi9 13.53 0.26 0 -FEP_26-1h1q 3.14 0.08 0 -FEP_32-31 4.89 0.29 0 -FEP_22-17 1.15 0.15 0 -FEP_30-1h1s -8.41 0.12 0 -FEP_28-22 30.75 0.32 0 -FEP_30-1oi9 21.87 0.12 0 -FEP_32-1h1s -26.64 0.32 0 -FEP_1oiy-1h1s -7.56 0.10 0 -FEP_31-22 16.13 0.13 0 -FEP_1oiy-17 40.53 0.20 0 -FEP_22-1h1q -2.23 0.17 0 -FEP_1oiy-1h1r 40.51 0.20 0 -FEP_29-1h1r 18.34 0.32 0 -FEP_32-1oiu -30.73 0.25 0 -FEP_31-29 -0.85 0.70 0 -FEP_32-21 24.41 0.21 0 -FEP_29-21 22.01 0.30 0 -FEP_32-20 10.52 0.29 0 -FEP_26-1h1s -41.80 0.17 0 -FEP_31-20 5.56 0.19 0 -FEP_1oiy-1oiu -11.50 0.16 0 -FEP_32-29 4.10 0.29 0 -FEP_31-1oiy -23.83 0.14 0 -FEP_21-1h1q -5.56 0.25 0 -FEP_29-1oiy -21.92 0.18 0 -FEP_30-29 21.67 0.09 0 -FEP_28-1h1s -17.25 0.14 0 -FEP_30-22 39.35 0.16 0 -FEP_1h1q-17 3.43 0.10 0 -FEP_29-28 -13.24 0.11 0 -FEP_1oiu-1h1r 52.78 0.17 0 -FEP_21-1h1s -51.76 0.28 0 -FEP_31-26 10.47 0.17 0 -FEP_20-1oiy -29.81 0.19 0 -FEP_31-17 17.35 0.23 0 -FEP_1oiu-1h1s 3.89 0.27 0 -FEP_20-1h1r 11.57 0.22 0 -FEP_22-20 -10.52 0.19 0 -FEP_30-20 28.68 0.28 0 -FEP_32-1oi9 3.89 0.23 0 -FEP_21-1oi9 -20.67 0.17 0 -FEP_20-1h1q 8.28 0.10 0 -FEP_28-1oiu -21.85 0.29 0 -FEP_26-1oi9 -12.10 0.17 0 -FEP_31-28 -14.17 0.17 0 -FEP_30-26 33.75 0.18 0 -FEP_28-1h1r 31.43 0.17 0 -FEP_1oi9-1h1r 18.49 0.19 0 -FEP_1oiy-1h1q 37.68 0.13 0 -FEP_31-1h1s -31.65 0.14 0 -FEP_29-22 17.19 0.29 0 -FEP_31-21 20.36 0.54 0 -FEP_22-1h1r 1.07 0.21 0 -FEP_30-17 40.10 0.34 0 -FEP_29-17 18.27 0.53 0 -FEP_21-1h1r -2.29 0.27 0 -FEP_28-26 24.83 0.29 0 -FEP_21-1oiy -43.14 0.10 0 -FEP_32-1h1r 21.98 0.30 0 -FEP_1h1s-1h1r 48.63 0.16 0 -FEP_26-22 5.51 0.17 0 -FEP_32-1oiy -18.40 0.40 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.30 0.07 0 -FEP_28-17 31.32 0.22 0 -FEP_29-1h1s -30.16 0.15 0 -FEP_1h1s-1h1q 45.61 0.18 0 -FEP_1h1s-17 48.42 0.16 0 -FEP_32-28 -9.51 0.37 0 -FEP_30-21 43.86 0.86 0 -FEP_31-30 -23.35 0.20 0 -FEP_21-1oiu -54.89 0.23 0 -FEP_20-1oiu -41.20 0.14 0 -FEP_30-1h1q 36.96 0.21 0 -FEP_1oiu-1oi9 34.21 0.13 0 -FEP_26-1oiu -47.02 0.21 0 -FEP_28-21 34.48 0.47 0 -FEP_20-17 11.55 0.17 0 -FEP_1oi9-1h1s -30.62 0.18 0 -FEP_30-1oiy -0.99 0.16 0 -FEP_22-1h1s -47.67 0.35 0 -FEP_31-1oiu -35.52 0.36 0 -FEP_32-30 -18.20 0.25 0 -FEP_29-26 11.52 0.29 0 -FEP_28-1h1q 28.28 0.13 0 -FEP_1oiy-1oi9 22.15 0.12 0 -FEP_31-1h1r 17.65 0.18 0 -FEP_30-1h1r 40.17 0.18 0 -FEP_31-1h1q 13.81 0.15 0 -FEP_29-1oiu -34.26 0.46 1 -FEP_22-1oiu -51.92 0.27 0 -FEP_30-28 8.30 0.19 0 -FEP_29-1oi9 -0.30 0.26 0 -FEP_22-21 3.42 0.17 0 -FEP_26-1oiy -34.43 0.19 0 -FEP_1h1r-17 -0.09 0.13 0 -FEP_1h1r-1h1q -3.39 0.14 0 -FEP_32-26 16.07 0.14 0 -FEP_32-22 21.06 0.16 0 -FEP_26-20 -5.57 0.19 0 -FEP_29-1h1q 15.25 0.29 0 -FEP_21-17 -2.74 0.29 0 -FEP_32-1h1q 19.53 0.24 0 -FEP_20-1h1s -37.05 0.17 0 -FEP_28-20 19.69 0.28 0 -FEP_26-21 9.46 0.30 0 -FEP_29-20 6.58 0.45 0 -FEP_30-1oiu -12.32 0.16 0 -FEP_20-1oi9 -7.06 0.15 0 -FEP_1oiu-17 52.86 0.25 0 -FEP_1oi9-17 18.51 0.14 0 -FEP_26-1h1r 6.52 0.14 0 -FEP_26-17 6.77 0.17 0 -FEP_21-20 -13.76 0.41 0 -FEP_22-1oi9 -17.90 0.46 0 -FEP_32-17 22.02 0.29 0 -FEP_22-1oiy -39.82 0.16 0 -FEP_28-1oiy -9.18 0.19 0 -FEP_1oiu-1h1q 49.18 0.10 0 -FEP_31-1oi9 -1.16 0.20 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/protein.txt deleted file mode 100755 index 72095039..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28-1oi9 12.62 0.57 0 -FEP_26-1h1q 3.73 0.19 0 -FEP_32-31 3.85 0.38 0 -FEP_22-17 -0.64 0.24 0 -FEP_30-1h1s -9.96 0.17 0 -FEP_28-22 34.45 0.37 0 -FEP_30-1oi9 20.55 0.33 0 -FEP_32-1h1s -28.42 0.53 0 -FEP_1oiy-1h1s -8.27 0.08 0 -FEP_31-22 20.20 0.62 0 -FEP_1oiy-17 42.59 0.84 0 -FEP_22-1h1q -3.68 0.23 0 -FEP_1oiy-1h1r 42.95 0.53 0 -FEP_29-1h1r 19.39 0.73 0 -FEP_32-1oiu -32.58 0.42 0 -FEP_31-29 -0.73 0.24 0 -FEP_32-21 25.58 0.38 0 -FEP_29-21 22.83 0.87 0 -FEP_32-20 10.56 0.46 0 -FEP_26-1h1s -44.75 0.36 0 -FEP_31-20 6.73 0.26 0 -FEP_1oiy-1oiu -12.61 0.40 0 -FEP_32-29 2.99 0.36 0 -FEP_31-1oiy -24.24 0.12 0 -FEP_21-1h1q -6.07 0.29 0 -FEP_29-1oiy -23.44 0.37 0 -FEP_30-29 21.13 0.19 0 -FEP_28-1h1s -18.10 0.27 0 -FEP_30-22 41.48 0.23 0 -FEP_29-28 -13.36 0.22 0 -FEP_1oiu-1h1r 56.10 0.29 0 -FEP_21-1h1s -54.75 0.52 0 -FEP_31-26 11.52 0.23 0 -FEP_20-1oiy -30.66 0.28 0 -FEP_31-17 17.63 0.61 0 -FEP_1oiu-1h1s 3.36 0.30 0 -FEP_20-1h1r 12.83 0.27 0 -FEP_22-20 -12.73 0.43 0 -FEP_30-20 29.01 0.23 0 -FEP_32-1oi9 2.15 0.48 0 -FEP_21-1oi9 -22.77 0.40 0 -FEP_20-1h1q 8.95 0.09 0 -FEP_28-1oiu -22.52 0.83 0 -FEP_26-1oi9 -14.81 0.44 0 -FEP_31-28 -14.45 0.34 0 -FEP_30-26 34.09 0.31 0 -FEP_28-1h1r 33.56 0.54 0 -FEP_1oi9-1h1r 20.52 0.52 0 -FEP_1oiy-1h1q 40.40 0.35 0 -FEP_31-1h1s -32.84 0.36 0 -FEP_29-22 22.21 0.43 0 -FEP_31-21 19.66 0.47 0 -FEP_22-1h1r -0.34 0.25 0 -FEP_30-17 41.40 0.44 0 -FEP_29-17 20.35 0.43 0 -FEP_21-1h1r -1.94 0.25 0 -FEP_28-26 26.37 0.16 0 -FEP_21-1oiy -44.63 0.66 0 -FEP_32-1h1r 23.18 0.23 0 -FEP_1h1s-1h1r 52.09 0.60 0 -FEP_26-22 7.08 0.45 0 -FEP_32-1oiy -20.26 0.32 0 -FEP_1oi9-1h1q 17.16 0.35 0 -FEP_28-17 33.12 0.63 0 -FEP_29-1h1s -31.70 0.37 0 -FEP_1h1s-1h1q 47.71 0.47 0 -FEP_1h1s-17 52.38 0.67 0 -FEP_32-28 -10.24 0.34 0 -FEP_30-21 44.70 0.64 0 -FEP_31-30 -21.77 0.17 0 -FEP_21-1oiu -58.15 0.25 0 -FEP_20-1oiu -43.10 0.29 0 -FEP_30-1h1q 37.90 0.24 0 -FEP_1oiu-1oi9 33.91 0.48 0 -FEP_26-1oiu -48.18 0.69 0 -FEP_28-21 36.45 0.38 0 -FEP_20-17 12.17 0.26 0 -FEP_1oi9-1h1s -30.35 0.37 0 -FEP_30-1oiy -1.90 0.22 0 -FEP_22-1h1s -52.25 0.71 0 -FEP_31-1oiu -36.23 0.64 0 -FEP_32-30 -18.96 0.27 0 -FEP_29-26 12.61 0.41 0 -FEP_28-1h1q 29.69 0.25 0 -FEP_1oiy-1oi9 21.49 0.46 0 -FEP_31-1h1r 19.35 0.54 0 -FEP_30-1h1r 42.63 0.28 0 -FEP_31-1h1q 15.53 0.28 0 -FEP_29-1oiu -36.70 0.58 0 -FEP_22-1oiu -56.20 0.53 0 -FEP_30-28 7.95 0.16 0 -FEP_29-1oi9 -2.03 0.93 0 -FEP_22-21 2.00 0.19 0 -FEP_26-1oiy -36.34 0.20 0 -FEP_1h1r-17 -0.23 0.04 0 -FEP_1h1r-1h1q -3.84 0.31 0 -FEP_32-26 15.38 0.46 0 -FEP_32-22 23.60 0.31 0 -FEP_26-20 -5.63 0.50 0 -FEP_29-1h1q 15.33 0.53 0 -FEP_21-17 -2.87 0.29 0 -FEP_32-1h1q 20.06 0.42 0 -FEP_20-1h1s -38.93 0.36 0 -FEP_28-20 20.74 0.74 0 -FEP_26-21 10.94 0.44 0 -FEP_29-20 6.76 0.50 0 -FEP_30-1oiu -13.12 0.23 0 -FEP_20-1oi9 -7.89 0.22 0 -FEP_1oiu-17 55.37 0.21 0 -FEP_1oi9-17 20.37 0.38 0 -FEP_26-1h1r 7.95 0.38 0 -FEP_26-17 6.82 0.58 0 -FEP_21-20 -14.67 0.34 0 -FEP_22-1oi9 -20.85 0.22 0 -FEP_32-17 22.83 0.40 0 -FEP_22-1oiy -43.22 0.49 0 -FEP_28-1oiy -9.95 0.54 0 -FEP_1oiu-1h1q 52.25 0.29 0 -FEP_31-1oi9 -2.86 0.33 0 -FEP_1h1q-17 2.87 0.25 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100755 index 72095039..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28-1oi9 12.62 0.57 0 -FEP_26-1h1q 3.73 0.19 0 -FEP_32-31 3.85 0.38 0 -FEP_22-17 -0.64 0.24 0 -FEP_30-1h1s -9.96 0.17 0 -FEP_28-22 34.45 0.37 0 -FEP_30-1oi9 20.55 0.33 0 -FEP_32-1h1s -28.42 0.53 0 -FEP_1oiy-1h1s -8.27 0.08 0 -FEP_31-22 20.20 0.62 0 -FEP_1oiy-17 42.59 0.84 0 -FEP_22-1h1q -3.68 0.23 0 -FEP_1oiy-1h1r 42.95 0.53 0 -FEP_29-1h1r 19.39 0.73 0 -FEP_32-1oiu -32.58 0.42 0 -FEP_31-29 -0.73 0.24 0 -FEP_32-21 25.58 0.38 0 -FEP_29-21 22.83 0.87 0 -FEP_32-20 10.56 0.46 0 -FEP_26-1h1s -44.75 0.36 0 -FEP_31-20 6.73 0.26 0 -FEP_1oiy-1oiu -12.61 0.40 0 -FEP_32-29 2.99 0.36 0 -FEP_31-1oiy -24.24 0.12 0 -FEP_21-1h1q -6.07 0.29 0 -FEP_29-1oiy -23.44 0.37 0 -FEP_30-29 21.13 0.19 0 -FEP_28-1h1s -18.10 0.27 0 -FEP_30-22 41.48 0.23 0 -FEP_29-28 -13.36 0.22 0 -FEP_1oiu-1h1r 56.10 0.29 0 -FEP_21-1h1s -54.75 0.52 0 -FEP_31-26 11.52 0.23 0 -FEP_20-1oiy -30.66 0.28 0 -FEP_31-17 17.63 0.61 0 -FEP_1oiu-1h1s 3.36 0.30 0 -FEP_20-1h1r 12.83 0.27 0 -FEP_22-20 -12.73 0.43 0 -FEP_30-20 29.01 0.23 0 -FEP_32-1oi9 2.15 0.48 0 -FEP_21-1oi9 -22.77 0.40 0 -FEP_20-1h1q 8.95 0.09 0 -FEP_28-1oiu -22.52 0.83 0 -FEP_26-1oi9 -14.81 0.44 0 -FEP_31-28 -14.45 0.34 0 -FEP_30-26 34.09 0.31 0 -FEP_28-1h1r 33.56 0.54 0 -FEP_1oi9-1h1r 20.52 0.52 0 -FEP_1oiy-1h1q 40.40 0.35 0 -FEP_31-1h1s -32.84 0.36 0 -FEP_29-22 22.21 0.43 0 -FEP_31-21 19.66 0.47 0 -FEP_22-1h1r -0.34 0.25 0 -FEP_30-17 41.40 0.44 0 -FEP_29-17 20.35 0.43 0 -FEP_21-1h1r -1.94 0.25 0 -FEP_28-26 26.37 0.16 0 -FEP_21-1oiy -44.63 0.66 0 -FEP_32-1h1r 23.18 0.23 0 -FEP_1h1s-1h1r 52.09 0.60 0 -FEP_26-22 7.08 0.45 0 -FEP_32-1oiy -20.26 0.32 0 -FEP_1oi9-1h1q 17.16 0.35 0 -FEP_28-17 33.12 0.63 0 -FEP_29-1h1s -31.70 0.37 0 -FEP_1h1s-1h1q 47.71 0.47 0 -FEP_1h1s-17 52.38 0.67 0 -FEP_32-28 -10.24 0.34 0 -FEP_30-21 44.70 0.64 0 -FEP_31-30 -21.77 0.17 0 -FEP_21-1oiu -58.15 0.25 0 -FEP_20-1oiu -43.10 0.29 0 -FEP_30-1h1q 37.90 0.24 0 -FEP_1oiu-1oi9 33.91 0.48 0 -FEP_26-1oiu -48.18 0.69 0 -FEP_28-21 36.45 0.38 0 -FEP_20-17 12.17 0.26 0 -FEP_1oi9-1h1s -30.35 0.37 0 -FEP_30-1oiy -1.90 0.22 0 -FEP_22-1h1s -52.25 0.71 0 -FEP_31-1oiu -36.23 0.64 0 -FEP_32-30 -18.96 0.27 0 -FEP_29-26 12.61 0.41 0 -FEP_28-1h1q 29.69 0.25 0 -FEP_1oiy-1oi9 21.49 0.46 0 -FEP_31-1h1r 19.35 0.54 0 -FEP_30-1h1r 42.63 0.28 0 -FEP_31-1h1q 15.53 0.28 0 -FEP_29-1oiu -36.70 0.58 0 -FEP_22-1oiu -56.20 0.53 0 -FEP_30-28 7.95 0.16 0 -FEP_29-1oi9 -2.03 0.93 0 -FEP_22-21 2.00 0.19 0 -FEP_26-1oiy -36.34 0.20 0 -FEP_1h1r-17 -0.23 0.04 0 -FEP_1h1r-1h1q -3.84 0.31 0 -FEP_32-26 15.38 0.46 0 -FEP_32-22 23.60 0.31 0 -FEP_26-20 -5.63 0.50 0 -FEP_29-1h1q 15.33 0.53 0 -FEP_21-17 -2.87 0.29 0 -FEP_32-1h1q 20.06 0.42 0 -FEP_20-1h1s -38.93 0.36 0 -FEP_28-20 20.74 0.74 0 -FEP_26-21 10.94 0.44 0 -FEP_29-20 6.76 0.50 0 -FEP_30-1oiu -13.12 0.23 0 -FEP_20-1oi9 -7.89 0.22 0 -FEP_1oiu-17 55.37 0.21 0 -FEP_1oi9-17 20.37 0.38 0 -FEP_26-1h1r 7.95 0.38 0 -FEP_26-17 6.82 0.58 0 -FEP_21-20 -14.67 0.34 0 -FEP_22-1oi9 -20.85 0.22 0 -FEP_32-17 22.83 0.40 0 -FEP_22-1oiy -43.22 0.49 0 -FEP_28-1oiy -9.95 0.54 0 -FEP_1oiu-1h1q 52.25 0.29 0 -FEP_31-1oi9 -2.86 0.33 0 -FEP_1h1q-17 2.87 0.25 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/vs/2fs/water.txt deleted file mode 100755 index 0c76d409..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28-1oi9 13.53 0.26 0 -FEP_26-1h1q 3.14 0.08 0 -FEP_32-31 4.89 0.29 0 -FEP_22-17 1.15 0.15 0 -FEP_30-1h1s -8.41 0.12 0 -FEP_28-22 30.75 0.32 0 -FEP_30-1oi9 21.87 0.12 0 -FEP_32-1h1s -26.64 0.32 0 -FEP_1oiy-1h1s -7.56 0.10 0 -FEP_31-22 16.13 0.13 0 -FEP_1oiy-17 40.53 0.20 0 -FEP_22-1h1q -2.23 0.17 0 -FEP_1oiy-1h1r 40.51 0.20 0 -FEP_29-1h1r 18.34 0.32 0 -FEP_32-1oiu -30.73 0.25 0 -FEP_31-29 -0.85 0.70 0 -FEP_32-21 24.41 0.21 0 -FEP_29-21 22.01 0.30 0 -FEP_32-20 10.52 0.29 0 -FEP_26-1h1s -41.80 0.17 0 -FEP_31-20 5.56 0.19 0 -FEP_1oiy-1oiu -11.50 0.16 0 -FEP_32-29 4.10 0.29 0 -FEP_31-1oiy -23.83 0.14 0 -FEP_21-1h1q -5.56 0.25 0 -FEP_29-1oiy -21.92 0.18 0 -FEP_30-29 21.67 0.09 0 -FEP_28-1h1s -17.25 0.14 0 -FEP_30-22 39.35 0.16 0 -FEP_1h1q-17 3.43 0.10 0 -FEP_29-28 -13.24 0.11 0 -FEP_1oiu-1h1r 52.78 0.17 0 -FEP_21-1h1s -51.76 0.28 0 -FEP_31-26 10.47 0.17 0 -FEP_20-1oiy -29.81 0.19 0 -FEP_31-17 17.35 0.23 0 -FEP_1oiu-1h1s 3.89 0.27 0 -FEP_20-1h1r 11.57 0.22 0 -FEP_22-20 -10.52 0.19 0 -FEP_30-20 28.68 0.28 0 -FEP_32-1oi9 3.89 0.23 0 -FEP_21-1oi9 -20.67 0.17 0 -FEP_20-1h1q 8.28 0.10 0 -FEP_28-1oiu -21.85 0.29 0 -FEP_26-1oi9 -12.10 0.17 0 -FEP_31-28 -14.17 0.17 0 -FEP_30-26 33.75 0.18 0 -FEP_28-1h1r 31.43 0.17 0 -FEP_1oi9-1h1r 18.49 0.19 0 -FEP_1oiy-1h1q 37.68 0.13 0 -FEP_31-1h1s -31.65 0.14 0 -FEP_29-22 17.19 0.29 0 -FEP_31-21 20.36 0.54 0 -FEP_22-1h1r 1.07 0.21 0 -FEP_30-17 40.10 0.34 0 -FEP_29-17 18.27 0.53 0 -FEP_21-1h1r -2.29 0.27 0 -FEP_28-26 24.83 0.29 0 -FEP_21-1oiy -43.14 0.10 0 -FEP_32-1h1r 21.98 0.30 0 -FEP_1h1s-1h1r 48.63 0.16 0 -FEP_26-22 5.51 0.17 0 -FEP_32-1oiy -18.40 0.40 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.30 0.07 0 -FEP_28-17 31.32 0.22 0 -FEP_29-1h1s -30.16 0.15 0 -FEP_1h1s-1h1q 45.61 0.18 0 -FEP_1h1s-17 48.42 0.16 0 -FEP_32-28 -9.51 0.37 0 -FEP_30-21 43.86 0.86 0 -FEP_31-30 -23.35 0.20 0 -FEP_21-1oiu -54.89 0.23 0 -FEP_20-1oiu -41.20 0.14 0 -FEP_30-1h1q 36.96 0.21 0 -FEP_1oiu-1oi9 34.21 0.13 0 -FEP_26-1oiu -47.02 0.21 0 -FEP_28-21 34.48 0.47 0 -FEP_20-17 11.55 0.17 0 -FEP_1oi9-1h1s -30.62 0.18 0 -FEP_30-1oiy -0.99 0.16 0 -FEP_22-1h1s -47.67 0.35 0 -FEP_31-1oiu -35.52 0.36 0 -FEP_32-30 -18.20 0.25 0 -FEP_29-26 11.52 0.29 0 -FEP_28-1h1q 28.28 0.13 0 -FEP_1oiy-1oi9 22.15 0.12 0 -FEP_31-1h1r 17.65 0.18 0 -FEP_30-1h1r 40.17 0.18 0 -FEP_31-1h1q 13.81 0.15 0 -FEP_29-1oiu -34.26 0.46 1 -FEP_22-1oiu -51.92 0.27 0 -FEP_30-28 8.30 0.19 0 -FEP_29-1oi9 -0.30 0.26 0 -FEP_22-21 3.42 0.17 0 -FEP_26-1oiy -34.43 0.19 0 -FEP_1h1r-17 -0.09 0.13 0 -FEP_1h1r-1h1q -3.39 0.14 0 -FEP_32-26 16.07 0.14 0 -FEP_32-22 21.06 0.16 0 -FEP_26-20 -5.57 0.19 0 -FEP_29-1h1q 15.25 0.29 0 -FEP_21-17 -2.74 0.29 0 -FEP_32-1h1q 19.53 0.24 0 -FEP_20-1h1s -37.05 0.17 0 -FEP_28-20 19.69 0.28 0 -FEP_26-21 9.46 0.30 0 -FEP_29-20 6.58 0.45 0 -FEP_30-1oiu -12.32 0.16 0 -FEP_20-1oi9 -7.06 0.15 0 -FEP_1oiu-17 52.86 0.25 0 -FEP_1oi9-17 18.51 0.14 0 -FEP_26-1h1r 6.52 0.14 0 -FEP_26-17 6.77 0.17 0 -FEP_21-20 -13.76 0.41 0 -FEP_22-1oi9 -17.90 0.46 0 -FEP_32-17 22.02 0.29 0 -FEP_22-1oiy -39.82 0.16 0 -FEP_28-1oiy -9.18 0.19 0 -FEP_1oiu-1h1q 49.18 0.10 0 -FEP_31-1oi9 -1.16 0.20 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/water.txt deleted file mode 100755 index 0c76d409..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/2.CDK2/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28-1oi9 13.53 0.26 0 -FEP_26-1h1q 3.14 0.08 0 -FEP_32-31 4.89 0.29 0 -FEP_22-17 1.15 0.15 0 -FEP_30-1h1s -8.41 0.12 0 -FEP_28-22 30.75 0.32 0 -FEP_30-1oi9 21.87 0.12 0 -FEP_32-1h1s -26.64 0.32 0 -FEP_1oiy-1h1s -7.56 0.10 0 -FEP_31-22 16.13 0.13 0 -FEP_1oiy-17 40.53 0.20 0 -FEP_22-1h1q -2.23 0.17 0 -FEP_1oiy-1h1r 40.51 0.20 0 -FEP_29-1h1r 18.34 0.32 0 -FEP_32-1oiu -30.73 0.25 0 -FEP_31-29 -0.85 0.70 0 -FEP_32-21 24.41 0.21 0 -FEP_29-21 22.01 0.30 0 -FEP_32-20 10.52 0.29 0 -FEP_26-1h1s -41.80 0.17 0 -FEP_31-20 5.56 0.19 0 -FEP_1oiy-1oiu -11.50 0.16 0 -FEP_32-29 4.10 0.29 0 -FEP_31-1oiy -23.83 0.14 0 -FEP_21-1h1q -5.56 0.25 0 -FEP_29-1oiy -21.92 0.18 0 -FEP_30-29 21.67 0.09 0 -FEP_28-1h1s -17.25 0.14 0 -FEP_30-22 39.35 0.16 0 -FEP_1h1q-17 3.43 0.10 0 -FEP_29-28 -13.24 0.11 0 -FEP_1oiu-1h1r 52.78 0.17 0 -FEP_21-1h1s -51.76 0.28 0 -FEP_31-26 10.47 0.17 0 -FEP_20-1oiy -29.81 0.19 0 -FEP_31-17 17.35 0.23 0 -FEP_1oiu-1h1s 3.89 0.27 0 -FEP_20-1h1r 11.57 0.22 0 -FEP_22-20 -10.52 0.19 0 -FEP_30-20 28.68 0.28 0 -FEP_32-1oi9 3.89 0.23 0 -FEP_21-1oi9 -20.67 0.17 0 -FEP_20-1h1q 8.28 0.10 0 -FEP_28-1oiu -21.85 0.29 0 -FEP_26-1oi9 -12.10 0.17 0 -FEP_31-28 -14.17 0.17 0 -FEP_30-26 33.75 0.18 0 -FEP_28-1h1r 31.43 0.17 0 -FEP_1oi9-1h1r 18.49 0.19 0 -FEP_1oiy-1h1q 37.68 0.13 0 -FEP_31-1h1s -31.65 0.14 0 -FEP_29-22 17.19 0.29 0 -FEP_31-21 20.36 0.54 0 -FEP_22-1h1r 1.07 0.21 0 -FEP_30-17 40.10 0.34 0 -FEP_29-17 18.27 0.53 0 -FEP_21-1h1r -2.29 0.27 0 -FEP_28-26 24.83 0.29 0 -FEP_21-1oiy -43.14 0.10 0 -FEP_32-1h1r 21.98 0.30 0 -FEP_1h1s-1h1r 48.63 0.16 0 -FEP_26-22 5.51 0.17 0 -FEP_32-1oiy -18.40 0.40 0 -FEP_1oi9-1h1q 15.30 0.07 0 -FEP_28-17 31.32 0.22 0 -FEP_29-1h1s -30.16 0.15 0 -FEP_1h1s-1h1q 45.61 0.18 0 -FEP_1h1s-17 48.42 0.16 0 -FEP_32-28 -9.51 0.37 0 -FEP_30-21 43.86 0.86 0 -FEP_31-30 -23.35 0.20 0 -FEP_21-1oiu -54.89 0.23 0 -FEP_20-1oiu -41.20 0.14 0 -FEP_30-1h1q 36.96 0.21 0 -FEP_1oiu-1oi9 34.21 0.13 0 -FEP_26-1oiu -47.02 0.21 0 -FEP_28-21 34.48 0.47 0 -FEP_20-17 11.55 0.17 0 -FEP_1oi9-1h1s -30.62 0.18 0 -FEP_30-1oiy -0.99 0.16 0 -FEP_22-1h1s -47.67 0.35 0 -FEP_31-1oiu -35.52 0.36 0 -FEP_32-30 -18.20 0.25 0 -FEP_29-26 11.52 0.29 0 -FEP_28-1h1q 28.28 0.13 0 -FEP_1oiy-1oi9 22.15 0.12 0 -FEP_31-1h1r 17.65 0.18 0 -FEP_30-1h1r 40.17 0.18 0 -FEP_31-1h1q 13.81 0.15 0 -FEP_29-1oiu -34.26 0.46 1 -FEP_22-1oiu -51.92 0.27 0 -FEP_30-28 8.30 0.19 0 -FEP_29-1oi9 -0.30 0.26 0 -FEP_22-21 3.42 0.17 0 -FEP_26-1oiy -34.43 0.19 0 -FEP_1h1r-17 -0.09 0.13 0 -FEP_1h1r-1h1q -3.39 0.14 0 -FEP_32-26 16.07 0.14 0 -FEP_32-22 21.06 0.16 0 -FEP_26-20 -5.57 0.19 0 -FEP_29-1h1q 15.25 0.29 0 -FEP_21-17 -2.74 0.29 0 -FEP_32-1h1q 19.53 0.24 0 -FEP_20-1h1s -37.05 0.17 0 -FEP_28-20 19.69 0.28 0 -FEP_26-21 9.46 0.30 0 -FEP_29-20 6.58 0.45 0 -FEP_30-1oiu -12.32 0.16 0 -FEP_20-1oi9 -7.06 0.15 0 -FEP_1oiu-17 52.86 0.25 0 -FEP_1oi9-17 18.51 0.14 0 -FEP_26-1h1r 6.52 0.14 0 -FEP_26-17 6.77 0.17 0 -FEP_21-20 -13.76 0.41 0 -FEP_22-1oi9 -17.90 0.46 0 -FEP_32-17 22.02 0.29 0 -FEP_22-1oiy -39.82 0.16 0 -FEP_28-1oiy -9.18 0.19 0 -FEP_1oiu-1h1q 49.18 0.10 0 -FEP_31-1oi9 -1.16 0.20 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/1fs/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/1fs/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index 0e470dbf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/1fs/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,32 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18626-1-18628-1 0.11 0.21 0 -FEP_18631-1-18624-1 6.29 0.37 0 -FEP_18629-1-18627-1 0.61 0.21 0 -FEP_18631-1-18660-1 -55.11 0.96 6 -FEP_18626-1-18660-1 -63.00 nan 9 -FEP_18631-1-18652-1 -16.45 0.72 7 -FEP_18636-1-18625-1 4.38 0.22 0 -FEP_18628-1-18624-1 -0.29 0.24 0 -FEP_18635-1-18625-1 nan nan 10 -FEP_18637-1-18631-1 19.35 0.62 3 -FEP_17124-1-18631-1 -3.54 0.57 0 -FEP_18626-1-18634-1 -6.89 0.63 1 -FEP_18626-1-18658-1 -14.19 0.61 2 -FEP_18632-1-18624-1 -1.61 0.49 0 -FEP_18636-1-18624-1 9.68 0.27 2 -FEP_18659-1-18634-1 3.05 0.85 0 -FEP_17124-1-18634-1 -4.51 0.48 0 -FEP_18639-1-18634-1 -12.24 0.47 0 -FEP_18626-1-18659-1 -9.83 1.48 4 -FEP_18634-1-18637-1 -18.08 1.17 0 -FEP_18627-1-18630-1 -0.43 0.24 0 -FEP_18635-1-18624-1 nan nan 10 -FEP_18626-1-18632-1 2.24 0.26 0 -FEP_18626-1-18624-1 0.46 0.28 0 -FEP_18639-1-18658-1 -20.34 0.51 0 -FEP_18626-1-18627-1 -1.13 0.34 0 -FEP_18626-1-18630-1 -1.19 0.25 4 -FEP_18633-1-18624-1 -0.18 0.22 0 -FEP_18638-1-18658-1 12.74 0.61 1 -FEP_18626-1-18625-1 -4.95 0.18 0 -FEP_18638-1-18634-1 20.49 0.74 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/1fs/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/1fs/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index 0c001538..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/1fs/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,32 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18626-1-18628-1 -2.44 0.14 0 -FEP_18631-1-18624-1 6.14 0.35 0 -FEP_18629-1-18627-1 1.03 0.24 0 -FEP_18631-1-18660-1 -54.39 0.63 6 -FEP_18626-1-18660-1 -64.85 0.38 7 -FEP_18631-1-18652-1 -14.60 nan 9 -FEP_18636-1-18625-1 4.64 0.38 2 -FEP_18628-1-18624-1 1.24 0.49 0 -FEP_18635-1-18625-1 -2.24 0.30 1 -FEP_18637-1-18631-1 19.61 0.96 2 -FEP_17124-1-18631-1 -4.06 0.48 2 -FEP_18626-1-18634-1 -7.78 0.68 6 -FEP_18626-1-18658-1 -12.76 0.68 3 -FEP_18632-1-18624-1 -1.79 0.35 0 -FEP_18636-1-18624-1 12.05 0.49 1 -FEP_18659-1-18634-1 2.11 0.46 0 -FEP_17124-1-18634-1 -3.97 0.22 1 -FEP_18639-1-18634-1 -11.55 0.44 0 -FEP_18626-1-18659-1 -9.79 0.92 1 -FEP_18634-1-18637-1 -18.81 0.48 3 -FEP_18627-1-18630-1 -1.25 0.23 0 -FEP_18635-1-18624-1 4.32 0.63 1 -FEP_18626-1-18632-1 1.41 0.33 0 -FEP_18626-1-18624-1 -1.03 0.35 0 -FEP_18639-1-18658-1 -19.41 0.30 0 -FEP_18626-1-18627-1 -1.75 0.22 0 -FEP_18626-1-18630-1 -3.67 0.37 0 -FEP_18633-1-18624-1 -0.55 0.42 0 -FEP_18638-1-18658-1 14.92 0.80 0 -FEP_18626-1-18625-1 -7.10 0.35 0 -FEP_18638-1-18634-1 20.35 1.34 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100755 index 570762a7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,211 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18659-1_18638-1 -17.47 0.29 0 -FEP_18638-1_18634-1 20.70 0.23 0 -FEP_18639-1_18625-1 -9.04 0.49 0 -FEP_18633-1_18632-1 0.09 0.22 0 -FEP_18630-1_18627-1 0.40 0.16 0 -FEP_18638-1_18624-1 29.05 0.83 2 -FEP_18628-1_18627-1 -1.40 0.21 0 -FEP_18632-1_18630-1 -3.13 0.25 0 -FEP_18652-1_18628-1 22.32 0.77 1 -FEP_18631-1_18630-1 5.73 0.28 0 -FEP_18660-1_18630-1 59.96 0.75 4 -FEP_18638-1_18629-1 28.45 0.39 1 -FEP_18658-1_18633-1 15.23 0.61 0 -FEP_18625-1_17124-1 0.85 0.39 0 -FEP_18637-1_18635-1 24.95 0.64 0 -FEP_18637-1_17124-1 23.62 0.28 0 -FEP_18635-1_18634-1 -6.00 0.32 0 -FEP_18633-1_18628-1 -0.40 0.14 0 -FEP_18658-1_18631-1 7.39 0.25 0 -FEP_18631-1_18629-1 5.25 0.49 0 -FEP_18630-1_18624-1 2.29 0.11 0 -FEP_18632-1_18627-1 -2.58 0.15 0 -FEP_18632-1_18625-1 -7.02 0.35 0 -FEP_18636-1_18633-1 10.48 0.31 0 -FEP_18659-1_18625-1 7.33 0.41 0 -FEP_18638-1_18630-1 27.05 0.72 2 -FEP_18635-1_18629-1 0.73 0.31 0 -FEP_18636-1_18634-1 1.55 0.41 0 -FEP_18635-1_18632-1 4.58 0.23 0 -FEP_18633-1_17124-1 -3.53 0.49 0 -FEP_18638-1_18628-1 30.01 0.47 0 -FEP_18659-1_18637-1 -16.95 0.45 0 -FEP_18634-1_18633-1 8.38 0.55 0 -FEP_18633-1_18625-1 -5.51 0.17 0 -FEP_18631-1_18624-1 7.70 0.23 0 -FEP_18660-1_18635-1 58.88 0.93 0 -FEP_18660-1_18633-1 63.86 0.90 4 -FEP_18652-1_18638-1 -6.85 0.56 0 -FEP_18630-1_18626-1 1.59 0.11 0 -FEP_18652-1_18629-1 20.93 0.72 1 -FEP_18631-1_18627-1 6.07 0.38 0 -FEP_18628-1_18626-1 -0.08 0.27 0 -FEP_18637-1_18627-1 24.34 0.86 2 -FEP_18652-1_18624-1 21.55 0.96 4 -FEP_18626-1_17124-1 -4.03 0.28 0 -FEP_18638-1_18632-1 30.43 0.72 1 -FEP_18658-1_18626-1 15.56 0.49 0 -FEP_18638-1_18625-1 24.08 0.56 0 -FEP_18659-1_18628-1 11.76 0.42 0 -FEP_18659-1_18652-1 -10.72 0.65 0 -FEP_18658-1_18634-1 6.75 0.34 0 -FEP_18633-1_18629-1 -2.73 0.19 0 -FEP_18639-1_18634-1 -11.82 0.38 0 -FEP_18639-1_18632-1 -2.36 0.73 0 -FEP_18658-1_18625-1 10.07 0.52 0 -FEP_18630-1_18625-1 -3.49 0.16 0 -FEP_18660-1_18637-1 35.96 0.46 0 -FEP_18634-1_18632-1 10.28 0.44 0 -FEP_18634-1_17124-1 4.54 0.30 0 -FEP_18635-1_18630-1 1.17 0.24 0 -FEP_18638-1_18633-1 27.94 0.95 1 -FEP_18635-1_18624-1 3.01 0.50 0 -FEP_18638-1_18626-1 30.14 0.51 0 -FEP_18637-1_18624-1 26.33 0.82 3 -FEP_18639-1_18638-1 -33.90 0.14 0 -FEP_18634-1_18630-1 6.64 0.47 0 -FEP_18637-1_18634-1 20.10 0.53 0 -FEP_18660-1_18658-1 46.77 0.56 0 -FEP_18659-1_18626-1 11.80 0.59 0 -FEP_18639-1_18637-1 -31.62 0.16 0 -FEP_18659-1_18632-1 13.95 0.80 1 -FEP_18660-1_17124-1 57.93 0.64 0 -FEP_18636-1_18635-1 7.10 0.22 0 -FEP_18630-1_18628-1 1.74 0.18 0 -FEP_18637-1_18630-1 25.78 0.50 1 -FEP_18660-1_18624-1 62.80 0.92 5 -FEP_18660-1_18629-1 61.44 1.31 5 -FEP_18652-1_18631-1 15.96 0.49 0 -FEP_18637-1_18631-1 20.46 0.20 0 -FEP_18635-1_18627-1 1.40 0.19 0 -FEP_18631-1_17124-1 4.41 0.17 0 -FEP_18627-1_18626-1 1.15 0.18 0 -FEP_18652-1_18639-1 27.36 0.41 0 -FEP_18660-1_18636-1 56.61 0.65 1 -FEP_18659-1_18634-1 3.22 0.62 0 -FEP_18639-1_18631-1 -12.19 0.22 0 -FEP_18632-1_18631-1 -9.30 0.45 0 -FEP_18631-1_18626-1 8.65 0.36 0 -FEP_18637-1_18636-1 17.89 0.52 0 -FEP_18658-1_18629-1 13.11 0.42 1 -FEP_18659-1_17124-1 7.46 0.24 0 -FEP_18632-1_18628-1 -1.84 0.27 1 -FEP_18636-1_18628-1 9.52 0.15 0 -FEP_18658-1_18635-1 13.76 0.30 0 -FEP_18626-1_18625-1 -5.33 0.16 0 -FEP_18635-1_18626-1 3.15 0.28 0 -FEP_18660-1_18631-1 55.94 0.29 1 -FEP_18636-1_18629-1 8.20 0.33 0 -FEP_18629-1_18625-1 -2.69 0.31 0 -FEP_18638-1_18635-1 27.49 0.26 0 -FEP_18629-1_18626-1 2.57 0.15 0 -FEP_18624-1_17124-1 -4.87 0.47 2 -FEP_18659-1_18627-1 9.34 0.60 1 -FEP_18637-1_18633-1 28.22 0.39 1 -FEP_18634-1_18631-1 0.85 0.15 0 -FEP_18636-1_18627-1 8.98 0.28 0 -FEP_18632-1_17124-1 -6.53 0.41 0 -FEP_18659-1_18633-1 10.60 0.70 0 -FEP_18639-1_17124-1 -8.18 0.14 0 -FEP_18634-1_18625-1 3.74 0.39 0 -FEP_18639-1_18628-1 -4.84 0.41 0 -FEP_18628-1_17124-1 -3.69 0.35 0 -FEP_18660-1_18638-1 33.37 0.85 0 -FEP_18652-1_18630-1 19.17 0.66 2 -FEP_18658-1_18628-1 15.11 0.49 0 -FEP_18659-1_18624-1 9.75 0.89 2 -FEP_18637-1_18629-1 24.26 1.08 6 -FEP_18639-1_18627-1 -7.42 0.83 0 -FEP_18652-1_18636-1 12.90 0.27 0 -FEP_18658-1_18639-1 18.89 0.28 0 -FEP_18658-1_17124-1 11.27 0.31 0 -FEP_18634-1_18628-1 8.54 0.25 0 -FEP_18652-1_17124-1 19.45 0.43 0 -FEP_18633-1_18626-1 -0.60 0.20 0 -FEP_18660-1_18634-1 53.89 0.61 0 -FEP_18652-1_18633-1 23.59 0.78 3 -FEP_18652-1_18627-1 20.25 1.14 1 -FEP_18660-1_18626-1 63.95 0.93 1 -FEP_18660-1_18628-1 62.82 0.96 0 -FEP_18637-1_18628-1 26.89 0.49 0 -FEP_18636-1_17124-1 5.89 0.38 0 -FEP_18634-1_18627-1 7.46 0.31 0 -FEP_18625-1_18624-1 5.52 0.28 0 -FEP_18658-1_18632-1 18.29 0.47 0 -FEP_18638-1_18631-1 22.53 0.30 0 -FEP_18652-1_18626-1 23.26 0.60 0 -FEP_18626-1_18624-1 0.22 0.19 0 -FEP_18637-1_18632-1 29.13 0.42 2 -FEP_18660-1_18625-1 55.61 0.86 2 -FEP_18635-1_18625-1 -2.15 0.16 0 -FEP_18634-1_18624-1 8.38 0.61 0 -FEP_18637-1_18626-1 28.28 0.64 0 -FEP_18658-1_18627-1 14.01 0.40 0 -FEP_18659-1_18636-1 2.01 0.38 0 -FEP_18634-1_18629-1 6.52 0.48 0 -FEP_18629-1_18627-1 1.08 0.14 0 -FEP_18636-1_18631-1 1.72 0.27 0 -FEP_18652-1_18625-1 17.68 0.66 0 -FEP_18659-1_18629-1 8.64 0.55 0 -FEP_18627-1_18625-1 -4.26 0.29 0 -FEP_18659-1_18635-1 8.42 0.54 0 -FEP_18636-1_18630-1 8.37 0.40 0 -FEP_18627-1_18624-1 1.66 0.18 0 -FEP_18658-1_18624-1 15.78 0.44 0 -FEP_18658-1_18638-1 -14.61 0.31 0 -FEP_18652-1_18634-1 13.49 0.42 0 -FEP_18659-1_18658-1 -3.85 0.30 0 -FEP_18660-1_18659-1 50.67 0.53 1 -FEP_18639-1_18626-1 -3.47 0.40 0 -FEP_18658-1_18630-1 12.65 0.73 0 -FEP_18629-1_17124-1 -0.50 0.33 0 -FEP_18638-1_17124-1 26.11 0.28 0 -FEP_18639-1_18629-1 -6.87 0.67 0 -FEP_18658-1_18652-1 -6.68 0.37 0 -FEP_18630-1_17124-1 -2.08 0.30 0 -FEP_18659-1_18631-1 3.79 0.53 0 -FEP_18632-1_18624-1 -1.34 0.18 0 -FEP_18630-1_18629-1 -0.26 0.13 0 -FEP_18659-1_18630-1 8.93 0.59 0 -FEP_18652-1_18635-1 19.72 0.45 0 -FEP_18628-1_18624-1 0.68 0.37 0 -FEP_18639-1_18624-1 -5.60 1.11 1 -FEP_18628-1_18625-1 -4.41 0.11 0 -FEP_18627-1_17124-1 -2.78 0.64 0 -FEP_18660-1_18632-1 63.83 1.26 2 -FEP_18636-1_18626-1 10.15 0.26 0 -FEP_18635-1_18628-1 2.21 0.32 0 -FEP_18633-1_18627-1 -1.25 0.16 0 -FEP_18660-1_18652-1 40.23 0.34 0 -FEP_18635-1_18631-1 -5.12 0.26 0 -FEP_18629-1_18624-1 2.44 0.19 0 -FEP_18639-1_18636-1 -13.81 0.33 0 -FEP_18635-1_17124-1 -1.53 0.47 0 -FEP_18639-1_18633-1 -5.18 0.66 0 -FEP_18633-1_18631-1 -7.44 0.15 0 -FEP_18636-1_18624-1 9.37 0.40 0 -FEP_18631-1_18628-1 8.13 0.28 0 -FEP_18637-1_18625-1 22.31 0.38 0 -FEP_18639-1_18635-1 -6.75 0.27 0 -FEP_18638-1_18627-1 28.23 0.64 2 -FEP_18659-1_18639-1 15.64 0.37 0 -FEP_18639-1_18630-1 -5.97 0.32 0 -FEP_18634-1_18626-1 9.62 0.38 0 -FEP_18629-1_18628-1 2.54 0.25 0 -FEP_18658-1_18637-1 -12.49 0.11 0 -FEP_18636-1_18632-1 11.06 0.34 0 -FEP_18652-1_18637-1 -4.54 0.48 0 -FEP_18660-1_18627-1 58.01 0.77 5 -FEP_18658-1_18636-1 7.08 0.38 0 -FEP_18638-1_18636-1 20.45 0.44 0 -FEP_18660-1_18639-1 67.58 0.47 0 -FEP_18632-1_18629-1 -3.60 0.24 0 -FEP_18636-1_18625-1 4.48 0.21 0 -FEP_18633-1_18624-1 0.18 0.20 0 -FEP_18631-1_18625-1 3.55 0.37 0 -FEP_18633-1_18630-1 -2.23 0.17 0 -FEP_18632-1_18626-1 -1.80 0.22 0 -FEP_18638-1_18637-1 2.54 0.19 0 -FEP_18652-1_18632-1 25.01 0.92 1 -FEP_18635-1_18633-1 3.02 0.27 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt deleted file mode 100755 index 63ae9307..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,210 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18659-1-18638-1 -17.47 0.29 0 -FEP_18638-1-18634-1 20.70 0.23 0 -FEP_18639-1-18625-1 -9.04 0.49 0 -FEP_18633-1-18632-1 0.09 0.22 0 -FEP_18630-1-18627-1 0.40 0.16 0 -FEP_18638-1-18624-1 29.05 0.83 2 -FEP_18628-1-18627-1 -1.40 0.21 0 -FEP_18632-1-18630-1 -3.13 0.25 0 -FEP_18652-1-18628-1 22.32 0.77 1 -FEP_18631-1-18630-1 5.73 0.28 0 -FEP_18660-1-18630-1 59.96 0.75 4 -FEP_18638-1-18629-1 28.45 0.39 1 -FEP_18658-1-18633-1 15.23 0.61 0 -FEP_18625-1-17124-1 0.85 0.39 0 -FEP_18637-1-18635-1 24.95 0.64 0 -FEP_18637-1-17124-1 23.62 0.28 0 -FEP_18635-1-18634-1 -6.00 0.32 0 -FEP_18633-1-18628-1 -0.40 0.14 0 -FEP_18658-1-18631-1 7.39 0.25 0 -FEP_18631-1-18629-1 5.25 0.49 0 -FEP_18630-1-18624-1 2.29 0.11 0 -FEP_18632-1-18627-1 -2.58 0.15 0 -FEP_18632-1-18625-1 -7.02 0.35 0 -FEP_18636-1-18633-1 10.48 0.31 0 -FEP_18659-1-18625-1 7.33 0.41 0 -FEP_18638-1-18630-1 27.05 0.72 2 -FEP_18635-1-18629-1 0.73 0.31 0 -FEP_18636-1-18634-1 1.55 0.41 0 -FEP_18635-1-18632-1 4.58 0.23 0 -FEP_18633-1-17124-1 -3.53 0.49 0 -FEP_18638-1-18628-1 30.01 0.47 0 -FEP_18659-1-18637-1 -16.95 0.45 0 -FEP_18634-1-18633-1 8.38 0.55 0 -FEP_18633-1-18625-1 -5.51 0.17 0 -FEP_18631-1-18624-1 7.70 0.23 0 -FEP_18660-1-18635-1 58.88 0.93 0 -FEP_18660-1-18633-1 63.86 0.90 4 -FEP_18652-1-18638-1 -6.85 0.56 0 -FEP_18630-1-18626-1 1.59 0.11 0 -FEP_18652-1-18629-1 20.93 0.72 1 -FEP_18631-1-18627-1 6.07 0.38 0 -FEP_18628-1-18626-1 -0.08 0.27 0 -FEP_18637-1-18627-1 24.34 0.86 2 -FEP_18652-1-18624-1 21.55 0.96 4 -FEP_18626-1-17124-1 -4.03 0.28 0 -FEP_18638-1-18632-1 30.43 0.72 1 -FEP_18658-1-18626-1 15.56 0.49 0 -FEP_18638-1-18625-1 24.08 0.56 0 -FEP_18659-1-18628-1 11.76 0.42 0 -FEP_18659-1-18652-1 -10.72 0.65 0 -FEP_18658-1-18634-1 6.75 0.34 0 -FEP_18633-1-18629-1 -2.73 0.19 0 -FEP_18639-1-18634-1 -11.82 0.38 0 -FEP_18639-1-18632-1 -2.36 0.73 0 -FEP_18658-1-18625-1 10.07 0.52 0 -FEP_18630-1-18625-1 -3.49 0.16 0 -FEP_18660-1-18637-1 35.96 0.46 0 -FEP_18634-1-18632-1 10.28 0.44 0 -FEP_18634-1-17124-1 4.54 0.30 0 -FEP_18635-1-18630-1 1.17 0.24 0 -FEP_18638-1-18633-1 27.94 0.95 1 -FEP_18635-1-18624-1 3.01 0.50 0 -FEP_18638-1-18626-1 30.14 0.51 0 -FEP_18637-1-18624-1 26.33 0.82 3 -FEP_18639-1-18638-1 -33.90 0.14 0 -FEP_18634-1-18630-1 6.64 0.47 0 -FEP_18637-1-18634-1 20.10 0.53 0 -FEP_18660-1-18658-1 46.77 0.56 0 -FEP_18659-1-18626-1 11.80 0.59 0 -FEP_18639-1-18637-1 -31.62 0.16 0 -FEP_18659-1-18632-1 13.95 0.80 1 -FEP_18660-1-17124-1 57.93 0.64 0 -FEP_18636-1-18635-1 7.10 0.22 0 -FEP_18630-1-18628-1 1.74 0.18 0 -FEP_18637-1-18630-1 25.78 0.50 1 -FEP_18660-1-18624-1 62.80 0.92 5 -FEP_18660-1-18629-1 61.44 1.31 5 -FEP_18652-1-18631-1 15.96 0.49 0 -FEP_18637-1-18631-1 20.46 0.20 0 -FEP_18635-1-18627-1 1.40 0.19 0 -FEP_18631-1-17124-1 4.41 0.17 0 -FEP_18627-1-18626-1 1.15 0.18 0 -FEP_18652-1-18639-1 27.36 0.41 0 -FEP_18660-1-18636-1 56.61 0.65 1 -FEP_18659-1-18634-1 3.22 0.62 0 -FEP_18639-1-18631-1 -12.19 0.22 0 -FEP_18632-1-18631-1 -9.30 0.45 0 -FEP_18631-1-18626-1 8.65 0.36 0 -FEP_18637-1-18636-1 17.89 0.52 0 -FEP_18658-1-18629-1 13.11 0.42 1 -FEP_18659-1-17124-1 7.46 0.24 0 -FEP_18632-1-18628-1 -1.84 0.27 1 -FEP_18636-1-18628-1 9.52 0.15 0 -FEP_18658-1-18635-1 13.76 0.30 0 -FEP_18626-1-18625-1 -5.33 0.16 0 -FEP_18635-1-18626-1 3.15 0.28 0 -FEP_18660-1-18631-1 55.94 0.29 1 -FEP_18636-1-18629-1 8.20 0.33 0 -FEP_18629-1-18625-1 -2.69 0.31 0 -FEP_18638-1-18635-1 27.49 0.26 0 -FEP_18629-1-18626-1 2.57 0.15 0 -FEP_18624-1-17124-1 -4.87 0.47 2 -FEP_18659-1-18627-1 9.34 0.60 1 -FEP_18637-1-18633-1 28.22 0.39 1 -FEP_18634-1-18631-1 0.85 0.15 0 -FEP_18636-1-18627-1 8.98 0.28 0 -FEP_18632-1-17124-1 -6.53 0.41 0 -FEP_18659-1-18633-1 10.60 0.70 0 -FEP_18639-1-17124-1 -8.18 0.14 0 -FEP_18634-1-18625-1 3.74 0.39 0 -FEP_18639-1-18628-1 -4.84 0.41 0 -FEP_18628-1-17124-1 -3.69 0.35 0 -FEP_18660-1-18638-1 33.37 0.85 0 -FEP_18652-1-18630-1 19.17 0.66 2 -FEP_18658-1-18628-1 15.11 0.49 0 -FEP_18659-1-18624-1 9.75 0.89 2 -FEP_18637-1-18629-1 24.26 1.08 6 -FEP_18639-1-18627-1 -7.42 0.83 0 -FEP_18652-1-18636-1 12.90 0.27 0 -FEP_18658-1-18639-1 18.89 0.28 0 -FEP_18658-1-17124-1 11.27 0.31 0 -FEP_18634-1-18628-1 8.54 0.25 0 -FEP_18652-1-17124-1 19.45 0.43 0 -FEP_18633-1-18626-1 -0.60 0.20 0 -FEP_18660-1-18634-1 53.89 0.61 0 -FEP_18652-1-18633-1 23.59 0.78 3 -FEP_18652-1-18627-1 20.25 1.14 1 -FEP_18660-1-18626-1 63.95 0.93 1 -FEP_18660-1-18628-1 62.82 0.96 0 -FEP_18637-1-18628-1 26.89 0.49 0 -FEP_18636-1-17124-1 5.89 0.38 0 -FEP_18634-1-18627-1 7.46 0.31 0 -FEP_18625-1-18624-1 5.52 0.28 0 -FEP_18658-1-18632-1 18.29 0.47 0 -FEP_18638-1-18631-1 22.53 0.30 0 -FEP_18652-1-18626-1 23.26 0.60 0 -FEP_18626-1-18624-1 0.22 0.19 0 -FEP_18637-1-18632-1 29.13 0.42 2 -FEP_18660-1-18625-1 55.61 0.86 2 -FEP_18635-1-18625-1 -2.15 0.16 0 -FEP_18634-1-18624-1 8.38 0.61 0 -FEP_18637-1-18626-1 28.28 0.64 0 -FEP_18658-1-18627-1 14.01 0.40 0 -FEP_18659-1-18636-1 2.01 0.38 0 -FEP_18634-1-18629-1 6.52 0.48 0 -FEP_18629-1-18627-1 1.08 0.14 0 -FEP_18636-1-18631-1 1.72 0.27 0 -FEP_18652-1-18625-1 17.68 0.66 0 -FEP_18659-1-18629-1 8.64 0.55 0 -FEP_18627-1-18625-1 -4.26 0.29 0 -FEP_18659-1-18635-1 8.42 0.54 0 -FEP_18636-1-18630-1 8.37 0.40 0 -FEP_18627-1-18624-1 1.66 0.18 0 -FEP_18658-1-18624-1 15.78 0.44 0 -FEP_18658-1-18638-1 -14.61 0.31 0 -FEP_18652-1-18634-1 13.49 0.42 0 -FEP_18659-1-18658-1 -3.85 0.30 0 -FEP_18660-1-18659-1 50.67 0.53 1 -FEP_18639-1-18626-1 -3.47 0.40 0 -FEP_18658-1-18630-1 12.65 0.73 0 -FEP_18629-1-17124-1 -0.50 0.33 0 -FEP_18638-1-17124-1 26.11 0.28 0 -FEP_18639-1-18629-1 -6.87 0.67 0 -FEP_18658-1-18652-1 -6.68 0.37 0 -FEP_18630-1-17124-1 -2.08 0.30 0 -FEP_18659-1-18631-1 3.79 0.53 0 -FEP_18632-1-18624-1 -1.34 0.18 0 -FEP_18630-1-18629-1 -0.26 0.13 0 -FEP_18659-1-18630-1 8.93 0.59 0 -FEP_18652-1-18635-1 19.72 0.45 0 -FEP_18628-1-18624-1 0.68 0.37 0 -FEP_18639-1-18624-1 -5.60 1.11 1 -FEP_18628-1-18625-1 -4.41 0.11 0 -FEP_18627-1-17124-1 -2.78 0.64 0 -FEP_18660-1-18632-1 63.83 1.26 2 -FEP_18636-1-18626-1 10.15 0.26 0 -FEP_18635-1-18628-1 2.21 0.32 0 -FEP_18633-1-18627-1 -1.25 0.16 0 -FEP_18660-1-18652-1 40.23 0.34 0 -FEP_18635-1-18631-1 -5.12 0.26 0 -FEP_18629-1-18624-1 2.44 0.19 0 -FEP_18639-1-18636-1 -13.81 0.33 0 -FEP_18635-1-17124-1 -1.53 0.47 0 -FEP_18639-1-18633-1 -5.18 0.66 0 -FEP_18633-1-18631-1 -7.44 0.15 0 -FEP_18636-1-18624-1 9.37 0.40 0 -FEP_18631-1-18628-1 8.13 0.28 0 -FEP_18637-1-18625-1 22.31 0.38 0 -FEP_18639-1-18635-1 -6.75 0.27 0 -FEP_18638-1-18627-1 28.23 0.64 2 -FEP_18659-1-18639-1 15.64 0.37 0 -FEP_18639-1-18630-1 -5.97 0.32 0 -FEP_18634-1-18626-1 9.62 0.38 0 -FEP_18629-1-18628-1 2.54 0.25 0 -FEP_18658-1-18637-1 -12.49 0.11 0 -FEP_18636-1-18632-1 11.06 0.34 0 -FEP_18652-1-18637-1 -4.54 0.48 0 -FEP_18660-1-18627-1 58.01 0.77 5 -FEP_18658-1-18636-1 7.08 0.38 0 -FEP_18638-1-18636-1 20.45 0.44 0 -FEP_18660-1-18639-1 67.58 0.47 0 -FEP_18632-1-18629-1 -3.60 0.24 0 -FEP_18636-1-18625-1 4.48 0.21 0 -FEP_18633-1-18624-1 0.18 0.20 0 -FEP_18631-1-18625-1 3.55 0.37 0 -FEP_18633-1-18630-1 -2.23 0.17 0 -FEP_18632-1-18626-1 -1.80 0.22 0 -FEP_18638-1-18637-1 2.54 0.19 0 -FEP_18652-1-18632-1 25.01 0.92 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt deleted file mode 100755 index 02349b17..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt +++ /dev/null @@ -1,211 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18632-1-18627-1 -2.17 0.34 0 -FEP_18639-1-18635-1 -10.42 0.18 0 -FEP_18634-1-18632-1 8.29 0.17 0 -FEP_18636-1-18631-1 6.19 0.17 0 -FEP_18632-1-18629-1 -3.88 0.18 0 -FEP_18636-1-18635-1 7.26 0.28 0 -FEP_18629-1-17124-1 1.71 0.35 0 -FEP_18629-1-18625-1 -3.18 0.34 0 -FEP_18637-1-18633-1 24.29 0.62 1 -FEP_18658-1-18637-1 -11.73 0.34 0 -FEP_18638-1-18636-1 16.18 0.47 0 -FEP_18660-1-18637-1 34.88 0.88 0 -FEP_18629-1-18626-1 2.82 0.18 0 -FEP_18639-1-18631-1 -11.74 0.26 0 -FEP_18638-1-18637-1 2.69 0.36 0 -FEP_18631-1-18629-1 2.66 0.38 0 -FEP_18635-1-18633-1 4.06 0.37 0 -FEP_18639-1-18637-1 -31.60 0.16 0 -FEP_18633-1-18625-1 -6.10 0.26 0 -FEP_18658-1-18635-1 9.64 0.35 0 -FEP_18635-1-18624-1 3.77 0.42 0 -FEP_18633-1-18632-1 0.44 0.25 0 -FEP_18659-1-18633-1 8.13 0.66 0 -FEP_18660-1-18632-1 63.23 0.76 2 -FEP_18636-1-18630-1 9.28 0.31 0 -FEP_18638-1-18630-1 24.81 0.52 1 -FEP_18627-1-18624-1 1.15 0.22 0 -FEP_18660-1-18624-1 59.09 1.01 8 -FEP_18636-1-18629-1 8.92 0.21 0 -FEP_18658-1-18638-1 -14.90 0.29 0 -FEP_18633-1-18624-1 0.24 0.27 0 -FEP_18638-1-18631-1 22.87 0.41 0 -FEP_18636-1-18624-1 10.95 0.29 0 -FEP_18634-1-18628-1 4.36 0.34 0 -FEP_18639-1-18630-1 -9.78 0.63 1 -FEP_18660-1-18626-1 62.81 0.16 3 -FEP_18659-1-18638-1 -17.96 0.36 0 -FEP_18632-1-17124-1 -1.84 0.48 1 -FEP_18659-1-18625-1 3.30 0.41 0 -FEP_18635-1-18630-1 1.85 0.24 0 -FEP_18659-1-18632-1 10.40 0.76 0 -FEP_18658-1-18627-1 11.24 0.48 0 -FEP_18631-1-18624-1 4.59 0.42 0 -FEP_18639-1-18632-1 -6.14 1.13 0 -FEP_18652-1-18624-1 17.27 0.71 3 -FEP_18625-1-18624-1 6.36 0.29 0 -FEP_18659-1-18635-1 5.20 0.34 0 -FEP_18660-1-18635-1 57.92 0.86 0 -FEP_18660-1-17124-1 60.70 0.63 0 -FEP_18639-1-18625-1 -12.54 0.18 0 -FEP_18628-1-18624-1 1.94 0.20 0 -FEP_18659-1-18627-1 7.11 0.61 0 -FEP_18639-1-18629-1 -8.85 0.40 0 -FEP_18635-1-18634-1 -2.57 0.25 0 -FEP_18635-1-18627-1 2.62 0.47 0 -FEP_18637-1-18635-1 21.59 0.32 0 -FEP_18633-1-18626-1 0.54 0.23 0 -FEP_18632-1-18628-1 -3.36 0.12 0 -FEP_18652-1-18639-1 27.78 0.17 0 -FEP_18660-1-18652-1 41.62 0.27 0 -FEP_18634-1-18629-1 3.45 0.19 0 -FEP_18660-1-18631-1 55.83 0.44 0 -FEP_18628-1-17124-1 1.17 0.51 0 -FEP_18634-1-18633-1 5.44 0.65 0 -FEP_18659-1-18631-1 4.12 0.26 0 -FEP_18638-1-18626-1 28.58 0.36 0 -FEP_18635-1-17124-1 3.11 0.21 0 -FEP_18652-1-18628-1 17.62 0.86 0 -FEP_18634-1-18625-1 -0.23 0.28 0 -FEP_18633-1-18629-1 -2.22 0.21 0 -FEP_18658-1-18633-1 12.06 0.47 1 -FEP_18659-1-18637-1 -15.64 0.43 0 -FEP_18658-1-18628-1 11.41 0.31 0 -FEP_18660-1-18633-1 60.13 0.87 1 -FEP_18660-1-18625-1 54.58 0.77 0 -FEP_18636-1-18625-1 5.23 0.24 0 -FEP_18629-1-18627-1 1.38 0.17 0 -FEP_18632-1-18631-1 -6.97 0.37 0 -FEP_18639-1-17124-1 -7.02 0.16 0 -FEP_18637-1-18625-1 19.70 0.62 0 -FEP_18652-1-18630-1 17.08 1.02 2 -FEP_18660-1-18659-1 52.11 0.99 0 -FEP_18652-1-18629-1 17.68 0.56 2 -FEP_18634-1-18631-1 0.47 0.23 0 -FEP_18659-1-18624-1 8.61 0.65 0 -FEP_18632-1-18624-1 -0.95 0.20 0 -FEP_18636-1-18627-1 9.64 0.30 0 -FEP_18652-1-18625-1 14.16 0.50 0 -FEP_18637-1-18636-1 14.55 0.51 0 -FEP_18639-1-18633-1 -6.25 0.37 1 -FEP_18631-1-18628-1 3.61 0.34 0 -FEP_18652-1-18637-1 -4.71 0.25 0 -FEP_18634-1-17124-1 3.87 0.73 0 -FEP_18633-1-18631-1 -5.46 0.38 0 -FEP_18637-1-18631-1 19.74 0.34 0 -FEP_18652-1-18638-1 -7.55 0.12 0 -FEP_18658-1-18634-1 6.80 0.63 0 -FEP_18632-1-18625-1 -7.85 0.32 0 -FEP_18659-1-18652-1 -10.76 0.38 0 -FEP_18630-1-18628-1 1.45 0.61 0 -FEP_18660-1-18627-1 60.48 0.72 4 -FEP_18637-1-18626-1 26.25 0.33 0 -FEP_18634-1-18624-1 5.45 0.17 0 -FEP_18659-1-18636-1 -1.64 0.39 0 -FEP_18633-1-18628-1 -1.62 0.36 0 -FEP_18638-1-18629-1 24.01 0.93 1 -FEP_18635-1-18631-1 -1.58 0.30 0 -FEP_18629-1-18628-1 0.87 0.26 0 -FEP_18636-1-18626-1 12.35 0.21 0 -FEP_18659-1-18634-1 3.15 0.25 0 -FEP_18652-1-18633-1 20.09 0.75 1 -FEP_18658-1-18626-1 13.60 0.22 0 -FEP_18658-1-17124-1 13.19 0.24 0 -FEP_18631-1-17124-1 5.12 0.26 0 -FEP_18639-1-18636-1 -18.09 0.38 0 -FEP_18628-1-18625-1 -4.91 0.35 0 -FEP_18636-1-18634-1 5.64 0.34 0 -FEP_18638-1-18634-1 22.41 0.35 0 -FEP_18660-1-18636-1 50.74 0.92 0 -FEP_18658-1-18629-1 11.12 0.29 0 -FEP_18658-1-18625-1 7.24 0.40 0 -FEP_18635-1-18625-1 -1.88 0.27 0 -FEP_18630-1-17124-1 2.60 0.45 0 -FEP_18637-1-18624-1 24.88 0.42 1 -FEP_18633-1-18627-1 -1.47 0.31 0 -FEP_18636-1-18628-1 9.38 0.26 0 -FEP_18658-1-18630-1 10.27 0.36 0 -FEP_18659-1-18629-1 6.14 0.58 0 -FEP_18658-1-18636-1 1.97 0.40 0 -FEP_18638-1-18627-1 25.57 0.49 1 -FEP_18626-1-17124-1 -1.10 0.19 0 -FEP_18637-1-18628-1 23.35 0.53 0 -FEP_18630-1-18627-1 1.13 0.46 0 -FEP_18652-1-17124-1 19.79 0.28 0 -FEP_18627-1-18625-1 -5.19 0.33 0 -FEP_18652-1-18631-1 15.25 0.33 0 -FEP_18639-1-18628-1 -8.61 0.43 0 -FEP_18635-1-18626-1 4.27 0.18 0 -FEP_18628-1-18627-1 0.49 0.22 0 -FEP_18660-1-18658-1 48.94 0.29 0 -FEP_18660-1-18629-1 58.99 0.80 3 -FEP_18631-1-18630-1 2.38 0.21 0 -FEP_18630-1-18626-1 3.33 0.34 0 -FEP_18631-1-18627-1 4.18 0.14 0 -FEP_18639-1-18626-1 -5.42 0.36 0 -FEP_18659-1-18658-1 -4.49 0.19 0 -FEP_18638-1-18635-1 24.17 0.34 0 -FEP_18660-1-18630-1 59.03 0.72 4 -FEP_18624-1-17124-1 -0.26 0.47 0 -FEP_18637-1-18634-1 19.97 0.36 0 -FEP_18637-1-18632-1 25.93 0.29 0 -FEP_18628-1-18626-1 2.44 0.35 0 -FEP_18638-1-17124-1 26.77 0.39 0 -FEP_18637-1-17124-1 24.19 0.27 0 -FEP_18634-1-18626-1 7.00 0.28 0 -FEP_18658-1-18639-1 19.99 0.24 0 -FEP_18652-1-18636-1 9.02 0.86 0 -FEP_18638-1-18633-1 27.54 0.29 1 -FEP_18631-1-18625-1 -0.88 0.33 0 -FEP_18629-1-18624-1 1.93 0.41 0 -FEP_18635-1-18629-1 1.52 0.15 0 -FEP_18634-1-18630-1 3.03 0.39 1 -FEP_18659-1-18639-1 15.69 0.37 0 -FEP_18632-1-18626-1 -0.85 0.34 0 -FEP_18639-1-18624-1 -7.46 0.57 0 -FEP_18639-1-18627-1 -7.85 0.27 0 -FEP_18631-1-18626-1 6.05 0.25 0 -FEP_18652-1-18634-1 14.51 0.52 0 -FEP_18636-1-18633-1 11.71 0.27 0 -FEP_18630-1-18629-1 -0.12 0.29 0 -FEP_18659-1-17124-1 8.21 0.13 0 -FEP_18637-1-18630-1 21.75 0.66 2 -FEP_18627-1-18626-1 1.61 0.12 0 -FEP_18633-1-17124-1 -0.72 0.34 0 -FEP_18636-1-17124-1 10.45 0.28 0 -FEP_18626-1-18624-1 -0.89 0.21 0 -FEP_18659-1-18626-1 9.48 0.31 0 -FEP_18652-1-18626-1 21.76 0.47 0 -FEP_18652-1-18635-1 16.12 0.31 0 -FEP_18634-1-18627-1 6.06 0.29 0 -FEP_18660-1-18638-1 34.30 0.47 0 -FEP_18638-1-18628-1 25.09 0.88 1 -FEP_18660-1-18628-1 60.87 0.43 2 -FEP_18635-1-18632-1 5.24 0.22 0 -FEP_18636-1-18632-1 12.83 0.44 0 -FEP_18637-1-18627-1 24.25 0.33 0 -FEP_18639-1-18638-1 -34.36 0.14 0 -FEP_18638-1-18624-1 27.16 0.89 3 -FEP_18658-1-18652-1 -7.10 0.31 0 -FEP_18660-1-18634-1 55.66 0.37 1 -FEP_18626-1-18625-1 -7.24 0.36 0 -FEP_18639-1-18634-1 -12.08 0.44 0 -FEP_18633-1-18630-1 -2.39 0.42 0 -FEP_18659-1-18628-1 7.15 0.15 0 -FEP_18658-1-18631-1 7.29 0.25 0 -FEP_18637-1-18629-1 22.63 0.61 2 -FEP_18630-1-18625-1 -3.62 0.33 0 -FEP_18658-1-18624-1 12.81 0.58 0 -FEP_18635-1-18628-1 2.24 0.34 0 -FEP_18652-1-18632-1 21.42 0.52 1 -FEP_18659-1-18630-1 5.36 0.75 0 -FEP_18625-1-17124-1 5.60 0.21 0 -FEP_18660-1-18639-1 68.39 0.89 0 -FEP_18638-1-18632-1 28.35 0.54 1 -FEP_18630-1-18624-1 2.17 0.12 0 -FEP_18638-1-18625-1 21.30 0.53 0 -FEP_18652-1-18627-1 18.76 0.65 1 -FEP_18632-1-18630-1 -3.58 0.20 0 -FEP_18627-1-17124-1 1.01 0.33 0 -FEP_18658-1-18632-1 15.29 0.28 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100755 index a37f8e02..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,212 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18632-1_18627-1 -2.17 0.34 0 -FEP_18639-1_18635-1 -10.42 0.18 0 -FEP_18634-1_18632-1 8.29 0.17 0 -FEP_18636-1_18631-1 6.19 0.17 0 -FEP_18632-1_18629-1 -3.88 0.18 0 -FEP_18636-1_18635-1 7.26 0.28 0 -FEP_18629-1_17124-1 1.71 0.35 0 -FEP_18629-1_18625-1 -3.18 0.34 0 -FEP_18637-1_18633-1 24.29 0.62 1 -FEP_18658-1_18637-1 -11.73 0.34 0 -FEP_18638-1_18636-1 16.18 0.47 0 -FEP_18660-1_18637-1 34.88 0.88 0 -FEP_18629-1_18626-1 2.82 0.18 0 -FEP_18639-1_18631-1 -11.74 0.26 0 -FEP_18638-1_18637-1 2.69 0.36 0 -FEP_18631-1_18629-1 2.66 0.38 0 -FEP_18635-1_18633-1 4.06 0.37 0 -FEP_18639-1_18637-1 -31.60 0.16 0 -FEP_18633-1_18625-1 -6.10 0.26 0 -FEP_18658-1_18635-1 9.64 0.35 0 -FEP_18635-1_18624-1 3.77 0.42 0 -FEP_18633-1_18632-1 0.44 0.25 0 -FEP_18659-1_18633-1 8.13 0.66 0 -FEP_18660-1_18632-1 63.23 0.76 2 -FEP_18636-1_18630-1 9.28 0.31 0 -FEP_18638-1_18630-1 24.81 0.52 1 -FEP_18627-1_18624-1 1.15 0.22 0 -FEP_18660-1_18624-1 59.09 1.01 8 -FEP_18636-1_18629-1 8.92 0.21 0 -FEP_18658-1_18638-1 -14.90 0.29 0 -FEP_18633-1_18624-1 0.24 0.27 0 -FEP_18638-1_18631-1 22.87 0.41 0 -FEP_18636-1_18624-1 10.95 0.29 0 -FEP_18634-1_18628-1 4.36 0.34 0 -FEP_18639-1_18630-1 -9.78 0.63 1 -FEP_18660-1_18626-1 62.81 0.16 3 -FEP_18659-1_18638-1 -17.96 0.36 0 -FEP_18632-1_17124-1 -1.84 0.48 1 -FEP_18659-1_18625-1 3.30 0.41 0 -FEP_18635-1_18630-1 1.85 0.24 0 -FEP_18659-1_18632-1 10.40 0.76 0 -FEP_18658-1_18627-1 11.24 0.48 0 -FEP_18631-1_18624-1 4.59 0.42 0 -FEP_18639-1_18632-1 -6.14 1.13 0 -FEP_18652-1_18624-1 17.27 0.71 3 -FEP_18625-1_18624-1 6.36 0.29 0 -FEP_18659-1_18635-1 5.20 0.34 0 -FEP_18660-1_18635-1 57.92 0.86 0 -FEP_18660-1_17124-1 60.70 0.63 0 -FEP_18639-1_18625-1 -12.54 0.18 0 -FEP_18628-1_18624-1 1.94 0.20 0 -FEP_18659-1_18627-1 7.11 0.61 0 -FEP_18639-1_18629-1 -8.85 0.40 0 -FEP_18635-1_18634-1 -2.57 0.25 0 -FEP_18635-1_18627-1 2.62 0.47 0 -FEP_18637-1_18635-1 21.59 0.32 0 -FEP_18633-1_18626-1 0.54 0.23 0 -FEP_18632-1_18628-1 -3.36 0.12 0 -FEP_18652-1_18639-1 27.78 0.17 0 -FEP_18660-1_18652-1 41.62 0.27 0 -FEP_18634-1_18629-1 3.45 0.19 0 -FEP_18660-1_18631-1 55.83 0.44 0 -FEP_18628-1_17124-1 1.17 0.51 0 -FEP_18634-1_18633-1 5.44 0.65 0 -FEP_18659-1_18631-1 4.12 0.26 0 -FEP_18638-1_18626-1 28.58 0.36 0 -FEP_18635-1_17124-1 3.11 0.21 0 -FEP_18652-1_18628-1 17.62 0.86 0 -FEP_18634-1_18625-1 -0.23 0.28 0 -FEP_18633-1_18629-1 -2.22 0.21 0 -FEP_18658-1_18633-1 12.06 0.47 1 -FEP_18659-1_18637-1 -15.64 0.43 0 -FEP_18658-1_18628-1 11.41 0.31 0 -FEP_18660-1_18633-1 60.13 0.87 1 -FEP_18660-1_18625-1 54.58 0.77 0 -FEP_18636-1_18625-1 5.23 0.24 0 -FEP_18629-1_18627-1 1.38 0.17 0 -FEP_18632-1_18631-1 -6.97 0.37 0 -FEP_18639-1_17124-1 -7.02 0.16 0 -FEP_18637-1_18625-1 19.70 0.62 0 -FEP_18652-1_18630-1 17.08 1.02 2 -FEP_18660-1_18659-1 52.11 0.99 0 -FEP_18652-1_18629-1 17.68 0.56 2 -FEP_18634-1_18631-1 0.47 0.23 0 -FEP_18659-1_18624-1 8.61 0.65 0 -FEP_18632-1_18624-1 -0.95 0.20 0 -FEP_18636-1_18627-1 9.64 0.30 0 -FEP_18652-1_18625-1 14.16 0.50 0 -FEP_18637-1_18636-1 14.55 0.51 0 -FEP_18639-1_18633-1 -6.25 0.37 1 -FEP_18631-1_18628-1 3.61 0.34 0 -FEP_18652-1_18637-1 -4.71 0.25 0 -FEP_18634-1_17124-1 3.87 0.73 0 -FEP_18633-1_18631-1 -5.46 0.38 0 -FEP_18637-1_18631-1 19.74 0.34 0 -FEP_18652-1_18638-1 -7.55 0.12 0 -FEP_18658-1_18634-1 6.80 0.63 0 -FEP_18632-1_18625-1 -7.85 0.32 0 -FEP_18659-1_18652-1 -10.76 0.38 0 -FEP_18630-1_18628-1 1.45 0.61 0 -FEP_18660-1_18627-1 60.48 0.72 4 -FEP_18637-1_18626-1 26.25 0.33 0 -FEP_18634-1_18624-1 5.45 0.17 0 -FEP_18659-1_18636-1 -1.64 0.39 0 -FEP_18633-1_18628-1 -1.62 0.36 0 -FEP_18638-1_18629-1 24.01 0.93 1 -FEP_18635-1_18631-1 -1.58 0.30 0 -FEP_18629-1_18628-1 0.87 0.26 0 -FEP_18636-1_18626-1 12.35 0.21 0 -FEP_18659-1_18634-1 3.15 0.25 0 -FEP_18652-1_18633-1 20.09 0.75 1 -FEP_18658-1_18626-1 13.60 0.22 0 -FEP_18658-1_17124-1 13.19 0.24 0 -FEP_18631-1_17124-1 5.12 0.26 0 -FEP_18639-1_18636-1 -18.09 0.38 0 -FEP_18628-1_18625-1 -4.91 0.35 0 -FEP_18636-1_18634-1 5.64 0.34 0 -FEP_18638-1_18634-1 22.41 0.35 0 -FEP_18660-1_18636-1 50.74 0.92 0 -FEP_18658-1_18629-1 11.12 0.29 0 -FEP_18658-1_18625-1 7.24 0.40 0 -FEP_18635-1_18625-1 -1.88 0.27 0 -FEP_18630-1_17124-1 2.60 0.45 0 -FEP_18637-1_18624-1 24.88 0.42 1 -FEP_18633-1_18627-1 -1.47 0.31 0 -FEP_18636-1_18628-1 9.38 0.26 0 -FEP_18658-1_18630-1 10.27 0.36 0 -FEP_18659-1_18629-1 6.14 0.58 0 -FEP_18658-1_18636-1 1.97 0.40 0 -FEP_18638-1_18627-1 25.57 0.49 1 -FEP_18626-1_17124-1 -1.10 0.19 0 -FEP_18637-1_18628-1 23.35 0.53 0 -FEP_18630-1_18627-1 1.13 0.46 0 -FEP_18652-1_17124-1 19.79 0.28 0 -FEP_18627-1_18625-1 -5.19 0.33 0 -FEP_18652-1_18631-1 15.25 0.33 0 -FEP_18639-1_18628-1 -8.61 0.43 0 -FEP_18635-1_18626-1 4.27 0.18 0 -FEP_18628-1_18627-1 0.49 0.22 0 -FEP_18660-1_18658-1 48.94 0.29 0 -FEP_18660-1_18629-1 58.99 0.80 3 -FEP_18631-1_18630-1 2.38 0.21 0 -FEP_18630-1_18626-1 3.33 0.34 0 -FEP_18631-1_18627-1 4.18 0.14 0 -FEP_18639-1_18626-1 -5.42 0.36 0 -FEP_18659-1_18658-1 -4.49 0.19 0 -FEP_18638-1_18635-1 24.17 0.34 0 -FEP_18660-1_18630-1 59.03 0.72 4 -FEP_18624-1_17124-1 -0.26 0.47 0 -FEP_18637-1_18634-1 19.97 0.36 0 -FEP_18637-1_18632-1 25.93 0.29 0 -FEP_18628-1_18626-1 2.44 0.35 0 -FEP_18638-1_17124-1 26.77 0.39 0 -FEP_18637-1_17124-1 24.19 0.27 0 -FEP_18634-1_18626-1 7.00 0.28 0 -FEP_18658-1_18639-1 19.99 0.24 0 -FEP_18652-1_18636-1 9.02 0.86 0 -FEP_18638-1_18633-1 27.54 0.29 1 -FEP_18631-1_18625-1 -0.88 0.33 0 -FEP_18629-1_18624-1 1.93 0.41 0 -FEP_18635-1_18629-1 1.52 0.15 0 -FEP_18634-1_18630-1 3.03 0.39 1 -FEP_18659-1_18639-1 15.69 0.37 0 -FEP_18632-1_18626-1 -0.85 0.34 0 -FEP_18639-1_18624-1 -7.46 0.57 0 -FEP_18639-1_18627-1 -7.85 0.27 0 -FEP_18631-1_18626-1 6.05 0.25 0 -FEP_18652-1_18634-1 14.51 0.52 0 -FEP_18636-1_18633-1 11.71 0.27 0 -FEP_18630-1_18629-1 -0.12 0.29 0 -FEP_18659-1_17124-1 8.21 0.13 0 -FEP_18637-1_18630-1 21.75 0.66 2 -FEP_18627-1_18626-1 1.61 0.12 0 -FEP_18633-1_17124-1 -0.72 0.34 0 -FEP_18636-1_17124-1 10.45 0.28 0 -FEP_18626-1_18624-1 -0.89 0.21 0 -FEP_18659-1_18626-1 9.48 0.31 0 -FEP_18652-1_18626-1 21.76 0.47 0 -FEP_18652-1_18635-1 16.12 0.31 0 -FEP_18634-1_18627-1 6.06 0.29 0 -FEP_18660-1_18638-1 34.30 0.47 0 -FEP_18638-1_18628-1 25.09 0.88 1 -FEP_18660-1_18628-1 60.87 0.43 2 -FEP_18635-1_18632-1 5.24 0.22 0 -FEP_18636-1_18632-1 12.83 0.44 0 -FEP_18637-1_18627-1 24.25 0.33 0 -FEP_18639-1_18638-1 -34.36 0.14 0 -FEP_18638-1_18624-1 27.16 0.89 3 -FEP_18658-1_18652-1 -7.10 0.31 0 -FEP_18660-1_18634-1 55.66 0.37 1 -FEP_18626-1_18625-1 -7.24 0.36 0 -FEP_18639-1_18634-1 -12.08 0.44 0 -FEP_18633-1_18630-1 -2.39 0.42 0 -FEP_18659-1_18628-1 7.15 0.15 0 -FEP_18658-1_18631-1 7.29 0.25 0 -FEP_18637-1_18629-1 22.63 0.61 2 -FEP_18630-1_18625-1 -3.62 0.33 0 -FEP_18658-1_18624-1 12.81 0.58 0 -FEP_18635-1_18628-1 2.24 0.34 0 -FEP_18652-1_18632-1 21.42 0.52 1 -FEP_18659-1_18630-1 5.36 0.75 0 -FEP_18625-1_17124-1 5.60 0.21 0 -FEP_18660-1_18639-1 68.39 0.89 0 -FEP_18638-1_18632-1 28.35 0.54 1 -FEP_18630-1_18624-1 2.17 0.12 0 -FEP_18638-1_18625-1 21.30 0.53 0 -FEP_18652-1_18627-1 18.76 0.65 1 -FEP_18632-1_18630-1 -3.58 0.20 0 -FEP_18627-1_17124-1 1.01 0.33 0 -FEP_18658-1_18632-1 15.29 0.28 1 -FEP_18635-1_18633-1 4.15 0.36 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/protein.txt deleted file mode 100755 index bfd6a841..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,211 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18659-1-18638-1 -17.47 0.29 0 -FEP_18638-1-18634-1 20.70 0.23 0 -FEP_18639-1-18625-1 -9.04 0.49 0 -FEP_18633-1-18632-1 0.09 0.22 0 -FEP_18630-1-18627-1 0.40 0.16 0 -FEP_18638-1-18624-1 29.05 0.83 2 -FEP_18628-1-18627-1 -1.40 0.21 0 -FEP_18632-1-18630-1 -3.13 0.25 0 -FEP_18652-1-18628-1 22.32 0.77 1 -FEP_18631-1-18630-1 5.73 0.28 0 -FEP_18660-1-18630-1 59.96 0.75 4 -FEP_18638-1-18629-1 28.45 0.39 1 -FEP_18658-1-18633-1 15.23 0.61 0 -FEP_18625-1-17124-1 0.85 0.39 0 -FEP_18637-1-18635-1 24.95 0.64 0 -FEP_18637-1-17124-1 23.62 0.28 0 -FEP_18635-1-18634-1 -6.00 0.32 0 -FEP_18633-1-18628-1 -0.40 0.14 0 -FEP_18658-1-18631-1 7.39 0.25 0 -FEP_18631-1-18629-1 5.25 0.49 0 -FEP_18630-1-18624-1 2.29 0.11 0 -FEP_18632-1-18627-1 -2.58 0.15 0 -FEP_18632-1-18625-1 -7.02 0.35 0 -FEP_18636-1-18633-1 10.48 0.31 0 -FEP_18659-1-18625-1 7.33 0.41 0 -FEP_18638-1-18630-1 27.05 0.72 2 -FEP_18635-1-18629-1 0.73 0.31 0 -FEP_18636-1-18634-1 1.55 0.41 0 -FEP_18635-1-18632-1 4.58 0.23 0 -FEP_18633-1-17124-1 -3.53 0.49 0 -FEP_18638-1-18628-1 30.01 0.47 0 -FEP_18659-1-18637-1 -16.95 0.45 0 -FEP_18634-1-18633-1 8.38 0.55 0 -FEP_18633-1-18625-1 -5.51 0.17 0 -FEP_18631-1-18624-1 7.70 0.23 0 -FEP_18660-1-18635-1 58.88 0.93 0 -FEP_18660-1-18633-1 63.86 0.90 4 -FEP_18652-1-18638-1 -6.85 0.56 0 -FEP_18630-1-18626-1 1.59 0.11 0 -FEP_18652-1-18629-1 20.93 0.72 1 -FEP_18631-1-18627-1 6.07 0.38 0 -FEP_18628-1-18626-1 -0.08 0.27 0 -FEP_18637-1-18627-1 24.34 0.86 2 -FEP_18652-1-18624-1 21.55 0.96 4 -FEP_18626-1-17124-1 -4.03 0.28 0 -FEP_18638-1-18632-1 30.43 0.72 1 -FEP_18658-1-18626-1 15.56 0.49 0 -FEP_18638-1-18625-1 24.08 0.56 0 -FEP_18659-1-18628-1 11.76 0.42 0 -FEP_18659-1-18652-1 -10.72 0.65 0 -FEP_18658-1-18634-1 6.75 0.34 0 -FEP_18633-1-18629-1 -2.73 0.19 0 -FEP_18639-1-18634-1 -11.82 0.38 0 -FEP_18639-1-18632-1 -2.36 0.73 0 -FEP_18658-1-18625-1 10.07 0.52 0 -FEP_18630-1-18625-1 -3.49 0.16 0 -FEP_18660-1-18637-1 35.96 0.46 0 -FEP_18634-1-18632-1 10.28 0.44 0 -FEP_18634-1-17124-1 4.54 0.30 0 -FEP_18635-1-18630-1 1.17 0.24 0 -FEP_18638-1-18633-1 27.94 0.95 1 -FEP_18635-1-18624-1 3.01 0.50 0 -FEP_18638-1-18626-1 30.14 0.51 0 -FEP_18637-1-18624-1 26.33 0.82 3 -FEP_18639-1-18638-1 -33.90 0.14 0 -FEP_18634-1-18630-1 6.64 0.47 0 -FEP_18637-1-18634-1 20.10 0.53 0 -FEP_18660-1-18658-1 46.77 0.56 0 -FEP_18659-1-18626-1 11.80 0.59 0 -FEP_18639-1-18637-1 -31.62 0.16 0 -FEP_18659-1-18632-1 13.95 0.80 1 -FEP_18660-1-17124-1 57.93 0.64 0 -FEP_18636-1-18635-1 7.10 0.22 0 -FEP_18630-1-18628-1 1.74 0.18 0 -FEP_18637-1-18630-1 25.78 0.50 1 -FEP_18660-1-18624-1 62.80 0.92 5 -FEP_18660-1-18629-1 61.44 1.31 5 -FEP_18652-1-18631-1 15.96 0.49 0 -FEP_18637-1-18631-1 20.46 0.20 0 -FEP_18635-1-18627-1 1.40 0.19 0 -FEP_18631-1-17124-1 4.41 0.17 0 -FEP_18627-1-18626-1 1.15 0.18 0 -FEP_18652-1-18639-1 27.36 0.41 0 -FEP_18660-1-18636-1 56.61 0.65 1 -FEP_18659-1-18634-1 3.22 0.62 0 -FEP_18639-1-18631-1 -12.19 0.22 0 -FEP_18632-1-18631-1 -9.30 0.45 0 -FEP_18631-1-18626-1 8.65 0.36 0 -FEP_18637-1-18636-1 17.89 0.52 0 -FEP_18658-1-18629-1 13.11 0.42 1 -FEP_18659-1-17124-1 7.46 0.24 0 -FEP_18632-1-18628-1 -1.84 0.27 1 -FEP_18636-1-18628-1 9.52 0.15 0 -FEP_18658-1-18635-1 13.76 0.30 0 -FEP_18626-1-18625-1 -5.33 0.16 0 -FEP_18635-1-18626-1 3.15 0.28 0 -FEP_18660-1-18631-1 55.94 0.29 1 -FEP_18636-1-18629-1 8.20 0.33 0 -FEP_18629-1-18625-1 -2.69 0.31 0 -FEP_18638-1-18635-1 27.49 0.26 0 -FEP_18629-1-18626-1 2.57 0.15 0 -FEP_18624-1-17124-1 -4.87 0.47 2 -FEP_18659-1-18627-1 9.34 0.60 1 -FEP_18637-1-18633-1 28.22 0.39 1 -FEP_18634-1-18631-1 0.85 0.15 0 -FEP_18636-1-18627-1 8.98 0.28 0 -FEP_18632-1-17124-1 -6.53 0.41 0 -FEP_18659-1-18633-1 10.60 0.70 0 -FEP_18639-1-17124-1 -8.18 0.14 0 -FEP_18634-1-18625-1 3.74 0.39 0 -FEP_18639-1-18628-1 -4.84 0.41 0 -FEP_18628-1-17124-1 -3.69 0.35 0 -FEP_18660-1-18638-1 33.37 0.85 0 -FEP_18652-1-18630-1 19.17 0.66 2 -FEP_18658-1-18628-1 15.11 0.49 0 -FEP_18659-1-18624-1 9.75 0.89 2 -FEP_18637-1-18629-1 24.26 1.08 6 -FEP_18639-1-18627-1 -7.42 0.83 0 -FEP_18652-1-18636-1 12.90 0.27 0 -FEP_18658-1-18639-1 18.89 0.28 0 -FEP_18658-1-17124-1 11.27 0.31 0 -FEP_18634-1-18628-1 8.54 0.25 0 -FEP_18652-1-17124-1 19.45 0.43 0 -FEP_18633-1-18626-1 -0.60 0.20 0 -FEP_18660-1-18634-1 53.89 0.61 0 -FEP_18652-1-18633-1 23.59 0.78 3 -FEP_18652-1-18627-1 20.25 1.14 1 -FEP_18660-1-18626-1 63.95 0.93 1 -FEP_18660-1-18628-1 62.82 0.96 0 -FEP_18637-1-18628-1 26.89 0.49 0 -FEP_18636-1-17124-1 5.89 0.38 0 -FEP_18634-1-18627-1 7.46 0.31 0 -FEP_18625-1-18624-1 5.52 0.28 0 -FEP_18658-1-18632-1 18.29 0.47 0 -FEP_18638-1-18631-1 22.53 0.30 0 -FEP_18652-1-18626-1 23.26 0.60 0 -FEP_18626-1-18624-1 0.22 0.19 0 -FEP_18637-1-18632-1 29.13 0.42 2 -FEP_18660-1-18625-1 55.61 0.86 2 -FEP_18635-1-18625-1 -2.15 0.16 0 -FEP_18634-1-18624-1 8.38 0.61 0 -FEP_18637-1-18626-1 28.28 0.64 0 -FEP_18658-1-18627-1 14.01 0.40 0 -FEP_18659-1-18636-1 2.01 0.38 0 -FEP_18634-1-18629-1 6.52 0.48 0 -FEP_18629-1-18627-1 1.08 0.14 0 -FEP_18636-1-18631-1 1.72 0.27 0 -FEP_18652-1-18625-1 17.68 0.66 0 -FEP_18659-1-18629-1 8.64 0.55 0 -FEP_18627-1-18625-1 -4.26 0.29 0 -FEP_18659-1-18635-1 8.42 0.54 0 -FEP_18636-1-18630-1 8.37 0.40 0 -FEP_18627-1-18624-1 1.66 0.18 0 -FEP_18658-1-18624-1 15.78 0.44 0 -FEP_18658-1-18638-1 -14.61 0.31 0 -FEP_18652-1-18634-1 13.49 0.42 0 -FEP_18659-1-18658-1 -3.85 0.30 0 -FEP_18660-1-18659-1 50.67 0.53 1 -FEP_18639-1-18626-1 -3.47 0.40 0 -FEP_18658-1-18630-1 12.65 0.73 0 -FEP_18629-1-17124-1 -0.50 0.33 0 -FEP_18638-1-17124-1 26.11 0.28 0 -FEP_18639-1-18629-1 -6.87 0.67 0 -FEP_18658-1-18652-1 -6.68 0.37 0 -FEP_18630-1-17124-1 -2.08 0.30 0 -FEP_18659-1-18631-1 3.79 0.53 0 -FEP_18632-1-18624-1 -1.34 0.18 0 -FEP_18630-1-18629-1 -0.26 0.13 0 -FEP_18659-1-18630-1 8.93 0.59 0 -FEP_18652-1-18635-1 19.72 0.45 0 -FEP_18628-1-18624-1 0.68 0.37 0 -FEP_18639-1-18624-1 -5.60 1.11 1 -FEP_18628-1-18625-1 -4.41 0.11 0 -FEP_18627-1-17124-1 -2.78 0.64 0 -FEP_18660-1-18632-1 63.83 1.26 2 -FEP_18636-1-18626-1 10.15 0.26 0 -FEP_18635-1-18628-1 2.21 0.32 0 -FEP_18633-1-18627-1 -1.25 0.16 0 -FEP_18660-1-18652-1 40.23 0.34 0 -FEP_18635-1-18631-1 -5.12 0.26 0 -FEP_18629-1-18624-1 2.44 0.19 0 -FEP_18639-1-18636-1 -13.81 0.33 0 -FEP_18635-1-17124-1 -1.53 0.47 0 -FEP_18639-1-18633-1 -5.18 0.66 0 -FEP_18633-1-18631-1 -7.44 0.15 0 -FEP_18636-1-18624-1 9.37 0.40 0 -FEP_18631-1-18628-1 8.13 0.28 0 -FEP_18637-1-18625-1 22.31 0.38 0 -FEP_18639-1-18635-1 -6.75 0.27 0 -FEP_18638-1-18627-1 28.23 0.64 2 -FEP_18659-1-18639-1 15.64 0.37 0 -FEP_18639-1-18630-1 -5.97 0.32 0 -FEP_18634-1-18626-1 9.62 0.38 0 -FEP_18629-1-18628-1 2.54 0.25 0 -FEP_18658-1-18637-1 -12.49 0.11 0 -FEP_18636-1-18632-1 11.06 0.34 0 -FEP_18652-1-18637-1 -4.54 0.48 0 -FEP_18660-1-18627-1 58.01 0.77 5 -FEP_18658-1-18636-1 7.08 0.38 0 -FEP_18638-1-18636-1 20.45 0.44 0 -FEP_18660-1-18639-1 67.58 0.47 0 -FEP_18632-1-18629-1 -3.60 0.24 0 -FEP_18636-1-18625-1 4.48 0.21 0 -FEP_18633-1-18624-1 0.18 0.20 0 -FEP_18631-1-18625-1 3.55 0.37 0 -FEP_18633-1-18630-1 -2.23 0.17 0 -FEP_18632-1-18626-1 -1.80 0.22 0 -FEP_18638-1-18637-1 2.54 0.19 0 -FEP_18652-1-18632-1 25.01 0.92 1 -FEP_18635-1-18633-1 3.02 0.27 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/water.txt deleted file mode 100755 index 209eaf00..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/3.JNK1/water.txt +++ /dev/null @@ -1,212 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18632-1-18627-1 -2.17 0.34 0 -FEP_18639-1-18635-1 -10.42 0.18 0 -FEP_18634-1-18632-1 8.29 0.17 0 -FEP_18636-1-18631-1 6.19 0.17 0 -FEP_18632-1-18629-1 -3.88 0.18 0 -FEP_18636-1-18635-1 7.26 0.28 0 -FEP_18629-1-17124-1 1.71 0.35 0 -FEP_18629-1-18625-1 -3.18 0.34 0 -FEP_18637-1-18633-1 24.29 0.62 1 -FEP_18658-1-18637-1 -11.73 0.34 0 -FEP_18638-1-18636-1 16.18 0.47 0 -FEP_18660-1-18637-1 34.88 0.88 0 -FEP_18629-1-18626-1 2.82 0.18 0 -FEP_18639-1-18631-1 -11.74 0.26 0 -FEP_18638-1-18637-1 2.69 0.36 0 -FEP_18631-1-18629-1 2.66 0.38 0 -FEP_18635-1-18633-1 4.06 0.37 0 -FEP_18639-1-18637-1 -31.60 0.16 0 -FEP_18633-1-18625-1 -6.10 0.26 0 -FEP_18658-1-18635-1 9.64 0.35 0 -FEP_18635-1-18624-1 3.77 0.42 0 -FEP_18633-1-18632-1 0.44 0.25 0 -FEP_18659-1-18633-1 8.13 0.66 0 -FEP_18660-1-18632-1 63.23 0.76 2 -FEP_18636-1-18630-1 9.28 0.31 0 -FEP_18638-1-18630-1 24.81 0.52 1 -FEP_18627-1-18624-1 1.15 0.22 0 -FEP_18660-1-18624-1 59.09 1.01 8 -FEP_18636-1-18629-1 8.92 0.21 0 -FEP_18658-1-18638-1 -14.90 0.29 0 -FEP_18633-1-18624-1 0.24 0.27 0 -FEP_18638-1-18631-1 22.87 0.41 0 -FEP_18636-1-18624-1 10.95 0.29 0 -FEP_18634-1-18628-1 4.36 0.34 0 -FEP_18639-1-18630-1 -9.78 0.63 1 -FEP_18660-1-18626-1 62.81 0.16 3 -FEP_18659-1-18638-1 -17.96 0.36 0 -FEP_18632-1-17124-1 -1.84 0.48 1 -FEP_18659-1-18625-1 3.30 0.41 0 -FEP_18635-1-18630-1 1.85 0.24 0 -FEP_18659-1-18632-1 10.40 0.76 0 -FEP_18658-1-18627-1 11.24 0.48 0 -FEP_18631-1-18624-1 4.59 0.42 0 -FEP_18639-1-18632-1 -6.14 1.13 0 -FEP_18652-1-18624-1 17.27 0.71 3 -FEP_18625-1-18624-1 6.36 0.29 0 -FEP_18659-1-18635-1 5.20 0.34 0 -FEP_18660-1-18635-1 57.92 0.86 0 -FEP_18660-1-17124-1 60.70 0.63 0 -FEP_18639-1-18625-1 -12.54 0.18 0 -FEP_18628-1-18624-1 1.94 0.20 0 -FEP_18659-1-18627-1 7.11 0.61 0 -FEP_18639-1-18629-1 -8.85 0.40 0 -FEP_18635-1-18634-1 -2.57 0.25 0 -FEP_18635-1-18627-1 2.62 0.47 0 -FEP_18637-1-18635-1 21.59 0.32 0 -FEP_18633-1-18626-1 0.54 0.23 0 -FEP_18632-1-18628-1 -3.36 0.12 0 -FEP_18652-1-18639-1 27.78 0.17 0 -FEP_18660-1-18652-1 41.62 0.27 0 -FEP_18634-1-18629-1 3.45 0.19 0 -FEP_18660-1-18631-1 55.83 0.44 0 -FEP_18628-1-17124-1 1.17 0.51 0 -FEP_18634-1-18633-1 5.44 0.65 0 -FEP_18659-1-18631-1 4.12 0.26 0 -FEP_18638-1-18626-1 28.58 0.36 0 -FEP_18635-1-17124-1 3.11 0.21 0 -FEP_18652-1-18628-1 17.62 0.86 0 -FEP_18634-1-18625-1 -0.23 0.28 0 -FEP_18633-1-18629-1 -2.22 0.21 0 -FEP_18658-1-18633-1 12.06 0.47 1 -FEP_18659-1-18637-1 -15.64 0.43 0 -FEP_18658-1-18628-1 11.41 0.31 0 -FEP_18660-1-18633-1 60.13 0.87 1 -FEP_18660-1-18625-1 54.58 0.77 0 -FEP_18636-1-18625-1 5.23 0.24 0 -FEP_18629-1-18627-1 1.38 0.17 0 -FEP_18632-1-18631-1 -6.97 0.37 0 -FEP_18639-1-17124-1 -7.02 0.16 0 -FEP_18637-1-18625-1 19.70 0.62 0 -FEP_18652-1-18630-1 17.08 1.02 2 -FEP_18660-1-18659-1 52.11 0.99 0 -FEP_18652-1-18629-1 17.68 0.56 2 -FEP_18634-1-18631-1 0.47 0.23 0 -FEP_18659-1-18624-1 8.61 0.65 0 -FEP_18632-1-18624-1 -0.95 0.20 0 -FEP_18636-1-18627-1 9.64 0.30 0 -FEP_18652-1-18625-1 14.16 0.50 0 -FEP_18637-1-18636-1 14.55 0.51 0 -FEP_18639-1-18633-1 -6.25 0.37 1 -FEP_18631-1-18628-1 3.61 0.34 0 -FEP_18652-1-18637-1 -4.71 0.25 0 -FEP_18634-1-17124-1 3.87 0.73 0 -FEP_18633-1-18631-1 -5.46 0.38 0 -FEP_18637-1-18631-1 19.74 0.34 0 -FEP_18652-1-18638-1 -7.55 0.12 0 -FEP_18658-1-18634-1 6.80 0.63 0 -FEP_18632-1-18625-1 -7.85 0.32 0 -FEP_18659-1-18652-1 -10.76 0.38 0 -FEP_18630-1-18628-1 1.45 0.61 0 -FEP_18660-1-18627-1 60.48 0.72 4 -FEP_18637-1-18626-1 26.25 0.33 0 -FEP_18634-1-18624-1 5.45 0.17 0 -FEP_18659-1-18636-1 -1.64 0.39 0 -FEP_18633-1-18628-1 -1.62 0.36 0 -FEP_18638-1-18629-1 24.01 0.93 1 -FEP_18635-1-18631-1 -1.58 0.30 0 -FEP_18629-1-18628-1 0.87 0.26 0 -FEP_18636-1-18626-1 12.35 0.21 0 -FEP_18659-1-18634-1 3.15 0.25 0 -FEP_18652-1-18633-1 20.09 0.75 1 -FEP_18658-1-18626-1 13.60 0.22 0 -FEP_18658-1-17124-1 13.19 0.24 0 -FEP_18631-1-17124-1 5.12 0.26 0 -FEP_18639-1-18636-1 -18.09 0.38 0 -FEP_18628-1-18625-1 -4.91 0.35 0 -FEP_18636-1-18634-1 5.64 0.34 0 -FEP_18638-1-18634-1 22.41 0.35 0 -FEP_18660-1-18636-1 50.74 0.92 0 -FEP_18658-1-18629-1 11.12 0.29 0 -FEP_18658-1-18625-1 7.24 0.40 0 -FEP_18635-1-18625-1 -1.88 0.27 0 -FEP_18630-1-17124-1 2.60 0.45 0 -FEP_18637-1-18624-1 24.88 0.42 1 -FEP_18633-1-18627-1 -1.47 0.31 0 -FEP_18636-1-18628-1 9.38 0.26 0 -FEP_18658-1-18630-1 10.27 0.36 0 -FEP_18659-1-18629-1 6.14 0.58 0 -FEP_18658-1-18636-1 1.97 0.40 0 -FEP_18638-1-18627-1 25.57 0.49 1 -FEP_18626-1-17124-1 -1.10 0.19 0 -FEP_18637-1-18628-1 23.35 0.53 0 -FEP_18630-1-18627-1 1.13 0.46 0 -FEP_18652-1-17124-1 19.79 0.28 0 -FEP_18627-1-18625-1 -5.19 0.33 0 -FEP_18652-1-18631-1 15.25 0.33 0 -FEP_18639-1-18628-1 -8.61 0.43 0 -FEP_18635-1-18626-1 4.27 0.18 0 -FEP_18628-1-18627-1 0.49 0.22 0 -FEP_18660-1-18658-1 48.94 0.29 0 -FEP_18660-1-18629-1 58.99 0.80 3 -FEP_18631-1-18630-1 2.38 0.21 0 -FEP_18630-1-18626-1 3.33 0.34 0 -FEP_18631-1-18627-1 4.18 0.14 0 -FEP_18639-1-18626-1 -5.42 0.36 0 -FEP_18659-1-18658-1 -4.49 0.19 0 -FEP_18638-1-18635-1 24.17 0.34 0 -FEP_18660-1-18630-1 59.03 0.72 4 -FEP_18624-1-17124-1 -0.26 0.47 0 -FEP_18637-1-18634-1 19.97 0.36 0 -FEP_18637-1-18632-1 25.93 0.29 0 -FEP_18628-1-18626-1 2.44 0.35 0 -FEP_18638-1-17124-1 26.77 0.39 0 -FEP_18637-1-17124-1 24.19 0.27 0 -FEP_18634-1-18626-1 7.00 0.28 0 -FEP_18658-1-18639-1 19.99 0.24 0 -FEP_18652-1-18636-1 9.02 0.86 0 -FEP_18638-1-18633-1 27.54 0.29 1 -FEP_18631-1-18625-1 -0.88 0.33 0 -FEP_18629-1-18624-1 1.93 0.41 0 -FEP_18635-1-18629-1 1.52 0.15 0 -FEP_18634-1-18630-1 3.03 0.39 1 -FEP_18659-1-18639-1 15.69 0.37 0 -FEP_18632-1-18626-1 -0.85 0.34 0 -FEP_18639-1-18624-1 -7.46 0.57 0 -FEP_18639-1-18627-1 -7.85 0.27 0 -FEP_18631-1-18626-1 6.05 0.25 0 -FEP_18652-1-18634-1 14.51 0.52 0 -FEP_18636-1-18633-1 11.71 0.27 0 -FEP_18630-1-18629-1 -0.12 0.29 0 -FEP_18659-1-17124-1 8.21 0.13 0 -FEP_18637-1-18630-1 21.75 0.66 2 -FEP_18627-1-18626-1 1.61 0.12 0 -FEP_18633-1-17124-1 -0.72 0.34 0 -FEP_18636-1-17124-1 10.45 0.28 0 -FEP_18626-1-18624-1 -0.89 0.21 0 -FEP_18659-1-18626-1 9.48 0.31 0 -FEP_18652-1-18626-1 21.76 0.47 0 -FEP_18652-1-18635-1 16.12 0.31 0 -FEP_18634-1-18627-1 6.06 0.29 0 -FEP_18660-1-18638-1 34.30 0.47 0 -FEP_18638-1-18628-1 25.09 0.88 1 -FEP_18660-1-18628-1 60.87 0.43 2 -FEP_18635-1-18632-1 5.24 0.22 0 -FEP_18636-1-18632-1 12.83 0.44 0 -FEP_18637-1-18627-1 24.25 0.33 0 -FEP_18639-1-18638-1 -34.36 0.14 0 -FEP_18638-1-18624-1 27.16 0.89 3 -FEP_18658-1-18652-1 -7.10 0.31 0 -FEP_18660-1-18634-1 55.66 0.37 1 -FEP_18626-1-18625-1 -7.24 0.36 0 -FEP_18639-1-18634-1 -12.08 0.44 0 -FEP_18633-1-18630-1 -2.39 0.42 0 -FEP_18659-1-18628-1 7.15 0.15 0 -FEP_18658-1-18631-1 7.29 0.25 0 -FEP_18637-1-18629-1 22.63 0.61 2 -FEP_18630-1-18625-1 -3.62 0.33 0 -FEP_18658-1-18624-1 12.81 0.58 0 -FEP_18635-1-18628-1 2.24 0.34 0 -FEP_18652-1-18632-1 21.42 0.52 1 -FEP_18659-1-18630-1 5.36 0.75 0 -FEP_18625-1-17124-1 5.60 0.21 0 -FEP_18660-1-18639-1 68.39 0.89 0 -FEP_18638-1-18632-1 28.35 0.54 1 -FEP_18630-1-18624-1 2.17 0.12 0 -FEP_18638-1-18625-1 21.30 0.53 0 -FEP_18652-1-18627-1 18.76 0.65 1 -FEP_18632-1-18630-1 -3.58 0.20 0 -FEP_18627-1-17124-1 1.01 0.33 0 -FEP_18658-1-18632-1 15.29 0.28 1 -FEP_18635-1-18633-1 4.15 0.36 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/misc/jobid-40cores-mcl1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/misc/jobid-40cores-mcl1.txt deleted file mode 100755 index 6bfffe9f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/misc/jobid-40cores-mcl1.txt +++ /dev/null @@ -1,3124 +0,0 @@ -Traceback (most recent call last): - File "submit.py", line 25, in - os.chdir(fepfiles[i]) -OSError: [Errno 20] Not a directory: 'FEP_48-39/FEP_submit.sh' -Submitted batch job 2902645 -Submitted batch job 2902646 -Submitted batch job 2902647 -Submitted batch job 2902648 -Submitted batch job 2902649 -Submitted batch job 2902650 -Submitted batch job 2902651 -Submitted batch job 2902652 -Submitted batch job 2902653 -Submitted batch job 2902654 -Submitted batch job 2902656 -Submitted batch job 2902657 -Submitted batch job 2902658 -Submitted batch job 2902659 -Submitted batch job 2902660 -Submitted batch job 2902661 -Submitted batch job 2902662 -Submitted batch job 2902663 -Submitted batch job 2902664 -Submitted batch job 2902665 -Submitted batch job 2902667 -Submitted batch job 2902668 -Submitted batch job 2902669 -Submitted batch job 2902670 -Submitted batch job 2902671 -Submitted batch job 2902672 -Submitted batch job 2902673 -Submitted batch job 2902674 -Submitted batch job 2902675 -Submitted batch job 2902676 -Submitted batch job 2902677 -Submitted batch job 2902678 -Submitted batch job 2902679 -Submitted batch job 2902680 -Submitted batch job 2902681 -Submitted batch job 2902682 -Submitted batch job 2902683 -Submitted batch job 2902684 -Submitted batch job 2902685 -Submitted batch job 2902686 -Submitted batch job 2902687 -Submitted batch job 2902688 -Submitted batch job 2902689 -Submitted batch job 2902690 -Submitted batch job 2902691 -Submitted batch job 2902692 -Submitted batch job 2902693 -Submitted batch job 2902694 -Submitted batch job 2902695 -Submitted batch job 2902696 -Submitted batch job 2902697 -Submitted batch job 2902698 -Submitted batch job 2902699 -Submitted batch job 2902700 -Submitted batch job 2902701 -Submitted batch job 2902702 -Submitted batch job 2902703 -Submitted batch job 2902704 -Submitted batch job 2902705 -Submitted batch job 2902706 -Submitted batch job 2902708 -Submitted batch job 2902709 -Submitted batch job 2902710 -Submitted batch job 2902711 -Submitted batch job 2902712 -Submitted batch job 2902713 -Submitted batch job 2902714 -Submitted batch job 2902715 -Submitted batch job 2902716 -Submitted batch job 2902717 -Submitted batch job 2902718 -Submitted batch job 2902719 -Submitted batch job 2902720 -Submitted batch job 2902721 -Submitted batch job 2902722 -Submitted batch job 2902723 -Submitted batch job 2902724 -Submitted batch job 2902725 -Submitted batch job 2902726 -Submitted batch job 2902727 -Submitted batch job 2902730 -Submitted batch job 2902731 -Submitted batch job 2902732 -Submitted batch job 2902733 -Submitted batch job 2902734 -Submitted batch job 2902735 -Submitted batch job 2902736 -Submitted batch job 2902737 -Submitted batch job 2902738 -Submitted batch job 2902739 -Submitted batch job 2902741 -Submitted batch job 2902742 -Submitted batch job 2902743 -Submitted batch job 2902744 -Submitted batch job 2902745 -Submitted batch job 2902746 -Submitted batch job 2902747 -Submitted batch job 2902748 -Submitted batch job 2902749 -Submitted batch job 2902750 -Submitted batch job 2902751 -Submitted batch job 2902752 -Submitted batch job 2902753 -Submitted batch job 2902754 -Submitted batch job 2902755 -Submitted batch job 2902756 -Submitted batch job 2902757 -Submitted batch job 2902758 -Submitted batch job 2902759 -Submitted batch job 2902760 -Submitted batch job 2902761 -Submitted batch job 2902762 -Submitted batch job 2902763 -Submitted batch job 2902764 -Submitted batch job 2902765 -Submitted batch job 2902766 -Submitted batch job 2902767 -Submitted batch job 2902768 -Submitted batch job 2902769 -Submitted batch job 2902770 -Submitted batch job 2902771 -Submitted batch job 2902772 -Submitted batch job 2902773 -Submitted batch job 2902774 -Submitted batch job 2902775 -Submitted batch job 2902776 -Submitted batch job 2902777 -Submitted batch job 2902778 -Submitted batch job 2902779 -Submitted batch job 2902780 -Submitted batch job 2902782 -Submitted batch job 2902783 -Submitted batch job 2902784 -Submitted batch job 2902785 -Submitted batch job 2902786 -Submitted batch job 2902787 -Submitted batch job 2902788 -Submitted batch job 2902789 -Submitted batch job 2902790 -Submitted batch job 2902791 -Submitted batch job 2902792 -Submitted batch job 2902793 -Submitted batch job 2902794 -Submitted batch job 2902795 -Submitted batch job 2902796 -Submitted batch job 2902797 -Submitted batch job 2902798 -Submitted batch job 2902799 -Submitted batch job 2902800 -Submitted batch job 2902801 -Submitted batch job 2902802 -Submitted batch job 2902803 -Submitted batch job 2902804 -Submitted batch job 2902805 -Submitted batch job 2902806 -Submitted batch job 2902807 -Submitted batch job 2902808 -Submitted batch job 2902809 -Submitted batch job 2902810 -Submitted batch job 2902811 -Submitted batch job 2902813 -Submitted batch job 2902814 -Submitted batch job 2902815 -Submitted batch job 2902816 -Submitted batch job 2902817 -Submitted batch job 2902818 -Submitted batch job 2902819 -Submitted batch job 2902820 -Submitted batch job 2902821 -Submitted batch job 2902822 -Submitted batch job 2902823 -Submitted batch job 2902824 -Submitted batch job 2902825 -Submitted batch job 2902826 -Submitted batch job 2902827 -Submitted batch job 2902828 -Submitted batch job 2902829 -Submitted batch job 2902830 -Submitted batch job 2902831 -Submitted batch job 2902832 -Submitted batch job 2902833 -Submitted batch job 2902834 -Submitted batch job 2902835 -Submitted batch job 2902836 -Submitted batch job 2902837 -Submitted batch job 2902838 -Submitted batch job 2902839 -Submitted batch job 2902840 -Submitted batch job 2902841 -Submitted batch job 2902842 -Submitted batch job 2902844 -Submitted batch job 2902845 -Submitted batch job 2902846 -Submitted batch job 2902847 -Submitted batch job 2902848 -Submitted batch job 2902849 -Submitted batch job 2902850 -Submitted batch job 2902851 -Submitted batch job 2902852 -Submitted batch job 2902853 -Submitted batch job 2902854 -Submitted batch job 2902855 -Submitted batch job 2902856 -Submitted batch job 2902857 -Submitted batch job 2902858 -Submitted batch job 2902859 -Submitted batch job 2902860 -Submitted batch job 2902861 -Submitted batch job 2902862 -Submitted batch job 2902863 -Submitted batch job 2902864 -Submitted batch job 2902865 -Submitted batch job 2902866 -Submitted batch job 2902867 -Submitted batch job 2902868 -Submitted batch job 2902869 -Submitted batch job 2902870 -Submitted batch job 2902871 -Submitted batch job 2902872 -Submitted batch job 2902873 -Submitted batch job 2902875 -Submitted batch job 2902876 -Submitted batch job 2902877 -Submitted batch job 2902878 -Submitted batch job 2902879 -Submitted batch job 2902880 -Submitted batch job 2902881 -Submitted batch job 2902882 -Submitted batch job 2902883 -Submitted batch job 2902884 -Submitted batch job 2902915 -Submitted batch job 2902916 -Submitted batch job 2902917 -Submitted batch job 2902918 -Submitted batch job 2902919 -Submitted batch job 2902920 -Submitted batch job 2902921 -Submitted batch job 2902922 -Submitted batch job 2902923 -Submitted batch job 2902924 -Submitted batch job 2902998 -Submitted batch job 2902999 -Submitted batch job 2903000 -Submitted batch job 2903001 -Submitted batch job 2903002 -Submitted batch job 2903003 -Submitted batch job 2903004 -Submitted batch job 2903005 -Submitted batch job 2903006 -Submitted batch job 2903007 -Submitted batch job 2903008 -Submitted batch job 2903009 -Submitted batch job 2903010 -Submitted batch job 2903011 -Submitted batch job 2903012 -Submitted batch job 2903013 -Submitted batch job 2903014 -Submitted batch job 2903015 -Submitted batch job 2903016 -Submitted batch job 2903017 -Submitted batch job 2903018 -Submitted batch job 2903019 -Submitted batch job 2903020 -Submitted batch job 2903021 -Submitted batch job 2903022 -Submitted batch job 2903023 -Submitted batch job 2903024 -Submitted batch job 2903025 -Submitted batch job 2903026 -Submitted batch job 2903027 -Submitted batch job 2903029 -Submitted batch job 2903030 -Submitted batch job 2903031 -Submitted batch job 2903032 -Submitted batch job 2903033 -Submitted batch job 2903034 -Submitted batch job 2903035 -Submitted batch job 2903036 -Submitted batch job 2903037 -Submitted batch job 2903038 -Submitted batch job 2903039 -Submitted batch job 2903040 -Submitted batch job 2903041 -Submitted batch job 2903042 -Submitted batch job 2903043 -Submitted batch job 2903044 -Submitted batch job 2903045 -Submitted batch job 2903046 -Submitted batch job 2903047 -Submitted batch job 2903048 -Submitted batch job 2903049 -Submitted batch job 2903050 -Submitted batch job 2903051 -Submitted batch job 2903052 -Submitted batch job 2903053 -Submitted batch job 2903054 -Submitted batch job 2903055 -Submitted batch job 2903056 -Submitted batch job 2903057 -Submitted batch job 2903058 -Submitted batch job 2903061 -Submitted batch job 2903062 -Submitted batch job 2903063 -Submitted batch job 2903064 -Submitted batch job 2903065 -Submitted batch job 2903066 -Submitted batch job 2903067 -Submitted batch job 2903068 -Submitted batch job 2903069 -Submitted batch job 2903070 -Submitted batch job 2903071 -Submitted batch job 2903072 -Submitted batch job 2903073 -Submitted batch job 2903074 -Submitted batch job 2903075 -Submitted batch job 2903076 -Submitted batch job 2903077 -Submitted batch job 2903078 -Submitted batch job 2903079 -Submitted batch job 2903080 -Submitted batch job 2903082 -Submitted batch job 2903083 -Submitted batch job 2903084 -Submitted batch job 2903085 -Submitted batch job 2903086 -Submitted batch job 2903087 -Submitted batch job 2903088 -Submitted batch job 2903089 -Submitted batch job 2903090 -Submitted batch job 2903091 -Submitted batch job 2903092 -Submitted batch job 2903093 -Submitted batch job 2903094 -Submitted batch job 2903095 -Submitted batch job 2903096 -Submitted batch job 2903097 -Submitted batch job 2903098 -Submitted batch job 2903099 -Submitted batch job 2903100 -Submitted batch job 2903101 -Submitted batch job 2903102 -Submitted batch job 2903103 -Submitted batch job 2903104 -Submitted batch job 2903105 -Submitted batch job 2903106 -Submitted batch job 2903107 -Submitted batch job 2903108 -Submitted batch job 2903109 -Submitted batch job 2903110 -Submitted batch job 2903111 -Submitted batch job 2903112 -Submitted batch job 2903113 -Submitted batch job 2903114 -Submitted batch job 2903115 -Submitted batch job 2903116 -Submitted batch job 2903117 -Submitted batch job 2903118 -Submitted batch job 2903119 -Submitted batch job 2903120 -Submitted batch job 2903121 -Submitted batch job 2903122 -Submitted batch job 2903123 -Submitted batch job 2903124 -Submitted batch job 2903125 -Submitted batch job 2903126 -Submitted batch job 2903127 -Submitted batch job 2903128 -Submitted batch job 2903129 -Submitted batch job 2903130 -Submitted batch job 2903131 -Submitted batch job 2903132 -Submitted batch job 2903133 -Submitted batch job 2903134 -Submitted batch job 2903135 -Submitted batch job 2903136 -Submitted batch job 2903137 -Submitted batch job 2903138 -Submitted batch job 2903139 -Submitted batch job 2903140 -Submitted batch job 2903141 -Submitted batch job 2915593 -Submitted batch job 2915594 -Submitted batch job 2915595 -Submitted batch job 2915596 -Submitted batch job 2915597 -Submitted batch job 2915598 -Submitted batch job 2915599 -Submitted batch job 2915600 -Submitted batch job 2915601 -Submitted batch job 2915602 -Submitted batch job 2915606 -Submitted batch job 2915607 -Submitted batch job 2915608 -Submitted batch job 2915609 -Submitted batch job 2915610 -Submitted batch job 2915611 -Submitted batch job 2915612 -Submitted batch job 2915613 -Submitted batch job 2915614 -Submitted batch job 2915615 -Submitted batch job 2915909 -Submitted batch job 2915910 -Submitted batch job 2915911 -Submitted batch job 2915912 -Submitted batch job 2915913 -Submitted batch job 2915914 -Submitted batch job 2915915 -Submitted batch job 2915916 -Submitted batch job 2915917 -Submitted batch job 2915918 -Submitted batch job 2916167 -Submitted batch job 2916168 -Submitted batch job 2916169 -Submitted batch job 2916170 -Submitted batch job 2916171 -Submitted batch job 2916172 -Submitted batch job 2916173 -Submitted batch job 2916174 -Submitted batch job 2916175 -Submitted batch job 2916176 -Submitted batch job 2916181 -Submitted batch job 2916182 -Submitted batch job 2916183 -Submitted batch job 2916184 -Submitted batch job 2916185 -Submitted batch job 2916186 -Submitted batch job 2916187 -Submitted batch job 2916188 -Submitted batch job 2916189 -Submitted batch job 2916190 -Submitted batch job 2916274 -Submitted batch job 2916275 -Submitted batch job 2916276 -Submitted batch job 2916277 -Submitted batch job 2916278 -Submitted batch job 2916279 -Submitted batch job 2916280 -Submitted batch job 2916281 -Submitted batch job 2916282 -Submitted batch job 2916283 -Submitted batch job 2916342 -Submitted batch job 2916343 -Submitted batch job 2916344 -Submitted batch job 2916345 -Submitted batch job 2916346 -Submitted batch job 2916347 -Submitted batch job 2916348 -Submitted batch job 2916349 -Submitted batch job 2916350 -Submitted batch job 2916351 -Submitted batch job 2916435 -Submitted batch job 2916436 -Submitted batch job 2916437 -Submitted batch job 2916438 -Submitted batch job 2916439 -Submitted batch job 2916440 -Submitted batch job 2916441 -Submitted batch job 2916442 -Submitted batch job 2916443 -Submitted batch job 2916444 -Submitted batch job 2916641 -Submitted batch job 2916642 -Submitted batch job 2916643 -Submitted batch job 2916644 -Submitted batch job 2916645 -Submitted batch job 2916646 -Submitted batch job 2916647 -Submitted batch job 2916648 -Submitted batch job 2916649 -Submitted batch job 2916650 -Submitted batch job 2916656 -Submitted batch job 2916657 -Submitted batch job 2916658 -Submitted batch job 2916659 -Submitted batch job 2916660 -Submitted batch job 2916661 -Submitted batch job 2916662 -Submitted batch job 2916663 -Submitted batch job 2916664 -Submitted batch job 2916665 -Submitted batch job 2916698 -Submitted batch job 2916699 -Submitted batch job 2916700 -Submitted batch job 2916701 -Submitted batch job 2916702 -Submitted batch job 2916703 -Submitted batch job 2916704 -Submitted batch job 2916705 -Submitted batch job 2916706 -Submitted batch job 2916707 -Submitted batch job 2916839 -Submitted batch job 2916840 -Submitted batch job 2916841 -Submitted batch job 2916842 -Submitted batch job 2916843 -Submitted batch job 2916844 -Submitted batch job 2916845 -Submitted batch job 2916846 -Submitted batch job 2916847 -Submitted batch job 2916848 -Submitted batch job 2916961 -Submitted batch job 2916962 -Submitted batch job 2916963 -Submitted batch job 2916964 -Submitted batch job 2916965 -Submitted batch job 2916966 -Submitted batch job 2916967 -Submitted batch job 2916968 -Submitted batch job 2916969 -Submitted batch job 2916970 -Submitted batch job 2916971 -Submitted batch job 2916972 -Submitted batch job 2916973 -Submitted batch job 2916974 -Submitted batch job 2916975 -Submitted batch job 2916976 -Submitted batch job 2916977 -Submitted batch job 2916978 -Submitted batch job 2916979 -Submitted batch job 2916980 -Submitted batch job 2917013 -Submitted batch job 2917014 -Submitted batch job 2917015 -Submitted batch job 2917016 -Submitted batch job 2917017 -Submitted batch job 2917018 -Submitted batch job 2917019 -Submitted batch job 2917020 -Submitted batch job 2917021 -Submitted batch job 2917022 -Submitted batch job 2917221 -Submitted batch job 2917222 -Submitted batch job 2917223 -Submitted batch job 2917224 -Submitted batch job 2917225 -Submitted batch job 2917226 -Submitted batch job 2917227 -Submitted batch job 2917228 -Submitted batch job 2917229 -Submitted batch job 2917230 -Submitted batch job 2917234 -Submitted batch job 2917235 -Submitted batch job 2917236 -Submitted batch job 2917237 -Submitted batch job 2917238 -Submitted batch job 2917239 -Submitted batch job 2917240 -Submitted batch job 2917241 -Submitted batch job 2917242 -Submitted batch job 2917243 -Submitted batch job 2917244 -Submitted batch job 2917245 -Submitted batch job 2917246 -Submitted batch job 2917247 -Submitted batch job 2917248 -Submitted batch job 2917249 -Submitted batch job 2917250 -Submitted batch job 2917251 -Submitted batch job 2917252 -Submitted batch job 2917253 -Submitted batch job 2917366 -Submitted batch job 2917367 -Submitted batch job 2917368 -Submitted batch job 2917369 -Submitted batch job 2917370 -Submitted batch job 2917371 -Submitted batch job 2917372 -Submitted batch job 2917373 -Submitted batch job 2917374 -Submitted batch job 2917375 -Submitted batch job 2917440 -Submitted batch job 2917441 -Submitted batch job 2917442 -Submitted batch job 2917443 -Submitted batch job 2917444 -Submitted batch job 2917445 -Submitted batch job 2917446 -Submitted batch job 2917447 -Submitted batch job 2917448 -Submitted batch job 2917449 -Submitted batch job 2917455 -Submitted batch job 2917456 -Submitted batch job 2917457 -Submitted batch job 2917458 -Submitted batch job 2917459 -Submitted batch job 2917460 -Submitted batch job 2917461 -Submitted batch job 2917462 -Submitted batch job 2917463 -Submitted batch job 2917464 -Submitted batch job 2917618 -Submitted batch job 2917619 -Submitted batch job 2917620 -Submitted batch job 2917621 -Submitted batch job 2917622 -Submitted batch job 2917623 -Submitted batch job 2917624 -Submitted batch job 2917625 -Submitted batch job 2917626 -Submitted batch job 2917627 -Submitted batch job 2917628 -Submitted batch job 2917629 -Submitted batch job 2917630 -Submitted batch job 2917631 -Submitted batch job 2917632 -Submitted batch job 2917633 -Submitted batch job 2917634 -Submitted batch job 2917635 -Submitted batch job 2917636 -Submitted batch job 2917637 -Submitted batch job 2917701 -Submitted batch job 2917702 -Submitted batch job 2917703 -Submitted batch job 2917704 -Submitted batch job 2917705 -Submitted batch job 2917706 -Submitted batch job 2917707 -Submitted batch job 2917708 -Submitted batch job 2917709 -Submitted batch job 2917710 -Submitted batch job 2917783 -Submitted batch job 2917784 -Submitted batch job 2917785 -Submitted batch job 2917786 -Submitted batch job 2917787 -Submitted batch job 2917788 -Submitted batch job 2917789 -Submitted batch job 2917790 -Submitted batch job 2917791 -Submitted batch job 2917792 -Submitted batch job 2917852 -Submitted batch job 2917853 -Submitted batch job 2917854 -Submitted batch job 2917855 -Submitted batch job 2917856 -Submitted batch job 2917857 -Submitted batch job 2917858 -Submitted batch job 2917859 -Submitted batch job 2917860 -Submitted batch job 2917861 -Submitted batch job 2917997 -Submitted batch job 2917998 -Submitted batch job 2917999 -Submitted batch job 2918000 -Submitted batch job 2918001 -Submitted batch job 2918002 -Submitted batch job 2918003 -Submitted batch job 2918004 -Submitted batch job 2918005 -Submitted batch job 2918006 -Submitted batch job 2918010 -Submitted batch job 2918011 -Submitted batch job 2918012 -Submitted batch job 2918013 -Submitted batch job 2918014 -Submitted batch job 2918015 -Submitted batch job 2918016 -Submitted batch job 2918017 -Submitted batch job 2918018 -Submitted batch job 2918019 -Submitted batch job 2918142 -Submitted batch job 2918143 -Submitted batch job 2918144 -Submitted batch job 2918145 -Submitted batch job 2918146 -Submitted batch job 2918147 -Submitted batch job 2918148 -Submitted batch job 2918149 -Submitted batch job 2918150 -Submitted batch job 2918151 -Submitted batch job 2918152 -Submitted batch job 2918153 -Submitted batch job 2918154 -Submitted batch job 2918155 -Submitted batch job 2918156 -Submitted batch job 2918157 -Submitted batch job 2918158 -Submitted batch job 2918159 -Submitted batch job 2918160 -Submitted batch job 2918161 -Submitted batch job 2918309 -Submitted batch job 2918310 -Submitted batch job 2918311 -Submitted batch job 2918312 -Submitted batch job 2918313 -Submitted batch job 2918314 -Submitted batch job 2918315 -Submitted batch job 2918316 -Submitted batch job 2918317 -Submitted batch job 2918318 -Submitted batch job 2918457 -Submitted batch job 2918458 -Submitted batch job 2918459 -Submitted batch job 2918460 -Submitted batch job 2918461 -Submitted batch job 2918462 -Submitted batch job 2918463 -Submitted batch job 2918464 -Submitted batch job 2918465 -Submitted batch job 2918466 -Submitted batch job 2918547 -Submitted batch job 2918548 -Submitted batch job 2918549 -Submitted batch job 2918550 -Submitted batch job 2918551 -Submitted batch job 2918552 -Submitted batch job 2918553 -Submitted batch job 2918554 -Submitted batch job 2918555 -Submitted batch job 2918556 -Submitted batch job 2918559 -Submitted batch job 2918560 -Submitted batch job 2918561 -Submitted batch job 2918562 -Submitted batch job 2918563 -Submitted batch job 2918564 -Submitted batch job 2918565 -Submitted batch job 2918566 -Submitted batch job 2918567 -Submitted batch job 2918568 -Submitted batch job 2918606 -Submitted batch job 2918607 -Submitted batch job 2918608 -Submitted batch job 2918609 -Submitted batch job 2918610 -Submitted batch job 2918611 -Submitted batch job 2918612 -Submitted batch job 2918613 -Submitted batch job 2918614 -Submitted batch job 2918615 -Submitted batch job 2918616 -Submitted batch job 2918617 -Submitted batch job 2918618 -Submitted batch job 2918619 -Submitted batch job 2918620 -Submitted batch job 2918621 -Submitted batch job 2918622 -Submitted batch job 2918623 -Submitted batch job 2918624 -Submitted batch job 2918625 -Submitted batch job 2918641 -Submitted batch job 2918642 -Submitted batch job 2918643 -Submitted batch job 2918644 -Submitted batch job 2918645 -Submitted batch job 2918646 -Submitted batch job 2918647 -Submitted batch job 2918648 -Submitted batch job 2918649 -Submitted batch job 2918650 -Submitted batch job 2918662 -Submitted batch job 2918663 -Submitted batch job 2918664 -Submitted batch job 2918665 -Submitted batch job 2918666 -Submitted batch job 2918667 -Submitted batch job 2918668 -Submitted batch job 2918669 -Submitted batch job 2918670 -Submitted batch job 2918671 -Submitted batch job 2921439 -Submitted batch job 2921440 -Submitted batch job 2921441 -Submitted batch job 2921442 -Submitted batch job 2921443 -Submitted batch job 2921444 -Submitted batch job 2921445 -Submitted batch job 2921446 -Submitted batch job 2921447 -Submitted batch job 2921448 -Submitted batch job 2921476 -Submitted batch job 2921477 -Submitted batch job 2921478 -Submitted batch job 2921479 -Submitted batch job 2921480 -Submitted batch job 2921481 -Submitted batch job 2921482 -Submitted batch job 2921483 -Submitted batch job 2921484 -Submitted batch job 2921485 -Submitted batch job 2921546 -Submitted batch job 2921547 -Submitted batch job 2921548 -Submitted batch job 2921549 -Submitted batch job 2921550 -Submitted batch job 2921551 -Submitted batch job 2921552 -Submitted batch job 2921553 -Submitted batch job 2921554 -Submitted batch job 2921555 -Submitted batch job 2922112 -Submitted batch job 2922113 -Submitted batch job 2922114 -Submitted batch job 2922115 -Submitted batch job 2922116 -Submitted batch job 2922117 -Submitted batch job 2922118 -Submitted batch job 2922119 -Submitted batch job 2922120 -Submitted batch job 2922121 -Submitted batch job 2922146 -Submitted batch job 2922147 -Submitted batch job 2922148 -Submitted batch job 2922149 -Submitted batch job 2922150 -Submitted batch job 2922151 -Submitted batch job 2922152 -Submitted batch job 2922153 -Submitted batch job 2922154 -Submitted batch job 2922155 -Submitted batch job 2922338 -Submitted batch job 2922339 -Submitted batch job 2922340 -Submitted batch job 2922341 -Submitted batch job 2922342 -Submitted batch job 2922343 -Submitted batch job 2922344 -Submitted batch job 2922345 -Submitted batch job 2922346 -Submitted batch job 2922347 -Submitted batch job 2922461 -Submitted batch job 2922462 -Submitted batch job 2922463 -Submitted batch job 2922464 -Submitted batch job 2922465 -Submitted batch job 2922466 -Submitted batch job 2922467 -Submitted batch job 2922468 -Submitted batch job 2922469 -Submitted batch job 2922470 -Submitted batch job 2922472 -Submitted batch job 2922473 -Submitted batch job 2922474 -Submitted batch job 2922475 -Submitted batch job 2922476 -Submitted batch job 2922477 -Submitted batch job 2922478 -Submitted batch job 2922479 -Submitted batch job 2922480 -Submitted batch job 2922481 -Submitted batch job 2922513 -Submitted batch job 2922514 -Submitted batch job 2922515 -Submitted batch job 2922516 -Submitted batch job 2922517 -Submitted batch job 2922518 -Submitted batch job 2922519 -Submitted batch job 2922520 -Submitted batch job 2922521 -Submitted batch job 2922522 -Submitted batch job 2922547 -Submitted batch job 2922548 -Submitted batch job 2922549 -Submitted batch job 2922550 -Submitted batch job 2922551 -Submitted batch job 2922552 -Submitted batch job 2922553 -Submitted batch job 2922554 -Submitted batch job 2922555 -Submitted batch job 2922556 -Submitted batch job 2922595 -Submitted batch job 2922596 -Submitted batch job 2922597 -Submitted batch job 2922598 -Submitted batch job 2922599 -Submitted batch job 2922600 -Submitted batch job 2922601 -Submitted batch job 2922602 -Submitted batch job 2922603 -Submitted batch job 2922604 -Submitted batch job 2922614 -Submitted batch job 2922615 -Submitted batch job 2922616 -Submitted batch job 2922617 -Submitted batch job 2922618 -Submitted batch job 2922619 -Submitted batch job 2922620 -Submitted batch job 2922621 -Submitted batch job 2922622 -Submitted batch job 2922623 -Submitted batch job 2922699 -Submitted batch job 2922700 -Submitted batch job 2922701 -Submitted batch job 2922702 -Submitted batch job 2922703 -Submitted batch job 2922704 -Submitted batch job 2922705 -Submitted batch job 2922706 -Submitted batch job 2922707 -Submitted batch job 2922708 -Submitted batch job 2922719 -Submitted batch job 2922720 -Submitted batch job 2922721 -Submitted batch job 2922722 -Submitted batch job 2922723 -Submitted batch job 2922724 -Submitted batch job 2922725 -Submitted batch job 2922726 -Submitted batch job 2922727 -Submitted batch job 2922728 -Submitted batch job 2922759 -Submitted batch job 2922760 -Submitted batch job 2922761 -Submitted batch job 2922762 -Submitted batch job 2922763 -Submitted batch job 2922764 -Submitted batch job 2922765 -Submitted batch job 2922766 -Submitted batch job 2922767 -Submitted batch job 2922768 -Submitted batch job 2922811 -Submitted batch job 2922812 -Submitted batch job 2922813 -Submitted batch job 2922814 -Submitted batch job 2922815 -Submitted batch job 2922816 -Submitted batch job 2922817 -Submitted batch job 2922818 -Submitted batch job 2922819 -Submitted batch job 2922820 -Submitted batch job 2922841 -Submitted batch job 2922842 -Submitted batch job 2922843 -Submitted batch job 2922844 -Submitted batch job 2922845 -Submitted batch job 2922846 -Submitted batch job 2922847 -Submitted batch job 2922848 -Submitted batch job 2922849 -Submitted batch job 2922850 -Submitted batch job 2922851 -Submitted batch job 2922852 -Submitted batch job 2922853 -Submitted batch job 2922854 -Submitted batch job 2922855 -Submitted batch job 2922856 -Submitted batch job 2922857 -Submitted batch job 2922858 -Submitted batch job 2922859 -Submitted batch job 2922860 -Submitted batch job 2922878 -Submitted batch job 2922879 -Submitted batch job 2922880 -Submitted batch job 2922881 -Submitted batch job 2922882 -Submitted batch job 2922883 -Submitted batch job 2922884 -Submitted batch job 2922885 -Submitted batch job 2922886 -Submitted batch job 2922887 -Submitted batch job 2922889 -Submitted batch job 2922890 -Submitted batch job 2922891 -Submitted batch job 2922892 -Submitted batch job 2922893 -Submitted batch job 2922894 -Submitted batch job 2922895 -Submitted batch job 2922896 -Submitted batch job 2922897 -Submitted batch job 2922898 -Submitted batch job 2922953 -Submitted batch job 2922954 -Submitted batch job 2922955 -Submitted batch job 2922956 -Submitted batch job 2922957 -Submitted batch job 2922958 -Submitted batch job 2922959 -Submitted batch job 2922960 -Submitted batch job 2922961 -Submitted batch job 2922962 -Submitted batch job 2922983 -Submitted batch job 2922984 -Submitted batch job 2922985 -Submitted batch job 2922986 -Submitted batch job 2922987 -Submitted batch job 2922988 -Submitted batch job 2922989 -Submitted batch job 2922990 -Submitted batch job 2922991 -Submitted batch job 2922992 -Submitted batch job 2923027 -Submitted batch job 2923028 -Submitted batch job 2923029 -Submitted batch job 2923030 -Submitted batch job 2923031 -Submitted batch job 2923032 -Submitted batch job 2923033 -Submitted batch job 2923034 -Submitted batch job 2923035 -Submitted batch job 2923036 -Submitted batch job 2923039 -Submitted batch job 2923040 -Submitted batch job 2923041 -Submitted batch job 2923042 -Submitted batch job 2923043 -Submitted batch job 2923044 -Submitted batch job 2923045 -Submitted batch job 2923046 -Submitted batch job 2923047 -Submitted batch job 2923048 -Submitted batch job 2923049 -Submitted batch job 2923050 -Submitted batch job 2923051 -Submitted batch job 2923052 -Submitted batch job 2923053 -Submitted batch job 2923054 -Submitted batch job 2923055 -Submitted batch job 2923056 -Submitted batch job 2923057 -Submitted batch job 2923058 -Submitted batch job 2923059 -Submitted batch job 2923060 -Submitted batch job 2923061 -Submitted batch job 2923062 -Submitted batch job 2923063 -Submitted batch job 2923064 -Submitted batch job 2923065 -Submitted batch job 2923066 -Submitted batch job 2923067 -Submitted batch job 2923068 -Submitted batch job 2923070 -Submitted batch job 2923071 -Submitted batch job 2923072 -Submitted batch job 2923073 -Submitted batch job 2923074 -Submitted batch job 2923075 -Submitted batch job 2923076 -Submitted batch job 2923077 -Submitted batch job 2923078 -Submitted batch job 2923079 -Submitted batch job 2923091 -Submitted batch job 2923092 -Submitted batch job 2923093 -Submitted batch job 2923094 -Submitted batch job 2923095 -Submitted batch job 2923096 -Submitted batch job 2923097 -Submitted batch job 2923098 -Submitted batch job 2923099 -Submitted batch job 2923100 -Submitted batch job 2923142 -Submitted batch job 2923143 -Submitted batch job 2923144 -Submitted batch job 2923145 -Submitted batch job 2923146 -Submitted batch job 2923147 -Submitted batch job 2923148 -Submitted batch job 2923149 -Submitted batch job 2923150 -Submitted batch job 2923151 -Submitted batch job 2923152 -Submitted batch job 2923153 -Submitted batch job 2923154 -Submitted batch job 2923155 -Submitted batch job 2923156 -Submitted batch job 2923157 -Submitted batch job 2923158 -Submitted batch job 2923159 -Submitted batch job 2923160 -Submitted batch job 2923161 -Submitted batch job 2923163 -Submitted batch job 2923164 -Submitted batch job 2923165 -Submitted batch job 2923166 -Submitted batch job 2923167 -Submitted batch job 2923168 -Submitted batch job 2923169 -Submitted batch job 2923170 -Submitted batch job 2923171 -Submitted batch job 2923172 -Submitted batch job 2923185 -Submitted batch job 2923186 -Submitted batch job 2923187 -Submitted batch job 2923188 -Submitted batch job 2923189 -Submitted batch job 2923190 -Submitted batch job 2923191 -Submitted batch job 2923192 -Submitted batch job 2923193 -Submitted batch job 2923194 -Submitted batch job 2923196 -Submitted batch job 2923197 -Submitted batch job 2923198 -Submitted batch job 2923199 -Submitted batch job 2923200 -Submitted batch job 2923201 -Submitted batch job 2923202 -Submitted batch job 2923203 -Submitted batch job 2923204 -Submitted batch job 2923205 -Submitted batch job 2923216 -Submitted batch job 2923217 -Submitted batch job 2923218 -Submitted batch job 2923219 -Submitted batch job 2923220 -Submitted batch job 2923221 -Submitted batch job 2923222 -Submitted batch job 2923223 -Submitted batch job 2923224 -Submitted batch job 2923225 -Submitted batch job 2923226 -Submitted batch job 2923227 -Submitted batch job 2923228 -Submitted batch job 2923229 -Submitted batch job 2923230 -Submitted batch job 2923231 -Submitted batch job 2923232 -Submitted batch job 2923233 -Submitted batch job 2923234 -Submitted batch job 2923235 -Submitted batch job 2923246 -Submitted batch job 2923247 -Submitted batch job 2923248 -Submitted batch job 2923249 -Submitted batch job 2923250 -Submitted batch job 2923251 -Submitted batch job 2923252 -Submitted batch job 2923253 -Submitted batch job 2923254 -Submitted batch job 2923255 -Submitted batch job 2923256 -Submitted batch job 2923257 -Submitted batch job 2923258 -Submitted batch job 2923259 -Submitted batch job 2923260 -Submitted batch job 2923261 -Submitted batch job 2923262 -Submitted batch job 2923263 -Submitted batch job 2923264 -Submitted batch job 2923265 -Submitted batch job 2923266 -Submitted batch job 2923267 -Submitted batch job 2923268 -Submitted batch job 2923269 -Submitted batch job 2923270 -Submitted batch job 2923271 -Submitted batch job 2923272 -Submitted batch job 2923273 -Submitted batch job 2923274 -Submitted batch job 2923275 -Submitted batch job 2923494 -Submitted batch job 2923495 -Submitted batch job 2923496 -Submitted batch job 2923497 -Submitted batch job 2923498 -Submitted batch job 2923499 -Submitted batch job 2923500 -Submitted batch job 2923501 -Submitted batch job 2923502 -Submitted batch job 2923503 -Submitted batch job 2923545 -Submitted batch job 2923546 -Submitted batch job 2923547 -Submitted batch job 2923548 -Submitted batch job 2923549 -Submitted batch job 2923550 -Submitted batch job 2923551 -Submitted batch job 2923552 -Submitted batch job 2923553 -Submitted batch job 2923554 -Submitted batch job 2923577 -Submitted batch job 2923578 -Submitted batch job 2923579 -Submitted batch job 2923580 -Submitted batch job 2923581 -Submitted batch job 2923582 -Submitted batch job 2923583 -Submitted batch job 2923584 -Submitted batch job 2923585 -Submitted batch job 2923586 -Submitted batch job 2923594 -Submitted batch job 2923595 -Submitted batch job 2923596 -Submitted batch job 2923597 -Submitted batch job 2923598 -Submitted batch job 2923599 -Submitted batch job 2923600 -Submitted batch job 2923601 -Submitted batch job 2923602 -Submitted batch job 2923603 -Submitted batch job 2923613 -Submitted batch job 2923614 -Submitted batch job 2923615 -Submitted batch job 2923616 -Submitted batch job 2923617 -Submitted batch job 2923618 -Submitted batch job 2923619 -Submitted batch job 2923620 -Submitted batch job 2923621 -Submitted batch job 2923622 -Submitted batch job 2923639 -Submitted batch job 2923640 -Submitted batch job 2923641 -Submitted batch job 2923642 -Submitted batch job 2923643 -Submitted batch job 2923644 -Submitted batch job 2923645 -Submitted batch job 2923646 -Submitted batch job 2923647 -Submitted batch job 2923648 -Submitted batch job 2923678 -Submitted batch job 2923679 -Submitted batch job 2923680 -Submitted batch job 2923681 -Submitted batch job 2923682 -Submitted batch job 2923683 -Submitted batch job 2923684 -Submitted batch job 2923685 -Submitted batch job 2923686 -Submitted batch job 2923687 -Submitted batch job 2923757 -Submitted batch job 2923758 -Submitted batch job 2923759 -Submitted batch job 2923760 -Submitted batch job 2923761 -Submitted batch job 2923762 -Submitted batch job 2923763 -Submitted batch job 2923764 -Submitted batch job 2923765 -Submitted batch job 2923766 -Submitted batch job 2923827 -Submitted batch job 2923828 -Submitted batch job 2923829 -Submitted batch job 2923830 -Submitted batch job 2923831 -Submitted batch job 2923832 -Submitted batch job 2923833 -Submitted batch job 2923834 -Submitted batch job 2923835 -Submitted batch job 2923836 -Submitted batch job 2923869 -Submitted batch job 2923870 -Submitted batch job 2923871 -Submitted batch job 2923872 -Submitted batch job 2923873 -Submitted batch job 2923874 -Submitted batch job 2923875 -Submitted batch job 2923876 -Submitted batch job 2923877 -Submitted batch job 2923878 -Submitted batch job 2923913 -Submitted batch job 2923914 -Submitted batch job 2923915 -Submitted batch job 2923916 -Submitted batch job 2923917 -Submitted batch job 2923918 -Submitted batch job 2923919 -Submitted batch job 2923920 -Submitted batch job 2923921 -Submitted batch job 2923922 -Submitted batch job 2923923 -Submitted batch job 2923924 -Submitted batch job 2923925 -Submitted batch job 2923926 -Submitted batch job 2923927 -Submitted batch job 2923928 -Submitted batch job 2923929 -Submitted batch job 2923930 -Submitted batch job 2923931 -Submitted batch job 2923932 -Submitted batch job 2924005 -Submitted batch job 2924006 -Submitted batch job 2924007 -Submitted batch job 2924008 -Submitted batch job 2924009 -Submitted batch job 2924010 -Submitted batch job 2924011 -Submitted batch job 2924012 -Submitted batch job 2924013 -Submitted batch job 2924014 -Submitted batch job 2924236 -Submitted batch job 2924237 -Submitted batch job 2924238 -Submitted batch job 2924239 -Submitted batch job 2924240 -Submitted batch job 2924241 -Submitted batch job 2924242 -Submitted batch job 2924243 -Submitted batch job 2924244 -Submitted batch job 2924245 -Submitted batch job 2924520 -Submitted batch job 2924521 -Submitted batch job 2924522 -Submitted batch job 2924523 -Submitted batch job 2924524 -Submitted batch job 2924525 -Submitted batch job 2924526 -Submitted batch job 2924527 -Submitted batch job 2924528 -Submitted batch job 2924529 -Submitted batch job 2924548 -Submitted batch job 2924549 -Submitted batch job 2924550 -Submitted batch job 2924551 -Submitted batch job 2924552 -Submitted batch job 2924553 -Submitted batch job 2924554 -Submitted batch job 2924555 -Submitted batch job 2924556 -Submitted batch job 2924557 -Submitted batch job 2924586 -Submitted batch job 2924587 -Submitted batch job 2924588 -Submitted batch job 2924589 -Submitted batch job 2924590 -Submitted batch job 2924591 -Submitted batch job 2924592 -Submitted batch job 2924593 -Submitted batch job 2924594 -Submitted batch job 2924595 -Submitted batch job 2924605 -Submitted batch job 2924606 -Submitted batch job 2924607 -Submitted batch job 2924608 -Submitted batch job 2924609 -Submitted batch job 2924610 -Submitted batch job 2924611 -Submitted batch job 2924612 -Submitted batch job 2924613 -Submitted batch job 2924614 -Submitted batch job 2924615 -Submitted batch job 2924616 -Submitted batch job 2924617 -Submitted batch job 2924618 -Submitted batch job 2924619 -Submitted batch job 2924620 -Submitted batch job 2924621 -Submitted batch job 2924622 -Submitted batch job 2924623 -Submitted batch job 2924624 -Submitted batch job 2924635 -Submitted batch job 2924636 -Submitted batch job 2924637 -Submitted batch job 2924638 -Submitted batch job 2924639 -Submitted batch job 2924640 -Submitted batch job 2924641 -Submitted batch job 2924642 -Submitted batch job 2924643 -Submitted batch job 2924644 -Submitted batch job 2924655 -Submitted batch job 2924656 -Submitted batch job 2924657 -Submitted batch job 2924658 -Submitted batch job 2924659 -Submitted batch job 2924660 -Submitted batch job 2924661 -Submitted batch job 2924662 -Submitted batch job 2924663 -Submitted batch job 2924664 -Submitted batch job 2924676 -Submitted batch job 2924677 -Submitted batch job 2924678 -Submitted batch job 2924679 -Submitted batch job 2924680 -Submitted batch job 2924681 -Submitted batch job 2924682 -Submitted batch job 2924683 -Submitted batch job 2924684 -Submitted batch job 2924685 -Submitted batch job 2925226 -Submitted batch job 2925227 -Submitted batch job 2925228 -Submitted batch job 2925229 -Submitted batch job 2925230 -Submitted batch job 2925231 -Submitted batch job 2925232 -Submitted batch job 2925233 -Submitted batch job 2925234 -Submitted batch job 2925235 -Submitted batch job 2925412 -Submitted batch job 2925413 -Submitted batch job 2925414 -Submitted batch job 2925415 -Submitted batch job 2925416 -Submitted batch job 2925417 -Submitted batch job 2925418 -Submitted batch job 2925419 -Submitted batch job 2925420 -Submitted batch job 2925421 -Submitted batch job 2925483 -Submitted batch job 2925484 -Submitted batch job 2925485 -Submitted batch job 2925486 -Submitted batch job 2925487 -Submitted batch job 2925488 -Submitted batch job 2925489 -Submitted batch job 2925490 -Submitted batch job 2925491 -Submitted batch job 2925492 -Submitted batch job 2925504 -Submitted batch job 2925505 -Submitted batch job 2925506 -Submitted batch job 2925507 -Submitted batch job 2925508 -Submitted batch job 2925509 -Submitted batch job 2925510 -Submitted batch job 2925511 -Submitted batch job 2925512 -Submitted batch job 2925513 -Submitted batch job 2925644 -Submitted batch job 2925645 -Submitted batch job 2925646 -Submitted batch job 2925647 -Submitted batch job 2925648 -Submitted batch job 2925649 -Submitted batch job 2925650 -Submitted batch job 2925651 -Submitted batch job 2925652 -Submitted batch job 2925653 -Submitted batch job 2925799 -Submitted batch job 2925800 -Submitted batch job 2925801 -Submitted batch job 2925802 -Submitted batch job 2925803 -Submitted batch job 2925804 -Submitted batch job 2925805 -Submitted batch job 2925806 -Submitted batch job 2925807 -Submitted batch job 2925808 -Submitted batch job 2925912 -Submitted batch job 2925913 -Submitted batch job 2925914 -Submitted batch job 2925915 -Submitted batch job 2925916 -Submitted batch job 2925917 -Submitted batch job 2925918 -Submitted batch job 2925919 -Submitted batch job 2925920 -Submitted batch job 2925921 -Submitted batch job 2925923 -Submitted batch job 2925924 -Submitted batch job 2925925 -Submitted batch job 2925926 -Submitted batch job 2925927 -Submitted batch job 2925928 -Submitted batch job 2925929 -Submitted batch job 2925930 -Submitted batch job 2925931 -Submitted batch job 2925932 -Submitted batch job 2925963 -Submitted batch job 2925964 -Submitted batch job 2925965 -Submitted batch job 2925966 -Submitted batch job 2925967 -Submitted batch job 2925968 -Submitted batch job 2925969 -Submitted batch job 2925970 -Submitted batch job 2925971 -Submitted batch job 2925972 -Submitted batch job 2926022 -Submitted batch job 2926023 -Submitted batch job 2926024 -Submitted batch job 2926025 -Submitted batch job 2926026 -Submitted batch job 2926027 -Submitted batch job 2926028 -Submitted batch job 2926029 -Submitted batch job 2926030 -Submitted batch job 2926031 -Submitted batch job 2926033 -Submitted batch job 2926034 -Submitted batch job 2926035 -Submitted batch job 2926036 -Submitted batch job 2926037 -Submitted batch job 2926038 -Submitted batch job 2926039 -Submitted batch job 2926040 -Submitted batch job 2926041 -Submitted batch job 2926042 -Submitted batch job 2926062 -Submitted batch job 2926063 -Submitted batch job 2926064 -Submitted batch job 2926065 -Submitted batch job 2926066 -Submitted batch job 2926067 -Submitted batch job 2926068 -Submitted batch job 2926069 -Submitted batch job 2926070 -Submitted batch job 2926071 -Submitted batch job 2926104 -Submitted batch job 2926105 -Submitted batch job 2926106 -Submitted batch job 2926107 -Submitted batch job 2926108 -Submitted batch job 2926109 -Submitted batch job 2926110 -Submitted batch job 2926111 -Submitted batch job 2926112 -Submitted batch job 2926113 -Submitted batch job 2926115 -Submitted batch job 2926116 -Submitted batch job 2926117 -Submitted batch job 2926118 -Submitted batch job 2926119 -Submitted batch job 2926120 -Submitted batch job 2926121 -Submitted batch job 2926122 -Submitted batch job 2926123 -Submitted batch job 2926124 -Submitted batch job 2926127 -Submitted batch job 2926128 -Submitted batch job 2926129 -Submitted batch job 2926130 -Submitted batch job 2926131 -Submitted batch job 2926132 -Submitted batch job 2926133 -Submitted batch job 2926134 -Submitted batch job 2926135 -Submitted batch job 2926136 -Submitted batch job 2926163 -Submitted batch job 2926164 -Submitted batch job 2926165 -Submitted batch job 2926166 -Submitted batch job 2926167 -Submitted batch job 2926168 -Submitted batch job 2926169 -Submitted batch job 2926170 -Submitted batch job 2926171 -Submitted batch job 2926172 -Submitted batch job 2926269 -Submitted batch job 2926270 -Submitted batch job 2926271 -Submitted batch job 2926272 -Submitted batch job 2926273 -Submitted batch job 2926274 -Submitted batch job 2926275 -Submitted batch job 2926276 -Submitted batch job 2926277 -Submitted batch job 2926278 -Submitted batch job 2926279 -Submitted batch job 2926280 -Submitted batch job 2926281 -Submitted batch job 2926282 -Submitted batch job 2926283 -Submitted batch job 2926284 -Submitted batch job 2926285 -Submitted batch job 2926286 -Submitted batch job 2926287 -Submitted batch job 2926288 -Submitted batch job 2926290 -Submitted batch job 2926291 -Submitted batch job 2926292 -Submitted batch job 2926293 -Submitted batch job 2926294 -Submitted batch job 2926295 -Submitted batch job 2926296 -Submitted batch job 2926297 -Submitted batch job 2926298 -Submitted batch job 2926299 -Submitted batch job 2926434 -Submitted batch job 2926435 -Submitted batch job 2926436 -Submitted batch job 2926437 -Submitted batch job 2926438 -Submitted batch job 2926439 -Submitted batch job 2926440 -Submitted batch job 2926441 -Submitted batch job 2926442 -Submitted batch job 2926443 -Submitted batch job 2926574 -Submitted batch job 2926575 -Submitted batch job 2926576 -Submitted batch job 2926577 -Submitted batch job 2926578 -Submitted batch job 2926579 -Submitted batch job 2926580 -Submitted batch job 2926581 -Submitted batch job 2926582 -Submitted batch job 2926583 -Submitted batch job 2926584 -Submitted batch job 2926585 -Submitted batch job 2926586 -Submitted batch job 2926587 -Submitted batch job 2926588 -Submitted batch job 2926589 -Submitted batch job 2926590 -Submitted batch job 2926591 -Submitted batch job 2926592 -Submitted batch job 2926593 -Submitted batch job 2926601 -Submitted batch job 2926602 -Submitted batch job 2926603 -Submitted batch job 2926604 -Submitted batch job 2926605 -Submitted batch job 2926606 -Submitted batch job 2926607 -Submitted batch job 2926608 -Submitted batch job 2926609 -Submitted batch job 2926610 -Submitted batch job 2926659 -Submitted batch job 2926660 -Submitted batch job 2926661 -Submitted batch job 2926662 -Submitted batch job 2926663 -Submitted batch job 2926664 -Submitted batch job 2926665 -Submitted batch job 2926666 -Submitted batch job 2926667 -Submitted batch job 2926668 -Submitted batch job 2926703 -Submitted batch job 2926704 -Submitted batch job 2926705 -Submitted batch job 2926706 -Submitted batch job 2926707 -Submitted batch job 2926708 -Submitted batch job 2926709 -Submitted batch job 2926710 -Submitted batch job 2926711 -Submitted batch job 2926712 -Submitted batch job 2926783 -Submitted batch job 2926784 -Submitted batch job 2926785 -Submitted batch job 2926786 -Submitted batch job 2926787 -Submitted batch job 2926788 -Submitted batch job 2926789 -Submitted batch job 2926790 -Submitted batch job 2926791 -Submitted batch job 2926792 -Submitted batch job 2926919 -Submitted batch job 2926920 -Submitted batch job 2926921 -Submitted batch job 2926922 -Submitted batch job 2926923 -Submitted batch job 2926924 -Submitted batch job 2926925 -Submitted batch job 2926926 -Submitted batch job 2926927 -Submitted batch job 2926928 -Submitted batch job 2927119 -Submitted batch job 2927120 -Submitted batch job 2927121 -Submitted batch job 2927122 -Submitted batch job 2927123 -Submitted batch job 2927124 -Submitted batch job 2927125 -Submitted batch job 2927126 -Submitted batch job 2927127 -Submitted batch job 2927128 -Submitted batch job 2927327 -Submitted batch job 2927328 -Submitted batch job 2927329 -Submitted batch job 2927330 -Submitted batch job 2927331 -Submitted batch job 2927332 -Submitted batch job 2927333 -Submitted batch job 2927334 -Submitted batch job 2927335 -Submitted batch job 2927336 -Submitted batch job 2927385 -Submitted batch job 2927386 -Submitted batch job 2927387 -Submitted batch job 2927388 -Submitted batch job 2927389 -Submitted batch job 2927390 -Submitted batch job 2927391 -Submitted batch job 2927392 -Submitted batch job 2927393 -Submitted batch job 2927394 -Submitted batch job 2927459 -Submitted batch job 2927460 -Submitted batch job 2927461 -Submitted batch job 2927462 -Submitted batch job 2927463 -Submitted batch job 2927464 -Submitted batch job 2927465 -Submitted batch job 2927466 -Submitted batch job 2927467 -Submitted batch job 2927468 -Submitted batch job 2927483 -Submitted batch job 2927484 -Submitted batch job 2927485 -Submitted batch job 2927486 -Submitted batch job 2927487 -Submitted batch job 2927488 -Submitted batch job 2927489 -Submitted batch job 2927490 -Submitted batch job 2927491 -Submitted batch job 2927492 -Submitted batch job 2927493 -Submitted batch job 2927494 -Submitted batch job 2927495 -Submitted batch job 2927496 -Submitted batch job 2927497 -Submitted batch job 2927498 -Submitted batch job 2927499 -Submitted batch job 2927500 -Submitted batch job 2927501 -Submitted batch job 2927502 -Submitted batch job 2927515 -Submitted batch job 2927516 -Submitted batch job 2927517 -Submitted batch job 2927518 -Submitted batch job 2927519 -Submitted batch job 2927520 -Submitted batch job 2927521 -Submitted batch job 2927522 -Submitted batch job 2927523 -Submitted batch job 2927524 -Submitted batch job 2927538 -Submitted batch job 2927539 -Submitted batch job 2927540 -Submitted batch job 2927541 -Submitted batch job 2927542 -Submitted batch job 2927543 -Submitted batch job 2927544 -Submitted batch job 2927545 -Submitted batch job 2927546 -Submitted batch job 2927547 -Submitted batch job 2927553 -Submitted batch job 2927554 -Submitted batch job 2927555 -Submitted batch job 2927556 -Submitted batch job 2927557 -Submitted batch job 2927558 -Submitted batch job 2927559 -Submitted batch job 2927560 -Submitted batch job 2927561 -Submitted batch job 2927562 -Submitted batch job 2927584 -Submitted batch job 2927585 -Submitted batch job 2927586 -Submitted batch job 2927587 -Submitted batch job 2927588 -Submitted batch job 2927589 -Submitted batch job 2927590 -Submitted batch job 2927591 -Submitted batch job 2927592 -Submitted batch job 2927593 -Submitted batch job 2927596 -Submitted batch job 2927597 -Submitted batch job 2927598 -Submitted batch job 2927599 -Submitted batch job 2927600 -Submitted batch job 2927601 -Submitted batch job 2927602 -Submitted batch job 2927603 -Submitted batch job 2927604 -Submitted batch job 2927605 -Submitted batch job 2927669 -Submitted batch job 2927670 -Submitted batch job 2927671 -Submitted batch job 2927672 -Submitted batch job 2927673 -Submitted batch job 2927674 -Submitted batch job 2927675 -Submitted batch job 2927676 -Submitted batch job 2927677 -Submitted batch job 2927678 -Submitted batch job 2927774 -Submitted batch job 2927775 -Submitted batch job 2927776 -Submitted batch job 2927777 -Submitted batch job 2927778 -Submitted batch job 2927779 -Submitted batch job 2927780 -Submitted batch job 2927781 -Submitted batch job 2927782 -Submitted batch job 2927783 -Submitted batch job 2927784 -Submitted batch job 2927785 -Submitted batch job 2927786 -Submitted batch job 2927787 -Submitted batch job 2927788 -Submitted batch job 2927789 -Submitted batch job 2927790 -Submitted batch job 2927791 -Submitted batch job 2927792 -Submitted batch job 2927793 -Submitted batch job 2927917 -Submitted batch job 2927918 -Submitted batch job 2927919 -Submitted batch job 2927920 -Submitted batch job 2927921 -Submitted batch job 2927922 -Submitted batch job 2927923 -Submitted batch job 2927924 -Submitted batch job 2927925 -Submitted batch job 2927926 -Submitted batch job 2927930 -Submitted batch job 2927931 -Submitted batch job 2927932 -Submitted batch job 2927933 -Submitted batch job 2927934 -Submitted batch job 2927935 -Submitted batch job 2927936 -Submitted batch job 2927937 -Submitted batch job 2927938 -Submitted batch job 2927939 -Submitted batch job 2927976 -Submitted batch job 2927977 -Submitted batch job 2927978 -Submitted batch job 2927979 -Submitted batch job 2927980 -Submitted batch job 2927981 -Submitted batch job 2927982 -Submitted batch job 2927983 -Submitted batch job 2927984 -Submitted batch job 2927985 -Submitted batch job 2927987 -Submitted batch job 2927988 -Submitted batch job 2927989 -Submitted batch job 2927990 -Submitted batch job 2927991 -Submitted batch job 2927992 -Submitted batch job 2927993 -Submitted batch job 2927994 -Submitted batch job 2927995 -Submitted batch job 2927996 -Submitted batch job 2928062 -Submitted batch job 2928063 -Submitted batch job 2928064 -Submitted batch job 2928065 -Submitted batch job 2928066 -Submitted batch job 2928067 -Submitted batch job 2928068 -Submitted batch job 2928069 -Submitted batch job 2928070 -Submitted batch job 2928071 -Submitted batch job 2928072 -Submitted batch job 2928073 -Submitted batch job 2928074 -Submitted batch job 2928075 -Submitted batch job 2928076 -Submitted batch job 2928078 -Submitted batch job 2928079 -Submitted batch job 2928080 -Submitted batch job 2928081 -Submitted batch job 2928082 -Submitted batch job 2928133 -Submitted batch job 2928134 -Submitted batch job 2928135 -Submitted batch job 2928136 -Submitted batch job 2928137 -Submitted batch job 2928138 -Submitted batch job 2928140 -Submitted batch job 2928141 -Submitted batch job 2928142 -Submitted batch job 2928143 -Submitted batch job 2928150 -Submitted batch job 2928151 -Submitted batch job 2928152 -Submitted batch job 2928153 -Submitted batch job 2928154 -Submitted batch job 2928155 -Submitted batch job 2928156 -Submitted batch job 2928157 -Submitted batch job 2928158 -Submitted batch job 2928159 -Submitted batch job 2928291 -Submitted batch job 2928292 -Submitted batch job 2928293 -Submitted batch job 2928294 -Submitted batch job 2928295 -Submitted batch job 2928296 -Submitted batch job 2928297 -Submitted batch job 2928298 -Submitted batch job 2928299 -Submitted batch job 2928300 -Submitted batch job 2928301 -Submitted batch job 2928302 -Submitted batch job 2928303 -Submitted batch job 2928304 -Submitted batch job 2928305 -Submitted batch job 2928306 -Submitted batch job 2928307 -Submitted batch job 2928308 -Submitted batch job 2928309 -Submitted batch job 2928310 -Submitted batch job 2928376 -Submitted batch job 2928377 -Submitted batch job 2928378 -Submitted batch job 2928379 -Submitted batch job 2928380 -Submitted batch job 2928381 -Submitted batch job 2928382 -Submitted batch job 2928383 -Submitted batch job 2928384 -Submitted batch job 2928385 -Submitted batch job 2928388 -Submitted batch job 2928389 -Submitted batch job 2928390 -Submitted batch job 2928391 -Submitted batch job 2928392 -Submitted batch job 2928393 -Submitted batch job 2928394 -Submitted batch job 2928395 -Submitted batch job 2928396 -Submitted batch job 2928397 -Submitted batch job 2928444 -Submitted batch job 2928445 -Submitted batch job 2928446 -Submitted batch job 2928447 -Submitted batch job 2928448 -Submitted batch job 2928449 -Submitted batch job 2928450 -Submitted batch job 2928451 -Submitted batch job 2928452 -Submitted batch job 2928453 -Submitted batch job 2928494 -Submitted batch job 2928495 -Submitted batch job 2928496 -Submitted batch job 2928497 -Submitted batch job 2928498 -Submitted batch job 2928499 -Submitted batch job 2928500 -Submitted batch job 2928501 -Submitted batch job 2928503 -Submitted batch job 2928504 -Submitted batch job 2928756 -Submitted batch job 2928757 -Submitted batch job 2928758 -Submitted batch job 2928759 -Submitted batch job 2928760 -Submitted batch job 2928761 -Submitted batch job 2928762 -Submitted batch job 2928763 -Submitted batch job 2928764 -Submitted batch job 2928765 -Submitted batch job 2928854 -Submitted batch job 2928855 -Submitted batch job 2928856 -Submitted batch job 2928857 -Submitted batch job 2928858 -Submitted batch job 2928859 -Submitted batch job 2928860 -Submitted batch job 2928861 -Submitted batch job 2928862 -Submitted batch job 2928863 -Submitted batch job 2928950 -Submitted batch job 2928951 -Submitted batch job 2928952 -Submitted batch job 2928953 -Submitted batch job 2928954 -Submitted batch job 2928955 -Submitted batch job 2928956 -Submitted batch job 2928957 -Submitted batch job 2928958 -Submitted batch job 2928959 -Submitted batch job 2929221 -Submitted batch job 2929222 -Submitted batch job 2929223 -Submitted batch job 2929224 -Submitted batch job 2929225 -Submitted batch job 2929226 -Submitted batch job 2929227 -Submitted batch job 2929228 -Submitted batch job 2929229 -Submitted batch job 2929230 -Submitted batch job 2929356 -Submitted batch job 2929357 -Submitted batch job 2929358 -Submitted batch job 2929359 -Submitted batch job 2929360 -Submitted batch job 2929361 -Submitted batch job 2929362 -Submitted batch job 2929363 -Submitted batch job 2929364 -Submitted batch job 2929365 -Submitted batch job 2929371 -Submitted batch job 2929372 -Submitted batch job 2929373 -Submitted batch job 2929374 -Submitted batch job 2929375 -Submitted batch job 2929376 -Submitted batch job 2929377 -Submitted batch job 2929378 -Submitted batch job 2929379 -Submitted batch job 2929380 -Submitted batch job 2929872 -Submitted batch job 2929873 -Submitted batch job 2929874 -Submitted batch job 2929875 -Submitted batch job 2929876 -Submitted batch job 2929877 -Submitted batch job 2929878 -Submitted batch job 2929879 -Submitted batch job 2929880 -Submitted batch job 2929881 -Submitted batch job 2930218 -Submitted batch job 2930219 -Submitted batch job 2930220 -Submitted batch job 2930221 -Submitted batch job 2930222 -Submitted batch job 2930223 -Submitted batch job 2930224 -Submitted batch job 2930225 -Submitted batch job 2930226 -Submitted batch job 2930227 -Submitted batch job 2930896 -Submitted batch job 2930897 -Submitted batch job 2930898 -Submitted batch job 2930899 -Submitted batch job 2930900 -Submitted batch job 2930901 -Submitted batch job 2930902 -Submitted batch job 2930903 -Submitted batch job 2930904 -Submitted batch job 2930905 -Submitted batch job 2931499 -Submitted batch job 2931500 -Submitted batch job 2931501 -Submitted batch job 2931502 -Submitted batch job 2931503 -Submitted batch job 2931504 -Submitted batch job 2931505 -Submitted batch job 2931506 -Submitted batch job 2931507 -Submitted batch job 2931508 -Submitted batch job 2932072 -Submitted batch job 2932073 -Submitted batch job 2932074 -Submitted batch job 2932075 -Submitted batch job 2932076 -Submitted batch job 2932077 -Submitted batch job 2932078 -Submitted batch job 2932079 -Submitted batch job 2932080 -Submitted batch job 2932081 -Submitted batch job 2932336 -Submitted batch job 2932337 -Submitted batch job 2932338 -Submitted batch job 2932339 -Submitted batch job 2932340 -Submitted batch job 2932341 -Submitted batch job 2932342 -Submitted batch job 2932343 -Submitted batch job 2932344 -Submitted batch job 2932345 -Submitted batch job 2933409 -Submitted batch job 2933410 -Submitted batch job 2933411 -Submitted batch job 2933412 -Submitted batch job 2933413 -Submitted batch job 2933414 -Submitted batch job 2933415 -Submitted batch job 2933416 -Submitted batch job 2933417 -Submitted batch job 2933418 -Submitted batch job 2933433 -Submitted batch job 2933434 -Submitted batch job 2933435 -Submitted batch job 2933436 -Submitted batch job 2933437 -Submitted batch job 2933438 -Submitted batch job 2933439 -Submitted batch job 2933440 -Submitted batch job 2933441 -Submitted batch job 2933442 -Submitted batch job 2933444 -Submitted batch job 2933445 -Submitted batch job 2933446 -Submitted batch job 2933447 -Submitted batch job 2933448 -Submitted batch job 2933449 -Submitted batch job 2933450 -Submitted batch job 2933451 -Submitted batch job 2933452 -Submitted batch job 2933453 -Submitted batch job 2933460 -Submitted batch job 2933461 -Submitted batch job 2933462 -Submitted batch job 2933463 -Submitted batch job 2933464 -Submitted batch job 2933465 -Submitted batch job 2933466 -Submitted batch job 2933467 -Submitted batch job 2933468 -Submitted batch job 2933469 -Submitted batch job 2933470 -Submitted batch job 2933471 -Submitted batch job 2933472 -Submitted batch job 2933473 -Submitted batch job 2933474 -Submitted batch job 2933475 -Submitted batch job 2933476 -Submitted batch job 2933477 -Submitted batch job 2933478 -Submitted batch job 2933479 -Submitted batch job 2933480 -Submitted batch job 2933481 -Submitted batch job 2933482 -Submitted batch job 2933483 -Submitted batch job 2933484 -Submitted batch job 2933485 -Submitted batch job 2933486 -Submitted batch job 2933487 -Submitted batch job 2933488 -Submitted batch job 2933489 -Submitted batch job 2933499 -Submitted batch job 2933500 -Submitted batch job 2933501 -Submitted batch job 2933502 -Submitted batch job 2933503 -Submitted batch job 2933504 -Submitted batch job 2933505 -Submitted batch job 2933506 -Submitted batch job 2933507 -Submitted batch job 2933508 -Submitted batch job 2933509 -Submitted batch job 2933510 -Submitted batch job 2933511 -Submitted batch job 2933512 -Submitted batch job 2933513 -Submitted batch job 2933514 -Submitted batch job 2933515 -Submitted batch job 2933516 -Submitted batch job 2933517 -Submitted batch job 2933518 -Submitted batch job 2933519 -Submitted batch job 2933520 -Submitted batch job 2933521 -Submitted batch job 2933522 -Submitted batch job 2933523 -Submitted batch job 2933524 -Submitted batch job 2933525 -Submitted batch job 2933526 -Submitted batch job 2933527 -Submitted batch job 2933528 -Submitted batch job 2933643 -Submitted batch job 2933644 -Submitted batch job 2933645 -Submitted batch job 2933646 -Submitted batch job 2933647 -Submitted batch job 2933648 -Submitted batch job 2933649 -Submitted batch job 2933650 -Submitted batch job 2933651 -Submitted batch job 2933652 -Submitted batch job 2933762 -Submitted batch job 2933763 -Submitted batch job 2933764 -Submitted batch job 2933765 -Submitted batch job 2933766 -Submitted batch job 2933767 -Submitted batch job 2933768 -Submitted batch job 2933769 -Submitted batch job 2933770 -Submitted batch job 2933771 -Submitted batch job 2933772 -Submitted batch job 2933773 -Submitted batch job 2933774 -Submitted batch job 2933775 -Submitted batch job 2933776 -Submitted batch job 2933777 -Submitted batch job 2933778 -Submitted batch job 2933779 -Submitted batch job 2933780 -Submitted batch job 2933781 -Submitted batch job 2933782 -Submitted batch job 2933783 -Submitted batch job 2933784 -Submitted batch job 2933785 -Submitted batch job 2933786 -Submitted batch job 2933787 -Submitted batch job 2933788 -Submitted batch job 2933789 -Submitted batch job 2933790 -Submitted batch job 2933791 -Submitted batch job 2933792 -Submitted batch job 2933793 -Submitted batch job 2933794 -Submitted batch job 2933795 -Submitted batch job 2933796 -Submitted batch job 2933797 -Submitted batch job 2933798 -Submitted batch job 2933799 -Submitted batch job 2933800 -Submitted batch job 2933801 -Submitted batch job 2933882 -Submitted batch job 2933883 -Submitted batch job 2933884 -Submitted batch job 2933885 -Submitted batch job 2933886 -Submitted batch job 2933887 -Submitted batch job 2933888 -Submitted batch job 2933889 -Submitted batch job 2933890 -Submitted batch job 2933891 -Submitted batch job 2933892 -Submitted batch job 2933893 -Submitted batch job 2933894 -Submitted batch job 2933895 -Submitted batch job 2933896 -Submitted batch job 2933897 -Submitted batch job 2933898 -Submitted batch job 2933899 -Submitted batch job 2933900 -Submitted batch job 2933901 -Submitted batch job 2933902 -Submitted batch job 2933903 -Submitted batch job 2933904 -Submitted batch job 2933905 -Submitted batch job 2933906 -Submitted batch job 2933907 -Submitted batch job 2933908 -Submitted batch job 2933909 -Submitted batch job 2933910 -Submitted batch job 2933911 -Submitted batch job 2933913 -Submitted batch job 2933914 -Submitted batch job 2933915 -Submitted batch job 2933916 -Submitted batch job 2933917 -Submitted batch job 2933918 -Submitted batch job 2933919 -Submitted batch job 2933920 -Submitted batch job 2933921 -Submitted batch job 2933922 -Submitted batch job 2933959 -Submitted batch job 2933960 -Submitted batch job 2933961 -Submitted batch job 2933962 -Submitted batch job 2933963 -Submitted batch job 2933964 -Submitted batch job 2933965 -Submitted batch job 2933966 -Submitted batch job 2933967 -Submitted batch job 2933968 -Submitted batch job 2933979 -Submitted batch job 2933980 -Submitted batch job 2933981 -Submitted batch job 2933982 -Submitted batch job 2933983 -Submitted batch job 2933984 -Submitted batch job 2933985 -Submitted batch job 2933986 -Submitted batch job 2933987 -Submitted batch job 2933988 -Submitted batch job 2933989 -Submitted batch job 2933990 -Submitted batch job 2933991 -Submitted batch job 2933992 -Submitted batch job 2933993 -Submitted batch job 2933994 -Submitted batch job 2933995 -Submitted batch job 2933996 -Submitted batch job 2933997 -Submitted batch job 2933998 -Submitted batch job 2933999 -Submitted batch job 2934000 -Submitted batch job 2934001 -Submitted batch job 2934002 -Submitted batch job 2934003 -Submitted batch job 2934004 -Submitted batch job 2934005 -Submitted batch job 2934006 -Submitted batch job 2934007 -Submitted batch job 2934008 -Submitted batch job 2934009 -Submitted batch job 2934010 -Submitted batch job 2934011 -Submitted batch job 2934012 -Submitted batch job 2934013 -Submitted batch job 2934014 -Submitted batch job 2934015 -Submitted batch job 2934016 -Submitted batch job 2934017 -Submitted batch job 2934018 -Submitted batch job 2934030 -Submitted batch job 2934031 -Submitted batch job 2934032 -Submitted batch job 2934033 -Submitted batch job 2934034 -Submitted batch job 2934035 -Submitted batch job 2934036 -Submitted batch job 2934037 -Submitted batch job 2934038 -Submitted batch job 2934039 -Submitted batch job 2934041 -Submitted batch job 2934042 -Submitted batch job 2934043 -Submitted batch job 2934044 -Submitted batch job 2934045 -Submitted batch job 2934046 -Submitted batch job 2934047 -Submitted batch job 2934048 -Submitted batch job 2934049 -Submitted batch job 2934050 -Submitted batch job 2934116 -Submitted batch job 2934117 -Submitted batch job 2934118 -Submitted batch job 2934119 -Submitted batch job 2934120 -Submitted batch job 2934121 -Submitted batch job 2934122 -Submitted batch job 2934123 -Submitted batch job 2934124 -Submitted batch job 2934125 -Submitted batch job 2934182 -Submitted batch job 2934183 -Submitted batch job 2934184 -Submitted batch job 2934185 -Submitted batch job 2934186 -Submitted batch job 2934187 -Submitted batch job 2934188 -Submitted batch job 2934189 -Submitted batch job 2934190 -Submitted batch job 2934191 -Submitted batch job 2934200 -Submitted batch job 2934201 -Submitted batch job 2934202 -Submitted batch job 2934203 -Submitted batch job 2934204 -Submitted batch job 2934205 -Submitted batch job 2934206 -Submitted batch job 2934207 -Submitted batch job 2934208 -Submitted batch job 2934209 -Submitted batch job 2934210 -Submitted batch job 2934211 -Submitted batch job 2934212 -Submitted batch job 2934213 -Submitted batch job 2934214 -Submitted batch job 2934215 -Submitted batch job 2934216 -Submitted batch job 2934217 -Submitted batch job 2934218 -Submitted batch job 2934219 -Submitted batch job 2934281 -Submitted batch job 2934282 -Submitted batch job 2934283 -Submitted batch job 2934284 -Submitted batch job 2934285 -Submitted batch job 2934286 -Submitted batch job 2934287 -Submitted batch job 2934288 -Submitted batch job 2934289 -Submitted batch job 2934290 -Submitted batch job 2934436 -Submitted batch job 2934437 -Submitted batch job 2934438 -Submitted batch job 2934439 -Submitted batch job 2934440 -Submitted batch job 2934441 -Submitted batch job 2934442 -Submitted batch job 2934443 -Submitted batch job 2934444 -Submitted batch job 2934445 -Submitted batch job 2934568 -Submitted batch job 2934569 -Submitted batch job 2934570 -Submitted batch job 2934571 -Submitted batch job 2934572 -Submitted batch job 2934573 -Submitted batch job 2934574 -Submitted batch job 2934575 -Submitted batch job 2934576 -Submitted batch job 2934577 -Submitted batch job 2934635 -Submitted batch job 2934636 -Submitted batch job 2934637 -Submitted batch job 2934638 -Submitted batch job 2934639 -Submitted batch job 2934640 -Submitted batch job 2934641 -Submitted batch job 2934642 -Submitted batch job 2934643 -Submitted batch job 2934644 -Submitted batch job 2934828 -Submitted batch job 2934829 -Submitted batch job 2934830 -Submitted batch job 2934831 -Submitted batch job 2934832 -Submitted batch job 2934833 -Submitted batch job 2934834 -Submitted batch job 2934835 -Submitted batch job 2934836 -Submitted batch job 2934837 -Submitted batch job 2935068 -Submitted batch job 2935069 -Submitted batch job 2935070 -Submitted batch job 2935071 -Submitted batch job 2935072 -Submitted batch job 2935073 -Submitted batch job 2935074 -Submitted batch job 2935075 -Submitted batch job 2935076 -Submitted batch job 2935077 -Submitted batch job 2935176 -Submitted batch job 2935177 -Submitted batch job 2935178 -Submitted batch job 2935179 -Submitted batch job 2935180 -Submitted batch job 2935181 -Submitted batch job 2935182 -Submitted batch job 2935183 -Submitted batch job 2935184 -Submitted batch job 2935185 -Submitted batch job 2936462 -Submitted batch job 2936463 -Submitted batch job 2936464 -Submitted batch job 2936465 -Submitted batch job 2936466 -Submitted batch job 2936467 -Submitted batch job 2936468 -Submitted batch job 2936469 -Submitted batch job 2936470 -Submitted batch job 2936471 -Submitted batch job 2936661 -Submitted batch job 2936662 -Submitted batch job 2936663 -Submitted batch job 2936664 -Submitted batch job 2936665 -Submitted batch job 2936666 -Submitted batch job 2936667 -Submitted batch job 2936668 -Submitted batch job 2936669 -Submitted batch job 2936670 -Submitted batch job 2937863 -Submitted batch job 2937864 -Submitted batch job 2937865 -Submitted batch job 2937866 -Submitted batch job 2937867 -Submitted batch job 2937868 -Submitted batch job 2937869 -Submitted batch job 2937870 -Submitted batch job 2937871 -Submitted batch job 2937872 -Submitted batch job 2938020 -Submitted batch job 2938021 -Submitted batch job 2938022 -Submitted batch job 2938023 -Submitted batch job 2938024 -Submitted batch job 2938025 -Submitted batch job 2938026 -Submitted batch job 2938027 -Submitted batch job 2938028 -Submitted batch job 2938029 -Submitted batch job 2938285 -Submitted batch job 2938286 -Submitted batch job 2938287 -Submitted batch job 2938288 -Submitted batch job 2938289 -Submitted batch job 2938290 -Submitted batch job 2938291 -Submitted batch job 2938292 -Submitted batch job 2938293 -Submitted batch job 2938294 -Submitted batch job 2938545 -Submitted batch job 2938546 -Submitted batch job 2938547 -Submitted batch job 2938548 -Submitted batch job 2938549 -Submitted batch job 2938550 -Submitted batch job 2938551 -Submitted batch job 2938552 -Submitted batch job 2938553 -Submitted batch job 2938554 -Submitted batch job 2938805 -Submitted batch job 2938806 -Submitted batch job 2938807 -Submitted batch job 2938808 -Submitted batch job 2938809 -Submitted batch job 2938810 -Submitted batch job 2938811 -Submitted batch job 2938812 -Submitted batch job 2938813 -Submitted batch job 2938814 -Submitted batch job 2938816 -Submitted batch job 2938817 -Submitted batch job 2938818 -Submitted batch job 2938819 -Submitted batch job 2938820 -Submitted batch job 2938821 -Submitted batch job 2938822 -Submitted batch job 2938823 -Submitted batch job 2938824 -Submitted batch job 2938825 -Submitted batch job 2938881 -Submitted batch job 2938882 -Submitted batch job 2938883 -Submitted batch job 2938884 -Submitted batch job 2938885 -Submitted batch job 2938886 -Submitted batch job 2938887 -Submitted batch job 2938888 -Submitted batch job 2938889 -Submitted batch job 2938890 -Submitted batch job 2939021 -Submitted batch job 2939022 -Submitted batch job 2939023 -Submitted batch job 2939024 -Submitted batch job 2939025 -Submitted batch job 2939026 -Submitted batch job 2939027 -Submitted batch job 2939028 -Submitted batch job 2939029 -Submitted batch job 2939030 -Submitted batch job 2939031 -Submitted batch job 2939032 -Submitted batch job 2939033 -Submitted batch job 2939034 -Submitted batch job 2939035 -Submitted batch job 2939036 -Submitted batch job 2939037 -Submitted batch job 2939038 -Submitted batch job 2939039 -Submitted batch job 2939040 -Submitted batch job 2939041 -Submitted batch job 2939042 -Submitted batch job 2939043 -Submitted batch job 2939044 -Submitted batch job 2939045 -Submitted batch job 2939046 -Submitted batch job 2939047 -Submitted batch job 2939048 -Submitted batch job 2939049 -Submitted batch job 2939050 -Submitted batch job 2939083 -Submitted batch job 2939084 -Submitted batch job 2939085 -Submitted batch job 2939086 -Submitted batch job 2939087 -Submitted batch job 2939088 -Submitted batch job 2939089 -Submitted batch job 2939090 -Submitted batch job 2939091 -Submitted batch job 2939092 -Submitted batch job 2939093 -Submitted batch job 2939094 -Submitted batch job 2939095 -Submitted batch job 2939096 -Submitted batch job 2939097 -Submitted batch job 2939098 -Submitted batch job 2939099 -Submitted batch job 2939100 -Submitted batch job 2939101 -Submitted batch job 2939102 -Submitted batch job 2939104 -Submitted batch job 2939105 -Submitted batch job 2939106 -Submitted batch job 2939107 -Submitted batch job 2939108 -Submitted batch job 2939109 -Submitted batch job 2939110 -Submitted batch job 2939111 -Submitted batch job 2939112 -Submitted batch job 2939113 -Submitted batch job 2939329 -Submitted batch job 2939330 -Submitted batch job 2939331 -Submitted batch job 2939332 -Submitted batch job 2939333 -Submitted batch job 2939334 -Submitted batch job 2939335 -Submitted batch job 2939336 -Submitted batch job 2939337 -Submitted batch job 2939338 -Submitted batch job 2939340 -Submitted batch job 2939341 -Submitted batch job 2939342 -Submitted batch job 2939343 -Submitted batch job 2939344 -Submitted batch job 2939345 -Submitted batch job 2939346 -Submitted batch job 2939347 -Submitted batch job 2939348 -Submitted batch job 2939349 -Submitted batch job 2939351 -Submitted batch job 2939352 -Submitted batch job 2939353 -Submitted batch job 2939354 -Submitted batch job 2939355 -Submitted batch job 2939356 -Submitted batch job 2939357 -Submitted batch job 2939358 -Submitted batch job 2939359 -Submitted batch job 2939360 -Submitted batch job 2939361 -Submitted batch job 2939362 -Submitted batch job 2939363 -Submitted batch job 2939364 -Submitted batch job 2939365 -Submitted batch job 2939366 -Submitted batch job 2939367 -Submitted batch job 2939368 -Submitted batch job 2939369 -Submitted batch job 2939370 -Submitted batch job 2939371 -Submitted batch job 2939372 -Submitted batch job 2939373 -Submitted batch job 2939374 -Submitted batch job 2939375 -Submitted batch job 2939376 -Submitted batch job 2939377 -Submitted batch job 2939378 -Submitted batch job 2939379 -Submitted batch job 2939380 -Submitted batch job 2939421 -Submitted batch job 2939422 -Submitted batch job 2939423 -Submitted batch job 2939424 -Submitted batch job 2939425 -Submitted batch job 2939426 -Submitted batch job 2939427 -Submitted batch job 2939428 -Submitted batch job 2939429 -Submitted batch job 2939430 -Submitted batch job 2939527 -Submitted batch job 2939528 -Submitted batch job 2939529 -Submitted batch job 2939530 -Submitted batch job 2939531 -Submitted batch job 2939532 -Submitted batch job 2939533 -Submitted batch job 2939534 -Submitted batch job 2939535 -Submitted batch job 2939536 -Submitted batch job 2939577 -Submitted batch job 2939578 -Submitted batch job 2939579 -Submitted batch job 2939580 -Submitted batch job 2939581 -Submitted batch job 2939582 -Submitted batch job 2939583 -Submitted batch job 2939584 -Submitted batch job 2939585 -Submitted batch job 2939586 -Submitted batch job 2939611 -Submitted batch job 2939612 -Submitted batch job 2939613 -Submitted batch job 2939614 -Submitted batch job 2939615 -Submitted batch job 2939616 -Submitted batch job 2939617 -Submitted batch job 2939618 -Submitted batch job 2939619 -Submitted batch job 2939620 -Submitted batch job 2939652 -Submitted batch job 2939653 -Submitted batch job 2939654 -Submitted batch job 2939655 -Submitted batch job 2939656 -Submitted batch job 2939657 -Submitted batch job 2939658 -Submitted batch job 2939659 -Submitted batch job 2939660 -Submitted batch job 2939661 -Submitted batch job 2939687 -Submitted batch job 2939688 -Submitted batch job 2939689 -Submitted batch job 2939690 -Submitted batch job 2939691 -Submitted batch job 2939692 -Submitted batch job 2939693 -Submitted batch job 2939694 -Submitted batch job 2939695 -Submitted batch job 2939696 -Submitted batch job 2939733 -Submitted batch job 2939734 -Submitted batch job 2939735 -Submitted batch job 2939736 -Submitted batch job 2939737 -Submitted batch job 2939738 -Submitted batch job 2939739 -Submitted batch job 2939740 -Submitted batch job 2939741 -Submitted batch job 2939742 -Submitted batch job 2939763 -Submitted batch job 2939764 -Submitted batch job 2939765 -Submitted batch job 2939766 -Submitted batch job 2939767 -Submitted batch job 2939768 -Submitted batch job 2939769 -Submitted batch job 2939770 -Submitted batch job 2939771 -Submitted batch job 2939772 -Submitted batch job 2939787 -Submitted batch job 2939788 -Submitted batch job 2939789 -Submitted batch job 2939790 -Submitted batch job 2939791 -Submitted batch job 2939792 -Submitted batch job 2939793 -Submitted batch job 2939794 -Submitted batch job 2939795 -Submitted batch job 2939796 -Submitted batch job 2939818 -Submitted batch job 2939819 -Submitted batch job 2939820 -Submitted batch job 2939821 -Submitted batch job 2939822 -Submitted batch job 2939823 -Submitted batch job 2939824 -Submitted batch job 2939825 -Submitted batch job 2939826 -Submitted batch job 2939827 -Submitted batch job 2939843 -Submitted batch job 2939844 -Submitted batch job 2939845 -Submitted batch job 2939846 -Submitted batch job 2939847 -Submitted batch job 2939848 -Submitted batch job 2939849 -Submitted batch job 2939850 -Submitted batch job 2939851 -Submitted batch job 2939852 -Submitted batch job 2939855 -Submitted batch job 2939856 -Submitted batch job 2939857 -Submitted batch job 2939858 -Submitted batch job 2939859 -Submitted batch job 2939860 -Submitted batch job 2939861 -Submitted batch job 2939862 -Submitted batch job 2939863 -Submitted batch job 2939864 -Submitted batch job 2939881 -Submitted batch job 2939882 -Submitted batch job 2939883 -Submitted batch job 2939884 -Submitted batch job 2939885 -Submitted batch job 2939886 -Submitted batch job 2939887 -Submitted batch job 2939888 -Submitted batch job 2939889 -Submitted batch job 2939890 -Submitted batch job 2939905 -Submitted batch job 2939906 -Submitted batch job 2939907 -Submitted batch job 2939908 -Submitted batch job 2939909 -Submitted batch job 2939910 -Submitted batch job 2939911 -Submitted batch job 2939912 -Submitted batch job 2939913 -Submitted batch job 2939914 -Submitted batch job 2939936 -Submitted batch job 2939937 -Submitted batch job 2939938 -Submitted batch job 2939939 -Submitted batch job 2939940 -Submitted batch job 2939941 -Submitted batch job 2939942 -Submitted batch job 2939943 -Submitted batch job 2939944 -Submitted batch job 2939945 -Submitted batch job 2939946 -Submitted batch job 2939947 -Submitted batch job 2939948 -Submitted batch job 2939949 -Submitted batch job 2939950 -Submitted batch job 2939951 -Submitted batch job 2939952 -Submitted batch job 2939953 -Submitted batch job 2939954 -Submitted batch job 2939955 -Submitted batch job 2939963 -Submitted batch job 2939964 -Submitted batch job 2939965 -Submitted batch job 2939966 -Submitted batch job 2939967 -Submitted batch job 2939968 -Submitted batch job 2939969 -Submitted batch job 2939970 -Submitted batch job 2939971 -Submitted batch job 2939972 -Submitted batch job 2940001 -Submitted batch job 2940002 -Submitted batch job 2940003 -Submitted batch job 2940004 -Submitted batch job 2940005 -Submitted batch job 2940006 -Submitted batch job 2940007 -Submitted batch job 2940008 -Submitted batch job 2940009 -Submitted batch job 2940010 -Submitted batch job 2940028 -Submitted batch job 2940029 -Submitted batch job 2940030 -Submitted batch job 2940031 -Submitted batch job 2940032 -Submitted batch job 2940033 -Submitted batch job 2940034 -Submitted batch job 2940035 -Submitted batch job 2940036 -Submitted batch job 2940037 -Submitted batch job 2940095 -Submitted batch job 2940096 -Submitted batch job 2940097 -Submitted batch job 2940098 -Submitted batch job 2940099 -Submitted batch job 2940100 -Submitted batch job 2940101 -Submitted batch job 2940102 -Submitted batch job 2940103 -Submitted batch job 2940104 -Submitted batch job 2946924 -Submitted batch job 2946925 -Submitted batch job 2946926 -Submitted batch job 2946927 -Submitted batch job 2946928 -Submitted batch job 2946929 -Submitted batch job 2946930 -Submitted batch job 2946931 -Submitted batch job 2946932 -Submitted batch job 2946933 -Submitted batch job 2947302 -Submitted batch job 2947303 -Submitted batch job 2947304 -Submitted batch job 2947305 -Submitted batch job 2947306 -Submitted batch job 2947307 -Submitted batch job 2947308 -Submitted batch job 2947309 -Submitted batch job 2947310 -Submitted batch job 2947311 -Submitted batch job 2947399 -Submitted batch job 2947400 -Submitted batch job 2947401 -Submitted batch job 2947402 -Submitted batch job 2947403 -Submitted batch job 2947404 -Submitted batch job 2947405 -Submitted batch job 2947406 -Submitted batch job 2947407 -Submitted batch job 2947408 -Submitted batch job 2947419 -Submitted batch job 2947420 -Submitted batch job 2947421 -Submitted batch job 2947422 -Submitted batch job 2947423 -Submitted batch job 2947424 -Submitted batch job 2947425 -Submitted batch job 2947426 -Submitted batch job 2947427 -Submitted batch job 2947428 -Submitted batch job 2947435 -Submitted batch job 2947436 -Submitted batch job 2947437 -Submitted batch job 2947438 -Submitted batch job 2947439 -Submitted batch job 2947440 -Submitted batch job 2947441 -Submitted batch job 2947442 -Submitted batch job 2947443 -Submitted batch job 2947444 -Submitted batch job 2947445 -Submitted batch job 2947446 -Submitted batch job 2947447 -Submitted batch job 2947448 -Submitted batch job 2947449 -Submitted batch job 2947450 -Submitted batch job 2947451 -Submitted batch job 2947452 -Submitted batch job 2947453 -Submitted batch job 2947454 -Submitted batch job 2947460 -Submitted batch job 2947461 -Submitted batch job 2947462 -Submitted batch job 2947463 -Submitted batch job 2947464 -Submitted batch job 2947465 -Submitted batch job 2947466 -Submitted batch job 2947467 -Submitted batch job 2947468 -Submitted batch job 2947469 -Submitted batch job 2947470 -Submitted batch job 2947471 -Submitted batch job 2947472 -Submitted batch job 2947473 -Submitted batch job 2947474 -Submitted batch job 2947475 -Submitted batch job 2947476 -Submitted batch job 2947477 -Submitted batch job 2947478 -Submitted batch job 2947479 -Submitted batch job 2947489 -Submitted batch job 2947490 -Submitted batch job 2947491 -Submitted batch job 2947492 -Submitted batch job 2947493 -Submitted batch job 2947494 -Submitted batch job 2947495 -Submitted batch job 2947496 -Submitted batch job 2947497 -Submitted batch job 2947498 -Submitted batch job 2947499 -Submitted batch job 2947500 -Submitted batch job 2947501 -Submitted batch job 2947502 -Submitted batch job 2947503 -Submitted batch job 2947504 -Submitted batch job 2947505 -Submitted batch job 2947506 -Submitted batch job 2947507 -Submitted batch job 2947508 -Submitted batch job 2947516 -Submitted batch job 2947517 -Submitted batch job 2947518 -Submitted batch job 2947519 -Submitted batch job 2947520 -Submitted batch job 2947521 -Submitted batch job 2947522 -Submitted batch job 2947523 -Submitted batch job 2947524 -Submitted batch job 2947525 -Submitted batch job 2947526 -Submitted batch job 2947527 -Submitted batch job 2947528 -Submitted batch job 2947529 -Submitted batch job 2947530 -Submitted batch job 2947531 -Submitted batch job 2947532 -Submitted batch job 2947533 -Submitted batch job 2947534 -Submitted batch job 2947535 -Submitted batch job 2947540 -Submitted batch job 2947541 -Submitted batch job 2947542 -Submitted batch job 2947543 -Submitted batch job 2947544 -Submitted batch job 2947545 -Submitted batch job 2947546 -Submitted batch job 2947547 -Submitted batch job 2947548 -Submitted batch job 2947549 -Submitted batch job 2947550 -Submitted batch job 2947551 -Submitted batch job 2947552 -Submitted batch job 2947553 -Submitted batch job 2947554 -Submitted batch job 2947555 -Submitted batch job 2947556 -Submitted batch job 2947557 -Submitted batch job 2947558 -Submitted batch job 2947559 -Submitted batch job 2947560 -Submitted batch job 2947561 -Submitted batch job 2947562 -Submitted batch job 2947563 -Submitted batch job 2947564 -Submitted batch job 2947565 -Submitted batch job 2947566 -Submitted batch job 2947567 -Submitted batch job 2947568 -Submitted batch job 2947569 -Submitted batch job 2947575 -Submitted batch job 2947576 -Submitted batch job 2947577 -Submitted batch job 2947578 -Submitted batch job 2947579 -Submitted batch job 2947580 -Submitted batch job 2947581 -Submitted batch job 2947582 -Submitted batch job 2947583 -Submitted batch job 2947584 -Submitted batch job 2947588 -Submitted batch job 2947589 -Submitted batch job 2947590 -Submitted batch job 2947591 -Submitted batch job 2947592 -Submitted batch job 2947593 -Submitted batch job 2947594 -Submitted batch job 2947595 -Submitted batch job 2947596 -Submitted batch job 2947597 -Submitted batch job 2947598 -Submitted batch job 2947599 -Submitted batch job 2947600 -Submitted batch job 2947601 -Submitted batch job 2947602 -Submitted batch job 2947603 -Submitted batch job 2947604 -Submitted batch job 2947605 -Submitted batch job 2947606 -Submitted batch job 2947607 -Submitted batch job 2947608 -Submitted batch job 2947609 -Submitted batch job 2947610 -Submitted batch job 2947611 -Submitted batch job 2947612 -Submitted batch job 2947613 -Submitted batch job 2947614 -Submitted batch job 2947615 -Submitted batch job 2947616 -Submitted batch job 2947617 -Submitted batch job 2947625 -Submitted batch job 2947626 -Submitted batch job 2947627 -Submitted batch job 2947628 -Submitted batch job 2947629 -Submitted batch job 2947630 -Submitted batch job 2947631 -Submitted batch job 2947632 -Submitted batch job 2947633 -Submitted batch job 2947634 -Submitted batch job 2947635 -Submitted batch job 2947636 -Submitted batch job 2947637 -Submitted batch job 2947638 -Submitted batch job 2947639 -Submitted batch job 2947640 -Submitted batch job 2947641 -Submitted batch job 2947642 -Submitted batch job 2947643 -Submitted batch job 2947644 -Submitted batch job 2947660 -Submitted batch job 2947661 -Submitted batch job 2947662 -Submitted batch job 2947663 -Submitted batch job 2947664 -Submitted batch job 2947665 -Submitted batch job 2947666 -Submitted batch job 2947667 -Submitted batch job 2947668 -Submitted batch job 2947669 -Submitted batch job 2947671 -Submitted batch job 2947672 -Submitted batch job 2947673 -Submitted batch job 2947674 -Submitted batch job 2947675 -Submitted batch job 2947676 -Submitted batch job 2947677 -Submitted batch job 2947678 -Submitted batch job 2947679 -Submitted batch job 2947680 -Submitted batch job 2947684 -Submitted batch job 2947685 -Submitted batch job 2947686 -Submitted batch job 2947687 -Submitted batch job 2947688 -Submitted batch job 2947689 -Submitted batch job 2947690 -Submitted batch job 2947691 -Submitted batch job 2947692 -Submitted batch job 2947693 -Submitted batch job 2947705 -Submitted batch job 2947706 -Submitted batch job 2947707 -Submitted batch job 2947708 -Submitted batch job 2947709 -Submitted batch job 2947710 -Submitted batch job 2947711 -Submitted batch job 2947712 -Submitted batch job 2947713 -Submitted batch job 2947714 -Submitted batch job 2947757 -Submitted batch job 2947758 -Submitted batch job 2947759 -Submitted batch job 2947760 -Submitted batch job 2947761 -Submitted batch job 2947762 -Submitted batch job 2947763 -Submitted batch job 2947764 -Submitted batch job 2947765 -Submitted batch job 2947766 -Submitted batch job 2947769 -Submitted batch job 2947770 -Submitted batch job 2947771 -Submitted batch job 2947772 -Submitted batch job 2947773 -Submitted batch job 2947774 -Submitted batch job 2947775 -Submitted batch job 2947776 -Submitted batch job 2947777 -Submitted batch job 2947778 -Submitted batch job 2947780 -Submitted batch job 2947781 -Submitted batch job 2947782 -Submitted batch job 2947783 -Submitted batch job 2947784 -Submitted batch job 2947785 -Submitted batch job 2947786 -Submitted batch job 2947787 -Submitted batch job 2947788 -Submitted batch job 2947789 -Submitted batch job 2947791 -Submitted batch job 2947792 -Submitted batch job 2947793 -Submitted batch job 2947794 -Submitted batch job 2947795 -Submitted batch job 2947796 -Submitted batch job 2947797 -Submitted batch job 2947798 -Submitted batch job 2947799 -Submitted batch job 2947800 -Submitted batch job 2947820 -Submitted batch job 2947821 -Submitted batch job 2947822 -Submitted batch job 2947823 -Submitted batch job 2947824 -Submitted batch job 2947825 -Submitted batch job 2947826 -Submitted batch job 2947827 -Submitted batch job 2947828 -Submitted batch job 2947829 -Submitted batch job 2947870 -Submitted batch job 2947871 -Submitted batch job 2947872 -Submitted batch job 2947873 -Submitted batch job 2947874 -Submitted batch job 2947875 -Submitted batch job 2947876 -Submitted batch job 2947877 -Submitted batch job 2947878 -Submitted batch job 2947879 -Submitted batch job 2947881 -Submitted batch job 2947882 -Submitted batch job 2947883 -Submitted batch job 2947884 -Submitted batch job 2947885 -Submitted batch job 2947886 -Submitted batch job 2947887 -Submitted batch job 2947888 -Submitted batch job 2947889 -Submitted batch job 2947890 -Submitted batch job 2947999 -Submitted batch job 2948000 -Submitted batch job 2948001 -Submitted batch job 2948002 -Submitted batch job 2948003 -Submitted batch job 2948004 -Submitted batch job 2948005 -Submitted batch job 2948006 -Submitted batch job 2948007 -Submitted batch job 2948008 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/misc/jobid-mcl1-prot-2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/misc/jobid-mcl1-prot-2.txt deleted file mode 100755 index 4fea8d0c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/misc/jobid-mcl1-prot-2.txt +++ /dev/null @@ -1,4160 +0,0 @@ -Submitted batch job 2987294 -Submitted batch job 2987295 -Submitted batch job 2987296 -Submitted batch job 2987297 -Submitted batch job 2987298 -Submitted batch job 2987299 -Submitted batch job 2987300 -Submitted batch job 2987301 -Submitted batch job 2987302 -Submitted batch job 2987303 -Submitted batch job 2987304 -Submitted batch job 2987305 -Submitted batch job 2987306 -Submitted batch job 2987307 -Submitted batch job 2987308 -Submitted batch job 2987309 -Submitted batch job 2987310 -Submitted batch job 2987311 -Submitted batch job 2987312 -Submitted batch job 2987313 -Submitted batch job 2987314 -Submitted batch job 2987315 -Submitted batch job 2987316 -Submitted batch job 2987317 -Submitted batch job 2987318 -Submitted batch job 2987319 -Submitted batch job 2987320 -Submitted batch job 2987321 -Submitted batch job 2987322 -Submitted batch job 2987323 -Submitted batch job 2987324 -Submitted batch job 2987325 -Submitted batch job 2987326 -Submitted batch job 2987327 -Submitted batch job 2987328 -Submitted batch job 2987329 -Submitted batch job 2987330 -Submitted batch job 2987331 -Submitted batch job 2987332 -Submitted batch job 2987333 -Submitted batch job 2987334 -Submitted batch job 2987335 -Submitted batch job 2987336 -Submitted batch job 2987337 -Submitted batch job 2987338 -Submitted batch job 2987339 -Submitted batch job 2987340 -Submitted batch job 2987341 -Submitted batch job 2987342 -Submitted batch job 2987343 -Submitted batch job 2987344 -Submitted batch job 2987345 -Submitted batch job 2987346 -Submitted batch job 2987347 -Submitted batch job 2987348 -Submitted batch job 2987349 -Submitted batch job 2987350 -Submitted batch job 2987351 -Submitted batch job 2987352 -Submitted batch job 2987353 -Submitted batch job 2987354 -Submitted batch job 2987355 -Submitted batch job 2987356 -Submitted batch job 2987358 -Submitted batch job 2987359 -Submitted batch job 2987360 -Submitted batch job 2987361 -Submitted batch job 2987362 -Submitted batch job 2987363 -Submitted batch job 2987364 -Submitted batch job 2987365 -Submitted batch job 2987366 -Submitted batch job 2987367 -Submitted batch job 2987368 -Submitted batch job 2987369 -Submitted batch job 2987370 -Submitted batch job 2987371 -Submitted batch job 2987372 -Submitted batch job 2987373 -Submitted batch job 2987374 -Submitted batch job 2987375 -Submitted batch job 2987376 -Submitted batch job 2987377 -Submitted batch job 2987378 -Submitted batch job 2987379 -Submitted batch job 2987380 -Submitted batch job 2987381 -Submitted batch job 2987382 -Submitted batch job 2987383 -Submitted batch job 2987384 -Submitted batch job 2987385 -Submitted batch job 2987386 -Submitted batch job 2987387 -Submitted batch job 2987388 -Submitted batch job 2987389 -Submitted batch job 2987390 -Submitted batch job 2987391 -Submitted batch job 2987392 -Submitted batch job 2987393 -Submitted batch job 2987394 -Submitted batch job 2987395 -Submitted batch job 2987396 -Submitted batch job 2987397 -Submitted batch job 2987398 -Submitted batch job 2987399 -Submitted batch job 2987400 -Submitted batch job 2987401 -Submitted batch job 2987402 -Submitted batch job 2987403 -Submitted batch job 2987404 -Submitted batch job 2987405 -Submitted batch job 2987406 -Submitted batch job 2987407 -Submitted batch job 2987408 -Submitted batch job 2987409 -Submitted batch job 2987410 -Submitted batch job 2987411 -Submitted batch job 2987412 -Submitted batch job 2987413 -Submitted batch job 2987414 -Submitted batch job 2987415 -Submitted batch job 2987416 -Submitted batch job 2987417 -Submitted batch job 2987418 -Submitted batch job 2987419 -Submitted batch job 2987420 -Submitted batch job 2987421 -Submitted batch job 2987422 -Submitted batch job 2987423 -Submitted batch job 2987424 -Submitted batch job 2987425 -Submitted batch job 2987426 -Submitted batch job 2987427 -Submitted batch job 2987428 -Submitted batch job 2987429 -Submitted batch job 2987430 -Submitted batch job 2987431 -Submitted batch job 2987432 -Submitted batch job 2987433 -Submitted batch job 2987434 -Submitted batch job 2987435 -Submitted batch job 2987436 -Submitted batch job 2987437 -Submitted batch job 2987438 -Submitted batch job 2987439 -Submitted batch job 2987440 -Submitted batch job 2987441 -Submitted batch job 2987442 -Submitted batch job 2987443 -Submitted batch job 2987444 -Submitted batch job 2987445 -Submitted batch job 2987446 -Submitted batch job 2987447 -Submitted batch job 2987448 -Submitted batch job 2987449 -Submitted batch job 2987450 -Submitted batch job 2987451 -Submitted batch job 2987452 -Submitted batch job 2987453 -Submitted batch job 2987454 -Submitted batch job 2987455 -Submitted batch job 2987456 -Submitted batch job 2987457 -Submitted batch job 2987458 -Submitted batch job 2987459 -Submitted batch job 2987460 -Submitted batch job 2987461 -Submitted batch job 2987462 -Submitted batch job 2987463 -Submitted batch job 2987464 -Submitted batch job 2987466 -Submitted batch job 2987467 -Submitted batch job 2987468 -Submitted batch job 2987469 -Submitted batch job 2987470 -Submitted batch job 2987471 -Submitted batch job 2987472 -Submitted batch job 2987473 -Submitted batch job 2987474 -Submitted batch job 2987475 -Submitted batch job 2987476 -Submitted batch job 2987477 -Submitted batch job 2987478 -Submitted batch job 2987479 -Submitted batch job 2987480 -Submitted batch job 2987481 -Submitted batch job 2987482 -Submitted batch job 2987483 -Submitted batch job 2987484 -Submitted batch job 2987485 -Submitted batch job 2987486 -Submitted batch job 2987487 -Submitted batch job 2987488 -Submitted batch job 2987489 -Submitted batch job 2987490 -Submitted batch job 2987491 -Submitted batch job 2987492 -Submitted batch job 2987493 -Submitted batch job 2987494 -Submitted batch job 2987495 -Submitted batch job 2987496 -Submitted batch job 2987497 -Submitted batch job 2987498 -Submitted batch job 2987499 -Submitted batch job 2987500 -Submitted batch job 2987501 -Submitted batch job 2987502 -Submitted batch job 2987503 -Submitted batch job 2987504 -Submitted batch job 2987505 -Submitted batch job 2987506 -Submitted batch job 2987507 -Submitted batch job 2987508 -Submitted batch job 2987509 -Submitted batch job 2987510 -Submitted batch job 2987511 -Submitted batch job 2987512 -Submitted batch job 2987513 -Submitted batch job 2987514 -Submitted batch job 2987515 -Submitted batch job 2987516 -Submitted batch job 2987517 -Submitted batch job 2987518 -Submitted batch job 2987519 -Submitted batch job 2987520 -Submitted batch job 2987521 -Submitted batch job 2987522 -Submitted batch job 2987523 -Submitted batch job 2987524 -Submitted batch job 2987525 -Submitted batch job 2987526 -Submitted batch job 2987527 -Submitted batch job 2987528 -Submitted batch job 2987529 -Submitted batch job 2987530 -Submitted batch job 2987531 -Submitted batch job 2987532 -Submitted batch job 2987533 -Submitted batch job 2987534 -Submitted batch job 2987535 -Submitted batch job 2987536 -Submitted batch job 2987537 -Submitted batch job 2987538 -Submitted batch job 2987539 -Submitted batch job 2987540 -Submitted batch job 2987541 -Submitted batch job 2987542 -Submitted batch job 2987543 -Submitted batch job 2987544 -Submitted batch job 2987545 -Submitted batch job 2987546 -Submitted batch job 2987547 -Submitted batch job 2987548 -Submitted batch job 2987549 -Submitted batch job 2987550 -Submitted batch job 2987551 -Submitted batch job 2987552 -Submitted batch job 2987553 -Submitted batch job 2987554 -Submitted batch job 2987555 -Submitted batch job 2987556 -Submitted batch job 2987557 -Submitted batch job 2987558 -Submitted batch job 2987559 -Submitted batch job 2987560 -Submitted batch job 2987561 -Submitted batch job 2987562 -Submitted batch job 2987563 -Submitted batch job 2987564 -Submitted batch job 2987565 -Submitted batch job 2987566 -Submitted batch job 2987567 -Submitted batch job 2987568 -Submitted batch job 2987569 -Submitted batch job 2987570 -Submitted batch job 2987571 -Submitted batch job 2987572 -Submitted batch job 2987573 -Submitted batch job 2987574 -Submitted batch job 2987575 -Submitted batch job 2987576 -Submitted batch job 2987577 -Submitted batch job 2987578 -Submitted batch job 2987579 -Submitted batch job 2987580 -Submitted batch job 2987581 -Submitted batch job 2987582 -Submitted batch job 2987583 -Submitted batch job 2987584 -Submitted batch job 2987585 -Submitted batch job 2987586 -Submitted batch job 2987587 -Submitted batch job 2987588 -Submitted batch job 2987589 -Submitted batch job 2987590 -Submitted batch job 2987591 -Submitted batch job 2987592 -Submitted batch job 2987593 -Submitted batch job 2987594 -Submitted batch job 2987595 -Submitted batch job 2987596 -Submitted batch job 2987597 -Submitted batch job 2987598 -Submitted batch job 2987599 -Submitted batch job 2987600 -Submitted batch job 2987601 -Submitted batch job 2987602 -Submitted batch job 2987603 -Submitted batch job 2987604 -Submitted batch job 2987605 -Submitted batch job 2987606 -Submitted batch job 2987607 -Submitted batch job 2987608 -Submitted batch job 2987609 -Submitted batch job 2987610 -Submitted batch job 2987611 -Submitted batch job 2987612 -Submitted batch job 2987613 -Submitted batch job 2987614 -Submitted batch job 2987615 -Submitted batch job 2987616 -Submitted batch job 2987617 -Submitted batch job 2987618 -Submitted batch job 2987619 -Submitted batch job 2987620 -Submitted batch job 2987621 -Submitted batch job 2987622 -Submitted batch job 2987623 -Submitted batch job 2987624 -Submitted batch job 2987625 -Submitted batch job 2987626 -Submitted batch job 2987627 -Submitted batch job 2987628 -Submitted batch job 2987629 -Submitted batch job 2987630 -Submitted batch job 2987631 -Submitted batch job 2987632 -Submitted batch job 2987633 -Submitted batch job 2987634 -Submitted batch job 2987635 -Submitted batch job 2987636 -Submitted batch job 2987637 -Submitted batch job 2987638 -Submitted batch job 2987639 -Submitted batch job 2987640 -Submitted batch job 2987641 -Submitted batch job 2987642 -Submitted batch job 2987643 -Submitted batch job 2987644 -Submitted batch job 2987645 -Submitted batch job 2987646 -Submitted batch job 2987647 -Submitted batch job 2987648 -Submitted batch job 2987650 -Submitted batch job 2987651 -Submitted batch job 2987652 -Submitted batch job 2987653 -Submitted batch job 2987654 -Submitted batch job 2987655 -Submitted batch job 2987656 -Submitted batch job 2987657 -Submitted batch job 2987658 -Submitted batch job 2987659 -Submitted batch job 2987660 -Submitted batch job 2987661 -Submitted batch job 2987662 -Submitted batch job 2987663 -Submitted batch job 2987664 -Submitted batch job 2987665 -Submitted batch job 2987666 -Submitted batch job 2987667 -Submitted batch job 2987668 -Submitted batch job 2987669 -Submitted batch job 2987670 -Submitted batch job 2987671 -Submitted batch job 2987672 -Submitted batch job 2987673 -Submitted batch job 2987674 -Submitted batch job 2987675 -Submitted batch job 2987676 -Submitted batch job 2988169 -Submitted batch job 2988170 -Submitted batch job 2988171 -Submitted batch job 2988172 -Submitted batch job 2988173 -Submitted batch job 2988174 -Submitted batch job 2988175 -Submitted batch job 2988176 -Submitted batch job 2988177 -Submitted batch job 2988178 -Submitted batch job 2990150 -Submitted batch job 2990151 -Submitted batch job 2990152 -Submitted batch job 2990153 -Submitted batch job 2990154 -Submitted batch job 2990155 -Submitted batch job 2990156 -Submitted batch job 2990157 -Submitted batch job 2990158 -Submitted batch job 2990159 -Submitted batch job 2991480 -Submitted batch job 2991481 -Submitted batch job 2991482 -Submitted batch job 2991483 -Submitted batch job 2991484 -Submitted batch job 2991485 -Submitted batch job 2991486 -Submitted batch job 2991487 -Submitted batch job 2991488 -Submitted batch job 2991489 -Submitted batch job 2991493 -Submitted batch job 2991494 -Submitted batch job 2991495 -Submitted batch job 2991496 -Submitted batch job 2991497 -Submitted batch job 2991498 -Submitted batch job 2991499 -Submitted batch job 2991500 -Submitted batch job 2991501 -Submitted batch job 2991502 -Submitted batch job 2991956 -Submitted batch job 2991957 -Submitted batch job 2991958 -Submitted batch job 2991959 -Submitted batch job 2991960 -Submitted batch job 2991961 -Submitted batch job 2991962 -Submitted batch job 2991963 -Submitted batch job 2991964 -Submitted batch job 2991965 -Submitted batch job 2992132 -Submitted batch job 2992133 -Submitted batch job 2992134 -Submitted batch job 2992135 -Submitted batch job 2992136 -Submitted batch job 2992137 -Submitted batch job 2992138 -Submitted batch job 2992139 -Submitted batch job 2992140 -Submitted batch job 2992141 -Submitted batch job 2992143 -Submitted batch job 2992144 -Submitted batch job 2992145 -Submitted batch job 2992146 -Submitted batch job 2992147 -Submitted batch job 2992148 -Submitted batch job 2992149 -Submitted batch job 2992150 -Submitted batch job 2992151 -Submitted batch job 2992152 -Submitted batch job 2992170 -Submitted batch job 2992171 -Submitted batch job 2992172 -Submitted batch job 2992173 -Submitted batch job 2992174 -Submitted batch job 2992175 -Submitted batch job 2992176 -Submitted batch job 2992177 -Submitted batch job 2992178 -Submitted batch job 2992179 -Submitted batch job 2992203 -Submitted batch job 2992204 -Submitted batch job 2992205 -Submitted batch job 2992206 -Submitted batch job 2992207 -Submitted batch job 2992208 -Submitted batch job 2992209 -Submitted batch job 2992210 -Submitted batch job 2992211 -Submitted batch job 2992212 -Submitted batch job 2992242 -Submitted batch job 2992243 -Submitted batch job 2992244 -Submitted batch job 2992245 -Submitted batch job 2992246 -Submitted batch job 2992247 -Submitted batch job 2992248 -Submitted batch job 2992249 -Submitted batch job 2992250 -Submitted batch job 2992251 -Submitted batch job 2992259 -Submitted batch job 2992260 -Submitted batch job 2992261 -Submitted batch job 2992262 -Submitted batch job 2992263 -Submitted batch job 2992264 -Submitted batch job 2992265 -Submitted batch job 2992266 -Submitted batch job 2992267 -Submitted batch job 2992268 -Submitted batch job 2992313 -Submitted batch job 2992314 -Submitted batch job 2992315 -Submitted batch job 2992316 -Submitted batch job 2992317 -Submitted batch job 2992318 -Submitted batch job 2992319 -Submitted batch job 2992320 -Submitted batch job 2992321 -Submitted batch job 2992322 -Submitted batch job 2992323 -Submitted batch job 2992324 -Submitted batch job 2992325 -Submitted batch job 2992326 -Submitted batch job 2992327 -Submitted batch job 2992328 -Submitted batch job 2992329 -Submitted batch job 2992330 -Submitted batch job 2992331 -Submitted batch job 2992332 -Submitted batch job 2992361 -Submitted batch job 2992362 -Submitted batch job 2992363 -Submitted batch job 2992364 -Submitted batch job 2992365 -Submitted batch job 2992366 -Submitted batch job 2992367 -Submitted batch job 2992368 -Submitted batch job 2992369 -Submitted batch job 2992370 -Submitted batch job 2992409 -Submitted batch job 2992410 -Submitted batch job 2992411 -Submitted batch job 2992412 -Submitted batch job 2992413 -Submitted batch job 2992414 -Submitted batch job 2992415 -Submitted batch job 2992416 -Submitted batch job 2992417 -Submitted batch job 2992418 -Submitted batch job 2992455 -Submitted batch job 2992456 -Submitted batch job 2992457 -Submitted batch job 2992458 -Submitted batch job 2992459 -Submitted batch job 2992460 -Submitted batch job 2992461 -Submitted batch job 2992462 -Submitted batch job 2992463 -Submitted batch job 2992464 -Submitted batch job 2992699 -Submitted batch job 2992700 -Submitted batch job 2992701 -Submitted batch job 2992702 -Submitted batch job 2992703 -Submitted batch job 2992704 -Submitted batch job 2992705 -Submitted batch job 2992706 -Submitted batch job 2992707 -Submitted batch job 2992708 -Submitted batch job 2992709 -Submitted batch job 2992710 -Submitted batch job 2992711 -Submitted batch job 2992712 -Submitted batch job 2992713 -Submitted batch job 2992714 -Submitted batch job 2992715 -Submitted batch job 2992716 -Submitted batch job 2992717 -Submitted batch job 2992718 -Submitted batch job 2992720 -Submitted batch job 2992721 -Submitted batch job 2992722 -Submitted batch job 2992723 -Submitted batch job 2992724 -Submitted batch job 2992725 -Submitted batch job 2992726 -Submitted batch job 2992727 -Submitted batch job 2992728 -Submitted batch job 2992729 -Submitted batch job 2992735 -Submitted batch job 2992736 -Submitted batch job 2992737 -Submitted batch job 2992738 -Submitted batch job 2992739 -Submitted batch job 2992740 -Submitted batch job 2992741 -Submitted batch job 2992742 -Submitted batch job 2992743 -Submitted batch job 2992744 -Submitted batch job 2992747 -Submitted batch job 2992748 -Submitted batch job 2992749 -Submitted batch job 2992750 -Submitted batch job 2992751 -Submitted batch job 2992752 -Submitted batch job 2992753 -Submitted batch job 2992754 -Submitted batch job 2992755 -Submitted batch job 2992756 -Submitted batch job 2992795 -Submitted batch job 2992796 -Submitted batch job 2992797 -Submitted batch job 2992798 -Submitted batch job 2992799 -Submitted batch job 2992800 -Submitted batch job 2992801 -Submitted batch job 2992802 -Submitted batch job 2992803 -Submitted batch job 2992804 -Submitted batch job 2992805 -Submitted batch job 2992806 -Submitted batch job 2992807 -Submitted batch job 2992808 -Submitted batch job 2992809 -Submitted batch job 2992810 -Submitted batch job 2992811 -Submitted batch job 2992812 -Submitted batch job 2992813 -Submitted batch job 2992814 -Submitted batch job 2992871 -Submitted batch job 2992872 -Submitted batch job 2992873 -Submitted batch job 2992874 -Submitted batch job 2992875 -Submitted batch job 2992876 -Submitted batch job 2992877 -Submitted batch job 2992878 -Submitted batch job 2992879 -Submitted batch job 2992880 -Submitted batch job 2992897 -Submitted batch job 2992898 -Submitted batch job 2992899 -Submitted batch job 2992900 -Submitted batch job 2992901 -Submitted batch job 2992902 -Submitted batch job 2992903 -Submitted batch job 2992904 -Submitted batch job 2992905 -Submitted batch job 2992906 -Submitted batch job 2992922 -Submitted batch job 2992923 -Submitted batch job 2992924 -Submitted batch job 2992925 -Submitted batch job 2992926 -Submitted batch job 2992927 -Submitted batch job 2992928 -Submitted batch job 2992929 -Submitted batch job 2992930 -Submitted batch job 2992931 -Submitted batch job 2992932 -Submitted batch job 2992933 -Submitted batch job 2992934 -Submitted batch job 2992935 -Submitted batch job 2992936 -Submitted batch job 2992937 -Submitted batch job 2992938 -Submitted batch job 2992939 -Submitted batch job 2992940 -Submitted batch job 2992941 -Submitted batch job 2992942 -Submitted batch job 2992943 -Submitted batch job 2992944 -Submitted batch job 2992945 -Submitted batch job 2992946 -Submitted batch job 2992947 -Submitted batch job 2992948 -Submitted batch job 2992949 -Submitted batch job 2992950 -Submitted batch job 2992951 -Submitted batch job 2992964 -Submitted batch job 2992965 -Submitted batch job 2992966 -Submitted batch job 2992967 -Submitted batch job 2992968 -Submitted batch job 2992969 -Submitted batch job 2992970 -Submitted batch job 2992971 -Submitted batch job 2992972 -Submitted batch job 2992973 -Submitted batch job 2992974 -Submitted batch job 2992975 -Submitted batch job 2992976 -Submitted batch job 2992977 -Submitted batch job 2992978 -Submitted batch job 2992979 -Submitted batch job 2992980 -Submitted batch job 2992981 -Submitted batch job 2992982 -Submitted batch job 2992983 -Submitted batch job 2992989 -Submitted batch job 2992990 -Submitted batch job 2992991 -Submitted batch job 2992992 -Submitted batch job 2992993 -Submitted batch job 2992994 -Submitted batch job 2992995 -Submitted batch job 2992996 -Submitted batch job 2992997 -Submitted batch job 2992998 -Submitted batch job 2993014 -Submitted batch job 2993015 -Submitted batch job 2993016 -Submitted batch job 2993017 -Submitted batch job 2993018 -Submitted batch job 2993019 -Submitted batch job 2993020 -Submitted batch job 2993021 -Submitted batch job 2993022 -Submitted batch job 2993023 -Submitted batch job 2993043 -Submitted batch job 2993044 -Submitted batch job 2993045 -Submitted batch job 2993046 -Submitted batch job 2993047 -Submitted batch job 2993048 -Submitted batch job 2993049 -Submitted batch job 2993050 -Submitted batch job 2993051 -Submitted batch job 2993052 -Submitted batch job 2993063 -Submitted batch job 2993064 -Submitted batch job 2993065 -Submitted batch job 2993066 -Submitted batch job 2993067 -Submitted batch job 2993068 -Submitted batch job 2993069 -Submitted batch job 2993070 -Submitted batch job 2993071 -Submitted batch job 2993072 -Submitted batch job 2993073 -Submitted batch job 2993074 -Submitted batch job 2993075 -Submitted batch job 2993076 -Submitted batch job 2993077 -Submitted batch job 2993078 -Submitted batch job 2993079 -Submitted batch job 2993080 -Submitted batch job 2993081 -Submitted batch job 2993082 -Submitted batch job 2993083 -Submitted batch job 2993084 -Submitted batch job 2993085 -Submitted batch job 2993086 -Submitted batch job 2993087 -Submitted batch job 2993088 -Submitted batch job 2993089 -Submitted batch job 2993090 -Submitted batch job 2993091 -Submitted batch job 2993092 -Submitted batch job 2993130 -Submitted batch job 2993131 -Submitted batch job 2993132 -Submitted batch job 2993133 -Submitted batch job 2993134 -Submitted batch job 2993135 -Submitted batch job 2993136 -Submitted batch job 2993137 -Submitted batch job 2993138 -Submitted batch job 2993139 -Submitted batch job 2993189 -Submitted batch job 2993190 -Submitted batch job 2993191 -Submitted batch job 2993192 -Submitted batch job 2993193 -Submitted batch job 2993194 -Submitted batch job 2993195 -Submitted batch job 2993196 -Submitted batch job 2993197 -Submitted batch job 2993198 -Submitted batch job 2993202 -Submitted batch job 2993203 -Submitted batch job 2993204 -Submitted batch job 2993205 -Submitted batch job 2993206 -Submitted batch job 2993207 -Submitted batch job 2993208 -Submitted batch job 2993209 -Submitted batch job 2993210 -Submitted batch job 2993211 -Submitted batch job 2993212 -Submitted batch job 2993213 -Submitted batch job 2993214 -Submitted batch job 2993215 -Submitted batch job 2993216 -Submitted batch job 2993217 -Submitted batch job 2993218 -Submitted batch job 2993219 -Submitted batch job 2993220 -Submitted batch job 2993221 -Submitted batch job 2993659 -Submitted batch job 2993660 -Submitted batch job 2993661 -Submitted batch job 2993662 -Submitted batch job 2993663 -Submitted batch job 2993664 -Submitted batch job 2993665 -Submitted batch job 2993666 -Submitted batch job 2993667 -Submitted batch job 2993668 -Submitted batch job 2993693 -Submitted batch job 2993694 -Submitted batch job 2993695 -Submitted batch job 2993696 -Submitted batch job 2993697 -Submitted batch job 2993698 -Submitted batch job 2993699 -Submitted batch job 2993700 -Submitted batch job 2993701 -Submitted batch job 2993702 -Submitted batch job 2993940 -Submitted batch job 2993941 -Submitted batch job 2993942 -Submitted batch job 2993943 -Submitted batch job 2993944 -Submitted batch job 2993945 -Submitted batch job 2993946 -Submitted batch job 2993947 -Submitted batch job 2993948 -Submitted batch job 2993949 -Submitted batch job 2993963 -Submitted batch job 2993964 -Submitted batch job 2993965 -Submitted batch job 2993966 -Submitted batch job 2993967 -Submitted batch job 2993968 -Submitted batch job 2993969 -Submitted batch job 2993970 -Submitted batch job 2993971 -Submitted batch job 2993972 -Submitted batch job 2994004 -Submitted batch job 2994005 -Submitted batch job 2994006 -Submitted batch job 2994007 -Submitted batch job 2994008 -Submitted batch job 2994009 -Submitted batch job 2994010 -Submitted batch job 2994011 -Submitted batch job 2994012 -Submitted batch job 2994013 -Submitted batch job 2994020 -Submitted batch job 2994021 -Submitted batch job 2994022 -Submitted batch job 2994023 -Submitted batch job 2994024 -Submitted batch job 2994025 -Submitted batch job 2994026 -Submitted batch job 2994027 -Submitted batch job 2994028 -Submitted batch job 2994029 -Submitted batch job 2994039 -Submitted batch job 2994040 -Submitted batch job 2994041 -Submitted batch job 2994042 -Submitted batch job 2994043 -Submitted batch job 2994044 -Submitted batch job 2994045 -Submitted batch job 2994046 -Submitted batch job 2994047 -Submitted batch job 2994048 -Submitted batch job 2994070 -Submitted batch job 2994071 -Submitted batch job 2994072 -Submitted batch job 2994073 -Submitted batch job 2994074 -Submitted batch job 2994075 -Submitted batch job 2994076 -Submitted batch job 2994077 -Submitted batch job 2994078 -Submitted batch job 2994079 -Submitted batch job 2994090 -Submitted batch job 2994091 -Submitted batch job 2994092 -Submitted batch job 2994093 -Submitted batch job 2994094 -Submitted batch job 2994095 -Submitted batch job 2994096 -Submitted batch job 2994097 -Submitted batch job 2994098 -Submitted batch job 2994099 -Submitted batch job 2994102 -Submitted batch job 2994103 -Submitted batch job 2994104 -Submitted batch job 2994105 -Submitted batch job 2994106 -Submitted batch job 2994107 -Submitted batch job 2994108 -Submitted batch job 2994109 -Submitted batch job 2994110 -Submitted batch job 2994111 -Submitted batch job 2994117 -Submitted batch job 2994118 -Submitted batch job 2994119 -Submitted batch job 2994120 -Submitted batch job 2994121 -Submitted batch job 2994122 -Submitted batch job 2994123 -Submitted batch job 2994124 -Submitted batch job 2994125 -Submitted batch job 2994126 -Submitted batch job 2994142 -Submitted batch job 2994143 -Submitted batch job 2994144 -Submitted batch job 2994145 -Submitted batch job 2994146 -Submitted batch job 2994147 -Submitted batch job 2994148 -Submitted batch job 2994149 -Submitted batch job 2994150 -Submitted batch job 2994151 -Submitted batch job 2994153 -Submitted batch job 2994154 -Submitted batch job 2994155 -Submitted batch job 2994156 -Submitted batch job 2994157 -Submitted batch job 2994158 -Submitted batch job 2994159 -Submitted batch job 2994160 -Submitted batch job 2994161 -Submitted batch job 2994162 -Submitted batch job 2994163 -Submitted batch job 2994164 -Submitted batch job 2994165 -Submitted batch job 2994166 -Submitted batch job 2994167 -Submitted batch job 2994168 -Submitted batch job 2994169 -Submitted batch job 2994170 -Submitted batch job 2994171 -Submitted batch job 2994172 -Submitted batch job 2994176 -Submitted batch job 2994177 -Submitted batch job 2994178 -Submitted batch job 2994179 -Submitted batch job 2994180 -Submitted batch job 2994181 -Submitted batch job 2994182 -Submitted batch job 2994183 -Submitted batch job 2994184 -Submitted batch job 2994185 -Submitted batch job 2994187 -Submitted batch job 2994188 -Submitted batch job 2994189 -Submitted batch job 2994190 -Submitted batch job 2994191 -Submitted batch job 2994192 -Submitted batch job 2994193 -Submitted batch job 2994194 -Submitted batch job 2994195 -Submitted batch job 2994196 -Submitted batch job 2994200 -Submitted batch job 2994201 -Submitted batch job 2994202 -Submitted batch job 2994203 -Submitted batch job 2994204 -Submitted batch job 2994205 -Submitted batch job 2994206 -Submitted batch job 2994207 -Submitted batch job 2994208 -Submitted batch job 2994209 -Submitted batch job 2994219 -Submitted batch job 2994220 -Submitted batch job 2994221 -Submitted batch job 2994222 -Submitted batch job 2994223 -Submitted batch job 2994224 -Submitted batch job 2994225 -Submitted batch job 2994226 -Submitted batch job 2994227 -Submitted batch job 2994228 -Submitted batch job 2994229 -Submitted batch job 2994230 -Submitted batch job 2994231 -Submitted batch job 2994232 -Submitted batch job 2994233 -Submitted batch job 2994234 -Submitted batch job 2994235 -Submitted batch job 2994236 -Submitted batch job 2994237 -Submitted batch job 2994238 -Submitted batch job 2994239 -Submitted batch job 2994240 -Submitted batch job 2994241 -Submitted batch job 2994242 -Submitted batch job 2994243 -Submitted batch job 2994244 -Submitted batch job 2994245 -Submitted batch job 2994246 -Submitted batch job 2994247 -Submitted batch job 2994248 -Submitted batch job 2994250 -Submitted batch job 2994251 -Submitted batch job 2994252 -Submitted batch job 2994253 -Submitted batch job 2994254 -Submitted batch job 2994255 -Submitted batch job 2994256 -Submitted batch job 2994257 -Submitted batch job 2994258 -Submitted batch job 2994259 -Submitted batch job 2994260 -Submitted batch job 2994261 -Submitted batch job 2994262 -Submitted batch job 2994263 -Submitted batch job 2994264 -Submitted batch job 2994265 -Submitted batch job 2994266 -Submitted batch job 2994267 -Submitted batch job 2994268 -Submitted batch job 2994269 -Submitted batch job 2994277 -Submitted batch job 2994278 -Submitted batch job 2994279 -Submitted batch job 2994280 -Submitted batch job 2994281 -Submitted batch job 2994282 -Submitted batch job 2994283 -Submitted batch job 2994284 -Submitted batch job 2994285 -Submitted batch job 2994286 -Submitted batch job 2994287 -Submitted batch job 2994288 -Submitted batch job 2994289 -Submitted batch job 2994290 -Submitted batch job 2994291 -Submitted batch job 2994292 -Submitted batch job 2994293 -Submitted batch job 2994294 -Submitted batch job 2994295 -Submitted batch job 2994296 -Submitted batch job 2994303 -Submitted batch job 2994304 -Submitted batch job 2994305 -Submitted batch job 2994306 -Submitted batch job 2994307 -Submitted batch job 2994308 -Submitted batch job 2994309 -Submitted batch job 2994310 -Submitted batch job 2994311 -Submitted batch job 2994312 -Submitted batch job 2994314 -Submitted batch job 2994315 -Submitted batch job 2994316 -Submitted batch job 2994317 -Submitted batch job 2994318 -Submitted batch job 2994319 -Submitted batch job 2994320 -Submitted batch job 2994321 -Submitted batch job 2994322 -Submitted batch job 2994323 -Submitted batch job 2994324 -Submitted batch job 2994325 -Submitted batch job 2994326 -Submitted batch job 2994327 -Submitted batch job 2994328 -Submitted batch job 2994329 -Submitted batch job 2994330 -Submitted batch job 2994331 -Submitted batch job 2994332 -Submitted batch job 2994333 -Submitted batch job 2994340 -Submitted batch job 2994341 -Submitted batch job 2994342 -Submitted batch job 2994343 -Submitted batch job 2994344 -Submitted batch job 2994345 -Submitted batch job 2994346 -Submitted batch job 2994347 -Submitted batch job 2994348 -Submitted batch job 2994349 -Submitted batch job 2994358 -Submitted batch job 2994359 -Submitted batch job 2994360 -Submitted batch job 2994361 -Submitted batch job 2994362 -Submitted batch job 2994363 -Submitted batch job 2994364 -Submitted batch job 2994365 -Submitted batch job 2994366 -Submitted batch job 2994367 -Submitted batch job 2994368 -Submitted batch job 2994369 -Submitted batch job 2994370 -Submitted batch job 2994371 -Submitted batch job 2994372 -Submitted batch job 2994373 -Submitted batch job 2994374 -Submitted batch job 2994375 -Submitted batch job 2994376 -Submitted batch job 2994377 -Submitted batch job 2994378 -Submitted batch job 2994379 -Submitted batch job 2994380 -Submitted batch job 2994381 -Submitted batch job 2994382 -Submitted batch job 2994383 -Submitted batch job 2994384 -Submitted batch job 2994385 -Submitted batch job 2994386 -Submitted batch job 2994387 -Submitted batch job 2994388 -Submitted batch job 2994389 -Submitted batch job 2994390 -Submitted batch job 2994391 -Submitted batch job 2994392 -Submitted batch job 2994393 -Submitted batch job 2994394 -Submitted batch job 2994395 -Submitted batch job 2994396 -Submitted batch job 2994397 -Submitted batch job 2994398 -Submitted batch job 2994399 -Submitted batch job 2994400 -Submitted batch job 2994401 -Submitted batch job 2994402 -Submitted batch job 2994403 -Submitted batch job 2994404 -Submitted batch job 2994405 -Submitted batch job 2994406 -Submitted batch job 2994407 -Submitted batch job 2994408 -Submitted batch job 2994409 -Submitted batch job 2994410 -Submitted batch job 2994411 -Submitted batch job 2994412 -Submitted batch job 2994413 -Submitted batch job 2994414 -Submitted batch job 2994415 -Submitted batch job 2994416 -Submitted batch job 2994417 -Submitted batch job 2994430 -Submitted batch job 2994431 -Submitted batch job 2994432 -Submitted batch job 2994433 -Submitted batch job 2994434 -Submitted batch job 2994435 -Submitted batch job 2994436 -Submitted batch job 2994437 -Submitted batch job 2994438 -Submitted batch job 2994439 -Submitted batch job 2994440 -Submitted batch job 2994441 -Submitted batch job 2994442 -Submitted batch job 2994443 -Submitted batch job 2994444 -Submitted batch job 2994445 -Submitted batch job 2994446 -Submitted batch job 2994447 -Submitted batch job 2994448 -Submitted batch job 2994449 -Submitted batch job 2994450 -Submitted batch job 2994451 -Submitted batch job 2994452 -Submitted batch job 2994453 -Submitted batch job 2994454 -Submitted batch job 2994455 -Submitted batch job 2994456 -Submitted batch job 2994457 -Submitted batch job 2994458 -Submitted batch job 2994459 -Submitted batch job 2994460 -Submitted batch job 2994461 -Submitted batch job 2994462 -Submitted batch job 2994463 -Submitted batch job 2994464 -Submitted batch job 2994465 -Submitted batch job 2994466 -Submitted batch job 2994467 -Submitted batch job 2994468 -Submitted batch job 2994469 -Submitted batch job 2994476 -Submitted batch job 2994477 -Submitted batch job 2994478 -Submitted batch job 2994479 -Submitted batch job 2994480 -Submitted batch job 2994481 -Submitted batch job 2994482 -Submitted batch job 2994483 -Submitted batch job 2994484 -Submitted batch job 2994485 -Submitted batch job 2994487 -Submitted batch job 2994488 -Submitted batch job 2994489 -Submitted batch job 2994490 -Submitted batch job 2994491 -Submitted batch job 2994492 -Submitted batch job 2994493 -Submitted batch job 2994494 -Submitted batch job 2994495 -Submitted batch job 2994496 -Submitted batch job 2994502 -Submitted batch job 2994503 -Submitted batch job 2994504 -Submitted batch job 2994505 -Submitted batch job 2994506 -Submitted batch job 2994507 -Submitted batch job 2994508 -Submitted batch job 2994509 -Submitted batch job 2994510 -Submitted batch job 2994511 -Submitted batch job 2994520 -Submitted batch job 2994521 -Submitted batch job 2994522 -Submitted batch job 2994523 -Submitted batch job 2994524 -Submitted batch job 2994525 -Submitted batch job 2994526 -Submitted batch job 2994527 -Submitted batch job 2994528 -Submitted batch job 2994529 -Submitted batch job 2994533 -Submitted batch job 2994534 -Submitted batch job 2994535 -Submitted batch job 2994536 -Submitted batch job 2994537 -Submitted batch job 2994538 -Submitted batch job 2994539 -Submitted batch job 2994540 -Submitted batch job 2994541 -Submitted batch job 2994542 -Submitted batch job 2994559 -Submitted batch job 2994560 -Submitted batch job 2994561 -Submitted batch job 2994562 -Submitted batch job 2994563 -Submitted batch job 2994564 -Submitted batch job 2994565 -Submitted batch job 2994566 -Submitted batch job 2994567 -Submitted batch job 2994568 -Submitted batch job 2994569 -Submitted batch job 2994570 -Submitted batch job 2994571 -Submitted batch job 2994572 -Submitted batch job 2994573 -Submitted batch job 2994574 -Submitted batch job 2994575 -Submitted batch job 2994576 -Submitted batch job 2994577 -Submitted batch job 2994578 -Submitted batch job 2994579 -Submitted batch job 2994580 -Submitted batch job 2994581 -Submitted batch job 2994582 -Submitted batch job 2994583 -Submitted batch job 2994584 -Submitted batch job 2994585 -Submitted batch job 2994586 -Submitted batch job 2994587 -Submitted batch job 2994588 -Submitted batch job 2994589 -Submitted batch job 2994590 -Submitted batch job 2994591 -Submitted batch job 2994592 -Submitted batch job 2994593 -Submitted batch job 2994594 -Submitted batch job 2994595 -Submitted batch job 2994596 -Submitted batch job 2994597 -Submitted batch job 2994598 -Submitted batch job 2994600 -Submitted batch job 2994601 -Submitted batch job 2994602 -Submitted batch job 2994603 -Submitted batch job 2994604 -Submitted batch job 2994605 -Submitted batch job 2994606 -Submitted batch job 2994607 -Submitted batch job 2994608 -Submitted batch job 2994609 -Submitted batch job 2994613 -Submitted batch job 2994614 -Submitted batch job 2994615 -Submitted batch job 2994616 -Submitted batch job 2994617 -Submitted batch job 2994618 -Submitted batch job 2994619 -Submitted batch job 2994620 -Submitted batch job 2994621 -Submitted batch job 2994622 -Submitted batch job 2994634 -Submitted batch job 2994635 -Submitted batch job 2994636 -Submitted batch job 2994637 -Submitted batch job 2994638 -Submitted batch job 2994639 -Submitted batch job 2994640 -Submitted batch job 2994641 -Submitted batch job 2994642 -Submitted batch job 2994643 -Submitted batch job 2994680 -Submitted batch job 2994681 -Submitted batch job 2994682 -Submitted batch job 2994683 -Submitted batch job 2994684 -Submitted batch job 2994685 -Submitted batch job 2994686 -Submitted batch job 2994687 -Submitted batch job 2994688 -Submitted batch job 2994689 -Submitted batch job 2994691 -Submitted batch job 2994692 -Submitted batch job 2994693 -Submitted batch job 2994694 -Submitted batch job 2994695 -Submitted batch job 2994696 -Submitted batch job 2994697 -Submitted batch job 2994698 -Submitted batch job 2994699 -Submitted batch job 2994700 -Submitted batch job 2994713 -Submitted batch job 2994714 -Submitted batch job 2994715 -Submitted batch job 2994716 -Submitted batch job 2994717 -Submitted batch job 2994718 -Submitted batch job 2994719 -Submitted batch job 2994720 -Submitted batch job 2994721 -Submitted batch job 2994722 -Submitted batch job 2994723 -Submitted batch job 2994724 -Submitted batch job 2994725 -Submitted batch job 2994726 -Submitted batch job 2994727 -Submitted batch job 2994728 -Submitted batch job 2994729 -Submitted batch job 2994730 -Submitted batch job 2994731 -Submitted batch job 2994732 -Submitted batch job 2994734 -Submitted batch job 2994735 -Submitted batch job 2994736 -Submitted batch job 2994737 -Submitted batch job 2994738 -Submitted batch job 2994739 -Submitted batch job 2994740 -Submitted batch job 2994741 -Submitted batch job 2994742 -Submitted batch job 2994743 -Submitted batch job 2994747 -Submitted batch job 2994748 -Submitted batch job 2994749 -Submitted batch job 2994750 -Submitted batch job 2994751 -Submitted batch job 2994752 -Submitted batch job 2994753 -Submitted batch job 2994754 -Submitted batch job 2994755 -Submitted batch job 2994756 -Submitted batch job 2994757 -Submitted batch job 2994759 -Submitted batch job 2994760 -Submitted batch job 2994761 -Submitted batch job 2994762 -Submitted batch job 2994763 -Submitted batch job 2994764 -Submitted batch job 2994765 -Submitted batch job 2994766 -Submitted batch job 2994767 -Submitted batch job 2994768 -Submitted batch job 2994769 -Submitted batch job 2994770 -Submitted batch job 2994771 -Submitted batch job 2994772 -Submitted batch job 2994773 -Submitted batch job 2994774 -Submitted batch job 2994775 -Submitted batch job 2994776 -Submitted batch job 2994777 -Submitted batch job 2994787 -Submitted batch job 2994788 -Submitted batch job 2994789 -Submitted batch job 2994790 -Submitted batch job 2994791 -Submitted batch job 2994792 -Submitted batch job 2994793 -Submitted batch job 2994794 -Submitted batch job 2994795 -Submitted batch job 2994796 -Submitted batch job 2994797 -Submitted batch job 2994798 -Submitted batch job 2994799 -Submitted batch job 2994800 -Submitted batch job 2994801 -Submitted batch job 2994802 -Submitted batch job 2994803 -Submitted batch job 2994804 -Submitted batch job 2994805 -Submitted batch job 2994806 -Submitted batch job 2994848 -Submitted batch job 2994849 -Submitted batch job 2994850 -Submitted batch job 2994851 -Submitted batch job 2994852 -Submitted batch job 2994853 -Submitted batch job 2994854 -Submitted batch job 2994855 -Submitted batch job 2994856 -Submitted batch job 2994857 -Submitted batch job 2994866 -Submitted batch job 2994867 -Submitted batch job 2994868 -Submitted batch job 2994869 -Submitted batch job 2994870 -Submitted batch job 2994871 -Submitted batch job 2994872 -Submitted batch job 2994873 -Submitted batch job 2994874 -Submitted batch job 2994875 -Submitted batch job 2994893 -Submitted batch job 2994894 -Submitted batch job 2994895 -Submitted batch job 2994896 -Submitted batch job 2994897 -Submitted batch job 2994898 -Submitted batch job 2994899 -Submitted batch job 2994900 -Submitted batch job 2994901 -Submitted batch job 2994902 -Submitted batch job 2994903 -Submitted batch job 2994904 -Submitted batch job 2994905 -Submitted batch job 2994906 -Submitted batch job 2994907 -Submitted batch job 2994908 -Submitted batch job 2994909 -Submitted batch job 2994910 -Submitted batch job 2994911 -Submitted batch job 2994912 -Submitted batch job 2994914 -Submitted batch job 2994915 -Submitted batch job 2994916 -Submitted batch job 2994917 -Submitted batch job 2994918 -Submitted batch job 2994919 -Submitted batch job 2994920 -Submitted batch job 2994921 -Submitted batch job 2994922 -Submitted batch job 2994923 -Submitted batch job 2994942 -Submitted batch job 2994943 -Submitted batch job 2994944 -Submitted batch job 2994945 -Submitted batch job 2994946 -Submitted batch job 2994947 -Submitted batch job 2994948 -Submitted batch job 2994949 -Submitted batch job 2994950 -Submitted batch job 2994951 -Submitted batch job 2994952 -Submitted batch job 2994953 -Submitted batch job 2994954 -Submitted batch job 2994955 -Submitted batch job 2994956 -Submitted batch job 2994957 -Submitted batch job 2994958 -Submitted batch job 2994959 -Submitted batch job 2994960 -Submitted batch job 2994961 -Submitted batch job 2995068 -Submitted batch job 2995069 -Submitted batch job 2995070 -Submitted batch job 2995071 -Submitted batch job 2995072 -Submitted batch job 2995073 -Submitted batch job 2995074 -Submitted batch job 2995075 -Submitted batch job 2995076 -Submitted batch job 2995077 -Submitted batch job 2995080 -Submitted batch job 2995081 -Submitted batch job 2995082 -Submitted batch job 2995083 -Submitted batch job 2995084 -Submitted batch job 2995085 -Submitted batch job 2995086 -Submitted batch job 2995087 -Submitted batch job 2995088 -Submitted batch job 2995089 -Submitted batch job 2995232 -Submitted batch job 2995233 -Submitted batch job 2995234 -Submitted batch job 2995235 -Submitted batch job 2995236 -Submitted batch job 2995237 -Submitted batch job 2995238 -Submitted batch job 2995239 -Submitted batch job 2995240 -Submitted batch job 2995241 -Submitted batch job 2995269 -Submitted batch job 2995270 -Submitted batch job 2995271 -Submitted batch job 2995272 -Submitted batch job 2995273 -Submitted batch job 2995274 -Submitted batch job 2995275 -Submitted batch job 2995276 -Submitted batch job 2995277 -Submitted batch job 2995278 -Submitted batch job 2995309 -Submitted batch job 2995310 -Submitted batch job 2995311 -Submitted batch job 2995312 -Submitted batch job 2995313 -Submitted batch job 2995314 -Submitted batch job 2995315 -Submitted batch job 2995316 -Submitted batch job 2995317 -Submitted batch job 2995318 -Submitted batch job 2995319 -Submitted batch job 2995320 -Submitted batch job 2995321 -Submitted batch job 2995322 -Submitted batch job 2995323 -Submitted batch job 2995324 -Submitted batch job 2995325 -Submitted batch job 2995326 -Submitted batch job 2995327 -Submitted batch job 2995328 -Submitted batch job 2995329 -Submitted batch job 2995330 -Submitted batch job 2995331 -Submitted batch job 2995332 -Submitted batch job 2995333 -Submitted batch job 2995334 -Submitted batch job 2995335 -Submitted batch job 2995336 -Submitted batch job 2995337 -Submitted batch job 2995338 -Submitted batch job 2997771 -Submitted batch job 2997772 -Submitted batch job 2997773 -Submitted batch job 2997774 -Submitted batch job 2997775 -Submitted batch job 2997776 -Submitted batch job 2997777 -Submitted batch job 2997778 -Submitted batch job 2997779 -Submitted batch job 2997780 -Submitted batch job 2997989 -Submitted batch job 2997990 -Submitted batch job 2997991 -Submitted batch job 2997992 -Submitted batch job 2997993 -Submitted batch job 2997994 -Submitted batch job 2997995 -Submitted batch job 2997996 -Submitted batch job 2997997 -Submitted batch job 2997998 -Submitted batch job 2998001 -Submitted batch job 2998002 -Submitted batch job 2998003 -Submitted batch job 2998004 -Submitted batch job 2998005 -Submitted batch job 2998006 -Submitted batch job 2998007 -Submitted batch job 2998008 -Submitted batch job 2998009 -Submitted batch job 2998010 -Submitted batch job 2998015 -Submitted batch job 2998016 -Submitted batch job 2998017 -Submitted batch job 2998018 -Submitted batch job 2998019 -Submitted batch job 2998020 -Submitted batch job 2998021 -Submitted batch job 2998022 -Submitted batch job 2998023 -Submitted batch job 2998024 -Submitted batch job 2998841 -Submitted batch job 2998842 -Submitted batch job 2998843 -Submitted batch job 2998844 -Submitted batch job 2998845 -Submitted batch job 2998846 -Submitted batch job 2998847 -Submitted batch job 2998848 -Submitted batch job 2998849 -Submitted batch job 2998850 -Submitted batch job 2999062 -Submitted batch job 2999063 -Submitted batch job 2999064 -Submitted batch job 2999065 -Submitted batch job 2999066 -Submitted batch job 2999067 -Submitted batch job 2999068 -Submitted batch job 2999069 -Submitted batch job 2999070 -Submitted batch job 2999071 -Submitted batch job 2999073 -Submitted batch job 2999074 -Submitted batch job 2999075 -Submitted batch job 2999076 -Submitted batch job 2999077 -Submitted batch job 2999078 -Submitted batch job 2999079 -Submitted batch job 2999080 -Submitted batch job 2999081 -Submitted batch job 2999082 -Submitted batch job 2999083 -Submitted batch job 2999084 -Submitted batch job 2999085 -Submitted batch job 2999086 -Submitted batch job 2999087 -Submitted batch job 2999088 -Submitted batch job 2999089 -Submitted batch job 2999090 -Submitted batch job 2999091 -Submitted batch job 2999092 -Submitted batch job 2999436 -Submitted batch job 2999437 -Submitted batch job 2999438 -Submitted batch job 2999439 -Submitted batch job 2999440 -Submitted batch job 2999441 -Submitted batch job 2999442 -Submitted batch job 2999443 -Submitted batch job 2999444 -Submitted batch job 2999445 -Submitted batch job 2999447 -Submitted batch job 2999448 -Submitted batch job 2999449 -Submitted batch job 2999450 -Submitted batch job 2999451 -Submitted batch job 2999452 -Submitted batch job 2999453 -Submitted batch job 2999454 -Submitted batch job 2999455 -Submitted batch job 2999456 -Submitted batch job 2999457 -Submitted batch job 2999458 -Submitted batch job 2999459 -Submitted batch job 2999460 -Submitted batch job 2999461 -Submitted batch job 2999462 -Submitted batch job 2999463 -Submitted batch job 2999464 -Submitted batch job 2999465 -Submitted batch job 2999466 -Submitted batch job 2999497 -Submitted batch job 2999498 -Submitted batch job 2999499 -Submitted batch job 2999500 -Submitted batch job 2999501 -Submitted batch job 2999502 -Submitted batch job 2999503 -Submitted batch job 2999504 -Submitted batch job 2999505 -Submitted batch job 2999506 -Submitted batch job 2999507 -Submitted batch job 2999508 -Submitted batch job 2999509 -Submitted batch job 2999510 -Submitted batch job 2999511 -Submitted batch job 2999512 -Submitted batch job 2999513 -Submitted batch job 2999514 -Submitted batch job 2999515 -Submitted batch job 2999516 -Submitted batch job 2999530 -Submitted batch job 2999531 -Submitted batch job 2999532 -Submitted batch job 2999533 -Submitted batch job 2999534 -Submitted batch job 2999535 -Submitted batch job 2999536 -Submitted batch job 2999537 -Submitted batch job 2999538 -Submitted batch job 2999539 -Submitted batch job 2999558 -Submitted batch job 2999559 -Submitted batch job 2999560 -Submitted batch job 2999561 -Submitted batch job 2999562 -Submitted batch job 2999563 -Submitted batch job 2999564 -Submitted batch job 2999565 -Submitted batch job 2999566 -Submitted batch job 2999567 -Submitted batch job 3000391 -Submitted batch job 3000392 -Submitted batch job 3000393 -Submitted batch job 3000394 -Submitted batch job 3000395 -Submitted batch job 3000396 -Submitted batch job 3000397 -Submitted batch job 3000398 -Submitted batch job 3000399 -Submitted batch job 3000400 -Submitted batch job 3000402 -Submitted batch job 3000403 -Submitted batch job 3000404 -Submitted batch job 3000405 -Submitted batch job 3000406 -Submitted batch job 3000407 -Submitted batch job 3000408 -Submitted batch job 3000409 -Submitted batch job 3000410 -Submitted batch job 3000411 -Submitted batch job 3000636 -Submitted batch job 3000637 -Submitted batch job 3000638 -Submitted batch job 3000639 -Submitted batch job 3000640 -Submitted batch job 3000641 -Submitted batch job 3000642 -Submitted batch job 3000643 -Submitted batch job 3000644 -Submitted batch job 3000645 -Submitted batch job 3000646 -Submitted batch job 3000647 -Submitted batch job 3000648 -Submitted batch job 3000649 -Submitted batch job 3000650 -Submitted batch job 3000651 -Submitted batch job 3000652 -Submitted batch job 3000653 -Submitted batch job 3000654 -Submitted batch job 3000655 -Submitted batch job 3001031 -Submitted batch job 3001032 -Submitted batch job 3001033 -Submitted batch job 3001034 -Submitted batch job 3001035 -Submitted batch job 3001036 -Submitted batch job 3001037 -Submitted batch job 3001038 -Submitted batch job 3001039 -Submitted batch job 3001040 -Submitted batch job 3001055 -Submitted batch job 3001056 -Submitted batch job 3001057 -Submitted batch job 3001058 -Submitted batch job 3001059 -Submitted batch job 3001060 -Submitted batch job 3001061 -Submitted batch job 3001062 -Submitted batch job 3001063 -Submitted batch job 3001064 -Submitted batch job 3001065 -Submitted batch job 3001066 -Submitted batch job 3001067 -Submitted batch job 3001068 -Submitted batch job 3001069 -Submitted batch job 3001070 -Submitted batch job 3001071 -Submitted batch job 3001072 -Submitted batch job 3001073 -Submitted batch job 3001074 -Submitted batch job 3001075 -Submitted batch job 3001076 -Submitted batch job 3001077 -Submitted batch job 3001078 -Submitted batch job 3001079 -Submitted batch job 3001080 -Submitted batch job 3001081 -Submitted batch job 3001082 -Submitted batch job 3001083 -Submitted batch job 3001084 -Submitted batch job 3001085 -Submitted batch job 3001086 -Submitted batch job 3001087 -Submitted batch job 3001088 -Submitted batch job 3001089 -Submitted batch job 3001090 -Submitted batch job 3001091 -Submitted batch job 3001092 -Submitted batch job 3001093 -Submitted batch job 3001094 -Submitted batch job 3001096 -Submitted batch job 3001097 -Submitted batch job 3001098 -Submitted batch job 3001099 -Submitted batch job 3001100 -Submitted batch job 3001101 -Submitted batch job 3001102 -Submitted batch job 3001103 -Submitted batch job 3001104 -Submitted batch job 3001105 -Submitted batch job 3001109 -Submitted batch job 3001110 -Submitted batch job 3001111 -Submitted batch job 3001112 -Submitted batch job 3001113 -Submitted batch job 3001114 -Submitted batch job 3001115 -Submitted batch job 3001116 -Submitted batch job 3001117 -Submitted batch job 3001118 -Submitted batch job 3001120 -Submitted batch job 3001121 -Submitted batch job 3001122 -Submitted batch job 3001123 -Submitted batch job 3001124 -Submitted batch job 3001125 -Submitted batch job 3001126 -Submitted batch job 3001127 -Submitted batch job 3001128 -Submitted batch job 3001129 -Submitted batch job 3001258 -Submitted batch job 3001259 -Submitted batch job 3001260 -Submitted batch job 3001261 -Submitted batch job 3001262 -Submitted batch job 3001263 -Submitted batch job 3001264 -Submitted batch job 3001265 -Submitted batch job 3001266 -Submitted batch job 3001267 -Submitted batch job 3001405 -Submitted batch job 3001406 -Submitted batch job 3001407 -Submitted batch job 3001408 -Submitted batch job 3001409 -Submitted batch job 3001410 -Submitted batch job 3001411 -Submitted batch job 3001412 -Submitted batch job 3001413 -Submitted batch job 3001414 -Submitted batch job 3001415 -Submitted batch job 3001416 -Submitted batch job 3001417 -Submitted batch job 3001418 -Submitted batch job 3001419 -Submitted batch job 3001420 -Submitted batch job 3001421 -Submitted batch job 3001422 -Submitted batch job 3001423 -Submitted batch job 3001424 -Submitted batch job 3001426 -Submitted batch job 3001427 -Submitted batch job 3001428 -Submitted batch job 3001429 -Submitted batch job 3001430 -Submitted batch job 3001431 -Submitted batch job 3001432 -Submitted batch job 3001433 -Submitted batch job 3001434 -Submitted batch job 3001435 -Submitted batch job 3001541 -Submitted batch job 3001542 -Submitted batch job 3001543 -Submitted batch job 3001544 -Submitted batch job 3001545 -Submitted batch job 3001546 -Submitted batch job 3001547 -Submitted batch job 3001548 -Submitted batch job 3001549 -Submitted batch job 3001550 -Submitted batch job 3001554 -Submitted batch job 3001555 -Submitted batch job 3001556 -Submitted batch job 3001557 -Submitted batch job 3001558 -Submitted batch job 3001559 -Submitted batch job 3001560 -Submitted batch job 3001561 -Submitted batch job 3001562 -Submitted batch job 3001563 -Submitted batch job 3001564 -Submitted batch job 3001565 -Submitted batch job 3001566 -Submitted batch job 3001567 -Submitted batch job 3001568 -Submitted batch job 3001569 -Submitted batch job 3001570 -Submitted batch job 3001571 -Submitted batch job 3001572 -Submitted batch job 3001573 -Submitted batch job 3001650 -Submitted batch job 3001651 -Submitted batch job 3001652 -Submitted batch job 3001653 -Submitted batch job 3001654 -Submitted batch job 3001655 -Submitted batch job 3001656 -Submitted batch job 3001657 -Submitted batch job 3001658 -Submitted batch job 3001659 -Submitted batch job 3001664 -Submitted batch job 3001665 -Submitted batch job 3001666 -Submitted batch job 3001667 -Submitted batch job 3001668 -Submitted batch job 3001669 -Submitted batch job 3001670 -Submitted batch job 3001671 -Submitted batch job 3001672 -Submitted batch job 3001673 -Submitted batch job 3001674 -Submitted batch job 3001675 -Submitted batch job 3001676 -Submitted batch job 3001677 -Submitted batch job 3001678 -Submitted batch job 3001679 -Submitted batch job 3001680 -Submitted batch job 3001681 -Submitted batch job 3001682 -Submitted batch job 3001683 -Submitted batch job 3001686 -Submitted batch job 3001687 -Submitted batch job 3001688 -Submitted batch job 3001689 -Submitted batch job 3001690 -Submitted batch job 3001691 -Submitted batch job 3001692 -Submitted batch job 3001693 -Submitted batch job 3001694 -Submitted batch job 3001695 -Submitted batch job 3001965 -Submitted batch job 3001966 -Submitted batch job 3001967 -Submitted batch job 3001968 -Submitted batch job 3001969 -Submitted batch job 3001970 -Submitted batch job 3001971 -Submitted batch job 3001972 -Submitted batch job 3001973 -Submitted batch job 3001974 -Submitted batch job 3002144 -Submitted batch job 3002145 -Submitted batch job 3002146 -Submitted batch job 3002147 -Submitted batch job 3002148 -Submitted batch job 3002149 -Submitted batch job 3002150 -Submitted batch job 3002151 -Submitted batch job 3002152 -Submitted batch job 3002153 -Submitted batch job 3002154 -Submitted batch job 3002155 -Submitted batch job 3002156 -Submitted batch job 3002157 -Submitted batch job 3002158 -Submitted batch job 3002159 -Submitted batch job 3002160 -Submitted batch job 3002161 -Submitted batch job 3002162 -Submitted batch job 3002163 -Submitted batch job 3002164 -Submitted batch job 3002165 -Submitted batch job 3002166 -Submitted batch job 3002167 -Submitted batch job 3002168 -Submitted batch job 3002169 -Submitted batch job 3002170 -Submitted batch job 3002171 -Submitted batch job 3002172 -Submitted batch job 3002173 -Submitted batch job 3002181 -Submitted batch job 3002182 -Submitted batch job 3002183 -Submitted batch job 3002184 -Submitted batch job 3002185 -Submitted batch job 3002186 -Submitted batch job 3002187 -Submitted batch job 3002188 -Submitted batch job 3002189 -Submitted batch job 3002190 -Submitted batch job 3002191 -Submitted batch job 3002192 -Submitted batch job 3002193 -Submitted batch job 3002194 -Submitted batch job 3002195 -Submitted batch job 3002196 -Submitted batch job 3002197 -Submitted batch job 3002198 -Submitted batch job 3002199 -Submitted batch job 3002200 -Submitted batch job 3002201 -Submitted batch job 3002202 -Submitted batch job 3002203 -Submitted batch job 3002204 -Submitted batch job 3002205 -Submitted batch job 3002206 -Submitted batch job 3002207 -Submitted batch job 3002208 -Submitted batch job 3002209 -Submitted batch job 3002210 -Submitted batch job 3002217 -Submitted batch job 3002218 -Submitted batch job 3002219 -Submitted batch job 3002220 -Submitted batch job 3002221 -Submitted batch job 3002222 -Submitted batch job 3002223 -Submitted batch job 3002224 -Submitted batch job 3002225 -Submitted batch job 3002226 -Submitted batch job 3002238 -Submitted batch job 3002239 -Submitted batch job 3002240 -Submitted batch job 3002241 -Submitted batch job 3002242 -Submitted batch job 3002243 -Submitted batch job 3002244 -Submitted batch job 3002245 -Submitted batch job 3002246 -Submitted batch job 3002247 -Submitted batch job 3002248 -Submitted batch job 3002249 -Submitted batch job 3002250 -Submitted batch job 3002251 -Submitted batch job 3002252 -Submitted batch job 3002253 -Submitted batch job 3002254 -Submitted batch job 3002255 -Submitted batch job 3002256 -Submitted batch job 3002257 -Submitted batch job 3002264 -Submitted batch job 3002265 -Submitted batch job 3002266 -Submitted batch job 3002267 -Submitted batch job 3002268 -Submitted batch job 3002269 -Submitted batch job 3002270 -Submitted batch job 3002271 -Submitted batch job 3002272 -Submitted batch job 3002273 -Submitted batch job 3002277 -Submitted batch job 3002278 -Submitted batch job 3002279 -Submitted batch job 3002280 -Submitted batch job 3002281 -Submitted batch job 3002282 -Submitted batch job 3002283 -Submitted batch job 3002284 -Submitted batch job 3002285 -Submitted batch job 3002286 -Submitted batch job 3002287 -Submitted batch job 3002288 -Submitted batch job 3002289 -Submitted batch job 3002290 -Submitted batch job 3002291 -Submitted batch job 3002292 -Submitted batch job 3002293 -Submitted batch job 3002294 -Submitted batch job 3002295 -Submitted batch job 3002296 -Submitted batch job 3002297 -Submitted batch job 3002298 -Submitted batch job 3002299 -Submitted batch job 3002300 -Submitted batch job 3002301 -Submitted batch job 3002302 -Submitted batch job 3002303 -Submitted batch job 3002304 -Submitted batch job 3002305 -Submitted batch job 3002306 -Submitted batch job 3002307 -Submitted batch job 3002308 -Submitted batch job 3002309 -Submitted batch job 3002310 -Submitted batch job 3002311 -Submitted batch job 3002312 -Submitted batch job 3002313 -Submitted batch job 3002314 -Submitted batch job 3002315 -Submitted batch job 3002316 -Submitted batch job 3002328 -Submitted batch job 3002329 -Submitted batch job 3002330 -Submitted batch job 3002331 -Submitted batch job 3002332 -Submitted batch job 3002333 -Submitted batch job 3002334 -Submitted batch job 3002335 -Submitted batch job 3002336 -Submitted batch job 3002337 -Submitted batch job 3002340 -Submitted batch job 3002341 -Submitted batch job 3002342 -Submitted batch job 3002343 -Submitted batch job 3002344 -Submitted batch job 3002345 -Submitted batch job 3002346 -Submitted batch job 3002347 -Submitted batch job 3002348 -Submitted batch job 3002349 -Submitted batch job 3002368 -Submitted batch job 3002369 -Submitted batch job 3002370 -Submitted batch job 3002371 -Submitted batch job 3002372 -Submitted batch job 3002373 -Submitted batch job 3002374 -Submitted batch job 3002375 -Submitted batch job 3002376 -Submitted batch job 3002377 -Submitted batch job 3002378 -Submitted batch job 3002379 -Submitted batch job 3002380 -Submitted batch job 3002381 -Submitted batch job 3002382 -Submitted batch job 3002383 -Submitted batch job 3002384 -Submitted batch job 3002385 -Submitted batch job 3002386 -Submitted batch job 3002387 -Submitted batch job 3002388 -Submitted batch job 3002389 -Submitted batch job 3002390 -Submitted batch job 3002391 -Submitted batch job 3002392 -Submitted batch job 3002393 -Submitted batch job 3002394 -Submitted batch job 3002395 -Submitted batch job 3002396 -Submitted batch job 3002397 -Submitted batch job 3002401 -Submitted batch job 3002402 -Submitted batch job 3002403 -Submitted batch job 3002404 -Submitted batch job 3002405 -Submitted batch job 3002406 -Submitted batch job 3002407 -Submitted batch job 3002408 -Submitted batch job 3002409 -Submitted batch job 3002410 -Submitted batch job 3002411 -Submitted batch job 3002412 -Submitted batch job 3002413 -Submitted batch job 3002414 -Submitted batch job 3002415 -Submitted batch job 3002416 -Submitted batch job 3002417 -Submitted batch job 3002418 -Submitted batch job 3002419 -Submitted batch job 3002420 -Submitted batch job 3002425 -Submitted batch job 3002426 -Submitted batch job 3002427 -Submitted batch job 3002428 -Submitted batch job 3002429 -Submitted batch job 3002430 -Submitted batch job 3002431 -Submitted batch job 3002432 -Submitted batch job 3002433 -Submitted batch job 3002434 -Submitted batch job 3002442 -Submitted batch job 3002443 -Submitted batch job 3002444 -Submitted batch job 3002445 -Submitted batch job 3002446 -Submitted batch job 3002447 -Submitted batch job 3002448 -Submitted batch job 3002449 -Submitted batch job 3002450 -Submitted batch job 3002451 -Submitted batch job 3002452 -Submitted batch job 3002453 -Submitted batch job 3002454 -Submitted batch job 3002455 -Submitted batch job 3002456 -Submitted batch job 3002457 -Submitted batch job 3002458 -Submitted batch job 3002459 -Submitted batch job 3002460 -Submitted batch job 3002461 -Submitted batch job 3002462 -Submitted batch job 3002463 -Submitted batch job 3002464 -Submitted batch job 3002465 -Submitted batch job 3002466 -Submitted batch job 3002467 -Submitted batch job 3002468 -Submitted batch job 3002469 -Submitted batch job 3002470 -Submitted batch job 3002471 -Submitted batch job 3002474 -Submitted batch job 3002475 -Submitted batch job 3002476 -Submitted batch job 3002477 -Submitted batch job 3002478 -Submitted batch job 3002479 -Submitted batch job 3002480 -Submitted batch job 3002481 -Submitted batch job 3002482 -Submitted batch job 3002483 -Submitted batch job 3002487 -Submitted batch job 3002488 -Submitted batch job 3002489 -Submitted batch job 3002490 -Submitted batch job 3002491 -Submitted batch job 3002492 -Submitted batch job 3002493 -Submitted batch job 3002494 -Submitted batch job 3002495 -Submitted batch job 3002496 -Submitted batch job 3002506 -Submitted batch job 3002507 -Submitted batch job 3002508 -Submitted batch job 3002509 -Submitted batch job 3002510 -Submitted batch job 3002511 -Submitted batch job 3002512 -Submitted batch job 3002513 -Submitted batch job 3002514 -Submitted batch job 3002515 -Submitted batch job 3002516 -Submitted batch job 3002517 -Submitted batch job 3002518 -Submitted batch job 3002519 -Submitted batch job 3002520 -Submitted batch job 3002521 -Submitted batch job 3002522 -Submitted batch job 3002523 -Submitted batch job 3002524 -Submitted batch job 3002525 -Submitted batch job 3002529 -Submitted batch job 3002530 -Submitted batch job 3002531 -Submitted batch job 3002532 -Submitted batch job 3002533 -Submitted batch job 3002534 -Submitted batch job 3002535 -Submitted batch job 3002536 -Submitted batch job 3002537 -Submitted batch job 3002538 -Submitted batch job 3002541 -Submitted batch job 3002542 -Submitted batch job 3002543 -Submitted batch job 3002544 -Submitted batch job 3002545 -Submitted batch job 3002546 -Submitted batch job 3002547 -Submitted batch job 3002548 -Submitted batch job 3002549 -Submitted batch job 3002550 -Submitted batch job 3002552 -Submitted batch job 3002553 -Submitted batch job 3002554 -Submitted batch job 3002555 -Submitted batch job 3002556 -Submitted batch job 3002557 -Submitted batch job 3002558 -Submitted batch job 3002559 -Submitted batch job 3002560 -Submitted batch job 3002561 -Submitted batch job 3002566 -Submitted batch job 3002567 -Submitted batch job 3002568 -Submitted batch job 3002569 -Submitted batch job 3002570 -Submitted batch job 3002571 -Submitted batch job 3002572 -Submitted batch job 3002573 -Submitted batch job 3002574 -Submitted batch job 3002575 -Submitted batch job 3002588 -Submitted batch job 3002589 -Submitted batch job 3002590 -Submitted batch job 3002591 -Submitted batch job 3002592 -Submitted batch job 3002593 -Submitted batch job 3002594 -Submitted batch job 3002595 -Submitted batch job 3002596 -Submitted batch job 3002597 -Submitted batch job 3002599 -Submitted batch job 3002600 -Submitted batch job 3002601 -Submitted batch job 3002602 -Submitted batch job 3002603 -Submitted batch job 3002604 -Submitted batch job 3002605 -Submitted batch job 3002606 -Submitted batch job 3002607 -Submitted batch job 3002608 -Submitted batch job 3002609 -Submitted batch job 3002610 -Submitted batch job 3002611 -Submitted batch job 3002612 -Submitted batch job 3002613 -Submitted batch job 3002614 -Submitted batch job 3002615 -Submitted batch job 3002616 -Submitted batch job 3002617 -Submitted batch job 3002618 -Submitted batch job 3002623 -Submitted batch job 3002624 -Submitted batch job 3002625 -Submitted batch job 3002626 -Submitted batch job 3002627 -Submitted batch job 3002628 -Submitted batch job 3002629 -Submitted batch job 3002630 -Submitted batch job 3002631 -Submitted batch job 3002632 -Submitted batch job 3002633 -Submitted batch job 3002634 -Submitted batch job 3002635 -Submitted batch job 3002636 -Submitted batch job 3002637 -Submitted batch job 3002638 -Submitted batch job 3002639 -Submitted batch job 3002640 -Submitted batch job 3002641 -Submitted batch job 3002642 -Submitted batch job 3002663 -Submitted batch job 3002664 -Submitted batch job 3002665 -Submitted batch job 3002666 -Submitted batch job 3002667 -Submitted batch job 3002668 -Submitted batch job 3002669 -Submitted batch job 3002670 -Submitted batch job 3002671 -Submitted batch job 3002672 -Submitted batch job 3002679 -Submitted batch job 3002680 -Submitted batch job 3002681 -Submitted batch job 3002682 -Submitted batch job 3002683 -Submitted batch job 3002684 -Submitted batch job 3002685 -Submitted batch job 3002686 -Submitted batch job 3002687 -Submitted batch job 3002688 -Submitted batch job 3002689 -Submitted batch job 3002690 -Submitted batch job 3002691 -Submitted batch job 3002692 -Submitted batch job 3002693 -Submitted batch job 3002694 -Submitted batch job 3002695 -Submitted batch job 3002696 -Submitted batch job 3002697 -Submitted batch job 3002698 -Submitted batch job 3002710 -Submitted batch job 3002711 -Submitted batch job 3002712 -Submitted batch job 3002713 -Submitted batch job 3002714 -Submitted batch job 3002715 -Submitted batch job 3002716 -Submitted batch job 3002717 -Submitted batch job 3002718 -Submitted batch job 3002719 -Submitted batch job 3002720 -Submitted batch job 3002721 -Submitted batch job 3002722 -Submitted batch job 3002723 -Submitted batch job 3002724 -Submitted batch job 3002725 -Submitted batch job 3002726 -Submitted batch job 3002727 -Submitted batch job 3002728 -Submitted batch job 3002729 -Submitted batch job 3002730 -Submitted batch job 3002731 -Submitted batch job 3002732 -Submitted batch job 3002733 -Submitted batch job 3002734 -Submitted batch job 3002735 -Submitted batch job 3002736 -Submitted batch job 3002737 -Submitted batch job 3002738 -Submitted batch job 3002739 -Submitted batch job 3002908 -Submitted batch job 3002909 -Submitted batch job 3002910 -Submitted batch job 3002911 -Submitted batch job 3002912 -Submitted batch job 3002913 -Submitted batch job 3002914 -Submitted batch job 3002915 -Submitted batch job 3002916 -Submitted batch job 3002917 -Submitted batch job 3002919 -Submitted batch job 3002920 -Submitted batch job 3002921 -Submitted batch job 3002922 -Submitted batch job 3002923 -Submitted batch job 3002924 -Submitted batch job 3002925 -Submitted batch job 3002926 -Submitted batch job 3002927 -Submitted batch job 3002928 -Submitted batch job 3002934 -Submitted batch job 3002935 -Submitted batch job 3002936 -Submitted batch job 3002937 -Submitted batch job 3002938 -Submitted batch job 3002939 -Submitted batch job 3002940 -Submitted batch job 3002941 -Submitted batch job 3002942 -Submitted batch job 3002943 -Submitted batch job 3002946 -Submitted batch job 3002947 -Submitted batch job 3002948 -Submitted batch job 3002949 -Submitted batch job 3002950 -Submitted batch job 3002951 -Submitted batch job 3002952 -Submitted batch job 3002953 -Submitted batch job 3002954 -Submitted batch job 3002955 -Submitted batch job 3003016 -Submitted batch job 3003017 -Submitted batch job 3003018 -Submitted batch job 3003019 -Submitted batch job 3003020 -Submitted batch job 3003021 -Submitted batch job 3003022 -Submitted batch job 3003023 -Submitted batch job 3003024 -Submitted batch job 3003025 -Submitted batch job 3003026 -Submitted batch job 3003027 -Submitted batch job 3003028 -Submitted batch job 3003029 -Submitted batch job 3003030 -Submitted batch job 3003031 -Submitted batch job 3003032 -Submitted batch job 3003033 -Submitted batch job 3003034 -Submitted batch job 3003035 -Submitted batch job 3003095 -Submitted batch job 3003096 -Submitted batch job 3003097 -Submitted batch job 3003098 -Submitted batch job 3003099 -Submitted batch job 3003100 -Submitted batch job 3003101 -Submitted batch job 3003102 -Submitted batch job 3003103 -Submitted batch job 3003104 -Submitted batch job 3003227 -Submitted batch job 3003228 -Submitted batch job 3003229 -Submitted batch job 3003230 -Submitted batch job 3003231 -Submitted batch job 3003232 -Submitted batch job 3003233 -Submitted batch job 3003234 -Submitted batch job 3003235 -Submitted batch job 3003236 -Submitted batch job 3003348 -Submitted batch job 3003349 -Submitted batch job 3003350 -Submitted batch job 3003351 -Submitted batch job 3003352 -Submitted batch job 3003353 -Submitted batch job 3003354 -Submitted batch job 3003355 -Submitted batch job 3003356 -Submitted batch job 3003357 -Submitted batch job 3003640 -Submitted batch job 3003641 -Submitted batch job 3003642 -Submitted batch job 3003643 -Submitted batch job 3003644 -Submitted batch job 3003645 -Submitted batch job 3003646 -Submitted batch job 3003647 -Submitted batch job 3003648 -Submitted batch job 3003649 -Submitted batch job 3004031 -Submitted batch job 3004032 -Submitted batch job 3004033 -Submitted batch job 3004034 -Submitted batch job 3004035 -Submitted batch job 3004036 -Submitted batch job 3004037 -Submitted batch job 3004038 -Submitted batch job 3004039 -Submitted batch job 3004040 -Submitted batch job 3004294 -Submitted batch job 3004295 -Submitted batch job 3004296 -Submitted batch job 3004297 -Submitted batch job 3004298 -Submitted batch job 3004299 -Submitted batch job 3004300 -Submitted batch job 3004301 -Submitted batch job 3004302 -Submitted batch job 3004303 -Submitted batch job 3004393 -Submitted batch job 3004394 -Submitted batch job 3004395 -Submitted batch job 3004396 -Submitted batch job 3004397 -Submitted batch job 3004398 -Submitted batch job 3004399 -Submitted batch job 3004400 -Submitted batch job 3004401 -Submitted batch job 3004402 -Submitted batch job 3004704 -Submitted batch job 3004705 -Submitted batch job 3004706 -Submitted batch job 3004707 -Submitted batch job 3004708 -Submitted batch job 3004709 -Submitted batch job 3004710 -Submitted batch job 3004711 -Submitted batch job 3004712 -Submitted batch job 3004713 -Submitted batch job 3009363 -Submitted batch job 3009364 -Submitted batch job 3009365 -Submitted batch job 3009366 -Submitted batch job 3009367 -Submitted batch job 3009368 -Submitted batch job 3009369 -Submitted batch job 3009370 -Submitted batch job 3009371 -Submitted batch job 3009372 -Submitted batch job 3009508 -Submitted batch job 3009509 -Submitted batch job 3009510 -Submitted batch job 3009511 -Submitted batch job 3009512 -Submitted batch job 3009513 -Submitted batch job 3009514 -Submitted batch job 3009515 -Submitted batch job 3009516 -Submitted batch job 3009517 -Submitted batch job 3009809 -Submitted batch job 3009810 -Submitted batch job 3009811 -Submitted batch job 3009812 -Submitted batch job 3009813 -Submitted batch job 3009814 -Submitted batch job 3009815 -Submitted batch job 3009816 -Submitted batch job 3009817 -Submitted batch job 3009818 -Submitted batch job 3010212 -Submitted batch job 3010213 -Submitted batch job 3010214 -Submitted batch job 3010215 -Submitted batch job 3010216 -Submitted batch job 3010217 -Submitted batch job 3010218 -Submitted batch job 3010219 -Submitted batch job 3010220 -Submitted batch job 3010221 -Submitted batch job 3013019 -Submitted batch job 3013020 -Submitted batch job 3013021 -Submitted batch job 3013022 -Submitted batch job 3013023 -Submitted batch job 3013024 -Submitted batch job 3013025 -Submitted batch job 3013026 -Submitted batch job 3013027 -Submitted batch job 3013028 -Submitted batch job 3013280 -Submitted batch job 3013281 -Submitted batch job 3013282 -Submitted batch job 3013283 -Submitted batch job 3013284 -Submitted batch job 3013285 -Submitted batch job 3013286 -Submitted batch job 3013287 -Submitted batch job 3013288 -Submitted batch job 3013289 -Submitted batch job 3013370 -Submitted batch job 3013371 -Submitted batch job 3013372 -Submitted batch job 3013373 -Submitted batch job 3013374 -Submitted batch job 3013375 -Submitted batch job 3013376 -Submitted batch job 3013377 -Submitted batch job 3013378 -Submitted batch job 3013379 -Submitted batch job 3013632 -Submitted batch job 3013633 -Submitted batch job 3013634 -Submitted batch job 3013635 -Submitted batch job 3013636 -Submitted batch job 3013637 -Submitted batch job 3013638 -Submitted batch job 3013639 -Submitted batch job 3013640 -Submitted batch job 3013641 -Submitted batch job 3013643 -Submitted batch job 3013644 -Submitted batch job 3013645 -Submitted batch job 3013646 -Submitted batch job 3013647 -Submitted batch job 3013648 -Submitted batch job 3013649 -Submitted batch job 3013650 -Submitted batch job 3013651 -Submitted batch job 3013652 -Submitted batch job 3013653 -Submitted batch job 3013654 -Submitted batch job 3013655 -Submitted batch job 3013656 -Submitted batch job 3013657 -Submitted batch job 3013658 -Submitted batch job 3013659 -Submitted batch job 3013660 -Submitted batch job 3013661 -Submitted batch job 3013662 -Submitted batch job 3013690 -Submitted batch job 3013691 -Submitted batch job 3013692 -Submitted batch job 3013693 -Submitted batch job 3013694 -Submitted batch job 3013695 -Submitted batch job 3013696 -Submitted batch job 3013697 -Submitted batch job 3013698 -Submitted batch job 3013699 -Submitted batch job 3013701 -Submitted batch job 3013702 -Submitted batch job 3013703 -Submitted batch job 3013704 -Submitted batch job 3013705 -Submitted batch job 3013706 -Submitted batch job 3013707 -Submitted batch job 3013708 -Submitted batch job 3013709 -Submitted batch job 3013710 -Submitted batch job 3013726 -Submitted batch job 3013727 -Submitted batch job 3013728 -Submitted batch job 3013729 -Submitted batch job 3013730 -Submitted batch job 3013731 -Submitted batch job 3013732 -Submitted batch job 3013733 -Submitted batch job 3013734 -Submitted batch job 3013735 -Submitted batch job 3013779 -Submitted batch job 3013780 -Submitted batch job 3013781 -Submitted batch job 3013782 -Submitted batch job 3013783 -Submitted batch job 3013784 -Submitted batch job 3013785 -Submitted batch job 3013786 -Submitted batch job 3013787 -Submitted batch job 3013788 -Submitted batch job 3013790 -Submitted batch job 3013791 -Submitted batch job 3013792 -Submitted batch job 3013793 -Submitted batch job 3013794 -Submitted batch job 3013795 -Submitted batch job 3013796 -Submitted batch job 3013797 -Submitted batch job 3013798 -Submitted batch job 3013799 -Submitted batch job 3013810 -Submitted batch job 3013811 -Submitted batch job 3013812 -Submitted batch job 3013813 -Submitted batch job 3013814 -Submitted batch job 3013815 -Submitted batch job 3013816 -Submitted batch job 3013817 -Submitted batch job 3013818 -Submitted batch job 3013819 -Submitted batch job 3013820 -Submitted batch job 3013821 -Submitted batch job 3013822 -Submitted batch job 3013823 -Submitted batch job 3013824 -Submitted batch job 3013825 -Submitted batch job 3013826 -Submitted batch job 3013827 -Submitted batch job 3013828 -Submitted batch job 3013829 -Submitted batch job 3013862 -Submitted batch job 3013863 -Submitted batch job 3013864 -Submitted batch job 3013865 -Submitted batch job 3013866 -Submitted batch job 3013867 -Submitted batch job 3013868 -Submitted batch job 3013869 -Submitted batch job 3013870 -Submitted batch job 3013871 -Submitted batch job 3013874 -Submitted batch job 3013875 -Submitted batch job 3013876 -Submitted batch job 3013877 -Submitted batch job 3013878 -Submitted batch job 3013879 -Submitted batch job 3013880 -Submitted batch job 3013881 -Submitted batch job 3013882 -Submitted batch job 3013883 -Submitted batch job 3013904 -Submitted batch job 3013905 -Submitted batch job 3013906 -Submitted batch job 3013907 -Submitted batch job 3013908 -Submitted batch job 3013909 -Submitted batch job 3013910 -Submitted batch job 3013911 -Submitted batch job 3013912 -Submitted batch job 3013913 -Submitted batch job 3013914 -Submitted batch job 3013915 -Submitted batch job 3013916 -Submitted batch job 3013917 -Submitted batch job 3013918 -Submitted batch job 3013919 -Submitted batch job 3013920 -Submitted batch job 3013921 -Submitted batch job 3013922 -Submitted batch job 3013923 -Submitted batch job 3013956 -Submitted batch job 3013957 -Submitted batch job 3013958 -Submitted batch job 3013959 -Submitted batch job 3013960 -Submitted batch job 3013961 -Submitted batch job 3013962 -Submitted batch job 3013963 -Submitted batch job 3013964 -Submitted batch job 3013965 -Submitted batch job 3013966 -Submitted batch job 3013967 -Submitted batch job 3013968 -Submitted batch job 3013969 -Submitted batch job 3013970 -Submitted batch job 3013971 -Submitted batch job 3013972 -Submitted batch job 3013973 -Submitted batch job 3013974 -Submitted batch job 3013975 -Submitted batch job 3013991 -Submitted batch job 3013992 -Submitted batch job 3013993 -Submitted batch job 3013994 -Submitted batch job 3013995 -Submitted batch job 3013996 -Submitted batch job 3013997 -Submitted batch job 3013998 -Submitted batch job 3013999 -Submitted batch job 3014000 -Submitted batch job 3014002 -Submitted batch job 3014003 -Submitted batch job 3014004 -Submitted batch job 3014005 -Submitted batch job 3014006 -Submitted batch job 3014007 -Submitted batch job 3014008 -Submitted batch job 3014009 -Submitted batch job 3014010 -Submitted batch job 3014011 -Submitted batch job 3014013 -Submitted batch job 3014014 -Submitted batch job 3014015 -Submitted batch job 3014016 -Submitted batch job 3014017 -Submitted batch job 3014018 -Submitted batch job 3014019 -Submitted batch job 3014020 -Submitted batch job 3014021 -Submitted batch job 3014022 -Submitted batch job 3014023 -Submitted batch job 3014024 -Submitted batch job 3014025 -Submitted batch job 3014026 -Submitted batch job 3014027 -Submitted batch job 3014028 -Submitted batch job 3014029 -Submitted batch job 3014030 -Submitted batch job 3014031 -Submitted batch job 3014032 -Submitted batch job 3014033 -Submitted batch job 3014034 -Submitted batch job 3014035 -Submitted batch job 3014036 -Submitted batch job 3014037 -Submitted batch job 3014038 -Submitted batch job 3014039 -Submitted batch job 3014040 -Submitted batch job 3014041 -Submitted batch job 3014042 -Submitted batch job 3014043 -Submitted batch job 3014044 -Submitted batch job 3014045 -Submitted batch job 3014046 -Submitted batch job 3014047 -Submitted batch job 3014048 -Submitted batch job 3014049 -Submitted batch job 3014050 -Submitted batch job 3014051 -Submitted batch job 3014052 -Submitted batch job 3014080 -Submitted batch job 3014081 -Submitted batch job 3014082 -Submitted batch job 3014083 -Submitted batch job 3014084 -Submitted batch job 3014085 -Submitted batch job 3014086 -Submitted batch job 3014087 -Submitted batch job 3014088 -Submitted batch job 3014089 -Submitted batch job 3014090 -Submitted batch job 3014091 -Submitted batch job 3014092 -Submitted batch job 3014093 -Submitted batch job 3014094 -Submitted batch job 3014095 -Submitted batch job 3014096 -Submitted batch job 3014097 -Submitted batch job 3014098 -Submitted batch job 3014099 -Submitted batch job 3014103 -Submitted batch job 3014104 -Submitted batch job 3014105 -Submitted batch job 3014106 -Submitted batch job 3014107 -Submitted batch job 3014108 -Submitted batch job 3014109 -Submitted batch job 3014110 -Submitted batch job 3014111 -Submitted batch job 3014112 -Submitted batch job 3014282 -Submitted batch job 3014283 -Submitted batch job 3014284 -Submitted batch job 3014285 -Submitted batch job 3014286 -Submitted batch job 3014287 -Submitted batch job 3014288 -Submitted batch job 3014289 -Submitted batch job 3014290 -Submitted batch job 3014291 -Submitted batch job 3014292 -Submitted batch job 3014293 -Submitted batch job 3014294 -Submitted batch job 3014295 -Submitted batch job 3014296 -Submitted batch job 3014297 -Submitted batch job 3014298 -Submitted batch job 3014299 -Submitted batch job 3014300 -Submitted batch job 3014301 -Submitted batch job 3014302 -Submitted batch job 3014303 -Submitted batch job 3014304 -Submitted batch job 3014305 -Submitted batch job 3014306 -Submitted batch job 3014307 -Submitted batch job 3014308 -Submitted batch job 3014309 -Submitted batch job 3014310 -Submitted batch job 3014311 -Submitted batch job 3014341 -Submitted batch job 3014342 -Submitted batch job 3014343 -Submitted batch job 3014344 -Submitted batch job 3014345 -Submitted batch job 3014346 -Submitted batch job 3014347 -Submitted batch job 3014348 -Submitted batch job 3014349 -Submitted batch job 3014350 -Submitted batch job 3014352 -Submitted batch job 3014353 -Submitted batch job 3014354 -Submitted batch job 3014355 -Submitted batch job 3014356 -Submitted batch job 3014357 -Submitted batch job 3014358 -Submitted batch job 3014359 -Submitted batch job 3014360 -Submitted batch job 3014361 -Submitted batch job 3014427 -Submitted batch job 3014428 -Submitted batch job 3014429 -Submitted batch job 3014430 -Submitted batch job 3014431 -Submitted batch job 3014432 -Submitted batch job 3014433 -Submitted batch job 3014434 -Submitted batch job 3014435 -Submitted batch job 3014436 -Submitted batch job 3018119 -Submitted batch job 3018120 -Submitted batch job 3018121 -Submitted batch job 3018122 -Submitted batch job 3018123 -Submitted batch job 3018124 -Submitted batch job 3018125 -Submitted batch job 3018126 -Submitted batch job 3018127 -Submitted batch job 3018128 -Submitted batch job 3018187 -Submitted batch job 3018188 -Submitted batch job 3018189 -Submitted batch job 3018190 -Submitted batch job 3018191 -Submitted batch job 3018192 -Submitted batch job 3018193 -Submitted batch job 3018194 -Submitted batch job 3018195 -Submitted batch job 3018196 -Submitted batch job 3018948 -Submitted batch job 3018949 -Submitted batch job 3018950 -Submitted batch job 3018951 -Submitted batch job 3018952 -Submitted batch job 3018953 -Submitted batch job 3018954 -Submitted batch job 3018955 -Submitted batch job 3018956 -Submitted batch job 3018957 -Submitted batch job 3018991 -Submitted batch job 3018992 -Submitted batch job 3018993 -Submitted batch job 3018994 -Submitted batch job 3018995 -Submitted batch job 3018996 -Submitted batch job 3018997 -Submitted batch job 3018998 -Submitted batch job 3018999 -Submitted batch job 3019000 -Submitted batch job 3019781 -Submitted batch job 3019782 -Submitted batch job 3019783 -Submitted batch job 3019784 -Submitted batch job 3019785 -Submitted batch job 3019786 -Submitted batch job 3019787 -Submitted batch job 3019788 -Submitted batch job 3019789 -Submitted batch job 3019790 -Submitted batch job 3019810 -Submitted batch job 3019811 -Submitted batch job 3019812 -Submitted batch job 3019813 -Submitted batch job 3019814 -Submitted batch job 3019815 -Submitted batch job 3019816 -Submitted batch job 3019817 -Submitted batch job 3019818 -Submitted batch job 3019819 -Submitted batch job 3019820 -Submitted batch job 3019821 -Submitted batch job 3019822 -Submitted batch job 3019823 -Submitted batch job 3019824 -Submitted batch job 3019825 -Submitted batch job 3019826 -Submitted batch job 3019827 -Submitted batch job 3019828 -Submitted batch job 3019829 -Submitted batch job 3019830 -Submitted batch job 3019831 -Submitted batch job 3019832 -Submitted batch job 3019833 -Submitted batch job 3019834 -Submitted batch job 3019835 -Submitted batch job 3019836 -Submitted batch job 3019837 -Submitted batch job 3019838 -Submitted batch job 3019839 -Submitted batch job 3019845 -Submitted batch job 3019846 -Submitted batch job 3019847 -Submitted batch job 3019848 -Submitted batch job 3019849 -Submitted batch job 3019850 -Submitted batch job 3019851 -Submitted batch job 3019852 -Submitted batch job 3019853 -Submitted batch job 3019854 -Submitted batch job 3019861 -Submitted batch job 3019862 -Submitted batch job 3019863 -Submitted batch job 3019864 -Submitted batch job 3019865 -Submitted batch job 3019866 -Submitted batch job 3019867 -Submitted batch job 3019868 -Submitted batch job 3019869 -Submitted batch job 3019870 -Submitted batch job 3019871 -Submitted batch job 3019872 -Submitted batch job 3019873 -Submitted batch job 3019874 -Submitted batch job 3019875 -Submitted batch job 3019876 -Submitted batch job 3019877 -Submitted batch job 3019878 -Submitted batch job 3019879 -Submitted batch job 3019880 -Submitted batch job 3019897 -Submitted batch job 3019898 -Submitted batch job 3019899 -Submitted batch job 3019900 -Submitted batch job 3019901 -Submitted batch job 3019902 -Submitted batch job 3019903 -Submitted batch job 3019904 -Submitted batch job 3019905 -Submitted batch job 3019906 -Submitted batch job 3019918 -Submitted batch job 3019919 -Submitted batch job 3019920 -Submitted batch job 3019921 -Submitted batch job 3019922 -Submitted batch job 3019923 -Submitted batch job 3019924 -Submitted batch job 3019925 -Submitted batch job 3019926 -Submitted batch job 3019927 -Submitted batch job 3019928 -Submitted batch job 3019929 -Submitted batch job 3019930 -Submitted batch job 3019931 -Submitted batch job 3019932 -Submitted batch job 3019933 -Submitted batch job 3019934 -Submitted batch job 3019935 -Submitted batch job 3019936 -Submitted batch job 3019937 -Submitted batch job 3019942 -Submitted batch job 3019943 -Submitted batch job 3019944 -Submitted batch job 3019945 -Submitted batch job 3019946 -Submitted batch job 3019947 -Submitted batch job 3019948 -Submitted batch job 3019949 -Submitted batch job 3019950 -Submitted batch job 3019951 -Submitted batch job 3019958 -Submitted batch job 3019959 -Submitted batch job 3019960 -Submitted batch job 3019961 -Submitted batch job 3019962 -Submitted batch job 3019963 -Submitted batch job 3019964 -Submitted batch job 3019965 -Submitted batch job 3019966 -Submitted batch job 3019967 -Submitted batch job 3019978 -Submitted batch job 3019979 -Submitted batch job 3019980 -Submitted batch job 3019981 -Submitted batch job 3019982 -Submitted batch job 3019983 -Submitted batch job 3019984 -Submitted batch job 3019985 -Submitted batch job 3019986 -Submitted batch job 3019987 -Submitted batch job 3019988 -Submitted batch job 3019989 -Submitted batch job 3019990 -Submitted batch job 3019991 -Submitted batch job 3019992 -Submitted batch job 3019993 -Submitted batch job 3019994 -Submitted batch job 3019995 -Submitted batch job 3019996 -Submitted batch job 3019997 -Submitted batch job 3020004 -Submitted batch job 3020005 -Submitted batch job 3020006 -Submitted batch job 3020007 -Submitted batch job 3020008 -Submitted batch job 3020009 -Submitted batch job 3020010 -Submitted batch job 3020011 -Submitted batch job 3020012 -Submitted batch job 3020013 -Submitted batch job 3020014 -Submitted batch job 3020015 -Submitted batch job 3020016 -Submitted batch job 3020017 -Submitted batch job 3020018 -Submitted batch job 3020019 -Submitted batch job 3020020 -Submitted batch job 3020021 -Submitted batch job 3020022 -Submitted batch job 3020023 -Submitted batch job 3020034 -Submitted batch job 3020035 -Submitted batch job 3020036 -Submitted batch job 3020037 -Submitted batch job 3020038 -Submitted batch job 3020039 -Submitted batch job 3020040 -Submitted batch job 3020041 -Submitted batch job 3020042 -Submitted batch job 3020043 -Submitted batch job 3020052 -Submitted batch job 3020053 -Submitted batch job 3020054 -Submitted batch job 3020055 -Submitted batch job 3020056 -Submitted batch job 3020057 -Submitted batch job 3020058 -Submitted batch job 3020059 -Submitted batch job 3020060 -Submitted batch job 3020061 -Submitted batch job 3020062 -Submitted batch job 3020063 -Submitted batch job 3020064 -Submitted batch job 3020065 -Submitted batch job 3020066 -Submitted batch job 3020067 -Submitted batch job 3020068 -Submitted batch job 3020069 -Submitted batch job 3020070 -Submitted batch job 3020071 -Submitted batch job 3020082 -Submitted batch job 3020083 -Submitted batch job 3020084 -Submitted batch job 3020085 -Submitted batch job 3020086 -Submitted batch job 3020087 -Submitted batch job 3020088 -Submitted batch job 3020089 -Submitted batch job 3020090 -Submitted batch job 3020091 -Submitted batch job 3020092 -Submitted batch job 3020093 -Submitted batch job 3020094 -Submitted batch job 3020095 -Submitted batch job 3020096 -Submitted batch job 3020097 -Submitted batch job 3020098 -Submitted batch job 3020099 -Submitted batch job 3020100 -Submitted batch job 3020101 -Submitted batch job 3020103 -Submitted batch job 3020104 -Submitted batch job 3020105 -Submitted batch job 3020106 -Submitted batch job 3020107 -Submitted batch job 3020108 -Submitted batch job 3020109 -Submitted batch job 3020110 -Submitted batch job 3020111 -Submitted batch job 3020112 -Submitted batch job 3020139 -Submitted batch job 3020140 -Submitted batch job 3020141 -Submitted batch job 3020142 -Submitted batch job 3020143 -Submitted batch job 3020144 -Submitted batch job 3020145 -Submitted batch job 3020146 -Submitted batch job 3020147 -Submitted batch job 3020148 -Submitted batch job 3020152 -Submitted batch job 3020153 -Submitted batch job 3020154 -Submitted batch job 3020155 -Submitted batch job 3020156 -Submitted batch job 3020157 -Submitted batch job 3020158 -Submitted batch job 3020159 -Submitted batch job 3020160 -Submitted batch job 3020161 -Submitted batch job 3020176 -Submitted batch job 3020177 -Submitted batch job 3020178 -Submitted batch job 3020179 -Submitted batch job 3020180 -Submitted batch job 3020181 -Submitted batch job 3020182 -Submitted batch job 3020183 -Submitted batch job 3020184 -Submitted batch job 3020185 -Submitted batch job 3020231 -Submitted batch job 3020232 -Submitted batch job 3020233 -Submitted batch job 3020234 -Submitted batch job 3020235 -Submitted batch job 3020236 -Submitted batch job 3020237 -Submitted batch job 3020238 -Submitted batch job 3020239 -Submitted batch job 3020240 -Submitted batch job 3020246 -Submitted batch job 3020247 -Submitted batch job 3020248 -Submitted batch job 3020249 -Submitted batch job 3020250 -Submitted batch job 3020251 -Submitted batch job 3020252 -Submitted batch job 3020253 -Submitted batch job 3020254 -Submitted batch job 3020255 -Submitted batch job 3020257 -Submitted batch job 3020258 -Submitted batch job 3020259 -Submitted batch job 3020260 -Submitted batch job 3020261 -Submitted batch job 3020262 -Submitted batch job 3020263 -Submitted batch job 3020264 -Submitted batch job 3020265 -Submitted batch job 3020266 -Submitted batch job 3020276 -Submitted batch job 3020277 -Submitted batch job 3020278 -Submitted batch job 3020279 -Submitted batch job 3020280 -Submitted batch job 3020281 -Submitted batch job 3020282 -Submitted batch job 3020283 -Submitted batch job 3020284 -Submitted batch job 3020285 -Submitted batch job 3020318 -Submitted batch job 3020319 -Submitted batch job 3020320 -Submitted batch job 3020321 -Submitted batch job 3020322 -Submitted batch job 3020323 -Submitted batch job 3020324 -Submitted batch job 3020325 -Submitted batch job 3020326 -Submitted batch job 3020327 -Submitted batch job 3020338 -Submitted batch job 3020339 -Submitted batch job 3020340 -Submitted batch job 3020341 -Submitted batch job 3020342 -Submitted batch job 3020343 -Submitted batch job 3020344 -Submitted batch job 3020345 -Submitted batch job 3020346 -Submitted batch job 3020347 -Submitted batch job 3020367 -Submitted batch job 3020368 -Submitted batch job 3020369 -Submitted batch job 3020370 -Submitted batch job 3020371 -Submitted batch job 3020372 -Submitted batch job 3020373 -Submitted batch job 3020374 -Submitted batch job 3020375 -Submitted batch job 3020376 -Submitted batch job 3020377 -Submitted batch job 3020378 -Submitted batch job 3020379 -Submitted batch job 3020380 -Submitted batch job 3020381 -Submitted batch job 3020382 -Submitted batch job 3020383 -Submitted batch job 3020384 -Submitted batch job 3020385 -Submitted batch job 3020386 -Submitted batch job 3020420 -Submitted batch job 3020421 -Submitted batch job 3020422 -Submitted batch job 3020423 -Submitted batch job 3020424 -Submitted batch job 3020425 -Submitted batch job 3020426 -Submitted batch job 3020427 -Submitted batch job 3020428 -Submitted batch job 3020429 -Submitted batch job 3021694 -Submitted batch job 3021695 -Submitted batch job 3021696 -Submitted batch job 3021697 -Submitted batch job 3021698 -Submitted batch job 3021699 -Submitted batch job 3021700 -Submitted batch job 3021701 -Submitted batch job 3021702 -Submitted batch job 3021703 -Submitted batch job 3021709 -Submitted batch job 3021710 -Submitted batch job 3021711 -Submitted batch job 3021712 -Submitted batch job 3021713 -Submitted batch job 3021714 -Submitted batch job 3021715 -Submitted batch job 3021716 -Submitted batch job 3021717 -Submitted batch job 3021718 -Submitted batch job 3021773 -Submitted batch job 3021774 -Submitted batch job 3021775 -Submitted batch job 3021776 -Submitted batch job 3021777 -Submitted batch job 3021778 -Submitted batch job 3021779 -Submitted batch job 3021780 -Submitted batch job 3021781 -Submitted batch job 3021782 -Submitted batch job 3021821 -Submitted batch job 3021822 -Submitted batch job 3021823 -Submitted batch job 3021824 -Submitted batch job 3021825 -Submitted batch job 3021826 -Submitted batch job 3021827 -Submitted batch job 3021828 -Submitted batch job 3021829 -Submitted batch job 3021830 -Submitted batch job 3021872 -Submitted batch job 3021873 -Submitted batch job 3021874 -Submitted batch job 3021875 -Submitted batch job 3021876 -Submitted batch job 3021877 -Submitted batch job 3021878 -Submitted batch job 3021879 -Submitted batch job 3021880 -Submitted batch job 3021881 -Submitted batch job 3021882 -Submitted batch job 3021883 -Submitted batch job 3021884 -Submitted batch job 3021885 -Submitted batch job 3021886 -Submitted batch job 3021887 -Submitted batch job 3021888 -Submitted batch job 3021889 -Submitted batch job 3021890 -Submitted batch job 3021891 -Submitted batch job 3021934 -Submitted batch job 3021935 -Submitted batch job 3021936 -Submitted batch job 3021937 -Submitted batch job 3021938 -Submitted batch job 3021939 -Submitted batch job 3021940 -Submitted batch job 3021941 -Submitted batch job 3021942 -Submitted batch job 3021943 -Submitted batch job 3021950 -Submitted batch job 3021951 -Submitted batch job 3021952 -Submitted batch job 3021953 -Submitted batch job 3021954 -Submitted batch job 3021955 -Submitted batch job 3021956 -Submitted batch job 3021957 -Submitted batch job 3021958 -Submitted batch job 3021959 -Submitted batch job 3022107 -Submitted batch job 3022108 -Submitted batch job 3022109 -Submitted batch job 3022110 -Submitted batch job 3022111 -Submitted batch job 3022112 -Submitted batch job 3022113 -Submitted batch job 3022114 -Submitted batch job 3022115 -Submitted batch job 3022116 -Submitted batch job 3022117 -Submitted batch job 3022118 -Submitted batch job 3022119 -Submitted batch job 3022120 -Submitted batch job 3022121 -Submitted batch job 3022122 -Submitted batch job 3022123 -Submitted batch job 3022124 -Submitted batch job 3022125 -Submitted batch job 3022126 -Submitted batch job 3022143 -Submitted batch job 3022144 -Submitted batch job 3022145 -Submitted batch job 3022146 -Submitted batch job 3022147 -Submitted batch job 3022148 -Submitted batch job 3022149 -Submitted batch job 3022150 -Submitted batch job 3022151 -Submitted batch job 3022152 -Submitted batch job 3022167 -Submitted batch job 3022168 -Submitted batch job 3022169 -Submitted batch job 3022170 -Submitted batch job 3022171 -Submitted batch job 3022172 -Submitted batch job 3022173 -Submitted batch job 3022174 -Submitted batch job 3022175 -Submitted batch job 3022176 -Submitted batch job 3022190 -Submitted batch job 3022191 -Submitted batch job 3022192 -Submitted batch job 3022193 -Submitted batch job 3022194 -Submitted batch job 3022195 -Submitted batch job 3022196 -Submitted batch job 3022197 -Submitted batch job 3022198 -Submitted batch job 3022199 -Submitted batch job 3022411 -Submitted batch job 3022412 -Submitted batch job 3022413 -Submitted batch job 3022414 -Submitted batch job 3022415 -Submitted batch job 3022416 -Submitted batch job 3022417 -Submitted batch job 3022418 -Submitted batch job 3022419 -Submitted batch job 3022420 -Submitted batch job 3022421 -Submitted batch job 3022422 -Submitted batch job 3022423 -Submitted batch job 3022424 -Submitted batch job 3022425 -Submitted batch job 3022426 -Submitted batch job 3022427 -Submitted batch job 3022428 -Submitted batch job 3022429 -Submitted batch job 3022430 -Submitted batch job 3022449 -Submitted batch job 3022450 -Submitted batch job 3022451 -Submitted batch job 3022452 -Submitted batch job 3022453 -Submitted batch job 3022454 -Submitted batch job 3022455 -Submitted batch job 3022456 -Submitted batch job 3022457 -Submitted batch job 3022458 -Submitted batch job 3022459 -Submitted batch job 3022460 -Submitted batch job 3022461 -Submitted batch job 3022462 -Submitted batch job 3022463 -Submitted batch job 3022464 -Submitted batch job 3022465 -Submitted batch job 3022466 -Submitted batch job 3022467 -Submitted batch job 3022468 -Submitted batch job 3022475 -Submitted batch job 3022476 -Submitted batch job 3022477 -Submitted batch job 3022478 -Submitted batch job 3022479 -Submitted batch job 3022480 -Submitted batch job 3022481 -Submitted batch job 3022482 -Submitted batch job 3022483 -Submitted batch job 3022484 -Submitted batch job 3022496 -Submitted batch job 3022497 -Submitted batch job 3022498 -Submitted batch job 3022499 -Submitted batch job 3022500 -Submitted batch job 3022501 -Submitted batch job 3022502 -Submitted batch job 3022503 -Submitted batch job 3022504 -Submitted batch job 3022505 -Submitted batch job 3022506 -Submitted batch job 3022507 -Submitted batch job 3022508 -Submitted batch job 3022509 -Submitted batch job 3022510 -Submitted batch job 3022511 -Submitted batch job 3022512 -Submitted batch job 3022513 -Submitted batch job 3022514 -Submitted batch job 3022515 -Submitted batch job 3022516 -Submitted batch job 3022517 -Submitted batch job 3022518 -Submitted batch job 3022519 -Submitted batch job 3022520 -Submitted batch job 3022521 -Submitted batch job 3022522 -Submitted batch job 3022523 -Submitted batch job 3022524 -Submitted batch job 3022525 -Submitted batch job 3022569 -Submitted batch job 3022570 -Submitted batch job 3022571 -Submitted batch job 3022572 -Submitted batch job 3022573 -Submitted batch job 3022574 -Submitted batch job 3022575 -Submitted batch job 3022576 -Submitted batch job 3022577 -Submitted batch job 3022578 -Submitted batch job 3022579 -Submitted batch job 3022580 -Submitted batch job 3022581 -Submitted batch job 3022582 -Submitted batch job 3022583 -Submitted batch job 3022584 -Submitted batch job 3022585 -Submitted batch job 3022586 -Submitted batch job 3022587 -Submitted batch job 3022588 -Submitted batch job 3022589 -Submitted batch job 3022590 -Submitted batch job 3022591 -Submitted batch job 3022592 -Submitted batch job 3022593 -Submitted batch job 3022594 -Submitted batch job 3022595 -Submitted batch job 3022596 -Submitted batch job 3022597 -Submitted batch job 3022598 -Submitted batch job 3022605 -Submitted batch job 3022606 -Submitted batch job 3022607 -Submitted batch job 3022608 -Submitted batch job 3022609 -Submitted batch job 3022610 -Submitted batch job 3022611 -Submitted batch job 3022612 -Submitted batch job 3022613 -Submitted batch job 3022614 -Submitted batch job 3022694 -Submitted batch job 3022695 -Submitted batch job 3022696 -Submitted batch job 3022697 -Submitted batch job 3022698 -Submitted batch job 3022699 -Submitted batch job 3022700 -Submitted batch job 3022701 -Submitted batch job 3022702 -Submitted batch job 3022703 -Submitted batch job 3022704 -Submitted batch job 3022705 -Submitted batch job 3022706 -Submitted batch job 3022707 -Submitted batch job 3022708 -Submitted batch job 3022709 -Submitted batch job 3022710 -Submitted batch job 3022711 -Submitted batch job 3022712 -Submitted batch job 3022713 -Submitted batch job 3022747 -Submitted batch job 3022748 -Submitted batch job 3022749 -Submitted batch job 3022750 -Submitted batch job 3022751 -Submitted batch job 3022752 -Submitted batch job 3022753 -Submitted batch job 3022754 -Submitted batch job 3022755 -Submitted batch job 3022756 -Submitted batch job 3022766 -Submitted batch job 3022767 -Submitted batch job 3022768 -Submitted batch job 3022769 -Submitted batch job 3022770 -Submitted batch job 3022771 -Submitted batch job 3022772 -Submitted batch job 3022773 -Submitted batch job 3022774 -Submitted batch job 3022775 -Submitted batch job 3022793 -Submitted batch job 3022794 -Submitted batch job 3022795 -Submitted batch job 3022796 -Submitted batch job 3022797 -Submitted batch job 3022798 -Submitted batch job 3022799 -Submitted batch job 3022800 -Submitted batch job 3022801 -Submitted batch job 3022802 -Submitted batch job 3022822 -Submitted batch job 3022823 -Submitted batch job 3022824 -Submitted batch job 3022825 -Submitted batch job 3022826 -Submitted batch job 3022827 -Submitted batch job 3022828 -Submitted batch job 3022829 -Submitted batch job 3022830 -Submitted batch job 3022831 -Submitted batch job 3022925 -Submitted batch job 3022926 -Submitted batch job 3022927 -Submitted batch job 3022928 -Submitted batch job 3022929 -Submitted batch job 3022930 -Submitted batch job 3022931 -Submitted batch job 3022932 -Submitted batch job 3022933 -Submitted batch job 3022934 -Submitted batch job 3022952 -Submitted batch job 3022953 -Submitted batch job 3022954 -Submitted batch job 3022955 -Submitted batch job 3022956 -Submitted batch job 3022957 -Submitted batch job 3022958 -Submitted batch job 3022959 -Submitted batch job 3022960 -Submitted batch job 3022961 -Submitted batch job 3022973 -Submitted batch job 3022974 -Submitted batch job 3022975 -Submitted batch job 3022976 -Submitted batch job 3022977 -Submitted batch job 3022978 -Submitted batch job 3022979 -Submitted batch job 3022980 -Submitted batch job 3022981 -Submitted batch job 3022982 -Submitted batch job 3023116 -Submitted batch job 3023117 -Submitted batch job 3023118 -Submitted batch job 3023119 -Submitted batch job 3023120 -Submitted batch job 3023121 -Submitted batch job 3023122 -Submitted batch job 3023123 -Submitted batch job 3023124 -Submitted batch job 3023125 -Submitted batch job 3023418 -Submitted batch job 3023419 -Submitted batch job 3023420 -Submitted batch job 3023421 -Submitted batch job 3023422 -Submitted batch job 3023423 -Submitted batch job 3023424 -Submitted batch job 3023425 -Submitted batch job 3023426 -Submitted batch job 3023427 -Submitted batch job 3023474 -Submitted batch job 3023475 -Submitted batch job 3023476 -Submitted batch job 3023477 -Submitted batch job 3023478 -Submitted batch job 3023479 -Submitted batch job 3023480 -Submitted batch job 3023481 -Submitted batch job 3023482 -Submitted batch job 3023483 -Submitted batch job 3023486 -Submitted batch job 3023487 -Submitted batch job 3023488 -Submitted batch job 3023489 -Submitted batch job 3023490 -Submitted batch job 3023491 -Submitted batch job 3023492 -Submitted batch job 3023493 -Submitted batch job 3023494 -Submitted batch job 3023495 -Submitted batch job 3023696 -Submitted batch job 3023697 -Submitted batch job 3023698 -Submitted batch job 3023699 -Submitted batch job 3023700 -Submitted batch job 3023701 -Submitted batch job 3023702 -Submitted batch job 3023703 -Submitted batch job 3023704 -Submitted batch job 3023705 -Submitted batch job 3023759 -Submitted batch job 3023760 -Submitted batch job 3023761 -Submitted batch job 3023762 -Submitted batch job 3023763 -Submitted batch job 3023764 -Submitted batch job 3023765 -Submitted batch job 3023766 -Submitted batch job 3023767 -Submitted batch job 3023768 -Submitted batch job 3023785 -Submitted batch job 3023786 -Submitted batch job 3023787 -Submitted batch job 3023788 -Submitted batch job 3023789 -Submitted batch job 3023790 -Submitted batch job 3023791 -Submitted batch job 3023792 -Submitted batch job 3023793 -Submitted batch job 3023794 -Submitted batch job 3023815 -Submitted batch job 3023816 -Submitted batch job 3023817 -Submitted batch job 3023818 -Submitted batch job 3023819 -Submitted batch job 3023820 -Submitted batch job 3023821 -Submitted batch job 3023822 -Submitted batch job 3023823 -Submitted batch job 3023824 -Submitted batch job 3023828 -Submitted batch job 3023829 -Submitted batch job 3023830 -Submitted batch job 3023831 -Submitted batch job 3023832 -Submitted batch job 3023833 -Submitted batch job 3023834 -Submitted batch job 3023835 -Submitted batch job 3023836 -Submitted batch job 3023837 -Submitted batch job 3023850 -Submitted batch job 3023851 -Submitted batch job 3023852 -Submitted batch job 3023853 -Submitted batch job 3023854 -Submitted batch job 3023855 -Submitted batch job 3023856 -Submitted batch job 3023857 -Submitted batch job 3023858 -Submitted batch job 3023859 -Submitted batch job 3023874 -Submitted batch job 3023875 -Submitted batch job 3023876 -Submitted batch job 3023877 -Submitted batch job 3023878 -Submitted batch job 3023879 -Submitted batch job 3023880 -Submitted batch job 3023881 -Submitted batch job 3023882 -Submitted batch job 3023883 -Submitted batch job 3023892 -Submitted batch job 3023893 -Submitted batch job 3023894 -Submitted batch job 3023895 -Submitted batch job 3023896 -Submitted batch job 3023897 -Submitted batch job 3023898 -Submitted batch job 3023899 -Submitted batch job 3023900 -Submitted batch job 3023901 -Submitted batch job 3023905 -Submitted batch job 3023906 -Submitted batch job 3023907 -Submitted batch job 3023908 -Submitted batch job 3023909 -Submitted batch job 3023910 -Submitted batch job 3023911 -Submitted batch job 3023912 -Submitted batch job 3023913 -Submitted batch job 3023914 -Submitted batch job 3023918 -Submitted batch job 3023919 -Submitted batch job 3023920 -Submitted batch job 3023921 -Submitted batch job 3023922 -Submitted batch job 3023923 -Submitted batch job 3023924 -Submitted batch job 3023925 -Submitted batch job 3023926 -Submitted batch job 3023927 -Submitted batch job 3023928 -Submitted batch job 3023929 -Submitted batch job 3023930 -Submitted batch job 3023931 -Submitted batch job 3023932 -Submitted batch job 3023933 -Submitted batch job 3023934 -Submitted batch job 3023935 -Submitted batch job 3023936 -Submitted batch job 3023937 -Submitted batch job 3023942 -Submitted batch job 3023943 -Submitted batch job 3023944 -Submitted batch job 3023945 -Submitted batch job 3023946 -Submitted batch job 3023947 -Submitted batch job 3023948 -Submitted batch job 3023949 -Submitted batch job 3023950 -Submitted batch job 3023951 -Submitted batch job 3023957 -Submitted batch job 3023958 -Submitted batch job 3023959 -Submitted batch job 3023960 -Submitted batch job 3023961 -Submitted batch job 3023962 -Submitted batch job 3023963 -Submitted batch job 3023964 -Submitted batch job 3023965 -Submitted batch job 3023966 -Submitted batch job 3023971 -Submitted batch job 3023972 -Submitted batch job 3023973 -Submitted batch job 3023974 -Submitted batch job 3023975 -Submitted batch job 3023976 -Submitted batch job 3023977 -Submitted batch job 3023978 -Submitted batch job 3023979 -Submitted batch job 3023980 -Submitted batch job 3023981 -Submitted batch job 3023982 -Submitted batch job 3023983 -Submitted batch job 3023984 -Submitted batch job 3023985 -Submitted batch job 3023986 -Submitted batch job 3023987 -Submitted batch job 3023988 -Submitted batch job 3023989 -Submitted batch job 3023990 -Submitted batch job 3023999 -Submitted batch job 3024000 -Submitted batch job 3024001 -Submitted batch job 3024002 -Submitted batch job 3024003 -Submitted batch job 3024004 -Submitted batch job 3024005 -Submitted batch job 3024006 -Submitted batch job 3024007 -Submitted batch job 3024008 -Submitted batch job 3024010 -Submitted batch job 3024011 -Submitted batch job 3024012 -Submitted batch job 3024013 -Submitted batch job 3024014 -Submitted batch job 3024015 -Submitted batch job 3024016 -Submitted batch job 3024017 -Submitted batch job 3024018 -Submitted batch job 3024019 -Submitted batch job 3024023 -Submitted batch job 3024024 -Submitted batch job 3024025 -Submitted batch job 3024026 -Submitted batch job 3024027 -Submitted batch job 3024028 -Submitted batch job 3024029 -Submitted batch job 3024030 -Submitted batch job 3024031 -Submitted batch job 3024032 -Submitted batch job 3024033 -Submitted batch job 3024034 -Submitted batch job 3024035 -Submitted batch job 3024036 -Submitted batch job 3024037 -Submitted batch job 3024038 -Submitted batch job 3024039 -Submitted batch job 3024040 -Submitted batch job 3024041 -Submitted batch job 3024042 -Submitted batch job 3024057 -Submitted batch job 3024058 -Submitted batch job 3024059 -Submitted batch job 3024060 -Submitted batch job 3024061 -Submitted batch job 3024062 -Submitted batch job 3024063 -Submitted batch job 3024064 -Submitted batch job 3024065 -Submitted batch job 3024066 -Submitted batch job 3024067 -Submitted batch job 3024068 -Submitted batch job 3024069 -Submitted batch job 3024070 -Submitted batch job 3024071 -Submitted batch job 3024072 -Submitted batch job 3024073 -Submitted batch job 3024074 -Submitted batch job 3024075 -Submitted batch job 3024076 -Submitted batch job 3024077 -Submitted batch job 3024078 -Submitted batch job 3024079 -Submitted batch job 3024080 -Submitted batch job 3024081 -Submitted batch job 3024082 -Submitted batch job 3024083 -Submitted batch job 3024084 -Submitted batch job 3024085 -Submitted batch job 3024086 -Submitted batch job 3024118 -Submitted batch job 3024119 -Submitted batch job 3024120 -Submitted batch job 3024121 -Submitted batch job 3024122 -Submitted batch job 3024123 -Submitted batch job 3024124 -Submitted batch job 3024125 -Submitted batch job 3024126 -Submitted batch job 3024127 -Submitted batch job 3024131 -Submitted batch job 3024132 -Submitted batch job 3024133 -Submitted batch job 3024134 -Submitted batch job 3024135 -Submitted batch job 3024136 -Submitted batch job 3024137 -Submitted batch job 3024138 -Submitted batch job 3024139 -Submitted batch job 3024140 -Submitted batch job 3024142 -Submitted batch job 3024143 -Submitted batch job 3024144 -Submitted batch job 3024145 -Submitted batch job 3024146 -Submitted batch job 3024147 -Submitted batch job 3024148 -Submitted batch job 3024149 -Submitted batch job 3024150 -Submitted batch job 3024151 -Submitted batch job 3024161 -Submitted batch job 3024162 -Submitted batch job 3024163 -Submitted batch job 3024164 -Submitted batch job 3024165 -Submitted batch job 3024166 -Submitted batch job 3024167 -Submitted batch job 3024168 -Submitted batch job 3024169 -Submitted batch job 3024170 -Submitted batch job 3024172 -Submitted batch job 3024173 -Submitted batch job 3024174 -Submitted batch job 3024175 -Submitted batch job 3024176 -Submitted batch job 3024177 -Submitted batch job 3024178 -Submitted batch job 3024179 -Submitted batch job 3024180 -Submitted batch job 3024181 -Submitted batch job 3024296 -Submitted batch job 3024297 -Submitted batch job 3024298 -Submitted batch job 3024299 -Submitted batch job 3024300 -Submitted batch job 3024301 -Submitted batch job 3024302 -Submitted batch job 3024303 -Submitted batch job 3024304 -Submitted batch job 3024305 -Submitted batch job 3024306 -Submitted batch job 3024307 -Submitted batch job 3024308 -Submitted batch job 3024309 -Submitted batch job 3024310 -Submitted batch job 3024311 -Submitted batch job 3024312 -Submitted batch job 3024313 -Submitted batch job 3024314 -Submitted batch job 3024315 -Submitted batch job 3024384 -Submitted batch job 3024385 -Submitted batch job 3024386 -Submitted batch job 3024387 -Submitted batch job 3024388 -Submitted batch job 3024389 -Submitted batch job 3024390 -Submitted batch job 3024391 -Submitted batch job 3024392 -Submitted batch job 3024393 -Submitted batch job 3024397 -Submitted batch job 3024398 -Submitted batch job 3024399 -Submitted batch job 3024400 -Submitted batch job 3024401 -Submitted batch job 3024402 -Submitted batch job 3024403 -Submitted batch job 3024404 -Submitted batch job 3024405 -Submitted batch job 3024406 -Submitted batch job 3024431 -Submitted batch job 3024432 -Submitted batch job 3024433 -Submitted batch job 3024434 -Submitted batch job 3024435 -Submitted batch job 3024436 -Submitted batch job 3024437 -Submitted batch job 3024438 -Submitted batch job 3024439 -Submitted batch job 3024440 -Submitted batch job 3024489 -Submitted batch job 3024490 -Submitted batch job 3024491 -Submitted batch job 3024492 -Submitted batch job 3024493 -Submitted batch job 3024494 -Submitted batch job 3024495 -Submitted batch job 3024496 -Submitted batch job 3024497 -Submitted batch job 3024498 -Submitted batch job 3024969 -Submitted batch job 3024970 -Submitted batch job 3024971 -Submitted batch job 3024972 -Submitted batch job 3024973 -Submitted batch job 3024974 -Submitted batch job 3024975 -Submitted batch job 3024976 -Submitted batch job 3024977 -Submitted batch job 3024978 -Submitted batch job 3024983 -Submitted batch job 3024984 -Submitted batch job 3024985 -Submitted batch job 3024986 -Submitted batch job 3024987 -Submitted batch job 3024988 -Submitted batch job 3024989 -Submitted batch job 3024990 -Submitted batch job 3024991 -Submitted batch job 3024992 -Submitted batch job 3025046 -Submitted batch job 3025047 -Submitted batch job 3025048 -Submitted batch job 3025049 -Submitted batch job 3025050 -Submitted batch job 3025051 -Submitted batch job 3025052 -Submitted batch job 3025053 -Submitted batch job 3025054 -Submitted batch job 3025055 -Submitted batch job 3025063 -Submitted batch job 3025064 -Submitted batch job 3025065 -Submitted batch job 3025066 -Submitted batch job 3025067 -Submitted batch job 3025068 -Submitted batch job 3025069 -Submitted batch job 3025070 -Submitted batch job 3025071 -Submitted batch job 3025072 -Submitted batch job 3025113 -Submitted batch job 3025114 -Submitted batch job 3025115 -Submitted batch job 3025116 -Submitted batch job 3025117 -Submitted batch job 3025118 -Submitted batch job 3025119 -Submitted batch job 3025120 -Submitted batch job 3025121 -Submitted batch job 3025122 -Submitted batch job 3025290 -Submitted batch job 3025291 -Submitted batch job 3025292 -Submitted batch job 3025293 -Submitted batch job 3025294 -Submitted batch job 3025295 -Submitted batch job 3025296 -Submitted batch job 3025297 -Submitted batch job 3025298 -Submitted batch job 3025299 -Submitted batch job 3026317 -Submitted batch job 3026318 -Submitted batch job 3026319 -Submitted batch job 3026320 -Submitted batch job 3026321 -Submitted batch job 3026322 -Submitted batch job 3026323 -Submitted batch job 3026324 -Submitted batch job 3026325 -Submitted batch job 3026326 -Submitted batch job 3026376 -Submitted batch job 3026377 -Submitted batch job 3026378 -Submitted batch job 3026379 -Submitted batch job 3026380 -Submitted batch job 3026381 -Submitted batch job 3026382 -Submitted batch job 3026383 -Submitted batch job 3026384 -Submitted batch job 3026385 -Submitted batch job 3026417 -Submitted batch job 3026418 -Submitted batch job 3026419 -Submitted batch job 3026420 -Submitted batch job 3026421 -Submitted batch job 3026422 -Submitted batch job 3026423 -Submitted batch job 3026424 -Submitted batch job 3026425 -Submitted batch job 3026426 -Submitted batch job 3026446 -Submitted batch job 3026447 -Submitted batch job 3026448 -Submitted batch job 3026449 -Submitted batch job 3026450 -Submitted batch job 3026451 -Submitted batch job 3026452 -Submitted batch job 3026453 -Submitted batch job 3026454 -Submitted batch job 3026455 -Submitted batch job 3026483 -Submitted batch job 3026484 -Submitted batch job 3026485 -Submitted batch job 3026486 -Submitted batch job 3026487 -Submitted batch job 3026488 -Submitted batch job 3026489 -Submitted batch job 3026490 -Submitted batch job 3026491 -Submitted batch job 3026492 -Submitted batch job 3026493 -Submitted batch job 3026494 -Submitted batch job 3026495 -Submitted batch job 3026496 -Submitted batch job 3026497 -Submitted batch job 3026498 -Submitted batch job 3026499 -Submitted batch job 3026500 -Submitted batch job 3026501 -Submitted batch job 3026502 -Submitted batch job 3026541 -Submitted batch job 3026542 -Submitted batch job 3026543 -Submitted batch job 3026544 -Submitted batch job 3026545 -Submitted batch job 3026546 -Submitted batch job 3026547 -Submitted batch job 3026548 -Submitted batch job 3026549 -Submitted batch job 3026550 -Submitted batch job 3026604 -Submitted batch job 3026605 -Submitted batch job 3026606 -Submitted batch job 3026607 -Submitted batch job 3026608 -Submitted batch job 3026609 -Submitted batch job 3026610 -Submitted batch job 3026611 -Submitted batch job 3026612 -Submitted batch job 3026613 -Submitted batch job 3026615 -Submitted batch job 3026616 -Submitted batch job 3026617 -Submitted batch job 3026618 -Submitted batch job 3026619 -Submitted batch job 3026620 -Submitted batch job 3026621 -Submitted batch job 3026622 -Submitted batch job 3026623 -Submitted batch job 3026624 -Submitted batch job 3026668 -Submitted batch job 3026669 -Submitted batch job 3026670 -Submitted batch job 3026671 -Submitted batch job 3026672 -Submitted batch job 3026673 -Submitted batch job 3026674 -Submitted batch job 3026675 -Submitted batch job 3026676 -Submitted batch job 3026677 -Submitted batch job 3026719 -Submitted batch job 3026720 -Submitted batch job 3026721 -Submitted batch job 3026722 -Submitted batch job 3026723 -Submitted batch job 3026724 -Submitted batch job 3026725 -Submitted batch job 3026726 -Submitted batch job 3026727 -Submitted batch job 3026728 -Submitted batch job 3026731 -Submitted batch job 3026732 -Submitted batch job 3026733 -Submitted batch job 3026734 -Submitted batch job 3026735 -Submitted batch job 3026736 -Submitted batch job 3026737 -Submitted batch job 3026738 -Submitted batch job 3026739 -Submitted batch job 3026740 -Submitted batch job 3026816 -Submitted batch job 3026817 -Submitted batch job 3026818 -Submitted batch job 3026819 -Submitted batch job 3026820 -Submitted batch job 3026821 -Submitted batch job 3026822 -Submitted batch job 3026823 -Submitted batch job 3026824 -Submitted batch job 3026825 -Submitted batch job 3026874 -Submitted batch job 3026875 -Submitted batch job 3026876 -Submitted batch job 3026877 -Submitted batch job 3026878 -Submitted batch job 3026879 -Submitted batch job 3026880 -Submitted batch job 3026881 -Submitted batch job 3026882 -Submitted batch job 3026883 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/misc/jobid_mcl4_2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/misc/jobid_mcl4_2.txt deleted file mode 100755 index c0ae615b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/misc/jobid_mcl4_2.txt +++ /dev/null @@ -1,1725 +0,0 @@ -Submitted batch job 2953995 -Submitted batch job 2953996 -Submitted batch job 2953997 -Submitted batch job 2953998 -Submitted batch job 2953999 -Submitted batch job 2954000 -Submitted batch job 2954001 -Submitted batch job 2954002 -Submitted batch job 2954003 -Submitted batch job 2954004 -Submitted batch job 2954941 -Submitted batch job 2954942 -Submitted batch job 2954943 -Submitted batch job 2954944 -Submitted batch job 2954945 -Submitted batch job 2954946 -Submitted batch job 2954947 -Submitted batch job 2954948 -Submitted batch job 2954949 -Submitted batch job 2954950 -Submitted batch job 2954951 -Submitted batch job 2954952 -Submitted batch job 2954953 -Submitted batch job 2954954 -Submitted batch job 2954955 -Submitted batch job 2954956 -Submitted batch job 2954957 -Submitted batch job 2954958 -Submitted batch job 2954959 -Submitted batch job 2954960 -Submitted batch job 2954961 -Submitted batch job 2954962 -Submitted batch job 2954963 -Submitted batch job 2954964 -Submitted batch job 2954965 -Submitted batch job 2954966 -Submitted batch job 2954967 -Submitted batch job 2954968 -Submitted batch job 2954969 -Submitted batch job 2954970 -Submitted batch job 2954971 -Submitted batch job 2954972 -Submitted batch job 2954973 -Submitted batch job 2954974 -Submitted batch job 2954975 -Submitted batch job 2954976 -Submitted batch job 2954977 -Submitted batch job 2954978 -Submitted batch job 2954979 -Submitted batch job 2954980 -Submitted batch job 2954981 -Submitted batch job 2954982 -Submitted batch job 2954983 -Submitted batch job 2954984 -Submitted batch job 2954985 -Submitted batch job 2954986 -Submitted batch job 2954987 -Submitted batch job 2954988 -Submitted batch job 2954989 -Submitted batch job 2954990 -Submitted batch job 2954991 -Submitted batch job 2954992 -Submitted batch job 2954993 -Submitted batch job 2954994 -Submitted batch job 2954995 -Submitted batch job 2954996 -Submitted batch job 2954997 -Submitted batch job 2954998 -Submitted batch job 2954999 -Submitted batch job 2955000 -Submitted batch job 2955001 -Submitted batch job 2955002 -Submitted batch job 2955003 -Submitted batch job 2955004 -Submitted batch job 2955005 -Submitted batch job 2955006 -Submitted batch job 2955007 -Submitted batch job 2955008 -Submitted batch job 2955009 -Submitted batch job 2955010 -Submitted batch job 2955011 -Submitted batch job 2955012 -Submitted batch job 2955013 -Submitted batch job 2955014 -Submitted batch job 2955015 -Submitted batch job 2955016 -Submitted batch job 2955017 -Submitted batch job 2955018 -Submitted batch job 2955019 -Submitted batch job 2955020 -Submitted batch job 2955021 -Submitted batch job 2955022 -Submitted batch job 2955023 -Submitted batch job 2955024 -Submitted batch job 2955025 -Submitted batch job 2955026 -Submitted batch job 2955027 -Submitted batch job 2955028 -Submitted batch job 2955029 -Submitted batch job 2955030 -Submitted batch job 2955031 -Submitted batch job 2955032 -Submitted batch job 2955033 -Submitted batch job 2955034 -Submitted batch job 2955035 -Submitted batch job 2955036 -Submitted batch job 2955037 -Submitted batch job 2955038 -Submitted batch job 2955039 -Submitted batch job 2955040 -Submitted batch job 2955041 -Submitted batch job 2955042 -Submitted batch job 2955043 -Submitted batch job 2955044 -Submitted batch job 2955045 -Submitted batch job 2955046 -Submitted batch job 2955047 -Submitted batch job 2955048 -Submitted batch job 2955049 -Submitted batch job 2955050 -Submitted batch job 2955051 -Submitted batch job 2955052 -Submitted batch job 2955053 -Submitted batch job 2955054 -Submitted batch job 2955055 -Submitted batch job 2955056 -Submitted batch job 2955057 -Submitted batch job 2955058 -Submitted batch job 2955059 -Submitted batch job 2955060 -Submitted batch job 2955061 -Submitted batch job 2955062 -Submitted batch job 2955063 -Submitted batch job 2955064 -Submitted batch job 2955065 -Submitted batch job 2955066 -Submitted batch job 2955067 -Submitted batch job 2955068 -Submitted batch job 2955069 -Submitted batch job 2955070 -Submitted batch job 2955071 -Submitted batch job 2955072 -Submitted batch job 2955073 -Submitted batch job 2955074 -Submitted batch job 2955075 -Submitted batch job 2955076 -Submitted batch job 2955077 -Submitted batch job 2955078 -Submitted batch job 2955079 -Submitted batch job 2955080 -Submitted batch job 2955082 -Submitted batch job 2955083 -Submitted batch job 2955084 -Submitted batch job 2955085 -Submitted batch job 2955086 -Submitted batch job 2955087 -Submitted batch job 2955088 -Submitted batch job 2955089 -Submitted batch job 2955090 -Submitted batch job 2955091 -Submitted batch job 2955092 -Submitted batch job 2955093 -Submitted batch job 2955094 -Submitted batch job 2955095 -Submitted batch job 2955096 -Submitted batch job 2955097 -Submitted batch job 2955098 -Submitted batch job 2955099 -Submitted batch job 2955100 -Submitted batch job 2955101 -Submitted batch job 2955102 -Submitted batch job 2955103 -Submitted batch job 2955104 -Submitted batch job 2955105 -Submitted batch job 2955106 -Submitted batch job 2955107 -Submitted batch job 2955108 -Submitted batch job 2955109 -Submitted batch job 2955110 -Submitted batch job 2955111 -Submitted batch job 2955112 -Submitted batch job 2955113 -Submitted batch job 2955114 -Submitted batch job 2955115 -Submitted batch job 2955116 -Submitted batch job 2955117 -Submitted batch job 2955118 -Submitted batch job 2955119 -Submitted batch job 2955120 -Submitted batch job 2955121 -Submitted batch job 2955122 -Submitted batch job 2955123 -Submitted batch job 2955124 -Submitted batch job 2955125 -Submitted batch job 2955126 -Submitted batch job 2955127 -Submitted batch job 2955128 -Submitted batch job 2955129 -Submitted batch job 2955130 -Submitted batch job 2955131 -Submitted batch job 2955132 -Submitted batch job 2955133 -Submitted batch job 2955134 -Submitted batch job 2955135 -Submitted batch job 2955136 -Submitted batch job 2955137 -Submitted batch job 2955138 -Submitted batch job 2955139 -Submitted batch job 2955140 -Submitted batch job 2955141 -Submitted batch job 2955143 -Submitted batch job 2955144 -Submitted batch job 2955145 -Submitted batch job 2955146 -Submitted batch job 2955147 -Submitted batch job 2955148 -Submitted batch job 2955149 -Submitted batch job 2955150 -Submitted batch job 2955151 -Submitted batch job 2955152 -Submitted batch job 2955153 -Submitted batch job 2955154 -Submitted batch job 2955155 -Submitted batch job 2955156 -Submitted batch job 2955157 -Submitted batch job 2955158 -Submitted batch job 2955159 -Submitted batch job 2955160 -Submitted batch job 2955161 -Submitted batch job 2955162 -Submitted batch job 2955163 -Submitted batch job 2955164 -Submitted batch job 2955165 -Submitted batch job 2955166 -Submitted batch job 2955167 -Submitted batch job 2955168 -Submitted batch job 2955169 -Submitted batch job 2955170 -Submitted batch job 2955171 -Submitted batch job 2955172 -Submitted batch job 2955173 -Submitted batch job 2955174 -Submitted batch job 2955175 -Submitted batch job 2955176 -Submitted batch job 2955177 -Submitted batch job 2955178 -Submitted batch job 2955179 -Submitted batch job 2955180 -Submitted batch job 2955181 -Submitted batch job 2955182 -Submitted batch job 2955183 -Submitted batch job 2955184 -Submitted batch job 2955185 -Submitted batch job 2955186 -Submitted batch job 2955187 -Submitted batch job 2955188 -Submitted batch job 2955189 -Submitted batch job 2955190 -Submitted batch job 2955191 -Submitted batch job 2955192 -Submitted batch job 2955193 -Submitted batch job 2955194 -Submitted batch job 2955195 -Submitted batch job 2955196 -Submitted batch job 2955197 -Submitted batch job 2955198 -Submitted batch job 2955199 -Submitted batch job 2955200 -Submitted batch job 2955201 -Submitted batch job 2955202 -Submitted batch job 2955203 -Submitted batch job 2955204 -Submitted batch job 2955205 -Submitted batch job 2955206 -Submitted batch job 2955207 -Submitted batch job 2955208 -Submitted batch job 2955209 -Submitted batch job 2955210 -Submitted batch job 2955211 -Submitted batch job 2955212 -Submitted batch job 2955213 -Submitted batch job 2955214 -Submitted batch job 2955215 -Submitted batch job 2955216 -Submitted batch job 2955217 -Submitted batch job 2955218 -Submitted batch job 2955219 -Submitted batch job 2955220 -Submitted batch job 2955221 -Submitted batch job 2955222 -Submitted batch job 2955223 -Submitted batch job 2955224 -Submitted batch job 2955225 -Submitted batch job 2955226 -Submitted batch job 2955227 -Submitted batch job 2955228 -Submitted batch job 2955229 -Submitted batch job 2955230 -Submitted batch job 2955231 -Submitted batch job 2955232 -Submitted batch job 2955233 -Submitted batch job 2955234 -Submitted batch job 2955235 -Submitted batch job 2955236 -Submitted batch job 2955237 -Submitted batch job 2955238 -Submitted batch job 2955239 -Submitted batch job 2955240 -Submitted batch job 2955241 -Submitted batch job 2955242 -Submitted batch job 2955243 -Submitted batch job 2955244 -Submitted batch job 2955245 -Submitted batch job 2955246 -Submitted batch job 2955247 -Submitted batch job 2955248 -Submitted batch job 2955249 -Submitted batch job 2955250 -Submitted batch job 2955251 -Submitted batch job 2955252 -Submitted batch job 2955253 -Submitted batch job 2955254 -Submitted batch job 2955255 -Submitted batch job 2955256 -Submitted batch job 2955257 -Submitted batch job 2955258 -Submitted batch job 2955259 -Submitted batch job 2955260 -Submitted batch job 2955261 -Submitted batch job 2955262 -Submitted batch job 2955263 -Submitted batch job 2955264 -Submitted batch job 2955265 -Submitted batch job 2955266 -Submitted batch job 2955267 -Submitted batch job 2955268 -Submitted batch job 2955269 -Submitted batch job 2955270 -Submitted batch job 2955271 -Submitted batch job 2955272 -Submitted batch job 2955273 -Submitted batch job 2955274 -Submitted batch job 2955275 -Submitted batch job 2955276 -Submitted batch job 2955277 -Submitted batch job 2955278 -Submitted batch job 2955279 -Submitted batch job 2955280 -Submitted batch job 2955281 -Submitted batch job 2955282 -Submitted batch job 2955283 -Submitted batch job 2955284 -Submitted batch job 2955285 -Submitted batch job 2955286 -Submitted batch job 2955287 -Submitted batch job 2955288 -Submitted batch job 2955289 -Submitted batch job 2955290 -Submitted batch job 2955291 -Submitted batch job 2955292 -Submitted batch job 2955293 -Submitted batch job 2955294 -Submitted batch job 2955295 -Submitted batch job 2955296 -Submitted batch job 2955297 -Submitted batch job 2955298 -Submitted batch job 2955299 -Submitted batch job 2955300 -Submitted batch job 2955301 -Submitted batch job 2955302 -Submitted batch job 2955303 -Submitted batch job 2955304 -Submitted batch job 2955305 -Submitted batch job 2955306 -Submitted batch job 2955307 -Submitted batch job 2955308 -Submitted batch job 2955309 -Submitted batch job 2955310 -Submitted batch job 2955311 -Submitted batch job 2955312 -Submitted batch job 2955313 -Submitted batch job 2955314 -Submitted batch job 2955315 -Submitted batch job 2955316 -Submitted batch job 2955317 -Submitted batch job 2955318 -Submitted batch job 2955319 -Submitted batch job 2955320 -Submitted batch job 2955321 -Submitted batch job 2955322 -Submitted batch job 2956321 -Submitted batch job 2956322 -Submitted batch job 2956323 -Submitted batch job 2956324 -Submitted batch job 2956325 -Submitted batch job 2956326 -Submitted batch job 2956327 -Submitted batch job 2956328 -Submitted batch job 2956329 -Submitted batch job 2956330 -Submitted batch job 2957399 -Submitted batch job 2957400 -Submitted batch job 2957401 -Submitted batch job 2957402 -Submitted batch job 2957403 -Submitted batch job 2957404 -Submitted batch job 2957405 -Submitted batch job 2957406 -Submitted batch job 2957407 -Submitted batch job 2957408 -Submitted batch job 2957711 -Submitted batch job 2957712 -Submitted batch job 2957713 -Submitted batch job 2957714 -Submitted batch job 2957715 -Submitted batch job 2957716 -Submitted batch job 2957717 -Submitted batch job 2957718 -Submitted batch job 2957719 -Submitted batch job 2957720 -Submitted batch job 2958647 -Submitted batch job 2958648 -Submitted batch job 2958649 -Submitted batch job 2958650 -Submitted batch job 2958651 -Submitted batch job 2958652 -Submitted batch job 2958653 -Submitted batch job 2958654 -Submitted batch job 2958655 -Submitted batch job 2958656 -Submitted batch job 2960603 -Submitted batch job 2960604 -Submitted batch job 2960605 -Submitted batch job 2960606 -Submitted batch job 2960607 -Submitted batch job 2960608 -Submitted batch job 2960609 -Submitted batch job 2960610 -Submitted batch job 2960611 -Submitted batch job 2960612 -Submitted batch job 2961210 -Submitted batch job 2961211 -Submitted batch job 2961212 -Submitted batch job 2961213 -Submitted batch job 2961214 -Submitted batch job 2961215 -Submitted batch job 2961216 -Submitted batch job 2961217 -Submitted batch job 2961218 -Submitted batch job 2961219 -Submitted batch job 2961234 -Submitted batch job 2961235 -Submitted batch job 2961236 -Submitted batch job 2961237 -Submitted batch job 2961238 -Submitted batch job 2961239 -Submitted batch job 2961240 -Submitted batch job 2961241 -Submitted batch job 2961242 -Submitted batch job 2961243 -Submitted batch job 2961785 -Submitted batch job 2961786 -Submitted batch job 2961787 -Submitted batch job 2961788 -Submitted batch job 2961789 -Submitted batch job 2961790 -Submitted batch job 2961791 -Submitted batch job 2961792 -Submitted batch job 2961793 -Submitted batch job 2961794 -Submitted batch job 2962318 -Submitted batch job 2962319 -Submitted batch job 2962320 -Submitted batch job 2962321 -Submitted batch job 2962322 -Submitted batch job 2962323 -Submitted batch job 2962324 -Submitted batch job 2962325 -Submitted batch job 2962326 -Submitted batch job 2962327 -Submitted batch job 2963244 -Submitted batch job 2963245 -Submitted batch job 2963246 -Submitted batch job 2963247 -Submitted batch job 2963248 -Submitted batch job 2963249 -Submitted batch job 2963250 -Submitted batch job 2963251 -Submitted batch job 2963252 -Submitted batch job 2963253 -Submitted batch job 2964311 -Submitted batch job 2964312 -Submitted batch job 2964313 -Submitted batch job 2964314 -Submitted batch job 2964315 -Submitted batch job 2964316 -Submitted batch job 2964317 -Submitted batch job 2964318 -Submitted batch job 2964319 -Submitted batch job 2964320 -Submitted batch job 2964324 -Submitted batch job 2964325 -Submitted batch job 2964326 -Submitted batch job 2964327 -Submitted batch job 2964328 -Submitted batch job 2964329 -Submitted batch job 2964330 -Submitted batch job 2964331 -Submitted batch job 2964332 -Submitted batch job 2964333 -Submitted batch job 2964344 -Submitted batch job 2964345 -Submitted batch job 2964346 -Submitted batch job 2964347 -Submitted batch job 2964348 -Submitted batch job 2964349 -Submitted batch job 2964350 -Submitted batch job 2964351 -Submitted batch job 2964352 -Submitted batch job 2964353 -Submitted batch job 2964364 -Submitted batch job 2964365 -Submitted batch job 2964366 -Submitted batch job 2964367 -Submitted batch job 2964368 -Submitted batch job 2964369 -Submitted batch job 2964370 -Submitted batch job 2964371 -Submitted batch job 2964372 -Submitted batch job 2964373 -Submitted batch job 2964377 -Submitted batch job 2964378 -Submitted batch job 2964379 -Submitted batch job 2964380 -Submitted batch job 2964381 -Submitted batch job 2964382 -Submitted batch job 2964383 -Submitted batch job 2964384 -Submitted batch job 2964385 -Submitted batch job 2964386 -Submitted batch job 2964387 -Submitted batch job 2964388 -Submitted batch job 2964389 -Submitted batch job 2964390 -Submitted batch job 2964391 -Submitted batch job 2964392 -Submitted batch job 2964393 -Submitted batch job 2964394 -Submitted batch job 2964395 -Submitted batch job 2964396 -Submitted batch job 2964397 -Submitted batch job 2964398 -Submitted batch job 2964399 -Submitted batch job 2964400 -Submitted batch job 2964401 -Submitted batch job 2964402 -Submitted batch job 2964403 -Submitted batch job 2964404 -Submitted batch job 2964405 -Submitted batch job 2964406 -Submitted batch job 2964408 -Submitted batch job 2964409 -Submitted batch job 2964410 -Submitted batch job 2964411 -Submitted batch job 2964412 -Submitted batch job 2964413 -Submitted batch job 2964414 -Submitted batch job 2964415 -Submitted batch job 2964416 -Submitted batch job 2964417 -Submitted batch job 2964428 -Submitted batch job 2964429 -Submitted batch job 2964430 -Submitted batch job 2964431 -Submitted batch job 2964432 -Submitted batch job 2964433 -Submitted batch job 2964434 -Submitted batch job 2964435 -Submitted batch job 2964436 -Submitted batch job 2964437 -Submitted batch job 2964439 -Submitted batch job 2964440 -Submitted batch job 2964441 -Submitted batch job 2964442 -Submitted batch job 2964443 -Submitted batch job 2964444 -Submitted batch job 2964445 -Submitted batch job 2964446 -Submitted batch job 2964447 -Submitted batch job 2964448 -Submitted batch job 2964453 -Submitted batch job 2964454 -Submitted batch job 2964455 -Submitted batch job 2964456 -Submitted batch job 2964457 -Submitted batch job 2964458 -Submitted batch job 2964459 -Submitted batch job 2964460 -Submitted batch job 2964461 -Submitted batch job 2964462 -Submitted batch job 2964463 -Submitted batch job 2964464 -Submitted batch job 2964465 -Submitted batch job 2964466 -Submitted batch job 2964467 -Submitted batch job 2964468 -Submitted batch job 2964469 -Submitted batch job 2964470 -Submitted batch job 2964471 -Submitted batch job 2964472 -Submitted batch job 2964473 -Submitted batch job 2964474 -Submitted batch job 2964475 -Submitted batch job 2964476 -Submitted batch job 2964477 -Submitted batch job 2964478 -Submitted batch job 2964479 -Submitted batch job 2964480 -Submitted batch job 2964481 -Submitted batch job 2964482 -Submitted batch job 2964487 -Submitted batch job 2964488 -Submitted batch job 2964489 -Submitted batch job 2964490 -Submitted batch job 2964491 -Submitted batch job 2964492 -Submitted batch job 2964493 -Submitted batch job 2964494 -Submitted batch job 2964495 -Submitted batch job 2964496 -Submitted batch job 2964501 -Submitted batch job 2964502 -Submitted batch job 2964503 -Submitted batch job 2964504 -Submitted batch job 2964505 -Submitted batch job 2964506 -Submitted batch job 2964507 -Submitted batch job 2964508 -Submitted batch job 2964509 -Submitted batch job 2964510 -Submitted batch job 2964517 -Submitted batch job 2964518 -Submitted batch job 2964519 -Submitted batch job 2964520 -Submitted batch job 2964521 -Submitted batch job 2964522 -Submitted batch job 2964523 -Submitted batch job 2964524 -Submitted batch job 2964525 -Submitted batch job 2964526 -Submitted batch job 2964530 -Submitted batch job 2964531 -Submitted batch job 2964532 -Submitted batch job 2964533 -Submitted batch job 2964534 -Submitted batch job 2964535 -Submitted batch job 2964536 -Submitted batch job 2964537 -Submitted batch job 2964538 -Submitted batch job 2964539 -Submitted batch job 2964540 -Submitted batch job 2964541 -Submitted batch job 2964542 -Submitted batch job 2964543 -Submitted batch job 2964544 -Submitted batch job 2964545 -Submitted batch job 2964546 -Submitted batch job 2964547 -Submitted batch job 2964548 -Submitted batch job 2964549 -Submitted batch job 2964552 -Submitted batch job 2964553 -Submitted batch job 2964554 -Submitted batch job 2964555 -Submitted batch job 2964556 -Submitted batch job 2964557 -Submitted batch job 2964558 -Submitted batch job 2964559 -Submitted batch job 2964560 -Submitted batch job 2964561 -Submitted batch job 2964566 -Submitted batch job 2964567 -Submitted batch job 2964568 -Submitted batch job 2964569 -Submitted batch job 2964570 -Submitted batch job 2964571 -Submitted batch job 2964572 -Submitted batch job 2964573 -Submitted batch job 2964574 -Submitted batch job 2964575 -Submitted batch job 2964585 -Submitted batch job 2964586 -Submitted batch job 2964587 -Submitted batch job 2964588 -Submitted batch job 2964589 -Submitted batch job 2964590 -Submitted batch job 2964591 -Submitted batch job 2964592 -Submitted batch job 2964593 -Submitted batch job 2964594 -Submitted batch job 2964597 -Submitted batch job 2964598 -Submitted batch job 2964599 -Submitted batch job 2964600 -Submitted batch job 2964601 -Submitted batch job 2964602 -Submitted batch job 2964603 -Submitted batch job 2964604 -Submitted batch job 2964605 -Submitted batch job 2964606 -Submitted batch job 2964610 -Submitted batch job 2964611 -Submitted batch job 2964612 -Submitted batch job 2964613 -Submitted batch job 2964614 -Submitted batch job 2964615 -Submitted batch job 2964616 -Submitted batch job 2964617 -Submitted batch job 2964618 -Submitted batch job 2964619 -Submitted batch job 2964620 -Submitted batch job 2964621 -Submitted batch job 2964622 -Submitted batch job 2964623 -Submitted batch job 2964624 -Submitted batch job 2964625 -Submitted batch job 2964626 -Submitted batch job 2964627 -Submitted batch job 2964628 -Submitted batch job 2964629 -Submitted batch job 2964630 -Submitted batch job 2964631 -Submitted batch job 2964632 -Submitted batch job 2964633 -Submitted batch job 2964634 -Submitted batch job 2964635 -Submitted batch job 2964636 -Submitted batch job 2964637 -Submitted batch job 2964638 -Submitted batch job 2964639 -Submitted batch job 2964640 -Submitted batch job 2964641 -Submitted batch job 2964642 -Submitted batch job 2964643 -Submitted batch job 2964644 -Submitted batch job 2964645 -Submitted batch job 2964646 -Submitted batch job 2964647 -Submitted batch job 2964648 -Submitted batch job 2964649 -Submitted batch job 2964652 -Submitted batch job 2964653 -Submitted batch job 2964654 -Submitted batch job 2964655 -Submitted batch job 2964656 -Submitted batch job 2964657 -Submitted batch job 2964658 -Submitted batch job 2964659 -Submitted batch job 2964660 -Submitted batch job 2964661 -Submitted batch job 2964662 -Submitted batch job 2964663 -Submitted batch job 2964664 -Submitted batch job 2964665 -Submitted batch job 2964666 -Submitted batch job 2964667 -Submitted batch job 2964668 -Submitted batch job 2964669 -Submitted batch job 2964670 -Submitted batch job 2964671 -Submitted batch job 2964672 -Submitted batch job 2964673 -Submitted batch job 2964674 -Submitted batch job 2964675 -Submitted batch job 2964676 -Submitted batch job 2964677 -Submitted batch job 2964678 -Submitted batch job 2964679 -Submitted batch job 2964680 -Submitted batch job 2964681 -Submitted batch job 2964685 -Submitted batch job 2964686 -Submitted batch job 2964687 -Submitted batch job 2964688 -Submitted batch job 2964689 -Submitted batch job 2964690 -Submitted batch job 2964691 -Submitted batch job 2964692 -Submitted batch job 2964693 -Submitted batch job 2964694 -Submitted batch job 2964697 -Submitted batch job 2964698 -Submitted batch job 2964699 -Submitted batch job 2964700 -Submitted batch job 2964701 -Submitted batch job 2964702 -Submitted batch job 2964703 -Submitted batch job 2964704 -Submitted batch job 2964705 -Submitted batch job 2964706 -Submitted batch job 2964724 -Submitted batch job 2964725 -Submitted batch job 2964726 -Submitted batch job 2964727 -Submitted batch job 2964728 -Submitted batch job 2964729 -Submitted batch job 2964730 -Submitted batch job 2964731 -Submitted batch job 2964732 -Submitted batch job 2964733 -Submitted batch job 2964769 -Submitted batch job 2964770 -Submitted batch job 2964771 -Submitted batch job 2964772 -Submitted batch job 2964773 -Submitted batch job 2964774 -Submitted batch job 2964775 -Submitted batch job 2964776 -Submitted batch job 2964777 -Submitted batch job 2964778 -Submitted batch job 2964779 -Submitted batch job 2964780 -Submitted batch job 2964781 -Submitted batch job 2964782 -Submitted batch job 2964783 -Submitted batch job 2964784 -Submitted batch job 2964785 -Submitted batch job 2964786 -Submitted batch job 2964787 -Submitted batch job 2964788 -Submitted batch job 2964789 -Submitted batch job 2964790 -Submitted batch job 2964791 -Submitted batch job 2964792 -Submitted batch job 2964793 -Submitted batch job 2964794 -Submitted batch job 2964795 -Submitted batch job 2964796 -Submitted batch job 2964797 -Submitted batch job 2964798 -Submitted batch job 2964799 -Submitted batch job 2964800 -Submitted batch job 2964801 -Submitted batch job 2964802 -Submitted batch job 2964803 -Submitted batch job 2964804 -Submitted batch job 2964805 -Submitted batch job 2964806 -Submitted batch job 2964807 -Submitted batch job 2964808 -Submitted batch job 2964827 -Submitted batch job 2964828 -Submitted batch job 2964829 -Submitted batch job 2964830 -Submitted batch job 2964831 -Submitted batch job 2964832 -Submitted batch job 2964833 -Submitted batch job 2964834 -Submitted batch job 2964835 -Submitted batch job 2964836 -Submitted batch job 2964875 -Submitted batch job 2964876 -Submitted batch job 2964877 -Submitted batch job 2964878 -Submitted batch job 2964879 -Submitted batch job 2964880 -Submitted batch job 2964881 -Submitted batch job 2964882 -Submitted batch job 2964883 -Submitted batch job 2964884 -Submitted batch job 2964954 -Submitted batch job 2964955 -Submitted batch job 2964956 -Submitted batch job 2964957 -Submitted batch job 2964958 -Submitted batch job 2964959 -Submitted batch job 2964960 -Submitted batch job 2964961 -Submitted batch job 2964962 -Submitted batch job 2964963 -Submitted batch job 2965171 -Submitted batch job 2965172 -Submitted batch job 2965173 -Submitted batch job 2965174 -Submitted batch job 2965175 -Submitted batch job 2965176 -Submitted batch job 2965177 -Submitted batch job 2965178 -Submitted batch job 2965179 -Submitted batch job 2965180 -Submitted batch job 2965236 -Submitted batch job 2965237 -Submitted batch job 2965238 -Submitted batch job 2965239 -Submitted batch job 2965240 -Submitted batch job 2965241 -Submitted batch job 2965242 -Submitted batch job 2965243 -Submitted batch job 2965244 -Submitted batch job 2965245 -Submitted batch job 2965248 -Submitted batch job 2965249 -Submitted batch job 2965250 -Submitted batch job 2965251 -Submitted batch job 2965252 -Submitted batch job 2965253 -Submitted batch job 2965254 -Submitted batch job 2965255 -Submitted batch job 2965256 -Submitted batch job 2965257 -Submitted batch job 2965261 -Submitted batch job 2965262 -Submitted batch job 2965263 -Submitted batch job 2965264 -Submitted batch job 2965265 -Submitted batch job 2965266 -Submitted batch job 2965267 -Submitted batch job 2965268 -Submitted batch job 2965269 -Submitted batch job 2965270 -Submitted batch job 2965278 -Submitted batch job 2965279 -Submitted batch job 2965280 -Submitted batch job 2965281 -Submitted batch job 2965282 -Submitted batch job 2965283 -Submitted batch job 2965284 -Submitted batch job 2965285 -Submitted batch job 2965286 -Submitted batch job 2965287 -Submitted batch job 2965288 -Submitted batch job 2965289 -Submitted batch job 2965290 -Submitted batch job 2965291 -Submitted batch job 2965292 -Submitted batch job 2965293 -Submitted batch job 2965294 -Submitted batch job 2965295 -Submitted batch job 2965296 -Submitted batch job 2965297 -Submitted batch job 2965298 -Submitted batch job 2965299 -Submitted batch job 2965300 -Submitted batch job 2965301 -Submitted batch job 2965302 -Submitted batch job 2965303 -Submitted batch job 2965304 -Submitted batch job 2965305 -Submitted batch job 2965306 -Submitted batch job 2965307 -Submitted batch job 2965310 -Submitted batch job 2965311 -Submitted batch job 2965312 -Submitted batch job 2965313 -Submitted batch job 2965314 -Submitted batch job 2965315 -Submitted batch job 2965316 -Submitted batch job 2965317 -Submitted batch job 2965318 -Submitted batch job 2965319 -Submitted batch job 2965563 -Submitted batch job 2965564 -Submitted batch job 2965565 -Submitted batch job 2965566 -Submitted batch job 2965567 -Submitted batch job 2965568 -Submitted batch job 2965569 -Submitted batch job 2965570 -Submitted batch job 2965571 -Submitted batch job 2965572 -Submitted batch job 2965573 -Submitted batch job 2965574 -Submitted batch job 2965575 -Submitted batch job 2965576 -Submitted batch job 2965577 -Submitted batch job 2965578 -Submitted batch job 2965579 -Submitted batch job 2965580 -Submitted batch job 2965581 -Submitted batch job 2965582 -Submitted batch job 2965693 -Submitted batch job 2965694 -Submitted batch job 2965695 -Submitted batch job 2965696 -Submitted batch job 2965697 -Submitted batch job 2965698 -Submitted batch job 2965699 -Submitted batch job 2965700 -Submitted batch job 2965701 -Submitted batch job 2965702 -Submitted batch job 2965707 -Submitted batch job 2965708 -Submitted batch job 2965709 -Submitted batch job 2965710 -Submitted batch job 2965711 -Submitted batch job 2965712 -Submitted batch job 2965713 -Submitted batch job 2965714 -Submitted batch job 2965715 -Submitted batch job 2965716 -Submitted batch job 2965718 -Submitted batch job 2965719 -Submitted batch job 2965720 -Submitted batch job 2965721 -Submitted batch job 2965722 -Submitted batch job 2965723 -Submitted batch job 2965724 -Submitted batch job 2965725 -Submitted batch job 2965726 -Submitted batch job 2965727 -Submitted batch job 2965731 -Submitted batch job 2965732 -Submitted batch job 2965733 -Submitted batch job 2965734 -Submitted batch job 2965735 -Submitted batch job 2965736 -Submitted batch job 2965737 -Submitted batch job 2965738 -Submitted batch job 2965739 -Submitted batch job 2965740 -Submitted batch job 2965966 -Submitted batch job 2965967 -Submitted batch job 2965968 -Submitted batch job 2965969 -Submitted batch job 2965970 -Submitted batch job 2965971 -Submitted batch job 2965972 -Submitted batch job 2965973 -Submitted batch job 2965974 -Submitted batch job 2965975 -Submitted batch job 2965978 -Submitted batch job 2965979 -Submitted batch job 2965980 -Submitted batch job 2965981 -Submitted batch job 2965982 -Submitted batch job 2965983 -Submitted batch job 2965984 -Submitted batch job 2965985 -Submitted batch job 2965986 -Submitted batch job 2965987 -Submitted batch job 2965990 -Submitted batch job 2965991 -Submitted batch job 2965992 -Submitted batch job 2965993 -Submitted batch job 2965994 -Submitted batch job 2965995 -Submitted batch job 2965996 -Submitted batch job 2965997 -Submitted batch job 2965998 -Submitted batch job 2965999 -Submitted batch job 2966001 -Submitted batch job 2966002 -Submitted batch job 2966003 -Submitted batch job 2966004 -Submitted batch job 2966005 -Submitted batch job 2966006 -Submitted batch job 2966007 -Submitted batch job 2966008 -Submitted batch job 2966009 -Submitted batch job 2966010 -Submitted batch job 2966012 -Submitted batch job 2966013 -Submitted batch job 2966014 -Submitted batch job 2966015 -Submitted batch job 2966016 -Submitted batch job 2966017 -Submitted batch job 2966018 -Submitted batch job 2966019 -Submitted batch job 2966020 -Submitted batch job 2966021 -Submitted batch job 2966084 -Submitted batch job 2966085 -Submitted batch job 2966086 -Submitted batch job 2966087 -Submitted batch job 2966088 -Submitted batch job 2966089 -Submitted batch job 2966090 -Submitted batch job 2966091 -Submitted batch job 2966092 -Submitted batch job 2966093 -Submitted batch job 2966096 -Submitted batch job 2966097 -Submitted batch job 2966098 -Submitted batch job 2966099 -Submitted batch job 2966100 -Submitted batch job 2966101 -Submitted batch job 2966102 -Submitted batch job 2966103 -Submitted batch job 2966104 -Submitted batch job 2966105 -Submitted batch job 2966106 -Submitted batch job 2966107 -Submitted batch job 2966108 -Submitted batch job 2966109 -Submitted batch job 2966110 -Submitted batch job 2966111 -Submitted batch job 2966112 -Submitted batch job 2966113 -Submitted batch job 2966114 -Submitted batch job 2966115 -Submitted batch job 2966124 -Submitted batch job 2966125 -Submitted batch job 2966126 -Submitted batch job 2966127 -Submitted batch job 2966128 -Submitted batch job 2966129 -Submitted batch job 2966130 -Submitted batch job 2966131 -Submitted batch job 2966132 -Submitted batch job 2966133 -Submitted batch job 2966134 -Submitted batch job 2966135 -Submitted batch job 2966136 -Submitted batch job 2966137 -Submitted batch job 2966138 -Submitted batch job 2966139 -Submitted batch job 2966140 -Submitted batch job 2966141 -Submitted batch job 2966142 -Submitted batch job 2966143 -Submitted batch job 2966145 -Submitted batch job 2966146 -Submitted batch job 2966147 -Submitted batch job 2966148 -Submitted batch job 2966149 -Submitted batch job 2966150 -Submitted batch job 2966151 -Submitted batch job 2966152 -Submitted batch job 2966153 -Submitted batch job 2966154 -Submitted batch job 2966155 -Submitted batch job 2966156 -Submitted batch job 2966157 -Submitted batch job 2966158 -Submitted batch job 2966159 -Submitted batch job 2966160 -Submitted batch job 2966161 -Submitted batch job 2966162 -Submitted batch job 2966163 -Submitted batch job 2966164 -Submitted batch job 2966165 -Submitted batch job 2966166 -Submitted batch job 2966167 -Submitted batch job 2966168 -Submitted batch job 2966169 -Submitted batch job 2966170 -Submitted batch job 2966171 -Submitted batch job 2966172 -Submitted batch job 2966173 -Submitted batch job 2966174 -Submitted batch job 2966175 -Submitted batch job 2966176 -Submitted batch job 2966177 -Submitted batch job 2966178 -Submitted batch job 2966179 -Submitted batch job 2966180 -Submitted batch job 2966181 -Submitted batch job 2966182 -Submitted batch job 2966183 -Submitted batch job 2966184 -Submitted batch job 2966297 -Submitted batch job 2966298 -Submitted batch job 2966299 -Submitted batch job 2966300 -Submitted batch job 2966301 -Submitted batch job 2966302 -Submitted batch job 2966303 -Submitted batch job 2966304 -Submitted batch job 2966305 -Submitted batch job 2966306 -Submitted batch job 2966307 -Submitted batch job 2966308 -Submitted batch job 2966309 -Submitted batch job 2966310 -Submitted batch job 2966311 -Submitted batch job 2966312 -Submitted batch job 2966313 -Submitted batch job 2966314 -Submitted batch job 2966315 -Submitted batch job 2966316 -Submitted batch job 2966319 -Submitted batch job 2966320 -Submitted batch job 2966321 -Submitted batch job 2966322 -Submitted batch job 2966323 -Submitted batch job 2966324 -Submitted batch job 2966325 -Submitted batch job 2966326 -Submitted batch job 2966327 -Submitted batch job 2966328 -Submitted batch job 2966454 -Submitted batch job 2966455 -Submitted batch job 2966456 -Submitted batch job 2966457 -Submitted batch job 2966458 -Submitted batch job 2966459 -Submitted batch job 2966460 -Submitted batch job 2966461 -Submitted batch job 2966462 -Submitted batch job 2966463 -Submitted batch job 2966549 -Submitted batch job 2966550 -Submitted batch job 2966551 -Submitted batch job 2966552 -Submitted batch job 2966553 -Submitted batch job 2966554 -Submitted batch job 2966555 -Submitted batch job 2966556 -Submitted batch job 2966557 -Submitted batch job 2966558 -Submitted batch job 2966559 -Submitted batch job 2966560 -Submitted batch job 2966561 -Submitted batch job 2966562 -Submitted batch job 2966563 -Submitted batch job 2966564 -Submitted batch job 2966565 -Submitted batch job 2966566 -Submitted batch job 2966567 -Submitted batch job 2966568 -Submitted batch job 2966725 -Submitted batch job 2966726 -Submitted batch job 2966727 -Submitted batch job 2966728 -Submitted batch job 2966729 -Submitted batch job 2966730 -Submitted batch job 2966731 -Submitted batch job 2966732 -Submitted batch job 2966733 -Submitted batch job 2966734 -Submitted batch job 2966790 -Submitted batch job 2966791 -Submitted batch job 2966792 -Submitted batch job 2966793 -Submitted batch job 2966794 -Submitted batch job 2966796 -Submitted batch job 2966797 -Submitted batch job 2966798 -Submitted batch job 2966799 -Submitted batch job 2966800 -Submitted batch job 2966801 -Submitted batch job 2966802 -Submitted batch job 2966803 -Submitted batch job 2966804 -Submitted batch job 2966805 -Submitted batch job 2966806 -Submitted batch job 2966807 -Submitted batch job 2966808 -Submitted batch job 2966809 -Submitted batch job 2966810 -Submitted batch job 2966811 -Submitted batch job 2966812 -Submitted batch job 2966813 -Submitted batch job 2966814 -Submitted batch job 2966815 -Submitted batch job 2966816 -Submitted batch job 2966817 -Submitted batch job 2966818 -Submitted batch job 2966819 -Submitted batch job 2966820 -Submitted batch job 2966821 -Submitted batch job 2966822 -Submitted batch job 2966823 -Submitted batch job 2966824 -Submitted batch job 2966825 -Submitted batch job 2966826 -Submitted batch job 2966827 -Submitted batch job 2966828 -Submitted batch job 2966829 -Submitted batch job 2966830 -Submitted batch job 2966932 -Submitted batch job 2966933 -Submitted batch job 2966934 -Submitted batch job 2966935 -Submitted batch job 2966936 -Submitted batch job 2966937 -Submitted batch job 2966938 -Submitted batch job 2966939 -Submitted batch job 2966940 -Submitted batch job 2966941 -Submitted batch job 2966943 -Submitted batch job 2966944 -Submitted batch job 2966945 -Submitted batch job 2966946 -Submitted batch job 2966947 -Submitted batch job 2966948 -Submitted batch job 2966949 -Submitted batch job 2966950 -Submitted batch job 2966951 -Submitted batch job 2966952 -Submitted batch job 2966953 -Submitted batch job 2966954 -Submitted batch job 2966955 -Submitted batch job 2966956 -Submitted batch job 2966957 -Submitted batch job 2966958 -Submitted batch job 2966959 -Submitted batch job 2966960 -Submitted batch job 2966961 -Submitted batch job 2966962 -Submitted batch job 2966963 -Submitted batch job 2966964 -Submitted batch job 2966965 -Submitted batch job 2966966 -Submitted batch job 2966967 -Submitted batch job 2966968 -Submitted batch job 2966969 -Submitted batch job 2966970 -Submitted batch job 2966971 -Submitted batch job 2966972 -Submitted batch job 2966973 -Submitted batch job 2966974 -Submitted batch job 2966975 -Submitted batch job 2966976 -Submitted batch job 2966977 -Submitted batch job 2966978 -Submitted batch job 2966979 -Submitted batch job 2966980 -Submitted batch job 2966981 -Submitted batch job 2966982 -Submitted batch job 2966983 -Submitted batch job 2966984 -Submitted batch job 2966985 -Submitted batch job 2966986 -Submitted batch job 2966987 -Submitted batch job 2966988 -Submitted batch job 2966989 -Submitted batch job 2966990 -Submitted batch job 2966991 -Submitted batch job 2966992 -Submitted batch job 2966993 -Submitted batch job 2966994 -Submitted batch job 2966995 -Submitted batch job 2966996 -Submitted batch job 2966997 -Submitted batch job 2966998 -Submitted batch job 2966999 -Submitted batch job 2967000 -Submitted batch job 2967001 -Submitted batch job 2967002 -Submitted batch job 2967003 -Submitted batch job 2967004 -Submitted batch job 2967005 -Submitted batch job 2967006 -Submitted batch job 2967007 -Submitted batch job 2967008 -Submitted batch job 2967009 -Submitted batch job 2967010 -Submitted batch job 2967011 -Submitted batch job 2967012 -Submitted batch job 2967066 -Submitted batch job 2967067 -Submitted batch job 2967068 -Submitted batch job 2967069 -Submitted batch job 2967070 -Submitted batch job 2967071 -Submitted batch job 2967072 -Submitted batch job 2967073 -Submitted batch job 2967074 -Submitted batch job 2967075 -Submitted batch job 2967076 -Submitted batch job 2967077 -Submitted batch job 2967078 -Submitted batch job 2967079 -Submitted batch job 2967080 -Submitted batch job 2967081 -Submitted batch job 2967082 -Submitted batch job 2967083 -Submitted batch job 2967084 -Submitted batch job 2967085 -Submitted batch job 2967087 -Submitted batch job 2967088 -Submitted batch job 2967089 -Submitted batch job 2967090 -Submitted batch job 2967091 -Submitted batch job 2967092 -Submitted batch job 2967093 -Submitted batch job 2967094 -Submitted batch job 2967095 -Submitted batch job 2967096 -Submitted batch job 2967099 -Submitted batch job 2967100 -Submitted batch job 2967101 -Submitted batch job 2967102 -Submitted batch job 2967103 -Submitted batch job 2967104 -Submitted batch job 2967105 -Submitted batch job 2967106 -Submitted batch job 2967107 -Submitted batch job 2967108 -Submitted batch job 2967112 -Submitted batch job 2967113 -Submitted batch job 2967114 -Submitted batch job 2967115 -Submitted batch job 2967116 -Submitted batch job 2967117 -Submitted batch job 2967118 -Submitted batch job 2967119 -Submitted batch job 2967120 -Submitted batch job 2967121 -Submitted batch job 2967123 -Submitted batch job 2967124 -Submitted batch job 2967125 -Submitted batch job 2967126 -Submitted batch job 2967127 -Submitted batch job 2967129 -Submitted batch job 2967130 -Submitted batch job 2967131 -Submitted batch job 2967132 -Submitted batch job 2967133 -Submitted batch job 2967139 -Submitted batch job 2967140 -Submitted batch job 2967141 -Submitted batch job 2967142 -Submitted batch job 2967143 -Submitted batch job 2967144 -Submitted batch job 2967145 -Submitted batch job 2967146 -Submitted batch job 2967147 -Submitted batch job 2967148 -Submitted batch job 2967267 -Submitted batch job 2967268 -Submitted batch job 2967269 -Submitted batch job 2967270 -Submitted batch job 2967271 -Submitted batch job 2967272 -Submitted batch job 2967273 -Submitted batch job 2967274 -Submitted batch job 2967275 -Submitted batch job 2967276 -Submitted batch job 2967277 -Submitted batch job 2967278 -Submitted batch job 2967279 -Submitted batch job 2967280 -Submitted batch job 2967281 -Submitted batch job 2967282 -Submitted batch job 2967283 -Submitted batch job 2967284 -Submitted batch job 2967285 -Submitted batch job 2967286 -Submitted batch job 2967287 -Submitted batch job 2967288 -Submitted batch job 2967289 -Submitted batch job 2967290 -Submitted batch job 2967291 -Submitted batch job 2967292 -Submitted batch job 2967293 -Submitted batch job 2967294 -Submitted batch job 2967295 -Submitted batch job 2967296 -Submitted batch job 2967402 -Submitted batch job 2967403 -Submitted batch job 2967404 -Submitted batch job 2967405 -Submitted batch job 2967406 -Submitted batch job 2967407 -Submitted batch job 2967408 -Submitted batch job 2967409 -Submitted batch job 2967410 -Submitted batch job 2967411 -Submitted batch job 2967413 -Submitted batch job 2967414 -Submitted batch job 2967415 -Submitted batch job 2967416 -Submitted batch job 2967417 -Submitted batch job 2967418 -Submitted batch job 2967419 -Submitted batch job 2967420 -Submitted batch job 2967421 -Submitted batch job 2967422 -Submitted batch job 2967429 -Submitted batch job 2967430 -Submitted batch job 2967431 -Submitted batch job 2967432 -Submitted batch job 2967433 -Submitted batch job 2967434 -Submitted batch job 2967435 -Submitted batch job 2967436 -Submitted batch job 2967437 -Submitted batch job 2967438 -Submitted batch job 2967439 -Submitted batch job 2967440 -Submitted batch job 2967441 -Submitted batch job 2967442 -Submitted batch job 2967443 -Submitted batch job 2967444 -Submitted batch job 2967445 -Submitted batch job 2967446 -Submitted batch job 2967447 -Submitted batch job 2967448 -Submitted batch job 2967449 -Submitted batch job 2967450 -Submitted batch job 2967451 -Submitted batch job 2967452 -Submitted batch job 2967453 -Submitted batch job 2967454 -Submitted batch job 2967455 -Submitted batch job 2967456 -Submitted batch job 2967457 -Submitted batch job 2967458 -Submitted batch job 2967459 -Submitted batch job 2967460 -Submitted batch job 2967461 -Submitted batch job 2967462 -Submitted batch job 2967463 -Submitted batch job 2967464 -Submitted batch job 2967465 -Submitted batch job 2967466 -Submitted batch job 2967467 -Submitted batch job 2967468 -Submitted batch job 2967469 -Submitted batch job 2967470 -Submitted batch job 2967471 -Submitted batch job 2967472 -Submitted batch job 2967473 -Submitted batch job 2967474 -Submitted batch job 2967475 -Submitted batch job 2967476 -Submitted batch job 2967477 -Submitted batch job 2967478 -Submitted batch job 2967479 -Submitted batch job 2967480 -Submitted batch job 2967481 -Submitted batch job 2967482 -Submitted batch job 2967483 -Submitted batch job 2967484 -Submitted batch job 2967485 -Submitted batch job 2967486 -Submitted batch job 2967487 -Submitted batch job 2967488 -Submitted batch job 2967489 -Submitted batch job 2967490 -Submitted batch job 2967491 -Submitted batch job 2967492 -Submitted batch job 2967493 -Submitted batch job 2967494 -Submitted batch job 2967495 -Submitted batch job 2967496 -Submitted batch job 2967497 -Submitted batch job 2967498 -Submitted batch job 2967510 -Submitted batch job 2967511 -Submitted batch job 2967512 -Submitted batch job 2967513 -Submitted batch job 2967514 -Submitted batch job 2967515 -Submitted batch job 2967516 -Submitted batch job 2967517 -Submitted batch job 2967518 -Submitted batch job 2967519 -Submitted batch job 2967525 -Submitted batch job 2967526 -Submitted batch job 2967527 -Submitted batch job 2967528 -Submitted batch job 2967529 -Submitted batch job 2967530 -Submitted batch job 2967531 -Submitted batch job 2967532 -Submitted batch job 2967533 -Submitted batch job 2967534 -Submitted batch job 2967554 -Submitted batch job 2967555 -Submitted batch job 2967556 -Submitted batch job 2967557 -Submitted batch job 2967558 -Submitted batch job 2967559 -Submitted batch job 2967560 -Submitted batch job 2967561 -Submitted batch job 2967562 -Submitted batch job 2967563 -Submitted batch job 2967565 -Submitted batch job 2967566 -Submitted batch job 2967567 -Submitted batch job 2967568 -Submitted batch job 2967569 -Submitted batch job 2967570 -Submitted batch job 2967571 -Submitted batch job 2967572 -Submitted batch job 2967573 -Submitted batch job 2967574 -Submitted batch job 2967576 -Submitted batch job 2967577 -Submitted batch job 2967578 -Submitted batch job 2967579 -Submitted batch job 2967580 -Submitted batch job 2967581 -Submitted batch job 2967582 -Submitted batch job 2967583 -Submitted batch job 2967584 -Submitted batch job 2967585 -Submitted batch job 2967639 -Submitted batch job 2967640 -Submitted batch job 2967641 -Submitted batch job 2967642 -Submitted batch job 2967643 -Submitted batch job 2967644 -Submitted batch job 2967645 -Submitted batch job 2967646 -Submitted batch job 2967647 -Submitted batch job 2967648 -Submitted batch job 2967650 -Submitted batch job 2967651 -Submitted batch job 2967652 -Submitted batch job 2967653 -Submitted batch job 2967654 -Submitted batch job 2967655 -Submitted batch job 2967656 -Submitted batch job 2967657 -Submitted batch job 2967658 -Submitted batch job 2967659 -Submitted batch job 2967760 -Submitted batch job 2967761 -Submitted batch job 2967762 -Submitted batch job 2967763 -Submitted batch job 2967764 -Submitted batch job 2967765 -Submitted batch job 2967766 -Submitted batch job 2967767 -Submitted batch job 2967768 -Submitted batch job 2967769 -Submitted batch job 2967774 -Submitted batch job 2967775 -Submitted batch job 2967776 -Submitted batch job 2967777 -Submitted batch job 2967778 -Submitted batch job 2967779 -Submitted batch job 2967780 -Submitted batch job 2967781 -Submitted batch job 2967782 -Submitted batch job 2967783 -Submitted batch job 2967784 -Submitted batch job 2967785 -Submitted batch job 2967786 -Submitted batch job 2967787 -Submitted batch job 2967788 -Submitted batch job 2967789 -Submitted batch job 2967790 -Submitted batch job 2967791 -Submitted batch job 2967792 -Submitted batch job 2967793 -Submitted batch job 2967794 -Submitted batch job 2967795 -Submitted batch job 2967796 -Submitted batch job 2967797 -Submitted batch job 2967798 -Submitted batch job 2967799 -Submitted batch job 2967800 -Submitted batch job 2967801 -Submitted batch job 2967802 -Submitted batch job 2967803 -Submitted batch job 2967910 -Submitted batch job 2967911 -Submitted batch job 2967912 -Submitted batch job 2967913 -Submitted batch job 2967914 -Submitted batch job 2967915 -Submitted batch job 2967916 -Submitted batch job 2967917 -Submitted batch job 2967918 -Submitted batch job 2967919 -Submitted batch job 2967921 -Submitted batch job 2967922 -Submitted batch job 2967923 -Submitted batch job 2967924 -Submitted batch job 2967925 -Submitted batch job 2967926 -Submitted batch job 2967927 -Submitted batch job 2967928 -Submitted batch job 2967929 -Submitted batch job 2967930 -Submitted batch job 2967948 -Submitted batch job 2967949 -Submitted batch job 2967950 -Submitted batch job 2967951 -Submitted batch job 2967952 -Submitted batch job 2967953 -Submitted batch job 2967954 -Submitted batch job 2967955 -Submitted batch job 2967956 -Submitted batch job 2967957 -Submitted batch job 2967959 -Submitted batch job 2967960 -Submitted batch job 2967961 -Submitted batch job 2967962 -Submitted batch job 2967963 -Submitted batch job 2967964 -Submitted batch job 2967965 -Submitted batch job 2967966 -Submitted batch job 2967967 -Submitted batch job 2967968 -Submitted batch job 2967969 -Submitted batch job 2967970 -sed: couldn't flush /scratch/jgynther/diazalej/Uppsala-FEP/1.JACS/4.MCL1/1.protein/FEP_64-61/inputfiles/sedyYdaQX: Disk quota exceeded -Submitted batch job 2967971 -sed: couldn't flush /scratch/jgynther/diazalej/Uppsala-FEP/1.JACS/4.MCL1/1.protein/FEP_64-61/inputfiles/sedsiaWMN: Disk quota exceeded -Submitted batch job 2967972 -Submitted batch job 2967973 -Submitted batch job 2967974 -Submitted batch job 2967975 -Submitted batch job 2967976 -Submitted batch job 2967977 -Submitted batch job 2967978 -sed: couldn't flush /scratch/jgynther/diazalej/Uppsala-FEP/1.JACS/4.MCL1/1.protein/FEP_62-58/inputfiles/sedrS92r1: Disk quota exceeded -sed: couldn't flush /scratch/jgynther/diazalej/Uppsala-FEP/1.JACS/4.MCL1/1.protein/FEP_62-58/inputfiles/sedPguzM0: Disk quota exceeded -sed: couldn't flush /scratch/jgynther/diazalej/Uppsala-FEP/1.JACS/4.MCL1/1.protein/FEP_62-58/inputfiles/sed6LVYPi: Disk quota exceeded -sed: couldn't flush /scratch/jgynther/diazalej/Uppsala-FEP/1.JACS/4.MCL1/1.protein/FEP_62-58/inputfiles/sedNc52rq: Disk quota exceeded -sed: couldn't flush /scratch/jgynther/diazalej/Uppsala-FEP/1.JACS/4.MCL1/1.protein/FEP_62-58/inputfiles/sed4uLH7z: Disk quota exceeded -Submitted batch job 2968222 -sed: couldn't flush /scratch/jgynther/diazalej/Uppsala-FEP/1.JACS/4.MCL1/1.protein/FEP_62-58/inputfiles/sed4VKsHK: Disk quota exceeded -Submitted batch job 2968223 -sed: couldn't flush /scratch/jgynther/diazalej/Uppsala-FEP/1.JACS/4.MCL1/1.protein/FEP_62-58/inputfiles/sedsTOkXX: Disk quota exceeded -Submitted batch job 2968224 -sed: couldn't flush /scratch/jgynther/diazalej/Uppsala-FEP/1.JACS/4.MCL1/1.protein/FEP_62-58/inputfiles/sedBzgHTZ: Disk quota exceeded -Submitted batch job 2968225 -sed: -Submitted batch job 2968226 -sed: -Submitted batch job 2968227 -sed: -sed: -sed: - - - - diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/no-vs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/no-vs/protein.txt deleted file mode 100755 index 7bb64ee9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/no-vs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,862 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_65-23 12.22 0.31 -FEP_68-52 -44.52 0.68 -FEP_65-34 -2.96 0.87 -FEP_67-39 -29.63 0.78 -FEP_53-40 nan nan -FEP_60-27 -11.78 0.58 -FEP_52-51 20.10 0.89 -FEP_51-50 -8.58 0.25 -FEP_65-35 -15.30 0.46 -FEP_30-29 22.20 0.83 -FEP_44-36 -7.06 0.32 -FEP_65-52 -16.29 1.25 -FEP_48-40 nan nan -FEP_41-26 39.32 0.88 -FEP_32-28 2.89 0.46 -FEP_57-33 -42.62 0.72 -FEP_56-50 -20.02 0.34 -FEP_68-53 -46.48 0.87 -FEP_35-28 5.77 0.35 -FEP_41-39 0.12 0.81 -FEP_61-30 -30.84 0.52 -FEP_40-37 -10.10 nan -FEP_45-23 24.64 0.46 -FEP_53-38 10.68 1.53 -FEP_57-47 -68.98 1.11 -FEP_68-48 -30.19 0.36 -FEP_65-48 -4.74 0.33 -FEP_37-29 24.37 0.78 -FEP_65-27 -11.79 0.78 -FEP_58-41 -17.35 1.80 -FEP_39-32 -6.24 1.07 -FEP_65-64 6.47 0.47 -FEP_44-41 -3.09 1.59 -FEP_49-46 -11.88 0.30 -FEP_46-41 7.96 nan -FEP_61-43 -27.82 0.47 -FEP_68-67 -4.51 0.39 -FEP_64-49 -12.32 0.82 -FEP_54-49 6.53 0.60 -FEP_53-34 17.16 0.70 -FEP_56-31 -21.53 0.49 -FEP_46-43 7.02 0.21 -FEP_68-23 -13.77 0.38 -FEP_37-23 23.96 0.41 -FEP_45-44 6.45 0.29 -FEP_65-40 -2.62 1.42 -FEP_66-54 -19.85 0.32 -FEP_51-26 28.75 0.35 -FEP_61-42 -24.88 0.56 -FEP_58-43 -17.69 0.51 -FEP_37-33 -1.69 1.33 -FEP_43-42 1.51 0.66 -FEP_41-36 -1.92 1.79 -FEP_45-26 45.56 0.69 -FEP_38-29 19.42 0.97 -FEP_45-36 -0.25 0.64 -FEP_50-42 -2.06 0.37 -FEP_68-26 6.99 0.71 -FEP_58-56 7.46 0.48 -FEP_48-33 -10.71 0.46 -FEP_56-44 -22.29 0.45 -FEP_67-23 -9.37 0.96 -FEP_38-32 -5.79 0.82 -FEP_58-52 -24.83 1.25 -FEP_67-41 -29.56 0.25 -FEP_68-35 -40.53 0.52 -FEP_60-33 -18.56 0.63 -FEP_63-28 -7.31 0.61 -FEP_54-48 6.15 0.44 -FEP_28-27 -0.36 0.60 -FEP_68-31 -32.13 0.63 -FEP_46-33 -0.26 0.62 -FEP_50-36 -8.01 0.76 -FEP_64-36 -20.48 0.59 -FEP_54-45 -1.75 0.33 -FEP_60-56 12.70 0.34 -FEP_52-32 4.55 0.46 -FEP_51-36 -17.33 0.48 -FEP_62-30 -38.73 0.55 -FEP_60-34 -6.75 0.60 -FEP_63-34 -0.81 0.65 -FEP_66-42 -15.22 0.31 -FEP_36-29 26.23 1.02 -FEP_41-23 21.29 0.96 -FEP_39-37 -4.49 0.66 -FEP_43-38 -0.11 0.60 -FEP_63-56 17.85 0.38 -FEP_65-50 -4.87 0.34 -FEP_60-26 30.79 0.44 -FEP_68-39 -34.73 1.76 -FEP_66-53 -30.64 0.34 -FEP_49-29 17.62 0.85 -FEP_52-44 11.00 0.57 -FEP_52-45 2.17 0.91 -FEP_65-53 -20.62 0.47 -FEP_62-31 -35.29 0.28 -FEP_63-26 35.07 0.51 -FEP_68-63 -29.06 0.53 -FEP_44-26 39.65 0.50 -FEP_63-31 -4.46 0.45 -FEP_38-30 -4.25 1.32 -FEP_57-23 -12.88 0.36 -FEP_61-40 -22.63 1.59 -FEP_56-38 nan nan -FEP_45-35 -3.01 0.54 -FEP_62-46 -45.35 0.28 -FEP_65-63 -1.85 0.35 -FEP_61-51 -15.46 0.43 -FEP_38-34 3.99 1.00 -FEP_68-57 -1.07 0.39 -FEP_43-26 42.97 0.58 -FEP_67-38 -30.14 0.48 -FEP_32-26 44.59 0.69 -FEP_57-40 -32.17 1.83 -FEP_42-30 -5.04 0.35 -FEP_46-42 10.93 0.31 -FEP_48-29 17.32 0.72 -FEP_40-33 -5.02 nan -FEP_67-50 -25.65 0.41 -FEP_53-46 5.24 0.41 -FEP_53-52 4.09 0.40 -FEP_64-31 -12.77 0.84 -FEP_66-32 -21.37 0.52 -FEP_45-31 6.89 0.78 -FEP_40-26 40.98 1.36 -FEP_39-34 2.90 0.53 -FEP_64-41 -15.13 1.44 -FEP_57-39 -32.75 1.13 -FEP_56-54 -28.54 1.01 -FEP_67-64 -15.36 0.85 -FEP_52-37 5.74 0.31 -FEP_65-32 -12.78 0.73 -FEP_64-26 26.17 0.49 -FEP_62-52 -44.07 0.54 -FEP_41-37 -2.99 0.56 -FEP_60-42 -8.52 0.41 -FEP_30-28 1.29 0.49 -FEP_66-27 -18.63 0.70 -FEP_45-37 0.09 0.79 -FEP_68-28 -37.27 1.24 -FEP_40-30 nan nan -FEP_67-58 -14.56 0.60 -FEP_65-43 -8.93 0.41 -FEP_67-43 -29.79 0.26 -FEP_40-27 nan nan -FEP_43-37 -2.25 0.31 -FEP_51-49 -9.59 0.46 -FEP_46-40 9.15 0.93 -FEP_31-29 17.62 0.35 -FEP_46-44 9.97 0.60 -FEP_66-62 18.95 0.58 -FEP_47-35 29.07 0.40 -FEP_44-35 -8.32 0.40 -FEP_54-27 1.26 0.67 -FEP_64-34 -12.76 1.24 -FEP_34-28 -6.10 0.35 -FEP_66-36 -23.29 0.29 -FEP_50-43 -4.83 0.42 -FEP_58-33 -25.41 1.17 -FEP_63-30 -7.62 0.37 -FEP_53-42 15.19 0.38 -FEP_50-39 -3.64 0.81 -FEP_58-49 -13.27 0.60 -FEP_64-51 -3.15 0.94 -FEP_29-28 -22.03 1.35 -FEP_64-42 -12.76 0.35 -FEP_43-29 22.33 0.98 -FEP_47-46 26.96 0.46 -FEP_65-44 -5.79 0.44 -FEP_45-30 2.75 0.43 -FEP_64-62 21.80 0.45 -FEP_38-35 -9.27 1.03 -FEP_66-35 -25.22 0.71 -FEP_62-36 -41.08 0.40 -FEP_46-32 3.97 0.32 -FEP_50-37 -7.60 0.34 -FEP_66-34 -13.40 0.74 -FEP_63-51 6.60 0.24 -FEP_56-48 -19.81 0.43 -FEP_67-63 -22.77 0.30 -FEP_46-27 6.09 0.31 -FEP_63-36 -11.07 0.48 -FEP_30-26 43.85 0.64 -FEP_68-38 -31.44 1.09 -FEP_47-34 38.80 0.40 -FEP_47-32 30.42 0.29 -FEP_61-29 -7.41 0.65 -FEP_66-63 -11.75 0.47 -FEP_67-44 -27.14 0.26 -FEP_57-49 -29.94 0.62 -FEP_42-38 -4.42 0.60 -FEP_47-39 34.72 1.21 -FEP_64-47 -50.38 0.93 -FEP_54-44 4.13 0.49 -FEP_46-38 9.31 1.24 -FEP_65-56 14.99 0.60 -FEP_67-28 -29.79 0.35 -FEP_37-28 1.86 0.61 -FEP_44-38 -3.45 0.89 -FEP_63-29 13.72 0.46 -FEP_50-29 16.90 0.33 -FEP_57-28 -35.56 0.50 -FEP_50-38 -0.70 0.50 -FEP_64-46 -22.27 1.00 -FEP_62-27 -38.42 0.62 -FEP_51-28 -13.16 0.26 -FEP_58-31 -14.94 0.83 -FEP_66-50 -14.62 0.60 -FEP_58-39 -16.40 0.31 -FEP_50-26 38.95 0.50 -FEP_68-62 3.34 0.87 -FEP_51-42 -9.46 0.53 -FEP_61-57 4.84 0.46 -FEP_53-29 31.77 0.77 -FEP_52-27 8.06 0.39 -FEP_47-29 54.71 0.84 -FEP_58-50 -12.86 0.52 -FEP_43-40 3.49 1.01 -FEP_58-44 -14.51 0.32 -FEP_61-26 13.73 0.46 -FEP_36-35 -2.09 0.29 -FEP_42-35 -8.44 0.51 -FEP_66-30 -19.39 0.39 -FEP_67-53 -41.57 0.17 -FEP_52-46 0.83 0.48 -FEP_68-47 -69.05 0.51 -FEP_57-27 -35.59 0.62 -FEP_63-39 -5.28 1.41 -FEP_65-61 19.95 0.32 -FEP_51-43 -13.24 0.43 -FEP_58-36 -21.44 0.74 -FEP_40-36 -8.59 0.61 -FEP_58-26 24.49 0.78 -FEP_43-31 2.44 0.47 -FEP_44-42 0.41 0.27 -FEP_28-26 42.00 0.37 -FEP_68-51 -21.72 0.37 -FEP_52-23 29.75 0.98 -FEP_56-52 -34.36 1.39 -FEP_58-37 -19.87 0.57 -FEP_49-47 -38.08 0.33 -FEP_53-23 32.76 0.30 -FEP_46-29 29.25 0.65 -FEP_64-33 -24.70 1.46 -FEP_32-27 2.51 0.38 -FEP_49-43 -4.96 0.40 -FEP_64-52 -23.10 0.71 -FEP_63-48 -2.61 0.81 -FEP_33-23 26.43 0.73 -FEP_68-36 -38.08 0.40 -FEP_61-60 -17.53 0.37 -FEP_33-32 3.00 0.30 -FEP_41-32 nan nan -FEP_57-52 -44.22 1.11 -FEP_62-50 -33.49 0.27 -FEP_45-43 5.84 0.71 -FEP_53-33 6.55 0.28 -FEP_45-40 4.78 1.76 -FEP_56-37 -27.10 0.31 -FEP_44-28 -3.82 0.67 -FEP_65-42 -6.02 0.21 -FEP_61-56 -4.26 0.49 -FEP_46-39 9.48 1.02 -FEP_44-34 3.14 0.41 -FEP_64-38 -14.77 0.69 -FEP_65-45 -11.10 0.56 -FEP_46-35 1.59 0.16 -FEP_65-41 -4.57 1.56 -FEP_48-37 -7.15 0.57 -FEP_50-40 -0.60 1.56 -FEP_45-38 5.50 0.75 -FEP_67-49 -25.02 0.45 -FEP_53-41 9.72 nan -FEP_52-49 12.33 0.46 -FEP_47-23 54.96 0.54 -FEP_43-36 -4.43 0.22 -FEP_65-46 -16.43 0.58 -FEP_52-35 1.40 0.60 -FEP_32-29 24.89 0.79 -FEP_64-45 -19.77 0.68 -FEP_37-35 -3.05 0.37 -FEP_66-64 -3.64 1.16 -FEP_64-27 -18.01 0.85 -FEP_64-60 -5.06 0.30 -FEP_54-39 1.02 0.93 -FEP_52-28 5.97 0.64 -FEP_53-32 9.57 0.37 -FEP_49-44 -1.10 0.52 -FEP_51-34 -7.11 0.75 -FEP_45-33 -2.69 0.85 -FEP_61-45 -31.70 0.66 -FEP_57-51 -21.20 0.58 -FEP_43-34 6.33 0.39 -FEP_45-41 1.65 0.51 -FEP_47-33 27.42 0.63 -FEP_63-41 -8.02 1.39 -FEP_42-37 -5.80 0.58 -FEP_38-37 -5.51 0.43 -FEP_62-41 -34.76 0.98 -FEP_46-28 5.07 0.95 -FEP_62-34 -32.45 0.56 -FEP_67-60 -18.33 0.28 -FEP_58-53 -29.12 0.48 -FEP_49-27 -5.42 0.50 -FEP_62-48 -33.04 0.33 -FEP_42-27 -5.60 1.17 -FEP_60-30 -12.31 0.31 -FEP_41-29 18.32 0.90 -FEP_52-39 11.73 1.00 -FEP_40-32 -11.99 nan -FEP_67-48 -26.54 0.58 -FEP_49-39 -0.30 1.24 -FEP_67-37 -32.81 0.33 -FEP_45-42 7.27 0.24 -FEP_60-39 -9.99 1.13 -FEP_34-29 15.85 0.49 -FEP_54-46 -4.46 0.67 -FEP_39-29 20.08 1.01 -FEP_58-34 -12.09 1.04 -FEP_45-27 3.94 0.47 -FEP_54-50 6.51 0.93 -FEP_66-65 -9.58 0.27 -FEP_60-44 -8.72 0.36 -FEP_48-38 -1.80 0.68 -FEP_52-30 6.18 0.49 -FEP_62-47 -71.42 0.27 -FEP_54-31 5.83 0.32 -FEP_48-34 -0.85 0.37 -FEP_40-28 nan nan -FEP_56-53 -36.90 0.72 -FEP_51-33 -19.25 0.70 -FEP_33-29 29.34 0.89 -FEP_48-41 -4.18 1.02 -FEP_39-33 -6.85 1.03 -FEP_53-51 23.87 0.47 -FEP_58-57 17.80 0.37 -FEP_54-34 7.03 0.93 -FEP_46-34 12.53 0.35 -FEP_67-45 -32.88 0.49 -FEP_26-23 -21.57 0.60 -FEP_34-26 36.27 0.59 -FEP_39-35 -10.14 1.27 -FEP_57-38 -33.00 1.01 -FEP_57-29 -12.70 0.81 -FEP_48-36 -8.59 0.43 -FEP_65-54 -11.62 0.31 -FEP_44-23 18.38 0.33 -FEP_64-29 3.73 0.90 -FEP_33-26 47.16 0.41 -FEP_51-23 9.21 0.34 -FEP_30-27 1.13 0.33 -FEP_60-47 -45.10 0.44 -FEP_60-48 -7.65 0.32 -FEP_36-26 46.85 0.53 -FEP_58-23 4.91 0.27 -FEP_60-57 23.03 0.48 -FEP_60-29 9.69 0.87 -FEP_36-23 24.27 0.30 -FEP_67-32 -32.77 0.29 -FEP_63-50 -2.05 0.82 -FEP_44-27 -4.69 0.50 -FEP_62-51 -24.46 0.15 -FEP_51-40 -9.48 1.32 -FEP_68-27 -37.62 0.86 -FEP_65-49 -6.69 0.47 -FEP_46-30 5.54 0.41 -FEP_57-56 -10.15 0.19 -FEP_66-61 10.38 0.89 -FEP_64-54 -19.25 0.35 -FEP_68-56 -9.89 0.46 -FEP_53-39 13.88 0.84 -FEP_64-39 -13.99 1.07 -FEP_67-46 -36.74 0.27 -FEP_67-26 11.32 0.32 -FEP_56-43 -25.22 0.31 -FEP_61-53 -41.19 2.02 -FEP_48-27 -4.57 0.41 -FEP_52-42 12.13 0.92 -FEP_36-28 3.14 0.77 -FEP_33-27 5.93 0.24 -FEP_54-43 1.49 0.70 -FEP_52-36 3.63 1.04 -FEP_48-28 -5.37 0.66 -FEP_58-32 -19.81 0.68 -FEP_58-28 -17.73 0.73 -FEP_67-66 -11.38 0.29 -FEP_56-27 -25.43 0.55 -FEP_42-40 -6.43 nan -FEP_60-23 9.80 0.30 -FEP_39-27 -5.09 0.65 -FEP_63-32 -9.40 0.38 -FEP_61-31 -26.59 0.73 -FEP_47-43 32.76 0.36 -FEP_67-54 -32.68 0.82 -FEP_36-31 6.59 0.25 -FEP_41-40 2.43 1.38 -FEP_49-38 -1.50 0.59 -FEP_63-46 -14.15 0.19 -FEP_47-45 29.53 0.57 -FEP_42-29 17.82 0.22 -FEP_68-29 -13.24 0.47 -FEP_34-23 16.27 0.92 -FEP_51-46 -20.59 0.64 -FEP_60-53 -23.24 0.54 -FEP_60-46 -19.23 0.40 -FEP_44-29 18.02 0.50 -FEP_56-40 -22.01 0.35 -FEP_56-51 nan nan -FEP_63-27 nan nan -FEP_64-44 nan nan -FEP_44-39 nan nan -FEP_62-53 nan nan -FEP_54-40 nan nan -FEP_61-54 nan nan -FEP_56-32 nan nan -FEP_36-27 nan nan -FEP_64-23 nan nan -FEP_61-49 nan nan -FEP_50-27 nan nan -FEP_35-27 nan nan -FEP_37-27 nan nan -FEP_68-58 nan nan -FEP_61-47 nan nan -FEP_43-35 nan nan -FEP_61-52 nan nan -FEP_65-60 nan nan -FEP_50-49 nan nan -FEP_56-33 nan nan -FEP_60-43 nan nan -FEP_65-26 nan nan -FEP_67-33 nan nan -FEP_48-32 nan nan -FEP_47-27 nan nan -FEP_31-30 nan nan -FEP_58-48 nan nan -FEP_67-27 nan nan -FEP_40-31 nan nan -FEP_60-54 nan nan -FEP_49-45 nan nan -FEP_47-36 nan nan -FEP_54-26 nan nan -FEP_61-48 nan nan -FEP_41-27 nan nan -FEP_64-61 nan nan -FEP_48-39 -3.48 0.72 -FEP_65-38 -7.56 0.65 -FEP_50-23 17.57 0.40 -FEP_61-50 -24.30 0.28 -FEP_52-43 8.30 0.37 -FEP_62-58 -20.20 0.85 -FEP_63-58 9.83 0.28 -FEP_63-45 -7.85 0.95 -FEP_50-30 -5.42 0.64 -FEP_35-33 -0.54 0.33 -FEP_41-35 -1.98 nan -FEP_53-44 14.11 0.39 -FEP_47-31 35.45 0.35 -FEP_42-34 0.60 0.82 -FEP_47-44 36.86 0.37 -FEP_53-49 15.96 0.69 -FEP_50-45 -7.11 0.93 -FEP_62-44 -35.39 0.34 -FEP_68-46 -42.63 0.56 -FEP_53-27 12.00 0.42 -FEP_53-37 8.50 0.46 -FEP_40-29 20.07 0.45 -FEP_39-30 -1.04 1.10 -FEP_49-41 -1.13 1.27 -FEP_52-26 51.70 0.60 -FEP_65-62 28.89 0.36 -FEP_65-58 8.13 0.46 -FEP_64-32 -22.03 1.34 -FEP_61-37 -31.14 0.42 -FEP_54-41 4.12 1.38 -FEP_58-51 -3.71 0.49 -FEP_60-45 -15.14 0.28 -FEP_43-41 -2.68 0.40 -FEP_67-52 -39.20 1.30 -FEP_51-44 -10.86 0.41 -FEP_57-44 -31.41 0.27 -FEP_64-48 -11.43 0.26 -FEP_54-47 -30.17 0.76 -FEP_49-26 38.02 0.23 -FEP_67-62 7.81 0.37 -FEP_37-36 -0.86 0.59 -FEP_41-31 4.57 0.38 -FEP_68-43 -35.40 0.95 -FEP_52-50 12.36 0.26 -FEP_63-38 -5.75 0.93 -FEP_66-57 15.54 0.34 -FEP_57-42 -31.37 0.44 -FEP_43-39 3.38 0.92 -FEP_37-30 1.61 0.47 -FEP_62-35 -44.08 0.42 -FEP_65-57 25.69 0.30 -FEP_42-33 -9.36 0.71 -FEP_58-29 5.48 1.46 -FEP_63-54 -9.32 0.17 -FEP_53-31 14.86 0.78 -FEP_66-26 23.59 0.35 -FEP_67-34 -23.71 0.47 -FEP_64-30 -18.35 0.80 -FEP_61-58 -13.03 0.43 -FEP_39-26 39.05 1.63 -FEP_67-42 -26.45 0.34 -FEP_54-36 -1.31 0.76 -FEP_56-28 -25.32 0.97 -FEP_60-51 2.02 0.74 -FEP_31-28 -3.23 0.56 -FEP_41-34 4.36 0.89 -FEP_31-27 -3.60 0.41 -FEP_60-50 -6.40 0.22 -FEP_66-31 -15.90 0.45 -FEP_67-56 -5.54 0.30 -FEP_57-36 -39.02 0.22 -FEP_44-37 -4.88 0.41 -FEP_62-33 -45.74 0.93 -FEP_56-26 16.24 0.78 -FEP_63-37 -9.85 0.37 -FEP_62-26 4.75 0.37 -FEP_35-34 11.22 0.32 -FEP_68-54 -37.08 0.26 -FEP_38-26 40.57 0.53 -FEP_68-32 -39.15 0.58 -FEP_44-32 -6.65 0.63 -FEP_29-26 20.20 0.39 -FEP_50-35 -10.62 0.34 -FEP_37-32 -0.08 0.46 -FEP_61-46 -35.35 0.44 -FEP_27-23 22.11 1.37 -FEP_66-48 -13.27 0.79 -FEP_58-38 -15.89 0.60 -FEP_64-57 18.48 0.75 -FEP_45-39 1.70 1.08 -FEP_39-28 -3.89 1.88 -FEP_68-64 -18.81 0.76 -FEP_47-42 39.21 0.42 -FEP_41-28 -0.33 1.22 -FEP_58-27 -19.70 0.93 -FEP_68-34 -31.01 1.23 -FEP_42-39 -3.99 1.51 -FEP_66-38 -18.10 0.73 -FEP_67-29 -8.15 1.70 -FEP_58-46 -24.64 0.53 -FEP_48-42 -1.13 0.29 -FEP_39-36 -3.38 1.67 -FEP_63-47 -40.38 0.17 -FEP_53-45 9.30 0.33 -FEP_51-30 -14.27 0.39 -FEP_29-23 -0.07 0.90 -FEP_62-38 -34.74 0.37 -FEP_63-33 -16.29 0.80 -FEP_52-38 9.51 0.80 -FEP_52-31 12.48 0.88 -FEP_54-51 15.60 0.46 -FEP_53-43 11.65 0.35 -FEP_46-37 4.14 0.32 -FEP_62-60 -27.19 0.51 -FEP_63-43 -6.75 0.34 -FEP_61-33 -36.56 0.65 -FEP_49-40 nan nan -FEP_62-56 -13.39 0.51 -FEP_49-31 -1.48 0.40 -FEP_36-32 0.02 0.48 -FEP_38-27 -0.51 1.45 -FEP_39-38 -0.84 0.91 -FEP_45-29 23.94 0.33 -FEP_47-40 43.69 nan -FEP_49-48 0.25 0.87 -FEP_63-49 -3.41 0.49 -FEP_44-43 -2.92 0.76 -FEP_51-47 -47.87 0.62 -FEP_53-36 8.48 0.38 -FEP_43-28 -0.52 0.88 -FEP_57-48 -30.73 0.39 -FEP_39-31 0.58 1.78 -FEP_51-27 -14.38 0.56 -FEP_32-31 6.16 0.32 -FEP_28-23 22.61 0.45 -FEP_49-23 16.72 0.40 -FEP_54-29 23.93 0.93 -FEP_53-48 16.72 0.43 -FEP_60-40 -8.32 0.32 -FEP_56-29 -2.12 0.74 -FEP_51-45 -16.32 0.32 -FEP_46-45 3.22 0.32 -FEP_40-23 18.87 0.89 -FEP_62-23 -15.99 0.52 -FEP_63-23 14.62 0.37 -FEP_57-34 -30.64 1.13 -FEP_33-28 5.94 0.54 -FEP_68-49 -31.27 0.65 -FEP_60-41 -11.82 0.80 -FEP_56-45 -28.11 0.66 -FEP_41-30 nan nan -FEP_62-43 -37.24 0.79 -FEP_68-61 -5.66 0.43 -FEP_49-35 -9.59 0.41 -FEP_68-40 -30.47 0.70 -FEP_57-32 -40.39 1.22 -FEP_58-47 -50.83 0.64 -FEP_64-28 -16.54 0.66 -FEP_54-52 -7.24 0.89 -FEP_50-46 -11.70 0.40 -FEP_44-40 2.29 0.92 -FEP_60-28 -12.64 0.74 -FEP_51-38 -10.37 0.40 -FEP_42-36 -8.66 0.49 -FEP_64-58 0.11 0.19 -FEP_57-30 -36.12 0.33 -FEP_64-43 -17.14 0.75 -FEP_64-63 -9.69 0.36 -FEP_67-57 3.97 0.39 -FEP_50-31 -1.99 0.62 -FEP_62-42 -34.35 0.63 -FEP_66-37 -21.46 0.54 -FEP_31-26 38.62 0.41 -FEP_61-28 -31.41 1.07 -FEP_47-28 32.70 0.41 -FEP_53-30 10.26 0.67 -FEP_61-35 -33.79 0.62 -FEP_49-37 -7.15 0.32 -FEP_50-32 -7.99 0.26 -FEP_42-41 -2.18 1.16 -FEP_43-30 -1.93 0.32 -FEP_43-27 -0.96 0.87 -FEP_30-23 22.58 0.37 -FEP_43-32 -2.87 0.31 -FEP_51-29 8.94 0.43 -FEP_54-30 1.70 0.38 -FEP_61-23 -7.33 0.44 -FEP_64-56 9.52 1.04 -FEP_54-33 -4.16 1.04 -FEP_63-62 30.99 0.36 -FEP_65-47 -42.39 0.35 -FEP_66-41 -20.62 1.32 -FEP_35-26 48.03 0.49 -FEP_29-27 -22.40 0.83 -FEP_53-28 11.68 0.97 -FEP_35-29 28.25 0.87 -FEP_38-23 17.82 0.94 -FEP_38-28 -4.46 1.61 -FEP_40-39 -2.48 2.00 -FEP_65-29 12.49 0.96 -FEP_50-28 -6.21 0.49 -FEP_43-23 20.51 0.37 -FEP_47-30 32.13 0.26 -FEP_51-37 -15.96 0.40 -FEP_66-29 2.10 0.58 -FEP_40-35 -2.35 nan -FEP_65-36 -13.12 0.27 -FEP_56-23 -3.82 0.34 -FEP_42-31 -0.05 0.25 -FEP_62-54 -36.03 1.37 -FEP_61-36 -32.42 0.42 -FEP_33-31 9.73 0.30 -FEP_67-35 -35.42 0.33 -FEP_46-26 49.05 0.56 -FEP_58-30 -18.79 0.46 -FEP_62-39 -35.88 0.50 -FEP_62-32 -41.78 0.44 -FEP_33-30 4.54 0.15 -FEP_63-53 -18.22 0.46 -FEP_48-30 -6.07 0.23 -FEP_64-50 -10.90 1.62 -FEP_68-66 -17.30 0.49 -FEP_45-28 2.11 0.35 -FEP_63-44 -4.52 0.65 -FEP_65-39 -5.28 0.75 -FEP_48-26 37.25 0.50 -FEP_52-48 11.45 0.54 -FEP_35-32 2.14 0.36 -FEP_66-23 3.47 0.34 -FEP_60-35 -17.07 0.24 -FEP_67-61 -1.07 0.62 -FEP_53-47 -22.31 0.35 -FEP_46-23 28.12 0.67 -FEP_41-33 nan nan -FEP_66-28 -18.84 0.25 -FEP_54-35 -2.73 0.64 -FEP_51-35 -17.82 0.39 -FEP_43-33 -6.27 0.45 -FEP_65-31 -7.00 0.39 -FEP_48-46 -12.07 0.27 -FEP_53-35 6.65 0.33 -FEP_66-45 -21.46 0.69 -FEP_50-33 -10.58 0.74 -FEP_52-41 7.97 0.80 -FEP_51-41 -11.94 0.92 -FEP_60-36 -15.93 0.42 -FEP_60-38 -9.12 0.68 -FEP_54-38 2.40 0.76 -FEP_40-34 -0.07 nan -FEP_56-42 -21.64 1.34 -FEP_66-58 -2.35 0.37 -FEP_35-23 27.20 1.31 -FEP_67-36 -33.83 0.29 -FEP_47-41 32.76 0.49 -FEP_54-23 23.67 0.40 -FEP_58-42 -14.48 0.47 -FEP_56-41 -23.82 0.75 -FEP_44-31 -0.15 0.51 -FEP_60-37 -14.80 0.32 -FEP_56-36 -28.54 0.22 -FEP_51-39 -9.10 1.21 -FEP_62-45 -41.72 0.28 -FEP_68-42 -31.63 0.24 -FEP_57-46 -41.64 0.71 -FEP_68-60 -22.35 0.23 -FEP_53-50 15.86 0.65 -FEP_62-28 -37.11 0.48 -FEP_53-26 53.12 0.64 -FEP_48-23 16.89 0.43 -FEP_57-26 7.07 0.66 -FEP_64-35 -21.87 1.09 -FEP_58-45 -21.19 0.47 -FEP_67-31 -27.26 0.48 -FEP_58-40 -12.46 0.78 -FEP_61-44 -25.67 0.44 -FEP_67-51 -19.30 1.08 -FEP_66-43 -18.32 0.49 -FEP_46-31 9.45 0.25 -FEP_66-51 -5.47 0.97 -FEP_64-37 -20.78 1.03 -FEP_37-26 45.68 0.08 -FEP_31-23 18.36 0.54 -FEP_27-26 43.71 0.62 -FEP_57-45 -38.24 0.48 -FEP_52-40 8.79 nan -FEP_48-43 -3.19 0.57 -FEP_42-32 -8.74 0.53 -FEP_68-45 -38.04 0.34 -FEP_56-46 -31.54 0.44 -FEP_57-41 -35.29 0.43 -FEP_34-31 -2.71 0.50 -FEP_62-29 -18.02 0.65 -FEP_68-37 -37.28 0.40 -FEP_56-30 -26.40 0.30 -FEP_51-32 -17.27 0.63 -FEP_62-37 -39.85 0.74 -FEP_63-61 21.92 0.60 -FEP_37-31 4.88 0.60 -FEP_49-33 -10.56 0.36 -FEP_66-49 -15.63 0.46 -FEP_60-52 -19.71 0.57 -FEP_57-35 -40.36 0.51 -FEP_35-31 8.20 0.31 -FEP_58-35 -24.12 1.07 -FEP_66-56 6.17 1.02 -FEP_49-28 -4.65 0.40 -FEP_57-53 -46.22 0.28 -FEP_38-31 -0.53 1.48 -FEP_65-28 -9.25 0.57 -FEP_56-39 -19.67 1.14 -FEP_66-40 nan nan -FEP_54-53 -10.03 0.57 -FEP_65-33 -17.69 0.79 -FEP_51-31 -10.01 0.43 -FEP_47-37 31.77 0.43 -FEP_48-45 -7.06 0.46 -FEP_36-34 8.39 0.34 -FEP_49-34 -0.20 0.35 -FEP_63-42 -4.02 0.74 -FEP_54-28 1.49 0.65 -FEP_68-30 -36.34 0.84 -FEP_49-42 0.78 0.96 -FEP_41-38 -0.38 0.67 -FEP_61-41 -28.59 1.38 -FEP_52-47 -25.23 0.76 -FEP_58-54 -20.06 0.50 -FEP_65-30 -9.95 0.43 -FEP_56-34 -21.04 1.04 -FEP_66-33 -24.90 0.48 -FEP_42-23 17.92 0.30 -FEP_67-40 -25.37 0.98 -FEP_66-60 -7.27 0.26 -FEP_67-47 -63.31 0.42 -FEP_50-34 0.70 0.81 -FEP_57-43 -34.56 0.55 -FEP_57-54 -37.50 0.32 -FEP_64-40 -11.90 0.19 -FEP_48-31 -1.36 0.32 -FEP_63-52 -15.23 0.54 -FEP_50-48 0.21 0.65 -FEP_39-23 21.16 1.00 -FEP_49-30 -5.68 0.28 -FEP_37-34 8.19 0.41 -FEP_66-47 -51.39 0.90 -FEP_36-33 -2.16 0.38 -FEP_62-61 -9.91 0.51 -FEP_60-49 -7.44 0.24 -FEP_48-35 -8.53 0.54 -FEP_63-60 4.97 0.23 -FEP_61-27 -27.85 0.68 -FEP_50-44 -2.47 0.39 -FEP_34-33 -11.31 0.20 -FEP_63-40 -3.28 0.95 -FEP_68-44 -32.41 0.48 -FEP_34-30 -6.45 0.43 -FEP_42-28 -4.38 0.53 -FEP_65-37 -11.40 0.14 -FEP_63-35 -12.82 0.54 -FEP_61-39 -27.15 0.79 -FEP_50-47 -38.13 0.28 -FEP_44-33 -9.79 0.59 -FEP_56-47 -59.59 0.83 -FEP_63-57 28.59 0.58 -FEP_40-38 -0.48 0.58 -FEP_66-39 -14.85 1.15 -FEP_57-50 -31.88 0.71 -FEP_49-32 -8.29 0.48 -FEP_66-44 -15.25 0.36 -FEP_48-44 -0.77 0.35 -FEP_65-51 3.74 0.46 -FEP_51-48 -8.23 0.43 -FEP_50-41 -2.24 1.06 -FEP_52-34 13.62 0.61 -FEP_34-27 -6.90 0.38 -FEP_62-49 -33.66 0.37 -FEP_45-34 9.43 0.68 -FEP_67-65 -21.20 0.42 -FEP_61-34 -21.97 0.45 -FEP_62-57 -3.79 0.40 -FEP_38-33 -8.15 1.04 -FEP_46-36 3.06 0.20 -FEP_68-50 -30.26 0.50 -FEP_56-49 -20.94 0.42 -FEP_54-37 -0.17 0.38 -FEP_44-30 -3.97 0.39 -FEP_52-29 26.85 0.62 -FEP_61-38 -26.64 0.78 -FEP_47-38 38.66 1.18 -FEP_66-52 -26.81 0.70 -FEP_38-36 -3.64 1.24 -FEP_64-53 -27.74 0.61 -FEP_66-46 -25.76 0.61 -FEP_60-32 -14.40 0.21 -FEP_56-35 -30.60 0.36 -FEP_68-65 -26.13 0.72 -FEP_54-42 5.81 0.37 -FEP_42-26 39.36 0.47 -FEP_45-32 -0.24 0.51 -FEP_34-32 -8.96 0.48 -FEP_47-26 76.13 0.58 -FEP_52-33 3.23 1.42 -FEP_32-23 24.73 0.54 -FEP_35-30 3.78 0.21 -FEP_32-30 2.05 0.32 -FEP_54-32 -3.13 1.25 -FEP_36-30 2.35 0.24 -FEP_49-36 -7.89 0.36 -FEP_68-41 -35.05 0.83 -FEP_60-31 -8.44 0.60 -FEP_68-33 -41.62 0.44 -FEP_62-40 -36.30 0.98 -FEP_61-32 -31.51 0.56 -FEP_57-31 -31.62 0.48 -FEP_67-30 -32.26 0.72 -FEP_57-37 -36.74 0.40 -FEP_48-47 -37.61 0.68 -FEP_60-58 5.35 0.20 \ No newline at end of file diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/no-vs/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/no-vs/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 344ab760..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/no-vs/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,862 +0,0 @@ -perturbation failed replicates -FEP_26-23/ 0 -FEP_28-26/ 0 -FEP_28-27/ 0 -FEP_29-28/ 0 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-27/ 0 -FEP_30-28/ 0 -FEP_30-29/ 2 -FEP_31-29/ 0 -FEP_31-30/ 0 -FEP_32-26/ 0 -FEP_32-27/ 0 -FEP_32-28/ 0 -FEP_32-29/ 0 -FEP_33-23/ 0 -FEP_33-26/ 1 -FEP_33-27/ 1 -FEP_33-29/ 0 -FEP_33-32/ 0 -FEP_34-23/ 0 -FEP_34-26/ 0 -FEP_34-28/ 0 -FEP_34-29/ 1 -FEP_35-27/ 0 -FEP_35-28/ 0 -FEP_36-23/ 0 -FEP_36-26/ 0 -FEP_36-27/ 0 -FEP_36-28/ 0 -FEP_36-29/ 0 -FEP_36-31/ 0 -FEP_36-35/ 0 -FEP_37-23/ 1 -FEP_37-27/ 0 -FEP_37-28/ 1 -FEP_37-29/ 0 -FEP_37-33/ 1 -FEP_37-35/ 1 -FEP_38-29/ 1 -FEP_38-30/ 0 -FEP_38-32/ 0 -FEP_38-34/ 0 -FEP_38-35/ 0 -FEP_38-37/ 0 -FEP_39-27/ 0 -FEP_39-29/ 0 -FEP_39-32/ 0 -FEP_39-33/ 1 -FEP_39-34/ 0 -FEP_39-35/ 0 -FEP_39-37/ 0 -FEP_40-26/ 0 -FEP_40-27/ 0 -FEP_40-28/ 0 -FEP_40-30/ 0 -FEP_40-31/ 0 -FEP_40-32/ 0 -FEP_40-33/ 0 -FEP_40-36/ 0 -FEP_40-37/ 0 -FEP_41-23/ 0 -FEP_41-26/ 0 -FEP_41-27/ 0 -FEP_41-29/ 0 -FEP_41-32/ 0 -FEP_41-36/ 0 -FEP_41-37/ 0 -FEP_41-39/ 0 -FEP_41-40/ 0 -FEP_42-27/ 0 -FEP_42-29/ 1 -FEP_42-30/ 0 -FEP_42-35/ 0 -FEP_42-37/ 1 -FEP_42-38/ 1 -FEP_42-40/ 2 -FEP_43-26/ 0 -FEP_43-29/ 0 -FEP_43-31/ 0 -FEP_43-34/ 0 -FEP_43-35/ 0 -FEP_43-36/ 0 -FEP_43-37/ 0 -FEP_43-38/ 0 -FEP_43-40/ 0 -FEP_43-42/ 0 -FEP_44-23/ 0 -FEP_44-26/ 0 -FEP_44-27/ 1 -FEP_44-28/ 0 -FEP_44-29/ 1 -FEP_44-34/ 0 -FEP_44-35/ 0 -FEP_44-36/ 0 -FEP_44-38/ 0 -FEP_44-39/ 0 -FEP_44-41/ 0 -FEP_44-42/ 0 -FEP_45-23/ 0 -FEP_45-26/ 1 -FEP_45-27/ 1 -FEP_45-30/ 0 -FEP_45-31/ 0 -FEP_45-33/ 0 -FEP_45-35/ 0 -FEP_45-36/ 0 -FEP_45-37/ 0 -FEP_45-38/ 0 -FEP_45-40/ 0 -FEP_45-41/ 0 -FEP_45-42/ 0 -FEP_45-43/ 0 -FEP_45-44/ 1 -FEP_46-27/ 0 -FEP_46-28/ 0 -FEP_46-29/ 0 -FEP_46-30/ 0 -FEP_46-32/ 0 -FEP_46-33/ 0 -FEP_46-34/ 0 -FEP_46-35/ 0 -FEP_46-38/ 0 -FEP_46-39/ 0 -FEP_46-40/ 0 -FEP_46-41/ 0 -FEP_46-42/ 0 -FEP_46-43/ 0 -FEP_46-44/ 0 -FEP_47-23/ 0 -FEP_47-27/ 0 -FEP_47-29/ 0 -FEP_47-32/ 0 -FEP_47-33/ 0 -FEP_47-34/ 0 -FEP_47-35/ 0 -FEP_47-36/ 0 -FEP_47-39/ 0 -FEP_47-43/ 0 -FEP_47-45/ 0 -FEP_47-46/ 0 -FEP_48-27/ 1 -FEP_48-28/ 0 -FEP_48-29/ 1 -FEP_48-32/ 0 -FEP_48-33/ 0 -FEP_48-34/ 2 -FEP_48-36/ 0 -FEP_48-37/ 0 -FEP_48-38/ 0 -FEP_48-39/ 0 -FEP_48-40/ 2 -FEP_48-41/ 0 -FEP_49-27/ 1 -FEP_49-29/ 0 -FEP_49-38/ 0 -FEP_49-39/ 0 -FEP_49-43/ 0 -FEP_49-44/ 1 -FEP_49-45/ 0 -FEP_49-46/ 0 -FEP_49-47/ 1 -FEP_50-26/ 1 -FEP_50-27/ 0 -FEP_50-29/ 0 -FEP_50-36/ 1 -FEP_50-37/ 1 -FEP_50-38/ 2 -FEP_50-39/ 1 -FEP_50-40/ 1 -FEP_50-42/ 0 -FEP_50-43/ 0 -FEP_50-49/ 0 -FEP_51-23/ 0 -FEP_51-26/ 0 -FEP_51-28/ 0 -FEP_51-33/ 0 -FEP_51-34/ 1 -FEP_51-36/ 0 -FEP_51-40/ 1 -FEP_51-42/ 0 -FEP_51-43/ 1 -FEP_51-46/ 2 -FEP_51-49/ 2 -FEP_51-50/ 1 -FEP_52-23/ 0 -FEP_52-27/ 0 -FEP_52-28/ 1 -FEP_52-30/ 1 -FEP_52-32/ 0 -FEP_52-35/ 0 -FEP_52-36/ 0 -FEP_52-37/ 0 -FEP_52-39/ 0 -FEP_52-42/ 0 -FEP_52-44/ 0 -FEP_52-45/ 0 -FEP_52-46/ 0 -FEP_52-49/ 0 -FEP_52-51/ 0 -FEP_53-23/ 0 -FEP_53-29/ 1 -FEP_53-32/ 1 -FEP_53-33/ 0 -FEP_53-34/ 3 -FEP_53-38/ 1 -FEP_53-39/ 1 -FEP_53-40/ 2 -FEP_53-41/ 1 -FEP_53-42/ 1 -FEP_53-46/ 0 -FEP_53-51/ 0 -FEP_53-52/ 3 -FEP_54-26/ 0 -FEP_54-27/ 0 -FEP_54-31/ 0 -FEP_54-34/ 0 -FEP_54-39/ 0 -FEP_54-40/ 1 -FEP_54-43/ 0 -FEP_54-44/ 2 -FEP_54-45/ 1 -FEP_54-46/ 0 -FEP_54-48/ 0 -FEP_54-49/ 0 -FEP_54-50/ 1 -FEP_56-27/ 0 -FEP_56-31/ 0 -FEP_56-32/ 0 -FEP_56-33/ 0 -FEP_56-37/ 0 -FEP_56-38/ 0 -FEP_56-40/ 0 -FEP_56-43/ 0 -FEP_56-44/ 0 -FEP_56-48/ 0 -FEP_56-50/ 1 -FEP_56-51/ 0 -FEP_56-52/ 0 -FEP_56-53/ 0 -FEP_56-54/ 1 -FEP_57-23/ 0 -FEP_57-27/ 0 -FEP_57-28/ 1 -FEP_57-29/ 0 -FEP_57-33/ 0 -FEP_57-38/ 0 -FEP_57-39/ 0 -FEP_57-40/ 0 -FEP_57-47/ 0 -FEP_57-49/ 0 -FEP_57-51/ 0 -FEP_57-52/ 0 -FEP_57-56/ 0 -FEP_58-23/ 0 -FEP_58-26/ 0 -FEP_58-28/ 0 -FEP_58-31/ 0 -FEP_58-32/ 0 -FEP_58-33/ 0 -FEP_58-34/ 0 -FEP_58-36/ 0 -FEP_58-37/ 0 -FEP_58-39/ 0 -FEP_58-41/ 0 -FEP_58-43/ 0 -FEP_58-44/ 0 -FEP_58-48/ 0 -FEP_58-49/ 0 -FEP_58-50/ 0 -FEP_58-52/ 0 -FEP_58-53/ 0 -FEP_58-56/ 0 -FEP_58-57/ 0 -FEP_60-23/ 0 -FEP_60-26/ 0 -FEP_60-27/ 1 -FEP_60-29/ 1 -FEP_60-30/ 1 -FEP_60-33/ 2 -FEP_60-34/ 1 -FEP_60-39/ 2 -FEP_60-42/ 1 -FEP_60-43/ 0 -FEP_60-44/ 0 -FEP_60-46/ 2 -FEP_60-47/ 1 -FEP_60-48/ 0 -FEP_60-53/ 0 -FEP_60-54/ 0 -FEP_60-56/ 2 -FEP_60-57/ 3 -FEP_61-26/ 0 -FEP_61-29/ 0 -FEP_61-30/ 0 -FEP_61-31/ 0 -FEP_61-40/ 0 -FEP_61-42/ 0 -FEP_61-43/ 0 -FEP_61-45/ 0 -FEP_61-47/ 0 -FEP_61-48/ 0 -FEP_61-49/ 0 -FEP_61-51/ 0 -FEP_61-52/ 0 -FEP_61-53/ 0 -FEP_61-54/ 0 -FEP_61-56/ 0 -FEP_61-57/ 0 -FEP_61-60/ 0 -FEP_62-27/ 0 -FEP_62-30/ 0 -FEP_62-31/ 0 -FEP_62-34/ 0 -FEP_62-36/ 0 -FEP_62-41/ 0 -FEP_62-46/ 1 -FEP_62-47/ 0 -FEP_62-48/ 1 -FEP_62-50/ 1 -FEP_62-51/ 1 -FEP_62-52/ 0 -FEP_62-53/ 0 -FEP_63-26/ 1 -FEP_63-27/ 0 -FEP_63-28/ 1 -FEP_63-29/ 1 -FEP_63-30/ 1 -FEP_63-31/ 0 -FEP_63-32/ 1 -FEP_63-34/ 0 -FEP_63-36/ 0 -FEP_63-39/ 0 -FEP_63-41/ 1 -FEP_63-46/ 1 -FEP_63-48/ 0 -FEP_63-50/ 0 -FEP_63-51/ 0 -FEP_63-56/ 0 -FEP_64-23/ 0 -FEP_64-26/ 0 -FEP_64-27/ 0 -FEP_64-29/ 0 -FEP_64-31/ 0 -FEP_64-33/ 0 -FEP_64-34/ 0 -FEP_64-36/ 0 -FEP_64-38/ 0 -FEP_64-39/ 0 -FEP_64-41/ 0 -FEP_64-42/ 0 -FEP_64-44/ 0 -FEP_64-45/ 0 -FEP_64-46/ 0 -FEP_64-47/ 0 -FEP_64-49/ 0 -FEP_64-51/ 0 -FEP_64-52/ 0 -FEP_64-54/ 0 -FEP_64-60/ 0 -FEP_64-61/ 0 -FEP_64-62/ 0 -FEP_65-23/ 0 -FEP_65-26/ 0 -FEP_65-27/ 0 -FEP_65-32/ 0 -FEP_65-34/ 0 -FEP_65-35/ 0 -FEP_65-40/ 0 -FEP_65-41/ 0 -FEP_65-42/ 0 -FEP_65-43/ 0 -FEP_65-44/ 0 -FEP_65-45/ 0 -FEP_65-46/ 0 -FEP_65-48/ 0 -FEP_65-49/ 0 -FEP_65-50/ 0 -FEP_65-52/ 0 -FEP_65-53/ 0 -FEP_65-54/ 0 -FEP_65-56/ 0 -FEP_65-60/ 0 -FEP_65-61/ 0 -FEP_65-63/ 0 -FEP_65-64/ 0 -FEP_66-27/ 0 -FEP_66-30/ 0 -FEP_66-32/ 0 -FEP_66-34/ 0 -FEP_66-35/ 1 -FEP_66-36/ 0 -FEP_66-42/ 1 -FEP_66-50/ 0 -FEP_66-53/ 0 -FEP_66-54/ 1 -FEP_66-61/ 0 -FEP_66-62/ 0 -FEP_66-63/ 1 -FEP_66-64/ 0 -FEP_66-65/ 0 -FEP_67-23/ 0 -FEP_67-26/ 0 -FEP_67-27/ 0 -FEP_67-28/ 0 -FEP_67-32/ 0 -FEP_67-33/ 0 -FEP_67-37/ 0 -FEP_67-38/ 1 -FEP_67-39/ 0 -FEP_67-41/ 0 -FEP_67-43/ 0 -FEP_67-44/ 1 -FEP_67-45/ 0 -FEP_67-46/ 0 -FEP_67-48/ 1 -FEP_67-49/ 0 -FEP_67-50/ 0 -FEP_67-53/ 0 -FEP_67-54/ 0 -FEP_67-58/ 0 -FEP_67-60/ 0 -FEP_67-63/ 0 -FEP_67-64/ 1 -FEP_67-66/ 0 -FEP_68-23/ 0 -FEP_68-26/ 0 -FEP_68-27/ 0 -FEP_68-28/ 0 -FEP_68-29/ 0 -FEP_68-31/ 0 -FEP_68-35/ 0 -FEP_68-36/ 0 -FEP_68-38/ 0 -FEP_68-39/ 0 -FEP_68-47/ 0 -FEP_68-48/ 0 -FEP_68-51/ 0 -FEP_68-52/ 0 -FEP_68-53/ 0 -FEP_68-56/ 0 -FEP_68-57/ 0 -FEP_68-58/ 0 -FEP_68-62/ 0 -FEP_68-63/ 0 -FEP_68-67/ 0 -FEP_27-23/ 0 -FEP_27-26/ 0 -FEP_28-23/ 0 -FEP_29-23/ 0 -FEP_29-26/ 0 -FEP_29-27/ 0 -FEP_30-23/ 0 -FEP_31-23/ 0 -FEP_31-26/ 0 -FEP_31-27/ 1 -FEP_31-28/ 1 -FEP_32-23/ 0 -FEP_32-30/ 0 -FEP_32-31/ 0 -FEP_33-28/ 0 -FEP_33-30/ 0 -FEP_33-31/ 0 -FEP_34-27/ 1 -FEP_34-30/ 1 -FEP_34-31/ 0 -FEP_34-32/ 0 -FEP_34-33/ 0 -FEP_35-23/ 0 -FEP_35-26/ 0 -FEP_35-29/ 0 -FEP_35-30/ 0 -FEP_35-31/ 0 -FEP_35-32/ 1 -FEP_35-33/ 1 -FEP_35-34/ 0 -FEP_36-30/ 0 -FEP_36-32/ 0 -FEP_36-33/ 0 -FEP_36-34/ 0 -FEP_37-26/ 1 -FEP_37-30/ 0 -FEP_37-31/ 0 -FEP_37-32/ 2 -FEP_37-34/ 0 -FEP_37-36/ 0 -FEP_38-23/ 0 -FEP_38-26/ 0 -FEP_38-27/ 2 -FEP_38-28/ 1 -FEP_38-31/ 1 -FEP_38-33/ 0 -FEP_38-36/ 0 -FEP_39-23/ 0 -FEP_39-26/ 0 -FEP_39-28/ 0 -FEP_39-30/ 0 -FEP_39-31/ 0 -FEP_39-36/ 0 -FEP_39-38/ 0 -FEP_40-23/ 0 -FEP_40-29/ 0 -FEP_40-34/ 0 -FEP_40-35/ 0 -FEP_40-38/ 0 -FEP_40-39/ 0 -FEP_41-28/ 0 -FEP_41-30/ 0 -FEP_41-31/ 0 -FEP_41-33/ 0 -FEP_41-34/ 0 -FEP_41-35/ 0 -FEP_41-38/ 0 -FEP_42-23/ 0 -FEP_42-26/ 0 -FEP_42-28/ 0 -FEP_42-31/ 1 -FEP_42-32/ 0 -FEP_42-33/ 0 -FEP_42-34/ 3 -FEP_42-36/ 1 -FEP_42-39/ 1 -FEP_42-41/ 1 -FEP_43-23/ 0 -FEP_43-27/ 0 -FEP_43-28/ 0 -FEP_43-30/ 0 -FEP_43-32/ 0 -FEP_43-33/ 0 -FEP_43-39/ 0 -FEP_43-41/ 0 -FEP_44-30/ 0 -FEP_44-31/ 2 -FEP_44-32/ 0 -FEP_44-33/ 0 -FEP_44-37/ 0 -FEP_44-40/ 0 -FEP_44-43/ 0 -FEP_45-28/ 0 -FEP_45-29/ 0 -FEP_45-32/ 2 -FEP_45-34/ 0 -FEP_45-39/ 0 -FEP_46-23/ 0 -FEP_46-26/ 0 -FEP_46-31/ 0 -FEP_46-36/ 0 -FEP_46-37/ 0 -FEP_46-45/ 0 -FEP_47-26/ 0 -FEP_47-28/ 0 -FEP_47-30/ 0 -FEP_47-31/ 0 -FEP_47-37/ 0 -FEP_47-38/ 0 -FEP_47-40/ 0 -FEP_47-41/ 0 -FEP_47-42/ 0 -FEP_47-44/ 0 -FEP_48-23/ 0 -FEP_48-26/ 0 -FEP_48-30/ 1 -FEP_48-31/ 1 -FEP_48-35/ 2 -FEP_48-42/ 2 -FEP_48-43/ 0 -FEP_48-44/ 1 -FEP_48-45/ 0 -FEP_48-46/ 0 -FEP_48-47/ 0 -FEP_49-23/ 0 -FEP_49-26/ 2 -FEP_49-28/ 1 -FEP_49-30/ 0 -FEP_49-31/ 1 -FEP_49-32/ 0 -FEP_49-33/ 0 -FEP_49-34/ 0 -FEP_49-35/ 0 -FEP_49-36/ 0 -FEP_49-37/ 1 -FEP_49-40/ 0 -FEP_49-41/ 1 -FEP_49-42/ 1 -FEP_49-48/ 2 -FEP_50-23/ 1 -FEP_50-28/ 1 -FEP_50-30/ 0 -FEP_50-31/ 1 -FEP_50-32/ 0 -FEP_50-33/ 0 -FEP_50-34/ 0 -FEP_50-35/ 0 -FEP_50-41/ 0 -FEP_50-44/ 1 -FEP_50-45/ 0 -FEP_50-46/ 1 -FEP_50-47/ 0 -FEP_50-48/ 1 -FEP_51-27/ 1 -FEP_51-29/ 1 -FEP_51-30/ 0 -FEP_51-31/ 0 -FEP_51-32/ 1 -FEP_51-35/ 0 -FEP_51-37/ 0 -FEP_51-38/ 1 -FEP_51-39/ 1 -FEP_51-41/ 1 -FEP_51-44/ 0 -FEP_51-45/ 0 -FEP_51-47/ 0 -FEP_51-48/ 1 -FEP_52-26/ 0 -FEP_52-29/ 0 -FEP_52-31/ 0 -FEP_52-33/ 0 -FEP_52-34/ 0 -FEP_52-38/ 0 -FEP_52-40/ 0 -FEP_52-41/ 0 -FEP_52-43/ 0 -FEP_52-47/ 0 -FEP_52-48/ 0 -FEP_52-50/ 0 -FEP_53-26/ 1 -FEP_53-27/ 0 -FEP_53-28/ 1 -FEP_53-30/ 1 -FEP_53-31/ 0 -FEP_53-35/ 1 -FEP_53-36/ 1 -FEP_53-37/ 0 -FEP_53-43/ 0 -FEP_53-44/ 0 -FEP_53-45/ 0 -FEP_53-47/ 0 -FEP_53-48/ 0 -FEP_53-49/ 0 -FEP_53-50/ 0 -FEP_54-23/ 0 -FEP_54-28/ 1 -FEP_54-29/ 0 -FEP_54-30/ 0 -FEP_54-32/ 0 -FEP_54-33/ 0 -FEP_54-35/ 2 -FEP_54-36/ 0 -FEP_54-37/ 1 -FEP_54-38/ 0 -FEP_54-41/ 1 -FEP_54-42/ 1 -FEP_54-47/ 1 -FEP_54-51/ 0 -FEP_54-52/ 0 -FEP_54-53/ 3 -FEP_56-23/ 0 -FEP_56-26/ 0 -FEP_56-28/ 0 -FEP_56-29/ 0 -FEP_56-30/ 0 -FEP_56-34/ 1 -FEP_56-35/ 1 -FEP_56-36/ 0 -FEP_56-39/ 0 -FEP_56-41/ 0 -FEP_56-42/ 1 -FEP_56-45/ 1 -FEP_56-46/ 0 -FEP_56-47/ 0 -FEP_56-49/ 0 -FEP_57-26/ 0 -FEP_57-30/ 0 -FEP_57-31/ 0 -FEP_57-32/ 0 -FEP_57-34/ 0 -FEP_57-35/ 1 -FEP_57-36/ 0 -FEP_57-37/ 0 -FEP_57-41/ 0 -FEP_57-42/ 0 -FEP_57-43/ 0 -FEP_57-44/ 0 -FEP_57-45/ 0 -FEP_57-46/ 0 -FEP_57-48/ 0 -FEP_57-50/ 0 -FEP_57-53/ 0 -FEP_57-54/ 0 -FEP_58-27/ 0 -FEP_58-29/ 0 -FEP_58-30/ 0 -FEP_58-35/ 0 -FEP_58-38/ 0 -FEP_58-40/ 0 -FEP_58-42/ 0 -FEP_58-45/ 0 -FEP_58-46/ 0 -FEP_58-47/ 0 -FEP_58-51/ 0 -FEP_58-54/ 0 -FEP_60-28/ 0 -FEP_60-31/ 1 -FEP_60-32/ 0 -FEP_60-35/ 1 -FEP_60-36/ 1 -FEP_60-37/ 0 -FEP_60-38/ 0 -FEP_60-40/ 1 -FEP_60-41/ 1 -FEP_60-45/ 0 -FEP_60-49/ 1 -FEP_60-50/ 0 -FEP_60-51/ 0 -FEP_60-52/ 0 -FEP_60-58/ 0 -FEP_61-23/ 0 -FEP_61-27/ 0 -FEP_61-28/ 0 -FEP_61-32/ 0 -FEP_61-33/ 0 -FEP_61-34/ 0 -FEP_61-35/ 0 -FEP_61-36/ 0 -FEP_61-37/ 0 -FEP_61-38/ 0 -FEP_61-39/ 0 -FEP_61-41/ 0 -FEP_61-44/ 0 -FEP_61-46/ 0 -FEP_61-50/ 0 -FEP_61-58/ 0 -FEP_62-23/ 0 -FEP_62-26/ 0 -FEP_62-28/ 0 -FEP_62-29/ 0 -FEP_62-32/ 0 -FEP_62-33/ 0 -FEP_62-35/ 0 -FEP_62-37/ 1 -FEP_62-38/ 0 -FEP_62-39/ 0 -FEP_62-40/ 0 -FEP_62-42/ 0 -FEP_62-43/ 0 -FEP_62-44/ 0 -FEP_62-45/ 0 -FEP_62-49/ 0 -FEP_62-54/ 0 -FEP_62-56/ 0 -FEP_62-57/ 1 -FEP_62-58/ 0 -FEP_62-60/ 0 -FEP_62-61/ 0 -FEP_63-23/ 0 -FEP_63-33/ 0 -FEP_63-35/ 1 -FEP_63-37/ 1 -FEP_63-38/ 1 -FEP_63-40/ 0 -FEP_63-42/ 0 -FEP_63-43/ 1 -FEP_63-44/ 0 -FEP_63-45/ 0 -FEP_63-47/ 0 -FEP_63-49/ 0 -FEP_63-52/ 0 -FEP_63-53/ 0 -FEP_63-54/ 0 -FEP_63-57/ 1 -FEP_63-58/ 2 -FEP_63-60/ 0 -FEP_63-61/ 1 -FEP_63-62/ 0 -FEP_64-28/ 0 -FEP_64-30/ 0 -FEP_64-32/ 0 -FEP_64-35/ 0 -FEP_64-37/ 0 -FEP_64-40/ 0 -FEP_64-43/ 0 -FEP_64-48/ 0 -FEP_64-50/ 0 -FEP_64-53/ 0 -FEP_64-56/ 0 -FEP_64-57/ 0 -FEP_64-58/ 0 -FEP_64-63/ 0 -FEP_65-28/ 0 -FEP_65-29/ 0 -FEP_65-30/ 0 -FEP_65-31/ 0 -FEP_65-33/ 0 -FEP_65-36/ 0 -FEP_65-37/ 0 -FEP_65-38/ 0 -FEP_65-39/ 0 -FEP_65-47/ 0 -FEP_65-51/ 0 -FEP_65-57/ 0 -FEP_65-58/ 0 -FEP_65-62/ 0 -FEP_66-23/ 0 -FEP_66-26/ 0 -FEP_66-28/ 0 -FEP_66-29/ 0 -FEP_66-31/ 0 -FEP_66-33/ 1 -FEP_66-37/ 0 -FEP_66-38/ 0 -FEP_66-39/ 0 -FEP_66-40/ 1 -FEP_66-41/ 1 -FEP_66-43/ 0 -FEP_66-44/ 1 -FEP_66-45/ 0 -FEP_66-46/ 0 -FEP_66-47/ 1 -FEP_66-48/ 1 -FEP_66-49/ 1 -FEP_66-51/ 0 -FEP_66-52/ 1 -FEP_66-56/ 0 -FEP_66-57/ 0 -FEP_66-58/ 0 -FEP_66-60/ 0 -FEP_67-29/ 0 -FEP_67-30/ 1 -FEP_67-31/ 0 -FEP_67-34/ 0 -FEP_67-35/ 0 -FEP_67-36/ 0 -FEP_67-40/ 0 -FEP_67-42/ 1 -FEP_67-47/ 0 -FEP_67-51/ 0 -FEP_67-52/ 0 -FEP_67-56/ 1 -FEP_67-57/ 1 -FEP_67-61/ 0 -FEP_67-62/ 0 -FEP_67-65/ 0 -FEP_68-30/ 0 -FEP_68-32/ 0 -FEP_68-33/ 0 -FEP_68-34/ 0 -FEP_68-37/ 0 -FEP_68-40/ 0 -FEP_68-41/ 0 -FEP_68-42/ 0 -FEP_68-43/ 0 -FEP_68-44/ 0 -FEP_68-45/ 0 -FEP_68-46/ 0 -FEP_68-49/ 0 -FEP_68-50/ 0 -FEP_68-54/ 0 -FEP_68-60/ 0 -FEP_68-61/ 0 -FEP_68-64/ 0 -FEP_68-65/ 0 -FEP_68-66/ 0 \ No newline at end of file diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/no-vs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/no-vs/water.txt deleted file mode 100755 index 5270d53b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/no-vs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,709 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_63-53 -17.88 0.33 -FEP_53-44 13.00 0.27 -FEP_64-23 4.77 0.21 -FEP_57-51 -22.30 0.28 -FEP_57-46 -43.25 0.29 -FEP_43-27 -3.23 0.74 -FEP_49-36 -7.95 0.31 -FEP_64-43 -16.89 0.25 -FEP_44-23 17.03 0.24 -FEP_65-23 8.80 0.27 -FEP_60-32 -19.25 0.30 -FEP_67-38 -29.56 0.43 -FEP_36-31 4.11 0.15 -FEP_46-26 49.21 0.31 -FEP_68-66 -12.51 0.78 -FEP_57-26 5.42 0.41 -FEP_53-29 22.77 0.35 -FEP_62-48 -37.33 0.44 -FEP_48-42 3.54 0.20 -FEP_51-31 -13.29 0.70 -FEP_52-32 3.85 0.43 -FEP_56-54 -27.86 1.07 -FEP_61-36 -34.26 0.31 -FEP_53-51 20.34 0.35 -FEP_67-65 -20.44 0.22 -FEP_63-45 -12.55 0.57 -FEP_47-38 41.55 0.67 -FEP_63-52 -19.59 0.88 -FEP_58-45 -24.02 0.51 -FEP_30-29 18.25 0.33 -FEP_46-43 7.70 0.18 -FEP_64-54 -17.31 0.15 -FEP_68-26 9.37 0.32 -FEP_47-37 34.31 0.16 -FEP_44-40 0.64 0.72 -FEP_40-33 nan nan -FEP_66-61 10.22 0.43 -FEP_57-32 -40.57 0.37 -FEP_48-33 -6.93 0.23 -FEP_43-42 3.48 0.36 -FEP_57-48 -35.28 0.61 -FEP_41-37 -6.32 1.20 -FEP_35-33 -1.70 0.21 -FEP_66-23 1.44 0.11 -FEP_58-40 -18.29 2.17 -FEP_58-49 -15.73 0.32 -FEP_63-26 32.12 0.19 -FEP_32-30 1.54 0.16 -FEP_42-31 -3.37 0.19 -FEP_60-39 -13.86 1.28 -FEP_54-49 3.78 0.65 -FEP_42-37 -6.52 0.19 -FEP_65-28 -17.42 0.89 -FEP_67-45 -35.61 0.20 -FEP_58-34 -18.91 0.70 -FEP_49-38 0.99 0.56 -FEP_56-34 -25.67 0.37 -FEP_41-32 nan nan -FEP_60-33 -20.97 0.20 -FEP_48-47 -37.76 0.29 -FEP_51-28 -18.38 0.28 -FEP_64-56 9.87 1.49 -FEP_44-39 -2.84 0.94 -FEP_50-36 -9.19 0.31 -FEP_67-60 -18.62 0.13 -FEP_50-43 -5.83 0.11 -FEP_60-58 6.17 0.13 -FEP_37-26 44.34 0.13 -FEP_49-48 -3.14 0.63 -FEP_66-60 -6.15 0.19 -FEP_56-53 -36.85 0.29 -FEP_48-35 -6.24 0.21 -FEP_40-34 -1.82 1.26 -FEP_41-38 1.00 0.60 -FEP_66-49 -16.64 0.19 -FEP_63-47 -46.67 0.43 -FEP_64-44 -12.49 0.30 -FEP_64-46 -24.98 0.31 -FEP_57-50 -29.82 0.34 -FEP_65-27 -16.20 0.63 -FEP_62-57 -3.21 0.20 -FEP_64-40 -11.97 0.73 -FEP_64-45 -20.14 0.43 -FEP_53-50 14.39 0.35 -FEP_62-33 -44.90 0.35 -FEP_68-51 -18.94 0.37 -FEP_66-58 -0.22 0.50 -FEP_34-29 13.39 0.42 -FEP_54-45 -2.80 0.25 -FEP_50-29 10.58 0.42 -FEP_58-27 -23.18 0.70 -FEP_63-62 29.13 0.38 -FEP_37-29 20.18 0.77 -FEP_41-40 6.86 0.59 -FEP_60-49 -10.15 0.35 -FEP_48-29 16.28 0.16 -FEP_66-44 -15.81 0.26 -FEP_42-29 12.12 0.92 -FEP_54-52 -8.34 0.48 -FEP_30-28 -1.44 0.61 -FEP_48-46 -7.71 0.31 -FEP_53-36 5.53 0.29 -FEP_46-30 4.83 0.17 -FEP_48-39 1.93 0.55 -FEP_45-42 7.49 0.19 -FEP_68-53 -40.35 0.22 -FEP_47-41 39.72 0.72 -FEP_56-47 -66.15 0.53 -FEP_57-56 -7.93 0.22 -FEP_34-33 -9.35 0.29 -FEP_60-41 -10.82 1.52 -FEP_66-51 -6.73 0.37 -FEP_38-33 -17.33 nan -FEP_43-30 -3.14 0.21 -FEP_67-23 -10.80 0.27 -FEP_64-34 -15.52 0.78 -FEP_65-45 -15.82 0.26 -FEP_48-43 -0.40 0.22 -FEP_66-27 -23.00 0.18 -FEP_68-60 -17.74 0.24 -FEP_68-23 -10.62 0.22 -FEP_65-31 -12.37 0.31 -FEP_45-28 -1.80 0.80 -FEP_62-53 -46.81 0.21 -FEP_31-27 -3.35 0.32 -FEP_50-39 -1.56 0.64 -FEP_62-61 -8.67 0.25 -FEP_58-41 -18.65 1.22 -FEP_68-67 1.15 0.39 -FEP_67-41 -30.09 0.14 -FEP_64-49 -16.67 0.75 -FEP_63-29 5.17 0.51 -FEP_48-31 -0.74 0.26 -FEP_53-40 10.79 0.34 -FEP_60-29 1.80 0.42 -FEP_45-32 -1.24 0.30 -FEP_62-34 -35.46 0.19 -FEP_63-39 -7.32 0.85 -FEP_54-43 0.39 0.51 -FEP_64-58 3.27 0.15 -FEP_52-36 6.04 0.71 -FEP_38-32 -8.40 nan -FEP_61-44 -25.55 0.66 -FEP_41-35 -7.81 nan -FEP_46-28 3.08 0.45 -FEP_53-35 2.89 0.18 -FEP_37-32 -1.71 0.32 -FEP_52-26 50.16 0.14 -FEP_62-41 -37.01 1.11 -FEP_29-26 24.75 0.31 -FEP_52-44 14.16 0.88 -FEP_53-31 8.64 0.32 -FEP_44-43 -4.92 0.13 -FEP_50-23 16.03 0.18 -FEP_52-23 31.40 0.42 -FEP_44-26 36.84 0.32 -FEP_67-66 -11.97 0.17 -FEP_53-27 6.03 0.36 -FEP_68-62 6.74 0.44 -FEP_61-42 -26.77 0.20 -FEP_52-28 4.37 0.30 -FEP_35-26 46.82 0.24 -FEP_45-40 7.16 0.43 -FEP_68-47 -70.66 0.56 -FEP_57-30 -38.77 0.19 -FEP_63-36 -13.19 0.30 -FEP_43-37 -2.69 0.27 -FEP_49-34 -1.13 0.22 -FEP_56-41 -26.26 0.66 -FEP_37-30 0.16 1.01 -FEP_43-28 -4.89 1.02 -FEP_37-36 -0.35 0.29 -FEP_50-45 -8.59 0.19 -FEP_68-28 -39.03 0.80 -FEP_62-39 -34.78 0.69 -FEP_48-41 -6.20 nan -FEP_37-34 5.98 0.24 -FEP_28-26 46.94 0.41 -FEP_60-54 -14.66 0.20 -FEP_52-38 9.97 1.09 -FEP_68-48 -31.95 0.24 -FEP_52-48 8.91 0.60 -FEP_57-38 -33.09 0.44 -FEP_61-28 -35.67 0.39 -FEP_65-29 3.27 1.06 -FEP_66-65 -8.07 0.18 -FEP_36-34 5.02 0.99 -FEP_41-30 nan nan -FEP_47-28 33.33 0.15 -FEP_51-41 -9.10 0.89 -FEP_56-33 -34.97 0.48 -FEP_64-35 -22.32 0.99 -FEP_67-29 -17.34 0.52 -FEP_63-41 -4.38 2.61 -FEP_49-35 -9.77 0.37 -FEP_68-41 -29.35 0.60 -FEP_27-23 24.41 0.73 -FEP_53-47 -30.07 0.40 -FEP_54-42 4.14 0.10 -FEP_35-31 5.75 0.10 -FEP_47-32 32.23 0.34 -FEP_54-47 -36.67 0.21 -FEP_64-48 -16.20 0.25 -FEP_66-64 -4.45 0.88 -FEP_67-62 5.32 0.50 -FEP_67-61 -3.09 0.74 -FEP_50-33 -12.86 0.20 -FEP_68-63 -23.31 0.16 -FEP_67-58 -12.38 0.29 -FEP_61-29 -14.10 0.77 -FEP_65-51 0.69 0.45 -FEP_65-26 28.51 0.35 -FEP_67-44 -27.90 0.23 -FEP_61-56 -2.86 0.20 -FEP_64-30 -20.08 0.17 -FEP_61-37 -33.39 0.24 -FEP_64-52 -26.65 0.90 -FEP_63-49 -5.43 0.36 -FEP_66-47 -57.07 0.50 -FEP_56-31 -28.67 0.56 -FEP_65-52 -22.58 1.01 -FEP_56-30 -31.38 0.47 -FEP_42-35 -9.32 0.22 -FEP_45-29 18.27 0.45 -FEP_51-34 -10.47 0.23 -FEP_65-46 -20.15 0.25 -FEP_38-37 -7.71 0.69 -FEP_66-36 -24.62 0.32 -FEP_37-31 3.15 0.37 -FEP_67-54 -33.27 0.31 -FEP_64-32 -23.49 0.82 -FEP_58-47 -59.05 0.48 -FEP_68-40 -28.05 0.80 -FEP_67-40 -26.78 1.14 -FEP_49-43 -4.73 0.25 -FEP_57-34 -33.59 0.72 -FEP_61-30 -34.13 0.91 -FEP_48-32 -5.31 0.57 -FEP_58-54 -21.33 0.30 -FEP_60-38 -11.43 0.38 -FEP_41-23 21.13 1.13 -FEP_65-40 nan nan -FEP_61-32 -34.92 0.47 -FEP_67-48 -32.01 0.53 -FEP_65-63 -3.56 0.19 -FEP_40-31 0.23 nan -FEP_42-28 -8.46 0.24 -FEP_54-48 0.46 0.40 -FEP_56-51 -14.71 0.35 -FEP_52-33 2.94 0.42 -FEP_51-37 -16.85 0.25 -FEP_67-27 -35.30 0.19 -FEP_62-46 -45.95 0.32 -FEP_63-42 -5.24 0.29 -FEP_49-32 -9.37 0.14 -FEP_46-41 11.00 1.56 -FEP_38-35 -9.27 0.75 -FEP_43-39 1.78 1.29 -FEP_68-34 -30.27 0.61 -FEP_62-23 -16.14 0.24 -FEP_49-33 -10.77 0.18 -FEP_44-32 -10.60 0.45 -FEP_40-36 -9.25 1.23 -FEP_31-30 -3.45 0.11 -FEP_63-57 26.36 0.24 -FEP_61-34 -27.46 0.34 -FEP_27-26 44.74 0.32 -FEP_66-34 -18.25 0.80 -FEP_44-42 -1.38 0.15 -FEP_67-34 -29.60 0.31 -FEP_61-40 -24.12 1.22 -FEP_51-49 -9.43 0.17 -FEP_32-31 5.47 0.19 -FEP_50-26 34.74 0.49 -FEP_66-63 -11.30 0.17 -FEP_50-27 -8.54 0.82 -FEP_51-45 -17.15 0.13 -FEP_61-48 -29.38 0.46 -FEP_52-49 12.69 0.89 -FEP_58-31 -19.42 1.00 -FEP_61-49 -26.44 0.29 -FEP_50-41 -1.43 nan -FEP_62-31 -38.11 0.31 -FEP_36-23 25.54 0.30 -FEP_53-37 4.81 0.31 -FEP_67-43 -32.73 0.32 -FEP_50-38 -0.88 0.37 -FEP_56-50 -22.78 0.31 -FEP_30-27 1.13 0.28 -FEP_66-45 -23.02 0.19 -FEP_63-30 -12.56 0.24 -FEP_41-31 2.59 nan -FEP_46-36 4.27 0.20 -FEP_56-23 -6.40 0.26 -FEP_62-49 -34.13 0.15 -FEP_50-28 -9.78 0.22 -FEP_52-50 13.58 0.23 -FEP_61-39 -28.71 0.68 -FEP_65-39 -15.47 1.10 -FEP_53-38 11.76 1.42 -FEP_46-31 8.05 0.23 -FEP_57-35 -40.82 0.33 -FEP_49-37 -6.98 0.22 -FEP_42-41 -0.04 0.27 -FEP_53-52 -1.14 0.63 -FEP_67-39 -30.95 0.94 -FEP_33-23 27.45 0.36 -FEP_56-46 -35.88 0.16 -FEP_58-33 -29.32 0.62 -FEP_58-37 -23.61 0.48 -FEP_68-42 -28.70 0.14 -FEP_64-61 12.75 0.73 -FEP_51-29 3.10 0.68 -FEP_61-35 -35.62 0.72 -FEP_51-50 -7.78 0.22 -FEP_41-27 nan nan -FEP_38-31 -4.72 1.14 -FEP_64-27 -18.04 0.72 -FEP_63-40 -4.32 1.06 -FEP_62-54 -40.58 1.06 -FEP_39-36 -4.09 1.03 -FEP_68-27 -34.68 0.34 -FEP_63-34 -6.96 0.50 -FEP_54-40 2.93 1.36 -FEP_65-56 15.74 0.46 -FEP_65-48 -12.45 0.32 -FEP_31-28 -4.66 0.46 -FEP_58-46 -28.20 0.18 -FEP_34-31 -2.86 0.48 -FEP_66-39 -17.12 0.69 -FEP_68-39 -31.99 0.82 -FEP_52-39 10.31 0.21 -FEP_50-48 -4.16 0.87 -FEP_56-38 nan nan -FEP_57-44 -30.97 0.17 -FEP_64-47 -54.58 0.47 -FEP_62-56 -10.78 0.23 -FEP_33-31 6.95 0.22 -FEP_44-36 -8.31 0.25 -FEP_56-52 -37.01 0.52 -FEP_54-37 -3.32 0.45 -FEP_35-27 2.76 0.16 -FEP_45-31 4.10 0.30 -FEP_36-26 45.65 0.24 -FEP_61-60 -15.53 0.49 -FEP_60-44 -9.17 0.23 -FEP_68-52 -42.08 0.70 -FEP_28-23 27.45 0.41 -FEP_49-40 1.75 0.08 -FEP_65-49 -8.66 0.65 -FEP_62-47 -77.01 0.59 -FEP_67-26 8.05 1.06 -FEP_62-37 -40.82 0.44 -FEP_56-39 -26.42 0.58 -FEP_52-46 0.71 0.44 -FEP_46-27 4.96 0.27 -FEP_48-44 4.71 0.26 -FEP_62-30 -41.51 0.36 -FEP_46-23 30.42 0.50 -FEP_39-23 19.29 0.83 -FEP_53-42 11.21 0.43 -FEP_53-34 10.79 0.48 -FEP_44-30 -8.29 0.27 -FEP_63-33 -17.40 0.51 -FEP_29-23 7.37 1.00 -FEP_66-37 -23.14 0.12 -FEP_40-26 35.63 0.83 -FEP_37-23 24.37 0.26 -FEP_65-33 -20.99 0.85 -FEP_51-48 -12.74 0.11 -FEP_47-34 39.98 0.29 -FEP_61-57 4.15 0.37 -FEP_44-27 -7.57 0.41 -FEP_66-57 15.17 0.20 -FEP_35-32 0.52 0.10 -FEP_54-35 -4.47 0.16 -FEP_40-28 -11.44 nan -FEP_37-35 -2.06 0.40 -FEP_41-39 -0.97 0.99 -FEP_52-45 5.50 0.39 -FEP_62-52 -48.51 0.89 -FEP_58-53 -28.51 0.18 -FEP_48-23 21.13 0.19 -FEP_56-49 -23.98 0.38 -FEP_65-42 -9.04 0.19 -FEP_42-33 -10.36 0.75 -FEP_60-57 21.37 0.24 -FEP_67-57 2.82 0.17 -FEP_47-45 35.03 0.68 -FEP_62-42 -33.85 0.57 -FEP_57-49 -31.45 0.63 -FEP_65-61 16.15 0.85 -FEP_67-64 -15.82 0.47 -FEP_56-37 -31.11 0.39 -FEP_51-47 -51.03 0.34 -FEP_38-34 -1.36 0.85 -FEP_58-36 -25.04 0.33 -FEP_41-29 nan nan -FEP_58-50 -15.09 0.42 -FEP_66-41 -21.61 2.22 -FEP_61-50 -24.75 0.15 -FEP_50-47 -42.56 0.31 -FEP_52-27 5.92 0.30 -FEP_65-44 -7.37 0.15 -FEP_53-45 4.65 0.18 -FEP_38-27 -7.21 1.37 -FEP_62-28 -42.87 0.50 -FEP_49-46 -12.17 0.39 -FEP_45-38 5.18 0.43 -FEP_56-45 -31.72 0.26 -FEP_47-27 35.05 0.34 -FEP_57-39 -34.16 1.15 -FEP_42-38 -0.56 0.40 -FEP_65-47 -49.81 0.18 -FEP_61-41 -27.71 1.98 -FEP_28-27 2.42 0.32 -FEP_32-28 -0.45 0.27 -FEP_67-35 -37.83 0.10 -FEP_33-27 4.38 0.15 -FEP_65-60 1.60 0.16 -FEP_60-34 -11.82 0.39 -FEP_46-37 4.08 0.51 -FEP_50-42 -2.02 0.21 -FEP_46-45 4.28 0.21 -FEP_68-49 -28.83 0.40 -FEP_49-45 -7.79 0.27 -FEP_29-27 -17.40 0.46 -FEP_26-23 -19.70 0.34 -FEP_39-35 -7.96 0.89 -FEP_63-61 20.88 0.42 -FEP_48-27 -2.39 0.38 -FEP_42-26 37.54 0.34 -FEP_58-32 -27.53 0.81 -FEP_51-30 -16.15 0.33 -FEP_52-34 10.77 0.14 -FEP_67-49 -28.65 0.11 -FEP_31-23 21.29 0.50 -FEP_31-29 14.74 0.40 -FEP_60-27 -16.81 0.17 -FEP_48-38 5.32 0.80 -FEP_58-42 -16.79 0.26 -FEP_67-52 -41.51 0.57 -FEP_65-58 7.74 0.13 -FEP_54-50 5.17 0.44 -FEP_58-43 -20.49 0.34 -FEP_44-38 -1.11 0.60 -FEP_68-50 -26.98 0.26 -FEP_64-29 -2.14 0.46 -FEP_44-28 -10.09 0.46 -FEP_60-56 14.00 0.11 -FEP_54-36 -0.96 1.61 -FEP_47-40 nan nan -FEP_47-46 29.98 0.61 -FEP_36-35 -1.58 0.15 -FEP_61-51 -16.76 0.16 -FEP_58-48 -19.90 0.44 -FEP_41-34 0.95 1.22 -FEP_42-23 17.95 0.14 -FEP_51-39 -10.56 0.83 -FEP_56-36 -31.88 0.35 -FEP_64-28 -22.75 0.77 -FEP_53-43 8.31 0.19 -FEP_56-42 -25.98 0.83 -FEP_61-47 -67.37 0.48 -FEP_50-30 -9.19 0.30 -FEP_64-41 -14.94 0.98 -FEP_62-43 -38.07 0.60 -FEP_40-29 12.51 nan -FEP_62-45 -42.01 0.18 -FEP_62-40 -33.38 0.99 -FEP_53-32 2.90 0.33 -FEP_38-29 12.31 0.76 -FEP_42-30 -6.47 0.16 -FEP_66-31 -20.15 0.21 -FEP_48-34 2.46 0.46 -FEP_66-29 -4.86 0.17 -FEP_58-28 -26.38 0.87 -FEP_60-31 -13.58 0.17 -FEP_60-46 -22.04 0.20 -FEP_57-52 -44.57 0.80 -FEP_50-37 -8.42 0.14 -FEP_54-33 -5.92 1.01 -FEP_50-44 -0.56 0.22 -FEP_34-23 19.63 0.51 -FEP_66-52 -29.89 0.58 -FEP_65-64 4.01 0.13 -FEP_66-46 -28.09 0.17 -FEP_54-30 -2.68 0.45 -FEP_46-34 11.09 0.26 -FEP_57-23 -13.86 0.18 -FEP_52-41 10.99 nan -FEP_47-31 38.20 0.21 -FEP_43-38 5.15 0.90 -FEP_63-32 -14.56 0.52 -FEP_52-35 2.80 0.56 -FEP_33-29 21.76 0.49 -FEP_39-31 -1.64 1.08 -FEP_57-28 -39.95 0.31 -FEP_67-50 -26.93 0.26 -FEP_64-42 -13.07 0.19 -FEP_60-51 -0.31 0.23 -FEP_42-39 -2.10 0.53 -FEP_60-43 -14.36 0.12 -FEP_49-30 -7.06 0.47 -FEP_57-41 -32.79 0.81 -FEP_36-30 0.54 0.14 -FEP_62-58 -16.19 0.50 -FEP_54-29 15.89 0.43 -FEP_47-42 40.83 0.26 -FEP_66-53 -28.78 0.17 -FEP_56-40 -20.99 0.75 -FEP_57-31 -35.37 0.17 -FEP_60-42 -10.95 0.14 -FEP_45-43 2.68 0.53 -FEP_68-33 -39.41 0.49 -FEP_60-26 27.84 0.36 -FEP_43-35 -5.10 0.09 -FEP_67-56 -4.86 0.32 -FEP_63-58 11.15 0.12 -FEP_35-29 21.30 0.53 -FEP_49-41 1.71 0.90 -FEP_38-30 -7.59 0.93 -FEP_64-53 -25.13 0.53 -FEP_64-60 -2.65 0.33 -FEP_40-27 nan nan -FEP_54-38 4.14 0.89 -FEP_53-41 11.41 0.76 -FEP_48-40 nan nan -FEP_65-38 -8.65 0.72 -FEP_39-38 0.54 0.51 -FEP_64-36 -20.71 0.17 -FEP_58-30 -24.11 0.42 -FEP_58-23 0.82 0.45 -FEP_46-29 23.76 0.67 -FEP_45-33 -2.96 0.22 -FEP_64-39 -17.34 0.33 -FEP_56-43 -28.04 0.15 -FEP_36-32 -1.20 0.31 -FEP_34-28 -7.33 0.21 -FEP_42-34 -0.10 0.39 -FEP_52-29 24.02 0.63 -FEP_41-33 -4.57 nan -FEP_43-32 -4.82 0.28 -FEP_67-37 -35.51 0.34 -FEP_46-35 2.33 0.16 -FEP_67-53 -40.88 0.10 -FEP_67-36 -36.53 0.14 -FEP_60-45 -17.84 0.13 -FEP_53-46 -0.04 0.34 -FEP_53-33 1.47 0.35 -FEP_37-27 0.98 0.54 -FEP_65-36 -16.38 0.13 -FEP_56-28 -34.32 0.82 -FEP_33-28 0.82 0.33 -FEP_52-43 9.79 0.65 -FEP_48-37 -3.46 0.35 -FEP_68-64 -14.55 0.33 -FEP_60-23 7.49 0.11 -FEP_52-40 12.64 nan -FEP_38-36 -6.45 0.87 -FEP_66-40 -18.75 nan -FEP_65-30 -15.92 0.31 -FEP_35-28 -1.09 0.66 -FEP_60-40 -10.50 0.34 -FEP_52-47 -29.43 0.36 -FEP_43-31 0.27 0.19 -FEP_58-44 -15.36 0.22 -FEP_35-34 8.09 0.39 -FEP_47-23 59.38 0.36 -FEP_65-54 -13.02 0.22 -FEP_46-32 2.97 0.14 -FEP_63-50 -5.11 0.84 -FEP_57-53 -43.89 0.65 -FEP_49-44 0.46 0.19 -FEP_66-50 -14.74 0.31 -FEP_68-61 -1.60 0.29 -FEP_32-26 47.08 0.24 -FEP_64-37 -19.86 0.45 -FEP_30-26 45.28 0.32 -FEP_37-28 -1.59 0.23 -FEP_51-27 -15.87 0.38 -FEP_41-26 36.84 1.15 -FEP_49-39 -0.62 1.07 -FEP_43-26 41.79 0.44 -FEP_54-53 -7.41 0.16 -FEP_45-35 -2.64 0.34 -FEP_49-29 12.85 0.66 -FEP_40-39 -2.13 0.72 -FEP_32-27 2.07 0.16 -FEP_40-30 -3.82 nan -FEP_67-46 -40.22 0.16 -FEP_63-27 -12.56 0.51 -FEP_46-33 0.89 0.30 -FEP_51-36 -17.13 0.68 -FEP_39-32 -7.92 0.80 -FEP_58-57 15.43 0.20 -FEP_53-30 4.90 0.38 -FEP_53-28 3.52 0.49 -FEP_56-27 -30.79 0.61 -FEP_40-38 -1.63 0.44 -FEP_68-44 -27.46 0.18 -FEP_45-39 4.28 0.86 -FEP_63-56 18.07 0.16 -FEP_57-54 -36.36 0.42 -FEP_66-48 -20.16 0.42 -FEP_54-32 -5.85 0.34 -FEP_53-39 9.49 0.92 -FEP_44-33 -11.62 0.30 -FEP_45-44 8.05 0.14 -FEP_65-43 -12.57 0.16 -FEP_54-31 1.32 0.27 -FEP_61-46 -37.97 0.94 -FEP_36-33 -2.78 0.17 -FEP_31-26 41.50 0.40 -FEP_56-32 -32.64 0.50 -FEP_45-26 44.03 0.49 -FEP_67-30 -35.61 0.17 -FEP_68-31 -32.09 0.39 -FEP_46-44 12.36 0.26 -FEP_36-29 19.27 0.39 -FEP_51-32 -17.23 0.57 -FEP_58-38 -17.14 0.92 -FEP_45-37 0.30 0.39 -FEP_51-26 28.48 0.18 -FEP_53-48 8.39 0.54 -FEP_60-52 -23.76 0.60 -FEP_47-30 34.11 0.24 -FEP_58-51 -6.52 0.32 -FEP_52-31 8.49 0.46 -FEP_51-42 -8.92 0.27 -FEP_68-57 3.12 0.27 -FEP_50-31 -5.19 0.18 -FEP_34-32 -7.77 0.42 -FEP_34-27 -4.68 0.42 -FEP_54-28 -4.10 0.25 -FEP_40-37 nan nan -FEP_65-37 -15.14 0.12 -FEP_64-31 -16.45 0.29 -FEP_62-35 -44.15 0.21 -FEP_57-27 -38.24 0.55 -FEP_57-36 -40.21 0.41 -FEP_35-30 2.22 0.10 -FEP_50-34 -2.89 0.20 -FEP_68-36 -35.48 0.20 -FEP_41-28 nan nan -FEP_49-47 -41.47 0.23 -FEP_66-35 -24.97 0.27 -FEP_56-29 -12.61 0.40 -FEP_44-41 -1.80 nan -FEP_62-32 -43.86 0.24 -FEP_66-54 -20.67 0.23 -FEP_39-28 -3.39 nan -FEP_62-51 -24.57 0.14 -FEP_30-23 24.36 0.21 -FEP_62-38 -34.15 0.32 -FEP_49-42 0.33 0.66 -FEP_58-39 -20.55 0.39 -FEP_41-36 -9.99 nan -FEP_60-37 -17.75 0.52 -FEP_38-28 -10.66 2.00 -FEP_68-58 -11.99 0.43 -FEP_62-36 -42.11 0.44 -FEP_65-57 22.82 0.35 -FEP_49-27 -7.14 0.32 -FEP_62-50 -33.03 0.17 -FEP_62-60 -25.02 0.19 -FEP_57-40 -32.20 0.99 -FEP_64-57 18.60 0.30 -FEP_47-44 42.09 0.26 -FEP_34-26 38.91 0.33 -FEP_67-42 -29.00 0.17 -FEP_67-47 -70.47 0.36 -FEP_45-41 6.37 0.94 -FEP_50-40 0.37 1.38 -FEP_58-26 20.81 0.58 -FEP_64-63 -7.85 0.15 -FEP_54-41 3.66 0.33 -FEP_46-39 9.28 0.43 -FEP_62-26 3.03 0.19 -FEP_66-30 -23.75 0.52 -FEP_61-54 -30.16 0.79 -FEP_39-30 -6.51 1.30 -FEP_63-54 -9.79 0.11 -FEP_51-44 -8.90 0.21 -FEP_67-31 -32.90 0.39 -FEP_39-33 -8.40 0.35 -FEP_47-36 33.62 0.27 -FEP_43-23 21.80 0.22 -FEP_67-51 -19.08 0.44 -FEP_68-56 -4.28 0.42 -FEP_40-23 18.32 0.04 -FEP_60-30 -17.10 0.20 -FEP_67-63 -23.60 0.21 -FEP_61-53 -35.90 0.85 -FEP_57-37 -38.35 0.43 -FEP_45-36 -0.15 0.33 -FEP_40-35 -9.44 nan -FEP_66-33 -26.71 1.03 -FEP_57-43 -35.99 0.20 -FEP_68-35 -38.49 0.86 -FEP_43-36 -3.43 0.17 -FEP_45-27 0.22 0.38 -FEP_63-23 12.27 0.19 -FEP_39-29 10.69 0.72 -FEP_63-28 -14.58 0.88 -FEP_47-43 37.40 0.40 -FEP_48-26 40.66 nan -FEP_63-48 -8.54 0.23 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/no-vs/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/no-vs/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index 47f6dac7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/no-vs/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,862 +0,0 @@ -perturbation failed replicates -FEP_26-23/ 0 -FEP_27-23/ 0 -FEP_27-26/ 0 -FEP_28-23/ 0 -FEP_28-26/ 0 -FEP_28-27/ 0 -FEP_29-23/ 0 -FEP_29-26/ 0 -FEP_29-27/ 0 -FEP_29-28/ 0 -FEP_30-23/ 0 -FEP_30-26/ 0 -FEP_30-27/ 0 -FEP_30-28/ 0 -FEP_30-29/ 0 -FEP_31-23/ 0 -FEP_31-26/ 0 -FEP_31-27/ 0 -FEP_31-28/ 0 -FEP_31-29/ 0 -FEP_31-30/ 0 -FEP_32-23/ 0 -FEP_32-26/ 0 -FEP_32-27/ 0 -FEP_32-28/ 0 -FEP_32-29/ 0 -FEP_32-30/ 0 -FEP_32-31/ 0 -FEP_33-23/ 0 -FEP_33-26/ 0 -FEP_33-27/ 0 -FEP_33-28/ 0 -FEP_33-29/ 0 -FEP_33-30/ 0 -FEP_33-31/ 0 -FEP_33-32/ 0 -FEP_34-23/ 0 -FEP_34-26/ 0 -FEP_34-27/ 0 -FEP_34-28/ 0 -FEP_34-29/ 0 -FEP_34-30/ 0 -FEP_34-31/ 0 -FEP_34-32/ 0 -FEP_34-33/ 0 -FEP_35-23/ 0 -FEP_35-26/ 0 -FEP_35-27/ 0 -FEP_35-28/ 0 -FEP_35-29/ 0 -FEP_35-30/ 0 -FEP_35-31/ 0 -FEP_35-32/ 0 -FEP_35-33/ 0 -FEP_35-34/ 0 -FEP_36-23/ 0 -FEP_36-26/ 0 -FEP_36-27/ 0 -FEP_36-28/ 0 -FEP_36-29/ 0 -FEP_36-30/ 0 -FEP_36-31/ 0 -FEP_36-32/ 0 -FEP_36-33/ 0 -FEP_36-34/ 0 -FEP_36-35/ 0 -FEP_37-23/ 0 -FEP_37-26/ 0 -FEP_37-27/ 0 -FEP_37-28/ 0 -FEP_37-29/ 0 -FEP_37-30/ 0 -FEP_37-31/ 0 -FEP_37-32/ 0 -FEP_37-33/ 0 -FEP_37-34/ 0 -FEP_37-35/ 0 -FEP_37-36/ 0 -FEP_38-23/ 0 -FEP_38-26/ 0 -FEP_38-27/ 0 -FEP_38-28/ 0 -FEP_38-29/ 0 -FEP_38-30/ 0 -FEP_38-31/ 0 -FEP_38-32/ 0 -FEP_38-33/ 0 -FEP_38-34/ 0 -FEP_38-35/ 0 -FEP_38-36/ 0 -FEP_38-37/ 0 -FEP_39-23/ 0 -FEP_39-26/ 0 -FEP_39-27/ 0 -FEP_39-28/ 0 -FEP_39-29/ 0 -FEP_39-30/ 0 -FEP_39-31/ 0 -FEP_39-32/ 0 -FEP_39-33/ 0 -FEP_39-34/ 0 -FEP_39-35/ 0 -FEP_39-36/ 0 -FEP_39-37/ 0 -FEP_39-38/ 0 -FEP_40-23/ 0 -FEP_40-26/ 0 -FEP_40-27/ 0 -FEP_40-28/ 0 -FEP_40-29/ 0 -FEP_40-30/ 0 -FEP_40-31/ 0 -FEP_40-32/ 0 -FEP_40-33/ 0 -FEP_40-34/ 0 -FEP_40-35/ 0 -FEP_40-36/ 0 -FEP_40-37/ 0 -FEP_40-38/ 0 -FEP_40-39/ 0 -FEP_41-23/ 0 -FEP_41-26/ 0 -FEP_41-27/ 0 -FEP_41-28/ 0 -FEP_41-29/ 0 -FEP_41-30/ 0 -FEP_41-31/ 0 -FEP_41-32/ 0 -FEP_41-33/ 0 -FEP_41-34/ 0 -FEP_41-35/ 0 -FEP_41-36/ 0 -FEP_41-37/ 0 -FEP_41-38/ 0 -FEP_41-39/ 0 -FEP_41-40/ 0 -FEP_42-23/ 0 -FEP_42-26/ 0 -FEP_42-27/ 0 -FEP_42-28/ 0 -FEP_42-29/ 0 -FEP_42-30/ 0 -FEP_42-31/ 0 -FEP_42-32/ 0 -FEP_42-33/ 0 -FEP_42-34/ 0 -FEP_42-35/ 0 -FEP_42-36/ 0 -FEP_42-37/ 0 -FEP_42-38/ 0 -FEP_42-39/ 0 -FEP_42-40/ 0 -FEP_42-41/ 0 -FEP_43-23/ 0 -FEP_43-26/ 0 -FEP_43-27/ 0 -FEP_43-28/ 0 -FEP_43-29/ 0 -FEP_43-30/ 0 -FEP_43-31/ 0 -FEP_43-32/ 0 -FEP_43-33/ 0 -FEP_43-34/ 0 -FEP_43-35/ 0 -FEP_43-36/ 0 -FEP_43-37/ 0 -FEP_43-38/ 0 -FEP_43-39/ 0 -FEP_43-40/ 0 -FEP_43-41/ 0 -FEP_43-42/ 0 -FEP_44-23/ 0 -FEP_44-26/ 0 -FEP_44-27/ 0 -FEP_44-28/ 0 -FEP_44-29/ 0 -FEP_44-30/ 0 -FEP_44-31/ 0 -FEP_44-32/ 0 -FEP_44-33/ 0 -FEP_44-34/ 0 -FEP_44-35/ 0 -FEP_44-36/ 0 -FEP_44-37/ 0 -FEP_44-38/ 0 -FEP_44-39/ 0 -FEP_44-40/ 0 -FEP_44-41/ 0 -FEP_44-42/ 0 -FEP_44-43/ 0 -FEP_45-23/ 0 -FEP_45-26/ 0 -FEP_45-27/ 0 -FEP_45-28/ 0 -FEP_45-29/ 0 -FEP_45-30/ 0 -FEP_45-31/ 0 -FEP_45-32/ 0 -FEP_45-33/ 0 -FEP_45-34/ 0 -FEP_45-35/ 0 -FEP_45-36/ 0 -FEP_45-37/ 0 -FEP_45-38/ 0 -FEP_45-39/ 0 -FEP_45-40/ 0 -FEP_45-41/ 0 -FEP_45-42/ 0 -FEP_45-43/ 0 -FEP_45-44/ 0 -FEP_46-23/ 0 -FEP_46-26/ 0 -FEP_46-27/ 0 -FEP_46-28/ 0 -FEP_46-29/ 0 -FEP_46-30/ 0 -FEP_46-31/ 0 -FEP_46-32/ 0 -FEP_46-33/ 0 -FEP_46-34/ 0 -FEP_46-35/ 0 -FEP_46-36/ 0 -FEP_46-37/ 0 -FEP_46-38/ 0 -FEP_46-39/ 0 -FEP_46-40/ 0 -FEP_46-41/ 0 -FEP_46-42/ 0 -FEP_46-43/ 0 -FEP_46-44/ 0 -FEP_46-45/ 0 -FEP_47-23/ 0 -FEP_47-26/ 0 -FEP_47-27/ 0 -FEP_47-28/ 0 -FEP_47-29/ 0 -FEP_47-30/ 0 -FEP_47-31/ 0 -FEP_47-32/ 0 -FEP_47-33/ 0 -FEP_47-34/ 0 -FEP_47-35/ 0 -FEP_47-36/ 0 -FEP_47-37/ 0 -FEP_47-38/ 0 -FEP_47-39/ 0 -FEP_47-40/ 0 -FEP_47-41/ 0 -FEP_47-42/ 0 -FEP_47-43/ 0 -FEP_47-44/ 0 -FEP_47-45/ 0 -FEP_47-46/ 0 -FEP_48-23/ 0 -FEP_48-26/ 0 -FEP_48-27/ 0 -FEP_48-28/ 0 -FEP_48-29/ 0 -FEP_48-30/ 0 -FEP_48-31/ 0 -FEP_48-32/ 0 -FEP_48-33/ 0 -FEP_48-34/ 0 -FEP_48-35/ 0 -FEP_48-36/ 0 -FEP_48-37/ 0 -FEP_48-38/ 0 -FEP_48-39/ 0 -FEP_48-40/ 0 -FEP_48-41/ 0 -FEP_48-42/ 0 -FEP_48-43/ 0 -FEP_48-44/ 0 -FEP_48-45/ 0 -FEP_48-46/ 0 -FEP_48-47/ 0 -FEP_49-23/ 0 -FEP_49-26/ 0 -FEP_49-27/ 0 -FEP_49-28/ 0 -FEP_49-29/ 0 -FEP_49-30/ 0 -FEP_49-31/ 0 -FEP_49-32/ 0 -FEP_49-33/ 0 -FEP_49-34/ 0 -FEP_49-35/ 0 -FEP_49-36/ 0 -FEP_49-37/ 0 -FEP_49-38/ 0 -FEP_49-39/ 0 -FEP_49-40/ 0 -FEP_49-41/ 0 -FEP_49-42/ 0 -FEP_49-43/ 0 -FEP_49-44/ 0 -FEP_49-45/ 0 -FEP_49-46/ 0 -FEP_49-47/ 0 -FEP_49-48/ 0 -FEP_50-23/ 0 -FEP_50-26/ 0 -FEP_50-27/ 0 -FEP_50-28/ 0 -FEP_50-29/ 0 -FEP_50-30/ 0 -FEP_50-31/ 0 -FEP_50-32/ 0 -FEP_50-33/ 0 -FEP_50-34/ 0 -FEP_50-35/ 0 -FEP_50-36/ 0 -FEP_50-37/ 0 -FEP_50-38/ 0 -FEP_50-39/ 0 -FEP_50-40/ 0 -FEP_50-41/ 0 -FEP_50-42/ 0 -FEP_50-43/ 0 -FEP_50-44/ 0 -FEP_50-45/ 0 -FEP_50-46/ 0 -FEP_50-47/ 0 -FEP_50-48/ 0 -FEP_50-49/ 0 -FEP_51-23/ 0 -FEP_51-26/ 0 -FEP_51-27/ 0 -FEP_51-28/ 0 -FEP_51-29/ 0 -FEP_51-30/ 0 -FEP_51-31/ 0 -FEP_51-32/ 0 -FEP_51-33/ 0 -FEP_51-34/ 0 -FEP_51-35/ 0 -FEP_51-36/ 0 -FEP_51-37/ 0 -FEP_51-38/ 0 -FEP_51-39/ 0 -FEP_51-40/ 0 -FEP_51-41/ 0 -FEP_51-42/ 0 -FEP_51-43/ 0 -FEP_51-44/ 0 -FEP_51-45/ 0 -FEP_51-46/ 0 -FEP_51-47/ 0 -FEP_51-48/ 0 -FEP_51-49/ 0 -FEP_51-50/ 0 -FEP_52-23/ 0 -FEP_52-26/ 0 -FEP_52-27/ 0 -FEP_52-28/ 0 -FEP_52-29/ 0 -FEP_52-30/ 0 -FEP_52-31/ 0 -FEP_52-32/ 0 -FEP_52-33/ 0 -FEP_52-34/ 0 -FEP_52-35/ 0 -FEP_52-36/ 0 -FEP_52-37/ 0 -FEP_52-38/ 0 -FEP_52-39/ 0 -FEP_52-40/ 0 -FEP_52-41/ 0 -FEP_52-42/ 0 -FEP_52-43/ 0 -FEP_52-44/ 0 -FEP_52-45/ 0 -FEP_52-46/ 0 -FEP_52-47/ 0 -FEP_52-48/ 0 -FEP_52-49/ 0 -FEP_52-50/ 0 -FEP_52-51/ 0 -FEP_53-23/ 0 -FEP_53-26/ 0 -FEP_53-27/ 0 -FEP_53-28/ 0 -FEP_53-29/ 0 -FEP_53-30/ 0 -FEP_53-31/ 0 -FEP_53-32/ 0 -FEP_53-33/ 0 -FEP_53-34/ 0 -FEP_53-35/ 0 -FEP_53-36/ 0 -FEP_53-37/ 0 -FEP_53-38/ 0 -FEP_53-39/ 0 -FEP_53-40/ 0 -FEP_53-41/ 0 -FEP_53-42/ 0 -FEP_53-43/ 0 -FEP_53-44/ 0 -FEP_53-45/ 0 -FEP_53-46/ 0 -FEP_53-47/ 0 -FEP_53-48/ 0 -FEP_53-49/ 0 -FEP_53-50/ 0 -FEP_53-51/ 0 -FEP_53-52/ 0 -FEP_54-23/ 0 -FEP_54-26/ 0 -FEP_54-27/ 0 -FEP_54-28/ 0 -FEP_54-29/ 0 -FEP_54-30/ 0 -FEP_54-31/ 0 -FEP_54-32/ 0 -FEP_54-33/ 0 -FEP_54-34/ 0 -FEP_54-35/ 0 -FEP_54-36/ 0 -FEP_54-37/ 0 -FEP_54-38/ 0 -FEP_54-39/ 0 -FEP_54-40/ 0 -FEP_54-41/ 0 -FEP_54-42/ 0 -FEP_54-43/ 0 -FEP_54-44/ 0 -FEP_54-45/ 0 -FEP_54-46/ 0 -FEP_54-47/ 0 -FEP_54-48/ 0 -FEP_54-49/ 0 -FEP_54-50/ 0 -FEP_54-51/ 0 -FEP_54-52/ 0 -FEP_54-53/ 0 -FEP_56-23/ 0 -FEP_56-26/ 0 -FEP_56-27/ 0 -FEP_56-28/ 0 -FEP_56-29/ 0 -FEP_56-30/ 0 -FEP_56-31/ 0 -FEP_56-32/ 0 -FEP_56-33/ 0 -FEP_56-34/ 0 -FEP_56-35/ 0 -FEP_56-36/ 0 -FEP_56-37/ 0 -FEP_56-38/ 0 -FEP_56-39/ 0 -FEP_56-40/ 0 -FEP_56-41/ 0 -FEP_56-42/ 0 -FEP_56-43/ 0 -FEP_56-44/ 0 -FEP_56-45/ 0 -FEP_56-46/ 0 -FEP_56-47/ 0 -FEP_56-48/ 0 -FEP_56-49/ 0 -FEP_56-50/ 0 -FEP_56-51/ 0 -FEP_56-52/ 0 -FEP_56-53/ 0 -FEP_56-54/ 0 -FEP_57-23/ 0 -FEP_57-26/ 0 -FEP_57-27/ 0 -FEP_57-28/ 0 -FEP_57-29/ 0 -FEP_57-30/ 0 -FEP_57-31/ 0 -FEP_57-32/ 0 -FEP_57-33/ 0 -FEP_57-34/ 0 -FEP_57-35/ 0 -FEP_57-36/ 0 -FEP_57-37/ 0 -FEP_57-38/ 0 -FEP_57-39/ 0 -FEP_57-40/ 0 -FEP_57-41/ 0 -FEP_57-42/ 0 -FEP_57-43/ 0 -FEP_57-44/ 0 -FEP_57-45/ 0 -FEP_57-46/ 0 -FEP_57-47/ 0 -FEP_57-48/ 0 -FEP_57-49/ 0 -FEP_57-50/ 0 -FEP_57-51/ 0 -FEP_57-52/ 0 -FEP_57-53/ 0 -FEP_57-54/ 0 -FEP_57-56/ 0 -FEP_58-23/ 0 -FEP_58-26/ 0 -FEP_58-27/ 0 -FEP_58-28/ 0 -FEP_58-29/ 0 -FEP_58-30/ 0 -FEP_58-31/ 0 -FEP_58-32/ 0 -FEP_58-33/ 0 -FEP_58-34/ 0 -FEP_58-35/ 0 -FEP_58-36/ 0 -FEP_58-37/ 0 -FEP_58-38/ 0 -FEP_58-39/ 0 -FEP_58-40/ 0 -FEP_58-41/ 0 -FEP_58-42/ 0 -FEP_58-43/ 0 -FEP_58-44/ 0 -FEP_58-45/ 0 -FEP_58-46/ 0 -FEP_58-47/ 0 -FEP_58-48/ 0 -FEP_58-49/ 0 -FEP_58-50/ 0 -FEP_58-51/ 0 -FEP_58-52/ 0 -FEP_58-53/ 0 -FEP_58-54/ 0 -FEP_58-56/ 0 -FEP_58-57/ 0 -FEP_60-23/ 0 -FEP_60-26/ 0 -FEP_60-27/ 0 -FEP_60-28/ 0 -FEP_60-29/ 0 -FEP_60-30/ 0 -FEP_60-31/ 0 -FEP_60-32/ 0 -FEP_60-33/ 0 -FEP_60-34/ 0 -FEP_60-35/ 0 -FEP_60-36/ 0 -FEP_60-37/ 0 -FEP_60-38/ 0 -FEP_60-39/ 0 -FEP_60-40/ 0 -FEP_60-41/ 0 -FEP_60-42/ 0 -FEP_60-43/ 0 -FEP_60-44/ 0 -FEP_60-45/ 0 -FEP_60-46/ 0 -FEP_60-47/ 0 -FEP_60-48/ 0 -FEP_60-49/ 0 -FEP_60-50/ 0 -FEP_60-51/ 0 -FEP_60-52/ 0 -FEP_60-53/ 0 -FEP_60-54/ 0 -FEP_60-56/ 0 -FEP_60-57/ 0 -FEP_60-58/ 0 -FEP_61-23/ 0 -FEP_61-26/ 0 -FEP_61-27/ 0 -FEP_61-28/ 0 -FEP_61-29/ 0 -FEP_61-30/ 0 -FEP_61-31/ 0 -FEP_61-32/ 0 -FEP_61-33/ 0 -FEP_61-34/ 0 -FEP_61-35/ 0 -FEP_61-36/ 0 -FEP_61-37/ 0 -FEP_61-38/ 0 -FEP_61-39/ 0 -FEP_61-40/ 0 -FEP_61-41/ 0 -FEP_61-42/ 0 -FEP_61-43/ 0 -FEP_61-44/ 0 -FEP_61-45/ 0 -FEP_61-46/ 0 -FEP_61-47/ 0 -FEP_61-48/ 0 -FEP_61-49/ 0 -FEP_61-50/ 0 -FEP_61-51/ 0 -FEP_61-52/ 0 -FEP_61-53/ 0 -FEP_61-54/ 0 -FEP_61-56/ 0 -FEP_61-57/ 0 -FEP_61-58/ 0 -FEP_61-60/ 0 -FEP_62-23/ 0 -FEP_62-26/ 0 -FEP_62-27/ 0 -FEP_62-28/ 0 -FEP_62-29/ 0 -FEP_62-30/ 0 -FEP_62-31/ 0 -FEP_62-32/ 0 -FEP_62-33/ 0 -FEP_62-34/ 0 -FEP_62-35/ 0 -FEP_62-36/ 0 -FEP_62-37/ 0 -FEP_62-38/ 0 -FEP_62-39/ 0 -FEP_62-40/ 0 -FEP_62-41/ 0 -FEP_62-42/ 0 -FEP_62-43/ 0 -FEP_62-44/ 0 -FEP_62-45/ 0 -FEP_62-46/ 0 -FEP_62-47/ 0 -FEP_62-48/ 0 -FEP_62-49/ 0 -FEP_62-50/ 0 -FEP_62-51/ 0 -FEP_62-52/ 0 -FEP_62-53/ 0 -FEP_62-54/ 0 -FEP_62-56/ 0 -FEP_62-57/ 0 -FEP_62-58/ 0 -FEP_62-60/ 0 -FEP_62-61/ 0 -FEP_63-23/ 0 -FEP_63-26/ 0 -FEP_63-27/ 0 -FEP_63-28/ 0 -FEP_63-29/ 0 -FEP_63-30/ 0 -FEP_63-31/ 0 -FEP_63-32/ 0 -FEP_63-33/ 0 -FEP_63-34/ 0 -FEP_63-35/ 0 -FEP_63-36/ 0 -FEP_63-37/ 0 -FEP_63-38/ 0 -FEP_63-39/ 0 -FEP_63-40/ 0 -FEP_63-41/ 0 -FEP_63-42/ 0 -FEP_63-43/ 0 -FEP_63-44/ 0 -FEP_63-45/ 0 -FEP_63-46/ 0 -FEP_63-47/ 0 -FEP_63-48/ 0 -FEP_63-49/ 0 -FEP_63-50/ 0 -FEP_63-51/ 0 -FEP_63-52/ 0 -FEP_63-53/ 0 -FEP_63-54/ 0 -FEP_63-56/ 0 -FEP_63-57/ 0 -FEP_63-58/ 0 -FEP_63-60/ 0 -FEP_63-61/ 0 -FEP_63-62/ 0 -FEP_64-23/ 0 -FEP_64-26/ 0 -FEP_64-27/ 0 -FEP_64-28/ 0 -FEP_64-29/ 0 -FEP_64-30/ 0 -FEP_64-31/ 0 -FEP_64-32/ 0 -FEP_64-33/ 0 -FEP_64-34/ 0 -FEP_64-35/ 0 -FEP_64-36/ 0 -FEP_64-37/ 0 -FEP_64-38/ 0 -FEP_64-39/ 0 -FEP_64-40/ 0 -FEP_64-41/ 0 -FEP_64-42/ 0 -FEP_64-43/ 0 -FEP_64-44/ 0 -FEP_64-45/ 0 -FEP_64-46/ 0 -FEP_64-47/ 0 -FEP_64-48/ 0 -FEP_64-49/ 0 -FEP_64-50/ 0 -FEP_64-51/ 0 -FEP_64-52/ 0 -FEP_64-53/ 0 -FEP_64-54/ 0 -FEP_64-56/ 0 -FEP_64-57/ 0 -FEP_64-58/ 0 -FEP_64-60/ 0 -FEP_64-61/ 0 -FEP_64-62/ 0 -FEP_64-63/ 0 -FEP_65-23/ 0 -FEP_65-26/ 0 -FEP_65-27/ 0 -FEP_65-28/ 0 -FEP_65-29/ 0 -FEP_65-30/ 0 -FEP_65-31/ 0 -FEP_65-32/ 0 -FEP_65-33/ 0 -FEP_65-34/ 0 -FEP_65-35/ 0 -FEP_65-36/ 0 -FEP_65-37/ 0 -FEP_65-38/ 0 -FEP_65-39/ 0 -FEP_65-40/ 0 -FEP_65-41/ 0 -FEP_65-42/ 0 -FEP_65-43/ 0 -FEP_65-44/ 0 -FEP_65-45/ 0 -FEP_65-46/ 0 -FEP_65-47/ 0 -FEP_65-48/ 0 -FEP_65-49/ 0 -FEP_65-50/ 0 -FEP_65-51/ 0 -FEP_65-52/ 0 -FEP_65-53/ 0 -FEP_65-54/ 0 -FEP_65-56/ 0 -FEP_65-57/ 0 -FEP_65-58/ 0 -FEP_65-60/ 0 -FEP_65-61/ 0 -FEP_65-62/ 0 -FEP_65-63/ 0 -FEP_65-64/ 0 -FEP_66-23/ 0 -FEP_66-26/ 0 -FEP_66-27/ 0 -FEP_66-28/ 0 -FEP_66-29/ 0 -FEP_66-30/ 0 -FEP_66-31/ 0 -FEP_66-32/ 0 -FEP_66-33/ 0 -FEP_66-34/ 0 -FEP_66-35/ 0 -FEP_66-36/ 0 -FEP_66-37/ 0 -FEP_66-38/ 0 -FEP_66-39/ 0 -FEP_66-40/ 0 -FEP_66-41/ 0 -FEP_66-42/ 0 -FEP_66-43/ 0 -FEP_66-44/ 0 -FEP_66-45/ 0 -FEP_66-46/ 0 -FEP_66-47/ 0 -FEP_66-48/ 0 -FEP_66-49/ 0 -FEP_66-50/ 0 -FEP_66-51/ 0 -FEP_66-52/ 0 -FEP_66-53/ 0 -FEP_66-54/ 0 -FEP_66-56/ 0 -FEP_66-57/ 0 -FEP_66-58/ 0 -FEP_66-60/ 0 -FEP_66-61/ 0 -FEP_66-62/ 0 -FEP_66-63/ 0 -FEP_66-64/ 0 -FEP_66-65/ 0 -FEP_67-23/ 0 -FEP_67-26/ 0 -FEP_67-27/ 0 -FEP_67-28/ 0 -FEP_67-29/ 0 -FEP_67-30/ 0 -FEP_67-31/ 0 -FEP_67-32/ 0 -FEP_67-33/ 0 -FEP_67-34/ 0 -FEP_67-35/ 0 -FEP_67-36/ 0 -FEP_67-37/ 0 -FEP_67-38/ 0 -FEP_67-39/ 0 -FEP_67-40/ 0 -FEP_67-41/ 0 -FEP_67-42/ 0 -FEP_67-43/ 0 -FEP_67-44/ 0 -FEP_67-45/ 0 -FEP_67-46/ 0 -FEP_67-47/ 0 -FEP_67-48/ 0 -FEP_67-49/ 0 -FEP_67-50/ 0 -FEP_67-51/ 0 -FEP_67-52/ 0 -FEP_67-53/ 0 -FEP_67-54/ 0 -FEP_67-56/ 0 -FEP_67-57/ 0 -FEP_67-58/ 0 -FEP_67-60/ 0 -FEP_67-61/ 0 -FEP_67-62/ 0 -FEP_67-63/ 0 -FEP_67-64/ 0 -FEP_67-65/ 0 -FEP_67-66/ 0 -FEP_68-23/ 0 -FEP_68-26/ 0 -FEP_68-27/ 0 -FEP_68-28/ 0 -FEP_68-29/ 0 -FEP_68-30/ 0 -FEP_68-31/ 0 -FEP_68-32/ 0 -FEP_68-33/ 0 -FEP_68-34/ 0 -FEP_68-35/ 0 -FEP_68-36/ 0 -FEP_68-37/ 0 -FEP_68-38/ 0 -FEP_68-39/ 0 -FEP_68-40/ 0 -FEP_68-41/ 0 -FEP_68-42/ 0 -FEP_68-43/ 0 -FEP_68-44/ 0 -FEP_68-45/ 0 -FEP_68-46/ 0 -FEP_68-47/ 0 -FEP_68-48/ 0 -FEP_68-49/ 0 -FEP_68-50/ 0 -FEP_68-51/ 0 -FEP_68-52/ 0 -FEP_68-53/ 0 -FEP_68-54/ 0 -FEP_68-56/ 0 -FEP_68-57/ 0 -FEP_68-58/ 0 -FEP_68-60/ 0 -FEP_68-61/ 0 -FEP_68-62/ 0 -FEP_68-63/ 0 -FEP_68-64/ 0 -FEP_68-65/ 0 -FEP_68-66/ 0 -FEP_68-67/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs-backup/water_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs-backup/water_1.txt deleted file mode 100755 index 1b0dde08..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs-backup/water_1.txt +++ /dev/null @@ -1,587 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_65-34 -8.86 0.54 1 -FEP_60-27 -14.53 0.22 0 -FEP_52-51 25.32 1.04 2 -FEP_51-50 -9.78 0.17 0 -FEP_65-35 -18.36 0.17 0 -FEP_30-29 18.03 0.59 1 -FEP_44-36 -8.98 0.27 0 -FEP_65-52 -24.44 0.66 1 -FEP_48-40 2.48 0.08 8 -FEP_41-26 37.49 0.96 7 -FEP_32-28 -0.81 0.99 0 -FEP_68-53 -43.32 0.28 1 -FEP_35-28 1.89 0.64 0 -FEP_41-39 -0.55 0.62 0 -FEP_45-23 25.28 0.15 0 -FEP_57-47 -73.02 0.78 3 -FEP_68-48 -30.75 0.45 0 -FEP_65-48 -11.31 0.20 1 -FEP_37-29 21.14 0.58 2 -FEP_65-27 -14.89 0.60 0 -FEP_39-32 -4.97 0.46 4 -FEP_49-46 -11.31 0.63 0 -FEP_61-43 -27.03 0.47 2 -FEP_68-67 -0.56 0.23 1 -FEP_64-49 -14.56 0.56 2 -FEP_56-31 -25.57 0.30 1 -FEP_46-43 7.59 0.11 1 -FEP_37-23 27.20 0.42 1 -FEP_45-44 7.22 0.17 0 -FEP_65-40 -6.66 1.66 7 -FEP_66-54 -23.56 0.22 0 -FEP_51-26 28.04 0.36 0 -FEP_58-43 -16.87 0.36 0 -FEP_41-36 -5.43 0.60 7 -FEP_38-29 14.44 0.49 3 -FEP_45-36 -1.06 0.18 0 -FEP_50-42 -0.52 0.28 0 -FEP_68-26 10.83 0.20 1 -FEP_58-56 8.73 0.23 0 -FEP_56-44 -21.89 0.27 0 -FEP_67-23 -8.92 0.41 1 -FEP_67-41 -26.86 1.41 7 -FEP_68-35 -38.19 0.28 0 -FEP_60-33 -19.74 0.34 0 -FEP_63-28 -9.27 0.38 1 -FEP_28-27 2.66 1.06 1 -FEP_68-31 -30.91 0.38 2 -FEP_64-36 -20.07 0.22 0 -FEP_54-45 -1.26 0.22 0 -FEP_60-56 13.37 0.22 0 -FEP_62-30 -41.42 0.35 1 -FEP_60-34 -9.71 0.42 0 -FEP_63-34 -2.96 0.64 0 -FEP_66-42 -17.94 0.26 1 -FEP_36-29 20.23 0.30 0 -FEP_41-23 16.55 0.53 8 -FEP_63-56 19.82 0.24 0 -FEP_65-50 -7.53 0.52 1 -FEP_60-26 29.97 0.34 1 -FEP_68-39 -31.43 0.79 5 -FEP_49-29 13.16 0.64 0 -FEP_52-45 8.35 0.77 2 -FEP_65-53 -23.33 0.34 1 -FEP_62-31 -37.51 0.28 1 -FEP_68-63 -26.04 0.33 0 -FEP_44-26 38.10 0.20 1 -FEP_63-31 -4.95 0.31 0 -FEP_57-23 -13.85 0.12 1 -FEP_61-40 -20.84 0.75 3 -FEP_56-38 -25.62 0.06 8 -FEP_62-46 -47.95 1.00 1 -FEP_65-63 -6.16 0.17 0 -FEP_61-51 -13.95 0.16 0 -FEP_38-34 -3.03 1.62 8 -FEP_68-57 4.40 0.16 0 -FEP_43-26 41.19 0.42 0 -FEP_67-38 -27.35 0.45 0 -FEP_42-30 -6.84 0.19 1 -FEP_46-42 10.67 0.38 0 -FEP_40-33 -12.37 0.83 8 -FEP_67-50 -26.84 0.26 0 -FEP_53-46 4.18 0.15 0 -FEP_53-52 -0.28 0.56 1 -FEP_64-31 -14.72 0.25 1 -FEP_66-32 -26.21 1.05 3 -FEP_40-26 33.93 1.06 3 -FEP_39-34 1.32 0.53 0 -FEP_64-41 -11.56 0.68 4 -FEP_57-39 -34.48 1.22 2 -FEP_56-54 -28.51 0.93 4 -FEP_67-64 -16.87 0.65 3 -FEP_52-37 6.68 0.23 1 -FEP_65-32 -17.09 0.55 1 -FEP_62-52 -49.79 0.71 1 -FEP_66-27 -23.64 0.27 4 -FEP_45-37 -1.97 0.28 0 -FEP_68-28 -36.75 0.45 0 -FEP_67-58 -12.77 0.52 0 -FEP_65-43 -11.72 0.22 2 -FEP_67-43 -30.80 0.11 1 -FEP_43-37 -5.13 0.52 2 -FEP_31-29 14.67 0.41 0 -FEP_46-44 13.37 1.24 0 -FEP_66-62 17.00 0.30 1 -FEP_44-35 -10.70 0.14 0 -FEP_64-34 -12.50 0.61 0 -FEP_34-28 -7.32 0.22 0 -FEP_66-36 -26.29 0.43 0 -FEP_50-43 -3.17 0.26 0 -FEP_58-33 -26.07 0.78 1 -FEP_63-30 -8.40 0.17 0 -FEP_53-42 15.42 0.38 0 -FEP_50-39 -1.08 0.75 3 -FEP_64-51 -1.89 0.32 1 -FEP_29-28 -23.16 0.91 5 -FEP_64-42 -11.53 0.13 0 -FEP_47-46 29.77 0.25 1 -FEP_65-44 -7.64 0.21 0 -FEP_45-30 0.07 0.46 1 -FEP_64-62 22.99 0.57 0 -FEP_38-35 -12.77 1.26 3 -FEP_62-36 -43.30 0.34 0 -FEP_50-37 -8.49 0.08 0 -FEP_66-34 -19.23 0.42 1 -FEP_63-51 7.92 0.67 0 -FEP_56-48 -25.51 0.50 1 -FEP_67-63 -25.13 0.18 0 -FEP_63-36 -9.82 0.24 1 -FEP_30-26 44.74 0.43 1 -FEP_47-32 32.87 0.31 1 -FEP_67-44 -26.62 0.16 0 -FEP_57-49 -34.59 0.69 1 -FEP_42-38 0.09 0.44 1 -FEP_46-38 13.46 0.65 3 -FEP_65-56 15.17 1.02 2 -FEP_37-28 0.66 0.20 0 -FEP_63-29 10.15 0.58 0 -FEP_50-29 13.12 0.55 1 -FEP_64-46 -23.21 0.43 1 -FEP_62-27 -41.05 0.30 0 -FEP_51-28 -17.84 0.21 1 -FEP_58-31 -16.37 0.19 1 -FEP_66-50 -18.31 0.21 0 -FEP_50-26 38.21 0.41 1 -FEP_51-42 -8.49 0.75 1 -FEP_61-57 7.18 0.24 0 -FEP_52-27 9.50 0.17 1 -FEP_58-50 -13.56 0.53 2 -FEP_58-44 -12.63 0.43 0 -FEP_61-26 14.21 0.61 0 -FEP_36-35 -2.01 0.14 0 -FEP_42-35 -10.64 0.27 0 -FEP_66-30 -24.40 0.52 1 -FEP_67-53 -42.23 0.12 0 -FEP_52-46 3.31 0.48 1 -FEP_57-27 -39.01 0.39 2 -FEP_65-61 16.23 0.37 0 -FEP_51-43 -14.14 0.29 0 -FEP_58-36 -23.08 0.38 0 -FEP_40-36 -9.27 0.75 6 -FEP_44-42 0.05 0.25 1 -FEP_28-26 46.38 0.41 1 -FEP_52-23 33.43 0.54 0 -FEP_56-52 -39.00 0.83 3 -FEP_58-37 -22.01 0.10 1 -FEP_49-47 -40.17 0.17 0 -FEP_53-23 33.15 0.33 1 -FEP_46-29 23.24 0.50 0 -FEP_32-27 2.26 0.10 0 -FEP_64-52 -27.64 0.39 0 -FEP_63-48 -4.46 0.38 1 -FEP_33-23 30.00 0.81 2 -FEP_68-36 -35.71 0.43 1 -FEP_61-60 -16.07 0.20 1 -FEP_62-50 -34.81 0.19 1 -FEP_45-43 3.57 0.28 0 -FEP_56-37 -31.95 0.32 0 -FEP_65-42 -7.72 0.21 1 -FEP_46-39 9.64 0.43 1 -FEP_44-34 -1.39 0.60 0 -FEP_46-35 0.84 0.13 0 -FEP_65-41 -8.86 0.96 6 -FEP_48-37 -6.09 0.27 1 -FEP_50-40 2.96 0.63 7 -FEP_67-49 -27.17 0.11 0 -FEP_52-49 14.24 0.20 0 -FEP_47-23 59.01 0.25 2 -FEP_43-36 -5.07 0.12 1 -FEP_65-46 -19.36 0.15 0 -FEP_52-35 5.17 0.25 1 -FEP_32-29 20.41 0.35 1 -FEP_64-60 -2.88 0.26 0 -FEP_54-39 3.75 1.18 2 -FEP_52-28 7.05 0.31 0 -FEP_49-44 1.23 0.30 0 -FEP_51-34 -10.56 0.31 0 -FEP_45-33 -3.81 0.19 1 -FEP_61-45 -31.65 0.28 0 -FEP_45-41 6.02 0.92 5 -FEP_47-33 29.27 0.61 0 -FEP_42-37 -8.38 0.22 0 -FEP_38-37 -9.13 0.71 1 -FEP_62-41 -32.97 0.83 6 -FEP_62-34 -35.57 0.62 1 -FEP_58-53 -28.70 0.33 0 -FEP_49-27 -5.99 0.41 0 -FEP_42-27 -6.84 0.96 1 -FEP_60-30 -15.06 0.16 0 -FEP_41-29 11.30 0.60 6 -FEP_52-39 13.67 0.59 2 -FEP_67-48 -30.82 0.43 1 -FEP_49-39 -0.58 0.61 1 -FEP_45-42 7.89 0.16 0 -FEP_60-39 -10.60 0.86 2 -FEP_34-29 13.10 0.48 2 -FEP_39-29 14.12 0.89 5 -FEP_45-27 -0.01 0.69 0 -FEP_54-50 5.17 0.48 1 -FEP_66-65 -10.75 0.13 0 -FEP_60-44 -8.00 0.15 0 -FEP_48-38 3.42 1.05 1 -FEP_62-47 -77.29 0.37 0 -FEP_51-33 -21.53 0.26 2 -FEP_39-33 -10.10 0.59 0 -FEP_53-51 25.90 0.25 1 -FEP_58-57 18.52 0.27 1 -FEP_54-34 6.13 0.27 1 -FEP_46-34 10.94 0.22 0 -FEP_26-23 -19.18 0.42 0 -FEP_34-26 38.23 0.31 0 -FEP_39-35 -9.81 1.06 1 -FEP_48-36 -5.68 0.21 1 -FEP_65-54 -13.94 0.17 1 -FEP_44-23 17.98 0.23 0 -FEP_33-26 49.08 0.47 1 -FEP_51-23 8.62 0.19 0 -FEP_58-23 4.89 0.12 1 -FEP_60-57 23.93 0.12 3 -FEP_63-50 -3.04 0.73 1 -FEP_44-27 -6.51 0.17 1 -FEP_62-51 -24.82 0.12 0 -FEP_51-40 -9.12 0.66 3 -FEP_68-27 -34.06 0.26 0 -FEP_65-49 -9.10 0.26 0 -FEP_46-30 4.84 0.15 3 -FEP_57-56 -10.56 0.19 0 -FEP_66-61 7.24 0.51 0 -FEP_64-54 -17.80 0.19 1 -FEP_68-56 -5.06 0.20 0 -FEP_64-39 -11.90 1.10 5 -FEP_67-46 -38.50 0.15 0 -FEP_56-43 -25.90 0.26 0 -FEP_61-53 -40.51 1.21 3 -FEP_33-27 5.19 0.14 0 -FEP_54-43 2.89 0.26 1 -FEP_52-36 7.42 0.43 1 -FEP_48-28 -5.07 0.32 1 -FEP_58-28 -23.98 1.23 3 -FEP_67-66 -8.34 0.21 0 -FEP_63-32 -10.17 0.24 0 -FEP_61-31 -27.77 0.17 0 -FEP_47-43 36.93 0.15 0 -FEP_41-40 5.57 0.54 7 -FEP_49-38 2.33 1.07 0 -FEP_47-45 35.93 0.77 2 -FEP_42-29 10.79 0.84 2 -FEP_68-29 -16.17 0.43 0 -FEP_34-23 19.33 0.48 1 -FEP_51-46 -21.72 0.90 0 -FEP_60-53 -24.25 0.09 0 -FEP_44-29 11.42 0.49 0 -FEP_56-40 -18.62 0.75 5 -FEP_63-27 -7.90 0.40 1 -FEP_62-53 -50.64 0.63 0 -FEP_54-40 9.08 0.06 7 -FEP_61-54 -27.33 1.42 5 -FEP_36-27 2.04 0.20 0 -FEP_64-23 6.61 0.19 0 -FEP_61-49 -25.51 0.13 1 -FEP_37-27 2.96 0.28 2 -FEP_61-47 -65.68 0.58 0 -FEP_43-35 -6.76 0.14 0 -FEP_65-60 0.09 0.09 1 -FEP_50-49 -0.90 0.11 2 -FEP_56-33 -33.53 0.62 0 -FEP_60-43 -12.03 0.21 0 -FEP_67-33 -37.51 0.18 1 -FEP_47-27 34.20 0.41 1 -FEP_31-30 -3.35 0.16 0 -FEP_58-48 -18.03 0.66 0 -FEP_67-27 -33.25 0.23 0 -FEP_40-31 -0.03 2.78 8 -FEP_60-54 -14.08 0.16 1 -FEP_49-45 -6.22 0.27 0 -FEP_47-36 32.15 0.27 0 -FEP_41-27 -2.62 1.25 8 -FEP_65-38 -8.12 0.96 2 -FEP_50-23 18.43 0.19 0 -FEP_61-50 -24.95 0.14 0 -FEP_62-58 -21.46 0.98 1 -FEP_63-58 11.80 0.13 0 -FEP_50-30 -7.09 0.36 0 -FEP_35-33 -0.48 0.18 1 -FEP_47-31 38.37 0.26 0 -FEP_47-44 42.53 0.69 0 -FEP_53-49 15.71 0.29 1 -FEP_53-27 9.34 0.47 0 -FEP_53-37 7.73 0.35 1 -FEP_40-29 10.37 1.15 6 -FEP_39-30 -5.31 1.34 3 -FEP_49-41 -0.51 0.90 6 -FEP_52-26 52.72 0.48 0 -FEP_65-62 26.78 0.39 0 -FEP_65-58 5.35 0.20 1 -FEP_61-37 -34.87 0.69 1 -FEP_58-51 -2.98 0.26 0 -FEP_43-41 2.34 1.68 6 -FEP_67-52 -42.01 0.37 0 -FEP_51-44 -10.06 0.21 0 -FEP_57-44 -31.84 0.15 0 -FEP_64-48 -14.36 0.21 0 -FEP_54-47 -35.60 0.49 1 -FEP_67-62 7.33 0.55 2 -FEP_41-31 2.82 0.74 7 -FEP_68-43 -31.07 0.21 1 -FEP_52-50 15.64 0.73 0 -FEP_63-38 -1.19 0.76 0 -FEP_66-57 14.02 0.20 0 -FEP_57-42 -32.02 0.27 1 -FEP_43-39 1.16 0.62 1 -FEP_37-30 3.26 0.24 1 -FEP_42-33 -12.24 0.76 2 -FEP_58-29 -2.17 0.45 2 -FEP_53-31 12.00 0.46 1 -FEP_66-26 18.67 0.40 1 -FEP_67-34 -27.39 0.20 0 -FEP_64-30 -18.36 0.25 0 -FEP_39-26 37.26 1.00 2 -FEP_67-42 -26.54 0.16 0 -FEP_54-36 -1.70 1.13 3 -FEP_56-28 -31.22 0.74 6 -FEP_31-28 -4.38 0.37 1 -FEP_31-27 -2.46 0.17 1 -FEP_60-50 -8.09 0.26 0 -FEP_66-31 -21.72 0.26 1 -FEP_57-36 -40.77 0.22 1 -FEP_44-37 -8.52 0.11 2 -FEP_56-26 14.62 0.82 0 -FEP_63-37 -11.28 0.34 0 -FEP_62-26 3.80 0.27 0 -FEP_68-54 -33.32 0.21 0 -FEP_68-32 -36.69 1.16 1 -FEP_44-32 -9.44 0.53 0 -FEP_50-35 -10.24 0.17 0 -FEP_61-46 -36.08 0.90 0 -FEP_27-23 24.88 0.99 1 -FEP_58-38 -13.66 1.01 1 -FEP_64-57 20.36 0.41 0 -FEP_45-39 3.52 0.78 1 -FEP_68-64 -15.98 0.36 1 -FEP_47-42 41.45 0.34 1 -FEP_41-28 -8.96 0.20 8 -FEP_66-38 -18.40 0.45 0 -FEP_58-46 -25.35 0.29 0 -FEP_48-42 3.46 0.27 1 -FEP_39-36 -7.46 0.98 1 -FEP_63-47 -42.50 0.21 0 -FEP_53-45 8.48 0.39 0 -FEP_51-30 -17.91 0.48 1 -FEP_63-33 -14.16 0.73 3 -FEP_52-31 12.33 0.54 0 -FEP_54-51 14.91 0.46 0 -FEP_53-43 12.39 0.28 0 -FEP_62-60 -27.29 0.30 2 -FEP_63-43 -4.84 0.13 1 -FEP_62-56 -12.79 0.43 0 -FEP_49-31 -2.44 0.25 0 -FEP_36-32 1.01 0.25 0 -FEP_38-27 -6.40 0.71 5 -FEP_39-38 0.86 0.82 0 -FEP_49-48 -0.52 0.56 0 -FEP_63-49 -2.42 0.26 0 -FEP_44-43 -4.00 0.21 0 -FEP_51-47 -51.03 0.32 0 -FEP_53-36 7.17 0.13 0 -FEP_57-48 -35.62 0.42 0 -FEP_39-31 -3.01 0.96 2 -FEP_51-27 -15.95 0.49 0 -FEP_32-31 4.84 0.25 1 -FEP_28-23 26.32 0.32 0 -FEP_49-23 18.99 0.59 0 -FEP_54-29 18.26 0.48 0 -FEP_60-40 -5.36 0.67 4 -FEP_56-29 -11.01 0.55 1 -FEP_46-45 5.74 0.36 1 -FEP_40-23 19.09 0.17 8 -FEP_63-23 16.29 0.26 1 -FEP_57-34 -32.90 0.89 0 -FEP_68-49 -28.71 0.24 0 -FEP_62-43 -38.57 0.40 2 -FEP_49-35 -9.91 0.15 0 -FEP_57-32 -40.39 0.62 0 -FEP_58-47 -54.83 0.53 0 -FEP_64-28 -19.33 0.32 1 -FEP_54-52 -10.47 0.71 2 -FEP_50-46 -11.12 0.28 0 -FEP_44-40 3.23 0.55 5 -FEP_60-28 -16.83 0.38 2 -FEP_51-38 -8.90 0.29 2 -FEP_42-36 -9.17 0.16 4 -FEP_64-58 2.05 0.28 0 -FEP_64-43 -15.41 0.81 0 -FEP_64-63 -10.10 0.14 0 -FEP_67-57 4.93 0.33 0 -FEP_66-37 -26.72 0.28 1 -FEP_31-26 40.40 0.52 0 -FEP_61-28 -34.13 1.13 4 -FEP_47-28 32.86 0.24 1 -FEP_49-37 -8.09 0.20 0 -FEP_42-41 2.93 0.49 7 -FEP_43-27 -2.18 0.22 1 -FEP_30-23 24.26 0.32 0 -FEP_43-32 -4.66 0.19 1 -FEP_51-29 3.96 0.99 0 -FEP_54-30 -0.80 0.43 0 -FEP_63-62 33.33 0.29 0 -FEP_65-47 -48.95 0.45 0 -FEP_66-41 -19.29 1.32 8 -FEP_29-27 -17.41 0.70 2 -FEP_53-28 7.32 0.45 1 -FEP_35-29 21.78 0.53 0 -FEP_40-39 -1.95 0.72 1 -FEP_50-28 -8.06 0.25 0 -FEP_47-30 34.28 0.20 0 -FEP_51-37 -18.65 0.21 0 -FEP_65-36 -16.88 0.25 0 -FEP_56-23 -4.39 0.19 0 -FEP_42-31 -2.39 0.52 1 -FEP_62-54 -36.96 1.17 8 -FEP_61-36 -33.61 0.23 0 -FEP_58-30 -20.26 0.27 0 -FEP_62-39 -36.23 0.91 1 -FEP_63-53 -17.09 0.23 1 -FEP_48-30 -2.97 0.19 1 -FEP_64-50 -14.01 0.60 2 -FEP_45-28 -2.64 0.91 1 -FEP_65-39 -9.78 1.12 6 -FEP_48-26 41.50 0.38 0 -FEP_60-35 -18.94 0.11 0 -FEP_67-61 -2.68 0.44 1 -FEP_53-47 -25.29 0.26 0 -FEP_41-33 -11.76 0.58 7 -FEP_66-28 -25.93 0.21 0 -FEP_51-35 -20.48 0.52 0 -FEP_43-33 -7.70 0.30 0 -FEP_65-31 -11.26 0.37 0 -FEP_66-45 -24.82 0.30 0 -FEP_50-33 -11.13 0.33 0 -FEP_52-41 15.25 1.33 6 -FEP_60-38 -8.67 0.43 0 -FEP_54-38 5.25 0.50 1 -FEP_40-34 0.21 1.40 8 -FEP_56-42 -23.48 1.05 4 -FEP_66-58 -4.72 0.40 0 -FEP_35-23 27.57 0.46 0 -FEP_67-36 -35.61 0.16 1 -FEP_47-41 41.03 0.56 8 -FEP_54-23 23.88 0.13 1 -FEP_58-42 -14.18 0.31 0 -FEP_44-31 -3.99 0.14 1 -FEP_60-37 -17.49 0.30 0 -FEP_56-36 -30.84 0.25 0 -FEP_51-39 -10.41 0.79 0 -FEP_62-45 -42.19 0.24 0 -FEP_68-42 -27.06 0.18 1 -FEP_57-46 -43.57 0.40 1 -FEP_53-50 15.76 0.16 2 -FEP_62-28 -42.98 0.38 1 -FEP_48-23 21.33 0.13 1 -FEP_64-35 -22.43 0.51 2 -FEP_58-45 -20.03 0.37 0 -FEP_67-31 -30.25 0.23 0 -FEP_58-40 -11.83 1.43 2 -FEP_61-44 -23.98 0.54 0 -FEP_67-51 -17.91 0.56 0 -FEP_66-43 -21.49 0.30 0 -FEP_46-31 8.28 0.20 0 -FEP_66-51 -8.03 0.32 0 -FEP_31-23 21.84 0.20 0 -FEP_48-43 -0.13 0.72 2 -FEP_42-32 -9.80 0.82 2 -FEP_68-45 -34.23 0.17 0 -FEP_56-46 -33.87 0.44 2 -FEP_57-41 -31.49 0.82 4 -FEP_34-31 -2.58 0.29 0 -FEP_62-29 -21.03 1.21 1 -FEP_56-30 -29.61 0.47 1 -FEP_51-32 -18.90 0.58 1 -FEP_62-37 -44.15 0.66 0 -FEP_63-61 21.68 0.97 2 -FEP_37-31 5.59 0.41 0 -FEP_49-33 -9.76 0.24 0 -FEP_66-49 -19.74 0.62 0 -FEP_60-52 -25.04 0.67 0 -FEP_57-35 -42.98 0.64 0 -FEP_58-35 -23.91 0.42 1 -FEP_66-56 4.64 0.52 2 -FEP_49-28 -6.83 0.28 0 -FEP_57-53 -47.29 0.63 3 -FEP_38-31 -4.63 0.87 4 -FEP_65-28 -15.50 0.29 1 -FEP_65-33 -20.48 1.00 0 -FEP_51-31 -13.80 0.30 0 -FEP_47-37 32.19 0.26 0 -FEP_48-45 -3.63 0.22 0 -FEP_49-34 -0.05 0.17 1 -FEP_63-42 -2.04 0.28 1 -FEP_54-28 -2.59 0.35 0 -FEP_41-38 0.10 0.75 3 -FEP_61-41 -26.01 0.96 7 -FEP_58-54 -19.30 0.33 0 -FEP_65-30 -14.41 0.15 0 -FEP_56-34 -23.45 0.42 1 -FEP_66-33 -30.04 1.00 3 -FEP_42-23 17.81 0.14 1 -FEP_67-40 -26.33 0.64 2 -FEP_67-47 -68.15 0.37 0 -FEP_50-34 -0.31 0.18 0 -FEP_57-43 -35.90 0.38 0 -FEP_57-54 -37.85 0.19 1 -FEP_63-52 -18.32 0.82 1 -FEP_50-48 -2.95 0.48 0 -FEP_39-23 22.03 0.97 2 -FEP_49-30 -6.16 0.18 0 -FEP_66-47 -58.29 0.67 0 -FEP_36-33 -2.81 0.21 1 -FEP_62-61 -10.38 0.13 0 -FEP_48-35 -7.65 0.28 1 -FEP_63-60 6.81 0.18 1 -FEP_61-27 -30.85 0.54 1 -FEP_50-44 0.08 0.23 1 -FEP_34-33 -10.28 0.13 1 -FEP_63-40 -1.19 1.20 4 -FEP_68-44 -27.09 0.20 0 -FEP_34-30 -5.63 0.33 0 -FEP_42-28 -7.91 0.18 1 -FEP_63-35 -12.20 0.28 0 -FEP_61-39 -25.65 0.88 2 -FEP_44-33 -12.14 0.35 0 -FEP_66-39 -20.78 0.97 1 -FEP_57-50 -32.39 0.40 1 -FEP_49-32 -8.00 0.31 0 -FEP_66-44 -17.39 0.23 0 -FEP_48-44 3.98 0.21 0 -FEP_65-51 2.47 0.50 1 -FEP_50-41 -0.92 0.31 7 -FEP_52-34 14.22 0.32 0 -FEP_34-27 -5.19 0.27 0 -FEP_45-34 6.67 0.84 1 -FEP_67-65 -19.43 0.29 0 -FEP_38-33 -10.20 0.73 5 -FEP_46-36 2.85 0.17 0 -FEP_68-50 -27.63 0.21 2 -FEP_56-49 -22.28 0.24 1 -FEP_44-30 -7.19 0.10 2 -FEP_52-29 28.42 0.59 3 -FEP_61-38 -23.88 1.08 1 -FEP_38-36 -8.40 0.93 2 -FEP_64-53 -27.55 0.94 1 -FEP_66-46 -29.54 0.22 0 -FEP_60-32 -16.88 0.23 0 -FEP_56-35 -32.28 0.27 0 -FEP_54-42 5.85 0.15 0 -FEP_42-26 36.62 0.64 1 -FEP_34-32 -7.83 0.17 1 -FEP_32-23 26.58 1.61 4 -FEP_35-30 3.77 0.10 0 -FEP_54-32 -2.98 0.96 2 -FEP_36-30 2.18 0.33 0 -FEP_49-36 -7.51 0.26 0 -FEP_60-31 -11.03 0.14 0 -FEP_68-33 -38.81 0.27 0 -FEP_61-32 -33.07 0.33 0 -FEP_67-30 -32.90 0.43 1 -FEP_48-47 -37.72 0.17 0 -FEP_60-58 5.03 0.12 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs-backup/water_2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs-backup/water_2.txt deleted file mode 100755 index 68393346..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs-backup/water_2.txt +++ /dev/null @@ -1,375 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_41-29 11.30 0.60 6 -FEP_40-28 nan nan 9 -FEP_53-40 15.27 1.46 7 -FEP_42-40 2.37 1.84 6 -FEP_56-38 -25.62 0.06 8 -FEP_41-32 -6.53 0.65 7 -FEP_48-41 nan nan 10 -FEP_40-35 nan nan 10 -FEP_40-36 -9.27 0.75 6 -FEP_40-27 -7.01 nan 9 -FEP_41-28 -8.96 0.20 8 -FEP_43-40 1.73 nan 9 -FEP_40-30 nan nan 10 -FEP_40-34 0.21 1.40 8 -FEP_46-41 8.45 0.88 8 -FEP_40-32 -2.02 nan 9 -FEP_52-40 18.38 0.33 8 -FEP_38-27 -6.40 0.71 5 -FEP_63-41 -5.16 0.54 7 -FEP_61-47 -65.68 0.58 0 -FEP_57-44 -31.84 0.15 0 -FEP_49-34 -0.05 0.17 1 -FEP_48-38 3.42 1.05 1 -FEP_67-48 -30.82 0.43 1 -FEP_57-39 -34.48 1.22 2 -FEP_65-50 -7.53 0.52 1 -FEP_51-44 -10.06 0.21 0 -FEP_63-30 -8.40 0.17 0 -FEP_63-49 -2.42 0.26 0 -FEP_52-39 13.67 0.59 2 -FEP_57-27 -39.01 0.39 2 -FEP_65-31 -11.26 0.37 0 -FEP_50-41 -0.92 0.31 7 -FEP_58-42 -14.18 0.31 0 -FEP_65-28 -15.50 0.29 1 -FEP_44-26 38.10 0.20 1 -FEP_40-31 -0.03 2.78 8 -FEP_60-53 -24.25 0.09 0 -FEP_61-54 -27.33 1.42 5 -FEP_51-39 -10.41 0.79 0 -FEP_60-33 -19.74 0.34 0 -FEP_43-41 2.34 1.68 6 -FEP_53-46 4.18 0.15 0 -FEP_56-49 -22.28 0.24 1 -FEP_53-47 -25.29 0.26 0 -FEP_58-35 -23.91 0.42 1 -FEP_42-33 -12.24 0.76 2 -FEP_46-45 5.74 0.36 1 -FEP_63-34 -2.96 0.64 0 -FEP_63-23 16.29 0.26 1 -FEP_52-29 28.42 0.59 3 -FEP_62-60 -27.29 0.30 2 -FEP_33-23 30.00 0.81 2 -FEP_62-31 -37.51 0.28 1 -FEP_42-35 -10.64 0.27 0 -FEP_39-35 -9.81 1.06 1 -FEP_50-23 18.43 0.19 0 -FEP_61-43 -27.03 0.47 2 -FEP_46-36 2.85 0.17 0 -FEP_68-67 -0.56 0.23 1 -FEP_39-31 -3.01 0.96 2 -FEP_63-31 -4.95 0.31 0 -FEP_62-39 -36.23 0.91 1 -FEP_32-28 -0.81 0.99 0 -FEP_60-26 29.97 0.34 1 -FEP_54-36 -1.70 1.13 3 -FEP_61-41 -26.01 0.96 7 -FEP_52-49 14.24 0.20 0 -FEP_37-29 21.14 0.58 2 -FEP_58-51 -2.98 0.26 0 -FEP_49-36 -7.51 0.26 0 -FEP_65-61 16.23 0.37 0 -FEP_44-27 -6.51 0.17 1 -FEP_63-33 -14.16 0.73 3 -FEP_64-36 -20.07 0.22 0 -FEP_41-23 16.55 0.53 8 -FEP_48-43 -0.13 0.72 2 -FEP_56-40 -18.62 0.75 5 -FEP_67-42 -26.54 0.16 0 -FEP_60-57 23.93 0.12 3 -FEP_65-54 -13.94 0.17 1 -FEP_67-44 -26.62 0.16 0 -FEP_46-34 10.94 0.22 0 -FEP_31-30 -3.35 0.16 0 -FEP_58-31 -16.37 0.19 1 -FEP_57-34 -32.90 0.89 0 -FEP_49-33 -9.76 0.24 0 -FEP_65-40 -6.66 1.66 7 -FEP_44-30 -7.19 0.10 2 -FEP_36-35 -2.01 0.14 0 -FEP_45-28 -2.64 0.91 1 -FEP_51-30 -17.91 0.48 1 -FEP_50-46 -11.12 0.28 0 -FEP_67-63 -25.13 0.18 0 -FEP_52-23 33.43 0.54 0 -FEP_67-43 -30.80 0.11 1 -FEP_33-26 49.08 0.47 1 -FEP_66-41 -19.29 1.32 8 -FEP_67-50 -26.84 0.26 0 -FEP_56-42 -23.48 1.05 4 -FEP_45-43 3.57 0.28 0 -FEP_65-48 -11.31 0.20 1 -FEP_52-31 12.33 0.54 0 -FEP_52-51 25.32 1.04 2 -FEP_57-43 -35.90 0.38 0 -FEP_65-56 15.17 1.02 2 -FEP_46-40 10.22 nan 9 -FEP_67-58 -12.77 0.52 0 -FEP_64-28 -19.33 0.32 1 -FEP_63-58 11.80 0.13 0 -FEP_65-43 -11.72 0.22 2 -FEP_63-53 -17.09 0.23 1 -FEP_62-52 -49.79 0.71 1 -FEP_64-57 20.36 0.41 0 -FEP_30-27 0.79 0.20 1 -FEP_56-32 -31.18 0.45 1 -FEP_51-36 -18.46 0.47 1 -FEP_38-28 -8.35 0.80 5 -FEP_65-26 29.40 0.43 0 -FEP_43-38 4.58 0.74 5 -FEP_47-35 30.66 0.34 0 -FEP_62-32 -43.26 0.36 0 -FEP_63-26 35.76 0.60 0 -FEP_54-44 6.17 0.16 1 -FEP_47-40 nan nan 10 -FEP_44-28 -9.23 0.55 0 -FEP_65-29 3.66 0.47 0 -FEP_54-48 2.40 0.31 0 -FEP_67-32 -35.11 0.19 0 -FEP_38-30 -5.49 1.31 7 -FEP_53-34 15.02 0.27 1 -FEP_43-31 0.89 0.23 1 -FEP_62-33 -46.25 0.64 0 -FEP_48-29 16.15 0.26 1 -FEP_37-35 -1.95 0.31 0 -FEP_50-31 -3.38 0.21 1 -FEP_45-38 6.80 0.39 0 -FEP_64-27 -18.58 0.68 1 -FEP_65-57 23.83 0.42 1 -FEP_57-26 6.51 0.39 0 -FEP_56-41 -24.75 1.10 7 -FEP_53-33 3.99 0.37 2 -FEP_61-29 -12.12 0.66 1 -FEP_48-39 4.19 1.07 7 -FEP_48-34 1.50 0.53 0 -FEP_60-49 -8.83 0.24 1 -FEP_53-29 27.63 0.31 1 -FEP_51-45 -17.33 0.21 2 -FEP_67-28 -34.70 0.37 0 -FEP_64-40 -9.56 0.62 3 -FEP_51-48 -13.12 0.30 1 -FEP_63-46 -12.77 0.18 0 -FEP_52-30 8.40 0.45 1 -FEP_32-30 1.58 0.13 0 -FEP_67-37 -35.66 0.38 1 -FEP_60-29 3.23 0.30 1 -FEP_54-53 -9.24 0.19 1 -FEP_56-47 -63.23 0.32 1 -FEP_58-27 -22.15 1.03 0 -FEP_61-33 -35.93 0.33 0 -FEP_57-33 -44.50 0.51 0 -FEP_49-42 1.95 0.77 0 -FEP_58-49 -14.24 0.28 1 -FEP_52-44 15.04 1.21 3 -FEP_33-28 3.02 0.51 1 -FEP_63-39 -4.70 1.08 1 -FEP_46-28 2.58 0.41 1 -FEP_65-37 -16.40 0.13 0 -FEP_29-26 25.76 0.95 1 -FEP_49-40 1.00 nan 9 -FEP_36-31 5.31 0.08 1 -FEP_36-26 47.13 0.46 0 -FEP_48-33 -8.26 0.14 0 -FEP_66-64 -5.83 0.80 0 -FEP_56-27 -29.35 0.62 1 -FEP_61-42 -24.11 0.60 2 -FEP_46-33 -0.12 0.14 0 -FEP_36-28 0.09 0.63 0 -FEP_58-26 23.74 0.56 0 -FEP_64-32 -19.54 0.55 1 -FEP_66-48 -21.07 0.92 0 -FEP_62-44 -34.70 0.23 0 -FEP_57-45 -38.94 0.22 0 -FEP_60-48 -12.14 0.31 0 -FEP_45-32 -3.20 0.69 1 -FEP_64-47 -53.37 0.74 2 -FEP_61-58 -11.17 0.45 1 -FEP_49-26 39.16 0.27 1 -FEP_54-33 -5.78 0.49 2 -FEP_50-32 -8.06 0.24 0 -FEP_52-32 6.71 0.54 1 -FEP_65-64 3.17 0.24 0 -FEP_67-54 -32.63 0.19 0 -FEP_65-45 -15.14 0.28 0 -FEP_54-31 3.16 0.27 1 -FEP_60-36 -17.06 0.15 0 -FEP_47-39 38.40 0.69 4 -FEP_63-44 -0.99 0.17 1 -FEP_68-62 7.82 0.19 0 -FEP_63-57 30.21 0.27 0 -FEP_68-38 -26.83 0.69 0 -FEP_54-26 43.82 0.16 0 -FEP_53-35 5.44 0.22 0 -FEP_61-35 -35.82 1.04 0 -FEP_47-29 53.85 0.33 0 -FEP_48-27 -2.81 0.34 0 -FEP_37-33 -1.60 0.44 0 -FEP_58-41 -14.70 0.71 5 -FEP_60-23 9.57 0.16 0 -FEP_38-23 17.55 0.78 2 -FEP_46-32 3.08 0.12 2 -FEP_41-30 -2.96 0.66 8 -FEP_37-32 0.25 0.40 0 -FEP_68-40 -27.37 0.69 3 -FEP_52-43 12.33 0.55 1 -FEP_48-32 -5.17 0.25 0 -FEP_43-29 15.03 0.27 0 -FEP_30-28 -0.50 0.31 0 -FEP_68-34 -28.11 0.66 0 -FEP_54-37 -2.90 0.31 0 -FEP_56-51 -12.20 0.17 0 -FEP_27-26 43.88 0.49 0 -FEP_41-37 -4.91 1.01 6 -FEP_61-56 -2.58 0.33 0 -FEP_44-39 -2.28 0.58 1 -FEP_58-39 -19.46 1.50 3 -FEP_56-45 -29.32 0.47 1 -FEP_57-38 -32.95 0.61 2 -FEP_50-45 -6.73 0.27 0 -FEP_57-52 -49.16 0.47 2 -FEP_53-39 13.13 0.78 4 -FEP_60-45 -15.27 0.18 0 -FEP_52-42 14.99 0.36 0 -FEP_64-61 14.41 0.37 2 -FEP_45-29 17.88 0.76 0 -FEP_54-41 4.18 0.26 7 -FEP_32-26 46.88 0.36 0 -FEP_35-34 9.29 0.44 2 -FEP_36-23 26.50 0.18 0 -FEP_57-29 -21.18 0.40 0 -FEP_47-34 40.62 0.30 1 -FEP_57-28 -40.30 0.51 0 -FEP_52-38 17.09 1.12 3 -FEP_58-32 -22.29 0.50 1 -FEP_67-35 -37.25 0.15 0 -FEP_37-36 0.52 0.41 0 -FEP_66-63 -16.71 0.28 1 -FEP_61-52 -39.11 0.96 1 -FEP_57-40 -31.78 0.77 2 -FEP_64-45 -19.52 0.35 2 -FEP_62-23 -16.10 0.26 2 -FEP_68-65 -19.53 0.17 0 -FEP_67-60 -18.55 0.13 0 -FEP_68-60 -18.44 0.25 0 -FEP_43-23 21.84 0.25 0 -FEP_49-43 -3.37 0.32 0 -FEP_40-37 -12.95 1.12 6 -FEP_43-30 -2.99 0.15 0 -FEP_54-27 -0.34 0.95 1 -FEP_53-41 16.53 0.85 6 -FEP_64-37 -21.40 0.79 0 -FEP_45-26 45.32 0.38 0 -FEP_46-27 5.17 0.17 1 -FEP_60-51 2.12 0.41 0 -FEP_67-39 -28.82 0.61 2 -FEP_54-49 3.84 0.46 2 -FEP_64-26 25.95 0.31 0 -FEP_58-34 -14.77 0.85 4 -FEP_35-27 4.31 0.17 0 -FEP_51-41 -10.22 1.28 3 -FEP_53-38 18.95 1.27 1 -FEP_64-29 -0.05 0.34 0 -FEP_51-49 -11.11 0.25 0 -FEP_29-23 6.47 0.42 0 -FEP_62-35 -45.13 0.37 2 -FEP_60-41 -7.85 0.84 6 -FEP_68-66 -9.68 0.18 1 -FEP_56-50 -22.33 0.34 0 -FEP_66-53 -34.10 0.29 2 -FEP_40-38 -1.53 0.42 1 -FEP_66-60 -9.63 0.21 0 -FEP_68-51 -18.19 0.26 0 -FEP_58-52 -29.97 1.24 3 -FEP_64-38 -10.75 0.50 3 -FEP_62-42 -33.45 0.65 1 -FEP_60-42 -8.70 0.24 0 -FEP_45-35 -3.38 0.39 0 -FEP_66-52 -35.10 0.56 1 -FEP_46-23 28.86 0.16 1 -FEP_50-27 -6.49 0.27 2 -FEP_33-30 4.70 0.23 1 -FEP_53-48 12.14 0.62 0 -FEP_48-31 -0.30 0.25 0 -FEP_39-27 -3.29 0.30 7 -FEP_33-29 22.51 0.40 1 -FEP_43-34 2.58 0.21 0 -FEP_53-44 15.57 0.40 0 -FEP_44-38 -0.76 0.67 1 -FEP_41-34 -2.27 0.40 7 -FEP_62-48 -38.52 0.31 0 -FEP_66-29 -6.82 0.55 2 -FEP_53-26 53.50 0.30 0 -FEP_46-37 2.50 0.29 0 -FEP_37-26 46.76 0.25 2 -FEP_53-32 7.11 0.20 1 -FEP_67-45 -33.69 0.11 0 -FEP_64-56 9.91 0.55 2 -FEP_63-54 -7.19 0.22 1 -FEP_39-28 -7.61 0.59 3 -FEP_45-31 4.09 0.39 0 -FEP_57-37 -40.24 0.45 1 -FEP_67-26 11.22 0.45 0 -FEP_68-47 -68.81 0.51 1 -FEP_35-26 48.65 0.31 0 -FEP_62-57 -3.09 0.18 0 -FEP_68-61 -3.53 0.25 1 -FEP_67-29 -15.23 0.46 1 -FEP_68-58 -14.06 0.35 0 -FEP_68-37 -36.17 0.27 1 -FEP_47-26 78.52 0.34 0 -FEP_39-37 -8.13 0.83 1 -FEP_68-30 -34.33 0.24 0 -FEP_42-39 -3.80 0.89 0 -FEP_52-33 4.68 0.82 2 -FEP_46-26 49.64 0.43 0 -FEP_57-31 -35.24 0.94 1 -FEP_61-30 -31.52 0.63 1 -FEP_50-36 -8.43 0.31 0 -FEP_54-46 -5.57 0.50 0 -FEP_68-41 -27.24 0.80 5 -FEP_54-35 -4.16 0.25 1 -FEP_68-23 -9.53 0.14 1 -FEP_43-42 3.91 0.32 0 -FEP_45-40 7.42 0.36 1 -FEP_44-41 -6.40 0.04 6 -FEP_60-46 -19.51 0.17 1 -FEP_50-38 1.28 0.45 0 -FEP_35-32 1.68 0.20 1 -FEP_42-34 -0.30 0.35 1 -FEP_66-40 -11.83 nan 9 -FEP_62-40 -32.88 0.55 1 -FEP_57-30 -38.75 0.28 1 -FEP_37-34 7.82 0.21 0 -FEP_48-46 -8.18 0.19 1 -FEP_56-53 -38.03 0.44 0 -FEP_66-35 -27.80 0.22 0 -FEP_62-49 -35.95 0.32 1 -FEP_62-38 -33.04 0.41 1 -FEP_66-23 0.01 0.11 0 -FEP_64-44 -11.41 0.50 1 -FEP_64-33 -23.74 1.15 3 -FEP_60-47 -49.39 0.28 0 -FEP_61-23 -6.49 0.28 1 -FEP_52-47 -25.53 0.47 1 -FEP_33-32 2.60 0.11 0 -FEP_38-26 37.59 0.53 1 -FEP_33-31 8.33 0.31 1 -FEP_35-31 7.08 0.15 0 -FEP_47-38 44.76 0.65 7 -FEP_36-34 7.40 0.31 1 -FEP_65-23 9.62 0.27 0 -FEP_38-32 nan nan 9 -FEP_50-47 -41.12 0.39 0 -FEP_68-52 -44.43 0.39 1 -FEP_57-51 -21.91 0.25 0 -FEP_63-45 -7.71 0.51 0 -FEP_41-35 -10.89 nan 9 -FEP_67-56 -4.51 0.28 1 -FEP_61-34 -25.15 0.27 0 -FEP_68-46 -38.75 0.36 1 -FEP_53-30 9.05 0.30 0 -FEP_43-28 -4.78 0.47 1 -FEP_56-39 -24.11 0.92 0 -FEP_61-48 -27.78 0.33 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs/protein_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs/protein_1.txt deleted file mode 100755 index 636d9173..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs/protein_1.txt +++ /dev/null @@ -1,210 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_51-50 -10.74 0.34 2 -FEP_68-28 -36.36 0.70 2 -FEP_40-23 nan nan 10 -FEP_57-48 -30.63 0.52 1 -FEP_67-31 -23.75 0.37 0 -FEP_67-51 -11.16 0.44 1 -FEP_68-29 -13.33 0.74 2 -FEP_56-34 -17.38 0.91 1 -FEP_63-29 11.28 1.01 1 -FEP_66-49 -10.73 0.29 2 -FEP_41-26 42.66 0.39 3 -FEP_48-26 38.52 0.67 2 -FEP_50-43 -6.61 0.47 2 -FEP_56-44 -19.86 0.33 0 -FEP_42-41 -4.24 0.10 6 -FEP_56-28 -25.42 1.07 2 -FEP_64-23 0.72 0.26 1 -FEP_48-47 -39.38 0.49 2 -FEP_49-39 -4.97 0.71 1 -FEP_57-49 -27.81 0.36 2 -FEP_27-23 22.79 1.31 4 -FEP_51-47 -48.97 0.32 1 -FEP_56-37 -27.56 0.46 0 -FEP_68-63 -26.44 0.79 1 -FEP_50-44 -3.96 0.58 1 -FEP_50-40 1.21 0.13 8 -FEP_52-50 19.49 0.55 0 -FEP_60-37 -14.70 0.31 0 -FEP_48-23 17.04 0.17 2 -FEP_46-43 6.85 0.24 0 -FEP_54-51 21.83 0.70 2 -FEP_54-40 nan nan 9 -FEP_53-51 34.83 0.64 0 -FEP_49-37 -11.09 0.28 0 -FEP_60-54 -16.44 0.34 0 -FEP_35-30 5.95 0.18 0 -FEP_41-29 18.54 1.29 7 -FEP_53-50 25.27 0.53 0 -FEP_42-37 -8.40 0.36 1 -FEP_53-27 18.53 0.64 0 -FEP_60-52 -23.82 0.59 0 -FEP_61-26 -2.19 0.88 0 -FEP_39-23 19.36 1.38 3 -FEP_51-23 4.11 0.29 1 -FEP_65-53 -23.13 0.52 1 -FEP_49-31 -3.56 0.48 0 -FEP_57-35 -40.97 0.50 0 -FEP_51-27 -17.93 0.57 0 -FEP_48-44 -0.69 0.41 1 -FEP_60-39 -6.37 0.72 3 -FEP_51-32 -18.74 0.48 1 -FEP_64-48 -16.31 0.55 0 -FEP_40-28 0.10 nan 9 -FEP_66-61 26.91 0.54 2 -FEP_64-49 -15.77 0.59 2 -FEP_52-36 8.60 0.59 2 -FEP_58-47 -44.90 0.57 0 -FEP_53-43 17.61 0.36 1 -FEP_64-50 -15.17 1.46 2 -FEP_68-54 -42.01 0.41 0 -FEP_53-31 21.71 0.76 0 -FEP_65-41 -3.62 0.91 5 -FEP_32-23 26.38 0.98 3 -FEP_56-54 -29.13 0.81 8 -FEP_38-37 -7.08 0.70 2 -FEP_64-31 -16.95 0.56 0 -FEP_39-36 -10.44 1.20 5 -FEP_61-27 -44.68 1.02 1 -FEP_61-40 -38.38 1.02 3 -FEP_63-27 -9.47 1.02 0 -FEP_57-36 -39.81 0.46 0 -FEP_61-57 -9.09 0.43 0 -FEP_42-28 -4.57 0.53 0 -FEP_61-37 -47.28 0.54 0 -FEP_49-41 -1.67 1.60 4 -FEP_52-27 13.02 0.58 1 -FEP_51-33 -24.59 0.49 0 -FEP_60-28 -10.04 0.83 1 -FEP_65-62 48.78 0.84 0 -FEP_66-32 -20.77 1.25 2 -FEP_32-27 2.52 0.26 2 -FEP_32-31 6.05 0.43 1 -FEP_61-51 -25.43 0.39 0 -FEP_63-28 -11.27 1.17 0 -FEP_67-57 5.82 0.31 0 -FEP_45-27 2.04 1.04 1 -FEP_39-26 40.11 0.83 4 -FEP_68-36 -40.32 0.56 0 -FEP_61-53 -59.16 1.82 7 -FEP_61-44 -40.50 0.57 0 -FEP_58-40 -4.13 0.83 5 -FEP_44-23 18.85 0.30 1 -FEP_44-42 1.10 0.35 0 -FEP_58-48 -6.56 0.51 1 -FEP_49-47 -39.96 0.21 0 -FEP_61-50 -36.82 0.37 0 -FEP_58-29 9.21 0.90 3 -FEP_42-36 -9.00 0.68 3 -FEP_65-34 0.97 0.87 0 -FEP_48-45 -7.88 0.25 0 -FEP_68-44 -33.89 0.44 0 -FEP_58-28 -12.02 0.72 1 -FEP_62-53 -72.06 0.58 0 -FEP_34-27 -5.22 0.62 0 -FEP_44-34 2.90 0.54 0 -FEP_58-30 -11.67 0.49 0 -FEP_45-37 -3.84 1.16 2 -FEP_49-30 -8.61 0.30 1 -FEP_53-40 19.63 nan 8 -FEP_63-52 -24.20 0.79 0 -FEP_49-38 -3.39 0.55 1 -FEP_64-51 -4.00 0.59 1 -FEP_45-33 -3.39 0.87 1 -FEP_66-62 36.91 0.65 1 -FEP_51-46 -23.47 0.51 1 -FEP_44-33 -10.40 0.63 0 -FEP_28-23 21.95 0.21 1 -FEP_53-23 39.37 0.43 0 -FEP_64-46 -27.28 0.58 1 -FEP_26-23 -20.95 0.44 1 -FEP_43-32 -3.44 0.42 0 -FEP_56-48 -18.53 0.71 2 -FEP_65-51 11.67 0.58 0 -FEP_68-42 -32.00 0.40 0 -FEP_47-37 28.83 0.39 0 -FEP_65-49 0.22 0.81 0 -FEP_67-64 -12.40 1.42 7 -FEP_65-58 6.20 0.34 0 -FEP_65-39 -3.54 1.06 7 -FEP_51-34 -11.28 0.29 1 -FEP_67-65 -23.02 0.22 1 -FEP_34-29 16.67 0.59 1 -FEP_65-47 -37.92 0.57 0 -FEP_62-36 -57.78 0.89 0 -FEP_65-44 -3.18 0.23 0 -FEP_66-31 -12.97 0.46 0 -FEP_66-46 -23.10 0.43 1 -FEP_58-54 -17.93 0.47 0 -FEP_54-50 13.10 0.50 1 -FEP_58-45 -14.57 0.31 1 -FEP_56-46 -29.94 0.29 1 -FEP_43-36 -5.05 0.27 0 -FEP_34-33 -12.03 0.27 0 -FEP_42-40 -3.63 0.33 6 -FEP_33-27 6.26 0.29 0 -FEP_64-60 -11.22 0.65 0 -FEP_54-29 27.98 0.44 3 -FEP_45-41 2.43 0.89 5 -FEP_65-27 -6.46 0.76 0 -FEP_56-35 -29.77 0.44 1 -FEP_35-29 27.44 0.80 2 -FEP_42-32 -6.23 1.82 5 -FEP_60-58 1.52 0.39 1 -FEP_68-50 -29.40 0.54 2 -FEP_66-65 -11.40 0.28 1 -FEP_50-33 -13.06 0.54 1 -FEP_54-42 9.70 0.37 0 -FEP_54-39 5.80 1.16 4 -FEP_42-38 -4.54 0.28 1 -FEP_50-28 -6.95 0.62 0 -FEP_31-29 18.52 0.63 0 -FEP_66-30 -18.64 0.83 2 -FEP_62-47 -87.19 0.32 1 -FEP_38-31 -0.42 1.07 2 -FEP_39-32 -5.60 1.29 3 -FEP_45-39 3.30 1.52 6 -FEP_64-41 -17.30 1.23 7 -FEP_38-35 -7.62 0.89 3 -FEP_47-44 35.19 0.60 0 -FEP_64-42 -17.66 0.34 0 -FEP_49-29 14.29 0.54 0 -FEP_66-39 -14.95 1.19 3 -FEP_65-35 -12.81 0.20 1 -FEP_61-36 -48.03 0.26 0 -FEP_61-31 -39.95 0.63 0 -FEP_66-37 -20.55 0.56 0 -FEP_56-38 nan nan 8 -FEP_66-50 -11.02 0.48 1 -FEP_66-27 -18.32 0.80 2 -FEP_34-30 -6.53 0.32 1 -FEP_44-31 1.02 0.64 1 -FEP_41-36 -2.87 1.57 5 -FEP_34-31 -3.16 0.53 0 -FEP_54-34 10.58 1.03 1 -FEP_67-66 -11.63 0.39 1 -FEP_37-27 4.35 0.54 0 -FEP_56-52 -37.44 0.90 1 -FEP_65-60 4.72 0.23 0 -FEP_63-43 -10.03 0.49 1 -FEP_37-28 4.62 0.34 0 -FEP_50-49 0.10 0.37 0 -FEP_51-40 -15.32 1.15 4 -FEP_57-47 -68.04 0.97 1 -FEP_48-30 -5.34 0.31 1 -FEP_60-56 13.14 0.33 0 -FEP_52-45 9.29 1.32 3 -FEP_51-31 -14.41 0.29 1 -FEP_65-63 3.74 0.24 2 -FEP_56-30 -24.44 0.36 0 -FEP_66-34 -10.17 0.59 0 -FEP_53-36 13.22 0.40 0 -FEP_68-57 -0.89 0.30 0 -FEP_32-29 24.84 0.62 3 -FEP_57-54 -42.43 0.90 2 -FEP_41-32 -2.80 1.36 7 -FEP_47-46 26.77 0.22 0 -FEP_66-33 -22.94 2.03 5 -FEP_67-46 -34.33 0.21 0 -FEP_56-23 -1.83 0.79 3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs/protein_2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs/protein_2.txt deleted file mode 100755 index dfe19143..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs/protein_2.txt +++ /dev/null @@ -1,164 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_40-23 19.14 nan 9 -FEP_54-40 11.15 0.20 6 -FEP_40-28 nan nan 10 -FEP_53-40 18.46 0.83 8 -FEP_56-38 nan nan 10 -FEP_67-47 -61.00 0.49 1 -FEP_45-30 2.80 0.23 2 -FEP_49-44 -3.83 0.61 0 -FEP_68-56 -12.28 0.60 0 -FEP_40-33 -5.97 1.07 8 -FEP_45-36 -1.81 0.51 0 -FEP_49-23 14.59 0.45 0 -FEP_68-26 7.76 0.67 1 -FEP_53-28 18.37 0.70 1 -FEP_30-29 21.70 0.87 0 -FEP_58-56 11.39 0.63 0 -FEP_51-38 -15.43 0.41 0 -FEP_67-33 -34.27 0.93 0 -FEP_49-46 -13.98 0.35 0 -FEP_50-34 -0.04 0.42 1 -FEP_44-36 -6.78 0.48 1 -FEP_43-37 -4.03 0.30 1 -FEP_57-53 -53.59 0.57 2 -FEP_47-42 36.94 0.53 1 -FEP_67-23 -6.02 0.48 1 -FEP_64-58 -10.13 0.31 1 -FEP_45-34 9.01 0.67 0 -FEP_67-61 14.62 0.42 0 -FEP_56-29 -0.55 0.15 4 -FEP_54-47 -26.27 0.57 0 -FEP_58-50 -4.07 0.58 1 -FEP_64-63 -11.93 0.19 0 -FEP_68-43 -35.20 0.83 0 -FEP_47-33 26.91 0.21 2 -FEP_63-32 -12.87 0.47 1 -FEP_29-28 -22.58 0.96 2 -FEP_66-45 -19.63 0.55 2 -FEP_39-30 -5.26 1.15 6 -FEP_38-36 -4.35 1.08 3 -FEP_67-41 -28.29 1.29 7 -FEP_42-27 -4.71 0.36 3 -FEP_62-41 -49.34 1.41 2 -FEP_48-41 -4.63 0.88 4 -FEP_66-36 -21.77 0.34 1 -FEP_40-26 35.69 0.77 7 -FEP_66-56 5.12 0.40 0 -FEP_65-46 -13.05 0.33 0 -FEP_58-43 -10.73 0.62 0 -FEP_67-49 -20.75 0.48 0 -FEP_43-39 2.47 0.97 2 -FEP_44-29 19.07 0.57 0 -FEP_56-36 -27.70 0.38 0 -FEP_66-28 -15.79 0.59 0 -FEP_41-31 3.93 0.79 6 -FEP_49-45 -9.20 0.55 0 -FEP_66-43 -17.25 0.37 1 -FEP_63-61 32.58 0.90 0 -FEP_46-38 7.65 0.92 1 -FEP_63-51 7.31 0.67 1 -FEP_64-34 -16.28 1.27 2 -FEP_60-27 -10.08 0.40 0 -FEP_49-32 -10.11 0.27 0 -FEP_31-26 38.30 0.65 0 -FEP_66-57 17.33 0.21 1 -FEP_57-41 -33.44 0.64 3 -FEP_37-30 4.00 0.50 0 -FEP_44-32 -5.97 0.59 3 -FEP_34-26 36.67 0.46 1 -FEP_53-49 25.25 0.57 1 -FEP_36-32 0.61 0.75 0 -FEP_64-52 -35.41 1.28 2 -FEP_42-30 -5.36 0.42 0 -FEP_63-36 -14.41 0.39 0 -FEP_54-45 2.87 0.42 0 -FEP_68-27 -37.88 0.78 0 -FEP_47-45 30.33 0.58 1 -FEP_30-23 22.40 0.28 0 -FEP_53-42 20.91 0.43 0 -FEP_29-27 -21.75 0.86 0 -FEP_44-37 -6.83 0.42 0 -FEP_62-54 -61.01 0.76 6 -FEP_60-44 -7.61 0.47 0 -FEP_57-46 -41.13 0.47 1 -FEP_67-27 -28.63 0.39 0 -FEP_52-26 57.09 0.31 0 -FEP_41-33 -7.05 1.19 7 -FEP_54-32 2.44 0.81 3 -FEP_61-28 -44.19 0.57 5 -FEP_39-29 15.05 1.08 8 -FEP_64-43 -20.87 0.54 0 -FEP_48-42 -0.13 0.33 0 -FEP_62-46 -61.43 0.28 2 -FEP_47-28 32.08 0.37 1 -FEP_58-46 -17.98 1.18 1 -FEP_65-38 -4.26 1.44 1 -FEP_54-43 6.23 0.71 1 -FEP_43-26 42.14 0.63 1 -FEP_39-33 -7.49 0.64 0 -FEP_63-37 -13.45 0.63 0 -FEP_60-31 -5.65 0.66 1 -FEP_50-37 -11.70 0.31 0 -FEP_56-26 19.01 0.75 0 -FEP_68-64 -15.60 0.57 2 -FEP_67-53 -46.15 0.41 0 -FEP_35-33 0.15 0.23 0 -FEP_51-29 5.87 1.19 0 -FEP_40-35 -11.43 0.59 7 -FEP_56-31 -19.54 0.26 1 -FEP_34-28 -6.88 0.53 1 -FEP_57-32 -38.19 0.56 1 -FEP_56-33 -29.96 0.47 0 -FEP_28-27 -0.90 0.76 1 -FEP_60-43 -8.92 0.21 1 -FEP_47-27 33.03 0.40 0 -FEP_54-30 5.92 0.59 2 -FEP_52-28 13.67 0.40 1 -FEP_62-45 -56.88 0.34 0 -FEP_63-60 0.02 0.29 0 -FEP_68-35 -42.76 0.35 0 -FEP_31-23 18.59 1.59 2 -FEP_60-40 -5.74 0.56 3 -FEP_47-32 29.80 0.76 0 -FEP_51-43 -14.68 1.05 0 -FEP_47-43 33.42 0.34 0 -FEP_65-36 -9.90 0.72 0 -FEP_58-57 24.12 0.41 0 -FEP_62-58 -41.33 0.76 2 -FEP_67-30 -29.42 0.34 1 -FEP_46-42 10.05 0.94 1 -FEP_40-36 nan nan 10 -FEP_40-27 nan nan 10 -FEP_64-62 32.15 0.58 0 -FEP_53-45 16.08 0.71 0 -FEP_62-51 -36.62 0.21 0 -FEP_63-48 -2.79 0.56 1 -FEP_47-23 54.47 0.59 0 -FEP_40-39 -1.86 0.96 2 -FEP_46-35 0.09 0.20 1 -FEP_62-50 -48.00 0.40 0 -FEP_65-30 -6.51 0.92 1 -FEP_61-39 -38.95 0.61 1 -FEP_67-62 25.84 0.46 0 -FEP_50-42 -2.70 0.25 2 -FEP_64-53 -40.62 0.56 4 -FEP_42-26 38.63 0.57 1 -FEP_41-28 0.71 0.74 4 -FEP_68-33 -43.09 0.56 1 -FEP_49-28 -8.03 0.85 0 -FEP_61-32 -45.58 0.50 1 -FEP_47-41 34.67 0.84 4 -FEP_67-36 -31.94 0.30 0 -FEP_43-40 4.60 nan 8 -FEP_61-38 -41.23 0.73 0 -FEP_48-35 -12.41 0.24 1 -FEP_63-35 -16.56 0.48 0 -FEP_63-62 44.69 0.57 0 -FEP_51-26 25.34 0.46 0 -FEP_40-30 -3.51 1.35 7 -FEP_31-28 -2.87 0.71 1 -FEP_44-35 -8.74 0.61 1 -FEP_38-33 -5.42 1.60 7 -FEP_42-29 19.48 1.55 0 -FEP_61-48 -38.74 0.56 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs/protein_3.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs/protein_3.txt deleted file mode 100755 index 861efc2d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs/protein_3.txt +++ /dev/null @@ -1,210 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_40-23 nan nan 10 -FEP_40-28 -0.36 3.19 8 -FEP_56-38 nan nan 9 -FEP_40-36 -9.17 1.42 6 -FEP_40-27 nan nan 10 -FEP_43-40 3.37 0.71 6 -FEP_50-48 -0.71 0.58 2 -FEP_50-39 -4.45 0.96 2 -FEP_30-26 43.00 0.67 0 -FEP_52-37 8.57 0.46 0 -FEP_48-40 -2.65 0.51 6 -FEP_65-33 -11.66 0.59 2 -FEP_63-56 13.07 0.39 0 -FEP_61-49 -36.69 0.47 0 -FEP_40-34 nan nan 10 -FEP_53-52 3.74 0.75 0 -FEP_43-27 0.03 0.56 1 -FEP_40-29 nan nan 10 -FEP_52-34 19.48 0.54 0 -FEP_41-39 -1.04 1.21 1 -FEP_61-46 -49.26 0.57 0 -FEP_49-35 -13.03 0.34 1 -FEP_50-29 16.14 0.49 1 -FEP_62-28 -53.89 0.54 0 -FEP_66-47 -50.21 0.39 4 -FEP_50-30 -7.78 0.41 0 -FEP_63-47 -43.53 0.63 0 -FEP_43-33 -7.55 0.49 1 -FEP_38-34 5.64 1.36 4 -FEP_45-42 7.07 0.27 0 -FEP_49-27 -6.59 0.63 1 -FEP_58-23 10.14 0.93 0 -FEP_36-27 3.68 0.46 1 -FEP_50-35 -13.37 0.27 1 -FEP_54-28 6.80 0.52 0 -FEP_43-35 -6.98 0.26 0 -FEP_47-30 32.14 0.34 0 -FEP_41-27 3.71 0.70 7 -FEP_52-46 8.48 0.35 0 -FEP_63-38 -8.26 0.99 0 -FEP_56-43 -22.36 0.56 1 -FEP_64-30 -21.88 0.88 0 -FEP_62-26 -11.78 0.53 0 -FEP_66-38 -13.94 1.06 2 -FEP_34-23 15.25 0.75 0 -FEP_57-42 -30.83 0.25 0 -FEP_63-40 -5.75 1.10 2 -FEP_65-52 -17.42 0.44 2 -FEP_58-44 -8.56 0.54 0 -FEP_67-52 -41.69 0.97 2 -FEP_41-40 2.92 0.57 3 -FEP_61-45 -47.31 0.40 0 -FEP_62-37 -58.90 0.38 0 -FEP_51-42 -12.15 0.31 1 -FEP_63-50 -2.70 0.83 3 -FEP_48-37 -9.38 0.61 2 -FEP_68-48 -31.23 0.38 0 -FEP_46-41 0.24 0.87 8 -FEP_62-27 -54.67 0.64 0 -FEP_51-35 -23.57 0.48 1 -FEP_58-53 -28.20 0.67 1 -FEP_51-37 -21.65 0.26 1 -FEP_68-39 -36.59 0.89 6 -FEP_34-32 -8.38 0.44 0 -FEP_39-38 0.03 0.86 0 -FEP_66-26 24.33 0.64 3 -FEP_46-29 28.37 0.62 3 -FEP_68-31 -31.90 0.35 0 -FEP_54-23 27.24 0.26 1 -FEP_45-44 5.19 0.35 0 -FEP_66-51 0.67 0.68 1 -FEP_64-35 -27.59 1.57 3 -FEP_62-56 -31.51 0.48 0 -FEP_45-23 24.46 0.36 0 -FEP_46-44 9.11 0.28 0 -FEP_54-38 8.92 1.11 1 -FEP_64-54 -27.10 0.20 0 -FEP_60-38 -8.08 1.00 0 -FEP_54-52 -8.83 1.09 3 -FEP_39-34 3.15 0.93 1 -FEP_68-53 -53.50 0.70 0 -FEP_51-28 -16.88 0.33 1 -FEP_60-34 -5.36 0.83 0 -FEP_57-50 -29.17 0.70 0 -FEP_50-26 36.07 0.26 2 -FEP_47-31 34.65 0.92 1 -FEP_46-31 9.87 0.38 2 -FEP_36-29 27.16 0.66 1 -FEP_42-31 -0.22 0.44 1 -FEP_60-35 -16.69 0.35 3 -FEP_62-61 -11.12 0.39 0 -FEP_35-28 7.01 0.45 2 -FEP_67-40 -23.41 0.86 1 -FEP_60-50 -2.90 0.45 0 -FEP_57-23 -13.33 0.25 0 -FEP_36-33 -1.87 0.53 0 -FEP_47-36 27.88 0.42 0 -FEP_42-23 17.61 0.24 0 -FEP_58-38 -10.88 0.63 3 -FEP_67-34 -22.29 0.71 2 -FEP_46-39 7.83 0.55 2 -FEP_49-48 -0.89 0.73 0 -FEP_44-43 -2.21 0.48 1 -FEP_62-29 -32.16 0.59 1 -FEP_44-40 1.48 0.60 7 -FEP_65-42 -1.56 0.30 0 -FEP_48-36 -9.78 0.43 0 -FEP_57-56 -11.77 0.43 1 -FEP_66-44 -14.76 0.16 0 -FEP_38-29 19.66 0.96 2 -FEP_36-30 3.65 0.31 0 -FEP_64-39 -15.78 1.15 6 -FEP_68-45 -38.62 0.27 0 -FEP_67-38 -26.69 0.95 1 -FEP_62-43 -54.97 0.85 0 -FEP_58-36 -16.79 0.67 0 -FEP_66-58 -6.70 0.40 0 -FEP_41-38 -0.01 0.89 2 -FEP_58-33 -19.44 0.82 0 -FEP_31-27 -4.38 0.50 1 -FEP_46-30 5.27 0.32 0 -FEP_40-32 -7.29 nan 9 -FEP_62-34 -49.14 0.82 0 -FEP_52-35 6.55 0.38 0 -FEP_65-32 -8.13 0.61 0 -FEP_48-28 -5.73 0.55 1 -FEP_52-40 nan nan 10 -FEP_66-42 -12.72 0.56 0 -FEP_60-32 -13.30 0.46 0 -FEP_37-31 6.61 0.27 1 -FEP_62-30 -55.04 0.57 0 -FEP_66-54 -22.79 0.42 0 -FEP_37-23 25.07 0.62 1 -FEP_60-30 -10.07 0.27 0 -FEP_38-27 0.33 0.68 4 -FEP_28-26 42.90 0.36 1 -FEP_63-42 -5.75 0.32 0 -FEP_58-37 -16.08 0.63 0 -FEP_52-41 15.14 0.62 4 -FEP_35-23 28.36 0.43 1 -FEP_63-41 -7.92 1.35 5 -FEP_53-37 14.02 0.44 1 -FEP_68-49 -28.96 0.68 1 -FEP_52-48 17.89 0.64 0 -FEP_68-32 -39.20 0.48 0 -FEP_61-60 -33.46 0.44 0 -FEP_61-47 -75.02 0.46 1 -FEP_57-44 -32.77 0.51 1 -FEP_49-34 -1.89 0.41 0 -FEP_48-38 -2.48 1.61 3 -FEP_67-48 -24.08 0.49 1 -FEP_57-39 -31.18 1.15 2 -FEP_65-50 0.96 0.33 2 -FEP_51-44 -15.51 0.42 0 -FEP_63-30 -9.92 0.64 0 -FEP_63-49 -2.44 0.61 0 -FEP_52-39 21.49 1.64 4 -FEP_57-27 -35.99 0.54 1 -FEP_65-31 -3.33 0.76 0 -FEP_50-41 -4.86 0.69 3 -FEP_58-42 -7.73 0.35 1 -FEP_65-28 -5.96 0.35 2 -FEP_44-26 40.65 0.49 0 -FEP_40-31 -1.99 nan 9 -FEP_60-53 -27.51 0.43 0 -FEP_61-54 -45.62 1.23 5 -FEP_51-39 -14.20 1.09 2 -FEP_60-33 -17.28 0.92 1 -FEP_43-41 -0.34 0.96 6 -FEP_53-46 11.17 0.44 0 -FEP_56-49 -16.44 0.69 1 -FEP_53-47 -14.98 0.59 3 -FEP_58-35 -18.39 0.48 0 -FEP_42-33 -10.03 0.71 1 -FEP_46-45 4.04 0.32 1 -FEP_63-34 -3.13 1.02 0 -FEP_63-23 12.18 0.45 1 -FEP_52-29 34.69 1.01 3 -FEP_62-60 -45.50 0.26 0 -FEP_33-23 29.02 0.96 3 -FEP_62-31 -51.22 0.52 0 -FEP_42-35 -11.31 0.34 1 -FEP_39-35 -9.50 1.01 1 -FEP_50-23 15.20 0.57 4 -FEP_61-43 -42.58 0.72 0 -FEP_46-36 1.70 0.22 0 -FEP_68-67 -7.29 0.46 0 -FEP_39-31 -0.96 1.23 6 -FEP_63-31 -6.11 0.37 1 -FEP_62-39 -53.48 0.75 0 -FEP_32-28 3.79 0.58 1 -FEP_60-26 32.75 0.58 2 -FEP_54-36 0.91 1.11 2 -FEP_61-41 -43.38 0.70 6 -FEP_52-49 19.88 0.57 0 -FEP_37-29 26.43 0.91 1 -FEP_58-51 5.75 0.40 0 -FEP_49-36 -11.65 0.26 1 -FEP_65-61 37.98 0.35 1 -FEP_44-27 -4.95 1.03 2 -FEP_63-33 -16.04 0.31 1 -FEP_64-36 -25.35 0.58 0 -FEP_41-23 19.21 0.98 5 -FEP_48-43 -4.60 0.46 0 -FEP_56-40 -19.44 1.62 4 -FEP_67-42 -23.80 0.29 0 -FEP_60-57 24.87 0.26 0 -FEP_65-54 -11.60 0.51 0 -FEP_56-39 -20.40 1.17 3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs/protein_4.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs/protein_4.txt deleted file mode 100755 index 11997f38..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/extra/backup/vs/protein_4.txt +++ /dev/null @@ -1,292 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_67-44 -25.88 0.29 1 -FEP_46-34 11.79 0.66 1 -FEP_31-30 -4.62 0.22 0 -FEP_58-31 -8.61 0.58 0 -FEP_57-34 -29.95 0.86 3 -FEP_49-33 -14.15 0.40 1 -FEP_65-40 -10.05 nan 5 -FEP_44-30 -3.37 0.69 0 -FEP_36-35 -2.32 0.33 0 -FEP_45-28 1.49 1.00 1 -FEP_51-30 -17.48 0.26 2 -FEP_50-46 -13.51 0.35 1 -FEP_67-63 -18.61 0.34 0 -FEP_52-23 33.48 1.04 1 -FEP_67-43 -27.20 0.24 0 -FEP_33-26 49.89 0.62 2 -FEP_66-41 -15.35 1.18 6 -FEP_67-50 -21.50 0.19 0 -FEP_56-42 -19.58 0.46 4 -FEP_45-43 3.43 0.92 0 -FEP_65-48 -0.30 0.40 1 -FEP_52-31 18.86 0.67 0 -FEP_52-51 29.05 0.53 0 -FEP_57-43 -34.29 0.49 1 -FEP_65-56 17.65 0.38 1 -FEP_46-40 10.84 1.12 8 -FEP_67-58 -16.69 0.39 0 -FEP_64-28 -23.43 0.81 1 -FEP_63-58 2.22 0.23 0 -FEP_65-43 -5.17 0.19 0 -FEP_63-53 -27.02 0.25 0 -FEP_62-52 -66.79 0.54 1 -FEP_64-57 14.58 1.28 1 -FEP_30-27 0.94 0.30 0 -FEP_56-32 -27.72 0.39 0 -FEP_51-36 -21.73 0.85 0 -FEP_38-28 -3.33 1.19 3 -FEP_65-26 37.15 0.75 0 -FEP_43-38 2.63 1.12 3 -FEP_47-35 26.81 0.34 0 -FEP_62-32 -57.79 0.63 1 -FEP_63-26 32.79 0.43 0 -FEP_54-44 8.51 0.37 1 -FEP_47-40 39.50 0.02 7 -FEP_44-28 -2.93 0.75 0 -FEP_65-29 15.89 0.62 3 -FEP_54-48 11.03 0.27 2 -FEP_67-32 -31.62 0.56 0 -FEP_38-30 -5.36 1.29 7 -FEP_53-34 23.70 0.86 1 -FEP_43-31 3.23 0.34 0 -FEP_62-33 -62.21 0.35 3 -FEP_48-29 15.85 1.43 3 -FEP_37-35 -3.27 0.39 1 -FEP_50-31 -3.24 0.41 1 -FEP_45-38 6.84 1.40 2 -FEP_64-27 -21.97 0.82 2 -FEP_65-57 29.49 0.39 0 -FEP_57-26 7.05 0.43 0 -FEP_56-41 -22.76 1.00 4 -FEP_53-33 13.40 1.00 1 -FEP_61-29 -21.60 0.81 1 -FEP_48-39 -2.18 0.91 4 -FEP_48-34 0.90 0.53 1 -FEP_60-49 -3.64 0.36 0 -FEP_53-29 41.12 1.33 1 -FEP_51-45 -20.11 0.44 1 -FEP_67-28 -27.79 0.39 0 -FEP_64-40 -18.25 1.84 4 -FEP_51-48 -12.71 0.49 0 -FEP_63-46 -16.27 0.38 0 -FEP_52-30 11.90 0.92 1 -FEP_32-30 1.88 0.41 0 -FEP_67-37 -33.04 0.34 0 -FEP_60-29 13.26 0.96 0 -FEP_54-53 -10.91 0.49 3 -FEP_56-47 -57.30 0.89 0 -FEP_58-27 -13.31 1.49 3 -FEP_61-33 -51.39 1.00 0 -FEP_57-33 -43.39 0.62 2 -FEP_49-42 -1.96 0.63 0 -FEP_58-49 -3.98 0.67 0 -FEP_52-44 17.22 0.68 2 -FEP_33-28 6.53 0.48 1 -FEP_63-39 -7.85 0.79 5 -FEP_46-28 5.02 0.67 0 -FEP_65-37 -9.45 0.30 1 -FEP_29-26 20.18 0.31 0 -FEP_49-40 -6.69 1.55 5 -FEP_36-31 7.93 0.36 0 -FEP_36-26 46.78 0.72 0 -FEP_48-33 -12.12 0.56 1 -FEP_66-64 4.18 0.56 2 -FEP_56-27 -24.49 0.55 0 -FEP_61-42 -38.60 0.75 4 -FEP_46-33 -0.66 0.55 1 -FEP_36-28 3.95 0.66 0 -FEP_58-26 29.92 0.86 2 -FEP_64-32 -25.35 0.92 8 -FEP_66-48 -10.81 0.64 2 -FEP_62-44 -51.50 0.51 1 -FEP_57-45 -37.96 0.42 0 -FEP_60-48 -5.30 0.30 1 -FEP_45-32 -0.27 0.58 0 -FEP_64-47 -54.80 0.84 0 -FEP_61-58 -31.90 1.22 0 -FEP_49-26 36.14 0.31 0 -FEP_54-33 -0.08 1.89 2 -FEP_50-32 -9.22 0.39 0 -FEP_52-32 10.26 0.39 0 -FEP_65-64 15.21 0.47 0 -FEP_67-54 -35.43 0.98 3 -FEP_65-45 -7.60 0.40 0 -FEP_54-31 10.97 0.77 2 -FEP_60-36 -14.40 0.33 0 -FEP_47-39 36.41 0.99 2 -FEP_63-44 -6.82 0.58 0 -FEP_68-62 18.43 0.38 0 -FEP_63-57 25.14 0.48 1 -FEP_68-38 -32.63 0.92 1 -FEP_54-26 47.43 0.86 0 -FEP_53-35 12.24 0.19 0 -FEP_61-35 -49.66 0.39 0 -FEP_47-29 55.45 0.57 2 -FEP_48-27 -4.34 0.40 0 -FEP_37-33 -1.44 0.59 0 -FEP_58-41 -11.19 1.27 6 -FEP_60-23 11.22 0.26 0 -FEP_38-23 20.50 1.03 1 -FEP_46-32 3.28 0.32 0 -FEP_41-30 1.09 1.88 8 -FEP_37-32 0.91 0.24 3 -FEP_68-40 -32.95 1.23 2 -FEP_52-43 14.26 0.65 0 -FEP_48-32 -7.50 0.30 0 -FEP_43-29 21.03 0.95 0 -FEP_30-28 1.34 0.47 0 -FEP_68-34 -30.53 1.09 0 -FEP_54-37 0.51 0.55 2 -FEP_56-51 -6.23 0.73 1 -FEP_27-26 41.91 0.57 2 -FEP_41-37 -5.55 1.08 5 -FEP_61-56 -20.41 0.52 0 -FEP_44-39 0.73 1.06 1 -FEP_58-39 -9.24 0.99 4 -FEP_56-45 -25.46 0.34 0 -FEP_57-38 -33.14 0.70 0 -FEP_50-45 -9.17 0.75 1 -FEP_57-52 -48.88 1.00 2 -FEP_53-39 21.48 1.28 4 -FEP_60-45 -11.90 0.84 0 -FEP_52-42 16.86 0.65 1 -FEP_64-61 21.47 1.57 4 -FEP_45-29 25.83 0.97 2 -FEP_54-41 3.91 0.14 8 -FEP_32-26 44.81 0.82 0 -FEP_35-34 12.83 0.30 1 -FEP_36-23 25.27 0.45 0 -FEP_57-29 -14.71 0.71 3 -FEP_47-34 39.04 0.44 0 -FEP_57-28 -34.74 0.90 0 -FEP_52-38 16.27 0.80 1 -FEP_58-32 -16.74 1.17 1 -FEP_67-35 -34.16 0.24 0 -FEP_37-36 0.53 0.41 1 -FEP_66-63 -6.66 0.68 0 -FEP_61-52 -56.46 0.65 2 -FEP_57-40 -25.83 1.16 7 -FEP_64-45 -24.21 0.45 0 -FEP_62-23 -31.88 0.49 0 -FEP_68-65 -31.57 0.26 0 -FEP_67-60 -17.80 0.19 0 -FEP_68-60 -25.52 0.33 0 -FEP_43-23 21.65 0.59 1 -FEP_49-43 -6.62 0.42 0 -FEP_40-37 -8.57 1.21 6 -FEP_43-30 -1.51 0.44 0 -FEP_54-27 5.30 1.23 5 -FEP_53-41 14.36 nan 9 -FEP_64-37 -25.10 1.07 4 -FEP_45-26 45.02 0.58 0 -FEP_46-27 6.14 0.62 0 -FEP_60-51 7.60 0.46 0 -FEP_67-39 -25.51 1.05 1 -FEP_54-49 12.63 1.01 2 -FEP_64-26 21.12 0.56 0 -FEP_58-34 -6.21 0.80 5 -FEP_35-27 5.89 0.24 2 -FEP_51-41 -16.08 0.96 1 -FEP_53-38 19.72 1.20 2 -FEP_64-29 2.29 1.15 1 -FEP_51-49 -10.09 0.96 0 -FEP_29-23 -0.13 0.56 2 -FEP_62-35 -62.47 0.44 0 -FEP_60-41 -7.08 1.16 4 -FEP_68-66 -19.32 0.21 1 -FEP_56-50 -15.89 0.76 1 -FEP_66-53 -35.32 0.30 1 -FEP_40-38 -0.28 0.68 0 -FEP_66-60 -7.64 0.36 1 -FEP_68-51 -19.03 0.31 0 -FEP_58-52 -28.93 0.96 7 -FEP_64-38 -17.97 1.08 2 -FEP_62-42 -49.69 0.62 0 -FEP_60-42 -6.19 0.39 0 -FEP_45-35 -3.57 0.46 1 -FEP_66-52 -30.94 0.89 3 -FEP_46-23 28.82 0.54 0 -FEP_50-27 -6.13 0.40 1 -FEP_33-30 5.94 0.44 1 -FEP_53-48 23.27 0.58 1 -FEP_48-31 -1.50 0.27 0 -FEP_39-27 -0.81 1.74 6 -FEP_33-29 29.44 0.35 2 -FEP_43-34 5.70 0.46 0 -FEP_53-44 19.57 0.39 1 -FEP_44-38 -0.27 0.72 1 -FEP_41-34 5.44 0.59 5 -FEP_62-48 -48.55 0.46 0 -FEP_66-29 4.03 0.52 3 -FEP_53-26 58.95 0.97 1 -FEP_46-37 2.39 0.51 1 -FEP_37-26 47.84 0.32 1 -FEP_53-32 15.07 0.54 0 -FEP_67-45 -30.70 0.58 0 -FEP_64-56 0.73 1.10 4 -FEP_63-54 -15.73 0.35 0 -FEP_39-28 -3.49 1.05 4 -FEP_45-31 7.09 0.37 2 -FEP_57-37 -39.40 0.25 1 -FEP_67-26 13.95 0.63 0 -FEP_68-47 -70.69 1.00 0 -FEP_35-26 48.60 0.50 1 -FEP_62-57 -20.32 0.36 0 -FEP_68-61 7.71 0.57 0 -FEP_67-29 -5.66 0.86 2 -FEP_68-58 -24.24 0.48 0 -FEP_68-37 -40.79 0.90 1 -FEP_47-26 75.13 0.67 1 -FEP_39-37 -5.95 0.61 0 -FEP_68-30 -35.77 0.72 0 -FEP_42-39 -1.19 0.87 5 -FEP_52-33 6.94 0.87 1 -FEP_46-26 50.18 0.64 0 -FEP_57-31 -31.84 0.45 1 -FEP_61-30 -43.59 0.44 0 -FEP_50-36 -11.20 0.30 0 -FEP_54-46 -0.07 0.61 5 -FEP_68-41 -37.29 0.77 3 -FEP_54-35 -0.41 0.52 0 -FEP_68-23 -14.73 0.21 0 -FEP_43-42 4.11 1.03 0 -FEP_45-40 7.07 0.99 4 -FEP_44-41 -0.60 0.24 4 -FEP_60-46 -16.61 0.28 0 -FEP_50-38 -2.20 0.52 2 -FEP_35-32 3.10 0.20 0 -FEP_42-34 1.69 0.64 2 -FEP_66-40 nan nan 9 -FEP_62-40 -47.87 1.04 4 -FEP_57-30 -37.28 0.62 3 -FEP_37-34 10.57 0.56 3 -FEP_48-46 -11.20 0.60 1 -FEP_56-53 -41.03 0.33 1 -FEP_66-35 -22.84 0.26 2 -FEP_62-49 -48.27 0.39 1 -FEP_62-38 -51.77 0.38 0 -FEP_66-23 4.67 0.19 0 -FEP_64-44 -19.74 0.84 1 -FEP_64-33 -27.88 1.10 6 -FEP_60-47 -43.90 0.47 1 -FEP_61-23 -21.46 0.36 0 -FEP_52-47 -20.31 0.49 0 -FEP_33-32 4.06 0.21 1 -FEP_38-26 39.41 0.28 2 -FEP_33-31 10.31 0.70 0 -FEP_35-31 9.98 0.31 0 -FEP_47-38 38.46 0.57 4 -FEP_36-34 9.44 0.83 0 -FEP_65-23 17.31 0.61 0 -FEP_38-32 -3.74 1.40 7 -FEP_50-47 -40.10 0.32 0 -FEP_68-52 -49.54 0.75 1 -FEP_57-51 -16.99 0.29 0 -FEP_63-45 -9.43 0.49 2 -FEP_41-35 -6.97 0.31 8 -FEP_67-56 -4.45 0.51 0 -FEP_61-34 -37.85 0.69 1 -FEP_68-46 -42.81 0.60 0 -FEP_53-30 17.69 0.32 0 -FEP_43-28 -1.39 0.69 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/1fs/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/1fs/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index 0b77469d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/1fs/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,72 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_43-47 -33.31 0.62 0 -FEP_62-45 -40.73 0.48 0 -FEP_43-27 -0.58 0.72 0 -FEP_35-39 6.24 1.16 2 -FEP_48-27 -5.16 0.47 0 -FEP_67-31 -26.32 0.80 0 -FEP_27-46 -6.97 0.49 0 -FEP_42-64 12.63 0.38 0 -FEP_33-27 6.26 0.34 0 -FEP_28-27 -0.28 0.40 1 -FEP_28-35 -5.00 0.50 0 -FEP_63-60 4.36 0.33 0 -FEP_38-60 9.90 0.83 0 -FEP_28-47 -32.55 0.34 0 -FEP_44-23 18.77 0.41 0 -FEP_51-45 -15.92 0.52 0 -FEP_29-35 -27.69 0.45 2 -FEP_56-35 -30.98 0.51 0 -FEP_35-33 -1.18 0.48 0 -FEP_49-67 26.42 0.82 1 -FEP_50-60 6.35 0.23 1 -FEP_26-57 -7.42 0.57 0 -FEP_27-23 18.89 1.21 4 -FEP_54-42 5.40 0.35 0 -FEP_35-34 12.03 0.40 0 -FEP_27-45 -3.28 0.67 1 -FEP_41-35 -3.55 nan 9 -FEP_60-36 -15.22 0.28 0 -FEP_32-46 -3.29 0.36 0 -FEP_67-58 -13.51 0.46 1 -FEP_67-52 -38.57 0.55 0 -FEP_65-67 21.36 0.24 0 -FEP_68-23 -13.77 0.33 0 -FEP_57-23 -13.67 0.33 0 -FEP_35-36 1.75 0.20 0 -FEP_30-40 2.92 nan 8 -FEP_35-60 17.38 0.35 0 -FEP_26-44 -39.96 0.43 0 -FEP_62-26 4.34 0.25 0 -FEP_65-60 2.34 0.20 0 -FEP_39-32 -5.50 0.90 3 -FEP_52-60 19.52 0.79 0 -FEP_67-27 -30.32 0.39 0 -FEP_30-27 0.39 0.38 0 -FEP_58-60 -5.55 0.40 0 -FEP_38-35 -6.10 0.70 1 -FEP_61-60 -17.26 0.36 0 -FEP_56-60 -12.72 0.32 0 -FEP_67-63 -22.55 0.30 0 -FEP_35-53 -6.02 0.35 0 -FEP_41-32 0.02 0.60 7 -FEP_67-35 -35.13 0.28 0 -FEP_29-27 -23.08 0.63 1 -FEP_29-40 -19.54 0.78 5 -FEP_67-53 -41.06 0.55 0 -FEP_31-35 -8.44 0.35 0 -FEP_30-48 5.40 0.36 0 -FEP_26-64 -25.74 0.50 0 -FEP_32-34 8.55 0.34 0 -FEP_67-50 -25.26 0.40 0 -FEP_35-37 2.82 0.24 0 -FEP_42-51 8.39 0.50 1 -FEP_30-35 -4.38 0.35 1 -FEP_54-23 23.65 0.29 0 -FEP_67-61 -0.90 0.38 0 -FEP_67-37 -32.39 0.35 0 -FEP_66-23 2.41 0.33 0 -FEP_49-35 -10.76 0.31 0 -FEP_67-32 -33.24 0.76 0 -FEP_68-45 -37.77 0.25 0 -FEP_66-42 -15.85 0.25 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/1fs/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/1fs/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index e41a316c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/1fs/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,72 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_43-47 -36.89 0.34 1 -FEP_62-45 -41.78 0.28 0 -FEP_43-27 -2.37 0.30 0 -FEP_35-39 7.17 0.64 0 -FEP_48-27 -2.39 0.25 2 -FEP_67-31 -32.10 0.25 0 -FEP_27-46 -5.32 0.18 0 -FEP_42-64 13.50 0.11 0 -FEP_33-27 4.46 0.14 0 -FEP_28-27 2.60 0.26 0 -FEP_28-35 -0.44 0.49 0 -FEP_63-60 4.89 0.13 0 -FEP_38-60 11.09 0.53 2 -FEP_28-47 -32.91 0.28 0 -FEP_44-23 16.94 0.19 0 -FEP_51-45 -17.10 0.11 0 -FEP_29-35 -20.18 0.41 0 -FEP_56-35 -33.13 0.15 0 -FEP_35-33 -1.55 0.24 0 -FEP_49-67 28.42 0.12 1 -FEP_50-60 8.60 0.14 0 -FEP_26-57 -5.90 0.45 0 -FEP_27-23 26.40 0.67 2 -FEP_54-42 4.47 0.11 1 -FEP_35-34 8.17 0.27 0 -FEP_27-45 -0.58 0.32 1 -FEP_41-35 -1.38 nan 8 -FEP_60-36 -17.50 0.15 1 -FEP_32-46 -2.95 0.19 0 -FEP_67-58 -12.86 0.14 1 -FEP_67-52 -40.56 0.22 0 -FEP_65-67 20.50 0.18 0 -FEP_68-23 -10.44 0.11 0 -FEP_57-23 -13.57 0.13 0 -FEP_35-36 1.93 0.11 1 -FEP_30-40 7.01 nan 9 -FEP_35-60 19.32 0.18 0 -FEP_26-44 -37.00 0.23 2 -FEP_62-26 3.45 0.25 0 -FEP_65-60 1.47 0.15 0 -FEP_39-32 -6.53 0.78 1 -FEP_52-60 23.34 0.80 0 -FEP_67-27 -35.13 0.27 0 -FEP_30-27 0.46 0.09 0 -FEP_58-60 -5.76 0.12 0 -FEP_38-35 -7.87 0.73 4 -FEP_61-60 -16.34 0.28 0 -FEP_56-60 -13.35 0.16 0 -FEP_67-63 -23.72 0.25 0 -FEP_35-53 -3.10 0.31 0 -FEP_41-32 -10.09 0.19 6 -FEP_67-35 -37.71 0.19 0 -FEP_29-27 -17.13 0.52 0 -FEP_29-40 -9.36 0.70 6 -FEP_67-53 -40.79 0.16 0 -FEP_31-35 -5.67 0.11 0 -FEP_30-48 3.06 0.32 0 -FEP_26-64 -24.85 0.26 0 -FEP_32-34 7.73 0.39 0 -FEP_67-50 -26.76 0.26 0 -FEP_35-37 1.62 0.36 1 -FEP_42-51 9.37 0.42 1 -FEP_30-35 -2.43 0.17 0 -FEP_54-23 22.44 0.15 0 -FEP_67-61 -3.19 0.73 0 -FEP_67-37 -35.24 0.30 0 -FEP_66-23 1.56 0.13 0 -FEP_49-35 -9.52 0.22 0 -FEP_67-32 -36.99 0.27 0 -FEP_68-45 -35.18 0.12 1 -FEP_66-42 -16.53 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/1fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/1fs/protein.txt deleted file mode 100755 index 0b77469d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/1fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,72 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_43-47 -33.31 0.62 0 -FEP_62-45 -40.73 0.48 0 -FEP_43-27 -0.58 0.72 0 -FEP_35-39 6.24 1.16 2 -FEP_48-27 -5.16 0.47 0 -FEP_67-31 -26.32 0.80 0 -FEP_27-46 -6.97 0.49 0 -FEP_42-64 12.63 0.38 0 -FEP_33-27 6.26 0.34 0 -FEP_28-27 -0.28 0.40 1 -FEP_28-35 -5.00 0.50 0 -FEP_63-60 4.36 0.33 0 -FEP_38-60 9.90 0.83 0 -FEP_28-47 -32.55 0.34 0 -FEP_44-23 18.77 0.41 0 -FEP_51-45 -15.92 0.52 0 -FEP_29-35 -27.69 0.45 2 -FEP_56-35 -30.98 0.51 0 -FEP_35-33 -1.18 0.48 0 -FEP_49-67 26.42 0.82 1 -FEP_50-60 6.35 0.23 1 -FEP_26-57 -7.42 0.57 0 -FEP_27-23 18.89 1.21 4 -FEP_54-42 5.40 0.35 0 -FEP_35-34 12.03 0.40 0 -FEP_27-45 -3.28 0.67 1 -FEP_41-35 -3.55 nan 9 -FEP_60-36 -15.22 0.28 0 -FEP_32-46 -3.29 0.36 0 -FEP_67-58 -13.51 0.46 1 -FEP_67-52 -38.57 0.55 0 -FEP_65-67 21.36 0.24 0 -FEP_68-23 -13.77 0.33 0 -FEP_57-23 -13.67 0.33 0 -FEP_35-36 1.75 0.20 0 -FEP_30-40 2.92 nan 8 -FEP_35-60 17.38 0.35 0 -FEP_26-44 -39.96 0.43 0 -FEP_62-26 4.34 0.25 0 -FEP_65-60 2.34 0.20 0 -FEP_39-32 -5.50 0.90 3 -FEP_52-60 19.52 0.79 0 -FEP_67-27 -30.32 0.39 0 -FEP_30-27 0.39 0.38 0 -FEP_58-60 -5.55 0.40 0 -FEP_38-35 -6.10 0.70 1 -FEP_61-60 -17.26 0.36 0 -FEP_56-60 -12.72 0.32 0 -FEP_67-63 -22.55 0.30 0 -FEP_35-53 -6.02 0.35 0 -FEP_41-32 0.02 0.60 7 -FEP_67-35 -35.13 0.28 0 -FEP_29-27 -23.08 0.63 1 -FEP_29-40 -19.54 0.78 5 -FEP_67-53 -41.06 0.55 0 -FEP_31-35 -8.44 0.35 0 -FEP_30-48 5.40 0.36 0 -FEP_26-64 -25.74 0.50 0 -FEP_32-34 8.55 0.34 0 -FEP_67-50 -25.26 0.40 0 -FEP_35-37 2.82 0.24 0 -FEP_42-51 8.39 0.50 1 -FEP_30-35 -4.38 0.35 1 -FEP_54-23 23.65 0.29 0 -FEP_67-61 -0.90 0.38 0 -FEP_67-37 -32.39 0.35 0 -FEP_66-23 2.41 0.33 0 -FEP_49-35 -10.76 0.31 0 -FEP_67-32 -33.24 0.76 0 -FEP_68-45 -37.77 0.25 0 -FEP_66-42 -15.85 0.25 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/1fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/1fs/water.txt deleted file mode 100755 index e41a316c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/1fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,72 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_43-47 -36.89 0.34 1 -FEP_62-45 -41.78 0.28 0 -FEP_43-27 -2.37 0.30 0 -FEP_35-39 7.17 0.64 0 -FEP_48-27 -2.39 0.25 2 -FEP_67-31 -32.10 0.25 0 -FEP_27-46 -5.32 0.18 0 -FEP_42-64 13.50 0.11 0 -FEP_33-27 4.46 0.14 0 -FEP_28-27 2.60 0.26 0 -FEP_28-35 -0.44 0.49 0 -FEP_63-60 4.89 0.13 0 -FEP_38-60 11.09 0.53 2 -FEP_28-47 -32.91 0.28 0 -FEP_44-23 16.94 0.19 0 -FEP_51-45 -17.10 0.11 0 -FEP_29-35 -20.18 0.41 0 -FEP_56-35 -33.13 0.15 0 -FEP_35-33 -1.55 0.24 0 -FEP_49-67 28.42 0.12 1 -FEP_50-60 8.60 0.14 0 -FEP_26-57 -5.90 0.45 0 -FEP_27-23 26.40 0.67 2 -FEP_54-42 4.47 0.11 1 -FEP_35-34 8.17 0.27 0 -FEP_27-45 -0.58 0.32 1 -FEP_41-35 -1.38 nan 8 -FEP_60-36 -17.50 0.15 1 -FEP_32-46 -2.95 0.19 0 -FEP_67-58 -12.86 0.14 1 -FEP_67-52 -40.56 0.22 0 -FEP_65-67 20.50 0.18 0 -FEP_68-23 -10.44 0.11 0 -FEP_57-23 -13.57 0.13 0 -FEP_35-36 1.93 0.11 1 -FEP_30-40 7.01 nan 9 -FEP_35-60 19.32 0.18 0 -FEP_26-44 -37.00 0.23 2 -FEP_62-26 3.45 0.25 0 -FEP_65-60 1.47 0.15 0 -FEP_39-32 -6.53 0.78 1 -FEP_52-60 23.34 0.80 0 -FEP_67-27 -35.13 0.27 0 -FEP_30-27 0.46 0.09 0 -FEP_58-60 -5.76 0.12 0 -FEP_38-35 -7.87 0.73 4 -FEP_61-60 -16.34 0.28 0 -FEP_56-60 -13.35 0.16 0 -FEP_67-63 -23.72 0.25 0 -FEP_35-53 -3.10 0.31 0 -FEP_41-32 -10.09 0.19 6 -FEP_67-35 -37.71 0.19 0 -FEP_29-27 -17.13 0.52 0 -FEP_29-40 -9.36 0.70 6 -FEP_67-53 -40.79 0.16 0 -FEP_31-35 -5.67 0.11 0 -FEP_30-48 3.06 0.32 0 -FEP_26-64 -24.85 0.26 0 -FEP_32-34 7.73 0.39 0 -FEP_67-50 -26.76 0.26 0 -FEP_35-37 1.62 0.36 1 -FEP_42-51 9.37 0.42 1 -FEP_30-35 -2.43 0.17 0 -FEP_54-23 22.44 0.15 0 -FEP_67-61 -3.19 0.73 0 -FEP_67-37 -35.24 0.30 0 -FEP_66-23 1.56 0.13 0 -FEP_49-35 -9.52 0.22 0 -FEP_67-32 -36.99 0.27 0 -FEP_68-45 -35.18 0.12 1 -FEP_66-42 -16.53 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/20rep-MFP-prot.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/20rep-MFP-prot.txt deleted file mode 100755 index 920b302e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/20rep-MFP-prot.txt +++ /dev/null @@ -1,75 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_50-37 -7.75 0.10 0 -FEP_23-64 -4.57 0.22 0 -FEP_39-27 -1.80 0.45 0 -FEP_57-56 -9.77 0.13 0 -FEP_30-40 3.65 0.96 7 -FEP_62-64 -21.90 0.23 0 -FEP_30-27 0.66 0.19 0 -FEP_48-28 -5.23 0.33 0 -FEP_41-27 0.04 0.57 3 -FEP_54-42 5.65 0.14 0 -FEP_61-60 -17.25 0.25 0 -FEP_26-68 -8.03 0.27 0 -FEP_32-27 2.51 0.13 0 -FEP_48-42 -0.29 0.19 1 -FEP_33-42 10.11 0.42 0 -FEP_29-42 -16.60 0.62 0 -FEP_65-63 -2.52 0.18 0 -FEP_47-43 33.35 0.18 0 -FEP_65-60 2.19 0.12 1 -FEP_50-49 -0.69 0.15 1 -FEP_33-40 11.77 0.38 13 -FEP_32-30 1.81 0.22 0 -FEP_61-63 -22.15 0.18 1 -FEP_33-27 5.71 0.14 0 -FEP_40-27 -4.58 0.79 11 -FEP_33-46 -1.10 0.16 0 -FEP_28-29 20.75 0.57 0 -FEP_33-36 2.44 0.17 0 -FEP_35-49 10.31 0.15 1 -FEP_63-60 5.09 0.23 0 -FEP_39-41 -1.38 0.33 0 -FEP_66-64 -2.91 0.31 0 -FEP_28-45 -3.08 0.34 0 -FEP_32-41 3.91 0.63 1 -FEP_32-39 5.85 0.45 0 -FEP_33-37 2.75 0.25 0 -FEP_46-43 7.18 0.11 1 -FEP_45-42 7.02 0.14 0 -FEP_44-42 0.34 0.20 0 -FEP_31-34 2.83 0.32 0 -FEP_33-44 9.88 0.24 0 -FEP_33-30 4.91 0.18 0 -FEP_51-54 -15.41 0.38 0 -FEP_40-41 -1.86 0.56 1 -FEP_33-47 -27.18 0.30 0 -FEP_35-36 1.87 0.09 0 -FEP_37-53 -8.67 0.27 0 -FEP_33-41 6.59 0.74 4 -FEP_38-27 -1.17 0.88 2 -FEP_35-37 3.28 0.19 0 -FEP_68-64 -17.55 0.29 0 -FEP_54-64 18.85 0.16 0 -FEP_31-30 -4.15 0.14 0 -FEP_33-34 11.18 0.24 0 -FEP_33-39 8.94 0.45 0 -FEP_52-53 -3.06 0.40 0 -FEP_33-32 2.67 0.10 0 -FEP_26-67 -11.64 0.17 0 -FEP_38-39 0.80 0.56 0 -FEP_51-42 -9.19 0.24 1 -FEP_66-62 19.47 0.20 0 -FEP_33-38 8.44 0.40 1 -FEP_58-56 7.94 0.17 0 -FEP_33-28 5.28 0.21 0 -FEP_33-43 7.13 0.24 0 -FEP_38-40 0.94 0.43 0 -FEP_23-62 16.82 0.22 0 -FEP_35-52 -2.05 0.29 0 -FEP_57-42 -32.69 0.29 0 -FEP_64-63 -9.31 0.17 0 -FEP_33-35 0.58 0.14 0 -FEP_58-53 -29.67 0.16 0 -FEP_60-67 17.92 0.14 1 -FEP_38-30 -3.13 0.60 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/20rep-MFP-water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/20rep-MFP-water.txt deleted file mode 100755 index d90d1712..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/20rep-MFP-water.txt +++ /dev/null @@ -1,75 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_50-37 -8.70 0.07 0 -FEP_23-64 -4.49 0.10 0 -FEP_39-27 -4.59 0.44 0 -FEP_57-56 -7.97 0.06 0 -FEP_30-40 7.91 0.59 9 -FEP_62-64 -21.82 0.18 0 -FEP_30-27 0.74 0.07 0 -FEP_48-28 -5.07 0.22 0 -FEP_41-27 -4.95 0.70 7 -FEP_54-42 4.33 0.04 0 -FEP_61-60 -16.05 0.15 0 -FEP_26-68 -9.42 0.12 0 -FEP_32-27 2.28 0.08 0 -FEP_48-42 3.76 0.17 0 -FEP_33-42 10.18 0.18 0 -FEP_29-42 -11.51 0.23 0 -FEP_65-63 -3.25 0.10 0 -FEP_47-43 37.11 0.15 0 -FEP_65-60 1.51 0.07 0 -FEP_50-49 -1.36 0.07 0 -FEP_33-40 11.97 0.74 4 -FEP_32-30 1.59 0.10 0 -FEP_61-63 -20.88 0.14 0 -FEP_33-27 4.29 0.06 0 -FEP_40-27 -6.96 0.55 10 -FEP_33-46 -0.99 0.10 0 -FEP_28-29 20.72 0.26 0 -FEP_33-36 2.89 0.08 0 -FEP_35-49 9.47 0.18 0 -FEP_63-60 4.80 0.06 0 -FEP_39-41 -0.38 0.15 0 -FEP_66-64 -3.46 0.24 0 -FEP_28-45 0.95 0.10 0 -FEP_32-41 7.72 0.64 3 -FEP_32-39 6.72 0.39 0 -FEP_33-37 3.40 0.20 0 -FEP_46-43 7.78 0.04 0 -FEP_45-42 7.34 0.08 0 -FEP_44-42 -1.25 0.14 0 -FEP_31-34 2.43 0.19 0 -FEP_33-44 11.93 0.13 0 -FEP_33-30 4.05 0.15 0 -FEP_51-54 -13.81 0.30 0 -FEP_40-41 -3.45 0.30 0 -FEP_33-47 -30.82 0.21 0 -FEP_35-36 1.60 0.07 0 -FEP_37-53 -5.55 0.16 0 -FEP_33-41 7.38 0.48 5 -FEP_38-27 -5.48 0.39 1 -FEP_35-37 2.44 0.17 0 -FEP_68-64 -15.11 0.27 0 -FEP_54-64 17.97 0.07 0 -FEP_31-30 -3.32 0.14 0 -FEP_33-34 9.31 0.15 0 -FEP_33-39 8.00 0.20 0 -FEP_52-53 0.23 0.20 0 -FEP_33-32 1.91 0.08 0 -FEP_26-67 -9.21 0.21 0 -FEP_38-39 -0.14 0.34 0 -FEP_51-42 -9.40 0.16 0 -FEP_66-62 18.22 0.20 0 -FEP_33-38 11.04 0.53 0 -FEP_58-56 7.05 0.17 0 -FEP_33-28 2.37 0.22 0 -FEP_33-43 7.00 0.14 0 -FEP_38-40 0.67 0.26 0 -FEP_23-62 16.99 0.13 0 -FEP_35-52 -3.37 0.19 0 -FEP_57-42 -33.56 0.19 0 -FEP_64-63 -8.08 0.29 0 -FEP_33-35 1.47 0.04 0 -FEP_58-53 -29.52 0.13 0 -FEP_60-67 18.27 0.08 0 -FEP_38-30 -7.02 0.49 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/20rep-MFP-prot.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/20rep-MFP-prot.txt deleted file mode 100755 index 920b302e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/20rep-MFP-prot.txt +++ /dev/null @@ -1,75 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_50-37 -7.75 0.10 0 -FEP_23-64 -4.57 0.22 0 -FEP_39-27 -1.80 0.45 0 -FEP_57-56 -9.77 0.13 0 -FEP_30-40 3.65 0.96 7 -FEP_62-64 -21.90 0.23 0 -FEP_30-27 0.66 0.19 0 -FEP_48-28 -5.23 0.33 0 -FEP_41-27 0.04 0.57 3 -FEP_54-42 5.65 0.14 0 -FEP_61-60 -17.25 0.25 0 -FEP_26-68 -8.03 0.27 0 -FEP_32-27 2.51 0.13 0 -FEP_48-42 -0.29 0.19 1 -FEP_33-42 10.11 0.42 0 -FEP_29-42 -16.60 0.62 0 -FEP_65-63 -2.52 0.18 0 -FEP_47-43 33.35 0.18 0 -FEP_65-60 2.19 0.12 1 -FEP_50-49 -0.69 0.15 1 -FEP_33-40 11.77 0.38 13 -FEP_32-30 1.81 0.22 0 -FEP_61-63 -22.15 0.18 1 -FEP_33-27 5.71 0.14 0 -FEP_40-27 -4.58 0.79 11 -FEP_33-46 -1.10 0.16 0 -FEP_28-29 20.75 0.57 0 -FEP_33-36 2.44 0.17 0 -FEP_35-49 10.31 0.15 1 -FEP_63-60 5.09 0.23 0 -FEP_39-41 -1.38 0.33 0 -FEP_66-64 -2.91 0.31 0 -FEP_28-45 -3.08 0.34 0 -FEP_32-41 3.91 0.63 1 -FEP_32-39 5.85 0.45 0 -FEP_33-37 2.75 0.25 0 -FEP_46-43 7.18 0.11 1 -FEP_45-42 7.02 0.14 0 -FEP_44-42 0.34 0.20 0 -FEP_31-34 2.83 0.32 0 -FEP_33-44 9.88 0.24 0 -FEP_33-30 4.91 0.18 0 -FEP_51-54 -15.41 0.38 0 -FEP_40-41 -1.86 0.56 1 -FEP_33-47 -27.18 0.30 0 -FEP_35-36 1.87 0.09 0 -FEP_37-53 -8.67 0.27 0 -FEP_33-41 6.59 0.74 4 -FEP_38-27 -1.17 0.88 2 -FEP_35-37 3.28 0.19 0 -FEP_68-64 -17.55 0.29 0 -FEP_54-64 18.85 0.16 0 -FEP_31-30 -4.15 0.14 0 -FEP_33-34 11.18 0.24 0 -FEP_33-39 8.94 0.45 0 -FEP_52-53 -3.06 0.40 0 -FEP_33-32 2.67 0.10 0 -FEP_26-67 -11.64 0.17 0 -FEP_38-39 0.80 0.56 0 -FEP_51-42 -9.19 0.24 1 -FEP_66-62 19.47 0.20 0 -FEP_33-38 8.44 0.40 1 -FEP_58-56 7.94 0.17 0 -FEP_33-28 5.28 0.21 0 -FEP_33-43 7.13 0.24 0 -FEP_38-40 0.94 0.43 0 -FEP_23-62 16.82 0.22 0 -FEP_35-52 -2.05 0.29 0 -FEP_57-42 -32.69 0.29 0 -FEP_64-63 -9.31 0.17 0 -FEP_33-35 0.58 0.14 0 -FEP_58-53 -29.67 0.16 0 -FEP_60-67 17.92 0.14 1 -FEP_38-30 -3.13 0.60 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/20rep-MFP-water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/20rep-MFP-water.txt deleted file mode 100755 index d90d1712..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/20rep-MFP-water.txt +++ /dev/null @@ -1,75 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_50-37 -8.70 0.07 0 -FEP_23-64 -4.49 0.10 0 -FEP_39-27 -4.59 0.44 0 -FEP_57-56 -7.97 0.06 0 -FEP_30-40 7.91 0.59 9 -FEP_62-64 -21.82 0.18 0 -FEP_30-27 0.74 0.07 0 -FEP_48-28 -5.07 0.22 0 -FEP_41-27 -4.95 0.70 7 -FEP_54-42 4.33 0.04 0 -FEP_61-60 -16.05 0.15 0 -FEP_26-68 -9.42 0.12 0 -FEP_32-27 2.28 0.08 0 -FEP_48-42 3.76 0.17 0 -FEP_33-42 10.18 0.18 0 -FEP_29-42 -11.51 0.23 0 -FEP_65-63 -3.25 0.10 0 -FEP_47-43 37.11 0.15 0 -FEP_65-60 1.51 0.07 0 -FEP_50-49 -1.36 0.07 0 -FEP_33-40 11.97 0.74 4 -FEP_32-30 1.59 0.10 0 -FEP_61-63 -20.88 0.14 0 -FEP_33-27 4.29 0.06 0 -FEP_40-27 -6.96 0.55 10 -FEP_33-46 -0.99 0.10 0 -FEP_28-29 20.72 0.26 0 -FEP_33-36 2.89 0.08 0 -FEP_35-49 9.47 0.18 0 -FEP_63-60 4.80 0.06 0 -FEP_39-41 -0.38 0.15 0 -FEP_66-64 -3.46 0.24 0 -FEP_28-45 0.95 0.10 0 -FEP_32-41 7.72 0.64 3 -FEP_32-39 6.72 0.39 0 -FEP_33-37 3.40 0.20 0 -FEP_46-43 7.78 0.04 0 -FEP_45-42 7.34 0.08 0 -FEP_44-42 -1.25 0.14 0 -FEP_31-34 2.43 0.19 0 -FEP_33-44 11.93 0.13 0 -FEP_33-30 4.05 0.15 0 -FEP_51-54 -13.81 0.30 0 -FEP_40-41 -3.45 0.30 0 -FEP_33-47 -30.82 0.21 0 -FEP_35-36 1.60 0.07 0 -FEP_37-53 -5.55 0.16 0 -FEP_33-41 7.38 0.48 5 -FEP_38-27 -5.48 0.39 1 -FEP_35-37 2.44 0.17 0 -FEP_68-64 -15.11 0.27 0 -FEP_54-64 17.97 0.07 0 -FEP_31-30 -3.32 0.14 0 -FEP_33-34 9.31 0.15 0 -FEP_33-39 8.00 0.20 0 -FEP_52-53 0.23 0.20 0 -FEP_33-32 1.91 0.08 0 -FEP_26-67 -9.21 0.21 0 -FEP_38-39 -0.14 0.34 0 -FEP_51-42 -9.40 0.16 0 -FEP_66-62 18.22 0.20 0 -FEP_33-38 11.04 0.53 0 -FEP_58-56 7.05 0.17 0 -FEP_33-28 2.37 0.22 0 -FEP_33-43 7.00 0.14 0 -FEP_38-40 0.67 0.26 0 -FEP_23-62 16.99 0.13 0 -FEP_35-52 -3.37 0.19 0 -FEP_57-42 -33.56 0.19 0 -FEP_64-63 -8.08 0.29 0 -FEP_33-35 1.47 0.04 0 -FEP_58-53 -29.52 0.13 0 -FEP_60-67 18.27 0.08 0 -FEP_38-30 -7.02 0.49 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/protein.txt deleted file mode 100755 index 14827f2d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,862 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_67_31 -27.36 0.48 0 -FEP_67_51 -17.11 0.34 0 -FEP_66_49 -14.87 0.48 0 -FEP_65_53 -20.81 0.29 0 -FEP_66_61 10.47 0.36 0 -FEP_65_62 28.09 0.24 0 -FEP_66_32 -23.06 0.41 0 -FEP_66_62 19.63 0.35 0 -FEP_65_51 3.57 0.28 0 -FEP_65_58 7.76 0.29 0 -FEP_66_31 -17.08 0.42 0 -FEP_66_46 -25.77 0.6 0 -FEP_66_65 -9.26 0.13 0 -FEP_66_30 -20.58 0.4 0 -FEP_66_39 -18.9 0.39 0 -FEP_66_37 -22.62 0.37 0 -FEP_66_50 -13.93 0.27 0 -FEP_66_27 -20.89 0.88 0 -FEP_65_60 2.5 0.1 0 -FEP_65_63 -2.75 0.34 0 -FEP_66_34 -12.95 0.54 0 -FEP_66_33 -27.82 1.02 0 -FEP_67_46 -36.99 0.23 0 -FEP_67_47 -64.29 0.43 0 -FEP_67_33 -36.93 0.52 0 -FEP_67_23 -9.01 0.22 0 -FEP_66_45 -21.77 0.29 0 -FEP_67_41 -30.67 0.73 0 -FEP_66_36 -23.19 0.35 0 -FEP_66_56 5.92 0.35 0 -FEP_67_49 -26.2 0.42 0 -FEP_66_28 -19.87 0.43 0 -FEP_66_43 -18.8 0.34 0 -FEP_66_57 16.08 0.18 0 -FEP_67_27 -30.88 0.4 0 -FEP_67_53 -41.63 0.26 0 -FEP_67_30 -31.22 0.33 0 -FEP_67_36 -34.49 0.11 0 -FEP_66_47 -53.28 0.43 0 -FEP_66_38 -19.74 0.51 0 -FEP_65_52 -17.67 0.29 0 -FEP_67_52 -37.86 0.41 0 -FEP_66_26 23.42 0.34 0 -FEP_66_51 -5.44 0.35 0 -FEP_67_40 -27.07 0.62 0 -FEP_67_34 -23.96 0.47 0 -FEP_66_44 -16.31 0.22 0 -FEP_67_38 -29.3 0.76 0 -FEP_66_58 -1.5 0.29 0 -FEP_66_42 -15.76 0.3 0 -FEP_66_54 -21.25 0.32 0 -FEP_67_48 -25.71 0.48 0 -FEP_65_61 19 0.31 0 -FEP_67_42 -27 0.29 0 -FEP_65_54 -11.86 0.21 0 -FEP_67_44 -27.83 0.28 0 -FEP_67_43 -30.12 0.24 0 -FEP_66_41 -18.95 1.08 0 -FEP_67_50 -25.44 0.14 0 -FEP_65_56 15.78 0.39 0 -FEP_67_32 -34.11 0.17 0 -FEP_65_57 25.94 0.36 0 -FEP_67_28 -30.62 0.34 0 -FEP_67_37 -32.75 0.21 0 -FEP_66_64 -3.05 0.34 0 -FEP_66_48 -15.58 0.72 0 -FEP_65_64 6.44 0.33 0 -FEP_67_54 -32.83 0.32 0 -FEP_67_35 -35.9 0.33 0 -FEP_66_63 -12.1 0.32 0 -FEP_67_39 -28.3 0.71 0 -FEP_66_53 -31.17 0.22 0 -FEP_66_60 -6.92 0.34 0 -FEP_66_52 -26.8 0.35 0 -FEP_66_29 0.48 0.59 0 -FEP_67_45 -33.42 0.33 0 -FEP_67_26 12.48 0.21 0 -FEP_67_29 -8.63 0.84 0 -FEP_66_40 -16.26 0.7 5 -FEP_66_35 -24.67 0.36 0 -FEP_66_23 2.14 0.22 0 -FEP_68_28 -35.83 0.58 0 -FEP_68_29 -14.47 0.37 0 -FEP_68_63 -28.03 0.3 0 -FEP_68_54 -37.39 0.25 0 -FEP_67_57 5.12 0.33 0 -FEP_68_36 -38.47 0.36 0 -FEP_68_44 -31.94 0.29 0 -FEP_68_42 -31.38 0.17 0 -FEP_67_64 -14.64 1.04 0 -FEP_67_65 -20.28 0.19 0 -FEP_68_50 -30.36 0.52 0 -FEP_67_66 -11.23 0.19 0 -FEP_68_57 1.03 0.12 0 -FEP_68_56 -8.64 0.23 0 -FEP_68_26 7.21 0.46 0 -FEP_67_61 -0.67 0.3 0 -FEP_68_43 -35.93 0.4 0 -FEP_68_27 -36.51 0.36 0 -FEP_68_64 -17.65 0.27 0 -FEP_68_35 -40.95 0.47 0 -FEP_67_62 7.93 0.23 0 -FEP_68_33 -40.23 0.21 0 -FEP_68_48 -30.73 0.28 0 -FEP_68_39 -33.77 1.1 0 -FEP_68_31 -32.99 0.63 0 -FEP_68_53 -46.52 0.29 0 -FEP_68_45 -38.31 0.19 0 -FEP_68_49 -31.84 0.37 0 -FEP_68_32 -39.22 0.49 0 -FEP_68_67 -4.93 0.32 0 -FEP_67_63 -22.9 0.23 0 -FEP_67_58 -12.02 0.36 0 -FEP_68_62 4.15 0.28 0 -FEP_68_38 -33.67 1.03 0 -FEP_68_40 -30.87 0.83 0 -FEP_68_34 -30.57 0.86 0 -FEP_68_65 -25 0.31 0 -FEP_67_60 -18.26 0.19 0 -FEP_68_60 -22.26 0.42 0 -FEP_68_66 -16.29 0.32 0 -FEP_68_51 -21.28 0.41 0 -FEP_68_47 -69.86 0.55 0 -FEP_68_61 -5.71 0.26 0 -FEP_68_58 -16.82 0.28 0 -FEP_68_37 -37.82 0.39 0 -FEP_68_30 -36.04 0.33 0 -FEP_68_41 -34.89 0.72 0 -FEP_68_23 -13.54 0.31 0 -FEP_68_52 -43.83 0.68 0 -FEP_67_56 -3.59 0.21 1 -FEP_68_46 -42 0.29 0 -FEP_48_26 38.39 0.37 0 -FEP_50_43 -4.67 0.27 0 -FEP_48_47 -38.14 0.22 0 -FEP_49_39 -3.27 0.5 0 -FEP_50_44 -1.92 0.32 0 -FEP_50_40 -2.74 0.52 3 -FEP_48_23 17.99 0.38 0 -FEP_49_37 -6.95 0.21 0 -FEP_49_31 -1.15 0.3 0 -FEP_48_44 0.25 0.41 0 -FEP_49_41 -3.88 0.52 1 -FEP_49_47 -37.57 0.16 0 -FEP_48_45 -6.82 0.33 0 -FEP_49_30 -5.37 0.26 0 -FEP_49_38 -3.31 0.54 0 -FEP_47_37 30.85 0.32 0 -FEP_50_33 -10.92 0.24 0 -FEP_50_28 -5.23 0.29 1 -FEP_47_44 37.99 0.27 0 -FEP_49_29 16.47 0.68 0 -FEP_48_30 -4.94 0.25 0 -FEP_47_46 26.23 0.27 0 -FEP_49_44 -0.55 0.54 0 -FEP_49_23 16.63 0.34 0 -FEP_49_46 -10.98 0.53 0 -FEP_50_34 0.78 0.33 0 -FEP_47_42 36.5 0.34 0 -FEP_48_41 -3.22 0.96 3 -FEP_49_45 -7.77 0.56 0 -FEP_49_32 -7.58 0.32 0 -FEP_47_45 31 0.41 1 -FEP_48_42 -0.22 0.37 0 -FEP_50_37 -7.8 0.21 0 -FEP_47_43 33.26 0.29 0 -FEP_50_42 -0.7 0.26 0 -FEP_49_28 -4.4 0.39 0 -FEP_47_41 34.21 0.58 0 -FEP_48_35 -9.77 0.3 0 -FEP_50_48 -0.37 0.44 0 -FEP_50_39 -3.91 0.4 0 -FEP_48_40 -2.27 0.89 2 -FEP_49_35 -10.24 0.36 0 -FEP_50_29 15.75 0.62 0 -FEP_50_30 -6.25 0.32 0 -FEP_49_27 -4.94 0.32 0 -FEP_50_35 -10.25 0.26 0 -FEP_48_37 -6.92 0.36 0 -FEP_50_26 38.04 0.19 0 -FEP_49_48 1.28 0.98 0 -FEP_48_36 -7.96 0.39 0 -FEP_48_28 -5.58 0.3 0 -FEP_49_34 1.01 0.19 0 -FEP_48_38 -1.49 0.39 0 -FEP_50_41 -4.58 0.3 0 -FEP_50_23 17.1 0.24 0 -FEP_49_36 -7.92 0.24 0 -FEP_48_43 -4.09 0.35 0 -FEP_49_33 -10.51 0.48 0 -FEP_50_46 -12.05 0.34 0 -FEP_47_40 36.84 0.73 3 -FEP_48_29 16.16 0.7 0 -FEP_50_31 -2 0.33 0 -FEP_48_39 -0.39 0.9 0 -FEP_48_34 1.74 0.61 0 -FEP_49_42 -0.47 0.41 0 -FEP_49_40 -1.62 1.36 2 -FEP_48_33 -10.53 0.31 0 -FEP_49_26 38.49 0.43 0 -FEP_50_32 -8.23 0.44 0 -FEP_47_39 35.27 0.51 0 -FEP_48_27 -5.08 0.32 0 -FEP_48_32 -7.57 0.4 0 -FEP_50_45 -7.75 0.29 0 -FEP_49_43 -4.4 0.35 0 -FEP_50_27 -5.22 0.28 0 -FEP_48_31 -1.34 0.38 0 -FEP_50_36 -9.06 0.28 0 -FEP_50_38 -2.78 0.59 0 -FEP_48_46 -11.26 0.31 0 -FEP_47_38 35.89 0.77 0 -FEP_50_47 -38.41 0.24 1 -FEP_51_50 -7.86 0.18 0 -FEP_51_47 -46.8 0.17 0 -FEP_52_50 12.82 0.38 0 -FEP_53_51 25.11 0.6 0 -FEP_53_50 17.02 0.36 0 -FEP_53_27 10.61 0.55 0 -FEP_51_23 8.66 0.34 0 -FEP_51_27 -14.31 0.37 0 -FEP_51_32 -15.96 0.19 1 -FEP_52_36 3.67 0.44 0 -FEP_53_43 11.86 0.25 0 -FEP_53_31 14.67 0.37 0 -FEP_52_27 6.98 0.53 0 -FEP_51_33 -20.77 0.55 1 -FEP_53_40 14.09 0.86 6 -FEP_51_46 -20.21 0.45 0 -FEP_53_23 33.63 0.33 0 -FEP_51_34 -7.83 0.34 0 -FEP_50_49 -1.14 0.26 0 -FEP_51_40 -12.03 0.44 0 -FEP_52_45 5.04 0.53 0 -FEP_51_31 -10.64 0.34 0 -FEP_53_36 8.58 0.35 0 -FEP_53_28 11.03 0.51 0 -FEP_51_38 -11.39 0.59 0 -FEP_53_49 15.93 0.57 0 -FEP_53_42 14.97 0.33 0 -FEP_52_26 50.52 0.28 0 -FEP_51_29 5.52 0.6 0 -FEP_52_28 7.55 0.34 0 -FEP_51_43 -13.41 0.3 0 -FEP_53_45 8.3 0.42 0 -FEP_51_26 29.29 0.41 0 -FEP_52_37 5.03 0.35 0 -FEP_52_34 13.46 0.28 0 -FEP_52_46 0.76 0.31 0 -FEP_51_42 -9.12 0.32 0 -FEP_51_35 -18.76 0.23 0 -FEP_51_37 -16.32 0.28 1 -FEP_51_28 -14.76 0.31 0 -FEP_52_35 2.05 0.38 0 -FEP_52_40 10.21 1.12 4 -FEP_52_41 8.55 0.91 0 -FEP_53_37 8.51 0.17 0 -FEP_52_48 12.07 0.39 0 -FEP_51_44 -10.38 0.25 0 -FEP_52_39 9.8 0.75 0 -FEP_51_39 -11.49 0.91 0 -FEP_53_46 5.27 0.36 0 -FEP_53_47 -22.46 0.48 0 -FEP_52_29 29.02 0.73 0 -FEP_52_49 11.46 0.36 0 -FEP_51_30 -15.2 0.34 0 -FEP_52_23 29.01 0.45 0 -FEP_52_31 11.05 0.24 0 -FEP_52_51 20.74 0.45 0 -FEP_51_36 -18.39 0.58 0 -FEP_53_34 16.64 0.77 0 -FEP_53_33 4.57 0.4 0 -FEP_53_29 31.52 0.31 0 -FEP_51_45 -16.16 0.52 0 -FEP_51_48 -9.7 0.34 0 -FEP_52_30 6.09 0.38 0 -FEP_52_44 11.42 0.44 0 -FEP_52_32 4.53 0.34 0 -FEP_53_35 6.36 0.3 0 -FEP_52_43 7.08 0.44 0 -FEP_53_39 14.43 0.93 0 -FEP_52_42 11 0.54 0 -FEP_52_38 11.67 0.67 0 -FEP_53_41 12.3 0.89 1 -FEP_51_41 -13.56 0.46 0 -FEP_53_38 12.85 1.32 1 -FEP_51_49 -9.92 0.3 1 -FEP_53_48 14.53 0.68 0 -FEP_53_44 13.74 0.25 0 -FEP_53_26 53.55 0.25 0 -FEP_53_32 7.39 0.81 0 -FEP_52_33 2.27 0.44 0 -FEP_52_47 -25.75 0.32 0 -FEP_53_30 9.55 0.49 0 -FEP_56_34 -21.04 0.25 0 -FEP_56_44 -22.61 0.36 0 -FEP_56_28 -28.38 0.86 0 -FEP_56_37 -28.97 0.37 0 -FEP_54_51 14.39 0.67 0 -FEP_54_40 2.18 1.25 8 -FEP_57_35 -42.22 0.33 1 -FEP_56_54 -29.67 0.77 1 -FEP_57_36 -40.59 0.45 0 -FEP_56_48 -21.89 0.4 0 -FEP_54_50 7.34 0.52 0 -FEP_56_46 -33.2 0.28 0 -FEP_54_29 21.74 0.53 0 -FEP_56_35 -31.63 0.35 0 -FEP_54_42 6.16 0.17 0 -FEP_54_39 3.26 0.88 0 -FEP_56_38 nan nan 9 -FEP_54_34 7.71 0.5 0 -FEP_56_52 -33.37 0.32 0 -FEP_56_30 -27.41 0.41 0 -FEP_56_29 -5.48 0.92 0 -FEP_54_47 -30.86 0.5 0 -FEP_56_36 -30.5 0.38 0 -FEP_57_41 -36.16 0.76 0 -FEP_54_45 -1.56 0.24 0 -FEP_54_32 0.52 0.95 0 -FEP_54_43 3.52 0.6 0 -FEP_56_26 16.43 0.29 0 -FEP_56_31 -23.6 0.31 0 -FEP_57_32 -39.38 0.56 0 -FEP_56_33 -32.27 0.24 0 -FEP_54_30 1.85 0.2 0 -FEP_53_52 3.89 0.26 0 -FEP_54_28 1.82 0.47 0 -FEP_56_43 -26.38 0.23 0 -FEP_57_42 -32.32 0.41 0 -FEP_54_23 24.01 0.22 0 -FEP_54_38 3.87 0.78 0 -FEP_54_52 -5.97 0.43 0 -FEP_57_23 -14.11 0.27 0 -FEP_57_44 -32.98 0.34 0 -FEP_57_39 -32.58 0.41 0 -FEP_57_27 -36.84 0.34 0 -FEP_56_49 -22.89 0.4 0 -FEP_54_36 -1.56 0.4 0 -FEP_56_40 -23 0.59 0 -FEP_57_34 -31.11 0.52 0 -FEP_56_42 -24.08 1.14 1 -FEP_57_43 -36.34 0.43 0 -FEP_56_32 -29.86 0.37 0 -FEP_54_44 4.85 0.37 0 -FEP_54_48 7.06 0.37 0 -FEP_57_26 5.62 0.3 0 -FEP_56_41 -27 0.39 0 -FEP_54_53 -8.86 0.25 0 -FEP_56_47 -59.99 0.38 0 -FEP_57_33 -42.45 0.27 0 -FEP_56_27 -27.02 0.55 0 -FEP_57_45 -38.53 0.3 0 -FEP_54_33 -4.1 0.98 2 -FEP_54_31 4.86 0.57 0 -FEP_54_26 44.44 0.2 0 -FEP_54_37 -0.17 0.53 0 -FEP_56_51 -12.71 0.22 0 -FEP_56_45 -29.13 0.35 0 -FEP_57_38 -33.08 0.99 0 -FEP_54_41 3.26 0.93 2 -FEP_57_29 -16.58 0.37 0 -FEP_57_28 -36.64 0.39 0 -FEP_57_40 -32.86 0.48 0 -FEP_54_27 0.84 0.84 0 -FEP_54_49 6.4 0.45 0 -FEP_56_50 -21.42 0.24 0 -FEP_57_37 -38.1 0.26 0 -FEP_57_31 -33.3 0.65 0 -FEP_54_46 -4.49 0.38 0 -FEP_54_35 -2.44 0.52 0 -FEP_57_30 -38.11 0.5 0 -FEP_56_53 -37.93 0.27 1 -FEP_56_39 -25.46 0.47 0 -FEP_56_23 -4.92 0.45 1 -FEP_58_48 -14.17 0.41 0 -FEP_64_27 -17.3 0.59 0 -FEP_60_28 -12.56 0.35 0 -FEP_60_50 -8.06 0.33 0 -FEP_60_34 -8.11 0.55 0 -FEP_63_41 -7.32 0.76 1 -FEP_65_27 -10.13 0.5 0 -FEP_63_52 -15.36 0.33 0 -FEP_63_23 13.71 0.38 0 -FEP_64_63 -9.47 0.26 0 -FEP_64_26 26.07 0.56 0 -FEP_62_52 -46.25 0.19 0 -FEP_64_56 7.86 1.24 0 -FEP_61_26 12.69 0.26 1 -FEP_61_44 -25.46 0.34 0 -FEP_64_47 -49.67 0.63 0 -FEP_63_49 -2.69 0.46 0 -FEP_62_40 -36.34 0.61 0 -FEP_60_26 29.72 0.2 0 -FEP_64_40 -13.68 0.57 0 -FEP_61_28 -30.49 0.32 1 -FEP_62_34 -34.04 0.23 0 -FEP_60_49 -8.04 0.27 0 -FEP_60_42 -9.33 0.37 0 -FEP_62_47 -72.91 0.29 0 -FEP_58_56 7.59 0.24 0 -FEP_62_33 -44.38 0.52 0 -FEP_61_58 -11.45 0.31 0 -FEP_63_33 -13.46 0.28 0 -FEP_62_44 -35.68 0.36 0 -FEP_63_34 -1.09 0.59 0 -FEP_60_44 -8.74 0.32 0 -FEP_62_58 -19.77 0.36 0 -FEP_58_38 -18.81 0.7 0 -FEP_60_48 -8.22 0.5 0 -FEP_65_33 -16.15 0.6 0 -FEP_62_49 -34.46 0.26 0 -FEP_63_42 -3.68 0.52 0 -FEP_63_43 -6.28 0.43 0 -FEP_65_42 -6.63 0.18 0 -FEP_63_31 -4.32 0.42 0 -FEP_63_45 -10.02 0.49 0 -FEP_62_39 -36.2 0.67 0 -FEP_61_50 -24.66 0.14 0 -FEP_63_35 -13.22 0.46 0 -FEP_64_51 -3.72 0.24 0 -FEP_65_45 -13.11 0.5 0 -FEP_61_45 -33.53 0.43 0 -FEP_64_43 -15.05 0.49 0 -FEP_62_48 -35.06 0.32 0 -FEP_58_23 3.4 0.34 0 -FEP_60_30 -13.52 0.24 0 -FEP_63_32 -11.09 0.56 0 -FEP_64_41 -16.83 0.59 0 -FEP_62_32 -41.74 0.26 0 -FEP_64_38 -13.98 0.79 1 -FEP_61_34 -23.75 0.37 0 -FEP_64_37 -20.07 0.33 0 -FEP_61_35 -34.67 0.46 0 -FEP_64_42 -12.81 0.29 0 -FEP_61_29 -9.8 0.65 0 -FEP_63_54 -9.41 0.18 0 -FEP_60_33 -18.66 0.21 0 -FEP_64_58 1.68 0.13 0 -FEP_60_40 -8.72 0.73 0 -FEP_60_51 1.37 0.23 0 -FEP_61_38 -27.41 0.49 0 -FEP_63_29 12 0.54 0 -FEP_64_57 19.04 0.3 0 -FEP_62_54 -39.53 0.64 0 -FEP_58_41 -17.97 0.83 1 -FEP_65_29 10.16 0.46 0 -FEP_60_46 -19.19 0.28 0 -FEP_57_56 -10.03 0.15 0 -FEP_57_54 -37.78 0.23 0 -FEP_62_50 -33.84 0.24 0 -FEP_60_29 8.84 0.57 0 -FEP_65_37 -13.7 0.22 0 -FEP_65_46 -17.1 0.23 0 -FEP_60_38 -10.85 1.04 0 -FEP_63_46 -14.26 0.43 0 -FEP_64_52 -24.44 0.31 0 -FEP_62_38 -36.25 0.62 0 -FEP_58_39 -16.81 0.93 0 -FEP_61_30 -30.86 0.41 0 -FEP_60_45 -15.77 0.3 0 -FEP_63_36 -11.28 0.58 0 -FEP_61_47 -63.4 0.26 0 -FEP_61_57 5.46 0.23 0 -FEP_64_23 4.41 0.3 0 -FEP_63_50 -2.66 0.51 0 -FEP_61_31 -27.1 0.46 0 -FEP_64_31 -13.14 0.4 0 -FEP_60_54 -14.37 0.35 0 -FEP_63_61 22.2 0.29 0 -FEP_58_45 -21.94 0.28 0 -FEP_61_60 -17.79 0.44 0 -FEP_58_31 -14.46 0.3 0 -FEP_58_26 24.33 0.42 0 -FEP_61_53 -41.19 0.58 2 -FEP_62_36 -42.06 0.41 0 -FEP_60_41 -12.62 0.54 0 -FEP_58_27 -18.17 0.33 0 -FEP_60_36 -16.3 0.33 0 -FEP_63_37 -10.72 0.36 0 -FEP_61_36 -33.66 0.21 0 -FEP_63_57 28.09 0.36 0 -FEP_64_45 -20.75 0.34 0 -FEP_64_46 -22.62 0.46 0 -FEP_62_29 -19.96 0.64 0 -FEP_62_26 4.29 0.25 0 -FEP_58_36 -22.96 0.4 0 -FEP_63_26 34.88 0.45 0 -FEP_65_30 -10.95 0.29 0 -FEP_63_27 -8.08 0.37 0 -FEP_61_46 -35.84 0.46 0 -FEP_63_28 -7.78 0.51 0 -FEP_61_51 -15.7 0.25 0 -FEP_63_48 -4.15 0.32 1 -FEP_65_38 -9.32 1.05 0 -FEP_57_48 -32.72 0.41 0 -FEP_60_53 -23.7 0.2 0 -FEP_63_58 10.43 0.25 0 -FEP_64_53 -28.91 0.66 0 -FEP_60_43 -11.78 0.28 0 -FEP_58_49 -14.19 0.48 0 -FEP_60_57 23.54 0.48 0 -FEP_61_37 -31.96 0.26 0 -FEP_64_44 -13.62 0.29 0 -FEP_58_42 -14.65 0.23 0 -FEP_60_27 -13.39 0.4 0 -FEP_64_49 -12.76 0.51 0 -FEP_61_39 -27.53 0.62 0 -FEP_63_53 -19.06 0.12 0 -FEP_64_34 -11.5 0.48 1 -FEP_60_37 -15.34 0.35 0 -FEP_58_51 -5.43 0.29 0 -FEP_61_42 -23.74 1.01 1 -FEP_58_50 -13.12 0.27 0 -FEP_64_35 -22.95 0.51 0 -FEP_65_39 -9.56 0.58 0 -FEP_61_40 -25.67 0.54 0 -FEP_58_52 -27.01 1.09 0 -FEP_61_27 -29.82 0.39 0 -FEP_65_47 -43.67 0.33 0 -FEP_62_27 -39.54 0.41 0 -FEP_57_49 -32.56 0.38 0 -FEP_65_23 11.46 0.21 0 -FEP_64_50 -12.54 0.51 0 -FEP_62_57 -3.32 0.27 0 -FEP_58_34 -12.76 1.09 0 -FEP_65_44 -6.8 0.36 1 -FEP_58_43 -19.62 0.46 0 -FEP_58_30 -19.57 0.35 0 -FEP_63_60 5.06 0.37 0 -FEP_58_29 1.31 0.38 0 -FEP_62_41 -37.67 0.29 1 -FEP_63_39 -5.86 0.63 0 -FEP_65_31 -6.95 0.39 0 -FEP_60_32 -15.64 0.55 0 -FEP_65_49 -6.14 0.44 0 -FEP_61_56 -3.43 0.17 0 -FEP_60_23 9 0.39 0 -FEP_62_46 -45.88 0.34 0 -FEP_61_52 -36.92 0.56 0 -FEP_57_52 -43.98 0.43 0 -FEP_65_34 -4.98 0.43 0 -FEP_58_40 -14.05 0.4 0 -FEP_64_48 -12.72 0.38 0 -FEP_65_50 -5.05 0.21 0 -FEP_60_31 -9.05 0.48 0 -FEP_58_54 -20.5 0.21 0 -FEP_65_36 -13.86 0.34 0 -FEP_65_41 -10.18 0.58 0 -FEP_60_47 -46.75 0.69 0 -FEP_60_39 -10.34 0.68 0 -FEP_64_62 22.66 0.26 0 -FEP_61_54 -29.21 1.04 1 -FEP_63_30 -8.75 0.59 0 -FEP_63_40 -4.83 1 1 -FEP_62_60 -26.32 0.35 0 -FEP_58_47 -51.75 0.58 0 -FEP_58_35 -24.17 0.43 0 -FEP_63_38 -7.21 0.55 0 -FEP_58_28 -17.83 0.42 0 -FEP_61_32 -32.91 0.48 0 -FEP_64_60 -4.92 0.33 0 -FEP_64_39 -16.74 0.96 1 -FEP_65_28 -10.39 0.48 0 -FEP_62_56 -12.59 0.43 0 -FEP_60_56 14.02 0.3 1 -FEP_57_53 -47.34 0.34 0 -FEP_62_37 -41.25 0.23 0 -FEP_61_43 -29.82 0.32 0 -FEP_57_50 -31.37 0.35 0 -FEP_62_45 -42.07 0.3 0 -FEP_60_35 -18.09 0.22 0 -FEP_64_28 -17.7 0.33 0 -FEP_60_58 5.51 0.22 0 -FEP_65_26 32.26 0.21 1 -FEP_61_33 -36.55 0.31 0 -FEP_64_29 4.05 1.04 0 -FEP_65_48 -6.23 0.28 0 -FEP_62_42 -34.91 0.5 0 -FEP_64_32 -21.02 1.35 0 -FEP_62_30 -40.02 0.22 0 -FEP_57_51 -22.85 0.25 0 -FEP_65_32 -13.22 0.54 1 -FEP_63_51 5.96 0.44 0 -FEP_62_51 -24.82 0.12 0 -FEP_58_32 -22.49 0.51 1 -FEP_65_40 -6.64 0.89 5 -FEP_65_43 -10.65 0.29 1 -FEP_62_31 -35.77 0.29 0 -FEP_58_33 -24.81 0.53 0 -FEP_58_46 -25.88 0.33 0 -FEP_65_35 -15.06 0.28 0 -FEP_63_47 -39.65 0.38 0 -FEP_58_37 -20.99 0.36 0 -FEP_57_46 -43.94 0.47 0 -FEP_64_30 -17.83 0.29 0 -FEP_64_33 -23.01 0.75 0 -FEP_63_62 31.2 0.33 0 -FEP_62_23 -16.79 0.28 0 -FEP_62_53 -49.97 0.48 0 -FEP_63_56 18.53 0.3 0 -FEP_61_49 -25.89 0.41 0 -FEP_64_61 12.59 0.35 0 -FEP_58_57 17.68 0.31 0 -FEP_60_52 -19.66 0.44 0 -FEP_57_47 -69.44 0.47 0 -FEP_62_43 -38.23 0.31 0 -FEP_61_23 -7.85 0.32 0 -FEP_61_41 -29.64 0.88 0 -FEP_61_48 -25.28 0.38 0 -FEP_58_44 -15.95 0.37 0 -FEP_64_54 -19.1 0.21 0 -FEP_63_44 -3.86 0.36 1 -FEP_62_61 -9.16 0.21 0 -FEP_62_28 -40.11 0.57 0 -FEP_58_53 -29.87 0.28 0 -FEP_62_35 -44.56 0.42 0 -FEP_64_36 -21.5 0.43 0 -FEP_41_35 -5.1 1.13 3 -FEP_40_31 -2.04 1.83 6 -FEP_37_34 8.8 0.21 0 -FEP_42_26 39.32 0.37 0 -FEP_46_37 3.87 0.19 0 -FEP_30_26 43.72 0.39 0 -FEP_39_30 -3.65 0.98 0 -FEP_37_29 24.24 0.61 0 -FEP_35_26 47.78 0.38 0 -FEP_40_36 -10.82 0.63 3 -FEP_37_36 -0.1 0.36 0 -FEP_45_41 2.72 1.28 0 -FEP_42_28 -5 0.32 0 -FEP_46_23 28.71 0.32 0 -FEP_45_36 -0.7 0.24 0 -FEP_33_26 47.62 0.42 0 -FEP_37_32 -0.42 0.41 0 -FEP_36_31 6.76 0.18 0 -FEP_46_36 2.7 0.17 0 -FEP_29_27 -21.77 0.52 0 -FEP_39_34 3.95 0.53 0 -FEP_42_38 -3.56 0.71 0 -FEP_47_35 27.98 0.38 0 -FEP_42_41 -3.42 0.68 0 -FEP_43_42 3.08 0.55 0 -FEP_33_29 28.96 0.71 0 -FEP_39_37 -3.79 0.55 0 -FEP_44_31 -0.96 0.37 0 -FEP_42_36 -6.69 0.92 0 -FEP_34_29 15.88 0.84 0 -FEP_38_30 -3.43 0.98 0 -FEP_43_39 -0.28 0.6 0 -FEP_40_39 -2.19 0.96 0 -FEP_40_30 -5.8 0.99 5 -FEP_45_27 2.38 0.67 0 -FEP_44_29 16.6 0.68 0 -FEP_46_30 5.49 0.18 0 -FEP_32_26 45.47 0.3 0 -FEP_47_33 28.1 0.32 0 -FEP_45_38 4.81 1.19 1 -FEP_32_28 2.67 0.37 0 -FEP_40_26 39.91 0.54 0 -FEP_36_32 0.14 0.24 0 -FEP_35_27 4.15 0.29 0 -FEP_43_33 -5.91 0.31 0 -FEP_45_32 -0.55 0.43 0 -FEP_32_30 1.56 0.26 0 -FEP_45_23 25.12 0.32 0 -FEP_46_38 8.21 1.03 1 -FEP_41_28 -1.83 0.92 0 -FEP_42_30 -5.11 0.43 0 -FEP_31_29 16.64 0.32 0 -FEP_46_29 27.15 0.94 0 -FEP_42_32 -7.7 0.85 0 -FEP_42_35 -8.81 0.18 0 -FEP_45_39 3.41 0.66 0 -FEP_41_34 6.18 0.71 1 -FEP_47_27 33.52 0.39 0 -FEP_37_27 2.99 0.36 0 -FEP_37_31 5.73 0.28 0 -FEP_39_32 -4.47 0.58 1 -FEP_41_37 -1.94 0.31 1 -FEP_39_38 -0.15 1.03 0 -FEP_35_23 28.08 0.35 0 -FEP_40_28 -5.57 2.01 8 -FEP_43_32 -3.33 0.22 1 -FEP_42_40 -1.48 0.86 4 -FEP_44_38 -2.11 1.02 0 -FEP_45_29 23.97 0.62 0 -FEP_46_34 11.98 0.43 0 -FEP_46_41 8.02 1.03 3 -FEP_43_41 -0.75 1.12 1 -FEP_41_31 2.78 0.81 2 -FEP_47_30 32.27 0.24 0 -FEP_45_37 -0.18 0.28 0 -FEP_47_29 54.85 0.77 0 -FEP_27_26 42.23 0.34 0 -FEP_36_34 8.94 0.4 0 -FEP_43_29 20.91 0.87 0 -FEP_42_27 -3.79 0.59 0 -FEP_43_34 5 0.54 0 -FEP_44_30 -5.02 0.6 0 -FEP_38_36 -3.86 0.57 0 -FEP_34_30 -6.07 0.28 0 -FEP_38_35 -6.78 0.81 0 -FEP_40_35 -7.42 0.89 4 -FEP_36_29 24.42 0.41 0 -FEP_36_33 -1.84 0.18 0 -FEP_44_42 0.47 0.33 0 -FEP_37_35 -2.85 0.27 0 -FEP_38_23 20 0.88 0 -FEP_29_28 -21.75 0.55 0 -FEP_36_30 2.3 0.29 0 -FEP_40_32 -4.84 1.32 4 -FEP_47_26 75.99 0.28 0 -FEP_46_28 6.34 0.3 0 -FEP_30_29 22.19 0.66 0 -FEP_35_29 25.81 0.52 0 -FEP_33_27 5.77 0.16 0 -FEP_30_28 0.96 0.47 0 -FEP_34_28 -6.02 0.51 0 -FEP_36_28 3.76 0.41 0 -FEP_44_26 39.8 0.39 0 -FEP_31_28 -2.96 0.24 0 -FEP_46_39 8.87 0.48 0 -FEP_31_27 -3.2 0.32 0 -FEP_34_26 36.38 0.2 0 -FEP_45_33 -2.27 0.17 0 -FEP_45_34 8.56 0.49 0 -FEP_34_31 -1.96 0.2 0 -FEP_34_33 -11.19 0.27 0 -FEP_41_26 41.26 0.55 0 -FEP_43_40 2.79 1 3 -FEP_47_34 38.27 0.34 0 -FEP_39_35 -7.36 0.56 0 -FEP_46_45 3.06 0.32 1 -FEP_39_27 -1.48 0.95 1 -FEP_29_23 1.22 0.73 0 -FEP_45_40 5.37 0.57 0 -FEP_36_26 46.12 0.27 0 -FEP_38_26 39.54 0.38 0 -FEP_42_29 16.45 0.48 0 -FEP_45_30 1.77 0.31 0 -FEP_38_31 1.2 0.87 0 -FEP_34_23 16.7 0.31 0 -FEP_26_23 -21.2 0.4 0 -FEP_44_33 -10.78 0.47 0 -FEP_37_28 2.16 0.37 0 -FEP_30_27 0.85 0.24 0 -FEP_42_39 -2.95 0.61 0 -FEP_37_23 25.13 0.27 0 -FEP_40_34 3.2 0.82 3 -FEP_41_29 19.87 1.39 4 -FEP_45_43 3.6 0.51 0 -FEP_33_32 3.07 0.29 0 -FEP_40_27 -5.73 1.04 6 -FEP_36_35 -1.56 0.14 0 -FEP_47_31 36.59 0.25 0 -FEP_43_27 -0.59 0.46 0 -FEP_37_30 2.01 0.3 0 -FEP_43_31 3.14 0.38 0 -FEP_45_26 46.06 0.3 0 -FEP_44_23 18.38 0.24 0 -FEP_41_23 22.62 0.83 1 -FEP_47_36 29.01 0.33 0 -FEP_41_36 -4.51 0.54 2 -FEP_35_33 -0.81 0.24 0 -FEP_46_35 1.4 0.13 0 -FEP_40_33 -10.12 1.34 5 -FEP_44_28 -4.75 0.47 0 -FEP_44_34 1.92 0.43 0 -FEP_46_26 49.04 0.31 0 -FEP_40_23 19.21 1.27 5 -FEP_45_42 7.12 0.16 1 -FEP_38_33 -9.38 1.26 1 -FEP_38_27 -0.79 0.81 3 -FEP_46_32 3.29 0.16 0 -FEP_42_23 18.28 0.2 0 -FEP_28_27 1.04 0.31 0 -FEP_37_26 45.56 0.26 0 -FEP_43_30 -2.17 0.56 0 -FEP_35_30 3.96 0.23 0 -FEP_41_39 0.82 0.64 0 -FEP_44_40 -0.59 0.97 0 -FEP_39_23 21.22 0.64 0 -FEP_32_23 25.22 0.43 0 -FEP_41_32 -2.03 0.4 3 -FEP_38_28 -1.46 0.92 0 -FEP_43_38 -0.39 0.91 0 -FEP_36_27 2.79 0.45 0 -FEP_38_29 18.19 0.47 0 -FEP_31_30 -4.05 0.17 0 -FEP_47_23 55.93 0.42 0 -FEP_45_28 1.79 0.61 0 -FEP_44_39 0.03 1.03 0 -FEP_27_23 22.57 0.64 0 -FEP_43_37 -2.74 0.29 0 -FEP_46_43 7.24 0.14 0 -FEP_39_36 -4.39 0.64 0 -FEP_35_32 1.64 0.17 0 -FEP_35_28 4.95 0.46 0 -FEP_39_28 -3.88 1.14 2 -FEP_44_43 -3.79 0.27 0 -FEP_44_35 -9.15 0.26 0 -FEP_38_34 2.94 1.16 1 -FEP_34_32 -8.68 0.37 0 -FEP_32_29 22.37 0.45 0 -FEP_41_40 0.53 0.73 0 -FEP_44_41 -4.45 0.45 2 -FEP_44_27 -4.45 0.35 0 -FEP_41_30 -2.26 0.81 5 -FEP_41_38 0.03 0.34 0 -FEP_39_31 1.08 0.56 1 -FEP_42_33 -9.83 0.54 1 -FEP_31_26 39.26 0.37 0 -FEP_46_44 10.07 0.32 0 -FEP_36_23 25.54 0.39 0 -FEP_28_23 23.3 0.44 0 -FEP_41_27 0.01 1.09 3 -FEP_46_33 0.7 0.25 0 -FEP_43_36 -4.01 0.2 0 -FEP_46_31 9.99 0.25 0 -FEP_45_44 6.3 0.15 0 -FEP_43_23 21.47 0.57 0 -FEP_43_35 -5.35 0.21 0 -FEP_33_31 8.77 0.27 0 -FEP_39_29 17.95 0.7 0 -FEP_40_38 -0.75 0.49 0 -FEP_35_31 7.95 0.21 0 -FEP_28_26 43.3 0.41 0 -FEP_43_26 41.81 0.5 0 -FEP_38_32 -1.94 0.39 4 -FEP_46_40 10.53 1.31 4 -FEP_39_33 -7.68 0.54 0 -FEP_45_31 6.01 0.36 0 -FEP_38_37 -4.61 0.66 0 -FEP_44_32 -6.69 0.42 0 -FEP_42_34 1.37 0.5 1 -FEP_33_23 28.64 0.44 0 -FEP_40_29 18.53 1.02 0 -FEP_35_34 10.85 0.35 0 -FEP_42_37 -6.77 0.33 0 -FEP_47_28 33.15 0.2 0 -FEP_46_27 6.49 0.47 0 -FEP_47_32 30.04 0.17 0 -FEP_41_33 -6.26 1.22 0 -FEP_42_31 -0.19 0.34 0 -FEP_30_23 23.63 0.51 0 -FEP_39_26 40.52 0.43 0 -FEP_44_37 -5.59 0.23 0 -FEP_31_23 19.28 0.52 0 -FEP_33_28 5.73 0.53 0 -FEP_34_27 -5.52 0.46 0 -FEP_32_31 6.45 0.4 0 -FEP_32_27 2.47 0.19 0 -FEP_45_35 -3.06 0.37 0 -FEP_44_36 -8.19 0.41 0 -FEP_40_37 -6.11 0.69 7 -FEP_37_33 -2.44 0.3 0 -FEP_43_28 -0.35 0.32 0 -FEP_46_42 9.91 0.19 0 -FEP_33_30 5.46 0.25 0 -FEP_29_26 21.08 0.42 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/protein_juju.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/protein_juju.txt deleted file mode 100644 index 31693bc3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/protein_juju.txt +++ /dev/null @@ -1,71 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28_48 5.43 0.47 0 -FEP_28_45 -2.36 0.53 0 -FEP_65_60 2.29 0.17 1 -FEP_42_48 0.19 0.22 0 -FEP_28_29 22.17 0.60 0 -FEP_68_26 7.95 0.50 0 -FEP_34_31 -2.42 0.39 0 -FEP_54_68 36.98 0.35 0 -FEP_35_37 2.91 0.30 0 -FEP_37_56 27.15 0.42 0 -FEP_33_53 -4.97 0.50 0 -FEP_54_64 18.36 0.26 0 -FEP_43_47 -33.02 0.27 0 -FEP_27_38 2.05 0.74 0 -FEP_23_62 17.07 0.42 0 -FEP_37_50 7.66 0.06 0 -FEP_63_58 9.81 0.20 0 -FEP_42_51 8.73 0.31 0 -FEP_35_50 10.77 0.25 0 -FEP_28_44 3.44 0.43 0 -FEP_27_30 -1.33 0.16 0 -FEP_27_40 4.17 1.30 5 -FEP_42_44 -0.22 0.19 0 -FEP_38_30 -6.15 1.25 1 -FEP_35_36 1.64 0.13 0 -FEP_27_46 -7.00 0.28 0 -FEP_35_53 -5.45 0.44 0 -FEP_27_41 0.22 0.49 0 -FEP_35_52 -1.97 0.51 0 -FEP_43_46 -7.03 0.21 0 -FEP_53_54 9.47 0.21 0 -FEP_52_53 -3.66 0.50 0 -FEP_54_51 15.74 0.37 0 -FEP_26_67 -12.39 0.28 0 -FEP_27_34 5.16 0.42 0 -FEP_56_57 10.15 0.24 0 -FEP_27_28 0.15 0.27 0 -FEP_30_31 4.15 0.16 0 -FEP_37_60 14.76 0.30 0 -FEP_58_56 7.76 0.19 0 -FEP_27_32 -2.58 0.30 0 -FEP_64_62 22.17 0.30 0 -FEP_27_47 -33.23 0.40 0 -FEP_64_63 -9.67 0.37 0 -FEP_49_50 0.99 0.20 0 -FEP_33_36 2.21 0.20 0 -FEP_62_66 -19.65 0.36 0 -FEP_33_35 0.86 0.20 0 -FEP_42_54 -5.46 0.22 0 -FEP_39_38 -0.05 1.02 0 -FEP_27_43 0.24 0.29 0 -FEP_51_62 24.67 0.13 0 -FEP_37_67 32.43 0.26 0 -FEP_35_49 9.93 0.34 0 -FEP_65_61 19.31 0.25 0 -FEP_42_29 16.92 0.38 0 -FEP_32_33 -2.98 0.25 0 -FEP_64_23 4.89 0.35 0 -FEP_64_66 2.78 0.35 0 -FEP_60_61 17.64 0.39 0 -FEP_41_40 3.07 0.36 0 -FEP_60_63 -4.17 0.32 0 -FEP_28_42 5.62 0.39 0 -FEP_27_33 -5.60 0.15 0 -FEP_27_39 2.68 0.82 0 -FEP_26_57 -7.83 0.53 0 -FEP_50_51 8.38 0.16 0 -FEP_66_65 -9.74 0.28 0 -FEP_42_45 -7.25 0.26 0 -FEP_37_53 -8.22 0.36 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/water.txt deleted file mode 100755 index 61837af7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/water.txt +++ /dev/null @@ -1,862 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_67_31 -32.31 0.12 0 -FEP_67_51 -19.11 0.3 0 -FEP_66_49 -16.75 0.08 0 -FEP_65_53 -20.75 0.1 0 -FEP_66_61 10 0.29 0 -FEP_65_62 25.75 0.17 0 -FEP_66_32 -26.14 0.22 0 -FEP_66_62 18.47 0.16 0 -FEP_65_51 0.56 0.18 0 -FEP_65_58 8.67 0.13 0 -FEP_66_31 -20.23 0.34 0 -FEP_66_46 -28.71 0.19 0 -FEP_66_65 -8.25 0.23 0 -FEP_66_30 -24.1 0.17 0 -FEP_66_39 -20.18 0.34 0 -FEP_66_37 -23.54 0.25 0 -FEP_66_50 -15.25 0.12 0 -FEP_66_27 -23.8 0.21 0 -FEP_65_60 1.55 0.09 0 -FEP_65_63 -3.21 0.07 0 -FEP_66_34 -17.73 0.32 0 -FEP_66_33 -27.32 0.6 1 -FEP_67_46 -40.76 0.15 0 -FEP_67_47 -70.08 0.2 0 -FEP_67_33 -39.2 0.18 0 -FEP_67_23 -10.79 0.16 0 -FEP_66_45 -24 0.1 0 -FEP_67_41 -30.12 1.09 1 -FEP_66_36 -24.91 0.33 0 -FEP_66_56 8.18 0.18 0 -FEP_67_49 -28.45 0.16 0 -FEP_66_28 -25.14 0.26 0 -FEP_66_43 -21.13 0.13 0 -FEP_66_57 16.15 0.16 0 -FEP_67_27 -35.27 0.15 0 -FEP_67_53 -40.97 0.12 0 -FEP_67_30 -35.87 0.25 0 -FEP_67_36 -36.3 0.24 0 -FEP_66_47 -57.85 0.2 0 -FEP_66_38 -16.54 0.5 0 -FEP_65_52 -21.85 0.42 0 -FEP_67_52 -40.88 0.23 0 -FEP_66_26 20.48 0.21 0 -FEP_66_51 -6.82 0.19 0 -FEP_67_40 -29.27 0.25 0 -FEP_67_34 -29.83 0.19 0 -FEP_66_44 -15.89 0.12 0 -FEP_67_38 -29.91 0.23 0 -FEP_66_58 0.56 0.19 0 -FEP_66_42 -17.19 0.12 0 -FEP_66_54 -21.6 0.21 0 -FEP_67_48 -33.07 0.22 0 -FEP_65_61 17.15 0.28 0 -FEP_67_42 -29.25 0.12 0 -FEP_65_54 -13.68 0.14 0 -FEP_67_44 -27.84 0.16 0 -FEP_67_43 -32.82 0.08 0 -FEP_66_41 -19.74 0.35 0 -FEP_67_50 -27.04 0.16 0 -FEP_65_56 16.18 0.43 0 -FEP_67_32 -37.52 0.09 0 -FEP_65_57 24.08 0.17 0 -FEP_67_28 -37.65 0.34 0 -FEP_67_37 -35.79 0.29 0 -FEP_66_64 -3.65 0.12 0 -FEP_66_48 -20.68 0.22 0 -FEP_65_64 3.74 0.15 0 -FEP_67_54 -33.77 0.1 0 -FEP_67_35 -38.14 0.15 0 -FEP_66_63 -10.88 0.29 0 -FEP_67_39 -31.34 0.32 0 -FEP_66_53 -29.18 0.07 0 -FEP_66_60 -6.44 0.12 0 -FEP_66_52 -28.97 0.21 0 -FEP_66_29 -5.76 0.23 0 -FEP_67_45 -36.57 0.12 0 -FEP_67_26 9.32 0.25 0 -FEP_67_29 -17.54 0.36 0 -FEP_66_40 -15.21 1.04 2 -FEP_66_35 -26.32 0.29 0 -FEP_66_23 1.31 0.08 0 -FEP_68_28 -36.9 0.21 0 -FEP_68_29 -18.5 0.48 0 -FEP_68_63 -22.94 0.17 0 -FEP_68_54 -33.37 0.16 0 -FEP_67_57 3.95 0.27 0 -FEP_68_36 -35.54 0.12 0 -FEP_68_44 -27.57 0.09 0 -FEP_68_42 -28.8 0.1 0 -FEP_67_64 -16.61 0.78 0 -FEP_67_65 -20.12 0.1 0 -FEP_68_50 -26.82 0.15 0 -FEP_67_66 -11.87 0.12 0 -FEP_68_57 4.6 0.13 0 -FEP_68_56 -2.79 0.09 0 -FEP_68_26 9.25 0.3 0 -FEP_67_61 -1.9 0.18 0 -FEP_68_43 -32.73 0.1 0 -FEP_68_27 -35.13 0.24 0 -FEP_68_64 -14.95 0.15 0 -FEP_68_35 -37.4 0.18 0 -FEP_67_62 6.46 0.2 0 -FEP_68_33 -39.18 0.19 0 -FEP_68_48 -31.69 0.1 0 -FEP_68_39 -32.01 0.58 0 -FEP_68_31 -32.05 0.15 0 -FEP_68_53 -40.64 0.08 0 -FEP_68_45 -35.73 0.07 0 -FEP_68_49 -28.23 0.12 0 -FEP_68_32 -37.77 0.16 0 -FEP_68_67 0.83 0.29 0 -FEP_67_63 -22.88 0.18 0 -FEP_67_58 -11.22 0.27 0 -FEP_68_62 7.06 0.17 0 -FEP_68_38 -28.9 0.26 0 -FEP_68_40 -28.43 0.4 0 -FEP_68_34 -29.68 0.26 0 -FEP_68_65 -19.87 0.24 0 -FEP_67_60 -18.09 0.17 0 -FEP_68_60 -17.68 0.16 0 -FEP_68_66 -11.8 0.22 0 -FEP_68_51 -18.55 0.2 0 -FEP_68_47 -69.79 0.18 0 -FEP_68_61 -1.49 0.18 0 -FEP_68_58 -10.9 0.21 0 -FEP_68_37 -35.68 0.18 0 -FEP_68_30 -35.63 0.14 0 -FEP_68_41 -31.76 0.4 0 -FEP_68_23 -10.15 0.12 0 -FEP_68_52 -40.58 0.12 0 -FEP_67_56 -3.39 0.14 0 -FEP_68_46 -40.38 0.16 0 -FEP_48_26 41.81 0.22 0 -FEP_50_43 -5.76 0.24 0 -FEP_48_47 -37.61 0.22 0 -FEP_49_39 -1.68 0.28 0 -FEP_50_44 -0.73 0.22 0 -FEP_50_40 -0.38 0.87 0 -FEP_48_23 22.19 0.23 0 -FEP_49_37 -7.22 0.09 0 -FEP_49_31 -3.68 0.23 0 -FEP_48_44 5.08 0.12 0 -FEP_49_41 -1.07 0.52 0 -FEP_49_47 -41.48 0.11 0 -FEP_48_45 -3.73 0.32 0 -FEP_49_30 -6.94 0.16 0 -FEP_49_38 0.25 0.23 0 -FEP_47_37 34.31 0.08 0 -FEP_50_33 -12.03 0.19 0 -FEP_50_28 -10.12 0.11 0 -FEP_47_44 42.73 0.17 0 -FEP_49_29 12.66 0.37 0 -FEP_48_30 -2.97 0.27 0 -FEP_47_46 29.39 0.34 0 -FEP_49_44 0.84 0.14 0 -FEP_49_23 17.66 0.11 0 -FEP_49_46 -12.5 0.13 0 -FEP_50_34 -2.66 0.12 0 -FEP_47_42 40.76 0.12 0 -FEP_48_41 3.23 1.27 2 -FEP_49_45 -7.71 0.11 0 -FEP_49_32 -9.37 0.14 0 -FEP_47_45 35.28 0.88 0 -FEP_48_42 3.74 0.22 0 -FEP_50_37 -8.54 0.09 0 -FEP_47_43 36.95 0.22 0 -FEP_50_42 -2.15 0.15 0 -FEP_49_28 -8.39 0.13 0 -FEP_47_41 38.59 0.5 1 -FEP_48_35 -5.15 0.23 0 -FEP_50_48 -5.03 0.22 0 -FEP_50_39 -2.88 0.68 0 -FEP_48_40 4.27 0.65 4 -FEP_49_35 -9.62 0.21 0 -FEP_50_29 10.42 0.33 0 -FEP_50_30 -8.71 0.18 0 -FEP_49_27 -6.71 0.23 0 -FEP_50_35 -11.1 0.17 0 -FEP_48_37 -3.41 0.1 0 -FEP_50_26 36.23 0.22 0 -FEP_49_48 -3.98 0.24 0 -FEP_48_36 -4.55 0.26 0 -FEP_48_28 -4.86 0.27 0 -FEP_49_34 -1.46 0.14 0 -FEP_48_38 3.94 0.65 0 -FEP_50_41 -3.87 0.41 0 -FEP_50_23 16.66 0.19 0 -FEP_49_36 -7.89 0.13 0 -FEP_48_43 -0.3 0.13 0 -FEP_49_33 -10.63 0.16 0 -FEP_50_46 -13.67 0.21 0 -FEP_47_40 44.08 0.54 4 -FEP_48_29 16.26 0.18 0 -FEP_50_31 -5.28 0.21 0 -FEP_48_39 1.46 0.32 0 -FEP_48_34 2.65 0.18 0 -FEP_49_42 -0.51 0.27 0 -FEP_49_40 2.13 0.92 1 -FEP_48_33 -6.89 0.31 0 -FEP_49_26 37.63 0.13 0 -FEP_50_32 -10.67 0.16 0 -FEP_47_39 38.49 0.62 0 -FEP_48_27 -2.6 0.32 0 -FEP_48_32 -4.72 0.28 0 -FEP_50_45 -8.91 0.18 0 -FEP_49_43 -4.5 0.14 0 -FEP_50_27 -8.11 0.25 0 -FEP_48_31 -0.18 0.17 0 -FEP_50_36 -8.93 0.22 0 -FEP_50_38 -1.34 0.23 0 -FEP_48_46 -7.63 0.21 0 -FEP_47_38 41.39 0.4 0 -FEP_50_47 -42.8 0.16 0 -FEP_51_50 -7.71 0.07 0 -FEP_51_47 -51.27 0.26 0 -FEP_52_50 13.57 0.21 0 -FEP_53_51 21.66 0.36 0 -FEP_53_50 13.7 0.17 0 -FEP_53_27 5.93 0.06 0 -FEP_51_23 8.77 0.16 0 -FEP_51_27 -16.22 0.21 0 -FEP_51_32 -18.33 0.4 0 -FEP_52_36 4.55 0.35 0 -FEP_53_43 8.19 0.1 0 -FEP_53_31 8.68 0.26 0 -FEP_52_27 5.3 0.29 0 -FEP_51_33 -20.51 0.29 0 -FEP_53_40 14.3 1.27 1 -FEP_51_46 -21.88 0.26 0 -FEP_53_23 30.11 0.11 0 -FEP_51_34 -10.69 0.25 0 -FEP_50_49 -1.49 0.1 0 -FEP_51_40 -8.6 0.63 0 -FEP_52_45 5.17 0.47 0 -FEP_51_31 -13.76 0.39 0 -FEP_53_36 4.56 0.15 0 -FEP_53_28 3.91 0.21 0 -FEP_51_38 -9.26 0.54 0 -FEP_53_49 12.78 0.18 0 -FEP_53_42 11.73 0.15 0 -FEP_52_26 50.55 0.27 0 -FEP_51_29 3.9 0.7 0 -FEP_52_28 4.01 0.16 0 -FEP_51_43 -14.09 0.29 0 -FEP_53_45 4.39 0.2 0 -FEP_51_26 28.57 0.2 0 -FEP_52_37 5.29 0.16 0 -FEP_52_34 11.19 0.2 0 -FEP_52_46 0.17 0.16 0 -FEP_51_42 -9.57 0.23 0 -FEP_51_35 -18.75 0.37 0 -FEP_51_37 -16.33 0.19 0 -FEP_51_28 -17.93 0.14 0 -FEP_52_35 3.41 0.32 0 -FEP_52_40 13.62 1.01 5 -FEP_52_41 10.33 0.32 0 -FEP_53_37 5.09 0.47 0 -FEP_52_48 8.69 0.1 0 -FEP_51_44 -9.07 0.19 0 -FEP_52_39 10.69 0.42 0 -FEP_51_39 -11.04 0.48 0 -FEP_53_46 0.57 0.15 0 -FEP_53_47 -29.31 0.22 0 -FEP_52_29 25.01 0.25 0 -FEP_52_49 12.67 0.25 0 -FEP_51_30 -16.75 0.2 0 -FEP_52_23 30.45 0.28 0 -FEP_52_31 9.62 0.22 0 -FEP_52_51 21.58 0.25 0 -FEP_51_36 -17.47 0.38 0 -FEP_53_34 11.14 0.22 0 -FEP_53_33 1.52 0.23 0 -FEP_53_29 23.63 0.32 0 -FEP_51_45 -17.2 0.2 0 -FEP_51_48 -13.17 0.14 0 -FEP_52_30 5.69 0.24 0 -FEP_52_44 13.69 0.27 0 -FEP_52_32 3.42 0.22 0 -FEP_53_35 2.96 0.16 0 -FEP_52_43 8.29 0.18 0 -FEP_53_39 8.65 0.44 0 -FEP_52_42 12.23 0.15 0 -FEP_52_38 11.69 0.42 0 -FEP_53_41 9.21 0.61 2 -FEP_51_41 -10.11 0.38 0 -FEP_53_38 11.7 0.47 0 -FEP_51_49 -9.44 0.07 0 -FEP_53_48 8.26 0.25 0 -FEP_53_44 13.02 0.26 0 -FEP_53_26 49.73 0.33 0 -FEP_53_32 3.29 0.27 0 -FEP_52_33 2.62 0.27 0 -FEP_52_47 -29.02 0.24 0 -FEP_53_30 4.87 0.31 0 -FEP_56_34 -27.04 0.28 0 -FEP_56_44 -24.15 0.06 0 -FEP_56_28 -33.38 0.3 0 -FEP_56_37 -32.26 0.26 0 -FEP_54_51 13.86 0.16 0 -FEP_54_40 5.83 1.18 1 -FEP_57_35 -42.1 0.1 0 -FEP_56_54 -30.46 0.4 0 -FEP_57_36 -41.7 0.61 0 -FEP_56_48 -28.65 0.15 0 -FEP_54_50 5.95 0.19 0 -FEP_56_46 -37.21 0.07 0 -FEP_54_29 15.38 0.22 0 -FEP_56_35 -34.77 0.1 0 -FEP_54_42 4.33 0.14 0 -FEP_54_39 1.15 0.35 0 -FEP_56_38 -28.73 0.28 8 -FEP_54_34 3.56 0.27 0 -FEP_56_52 -37.94 0.29 0 -FEP_56_30 -32.71 0.17 0 -FEP_56_29 -14.13 0.15 0 -FEP_54_47 -36.28 0.16 0 -FEP_56_36 -33.03 0.13 0 -FEP_57_41 -36.06 0.6 0 -FEP_54_45 -3.04 0.11 0 -FEP_54_32 -4.4 0.5 0 -FEP_54_43 0.7 0.3 0 -FEP_56_26 12.32 0.45 0 -FEP_56_31 -28.72 0.1 0 -FEP_57_32 -41.88 0.17 0 -FEP_56_33 -35.91 0.12 0 -FEP_54_30 -2.91 0.32 0 -FEP_53_52 0.16 0.19 0 -FEP_54_28 -3.88 0.11 0 -FEP_56_43 -29.55 0.08 0 -FEP_57_42 -33.35 0.1 0 -FEP_54_23 22.75 0.1 0 -FEP_54_38 4.34 0.37 0 -FEP_54_52 -8.51 0.59 0 -FEP_57_23 -14.66 0.12 0 -FEP_57_44 -32.3 0.08 0 -FEP_57_39 -36.1 0.48 0 -FEP_57_27 -39.37 0.19 0 -FEP_56_49 -24.78 0.18 0 -FEP_54_36 -3.8 0.61 1 -FEP_56_40 -24.83 0.44 0 -FEP_57_34 -33.73 0.3 0 -FEP_56_42 -26.62 0.87 0 -FEP_57_43 -36.94 0.07 0 -FEP_56_32 -34.24 0.13 0 -FEP_54_44 5.52 0.1 0 -FEP_54_48 0.88 0.12 0 -FEP_57_26 4.81 0.29 0 -FEP_56_41 -28.52 0.33 0 -FEP_54_53 -7.28 0.1 0 -FEP_56_47 -66.86 0.24 0 -FEP_57_33 -44.01 0.24 0 -FEP_56_27 -32.33 0.35 0 -FEP_57_45 -40.67 0.1 0 -FEP_54_33 -5.86 0.46 0 -FEP_54_31 0.65 0.63 0 -FEP_54_26 42.11 0.16 0 -FEP_54_37 -2.24 0.08 0 -FEP_56_51 -15.35 0.23 0 -FEP_56_45 -33.06 0.18 0 -FEP_57_38 -33.93 0.33 0 -FEP_54_41 1.56 0.66 0 -FEP_57_29 -22.58 0.31 0 -FEP_57_28 -41.37 0.22 0 -FEP_57_40 -33.82 0.32 0 -FEP_54_27 -2.54 0.68 0 -FEP_54_49 4.25 0.22 0 -FEP_56_50 -23.91 0.08 0 -FEP_57_37 -39.42 0.16 0 -FEP_57_31 -36.84 0.21 0 -FEP_54_46 -6.65 0.25 0 -FEP_54_35 -4.32 0.19 0 -FEP_57_30 -40.49 0.15 0 -FEP_56_53 -37.48 0.09 0 -FEP_56_39 -28.22 0.44 0 -FEP_56_23 -7.33 0.35 0 -FEP_58_48 -22.17 0.31 0 -FEP_64_27 -19.89 0.33 0 -FEP_60_28 -18.47 0.2 0 -FEP_60_50 -9.15 0.23 0 -FEP_60_34 -12.07 0.19 0 -FEP_63_41 -8.12 0.32 0 -FEP_65_27 -15.74 0.24 0 -FEP_63_52 -18.52 0.21 0 -FEP_63_23 12.26 0.26 0 -FEP_64_63 -7.62 0.1 0 -FEP_64_26 25.06 0.18 0 -FEP_62_52 -47.2 0.17 0 -FEP_64_56 11.99 0.44 0 -FEP_61_26 11.23 0.27 0 -FEP_61_44 -25.78 0.16 0 -FEP_64_47 -54.68 0.17 0 -FEP_63_49 -6.06 0.13 0 -FEP_62_40 -34.16 0.21 0 -FEP_60_26 27.17 0.33 0 -FEP_64_40 -13.36 0.28 0 -FEP_61_28 -36.6 0.29 0 -FEP_62_34 -35.54 0.17 0 -FEP_60_49 -10.43 0.14 0 -FEP_60_42 -11.53 0.16 0 -FEP_62_47 -76.33 0.12 0 -FEP_58_56 7.18 0.14 0 -FEP_62_33 -45.83 0.39 0 -FEP_61_58 -8.74 0.38 0 -FEP_63_33 -16.47 0.25 0 -FEP_62_44 -34.58 0.1 0 -FEP_63_34 -6.68 0.26 0 -FEP_60_44 -9.26 0.06 0 -FEP_62_58 -17.45 0.23 0 -FEP_58_38 -18.15 0.58 0 -FEP_60_48 -14.71 0.14 0 -FEP_65_33 -19.56 0.3 0 -FEP_62_49 -35.05 0.12 0 -FEP_63_42 -6.56 0.38 0 -FEP_63_43 -9.63 0.06 0 -FEP_65_42 -9.37 0.1 0 -FEP_63_31 -9.4 0.05 0 -FEP_63_45 -13.03 0.14 0 -FEP_62_39 -37.1 0.48 0 -FEP_61_50 -25.2 0.15 0 -FEP_63_35 -15.19 0.1 0 -FEP_64_51 -3.69 0.17 0 -FEP_65_45 -16.67 0.21 0 -FEP_61_45 -34.55 0.17 0 -FEP_64_43 -17.23 0.24 0 -FEP_62_48 -39.39 0.47 0 -FEP_58_23 0.43 0.1 0 -FEP_60_30 -17.65 0.07 0 -FEP_63_32 -14.5 0.14 0 -FEP_64_41 -17.48 0.44 1 -FEP_62_32 -44.33 0.29 0 -FEP_64_38 -13.7 0.35 0 -FEP_61_34 -27.48 0.18 0 -FEP_64_37 -20.68 0.2 0 -FEP_61_35 -36.04 0.24 0 -FEP_64_42 -13.61 0.14 0 -FEP_61_29 -14.73 0.39 0 -FEP_63_54 -10.25 0.1 0 -FEP_60_33 -21.54 0.2 0 -FEP_64_58 4.63 0.13 0 -FEP_60_40 -10.4 0.3 0 -FEP_60_51 -0.06 0.28 0 -FEP_61_38 -26.95 0.37 0 -FEP_63_29 6 0.37 0 -FEP_64_57 19.6 0.07 0 -FEP_62_54 -38.36 0.32 1 -FEP_58_41 -20.31 0.25 0 -FEP_65_29 2.18 0.36 0 -FEP_60_46 -22.69 0.21 0 -FEP_57_56 -8.17 0.1 0 -FEP_57_54 -37.42 0.14 0 -FEP_62_50 -33.36 0.11 0 -FEP_60_29 0.68 0.35 0 -FEP_65_37 -15.73 0.15 0 -FEP_65_46 -21.25 0.15 0 -FEP_60_38 -10.46 0.19 0 -FEP_63_46 -17.63 0.19 0 -FEP_64_52 -25.79 0.15 0 -FEP_62_38 -34.64 0.3 0 -FEP_58_39 -20.55 0.29 0 -FEP_61_30 -33.71 0.19 0 -FEP_60_45 -17.89 0.09 0 -FEP_63_36 -13.62 0.17 0 -FEP_61_47 -68.08 0.26 0 -FEP_61_57 5.54 0.46 0 -FEP_64_23 4.74 0.15 0 -FEP_63_50 -4.64 0.22 0 -FEP_61_31 -30.59 0.15 0 -FEP_64_31 -16.82 0.24 0 -FEP_60_54 -15.49 0.09 0 -FEP_63_61 20.52 0.34 0 -FEP_58_45 -25.41 0.13 0 -FEP_61_60 -16.22 0.21 0 -FEP_58_31 -21.46 0.21 0 -FEP_58_26 20.44 0.27 0 -FEP_61_53 -38.2 0.7 0 -FEP_62_36 -42.91 0.26 0 -FEP_60_41 -12.15 0.26 0 -FEP_58_27 -24.32 0.15 0 -FEP_60_36 -18.08 0.18 0 -FEP_63_37 -12.65 0.19 0 -FEP_61_36 -34.81 0.16 0 -FEP_63_57 27.49 0.16 0 -FEP_64_45 -21.35 0.32 0 -FEP_64_46 -24.73 0.41 0 -FEP_62_29 -22.13 0.78 0 -FEP_62_26 2.69 0.15 0 -FEP_58_36 -25.72 0.1 0 -FEP_63_26 31.88 0.28 0 -FEP_65_30 -16.18 0.08 0 -FEP_63_27 -12.07 0.09 0 -FEP_61_46 -37.82 0.43 0 -FEP_63_28 -14.1 0.39 0 -FEP_61_51 -16.85 0.21 0 -FEP_63_48 -9.89 0.31 0 -FEP_65_38 -9.78 0.42 0 -FEP_57_48 -37.7 0.44 0 -FEP_60_53 -22.93 0.06 0 -FEP_63_58 11.93 0.09 0 -FEP_64_53 -25.44 0.36 0 -FEP_60_43 -14.61 0.09 0 -FEP_58_49 -17.75 0.14 0 -FEP_60_57 22.74 0.11 0 -FEP_61_37 -33.9 0.19 0 -FEP_64_44 -12.16 0.4 0 -FEP_58_42 -18.67 0.52 0 -FEP_60_27 -17.14 0.14 0 -FEP_64_49 -13.96 0.13 0 -FEP_61_39 -28.51 0.24 0 -FEP_63_53 -17.87 0.19 0 -FEP_64_34 -15.49 0.42 0 -FEP_60_37 -18.19 0.39 0 -FEP_58_51 -7.52 0.24 0 -FEP_61_42 -27.04 0.29 1 -FEP_58_50 -15.84 0.17 0 -FEP_64_35 -21.85 0.19 0 -FEP_65_39 -12.45 0.35 0 -FEP_61_40 -25.94 0.45 0 -FEP_58_52 -31.52 0.74 0 -FEP_61_27 -32.7 0.34 0 -FEP_65_47 -50.46 0.3 0 -FEP_62_27 -41.96 0.16 0 -FEP_57_49 -33.23 0.29 0 -FEP_65_23 9.07 0.09 0 -FEP_64_50 -11.95 0.33 0 -FEP_62_57 -2.31 0.12 0 -FEP_58_34 -18.91 0.27 0 -FEP_65_44 -7.86 0.14 0 -FEP_58_43 -21.64 0.09 0 -FEP_58_30 -24.95 0.11 0 -FEP_63_60 4.93 0.04 0 -FEP_58_29 -7.05 0.3 0 -FEP_62_41 -36.91 0.41 0 -FEP_63_39 -8.8 0.4 0 -FEP_65_31 -12.62 0.31 0 -FEP_60_32 -18.97 0.16 0 -FEP_65_49 -9.3 0.19 0 -FEP_61_56 -2 0.1 0 -FEP_60_23 7.43 0.05 0 -FEP_62_46 -47.25 0.23 0 -FEP_61_52 -38.75 0.3 0 -FEP_57_52 -45.55 0.18 0 -FEP_65_34 -10.22 0.28 0 -FEP_58_40 -17.8 0.34 0 -FEP_64_48 -16.95 0.27 0 -FEP_65_50 -7.43 0.13 0 -FEP_60_31 -13.82 0.07 0 -FEP_58_54 -22.7 0.13 0 -FEP_65_36 -17.25 0.34 0 -FEP_65_41 -12.57 0.47 0 -FEP_60_47 -52.44 0.16 0 -FEP_60_39 -13.57 0.75 0 -FEP_64_62 21.64 0.11 0 -FEP_61_54 -31.42 0.33 1 -FEP_63_30 -12.8 0.13 0 -FEP_63_40 -6.18 0.43 0 -FEP_62_60 -25 0.22 0 -FEP_58_47 -58.9 0.1 0 -FEP_58_35 -27.14 0.24 0 -FEP_63_38 -6.53 0.2 0 -FEP_58_28 -25.85 0.15 0 -FEP_61_32 -35.03 0.45 0 -FEP_64_60 -2.52 0.19 0 -FEP_64_39 -16.87 0.31 0 -FEP_65_28 -17.47 0.24 0 -FEP_62_56 -9.86 0.2 0 -FEP_60_56 14.86 0.07 0 -FEP_57_53 -45.68 0.11 0 -FEP_62_37 -41.94 0.08 0 -FEP_61_43 -30.3 0.34 0 -FEP_57_50 -31.43 0.2 0 -FEP_62_45 -43.01 0.21 0 -FEP_60_35 -19.93 0.07 0 -FEP_64_28 -21.63 0.31 0 -FEP_60_58 7.23 0.15 0 -FEP_65_26 28.92 0.3 0 -FEP_61_33 -37.72 0.18 0 -FEP_64_29 -2.35 0.28 0 -FEP_65_48 -13.25 0.17 0 -FEP_62_42 -35.34 0.36 0 -FEP_64_32 -22.21 0.44 1 -FEP_62_30 -42.27 0.4 0 -FEP_57_51 -23.35 0.14 0 -FEP_65_32 -17.78 0.2 0 -FEP_63_51 4.54 0.32 0 -FEP_62_51 -25.21 0.06 0 -FEP_58_32 -26.62 0.3 0 -FEP_65_40 -6.86 0.71 3 -FEP_65_43 -12.89 0.12 0 -FEP_62_31 -38.76 0.28 0 -FEP_58_33 -28.85 0.44 0 -FEP_58_46 -29.63 0.17 0 -FEP_65_35 -18.09 0.06 0 -FEP_63_47 -46.85 0.1 0 -FEP_58_37 -24.52 0.23 0 -FEP_57_46 -44.84 0.18 0 -FEP_64_30 -20.19 0.11 0 -FEP_64_33 -24.27 0.34 0 -FEP_63_62 29.59 0.2 0 -FEP_62_23 -16.91 0.19 0 -FEP_62_53 -47.78 0.32 0 -FEP_63_56 18.77 0.38 0 -FEP_61_49 -26.94 0.14 0 -FEP_64_61 13.14 0.31 0 -FEP_58_57 15.36 0.17 0 -FEP_60_52 -23.13 0.28 0 -FEP_57_47 -74.57 0.32 0 -FEP_62_43 -39.59 0.31 0 -FEP_61_23 -8.5 0.25 0 -FEP_61_41 -28.35 0.63 0 -FEP_61_48 -30.61 0.28 0 -FEP_58_44 -16.72 0.14 0 -FEP_64_54 -17.98 0.18 0 -FEP_63_44 -4.56 0.14 0 -FEP_62_61 -8.57 0.11 0 -FEP_62_28 -43.35 0.15 0 -FEP_58_53 -30.02 0.23 0 -FEP_62_35 -44.93 0.12 0 -FEP_64_36 -21 0.09 0 -FEP_41_35 -8.04 0.83 0 -FEP_40_31 -5.59 0.93 2 -FEP_37_34 6.06 0.13 0 -FEP_42_26 38.25 0.35 0 -FEP_46_37 4.89 0.32 0 -FEP_30_26 44.9 0.34 0 -FEP_39_30 -5.22 0.42 0 -FEP_37_29 19.24 0.4 0 -FEP_35_26 47.09 0.17 0 -FEP_40_36 -8.5 0.97 2 -FEP_37_36 0.13 0.22 0 -FEP_45_41 4.85 0.3 0 -FEP_42_28 -7.55 0.22 0 -FEP_46_23 29.75 0.15 0 -FEP_45_36 0.11 0.2 0 -FEP_33_26 48.37 0.2 0 -FEP_37_32 -1.94 0.35 0 -FEP_36_31 4.12 0.28 0 -FEP_46_36 4.16 0.06 0 -FEP_29_27 -18.46 0.36 0 -FEP_39_34 0.08 0.44 0 -FEP_42_38 0.9 0.35 0 -FEP_47_35 32.39 0.23 0 -FEP_42_41 -1.68 0.72 1 -FEP_43_42 3.58 0.18 0 -FEP_33_29 21.88 0.22 0 -FEP_39_37 -6.03 0.59 0 -FEP_44_31 -4.8 0.09 0 -FEP_42_36 -7.4 0.2 0 -FEP_34_29 13.85 0.38 0 -FEP_38_30 -6.72 0.37 1 -FEP_43_39 1.35 0.25 0 -FEP_40_39 -2.52 0.44 0 -FEP_40_30 -8.34 0.69 6 -FEP_45_27 0.91 0.28 0 -FEP_44_29 10.38 0.24 0 -FEP_46_30 4.82 0.16 0 -FEP_32_26 46.72 0.29 0 -FEP_47_33 31.28 0.47 0 -FEP_45_38 6.53 0.22 0 -FEP_32_28 0.01 0.54 0 -FEP_40_26 36.83 0.36 0 -FEP_36_32 -1.25 0.07 0 -FEP_35_27 2.64 0.07 0 -FEP_43_33 -6.81 0.12 0 -FEP_45_32 -1.13 0.26 0 -FEP_32_30 1.79 0.13 0 -FEP_45_23 25.77 0.09 0 -FEP_46_38 11.3 0.38 0 -FEP_41_28 -8.22 0.99 3 -FEP_42_30 -6.58 0.09 0 -FEP_31_29 14.94 0.34 0 -FEP_46_29 23.43 0.16 0 -FEP_42_32 -8.33 0.37 0 -FEP_42_35 -8.61 0.21 0 -FEP_45_39 4.99 0.3 0 -FEP_41_34 0.74 0.69 0 -FEP_47_27 35.06 0.25 0 -FEP_37_27 0.68 0.37 0 -FEP_37_31 3.39 0.37 0 -FEP_39_32 -5.98 0.27 0 -FEP_41_37 -6.16 0.39 0 -FEP_39_38 0.39 0.45 0 -FEP_35_23 26.91 0.48 0 -FEP_40_28 -10.48 1.11 6 -FEP_43_32 -4.52 0.31 0 -FEP_42_40 3.73 1.31 3 -FEP_44_38 -1.38 0.33 0 -FEP_45_29 18.29 0.29 0 -FEP_46_34 11.24 0.16 0 -FEP_46_41 8.82 0.71 1 -FEP_43_41 1.41 0.76 0 -FEP_41_31 -2.43 0.79 1 -FEP_47_30 33.99 0.26 0 -FEP_45_37 0.62 0.24 0 -FEP_47_29 53.55 0.45 0 -FEP_27_26 44.54 0.27 0 -FEP_36_34 6.25 0.25 0 -FEP_43_29 15.23 0.23 0 -FEP_42_27 -6.29 0.53 0 -FEP_43_34 2.96 0.21 0 -FEP_44_30 -8.16 0.15 0 -FEP_38_36 -8.1 0.54 0 -FEP_34_30 -5.93 0.15 0 -FEP_38_35 -8.83 0.56 0 -FEP_40_35 -10.77 0.96 0 -FEP_36_29 18.41 0.25 0 -FEP_36_33 -3.35 0.12 0 -FEP_44_42 -1.28 0.18 0 -FEP_37_35 -1.82 0.23 0 -FEP_38_23 18.73 0.35 0 -FEP_29_28 -20.21 0.38 0 -FEP_36_30 0.72 0.13 0 -FEP_40_32 -9.76 1.07 1 -FEP_47_26 79.37 0.28 0 -FEP_46_28 3.22 0.5 0 -FEP_30_29 18.51 0.38 0 -FEP_35_29 20.82 0.22 0 -FEP_33_27 4.29 0.18 0 -FEP_30_28 -0.93 0.14 0 -FEP_34_28 -7.39 0.07 0 -FEP_36_28 -0.21 0.27 0 -FEP_44_26 37.34 0.18 0 -FEP_31_28 -5.33 0.38 0 -FEP_46_39 9.23 0.36 0 -FEP_31_27 -2.72 0.2 0 -FEP_34_26 38.74 0.16 0 -FEP_45_33 -3.13 0.14 0 -FEP_45_34 7.09 0.21 0 -FEP_34_31 -2.38 0.14 0 -FEP_34_33 -9.33 0.12 0 -FEP_41_26 40.3 0.41 0 -FEP_43_40 4.64 0.59 2 -FEP_47_34 40.3 0.11 0 -FEP_39_35 -6.48 0.56 0 -FEP_46_45 4.44 0.29 0 -FEP_39_27 -4.00 0.48 0 -FEP_29_23 7.31 0.25 0 -FEP_45_40 7.78 0.26 0 -FEP_36_26 45.87 0.22 0 -FEP_38_26 37.14 0.27 0 -FEP_42_29 11.13 0.14 0 -FEP_45_30 0.09 0.2 0 -FEP_38_31 -3.64 0.56 0 -FEP_34_23 19.31 0.18 0 -FEP_26_23 -19.73 0.16 0 -FEP_44_33 -11.85 0.15 0 -FEP_37_28 -1.4 0.15 0 -FEP_30_27 0.65 0.12 0 -FEP_42_39 -3.1 0.27 0 -FEP_37_23 24.74 0.09 0 -FEP_40_34 -2 0.9 1 -FEP_41_29 11.78 0.67 1 -FEP_45_43 3.51 0.16 0 -FEP_33_32 1.83 0.18 0 -FEP_40_27 -8.31 1.02 4 -FEP_36_35 -1.71 0.11 0 -FEP_47_31 38.16 0.19 0 -FEP_43_27 -2.41 0.14 0 -FEP_37_30 0.3 0.23 0 -FEP_43_31 0.2 0.26 0 -FEP_45_26 45.41 0.18 0 -FEP_44_23 17.42 0.11 0 -FEP_41_23 19.88 1.07 0 -FEP_47_36 33.7 0.18 0 -FEP_41_36 -5.28 0.61 0 -FEP_35_33 -1.42 0.07 0 -FEP_46_35 2.39 0.11 0 -FEP_40_33 -12.23 1.02 2 -FEP_44_28 -9.22 0.21 0 -FEP_44_34 -1.91 0.19 0 -FEP_46_26 49.59 0.36 0 -FEP_40_23 17.84 1.46 3 -FEP_45_42 7.18 0.07 0 -FEP_38_33 -10.55 0.38 0 -FEP_38_27 -5.81 0.94 0 -FEP_46_32 2.89 0.23 0 -FEP_42_23 18.5 0.07 0 -FEP_28_27 1.89 0.33 0 -FEP_37_26 44.93 0.19 0 -FEP_43_30 -3.1 0.1 0 -FEP_35_30 2.18 0.15 0 -FEP_41_39 0.63 0.2 0 -FEP_44_40 -0.9 0.53 0 -FEP_39_23 21.15 0.27 0 -FEP_32_23 28.5 1.11 0 -FEP_41_32 -4.72 0.19 4 -FEP_38_28 -9.98 0.81 1 -FEP_43_38 3.56 0.54 1 -FEP_36_27 1.06 0.18 0 -FEP_38_29 12.98 0.49 0 -FEP_31_30 -3.46 0.12 0 -FEP_47_23 59.36 0.15 0 -FEP_45_28 -0.52 0.22 0 -FEP_44_39 -3.59 0.42 0 -FEP_27_23 24.65 0.3 0 -FEP_43_37 -2.85 0.34 0 -FEP_46_43 7.76 0.07 0 -FEP_39_36 -4.99 0.46 0 -FEP_35_32 0.43 0.23 0 -FEP_35_28 0.94 0.37 0 -FEP_39_28 -5.91 0.52 1 -FEP_44_43 -4.95 0.11 0 -FEP_44_35 -10.1 0.07 0 -FEP_38_34 -0.33 0.41 1 -FEP_34_32 -7.12 0.24 0 -FEP_32_29 19.88 0.44 0 -FEP_41_40 2.15 0.56 0 -FEP_44_41 -3.86 0.17 3 -FEP_44_27 -7.49 0.12 0 -FEP_41_30 -6.29 0.99 2 -FEP_41_38 1.44 0.36 0 -FEP_39_31 -1.14 0.3 1 -FEP_42_33 -10.6 0.74 0 -FEP_31_26 40.67 0.17 0 -FEP_46_44 13.09 0.2 0 -FEP_36_23 26.22 0.21 0 -FEP_28_23 27.18 0.33 0 -FEP_41_27 -4.05 0.49 4 -FEP_46_33 1.16 0.18 0 -FEP_43_36 -4.09 0.23 0 -FEP_46_31 8.15 0.18 0 -FEP_45_44 8.3 0.1 0 -FEP_43_23 22.38 0.17 0 -FEP_43_35 -5.22 0.1 0 -FEP_33_31 6.71 0.18 0 -FEP_39_29 12.39 0.7 0 -FEP_40_38 -0.78 0.46 0 -FEP_35_31 5.83 0.08 0 -FEP_28_26 45.83 0.19 0 -FEP_43_26 42.12 0.15 0 -FEP_38_32 -9.72 1.07 3 -FEP_46_40 12.4 0.39 0 -FEP_39_33 -7.82 0.21 0 -FEP_45_31 4.19 0.23 0 -FEP_38_37 -7.24 0.43 0 -FEP_44_32 -9.64 0.15 0 -FEP_42_34 -0.97 0.23 0 -FEP_33_23 28.52 0.32 0 -FEP_40_29 10.99 0.54 0 -FEP_35_34 7.93 0.25 0 -FEP_42_37 -6.13 0.19 0 -FEP_47_28 32.74 0.18 0 -FEP_46_27 5.51 0.11 0 -FEP_47_32 32.48 0.31 0 -FEP_41_33 -8.37 1.16 1 -FEP_42_31 -2.94 0.21 0 -FEP_30_23 25.72 0.43 0 -FEP_39_26 39.59 0.46 0 -FEP_44_37 -7.41 0.1 0 -FEP_31_23 21.83 0.33 0 -FEP_33_28 1.79 0.47 0 -FEP_34_27 -5.03 0.28 0 -FEP_32_31 5.38 0.13 0 -FEP_32_27 2.17 0.14 0 -FEP_45_35 -1.98 0.11 0 -FEP_44_36 -9.24 0.19 0 -FEP_40_37 -7.47 0.43 2 -FEP_37_33 -3.1 0.23 0 -FEP_43_28 -4.12 0.35 0 -FEP_46_42 11 0.31 0 -FEP_33_30 4.31 0.23 0 -FEP_29_26 25.27 0.17 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/water_juju.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/water_juju.txt deleted file mode 100644 index b44e1546..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/backup/water_juju.txt +++ /dev/null @@ -1,71 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_42_54 -4.31 0.10 0 -FEP_65_60 1.40 0.10 0 -FEP_49_50 1.35 0.10 0 -FEP_34_31 -2.20 0.16 0 -FEP_27_39 4.67 0.61 0 -FEP_64_66 3.71 0.40 0 -FEP_41_40 3.13 0.65 0 -FEP_35_36 1.53 0.05 0 -FEP_56_57 8.11 0.11 0 -FEP_28_29 20.57 0.54 0 -FEP_66_65 -7.94 0.08 0 -FEP_54_51 13.87 0.26 0 -FEP_23_62 16.44 0.25 0 -FEP_42_48 -3.19 0.15 0 -FEP_28_45 0.62 0.17 0 -FEP_50_51 7.56 0.09 0 -FEP_28_48 4.81 0.34 0 -FEP_28_42 7.97 0.40 0 -FEP_27_28 -2.45 0.39 0 -FEP_42_51 9.90 0.41 0 -FEP_27_46 -5.29 0.13 0 -FEP_54_64 17.74 0.15 0 -FEP_27_34 5.35 0.24 0 -FEP_64_62 21.71 0.21 0 -FEP_35_53 -3.07 0.20 0 -FEP_27_38 6.60 0.83 0 -FEP_28_44 9.23 0.23 0 -FEP_51_62 24.80 0.10 0 -FEP_26_67 -8.75 0.30 0 -FEP_27_33 -4.42 0.19 0 -FEP_52_53 0.05 0.23 0 -FEP_43_47 -37.30 0.40 0 -FEP_39_38 0.49 0.30 0 -FEP_60_63 -4.85 0.06 0 -FEP_68_26 9.74 0.27 0 -FEP_27_41 5.84 0.51 4 -FEP_37_56 30.60 0.09 0 -FEP_32_33 -1.97 0.09 0 -FEP_64_63 -7.81 0.08 0 -FEP_37_53 -5.32 0.22 0 -FEP_35_37 2.21 0.18 0 -FEP_35_50 10.82 0.21 0 -FEP_33_53 -1.32 0.27 0 -FEP_63_58 10.88 0.09 0 -FEP_27_32 -2.40 0.10 0 -FEP_42_44 1.17 0.06 0 -FEP_27_40 6.39 0.55 4 -FEP_27_43 2.73 0.20 0 -FEP_35_52 -3.69 0.33 0 -FEP_42_45 -7.22 0.10 0 -FEP_58_56 6.97 0.25 0 -FEP_35_49 9.55 0.17 0 -FEP_30_31 3.37 0.07 0 -FEP_60_61 16.16 0.16 0 -FEP_43_46 -7.87 0.07 0 -FEP_33_36 3.08 0.11 0 -FEP_26_57 -6.33 0.31 0 -FEP_37_60 17.21 0.17 0 -FEP_37_50 8.43 0.08 0 -FEP_27_47 -34.34 0.30 0 -FEP_27_30 -0.73 0.10 0 -FEP_42_29 11.77 0.37 0 -FEP_33_35 2.07 0.30 0 -FEP_53_54 7.22 0.15 0 -FEP_64_23 4.58 0.09 0 -FEP_62_66 -18.08 0.24 0 -FEP_65_61 16.88 0.24 0 -FEP_54_68 33.10 0.19 0 -FEP_37_67 36.26 0.22 0 -FEP_38_30 -6.32 0.52 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100755 index 14827f2d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,862 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_67_31 -27.36 0.48 0 -FEP_67_51 -17.11 0.34 0 -FEP_66_49 -14.87 0.48 0 -FEP_65_53 -20.81 0.29 0 -FEP_66_61 10.47 0.36 0 -FEP_65_62 28.09 0.24 0 -FEP_66_32 -23.06 0.41 0 -FEP_66_62 19.63 0.35 0 -FEP_65_51 3.57 0.28 0 -FEP_65_58 7.76 0.29 0 -FEP_66_31 -17.08 0.42 0 -FEP_66_46 -25.77 0.6 0 -FEP_66_65 -9.26 0.13 0 -FEP_66_30 -20.58 0.4 0 -FEP_66_39 -18.9 0.39 0 -FEP_66_37 -22.62 0.37 0 -FEP_66_50 -13.93 0.27 0 -FEP_66_27 -20.89 0.88 0 -FEP_65_60 2.5 0.1 0 -FEP_65_63 -2.75 0.34 0 -FEP_66_34 -12.95 0.54 0 -FEP_66_33 -27.82 1.02 0 -FEP_67_46 -36.99 0.23 0 -FEP_67_47 -64.29 0.43 0 -FEP_67_33 -36.93 0.52 0 -FEP_67_23 -9.01 0.22 0 -FEP_66_45 -21.77 0.29 0 -FEP_67_41 -30.67 0.73 0 -FEP_66_36 -23.19 0.35 0 -FEP_66_56 5.92 0.35 0 -FEP_67_49 -26.2 0.42 0 -FEP_66_28 -19.87 0.43 0 -FEP_66_43 -18.8 0.34 0 -FEP_66_57 16.08 0.18 0 -FEP_67_27 -30.88 0.4 0 -FEP_67_53 -41.63 0.26 0 -FEP_67_30 -31.22 0.33 0 -FEP_67_36 -34.49 0.11 0 -FEP_66_47 -53.28 0.43 0 -FEP_66_38 -19.74 0.51 0 -FEP_65_52 -17.67 0.29 0 -FEP_67_52 -37.86 0.41 0 -FEP_66_26 23.42 0.34 0 -FEP_66_51 -5.44 0.35 0 -FEP_67_40 -27.07 0.62 0 -FEP_67_34 -23.96 0.47 0 -FEP_66_44 -16.31 0.22 0 -FEP_67_38 -29.3 0.76 0 -FEP_66_58 -1.5 0.29 0 -FEP_66_42 -15.76 0.3 0 -FEP_66_54 -21.25 0.32 0 -FEP_67_48 -25.71 0.48 0 -FEP_65_61 19 0.31 0 -FEP_67_42 -27 0.29 0 -FEP_65_54 -11.86 0.21 0 -FEP_67_44 -27.83 0.28 0 -FEP_67_43 -30.12 0.24 0 -FEP_66_41 -18.95 1.08 0 -FEP_67_50 -25.44 0.14 0 -FEP_65_56 15.78 0.39 0 -FEP_67_32 -34.11 0.17 0 -FEP_65_57 25.94 0.36 0 -FEP_67_28 -30.62 0.34 0 -FEP_67_37 -32.75 0.21 0 -FEP_66_64 -3.05 0.34 0 -FEP_66_48 -15.58 0.72 0 -FEP_65_64 6.44 0.33 0 -FEP_67_54 -32.83 0.32 0 -FEP_67_35 -35.9 0.33 0 -FEP_66_63 -12.1 0.32 0 -FEP_67_39 -28.3 0.71 0 -FEP_66_53 -31.17 0.22 0 -FEP_66_60 -6.92 0.34 0 -FEP_66_52 -26.8 0.35 0 -FEP_66_29 0.48 0.59 0 -FEP_67_45 -33.42 0.33 0 -FEP_67_26 12.48 0.21 0 -FEP_67_29 -8.63 0.84 0 -FEP_66_40 -16.26 0.7 5 -FEP_66_35 -24.67 0.36 0 -FEP_66_23 2.14 0.22 0 -FEP_68_28 -35.83 0.58 0 -FEP_68_29 -14.47 0.37 0 -FEP_68_63 -28.03 0.3 0 -FEP_68_54 -37.39 0.25 0 -FEP_67_57 5.12 0.33 0 -FEP_68_36 -38.47 0.36 0 -FEP_68_44 -31.94 0.29 0 -FEP_68_42 -31.38 0.17 0 -FEP_67_64 -14.64 1.04 0 -FEP_67_65 -20.28 0.19 0 -FEP_68_50 -30.36 0.52 0 -FEP_67_66 -11.23 0.19 0 -FEP_68_57 1.03 0.12 0 -FEP_68_56 -8.64 0.23 0 -FEP_68_26 7.21 0.46 0 -FEP_67_61 -0.67 0.3 0 -FEP_68_43 -35.93 0.4 0 -FEP_68_27 -36.51 0.36 0 -FEP_68_64 -17.65 0.27 0 -FEP_68_35 -40.95 0.47 0 -FEP_67_62 7.93 0.23 0 -FEP_68_33 -40.23 0.21 0 -FEP_68_48 -30.73 0.28 0 -FEP_68_39 -33.77 1.1 0 -FEP_68_31 -32.99 0.63 0 -FEP_68_53 -46.52 0.29 0 -FEP_68_45 -38.31 0.19 0 -FEP_68_49 -31.84 0.37 0 -FEP_68_32 -39.22 0.49 0 -FEP_68_67 -4.93 0.32 0 -FEP_67_63 -22.9 0.23 0 -FEP_67_58 -12.02 0.36 0 -FEP_68_62 4.15 0.28 0 -FEP_68_38 -33.67 1.03 0 -FEP_68_40 -30.87 0.83 0 -FEP_68_34 -30.57 0.86 0 -FEP_68_65 -25 0.31 0 -FEP_67_60 -18.26 0.19 0 -FEP_68_60 -22.26 0.42 0 -FEP_68_66 -16.29 0.32 0 -FEP_68_51 -21.28 0.41 0 -FEP_68_47 -69.86 0.55 0 -FEP_68_61 -5.71 0.26 0 -FEP_68_58 -16.82 0.28 0 -FEP_68_37 -37.82 0.39 0 -FEP_68_30 -36.04 0.33 0 -FEP_68_41 -34.89 0.72 0 -FEP_68_23 -13.54 0.31 0 -FEP_68_52 -43.83 0.68 0 -FEP_67_56 -3.59 0.21 1 -FEP_68_46 -42 0.29 0 -FEP_48_26 38.39 0.37 0 -FEP_50_43 -4.67 0.27 0 -FEP_48_47 -38.14 0.22 0 -FEP_49_39 -3.27 0.5 0 -FEP_50_44 -1.92 0.32 0 -FEP_50_40 -2.74 0.52 3 -FEP_48_23 17.99 0.38 0 -FEP_49_37 -6.95 0.21 0 -FEP_49_31 -1.15 0.3 0 -FEP_48_44 0.25 0.41 0 -FEP_49_41 -3.88 0.52 1 -FEP_49_47 -37.57 0.16 0 -FEP_48_45 -6.82 0.33 0 -FEP_49_30 -5.37 0.26 0 -FEP_49_38 -3.31 0.54 0 -FEP_47_37 30.85 0.32 0 -FEP_50_33 -10.92 0.24 0 -FEP_50_28 -5.23 0.29 1 -FEP_47_44 37.99 0.27 0 -FEP_49_29 16.47 0.68 0 -FEP_48_30 -4.94 0.25 0 -FEP_47_46 26.23 0.27 0 -FEP_49_44 -0.55 0.54 0 -FEP_49_23 16.63 0.34 0 -FEP_49_46 -10.98 0.53 0 -FEP_50_34 0.78 0.33 0 -FEP_47_42 36.5 0.34 0 -FEP_48_41 -3.22 0.96 3 -FEP_49_45 -7.77 0.56 0 -FEP_49_32 -7.58 0.32 0 -FEP_47_45 31 0.41 1 -FEP_48_42 -0.22 0.37 0 -FEP_50_37 -7.8 0.21 0 -FEP_47_43 33.26 0.29 0 -FEP_50_42 -0.7 0.26 0 -FEP_49_28 -4.4 0.39 0 -FEP_47_41 34.21 0.58 0 -FEP_48_35 -9.77 0.3 0 -FEP_50_48 -0.37 0.44 0 -FEP_50_39 -3.91 0.4 0 -FEP_48_40 -2.27 0.89 2 -FEP_49_35 -10.24 0.36 0 -FEP_50_29 15.75 0.62 0 -FEP_50_30 -6.25 0.32 0 -FEP_49_27 -4.94 0.32 0 -FEP_50_35 -10.25 0.26 0 -FEP_48_37 -6.92 0.36 0 -FEP_50_26 38.04 0.19 0 -FEP_49_48 1.28 0.98 0 -FEP_48_36 -7.96 0.39 0 -FEP_48_28 -5.58 0.3 0 -FEP_49_34 1.01 0.19 0 -FEP_48_38 -1.49 0.39 0 -FEP_50_41 -4.58 0.3 0 -FEP_50_23 17.1 0.24 0 -FEP_49_36 -7.92 0.24 0 -FEP_48_43 -4.09 0.35 0 -FEP_49_33 -10.51 0.48 0 -FEP_50_46 -12.05 0.34 0 -FEP_47_40 36.84 0.73 3 -FEP_48_29 16.16 0.7 0 -FEP_50_31 -2 0.33 0 -FEP_48_39 -0.39 0.9 0 -FEP_48_34 1.74 0.61 0 -FEP_49_42 -0.47 0.41 0 -FEP_49_40 -1.62 1.36 2 -FEP_48_33 -10.53 0.31 0 -FEP_49_26 38.49 0.43 0 -FEP_50_32 -8.23 0.44 0 -FEP_47_39 35.27 0.51 0 -FEP_48_27 -5.08 0.32 0 -FEP_48_32 -7.57 0.4 0 -FEP_50_45 -7.75 0.29 0 -FEP_49_43 -4.4 0.35 0 -FEP_50_27 -5.22 0.28 0 -FEP_48_31 -1.34 0.38 0 -FEP_50_36 -9.06 0.28 0 -FEP_50_38 -2.78 0.59 0 -FEP_48_46 -11.26 0.31 0 -FEP_47_38 35.89 0.77 0 -FEP_50_47 -38.41 0.24 1 -FEP_51_50 -7.86 0.18 0 -FEP_51_47 -46.8 0.17 0 -FEP_52_50 12.82 0.38 0 -FEP_53_51 25.11 0.6 0 -FEP_53_50 17.02 0.36 0 -FEP_53_27 10.61 0.55 0 -FEP_51_23 8.66 0.34 0 -FEP_51_27 -14.31 0.37 0 -FEP_51_32 -15.96 0.19 1 -FEP_52_36 3.67 0.44 0 -FEP_53_43 11.86 0.25 0 -FEP_53_31 14.67 0.37 0 -FEP_52_27 6.98 0.53 0 -FEP_51_33 -20.77 0.55 1 -FEP_53_40 14.09 0.86 6 -FEP_51_46 -20.21 0.45 0 -FEP_53_23 33.63 0.33 0 -FEP_51_34 -7.83 0.34 0 -FEP_50_49 -1.14 0.26 0 -FEP_51_40 -12.03 0.44 0 -FEP_52_45 5.04 0.53 0 -FEP_51_31 -10.64 0.34 0 -FEP_53_36 8.58 0.35 0 -FEP_53_28 11.03 0.51 0 -FEP_51_38 -11.39 0.59 0 -FEP_53_49 15.93 0.57 0 -FEP_53_42 14.97 0.33 0 -FEP_52_26 50.52 0.28 0 -FEP_51_29 5.52 0.6 0 -FEP_52_28 7.55 0.34 0 -FEP_51_43 -13.41 0.3 0 -FEP_53_45 8.3 0.42 0 -FEP_51_26 29.29 0.41 0 -FEP_52_37 5.03 0.35 0 -FEP_52_34 13.46 0.28 0 -FEP_52_46 0.76 0.31 0 -FEP_51_42 -9.12 0.32 0 -FEP_51_35 -18.76 0.23 0 -FEP_51_37 -16.32 0.28 1 -FEP_51_28 -14.76 0.31 0 -FEP_52_35 2.05 0.38 0 -FEP_52_40 10.21 1.12 4 -FEP_52_41 8.55 0.91 0 -FEP_53_37 8.51 0.17 0 -FEP_52_48 12.07 0.39 0 -FEP_51_44 -10.38 0.25 0 -FEP_52_39 9.8 0.75 0 -FEP_51_39 -11.49 0.91 0 -FEP_53_46 5.27 0.36 0 -FEP_53_47 -22.46 0.48 0 -FEP_52_29 29.02 0.73 0 -FEP_52_49 11.46 0.36 0 -FEP_51_30 -15.2 0.34 0 -FEP_52_23 29.01 0.45 0 -FEP_52_31 11.05 0.24 0 -FEP_52_51 20.74 0.45 0 -FEP_51_36 -18.39 0.58 0 -FEP_53_34 16.64 0.77 0 -FEP_53_33 4.57 0.4 0 -FEP_53_29 31.52 0.31 0 -FEP_51_45 -16.16 0.52 0 -FEP_51_48 -9.7 0.34 0 -FEP_52_30 6.09 0.38 0 -FEP_52_44 11.42 0.44 0 -FEP_52_32 4.53 0.34 0 -FEP_53_35 6.36 0.3 0 -FEP_52_43 7.08 0.44 0 -FEP_53_39 14.43 0.93 0 -FEP_52_42 11 0.54 0 -FEP_52_38 11.67 0.67 0 -FEP_53_41 12.3 0.89 1 -FEP_51_41 -13.56 0.46 0 -FEP_53_38 12.85 1.32 1 -FEP_51_49 -9.92 0.3 1 -FEP_53_48 14.53 0.68 0 -FEP_53_44 13.74 0.25 0 -FEP_53_26 53.55 0.25 0 -FEP_53_32 7.39 0.81 0 -FEP_52_33 2.27 0.44 0 -FEP_52_47 -25.75 0.32 0 -FEP_53_30 9.55 0.49 0 -FEP_56_34 -21.04 0.25 0 -FEP_56_44 -22.61 0.36 0 -FEP_56_28 -28.38 0.86 0 -FEP_56_37 -28.97 0.37 0 -FEP_54_51 14.39 0.67 0 -FEP_54_40 2.18 1.25 8 -FEP_57_35 -42.22 0.33 1 -FEP_56_54 -29.67 0.77 1 -FEP_57_36 -40.59 0.45 0 -FEP_56_48 -21.89 0.4 0 -FEP_54_50 7.34 0.52 0 -FEP_56_46 -33.2 0.28 0 -FEP_54_29 21.74 0.53 0 -FEP_56_35 -31.63 0.35 0 -FEP_54_42 6.16 0.17 0 -FEP_54_39 3.26 0.88 0 -FEP_56_38 nan nan 9 -FEP_54_34 7.71 0.5 0 -FEP_56_52 -33.37 0.32 0 -FEP_56_30 -27.41 0.41 0 -FEP_56_29 -5.48 0.92 0 -FEP_54_47 -30.86 0.5 0 -FEP_56_36 -30.5 0.38 0 -FEP_57_41 -36.16 0.76 0 -FEP_54_45 -1.56 0.24 0 -FEP_54_32 0.52 0.95 0 -FEP_54_43 3.52 0.6 0 -FEP_56_26 16.43 0.29 0 -FEP_56_31 -23.6 0.31 0 -FEP_57_32 -39.38 0.56 0 -FEP_56_33 -32.27 0.24 0 -FEP_54_30 1.85 0.2 0 -FEP_53_52 3.89 0.26 0 -FEP_54_28 1.82 0.47 0 -FEP_56_43 -26.38 0.23 0 -FEP_57_42 -32.32 0.41 0 -FEP_54_23 24.01 0.22 0 -FEP_54_38 3.87 0.78 0 -FEP_54_52 -5.97 0.43 0 -FEP_57_23 -14.11 0.27 0 -FEP_57_44 -32.98 0.34 0 -FEP_57_39 -32.58 0.41 0 -FEP_57_27 -36.84 0.34 0 -FEP_56_49 -22.89 0.4 0 -FEP_54_36 -1.56 0.4 0 -FEP_56_40 -23 0.59 0 -FEP_57_34 -31.11 0.52 0 -FEP_56_42 -24.08 1.14 1 -FEP_57_43 -36.34 0.43 0 -FEP_56_32 -29.86 0.37 0 -FEP_54_44 4.85 0.37 0 -FEP_54_48 7.06 0.37 0 -FEP_57_26 5.62 0.3 0 -FEP_56_41 -27 0.39 0 -FEP_54_53 -8.86 0.25 0 -FEP_56_47 -59.99 0.38 0 -FEP_57_33 -42.45 0.27 0 -FEP_56_27 -27.02 0.55 0 -FEP_57_45 -38.53 0.3 0 -FEP_54_33 -4.1 0.98 2 -FEP_54_31 4.86 0.57 0 -FEP_54_26 44.44 0.2 0 -FEP_54_37 -0.17 0.53 0 -FEP_56_51 -12.71 0.22 0 -FEP_56_45 -29.13 0.35 0 -FEP_57_38 -33.08 0.99 0 -FEP_54_41 3.26 0.93 2 -FEP_57_29 -16.58 0.37 0 -FEP_57_28 -36.64 0.39 0 -FEP_57_40 -32.86 0.48 0 -FEP_54_27 0.84 0.84 0 -FEP_54_49 6.4 0.45 0 -FEP_56_50 -21.42 0.24 0 -FEP_57_37 -38.1 0.26 0 -FEP_57_31 -33.3 0.65 0 -FEP_54_46 -4.49 0.38 0 -FEP_54_35 -2.44 0.52 0 -FEP_57_30 -38.11 0.5 0 -FEP_56_53 -37.93 0.27 1 -FEP_56_39 -25.46 0.47 0 -FEP_56_23 -4.92 0.45 1 -FEP_58_48 -14.17 0.41 0 -FEP_64_27 -17.3 0.59 0 -FEP_60_28 -12.56 0.35 0 -FEP_60_50 -8.06 0.33 0 -FEP_60_34 -8.11 0.55 0 -FEP_63_41 -7.32 0.76 1 -FEP_65_27 -10.13 0.5 0 -FEP_63_52 -15.36 0.33 0 -FEP_63_23 13.71 0.38 0 -FEP_64_63 -9.47 0.26 0 -FEP_64_26 26.07 0.56 0 -FEP_62_52 -46.25 0.19 0 -FEP_64_56 7.86 1.24 0 -FEP_61_26 12.69 0.26 1 -FEP_61_44 -25.46 0.34 0 -FEP_64_47 -49.67 0.63 0 -FEP_63_49 -2.69 0.46 0 -FEP_62_40 -36.34 0.61 0 -FEP_60_26 29.72 0.2 0 -FEP_64_40 -13.68 0.57 0 -FEP_61_28 -30.49 0.32 1 -FEP_62_34 -34.04 0.23 0 -FEP_60_49 -8.04 0.27 0 -FEP_60_42 -9.33 0.37 0 -FEP_62_47 -72.91 0.29 0 -FEP_58_56 7.59 0.24 0 -FEP_62_33 -44.38 0.52 0 -FEP_61_58 -11.45 0.31 0 -FEP_63_33 -13.46 0.28 0 -FEP_62_44 -35.68 0.36 0 -FEP_63_34 -1.09 0.59 0 -FEP_60_44 -8.74 0.32 0 -FEP_62_58 -19.77 0.36 0 -FEP_58_38 -18.81 0.7 0 -FEP_60_48 -8.22 0.5 0 -FEP_65_33 -16.15 0.6 0 -FEP_62_49 -34.46 0.26 0 -FEP_63_42 -3.68 0.52 0 -FEP_63_43 -6.28 0.43 0 -FEP_65_42 -6.63 0.18 0 -FEP_63_31 -4.32 0.42 0 -FEP_63_45 -10.02 0.49 0 -FEP_62_39 -36.2 0.67 0 -FEP_61_50 -24.66 0.14 0 -FEP_63_35 -13.22 0.46 0 -FEP_64_51 -3.72 0.24 0 -FEP_65_45 -13.11 0.5 0 -FEP_61_45 -33.53 0.43 0 -FEP_64_43 -15.05 0.49 0 -FEP_62_48 -35.06 0.32 0 -FEP_58_23 3.4 0.34 0 -FEP_60_30 -13.52 0.24 0 -FEP_63_32 -11.09 0.56 0 -FEP_64_41 -16.83 0.59 0 -FEP_62_32 -41.74 0.26 0 -FEP_64_38 -13.98 0.79 1 -FEP_61_34 -23.75 0.37 0 -FEP_64_37 -20.07 0.33 0 -FEP_61_35 -34.67 0.46 0 -FEP_64_42 -12.81 0.29 0 -FEP_61_29 -9.8 0.65 0 -FEP_63_54 -9.41 0.18 0 -FEP_60_33 -18.66 0.21 0 -FEP_64_58 1.68 0.13 0 -FEP_60_40 -8.72 0.73 0 -FEP_60_51 1.37 0.23 0 -FEP_61_38 -27.41 0.49 0 -FEP_63_29 12 0.54 0 -FEP_64_57 19.04 0.3 0 -FEP_62_54 -39.53 0.64 0 -FEP_58_41 -17.97 0.83 1 -FEP_65_29 10.16 0.46 0 -FEP_60_46 -19.19 0.28 0 -FEP_57_56 -10.03 0.15 0 -FEP_57_54 -37.78 0.23 0 -FEP_62_50 -33.84 0.24 0 -FEP_60_29 8.84 0.57 0 -FEP_65_37 -13.7 0.22 0 -FEP_65_46 -17.1 0.23 0 -FEP_60_38 -10.85 1.04 0 -FEP_63_46 -14.26 0.43 0 -FEP_64_52 -24.44 0.31 0 -FEP_62_38 -36.25 0.62 0 -FEP_58_39 -16.81 0.93 0 -FEP_61_30 -30.86 0.41 0 -FEP_60_45 -15.77 0.3 0 -FEP_63_36 -11.28 0.58 0 -FEP_61_47 -63.4 0.26 0 -FEP_61_57 5.46 0.23 0 -FEP_64_23 4.41 0.3 0 -FEP_63_50 -2.66 0.51 0 -FEP_61_31 -27.1 0.46 0 -FEP_64_31 -13.14 0.4 0 -FEP_60_54 -14.37 0.35 0 -FEP_63_61 22.2 0.29 0 -FEP_58_45 -21.94 0.28 0 -FEP_61_60 -17.79 0.44 0 -FEP_58_31 -14.46 0.3 0 -FEP_58_26 24.33 0.42 0 -FEP_61_53 -41.19 0.58 2 -FEP_62_36 -42.06 0.41 0 -FEP_60_41 -12.62 0.54 0 -FEP_58_27 -18.17 0.33 0 -FEP_60_36 -16.3 0.33 0 -FEP_63_37 -10.72 0.36 0 -FEP_61_36 -33.66 0.21 0 -FEP_63_57 28.09 0.36 0 -FEP_64_45 -20.75 0.34 0 -FEP_64_46 -22.62 0.46 0 -FEP_62_29 -19.96 0.64 0 -FEP_62_26 4.29 0.25 0 -FEP_58_36 -22.96 0.4 0 -FEP_63_26 34.88 0.45 0 -FEP_65_30 -10.95 0.29 0 -FEP_63_27 -8.08 0.37 0 -FEP_61_46 -35.84 0.46 0 -FEP_63_28 -7.78 0.51 0 -FEP_61_51 -15.7 0.25 0 -FEP_63_48 -4.15 0.32 1 -FEP_65_38 -9.32 1.05 0 -FEP_57_48 -32.72 0.41 0 -FEP_60_53 -23.7 0.2 0 -FEP_63_58 10.43 0.25 0 -FEP_64_53 -28.91 0.66 0 -FEP_60_43 -11.78 0.28 0 -FEP_58_49 -14.19 0.48 0 -FEP_60_57 23.54 0.48 0 -FEP_61_37 -31.96 0.26 0 -FEP_64_44 -13.62 0.29 0 -FEP_58_42 -14.65 0.23 0 -FEP_60_27 -13.39 0.4 0 -FEP_64_49 -12.76 0.51 0 -FEP_61_39 -27.53 0.62 0 -FEP_63_53 -19.06 0.12 0 -FEP_64_34 -11.5 0.48 1 -FEP_60_37 -15.34 0.35 0 -FEP_58_51 -5.43 0.29 0 -FEP_61_42 -23.74 1.01 1 -FEP_58_50 -13.12 0.27 0 -FEP_64_35 -22.95 0.51 0 -FEP_65_39 -9.56 0.58 0 -FEP_61_40 -25.67 0.54 0 -FEP_58_52 -27.01 1.09 0 -FEP_61_27 -29.82 0.39 0 -FEP_65_47 -43.67 0.33 0 -FEP_62_27 -39.54 0.41 0 -FEP_57_49 -32.56 0.38 0 -FEP_65_23 11.46 0.21 0 -FEP_64_50 -12.54 0.51 0 -FEP_62_57 -3.32 0.27 0 -FEP_58_34 -12.76 1.09 0 -FEP_65_44 -6.8 0.36 1 -FEP_58_43 -19.62 0.46 0 -FEP_58_30 -19.57 0.35 0 -FEP_63_60 5.06 0.37 0 -FEP_58_29 1.31 0.38 0 -FEP_62_41 -37.67 0.29 1 -FEP_63_39 -5.86 0.63 0 -FEP_65_31 -6.95 0.39 0 -FEP_60_32 -15.64 0.55 0 -FEP_65_49 -6.14 0.44 0 -FEP_61_56 -3.43 0.17 0 -FEP_60_23 9 0.39 0 -FEP_62_46 -45.88 0.34 0 -FEP_61_52 -36.92 0.56 0 -FEP_57_52 -43.98 0.43 0 -FEP_65_34 -4.98 0.43 0 -FEP_58_40 -14.05 0.4 0 -FEP_64_48 -12.72 0.38 0 -FEP_65_50 -5.05 0.21 0 -FEP_60_31 -9.05 0.48 0 -FEP_58_54 -20.5 0.21 0 -FEP_65_36 -13.86 0.34 0 -FEP_65_41 -10.18 0.58 0 -FEP_60_47 -46.75 0.69 0 -FEP_60_39 -10.34 0.68 0 -FEP_64_62 22.66 0.26 0 -FEP_61_54 -29.21 1.04 1 -FEP_63_30 -8.75 0.59 0 -FEP_63_40 -4.83 1 1 -FEP_62_60 -26.32 0.35 0 -FEP_58_47 -51.75 0.58 0 -FEP_58_35 -24.17 0.43 0 -FEP_63_38 -7.21 0.55 0 -FEP_58_28 -17.83 0.42 0 -FEP_61_32 -32.91 0.48 0 -FEP_64_60 -4.92 0.33 0 -FEP_64_39 -16.74 0.96 1 -FEP_65_28 -10.39 0.48 0 -FEP_62_56 -12.59 0.43 0 -FEP_60_56 14.02 0.3 1 -FEP_57_53 -47.34 0.34 0 -FEP_62_37 -41.25 0.23 0 -FEP_61_43 -29.82 0.32 0 -FEP_57_50 -31.37 0.35 0 -FEP_62_45 -42.07 0.3 0 -FEP_60_35 -18.09 0.22 0 -FEP_64_28 -17.7 0.33 0 -FEP_60_58 5.51 0.22 0 -FEP_65_26 32.26 0.21 1 -FEP_61_33 -36.55 0.31 0 -FEP_64_29 4.05 1.04 0 -FEP_65_48 -6.23 0.28 0 -FEP_62_42 -34.91 0.5 0 -FEP_64_32 -21.02 1.35 0 -FEP_62_30 -40.02 0.22 0 -FEP_57_51 -22.85 0.25 0 -FEP_65_32 -13.22 0.54 1 -FEP_63_51 5.96 0.44 0 -FEP_62_51 -24.82 0.12 0 -FEP_58_32 -22.49 0.51 1 -FEP_65_40 -6.64 0.89 5 -FEP_65_43 -10.65 0.29 1 -FEP_62_31 -35.77 0.29 0 -FEP_58_33 -24.81 0.53 0 -FEP_58_46 -25.88 0.33 0 -FEP_65_35 -15.06 0.28 0 -FEP_63_47 -39.65 0.38 0 -FEP_58_37 -20.99 0.36 0 -FEP_57_46 -43.94 0.47 0 -FEP_64_30 -17.83 0.29 0 -FEP_64_33 -23.01 0.75 0 -FEP_63_62 31.2 0.33 0 -FEP_62_23 -16.79 0.28 0 -FEP_62_53 -49.97 0.48 0 -FEP_63_56 18.53 0.3 0 -FEP_61_49 -25.89 0.41 0 -FEP_64_61 12.59 0.35 0 -FEP_58_57 17.68 0.31 0 -FEP_60_52 -19.66 0.44 0 -FEP_57_47 -69.44 0.47 0 -FEP_62_43 -38.23 0.31 0 -FEP_61_23 -7.85 0.32 0 -FEP_61_41 -29.64 0.88 0 -FEP_61_48 -25.28 0.38 0 -FEP_58_44 -15.95 0.37 0 -FEP_64_54 -19.1 0.21 0 -FEP_63_44 -3.86 0.36 1 -FEP_62_61 -9.16 0.21 0 -FEP_62_28 -40.11 0.57 0 -FEP_58_53 -29.87 0.28 0 -FEP_62_35 -44.56 0.42 0 -FEP_64_36 -21.5 0.43 0 -FEP_41_35 -5.1 1.13 3 -FEP_40_31 -2.04 1.83 6 -FEP_37_34 8.8 0.21 0 -FEP_42_26 39.32 0.37 0 -FEP_46_37 3.87 0.19 0 -FEP_30_26 43.72 0.39 0 -FEP_39_30 -3.65 0.98 0 -FEP_37_29 24.24 0.61 0 -FEP_35_26 47.78 0.38 0 -FEP_40_36 -10.82 0.63 3 -FEP_37_36 -0.1 0.36 0 -FEP_45_41 2.72 1.28 0 -FEP_42_28 -5 0.32 0 -FEP_46_23 28.71 0.32 0 -FEP_45_36 -0.7 0.24 0 -FEP_33_26 47.62 0.42 0 -FEP_37_32 -0.42 0.41 0 -FEP_36_31 6.76 0.18 0 -FEP_46_36 2.7 0.17 0 -FEP_29_27 -21.77 0.52 0 -FEP_39_34 3.95 0.53 0 -FEP_42_38 -3.56 0.71 0 -FEP_47_35 27.98 0.38 0 -FEP_42_41 -3.42 0.68 0 -FEP_43_42 3.08 0.55 0 -FEP_33_29 28.96 0.71 0 -FEP_39_37 -3.79 0.55 0 -FEP_44_31 -0.96 0.37 0 -FEP_42_36 -6.69 0.92 0 -FEP_34_29 15.88 0.84 0 -FEP_38_30 -3.43 0.98 0 -FEP_43_39 -0.28 0.6 0 -FEP_40_39 -2.19 0.96 0 -FEP_40_30 -5.8 0.99 5 -FEP_45_27 2.38 0.67 0 -FEP_44_29 16.6 0.68 0 -FEP_46_30 5.49 0.18 0 -FEP_32_26 45.47 0.3 0 -FEP_47_33 28.1 0.32 0 -FEP_45_38 4.81 1.19 1 -FEP_32_28 2.67 0.37 0 -FEP_40_26 39.91 0.54 0 -FEP_36_32 0.14 0.24 0 -FEP_35_27 4.15 0.29 0 -FEP_43_33 -5.91 0.31 0 -FEP_45_32 -0.55 0.43 0 -FEP_32_30 1.56 0.26 0 -FEP_45_23 25.12 0.32 0 -FEP_46_38 8.21 1.03 1 -FEP_41_28 -1.83 0.92 0 -FEP_42_30 -5.11 0.43 0 -FEP_31_29 16.64 0.32 0 -FEP_46_29 27.15 0.94 0 -FEP_42_32 -7.7 0.85 0 -FEP_42_35 -8.81 0.18 0 -FEP_45_39 3.41 0.66 0 -FEP_41_34 6.18 0.71 1 -FEP_47_27 33.52 0.39 0 -FEP_37_27 2.99 0.36 0 -FEP_37_31 5.73 0.28 0 -FEP_39_32 -4.47 0.58 1 -FEP_41_37 -1.94 0.31 1 -FEP_39_38 -0.15 1.03 0 -FEP_35_23 28.08 0.35 0 -FEP_40_28 -5.57 2.01 8 -FEP_43_32 -3.33 0.22 1 -FEP_42_40 -1.48 0.86 4 -FEP_44_38 -2.11 1.02 0 -FEP_45_29 23.97 0.62 0 -FEP_46_34 11.98 0.43 0 -FEP_46_41 8.02 1.03 3 -FEP_43_41 -0.75 1.12 1 -FEP_41_31 2.78 0.81 2 -FEP_47_30 32.27 0.24 0 -FEP_45_37 -0.18 0.28 0 -FEP_47_29 54.85 0.77 0 -FEP_27_26 42.23 0.34 0 -FEP_36_34 8.94 0.4 0 -FEP_43_29 20.91 0.87 0 -FEP_42_27 -3.79 0.59 0 -FEP_43_34 5 0.54 0 -FEP_44_30 -5.02 0.6 0 -FEP_38_36 -3.86 0.57 0 -FEP_34_30 -6.07 0.28 0 -FEP_38_35 -6.78 0.81 0 -FEP_40_35 -7.42 0.89 4 -FEP_36_29 24.42 0.41 0 -FEP_36_33 -1.84 0.18 0 -FEP_44_42 0.47 0.33 0 -FEP_37_35 -2.85 0.27 0 -FEP_38_23 20 0.88 0 -FEP_29_28 -21.75 0.55 0 -FEP_36_30 2.3 0.29 0 -FEP_40_32 -4.84 1.32 4 -FEP_47_26 75.99 0.28 0 -FEP_46_28 6.34 0.3 0 -FEP_30_29 22.19 0.66 0 -FEP_35_29 25.81 0.52 0 -FEP_33_27 5.77 0.16 0 -FEP_30_28 0.96 0.47 0 -FEP_34_28 -6.02 0.51 0 -FEP_36_28 3.76 0.41 0 -FEP_44_26 39.8 0.39 0 -FEP_31_28 -2.96 0.24 0 -FEP_46_39 8.87 0.48 0 -FEP_31_27 -3.2 0.32 0 -FEP_34_26 36.38 0.2 0 -FEP_45_33 -2.27 0.17 0 -FEP_45_34 8.56 0.49 0 -FEP_34_31 -1.96 0.2 0 -FEP_34_33 -11.19 0.27 0 -FEP_41_26 41.26 0.55 0 -FEP_43_40 2.79 1 3 -FEP_47_34 38.27 0.34 0 -FEP_39_35 -7.36 0.56 0 -FEP_46_45 3.06 0.32 1 -FEP_39_27 -1.48 0.95 1 -FEP_29_23 1.22 0.73 0 -FEP_45_40 5.37 0.57 0 -FEP_36_26 46.12 0.27 0 -FEP_38_26 39.54 0.38 0 -FEP_42_29 16.45 0.48 0 -FEP_45_30 1.77 0.31 0 -FEP_38_31 1.2 0.87 0 -FEP_34_23 16.7 0.31 0 -FEP_26_23 -21.2 0.4 0 -FEP_44_33 -10.78 0.47 0 -FEP_37_28 2.16 0.37 0 -FEP_30_27 0.85 0.24 0 -FEP_42_39 -2.95 0.61 0 -FEP_37_23 25.13 0.27 0 -FEP_40_34 3.2 0.82 3 -FEP_41_29 19.87 1.39 4 -FEP_45_43 3.6 0.51 0 -FEP_33_32 3.07 0.29 0 -FEP_40_27 -5.73 1.04 6 -FEP_36_35 -1.56 0.14 0 -FEP_47_31 36.59 0.25 0 -FEP_43_27 -0.59 0.46 0 -FEP_37_30 2.01 0.3 0 -FEP_43_31 3.14 0.38 0 -FEP_45_26 46.06 0.3 0 -FEP_44_23 18.38 0.24 0 -FEP_41_23 22.62 0.83 1 -FEP_47_36 29.01 0.33 0 -FEP_41_36 -4.51 0.54 2 -FEP_35_33 -0.81 0.24 0 -FEP_46_35 1.4 0.13 0 -FEP_40_33 -10.12 1.34 5 -FEP_44_28 -4.75 0.47 0 -FEP_44_34 1.92 0.43 0 -FEP_46_26 49.04 0.31 0 -FEP_40_23 19.21 1.27 5 -FEP_45_42 7.12 0.16 1 -FEP_38_33 -9.38 1.26 1 -FEP_38_27 -0.79 0.81 3 -FEP_46_32 3.29 0.16 0 -FEP_42_23 18.28 0.2 0 -FEP_28_27 1.04 0.31 0 -FEP_37_26 45.56 0.26 0 -FEP_43_30 -2.17 0.56 0 -FEP_35_30 3.96 0.23 0 -FEP_41_39 0.82 0.64 0 -FEP_44_40 -0.59 0.97 0 -FEP_39_23 21.22 0.64 0 -FEP_32_23 25.22 0.43 0 -FEP_41_32 -2.03 0.4 3 -FEP_38_28 -1.46 0.92 0 -FEP_43_38 -0.39 0.91 0 -FEP_36_27 2.79 0.45 0 -FEP_38_29 18.19 0.47 0 -FEP_31_30 -4.05 0.17 0 -FEP_47_23 55.93 0.42 0 -FEP_45_28 1.79 0.61 0 -FEP_44_39 0.03 1.03 0 -FEP_27_23 22.57 0.64 0 -FEP_43_37 -2.74 0.29 0 -FEP_46_43 7.24 0.14 0 -FEP_39_36 -4.39 0.64 0 -FEP_35_32 1.64 0.17 0 -FEP_35_28 4.95 0.46 0 -FEP_39_28 -3.88 1.14 2 -FEP_44_43 -3.79 0.27 0 -FEP_44_35 -9.15 0.26 0 -FEP_38_34 2.94 1.16 1 -FEP_34_32 -8.68 0.37 0 -FEP_32_29 22.37 0.45 0 -FEP_41_40 0.53 0.73 0 -FEP_44_41 -4.45 0.45 2 -FEP_44_27 -4.45 0.35 0 -FEP_41_30 -2.26 0.81 5 -FEP_41_38 0.03 0.34 0 -FEP_39_31 1.08 0.56 1 -FEP_42_33 -9.83 0.54 1 -FEP_31_26 39.26 0.37 0 -FEP_46_44 10.07 0.32 0 -FEP_36_23 25.54 0.39 0 -FEP_28_23 23.3 0.44 0 -FEP_41_27 0.01 1.09 3 -FEP_46_33 0.7 0.25 0 -FEP_43_36 -4.01 0.2 0 -FEP_46_31 9.99 0.25 0 -FEP_45_44 6.3 0.15 0 -FEP_43_23 21.47 0.57 0 -FEP_43_35 -5.35 0.21 0 -FEP_33_31 8.77 0.27 0 -FEP_39_29 17.95 0.7 0 -FEP_40_38 -0.75 0.49 0 -FEP_35_31 7.95 0.21 0 -FEP_28_26 43.3 0.41 0 -FEP_43_26 41.81 0.5 0 -FEP_38_32 -1.94 0.39 4 -FEP_46_40 10.53 1.31 4 -FEP_39_33 -7.68 0.54 0 -FEP_45_31 6.01 0.36 0 -FEP_38_37 -4.61 0.66 0 -FEP_44_32 -6.69 0.42 0 -FEP_42_34 1.37 0.5 1 -FEP_33_23 28.64 0.44 0 -FEP_40_29 18.53 1.02 0 -FEP_35_34 10.85 0.35 0 -FEP_42_37 -6.77 0.33 0 -FEP_47_28 33.15 0.2 0 -FEP_46_27 6.49 0.47 0 -FEP_47_32 30.04 0.17 0 -FEP_41_33 -6.26 1.22 0 -FEP_42_31 -0.19 0.34 0 -FEP_30_23 23.63 0.51 0 -FEP_39_26 40.52 0.43 0 -FEP_44_37 -5.59 0.23 0 -FEP_31_23 19.28 0.52 0 -FEP_33_28 5.73 0.53 0 -FEP_34_27 -5.52 0.46 0 -FEP_32_31 6.45 0.4 0 -FEP_32_27 2.47 0.19 0 -FEP_45_35 -3.06 0.37 0 -FEP_44_36 -8.19 0.41 0 -FEP_40_37 -6.11 0.69 7 -FEP_37_33 -2.44 0.3 0 -FEP_43_28 -0.35 0.32 0 -FEP_46_42 9.91 0.19 0 -FEP_33_30 5.46 0.25 0 -FEP_29_26 21.08 0.42 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/protein_juju.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/protein_juju.txt deleted file mode 100644 index 31693bc3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/protein_juju.txt +++ /dev/null @@ -1,71 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28_48 5.43 0.47 0 -FEP_28_45 -2.36 0.53 0 -FEP_65_60 2.29 0.17 1 -FEP_42_48 0.19 0.22 0 -FEP_28_29 22.17 0.60 0 -FEP_68_26 7.95 0.50 0 -FEP_34_31 -2.42 0.39 0 -FEP_54_68 36.98 0.35 0 -FEP_35_37 2.91 0.30 0 -FEP_37_56 27.15 0.42 0 -FEP_33_53 -4.97 0.50 0 -FEP_54_64 18.36 0.26 0 -FEP_43_47 -33.02 0.27 0 -FEP_27_38 2.05 0.74 0 -FEP_23_62 17.07 0.42 0 -FEP_37_50 7.66 0.06 0 -FEP_63_58 9.81 0.20 0 -FEP_42_51 8.73 0.31 0 -FEP_35_50 10.77 0.25 0 -FEP_28_44 3.44 0.43 0 -FEP_27_30 -1.33 0.16 0 -FEP_27_40 4.17 1.30 5 -FEP_42_44 -0.22 0.19 0 -FEP_38_30 -6.15 1.25 1 -FEP_35_36 1.64 0.13 0 -FEP_27_46 -7.00 0.28 0 -FEP_35_53 -5.45 0.44 0 -FEP_27_41 0.22 0.49 0 -FEP_35_52 -1.97 0.51 0 -FEP_43_46 -7.03 0.21 0 -FEP_53_54 9.47 0.21 0 -FEP_52_53 -3.66 0.50 0 -FEP_54_51 15.74 0.37 0 -FEP_26_67 -12.39 0.28 0 -FEP_27_34 5.16 0.42 0 -FEP_56_57 10.15 0.24 0 -FEP_27_28 0.15 0.27 0 -FEP_30_31 4.15 0.16 0 -FEP_37_60 14.76 0.30 0 -FEP_58_56 7.76 0.19 0 -FEP_27_32 -2.58 0.30 0 -FEP_64_62 22.17 0.30 0 -FEP_27_47 -33.23 0.40 0 -FEP_64_63 -9.67 0.37 0 -FEP_49_50 0.99 0.20 0 -FEP_33_36 2.21 0.20 0 -FEP_62_66 -19.65 0.36 0 -FEP_33_35 0.86 0.20 0 -FEP_42_54 -5.46 0.22 0 -FEP_39_38 -0.05 1.02 0 -FEP_27_43 0.24 0.29 0 -FEP_51_62 24.67 0.13 0 -FEP_37_67 32.43 0.26 0 -FEP_35_49 9.93 0.34 0 -FEP_65_61 19.31 0.25 0 -FEP_42_29 16.92 0.38 0 -FEP_32_33 -2.98 0.25 0 -FEP_64_23 4.89 0.35 0 -FEP_64_66 2.78 0.35 0 -FEP_60_61 17.64 0.39 0 -FEP_41_40 3.07 0.36 0 -FEP_60_63 -4.17 0.32 0 -FEP_28_42 5.62 0.39 0 -FEP_27_33 -5.60 0.15 0 -FEP_27_39 2.68 0.82 0 -FEP_26_57 -7.83 0.53 0 -FEP_50_51 8.38 0.16 0 -FEP_66_65 -9.74 0.28 0 -FEP_42_45 -7.25 0.26 0 -FEP_37_53 -8.22 0.36 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100755 index 61837af7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,862 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_67_31 -32.31 0.12 0 -FEP_67_51 -19.11 0.3 0 -FEP_66_49 -16.75 0.08 0 -FEP_65_53 -20.75 0.1 0 -FEP_66_61 10 0.29 0 -FEP_65_62 25.75 0.17 0 -FEP_66_32 -26.14 0.22 0 -FEP_66_62 18.47 0.16 0 -FEP_65_51 0.56 0.18 0 -FEP_65_58 8.67 0.13 0 -FEP_66_31 -20.23 0.34 0 -FEP_66_46 -28.71 0.19 0 -FEP_66_65 -8.25 0.23 0 -FEP_66_30 -24.1 0.17 0 -FEP_66_39 -20.18 0.34 0 -FEP_66_37 -23.54 0.25 0 -FEP_66_50 -15.25 0.12 0 -FEP_66_27 -23.8 0.21 0 -FEP_65_60 1.55 0.09 0 -FEP_65_63 -3.21 0.07 0 -FEP_66_34 -17.73 0.32 0 -FEP_66_33 -27.32 0.6 1 -FEP_67_46 -40.76 0.15 0 -FEP_67_47 -70.08 0.2 0 -FEP_67_33 -39.2 0.18 0 -FEP_67_23 -10.79 0.16 0 -FEP_66_45 -24 0.1 0 -FEP_67_41 -30.12 1.09 1 -FEP_66_36 -24.91 0.33 0 -FEP_66_56 8.18 0.18 0 -FEP_67_49 -28.45 0.16 0 -FEP_66_28 -25.14 0.26 0 -FEP_66_43 -21.13 0.13 0 -FEP_66_57 16.15 0.16 0 -FEP_67_27 -35.27 0.15 0 -FEP_67_53 -40.97 0.12 0 -FEP_67_30 -35.87 0.25 0 -FEP_67_36 -36.3 0.24 0 -FEP_66_47 -57.85 0.2 0 -FEP_66_38 -16.54 0.5 0 -FEP_65_52 -21.85 0.42 0 -FEP_67_52 -40.88 0.23 0 -FEP_66_26 20.48 0.21 0 -FEP_66_51 -6.82 0.19 0 -FEP_67_40 -29.27 0.25 0 -FEP_67_34 -29.83 0.19 0 -FEP_66_44 -15.89 0.12 0 -FEP_67_38 -29.91 0.23 0 -FEP_66_58 0.56 0.19 0 -FEP_66_42 -17.19 0.12 0 -FEP_66_54 -21.6 0.21 0 -FEP_67_48 -33.07 0.22 0 -FEP_65_61 17.15 0.28 0 -FEP_67_42 -29.25 0.12 0 -FEP_65_54 -13.68 0.14 0 -FEP_67_44 -27.84 0.16 0 -FEP_67_43 -32.82 0.08 0 -FEP_66_41 -19.74 0.35 0 -FEP_67_50 -27.04 0.16 0 -FEP_65_56 16.18 0.43 0 -FEP_67_32 -37.52 0.09 0 -FEP_65_57 24.08 0.17 0 -FEP_67_28 -37.65 0.34 0 -FEP_67_37 -35.79 0.29 0 -FEP_66_64 -3.65 0.12 0 -FEP_66_48 -20.68 0.22 0 -FEP_65_64 3.74 0.15 0 -FEP_67_54 -33.77 0.1 0 -FEP_67_35 -38.14 0.15 0 -FEP_66_63 -10.88 0.29 0 -FEP_67_39 -31.34 0.32 0 -FEP_66_53 -29.18 0.07 0 -FEP_66_60 -6.44 0.12 0 -FEP_66_52 -28.97 0.21 0 -FEP_66_29 -5.76 0.23 0 -FEP_67_45 -36.57 0.12 0 -FEP_67_26 9.32 0.25 0 -FEP_67_29 -17.54 0.36 0 -FEP_66_40 -15.21 1.04 2 -FEP_66_35 -26.32 0.29 0 -FEP_66_23 1.31 0.08 0 -FEP_68_28 -36.9 0.21 0 -FEP_68_29 -18.5 0.48 0 -FEP_68_63 -22.94 0.17 0 -FEP_68_54 -33.37 0.16 0 -FEP_67_57 3.95 0.27 0 -FEP_68_36 -35.54 0.12 0 -FEP_68_44 -27.57 0.09 0 -FEP_68_42 -28.8 0.1 0 -FEP_67_64 -16.61 0.78 0 -FEP_67_65 -20.12 0.1 0 -FEP_68_50 -26.82 0.15 0 -FEP_67_66 -11.87 0.12 0 -FEP_68_57 4.6 0.13 0 -FEP_68_56 -2.79 0.09 0 -FEP_68_26 9.25 0.3 0 -FEP_67_61 -1.9 0.18 0 -FEP_68_43 -32.73 0.1 0 -FEP_68_27 -35.13 0.24 0 -FEP_68_64 -14.95 0.15 0 -FEP_68_35 -37.4 0.18 0 -FEP_67_62 6.46 0.2 0 -FEP_68_33 -39.18 0.19 0 -FEP_68_48 -31.69 0.1 0 -FEP_68_39 -32.01 0.58 0 -FEP_68_31 -32.05 0.15 0 -FEP_68_53 -40.64 0.08 0 -FEP_68_45 -35.73 0.07 0 -FEP_68_49 -28.23 0.12 0 -FEP_68_32 -37.77 0.16 0 -FEP_68_67 0.83 0.29 0 -FEP_67_63 -22.88 0.18 0 -FEP_67_58 -11.22 0.27 0 -FEP_68_62 7.06 0.17 0 -FEP_68_38 -28.9 0.26 0 -FEP_68_40 -28.43 0.4 0 -FEP_68_34 -29.68 0.26 0 -FEP_68_65 -19.87 0.24 0 -FEP_67_60 -18.09 0.17 0 -FEP_68_60 -17.68 0.16 0 -FEP_68_66 -11.8 0.22 0 -FEP_68_51 -18.55 0.2 0 -FEP_68_47 -69.79 0.18 0 -FEP_68_61 -1.49 0.18 0 -FEP_68_58 -10.9 0.21 0 -FEP_68_37 -35.68 0.18 0 -FEP_68_30 -35.63 0.14 0 -FEP_68_41 -31.76 0.4 0 -FEP_68_23 -10.15 0.12 0 -FEP_68_52 -40.58 0.12 0 -FEP_67_56 -3.39 0.14 0 -FEP_68_46 -40.38 0.16 0 -FEP_48_26 41.81 0.22 0 -FEP_50_43 -5.76 0.24 0 -FEP_48_47 -37.61 0.22 0 -FEP_49_39 -1.68 0.28 0 -FEP_50_44 -0.73 0.22 0 -FEP_50_40 -0.38 0.87 0 -FEP_48_23 22.19 0.23 0 -FEP_49_37 -7.22 0.09 0 -FEP_49_31 -3.68 0.23 0 -FEP_48_44 5.08 0.12 0 -FEP_49_41 -1.07 0.52 0 -FEP_49_47 -41.48 0.11 0 -FEP_48_45 -3.73 0.32 0 -FEP_49_30 -6.94 0.16 0 -FEP_49_38 0.25 0.23 0 -FEP_47_37 34.31 0.08 0 -FEP_50_33 -12.03 0.19 0 -FEP_50_28 -10.12 0.11 0 -FEP_47_44 42.73 0.17 0 -FEP_49_29 12.66 0.37 0 -FEP_48_30 -2.97 0.27 0 -FEP_47_46 29.39 0.34 0 -FEP_49_44 0.84 0.14 0 -FEP_49_23 17.66 0.11 0 -FEP_49_46 -12.5 0.13 0 -FEP_50_34 -2.66 0.12 0 -FEP_47_42 40.76 0.12 0 -FEP_48_41 3.23 1.27 2 -FEP_49_45 -7.71 0.11 0 -FEP_49_32 -9.37 0.14 0 -FEP_47_45 35.28 0.88 0 -FEP_48_42 3.74 0.22 0 -FEP_50_37 -8.54 0.09 0 -FEP_47_43 36.95 0.22 0 -FEP_50_42 -2.15 0.15 0 -FEP_49_28 -8.39 0.13 0 -FEP_47_41 38.59 0.5 1 -FEP_48_35 -5.15 0.23 0 -FEP_50_48 -5.03 0.22 0 -FEP_50_39 -2.88 0.68 0 -FEP_48_40 4.27 0.65 4 -FEP_49_35 -9.62 0.21 0 -FEP_50_29 10.42 0.33 0 -FEP_50_30 -8.71 0.18 0 -FEP_49_27 -6.71 0.23 0 -FEP_50_35 -11.1 0.17 0 -FEP_48_37 -3.41 0.1 0 -FEP_50_26 36.23 0.22 0 -FEP_49_48 -3.98 0.24 0 -FEP_48_36 -4.55 0.26 0 -FEP_48_28 -4.86 0.27 0 -FEP_49_34 -1.46 0.14 0 -FEP_48_38 3.94 0.65 0 -FEP_50_41 -3.87 0.41 0 -FEP_50_23 16.66 0.19 0 -FEP_49_36 -7.89 0.13 0 -FEP_48_43 -0.3 0.13 0 -FEP_49_33 -10.63 0.16 0 -FEP_50_46 -13.67 0.21 0 -FEP_47_40 44.08 0.54 4 -FEP_48_29 16.26 0.18 0 -FEP_50_31 -5.28 0.21 0 -FEP_48_39 1.46 0.32 0 -FEP_48_34 2.65 0.18 0 -FEP_49_42 -0.51 0.27 0 -FEP_49_40 2.13 0.92 1 -FEP_48_33 -6.89 0.31 0 -FEP_49_26 37.63 0.13 0 -FEP_50_32 -10.67 0.16 0 -FEP_47_39 38.49 0.62 0 -FEP_48_27 -2.6 0.32 0 -FEP_48_32 -4.72 0.28 0 -FEP_50_45 -8.91 0.18 0 -FEP_49_43 -4.5 0.14 0 -FEP_50_27 -8.11 0.25 0 -FEP_48_31 -0.18 0.17 0 -FEP_50_36 -8.93 0.22 0 -FEP_50_38 -1.34 0.23 0 -FEP_48_46 -7.63 0.21 0 -FEP_47_38 41.39 0.4 0 -FEP_50_47 -42.8 0.16 0 -FEP_51_50 -7.71 0.07 0 -FEP_51_47 -51.27 0.26 0 -FEP_52_50 13.57 0.21 0 -FEP_53_51 21.66 0.36 0 -FEP_53_50 13.7 0.17 0 -FEP_53_27 5.93 0.06 0 -FEP_51_23 8.77 0.16 0 -FEP_51_27 -16.22 0.21 0 -FEP_51_32 -18.33 0.4 0 -FEP_52_36 4.55 0.35 0 -FEP_53_43 8.19 0.1 0 -FEP_53_31 8.68 0.26 0 -FEP_52_27 5.3 0.29 0 -FEP_51_33 -20.51 0.29 0 -FEP_53_40 14.3 1.27 1 -FEP_51_46 -21.88 0.26 0 -FEP_53_23 30.11 0.11 0 -FEP_51_34 -10.69 0.25 0 -FEP_50_49 -1.49 0.1 0 -FEP_51_40 -8.6 0.63 0 -FEP_52_45 5.17 0.47 0 -FEP_51_31 -13.76 0.39 0 -FEP_53_36 4.56 0.15 0 -FEP_53_28 3.91 0.21 0 -FEP_51_38 -9.26 0.54 0 -FEP_53_49 12.78 0.18 0 -FEP_53_42 11.73 0.15 0 -FEP_52_26 50.55 0.27 0 -FEP_51_29 3.9 0.7 0 -FEP_52_28 4.01 0.16 0 -FEP_51_43 -14.09 0.29 0 -FEP_53_45 4.39 0.2 0 -FEP_51_26 28.57 0.2 0 -FEP_52_37 5.29 0.16 0 -FEP_52_34 11.19 0.2 0 -FEP_52_46 0.17 0.16 0 -FEP_51_42 -9.57 0.23 0 -FEP_51_35 -18.75 0.37 0 -FEP_51_37 -16.33 0.19 0 -FEP_51_28 -17.93 0.14 0 -FEP_52_35 3.41 0.32 0 -FEP_52_40 13.62 1.01 5 -FEP_52_41 10.33 0.32 0 -FEP_53_37 5.09 0.47 0 -FEP_52_48 8.69 0.1 0 -FEP_51_44 -9.07 0.19 0 -FEP_52_39 10.69 0.42 0 -FEP_51_39 -11.04 0.48 0 -FEP_53_46 0.57 0.15 0 -FEP_53_47 -29.31 0.22 0 -FEP_52_29 25.01 0.25 0 -FEP_52_49 12.67 0.25 0 -FEP_51_30 -16.75 0.2 0 -FEP_52_23 30.45 0.28 0 -FEP_52_31 9.62 0.22 0 -FEP_52_51 21.58 0.25 0 -FEP_51_36 -17.47 0.38 0 -FEP_53_34 11.14 0.22 0 -FEP_53_33 1.52 0.23 0 -FEP_53_29 23.63 0.32 0 -FEP_51_45 -17.2 0.2 0 -FEP_51_48 -13.17 0.14 0 -FEP_52_30 5.69 0.24 0 -FEP_52_44 13.69 0.27 0 -FEP_52_32 3.42 0.22 0 -FEP_53_35 2.96 0.16 0 -FEP_52_43 8.29 0.18 0 -FEP_53_39 8.65 0.44 0 -FEP_52_42 12.23 0.15 0 -FEP_52_38 11.69 0.42 0 -FEP_53_41 9.21 0.61 2 -FEP_51_41 -10.11 0.38 0 -FEP_53_38 11.7 0.47 0 -FEP_51_49 -9.44 0.07 0 -FEP_53_48 8.26 0.25 0 -FEP_53_44 13.02 0.26 0 -FEP_53_26 49.73 0.33 0 -FEP_53_32 3.29 0.27 0 -FEP_52_33 2.62 0.27 0 -FEP_52_47 -29.02 0.24 0 -FEP_53_30 4.87 0.31 0 -FEP_56_34 -27.04 0.28 0 -FEP_56_44 -24.15 0.06 0 -FEP_56_28 -33.38 0.3 0 -FEP_56_37 -32.26 0.26 0 -FEP_54_51 13.86 0.16 0 -FEP_54_40 5.83 1.18 1 -FEP_57_35 -42.1 0.1 0 -FEP_56_54 -30.46 0.4 0 -FEP_57_36 -41.7 0.61 0 -FEP_56_48 -28.65 0.15 0 -FEP_54_50 5.95 0.19 0 -FEP_56_46 -37.21 0.07 0 -FEP_54_29 15.38 0.22 0 -FEP_56_35 -34.77 0.1 0 -FEP_54_42 4.33 0.14 0 -FEP_54_39 1.15 0.35 0 -FEP_56_38 -28.73 0.28 8 -FEP_54_34 3.56 0.27 0 -FEP_56_52 -37.94 0.29 0 -FEP_56_30 -32.71 0.17 0 -FEP_56_29 -14.13 0.15 0 -FEP_54_47 -36.28 0.16 0 -FEP_56_36 -33.03 0.13 0 -FEP_57_41 -36.06 0.6 0 -FEP_54_45 -3.04 0.11 0 -FEP_54_32 -4.4 0.5 0 -FEP_54_43 0.7 0.3 0 -FEP_56_26 12.32 0.45 0 -FEP_56_31 -28.72 0.1 0 -FEP_57_32 -41.88 0.17 0 -FEP_56_33 -35.91 0.12 0 -FEP_54_30 -2.91 0.32 0 -FEP_53_52 0.16 0.19 0 -FEP_54_28 -3.88 0.11 0 -FEP_56_43 -29.55 0.08 0 -FEP_57_42 -33.35 0.1 0 -FEP_54_23 22.75 0.1 0 -FEP_54_38 4.34 0.37 0 -FEP_54_52 -8.51 0.59 0 -FEP_57_23 -14.66 0.12 0 -FEP_57_44 -32.3 0.08 0 -FEP_57_39 -36.1 0.48 0 -FEP_57_27 -39.37 0.19 0 -FEP_56_49 -24.78 0.18 0 -FEP_54_36 -3.8 0.61 1 -FEP_56_40 -24.83 0.44 0 -FEP_57_34 -33.73 0.3 0 -FEP_56_42 -26.62 0.87 0 -FEP_57_43 -36.94 0.07 0 -FEP_56_32 -34.24 0.13 0 -FEP_54_44 5.52 0.1 0 -FEP_54_48 0.88 0.12 0 -FEP_57_26 4.81 0.29 0 -FEP_56_41 -28.52 0.33 0 -FEP_54_53 -7.28 0.1 0 -FEP_56_47 -66.86 0.24 0 -FEP_57_33 -44.01 0.24 0 -FEP_56_27 -32.33 0.35 0 -FEP_57_45 -40.67 0.1 0 -FEP_54_33 -5.86 0.46 0 -FEP_54_31 0.65 0.63 0 -FEP_54_26 42.11 0.16 0 -FEP_54_37 -2.24 0.08 0 -FEP_56_51 -15.35 0.23 0 -FEP_56_45 -33.06 0.18 0 -FEP_57_38 -33.93 0.33 0 -FEP_54_41 1.56 0.66 0 -FEP_57_29 -22.58 0.31 0 -FEP_57_28 -41.37 0.22 0 -FEP_57_40 -33.82 0.32 0 -FEP_54_27 -2.54 0.68 0 -FEP_54_49 4.25 0.22 0 -FEP_56_50 -23.91 0.08 0 -FEP_57_37 -39.42 0.16 0 -FEP_57_31 -36.84 0.21 0 -FEP_54_46 -6.65 0.25 0 -FEP_54_35 -4.32 0.19 0 -FEP_57_30 -40.49 0.15 0 -FEP_56_53 -37.48 0.09 0 -FEP_56_39 -28.22 0.44 0 -FEP_56_23 -7.33 0.35 0 -FEP_58_48 -22.17 0.31 0 -FEP_64_27 -19.89 0.33 0 -FEP_60_28 -18.47 0.2 0 -FEP_60_50 -9.15 0.23 0 -FEP_60_34 -12.07 0.19 0 -FEP_63_41 -8.12 0.32 0 -FEP_65_27 -15.74 0.24 0 -FEP_63_52 -18.52 0.21 0 -FEP_63_23 12.26 0.26 0 -FEP_64_63 -7.62 0.1 0 -FEP_64_26 25.06 0.18 0 -FEP_62_52 -47.2 0.17 0 -FEP_64_56 11.99 0.44 0 -FEP_61_26 11.23 0.27 0 -FEP_61_44 -25.78 0.16 0 -FEP_64_47 -54.68 0.17 0 -FEP_63_49 -6.06 0.13 0 -FEP_62_40 -34.16 0.21 0 -FEP_60_26 27.17 0.33 0 -FEP_64_40 -13.36 0.28 0 -FEP_61_28 -36.6 0.29 0 -FEP_62_34 -35.54 0.17 0 -FEP_60_49 -10.43 0.14 0 -FEP_60_42 -11.53 0.16 0 -FEP_62_47 -76.33 0.12 0 -FEP_58_56 7.18 0.14 0 -FEP_62_33 -45.83 0.39 0 -FEP_61_58 -8.74 0.38 0 -FEP_63_33 -16.47 0.25 0 -FEP_62_44 -34.58 0.1 0 -FEP_63_34 -6.68 0.26 0 -FEP_60_44 -9.26 0.06 0 -FEP_62_58 -17.45 0.23 0 -FEP_58_38 -18.15 0.58 0 -FEP_60_48 -14.71 0.14 0 -FEP_65_33 -19.56 0.3 0 -FEP_62_49 -35.05 0.12 0 -FEP_63_42 -6.56 0.38 0 -FEP_63_43 -9.63 0.06 0 -FEP_65_42 -9.37 0.1 0 -FEP_63_31 -9.4 0.05 0 -FEP_63_45 -13.03 0.14 0 -FEP_62_39 -37.1 0.48 0 -FEP_61_50 -25.2 0.15 0 -FEP_63_35 -15.19 0.1 0 -FEP_64_51 -3.69 0.17 0 -FEP_65_45 -16.67 0.21 0 -FEP_61_45 -34.55 0.17 0 -FEP_64_43 -17.23 0.24 0 -FEP_62_48 -39.39 0.47 0 -FEP_58_23 0.43 0.1 0 -FEP_60_30 -17.65 0.07 0 -FEP_63_32 -14.5 0.14 0 -FEP_64_41 -17.48 0.44 1 -FEP_62_32 -44.33 0.29 0 -FEP_64_38 -13.7 0.35 0 -FEP_61_34 -27.48 0.18 0 -FEP_64_37 -20.68 0.2 0 -FEP_61_35 -36.04 0.24 0 -FEP_64_42 -13.61 0.14 0 -FEP_61_29 -14.73 0.39 0 -FEP_63_54 -10.25 0.1 0 -FEP_60_33 -21.54 0.2 0 -FEP_64_58 4.63 0.13 0 -FEP_60_40 -10.4 0.3 0 -FEP_60_51 -0.06 0.28 0 -FEP_61_38 -26.95 0.37 0 -FEP_63_29 6 0.37 0 -FEP_64_57 19.6 0.07 0 -FEP_62_54 -38.36 0.32 1 -FEP_58_41 -20.31 0.25 0 -FEP_65_29 2.18 0.36 0 -FEP_60_46 -22.69 0.21 0 -FEP_57_56 -8.17 0.1 0 -FEP_57_54 -37.42 0.14 0 -FEP_62_50 -33.36 0.11 0 -FEP_60_29 0.68 0.35 0 -FEP_65_37 -15.73 0.15 0 -FEP_65_46 -21.25 0.15 0 -FEP_60_38 -10.46 0.19 0 -FEP_63_46 -17.63 0.19 0 -FEP_64_52 -25.79 0.15 0 -FEP_62_38 -34.64 0.3 0 -FEP_58_39 -20.55 0.29 0 -FEP_61_30 -33.71 0.19 0 -FEP_60_45 -17.89 0.09 0 -FEP_63_36 -13.62 0.17 0 -FEP_61_47 -68.08 0.26 0 -FEP_61_57 5.54 0.46 0 -FEP_64_23 4.74 0.15 0 -FEP_63_50 -4.64 0.22 0 -FEP_61_31 -30.59 0.15 0 -FEP_64_31 -16.82 0.24 0 -FEP_60_54 -15.49 0.09 0 -FEP_63_61 20.52 0.34 0 -FEP_58_45 -25.41 0.13 0 -FEP_61_60 -16.22 0.21 0 -FEP_58_31 -21.46 0.21 0 -FEP_58_26 20.44 0.27 0 -FEP_61_53 -38.2 0.7 0 -FEP_62_36 -42.91 0.26 0 -FEP_60_41 -12.15 0.26 0 -FEP_58_27 -24.32 0.15 0 -FEP_60_36 -18.08 0.18 0 -FEP_63_37 -12.65 0.19 0 -FEP_61_36 -34.81 0.16 0 -FEP_63_57 27.49 0.16 0 -FEP_64_45 -21.35 0.32 0 -FEP_64_46 -24.73 0.41 0 -FEP_62_29 -22.13 0.78 0 -FEP_62_26 2.69 0.15 0 -FEP_58_36 -25.72 0.1 0 -FEP_63_26 31.88 0.28 0 -FEP_65_30 -16.18 0.08 0 -FEP_63_27 -12.07 0.09 0 -FEP_61_46 -37.82 0.43 0 -FEP_63_28 -14.1 0.39 0 -FEP_61_51 -16.85 0.21 0 -FEP_63_48 -9.89 0.31 0 -FEP_65_38 -9.78 0.42 0 -FEP_57_48 -37.7 0.44 0 -FEP_60_53 -22.93 0.06 0 -FEP_63_58 11.93 0.09 0 -FEP_64_53 -25.44 0.36 0 -FEP_60_43 -14.61 0.09 0 -FEP_58_49 -17.75 0.14 0 -FEP_60_57 22.74 0.11 0 -FEP_61_37 -33.9 0.19 0 -FEP_64_44 -12.16 0.4 0 -FEP_58_42 -18.67 0.52 0 -FEP_60_27 -17.14 0.14 0 -FEP_64_49 -13.96 0.13 0 -FEP_61_39 -28.51 0.24 0 -FEP_63_53 -17.87 0.19 0 -FEP_64_34 -15.49 0.42 0 -FEP_60_37 -18.19 0.39 0 -FEP_58_51 -7.52 0.24 0 -FEP_61_42 -27.04 0.29 1 -FEP_58_50 -15.84 0.17 0 -FEP_64_35 -21.85 0.19 0 -FEP_65_39 -12.45 0.35 0 -FEP_61_40 -25.94 0.45 0 -FEP_58_52 -31.52 0.74 0 -FEP_61_27 -32.7 0.34 0 -FEP_65_47 -50.46 0.3 0 -FEP_62_27 -41.96 0.16 0 -FEP_57_49 -33.23 0.29 0 -FEP_65_23 9.07 0.09 0 -FEP_64_50 -11.95 0.33 0 -FEP_62_57 -2.31 0.12 0 -FEP_58_34 -18.91 0.27 0 -FEP_65_44 -7.86 0.14 0 -FEP_58_43 -21.64 0.09 0 -FEP_58_30 -24.95 0.11 0 -FEP_63_60 4.93 0.04 0 -FEP_58_29 -7.05 0.3 0 -FEP_62_41 -36.91 0.41 0 -FEP_63_39 -8.8 0.4 0 -FEP_65_31 -12.62 0.31 0 -FEP_60_32 -18.97 0.16 0 -FEP_65_49 -9.3 0.19 0 -FEP_61_56 -2 0.1 0 -FEP_60_23 7.43 0.05 0 -FEP_62_46 -47.25 0.23 0 -FEP_61_52 -38.75 0.3 0 -FEP_57_52 -45.55 0.18 0 -FEP_65_34 -10.22 0.28 0 -FEP_58_40 -17.8 0.34 0 -FEP_64_48 -16.95 0.27 0 -FEP_65_50 -7.43 0.13 0 -FEP_60_31 -13.82 0.07 0 -FEP_58_54 -22.7 0.13 0 -FEP_65_36 -17.25 0.34 0 -FEP_65_41 -12.57 0.47 0 -FEP_60_47 -52.44 0.16 0 -FEP_60_39 -13.57 0.75 0 -FEP_64_62 21.64 0.11 0 -FEP_61_54 -31.42 0.33 1 -FEP_63_30 -12.8 0.13 0 -FEP_63_40 -6.18 0.43 0 -FEP_62_60 -25 0.22 0 -FEP_58_47 -58.9 0.1 0 -FEP_58_35 -27.14 0.24 0 -FEP_63_38 -6.53 0.2 0 -FEP_58_28 -25.85 0.15 0 -FEP_61_32 -35.03 0.45 0 -FEP_64_60 -2.52 0.19 0 -FEP_64_39 -16.87 0.31 0 -FEP_65_28 -17.47 0.24 0 -FEP_62_56 -9.86 0.2 0 -FEP_60_56 14.86 0.07 0 -FEP_57_53 -45.68 0.11 0 -FEP_62_37 -41.94 0.08 0 -FEP_61_43 -30.3 0.34 0 -FEP_57_50 -31.43 0.2 0 -FEP_62_45 -43.01 0.21 0 -FEP_60_35 -19.93 0.07 0 -FEP_64_28 -21.63 0.31 0 -FEP_60_58 7.23 0.15 0 -FEP_65_26 28.92 0.3 0 -FEP_61_33 -37.72 0.18 0 -FEP_64_29 -2.35 0.28 0 -FEP_65_48 -13.25 0.17 0 -FEP_62_42 -35.34 0.36 0 -FEP_64_32 -22.21 0.44 1 -FEP_62_30 -42.27 0.4 0 -FEP_57_51 -23.35 0.14 0 -FEP_65_32 -17.78 0.2 0 -FEP_63_51 4.54 0.32 0 -FEP_62_51 -25.21 0.06 0 -FEP_58_32 -26.62 0.3 0 -FEP_65_40 -6.86 0.71 3 -FEP_65_43 -12.89 0.12 0 -FEP_62_31 -38.76 0.28 0 -FEP_58_33 -28.85 0.44 0 -FEP_58_46 -29.63 0.17 0 -FEP_65_35 -18.09 0.06 0 -FEP_63_47 -46.85 0.1 0 -FEP_58_37 -24.52 0.23 0 -FEP_57_46 -44.84 0.18 0 -FEP_64_30 -20.19 0.11 0 -FEP_64_33 -24.27 0.34 0 -FEP_63_62 29.59 0.2 0 -FEP_62_23 -16.91 0.19 0 -FEP_62_53 -47.78 0.32 0 -FEP_63_56 18.77 0.38 0 -FEP_61_49 -26.94 0.14 0 -FEP_64_61 13.14 0.31 0 -FEP_58_57 15.36 0.17 0 -FEP_60_52 -23.13 0.28 0 -FEP_57_47 -74.57 0.32 0 -FEP_62_43 -39.59 0.31 0 -FEP_61_23 -8.5 0.25 0 -FEP_61_41 -28.35 0.63 0 -FEP_61_48 -30.61 0.28 0 -FEP_58_44 -16.72 0.14 0 -FEP_64_54 -17.98 0.18 0 -FEP_63_44 -4.56 0.14 0 -FEP_62_61 -8.57 0.11 0 -FEP_62_28 -43.35 0.15 0 -FEP_58_53 -30.02 0.23 0 -FEP_62_35 -44.93 0.12 0 -FEP_64_36 -21 0.09 0 -FEP_41_35 -8.04 0.83 0 -FEP_40_31 -5.59 0.93 2 -FEP_37_34 6.06 0.13 0 -FEP_42_26 38.25 0.35 0 -FEP_46_37 4.89 0.32 0 -FEP_30_26 44.9 0.34 0 -FEP_39_30 -5.22 0.42 0 -FEP_37_29 19.24 0.4 0 -FEP_35_26 47.09 0.17 0 -FEP_40_36 -8.5 0.97 2 -FEP_37_36 0.13 0.22 0 -FEP_45_41 4.85 0.3 0 -FEP_42_28 -7.55 0.22 0 -FEP_46_23 29.75 0.15 0 -FEP_45_36 0.11 0.2 0 -FEP_33_26 48.37 0.2 0 -FEP_37_32 -1.94 0.35 0 -FEP_36_31 4.12 0.28 0 -FEP_46_36 4.16 0.06 0 -FEP_29_27 -18.46 0.36 0 -FEP_39_34 0.08 0.44 0 -FEP_42_38 0.9 0.35 0 -FEP_47_35 32.39 0.23 0 -FEP_42_41 -1.68 0.72 1 -FEP_43_42 3.58 0.18 0 -FEP_33_29 21.88 0.22 0 -FEP_39_37 -6.03 0.59 0 -FEP_44_31 -4.8 0.09 0 -FEP_42_36 -7.4 0.2 0 -FEP_34_29 13.85 0.38 0 -FEP_38_30 -6.72 0.37 1 -FEP_43_39 1.35 0.25 0 -FEP_40_39 -2.52 0.44 0 -FEP_40_30 -8.34 0.69 6 -FEP_45_27 0.91 0.28 0 -FEP_44_29 10.38 0.24 0 -FEP_46_30 4.82 0.16 0 -FEP_32_26 46.72 0.29 0 -FEP_47_33 31.28 0.47 0 -FEP_45_38 6.53 0.22 0 -FEP_32_28 0.01 0.54 0 -FEP_40_26 36.83 0.36 0 -FEP_36_32 -1.25 0.07 0 -FEP_35_27 2.64 0.07 0 -FEP_43_33 -6.81 0.12 0 -FEP_45_32 -1.13 0.26 0 -FEP_32_30 1.79 0.13 0 -FEP_45_23 25.77 0.09 0 -FEP_46_38 11.3 0.38 0 -FEP_41_28 -8.22 0.99 3 -FEP_42_30 -6.58 0.09 0 -FEP_31_29 14.94 0.34 0 -FEP_46_29 23.43 0.16 0 -FEP_42_32 -8.33 0.37 0 -FEP_42_35 -8.61 0.21 0 -FEP_45_39 4.99 0.3 0 -FEP_41_34 0.74 0.69 0 -FEP_47_27 35.06 0.25 0 -FEP_37_27 0.68 0.37 0 -FEP_37_31 3.39 0.37 0 -FEP_39_32 -5.98 0.27 0 -FEP_41_37 -6.16 0.39 0 -FEP_39_38 0.39 0.45 0 -FEP_35_23 26.91 0.48 0 -FEP_40_28 -10.48 1.11 6 -FEP_43_32 -4.52 0.31 0 -FEP_42_40 3.73 1.31 3 -FEP_44_38 -1.38 0.33 0 -FEP_45_29 18.29 0.29 0 -FEP_46_34 11.24 0.16 0 -FEP_46_41 8.82 0.71 1 -FEP_43_41 1.41 0.76 0 -FEP_41_31 -2.43 0.79 1 -FEP_47_30 33.99 0.26 0 -FEP_45_37 0.62 0.24 0 -FEP_47_29 53.55 0.45 0 -FEP_27_26 44.54 0.27 0 -FEP_36_34 6.25 0.25 0 -FEP_43_29 15.23 0.23 0 -FEP_42_27 -6.29 0.53 0 -FEP_43_34 2.96 0.21 0 -FEP_44_30 -8.16 0.15 0 -FEP_38_36 -8.1 0.54 0 -FEP_34_30 -5.93 0.15 0 -FEP_38_35 -8.83 0.56 0 -FEP_40_35 -10.77 0.96 0 -FEP_36_29 18.41 0.25 0 -FEP_36_33 -3.35 0.12 0 -FEP_44_42 -1.28 0.18 0 -FEP_37_35 -1.82 0.23 0 -FEP_38_23 18.73 0.35 0 -FEP_29_28 -20.21 0.38 0 -FEP_36_30 0.72 0.13 0 -FEP_40_32 -9.76 1.07 1 -FEP_47_26 79.37 0.28 0 -FEP_46_28 3.22 0.5 0 -FEP_30_29 18.51 0.38 0 -FEP_35_29 20.82 0.22 0 -FEP_33_27 4.29 0.18 0 -FEP_30_28 -0.93 0.14 0 -FEP_34_28 -7.39 0.07 0 -FEP_36_28 -0.21 0.27 0 -FEP_44_26 37.34 0.18 0 -FEP_31_28 -5.33 0.38 0 -FEP_46_39 9.23 0.36 0 -FEP_31_27 -2.72 0.2 0 -FEP_34_26 38.74 0.16 0 -FEP_45_33 -3.13 0.14 0 -FEP_45_34 7.09 0.21 0 -FEP_34_31 -2.38 0.14 0 -FEP_34_33 -9.33 0.12 0 -FEP_41_26 40.3 0.41 0 -FEP_43_40 4.64 0.59 2 -FEP_47_34 40.3 0.11 0 -FEP_39_35 -6.48 0.56 0 -FEP_46_45 4.44 0.29 0 -FEP_39_27 -4.00 0.48 0 -FEP_29_23 7.31 0.25 0 -FEP_45_40 7.78 0.26 0 -FEP_36_26 45.87 0.22 0 -FEP_38_26 37.14 0.27 0 -FEP_42_29 11.13 0.14 0 -FEP_45_30 0.09 0.2 0 -FEP_38_31 -3.64 0.56 0 -FEP_34_23 19.31 0.18 0 -FEP_26_23 -19.73 0.16 0 -FEP_44_33 -11.85 0.15 0 -FEP_37_28 -1.4 0.15 0 -FEP_30_27 0.65 0.12 0 -FEP_42_39 -3.1 0.27 0 -FEP_37_23 24.74 0.09 0 -FEP_40_34 -2 0.9 1 -FEP_41_29 11.78 0.67 1 -FEP_45_43 3.51 0.16 0 -FEP_33_32 1.83 0.18 0 -FEP_40_27 -8.31 1.02 4 -FEP_36_35 -1.71 0.11 0 -FEP_47_31 38.16 0.19 0 -FEP_43_27 -2.41 0.14 0 -FEP_37_30 0.3 0.23 0 -FEP_43_31 0.2 0.26 0 -FEP_45_26 45.41 0.18 0 -FEP_44_23 17.42 0.11 0 -FEP_41_23 19.88 1.07 0 -FEP_47_36 33.7 0.18 0 -FEP_41_36 -5.28 0.61 0 -FEP_35_33 -1.42 0.07 0 -FEP_46_35 2.39 0.11 0 -FEP_40_33 -12.23 1.02 2 -FEP_44_28 -9.22 0.21 0 -FEP_44_34 -1.91 0.19 0 -FEP_46_26 49.59 0.36 0 -FEP_40_23 17.84 1.46 3 -FEP_45_42 7.18 0.07 0 -FEP_38_33 -10.55 0.38 0 -FEP_38_27 -5.81 0.94 0 -FEP_46_32 2.89 0.23 0 -FEP_42_23 18.5 0.07 0 -FEP_28_27 1.89 0.33 0 -FEP_37_26 44.93 0.19 0 -FEP_43_30 -3.1 0.1 0 -FEP_35_30 2.18 0.15 0 -FEP_41_39 0.63 0.2 0 -FEP_44_40 -0.9 0.53 0 -FEP_39_23 21.15 0.27 0 -FEP_32_23 28.5 1.11 0 -FEP_41_32 -4.72 0.19 4 -FEP_38_28 -9.98 0.81 1 -FEP_43_38 3.56 0.54 1 -FEP_36_27 1.06 0.18 0 -FEP_38_29 12.98 0.49 0 -FEP_31_30 -3.46 0.12 0 -FEP_47_23 59.36 0.15 0 -FEP_45_28 -0.52 0.22 0 -FEP_44_39 -3.59 0.42 0 -FEP_27_23 24.65 0.3 0 -FEP_43_37 -2.85 0.34 0 -FEP_46_43 7.76 0.07 0 -FEP_39_36 -4.99 0.46 0 -FEP_35_32 0.43 0.23 0 -FEP_35_28 0.94 0.37 0 -FEP_39_28 -5.91 0.52 1 -FEP_44_43 -4.95 0.11 0 -FEP_44_35 -10.1 0.07 0 -FEP_38_34 -0.33 0.41 1 -FEP_34_32 -7.12 0.24 0 -FEP_32_29 19.88 0.44 0 -FEP_41_40 2.15 0.56 0 -FEP_44_41 -3.86 0.17 3 -FEP_44_27 -7.49 0.12 0 -FEP_41_30 -6.29 0.99 2 -FEP_41_38 1.44 0.36 0 -FEP_39_31 -1.14 0.3 1 -FEP_42_33 -10.6 0.74 0 -FEP_31_26 40.67 0.17 0 -FEP_46_44 13.09 0.2 0 -FEP_36_23 26.22 0.21 0 -FEP_28_23 27.18 0.33 0 -FEP_41_27 -4.05 0.49 4 -FEP_46_33 1.16 0.18 0 -FEP_43_36 -4.09 0.23 0 -FEP_46_31 8.15 0.18 0 -FEP_45_44 8.3 0.1 0 -FEP_43_23 22.38 0.17 0 -FEP_43_35 -5.22 0.1 0 -FEP_33_31 6.71 0.18 0 -FEP_39_29 12.39 0.7 0 -FEP_40_38 -0.78 0.46 0 -FEP_35_31 5.83 0.08 0 -FEP_28_26 45.83 0.19 0 -FEP_43_26 42.12 0.15 0 -FEP_38_32 -9.72 1.07 3 -FEP_46_40 12.4 0.39 0 -FEP_39_33 -7.82 0.21 0 -FEP_45_31 4.19 0.23 0 -FEP_38_37 -7.24 0.43 0 -FEP_44_32 -9.64 0.15 0 -FEP_42_34 -0.97 0.23 0 -FEP_33_23 28.52 0.32 0 -FEP_40_29 10.99 0.54 0 -FEP_35_34 7.93 0.25 0 -FEP_42_37 -6.13 0.19 0 -FEP_47_28 32.74 0.18 0 -FEP_46_27 5.51 0.11 0 -FEP_47_32 32.48 0.31 0 -FEP_41_33 -8.37 1.16 1 -FEP_42_31 -2.94 0.21 0 -FEP_30_23 25.72 0.43 0 -FEP_39_26 39.59 0.46 0 -FEP_44_37 -7.41 0.1 0 -FEP_31_23 21.83 0.33 0 -FEP_33_28 1.79 0.47 0 -FEP_34_27 -5.03 0.28 0 -FEP_32_31 5.38 0.13 0 -FEP_32_27 2.17 0.14 0 -FEP_45_35 -1.98 0.11 0 -FEP_44_36 -9.24 0.19 0 -FEP_40_37 -7.47 0.43 2 -FEP_37_33 -3.1 0.23 0 -FEP_43_28 -4.12 0.35 0 -FEP_46_42 11 0.31 0 -FEP_33_30 4.31 0.23 0 -FEP_29_26 25.27 0.17 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/water_juju.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/water_juju.txt deleted file mode 100644 index b44e1546..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/no-vs/2fs/water_juju.txt +++ /dev/null @@ -1,71 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_42_54 -4.31 0.10 0 -FEP_65_60 1.40 0.10 0 -FEP_49_50 1.35 0.10 0 -FEP_34_31 -2.20 0.16 0 -FEP_27_39 4.67 0.61 0 -FEP_64_66 3.71 0.40 0 -FEP_41_40 3.13 0.65 0 -FEP_35_36 1.53 0.05 0 -FEP_56_57 8.11 0.11 0 -FEP_28_29 20.57 0.54 0 -FEP_66_65 -7.94 0.08 0 -FEP_54_51 13.87 0.26 0 -FEP_23_62 16.44 0.25 0 -FEP_42_48 -3.19 0.15 0 -FEP_28_45 0.62 0.17 0 -FEP_50_51 7.56 0.09 0 -FEP_28_48 4.81 0.34 0 -FEP_28_42 7.97 0.40 0 -FEP_27_28 -2.45 0.39 0 -FEP_42_51 9.90 0.41 0 -FEP_27_46 -5.29 0.13 0 -FEP_54_64 17.74 0.15 0 -FEP_27_34 5.35 0.24 0 -FEP_64_62 21.71 0.21 0 -FEP_35_53 -3.07 0.20 0 -FEP_27_38 6.60 0.83 0 -FEP_28_44 9.23 0.23 0 -FEP_51_62 24.80 0.10 0 -FEP_26_67 -8.75 0.30 0 -FEP_27_33 -4.42 0.19 0 -FEP_52_53 0.05 0.23 0 -FEP_43_47 -37.30 0.40 0 -FEP_39_38 0.49 0.30 0 -FEP_60_63 -4.85 0.06 0 -FEP_68_26 9.74 0.27 0 -FEP_27_41 5.84 0.51 4 -FEP_37_56 30.60 0.09 0 -FEP_32_33 -1.97 0.09 0 -FEP_64_63 -7.81 0.08 0 -FEP_37_53 -5.32 0.22 0 -FEP_35_37 2.21 0.18 0 -FEP_35_50 10.82 0.21 0 -FEP_33_53 -1.32 0.27 0 -FEP_63_58 10.88 0.09 0 -FEP_27_32 -2.40 0.10 0 -FEP_42_44 1.17 0.06 0 -FEP_27_40 6.39 0.55 4 -FEP_27_43 2.73 0.20 0 -FEP_35_52 -3.69 0.33 0 -FEP_42_45 -7.22 0.10 0 -FEP_58_56 6.97 0.25 0 -FEP_35_49 9.55 0.17 0 -FEP_30_31 3.37 0.07 0 -FEP_60_61 16.16 0.16 0 -FEP_43_46 -7.87 0.07 0 -FEP_33_36 3.08 0.11 0 -FEP_26_57 -6.33 0.31 0 -FEP_37_60 17.21 0.17 0 -FEP_37_50 8.43 0.08 0 -FEP_27_47 -34.34 0.30 0 -FEP_27_30 -0.73 0.10 0 -FEP_42_29 11.77 0.37 0 -FEP_33_35 2.07 0.30 0 -FEP_53_54 7.22 0.15 0 -FEP_64_23 4.58 0.09 0 -FEP_62_66 -18.08 0.24 0 -FEP_65_61 16.88 0.24 0 -FEP_54_68 33.10 0.19 0 -FEP_37_67 36.26 0.22 0 -FEP_38_30 -6.32 0.52 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/protein.txt deleted file mode 100755 index 997cb0a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,862 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_67_31 -27.36 0.48 0 -FEP_67_51 -17.11 0.34 0 -FEP_66_49 -14.87 0.48 0 -FEP_65_53 -20.81 0.29 0 -FEP_66_61 10.47 0.36 0 -FEP_65_62 28.09 0.24 0 -FEP_66_32 -23.06 0.41 0 -FEP_66_62 19.63 0.35 0 -FEP_65_51 3.57 0.28 0 -FEP_65_58 7.76 0.29 0 -FEP_66_31 -17.08 0.42 0 -FEP_66_46 -25.77 0.6 0 -FEP_66_65 -9.26 0.13 0 -FEP_66_30 -20.58 0.4 0 -FEP_66_39 -18.9 0.39 0 -FEP_66_37 -22.62 0.37 0 -FEP_66_50 -13.93 0.27 0 -FEP_66_27 -20.89 0.88 0 -FEP_65_60 2.5 0.1 0 -FEP_65_63 -2.75 0.34 0 -FEP_66_34 -12.95 0.54 0 -FEP_66_33 -27.82 1.02 0 -FEP_67_46 -36.99 0.23 0 -FEP_67_47 -64.29 0.43 0 -FEP_67_33 -36.93 0.52 0 -FEP_67_23 -9.01 0.22 0 -FEP_66_45 -21.77 0.29 0 -FEP_67_41 -30.67 0.73 0 -FEP_66_36 -23.19 0.35 0 -FEP_66_56 5.92 0.35 0 -FEP_67_49 -26.2 0.42 0 -FEP_66_28 -19.87 0.43 0 -FEP_66_43 -18.8 0.34 0 -FEP_66_57 16.08 0.18 0 -FEP_67_27 -30.88 0.4 0 -FEP_67_53 -41.63 0.26 0 -FEP_67_30 -31.22 0.33 0 -FEP_67_36 -34.49 0.11 0 -FEP_66_47 -53.28 0.43 0 -FEP_66_38 -19.74 0.51 0 -FEP_65_52 -17.67 0.29 0 -FEP_67_52 -37.86 0.41 0 -FEP_66_26 23.42 0.34 0 -FEP_66_51 -5.44 0.35 0 -FEP_67_40 -27.07 0.62 0 -FEP_67_34 -23.96 0.47 0 -FEP_66_44 -16.31 0.22 0 -FEP_67_38 -29.3 0.76 0 -FEP_66_58 -1.5 0.29 0 -FEP_66_42 -15.76 0.3 0 -FEP_66_54 -21.25 0.32 0 -FEP_67_48 -25.71 0.48 0 -FEP_65_61 19 0.31 0 -FEP_67_42 -27 0.29 0 -FEP_65_54 -11.86 0.21 0 -FEP_67_44 -27.83 0.28 0 -FEP_67_43 -30.12 0.24 0 -FEP_66_41 -18.95 1.08 0 -FEP_67_50 -25.44 0.14 0 -FEP_65_56 15.78 0.39 0 -FEP_67_32 -34.11 0.17 0 -FEP_65_57 25.94 0.36 0 -FEP_67_28 -30.62 0.34 0 -FEP_67_37 -32.86 0.25 0 -FEP_66_64 -3.05 0.34 0 -FEP_66_48 -15.58 0.72 0 -FEP_65_64 6.44 0.33 0 -FEP_67_54 -32.83 0.32 0 -FEP_67_35 -35.9 0.33 0 -FEP_66_63 -12.1 0.32 0 -FEP_67_39 -28.3 0.71 0 -FEP_66_53 -31.17 0.22 0 -FEP_66_60 -6.92 0.34 0 -FEP_66_52 -26.8 0.35 0 -FEP_66_29 0.48 0.59 0 -FEP_67_45 -33.42 0.33 0 -FEP_67_26 12.59 0.21 0 -FEP_67_29 -8.63 0.84 0 -FEP_66_40 -16.26 0.7 5 -FEP_66_35 -24.67 0.36 0 -FEP_66_23 2.14 0.22 0 -FEP_68_28 -35.83 0.58 0 -FEP_68_29 -14.47 0.37 0 -FEP_68_63 -28.03 0.3 0 -FEP_68_54 -37.39 0.25 0 -FEP_67_57 5.12 0.33 0 -FEP_68_36 -38.47 0.36 0 -FEP_68_44 -31.94 0.29 0 -FEP_68_42 -31.38 0.17 0 -FEP_67_64 -14.64 1.04 0 -FEP_67_65 -20.28 0.19 0 -FEP_68_50 -30.36 0.52 0 -FEP_67_66 -11.23 0.19 0 -FEP_68_57 1.03 0.12 0 -FEP_68_56 -8.64 0.23 0 -FEP_68_26 7.21 0.46 0 -FEP_67_61 -0.67 0.3 0 -FEP_68_43 -35.93 0.4 0 -FEP_68_27 -36.51 0.36 0 -FEP_68_64 -17.65 0.27 0 -FEP_68_35 -40.95 0.47 0 -FEP_67_62 7.93 0.23 0 -FEP_68_33 -40.23 0.21 0 -FEP_68_48 -30.73 0.28 0 -FEP_68_39 -33.77 1.1 0 -FEP_68_31 -32.99 0.63 0 -FEP_68_53 -46.52 0.29 0 -FEP_68_45 -38.31 0.19 0 -FEP_68_49 -31.84 0.37 0 -FEP_68_32 -39.22 0.49 0 -FEP_68_67 -4.93 0.32 0 -FEP_67_63 -22.9 0.23 0 -FEP_67_58 -12.02 0.36 0 -FEP_68_62 4.15 0.28 0 -FEP_68_38 -33.67 1.03 0 -FEP_68_40 -30.87 0.83 0 -FEP_68_34 -30.57 0.86 0 -FEP_68_65 -25 0.31 0 -FEP_67_60 -18.26 0.19 0 -FEP_68_60 -22.26 0.42 0 -FEP_68_66 -16.29 0.32 0 -FEP_68_51 -21.28 0.41 0 -FEP_68_47 -69.86 0.55 0 -FEP_68_61 -5.71 0.26 0 -FEP_68_58 -16.82 0.28 0 -FEP_68_37 -37.82 0.39 0 -FEP_68_30 -36.04 0.33 0 -FEP_68_41 -34.89 0.72 0 -FEP_68_23 -13.54 0.31 0 -FEP_68_52 -43.83 0.68 0 -FEP_67_56 -3.59 0.21 1 -FEP_68_46 -42 0.29 0 -FEP_48_26 38.39 0.37 0 -FEP_50_43 -4.67 0.27 0 -FEP_48_47 -38.14 0.22 0 -FEP_49_39 -3.27 0.5 0 -FEP_50_44 -1.92 0.32 0 -FEP_50_40 -2.74 0.52 3 -FEP_48_23 17.99 0.38 0 -FEP_49_37 -6.95 0.21 0 -FEP_49_31 -1.15 0.3 0 -FEP_48_44 0.25 0.41 0 -FEP_49_41 -3.88 0.52 1 -FEP_49_47 -37.57 0.16 0 -FEP_48_45 -6.82 0.33 0 -FEP_49_30 -5.37 0.26 0 -FEP_49_38 -3.31 0.54 0 -FEP_47_37 30.85 0.32 0 -FEP_50_33 -10.92 0.24 0 -FEP_50_28 -5.23 0.29 1 -FEP_47_44 37.99 0.27 0 -FEP_49_29 16.47 0.68 0 -FEP_48_30 -4.94 0.25 0 -FEP_47_46 26.23 0.27 0 -FEP_49_44 -0.55 0.54 0 -FEP_49_23 16.63 0.34 0 -FEP_49_46 -10.98 0.53 0 -FEP_50_34 0.78 0.33 0 -FEP_47_42 36.5 0.34 0 -FEP_48_41 -3.22 0.96 3 -FEP_49_45 -7.77 0.56 0 -FEP_49_32 -7.58 0.32 0 -FEP_47_45 31 0.41 1 -FEP_48_42 -0.22 0.37 0 -FEP_50_37 -7.8 0.21 0 -FEP_47_43 33.26 0.29 0 -FEP_50_42 -0.7 0.26 0 -FEP_49_28 -4.4 0.39 0 -FEP_47_41 34.21 0.58 0 -FEP_48_35 -9.77 0.3 0 -FEP_50_48 -0.37 0.44 0 -FEP_50_39 -3.91 0.4 0 -FEP_48_40 -2.27 0.89 2 -FEP_49_35 -10.24 0.36 0 -FEP_50_29 15.75 0.62 0 -FEP_50_30 -6.25 0.32 0 -FEP_49_27 -4.94 0.32 0 -FEP_50_35 -10.25 0.26 0 -FEP_48_37 -6.92 0.36 0 -FEP_50_26 38.04 0.19 0 -FEP_49_48 1.28 0.98 0 -FEP_48_36 -7.96 0.39 0 -FEP_48_28 -5.58 0.3 0 -FEP_49_34 1.01 0.19 0 -FEP_48_38 -1.49 0.39 0 -FEP_50_41 -4.58 0.3 0 -FEP_50_23 17.1 0.24 0 -FEP_49_36 -7.92 0.24 0 -FEP_48_43 -4.09 0.35 0 -FEP_49_33 -10.51 0.48 0 -FEP_50_46 -12.05 0.34 0 -FEP_47_40 36.84 0.73 3 -FEP_48_29 16.16 0.7 0 -FEP_50_31 -2 0.33 0 -FEP_48_39 -0.39 0.9 0 -FEP_48_34 1.74 0.61 0 -FEP_49_42 -0.47 0.41 0 -FEP_49_40 -1.62 1.36 2 -FEP_48_33 -10.53 0.31 0 -FEP_49_26 38.49 0.43 0 -FEP_50_32 -8.23 0.44 0 -FEP_47_39 35.27 0.51 0 -FEP_48_27 -5.08 0.32 0 -FEP_48_32 -7.57 0.4 0 -FEP_50_45 -7.75 0.29 0 -FEP_49_43 -4.4 0.35 0 -FEP_50_27 -5.22 0.28 0 -FEP_48_31 -1.34 0.38 0 -FEP_50_36 -9.06 0.28 0 -FEP_50_38 -2.78 0.59 0 -FEP_48_46 -11.26 0.31 0 -FEP_47_38 35.89 0.77 0 -FEP_50_47 -38.41 0.24 1 -FEP_51_50 -7.86 0.18 0 -FEP_51_47 -46.8 0.17 0 -FEP_52_50 12.82 0.38 0 -FEP_53_51 25.11 0.6 0 -FEP_53_50 17.02 0.36 0 -FEP_53_27 10.61 0.55 0 -FEP_51_23 8.66 0.34 0 -FEP_51_27 -14.31 0.37 0 -FEP_51_32 -15.96 0.19 1 -FEP_52_36 3.67 0.44 0 -FEP_53_43 11.86 0.25 0 -FEP_53_31 14.67 0.37 0 -FEP_52_27 6.98 0.53 0 -FEP_51_33 -20.77 0.55 1 -FEP_53_40 14.09 0.86 6 -FEP_51_46 -20.21 0.45 0 -FEP_53_23 33.63 0.33 0 -FEP_51_34 -7.83 0.34 0 -FEP_50_49 -1.14 0.26 0 -FEP_51_40 -12.03 0.44 0 -FEP_52_45 5.04 0.53 0 -FEP_51_31 -10.64 0.34 0 -FEP_53_36 8.58 0.35 0 -FEP_53_28 11.03 0.51 0 -FEP_51_38 -11.39 0.59 0 -FEP_53_49 15.93 0.57 0 -FEP_53_42 14.97 0.33 0 -FEP_52_26 50.52 0.28 0 -FEP_51_29 5.52 0.6 0 -FEP_52_28 7.55 0.34 0 -FEP_51_43 -13.41 0.3 0 -FEP_53_45 8.3 0.42 0 -FEP_51_26 29.29 0.41 0 -FEP_52_37 5.03 0.35 0 -FEP_52_34 13.46 0.28 0 -FEP_52_46 0.76 0.31 0 -FEP_51_42 -9.12 0.32 0 -FEP_51_35 -18.76 0.23 0 -FEP_51_37 -16.32 0.28 1 -FEP_51_28 -14.76 0.31 0 -FEP_52_35 2.05 0.38 0 -FEP_52_40 10.21 1.12 4 -FEP_52_41 8.55 0.91 0 -FEP_53_37 8.51 0.17 0 -FEP_52_48 12.07 0.39 0 -FEP_51_44 -10.38 0.25 0 -FEP_52_39 9.8 0.75 0 -FEP_51_39 -11.49 0.91 0 -FEP_53_46 5.27 0.36 0 -FEP_53_47 -22.46 0.48 0 -FEP_52_29 29.02 0.73 0 -FEP_52_49 11.46 0.36 0 -FEP_51_30 -15.2 0.34 0 -FEP_52_23 29.01 0.45 0 -FEP_52_31 11.05 0.24 0 -FEP_52_51 20.74 0.45 0 -FEP_51_36 -18.39 0.58 0 -FEP_53_34 16.64 0.77 0 -FEP_53_33 4.57 0.4 0 -FEP_53_29 31.52 0.31 0 -FEP_51_45 -16.16 0.52 0 -FEP_51_48 -9.7 0.34 0 -FEP_52_30 6.09 0.38 0 -FEP_52_44 11.42 0.44 0 -FEP_52_32 4.53 0.34 0 -FEP_53_35 6.36 0.3 0 -FEP_52_43 7.08 0.44 0 -FEP_53_39 14.43 0.93 0 -FEP_52_42 11 0.54 0 -FEP_52_38 11.67 0.67 0 -FEP_53_41 12.3 0.89 1 -FEP_51_41 -13.56 0.46 0 -FEP_53_38 12.85 1.32 1 -FEP_51_49 -9.92 0.3 1 -FEP_53_48 14.53 0.68 0 -FEP_53_44 13.74 0.25 0 -FEP_53_26 53.55 0.25 0 -FEP_53_32 7.39 0.81 0 -FEP_52_33 2.27 0.44 0 -FEP_52_47 -25.75 0.32 0 -FEP_53_30 9.55 0.49 0 -FEP_56_34 -21.04 0.25 0 -FEP_56_44 -22.61 0.36 0 -FEP_56_28 -28.38 0.86 0 -FEP_56_37 -28.97 0.37 0 -FEP_54_51 14.39 0.67 0 -FEP_54_40 2.18 1.25 8 -FEP_57_35 -42.22 0.33 1 -FEP_56_54 -29.67 0.77 1 -FEP_57_36 -40.59 0.45 0 -FEP_56_48 -21.89 0.4 0 -FEP_54_50 7.34 0.52 0 -FEP_56_46 -33.2 0.28 0 -FEP_54_29 21.74 0.53 0 -FEP_56_35 -31.63 0.35 0 -FEP_54_42 6.16 0.17 0 -FEP_54_39 3.26 0.88 0 -FEP_56_38 nan nan 9 -FEP_54_34 7.71 0.5 0 -FEP_56_52 -33.37 0.32 0 -FEP_56_30 -27.41 0.41 0 -FEP_56_29 -5.48 0.92 0 -FEP_54_47 -30.86 0.5 0 -FEP_56_36 -30.5 0.38 0 -FEP_57_41 -36.16 0.76 0 -FEP_54_45 -1.56 0.24 0 -FEP_54_32 0.52 0.95 0 -FEP_54_43 3.52 0.6 0 -FEP_56_26 16.43 0.29 0 -FEP_56_31 -23.6 0.31 0 -FEP_57_32 -39.38 0.56 0 -FEP_56_33 -32.27 0.24 0 -FEP_54_30 1.85 0.2 0 -FEP_53_52 3.87 0.52 0 -FEP_54_28 1.82 0.47 0 -FEP_56_43 -26.38 0.23 0 -FEP_57_42 -32.32 0.41 0 -FEP_54_23 24.01 0.22 0 -FEP_54_38 3.87 0.78 0 -FEP_54_52 -5.97 0.43 0 -FEP_57_23 -14.11 0.27 0 -FEP_57_44 -32.98 0.34 0 -FEP_57_39 -32.58 0.41 0 -FEP_57_27 -36.84 0.34 0 -FEP_56_49 -22.89 0.4 0 -FEP_54_36 -1.56 0.4 0 -FEP_56_40 -23 0.59 0 -FEP_57_34 -31.11 0.52 0 -FEP_56_42 -24.08 1.14 1 -FEP_57_43 -36.34 0.43 0 -FEP_56_32 -29.86 0.37 0 -FEP_54_44 4.85 0.37 0 -FEP_54_48 7.06 0.37 0 -FEP_57_26 5.62 0.3 0 -FEP_56_41 -27 0.39 0 -FEP_54_53 -8.86 0.25 0 -FEP_56_47 -59.99 0.38 0 -FEP_57_33 -42.45 0.27 0 -FEP_56_27 -27.02 0.55 0 -FEP_57_45 -38.53 0.3 0 -FEP_54_33 -4.1 0.98 2 -FEP_54_31 4.86 0.57 0 -FEP_54_26 44.44 0.2 0 -FEP_54_37 -0.17 0.53 0 -FEP_56_51 -12.71 0.22 0 -FEP_56_45 -29.13 0.35 0 -FEP_57_38 -33.08 0.99 0 -FEP_54_41 3.26 0.93 2 -FEP_57_29 -16.58 0.37 0 -FEP_57_28 -36.64 0.39 0 -FEP_57_40 -32.86 0.48 0 -FEP_54_27 0.84 0.84 0 -FEP_54_49 6.4 0.45 0 -FEP_56_50 -21.42 0.24 0 -FEP_57_37 -38.1 0.26 0 -FEP_57_31 -33.3 0.65 0 -FEP_54_46 -4.49 0.38 0 -FEP_54_35 -2.44 0.52 0 -FEP_57_30 -38.11 0.5 0 -FEP_56_53 -37.93 0.27 1 -FEP_56_39 -25.46 0.47 0 -FEP_56_23 -4.92 0.45 1 -FEP_58_48 -14.17 0.41 0 -FEP_64_27 -17.3 0.59 0 -FEP_60_28 -12.56 0.35 0 -FEP_60_50 -8.06 0.33 0 -FEP_60_34 -8.11 0.55 0 -FEP_63_41 -7.32 0.76 1 -FEP_65_27 -10.13 0.5 0 -FEP_63_52 -15.36 0.33 0 -FEP_63_23 13.71 0.38 0 -FEP_64_63 -9.47 0.26 0 -FEP_64_26 26.07 0.56 0 -FEP_62_52 -46.25 0.19 0 -FEP_64_56 7.86 1.24 0 -FEP_61_26 12.69 0.26 1 -FEP_61_44 -25.46 0.34 0 -FEP_64_47 -49.67 0.63 0 -FEP_63_49 -2.69 0.46 0 -FEP_62_40 -36.34 0.61 0 -FEP_60_26 29.72 0.2 0 -FEP_64_40 -13.68 0.57 0 -FEP_61_28 -30.49 0.32 1 -FEP_62_34 -34.04 0.23 0 -FEP_60_49 -8.04 0.27 0 -FEP_60_42 -9.33 0.37 0 -FEP_62_47 -72.91 0.29 0 -FEP_58_56 7.59 0.24 0 -FEP_62_33 -44.38 0.52 0 -FEP_61_58 -11.45 0.31 0 -FEP_63_33 -13.46 0.28 0 -FEP_62_44 -35.68 0.36 0 -FEP_63_34 -1.09 0.59 0 -FEP_60_44 -8.74 0.32 0 -FEP_62_58 -19.77 0.36 0 -FEP_58_38 -18.81 0.7 0 -FEP_60_48 -8.22 0.5 0 -FEP_65_33 -16.15 0.6 0 -FEP_62_49 -34.46 0.26 0 -FEP_63_42 -3.68 0.52 0 -FEP_63_43 -6.28 0.43 0 -FEP_65_42 -6.63 0.18 0 -FEP_63_31 -4.32 0.42 0 -FEP_63_45 -10.02 0.49 0 -FEP_62_39 -36.2 0.67 0 -FEP_61_50 -24.66 0.14 0 -FEP_63_35 -13.22 0.46 0 -FEP_64_51 -3.72 0.24 0 -FEP_65_45 -13.11 0.5 0 -FEP_61_45 -33.53 0.43 0 -FEP_64_43 -15.05 0.49 0 -FEP_62_48 -35.06 0.32 0 -FEP_58_23 3.4 0.34 0 -FEP_60_30 -13.52 0.24 0 -FEP_63_32 -11.09 0.56 0 -FEP_64_41 -16.83 0.59 0 -FEP_62_32 -41.74 0.26 0 -FEP_64_38 -13.98 0.79 1 -FEP_61_34 -23.75 0.37 0 -FEP_64_37 -20.07 0.33 0 -FEP_61_35 -34.67 0.46 0 -FEP_64_42 -12.81 0.29 0 -FEP_61_29 -9.8 0.65 0 -FEP_63_54 -9.41 0.18 0 -FEP_60_33 -18.66 0.21 0 -FEP_64_58 1.68 0.13 0 -FEP_60_40 -8.72 0.73 0 -FEP_60_51 1.37 0.23 0 -FEP_61_38 -27.41 0.49 0 -FEP_63_29 12 0.54 0 -FEP_64_57 19.04 0.3 0 -FEP_62_54 -39.53 0.64 0 -FEP_58_41 -17.97 0.83 1 -FEP_65_29 10.16 0.46 0 -FEP_60_46 -19.19 0.28 0 -FEP_57_56 -10.03 0.15 0 -FEP_57_54 -37.78 0.23 0 -FEP_62_50 -33.84 0.24 0 -FEP_60_29 8.84 0.57 0 -FEP_65_37 -13.7 0.22 0 -FEP_65_46 -17.1 0.23 0 -FEP_60_38 -10.85 1.04 0 -FEP_63_46 -14.26 0.43 0 -FEP_64_52 -24.44 0.31 0 -FEP_62_38 -36.25 0.62 0 -FEP_58_39 -16.81 0.93 0 -FEP_61_30 -30.86 0.41 0 -FEP_60_45 -15.77 0.3 0 -FEP_63_36 -11.28 0.58 0 -FEP_61_47 -63.4 0.26 0 -FEP_61_57 5.46 0.23 0 -FEP_64_23 4.41 0.3 0 -FEP_63_50 -2.66 0.51 0 -FEP_61_31 -27.1 0.46 0 -FEP_64_31 -13.14 0.4 0 -FEP_60_54 -14.37 0.35 0 -FEP_63_61 22.2 0.29 0 -FEP_58_45 -21.94 0.28 0 -FEP_61_60 -17.79 0.44 0 -FEP_58_31 -14.46 0.3 0 -FEP_58_26 24.33 0.42 0 -FEP_61_53 -41.19 0.58 2 -FEP_62_36 -42.06 0.41 0 -FEP_60_41 -12.62 0.54 0 -FEP_58_27 -18.17 0.33 0 -FEP_60_36 -16.3 0.33 0 -FEP_63_37 -10.72 0.36 0 -FEP_61_36 -33.66 0.21 0 -FEP_63_57 28.09 0.36 0 -FEP_64_45 -20.75 0.34 0 -FEP_64_46 -22.62 0.46 0 -FEP_62_29 -19.96 0.64 0 -FEP_62_26 4.29 0.25 0 -FEP_58_36 -22.96 0.4 0 -FEP_63_26 34.88 0.45 0 -FEP_65_30 -10.95 0.29 0 -FEP_63_27 -8.08 0.37 0 -FEP_61_46 -35.84 0.46 0 -FEP_63_28 -7.78 0.51 0 -FEP_61_51 -15.7 0.25 0 -FEP_63_48 -4.15 0.32 1 -FEP_65_38 -9.32 1.05 0 -FEP_57_48 -32.72 0.41 0 -FEP_60_53 -23.7 0.2 0 -FEP_63_58 10.43 0.25 0 -FEP_64_53 -28.91 0.66 0 -FEP_60_43 -11.78 0.28 0 -FEP_58_49 -14.19 0.48 0 -FEP_60_57 23.54 0.48 0 -FEP_61_37 -31.96 0.26 0 -FEP_64_44 -13.62 0.29 0 -FEP_58_42 -14.65 0.23 0 -FEP_60_27 -13.39 0.4 0 -FEP_64_49 -12.76 0.51 0 -FEP_61_39 -27.53 0.62 0 -FEP_63_53 -19.06 0.12 0 -FEP_64_34 -11.5 0.48 1 -FEP_60_37 -15.34 0.35 0 -FEP_58_51 -5.43 0.29 0 -FEP_61_42 -23.74 1.01 1 -FEP_58_50 -13.12 0.27 0 -FEP_64_35 -22.95 0.51 0 -FEP_65_39 -9.56 0.58 0 -FEP_61_40 -25.67 0.54 0 -FEP_58_52 -27.01 1.09 0 -FEP_61_27 -29.82 0.39 0 -FEP_65_47 -43.67 0.33 0 -FEP_62_27 -39.54 0.41 0 -FEP_57_49 -32.56 0.38 0 -FEP_65_23 11.46 0.21 0 -FEP_64_50 -12.54 0.51 0 -FEP_62_57 -3.32 0.27 0 -FEP_58_34 -12.76 1.09 0 -FEP_65_44 -6.8 0.36 1 -FEP_58_43 -19.62 0.46 0 -FEP_58_30 -19.57 0.35 0 -FEP_63_60 5.06 0.37 0 -FEP_58_29 1.31 0.38 0 -FEP_62_41 -37.67 0.29 1 -FEP_63_39 -5.86 0.63 0 -FEP_65_31 -6.95 0.39 0 -FEP_60_32 -15.64 0.55 0 -FEP_65_49 -6.14 0.44 0 -FEP_61_56 -3.43 0.17 0 -FEP_60_23 9 0.39 0 -FEP_62_46 -45.88 0.34 0 -FEP_61_52 -36.92 0.56 0 -FEP_57_52 -43.98 0.43 0 -FEP_65_34 -4.98 0.43 0 -FEP_58_40 -14.05 0.4 0 -FEP_64_48 -12.72 0.38 0 -FEP_65_50 -5.05 0.21 0 -FEP_60_31 -9.05 0.48 0 -FEP_58_54 -20.5 0.21 0 -FEP_65_36 -13.86 0.34 0 -FEP_65_41 -10.18 0.58 0 -FEP_60_47 -46.75 0.69 0 -FEP_60_39 -10.34 0.68 0 -FEP_64_62 22.66 0.26 0 -FEP_61_54 -29.21 1.04 1 -FEP_63_30 -8.75 0.59 0 -FEP_63_40 -4.83 1 1 -FEP_62_60 -26.32 0.35 0 -FEP_58_47 -51.75 0.58 0 -FEP_58_35 -24.17 0.43 0 -FEP_63_38 -7.21 0.55 0 -FEP_58_28 -17.83 0.42 0 -FEP_61_32 -32.91 0.48 0 -FEP_64_60 -4.92 0.33 0 -FEP_64_39 -16.74 0.96 1 -FEP_65_28 -10.39 0.48 0 -FEP_62_56 -12.59 0.43 0 -FEP_60_56 14.02 0.3 1 -FEP_57_53 -47.34 0.34 0 -FEP_62_37 -41.25 0.23 0 -FEP_61_43 -29.82 0.32 0 -FEP_57_50 -31.37 0.35 0 -FEP_62_45 -42.07 0.3 0 -FEP_60_35 -18.09 0.22 0 -FEP_64_28 -17.7 0.33 0 -FEP_60_58 5.51 0.22 0 -FEP_65_26 32.26 0.21 1 -FEP_61_33 -36.55 0.31 0 -FEP_64_29 4.05 1.04 0 -FEP_65_48 -6.23 0.28 0 -FEP_62_42 -34.91 0.5 0 -FEP_64_32 -21.02 1.35 0 -FEP_62_30 -40.02 0.22 0 -FEP_57_51 -22.85 0.25 0 -FEP_65_32 -13.22 0.54 1 -FEP_63_51 5.96 0.44 0 -FEP_62_51 -24.82 0.12 0 -FEP_58_32 -22.49 0.51 1 -FEP_65_40 -6.64 0.89 5 -FEP_65_43 -10.65 0.29 1 -FEP_62_31 -35.77 0.29 0 -FEP_58_33 -24.81 0.53 0 -FEP_58_46 -25.88 0.33 0 -FEP_65_35 -15.06 0.28 0 -FEP_63_47 -39.65 0.38 0 -FEP_58_37 -20.99 0.36 0 -FEP_57_46 -43.94 0.47 0 -FEP_64_30 -17.83 0.29 0 -FEP_64_33 -23.01 0.75 0 -FEP_63_62 31.2 0.33 0 -FEP_62_23 -16.79 0.28 0 -FEP_62_53 -49.97 0.48 0 -FEP_63_56 18.53 0.3 0 -FEP_61_49 -25.89 0.41 0 -FEP_64_61 12.59 0.35 0 -FEP_58_57 17.68 0.31 0 -FEP_60_52 -19.66 0.44 0 -FEP_57_47 -69.44 0.47 0 -FEP_62_43 -38.23 0.31 0 -FEP_61_23 -7.85 0.32 0 -FEP_61_41 -29.64 0.88 0 -FEP_61_48 -25.28 0.38 0 -FEP_58_44 -15.95 0.37 0 -FEP_64_54 -19.1 0.21 0 -FEP_63_44 -3.86 0.36 1 -FEP_62_61 -9.16 0.21 0 -FEP_62_28 -40.11 0.57 0 -FEP_58_53 -29.87 0.28 0 -FEP_62_35 -44.56 0.42 0 -FEP_64_36 -21.5 0.43 0 -FEP_41_35 -5.1 1.13 3 -FEP_40_31 -2.04 1.83 6 -FEP_37_34 8.8 0.21 0 -FEP_42_26 39.32 0.37 0 -FEP_46_37 3.87 0.19 0 -FEP_30_26 43.72 0.39 0 -FEP_39_30 -3.65 0.98 0 -FEP_37_29 24.24 0.61 0 -FEP_35_26 47.78 0.38 0 -FEP_40_36 -10.82 0.63 3 -FEP_37_36 -0.1 0.36 0 -FEP_45_41 2.72 1.28 0 -FEP_42_28 -5 0.32 0 -FEP_46_23 28.71 0.32 0 -FEP_45_36 -0.7 0.24 0 -FEP_33_26 47.62 0.42 0 -FEP_37_32 -0.42 0.41 0 -FEP_36_31 6.76 0.18 0 -FEP_46_36 2.7 0.17 0 -FEP_29_27 -21.77 0.52 0 -FEP_39_34 3.95 0.53 0 -FEP_42_38 -3.56 0.71 0 -FEP_47_35 27.98 0.38 0 -FEP_42_41 -3.42 0.68 0 -FEP_43_42 3.08 0.55 0 -FEP_33_29 28.96 0.71 0 -FEP_39_37 -3.79 0.55 0 -FEP_44_31 -0.96 0.37 0 -FEP_42_36 -6.69 0.92 0 -FEP_34_29 15.88 0.84 0 -FEP_38_30 -1.65 0.79 2 -FEP_43_39 -0.28 0.6 0 -FEP_40_39 -2.19 0.96 0 -FEP_40_30 -5.8 0.99 5 -FEP_45_27 2.38 0.67 0 -FEP_44_29 16.6 0.68 0 -FEP_46_30 5.49 0.18 0 -FEP_32_26 45.47 0.3 0 -FEP_47_33 28.1 0.32 0 -FEP_45_38 4.81 1.19 1 -FEP_32_28 2.67 0.37 0 -FEP_40_26 39.91 0.54 0 -FEP_36_32 0.14 0.24 0 -FEP_35_27 4.15 0.29 0 -FEP_43_33 -5.91 0.31 0 -FEP_45_32 -0.55 0.43 0 -FEP_32_30 1.56 0.26 0 -FEP_45_23 25.12 0.32 0 -FEP_46_38 8.21 1.03 1 -FEP_41_28 -1.83 0.92 0 -FEP_42_30 -5.11 0.43 0 -FEP_31_29 16.64 0.32 0 -FEP_46_29 27.15 0.94 0 -FEP_42_32 -7.7 0.85 0 -FEP_42_35 -8.81 0.18 0 -FEP_45_39 3.41 0.66 0 -FEP_41_34 6.18 0.71 1 -FEP_47_27 33.52 0.39 0 -FEP_37_27 2.99 0.36 0 -FEP_37_31 5.73 0.28 0 -FEP_39_32 -4.47 0.58 1 -FEP_41_37 -1.94 0.31 1 -FEP_39_38 -0.15 1.03 0 -FEP_35_23 28.08 0.35 0 -FEP_40_28 -5.57 2.01 8 -FEP_43_32 -3.33 0.22 1 -FEP_42_40 -1.48 0.86 4 -FEP_44_38 -2.11 1.02 0 -FEP_45_29 23.97 0.62 0 -FEP_46_34 11.98 0.43 0 -FEP_46_41 8.02 1.03 3 -FEP_43_41 -0.75 1.12 1 -FEP_41_31 2.78 0.81 2 -FEP_47_30 32.27 0.24 0 -FEP_45_37 -0.18 0.28 0 -FEP_47_29 54.85 0.77 0 -FEP_27_26 42.23 0.34 0 -FEP_36_34 8.94 0.4 0 -FEP_43_29 20.91 0.87 0 -FEP_42_27 -3.79 0.59 0 -FEP_43_34 5 0.54 0 -FEP_44_30 -5.02 0.6 0 -FEP_38_36 -3.86 0.57 0 -FEP_34_30 -6.07 0.28 0 -FEP_38_35 -6.78 0.81 0 -FEP_40_35 -7.42 0.89 4 -FEP_36_29 24.42 0.41 0 -FEP_36_33 -1.84 0.18 0 -FEP_44_42 0.47 0.33 0 -FEP_37_35 -2.85 0.27 0 -FEP_38_23 20 0.88 0 -FEP_29_28 -21.75 0.55 0 -FEP_36_30 2.3 0.29 0 -FEP_40_32 -4.84 1.32 4 -FEP_47_26 75.99 0.28 0 -FEP_46_28 6.34 0.3 0 -FEP_30_29 22.19 0.66 0 -FEP_35_29 25.81 0.52 0 -FEP_33_27 5.77 0.16 0 -FEP_30_28 0.96 0.47 0 -FEP_34_28 -6.02 0.51 0 -FEP_36_28 3.76 0.41 0 -FEP_44_26 39.8 0.39 0 -FEP_31_28 -2.96 0.24 0 -FEP_46_39 8.87 0.48 0 -FEP_31_27 -3.2 0.32 0 -FEP_34_26 36.38 0.2 0 -FEP_45_33 -2.27 0.17 0 -FEP_45_34 8.56 0.49 0 -FEP_34_31 -1.96 0.2 0 -FEP_34_33 -11.19 0.27 0 -FEP_41_26 41.26 0.55 0 -FEP_43_40 2.79 1 3 -FEP_47_34 38.27 0.34 0 -FEP_39_35 -7.36 0.56 0 -FEP_46_45 3.06 0.32 1 -FEP_39_27 -1.16 0.35 1 -FEP_29_23 1.22 0.73 0 -FEP_45_40 5.37 0.57 0 -FEP_36_26 46.12 0.27 0 -FEP_38_26 39.54 0.38 0 -FEP_42_29 16.59 0.49 0 -FEP_45_30 1.77 0.31 0 -FEP_38_31 1.2 0.87 0 -FEP_34_23 16.7 0.31 0 -FEP_26_23 -21.2 0.4 0 -FEP_44_33 -10.78 0.47 0 -FEP_37_28 2.16 0.37 0 -FEP_30_27 0.85 0.24 0 -FEP_42_39 -2.95 0.61 0 -FEP_37_23 25.13 0.27 0 -FEP_40_34 3.2 0.82 3 -FEP_41_29 19.87 1.39 4 -FEP_45_43 3.6 0.51 0 -FEP_33_32 3.07 0.29 0 -FEP_40_27 -2.81 0.12 6 -FEP_36_35 -1.56 0.14 0 -FEP_47_31 36.59 0.25 0 -FEP_43_27 -0.59 0.46 0 -FEP_37_30 2.01 0.3 0 -FEP_43_31 3.14 0.38 0 -FEP_45_26 46.06 0.3 0 -FEP_44_23 18.38 0.24 0 -FEP_41_23 22.62 0.83 1 -FEP_47_36 29.01 0.33 0 -FEP_41_36 -4.51 0.54 2 -FEP_35_33 -0.81 0.24 0 -FEP_46_35 1.4 0.13 0 -FEP_40_33 -10.12 1.34 5 -FEP_44_28 -4.75 0.47 0 -FEP_44_34 1.92 0.43 0 -FEP_46_26 49.04 0.31 0 -FEP_40_23 19.21 1.27 5 -FEP_45_42 7.12 0.16 1 -FEP_38_33 -9.38 1.26 1 -FEP_38_27 -0.62 0.61 3 -FEP_46_32 3.29 0.16 0 -FEP_42_23 18.28 0.2 0 -FEP_28_27 1.04 0.31 0 -FEP_37_26 45.56 0.26 0 -FEP_43_30 -2.17 0.56 0 -FEP_35_30 3.96 0.23 0 -FEP_41_39 0.82 0.64 0 -FEP_44_40 -0.59 0.97 0 -FEP_39_23 21.22 0.64 0 -FEP_32_23 25.22 0.43 0 -FEP_41_32 -2.03 0.4 3 -FEP_38_28 -1.46 0.92 0 -FEP_43_38 -0.39 0.91 0 -FEP_36_27 2.79 0.45 0 -FEP_38_29 18.19 0.47 0 -FEP_31_30 -4.05 0.17 0 -FEP_47_23 55.93 0.42 0 -FEP_45_28 1.79 0.61 0 -FEP_44_39 0.03 1.03 0 -FEP_27_23 22.57 0.64 0 -FEP_43_37 -2.74 0.29 0 -FEP_46_43 7.24 0.14 0 -FEP_39_36 -4.39 0.64 0 -FEP_35_32 1.64 0.17 0 -FEP_35_28 4.95 0.46 0 -FEP_39_28 -3.88 1.14 2 -FEP_44_43 -3.79 0.27 0 -FEP_44_35 -9.15 0.26 0 -FEP_38_34 2.94 1.16 1 -FEP_34_32 -8.68 0.37 0 -FEP_32_29 22.37 0.45 0 -FEP_41_40 0.53 0.73 0 -FEP_44_41 -4.45 0.45 2 -FEP_44_27 -4.45 0.35 0 -FEP_41_30 -2.26 0.81 5 -FEP_41_38 0.03 0.34 0 -FEP_39_31 1.08 0.56 1 -FEP_42_33 -9.83 0.54 1 -FEP_31_26 39.26 0.37 0 -FEP_46_44 10.07 0.32 0 -FEP_36_23 25.54 0.39 0 -FEP_28_23 23.3 0.44 0 -FEP_41_27 0.01 1.09 3 -FEP_46_33 0.7 0.25 0 -FEP_43_36 -4.01 0.2 0 -FEP_46_31 9.99 0.25 0 -FEP_45_44 6.3 0.15 0 -FEP_43_23 21.47 0.57 0 -FEP_43_35 -5.35 0.21 0 -FEP_33_31 8.77 0.27 0 -FEP_39_29 17.95 0.7 0 -FEP_40_38 -0.75 0.49 0 -FEP_35_31 7.95 0.21 0 -FEP_28_26 43.3 0.41 0 -FEP_43_26 41.81 0.5 0 -FEP_38_32 -1.94 0.39 4 -FEP_46_40 10.53 1.31 4 -FEP_39_33 -7.68 0.54 0 -FEP_45_31 6.01 0.36 0 -FEP_38_37 -4.61 0.66 0 -FEP_44_32 -6.69 0.42 0 -FEP_42_34 1.37 0.5 1 -FEP_33_23 28.64 0.44 0 -FEP_40_29 18.53 1.02 0 -FEP_35_34 10.85 0.35 0 -FEP_42_37 -6.77 0.33 0 -FEP_47_28 33.15 0.2 0 -FEP_46_27 6.49 0.47 0 -FEP_47_32 30.04 0.17 0 -FEP_41_33 -6.26 1.22 0 -FEP_42_31 -0.19 0.34 0 -FEP_30_23 23.63 0.51 0 -FEP_39_26 40.52 0.43 0 -FEP_44_37 -5.59 0.23 0 -FEP_31_23 19.28 0.52 0 -FEP_33_28 5.73 0.53 0 -FEP_34_27 -5.52 0.46 0 -FEP_32_31 6.45 0.4 0 -FEP_32_27 2.47 0.19 0 -FEP_45_35 -3.06 0.37 0 -FEP_44_36 -8.19 0.41 0 -FEP_40_37 -6.11 0.69 7 -FEP_37_33 -2.44 0.3 0 -FEP_43_28 -0.35 0.32 0 -FEP_46_42 9.91 0.19 0 -FEP_33_30 5.46 0.25 0 -FEP_29_26 21.08 0.42 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100755 index 478ad7fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,72 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_67-31 -24.14 0.39 0 -FEP_27-23 20.61 0.48 0 -FEP_26-64 -28.31 0.23 0 -FEP_29-35 -28.22 0.60 1 -FEP_44-23 17.66 0.16 0 -FEP_43-47 -34.49 0.48 0 -FEP_58-60 -2.71 0.17 1 -FEP_42-51 12.14 0.42 1 -FEP_35-36 2.65 0.14 0 -FEP_26-44 -40.11 0.16 1 -FEP_29-40 -17.51 0.64 2 -FEP_33-27 6.47 0.14 1 -FEP_56-35 -28.55 0.22 1 -FEP_54-42 7.68 0.16 0 -FEP_39-32 -7.59 0.89 1 -FEP_38-35 -11.72 0.86 6 -FEP_30-48 4.52 0.19 0 -FEP_27-46 -4.88 0.44 0 -FEP_65-60 2.41 0.15 2 -FEP_41-32 -3.96 0.72 3 -FEP_35-60 15.42 0.15 0 -FEP_67-61 6.37 0.26 0 -FEP_27-45 -2.75 0.49 1 -FEP_29-27 -22.27 0.52 0 -FEP_67-27 -28.56 0.45 0 -FEP_35-37 2.65 0.19 0 -FEP_67-53 -43.70 0.17 1 -FEP_35-33 -0.42 0.24 0 -FEP_49-67 20.77 0.34 0 -FEP_32-34 7.57 0.56 0 -FEP_28-27 -1.28 0.36 0 -FEP_62-45 -48.13 0.43 0 -FEP_63-60 4.33 0.19 1 -FEP_42-64 12.32 0.17 1 -FEP_35-53 -9.41 0.18 1 -FEP_43-27 -2.39 0.29 1 -FEP_49-35 -12.71 0.48 0 -FEP_38-60 4.77 0.52 0 -FEP_62-26 -0.71 0.14 0 -FEP_67-52 -37.13 0.54 0 -FEP_54-23 25.10 0.14 0 -FEP_28-47 -31.82 0.18 1 -FEP_57-23 -13.06 0.20 0 -FEP_68-45 -36.72 0.25 3 -FEP_66-42 -15.13 0.25 0 -FEP_61-60 -24.27 0.59 0 -FEP_65-67 21.42 0.17 0 -FEP_67-63 -23.03 0.30 1 -FEP_67-50 -21.68 0.26 0 -FEP_67-58 -15.52 0.47 3 -FEP_30-27 0.59 0.21 0 -FEP_50-60 3.31 0.27 0 -FEP_67-32 -30.40 0.35 0 -FEP_51-45 -19.53 0.28 0 -FEP_67-37 -30.70 0.19 1 -FEP_60-36 -13.19 0.21 2 -FEP_48-27 -4.52 0.17 0 -FEP_26-57 -9.27 0.44 1 -FEP_35-34 12.11 0.51 0 -FEP_35-39 10.88 0.87 1 -FEP_52-60 18.28 0.38 0 -FEP_67-35 -34.18 0.21 0 -FEP_31-35 -10.00 0.20 0 -FEP_30-35 -5.64 0.18 1 -FEP_32-46 -2.75 0.24 1 -FEP_30-40 8.94 1.13 5 -FEP_28-35 -6.21 0.48 1 -FEP_68-23 -12.98 0.18 1 -FEP_66-23 2.37 0.12 1 -FEP_41-35 -8.72 1.18 2 -FEP_56-60 -13.03 0.11 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt deleted file mode 100755 index 478ad7fa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,72 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_67-31 -24.14 0.39 0 -FEP_27-23 20.61 0.48 0 -FEP_26-64 -28.31 0.23 0 -FEP_29-35 -28.22 0.60 1 -FEP_44-23 17.66 0.16 0 -FEP_43-47 -34.49 0.48 0 -FEP_58-60 -2.71 0.17 1 -FEP_42-51 12.14 0.42 1 -FEP_35-36 2.65 0.14 0 -FEP_26-44 -40.11 0.16 1 -FEP_29-40 -17.51 0.64 2 -FEP_33-27 6.47 0.14 1 -FEP_56-35 -28.55 0.22 1 -FEP_54-42 7.68 0.16 0 -FEP_39-32 -7.59 0.89 1 -FEP_38-35 -11.72 0.86 6 -FEP_30-48 4.52 0.19 0 -FEP_27-46 -4.88 0.44 0 -FEP_65-60 2.41 0.15 2 -FEP_41-32 -3.96 0.72 3 -FEP_35-60 15.42 0.15 0 -FEP_67-61 6.37 0.26 0 -FEP_27-45 -2.75 0.49 1 -FEP_29-27 -22.27 0.52 0 -FEP_67-27 -28.56 0.45 0 -FEP_35-37 2.65 0.19 0 -FEP_67-53 -43.70 0.17 1 -FEP_35-33 -0.42 0.24 0 -FEP_49-67 20.77 0.34 0 -FEP_32-34 7.57 0.56 0 -FEP_28-27 -1.28 0.36 0 -FEP_62-45 -48.13 0.43 0 -FEP_63-60 4.33 0.19 1 -FEP_42-64 12.32 0.17 1 -FEP_35-53 -9.41 0.18 1 -FEP_43-27 -2.39 0.29 1 -FEP_49-35 -12.71 0.48 0 -FEP_38-60 4.77 0.52 0 -FEP_62-26 -0.71 0.14 0 -FEP_67-52 -37.13 0.54 0 -FEP_54-23 25.10 0.14 0 -FEP_28-47 -31.82 0.18 1 -FEP_57-23 -13.06 0.20 0 -FEP_68-45 -36.72 0.25 3 -FEP_66-42 -15.13 0.25 0 -FEP_61-60 -24.27 0.59 0 -FEP_65-67 21.42 0.17 0 -FEP_67-63 -23.03 0.30 1 -FEP_67-50 -21.68 0.26 0 -FEP_67-58 -15.52 0.47 3 -FEP_30-27 0.59 0.21 0 -FEP_50-60 3.31 0.27 0 -FEP_67-32 -30.40 0.35 0 -FEP_51-45 -19.53 0.28 0 -FEP_67-37 -30.70 0.19 1 -FEP_60-36 -13.19 0.21 2 -FEP_48-27 -4.52 0.17 0 -FEP_26-57 -9.27 0.44 1 -FEP_35-34 12.11 0.51 0 -FEP_35-39 10.88 0.87 1 -FEP_52-60 18.28 0.38 0 -FEP_67-35 -34.18 0.21 0 -FEP_31-35 -10.00 0.20 0 -FEP_30-35 -5.64 0.18 1 -FEP_32-46 -2.75 0.24 1 -FEP_30-40 8.94 1.13 5 -FEP_28-35 -6.21 0.48 1 -FEP_68-23 -12.98 0.18 1 -FEP_66-23 2.37 0.12 1 -FEP_41-35 -8.72 1.18 2 -FEP_56-60 -13.03 0.11 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt deleted file mode 100755 index 92d3c5a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt +++ /dev/null @@ -1,72 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_67-31 -30.17 0.13 2 -FEP_27-23 24.12 0.50 1 -FEP_26-64 -26.87 0.26 1 -FEP_29-35 -23.03 0.15 0 -FEP_44-23 17.69 0.07 0 -FEP_43-47 -37.59 0.33 0 -FEP_58-60 -4.91 0.10 0 -FEP_42-51 9.16 0.24 0 -FEP_35-36 1.95 0.08 0 -FEP_26-44 -38.20 0.29 1 -FEP_29-40 -12.41 0.24 2 -FEP_33-27 5.13 0.09 0 -FEP_56-35 -32.33 0.09 0 -FEP_54-42 5.95 0.08 2 -FEP_39-32 -5.93 0.39 0 -FEP_38-35 -8.96 0.91 1 -FEP_30-48 2.41 0.10 2 -FEP_27-46 -5.38 0.18 0 -FEP_65-60 0.15 0.09 0 -FEP_41-32 -6.11 0.43 3 -FEP_35-60 18.86 0.11 0 -FEP_67-61 -2.93 0.23 0 -FEP_27-45 -1.37 0.07 0 -FEP_29-27 -17.45 0.48 3 -FEP_67-27 -32.96 0.09 0 -FEP_35-37 1.26 0.34 1 -FEP_67-53 -42.46 0.09 0 -FEP_35-33 -0.51 0.14 1 -FEP_49-67 27.51 0.18 0 -FEP_32-34 7.98 0.19 1 -FEP_28-27 1.59 0.16 0 -FEP_62-45 -42.16 0.33 0 -FEP_63-60 6.78 0.10 1 -FEP_42-64 11.20 0.09 0 -FEP_35-53 -5.19 0.06 1 -FEP_43-27 -2.68 0.12 1 -FEP_49-35 -9.91 0.16 0 -FEP_38-60 8.42 0.32 0 -FEP_62-26 3.92 0.14 1 -FEP_67-52 -41.63 0.37 0 -FEP_54-23 23.93 0.10 1 -FEP_28-47 -32.45 0.16 1 -FEP_57-23 -13.39 0.08 1 -FEP_68-45 -34.27 0.11 0 -FEP_66-42 -18.35 0.21 3 -FEP_61-60 -15.52 0.21 0 -FEP_65-67 19.13 0.24 0 -FEP_67-63 -25.50 0.08 0 -FEP_67-50 -26.80 0.14 0 -FEP_67-58 -13.65 0.21 0 -FEP_30-27 0.71 0.16 0 -FEP_50-60 8.47 0.16 0 -FEP_67-32 -35.31 0.08 2 -FEP_51-45 -17.26 0.18 1 -FEP_67-37 -35.39 0.21 2 -FEP_60-36 -16.75 0.09 0 -FEP_48-27 -2.08 0.29 2 -FEP_26-57 -6.09 0.25 1 -FEP_35-34 9.81 0.24 0 -FEP_35-39 8.41 0.17 0 -FEP_52-60 24.00 0.35 2 -FEP_67-35 -37.33 0.07 0 -FEP_31-35 -7.35 0.05 0 -FEP_30-35 -3.67 0.21 2 -FEP_32-46 -2.93 0.12 0 -FEP_30-40 9.61 1.33 4 -FEP_28-35 -2.18 0.32 0 -FEP_68-23 -9.36 0.09 1 -FEP_66-23 0.01 0.09 0 -FEP_41-35 -9.18 0.80 4 -FEP_56-60 -13.86 0.28 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/vs/2fs/water.txt deleted file mode 100755 index 92d3c5a5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,72 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_67-31 -30.17 0.13 2 -FEP_27-23 24.12 0.50 1 -FEP_26-64 -26.87 0.26 1 -FEP_29-35 -23.03 0.15 0 -FEP_44-23 17.69 0.07 0 -FEP_43-47 -37.59 0.33 0 -FEP_58-60 -4.91 0.10 0 -FEP_42-51 9.16 0.24 0 -FEP_35-36 1.95 0.08 0 -FEP_26-44 -38.20 0.29 1 -FEP_29-40 -12.41 0.24 2 -FEP_33-27 5.13 0.09 0 -FEP_56-35 -32.33 0.09 0 -FEP_54-42 5.95 0.08 2 -FEP_39-32 -5.93 0.39 0 -FEP_38-35 -8.96 0.91 1 -FEP_30-48 2.41 0.10 2 -FEP_27-46 -5.38 0.18 0 -FEP_65-60 0.15 0.09 0 -FEP_41-32 -6.11 0.43 3 -FEP_35-60 18.86 0.11 0 -FEP_67-61 -2.93 0.23 0 -FEP_27-45 -1.37 0.07 0 -FEP_29-27 -17.45 0.48 3 -FEP_67-27 -32.96 0.09 0 -FEP_35-37 1.26 0.34 1 -FEP_67-53 -42.46 0.09 0 -FEP_35-33 -0.51 0.14 1 -FEP_49-67 27.51 0.18 0 -FEP_32-34 7.98 0.19 1 -FEP_28-27 1.59 0.16 0 -FEP_62-45 -42.16 0.33 0 -FEP_63-60 6.78 0.10 1 -FEP_42-64 11.20 0.09 0 -FEP_35-53 -5.19 0.06 1 -FEP_43-27 -2.68 0.12 1 -FEP_49-35 -9.91 0.16 0 -FEP_38-60 8.42 0.32 0 -FEP_62-26 3.92 0.14 1 -FEP_67-52 -41.63 0.37 0 -FEP_54-23 23.93 0.10 1 -FEP_28-47 -32.45 0.16 1 -FEP_57-23 -13.39 0.08 1 -FEP_68-45 -34.27 0.11 0 -FEP_66-42 -18.35 0.21 3 -FEP_61-60 -15.52 0.21 0 -FEP_65-67 19.13 0.24 0 -FEP_67-63 -25.50 0.08 0 -FEP_67-50 -26.80 0.14 0 -FEP_67-58 -13.65 0.21 0 -FEP_30-27 0.71 0.16 0 -FEP_50-60 8.47 0.16 0 -FEP_67-32 -35.31 0.08 2 -FEP_51-45 -17.26 0.18 1 -FEP_67-37 -35.39 0.21 2 -FEP_60-36 -16.75 0.09 0 -FEP_48-27 -2.08 0.29 2 -FEP_26-57 -6.09 0.25 1 -FEP_35-34 9.81 0.24 0 -FEP_35-39 8.41 0.17 0 -FEP_52-60 24.00 0.35 2 -FEP_67-35 -37.33 0.07 0 -FEP_31-35 -7.35 0.05 0 -FEP_30-35 -3.67 0.21 2 -FEP_32-46 -2.93 0.12 0 -FEP_30-40 9.61 1.33 4 -FEP_28-35 -2.18 0.32 0 -FEP_68-23 -9.36 0.09 1 -FEP_66-23 0.01 0.09 0 -FEP_41-35 -9.18 0.80 4 -FEP_56-60 -13.86 0.28 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/water.txt deleted file mode 100755 index 4aca8f7b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/4.MCL1/water.txt +++ /dev/null @@ -1,862 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_67_31 -32.31 0.12 0 -FEP_67_51 -19.11 0.3 0 -FEP_66_49 -16.75 0.08 0 -FEP_65_53 -20.75 0.1 0 -FEP_66_61 10 0.29 0 -FEP_65_62 25.75 0.17 0 -FEP_66_32 -26.14 0.22 0 -FEP_66_62 18.47 0.16 0 -FEP_65_51 0.56 0.18 0 -FEP_65_58 8.67 0.13 0 -FEP_66_31 -20.23 0.34 0 -FEP_66_46 -28.71 0.19 0 -FEP_66_65 -8.25 0.23 0 -FEP_66_30 -24.1 0.17 0 -FEP_66_39 -20.18 0.34 0 -FEP_66_37 -23.54 0.25 0 -FEP_66_50 -15.25 0.12 0 -FEP_66_27 -23.8 0.21 0 -FEP_65_60 1.55 0.09 0 -FEP_65_63 -3.21 0.07 0 -FEP_66_34 -17.73 0.32 0 -FEP_66_33 -27.32 0.6 1 -FEP_67_46 -40.76 0.15 0 -FEP_67_47 -70.08 0.2 0 -FEP_67_33 -39.2 0.18 0 -FEP_67_23 -10.79 0.16 0 -FEP_66_45 -24 0.1 0 -FEP_67_41 -30.12 1.09 1 -FEP_66_36 -24.91 0.33 0 -FEP_66_56 8.18 0.18 0 -FEP_67_49 -28.45 0.16 0 -FEP_66_28 -25.14 0.26 0 -FEP_66_43 -21.13 0.13 0 -FEP_66_57 16.15 0.16 0 -FEP_67_27 -35.27 0.15 0 -FEP_67_53 -40.97 0.12 0 -FEP_67_30 -35.87 0.25 0 -FEP_67_36 -36.3 0.24 0 -FEP_66_47 -57.85 0.2 0 -FEP_66_38 -16.54 0.5 0 -FEP_65_52 -21.85 0.42 0 -FEP_67_52 -40.88 0.23 0 -FEP_66_26 20.48 0.21 0 -FEP_66_51 -6.82 0.19 0 -FEP_67_40 -29.27 0.25 0 -FEP_67_34 -29.83 0.19 0 -FEP_66_44 -15.89 0.12 0 -FEP_67_38 -29.91 0.23 0 -FEP_66_58 0.56 0.19 0 -FEP_66_42 -17.19 0.12 0 -FEP_66_54 -21.6 0.21 0 -FEP_67_48 -33.07 0.22 0 -FEP_65_61 17.15 0.28 0 -FEP_67_42 -29.25 0.12 0 -FEP_65_54 -13.68 0.14 0 -FEP_67_44 -27.84 0.16 0 -FEP_67_43 -32.82 0.08 0 -FEP_66_41 -19.74 0.35 0 -FEP_67_50 -27.04 0.16 0 -FEP_65_56 16.18 0.43 0 -FEP_67_32 -37.52 0.09 0 -FEP_65_57 24.08 0.17 0 -FEP_67_28 -37.65 0.34 0 -FEP_67_37 -36.08 0.29 0 -FEP_66_64 -3.65 0.12 0 -FEP_66_48 -20.68 0.22 0 -FEP_65_64 3.74 0.15 0 -FEP_67_54 -33.77 0.1 0 -FEP_67_35 -38.14 0.15 0 -FEP_66_63 -10.88 0.29 0 -FEP_67_39 -31.34 0.32 0 -FEP_66_53 -29.18 0.07 0 -FEP_66_60 -6.44 0.12 0 -FEP_66_52 -28.97 0.21 0 -FEP_66_29 -5.76 0.23 0 -FEP_67_45 -36.57 0.12 0 -FEP_67_26 9.32 0.25 0 -FEP_67_29 -17.54 0.36 0 -FEP_66_40 -15.21 1.04 2 -FEP_66_35 -26.32 0.29 0 -FEP_66_23 1.31 0.08 0 -FEP_68_28 -36.9 0.21 0 -FEP_68_29 -18.5 0.48 0 -FEP_68_63 -22.94 0.17 0 -FEP_68_54 -33.37 0.16 0 -FEP_67_57 3.95 0.27 0 -FEP_68_36 -35.54 0.12 0 -FEP_68_44 -27.57 0.09 0 -FEP_68_42 -28.8 0.1 0 -FEP_67_64 -16.61 0.78 0 -FEP_67_65 -20.12 0.1 0 -FEP_68_50 -26.82 0.15 0 -FEP_67_66 -11.87 0.12 0 -FEP_68_57 4.6 0.13 0 -FEP_68_56 -2.79 0.09 0 -FEP_68_26 9.25 0.3 0 -FEP_67_61 -1.9 0.18 0 -FEP_68_43 -32.73 0.1 0 -FEP_68_27 -35.13 0.24 0 -FEP_68_64 -14.95 0.15 0 -FEP_68_35 -37.4 0.18 0 -FEP_67_62 6.46 0.2 0 -FEP_68_33 -39.18 0.19 0 -FEP_68_48 -31.69 0.1 0 -FEP_68_39 -32.01 0.58 0 -FEP_68_31 -32.05 0.15 0 -FEP_68_53 -40.64 0.08 0 -FEP_68_45 -35.73 0.07 0 -FEP_68_49 -28.23 0.12 0 -FEP_68_32 -37.77 0.16 0 -FEP_68_67 0.83 0.29 0 -FEP_67_63 -22.88 0.18 0 -FEP_67_58 -11.22 0.27 0 -FEP_68_62 7.06 0.17 0 -FEP_68_38 -28.9 0.26 0 -FEP_68_40 -28.43 0.4 0 -FEP_68_34 -29.68 0.26 0 -FEP_68_65 -19.87 0.24 0 -FEP_67_60 -18.09 0.17 0 -FEP_68_60 -17.68 0.16 0 -FEP_68_66 -11.8 0.22 0 -FEP_68_51 -18.55 0.2 0 -FEP_68_47 -69.79 0.18 0 -FEP_68_61 -1.49 0.18 0 -FEP_68_58 -10.9 0.21 0 -FEP_68_37 -35.68 0.18 0 -FEP_68_30 -35.63 0.14 0 -FEP_68_41 -31.76 0.4 0 -FEP_68_23 -10.15 0.12 0 -FEP_68_52 -40.58 0.12 0 -FEP_67_56 -3.39 0.14 0 -FEP_68_46 -40.38 0.16 0 -FEP_48_26 41.81 0.22 0 -FEP_50_43 -5.76 0.24 0 -FEP_48_47 -37.61 0.22 0 -FEP_49_39 -1.68 0.28 0 -FEP_50_44 -0.73 0.22 0 -FEP_50_40 -0.38 0.87 0 -FEP_48_23 22.19 0.23 0 -FEP_49_37 -7.22 0.09 0 -FEP_49_31 -3.68 0.23 0 -FEP_48_44 5.08 0.12 0 -FEP_49_41 -1.07 0.52 0 -FEP_49_47 -41.48 0.11 0 -FEP_48_45 -3.73 0.32 0 -FEP_49_30 -6.94 0.16 0 -FEP_49_38 0.25 0.23 0 -FEP_47_37 34.31 0.08 0 -FEP_50_33 -12.03 0.19 0 -FEP_50_28 -10.12 0.11 0 -FEP_47_44 42.73 0.17 0 -FEP_49_29 12.66 0.37 0 -FEP_48_30 -2.97 0.27 0 -FEP_47_46 29.39 0.34 0 -FEP_49_44 0.84 0.14 0 -FEP_49_23 17.66 0.11 0 -FEP_49_46 -12.5 0.13 0 -FEP_50_34 -2.66 0.12 0 -FEP_47_42 40.76 0.12 0 -FEP_48_41 3.23 1.27 2 -FEP_49_45 -7.71 0.11 0 -FEP_49_32 -9.37 0.14 0 -FEP_47_45 35.28 0.88 0 -FEP_48_42 3.74 0.22 0 -FEP_50_37 -8.54 0.09 0 -FEP_47_43 37.7 0.31 0 -FEP_50_42 -2.15 0.15 0 -FEP_49_28 -8.39 0.13 0 -FEP_47_41 38.59 0.5 1 -FEP_48_35 -5.15 0.23 0 -FEP_50_48 -5.03 0.22 0 -FEP_50_39 -2.88 0.68 0 -FEP_48_40 4.27 0.65 4 -FEP_49_35 -9.62 0.21 0 -FEP_50_29 10.42 0.33 0 -FEP_50_30 -8.71 0.18 0 -FEP_49_27 -6.71 0.23 0 -FEP_50_35 -11.1 0.17 0 -FEP_48_37 -3.41 0.1 0 -FEP_50_26 36.23 0.22 0 -FEP_49_48 -3.98 0.24 0 -FEP_48_36 -4.55 0.26 0 -FEP_48_28 -4.86 0.27 0 -FEP_49_34 -1.46 0.14 0 -FEP_48_38 3.94 0.65 0 -FEP_50_41 -3.87 0.41 0 -FEP_50_23 16.66 0.19 0 -FEP_49_36 -7.89 0.13 0 -FEP_48_43 -0.3 0.13 0 -FEP_49_33 -10.63 0.16 0 -FEP_50_46 -13.67 0.21 0 -FEP_47_40 44.08 0.54 4 -FEP_48_29 16.26 0.18 0 -FEP_50_31 -5.28 0.21 0 -FEP_48_39 1.46 0.32 0 -FEP_48_34 2.65 0.18 0 -FEP_49_42 -0.51 0.27 0 -FEP_49_40 2.13 0.92 1 -FEP_48_33 -6.89 0.31 0 -FEP_49_26 37.63 0.13 0 -FEP_50_32 -10.67 0.16 0 -FEP_47_39 38.49 0.62 0 -FEP_48_27 -2.6 0.32 0 -FEP_48_32 -4.72 0.28 0 -FEP_50_45 -8.91 0.18 0 -FEP_49_43 -4.5 0.14 0 -FEP_50_27 -8.11 0.25 0 -FEP_48_31 -0.18 0.17 0 -FEP_50_36 -8.93 0.22 0 -FEP_50_38 -1.34 0.23 0 -FEP_48_46 -7.63 0.21 0 -FEP_47_38 41.39 0.4 0 -FEP_50_47 -42.8 0.16 0 -FEP_51_50 -7.71 0.07 0 -FEP_51_47 -51.27 0.26 0 -FEP_52_50 13.57 0.21 0 -FEP_53_51 21.66 0.36 0 -FEP_53_50 13.7 0.17 0 -FEP_53_27 5.93 0.06 0 -FEP_51_23 8.77 0.16 0 -FEP_51_27 -16.22 0.21 0 -FEP_51_32 -18.33 0.4 0 -FEP_52_36 4.55 0.35 0 -FEP_53_43 8.19 0.1 0 -FEP_53_31 8.68 0.26 0 -FEP_52_27 5.3 0.29 0 -FEP_51_33 -20.51 0.29 0 -FEP_53_40 14.3 1.27 1 -FEP_51_46 -21.88 0.26 0 -FEP_53_23 30.11 0.11 0 -FEP_51_34 -10.69 0.25 0 -FEP_50_49 -1.49 0.1 0 -FEP_51_40 -8.6 0.63 0 -FEP_52_45 5.17 0.47 0 -FEP_51_31 -13.76 0.39 0 -FEP_53_36 4.56 0.15 0 -FEP_53_28 3.91 0.21 0 -FEP_51_38 -9.26 0.54 0 -FEP_53_49 12.78 0.18 0 -FEP_53_42 11.73 0.15 0 -FEP_52_26 50.55 0.27 0 -FEP_51_29 3.9 0.7 0 -FEP_52_28 4.01 0.16 0 -FEP_51_43 -14.09 0.29 0 -FEP_53_45 4.39 0.2 0 -FEP_51_26 28.57 0.2 0 -FEP_52_37 5.29 0.16 0 -FEP_52_34 11.19 0.2 0 -FEP_52_46 0.17 0.16 0 -FEP_51_42 -9.57 0.23 0 -FEP_51_35 -18.75 0.37 0 -FEP_51_37 -16.33 0.19 0 -FEP_51_28 -17.93 0.14 0 -FEP_52_35 3.41 0.32 0 -FEP_52_40 13.62 1.01 5 -FEP_52_41 10.33 0.32 0 -FEP_53_37 4.7 0.47 0 -FEP_52_48 8.69 0.1 0 -FEP_51_44 -9.07 0.19 0 -FEP_52_39 10.69 0.42 0 -FEP_51_39 -11.04 0.48 0 -FEP_53_46 0.57 0.15 0 -FEP_53_47 -29.31 0.22 0 -FEP_52_29 25.01 0.25 0 -FEP_52_49 12.67 0.25 0 -FEP_51_30 -16.75 0.2 0 -FEP_52_23 30.45 0.28 0 -FEP_52_31 9.62 0.22 0 -FEP_52_51 21.58 0.25 0 -FEP_51_36 -17.47 0.38 0 -FEP_53_34 11.14 0.22 0 -FEP_53_33 1.52 0.23 0 -FEP_53_29 23.63 0.32 0 -FEP_51_45 -17.2 0.2 0 -FEP_51_48 -13.17 0.14 0 -FEP_52_30 5.69 0.24 0 -FEP_52_44 13.69 0.27 0 -FEP_52_32 3.42 0.22 0 -FEP_53_35 2.96 0.16 0 -FEP_52_43 8.29 0.18 0 -FEP_53_39 8.65 0.44 0 -FEP_52_42 12.23 0.15 0 -FEP_52_38 11.69 0.42 0 -FEP_53_41 9.21 0.61 2 -FEP_51_41 -10.11 0.38 0 -FEP_53_38 11.7 0.47 0 -FEP_51_49 -9.44 0.07 0 -FEP_53_48 8.26 0.25 0 -FEP_53_44 13.02 0.26 0 -FEP_53_26 49.73 0.33 0 -FEP_53_32 3.29 0.27 0 -FEP_52_33 2.62 0.27 0 -FEP_52_47 -29.02 0.24 0 -FEP_53_30 4.87 0.31 0 -FEP_56_34 -27.04 0.28 0 -FEP_56_44 -24.15 0.06 0 -FEP_56_28 -33.38 0.3 0 -FEP_56_37 -32.26 0.26 0 -FEP_54_51 13.86 0.16 0 -FEP_54_40 5.83 1.18 1 -FEP_57_35 -42.1 0.1 0 -FEP_56_54 -30.46 0.4 0 -FEP_57_36 -41.7 0.61 0 -FEP_56_48 -28.65 0.15 0 -FEP_54_50 5.95 0.19 0 -FEP_56_46 -37.21 0.07 0 -FEP_54_29 15.38 0.22 0 -FEP_56_35 -34.77 0.1 0 -FEP_54_42 4.33 0.14 0 -FEP_54_39 1.15 0.35 0 -FEP_56_38 -28.73 0.28 8 -FEP_54_34 3.56 0.27 0 -FEP_56_52 -37.94 0.29 0 -FEP_56_30 -32.71 0.17 0 -FEP_56_29 -14.13 0.15 0 -FEP_54_47 -36.28 0.16 0 -FEP_56_36 -33.03 0.13 0 -FEP_57_41 -36.06 0.6 0 -FEP_54_45 -3.04 0.11 0 -FEP_54_32 -4.4 0.5 0 -FEP_54_43 0.7 0.3 0 -FEP_56_26 12.32 0.45 0 -FEP_56_31 -28.72 0.1 0 -FEP_57_32 -41.88 0.17 0 -FEP_56_33 -35.91 0.12 0 -FEP_54_30 -2.91 0.32 0 -FEP_53_52 -0.52 0.35 0 -FEP_54_28 -3.88 0.11 0 -FEP_56_43 -29.55 0.08 0 -FEP_57_42 -33.35 0.1 0 -FEP_54_23 22.75 0.1 0 -FEP_54_38 4.34 0.37 0 -FEP_54_52 -8.51 0.59 0 -FEP_57_23 -14.66 0.12 0 -FEP_57_44 -32.3 0.08 0 -FEP_57_39 -36.1 0.48 0 -FEP_57_27 -39.37 0.19 0 -FEP_56_49 -24.78 0.18 0 -FEP_54_36 -3.8 0.61 1 -FEP_56_40 -24.83 0.44 0 -FEP_57_34 -33.73 0.3 0 -FEP_56_42 -26.62 0.87 0 -FEP_57_43 -36.94 0.07 0 -FEP_56_32 -34.24 0.13 0 -FEP_54_44 5.52 0.1 0 -FEP_54_48 0.88 0.12 0 -FEP_57_26 4.81 0.29 0 -FEP_56_41 -28.52 0.33 0 -FEP_54_53 -7.28 0.1 0 -FEP_56_47 -66.86 0.24 0 -FEP_57_33 -44.01 0.24 0 -FEP_56_27 -32.33 0.35 0 -FEP_57_45 -40.67 0.1 0 -FEP_54_33 -5.86 0.46 0 -FEP_54_31 0.65 0.63 0 -FEP_54_26 42.11 0.16 0 -FEP_54_37 -2.24 0.08 0 -FEP_56_51 -15.35 0.23 0 -FEP_56_45 -33.06 0.18 0 -FEP_57_38 -33.93 0.33 0 -FEP_54_41 1.56 0.66 0 -FEP_57_29 -22.58 0.31 0 -FEP_57_28 -41.37 0.22 0 -FEP_57_40 -33.82 0.32 0 -FEP_54_27 -2.54 0.68 0 -FEP_54_49 4.25 0.22 0 -FEP_56_50 -23.91 0.08 0 -FEP_57_37 -39.42 0.16 0 -FEP_57_31 -36.84 0.21 0 -FEP_54_46 -6.65 0.25 0 -FEP_54_35 -4.32 0.19 0 -FEP_57_30 -40.49 0.15 0 -FEP_56_53 -37.48 0.09 0 -FEP_56_39 -28.22 0.44 0 -FEP_56_23 -7.33 0.35 0 -FEP_58_48 -22.17 0.31 0 -FEP_64_27 -19.89 0.33 0 -FEP_60_28 -18.47 0.2 0 -FEP_60_50 -9.15 0.23 0 -FEP_60_34 -12.07 0.19 0 -FEP_63_41 -8.12 0.32 0 -FEP_65_27 -15.74 0.24 0 -FEP_63_52 -18.52 0.21 0 -FEP_63_23 12.26 0.26 0 -FEP_64_63 -7.62 0.1 0 -FEP_64_26 25.06 0.18 0 -FEP_62_52 -47.2 0.17 0 -FEP_64_56 11.99 0.44 0 -FEP_61_26 11.23 0.27 0 -FEP_61_44 -25.78 0.16 0 -FEP_64_47 -54.68 0.17 0 -FEP_63_49 -6.06 0.13 0 -FEP_62_40 -34.16 0.21 0 -FEP_60_26 27.17 0.33 0 -FEP_64_40 -13.36 0.28 0 -FEP_61_28 -36.6 0.29 0 -FEP_62_34 -35.54 0.17 0 -FEP_60_49 -10.43 0.14 0 -FEP_60_42 -11.53 0.16 0 -FEP_62_47 -76.33 0.12 0 -FEP_58_56 7.18 0.14 0 -FEP_62_33 -45.83 0.39 0 -FEP_61_58 -8.74 0.38 0 -FEP_63_33 -16.47 0.25 0 -FEP_62_44 -34.58 0.1 0 -FEP_63_34 -6.68 0.26 0 -FEP_60_44 -9.26 0.06 0 -FEP_62_58 -17.45 0.23 0 -FEP_58_38 -18.15 0.58 0 -FEP_60_48 -14.71 0.14 0 -FEP_65_33 -19.56 0.3 0 -FEP_62_49 -35.05 0.12 0 -FEP_63_42 -6.56 0.38 0 -FEP_63_43 -9.63 0.06 0 -FEP_65_42 -9.37 0.1 0 -FEP_63_31 -9.4 0.05 0 -FEP_63_45 -13.03 0.14 0 -FEP_62_39 -37.1 0.48 0 -FEP_61_50 -25.2 0.15 0 -FEP_63_35 -15.19 0.1 0 -FEP_64_51 -3.69 0.17 0 -FEP_65_45 -16.67 0.21 0 -FEP_61_45 -34.55 0.17 0 -FEP_64_43 -17.23 0.24 0 -FEP_62_48 -39.39 0.47 0 -FEP_58_23 0.43 0.1 0 -FEP_60_30 -17.65 0.07 0 -FEP_63_32 -14.5 0.14 0 -FEP_64_41 -17.48 0.44 1 -FEP_62_32 -44.33 0.29 0 -FEP_64_38 -13.7 0.35 0 -FEP_61_34 -27.48 0.18 0 -FEP_64_37 -20.68 0.2 0 -FEP_61_35 -36.04 0.24 0 -FEP_64_42 -13.61 0.14 0 -FEP_61_29 -14.73 0.39 0 -FEP_63_54 -10.25 0.1 0 -FEP_60_33 -21.54 0.2 0 -FEP_64_58 4.63 0.13 0 -FEP_60_40 -10.4 0.3 0 -FEP_60_51 -0.06 0.28 0 -FEP_61_38 -26.95 0.37 0 -FEP_63_29 6 0.37 0 -FEP_64_57 19.6 0.07 0 -FEP_62_54 -38.36 0.32 1 -FEP_58_41 -20.31 0.25 0 -FEP_65_29 2.18 0.36 0 -FEP_60_46 -22.69 0.21 0 -FEP_57_56 -8.17 0.1 0 -FEP_57_54 -37.42 0.14 0 -FEP_62_50 -33.36 0.11 0 -FEP_60_29 0.68 0.35 0 -FEP_65_37 -15.73 0.15 0 -FEP_65_46 -21.25 0.15 0 -FEP_60_38 -10.46 0.19 0 -FEP_63_46 -17.63 0.19 0 -FEP_64_52 -25.79 0.15 0 -FEP_62_38 -34.64 0.3 0 -FEP_58_39 -20.55 0.29 0 -FEP_61_30 -33.71 0.19 0 -FEP_60_45 -17.89 0.09 0 -FEP_63_36 -13.62 0.17 0 -FEP_61_47 -68.08 0.26 0 -FEP_61_57 5.54 0.46 0 -FEP_64_23 4.74 0.15 0 -FEP_63_50 -4.64 0.22 0 -FEP_61_31 -30.59 0.15 0 -FEP_64_31 -16.82 0.24 0 -FEP_60_54 -15.49 0.09 0 -FEP_63_61 20.52 0.34 0 -FEP_58_45 -25.41 0.13 0 -FEP_61_60 -16.22 0.21 0 -FEP_58_31 -21.46 0.21 0 -FEP_58_26 20.44 0.27 0 -FEP_61_53 -38.2 0.7 0 -FEP_62_36 -42.91 0.26 0 -FEP_60_41 -12.15 0.26 0 -FEP_58_27 -24.32 0.15 0 -FEP_60_36 -18.08 0.18 0 -FEP_63_37 -12.65 0.19 0 -FEP_61_36 -34.81 0.16 0 -FEP_63_57 27.49 0.16 0 -FEP_64_45 -21.35 0.32 0 -FEP_64_46 -24.73 0.41 0 -FEP_62_29 -22.13 0.78 0 -FEP_62_26 2.69 0.15 0 -FEP_58_36 -25.72 0.1 0 -FEP_63_26 31.88 0.28 0 -FEP_65_30 -16.18 0.08 0 -FEP_63_27 -12.07 0.09 0 -FEP_61_46 -37.82 0.43 0 -FEP_63_28 -14.1 0.39 0 -FEP_61_51 -16.85 0.21 0 -FEP_63_48 -9.89 0.31 0 -FEP_65_38 -9.78 0.42 0 -FEP_57_48 -37.7 0.44 0 -FEP_60_53 -22.93 0.06 0 -FEP_63_58 11.93 0.09 0 -FEP_64_53 -25.44 0.36 0 -FEP_60_43 -14.61 0.09 0 -FEP_58_49 -17.75 0.14 0 -FEP_60_57 22.74 0.11 0 -FEP_61_37 -33.9 0.19 0 -FEP_64_44 -12.16 0.4 0 -FEP_58_42 -18.67 0.52 0 -FEP_60_27 -17.14 0.14 0 -FEP_64_49 -13.96 0.13 0 -FEP_61_39 -28.51 0.24 0 -FEP_63_53 -17.87 0.19 0 -FEP_64_34 -15.49 0.42 0 -FEP_60_37 -18.19 0.39 0 -FEP_58_51 -7.52 0.24 0 -FEP_61_42 -27.04 0.29 1 -FEP_58_50 -15.84 0.17 0 -FEP_64_35 -21.85 0.19 0 -FEP_65_39 -12.45 0.35 0 -FEP_61_40 -25.94 0.45 0 -FEP_58_52 -31.52 0.74 0 -FEP_61_27 -32.7 0.34 0 -FEP_65_47 -50.46 0.3 0 -FEP_62_27 -41.96 0.16 0 -FEP_57_49 -33.23 0.29 0 -FEP_65_23 9.07 0.09 0 -FEP_64_50 -11.95 0.33 0 -FEP_62_57 -2.31 0.12 0 -FEP_58_34 -18.91 0.27 0 -FEP_65_44 -7.86 0.14 0 -FEP_58_43 -21.64 0.09 0 -FEP_58_30 -24.95 0.11 0 -FEP_63_60 4.93 0.04 0 -FEP_58_29 -7.05 0.3 0 -FEP_62_41 -36.91 0.41 0 -FEP_63_39 -8.8 0.4 0 -FEP_65_31 -12.62 0.31 0 -FEP_60_32 -18.97 0.16 0 -FEP_65_49 -9.3 0.19 0 -FEP_61_56 -2 0.1 0 -FEP_60_23 7.43 0.05 0 -FEP_62_46 -47.25 0.23 0 -FEP_61_52 -38.75 0.3 0 -FEP_57_52 -45.55 0.18 0 -FEP_65_34 -10.22 0.28 0 -FEP_58_40 -17.8 0.34 0 -FEP_64_48 -16.95 0.27 0 -FEP_65_50 -7.43 0.13 0 -FEP_60_31 -13.82 0.07 0 -FEP_58_54 -22.7 0.13 0 -FEP_65_36 -17.25 0.34 0 -FEP_65_41 -12.57 0.47 0 -FEP_60_47 -52.44 0.16 0 -FEP_60_39 -13.57 0.75 0 -FEP_64_62 21.64 0.11 0 -FEP_61_54 -31.42 0.33 1 -FEP_63_30 -12.8 0.13 0 -FEP_63_40 -6.18 0.43 0 -FEP_62_60 -25 0.22 0 -FEP_58_47 -58.9 0.1 0 -FEP_58_35 -27.14 0.24 0 -FEP_63_38 -6.53 0.2 0 -FEP_58_28 -25.85 0.15 0 -FEP_61_32 -35.03 0.45 0 -FEP_64_60 -2.52 0.19 0 -FEP_64_39 -16.87 0.31 0 -FEP_65_28 -17.47 0.24 0 -FEP_62_56 -9.86 0.2 0 -FEP_60_56 14.86 0.07 0 -FEP_57_53 -45.68 0.11 0 -FEP_62_37 -41.94 0.08 0 -FEP_61_43 -30.3 0.34 0 -FEP_57_50 -31.43 0.2 0 -FEP_62_45 -43.01 0.21 0 -FEP_60_35 -19.93 0.07 0 -FEP_64_28 -21.63 0.31 0 -FEP_60_58 7.23 0.15 0 -FEP_65_26 28.92 0.3 0 -FEP_61_33 -37.72 0.18 0 -FEP_64_29 -2.35 0.28 0 -FEP_65_48 -13.25 0.17 0 -FEP_62_42 -35.34 0.36 0 -FEP_64_32 -22.21 0.44 1 -FEP_62_30 -42.27 0.4 0 -FEP_57_51 -23.35 0.14 0 -FEP_65_32 -17.78 0.2 0 -FEP_63_51 4.54 0.32 0 -FEP_62_51 -25.21 0.06 0 -FEP_58_32 -26.62 0.3 0 -FEP_65_40 -6.86 0.71 3 -FEP_65_43 -12.89 0.12 0 -FEP_62_31 -38.76 0.28 0 -FEP_58_33 -28.85 0.44 0 -FEP_58_46 -29.63 0.17 0 -FEP_65_35 -18.09 0.06 0 -FEP_63_47 -46.85 0.1 0 -FEP_58_37 -24.52 0.23 0 -FEP_57_46 -44.84 0.18 0 -FEP_64_30 -20.19 0.11 0 -FEP_64_33 -24.27 0.34 0 -FEP_63_62 29.59 0.2 0 -FEP_62_23 -16.91 0.19 0 -FEP_62_53 -47.78 0.32 0 -FEP_63_56 18.77 0.38 0 -FEP_61_49 -26.94 0.14 0 -FEP_64_61 13.14 0.31 0 -FEP_58_57 15.36 0.17 0 -FEP_60_52 -23.13 0.28 0 -FEP_57_47 -74.57 0.32 0 -FEP_62_43 -39.59 0.31 0 -FEP_61_23 -8.5 0.25 0 -FEP_61_41 -28.35 0.63 0 -FEP_61_48 -30.61 0.28 0 -FEP_58_44 -16.72 0.14 0 -FEP_64_54 -17.98 0.18 0 -FEP_63_44 -4.56 0.14 0 -FEP_62_61 -8.57 0.11 0 -FEP_62_28 -43.35 0.15 0 -FEP_58_53 -30.02 0.23 0 -FEP_62_35 -44.93 0.12 0 -FEP_64_36 -21 0.09 0 -FEP_41_35 -8.04 0.83 0 -FEP_40_31 -5.59 0.93 2 -FEP_37_34 6.06 0.13 0 -FEP_42_26 38.25 0.35 0 -FEP_46_37 4.89 0.32 0 -FEP_30_26 44.9 0.34 0 -FEP_39_30 -5.22 0.42 0 -FEP_37_29 19.24 0.4 0 -FEP_35_26 47.09 0.17 0 -FEP_40_36 -8.5 0.97 2 -FEP_37_36 0.13 0.22 0 -FEP_45_41 4.85 0.3 0 -FEP_42_28 -7.55 0.22 0 -FEP_46_23 29.75 0.15 0 -FEP_45_36 0.11 0.2 0 -FEP_33_26 48.37 0.2 0 -FEP_37_32 -1.94 0.35 0 -FEP_36_31 4.12 0.28 0 -FEP_46_36 4.16 0.06 0 -FEP_29_27 -18.46 0.36 0 -FEP_39_34 0.08 0.44 0 -FEP_42_38 0.9 0.35 0 -FEP_47_35 32.39 0.23 0 -FEP_42_41 -1.68 0.72 1 -FEP_43_42 3.58 0.18 0 -FEP_33_29 21.88 0.22 0 -FEP_39_37 -6.03 0.59 0 -FEP_44_31 -4.8 0.09 0 -FEP_42_36 -7.4 0.2 0 -FEP_34_29 13.85 0.38 0 -FEP_38_30 -7.61 0.75 1 -FEP_43_39 1.35 0.25 0 -FEP_40_39 -2.52 0.44 0 -FEP_40_30 -8.34 0.69 6 -FEP_45_27 0.91 0.28 0 -FEP_44_29 10.38 0.24 0 -FEP_46_30 4.82 0.16 0 -FEP_32_26 46.72 0.29 0 -FEP_47_33 31.28 0.47 0 -FEP_45_38 6.53 0.22 0 -FEP_32_28 0.01 0.54 0 -FEP_40_26 36.83 0.36 0 -FEP_36_32 -1.25 0.07 0 -FEP_35_27 2.64 0.07 0 -FEP_43_33 -6.81 0.12 0 -FEP_45_32 -1.13 0.26 0 -FEP_32_30 1.79 0.13 0 -FEP_45_23 25.77 0.09 0 -FEP_46_38 11.3 0.38 0 -FEP_41_28 -8.22 0.99 3 -FEP_42_30 -6.58 0.09 0 -FEP_31_29 14.94 0.34 0 -FEP_46_29 23.43 0.16 0 -FEP_42_32 -8.33 0.37 0 -FEP_42_35 -8.61 0.21 0 -FEP_45_39 4.99 0.3 0 -FEP_41_34 0.74 0.69 0 -FEP_47_27 35.06 0.25 0 -FEP_37_27 0.68 0.37 0 -FEP_37_31 3.39 0.37 0 -FEP_39_32 -5.98 0.27 0 -FEP_41_37 -6.16 0.39 0 -FEP_39_38 0.39 0.45 0 -FEP_35_23 26.91 0.48 0 -FEP_40_28 -10.48 1.11 6 -FEP_43_32 -4.52 0.31 0 -FEP_42_40 3.73 1.31 3 -FEP_44_38 -1.38 0.33 0 -FEP_45_29 18.29 0.29 0 -FEP_46_34 11.24 0.16 0 -FEP_46_41 8.82 0.71 1 -FEP_43_41 1.41 0.76 0 -FEP_41_31 -2.43 0.79 1 -FEP_47_30 33.99 0.26 0 -FEP_45_37 0.62 0.24 0 -FEP_47_29 53.55 0.45 0 -FEP_27_26 44.54 0.27 0 -FEP_36_34 6.25 0.25 0 -FEP_43_29 15.23 0.23 0 -FEP_42_27 -6.29 0.53 0 -FEP_43_34 2.96 0.21 0 -FEP_44_30 -8.16 0.15 0 -FEP_38_36 -8.1 0.54 0 -FEP_34_30 -5.93 0.15 0 -FEP_38_35 -8.83 0.56 0 -FEP_40_35 -10.77 0.96 0 -FEP_36_29 18.41 0.25 0 -FEP_36_33 -3.35 0.12 0 -FEP_44_42 -1.28 0.18 0 -FEP_37_35 -1.82 0.23 0 -FEP_38_23 18.73 0.35 0 -FEP_29_28 -20.21 0.38 0 -FEP_36_30 0.72 0.13 0 -FEP_40_32 -9.76 1.07 1 -FEP_47_26 79.37 0.28 0 -FEP_46_28 3.22 0.5 0 -FEP_30_29 18.51 0.38 0 -FEP_35_29 20.82 0.22 0 -FEP_33_27 4.29 0.18 0 -FEP_30_28 -0.93 0.14 0 -FEP_34_28 -7.39 0.07 0 -FEP_36_28 -0.21 0.27 0 -FEP_44_26 37.34 0.18 0 -FEP_31_28 -5.33 0.38 0 -FEP_46_39 9.23 0.36 0 -FEP_31_27 -2.72 0.2 0 -FEP_34_26 38.74 0.16 0 -FEP_45_33 -3.13 0.14 0 -FEP_45_34 7.09 0.21 0 -FEP_34_31 -2.38 0.14 0 -FEP_34_33 -9.33 0.12 0 -FEP_41_26 40.3 0.41 0 -FEP_43_40 4.64 0.59 2 -FEP_47_34 40.3 0.11 0 -FEP_39_35 -6.48 0.56 0 -FEP_46_45 4.44 0.29 0 -FEP_39_27 -4.99 0.85 0 -FEP_29_23 7.31 0.25 0 -FEP_45_40 7.78 0.26 0 -FEP_36_26 45.87 0.22 0 -FEP_38_26 37.14 0.27 0 -FEP_42_29 11.57 0.48 0 -FEP_45_30 0.09 0.2 0 -FEP_38_31 -3.64 0.56 0 -FEP_34_23 19.31 0.18 0 -FEP_26_23 -19.73 0.16 0 -FEP_44_33 -11.85 0.15 0 -FEP_37_28 -1.4 0.15 0 -FEP_30_27 0.65 0.12 0 -FEP_42_39 -3.1 0.27 0 -FEP_37_23 24.74 0.09 0 -FEP_40_34 -2 0.9 1 -FEP_41_29 11.78 0.67 1 -FEP_45_43 3.51 0.16 0 -FEP_33_32 1.83 0.18 0 -FEP_40_27 -7.87 0.99 2 -FEP_36_35 -1.71 0.11 0 -FEP_47_31 38.16 0.19 0 -FEP_43_27 -2.41 0.14 0 -FEP_37_30 0.3 0.23 0 -FEP_43_31 0.2 0.26 0 -FEP_45_26 45.41 0.18 0 -FEP_44_23 17.42 0.11 0 -FEP_41_23 19.88 1.07 0 -FEP_47_36 33.7 0.18 0 -FEP_41_36 -5.28 0.61 0 -FEP_35_33 -1.42 0.07 0 -FEP_46_35 2.39 0.11 0 -FEP_40_33 -12.23 1.02 2 -FEP_44_28 -9.22 0.21 0 -FEP_44_34 -1.91 0.19 0 -FEP_46_26 49.59 0.36 0 -FEP_40_23 17.84 1.46 3 -FEP_45_42 7.18 0.07 0 -FEP_38_33 -10.55 0.38 0 -FEP_38_27 -7.21 0.97 1 -FEP_46_32 2.89 0.23 0 -FEP_42_23 18.5 0.07 0 -FEP_28_27 1.89 0.33 0 -FEP_37_26 44.93 0.19 0 -FEP_43_30 -3.1 0.1 0 -FEP_35_30 2.18 0.15 0 -FEP_41_39 0.63 0.2 0 -FEP_44_40 -0.9 0.53 0 -FEP_39_23 21.15 0.27 0 -FEP_32_23 28.5 1.11 0 -FEP_41_32 -4.72 0.19 4 -FEP_38_28 -9.98 0.81 1 -FEP_43_38 3.56 0.54 1 -FEP_36_27 1.06 0.18 0 -FEP_38_29 12.98 0.49 0 -FEP_31_30 -3.46 0.12 0 -FEP_47_23 59.36 0.15 0 -FEP_45_28 -0.52 0.22 0 -FEP_44_39 -3.59 0.42 0 -FEP_27_23 24.65 0.3 0 -FEP_43_37 -2.85 0.34 0 -FEP_46_43 7.76 0.07 0 -FEP_39_36 -4.99 0.46 0 -FEP_35_32 0.43 0.23 0 -FEP_35_28 0.94 0.37 0 -FEP_39_28 -5.91 0.52 1 -FEP_44_43 -4.95 0.11 0 -FEP_44_35 -10.1 0.07 0 -FEP_38_34 -0.33 0.41 1 -FEP_34_32 -7.12 0.24 0 -FEP_32_29 19.88 0.44 0 -FEP_41_40 2.15 0.56 0 -FEP_44_41 -3.86 0.17 3 -FEP_44_27 -7.49 0.12 0 -FEP_41_30 -6.29 0.99 2 -FEP_41_38 1.44 0.36 0 -FEP_39_31 -1.14 0.3 1 -FEP_42_33 -10.6 0.74 0 -FEP_31_26 40.67 0.17 0 -FEP_46_44 13.09 0.2 0 -FEP_36_23 26.22 0.21 0 -FEP_28_23 27.18 0.33 0 -FEP_41_27 -4.05 0.49 4 -FEP_46_33 1.16 0.18 0 -FEP_43_36 -4.09 0.23 0 -FEP_46_31 8.15 0.18 0 -FEP_45_44 8.3 0.1 0 -FEP_43_23 22.38 0.17 0 -FEP_43_35 -5.22 0.1 0 -FEP_33_31 6.71 0.18 0 -FEP_39_29 12.39 0.7 0 -FEP_40_38 -0.78 0.46 0 -FEP_35_31 5.83 0.08 0 -FEP_28_26 45.83 0.19 0 -FEP_43_26 42.12 0.15 0 -FEP_38_32 -9.72 1.07 3 -FEP_46_40 12.4 0.39 0 -FEP_39_33 -7.82 0.21 0 -FEP_45_31 4.19 0.23 0 -FEP_38_37 -7.24 0.43 0 -FEP_44_32 -9.64 0.15 0 -FEP_42_34 -0.97 0.23 0 -FEP_33_23 28.52 0.32 0 -FEP_40_29 10.99 0.54 0 -FEP_35_34 7.93 0.25 0 -FEP_42_37 -6.13 0.19 0 -FEP_47_28 32.74 0.18 0 -FEP_46_27 5.51 0.11 0 -FEP_47_32 32.48 0.31 0 -FEP_41_33 -8.37 1.16 1 -FEP_42_31 -2.94 0.21 0 -FEP_30_23 25.72 0.43 0 -FEP_39_26 39.59 0.46 0 -FEP_44_37 -7.41 0.1 0 -FEP_31_23 21.83 0.33 0 -FEP_33_28 1.79 0.47 0 -FEP_34_27 -5.03 0.28 0 -FEP_32_31 5.38 0.13 0 -FEP_32_27 2.17 0.14 0 -FEP_45_35 -1.98 0.11 0 -FEP_44_36 -9.24 0.19 0 -FEP_40_37 -7.47 0.43 2 -FEP_37_33 -3.1 0.23 0 -FEP_43_28 -4.12 0.35 0 -FEP_46_42 11 0.31 0 -FEP_33_30 4.31 0.23 0 -FEP_29_26 25.27 0.17 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/failed.txt deleted file mode 100755 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/1fs/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/1fs/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index cba61038..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/1fs/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23482-23486 nan nan 10 -FEP_23467-23475 -6.24 0.65 3 -FEP_20670_2qbs_-23483 nan nan 10 -FEP_23467-23466 -7.75 0.57 0 -FEP_23477-23479 -7.40 0.93 1 -FEP_23477-23482 -54.12 0.96 4 -FEP_23480-23482 -50.93 0.48 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -8.93 0.32 0 -FEP_23483-23479 -3.77 0.12 8 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.50 0.30 0 -FEP_23476-23466 3.50 0.40 8 -FEP_23485-23479 nan nan 10 -FEP_23484-23485 5.66 0.86 0 -FEP_23471-23466 8.26 0.89 1 -FEP_20670_2qbs_-23466 nan nan 10 -FEP_23482-23485 33.21 nan 9 -FEP_23467-23468 -14.68 0.59 0 -FEP_23469-23472 -19.80 0.97 1 -FEP_23474-23466 3.14 nan 9 -FEP_20670_2qbs_-23482 -51.09 0.66 1 -FEP_23467-23476 nan nan 10 -FEP_23466-23475 -0.21 1.10 7 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.12 0.37 0 -FEP_23467-23470 -25.69 0.84 4 -FEP_23484-23479 nan nan 10 -FEP_23482-23479 48.82 0.42 0 -FEP_23486-23485 3.95 0.39 0 -FEP_23480-23479 -1.78 0.38 0 -FEP_23477-23483 nan nan 10 -FEP_23477-23467 0.56 nan 9 -FEP_20667_2qbp_-23485 3.55 0.32 0 -FEP_23467-23473 3.27 nan 9 -FEP_23469-20669_2qbr_ -0.24 0.69 0 -FEP_23484-23482 -32.77 0.51 6 -FEP_20670_2qbs_-23479 -3.71 0.37 0 -FEP_23467-23469 -3.32 nan 8 -FEP_20669_2qbr_-23472 -20.23 0.76 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 14.18 0.64 2 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.91 0.62 0 -FEP_20669_2qbr_-23466 nan nan 10 -FEP_23471-23468 0.32 0.53 0 -FEP_23471-23470 -6.59 1.29 0 -FEP_23477-23466 -2.68 nan 8 -FEP_23486-23479 nan nan 10 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.51 0.60 4 -FEP_20667_2qbp_-23482 nan nan 10 -FEP_20667_2qbp_-23479 11.96 nan 9 -FEP_23484-23486 1.08 0.72 0 -FEP_23467-23474 -6.28 0.49 8 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/1fs/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/1fs/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index 3641ce8c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/1fs/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23482-23486 37.03 0.41 6 -FEP_23467-23475 -6.48 0.63 3 -FEP_20670_2qbs_-23483 2.99 1.10 8 -FEP_23467-23466 -7.80 0.16 1 -FEP_23477-23479 -5.99 0.92 3 -FEP_23477-23482 -55.54 0.73 4 -FEP_23480-23482 -50.51 0.41 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.80 0.31 0 -FEP_23483-23479 -4.08 0.52 6 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.22 0.37 0 -FEP_23476-23466 nan nan 10 -FEP_23485-23479 nan nan 10 -FEP_23484-23485 1.35 0.42 0 -FEP_23471-23466 7.75 0.89 4 -FEP_20670_2qbs_-23466 1.63 0.15 7 -FEP_23482-23485 39.17 nan 9 -FEP_23467-23468 -14.96 0.49 0 -FEP_23469-23472 -21.02 0.98 1 -FEP_23474-23466 nan nan 10 -FEP_20670_2qbs_-23482 -51.32 0.53 0 -FEP_23467-23476 -4.48 0.88 6 -FEP_23466-23475 -1.75 0.60 7 -FEP_20667_2qbp_-23486 1.17 0.54 1 -FEP_23467-23470 -26.77 0.68 3 -FEP_23484-23479 11.43 nan 7 -FEP_23482-23479 49.29 0.73 0 -FEP_23486-23485 -0.30 0.26 0 -FEP_23480-23479 -1.46 0.34 0 -FEP_23477-23483 -3.69 nan 9 -FEP_23477-23467 -0.64 0.39 7 -FEP_20667_2qbp_-23485 1.11 0.46 0 -FEP_23467-23473 7.87 0.51 4 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.48 0.22 0 -FEP_23484-23482 -32.78 0.31 8 -FEP_20670_2qbs_-23479 -3.86 0.45 0 -FEP_23467-23469 -7.04 nan 9 -FEP_20669_2qbr_-23472 -21.00 0.37 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 16.03 0.68 3 -FEP_20667_2qbp_-23484 0.47 0.24 0 -FEP_20669_2qbr_-23466 -5.28 nan 8 -FEP_23471-23468 1.07 0.50 0 -FEP_23471-23470 -8.96 0.81 2 -FEP_23477-23466 -5.39 0.65 6 -FEP_23486-23479 13.77 1.36 8 -FEP_23477-23330_2qbq_ 11.44 1.08 5 -FEP_20667_2qbp_-23482 -33.70 0.29 8 -FEP_20667_2qbp_-23479 nan nan 7 -FEP_23484-23486 1.28 0.24 0 -FEP_23467-23474 nan nan 10 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/1fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/1fs/protein.txt deleted file mode 100755 index cba61038..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/1fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23482-23486 nan nan 10 -FEP_23467-23475 -6.24 0.65 3 -FEP_20670_2qbs_-23483 nan nan 10 -FEP_23467-23466 -7.75 0.57 0 -FEP_23477-23479 -7.40 0.93 1 -FEP_23477-23482 -54.12 0.96 4 -FEP_23480-23482 -50.93 0.48 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -8.93 0.32 0 -FEP_23483-23479 -3.77 0.12 8 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.50 0.30 0 -FEP_23476-23466 3.50 0.40 8 -FEP_23485-23479 nan nan 10 -FEP_23484-23485 5.66 0.86 0 -FEP_23471-23466 8.26 0.89 1 -FEP_20670_2qbs_-23466 nan nan 10 -FEP_23482-23485 33.21 nan 9 -FEP_23467-23468 -14.68 0.59 0 -FEP_23469-23472 -19.80 0.97 1 -FEP_23474-23466 3.14 nan 9 -FEP_20670_2qbs_-23482 -51.09 0.66 1 -FEP_23467-23476 nan nan 10 -FEP_23466-23475 -0.21 1.10 7 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.12 0.37 0 -FEP_23467-23470 -25.69 0.84 4 -FEP_23484-23479 nan nan 10 -FEP_23482-23479 48.82 0.42 0 -FEP_23486-23485 3.95 0.39 0 -FEP_23480-23479 -1.78 0.38 0 -FEP_23477-23483 nan nan 10 -FEP_23477-23467 0.56 nan 9 -FEP_20667_2qbp_-23485 3.55 0.32 0 -FEP_23467-23473 3.27 nan 9 -FEP_23469-20669_2qbr_ -0.24 0.69 0 -FEP_23484-23482 -32.77 0.51 6 -FEP_20670_2qbs_-23479 -3.71 0.37 0 -FEP_23467-23469 -3.32 nan 8 -FEP_20669_2qbr_-23472 -20.23 0.76 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 14.18 0.64 2 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.91 0.62 0 -FEP_20669_2qbr_-23466 nan nan 10 -FEP_23471-23468 0.32 0.53 0 -FEP_23471-23470 -6.59 1.29 0 -FEP_23477-23466 -2.68 nan 8 -FEP_23486-23479 nan nan 10 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.51 0.60 4 -FEP_20667_2qbp_-23482 nan nan 10 -FEP_20667_2qbp_-23479 11.96 nan 9 -FEP_23484-23486 1.08 0.72 0 -FEP_23467-23474 -6.28 0.49 8 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/1fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/1fs/water.txt deleted file mode 100755 index 3641ce8c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/1fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23482-23486 37.03 0.41 6 -FEP_23467-23475 -6.48 0.63 3 -FEP_20670_2qbs_-23483 2.99 1.10 8 -FEP_23467-23466 -7.80 0.16 1 -FEP_23477-23479 -5.99 0.92 3 -FEP_23477-23482 -55.54 0.73 4 -FEP_23480-23482 -50.51 0.41 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.80 0.31 0 -FEP_23483-23479 -4.08 0.52 6 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.22 0.37 0 -FEP_23476-23466 nan nan 10 -FEP_23485-23479 nan nan 10 -FEP_23484-23485 1.35 0.42 0 -FEP_23471-23466 7.75 0.89 4 -FEP_20670_2qbs_-23466 1.63 0.15 7 -FEP_23482-23485 39.17 nan 9 -FEP_23467-23468 -14.96 0.49 0 -FEP_23469-23472 -21.02 0.98 1 -FEP_23474-23466 nan nan 10 -FEP_20670_2qbs_-23482 -51.32 0.53 0 -FEP_23467-23476 -4.48 0.88 6 -FEP_23466-23475 -1.75 0.60 7 -FEP_20667_2qbp_-23486 1.17 0.54 1 -FEP_23467-23470 -26.77 0.68 3 -FEP_23484-23479 11.43 nan 7 -FEP_23482-23479 49.29 0.73 0 -FEP_23486-23485 -0.30 0.26 0 -FEP_23480-23479 -1.46 0.34 0 -FEP_23477-23483 -3.69 nan 9 -FEP_23477-23467 -0.64 0.39 7 -FEP_20667_2qbp_-23485 1.11 0.46 0 -FEP_23467-23473 7.87 0.51 4 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.48 0.22 0 -FEP_23484-23482 -32.78 0.31 8 -FEP_20670_2qbs_-23479 -3.86 0.45 0 -FEP_23467-23469 -7.04 nan 9 -FEP_20669_2qbr_-23472 -21.00 0.37 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 16.03 0.68 3 -FEP_20667_2qbp_-23484 0.47 0.24 0 -FEP_20669_2qbr_-23466 -5.28 nan 8 -FEP_23471-23468 1.07 0.50 0 -FEP_23471-23470 -8.96 0.81 2 -FEP_23477-23466 -5.39 0.65 6 -FEP_23486-23479 13.77 1.36 8 -FEP_23477-23330_2qbq_ 11.44 1.08 5 -FEP_20667_2qbp_-23482 -33.70 0.29 8 -FEP_20667_2qbp_-23479 nan nan 7 -FEP_23484-23486 1.28 0.24 0 -FEP_23467-23474 nan nan 10 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/latest/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/latest/protein.txt deleted file mode 100755 index 2da9cc48..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/latest/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,52 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_20667_2qbp_-23485 3.74 0.25 0 -FEP_23473-23467 -5.88 0.75 0 -FEP_23470-23468 10.47 0.46 0 -FEP_23475-23330_2qbq_ 15.71 0.37 0 -FEP_23472-23471 6.87 0.87 3 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.34 0.31 0 -FEP_23474-23475 -5.09 0.69 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 1.70 0.28 0 -FEP_23483-20670_2qbs_ -4.18 1.07 4 -FEP_23480-23483 4.58 0.66 2 -FEP_23480-23476 1.49 0.56 0 -FEP_23480-23477 7.67 0.35 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.74 0.33 0 -FEP_23475-23477 6.94 0.24 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ 0.47 0.30 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 13.37 0.28 0 -FEP_23482-23483 55.18 0.30 0 -FEP_23483-20667_2qbp_ -22.21 0.72 0 -FEP_23474-23476 -2.53 0.37 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.04 0.41 0 -FEP_23477-23479 -7.57 0.28 0 -FEP_23480-23479 -1.16 0.25 0 -FEP_23471-23467 17.20 0.43 0 -FEP_23482-23476 52.23 0.48 0 -FEP_23486-23485 3.72 0.20 0 -FEP_23485-23484 -4.87 0.52 0 -FEP_23476-23330_2qbq_ 12.22 0.24 0 -FEP_23483-23476 -3.59 0.87 3 -FEP_23468-23471 -1.36 0.86 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 15.61 1.32 2 -FEP_23470-23471 10.11 1.18 0 -FEP_23483-23475 -6.53 0.01 8 -FEP_20667_2qbp_-23484 -1.31 0.61 0 -FEP_23482-23479 48.42 0.26 0 -FEP_23486-23484 -0.94 0.49 0 -FEP_23476-23479 -4.20 0.35 0 -FEP_23482-20667_2qbp_ 34.76 0.94 1 -FEP_23480-23475 -0.99 0.30 0 -FEP_23469-23471 -13.61 0.63 0 -FEP_23482-23477 57.32 0.31 0 -FEP_23467-23466 -7.43 0.37 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -2.52 0.41 0 -FEP_23469-23468 -12.35 0.82 1 -FEP_23486-20667_2qbp_ -0.13 0.25 0 -FEP_23483-23479 -6.88 0.97 1 -FEP_23480-23482 -51.62 0.55 0 -FEP_20670_2qbs_-23479 -3.47 0.36 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 8.34 0.20 0 -FEP_23475-23479 -1.20 0.45 0 -FEP_20670_2qbs_-23475 -2.98 0.43 0 -FEP_23482-23475 50.07 0.43 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/latest/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/latest/water.txt deleted file mode 100755 index 5faa35ff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/latest/water.txt +++ /dev/null @@ -1,52 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_20667_2qbp_-23485 0.53 0.13 0 -FEP_23473-23467 -8.17 0.60 0 -FEP_23470-23468 10.35 0.27 0 -FEP_23475-23330_2qbq_ 17.04 0.26 0 -FEP_23472-23471 4.37 1.16 0 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.77 0.22 0 -FEP_23474-23475 -5.77 0.22 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 2.58 0.34 0 -FEP_23483-20670_2qbs_ -3.83 0.82 2 -FEP_23480-23483 4.96 0.70 0 -FEP_23480-23476 3.00 0.35 1 -FEP_23480-23477 6.30 0.30 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 3.99 0.13 0 -FEP_23475-23477 6.76 0.17 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ -0.69 0.23 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 14.07 0.21 0 -FEP_23482-23483 55.47 0.23 0 -FEP_23483-20667_2qbp_ -20.21 0.20 0 -FEP_23474-23476 -2.87 0.27 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.32 0.25 0 -FEP_23477-23479 -8.61 0.25 0 -FEP_23480-23479 -1.46 0.11 0 -FEP_23471-23467 16.61 0.21 0 -FEP_23482-23476 53.09 0.33 0 -FEP_23486-23485 -0.25 0.20 0 -FEP_23485-23484 -0.70 0.35 0 -FEP_23476-23330_2qbq_ 12.93 0.21 0 -FEP_23483-23476 -3.36 0.80 5 -FEP_23468-23471 0.02 0.41 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 13.38 0.66 1 -FEP_23470-23471 11.83 0.24 0 -FEP_23483-23475 -5.64 0.79 4 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.06 0.17 0 -FEP_23482-23479 48.50 0.25 0 -FEP_23486-23484 -0.83 0.17 0 -FEP_23476-23479 -5.33 0.32 0 -FEP_23482-20667_2qbp_ 36.21 0.65 0 -FEP_23480-23475 0.30 0.20 0 -FEP_23469-23471 -12.37 0.25 0 -FEP_23482-23477 56.68 0.22 0 -FEP_23467-23466 -7.43 0.30 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -3.41 0.40 0 -FEP_23469-23468 -12.59 0.47 0 -FEP_23486-20667_2qbp_ -0.65 0.19 0 -FEP_23483-23479 -7.27 1.03 0 -FEP_23480-23482 -50.22 0.14 0 -FEP_20670_2qbs_-23479 -4.28 0.16 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.89 0.09 0 -FEP_23475-23479 -1.21 0.10 0 -FEP_20670_2qbs_-23475 -2.44 0.17 0 -FEP_23482-23475 50.27 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/lineal/pairs.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/lineal/pairs.txt deleted file mode 100755 index facf083d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/lineal/pairs.txt +++ /dev/null @@ -1,253 +0,0 @@ -20669_2qbr_ 20667_2qbp_ -20670_2qbs_ 20667_2qbp_ -23330_2qbq_ 20667_2qbp_ -23466 20667_2qbp_ -23467 20667_2qbp_ -23468 20667_2qbp_ -23469 20667_2qbp_ -23470 20667_2qbp_ -23471 20667_2qbp_ -23472 20667_2qbp_ -23473 20667_2qbp_ -23474 20667_2qbp_ -23475 20667_2qbp_ -23476 20667_2qbp_ -23477 20667_2qbp_ -23479 20667_2qbp_ -23480 20667_2qbp_ -23482 20667_2qbp_ -23483 20667_2qbp_ -23484 20667_2qbp_ -23485 20667_2qbp_ -23486 20667_2qbp_ -20670_2qbs_ 20669_2qbr_ -23330_2qbq_ 20669_2qbr_ -23466 20669_2qbr_ -23467 20669_2qbr_ -23468 20669_2qbr_ -23469 20669_2qbr_ -23470 20669_2qbr_ -23471 20669_2qbr_ -23472 20669_2qbr_ -23473 20669_2qbr_ -23474 20669_2qbr_ -23475 20669_2qbr_ -23476 20669_2qbr_ -23477 20669_2qbr_ -23479 20669_2qbr_ -23480 20669_2qbr_ -23482 20669_2qbr_ -23483 20669_2qbr_ -23484 20669_2qbr_ -23485 20669_2qbr_ -23486 20669_2qbr_ -23330_2qbq_ 20670_2qbs_ -23466 20670_2qbs_ -23467 20670_2qbs_ -23468 20670_2qbs_ -23469 20670_2qbs_ -23470 20670_2qbs_ -23471 20670_2qbs_ -23472 20670_2qbs_ -23473 20670_2qbs_ -23474 20670_2qbs_ -23475 20670_2qbs_ -23476 20670_2qbs_ -23477 20670_2qbs_ -23479 20670_2qbs_ -23480 20670_2qbs_ -23482 20670_2qbs_ -23483 20670_2qbs_ -23484 20670_2qbs_ -23485 20670_2qbs_ -23486 20670_2qbs_ -23466 23330_2qbq_ -23467 23330_2qbq_ -23468 23330_2qbq_ -23469 23330_2qbq_ -23470 23330_2qbq_ -23471 23330_2qbq_ -23472 23330_2qbq_ -23473 23330_2qbq_ -23474 23330_2qbq_ -23475 23330_2qbq_ -23476 23330_2qbq_ -23477 23330_2qbq_ -23479 23330_2qbq_ -23480 23330_2qbq_ -23482 23330_2qbq_ -23483 23330_2qbq_ -23484 23330_2qbq_ -23485 23330_2qbq_ -23486 23330_2qbq_ -23467 23466 -23468 23466 -23469 23466 -23470 23466 -23471 23466 -23472 23466 -23473 23466 -23474 23466 -23475 23466 -23476 23466 -23477 23466 -23479 23466 -23480 23466 -23482 23466 -23483 23466 -23484 23466 -23485 23466 -23486 23466 -23468 23467 -23469 23467 -23470 23467 -23471 23467 -23472 23467 -23473 23467 -23474 23467 -23475 23467 -23476 23467 -23477 23467 -23479 23467 -23480 23467 -23482 23467 -23483 23467 -23484 23467 -23485 23467 -23486 23467 -23469 23468 -23470 23468 -23471 23468 -23472 23468 -23473 23468 -23474 23468 -23475 23468 -23476 23468 -23477 23468 -23479 23468 -23480 23468 -23482 23468 -23483 23468 -23484 23468 -23485 23468 -23486 23468 -23470 23469 -23471 23469 -23472 23469 -23473 23469 -23474 23469 -23475 23469 -23476 23469 -23477 23469 -23479 23469 -23480 23469 -23482 23469 -23483 23469 -23484 23469 -23485 23469 -23486 23469 -23471 23470 -23472 23470 -23473 23470 -23474 23470 -23475 23470 -23476 23470 -23477 23470 -23479 23470 -23480 23470 -23482 23470 -23483 23470 -23484 23470 -23485 23470 -23486 23470 -23472 23471 -23473 23471 -23474 23471 -23475 23471 -23476 23471 -23477 23471 -23479 23471 -23480 23471 -23482 23471 -23483 23471 -23484 23471 -23485 23471 -23486 23471 -23473 23472 -23474 23472 -23475 23472 -23476 23472 -23477 23472 -23479 23472 -23480 23472 -23482 23472 -23483 23472 -23484 23472 -23485 23472 -23486 23472 -23474 23473 -23475 23473 -23476 23473 -23477 23473 -23479 23473 -23480 23473 -23482 23473 -23483 23473 -23484 23473 -23485 23473 -23486 23473 -23475 23474 -23476 23474 -23477 23474 -23479 23474 -23480 23474 -23482 23474 -23483 23474 -23484 23474 -23485 23474 -23486 23474 -23476 23475 -23477 23475 -23479 23475 -23480 23475 -23482 23475 -23483 23475 -23484 23475 -23485 23475 -23486 23475 -23477 23476 -23479 23476 -23480 23476 -23482 23476 -23483 23476 -23484 23476 -23485 23476 -23486 23476 -23479 23477 -23480 23477 -23482 23477 -23483 23477 -23484 23477 -23485 23477 -23486 23477 -23480 23479 -23482 23479 -23483 23479 -23484 23479 -23485 23479 -23486 23479 -23482 23480 -23483 23480 -23484 23480 -23485 23480 -23486 23480 -23483 23482 -23484 23482 -23485 23482 -23486 23482 -23484 23483 -23485 23483 -23486 23483 -23485 23484 -23486 23484 -23486 23485 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index 409358c6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,254 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23480-23472 -16.09 1.07 4 -FEP_23480-23473 15.00 0.12 8 -FEP_23477-23470 -23.32 0.35 1 -FEP_23479-20670_2qbs_ 3.02 0.48 0 -FEP_23486-23467 nan nan 10 -FEP_23473-23330_2qbq_ nan nan 10 -FEP_23477-23471 -17.86 1.96 5 -FEP_23486-23480 nan nan 10 -FEP_23480-23476 2.93 0.49 1 -FEP_23466-20669_2qbr_ 7.10 nan 8 -FEP_23485-23466 nan nan 10 -FEP_23470-23467 27.09 0.23 8 -FEP_23485-23468 nan nan 10 -FEP_23468-20667_2qbp_ nan nan 2 -FEP_23480-23471 -7.66 nan 9 -FEP_23483-23469 nan nan 10 -FEP_23483-23466 nan nan 10 -FEP_23486-23472 nan nan 10 -FEP_23467-23466 -7.95 0.63 0 -FEP_23483-23470 nan nan 10 -FEP_23473-23466 -9.36 nan 9 -FEP_23484-23467 nan nan 10 -FEP_23479-23469 4.13 1.37 6 -FEP_23483-23476 nan nan 10 -FEP_23474-23471 -12.82 1.84 8 -FEP_23475-23468 -5.97 0.42 0 -FEP_23483-20670_2qbs_ nan nan 10 -FEP_23473-23471 -22.35 1.03 5 -FEP_23484-23471 nan nan 10 -FEP_23473-20669_2qbr_ -8.84 0.31 0 -FEP_23470-23466 19.41 nan 9 -FEP_23485-23484 -4.83 0.59 0 -FEP_23469-23467 0.42 0.36 8 -FEP_23475-23469 6.34 0.79 4 -FEP_23476-23475 -2.65 0.28 0 -FEP_23479-23467 13.83 nan 9 -FEP_23483-23479 -9.72 0.23 8 -FEP_23467-23330_2qbq_ nan nan 4 -FEP_23483-23330_2qbq_ 11.36 nan 9 -FEP_23483-23471 nan nan 10 -FEP_23466-20670_2qbs_ nan nan 9 -FEP_23477-20670_2qbs_ -4.90 0.25 0 -FEP_23483-23482 -55.83 0.71 7 -FEP_23482-23471 nan nan 10 -FEP_23476-23466 nan nan 10 -FEP_23472-23330_2qbq_ 29.31 1.53 6 -FEP_23475-23466 1.68 1.62 6 -FEP_23467-20667_2qbp_ nan nan 0 -FEP_23484-23330_2qbq_ nan nan 10 -FEP_23466-20667_2qbp_ nan nan 1 -FEP_23485-23479 nan nan 10 -FEP_23477-23468 -12.42 0.35 0 -FEP_23471-23466 10.47 1.05 4 -FEP_23475-20670_2qbs_ 2.60 0.33 0 -FEP_23486-23476 nan nan 10 -FEP_23476-23467 2.60 nan 9 -FEP_23476-23473 12.26 1.25 2 -FEP_23483-23477 nan nan 10 -FEP_23477-23474 0.14 0.63 1 -FEP_23475-20669_2qbr_ 3.24 0.94 3 -FEP_23484-20670_2qbs_ 24.76 0.56 8 -FEP_23485-23483 14.80 0.57 5 -FEP_23483-20667_2qbp_ -19.08 0.76 0 -FEP_23485-20667_2qbp_ -4.32 0.31 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 0.28 0.89 0 -FEP_23469-20667_2qbp_ nan nan 4 -FEP_23484-23470 nan nan 10 -FEP_23471-23467 17.26 0.60 1 -FEP_23482-23477 54.64 0.47 6 -FEP_23482-23480 51.22 0.60 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -2.62 0.59 0 -FEP_23484-23483 21.31 1.09 0 -FEP_23482-23476 51.94 0.97 1 -FEP_23330_2qbq_-20670_2qbs_ -14.53 0.71 1 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.01 0.47 0 -FEP_23472-20667_2qbp_ nan nan 8 -FEP_23474-23466 nan nan 10 -FEP_23474-23330_2qbq_ 11.79 0.33 7 -FEP_20669_2qbr_-20667_2qbp_ nan nan 2 -FEP_23484-23477 nan nan 10 -FEP_23472-20669_2qbr_ 20.54 0.46 0 -FEP_23476-23468 -10.88 0.60 5 -FEP_23469-23330_2qbq_ nan nan 9 -FEP_23483-23474 -4.84 nan 9 -FEP_23484-23474 nan nan 10 -FEP_23476-20669_2qbr_ 2.86 0.82 1 -FEP_23482-23473 65.46 0.76 4 -FEP_23471-23469 14.14 0.96 2 -FEP_23475-23473 14.17 0.40 2 -FEP_23474-20669_2qbr_ -0.44 0.91 0 -FEP_23485-23475 nan nan 10 -FEP_23484-23473 nan nan 10 -FEP_23470-23330_2qbq_ nan nan 10 -FEP_23479-23476 3.81 0.90 1 -FEP_23474-20667_2qbp_ nan nan 7 -FEP_23479-23470 -15.72 0.69 0 -FEP_23470-23469 23.99 0.87 0 -FEP_23469-23466 nan nan 10 -FEP_23479-23468 -5.09 0.67 4 -FEP_23480-23474 4.15 0.76 1 -FEP_23485-23472 nan nan 10 -FEP_23485-23330_2qbq_ nan nan 10 -FEP_23471-20670_2qbs_ 8.83 0.75 4 -FEP_23480-23470 -20.41 1.65 7 -FEP_23479-23477 6.73 0.96 0 -FEP_23476-23474 2.06 0.55 1 -FEP_23480-23469 3.21 nan 9 -FEP_23485-23467 nan nan 10 -FEP_23330_2qbq_-20667_2qbp_ nan nan 8 -FEP_23479-20669_2qbr_ 6.90 2.03 6 -FEP_23484-23479 10.30 nan 9 -FEP_23474-23472 -19.50 0.61 1 -FEP_23468-20670_2qbs_ 8.71 1.27 0 -FEP_23482-23479 48.75 0.30 0 -FEP_23486-23466 nan nan 10 -FEP_23485-23477 nan nan 10 -FEP_23482-20667_2qbp_ 32.46 0.47 8 -FEP_23486-20669_2qbr_ nan nan 10 -FEP_23475-23471 -8.33 1.31 2 -FEP_23483-23480 -5.75 1.40 6 -FEP_23480-23466 nan nan 10 -FEP_23484-20669_2qbr_ nan nan 10 -FEP_23468-20669_2qbr_ 11.88 1.10 1 -FEP_23468-23467 13.20 0.93 2 -FEP_23472-23470 -4.33 nan 9 -FEP_23486-23330_2qbq_ nan nan 10 -FEP_23480-23467 9.65 nan 9 -FEP_23475-23472 -12.86 0.72 4 -FEP_23476-23469 1.05 1.16 5 -FEP_23472-23471 nan nan 10 -FEP_23473-23472 -29.32 0.89 0 -FEP_23485-20669_2qbr_ nan nan 10 -FEP_23479-23466 nan nan 10 -FEP_23470-20669_2qbr_ 22.04 0.43 3 -FEP_23473-23470 -33.09 0.88 4 -FEP_23486-23473 nan nan 10 -FEP_23483-20669_2qbr_ nan nan 10 -FEP_23486-23485 4.10 0.42 0 -FEP_23476-23330_2qbq_ 12.85 0.80 5 -FEP_23479-23471 -6.32 1.38 8 -FEP_23466-23330_2qbq_ nan nan 2 -FEP_23485-23473 nan nan 10 -FEP_23482-23475 49.66 0.65 3 -FEP_23477-23476 -3.65 0.49 0 -FEP_23482-20669_2qbr_ 54.31 0.86 6 -FEP_23486-20670_2qbs_ nan nan 10 -FEP_23475-23330_2qbq_ 12.90 0.47 6 -FEP_23480-23479 -1.45 0.31 0 -FEP_23479-23473 16.98 1.46 6 -FEP_23477-23472 -23.16 1.36 3 -FEP_23486-20667_2qbp_ -0.47 0.22 0 -FEP_23468-23330_2qbq_ 17.23 nan 8 -FEP_23485-23476 nan nan 10 -FEP_23470-20670_2qbs_ 18.75 0.73 1 -FEP_23482-23468 43.07 1.69 8 -FEP_23471-20667_2qbp_ nan nan 1 -FEP_23477-23475 -7.27 0.25 0 -FEP_23473-23468 -18.93 1.24 1 -FEP_23486-23482 -36.29 0.55 7 -FEP_23486-23474 nan nan 10 -FEP_23472-23468 11.22 1.37 7 -FEP_23476-23470 -20.59 1.27 2 -FEP_23467-20670_2qbs_ -8.72 nan 8 -FEP_23484-23469 nan nan 10 -FEP_23486-23475 nan nan 10 -FEP_23477-23467 0.42 nan 9 -FEP_23483-23473 nan nan 10 -FEP_23472-20670_2qbs_ 15.84 1.11 1 -FEP_23474-23469 -0.00 0.71 0 -FEP_23486-23471 nan nan 10 -FEP_23482-23470 32.19 0.80 2 -FEP_23469-20669_2qbr_ -1.05 0.64 0 -FEP_23484-23482 -32.92 nan 9 -FEP_23483-23475 nan nan 10 -FEP_23484-23466 nan nan 10 -FEP_20670_2qbs_-20667_2qbp_ nan nan 8 -FEP_23477-23469 -1.14 1.14 6 -FEP_23477-23473 7.44 0.66 2 -FEP_23469-20670_2qbs_ -3.72 0.56 1 -FEP_23480-23477 5.05 1.02 3 -FEP_23473-23467 -5.33 nan 9 -FEP_23485-23474 nan nan 10 -FEP_23474-23473 9.26 1.01 0 -FEP_23471-23330_2qbq_ nan nan 7 -FEP_23476-23472 -18.37 1.25 2 -FEP_23475-23474 6.01 0.50 0 -FEP_23476-20667_2qbp_ nan nan 8 -FEP_23472-23469 19.80 0.41 2 -FEP_23479-20667_2qbp_ -14.17 nan 9 -FEP_23486-23470 nan nan 10 -FEP_23485-23469 nan nan 10 -FEP_23482-23467 66.14 nan 9 -FEP_23484-20667_2qbp_ 0.86 0.76 0 -FEP_23476-20670_2qbs_ -0.25 0.38 0 -FEP_23470-20667_2qbp_ nan nan 5 -FEP_23475-20667_2qbp_ nan nan 7 -FEP_23479-23330_2qbq_ 17.80 0.79 1 -FEP_23484-23480 18.49 0.64 8 -FEP_23484-23468 nan nan 10 -FEP_23485-23470 nan nan 10 -FEP_23480-20667_2qbp_ -18.68 0.22 8 -FEP_23473-23469 -7.90 0.82 0 -FEP_23477-20669_2qbr_ 0.14 0.83 3 -FEP_23472-23466 nan nan 10 -FEP_23473-20670_2qbs_ -10.83 0.84 0 -FEP_23479-23472 -15.09 0.65 2 -FEP_23483-23467 nan nan 10 -FEP_23480-20669_2qbr_ 3.29 0.15 8 -FEP_23473-20667_2qbp_ nan nan 5 -FEP_23484-23472 nan nan 10 -FEP_23477-20667_2qbp_ nan nan 7 -FEP_23485-23482 nan nan 10 -FEP_23467-20669_2qbr_ -6.56 nan 9 -FEP_23480-23468 -7.52 1.22 8 -FEP_23482-23466 nan nan 10 -FEP_23471-23468 1.22 1.60 1 -FEP_23475-23467 8.76 0.54 6 -FEP_23482-23472 34.86 1.81 7 -FEP_23470-23468 10.06 0.48 0 -FEP_23474-23468 -10.70 0.62 5 -FEP_23471-23470 -10.42 0.50 1 -FEP_20670_2qbs_-20669_2qbr_ 2.52 0.40 0 -FEP_23485-23471 nan nan 10 -FEP_23480-23475 0.85 0.70 3 -FEP_23486-23469 nan nan 10 -FEP_23471-20669_2qbr_ 12.55 0.87 4 -FEP_23483-23468 nan nan 10 -FEP_23482-23330_2qbq_ 66.60 1.11 1 -FEP_23479-23474 6.44 0.26 6 -FEP_23477-23466 -6.85 nan 9 -FEP_23485-20670_2qbs_ nan nan 10 -FEP_23474-23467 8.46 nan 9 -FEP_23482-23469 51.65 0.74 6 -FEP_23486-23468 nan nan 10 -FEP_23486-23483 nan nan 10 -FEP_23484-23475 nan nan 10 -FEP_23485-23480 14.49 0.42 8 -FEP_23482-23474 54.62 0.80 1 -FEP_23468-23466 4.64 0.02 8 -FEP_23480-23330_2qbq_ 14.33 1.28 3 -FEP_23486-23479 nan nan 10 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.85 0.95 5 -FEP_23486-23484 -1.37 0.90 0 -FEP_23330_2qbq_-20669_2qbr_ nan nan 10 -FEP_23469-23468 -13.41 0.32 5 -FEP_23475-23470 -16.08 0.67 0 -FEP_23476-23471 -22.29 nan 9 -FEP_23483-23472 nan nan 10 -FEP_23474-23470 -23.97 0.90 3 -FEP_23486-23477 nan nan 10 -FEP_23484-23476 nan nan 10 -FEP_23479-23475 1.95 0.48 0 -FEP_23472-23467 nan nan 10 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index b8581e81..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,254 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23480-23472 -17.85 1.10 5 -FEP_23480-23473 12.39 0.95 7 -FEP_23477-23470 -25.57 0.66 2 -FEP_23479-20670_2qbs_ 3.74 0.46 0 -FEP_23486-23467 nan nan 10 -FEP_23473-23330_2qbq_ -3.73 nan 8 -FEP_23477-23471 -16.21 0.64 4 -FEP_23486-23480 13.95 1.50 8 -FEP_23480-23476 1.87 0.73 0 -FEP_23466-20669_2qbr_ nan nan 7 -FEP_23485-23466 nan nan 10 -FEP_23470-23467 nan nan 10 -FEP_23485-23468 nan nan 9 -FEP_23468-20667_2qbp_ nan nan 7 -FEP_23480-23471 -6.58 nan 8 -FEP_23483-23469 nan nan 9 -FEP_23483-23466 nan nan 10 -FEP_23486-23472 nan nan 7 -FEP_23467-23466 -8.38 0.21 0 -FEP_23483-23470 nan nan 10 -FEP_23473-23466 nan nan 9 -FEP_23484-23467 nan nan 10 -FEP_23479-23469 4.83 1.53 5 -FEP_23483-23476 2.04 nan 9 -FEP_23474-23471 -15.76 0.39 6 -FEP_23475-23468 -7.53 0.20 0 -FEP_23483-20670_2qbs_ 2.62 nan 8 -FEP_23473-23471 -25.13 0.81 2 -FEP_23484-23471 nan nan 10 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.76 0.21 1 -FEP_23470-23466 22.95 1.58 8 -FEP_23485-23484 -1.13 0.38 0 -FEP_23469-23467 nan nan 10 -FEP_23475-23469 7.02 1.51 5 -FEP_23476-23475 -3.53 0.28 0 -FEP_23479-23467 nan nan 9 -FEP_23483-23479 -7.28 1.01 6 -FEP_23467-23330_2qbq_ nan nan 4 -FEP_23483-23330_2qbq_ 8.91 0.03 8 -FEP_23483-23471 nan nan 10 -FEP_23466-20670_2qbs_ nan nan 10 -FEP_23477-20670_2qbs_ -3.79 0.44 0 -FEP_23483-23482 -56.23 0.88 4 -FEP_23482-23471 43.74 1.93 7 -FEP_23476-23466 nan nan 10 -FEP_23472-23330_2qbq_ 31.22 0.79 6 -FEP_23475-23466 -0.94 0.90 7 -FEP_23467-20667_2qbp_ nan nan 3 -FEP_23484-23330_2qbq_ nan nan 10 -FEP_23466-20667_2qbp_ nan nan 3 -FEP_23485-23479 nan nan 10 -FEP_23477-23468 -14.34 0.25 1 -FEP_23471-23466 9.00 0.48 1 -FEP_23475-20670_2qbs_ 2.80 0.21 0 -FEP_23486-23476 nan nan 10 -FEP_23476-23467 nan nan 10 -FEP_23476-23473 11.16 1.14 3 -FEP_23483-23477 nan nan 10 -FEP_23477-23474 1.73 0.86 2 -FEP_23475-20669_2qbr_ 3.54 0.89 6 -FEP_23484-20670_2qbs_ nan nan 10 -FEP_23485-23483 18.22 0.89 3 -FEP_23483-20667_2qbp_ -18.05 0.50 2 -FEP_23485-20667_2qbp_ -1.62 0.43 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 0.55 0.79 0 -FEP_23469-20667_2qbp_ nan nan 6 -FEP_23484-23470 nan nan 10 -FEP_23471-23467 16.73 0.28 0 -FEP_23482-23477 54.03 nan 9 -FEP_23482-23480 50.07 0.49 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -3.94 0.74 0 -FEP_23484-23483 20.78 0.71 1 -FEP_23482-23476 52.48 0.74 1 -FEP_23330_2qbq_-20670_2qbs_ -14.84 0.57 0 -FEP_23482-20670_2qbs_ 51.40 0.53 2 -FEP_23472-20667_2qbp_ nan nan 7 -FEP_23474-23466 nan nan 10 -FEP_23474-23330_2qbq_ 10.87 0.84 7 -FEP_20669_2qbr_-20667_2qbp_ nan nan 9 -FEP_23484-23477 21.74 nan 9 -FEP_23472-20669_2qbr_ 19.93 0.79 1 -FEP_23476-23468 -10.96 1.04 5 -FEP_23469-23330_2qbq_ nan nan 10 -FEP_23483-23474 nan nan 10 -FEP_23484-23474 25.39 nan 7 -FEP_23476-20669_2qbr_ 2.87 0.66 5 -FEP_23482-23473 62.32 1.53 6 -FEP_23471-23469 13.80 0.94 4 -FEP_23475-23473 16.61 0.47 2 -FEP_23474-20669_2qbr_ -0.65 0.46 0 -FEP_23485-23475 nan nan 9 -FEP_23484-23473 33.31 0.96 8 -FEP_23470-23330_2qbq_ nan nan 10 -FEP_23479-23476 4.27 0.93 2 -FEP_23474-20667_2qbp_ nan nan 9 -FEP_23479-23470 -16.70 0.82 2 -FEP_23470-23469 21.88 0.64 0 -FEP_23469-23466 nan nan 10 -FEP_23479-23468 -7.54 1.19 4 -FEP_23480-23474 5.77 0.77 4 -FEP_23485-23472 nan nan 10 -FEP_23485-23330_2qbq_ nan nan 10 -FEP_23471-20670_2qbs_ 10.63 0.73 8 -FEP_23480-23470 -20.15 0.73 6 -FEP_23479-23477 7.34 0.68 0 -FEP_23476-23474 2.77 0.86 2 -FEP_23480-23469 4.61 1.27 4 -FEP_23485-23467 nan nan 10 -FEP_23330_2qbq_-20667_2qbp_ nan nan 10 -FEP_23479-20669_2qbr_ 5.22 0.54 4 -FEP_23484-23479 10.74 0.45 5 -FEP_23474-23472 -21.52 0.51 0 -FEP_23468-20670_2qbs_ 9.82 0.45 0 -FEP_23482-23479 48.79 0.52 0 -FEP_23486-23466 nan nan 8 -FEP_23485-23477 nan nan 10 -FEP_23482-20667_2qbp_ 36.40 0.58 8 -FEP_23486-20669_2qbr_ nan nan 10 -FEP_23475-23471 -9.41 0.82 2 -FEP_23483-23480 -6.06 0.71 6 -FEP_23480-23466 nan nan 10 -FEP_23484-20669_2qbr_ nan nan 10 -FEP_23468-20669_2qbr_ 13.69 0.76 2 -FEP_23468-23467 13.97 0.93 1 -FEP_23472-23470 -3.48 1.59 2 -FEP_23486-23330_2qbq_ 25.57 nan 9 -FEP_23480-23467 nan nan 10 -FEP_23475-23472 -14.24 0.74 5 -FEP_23476-23469 nan nan 8 -FEP_23472-23471 7.22 0.28 7 -FEP_23473-23472 -31.32 0.35 2 -FEP_23485-20669_2qbr_ nan nan 9 -FEP_23479-23466 nan nan 9 -FEP_23470-20669_2qbr_ 24.23 0.37 3 -FEP_23473-23470 -33.22 0.93 2 -FEP_23486-23473 nan nan 9 -FEP_23483-20669_2qbr_ nan nan 10 -FEP_23486-23485 0.77 0.43 0 -FEP_23476-23330_2qbq_ 14.17 0.80 3 -FEP_23479-23471 nan nan 9 -FEP_23466-23330_2qbq_ nan nan 1 -FEP_23485-23473 nan nan 10 -FEP_23482-23475 49.43 0.62 2 -FEP_23477-23476 -3.04 0.60 0 -FEP_23482-20669_2qbr_ 53.50 0.59 4 -FEP_23486-20670_2qbs_ nan nan 10 -FEP_23475-23330_2qbq_ 16.08 0.16 7 -FEP_23480-23479 -1.71 0.28 0 -FEP_23479-23473 15.49 1.26 8 -FEP_23477-23472 -20.62 0.78 0 -FEP_23486-20667_2qbp_ -0.61 0.53 0 -FEP_23468-23330_2qbq_ nan nan 10 -FEP_23485-23476 nan nan 10 -FEP_23470-20670_2qbs_ 21.31 0.49 0 -FEP_23482-23468 nan nan 9 -FEP_23471-20667_2qbp_ nan nan 4 -FEP_23477-23475 -6.43 0.29 0 -FEP_23473-23468 -24.10 0.84 3 -FEP_23486-23482 -33.01 0.04 8 -FEP_23486-23474 nan nan 9 -FEP_23472-23468 10.26 1.63 5 -FEP_23476-23470 -21.88 0.68 7 -FEP_23467-20670_2qbs_ -4.60 nan 9 -FEP_23484-23469 nan nan 10 -FEP_23486-23475 nan nan 10 -FEP_23477-23467 0.80 2.10 8 -FEP_23483-23473 nan nan 10 -FEP_23472-20670_2qbs_ 17.30 0.99 2 -FEP_23474-23469 -0.29 0.39 0 -FEP_23486-23471 nan nan 9 -FEP_23482-23470 31.19 0.70 5 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.43 0.60 0 -FEP_23484-23482 -34.44 0.72 8 -FEP_23483-23475 nan nan 10 -FEP_23484-23466 nan nan 10 -FEP_20670_2qbs_-20667_2qbp_ nan nan 7 -FEP_23477-23469 -0.95 0.53 5 -FEP_23477-23473 8.22 0.85 2 -FEP_23469-20670_2qbs_ -1.69 0.37 5 -FEP_23480-23477 6.30 0.67 2 -FEP_23473-23467 -10.73 nan 7 -FEP_23485-23474 nan nan 10 -FEP_23474-23473 8.94 0.46 0 -FEP_23471-23330_2qbq_ nan nan 4 -FEP_23476-23472 -17.01 1.19 4 -FEP_23475-23474 6.47 1.02 3 -FEP_23476-20667_2qbp_ -16.74 nan 8 -FEP_23472-23469 20.87 0.35 1 -FEP_23479-20667_2qbp_ -15.01 1.27 8 -FEP_23486-23470 nan nan 10 -FEP_23485-23469 nan nan 10 -FEP_23482-23467 nan nan 10 -FEP_23484-20667_2qbp_ -0.24 0.44 1 -FEP_23476-20670_2qbs_ -1.20 0.40 1 -FEP_23470-20667_2qbp_ nan nan 8 -FEP_23475-20667_2qbp_ nan nan 9 -FEP_23479-23330_2qbq_ 18.54 0.63 3 -FEP_23484-23480 12.14 0.11 8 -FEP_23484-23468 nan nan 8 -FEP_23485-23470 nan nan 10 -FEP_23480-20667_2qbp_ -14.73 1.39 8 -FEP_23473-23469 -9.79 0.47 0 -FEP_23477-20669_2qbr_ -1.23 1.46 4 -FEP_23472-23466 18.07 nan 9 -FEP_23473-20670_2qbs_ -13.09 0.42 1 -FEP_23479-23472 -15.28 0.67 2 -FEP_23483-23467 nan nan 10 -FEP_23480-20669_2qbr_ 7.10 0.60 6 -FEP_23473-20667_2qbp_ nan nan 9 -FEP_23484-23472 3.42 1.34 8 -FEP_23477-20667_2qbp_ nan nan 6 -FEP_23485-23482 nan nan 9 -FEP_23467-20669_2qbr_ -0.69 nan 9 -FEP_23480-23468 -10.46 0.35 8 -FEP_23482-23466 nan nan 9 -FEP_23471-23468 1.57 0.45 2 -FEP_23475-23467 5.57 1.40 5 -FEP_23482-23472 33.74 1.16 6 -FEP_23470-23468 10.81 0.19 1 -FEP_23474-23468 -12.36 1.16 6 -FEP_23471-23470 -8.60 0.98 4 -FEP_20670_2qbs_-20669_2qbr_ 2.72 0.41 0 -FEP_23485-23471 nan nan 10 -FEP_23480-23475 -1.90 0.81 2 -FEP_23486-23469 nan nan 10 -FEP_23471-20669_2qbr_ 15.79 0.97 5 -FEP_23483-23468 nan nan 9 -FEP_23482-23330_2qbq_ 68.84 0.83 4 -FEP_23479-23474 7.23 0.82 3 -FEP_23477-23466 -3.85 nan 9 -FEP_23485-20670_2qbs_ nan nan 10 -FEP_23474-23467 4.98 nan 9 -FEP_23482-23469 50.67 0.48 6 -FEP_23486-23468 nan nan 9 -FEP_23486-23483 nan nan 10 -FEP_23484-23475 21.55 nan 8 -FEP_23485-23480 12.42 0.57 7 -FEP_23482-23474 54.75 0.95 3 -FEP_23468-23466 9.72 nan 9 -FEP_23480-23330_2qbq_ 17.53 1.00 1 -FEP_23486-23479 11.60 1.28 7 -FEP_23477-23330_2qbq_ 10.56 0.68 6 -FEP_23486-23484 -1.03 0.36 0 -FEP_23330_2qbq_-20669_2qbr_ nan nan 10 -FEP_23469-23468 -12.61 0.78 2 -FEP_23475-23470 -17.89 0.35 0 -FEP_23476-23471 -12.74 0.12 6 -FEP_23483-23472 nan nan 10 -FEP_23474-23470 -26.45 1.45 5 -FEP_23486-23477 nan nan 8 -FEP_23484-23476 nan nan 10 -FEP_23479-23475 0.68 0.79 1 -FEP_23472-23467 23.98 nan 9 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100755 index 1d62d394..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,255 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23467_20669-2qbr- -1.66 0.57 0 -FEP_23472_23470 -5.17 1.29 1 -FEP_23471_23468 1.22 0.48 0 -FEP_23472_23330-2qbq- 30.00 0.57 0 -FEP_23472_20670-2qbs- 16.94 0.59 0 -FEP_23330-2qbq-_20669-2qbr- -9.99 0.83 4 -FEP_23469_20670-2qbs- -3.97 0.43 0 -FEP_23473_23467 -6.40 1.12 0 -FEP_23471_20667-2qbp- -23.33 1.11 0 -FEP_23469_23330-2qbq- 9.30 0.69 4 -FEP_23475_20670-2qbs- 2.91 0.16 0 -FEP_23475_20669-2qbr- 5.92 0.33 1 -FEP_23473_20670-2qbs- -11.95 0.21 0 -FEP_23466_20669-2qbr- 4.91 0.73 3 -FEP_23470_23330-2qbq- 31.73 0.61 3 -FEP_23470_23469 22.31 0.47 0 -FEP_23468_20669-2qbr- 11.14 0.49 0 -FEP_23469_23468 -12.10 0.51 0 -FEP_23474_20669-2qbr- 0.48 0.34 0 -FEP_23471_23469 12.74 0.36 0 -FEP_23470_20670-2qbs- 17.11 0.44 0 -FEP_23474_23468 -11.15 0.27 4 -FEP_23474_23466 3.73 0.59 0 -FEP_23468_23466 7.62 0.51 1 -FEP_23472_23467 23.73 0.65 3 -FEP_20669-2qbr-_20667-2qbp- -30.39 1.00 0 -FEP_23330-2qbq-_20667-2qbp- -29.21 1.83 6 -FEP_23472_23469 20.09 0.36 0 -FEP_23467_23466 -7.30 0.26 0 -FEP_23474_23471 -13.15 1.31 0 -FEP_23467_20670-2qbs- -6.24 0.85 3 -FEP_23472_20667-2qbp- -10.81 1.39 0 -FEP_23474_23473 9.84 0.28 0 -FEP_23474_20670-2qbs- -2.21 0.42 0 -FEP_23468_20667-2qbp- -12.98 0.88 8 -FEP_23466_20667-2qbp- -36.03 0.98 0 -FEP_23471_20670-2qbs- 9.22 0.69 0 -FEP_23473_20667-2qbp- -39.72 0.87 0 -FEP_23330-2qbq-_20670-2qbs- -13.18 0.17 0 -FEP_23471_23467 16.57 0.44 0 -FEP_23470_23467 26.12 0.92 0 -FEP_23473_23469 -8.49 0.50 0 -FEP_23474_20667-2qbp- -25.72 1.63 6 -FEP_20670-2qbs-_20667-2qbp- -19.99 0.68 7 -FEP_23473_23468 -20.58 0.57 0 -FEP_23466_23330-2qbq- 3.24 0.21 0 -FEP_23474_23467 3.50 0.87 7 -FEP_23468_23467 15.40 0.44 0 -FEP_23469_20669-2qbr- -0.61 0.41 0 -FEP_20670-2qbs-_20669-2qbr- 3.71 0.24 0 -FEP_23473_23330-2qbq- 2.51 0.59 1 -FEP_23469_20667-2qbp- -32.02 1.01 0 -FEP_23469_23466 -2.96 0.64 3 -FEP_23473_23471 -20.64 0.51 0 -FEP_23474_23469 1.50 0.26 0 -FEP_23473_23466 -12.62 0.42 5 -FEP_23471_23470 -11.31 0.47 0 -FEP_23472_23466 15.32 0.91 5 -FEP_23475_20667-2qbp- -19.61 0.73 7 -FEP_23471_23330-2qbq- 23.04 0.80 3 -FEP_23472_23471 6.36 1.11 0 -FEP_23471_23466 8.36 0.40 0 -FEP_23471_20669-2qbr- 12.61 0.74 0 -FEP_23467_23330-2qbq- -2.36 0.25 0 -FEP_23473_20669-2qbr- -9.35 0.18 0 -FEP_23470_23468 10.70 0.49 0 -FEP_23467_20667-2qbp- -41.00 1.21 0 -FEP_23474_23470 -22.93 0.85 1 -FEP_23470_23466 18.76 0.44 0 -FEP_23474_23330-2qbq- 10.98 0.42 0 -FEP_23468_23330-2qbq- 21.44 0.64 2 -FEP_23473_23470 -32.89 0.97 0 -FEP_23466_20670-2qbs- 0.37 0.41 6 -FEP_23472_20669-2qbr- 20.40 0.53 0 -FEP_23470_20669-2qbr- 22.19 0.52 1 -FEP_23468_20670-2qbs- 7.68 0.42 0 -FEP_23472_23468 7.10 1.24 3 -FEP_23474_23472 -20.23 0.34 0 -FEP_23469_23467 4.25 0.41 2 -FEP_23473_23472 -28.88 0.19 0 -FEP_23470_20667-2qbp- -6.75 0.04 7 -FEP_23479_23471 -6.30 0.91 5 -FEP_23482_23477 56.98 0.28 1 -FEP_23479_23475 1.02 0.22 2 -FEP_23482_23330-2qbq- 65.44 0.30 0 -FEP_23476_23466 -2.04 1.11 7 -FEP_23475_23473 14.00 0.32 1 -FEP_23477_20670-2qbs- -4.61 0.12 1 -FEP_23479_23467 8.73 0.01 8 -FEP_23476_23467 6.33 0.97 1 -FEP_23485_23471 18.06 0.63 0 -FEP_23485_23330-2qbq- 29.78 1.11 6 -FEP_23486_23476 26.66 1.47 8 -FEP_23485_20670-2qbs- 20.52 0.32 8 -FEP_23485_23474 17.31 0.09 8 -FEP_23482_23469 53.37 0.95 4 -FEP_23485_23467 38.36 0.69 0 -FEP_23479_23474 5.76 0.68 0 -FEP_23483_23480 -6.39 0.59 0 -FEP_23483_23477 0.16 0.86 5 -FEP_23476_23470 -19.74 0.72 3 -FEP_23477_23468 -12.25 0.27 0 -FEP_23483_23471 -14.83 0.09 8 -FEP_23482_23475 50.75 0.35 1 -FEP_23483_23469 -0.04 1.00 7 -FEP_23482_20669-2qbr- 54.35 0.70 4 -FEP_23486_23473 40.86 1.14 0 -FEP_23480_23479 -1.58 0.20 0 -FEP_23476_23472 -18.16 0.45 0 -FEP_23483_23472 -21.41 1.19 5 -FEP_23477_23469 -1.75 0.31 1 -FEP_23486_23467 41.31 1.24 0 -FEP_23475_23466 2.37 0.70 0 -FEP_23483_23479 -6.93 0.82 2 -FEP_23485_23476 20.00 1.05 8 -FEP_23486_23466 36.79 1.33 0 -FEP_23485_23477 18.01 0.39 8 -FEP_23475_23469 6.17 0.63 4 -FEP_23476_23330-2qbq- 11.96 0.35 0 -FEP_23479_23468 -3.85 0.35 3 -FEP_23476_20669-2qbr- 2.54 0.50 2 -FEP_23486_23471 22.75 1.40 0 -FEP_23483_20670-2qbs- -4.89 0.99 4 -FEP_23482_23473 62.81 0.90 0 -FEP_23480_23474 4.08 1.16 2 -FEP_23486_20670-2qbs- 19.52 0.64 6 -FEP_23476_23474 1.72 0.30 3 -FEP_23485_23475 12.36 0.46 8 -FEP_23479_20670-2qbs- 3.91 0.29 2 -FEP_23476_20667-2qbp- -28.56 0.89 0 -FEP_23477_23474 -1.91 0.39 1 -FEP_23480_23466 2.27 0.58 8 -FEP_23477_23471 -15.50 0.85 0 -FEP_23485_23468 22.92 0.78 1 -FEP_23483_23467 14.78 0.47 0 -FEP_23485_23473 37.43 0.81 0 -FEP_23475_23470 -15.73 0.42 1 -FEP_23480_23470 -16.07 0.40 5 -FEP_23475_23472 -14.42 0.37 0 -FEP_23482_23466 60.89 0.20 0 -FEP_23483_20669-2qbr- -2.80 0.70 6 -FEP_23486_23483 nan nan 10 -FEP_23485_23480 15.85 0.90 5 -FEP_23475_23330-2qbq- 15.72 0.20 3 -FEP_23486_23468 14.04 0.21 8 -FEP_23483_23476 -3.95 0.86 5 -FEP_23479_23476 4.28 0.29 0 -FEP_23480_23471 -8.72 0.95 6 -FEP_23475_23467 9.04 0.73 1 -FEP_23486_23480 22.26 0.78 2 -FEP_23475_23471 -6.80 0.52 1 -FEP_23483_20667-2qbp- -22.01 0.53 0 -FEP_23477_23476 -3.70 0.41 0 -FEP_23482_23472 34.22 1.13 1 -FEP_23479_23472 -12.92 0.62 0 -FEP_23486_23482 nan nan 10 -FEP_23482_23471 42.75 0.94 2 -FEP_23486_23485 4.46 0.21 0 -FEP_23479_23470 -13.37 0.45 0 -FEP_23486_23474 22.28 0.91 7 -FEP_23485_23479 12.24 1.56 2 -FEP_23477_23330-2qbq- 8.38 0.25 0 -FEP_23477_23473 7.35 0.33 0 -FEP_23485_20667-2qbp- -3.63 0.14 0 -FEP_23486_23470 7.93 0.45 8 -FEP_23480_23330-2qbq- 15.01 0.35 0 -FEP_23485_20669-2qbr- 19.72 0.86 6 -FEP_23480_23475 0.78 0.53 0 -FEP_23479_23330-2qbq- 16.45 0.33 0 -FEP_23479_23473 15.77 0.82 1 -FEP_23485_23483 18.00 0.68 0 -FEP_23482_23474 53.63 0.93 1 -FEP_23475_23474 5.51 0.46 0 -FEP_23483_23474 0.52 0.69 3 -FEP_23476_23468 -8.17 0.71 0 -FEP_23483_23466 9.65 0.23 0 -FEP_23475_23468 -5.39 0.30 0 -FEP_23485_23472 9.48 1.06 0 -FEP_23486_23475 27.96 0.98 0 -FEP_23486_23477 25.79 0.25 7 -FEP_23480_20667-2qbp- -22.67 0.66 1 -FEP_23482_23480 51.72 0.75 0 -FEP_23483_23473 11.10 0.66 5 -FEP_23482_23467 59.15 1.01 5 -FEP_23482_23470 34.93 0.52 2 -FEP_23477_20669-2qbr- -0.74 0.55 1 -FEP_23486_20667-2qbp- 0.47 0.17 0 -FEP_23476_23471 -9.94 0.51 1 -FEP_23480_23469 6.32 1.24 5 -FEP_23482_20670-2qbs- 52.64 0.28 0 -FEP_23486_23472 8.69 1.63 8 -FEP_23479_23469 7.87 0.41 4 -FEP_23480_23472 -14.68 0.43 1 -FEP_23486_23330-2qbq- 34.75 1.84 1 -FEP_23483_23470 -22.88 0.97 5 -FEP_23480_23476 2.98 0.44 0 -FEP_23483_23330-2qbq- 8.19 0.98 1 -FEP_23477_23467 1.25 0.91 1 -FEP_23482_23476 52.62 0.30 0 -FEP_23479_20667-2qbp- -18.24 0.91 1 -FEP_23485_23466 35.77 0.87 0 -FEP_23480_20670-2qbs- 3.30 0.24 0 -FEP_23485_23469 28.52 1.04 0 -FEP_23480_20669-2qbr- 6.02 0.43 1 -FEP_23482_23479 48.07 0.62 0 -FEP_23477_23470 -22.50 0.22 0 -FEP_23477_23472 -21.51 0.42 0 -FEP_23476_23469 2.53 1.33 1 -FEP_23486_20669-2qbr- 30.64 1.09 0 -FEP_23483_23468 -12.33 0.69 8 -FEP_23477_23466 -5.65 0.79 4 -FEP_23482_20667-2qbp- 34.11 0.73 0 -FEP_23479_23477 8.13 0.29 0 -FEP_23486_23469 27.23 2.20 8 -FEP_23479_20669-2qbr- 6.24 0.98 1 -FEP_23476_23475 -3.32 0.26 0 -FEP_23480_23473 15.18 0.19 2 -FEP_23479_23466 11.88 0.55 0 -FEP_23480_23468 -6.17 0.84 3 -FEP_23485_23470 5.96 0.84 0 -FEP_23482_23468 44.00 0.78 1 -FEP_23483_23475 -8.09 0.63 6 -FEP_23480_23477 7.44 0.29 0 -FEP_23485_23482 nan nan 10 -FEP_23476_23473 11.46 0.34 0 -FEP_23477_20667-2qbp- -36.12 0.79 0 -FEP_23483_23482 nan nan 10 -FEP_23480_23467 8.76 1.58 7 -FEP_23476_20670-2qbs- -0.23 0.10 0 -FEP_23477_23475 -7.12 0.17 0 -FEP_23486_23479 17.33 1.09 2 -FEP_23484_23479 18.62 0.53 3 -FEP_23484_23477 26.11 0.34 8 -FEP_23484_23475 26.74 1.19 0 -FEP_23484_23468 14.34 0.18 8 -FEP_23484_23466 35.74 0.91 0 -FEP_23484_20667-2qbp- -0.15 0.25 0 -FEP_23484_23470 3.95 1.63 6 -FEP_23484_23482 nan nan 10 -FEP_23484_23467 40.29 1.00 0 -FEP_23484_23483 20.97 0.50 0 -FEP_23484_23485 3.42 0.20 0 -FEP_23484_23472 10.84 1.32 0 -FEP_23484_23480 20.06 0.88 1 -FEP_23484_23330-2qbq- 36.07 0.58 3 -FEP_23484_23469 27.61 1.18 8 -FEP_23484_23486 -0.26 0.19 0 -FEP_23484_23473 30.58 nan 9 -FEP_23484_20669-2qbr- 22.75 2.33 7 -FEP_23484_23476 21.61 1.31 5 -FEP_23484_23474 21.70 1.45 7 -FEP_23484_23471 20.63 1.46 0 -FEP_23484_20670-2qbs- 22.40 2.16 7 -FEP_23482_23483 55.11 0.37 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein_sc-lin.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein_sc-lin.txt deleted file mode 100755 index 2ba495fe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein_sc-lin.txt +++ /dev/null @@ -1,29 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-23468 20.39 3.47 0 -FEP_23475-20670_2qbs_ 26.11 3.55 0 -FEP_23480-23476 29.21 4.05 0 -FEP_23479-23476 23.56 3.08 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ 29.82 3.82 0 -FEP_23482-20667_2qbp_ 60.80 3.79 0 -FEP_23468-23470 3.81 3.27 0 -FEP_23467-23466 13.44 1.58 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 36.64 3.57 0 -FEP_23479-23480 32.81 2.55 0 -FEP_23471-23467 36.64 2.29 0 -FEP_23486-23484 30.38 3.64 0 -FEP_20670_2qbs_-23474 24.48 1.81 0 -FEP_20669_2qbr_-23469 29.80 3.25 0 -FEP_23475-23330_2qbq_ 38.35 3.12 0 -FEP_23473-23466 12.88 3.00 0 -FEP_23471-23470 9.21 2.36 0 -FEP_23475-23477 30.09 3.71 0 -FEP_23486-23485 44.28 3.14 0 -FEP_23483-23472 7.44 3.48 0 -FEP_23469-23471 11.54 3.49 0 -FEP_23485-23484 27.81 4.39 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 40.78 2.79 0 -FEP_23471-23472 8.86 2.26 0 -FEP_23467-23473 29.25 3.58 0 -FEP_23475-23479 17.18 2.27 0 -FEP_20667_2qbp_-23483 51.75 4.19 0 -FEP_23479-23482 -29.85 1.73 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-10rep/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-10rep/protein.txt deleted file mode 100755 index 9aa98807..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-10rep/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_20667_2qbp_-23485 3.62 0.09 0 -FEP_23484-23482 -33.02 0.49 1 -FEP_23477-23467 1.34 0.85 1 -FEP_23467-23475 -8.48 0.63 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.42 0.28 0 -FEP_20669_2qbr_-23472 -21.34 0.22 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 13.61 0.29 0 -FEP_23476-23466 -1.68 1.15 7 -FEP_23471-23470 -10.08 0.93 0 -FEP_23471-23466 8.93 0.66 0 -FEP_23477-23482 -56.65 0.36 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ -0.21 0.56 0 -FEP_23477-23479 -8.19 0.49 0 -FEP_20670_2qbs_-23483 2.64 0.97 2 -FEP_23480-23479 -1.64 0.26 0 -FEP_23482-23485 37.75 0.50 0 -FEP_23486-23485 3.52 0.12 0 -FEP_23484-23479 19.14 0.82 2 -FEP_23467-23468 -15.36 0.41 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 17.00 0.70 1 -FEP_23467-23469 -1.74 0.75 1 -FEP_23469-23472 -20.00 0.54 0 -FEP_20669_2qbr_-23466 -3.38 0.91 2 -FEP_20667_2qbp_-23484 -1.17 0.41 0 -FEP_23477-23466 -8.58 0.49 3 -FEP_23482-23479 49.00 0.61 0 -FEP_23477-23483 -3.15 0.43 6 -FEP_23486-23479 15.90 0.78 0 -FEP_20670_2qbs_-23466 -1.76 0.31 6 -FEP_23471-23468 1.41 0.77 0 -FEP_23466-23475 -0.35 1.21 1 -FEP_23485-23479 14.01 0.76 1 -FEP_20667_2qbp_-23482 -33.90 0.77 2 -FEP_23467-23466 -7.88 0.38 0 -FEP_23484-23485 5.27 0.32 0 -FEP_23467-23476 -5.10 0.79 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -8.91 0.17 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.37 0.26 0 -FEP_23467-23474 0.65 0.95 4 -FEP_20670_2qbs_-23482 -52.10 0.27 0 -FEP_23483-23479 -6.17 0.47 0 -FEP_23480-23482 -51.71 0.61 0 -FEP_23482-23486 33.52 0.41 2 -FEP_23467-23473 5.79 0.44 2 -FEP_20670_2qbs_-23479 -3.40 0.34 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 8.62 0.34 0 -FEP_23474-23466 -4.05 1.11 7 -FEP_23484-23486 2.18 0.36 0 -FEP_23467-23470 -27.09 0.66 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-10rep/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-10rep/water.txt deleted file mode 100755 index 13cb60a1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-10rep/water.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_20667_2qbp_-23485 0.50 0.27 0 -FEP_23484-23482 -35.25 0.51 0 -FEP_23477-23467 0.92 0.64 0 -FEP_23467-23475 -9.02 0.25 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.19 0.17 0 -FEP_20669_2qbr_-23472 -20.79 0.39 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 13.79 0.24 0 -FEP_23476-23466 nan nan 10 -FEP_23471-23470 -11.66 0.23 0 -FEP_23471-23466 9.40 0.28 0 -FEP_23477-23482 -57.14 0.41 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.26 0.21 0 -FEP_23477-23479 -8.20 0.17 0 -FEP_20670_2qbs_-23483 3.46 0.78 3 -FEP_23480-23479 -1.62 0.16 0 -FEP_23482-23485 35.23 0.38 2 -FEP_23486-23485 -0.35 0.17 0 -FEP_23484-23479 12.24 0.68 2 -FEP_23467-23468 -15.98 0.28 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 12.88 0.99 1 -FEP_23467-23469 -1.56 0.96 1 -FEP_23469-23472 -20.98 0.23 0 -FEP_20669_2qbr_-23466 -6.41 0.85 3 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.23 0.18 0 -FEP_23477-23466 -6.35 0.77 3 -FEP_23482-23479 48.71 0.29 0 -FEP_23477-23483 -0.84 0.53 6 -FEP_23486-23479 11.62 1.14 1 -FEP_20670_2qbs_-23466 -2.90 0.64 3 -FEP_23471-23468 0.03 0.39 0 -FEP_23466-23475 -0.76 0.53 2 -FEP_23485-23479 11.82 1.02 1 -FEP_20667_2qbp_-23482 -35.98 0.94 0 -FEP_23467-23466 -7.66 0.15 0 -FEP_23484-23485 0.37 0.16 0 -FEP_23467-23476 -4.53 0.57 2 -FEP_23473-20669_2qbr_ -10.01 0.17 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.61 0.17 0 -FEP_23467-23474 -2.22 0.58 2 -FEP_20670_2qbs_-23482 -53.18 0.21 0 -FEP_23483-23479 -6.07 0.39 0 -FEP_23480-23482 -50.43 0.16 0 -FEP_23482-23486 35.92 0.45 0 -FEP_23467-23473 8.38 0.76 1 -FEP_20670_2qbs_-23479 -4.11 0.17 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.69 0.17 0 -FEP_23474-23466 -5.20 0.60 7 -FEP_23484-23486 1.07 0.25 0 -FEP_23467-23470 -26.76 0.56 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-20rep/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-20rep/protein.txt deleted file mode 100755 index 754b98db..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-20rep/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_20667_2qbp_-23485 3.47 0.13 0 -FEP_23484-23482 -33.47 0.94 3 -FEP_23477-23467 0.99 0.77 0 -FEP_23467-23475 -9.22 0.35 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.55 0.17 0 -FEP_20669_2qbr_-23472 -20.15 0.29 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 14.02 0.26 0 -FEP_23476-23466 -0.79 0.74 14 -FEP_23471-23470 -9.74 0.81 0 -FEP_23471-23466 8.23 0.40 0 -FEP_23477-23482 -56.54 0.28 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ -0.91 0.26 0 -FEP_23477-23479 -8.22 0.23 0 -FEP_20670_2qbs_-23483 4.77 0.51 6 -FEP_23480-23479 -1.27 0.17 0 -FEP_23482-23485 37.57 0.43 2 -FEP_23486-23485 3.47 0.18 0 -FEP_23484-23479 16.81 0.82 2 -FEP_23467-23468 -15.32 0.21 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 14.39 0.91 4 -FEP_23467-23469 -1.43 0.64 8 -FEP_23469-23472 -19.60 0.33 0 -FEP_20669_2qbr_-23466 -4.45 0.44 3 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.68 0.50 0 -FEP_23477-23466 -5.05 0.48 9 -FEP_23482-23479 48.95 0.29 0 -FEP_23477-23483 -0.73 0.84 8 -FEP_23486-23479 13.98 0.61 7 -FEP_20670_2qbs_-23466 -2.72 0.73 6 -FEP_23471-23468 2.48 0.82 0 -FEP_23466-23475 -0.97 0.49 7 -FEP_23485-23479 12.25 0.71 4 -FEP_20667_2qbp_-23482 -32.89 0.27 3 -FEP_23467-23466 -7.82 0.26 0 -FEP_23484-23485 4.50 0.34 0 -FEP_23467-23476 -5.34 0.68 3 -FEP_23473-20669_2qbr_ -8.86 0.17 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 -0.18 0.15 0 -FEP_23467-23474 -3.58 0.66 5 -FEP_20670_2qbs_-23482 -51.71 0.30 0 -FEP_23483-23479 -6.79 0.68 1 -FEP_23480-23482 -51.63 0.39 0 -FEP_23482-23486 33.95 0.68 1 -FEP_23467-23473 5.99 0.44 2 -FEP_20670_2qbs_-23479 -3.69 0.23 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 8.46 0.21 0 -FEP_23474-23466 -3.74 0.90 16 -FEP_23484-23486 1.15 0.36 0 -FEP_23467-23470 -25.42 0.52 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-20rep/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-20rep/water.txt deleted file mode 100755 index 526e2374..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-20rep/water.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_20667_2qbp_-23485 0.51 0.15 0 -FEP_23484-23482 -36.21 0.41 1 -FEP_23477-23467 0.50 0.58 0 -FEP_23467-23475 -8.28 0.23 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 3.91 0.15 0 -FEP_20669_2qbr_-23472 -20.95 0.18 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 14.19 0.18 0 -FEP_23476-23466 -3.61 0.57 15 -FEP_23471-23470 -10.94 0.58 0 -FEP_23471-23466 9.19 0.25 0 -FEP_23477-23482 -56.88 0.23 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.31 0.14 0 -FEP_23477-23479 -8.15 0.12 0 -FEP_20670_2qbs_-23483 4.01 0.57 5 -FEP_23480-23479 -1.47 0.10 0 -FEP_23482-23485 36.58 0.48 1 -FEP_23486-23485 -0.53 0.14 0 -FEP_23484-23479 13.24 0.55 1 -FEP_23467-23468 -16.07 0.19 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 12.90 0.40 5 -FEP_23467-23469 -3.09 0.57 5 -FEP_23469-23472 -20.35 0.21 1 -FEP_20669_2qbr_-23466 -6.64 0.54 4 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.05 0.19 0 -FEP_23477-23466 -8.51 0.71 5 -FEP_23482-23479 48.63 0.12 0 -FEP_23477-23483 -1.91 0.58 9 -FEP_23486-23479 11.97 0.35 3 -FEP_20670_2qbs_-23466 -4.01 0.42 14 -FEP_23471-23468 0.40 0.22 0 -FEP_23466-23475 -0.24 0.46 1 -FEP_23485-23479 12.57 0.56 1 -FEP_20667_2qbp_-23482 -34.93 0.30 1 -FEP_23467-23466 -7.63 0.19 0 -FEP_23484-23485 0.78 0.12 0 -FEP_23467-23476 -4.36 0.49 3 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.92 0.11 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.78 0.13 0 -FEP_23467-23474 -1.57 0.51 8 -FEP_20670_2qbs_-23482 -52.96 0.19 0 -FEP_23483-23479 -6.34 0.40 0 -FEP_23480-23482 -50.18 0.14 0 -FEP_23482-23486 36.81 0.50 2 -FEP_23467-23473 8.01 0.50 2 -FEP_20670_2qbs_-23479 -4.19 0.07 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 10.19 0.16 0 -FEP_23474-23466 -5.91 0.68 15 -FEP_23484-23486 1.01 0.15 0 -FEP_23467-23470 -26.92 0.34 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-30rep/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-30rep/protein.txt deleted file mode 100755 index 52d5b81d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-30rep/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_20667_2qbp_-23485 3.65 0.23 0 -FEP_23484-23482 -32.66 0.30 2 -FEP_23477-23467 1.51 0.42 1 -FEP_23467-23475 -9.10 0.32 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.70 0.18 0 -FEP_20669_2qbr_-23472 -21.14 0.18 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 13.44 0.16 0 -FEP_23476-23466 -1.88 0.41 20 -FEP_23471-23470 -10.23 0.61 0 -FEP_23471-23466 8.79 0.37 0 -FEP_23477-23482 -56.59 0.20 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.07 0.29 0 -FEP_23477-23479 -8.06 0.21 0 -FEP_20670_2qbs_-23483 3.59 0.59 4 -FEP_23480-23479 -1.53 0.12 0 -FEP_23482-23485 37.80 0.51 1 -FEP_23486-23485 3.55 0.11 0 -FEP_23484-23479 17.24 0.59 4 -FEP_23467-23468 -15.58 0.24 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 16.22 0.53 4 -FEP_23467-23469 -2.06 0.44 9 -FEP_23469-23472 -20.43 0.30 0 -FEP_20669_2qbr_-23466 -5.50 0.57 7 -FEP_20667_2qbp_-23484 -1.64 0.26 0 -FEP_23477-23466 -7.41 0.47 10 -FEP_23482-23479 49.04 0.25 0 -FEP_23477-23483 -1.25 0.67 13 -FEP_23486-23479 15.89 0.56 4 -FEP_20670_2qbs_-23466 -2.59 0.37 18 -FEP_23471-23468 1.30 0.39 0 -FEP_23466-23475 -0.00 0.66 3 -FEP_23485-23479 13.32 0.55 6 -FEP_20667_2qbp_-23482 -33.16 0.33 6 -FEP_23467-23466 -7.62 0.21 0 -FEP_23484-23485 4.96 0.25 0 -FEP_23467-23476 -5.26 0.48 4 -FEP_23473-20669_2qbr_ -8.69 0.18 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.19 0.14 0 -FEP_23467-23474 -1.32 0.54 12 -FEP_20670_2qbs_-23482 -51.79 0.20 0 -FEP_23483-23479 -6.63 0.46 2 -FEP_23480-23482 -51.95 0.29 0 -FEP_23482-23486 33.78 0.41 4 -FEP_23467-23473 5.96 0.34 2 -FEP_20670_2qbs_-23479 -3.65 0.18 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 8.87 0.22 0 -FEP_23474-23466 -2.47 0.60 25 -FEP_23484-23486 1.68 0.26 0 -FEP_23467-23470 -26.31 0.36 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-30rep/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-30rep/water.txt deleted file mode 100755 index 3023be98..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-30rep/water.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_20667_2qbp_-23485 0.47 0.12 0 -FEP_23484-23482 -35.27 0.27 1 -FEP_23477-23467 1.13 0.28 0 -FEP_23467-23475 -8.72 0.13 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.07 0.11 0 -FEP_20669_2qbr_-23472 -20.83 0.18 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 14.08 0.12 0 -FEP_23476-23466 -6.79 0.42 26 -FEP_23471-23470 -11.85 0.15 0 -FEP_23471-23466 9.39 0.15 0 -FEP_23477-23482 -56.96 0.16 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.39 0.12 0 -FEP_23477-23479 -8.11 0.12 0 -FEP_20670_2qbs_-23483 3.52 0.45 8 -FEP_23480-23479 -1.53 0.09 0 -FEP_23482-23485 36.24 0.34 2 -FEP_23486-23485 -0.50 0.10 0 -FEP_23484-23479 12.54 0.34 3 -FEP_23467-23468 -15.81 0.13 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 12.44 0.57 2 -FEP_23467-23469 -0.68 0.69 11 -FEP_23469-23472 -20.94 0.13 0 -FEP_20669_2qbr_-23466 -6.49 0.47 12 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.14 0.11 0 -FEP_23477-23466 -6.58 0.44 9 -FEP_23482-23479 48.82 0.16 0 -FEP_23477-23483 -1.59 0.40 16 -FEP_23486-23479 12.42 0.44 3 -FEP_20670_2qbs_-23466 -4.02 0.48 10 -FEP_23471-23468 0.01 0.31 0 -FEP_23466-23475 -0.70 0.36 3 -FEP_23485-23479 12.17 0.46 5 -FEP_20667_2qbp_-23482 -35.84 0.39 1 -FEP_23467-23466 -7.67 0.08 0 -FEP_23484-23485 0.63 0.10 0 -FEP_23467-23476 -3.95 0.42 4 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.91 0.15 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.61 0.17 0 -FEP_23467-23474 -2.22 0.58 2 -FEP_20670_2qbs_-23482 -53.18 0.21 0 -FEP_23483-23479 -6.07 0.39 0 -FEP_23480-23482 -50.43 0.16 0 -FEP_23482-23486 35.92 0.45 0 -FEP_23467-23473 8.38 0.76 1 -FEP_20670_2qbs_-23479 -4.11 0.17 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.69 0.17 0 -FEP_23474-23466 -5.20 0.60 7 -FEP_23484-23486 1.07 0.25 0 -FEP_23467-23470 -26.81 0.38 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-MFP-10rep/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-MFP-10rep/protein.txt deleted file mode 100755 index 2da9cc48..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-MFP-10rep/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,52 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_20667_2qbp_-23485 3.74 0.25 0 -FEP_23473-23467 -5.88 0.75 0 -FEP_23470-23468 10.47 0.46 0 -FEP_23475-23330_2qbq_ 15.71 0.37 0 -FEP_23472-23471 6.87 0.87 3 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.34 0.31 0 -FEP_23474-23475 -5.09 0.69 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 1.70 0.28 0 -FEP_23483-20670_2qbs_ -4.18 1.07 4 -FEP_23480-23483 4.58 0.66 2 -FEP_23480-23476 1.49 0.56 0 -FEP_23480-23477 7.67 0.35 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.74 0.33 0 -FEP_23475-23477 6.94 0.24 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ 0.47 0.30 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 13.37 0.28 0 -FEP_23482-23483 55.18 0.30 0 -FEP_23483-20667_2qbp_ -22.21 0.72 0 -FEP_23474-23476 -2.53 0.37 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.04 0.41 0 -FEP_23477-23479 -7.57 0.28 0 -FEP_23480-23479 -1.16 0.25 0 -FEP_23471-23467 17.20 0.43 0 -FEP_23482-23476 52.23 0.48 0 -FEP_23486-23485 3.72 0.20 0 -FEP_23485-23484 -4.87 0.52 0 -FEP_23476-23330_2qbq_ 12.22 0.24 0 -FEP_23483-23476 -3.59 0.87 3 -FEP_23468-23471 -1.36 0.86 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 15.61 1.32 2 -FEP_23470-23471 10.11 1.18 0 -FEP_23483-23475 -6.53 0.01 8 -FEP_20667_2qbp_-23484 -1.31 0.61 0 -FEP_23482-23479 48.42 0.26 0 -FEP_23486-23484 -0.94 0.49 0 -FEP_23476-23479 -4.20 0.35 0 -FEP_23482-20667_2qbp_ 34.76 0.94 1 -FEP_23480-23475 -0.99 0.30 0 -FEP_23469-23471 -13.61 0.63 0 -FEP_23482-23477 57.32 0.31 0 -FEP_23467-23466 -7.43 0.37 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -2.52 0.41 0 -FEP_23469-23468 -12.35 0.82 1 -FEP_23486-20667_2qbp_ -0.13 0.25 0 -FEP_23483-23479 -6.88 0.97 1 -FEP_23480-23482 -51.62 0.55 0 -FEP_20670_2qbs_-23479 -3.47 0.36 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 8.34 0.20 0 -FEP_23475-23479 -1.20 0.45 0 -FEP_20670_2qbs_-23475 -2.98 0.43 0 -FEP_23482-23475 50.07 0.43 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-MFP-10rep/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-MFP-10rep/water.txt deleted file mode 100755 index 5faa35ff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-MFP-10rep/water.txt +++ /dev/null @@ -1,52 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_20667_2qbp_-23485 0.53 0.13 0 -FEP_23473-23467 -8.17 0.60 0 -FEP_23470-23468 10.35 0.27 0 -FEP_23475-23330_2qbq_ 17.04 0.26 0 -FEP_23472-23471 4.37 1.16 0 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.77 0.22 0 -FEP_23474-23475 -5.77 0.22 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 2.58 0.34 0 -FEP_23483-20670_2qbs_ -3.83 0.82 2 -FEP_23480-23483 4.96 0.70 0 -FEP_23480-23476 3.00 0.35 1 -FEP_23480-23477 6.30 0.30 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 3.99 0.13 0 -FEP_23475-23477 6.76 0.17 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ -0.69 0.23 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 14.07 0.21 0 -FEP_23482-23483 55.47 0.23 0 -FEP_23483-20667_2qbp_ -20.21 0.20 0 -FEP_23474-23476 -2.87 0.27 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.32 0.25 0 -FEP_23477-23479 -8.61 0.25 0 -FEP_23480-23479 -1.46 0.11 0 -FEP_23471-23467 16.61 0.21 0 -FEP_23482-23476 53.09 0.33 0 -FEP_23486-23485 -0.25 0.20 0 -FEP_23485-23484 -0.70 0.35 0 -FEP_23476-23330_2qbq_ 12.93 0.21 0 -FEP_23483-23476 -3.36 0.80 5 -FEP_23468-23471 0.02 0.41 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 13.38 0.66 1 -FEP_23470-23471 11.83 0.24 0 -FEP_23483-23475 -5.64 0.79 4 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.06 0.17 0 -FEP_23482-23479 48.50 0.25 0 -FEP_23486-23484 -0.83 0.17 0 -FEP_23476-23479 -5.33 0.32 0 -FEP_23482-20667_2qbp_ 36.21 0.65 0 -FEP_23480-23475 0.30 0.20 0 -FEP_23469-23471 -12.37 0.25 0 -FEP_23482-23477 56.68 0.22 0 -FEP_23467-23466 -7.43 0.30 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -3.41 0.40 0 -FEP_23469-23468 -12.59 0.47 0 -FEP_23486-20667_2qbp_ -0.65 0.19 0 -FEP_23483-23479 -7.27 1.03 0 -FEP_23480-23482 -50.22 0.14 0 -FEP_20670_2qbs_-23479 -4.28 0.16 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.89 0.09 0 -FEP_23475-23479 -1.21 0.10 0 -FEP_20670_2qbs_-23475 -2.44 0.17 0 -FEP_23482-23475 50.27 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/protein.txt deleted file mode 100755 index 027dfe7c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-23468 1.69 0.94 0 -FEP_23484-23479 13.14 1.31 1 -FEP_23477-23483 0.04 1.05 4 -FEP_23477-23482 -57.25 0.86 0 -FEP_23467-23476 -5.25 0.91 3 -FEP_23469-23472 -18.16 0.73 1 -FEP_23482-23479 49.50 0.56 1 -FEP_23467-23469 -0.53 1.24 2 -FEP_23467-23474 -1.76 1.23 4 -FEP_20670_2qbs_-23466 0.35 1.13 4 -FEP_20670_2qbs_-23479 -2.82 0.30 1 -FEP_23474-23466 -5.44 0.69 7 -FEP_23476-23466 -0.59 0.69 7 -FEP_20669_2qbr_-23466 -5.40 0.77 6 -FEP_23467-23475 -8.49 0.60 0 -FEP_23486-23479 16.57 0.84 1 -FEP_23477-23466 -6.18 0.99 0 -FEP_23467-23466 -8.07 0.44 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.08 0.58 1 -FEP_23484-23482 -33.72 0.97 0 -FEP_23466-23475 -2.55 0.47 1 -FEP_20669_2qbr_-23472 -20.48 0.45 0 -FEP_20667_2qbp_-23482 -36.64 0.95 1 -FEP_23484-23485 3.94 0.47 1 -FEP_23485-23479 12.35 0.89 1 -FEP_23482-23486 35.42 0.69 4 -FEP_23477-23467 1.45 0.70 4 -FEP_20667_2qbp_-23485 2.63 0.33 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ -0.31 0.59 1 -FEP_23483-23479 -6.30 0.42 1 -FEP_23477-23479 -8.35 0.32 0 -FEP_20670_2qbs_-23483 2.38 1.11 3 -FEP_20670_2qbs_-23482 -52.65 1.01 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 13.85 0.21 0 -FEP_23471-23470 -7.63 1.51 1 -FEP_23484-23486 -0.41 0.57 0 -FEP_23482-23485 41.64 1.13 1 -FEP_23486-23485 3.34 0.43 2 -FEP_23471-23466 8.93 0.99 0 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.69 0.59 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.78 0.22 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.08 0.28 1 -FEP_23480-23479 -1.98 0.14 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.64 0.23 0 -FEP_23467-23473 8.11 1.53 1 -FEP_23467-23468 -15.48 0.49 0 -FEP_23480-23482 -51.72 0.48 1 -FEP_23467-23470 -25.74 0.34 1 -FEP_20667_2qbp_-23479 14.41 1.31 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/water.txt deleted file mode 100755 index f62b7543..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/water.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-23468 0.74 0.53 0 -FEP_23484-23479 11.94 0.45 1 -FEP_23477-23483 0.55 1.05 4 -FEP_23477-23482 -55.88 0.76 1 -FEP_23467-23476 -3.22 0.77 1 -FEP_23469-23472 -20.90 0.29 1 -FEP_23482-23479 48.72 0.33 1 -FEP_23467-23469 -0.26 0.66 7 -FEP_23467-23474 -0.17 1.18 4 -FEP_20670_2qbs_-23466 -3.41 0.60 4 -FEP_20670_2qbs_-23479 -4.18 0.17 0 -FEP_23474-23466 -5.31 0.07 8 -FEP_23476-23466 -6.87 0.46 5 -FEP_20669_2qbr_-23466 -5.66 0.56 4 -FEP_23467-23475 -8.81 0.32 0 -FEP_23486-23479 13.32 0.35 4 -FEP_23477-23466 -8.19 0.72 5 -FEP_23467-23466 -7.82 0.16 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 10.07 0.19 1 -FEP_23484-23482 -35.20 0.60 0 -FEP_23466-23475 0.70 0.90 1 -FEP_20669_2qbr_-23472 -21.08 0.24 0 -FEP_20667_2qbp_-23482 -35.79 0.49 1 -FEP_23484-23485 0.14 0.18 1 -FEP_23485-23479 12.52 0.62 0 -FEP_23482-23486 36.17 0.63 2 -FEP_23477-23467 1.51 0.40 0 -FEP_20667_2qbp_-23485 0.36 0.12 1 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.12 0.15 0 -FEP_23483-23479 -7.10 0.72 3 -FEP_23477-23479 -8.51 0.27 1 -FEP_20670_2qbs_-23483 3.59 0.48 4 -FEP_20670_2qbs_-23482 -52.44 0.21 1 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 13.75 0.29 1 -FEP_23471-23470 -11.52 0.34 1 -FEP_23484-23486 0.73 0.14 0 -FEP_23482-23485 35.10 0.27 3 -FEP_23486-23485 -0.68 0.19 0 -FEP_23471-23466 8.96 0.16 1 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.19 0.23 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.98 0.17 1 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.99 0.15 1 -FEP_23480-23479 -1.53 0.18 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.21 0.22 0 -FEP_23467-23473 8.01 0.60 2 -FEP_23467-23468 -15.83 0.32 1 -FEP_23480-23482 -50.47 0.14 0 -FEP_23467-23470 -27.82 0.25 3 -FEP_20667_2qbp_-23479 12.44 0.77 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r28/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r28/protein.txt deleted file mode 100755 index 90382c54..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r28/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-23468 1.78 0.56 1 -FEP_23484-23479 16.30 1.03 0 -FEP_23477-23483 -3.16 1.34 2 -FEP_23477-23482 -57.37 1.31 0 -FEP_23467-23476 -7.62 0.67 0 -FEP_23469-23472 -20.73 0.77 0 -FEP_23482-23479 48.23 0.72 1 -FEP_23467-23469 -4.80 1.45 2 -FEP_23467-23474 -6.69 0.98 0 -FEP_20670_2qbs_-23466 4.49 0.51 0 -FEP_20670_2qbs_-23479 -4.33 0.49 1 -FEP_23474-23466 1.56 0.78 0 -FEP_23476-23466 4.61 0.46 0 -FEP_20669_2qbr_-23466 1.26 0.86 1 -FEP_23467-23475 -9.62 0.38 0 -FEP_23486-23479 14.70 1.12 1 -FEP_23477-23466 -1.15 1.00 0 -FEP_23467-23466 -4.79 0.47 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 5.47 0.92 0 -FEP_23484-23482 -32.32 0.72 2 -FEP_23466-23475 -5.47 0.66 0 -FEP_20669_2qbr_-23472 -19.43 1.02 1 -FEP_20667_2qbp_-23482 -34.77 1.15 2 -FEP_23484-23485 3.07 0.81 0 -FEP_23485-23479 13.88 1.61 2 -FEP_23482-23486 33.40 0.39 0 -FEP_23477-23467 5.17 1.14 0 -FEP_20667_2qbp_-23485 1.56 0.53 1 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.81 0.64 0 -FEP_23483-23479 -3.79 0.53 1 -FEP_23477-23479 -12.30 0.51 0 -FEP_20670_2qbs_-23483 1.05 1.04 0 -FEP_20670_2qbs_-23482 -52.02 0.61 1 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 11.29 0.63 1 -FEP_23471-23470 -8.92 1.81 1 -FEP_23484-23486 2.35 0.68 0 -FEP_23482-23485 36.31 0.79 3 -FEP_23486-23485 1.01 0.32 1 -FEP_23471-23466 13.53 0.62 1 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.56 0.63 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -10.26 0.73 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.64 0.41 0 -FEP_23480-23479 0.53 0.37 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 5.84 0.24 1 -FEP_23467-23473 1.54 0.36 1 -FEP_23467-23468 -16.00 1.01 0 -FEP_23480-23482 -48.13 0.77 1 -FEP_23467-23470 -30.33 1.38 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 16.45 0.81 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r28/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r28/water.txt deleted file mode 100755 index c07bcc8f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r28/water.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-23468 1.16 0.29 1 -FEP_23484-23479 10.62 0.89 3 -FEP_23477-23483 -1.97 1.18 2 -FEP_23477-23482 -56.28 0.27 1 -FEP_23467-23476 -4.89 0.46 0 -FEP_23469-23472 -20.78 0.18 1 -FEP_23482-23479 48.73 0.24 0 -FEP_23467-23469 -1.48 0.74 3 -FEP_23467-23474 -1.29 0.87 3 -FEP_20670_2qbs_-23466 -5.29 0.61 6 -FEP_20670_2qbs_-23479 -4.41 0.26 1 -FEP_23474-23466 nan nan 10 -FEP_23476-23466 -3.01 0.75 8 -FEP_20669_2qbr_-23466 -5.82 0.64 4 -FEP_23467-23475 -8.61 0.51 1 -FEP_23486-23479 10.87 0.89 1 -FEP_23477-23466 -8.66 0.90 3 -FEP_23467-23466 -7.51 0.14 1 -FEP_23477-23330_2qbq_ 10.27 0.29 0 -FEP_23484-23482 -36.28 0.68 1 -FEP_23466-23475 0.14 0.94 1 -FEP_20669_2qbr_-23472 -21.13 0.12 1 -FEP_20667_2qbp_-23482 -35.69 0.68 0 -FEP_23484-23485 0.76 0.22 0 -FEP_23485-23479 12.06 0.84 2 -FEP_23482-23486 37.52 0.61 2 -FEP_23477-23467 0.29 0.90 0 -FEP_20667_2qbp_-23485 0.29 0.12 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.65 0.18 0 -FEP_23483-23479 -6.01 0.23 2 -FEP_23477-23479 -8.40 0.26 1 -FEP_20670_2qbs_-23483 3.42 0.79 1 -FEP_20670_2qbs_-23482 -52.62 0.16 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 14.28 0.22 0 -FEP_23471-23470 -11.52 0.31 1 -FEP_23484-23486 0.70 0.20 0 -FEP_23482-23485 35.99 0.77 0 -FEP_23486-23485 -0.18 0.24 0 -FEP_23471-23466 9.40 0.24 1 -FEP_20667_2qbp_-23484 0.14 0.11 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -10.01 0.15 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.82 0.28 1 -FEP_23480-23479 -1.31 0.15 1 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.04 0.13 0 -FEP_23467-23473 7.73 0.53 1 -FEP_23467-23468 -15.33 0.35 0 -FEP_23480-23482 -50.64 0.25 0 -FEP_23467-23470 -27.07 0.52 2 -FEP_20667_2qbp_-23479 11.02 1.04 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r31/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r31/protein.txt deleted file mode 100755 index 0f2fcc6a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r31/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,16 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23484-23479 20.98 0.47 4 -FEP_23469-23472 -20.34 0.72 0 -FEP_20670_2qbs_-23466 -3.41 0.38 8 -FEP_23476-23466 -1.60 0.45 8 -FEP_23484-23482 -31.43 0.71 2 -FEP_23466-23475 -1.93 0.65 2 -FEP_20667_2qbp_-23482 -33.43 0.92 3 -FEP_23484-23485 5.05 0.47 0 -FEP_23485-23479 17.16 0.48 8 -FEP_23471-23470 -9.42 0.95 0 -FEP_23484-23486 1.94 0.69 0 -FEP_23482-23485 37.26 0.98 4 -FEP_23486-23485 3.01 0.37 0 -FEP_20667_2qbp_-23484 -1.54 0.60 0 -FEP_23467-23470 -25.09 0.68 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r31/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r31/water.txt deleted file mode 100755 index 85035c5b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r31/water.txt +++ /dev/null @@ -1,16 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23484-23479 13.15 0.46 2 -FEP_23469-23472 -21.56 0.57 0 -FEP_20670_2qbs_-23466 -0.97 1.03 8 -FEP_23476-23466 -0.55 nan 9 -FEP_23484-23482 -38.33 1.06 2 -FEP_23466-23475 0.67 0.52 4 -FEP_20667_2qbp_-23482 -35.17 0.62 2 -FEP_23484-23485 0.42 0.15 0 -FEP_23485-23479 13.41 0.35 1 -FEP_23471-23470 -11.07 0.52 0 -FEP_23484-23486 1.39 0.29 0 -FEP_23482-23485 36.00 0.55 3 -FEP_23486-23485 0.03 0.18 0 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.45 0.24 0 -FEP_23467-23470 -26.64 0.53 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r33/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r33/protein.txt deleted file mode 100755 index fe1f83d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r33/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,16 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23484-23479 16.73 0.91 1 -FEP_23469-23472 -21.20 0.75 0 -FEP_20670_2qbs_-23466 -0.60 1.17 5 -FEP_23476-23466 -2.62 nan 9 -FEP_23484-23482 -31.24 0.82 1 -FEP_23466-23475 -2.68 0.45 3 -FEP_20667_2qbp_-23482 -33.31 1.01 1 -FEP_23484-23485 6.08 0.52 0 -FEP_23485-23479 15.28 0.75 0 -FEP_23471-23470 -9.74 0.83 0 -FEP_23484-23486 1.68 0.60 0 -FEP_23482-23485 36.88 1.14 2 -FEP_23486-23485 3.89 0.24 0 -FEP_20667_2qbp_-23484 -1.54 0.66 0 -FEP_23467-23470 -26.81 1.07 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r33/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r33/water.txt deleted file mode 100755 index 59ce4e2d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r33/water.txt +++ /dev/null @@ -1,16 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23484-23479 12.00 0.59 2 -FEP_23469-23472 -20.92 0.36 1 -FEP_20670_2qbs_-23466 -3.13 0.63 4 -FEP_23476-23466 -3.28 0.95 7 -FEP_23484-23482 -34.86 0.45 0 -FEP_23466-23475 0.82 0.83 1 -FEP_20667_2qbp_-23482 -34.44 0.32 0 -FEP_23484-23485 0.78 0.21 0 -FEP_23485-23479 11.29 1.12 0 -FEP_23471-23470 -11.68 0.26 0 -FEP_23484-23486 0.94 0.15 0 -FEP_23482-23485 37.10 0.80 0 -FEP_23486-23485 -0.07 0.16 0 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.07 0.20 0 -FEP_23467-23470 -27.37 0.44 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt deleted file mode 100755 index d0ab4396..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-23468 1.07 0.69 1 -FEP_23484-23479 15.52 0.63 1 -FEP_23477-23483 -0.96 0.98 5 -FEP_23477-23482 -56.59 0.34 1 -FEP_23467-23476 -5.87 0.86 2 -FEP_23469-23472 -19.18 0.31 1 -FEP_23482-23479 48.56 0.42 0 -FEP_23467-23469 -1.69 1.01 3 -FEP_23467-23474 -3.60 0.46 4 -FEP_20670_2qbs_-23466 0.06 1.08 6 -FEP_20670_2qbs_-23479 -3.90 0.26 0 -FEP_23474-23466 nan nan 10 -FEP_23476-23466 1.73 nan 9 -FEP_20669_2qbr_-23466 -5.38 0.56 5 -FEP_23467-23475 -9.68 0.46 0 -FEP_23486-23479 15.57 1.49 2 -FEP_23477-23466 -7.84 0.64 5 -FEP_23467-23466 -8.20 0.28 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.17 0.31 0 -FEP_23484-23482 -33.66 0.57 0 -FEP_23466-23475 -0.84 1.13 3 -FEP_20669_2qbr_-23472 -20.59 0.36 1 -FEP_20667_2qbp_-23482 -34.45 0.35 3 -FEP_23484-23485 3.87 0.47 0 -FEP_23485-23479 12.81 0.88 3 -FEP_23482-23486 33.81 0.61 2 -FEP_23477-23467 0.32 1.14 1 -FEP_20667_2qbp_-23485 3.60 0.24 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ -0.92 0.57 0 -FEP_23483-23479 -6.27 0.54 0 -FEP_23477-23479 -8.42 0.39 0 -FEP_20670_2qbs_-23483 2.40 1.40 2 -FEP_20670_2qbs_-23482 -52.44 0.26 1 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 12.77 0.54 2 -FEP_23471-23470 -8.56 1.27 0 -FEP_23484-23486 -0.70 0.56 1 -FEP_23482-23485 37.53 0.80 0 -FEP_23486-23485 3.45 0.27 1 -FEP_23471-23466 8.45 0.43 0 -FEP_20667_2qbp_-23484 0.50 0.40 1 -FEP_23473-20669_2qbr_ -8.38 0.27 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.30 0.23 0 -FEP_23480-23479 -1.42 0.35 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.48 0.22 1 -FEP_23467-23473 6.91 1.21 2 -FEP_23467-23468 -15.08 0.47 0 -FEP_23480-23482 -52.37 0.55 0 -FEP_23467-23470 -26.53 0.96 2 -FEP_20667_2qbp_-23479 16.18 0.70 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt deleted file mode 100755 index 1dbd16fc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-23468 1.66 0.78 0 -FEP_23484-23479 13.51 0.67 2 -FEP_23477-23483 -1.14 1.26 6 -FEP_23477-23482 -56.38 0.23 1 -FEP_23467-23476 -4.78 0.43 4 -FEP_23469-23472 -21.54 0.34 0 -FEP_23482-23479 48.80 0.20 1 -FEP_23467-23469 0.81 0.69 3 -FEP_23467-23474 -2.96 0.52 5 -FEP_20670_2qbs_-23466 -2.20 0.70 2 -FEP_20670_2qbs_-23479 -4.36 0.23 0 -FEP_23474-23466 -9.55 nan 9 -FEP_23476-23466 -4.35 0.17 8 -FEP_20669_2qbr_-23466 -5.24 0.25 4 -FEP_23467-23475 -8.89 0.24 1 -FEP_23486-23479 13.41 0.76 3 -FEP_23477-23466 -7.31 0.91 1 -FEP_23467-23466 -7.84 0.10 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 10.02 0.23 0 -FEP_23484-23482 -34.53 0.38 1 -FEP_23466-23475 -0.62 0.51 3 -FEP_20669_2qbr_-23472 -21.19 0.34 0 -FEP_20667_2qbp_-23482 -34.79 0.31 2 -FEP_23484-23485 0.56 0.13 0 -FEP_23485-23479 12.33 0.46 0 -FEP_23482-23486 37.20 0.74 1 -FEP_23477-23467 1.12 0.48 0 -FEP_20667_2qbp_-23485 0.07 0.18 2 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.27 0.18 2 -FEP_23483-23479 -7.50 0.97 1 -FEP_23477-23479 -8.22 0.23 0 -FEP_20670_2qbs_-23483 3.13 0.69 3 -FEP_20670_2qbs_-23482 -52.90 0.25 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 14.24 0.28 1 -FEP_23471-23470 -11.73 0.19 0 -FEP_23484-23486 1.15 0.15 2 -FEP_23482-23485 36.10 0.75 0 -FEP_23486-23485 -0.53 0.18 3 -FEP_23471-23466 8.26 0.52 4 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.14 0.25 1 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.90 0.20 2 -FEP_20667_2qbp_-23486 1.02 0.20 1 -FEP_23480-23479 -1.50 0.17 0 -FEP_20670_2qbs_-23477 3.98 0.10 0 -FEP_23467-23473 8.65 0.75 2 -FEP_23467-23468 -15.41 0.21 0 -FEP_23480-23482 -50.39 0.22 0 -FEP_23467-23470 -27.27 0.37 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 12.88 0.60 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-50w/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-50w/protein.txt deleted file mode 100755 index 3a0a0eee..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-50w/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-23468 2.16 0.80 1 -FEP_23484-23479 16.11 1.02 4 -FEP_23477-23483 -2.70 0.51 6 -FEP_23477-23482 -56.05 0.24 1 -FEP_23467-23476 -3.50 0.96 5 -FEP_23469-23472 -19.17 0.50 0 -FEP_23482-23479 48.67 0.53 0 -FEP_23467-23469 -2.00 1.46 5 -FEP_23467-23474 -3.86 0.86 4 -FEP_20670_2qbs_-23466 -1.57 1.00 4 -FEP_20670_2qbs_-23479 -4.21 0.37 0 -FEP_23474-23466 -4.00 nan 9 -FEP_23476-23466 -1.98 nan 9 -FEP_20669_2qbr_-23466 -3.87 0.44 7 -FEP_23467-23475 -10.13 0.39 0 -FEP_23486-23479 14.95 0.91 4 -FEP_23477-23466 -3.54 0.42 5 -FEP_23467-23466 -7.67 0.37 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 8.47 0.39 0 -FEP_23484-23482 -35.61 1.23 1 -FEP_23466-23475 -1.24 0.82 4 -FEP_20669_2qbr_-23472 -20.55 0.31 0 -FEP_20667_2qbp_-23482 -36.96 1.08 2 -FEP_23484-23485 3.43 0.43 0 -FEP_23485-23479 11.29 0.87 2 -FEP_23482-23486 33.25 1.02 1 -FEP_23477-23467 2.21 1.09 0 -FEP_20667_2qbp_-23485 3.80 0.31 1 -FEP_23469-20669_2qbr_ -0.16 0.33 1 -FEP_23483-23479 -7.28 1.04 0 -FEP_23477-23479 -8.30 0.31 1 -FEP_20670_2qbs_-23483 3.75 1.17 5 -FEP_20670_2qbs_-23482 -52.00 0.52 0 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 12.51 0.23 1 -FEP_23471-23470 -6.30 1.33 2 -FEP_23484-23486 -0.19 0.45 0 -FEP_23482-23485 37.37 0.60 2 -FEP_23486-23485 4.00 0.21 0 -FEP_23471-23466 11.06 1.20 0 -FEP_20667_2qbp_-23484 0.38 0.60 1 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.25 0.28 1 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.26 0.22 0 -FEP_23480-23479 -1.09 0.13 1 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.86 0.24 2 -FEP_23467-23473 5.33 0.53 4 -FEP_23467-23468 -14.85 0.58 1 -FEP_23480-23482 -52.52 0.70 1 -FEP_23467-23470 -25.54 0.71 0 -FEP_20667_2qbp_-23479 16.64 1.04 3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-50w/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-50w/water.txt deleted file mode 100755 index 0cdf2521..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/sigmoidal-50w/water.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-23468 0.21 0.22 2 -FEP_23484-23479 12.96 0.65 5 -FEP_23477-23483 -1.52 1.08 7 -FEP_23477-23482 -56.41 0.27 2 -FEP_23467-23476 -5.35 0.54 1 -FEP_23469-23472 -21.15 0.40 1 -FEP_23482-23479 48.69 0.25 0 -FEP_23467-23469 -1.85 1.42 7 -FEP_23467-23474 -0.16 0.60 3 -FEP_20670_2qbs_-23466 -2.48 0.59 3 -FEP_20670_2qbs_-23479 -3.94 0.18 0 -FEP_23474-23466 -2.03 nan 7 -FEP_23476-23466 -1.67 0.15 7 -FEP_20669_2qbr_-23466 -7.05 0.81 5 -FEP_23467-23475 -8.38 0.63 1 -FEP_23486-23479 11.85 0.83 3 -FEP_23477-23466 -7.96 0.90 5 -FEP_23467-23466 -7.95 0.33 2 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.84 0.31 0 -FEP_23484-23482 -37.44 1.07 2 -FEP_23466-23475 0.90 1.00 2 -FEP_20669_2qbr_-23472 -21.03 0.24 0 -FEP_20667_2qbp_-23482 -34.65 0.40 2 -FEP_23484-23485 1.03 0.25 0 -FEP_23485-23479 11.90 0.60 1 -FEP_23482-23486 36.81 0.84 0 -FEP_23477-23467 0.91 0.87 2 -FEP_20667_2qbp_-23485 0.48 0.16 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.27 0.62 0 -FEP_23483-23479 -7.44 1.23 2 -FEP_23477-23479 -8.29 0.32 1 -FEP_20670_2qbs_-23483 2.29 0.76 3 -FEP_20670_2qbs_-23482 -53.15 0.26 2 -FEP_20670_2qbs_-23330_2qbq_ 13.89 0.22 0 -FEP_23471-23470 -10.86 0.38 0 -FEP_23484-23486 1.07 0.32 0 -FEP_23482-23485 35.33 0.54 4 -FEP_23486-23485 -0.07 0.24 1 -FEP_23471-23466 8.41 0.75 0 -FEP_20667_2qbp_-23484 -0.07 0.22 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.60 0.25 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.90 0.15 0 -FEP_23480-23479 -1.54 0.21 1 -FEP_20670_2qbs_-23477 4.19 0.14 1 -FEP_23467-23473 8.20 0.33 3 -FEP_23467-23468 -15.28 0.29 0 -FEP_23480-23482 -50.58 0.37 1 -FEP_23467-23470 -28.12 0.33 1 -FEP_20667_2qbp_-23479 12.44 0.93 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/softcore-200alpha/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/softcore-200alpha/protein.txt deleted file mode 100755 index 89a2b3f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/softcore-200alpha/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,26 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23480-23476 4.38 0.36 1 -FEP_23479-23476 5.47 0.27 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ -0.38 0.39 2 -FEP_23482-20667_2qbp_ 32.21 0.46 2 -FEP_23468-23470 -12.07 0.63 2 -FEP_23467-23466 -8.37 0.51 1 -FEP_23477-23330_2qbq_ 7.85 0.51 2 -FEP_23479-23480 1.01 0.26 2 -FEP_23471-23467 18.45 0.53 0 -FEP_23486-23484 0.87 0.38 4 -FEP_20670_2qbs_-23474 2.25 0.32 6 -FEP_20669_2qbr_-23469 -0.54 0.25 1 -FEP_23475-23330_2qbq_ 13.87 0.62 3 -FEP_23473-23466 -12.03 0.71 4 -FEP_23471-23470 -11.18 0.80 2 -FEP_23475-23477 6.90 0.24 1 -FEP_23486-23485 4.30 0.36 3 -FEP_23483-23472 -19.05 0.89 1 -FEP_23469-23471 -11.69 0.59 1 -FEP_23485-23484 -3.23 0.53 3 -FEP_20667_2qbp_-23486 -1.00 0.25 1 -FEP_23471-23472 -8.11 0.99 1 -FEP_23467-23473 4.88 0.63 1 -FEP_23475-23479 -2.97 0.32 1 -FEP_20667_2qbp_-23483 20.31 0.48 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/softcore-200alpha/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/softcore-200alpha/water.txt deleted file mode 100755 index fb867515..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/softcore-200alpha/water.txt +++ /dev/null @@ -1,26 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23480-23476 5.02 0.28 4 -FEP_23479-23476 6.46 0.32 3 -FEP_23474-20669_2qbr_ -1.39 0.23 4 -FEP_23482-20667_2qbp_ 32.39 0.54 1 -FEP_23468-23470 -12.14 0.16 4 -FEP_23467-23466 -7.47 0.31 4 -FEP_23477-23330_2qbq_ 8.77 0.41 3 -FEP_23479-23480 1.10 0.18 4 -FEP_23471-23467 19.21 0.31 2 -FEP_23486-23484 -0.89 0.17 3 -FEP_20670_2qbs_-23474 4.11 0.24 3 -FEP_20669_2qbr_-23469 -0.59 0.18 4 -FEP_23475-23330_2qbq_ 15.54 0.45 4 -FEP_23473-23466 -14.16 0.50 2 -FEP_23471-23470 -11.19 0.83 1 -FEP_23475-23477 6.52 0.32 4 -FEP_23486-23485 -0.64 0.17 0 -FEP_23483-23472 -18.13 0.92 4 -FEP_23469-23471 -11.94 0.53 4 -FEP_23485-23484 -0.48 0.22 2 -FEP_20667_2qbp_-23486 0.41 0.28 4 -FEP_23471-23472 -7.76 0.30 4 -FEP_23467-23473 5.17 0.40 4 -FEP_23475-23479 -4.06 0.47 5 -FEP_20667_2qbp_-23483 20.78 0.16 4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/softcore-23484edges/protein_23484edges.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/softcore-23484edges/protein_23484edges.txt deleted file mode 100755 index ea569996..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/softcore-23484edges/protein_23484edges.txt +++ /dev/null @@ -1,23 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23484-23479 15.78 0.49 3 -FEP_23484-23477 27.43 0.71 5 -FEP_23484-23475 18.71 0.92 1 -FEP_23484-23468 13.45 0.86 1 -FEP_23484-23466 32.97 0.36 8 -FEP_23484-20667_2qbp_ 0.18 0.29 2 -FEP_23484-23470 2.33 1.01 2 -FEP_23484-23482 -32.09 0.93 3 -FEP_23484-23467 30.19 1.08 6 -FEP_23484-23483 19.56 0.73 0 -FEP_23484-23485 3.23 0.45 0 -FEP_23484-23472 4.95 0.63 1 -FEP_23484-23480 17.41 0.52 2 -FEP_23484-23330_2qbq_ 30.55 0.88 2 -FEP_23484-23469 20.99 0.85 4 -FEP_23484-23486 0.02 0.26 6 -FEP_23484-23473 31.17 0.88 3 -FEP_23484-20669_2qbr_ 21.25 1.40 2 -FEP_23484-23476 21.78 0.64 5 -FEP_23484-23474 25.21 0.99 2 -FEP_23484-23471 9.32 1.44 3 -FEP_23484-20670_2qbs_ 20.76 0.59 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/softcore-23484edges/water_23484edges.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/softcore-23484edges/water_23484edges.txt deleted file mode 100755 index b1aa0fd0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/softcore-23484edges/water_23484edges.txt +++ /dev/null @@ -1,23 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23484-23479 14.85 0.63 2 -FEP_23484-23477 25.94 0.55 4 -FEP_23484-23475 17.74 0.37 3 -FEP_23484-23468 10.82 0.63 4 -FEP_23484-23466 21.96 0.03 8 -FEP_23484-20667_2qbp_ 0.46 0.25 4 -FEP_23484-23470 -1.37 0.42 2 -FEP_23484-23482 -32.48 0.29 2 -FEP_23484-23467 27.97 1.28 5 -FEP_23484-23483 20.65 0.18 2 -FEP_23484-23485 0.38 0.24 3 -FEP_23484-23472 0.96 0.86 3 -FEP_23484-23480 16.99 0.51 3 -FEP_23484-23330_2qbq_ 33.88 0.28 1 -FEP_23484-23469 23.87 1.25 3 -FEP_23484-23486 0.38 0.16 2 -FEP_23484-23473 34.13 0.51 5 -FEP_23484-20669_2qbr_ 22.37 0.71 2 -FEP_23484-23476 22.02 0.68 1 -FEP_23484-23474 22.84 0.49 3 -FEP_23484-23471 10.89 0.90 6 -FEP_23484-20670_2qbs_ 21.37 0.59 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100755 index 65323b72..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,255 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471_20669-2qbr- 13.29 0.83 0 -FEP_23474_20669-2qbr- -0.95 0.22 0 -FEP_23468_23330-2qbq- 24.77 0.54 0 -FEP_23473_23466 -15.84 0.60 4 -FEP_23469_20667-2qbp- -19.00 1.13 5 -FEP_23471_23468 0.18 0.24 0 -FEP_23473_23470 -34.42 0.37 1 -FEP_23472_23469 21.51 0.49 0 -FEP_20670-2qbs-_20669-2qbr- 3.08 0.26 0 -FEP_23470_23468 10.48 0.27 0 -FEP_23470_23469 23.53 0.16 0 -FEP_23473_20667-2qbp- -36.28 0.29 0 -FEP_23468_23467 15.32 0.25 0 -FEP_23471_23330-2qbq- 25.10 0.56 6 -FEP_23471_23470 -11.30 0.32 0 -FEP_23471_20670-2qbs- 10.76 0.58 3 -FEP_23469_23330-2qbq- 11.91 0.97 6 -FEP_23469_20670-2qbs- -3.12 0.27 1 -FEP_23472_20667-2qbp- -0.96 0.58 5 -FEP_23468_20670-2qbs- 9.83 0.35 0 -FEP_23474_23472 -21.44 0.35 0 -FEP_23473_23472 -31.12 0.21 0 -FEP_23468_20667-2qbp- -15.83 0.21 0 -FEP_23471_23466 9.35 0.30 0 -FEP_23330-2qbq-_20669-2qbr- -11.09 0.50 2 -FEP_23470_20667-2qbp- 1.88 0.23 7 -FEP_23330-2qbq-_20667-2qbp- -30.31 0.65 4 -FEP_23473_23467 -8.40 0.54 2 -FEP_23473_23468 -23.27 0.39 0 -FEP_23471_23467 17.11 0.28 0 -FEP_23467_20669-2qbr- -1.85 0.25 1 -FEP_23474_23466 1.53 0.24 0 -FEP_23474_23471 -14.92 0.94 2 -FEP_23472_23466 15.49 0.87 7 -FEP_23474_23468 -15.15 1.02 3 -FEP_20670-2qbs-_20667-2qbp- -15.93 1.19 4 -FEP_23475_20667-2qbp- -10.61 0.04 8 -FEP_23469_23466 -6.71 0.82 5 -FEP_23470_20669-2qbr- 23.99 0.38 2 -FEP_23467_23330-2qbq- 0.54 0.18 0 -FEP_23472_20670-2qbs- 17.90 0.26 0 -FEP_23471_20667-2qbp- -15.42 0.26 0 -FEP_23469_23467 1.70 0.43 6 -FEP_23466_20669-2qbr- 6.99 1.02 6 -FEP_23471_23469 12.56 0.27 0 -FEP_23474_23473 9.23 0.24 0 -FEP_23467_20667-2qbp- -33.80 0.17 0 -FEP_23474_20670-2qbs- -3.25 0.43 0 -FEP_23472_20669-2qbr- 21.13 0.17 0 -FEP_23474_23330-2qbq- 10.24 0.45 0 -FEP_23470_23466 19.12 0.43 2 -FEP_23469_20669-2qbr- 0.26 0.17 0 -FEP_23473_23330-2qbq- 0.79 0.49 1 -FEP_23468_23466 8.00 0.38 0 -FEP_23473_23471 -23.89 0.54 0 -FEP_23474_23469 -1.35 0.19 0 -FEP_23475_20669-2qbr- 5.92 0.42 0 -FEP_20669-2qbr-_20667-2qbp- -21.59 0.70 7 -FEP_23470_23467 25.99 0.56 0 -FEP_23467_20670-2qbs- -5.76 0.51 2 -FEP_23473_23469 -10.37 0.21 0 -FEP_23466_20667-2qbp- -28.26 0.21 0 -FEP_23468_20669-2qbr- 14.02 0.45 0 -FEP_23466_23330-2qbq- 6.11 0.14 0 -FEP_23472_23330-2qbq- 32.48 0.47 0 -FEP_23472_23471 5.64 0.91 0 -FEP_23472_23470 -5.46 0.89 3 -FEP_23473_20670-2qbs- -12.40 0.30 0 -FEP_23469_23468 -12.30 0.19 2 -FEP_23470_20670-2qbs- 20.94 0.19 0 -FEP_23470_23330-2qbq- 34.09 0.37 3 -FEP_23467_23466 -7.54 0.23 0 -FEP_23474_23467 1.68 0.86 3 -FEP_23472_23468 6.78 0.68 2 -FEP_23472_23467 23.06 0.67 1 -FEP_23475_20670-2qbs- 2.25 0.14 0 -FEP_23474_20667-2qbp- -20.45 0.79 5 -FEP_23473_20669-2qbr- -9.92 0.11 0 -FEP_23474_23470 -23.36 0.63 1 -FEP_23330-2qbq-_20670-2qbs- -14.55 0.20 0 -FEP_23466_20670-2qbs- 4.27 1.21 7 -FEP_23479_23471 -6.53 0.97 1 -FEP_23482_23477 56.23 0.37 0 -FEP_23479_23475 1.42 0.20 0 -FEP_23482_23330-2qbq- 66.92 0.18 0 -FEP_23476_23466 -3.00 0.92 3 -FEP_23475_23473 15.39 0.45 0 -FEP_23477_20670-2qbs- -3.82 0.18 0 -FEP_23479_23467 7.24 0.79 4 -FEP_23476_23467 3.05 0.87 0 -FEP_23485_23471 15.52 0.24 0 -FEP_23485_23330-2qbq- 30.64 0.86 2 -FEP_23486_23476 15.36 0.63 5 -FEP_23485_20670-2qbs- 14.75 0.30 7 -FEP_23485_23474 19.37 0.84 8 -FEP_23482_23469 52.19 0.94 2 -FEP_23485_23467 33.90 0.20 0 -FEP_23479_23474 6.74 0.51 0 -FEP_23483_23480 -4.69 0.69 0 -FEP_23483_23477 1.84 0.30 4 -FEP_23476_23470 -22.47 0.58 2 -FEP_23477_23468 -13.88 0.21 0 -FEP_23483_23471 -5.95 0.75 0 -FEP_23482_23475 49.87 0.26 0 -FEP_23483_23469 0.76 0.67 7 -FEP_23482_20669-2qbr- 53.83 0.87 3 -FEP_23486_23473 30.11 0.87 5 -FEP_23480_23479 -1.48 0.17 0 -FEP_23476_23472 -19.26 0.49 0 -FEP_23483_23472 -20.80 0.63 5 -FEP_23477_23469 -2.15 0.50 1 -FEP_23486_23467 32.97 0.22 0 -FEP_23475_23466 -0.15 0.65 0 -FEP_23483_23479 -7.70 0.88 1 -FEP_23485_23476 17.50 0.83 5 -FEP_23486_23466 27.15 0.11 0 -FEP_23485_23477 21.20 1.04 6 -FEP_23475_23469 5.33 0.85 1 -FEP_23476_23330-2qbq- 13.15 0.26 0 -FEP_23479_23468 -5.85 0.50 0 -FEP_23476_20669-2qbr- 3.28 0.38 0 -FEP_23486_23471 4.84 1.04 8 -FEP_23483_20670-2qbs- -4.13 1.07 6 -FEP_23482_23473 64.92 1.10 1 -FEP_23480_23474 6.48 0.29 0 -FEP_23486_20670-2qbs- 15.70 1.21 8 -FEP_23476_23474 1.77 0.47 0 -FEP_23485_23475 21.62 0.24 0 -FEP_23479_20670-2qbs- 3.98 0.18 0 -FEP_23476_20667-2qbp- -16.16 0.68 5 -FEP_23477_23474 -0.69 0.31 0 -FEP_23480_23466 8.53 0.13 0 -FEP_23477_23471 -16.00 1.05 0 -FEP_23485_23468 16.16 0.24 0 -FEP_23483_23467 12.88 0.25 0 -FEP_23485_23473 28.46 1.15 8 -FEP_23475_23470 -16.59 0.29 0 -FEP_23480_23470 -18.05 0.38 0 -FEP_23475_23472 -15.56 0.38 0 -FEP_23482_23466 58.68 0.19 0 -FEP_23483_20669-2qbr- 2.29 0.85 7 -FEP_23486_23483 nan nan 10 -FEP_23485_23480 14.26 0.71 1 -FEP_23475_23330-2qbq- 16.70 0.24 0 -FEP_23486_23468 7.06 0.47 8 -FEP_23483_23476 -4.09 0.80 2 -FEP_23479_23476 4.64 0.47 0 -FEP_23480_23471 -8.28 0.53 4 -FEP_23475_23467 8.90 0.28 0 -FEP_23486_23480 14.06 0.49 1 -FEP_23475_23471 -9.09 0.67 0 -FEP_23483_20667-2qbp- -20.76 0.25 0 -FEP_23477_23476 -3.25 0.11 0 -FEP_23482_23472 34.83 0.43 0 -FEP_23479_23472 -13.94 0.34 0 -FEP_23486_23482 nan nan 10 -FEP_23482_23471 41.33 0.36 6 -FEP_23486_23485 -0.15 0.16 0 -FEP_23479_23470 -16.83 0.34 0 -FEP_23486_23474 18.24 1.05 7 -FEP_23485_23479 13.27 0.32 1 -FEP_23477_23330-2qbq- 9.51 0.15 0 -FEP_23477_23473 8.01 0.95 0 -FEP_23485_20667-2qbp- -0.35 0.22 0 -FEP_23486_23470 -5.86 1.10 6 -FEP_23480_23330-2qbq- 16.59 0.22 0 -FEP_23485_20669-2qbr- 16.21 0.30 8 -FEP_23480_23475 -0.78 0.25 0 -FEP_23479_23330-2qbq- 18.16 0.16 0 -FEP_23479_23473 16.51 0.55 1 -FEP_23485_23483 19.97 0.16 0 -FEP_23482_23474 55.87 0.37 1 -FEP_23475_23474 5.28 0.20 0 -FEP_23483_23474 2.26 0.41 3 -FEP_23476_23468 -11.63 0.73 0 -FEP_23483_23466 7.14 0.16 0 -FEP_23475_23468 -6.95 0.16 0 -FEP_23485_23472 -3.08 1.26 7 -FEP_23486_23475 15.15 0.58 5 -FEP_23486_23477 27.51 0.19 0 -FEP_23480_20667-2qbp- -15.37 0.53 1 -FEP_23482_23480 50.56 0.20 0 -FEP_23483_23473 6.60 0.44 8 -FEP_23482_23467 57.10 0.54 3 -FEP_23482_23470 32.09 0.42 1 -FEP_23477_20669-2qbr- -0.47 0.54 0 -FEP_23486_20667-2qbp- -0.37 0.10 0 -FEP_23476_23471 -13.37 1.02 2 -FEP_23480_23469 4.98 1.08 1 -FEP_23482_20670-2qbs- 52.32 0.27 0 -FEP_23486_23472 0.82 0.84 7 -FEP_23479_23469 5.66 1.13 2 -FEP_23480_23472 -15.16 0.29 0 -FEP_23486_23330-2qbq- 29.70 1.04 4 -FEP_23483_23470 -24.50 0.25 7 -FEP_23480_23476 3.35 0.20 0 -FEP_23483_23330-2qbq- 10.86 0.61 1 -FEP_23477_23467 1.58 0.32 1 -FEP_23482_23476 53.07 0.22 0 -FEP_23479_20667-2qbp- -13.29 0.46 3 -FEP_23485_23466 28.41 0.23 0 -FEP_23480_20670-2qbs- 2.11 0.26 0 -FEP_23485_23469 25.83 0.21 0 -FEP_23480_20669-2qbr- 5.88 0.51 0 -FEP_23482_23479 48.66 0.26 0 -FEP_23477_23470 -25.34 0.83 0 -FEP_23477_23472 -22.27 0.25 0 -FEP_23476_23469 1.00 0.78 0 -FEP_23486_20669-2qbr- 17.14 0.36 7 -FEP_23483_23468 -14.89 0.48 8 -FEP_23477_23466 -6.73 0.53 2 -FEP_23482_20667-2qbp- 36.38 0.92 0 -FEP_23479_23477 8.18 0.19 0 -FEP_23486_23469 17.96 0.64 5 -FEP_23479_20669-2qbr- 6.78 0.61 0 -FEP_23476_23475 -3.39 0.25 0 -FEP_23480_23473 14.18 0.70 1 -FEP_23479_23466 9.69 0.09 0 -FEP_23480_23468 -8.55 0.75 1 -FEP_23485_23470 -4.26 0.65 4 -FEP_23482_23468 42.68 0.46 0 -FEP_23483_23475 -8.64 0.53 6 -FEP_23480_23477 6.73 0.16 0 -FEP_23485_23482 nan nan 10 -FEP_23476_23473 11.48 0.79 0 -FEP_23477_20667-2qbp- -19.85 0.86 5 -FEP_23483_23482 nan nan 10 -FEP_23480_23467 7.86 0.17 7 -FEP_23476_20670-2qbs- -0.42 0.26 0 -FEP_23477_23475 -6.86 0.19 0 -FEP_23486_23479 12.39 0.73 1 -FEP_23484_23479 12.67 0.47 1 -FEP_23484_23477 20.65 1.33 7 -FEP_23484_23475 12.75 0.54 5 -FEP_23484_23468 15.59 0.15 0 -FEP_23484_23466 27.65 0.23 0 -FEP_23484_20667-2qbp- -0.21 0.17 0 -FEP_23484_23470 -3.99 0.68 5 -FEP_23484_23482 nan nan 10 -FEP_23484_23467 33.00 0.12 0 -FEP_23484_23483 20.26 0.38 0 -FEP_23484_23485 0.82 0.23 0 -FEP_23484_23472 -0.96 0.92 3 -FEP_23484_23480 16.53 0.39 0 -FEP_23484_23330-2qbq- 31.91 0.64 3 -FEP_23484_23469 25.66 0.11 0 -FEP_23484_23486 0.76 0.17 0 -FEP_23484_23473 33.60 0.20 7 -FEP_23484_20669-2qbr- 19.08 0.65 6 -FEP_23484_23476 18.34 0.89 4 -FEP_23484_23474 20.30 1.16 4 -FEP_23484_23471 4.50 0.15 8 -FEP_23484_20670-2qbs- 14.34 0.84 4 -FEP_23482_23483 55.48 0.31 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/water_sc.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/water_sc.txt deleted file mode 100755 index 9da83602..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/water_sc.txt +++ /dev/null @@ -1,29 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-23468 0.86 0.31 0 -FEP_23475-20670_2qbs_ 2.45 0.29 0 -FEP_23480-23476 4.40 0.39 0 -FEP_23479-23476 5.14 0.36 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ 0.41 0.54 0 -FEP_23482-20667_2qbp_ 34.74 0.43 0 -FEP_23468-23470 -12.03 0.40 0 -FEP_23467-23466 -6.72 0.45 0 -FEP_23477-23330_2qbq_ 8.46 0.32 0 -FEP_23479-23480 1.43 0.34 0 -FEP_23471-23467 15.69 0.45 0 -FEP_23486-23484 -1.24 0.49 0 -FEP_20670_2qbs_-23474 3.98 0.35 0 -FEP_20669_2qbr_-23469 -0.48 0.28 0 -FEP_23475-23330_2qbq_ 16.47 0.36 0 -FEP_23473-23466 -14.54 0.72 0 -FEP_23471-23470 -10.80 0.53 0 -FEP_23475-23477 6.88 0.33 0 -FEP_23486-23485 0.06 0.33 0 -FEP_23483-23472 -18.99 0.54 0 -FEP_23469-23471 -13.32 0.76 0 -FEP_23485-23484 -0.79 0.41 0 -FEP_20667_2qbp_-23486 1.44 0.60 0 -FEP_23471-23472 -6.27 0.84 0 -FEP_23467-23473 7.61 0.44 0 -FEP_23475-23479 -1.87 0.45 0 -FEP_20667_2qbp_-23483 20.19 0.34 0 -FEP_23479-23482 -48.72 0.43 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/whole-matrix/protein_whole.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/whole-matrix/protein_whole.txt deleted file mode 100755 index fcb784f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/whole-matrix/protein_whole.txt +++ /dev/null @@ -1,254 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23467-20669_2qbr_ -1.66 0.57 0 -FEP_23472-23470 -5.17 1.29 1 -FEP_23471-23468 1.22 0.48 0 -FEP_23472-23330_2qbq_ 30.00 0.57 0 -FEP_23472-20670_2qbs_ 16.94 0.59 0 -FEP_23330_2qbq_-20669_2qbr_ -9.99 0.83 4 -FEP_23469-20670_2qbs_ -3.97 0.43 0 -FEP_23473-23467 -6.40 1.12 0 -FEP_23471-20667_2qbp_ -23.33 1.11 0 -FEP_23469-23330_2qbq_ 9.30 0.69 4 -FEP_23475-20670_2qbs_ 2.91 0.16 0 -FEP_23475-20669_2qbr_ 5.92 0.33 1 -FEP_23473-20670_2qbs_ -11.95 0.21 0 -FEP_23466-20669_2qbr_ 4.91 0.73 3 -FEP_23470-23330_2qbq_ 31.73 0.61 3 -FEP_23470-23469 22.31 0.47 0 -FEP_23468-20669_2qbr_ 11.14 0.49 0 -FEP_23469-23468 -12.10 0.51 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ 0.48 0.34 0 -FEP_23471-23469 12.74 0.36 0 -FEP_23470-20670_2qbs_ 17.11 0.44 0 -FEP_23474-23468 -11.15 0.27 4 -FEP_23474-23466 3.73 0.59 0 -FEP_23468-23466 7.62 0.51 1 -FEP_23472-23467 23.73 0.65 3 -FEP_20669_2qbr_-20667_2qbp_ -30.39 1.00 0 -FEP_23330_2qbq_-20667_2qbp_ -29.21 1.83 6 -FEP_23472-23469 20.09 0.36 0 -FEP_23467-23466 -7.30 0.26 0 -FEP_23474-23471 -13.15 1.31 0 -FEP_23467-20670_2qbs_ -6.24 0.85 3 -FEP_23472-20667_2qbp_ -10.81 1.39 0 -FEP_23474-23473 9.84 0.28 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -2.21 0.42 0 -FEP_23468-20667_2qbp_ -12.98 0.88 8 -FEP_23466-20667_2qbp_ -36.03 0.98 0 -FEP_23471-20670_2qbs_ 9.22 0.69 0 -FEP_23473-20667_2qbp_ -39.72 0.87 0 -FEP_23330_2qbq_-20670_2qbs_ -13.18 0.17 0 -FEP_23471-23467 16.57 0.44 0 -FEP_23470-23467 26.12 0.92 0 -FEP_23473-23469 -8.49 0.50 0 -FEP_23474-20667_2qbp_ -25.72 1.63 6 -FEP_20670_2qbs_-20667_2qbp_ -19.99 0.68 7 -FEP_23473-23468 -20.58 0.57 0 -FEP_23466-23330_2qbq_ 3.24 0.21 0 -FEP_23474-23467 3.50 0.87 7 -FEP_23468-23467 15.40 0.44 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ -0.61 0.41 0 -FEP_20670_2qbs_-20669_2qbr_ 3.71 0.24 0 -FEP_23473-23330_2qbq_ 2.51 0.59 1 -FEP_23469-20667_2qbp_ -32.02 1.01 0 -FEP_23469-23466 -2.96 0.64 3 -FEP_23473-23471 -20.64 0.51 0 -FEP_23474-23469 1.50 0.26 0 -FEP_23473-23466 -12.62 0.42 5 -FEP_23471-23470 -11.31 0.47 0 -FEP_23472-23466 15.32 0.91 5 -FEP_23475-20667_2qbp_ -19.61 0.73 7 -FEP_23471-23330_2qbq_ 23.04 0.80 3 -FEP_23472-23471 6.36 1.11 0 -FEP_23471-23466 8.36 0.40 0 -FEP_23471-20669_2qbr_ 12.61 0.74 0 -FEP_23467-23330_2qbq_ -2.36 0.25 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.35 0.18 0 -FEP_23470-23468 10.70 0.49 0 -FEP_23467-20667_2qbp_ -41.00 1.21 0 -FEP_23474-23470 -22.93 0.85 1 -FEP_23470-23466 18.76 0.44 0 -FEP_23474-23330_2qbq_ 10.98 0.42 0 -FEP_23468-23330_2qbq_ 21.44 0.64 2 -FEP_23473-23470 -32.89 0.97 0 -FEP_23466-20670_2qbs_ 0.37 0.41 6 -FEP_23472-20669_2qbr_ 20.40 0.53 0 -FEP_23470-20669_2qbr_ 22.19 0.52 1 -FEP_23468-20670_2qbs_ 7.68 0.42 0 -FEP_23472-23468 7.10 1.24 3 -FEP_23474-23472 -20.23 0.34 0 -FEP_23469-23467 4.25 0.41 2 -FEP_23473-23472 -28.88 0.19 0 -FEP_23470-20667_2qbp_ -6.75 0.04 7 -FEP_23479-23471 -6.30 0.91 5 -FEP_23482-23477 56.98 0.28 1 -FEP_23479-23475 1.02 0.22 2 -FEP_23482-23330_2qbq_ 65.44 0.30 0 -FEP_23476-23466 -2.04 1.11 7 -FEP_23475-23473 14.00 0.32 1 -FEP_23477-20670_2qbs_ -4.61 0.12 1 -FEP_23479-23467 8.73 0.01 8 -FEP_23476-23467 6.33 0.97 1 -FEP_23485-23471 18.06 0.63 0 -FEP_23485-23330_2qbq_ 29.78 1.11 6 -FEP_23486-23476 26.66 1.47 8 -FEP_23485-20670_2qbs_ 20.52 0.32 8 -FEP_23485-23474 17.31 0.09 8 -FEP_23482-23469 53.37 0.95 4 -FEP_23485-23467 38.36 0.69 0 -FEP_23479-23474 5.76 0.68 0 -FEP_23483-23480 -6.39 0.59 0 -FEP_23483-23477 0.16 0.86 5 -FEP_23476-23470 -19.74 0.72 3 -FEP_23477-23468 -12.25 0.27 0 -FEP_23483-23471 -14.83 0.09 8 -FEP_23482-23475 50.75 0.35 1 -FEP_23483-23469 -0.04 1.00 7 -FEP_23482-20669_2qbr_ 54.35 0.70 4 -FEP_23486-23473 40.86 1.14 0 -FEP_23480-23479 -1.58 0.20 0 -FEP_23476-23472 -18.16 0.45 0 -FEP_23483-23472 -21.41 1.19 5 -FEP_23477-23469 -1.75 0.31 1 -FEP_23486-23467 41.31 1.24 0 -FEP_23475-23466 2.37 0.70 0 -FEP_23483-23479 -6.93 0.82 2 -FEP_23485-23476 20.00 1.05 8 -FEP_23486-23466 36.79 1.33 0 -FEP_23485-23477 18.01 0.39 8 -FEP_23475-23469 6.17 0.63 4 -FEP_23476-23330_2qbq_ 11.96 0.35 0 -FEP_23479-23468 -3.85 0.35 3 -FEP_23476-20669_2qbr_ 2.54 0.50 2 -FEP_23486-23471 22.75 1.40 0 -FEP_23483-20670_2qbs_ -4.89 0.99 4 -FEP_23482-23473 62.81 0.90 0 -FEP_23480-23474 4.08 1.16 2 -FEP_23486-20670_2qbs_ 19.52 0.64 6 -FEP_23476-23474 1.72 0.30 3 -FEP_23485-23475 12.36 0.46 8 -FEP_23479-20670_2qbs_ 3.91 0.29 2 -FEP_23476-20667_2qbp_ -28.56 0.89 0 -FEP_23477-23474 -1.91 0.39 1 -FEP_23480-23466 2.27 0.58 8 -FEP_23477-23471 -15.50 0.85 0 -FEP_23485-23468 22.92 0.78 1 -FEP_23483-23467 14.78 0.47 0 -FEP_23485-23473 37.43 0.81 0 -FEP_23475-23470 -15.73 0.42 1 -FEP_23480-23470 -16.07 0.40 5 -FEP_23475-23472 -14.42 0.37 0 -FEP_23482-23466 60.89 0.20 0 -FEP_23483-20669_2qbr_ -2.80 0.70 6 -FEP_23486-23483 nan nan 10 -FEP_23485-23480 15.85 0.90 5 -FEP_23475-23330_2qbq_ 15.72 0.20 3 -FEP_23486-23468 14.04 0.21 8 -FEP_23483-23476 -3.95 0.86 5 -FEP_23479-23476 4.28 0.29 0 -FEP_23480-23471 -8.72 0.95 6 -FEP_23475-23467 9.04 0.73 1 -FEP_23486-23480 22.26 0.78 2 -FEP_23475-23471 -6.80 0.52 1 -FEP_23483-20667_2qbp_ -22.01 0.53 0 -FEP_23477-23476 -3.70 0.41 0 -FEP_23482-23472 34.22 1.13 1 -FEP_23479-23472 -12.92 0.62 0 -FEP_23486-23482 nan nan 10 -FEP_23482-23471 42.75 0.94 2 -FEP_23486-23485 4.46 0.21 0 -FEP_23479-23470 -13.37 0.45 0 -FEP_23486-23474 22.28 0.91 7 -FEP_23485-23479 12.24 1.56 2 -FEP_23477-23330_2qbq_ 8.38 0.25 0 -FEP_23477-23473 7.35 0.33 0 -FEP_23485-20667_2qbp_ -3.63 0.14 0 -FEP_23486-23470 7.93 0.45 8 -FEP_23480-23330_2qbq_ 15.01 0.35 0 -FEP_23485-20669_2qbr_ 19.72 0.86 6 -FEP_23480-23475 0.78 0.53 0 -FEP_23479-23330_2qbq_ 16.45 0.33 0 -FEP_23479-23473 15.77 0.82 1 -FEP_23485-23483 18.00 0.68 0 -FEP_23482-23474 53.63 0.93 1 -FEP_23475-23474 5.51 0.46 0 -FEP_23483-23474 0.52 0.69 3 -FEP_23476-23468 -8.17 0.71 0 -FEP_23483-23466 9.65 0.23 0 -FEP_23475-23468 -5.39 0.30 0 -FEP_23485-23472 9.48 1.06 0 -FEP_23486-23475 27.96 0.98 0 -FEP_23486-23477 25.79 0.25 7 -FEP_23480-20667_2qbp_ -22.67 0.66 1 -FEP_23482-23480 51.72 0.75 0 -FEP_23483-23473 11.10 0.66 5 -FEP_23482-23467 59.15 1.01 5 -FEP_23482-23470 34.93 0.52 2 -FEP_23477-20669_2qbr_ -0.74 0.55 1 -FEP_23486-20667_2qbp_ 0.47 0.17 0 -FEP_23476-23471 -9.94 0.51 1 -FEP_23480-23469 6.32 1.24 5 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.64 0.28 0 -FEP_23486-23472 8.69 1.63 8 -FEP_23479-23469 7.87 0.41 4 -FEP_23480-23472 -14.68 0.43 1 -FEP_23486-23330_2qbq_ 34.75 1.84 1 -FEP_23483-23470 -22.88 0.97 5 -FEP_23480-23476 2.98 0.44 0 -FEP_23483-23330_2qbq_ 8.19 0.98 1 -FEP_23477-23467 1.25 0.91 1 -FEP_23482-23476 52.62 0.30 0 -FEP_23479-20667_2qbp_ -18.24 0.91 1 -FEP_23485-23466 35.77 0.87 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 3.30 0.24 0 -FEP_23485-23469 28.52 1.04 0 -FEP_23480-20669_2qbr_ 6.02 0.43 1 -FEP_23482-23479 48.07 0.62 0 -FEP_23477-23470 -22.50 0.22 0 -FEP_23477-23472 -21.51 0.42 0 -FEP_23476-23469 2.53 1.33 1 -FEP_23486-20669_2qbr_ 30.64 1.09 0 -FEP_23483-23468 -12.33 0.69 8 -FEP_23477-23466 -5.65 0.79 4 -FEP_23482-20667_2qbp_ 34.11 0.73 0 -FEP_23479-23477 8.13 0.29 0 -FEP_23486-23469 27.23 2.20 8 -FEP_23479-20669_2qbr_ 6.24 0.98 1 -FEP_23476-23475 -3.32 0.26 0 -FEP_23480-23473 15.18 0.19 2 -FEP_23479-23466 11.88 0.55 0 -FEP_23480-23468 -6.17 0.84 3 -FEP_23485-23470 5.96 0.84 0 -FEP_23482-23468 44.00 0.78 1 -FEP_23483-23475 -8.09 0.63 6 -FEP_23480-23477 7.44 0.29 0 -FEP_23485-23482 nan nan 10 -FEP_23476-23473 11.46 0.34 0 -FEP_23477-20667_2qbp_ -36.12 0.79 0 -FEP_23483-23482 nan nan 10 -FEP_23480-23467 8.76 1.58 7 -FEP_23476-20670_2qbs_ -0.23 0.10 0 -FEP_23477-23475 -7.12 0.17 0 -FEP_23486-23479 17.33 1.09 2 -FEP_23484-23479 18.62 0.53 3 -FEP_23484-23477 26.11 0.34 8 -FEP_23484-23475 26.74 1.19 0 -FEP_23484-23468 14.34 0.18 8 -FEP_23484-23466 35.74 0.91 0 -FEP_23484-20667_2qbp_ -0.15 0.25 0 -FEP_23484-23470 3.95 1.63 6 -FEP_23484-23482 nan nan 10 -FEP_23484-23467 40.29 1.00 0 -FEP_23484-23483 20.97 0.50 0 -FEP_23484-23485 3.42 0.20 0 -FEP_23484-23472 10.84 1.32 0 -FEP_23484-23480 20.06 0.88 1 -FEP_23484-23330_2qbq_ 36.07 0.58 3 -FEP_23484-23469 27.61 1.18 8 -FEP_23484-23486 -0.26 0.19 0 -FEP_23484-23473 30.58 nan 9 -FEP_23484-20669_2qbr_ 22.75 2.33 7 -FEP_23484-23476 21.61 1.31 5 -FEP_23484-23474 21.70 1.45 7 -FEP_23484-23471 20.63 1.46 0 -FEP_23484-20670_2qbs_ 22.40 2.16 7 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/whole-matrix/water_whole.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/whole-matrix/water_whole.txt deleted file mode 100755 index adac546f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/whole-matrix/water_whole.txt +++ /dev/null @@ -1,256 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-20669_2qbr_ 13.29 0.83 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ -0.95 0.22 0 -FEP_23468-23330_2qbq_ 24.77 0.54 0 -FEP_23473-23466 -15.84 0.60 4 -FEP_23469-20667_2qbp_ -19.00 1.13 5 -FEP_23471-23468 0.18 0.24 0 -FEP_23473-23470 -34.42 0.37 1 -FEP_23472-23469 21.51 0.49 0 -FEP_20670_2qbs_-20669_2qbr_ 3.08 0.26 0 -FEP_23470-23468 10.48 0.27 0 -FEP_23470-23469 23.53 0.16 0 -FEP_23473-20667_2qbp_ -36.28 0.29 0 -FEP_23468-23467 15.32 0.25 0 -FEP_23471-23330_2qbq_ 25.10 0.56 6 -FEP_23471-23470 -11.30 0.32 0 -FEP_23471-20670_2qbs_ 10.76 0.58 3 -FEP_23469-23330_2qbq_ 11.91 0.97 6 -FEP_23469-20670_2qbs_ -3.12 0.27 1 -FEP_23472-20667_2qbp_ -0.96 0.58 5 -FEP_23468-20670_2qbs_ 9.83 0.35 0 -FEP_23474-23472 -21.44 0.35 0 -FEP_23473-23472 -31.12 0.21 0 -FEP_23468-20667_2qbp_ -15.83 0.21 0 -FEP_23471-23466 9.35 0.30 0 -FEP_23330_2qbq_-20669_2qbr_ -11.09 0.50 2 -FEP_23470-20667_2qbp_ 1.88 0.23 7 -FEP_23330_2qbq_-20667_2qbp_ -30.31 0.65 4 -FEP_23473-23467 -8.40 0.54 2 -FEP_23473-23468 -23.27 0.39 0 -FEP_23471-23467 17.11 0.28 0 -FEP_23467-20669_2qbr_ -1.85 0.25 1 -FEP_23474-23466 1.53 0.24 0 -FEP_23474-23471 -14.92 0.94 2 -FEP_23472-23466 15.49 0.87 7 -FEP_23474-23468 -15.15 1.02 3 -FEP_20670_2qbs_-20667_2qbp_ -15.93 1.19 4 -FEP_23475-20667_2qbp_ -10.61 0.04 8 -FEP_23469-23466 -6.71 0.82 5 -FEP_23470-20669_2qbr_ 23.99 0.38 2 -FEP_23467-23330_2qbq_ 0.54 0.18 0 -FEP_23472-20670_2qbs_ 17.90 0.26 0 -FEP_23471-20667_2qbp_ -15.42 0.26 0 -FEP_23469-23467 1.70 0.43 6 -FEP_23466-20669_2qbr_ 6.99 1.02 6 -FEP_23471-23469 12.56 0.27 0 -FEP_23474-23473 9.23 0.24 0 -FEP_23467-20667_2qbp_ -33.80 0.17 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -3.25 0.43 0 -FEP_23472-20669_2qbr_ 21.13 0.17 0 -FEP_23474-23330_2qbq_ 10.24 0.45 0 -FEP_23470-23466 19.12 0.43 2 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.26 0.17 0 -FEP_23473-23330_2qbq_ 0.79 0.49 1 -FEP_23468-23466 8.00 0.38 0 -FEP_23473-23471 -23.89 0.54 0 -FEP_23474-23469 -1.35 0.19 0 -FEP_23475-20669_2qbr_ 5.92 0.42 0 -FEP_20669_2qbr_-20667_2qbp_ -21.59 0.70 7 -FEP_23470-23467 25.99 0.56 0 -FEP_23467-20670_2qbs_ -5.76 0.51 2 -FEP_23473-23469 -10.37 0.21 0 -FEP_23466-20667_2qbp_ -28.26 0.21 0 -FEP_23468-20669_2qbr_ 14.02 0.45 0 -FEP_23466-23330_2qbq_ 6.11 0.14 0 -FEP_23472-23330_2qbq_ 32.48 0.47 0 -FEP_23472-23471 5.64 0.91 0 -FEP_23472-23470 -5.46 0.89 3 -FEP_23473-20670_2qbs_ -12.40 0.30 0 -FEP_23469-23468 -12.30 0.19 2 -FEP_23470-20670_2qbs_ 20.94 0.19 0 -FEP_23470-23330_2qbq_ 34.09 0.37 3 -FEP_23467-23466 -7.54 0.23 0 -FEP_23474-23467 1.68 0.86 3 -FEP_23472-23468 6.78 0.68 2 -FEP_23472-23467 23.06 0.67 1 -FEP_23475-20670_2qbs_ 2.25 0.14 0 -FEP_23474-20667_2qbp_ -20.45 0.79 5 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.92 0.11 0 -FEP_23474-23470 -23.36 0.63 1 -FEP_23330_2qbq_-20670_2qbs_ -14.55 0.20 0 -FEP_23466-20670_2qbs_ 4.27 1.21 7 -FEP dG sem crashes -FEP_23479-23471 -6.53 0.97 1 -FEP_23482-23477 56.23 0.37 0 -FEP_23479-23475 1.42 0.20 0 -FEP_23482-23330_2qbq_ 66.92 0.18 0 -FEP_23476-23466 -3.00 0.92 3 -FEP_23475-23473 15.39 0.45 0 -FEP_23477-20670_2qbs_ -3.82 0.18 0 -FEP_23479-23467 7.24 0.79 4 -FEP_23476-23467 3.05 0.87 0 -FEP_23485-23471 15.52 0.24 0 -FEP_23485-23330_2qbq_ 30.64 0.86 2 -FEP_23486-23476 15.36 0.63 5 -FEP_23485-20670_2qbs_ 14.75 0.30 7 -FEP_23485-23474 19.37 0.84 8 -FEP_23482-23469 52.19 0.94 2 -FEP_23485-23467 33.90 0.20 0 -FEP_23479-23474 6.74 0.51 0 -FEP_23483-23480 -4.69 0.69 0 -FEP_23483-23477 1.84 0.30 4 -FEP_23476-23470 -22.47 0.58 2 -FEP_23477-23468 -13.88 0.21 0 -FEP_23483-23471 -5.95 0.75 0 -FEP_23482-23475 49.87 0.26 0 -FEP_23483-23469 0.76 0.67 7 -FEP_23482-20669_2qbr_ 53.83 0.87 3 -FEP_23486-23473 30.11 0.87 5 -FEP_23480-23479 -1.48 0.17 0 -FEP_23476-23472 -19.26 0.49 0 -FEP_23483-23472 -20.80 0.63 5 -FEP_23477-23469 -2.15 0.50 1 -FEP_23486-23467 32.97 0.22 0 -FEP_23475-23466 -0.15 0.65 0 -FEP_23483-23479 -7.70 0.88 1 -FEP_23485-23476 17.50 0.83 5 -FEP_23486-23466 27.15 0.11 0 -FEP_23485-23477 21.20 1.04 6 -FEP_23475-23469 5.33 0.85 1 -FEP_23476-23330_2qbq_ 13.15 0.26 0 -FEP_23479-23468 -5.85 0.50 0 -FEP_23476-20669_2qbr_ 3.28 0.38 0 -FEP_23486-23471 4.84 1.04 8 -FEP_23483-20670_2qbs_ -4.13 1.07 6 -FEP_23482-23473 64.92 1.10 1 -FEP_23480-23474 6.48 0.29 0 -FEP_23486-20670_2qbs_ 15.70 1.21 8 -FEP_23476-23474 1.77 0.47 0 -FEP_23485-23475 21.62 0.24 0 -FEP_23479-20670_2qbs_ 3.98 0.18 0 -FEP_23476-20667_2qbp_ -16.16 0.68 5 -FEP_23477-23474 -0.69 0.31 0 -FEP_23480-23466 8.53 0.13 0 -FEP_23477-23471 -16.00 1.05 0 -FEP_23485-23468 16.16 0.24 0 -FEP_23483-23467 12.88 0.25 0 -FEP_23485-23473 28.46 1.15 8 -FEP_23475-23470 -16.59 0.29 0 -FEP_23480-23470 -18.05 0.38 0 -FEP_23475-23472 -15.56 0.38 0 -FEP_23482-23466 58.68 0.19 0 -FEP_23483-20669_2qbr_ 2.29 0.85 7 -FEP_23486-23483 nan nan 10 -FEP_23485-23480 14.26 0.71 1 -FEP_23475-23330_2qbq_ 16.70 0.24 0 -FEP_23486-23468 7.06 0.47 8 -FEP_23483-23476 -4.09 0.80 2 -FEP_23479-23476 4.64 0.47 0 -FEP_23480-23471 -8.28 0.53 4 -FEP_23475-23467 8.90 0.28 0 -FEP_23486-23480 14.06 0.49 1 -FEP_23475-23471 -9.09 0.67 0 -FEP_23483-20667_2qbp_ -20.76 0.25 0 -FEP_23477-23476 -3.25 0.11 0 -FEP_23482-23472 34.83 0.43 0 -FEP_23479-23472 -13.94 0.34 0 -FEP_23486-23482 nan nan 10 -FEP_23482-23471 41.33 0.36 6 -FEP_23486-23485 -0.15 0.16 0 -FEP_23479-23470 -16.83 0.34 0 -FEP_23486-23474 18.24 1.05 7 -FEP_23485-23479 13.27 0.32 1 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.51 0.15 0 -FEP_23477-23473 8.01 0.95 0 -FEP_23485-20667_2qbp_ -0.35 0.22 0 -FEP_23486-23470 -5.86 1.10 6 -FEP_23480-23330_2qbq_ 16.59 0.22 0 -FEP_23485-20669_2qbr_ 16.21 0.30 8 -FEP_23480-23475 -0.78 0.25 0 -FEP_23479-23330_2qbq_ 18.16 0.16 0 -FEP_23479-23473 16.51 0.55 1 -FEP_23485-23483 19.97 0.16 0 -FEP_23482-23474 55.87 0.37 1 -FEP_23475-23474 5.28 0.20 0 -FEP_23483-23474 2.26 0.41 3 -FEP_23476-23468 -11.63 0.73 0 -FEP_23483-23466 7.14 0.16 0 -FEP_23475-23468 -6.95 0.16 0 -FEP_23485-23472 -3.08 1.26 7 -FEP_23486-23475 15.15 0.58 5 -FEP_23486-23477 27.51 0.19 0 -FEP_23480-20667_2qbp_ -15.37 0.53 1 -FEP_23482-23480 50.56 0.20 0 -FEP_23483-23473 6.60 0.44 8 -FEP_23482-23467 57.10 0.54 3 -FEP_23482-23470 32.09 0.42 1 -FEP_23477-20669_2qbr_ -0.47 0.54 0 -FEP_23486-20667_2qbp_ -0.37 0.10 0 -FEP_23476-23471 -13.37 1.02 2 -FEP_23480-23469 4.98 1.08 1 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.32 0.27 0 -FEP_23486-23472 0.82 0.84 7 -FEP_23479-23469 5.66 1.13 2 -FEP_23480-23472 -15.16 0.29 0 -FEP_23486-23330_2qbq_ 29.70 1.04 4 -FEP_23483-23470 -24.50 0.25 7 -FEP_23480-23476 3.35 0.20 0 -FEP_23483-23330_2qbq_ 10.86 0.61 1 -FEP_23477-23467 1.58 0.32 1 -FEP_23482-23476 53.07 0.22 0 -FEP_23479-20667_2qbp_ -13.29 0.46 3 -FEP_23485-23466 28.41 0.23 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 2.11 0.26 0 -FEP_23485-23469 25.83 0.21 0 -FEP_23480-20669_2qbr_ 5.88 0.51 0 -FEP_23482-23479 48.66 0.26 0 -FEP_23477-23470 -25.34 0.83 0 -FEP_23477-23472 -22.27 0.25 0 -FEP_23476-23469 1.00 0.78 0 -FEP_23486-20669_2qbr_ 17.14 0.36 7 -FEP_23483-23468 -14.89 0.48 8 -FEP_23477-23466 -6.73 0.53 2 -FEP_23482-20667_2qbp_ 36.38 0.92 0 -FEP_23479-23477 8.18 0.19 0 -FEP_23486-23469 17.96 0.64 5 -FEP_23479-20669_2qbr_ 6.78 0.61 0 -FEP_23476-23475 -3.39 0.25 0 -FEP_23480-23473 14.18 0.70 1 -FEP_23479-23466 9.69 0.09 0 -FEP_23480-23468 -8.55 0.75 1 -FEP_23485-23470 -4.26 0.65 4 -FEP_23482-23468 42.68 0.46 0 -FEP_23483-23475 -8.64 0.53 6 -FEP_23480-23477 6.73 0.16 0 -FEP_23485-23482 nan nan 10 -FEP_23476-23473 11.48 0.79 0 -FEP_23477-20667_2qbp_ -19.85 0.86 5 -FEP_23483-23482 nan nan 10 -FEP_23480-23467 7.86 0.17 7 -FEP_23476-20670_2qbs_ -0.42 0.26 0 -FEP_23477-23475 -6.86 0.19 0 -FEP_23486-23479 12.39 0.73 1 -FEP dG sem crashes -FEP_23484-23479 12.67 0.47 1 -FEP_23484-23477 20.65 1.33 7 -FEP_23484-23475 12.75 0.54 5 -FEP_23484-23468 15.59 0.15 0 -FEP_23484-23466 27.65 0.23 0 -FEP_23484-20667_2qbp_ -0.21 0.17 0 -FEP_23484-23470 -3.99 0.68 5 -FEP_23484-23482 nan nan 10 -FEP_23484-23467 33.00 0.12 0 -FEP_23484-23483 20.26 0.38 0 -FEP_23484-23485 0.82 0.23 0 -FEP_23484-23472 -0.96 0.92 3 -FEP_23484-23480 16.53 0.39 0 -FEP_23484-23330_2qbq_ 31.91 0.64 3 -FEP_23484-23469 25.66 0.11 0 -FEP_23484-23486 0.76 0.17 0 -FEP_23484-23473 33.60 0.20 7 -FEP_23484-20669_2qbr_ 19.08 0.65 6 -FEP_23484-23476 18.34 0.89 4 -FEP_23484-23474 20.30 1.16 4 -FEP_23484-23471 4.50 0.15 8 -FEP_23484-20670_2qbs_ 14.34 0.84 4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/withhoh/protein_withw.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/withhoh/protein_withw.txt deleted file mode 100755 index fcb784f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/withhoh/protein_withw.txt +++ /dev/null @@ -1,254 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23467-20669_2qbr_ -1.66 0.57 0 -FEP_23472-23470 -5.17 1.29 1 -FEP_23471-23468 1.22 0.48 0 -FEP_23472-23330_2qbq_ 30.00 0.57 0 -FEP_23472-20670_2qbs_ 16.94 0.59 0 -FEP_23330_2qbq_-20669_2qbr_ -9.99 0.83 4 -FEP_23469-20670_2qbs_ -3.97 0.43 0 -FEP_23473-23467 -6.40 1.12 0 -FEP_23471-20667_2qbp_ -23.33 1.11 0 -FEP_23469-23330_2qbq_ 9.30 0.69 4 -FEP_23475-20670_2qbs_ 2.91 0.16 0 -FEP_23475-20669_2qbr_ 5.92 0.33 1 -FEP_23473-20670_2qbs_ -11.95 0.21 0 -FEP_23466-20669_2qbr_ 4.91 0.73 3 -FEP_23470-23330_2qbq_ 31.73 0.61 3 -FEP_23470-23469 22.31 0.47 0 -FEP_23468-20669_2qbr_ 11.14 0.49 0 -FEP_23469-23468 -12.10 0.51 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ 0.48 0.34 0 -FEP_23471-23469 12.74 0.36 0 -FEP_23470-20670_2qbs_ 17.11 0.44 0 -FEP_23474-23468 -11.15 0.27 4 -FEP_23474-23466 3.73 0.59 0 -FEP_23468-23466 7.62 0.51 1 -FEP_23472-23467 23.73 0.65 3 -FEP_20669_2qbr_-20667_2qbp_ -30.39 1.00 0 -FEP_23330_2qbq_-20667_2qbp_ -29.21 1.83 6 -FEP_23472-23469 20.09 0.36 0 -FEP_23467-23466 -7.30 0.26 0 -FEP_23474-23471 -13.15 1.31 0 -FEP_23467-20670_2qbs_ -6.24 0.85 3 -FEP_23472-20667_2qbp_ -10.81 1.39 0 -FEP_23474-23473 9.84 0.28 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -2.21 0.42 0 -FEP_23468-20667_2qbp_ -12.98 0.88 8 -FEP_23466-20667_2qbp_ -36.03 0.98 0 -FEP_23471-20670_2qbs_ 9.22 0.69 0 -FEP_23473-20667_2qbp_ -39.72 0.87 0 -FEP_23330_2qbq_-20670_2qbs_ -13.18 0.17 0 -FEP_23471-23467 16.57 0.44 0 -FEP_23470-23467 26.12 0.92 0 -FEP_23473-23469 -8.49 0.50 0 -FEP_23474-20667_2qbp_ -25.72 1.63 6 -FEP_20670_2qbs_-20667_2qbp_ -19.99 0.68 7 -FEP_23473-23468 -20.58 0.57 0 -FEP_23466-23330_2qbq_ 3.24 0.21 0 -FEP_23474-23467 3.50 0.87 7 -FEP_23468-23467 15.40 0.44 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ -0.61 0.41 0 -FEP_20670_2qbs_-20669_2qbr_ 3.71 0.24 0 -FEP_23473-23330_2qbq_ 2.51 0.59 1 -FEP_23469-20667_2qbp_ -32.02 1.01 0 -FEP_23469-23466 -2.96 0.64 3 -FEP_23473-23471 -20.64 0.51 0 -FEP_23474-23469 1.50 0.26 0 -FEP_23473-23466 -12.62 0.42 5 -FEP_23471-23470 -11.31 0.47 0 -FEP_23472-23466 15.32 0.91 5 -FEP_23475-20667_2qbp_ -19.61 0.73 7 -FEP_23471-23330_2qbq_ 23.04 0.80 3 -FEP_23472-23471 6.36 1.11 0 -FEP_23471-23466 8.36 0.40 0 -FEP_23471-20669_2qbr_ 12.61 0.74 0 -FEP_23467-23330_2qbq_ -2.36 0.25 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.35 0.18 0 -FEP_23470-23468 10.70 0.49 0 -FEP_23467-20667_2qbp_ -41.00 1.21 0 -FEP_23474-23470 -22.93 0.85 1 -FEP_23470-23466 18.76 0.44 0 -FEP_23474-23330_2qbq_ 10.98 0.42 0 -FEP_23468-23330_2qbq_ 21.44 0.64 2 -FEP_23473-23470 -32.89 0.97 0 -FEP_23466-20670_2qbs_ 0.37 0.41 6 -FEP_23472-20669_2qbr_ 20.40 0.53 0 -FEP_23470-20669_2qbr_ 22.19 0.52 1 -FEP_23468-20670_2qbs_ 7.68 0.42 0 -FEP_23472-23468 7.10 1.24 3 -FEP_23474-23472 -20.23 0.34 0 -FEP_23469-23467 4.25 0.41 2 -FEP_23473-23472 -28.88 0.19 0 -FEP_23470-20667_2qbp_ -6.75 0.04 7 -FEP_23479-23471 -6.30 0.91 5 -FEP_23482-23477 56.98 0.28 1 -FEP_23479-23475 1.02 0.22 2 -FEP_23482-23330_2qbq_ 65.44 0.30 0 -FEP_23476-23466 -2.04 1.11 7 -FEP_23475-23473 14.00 0.32 1 -FEP_23477-20670_2qbs_ -4.61 0.12 1 -FEP_23479-23467 8.73 0.01 8 -FEP_23476-23467 6.33 0.97 1 -FEP_23485-23471 18.06 0.63 0 -FEP_23485-23330_2qbq_ 29.78 1.11 6 -FEP_23486-23476 26.66 1.47 8 -FEP_23485-20670_2qbs_ 20.52 0.32 8 -FEP_23485-23474 17.31 0.09 8 -FEP_23482-23469 53.37 0.95 4 -FEP_23485-23467 38.36 0.69 0 -FEP_23479-23474 5.76 0.68 0 -FEP_23483-23480 -6.39 0.59 0 -FEP_23483-23477 0.16 0.86 5 -FEP_23476-23470 -19.74 0.72 3 -FEP_23477-23468 -12.25 0.27 0 -FEP_23483-23471 -14.83 0.09 8 -FEP_23482-23475 50.75 0.35 1 -FEP_23483-23469 -0.04 1.00 7 -FEP_23482-20669_2qbr_ 54.35 0.70 4 -FEP_23486-23473 40.86 1.14 0 -FEP_23480-23479 -1.58 0.20 0 -FEP_23476-23472 -18.16 0.45 0 -FEP_23483-23472 -21.41 1.19 5 -FEP_23477-23469 -1.75 0.31 1 -FEP_23486-23467 41.31 1.24 0 -FEP_23475-23466 2.37 0.70 0 -FEP_23483-23479 -6.93 0.82 2 -FEP_23485-23476 20.00 1.05 8 -FEP_23486-23466 36.79 1.33 0 -FEP_23485-23477 18.01 0.39 8 -FEP_23475-23469 6.17 0.63 4 -FEP_23476-23330_2qbq_ 11.96 0.35 0 -FEP_23479-23468 -3.85 0.35 3 -FEP_23476-20669_2qbr_ 2.54 0.50 2 -FEP_23486-23471 22.75 1.40 0 -FEP_23483-20670_2qbs_ -4.89 0.99 4 -FEP_23482-23473 62.81 0.90 0 -FEP_23480-23474 4.08 1.16 2 -FEP_23486-20670_2qbs_ 19.52 0.64 6 -FEP_23476-23474 1.72 0.30 3 -FEP_23485-23475 12.36 0.46 8 -FEP_23479-20670_2qbs_ 3.91 0.29 2 -FEP_23476-20667_2qbp_ -28.56 0.89 0 -FEP_23477-23474 -1.91 0.39 1 -FEP_23480-23466 2.27 0.58 8 -FEP_23477-23471 -15.50 0.85 0 -FEP_23485-23468 22.92 0.78 1 -FEP_23483-23467 14.78 0.47 0 -FEP_23485-23473 37.43 0.81 0 -FEP_23475-23470 -15.73 0.42 1 -FEP_23480-23470 -16.07 0.40 5 -FEP_23475-23472 -14.42 0.37 0 -FEP_23482-23466 60.89 0.20 0 -FEP_23483-20669_2qbr_ -2.80 0.70 6 -FEP_23486-23483 nan nan 10 -FEP_23485-23480 15.85 0.90 5 -FEP_23475-23330_2qbq_ 15.72 0.20 3 -FEP_23486-23468 14.04 0.21 8 -FEP_23483-23476 -3.95 0.86 5 -FEP_23479-23476 4.28 0.29 0 -FEP_23480-23471 -8.72 0.95 6 -FEP_23475-23467 9.04 0.73 1 -FEP_23486-23480 22.26 0.78 2 -FEP_23475-23471 -6.80 0.52 1 -FEP_23483-20667_2qbp_ -22.01 0.53 0 -FEP_23477-23476 -3.70 0.41 0 -FEP_23482-23472 34.22 1.13 1 -FEP_23479-23472 -12.92 0.62 0 -FEP_23486-23482 nan nan 10 -FEP_23482-23471 42.75 0.94 2 -FEP_23486-23485 4.46 0.21 0 -FEP_23479-23470 -13.37 0.45 0 -FEP_23486-23474 22.28 0.91 7 -FEP_23485-23479 12.24 1.56 2 -FEP_23477-23330_2qbq_ 8.38 0.25 0 -FEP_23477-23473 7.35 0.33 0 -FEP_23485-20667_2qbp_ -3.63 0.14 0 -FEP_23486-23470 7.93 0.45 8 -FEP_23480-23330_2qbq_ 15.01 0.35 0 -FEP_23485-20669_2qbr_ 19.72 0.86 6 -FEP_23480-23475 0.78 0.53 0 -FEP_23479-23330_2qbq_ 16.45 0.33 0 -FEP_23479-23473 15.77 0.82 1 -FEP_23485-23483 18.00 0.68 0 -FEP_23482-23474 53.63 0.93 1 -FEP_23475-23474 5.51 0.46 0 -FEP_23483-23474 0.52 0.69 3 -FEP_23476-23468 -8.17 0.71 0 -FEP_23483-23466 9.65 0.23 0 -FEP_23475-23468 -5.39 0.30 0 -FEP_23485-23472 9.48 1.06 0 -FEP_23486-23475 27.96 0.98 0 -FEP_23486-23477 25.79 0.25 7 -FEP_23480-20667_2qbp_ -22.67 0.66 1 -FEP_23482-23480 51.72 0.75 0 -FEP_23483-23473 11.10 0.66 5 -FEP_23482-23467 59.15 1.01 5 -FEP_23482-23470 34.93 0.52 2 -FEP_23477-20669_2qbr_ -0.74 0.55 1 -FEP_23486-20667_2qbp_ 0.47 0.17 0 -FEP_23476-23471 -9.94 0.51 1 -FEP_23480-23469 6.32 1.24 5 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.64 0.28 0 -FEP_23486-23472 8.69 1.63 8 -FEP_23479-23469 7.87 0.41 4 -FEP_23480-23472 -14.68 0.43 1 -FEP_23486-23330_2qbq_ 34.75 1.84 1 -FEP_23483-23470 -22.88 0.97 5 -FEP_23480-23476 2.98 0.44 0 -FEP_23483-23330_2qbq_ 8.19 0.98 1 -FEP_23477-23467 1.25 0.91 1 -FEP_23482-23476 52.62 0.30 0 -FEP_23479-20667_2qbp_ -18.24 0.91 1 -FEP_23485-23466 35.77 0.87 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 3.30 0.24 0 -FEP_23485-23469 28.52 1.04 0 -FEP_23480-20669_2qbr_ 6.02 0.43 1 -FEP_23482-23479 48.07 0.62 0 -FEP_23477-23470 -22.50 0.22 0 -FEP_23477-23472 -21.51 0.42 0 -FEP_23476-23469 2.53 1.33 1 -FEP_23486-20669_2qbr_ 30.64 1.09 0 -FEP_23483-23468 -12.33 0.69 8 -FEP_23477-23466 -5.65 0.79 4 -FEP_23482-20667_2qbp_ 34.11 0.73 0 -FEP_23479-23477 8.13 0.29 0 -FEP_23486-23469 27.23 2.20 8 -FEP_23479-20669_2qbr_ 6.24 0.98 1 -FEP_23476-23475 -3.32 0.26 0 -FEP_23480-23473 15.18 0.19 2 -FEP_23479-23466 11.88 0.55 0 -FEP_23480-23468 -6.17 0.84 3 -FEP_23485-23470 5.96 0.84 0 -FEP_23482-23468 44.00 0.78 1 -FEP_23483-23475 -8.09 0.63 6 -FEP_23480-23477 7.44 0.29 0 -FEP_23485-23482 nan nan 10 -FEP_23476-23473 11.46 0.34 0 -FEP_23477-20667_2qbp_ -36.12 0.79 0 -FEP_23483-23482 nan nan 10 -FEP_23480-23467 8.76 1.58 7 -FEP_23476-20670_2qbs_ -0.23 0.10 0 -FEP_23477-23475 -7.12 0.17 0 -FEP_23486-23479 17.33 1.09 2 -FEP_23484-23479 18.62 0.53 3 -FEP_23484-23477 26.11 0.34 8 -FEP_23484-23475 26.74 1.19 0 -FEP_23484-23468 14.34 0.18 8 -FEP_23484-23466 35.74 0.91 0 -FEP_23484-20667_2qbp_ -0.15 0.25 0 -FEP_23484-23470 3.95 1.63 6 -FEP_23484-23482 nan nan 10 -FEP_23484-23467 40.29 1.00 0 -FEP_23484-23483 20.97 0.50 0 -FEP_23484-23485 3.42 0.20 0 -FEP_23484-23472 10.84 1.32 0 -FEP_23484-23480 20.06 0.88 1 -FEP_23484-23330_2qbq_ 36.07 0.58 3 -FEP_23484-23469 27.61 1.18 8 -FEP_23484-23486 -0.26 0.19 0 -FEP_23484-23473 30.58 nan 9 -FEP_23484-20669_2qbr_ 22.75 2.33 7 -FEP_23484-23476 21.61 1.31 5 -FEP_23484-23474 21.70 1.45 7 -FEP_23484-23471 20.63 1.46 0 -FEP_23484-20670_2qbs_ 22.40 2.16 7 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/withhoh/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/withhoh/water.txt deleted file mode 100755 index adac546f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/withhoh/water.txt +++ /dev/null @@ -1,256 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-20669_2qbr_ 13.29 0.83 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ -0.95 0.22 0 -FEP_23468-23330_2qbq_ 24.77 0.54 0 -FEP_23473-23466 -15.84 0.60 4 -FEP_23469-20667_2qbp_ -19.00 1.13 5 -FEP_23471-23468 0.18 0.24 0 -FEP_23473-23470 -34.42 0.37 1 -FEP_23472-23469 21.51 0.49 0 -FEP_20670_2qbs_-20669_2qbr_ 3.08 0.26 0 -FEP_23470-23468 10.48 0.27 0 -FEP_23470-23469 23.53 0.16 0 -FEP_23473-20667_2qbp_ -36.28 0.29 0 -FEP_23468-23467 15.32 0.25 0 -FEP_23471-23330_2qbq_ 25.10 0.56 6 -FEP_23471-23470 -11.30 0.32 0 -FEP_23471-20670_2qbs_ 10.76 0.58 3 -FEP_23469-23330_2qbq_ 11.91 0.97 6 -FEP_23469-20670_2qbs_ -3.12 0.27 1 -FEP_23472-20667_2qbp_ -0.96 0.58 5 -FEP_23468-20670_2qbs_ 9.83 0.35 0 -FEP_23474-23472 -21.44 0.35 0 -FEP_23473-23472 -31.12 0.21 0 -FEP_23468-20667_2qbp_ -15.83 0.21 0 -FEP_23471-23466 9.35 0.30 0 -FEP_23330_2qbq_-20669_2qbr_ -11.09 0.50 2 -FEP_23470-20667_2qbp_ 1.88 0.23 7 -FEP_23330_2qbq_-20667_2qbp_ -30.31 0.65 4 -FEP_23473-23467 -8.40 0.54 2 -FEP_23473-23468 -23.27 0.39 0 -FEP_23471-23467 17.11 0.28 0 -FEP_23467-20669_2qbr_ -1.85 0.25 1 -FEP_23474-23466 1.53 0.24 0 -FEP_23474-23471 -14.92 0.94 2 -FEP_23472-23466 15.49 0.87 7 -FEP_23474-23468 -15.15 1.02 3 -FEP_20670_2qbs_-20667_2qbp_ -15.93 1.19 4 -FEP_23475-20667_2qbp_ -10.61 0.04 8 -FEP_23469-23466 -6.71 0.82 5 -FEP_23470-20669_2qbr_ 23.99 0.38 2 -FEP_23467-23330_2qbq_ 0.54 0.18 0 -FEP_23472-20670_2qbs_ 17.90 0.26 0 -FEP_23471-20667_2qbp_ -15.42 0.26 0 -FEP_23469-23467 1.70 0.43 6 -FEP_23466-20669_2qbr_ 6.99 1.02 6 -FEP_23471-23469 12.56 0.27 0 -FEP_23474-23473 9.23 0.24 0 -FEP_23467-20667_2qbp_ -33.80 0.17 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -3.25 0.43 0 -FEP_23472-20669_2qbr_ 21.13 0.17 0 -FEP_23474-23330_2qbq_ 10.24 0.45 0 -FEP_23470-23466 19.12 0.43 2 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.26 0.17 0 -FEP_23473-23330_2qbq_ 0.79 0.49 1 -FEP_23468-23466 8.00 0.38 0 -FEP_23473-23471 -23.89 0.54 0 -FEP_23474-23469 -1.35 0.19 0 -FEP_23475-20669_2qbr_ 5.92 0.42 0 -FEP_20669_2qbr_-20667_2qbp_ -21.59 0.70 7 -FEP_23470-23467 25.99 0.56 0 -FEP_23467-20670_2qbs_ -5.76 0.51 2 -FEP_23473-23469 -10.37 0.21 0 -FEP_23466-20667_2qbp_ -28.26 0.21 0 -FEP_23468-20669_2qbr_ 14.02 0.45 0 -FEP_23466-23330_2qbq_ 6.11 0.14 0 -FEP_23472-23330_2qbq_ 32.48 0.47 0 -FEP_23472-23471 5.64 0.91 0 -FEP_23472-23470 -5.46 0.89 3 -FEP_23473-20670_2qbs_ -12.40 0.30 0 -FEP_23469-23468 -12.30 0.19 2 -FEP_23470-20670_2qbs_ 20.94 0.19 0 -FEP_23470-23330_2qbq_ 34.09 0.37 3 -FEP_23467-23466 -7.54 0.23 0 -FEP_23474-23467 1.68 0.86 3 -FEP_23472-23468 6.78 0.68 2 -FEP_23472-23467 23.06 0.67 1 -FEP_23475-20670_2qbs_ 2.25 0.14 0 -FEP_23474-20667_2qbp_ -20.45 0.79 5 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.92 0.11 0 -FEP_23474-23470 -23.36 0.63 1 -FEP_23330_2qbq_-20670_2qbs_ -14.55 0.20 0 -FEP_23466-20670_2qbs_ 4.27 1.21 7 -FEP dG sem crashes -FEP_23479-23471 -6.53 0.97 1 -FEP_23482-23477 56.23 0.37 0 -FEP_23479-23475 1.42 0.20 0 -FEP_23482-23330_2qbq_ 66.92 0.18 0 -FEP_23476-23466 -3.00 0.92 3 -FEP_23475-23473 15.39 0.45 0 -FEP_23477-20670_2qbs_ -3.82 0.18 0 -FEP_23479-23467 7.24 0.79 4 -FEP_23476-23467 3.05 0.87 0 -FEP_23485-23471 15.52 0.24 0 -FEP_23485-23330_2qbq_ 30.64 0.86 2 -FEP_23486-23476 15.36 0.63 5 -FEP_23485-20670_2qbs_ 14.75 0.30 7 -FEP_23485-23474 19.37 0.84 8 -FEP_23482-23469 52.19 0.94 2 -FEP_23485-23467 33.90 0.20 0 -FEP_23479-23474 6.74 0.51 0 -FEP_23483-23480 -4.69 0.69 0 -FEP_23483-23477 1.84 0.30 4 -FEP_23476-23470 -22.47 0.58 2 -FEP_23477-23468 -13.88 0.21 0 -FEP_23483-23471 -5.95 0.75 0 -FEP_23482-23475 49.87 0.26 0 -FEP_23483-23469 0.76 0.67 7 -FEP_23482-20669_2qbr_ 53.83 0.87 3 -FEP_23486-23473 30.11 0.87 5 -FEP_23480-23479 -1.48 0.17 0 -FEP_23476-23472 -19.26 0.49 0 -FEP_23483-23472 -20.80 0.63 5 -FEP_23477-23469 -2.15 0.50 1 -FEP_23486-23467 32.97 0.22 0 -FEP_23475-23466 -0.15 0.65 0 -FEP_23483-23479 -7.70 0.88 1 -FEP_23485-23476 17.50 0.83 5 -FEP_23486-23466 27.15 0.11 0 -FEP_23485-23477 21.20 1.04 6 -FEP_23475-23469 5.33 0.85 1 -FEP_23476-23330_2qbq_ 13.15 0.26 0 -FEP_23479-23468 -5.85 0.50 0 -FEP_23476-20669_2qbr_ 3.28 0.38 0 -FEP_23486-23471 4.84 1.04 8 -FEP_23483-20670_2qbs_ -4.13 1.07 6 -FEP_23482-23473 64.92 1.10 1 -FEP_23480-23474 6.48 0.29 0 -FEP_23486-20670_2qbs_ 15.70 1.21 8 -FEP_23476-23474 1.77 0.47 0 -FEP_23485-23475 21.62 0.24 0 -FEP_23479-20670_2qbs_ 3.98 0.18 0 -FEP_23476-20667_2qbp_ -16.16 0.68 5 -FEP_23477-23474 -0.69 0.31 0 -FEP_23480-23466 8.53 0.13 0 -FEP_23477-23471 -16.00 1.05 0 -FEP_23485-23468 16.16 0.24 0 -FEP_23483-23467 12.88 0.25 0 -FEP_23485-23473 28.46 1.15 8 -FEP_23475-23470 -16.59 0.29 0 -FEP_23480-23470 -18.05 0.38 0 -FEP_23475-23472 -15.56 0.38 0 -FEP_23482-23466 58.68 0.19 0 -FEP_23483-20669_2qbr_ 2.29 0.85 7 -FEP_23486-23483 nan nan 10 -FEP_23485-23480 14.26 0.71 1 -FEP_23475-23330_2qbq_ 16.70 0.24 0 -FEP_23486-23468 7.06 0.47 8 -FEP_23483-23476 -4.09 0.80 2 -FEP_23479-23476 4.64 0.47 0 -FEP_23480-23471 -8.28 0.53 4 -FEP_23475-23467 8.90 0.28 0 -FEP_23486-23480 14.06 0.49 1 -FEP_23475-23471 -9.09 0.67 0 -FEP_23483-20667_2qbp_ -20.76 0.25 0 -FEP_23477-23476 -3.25 0.11 0 -FEP_23482-23472 34.83 0.43 0 -FEP_23479-23472 -13.94 0.34 0 -FEP_23486-23482 nan nan 10 -FEP_23482-23471 41.33 0.36 6 -FEP_23486-23485 -0.15 0.16 0 -FEP_23479-23470 -16.83 0.34 0 -FEP_23486-23474 18.24 1.05 7 -FEP_23485-23479 13.27 0.32 1 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.51 0.15 0 -FEP_23477-23473 8.01 0.95 0 -FEP_23485-20667_2qbp_ -0.35 0.22 0 -FEP_23486-23470 -5.86 1.10 6 -FEP_23480-23330_2qbq_ 16.59 0.22 0 -FEP_23485-20669_2qbr_ 16.21 0.30 8 -FEP_23480-23475 -0.78 0.25 0 -FEP_23479-23330_2qbq_ 18.16 0.16 0 -FEP_23479-23473 16.51 0.55 1 -FEP_23485-23483 19.97 0.16 0 -FEP_23482-23474 55.87 0.37 1 -FEP_23475-23474 5.28 0.20 0 -FEP_23483-23474 2.26 0.41 3 -FEP_23476-23468 -11.63 0.73 0 -FEP_23483-23466 7.14 0.16 0 -FEP_23475-23468 -6.95 0.16 0 -FEP_23485-23472 -3.08 1.26 7 -FEP_23486-23475 15.15 0.58 5 -FEP_23486-23477 27.51 0.19 0 -FEP_23480-20667_2qbp_ -15.37 0.53 1 -FEP_23482-23480 50.56 0.20 0 -FEP_23483-23473 6.60 0.44 8 -FEP_23482-23467 57.10 0.54 3 -FEP_23482-23470 32.09 0.42 1 -FEP_23477-20669_2qbr_ -0.47 0.54 0 -FEP_23486-20667_2qbp_ -0.37 0.10 0 -FEP_23476-23471 -13.37 1.02 2 -FEP_23480-23469 4.98 1.08 1 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.32 0.27 0 -FEP_23486-23472 0.82 0.84 7 -FEP_23479-23469 5.66 1.13 2 -FEP_23480-23472 -15.16 0.29 0 -FEP_23486-23330_2qbq_ 29.70 1.04 4 -FEP_23483-23470 -24.50 0.25 7 -FEP_23480-23476 3.35 0.20 0 -FEP_23483-23330_2qbq_ 10.86 0.61 1 -FEP_23477-23467 1.58 0.32 1 -FEP_23482-23476 53.07 0.22 0 -FEP_23479-20667_2qbp_ -13.29 0.46 3 -FEP_23485-23466 28.41 0.23 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 2.11 0.26 0 -FEP_23485-23469 25.83 0.21 0 -FEP_23480-20669_2qbr_ 5.88 0.51 0 -FEP_23482-23479 48.66 0.26 0 -FEP_23477-23470 -25.34 0.83 0 -FEP_23477-23472 -22.27 0.25 0 -FEP_23476-23469 1.00 0.78 0 -FEP_23486-20669_2qbr_ 17.14 0.36 7 -FEP_23483-23468 -14.89 0.48 8 -FEP_23477-23466 -6.73 0.53 2 -FEP_23482-20667_2qbp_ 36.38 0.92 0 -FEP_23479-23477 8.18 0.19 0 -FEP_23486-23469 17.96 0.64 5 -FEP_23479-20669_2qbr_ 6.78 0.61 0 -FEP_23476-23475 -3.39 0.25 0 -FEP_23480-23473 14.18 0.70 1 -FEP_23479-23466 9.69 0.09 0 -FEP_23480-23468 -8.55 0.75 1 -FEP_23485-23470 -4.26 0.65 4 -FEP_23482-23468 42.68 0.46 0 -FEP_23483-23475 -8.64 0.53 6 -FEP_23480-23477 6.73 0.16 0 -FEP_23485-23482 nan nan 10 -FEP_23476-23473 11.48 0.79 0 -FEP_23477-20667_2qbp_ -19.85 0.86 5 -FEP_23483-23482 nan nan 10 -FEP_23480-23467 7.86 0.17 7 -FEP_23476-20670_2qbs_ -0.42 0.26 0 -FEP_23477-23475 -6.86 0.19 0 -FEP_23486-23479 12.39 0.73 1 -FEP dG sem crashes -FEP_23484-23479 12.67 0.47 1 -FEP_23484-23477 20.65 1.33 7 -FEP_23484-23475 12.75 0.54 5 -FEP_23484-23468 15.59 0.15 0 -FEP_23484-23466 27.65 0.23 0 -FEP_23484-20667_2qbp_ -0.21 0.17 0 -FEP_23484-23470 -3.99 0.68 5 -FEP_23484-23482 nan nan 10 -FEP_23484-23467 33.00 0.12 0 -FEP_23484-23483 20.26 0.38 0 -FEP_23484-23485 0.82 0.23 0 -FEP_23484-23472 -0.96 0.92 3 -FEP_23484-23480 16.53 0.39 0 -FEP_23484-23330_2qbq_ 31.91 0.64 3 -FEP_23484-23469 25.66 0.11 0 -FEP_23484-23486 0.76 0.17 0 -FEP_23484-23473 33.60 0.20 7 -FEP_23484-20669_2qbr_ 19.08 0.65 6 -FEP_23484-23476 18.34 0.89 4 -FEP_23484-23474 20.30 1.16 4 -FEP_23484-23471 4.50 0.15 8 -FEP_23484-20670_2qbs_ 14.34 0.84 4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/withouthoh/proteinPTP1BresultswithoutHOH.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/withouthoh/proteinPTP1BresultswithoutHOH.txt deleted file mode 100755 index d409e77d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/withouthoh/proteinPTP1BresultswithoutHOH.txt +++ /dev/null @@ -1,255 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-20669_2qbr_ 14.72 0.86 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ -0.16 0.30 0 -FEP_23468-23330_2qbq_ 20.97 0.49 0 -FEP_23473-23466 -12.47 0.37 2 -FEP_23469-20667_2qbp_ -34.63 0.71 0 -FEP_23471-23468 1.15 0.49 0 -FEP_23473-23470 -32.73 0.39 0 -FEP_23472-23469 19.81 0.53 0 -FEP_20670_2qbs_-20669_2qbr_ 3.89 0.22 0 -FEP_23470-23468 9.80 0.57 0 -FEP_23470-23469 23.33 0.79 2 -FEP_23473-20667_2qbp_ -40.94 1.28 0 -FEP_23468-23467 14.96 0.33 0 -FEP_23471-23330_2qbq_ 25.10 1.01 6 -FEP_23471-23470 -10.21 0.29 0 -FEP_23471-20670_2qbs_ 9.14 0.78 1 -FEP_23469-23330_2qbq_ 10.45 0.67 6 -FEP_23469-20670_2qbs_ -4.38 0.67 0 -FEP_23472-20667_2qbp_ -12.60 1.33 0 -FEP_23468-20670_2qbs_ 8.36 0.29 0 -FEP_23474-23472 -21.12 0.57 0 -FEP_23473-23472 -29.65 0.22 0 -FEP_23468-20667_2qbp_ -23.24 1.19 0 -FEP_23471-23466 9.60 0.40 0 -FEP_23330_2qbq_-20669_2qbr_ -11.16 0.90 1 -FEP_23470-20667_2qbp_ -11.46 1.34 0 -FEP_23330_2qbq_-20667_2qbp_ -39.01 1.07 4 -FEP_23473-23467 -5.77 0.73 0 -FEP_23473-23468 -20.43 0.74 0 -FEP_23471-23467 17.06 0.23 0 -FEP_23467-20669_2qbr_ -3.23 0.64 1 -FEP_23474-23466 -2.27 1.03 7 -FEP_23474-23471 -15.22 1.16 1 -FEP_23472-23466 14.11 1.19 6 -FEP_23474-23468 -13.80 0.96 4 -FEP_20670_2qbs_-20667_2qbp_ -22.71 1.10 7 -FEP_23475-20667_2qbp_ -30.45 0.80 0 -FEP_23469-23466 -5.07 0.73 3 -FEP_23470-20669_2qbr_ 22.80 0.56 0 -FEP_23467-23330_2qbq_ -2.97 0.35 0 -FEP_23472-20670_2qbs_ 16.91 0.61 0 -FEP_23471-20667_2qbp_ -24.05 1.73 0 -FEP_23469-23467 3.20 0.72 0 -FEP_23466-20669_2qbr_ 5.84 0.99 3 -FEP_23471-23469 14.05 0.69 2 -FEP_23474-23473 9.16 0.69 0 -FEP_23467-20667_2qbp_ -42.21 0.98 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -3.04 0.29 0 -FEP_23472-20669_2qbr_ 20.88 0.49 0 -FEP_23474-23330_2qbq_ 11.35 0.90 0 -FEP_23470-23466 15.21 1.32 3 -FEP_23469-20669_2qbr_ -0.26 0.42 0 -FEP_23473-23330_2qbq_ 2.16 0.70 0 -FEP_23468-23466 8.68 0.46 0 -FEP_23473-23471 -22.05 0.90 0 -FEP_23474-23469 -0.22 0.51 0 -FEP_23475-20669_2qbr_ 5.97 0.54 0 -FEP_20669_2qbr_-20667_2qbp_ -31.17 0.94 0 -FEP_23470-23467 25.13 0.54 0 -FEP_23467-20670_2qbs_ -7.03 0.84 1 -FEP_23473-23469 -9.19 0.43 0 -FEP_23466-20667_2qbp_ -38.42 0.72 0 -FEP_23468-20669_2qbr_ 13.25 0.86 1 -FEP_23466-23330_2qbq_ 2.82 0.47 0 -FEP_23472-23330_2qbq_ 31.66 0.84 0 -FEP_23472-23471 7.90 0.86 3 -FEP_23472-23470 -1.48 0.89 2 -FEP_23473-20670_2qbs_ -11.99 0.34 0 -FEP_23469-23468 -12.75 0.22 3 -FEP_23470-20670_2qbs_ 17.24 0.35 0 -FEP_23470-23330_2qbq_ 32.02 0.87 1 -FEP_23467-23466 -8.05 0.41 0 -FEP_23474-23467 3.77 0.38 5 -FEP_23472-23468 6.93 1.54 3 -FEP_23472-23467 22.68 1.34 5 -FEP_23475-20670_2qbs_ 2.63 0.22 0 -FEP_23474-20667_2qbp_ -23.82 2.87 7 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.10 0.27 0 -FEP_23474-23470 -24.18 1.28 2 -FEP_23330_2qbq_-20670_2qbs_ -13.14 0.14 0 -FEP_23466-20670_2qbs_ 4.74 0.51 5 -FEP dG sem crashes -FEP_23479-23471 -6.43 0.54 3 -FEP_23482-23477 57.66 0.41 0 -FEP_23479-23475 1.03 0.48 0 -FEP_23482-23330_2qbq_ 65.48 0.19 0 -FEP_23476-23466 -0.16 0.99 8 -FEP_23475-23473 15.47 0.52 1 -FEP_23477-20670_2qbs_ -4.83 0.22 0 -FEP_23479-23467 12.01 2.07 8 -FEP_23476-23467 6.38 0.62 1 -FEP_23485-23471 18.08 0.57 0 -FEP_23485-23330_2qbq_ 33.68 0.90 6 -FEP_23486-23476 23.37 2.05 7 -FEP_23485-20670_2qbs_ 15.44 1.72 6 -FEP_23485-23474 20.58 0.94 6 -FEP_23482-23469 56.19 0.73 1 -FEP_23485-23467 38.25 0.70 0 -FEP_23479-23474 6.38 0.50 0 -FEP_23483-23480 -5.39 0.84 1 -FEP_23483-23477 1.69 0.85 7 -FEP_23476-23470 -18.03 0.48 0 -FEP_23477-23468 -11.95 0.28 0 -FEP_23482-23475 50.05 0.42 0 -FEP_23483-23469 4.32 0.76 8 -FEP_23482-20669_2qbr_ 55.51 0.22 0 -FEP_23486-23473 41.30 1.18 0 -FEP_23480-23479 -1.66 0.17 0 -FEP_23476-23472 -18.00 0.32 0 -FEP_23483-23472 -20.15 0.56 7 -FEP_23477-23469 -0.06 0.99 0 -FEP_23486-23467 43.00 1.09 0 -FEP_23475-23466 2.71 0.70 1 -FEP_23483-23479 -6.65 1.01 1 -FEP_23485-23476 16.13 0.03 8 -FEP_23486-23466 37.34 1.47 0 -FEP_23485-23477 31.56 1.02 0 -FEP_23475-23469 6.06 0.73 0 -FEP_23476-23330_2qbq_ 12.22 0.25 0 -FEP_23479-23468 -5.28 0.47 0 -FEP_23476-20669_2qbr_ 2.91 0.62 1 -FEP_23486-23471 19.06 1.52 0 -FEP_23483-20670_2qbs_ -4.80 1.14 4 -FEP_23482-23473 63.49 1.04 3 -FEP_23480-23474 5.28 0.58 0 -FEP_23486-20670_2qbs_ 14.54 1.06 7 -FEP_23476-23474 2.02 0.28 0 -FEP_23485-23475 24.72 1.12 0 -FEP_23479-20670_2qbs_ 3.90 0.38 0 -FEP_23476-20667_2qbp_ -23.86 1.89 6 -FEP_23477-23474 -1.85 0.35 0 -FEP_23480-23466 11.04 0.30 0 -FEP_23477-23471 -14.97 0.83 0 -FEP_23485-23468 19.26 1.16 0 -FEP_23483-23467 15.26 0.36 0 -FEP_23485-23473 33.21 1.75 7 -FEP_23475-23470 -15.20 0.38 0 -FEP_23480-23470 -16.01 0.43 0 -FEP_23475-23472 -13.85 0.84 0 -FEP_23482-23466 50.75 1.58 8 -FEP_23483-20669_2qbr_ -0.17 0.29 7 -FEP_23486-23483 nan nan 10 -FEP_23485-23480 17.25 1.26 3 -FEP_23475-23330_2qbq_ 16.07 0.35 0 -FEP_23486-23468 24.74 0.98 0 -FEP_23483-23476 -3.53 0.60 5 -FEP_23479-23476 4.52 0.47 0 -FEP_23480-23471 -6.77 0.27 7 -FEP_23475-23467 10.50 0.51 0 -FEP_23486-23480 19.42 0.67 2 -FEP_23475-23471 -9.16 1.17 0 -FEP_23483-20667_2qbp_ -22.42 0.69 0 -FEP_23477-23476 -4.30 0.42 0 -FEP_23482-23472 35.45 0.51 1 -FEP_23479-23472 -14.68 0.64 0 -FEP_23486-23482 nan nan 10 -FEP_23482-23471 41.08 0.87 2 -FEP_23486-23485 3.76 0.22 0 -FEP_23479-23470 -15.02 0.31 0 -FEP_23486-23474 24.15 1.04 5 -FEP_23485-23479 15.69 0.90 2 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.54 0.28 0 -FEP_23477-23473 8.39 0.42 0 -FEP_23485-20667_2qbp_ -3.99 0.30 0 -FEP_23486-23470 7.05 1.52 8 -FEP_23480-23330_2qbq_ 15.79 0.31 0 -FEP_23485-20669_2qbr_ 29.90 0.62 0 -FEP_23480-23475 -1.05 0.41 0 -FEP_23479-23330_2qbq_ 16.88 0.35 0 -FEP_23479-23473 16.82 0.93 1 -FEP_23485-23483 17.57 0.66 0 -FEP_23482-23474 55.33 0.14 0 -FEP_23475-23474 5.36 0.41 0 -FEP_23483-23474 -1.55 1.24 6 -FEP_23476-23468 -9.62 0.72 0 -FEP_23483-23466 9.17 0.34 0 -FEP_23475-23468 -5.22 0.15 0 -FEP_23485-23472 4.01 1.98 7 -FEP_23486-23475 26.31 1.25 0 -FEP_23486-23477 24.09 0.86 8 -FEP_23480-20667_2qbp_ -20.80 1.16 1 -FEP_23482-23480 51.65 0.77 0 -FEP_23483-23473 9.76 1.20 8 -FEP_23482-23467 55.88 1.26 6 -FEP_23482-23470 34.28 0.59 1 -FEP_23477-20669_2qbr_ -0.98 0.26 0 -FEP_23486-20667_2qbp_ -0.16 0.14 0 -FEP_23476-23471 -11.29 1.15 0 -FEP_23480-23469 5.86 1.05 1 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.32 0.59 0 -FEP_23486-23472 3.51 2.05 6 -FEP_23479-23469 6.71 0.53 6 -FEP_23480-23472 -16.19 0.45 0 -FEP_23486-23330_2qbq_ 34.31 1.49 4 -FEP_23483-23470 -21.75 0.91 7 -FEP_23480-23476 2.40 0.28 0 -FEP_23483-23330_2qbq_ 7.90 0.67 2 -FEP_23477-23467 2.41 0.34 0 -FEP_23482-23476 52.88 0.28 1 -FEP_23479-20667_2qbp_ -14.48 1.39 1 -FEP_23485-23466 33.59 1.36 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 2.20 0.24 0 -FEP_23485-23469 27.80 0.97 0 -FEP_23480-20669_2qbr_ 6.77 0.48 4 -FEP_23482-23479 48.75 0.47 0 -FEP_23477-23470 -21.98 0.50 0 -FEP_23477-23472 -21.70 0.77 0 -FEP_23476-23469 3.63 0.61 3 -FEP_23486-20669_2qbr_ 27.00 1.22 6 -FEP_23483-23468 -10.96 1.14 8 -FEP_23477-23466 -5.94 1.00 2 -FEP_23482-20667_2qbp_ 33.81 0.25 3 -FEP_23479-23477 8.64 0.37 0 -FEP_23486-23469 33.12 1.12 0 -FEP_23479-20669_2qbr_ 7.14 0.54 1 -FEP_23476-23475 -3.01 0.15 0 -FEP_23480-23473 12.68 1.10 2 -FEP_23479-23466 11.48 0.26 0 -FEP_23480-23468 -6.65 0.34 0 -FEP_23485-23470 9.47 1.38 0 -FEP_23482-23468 43.55 0.47 2 -FEP_23483-23475 -7.66 1.01 7 -FEP_23480-23477 6.03 0.33 0 -FEP_23485-23482 nan nan 10 -FEP_23476-23473 12.17 0.59 0 -FEP_23477-20667_2qbp_ -28.68 1.53 7 -FEP_23483-23482 nan nan 10 -FEP_23480-23467 11.85 0.67 8 -FEP_23476-20670_2qbs_ -0.36 0.34 0 -FEP_23477-23475 -6.99 0.16 0 -FEP_23486-23479 18.23 0.98 1 -FEP dG sem crashes -FEP_23484-23479 19.33 0.84 4 -FEP_23484-23477 29.38 2.20 7 -FEP_23484-23475 26.03 1.27 0 -FEP_23484-23468 21.37 1.14 0 -FEP_23484-23466 33.46 1.01 0 -FEP_23484-20667_2qbp_ 0.70 0.37 0 -FEP_23484-23470 -5.10 1.47 8 -FEP_23484-23482 nan nan 10 -FEP_23484-23467 43.84 1.07 0 -FEP_23484-23483 22.20 0.81 0 -FEP_23484-23485 3.80 0.53 0 -FEP_23484-23472 3.03 1.76 6 -FEP_23484-23480 18.97 1.49 0 -FEP_23484-23330_2qbq_ 35.01 2.71 8 -FEP_23484-23469 33.06 1.24 0 -FEP_23484-23486 0.53 0.35 0 -FEP_23484-23473 37.28 1.16 4 -FEP_23484-20669_2qbr_ 26.54 0.87 7 -FEP_23484-23476 23.86 0.30 8 -FEP_23484-23474 24.94 0.93 6 -FEP_23484-23471 11.88 1.62 8 -FEP_23484-20670_2qbs_ 21.44 2.04 6 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/withouthoh/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/withouthoh/water.txt deleted file mode 100755 index adac546f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/no-vs/2fs/withouthoh/water.txt +++ /dev/null @@ -1,256 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-20669_2qbr_ 13.29 0.83 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ -0.95 0.22 0 -FEP_23468-23330_2qbq_ 24.77 0.54 0 -FEP_23473-23466 -15.84 0.60 4 -FEP_23469-20667_2qbp_ -19.00 1.13 5 -FEP_23471-23468 0.18 0.24 0 -FEP_23473-23470 -34.42 0.37 1 -FEP_23472-23469 21.51 0.49 0 -FEP_20670_2qbs_-20669_2qbr_ 3.08 0.26 0 -FEP_23470-23468 10.48 0.27 0 -FEP_23470-23469 23.53 0.16 0 -FEP_23473-20667_2qbp_ -36.28 0.29 0 -FEP_23468-23467 15.32 0.25 0 -FEP_23471-23330_2qbq_ 25.10 0.56 6 -FEP_23471-23470 -11.30 0.32 0 -FEP_23471-20670_2qbs_ 10.76 0.58 3 -FEP_23469-23330_2qbq_ 11.91 0.97 6 -FEP_23469-20670_2qbs_ -3.12 0.27 1 -FEP_23472-20667_2qbp_ -0.96 0.58 5 -FEP_23468-20670_2qbs_ 9.83 0.35 0 -FEP_23474-23472 -21.44 0.35 0 -FEP_23473-23472 -31.12 0.21 0 -FEP_23468-20667_2qbp_ -15.83 0.21 0 -FEP_23471-23466 9.35 0.30 0 -FEP_23330_2qbq_-20669_2qbr_ -11.09 0.50 2 -FEP_23470-20667_2qbp_ 1.88 0.23 7 -FEP_23330_2qbq_-20667_2qbp_ -30.31 0.65 4 -FEP_23473-23467 -8.40 0.54 2 -FEP_23473-23468 -23.27 0.39 0 -FEP_23471-23467 17.11 0.28 0 -FEP_23467-20669_2qbr_ -1.85 0.25 1 -FEP_23474-23466 1.53 0.24 0 -FEP_23474-23471 -14.92 0.94 2 -FEP_23472-23466 15.49 0.87 7 -FEP_23474-23468 -15.15 1.02 3 -FEP_20670_2qbs_-20667_2qbp_ -15.93 1.19 4 -FEP_23475-20667_2qbp_ -10.61 0.04 8 -FEP_23469-23466 -6.71 0.82 5 -FEP_23470-20669_2qbr_ 23.99 0.38 2 -FEP_23467-23330_2qbq_ 0.54 0.18 0 -FEP_23472-20670_2qbs_ 17.90 0.26 0 -FEP_23471-20667_2qbp_ -15.42 0.26 0 -FEP_23469-23467 1.70 0.43 6 -FEP_23466-20669_2qbr_ 6.99 1.02 6 -FEP_23471-23469 12.56 0.27 0 -FEP_23474-23473 9.23 0.24 0 -FEP_23467-20667_2qbp_ -33.80 0.17 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -3.25 0.43 0 -FEP_23472-20669_2qbr_ 21.13 0.17 0 -FEP_23474-23330_2qbq_ 10.24 0.45 0 -FEP_23470-23466 19.12 0.43 2 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.26 0.17 0 -FEP_23473-23330_2qbq_ 0.79 0.49 1 -FEP_23468-23466 8.00 0.38 0 -FEP_23473-23471 -23.89 0.54 0 -FEP_23474-23469 -1.35 0.19 0 -FEP_23475-20669_2qbr_ 5.92 0.42 0 -FEP_20669_2qbr_-20667_2qbp_ -21.59 0.70 7 -FEP_23470-23467 25.99 0.56 0 -FEP_23467-20670_2qbs_ -5.76 0.51 2 -FEP_23473-23469 -10.37 0.21 0 -FEP_23466-20667_2qbp_ -28.26 0.21 0 -FEP_23468-20669_2qbr_ 14.02 0.45 0 -FEP_23466-23330_2qbq_ 6.11 0.14 0 -FEP_23472-23330_2qbq_ 32.48 0.47 0 -FEP_23472-23471 5.64 0.91 0 -FEP_23472-23470 -5.46 0.89 3 -FEP_23473-20670_2qbs_ -12.40 0.30 0 -FEP_23469-23468 -12.30 0.19 2 -FEP_23470-20670_2qbs_ 20.94 0.19 0 -FEP_23470-23330_2qbq_ 34.09 0.37 3 -FEP_23467-23466 -7.54 0.23 0 -FEP_23474-23467 1.68 0.86 3 -FEP_23472-23468 6.78 0.68 2 -FEP_23472-23467 23.06 0.67 1 -FEP_23475-20670_2qbs_ 2.25 0.14 0 -FEP_23474-20667_2qbp_ -20.45 0.79 5 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.92 0.11 0 -FEP_23474-23470 -23.36 0.63 1 -FEP_23330_2qbq_-20670_2qbs_ -14.55 0.20 0 -FEP_23466-20670_2qbs_ 4.27 1.21 7 -FEP dG sem crashes -FEP_23479-23471 -6.53 0.97 1 -FEP_23482-23477 56.23 0.37 0 -FEP_23479-23475 1.42 0.20 0 -FEP_23482-23330_2qbq_ 66.92 0.18 0 -FEP_23476-23466 -3.00 0.92 3 -FEP_23475-23473 15.39 0.45 0 -FEP_23477-20670_2qbs_ -3.82 0.18 0 -FEP_23479-23467 7.24 0.79 4 -FEP_23476-23467 3.05 0.87 0 -FEP_23485-23471 15.52 0.24 0 -FEP_23485-23330_2qbq_ 30.64 0.86 2 -FEP_23486-23476 15.36 0.63 5 -FEP_23485-20670_2qbs_ 14.75 0.30 7 -FEP_23485-23474 19.37 0.84 8 -FEP_23482-23469 52.19 0.94 2 -FEP_23485-23467 33.90 0.20 0 -FEP_23479-23474 6.74 0.51 0 -FEP_23483-23480 -4.69 0.69 0 -FEP_23483-23477 1.84 0.30 4 -FEP_23476-23470 -22.47 0.58 2 -FEP_23477-23468 -13.88 0.21 0 -FEP_23483-23471 -5.95 0.75 0 -FEP_23482-23475 49.87 0.26 0 -FEP_23483-23469 0.76 0.67 7 -FEP_23482-20669_2qbr_ 53.83 0.87 3 -FEP_23486-23473 30.11 0.87 5 -FEP_23480-23479 -1.48 0.17 0 -FEP_23476-23472 -19.26 0.49 0 -FEP_23483-23472 -20.80 0.63 5 -FEP_23477-23469 -2.15 0.50 1 -FEP_23486-23467 32.97 0.22 0 -FEP_23475-23466 -0.15 0.65 0 -FEP_23483-23479 -7.70 0.88 1 -FEP_23485-23476 17.50 0.83 5 -FEP_23486-23466 27.15 0.11 0 -FEP_23485-23477 21.20 1.04 6 -FEP_23475-23469 5.33 0.85 1 -FEP_23476-23330_2qbq_ 13.15 0.26 0 -FEP_23479-23468 -5.85 0.50 0 -FEP_23476-20669_2qbr_ 3.28 0.38 0 -FEP_23486-23471 4.84 1.04 8 -FEP_23483-20670_2qbs_ -4.13 1.07 6 -FEP_23482-23473 64.92 1.10 1 -FEP_23480-23474 6.48 0.29 0 -FEP_23486-20670_2qbs_ 15.70 1.21 8 -FEP_23476-23474 1.77 0.47 0 -FEP_23485-23475 21.62 0.24 0 -FEP_23479-20670_2qbs_ 3.98 0.18 0 -FEP_23476-20667_2qbp_ -16.16 0.68 5 -FEP_23477-23474 -0.69 0.31 0 -FEP_23480-23466 8.53 0.13 0 -FEP_23477-23471 -16.00 1.05 0 -FEP_23485-23468 16.16 0.24 0 -FEP_23483-23467 12.88 0.25 0 -FEP_23485-23473 28.46 1.15 8 -FEP_23475-23470 -16.59 0.29 0 -FEP_23480-23470 -18.05 0.38 0 -FEP_23475-23472 -15.56 0.38 0 -FEP_23482-23466 58.68 0.19 0 -FEP_23483-20669_2qbr_ 2.29 0.85 7 -FEP_23486-23483 nan nan 10 -FEP_23485-23480 14.26 0.71 1 -FEP_23475-23330_2qbq_ 16.70 0.24 0 -FEP_23486-23468 7.06 0.47 8 -FEP_23483-23476 -4.09 0.80 2 -FEP_23479-23476 4.64 0.47 0 -FEP_23480-23471 -8.28 0.53 4 -FEP_23475-23467 8.90 0.28 0 -FEP_23486-23480 14.06 0.49 1 -FEP_23475-23471 -9.09 0.67 0 -FEP_23483-20667_2qbp_ -20.76 0.25 0 -FEP_23477-23476 -3.25 0.11 0 -FEP_23482-23472 34.83 0.43 0 -FEP_23479-23472 -13.94 0.34 0 -FEP_23486-23482 nan nan 10 -FEP_23482-23471 41.33 0.36 6 -FEP_23486-23485 -0.15 0.16 0 -FEP_23479-23470 -16.83 0.34 0 -FEP_23486-23474 18.24 1.05 7 -FEP_23485-23479 13.27 0.32 1 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.51 0.15 0 -FEP_23477-23473 8.01 0.95 0 -FEP_23485-20667_2qbp_ -0.35 0.22 0 -FEP_23486-23470 -5.86 1.10 6 -FEP_23480-23330_2qbq_ 16.59 0.22 0 -FEP_23485-20669_2qbr_ 16.21 0.30 8 -FEP_23480-23475 -0.78 0.25 0 -FEP_23479-23330_2qbq_ 18.16 0.16 0 -FEP_23479-23473 16.51 0.55 1 -FEP_23485-23483 19.97 0.16 0 -FEP_23482-23474 55.87 0.37 1 -FEP_23475-23474 5.28 0.20 0 -FEP_23483-23474 2.26 0.41 3 -FEP_23476-23468 -11.63 0.73 0 -FEP_23483-23466 7.14 0.16 0 -FEP_23475-23468 -6.95 0.16 0 -FEP_23485-23472 -3.08 1.26 7 -FEP_23486-23475 15.15 0.58 5 -FEP_23486-23477 27.51 0.19 0 -FEP_23480-20667_2qbp_ -15.37 0.53 1 -FEP_23482-23480 50.56 0.20 0 -FEP_23483-23473 6.60 0.44 8 -FEP_23482-23467 57.10 0.54 3 -FEP_23482-23470 32.09 0.42 1 -FEP_23477-20669_2qbr_ -0.47 0.54 0 -FEP_23486-20667_2qbp_ -0.37 0.10 0 -FEP_23476-23471 -13.37 1.02 2 -FEP_23480-23469 4.98 1.08 1 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.32 0.27 0 -FEP_23486-23472 0.82 0.84 7 -FEP_23479-23469 5.66 1.13 2 -FEP_23480-23472 -15.16 0.29 0 -FEP_23486-23330_2qbq_ 29.70 1.04 4 -FEP_23483-23470 -24.50 0.25 7 -FEP_23480-23476 3.35 0.20 0 -FEP_23483-23330_2qbq_ 10.86 0.61 1 -FEP_23477-23467 1.58 0.32 1 -FEP_23482-23476 53.07 0.22 0 -FEP_23479-20667_2qbp_ -13.29 0.46 3 -FEP_23485-23466 28.41 0.23 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 2.11 0.26 0 -FEP_23485-23469 25.83 0.21 0 -FEP_23480-20669_2qbr_ 5.88 0.51 0 -FEP_23482-23479 48.66 0.26 0 -FEP_23477-23470 -25.34 0.83 0 -FEP_23477-23472 -22.27 0.25 0 -FEP_23476-23469 1.00 0.78 0 -FEP_23486-20669_2qbr_ 17.14 0.36 7 -FEP_23483-23468 -14.89 0.48 8 -FEP_23477-23466 -6.73 0.53 2 -FEP_23482-20667_2qbp_ 36.38 0.92 0 -FEP_23479-23477 8.18 0.19 0 -FEP_23486-23469 17.96 0.64 5 -FEP_23479-20669_2qbr_ 6.78 0.61 0 -FEP_23476-23475 -3.39 0.25 0 -FEP_23480-23473 14.18 0.70 1 -FEP_23479-23466 9.69 0.09 0 -FEP_23480-23468 -8.55 0.75 1 -FEP_23485-23470 -4.26 0.65 4 -FEP_23482-23468 42.68 0.46 0 -FEP_23483-23475 -8.64 0.53 6 -FEP_23480-23477 6.73 0.16 0 -FEP_23485-23482 nan nan 10 -FEP_23476-23473 11.48 0.79 0 -FEP_23477-20667_2qbp_ -19.85 0.86 5 -FEP_23483-23482 nan nan 10 -FEP_23480-23467 7.86 0.17 7 -FEP_23476-20670_2qbs_ -0.42 0.26 0 -FEP_23477-23475 -6.86 0.19 0 -FEP_23486-23479 12.39 0.73 1 -FEP dG sem crashes -FEP_23484-23479 12.67 0.47 1 -FEP_23484-23477 20.65 1.33 7 -FEP_23484-23475 12.75 0.54 5 -FEP_23484-23468 15.59 0.15 0 -FEP_23484-23466 27.65 0.23 0 -FEP_23484-20667_2qbp_ -0.21 0.17 0 -FEP_23484-23470 -3.99 0.68 5 -FEP_23484-23482 nan nan 10 -FEP_23484-23467 33.00 0.12 0 -FEP_23484-23483 20.26 0.38 0 -FEP_23484-23485 0.82 0.23 0 -FEP_23484-23472 -0.96 0.92 3 -FEP_23484-23480 16.53 0.39 0 -FEP_23484-23330_2qbq_ 31.91 0.64 3 -FEP_23484-23469 25.66 0.11 0 -FEP_23484-23486 0.76 0.17 0 -FEP_23484-23473 33.60 0.20 7 -FEP_23484-20669_2qbr_ 19.08 0.65 6 -FEP_23484-23476 18.34 0.89 4 -FEP_23484-23474 20.30 1.16 4 -FEP_23484-23471 4.50 0.15 8 -FEP_23484-20670_2qbs_ 14.34 0.84 4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/protein.txt deleted file mode 100755 index fcb784f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,254 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23467-20669_2qbr_ -1.66 0.57 0 -FEP_23472-23470 -5.17 1.29 1 -FEP_23471-23468 1.22 0.48 0 -FEP_23472-23330_2qbq_ 30.00 0.57 0 -FEP_23472-20670_2qbs_ 16.94 0.59 0 -FEP_23330_2qbq_-20669_2qbr_ -9.99 0.83 4 -FEP_23469-20670_2qbs_ -3.97 0.43 0 -FEP_23473-23467 -6.40 1.12 0 -FEP_23471-20667_2qbp_ -23.33 1.11 0 -FEP_23469-23330_2qbq_ 9.30 0.69 4 -FEP_23475-20670_2qbs_ 2.91 0.16 0 -FEP_23475-20669_2qbr_ 5.92 0.33 1 -FEP_23473-20670_2qbs_ -11.95 0.21 0 -FEP_23466-20669_2qbr_ 4.91 0.73 3 -FEP_23470-23330_2qbq_ 31.73 0.61 3 -FEP_23470-23469 22.31 0.47 0 -FEP_23468-20669_2qbr_ 11.14 0.49 0 -FEP_23469-23468 -12.10 0.51 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ 0.48 0.34 0 -FEP_23471-23469 12.74 0.36 0 -FEP_23470-20670_2qbs_ 17.11 0.44 0 -FEP_23474-23468 -11.15 0.27 4 -FEP_23474-23466 3.73 0.59 0 -FEP_23468-23466 7.62 0.51 1 -FEP_23472-23467 23.73 0.65 3 -FEP_20669_2qbr_-20667_2qbp_ -30.39 1.00 0 -FEP_23330_2qbq_-20667_2qbp_ -29.21 1.83 6 -FEP_23472-23469 20.09 0.36 0 -FEP_23467-23466 -7.30 0.26 0 -FEP_23474-23471 -13.15 1.31 0 -FEP_23467-20670_2qbs_ -6.24 0.85 3 -FEP_23472-20667_2qbp_ -10.81 1.39 0 -FEP_23474-23473 9.84 0.28 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -2.21 0.42 0 -FEP_23468-20667_2qbp_ -12.98 0.88 8 -FEP_23466-20667_2qbp_ -36.03 0.98 0 -FEP_23471-20670_2qbs_ 9.22 0.69 0 -FEP_23473-20667_2qbp_ -39.72 0.87 0 -FEP_23330_2qbq_-20670_2qbs_ -13.18 0.17 0 -FEP_23471-23467 16.57 0.44 0 -FEP_23470-23467 26.12 0.92 0 -FEP_23473-23469 -8.49 0.50 0 -FEP_23474-20667_2qbp_ -25.72 1.63 6 -FEP_20670_2qbs_-20667_2qbp_ -19.99 0.68 7 -FEP_23473-23468 -20.58 0.57 0 -FEP_23466-23330_2qbq_ 3.24 0.21 0 -FEP_23474-23467 3.50 0.87 7 -FEP_23468-23467 15.40 0.44 0 -FEP_23469-20669_2qbr_ -0.61 0.41 0 -FEP_20670_2qbs_-20669_2qbr_ 3.71 0.24 0 -FEP_23473-23330_2qbq_ 2.51 0.59 1 -FEP_23469-20667_2qbp_ -32.02 1.01 0 -FEP_23469-23466 -2.96 0.64 3 -FEP_23473-23471 -20.64 0.51 0 -FEP_23474-23469 1.50 0.26 0 -FEP_23473-23466 -12.62 0.42 5 -FEP_23471-23470 -11.31 0.47 0 -FEP_23472-23466 15.32 0.91 5 -FEP_23475-20667_2qbp_ -19.61 0.73 7 -FEP_23471-23330_2qbq_ 23.04 0.80 3 -FEP_23472-23471 6.36 1.11 0 -FEP_23471-23466 8.36 0.40 0 -FEP_23471-20669_2qbr_ 12.61 0.74 0 -FEP_23467-23330_2qbq_ -2.36 0.25 0 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.35 0.18 0 -FEP_23470-23468 10.70 0.49 0 -FEP_23467-20667_2qbp_ -41.00 1.21 0 -FEP_23474-23470 -22.93 0.85 1 -FEP_23470-23466 18.76 0.44 0 -FEP_23474-23330_2qbq_ 10.98 0.42 0 -FEP_23468-23330_2qbq_ 21.44 0.64 2 -FEP_23473-23470 -32.89 0.97 0 -FEP_23466-20670_2qbs_ 0.37 0.41 6 -FEP_23472-20669_2qbr_ 20.40 0.53 0 -FEP_23470-20669_2qbr_ 22.19 0.52 1 -FEP_23468-20670_2qbs_ 7.68 0.42 0 -FEP_23472-23468 7.10 1.24 3 -FEP_23474-23472 -20.23 0.34 0 -FEP_23469-23467 4.25 0.41 2 -FEP_23473-23472 -28.88 0.19 0 -FEP_23470-20667_2qbp_ -6.75 0.04 7 -FEP_23479-23471 -6.30 0.91 5 -FEP_23482-23477 56.98 0.28 1 -FEP_23479-23475 1.02 0.22 2 -FEP_23482-23330_2qbq_ 65.44 0.30 0 -FEP_23476-23466 -2.04 1.11 7 -FEP_23475-23473 14.00 0.32 1 -FEP_23477-20670_2qbs_ -4.61 0.12 1 -FEP_23479-23467 8.73 0.01 8 -FEP_23476-23467 6.33 0.97 1 -FEP_23485-23471 18.06 0.63 0 -FEP_23485-23330_2qbq_ 29.78 1.11 6 -FEP_23486-23476 26.66 1.47 8 -FEP_23485-20670_2qbs_ 20.52 0.32 8 -FEP_23485-23474 17.31 0.09 8 -FEP_23482-23469 53.37 0.95 4 -FEP_23485-23467 38.36 0.69 0 -FEP_23479-23474 5.76 0.68 0 -FEP_23483-23480 -6.39 0.59 0 -FEP_23483-23477 0.16 0.86 5 -FEP_23476-23470 -19.74 0.72 3 -FEP_23477-23468 -12.25 0.27 0 -FEP_23483-23471 -14.83 0.09 8 -FEP_23482-23475 50.75 0.35 1 -FEP_23483-23469 -0.04 1.00 7 -FEP_23482-20669_2qbr_ 54.35 0.70 4 -FEP_23486-23473 40.86 1.14 0 -FEP_23480-23479 -1.58 0.20 0 -FEP_23476-23472 -18.16 0.45 0 -FEP_23483-23472 -21.41 1.19 5 -FEP_23477-23469 -1.75 0.31 1 -FEP_23486-23467 41.31 1.24 0 -FEP_23475-23466 2.37 0.70 0 -FEP_23483-23479 -6.93 0.82 2 -FEP_23485-23476 20.00 1.05 8 -FEP_23486-23466 36.79 1.33 0 -FEP_23485-23477 18.01 0.39 8 -FEP_23475-23469 6.17 0.63 4 -FEP_23476-23330_2qbq_ 11.96 0.35 0 -FEP_23479-23468 -3.85 0.35 3 -FEP_23476-20669_2qbr_ 2.54 0.50 2 -FEP_23486-23471 22.75 1.40 0 -FEP_23483-20670_2qbs_ -4.89 0.99 4 -FEP_23482-23473 62.81 0.90 0 -FEP_23480-23474 4.08 1.16 2 -FEP_23486-20670_2qbs_ 19.52 0.64 6 -FEP_23476-23474 1.72 0.30 3 -FEP_23485-23475 12.36 0.46 8 -FEP_23479-20670_2qbs_ 3.91 0.29 2 -FEP_23476-20667_2qbp_ -28.56 0.89 0 -FEP_23477-23474 -1.91 0.39 1 -FEP_23480-23466 2.27 0.58 8 -FEP_23477-23471 -15.50 0.85 0 -FEP_23485-23468 22.92 0.78 1 -FEP_23483-23467 14.78 0.47 0 -FEP_23485-23473 37.43 0.81 0 -FEP_23475-23470 -15.73 0.42 1 -FEP_23480-23470 -16.07 0.40 5 -FEP_23475-23472 -14.42 0.37 0 -FEP_23482-23466 60.89 0.20 0 -FEP_23483-20669_2qbr_ -2.80 0.70 6 -FEP_23486-23483 nan nan 10 -FEP_23485-23480 15.85 0.90 5 -FEP_23475-23330_2qbq_ 15.72 0.20 3 -FEP_23486-23468 14.04 0.21 8 -FEP_23483-23476 -3.95 0.86 5 -FEP_23479-23476 4.28 0.29 0 -FEP_23480-23471 -8.72 0.95 6 -FEP_23475-23467 9.04 0.73 1 -FEP_23486-23480 22.26 0.78 2 -FEP_23475-23471 -6.80 0.52 1 -FEP_23483-20667_2qbp_ -22.01 0.53 0 -FEP_23477-23476 -3.70 0.41 0 -FEP_23482-23472 34.22 1.13 1 -FEP_23479-23472 -12.92 0.62 0 -FEP_23486-23482 nan nan 10 -FEP_23482-23471 42.75 0.94 2 -FEP_23486-23485 4.46 0.21 0 -FEP_23479-23470 -13.37 0.45 0 -FEP_23486-23474 22.28 0.91 7 -FEP_23485-23479 12.24 1.56 2 -FEP_23477-23330_2qbq_ 8.38 0.25 0 -FEP_23477-23473 7.35 0.33 0 -FEP_23485-20667_2qbp_ -3.63 0.14 0 -FEP_23486-23470 7.93 0.45 8 -FEP_23480-23330_2qbq_ 15.01 0.35 0 -FEP_23485-20669_2qbr_ 19.72 0.86 6 -FEP_23480-23475 0.78 0.53 0 -FEP_23479-23330_2qbq_ 16.45 0.33 0 -FEP_23479-23473 15.77 0.82 1 -FEP_23485-23483 18.00 0.68 0 -FEP_23482-23474 53.63 0.93 1 -FEP_23475-23474 5.51 0.46 0 -FEP_23483-23474 0.52 0.69 3 -FEP_23476-23468 -8.17 0.71 0 -FEP_23483-23466 9.65 0.23 0 -FEP_23475-23468 -5.39 0.30 0 -FEP_23485-23472 9.48 1.06 0 -FEP_23486-23475 27.96 0.98 0 -FEP_23486-23477 25.79 0.25 7 -FEP_23480-20667_2qbp_ -22.67 0.66 1 -FEP_23482-23480 51.72 0.75 0 -FEP_23483-23473 11.10 0.66 5 -FEP_23482-23467 59.15 1.01 5 -FEP_23482-23470 34.93 0.52 2 -FEP_23477-20669_2qbr_ -0.74 0.55 1 -FEP_23486-20667_2qbp_ 0.47 0.17 0 -FEP_23476-23471 -9.94 0.51 1 -FEP_23480-23469 6.32 1.24 5 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.64 0.28 0 -FEP_23486-23472 8.69 1.63 8 -FEP_23479-23469 7.87 0.41 4 -FEP_23480-23472 -14.68 0.43 1 -FEP_23486-23330_2qbq_ 34.75 1.84 1 -FEP_23483-23470 -22.88 0.97 5 -FEP_23480-23476 2.98 0.44 0 -FEP_23483-23330_2qbq_ 8.19 0.98 1 -FEP_23477-23467 1.25 0.91 1 -FEP_23482-23476 52.62 0.30 0 -FEP_23479-20667_2qbp_ -18.24 0.91 1 -FEP_23485-23466 35.77 0.87 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 3.30 0.24 0 -FEP_23485-23469 28.52 1.04 0 -FEP_23480-20669_2qbr_ 6.02 0.43 1 -FEP_23482-23479 48.07 0.62 0 -FEP_23477-23470 -22.50 0.22 0 -FEP_23477-23472 -21.51 0.42 0 -FEP_23476-23469 2.53 1.33 1 -FEP_23486-20669_2qbr_ 30.64 1.09 0 -FEP_23483-23468 -12.33 0.69 8 -FEP_23477-23466 -5.65 0.79 4 -FEP_23482-20667_2qbp_ 34.11 0.73 0 -FEP_23479-23477 8.13 0.29 0 -FEP_23486-23469 27.23 2.20 8 -FEP_23479-20669_2qbr_ 6.24 0.98 1 -FEP_23476-23475 -3.32 0.26 0 -FEP_23480-23473 15.18 0.19 2 -FEP_23479-23466 11.88 0.55 0 -FEP_23480-23468 -6.17 0.84 3 -FEP_23485-23470 5.96 0.84 0 -FEP_23482-23468 44.00 0.78 1 -FEP_23483-23475 -8.09 0.63 6 -FEP_23480-23477 7.44 0.29 0 -FEP_23485-23482 nan nan 10 -FEP_23476-23473 11.46 0.34 0 -FEP_23477-20667_2qbp_ -36.12 0.79 0 -FEP_23483-23482 nan nan 10 -FEP_23480-23467 8.76 1.58 7 -FEP_23476-20670_2qbs_ -0.23 0.10 0 -FEP_23477-23475 -7.12 0.17 0 -FEP_23486-23479 17.33 1.09 2 -FEP_23484-23479 18.62 0.53 3 -FEP_23484-23477 26.11 0.34 8 -FEP_23484-23475 26.74 1.19 0 -FEP_23484-23468 14.34 0.18 8 -FEP_23484-23466 35.74 0.91 0 -FEP_23484-20667_2qbp_ -0.15 0.25 0 -FEP_23484-23470 3.95 1.63 6 -FEP_23484-23482 nan nan 10 -FEP_23484-23467 40.29 1.00 0 -FEP_23484-23483 20.97 0.50 0 -FEP_23484-23485 3.42 0.20 0 -FEP_23484-23472 10.84 1.32 0 -FEP_23484-23480 20.06 0.88 1 -FEP_23484-23330_2qbq_ 36.07 0.58 3 -FEP_23484-23469 27.61 1.18 8 -FEP_23484-23486 -0.26 0.19 0 -FEP_23484-23473 30.58 nan 9 -FEP_23484-20669_2qbr_ 22.75 2.33 7 -FEP_23484-23476 21.61 1.31 5 -FEP_23484-23474 21.70 1.45 7 -FEP_23484-23471 20.63 1.46 0 -FEP_23484-20670_2qbs_ 22.40 2.16 7 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/protein_23484edges.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/protein_23484edges.txt deleted file mode 100755 index ea569996..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/protein_23484edges.txt +++ /dev/null @@ -1,23 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23484-23479 15.78 0.49 3 -FEP_23484-23477 27.43 0.71 5 -FEP_23484-23475 18.71 0.92 1 -FEP_23484-23468 13.45 0.86 1 -FEP_23484-23466 32.97 0.36 8 -FEP_23484-20667_2qbp_ 0.18 0.29 2 -FEP_23484-23470 2.33 1.01 2 -FEP_23484-23482 -32.09 0.93 3 -FEP_23484-23467 30.19 1.08 6 -FEP_23484-23483 19.56 0.73 0 -FEP_23484-23485 3.23 0.45 0 -FEP_23484-23472 4.95 0.63 1 -FEP_23484-23480 17.41 0.52 2 -FEP_23484-23330_2qbq_ 30.55 0.88 2 -FEP_23484-23469 20.99 0.85 4 -FEP_23484-23486 0.02 0.26 6 -FEP_23484-23473 31.17 0.88 3 -FEP_23484-20669_2qbr_ 21.25 1.40 2 -FEP_23484-23476 21.78 0.64 5 -FEP_23484-23474 25.21 0.99 2 -FEP_23484-23471 9.32 1.44 3 -FEP_23484-20670_2qbs_ 20.76 0.59 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/water.txt deleted file mode 100755 index adac546f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/5.PTP1B/water.txt +++ /dev/null @@ -1,256 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471-20669_2qbr_ 13.29 0.83 0 -FEP_23474-20669_2qbr_ -0.95 0.22 0 -FEP_23468-23330_2qbq_ 24.77 0.54 0 -FEP_23473-23466 -15.84 0.60 4 -FEP_23469-20667_2qbp_ -19.00 1.13 5 -FEP_23471-23468 0.18 0.24 0 -FEP_23473-23470 -34.42 0.37 1 -FEP_23472-23469 21.51 0.49 0 -FEP_20670_2qbs_-20669_2qbr_ 3.08 0.26 0 -FEP_23470-23468 10.48 0.27 0 -FEP_23470-23469 23.53 0.16 0 -FEP_23473-20667_2qbp_ -36.28 0.29 0 -FEP_23468-23467 15.32 0.25 0 -FEP_23471-23330_2qbq_ 25.10 0.56 6 -FEP_23471-23470 -11.30 0.32 0 -FEP_23471-20670_2qbs_ 10.76 0.58 3 -FEP_23469-23330_2qbq_ 11.91 0.97 6 -FEP_23469-20670_2qbs_ -3.12 0.27 1 -FEP_23472-20667_2qbp_ -0.96 0.58 5 -FEP_23468-20670_2qbs_ 9.83 0.35 0 -FEP_23474-23472 -21.44 0.35 0 -FEP_23473-23472 -31.12 0.21 0 -FEP_23468-20667_2qbp_ -15.83 0.21 0 -FEP_23471-23466 9.35 0.30 0 -FEP_23330_2qbq_-20669_2qbr_ -11.09 0.50 2 -FEP_23470-20667_2qbp_ 1.88 0.23 7 -FEP_23330_2qbq_-20667_2qbp_ -30.31 0.65 4 -FEP_23473-23467 -8.40 0.54 2 -FEP_23473-23468 -23.27 0.39 0 -FEP_23471-23467 17.11 0.28 0 -FEP_23467-20669_2qbr_ -1.85 0.25 1 -FEP_23474-23466 1.53 0.24 0 -FEP_23474-23471 -14.92 0.94 2 -FEP_23472-23466 15.49 0.87 7 -FEP_23474-23468 -15.15 1.02 3 -FEP_20670_2qbs_-20667_2qbp_ -15.93 1.19 4 -FEP_23475-20667_2qbp_ -10.61 0.04 8 -FEP_23469-23466 -6.71 0.82 5 -FEP_23470-20669_2qbr_ 23.99 0.38 2 -FEP_23467-23330_2qbq_ 0.54 0.18 0 -FEP_23472-20670_2qbs_ 17.90 0.26 0 -FEP_23471-20667_2qbp_ -15.42 0.26 0 -FEP_23469-23467 1.70 0.43 6 -FEP_23466-20669_2qbr_ 6.99 1.02 6 -FEP_23471-23469 12.56 0.27 0 -FEP_23474-23473 9.23 0.24 0 -FEP_23467-20667_2qbp_ -33.80 0.17 0 -FEP_23474-20670_2qbs_ -3.25 0.43 0 -FEP_23472-20669_2qbr_ 21.13 0.17 0 -FEP_23474-23330_2qbq_ 10.24 0.45 0 -FEP_23470-23466 19.12 0.43 2 -FEP_23469-20669_2qbr_ 0.26 0.17 0 -FEP_23473-23330_2qbq_ 0.79 0.49 1 -FEP_23468-23466 8.00 0.38 0 -FEP_23473-23471 -23.89 0.54 0 -FEP_23474-23469 -1.35 0.19 0 -FEP_23475-20669_2qbr_ 5.92 0.42 0 -FEP_20669_2qbr_-20667_2qbp_ -21.59 0.70 7 -FEP_23470-23467 25.99 0.56 0 -FEP_23467-20670_2qbs_ -5.76 0.51 2 -FEP_23473-23469 -10.37 0.21 0 -FEP_23466-20667_2qbp_ -28.26 0.21 0 -FEP_23468-20669_2qbr_ 14.02 0.45 0 -FEP_23466-23330_2qbq_ 6.11 0.14 0 -FEP_23472-23330_2qbq_ 32.48 0.47 0 -FEP_23472-23471 5.64 0.91 0 -FEP_23472-23470 -5.46 0.89 3 -FEP_23473-20670_2qbs_ -12.40 0.30 0 -FEP_23469-23468 -12.30 0.19 2 -FEP_23470-20670_2qbs_ 20.94 0.19 0 -FEP_23470-23330_2qbq_ 34.09 0.37 3 -FEP_23467-23466 -7.54 0.23 0 -FEP_23474-23467 1.68 0.86 3 -FEP_23472-23468 6.78 0.68 2 -FEP_23472-23467 23.06 0.67 1 -FEP_23475-20670_2qbs_ 2.25 0.14 0 -FEP_23474-20667_2qbp_ -20.45 0.79 5 -FEP_23473-20669_2qbr_ -9.92 0.11 0 -FEP_23474-23470 -23.36 0.63 1 -FEP_23330_2qbq_-20670_2qbs_ -14.55 0.20 0 -FEP_23466-20670_2qbs_ 4.27 1.21 7 -FEP dG sem crashes -FEP_23479-23471 -6.53 0.97 1 -FEP_23482-23477 56.23 0.37 0 -FEP_23479-23475 1.42 0.20 0 -FEP_23482-23330_2qbq_ 66.92 0.18 0 -FEP_23476-23466 -3.00 0.92 3 -FEP_23475-23473 15.39 0.45 0 -FEP_23477-20670_2qbs_ -3.82 0.18 0 -FEP_23479-23467 7.24 0.79 4 -FEP_23476-23467 3.05 0.87 0 -FEP_23485-23471 15.52 0.24 0 -FEP_23485-23330_2qbq_ 30.64 0.86 2 -FEP_23486-23476 15.36 0.63 5 -FEP_23485-20670_2qbs_ 14.75 0.30 7 -FEP_23485-23474 19.37 0.84 8 -FEP_23482-23469 52.19 0.94 2 -FEP_23485-23467 33.90 0.20 0 -FEP_23479-23474 6.74 0.51 0 -FEP_23483-23480 -4.69 0.69 0 -FEP_23483-23477 1.84 0.30 4 -FEP_23476-23470 -22.47 0.58 2 -FEP_23477-23468 -13.88 0.21 0 -FEP_23483-23471 -5.95 0.75 0 -FEP_23482-23475 49.87 0.26 0 -FEP_23483-23469 0.76 0.67 7 -FEP_23482-20669_2qbr_ 53.83 0.87 3 -FEP_23486-23473 30.11 0.87 5 -FEP_23480-23479 -1.48 0.17 0 -FEP_23476-23472 -19.26 0.49 0 -FEP_23483-23472 -20.80 0.63 5 -FEP_23477-23469 -2.15 0.50 1 -FEP_23486-23467 32.97 0.22 0 -FEP_23475-23466 -0.15 0.65 0 -FEP_23483-23479 -7.70 0.88 1 -FEP_23485-23476 17.50 0.83 5 -FEP_23486-23466 27.15 0.11 0 -FEP_23485-23477 21.20 1.04 6 -FEP_23475-23469 5.33 0.85 1 -FEP_23476-23330_2qbq_ 13.15 0.26 0 -FEP_23479-23468 -5.85 0.50 0 -FEP_23476-20669_2qbr_ 3.28 0.38 0 -FEP_23486-23471 4.84 1.04 8 -FEP_23483-20670_2qbs_ -4.13 1.07 6 -FEP_23482-23473 64.92 1.10 1 -FEP_23480-23474 6.48 0.29 0 -FEP_23486-20670_2qbs_ 15.70 1.21 8 -FEP_23476-23474 1.77 0.47 0 -FEP_23485-23475 21.62 0.24 0 -FEP_23479-20670_2qbs_ 3.98 0.18 0 -FEP_23476-20667_2qbp_ -16.16 0.68 5 -FEP_23477-23474 -0.69 0.31 0 -FEP_23480-23466 8.53 0.13 0 -FEP_23477-23471 -16.00 1.05 0 -FEP_23485-23468 16.16 0.24 0 -FEP_23483-23467 12.88 0.25 0 -FEP_23485-23473 28.46 1.15 8 -FEP_23475-23470 -16.59 0.29 0 -FEP_23480-23470 -18.05 0.38 0 -FEP_23475-23472 -15.56 0.38 0 -FEP_23482-23466 58.68 0.19 0 -FEP_23483-20669_2qbr_ 2.29 0.85 7 -FEP_23486-23483 nan nan 10 -FEP_23485-23480 14.26 0.71 1 -FEP_23475-23330_2qbq_ 16.70 0.24 0 -FEP_23486-23468 7.06 0.47 8 -FEP_23483-23476 -4.09 0.80 2 -FEP_23479-23476 4.64 0.47 0 -FEP_23480-23471 -8.28 0.53 4 -FEP_23475-23467 8.90 0.28 0 -FEP_23486-23480 14.06 0.49 1 -FEP_23475-23471 -9.09 0.67 0 -FEP_23483-20667_2qbp_ -20.76 0.25 0 -FEP_23477-23476 -3.25 0.11 0 -FEP_23482-23472 34.83 0.43 0 -FEP_23479-23472 -13.94 0.34 0 -FEP_23486-23482 nan nan 10 -FEP_23482-23471 41.33 0.36 6 -FEP_23486-23485 -0.15 0.16 0 -FEP_23479-23470 -16.83 0.34 0 -FEP_23486-23474 18.24 1.05 7 -FEP_23485-23479 13.27 0.32 1 -FEP_23477-23330_2qbq_ 9.51 0.15 0 -FEP_23477-23473 8.01 0.95 0 -FEP_23485-20667_2qbp_ -0.35 0.22 0 -FEP_23486-23470 -5.86 1.10 6 -FEP_23480-23330_2qbq_ 16.59 0.22 0 -FEP_23485-20669_2qbr_ 16.21 0.30 8 -FEP_23480-23475 -0.78 0.25 0 -FEP_23479-23330_2qbq_ 18.16 0.16 0 -FEP_23479-23473 16.51 0.55 1 -FEP_23485-23483 19.97 0.16 0 -FEP_23482-23474 55.87 0.37 1 -FEP_23475-23474 5.28 0.20 0 -FEP_23483-23474 2.26 0.41 3 -FEP_23476-23468 -11.63 0.73 0 -FEP_23483-23466 7.14 0.16 0 -FEP_23475-23468 -6.95 0.16 0 -FEP_23485-23472 -3.08 1.26 7 -FEP_23486-23475 15.15 0.58 5 -FEP_23486-23477 27.51 0.19 0 -FEP_23480-20667_2qbp_ -15.37 0.53 1 -FEP_23482-23480 50.56 0.20 0 -FEP_23483-23473 6.60 0.44 8 -FEP_23482-23467 57.10 0.54 3 -FEP_23482-23470 32.09 0.42 1 -FEP_23477-20669_2qbr_ -0.47 0.54 0 -FEP_23486-20667_2qbp_ -0.37 0.10 0 -FEP_23476-23471 -13.37 1.02 2 -FEP_23480-23469 4.98 1.08 1 -FEP_23482-20670_2qbs_ 52.32 0.27 0 -FEP_23486-23472 0.82 0.84 7 -FEP_23479-23469 5.66 1.13 2 -FEP_23480-23472 -15.16 0.29 0 -FEP_23486-23330_2qbq_ 29.70 1.04 4 -FEP_23483-23470 -24.50 0.25 7 -FEP_23480-23476 3.35 0.20 0 -FEP_23483-23330_2qbq_ 10.86 0.61 1 -FEP_23477-23467 1.58 0.32 1 -FEP_23482-23476 53.07 0.22 0 -FEP_23479-20667_2qbp_ -13.29 0.46 3 -FEP_23485-23466 28.41 0.23 0 -FEP_23480-20670_2qbs_ 2.11 0.26 0 -FEP_23485-23469 25.83 0.21 0 -FEP_23480-20669_2qbr_ 5.88 0.51 0 -FEP_23482-23479 48.66 0.26 0 -FEP_23477-23470 -25.34 0.83 0 -FEP_23477-23472 -22.27 0.25 0 -FEP_23476-23469 1.00 0.78 0 -FEP_23486-20669_2qbr_ 17.14 0.36 7 -FEP_23483-23468 -14.89 0.48 8 -FEP_23477-23466 -6.73 0.53 2 -FEP_23482-20667_2qbp_ 36.38 0.92 0 -FEP_23479-23477 8.18 0.19 0 -FEP_23486-23469 17.96 0.64 5 -FEP_23479-20669_2qbr_ 6.78 0.61 0 -FEP_23476-23475 -3.39 0.25 0 -FEP_23480-23473 14.18 0.70 1 -FEP_23479-23466 9.69 0.09 0 -FEP_23480-23468 -8.55 0.75 1 -FEP_23485-23470 -4.26 0.65 4 -FEP_23482-23468 42.68 0.46 0 -FEP_23483-23475 -8.64 0.53 6 -FEP_23480-23477 6.73 0.16 0 -FEP_23485-23482 nan nan 10 -FEP_23476-23473 11.48 0.79 0 -FEP_23477-20667_2qbp_ -19.85 0.86 5 -FEP_23483-23482 nan nan 10 -FEP_23480-23467 7.86 0.17 7 -FEP_23476-20670_2qbs_ -0.42 0.26 0 -FEP_23477-23475 -6.86 0.19 0 -FEP_23486-23479 12.39 0.73 1 -FEP dG sem crashes -FEP_23484-23479 12.67 0.47 1 -FEP_23484-23477 20.65 1.33 7 -FEP_23484-23475 12.75 0.54 5 -FEP_23484-23468 15.59 0.15 0 -FEP_23484-23466 27.65 0.23 0 -FEP_23484-20667_2qbp_ -0.21 0.17 0 -FEP_23484-23470 -3.99 0.68 5 -FEP_23484-23482 nan nan 10 -FEP_23484-23467 33.00 0.12 0 -FEP_23484-23483 20.26 0.38 0 -FEP_23484-23485 0.82 0.23 0 -FEP_23484-23472 -0.96 0.92 3 -FEP_23484-23480 16.53 0.39 0 -FEP_23484-23330_2qbq_ 31.91 0.64 3 -FEP_23484-23469 25.66 0.11 0 -FEP_23484-23486 0.76 0.17 0 -FEP_23484-23473 33.60 0.20 7 -FEP_23484-20669_2qbr_ 19.08 0.65 6 -FEP_23484-23476 18.34 0.89 4 -FEP_23484-23474 20.30 1.16 4 -FEP_23484-23471 4.50 0.15 8 -FEP_23484-20670_2qbs_ 14.34 0.84 4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/pairs.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/pairs.txt deleted file mode 100755 index bf67b35e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/pairs.txt +++ /dev/null @@ -1,55 +0,0 @@ -1b 1a -1c 1a -1d 1a -3a 1a -3b 1a -5 1a -6a 1a -6b 1a -6e 1a -7a 1a -1c 1b -1d 1b -3a 1b -3b 1b -5 1b -6a 1b -6b 1b -6e 1b -7a 1b -1d 1c -3a 1c -3b 1c -5 1c -6a 1c -6b 1c -6e 1c -7a 1c -3a 1d -3b 1d -5 1d -6a 1d -6b 1d -6e 1d -7a 1d -3b 3a -5 3a -6a 3a -6b 3a -6e 3a -7a 3a -5 3b -6a 3b -6b 3b -6e 3b -7a 3b -6a 5 -6b 5 -6e 5 -7a 5 -6b 6a -6e 6a -7a 6a -6e 6b -7a 6b -7a 6e diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index e49d374a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,111 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_6e-7a 1.25 0.97 -FEP_6e-1a 3.22 0.37 -FEP_6e-1b 0.42 0.34 -FEP_6e-1c 0.11 0.59 -FEP_6e-1d 0.31 0.25 -FEP_6e-3a 1.67 1.04 -FEP_6e-3b 1.46 0.96 -FEP_6e-5 4.43 0.73 -FEP_6e-6a 1.31 0.46 -FEP_6e-6b 1.52 0.48 -FEP_7a-6e -5.44 0.97 -FEP_7a-1a 1.18 0.54 -FEP_7a-1b -2.82 0.96 -FEP_7a-1c -3.72 0.91 -FEP_7a-1d -4.41 1.24 -FEP_7a-3a -2.74 0.73 -FEP_7a-3b -2.05 0.32 -FEP_7a-5 -0.35 1.31 -FEP_7a-6a -4.37 1.41 -FEP_7a-6b -2.17 0.76 -FEP_1a-6e -2.98 0.45 -FEP_1a-7a 0.31 0.88 -FEP_1a-1b -2.43 0.34 -FEP_1a-1c -3.18 0.33 -FEP_1a-1d -4.09 0.60 -FEP_1a-3a -0.79 0.70 -FEP_1a-3b -1.37 0.47 -FEP_1a-5 2.02 0.40 -FEP_1a-6a -2.79 0.36 -FEP_1a-6b 0.35 0.55 -FEP_1b-6e -0.86 0.54 -FEP_1b-7a 3.37 0.86 -FEP_1b-1a 1.66 0.30 -FEP_1b-1c -1.91 0.31 -FEP_1b-1d -0.98 0.58 -FEP_1b-3a 0.63 0.53 -FEP_1b-3b 1.55 1.12 -FEP_1b-5 3.26 0.62 -FEP_1b-6a -0.79 0.39 -FEP_1b-6b 2.38 0.82 -FEP_1c-6e 0.99 0.61 -FEP_1c-7a 3.31 0.85 -FEP_1c-1a 3.69 0.36 -FEP_1c-1b 1.71 0.23 -FEP_1c-1d -0.64 0.41 -FEP_1c-3a 1.39 1.22 -FEP_1c-3b 2.60 0.71 -FEP_1c-5 3.29 1.45 -FEP_1c-6a 0.62 0.49 -FEP_1c-6b 2.55 0.67 -FEP_1d-6e 0.05 0.31 -FEP_1d-7a 5.55 1.33 -FEP_1d-1a 3.29 0.45 -FEP_1d-1b 1.60 0.87 -FEP_1d-1c 0.34 0.37 -FEP_1d-3a 2.13 0.66 -FEP_1d-3b 3.91 0.89 -FEP_1d-5 4.19 0.87 -FEP_1d-6a 2.45 0.57 -FEP_1d-6b 3.17 0.75 -FEP_3a-6e -3.79 1.26 -FEP_3a-7a 2.07 0.71 -FEP_3a-1a 0.61 0.35 -FEP_3a-1b 0.42 1.32 -FEP_3a-1c -1.06 0.83 -FEP_3a-1d -2.48 0.75 -FEP_3a-3b -0.16 0.36 -FEP_3a-5 2.55 0.27 -FEP_3a-6a -2.90 1.04 -FEP_3a-6b -0.59 0.55 -FEP_3b-6e -2.12 0.71 -FEP_3b-7a 2.07 0.78 -FEP_3b-1a -0.05 1.08 -FEP_3b-1b 0.10 0.86 -FEP_3b-1c -3.84 1.10 -FEP_3b-1d -3.64 0.67 -FEP_3b-3a -0.46 0.34 -FEP_3b-5 4.82 0.51 -FEP_3b-6a -2.40 1.20 -FEP_3b-6b 0.59 1.00 -FEP_5-6e -4.29 0.82 -FEP_5-7a -1.20 0.80 -FEP_5-1a -2.45 0.39 -FEP_5-1b -4.33 0.25 -FEP_5-1c -6.01 0.78 -FEP_5-1d -6.30 0.86 -FEP_5-3a -1.24 0.79 -FEP_5-3b -2.82 0.59 -FEP_5-6a -4.51 0.61 -FEP_5-6b -3.00 0.68 -FEP_6a-6e -0.74 0.35 -FEP_6a-7a 2.27 1.28 -FEP_6a-1a 1.62 0.49 -FEP_6a-1b 1.09 0.44 -FEP_6a-1c -0.71 0.53 -FEP_6a-1d -1.50 0.99 -FEP_6a-3a 0.75 0.88 -FEP_6a-3b 3.30 0.89 -FEP_6a-5 4.56 0.98 -FEP_6a-6b 1.36 0.36 -FEP_6b-6e -2.87 0.40 -FEP_6b-7a 3.05 0.82 -FEP_6b-1a -0.04 0.92 -FEP_6b-1b -1.36 0.81 -FEP_6b-1c -3.11 nan -FEP_6b-1d nan nan -FEP_6b-3a 0.17 0.56 -FEP_6b-3b 0.14 0.88 -FEP_6b-5 2.54 1.06 -FEP_6b-6a -1.90 0.36 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 6e84b667..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,111 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1a-1b/ 0 -FEP_1a-1c/ 0 -FEP_1a-1d/ 0 -FEP_1a-3a/ 0 -FEP_1a-3b/ 0 -FEP_1a-5/ 0 -FEP_1a-6a/ 0 -FEP_1a-6b/ 0 -FEP_1a-6e/ 0 -FEP_1a-7a/ 0 -FEP_1b-1a/ 0 -FEP_1b-1c/ 0 -FEP_1b-1d/ 0 -FEP_1b-3a/ 0 -FEP_1b-3b/ 0 -FEP_1b-5/ 0 -FEP_1b-6a/ 0 -FEP_1b-6b/ 0 -FEP_1b-6e/ 0 -FEP_1b-7a/ 0 -FEP_1c-1a/ 0 -FEP_1c-1b/ 0 -FEP_1c-1d/ 0 -FEP_1c-3a/ 0 -FEP_1c-3b/ 0 -FEP_1c-5/ 0 -FEP_1c-6a/ 0 -FEP_1c-6b/ 0 -FEP_1c-6e/ 0 -FEP_1c-7a/ 0 -FEP_1d-1a/ 0 -FEP_1d-1b/ 0 -FEP_1d-1c/ 0 -FEP_1d-3a/ 0 -FEP_1d-3b/ 0 -FEP_1d-5/ 0 -FEP_1d-6a/ 0 -FEP_1d-6b/ 0 -FEP_1d-6e/ 0 -FEP_1d-7a/ 0 -FEP_3a-1a/ 0 -FEP_3a-1b/ 1 -FEP_3a-1c/ 0 -FEP_3a-1d/ 0 -FEP_3a-3b/ 0 -FEP_3a-5/ 0 -FEP_3a-6a/ 0 -FEP_3a-6b/ 0 -FEP_3a-6e/ 0 -FEP_3a-7a/ 0 -FEP_3b-1a/ 0 -FEP_3b-1b/ 0 -FEP_3b-1c/ 0 -FEP_3b-1d/ 0 -FEP_3b-3a/ 0 -FEP_3b-5/ 0 -FEP_3b-6a/ 0 -FEP_3b-6b/ 0 -FEP_3b-6e/ 0 -FEP_3b-7a/ 0 -FEP_5-1a/ 0 -FEP_5-1b/ 0 -FEP_5-1c/ 0 -FEP_5-1d/ 0 -FEP_5-3a/ 0 -FEP_5-3b/ 1 -FEP_5-6a/ 0 -FEP_5-6b/ 0 -FEP_5-6e/ 0 -FEP_5-7a/ 0 -FEP_6a-1a/ 0 -FEP_6a-1b/ 0 -FEP_6a-1c/ 0 -FEP_6a-1d/ 0 -FEP_6a-3a/ 0 -FEP_6a-3b/ 0 -FEP_6a-5/ 0 -FEP_6a-6b/ 0 -FEP_6a-6e/ 0 -FEP_6a-7a/ 0 -FEP_6b-1a/ 0 -FEP_6b-1b/ 0 -FEP_6b-1c/ 0 -FEP_6b-1d/ 0 -FEP_6b-3a/ 0 -FEP_6b-3b/ 0 -FEP_6b-5/ 0 -FEP_6b-6a/ 0 -FEP_6b-6e/ 0 -FEP_6b-7a/ 0 -FEP_6e-1a/ 0 -FEP_6e-1b/ 0 -FEP_6e-1c/ 0 -FEP_6e-1d/ 0 -FEP_6e-3a/ 0 -FEP_6e-3b/ 0 -FEP_6e-5/ 0 -FEP_6e-6a/ 0 -FEP_6e-6b/ 0 -FEP_6e-7a/ 0 -FEP_7a-1a/ 0 -FEP_7a-1b/ 0 -FEP_7a-1c/ 0 -FEP_7a-1d/ 0 -FEP_7a-3a/ 0 -FEP_7a-3b/ 0 -FEP_7a-5/ 0 -FEP_7a-6a/ 0 -FEP_7a-6b/ 0 -FEP_7a-6e/ 0 \ No newline at end of file diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index a8b69a97..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,111 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_6e-7a 1.51 0.34 -FEP_6e-1a 1.36 0.28 -FEP_6e-1b 1.96 0.20 -FEP_6e-1c 2.10 0.25 -FEP_6e-1d 2.74 0.15 -FEP_6e-3a 1.77 0.25 -FEP_6e-3b 0.62 0.22 -FEP_6e-5 3.56 0.21 -FEP_6e-6a 0.84 0.16 -FEP_6e-6b 2.01 0.15 -FEP_7a-6e -2.16 0.32 -FEP_7a-1a -0.29 0.29 -FEP_7a-1b 0.73 0.31 -FEP_7a-1c 0.04 0.42 -FEP_7a-1d 0.83 0.26 -FEP_7a-3a -0.09 0.10 -FEP_7a-3b -0.27 0.10 -FEP_7a-5 2.37 0.23 -FEP_7a-6a -0.15 0.18 -FEP_7a-6b 0.46 0.20 -FEP_1a-6e -1.97 0.18 -FEP_1a-7a -0.05 0.14 -FEP_1a-1b 0.10 0.15 -FEP_1a-1c -0.28 0.08 -FEP_1a-1d 0.56 0.13 -FEP_1a-3a -0.12 0.16 -FEP_1a-3b -0.49 0.13 -FEP_1a-5 2.36 0.18 -FEP_1a-6a -0.60 0.14 -FEP_1a-6b 0.47 0.14 -FEP_1b-6e -1.73 0.12 -FEP_1b-7a 0.26 0.66 -FEP_1b-1a -0.39 0.16 -FEP_1b-1c -0.13 0.10 -FEP_1b-1d 0.33 0.14 -FEP_1b-3a -0.09 0.22 -FEP_1b-3b -1.43 0.25 -FEP_1b-5 1.92 0.15 -FEP_1b-6a -1.13 0.17 -FEP_1b-6b -0.02 0.13 -FEP_1c-6e -1.81 0.14 -FEP_1c-7a -0.32 0.15 -FEP_1c-1a 0.14 0.10 -FEP_1c-1b 0.55 0.16 -FEP_1c-1d 0.84 0.16 -FEP_1c-3a -0.04 0.15 -FEP_1c-3b -0.87 0.21 -FEP_1c-5 2.52 0.12 -FEP_1c-6a -0.44 0.15 -FEP_1c-6b 0.38 0.28 -FEP_1d-6e -2.83 0.27 -FEP_1d-7a -1.64 0.29 -FEP_1d-1a -0.87 0.19 -FEP_1d-1b -0.50 0.15 -FEP_1d-1c -1.00 0.19 -FEP_1d-3a -0.94 0.22 -FEP_1d-3b -1.68 0.17 -FEP_1d-5 1.40 0.42 -FEP_1d-6a -1.79 0.13 -FEP_1d-6b -0.67 0.23 -FEP_3a-6e -1.75 0.21 -FEP_3a-7a 0.12 0.13 -FEP_3a-1a 0.07 0.13 -FEP_3a-1b 0.74 0.26 -FEP_3a-1c -0.01 0.16 -FEP_3a-1d 1.18 0.31 -FEP_3a-3b -0.76 0.10 -FEP_3a-5 2.22 0.17 -FEP_3a-6a -0.70 0.18 -FEP_3a-6b 0.29 0.12 -FEP_3b-6e -1.01 0.16 -FEP_3b-7a 0.45 0.20 -FEP_3b-1a 0.47 0.23 -FEP_3b-1b 1.20 0.20 -FEP_3b-1c 0.43 0.22 -FEP_3b-1d 1.60 0.12 -FEP_3b-3a 0.38 0.15 -FEP_3b-5 2.64 0.41 -FEP_3b-6a 0.21 0.31 -FEP_3b-6b 1.52 0.36 -FEP_5-6e -3.99 0.36 -FEP_5-7a -2.89 0.15 -FEP_5-1a -2.43 0.12 -FEP_5-1b -1.81 0.24 -FEP_5-1c -2.14 0.21 -FEP_5-1d -1.44 0.23 -FEP_5-3a -2.38 0.14 -FEP_5-3b -3.11 0.18 -FEP_5-6a -2.87 0.17 -FEP_5-6b -2.47 0.22 -FEP_6a-6e -0.96 0.14 -FEP_6a-7a 0.76 0.22 -FEP_6a-1a 0.99 0.18 -FEP_6a-1b 1.33 0.13 -FEP_6a-1c 1.01 0.21 -FEP_6a-1d 2.06 0.24 -FEP_6a-3a 0.40 0.19 -FEP_6a-3b 0.15 0.17 -FEP_6a-5 2.41 0.64 -FEP_6a-6b 1.08 0.12 -FEP_6b-6e -2.10 0.10 -FEP_6b-7a -0.58 0.18 -FEP_6b-1a -0.27 0.29 -FEP_6b-1b 0.19 0.10 -FEP_6b-1c -0.41 0.21 -FEP_6b-1d nan nan -FEP_6b-3a -0.78 0.21 -FEP_6b-3b -0.71 0.10 -FEP_6b-5 1.68 0.84 -FEP_6b-6a -1.17 0.18 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index 6ce1a537..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/1fs/lineal/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,111 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1a-1b/ 0 -FEP_1a-1c/ 0 -FEP_1a-1d/ 0 -FEP_1a-3a/ 0 -FEP_1a-3b/ 0 -FEP_1a-5/ 0 -FEP_1a-6a/ 0 -FEP_1a-6b/ 0 -FEP_1a-6e/ 0 -FEP_1a-7a/ 0 -FEP_1b-1a/ 0 -FEP_1b-1c/ 0 -FEP_1b-1d/ 0 -FEP_1b-3a/ 0 -FEP_1b-3b/ 0 -FEP_1b-5/ 0 -FEP_1b-6a/ 0 -FEP_1b-6b/ 0 -FEP_1b-6e/ 0 -FEP_1b-7a/ 0 -FEP_1c-1a/ 0 -FEP_1c-1b/ 0 -FEP_1c-1d/ 0 -FEP_1c-3a/ 0 -FEP_1c-3b/ 0 -FEP_1c-5/ 0 -FEP_1c-6a/ 0 -FEP_1c-6b/ 0 -FEP_1c-6e/ 0 -FEP_1c-7a/ 0 -FEP_1d-1a/ 0 -FEP_1d-1b/ 0 -FEP_1d-1c/ 0 -FEP_1d-3a/ 0 -FEP_1d-3b/ 0 -FEP_1d-5/ 0 -FEP_1d-6a/ 0 -FEP_1d-6b/ 0 -FEP_1d-6e/ 0 -FEP_1d-7a/ 0 -FEP_3a-1a/ 0 -FEP_3a-1b/ 0 -FEP_3a-1c/ 0 -FEP_3a-1d/ 0 -FEP_3a-3b/ 0 -FEP_3a-5/ 0 -FEP_3a-6a/ 0 -FEP_3a-6b/ 0 -FEP_3a-6e/ 0 -FEP_3a-7a/ 0 -FEP_3b-1a/ 0 -FEP_3b-1b/ 0 -FEP_3b-1c/ 0 -FEP_3b-1d/ 0 -FEP_3b-3a/ 0 -FEP_3b-5/ 0 -FEP_3b-6a/ 0 -FEP_3b-6b/ 0 -FEP_3b-6e/ 0 -FEP_3b-7a/ 0 -FEP_5-1a/ 0 -FEP_5-1b/ 0 -FEP_5-1c/ 0 -FEP_5-1d/ 0 -FEP_5-3a/ 0 -FEP_5-3b/ 0 -FEP_5-6a/ 0 -FEP_5-6b/ 0 -FEP_5-6e/ 0 -FEP_5-7a/ 1 -FEP_6a-1a/ 0 -FEP_6a-1b/ 0 -FEP_6a-1c/ 0 -FEP_6a-1d/ 1 -FEP_6a-3a/ 0 -FEP_6a-3b/ 0 -FEP_6a-5/ 0 -FEP_6a-6b/ 0 -FEP_6a-6e/ 0 -FEP_6a-7a/ 0 -FEP_6b-1a/ 0 -FEP_6b-1b/ 0 -FEP_6b-1c/ 0 -FEP_6b-1d/ 0 -FEP_6b-3a/ 0 -FEP_6b-3b/ 0 -FEP_6b-5/ 0 -FEP_6b-6a/ 0 -FEP_6b-6e/ 0 -FEP_6b-7a/ 0 -FEP_6e-1a/ 0 -FEP_6e-1b/ 0 -FEP_6e-1c/ 0 -FEP_6e-1d/ 0 -FEP_6e-3a/ 0 -FEP_6e-3b/ 0 -FEP_6e-5/ 0 -FEP_6e-6a/ 0 -FEP_6e-6b/ 0 -FEP_6e-7a/ 0 -FEP_7a-1a/ 0 -FEP_7a-1b/ 0 -FEP_7a-1c/ 0 -FEP_7a-1d/ 0 -FEP_7a-3a/ 0 -FEP_7a-3b/ 0 -FEP_7a-5/ 0 -FEP_7a-6a/ 0 -FEP_7a-6b/ 0 -FEP_7a-6e/ 0 \ No newline at end of file diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs-sc/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs-sc/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index 1cefbdbf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs-sc/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,111 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_6e-7a 8.66 1.82 -FEP_6e-1a 3.76 0.33 -FEP_6e-1b 1.43 0.38 -FEP_6e-1c 0.07 0.29 -FEP_6e-1d 0.73 0.72 -FEP_6e-3a 3.57 1.06 -FEP_6e-3b 4.74 0.72 -FEP_6e-5 5.22 0.64 -FEP_6e-6a 1.32 0.31 -FEP_6e-6b 2.80 0.50 -FEP_7a-6e -0.65 1.30 -FEP_7a-1a -0.11 0.79 -FEP_7a-1b -1.71 0.82 -FEP_7a-1c -1.80 1.37 -FEP_7a-1d -1.54 1.78 -FEP_7a-3a -1.35 0.34 -FEP_7a-3b -1.42 0.55 -FEP_7a-5 1.16 0.69 -FEP_7a-6a 1.37 1.07 -FEP_7a-6b 0.14 0.68 -FEP_1a-6e -2.00 0.66 -FEP_1a-7a 4.55 1.67 -FEP_1a-1b -1.72 0.46 -FEP_1a-1c -2.21 0.35 -FEP_1a-1d -1.17 0.71 -FEP_1a-3a -0.65 0.23 -FEP_1a-3b 0.03 0.47 -FEP_1a-5 3.70 0.29 -FEP_1a-6a 3.13 1.36 -FEP_1a-6b 2.75 0.95 -FEP_1b-6e -0.41 0.33 -FEP_1b-7a 7.27 1.30 -FEP_1b-1a 2.65 0.20 -FEP_1b-1c -0.02 0.47 -FEP_1b-1d -0.05 0.33 -FEP_1b-3a 2.30 1.35 -FEP_1b-3b 1.98 0.67 -FEP_1b-5 3.76 0.59 -FEP_1b-6a 0.08 0.40 -FEP_1b-6b 1.52 0.35 -FEP_1c-6e 1.82 0.38 -FEP_1c-7a 8.68 1.53 -FEP_1c-1a 4.26 0.26 -FEP_1c-1b 1.85 0.24 -FEP_1c-1d 0.35 0.61 -FEP_1c-3a 3.94 0.67 -FEP_1c-3b 5.18 1.13 -FEP_1c-5 6.69 0.58 -FEP_1c-6a 3.18 0.97 -FEP_1c-6b 5.18 0.99 -FEP_1d-6e 1.73 0.75 -FEP_1d-7a 8.05 1.16 -FEP_1d-1a 3.94 0.77 -FEP_1d-1b 2.24 0.31 -FEP_1d-1c 1.44 0.47 -FEP_1d-3a 3.56 0.74 -FEP_1d-3b 4.40 1.47 -FEP_1d-5 6.16 0.90 -FEP_1d-6a 5.23 1.47 -FEP_1d-6b 5.32 0.68 -FEP_3a-6e 0.86 0.97 -FEP_3a-7a 4.27 0.57 -FEP_3a-1a 1.24 0.54 -FEP_3a-1b 0.70 0.70 -FEP_3a-1c -1.23 0.49 -FEP_3a-1d -1.44 0.78 -FEP_3a-3b -0.60 0.60 -FEP_3a-5 2.59 0.30 -FEP_3a-6a 5.89 1.54 -FEP_3a-6b 0.01 0.39 -FEP_3b-6e -1.19 1.01 -FEP_3b-7a 4.30 0.79 -FEP_3b-1a 3.19 0.37 -FEP_3b-1b 0.88 0.63 -FEP_3b-1c -0.42 0.42 -FEP_3b-1d 0.54 1.08 -FEP_3b-3a 1.62 0.30 -FEP_3b-5 5.07 0.58 -FEP_3b-6a 2.46 1.85 -FEP_3b-6b 1.81 0.66 -FEP_5-6e 1.04 0.98 -FEP_5-7a 3.67 1.35 -FEP_5-1a -1.48 0.49 -FEP_5-1b -1.24 1.28 -FEP_5-1c -2.68 1.09 -FEP_5-1d 3.70 2.04 -FEP_5-3a -0.67 0.53 -FEP_5-3b -1.45 0.70 -FEP_5-6a -0.27 0.92 -FEP_5-6b 1.84 1.15 -FEP_6a-6e -0.94 0.47 -FEP_6a-7a 8.63 1.12 -FEP_6a-1a 2.85 0.57 -FEP_6a-1b 0.95 0.70 -FEP_6a-1c -1.24 0.58 -FEP_6a-1d -0.74 0.62 -FEP_6a-3a 3.31 0.60 -FEP_6a-3b 4.02 0.89 -FEP_6a-5 5.31 1.06 -FEP_6a-6b 1.38 0.51 -FEP_6b-6e -2.72 0.64 -FEP_6b-7a 5.32 0.81 -FEP_6b-1a 1.42 0.84 -FEP_6b-1b -0.62 0.42 -FEP_6b-1c -1.26 0.50 -FEP_6b-1d -1.35 0.71 -FEP_6b-3a 2.36 0.39 -FEP_6b-3b 1.61 0.49 -FEP_6b-5 2.20 1.14 -FEP_6b-6a -1.17 0.22 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs-sc/lineal/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs-sc/lineal/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 2235b14a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs-sc/lineal/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,111 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1a-1b/ 0 -FEP_1a-1c/ 0 -FEP_1a-1d/ 0 -FEP_1a-3a/ 0 -FEP_1a-3b/ 0 -FEP_1a-5/ 0 -FEP_1a-6a/ 0 -FEP_1a-6b/ 0 -FEP_1a-6e/ 0 -FEP_1a-7a/ 0 -FEP_1b-1a/ 0 -FEP_1b-1c/ 0 -FEP_1b-1d/ 0 -FEP_1b-3a/ 0 -FEP_1b-3b/ 0 -FEP_1b-5/ 0 -FEP_1b-6a/ 0 -FEP_1b-6b/ 0 -FEP_1b-6e/ 0 -FEP_1b-7a/ 0 -FEP_1c-1a/ 0 -FEP_1c-1b/ 0 -FEP_1c-1d/ 0 -FEP_1c-3a/ 0 -FEP_1c-3b/ 0 -FEP_1c-5/ 0 -FEP_1c-6a/ 0 -FEP_1c-6b/ 0 -FEP_1c-6e/ 0 -FEP_1c-7a/ 0 -FEP_1d-1a/ 0 -FEP_1d-1b/ 0 -FEP_1d-1c/ 0 -FEP_1d-3a/ 0 -FEP_1d-3b/ 0 -FEP_1d-5/ 0 -FEP_1d-6a/ 0 -FEP_1d-6b/ 0 -FEP_1d-6e/ 0 -FEP_1d-7a/ 0 -FEP_3a-1a/ 0 -FEP_3a-1b/ 0 -FEP_3a-1c/ 0 -FEP_3a-1d/ 0 -FEP_3a-3b/ 0 -FEP_3a-5/ 0 -FEP_3a-6a/ 0 -FEP_3a-6b/ 0 -FEP_3a-6e/ 0 -FEP_3a-7a/ 0 -FEP_3b-1a/ 0 -FEP_3b-1b/ 0 -FEP_3b-1c/ 0 -FEP_3b-1d/ 0 -FEP_3b-3a/ 0 -FEP_3b-5/ 0 -FEP_3b-6a/ 0 -FEP_3b-6b/ 0 -FEP_3b-6e/ 0 -FEP_3b-7a/ 0 -FEP_5-1a/ 0 -FEP_5-1b/ 0 -FEP_5-1c/ 0 -FEP_5-1d/ 0 -FEP_5-3a/ 0 -FEP_5-3b/ 0 -FEP_5-6a/ 0 -FEP_5-6b/ 0 -FEP_5-6e/ 0 -FEP_5-7a/ 0 -FEP_6a-1a/ 0 -FEP_6a-1b/ 0 -FEP_6a-1c/ 0 -FEP_6a-1d/ 0 -FEP_6a-3a/ 0 -FEP_6a-3b/ 0 -FEP_6a-5/ 0 -FEP_6a-6b/ 0 -FEP_6a-6e/ 0 -FEP_6a-7a/ 0 -FEP_6b-1a/ 0 -FEP_6b-1b/ 0 -FEP_6b-1c/ 0 -FEP_6b-1d/ 0 -FEP_6b-3a/ 0 -FEP_6b-3b/ 0 -FEP_6b-5/ 0 -FEP_6b-6a/ 0 -FEP_6b-6e/ 0 -FEP_6b-7a/ 0 -FEP_6e-1a/ 0 -FEP_6e-1b/ 0 -FEP_6e-1c/ 0 -FEP_6e-1d/ 0 -FEP_6e-3a/ 0 -FEP_6e-3b/ 0 -FEP_6e-5/ 0 -FEP_6e-6a/ 0 -FEP_6e-6b/ 0 -FEP_6e-7a/ 0 -FEP_7a-1a/ 0 -FEP_7a-1b/ 0 -FEP_7a-1c/ 0 -FEP_7a-1d/ 0 -FEP_7a-3a/ 0 -FEP_7a-3b/ 0 -FEP_7a-5/ 0 -FEP_7a-6a/ 0 -FEP_7a-6b/ 0 -FEP_7a-6e/ 0 \ No newline at end of file diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs-sc/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs-sc/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index bc1eabc3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs-sc/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,111 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_6e-7a 2.98 0.72 -FEP_6e-1a 1.78 0.19 -FEP_6e-1b 1.96 0.18 -FEP_6e-1c 1.97 0.11 -FEP_6e-1d 3.11 0.21 -FEP_6e-3a 1.65 0.24 -FEP_6e-3b 0.96 0.44 -FEP_6e-5 3.51 0.09 -FEP_6e-6a 1.13 0.11 -FEP_6e-6b 2.45 0.14 -FEP_7a-6e -1.58 0.39 -FEP_7a-1a -0.17 0.23 -FEP_7a-1b -0.06 0.32 -FEP_7a-1c -0.09 0.28 -FEP_7a-1d 1.26 0.30 -FEP_7a-3a -0.29 0.16 -FEP_7a-3b -0.63 0.14 -FEP_7a-5 2.13 0.11 -FEP_7a-6a -0.54 0.14 -FEP_7a-6b 0.30 0.15 -FEP_1a-6e -1.45 0.16 -FEP_1a-7a 1.02 0.32 -FEP_1a-1b 0.17 0.17 -FEP_1a-1c 0.23 0.24 -FEP_1a-1d 1.07 0.34 -FEP_1a-3a -0.16 0.11 -FEP_1a-3b -0.46 0.23 -FEP_1a-5 2.47 0.34 -FEP_1a-6a -0.01 0.27 -FEP_1a-6b 0.68 0.20 -FEP_1b-6e -1.68 0.28 -FEP_1b-7a -0.09 0.45 -FEP_1b-1a 0.37 0.37 -FEP_1b-1c -0.06 0.20 -FEP_1b-1d 0.80 0.26 -FEP_1b-3a 0.03 0.32 -FEP_1b-3b -0.81 0.16 -FEP_1b-5 2.17 0.26 -FEP_1b-6a -0.10 0.30 -FEP_1b-6b 0.34 0.32 -FEP_1c-6e -1.53 0.24 -FEP_1c-7a 0.18 0.39 -FEP_1c-1a 0.12 0.15 -FEP_1c-1b 0.32 0.13 -FEP_1c-1d 0.88 0.15 -FEP_1c-3a -0.67 0.24 -FEP_1c-3b -0.17 0.17 -FEP_1c-5 2.46 0.18 -FEP_1c-6a -0.48 0.32 -FEP_1c-6b 1.53 0.36 -FEP_1d-6e -2.30 0.22 -FEP_1d-7a -0.97 0.29 -FEP_1d-1a -0.97 0.17 -FEP_1d-1b -0.76 0.18 -FEP_1d-1c -1.21 0.13 -FEP_1d-3a -1.01 0.17 -FEP_1d-3b -1.81 0.21 -FEP_1d-5 0.39 0.77 -FEP_1d-6a -1.24 0.27 -FEP_1d-6b 0.10 0.27 -FEP_3a-6e -0.57 0.15 -FEP_3a-7a 0.69 0.48 -FEP_3a-1a 0.02 0.13 -FEP_3a-1b 0.90 0.24 -FEP_3a-1c 0.71 0.23 -FEP_3a-1d 1.62 0.15 -FEP_3a-3b -0.42 0.17 -FEP_3a-5 2.25 0.16 -FEP_3a-6a 0.86 0.40 -FEP_3a-6b 1.17 0.20 -FEP_3b-6e -0.71 0.15 -FEP_3b-7a 1.89 0.48 -FEP_3b-1a 0.13 0.39 -FEP_3b-1b 1.07 0.18 -FEP_3b-1c 0.72 0.13 -FEP_3b-1d 2.34 0.26 -FEP_3b-3a 0.76 0.14 -FEP_3b-5 2.90 0.17 -FEP_3b-6a 1.81 0.66 -FEP_3b-6b 1.75 0.30 -FEP_5-6e -3.40 0.25 -FEP_5-7a -1.20 0.22 -FEP_5-1a -2.44 0.14 -FEP_5-1b -2.35 0.17 -FEP_5-1c -2.59 0.26 -FEP_5-1d -1.45 0.23 -FEP_5-3a -2.60 0.11 -FEP_5-3b -2.50 0.33 -FEP_5-6a -1.71 0.18 -FEP_5-6b -0.69 0.45 -FEP_6a-6e -1.24 0.08 -FEP_6a-7a 0.90 0.29 -FEP_6a-1a 0.32 0.29 -FEP_6a-1b 0.91 0.16 -FEP_6a-1c 0.67 0.18 -FEP_6a-1d 1.68 0.12 -FEP_6a-3a 0.68 0.24 -FEP_6a-3b -0.02 0.31 -FEP_6a-5 2.41 0.39 -FEP_6a-6b 1.32 0.18 -FEP_6b-6e -2.30 0.25 -FEP_6b-7a -0.16 0.39 -FEP_6b-1a -0.43 0.17 -FEP_6b-1b -0.38 0.20 -FEP_6b-1c -0.73 0.38 -FEP_6b-1d 0.70 0.23 -FEP_6b-3a -0.90 0.29 -FEP_6b-3b -1.60 0.16 -FEP_6b-5 1.42 0.52 -FEP_6b-6a -1.71 0.17 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs-sc/lineal/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs-sc/lineal/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index ce731bd9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs-sc/lineal/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,111 +0,0 @@ -perturbation crashed replicates -FEP_1a-1b/ 0 -FEP_1a-1c/ 0 -FEP_1a-1d/ 0 -FEP_1a-3a/ 0 -FEP_1a-3b/ 0 -FEP_1a-5/ 0 -FEP_1a-6a/ 0 -FEP_1a-6b/ 0 -FEP_1a-6e/ 0 -FEP_1a-7a/ 0 -FEP_1b-1a/ 0 -FEP_1b-1c/ 0 -FEP_1b-1d/ 0 -FEP_1b-3a/ 0 -FEP_1b-3b/ 0 -FEP_1b-5/ 0 -FEP_1b-6a/ 0 -FEP_1b-6b/ 0 -FEP_1b-6e/ 0 -FEP_1b-7a/ 0 -FEP_1c-1a/ 0 -FEP_1c-1b/ 0 -FEP_1c-1d/ 0 -FEP_1c-3a/ 0 -FEP_1c-3b/ 0 -FEP_1c-5/ 0 -FEP_1c-6a/ 0 -FEP_1c-6b/ 0 -FEP_1c-6e/ 0 -FEP_1c-7a/ 0 -FEP_1d-1a/ 0 -FEP_1d-1b/ 0 -FEP_1d-1c/ 0 -FEP_1d-3a/ 0 -FEP_1d-3b/ 0 -FEP_1d-5/ 0 -FEP_1d-6a/ 0 -FEP_1d-6b/ 0 -FEP_1d-6e/ 0 -FEP_1d-7a/ 0 -FEP_3a-1a/ 0 -FEP_3a-1b/ 0 -FEP_3a-1c/ 0 -FEP_3a-1d/ 0 -FEP_3a-3b/ 0 -FEP_3a-5/ 0 -FEP_3a-6a/ 0 -FEP_3a-6b/ 0 -FEP_3a-6e/ 0 -FEP_3a-7a/ 0 -FEP_3b-1a/ 0 -FEP_3b-1b/ 0 -FEP_3b-1c/ 0 -FEP_3b-1d/ 0 -FEP_3b-3a/ 0 -FEP_3b-5/ 0 -FEP_3b-6a/ 0 -FEP_3b-6b/ 0 -FEP_3b-6e/ 0 -FEP_3b-7a/ 0 -FEP_5-1a/ 0 -FEP_5-1b/ 0 -FEP_5-1c/ 0 -FEP_5-1d/ 0 -FEP_5-3a/ 0 -FEP_5-3b/ 0 -FEP_5-6a/ 0 -FEP_5-6b/ 0 -FEP_5-6e/ 0 -FEP_5-7a/ 0 -FEP_6a-1a/ 0 -FEP_6a-1b/ 0 -FEP_6a-1c/ 0 -FEP_6a-1d/ 0 -FEP_6a-3a/ 0 -FEP_6a-3b/ 0 -FEP_6a-5/ 0 -FEP_6a-6b/ 0 -FEP_6a-6e/ 0 -FEP_6a-7a/ 0 -FEP_6b-1a/ 0 -FEP_6b-1b/ 0 -FEP_6b-1c/ 0 -FEP_6b-1d/ 0 -FEP_6b-3a/ 0 -FEP_6b-3b/ 0 -FEP_6b-5/ 0 -FEP_6b-6a/ 0 -FEP_6b-6e/ 0 -FEP_6b-7a/ 0 -FEP_6e-1a/ 0 -FEP_6e-1b/ 0 -FEP_6e-1c/ 0 -FEP_6e-1d/ 0 -FEP_6e-3a/ 0 -FEP_6e-3b/ 0 -FEP_6e-5/ 0 -FEP_6e-6a/ 0 -FEP_6e-6b/ 0 -FEP_6e-7a/ 0 -FEP_7a-1a/ 0 -FEP_7a-1b/ 0 -FEP_7a-1c/ 0 -FEP_7a-1d/ 0 -FEP_7a-3a/ 0 -FEP_7a-3b/ 0 -FEP_7a-5/ 0 -FEP_7a-6a/ 0 -FEP_7a-6b/ 0 -FEP_7a-6e/ 0 \ No newline at end of file diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/protein.txt deleted file mode 100755 index 8da1ac26..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1b-7a 3.31 0.51 3 -FEP_1b-1c -1.60 0.11 2 -FEP_1d-1c 0.33 0.28 2 -FEP_1a-3b -2.05 0.45 0 -FEP_1d-6e 1.20 0.31 0 -FEP_1a-5 2.27 0.18 1 -FEP_1b-3b 0.37 0.45 3 -FEP_6a-1b 0.16 0.24 4 -FEP_6a-6b 1.80 0.21 1 -FEP_1d-5 5.88 0.61 0 -FEP_6e-6b 2.50 0.32 2 -FEP_3a-1d -2.62 0.55 1 -FEP_3a-1b -0.95 0.28 3 -FEP_1d-1a 3.66 0.29 3 -FEP_1d-7a 4.54 0.51 2 -FEP_1b-1a 1.93 0.19 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/water.txt deleted file mode 100755 index 7440186c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/water.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1b-7a 0.21 0.24 2 -FEP_1b-1c -0.24 0.11 1 -FEP_1d-1c -1.40 0.12 1 -FEP_1a-3b -0.29 0.14 1 -FEP_1d-6e -2.70 0.15 1 -FEP_1a-5 2.31 0.09 0 -FEP_1b-3b -1.00 0.15 1 -FEP_6a-1b 1.12 0.07 0 -FEP_6a-6b 1.13 0.12 0 -FEP_1d-5 1.07 0.22 3 -FEP_6e-6b 2.27 0.09 0 -FEP_3a-1d 1.46 0.24 0 -FEP_3a-1b 0.59 0.25 0 -FEP_1d-1a -0.78 0.09 0 -FEP_1d-7a -1.26 0.29 1 -FEP_1b-1a -0.29 0.08 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt deleted file mode 100755 index b67a3f52..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1b-7a 3.08 1.00 1 -FEP_1b-1c -1.35 0.16 0 -FEP_1d-1c 0.12 0.24 0 -FEP_1a-3b -1.83 0.50 0 -FEP_1d-6e 1.03 0.18 2 -FEP_1a-5 2.11 0.15 0 -FEP_1b-3b -1.11 0.38 0 -FEP_6a-1b 0.85 0.42 1 -FEP_6a-6b 2.36 0.36 1 -FEP_1d-5 5.39 0.78 1 -FEP_6e-6b 2.12 0.18 0 -FEP_3a-1d -2.24 0.21 1 -FEP_3a-1b -0.23 0.29 0 -FEP_1d-1a 4.58 0.24 1 -FEP_1d-7a 4.05 0.78 1 -FEP_1b-1a 1.88 0.26 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt deleted file mode 100755 index 38569cdb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1b-7a 0.25 0.18 2 -FEP_1b-1c -0.42 0.07 1 -FEP_1d-1c -0.85 0.07 1 -FEP_1a-3b -0.28 0.07 0 -FEP_1d-6e -2.64 0.12 0 -FEP_1a-5 2.35 0.07 0 -FEP_1b-3b -1.08 0.23 2 -FEP_6a-1b 0.84 0.16 1 -FEP_6a-6b 0.95 0.12 0 -FEP_1d-5 1.02 0.15 1 -FEP_6e-6b 2.36 0.09 0 -FEP_3a-1d 1.17 0.11 2 -FEP_3a-1b 0.25 0.14 0 -FEP_1d-1a -0.86 0.12 0 -FEP_1d-7a -1.08 0.27 0 -FEP_1b-1a -0.10 0.14 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/protein.txt deleted file mode 100755 index 8a0750aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_6b-3a 0.03 0.34 0 -FEP_6b-1c -2.64 0.25 0 -FEP_6e-1c 0.05 0.24 0 -FEP_6a-1c 0.41 0.21 0 -FEP_7a-6b -1.74 0.61 0 -FEP_1c-1a 4.68 0.25 0 -FEP_6e-1b 1.58 0.35 0 -FEP_7a-1a 0.91 0.49 0 -FEP_6a-1d -1.04 0.27 0 -FEP_1c-1b 1.89 0.20 0 -FEP_7a-6e -5.01 0.80 0 -FEP_3a-1c -2.42 0.38 0 -FEP_3b-1d -2.96 0.50 0 -FEP_6a-3a 3.62 0.53 0 -FEP_5-1d -7.30 0.50 0 -FEP_6b-1a 1.74 0.28 0 -FEP_7a-5 1.84 0.47 0 -FEP_5-1a -2.46 0.19 0 -FEP_1d-1c 1.34 0.26 0 -FEP_6e-6a 0.22 0.19 0 -FEP_7a-1d -4.39 0.34 0 -FEP_6a-1b 1.98 0.30 0 -FEP_6b-6a -2.53 0.21 0 -FEP_5-3b -5.08 0.26 0 -FEP_3b-1b -0.16 0.44 0 -FEP_6a-1a 4.42 0.41 0 -FEP_3b-3a 1.73 0.22 0 -FEP_6e-3a 2.12 0.24 0 -FEP_6e-6b 2.22 0.13 0 -FEP_3a-1d -3.68 0.40 0 -FEP_7a-6a -4.35 0.88 1 -FEP_6a-3b 1.01 0.44 0 -FEP_6b-5 3.25 0.78 0 -FEP_3a-1b -1.58 0.49 0 -FEP_7a-3b -2.23 0.36 0 -FEP_1d-1b 2.60 0.22 0 -FEP_1d-1a 5.77 0.30 0 -FEP_7a-1b -2.82 0.72 0 -FEP_6b-1b -0.75 0.29 0 -FEP_6e-5 6.77 0.35 0 -FEP_5-1c -5.85 0.56 1 -FEP_6e-3b 1.35 0.41 0 -FEP_3b-1c -1.30 0.41 0 -FEP_3a-1a 1.68 0.44 0 -FEP_6e-1a 3.76 0.33 0 -FEP_6a-5 7.07 0.73 1 -FEP_3b-1a 2.58 0.52 0 -FEP_5-1b -4.23 0.45 0 -FEP_6b-3b -1.16 0.53 0 -FEP_1b-1a 2.78 0.26 0 -FEP_7a-3a -1.80 0.87 0 -FEP_6e-1d -1.08 0.54 0 -FEP_6b-1d -3.81 0.12 0 -FEP_7a-1c -3.76 0.52 0 -FEP_5-3a -3.22 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/1fs/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/1fs/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index f9f48028..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/1fs/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_6b-3a -0.42 0.72 0 -FEP_6b-1c -3.78 0.86 0 -FEP_6e-1c -1.28 0.66 0 -FEP_6a-1c -0.10 0.48 0 -FEP_7a-6b -0.95 0.61 0 -FEP_1c-1a 3.77 0.65 0 -FEP_6e-1b 1.18 0.37 0 -FEP_7a-1a -0.77 0.93 1 -FEP_6a-1d -2.05 1.15 1 -FEP_1c-1b 1.92 0.32 0 -FEP_7a-6e -3.77 1.48 5 -FEP_3a-1c -1.66 1.38 0 -FEP_3b-1d -3.09 1.17 0 -FEP_6a-3a 3.93 1.06 1 -FEP_5-1d -6.50 0.82 0 -FEP_6b-1a 2.11 0.76 0 -FEP_7a-5 2.34 0.36 3 -FEP_5-1a -2.46 0.36 0 -FEP_1d-1c 0.81 0.49 0 -FEP_6e-6a -0.26 0.34 0 -FEP_7a-1d -8.24 1.06 4 -FEP_6a-1b 1.43 0.27 0 -FEP_6b-6a -3.53 0.76 0 -FEP_5-3b -2.77 0.90 2 -FEP_3b-1b -0.30 0.98 0 -FEP_6a-1a 4.96 0.44 1 -FEP_3b-3a 0.61 0.37 0 -FEP_6e-3a 1.66 1.26 3 -FEP_6e-6b 3.11 0.38 0 -FEP_3a-1d -2.90 0.87 1 -FEP_7a-6a -1.53 0.73 4 -FEP_6a-3b -0.08 1.20 1 -FEP_6b-5 2.41 0.98 5 -FEP_3a-1b 0.82 0.45 1 -FEP_7a-3b -1.62 0.28 0 -FEP_1d-1b 1.76 0.34 0 -FEP_1d-1a 5.62 0.45 0 -FEP_7a-1b -2.80 0.54 3 -FEP_6b-1b -1.40 0.32 0 -FEP_6e-5 5.40 0.74 0 -FEP_5-1c -6.35 1.07 1 -FEP_6e-3b 2.56 0.97 1 -FEP_3b-1c -2.80 0.78 3 -FEP_3a-1a 2.65 0.46 0 -FEP_6e-1a 4.20 0.36 0 -FEP_6a-5 7.08 0.67 4 -FEP_3b-1a 2.68 0.76 0 -FEP_5-1b -5.23 0.55 2 -FEP_6b-3b -0.34 0.55 0 -FEP_1b-1a 2.67 0.22 0 -FEP_7a-3a -2.03 0.97 0 -FEP_6e-1d -0.59 0.30 0 -FEP_6b-1d -3.96 0.36 1 -FEP_7a-1c -4.07 0.80 2 -FEP_5-3a -3.53 0.39 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/1fs/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/1fs/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index 0a10bff1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/1fs/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_6b-3a 0.21 0.16 0 -FEP_6b-1c -0.95 0.20 0 -FEP_6e-1c 1.48 0.20 0 -FEP_6a-1c 1.18 0.17 0 -FEP_7a-6b -0.22 0.24 0 -FEP_1c-1a 1.40 0.13 0 -FEP_6e-1b 1.63 0.22 0 -FEP_7a-1a -0.34 0.19 0 -FEP_6a-1d 0.80 0.19 0 -FEP_1c-1b 0.86 0.14 0 -FEP_7a-6e -2.93 0.25 0 -FEP_3a-1c -1.02 0.30 0 -FEP_3b-1d -0.58 0.18 0 -FEP_6a-3a 2.12 0.28 0 -FEP_5-1d -2.80 0.46 0 -FEP_6b-1a 0.07 0.16 0 -FEP_7a-5 2.66 0.23 0 -FEP_5-1a -2.17 0.16 0 -FEP_1d-1c 0.05 0.16 1 -FEP_6e-6a 0.40 0.09 0 -FEP_7a-1d -1.43 0.20 0 -FEP_6a-1b 1.68 0.14 0 -FEP_6b-6a -1.73 0.12 0 -FEP_5-3b -2.79 0.22 1 -FEP_3b-1b 0.29 0.25 1 -FEP_6a-1a 2.44 0.23 0 -FEP_3b-3a 0.52 0.08 0 -FEP_6e-3a 2.52 0.14 0 -FEP_6e-6b 2.45 0.19 0 -FEP_3a-1d -0.97 0.17 1 -FEP_7a-6a -2.25 0.15 0 -FEP_6a-3b 1.69 0.17 0 -FEP_6b-5 2.82 0.17 1 -FEP_3a-1b -0.73 0.21 0 -FEP_7a-3b -0.86 0.12 1 -FEP_1d-1b 0.90 0.24 0 -FEP_1d-1a 1.28 0.21 0 -FEP_7a-1b -0.71 0.21 0 -FEP_6b-1b -0.08 0.08 0 -FEP_6e-5 4.79 0.25 0 -FEP_5-1c -3.84 0.16 0 -FEP_6e-3b 1.69 0.23 1 -FEP_3b-1c -0.48 0.31 0 -FEP_3a-1a -0.04 0.21 0 -FEP_6e-1a 2.57 0.24 0 -FEP_6a-5 4.13 0.33 0 -FEP_3b-1a 0.33 0.28 0 -FEP_5-1b -2.60 0.21 1 -FEP_6b-3b -0.80 0.26 0 -FEP_1b-1a 0.50 0.15 1 -FEP_7a-3a -0.69 0.34 1 -FEP_6e-1d 1.63 0.24 0 -FEP_6b-1d -0.89 0.19 0 -FEP_7a-1c -0.94 0.24 0 -FEP_5-3a -2.16 0.33 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index 8a0750aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_6b-3a 0.03 0.34 0 -FEP_6b-1c -2.64 0.25 0 -FEP_6e-1c 0.05 0.24 0 -FEP_6a-1c 0.41 0.21 0 -FEP_7a-6b -1.74 0.61 0 -FEP_1c-1a 4.68 0.25 0 -FEP_6e-1b 1.58 0.35 0 -FEP_7a-1a 0.91 0.49 0 -FEP_6a-1d -1.04 0.27 0 -FEP_1c-1b 1.89 0.20 0 -FEP_7a-6e -5.01 0.80 0 -FEP_3a-1c -2.42 0.38 0 -FEP_3b-1d -2.96 0.50 0 -FEP_6a-3a 3.62 0.53 0 -FEP_5-1d -7.30 0.50 0 -FEP_6b-1a 1.74 0.28 0 -FEP_7a-5 1.84 0.47 0 -FEP_5-1a -2.46 0.19 0 -FEP_1d-1c 1.34 0.26 0 -FEP_6e-6a 0.22 0.19 0 -FEP_7a-1d -4.39 0.34 0 -FEP_6a-1b 1.98 0.30 0 -FEP_6b-6a -2.53 0.21 0 -FEP_5-3b -5.08 0.26 0 -FEP_3b-1b -0.16 0.44 0 -FEP_6a-1a 4.42 0.41 0 -FEP_3b-3a 1.73 0.22 0 -FEP_6e-3a 2.12 0.24 0 -FEP_6e-6b 2.22 0.13 0 -FEP_3a-1d -3.68 0.40 0 -FEP_7a-6a -4.35 0.88 1 -FEP_6a-3b 1.01 0.44 0 -FEP_6b-5 3.25 0.78 0 -FEP_3a-1b -1.58 0.49 0 -FEP_7a-3b -2.23 0.36 0 -FEP_1d-1b 2.60 0.22 0 -FEP_1d-1a 5.77 0.30 0 -FEP_7a-1b -2.82 0.72 0 -FEP_6b-1b -0.75 0.29 0 -FEP_6e-5 6.77 0.35 0 -FEP_5-1c -5.85 0.56 1 -FEP_6e-3b 1.35 0.41 0 -FEP_3b-1c -1.30 0.41 0 -FEP_3a-1a 1.68 0.44 0 -FEP_6e-1a 3.76 0.33 0 -FEP_6a-5 7.07 0.73 1 -FEP_3b-1a 2.58 0.52 0 -FEP_5-1b -4.23 0.45 0 -FEP_6b-3b -1.16 0.53 0 -FEP_1b-1a 2.78 0.26 0 -FEP_7a-3a -1.80 0.87 0 -FEP_6e-1d -1.08 0.54 0 -FEP_6b-1d -3.81 0.12 0 -FEP_7a-1c -3.76 0.52 0 -FEP_5-3a -3.22 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/lineal/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/lineal/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index ce03902a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/lineal/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -perturbation failed replicates -FEP_1b-1a/ 0 -FEP_1c-1a/ 0 -FEP_1c-1b/ 0 -FEP_1d-1a/ 0 -FEP_1d-1b/ 0 -FEP_1d-1c/ 0 -FEP_3a-1a/ 0 -FEP_3a-1b/ 0 -FEP_3a-1c/ 0 -FEP_3a-1d/ 0 -FEP_3b-1a/ 0 -FEP_3b-1b/ 0 -FEP_3b-1c/ 0 -FEP_3b-1d/ 0 -FEP_3b-3a/ 0 -FEP_5-1a/ 0 -FEP_5-1b/ 0 -FEP_5-1c/ 0 -FEP_5-1d/ 0 -FEP_5-3a/ 0 -FEP_5-3b/ 0 -FEP_6a-1a/ 0 -FEP_6a-1b/ 0 -FEP_6a-1c/ 0 -FEP_6a-1d/ 0 -FEP_6a-3a/ 0 -FEP_6a-3b/ 0 -FEP_6a-5/ 0 -FEP_6b-1a/ 0 -FEP_6b-1b/ 0 -FEP_6b-1c/ 0 -FEP_6b-1d/ 0 -FEP_6b-3a/ 0 -FEP_6b-3b/ 0 -FEP_6b-5/ 0 -FEP_6b-6a/ 0 -FEP_6e-1a/ 0 -FEP_6e-1b/ 0 -FEP_6e-1c/ 0 -FEP_6e-1d/ 0 -FEP_6e-3a/ 0 -FEP_6e-3b/ 0 -FEP_6e-5/ 0 -FEP_6e-6a/ 0 -FEP_6e-6b/ 0 -FEP_7a-1a/ 0 -FEP_7a-1b/ 0 -FEP_7a-1c/ 0 -FEP_7a-1d/ 0 -FEP_7a-3a/ 0 -FEP_7a-3b/ 0 -FEP_7a-5/ 0 -FEP_7a-6a/ 0 -FEP_7a-6b/ 0 -FEP_7a-6e/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index 328aa697..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_6b-3a 0.29 0.11 0 -FEP_6b-1c -0.95 0.23 0 -FEP_6e-1c 1.66 0.12 0 -FEP_6a-1c 0.89 0.17 0 -FEP_7a-6b -0.21 0.15 0 -FEP_1c-1a 1.22 0.11 0 -FEP_6e-1b 1.84 0.13 0 -FEP_7a-1a -0.49 0.20 0 -FEP_6a-1d 1.15 0.12 0 -FEP_1c-1b 0.33 0.08 0 -FEP_7a-6e -3.01 0.12 0 -FEP_3a-1c -1.09 0.08 0 -FEP_3b-1d -0.35 0.11 0 -FEP_6a-3a 1.85 0.14 0 -FEP_5-1d -3.33 0.18 0 -FEP_6b-1a 0.12 0.16 0 -FEP_7a-5 1.87 0.17 0 -FEP_5-1a -2.37 0.13 0 -FEP_1d-1c 0.05 0.10 0 -FEP_6e-6a 0.53 0.07 0 -FEP_7a-1d -0.90 0.22 0 -FEP_6a-1b 1.72 0.10 0 -FEP_6b-6a -1.92 0.08 0 -FEP_5-3b -2.48 0.15 0 -FEP_3b-1b 0.08 0.12 0 -FEP_6a-1a 1.86 0.17 0 -FEP_3b-3a 0.50 0.10 0 -FEP_6e-3a 2.15 0.13 0 -FEP_6e-6b 2.40 0.12 0 -FEP_3a-1d -0.57 0.22 0 -FEP_7a-6a -1.99 0.20 0 -FEP_6a-3b 1.60 0.19 0 -FEP_6b-5 2.46 0.20 0 -FEP_3a-1b -0.42 0.20 0 -FEP_7a-3b -0.73 0.16 0 -FEP_1d-1b 0.43 0.12 0 -FEP_1d-1a 1.42 0.11 0 -FEP_7a-1b -0.65 0.23 0 -FEP_6b-1b -0.18 0.19 0 -FEP_6e-5 4.86 0.15 0 -FEP_5-1c -3.37 0.08 0 -FEP_6e-3b 1.61 0.15 0 -FEP_3b-1c -0.48 0.17 0 -FEP_3a-1a 0.07 0.09 0 -FEP_6e-1a 2.51 0.24 0 -FEP_6a-5 4.25 0.18 0 -FEP_3b-1a 0.31 0.12 0 -FEP_5-1b -2.63 0.17 0 -FEP_6b-3b -0.60 0.12 0 -FEP_1b-1a 0.59 0.08 0 -FEP_7a-3a -0.53 0.19 0 -FEP_6e-1d 1.77 0.14 0 -FEP_6b-1d -0.86 0.11 0 -FEP_7a-1c -1.45 0.14 0 -FEP_5-3a -2.25 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/lineal/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/lineal/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index ce03902a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/lineal/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -perturbation failed replicates -FEP_1b-1a/ 0 -FEP_1c-1a/ 0 -FEP_1c-1b/ 0 -FEP_1d-1a/ 0 -FEP_1d-1b/ 0 -FEP_1d-1c/ 0 -FEP_3a-1a/ 0 -FEP_3a-1b/ 0 -FEP_3a-1c/ 0 -FEP_3a-1d/ 0 -FEP_3b-1a/ 0 -FEP_3b-1b/ 0 -FEP_3b-1c/ 0 -FEP_3b-1d/ 0 -FEP_3b-3a/ 0 -FEP_5-1a/ 0 -FEP_5-1b/ 0 -FEP_5-1c/ 0 -FEP_5-1d/ 0 -FEP_5-3a/ 0 -FEP_5-3b/ 0 -FEP_6a-1a/ 0 -FEP_6a-1b/ 0 -FEP_6a-1c/ 0 -FEP_6a-1d/ 0 -FEP_6a-3a/ 0 -FEP_6a-3b/ 0 -FEP_6a-5/ 0 -FEP_6b-1a/ 0 -FEP_6b-1b/ 0 -FEP_6b-1c/ 0 -FEP_6b-1d/ 0 -FEP_6b-3a/ 0 -FEP_6b-3b/ 0 -FEP_6b-5/ 0 -FEP_6b-6a/ 0 -FEP_6e-1a/ 0 -FEP_6e-1b/ 0 -FEP_6e-1c/ 0 -FEP_6e-1d/ 0 -FEP_6e-3a/ 0 -FEP_6e-3b/ 0 -FEP_6e-5/ 0 -FEP_6e-6a/ 0 -FEP_6e-6b/ 0 -FEP_7a-1a/ 0 -FEP_7a-1b/ 0 -FEP_7a-1c/ 0 -FEP_7a-1d/ 0 -FEP_7a-3a/ 0 -FEP_7a-3b/ 0 -FEP_7a-5/ 0 -FEP_7a-6a/ 0 -FEP_7a-6b/ 0 -FEP_7a-6e/ 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100755 index 29575c3c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_6b_3a 0.03 0.34 0 -FEP_6b_1c -2.64 0.25 0 -FEP_6e_1c 0.05 0.24 0 -FEP_6a_1c 0.41 0.21 0 -FEP_7a_6b -1.74 0.61 0 -FEP_1c_1a 4.68 0.25 0 -FEP_6e_1b 1.58 0.35 0 -FEP_7a_1a 0.91 0.49 0 -FEP_6a_1d -1.04 0.27 0 -FEP_1c_1b 1.89 0.2 0 -FEP_7a_6e -5.01 0.8 0 -FEP_3a_1c -2.42 0.38 0 -FEP_3b_1d -2.96 0.5 0 -FEP_6a_3a 3.62 0.53 0 -FEP_5_1d -7.3 0.5 0 -FEP_6b_1a 1.74 0.28 0 -FEP_7a_5 1.84 0.47 0 -FEP_5_1a -2.46 0.19 0 -FEP_1d_1c 1.34 0.26 0 -FEP_6e_6a 0.22 0.19 0 -FEP_7a_1d -4.39 0.34 0 -FEP_6a_1b 1.98 0.3 0 -FEP_6b_6a -2.53 0.21 0 -FEP_5_3b -5.08 0.26 0 -FEP_3b_1b -0.16 0.44 0 -FEP_6a_1a 4.42 0.41 0 -FEP_3b_3a 1.73 0.22 0 -FEP_6e_3a 2.12 0.24 0 -FEP_6e_6b 2.22 0.13 0 -FEP_3a_1d -3.68 0.4 0 -FEP_7a_6a -4.35 0.88 1 -FEP_6a_3b 1.01 0.44 0 -FEP_6b_5 3.25 0.78 0 -FEP_3a_1b -1.58 0.49 0 -FEP_7a_3b -2.23 0.36 0 -FEP_1d_1b 2.6 0.22 0 -FEP_1d_1a 5.77 0.3 0 -FEP_7a_1b -2.82 0.72 0 -FEP_6b_1b -0.75 0.29 0 -FEP_6e_5 6.77 0.35 0 -FEP_5_1c -5.85 0.56 1 -FEP_6e_3b 1.35 0.41 0 -FEP_3b_1c -1.3 0.41 0 -FEP_3a_1a 1.68 0.44 0 -FEP_6e_1a 3.76 0.33 0 -FEP_6a_5 7.07 0.73 1 -FEP_3b_1a 2.58 0.52 0 -FEP_5_1b -4.23 0.45 0 -FEP_6b_3b -1.16 0.53 0 -FEP_1b_1a 2.78 0.26 0 -FEP_7a_3a -1.8 0.87 0 -FEP_6e_1d -1.08 0.54 0 -FEP_6b_1d -3.81 0.12 0 -FEP_7a_1c -3.76 0.52 0 -FEP_5_3a -3.22 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/protein.txt deleted file mode 100755 index 16ca09ed..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1b-7a 0.95 nan 9 -FEP_1b-1c -1.70 0.12 4 -FEP_1d-1c 1.27 0.21 6 -FEP_1a-3b -1.59 0.43 1 -FEP_1d-6e 1.38 0.24 6 -FEP_1a-5 2.61 0.18 7 -FEP_1b-3b 1.93 1.17 5 -FEP_6a-1b 1.96 0.08 5 -FEP_6a-6b 2.19 0.23 3 -FEP_1d-5 5.86 0.80 5 -FEP_6e-6b 3.26 0.32 3 -FEP_3a-1d -2.61 0.58 7 -FEP_3a-1b -1.09 0.37 6 -FEP_1d-1a 5.48 0.25 6 -FEP_1d-7a 5.73 0.87 3 -FEP_1b-1a 3.33 0.14 3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/water.txt deleted file mode 100755 index 93723e94..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/water.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1b-7a 0.73 0.21 0 -FEP_1b-1c -0.55 0.11 1 -FEP_1d-1c 0.03 0.14 1 -FEP_1a-3b -0.46 0.11 0 -FEP_1d-6e -1.48 0.17 2 -FEP_1a-5 2.58 0.12 1 -FEP_1b-3b 0.08 0.17 0 -FEP_6a-1b 1.83 0.09 0 -FEP_6a-6b 1.75 0.09 1 -FEP_1d-5 3.49 0.19 0 -FEP_6e-6b 2.33 0.08 1 -FEP_3a-1d -0.62 0.10 1 -FEP_3a-1b -0.44 0.17 0 -FEP_1d-1a 1.47 0.11 0 -FEP_1d-7a 0.90 0.15 2 -FEP_1b-1a 0.60 0.14 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt deleted file mode 100755 index 8a0750aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_6b-3a 0.03 0.34 0 -FEP_6b-1c -2.64 0.25 0 -FEP_6e-1c 0.05 0.24 0 -FEP_6a-1c 0.41 0.21 0 -FEP_7a-6b -1.74 0.61 0 -FEP_1c-1a 4.68 0.25 0 -FEP_6e-1b 1.58 0.35 0 -FEP_7a-1a 0.91 0.49 0 -FEP_6a-1d -1.04 0.27 0 -FEP_1c-1b 1.89 0.20 0 -FEP_7a-6e -5.01 0.80 0 -FEP_3a-1c -2.42 0.38 0 -FEP_3b-1d -2.96 0.50 0 -FEP_6a-3a 3.62 0.53 0 -FEP_5-1d -7.30 0.50 0 -FEP_6b-1a 1.74 0.28 0 -FEP_7a-5 1.84 0.47 0 -FEP_5-1a -2.46 0.19 0 -FEP_1d-1c 1.34 0.26 0 -FEP_6e-6a 0.22 0.19 0 -FEP_7a-1d -4.39 0.34 0 -FEP_6a-1b 1.98 0.30 0 -FEP_6b-6a -2.53 0.21 0 -FEP_5-3b -5.08 0.26 0 -FEP_3b-1b -0.16 0.44 0 -FEP_6a-1a 4.42 0.41 0 -FEP_3b-3a 1.73 0.22 0 -FEP_6e-3a 2.12 0.24 0 -FEP_6e-6b 2.22 0.13 0 -FEP_3a-1d -3.68 0.40 0 -FEP_7a-6a -4.35 0.88 1 -FEP_6a-3b 1.01 0.44 0 -FEP_6b-5 3.25 0.78 0 -FEP_3a-1b -1.58 0.49 0 -FEP_7a-3b -2.23 0.36 0 -FEP_1d-1b 2.60 0.22 0 -FEP_1d-1a 5.77 0.30 0 -FEP_7a-1b -2.82 0.72 0 -FEP_6b-1b -0.75 0.29 0 -FEP_6e-5 6.77 0.35 0 -FEP_5-1c -5.85 0.56 1 -FEP_6e-3b 1.35 0.41 0 -FEP_3b-1c -1.30 0.41 0 -FEP_3a-1a 1.68 0.44 0 -FEP_6e-1a 3.76 0.33 0 -FEP_6a-5 7.07 0.73 1 -FEP_3b-1a 2.58 0.52 0 -FEP_5-1b -4.23 0.45 0 -FEP_6b-3b -1.16 0.53 0 -FEP_1b-1a 2.78 0.26 0 -FEP_7a-3a -1.80 0.87 0 -FEP_6e-1d -1.08 0.54 0 -FEP_6b-1d -3.81 0.12 0 -FEP_7a-1c -3.76 0.52 0 -FEP_5-3a -3.22 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt deleted file mode 100755 index 328aa697..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_6b-3a 0.29 0.11 0 -FEP_6b-1c -0.95 0.23 0 -FEP_6e-1c 1.66 0.12 0 -FEP_6a-1c 0.89 0.17 0 -FEP_7a-6b -0.21 0.15 0 -FEP_1c-1a 1.22 0.11 0 -FEP_6e-1b 1.84 0.13 0 -FEP_7a-1a -0.49 0.20 0 -FEP_6a-1d 1.15 0.12 0 -FEP_1c-1b 0.33 0.08 0 -FEP_7a-6e -3.01 0.12 0 -FEP_3a-1c -1.09 0.08 0 -FEP_3b-1d -0.35 0.11 0 -FEP_6a-3a 1.85 0.14 0 -FEP_5-1d -3.33 0.18 0 -FEP_6b-1a 0.12 0.16 0 -FEP_7a-5 1.87 0.17 0 -FEP_5-1a -2.37 0.13 0 -FEP_1d-1c 0.05 0.10 0 -FEP_6e-6a 0.53 0.07 0 -FEP_7a-1d -0.90 0.22 0 -FEP_6a-1b 1.72 0.10 0 -FEP_6b-6a -1.92 0.08 0 -FEP_5-3b -2.48 0.15 0 -FEP_3b-1b 0.08 0.12 0 -FEP_6a-1a 1.86 0.17 0 -FEP_3b-3a 0.50 0.10 0 -FEP_6e-3a 2.15 0.13 0 -FEP_6e-6b 2.40 0.12 0 -FEP_3a-1d -0.57 0.22 0 -FEP_7a-6a -1.99 0.20 0 -FEP_6a-3b 1.60 0.19 0 -FEP_6b-5 2.46 0.20 0 -FEP_3a-1b -0.42 0.20 0 -FEP_7a-3b -0.73 0.16 0 -FEP_1d-1b 0.43 0.12 0 -FEP_1d-1a 1.42 0.11 0 -FEP_7a-1b -0.65 0.23 0 -FEP_6b-1b -0.18 0.19 0 -FEP_6e-5 4.86 0.15 0 -FEP_5-1c -3.37 0.08 0 -FEP_6e-3b 1.61 0.15 0 -FEP_3b-1c -0.48 0.17 0 -FEP_3a-1a 0.07 0.09 0 -FEP_6e-1a 2.51 0.24 0 -FEP_6a-5 4.25 0.18 0 -FEP_3b-1a 0.31 0.12 0 -FEP_5-1b -2.63 0.17 0 -FEP_6b-3b -0.60 0.12 0 -FEP_1b-1a 0.59 0.08 0 -FEP_7a-3a -0.53 0.19 0 -FEP_6e-1d 1.77 0.14 0 -FEP_6b-1d -0.86 0.11 0 -FEP_7a-1c -1.45 0.14 0 -FEP_5-3a -2.25 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-50w/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-50w/protein.txt deleted file mode 100755 index 6ab87cec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-50w/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1b-7a 2.16 0.93 0 -FEP_1b-1c -1.66 0.21 0 -FEP_1d-1c 0.95 0.17 1 -FEP_1a-3b -4.01 0.44 0 -FEP_1d-6e 0.77 0.27 0 -FEP_1a-5 1.43 0.27 0 -FEP_1b-3b -0.72 0.53 0 -FEP_6a-1b 1.90 0.23 1 -FEP_6a-6b 2.77 0.50 1 -FEP_1d-5 7.13 0.72 2 -FEP_6e-6b 3.42 0.43 0 -FEP_3a-1d -3.29 0.66 1 -FEP_3a-1b 0.30 0.55 0 -FEP_1d-1a 6.18 0.35 0 -FEP_1d-7a 3.22 0.45 0 -FEP_1b-1a 3.32 0.39 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-50w/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-50w/water.txt deleted file mode 100755 index a9a03641..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/sigmoidal-50w/water.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1b-7a 0.85 0.24 1 -FEP_1b-1c -0.44 0.13 0 -FEP_1d-1c -0.13 0.14 0 -FEP_1a-3b -0.28 0.11 1 -FEP_1d-6e -1.46 0.12 1 -FEP_1a-5 2.12 0.06 0 -FEP_1b-3b -0.27 0.22 1 -FEP_6a-1b 1.78 0.19 0 -FEP_6a-6b 2.03 0.11 0 -FEP_1d-5 3.15 0.20 0 -FEP_6e-6b 2.36 0.16 1 -FEP_3a-1d -0.74 0.18 0 -FEP_3a-1b -0.14 0.17 0 -FEP_1d-1a 1.18 0.12 1 -FEP_1d-7a 1.07 0.14 2 -FEP_1b-1a 0.52 0.10 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/water.txt deleted file mode 100755 index ec97aec0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_6b_3a 0.29 0.11 0 -FEP_6b_1c -0.95 0.23 0 -FEP_6e_1c 1.66 0.12 0 -FEP_6a_1c 0.89 0.17 0 -FEP_7a_6b -0.21 0.15 0 -FEP_1c_1a 1.22 0.11 0 -FEP_6e_1b 1.84 0.13 0 -FEP_7a_1a -0.49 0.2 0 -FEP_6a_1d 1.15 0.12 0 -FEP_1c_1b 0.33 0.08 0 -FEP_7a_6e -3.01 0.12 0 -FEP_3a_1c -1.09 0.08 0 -FEP_3b_1d -0.35 0.11 0 -FEP_6a_3a 1.85 0.14 0 -FEP_5_1d -3.33 0.18 0 -FEP_6b_1a 0.12 0.16 0 -FEP_7a_5 1.87 0.17 0 -FEP_5_1a -2.37 0.13 0 -FEP_1d_1c 0.05 0.1 0 -FEP_6e_6a 0.53 0.07 0 -FEP_7a_1d -0.9 0.22 0 -FEP_6a_1b 1.72 0.1 0 -FEP_6b_6a -1.92 0.08 0 -FEP_5_3b -2.48 0.15 0 -FEP_3b_1b 0.08 0.12 0 -FEP_6a_1a 1.86 0.17 0 -FEP_3b_3a 0.5 0.1 0 -FEP_6e_3a 2.15 0.13 0 -FEP_6e_6b 2.4 0.12 0 -FEP_3a_1d -0.57 0.22 0 -FEP_7a_6a -1.99 0.2 0 -FEP_6a_3b 1.6 0.19 0 -FEP_6b_5 2.46 0.2 0 -FEP_3a_1b -0.42 0.2 0 -FEP_7a_3b -0.73 0.16 0 -FEP_1d_1b 0.43 0.12 0 -FEP_1d_1a 1.42 0.11 0 -FEP_7a_1b -0.65 0.23 0 -FEP_6b_1b -0.18 0.19 0 -FEP_6e_5 4.86 0.15 0 -FEP_5_1c -3.37 0.08 0 -FEP_6e_3b 1.61 0.15 0 -FEP_3b_1c -0.48 0.17 0 -FEP_3a_1a 0.07 0.09 0 -FEP_6e_1a 2.51 0.24 0 -FEP_6a_5 4.25 0.18 0 -FEP_3b_1a 0.31 0.12 0 -FEP_5_1b -2.63 0.17 0 -FEP_6b_3b -0.6 0.12 0 -FEP_1b_1a 0.59 0.08 0 -FEP_7a_3a -0.53 0.19 0 -FEP_6e_1d 1.77 0.14 0 -FEP_6b_1d -0.86 0.11 0 -FEP_7a_1c -1.45 0.14 0 -FEP_5_3a -2.25 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/water.txt deleted file mode 100755 index 328aa697..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/6.Thrombin/water.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_6b-3a 0.29 0.11 0 -FEP_6b-1c -0.95 0.23 0 -FEP_6e-1c 1.66 0.12 0 -FEP_6a-1c 0.89 0.17 0 -FEP_7a-6b -0.21 0.15 0 -FEP_1c-1a 1.22 0.11 0 -FEP_6e-1b 1.84 0.13 0 -FEP_7a-1a -0.49 0.20 0 -FEP_6a-1d 1.15 0.12 0 -FEP_1c-1b 0.33 0.08 0 -FEP_7a-6e -3.01 0.12 0 -FEP_3a-1c -1.09 0.08 0 -FEP_3b-1d -0.35 0.11 0 -FEP_6a-3a 1.85 0.14 0 -FEP_5-1d -3.33 0.18 0 -FEP_6b-1a 0.12 0.16 0 -FEP_7a-5 1.87 0.17 0 -FEP_5-1a -2.37 0.13 0 -FEP_1d-1c 0.05 0.10 0 -FEP_6e-6a 0.53 0.07 0 -FEP_7a-1d -0.90 0.22 0 -FEP_6a-1b 1.72 0.10 0 -FEP_6b-6a -1.92 0.08 0 -FEP_5-3b -2.48 0.15 0 -FEP_3b-1b 0.08 0.12 0 -FEP_6a-1a 1.86 0.17 0 -FEP_3b-3a 0.50 0.10 0 -FEP_6e-3a 2.15 0.13 0 -FEP_6e-6b 2.40 0.12 0 -FEP_3a-1d -0.57 0.22 0 -FEP_7a-6a -1.99 0.20 0 -FEP_6a-3b 1.60 0.19 0 -FEP_6b-5 2.46 0.20 0 -FEP_3a-1b -0.42 0.20 0 -FEP_7a-3b -0.73 0.16 0 -FEP_1d-1b 0.43 0.12 0 -FEP_1d-1a 1.42 0.11 0 -FEP_7a-1b -0.65 0.23 0 -FEP_6b-1b -0.18 0.19 0 -FEP_6e-5 4.86 0.15 0 -FEP_5-1c -3.37 0.08 0 -FEP_6e-3b 1.61 0.15 0 -FEP_3b-1c -0.48 0.17 0 -FEP_3a-1a 0.07 0.09 0 -FEP_6e-1a 2.51 0.24 0 -FEP_6a-5 4.25 0.18 0 -FEP_3b-1a 0.31 0.12 0 -FEP_5-1b -2.63 0.17 0 -FEP_6b-3b -0.60 0.12 0 -FEP_1b-1a 0.59 0.08 0 -FEP_7a-3a -0.53 0.19 0 -FEP_6e-1d 1.77 0.14 0 -FEP_6b-1d -0.86 0.11 0 -FEP_7a-1c -1.45 0.14 0 -FEP_5-3a -2.25 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index 13884e7c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_jmc_23-ejm_43 -0.86 0.21 -FEP_ejm_54-ejm_47 10.09 0.23 -FEP_ejm_45-ejm_44 -7.17 0.18 -FEP_jmc_27-ejm_44 1.67 0.47 -FEP_ejm_44-ejm_42 -1.27 0.50 -FEP_ejm_50-ejm_47 7.60 0.50 -FEP_ejm_47-ejm_46 -4.23 0.16 -FEP_jmc_30-ejm_43 18.44 0.31 -FEP_ejm_45-ejm_42 -8.64 0.29 -FEP_ejm_54-ejm_43 5.14 0.18 -FEP_ejm_48-ejm_31 -9.35 0.73 -FEP_ejm_48-ejm_43 -8.18 0.22 -FEP_ejm_50-ejm_48 11.20 0.71 -FEP_ejm_47-ejm_45 4.69 0.19 -FEP_jmc_28-ejm_45 2.81 0.35 -FEP_ejm_55-ejm_50 3.12 0.20 -FEP_jmc_27-ejm_49 12.59 0.36 -FEP_ejm_47-ejm_42 -4.60 0.22 -FEP_jmc_30-ejm_55 12.41 0.21 -FEP_jmc_30-ejm_31 17.98 0.45 -FEP_ejm_55-ejm_48 14.38 0.57 -FEP_ejm_55-ejm_44 7.82 0.40 -FEP_ejm_54-ejm_45 13.82 0.26 -FEP_ejm_55-ejm_43 5.95 0.13 -FEP_jmc_30-ejm_47 22.63 0.17 -FEP_ejm_49-ejm_43 -11.49 0.21 -FEP_jmc_27-ejm_46 -0.68 0.23 -FEP_ejm_54-ejm_42 5.35 0.19 -FEP_jmc_30-jmc_27 18.94 0.35 -FEP_jmc_23-ejm_47 3.18 0.25 -FEP_jmc_23-ejm_31 -1.55 0.23 -FEP_jmc_28-ejm_44 -3.59 0.22 -FEP_jmc_23-ejm_45 8.34 0.33 -FEP_jmc_27-ejm_48 7.58 0.21 -FEP_jmc_28-jmc_23 -5.91 0.32 -FEP_jmc_23-ejm_44 0.66 0.22 -FEP_ejm_49-ejm_45 -2.85 0.41 -FEP_jmc_28-ejm_54 -12.01 0.18 -FEP_ejm_55-ejm_45 14.60 0.25 -FEP_jmc_30-ejm_54 13.84 0.36 -FEP_jmc_30-ejm_49 30.98 0.75 -FEP_ejm_50-ejm_42 3.60 0.28 -FEP_jmc_27-ejm_54 -5.72 0.19 -FEP_jmc_27-ejm_50 -2.89 0.28 -FEP_ejm_45-ejm_43 -8.67 0.23 -FEP_ejm_50-ejm_43 3.31 0.54 -FEP_jmc_28-ejm_31 -8.48 0.52 -FEP_ejm_50-ejm_31 1.77 0.14 -FEP_ejm_54-ejm_31 4.36 0.29 -FEP_jmc_23-ejm_46 -0.56 0.15 -FEP_ejm_54-ejm_50 2.15 0.48 -FEP_jmc_27-ejm_42 -0.39 0.29 -FEP_jmc_27-ejm_55 -6.38 0.23 -FEP_jmc_27-jmc_23 0.59 0.25 -FEP_ejm_47-ejm_31 -5.93 0.33 -FEP_ejm_55-ejm_47 10.35 0.27 -FEP_jmc_27-ejm_31 -0.77 0.30 -FEP_ejm_45-ejm_31 -9.80 0.53 -FEP_jmc_30-jmc_23 19.17 0.28 -FEP_ejm_48-ejm_45 0.38 0.29 -FEP_jmc_30-ejm_42 18.95 0.14 -FEP_jmc_28-ejm_50 -11.13 0.69 -FEP_ejm_46-ejm_43 0.06 0.22 -FEP_ejm_47-ejm_43 -4.16 0.16 -FEP_jmc_23-ejm_55 -6.80 0.17 -FEP_ejm_50-ejm_45 12.58 0.60 -FEP_ejm_49-ejm_48 -4.90 0.20 -FEP_jmc_30-ejm_44 19.86 0.51 -FEP_jmc_28-ejm_43 -6.32 0.17 -FEP_jmc_30-ejm_50 16.50 0.32 -FEP_ejm_49-ejm_31 -15.15 0.87 -FEP_ejm_43-ejm_42 -0.26 0.32 -FEP_ejm_49-ejm_46 -11.94 0.31 -FEP_jmc_23-ejm_49 11.82 0.49 -FEP_ejm_55-ejm_54 0.63 0.32 -FEP_ejm_44-ejm_43 -1.28 0.15 -FEP_jmc_28-jmc_27 -6.92 0.20 -FEP_ejm_54-ejm_49 17.32 0.63 -FEP_ejm_55-ejm_49 18.86 0.38 -FEP_ejm_46-ejm_44 1.57 0.17 -FEP_ejm_55-ejm_46 5.89 0.11 -FEP_jmc_27-ejm_43 -0.02 0.19 -FEP_ejm_42-ejm_31 -1.25 0.19 -FEP_ejm_50-ejm_49 17.07 0.81 -FEP_jmc_28-ejm_47 -2.53 0.19 -FEP_jmc_30-ejm_45 28.27 0.37 -FEP_jmc_30-ejm_48 26.77 0.32 -FEP_ejm_43-ejm_31 -0.60 0.30 -FEP_jmc_30-ejm_46 18.16 0.19 -FEP_ejm_46-ejm_45 9.11 0.19 -FEP_ejm_47-ejm_44 -2.58 0.31 -FEP_jmc_27-ejm_47 3.56 0.16 -FEP_ejm_48-ejm_47 -3.53 0.15 -FEP_jmc_23-ejm_48 7.34 0.28 -FEP_ejm_54-ejm_44 7.29 0.43 -FEP_jmc_30-jmc_28 24.89 0.15 -FEP_ejm_55-ejm_31 4.62 0.16 -FEP_jmc_23-ejm_50 -3.61 0.15 -FEP_jmc_28-ejm_48 0.97 0.09 -FEP_ejm_50-ejm_46 2.42 0.33 -FEP_jmc_23-ejm_42 -0.32 0.21 -FEP_ejm_50-ejm_44 4.35 0.35 -FEP_ejm_48-ejm_42 -8.26 0.38 -FEP_jmc_28-ejm_42 -6.69 0.11 -FEP_ejm_44-ejm_31 -2.38 0.27 -FEP_ejm_46-ejm_31 -1.20 0.27 -FEP_jmc_27-ejm_45 9.00 0.18 -FEP_ejm_48-ejm_44 -6.25 0.28 -FEP_jmc_28-ejm_46 -7.52 0.29 -FEP_ejm_46-ejm_42 0.38 0.17 -FEP_jmc_23-ejm_54 -6.40 0.24 -FEP_ejm_49-ejm_42 -12.31 0.80 -FEP_ejm_54-ejm_48 14.32 0.43 -FEP_ejm_49-ejm_44 -11.19 0.35 -FEP_jmc_28-ejm_49 6.01 0.53 -FEP_jmc_28-ejm_55 -13.29 0.26 -FEP_ejm_55-ejm_42 5.96 0.25 -FEP_ejm_48-ejm_46 -7.93 0.12 -FEP_ejm_49-ejm_47 -7.97 0.26 -FEP_ejm_54-ejm_46 5.54 0.13 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/lineal/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/lineal/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 1f815ce3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/lineal/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation failed replicates -FEP_ejm_42-ejm_31/ 2 -FEP_ejm_43-ejm_31/ 1 -FEP_ejm_43-ejm_42/ 1 -FEP_ejm_44-ejm_31/ 3 -FEP_ejm_44-ejm_42/ 3 -FEP_ejm_44-ejm_43/ 2 -FEP_ejm_45-ejm_31/ 1 -FEP_ejm_45-ejm_42/ 1 -FEP_ejm_45-ejm_43/ 1 -FEP_ejm_45-ejm_44/ 1 -FEP_ejm_46-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_43/ 1 -FEP_ejm_46-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_42/ 1 -FEP_ejm_47-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_46/ 1 -FEP_ejm_48-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_31/ 2 -FEP_ejm_49-ejm_42/ 2 -FEP_ejm_49-ejm_43/ 2 -FEP_ejm_49-ejm_44/ 1 -FEP_ejm_49-ejm_45/ 3 -FEP_ejm_49-ejm_46/ 5 -FEP_ejm_49-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_48/ 3 -FEP_ejm_50-ejm_31/ 1 -FEP_ejm_50-ejm_42/ 1 -FEP_ejm_50-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_48/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_49/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_44/ 1 -FEP_ejm_54-ejm_45/ 1 -FEP_ejm_54-ejm_46/ 2 -FEP_ejm_54-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_48/ 1 -FEP_ejm_54-ejm_49/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_50/ 1 -FEP_ejm_55-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_42/ 1 -FEP_ejm_55-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_45/ 2 -FEP_ejm_55-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_47/ 1 -FEP_ejm_55-ejm_48/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_49/ 1 -FEP_ejm_55-ejm_50/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_54/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_42/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_43/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_44/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_45/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_47/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_48/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_49/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_50/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_54/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_42/ 1 -FEP_jmc_27-ejm_43/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_44/ 1 -FEP_jmc_27-ejm_45/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_47/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_48/ 2 -FEP_jmc_27-ejm_49/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_50/ 3 -FEP_jmc_27-ejm_54/ 2 -FEP_jmc_27-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_27-jmc_23/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_42/ 1 -FEP_jmc_28-ejm_43/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_44/ 1 -FEP_jmc_28-ejm_45/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_47/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_48/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_49/ 1 -FEP_jmc_28-ejm_50/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_54/ 1 -FEP_jmc_28-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_28-jmc_23/ 0 -FEP_jmc_28-jmc_27/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_42/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_43/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_44/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_45/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_47/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_48/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_49/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_50/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_54/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_30-jmc_23/ 0 -FEP_jmc_30-jmc_27/ 0 -FEP_jmc_30-jmc_28/ 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index c4e74280..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem -FEP_jmc_23-ejm_43 -2.03 0.25 -FEP_ejm_54-ejm_47 9.98 0.38 -FEP_ejm_45-ejm_44 -8.51 0.23 -FEP_jmc_27-ejm_44 -1.88 0.39 -FEP_ejm_44-ejm_42 -0.33 0.30 -FEP_ejm_50-ejm_47 8.83 0.51 -FEP_ejm_47-ejm_46 -3.30 0.21 -FEP_jmc_30-ejm_43 17.29 0.15 -FEP_ejm_45-ejm_42 -8.97 0.48 -FEP_ejm_54-ejm_43 5.26 0.15 -FEP_ejm_48-ejm_31 -9.70 0.59 -FEP_ejm_48-ejm_43 -8.66 0.26 -FEP_ejm_50-ejm_48 13.09 0.61 -FEP_ejm_47-ejm_45 5.01 0.35 -FEP_jmc_28-ejm_45 2.39 0.34 -FEP_ejm_55-ejm_50 1.35 0.31 -FEP_jmc_27-ejm_49 8.89 0.37 -FEP_ejm_47-ejm_42 -4.50 0.33 -FEP_jmc_30-ejm_55 12.14 0.39 -FEP_jmc_30-ejm_31 17.02 0.61 -FEP_ejm_55-ejm_48 12.62 0.29 -FEP_ejm_55-ejm_44 6.39 0.25 -FEP_ejm_54-ejm_45 14.44 0.18 -FEP_ejm_55-ejm_43 4.61 0.26 -FEP_jmc_30-ejm_47 22.09 0.17 -FEP_ejm_49-ejm_43 -10.49 0.51 -FEP_jmc_27-ejm_46 -0.30 0.38 -FEP_ejm_54-ejm_42 5.95 0.11 -FEP_jmc_30-jmc_27 19.49 0.21 -FEP_jmc_23-ejm_47 2.83 0.37 -FEP_jmc_23-ejm_31 -2.21 0.60 -FEP_jmc_28-ejm_44 -8.02 0.30 -FEP_jmc_23-ejm_45 6.82 0.33 -FEP_jmc_27-ejm_48 5.96 0.21 -FEP_jmc_28-jmc_23 -6.65 0.24 -FEP_jmc_23-ejm_44 -1.01 0.22 -FEP_ejm_49-ejm_45 -0.64 0.20 -FEP_jmc_28-ejm_54 -13.79 0.28 -FEP_ejm_55-ejm_45 13.85 0.25 -FEP_jmc_30-ejm_54 12.19 0.24 -FEP_jmc_30-ejm_49 28.15 0.38 -FEP_ejm_50-ejm_42 4.17 0.35 -FEP_jmc_27-ejm_54 -7.84 0.27 -FEP_jmc_27-ejm_50 -6.04 0.38 -FEP_ejm_45-ejm_43 -9.49 0.30 -FEP_ejm_50-ejm_43 3.20 0.25 -FEP_jmc_28-ejm_31 -9.20 0.50 -FEP_ejm_50-ejm_31 2.93 0.28 -FEP_ejm_54-ejm_31 4.90 0.38 -FEP_jmc_23-ejm_46 -0.39 0.27 -FEP_ejm_54-ejm_50 1.53 0.42 -FEP_jmc_27-ejm_42 -1.22 0.41 -FEP_jmc_27-ejm_55 -7.45 0.34 -FEP_jmc_27-jmc_23 -0.39 0.27 -FEP_ejm_47-ejm_31 -5.92 0.52 -FEP_ejm_55-ejm_47 9.40 0.23 -FEP_jmc_27-ejm_31 -2.95 0.43 -FEP_ejm_45-ejm_31 -10.73 0.68 -FEP_jmc_30-jmc_23 20.17 0.31 -FEP_ejm_48-ejm_45 0.72 0.26 -FEP_jmc_30-ejm_42 18.23 0.37 -FEP_jmc_28-ejm_50 -11.47 0.36 -FEP_ejm_46-ejm_43 -1.27 0.51 -FEP_ejm_47-ejm_43 -5.00 0.38 -FEP_jmc_23-ejm_55 -6.90 0.10 -FEP_ejm_50-ejm_45 14.01 0.86 -FEP_ejm_49-ejm_48 -2.93 0.40 -FEP_jmc_30-ejm_44 18.56 0.41 -FEP_jmc_28-ejm_43 -8.16 0.36 -FEP_jmc_30-ejm_50 13.09 0.44 -FEP_ejm_49-ejm_31 -12.32 0.49 -FEP_ejm_43-ejm_42 1.07 0.32 -FEP_ejm_49-ejm_46 -9.61 0.30 -FEP_jmc_23-ejm_49 8.38 0.42 -FEP_ejm_55-ejm_54 -1.12 0.17 -FEP_ejm_44-ejm_43 -0.71 0.32 -FEP_jmc_28-jmc_27 -5.94 0.28 -FEP_ejm_54-ejm_49 15.91 0.42 -FEP_ejm_55-ejm_49 15.50 0.49 -FEP_ejm_46-ejm_44 -0.78 0.36 -FEP_ejm_55-ejm_46 6.15 0.25 -FEP_jmc_27-ejm_43 -2.97 0.29 -FEP_ejm_42-ejm_31 -0.74 0.36 -FEP_ejm_50-ejm_49 15.25 0.61 -FEP_jmc_28-ejm_47 -3.91 0.27 -FEP_jmc_30-ejm_45 28.02 0.16 -FEP_jmc_30-ejm_48 26.10 0.43 -FEP_ejm_43-ejm_31 -1.34 0.31 -FEP_jmc_30-ejm_46 19.07 0.27 -FEP_ejm_46-ejm_45 8.23 0.22 -FEP_ejm_47-ejm_44 -4.05 0.32 -FEP_jmc_27-ejm_47 2.96 0.30 -FEP_ejm_48-ejm_47 -3.24 0.24 -FEP_jmc_23-ejm_48 5.95 0.21 -FEP_ejm_54-ejm_44 5.77 0.28 -FEP_jmc_30-jmc_28 25.27 0.28 -FEP_ejm_55-ejm_31 4.43 0.38 -FEP_jmc_23-ejm_50 -6.19 0.35 -FEP_jmc_28-ejm_48 0.13 0.29 -FEP_ejm_50-ejm_46 4.86 0.34 -FEP_jmc_23-ejm_42 -1.75 0.19 -FEP_ejm_50-ejm_44 4.70 0.33 -FEP_ejm_48-ejm_42 -8.07 0.29 -FEP_jmc_28-ejm_42 -7.26 0.33 -FEP_ejm_44-ejm_31 -0.66 0.30 -FEP_ejm_46-ejm_31 -2.56 0.38 -FEP_jmc_27-ejm_45 7.15 0.23 -FEP_ejm_48-ejm_44 -7.47 0.25 -FEP_jmc_28-ejm_46 -6.49 0.20 -FEP_ejm_46-ejm_42 -0.97 0.38 -FEP_jmc_23-ejm_54 -7.44 0.14 -FEP_ejm_49-ejm_42 -10.71 0.28 -FEP_ejm_54-ejm_48 13.89 0.24 -FEP_ejm_49-ejm_44 -10.13 0.48 -FEP_jmc_28-ejm_49 2.92 0.44 -FEP_jmc_28-ejm_55 -13.39 0.32 -FEP_ejm_55-ejm_42 5.16 0.12 -FEP_ejm_48-ejm_46 -6.81 0.36 -FEP_ejm_49-ejm_47 -6.12 0.34 -FEP_ejm_54-ejm_46 6.71 0.21 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/lineal/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/lineal/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index 5cab51e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/lineal/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation failed replicates -FEP_ejm_42-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_43-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_43-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_44-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_44-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_44-ejm_43/ 1 -FEP_ejm_45-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_45-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_45-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_45-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_45/ 1 -FEP_ejm_47-ejm_46/ 1 -FEP_ejm_48-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_42/ 1 -FEP_ejm_49-ejm_43/ 1 -FEP_ejm_49-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_48/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_47/ 1 -FEP_ejm_50-ejm_48/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_49/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_48/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_49/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_50/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_31/ 2 -FEP_ejm_55-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_48/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_49/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_50/ 1 -FEP_ejm_55-ejm_54/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_31/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_42/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_43/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_44/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_45/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_47/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_48/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_49/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_50/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_54/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_42/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_43/ 1 -FEP_jmc_27-ejm_44/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_45/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_47/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_48/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_49/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_50/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_54/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_55/ 2 -FEP_jmc_27-jmc_23/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_42/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_43/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_44/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_45/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_47/ 1 -FEP_jmc_28-ejm_48/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_49/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_50/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_54/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_28-jmc_23/ 0 -FEP_jmc_28-jmc_27/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_42/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_43/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_44/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_45/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_47/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_48/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_49/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_50/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_54/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_30-jmc_23/ 0 -FEP_jmc_30-jmc_27/ 1 -FEP_jmc_30-jmc_28/ 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100755 index d081e5e3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_jmc-23_ejm-43 -0.27 0.19 1 -FEP_ejm-54_ejm-47 9.92 0.23 1 -FEP_ejm-45_ejm-44 -7.04 0.16 0 -FEP_jmc-27_ejm-44 1.50 0.18 0 -FEP_ejm-44_ejm-42 -1.77 0.34 4 -FEP_ejm-50_ejm-47 7.24 0.19 0 -FEP_ejm-47_ejm-46 -4.57 0.16 0 -FEP_jmc-30_ejm-43 18.70 0.31 1 -FEP_ejm-45_ejm-42 -8.67 0.14 0 -FEP_ejm-54_ejm-43 6.21 0.25 0 -FEP_ejm-48_ejm-31 -9.68 0.24 0 -FEP_ejm-48_ejm-43 -8.02 0.19 2 -FEP_ejm-50_ejm-48 10.74 0.28 0 -FEP_ejm-47_ejm-45 4.26 0.16 0 -FEP_jmc-28_ejm-45 2.64 0.17 0 -FEP_ejm-55_ejm-50 3.02 0.15 0 -FEP_jmc-27_ejm-49 11.66 0.19 1 -FEP_ejm-47_ejm-42 -4.37 0.16 0 -FEP_jmc-30_ejm-55 12.66 0.21 0 -FEP_jmc-30_ejm-31 17.82 0.31 0 -FEP_ejm-55_ejm-48 14.05 0.19 3 -FEP_ejm-55_ejm-44 7.89 0.23 0 -FEP_ejm-54_ejm-45 14.22 0.19 0 -FEP_ejm-55_ejm-43 6.12 0.20 0 -FEP_jmc-30_ejm-47 22.57 0.21 0 -FEP_ejm-49_ejm-43 -11.92 0.20 4 -FEP_jmc-27_ejm-46 -0.55 0.12 0 -FEP_ejm-54_ejm-42 5.64 0.09 1 -FEP_jmc-30_jmc-27 18.76 0.18 0 -FEP_jmc-23_ejm-47 3.19 0.14 1 -FEP_jmc-23_ejm-31 -1.81 0.22 0 -FEP_jmc-28_ejm-44 -4.75 0.25 2 -FEP_jmc-23_ejm-45 8.03 0.14 1 -FEP_jmc-27_ejm-48 7.83 0.24 2 -FEP_jmc-28_jmc-23 -6.36 0.15 1 -FEP_jmc-23_ejm-44 0.84 0.29 1 -FEP_ejm-49_ejm-45 -3.25 0.17 5 -FEP_jmc-28_ejm-54 -12.22 0.14 1 -FEP_ejm-55_ejm-45 14.72 0.22 0 -FEP_jmc-30_ejm-54 13.43 0.30 1 -FEP_jmc-30_ejm-49 31.05 0.38 0 -FEP_ejm-50_ejm-42 3.23 0.22 0 -FEP_jmc-27_ejm-54 -6.10 0.20 0 -FEP_jmc-27_ejm-50 -3.22 0.22 0 -FEP_ejm-45_ejm-43 -8.41 0.13 0 -FEP_ejm-50_ejm-43 3.47 0.29 0 -FEP_jmc-28_ejm-31 -7.33 0.13 0 -FEP_ejm-50_ejm-31 1.85 0.09 0 -FEP_ejm-54_ejm-31 4.64 0.15 0 -FEP_jmc-23_ejm-46 -0.96 0.15 0 -FEP_ejm-54_ejm-50 2.18 0.19 0 -FEP_jmc-27_ejm-42 -0.52 0.22 0 -FEP_jmc-27_ejm-55 -6.54 0.16 1 -FEP_jmc-27_jmc-23 0.53 0.06 0 -FEP_ejm-47_ejm-31 -5.17 0.18 0 -FEP_ejm-55_ejm-47 10.56 0.13 0 -FEP_jmc-27_ejm-31 -1.70 0.19 0 -FEP_ejm-45_ejm-31 -9.88 0.16 0 -FEP_jmc-30_jmc-23 19.13 0.22 0 -FEP_ejm-48_ejm-45 0.09 0.24 2 -FEP_jmc-30_ejm-42 18.54 0.24 1 -FEP_jmc-28_ejm-50 -10.10 0.23 0 -FEP_ejm-46_ejm-43 0.27 0.14 0 -FEP_ejm-47_ejm-43 -4.58 0.14 0 -FEP_jmc-23_ejm-55 -6.83 0.14 1 -FEP_ejm-50_ejm-45 11.95 0.20 0 -FEP_ejm-49_ejm-48 -3.50 0.24 5 -FEP_jmc-30_ejm-44 19.67 0.37 0 -FEP_jmc-28_ejm-43 -6.41 0.14 0 -FEP_jmc-30_ejm-50 15.86 0.25 0 -FEP_ejm-49_ejm-31 -13.63 0.32 0 -FEP_ejm-43_ejm-42 -0.17 0.22 0 -FEP_ejm-49_ejm-46 -12.26 0.19 0 -FEP_jmc-23_ejm-49 11.77 0.17 1 -FEP_ejm-55_ejm-54 0.54 0.20 0 -FEP_ejm-44_ejm-43 -1.71 0.18 2 -FEP_jmc-28_jmc-27 -6.60 0.15 0 -FEP_ejm-54_ejm-49 18.04 0.22 0 -FEP_ejm-55_ejm-49 17.71 0.36 1 -FEP_ejm-46_ejm-44 1.90 0.18 1 -FEP_ejm-55_ejm-46 5.96 0.10 0 -FEP_jmc-27_ejm-43 0.16 0.20 1 -FEP_ejm-42_ejm-31 -1.08 0.11 0 -FEP_ejm-50_ejm-49 15.32 0.32 0 -FEP_jmc-28_ejm-47 -3.05 0.19 0 -FEP_jmc-30_ejm-45 27.90 0.29 0 -FEP_jmc-30_ejm-48 26.12 0.30 0 -FEP_ejm-43_ejm-31 -1.17 0.14 0 -FEP_jmc-30_ejm-46 18.38 0.20 1 -FEP_ejm-46_ejm-45 9.09 0.14 0 -FEP_ejm-47_ejm-44 -2.92 0.19 0 -FEP_jmc-27_ejm-47 4.20 0.15 0 -FEP_ejm-48_ejm-47 -3.78 0.08 1 -FEP_jmc-23_ejm-48 7.26 0.21 0 -FEP_ejm-54_ejm-44 7.20 0.30 1 -FEP_jmc-30_jmc-28 25.04 0.17 0 -FEP_ejm-55_ejm-31 4.91 0.08 0 -FEP_jmc-23_ejm-50 -3.68 0.21 0 -FEP_jmc-28_ejm-48 1.29 0.10 1 -FEP_ejm-50_ejm-46 2.72 0.15 0 -FEP_jmc-23_ejm-42 -0.81 0.14 0 -FEP_ejm-50_ejm-44 4.59 0.24 0 -FEP_ejm-48_ejm-42 -8.74 0.19 0 -FEP_jmc-28_ejm-42 -6.50 0.16 0 -FEP_ejm-44_ejm-31 -2.63 0.31 2 -FEP_ejm-46_ejm-31 -1.08 0.13 0 -FEP_jmc-27_ejm-45 8.43 0.15 0 -FEP_ejm-48_ejm-44 -6.56 0.25 0 -FEP_jmc-28_ejm-46 -6.93 0.14 0 -FEP_ejm-46_ejm-42 0.17 0.12 1 -FEP_jmc-23_ejm-54 -6.06 0.10 0 -FEP_ejm-49_ejm-42 -12.58 0.20 2 -FEP_ejm-54_ejm-48 13.86 0.28 0 -FEP_ejm-49_ejm-44 -11.20 0.19 4 -FEP_jmc-28_ejm-49 5.94 0.22 1 -FEP_jmc-28_ejm-55 -13.00 0.20 0 -FEP_ejm-55_ejm-42 6.03 0.11 0 -FEP_ejm-48_ejm-46 -8.65 0.17 0 -FEP_ejm-49_ejm-47 -8.16 0.12 5 -FEP_ejm-54_ejm-46 5.40 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein_replicates.txt deleted file mode 100755 index 1f815ce3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation failed replicates -FEP_ejm_42-ejm_31/ 2 -FEP_ejm_43-ejm_31/ 1 -FEP_ejm_43-ejm_42/ 1 -FEP_ejm_44-ejm_31/ 3 -FEP_ejm_44-ejm_42/ 3 -FEP_ejm_44-ejm_43/ 2 -FEP_ejm_45-ejm_31/ 1 -FEP_ejm_45-ejm_42/ 1 -FEP_ejm_45-ejm_43/ 1 -FEP_ejm_45-ejm_44/ 1 -FEP_ejm_46-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_43/ 1 -FEP_ejm_46-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_42/ 1 -FEP_ejm_47-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_46/ 1 -FEP_ejm_48-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_31/ 2 -FEP_ejm_49-ejm_42/ 2 -FEP_ejm_49-ejm_43/ 2 -FEP_ejm_49-ejm_44/ 1 -FEP_ejm_49-ejm_45/ 3 -FEP_ejm_49-ejm_46/ 5 -FEP_ejm_49-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_48/ 3 -FEP_ejm_50-ejm_31/ 1 -FEP_ejm_50-ejm_42/ 1 -FEP_ejm_50-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_48/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_49/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_44/ 1 -FEP_ejm_54-ejm_45/ 1 -FEP_ejm_54-ejm_46/ 2 -FEP_ejm_54-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_48/ 1 -FEP_ejm_54-ejm_49/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_50/ 1 -FEP_ejm_55-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_42/ 1 -FEP_ejm_55-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_45/ 2 -FEP_ejm_55-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_47/ 1 -FEP_ejm_55-ejm_48/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_49/ 1 -FEP_ejm_55-ejm_50/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_54/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_42/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_43/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_44/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_45/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_47/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_48/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_49/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_50/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_54/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_42/ 1 -FEP_jmc_27-ejm_43/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_44/ 1 -FEP_jmc_27-ejm_45/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_47/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_48/ 2 -FEP_jmc_27-ejm_49/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_50/ 3 -FEP_jmc_27-ejm_54/ 2 -FEP_jmc_27-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_27-jmc_23/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_42/ 1 -FEP_jmc_28-ejm_43/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_44/ 1 -FEP_jmc_28-ejm_45/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_47/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_48/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_49/ 1 -FEP_jmc_28-ejm_50/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_54/ 1 -FEP_jmc_28-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_28-jmc_23/ 0 -FEP_jmc_28-jmc_27/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_42/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_43/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_44/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_45/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_47/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_48/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_49/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_50/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_54/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_30-jmc_23/ 0 -FEP_jmc_30-jmc_27/ 0 -FEP_jmc_30-jmc_28/ 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt deleted file mode 100755 index 0dcd9eae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_jmc_23-ejm_43 -0.27 0.19 1 -FEP_ejm_54-ejm_47 9.92 0.23 1 -FEP_ejm_45-ejm_44 -7.04 0.16 0 -FEP_jmc_27-ejm_44 1.50 0.18 0 -FEP_ejm_44-ejm_42 -1.77 0.34 4 -FEP_ejm_50-ejm_47 7.24 0.19 0 -FEP_ejm_47-ejm_46 -4.57 0.16 0 -FEP_jmc_30-ejm_43 18.70 0.31 1 -FEP_ejm_45-ejm_42 -8.67 0.14 0 -FEP_ejm_54-ejm_43 6.21 0.25 0 -FEP_ejm_48-ejm_31 -9.68 0.24 0 -FEP_ejm_48-ejm_43 -8.02 0.19 2 -FEP_ejm_50-ejm_48 10.74 0.28 0 -FEP_ejm_47-ejm_45 4.26 0.16 0 -FEP_jmc_28-ejm_45 2.64 0.17 0 -FEP_ejm_55-ejm_50 3.02 0.15 0 -FEP_jmc_27-ejm_49 11.66 0.19 1 -FEP_ejm_47-ejm_42 -4.37 0.16 0 -FEP_jmc_30-ejm_55 12.66 0.21 0 -FEP_jmc_30-ejm_31 17.82 0.31 0 -FEP_ejm_55-ejm_48 14.05 0.19 3 -FEP_ejm_55-ejm_44 7.89 0.23 0 -FEP_ejm_54-ejm_45 14.22 0.19 0 -FEP_ejm_55-ejm_43 6.12 0.20 0 -FEP_jmc_30-ejm_47 22.57 0.21 0 -FEP_ejm_49-ejm_43 -11.92 0.20 4 -FEP_jmc_27-ejm_46 -0.55 0.12 0 -FEP_ejm_54-ejm_42 5.64 0.09 1 -FEP_jmc_30-jmc_27 18.76 0.18 0 -FEP_jmc_23-ejm_47 3.19 0.14 1 -FEP_jmc_23-ejm_31 -1.81 0.22 0 -FEP_jmc_28-ejm_44 -4.75 0.25 2 -FEP_jmc_23-ejm_45 8.03 0.14 1 -FEP_jmc_27-ejm_48 7.83 0.24 2 -FEP_jmc_28-jmc_23 -6.36 0.15 1 -FEP_jmc_23-ejm_44 0.84 0.29 1 -FEP_ejm_49-ejm_45 -3.25 0.17 5 -FEP_jmc_28-ejm_54 -12.22 0.14 1 -FEP_ejm_55-ejm_45 14.72 0.22 0 -FEP_jmc_30-ejm_54 13.43 0.30 1 -FEP_jmc_30-ejm_49 31.05 0.38 0 -FEP_ejm_50-ejm_42 3.23 0.22 0 -FEP_jmc_27-ejm_54 -6.10 0.20 0 -FEP_jmc_27-ejm_50 -3.22 0.22 0 -FEP_ejm_45-ejm_43 -8.41 0.13 0 -FEP_ejm_50-ejm_43 3.47 0.29 0 -FEP_jmc_28-ejm_31 -7.33 0.13 0 -FEP_ejm_50-ejm_31 1.85 0.09 0 -FEP_ejm_54-ejm_31 4.64 0.15 0 -FEP_jmc_23-ejm_46 -0.96 0.15 0 -FEP_ejm_54-ejm_50 2.18 0.19 0 -FEP_jmc_27-ejm_42 -0.52 0.22 0 -FEP_jmc_27-ejm_55 -6.54 0.16 1 -FEP_jmc_27-jmc_23 0.53 0.06 0 -FEP_ejm_47-ejm_31 -5.17 0.18 0 -FEP_ejm_55-ejm_47 10.56 0.13 0 -FEP_jmc_27-ejm_31 -1.70 0.19 0 -FEP_ejm_45-ejm_31 -9.88 0.16 0 -FEP_jmc_30-jmc_23 19.13 0.22 0 -FEP_ejm_48-ejm_45 0.09 0.24 2 -FEP_jmc_30-ejm_42 18.54 0.24 1 -FEP_jmc_28-ejm_50 -10.10 0.23 0 -FEP_ejm_46-ejm_43 0.27 0.14 0 -FEP_ejm_47-ejm_43 -4.58 0.14 0 -FEP_jmc_23-ejm_55 -6.83 0.14 1 -FEP_ejm_50-ejm_45 11.95 0.20 0 -FEP_ejm_49-ejm_48 -3.50 0.24 5 -FEP_jmc_30-ejm_44 19.67 0.37 0 -FEP_jmc_28-ejm_43 -6.41 0.14 0 -FEP_jmc_30-ejm_50 15.86 0.25 0 -FEP_ejm_49-ejm_31 -13.63 0.32 0 -FEP_ejm_43-ejm_42 -0.17 0.22 0 -FEP_ejm_49-ejm_46 -12.26 0.19 0 -FEP_jmc_23-ejm_49 11.77 0.17 1 -FEP_ejm_55-ejm_54 0.54 0.20 0 -FEP_ejm_44-ejm_43 -1.71 0.18 2 -FEP_jmc_28-jmc_27 -6.60 0.15 0 -FEP_ejm_54-ejm_49 18.04 0.22 0 -FEP_ejm_55-ejm_49 17.71 0.36 1 -FEP_ejm_46-ejm_44 1.90 0.18 1 -FEP_ejm_55-ejm_46 5.96 0.10 0 -FEP_jmc_27-ejm_43 0.16 0.20 1 -FEP_ejm_42-ejm_31 -1.08 0.11 0 -FEP_ejm_50-ejm_49 15.32 0.32 0 -FEP_jmc_28-ejm_47 -3.05 0.19 0 -FEP_jmc_30-ejm_45 27.90 0.29 0 -FEP_jmc_30-ejm_48 26.12 0.30 0 -FEP_ejm_43-ejm_31 -1.17 0.14 0 -FEP_jmc_30-ejm_46 18.38 0.20 1 -FEP_ejm_46-ejm_45 9.09 0.14 0 -FEP_ejm_47-ejm_44 -2.92 0.19 0 -FEP_jmc_27-ejm_47 4.20 0.15 0 -FEP_ejm_48-ejm_47 -3.78 0.08 1 -FEP_jmc_23-ejm_48 7.26 0.21 0 -FEP_ejm_54-ejm_44 7.20 0.30 1 -FEP_jmc_30-jmc_28 25.04 0.17 0 -FEP_ejm_55-ejm_31 4.91 0.08 0 -FEP_jmc_23-ejm_50 -3.68 0.21 0 -FEP_jmc_28-ejm_48 1.29 0.10 1 -FEP_ejm_50-ejm_46 2.72 0.15 0 -FEP_jmc_23-ejm_42 -0.81 0.14 0 -FEP_ejm_50-ejm_44 4.59 0.24 0 -FEP_ejm_48-ejm_42 -8.74 0.19 0 -FEP_jmc_28-ejm_42 -6.50 0.16 0 -FEP_ejm_44-ejm_31 -2.63 0.31 2 -FEP_ejm_46-ejm_31 -1.08 0.13 0 -FEP_jmc_27-ejm_45 8.43 0.15 0 -FEP_ejm_48-ejm_44 -6.56 0.25 0 -FEP_jmc_28-ejm_46 -6.93 0.14 0 -FEP_ejm_46-ejm_42 0.17 0.12 1 -FEP_jmc_23-ejm_54 -6.06 0.10 0 -FEP_ejm_49-ejm_42 -12.58 0.20 2 -FEP_ejm_54-ejm_48 13.86 0.28 0 -FEP_ejm_49-ejm_44 -11.20 0.19 4 -FEP_jmc_28-ejm_49 5.94 0.22 1 -FEP_jmc_28-ejm_55 -13.00 0.20 0 -FEP_ejm_55-ejm_42 6.03 0.11 0 -FEP_ejm_48-ejm_46 -8.65 0.17 0 -FEP_ejm_49-ejm_47 -8.16 0.12 5 -FEP_ejm_54-ejm_46 5.40 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt deleted file mode 100755 index 713b6cbf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_jmc_23-ejm_43 -2.24 0.12 0 -FEP_ejm_54-ejm_47 10.73 0.14 0 -FEP_ejm_45-ejm_44 -8.93 0.43 0 -FEP_jmc_27-ejm_44 -1.63 0.30 0 -FEP_ejm_44-ejm_42 -0.35 0.25 0 -FEP_ejm_50-ejm_47 8.62 0.44 0 -FEP_ejm_47-ejm_46 -3.68 0.19 0 -FEP_jmc_30-ejm_43 17.03 0.24 0 -FEP_ejm_45-ejm_42 -8.70 0.20 0 -FEP_ejm_54-ejm_43 5.31 0.27 0 -FEP_ejm_48-ejm_31 -9.10 0.28 0 -FEP_ejm_48-ejm_43 -8.37 0.25 0 -FEP_ejm_50-ejm_48 11.98 0.24 0 -FEP_ejm_47-ejm_45 4.84 0.19 0 -FEP_jmc_28-ejm_45 1.83 0.25 0 -FEP_ejm_55-ejm_50 0.95 0.16 0 -FEP_jmc_27-ejm_49 8.42 0.20 0 -FEP_ejm_47-ejm_42 -4.31 0.29 0 -FEP_jmc_30-ejm_55 12.63 0.13 0 -FEP_jmc_30-ejm_31 16.94 0.23 0 -FEP_ejm_55-ejm_48 12.83 0.11 0 -FEP_ejm_55-ejm_44 5.11 0.23 0 -FEP_ejm_54-ejm_45 14.89 0.19 0 -FEP_ejm_55-ejm_43 4.82 0.12 0 -FEP_jmc_30-ejm_47 22.22 0.27 0 -FEP_ejm_49-ejm_43 -10.71 0.28 0 -FEP_jmc_27-ejm_46 -0.83 0.31 0 -FEP_ejm_54-ejm_42 5.94 0.13 0 -FEP_jmc_30-jmc_27 19.48 0.17 0 -FEP_jmc_23-ejm_47 2.67 0.20 0 -FEP_jmc_23-ejm_31 -2.23 0.25 0 -FEP_jmc_28-ejm_44 -7.85 0.34 0 -FEP_jmc_23-ejm_45 7.41 0.33 0 -FEP_jmc_27-ejm_48 6.07 0.11 0 -FEP_jmc_28-jmc_23 -6.34 0.26 0 -FEP_jmc_23-ejm_44 -1.61 0.15 0 -FEP_ejm_49-ejm_45 -1.23 0.36 0 -FEP_jmc_28-ejm_54 -13.18 0.20 0 -FEP_ejm_55-ejm_45 13.71 0.23 0 -FEP_jmc_30-ejm_54 12.76 0.30 0 -FEP_jmc_30-ejm_49 28.15 0.33 0 -FEP_ejm_50-ejm_42 4.21 0.11 0 -FEP_jmc_27-ejm_54 -7.71 0.13 0 -FEP_jmc_27-ejm_50 -5.65 0.14 0 -FEP_ejm_45-ejm_43 -9.64 0.25 0 -FEP_ejm_50-ejm_43 3.57 0.37 0 -FEP_jmc_28-ejm_31 -8.64 0.22 0 -FEP_ejm_50-ejm_31 2.87 0.29 0 -FEP_ejm_54-ejm_31 4.93 0.24 0 -FEP_jmc_23-ejm_46 -0.29 0.24 0 -FEP_ejm_54-ejm_50 1.81 0.15 0 -FEP_jmc_27-ejm_42 -1.64 0.20 0 -FEP_jmc_27-ejm_55 -7.04 0.14 0 -FEP_jmc_27-jmc_23 -0.15 0.30 0 -FEP_ejm_47-ejm_31 -5.38 0.14 0 -FEP_ejm_55-ejm_47 9.41 0.18 0 -FEP_jmc_27-ejm_31 -2.25 0.21 0 -FEP_ejm_45-ejm_31 -9.72 0.20 0 -FEP_jmc_30-jmc_23 19.63 0.12 0 -FEP_ejm_48-ejm_45 1.20 0.29 0 -FEP_jmc_30-ejm_42 17.93 0.10 0 -FEP_jmc_28-ejm_50 -11.88 0.17 0 -FEP_ejm_46-ejm_43 -0.91 0.29 0 -FEP_ejm_47-ejm_43 -5.12 0.25 0 -FEP_jmc_23-ejm_55 -7.10 0.28 0 -FEP_ejm_50-ejm_45 12.65 0.26 0 -FEP_ejm_49-ejm_48 -2.41 0.10 0 -FEP_jmc_30-ejm_44 17.83 0.11 0 -FEP_jmc_28-ejm_43 -8.58 0.21 0 -FEP_jmc_30-ejm_50 14.01 0.32 0 -FEP_ejm_49-ejm_31 -11.47 0.29 0 -FEP_ejm_43-ejm_42 0.74 0.18 0 -FEP_ejm_49-ejm_46 -9.25 0.34 0 -FEP_jmc_23-ejm_49 8.80 0.27 0 -FEP_ejm_55-ejm_54 -0.80 0.10 0 -FEP_ejm_44-ejm_43 -0.82 0.27 0 -FEP_jmc_28-jmc_27 -6.52 0.22 0 -FEP_ejm_54-ejm_49 16.06 0.35 0 -FEP_ejm_55-ejm_49 15.55 0.23 0 -FEP_ejm_46-ejm_44 -0.32 0.25 0 -FEP_ejm_55-ejm_46 6.13 0.11 0 -FEP_jmc_27-ejm_43 -2.36 0.13 0 -FEP_ejm_42-ejm_31 -1.37 0.30 0 -FEP_ejm_50-ejm_49 15.14 0.34 0 -FEP_jmc_28-ejm_47 -3.37 0.07 0 -FEP_jmc_30-ejm_45 27.09 0.15 0 -FEP_jmc_30-ejm_48 25.95 0.21 0 -FEP_ejm_43-ejm_31 -0.18 0.23 0 -FEP_jmc_30-ejm_46 18.89 0.21 0 -FEP_ejm_46-ejm_45 8.23 0.24 0 -FEP_ejm_47-ejm_44 -4.30 0.37 0 -FEP_jmc_27-ejm_47 2.76 0.38 0 -FEP_ejm_48-ejm_47 -2.75 0.27 0 -FEP_jmc_23-ejm_48 5.93 0.18 0 -FEP_ejm_54-ejm_44 6.54 0.18 0 -FEP_jmc_30-jmc_28 25.63 0.22 0 -FEP_ejm_55-ejm_31 3.64 0.19 0 -FEP_jmc_23-ejm_50 -5.69 0.16 0 -FEP_jmc_28-ejm_48 -0.03 0.10 0 -FEP_ejm_50-ejm_46 4.83 0.16 0 -FEP_jmc_23-ejm_42 -1.44 0.08 0 -FEP_ejm_50-ejm_44 4.50 0.24 0 -FEP_ejm_48-ejm_42 -7.68 0.29 0 -FEP_jmc_28-ejm_42 -7.99 0.22 0 -FEP_ejm_44-ejm_31 -1.11 0.31 0 -FEP_ejm_46-ejm_31 -2.07 0.17 0 -FEP_jmc_27-ejm_45 6.94 0.31 0 -FEP_ejm_48-ejm_44 -7.92 0.28 0 -FEP_jmc_28-ejm_46 -7.15 0.10 0 -FEP_ejm_46-ejm_42 -0.37 0.30 0 -FEP_jmc_23-ejm_54 -7.48 0.22 0 -FEP_ejm_49-ejm_42 -9.93 0.26 0 -FEP_ejm_54-ejm_48 13.84 0.12 0 -FEP_ejm_49-ejm_44 -10.62 0.27 0 -FEP_jmc_28-ejm_49 2.02 0.25 0 -FEP_jmc_28-ejm_55 -13.03 0.25 0 -FEP_ejm_55-ejm_42 5.16 0.16 0 -FEP_ejm_48-ejm_46 -6.87 0.15 0 -FEP_ejm_49-ejm_47 -5.08 0.18 0 -FEP_ejm_54-ejm_46 6.92 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100755 index 19ba421e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_jmc-23_ejm-43 -2.24 0.12 0 -FEP_ejm-54_ejm-47 10.73 0.14 0 -FEP_ejm-45_ejm-44 -8.93 0.43 0 -FEP_jmc-27_ejm-44 -1.63 0.30 0 -FEP_ejm-44_ejm-42 -0.35 0.25 0 -FEP_ejm-50_ejm-47 8.62 0.44 0 -FEP_ejm-47_ejm-46 -3.68 0.19 0 -FEP_jmc-30_ejm-43 17.03 0.24 0 -FEP_ejm-45_ejm-42 -8.70 0.20 0 -FEP_ejm-54_ejm-43 5.31 0.27 0 -FEP_ejm-48_ejm-31 -9.10 0.28 0 -FEP_ejm-48_ejm-43 -8.37 0.25 0 -FEP_ejm-50_ejm-48 11.98 0.24 0 -FEP_ejm-47_ejm-45 4.84 0.19 0 -FEP_jmc-28_ejm-45 1.83 0.25 0 -FEP_ejm-55_ejm-50 0.95 0.16 0 -FEP_jmc-27_ejm-49 8.42 0.20 0 -FEP_ejm-47_ejm-42 -4.31 0.29 0 -FEP_jmc-30_ejm-55 12.63 0.13 0 -FEP_jmc-30_ejm-31 16.94 0.23 0 -FEP_ejm-55_ejm-48 12.83 0.11 0 -FEP_ejm-55_ejm-44 5.11 0.23 0 -FEP_ejm-54_ejm-45 14.89 0.19 0 -FEP_ejm-55_ejm-43 4.82 0.12 0 -FEP_jmc-30_ejm-47 22.22 0.27 0 -FEP_ejm-49_ejm-43 -10.71 0.28 0 -FEP_jmc-27_ejm-46 -0.83 0.31 0 -FEP_ejm-54_ejm-42 5.94 0.13 0 -FEP_jmc-30_jmc-27 19.48 0.17 0 -FEP_jmc-23_ejm-47 2.67 0.20 0 -FEP_jmc-23_ejm-31 -2.23 0.25 0 -FEP_jmc-28_ejm-44 -7.85 0.34 0 -FEP_jmc-23_ejm-45 7.41 0.33 0 -FEP_jmc-27_ejm-48 6.07 0.11 0 -FEP_jmc-28_jmc-23 -6.34 0.26 0 -FEP_jmc-23_ejm-44 -1.61 0.15 0 -FEP_ejm-49_ejm-45 -1.23 0.36 0 -FEP_jmc-28_ejm-54 -13.18 0.20 0 -FEP_ejm-55_ejm-45 13.71 0.23 0 -FEP_jmc-30_ejm-54 12.76 0.30 0 -FEP_jmc-30_ejm-49 28.15 0.33 0 -FEP_ejm-50_ejm-42 4.21 0.11 0 -FEP_jmc-27_ejm-54 -7.71 0.13 0 -FEP_jmc-27_ejm-50 -5.65 0.14 0 -FEP_ejm-45_ejm-43 -9.64 0.25 0 -FEP_ejm-50_ejm-43 3.57 0.37 0 -FEP_jmc-28_ejm-31 -8.64 0.22 0 -FEP_ejm-50_ejm-31 2.87 0.29 0 -FEP_ejm-54_ejm-31 4.93 0.24 0 -FEP_jmc-23_ejm-46 -0.29 0.24 0 -FEP_ejm-54_ejm-50 1.81 0.15 0 -FEP_jmc-27_ejm-42 -1.64 0.20 0 -FEP_jmc-27_ejm-55 -7.04 0.14 0 -FEP_jmc-27_jmc-23 -0.15 0.30 0 -FEP_ejm-47_ejm-31 -5.38 0.14 0 -FEP_ejm-55_ejm-47 9.41 0.18 0 -FEP_jmc-27_ejm-31 -2.25 0.21 0 -FEP_ejm-45_ejm-31 -9.72 0.20 0 -FEP_jmc-30_jmc-23 19.63 0.12 0 -FEP_ejm-48_ejm-45 1.20 0.29 0 -FEP_jmc-30_ejm-42 17.93 0.10 0 -FEP_jmc-28_ejm-50 -11.88 0.17 0 -FEP_ejm-46_ejm-43 -0.91 0.29 0 -FEP_ejm-47_ejm-43 -5.12 0.25 0 -FEP_jmc-23_ejm-55 -7.10 0.28 0 -FEP_ejm-50_ejm-45 12.65 0.26 0 -FEP_ejm-49_ejm-48 -2.41 0.10 0 -FEP_jmc-30_ejm-44 17.83 0.11 0 -FEP_jmc-28_ejm-43 -8.58 0.21 0 -FEP_jmc-30_ejm-50 14.01 0.32 0 -FEP_ejm-49_ejm-31 -11.47 0.29 0 -FEP_ejm-43_ejm-42 0.74 0.18 0 -FEP_ejm-49_ejm-46 -9.25 0.34 0 -FEP_jmc-23_ejm-49 8.80 0.27 0 -FEP_ejm-55_ejm-54 -0.80 0.10 0 -FEP_ejm-44_ejm-43 -0.82 0.27 0 -FEP_jmc-28_jmc-27 -6.52 0.22 0 -FEP_ejm-54_ejm-49 16.06 0.35 0 -FEP_ejm-55_ejm-49 15.55 0.23 0 -FEP_ejm-46_ejm-44 -0.32 0.25 0 -FEP_ejm-55_ejm-46 6.13 0.11 0 -FEP_jmc-27_ejm-43 -2.36 0.13 0 -FEP_ejm-42_ejm-31 -1.37 0.30 0 -FEP_ejm-50_ejm-49 15.14 0.34 0 -FEP_jmc-28_ejm-47 -3.37 0.07 0 -FEP_jmc-30_ejm-45 27.09 0.15 0 -FEP_jmc-30_ejm-48 25.95 0.21 0 -FEP_ejm-43_ejm-31 -0.18 0.23 0 -FEP_jmc-30_ejm-46 18.89 0.21 0 -FEP_ejm-46_ejm-45 8.23 0.24 0 -FEP_ejm-47_ejm-44 -4.30 0.37 0 -FEP_jmc-27_ejm-47 2.76 0.38 0 -FEP_ejm-48_ejm-47 -2.75 0.27 0 -FEP_jmc-23_ejm-48 5.93 0.18 0 -FEP_ejm-54_ejm-44 6.54 0.18 0 -FEP_jmc-30_jmc-28 25.63 0.22 0 -FEP_ejm-55_ejm-31 3.64 0.19 0 -FEP_jmc-23_ejm-50 -5.69 0.16 0 -FEP_jmc-28_ejm-48 -0.03 0.10 0 -FEP_ejm-50_ejm-46 4.83 0.16 0 -FEP_jmc-23_ejm-42 -1.44 0.08 0 -FEP_ejm-50_ejm-44 4.50 0.24 0 -FEP_ejm-48_ejm-42 -7.68 0.29 0 -FEP_jmc-28_ejm-42 -7.99 0.22 0 -FEP_ejm-44_ejm-31 -1.11 0.31 0 -FEP_ejm-46_ejm-31 -2.07 0.17 0 -FEP_jmc-27_ejm-45 6.94 0.31 0 -FEP_ejm-48_ejm-44 -7.92 0.28 0 -FEP_jmc-28_ejm-46 -7.15 0.10 0 -FEP_ejm-46_ejm-42 -0.37 0.30 0 -FEP_jmc-23_ejm-54 -7.48 0.22 0 -FEP_ejm-49_ejm-42 -9.93 0.26 0 -FEP_ejm-54_ejm-48 13.84 0.12 0 -FEP_ejm-49_ejm-44 -10.62 0.27 0 -FEP_jmc-28_ejm-49 2.02 0.25 0 -FEP_jmc-28_ejm-55 -13.03 0.25 0 -FEP_ejm-55_ejm-42 5.16 0.16 0 -FEP_ejm-48_ejm-46 -6.87 0.15 0 -FEP_ejm-49_ejm-47 -5.08 0.18 0 -FEP_ejm-54_ejm-46 6.92 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/water_replicates.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/water_replicates.txt deleted file mode 100755 index 5cab51e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/no-vs/2fs/water_replicates.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -perturbation failed replicates -FEP_ejm_42-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_43-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_43-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_44-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_44-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_44-ejm_43/ 1 -FEP_ejm_45-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_45-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_45-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_45-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_46-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_47-ejm_45/ 1 -FEP_ejm_47-ejm_46/ 1 -FEP_ejm_48-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_48-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_42/ 1 -FEP_ejm_49-ejm_43/ 1 -FEP_ejm_49-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_49-ejm_48/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_47/ 1 -FEP_ejm_50-ejm_48/ 0 -FEP_ejm_50-ejm_49/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_31/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_48/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_49/ 0 -FEP_ejm_54-ejm_50/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_31/ 2 -FEP_ejm_55-ejm_42/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_43/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_44/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_45/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_46/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_47/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_48/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_49/ 0 -FEP_ejm_55-ejm_50/ 1 -FEP_ejm_55-ejm_54/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_31/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_42/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_43/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_44/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_45/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_47/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_48/ 1 -FEP_jmc_23-ejm_49/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_50/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_54/ 0 -FEP_jmc_23-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_42/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_43/ 1 -FEP_jmc_27-ejm_44/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_45/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_47/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_48/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_49/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_50/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_54/ 0 -FEP_jmc_27-ejm_55/ 2 -FEP_jmc_27-jmc_23/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_42/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_43/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_44/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_45/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_47/ 1 -FEP_jmc_28-ejm_48/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_49/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_50/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_54/ 0 -FEP_jmc_28-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_28-jmc_23/ 0 -FEP_jmc_28-jmc_27/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_31/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_42/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_43/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_44/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_45/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_46/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_47/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_48/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_49/ 1 -FEP_jmc_30-ejm_50/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_54/ 0 -FEP_jmc_30-ejm_55/ 0 -FEP_jmc_30-jmc_23/ 0 -FEP_jmc_30-jmc_27/ 1 -FEP_jmc_30-jmc_28/ 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/protein.txt deleted file mode 100755 index 0dcd9eae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_jmc_23-ejm_43 -0.27 0.19 1 -FEP_ejm_54-ejm_47 9.92 0.23 1 -FEP_ejm_45-ejm_44 -7.04 0.16 0 -FEP_jmc_27-ejm_44 1.50 0.18 0 -FEP_ejm_44-ejm_42 -1.77 0.34 4 -FEP_ejm_50-ejm_47 7.24 0.19 0 -FEP_ejm_47-ejm_46 -4.57 0.16 0 -FEP_jmc_30-ejm_43 18.70 0.31 1 -FEP_ejm_45-ejm_42 -8.67 0.14 0 -FEP_ejm_54-ejm_43 6.21 0.25 0 -FEP_ejm_48-ejm_31 -9.68 0.24 0 -FEP_ejm_48-ejm_43 -8.02 0.19 2 -FEP_ejm_50-ejm_48 10.74 0.28 0 -FEP_ejm_47-ejm_45 4.26 0.16 0 -FEP_jmc_28-ejm_45 2.64 0.17 0 -FEP_ejm_55-ejm_50 3.02 0.15 0 -FEP_jmc_27-ejm_49 11.66 0.19 1 -FEP_ejm_47-ejm_42 -4.37 0.16 0 -FEP_jmc_30-ejm_55 12.66 0.21 0 -FEP_jmc_30-ejm_31 17.82 0.31 0 -FEP_ejm_55-ejm_48 14.05 0.19 3 -FEP_ejm_55-ejm_44 7.89 0.23 0 -FEP_ejm_54-ejm_45 14.22 0.19 0 -FEP_ejm_55-ejm_43 6.12 0.20 0 -FEP_jmc_30-ejm_47 22.57 0.21 0 -FEP_ejm_49-ejm_43 -11.92 0.20 4 -FEP_jmc_27-ejm_46 -0.55 0.12 0 -FEP_ejm_54-ejm_42 5.64 0.09 1 -FEP_jmc_30-jmc_27 18.76 0.18 0 -FEP_jmc_23-ejm_47 3.19 0.14 1 -FEP_jmc_23-ejm_31 -1.81 0.22 0 -FEP_jmc_28-ejm_44 -4.75 0.25 2 -FEP_jmc_23-ejm_45 8.03 0.14 1 -FEP_jmc_27-ejm_48 7.83 0.24 2 -FEP_jmc_28-jmc_23 -6.36 0.15 1 -FEP_jmc_23-ejm_44 0.84 0.29 1 -FEP_ejm_49-ejm_45 -3.25 0.17 5 -FEP_jmc_28-ejm_54 -12.22 0.14 1 -FEP_ejm_55-ejm_45 14.72 0.22 0 -FEP_jmc_30-ejm_54 13.43 0.30 1 -FEP_jmc_30-ejm_49 31.05 0.38 0 -FEP_ejm_50-ejm_42 3.23 0.22 0 -FEP_jmc_27-ejm_54 -6.10 0.20 0 -FEP_jmc_27-ejm_50 -3.22 0.22 0 -FEP_ejm_45-ejm_43 -8.41 0.13 0 -FEP_ejm_50-ejm_43 3.47 0.29 0 -FEP_jmc_28-ejm_31 -7.33 0.13 0 -FEP_ejm_50-ejm_31 1.85 0.09 0 -FEP_ejm_54-ejm_31 4.64 0.15 0 -FEP_jmc_23-ejm_46 -0.96 0.15 0 -FEP_ejm_54-ejm_50 2.18 0.19 0 -FEP_jmc_27-ejm_42 -0.52 0.22 0 -FEP_jmc_27-ejm_55 -6.54 0.16 1 -FEP_jmc_27-jmc_23 0.53 0.06 0 -FEP_ejm_47-ejm_31 -5.17 0.18 0 -FEP_ejm_55-ejm_47 10.56 0.13 0 -FEP_jmc_27-ejm_31 -1.70 0.19 0 -FEP_ejm_45-ejm_31 -9.88 0.16 0 -FEP_jmc_30-jmc_23 19.13 0.22 0 -FEP_ejm_48-ejm_45 0.09 0.24 2 -FEP_jmc_30-ejm_42 18.54 0.24 1 -FEP_jmc_28-ejm_50 -10.10 0.23 0 -FEP_ejm_46-ejm_43 0.27 0.14 0 -FEP_ejm_47-ejm_43 -4.58 0.14 0 -FEP_jmc_23-ejm_55 -6.83 0.14 1 -FEP_ejm_50-ejm_45 11.95 0.20 0 -FEP_ejm_49-ejm_48 -3.50 0.24 5 -FEP_jmc_30-ejm_44 19.67 0.37 0 -FEP_jmc_28-ejm_43 -6.41 0.14 0 -FEP_jmc_30-ejm_50 15.86 0.25 0 -FEP_ejm_49-ejm_31 -13.63 0.32 0 -FEP_ejm_43-ejm_42 -0.17 0.22 0 -FEP_ejm_49-ejm_46 -12.26 0.19 0 -FEP_jmc_23-ejm_49 11.77 0.17 1 -FEP_ejm_55-ejm_54 0.54 0.20 0 -FEP_ejm_44-ejm_43 -1.71 0.18 2 -FEP_jmc_28-jmc_27 -6.60 0.15 0 -FEP_ejm_54-ejm_49 18.04 0.22 0 -FEP_ejm_55-ejm_49 17.71 0.36 1 -FEP_ejm_46-ejm_44 1.90 0.18 1 -FEP_ejm_55-ejm_46 5.96 0.10 0 -FEP_jmc_27-ejm_43 0.16 0.20 1 -FEP_ejm_42-ejm_31 -1.08 0.11 0 -FEP_ejm_50-ejm_49 15.32 0.32 0 -FEP_jmc_28-ejm_47 -3.05 0.19 0 -FEP_jmc_30-ejm_45 27.90 0.29 0 -FEP_jmc_30-ejm_48 26.12 0.30 0 -FEP_ejm_43-ejm_31 -1.17 0.14 0 -FEP_jmc_30-ejm_46 18.38 0.20 1 -FEP_ejm_46-ejm_45 9.09 0.14 0 -FEP_ejm_47-ejm_44 -2.92 0.19 0 -FEP_jmc_27-ejm_47 4.20 0.15 0 -FEP_ejm_48-ejm_47 -3.78 0.08 1 -FEP_jmc_23-ejm_48 7.26 0.21 0 -FEP_ejm_54-ejm_44 7.20 0.30 1 -FEP_jmc_30-jmc_28 25.04 0.17 0 -FEP_ejm_55-ejm_31 4.91 0.08 0 -FEP_jmc_23-ejm_50 -3.68 0.21 0 -FEP_jmc_28-ejm_48 1.29 0.10 1 -FEP_ejm_50-ejm_46 2.72 0.15 0 -FEP_jmc_23-ejm_42 -0.81 0.14 0 -FEP_ejm_50-ejm_44 4.59 0.24 0 -FEP_ejm_48-ejm_42 -8.74 0.19 0 -FEP_jmc_28-ejm_42 -6.50 0.16 0 -FEP_ejm_44-ejm_31 -2.63 0.31 2 -FEP_ejm_46-ejm_31 -1.08 0.13 0 -FEP_jmc_27-ejm_45 8.43 0.15 0 -FEP_ejm_48-ejm_44 -6.56 0.25 0 -FEP_jmc_28-ejm_46 -6.93 0.14 0 -FEP_ejm_46-ejm_42 0.17 0.12 1 -FEP_jmc_23-ejm_54 -6.06 0.10 0 -FEP_ejm_49-ejm_42 -12.58 0.20 2 -FEP_ejm_54-ejm_48 13.86 0.28 0 -FEP_ejm_49-ejm_44 -11.20 0.19 4 -FEP_jmc_28-ejm_49 5.94 0.22 1 -FEP_jmc_28-ejm_55 -13.00 0.20 0 -FEP_ejm_55-ejm_42 6.03 0.11 0 -FEP_ejm_48-ejm_46 -8.65 0.17 0 -FEP_ejm_49-ejm_47 -8.16 0.12 5 -FEP_ejm_54-ejm_46 5.40 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/water.txt deleted file mode 100755 index 713b6cbf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/7.Tyk2/water.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_jmc_23-ejm_43 -2.24 0.12 0 -FEP_ejm_54-ejm_47 10.73 0.14 0 -FEP_ejm_45-ejm_44 -8.93 0.43 0 -FEP_jmc_27-ejm_44 -1.63 0.30 0 -FEP_ejm_44-ejm_42 -0.35 0.25 0 -FEP_ejm_50-ejm_47 8.62 0.44 0 -FEP_ejm_47-ejm_46 -3.68 0.19 0 -FEP_jmc_30-ejm_43 17.03 0.24 0 -FEP_ejm_45-ejm_42 -8.70 0.20 0 -FEP_ejm_54-ejm_43 5.31 0.27 0 -FEP_ejm_48-ejm_31 -9.10 0.28 0 -FEP_ejm_48-ejm_43 -8.37 0.25 0 -FEP_ejm_50-ejm_48 11.98 0.24 0 -FEP_ejm_47-ejm_45 4.84 0.19 0 -FEP_jmc_28-ejm_45 1.83 0.25 0 -FEP_ejm_55-ejm_50 0.95 0.16 0 -FEP_jmc_27-ejm_49 8.42 0.20 0 -FEP_ejm_47-ejm_42 -4.31 0.29 0 -FEP_jmc_30-ejm_55 12.63 0.13 0 -FEP_jmc_30-ejm_31 16.94 0.23 0 -FEP_ejm_55-ejm_48 12.83 0.11 0 -FEP_ejm_55-ejm_44 5.11 0.23 0 -FEP_ejm_54-ejm_45 14.89 0.19 0 -FEP_ejm_55-ejm_43 4.82 0.12 0 -FEP_jmc_30-ejm_47 22.22 0.27 0 -FEP_ejm_49-ejm_43 -10.71 0.28 0 -FEP_jmc_27-ejm_46 -0.83 0.31 0 -FEP_ejm_54-ejm_42 5.94 0.13 0 -FEP_jmc_30-jmc_27 19.48 0.17 0 -FEP_jmc_23-ejm_47 2.67 0.20 0 -FEP_jmc_23-ejm_31 -2.23 0.25 0 -FEP_jmc_28-ejm_44 -7.85 0.34 0 -FEP_jmc_23-ejm_45 7.41 0.33 0 -FEP_jmc_27-ejm_48 6.07 0.11 0 -FEP_jmc_28-jmc_23 -6.34 0.26 0 -FEP_jmc_23-ejm_44 -1.61 0.15 0 -FEP_ejm_49-ejm_45 -1.23 0.36 0 -FEP_jmc_28-ejm_54 -13.18 0.20 0 -FEP_ejm_55-ejm_45 13.71 0.23 0 -FEP_jmc_30-ejm_54 12.76 0.30 0 -FEP_jmc_30-ejm_49 28.15 0.33 0 -FEP_ejm_50-ejm_42 4.21 0.11 0 -FEP_jmc_27-ejm_54 -7.71 0.13 0 -FEP_jmc_27-ejm_50 -5.65 0.14 0 -FEP_ejm_45-ejm_43 -9.64 0.25 0 -FEP_ejm_50-ejm_43 3.57 0.37 0 -FEP_jmc_28-ejm_31 -8.64 0.22 0 -FEP_ejm_50-ejm_31 2.87 0.29 0 -FEP_ejm_54-ejm_31 4.93 0.24 0 -FEP_jmc_23-ejm_46 -0.29 0.24 0 -FEP_ejm_54-ejm_50 1.81 0.15 0 -FEP_jmc_27-ejm_42 -1.64 0.20 0 -FEP_jmc_27-ejm_55 -7.04 0.14 0 -FEP_jmc_27-jmc_23 -0.15 0.30 0 -FEP_ejm_47-ejm_31 -5.38 0.14 0 -FEP_ejm_55-ejm_47 9.41 0.18 0 -FEP_jmc_27-ejm_31 -2.25 0.21 0 -FEP_ejm_45-ejm_31 -9.72 0.20 0 -FEP_jmc_30-jmc_23 19.63 0.12 0 -FEP_ejm_48-ejm_45 1.20 0.29 0 -FEP_jmc_30-ejm_42 17.93 0.10 0 -FEP_jmc_28-ejm_50 -11.88 0.17 0 -FEP_ejm_46-ejm_43 -0.91 0.29 0 -FEP_ejm_47-ejm_43 -5.12 0.25 0 -FEP_jmc_23-ejm_55 -7.10 0.28 0 -FEP_ejm_50-ejm_45 12.65 0.26 0 -FEP_ejm_49-ejm_48 -2.41 0.10 0 -FEP_jmc_30-ejm_44 17.83 0.11 0 -FEP_jmc_28-ejm_43 -8.58 0.21 0 -FEP_jmc_30-ejm_50 14.01 0.32 0 -FEP_ejm_49-ejm_31 -11.47 0.29 0 -FEP_ejm_43-ejm_42 0.74 0.18 0 -FEP_ejm_49-ejm_46 -9.25 0.34 0 -FEP_jmc_23-ejm_49 8.80 0.27 0 -FEP_ejm_55-ejm_54 -0.80 0.10 0 -FEP_ejm_44-ejm_43 -0.82 0.27 0 -FEP_jmc_28-jmc_27 -6.52 0.22 0 -FEP_ejm_54-ejm_49 16.06 0.35 0 -FEP_ejm_55-ejm_49 15.55 0.23 0 -FEP_ejm_46-ejm_44 -0.32 0.25 0 -FEP_ejm_55-ejm_46 6.13 0.11 0 -FEP_jmc_27-ejm_43 -2.36 0.13 0 -FEP_ejm_42-ejm_31 -1.37 0.30 0 -FEP_ejm_50-ejm_49 15.14 0.34 0 -FEP_jmc_28-ejm_47 -3.37 0.07 0 -FEP_jmc_30-ejm_45 27.09 0.15 0 -FEP_jmc_30-ejm_48 25.95 0.21 0 -FEP_ejm_43-ejm_31 -0.18 0.23 0 -FEP_jmc_30-ejm_46 18.89 0.21 0 -FEP_ejm_46-ejm_45 8.23 0.24 0 -FEP_ejm_47-ejm_44 -4.30 0.37 0 -FEP_jmc_27-ejm_47 2.76 0.38 0 -FEP_ejm_48-ejm_47 -2.75 0.27 0 -FEP_jmc_23-ejm_48 5.93 0.18 0 -FEP_ejm_54-ejm_44 6.54 0.18 0 -FEP_jmc_30-jmc_28 25.63 0.22 0 -FEP_ejm_55-ejm_31 3.64 0.19 0 -FEP_jmc_23-ejm_50 -5.69 0.16 0 -FEP_jmc_28-ejm_48 -0.03 0.10 0 -FEP_ejm_50-ejm_46 4.83 0.16 0 -FEP_jmc_23-ejm_42 -1.44 0.08 0 -FEP_ejm_50-ejm_44 4.50 0.24 0 -FEP_ejm_48-ejm_42 -7.68 0.29 0 -FEP_jmc_28-ejm_42 -7.99 0.22 0 -FEP_ejm_44-ejm_31 -1.11 0.31 0 -FEP_ejm_46-ejm_31 -2.07 0.17 0 -FEP_jmc_27-ejm_45 6.94 0.31 0 -FEP_ejm_48-ejm_44 -7.92 0.28 0 -FEP_jmc_28-ejm_46 -7.15 0.10 0 -FEP_ejm_46-ejm_42 -0.37 0.30 0 -FEP_jmc_23-ejm_54 -7.48 0.22 0 -FEP_ejm_49-ejm_42 -9.93 0.26 0 -FEP_ejm_54-ejm_48 13.84 0.12 0 -FEP_ejm_49-ejm_44 -10.62 0.27 0 -FEP_jmc_28-ejm_49 2.02 0.25 0 -FEP_jmc_28-ejm_55 -13.03 0.25 0 -FEP_ejm_55-ejm_42 5.16 0.16 0 -FEP_ejm_48-ejm_46 -6.87 0.15 0 -FEP_ejm_49-ejm_47 -5.08 0.18 0 -FEP_ejm_54-ejm_46 6.92 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/check_missing.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/check_missing.py deleted file mode 100755 index 0d449093..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/check_missing.py +++ /dev/null @@ -1,43 +0,0 @@ -l1 = [] -l2 = [] - -with open('protein.txt', 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - l1.append(line[0]) -infile.close() - -for f in ['water.txt']: - with open(f, 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - l2.append(line[0]) -infile.close() - -list1 = [item for item in l2 if item not in l1] #in water but not in protein -list2 = [item for item in l1 if item not in l2] #in protein but not in water -print(list2) - -with open('protein.txt', 'r') as infile: - with open('super_protein.txt', 'w') as outfile1: - for line in infile: - line = line.split() - if line[0] not in list2: - outfile1.write('{}\t{}\t{}\t{}\n'.format(line[0], line[1], line[2], line[3])) - else: - continue -infile.close() -outfile1.close() - -with open('water.txt', 'r') as infile: - with open('super_water.txt', 'w') as outfile2: - for line in infile: - line = line.split() - if line[0] not in list1: - outfile2.write('{}\t{}\t{}\t{}\n'.format(line[0], line[1], line[2], line[3])) - else: - continue -infile.close() -outfile2.close() - - diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/correct_file.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/correct_file.py deleted file mode 100755 index 710275b5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/correct_file.py +++ /dev/null @@ -1,12 +0,0 @@ -feps = [] -with open('water.txt', 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - if line[0] == 'FEP': - continue - else: - feps.append(line[0]) -infile.close() -for i in feps: - if feps.count(i) > 1: - print(i) diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/check_missing.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/check_missing.py deleted file mode 100755 index 0d449093..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/check_missing.py +++ /dev/null @@ -1,43 +0,0 @@ -l1 = [] -l2 = [] - -with open('protein.txt', 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - l1.append(line[0]) -infile.close() - -for f in ['water.txt']: - with open(f, 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - l2.append(line[0]) -infile.close() - -list1 = [item for item in l2 if item not in l1] #in water but not in protein -list2 = [item for item in l1 if item not in l2] #in protein but not in water -print(list2) - -with open('protein.txt', 'r') as infile: - with open('super_protein.txt', 'w') as outfile1: - for line in infile: - line = line.split() - if line[0] not in list2: - outfile1.write('{}\t{}\t{}\t{}\n'.format(line[0], line[1], line[2], line[3])) - else: - continue -infile.close() -outfile1.close() - -with open('water.txt', 'r') as infile: - with open('super_water.txt', 'w') as outfile2: - for line in infile: - line = line.split() - if line[0] not in list1: - outfile2.write('{}\t{}\t{}\t{}\n'.format(line[0], line[1], line[2], line[3])) - else: - continue -infile.close() -outfile2.close() - - diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/correct_file.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/correct_file.py deleted file mode 100755 index 710275b5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/correct_file.py +++ /dev/null @@ -1,12 +0,0 @@ -feps = [] -with open('water.txt', 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - if line[0] == 'FEP': - continue - else: - feps.append(line[0]) -infile.close() -for i in feps: - if feps.count(i) > 1: - print(i) diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/missing_pairs.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/missing_pairs.txt deleted file mode 100755 index d4f966d2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/missing_pairs.txt +++ /dev/null @@ -1,25 +0,0 @@ -p38a_2u p38a_2aa -p38a_2g p38a_2c -p38a_2k p38a_2c -p38a_2q p38a_2c -p38a_2s p38a_2c -p38a_2u p38a_2c -p38a_2x p38a_2c -p38a_3fmh p38a_2c -p38a_2p p38a_2f -p38a_2q p38a_2g -p38a_2q p38a_2j -p38a_2v p38a_2u -p38a_2z p38a_2u -p38a_3fly p38a_2u -p38a_3flz p38a_2u -p38a_2u p38a_2aa -p38a_2u p38a_2bb -p38a_2p p38a_2c -p38a_2r p38a_2c -p38a_2o p38a_2ee -p38a_2u p38a_2ee -p38a_2u p38a_2f -p38a_2u p38a_2h -p38a_3flz p38a_2p -p38a_3flz p38a_2u diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/pairs.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/pairs.txt deleted file mode 100755 index a124a500..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/pairs.txt +++ /dev/null @@ -1,561 +0,0 @@ -p38a_2bb p38a_2aa -p38a_2c p38a_2aa -p38a_2e p38a_2aa -p38a_2ee p38a_2aa -p38a_2f p38a_2aa -p38a_2ff p38a_2aa -p38a_2g p38a_2aa -p38a_2gg p38a_2aa -p38a_2h p38a_2aa -p38a_2i p38a_2aa -p38a_2j p38a_2aa -p38a_2k p38a_2aa -p38a_2l p38a_2aa -p38a_2m p38a_2aa -p38a_2n p38a_2aa -p38a_2o p38a_2aa -p38a_2p p38a_2aa -p38a_2q p38a_2aa -p38a_2r p38a_2aa -p38a_2s p38a_2aa -p38a_2t p38a_2aa -p38a_2u p38a_2aa -p38a_2v p38a_2aa -p38a_2x p38a_2aa -p38a_2y p38a_2aa -p38a_2z p38a_2aa -p38a_3fln p38a_2aa -p38a_3flq p38a_2aa -p38a_3flw p38a_2aa -p38a_3fly p38a_2aa -p38a_3flz p38a_2aa -p38a_3fmh p38a_2aa -p38a_3fmk p38a_2aa -p38a_2c p38a_2bb -p38a_2e p38a_2bb -p38a_2ee p38a_2bb -p38a_2f p38a_2bb -p38a_2ff p38a_2bb -p38a_2g p38a_2bb -p38a_2gg p38a_2bb -p38a_2h p38a_2bb -p38a_2i p38a_2bb -p38a_2j p38a_2bb -p38a_2k p38a_2bb -p38a_2l p38a_2bb -p38a_2m p38a_2bb -p38a_2n p38a_2bb -p38a_2o p38a_2bb -p38a_2p p38a_2bb -p38a_2q p38a_2bb -p38a_2r p38a_2bb -p38a_2s p38a_2bb -p38a_2t p38a_2bb -p38a_2u p38a_2bb -p38a_2v p38a_2bb -p38a_2x p38a_2bb -p38a_2y p38a_2bb -p38a_2z p38a_2bb -p38a_3fln p38a_2bb -p38a_3flq p38a_2bb -p38a_3flw p38a_2bb -p38a_3fly p38a_2bb -p38a_3flz p38a_2bb -p38a_3fmh p38a_2bb -p38a_3fmk p38a_2bb -p38a_2e p38a_2c -p38a_2ee p38a_2c -p38a_2f p38a_2c -p38a_2ff p38a_2c -p38a_2g p38a_2c -p38a_2gg p38a_2c -p38a_2h p38a_2c -p38a_2i p38a_2c -p38a_2j p38a_2c -p38a_2k p38a_2c -p38a_2l p38a_2c -p38a_2m p38a_2c -p38a_2n p38a_2c -p38a_2o p38a_2c -p38a_2p p38a_2c -p38a_2q p38a_2c -p38a_2r p38a_2c -p38a_2s p38a_2c -p38a_2t p38a_2c -p38a_2u p38a_2c -p38a_2v p38a_2c -p38a_2x p38a_2c -p38a_2y p38a_2c -p38a_2z p38a_2c -p38a_3fln p38a_2c -p38a_3flq p38a_2c -p38a_3flw p38a_2c -p38a_3fly p38a_2c -p38a_3flz p38a_2c -p38a_3fmh p38a_2c -p38a_3fmk p38a_2c -p38a_2ee p38a_2e -p38a_2f p38a_2e -p38a_2ff p38a_2e -p38a_2g p38a_2e -p38a_2gg p38a_2e -p38a_2h p38a_2e -p38a_2i p38a_2e -p38a_2j p38a_2e -p38a_2k p38a_2e -p38a_2l p38a_2e -p38a_2m p38a_2e -p38a_2n p38a_2e -p38a_2o p38a_2e -p38a_2p p38a_2e -p38a_2q p38a_2e -p38a_2r p38a_2e -p38a_2s p38a_2e -p38a_2t p38a_2e -p38a_2u p38a_2e -p38a_2v p38a_2e -p38a_2x p38a_2e -p38a_2y p38a_2e -p38a_2z p38a_2e -p38a_3fln p38a_2e -p38a_3flq p38a_2e -p38a_3flw p38a_2e -p38a_3fly p38a_2e -p38a_3flz p38a_2e -p38a_3fmh p38a_2e -p38a_3fmk p38a_2e -p38a_2f p38a_2ee -p38a_2ff p38a_2ee -p38a_2g p38a_2ee -p38a_2gg p38a_2ee -p38a_2h p38a_2ee -p38a_2i p38a_2ee -p38a_2j p38a_2ee -p38a_2k p38a_2ee -p38a_2l p38a_2ee -p38a_2m p38a_2ee -p38a_2n p38a_2ee -p38a_2o p38a_2ee -p38a_2p p38a_2ee -p38a_2q p38a_2ee -p38a_2r p38a_2ee -p38a_2s p38a_2ee -p38a_2t p38a_2ee -p38a_2u p38a_2ee -p38a_2v p38a_2ee -p38a_2x p38a_2ee -p38a_2y p38a_2ee -p38a_2z p38a_2ee -p38a_3fln p38a_2ee -p38a_3flq p38a_2ee -p38a_3flw p38a_2ee -p38a_3fly p38a_2ee -p38a_3flz p38a_2ee -p38a_3fmh p38a_2ee -p38a_3fmk p38a_2ee -p38a_2ff p38a_2f -p38a_2g p38a_2f -p38a_2gg p38a_2f -p38a_2h p38a_2f -p38a_2i p38a_2f -p38a_2j p38a_2f -p38a_2k p38a_2f -p38a_2l p38a_2f -p38a_2m p38a_2f -p38a_2n p38a_2f -p38a_2o p38a_2f -p38a_2p p38a_2f -p38a_2q p38a_2f -p38a_2r p38a_2f -p38a_2s p38a_2f -p38a_2t p38a_2f -p38a_2u p38a_2f -p38a_2v p38a_2f -p38a_2x p38a_2f -p38a_2y p38a_2f -p38a_2z p38a_2f -p38a_3fln p38a_2f -p38a_3flq p38a_2f -p38a_3flw p38a_2f -p38a_3fly p38a_2f -p38a_3flz p38a_2f -p38a_3fmh p38a_2f -p38a_3fmk p38a_2f -p38a_2g p38a_2ff -p38a_2gg p38a_2ff -p38a_2h p38a_2ff -p38a_2i p38a_2ff -p38a_2j p38a_2ff -p38a_2k p38a_2ff -p38a_2l p38a_2ff -p38a_2m p38a_2ff -p38a_2n p38a_2ff -p38a_2o p38a_2ff -p38a_2p p38a_2ff -p38a_2q p38a_2ff -p38a_2r p38a_2ff -p38a_2s p38a_2ff -p38a_2t p38a_2ff -p38a_2u p38a_2ff -p38a_2v p38a_2ff -p38a_2x p38a_2ff -p38a_2y p38a_2ff -p38a_2z p38a_2ff -p38a_3fln p38a_2ff -p38a_3flq p38a_2ff -p38a_3flw p38a_2ff -p38a_3fly p38a_2ff -p38a_3flz p38a_2ff -p38a_3fmh p38a_2ff -p38a_3fmk p38a_2ff -p38a_2gg p38a_2g -p38a_2h p38a_2g -p38a_2i p38a_2g -p38a_2j p38a_2g -p38a_2k p38a_2g -p38a_2l p38a_2g -p38a_2m p38a_2g -p38a_2n p38a_2g -p38a_2o p38a_2g -p38a_2p p38a_2g -p38a_2q p38a_2g -p38a_2r p38a_2g -p38a_2s p38a_2g -p38a_2t p38a_2g -p38a_2u p38a_2g -p38a_2v p38a_2g -p38a_2x p38a_2g -p38a_2y p38a_2g -p38a_2z p38a_2g -p38a_3fln p38a_2g -p38a_3flq p38a_2g -p38a_3flw p38a_2g -p38a_3fly p38a_2g -p38a_3flz p38a_2g -p38a_3fmh p38a_2g -p38a_3fmk p38a_2g -p38a_2h p38a_2gg -p38a_2i p38a_2gg -p38a_2j p38a_2gg -p38a_2k p38a_2gg -p38a_2l p38a_2gg -p38a_2m p38a_2gg -p38a_2n p38a_2gg -p38a_2o p38a_2gg -p38a_2p p38a_2gg -p38a_2q p38a_2gg -p38a_2r p38a_2gg -p38a_2s p38a_2gg -p38a_2t p38a_2gg -p38a_2u p38a_2gg -p38a_2v p38a_2gg -p38a_2x p38a_2gg -p38a_2y p38a_2gg -p38a_2z p38a_2gg -p38a_3fln p38a_2gg -p38a_3flq p38a_2gg -p38a_3flw p38a_2gg -p38a_3fly p38a_2gg -p38a_3flz p38a_2gg -p38a_3fmh p38a_2gg -p38a_3fmk p38a_2gg -p38a_2i p38a_2h -p38a_2j p38a_2h -p38a_2k p38a_2h -p38a_2l p38a_2h -p38a_2m p38a_2h -p38a_2n p38a_2h -p38a_2o p38a_2h -p38a_2p p38a_2h -p38a_2q p38a_2h -p38a_2r p38a_2h -p38a_2s p38a_2h -p38a_2t p38a_2h -p38a_2u p38a_2h -p38a_2v p38a_2h -p38a_2x p38a_2h -p38a_2y p38a_2h -p38a_2z p38a_2h -p38a_3fln p38a_2h -p38a_3flq p38a_2h -p38a_3flw p38a_2h -p38a_3fly p38a_2h -p38a_3flz p38a_2h -p38a_3fmh p38a_2h -p38a_3fmk p38a_2h -p38a_2j p38a_2i -p38a_2k p38a_2i -p38a_2l p38a_2i -p38a_2m p38a_2i -p38a_2n p38a_2i -p38a_2o p38a_2i -p38a_2p p38a_2i -p38a_2q p38a_2i -p38a_2r p38a_2i -p38a_2s p38a_2i -p38a_2t p38a_2i -p38a_2u p38a_2i -p38a_2v p38a_2i -p38a_2x p38a_2i -p38a_2y p38a_2i -p38a_2z p38a_2i -p38a_3fln p38a_2i -p38a_3flq p38a_2i -p38a_3flw p38a_2i -p38a_3fly p38a_2i -p38a_3flz p38a_2i -p38a_3fmh p38a_2i -p38a_3fmk p38a_2i -p38a_2k p38a_2j -p38a_2l p38a_2j -p38a_2m p38a_2j -p38a_2n p38a_2j -p38a_2o p38a_2j -p38a_2p p38a_2j -p38a_2q p38a_2j -p38a_2r p38a_2j -p38a_2s p38a_2j -p38a_2t p38a_2j -p38a_2u p38a_2j -p38a_2v p38a_2j -p38a_2x p38a_2j -p38a_2y p38a_2j -p38a_2z p38a_2j -p38a_3fln p38a_2j -p38a_3flq p38a_2j -p38a_3flw p38a_2j -p38a_3fly p38a_2j -p38a_3flz p38a_2j -p38a_3fmh p38a_2j -p38a_3fmk p38a_2j -p38a_2l p38a_2k -p38a_2m p38a_2k -p38a_2n p38a_2k -p38a_2o p38a_2k -p38a_2p p38a_2k -p38a_2q p38a_2k -p38a_2r p38a_2k -p38a_2s p38a_2k -p38a_2t p38a_2k -p38a_2u p38a_2k -p38a_2v p38a_2k -p38a_2x p38a_2k -p38a_2y p38a_2k -p38a_2z p38a_2k -p38a_3fln p38a_2k -p38a_3flq p38a_2k -p38a_3flw p38a_2k -p38a_3fly p38a_2k -p38a_3flz p38a_2k -p38a_3fmh p38a_2k -p38a_3fmk p38a_2k -p38a_2m p38a_2l -p38a_2n p38a_2l -p38a_2o p38a_2l -p38a_2p p38a_2l -p38a_2q p38a_2l -p38a_2r p38a_2l -p38a_2s p38a_2l -p38a_2t p38a_2l -p38a_2u p38a_2l -p38a_2v p38a_2l -p38a_2x p38a_2l -p38a_2y p38a_2l -p38a_2z p38a_2l -p38a_3fln p38a_2l -p38a_3flq p38a_2l -p38a_3flw p38a_2l -p38a_3fly p38a_2l -p38a_3flz p38a_2l -p38a_3fmh p38a_2l -p38a_3fmk p38a_2l -p38a_2n p38a_2m -p38a_2o p38a_2m -p38a_2p p38a_2m -p38a_2q p38a_2m -p38a_2r p38a_2m -p38a_2s p38a_2m -p38a_2t p38a_2m -p38a_2u p38a_2m -p38a_2v p38a_2m -p38a_2x p38a_2m -p38a_2y p38a_2m -p38a_2z p38a_2m -p38a_3fln p38a_2m -p38a_3flq p38a_2m -p38a_3flw p38a_2m -p38a_3fly p38a_2m -p38a_3flz p38a_2m -p38a_3fmh p38a_2m -p38a_3fmk p38a_2m -p38a_2o p38a_2n -p38a_2p p38a_2n -p38a_2q p38a_2n -p38a_2r p38a_2n -p38a_2s p38a_2n -p38a_2t p38a_2n -p38a_2u p38a_2n -p38a_2v p38a_2n -p38a_2x p38a_2n -p38a_2y p38a_2n -p38a_2z p38a_2n -p38a_3fln p38a_2n -p38a_3flq p38a_2n -p38a_3flw p38a_2n -p38a_3fly p38a_2n -p38a_3flz p38a_2n -p38a_3fmh p38a_2n -p38a_3fmk p38a_2n -p38a_2p p38a_2o -p38a_2q p38a_2o -p38a_2r p38a_2o -p38a_2s p38a_2o -p38a_2t p38a_2o -p38a_2u p38a_2o -p38a_2v p38a_2o -p38a_2x p38a_2o -p38a_2y p38a_2o -p38a_2z p38a_2o -p38a_3fln p38a_2o -p38a_3flq p38a_2o -p38a_3flw p38a_2o -p38a_3fly p38a_2o -p38a_3flz p38a_2o -p38a_3fmh p38a_2o -p38a_3fmk p38a_2o -p38a_2q p38a_2p -p38a_2r p38a_2p -p38a_2s p38a_2p -p38a_2t p38a_2p -p38a_2u p38a_2p -p38a_2v p38a_2p -p38a_2x p38a_2p -p38a_2y p38a_2p -p38a_2z p38a_2p -p38a_3fln p38a_2p -p38a_3flq p38a_2p -p38a_3flw p38a_2p -p38a_3fly p38a_2p -p38a_3flz p38a_2p -p38a_3fmh p38a_2p -p38a_3fmk p38a_2p -p38a_2r p38a_2q -p38a_2s p38a_2q -p38a_2t p38a_2q -p38a_2u p38a_2q -p38a_2v p38a_2q -p38a_2x p38a_2q -p38a_2y p38a_2q -p38a_2z p38a_2q -p38a_3fln p38a_2q -p38a_3flq p38a_2q -p38a_3flw p38a_2q -p38a_3fly p38a_2q -p38a_3flz p38a_2q -p38a_3fmh p38a_2q -p38a_3fmk p38a_2q -p38a_2s p38a_2r -p38a_2t p38a_2r -p38a_2u p38a_2r -p38a_2v p38a_2r -p38a_2x p38a_2r -p38a_2y p38a_2r -p38a_2z p38a_2r -p38a_3fln p38a_2r -p38a_3flq p38a_2r -p38a_3flw p38a_2r -p38a_3fly p38a_2r -p38a_3flz p38a_2r -p38a_3fmh p38a_2r -p38a_3fmk p38a_2r -p38a_2t p38a_2s -p38a_2u p38a_2s -p38a_2v p38a_2s -p38a_2x p38a_2s -p38a_2y p38a_2s -p38a_2z p38a_2s -p38a_3fln p38a_2s -p38a_3flq p38a_2s -p38a_3flw p38a_2s -p38a_3fly p38a_2s -p38a_3flz p38a_2s -p38a_3fmh p38a_2s -p38a_3fmk p38a_2s -p38a_2u p38a_2t -p38a_2v p38a_2t -p38a_2x p38a_2t -p38a_2y p38a_2t -p38a_2z p38a_2t -p38a_3fln p38a_2t -p38a_3flq p38a_2t -p38a_3flw p38a_2t -p38a_3fly p38a_2t -p38a_3flz p38a_2t -p38a_3fmh p38a_2t -p38a_3fmk p38a_2t -p38a_2v p38a_2u -p38a_2x p38a_2u -p38a_2y p38a_2u -p38a_2z p38a_2u -p38a_3fln p38a_2u -p38a_3flq p38a_2u -p38a_3flw p38a_2u -p38a_3fly p38a_2u -p38a_3flz p38a_2u -p38a_3fmh p38a_2u -p38a_3fmk p38a_2u -p38a_2x p38a_2v -p38a_2y p38a_2v -p38a_2z p38a_2v -p38a_3fln p38a_2v -p38a_3flq p38a_2v -p38a_3flw p38a_2v -p38a_3fly p38a_2v -p38a_3flz p38a_2v -p38a_3fmh p38a_2v -p38a_3fmk p38a_2v -p38a_2y p38a_2x -p38a_2z p38a_2x -p38a_3fln p38a_2x -p38a_3flq p38a_2x -p38a_3flw p38a_2x -p38a_3fly p38a_2x -p38a_3flz p38a_2x -p38a_3fmh p38a_2x -p38a_3fmk p38a_2x -p38a_2z p38a_2y -p38a_3fln p38a_2y -p38a_3flq p38a_2y -p38a_3flw p38a_2y -p38a_3fly p38a_2y -p38a_3flz p38a_2y -p38a_3fmh p38a_2y -p38a_3fmk p38a_2y -p38a_3fln p38a_2z -p38a_3flq p38a_2z -p38a_3flw p38a_2z -p38a_3fly p38a_2z -p38a_3flz p38a_2z -p38a_3fmh p38a_2z -p38a_3fmk p38a_2z -p38a_3flq p38a_3fln -p38a_3flw p38a_3fln -p38a_3fly p38a_3fln -p38a_3flz p38a_3fln -p38a_3fmh p38a_3fln -p38a_3fmk p38a_3fln -p38a_3flw p38a_3flq -p38a_3fly p38a_3flq -p38a_3flz p38a_3flq -p38a_3fmh p38a_3flq -p38a_3fmk p38a_3flq -p38a_3fly p38a_3flw -p38a_3flz p38a_3flw -p38a_3fmh p38a_3flw -p38a_3fmk p38a_3flw -p38a_3flz p38a_3fly -p38a_3fmh p38a_3fly -p38a_3fmk p38a_3fly -p38a_3fmh p38a_3flz -p38a_3fmk p38a_3flz -p38a_3fmk p38a_3fmh diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/protein.txt deleted file mode 100755 index b08d0685..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,538 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_2n-p38a_2m 16.00 0.59 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2z 21.91 1.08 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2g -14.00 0.45 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2j 15.95 0.84 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2s-p38a_2o -23.16 0.68 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2u nan nan 10 -FEP_p38a_3fly-p38a_2s -19.40 0.81 6 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2m 14.98 0.57 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2bb -52.89 0.35 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2gg -71.79 1.02 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2ff -25.06 0.45 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2aa -35.81 0.58 3 -FEP_p38a_2s-p38a_2bb -32.30 0.78 3 -FEP_p38a_2n-p38a_2h -3.59 1.07 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -28.72 0.38 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2n 6.77 0.90 5 -FEP_p38a_3flw-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3flq-p38a_2q nan nan 9 -FEP_p38a_2x-p38a_2g 17.94 0.42 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2h -1.62 0.44 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2h 18.93 0.81 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2y -49.73 0.56 1 -FEP_p38a_2f-p38a_2aa -31.90 0.77 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2g -5.84 0.42 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fln -0.39 0.28 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2h 71.69 1.13 8 -FEP_p38a_3fln-p38a_2z -15.77 0.60 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2g 10.20 0.29 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2n 13.83 0.94 6 -FEP_p38a_2x-p38a_2j 8.67 0.33 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2x -18.63 0.90 1 -FEP_p38a_2k-p38a_2aa -8.47 0.39 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2aa -16.81 0.41 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2bb-p38a_2aa 20.75 1.19 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2ff -24.18 0.77 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2e nan nan 10 -FEP_p38a_2r-p38a_2ff 7.81 0.92 6 -FEP_p38a_3flz-p38a_2q -60.53 nan 9 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2e -5.91 1.04 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2ee 11.40 0.57 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2aa 11.71 0.75 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2aa -48.78 0.66 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2gg -107.87 0.28 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2r -10.94 0.55 6 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 5.95 0.34 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2l 19.96 0.53 3 -FEP_p38a_3fly-p38a_2h 2.85 0.29 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -24.67 0.91 7 -FEP_p38a_3flq-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2y-p38a_2gg -41.86 0.80 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2f 20.61 0.40 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2e 17.01 0.30 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ff -22.38 0.83 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2ee 39.85 1.18 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2l 8.96 0.35 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2bb -31.85 0.33 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2h 64.41 1.63 7 -FEP_p38a_2o-p38a_2e 39.20 nan 9 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2r -31.10 0.13 8 -FEP_p38a_3fln-p38a_2m 20.18 0.32 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2i -11.58 0.37 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fln -3.56 0.23 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 31.78 0.98 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2q -22.90 0.99 8 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2g 1.26 0.98 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2bb 18.15 0.68 8 -FEP_p38a_3fln-p38a_2u nan nan 8 -FEP_p38a_2m-p38a_2bb -70.39 0.46 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fly -2.34 0.71 5 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2s -21.68 1.57 6 -FEP_p38a_2l-p38a_2h -9.72 1.05 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2r 12.01 1.02 4 -FEP_p38a_2z-p38a_2ff -1.88 0.79 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fly -5.27 0.33 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2i 9.16 0.71 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2i-p38a_2h 3.41 0.26 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2r -29.16 1.15 7 -FEP_p38a_2z-p38a_2k -2.86 0.67 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2e -0.73 0.17 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ee 31.70 0.85 2 -FEP_p38a_2s-p38a_2gg -70.54 0.42 6 -FEP_p38a_3fly-p38a_2q -62.31 nan 9 -FEP_p38a_3flq-p38a_2j 33.83 0.64 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2q -66.01 nan 9 -FEP_p38a_2k-p38a_2i 19.26 0.46 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2gg -86.66 0.89 1 -FEP_p38a_2h-p38a_2ff -22.13 0.41 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2bb nan nan 10 -FEP_p38a_2u-p38a_2l 51.89 nan 9 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2v -11.47 0.95 6 -FEP_p38a_2p-p38a_2e 68.27 nan 9 -FEP_p38a_2p-p38a_2i 66.92 0.98 8 -FEP_p38a_2u-p38a_2o -7.33 0.79 3 -FEP_p38a_2m-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 6.82 0.17 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_3fly-p38a_2l 12.66 0.31 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2y -47.38 1.07 2 -FEP_p38a_2ff-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2r-p38a_2o -21.90 1.33 2 -FEP_p38a_2p-p38a_2g 71.00 nan 9 -FEP_p38a_3flz-p38a_2z -19.63 0.58 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2k -0.07 1.01 7 -FEP_p38a_3flw-p38a_2i -4.77 0.51 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2k 19.66 0.90 4 -FEP_p38a_3flz-p38a_2o -53.21 nan 9 -FEP_p38a_2y-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2g-p38a_2e -7.70 0.20 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2bb -47.13 0.42 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2e -4.32 0.17 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2gg -69.35 0.69 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2n 17.87 0.48 4 -FEP_p38a_2z-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3flq-p38a_2n 44.42 0.49 3 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2k -26.50 0.58 4 -FEP_p38a_2h-p38a_2g 2.74 0.30 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2r -26.61 1.39 8 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 7.04 0.44 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2p -37.07 0.73 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2aa nan nan 10 -FEP_p38a_3flq-p38a_2l 50.08 0.65 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2bb -48.88 0.43 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2n 50.74 0.99 3 -FEP_p38a_2r-p38a_2gg -64.38 0.48 8 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2p -67.10 0.52 8 -FEP_p38a_2k-p38a_2f 24.11 0.96 3 -FEP_p38a_2ee-p38a_2bb -43.75 0.96 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2f 23.40 1.08 5 -FEP_p38a_2x-p38a_2ee 6.72 0.60 3 -FEP_p38a_2j-p38a_2e 2.76 0.13 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ff -0.13 1.23 2 -FEP_p38a_2r-p38a_2n 31.10 0.26 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 6.05 0.86 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2f 18.02 0.76 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2u -2.23 nan 8 -FEP_p38a_2u-p38a_2j nan nan 10 -FEP_p38a_2o-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ff -17.77 0.53 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2p -19.79 nan 8 -FEP_p38a_2o-p38a_2ff 24.60 1.20 7 -FEP_p38a_2c-p38a_2aa nan nan 10 -FEP_p38a_2y-p38a_2h 50.43 0.57 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2o -49.73 0.67 5 -FEP_p38a_2y-p38a_2e 43.81 0.76 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2t -28.57 0.84 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2n 1.27 0.81 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2v -8.38 0.85 3 -FEP_p38a_2e-p38a_2aa -26.97 0.76 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2v 37.69 0.93 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2k -23.51 0.93 5 -FEP_p38a_2u-p38a_2g nan nan 10 -FEP_p38a_3flq-p38a_2aa 8.45 0.90 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2o -44.43 0.69 6 -FEP_p38a_2v-p38a_2r -21.73 nan 9 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -41.16 0.90 5 -FEP_p38a_2u-p38a_2gg nan nan 10 -FEP_p38a_2o-p38a_2h 52.86 1.02 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2p -71.93 2.15 8 -FEP_p38a_2j-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2q-p38a_2e 56.54 nan 9 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2h -0.78 0.59 1 -FEP_p38a_2k-p38a_2e 18.01 0.75 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 0.82 0.26 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2f 26.81 0.91 8 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 5.34 0.72 3 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3flq-p38a_2v 29.34 0.64 7 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2u nan nan 8 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2o -46.43 0.81 6 -FEP_p38a_2n-p38a_2bb -53.38 0.75 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2t -45.07 0.57 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2v 6.08 0.59 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ee -11.53 1.04 1 -FEP_p38a_2l-p38a_2gg -100.78 0.21 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2bb -6.02 1.22 8 -FEP_p38a_2v-p38a_2m 28.40 0.63 5 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2v -11.74 1.04 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ff -20.67 0.28 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2e -4.87 0.47 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flq -39.39 0.38 5 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -17.00 0.89 2 -FEP_p38a_2y-p38a_2f 48.18 0.60 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -66.16 0.89 7 -FEP_p38a_2c-p38a_2bb nan nan 10 -FEP_p38a_2t-p38a_2i 40.83 0.54 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2o -37.16 nan 8 -FEP_p38a_2o-p38a_2i 43.30 nan 9 -FEP_p38a_2o-p38a_2k 27.28 1.57 8 -FEP_p38a_2h-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2x-p38a_2p -55.90 0.52 7 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2x -18.06 0.73 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2l 23.99 0.64 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2k 47.90 1.02 7 -FEP_p38a_2x-p38a_2u nan nan 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2bb -54.72 0.81 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2y -8.37 0.89 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2v -10.97 0.93 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2bb -22.60 0.82 5 -FEP_p38a_2gg-p38a_2aa 59.59 0.85 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2p -47.31 nan 9 -FEP_p38a_2v-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2s -11.83 0.57 8 -FEP_p38a_2z-p38a_2e 15.33 0.62 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flz -2.46 0.40 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2g 6.04 0.37 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2f 48.83 nan 9 -FEP_p38a_2u-p38a_2i nan nan 10 -FEP_p38a_2r-p38a_2i 26.08 1.10 7 -FEP_p38a_3fln-p38a_2q -56.53 1.61 8 -FEP_p38a_2r-p38a_2aa -4.72 0.74 6 -FEP_p38a_2t-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2y-p38a_2u 4.76 nan 9 -FEP_p38a_2x-p38a_2q nan nan 10 -FEP_p38a_2y-p38a_2q -14.34 nan 9 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2u -37.54 nan 8 -FEP_p38a_3fln-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2i-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2z-p38a_2o -27.37 1.55 4 -FEP_p38a_2x-p38a_2r -12.61 0.84 5 -FEP_p38a_2l-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2p-p38a_2j 60.11 1.27 4 -FEP_p38a_2n-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fly-p38a_2p -68.00 0.85 7 -FEP_p38a_3flq-p38a_2o -7.20 0.31 4 -FEP_p38a_2v-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ff -22.49 0.56 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flw -1.09 0.70 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ff -4.98 0.61 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2n 3.63 0.60 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2l 12.99 0.28 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2aa 38.04 nan 9 -FEP_p38a_2y-p38a_2aa 16.22 0.49 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2i 37.02 1.08 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2ee 34.81 0.97 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fln -3.50 0.72 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2ff -18.04 0.31 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2h 9.29 0.60 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2r 14.79 0.64 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2r -27.74 0.89 7 -FEP_p38a_2ee-p38a_2e 5.07 0.86 2 -FEP_p38a_2y-p38a_2i 45.98 0.50 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2i 3.57 0.34 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2p -41.76 1.20 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2e 35.50 0.79 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2l 9.95 0.63 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2x 33.83 0.71 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2e 38.73 0.50 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2h 0.66 0.36 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2h 42.18 0.63 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2j 11.76 0.81 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2u-p38a_2s 19.05 1.00 6 -FEP_p38a_2x-p38a_2m 32.37 0.69 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.10 0.39 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2t -46.01 0.47 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2bb -9.67 0.59 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2n 41.89 0.82 6 -FEP_p38a_2n-p38a_2e -4.29 0.60 2 -FEP_p38a_2p-p38a_2ee 58.21 0.81 7 -FEP_p38a_2p-p38a_2l 77.28 1.03 4 -FEP_p38a_3fly-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2z-p38a_2n 21.22 0.86 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2ff 29.12 0.32 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2m 65.63 0.43 3 -FEP_p38a_3fly-p38a_2m 20.91 0.66 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2g 1.74 0.33 2 -FEP_p38a_3flq-p38a_2m 56.65 0.71 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2bb -55.32 0.70 2 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ff -22.96 1.09 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2s 21.56 0.57 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2g 14.13 0.84 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2q -31.65 0.56 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2e 87.51 0.43 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2e -4.43 0.30 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2n 26.24 0.50 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2o 15.94 0.46 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2o 1.47 0.28 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2j -7.02 0.74 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2g 95.21 0.45 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -36.52 0.83 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2bb -5.39 0.42 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2gg -75.96 0.56 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2bb 37.65 0.43 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2aa -32.84 0.58 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flq -41.30 0.83 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2y -45.48 0.42 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2bb -49.55 0.41 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flw 4.71 0.37 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2o -35.72 1.04 8 -FEP_p38a_3fln-p38a_2j -2.56 0.22 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2g 25.28 0.49 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2t -31.37 1.01 3 -FEP_p38a_2g-p38a_2bb -56.30 0.58 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2t -24.49 0.72 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2f 43.01 0.55 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2i 18.73 1.27 6 -FEP_p38a_3fly-p38a_2v -7.75 0.36 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2aa -32.16 1.14 2 -FEP_p38a_2r-p38a_2l 39.07 0.70 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2g 43.70 0.95 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2g 0.37 0.42 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2bb -11.23 0.99 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2z -20.15 0.67 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2h 45.00 0.31 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ff 70.48 0.28 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2bb -50.56 0.47 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -17.98 0.48 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2p -71.01 0.62 7 -FEP_p38a_2n-p38a_2aa -35.33 0.70 3 -FEP_p38a_2g-p38a_2ee -12.04 1.07 2 -FEP_p38a_2q-p38a_2ff 43.06 0.82 5 -FEP_p38a_2z-p38a_2i 15.94 0.52 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2e 7.00 0.74 1 -FEP_p38a_3flq-p38a_2x 26.15 0.47 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2f 3.16 0.41 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2l -8.07 0.32 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2gg -88.99 0.50 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ee -8.39 0.24 6 -FEP_p38a_2q-p38a_2n 64.71 0.25 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2p -24.35 0.68 7 -FEP_p38a_2m-p38a_2ee -26.11 0.75 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2s -6.12 0.95 3 -FEP_p38a_2y-p38a_2j 42.15 0.35 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2aa -40.59 0.67 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2i -4.52 0.92 2 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 36.36 0.43 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -42.74 0.99 7 -FEP_p38a_2q-p38a_2f 62.31 0.92 8 -FEP_p38a_2r-p38a_2h 32.67 0.42 8 -FEP_p38a_3flz-p38a_2gg -91.81 0.51 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2f -2.37 0.85 2 -FEP_p38a_2i-p38a_2f 2.55 0.28 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2f -1.28 0.49 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2e 10.92 0.59 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2l 7.00 0.55 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2aa -10.66 0.53 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2ee -5.19 0.93 2 -FEP_p38a_3flq-p38a_2s 19.27 1.42 3 -FEP_p38a_2m-p38a_2f -18.07 0.59 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2gg -92.98 0.56 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2i -20.46 0.22 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2aa -20.95 0.48 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fln -5.94 0.53 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2j -9.34 0.36 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2q -62.72 0.42 8 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -12.84 0.52 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2m 45.75 0.82 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2x -11.77 0.61 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2l 7.12 0.46 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2aa -34.10 0.52 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2m 83.04 1.12 5 -FEP_p38a_2f-p38a_2bb -53.18 0.57 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2y -46.20 0.33 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2z -16.54 0.19 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2t -44.21 0.55 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2ff -7.98 0.57 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2gg -92.61 0.90 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2q -43.04 0.60 8 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flq -41.39 0.59 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2v 3.40 0.65 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2gg -93.84 0.66 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2t -3.49 1.00 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2v -13.90 1.04 7 -FEP_p38a_3fly-p38a_2e -1.83 0.18 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2i -2.88 0.36 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2t 5.44 0.50 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2z -17.37 0.78 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2q -56.70 1.21 7 -FEP_p38a_2v-p38a_2gg -80.84 0.98 7 -FEP_p38a_2t-p38a_2k 21.33 1.01 2 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -15.40 0.36 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2g 24.20 1.23 4 -FEP_p38a_3fly-p38a_2aa -28.17 0.51 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2e -14.09 0.39 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2j 19.82 0.76 6 -FEP_p38a_2x-p38a_2i 13.55 0.55 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2k -22.07 0.65 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2ee 21.86 0.50 7 -FEP_p38a_2gg-p38a_2f 92.76 0.98 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2y -49.44 0.89 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2m 38.73 0.85 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2e -21.35 0.82 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2gg -44.30 1.13 8 -FEP_p38a_2k-p38a_2ff 1.35 0.53 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2f 11.30 0.71 3 -FEP_p38a_2o-p38a_2g 50.97 0.70 8 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2l 9.82 0.59 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2e 17.60 1.19 7 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2s -25.25 1.67 6 -FEP_p38a_2r-p38a_2e 24.38 0.98 7 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2bb -54.13 0.94 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2s 30.44 0.90 4 -FEP_p38a_3flw-p38a_3fln -5.75 0.53 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ff 18.64 0.25 1 -FEP_p38a_2o-p38a_2n 48.54 0.65 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2l 52.47 0.16 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2e -5.81 0.43 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2ee -8.93 0.78 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2h 21.56 1.24 5 -FEP_p38a_2l-p38a_2ff -30.16 0.23 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2ee -17.49 1.03 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2r -7.54 0.66 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2k -22.27 0.86 4 -FEP_p38a_2r-p38a_2g 32.70 0.93 6 -FEP_p38a_3flw-p38a_2f -2.17 0.62 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2aa -27.33 0.46 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2i 59.20 0.78 8 -FEP_p38a_2z-p38a_2x 4.70 0.84 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2e -7.86 0.86 1 -FEP_p38a_3flq-p38a_3fln 36.89 0.39 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2n 1.78 0.82 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ee -10.03 1.39 2 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fmh 1.12 0.57 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2bb -33.12 0.74 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -11.57 0.30 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2i -0.34 0.32 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2f 15.32 0.41 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2aa -23.93 0.47 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2gg -50.70 0.64 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2j -6.59 0.18 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2t -43.63 0.30 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ee -12.93 0.56 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2ee -0.60 0.82 8 -FEP_p38a_2t-p38a_2n 45.73 0.35 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2j 40.17 0.81 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fly -2.93 0.24 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2ff -38.13 0.23 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.30 0.21 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2aa -31.15 0.82 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2o 18.85 0.87 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2t -40.15 0.32 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2z -22.47 1.06 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -3.67 0.31 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2ee 10.74 0.87 4 -FEP_p38a_2z-p38a_2g 22.47 0.58 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2k -25.07 0.52 4 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ee 81.49 0.31 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2g 46.93 0.41 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2gg -23.78 1.23 7 -FEP_p38a_2ee-p38a_2aa -20.87 0.69 4 -FEP_p38a_2h-p38a_2gg -92.11 0.40 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2gg -92.33 1.01 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2h 4.58 0.40 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2i -4.96 0.51 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2bb -62.52 0.39 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2gg -29.55 0.33 7 -FEP_p38a_2n-p38a_2f -2.74 0.90 3 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -39.66 0.42 3 -FEP_p38a_2y-p38a_2l 58.37 0.43 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2s -20.91 1.69 6 -FEP_p38a_3flz-p38a_2f -0.13 0.36 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2m 16.83 0.73 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -16.84 0.23 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2x -14.97 0.78 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2m 60.96 0.59 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -88.99 0.25 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2aa -28.75 0.53 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2n 66.77 0.86 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2h -16.00 0.66 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_3flq -43.05 0.90 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2g 5.72 0.33 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2j 11.77 1.13 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2y -49.11 0.58 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2bb -52.78 0.61 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ee 12.08 1.13 3 -FEP_p38a_2x-p38a_2k -8.04 1.05 1 -FEP_p38a_3flq-p38a_2t -3.44 0.50 1 -FEP_p38a_3flq-p38a_2f 38.42 0.60 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2aa -32.24 0.69 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -23.83 0.25 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2h -1.03 0.57 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2g 51.21 0.44 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ee -4.49 0.84 2 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2f -1.79 0.94 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2j -3.00 0.40 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2q -38.54 0.95 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2ff 22.81 0.37 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2o -3.48 0.91 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flw 1.92 0.35 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2k -10.39 0.47 2 -FEP_p38a_2q-p38a_2ee 53.82 0.86 8 -FEP_p38a_2j-p38a_2ee -3.68 0.57 2 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2i -3.42 0.63 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2r 13.73 1.04 5 -FEP_p38a_3fly-p38a_2bb -49.31 0.60 3 -FEP_p38a_2x-p38a_2bb -37.06 0.56 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2ee 12.78 0.76 3 -FEP_p38a_2p-p38a_2ff 48.81 0.04 8 -FEP_p38a_2y-p38a_2k 26.71 0.69 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2aa 17.26 0.82 8 -FEP_p38a_2s-p38a_2aa -9.98 0.80 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -21.37 0.51 3 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2m 17.56 0.72 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -14.85 0.24 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2g 1.00 0.66 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2l 54.05 0.85 2 -FEP_p38a_2q-p38a_2m 79.75 0.51 4 -FEP_p38a_2n-p38a_2ee -10.69 1.14 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -0.55 0.16 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2gg -47.84 0.41 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2r -32.41 1.19 7 -FEP_p38a_2k-p38a_2bb -30.30 0.75 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2x -15.65 0.63 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2p -27.79 0.95 3 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ee -8.86 0.65 3 -FEP_p38a_3flz-p38a_2s -18.27 0.13 8 -FEP_p38a_2t-p38a_2r 14.96 0.74 1 -FEP_p38a_2f-p38a_2ee -8.72 0.69 4 -FEP_p38a_2u-p38a_2m 60.77 1.33 8 -FEP_p38a_2z-p38a_2s -2.21 1.12 5 -FEP_p38a_2x-p38a_2h 15.10 0.67 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2m 14.94 0.92 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2k -18.77 0.53 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2f 3.01 0.42 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2h 24.31 0.94 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2q -60.49 1.26 7 -FEP_p38a_2j-p38a_2gg -85.31 0.25 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2l 71.52 1.03 6 -FEP_p38a_2l-p38a_2f -10.98 0.98 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flz -2.77 1.19 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2m 36.57 0.67 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2o -47.82 0.66 7 -FEP_p38a_2l-p38a_2k -31.56 0.65 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2j -6.55 0.62 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2n 3.65 0.66 4 -FEP_p38a_2y-p38a_2m 65.99 0.74 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2j -9.38 0.93 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2l 28.18 0.72 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2p -4.00 0.47 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flw 0.96 0.82 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/protein_old.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/protein_old.txt deleted file mode 100755 index 06789274..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/protein_old.txt +++ /dev/null @@ -1,543 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_2n-p38a_2m 16.00 0.59 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2z 21.91 1.08 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2g -14.00 0.45 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2j 15.95 0.84 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2s-p38a_2o -23.16 0.68 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2u nan nan 10 -FEP_p38a_3fly-p38a_2s -19.40 0.81 6 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2m 14.98 0.57 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2bb -52.89 0.35 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2gg -71.79 1.02 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2ff -25.06 0.45 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2aa -35.81 0.58 3 -FEP_p38a_2s-p38a_2bb -32.30 0.78 3 -FEP_p38a_2n-p38a_2h -3.59 1.07 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -28.72 0.38 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2n 6.77 0.90 5 -FEP_p38a_3flw-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3flq-p38a_2q nan nan 9 -FEP_p38a_2x-p38a_2g 17.94 0.42 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2h -1.62 0.44 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2h 18.93 0.81 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2y -49.73 0.56 1 -FEP_p38a_2f-p38a_2aa -31.90 0.77 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2g -5.84 0.42 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fln -0.39 0.28 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2h 71.69 1.13 8 -FEP_p38a_3fln-p38a_2z -15.77 0.60 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2g 10.20 0.29 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2n 13.83 0.94 6 -FEP_p38a_2x-p38a_2j 8.67 0.33 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2x -18.63 0.90 1 -FEP_p38a_2k-p38a_2aa -8.47 0.39 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2aa -16.81 0.41 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2bb-p38a_2aa 20.75 1.19 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2ff -24.18 0.77 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2e nan nan 10 -FEP_p38a_2r-p38a_2ff 7.81 0.92 6 -FEP_p38a_3flz-p38a_2q -60.53 nan 9 -FEP_p38a_2r-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2e -5.91 1.04 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2ee 11.40 0.57 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2aa 11.71 0.75 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2aa -48.78 0.66 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2gg -107.87 0.28 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2r -10.94 0.55 6 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 5.95 0.34 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2l 19.96 0.53 3 -FEP_p38a_3fly-p38a_2h 2.85 0.29 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -24.67 0.91 7 -FEP_p38a_3flq-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2y-p38a_2gg -41.86 0.80 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2f 20.61 0.40 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2e 17.01 0.30 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ff -22.38 0.83 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2ee 39.85 1.18 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2l 8.96 0.35 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2bb -31.85 0.33 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2h 64.41 1.63 7 -FEP_p38a_2o-p38a_2e 39.20 nan 9 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2r -31.10 0.13 8 -FEP_p38a_3fln-p38a_2m 20.18 0.32 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2i -11.58 0.37 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fln -3.56 0.23 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 31.78 0.98 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2q -22.90 0.99 8 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2g 1.26 0.98 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2bb 18.15 0.68 8 -FEP_p38a_3fln-p38a_2u nan nan 8 -FEP_p38a_2m-p38a_2bb -70.39 0.46 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fly -2.34 0.71 5 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2s -21.68 1.57 6 -FEP_p38a_2l-p38a_2h -9.72 1.05 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2r 12.01 1.02 4 -FEP_p38a_2z-p38a_2ff -1.88 0.79 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fly -5.27 0.33 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2i 9.16 0.71 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2i-p38a_2h 3.41 0.26 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2r -29.16 1.15 7 -FEP_p38a_2z-p38a_2k -2.86 0.67 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2e -0.73 0.17 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ee 31.70 0.85 2 -FEP_p38a_2s-p38a_2gg -70.54 0.42 6 -FEP_p38a_3fly-p38a_2q -62.31 nan 9 -FEP_p38a_3flq-p38a_2j 33.83 0.64 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2q -66.01 nan 9 -FEP_p38a_2k-p38a_2i 19.26 0.46 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2gg -86.66 0.89 1 -FEP_p38a_2h-p38a_2ff -22.13 0.41 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2bb nan nan 10 -FEP_p38a_2u-p38a_2l 51.89 nan 9 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2v -11.47 0.95 6 -FEP_p38a_2p-p38a_2e 68.27 nan 9 -FEP_p38a_2u-p38a_2ee 37.55 nan 9 -FEP_p38a_2p-p38a_2i 66.92 0.98 8 -FEP_p38a_2u-p38a_2o -7.33 0.79 3 -FEP_p38a_2m-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 6.82 0.17 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_3fly-p38a_2l 12.66 0.31 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2y -47.38 1.07 2 -FEP_p38a_2ff-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2r-p38a_2o -21.90 1.33 2 -FEP_p38a_2p-p38a_2g 71.00 nan 9 -FEP_p38a_3flz-p38a_2z -19.63 0.58 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2k -0.07 1.01 7 -FEP_p38a_3flw-p38a_2i -4.77 0.51 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2k 19.66 0.90 4 -FEP_p38a_3flz-p38a_2o -53.21 nan 9 -FEP_p38a_2y-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2g-p38a_2e -7.70 0.20 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2bb -47.13 0.42 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2e -4.32 0.17 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2gg -69.35 0.69 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2n 17.87 0.48 4 -FEP_p38a_2z-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3flq-p38a_2n 44.42 0.49 3 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2k -26.50 0.58 4 -FEP_p38a_2h-p38a_2g 2.74 0.30 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2r -26.61 1.39 8 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 7.04 0.44 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2p -37.07 0.73 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2aa nan nan 10 -FEP_p38a_3flq-p38a_2l 50.08 0.65 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2bb -48.88 0.43 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2n 50.74 0.99 3 -FEP_p38a_2r-p38a_2gg -64.38 0.48 8 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2p -67.10 0.52 8 -FEP_p38a_2k-p38a_2f 24.11 0.96 3 -FEP_p38a_2ee-p38a_2bb -43.75 0.96 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2f 23.40 1.08 5 -FEP_p38a_2x-p38a_2ee 6.72 0.60 3 -FEP_p38a_2j-p38a_2e 2.76 0.13 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ff -0.13 1.23 2 -FEP_p38a_2r-p38a_2n 31.10 0.26 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 6.05 0.86 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2f 18.02 0.76 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2u -2.23 nan 8 -FEP_p38a_2u-p38a_2j nan nan 10 -FEP_p38a_2o-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ff -17.77 0.53 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2p -19.79 nan 8 -FEP_p38a_2o-p38a_2ff 24.60 1.20 7 -FEP_p38a_2c-p38a_2aa nan nan 10 -FEP_p38a_2y-p38a_2h 50.43 0.57 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2o -49.73 0.67 5 -FEP_p38a_2y-p38a_2e 43.81 0.76 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2t -28.57 0.84 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2n 1.27 0.81 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2v -8.38 0.85 3 -FEP_p38a_2e-p38a_2aa -26.97 0.76 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2v 37.69 0.93 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2k -23.51 0.93 5 -FEP_p38a_2u-p38a_2g nan nan 10 -FEP_p38a_3flq-p38a_2aa 8.45 0.90 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2o -44.43 0.69 6 -FEP_p38a_2v-p38a_2r -21.73 nan 9 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -41.16 0.90 5 -FEP_p38a_2u-p38a_2gg nan nan 10 -FEP_p38a_2o-p38a_2h 52.86 1.02 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2p -71.93 2.15 8 -FEP_p38a_2j-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2q-p38a_2e 56.54 nan 9 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2h -0.78 0.59 1 -FEP_p38a_2k-p38a_2e 18.01 0.75 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 0.82 0.26 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2f 26.81 0.91 8 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 5.34 0.72 3 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3flq-p38a_2v 29.34 0.64 7 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2u nan nan 8 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2o -46.43 0.81 6 -FEP_p38a_2n-p38a_2bb -53.38 0.75 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2t -45.07 0.57 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2v 6.08 0.59 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ee -11.53 1.04 1 -FEP_p38a_2l-p38a_2gg -100.78 0.21 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2bb -6.02 1.22 8 -FEP_p38a_2v-p38a_2m 28.40 0.63 5 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2v -11.74 1.04 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ff -20.67 0.28 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2e -4.87 0.47 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flq -39.39 0.38 5 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -17.00 0.89 2 -FEP_p38a_2y-p38a_2f 48.18 0.60 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -66.16 0.89 7 -FEP_p38a_2c-p38a_2bb nan nan 10 -FEP_p38a_2t-p38a_2i 40.83 0.54 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2o -37.16 nan 8 -FEP_p38a_2o-p38a_2i 43.30 nan 9 -FEP_p38a_2o-p38a_2k 27.28 1.57 8 -FEP_p38a_2h-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2x-p38a_2p -55.90 0.52 7 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2x -18.06 0.73 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2l 23.99 0.64 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2k 47.90 1.02 7 -FEP_p38a_2x-p38a_2u nan nan 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2bb -54.72 0.81 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2y -8.37 0.89 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2v -10.97 0.93 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2bb -22.60 0.82 5 -FEP_p38a_2gg-p38a_2aa 59.59 0.85 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2p -47.31 nan 9 -FEP_p38a_2v-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2s -11.83 0.57 8 -FEP_p38a_2z-p38a_2e 15.33 0.62 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flz -2.46 0.40 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2g 6.04 0.37 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2f 48.83 nan 9 -FEP_p38a_2u-p38a_2i nan nan 10 -FEP_p38a_2r-p38a_2i 26.08 1.10 7 -FEP_p38a_3fln-p38a_2q -56.53 1.61 8 -FEP_p38a_2p-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2r-p38a_2aa -4.72 0.74 6 -FEP_p38a_2t-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2y-p38a_2u 4.76 nan 9 -FEP_p38a_2x-p38a_2q nan nan 10 -FEP_p38a_2y-p38a_2q -14.34 nan 9 -FEP_p38a_2u-p38a_2ff 25.68 nan 9 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2u -37.54 nan 8 -FEP_p38a_3fln-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2i-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2z-p38a_2o -27.37 1.55 4 -FEP_p38a_2x-p38a_2r -12.61 0.84 5 -FEP_p38a_2l-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2p-p38a_2j 60.11 1.27 4 -FEP_p38a_2n-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fly-p38a_2p -68.00 0.85 7 -FEP_p38a_3flq-p38a_2o -7.20 0.31 4 -FEP_p38a_2v-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ff -22.49 0.56 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flw -1.09 0.70 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ff -4.98 0.61 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2n 3.63 0.60 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2l 12.99 0.28 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2aa 38.04 nan 9 -FEP_p38a_2y-p38a_2aa 16.22 0.49 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2i 37.02 1.08 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2ee 34.81 0.97 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fln -3.50 0.72 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2ff -18.04 0.31 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2h 9.29 0.60 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2r 14.79 0.64 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2r -27.74 0.89 7 -FEP_p38a_2ee-p38a_2e 5.07 0.86 2 -FEP_p38a_2y-p38a_2i 45.98 0.50 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2i 3.57 0.34 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2p -41.76 1.20 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2e 35.50 0.79 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2l 9.95 0.63 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2x 33.83 0.71 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2e 38.73 0.50 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2h 0.66 0.36 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2h 42.18 0.63 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2j 11.76 0.81 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2u-p38a_2s 19.05 1.00 6 -FEP_p38a_2x-p38a_2m 32.37 0.69 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.10 0.39 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2t -46.01 0.47 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2bb -9.67 0.59 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2n 41.89 0.82 6 -FEP_p38a_2n-p38a_2e -4.29 0.60 2 -FEP_p38a_2p-p38a_2ee 58.21 0.81 7 -FEP_p38a_2p-p38a_2l 77.28 1.03 4 -FEP_p38a_3fly-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2z-p38a_2n 21.22 0.86 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2ff 29.12 0.32 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2m 65.63 0.43 3 -FEP_p38a_3fly-p38a_2m 20.91 0.66 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2g 1.74 0.33 2 -FEP_p38a_3flq-p38a_2m 56.65 0.71 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2bb -55.32 0.70 2 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ff -22.96 1.09 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2s 21.56 0.57 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2g 14.13 0.84 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2q -31.65 0.56 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2e 87.51 0.43 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2e -4.43 0.30 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2n 26.24 0.50 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2o 15.94 0.46 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2o 1.47 0.28 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2j -7.02 0.74 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2g 95.21 0.45 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -36.52 0.83 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2bb -5.39 0.42 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2gg -75.96 0.56 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2bb 37.65 0.43 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2aa -32.84 0.58 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flq -41.30 0.83 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2y -45.48 0.42 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2bb -49.55 0.41 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flw 4.71 0.37 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2o -35.72 1.04 8 -FEP_p38a_3fln-p38a_2j -2.56 0.22 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2g 25.28 0.49 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2t -31.37 1.01 3 -FEP_p38a_2g-p38a_2bb -56.30 0.58 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2t -24.49 0.72 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2f 43.01 0.55 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2i 18.73 1.27 6 -FEP_p38a_3fly-p38a_2v -7.75 0.36 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2aa -32.16 1.14 2 -FEP_p38a_2r-p38a_2l 39.07 0.70 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2g 43.70 0.95 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2g 0.37 0.42 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2bb -11.23 0.99 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2z -20.15 0.67 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2h 45.00 0.31 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ff 70.48 0.28 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2bb -50.56 0.47 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -17.98 0.48 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2p -71.01 0.62 7 -FEP_p38a_2n-p38a_2aa -35.33 0.70 3 -FEP_p38a_2g-p38a_2ee -12.04 1.07 2 -FEP_p38a_2q-p38a_2ff 43.06 0.82 5 -FEP_p38a_2z-p38a_2i 15.94 0.52 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2e 7.00 0.74 1 -FEP_p38a_3flq-p38a_2x 26.15 0.47 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2f 3.16 0.41 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2l -8.07 0.32 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2gg -88.99 0.50 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ee -8.39 0.24 6 -FEP_p38a_2q-p38a_2n 64.71 0.25 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2p -24.35 0.68 7 -FEP_p38a_2m-p38a_2ee -26.11 0.75 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2s -6.12 0.95 3 -FEP_p38a_2y-p38a_2j 42.15 0.35 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2aa -40.59 0.67 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2i -4.52 0.92 2 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 36.36 0.43 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -42.74 0.99 7 -FEP_p38a_2q-p38a_2f 62.31 0.92 8 -FEP_p38a_2r-p38a_2h 32.67 0.42 8 -FEP_p38a_3flz-p38a_2gg -91.81 0.51 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2f -2.37 0.85 2 -FEP_p38a_2i-p38a_2f 2.55 0.28 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2f -1.28 0.49 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2e 10.92 0.59 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2l 7.00 0.55 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2aa -10.66 0.53 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2ee -5.19 0.93 2 -FEP_p38a_3flq-p38a_2s 19.27 1.42 3 -FEP_p38a_2m-p38a_2f -18.07 0.59 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2gg -92.98 0.56 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2i -20.46 0.22 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2aa -20.95 0.48 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fln -5.94 0.53 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2j -9.34 0.36 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2q -62.72 0.42 8 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -12.84 0.52 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2m 45.75 0.82 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2x -11.77 0.61 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2l 7.12 0.46 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2aa -34.10 0.52 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2m 83.04 1.12 5 -FEP_p38a_2f-p38a_2bb -53.18 0.57 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2y -46.20 0.33 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2z -16.54 0.19 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2t -44.21 0.55 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2ff -7.98 0.57 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2gg -92.61 0.90 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2q -43.04 0.60 8 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flq -41.39 0.59 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2v 3.40 0.65 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2gg -93.84 0.66 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2t -3.49 1.00 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2v -13.90 1.04 7 -FEP_p38a_3fly-p38a_2e -1.83 0.18 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2i -2.88 0.36 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2t 5.44 0.50 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2z -17.37 0.78 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2q -56.70 1.21 7 -FEP_p38a_2v-p38a_2gg -80.84 0.98 7 -FEP_p38a_2t-p38a_2k 21.33 1.01 2 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -15.40 0.36 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2g 24.20 1.23 4 -FEP_p38a_3fly-p38a_2aa -28.17 0.51 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2e -14.09 0.39 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2ee 37.65 1.20 6 -FEP_p38a_2r-p38a_2j 19.82 0.76 6 -FEP_p38a_2x-p38a_2i 13.55 0.55 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2k -22.07 0.65 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2ee 21.86 0.50 7 -FEP_p38a_2gg-p38a_2f 92.76 0.98 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2y -49.44 0.89 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2m 38.73 0.85 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2e -21.35 0.82 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2gg -44.30 1.13 8 -FEP_p38a_2k-p38a_2ff 1.35 0.53 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2f 11.30 0.71 3 -FEP_p38a_2o-p38a_2g 50.97 0.70 8 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2l 9.82 0.59 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2e 17.60 1.19 7 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2s -25.25 1.67 6 -FEP_p38a_2r-p38a_2e 24.38 0.98 7 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2bb -54.13 0.94 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2s 30.44 0.90 4 -FEP_p38a_3flw-p38a_3fln -5.75 0.53 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ff 18.64 0.25 1 -FEP_p38a_2o-p38a_2n 48.54 0.65 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2l 52.47 0.16 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2e -5.81 0.43 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2ee -8.93 0.78 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2h 21.56 1.24 5 -FEP_p38a_2l-p38a_2ff -30.16 0.23 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2ee -17.49 1.03 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2r -7.54 0.66 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2k -22.27 0.86 4 -FEP_p38a_2r-p38a_2g 32.70 0.93 6 -FEP_p38a_3flw-p38a_2f -2.17 0.62 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2aa -27.33 0.46 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2i 59.20 0.78 8 -FEP_p38a_2z-p38a_2x 4.70 0.84 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2e -7.86 0.86 1 -FEP_p38a_3flq-p38a_3fln 36.89 0.39 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2n 1.78 0.82 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ee -10.03 1.39 2 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fmh 1.12 0.57 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2bb -33.12 0.74 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -11.57 0.30 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2i -0.34 0.32 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2f 15.32 0.41 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2aa -23.93 0.47 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2gg -50.70 0.64 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2j -6.59 0.18 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2t -43.63 0.30 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ee -12.93 0.56 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2ee -0.60 0.82 8 -FEP_p38a_2t-p38a_2n 45.73 0.35 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2j 40.17 0.81 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fly -2.93 0.24 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2ff -38.13 0.23 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.30 0.21 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2aa -31.15 0.82 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2o 18.85 0.87 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2t -40.15 0.32 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2z -22.47 1.06 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -3.67 0.31 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2ee 10.74 0.87 4 -FEP_p38a_2z-p38a_2g 22.47 0.58 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2k -25.07 0.52 4 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ee 81.49 0.31 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2g 46.93 0.41 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2gg -23.78 1.23 7 -FEP_p38a_2ee-p38a_2aa -20.87 0.69 4 -FEP_p38a_2h-p38a_2gg -92.11 0.40 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2gg -92.33 1.01 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2h 4.58 0.40 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2i -4.96 0.51 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2bb -62.52 0.39 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2gg -29.55 0.33 7 -FEP_p38a_2n-p38a_2f -2.74 0.90 3 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -39.66 0.42 3 -FEP_p38a_2y-p38a_2l 58.37 0.43 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2s -20.91 1.69 6 -FEP_p38a_3flz-p38a_2f -0.13 0.36 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2m 16.83 0.73 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -16.84 0.23 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2x -14.97 0.78 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2m 60.96 0.59 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -88.99 0.25 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2aa -28.75 0.53 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2n 66.77 0.86 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2h -16.00 0.66 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_3flq -43.05 0.90 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2g 5.72 0.33 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2j 11.77 1.13 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2y -49.11 0.58 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2bb -52.78 0.61 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ee 12.08 1.13 3 -FEP_p38a_2x-p38a_2k -8.04 1.05 1 -FEP_p38a_3flq-p38a_2t -3.44 0.50 1 -FEP_p38a_3flq-p38a_2f 38.42 0.60 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2aa -32.24 0.69 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -23.83 0.25 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2h -1.03 0.57 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2g 51.21 0.44 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ee -4.49 0.84 2 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2f -1.79 0.94 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2j -3.00 0.40 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2q -38.54 0.95 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2ff 22.81 0.37 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2o -3.48 0.91 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flw 1.92 0.35 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2k -10.39 0.47 2 -FEP_p38a_2q-p38a_2ee 53.82 0.86 8 -FEP_p38a_2j-p38a_2ee -3.68 0.57 2 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2i -3.42 0.63 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2r 13.73 1.04 5 -FEP_p38a_3fly-p38a_2bb -49.31 0.60 3 -FEP_p38a_2x-p38a_2bb -37.06 0.56 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2ee 12.78 0.76 3 -FEP_p38a_2p-p38a_2ff 48.81 0.04 8 -FEP_p38a_2y-p38a_2k 26.71 0.69 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2aa 17.26 0.82 8 -FEP_p38a_2s-p38a_2aa -9.98 0.80 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -21.37 0.51 3 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2m 17.56 0.72 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -14.85 0.24 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2g 1.00 0.66 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2l 54.05 0.85 2 -FEP_p38a_2q-p38a_2m 79.75 0.51 4 -FEP_p38a_2n-p38a_2ee -10.69 1.14 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -0.55 0.16 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2gg -47.84 0.41 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2r -32.41 1.19 7 -FEP_p38a_2k-p38a_2bb -30.30 0.75 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2x -15.65 0.63 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2p -27.79 0.95 3 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ee -8.86 0.65 3 -FEP_p38a_3flz-p38a_2s -18.27 0.13 8 -FEP_p38a_2t-p38a_2r 14.96 0.74 1 -FEP_p38a_2f-p38a_2ee -8.72 0.69 4 -FEP_p38a_2u-p38a_2m 60.77 1.33 8 -FEP_p38a_2z-p38a_2s -2.21 1.12 5 -FEP_p38a_2x-p38a_2h 15.10 0.67 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2m 14.94 0.92 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2k -18.77 0.53 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2f 3.01 0.42 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2h 24.31 0.94 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2q -60.49 1.26 7 -FEP_p38a_2j-p38a_2gg -85.31 0.25 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2l 71.52 1.03 6 -FEP_p38a_2l-p38a_2f -10.98 0.98 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flz -2.77 1.19 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2m 36.57 0.67 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2o -47.82 0.66 7 -FEP_p38a_2l-p38a_2k -31.56 0.65 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2j -6.55 0.62 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2n 3.65 0.66 4 -FEP_p38a_2y-p38a_2m 65.99 0.74 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2j -9.38 0.93 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2l 28.18 0.72 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2p -4.00 0.47 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flw 0.96 0.82 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/water.txt deleted file mode 100755 index 47153e8c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/water.txt +++ /dev/null @@ -1,538 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_2n-p38a_2m 15.14 0.36 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2aa -4.17 0.70 7 -FEP_p38a_3flq-p38a_2z 22.71 0.79 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2g 23.80 0.72 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2o 13.61 0.62 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2l 60.22 0.71 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2m 68.33 0.48 2 -FEP_p38a_3flw-p38a_2gg -93.89 0.65 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2ee 19.30 0.64 5 -FEP_p38a_2gg-p38a_2bb 37.58 0.66 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2g -15.94 0.78 1 -FEP_p38a_3flq-p38a_2t -2.58 0.51 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2bb -36.35 0.63 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2g -1.49 1.09 6 -FEP_p38a_2v-p38a_2t -30.25 0.55 5 -FEP_p38a_2x-p38a_2e 10.53 0.43 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2bb -55.36 0.70 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2ee 10.30 0.81 5 -FEP_p38a_3fly-p38a_2v -9.38 0.19 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2r -7.93 0.23 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2j 17.76 0.49 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2o -24.27 0.82 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ee -11.39 0.52 3 -FEP_p38a_2s-p38a_2e 17.70 0.67 3 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2m 14.87 1.05 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2bb -54.38 0.27 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2l 7.48 0.73 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2x -12.57 0.34 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2gg -73.23 0.84 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2n 45.52 0.22 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2l 73.30 0.67 3 -FEP_p38a_2g-p38a_2ff -24.73 0.27 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2aa -36.87 1.02 2 -FEP_p38a_2t-p38a_2c 48.71 0.72 8 -FEP_p38a_2s-p38a_2bb -36.70 0.27 6 -FEP_p38a_2n-p38a_2j -8.25 1.43 5 -FEP_p38a_2h-p38a_2bb -55.27 0.33 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2h -2.04 0.24 4 -FEP_p38a_2o-p38a_2g nan nan 9 -FEP_p38a_2k-p38a_2h 23.86 0.68 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -29.36 0.64 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2gg -94.49 0.30 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2n 7.11 0.91 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2y -47.39 0.51 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2j 14.03 0.84 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2s -5.77 1.33 5 -FEP_p38a_2x-p38a_2g 19.62 0.37 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2ff 23.06 0.14 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2h 31.08 0.69 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2h -0.45 0.22 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2h 19.36 0.91 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2v 2.15 0.47 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2gg -22.41 nan 9 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2y -52.12 0.38 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2m 39.19 0.92 1 -FEP_p38a_2f-p38a_2aa -29.97 0.76 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2l -8.17 0.30 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2o -7.52 0.69 7 -FEP_p38a_2l-p38a_2g -6.39 0.25 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2s -22.29 1.38 7 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fln -0.54 0.18 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2ff 30.17 0.26 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2bb -38.52 0.67 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2h 72.10 nan 9 -FEP_p38a_3fly-p38a_2bb -51.98 0.46 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2z -16.05 0.79 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2g 8.48 0.15 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2t -39.86 0.55 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -15.31 0.34 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2gg -48.49 0.13 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -14.99 0.36 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2s 29.57 0.87 2 -FEP_p38a_2x-p38a_2j 11.03 0.45 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2x -15.74 0.77 1 -FEP_p38a_2k-p38a_2aa -11.60 0.63 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2n 2.77 0.47 5 -FEP_p38a_2x-p38a_2aa -18.16 0.50 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2aa 15.94 1.85 7 -FEP_p38a_3flq-p38a_2gg -50.80 0.44 2 -FEP_p38a_2bb-p38a_2aa 21.21 1.04 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2z -24.99 1.11 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2ff -24.10 0.72 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2e nan nan 10 -FEP_p38a_2n-p38a_2i -5.53 0.88 2 -FEP_p38a_2k-p38a_2bb -31.59 0.41 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_3flq -41.01 0.65 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -1.08 0.12 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2ff 9.59 0.66 5 -FEP_p38a_2r-p38a_2l 39.79 0.76 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2g 2.16 0.25 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2g 54.44 0.35 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2ff -39.60 0.37 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2aa -36.47 1.38 4 -FEP_p38a_3flz-p38a_2q -62.21 nan 9 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -16.20 0.10 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2bb -51.26 0.26 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2i 50.13 0.31 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2bb -3.31 0.57 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2f -2.46 0.20 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2e -7.63 0.37 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2e -2.70 0.09 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2ee 10.45 0.16 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2aa 11.16 0.59 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2j -7.52 0.23 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2t 7.61 0.94 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2aa -50.90 0.61 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flz -3.97 1.06 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2o -29.00 1.10 7 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ff 71.59 0.13 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2gg -110.59 0.33 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2n 21.65 0.94 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2l 13.71 0.26 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2r -10.25 0.66 7 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 3.39 0.38 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2gg -78.28 0.26 6 -FEP_p38a_2v-p38a_2l 24.58 0.78 4 -FEP_p38a_3flw-p38a_3fln -4.73 0.33 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -23.66 0.79 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2e -9.03 0.68 3 -FEP_p38a_2k-p38a_2ee 14.65 0.61 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2h 3.64 0.15 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -89.41 0.29 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2n 63.34 0.46 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -23.67 0.73 7 -FEP_p38a_2z-p38a_2i 19.20 0.60 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2h -19.39 0.85 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2gg -41.96 0.51 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2x 7.25 0.36 1 -FEP_p38a_2i-p38a_2ee -8.03 0.81 2 -FEP_p38a_2ff-p38a_2f 19.41 0.28 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2aa -27.21 0.74 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2e 16.19 0.38 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ff -23.03 1.23 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2ee 41.83 0.87 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2x -15.87 0.47 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2l 8.09 0.82 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2x -16.87 0.52 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2z -23.50 0.98 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2bb -33.08 0.24 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2h 44.08 0.28 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2e -6.45 0.30 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2h 68.00 0.37 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2aa -34.35 0.68 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2p -26.44 0.98 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2y -47.06 0.36 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2i 4.54 0.12 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2m 22.01 0.87 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ee -5.60 0.46 2 -FEP_p38a_2l-p38a_2i -11.17 0.94 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2n 1.90 0.97 4 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fln -3.39 0.18 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 32.66 0.65 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2ff -31.49 0.21 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2ee -7.86 0.82 5 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flq -43.96 0.70 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2q -18.93 0.58 8 -FEP_p38a_2m-p38a_2ee -27.95 0.68 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2j -6.51 0.26 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2g 1.43 0.32 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2bb -12.43 0.44 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flw 4.65 0.90 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2ee 33.55 0.63 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -38.39 0.18 7 -FEP_p38a_2i-p38a_2g 4.30 0.20 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2bb -72.11 0.46 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2z -17.52 0.59 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2m 18.29 1.05 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fly -6.92 0.69 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flw 0.98 0.49 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2r 11.97 0.51 4 -FEP_p38a_2t-p38a_2s 20.98 0.65 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2bb -54.13 0.35 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flw -0.94 0.84 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2m 36.26 0.55 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2s -23.62 1.36 4 -FEP_p38a_2h-p38a_2gg -92.94 0.42 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2k -24.15 0.95 3 -FEP_p38a_2l-p38a_2h -8.89 0.20 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2j 46.53 0.56 8 -FEP_p38a_2u-p38a_2r 8.53 1.05 6 -FEP_p38a_2g-p38a_2ee -13.65 0.70 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2ff -3.58 0.73 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fly -5.74 0.53 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2e 8.40 0.40 6 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fln -5.81 0.34 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2i 14.33 0.57 3 -FEP_p38a_3flq-p38a_2s 20.03 0.92 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2c 4.17 1.06 4 -FEP_p38a_2x-p38a_2i 16.32 0.40 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2ff -8.55 0.30 7 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2g 1.16 0.38 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2n 68.91 0.41 1 -FEP_p38a_2i-p38a_2h 1.88 0.14 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2aa -23.82 0.89 5 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ee -13.16 0.40 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2k -2.94 0.74 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2x 34.51 0.97 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2i 18.61 0.59 4 -FEP_p38a_3flq-p38a_2c 42.78 0.23 8 -FEP_p38a_3fly-p38a_2s -16.56 0.66 6 -FEP_p38a_2gg-p38a_2c 94.88 1.11 7 -FEP_p38a_3flw-p38a_2c 1.33 0.41 8 -FEP_p38a_2r-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2y-p38a_2u 9.26 nan 7 -FEP_p38a_2x-p38a_2r -12.96 0.12 7 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2q -64.83 nan 9 -FEP_p38a_3fly-p38a_2p -63.01 0.01 8 -FEP_p38a_2r-p38a_2e 23.57 0.38 8 -FEP_p38a_2o-p38a_2e 45.54 0.67 7 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2r -28.05 0.21 7 -FEP_p38a_2p-p38a_2bb 13.41 nan 9 -FEP_p38a_2u-p38a_2s 13.21 0.46 7 -FEP_p38a_2x-p38a_2h 16.68 0.34 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2u -42.69 nan 6 -FEP_p38a_3flq-p38a_2q nan nan 10 -FEP_p38a_2ee-p38a_2c 17.07 nan 8 -FEP_p38a_2u-p38a_2t -2.81 nan 8 -FEP_p38a_2v-p38a_2n 16.45 0.65 8 -FEP_p38a_2r-p38a_2i 29.14 0.42 5 -FEP_p38a_3flq-p38a_2p -25.56 nan 9 -FEP_p38a_3fln-p38a_2u nan nan 6 -FEP_p38a_2q-p38a_2i 60.93 0.44 7 -FEP_p38a_2p-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_3flz-p38a_2r -32.13 nan 9 -FEP_p38a_2i-p38a_2e -4.25 0.14 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ee 31.51 0.71 3 -FEP_p38a_2s-p38a_2gg -71.16 0.95 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2q nan nan 9 -FEP_p38a_3flq-p38a_2j 36.08 0.53 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2q -63.82 0.51 7 -FEP_p38a_2v-p38a_2h 14.97 0.79 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2o -2.33 0.98 4 -FEP_p38a_2k-p38a_2i 22.39 0.44 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2gg -89.31 0.59 5 -FEP_p38a_2h-p38a_2ff -21.59 0.29 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2k 20.97 0.64 2 -FEP_p38a_2x-p38a_2ff -4.94 0.43 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -5.74 0.15 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2bb nan nan 10 -FEP_p38a_3flw-p38a_2t -44.54 0.63 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2l 48.67 0.13 5 -FEP_p38a_2v-p38a_2c 18.59 nan 9 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -19.12 0.48 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2g 44.62 0.42 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2n 50.52 0.70 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2f -4.17 0.21 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2ff 42.18 nan 9 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2v -16.64 0.24 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2j -6.08 0.24 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2g 97.33 0.62 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2e 61.68 nan 9 -FEP_p38a_2p-p38a_2i 68.97 nan 8 -FEP_p38a_2i-p38a_2ff -20.27 0.35 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2aa -30.26 0.68 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2m 84.91 0.52 6 -FEP_p38a_2u-p38a_2o -10.02 0.53 5 -FEP_p38a_3flw-p38a_2m 17.74 0.68 1 -FEP_p38a_2g-p38a_2aa -37.23 0.39 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2s-p38a_2h 22.21 0.58 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 7.28 0.09 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ff 20.66 0.91 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2o -49.29 0.91 7 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fmh -0.05 0.34 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2m 16.57 0.97 1 -FEP_p38a_2q-p38a_2gg -27.53 nan 9 -FEP_p38a_2u-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_3flq-p38a_2h 41.47 0.42 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2l 13.63 0.63 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.72 0.14 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2y -52.05 0.34 2 -FEP_p38a_2r-p38a_2q -31.65 0.83 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2c 22.86 0.68 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_2aa -33.02 0.81 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2q -41.66 nan 9 -FEP_p38a_2i-p38a_2gg -90.44 0.80 2 -FEP_p38a_2x-p38a_2m 34.95 0.76 2 -FEP_p38a_2q-p38a_2ff 41.29 0.86 7 -FEP_p38a_2x-p38a_2k -7.32 0.48 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2q -62.84 0.69 6 -FEP_p38a_3flq-p38a_2i 39.21 0.84 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2o -18.98 0.98 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2g nan nan 9 -FEP_p38a_3flz-p38a_2z -19.23 0.71 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2y-p38a_2j 45.96 0.48 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2q -38.24 1.00 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2i -0.70 0.12 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ff -22.76 0.76 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2l 28.86 0.62 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2e 39.14 0.35 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2i -1.53 0.33 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -44.41 1.31 5 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -22.52 0.51 3 -FEP_p38a_2p-p38a_2ee 56.62 0.43 8 -FEP_p38a_3flq-p38a_2k 19.09 0.56 3 -FEP_p38a_3flz-p38a_2o -50.40 nan 9 -FEP_p38a_2n-p38a_2gg -96.52 0.64 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2o -32.88 nan 9 -FEP_p38a_3fln-p38a_2h 4.26 0.12 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2c 52.96 0.90 7 -FEP_p38a_2n-p38a_2ee -13.67 0.80 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2i 2.73 0.16 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2e -8.75 0.11 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2bb -49.87 0.40 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2k 28.22 0.59 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2bb -65.22 0.17 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2e -4.56 0.18 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2i -2.68 0.28 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2r -30.46 nan 9 -FEP_p38a_2gg-p38a_2f 90.26 0.89 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2gg -87.06 0.50 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2f 1.56 0.17 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2q -17.66 nan 9 -FEP_p38a_2y-p38a_2o -1.62 0.71 8 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2h -2.31 0.84 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2x 23.95 0.98 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2gg -69.76 0.40 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2n 19.32 1.05 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ee -9.42 0.91 3 -FEP_p38a_2k-p38a_2ff 1.01 0.19 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2m 57.98 nan 9 -FEP_p38a_2s-p38a_2aa -13.91 0.46 2 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flw -1.77 0.98 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2r -29.71 0.74 7 -FEP_p38a_2z-p38a_2c 23.58 1.02 7 -FEP_p38a_2k-p38a_2g 26.17 0.37 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2e -6.28 0.69 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2f 38.97 0.39 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2n 45.26 0.96 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2k -25.57 0.43 2 -FEP_p38a_2h-p38a_2g 3.11 0.11 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2r nan nan 10 -FEP_p38a_2o-p38a_2m 65.87 1.01 2 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 6.37 0.15 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2p -37.01 0.57 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2aa -20.40 0.61 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2e -23.72 0.98 1 -FEP_p38a_2l-p38a_2e -14.84 0.54 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2aa 34.08 1.20 7 -FEP_p38a_3flq-p38a_2l 51.13 0.42 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2bb -49.60 0.32 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2n 55.21 0.61 5 -FEP_p38a_2r-p38a_2gg -64.73 0.84 6 -FEP_p38a_2m-p38a_2f -19.50 0.62 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2s -3.01 0.53 5 -FEP_p38a_3flq-p38a_3fln 37.88 0.21 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2k-p38a_2f 21.55 0.66 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2f 58.12 nan 8 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.35 0.17 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2r 13.67 0.76 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2bb -44.07 0.71 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2k -33.90 0.73 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2f 21.59 0.38 7 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2q-p38a_2ee 51.82 nan 8 -FEP_p38a_2s-p38a_2g 25.51 1.23 4 -FEP_p38a_2y-p38a_2aa 16.18 0.58 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ee 7.52 1.19 4 -FEP_p38a_2i-p38a_2f -1.34 0.17 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fly -3.16 0.21 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2e 0.26 0.18 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2j -1.73 0.20 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2aa -33.44 0.64 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ff -0.25 0.77 3 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fln -5.66 0.40 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2n 32.71 0.31 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 7.90 0.90 3 -FEP_p38a_2v-p38a_2q -54.33 nan 8 -FEP_p38a_2z-p38a_2f 17.39 0.71 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2u nan nan 10 -FEP_p38a_2u-p38a_2j nan nan 10 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2t -46.20 0.31 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2p -19.07 nan 9 -FEP_p38a_2o-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2t-p38a_2bb -10.54 0.32 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ff -16.48 1.06 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2aa -10.99 0.50 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2l-p38a_2ee -19.92 0.57 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2ff 29.40 0.80 6 -FEP_p38a_2c-p38a_2aa -37.76 0.37 8 -FEP_p38a_2y-p38a_2h 51.11 0.33 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -12.25 0.32 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2j 15.83 0.53 4 -FEP_p38a_2m-p38a_2i -20.35 0.77 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2aa -37.85 1.37 5 -FEP_p38a_2l-p38a_2aa -43.18 0.51 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2c 3.54 0.63 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2j -5.18 0.17 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2o -52.55 0.43 7 -FEP_p38a_2q-p38a_2aa 34.49 nan 8 -FEP_p38a_2y-p38a_2e 45.76 0.33 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2t -28.26 0.74 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2e 88.50 0.74 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2l 58.98 0.85 2 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2n 0.69 1.05 3 -FEP_p38a_3fln-p38a_2v -10.47 1.02 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2ee -6.12 0.30 3 -FEP_p38a_2e-p38a_2aa -29.00 0.65 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2v 34.46 0.94 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2ee 13.54 0.85 2 -FEP_p38a_3flq-p38a_2e 35.23 0.87 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2k -26.45 0.95 1 -FEP_p38a_2u-p38a_2g nan nan 8 -FEP_p38a_3flq-p38a_2aa 7.64 0.88 2 -FEP_p38a_2n-p38a_2l 8.10 0.22 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2o -47.44 0.04 8 -FEP_p38a_2v-p38a_2r -19.20 nan 9 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c -1.37 1.12 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ee -4.90 0.07 6 -FEP_p38a_2t-p38a_2m 61.64 0.21 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2k -26.99 0.28 8 -FEP_p38a_2x-p38a_2q nan nan 10 -FEP_p38a_2p-p38a_2j 63.22 nan 9 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -39.00 0.08 8 -FEP_p38a_2u-p38a_2gg -50.49 nan 9 -FEP_p38a_2o-p38a_2h 53.20 0.38 8 -FEP_p38a_2y-p38a_2r 22.18 1.07 7 -FEP_p38a_3flw-p38a_2y -50.14 0.58 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2p -69.55 nan 8 -FEP_p38a_2v-p38a_2g 17.29 0.51 3 -FEP_p38a_2j-p38a_2c 5.84 0.94 1 -FEP_p38a_2q-p38a_2e nan nan 10 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2bb -55.34 0.35 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2h -1.90 0.47 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2i 38.05 nan 9 -FEP_p38a_2t-p38a_2l 53.95 0.08 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2n 40.06 1.22 8 -FEP_p38a_2h-p38a_2ee -7.53 1.03 4 -FEP_p38a_2z-p38a_2t -25.05 0.62 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2e 18.40 0.91 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2gg -44.52 0.93 3 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 3.03 0.14 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2f 28.82 1.05 7 -FEP_p38a_2i-p38a_2aa -32.74 0.99 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 9.41 0.76 5 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2c -1.16 nan 8 -FEP_p38a_2l-p38a_2f -11.48 0.40 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2l 11.36 0.45 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2e -1.84 0.25 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2v 27.98 0.48 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_2gg -92.62 0.49 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2f 42.31 0.28 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2u nan nan 9 -FEP_p38a_2p-p38a_2l 77.47 0.99 5 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2o -49.53 nan 9 -FEP_p38a_2r-p38a_2g 31.94 nan 9 -FEP_p38a_3flz-p38a_2k -22.11 0.55 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2bb -58.51 0.81 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2q nan nan 10 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2t -46.09 0.62 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2l 8.29 0.50 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2v 7.53 0.60 1 -FEP_p38a_3flq-p38a_2m 58.38 0.94 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2u nan nan 7 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ee -8.89 1.17 3 -FEP_p38a_2x-p38a_2f 13.81 0.33 1 -FEP_p38a_2l-p38a_2gg -102.69 0.12 1 -FEP_p38a_2o-p38a_2bb -3.32 0.10 8 -FEP_p38a_3fly-p38a_2f 0.99 0.30 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2m 22.30 0.86 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2m 32.08 0.00 8 -FEP_p38a_3flz-p38a_2f -2.29 0.19 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2c 3.18 1.21 6 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2v -16.97 0.48 6 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ff -20.61 0.30 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2e -4.92 0.10 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2s -24.59 0.25 6 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2f -4.76 0.66 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2c 2.96 1.14 3 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flq -38.16 1.06 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -17.78 0.91 3 -FEP_p38a_2y-p38a_2f 48.98 0.38 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2m 47.64 0.55 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2j -1.13 0.16 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2gg -76.49 0.51 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2v -13.94 0.52 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p nan nan 9 -FEP_p38a_2c-p38a_2bb -51.90 0.42 7 -FEP_p38a_2t-p38a_2i 43.81 0.25 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2t -43.56 0.38 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -39.63 0.26 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2ee nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2o nan nan 10 -FEP_p38a_2s-p38a_2n 27.86 0.37 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2i 47.11 0.78 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2s -23.48 1.86 5 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ee 82.00 0.23 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2f -3.29 0.77 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2z -20.41 0.72 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2h-p38a_2c 0.38 0.70 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2j 22.97 0.59 8 -FEP_p38a_2x-p38a_2p nan nan 9 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2x -20.07 1.00 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2f 12.82 0.68 3 -FEP_p38a_2v-p38a_2k -10.50 0.97 3 -FEP_p38a_3flz-p38a_2h 0.18 0.14 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2l 25.70 0.46 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2k nan nan 8 -FEP_p38a_2n-p38a_2f -4.20 0.74 5 -FEP_p38a_2x-p38a_2u nan nan 8 -FEP_p38a_2q-p38a_2m 80.04 1.06 4 -FEP_p38a_3flw-p38a_2bb -56.40 0.82 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2g 47.70 0.25 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2y -7.50 0.97 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2v -13.49 1.06 4 -FEP_p38a_2g-p38a_2bb -58.40 0.28 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flq -42.66 1.02 2 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 38.76 0.40 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2y -51.24 0.36 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2o 18.26 0.37 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2bb -23.77 0.41 8 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2i -3.41 0.30 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2gg -95.00 0.59 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2aa 59.78 0.45 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2aa -31.57 0.52 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2p -43.11 1.12 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -42.52 1.68 7 -FEP_p38a_2z-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2s nan nan 10 -FEP_p38a_2f-p38a_2bb -52.72 0.15 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2e 14.27 0.78 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flz -3.40 0.82 3 -FEP_p38a_3fly-p38a_2g 6.97 0.16 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ff -23.55 1.13 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2k -19.20 0.44 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2c -11.47 1.21 8 -FEP_p38a_2o-p38a_2f nan nan 9 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2n 0.36 1.25 2 -FEP_p38a_2ee-p38a_2e 4.46 0.88 3 -FEP_p38a_2e-p38a_2c 7.23 1.12 6 -FEP_p38a_2q-p38a_2p -4.81 0.49 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2c nan nan 10 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/water_old.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/water_old.txt deleted file mode 100755 index b7b9dea2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/lineal/water_old.txt +++ /dev/null @@ -1,551 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_2n-p38a_2m 15.14 0.36 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2aa -4.17 0.70 7 -FEP_p38a_3flq-p38a_2z 22.71 0.79 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2g 23.80 0.72 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2o 13.61 0.62 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2l 60.22 0.71 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2m 68.33 0.48 2 -FEP_p38a_3flw-p38a_2gg -93.89 0.65 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2ee 19.30 0.64 5 -FEP_p38a_2gg-p38a_2bb 37.58 0.66 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2g -15.94 0.78 1 -FEP_p38a_3flq-p38a_2t -2.58 0.51 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2bb -36.35 0.63 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2g -1.49 1.09 6 -FEP_p38a_2v-p38a_2t -30.25 0.55 5 -FEP_p38a_2x-p38a_2e 10.53 0.43 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2bb -55.36 0.70 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2ee 10.30 0.81 5 -FEP_p38a_3fly-p38a_2v -9.38 0.19 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2r -7.93 0.23 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2j 17.76 0.49 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2o -24.27 0.82 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ee -11.39 0.52 3 -FEP_p38a_2s-p38a_2e 17.70 0.67 3 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2m 14.87 1.05 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2bb -54.38 0.27 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2l 7.48 0.73 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2x -12.57 0.34 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2gg -73.23 0.84 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2n 45.52 0.22 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2l 73.30 0.67 3 -FEP_p38a_2g-p38a_2ff -24.73 0.27 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2aa -36.87 1.02 2 -FEP_p38a_2t-p38a_2c 48.71 0.72 8 -FEP_p38a_2s-p38a_2bb -36.70 0.27 6 -FEP_p38a_2n-p38a_2j -8.25 1.43 5 -FEP_p38a_2h-p38a_2bb -55.27 0.33 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2h -2.04 0.24 4 -FEP_p38a_2o-p38a_2g nan nan 9 -FEP_p38a_2k-p38a_2h 23.86 0.68 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -29.36 0.64 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2gg -94.49 0.30 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2n 7.11 0.91 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2y -47.39 0.51 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2j 14.03 0.84 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2s -5.77 1.33 5 -FEP_p38a_2x-p38a_2g 19.62 0.37 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2ff 23.06 0.14 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2h 31.08 0.69 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2h -0.45 0.22 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2h 19.36 0.91 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2v 2.15 0.47 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2gg -22.41 nan 9 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2y -52.12 0.38 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2m 39.19 0.92 1 -FEP_p38a_2f-p38a_2aa -29.97 0.76 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2l -8.17 0.30 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2o -7.52 0.69 7 -FEP_p38a_2l-p38a_2g -6.39 0.25 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2s -22.29 1.38 7 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fln -0.54 0.18 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2ff 30.17 0.26 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2bb -38.52 0.67 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2h 72.10 nan 9 -FEP_p38a_3fly-p38a_2bb -51.98 0.46 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2z -16.05 0.79 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2g 8.48 0.15 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2t -39.86 0.55 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -15.31 0.34 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2gg -48.49 0.13 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -14.99 0.36 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2s 29.57 0.87 2 -FEP_p38a_2x-p38a_2j 11.03 0.45 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2x -15.74 0.77 1 -FEP_p38a_2k-p38a_2aa -11.60 0.63 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2n 2.77 0.47 5 -FEP_p38a_2x-p38a_2aa -18.16 0.50 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2c 24.65 1.06 8 -FEP_p38a_2o-p38a_2aa 15.94 1.85 7 -FEP_p38a_3flq-p38a_2gg -50.80 0.44 2 -FEP_p38a_2bb-p38a_2aa 21.21 1.04 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2z -24.99 1.11 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2ff -24.10 0.72 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2e nan nan 10 -FEP_p38a_2n-p38a_2i -5.53 0.88 2 -FEP_p38a_2k-p38a_2bb -31.59 0.41 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_3flq -41.01 0.65 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -1.08 0.12 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2ff 9.59 0.66 5 -FEP_p38a_2r-p38a_2l 39.79 0.76 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2g 2.16 0.25 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2g 54.44 0.35 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2ff -39.60 0.37 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2aa -36.47 1.38 4 -FEP_p38a_3flz-p38a_2q -62.21 nan 9 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -16.20 0.10 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2bb -51.26 0.26 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2j 58.00 0.57 7 -FEP_p38a_2y-p38a_2i 50.13 0.31 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2bb -3.31 0.57 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2f -2.46 0.20 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2e -7.63 0.37 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2e -2.70 0.09 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2ee 10.45 0.16 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2aa 11.16 0.59 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2j -7.52 0.23 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2t 7.61 0.94 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2aa -50.90 0.61 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flz -3.97 1.06 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2o -29.00 1.10 7 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ff 71.59 0.13 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2gg -110.59 0.33 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2n 21.65 0.94 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2l 13.71 0.26 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2r -10.25 0.66 7 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 3.39 0.38 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2gg -78.28 0.26 6 -FEP_p38a_2v-p38a_2l 24.58 0.78 4 -FEP_p38a_3flw-p38a_3fln -4.73 0.33 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -23.66 0.79 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2e -9.03 0.68 3 -FEP_p38a_2k-p38a_2ee 14.65 0.61 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2h 3.64 0.15 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -89.41 0.29 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2n 63.34 0.46 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -23.67 0.73 7 -FEP_p38a_2z-p38a_2i 19.20 0.60 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2h -19.39 0.85 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2gg -41.96 0.51 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2x 7.25 0.36 1 -FEP_p38a_2i-p38a_2ee -8.03 0.81 2 -FEP_p38a_2ff-p38a_2f 19.41 0.28 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2aa -27.21 0.74 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2e 16.19 0.38 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ff -23.03 1.23 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2ee 41.83 0.87 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2x -15.87 0.47 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2l 8.09 0.82 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2x -16.87 0.52 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2z -23.50 0.98 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2bb -33.08 0.24 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2h 44.08 0.28 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2e -6.45 0.30 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2h 68.00 0.37 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2aa -34.35 0.68 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2p -26.44 0.98 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2y -47.06 0.36 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2i 4.54 0.12 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2m 22.01 0.87 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ee -5.60 0.46 2 -FEP_p38a_2l-p38a_2i -11.17 0.94 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2n 1.90 0.97 4 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fln -3.39 0.18 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 32.66 0.65 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2ff -31.49 0.21 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2ee -7.86 0.82 5 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flq -43.96 0.70 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2q -18.93 0.58 8 -FEP_p38a_2m-p38a_2ee -27.95 0.68 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2j -6.51 0.26 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2g 1.43 0.32 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2bb -12.43 0.44 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flw 4.65 0.90 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2ee 33.55 0.63 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -38.39 0.18 7 -FEP_p38a_2i-p38a_2g 4.30 0.20 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2bb -72.11 0.46 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2z -17.52 0.59 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2m 18.29 1.05 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fly -6.92 0.69 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flw 0.98 0.49 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2r 11.97 0.51 4 -FEP_p38a_2t-p38a_2s 20.98 0.65 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2bb -54.13 0.35 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flw -0.94 0.84 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2m 36.26 0.55 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2s -23.62 1.36 4 -FEP_p38a_2h-p38a_2gg -92.94 0.42 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2k -24.15 0.95 3 -FEP_p38a_2l-p38a_2h -8.89 0.20 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2j 46.53 0.56 8 -FEP_p38a_2u-p38a_2r 8.53 1.05 6 -FEP_p38a_2g-p38a_2ee -13.65 0.70 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2ff -3.58 0.73 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fly -5.74 0.53 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2e 8.40 0.40 6 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fln -5.81 0.34 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2i 14.33 0.57 3 -FEP_p38a_3flq-p38a_2s 20.03 0.92 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2c 4.17 1.06 4 -FEP_p38a_2x-p38a_2i 16.32 0.40 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2ff -8.55 0.30 7 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2g 1.16 0.38 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2n 68.91 0.41 1 -FEP_p38a_2i-p38a_2h 1.88 0.14 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2aa -23.82 0.89 5 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ee -13.16 0.40 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2k -2.94 0.74 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2x 34.51 0.97 1 -FEP_p38a_2u-p38a_2c nan nan 9 -FEP_p38a_2s-p38a_2i 18.61 0.59 4 -FEP_p38a_3flq-p38a_2c 42.78 0.23 8 -FEP_p38a_3fly-p38a_2s -16.56 0.66 6 -FEP_p38a_2gg-p38a_2c 94.88 1.11 7 -FEP_p38a_3flw-p38a_2c 1.33 0.41 8 -FEP_p38a_2r-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2y-p38a_2u 9.26 nan 7 -FEP_p38a_2x-p38a_2r -12.96 0.12 7 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2q -64.83 nan 9 -FEP_p38a_3fly-p38a_2p -63.01 0.01 8 -FEP_p38a_2r-p38a_2e 23.57 0.38 8 -FEP_p38a_2o-p38a_2e 45.54 0.67 7 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2r -28.05 0.21 7 -FEP_p38a_2p-p38a_2bb 13.41 nan 9 -FEP_p38a_2u-p38a_2s 13.21 0.46 7 -FEP_p38a_2x-p38a_2h 16.68 0.34 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2u -42.69 nan 6 -FEP_p38a_2s-p38a_2c nan nan 9 -FEP_p38a_3flq-p38a_2q nan nan 10 -FEP_p38a_2ee-p38a_2c 17.07 nan 8 -FEP_p38a_2u-p38a_2t -2.81 nan 8 -FEP_p38a_2v-p38a_2n 16.45 0.65 8 -FEP_p38a_2r-p38a_2i 29.14 0.42 5 -FEP_p38a_3flq-p38a_2p -25.56 nan 9 -FEP_p38a_3fln-p38a_2u nan nan 6 -FEP_p38a_2q-p38a_2i 60.93 0.44 7 -FEP_p38a_2p-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_3flz-p38a_2r -32.13 nan 9 -FEP_p38a_2i-p38a_2e -4.25 0.14 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ee 31.51 0.71 3 -FEP_p38a_2s-p38a_2gg -71.16 0.95 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2q nan nan 9 -FEP_p38a_3flq-p38a_2j 36.08 0.53 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2q -63.82 0.51 7 -FEP_p38a_2v-p38a_2u nan nan 5 -FEP_p38a_2v-p38a_2h 14.97 0.79 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2o -2.33 0.98 4 -FEP_p38a_2k-p38a_2i 22.39 0.44 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2gg -89.31 0.59 5 -FEP_p38a_2h-p38a_2ff -21.59 0.29 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2k 20.97 0.64 2 -FEP_p38a_2x-p38a_2ff -4.94 0.43 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -5.74 0.15 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2bb nan nan 10 -FEP_p38a_3flw-p38a_2t -44.54 0.63 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2l 48.67 0.13 5 -FEP_p38a_2v-p38a_2c 18.59 nan 9 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -19.12 0.48 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2g 44.62 0.42 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2n 50.52 0.70 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2f -4.17 0.21 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2ff 42.18 nan 9 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2v -16.64 0.24 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2j -6.08 0.24 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2g 97.33 0.62 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2e 61.68 nan 9 -FEP_p38a_2p-p38a_2i 68.97 nan 8 -FEP_p38a_2i-p38a_2ff -20.27 0.35 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2aa -30.26 0.68 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2m 84.91 0.52 6 -FEP_p38a_2u-p38a_2o -10.02 0.53 5 -FEP_p38a_3flw-p38a_2m 17.74 0.68 1 -FEP_p38a_2g-p38a_2aa -37.23 0.39 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2s-p38a_2h 22.21 0.58 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 7.28 0.09 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ff 20.66 0.91 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2o -49.29 0.91 7 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fmh -0.05 0.34 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2m 16.57 0.97 1 -FEP_p38a_2q-p38a_2gg -27.53 nan 9 -FEP_p38a_2u-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_3flq-p38a_2h 41.47 0.42 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2l 13.63 0.63 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.72 0.14 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2y -52.05 0.34 2 -FEP_p38a_2r-p38a_2q -31.65 0.83 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2c 22.86 0.68 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_2aa -33.02 0.81 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2q -41.66 nan 9 -FEP_p38a_2i-p38a_2gg -90.44 0.80 2 -FEP_p38a_2x-p38a_2m 34.95 0.76 2 -FEP_p38a_2q-p38a_2ff 41.29 0.86 7 -FEP_p38a_2x-p38a_2k -7.32 0.48 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2q -62.84 0.69 6 -FEP_p38a_3flq-p38a_2i 39.21 0.84 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2o -18.98 0.98 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2g nan nan 9 -FEP_p38a_3flz-p38a_2z -19.23 0.71 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2y-p38a_2j 45.96 0.48 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2q -38.24 1.00 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2i -0.70 0.12 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ff -22.76 0.76 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2l 28.86 0.62 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2e 39.14 0.35 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2i -1.53 0.33 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -44.41 1.31 5 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -22.52 0.51 3 -FEP_p38a_2p-p38a_2ee 56.62 0.43 8 -FEP_p38a_3flq-p38a_2k 19.09 0.56 3 -FEP_p38a_3flz-p38a_2o -50.40 nan 9 -FEP_p38a_2n-p38a_2gg -96.52 0.64 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2o -32.88 nan 9 -FEP_p38a_3fln-p38a_2h 4.26 0.12 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2c 52.96 0.90 7 -FEP_p38a_2n-p38a_2ee -13.67 0.80 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2i 2.73 0.16 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2e -8.75 0.11 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2bb -49.87 0.40 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2k 28.22 0.59 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2bb -65.22 0.17 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2e -4.56 0.18 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2i -2.68 0.28 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2r -30.46 nan 9 -FEP_p38a_2gg-p38a_2f 90.26 0.89 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2gg -87.06 0.50 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2f 1.56 0.17 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2q -17.66 nan 9 -FEP_p38a_2y-p38a_2o -1.62 0.71 8 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2h -2.31 0.84 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2x 23.95 0.98 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2gg -69.76 0.40 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2n 19.32 1.05 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ee -9.42 0.91 3 -FEP_p38a_2k-p38a_2ff 1.01 0.19 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2m 57.98 nan 9 -FEP_p38a_2s-p38a_2aa -13.91 0.46 2 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flw -1.77 0.98 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2r -29.71 0.74 7 -FEP_p38a_2z-p38a_2c 23.58 1.02 7 -FEP_p38a_3fly-p38a_2u nan nan 8 -FEP_p38a_2k-p38a_2g 26.17 0.37 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2e -6.28 0.69 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2c -1.09 0.41 3 -FEP_p38a_3flq-p38a_2f 38.97 0.39 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2n 45.26 0.96 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2k -25.57 0.43 2 -FEP_p38a_2h-p38a_2g 3.11 0.11 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2r nan nan 10 -FEP_p38a_2o-p38a_2m 65.87 1.01 2 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 6.37 0.15 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2p -37.01 0.57 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2aa -20.40 0.61 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2e -23.72 0.98 1 -FEP_p38a_2l-p38a_2e -14.84 0.54 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2aa 34.08 1.20 7 -FEP_p38a_3flq-p38a_2l 51.13 0.42 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2bb -49.60 0.32 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2n 55.21 0.61 5 -FEP_p38a_2r-p38a_2gg -64.73 0.84 6 -FEP_p38a_2m-p38a_2f -19.50 0.62 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2s -3.01 0.53 5 -FEP_p38a_3flq-p38a_3fln 37.88 0.21 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2k-p38a_2f 21.55 0.66 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2f 58.12 nan 8 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.35 0.17 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2r 13.67 0.76 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2c -4.51 0.75 7 -FEP_p38a_2ee-p38a_2bb -44.07 0.71 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2k -33.90 0.73 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2f 21.59 0.38 7 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2q-p38a_2ee 51.82 nan 8 -FEP_p38a_2s-p38a_2g 25.51 1.23 4 -FEP_p38a_2y-p38a_2aa 16.18 0.58 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ee 7.52 1.19 4 -FEP_p38a_2i-p38a_2f -1.34 0.17 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fly -3.16 0.21 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2e 0.26 0.18 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2j -1.73 0.20 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2aa -33.44 0.64 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ff -0.25 0.77 3 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fln -5.66 0.40 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2n 32.71 0.31 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 7.90 0.90 3 -FEP_p38a_2v-p38a_2q -54.33 nan 8 -FEP_p38a_2z-p38a_2f 17.39 0.71 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2u nan nan 10 -FEP_p38a_2u-p38a_2j nan nan 10 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2t -46.20 0.31 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2p -19.07 nan 9 -FEP_p38a_2o-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2t-p38a_2bb -10.54 0.32 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ff -16.48 1.06 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2aa -10.99 0.50 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2l-p38a_2ee -19.92 0.57 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2ff 29.40 0.80 6 -FEP_p38a_2c-p38a_2aa -37.76 0.37 8 -FEP_p38a_2y-p38a_2h 51.11 0.33 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -12.25 0.32 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2j 15.83 0.53 4 -FEP_p38a_2m-p38a_2i -20.35 0.77 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2aa -37.85 1.37 5 -FEP_p38a_2l-p38a_2aa -43.18 0.51 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2c 3.54 0.63 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2j -5.18 0.17 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2o -52.55 0.43 7 -FEP_p38a_2q-p38a_2aa 34.49 nan 8 -FEP_p38a_2y-p38a_2e 45.76 0.33 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2t -28.26 0.74 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2e 88.50 0.74 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2l 58.98 0.85 2 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2n 0.69 1.05 3 -FEP_p38a_3fln-p38a_2v -10.47 1.02 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2ee -6.12 0.30 3 -FEP_p38a_2e-p38a_2aa -29.00 0.65 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2v 34.46 0.94 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2ee 13.54 0.85 2 -FEP_p38a_3flq-p38a_2e 35.23 0.87 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2k -26.45 0.95 1 -FEP_p38a_2u-p38a_2g nan nan 8 -FEP_p38a_3flq-p38a_2aa 7.64 0.88 2 -FEP_p38a_2n-p38a_2l 8.10 0.22 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2o -47.44 0.04 8 -FEP_p38a_2v-p38a_2r -19.20 nan 9 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c -1.37 1.12 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ee -4.90 0.07 6 -FEP_p38a_2t-p38a_2m 61.64 0.21 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2k -26.99 0.28 8 -FEP_p38a_2x-p38a_2q nan nan 10 -FEP_p38a_2p-p38a_2j 63.22 nan 9 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -39.00 0.08 8 -FEP_p38a_2u-p38a_2gg -50.49 nan 9 -FEP_p38a_2o-p38a_2h 53.20 0.38 8 -FEP_p38a_2y-p38a_2r 22.18 1.07 7 -FEP_p38a_3flw-p38a_2y -50.14 0.58 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2u nan nan 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2p -69.55 nan 8 -FEP_p38a_2v-p38a_2g 17.29 0.51 3 -FEP_p38a_2j-p38a_2c 5.84 0.94 1 -FEP_p38a_2q-p38a_2e nan nan 10 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2bb -55.34 0.35 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2h -1.90 0.47 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2i 38.05 nan 9 -FEP_p38a_2t-p38a_2l 53.95 0.08 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2n 40.06 1.22 8 -FEP_p38a_2h-p38a_2ee -7.53 1.03 4 -FEP_p38a_2z-p38a_2t -25.05 0.62 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2e 18.40 0.91 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2gg -44.52 0.93 3 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 3.03 0.14 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2f 28.82 1.05 7 -FEP_p38a_2i-p38a_2aa -32.74 0.99 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 9.41 0.76 5 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2c -1.16 nan 8 -FEP_p38a_2l-p38a_2f -11.48 0.40 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2l 11.36 0.45 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2e -1.84 0.25 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2v 27.98 0.48 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_2gg -92.62 0.49 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2f 42.31 0.28 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2u nan nan 9 -FEP_p38a_2p-p38a_2l 77.47 0.99 5 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2o -49.53 nan 9 -FEP_p38a_2r-p38a_2g 31.94 nan 9 -FEP_p38a_3flz-p38a_2k -22.11 0.55 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2bb -58.51 0.81 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2q nan nan 10 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2t -46.09 0.62 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2l 8.29 0.50 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2v 7.53 0.60 1 -FEP_p38a_3flq-p38a_2m 58.38 0.94 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2u nan nan 7 -FEP_p38a_2p-p38a_2f nan nan 10 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ee -8.89 1.17 3 -FEP_p38a_2x-p38a_2f 13.81 0.33 1 -FEP_p38a_2l-p38a_2gg -102.69 0.12 1 -FEP_p38a_2o-p38a_2bb -3.32 0.10 8 -FEP_p38a_3fly-p38a_2f 0.99 0.30 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2m 22.30 0.86 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2m 32.08 0.00 8 -FEP_p38a_3flz-p38a_2f -2.29 0.19 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2c 3.18 1.21 6 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2v -16.97 0.48 6 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ff -20.61 0.30 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2e -4.92 0.10 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2s -24.59 0.25 6 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2f -4.76 0.66 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2c 16.94 0.42 6 -FEP_p38a_2f-p38a_2c 2.96 1.14 3 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flq -38.16 1.06 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -17.78 0.91 3 -FEP_p38a_2y-p38a_2f 48.98 0.38 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2m 47.64 0.55 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2j -1.13 0.16 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2gg -76.49 0.51 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2v -13.94 0.52 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p nan nan 9 -FEP_p38a_2c-p38a_2bb -51.90 0.42 7 -FEP_p38a_2t-p38a_2i 43.81 0.25 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2t -43.56 0.38 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2g nan nan 10 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -39.63 0.26 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2ee nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2o nan nan 10 -FEP_p38a_2s-p38a_2n 27.86 0.37 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2i 47.11 0.78 8 -FEP_p38a_3flw-p38a_2s -23.48 1.86 5 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ee 82.00 0.23 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2f -3.29 0.77 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2z -20.41 0.72 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2h-p38a_2c 0.38 0.70 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2j 22.97 0.59 8 -FEP_p38a_2x-p38a_2p nan nan 9 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2x -20.07 1.00 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2f 12.82 0.68 3 -FEP_p38a_2v-p38a_2k -10.50 0.97 3 -FEP_p38a_3flz-p38a_2h 0.18 0.14 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2l 25.70 0.46 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2k nan nan 8 -FEP_p38a_2n-p38a_2f -4.20 0.74 5 -FEP_p38a_2x-p38a_2u nan nan 8 -FEP_p38a_2q-p38a_2m 80.04 1.06 4 -FEP_p38a_3flw-p38a_2bb -56.40 0.82 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2g 47.70 0.25 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2y -7.50 0.97 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2v -13.49 1.06 4 -FEP_p38a_2q-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2g-p38a_2bb -58.40 0.28 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flq -42.66 1.02 2 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 38.76 0.40 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2y -51.24 0.36 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2o 18.26 0.37 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2bb -23.77 0.41 8 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2i -3.41 0.30 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2gg -95.00 0.59 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2aa 59.78 0.45 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2aa -31.57 0.52 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2p -43.11 1.12 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -42.52 1.68 7 -FEP_p38a_2z-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2p nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2s nan nan 10 -FEP_p38a_2f-p38a_2bb -52.72 0.15 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2e 14.27 0.78 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flz -3.40 0.82 3 -FEP_p38a_3fly-p38a_2g 6.97 0.16 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ff -23.55 1.13 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2k -19.20 0.44 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2c -11.47 1.21 8 -FEP_p38a_2o-p38a_2f nan nan 9 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2n 0.36 1.25 2 -FEP_p38a_2ee-p38a_2e 4.46 0.88 3 -FEP_p38a_2e-p38a_2c 7.23 1.12 6 -FEP_p38a_2q-p38a_2p -4.81 0.49 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2c nan nan 10 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100755 index 25fb07e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,562 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a-2t_p38a-2ff 22.48 0.27 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2h 31.58 0.57 1 -FEP_p38a-2s_p38a-2l 31.75 0.52 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2p -23.46 0.51 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2m 81.34 0.38 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2j 17.46 0.48 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2g 46.42 0.30 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2m 40.69 0.71 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2p -45.13 0.58 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2k 0.61 0.83 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2j 57.57 0.71 2 -FEP_p38a-2t_p38a-2q -18.85 0.32 1 -FEP_p38a-2t_p38a-2r 13.74 0.29 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2c 44.55 0.80 2 -FEP_p38a-2q_p38a-2l 72.22 0.35 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2bb -10.19 0.44 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2j 38.50 0.33 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2ee 19.14 0.60 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2p -4.23 0.35 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2gg -62.16 0.57 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2l 39.31 0.14 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2c 28.30 nan 9 -FEP_p38a-2t_p38a-2h 45.68 0.32 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2c nan nan 10 -FEP_p38a-2t_p38a-2i 41.75 0.28 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2bb -23.57 0.59 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2r -7.12 0.41 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2h 43.58 1.08 4 -FEP_p38a-2t_p38a-2n 45.11 0.38 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2e 18.04 0.63 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2l 52.93 0.28 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2aa -8.83 0.75 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2e 36.75 0.08 7 -FEP_p38a-2u_p38a-2f 44.04 1.00 7 -FEP_p38a-2q_p38a-2k 45.29 nan 9 -FEP_p38a-2r_p38a-2ff 9.03 0.36 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2k 22.29 0.24 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2h 25.80 0.62 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2f 29.18 0.52 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2n 31.47 0.28 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2o -5.17 0.54 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2bb -13.61 1.09 7 -FEP_p38a-2t_p38a-2ee 33.67 0.32 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2o -17.91 0.57 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2ee 11.86 0.59 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2o -21.96 0.60 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2h 62.28 0.89 2 -FEP_p38a-2u_p38a-2aa 10.32 0.98 6 -FEP_p38a-2t_p38a-2f 43.60 0.25 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2i 61.87 0.79 4 -FEP_p38a-2r_p38a-2i 27.62 0.72 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2gg -48.80 0.69 4 -FEP_p38a-2r_p38a-2g 32.52 0.40 1 -FEP_p38a-2r_p38a-2j 25.03 0.40 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2q -39.87 0.62 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2n 27.03 0.64 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2m 60.75 0.16 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2bb -31.91 0.64 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2p -38.12 0.48 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2g 25.40 0.82 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2aa -3.54 0.97 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2gg -68.23 0.75 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2i 41.08 1.46 6 -FEP_p38a-2s_p38a-2i 21.48 0.56 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2f 23.48 0.77 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2s 19.33 0.72 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2aa 11.77 0.48 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2m 46.71 0.39 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2g 44.47 0.91 6 -FEP_p38a-2q_p38a-2o 15.16 0.29 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2ff 1.57 0.69 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2e 39.39 0.14 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2ff 22.10 0.74 4 -FEP_p38a-2u_p38a-2j 34.46 1.10 6 -FEP_p38a-2r_p38a-2k 6.82 1.00 1 -FEP_p38a-2r_p38a-2q -33.57 0.28 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2ee 28.83 0.94 7 -FEP_p38a-2t_p38a-2gg -47.98 0.31 1 -FEP_p38a-2r_p38a-2e 25.36 0.56 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2n 64.37 0.22 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2c 26.71 nan 9 -FEP_p38a-2k_p38a-2ff 0.53 0.26 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2aa -33.52 0.52 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2f 21.43 0.22 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2f 21.71 0.35 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2c nan nan 10 -FEP_p38a-2j_p38a-2h 6.58 0.16 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2bb 15.57 0.62 1 -FEP_p38a-2ee_p38a-2bb -43.90 0.52 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2g -13.55 0.27 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2h 68.69 0.67 1 -FEP_p38a-2g_p38a-2bb -56.18 0.13 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2c 2.46 0.72 2 -FEP_p38a-2p_p38a-2f 67.72 0.75 2 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ff 70.39 0.12 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2k 24.41 0.43 4 -FEP_p38a-2i_p38a-2g 3.82 0.23 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2ff -22.96 0.28 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2j -14.24 0.29 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2c -7.97 0.66 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2ff -23.91 0.22 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2ff -16.62 0.24 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2bb -70.24 0.44 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2i 45.25 1.09 1 -FEP_p38a-2n_p38a-2aa -33.24 0.56 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2j 17.03 0.15 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2ee -11.62 0.36 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2g 65.37 0.71 1 -FEP_p38a-2ee_p38a-2e 5.82 0.57 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2c 23.97 1.05 2 -FEP_p38a-2q_p38a-2aa 32.04 0.78 2 -FEP_p38a-2gg_p38a-2bb 37.69 0.31 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2ee -9.19 0.51 0 -FEP_p38a-2e_p38a-2c 5.70 0.36 1 -FEP_p38a-2n_p38a-2bb -54.62 0.36 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2f -16.49 0.29 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2m 15.99 0.20 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2aa -48.13 0.39 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2f 92.34 0.34 0 -FEP_p38a-2f_p38a-2aa -31.91 0.47 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2aa -26.61 0.37 0 -FEP_p38a-2f_p38a-2c -0.15 1.05 1 -FEP_p38a-2p_p38a-2aa 34.65 1.09 2 -FEP_p38a-2k_p38a-2gg -70.19 0.15 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2e -6.99 0.22 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2i 64.31 1.09 2 -FEP_p38a-2j_p38a-2ee -6.10 0.35 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2gg -27.53 0.52 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 68.64 0.38 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2i -18.62 0.24 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2g 51.19 0.52 1 -FEP_p38a-2o_p38a-2c 47.92 nan 9 -FEP_p38a-2ee_p38a-2aa -20.73 0.33 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2ff 42.54 0.64 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2bb -62.83 0.47 1 -FEP_p38a-2j_p38a-2c 5.16 0.59 3 -FEP_p38a-2n_p38a-2ee -11.23 0.42 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2f 62.71 0.76 3 -FEP_p38a-2p_p38a-2g 68.39 1.14 3 -FEP_p38a-2p_p38a-2gg -25.77 0.84 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2j -6.79 0.31 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2m 83.61 0.72 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2i -2.95 0.39 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2c 67.36 nan 9 -FEP_p38a-2j_p38a-2bb -49.50 0.24 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2aa -34.22 0.45 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2bb -32.47 0.19 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2aa 15.59 0.73 1 -FEP_p38a-2m_p38a-2j -21.91 0.32 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2ee 58.21 0.53 2 -FEP_p38a-2h_p38a-2bb -55.17 0.28 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2gg -87.68 0.25 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2bb 10.14 0.75 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2f -1.44 0.31 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2k -24.15 0.61 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2bb -52.76 0.33 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2k -30.43 0.19 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2f 47.24 0.82 1 -FEP_p38a-2c_p38a-2aa -32.45 1.13 2 -FEP_p38a-2j_p38a-2e 0.10 0.21 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2ff 26.80 0.79 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2gg -92.62 0.17 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2g -6.21 0.22 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2h -7.02 0.22 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2f 4.63 0.36 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2e -6.12 0.12 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2e 16.62 0.17 0 -FEP_p38a-2e_p38a-2aa -27.89 0.31 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2ee 38.52 0.57 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2aa -10.25 0.39 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2ee 11.64 0.30 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2l 77.43 0.43 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2e -2.69 0.17 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2gg -100.96 0.11 0 -FEP_p38a-2f_p38a-2ee -10.37 0.81 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2bb -32.86 0.33 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2gg -90.37 0.27 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2c 22.54 0.81 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2gg -44.27 0.92 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2ee -27.34 0.27 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2ff -19.66 0.30 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2h 50.61 0.80 1 -FEP_p38a-2n_p38a-2ff -22.13 0.24 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2aa -40.30 0.33 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2c -0.98 1.17 3 -FEP_p38a-2n_p38a-2f -1.34 0.48 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2j 61.63 0.79 1 -FEP_p38a-2o_p38a-2m 64.58 0.63 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2ee 52.73 0.89 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2h 3.23 0.24 0 -FEP_p38a-2f_p38a-2e -4.94 0.14 0 -FEP_p38a-2e_p38a-2bb -49.55 0.22 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2n 49.42 0.27 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2aa -9.85 0.36 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2g 6.81 0.22 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2e -13.51 0.39 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2h -14.92 0.53 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2e 87.54 0.20 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2g 94.82 0.13 0 -FEP_p38a-2c_p38a-2bb -53.67 1.04 3 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 57.48 0.43 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2h 1.65 0.23 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2i 20.23 0.22 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2e 57.46 0.76 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2f -8.97 0.23 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2bb -4.86 0.59 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2c 93.63 1.06 2 -FEP_p38a-2m_p38a-2ff -37.70 0.20 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2aa 60.21 0.36 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2g 0.78 0.14 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2l 7.93 0.26 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-2c 11.95 0.69 3 -FEP_p38a-2f_p38a-2bb -54.10 0.28 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2e -5.69 0.42 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ee 81.59 0.15 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2ee -19.32 0.31 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2k 45.30 1.17 4 -FEP_p38a-2k_p38a-2h 22.97 0.34 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2f -2.54 0.16 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 2.67 0.09 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2o 19.22 0.20 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2e -21.15 0.30 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2i -10.95 0.22 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2gg -108.48 0.28 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2e 17.56 0.29 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2f 2.02 0.23 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -39.03 0.43 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2j 42.44 1.34 1 -FEP_p38a-2bb_p38a-2aa 22.21 0.71 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2c -1.53 0.32 1 -FEP_p38a-2n_p38a-2g 1.79 0.43 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2c -18.16 1.10 2 -FEP_p38a-2k_p38a-2g 24.02 0.21 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2gg -92.70 0.25 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2e 43.95 0.49 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2ff -30.34 0.19 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2ff 46.13 0.68 1 -FEP_p38a-2p_p38a-2e 63.72 0.76 3 -FEP_p38a-2m_p38a-2l -7.57 0.18 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2aa -30.07 0.62 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2ee -13.13 0.41 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2ee 11.29 0.26 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2c -1.05 0.72 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb -12.62 0.55 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -18.28 0.32 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2i 17.88 0.70 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2e 6.12 0.23 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2x 25.29 0.29 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2f 4.07 0.21 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2s -6.95 1.08 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2j 45.50 0.48 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2o -44.47 0.57 2 -FEP_p38a-2x_p38a-2e 11.58 0.31 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2s 18.43 0.63 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2aa -21.47 0.40 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2p -64.23 0.75 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2q -59.59 0.84 2 -FEP_p38a-2z_p38a-2aa -13.05 0.38 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x -11.40 0.29 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2y -46.56 0.57 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2p -57.52 0.59 3 -FEP_p38a-2v_p38a-2ff -10.68 0.44 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2q -44.50 0.50 1 -FEP_p38a-2y_p38a-2u 5.95 0.19 8 -FEP_p38a-2x_p38a-2v 3.52 0.24 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2c 16.45 0.51 1 -FEP_p38a-2x_p38a-2q -48.57 0.59 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2t -0.37 0.65 2 -FEP_p38a-2y_p38a-2t 5.83 0.53 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2q -49.73 1.05 5 -FEP_p38a-2v_p38a-2gg -79.78 0.92 1 -FEP_p38a-2y_p38a-2q -15.71 0.32 1 -FEP_p38a-2x_p38a-2i 13.98 0.34 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2f 10.96 0.31 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2s 27.28 0.71 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2ff 19.79 0.28 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2c 2.82 1.01 3 -FEP_p38a-2v_p38a-2r -18.19 0.80 2 -FEP_p38a-3fln_p38a-2aa -27.84 0.47 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2o -28.16 0.84 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2x 5.70 0.41 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2r -15.30 0.60 1 -FEP_p38a-2z_p38a-2u -19.84 1.36 5 -FEP_p38a-2z_p38a-2bb -34.34 0.75 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2f 15.69 0.36 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2gg -50.79 0.21 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2ee 1.49 1.04 1 -FEP_p38a-2z_p38a-2ee 9.97 0.43 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2g 22.26 0.83 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2h 5.85 0.22 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2l 58.59 0.59 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2ff -17.72 0.19 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2gg -88.68 0.29 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2k -6.61 0.36 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2t -2.87 0.32 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2f 40.24 0.27 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2g 51.73 0.54 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2ee -6.78 0.25 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2k -10.49 0.36 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2r 10.80 0.51 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2bb -37.81 0.39 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2k 26.99 0.77 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2q -22.24 0.47 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2o -6.25 1.06 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -0.71 0.16 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2u nan nan 10 -FEP_p38a-2u_p38a-2p -26.48 0.49 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2m 58.78 0.75 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2s -2.53 1.15 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2h 17.34 0.32 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2c 11.35 0.91 4 -FEP_p38a-2z_p38a-2m 37.46 0.52 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2m 65.98 0.68 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2l 29.70 0.46 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2ff -5.69 0.37 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2l 13.00 0.16 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2aa 15.88 0.34 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2i 39.51 0.21 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2h 12.03 0.38 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2r 20.38 0.96 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2i 47.81 0.55 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2e 36.08 0.27 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2x 33.31 0.77 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2h 41.71 0.31 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2j 14.74 0.41 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2s 18.71 0.77 1 -FEP_p38a-2x_p38a-2m 32.22 0.55 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2u -0.49 0.80 5 -FEP_p38a-3fln_p38a-2t -40.61 0.18 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2n 43.85 0.53 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2q -21.80 0.88 2 -FEP_p38a-2z_p38a-2n 21.11 0.65 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2ff 29.23 0.24 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2m 58.70 0.50 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2p -17.39 0.98 1 -FEP_p38a-2v_p38a-2g 13.81 0.28 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2o 0.66 0.81 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2bb -4.93 0.57 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2gg -77.00 0.34 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2bb -50.42 0.37 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2o -32.00 1.04 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -0.71 0.20 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2t -32.80 0.23 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2t -24.32 0.69 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2g 43.17 0.36 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2p -26.61 0.85 2 -FEP_p38a-2x_p38a-2g 17.59 0.42 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v -7.79 0.51 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2r 11.25 0.66 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2n 5.02 0.28 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2k 18.58 0.27 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2n 41.74 0.31 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2gg -72.94 0.52 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2n 51.23 0.55 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2l 50.03 0.29 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2o -6.92 0.92 1 -FEP_p38a-2y_p38a-2f 49.88 0.25 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2k 23.76 nan 9 -FEP_p38a-2y_p38a-2e 45.19 0.35 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2c 51.11 0.71 3 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 5.96 0.09 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2n 12.54 0.94 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2h 21.32 0.55 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2s -12.74 0.81 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2gg -43.39 0.35 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2c 19.04 0.44 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2m 28.66 0.62 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2o -35.92 0.93 1 -FEP_p38a-2x_p38a-2p -53.90 0.43 3 -FEP_p38a-3flq_p38a-2y -7.59 0.64 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2l 24.28 0.27 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2r -7.68 0.89 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2v 29.31 0.69 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2aa 9.53 0.59 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2n 16.58 0.27 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2j 10.65 0.53 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2r -26.48 0.36 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2v 38.38 0.55 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2j 5.60 0.25 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2p -47.08 0.96 1 -FEP_p38a-2y_p38a-2ee 39.41 0.47 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2bb -41.99 0.43 1 -FEP_p38a-2z_p38a-2v 8.49 0.53 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2i 9.63 0.42 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2i 1.82 0.15 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2u -36.84 1.00 6 -FEP_p38a-3flq_p38a-2j 36.33 0.37 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2ff -2.65 0.69 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2ee 4.97 0.36 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2e 13.45 0.57 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2aa -17.15 0.47 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2z -15.55 0.64 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2s -19.35 0.47 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2m 20.18 0.27 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2c 42.59 0.86 2 -FEP_p38a-2v_p38a-2l 20.14 0.21 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2k -2.10 0.60 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2l 52.20 0.29 2 -FEP_p38a-2z_p38a-2y -27.69 0.33 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2ee 30.96 0.22 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2f 20.29 0.51 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2u -27.71 nan 9 -FEP_p38a-2x_p38a-2t -27.88 0.31 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2z 20.30 0.49 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2h 50.65 0.89 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2z -20.26 0.64 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2p -64.89 0.83 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2ee -7.40 0.25 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2gg -91.78 0.19 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2f -1.70 0.37 1 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2l 7.04 0.29 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2gg -93.30 0.24 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fln -4.56 0.24 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2j -6.96 0.27 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2q -64.04 0.72 1 -FEP_p38a-3fly_p38a-2o -43.89 1.27 3 -FEP_p38a-3fly_p38a-2z -16.30 0.62 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2t -44.13 0.36 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2gg -92.32 0.33 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -41.39 0.45 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2v -12.72 0.60 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2e -1.16 0.13 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2i -0.59 0.18 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2u -37.00 0.93 7 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2z -17.89 0.80 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2aa -29.33 0.50 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2k -21.35 0.29 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2y -49.81 0.46 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2l 9.10 0.41 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2s -24.85 0.71 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2bb -54.39 0.67 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fln -4.51 0.20 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2u -42.09 0.72 5 -FEP_p38a-3flw_p38a-2e -5.66 0.17 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2q -62.68 0.77 1 -FEP_p38a-3flw_p38a-2f -2.25 0.73 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2u -39.22 0.77 8 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2e -6.24 0.47 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fln 37.43 0.29 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2n 0.96 0.34 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2ee -8.55 0.58 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fmh 2.39 0.61 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2q -59.27 1.05 3 -FEP_p38a-3fly_p38a-2x -12.25 0.24 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2i 2.02 0.28 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2j -3.80 0.21 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2t -43.05 0.23 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2ee -11.82 0.38 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-3fly -2.15 0.15 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2g 3.54 0.15 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2aa -31.17 0.39 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2t -40.09 0.31 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2z -20.71 0.67 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2k -22.78 0.29 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2gg -92.32 0.53 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2i -3.15 0.41 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2s -24.07 0.62 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2p -67.88 0.63 2 -FEP_p38a-3flz_p38a-2f 1.11 0.12 1 -FEP_p38a-3flz_p38a-2m 18.07 0.26 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2x -13.45 0.35 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3flq -41.24 0.48 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2y -48.94 0.42 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2aa -32.06 0.50 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2h -1.03 0.23 1 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2f 0.48 0.41 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2j -1.60 0.23 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-3flw 2.05 0.25 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2p -64.37 1.08 1 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2i -1.94 0.28 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2u -43.64 0.51 6 -FEP_p38a-3fly_p38a-2bb -51.12 0.18 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2m 17.17 0.38 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2g 1.31 0.30 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2r -29.81 0.53 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2x -14.55 0.40 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2ee -9.60 0.35 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2s -23.66 0.47 2 -FEP_p38a-3flw_p38a-2m 16.50 0.38 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2k -18.97 0.29 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2f 3.09 0.25 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2q -60.53 0.83 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flz 0.46 0.71 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2o -47.89 1.25 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2j -4.30 0.51 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2n 1.42 0.44 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2ff -22.54 0.26 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flw -1.06 0.29 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2n 2.32 0.33 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2r -29.56 0.52 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fln -2.48 0.58 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2r -31.19 0.45 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2l 10.34 0.28 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2p -67.95 0.66 1 -FEP_p38a-3flz_p38a-2h 2.25 0.22 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2t -43.43 0.19 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2c 4.80 0.39 2 -FEP_p38a-3fly_p38a-2m 20.06 0.18 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2bb -54.82 0.23 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2ff -21.90 0.21 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2c -0.86 0.98 5 -FEP_p38a-3flw_p38a-2j -5.80 0.31 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3flq -37.52 0.68 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq -42.18 0.59 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2c 1.67 0.85 2 -FEP_p38a-3fly_p38a-2y -45.12 0.47 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3flw 4.13 0.42 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2v -7.92 0.17 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2aa -31.24 0.57 1 -FEP_p38a-3fly_p38a-2h 4.89 0.20 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2l 8.36 0.29 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2e -3.66 0.16 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3fln -0.45 0.11 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2n -0.07 0.46 1 -FEP_p38a-3flz_p38a-2z -18.17 0.78 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2ee -11.20 0.56 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2x -17.17 0.29 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2q -64.81 1.22 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2e -3.40 0.34 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2r -25.27 0.79 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2h 0.18 0.36 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2v -9.65 0.62 1 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2m 15.02 0.29 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2g 3.01 0.38 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2y -47.86 0.74 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2r -32.07 0.63 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly -1.61 0.32 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2k -23.32 0.31 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2aa -33.57 0.40 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2n 4.03 0.39 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2ff -22.50 0.42 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2v -10.33 0.39 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-3flq -39.89 0.27 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2i -2.44 0.16 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2s -19.50 0.72 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2o -48.98 0.87 1 -FEP_p38a-3fly_p38a-2g 5.77 0.20 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2k -21.11 0.57 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2o -47.37 0.72 1 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2h 2.45 0.60 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly -5.04 0.48 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2l 11.94 0.28 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flz -2.27 0.23 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c 2.54 0.57 1 -FEP_p38a-3flw_p38a-2bb -53.54 0.48 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2ff -18.34 0.25 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2o -47.16 0.68 2 -FEP_p38a-3flw_p38a-2x -15.20 0.34 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2u -42.35 0.32 5 -FEP_p38a-3flz_p38a-2bb -52.67 0.34 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2s -22.68 0.76 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2gg -89.40 0.27 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2y -49.94 0.58 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-3fln -2.71 0.17 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2ff -20.54 0.13 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2p -66.28 0.87 1 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2t -44.70 0.17 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2c -0.42 0.90 1 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2v -13.36 0.67 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2g 0.65 0.20 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flw 1.86 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-MFP/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-MFP/protein.txt deleted file mode 100755 index d90cb287..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-MFP/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,58 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_2gg-p38a_2ff 70.70 0.12 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -18.19 0.27 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -45.06 0.83 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2p -69.07 0.28 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2x -11.86 0.28 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2l 8.02 0.24 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2ff -10.68 0.16 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2aa -28.53 0.47 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2l 52.66 0.16 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2r -8.12 0.29 0 -FEP_p38a_2f-p38a_3fln -3.83 0.17 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2p -75.54 0.43 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.22 0.18 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2r -31.18 0.34 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2o 19.44 0.28 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ee 81.59 0.15 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2f 1.31 0.15 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.46 0.10 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -88.59 0.31 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ee -7.25 0.29 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2x -17.42 0.37 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2m 81.31 0.28 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -0.63 0.12 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2r 13.57 0.40 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2m 59.34 0.65 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2s -27.32 0.62 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ff -5.56 0.35 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2l 12.44 0.20 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2i 2.95 0.19 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2o -57.04 0.48 0 -FEP_p38a_2aa-p38a_3flw 31.89 0.48 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2e -4.36 0.15 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -37.74 0.24 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flw 3.62 0.33 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2j -1.27 0.17 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2l 38.99 0.35 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2m 7.46 0.19 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2t -44.69 0.17 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2y -37.50 0.60 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2e -3.53 0.17 0 -FEP_p38a_2bb-p38a_3flq 12.12 0.25 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fly 8.14 0.20 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2o -17.37 0.20 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 32.53 0.44 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2e -7.05 0.19 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 5.97 0.10 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2g 2.24 0.19 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2o -49.69 0.34 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2ff -11.13 0.23 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fly -4.49 0.26 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c 2.29 0.63 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2i -3.37 0.15 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2m 20.56 0.24 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -28.05 0.28 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2u 21.40 0.41 0 -FEP_p38a_2n-p38a_3fln -4.87 0.36 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flw 1.72 0.47 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-MFP/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-MFP/water.txt deleted file mode 100755 index ffbf0496..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-MFP/water.txt +++ /dev/null @@ -1,58 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_2gg-p38a_2ff 71.57 0.14 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -18.74 0.18 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -45.31 0.94 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2p -69.61 0.24 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2x -12.20 0.23 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2l 8.05 0.08 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2ff -7.93 0.54 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2aa -31.04 0.40 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2l 53.88 0.09 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2r -7.59 0.37 0 -FEP_p38a_2f-p38a_3fln -1.67 0.12 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2p -77.62 0.42 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.77 0.05 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2r -32.73 0.16 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2o 18.11 0.22 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ee 82.09 0.10 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2f -1.87 0.06 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.67 0.11 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -89.52 0.22 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ee -6.72 0.39 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2x -19.63 0.18 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2m 81.40 0.25 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -1.06 0.10 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2r 13.06 0.13 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2m 58.72 0.56 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2s -28.51 0.27 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ff -5.40 0.21 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2l 13.55 0.16 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2i 4.42 0.07 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2o -59.66 0.15 0 -FEP_p38a_2aa-p38a_3flw 34.56 0.59 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2e -2.79 0.06 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -37.81 0.48 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flw 4.06 0.15 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2j -1.14 0.08 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2l 40.61 0.21 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2m 8.20 0.21 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2t -45.72 0.12 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2y -38.37 0.51 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2e -4.89 0.09 0 -FEP_p38a_2bb-p38a_3flq 13.06 0.31 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fly 9.23 0.09 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2o -18.18 0.24 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 33.25 0.43 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2e -8.54 0.09 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 7.25 0.10 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2g 5.73 0.07 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2o -50.78 0.18 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2ff -10.29 0.10 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fly -4.93 0.20 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c 2.17 0.40 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2i -1.97 0.06 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2m 21.59 0.17 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -28.55 0.26 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2u 22.34 0.17 0 -FEP_p38a_2n-p38a_3fln -5.22 0.17 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flw -1.23 0.24 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/protein.txt deleted file mode 100755 index 495f47b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,57 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_2v-p38a_3fmh 14.19 0.30 7 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -62.32 0.68 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 1.25 0.34 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -12.24 0.29 4 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -39.23 0.34 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 5.11 0.20 8 -FEP_p38a_2z-p38a_3fmk 18.10 0.87 3 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmk 10.56 0.41 6 -FEP_p38a_2gg-p38a_2j 86.12 0.32 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3flq -21.93 0.77 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -0.35 0.11 2 -FEP_p38a_2g-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2l-p38a_2o -56.57 0.32 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2z-p38a_3flw 21.40 0.63 2 -FEP_p38a_2ee-p38a_3fln 6.27 0.33 2 -FEP_p38a_2l-p38a_2n -7.09 0.27 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_3flz 3.03 0.17 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -25.41 0.33 4 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -20.86 0.26 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -87.72 0.25 5 -FEP_p38a_2aa-p38a_2bb -22.13 0.20 5 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -15.09 0.28 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -18.06 0.63 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -43.09 0.82 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -18.64 0.33 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -41.66 0.22 5 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.04 0.23 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 6.00 0.16 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2y nan nan 10 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fmh 5.78 0.12 5 -FEP_p38a_2aa-p38a_3flw 33.40 0.33 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 37.21 0.26 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.13 0.24 3 -FEP_p38a_2v-p38a_3fly 7.95 0.31 7 -FEP_p38a_2j-p38a_2q -56.77 0.63 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2p -75.48 0.33 4 -FEP_p38a_2ee-p38a_2j 3.76 0.31 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2r -21.14 0.34 6 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 5.84 0.18 4 -FEP_p38a_2u-p38a_2k 23.76 0.49 8 -FEP_p38a_2v-p38a_2x -3.95 0.23 7 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -36.86 0.40 4 -FEP_p38a_2g-p38a_2h -2.37 0.27 2 -FEP_p38a_2g-p38a_2i -4.67 0.27 2 -FEP_p38a_2v-p38a_3fln 7.64 0.23 3 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 6.32 0.38 3 -FEP_p38a_2e-p38a_2j -1.44 0.19 6 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.02 0.25 3 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -12.66 0.23 4 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -24.02 0.23 4 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -14.61 0.20 6 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -2.76 0.15 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 5.09 0.27 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2y nan nan 10 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 30.35 0.37 5 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/water.txt deleted file mode 100755 index e06bba56..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r22/water.txt +++ /dev/null @@ -1,57 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_2v-p38a_3fmh 15.67 0.70 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -63.65 0.51 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 3.13 0.09 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -13.97 0.41 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -40.50 0.28 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 7.68 0.13 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3fmk 22.03 0.51 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmk 14.74 0.30 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2j 88.13 0.18 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3flq -22.73 0.70 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -1.22 0.06 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2c -2.35 0.20 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2o -59.87 0.17 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c 1.50 0.41 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3flw 19.98 0.66 3 -FEP_p38a_2ee-p38a_3fln 7.08 0.31 1 -FEP_p38a_2l-p38a_2n -7.98 0.11 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_3flz 3.55 0.07 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -26.74 0.25 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -22.69 0.39 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -89.55 0.26 0 -FEP_p38a_2aa-p38a_2bb -21.55 0.84 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -14.94 0.14 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -19.87 0.55 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -45.19 0.64 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -18.64 0.12 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -41.06 0.85 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.43 0.17 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 7.32 0.07 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2y -38.44 0.36 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fmh 4.96 0.23 0 -FEP_p38a_2aa-p38a_3flw 33.60 0.48 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 39.14 0.13 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.73 0.10 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fly 9.31 0.07 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2q -56.87 0.94 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2p -76.99 0.41 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2j 5.93 0.12 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2r -26.29 0.49 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 6.31 0.09 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2k 23.81 nan 9 -FEP_p38a_2v-p38a_2x -2.49 0.30 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -38.18 0.15 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2h -2.95 0.08 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2i -4.21 0.11 1 -FEP_p38a_2v-p38a_3fln 8.89 0.23 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 5.36 0.16 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2j -0.43 0.14 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.28 0.15 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -12.35 0.30 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -22.54 0.21 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -16.03 0.11 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -5.71 0.09 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 3.31 0.19 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -28.50 0.26 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 32.97 0.36 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r29/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r29/protein.txt deleted file mode 100755 index 72e5688b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r29/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,57 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 6.33 0.08 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -27.76 0.19 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 1.64 0.21 1 -FEP_p38a_2u-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2x -3.45 0.18 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 32.78 0.79 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 6.40 0.23 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -45.13 0.81 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 5.93 0.32 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2o -57.26 1.10 1 -FEP_p38a_2z-p38a_3fmk 18.10 0.45 1 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -13.95 0.29 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -16.23 0.15 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -18.47 0.49 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -88.56 0.23 3 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 38.63 0.44 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -18.28 0.21 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -64.91 0.86 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.09 0.14 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 4.15 0.25 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -42.48 0.54 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -12.36 0.23 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -12.24 0.29 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2j 5.06 0.51 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -38.24 0.38 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -22.26 0.21 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.52 0.27 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2r -23.68 0.89 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -26.83 0.63 2 -FEP_p38a_2aa-p38a_3flw 32.03 0.54 1 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmk 10.10 0.68 2 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 4.65 0.30 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fmh 4.38 0.23 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -0.56 0.15 1 -FEP_p38a_2e-p38a_2j -0.49 0.20 2 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmh 14.30 0.58 1 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -20.35 0.28 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3flq -20.49 0.46 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_3fln 7.03 0.31 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fln 7.06 0.26 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3flw 19.09 0.59 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2j 86.70 0.22 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fly 7.80 0.20 1 -FEP_p38a_2aa-p38a_2bb -23.02 0.44 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2y -39.24 0.50 6 -FEP_p38a_3fln-p38a_3flz 3.47 0.21 1 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -2.51 0.15 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2p -77.59 0.38 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -38.34 0.39 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.61 0.11 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2g-p38a_2h -1.40 0.20 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2q -58.37 1.11 1 -FEP_p38a_2g-p38a_2i -4.38 0.22 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2n -7.70 0.18 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r29/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r29/water.txt deleted file mode 100755 index 5fbc7ae8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w-r29/water.txt +++ /dev/null @@ -1,57 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 7.42 0.06 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -29.16 0.29 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 3.12 0.10 3 -FEP_p38a_2u-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2x -2.96 0.27 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 33.61 0.61 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 6.17 0.06 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -44.57 0.87 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 8.01 0.22 2 -FEP_p38a_2l-p38a_2o -59.61 0.18 2 -FEP_p38a_2z-p38a_3fmk 22.11 0.47 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -14.76 0.14 2 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -16.04 0.14 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -19.79 0.55 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -89.62 0.23 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 38.91 0.19 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -18.63 0.16 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -62.55 0.67 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.56 0.07 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 5.32 0.22 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -41.52 0.67 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -13.36 0.29 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -12.49 0.31 3 -FEP_p38a_2ee-p38a_2j 5.74 0.17 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -38.28 0.31 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -22.51 0.25 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c 1.25 0.39 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.41 0.21 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2r -25.90 0.46 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -27.54 0.44 3 -FEP_p38a_2aa-p38a_3flw 33.77 0.56 2 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmk 14.98 0.51 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 3.36 0.17 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fmh 5.04 0.23 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -1.02 0.11 1 -FEP_p38a_2e-p38a_2j -0.39 0.12 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmh 14.89 0.44 1 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -22.45 0.22 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3flq -22.66 0.77 2 -FEP_p38a_2ee-p38a_3fln 7.24 0.23 1 -FEP_p38a_2v-p38a_3fln 8.84 0.30 3 -FEP_p38a_2z-p38a_3flw 19.82 0.76 1 -FEP_p38a_2gg-p38a_2j 87.87 0.12 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fly 9.32 0.13 1 -FEP_p38a_2aa-p38a_2bb -22.66 0.37 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2y -37.55 0.64 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_3flz 3.54 0.09 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -5.54 0.06 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2p -77.41 0.56 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -40.35 0.36 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.29 0.17 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2c -3.43 0.95 2 -FEP_p38a_2g-p38a_2h -3.10 0.08 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2q -58.20 0.49 1 -FEP_p38a_2g-p38a_2i -4.26 0.09 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2n -8.28 0.16 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt deleted file mode 100755 index 081b3c71..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,57 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -17.97 0.25 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 38.33 0.33 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -45.02 0.47 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2i -3.77 0.21 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -65.48 0.40 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -13.89 0.45 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2h -0.96 0.13 1 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -14.54 0.25 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2x -3.76 0.27 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_3flz 3.23 0.12 2 -FEP_p38a_2ee-p38a_2j 5.23 0.21 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -11.92 0.30 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2p -77.16 0.26 4 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.10 0.08 1 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -2.53 0.13 2 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -38.21 0.33 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.34 0.13 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -88.72 0.23 1 -FEP_p38a_2g-p38a_2c -0.94 0.48 1 -FEP_p38a_2aa-p38a_2bb -22.68 0.51 2 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -22.26 0.55 1 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -20.46 0.22 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -16.13 0.15 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -0.56 0.18 1 -FEP_p38a_2z-p38a_3flw 20.06 0.51 1 -FEP_p38a_2ee-p38a_3fln 6.36 0.16 5 -FEP_p38a_2j-p38a_2r -22.80 0.77 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2j -0.84 0.17 1 -FEP_p38a_2z-p38a_3fmk 19.66 0.57 1 -FEP_p38a_2l-p38a_2n -7.91 0.10 1 -FEP_p38a_2l-p38a_2o -57.53 0.38 1 -FEP_p38a_2aa-p38a_3flw 33.27 0.58 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.23 0.14 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -37.09 0.44 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2j 86.51 0.28 2 -FEP_p38a_2v-p38a_3fln 7.86 0.19 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2y -36.61 0.35 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 4.85 0.27 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fly 7.89 0.23 3 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 31.41 0.37 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 5.93 0.17 3 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -25.69 0.69 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 6.10 0.13 2 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmh 12.62 0.31 2 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 7.20 0.18 3 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmk 10.60 1.03 3 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -42.04 0.52 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c 1.82 0.33 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 1.85 0.18 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2q -59.15 0.65 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 5.63 0.18 3 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -20.78 0.45 2 -FEP_p38a_2z-p38a_3flq -21.38 0.75 3 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -28.86 0.30 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fmh 4.97 0.31 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt deleted file mode 100755 index 8c93372c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-100w/water.txt +++ /dev/null @@ -1,57 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -18.85 0.27 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 39.29 0.26 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -44.71 0.80 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2i -4.15 0.08 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -62.41 1.05 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -13.82 0.52 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2h -3.05 0.06 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -14.73 0.11 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2x -2.91 0.27 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_3flz 3.52 0.07 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2j 6.13 0.37 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -12.36 0.17 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2p -78.03 0.32 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.72 0.07 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -5.81 0.15 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -40.66 0.37 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.58 0.14 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -88.90 0.14 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2c -3.62 0.84 0 -FEP_p38a_2aa-p38a_2bb -22.83 0.47 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -22.51 0.11 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -22.21 0.41 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -16.36 0.15 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -1.16 0.07 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3flw 21.69 0.34 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_3fln 7.18 0.15 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2r -26.20 0.33 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2j -0.31 0.14 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3fmk 21.11 0.73 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2n -8.12 0.11 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2o -59.27 0.34 0 -FEP_p38a_2aa-p38a_3flw 34.49 0.34 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.42 0.21 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -36.82 0.63 1 -FEP_p38a_2gg-p38a_2j 88.48 0.20 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fln 8.71 0.22 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2y -38.42 0.45 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 5.28 0.16 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fly 9.37 0.06 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 33.92 0.63 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 7.21 0.11 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -26.91 0.35 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 7.86 0.25 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmh 14.40 0.39 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 6.29 0.07 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmk 15.32 0.54 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -41.59 0.26 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c 1.08 0.65 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 3.22 0.11 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2q -56.47 0.55 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 3.11 0.16 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -18.66 0.77 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3flq -22.15 0.96 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -28.59 0.27 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fmh 5.04 0.18 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-50w-r29/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-50w-r29/protein.txt deleted file mode 100755 index 18bcb607..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-50w-r29/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,57 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 6.14 0.11 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -28.04 0.35 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 1.65 0.24 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2k 30.21 nan 9 -FEP_p38a_2v-p38a_2x -3.65 0.26 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 33.05 0.67 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 6.99 0.22 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -45.95 0.42 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 4.95 0.38 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2o -58.15 0.35 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3fmk 18.78 0.66 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -14.00 0.20 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -15.68 0.26 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -18.99 0.63 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -88.37 0.18 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 38.35 0.22 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -17.55 0.35 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -64.17 0.63 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 2.89 0.15 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 4.37 0.37 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -43.53 0.49 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -12.69 0.35 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -11.77 0.26 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2j 5.53 0.41 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -37.06 0.38 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -21.52 0.28 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.06 0.25 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2r -24.47 0.39 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -25.96 0.70 0 -FEP_p38a_2aa-p38a_3flw 30.73 0.53 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmk 10.35 0.87 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 5.53 0.20 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fmh 4.23 0.21 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -0.70 0.11 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2j -1.24 0.24 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmh 11.31 0.31 1 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -20.95 0.43 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3flq -20.53 0.63 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_3fln 6.97 0.43 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fln 6.65 0.32 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3flw 19.03 0.77 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2j 87.16 0.26 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fly 7.56 0.20 0 -FEP_p38a_2aa-p38a_2bb -22.57 0.59 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2y -39.07 0.29 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_3flz 3.32 0.18 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -2.44 0.14 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2p -77.40 0.33 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -38.25 0.37 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.51 0.24 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2g-p38a_2h -1.13 0.10 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2q -60.31 0.38 3 -FEP_p38a_2g-p38a_2i -4.60 0.12 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2n -8.19 0.22 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-50w-r29/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-50w-r29/water.txt deleted file mode 100755 index c4c08564..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/sigmoidal-50w-r29/water.txt +++ /dev/null @@ -1,57 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 7.41 0.08 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -29.11 0.30 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 2.95 0.16 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2k nan nan 10 -FEP_p38a_2v-p38a_2x -2.42 0.33 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 34.24 0.65 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 6.38 0.07 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -45.20 0.72 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 7.50 0.20 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2o -59.42 0.34 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3fmk 22.53 0.55 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -14.80 0.18 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -16.23 0.21 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -19.59 0.67 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -89.73 0.28 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 39.08 0.24 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -18.06 0.23 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -61.23 0.90 3 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.79 0.10 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 5.16 0.19 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -41.69 0.31 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -13.13 0.33 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -12.46 0.46 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2j 6.18 0.19 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -38.24 0.34 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -22.62 0.26 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c 1.17 0.37 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.61 0.14 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2r -24.37 0.82 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -27.61 0.26 1 -FEP_p38a_2aa-p38a_3flw 33.80 0.96 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmk 15.85 0.68 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 3.26 0.19 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fmh 5.36 0.37 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -1.10 0.11 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2j -0.27 0.13 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fmh 15.28 0.61 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -22.71 0.27 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3flq -20.27 0.58 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_3fln 7.17 0.29 1 -FEP_p38a_2v-p38a_3fln 8.97 0.15 0 -FEP_p38a_2z-p38a_3flw 20.52 0.61 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2j 88.09 0.34 0 -FEP_p38a_2v-p38a_3fly 9.31 0.14 0 -FEP_p38a_2aa-p38a_2bb -23.23 0.42 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2y -38.43 0.49 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_3flz 3.44 0.08 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -5.65 0.12 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2p -77.90 0.39 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -39.69 0.31 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.43 0.06 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2c -2.16 0.25 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2h -3.10 0.08 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2q -57.01 0.85 3 -FEP_p38a_2g-p38a_2i -4.46 0.06 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2n -8.20 0.07 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100755 index a2d5246c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,562 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a-2t_p38a-2ff 22.80 0.12 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2h 30.48 0.91 1 -FEP_p38a-2s_p38a-2l 33.81 0.73 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2p -24.49 0.18 1 -FEP_p38a-2q_p38a-2m 80.82 0.44 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2j 17.36 0.59 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2g 47.41 0.17 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2m 40.99 0.68 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2p -42.81 0.72 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2k -0.43 0.67 1 -FEP_p38a-2q_p38a-2j 57.61 0.50 1 -FEP_p38a-2t_p38a-2q -18.86 0.42 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2r 12.92 0.17 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2c 44.74 0.71 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2l 73.04 0.18 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2bb -10.33 0.17 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2j 39.25 0.18 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2ee 19.85 0.18 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2p -5.04 0.35 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2gg -61.96 0.27 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2l 40.89 0.25 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2c 32.54 0.86 7 -FEP_p38a-2t_p38a-2h 44.42 0.14 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2c 38.85 nan 9 -FEP_p38a-2t_p38a-2i 43.70 0.20 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2bb -24.71 0.47 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2r -7.48 0.42 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2h 39.48 0.81 5 -FEP_p38a-2t_p38a-2n 45.61 0.12 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2e 17.60 0.37 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2l 53.95 0.08 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2aa -10.05 0.78 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2e 34.93 0.93 6 -FEP_p38a-2u_p38a-2f 37.33 0.32 8 -FEP_p38a-2q_p38a-2k 37.09 0.23 7 -FEP_p38a-2r_p38a-2ff 8.80 0.53 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2k 21.72 0.14 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2h 23.43 0.44 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2f 28.31 0.43 1 -FEP_p38a-2r_p38a-2n 32.60 0.20 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2o -5.52 0.28 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2bb -12.12 nan 9 -FEP_p38a-2t_p38a-2ee 33.52 0.18 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2o -18.75 0.26 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2ee 12.53 0.34 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2o -22.87 0.73 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2h 62.71 0.86 2 -FEP_p38a-2u_p38a-2aa 9.45 0.90 5 -FEP_p38a-2t_p38a-2f 41.83 0.16 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2i 62.74 0.57 2 -FEP_p38a-2r_p38a-2i 29.25 0.52 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2gg -52.22 0.87 5 -FEP_p38a-2r_p38a-2g 34.18 0.46 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2j 25.52 0.53 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2q -38.83 0.53 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2n 28.41 0.40 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2m 61.67 0.16 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2bb -31.60 0.38 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2p -37.28 0.27 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2g 26.12 0.24 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2aa -2.86 0.79 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2gg -69.71 0.39 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2i 34.89 nan 9 -FEP_p38a-2s_p38a-2i 22.78 0.59 1 -FEP_p38a-2s_p38a-2f 21.07 0.45 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2s 19.83 0.57 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2aa 11.34 0.54 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2m 48.31 0.37 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2g 42.00 0.99 6 -FEP_p38a-2q_p38a-2o 13.04 0.17 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2ff 1.18 0.36 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2e 39.20 0.11 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2ff 17.45 0.92 4 -FEP_p38a-2u_p38a-2j 31.02 nan 9 -FEP_p38a-2r_p38a-2k 7.29 0.53 3 -FEP_p38a-2r_p38a-2q -31.59 0.25 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2ee 30.07 0.70 5 -FEP_p38a-2t_p38a-2gg -48.87 0.10 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2e 25.76 0.60 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2n 64.87 0.25 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2c 22.67 1.44 3 -FEP_p38a-2k_p38a-2ff 1.04 0.17 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2aa -32.19 0.49 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2f 19.00 0.15 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2f 19.92 0.23 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2c 62.51 0.56 7 -FEP_p38a-2j_p38a-2h 6.23 0.06 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2bb 12.34 1.03 1 -FEP_p38a-2ee_p38a-2bb -43.71 0.32 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2g -13.90 0.25 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2h 66.74 1.03 1 -FEP_p38a-2g_p38a-2bb -58.28 0.15 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2c 3.26 0.28 1 -FEP_p38a-2p_p38a-2f 65.29 0.86 2 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ff 71.56 0.08 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2k 25.29 0.78 4 -FEP_p38a-2i_p38a-2g 4.14 0.09 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2ff -21.67 0.11 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2j -14.82 0.15 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2c -7.11 0.36 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2ff -24.72 0.12 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2ff -16.15 0.11 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2bb -72.44 0.24 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2i 46.75 0.79 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2aa -33.63 0.44 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2j 17.48 0.12 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2ee -11.45 0.29 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2g 66.21 0.87 2 -FEP_p38a-2ee_p38a-2e 5.82 0.30 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2c 24.43 0.42 1 -FEP_p38a-2q_p38a-2aa 28.30 1.00 2 -FEP_p38a-2gg_p38a-2bb 38.47 0.20 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2ee -10.14 0.29 0 -FEP_p38a-2e_p38a-2c 6.14 0.31 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2bb -56.27 0.19 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2f -19.64 0.27 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2m 16.12 0.23 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2aa -50.75 0.56 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2f 91.31 0.34 0 -FEP_p38a-2f_p38a-2aa -30.49 0.61 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2aa -28.59 0.74 0 -FEP_p38a-2f_p38a-2c 4.67 0.17 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2aa 34.38 0.76 1 -FEP_p38a-2k_p38a-2gg -70.45 0.20 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2e -8.39 0.10 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2i 63.93 0.72 3 -FEP_p38a-2j_p38a-2ee -5.43 0.23 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2gg -31.46 0.72 1 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 70.02 0.25 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2i -18.28 0.29 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2g 52.20 0.71 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2c 51.21 0.91 6 -FEP_p38a-2ee_p38a-2aa -22.66 1.03 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2ff 41.03 0.57 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2bb -64.85 0.14 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2c 7.44 0.29 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2ee -12.41 0.22 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2f 59.90 0.83 1 -FEP_p38a-2p_p38a-2g 68.61 0.62 2 -FEP_p38a-2p_p38a-2gg -25.99 0.71 1 -FEP_p38a-2n_p38a-2j -6.71 0.22 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2m 85.22 0.22 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2i -2.78 0.23 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2c 69.67 0.99 8 -FEP_p38a-2j_p38a-2bb -49.90 0.19 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2aa -36.46 0.61 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2bb -33.11 0.15 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2aa 16.18 0.71 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2j -22.94 0.23 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2ee 55.41 0.78 2 -FEP_p38a-2h_p38a-2bb -55.13 0.16 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2gg -87.86 0.25 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2bb 8.93 0.60 2 -FEP_p38a-2h_p38a-2f -2.22 0.08 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2k -24.26 0.35 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2bb -54.10 0.25 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2k -32.15 0.11 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2f 45.48 0.87 2 -FEP_p38a-2c_p38a-2aa -32.83 0.73 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2e 0.40 0.15 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2ff 27.49 0.96 1 -FEP_p38a-2n_p38a-2gg -94.75 0.19 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2g -6.25 0.13 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2h -9.37 0.18 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2f 3.15 0.19 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2e -5.03 0.07 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2e 16.04 0.18 0 -FEP_p38a-2e_p38a-2aa -27.42 0.43 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2ee 37.96 0.77 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2aa -11.13 0.56 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2ee 11.73 0.22 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2l 77.86 0.41 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2e -4.16 0.12 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2gg -102.72 0.05 0 -FEP_p38a-2f_p38a-2ee -8.33 0.27 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2bb -32.16 0.14 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2gg -92.43 0.25 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2c 22.28 0.58 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2gg -43.27 0.56 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2ee -28.48 0.10 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2ff -20.87 0.15 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2h 48.61 0.85 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2ff -22.71 0.16 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2aa -42.83 0.48 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2c -1.58 0.88 5 -FEP_p38a-2n_p38a-2f -3.93 0.18 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2j 62.24 0.83 1 -FEP_p38a-2o_p38a-2m 67.21 0.39 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2ee 52.59 0.33 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2h 1.86 0.12 0 -FEP_p38a-2f_p38a-2e -2.72 0.08 0 -FEP_p38a-2e_p38a-2bb -49.99 0.20 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2n 50.48 0.20 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2aa -11.01 0.62 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2g 8.63 0.15 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2e -14.89 0.20 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2h -17.49 0.24 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2e 88.39 0.15 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2g 97.06 0.19 0 -FEP_p38a-2c_p38a-2bb -56.35 0.64 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 59.26 0.20 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2h -1.55 0.18 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2i 21.56 0.25 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2e 57.16 0.74 3 -FEP_p38a-2l_p38a-2f -12.01 0.22 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2bb -5.98 0.59 3 -FEP_p38a-2gg_p38a-2c 95.17 0.72 1 -FEP_p38a-2m_p38a-2ff -38.87 0.17 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2aa 59.99 0.33 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2g 3.16 0.08 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2l 8.39 0.15 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-2c 12.59 0.66 2 -FEP_p38a-2f_p38a-2bb -52.74 0.20 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2e -6.81 0.14 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ee 82.15 0.12 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2ee -20.50 0.14 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2k 45.16 0.53 6 -FEP_p38a-2k_p38a-2h 22.67 0.17 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2f -5.76 0.08 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 4.40 0.07 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2o 18.01 0.32 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2e -22.53 0.23 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2i -10.63 0.21 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2gg -110.61 0.16 0 -FEP_p38a-2k_p38a-2e 17.45 0.19 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2f -1.20 0.13 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -39.68 0.11 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2j 43.76 0.66 3 -FEP_p38a-2bb_p38a-2aa 22.89 0.47 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2c -2.02 0.73 1 -FEP_p38a-2n_p38a-2g 1.70 0.25 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2c -15.03 0.42 2 -FEP_p38a-2k_p38a-2g 26.12 0.28 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2gg -93.08 0.26 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2e 43.76 0.58 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2ff -31.18 0.13 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2ff 45.31 0.78 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2e 63.10 0.38 3 -FEP_p38a-2m_p38a-2l -7.96 0.22 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2aa -32.02 0.58 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2ee -14.04 0.27 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2ee 10.42 0.13 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2c 2.71 0.31 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb -13.08 0.28 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -19.10 0.26 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2i 19.36 0.72 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2e 7.81 0.24 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2x 26.39 0.31 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2f 1.57 0.06 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2s -6.72 0.48 1 -FEP_p38a-2y_p38a-2j 45.80 0.51 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2o -46.21 0.44 1 -FEP_p38a-2x_p38a-2e 10.62 0.22 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2s 18.01 0.45 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2aa -20.16 0.45 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2p -64.13 0.49 3 -FEP_p38a-3fln_p38a-2q -59.57 0.61 1 -FEP_p38a-2z_p38a-2aa -13.99 0.53 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x -11.91 0.24 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2y -47.19 0.31 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2p -54.34 0.61 4 -FEP_p38a-2v_p38a-2ff -8.76 0.26 1 -FEP_p38a-2z_p38a-2q -42.65 1.26 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2u 9.00 nan 9 -FEP_p38a-2x_p38a-2v 2.53 0.25 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2c 17.25 0.85 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2q -46.46 0.96 2 -FEP_p38a-2u_p38a-2t -3.23 0.38 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2t 6.95 0.51 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2q -49.61 1.01 6 -FEP_p38a-2v_p38a-2gg -80.20 0.50 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2q -12.30 0.49 2 -FEP_p38a-2x_p38a-2i 15.28 0.34 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2f 10.50 0.16 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2s 28.13 0.85 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2ff 19.76 0.34 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2c 3.61 0.91 1 -FEP_p38a-2v_p38a-2r -16.25 0.56 4 -FEP_p38a-3fln_p38a-2aa -28.10 0.23 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2o -30.02 0.91 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2x 5.86 0.63 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2r -14.66 0.58 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2u -20.92 1.14 7 -FEP_p38a-2z_p38a-2bb -35.44 0.58 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2f 13.33 0.26 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2gg -51.59 0.32 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2ee 3.85 0.78 2 -FEP_p38a-2z_p38a-2ee 9.95 0.67 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2g 23.74 0.81 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2h 4.19 0.05 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2l 60.70 0.53 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2ff -17.45 0.15 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2gg -89.47 0.32 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2k -6.83 0.42 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2t -2.98 0.26 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2f 39.56 0.23 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2g 55.35 0.22 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2ee -6.78 0.15 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2k -9.81 0.28 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2r 11.55 0.82 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2bb -37.73 0.33 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2k 28.49 0.44 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2q -22.84 0.31 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2o -8.55 0.48 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -1.23 0.06 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2u nan nan 10 -FEP_p38a-2u_p38a-2p -27.61 0.93 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2m 58.92 0.53 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2s -3.68 0.92 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2h 16.15 0.28 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2c 15.44 0.57 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2m 36.57 0.77 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2m 68.38 0.44 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2l 29.34 0.79 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2ff -5.14 0.45 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2l 13.78 0.13 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2aa 15.69 0.15 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2i 40.50 0.31 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2h 13.06 0.23 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2r 18.99 0.64 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2i 49.98 0.28 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2e 36.70 0.15 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2x 35.02 1.12 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2h 41.00 0.33 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2j 15.91 0.79 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2s 16.85 0.64 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2m 34.02 0.27 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2u -0.32 0.69 5 -FEP_p38a-3fln_p38a-2t -40.51 0.17 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2n 42.24 0.50 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2q -20.04 1.11 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2n 22.64 0.68 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2ff 30.65 0.24 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2m 59.15 0.32 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2p -16.62 0.74 2 -FEP_p38a-2v_p38a-2g 16.33 0.21 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2o 0.47 0.60 1 -FEP_p38a-2y_p38a-2bb -3.57 0.58 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2gg -77.11 0.31 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2bb -51.09 0.15 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2o -33.18 0.79 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -1.41 0.13 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2t -31.63 0.21 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2t -24.28 0.76 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2g 45.21 0.12 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2p -26.61 0.79 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2g 19.58 0.29 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v -9.20 0.43 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2r 10.76 0.22 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2n 5.43 0.27 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2k 19.00 0.20 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2n 42.79 0.41 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2gg -74.36 0.64 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2n 51.97 0.58 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2l 51.34 0.16 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2o -8.65 0.20 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2f 49.25 0.27 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2k 20.59 nan 9 -FEP_p38a-2y_p38a-2e 46.55 0.28 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2c 52.56 0.94 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 7.28 0.08 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2n 15.09 0.50 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2h 21.09 0.71 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2s -10.51 1.02 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2gg -42.78 0.78 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2c 22.97 0.74 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2m 31.35 0.60 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2o -35.50 0.87 3 -FEP_p38a-2x_p38a-2p -49.67 1.03 4 -FEP_p38a-3flq_p38a-2y -8.93 0.81 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2l 25.62 0.40 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2r -11.89 0.75 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2v 27.63 0.85 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2aa 9.21 0.34 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2n 17.49 0.51 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2j 10.86 0.26 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2r -25.96 0.85 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2v 37.79 0.48 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2j 7.75 0.33 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2p -46.94 0.83 1 -FEP_p38a-2y_p38a-2ee 40.88 0.74 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2bb -41.74 0.29 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2v 8.66 0.22 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2i 11.77 0.14 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2i 3.19 0.09 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2u -34.83 0.27 7 -FEP_p38a-3flq_p38a-2j 36.03 0.18 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2ff -1.23 0.69 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2ee 5.65 0.26 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2e 16.26 0.68 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2aa -18.49 0.74 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2z -16.62 0.83 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2s -19.21 0.53 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2m 21.51 0.19 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2c 40.90 0.73 1 -FEP_p38a-2v_p38a-2l 22.66 0.16 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2k -2.77 0.73 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2l 49.84 0.94 1 -FEP_p38a-2z_p38a-2y -28.73 0.38 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2ee 30.54 0.36 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2f 18.75 0.80 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2u -25.89 1.80 8 -FEP_p38a-2x_p38a-2t -28.82 0.30 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2z 20.76 0.59 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2h 51.56 0.15 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2z -20.78 0.44 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2p -70.02 0.42 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2ee -6.65 0.68 1 -FEP_p38a-3flz_p38a-2gg -93.13 0.33 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2f -3.94 0.43 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2l 8.01 0.31 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2gg -94.70 0.32 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fln -5.54 0.14 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2j -6.84 0.40 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2q -64.30 0.48 4 -FEP_p38a-3fly_p38a-2o -44.23 0.89 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2z -17.26 0.56 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2t -46.03 0.22 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2gg -93.35 0.22 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -43.28 0.09 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2v -13.35 0.73 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2e -1.76 0.06 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2i -0.83 0.13 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2u -39.10 0.05 8 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2z -22.50 0.50 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2aa -30.76 0.52 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2k -22.16 0.23 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2y -51.14 0.71 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2l 7.56 0.21 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2s -24.90 0.60 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2bb -56.07 0.15 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fln -4.70 0.21 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2u -41.29 0.96 4 -FEP_p38a-3flw_p38a-2e -5.35 0.17 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2q -62.29 0.80 1 -FEP_p38a-3flw_p38a-2f -3.00 0.14 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2u -40.80 0.91 6 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2e -6.78 0.17 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fln 37.68 0.20 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2n 1.27 0.21 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2ee -12.37 0.30 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fmh -0.08 0.23 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2q -58.52 1.39 6 -FEP_p38a-3fly_p38a-2x -12.57 0.23 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2i 2.67 0.12 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2j -5.27 0.14 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2t -43.92 0.19 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2ee -11.62 0.83 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-3fly -2.94 0.13 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2g 3.80 0.07 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2aa -33.60 0.61 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2t -40.87 0.16 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2z -22.47 0.59 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2k -22.95 0.26 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2gg -94.59 0.08 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2i -2.21 0.14 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2s -23.67 0.39 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2p -68.06 0.66 1 -FEP_p38a-3flz_p38a-2f -1.84 0.08 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2m 18.15 0.41 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2x -17.71 0.34 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3flq -40.96 0.24 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2y -51.26 0.22 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2aa -33.78 0.64 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2h -1.24 0.13 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2f -4.12 0.15 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2j -1.58 0.10 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-3flw 0.53 0.17 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2p -63.78 0.84 3 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2i -2.56 0.17 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2u -41.27 1.00 8 -FEP_p38a-3fly_p38a-2bb -51.34 0.13 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2m 15.78 0.35 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2g 2.84 0.24 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2r -32.79 0.48 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2x -15.55 0.31 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2ee -10.43 0.26 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2s -21.90 0.57 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2m 17.17 0.33 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2k -19.07 0.22 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2f 0.96 0.10 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2q -64.46 0.60 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flz -2.27 0.15 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2o -49.03 0.56 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2j -6.55 0.13 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2n -0.10 0.21 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2ff -23.46 0.23 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flw -1.15 0.35 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2n 2.04 0.28 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2r -30.96 0.56 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fln -5.62 0.19 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2r -31.45 0.26 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2l 9.99 0.19 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2p -67.24 0.93 2 -FEP_p38a-3flz_p38a-2h 0.19 0.07 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2t -44.50 0.25 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2c 4.59 0.42 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2m 20.98 0.19 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2bb -56.11 0.29 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2ff -21.52 0.30 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2c -0.63 0.80 2 -FEP_p38a-3flw_p38a-2j -5.89 0.16 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3flq -38.31 0.43 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq -43.09 0.18 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2c -1.23 0.92 1 -FEP_p38a-3fly_p38a-2y -48.34 0.26 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3flw 3.85 0.22 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2v -9.43 0.11 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2aa -35.95 0.79 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2h 3.75 0.08 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2l 9.49 0.26 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2e -4.72 0.08 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3fln -0.57 0.09 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2n 0.22 0.27 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2z -20.31 0.70 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2ee -10.38 0.21 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2x -18.17 0.19 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2q -62.80 0.73 2 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2e -6.90 0.14 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2r -27.42 0.40 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2h -0.27 0.22 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2v -14.87 0.28 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2m 15.85 0.30 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2g 1.46 0.25 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2y -52.15 0.73 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2r -32.93 0.31 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly -5.20 0.17 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2k -24.09 0.25 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2aa -34.62 0.65 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2n 5.93 0.31 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2ff -23.21 0.25 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2v -12.21 0.19 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-3flq -40.43 0.70 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2i -1.44 0.22 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2s -19.41 0.81 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2o -50.80 0.35 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2g 6.81 0.09 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2k -23.89 0.20 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2o -47.67 0.78 1 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2h -1.10 0.12 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly -5.24 0.20 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2l 12.92 0.14 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flz -2.07 0.21 1 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c 1.98 0.45 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2bb -54.96 0.31 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2ff -18.20 0.16 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2o -50.80 0.88 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2x -15.86 0.27 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2u -39.55 1.20 5 -FEP_p38a-3flz_p38a-2bb -54.60 0.16 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-2s -24.00 0.87 1 -FEP_p38a-3fly_p38a-2gg -90.22 0.34 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2y -52.61 0.73 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-3fln -3.67 0.08 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2ff -20.98 0.13 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2p -66.73 0.40 1 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2t -45.90 0.30 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2c 1.48 0.41 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2v -15.23 0.42 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-2g 1.99 0.18 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flw -1.20 0.40 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/whole-matrix/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/whole-matrix/protein.txt deleted file mode 100755 index adabbfb1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/whole-matrix/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,562 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_2t-p38a_2ff 22.48 0.27 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2h 31.58 0.57 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 31.75 0.52 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2p -23.46 0.51 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2m 81.34 0.38 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2j 17.46 0.48 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2g 46.42 0.30 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2m 40.69 0.71 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2p -45.13 0.58 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2k 0.61 0.83 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2j 57.57 0.71 2 -FEP_p38a_2t-p38a_2q -18.85 0.32 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2r 13.74 0.29 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2c 44.55 0.80 2 -FEP_p38a_2q-p38a_2l 72.22 0.35 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2bb -10.19 0.44 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 38.50 0.33 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2ee 19.14 0.60 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2p -4.23 0.35 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2gg -62.16 0.57 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2l 39.31 0.14 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2c 28.30 nan 9 -FEP_p38a_2t-p38a_2h 45.68 0.32 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2t-p38a_2i 41.75 0.28 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2bb -23.57 0.59 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2r -7.12 0.41 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2h 43.58 1.08 4 -FEP_p38a_2t-p38a_2n 45.11 0.38 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2e 18.04 0.63 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2l 52.93 0.28 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2aa -8.83 0.75 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2e 36.75 0.08 7 -FEP_p38a_2u-p38a_2f 44.04 1.00 7 -FEP_p38a_2q-p38a_2k 45.29 nan 9 -FEP_p38a_2r-p38a_2ff 9.03 0.36 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2k 22.29 0.24 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2h 25.80 0.62 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2f 29.18 0.52 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2n 31.47 0.28 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2o -5.17 0.54 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2bb -13.61 1.09 7 -FEP_p38a_2t-p38a_2ee 33.67 0.32 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2o -17.91 0.57 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ee 11.86 0.59 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2o -21.96 0.60 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2h 62.28 0.89 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2aa 10.32 0.98 6 -FEP_p38a_2t-p38a_2f 43.60 0.25 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2i 61.87 0.79 4 -FEP_p38a_2r-p38a_2i 27.62 0.72 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2gg -48.80 0.69 4 -FEP_p38a_2r-p38a_2g 32.52 0.40 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2j 25.03 0.40 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2q -39.87 0.62 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2n 27.03 0.64 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2m 60.75 0.16 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2bb -31.91 0.64 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2p -38.12 0.48 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2g 25.40 0.82 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2aa -3.54 0.97 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2gg -68.23 0.75 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2i 41.08 1.46 6 -FEP_p38a_2s-p38a_2i 21.48 0.56 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2f 23.48 0.77 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2s 19.33 0.72 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2aa 11.77 0.48 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2m 46.71 0.39 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2g 44.47 0.91 6 -FEP_p38a_2q-p38a_2o 15.16 0.29 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ff 1.57 0.69 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2e 39.39 0.14 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2ff 22.10 0.74 4 -FEP_p38a_2u-p38a_2j 34.46 1.10 6 -FEP_p38a_2r-p38a_2k 6.82 1.00 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2q -33.57 0.28 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2ee 28.83 0.94 7 -FEP_p38a_2t-p38a_2gg -47.98 0.31 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2e 25.36 0.56 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2n 64.37 0.22 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2c 26.71 nan 9 -FEP_p38a_2k-p38a_2ff 0.53 0.26 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2aa -33.52 0.52 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2f 21.43 0.22 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2f 21.71 0.35 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 6.58 0.16 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2bb 15.57 0.62 1 -FEP_p38a_2ee-p38a_2bb -43.90 0.52 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2g -13.55 0.27 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2h 68.69 0.67 1 -FEP_p38a_2g-p38a_2bb -56.18 0.13 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2c 2.46 0.72 2 -FEP_p38a_2p-p38a_2f 67.72 0.75 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ff 70.39 0.12 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2k 24.41 0.43 4 -FEP_p38a_2i-p38a_2g 3.82 0.23 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2ff -22.96 0.28 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -14.24 0.29 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2c -7.97 0.66 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2ff -23.91 0.22 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -16.62 0.24 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2bb -70.24 0.44 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2i 45.25 1.09 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2aa -33.24 0.56 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2j 17.03 0.15 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2ee -11.62 0.36 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2g 65.37 0.71 1 -FEP_p38a_2ee-p38a_2e 5.82 0.57 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2c 23.97 1.05 2 -FEP_p38a_2q-p38a_2aa 32.04 0.78 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2bb 37.69 0.31 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2ee -9.19 0.51 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2c 5.70 0.36 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2bb -54.62 0.36 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2f -16.49 0.29 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2m 15.99 0.20 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2aa -48.13 0.39 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2f 92.34 0.34 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2aa -31.91 0.47 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2aa -26.61 0.37 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2c -0.15 1.05 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2aa 34.65 1.09 2 -FEP_p38a_2k-p38a_2gg -70.19 0.15 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2e -6.99 0.22 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2i 64.31 1.09 2 -FEP_p38a_2j-p38a_2ee -6.10 0.35 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2gg -27.53 0.52 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2n 68.64 0.38 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2i -18.62 0.24 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2g 51.19 0.52 1 -FEP_p38a_2o-p38a_2c 47.92 nan 9 -FEP_p38a_2ee-p38a_2aa -20.73 0.33 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2ff 42.54 0.64 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2bb -62.83 0.47 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2c 5.16 0.59 3 -FEP_p38a_2n-p38a_2ee -11.23 0.42 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2f 62.71 0.76 3 -FEP_p38a_2p-p38a_2g 68.39 1.14 3 -FEP_p38a_2p-p38a_2gg -25.77 0.84 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2j -6.79 0.31 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2m 83.61 0.72 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2i -2.95 0.39 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2c 67.36 nan 9 -FEP_p38a_2j-p38a_2bb -49.50 0.24 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2aa -34.22 0.45 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2bb -32.47 0.19 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2aa 15.59 0.73 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -21.91 0.32 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2ee 58.21 0.53 2 -FEP_p38a_2h-p38a_2bb -55.17 0.28 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2gg -87.68 0.25 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2bb 10.14 0.75 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2f -1.44 0.31 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2k -24.15 0.61 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2bb -52.76 0.33 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2k -30.43 0.19 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2f 47.24 0.82 1 -FEP_p38a_2c-p38a_2aa -32.45 1.13 2 -FEP_p38a_2j-p38a_2e 0.10 0.21 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2ff 26.80 0.79 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2gg -92.62 0.17 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2g -6.21 0.22 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2h -7.02 0.22 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 4.63 0.36 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2e -6.12 0.12 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2e 16.62 0.17 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2aa -27.89 0.31 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2ee 38.52 0.57 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2aa -10.25 0.39 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2ee 11.64 0.30 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2l 77.43 0.43 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2e -2.69 0.17 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2gg -100.96 0.11 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2ee -10.37 0.81 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2bb -32.86 0.33 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2gg -90.37 0.27 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2c 22.54 0.81 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2gg -44.27 0.92 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2ee -27.34 0.27 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2ff -19.66 0.30 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2h 50.61 0.80 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2ff -22.13 0.24 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2aa -40.30 0.33 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2c -0.98 1.17 3 -FEP_p38a_2n-p38a_2f -1.34 0.48 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2j 61.63 0.79 1 -FEP_p38a_2o-p38a_2m 64.58 0.63 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2ee 52.73 0.89 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2h 3.23 0.24 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2e -4.94 0.14 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2bb -49.55 0.22 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2n 49.42 0.27 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2aa -9.85 0.36 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2g 6.81 0.22 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2e -13.51 0.39 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2h -14.92 0.53 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2e 87.54 0.20 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2g 94.82 0.13 0 -FEP_p38a_2c-p38a_2bb -53.67 1.04 3 -FEP_p38a_2o-p38a_2l 57.48 0.43 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2h 1.65 0.23 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2i 20.23 0.22 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2e 57.46 0.76 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2f -8.97 0.23 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2bb -4.86 0.59 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2c 93.63 1.06 2 -FEP_p38a_2m-p38a_2ff -37.70 0.20 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2aa 60.21 0.36 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2g 0.78 0.14 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2l 7.93 0.26 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2c 11.95 0.69 3 -FEP_p38a_2f-p38a_2bb -54.10 0.28 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2e -5.69 0.42 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ee 81.59 0.15 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2ee -19.32 0.31 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2k 45.30 1.17 4 -FEP_p38a_2k-p38a_2h 22.97 0.34 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -2.54 0.16 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2i 2.67 0.09 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2o 19.22 0.20 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2e -21.15 0.30 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2i -10.95 0.22 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2gg -108.48 0.28 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2e 17.56 0.29 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2f 2.02 0.23 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -39.03 0.43 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2j 42.44 1.34 1 -FEP_p38a_2bb-p38a_2aa 22.21 0.71 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2c -1.53 0.32 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2g 1.79 0.43 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2c -18.16 1.10 2 -FEP_p38a_2k-p38a_2g 24.02 0.21 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2gg -92.70 0.25 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2e 43.95 0.49 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2ff -30.34 0.19 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2ff 46.13 0.68 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2e 63.72 0.76 3 -FEP_p38a_2m-p38a_2l -7.57 0.18 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2aa -30.07 0.62 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2ee -13.13 0.41 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2ee 11.29 0.26 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2c -1.05 0.72 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2bb -12.62 0.55 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -18.28 0.32 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2i 17.88 0.70 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2e 6.12 0.23 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2x 25.29 0.29 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2f 4.07 0.21 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2s -6.95 1.08 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2j 45.50 0.48 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -44.47 0.57 2 -FEP_p38a_2x-p38a_2e 11.58 0.31 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2s 18.43 0.63 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2aa -21.47 0.40 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -64.23 0.75 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2q -59.59 0.84 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -13.05 0.38 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2x -11.40 0.29 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2y -46.56 0.57 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2p -57.52 0.59 3 -FEP_p38a_2v-p38a_2ff -10.68 0.44 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2q -44.50 0.50 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2u 5.95 0.19 8 -FEP_p38a_2x-p38a_2v 3.52 0.24 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2c 16.45 0.51 1 -FEP_p38a_2x-p38a_2q -48.57 0.59 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2t -0.37 0.65 2 -FEP_p38a_2y-p38a_2t 5.83 0.53 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2q -49.73 1.05 5 -FEP_p38a_2v-p38a_2gg -79.78 0.92 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2q -15.71 0.32 1 -FEP_p38a_2x-p38a_2i 13.98 0.34 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2f 10.96 0.31 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2s 27.28 0.71 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ff 19.79 0.28 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2c 2.82 1.01 3 -FEP_p38a_2v-p38a_2r -18.19 0.80 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2aa -27.84 0.47 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2o -28.16 0.84 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2x 5.70 0.41 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2r -15.30 0.60 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2u -19.84 1.36 5 -FEP_p38a_2z-p38a_2bb -34.34 0.75 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2f 15.69 0.36 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2gg -50.79 0.21 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2ee 1.49 1.04 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2ee 9.97 0.43 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2g 22.26 0.83 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2h 5.85 0.22 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2l 58.59 0.59 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.72 0.19 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -88.68 0.29 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2k -6.61 0.36 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2t -2.87 0.32 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2f 40.24 0.27 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2g 51.73 0.54 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ee -6.78 0.25 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2k -10.49 0.36 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2r 10.80 0.51 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2bb -37.81 0.39 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2k 26.99 0.77 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -22.24 0.47 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2o -6.25 1.06 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -0.71 0.16 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2u nan nan 10 -FEP_p38a_2u-p38a_2p -26.48 0.49 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2m 58.78 0.75 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2s -2.53 1.15 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2h 17.34 0.32 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2c 11.35 0.91 4 -FEP_p38a_2z-p38a_2m 37.46 0.52 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2m 65.98 0.68 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2l 29.70 0.46 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ff -5.69 0.37 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2l 13.00 0.16 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2aa 15.88 0.34 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2i 39.51 0.21 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2h 12.03 0.38 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2r 20.38 0.96 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2i 47.81 0.55 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2e 36.08 0.27 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2x 33.31 0.77 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2h 41.71 0.31 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2j 14.74 0.41 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2s 18.71 0.77 1 -FEP_p38a_2x-p38a_2m 32.22 0.55 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2u -0.49 0.80 5 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.61 0.18 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2n 43.85 0.53 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2q -21.80 0.88 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2n 21.11 0.65 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2ff 29.23 0.24 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2m 58.70 0.50 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2p -17.39 0.98 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2g 13.81 0.28 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2o 0.66 0.81 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2bb -4.93 0.57 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2gg -77.00 0.34 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2bb -50.42 0.37 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2o -32.00 1.04 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2j -0.71 0.20 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2t -32.80 0.23 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2t -24.32 0.69 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2g 43.17 0.36 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2p -26.61 0.85 2 -FEP_p38a_2x-p38a_2g 17.59 0.42 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2v -7.79 0.51 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2r 11.25 0.66 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 5.02 0.28 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2k 18.58 0.27 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2n 41.74 0.31 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2gg -72.94 0.52 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2n 51.23 0.55 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2l 50.03 0.29 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2o -6.92 0.92 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2f 49.88 0.25 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2k 23.76 nan 9 -FEP_p38a_2y-p38a_2e 45.19 0.35 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2c 51.11 0.71 3 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 5.96 0.09 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2n 12.54 0.94 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2h 21.32 0.55 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2s -12.74 0.81 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2gg -43.39 0.35 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2c 19.04 0.44 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2m 28.66 0.62 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2o -35.92 0.93 1 -FEP_p38a_2x-p38a_2p -53.90 0.43 3 -FEP_p38a_3flq-p38a_2y -7.59 0.64 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2l 24.28 0.27 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2r -7.68 0.89 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2v 29.31 0.69 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2aa 9.53 0.59 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2n 16.58 0.27 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2j 10.65 0.53 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -26.48 0.36 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2v 38.38 0.55 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 5.60 0.25 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2p -47.08 0.96 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2ee 39.41 0.47 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -41.99 0.43 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2v 8.49 0.53 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2i 9.63 0.42 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 1.82 0.15 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2u -36.84 1.00 6 -FEP_p38a_3flq-p38a_2j 36.33 0.37 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2ff -2.65 0.69 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ee 4.97 0.36 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2e 13.45 0.57 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2aa -17.15 0.47 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2z -15.55 0.64 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -19.35 0.47 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2m 20.18 0.27 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2c 42.59 0.86 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2l 20.14 0.21 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2k -2.10 0.60 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2l 52.20 0.29 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -27.69 0.33 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ee 30.96 0.22 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2f 20.29 0.51 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2u -27.71 nan 9 -FEP_p38a_2x-p38a_2t -27.88 0.31 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2z 20.30 0.49 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2h 50.65 0.89 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2z -20.26 0.64 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2p -64.89 0.83 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ee -7.40 0.25 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2gg -91.78 0.19 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2f -1.70 0.37 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2l 7.04 0.29 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2gg -93.30 0.24 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fln -4.56 0.24 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2j -6.96 0.27 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2q -64.04 0.72 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2o -43.89 1.27 3 -FEP_p38a_3fly-p38a_2z -16.30 0.62 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2t -44.13 0.36 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2gg -92.32 0.33 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flq -41.39 0.45 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2v -12.72 0.60 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2e -1.16 0.13 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2i -0.59 0.18 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2u -37.00 0.93 7 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2z -17.89 0.80 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2aa -29.33 0.50 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2k -21.35 0.29 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2y -49.81 0.46 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2l 9.10 0.41 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2s -24.85 0.71 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2bb -54.39 0.67 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_3fln -4.51 0.20 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2u -42.09 0.72 5 -FEP_p38a_3flw-p38a_2e -5.66 0.17 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2q -62.68 0.77 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2f -2.25 0.73 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2u -39.22 0.77 8 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2e -6.24 0.47 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_3fln 37.43 0.29 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2n 0.96 0.34 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ee -8.55 0.58 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fmh 2.39 0.61 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2q -59.27 1.05 3 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -12.25 0.24 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2i 2.02 0.28 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2j -3.80 0.21 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2t -43.05 0.23 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ee -11.82 0.38 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fly -2.15 0.15 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.54 0.15 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2aa -31.17 0.39 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2t -40.09 0.31 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2z -20.71 0.67 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2k -22.78 0.29 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2gg -92.32 0.53 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2i -3.15 0.41 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2s -24.07 0.62 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2p -67.88 0.63 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2f 1.11 0.12 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2m 18.07 0.26 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2x -13.45 0.35 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_3flq -41.24 0.48 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2y -48.94 0.42 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2aa -32.06 0.50 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2h -1.03 0.23 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2f 0.48 0.41 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2j -1.60 0.23 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flw 2.05 0.25 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2p -64.37 1.08 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2i -1.94 0.28 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2u -43.64 0.51 6 -FEP_p38a_3fly-p38a_2bb -51.12 0.18 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2m 17.17 0.38 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2g 1.31 0.30 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2r -29.81 0.53 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2x -14.55 0.40 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ee -9.60 0.35 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2s -23.66 0.47 2 -FEP_p38a_3flw-p38a_2m 16.50 0.38 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2k -18.97 0.29 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2f 3.09 0.25 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2q -60.53 0.83 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flz 0.46 0.71 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2o -47.89 1.25 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2j -4.30 0.51 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2n 1.42 0.44 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ff -22.54 0.26 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flw -1.06 0.29 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2n 2.32 0.33 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2r -29.56 0.52 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fln -2.48 0.58 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2r -31.19 0.45 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2l 10.34 0.28 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2p -67.95 0.66 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2h 2.25 0.22 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2t -43.43 0.19 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2c 4.80 0.39 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2m 20.06 0.18 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2bb -54.82 0.23 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ff -21.90 0.21 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2c -0.86 0.98 5 -FEP_p38a_3flw-p38a_2j -5.80 0.31 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -37.52 0.68 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flq -42.18 0.59 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2c 1.67 0.85 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2y -45.12 0.47 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flw 4.13 0.42 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2v -7.92 0.17 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2aa -31.24 0.57 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2h 4.89 0.20 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2l 8.36 0.29 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2e -3.66 0.16 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fln -0.45 0.11 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2n -0.07 0.46 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2z -18.17 0.78 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ee -11.20 0.56 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2x -17.17 0.29 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2q -64.81 1.22 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2e -3.40 0.34 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2r -25.27 0.79 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2h 0.18 0.36 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2v -9.65 0.62 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2m 15.02 0.29 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2g 3.01 0.38 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2y -47.86 0.74 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2r -32.07 0.63 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fly -1.61 0.32 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2k -23.32 0.31 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2aa -33.57 0.40 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2n 4.03 0.39 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ff -22.50 0.42 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2v -10.33 0.39 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flq -39.89 0.27 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2i -2.44 0.16 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2s -19.50 0.72 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2o -48.98 0.87 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2g 5.77 0.20 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2k -21.11 0.57 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2o -47.37 0.72 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2h 2.45 0.60 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fly -5.04 0.48 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2l 11.94 0.28 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flz -2.27 0.23 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c 2.54 0.57 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2bb -53.54 0.48 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ff -18.34 0.25 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2o -47.16 0.68 2 -FEP_p38a_3flw-p38a_2x -15.20 0.34 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2u -42.35 0.32 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_2bb -52.67 0.34 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2s -22.68 0.76 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2gg -89.40 0.27 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2y -49.94 0.58 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fln -2.71 0.17 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ff -20.54 0.13 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2p -66.28 0.87 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2t -44.70 0.17 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2c -0.42 0.90 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2v -13.36 0.67 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2g 0.65 0.20 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flw 1.86 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/whole-matrix/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/whole-matrix/water.txt deleted file mode 100755 index 954a9b50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/no-vs/2fs/whole-matrix/water.txt +++ /dev/null @@ -1,562 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_2t-p38a_2ff 22.80 0.12 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2h 30.48 0.91 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 33.81 0.73 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2p -24.49 0.18 1 -FEP_p38a_2q-p38a_2m 80.82 0.44 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2j 17.36 0.59 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2g 47.41 0.17 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2m 40.99 0.68 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2p -42.81 0.72 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2k -0.43 0.67 1 -FEP_p38a_2q-p38a_2j 57.61 0.50 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2q -18.86 0.42 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2r 12.92 0.17 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2c 44.74 0.71 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2l 73.04 0.18 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2bb -10.33 0.17 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 39.25 0.18 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2ee 19.85 0.18 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2p -5.04 0.35 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2gg -61.96 0.27 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2l 40.89 0.25 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2c 32.54 0.86 7 -FEP_p38a_2t-p38a_2h 44.42 0.14 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2c 38.85 nan 9 -FEP_p38a_2t-p38a_2i 43.70 0.20 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2bb -24.71 0.47 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2r -7.48 0.42 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2h 39.48 0.81 5 -FEP_p38a_2t-p38a_2n 45.61 0.12 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2e 17.60 0.37 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2l 53.95 0.08 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2aa -10.05 0.78 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2e 34.93 0.93 6 -FEP_p38a_2u-p38a_2f 37.33 0.32 8 -FEP_p38a_2q-p38a_2k 37.09 0.23 7 -FEP_p38a_2r-p38a_2ff 8.80 0.53 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2k 21.72 0.14 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2h 23.43 0.44 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2f 28.31 0.43 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2n 32.60 0.20 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2o -5.52 0.28 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2bb -12.12 nan 9 -FEP_p38a_2t-p38a_2ee 33.52 0.18 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2o -18.75 0.26 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ee 12.53 0.34 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2o -22.87 0.73 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2h 62.71 0.86 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2aa 9.45 0.90 5 -FEP_p38a_2t-p38a_2f 41.83 0.16 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2i 62.74 0.57 2 -FEP_p38a_2r-p38a_2i 29.25 0.52 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2gg -52.22 0.87 5 -FEP_p38a_2r-p38a_2g 34.18 0.46 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2j 25.52 0.53 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2q -38.83 0.53 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2n 28.41 0.40 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2m 61.67 0.16 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2bb -31.60 0.38 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2p -37.28 0.27 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2g 26.12 0.24 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2aa -2.86 0.79 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2gg -69.71 0.39 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2i 34.89 nan 9 -FEP_p38a_2s-p38a_2i 22.78 0.59 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2f 21.07 0.45 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2s 19.83 0.57 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2aa 11.34 0.54 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2m 48.31 0.37 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2g 42.00 0.99 6 -FEP_p38a_2q-p38a_2o 13.04 0.17 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ff 1.18 0.36 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2e 39.20 0.11 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2ff 17.45 0.92 4 -FEP_p38a_2u-p38a_2j 31.02 nan 9 -FEP_p38a_2r-p38a_2k 7.29 0.53 3 -FEP_p38a_2r-p38a_2q -31.59 0.25 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2ee 30.07 0.70 5 -FEP_p38a_2t-p38a_2gg -48.87 0.10 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2e 25.76 0.60 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2n 64.87 0.25 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2c 22.67 1.44 3 -FEP_p38a_2k-p38a_2ff 1.04 0.17 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2aa -32.19 0.49 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2f 19.00 0.15 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2f 19.92 0.23 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2c 62.51 0.56 7 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 6.23 0.06 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2bb 12.34 1.03 1 -FEP_p38a_2ee-p38a_2bb -43.71 0.32 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2g -13.90 0.25 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2h 66.74 1.03 1 -FEP_p38a_2g-p38a_2bb -58.28 0.15 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2c 3.26 0.28 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2f 65.29 0.86 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ff 71.56 0.08 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2k 25.29 0.78 4 -FEP_p38a_2i-p38a_2g 4.14 0.09 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2ff -21.67 0.11 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -14.82 0.15 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2c -7.11 0.36 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2ff -24.72 0.12 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -16.15 0.11 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2bb -72.44 0.24 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2i 46.75 0.79 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2aa -33.63 0.44 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2j 17.48 0.12 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2ee -11.45 0.29 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2g 66.21 0.87 2 -FEP_p38a_2ee-p38a_2e 5.82 0.30 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2c 24.43 0.42 1 -FEP_p38a_2q-p38a_2aa 28.30 1.00 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2bb 38.47 0.20 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2ee -10.14 0.29 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2c 6.14 0.31 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2bb -56.27 0.19 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2f -19.64 0.27 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2m 16.12 0.23 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2aa -50.75 0.56 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2f 91.31 0.34 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2aa -30.49 0.61 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2aa -28.59 0.74 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2c 4.67 0.17 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2aa 34.38 0.76 1 -FEP_p38a_2k-p38a_2gg -70.45 0.20 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2e -8.39 0.10 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2i 63.93 0.72 3 -FEP_p38a_2j-p38a_2ee -5.43 0.23 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2gg -31.46 0.72 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2n 70.02 0.25 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2i -18.28 0.29 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2g 52.20 0.71 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2c 51.21 0.91 6 -FEP_p38a_2ee-p38a_2aa -22.66 1.03 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2ff 41.03 0.57 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2bb -64.85 0.14 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2c 7.44 0.29 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2ee -12.41 0.22 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2f 59.90 0.83 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2g 68.61 0.62 2 -FEP_p38a_2p-p38a_2gg -25.99 0.71 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2j -6.71 0.22 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2m 85.22 0.22 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2i -2.78 0.23 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2c 69.67 0.99 8 -FEP_p38a_2j-p38a_2bb -49.90 0.19 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2aa -36.46 0.61 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2bb -33.11 0.15 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2aa 16.18 0.71 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -22.94 0.23 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2ee 55.41 0.78 2 -FEP_p38a_2h-p38a_2bb -55.13 0.16 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2gg -87.86 0.25 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2bb 8.93 0.60 2 -FEP_p38a_2h-p38a_2f -2.22 0.08 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2k -24.26 0.35 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2bb -54.10 0.25 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2k -32.15 0.11 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2f 45.48 0.87 2 -FEP_p38a_2c-p38a_2aa -32.83 0.73 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2e 0.40 0.15 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2ff 27.49 0.96 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2gg -94.75 0.19 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2g -6.25 0.13 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2h -9.37 0.18 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 3.15 0.19 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2e -5.03 0.07 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2e 16.04 0.18 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2aa -27.42 0.43 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2ee 37.96 0.77 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2aa -11.13 0.56 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2ee 11.73 0.22 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2l 77.86 0.41 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2e -4.16 0.12 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2gg -102.72 0.05 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2ee -8.33 0.27 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2bb -32.16 0.14 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2gg -92.43 0.25 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2c 22.28 0.58 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2gg -43.27 0.56 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2ee -28.48 0.10 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2ff -20.87 0.15 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2h 48.61 0.85 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2ff -22.71 0.16 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2aa -42.83 0.48 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2c -1.58 0.88 5 -FEP_p38a_2n-p38a_2f -3.93 0.18 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2j 62.24 0.83 1 -FEP_p38a_2o-p38a_2m 67.21 0.39 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2ee 52.59 0.33 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2h 1.86 0.12 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2e -2.72 0.08 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2bb -49.99 0.20 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2n 50.48 0.20 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2aa -11.01 0.62 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2g 8.63 0.15 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2e -14.89 0.20 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2h -17.49 0.24 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2e 88.39 0.15 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2g 97.06 0.19 0 -FEP_p38a_2c-p38a_2bb -56.35 0.64 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2l 59.26 0.20 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2h -1.55 0.18 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2i 21.56 0.25 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2e 57.16 0.74 3 -FEP_p38a_2l-p38a_2f -12.01 0.22 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2bb -5.98 0.59 3 -FEP_p38a_2gg-p38a_2c 95.17 0.72 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2ff -38.87 0.17 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2aa 59.99 0.33 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2g 3.16 0.08 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2l 8.39 0.15 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2c 12.59 0.66 2 -FEP_p38a_2f-p38a_2bb -52.74 0.20 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2e -6.81 0.14 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ee 82.15 0.12 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2ee -20.50 0.14 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2k 45.16 0.53 6 -FEP_p38a_2k-p38a_2h 22.67 0.17 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -5.76 0.08 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2i 4.40 0.07 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2o 18.01 0.32 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2e -22.53 0.23 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2i -10.63 0.21 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2gg -110.61 0.16 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2e 17.45 0.19 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2f -1.20 0.13 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -39.68 0.11 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2j 43.76 0.66 3 -FEP_p38a_2bb-p38a_2aa 22.89 0.47 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2c -2.02 0.73 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2g 1.70 0.25 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2c -15.03 0.42 2 -FEP_p38a_2k-p38a_2g 26.12 0.28 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2gg -93.08 0.26 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2e 43.76 0.58 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2ff -31.18 0.13 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2ff 45.31 0.78 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2e 63.10 0.38 3 -FEP_p38a_2m-p38a_2l -7.96 0.22 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2aa -32.02 0.58 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2ee -14.04 0.27 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2ee 10.42 0.13 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2c 2.71 0.31 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2bb -13.08 0.28 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -19.10 0.26 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2i 19.36 0.72 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2e 7.81 0.24 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2x 26.39 0.31 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2f 1.57 0.06 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2s -6.72 0.48 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2j 45.80 0.51 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -46.21 0.44 1 -FEP_p38a_2x-p38a_2e 10.62 0.22 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2s 18.01 0.45 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2aa -20.16 0.45 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -64.13 0.49 3 -FEP_p38a_3fln-p38a_2q -59.57 0.61 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -13.99 0.53 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2x -11.91 0.24 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2y -47.19 0.31 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2p -54.34 0.61 4 -FEP_p38a_2v-p38a_2ff -8.76 0.26 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2q -42.65 1.26 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2u 9.00 nan 9 -FEP_p38a_2x-p38a_2v 2.53 0.25 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2c 17.25 0.85 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2q -46.46 0.96 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2t -3.23 0.38 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2t 6.95 0.51 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2q -49.61 1.01 6 -FEP_p38a_2v-p38a_2gg -80.20 0.50 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2q -12.30 0.49 2 -FEP_p38a_2x-p38a_2i 15.28 0.34 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2f 10.50 0.16 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2s 28.13 0.85 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ff 19.76 0.34 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2c 3.61 0.91 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2r -16.25 0.56 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2aa -28.10 0.23 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2o -30.02 0.91 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2x 5.86 0.63 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2r -14.66 0.58 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2u -20.92 1.14 7 -FEP_p38a_2z-p38a_2bb -35.44 0.58 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2f 13.33 0.26 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2gg -51.59 0.32 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2ee 3.85 0.78 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2ee 9.95 0.67 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2g 23.74 0.81 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2h 4.19 0.05 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2l 60.70 0.53 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.45 0.15 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -89.47 0.32 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2k -6.83 0.42 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2t -2.98 0.26 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2f 39.56 0.23 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2g 55.35 0.22 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ee -6.78 0.15 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2k -9.81 0.28 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2r 11.55 0.82 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2bb -37.73 0.33 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2k 28.49 0.44 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -22.84 0.31 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2o -8.55 0.48 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -1.23 0.06 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2u nan nan 10 -FEP_p38a_2u-p38a_2p -27.61 0.93 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2m 58.92 0.53 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2s -3.68 0.92 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2h 16.15 0.28 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2c 15.44 0.57 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2m 36.57 0.77 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2m 68.38 0.44 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2l 29.34 0.79 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ff -5.14 0.45 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2l 13.78 0.13 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2aa 15.69 0.15 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2i 40.50 0.31 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2h 13.06 0.23 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2r 18.99 0.64 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2i 49.98 0.28 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2e 36.70 0.15 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2x 35.02 1.12 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2h 41.00 0.33 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2j 15.91 0.79 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2s 16.85 0.64 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2m 34.02 0.27 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2u -0.32 0.69 5 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.51 0.17 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2n 42.24 0.50 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2q -20.04 1.11 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2n 22.64 0.68 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2ff 30.65 0.24 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2m 59.15 0.32 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2p -16.62 0.74 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2g 16.33 0.21 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2o 0.47 0.60 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2bb -3.57 0.58 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2gg -77.11 0.31 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2bb -51.09 0.15 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2o -33.18 0.79 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2j -1.41 0.13 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2t -31.63 0.21 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2t -24.28 0.76 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2g 45.21 0.12 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2p -26.61 0.79 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2g 19.58 0.29 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2v -9.20 0.43 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2r 10.76 0.22 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 5.43 0.27 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2k 19.00 0.20 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2n 42.79 0.41 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2gg -74.36 0.64 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2n 51.97 0.58 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2l 51.34 0.16 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2o -8.65 0.20 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2f 49.25 0.27 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2k 20.59 nan 9 -FEP_p38a_2y-p38a_2e 46.55 0.28 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2c 52.56 0.94 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 7.28 0.08 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2n 15.09 0.50 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2h 21.09 0.71 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2s -10.51 1.02 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2gg -42.78 0.78 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2c 22.97 0.74 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2m 31.35 0.60 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2o -35.50 0.87 3 -FEP_p38a_2x-p38a_2p -49.67 1.03 4 -FEP_p38a_3flq-p38a_2y -8.93 0.81 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2l 25.62 0.40 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2r -11.89 0.75 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2v 27.63 0.85 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2aa 9.21 0.34 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2n 17.49 0.51 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2j 10.86 0.26 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -25.96 0.85 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2v 37.79 0.48 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 7.75 0.33 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2p -46.94 0.83 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2ee 40.88 0.74 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -41.74 0.29 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2v 8.66 0.22 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2i 11.77 0.14 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 3.19 0.09 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2u -34.83 0.27 7 -FEP_p38a_3flq-p38a_2j 36.03 0.18 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2ff -1.23 0.69 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ee 5.65 0.26 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2e 16.26 0.68 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2aa -18.49 0.74 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2z -16.62 0.83 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -19.21 0.53 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2m 21.51 0.19 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2c 40.90 0.73 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2l 22.66 0.16 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2k -2.77 0.73 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2l 49.84 0.94 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -28.73 0.38 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ee 30.54 0.36 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2f 18.75 0.80 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2u -25.89 1.80 8 -FEP_p38a_2x-p38a_2t -28.82 0.30 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2z 20.76 0.59 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2h 51.56 0.15 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2z -20.78 0.44 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2p -70.02 0.42 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ee -6.65 0.68 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2gg -93.13 0.33 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2f -3.94 0.43 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2l 8.01 0.31 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2gg -94.70 0.32 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fln -5.54 0.14 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2j -6.84 0.40 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2q -64.30 0.48 4 -FEP_p38a_3fly-p38a_2o -44.23 0.89 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2z -17.26 0.56 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2t -46.03 0.22 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2gg -93.35 0.22 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flq -43.28 0.09 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2v -13.35 0.73 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2e -1.76 0.06 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2i -0.83 0.13 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2u -39.10 0.05 8 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2z -22.50 0.50 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2aa -30.76 0.52 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2k -22.16 0.23 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2y -51.14 0.71 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2l 7.56 0.21 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2s -24.90 0.60 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2bb -56.07 0.15 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_3fln -4.70 0.21 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2u -41.29 0.96 4 -FEP_p38a_3flw-p38a_2e -5.35 0.17 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2q -62.29 0.80 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2f -3.00 0.14 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2u -40.80 0.91 6 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2e -6.78 0.17 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_3fln 37.68 0.20 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2n 1.27 0.21 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ee -12.37 0.30 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fmh -0.08 0.23 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2q -58.52 1.39 6 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -12.57 0.23 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2i 2.67 0.12 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2j -5.27 0.14 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2t -43.92 0.19 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ee -11.62 0.83 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fly -2.94 0.13 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.80 0.07 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2aa -33.60 0.61 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2t -40.87 0.16 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2z -22.47 0.59 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2k -22.95 0.26 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2gg -94.59 0.08 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2i -2.21 0.14 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2s -23.67 0.39 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2p -68.06 0.66 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2f -1.84 0.08 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2m 18.15 0.41 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2x -17.71 0.34 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_3flq -40.96 0.24 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2y -51.26 0.22 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2aa -33.78 0.64 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2h -1.24 0.13 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2f -4.12 0.15 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2j -1.58 0.10 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flw 0.53 0.17 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2p -63.78 0.84 3 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2i -2.56 0.17 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2u -41.27 1.00 8 -FEP_p38a_3fly-p38a_2bb -51.34 0.13 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2m 15.78 0.35 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2g 2.84 0.24 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2r -32.79 0.48 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2x -15.55 0.31 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ee -10.43 0.26 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2s -21.90 0.57 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2m 17.17 0.33 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2k -19.07 0.22 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2f 0.96 0.10 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2q -64.46 0.60 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flz -2.27 0.15 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2o -49.03 0.56 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2j -6.55 0.13 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2n -0.10 0.21 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ff -23.46 0.23 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flw -1.15 0.35 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2n 2.04 0.28 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2r -30.96 0.56 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fln -5.62 0.19 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2r -31.45 0.26 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2l 9.99 0.19 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2p -67.24 0.93 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2h 0.19 0.07 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2t -44.50 0.25 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2c 4.59 0.42 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2m 20.98 0.19 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2bb -56.11 0.29 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ff -21.52 0.30 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2c -0.63 0.80 2 -FEP_p38a_3flw-p38a_2j -5.89 0.16 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -38.31 0.43 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flq -43.09 0.18 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2c -1.23 0.92 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2y -48.34 0.26 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flw 3.85 0.22 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2v -9.43 0.11 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2aa -35.95 0.79 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2h 3.75 0.08 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2l 9.49 0.26 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2e -4.72 0.08 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fln -0.57 0.09 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2n 0.22 0.27 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2z -20.31 0.70 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ee -10.38 0.21 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2x -18.17 0.19 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2q -62.80 0.73 2 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2e -6.90 0.14 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2r -27.42 0.40 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2h -0.27 0.22 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2v -14.87 0.28 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2m 15.85 0.30 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2g 1.46 0.25 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2y -52.15 0.73 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2r -32.93 0.31 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fly -5.20 0.17 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2k -24.09 0.25 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2aa -34.62 0.65 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2n 5.93 0.31 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ff -23.21 0.25 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2v -12.21 0.19 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flq -40.43 0.70 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2i -1.44 0.22 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2s -19.41 0.81 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2o -50.80 0.35 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2g 6.81 0.09 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2k -23.89 0.20 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2o -47.67 0.78 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2h -1.10 0.12 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fly -5.24 0.20 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2l 12.92 0.14 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flz -2.07 0.21 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c 1.98 0.45 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2bb -54.96 0.31 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ff -18.20 0.16 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2o -50.80 0.88 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2x -15.86 0.27 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2u -39.55 1.20 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_2bb -54.60 0.16 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2s -24.00 0.87 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2gg -90.22 0.34 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2y -52.61 0.73 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fln -3.67 0.08 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ff -20.98 0.13 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2p -66.73 0.40 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2t -45.90 0.30 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2c 1.48 0.41 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2v -15.23 0.42 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2g 1.99 0.18 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flw -1.20 0.40 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/protein.txt deleted file mode 100755 index adabbfb1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,562 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_2t-p38a_2ff 22.48 0.27 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2h 31.58 0.57 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 31.75 0.52 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2p -23.46 0.51 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2m 81.34 0.38 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2j 17.46 0.48 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2g 46.42 0.30 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2m 40.69 0.71 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2p -45.13 0.58 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2k 0.61 0.83 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2j 57.57 0.71 2 -FEP_p38a_2t-p38a_2q -18.85 0.32 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2r 13.74 0.29 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2c 44.55 0.80 2 -FEP_p38a_2q-p38a_2l 72.22 0.35 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2bb -10.19 0.44 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 38.50 0.33 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2ee 19.14 0.60 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2p -4.23 0.35 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2gg -62.16 0.57 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2l 39.31 0.14 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2c 28.30 nan 9 -FEP_p38a_2t-p38a_2h 45.68 0.32 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2t-p38a_2i 41.75 0.28 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2bb -23.57 0.59 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2r -7.12 0.41 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2h 43.58 1.08 4 -FEP_p38a_2t-p38a_2n 45.11 0.38 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2e 18.04 0.63 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2l 52.93 0.28 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2aa -8.83 0.75 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2e 36.75 0.08 7 -FEP_p38a_2u-p38a_2f 44.04 1.00 7 -FEP_p38a_2q-p38a_2k 45.29 nan 9 -FEP_p38a_2r-p38a_2ff 9.03 0.36 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2k 22.29 0.24 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2h 25.80 0.62 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2f 29.18 0.52 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2n 31.47 0.28 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2o -5.17 0.54 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2bb -13.61 1.09 7 -FEP_p38a_2t-p38a_2ee 33.67 0.32 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2o -17.91 0.57 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ee 11.86 0.59 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2o -21.96 0.60 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2h 62.28 0.89 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2aa 10.32 0.98 6 -FEP_p38a_2t-p38a_2f 43.60 0.25 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2i 61.87 0.79 4 -FEP_p38a_2r-p38a_2i 27.62 0.72 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2gg -48.80 0.69 4 -FEP_p38a_2r-p38a_2g 32.52 0.40 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2j 25.03 0.40 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2q -39.87 0.62 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2n 27.03 0.64 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2m 60.75 0.16 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2bb -31.91 0.64 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2p -38.12 0.48 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2g 25.40 0.82 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2aa -3.54 0.97 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2gg -68.23 0.75 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2i 41.08 1.46 6 -FEP_p38a_2s-p38a_2i 21.48 0.56 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2f 23.48 0.77 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2s 19.33 0.72 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2aa 11.77 0.48 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2m 46.71 0.39 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2g 44.47 0.91 6 -FEP_p38a_2q-p38a_2o 15.16 0.29 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ff 1.57 0.69 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2e 39.39 0.14 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2ff 22.10 0.74 4 -FEP_p38a_2u-p38a_2j 34.46 1.10 6 -FEP_p38a_2r-p38a_2k 6.82 1.00 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2q -33.57 0.28 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2ee 28.83 0.94 7 -FEP_p38a_2t-p38a_2gg -47.98 0.31 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2e 25.36 0.56 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2n 64.37 0.22 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2c 26.71 nan 9 -FEP_p38a_2k-p38a_2ff 0.53 0.26 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2aa -33.52 0.52 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2f 21.43 0.22 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2f 21.71 0.35 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2c nan nan 10 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 6.58 0.16 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2bb 15.57 0.62 1 -FEP_p38a_2ee-p38a_2bb -43.90 0.52 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2g -13.55 0.27 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2h 68.69 0.67 1 -FEP_p38a_2g-p38a_2bb -56.18 0.13 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2c 2.46 0.72 2 -FEP_p38a_2p-p38a_2f 67.72 0.75 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ff 70.39 0.12 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2k 24.41 0.43 4 -FEP_p38a_2i-p38a_2g 3.82 0.23 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2ff -22.96 0.28 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -14.24 0.29 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2c -7.97 0.66 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2ff -23.91 0.22 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -16.62 0.24 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2bb -70.24 0.44 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2i 45.25 1.09 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2aa -33.24 0.56 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2j 17.03 0.15 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2ee -11.62 0.36 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2g 65.37 0.71 1 -FEP_p38a_2ee-p38a_2e 5.82 0.57 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2c 23.97 1.05 2 -FEP_p38a_2q-p38a_2aa 32.04 0.78 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2bb 37.69 0.31 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2ee -9.19 0.51 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2c 5.70 0.36 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2bb -54.62 0.36 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2f -16.49 0.29 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2m 15.99 0.20 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2aa -48.13 0.39 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2f 92.34 0.34 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2aa -31.91 0.47 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2aa -26.61 0.37 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2c -0.15 1.05 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2aa 34.65 1.09 2 -FEP_p38a_2k-p38a_2gg -70.19 0.15 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2e -6.99 0.22 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2i 64.31 1.09 2 -FEP_p38a_2j-p38a_2ee -6.10 0.35 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2gg -27.53 0.52 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2n 68.64 0.38 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2i -18.62 0.24 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2g 51.19 0.52 1 -FEP_p38a_2o-p38a_2c 47.92 nan 9 -FEP_p38a_2ee-p38a_2aa -20.73 0.33 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2ff 42.54 0.64 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2bb -62.83 0.47 1 -FEP_p38a_2j-p38a_2c 5.16 0.59 3 -FEP_p38a_2n-p38a_2ee -11.23 0.42 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2f 62.71 0.76 3 -FEP_p38a_2p-p38a_2g 68.39 1.14 3 -FEP_p38a_2p-p38a_2gg -25.77 0.84 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2j -6.79 0.31 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2m 83.61 0.72 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2i -2.95 0.39 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2c 67.36 nan 9 -FEP_p38a_2j-p38a_2bb -49.50 0.24 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2aa -34.22 0.45 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2bb -32.47 0.19 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2aa 15.59 0.73 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -21.91 0.32 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2ee 58.21 0.53 2 -FEP_p38a_2h-p38a_2bb -55.17 0.28 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2gg -87.68 0.25 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2bb 10.14 0.75 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2f -1.44 0.31 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2k -24.15 0.61 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2bb -52.76 0.33 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2k -30.43 0.19 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2f 47.24 0.82 1 -FEP_p38a_2c-p38a_2aa -32.45 1.13 2 -FEP_p38a_2j-p38a_2e 0.10 0.21 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2ff 26.80 0.79 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2gg -92.62 0.17 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2g -6.21 0.22 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2h -7.02 0.22 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 4.63 0.36 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2e -6.12 0.12 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2e 16.62 0.17 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2aa -27.89 0.31 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2ee 38.52 0.57 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2aa -10.25 0.39 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2ee 11.64 0.30 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2l 77.43 0.43 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2e -2.69 0.17 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2gg -100.96 0.11 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2ee -10.37 0.81 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2bb -32.86 0.33 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2gg -90.37 0.27 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2c 22.54 0.81 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2gg -44.27 0.92 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2ee -27.34 0.27 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2ff -19.66 0.30 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2h 50.61 0.80 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2ff -22.13 0.24 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2aa -40.30 0.33 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2c -0.98 1.17 3 -FEP_p38a_2n-p38a_2f -1.34 0.48 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2j 61.63 0.79 1 -FEP_p38a_2o-p38a_2m 64.58 0.63 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2ee 52.73 0.89 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2h 3.23 0.24 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2e -4.94 0.14 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2bb -49.55 0.22 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2n 49.42 0.27 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2aa -9.85 0.36 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2g 6.81 0.22 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2e -13.51 0.39 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2h -14.92 0.53 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2e 87.54 0.20 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2g 94.82 0.13 0 -FEP_p38a_2c-p38a_2bb -53.67 1.04 3 -FEP_p38a_2o-p38a_2l 57.48 0.43 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2h 1.65 0.23 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2i 20.23 0.22 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2e 57.46 0.76 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2f -8.97 0.23 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2bb -4.86 0.59 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2c 93.63 1.06 2 -FEP_p38a_2m-p38a_2ff -37.70 0.20 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2aa 60.21 0.36 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2g 0.78 0.14 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2l 7.93 0.26 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2c 11.95 0.69 3 -FEP_p38a_2f-p38a_2bb -54.10 0.28 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2e -5.69 0.42 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ee 81.59 0.15 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2ee -19.32 0.31 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2k 45.30 1.17 4 -FEP_p38a_2k-p38a_2h 22.97 0.34 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -2.54 0.16 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2i 2.67 0.09 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2o 19.22 0.20 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2e -21.15 0.30 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2i -10.95 0.22 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2gg -108.48 0.28 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2e 17.56 0.29 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2f 2.02 0.23 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -39.03 0.43 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2j 42.44 1.34 1 -FEP_p38a_2bb-p38a_2aa 22.21 0.71 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2c -1.53 0.32 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2g 1.79 0.43 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2c -18.16 1.10 2 -FEP_p38a_2k-p38a_2g 24.02 0.21 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2gg -92.70 0.25 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2e 43.95 0.49 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2ff -30.34 0.19 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2ff 46.13 0.68 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2e 63.72 0.76 3 -FEP_p38a_2m-p38a_2l -7.57 0.18 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2aa -30.07 0.62 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2ee -13.13 0.41 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2ee 11.29 0.26 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2c -1.05 0.72 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2bb -12.62 0.55 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -18.28 0.32 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2i 17.88 0.70 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2e 6.12 0.23 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2x 25.29 0.29 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2f 4.07 0.21 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2s -6.95 1.08 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2j 45.50 0.48 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -44.47 0.57 2 -FEP_p38a_2x-p38a_2e 11.58 0.31 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2s 18.43 0.63 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2aa -21.47 0.40 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -64.23 0.75 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2q -59.59 0.84 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -13.05 0.38 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2x -11.40 0.29 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2y -46.56 0.57 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2p -57.52 0.59 3 -FEP_p38a_2v-p38a_2ff -10.68 0.44 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2q -44.50 0.50 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2u 5.95 0.19 8 -FEP_p38a_2x-p38a_2v 3.52 0.24 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2c 16.45 0.51 1 -FEP_p38a_2x-p38a_2q -48.57 0.59 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2t -0.37 0.65 2 -FEP_p38a_2y-p38a_2t 5.83 0.53 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2q -49.73 1.05 5 -FEP_p38a_2v-p38a_2gg -79.78 0.92 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2q -15.71 0.32 1 -FEP_p38a_2x-p38a_2i 13.98 0.34 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2f 10.96 0.31 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2s 27.28 0.71 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ff 19.79 0.28 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2c 2.82 1.01 3 -FEP_p38a_2v-p38a_2r -18.19 0.80 2 -FEP_p38a_3fln-p38a_2aa -27.84 0.47 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2o -28.16 0.84 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2x 5.70 0.41 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2r -15.30 0.60 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2u -19.84 1.36 5 -FEP_p38a_2z-p38a_2bb -34.34 0.75 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2f 15.69 0.36 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2gg -50.79 0.21 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2ee 1.49 1.04 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2ee 9.97 0.43 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2g 22.26 0.83 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2h 5.85 0.22 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2l 58.59 0.59 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.72 0.19 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -88.68 0.29 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2k -6.61 0.36 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2t -2.87 0.32 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2f 40.24 0.27 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2g 51.73 0.54 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ee -6.78 0.25 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2k -10.49 0.36 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2r 10.80 0.51 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2bb -37.81 0.39 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2k 26.99 0.77 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -22.24 0.47 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2o -6.25 1.06 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -0.71 0.16 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2u nan nan 10 -FEP_p38a_2u-p38a_2p -26.48 0.49 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2m 58.78 0.75 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2s -2.53 1.15 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2h 17.34 0.32 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2c 11.35 0.91 4 -FEP_p38a_2z-p38a_2m 37.46 0.52 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2m 65.98 0.68 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2l 29.70 0.46 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ff -5.69 0.37 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2l 13.00 0.16 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2aa 15.88 0.34 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2i 39.51 0.21 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2h 12.03 0.38 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2r 20.38 0.96 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2i 47.81 0.55 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2e 36.08 0.27 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2x 33.31 0.77 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2h 41.71 0.31 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2j 14.74 0.41 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2s 18.71 0.77 1 -FEP_p38a_2x-p38a_2m 32.22 0.55 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2u -0.49 0.80 5 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.61 0.18 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2n 43.85 0.53 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2q -21.80 0.88 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2n 21.11 0.65 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2ff 29.23 0.24 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2m 58.70 0.50 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2p -17.39 0.98 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2g 13.81 0.28 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2o 0.66 0.81 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2bb -4.93 0.57 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2gg -77.00 0.34 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2bb -50.42 0.37 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2o -32.00 1.04 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2j -0.71 0.20 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2t -32.80 0.23 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2t -24.32 0.69 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2g 43.17 0.36 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2p -26.61 0.85 2 -FEP_p38a_2x-p38a_2g 17.59 0.42 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2v -7.79 0.51 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2r 11.25 0.66 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 5.02 0.28 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2k 18.58 0.27 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2n 41.74 0.31 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2gg -72.94 0.52 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2n 51.23 0.55 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2l 50.03 0.29 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2o -6.92 0.92 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2f 49.88 0.25 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2k 23.76 nan 9 -FEP_p38a_2y-p38a_2e 45.19 0.35 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2c 51.11 0.71 3 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 5.96 0.09 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2n 12.54 0.94 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2h 21.32 0.55 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2s -12.74 0.81 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2gg -43.39 0.35 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2c 19.04 0.44 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2m 28.66 0.62 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2o -35.92 0.93 1 -FEP_p38a_2x-p38a_2p -53.90 0.43 3 -FEP_p38a_3flq-p38a_2y -7.59 0.64 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2l 24.28 0.27 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2r -7.68 0.89 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2v 29.31 0.69 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2aa 9.53 0.59 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2n 16.58 0.27 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2j 10.65 0.53 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -26.48 0.36 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2v 38.38 0.55 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 5.60 0.25 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2p -47.08 0.96 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2ee 39.41 0.47 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -41.99 0.43 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2v 8.49 0.53 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2i 9.63 0.42 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 1.82 0.15 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2u -36.84 1.00 6 -FEP_p38a_3flq-p38a_2j 36.33 0.37 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2ff -2.65 0.69 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ee 4.97 0.36 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2e 13.45 0.57 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2aa -17.15 0.47 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2z -15.55 0.64 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -19.35 0.47 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2m 20.18 0.27 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2c 42.59 0.86 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2l 20.14 0.21 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2k -2.10 0.60 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2l 52.20 0.29 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -27.69 0.33 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ee 30.96 0.22 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2f 20.29 0.51 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2u -27.71 nan 9 -FEP_p38a_2x-p38a_2t -27.88 0.31 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2z 20.30 0.49 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2h 50.65 0.89 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2z -20.26 0.64 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2p -64.89 0.83 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ee -7.40 0.25 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2gg -91.78 0.19 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2f -1.70 0.37 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2l 7.04 0.29 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2gg -93.30 0.24 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fln -4.56 0.24 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2j -6.96 0.27 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2q -64.04 0.72 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2o -43.89 1.27 3 -FEP_p38a_3fly-p38a_2z -16.30 0.62 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2t -44.13 0.36 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2gg -92.32 0.33 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flq -41.39 0.45 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2v -12.72 0.60 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2e -1.16 0.13 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2i -0.59 0.18 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2u -37.00 0.93 7 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2z -17.89 0.80 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2aa -29.33 0.50 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2k -21.35 0.29 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2y -49.81 0.46 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2l 9.10 0.41 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2s -24.85 0.71 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2bb -54.39 0.67 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_3fln -4.51 0.20 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2u -42.09 0.72 5 -FEP_p38a_3flw-p38a_2e -5.66 0.17 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2q -62.68 0.77 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2f -2.25 0.73 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2u -39.22 0.77 8 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2e -6.24 0.47 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_3fln 37.43 0.29 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2n 0.96 0.34 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ee -8.55 0.58 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fmh 2.39 0.61 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2q -59.27 1.05 3 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -12.25 0.24 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2i 2.02 0.28 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2j -3.80 0.21 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2t -43.05 0.23 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ee -11.82 0.38 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fly -2.15 0.15 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.54 0.15 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2aa -31.17 0.39 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2t -40.09 0.31 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2z -20.71 0.67 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2k -22.78 0.29 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2gg -92.32 0.53 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2i -3.15 0.41 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2s -24.07 0.62 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2p -67.88 0.63 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2f 1.11 0.12 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2m 18.07 0.26 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2x -13.45 0.35 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_3flq -41.24 0.48 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2y -48.94 0.42 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2aa -32.06 0.50 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2h -1.03 0.23 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2f 0.48 0.41 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2j -1.60 0.23 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flw 2.05 0.25 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2p -64.37 1.08 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2i -1.94 0.28 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2u -43.64 0.51 6 -FEP_p38a_3fly-p38a_2bb -51.12 0.18 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2m 17.17 0.38 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2g 1.31 0.30 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2r -29.81 0.53 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2x -14.55 0.40 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ee -9.60 0.35 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2s -23.66 0.47 2 -FEP_p38a_3flw-p38a_2m 16.50 0.38 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2k -18.97 0.29 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2f 3.09 0.25 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2q -60.53 0.83 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flz 0.46 0.71 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2o -47.89 1.25 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2j -4.30 0.51 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2n 1.42 0.44 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ff -22.54 0.26 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flw -1.06 0.29 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2n 2.32 0.33 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2r -29.56 0.52 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fln -2.48 0.58 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2r -31.19 0.45 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2l 10.34 0.28 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2p -67.95 0.66 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2h 2.25 0.22 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2t -43.43 0.19 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2c 4.80 0.39 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2m 20.06 0.18 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2bb -54.82 0.23 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ff -21.90 0.21 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2c -0.86 0.98 5 -FEP_p38a_3flw-p38a_2j -5.80 0.31 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -37.52 0.68 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flq -42.18 0.59 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2c 1.67 0.85 2 -FEP_p38a_3fly-p38a_2y -45.12 0.47 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flw 4.13 0.42 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2v -7.92 0.17 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2aa -31.24 0.57 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2h 4.89 0.20 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2l 8.36 0.29 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2e -3.66 0.16 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fln -0.45 0.11 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2n -0.07 0.46 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2z -18.17 0.78 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ee -11.20 0.56 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2x -17.17 0.29 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2q -64.81 1.22 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2e -3.40 0.34 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2r -25.27 0.79 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2h 0.18 0.36 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2v -9.65 0.62 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2m 15.02 0.29 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2g 3.01 0.38 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2y -47.86 0.74 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2r -32.07 0.63 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fly -1.61 0.32 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2k -23.32 0.31 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2aa -33.57 0.40 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2n 4.03 0.39 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ff -22.50 0.42 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2v -10.33 0.39 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flq -39.89 0.27 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2i -2.44 0.16 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2s -19.50 0.72 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2o -48.98 0.87 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2g 5.77 0.20 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2k -21.11 0.57 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2o -47.37 0.72 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2h 2.45 0.60 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fly -5.04 0.48 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2l 11.94 0.28 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flz -2.27 0.23 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c 2.54 0.57 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2bb -53.54 0.48 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ff -18.34 0.25 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2o -47.16 0.68 2 -FEP_p38a_3flw-p38a_2x -15.20 0.34 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2u -42.35 0.32 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_2bb -52.67 0.34 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2s -22.68 0.76 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2gg -89.40 0.27 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2y -49.94 0.58 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fln -2.71 0.17 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ff -20.54 0.13 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2p -66.28 0.87 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2t -44.70 0.17 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2c -0.42 0.90 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2v -13.36 0.67 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2g 0.65 0.20 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flw 1.86 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/water.txt deleted file mode 100755 index 954a9b50..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/OPLS2015/8.p38/water.txt +++ /dev/null @@ -1,562 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a_2t-p38a_2ff 22.80 0.12 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2h 30.48 0.91 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2l 33.81 0.73 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2p -24.49 0.18 1 -FEP_p38a_2q-p38a_2m 80.82 0.44 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2j 17.36 0.59 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2g 47.41 0.17 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2m 40.99 0.68 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2p -42.81 0.72 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2k -0.43 0.67 1 -FEP_p38a_2q-p38a_2j 57.61 0.50 1 -FEP_p38a_2t-p38a_2q -18.86 0.42 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2r 12.92 0.17 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2c 44.74 0.71 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2l 73.04 0.18 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2bb -10.33 0.17 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2j 39.25 0.18 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2ee 19.85 0.18 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2p -5.04 0.35 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2gg -61.96 0.27 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2l 40.89 0.25 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2c 32.54 0.86 7 -FEP_p38a_2t-p38a_2h 44.42 0.14 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2c 38.85 nan 9 -FEP_p38a_2t-p38a_2i 43.70 0.20 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2bb -24.71 0.47 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2r -7.48 0.42 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2h 39.48 0.81 5 -FEP_p38a_2t-p38a_2n 45.61 0.12 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2e 17.60 0.37 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2l 53.95 0.08 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2aa -10.05 0.78 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2e 34.93 0.93 6 -FEP_p38a_2u-p38a_2f 37.33 0.32 8 -FEP_p38a_2q-p38a_2k 37.09 0.23 7 -FEP_p38a_2r-p38a_2ff 8.80 0.53 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2k 21.72 0.14 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2h 23.43 0.44 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2f 28.31 0.43 1 -FEP_p38a_2r-p38a_2n 32.60 0.20 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2o -5.52 0.28 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2bb -12.12 nan 9 -FEP_p38a_2t-p38a_2ee 33.52 0.18 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2o -18.75 0.26 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ee 12.53 0.34 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2o -22.87 0.73 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2h 62.71 0.86 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2aa 9.45 0.90 5 -FEP_p38a_2t-p38a_2f 41.83 0.16 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2i 62.74 0.57 2 -FEP_p38a_2r-p38a_2i 29.25 0.52 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2gg -52.22 0.87 5 -FEP_p38a_2r-p38a_2g 34.18 0.46 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2j 25.52 0.53 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2q -38.83 0.53 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2n 28.41 0.40 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2m 61.67 0.16 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2bb -31.60 0.38 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2p -37.28 0.27 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2g 26.12 0.24 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2aa -2.86 0.79 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2gg -69.71 0.39 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2i 34.89 nan 9 -FEP_p38a_2s-p38a_2i 22.78 0.59 1 -FEP_p38a_2s-p38a_2f 21.07 0.45 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2s 19.83 0.57 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2aa 11.34 0.54 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2m 48.31 0.37 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2g 42.00 0.99 6 -FEP_p38a_2q-p38a_2o 13.04 0.17 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2ff 1.18 0.36 0 -FEP_p38a_2t-p38a_2e 39.20 0.11 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2ff 17.45 0.92 4 -FEP_p38a_2u-p38a_2j 31.02 nan 9 -FEP_p38a_2r-p38a_2k 7.29 0.53 3 -FEP_p38a_2r-p38a_2q -31.59 0.25 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2ee 30.07 0.70 5 -FEP_p38a_2t-p38a_2gg -48.87 0.10 0 -FEP_p38a_2r-p38a_2e 25.76 0.60 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2n 64.87 0.25 0 -FEP_p38a_2s-p38a_2c 22.67 1.44 3 -FEP_p38a_2k-p38a_2ff 1.04 0.17 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2aa -32.19 0.49 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2f 19.00 0.15 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2f 19.92 0.23 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2c 62.51 0.56 7 -FEP_p38a_2j-p38a_2h 6.23 0.06 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2bb 12.34 1.03 1 -FEP_p38a_2ee-p38a_2bb -43.71 0.32 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2g -13.90 0.25 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2h 66.74 1.03 1 -FEP_p38a_2g-p38a_2bb -58.28 0.15 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2c 3.26 0.28 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2f 65.29 0.86 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ff 71.56 0.08 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2k 25.29 0.78 4 -FEP_p38a_2i-p38a_2g 4.14 0.09 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2ff -21.67 0.11 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2j -14.82 0.15 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2c -7.11 0.36 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2ff -24.72 0.12 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2ff -16.15 0.11 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2bb -72.44 0.24 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2i 46.75 0.79 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2aa -33.63 0.44 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2j 17.48 0.12 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2ee -11.45 0.29 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2g 66.21 0.87 2 -FEP_p38a_2ee-p38a_2e 5.82 0.30 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2c 24.43 0.42 1 -FEP_p38a_2q-p38a_2aa 28.30 1.00 2 -FEP_p38a_2gg-p38a_2bb 38.47 0.20 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2ee -10.14 0.29 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2c 6.14 0.31 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2bb -56.27 0.19 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2f -19.64 0.27 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2m 16.12 0.23 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2aa -50.75 0.56 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2f 91.31 0.34 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2aa -30.49 0.61 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2aa -28.59 0.74 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2c 4.67 0.17 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2aa 34.38 0.76 1 -FEP_p38a_2k-p38a_2gg -70.45 0.20 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2e -8.39 0.10 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2i 63.93 0.72 3 -FEP_p38a_2j-p38a_2ee -5.43 0.23 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2gg -31.46 0.72 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2n 70.02 0.25 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2i -18.28 0.29 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2g 52.20 0.71 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2c 51.21 0.91 6 -FEP_p38a_2ee-p38a_2aa -22.66 1.03 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2ff 41.03 0.57 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2bb -64.85 0.14 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2c 7.44 0.29 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2ee -12.41 0.22 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2f 59.90 0.83 1 -FEP_p38a_2p-p38a_2g 68.61 0.62 2 -FEP_p38a_2p-p38a_2gg -25.99 0.71 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2j -6.71 0.22 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2m 85.22 0.22 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2i -2.78 0.23 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2c 69.67 0.99 8 -FEP_p38a_2j-p38a_2bb -49.90 0.19 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2aa -36.46 0.61 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2bb -33.11 0.15 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2aa 16.18 0.71 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2j -22.94 0.23 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2ee 55.41 0.78 2 -FEP_p38a_2h-p38a_2bb -55.13 0.16 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2gg -87.86 0.25 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2bb 8.93 0.60 2 -FEP_p38a_2h-p38a_2f -2.22 0.08 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2k -24.26 0.35 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2bb -54.10 0.25 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2k -32.15 0.11 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2f 45.48 0.87 2 -FEP_p38a_2c-p38a_2aa -32.83 0.73 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2e 0.40 0.15 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2ff 27.49 0.96 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2gg -94.75 0.19 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2g -6.25 0.13 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2h -9.37 0.18 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2f 3.15 0.19 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2e -5.03 0.07 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2e 16.04 0.18 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2aa -27.42 0.43 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2ee 37.96 0.77 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2aa -11.13 0.56 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2ee 11.73 0.22 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2l 77.86 0.41 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2e -4.16 0.12 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2gg -102.72 0.05 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2ee -8.33 0.27 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2bb -32.16 0.14 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2gg -92.43 0.25 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2c 22.28 0.58 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2gg -43.27 0.56 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2ee -28.48 0.10 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2ff -20.87 0.15 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2h 48.61 0.85 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2ff -22.71 0.16 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2aa -42.83 0.48 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2c -1.58 0.88 5 -FEP_p38a_2n-p38a_2f -3.93 0.18 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2j 62.24 0.83 1 -FEP_p38a_2o-p38a_2m 67.21 0.39 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2ee 52.59 0.33 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2h 1.86 0.12 0 -FEP_p38a_2f-p38a_2e -2.72 0.08 0 -FEP_p38a_2e-p38a_2bb -49.99 0.20 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2n 50.48 0.20 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2aa -11.01 0.62 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2g 8.63 0.15 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2e -14.89 0.20 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2h -17.49 0.24 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2e 88.39 0.15 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2g 97.06 0.19 0 -FEP_p38a_2c-p38a_2bb -56.35 0.64 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2l 59.26 0.20 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2h -1.55 0.18 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2i 21.56 0.25 0 -FEP_p38a_2q-p38a_2e 57.16 0.74 3 -FEP_p38a_2l-p38a_2f -12.01 0.22 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2bb -5.98 0.59 3 -FEP_p38a_2gg-p38a_2c 95.17 0.72 1 -FEP_p38a_2m-p38a_2ff -38.87 0.17 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2aa 59.99 0.33 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2g 3.16 0.08 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2l 8.39 0.15 0 -FEP_p38a_2ee-p38a_2c 12.59 0.66 2 -FEP_p38a_2f-p38a_2bb -52.74 0.20 0 -FEP_p38a_2n-p38a_2e -6.81 0.14 0 -FEP_p38a_2gg-p38a_2ee 82.15 0.12 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2ee -20.50 0.14 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2k 45.16 0.53 6 -FEP_p38a_2k-p38a_2h 22.67 0.17 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2f -5.76 0.08 0 -FEP_p38a_2j-p38a_2i 4.40 0.07 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2o 18.01 0.32 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2e -22.53 0.23 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2i -10.63 0.21 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2gg -110.61 0.16 0 -FEP_p38a_2k-p38a_2e 17.45 0.19 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2f -1.20 0.13 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2k -39.68 0.11 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2j 43.76 0.66 3 -FEP_p38a_2bb-p38a_2aa 22.89 0.47 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2c -2.02 0.73 1 -FEP_p38a_2n-p38a_2g 1.70 0.25 0 -FEP_p38a_2m-p38a_2c -15.03 0.42 2 -FEP_p38a_2k-p38a_2g 26.12 0.28 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2gg -93.08 0.26 0 -FEP_p38a_2o-p38a_2e 43.76 0.58 0 -FEP_p38a_2l-p38a_2ff -31.18 0.13 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2ff 45.31 0.78 0 -FEP_p38a_2p-p38a_2e 63.10 0.38 3 -FEP_p38a_2m-p38a_2l -7.96 0.22 0 -FEP_p38a_2i-p38a_2aa -32.02 0.58 0 -FEP_p38a_2g-p38a_2ee -14.04 0.27 0 -FEP_p38a_2ff-p38a_2ee 10.42 0.13 0 -FEP_p38a_2h-p38a_2c 2.71 0.31 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2bb -13.08 0.28 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2k -19.10 0.26 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2i 19.36 0.72 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2e 7.81 0.24 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2x 26.39 0.31 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2f 1.57 0.06 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2s -6.72 0.48 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2j 45.80 0.51 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2o -46.21 0.44 1 -FEP_p38a_2x-p38a_2e 10.62 0.22 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2s 18.01 0.45 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2aa -20.16 0.45 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2p -64.13 0.49 3 -FEP_p38a_3fln-p38a_2q -59.57 0.61 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2aa -13.99 0.53 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2x -11.91 0.24 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2y -47.19 0.31 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2p -54.34 0.61 4 -FEP_p38a_2v-p38a_2ff -8.76 0.26 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2q -42.65 1.26 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2u 9.00 nan 9 -FEP_p38a_2x-p38a_2v 2.53 0.25 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2c 17.25 0.85 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2q -46.46 0.96 2 -FEP_p38a_2u-p38a_2t -3.23 0.38 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2t 6.95 0.51 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2q -49.61 1.01 6 -FEP_p38a_2v-p38a_2gg -80.20 0.50 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2q -12.30 0.49 2 -FEP_p38a_2x-p38a_2i 15.28 0.34 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2f 10.50 0.16 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2s 28.13 0.85 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ff 19.76 0.34 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2c 3.61 0.91 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2r -16.25 0.56 4 -FEP_p38a_3fln-p38a_2aa -28.10 0.23 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2o -30.02 0.91 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2x 5.86 0.63 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2r -14.66 0.58 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2u -20.92 1.14 7 -FEP_p38a_2z-p38a_2bb -35.44 0.58 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2f 13.33 0.26 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2gg -51.59 0.32 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2ee 3.85 0.78 2 -FEP_p38a_2z-p38a_2ee 9.95 0.67 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2g 23.74 0.81 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2h 4.19 0.05 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2l 60.70 0.53 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ff -17.45 0.15 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2gg -89.47 0.32 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2k -6.83 0.42 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2t -2.98 0.26 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2f 39.56 0.23 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2g 55.35 0.22 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2ee -6.78 0.15 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2k -9.81 0.28 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2r 11.55 0.82 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2bb -37.73 0.33 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2k 28.49 0.44 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2q -22.84 0.31 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2o -8.55 0.48 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2e -1.23 0.06 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2u nan nan 10 -FEP_p38a_2u-p38a_2p -27.61 0.93 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2m 58.92 0.53 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2s -3.68 0.92 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2h 16.15 0.28 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2c 15.44 0.57 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2m 36.57 0.77 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2m 68.38 0.44 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2l 29.34 0.79 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ff -5.14 0.45 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2l 13.78 0.13 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2aa 15.69 0.15 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2i 40.50 0.31 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2h 13.06 0.23 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2r 18.99 0.64 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2i 49.98 0.28 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2e 36.70 0.15 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2x 35.02 1.12 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2h 41.00 0.33 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2j 15.91 0.79 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2s 16.85 0.64 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2m 34.02 0.27 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2u -0.32 0.69 5 -FEP_p38a_3fln-p38a_2t -40.51 0.17 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2n 42.24 0.50 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2q -20.04 1.11 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2n 22.64 0.68 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2ff 30.65 0.24 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2m 59.15 0.32 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2p -16.62 0.74 2 -FEP_p38a_2v-p38a_2g 16.33 0.21 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2o 0.47 0.60 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2bb -3.57 0.58 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2gg -77.11 0.31 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2bb -51.09 0.15 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2o -33.18 0.79 1 -FEP_p38a_3fln-p38a_2j -1.41 0.13 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2t -31.63 0.21 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2t -24.28 0.76 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2g 45.21 0.12 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2p -26.61 0.79 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2g 19.58 0.29 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2v -9.20 0.43 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2r 10.76 0.22 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2n 5.43 0.27 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2k 19.00 0.20 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2n 42.79 0.41 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2gg -74.36 0.64 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2n 51.97 0.58 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2l 51.34 0.16 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2o -8.65 0.20 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2f 49.25 0.27 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2k 20.59 nan 9 -FEP_p38a_2y-p38a_2e 46.55 0.28 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2c 52.56 0.94 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2g 7.28 0.08 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2n 15.09 0.50 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2h 21.09 0.71 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2s -10.51 1.02 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2gg -42.78 0.78 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2c 22.97 0.74 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2m 31.35 0.60 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2o -35.50 0.87 3 -FEP_p38a_2x-p38a_2p -49.67 1.03 4 -FEP_p38a_3flq-p38a_2y -8.93 0.81 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2l 25.62 0.40 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2r -11.89 0.75 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2v 27.63 0.85 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2aa 9.21 0.34 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2n 17.49 0.51 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2j 10.86 0.26 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2r -25.96 0.85 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2v 37.79 0.48 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2j 7.75 0.33 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2p -46.94 0.83 1 -FEP_p38a_2y-p38a_2ee 40.88 0.74 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2bb -41.74 0.29 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2v 8.66 0.22 0 -FEP_p38a_2v-p38a_2i 11.77 0.14 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2i 3.19 0.09 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2u -34.83 0.27 7 -FEP_p38a_3flq-p38a_2j 36.03 0.18 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2ff -1.23 0.69 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2ee 5.65 0.26 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2e 16.26 0.68 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2aa -18.49 0.74 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2z -16.62 0.83 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2s -19.21 0.53 0 -FEP_p38a_3fln-p38a_2m 21.51 0.19 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2c 40.90 0.73 1 -FEP_p38a_2v-p38a_2l 22.66 0.16 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2k -2.77 0.73 0 -FEP_p38a_2u-p38a_2l 49.84 0.94 1 -FEP_p38a_2z-p38a_2y -28.73 0.38 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2ee 30.54 0.36 0 -FEP_p38a_2z-p38a_2f 18.75 0.80 0 -FEP_p38a_2x-p38a_2u -25.89 1.80 8 -FEP_p38a_2x-p38a_2t -28.82 0.30 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_2z 20.76 0.59 0 -FEP_p38a_2y-p38a_2h 51.56 0.15 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2z -20.78 0.44 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2p -70.02 0.42 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ee -6.65 0.68 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2gg -93.13 0.33 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2f -3.94 0.43 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2l 8.01 0.31 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2gg -94.70 0.32 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fln -5.54 0.14 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2j -6.84 0.40 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2q -64.30 0.48 4 -FEP_p38a_3fly-p38a_2o -44.23 0.89 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2z -17.26 0.56 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2t -46.03 0.22 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2gg -93.35 0.22 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flq -43.28 0.09 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2v -13.35 0.73 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2e -1.76 0.06 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2i -0.83 0.13 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2u -39.10 0.05 8 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2z -22.50 0.50 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2aa -30.76 0.52 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2k -22.16 0.23 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2y -51.14 0.71 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2l 7.56 0.21 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2s -24.90 0.60 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2bb -56.07 0.15 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_3fln -4.70 0.21 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2u -41.29 0.96 4 -FEP_p38a_3flw-p38a_2e -5.35 0.17 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2q -62.29 0.80 1 -FEP_p38a_3flw-p38a_2f -3.00 0.14 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2u -40.80 0.91 6 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2e -6.78 0.17 0 -FEP_p38a_3flq-p38a_3fln 37.68 0.20 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2n 1.27 0.21 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ee -12.37 0.30 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fmh -0.08 0.23 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2q -58.52 1.39 6 -FEP_p38a_3fly-p38a_2x -12.57 0.23 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2i 2.67 0.12 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2j -5.27 0.14 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2t -43.92 0.19 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ee -11.62 0.83 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fly -2.94 0.13 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2g 3.80 0.07 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2aa -33.60 0.61 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2t -40.87 0.16 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2z -22.47 0.59 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2k -22.95 0.26 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2gg -94.59 0.08 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2i -2.21 0.14 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2s -23.67 0.39 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2p -68.06 0.66 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2f -1.84 0.08 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2m 18.15 0.41 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2x -17.71 0.34 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_3flq -40.96 0.24 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2y -51.26 0.22 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2aa -33.78 0.64 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2h -1.24 0.13 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2f -4.12 0.15 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2j -1.58 0.10 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flw 0.53 0.17 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2p -63.78 0.84 3 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2i -2.56 0.17 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2u -41.27 1.00 8 -FEP_p38a_3fly-p38a_2bb -51.34 0.13 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2m 15.78 0.35 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2g 2.84 0.24 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2r -32.79 0.48 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2x -15.55 0.31 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ee -10.43 0.26 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2s -21.90 0.57 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2m 17.17 0.33 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2k -19.07 0.22 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2f 0.96 0.10 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2q -64.46 0.60 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flz -2.27 0.15 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2o -49.03 0.56 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2j -6.55 0.13 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2n -0.10 0.21 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2ff -23.46 0.23 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flw -1.15 0.35 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2n 2.04 0.28 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2r -30.96 0.56 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fln -5.62 0.19 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2r -31.45 0.26 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2l 9.99 0.19 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2p -67.24 0.93 2 -FEP_p38a_3flz-p38a_2h 0.19 0.07 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2t -44.50 0.25 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2c 4.59 0.42 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2m 20.98 0.19 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2bb -56.11 0.29 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ff -21.52 0.30 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2c -0.63 0.80 2 -FEP_p38a_3flw-p38a_2j -5.89 0.16 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flq -38.31 0.43 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flq -43.09 0.18 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2c -1.23 0.92 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2y -48.34 0.26 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3flw 3.85 0.22 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2v -9.43 0.11 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2aa -35.95 0.79 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2h 3.75 0.08 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2l 9.49 0.26 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2e -4.72 0.08 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_3fln -0.57 0.09 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2n 0.22 0.27 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2z -20.31 0.70 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2ee -10.38 0.21 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2x -18.17 0.19 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2q -62.80 0.73 2 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2e -6.90 0.14 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2r -27.42 0.40 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2h -0.27 0.22 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2v -14.87 0.28 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2m 15.85 0.30 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2g 1.46 0.25 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2y -52.15 0.73 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2r -32.93 0.31 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3fly -5.20 0.17 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2k -24.09 0.25 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2aa -34.62 0.65 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2n 5.93 0.31 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2ff -23.21 0.25 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2v -12.21 0.19 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3flq -40.43 0.70 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2i -1.44 0.22 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2s -19.41 0.81 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2o -50.80 0.35 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2g 6.81 0.09 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2k -23.89 0.20 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2o -47.67 0.78 1 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2h -1.10 0.12 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3fly -5.24 0.20 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2l 12.92 0.14 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_3flz -2.07 0.21 1 -FEP_p38a_3flz-p38a_2c 1.98 0.45 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2bb -54.96 0.31 0 -FEP_p38a_3fly-p38a_2ff -18.20 0.16 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2o -50.80 0.88 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2x -15.86 0.27 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2u -39.55 1.20 5 -FEP_p38a_3flz-p38a_2bb -54.60 0.16 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_2s -24.00 0.87 1 -FEP_p38a_3fly-p38a_2gg -90.22 0.34 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2y -52.61 0.73 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_3fln -3.67 0.08 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2ff -20.98 0.13 0 -FEP_p38a_3flz-p38a_2p -66.73 0.40 1 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2t -45.90 0.30 0 -FEP_p38a_3flw-p38a_2c 1.48 0.41 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2v -15.23 0.42 0 -FEP_p38a_3fmh-p38a_2g 1.99 0.18 0 -FEP_p38a_3fmk-p38a_3flw -1.20 0.40 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index c7df038f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,66 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-17i_CAT-17g 16.53 0.44 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13i 9.96 0.15 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -0.21 0.27 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -8.80 0.14 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b -18.23 0.30 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j -6.73 0.37 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -3.66 0.21 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -76.00 0.23 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 78.71 0.25 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13c 7.84 0.18 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 16.35 0.20 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17b -8.15 0.23 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b -2.81 0.75 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13b 2.39 0.12 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4o 25.22 0.23 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13h 18.02 0.84 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -3.30 0.16 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13i -2.19 0.60 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13o -1.83 0.31 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -70.86 0.26 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4p 14.13 0.17 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -17.42 0.25 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4d -2.77 0.23 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 11.35 0.12 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -14.27 0.62 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13k -12.82 0.39 0 -FEP_CAT-17i_CAT-24 -2.45 0.62 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13c 10.46 0.39 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 73.19 0.27 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17e 17.95 0.12 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m 8.99 0.18 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17a -7.38 0.57 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -4.86 0.50 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4c -10.21 0.45 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -5.40 0.42 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -7.67 0.37 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 13.39 0.08 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -3.14 0.23 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -2.27 0.61 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4d -17.40 0.37 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13h 2.86 0.58 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 28.61 0.30 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13d 3.22 0.41 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13n -10.19 0.16 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17c -0.94 0.47 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -12.75 0.29 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 74.28 0.33 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 4.94 0.11 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 17.62 0.15 0 -FEP_CAT-17f_CAT-4n -0.66 0.33 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -81.24 0.32 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4a 10.99 0.29 0 -FEP_CAT-13f_CAT-17a -1.85 0.51 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4n -5.25 0.31 0 -FEP_CAT-13k_CAT-4p 21.70 0.20 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4j -15.04 0.21 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a 14.28 0.19 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17h -0.08 0.19 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13e -4.53 0.89 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13n -92.96 0.44 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13e 2.04 0.76 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17i 9.76 0.53 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 18.63 0.68 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17f -27.57 0.69 0 -FEP_CAT-17e_CAT-24 -20.19 0.56 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index c436b2ce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-13k-CAT-4p 21.70 0.20 0 -FEP_CAT-4a-CAT-4j -15.04 0.21 0 -FEP_CAT-4b-CAT-4a 14.28 0.19 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17h -0.08 0.19 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/protein_nodisulf.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/protein_nodisulf.txt deleted file mode 100644 index b32afc40..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/protein_nodisulf.txt +++ /dev/null @@ -1,54 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-17i_CAT-17g 16.58 0.60 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13i 10.22 0.25 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e 0.25 0.21 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -8.75 0.08 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b -18.34 0.23 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j -6.86 0.29 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -3.48 0.21 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -75.04 0.35 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 78.19 0.27 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13c 7.49 0.17 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 16.35 0.15 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17b -8.28 0.44 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b -3.41 0.38 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13b 2.78 0.41 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13h 16.78 0.86 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -3.76 0.16 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13i -2.42 0.60 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13o -1.40 0.26 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -70.98 0.23 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -17.24 0.18 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4d -2.63 0.21 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 11.46 0.20 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -14.63 0.53 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13k -12.94 0.34 0 -FEP_CAT-17i_CAT-24 -2.40 0.60 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13c 10.37 0.34 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 73.84 0.35 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17e 18.19 0.31 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m 9.08 0.21 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17a -7.51 0.42 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -5.90 0.36 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4c -10.45 0.30 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -5.11 0.73 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -8.33 0.57 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 13.20 0.14 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -3.58 0.17 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -3.73 0.47 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4d -17.58 0.36 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13h 0.60 0.80 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 28.40 0.17 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13d 3.60 0.54 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13n -9.11 0.28 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17c -1.56 0.74 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -12.73 0.20 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 74.00 0.29 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 4.67 0.17 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 17.40 0.10 0 -FEP_CAT-17f_CAT-4n -0.52 0.19 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -80.25 0.27 0 -FEP_CAT-13f_CAT-17a -3.29 0.69 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4m -11.27 0.21 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4n -25.21 0.18 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4n -14.03 0.12 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 0aad4b2d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,66 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-13f_CAT-13d 3.92 0.12 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13i 9.51 0.07 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -8.61 0.07 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -6.36 0.13 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13h 13.13 0.14 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13c 7.56 0.08 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b 0.42 0.26 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17e 19.73 0.10 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -11.94 0.08 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 28.73 0.04 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -82.43 0.13 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17b -7.66 0.16 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 79.76 0.18 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13o -2.77 0.20 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m 9.00 0.12 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j -7.27 0.16 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4d -3.30 0.11 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4a 8.41 0.07 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13h 0.64 0.12 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4p 14.84 0.06 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -12.94 0.07 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13n -12.50 0.15 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 75.58 0.32 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b -18.84 0.08 0 -FEP_CAT-13f_CAT-17a -2.07 0.16 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e 0.09 0.10 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -2.92 0.06 0 -FEP_CAT-17i_CAT-24 1.43 0.09 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 16.98 0.11 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4o 24.29 0.13 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 11.36 0.10 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -69.99 0.05 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 15.00 0.06 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -17.36 0.08 0 -FEP_CAT-17f_CAT-4n -0.41 0.11 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -2.71 0.06 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13i -2.25 0.11 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -6.64 0.05 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -75.21 0.11 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -2.80 0.15 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 17.20 0.07 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -13.66 0.07 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13k -10.94 0.11 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 72.78 0.12 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17c 1.15 0.17 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17a -6.30 0.09 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 5.74 0.05 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4c -9.97 0.10 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13b 1.71 0.12 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13c 5.92 0.09 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4d -13.38 0.19 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 9.53 0.07 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -5.71 0.11 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4n -2.20 0.20 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4j -15.20 0.09 0 -FEP_CAT-13k_CAT-4p 23.10 0.23 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a 9.65 0.09 0 -FEP_CAT-4p_CAT-17h -1.63 0.06 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13e 2.13 0.09 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13n -93.64 0.18 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13e -3.92 0.09 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17f -27.16 0.14 0 -FEP_CAT-17e_CAT-24 -18.10 0.11 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 16.01 0.11 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17i 7.36 0.10 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index 9f8b8138..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-4a-CAT-4j -15.20 0.09 0 -FEP_CAT-13k-CAT-4p 23.10 0.23 0 -FEP_CAT-4b-CAT-4a 9.65 0.09 0 -FEP_CAT-4p-CAT-17h -1.63 0.06 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/water_nodisulf.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/water_nodisulf.txt deleted file mode 100644 index 158d4dd5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/1.BACE/no-vs/2fs/water_nodisulf.txt +++ /dev/null @@ -1,54 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-13f_CAT-13d 3.98 0.16 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13i 9.64 0.19 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -9.06 0.13 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -6.53 0.10 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13h 13.39 0.15 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13c 7.80 0.08 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b 0.59 0.22 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17e 19.64 0.10 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -11.84 0.11 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 28.74 0.06 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -82.29 0.23 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17b -7.87 0.09 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 80.00 0.16 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13o -2.30 0.13 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m 9.09 0.05 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j -7.41 0.16 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4d -3.16 0.19 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13h 0.48 0.12 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -13.04 0.13 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13n -12.30 0.15 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 75.33 0.22 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b -18.86 0.10 0 -FEP_CAT-13f_CAT-17a -2.17 0.17 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -0.01 0.03 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -2.84 0.06 0 -FEP_CAT-17i_CAT-24 1.27 0.12 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 17.04 0.08 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 11.28 0.07 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -69.72 0.07 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 15.12 0.09 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -17.42 0.11 0 -FEP_CAT-17f_CAT-4n -0.30 0.14 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -2.58 0.06 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13i -2.13 0.26 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -6.66 0.11 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -74.89 0.09 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -2.93 0.19 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 17.20 0.08 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -13.79 0.11 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13k -10.70 0.18 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 72.76 0.13 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17c 1.31 0.11 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17a -6.33 0.07 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 5.70 0.10 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4c -10.07 0.11 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13b 1.61 0.11 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13c 6.12 0.07 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4d -13.03 0.15 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 9.57 0.08 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -5.59 0.13 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4m -8.38 0.10 0 -FEP_CAT-4o_CAT-4n -24.15 0.13 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4n -14.57 0.09 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/2.CDK2/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/2.CDK2/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index ef6e95dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/2.CDK2/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,122 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_29_20 83.56 0.64 1 -FEP_31_28 -100.45 0.38 0 -FEP_22_17 7.66 nan 9 -FEP_22_1oi9 -11.17 0.91 8 -FEP_31_17 35.18 0.32 0 -FEP_28_21 121.73 0.63 4 -FEP_28_26 138.37 0.43 3 -FEP_1oi9_1h1r 12.67 0.56 0 -FEP_1oiy_1h1r 54.39 0.3 0 -FEP_29_1h1s -95.16 0.84 0 -FEP_30_28 -51.5 0.14 0 -FEP_26_20 nan nan 10 -FEP_31_26 33.58 0.27 0 -FEP_1oiy_17 59.6 0.49 0 -FEP_21_1oiu -132.39 0.12 7 -FEP_32_29 143.76 0.57 0 -FEP_32_28 96.84 0.82 0 -FEP_1h1q_17 -0.12 0.41 0 -FEP_22_1h1s nan nan 10 -FEP_30_1oiu -61.92 0.84 0 -FEP_28_1oiy 79.17 0.33 6 -FEP_26_1oiy -57.96 0.01 8 -FEP_28_20 130.33 0.25 5 -FEP_1oiy_1oiu -89.48 0.57 0 -FEP_1oiy_1h1q 58.57 0.3 0 -FEP_31_21 19.12 0.43 0 -FEP_29_17 91.37 0.51 4 -FEP_22_20 -1.01 0.77 6 -FEP_21_1h1s -170.14 0.28 3 -FEP_28_1h1r 134.02 0.14 8 -FEP_32_22 229.72 0.57 0 -FEP_20_1h1r 3.41 0.4 0 -FEP_29_1oi9 73.6 0.8 1 -FEP_1oiy_1oi9 41.07 0.27 0 -FEP_20_1h1q 7.49 0.17 0 -FEP_30_1h1q 85.98 0.28 0 -FEP_30_22 80.38 0.47 0 -FEP_31_1h1q 35.34 0.39 0 -FEP_29_22 84.07 0.7 0 -FEP_22_1oiu -141.87 0.84 8 -FEP_30_29 -5.98 0.18 0 -FEP_22_1oiy -51.08 0.68 7 -FEP_26_1h1s -185.52 0.63 0 -FEP_1oi9_1h1q 16.64 0.32 0 -FEP_31_22 28.74 0.4 0 -FEP_32_20 225.35 0.84 0 -FEP_29_1h1r 87.31 0.26 1 -FEP_26_1oi9 -15.49 0.28 0 -FEP_32_21 218.33 0.69 0 -FEP_30_17 86.8 0.31 0 -FEP_31_30 -49.08 0.36 0 -FEP_32_31 196.16 0.5 0 -FEP_32_1oiy 174.75 0.56 0 -FEP_22_1h1q 5.8 0.2 7 -FEP_26_1h1r -5.06 0.5 3 -FEP_29_1oiu -57.93 0.99 1 -FEP_30_1h1r 81.55 0.36 0 -FEP_1oi9_1h1s -169.92 0.45 0 -FEP_22_1h1r 1.75 0.06 8 -FEP_20_17 7.87 0.5 0 -FEP_21_1h1q 17.14 0.37 0 -FEP_26_1oiu -146.26 0.77 1 -FEP_28_1oi9 123.89 nan 9 -FEP_26_22 -3.96 nan 9 -FEP_1h1s_1h1r 182.02 0.63 0 -FEP_32_1oi9 216.81 1.18 0 -FEP_31_29 -54.47 0.37 0 -FEP_30_21 69.9 0.56 0 -FEP_31_1oi9 17.71 0.45 0 -FEP_31_1h1s -148.48 0.38 0 -FEP_20_1oi9 -9.1 0.28 0 -FEP_30_1oiy 27.43 0.25 0 -FEP_1oiu_1oi9 129.19 0.59 0 -FEP_1h1r_17 5.3 0.18 0 -FEP_20_1oiy -50.54 0.36 0 -FEP_21_1oiy -41 0.19 6 -FEP_31_1oiy -24.1 0.34 0 -FEP_21_1oi9 1.77 0.28 6 -FEP_20_1h1s -178.14 0.73 0 -FEP_32_1h1s 46.79 1.05 0 -FEP_31_20 26.05 0.51 0 -FEP_22_21 -11.09 0.46 5 -FEP_28_22 129.96 0.59 4 -FEP_31_1h1r 30.15 0.34 0 -FEP_28_1oiu nan nan 10 -FEP_30_26 85.55 0.28 0 -FEP_32_17 234.47 0.86 0 -FEP_30_20 77.98 0.49 0 -FEP_21_17 17.37 0.31 0 -FEP_1oiu_1h1r 143.72 0.57 0 -FEP_1h1r_1h1q 4.37 0.37 0 -FEP_1oi9_17 16.98 0.62 0 -FEP_28_17 139.6 0.16 7 -FEP_1h1s_1h1q 187.11 0.42 0 -FEP_1oiu_1h1s -41.18 1.16 0 -FEP_28_1h1q 138.95 nan 9 -FEP_26_21 -16.18 0.49 0 -FEP_1h1s_17 187.28 1.12 0 -FEP_31_1oiu -112.97 1.24 0 -FEP_32_1h1q 234.8 0.67 0 -FEP_32_1h1r 229.87 0.65 0 -FEP_29_26 90.84 0.48 0 -FEP_30_1h1s -100.14 0.46 0 -FEP_29_28 -45.22 0.09 0 -FEP_26_1h1q 1.78 0.2 7 -FEP_29_21 75.06 0.64 0 -FEP_30_1oi9 69.25 0.35 0 -FEP_29_1oiy 32.89 0.38 0 -FEP_28_1h1s -49.5 0.59 7 -FEP_26_17 0.98 0.53 8 -FEP_20_1oiu -139.65 0.78 0 -FEP_1oiy_1h1s -127.43 0.28 0 -FEP_1oiu_17 146.73 0.74 0 -FEP_32_26 234.23 0.55 0 -FEP_1oiu_1h1q 147.54 0.24 0 -FEP_21_20 8.92 0.46 8 -FEP_32_1oiu 86.62 1.16 0 -FEP_21_1h1r 11.83 0.23 0 -FEP_29_1h1q 93.23 0.32 2 -FEP_28_1oiu -10.70 1.21 0 -FEP_32_30 147.63 0.6 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/2.CDK2/no-vs/2fs/protein_jarnik.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/2.CDK2/no-vs/2fs/protein_jarnik.txt deleted file mode 100644 index 1f6509c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/2.CDK2/no-vs/2fs/protein_jarnik.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -100.07 0.79 0 -FEP_1oiy-22 51.99 0.40 0 -FEP_30-29 -5.82 0.25 0 -FEP_31-26 34.08 0.28 0 -FEP_30-31 48.70 0.15 0 -FEP_26-1oi9 -16.24 0.34 0 -FEP_1oi9-1oiy -41.03 0.32 0 -FEP_1h1s-1oiu 38.74 0.84 0 -FEP_21-22 10.88 0.24 0 -FEP_1h1q-1h1r -4.71 0.35 0 -FEP_1oiu-32 -87.57 0.72 0 -FEP_1oi9-1h1q 16.39 0.28 0 -FEP_28-29 45.62 0.20 0 -FEP_1h1r-20 -2.97 0.23 0 -FEP_30-28 -51.53 0.23 0 -FEP_1h1r-17 5.07 0.21 0 -FEP_26-21 -16.62 0.38 0 -FEP_1h1s-32 -46.75 0.76 0 -FEP_17-20 -8.50 0.31 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/2.CDK2/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/2.CDK2/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index f1fc4776..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/2.CDK2/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,122 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_20_17 5.23 0.17 0 -FEP_1h1s_17 183.7 0.47 0 -FEP_30_20 77.48 0.22 0 -FEP_1h1q_17 -2.15 0.1 0 -FEP_31_1oiy -20.71 0.17 0 -FEP_22_1h1q 9.47 0.07 0 -FEP_28_17 134.4 0.22 0 -FEP_28_21 118.08 0.23 0 -FEP_32_1oiy 179.4 0.58 0 -FEP_28_1h1q 136.02 0.37 0 -FEP_1oiy_1h1q 55.86 0.18 0 -FEP_31_1h1r 28.8 0.16 0 -FEP_1h1r_1h1q 6.01 0.14 0 -FEP_31_17 33.09 0.14 0 -FEP_26_20 -7.47 0.13 0 -FEP_32_1h1q 234.64 0.37 0 -FEP_32_28 98.47 0.55 0 -FEP_21_1oiu -125.62 0.28 0 -FEP_32_22 225.53 0.31 0 -FEP_26_21 -18.85 0.24 0 -FEP_29_20 82.79 0.59 0 -FEP_22_17 7.12 0.28 0 -FEP_32_29 144.43 0.52 0 -FEP_26_1h1r -6.34 0.2 0 -FEP_22_1h1r 3.58 0.14 0 -FEP_28_20 128.68 0.28 0 -FEP_30_1h1r 78.73 0.2 0 -FEP_31_1h1s -150.34 0.37 0 -FEP_29_22 82 0.36 0 -FEP_32_30 150.72 0.5 0 -FEP_30_21 66.23 0.15 0 -FEP_31_29 -56.39 0.26 0 -FEP_21_17 16.67 0.3 0 -FEP_20_1h1r 1.29 0.16 0 -FEP_31_1h1q 34.88 0.21 0 -FEP_30_1oiy 29.1 0.21 0 -FEP_22_21 -9.73 0.13 0 -FEP_20_1oiu -136.95 0.49 0 -FEP_26_1h1q -0.01 0.15 0 -FEP_29_1h1r 85.19 0.27 0 -FEP_26_1oi9 -14.25 0.14 0 -FEP_26_1oiy -55.62 0.16 0 -FEP_1oi9_1h1r 8.3 0.16 0 -FEP_29_1h1s -94.32 0.41 0 -FEP_29_1h1q 91.29 0.3 1 -FEP_26_22 -9.6 0.18 0 -FEP_32_31 200.66 0.71 0 -FEP_28_1oi9 121.73 0.36 0 -FEP_26_1oiu -145.68 0.74 0 -FEP_26_1h1s -185.43 0.34 0 -FEP_1oiy_1h1s -129.54 0.54 0 -FEP_1oi9_1h1s -171.67 0.64 0 -FEP_20_1h1s -178.58 0.39 0 -FEP_31_22 25.77 0.22 0 -FEP_32_26 235.68 0.65 0 -FEP_1oiu_1oi9 130.53 0.6 0 -FEP_21_1oiy -36.92 0.17 0 -FEP_29_1oiy 35.35 0.15 0 -FEP_22_1oiy -46.45 0.29 0 -FEP_1oi9_17 12.31 0.21 0 -FEP_1oiy_1oi9 41.14 0.11 0 -FEP_31_1oiu -109.45 0.38 0 -FEP_32_17 233.77 0.66 0 -FEP_1h1s_1h1r 179.64 0.36 0 -FEP_21_1h1q 18.94 0.16 0 -FEP_1h1s_1h1q 185.55 0.34 0 -FEP_30_26 84.79 0.22 0 -FEP_20_1oi9 -6.77 0.12 0 -FEP_30_1h1s -100.12 0.43 0 -FEP_28_1h1r 130.25 0.19 0 -FEP_20_1h1q 7.33 0.08 0 -FEP_32_21 215.9 0.29 0 -FEP_29_21 72.75 0.37 0 -FEP_28_1oiu -8.71 0.61 0 -FEP_22_1h1s -176 0.44 0 -FEP_30_1oi9 70.77 0.19 0 -FEP_1oi9_1h1q 14.06 0.1 0 -FEP_22_1oiu -135.32 0.66 0 -FEP_1oiu_1h1q 144.69 0.32 0 -FEP_29_26 90.83 0.29 0 -FEP_21_1h1r 12.68 0.17 0 -FEP_32_1h1s 50.5 0.67 0 -FEP_20_1oiy -48.01 0.13 0 -FEP_32_20 227.01 0.61 0 -FEP_30_17 82.87 0.12 0 -FEP_1oiu_1h1r 138.23 0.65 0 -FEP_21_1h1s -166.13 0.56 0 -FEP_29_28 -45.46 0.14 0 -FEP_1oiu_1h1s -41.97 0.43 0 -FEP_22_20 1.66 0.25 0 -FEP_32_1oiu 89.85 0.91 0 -FEP_28_1oiy 80.66 0.16 0 -FEP_28_22 126.31 0.29 0 -FEP_28_1h1s -49.05 0.63 0 -FEP_28_26 136.41 0.21 0 -FEP_30_29 -6.19 0.15 0 -FEP_1oiy_1oiu -89.36 0.58 0 -FEP_29_1oi9 77.1 0.41 0 -FEP_31_26 35.08 0.23 0 -FEP_31_30 -49.78 0.11 0 -FEP_1oiy_17 53.27 0.21 0 -FEP_21_20 10.93 0.43 0 -FEP_22_1oi9 -5.38 0.35 0 -FEP_32_1oi9 220.24 0.26 0 -FEP_30_1oiu -58.92 0.31 0 -FEP_1h1r_17 4.05 0.11 0 -FEP_32_1h1r 229.28 0.82 0 -FEP_31_28 -101.48 0.15 0 -FEP_21_1oi9 4.48 0.16 0 -FEP_30_1h1q 84.76 0.17 0 -FEP_1oiu_17 142.72 0.6 0 -FEP_26_17 -2.41 0.16 0 -FEP_1oiy_1h1r 49.53 0.18 0 -FEP_29_17 89.01 0.24 0 -FEP_31_21 16.33 0.22 0 -FEP_31_20 27.43 0.1 0 -FEP_30_28 -51.41 0.23 0 -FEP_30_22 75.75 0.19 0 -FEP_29_1oiu -54.48 0.81 0 -FEP_31_1oi9 20.78 0.21 0 -FEP_28_1oiu -7.87 0.49 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/2.CDK2/no-vs/2fs/water_jarnik.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/2.CDK2/no-vs/2fs/water_jarnik.txt deleted file mode 100644 index 6073f142..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/2.CDK2/no-vs/2fs/water_jarnik.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30-1h1s -99.75 0.44 0 -FEP_30-29 -6.59 0.38 0 -FEP_1oi9-1oiy -41.04 0.14 0 -FEP_1h1q-1h1r -6.39 0.26 0 -FEP_26-1oi9 -14.28 0.19 0 -FEP_28-29 45.64 0.15 0 -FEP_1oiu-32 -91.02 0.56 0 -FEP_1oi9-1h1q 14.00 0.12 0 -FEP_31-26 34.87 0.16 0 -FEP_1h1r-17 3.91 0.13 0 -FEP_1h1s-32 -49.27 0.52 0 -FEP_1h1r-20 -1.18 0.14 0 -FEP_30-28 -51.73 0.11 0 -FEP_1oiy-22 46.32 0.13 0 -FEP_26-21 -18.51 0.20 0 -FEP_21-22 9.54 0.12 0 -FEP_30-31 49.88 0.18 0 -FEP_17-20 -5.31 0.16 0 -FEP_1h1s-1oiu 41.13 0.43 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 83276736..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,36 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18629-1_18626-1 0.47 0.15 0 -FEP_18638-1_18652-1 -3.01 0.51 0 -FEP_18633-1_18632-1 -8.67 0.25 0 -FEP_18637-1_18639-1 63.48 0.20 0 -FEP_18627-1_18624-1 3.12 0.16 0 -FEP_18635-1_18630-1 0.39 0.30 0 -FEP_18630-1_18633-1 3.16 0.17 0 -FEP_17124-1_18638-1 -84.57 0.29 0 -FEP_18637-1_18638-1 -27.86 0.29 0 -FEP_18634-1_18631-1 11.06 0.22 0 -FEP_18631-1_18628-1 6.36 0.15 0 -FEP_18634-1_17124-1 4.18 0.24 0 -FEP_18658-1_18634-1 -5.78 0.40 0 -FEP_18659-1_18634-1 -11.85 0.27 0 -FEP_18628-1_18625-1 -3.62 0.24 0 -FEP_18628-1_18635-1 -4.34 0.29 0 -FEP_18624-1_18629-1 -5.30 0.11 0 -FEP_18630-1_18627-1 1.30 0.12 0 -FEP_18659-1_18658-1 -5.99 0.51 0 -FEP_17124-1_18639-1 6.66 0.12 0 -FEP_18631-1_18625-1 1.69 0.38 0 -FEP_17124-1_18652-1 -88.73 0.80 0 -FEP_18627-1_18626-1 -1.61 0.15 0 -FEP_18628-1_18636-1 3.26 0.30 0 -FEP_18629-1_18632-1 -4.23 0.24 0 -FEP_17124-1_18637-1 -56.61 0.23 0 -FEP_17124-1_18636-1 15.61 0.53 0 -FEP_18658-1_18660-1 -121.27 0.90 0 -FEP_18659-1_18660-1 -126.40 1.00 0 -FEP_18630-1_18624-1 4.24 0.13 0 -FEP_18626-1_18624-1 4.37 0.21 0 -FEP_18633-1_18627-1 -2.34 0.23 0 -FEP_18624-1_18625-1 -3.23 0.33 0 -FEP-18660-1_18634-1 115.44 0.72 2 -FEP-18633-1_18634-1 -16.88 0.40 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index 091d41d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,2 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18624_1_18625_1 -3.23 0.33 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/protein_old_protopls.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/protein_old_protopls.txt deleted file mode 100644 index e7828b47..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/protein_old_protopls.txt +++ /dev/null @@ -1,31 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18624-1-18629-1 -4.81 0.16 0 -FEP_17124-1-18652-1 -87.73 0.63 0 -FEP_18659-1-18660-1 -127.53 1.28 0 -FEP_17124-1-18638-1 -84.71 0.19 0 -FEP_18634-1-18631-1 10.97 0.19 0 -FEP_18628-1-18625-1 -3.47 0.18 0 -FEP_17124-1-18637-1 -56.45 0.12 0 -FEP_18659-1-18658-1 -5.84 0.28 0 -FEP_18630-1-18633-1 3.64 0.11 0 -FEP_18659-1-18634-1 -12.29 0.34 0 -FEP_18637-1-18639-1 62.75 0.37 0 -FEP_18627-1-18624-1 3.25 0.22 0 -FEP_18628-1-18636-1 3.16 0.24 0 -FEP_18630-1-18627-1 1.20 0.11 0 -FEP_17124-1-18639-1 6.53 0.14 0 -FEP_17124-1-18636-1 16.21 0.42 0 -FEP_18631-1-18628-1 5.74 0.29 0 -FEP_18638-1-18652-1 -3.45 0.62 0 -FEP_18634-1-17124-1 4.30 0.13 0 -FEP_18630-1-18624-1 4.28 0.15 0 -FEP_18633-1-18632-1 -8.55 0.27 0 -FEP_18635-1-18630-1 0.34 0.35 0 -FEP_18629-1-18632-1 -4.39 0.29 0 -FEP_18631-1-18625-1 1.54 0.50 0 -FEP_18629-1-18626-1 0.87 0.20 0 -FEP_18658-1-18634-1 -5.49 0.25 0 -FEP_18628-1-18635-1 -4.03 0.25 0 -FEP_18658-1-18660-1 -123.27 0.80 0 -FEP_18627-1-18626-1 -1.15 0.17 0 -FEP_18637-1-18638-1 -28.30 0.50 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index c8bff3a0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,36 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18637-1_18638-1 -28.12 0.19 0 -FEP_18631-1_18628-1 3.17 0.14 0 -FEP_18658-1_18634-1 -5.81 0.12 0 -FEP_18638-1_18652-1 -5.13 0.34 0 -FEP_17124-1_18639-1 6.00 0.11 0 -FEP_18627-1_18626-1 -0.73 0.08 0 -FEP_17124-1_18652-1 -91.49 0.26 0 -FEP_18629-1_18626-1 1.50 0.08 0 -FEP_18628-1_18636-1 2.84 0.27 0 -FEP_18634-1_17124-1 4.87 0.12 0 -FEP_18631-1_18625-1 -0.45 0.12 0 -FEP_18658-1_18660-1 -122.05 0.42 1 -FEP_18659-1_18660-1 -127.02 0.65 0 -FEP_18628-1_18635-1 -4.01 0.11 0 -FEP_18624-1_18629-1 -4.84 0.07 0 -FEP_18635-1_18630-1 0.39 0.14 0 -FEP_18627-1_18624-1 2.66 0.14 0 -FEP_18659-1_18634-1 -11.42 0.14 0 -FEP_18629-1_18632-1 -3.86 0.16 0 -FEP_17124-1_18636-1 11.52 0.26 0 -FEP_18637-1_18639-1 63.66 0.15 0 -FEP_18634-1_18631-1 10.58 0.11 0 -FEP_18633-1_18632-1 -8.36 0.29 0 -FEP_18630-1_18627-1 1.65 0.08 0 -FEP_17124-1_18637-1 -57.88 0.11 0 -FEP_18630-1_18624-1 4.05 0.09 0 -FEP_18659-1_18658-1 -6.38 0.30 0 -FEP_18630-1_18633-1 4.03 0.09 0 -FEP_17124-1_18638-1 -85.99 0.09 0 -FEP_18628-1_18625-1 -3.51 0.13 0 -FEP_18626-1_18624-1 3.17 0.13 0 -FEP_18633-1_18627-1 -2.23 0.08 0 -FEP_18624-1_18625-1 -4.21 0.14 0 -FEP-18633-1_18634-1 -14.20 0.27 0 -FEP-18660-1_18634-1 114.82 1.09 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index ebca5068..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,2 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18624_1_18625_1 -4.21 0.14 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/water_old_protopls.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/water_old_protopls.txt deleted file mode 100644 index caa459e4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/3.JNK1/no-vs/2fs/water_old_protopls.txt +++ /dev/null @@ -1,31 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18637-1-18638-1 -28.01 0.18 0 -FEP_18631-1-18628-1 2.99 0.15 0 -FEP_18658-1-18634-1 -5.38 0.16 0 -FEP_18638-1-18652-1 -5.63 0.46 0 -FEP_17124-1-18639-1 6.17 0.14 0 -FEP_18627-1-18626-1 -0.87 0.13 0 -FEP_17124-1-18652-1 -90.96 0.46 0 -FEP_18629-1-18626-1 1.80 0.12 0 -FEP_18628-1-18636-1 2.97 0.19 0 -FEP_18634-1-17124-1 5.07 0.31 0 -FEP_18631-1-18625-1 0.10 0.11 0 -FEP_18658-1-18660-1 -121.70 0.46 0 -FEP_18659-1-18660-1 -125.79 0.86 0 -FEP_18628-1-18635-1 -3.83 0.09 0 -FEP_18624-1-18629-1 -4.77 0.11 0 -FEP_18635-1-18630-1 0.70 0.12 0 -FEP_18627-1-18624-1 2.34 0.11 0 -FEP_18659-1-18634-1 -11.78 0.13 0 -FEP_18629-1-18632-1 -3.76 0.11 0 -FEP_17124-1-18636-1 11.44 0.32 0 -FEP_18637-1-18639-1 63.83 0.30 0 -FEP_18634-1-18631-1 10.40 0.15 0 -FEP_18633-1-18632-1 -8.53 0.17 0 -FEP_18630-1-18627-1 1.64 0.08 0 -FEP_17124-1-18637-1 -57.81 0.17 0 -FEP_18630-1-18624-1 4.07 0.08 0 -FEP_18659-1-18658-1 -5.86 0.32 0 -FEP_18630-1-18633-1 3.82 0.11 0 -FEP_17124-1-18638-1 -86.05 0.14 0 -FEP_18628-1-18625-1 -3.48 0.16 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/.protein.txt.swp b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/.protein.txt.swp deleted file mode 100644 index 83a6ffc2..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/.protein.txt.swp and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index b9d6f840..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,81 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28_48 -8.7 0.22 0 -FEP_28_45 -1.17 0.22 0 -FEP_65_60 4.2 0.13 0 -FEP_42_48 -10.57 0.29 0 -FEP_28_29 -6.41 0.7 5 -FEP_68_26 4.15 0.74 0 -FEP_34_31 14.9 0.24 0 -FEP_54_68 35.41 0.36 0 -FEP_35_37 1.6 0.44 0 -FEP_54_64 -5.72 0.2 0 -FEP_43_47 -7.63 0.69 0 -FEP_27_38 -2.89 0.82 0 -FEP_23_62 10.04 0.37 0 -FEP_37_50 5.62 0.09 0 -FEP_63_58 0.7 0.12 0 -FEP_42_51 6.64 0.27 0 -FEP_28_44 3.25 0.52 0 -FEP_27_30 -7.6 0.16 0 -FEP_27_40 -22.04 0.31 6 -FEP_42_44 2.89 0.23 0 -FEP_38_30 -7.36 1.08 0 -FEP_35_36 3.97 0.17 0 -FEP_27_46 -8.91 0.21 0 -FEP_35_52 -1.41 0.38 0 -FEP_43_46 -6.1 0.24 0 -FEP_52_53 -4.85 0.76 0 -FEP_54_51 13.08 0.4 0 -FEP_26_67 -14.82 0.47 0 -FEP_27_34 1.68 0.65 0 -FEP_56_57 16.17 0.13 0 -FEP_27_28 3.95 0.74 0 -FEP_30_31 26.3 0.17 0 -FEP_58_56 3.1 0.22 0 -FEP_27_32 -4.95 0.14 0 -FEP_27_47 -12.02 0.59 0 -FEP_49_50 -1.99 0.19 0 -FEP_33_36 -0.77 0.4 0 -FEP_62_66 -7.22 0.25 0 -FEP_33_35 -4.22 0.21 0 -FEP_42_54 -6.75 0.09 0 -FEP_39_38 -0.1 0.98 0 -FEP_27_43 -4.34 0.26 0 -FEP_41_27 5.21 0.47 2 -FEP_37_67 25.31 0.48 0 -FEP_35_49 9.54 0.39 0 -FEP_65_61 11.73 0.43 0 -FEP_42_29 -5.3 0.59 0 -FEP_32_33 1.89 0.16 0 -FEP_64_23 6.06 0.12 0 -FEP_60_61 8.13 0.22 0 -FEP_41_40 -12.33 1.2 2 -FEP_60_63 -4.76 0.2 0 -FEP_28_42 0.14 0.36 0 -FEP_27_33 -2.98 0.14 0 -FEP_27_39 -1.95 1.06 1 -FEP_26_57 -25.58 0.71 0 -FEP_66_65 -12.46 0.25 0 -FEP_42_45 -1.21 0.2 0 -FEP_37_53 -8.7 0.51 0 -FEP_57_37 -13.46 0.24 0 -FEP_58_53 -3.09 0.18 0 -FEP_60_37 1.15 0.43 0 -FEP_61_50 -1.15 0.29 0 -FEP_66_64 -9.29 0.36 0 -FEP_63_64 3.17 0.23 0 -FEP_63_53 -2.77 0.2 0 -FEP_62_64 -16 0.35 0 -FEP_62_51 3.5 0.1 0 -FEP_56_37 0.72 0.52 4 -FEP_51_50 -11.01 0.30 0 -FEP_50_35 -6.90 0.29 0 -FEP_53_33 12.03 0.35 0 -FEP_54_53 -10.60 0.25 0 -FEP_53_35 6.77 0.21 0 -FEP dG sem crashes -FEP_39_41 -1.87 0.72 0 -FEP_32_39 3.37 0.91 0 -FEP_35_41 3.76 0.92 3 -FEP_38_40 -17.44 0.54 0 -FEP_42_27 -4.74 0.39 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index 0601a3a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_39_41 -1.87 0.72 0 -FEP_32_39 3.37 0.91 0 -FEP_35_41 3.76 0.92 3 -FEP_38_40 -17.44 0.54 0 -FEP_42_27 -4.74 0.39 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 922b6ade..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,81 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_42_54 -5.76 0.08 0 -FEP_65_60 3.27 0.1 2 -FEP_49_50 0.27 0.11 0 -FEP_34_31 14.43 0.2 0 -FEP_27_39 2.57 0.8 0 -FEP_41_40 -13.59 0.94 4 -FEP_35_36 3.06 0.06 0 -FEP_41_27 -4.26 0.66 7 -FEP_56_57 13.91 0.25 4 -FEP_28_29 -3.69 0.63 0 -FEP_66_65 -9.82 0.18 0 -FEP_54_51 12.93 0.45 0 -FEP_23_62 10.47 0.48 0 -FEP_42_48 -14.54 0.28 0 -FEP_28_45 5.24 0.29 0 -FEP_28_48 -8.21 0.41 0 -FEP_28_42 5.02 0.22 0 -FEP_27_28 0.56 0.44 0 -FEP_42_51 6.94 0.22 0 -FEP_27_46 -7.98 0.13 0 -FEP_54_64 -5.37 0.25 0 -FEP_27_34 4.55 0.16 0 -FEP_27_38 3.23 0.46 0 -FEP_28_44 8.57 0.35 0 -FEP_26_67 -11.05 0.33 0 -FEP_27_33 -0.65 0.18 0 -FEP_52_53 -0.71 0.24 0 -FEP_43_47 -10.77 0.4 0 -FEP_39_38 2 0.45 0 -FEP_60_63 -3.77 0.13 2 -FEP_68_26 3.39 0.19 0 -FEP_32_33 2.88 0.12 0 -FEP_37_53 -3.38 0.31 0 -FEP_35_37 1.44 0.19 0 -FEP_63_58 1.03 0.2 1 -FEP_27_32 -3.44 0.21 0 -FEP_42_44 4.18 0.09 2 -FEP_27_40 -11.08 0.43 7 -FEP_27_43 -2.79 0.21 0 -FEP_35_52 -2.17 0.31 0 -FEP_42_45 -0.72 0.24 0 -FEP_58_56 1.84 0.25 1 -FEP_35_49 8.04 0.43 0 -FEP_30_31 26.74 0.19 0 -FEP_60_61 6.44 0.22 0 -FEP_43_46 -5.21 0.14 0 -FEP_33_36 -0.75 0.21 0 -FEP_26_57 -25.3 0.27 0 -FEP_37_50 6.29 0.14 0 -FEP_27_47 -12.97 0.35 0 -FEP_27_30 -7.64 0.21 0 -FEP_42_29 -9.62 0.5 2 -FEP_33_35 -3.76 0.14 0 -FEP_64_23 6.04 0.21 2 -FEP_62_66 -6.85 0.32 0 -FEP_65_61 9.38 0.54 0 -FEP_54_68 32.66 0.23 1 -FEP_37_67 27.91 0.34 0 -FEP_38_30 -11.08 0.53 0 -FEP_57_37 -12.93 0.27 0 -FEP_58_53 -2.12 0.17 0 -FEP_60_37 -1.61 0.18 0 -FEP_61_50 -2.04 0.2 0 -FEP_66_64 -10.05 0.42 0 -FEP_63_64 0.02 0.16 0 -FEP_63_53 -1.72 0.19 0 -FEP_62_64 -16.85 0.24 0 -FEP_62_51 2.89 0.17 0 -FEP_56_37 -0.55 0.32 3 -FEP_51_50 -9.83 0.23 0 -FEP_50_35 -7.40 0.30 0 -FEP_53_33 6.84 0.32 0 -FEP_54_53 -6.90 0.33 0 -FEP_53_35 2.42 0.15 0 -FEP dG sem crashes -FEP_32_39 3.89 0.44 0 -FEP_35_41 4.08 0.77 4 -FEP_42_27 -7.96 0.77 0 -FEP_39_41 -1.17 0.59 1 -FEP_38_40 -16.32 0.34 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index a89ce6a7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/4.MCL1/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,6 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_32_39 3.89 0.44 0 -FEP_35_41 4.08 0.77 4 -FEP_42_27 -7.96 0.77 0 -FEP_39_41 -1.17 0.59 1 -FEP_38_40 -16.32 0.34 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 49a7b4b6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,51 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471_23468 18.33 0.67 0 -FEP_23475_20670-2qbs- 0.85 0.30 0 -FEP_23479_23476 50.19 0.71 0 -FEP_23474_20669-2qbr- -0.08 0.63 0 -FEP_23482_20667-2qbp- 11.65 1.66 4 -FEP_23468_23470 -41.15 0.57 0 -FEP_23467_23466 -23.78 0.50 0 -FEP_23479_23480 9.68 0.23 0 -FEP_20669-2qbr-_23472 -110.26 0.57 0 -FEP_23471_23467 43.83 1.00 0 -FEP_23486_23484 9.32 0.27 0 -FEP_20670-2qbs-_23474 6.01 0.40 0 -FEP_20669-2qbr-_23469 -1.08 1.08 0 -FEP_23479_23483 -56.49 1.09 1 -FEP_20667-2qbp-_23485 4.47 0.36 0 -FEP_23475_23330-2qbq- 3.66 0.42 0 -FEP_23473_23466 -29.28 0.83 3 -FEP_20670-2qbs-_23330-2qbq- 2.86 0.31 0 -FEP_23471_23470 -23.40 0.36 0 -FEP_23475_23477 -12.12 0.40 0 -FEP_23486_23485 -6.06 0.64 0 -FEP_23469_23471 -34.87 1.13 0 -FEP_23476_23474 3.08 0.53 0 -FEP_20667-2qbp-_23484 18.14 0.49 0 -FEP_20667-2qbp-_23486 10.09 0.17 0 -FEP_20669-2qbr-_23473 13.67 0.35 0 -FEP_20670-2qbs-_23477 -10.26 0.37 0 -FEP_23471_23472 -73.08 0.95 4 -FEP_23467_23473 4.73 0.67 1 -FEP_23475_23479 -44.53 0.76 0 -FEP_23480_23482 -90.58 0.48 0 -FEP_20667-2qbp-_23483 19.03 0.74 0 -FEP_23479_23482 -81.55 0.71 0 -FEP_23477_23476 14.46 0.42 0 -FEP_23476_23475 -4.34 0.36 0 -FEP_23483_23482 -28.65 1.15 0 -FEP_23486_23483 nan nan 10 -FEP_23471_23477 17.14 0.68 0 -FEP_23483_23480 64.47 1.88 2 -FEP_23473_23469 -15.24 0.84 0 -FEP_23466_23471 -21.40 1.78 1 -FEP_23472_23469 109.24 0.70 1 -FEP_23479_20670-2qbs- 43.80 0.30 0 -FEP_23482_20670-2qbs- 126.88 0.56 0 -FEP_23482_23476 129.80 0.99 0 -FEP_20670-2qbs-_23476 3.17 0.30 0 -FEP_23330-2qbq-_23476 0.22 0.19 1 -FEP_23476_20670-2qbs- -3.27 0.37 0 -FEP_23476_23330-2qbq- -0.46 0.26 0 -FEP_23476_23482 -132.37 1.09 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index 85eef501..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23486_23483 nan nan 10 -FEP_23471_23477 17.14 0.68 0 -FEP_23483_23480 64.47 1.88 2 -FEP_23473_23469 -15.24 0.84 0 -FEP_23466_23471 -21.40 1.78 1 -FEP_23472_23469 109.24 0.70 1 -FEP_23479_20670_2qbs_ 43.80 0.30 0 -FEP_23482_20670_2qbs_ 126.88 0.56 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 8ee569f6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,47 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471_23468 13.88 0.72 0 -FEP_23475_20670-2qbs- 1.48 0.16 0 -FEP_23479_23476 49.90 0.51 0 -FEP_23474_20669-2qbr- -1.95 0.31 0 -FEP_23482_20667-2qbp- 10.55 0.78 0 -FEP_23468_23470 -40.32 0.23 0 -FEP_23467_23466 -24.01 0.17 0 -FEP_23479_23480 9.91 0.19 0 -FEP_20669-2qbr-_23472 -108.69 0.23 0 -FEP_23471_23467 46.57 1.30 0 -FEP_23486_23484 7.13 0.16 0 -FEP_20670-2qbs-_23474 7.33 0.33 0 -FEP_20669-2qbr-_23469 -1.81 0.68 0 -FEP_23479_23483 -52.63 1.24 1 -FEP_20667-2qbp-_23485 2.54 0.23 0 -FEP_23475_23330-2qbq- 4.70 0.25 0 -FEP_23473_23466 -30.38 1.13 6 -FEP_20670-2qbs-_23330-2qbq- 3.44 0.24 0 -FEP_23471_23470 -27.03 1.04 0 -FEP_23475_23477 -12.39 0.71 0 -FEP_23486_23485 -9.43 0.17 0 -FEP_23469_23471 -32.81 0.26 0 -FEP_23476_23474 4.51 0.26 0 -FEP_20667-2qbp-_23484 19.48 0.30 0 -FEP_20667-2qbp-_23486 11.88 0.20 0 -FEP_20669-2qbr-_23473 15.79 0.11 0 -FEP_20670-2qbs-_23477 -12.85 1.14 0 -FEP_23471_23472 -70.26 0.86 1 -FEP_23467_23473 5.58 0.67 1 -FEP_23475_23479 -46.43 0.50 0 -FEP_23480_23482 -90.32 0.28 0 -FEP_20667-2qbp-_23483 16.82 0.38 0 -FEP_23479_23482 -81.14 0.66 0 -FEP_23477_23476 16.89 0.55 0 -FEP_23476_23475 -4.78 0.25 0 -FEP_23483_23482 -26.99 0.72 0 -FEP_23473_23469 -19.27 0.73 0 -FEP_23472_23469 108.14 0.19 0 -FEP_23479_20670-2qbs- 47.59 0.97 0 -FEP_23483_23480 62.10 1.12 1 -FEP_23482_20670-2qbs- 128.21 0.93 0 -FEP_23471_23477 13.44 1.31 2 -FEP_23466_23471 -21.43 0.73 0 -FEP_23476_23482 -132.29 0.78 0 -FEP_23476_20670-2qbs- -3.34 0.32 0 -FEP_23476_23330-2qbq- 0.38 0.34 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index e0d2bffa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/5.PTP1B/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23473_23469 -19.27 0.73 0 -FEP_23472_23469 108.14 0.19 0 -FEP_23479_20670_2qbs_ 47.59 0.97 0 -FEP_23483_23480 62.10 1.12 1 -FEP_23486_23483 nan nan 10 -FEP_23482_20670_2qbs_ 128.21 0.93 0 -FEP_23471_23477 13.44 1.31 2 -FEP_23466_23471 -21.43 0.73 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 5b8eacac..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1b_1a 0.92 0.17 0 -FEP_1b_5 7.52 0.31 0 -FEP_7a_3a -2.08 0.26 0 -FEP_3b_3a -4.09 0.20 0 -FEP_6e_6b 4.04 0.25 0 -FEP_1b_1d 1.90 0.26 0 -FEP_6e_6a -1.22 0.23 0 -FEP_5_1d -5.87 0.32 0 -FEP_1b_1c 0.43 0.23 0 -FEP_5_1c -7.03 0.21 0 -FEP_5_1a -6.73 0.19 0 -FEP_6a_1b 5.32 0.33 0 -FEP_6a_6b 5.18 0.20 0 -FEP_5_3b -5.43 0.20 0 -FEP_5_3a -7.83 0.34 0 -FEP_6b_7a 0.85 0.25 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/protein_old.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/protein_old.txt deleted file mode 100644 index 2b52fcdd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/protein_old.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1b_1a 0.17 0.22 0 -FEP_1b_5 8 0.16 0 -FEP_7a_3a -2.84 0.44 0 -FEP_3b_3a -4.54 0.23 0 -FEP_6e_6b 4.43 0.23 0 -FEP_1b_1d 1.84 0.3 0 -FEP_6e_6a -1.18 0.23 0 -FEP_5_1d -5.81 0.39 0 -FEP_1b_1c 0.47 0.17 0 -FEP_5_1c -7.07 0.38 0 -FEP_5_1a -7.53 0.17 0 -FEP_6a_1b 5.6 0.21 0 -FEP_6a_6b 5.43 0.17 0 -FEP_5_3b -5.41 0.26 0 -FEP_6b_7a 0.67 0.25 0 -FEP_3a_5 6.96 0.26 3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index e1d986db..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_6a_6b 4.30 0.10 0 -FEP_7a_3a -1.99 0.06 0 -FEP_5_1a -5.77 0.10 0 -FEP_5_3b -2.55 0.12 0 -FEP_6b_7a -1.47 0.18 0 -FEP_6e_6a -1.07 0.12 0 -FEP_1b_1a -1.28 0.14 0 -FEP_6e_6b 2.85 0.09 0 -FEP_5_3a -8.62 0.10 0 -FEP_1b_5 4.37 0.15 0 -FEP_5_1c -3.50 0.18 0 -FEP_5_1d -3.38 0.20 0 -FEP_1b_1c 0.79 0.14 0 -FEP_6a_1b 4.87 0.10 0 -FEP_3b_3a -5.81 0.12 0 -FEP_1b_1d 1.06 0.13 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/water_old.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/water_old.txt deleted file mode 100644 index 0b7e30a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/6.Thrombin/no-vs/2fs/water_old.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_6a_6b 4.03 0.05 0 -FEP_7a_3a -2.07 0.08 0 -FEP_5_1a -5.64 0.09 0 -FEP_5_3b -2.46 0.16 0 -FEP_6b_7a -1.28 0.09 0 -FEP_6e_6a -1.02 0.1 0 -FEP_1b_1a -1.15 0.14 0 -FEP_6e_6b 2.82 0.09 0 -FEP_1b_5 4.45 0.1 0 -FEP_5_1c -3.63 0.21 0 -FEP_5_1d -3.21 0.17 0 -FEP_1b_1c 0.81 0.09 0 -FEP_6a_1b 4.96 0.11 0 -FEP_3b_3a -6.08 0.05 0 -FEP_1b_1d 1.13 0.16 0 -FEP_3a_5 8.55 0.12 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 64951e6b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,28 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_jmc-27_jmc-28 -4.37 0.14 2 -FEP_ejm-45_ejm-50 40.55 0.22 1 -FEP_ejm-46_ejm-45 -16.08 0.14 1 -FEP_ejm-42_ejm-54 -33.46 0.15 2 -FEP_jmc-28_jmc-30 5.61 0.16 3 -FEP_ejm-31_ejm-44 30.43 0.28 0 -FEP_ejm-47_ejm-46 7.66 0.16 1 -FEP_ejm-31_ejm-43 24.76 0.22 0 -FEP_ejm-55_ejm-43 37.09 0.18 0 -FEP_ejm-50_ejm-42 -33.47 0.20 2 -FEP_ejm-48_ejm-47 5.41 0.09 3 -FEP_jmc-27_jmc-30 1.60 0.15 2 -FEP_ejm-31_ejm-55 -12.46 0.08 1 -FEP_jmc-27_jmc-23 -12.77 0.12 1 -FEP_ejm-48_ejm-46 13.17 0.13 2 -FEP_jmc-28_jmc-23 -8.20 0.14 1 -FEP_ejm-31_ejm-54 -20.50 0.13 0 -FEP_ejm-50_ejm-49 -13.21 0.17 2 -FEP_ejm-46_jmc-27 -7.94 0.14 1 -FEP_ejm-31_ejm-49 34.03 0.28 1 -FEP_ejm-42_ejm-31 -13.23 0.10 1 -FEP_ejm-55_ejm-44 43.05 0.15 1 -FEP_ejm-42_ejm-46 9.38 0.12 1 -FEP_jmc-30_ejm-46 6.67 0.29 0 -FEP_ejm-49_ejm-46 -11.51 0.29 1 -FEP_ejm-55_ejm-42 25.90 0.21 2 -FEP_jmc-27_ejm-47 0.55 0.18 3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index 5b2e9845..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_ejm_42_ejm_46 9.38 0.12 1 -FEP_jmc_30_ejm_46 6.67 0.29 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein_old.tt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein_old.tt deleted file mode 100644 index 2fa0da80..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein_old.tt +++ /dev/null @@ -1,23 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_jmc_27-jmc_28 -4.39 0.23 2 -FEP_ejm_45-ejm_50 40.39 0.29 0 -FEP_ejm_46-ejm_45 -15.94 0.18 1 -FEP_ejm_42-ejm_54 -33.37 0.14 0 -FEP_jmc_28-jmc_30 5.45 0.12 1 -FEP_ejm_31-ejm_44 29.31 0.26 2 -FEP_ejm_47-ejm_46 7.66 0.08 0 -FEP_ejm_31-ejm_43 24.32 0.23 2 -FEP_ejm_55-ejm_43 37.10 0.28 1 -FEP_ejm_50-ejm_42 -34.11 0.20 2 -FEP_ejm_48-ejm_47 5.45 0.10 0 -FEP_jmc_27-jmc_30 1.44 0.23 2 -FEP_ejm_31-ejm_55 -12.48 0.14 1 -FEP_jmc_27-jmc_23 -12.45 0.12 0 -FEP_ejm_48-ejm_46 13.20 0.29 1 -FEP_jmc_28-jmc_23 -7.80 0.19 3 -FEP_ejm_31-ejm_54 -20.36 0.12 3 -FEP_ejm_50-ejm_49 -12.77 0.25 0 -FEP_ejm_46-jmc_27 -8.26 0.11 3 -FEP_ejm_31-ejm_49 33.78 0.42 0 -FEP_ejm_42-ejm_31 -12.86 0.09 2 -FEP_ejm_55-ejm_44 42.39 0.19 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index eb05f6d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,28 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_jmc-27_jmc-28 -6.35 0.11 7 -FEP_ejm-50_ejm-49 -13.79 0.24 7 -FEP_ejm-31_ejm-49 32.73 0.13 0 -FEP_ejm-31_ejm-43 23.51 0.07 0 -FEP_ejm-31_ejm-55 -11.82 0.08 0 -FEP_ejm-48_ejm-46 15.66 0.11 3 -FEP_ejm-31_ejm-54 -19.38 0.08 0 -FEP_jmc-27_jmc-23 -12.82 0.11 3 -FEP_ejm-45_ejm-50 41.41 0.21 0 -FEP_ejm-46_jmc-27 -7.10 0.11 0 -FEP_jmc-27_jmc-30 1.36 0.14 5 -FEP_ejm-42_ejm-54 -32.34 0.09 0 -FEP_ejm-47_ejm-46 8.26 0.10 3 -FEP_ejm-55_ejm-44 38.54 0.11 6 -FEP_ejm-42_ejm-31 -13.00 0.06 0 -FEP_jmc-28_jmc-30 7.66 0.08 0 -FEP_ejm-46_ejm-45 -17.88 0.10 0 -FEP_ejm-31_ejm-44 26.69 0.06 0 -FEP_jmc-28_jmc-23 -6.79 0.10 2 -FEP_ejm-55_ejm-43 35.08 0.16 3 -FEP_ejm-48_ejm-47 7.13 0.07 4 -FEP_ejm-50_ejm-42 -33.99 0.15 4 -FEP_jmc-30_ejm-46 5.90 0.12 0 -FEP_ejm-42_ejm-46 10.24 0.10 1 -FEP_jmc-27_ejm-47 -1.00 0.11 0 -FEP_ejm-49_ejm-46 -9.36 0.08 0 -FEP_ejm-55_ejm-42 24.99 0.10 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index 6b9d9cb5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_jmc_30_ejm_46 5.90 0.12 0 -FEP_ejm_42_ejm_46 10.24 0.10 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/water_old.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/water_old.txt deleted file mode 100644 index 2d7c5340..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/7.Tyk2/no-vs/2fs/water_old.txt +++ /dev/null @@ -1,23 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_jmc_27-jmc_28 -6.39 0.11 0 -FEP_ejm_50-ejm_49 -14.05 0.19 0 -FEP_ejm_31-ejm_49 32.92 0.15 0 -FEP_ejm_31-ejm_43 23.21 0.14 0 -FEP_ejm_31-ejm_55 -11.51 0.12 0 -FEP_ejm_48-ejm_46 15.61 0.10 0 -FEP_ejm_31-ejm_54 -19.28 0.13 0 -FEP_jmc_27-jmc_23 -12.99 0.07 0 -FEP_ejm_45-ejm_50 41.21 0.11 0 -FEP_ejm_46-jmc_27 -7.34 0.09 0 -FEP_jmc_27-jmc_30 1.32 0.09 0 -FEP_ejm_42-ejm_54 -32.46 0.14 0 -FEP_ejm_47-ejm_46 8.26 0.08 0 -FEP_ejm_55-ejm_44 38.50 0.16 0 -FEP_ejm_42-ejm_31 -12.89 0.07 0 -FEP_jmc_28-jmc_30 7.63 0.09 1 -FEP_ejm_46-ejm_45 -17.81 0.09 0 -FEP_ejm_31-ejm_44 26.89 0.11 0 -FEP_jmc_28-jmc_23 -6.90 0.08 0 -FEP_ejm_55-ejm_43 35.31 0.08 0 -FEP_ejm_48-ejm_47 7.16 0.12 0 -FEP_ejm_50-ejm_42 -34.11 0.11 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index dee77137..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,58 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a-2e_p38a-2f -0.09 0.33 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fmk 6.10 0.39 0 -FEP_p38a-2v_p38a-3fly -15.38 0.21 0 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln 8.03 0.26 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-3flw -46.63 0.55 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2u -66.89 0.26 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2f -6.53 0.13 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fmh 122.93 0.40 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -46.70 0.29 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb 13.84 0.75 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2aa 29.50 0.30 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3flq -127.05 0.52 1 -FEP_p38a-2n_p38a-2r -7.59 0.30 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2q -74.58 0.49 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2bb -129.07 0.22 8 -FEP_p38a-2l_p38a-2s 10.22 0.41 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2ee -26.62 0.23 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -5.20 0.24 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2ff -4.40 0.20 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z -23.78 0.20 0 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 6.56 0.22 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -1.05 0.33 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -53.25 0.64 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2u -139.71 0.71 4 -FEP_p38a-2n_p38a-2s 17.82 0.31 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2r -13.51 0.30 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 75.30 0.53 1 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 111.11 0.54 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -29.01 0.15 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2o -30.89 0.46 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2g -12.09 0.29 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3fmh -4.40 0.28 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2m 6.41 0.20 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 9.02 0.22 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2y 0.07 0.20 7 -FEP_p38a-2g_p38a-2h -40.27 0.21 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2ee -31.17 0.33 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2gg -33.30 0.17 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 11.75 0.23 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v 22.12 0.29 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x 21.10 0.19 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2h -13.90 0.20 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2t -7.33 0.20 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2gg -37.07 0.27 0 -FEP_p38a-2c_p38a-2h -6.97 1.40 3 -FEP_p38a-2z_p38a-2g -3.06 0.56 3 -FEP_p38a-2c_p38a-3flz 23.98 0.83 5 -FEP_p38a-2c_p38a-2h -9.17 0.52 1 -FEP_p38a-2c_p38a-3flz 21.91 0.80 0 -FEP_p38a-2y_p38a-3fmk -28.57 0.27 3 -FEP_p38a-2z_p38a-2y 8.68 0.21 4 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -115.49 0.45 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fly 18.70 0.33 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly 12.86 0.35 1 -FEP_p38a-2u_p38a-2o 15.18 0.29 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2gg -42.48 0.67 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2ff -9.73 0.22 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index dcc43b51..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a-2u_p38a-2o 15.18 0.29 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2gg -42.48 0.67 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index ba79dd46..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,62 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a-2e_p38a-2f -1.35 0.14 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fmk 8.77 0.58 1 -FEP_p38a-2v_p38a-3fly -14.23 0.13 0 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln 6.55 0.13 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-3flw -45.91 0.36 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2u -67.95 0.26 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2f -9.01 0.14 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fmh 123.09 0.48 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -46.79 0.10 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb 12.40 0.52 1 -FEP_p38a-3fly_p38a-2aa 28.97 0.20 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3flq -126.65 0.87 2 -FEP_p38a-2n_p38a-2r -8.07 0.24 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2q -73.95 0.23 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2bb -130.16 0.18 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2s 9.83 0.19 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2ee -27.48 0.20 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -6.47 0.23 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2z -8.20 0.24 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2ff -3.39 0.12 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z -24.07 0.49 0 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 7.62 0.16 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -1.08 0.20 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -55.61 0.49 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2u -139.35 0.80 3 -FEP_p38a-2n_p38a-2s 15.39 0.30 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2r -13.07 0.17 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 76.66 0.29 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 112.68 0.20 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -29.56 0.12 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2o -30.45 0.33 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c -23.32 0.54 1 -FEP_p38a-2x_p38a-2g -12.03 0.21 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3fmh -4.58 0.11 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2m 8.90 0.18 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 9.66 0.09 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2y -0.21 0.24 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2h -41.72 0.14 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2ee -31.16 0.37 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2gg -34.13 0.08 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 12.13 0.07 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v 20.28 0.24 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x 21.72 0.23 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2h -15.05 0.09 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2t -6.28 0.17 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2gg -37.25 0.18 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2c 12.26 0.35 0 -FEP_p38a-2y_p38a-3fmk -22.36 0.43 2 -FEP_p38a-2z_p38a-2g -2.21 0.41 2 -FEP_p38a-2c_p38a-3flz 23.23 0.80 2 -FEP_p38a-2c_p38a-2h -13.14 0.26 5 -FEP_p38a-2y_p38a-3fmk -23.24 0.40 2 -FEP_p38a-2c_p38a-3flz 22.22 0.24 0 -FEP_p38a-2c_p38a-2h -11.39 0.76 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2y 8.88 0.40 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -118.58 0.21 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fly 16.82 0.19 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly 8.55 0.34 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2gg -43.46 0.40 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2o 14.23 0.24 1 -FEP_p38a-3fly_p38a-2ff -9.19 0.41 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index 4c843d54..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF/8.p38/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a-3fly_p38a-2gg -43.46 0.40 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2o 14.23 0.24 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/1.BACE/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/1.BACE/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 40c0ad64..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/1.BACE/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,63 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-17i_CAT-17d -4.10 0.52 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 5.19 0.12 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13h 2.38 0.69 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -8.74 0.16 0 -FEP_CAT-17i_CAT-24 -1.50 0.36 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17b -7.91 0.31 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -3.53 0.14 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -8.26 0.51 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13d 3.23 0.47 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4p 14.46 0.07 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m 9.39 0.19 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -71.20 0.15 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17c 2.42 0.69 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17a -7.39 0.41 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -18.09 0.26 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 16.39 0.13 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4j 5.52 0.30 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -4.60 0.50 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 17.03 0.51 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 28.46 0.21 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 19.77 0.14 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13i -3.61 0.44 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13c 9.95 0.26 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b -3.60 0.21 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -82.07 0.29 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4d -15.64 0.24 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -0.68 0.19 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -12.82 0.18 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 73.94 0.25 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 74.22 0.24 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j -7.54 0.31 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -13.21 0.68 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13i 9.94 0.36 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13c 7.82 0.34 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -3.06 0.22 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -2.93 0.30 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 11.47 0.17 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 77.41 0.27 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13k -11.79 0.44 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17e 19.25 0.35 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 13.20 0.12 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4c -9.56 0.42 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13n -10.59 0.23 0 -FEP_CAT-13f_CAT-17a -5.73 0.41 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13o -4.45 0.40 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -3.87 0.56 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4d -2.14 0.22 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13b 1.76 0.16 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4o 25.76 0.17 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13h 16.92 1.11 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -76.36 0.27 0 -FEP_CAT-17f_CAT-4n 1.72 0.33 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b -17.59 0.47 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13n -91.33 0.39 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4j -15.31 0.18 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a 13.65 0.22 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13e -2.70 0.42 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13e 3.35 0.70 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17i 9.12 0.68 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 17.49 0.64 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17f -26.92 0.57 0 -FEP_CAT-17e_CAT-24 -20.42 0.47 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/1.BACE/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/1.BACE/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index ff33938d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/1.BACE/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,63 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CAT-17i_CAT-17d -6.54 0.10 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 5.55 0.11 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13h 0.48 0.15 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -11.84 0.08 0 -FEP_CAT-17i_CAT-24 1.34 0.17 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17b -7.01 0.10 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -6.66 0.05 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -8.98 0.14 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13d 3.38 0.14 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4p 14.60 0.05 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m 9.01 0.04 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -70.51 0.10 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17c 2.98 0.12 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17a -6.42 0.07 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -17.95 0.10 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 15.06 0.08 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4j 2.31 0.09 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -3.12 0.11 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 16.80 0.22 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 28.90 0.07 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 19.15 0.07 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13i -2.49 0.10 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13c 8.21 0.10 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b 0.14 0.24 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -83.62 0.10 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4d -11.80 0.21 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -0.43 0.09 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -13.47 0.11 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 72.73 0.20 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 76.40 0.25 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j -7.98 0.10 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -12.84 0.10 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13i 10.01 0.23 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13c 6.23 0.11 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -2.72 0.03 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -2.88 0.07 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 9.73 0.09 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 78.30 0.14 0 -FEP_CAT-4j_CAT-13k -11.15 0.10 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17e 20.22 0.08 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 11.29 0.11 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4c -9.61 0.13 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13n -13.20 0.14 0 -FEP_CAT-13f_CAT-17a -3.37 0.18 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13o -5.68 0.29 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -5.55 0.28 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4d -2.55 0.10 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13b 1.69 0.07 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4o 23.98 0.09 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13h 13.51 0.14 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -75.31 0.09 0 -FEP_CAT-17f_CAT-4n 2.62 0.08 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b -18.39 0.06 0 -FEP_CAT-13a_CAT-13n -92.82 0.09 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4j -15.35 0.11 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a 9.14 0.13 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13e -3.98 0.19 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13e 2.77 0.17 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17f -27.52 0.16 0 -FEP_CAT-17e_CAT-24 -18.41 0.13 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 16.12 0.13 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17i 7.44 0.08 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/2.CDK2/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/2.CDK2/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 952b621e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/2.CDK2/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -0.88 0.31 0 -FEP_30_1h1s -97.94 0.34 0 -FEP_1h1s_1oiy 126.37 0.33 0 -FEP_30_29 -4.56 0.30 0 -FEP_28_1h1s -47.41 0.39 0 -FEP_1h1q_17 -1.39 0.46 0 -FEP_1oiu_1h1r 138.45 0.42 0 -FEP_31_26 36.31 0.11 0 -FEP_28_30 50.87 0.19 0 -FEP_30_31 48.85 0.25 0 -FEP_26_1oi9 -16.64 0.25 0 -FEP_1oi9_1oiy -40.32 0.41 0 -FEP_1h1s_1oiu 41.51 0.76 0 -FEP_21_22 10.75 0.36 0 -FEP_1h1q_1h1r -5.51 0.24 0 -FEP_1oiu_32 -87.23 0.48 0 -FEP_1oi9_1h1q 17.29 0.37 0 -FEP_28_29 46.15 0.28 0 -FEP_1h1r_20 -3.25 0.43 0 -FEP_1h1r_17 4.51 0.13 0 -FEP_26_21 -16.92 0.19 0 -FEP_1h1s_32 -46.32 0.45 0 -FEP_17_20 -6.90 0.55 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/2.CDK2/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/2.CDK2/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index c9b785e8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/2.CDK2/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1h1r_22 -2.79 0.33 0 -FEP_30_1h1s -97.23 0.11 0 -FEP_1h1s_1oiy 126.25 0.11 0 -FEP_30_29 -4.97 0.11 0 -FEP_28_1h1s -46.49 0.15 0 -FEP_1h1q_17 -2.34 0.24 0 -FEP_1oiu_1h1r 134.66 0.15 0 -FEP_31_26 34.55 0.17 0 -FEP_28_30 50.93 0.16 0 -FEP_30_31 50.03 0.20 0 -FEP_26_1oi9 -14.88 0.13 0 -FEP_1oi9_1oiy -40.20 0.11 0 -FEP_1h1s_1oiu 40.27 0.26 0 -FEP_21_22 9.43 0.12 0 -FEP_1h1q_1h1r -6.07 0.15 0 -FEP_1oiu_32 -90.12 0.32 0 -FEP_1oi9_1h1q 14.85 0.06 0 -FEP_28_29 45.82 0.15 0 -FEP_1h1r_20 -1.65 0.14 0 -FEP_1h1r_17 4.14 0.19 0 -FEP_26_21 -18.60 0.21 0 -FEP_1h1s_32 -49.59 0.23 0 -FEP_17_20 -5.43 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/3.JNK1/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/3.JNK1/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 8e6d1cd0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/3.JNK1/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,34 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18624-1_18629-1 -4.87 0.17 0 -FEP_18658-1_18659-1 -2.37 0.50 0 -FEP_17124-1_18652-1 -93.29 0.79 0 -FEP_18659-1_18660-1 -124.67 0.51 2 -FEP_18627-1_18633-1 -2.32 0.16 0 -FEP_17124-1_18638-1 -88.73 0.16 0 -FEP_18634-1_18631-1 6.52 0.17 0 -FEP_18628-1_18625-1 -7.82 0.15 0 -FEP_17124-1_18637-1 -54.16 0.18 0 -FEP_18630-1_18633-1 -1.68 0.14 0 -FEP_18659-1_18634-1 -10.50 0.37 0 -FEP_18637-1_18639-1 50.41 0.25 0 -FEP_18627-1_18624-1 2.76 0.18 0 -FEP_18628-1_18636-1 -8.08 0.26 0 -FEP_18630-1_18627-1 0.96 0.16 0 -FEP_17124-1_18639-1 -4.37 0.21 0 -FEP_17124-1_18636-1 2.56 0.20 0 -FEP_18631-1_18628-1 12.49 0.24 0 -FEP_18638-1_18652-1 -3.06 0.47 0 -FEP_18634-1_17124-1 9.60 0.32 0 -FEP_18630-1_18624-1 3.80 0.09 0 -FEP_18633-1_18632-1 -4.31 0.27 0 -FEP_18635-1_18630-1 -3.58 0.28 0 -FEP_18629-1_18632-1 -4.02 0.16 0 -FEP_18631-1_18625-1 4.32 0.31 0 -FEP_18629-1_18626-1 0.61 0.21 0 -FEP_18658-1_18634-1 -12.92 0.40 0 -FEP_18628-1_18635-1 -3.54 0.21 0 -FEP_18658-1_18660-1 -125.38 0.75 1 -FEP_18627-1_18626-1 -1.14 0.26 0 -FEP_18637-1_18638-1 -34.49 0.31 0 -FEP_18633-1_18634-1 -9.75 0.25 0 -FEP_18660-1_18634-1 113.67 0.83 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/3.JNK1/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/3.JNK1/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 4915b0f8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/3.JNK1/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,34 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_18637-1_18638-1 -35.54 0.12 0 -FEP_18658-1_18659-1 -1.56 0.27 0 -FEP_18631-1_18628-1 10.08 0.11 0 -FEP_18658-1_18634-1 -11.82 0.09 0 -FEP_18638-1_18652-1 -3.60 0.41 0 -FEP_18627-1_18633-1 -2.88 0.10 0 -FEP_17124-1_18639-1 -5.15 0.11 0 -FEP_18627-1_18626-1 -0.90 0.15 0 -FEP_17124-1_18652-1 -93.84 0.40 0 -FEP_18629-1_18626-1 1.15 0.11 0 -FEP_18628-1_18636-1 -8.16 0.19 0 -FEP_18634-1_17124-1 10.05 0.12 0 -FEP_18631-1_18625-1 1.60 0.16 0 -FEP_18658-1_18660-1 -126.19 0.44 0 -FEP_18659-1_18660-1 -124.68 0.59 0 -FEP_18628-1_18635-1 -2.84 0.13 0 -FEP_18624-1_18629-1 -4.41 0.12 0 -FEP_18635-1_18630-1 -4.07 0.13 0 -FEP_18627-1_18624-1 2.40 0.09 0 -FEP_18659-1_18634-1 -9.97 0.18 0 -FEP_18629-1_18632-1 -3.73 0.14 0 -FEP_17124-1_18636-1 -1.56 0.12 0 -FEP_18637-1_18639-1 49.44 0.24 0 -FEP_18634-1_18631-1 5.73 0.13 0 -FEP_18633-1_18632-1 -2.95 0.15 0 -FEP_18630-1_18627-1 1.65 0.07 0 -FEP_17124-1_18637-1 -54.65 0.15 0 -FEP_18630-1_18624-1 3.81 0.08 0 -FEP_18630-1_18633-1 -1.30 0.16 0 -FEP_17124-1_18638-1 -90.14 0.17 0 -FEP_18628-1_18625-1 -8.51 0.14 0 -FEP_18633-1_18634-1 -6.72 0.23 0 -FEP_18660-1_18634-1 115.03 0.61 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/4.MCL1/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/4.MCL1/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index a7ca3f98..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/4.MCL1/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,121 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_28_48 -8.24 0.33 0 -FEP_28_45 -0.18 0.30 0 -FEP_65_60 5.15 0.13 0 -FEP_42_48 -11.24 0.21 0 -FEP_28_29 -9.90 1.06 0 -FEP_68_26 3.27 0.49 0 -FEP_34_31 14.41 0.41 0 -FEP_54_68 35.21 0.40 0 -FEP_35_37 1.21 0.26 0 -FEP_37_56 -0.20 0.27 0 -FEP_33_53 -12.68 0.25 0 -FEP_54_64 -5.56 0.14 0 -FEP_43_47 -6.89 0.41 0 -FEP_27_38 0.64 0.77 0 -FEP_23_62 1.29 0.33 1 -FEP_37_50 4.90 0.14 0 -FEP_63_58 1.51 0.21 0 -FEP_42_51 5.76 0.68 1 -FEP_35_50 6.69 0.25 0 -FEP_28_44 3.89 0.24 0 -FEP_27_30 -6.49 0.19 0 -FEP_27_40 -13.95 1.20 4 -FEP_42_44 1.03 0.27 0 -FEP_38_30 -10.65 1.25 0 -FEP_35_36 5.76 0.35 0 -FEP_27_46 -9.53 0.33 0 -FEP_35_53 -7.85 0.21 0 -FEP_27_41 -1.04 0.60 5 -FEP_35_52 -3.56 0.68 0 -FEP_43_46 -7.41 0.17 0 -FEP_53_54 13.71 0.29 0 -FEP_52_53 -5.60 0.18 0 -FEP_54_51 12.41 0.30 0 -FEP_26_67 -18.21 0.43 0 -FEP_27_34 2.41 0.38 0 -FEP_56_57 16.84 0.29 0 -FEP_27_28 4.35 0.29 0 -FEP_30_31 25.51 0.27 0 -FEP_37_60 -0.11 0.32 0 -FEP_58_56 4.28 0.26 0 -FEP_27_32 -4.98 0.17 0 -FEP_64_62 12.54 0.39 0 -FEP_27_47 -8.78 0.51 0 -FEP_64_63 -5.77 0.18 0 -FEP_49_50 -1.77 0.28 0 -FEP_33_36 -0.31 0.23 0 -FEP_62_66 -6.99 0.26 0 -FEP_33_35 -5.37 0.29 0 -FEP_42_54 -7.43 0.21 0 -FEP_39_38 0.05 0.75 0 -FEP_27_43 -2.44 0.25 0 -FEP_51_62 -5.18 0.14 0 -FEP_37_67 25.13 0.46 0 -FEP_35_49 8.85 0.48 0 -FEP_65_61 10.22 0.36 0 -FEP_42_29 -10.10 0.34 0 -FEP_32_33 2.58 0.26 0 -FEP_64_23 11.52 0.33 0 -FEP_64_66 7.08 0.59 0 -FEP_60_61 6.01 0.33 0 -FEP_41_40 -15.55 1.50 5 -FEP_60_63 -4.95 0.22 0 -FEP_28_42 2.47 0.27 0 -FEP_27_33 -2.66 0.24 0 -FEP_27_39 2.26 0.85 0 -FEP_26_57 -27.35 0.38 0 -FEP_50_51 13.36 0.29 0 -FEP_66_65 -11.58 0.27 0 -FEP_42_45 -2.77 0.30 0 -FEP_37_53 -8.54 0.26 0 -FEP_39_41 -0.15 0.47 1 -FEP_42_27 -8.87 0.98 1 -FEP_32_39 6.98 0.47 0 -FEP_38_40 -15.80 0.61 0 -FEP_35_41 7.15 1.03 3 -FEP_39_41 -0.15 0.47 1 -FEP_42_27 -8.87 0.98 1 -FEP_32_39 6.98 0.47 0 -FEP_38_40 -15.80 0.61 0 -FEP_35_41 3.29 0.35 0 -FEP_27_42 6.75 0.51 0 -FEP_63_53 -2.66 0.11 0 -FEP_40_38 16.00 0.67 0 -FEP_41_40 -14.49 0.74 3 -FEP_60_63 -4.97 0.22 0 -FEP_42_29 -9.49 0.94 0 -FEP_28_44 3.46 0.31 0 -FEP_27_30 -6.08 0.27 0 -FEP_52_53 -4.51 0.64 0 -FEP_54_51 12.49 0.25 0 -FEP_28_48 -9.23 0.47 0 -FEP_33_35 -5.56 0.18 0 -FEP_58_56 3.76 0.45 0 -FEP_35_36 5.71 0.13 0 -FEP_37_53 -8.43 0.64 0 -FEP_37_67 25.31 0.42 0 -FEP_66_65 -12.08 0.25 0 -FEP_40_38 15.31 0.45 0 -FEP_26_57 -26.91 0.29 0 -FEP_27_41 -2.04 0.14 5 -FEP_33_36 -0.20 0.27 0 -FEP_42_54 -6.92 0.34 0 -FEP_35_52 -3.44 0.53 0 -FEP_56_57 16.60 0.23 0 -FEP_63_58 1.44 0.21 0 -FEP_28_29 -8.30 0.89 0 -FEP_65_61 10.59 0.24 0 -FEP_27_28 5.04 0.34 0 -FEP_60_61 5.98 0.30 0 -FEP_26_67 -17.73 0.56 0 -FEP_42_51 5.04 0.29 1 -FEP_38_30 -10.87 0.84 1 -FEP_27_33 -1.87 0.25 0 -FEP_64_66 7.04 0.36 0 -FEP_42_44 1.42 0.28 0 -FEP_63_53 -3.08 0.14 0 -FEP_42_48 -11.44 0.28 0 -FEP_28_42 2.92 0.36 0 -FEP_54_64 -5.36 0.22 0 -FEP_65_60 5.08 0.13 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/4.MCL1/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/4.MCL1/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 30688992..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/4.MCL1/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,79 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_42_54 -5.79 0.09 0 -FEP_65_60 3.43 0.07 0 -FEP_49_50 -0.32 0.17 0 -FEP_34_31 13.95 0.12 0 -FEP_27_39 4.59 0.57 0 -FEP_64_66 7.11 0.24 0 -FEP_41_40 -11.05 1.37 4 -FEP_35_36 5.86 0.15 0 -FEP_56_57 14.97 0.40 0 -FEP_28_29 -4.45 0.70 1 -FEP_66_65 -9.90 0.18 0 -FEP_54_51 11.93 0.57 0 -FEP_23_62 2.27 0.34 0 -FEP_42_48 -15.64 0.31 0 -FEP_28_45 4.80 0.32 0 -FEP_50_51 13.16 0.09 0 -FEP_28_48 -9.64 0.33 0 -FEP_28_42 6.30 0.26 0 -FEP_27_28 1.53 0.28 0 -FEP_42_51 6.22 0.35 0 -FEP_27_46 -8.00 0.11 0 -FEP_54_64 -5.68 0.17 0 -FEP_27_34 5.69 0.26 0 -FEP_64_62 13.31 0.35 0 -FEP_35_53 -3.26 0.14 0 -FEP_27_38 7.58 1.12 0 -FEP_28_44 8.33 0.20 0 -FEP_51_62 -4.62 0.23 0 -FEP_26_67 -14.51 0.46 0 -FEP_27_33 -0.29 0.15 0 -FEP_52_53 -0.85 0.22 0 -FEP_43_47 -9.40 0.21 0 -FEP_39_38 1.79 0.35 0 -FEP_60_63 -4.03 0.10 0 -FEP_68_26 3.70 0.34 0 -FEP_27_41 2.10 0.60 8 -FEP_37_56 2.11 0.25 0 -FEP_32_33 3.08 0.22 0 -FEP_64_63 -3.58 0.13 0 -FEP_37_53 -5.25 0.24 0 -FEP_35_37 2.02 0.20 0 -FEP_35_50 7.12 0.25 0 -FEP_33_53 -8.12 0.22 0 -FEP_63_58 1.63 0.13 0 -FEP_27_32 -3.62 0.15 0 -FEP_42_44 2.26 0.40 0 -FEP_27_40 -7.13 0.94 4 -FEP_27_43 -0.62 0.25 0 -FEP_35_52 -1.53 0.52 0 -FEP_42_45 -1.89 0.10 0 -FEP_58_56 1.70 0.34 0 -FEP_35_49 7.93 0.28 0 -FEP_30_31 26.19 0.16 0 -FEP_60_61 5.04 0.41 0 -FEP_43_46 -7.01 0.09 0 -FEP_33_36 1.01 0.20 0 -FEP_26_57 -26.15 0.40 0 -FEP_37_60 2.24 0.23 0 -FEP_37_50 5.56 0.07 0 -FEP_27_47 -10.88 0.25 0 -FEP_27_30 -6.95 0.07 0 -FEP_42_29 -12.51 0.26 0 -FEP_33_35 -4.81 0.19 0 -FEP_53_54 10.43 0.15 0 -FEP_64_23 11.10 0.19 0 -FEP_62_66 -7.04 0.32 0 -FEP_65_61 6.84 0.39 0 -FEP_54_68 32.44 0.20 0 -FEP_37_67 27.57 0.20 0 -FEP_38_30 -14.79 0.82 0 -FEP_39_41 1.66 0.80 0 -FEP_42_27 -9.14 0.29 0 -FEP_32_39 7.92 0.53 0 -FEP_38_40 -16.97 0.31 0 -FEP_35_41 4.11 0.34 0 -FEP_27_42 8.97 0.47 0 -FEP_63_53 -2.44 0.06 0 -FEP_40_38 16.73 0.38 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index b2c020ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/5.PTP1B/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,43 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471_23468 16.31 0.24 0 -FEP_23475_20670-2qbs- 1.20 0.26 0 -FEP_23474_20669-2qbr- 3.00 0.54 0 -FEP_23475_23476 4.68 0.27 0 -FEP_23468_23470 -39.86 0.40 0 -FEP_23467_23466 -23.67 0.45 0 -FEP_23479_23480 10.37 0.43 0 -FEP_20669-2qbr-_23472 -104.02 0.44 0 -FEP_23471_23467 46.67 0.49 0 -FEP_23486_23484 14.72 0.35 0 -FEP_20670-2qbs-_23474 6.30 0.51 0 -FEP_20669-2qbr-_23469 0.26 0.37 0 -FEP_20667-2qbp-_23485 25.48 0.28 0 -FEP_23475_23330-2qbq- 4.03 0.52 0 -FEP_23473_23466 -33.16 0.76 5 -FEP_23476_23477 -15.88 0.32 0 -FEP_20670-2qbs-_23330-2qbq- 2.68 0.20 0 -FEP_23471_23470 -22.80 0.34 0 -FEP_23475_23477 -12.24 0.49 0 -FEP_23486_23485 16.63 0.25 0 -FEP_23469_23471 -38.67 0.52 0 -FEP_20667-2qbp-_23484 22.32 0.54 0 -FEP_20667-2qbp-_23486 9.01 0.20 0 -FEP_20669-2qbr-_23473 13.36 0.41 0 -FEP_20670-2qbs-_23477 -12.45 0.51 0 -FEP_23471_23472 -65.11 0.98 4 -FEP_23483_20667-2qbp- -18.55 0.54 0 -FEP_23467_23473 7.18 0.79 3 -FEP_23482_23483 34.96 0.90 1 -FEP_23475_23479 -45.67 0.57 0 -FEP_23480_23482 -93.19 0.72 0 -FEP_23479_23482 -81.33 0.67 0 -FEP_23479_23476 50.24 0.84 0 -FEP_23482_23476 133.01 0.64 1 -FEP_23330-2qbq-_23476 0.58 0.37 0 -FEP_23466_23471 -22.06 0.65 0 -FEP_23474_23476 -2.74 0.60 0 -FEP_20667-2qbp-_23482 -14.27 1.20 2 -FEP_20670-2qbs-_23476 3.96 0.11 0 -FEP_23483_20667-2qbp- -18.92 0.46 0 -FEP_23482_23483 32.99 1.27 0 -FEP_20667-2qbp-_23482 -14.11 1.03 3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/5.PTP1B/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/5.PTP1B/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index dffbebae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/5.PTP1B/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,43 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_23471_23468 15.47 0.43 0 -FEP_23475_20670-2qbs- 1.54 0.08 0 -FEP_23474_20669-2qbr- 0.36 0.27 0 -FEP_23475_23476 5.19 0.13 0 -FEP_23468_23470 -39.31 0.23 0 -FEP_23467_23466 -24.78 0.13 0 -FEP_23479_23480 10.42 0.22 0 -FEP_20669-2qbr-_23472 -102.76 0.26 0 -FEP_23471_23467 46.37 0.55 0 -FEP_23486_23484 12.61 0.29 0 -FEP_20670-2qbs-_23474 6.39 0.29 0 -FEP_20669-2qbr-_23469 -0.09 0.17 0 -FEP_20667-2qbp-_23485 22.18 0.18 0 -FEP_23475_23330-2qbq- 4.14 0.15 0 -FEP_23473_23466 -33.27 0.71 2 -FEP_23476_23477 -16.01 0.47 0 -FEP_20670-2qbs-_23330-2qbq- 2.64 0.26 0 -FEP_23471_23470 -23.67 0.31 0 -FEP_23475_23477 -12.78 0.33 0 -FEP_23486_23485 13.23 0.13 0 -FEP_23469_23471 -36.23 0.51 0 -FEP_20667-2qbp-_23484 21.66 0.13 0 -FEP_20667-2qbp-_23486 8.65 0.16 0 -FEP_20669-2qbr-_23473 15.97 0.13 0 -FEP_20670-2qbs-_23477 -13.09 1.14 0 -FEP_23471_23472 -64.14 0.91 1 -FEP_23483_20667-2qbp- -17.60 0.28 0 -FEP_23467_23473 7.97 0.74 0 -FEP_23482_23483 31.63 0.60 0 -FEP_23475_23479 -46.89 0.41 0 -FEP_23480_23482 -92.87 0.24 0 -FEP_23479_23482 -81.82 0.24 0 -FEP_23479_23476 50.82 0.58 0 -FEP_23482_23476 133.53 0.69 0 -FEP_23330-2qbq-_23476 0.74 0.58 0 -FEP_23466_23471 -21.20 0.62 0 -FEP_23474_23476 -3.01 0.31 0 -FEP_20667-2qbp-_23482 -17.14 0.88 2 -FEP_20667-2qbp-_23482 -16.12 1.06 1 -FEP_23482_23483 31.25 0.61 0 -FEP_23483_20667-2qbp- -17.23 0.24 0 -FEP_20670-2qbs-_23476 3.42 0.17 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/6.Thrombin/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/6.Thrombin/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 7cdc10e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/6.Thrombin/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1b_1c -2.63 0.11 0 -FEP_1b_5 1.55 0.29 0 -FEP_5_1d -2.36 0.22 0 -FEP_5_1a -3.08 0.18 0 -FEP_6e_6a -0.01 0.28 0 -FEP_6a_1b 9.24 0.28 0 -FEP_6a_6b 5.31 0.14 0 -FEP_5_3b 1.42 0.23 0 -FEP_3b_3a -8.79 0.27 0 -FEP_6e_6b 5.05 0.30 0 -FEP_1b_1d -2.00 0.25 0 -FEP_5_1c -3.64 0.28 0 -FEP_6b_7a -9.51 0.21 0 -FEP_1b_1a -2.14 0.09 0 -FEP_7a_3a 6.95 0.28 0 -FEP_5_3a -5.42 0.40 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/6.Thrombin/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/6.Thrombin/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index e236e62d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/6.Thrombin/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_1b_1c -1.40 0.12 0 -FEP_1b_5 -1.21 0.16 0 -FEP_5_1d 0.43 0.18 0 -FEP_5_1a -2.27 0.11 0 -FEP_6e_6a 0.70 0.10 0 -FEP_6a_1b 7.31 0.09 0 -FEP_6a_6b 4.05 0.11 0 -FEP_5_3b 4.11 0.21 0 -FEP_3b_3a -9.09 0.12 0 -FEP_6e_6b 4.80 0.10 0 -FEP_1b_1d -0.65 0.14 0 -FEP_5_1c -0.53 0.19 0 -FEP_6b_7a -12.02 0.14 0 -FEP_1b_1a -3.29 0.08 0 -FEP_7a_3a 9.00 0.11 0 -FEP_5_3a -5.25 0.11 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 3317963d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/7.Tyk2/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,26 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_ejm-50_ejm-42 -32.35 0.18 0 -FEP_ejm-47_ejm-48 -2.05 0.11 2 -FEP_ejm-45_ejm-50 32.23 0.35 2 -FEP_jmc-28_jmc-23 -19.15 0.19 0 -FEP_ejm-46_ejm-45 -8.90 0.14 2 -FEP_ejm-31_ejm-44 30.79 0.36 3 -FEP_ejm-31_ejm-54 -22.10 0.16 0 -FEP_jmc-27_jmc-28 7.01 0.12 0 -FEP_ejm-42_ejm-54 -35.35 0.09 1 -FEP_ejm-31_ejm-55 -11.82 0.09 2 -FEP_ejm-55_ejm-43 38.56 0.12 2 -FEP_ejm-31_ejm-49 36.27 0.19 1 -FEP_ejm-50_ejm-49 -10.00 0.19 0 -FEP_jmc-28_jmc-30 -5.60 0.18 1 -FEP_jmc-27_jmc-23 -12.75 0.20 1 -FEP_ejm-55_ejm-44 42.39 0.40 1 -FEP_ejm-48_ejm-46 1.42 0.13 4 -FEP_ejm-46_jmc-27 -7.73 0.13 1 -FEP_ejm-31_ejm-43 26.22 0.32 0 -FEP_ejm-47_ejm-46 -0.04 0.16 1 -FEP_ejm-42_ejm-31 -13.67 0.19 0 -FEP_jmc-27_jmc-30 1.35 0.12 0 -FEP_ejm-49_ejm-46 -13.43 0.22 1 -FEP_jmc-27_ejm-47 8.21 0.10 3 -FEP_ejm-55_ejm-42 25.44 0.07 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/7.Tyk2/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/7.Tyk2/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index d06115c4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/7.Tyk2/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,26 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_jmc-27_jmc-28 5.14 0.16 0 -FEP_ejm-45_ejm-50 31.91 0.16 0 -FEP_ejm-46_ejm-45 -10.34 0.09 0 -FEP_ejm-42_ejm-54 -34.56 0.10 0 -FEP_jmc-28_jmc-30 -3.82 0.08 0 -FEP_ejm-31_ejm-44 26.89 0.13 0 -FEP_ejm-47_ejm-46 1.11 0.08 0 -FEP_ejm-31_ejm-43 24.89 0.14 0 -FEP_ejm-55_ejm-43 36.38 0.14 0 -FEP_ejm-50_ejm-42 -31.71 0.13 0 -FEP_jmc-27_jmc-30 1.43 0.11 0 -FEP_ejm-31_ejm-55 -11.04 0.09 0 -FEP_jmc-27_jmc-23 -12.41 0.10 0 -FEP_ejm-48_ejm-46 3.99 0.12 0 -FEP_ejm-47_ejm-48 -2.45 0.11 0 -FEP_jmc-28_jmc-23 -17.76 0.16 0 -FEP_ejm-31_ejm-54 -21.33 0.05 0 -FEP_ejm-50_ejm-49 -10.15 0.12 0 -FEP_ejm-46_jmc-27 -7.47 0.13 0 -FEP_ejm-31_ejm-49 35.05 0.16 0 -FEP_ejm-42_ejm-31 -13.26 0.08 0 -FEP_ejm-55_ejm-44 38.48 0.10 0 -FEP_ejm-49_ejm-46 -11.26 0.11 0 -FEP_jmc-27_ejm-47 6.10 0.10 1 -FEP_ejm-55_ejm-42 24.62 0.10 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/8.p38/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/8.p38/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 46135e29..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/8.p38/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a-3fln_p38a-2gg -35.80 0.41 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 9.43 0.20 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2gg -30.98 0.16 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -29.40 0.37 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2z -9.16 0.22 2 -FEP_p38a-3fln_p38a-2ee -29.88 0.33 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2ee -24.69 0.18 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2r -7.90 0.28 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2u -65.69 0.22 8 -FEP_p38a-2g_p38a-2h -41.88 0.34 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2u -142.06 nan 9 -FEP_p38a-2m_p38a-2q -75.64 0.72 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-3flw -46.73 0.48 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v 21.32 0.28 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2ff -4.92 0.26 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2bb -127.49 0.61 4 -FEP_p38a-2l_p38a-2r -14.41 0.39 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2p 32.46 0.58 0 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln 7.82 0.21 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2y -1.37 0.31 2 -FEP_p38a-2v_p38a-3fly -15.39 0.27 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3fmh -4.23 0.60 1 -FEP_p38a-3fly_p38a-3flw -18.13 0.49 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2m 8.21 0.36 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2s 16.96 0.24 0 -FEP_p38a-2e_p38a-2f -0.33 0.30 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2aa 27.87 0.48 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 12.24 0.15 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3flq -126.06 0.54 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x 22.69 0.37 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2t -10.66 0.14 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 112.75 0.51 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c -22.97 0.52 1 -FEP_p38a-3fly_p38a-3fmk -11.07 0.58 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2f -6.56 0.19 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2h -15.50 0.22 0 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 6.82 0.28 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2c 10.56 0.52 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -5.31 0.12 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -5.37 0.25 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fmk 114.28 0.79 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fmh 121.62 0.88 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -46.78 0.17 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -55.70 0.52 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2s 9.90 0.30 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2g -13.24 0.23 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z -23.07 0.31 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 74.65 0.31 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb 14.42 0.67 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/8.p38/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/8.p38/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 305e151b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/1.JACS/openFF2/8.p38/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_p38a-3fln_p38a-2ee -30.48 0.14 0 -FEP_p38a-2v_p38a-2y -1.15 0.30 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb 11.42 0.75 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -47.79 0.20 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2m 9.38 0.15 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2ee -25.77 0.21 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2s 15.19 0.25 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2r -8.86 0.19 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2u -67.07 0.06 7 -FEP_p38a-2y_p38a-2bb -128.17 0.22 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fmk 118.56 0.64 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2s 9.53 0.18 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3flq -126.48 0.67 2 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln 6.14 0.25 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3fmk -8.93 0.34 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -4.03 0.19 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2c 13.06 0.20 1 -FEP_p38a-2e_p38a-2f -1.09 0.13 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2h -43.34 0.06 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3fmh -4.60 0.16 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2f -8.69 0.10 0 -FEP_p38a-2v_p38a-3fly -13.96 0.15 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 114.04 0.29 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 76.58 0.42 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2q -73.85 0.35 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -6.98 0.26 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2p 32.65 0.55 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2z -9.02 0.26 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2u nan nan 10 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fmh 122.46 1.16 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2r -14.64 0.19 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2g -12.74 0.19 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -56.95 0.19 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2gg -31.99 0.12 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c -23.04 0.48 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2gg -36.71 0.33 0 -FEP_p38a-2l_p38a-2t -9.60 0.10 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2aa 27.14 0.27 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 12.24 0.07 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-3flw -44.82 0.31 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 9.60 0.18 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v 20.64 0.15 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2h -15.66 0.10 0 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 7.87 0.31 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z -23.89 0.43 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -30.05 0.14 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x 22.11 0.13 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-3flw -16.51 0.30 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2ff -4.04 0.16 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 829c8b18..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CAT-13d_CAT-13a -9.93 0.63 1.99 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -3.58 0.48 1.53 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -0.06 0.31 0.98 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j 3.91 0.26 0.83 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13b -6.97 0.31 0.97 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13d 0.05 0.37 1.16 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 2.73 0.15 0.46 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 3.01 0.14 0.45 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -20.54 0.35 1.10 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -38.77 0.21 0.66 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b -2.99 0.37 1.16 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b 17.84 0.53 1.67 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -61.02 0.19 0.59 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 9.80 0.54 1.69 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 52.95 0.24 0.77 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -7.71 0.16 0.50 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4a 4.35 0.13 0.40 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -72.69 0.31 0.98 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17f -7.43 0.34 1.06 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17d -6.39 0.34 1.07 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4a 0.65 0.34 1.07 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a 3.80 0.13 0.41 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13a -23.01 1.04 3.28 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -0.71 0.32 1.00 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -9.99 0.25 0.80 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4a 31.16 0.16 0.49 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 11.95 0.26 0.81 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -63.05 0.23 0.72 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13m -95.07 0.15 0.46 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -6.67 0.79 2.50 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13a -17.40 0.29 0.92 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13o 30.61 0.26 0.81 0 -FEP_CAT-13k_CAT-4j 14.75 0.36 1.14 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4j 0.38 0.18 0.57 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13d -0.34 0.70 2.22 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13d -1.20 0.30 0.95 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 8.74 0.18 0.58 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -2.98 0.19 0.60 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13a -8.91 0.35 1.12 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j 1.37 0.12 0.37 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4b 0.97 0.18 0.57 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13d -10.52 0.44 1.38 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13d 0.61 0.40 1.26 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 94.88 0.32 1.02 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13b -2.39 0.42 1.34 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13d 5.66 0.26 0.81 0 -FEP_CAT-13e_CAT-17a -5.58 0.86 2.71 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m -0.98 0.19 0.60 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17i -10.15 0.52 1.66 0 -FEP_CAT-24_CAT-17i 1.55 0.38 1.21 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f 1.46 0.66 2.09 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 40.99 0.23 0.72 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 28.83 0.11 0.34 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17d -27.27 0.20 0.62 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 68.05 0.25 0.79 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 2981ef70..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,56 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CAT-13g_CAT-13f -2.75 0.19 0.60 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13b -2.39 0.22 0.71 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4a 0.01 0.24 0.77 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -9.10 0.19 0.59 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -3.80 0.30 0.96 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 69.07 0.28 0.89 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 52.40 0.23 0.74 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 42.49 0.16 0.51 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17d -28.11 0.15 0.49 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -11.44 0.19 0.60 0 -FEP_CAT-24_CAT-17i -2.97 0.23 0.72 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13a -19.25 0.17 0.54 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17f -8.96 0.28 0.90 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4a 1.33 0.15 0.46 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a -0.32 0.29 0.91 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 10.51 0.17 0.55 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13d -2.52 0.26 0.82 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17d -8.89 0.14 0.45 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 1.83 0.25 0.78 0 -FEP_CAT-13k_CAT-4j 16.04 0.31 0.97 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -0.72 0.31 0.97 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13a -7.54 0.24 0.75 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 1.47 0.22 0.71 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b 0.85 0.36 1.14 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j 4.94 0.33 1.05 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -63.17 0.24 0.76 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -12.59 0.24 0.77 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m -0.91 0.22 0.69 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -39.06 0.20 0.62 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 28.55 0.31 0.97 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -61.22 0.19 0.61 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 8.96 0.24 0.77 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13d -6.63 0.24 0.75 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -18.18 0.19 0.60 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4a 30.47 0.21 0.65 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13d -1.29 0.51 1.62 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13d 1.55 0.30 0.94 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -70.21 0.26 0.82 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13a -15.74 0.30 0.96 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13m -96.50 0.26 0.83 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 92.67 0.22 0.71 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13d -1.23 0.18 0.58 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4b 0.84 0.22 0.70 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13d 4.55 0.16 0.51 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b 17.14 0.32 1.01 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13o 30.06 0.26 0.82 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -9.84 0.29 0.91 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 10.11 0.17 0.54 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13b -6.93 0.15 0.48 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -0.71 0.25 0.80 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4j -1.18 0.21 0.67 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -1.31 0.31 0.99 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -0.11 0.20 0.63 0 -FEP_CAT-13e_CAT-17a -6.29 0.41 1.30 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17i -13.57 0.21 0.66 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 2b01a3f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,54 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CAT-13g_CAT-13f -3.37 0.269 1.2 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -4.61 0.57 2.48 1 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -0.84 0.557 2.49 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13d 0.835 0.931 4.16 0 -FEP_CAT-13e_CAT-17a -3.41 0.757 3.38 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13d 5.45 0.403 1.8 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -19.5 0.532 2.38 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13d -2.04 0.396 1.73 1 -FEP_CAT-17c_CAT-13d -1.48 0.378 1.69 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 27.4 0.403 1.8 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13d -9.66 1.25 5.57 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13d 2.38 0.58 2.59 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -11.1 1.03 4.38 2 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -7.42 0.587 2.42 3 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 3.38 0.205 0.918 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -7.62 0.22 0.957 1 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 11.6 0.68 2.8 3 -FEP_CAT-17i_CAT-17d 0.07 0.497 2.22 0 -FEP_CAT-24_CAT-17i 0.08 0.478 2.14 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17i -11.3 0.184 0.825 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f 0.09 0.627 2.8 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 28.5 0.297 1.29 1 -FEP_CAT-4n_CAT-17f -7.44 0.524 2.16 3 -FEP_CAT-17e_CAT-17b 17.5 0.594 2.52 2 -FEP_CAT-4n_CAT-4m -0.715 0.326 1.34 3 -FEP_CAT-4n_CAT-4j 0.63 0.304 1.36 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 8.79 0.233 1.04 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 12.1 0.23 1.03 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j 1.04 0.318 1.39 1 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 3.64 0.262 1.17 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -10.1 0.233 1.02 1 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 53.1 0.311 1.39 0 -FEP_CAT-13k_CAT-4j 17.0 0.366 1.6 1 -FEP_CAT-4j_CAT-4a 30.7 0.28 1.25 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 41.0 0.219 0.93 2 -FEP_CAT-4c_CAT-4a 0.22 0.442 1.98 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4a 2.6 0.408 1.82 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -39.0 0.34 1.52 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a 3.08 0.206 0.922 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b -3.54 0.651 2.91 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4b 0.065 0.273 1.16 2 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -60.8 0.277 1.24 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -72.0 0.22 0.908 3 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -62.0 0.44 1.97 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j 5.66 0.342 1.53 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13o 31.8 0.439 1.81 3 -FEP_CAT-13m_CAT-13n 9.97 0.426 1.91 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 67.7 0.305 1.33 1 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 93.9 0.371 1.66 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13a -17.9 0.447 2.0 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13a -22.2 1.57 7.02 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13b -1.72 0.368 1.64 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13b -8.38 0.286 1.28 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 30f1c37d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,54 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CAT-13g_CAT-13f -2.79 0.34 1.52 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -3.85 0.338 1.44 2 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -0.975 0.305 1.37 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13d -0.965 0.584 2.61 0 -FEP_CAT-13e_CAT-17a -5.43 0.336 1.5 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13d 4.83 0.267 1.07 4 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -18.5 0.295 1.32 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13d -2.48 0.233 1.04 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13d -1.46 0.231 1.03 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 27.2 0.225 1.0 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13d -7.06 0.262 1.14 1 -FEP_CAT-13i_CAT-13d 1.33 0.255 1.11 1 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -12.2 0.198 0.885 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -9.2 0.264 1.15 1 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 1.44 0.262 1.17 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -9.69 0.304 1.32 1 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 10.4 0.242 1.08 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -0.88 0.228 0.994 1 -FEP_CAT-24_CAT-17i -2.79 0.184 0.801 1 -FEP_CAT-17e_CAT-17i -13.5 0.336 1.5 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -2.03 0.278 1.21 1 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 28.7 0.301 1.31 1 -FEP_CAT-4n_CAT-17f -9.16 0.211 0.943 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b 17.0 0.273 1.22 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m -1.02 0.198 0.888 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4j -1.42 0.192 0.815 2 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 9.21 0.219 0.981 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 10.6 0.316 1.41 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -0.625 0.228 0.995 1 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 1.39 0.278 1.21 1 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -12.6 0.221 0.885 4 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 53.0 0.196 0.834 2 -FEP_CAT-13k_CAT-4j 15.4 0.449 2.01 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4a 30.4 0.304 1.36 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 42.8 0.228 1.02 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4a 0.885 0.197 0.837 2 -FEP_CAT-4d_CAT-4a -0.19 0.351 1.57 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -38.6 0.289 1.29 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a -0.46 0.201 0.877 1 -FEP_CAT-4c_CAT-4b 1.21 0.283 1.27 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4b 0.485 0.34 1.52 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -61.1 0.272 1.12 3 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -71.0 0.438 1.96 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -63.3 0.164 0.676 3 -FEP_CAT-13k_CAT-13j 5.17 0.42 1.83 1 -FEP_CAT-13k_CAT-13o 29.6 0.277 1.03 6 -FEP_CAT-13m_CAT-13n 7.2 0.206 0.899 1 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 68.5 0.354 1.5 2 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 92.7 0.273 1.16 2 -FEP_CAT-13c_CAT-13a -15.8 0.408 1.83 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13a -18.7 0.326 1.46 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13b -2.52 0.34 1.52 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13b -7.9 0.309 1.38 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/merged/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/merged/water.txt deleted file mode 100644 index 46ea45be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/1.BACE/merged/water.txt +++ /dev/null @@ -1,54 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CAT-13g_CAT-13f -2.79 0.3401470270338991.52118374958451370 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -3.85 0.338378486313772651.43561833368064782 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -0.975 0.305286750449474951.3652838532700810 -FEP_CAT-13e_CAT-13d -0.96500000000000010.58412327466040942.61227869876091170 -FEP_CAT-13e_CAT-17a -5.4250000000000010.33600595232822891.5026643005009470 -FEP_CAT-17a_CAT-13d 4.835 0.26683328128252671.06733312513010684 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -18.48 0.295465734053883161.32136293273271450 -FEP_CAT-17b_CAT-13d -2.48 0.232594066992260121.04019228991566750 -FEP_CAT-17c_CAT-13d -1.46499999999999990.23086792761230391.03247275993122440 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 27.205 0.224722050542442321.00498756211208920 -FEP_CAT-13h_CAT-13d -7.06000000000000050.26248809496813381.14415907984860251 -FEP_CAT-13i_CAT-13d 1.335 0.254950975679639261.11130553854464351 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -12.18 0.197989898732233330.88543774484714630 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -9.195 0.26400757564888171.15078234258264511 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 1.44 0.262488094968133741.17388244726633520 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -9.69 0.303644529013779531.32355581673006921 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 10.39 0.241867732448956491.08166538263919690 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -0.88 0.22803508501982760.99398189118313431 -FEP_CAT-24_CAT-17i -2.79 0.183847763108502370.8013738203859671 -FEP_CAT-17e_CAT-17i -13.505 0.33615472627943221.5033296378372910 -FEP_CAT-24_CAT-17f -2.03000000000000020.27802877548915691.21189933575359321 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 28.73 0.30149626863362671.31419176682857081 -FEP_CAT-4n_CAT-17f -9.16 0.210950231097289860.94339811320566040 -FEP_CAT-17e_CAT-17b 17.035 0.273130005674953271.22147451876819770 -FEP_CAT-4n_CAT-4m -1.02 0.19849433241279210.88769364084688610 -FEP_CAT-4n_CAT-4j -1.42 0.192093727122985470.81498466243236742 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 9.205 0.21931712199461310.98081598681913830 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 10.55 0.31575306807693891.41209064864830850 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -0.625 0.228254244210266580.9949371839468061 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 1.39 0.27784887978899611.21111518857621481 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -12.61 0.221359436211786550.88543774484714624 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 53.0250000000000060.196468827043885020.83354663936698832 -FEP_CAT-13k_CAT-4j 15.435 0.449444101084884642.00997512422417830 -FEP_CAT-4j_CAT-4a 30.405 0.303644529013779531.35793961574143650 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 42.83 0.228473193175917241.02176318195558410 -FEP_CAT-4c_CAT-4a 0.885 0.19723082923316020.83677954085888122 -FEP_CAT-4d_CAT-4a -0.19 0.351140997321588771.57035027939628820 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -38.625 0.288617393793236251.29073622402100430 -FEP_CAT-4b_CAT-4a -0.459999999999999960.201246117974981070.87721149103280681 -FEP_CAT-4c_CAT-4b 1.21 0.28319604517012591.26649121591900520 -FEP_CAT-4d_CAT-4b 0.485 0.3401470270338991.52118374958451370 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -61.08 0.27202941017470891.12160599142479623 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -71.05 0.438406204335659471.96061214930439530 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -63.295 0.164012194668567260.67623960250786853 -FEP_CAT-13k_CAT-13j 5.175 0.42047592083257281.83281204710139361 -FEP_CAT-13k_CAT-13o 29.6300000000000030.27658633371878661.03489129863962046 -FEP_CAT-13m_CAT-13n 7.2 0.206155281280883030.89861003778057161 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 68.525 0.35355339059327381.5 2 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 92.669999999999990.273130005674953271.15879247494967792 -FEP_CAT-13c_CAT-13a -15.8 0.4081666326391711.82537667345674160 -FEP_CAT-13h_CAT-13a -18.6749999999999970.32557641192199411.45602197785610370 -FEP_CAT-13i_CAT-13b -2.52 0.3401470270338991.52118374958451370 -FEP_CAT-13c_CAT-13b -7.9049999999999990.308868904229610051.38130373198656090 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/.ipynb_checkpoints/pairs-checkpoint.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/.ipynb_checkpoints/pairs-checkpoint.txt deleted file mode 100755 index caf277ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/.ipynb_checkpoints/pairs-checkpoint.txt +++ /dev/null @@ -1,120 +0,0 @@ -1h1q 17 -1h1r 17 -1h1s 17 -1oi9 17 -1oiu 17 -1oiy 17 -20 17 -21 17 -22 17 -26 17 -28 17 -29 17 -30 17 -31 17 -32 17 -1h1r 1h1q -1h1s 1h1q -1oi9 1h1q -1oiu 1h1q -1oiy 1h1q -20 1h1q -21 1h1q -22 1h1q -26 1h1q -28 1h1q -29 1h1q -30 1h1q -31 1h1q -32 1h1q -1h1s 1h1r -1oi9 1h1r -1oiu 1h1r -1oiy 1h1r -20 1h1r -21 1h1r -22 1h1r -26 1h1r -28 1h1r -29 1h1r -30 1h1r -31 1h1r -32 1h1r -1oi9 1h1s -1oiu 1h1s -1oiy 1h1s -20 1h1s -21 1h1s -22 1h1s -26 1h1s -28 1h1s -29 1h1s -30 1h1s -31 1h1s -32 1h1s -1oiu 1oi9 -1oiy 1oi9 -20 1oi9 -21 1oi9 -22 1oi9 -26 1oi9 -28 1oi9 -29 1oi9 -30 1oi9 -31 1oi9 -32 1oi9 -1oiy 1oiu -20 1oiu -21 1oiu -22 1oiu -26 1oiu -28 1oiu -29 1oiu -30 1oiu -31 1oiu -32 1oiu -20 1oiy -21 1oiy -22 1oiy -26 1oiy -28 1oiy -29 1oiy -30 1oiy -31 1oiy -32 1oiy -21 20 -22 20 -26 20 -28 20 -29 20 -30 20 -31 20 -32 20 -22 21 -26 21 -28 21 -29 21 -30 21 -31 21 -32 21 -26 22 -28 22 -29 22 -30 22 -31 22 -32 22 -28 26 -29 26 -30 26 -31 26 -32 26 -29 28 -30 28 -31 28 -32 28 -30 29 -31 29 -32 29 -31 30 -32 30 -32 31 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 31941dea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,26 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_20_17 4.33 0.42 1.33 0 -FEP_32_1h1s -21.44 0.44 1.40 1 -FEP_1h1r_17 -0.63 0.05 0.15 0 -FEP_1h1s_1oiu -3.78 0.25 0.77 0 -FEP_1oiu_1h1r 20.28 0.26 0.81 0 -FEP_26_1oi9 -6.58 0.21 0.65 0 -FEP_26_1h1q 4.53 0.26 0.82 0 -FEP_17_1h1q -1.67 0.29 0.93 0 -FEP_29_28 -5.86 0.21 0.67 0 -FEP_1h1r_1h1q -2.90 0.34 1.07 0 -FEP_1oiy_1oi9 -3.03 0.30 0.96 0 -FEP_29_30 -11.07 0.17 0.53 0 -FEP_1oi9_1h1q 11.31 0.11 0.36 0 -FEP_21_1h1r -2.49 0.35 1.10 0 -FEP_21_22 -4.70 0.24 0.76 0 -FEP_28_1h1s -9.84 0.18 0.56 0 -FEP_32_30 -15.63 0.42 1.34 0 -FEP_28_30 -4.83 0.14 0.44 0 -FEP_22_1h1r 2.00 0.28 0.89 0 -FEP_1h1s_1oiy 5.99 0.21 0.67 0 -FEP_1h1s_30 4.37 0.14 0.44 0 -FEP_31_26 4.20 0.18 0.55 0 -FEP_30_31 0.12 0.16 0.50 0 -FEP_20_1h1r 5.42 0.42 1.33 0 -FEP_30_26 5.13 0.18 0.56 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 584c4d1a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,26 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_32_30 -14.90 0.31 0.97 0 -FEP_1h1s_1oiu -2.55 0.25 0.78 0 -FEP_29_30 -11.89 0.14 0.46 0 -FEP_17_1h1q -0.44 0.06 0.20 0 -FEP_1oiu_1h1r 16.00 0.23 0.72 0 -FEP_31_26 2.89 0.19 0.59 0 -FEP_1oiy_1oi9 -2.89 0.13 0.41 0 -FEP_29_28 -6.40 0.14 0.44 0 -FEP_21_22 -5.62 0.15 0.48 0 -FEP_1h1s_30 4.62 0.11 0.35 0 -FEP_32_1h1s -19.13 0.26 0.82 0 -FEP_20_17 1.06 0.17 0.55 0 -FEP_20_1h1r 1.28 0.16 0.50 0 -FEP_1h1s_1oiy 6.12 0.21 0.66 0 -FEP_28_1h1s -10.04 0.12 0.39 0 -FEP_28_30 -5.35 0.25 0.78 0 -FEP_22_1h1r 2.57 0.15 0.48 0 -FEP_26_1oi9 -5.39 0.15 0.47 0 -FEP_26_1h1q 3.94 0.10 0.30 0 -FEP_21_1h1r -3.02 0.15 0.49 0 -FEP_1h1r_17 -0.32 0.14 0.45 0 -FEP_30_31 0.63 0.21 0.67 0 -FEP_1oi9_1h1q 9.76 0.18 0.58 0 -FEP_1h1r_1h1q -0.67 0.10 0.31 0 -FEP_30_26 4.22 0.21 0.66 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 4dfb8e44..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,25 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_28_30 -8.04 0.219 0.981 0 -FEP_28_1h1s -18.4 0.45 2.01 0 -FEP_29_28 -13.0 0.261 1.17 0 -FEP_30_1h1s -9.76 0.311 1.32 2 -FEP_29_30 -21.1 0.225 0.899 4 -FEP_30_31 21.9 0.262 1.17 0 -FEP_32_1h1s -29.1 0.722 3.23 0 -FEP_1h1s_1oiy 8.43 0.282 1.26 0 -FEP_1h1s_1oiu -3.51 0.762 3.23 2 -FEP_1oiu_1h1r 56.0 0.376 1.64 1 -FEP_32_1oiu -32.5 0.587 2.62 0 -FEP_31_26 11.8 0.292 1.17 4 -FEP_26_21 11.3 0.835 3.74 0 -FEP_26_1oi9 -14.7 0.562 2.51 0 -FEP_21_22 -2.34 0.262 0.944 7 -FEP_21_1h1r -2.13 0.414 1.85 0 -FEP_1oi9_1h1q 17.7 0.385 1.68 1 -FEP_1oiy_1oi9 21.7 0.566 2.53 0 -FEP_1h1r_1h1q -4.81 0.563 2.52 0 -FEP_17_1h1q -3.75 0.447 1.95 1 -FEP_1h1r_17 -0.395 0.0985 0.418 2 -FEP_20_1h1r 13.2 0.508 2.21 1 -FEP_22_1h1r 0.125 0.34 1.52 0 -FEP_20_17 12.8 0.636 2.77 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 2d54f775..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,25 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_28_30 -8.5 0.225 0.81 7 -FEP_28_1h1s -17.2 0.198 0.863 1 -FEP_29_28 -12.9 0.194 0.846 1 -FEP_30_1h1s -8.22 0.177 0.791 0 -FEP_29_30 -21.8 0.238 1.06 0 -FEP_30_31 23.2 0.256 1.15 0 -FEP_32_1h1s -26.8 0.412 1.84 0 -FEP_1h1s_1oiy 7.58 0.189 0.844 0 -FEP_1h1s_1oiu -3.73 0.368 1.56 2 -FEP_1oiu_1h1r 52.9 0.208 0.931 0 -FEP_32_1oiu -30.6 0.326 1.46 0 -FEP_31_26 10.5 0.233 1.04 0 -FEP_26_21 9.12 0.327 1.43 1 -FEP_26_1oi9 -11.8 0.278 1.24 0 -FEP_21_22 -3.57 0.214 0.957 0 -FEP_21_1h1r -2.49 0.314 1.4 0 -FEP_1oi9_1h1q 15.3 0.24 1.05 1 -FEP_1oiy_1oi9 22.3 0.177 0.729 3 -FEP_1h1r_1h1q -3.16 0.213 0.927 1 -FEP_17_1h1q -3.17 0.18 0.806 0 -FEP_1h1r_17 -0.19 0.184 0.822 0 -FEP_20_1h1r 11.7 0.251 1.12 0 -FEP_22_1h1r 1.1 0.297 1.26 2 -FEP_20_17 11.3 0.227 0.988 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/merged/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/merged/water.txt deleted file mode 100644 index 331c28a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/2.CDK2/merged/water.txt +++ /dev/null @@ -1,25 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_28_30 -8.4950000000000010.224722050542442320.81024687595818597 -FEP_28_1h1s -17.1899999999999980.197989898732233330.86301796041565691 -FEP_29_28 -12.95 0.1941648783894760.84634508328459031 -FEP_30_1h1s -8.225 0.176918060129541340.79120161779409940 -FEP_29_30 -21.78 0.237697286480094251.0630145812734650 -FEP_30_31 23.205 0.256124969497313951.14542568506210830 -FEP_32_1h1s -26.78 0.412310562561766071.84390889145857770 -FEP_1h1s_1oiy 7.585 0.188679622641132080.84380092438915950 -FEP_1h1s_1oiu -3.725 0.3679673898594821.56115341975092252 -FEP_1oiu_1h1r 52.8799999999999950.208086520466848140.93059120993054740 -FEP_32_1oiu -30.62 0.326496554346290161.46013697987551840 -FEP_31_26 10.4750000000000010.233452350598575051.0440306508910550 -FEP_26_21 9.115 0.32695565448543631.42516665692121781 -FEP_26_1oi9 -11.825 0.27802877548915691.24338248338956440 -FEP_21_22 -3.57000000000000030.214009345590326970.95707888912043190 -FEP_21_1h1r -2.48500000000000030.31384709652950431.40356688476182010 -FEP_1oi9_1h1q 15.345 0.240416305603426171.0479503805047261 -FEP_1oiy_1oi9 22.345 0.176918060129541340.72945184899347553 -FEP_1h1r_1h1q -3.16 0.2126029162546930.92671462705624761 -FEP_17_1h1q -3.165 0.180277563773199480.8062257748298550 -FEP_1h1r_17 -0.19 0.183847763108502370.82219219164377880 -FEP_20_1h1r 11.6550000000000010.250599281722833361.1207140580897520 -FEP_22_1h1r 1.105 0.296984848098349961.26 2 -FEP_20_17 11.2800000000000010.226715680975092680.98823074228643591 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 488f07b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_18628-1_18625-1 -5.07 0.25 0.79 0 -FEP_18652-1_18638-1 -6.60 0.66 2.08 0 -FEP_18658-1_18634-1 7.19 0.35 1.11 0 -FEP_18626-1_18624-1 0.86 0.06 0.18 0 -FEP_18659-1_18634-1 3.27 0.49 1.56 0 -FEP_18639-1_17124-1 -7.35 0.20 0.62 0 -FEP_18629-1_18626-1 1.27 0.13 0.42 0 -FEP_17124-1_18634-1 -2.44 0.42 1.32 0 -FEP_18627-1_18624-1 2.68 0.18 0.56 0 -FEP_18660-1_18658-1 49.15 0.79 2.51 0 -FEP_18659-1_18658-1 -3.83 0.55 1.75 0 -FEP_18636-1_18628-1 10.10 0.29 0.93 0 -FEP_18633-1_18627-1 -1.32 0.17 0.52 0 -FEP_18629-1_18624-1 2.69 0.11 0.34 0 -FEP_18635-1_18628-1 2.64 0.17 0.53 0 -FEP_18631-1_18628-1 6.03 0.27 0.87 0 -FEP_18638-1_18639-1 34.77 0.22 0.68 0 -FEP_18631-1_18625-1 1.56 0.25 0.79 0 -FEP_18632-1_18629-1 -3.10 0.20 0.64 0 -FEP_18630-1_18627-1 0.53 0.17 0.54 0 -FEP_18633-1_18630-1 -1.92 0.17 0.55 0 -FEP_18635-1_18630-1 1.40 0.23 0.72 0 -FEP_17124-1_18631-1 -2.61 0.22 0.70 0 -FEP_18631-1_18624-1 6.92 0.34 1.08 0 -FEP_18637-1_18638-1 -2.65 0.26 0.84 0 -FEP_18628-1_18624-1 0.97 0.14 0.45 0 -FEP_18637-1_17124-1 24.68 0.27 0.85 0 -FEP_18634-1_18631-1 1.28 0.16 0.51 0 -FEP_18635-1_18636-1 -7.09 0.16 0.51 0 -FEP_18632-1_18626-1 -1.52 0.26 0.83 0 -FEP_18638-1_17124-1 26.87 0.19 0.60 0 -FEP_18630-1_18624-1 3.04 0.14 0.44 0 -FEP_18652-1_17124-1 21.25 0.34 1.08 0 -FEP_18660-1_18659-1 52.29 0.66 2.10 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index cc844590..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_18630-1_18627-1 2.77 0.35 1.09 0 -FEP_18659-1_18634-1 3.73 0.28 0.89 0 -FEP_18652-1_17124-1 20.23 0.39 1.22 0 -FEP_18639-1_17124-1 -7.18 0.22 0.71 0 -FEP_18660-1_18658-1 47.52 0.90 2.86 0 -FEP_18628-1_18625-1 -5.02 0.32 1.01 0 -FEP_18633-1_18627-1 -1.72 0.31 0.98 0 -FEP_18633-1_18630-1 -3.64 0.27 0.84 0 -FEP_18631-1_18624-1 4.97 0.25 0.78 0 -FEP_18637-1_17124-1 24.90 0.34 1.09 0 -FEP_18631-1_18625-1 -1.40 0.21 0.65 0 -FEP_18631-1_18628-1 3.13 0.18 0.57 0 -FEP_18658-1_18634-1 7.43 0.30 0.94 0 -FEP_18632-1_18629-1 -3.61 0.29 0.93 0 -FEP_18629-1_18624-1 2.71 0.39 1.25 0 -FEP_18637-1_18638-1 -3.19 0.36 1.15 0 -FEP_18638-1_18639-1 34.53 0.33 1.04 0 -FEP_17124-1_18631-1 -4.92 0.33 1.05 0 -FEP_18630-1_18624-1 2.70 0.33 1.05 0 -FEP_18629-1_18626-1 3.20 0.24 0.75 0 -FEP_18636-1_18628-1 9.65 0.39 1.24 0 -FEP_18638-1_17124-1 27.77 0.27 0.86 0 -FEP_18635-1_18628-1 3.31 0.29 0.90 0 -FEP_18632-1_18626-1 -0.75 0.30 0.95 0 -FEP_18627-1_18624-1 1.75 0.25 0.79 0 -FEP_18635-1_18636-1 -5.90 0.37 1.18 0 -FEP_17124-1_18634-1 -5.41 0.44 1.39 0 -FEP_18660-1_18659-1 52.60 0.37 1.16 0 -FEP_18659-1_18658-1 -4.17 0.30 0.94 0 -FEP_18626-1_18624-1 -0.44 0.33 1.05 0 -FEP_18652-1_18638-1 -6.75 0.37 1.16 0 -FEP_18635-1_18630-1 2.20 0.29 0.92 0 -FEP_18628-1_18624-1 1.05 0.26 0.83 0 -FEP_18634-1_18631-1 0.59 0.51 1.63 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 3bc658af..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,32 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_18659-1_18658-1 -4.04 0.446 1.99 0 -FEP_18658-1_18634-1 6.52 0.44 1.97 0 -FEP_18660-1_18658-1 46.5 0.944 4.22 0 -FEP_18660-1_18659-1 51.5 0.604 2.63 1 -FEP_18634-1_18631-1 1.23 0.242 1.08 0 -FEP_17124-1_18634-1 -4.31 0.446 1.94 1 -FEP_18660-1_18634-1 54.1 0.694 3.1 0 -FEP_18634-1_18633-1 8.73 0.617 2.76 0 -FEP_18631-1_18628-1 7.99 0.313 1.4 0 -FEP_18631-1_18625-1 3.81 0.56 2.5 0 -FEP_18628-1_18625-1 -4.53 0.163 0.728 0 -FEP_18635-1_18628-1 2.5 0.358 1.6 0 -FEP_18636-1_18628-1 9.44 0.353 1.58 0 -FEP_18635-1_18630-1 1.62 0.424 1.9 0 -FEP_18630-1_18627-1 0.415 0.189 0.844 0 -FEP_18630-1_18624-1 2.26 0.186 0.832 0 -FEP_18633-1_18630-1 -2.07 0.233 1.04 0 -FEP_18627-1_18624-1 1.73 0.222 0.993 0 -FEP_18627-1_18626-1 1.22 0.228 1.02 0 -FEP_18629-1_18624-1 2.71 0.21 0.916 1 -FEP_18629-1_18626-1 2.72 0.25 1.12 0 -FEP_18632-1_18629-1 -3.46 0.264 1.18 0 -FEP_18633-1_18632-1 0.075 0.284 1.27 0 -FEP_18637-1_17124-1 24.2 0.318 1.42 0 -FEP_18638-1_17124-1 26.9 0.356 1.59 0 -FEP_18639-1_17124-1 -7.9 0.228 1.02 0 -FEP_17124-1_18636-1 -4.56 0.552 2.47 0 -FEP_18652-1_17124-1 20.0 0.667 2.98 0 -FEP_18637-1_18638-1 -2.37 0.314 1.4 0 -FEP_18637-1_18639-1 32.2 0.2 0.894 0 -FEP_18652-1_18638-1 -6.37 0.85 3.8 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 1ea7e8ef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,32 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_18659-1_18658-1 -4.54 0.338 1.51 0 -FEP_18658-1_18634-1 7.02 0.707 3.16 0 -FEP_18660-1_18658-1 49.1 0.478 2.14 0 -FEP_18660-1_18659-1 53.2 1.05 4.68 0 -FEP_18634-1_18631-1 0.68 0.402 1.8 0 -FEP_17124-1_18634-1 -4.48 0.818 3.66 0 -FEP_18660-1_18634-1 56.0 0.638 2.78 1 -FEP_18634-1_18633-1 5.6 0.763 3.41 0 -FEP_18631-1_18628-1 3.88 0.428 1.91 0 -FEP_18631-1_18625-1 -1.06 0.376 1.68 0 -FEP_18628-1_18625-1 -4.46 0.442 1.98 0 -FEP_18635-1_18628-1 2.42 0.447 2.0 0 -FEP_18636-1_18628-1 9.61 0.412 1.84 0 -FEP_18635-1_18630-1 2.09 0.424 1.9 0 -FEP_18630-1_18627-1 1.61 0.506 2.26 0 -FEP_18630-1_18624-1 2.08 0.242 1.08 0 -FEP_18633-1_18630-1 -2.92 0.54 2.42 0 -FEP_18627-1_18624-1 0.94 0.483 2.16 0 -FEP_18627-1_18626-1 1.44 0.398 1.78 0 -FEP_18629-1_18624-1 2.34 0.47 2.1 0 -FEP_18629-1_18626-1 3.15 0.316 1.41 0 -FEP_18632-1_18629-1 -3.84 0.457 2.04 0 -FEP_18633-1_18632-1 0.875 0.347 1.55 0 -FEP_18637-1_17124-1 24.1 0.542 2.42 0 -FEP_18638-1_17124-1 27.1 0.492 2.2 0 -FEP_18639-1_17124-1 -7.07 0.256 1.15 0 -FEP_17124-1_18636-1 -10.4 0.375 1.68 0 -FEP_18652-1_17124-1 20.1 0.48 2.15 0 -FEP_18637-1_18638-1 -2.75 0.417 1.86 0 -FEP_18637-1_18639-1 31.5 0.314 1.4 0 -FEP_18652-1_18638-1 -7.04 0.314 1.4 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/merged/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/merged/water.txt deleted file mode 100644 index d20c4d31..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/3.JNK1/merged/water.txt +++ /dev/null @@ -1,32 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_18659-1_18658-1 -4.535 0.338378486313772651.51327459504215580 -FEP_18658-1_18634-1 7.02 0.70661163307718063.16006329050542960 -FEP_18660-1_18658-1 49.1449999999999960.47801673610868482.1377558326431950 -FEP_18660-1_18659-1 53.21 1.04675689632311464.68123915219036850 -FEP_18634-1_18631-1 0.67999999999999990.402243707222375351.7988885457415090 -FEP_17124-1_18634-1 -4.4849999999999990.81841309862440493.6600546444008180 -FEP_18660-1_18634-1 55.965 0.6382005954243542.7818519011622461 -FEP_18634-1_18633-1 5.6 0.76321687612368743.41320963317520270 -FEP_18631-1_18628-1 3.88 0.428018691180653941.91415777824086390 -FEP_18631-1_18625-1 -1.065 0.375898922584250061.68107108713462820 -FEP_18628-1_18625-1 -4.455 0.442040722106006871.97686620690425090 -FEP_18635-1_18628-1 2.425 0.44687805943008661.99849943707772940 -FEP_18636-1_18628-1 9.605 0.412310562561766071.84390889145857770 -FEP_18635-1_18630-1 2.09 0.42438190347845891.89789356919717720 -FEP_18630-1_18627-1 1.60999999999999990.50566787519082122.26141548592911160 -FEP_18630-1_18624-1 2.085 0.241867732448956491.08166538263919690 -FEP_18633-1_18630-1 -2.92 0.54037024344425182.4166091947189140 -FEP_18627-1_18624-1 0.94 0.48301138702933292.1600925906080970 -FEP_18627-1_18626-1 1.44 0.39849717690342551.78213355279563720 -FEP_18629-1_18624-1 2.34499999999999980.47010637094172632.10237960416286370 -FEP_18629-1_18626-1 3.145 0.316227766016837941.41421356237309510 -FEP_18632-1_18629-1 -3.84 0.45694638635183452.04352636391116830 -FEP_18633-1_18632-1 0.875 0.346554469023269141.54983870128474990 -FEP_18637-1_17124-1 24.1 0.54203320931470612.42404620418011030 -FEP_18638-1_17124-1 27.085 0.492036584005701772.200454498507070 -FEP_18639-1_17124-1 -7.07 0.256124969497313951.14542568506210830 -FEP_17124-1_18636-1 -10.375 0.37536648758246921.67868996541946380 -FEP_18652-1_17124-1 20.08 0.48010415536631222.1470910553583890 -FEP_18637-1_18638-1 -2.75 0.41677331968349411.8638669480410880 -FEP_18637-1_18639-1 31.5050000000000030.31384709652950431.40356688476182010 -FEP_18652-1_18638-1 -7.035 0.31384709652950431.40356688476182010 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/20rep/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/20rep/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/20rep/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/20rep/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 5daf941b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/20rep/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,65 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_33_37 2.59 0.27 1.20 2 -FEP_32_46 -3.58 0.17 0.77 3 -FEP_23_64 -4.82 0.24 1.07 0 -FEP_37_56 27.13 0.18 0.80 0 -FEP_35_52 -2.03 0.24 1.07 2 -FEP_61_50 -24.54 0.13 0.57 0 -FEP_45_42 6.76 0.23 1.03 0 -FEP_49_50 1.06 0.18 0.82 0 -FEP_67_60 -18.47 0.18 0.80 0 -FEP_51_54 -15.21 0.22 0.98 0 -FEP_42_54 -6.14 0.15 0.68 0 -FEP_33_64 22.86 0.38 1.71 2 -FEP_27_33 -5.93 0.17 0.74 2 -FEP_37_54 0.23 0.20 0.91 0 -FEP_27_34 5.39 0.22 0.98 3 -FEP_26_23 -21.65 0.19 0.86 2 -FEP_27_32 -2.99 0.13 0.59 1 -FEP_42_51 8.47 0.31 1.37 0 -FEP_48_42 -0.26 0.12 0.54 0 -FEP_63_58 9.77 0.12 0.53 0 -FEP_28_29 21.63 0.41 1.84 0 -FEP_27_28 -0.23 0.36 1.60 0 -FEP_32_43 3.61 0.25 1.11 1 -FEP_64_54 -18.95 0.19 0.85 16 -FEP_60_63 -4.95 0.16 0.70 0 -FEP_27_38 -0.39 0.45 2.00 2 -FEP_47_43 33.78 0.08 0.34 16 -FEP_68_54 -36.77 nan nan 19 -FEP_26_57 -7.48 0.26 1.18 1 -FEP_31_34 2.77 0.24 1.07 2 -FEP_60_65 -2.28 0.16 0.71 0 -FEP_35_49 9.97 0.19 0.83 0 -FEP_39_41 -2.01 0.34 1.51 0 -FEP_27_39 2.75 0.40 1.79 1 -FEP_65_61 19.79 0.25 1.10 0 -FEP_30_32 -2.01 0.16 0.72 0 -FEP_56_58 -8.31 0.18 0.80 0 -FEP_32_47 -30.49 0.30 1.33 0 -FEP_28_44 4.22 0.39 1.74 0 -FEP_30_31 3.71 0.16 0.70 0 -FEP_28_42 5.13 0.36 1.61 0 -FEP_23_66 -2.34 0.11 0.49 0 -FEP_23_62 16.25 0.28 1.23 0 -FEP_56_57 10.06 0.19 0.85 0 -FEP_27_41 -0.31 0.52 2.33 8 -FEP_52_53 -3.99 0.34 1.51 1 -FEP_28_45 -1.00 0.41 1.85 0 -FEP_60_61 16.89 0.24 1.08 0 -FEP_27_30 -0.84 0.16 0.71 2 -FEP_35_36 1.83 0.12 0.55 1 -FEP_46_43 7.25 0.13 0.57 0 -FEP_38_40 0.53 0.30 1.34 0 -FEP_27_40 3.08 1.01 4.51 13 -FEP_66_62 19.53 0.23 1.04 0 -FEP_37_53 -8.91 0.17 0.76 0 -FEP_26_68 -7.35 0.30 1.36 2 -FEP_33_36 2.01 0.24 1.06 1 -FEP_67_37 -33.11 0.18 0.80 0 -FEP_28_48 5.46 0.27 1.22 0 -FEP_33_35 0.70 0.14 0.61 5 -FEP_35_37 3.42 0.21 0.95 1 -FEP_29_42 -16.46 0.61 2.72 3 -FEP_42_44 -0.29 0.21 0.94 0 -FEP_37_50 7.30 0.13 0.57 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/20rep/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/20rep/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 1d60b8ff..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/20rep/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,65 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_33_37 3.10 0.21 0.93 0 -FEP_32_46 -1.27 0.15 0.66 0 -FEP_23_64 -4.84 0.16 0.71 0 -FEP_37_56 31.92 0.16 0.72 0 -FEP_35_52 -4.38 0.24 1.09 0 -FEP_61_50 -24.96 0.14 0.63 0 -FEP_45_42 7.14 0.14 0.65 0 -FEP_49_50 1.52 0.09 0.42 0 -FEP_67_60 -18.48 0.10 0.47 0 -FEP_51_54 -15.22 0.46 2.06 0 -FEP_42_54 -4.35 0.11 0.51 0 -FEP_33_64 23.57 0.18 0.81 0 -FEP_27_33 -4.23 0.10 0.45 0 -FEP_37_54 3.01 0.11 0.51 0 -FEP_27_34 4.49 0.19 0.87 0 -FEP_26_23 -20.29 0.11 0.49 0 -FEP_27_32 -2.94 0.14 0.61 0 -FEP_42_51 10.55 0.27 1.20 0 -FEP_48_42 3.83 0.23 0.98 1 -FEP_63_58 11.10 0.09 0.42 0 -FEP_28_29 22.25 0.31 1.39 0 -FEP_27_28 -2.39 0.20 0.90 0 -FEP_32_43 6.55 0.15 0.68 0 -FEP_64_54 -17.73 0.15 0.69 0 -FEP_60_63 -4.97 0.09 0.40 0 -FEP_27_38 5.59 0.36 1.61 2 -FEP_47_43 37.37 0.17 0.76 0 -FEP_68_54 -33.00 0.17 0.77 0 -FEP_26_57 -6.06 0.21 0.93 0 -FEP_31_34 1.96 0.17 0.77 0 -FEP_60_65 -1.72 0.14 0.63 0 -FEP_35_49 9.89 0.20 0.90 0 -FEP_39_41 -0.55 0.22 0.98 0 -FEP_27_39 4.84 0.28 1.24 0 -FEP_65_61 17.62 0.17 0.78 0 -FEP_30_32 -1.75 0.18 0.79 1 -FEP_56_58 -7.13 0.19 0.87 0 -FEP_32_47 -32.19 0.23 1.04 0 -FEP_28_44 9.90 0.20 0.90 0 -FEP_30_31 5.29 0.12 0.53 1 -FEP_28_42 9.18 0.17 0.76 0 -FEP_23_66 -1.15 0.16 0.74 0 -FEP_23_62 17.76 0.28 1.27 0 -FEP_56_57 9.63 0.14 0.62 0 -FEP_27_41 5.69 0.62 2.76 5 -FEP_52_53 0.89 0.23 1.03 0 -FEP_28_45 1.71 0.16 0.73 0 -FEP_60_61 16.20 0.16 0.70 0 -FEP_27_30 -1.34 0.12 0.54 0 -FEP_35_36 3.41 0.13 0.59 0 -FEP_46_43 7.95 0.11 0.48 0 -FEP_38_40 0.95 0.22 0.98 0 -FEP_27_40 7.60 0.78 3.48 9 -FEP_66_62 18.89 0.16 0.72 0 -FEP_37_53 -4.83 0.21 0.93 0 -FEP_26_68 -9.79 0.20 0.88 0 -FEP_33_36 3.08 0.12 0.56 0 -FEP_67_37 -35.79 0.18 0.78 0 -FEP_28_48 4.81 0.20 0.89 0 -FEP_33_35 1.05 0.12 0.54 0 -FEP_35_37 2.46 0.27 1.21 0 -FEP_29_42 -11.44 0.25 1.12 0 -FEP_42_44 1.16 0.13 0.57 0 -FEP_37_50 8.45 0.10 0.47 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/28r/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/28r/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index 393b6929..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/28r/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP_33_64 protein/ -FEP_23_64 protein/ -FEP_64_54 protein/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/28r/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/28r/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index c90120d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/28r/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,62 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_32_43 3.57 0.30 0.95 2 -FEP_60_63 -4.46 0.16 0.49 3 -FEP_63_58 9.83 0.15 0.47 4 -FEP_28_48 5.38 0.50 1.59 0 -FEP_31_34 3.02 0.38 1.19 2 -FEP_51_54 -15.93 0.30 0.96 1 -FEP_33_36 2.71 0.28 0.88 3 -FEP_52_53 -3.85 0.16 0.50 3 -FEP_35_36 1.61 0.23 0.72 1 -FEP_23_66 -2.18 0.23 0.74 2 -FEP_37_54 0.31 0.24 0.75 0 -FEP_48_42 0.07 0.33 1.03 0 -FEP_27_30 -0.67 0.15 0.47 3 -FEP_49_50 0.64 0.15 0.47 0 -FEP_35_49 10.24 0.39 1.24 5 -FEP_27_40 4.20 0.77 2.44 6 -FEP_42_54 -5.62 0.15 0.48 2 -FEP_67_37 -32.75 0.24 0.77 1 -FEP_35_37 2.22 0.28 0.87 2 -FEP_26_57 -7.67 0.41 1.29 2 -FEP_30_32 -2.35 0.13 0.42 0 -FEP_37_53 -8.03 0.25 0.79 0 -FEP_29_42 -17.64 0.44 1.40 3 -FEP_28_42 5.13 0.46 1.44 0 -FEP_37_56 27.78 0.30 0.93 1 -FEP_66_62 19.15 0.24 0.76 1 -FEP_47_43 34.13 0.19 0.60 1 -FEP_60_61 16.85 0.23 0.73 1 -FEP_27_34 3.24 0.68 2.14 4 -FEP_65_61 19.07 0.14 0.46 1 -FEP_61_50 -24.31 0.21 0.66 0 -FEP_42_44 -0.58 0.23 0.74 1 -FEP_39_41 -2.48 0.48 1.53 4 -FEP_30_31 3.91 0.11 0.35 0 -FEP_28_44 3.19 0.29 0.93 0 -FEP_38_40 -0.59 0.48 1.50 3 -FEP_42_51 9.14 0.36 1.12 6 -FEP_32_46 -3.24 0.18 0.58 2 -FEP_45_42 7.48 0.43 1.35 4 -FEP_56_57 10.03 0.19 0.61 3 -FEP_26_68 -7.48 0.56 1.77 0 -FEP_33_35 0.48 0.31 1.00 3 -FEP_35_52 -1.22 0.63 2.00 2 -FEP_27_32 -2.58 0.18 0.56 1 -FEP_23_62 17.79 0.36 1.15 1 -FEP_60_65 -2.36 0.15 0.48 1 -FEP_27_33 -5.90 0.29 0.92 4 -FEP_27_41 -0.72 0.92 2.91 3 -FEP_68_54 -36.86 0.31 0.98 0 -FEP_27_28 0.47 0.29 0.91 1 -FEP_37_50 7.44 0.19 0.60 0 -FEP_27_39 1.34 1.25 3.95 1 -FEP_27_38 0.35 0.87 2.76 3 -FEP_67_60 -18.65 0.10 0.33 3 -FEP_56_58 -7.51 0.29 0.91 3 -FEP_28_45 -3.11 0.39 1.25 0 -FEP_33_37 2.74 0.44 1.39 1 -FEP_32_47 -29.18 0.31 0.98 3 -FEP_46_43 7.44 0.19 0.60 1 -FEP_26_23 -21.72 0.46 1.45 1 -FEP_28_29 20.54 0.77 2.43 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/28r/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/28r/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index f939a0a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/28r/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,65 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_32_43 6.32 0.18 0.57 0 -FEP_60_63 -4.93 0.11 0.36 0 -FEP_63_58 11.03 0.08 0.26 0 -FEP_28_48 4.39 0.35 1.11 0 -FEP_31_34 1.72 0.21 0.66 0 -FEP_51_54 -14.47 0.39 1.25 0 -FEP_33_36 2.77 0.20 0.64 0 -FEP_52_53 0.52 0.30 0.93 0 -FEP_35_36 3.22 0.27 0.87 0 -FEP_23_66 -1.29 0.20 0.62 0 -FEP_37_54 3.26 0.21 0.66 0 -FEP_48_42 3.42 0.25 0.79 0 -FEP_27_30 -1.34 0.18 0.56 0 -FEP_49_50 1.65 0.11 0.35 0 -FEP_35_49 9.72 0.29 0.90 0 -FEP_27_40 5.58 0.59 1.85 7 -FEP_42_54 -4.57 0.14 0.43 0 -FEP_67_37 -36.27 0.23 0.73 0 -FEP_35_37 2.15 0.39 1.24 0 -FEP_26_57 -6.14 0.20 0.63 0 -FEP_33_64 23.05 0.24 0.76 0 -FEP_30_32 -1.74 0.23 0.73 0 -FEP_37_53 -5.20 0.25 0.78 0 -FEP_29_42 -11.39 0.30 0.94 0 -FEP_28_42 9.05 0.28 0.88 0 -FEP_37_56 31.26 0.26 0.82 0 -FEP_66_62 19.07 0.22 0.68 0 -FEP_47_43 37.78 0.25 0.78 0 -FEP_60_61 16.16 0.23 0.73 0 -FEP_27_34 4.94 0.35 1.11 0 -FEP_65_61 17.85 0.43 1.37 0 -FEP_61_50 -24.52 0.20 0.63 0 -FEP_42_44 1.36 0.13 0.40 0 -FEP_39_41 -0.49 0.31 0.98 0 -FEP_30_31 4.86 0.28 0.89 0 -FEP_28_44 9.79 0.24 0.77 0 -FEP_23_64 -4.69 0.16 0.52 0 -FEP_38_40 1.02 0.27 0.84 0 -FEP_42_51 9.70 0.33 1.06 0 -FEP_64_54 -17.65 0.17 0.52 0 -FEP_32_46 -1.29 0.19 0.60 0 -FEP_45_42 7.58 0.15 0.47 0 -FEP_56_57 9.33 0.31 0.99 0 -FEP_26_68 -9.64 0.20 0.63 0 -FEP_33_35 1.28 0.22 0.69 0 -FEP_35_52 -4.31 0.31 0.99 0 -FEP_27_32 -2.62 0.30 0.96 0 -FEP_23_62 17.50 0.33 1.03 0 -FEP_60_65 -1.43 0.10 0.31 0 -FEP_27_33 -4.75 0.15 0.49 0 -FEP_27_41 5.87 0.78 2.46 2 -FEP_68_54 -32.91 0.10 0.31 0 -FEP_27_28 -2.86 0.31 1.00 0 -FEP_37_50 8.51 0.11 0.34 0 -FEP_27_39 4.18 0.50 1.59 0 -FEP_27_38 5.81 0.56 1.78 1 -FEP_67_60 -18.68 0.10 0.31 0 -FEP_56_58 -7.76 0.34 1.07 0 -FEP_28_45 2.11 0.27 0.84 0 -FEP_33_37 3.63 0.38 1.20 0 -FEP_32_47 -32.07 0.23 0.74 0 -FEP_46_43 7.74 0.15 0.47 0 -FEP_26_23 -20.34 0.38 1.21 0 -FEP_28_29 21.54 0.30 0.95 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 0ae4d451..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,69 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_28_42 5.36 0.34 1.08 0 -FEP_27_30 -0.82 0.07 0.23 1 -FEP_48_42 0.72 0.40 1.27 0 -FEP_67_60 -19.00 0.27 0.84 0 -FEP_27_33 -5.35 0.26 0.81 0 -FEP_51_54 -14.84 0.33 1.04 0 -FEP_33_35 0.59 0.17 0.55 1 -FEP_64_54 -17.84 0.17 0.55 6 -FEP_56_58 -8.62 0.86 2.72 0 -FEP_33_36 2.05 0.26 0.82 0 -FEP_27_32 -2.46 0.17 0.53 0 -FEP_52_53 -2.98 0.70 2.21 1 -FEP_28_44 4.77 0.56 1.79 0 -FEP_49_50 1.23 0.22 0.71 0 -FEP_56_57 10.65 0.15 0.47 0 -FEP_23_66 -2.26 0.22 0.70 0 -FEP_33_54 4.11 0.68 2.15 1 -FEP_27_40 1.56 1.20 3.79 4 -FEP_27_34 5.70 0.41 1.31 1 -FEP_67_37 -32.63 0.22 0.71 0 -FEP_35_36 1.25 0.15 0.48 0 -FEP_42_54 -6.22 0.25 0.78 0 -FEP_68_54 -35.87 0.55 1.75 8 -FEP_26_23 -21.49 0.44 1.38 0 -FEP_27_28 -0.74 0.43 1.34 0 -FEP_37_53 -8.76 0.33 1.05 0 -FEP_28_29 20.85 0.49 1.56 0 -FEP_33_37 3.20 0.37 1.17 0 -FEP_23_62 15.47 0.43 1.37 0 -FEP_60_63 -5.28 0.19 0.61 0 -FEP_66_62 19.47 0.27 0.85 0 -FEP_61_50 -24.32 0.18 0.58 0 -FEP_35_52 -2.81 0.49 1.55 0 -FEP_30_32 -1.61 0.23 0.72 0 -FEP_32_47 -30.32 0.18 0.57 0 -FEP_27_38 1.95 0.71 2.24 0 -FEP_35_37 3.66 0.32 1.02 0 -FEP_47_43 33.44 0.30 0.96 7 -FEP_29_42 -16.71 0.70 2.21 0 -FEP_39_41 -2.08 0.58 1.83 0 -FEP_28_48 5.54 0.29 0.93 0 -FEP_32_43 2.68 0.09 0.30 1 -FEP_33_64 22.70 0.58 1.85 1 -FEP_27_39 2.62 0.68 2.16 1 -FEP_60_61 17.40 0.33 1.04 0 -FEP_23_64 -5.21 0.34 1.07 0 -FEP_26_57 -7.54 0.44 1.38 1 -FEP_60_37 -15.11 0.36 1.13 0 -FEP_65_61 19.60 0.31 0.98 0 -FEP_46_43 7.22 0.25 0.78 0 -FEP_42_51 8.52 0.44 1.40 0 -FEP_37_56 27.93 0.30 0.95 0 -FEP_63_58 9.94 0.28 0.88 0 -FEP_42_44 -0.20 0.23 0.73 0 -FEP_26_68 -7.23 0.35 1.11 0 -FEP_27_41 -0.11 0.52 1.66 4 -FEP_45_42 6.95 0.43 1.37 0 -FEP_38_40 -0.37 0.45 1.43 0 -FEP_32_46 -3.47 0.22 0.71 0 -FEP_31_34 2.98 0.27 0.85 0 -FEP_30_31 3.41 0.12 0.39 0 -FEP_35_49 9.90 0.18 0.58 0 -FEP_60_65 -2.35 0.14 0.44 0 -FEP_28_45 -1.39 0.21 0.65 0 -FEP_51_62 24.53 0.24 0.75 0 -FEP_57_42 -31.15 0.44 1.39 0 -FEP_37_50 7.39 0.16 0.50 0 -FEP_37_54 -0.02 0.33 1.03 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 25af4b16..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,69 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_33_37 3.15 0.18 0.57 0 -FEP_26_23 -20.33 0.19 0.59 0 -FEP_39_41 -0.28 0.22 0.70 0 -FEP_60_37 -17.58 0.23 0.73 0 -FEP_61_50 -24.92 0.19 0.61 0 -FEP_32_46 -1.30 0.25 0.78 0 -FEP_67_37 -35.89 0.39 1.23 0 -FEP_49_50 1.41 0.15 0.47 0 -FEP_68_54 -32.60 0.23 0.72 0 -FEP_27_28 -2.52 0.28 0.89 0 -FEP_33_64 23.75 0.46 1.44 0 -FEP_27_34 4.87 0.24 0.75 0 -FEP_38_40 0.75 0.33 1.04 0 -FEP_45_42 7.49 0.14 0.44 0 -FEP_27_32 -2.69 0.16 0.49 0 -FEP_42_51 9.97 0.17 0.54 0 -FEP_35_49 10.02 0.40 1.26 0 -FEP_48_42 3.62 0.27 0.84 0 -FEP_63_58 11.20 0.19 0.61 0 -FEP_33_54 5.79 0.48 1.52 0 -FEP_28_45 2.32 0.22 0.70 0 -FEP_32_43 6.23 0.13 0.42 0 -FEP_29_42 -11.22 0.23 0.72 0 -FEP_27_38 5.20 0.42 1.32 1 -FEP_47_43 37.63 0.29 0.93 0 -FEP_52_53 1.03 0.34 1.08 0 -FEP_35_52 -4.02 0.34 1.08 0 -FEP_27_40 6.68 0.84 2.66 3 -FEP_23_64 -4.42 0.27 0.86 0 -FEP_26_57 -5.83 0.19 0.59 0 -FEP_37_56 31.86 0.35 1.11 0 -FEP_31_34 2.19 0.25 0.79 0 -FEP_65_61 17.37 0.37 1.18 0 -FEP_46_43 7.79 0.15 0.48 0 -FEP_23_66 -1.00 0.23 0.72 0 -FEP_30_32 -1.10 0.23 0.73 0 -FEP_56_58 -7.70 0.38 1.20 0 -FEP_32_47 -32.33 0.36 1.14 0 -FEP_28_44 9.95 0.30 0.95 0 -FEP_28_42 8.80 0.09 0.28 0 -FEP_51_54 -14.81 0.46 1.45 0 -FEP_56_57 9.57 0.09 0.29 0 -FEP_60_61 15.58 0.49 1.54 0 -FEP_60_63 -4.95 0.10 0.32 0 -FEP_67_60 -18.67 0.17 0.53 0 -FEP_27_41 4.15 0.95 3.00 2 -FEP_30_31 5.25 0.15 0.46 0 -FEP_27_30 -1.25 0.12 0.38 0 -FEP_33_36 3.08 0.26 0.82 0 -FEP_23_62 17.73 0.34 1.07 0 -FEP_35_36 3.17 0.16 0.52 0 -FEP_66_62 18.51 0.29 0.90 0 -FEP_37_53 -5.70 0.47 1.49 0 -FEP_28_29 22.53 0.48 1.52 0 -FEP_27_33 -4.39 0.24 0.77 0 -FEP_26_68 -9.43 0.31 0.97 0 -FEP_27_39 5.44 0.67 2.13 0 -FEP_42_54 -4.55 0.14 0.45 0 -FEP_28_48 4.57 0.17 0.54 0 -FEP_33_35 1.18 0.28 0.87 0 -FEP_60_65 -1.56 0.10 0.32 0 -FEP_35_37 1.82 0.41 1.30 0 -FEP_64_54 -17.49 0.17 0.55 0 -FEP_42_44 1.34 0.24 0.77 0 -FEP_51_62 25.15 0.14 0.44 0 -FEP_57_42 -32.87 0.27 0.86 0 -FEP_37_50 8.45 0.11 0.36 0 -FEP_37_54 2.49 0.15 0.48 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/maestro-prot/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/maestro-prot/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/maestro-prot/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/maestro-prot/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index b80161a9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/maestro-prot/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,65 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_32_43 3.20 0.23 0.74 1 -FEP_60_63 -4.62 0.25 0.80 1 -FEP_63_58 9.70 0.16 0.52 0 -FEP_28_48 4.64 0.40 1.26 2 -FEP_31_34 2.93 0.44 1.38 3 -FEP_51_54 -14.86 0.36 1.14 2 -FEP_33_36 1.61 0.16 0.49 2 -FEP_52_53 -4.03 0.55 1.75 2 -FEP_35_36 1.21 0.18 0.55 0 -FEP_23_66 -2.24 0.16 0.51 1 -FEP_37_54 -0.18 0.43 1.34 4 -FEP_48_42 1.35 0.22 0.69 0 -FEP_27_30 -1.26 0.24 0.76 3 -FEP_49_50 0.99 0.26 0.82 0 -FEP_35_49 10.06 0.11 0.36 0 -FEP_27_40 1.77 0.71 2.24 7 -FEP_42_54 -5.94 0.20 0.64 0 -FEP_67_37 -33.29 0.27 0.87 0 -FEP_35_37 2.91 0.19 0.61 1 -FEP_26_57 -8.13 0.34 1.06 1 -FEP_33_64 22.85 0.80 2.52 2 -FEP_30_32 -1.39 0.22 0.69 0 -FEP_37_53 -9.25 0.22 0.68 3 -FEP_29_42 -15.87 0.72 2.29 3 -FEP_28_42 4.90 0.45 1.44 0 -FEP_37_56 27.41 0.22 0.70 1 -FEP_66_62 18.58 0.28 0.89 0 -FEP_47_43 33.35 0.18 0.58 0 -FEP_60_61 16.91 0.30 0.95 0 -FEP_27_34 5.89 0.17 0.55 3 -FEP_65_61 19.10 0.31 1.00 0 -FEP_61_50 -24.28 0.21 0.67 0 -FEP_42_44 -0.92 0.20 0.65 1 -FEP_39_41 -2.56 0.58 1.85 2 -FEP_30_31 3.98 0.30 0.95 0 -FEP_28_44 3.18 0.47 1.48 0 -FEP_23_64 -4.91 0.20 0.63 0 -FEP_38_40 0.43 0.35 1.09 2 -FEP_42_51 8.50 0.49 1.55 0 -FEP_64_54 -18.35 0.19 0.60 0 -FEP_32_46 -3.80 0.25 0.80 0 -FEP_45_42 6.73 0.16 0.51 0 -FEP_56_57 10.33 0.21 0.65 1 -FEP_26_68 -7.30 0.42 1.33 0 -FEP_33_35 0.73 0.17 0.54 0 -FEP_35_52 -3.19 0.27 0.85 0 -FEP_27_32 -3.20 0.22 0.69 1 -FEP_23_62 16.53 0.38 1.21 0 -FEP_60_65 -2.30 0.20 0.65 0 -FEP_27_33 -6.11 0.23 0.72 0 -FEP_27_41 -0.52 1.05 3.34 7 -FEP_68_54 -37.12 0.40 1.27 0 -FEP_27_28 -0.87 0.43 1.34 2 -FEP_37_50 7.71 0.13 0.41 4 -FEP_27_39 2.22 0.62 1.96 1 -FEP_27_38 1.66 1.02 3.22 2 -FEP_67_60 -18.67 0.18 0.58 1 -FEP_56_58 -7.54 0.42 1.34 3 -FEP_28_45 -0.30 0.36 1.15 2 -FEP_33_37 2.17 0.45 1.41 2 -FEP_32_47 -30.69 0.20 0.63 1 -FEP_46_43 6.87 0.15 0.46 0 -FEP_26_23 -21.35 0.33 1.05 0 -FEP_28_29 22.17 0.84 2.65 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/maestro-prot/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/maestro-prot/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index aade7df6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/maestro-prot/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,65 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_32_43 6.13 0.20 0.62 0 -FEP_60_63 -5.10 0.05 0.14 0 -FEP_63_58 10.95 0.13 0.42 0 -FEP_28_48 4.80 0.23 0.74 0 -FEP_31_34 2.00 0.23 0.72 0 -FEP_51_54 -14.49 0.48 1.51 0 -FEP_33_36 3.08 0.25 0.78 0 -FEP_52_53 1.06 0.29 0.90 0 -FEP_35_36 3.59 0.09 0.29 0 -FEP_23_66 -1.43 0.18 0.57 0 -FEP_37_54 3.28 0.15 0.47 0 -FEP_48_42 3.65 0.21 0.67 0 -FEP_27_30 -0.79 0.29 0.92 0 -FEP_49_50 1.75 0.17 0.53 0 -FEP_35_49 9.05 0.27 0.85 0 -FEP_27_40 7.77 1.15 3.63 3 -FEP_42_54 -4.56 0.13 0.41 0 -FEP_67_37 -35.90 0.23 0.72 0 -FEP_35_37 1.83 0.34 1.08 0 -FEP_26_57 -5.86 0.25 0.80 0 -FEP_33_64 23.27 0.22 0.69 0 -FEP_30_32 -1.57 0.18 0.58 0 -FEP_37_53 -4.61 0.38 1.21 0 -FEP_29_42 -11.32 0.18 0.57 0 -FEP_28_42 8.99 0.31 0.99 0 -FEP_37_56 31.08 0.23 0.73 0 -FEP_66_62 19.34 0.34 1.07 0 -FEP_47_43 37.22 0.19 0.61 0 -FEP_60_61 15.73 0.49 1.54 0 -FEP_27_34 4.67 0.20 0.63 0 -FEP_65_61 17.27 0.47 1.48 0 -FEP_61_50 -25.01 0.20 0.65 0 -FEP_42_44 1.48 0.19 0.59 0 -FEP_39_41 -0.81 0.43 1.35 0 -FEP_30_31 5.30 0.19 0.59 0 -FEP_28_44 9.83 0.36 1.13 0 -FEP_23_64 -4.95 0.14 0.45 0 -FEP_38_40 1.05 0.33 1.05 0 -FEP_42_51 9.73 0.43 1.37 0 -FEP_64_54 -17.22 0.16 0.50 0 -FEP_32_46 -1.28 0.22 0.70 0 -FEP_45_42 7.16 0.12 0.38 0 -FEP_56_57 9.48 0.18 0.58 0 -FEP_26_68 -9.74 0.33 1.03 0 -FEP_33_35 1.34 0.23 0.73 0 -FEP_35_52 -4.19 0.33 1.04 0 -FEP_27_32 -2.72 0.17 0.55 0 -FEP_23_62 18.03 0.40 1.26 0 -FEP_60_65 -1.54 0.10 0.33 0 -FEP_27_33 -4.67 0.14 0.45 0 -FEP_27_41 4.86 0.93 2.93 2 -FEP_68_54 -32.74 0.21 0.67 0 -FEP_27_28 -3.02 0.29 0.91 0 -FEP_37_50 8.50 0.13 0.40 0 -FEP_27_39 3.92 0.51 1.61 0 -FEP_27_38 5.82 0.94 2.99 0 -FEP_67_60 -18.70 0.13 0.40 0 -FEP_56_58 -7.16 0.30 0.96 0 -FEP_28_45 1.91 0.30 0.96 0 -FEP_33_37 3.10 0.20 0.63 0 -FEP_32_47 -32.46 0.34 1.07 0 -FEP_46_43 8.03 0.12 0.37 0 -FEP_26_23 -20.27 0.20 0.65 0 -FEP_28_29 21.89 0.34 1.06 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 46eacdd9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,69 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_32_27 2.6 0.276 1.23 0 -FEP_33_27 5.73 0.213 0.951 0 -FEP_30_27 1.01 0.312 1.4 0 -FEP_34_27 -5.45 0.603 2.7 0 -FEP_43_27 -0.19 0.603 2.7 0 -FEP_28_27 0.69 0.424 1.85 1 -FEP_37_27 2.1 0.657 2.94 0 -FEP_47_27 33.1 0.498 2.23 0 -FEP_46_27 6.64 0.537 2.4 0 -FEP_42_27 -4.44 1.32 5.9 0 -FEP_39_27 -2.86 1.58 6.88 1 -FEP_41_27 -0.56 1.28 4.98 5 -FEP_41_40 1.19 0.964 4.31 0 -FEP_39_38 -0.615 1.21 5.42 0 -FEP_40_38 -0.245 0.767 3.43 0 -FEP_32_33 -2.95 0.439 1.96 0 -FEP_35_33 -0.765 0.369 1.65 0 -FEP_36_33 -2.17 0.248 1.11 0 -FEP_37_33 -2.84 0.583 2.61 0 -FEP_38_30 -3.86 1.26 5.63 0 -FEP_31_30 -3.88 0.27 1.21 0 -FEP_34_31 -2.16 0.483 2.16 0 -FEP_43_47 -33.4 0.439 1.96 0 -FEP_43_46 -6.94 0.213 0.951 0 -FEP_36_35 -1.68 0.191 0.854 0 -FEP_37_35 -3.34 0.525 2.35 0 -FEP_52_35 2.43 0.455 2.03 0 -FEP_49_35 -10.2 0.427 1.91 0 -FEP_53_37 8.56 0.336 1.5 0 -FEP_50_37 -7.56 0.283 1.27 0 -FEP_37_67 32.7 0.391 1.75 0 -FEP_53_52 3.87 0.511 2.29 0 -FEP_58_53 -28.6 0.418 1.87 0 -FEP_54_53 -9.02 0.308 1.38 0 -FEP_53_63 18.7 0.314 1.4 0 -FEP_50_49 -0.865 0.334 1.46 1 -FEP_42_28 -4.86 0.611 2.73 0 -FEP_29_28 -21.9 0.836 3.74 0 -FEP_48_28 -5.61 0.508 2.27 0 -FEP_45_28 2.23 0.906 4.05 0 -FEP_44_28 -4.44 0.651 2.91 0 -FEP_54_42 6.33 0.278 1.24 0 -FEP_42_48 0.24 0.545 2.44 0 -FEP_51_42 -9.46 0.654 2.92 0 -FEP_44_42 0.335 0.367 1.64 0 -FEP_42_29 16.5 0.849 3.8 0 -FEP_42_45 -6.91 0.248 1.08 1 -FEP_54_68 37.4 0.368 1.65 0 -FEP_54_64 18.5 0.319 1.43 0 -FEP_54_51 15.4 0.705 3.15 0 -FEP_64_23 4.68 0.391 1.75 0 -FEP_64_63 -9.71 0.42 1.88 0 -FEP_64_68 18.0 0.426 1.91 0 -FEP_64_66 3.11 0.533 2.38 0 -FEP_62_23 -16.8 0.456 2.04 0 -FEP_62_66 -19.6 0.442 1.98 0 -FEP_66_65 -9.46 0.273 1.22 0 -FEP_65_60 2.3 0.233 1.04 0 -FEP_65_61 19.7 0.431 1.93 0 -FEP_65_63 -2.92 0.453 2.03 0 -FEP_63_60 5.2 0.396 1.77 0 -FEP_61_60 -17.9 0.506 2.26 0 -FEP_58_63 -10.1 0.273 1.22 0 -FEP_26_67 -11.9 0.4 1.74 1 -FEP_68_26 7.27 0.679 3.04 0 -FEP_57_26 6.75 0.492 2.2 0 -FEP_58_56 7.64 0.361 1.62 0 -FEP_57_56 -10.0 0.219 0.981 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index d9210b75..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,69 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_32_27 2.37 0.304 1.36 0 -FEP_33_27 4.25 0.292 1.31 0 -FEP_30_27 0.905 0.2 0.894 0 -FEP_34_27 -4.89 0.375 1.68 0 -FEP_43_27 -2.1 0.295 1.32 0 -FEP_28_27 2.5 0.496 2.22 0 -FEP_37_27 0.835 0.464 2.08 0 -FEP_47_27 35.4 0.368 1.65 0 -FEP_46_27 5.67 0.237 1.06 0 -FEP_42_27 -6.1 0.729 3.26 0 -FEP_39_27 -4.75 0.776 3.47 0 -FEP_41_27 -4.19 0.854 3.31 5 -FEP_41_40 2.71 0.881 3.94 0 -FEP_39_38 0.475 0.695 3.11 0 -FEP_40_38 -0.96 0.566 2.53 0 -FEP_32_33 -1.33 0.376 1.68 0 -FEP_35_33 -1.19 0.166 0.74 0 -FEP_36_33 -3.27 0.242 1.08 0 -FEP_37_33 -3.31 0.355 1.59 0 -FEP_38_30 -6.71 0.567 2.41 2 -FEP_31_30 -4.34 0.2 0.894 0 -FEP_34_31 -2.38 0.287 1.28 0 -FEP_43_47 -37.3 0.388 1.74 0 -FEP_43_46 -7.84 0.212 0.948 0 -FEP_36_35 -2.57 0.246 1.1 0 -FEP_37_35 -2.25 0.453 2.02 0 -FEP_52_35 4.04 0.394 1.76 0 -FEP_49_35 -9.63 0.29 1.3 0 -FEP_53_37 5.21 0.528 2.36 0 -FEP_50_37 -8.42 0.158 0.707 0 -FEP_37_67 35.9 0.403 1.8 0 -FEP_53_52 -0.395 0.291 1.3 0 -FEP_58_53 -29.2 0.311 1.39 0 -FEP_54_53 -7.88 0.26 1.16 0 -FEP_53_63 17.6 0.242 1.08 0 -FEP_50_49 -1.49 0.251 1.12 0 -FEP_42_28 -8.27 0.372 1.66 0 -FEP_29_28 -21.1 0.51 2.28 0 -FEP_48_28 -4.64 0.336 1.5 0 -FEP_45_28 -1.17 0.388 1.74 0 -FEP_44_28 -9.73 0.35 1.57 0 -FEP_54_42 4.33 0.184 0.825 0 -FEP_42_48 -3.72 0.318 1.42 0 -FEP_51_42 -9.94 0.332 1.49 0 -FEP_44_42 -1.25 0.262 1.17 0 -FEP_42_29 11.7 0.261 1.17 0 -FEP_42_45 -7.33 0.139 0.621 0 -FEP_54_68 33.4 0.478 2.14 0 -FEP_54_64 17.8 0.394 1.76 0 -FEP_54_51 14.1 0.64 2.86 0 -FEP_64_23 4.29 0.455 2.04 0 -FEP_64_63 -8.56 0.326 1.46 0 -FEP_64_68 15.1 0.275 1.23 0 -FEP_64_66 3.73 0.389 1.74 0 -FEP_62_23 -17.2 0.389 1.74 0 -FEP_62_66 -18.6 0.28 1.25 0 -FEP_66_65 -8.88 0.269 1.2 0 -FEP_65_60 1.68 0.158 0.707 0 -FEP_65_61 17.3 0.344 1.54 0 -FEP_65_63 -3.3 0.202 0.906 0 -FEP_63_60 5.0 0.117 0.523 0 -FEP_61_60 -16.1 0.35 1.57 0 -FEP_58_63 -11.6 0.158 0.707 0 -FEP_26_67 -9.5 0.368 1.65 0 -FEP_68_26 9.55 0.446 1.99 0 -FEP_57_26 5.61 0.424 1.9 0 -FEP_58_56 7.21 0.5 2.24 0 -FEP_57_56 -9.2 0.345 1.54 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/merged/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/merged/water.txt deleted file mode 100644 index c5b742f3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/merged/water.txt +++ /dev/null @@ -1,69 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_32_27 2.365 0.3041381265149111.36014705087354450 -FEP_33_27 4.255 0.29206163733020471.30613934938045580 -FEP_30_27 0.905 0.2 0.8944271909999160 -FEP_34_27 -4.8900000000000010.37536648758246921.67868996541946380 -FEP_43_27 -2.105 0.2952964612046681.32060592153753430 -FEP_28_27 2.505 0.49578221024962162.2172054483064940 -FEP_37_27 0.835 0.46400431032480722.0750903594783530 -FEP_47_27 35.4150000000000060.3679673898594821.64560019445793730 -FEP_46_27 5.665 0.237065391822593951.06018866245588580 -FEP_42_27 -6.1 0.72862884927787493.2585272747055540 -FEP_39_27 -4.75 0.77620873481300123.4713109915419570 -FEP_41_27 -4.18999999999999950.85445889310135913.30930506300038775 -FEP_41_40 2.715 0.88090862182180973.93954312071844240 -FEP_39_38 0.475000000000000030.69526973183074793.10934076614320350 -FEP_40_38 -0.96 0.56612719418872652.53179778023443270 -FEP_32_33 -1.33 0.375898922584250061.68107108713462820 -FEP_35_33 -1.185 0.165529453572468480.74027022093286990 -FEP_36_33 -3.27 0.241867732448956491.08166538263919690 -FEP_37_33 -3.315 0.354682957019364031.58619040471186850 -FEP_38_30 -6.715 0.56727418414731332.4067405344157892 -FEP_31_30 -4.34 0.2 0.8944271909999160 -FEP_34_31 -2.38 0.28653097563788811.2814054783713080 -FEP_43_47 -37.2600000000000050.3883297567789521.73666346768739290 -FEP_43_46 -7.845 0.211896201004170920.94762861923857080 -FEP_36_35 -2.57000000000000030.245967477524976861.1 0 -FEP_37_35 -2.245 0.452769256906870872.0248456731316590 -FEP_52_35 4.04 0.39408120990476061.76238474800481630 -FEP_49_35 -9.635 0.290000000000000041.29691942694987830 -FEP_53_37 5.21 0.52773099207835042.3600847442411890 -FEP_50_37 -8.42 0.158113883008418970.70710678118654760 -FEP_37_67 35.92 0.40311288741492751.80277563773199480 -FEP_53_52 -0.394999999999999960.29068883707497271.3 0 -FEP_58_53 -29.215 0.311448230047948751.3928388277184120 -FEP_54_53 -7.8800000000000010.26 1.16275534829989070 -FEP_53_63 17.6 0.24207436873820411.08258948821794880 -FEP_50_49 -1.49 0.250798724079689061.12160599142479620 -FEP_42_28 -8.265 0.37202150475476551.66373074744683370 -FEP_29_28 -21.07 0.50990195135927852.2803508501982760 -FEP_48_28 -4.6400000000000010.33600595232822891.5026643005009470 -FEP_45_28 -1.165 0.3883297567789521.73666346768739290 -FEP_44_28 -9.7250000000000010.35 1.56524758424985280 -FEP_54_42 4.335 0.184390889145857740.82462112512353210 -FEP_42_48 -3.72 0.318276609256790971.4233762678926470 -FEP_51_42 -9.9400000000000010.332415402771893241.48660687473185060 -FEP_44_42 -1.245 0.2617250465660481.17046999107196250 -FEP_42_29 11.6550000000000010.2607680962081061.16619037896906020 -FEP_42_45 -7.33 0.138924439894498040.62128898268036270 -FEP_54_68 33.3799999999999950.477598157450382142.13588389197540440 -FEP_54_64 17.8 0.393573373083088541.7601136326953440 -FEP_54_51 14.11 0.64031242374328492.8635642126552710 -FEP_64_23 4.29 0.455411901469427952.03666393889615450 -FEP_64_63 -8.56 0.32572994949804661.45670861877041150 -FEP_64_68 15.05 0.27459060435491961.22800651464070020 -FEP_64_66 3.735 0.38897300677553451.73954016912516280 -FEP_62_23 -17.1850000000000020.389486841883008971.74183810958424060 -FEP_62_66 -18.6049999999999970.280178514522437971.25299640861416670 -FEP_66_65 -8.885 0.269258240356725241.20415945787922980 -FEP_65_60 1.675 0.158113883008418970.70710678118654760 -FEP_65_61 17.3149999999999980.34409301068170511.53883072493370790 -FEP_65_63 -3.3 0.20248456731316590.90553851381374170 -FEP_63_60 5.005 0.117046999107196250.5234500931320960 -FEP_61_60 -16.1349999999999980.35 1.56524758424985280 -FEP_58_63 -11.6299999999999990.158113883008418970.70710678118654760 -FEP_26_67 -9.5049999999999990.3679673898594821.64560019445793730 -FEP_68_26 9.555 0.44598206241955521.99449241663135960 -FEP_57_26 5.605 0.42449970553582251.8984203960134860 -FEP_58_56 7.215 0.5 2.236067977499790 -FEP_57_56 -9.195 0.344818792991333331.54207652209609880 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/x2sampling/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/x2sampling/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index 21b387e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/x2sampling/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -FEP_68_54 protein/ -FEP_67_60 water/ -FEP_68_54 water/ -FEP_66_62 water/ -FEP_67_37 water/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/x2sampling/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/x2sampling/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index c7c4c44a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/x2sampling/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,64 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_33_37 2.55 0.48 1.50 0 -FEP_32_46 -3.69 0.17 0.55 1 -FEP_23_64 -4.68 0.22 0.68 0 -FEP_37_56 27.53 0.23 0.72 0 -FEP_35_52 -2.55 0.32 1.02 0 -FEP_61_50 -24.70 0.19 0.61 0 -FEP_45_42 6.67 0.29 0.90 0 -FEP_49_50 0.66 0.16 0.50 0 -FEP_67_60 -18.47 0.20 0.62 0 -FEP_51_54 -15.29 0.36 1.15 0 -FEP_42_54 -6.12 0.25 0.80 0 -FEP_33_64 23.58 0.76 2.41 3 -FEP_27_33 -6.12 0.23 0.72 0 -FEP_37_54 0.97 0.31 0.97 0 -FEP_27_34 5.09 0.27 0.87 1 -FEP_26_23 -21.55 0.27 0.84 0 -FEP_27_32 -2.99 0.20 0.62 0 -FEP_42_51 8.50 0.51 1.63 0 -FEP_48_42 0.39 0.51 1.62 0 -FEP_63_58 9.63 0.16 0.50 0 -FEP_28_29 22.52 0.37 1.16 0 -FEP_27_28 -1.13 0.38 1.20 1 -FEP_32_43 3.62 0.43 1.37 1 -FEP_64_54 -18.76 0.41 1.29 6 -FEP_60_63 -5.37 0.27 0.84 0 -FEP_27_38 -0.92 0.59 1.88 1 -FEP_47_43 32.67 0.26 0.82 8 -FEP_26_57 -7.67 0.48 1.51 1 -FEP_31_34 2.68 0.44 1.40 1 -FEP_60_65 -2.36 0.28 0.90 0 -FEP_35_49 9.79 0.20 0.64 0 -FEP_39_41 -0.83 0.52 1.63 0 -FEP_27_39 3.22 0.81 2.56 0 -FEP_65_61 19.98 0.43 1.37 0 -FEP_30_32 -2.05 0.25 0.80 0 -FEP_56_58 -8.06 0.21 0.68 0 -FEP_32_47 -30.60 0.16 0.51 1 -FEP_28_44 3.75 0.35 1.12 0 -FEP_30_31 4.07 0.11 0.35 0 -FEP_28_42 5.42 0.57 1.79 0 -FEP_23_66 -2.42 0.32 1.01 0 -FEP_23_62 16.67 0.41 1.30 0 -FEP_56_57 10.01 0.30 0.96 0 -FEP_27_41 -0.77 0.60 1.89 3 -FEP_52_53 -4.63 0.23 0.71 0 -FEP_28_45 -1.72 0.33 1.03 0 -FEP_60_61 17.22 0.32 1.00 0 -FEP_27_30 -0.94 0.23 0.74 0 -FEP_35_36 1.56 0.21 0.66 1 -FEP_46_43 6.93 0.20 0.64 0 -FEP_38_40 0.83 0.37 1.17 0 -FEP_27_40 1.20 0.45 1.43 5 -FEP_66_62 19.26 0.31 0.98 0 -FEP_37_53 -8.10 0.39 1.23 0 -FEP_26_68 -7.31 0.36 1.14 1 -FEP_33_36 1.69 0.19 0.60 1 -FEP_67_37 -32.99 0.27 0.86 0 -FEP_28_48 5.16 0.37 1.17 0 -FEP_33_35 0.37 0.18 0.56 2 -FEP_35_37 3.20 0.24 0.77 1 -FEP_29_42 -15.45 0.60 1.89 1 -FEP_42_44 -0.81 0.20 0.63 0 -FEP_37_50 7.48 0.08 0.24 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/x2sampling/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/x2sampling/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 922517a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/4.MCL1/x2sampling/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,61 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_33_37 3.33 0.24 0.75 0 -FEP_32_46 -1.35 0.12 0.37 0 -FEP_23_64 -4.76 0.29 0.91 0 -FEP_37_56 30.80 0.39 1.25 0 -FEP_35_52 -3.87 0.35 1.12 0 -FEP_61_50 -25.03 0.09 0.27 0 -FEP_45_42 7.44 0.17 0.54 0 -FEP_49_50 1.58 0.17 0.54 0 -FEP_51_54 -15.01 0.96 3.02 0 -FEP_42_54 -4.63 0.11 0.35 0 -FEP_33_64 23.56 0.21 0.68 0 -FEP_27_33 -4.59 0.21 0.68 0 -FEP_37_54 3.25 0.27 0.84 0 -FEP_27_34 4.86 0.26 0.83 0 -FEP_26_23 -20.72 0.29 0.91 0 -FEP_27_32 -2.71 0.25 0.79 0 -FEP_42_51 10.38 0.33 1.05 0 -FEP_48_42 3.50 0.26 0.84 0 -FEP_63_58 11.30 0.17 0.55 0 -FEP_28_29 21.83 0.44 1.38 0 -FEP_27_28 -2.25 0.16 0.51 0 -FEP_32_43 6.39 0.13 0.41 0 -FEP_64_54 -17.33 0.11 0.35 1 -FEP_60_63 -5.14 0.14 0.44 0 -FEP_27_38 7.18 0.95 3.00 0 -FEP_47_43 37.53 0.28 0.88 0 -FEP_26_57 -6.27 0.25 0.78 0 -FEP_31_34 1.63 0.12 0.37 0 -FEP_60_65 -1.59 0.10 0.32 0 -FEP_35_49 9.46 0.34 1.07 0 -FEP_39_41 0.22 0.31 0.99 0 -FEP_27_39 5.51 0.76 2.40 0 -FEP_65_61 17.28 0.33 1.04 5 -FEP_30_32 -1.66 0.22 0.70 0 -FEP_56_58 -7.47 0.23 0.72 0 -FEP_32_47 -31.62 0.35 1.10 0 -FEP_28_44 10.01 0.27 0.86 0 -FEP_30_31 5.06 0.24 0.76 0 -FEP_28_42 9.15 0.17 0.55 0 -FEP_23_66 -1.35 0.23 0.73 0 -FEP_23_62 17.87 0.25 0.78 0 -FEP_56_57 9.68 0.14 0.44 0 -FEP_27_41 4.45 0.87 2.74 1 -FEP_52_53 1.36 0.39 1.23 0 -FEP_28_45 1.89 0.20 0.65 0 -FEP_60_61 16.23 0.17 0.53 0 -FEP_27_30 -1.17 0.16 0.50 0 -FEP_35_36 3.85 0.19 0.61 0 -FEP_46_43 7.96 0.16 0.52 0 -FEP_38_40 1.68 0.45 1.43 0 -FEP_27_40 6.19 1.01 3.21 2 -FEP_37_53 -5.54 0.37 1.17 0 -FEP_26_68 -9.81 0.42 1.34 0 -FEP_33_36 2.90 0.19 0.62 0 -FEP_28_48 4.93 0.22 0.69 0 -FEP_33_35 1.10 0.28 0.89 0 -FEP_35_37 2.52 0.41 1.30 0 -FEP_29_42 -11.66 0.38 1.19 0 -FEP_42_44 0.98 0.14 0.45 0 -FEP_37_50 8.47 0.07 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 974cc5e7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,45 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_23470_23468 10.70 0.39 1.24 0 -FEP_23471_23466 8.93 0.34 1.09 0 -FEP_23330-2qbq-_23475 -13.47 0.48 1.52 0 -FEP_23486_23484 1.29 0.19 0.61 0 -FEP_20667-2qbp-_23482 -33.38 0.48 1.51 0 -FEP_23469_20669-2qbr- -0.59 0.26 0.81 0 -FEP_23476_23475 -2.73 0.28 0.88 0 -FEP_20667-2qbp-_23483 21.62 0.66 2.08 0 -FEP_23467_23466 -8.26 0.40 1.25 0 -FEP_23471_23468 0.72 0.43 1.37 0 -FEP_20667-2qbp-_23484 0.93 0.38 1.20 0 -FEP_23480_23482 -53.57 0.47 1.47 0 -FEP_20669-2qbr-_23473 10.03 0.33 1.05 0 -FEP_23471_23467 17.04 0.34 1.07 0 -FEP_23472_23471 10.21 0.35 1.09 0 -FEP_20667-2qbp-_23485 3.68 0.19 0.60 0 -FEP_23469_23471 -11.66 0.32 1.01 0 -FEP_23482_23476 53.72 0.22 0.71 0 -FEP_23480_23479 -1.18 0.29 0.91 0 -FEP_20667-2qbp-_23486 -0.21 0.14 0.45 0 -FEP_23477_23475 -6.86 0.19 0.60 0 -FEP_23486_23485 3.60 0.15 0.48 0 -FEP_23476_20670-2qbs- -0.22 0.23 0.73 0 -FEP_23330-2qbq-_23476 -11.58 0.45 1.42 0 -FEP_23470_23471 11.30 1.07 3.37 0 -FEP_23474_20669-2qbr- 0.25 0.23 0.74 0 -FEP_23479_23476 4.36 0.46 1.45 0 -FEP_23479_23475 1.81 0.19 0.60 0 -FEP_23473_23467 -4.40 0.58 1.84 1 -FEP_23483_23482 -54.41 0.28 0.90 0 -FEP_23482_23479 50.48 0.54 1.71 0 -FEP_20670-2qbs-_23477 4.82 0.18 0.57 0 -FEP_23472_20669-2qbr- 20.53 0.26 0.81 0 -FEP_23476_23474 2.43 0.37 1.18 0 -FEP_20670-2qbs-_23475 -2.02 0.18 0.56 0 -FEP_23475_23468 -4.38 0.31 0.97 0 -FEP_23469_23468 -10.46 0.44 1.39 0 -FEP_23474_23475 -4.79 0.27 0.87 0 -FEP_23482_23475 51.20 0.68 2.14 0 -FEP_23468_23466 8.18 0.57 1.81 0 -FEP_23472_23469 20.45 0.67 2.12 0 -FEP_23468_23471 0.28 0.33 1.05 0 -FEP_23476_23477 4.39 0.20 0.64 0 -FEP_23468_23467 16.91 0.49 1.55 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index d8ee1ea4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,45 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_23470_23468 11.46 0.27 0.85 0 -FEP_23471_23466 9.16 0.27 0.87 0 -FEP_23330-2qbq-_23475 -17.00 0.33 1.03 0 -FEP_23486_23484 -1.19 0.15 0.47 0 -FEP_20667-2qbp-_23482 -35.03 0.58 1.84 1 -FEP_23469_20669-2qbr- 1.14 0.26 0.82 0 -FEP_23476_23475 -3.48 0.16 0.51 0 -FEP_20667-2qbp-_23483 20.84 0.36 1.13 0 -FEP_23467_23466 -7.80 0.16 0.50 0 -FEP_23471_23468 1.11 0.84 2.65 0 -FEP_20667-2qbp-_23484 -0.15 0.22 0.69 0 -FEP_23480_23482 -50.32 0.27 0.87 0 -FEP_20669-2qbr-_23473 9.80 0.11 0.35 0 -FEP_23471_23467 17.66 0.38 1.20 0 -FEP_23472_23471 5.79 0.72 2.28 2 -FEP_20667-2qbp-_23485 0.73 0.12 0.37 0 -FEP_23469_23471 -13.83 0.87 2.74 2 -FEP_23482_23476 53.58 0.29 0.92 0 -FEP_23480_23479 -1.16 0.18 0.56 0 -FEP_20667-2qbp-_23486 1.04 0.20 0.62 0 -FEP_23477_23475 -6.96 0.20 0.63 0 -FEP_23486_23485 -0.13 0.24 0.77 0 -FEP_23476_20670-2qbs- -0.80 0.34 1.08 0 -FEP_23330-2qbq-_23476 -13.02 0.25 0.81 0 -FEP_23470_23471 11.49 0.38 1.20 0 -FEP_23474_20669-2qbr- -1.11 0.35 1.11 0 -FEP_23479_23476 4.74 0.26 0.84 0 -FEP_23479_23475 0.98 0.28 0.87 0 -FEP_23473_23467 -7.77 0.61 1.94 0 -FEP_23483_23482 -55.53 0.31 0.99 0 -FEP_23482_23479 49.11 0.25 0.78 0 -FEP_20670-2qbs-_23477 4.55 0.15 0.47 0 -FEP_23472_20669-2qbr- 21.34 0.34 1.07 0 -FEP_23476_23474 2.59 0.52 1.64 0 -FEP_20670-2qbs-_23475 -2.58 0.22 0.70 0 -FEP_23475_23468 -7.17 0.11 0.35 0 -FEP_23472_23469 21.57 0.52 1.65 0 -FEP_23474_23475 -6.18 0.26 0.82 0 -FEP_23468_23466 8.20 0.25 0.80 0 -FEP_23482_23475 49.89 0.32 1.02 0 -FEP_23469_23468 -11.20 0.22 0.70 0 -FEP_23468_23471 -0.75 0.41 1.30 0 -FEP_23476_23477 2.94 0.29 0.92 0 -FEP_23468_23467 16.23 0.30 0.94 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 3cc9cb09..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,36 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_23476_20670-2qbs- -0.225 0.251 1.12 0 -FEP_23476_23474 2.08 0.476 1.96 3 -FEP_23330-2qbq-_23476 -11.8 0.57 2.55 0 -FEP_23476_23475 -3.02 0.382 1.71 0 -FEP_23479_23476 4.32 0.544 2.43 0 -FEP_23482_23476 53.2 0.372 1.66 0 -FEP_20670-2qbs-_23475 -2.46 0.241 1.08 0 -FEP_20670-2qbs-_23477 4.71 0.216 0.943 1 -FEP_23477_23475 -6.99 0.255 1.14 0 -FEP_23479_23475 1.42 0.291 1.23 2 -FEP_23330-2qbq-_23475 -14.6 0.52 2.14 3 -FEP_23480_23479 -1.38 0.352 1.58 0 -FEP_23482_23479 49.3 0.822 3.68 0 -FEP_23480_23482 -52.6 0.885 3.96 0 -FEP_23483_23482 -54.8 0.464 2.08 0 -FEP_20667-2qbp-_23482 -33.7 0.874 3.91 0 -FEP_20667-2qbp-_23483 21.8 0.846 3.79 0 -FEP_20667-2qbp-_23486 -0.34 0.22 0.985 0 -FEP_20667-2qbp-_23485 3.66 0.236 1.06 0 -FEP_20667-2qbp-_23484 0.54 0.455 2.03 0 -FEP_23486_23485 4.03 0.258 1.15 0 -FEP_23486_23484 0.775 0.269 1.2 0 -FEP_23474_20669-2qbr- 0.365 0.41 1.84 0 -FEP_23469_20669-2qbr- -0.6 0.485 2.17 0 -FEP_20669-2qbr-_23473 9.69 0.376 1.68 0 -FEP_23472_20669-2qbr- 20.5 0.59 2.64 0 -FEP_23469_23471 -12.2 0.482 2.15 0 -FEP_23471_23468 0.97 0.644 2.88 0 -FEP_23470_23471 11.3 1.17 5.23 0 -FEP_23471_23467 16.8 0.556 2.49 0 -FEP_23472_23471 8.29 1.16 5.2 0 -FEP_23471_23466 8.64 0.525 2.35 0 -FEP_23470_23468 10.7 0.626 2.8 0 -FEP_23467_23466 -7.78 0.477 2.13 0 -FEP_23473_23467 -5.4 1.26 5.5 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index ceb29527..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,36 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_23476_20670-2qbs- -0.61 0.428 1.91 0 -FEP_23476_23474 2.18 0.701 3.13 0 -FEP_23330-2qbq-_23476 -13.1 0.361 1.61 0 -FEP_23476_23475 -3.44 0.297 1.33 0 -FEP_23479_23476 4.69 0.537 2.4 0 -FEP_23482_23476 53.3 0.364 1.63 0 -FEP_20670-2qbs-_23475 -2.42 0.261 1.17 0 -FEP_20670-2qbs-_23477 4.18 0.234 1.05 0 -FEP_23477_23475 -6.91 0.276 1.23 0 -FEP_23479_23475 1.2 0.344 1.54 0 -FEP_23330-2qbq-_23475 -16.9 0.408 1.82 0 -FEP_23480_23479 -1.32 0.248 1.11 0 -FEP_23482_23479 48.9 0.361 1.61 0 -FEP_23480_23482 -50.4 0.336 1.5 0 -FEP_23483_23482 -55.5 0.438 1.96 0 -FEP_20667-2qbp-_23482 -35.7 1.09 4.74 1 -FEP_20667-2qbp-_23483 20.8 0.438 1.96 0 -FEP_20667-2qbp-_23486 0.705 0.224 1.0 0 -FEP_20667-2qbp-_23485 0.54 0.251 1.12 0 -FEP_20667-2qbp-_23484 0.03 0.278 1.24 0 -FEP_23486_23485 -0.14 0.288 1.29 0 -FEP_23486_23484 -0.975 0.227 1.01 0 -FEP_23474_20669-2qbr- -1.03 0.413 1.85 0 -FEP_23469_20669-2qbr- 0.7 0.311 1.39 0 -FEP_20669-2qbr-_23473 9.86 0.156 0.696 0 -FEP_23472_20669-2qbr- 21.2 0.38 1.7 0 -FEP_23469_23471 -13.2 0.911 3.86 2 -FEP_23471_23468 0.645 0.874 3.91 0 -FEP_23470_23471 11.4 0.497 2.22 0 -FEP_23471_23467 17.4 0.472 2.11 0 -FEP_23472_23471 5.71 1.16 4.92 2 -FEP_23471_23466 9.25 0.404 1.8 0 -FEP_23470_23468 11.0 0.382 1.71 0 -FEP_23467_23466 -7.67 0.28 1.25 0 -FEP_23473_23467 -8.09 0.815 3.46 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/merged/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/merged/water.txt deleted file mode 100644 index 328d5897..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/5.PTP1B/merged/water.txt +++ /dev/null @@ -1,36 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_23476_20670-2qbs- -0.61 0.428018691180653941.91415777824086390 -FEP_23476_23474 2.17999999999999970.70092795635500233.1346451154795820 -FEP_23330-2qbq-_23476 -13.085 0.36069377593742871.6130716041143370 -FEP_23476_23475 -3.435 0.29681644159311661.32740348048360950 -FEP_23479_23476 4.68999999999999950.53712196007983142.40208242989286270 -FEP_23482_23476 53.325 0.36400549446402591.62788205960997080 -FEP_20670-2qbs-_23475 -2.415 0.2607680962081061.16619037896906020 -FEP_20670-2qbs-_23477 4.185 0.234307490277199631.0478549517943790 -FEP_23477_23475 -6.91 0.27586228448267441.23369364106329080 -FEP_23479_23475 1.2 0.34409301068170511.53883072493370790 -FEP_23330-2qbq-_23475 -16.85 0.40804411526206331.8248287590894660 -FEP_23480_23479 -1.31999999999999980.247588368062798961.1072488428533130 -FEP_23482_23479 48.885 0.36069377593742871.6130716041143370 -FEP_23480_23482 -50.44 0.33600595232822891.5026643005009470 -FEP_23483_23482 -55.5049999999999950.438406204335659471.96061214930439530 -FEP_20667-2qbp-_23482 -35.705 1.0875660899458024.7405906804954171 -FEP_20667-2qbp-_23483 20.8 0.43829214001622251.96010203816025870 -FEP_20667-2qbp-_23486 0.70500000000000010.2236067977499791.00000000000000020 -FEP_20667-2qbp-_23485 0.54 0.250599281722833361.1207140580897520 -FEP_20667-2qbp-_23484 0.03 0.27802877548915691.24338248338956440 -FEP_23486_23485 -0.14 0.28844410203711911.2899612397277680 -FEP_23486_23484 -0.975 0.226715680975092681.01390334845092610 -FEP_23474_20669-2qbr- -1.03 0.413400532171887771.84878338374185970 -FEP_23469_20669-2qbr- 0.7 0.310644491340181351.38924439894498050 -FEP_20669-2qbr-_23473 9.86 0.155563491861040460.69570108523704350 -FEP_23472_20669-2qbr- 21.235 0.380131556174964251.70000000000000020 -FEP_23469_23471 -13.195 0.91093358704133853.86476389964509932 -FEP_23471_23468 0.645 0.87361318671366223.90691694306392940 -FEP_23470_23471 11.395 0.496789693934968862.22171105231981070 -FEP_23471_23467 17.3849999999999980.472016948848237862.1109239683134020 -FEP_23472_23471 5.715 1.16038786618957724.9231087739354292 -FEP_23471_23466 9.2549999999999990.403608721412211271.80499307477895870 -FEP_23470_23468 10.97 0.38183766184073571.7076299364909250 -FEP_23467_23466 -7.67 0.280178514522437971.25299640861416670 -FEP_23473_23467 -8.085 0.81467785044151043.45638539517803172 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 18ccf2b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_6e_6b 2.61 0.21 0.66 0 -FEP_3b_5 6.10 0.28 0.89 0 -FEP_1c_5 5.68 0.55 1.73 0 -FEP_3b_3a 2.13 0.21 0.65 0 -FEP_3a_5 3.18 0.30 0.96 0 -FEP_6a_1b 1.90 0.35 1.11 0 -FEP_7a_3a -1.17 0.17 0.52 0 -FEP_6b_7a 1.72 0.35 1.12 0 -FEP_1b_1a 2.59 0.19 0.62 0 -FEP_1b_1c -1.34 0.22 0.69 0 -FEP_1b_5 4.61 0.46 1.47 0 -FEP_6a_6b 2.88 0.30 0.96 0 -FEP_6e_6a 0.17 0.23 0.74 0 -FEP_1b_1d -2.57 0.33 1.04 0 -FEP_1a_5 2.36 0.21 0.68 0 -FEP_1d_5 7.03 0.62 1.97 0 -FEP_6b_6e -3.12 0.21 0.68 0 -FEP_6a_6e -0.36 0.16 0.52 0 -FEP_6b_6a -2.33 0.20 0.63 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index aa2e9620..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,20 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_6e_6b 2.15 0.15 0.46 0 -FEP_3b_5 3.08 0.21 0.65 0 -FEP_1c_5 3.28 0.14 0.44 0 -FEP_3b_3a -1.36 0.06 0.18 0 -FEP_3a_5 2.52 0.08 0.26 0 -FEP_6a_1b 1.80 0.18 0.56 0 -FEP_7a_3a -0.56 0.20 0.62 0 -FEP_6b_7a 0.12 0.27 0.85 0 -FEP_1b_1a 0.36 0.17 0.54 0 -FEP_1b_1c -0.73 0.28 0.88 0 -FEP_1b_5 2.73 0.18 0.58 0 -FEP_6a_6b 1.83 0.21 0.67 0 -FEP_6e_6a 0.57 0.15 0.49 0 -FEP_1b_1d -0.60 0.21 0.66 0 -FEP_1a_5 2.46 0.15 0.47 0 -FEP_1d_5 4.08 0.13 0.42 0 -FEP_6b_6a -1.53 0.14 0.43 0 -FEP_6a_6e -0.44 0.09 0.29 0 -FEP_6b_6e -2.30 0.14 0.45 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index f5e623e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_6e_6a 0.195 0.298 1.33 0 -FEP_6e_6b 2.42 0.247 1.1 0 -FEP_6a_6b 2.71 0.366 1.64 0 -FEP_6a_1b 1.94 0.461 2.06 0 -FEP_6b_7a 1.73 0.703 3.15 0 -FEP_7a_3a -1.48 0.886 3.96 0 -FEP_1b_5 4.42 0.644 2.88 0 -FEP_1b_1d -2.58 0.397 1.77 0 -FEP_1b_1a 2.68 0.322 1.44 0 -FEP_1b_1c -1.61 0.297 1.33 0 -FEP_1d_5 7.17 0.796 3.56 0 -FEP_1a_5 2.41 0.283 1.27 0 -FEP_3a_5 3.2 0.378 1.69 0 -FEP_1c_5 5.76 0.785 3.42 1 -FEP_3b_5 5.59 0.382 1.71 0 -FEP_3b_3a 1.93 0.304 1.36 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 1689fe04..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_6e_6a 0.55 0.166 0.74 0 -FEP_6e_6b 2.27 0.192 0.859 0 -FEP_6a_6b 1.88 0.225 1.0 0 -FEP_6a_1b 1.76 0.206 0.921 0 -FEP_6b_7a 0.165 0.309 1.38 0 -FEP_7a_3a -0.545 0.276 1.23 0 -FEP_1b_5 2.68 0.248 1.11 0 -FEP_1b_1d -0.515 0.242 1.08 0 -FEP_1b_1a 0.475 0.188 0.84 0 -FEP_1b_1c -0.53 0.291 1.3 0 -FEP_1d_5 3.71 0.222 0.993 0 -FEP_1a_5 2.42 0.198 0.888 0 -FEP_3a_5 2.38 0.17 0.76 0 -FEP_1c_5 3.33 0.161 0.721 0 -FEP_3b_5 2.78 0.258 1.15 0 -FEP_3b_3a -0.43 0.117 0.522 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/merged/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/merged/water.txt deleted file mode 100644 index 9bf2ef3c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/6.Thrombin/merged/water.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_6e_6a 0.55 0.165529453572468480.74027022093286990 -FEP_6e_6b 2.275 0.192093727122985470.85906926379658130 -FEP_6a_6b 1.875 0.224722050542442321.00498756211208920 -FEP_6a_1b 1.76 0.205912602819740.9208691546577070 -FEP_6b_7a 0.164999999999999980.308868904229610051.38130373198656090 -FEP_7a_3a -0.545 0.27586228448267441.23369364106329080 -FEP_1b_5 2.67999999999999970.247588368062798961.1072488428533130 -FEP_1b_1d -0.515 0.241867732448956491.08166538263919690 -FEP_1b_1a 0.475 0.187882942280559380.84023806150400030 -FEP_1b_1c -0.53 0.291204395571220741.30230564768797660 -FEP_1d_5 3.705 0.222036033111745160.99297532698451270 -FEP_1a_5 2.415 0.19849433241279210.88769364084688610 -FEP_3a_5 2.385 0.169999999999999980.76026311234992850 -FEP_1c_5 3.325 0.1612451549659710.72111025509279790 -FEP_3b_5 2.78000000000000020.25806975801127881.15412304370028070 -FEP_3b_3a -0.430000000000000050.116619037896906020.5215361924162120 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 8ed73b10..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,28 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_ejm-43_ejm-31 -0.54 0.35 1.12 0 -FEP_ejm-48_ejm-46 -7.56 0.24 0.77 0 -FEP_jmc-28_ejm-46 -6.41 0.19 0.59 0 -FEP_ejm-46_ejm-42 0.53 0.15 0.46 0 -FEP_jmc-27_jmc-28 6.28 0.10 0.33 0 -FEP_ejm-49_ejm-31 -11.67 0.36 1.14 0 -FEP_ejm-42_ejm-31 -0.80 0.14 0.46 1 -FEP_ejm-42_ejm-55 -6.29 0.16 0.51 0 -FEP_ejm-55_ejm-31 5.15 0.17 0.53 1 -FEP_ejm-44_ejm-43 -1.48 0.18 0.56 0 -FEP_jmc-28_jmc-23 -6.46 0.22 0.69 1 -FEP_ejm-50_ejm-31 2.30 0.11 0.35 0 -FEP_ejm-54_ejm-42 5.87 0.17 0.53 0 -FEP_ejm-45_ejm-46 -8.35 0.22 0.68 0 -FEP_jmc-27_ejm-46 -0.27 0.21 0.68 0 -FEP_ejm-45_ejm-50 -12.82 0.52 1.64 1 -FEP_ejm-54_ejm-31 5.05 0.22 0.70 0 -FEP_ejm-43_ejm-55 -5.90 0.25 0.79 0 -FEP_ejm-48_ejm-47 -3.31 0.17 0.55 1 -FEP_ejm-47_ejm-46 -4.21 0.11 0.35 0 -FEP_jmc-30_jmc-28 25.49 0.48 1.50 1 -FEP_ejm-50_ejm-42 3.36 0.16 0.52 1 -FEP_jmc-30_jmc-27 19.07 0.22 0.71 0 -FEP_ejm-45_ejm-42 -8.32 0.10 0.32 0 -FEP_ejm-49_ejm-43 -11.24 0.21 0.66 1 -FEP_jmc-27_jmc-23 0.26 0.15 0.49 0 -FEP_ejm-44_ejm-31 -2.45 0.44 1.40 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 5cb9ee85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,28 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_ejm-50_ejm-42 3.98 0.18 0.57 0 -FEP_ejm-54_ejm-42 6.19 0.27 0.86 0 -FEP_ejm-48_ejm-47 -3.21 0.27 0.86 0 -FEP_jmc-27_jmc-23 0.61 0.36 1.15 0 -FEP_ejm-44_ejm-43 -0.66 0.40 1.25 0 -FEP_jmc-30_jmc-27 19.52 0.30 0.95 0 -FEP_jmc-28_ejm-46 -7.12 0.35 1.11 0 -FEP_ejm-43_ejm-31 -1.46 0.20 0.64 0 -FEP_jmc-27_ejm-46 -0.62 0.30 0.95 0 -FEP_jmc-30_jmc-28 26.02 0.21 0.65 0 -FEP_ejm-43_ejm-55 -5.52 0.21 0.66 0 -FEP_ejm-49_ejm-31 -12.34 0.31 0.98 0 -FEP_ejm-50_ejm-31 2.06 0.30 0.95 0 -FEP_ejm-44_ejm-31 -1.16 0.20 0.65 0 -FEP_ejm-46_ejm-42 -0.43 0.22 0.70 0 -FEP_ejm-48_ejm-46 -6.96 0.27 0.85 0 -FEP_ejm-54_ejm-31 4.56 0.40 1.27 0 -FEP_ejm-45_ejm-50 -12.81 0.24 0.76 0 -FEP_ejm-42_ejm-55 -6.59 0.37 1.17 0 -FEP_ejm-47_ejm-46 -3.75 0.43 1.35 0 -FEP_ejm-45_ejm-42 -8.44 0.28 0.88 0 -FEP_jmc-28_jmc-23 -5.94 0.36 1.13 0 -FEP_jmc-27_jmc-28 6.35 0.26 0.81 0 -FEP_ejm-42_ejm-31 -2.55 0.23 0.74 0 -FEP_ejm-49_ejm-43 -10.18 0.23 0.72 0 -FEP_ejm-55_ejm-31 3.18 0.31 0.97 0 -FEP_ejm-45_ejm-46 -8.02 0.33 1.04 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 94884e43..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,25 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_ejm-48_ejm-47 -3.57 0.225 0.98 1 -FEP_ejm-47_ejm-46 -4.27 0.184 0.821 0 -FEP_ejm-47_jmc-27 -4.08 0.266 1.16 1 -FEP_ejm-48_ejm-46 -8.46 0.233 1.02 1 -FEP_jmc-27_ejm-46 -0.52 0.233 1.02 1 -FEP_ejm-45_ejm-46 -8.91 0.198 0.863 1 -FEP_ejm-49_ejm-46 -11.9 0.33 1.32 4 -FEP_jmc-27_jmc-28 6.54 0.166 0.74 0 -FEP_jmc-27_jmc-23 0.285 0.209 0.934 0 -FEP_jmc-30_jmc-27 19.2 0.35 1.52 1 -FEP_jmc-28_jmc-23 -6.1 0.283 1.17 3 -FEP_jmc-30_jmc-28 25.4 0.354 1.54 1 -FEP_ejm-45_ejm-50 -11.6 0.297 1.33 0 -FEP_ejm-50_ejm-42 3.11 0.246 1.1 0 -FEP_ejm-42_ejm-31 -0.93 0.178 0.796 0 -FEP_ejm-54_ejm-42 5.78 0.142 0.62 1 -FEP_ejm-42_ejm-55 -5.98 0.17 0.742 1 -FEP_ejm-55_ejm-31 4.93 0.215 0.963 0 -FEP_ejm-54_ejm-31 4.74 0.186 0.811 1 -FEP_ejm-43_ejm-31 -0.675 0.191 0.833 1 -FEP_ejm-44_ejm-31 -2.75 0.468 1.93 3 -FEP_ejm-49_ejm-31 -13.1 0.585 2.48 2 -FEP_ejm-43_ejm-55 -5.95 0.262 1.17 0 -FEP_ejm-44_ejm-55 -7.63 0.488 2.13 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 8d7a5e7b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,25 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_ejm-48_ejm-47 -2.61 0.466 2.08 0 -FEP_ejm-47_ejm-46 -3.79 0.347 1.55 0 -FEP_ejm-47_jmc-27 -2.87 0.466 2.08 0 -FEP_ejm-48_ejm-46 -6.94 0.192 0.859 0 -FEP_jmc-27_ejm-46 -0.905 0.374 1.67 0 -FEP_ejm-45_ejm-46 -8.04 0.332 1.49 0 -FEP_ejm-49_ejm-46 -9.34 0.44 1.97 0 -FEP_jmc-27_jmc-28 6.57 0.341 1.52 0 -FEP_jmc-27_jmc-23 -0.36 0.366 1.64 0 -FEP_jmc-30_jmc-27 19.6 0.319 1.43 0 -FEP_jmc-28_jmc-23 -6.13 0.412 1.84 0 -FEP_jmc-30_jmc-28 26.0 0.38 1.7 0 -FEP_ejm-45_ejm-50 -12.7 0.322 1.44 0 -FEP_ejm-50_ejm-42 4.2 0.292 1.3 0 -FEP_ejm-42_ejm-31 -2.0 0.461 2.06 0 -FEP_ejm-54_ejm-42 6.11 0.282 1.26 0 -FEP_ejm-42_ejm-55 -5.37 0.272 1.22 0 -FEP_ejm-55_ejm-31 3.39 0.364 1.63 0 -FEP_ejm-54_ejm-31 4.47 0.416 1.86 0 -FEP_ejm-43_ejm-31 -0.68 0.427 1.91 0 -FEP_ejm-44_ejm-31 -1.18 0.424 1.9 0 -FEP_ejm-49_ejm-31 -11.7 0.331 1.48 0 -FEP_ejm-43_ejm-55 -5.08 0.268 1.2 0 -FEP_ejm-44_ejm-55 -5.94 0.419 1.87 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/merged/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/merged/water.txt deleted file mode 100644 index 28e912b0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/7.Tyk2/merged/water.txt +++ /dev/null @@ -1,25 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_ejm-48_ejm-47 -2.61000000000000030.466154480832266572.08470621431414170 -FEP_ejm-47_ejm-46 -3.795 0.34669871646719431.55048379546514450 -FEP_ejm-47_jmc-27 -2.865 0.466154480832266572.08470621431414170 -FEP_ejm-48_ejm-46 -6.93999999999999950.192093727122985470.85906926379658130 -FEP_jmc-27_ejm-46 -0.905 0.37443290453698111.67451485511475840 -FEP_ejm-45_ejm-46 -8.04 0.332415402771893241.48660687473185060 -FEP_ejm-49_ejm-46 -9.34 0.440454310910904871.96977156035922120 -FEP_jmc-27_jmc-28 6.57 0.340587727318528041.52315462117278180 -FEP_jmc-27_jmc-23 -0.36 0.36619666847201111.63768128767474170 -FEP_jmc-30_jmc-27 19.65 0.31906112267087641.42688471853895770 -FEP_jmc-28_jmc-23 -6.135 0.412310562561766071.84390889145857770 -FEP_jmc-30_jmc-28 25.96 0.380131556174964251.70000000000000020 -FEP_ejm-45_ejm-50 -12.6900000000000010.32202484376209241.44013888219157550 -FEP_ejm-50_ejm-42 4.2 0.291547594742265051.303840481040530 -FEP_ejm-42_ejm-31 -2.005 0.46097722286464432.06155281280883030 -FEP_ejm-54_ejm-42 6.11 0.281780056072107431.26015872016186940 -FEP_ejm-42_ejm-55 -5.365 0.27202941017470891.2165525060596440 -FEP_ejm-55_ejm-31 3.39 0.363593179253956841.62603812993422770 -FEP_ejm-54_ejm-31 4.47 0.41617304093369631.8611824198610950 -FEP_ejm-43_ejm-31 -0.67999999999999990.427200187265876551.910497317454280 -FEP_ejm-44_ejm-31 -1.175 0.42449970553582251.8984203960134860 -FEP_ejm-49_ejm-31 -11.665 0.331209903233583851.4812157169028420 -FEP_ejm-43_ejm-55 -5.085 0.26832815729997481.20000000000000020 -FEP_ejm-44_ejm-55 -5.93500000000000050.418807831827438471.87296556295090480 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index d299653b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/benchmark/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -FEP_p38a-2y_p38a-2v protein/ -FEP_p38a-2z_p38a-2y protein/ -FEP_p38a-2u_p38a-2m protein/ -FEP_p38a-2bb_p38a-2y protein/ -FEP_p38a-2u_p38a-2q protein/ -FEP_p38a-2y_p38a-2v water/ -FEP_p38a-2z_p38a-2y water/ -FEP_p38a-2u_p38a-2m water/ -FEP_p38a-2bb_p38a-2y water/ -FEP_p38a-2u_p38a-2q water/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index e45767b9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,54 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_p38a-2r_p38a-2l 39.82 0.41 1.29 2 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -39.81 0.74 2.33 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fly -2.82 0.29 0.91 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2l 52.67 0.26 0.81 2 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ff 71.09 0.17 0.53 1 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq -42.18 0.48 1.52 1 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly -4.06 0.21 0.67 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2n 49.52 0.30 0.96 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v -6.17 0.22 0.69 5 -FEP_p38a-2h_p38a-2c -0.31 0.79 2.49 2 -FEP_p38a-2i_p38a-2h 2.93 0.12 0.37 1 -FEP_p38a-2r_p38a-2n 30.83 0.32 1.03 2 -FEP_p38a-2q_p38a-2m 82.34 0.18 0.58 1 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 3.58 0.15 0.46 3 -FEP_p38a-2ff_p38a-2v 12.21 0.31 0.98 1 -FEP_p38a-2s_p38a-2n 27.66 0.43 1.36 2 -FEP_p38a-2f_p38a-3flz -0.67 0.22 0.69 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 69.73 0.50 1.58 1 -FEP_p38a-3flw_p38a-2aa -32.50 0.54 1.72 2 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 5.82 0.18 0.57 3 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 3.10 0.10 0.31 4 -FEP_p38a-2gg_p38a-3fln 89.41 0.26 0.82 1 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -37.81 0.48 1.51 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2h -1.32 0.17 0.53 2 -FEP_p38a-2ff_p38a-3fln 17.71 0.07 0.22 1 -FEP_p38a-2ee_p38a-3fln 7.92 0.24 0.76 1 -FEP_p38a-2x_p38a-2g 17.02 0.20 0.62 1 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c 1.78 0.67 2.12 3 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -18.21 0.20 0.64 1 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fly 38.39 0.37 1.18 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -0.56 0.17 0.53 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-2ff -10.61 0.15 0.49 1 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln -12.37 0.23 0.71 2 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -44.59 0.32 1.01 2 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb -12.66 0.56 1.77 2 -FEP_p38a-3fly_p38a-2v -7.05 0.17 0.54 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2l 8.33 0.27 0.86 1 -FEP_p38a-2m_p38a-2l -7.81 0.27 0.85 3 -FEP_p38a-2m_p38a-3fln -19.89 0.26 0.83 1 -FEP_p38a-2e_p38a-2f 4.20 0.23 0.74 1 -FEP_p38a-2aa_p38a-3fly 28.29 0.35 1.11 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly -1.47 0.53 1.67 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2o 19.28 0.29 0.90 3 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -1.31 0.18 0.56 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x -11.01 0.23 0.72 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2l 32.85 0.64 2.03 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z 12.55 0.43 1.36 1 -FEP_p38a-2u_p38a-2m 60.24 0.73 2.30 2 -FEP_p38a-2bb_p38a-2y 4.54 0.80 2.54 1 -FEP_p38a-2z_p38a-2y -27.52 0.20 0.64 1 -FEP_p38a-2y_p38a-2v 38.96 0.49 1.55 1 -FEP_p38a-2u_p38a-2q -20.76 0.42 1.32 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-3flz 3.42 0.21 0.68 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 0bf7b2d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,54 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_p38a-2r_p38a-2l 40.70 0.28 0.89 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -43.15 0.24 0.77 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fly -4.17 0.13 0.40 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2l 54.02 0.12 0.39 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ff 72.07 0.17 0.55 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq -42.64 0.23 0.71 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly -5.22 0.10 0.31 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2n 51.25 0.19 0.61 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v -9.13 0.18 0.57 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2c 1.17 0.58 1.83 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2h 1.89 0.17 0.55 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2n 32.56 0.23 0.72 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2m 81.71 0.14 0.45 0 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 4.47 0.20 0.62 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2v 7.94 0.45 1.43 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2n 27.52 0.67 2.13 0 -FEP_p38a-2f_p38a-3flz 2.01 0.14 0.43 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 69.60 0.16 0.50 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2aa -33.52 0.51 1.60 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 7.30 0.08 0.24 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 4.38 0.07 0.23 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-3fln 89.53 0.37 1.15 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -39.93 0.20 0.64 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2h -3.04 0.09 0.27 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-3fln 17.62 0.16 0.50 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-3fln 6.98 0.32 1.02 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2g 19.30 0.16 0.52 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c 1.50 0.27 0.87 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -18.27 0.10 0.32 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fly 37.38 0.27 0.86 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -1.43 0.11 0.34 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-2ff -10.19 0.15 0.46 0 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln -14.40 0.18 0.56 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -46.04 0.14 0.45 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb -12.45 0.29 0.91 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2v -9.59 0.09 0.29 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2l 8.35 0.14 0.45 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2l -7.68 0.20 0.63 0 -FEP_p38a-2m_p38a-3fln -21.85 0.15 0.47 0 -FEP_p38a-2e_p38a-2f 2.62 0.12 0.37 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-3fly 30.00 0.47 1.48 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly -5.58 0.37 1.16 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2o 18.31 0.20 0.64 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -0.97 0.13 0.40 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x -12.71 0.24 0.76 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2l 32.41 0.22 0.69 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z 14.30 0.24 0.76 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2m 59.00 0.44 1.38 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2q -21.07 0.32 1.00 0 -FEP_p38a-2bb_p38a-2y 6.62 0.46 1.46 0 -FEP_p38a-2z_p38a-2y -29.02 0.51 1.62 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2v 35.64 0.61 1.92 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-3flz 3.59 0.08 0.26 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 285fa8aa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,49 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_p38a-2p_p38a-2o 19.2 0.328 1.43 1 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 58.4 0.524 2.16 3 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 69.7 0.537 2.22 3 -FEP_p38a-2s_p38a-2n 27.0 0.891 3.98 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2n 31.3 0.425 1.8 2 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -45.0 0.455 1.88 3 -FEP_p38a-2r_p38a-2l 39.7 0.205 0.846 3 -FEP_p38a-2t_p38a-2l 52.9 0.418 1.62 5 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln -12.9 0.256 1.06 3 -FEP_p38a-2s_p38a-2l 32.6 0.786 3.24 3 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x -11.4 0.347 1.47 2 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 6.03 0.175 0.762 1 -FEP_p38a-2ff_p38a-3fln 17.7 0.269 1.2 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -0.705 0.2 0.894 0 -FEP_p38a-2m_p38a-3fln -20.0 0.304 1.29 2 -FEP_p38a-2gg_p38a-3fln 89.1 0.376 1.55 3 -FEP_p38a-2ee_p38a-3fln 7.34 0.314 1.37 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -18.4 0.388 1.65 2 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v -7.15 0.559 2.37 2 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -1.38 0.233 1.02 1 -FEP_p38a-2x_p38a-2g 17.8 0.623 2.41 5 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ff 70.7 0.286 1.21 2 -FEP_p38a-2ee_p38a-2ff -10.8 0.3 1.27 2 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 3.56 0.233 0.963 3 -FEP_p38a-2e_p38a-2f 4.54 0.295 1.29 1 -FEP_p38a-2f_p38a-3flz -0.985 0.277 1.18 2 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c 2.59 0.799 3.29 3 -FEP_p38a-2q_p38a-2m 81.6 0.444 1.88 2 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -39.4 0.667 2.98 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2m 59.9 0.948 4.13 1 -FEP_p38a-2u_p38a-2q -22.0 0.739 3.13 2 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 3.04 0.15 0.6 4 -FEP_p38a-2i_p38a-2h 3.46 0.3 1.24 3 -FEP_p38a-3fly_p38a-2v -7.46 0.278 1.18 2 -FEP_p38a-2y_p38a-2v 38.6 0.68 2.89 2 -FEP_p38a-2aa_p38a-3fly 29.3 0.766 2.97 5 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fly 38.1 0.752 3.36 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fly -3.73 0.474 1.77 6 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly -4.72 0.577 2.51 1 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly -1.66 0.4 1.7 2 -FEP_p38a-3flw_p38a-2aa -32.1 0.804 3.32 3 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z 12.9 0.484 2.05 2 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb -12.0 0.829 3.52 2 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq -42.3 0.691 2.93 2 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -41.8 0.589 2.5 2 -FEP_p38a-2bb_p38a-2y 5.42 0.669 2.76 3 -FEP_p38a-2y_p38a-2z 27.9 0.381 1.62 2 -FEP_p38a-2h_p38a-2c 0.125 1.35 5.56 3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 3e470c65..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,49 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_p38a-2p_p38a-2o 17.9 0.497 2.22 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 59.4 0.269 1.2 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 70.0 0.347 1.55 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2n 27.7 0.656 2.93 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2n 32.7 0.244 1.09 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -45.7 0.184 0.804 1 -FEP_p38a-2r_p38a-2l 40.9 0.32 1.4 1 -FEP_p38a-2t_p38a-2l 54.0 0.161 0.665 3 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln -13.9 0.222 0.968 1 -FEP_p38a-2s_p38a-2l 33.7 0.891 3.88 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x -12.2 0.306 1.37 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 7.35 0.144 0.645 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-3fln 17.5 0.219 0.956 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -1.14 0.18 0.806 0 -FEP_p38a-2m_p38a-3fln -21.7 0.298 1.3 1 -FEP_p38a-2gg_p38a-3fln 89.7 0.425 1.9 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-3fln 7.01 0.234 1.02 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -18.9 0.311 1.32 2 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v -9.05 0.479 2.09 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -1.2 0.256 1.11 1 -FEP_p38a-2x_p38a-2g 19.6 0.383 1.62 2 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ff 71.8 0.161 0.721 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-2ff -10.6 0.184 0.822 0 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 4.82 0.188 0.819 1 -FEP_p38a-2e_p38a-2f 2.92 0.113 0.466 3 -FEP_p38a-2f_p38a-3flz 2.0 0.153 0.665 1 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c 2.26 0.558 2.43 1 -FEP_p38a-2q_p38a-2m 80.9 0.506 2.21 1 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -39.8 0.264 1.06 4 -FEP_p38a-2u_p38a-2m 59.2 0.715 3.12 1 -FEP_p38a-2u_p38a-2q -22.1 0.349 1.56 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 4.59 0.184 0.801 1 -FEP_p38a-2i_p38a-2h 1.77 0.15 0.636 2 -FEP_p38a-3fly_p38a-2v -9.48 0.13 0.568 1 -FEP_p38a-2y_p38a-2v 37.2 0.784 3.42 1 -FEP_p38a-2aa_p38a-3fly 30.0 0.825 3.5 2 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fly 38.3 0.524 2.34 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fly -3.88 0.291 1.3 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly -5.41 0.32 1.43 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly -5.15 0.345 1.46 2 -FEP_p38a-3flw_p38a-2aa -34.0 0.891 3.78 2 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z 14.3 0.764 3.33 1 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb -13.2 0.375 1.5 4 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq -43.0 0.569 2.41 2 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -43.2 0.192 0.838 1 -FEP_p38a-2bb_p38a-2y 4.17 0.917 4.1 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2z 28.8 0.589 2.57 1 -FEP_p38a-2h_p38a-2c 2.38 0.506 2.21 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/merged/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/merged/water.txt deleted file mode 100644 index dc570dd3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/8.p38/merged/water.txt +++ /dev/null @@ -1,49 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_p38a-2p_p38a-2o 17.855 0.496789693934968862.22171105231981070 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 59.41 0.269072480941474231.2033287165193060 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 70.05 0.346554469023269141.54983870128474990 -FEP_p38a-2s_p38a-2n 27.735 0.6560487786742692.933939331342760 -FEP_p38a-2r_p38a-2n 32.69 0.244131112314674081.09178752511649460 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -45.67 0.184390889145857740.80374125189640491 -FEP_p38a-2r_p38a-2l 40.8949999999999960.320156211871642451.39552857369528651 -FEP_p38a-2t_p38a-2l 53.965 0.1612451549659710.66483080554378653 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln -13.875 0.222036033111745160.96783263015874811 -FEP_p38a-2s_p38a-2l 33.74 0.89050547443572743.88162337173507851 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x -12.205 0.306104557300279361.36894119669180840 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 7.35 0.144222051018559560.6449806198638840 -FEP_p38a-2ff_p38a-3fln 17.5 0.21931712199461310.95598117136270011 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -1.135 0.180277563773199480.8062257748298550 -FEP_p38a-2m_p38a-3fln -21.67 0.298328677803525951.30038455850567551 -FEP_p38a-2gg_p38a-3fln 89.685 0.4252058325093861.90157829184075420 -FEP_p38a-2ee_p38a-3fln 7.01 0.234307490277199631.02132267183295221 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -18.875 0.310644491340181351.31795295818932772 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v -9.05 0.47853944456021592.0859050793360661 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -1.2 0.255538646783612771.1138671374989031 -FEP_p38a-2x_p38a-2g 19.575 0.382883794381532971.6244383644817062 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ff 71.775 0.1612451549659710.72111025509279790 -FEP_p38a-2ee_p38a-2ff -10.575 0.183847763108502370.82219219164377880 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 4.82 0.187882942280559380.81896275861604371 -FEP_p38a-2e_p38a-2f 2.915 0.11313708498984760.466476151587624073 -FEP_p38a-2f_p38a-3flz 1.995 0.152643375224737480.66535704700559081 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c 2.26 0.55803225713214822.43240621607493871 -FEP_p38a-2q_p38a-2m 80.919999999999990.50606323715519992.2058785098005741 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -39.75 0.26400757564888171.05603030259552694 -FEP_p38a-2u_p38a-2m 59.225 0.71505244562899033.1168413498283811 -FEP_p38a-2u_p38a-2q -22.145 0.348855270850248141.56012819986051140 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 4.59 0.183847763108502370.8013738203859671 -FEP_p38a-2i_p38a-2h 1.775 0.15 0.63639610306789272 -FEP_p38a-3fly_p38a-2v -9.485 0.1303840481040530.5683308895353131 -FEP_p38a-2y_p38a-2v 37.155 0.78409183135650643.4177770553387481 -FEP_p38a-2aa_p38a-3fly 30.03 0.82462112512353213.498571136907182 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fly 38.305 0.52430906915673312.34478143970818740 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fly -3.875 0.29068883707497271.3 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly -5.405 0.320156211871642451.43178210632763550 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly -5.15 0.344818792991333331.4629422408283932 -FEP_p38a-3flw_p38a-2aa -34.0199999999999960.89106677639781863.7804761604856072 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z 14.265 0.76380625815713253.32935429175088031 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb -13.15 0.37536648758246921.50146595032987684 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq -43.05 0.56920997883030832.4149534156997732 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -43.185 0.192353840616713460.83845095265018341 -FEP_p38a-2bb_p38a-2y 4.165 0.91678787077491374.1 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2z 28.8100000000000020.58898217290508882.56731377124028231 -FEP_p38a-2h_p38a-2c 2.375 0.50606323715519992.2058785098005741 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/BACE_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/BACE_MFP.txt deleted file mode 100644 index e59784d4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/BACE_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,53 +0,0 @@ -CAT-13g CAT-13f -CAT-13g CAT-13e -CAT-13f CAT-13e -CAT-13e CAT-13d -CAT-13e CAT-17a -CAT-17a CAT-13d -CAT-13d CAT-17h -CAT-17b CAT-13d -CAT-17c CAT-13d -CAT-17f CAT-13d -CAT-13h CAT-13d -CAT-13i CAT-13d -CAT-13d CAT-13a -CAT-17h CAT-17i -CAT-17h CAT-17g -CAT-17h CAT-17d -CAT-17i CAT-17g -CAT-17i CAT-17d -CAT-24 CAT-17i -CAT-17e CAT-17i -CAT-24 CAT-17f -CAT-17f CAT-17c -CAT-4n CAT-17f -CAT-17e CAT-17b -CAT-4n CAT-4m -CAT-4n CAT-4j -CAT-4m CAT-4p -CAT-4m CAT-4o -CAT-4m CAT-4j -CAT-4p CAT-4o -CAT-4j CAT-4k -CAT-4j CAT-4l -CAT-13k CAT-4j -CAT-4j CAT-4a -CAT-4k CAT-4a -CAT-4c CAT-4a -CAT-4d CAT-4a -CAT-4a CAT-4i -CAT-4b CAT-4a -CAT-4c CAT-4b -CAT-4d CAT-4b -CAT-4l CAT-4i -CAT-13k CAT-13m -CAT-13k CAT-13n -CAT-13k CAT-13j -CAT-13k CAT-13o -CAT-13m CAT-13n -CAT-13n CAT-13j -CAT-13n CAT-13o -CAT-13c CAT-13a -CAT-13h CAT-13a -CAT-13i CAT-13b -CAT-13c CAT-13b diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/CDK2_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/CDK2_MFP.txt deleted file mode 100644 index 1bf66b85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/CDK2_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -28 30 -28 1h1s -29 28 -30 1h1s -29 30 -30 31 -32 1h1s -1h1s 1oiy -1h1s 1oiu -1oiu 1h1r -32 1oiu -31 26 -26 21 -26 1oi9 -21 22 -21 1h1r -1oi9 1h1q -1oiy 1oi9 -1h1r 1h1q -17 1h1q -1h1r 17 -20 1h1r -22 1h1r -20 17 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/JNK1_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/JNK1_MFP.txt deleted file mode 100644 index 9d70b76a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/JNK1_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,31 +0,0 @@ -18659-1 18658-1 -18658-1 18634-1 -18660-1 18658-1 -18660-1 18659-1 -18634-1 18631-1 -17124-1 18634-1 -18660-1 18634-1 -18634-1 18633-1 -18631-1 18628-1 -18631-1 18625-1 -18628-1 18625-1 -18635-1 18628-1 -18636-1 18628-1 -18635-1 18630-1 -18630-1 18627-1 -18630-1 18624-1 -18633-1 18630-1 -18627-1 18624-1 -18627-1 18626-1 -18629-1 18624-1 -18629-1 18626-1 -18632-1 18629-1 -18633-1 18632-1 -18637-1 17124-1 -18638-1 17124-1 -18639-1 17124-1 -17124-1 18636-1 -18652-1 17124-1 -18637-1 18638-1 -18637-1 18639-1 -18652-1 18638-1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/MCL1_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/MCL1_MFP.txt deleted file mode 100644 index 87e97811..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/MCL1_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,68 +0,0 @@ -32 27 -33 27 -30 27 -34 27 -43 27 -28 27 -37 27 -47 27 -46 27 -42 27 -39 27 -41 27 -41 40 -39 38 -40 38 -32 33 -35 33 -36 33 -37 33 -38 30 -31 30 -34 31 -43 47 -43 46 -36 35 -37 35 -52 35 -49 35 -53 37 -50 37 -37 67 -53 52 -58 53 -54 53 -53 63 -50 49 -42 28 -29 28 -48 28 -45 28 -44 28 -54 42 -42 48 -51 42 -44 42 -42 29 -42 45 -54 68 -54 64 -54 51 -64 23 -64 63 -64 68 -64 66 -62 23 -62 66 -66 65 -65 60 -65 61 -65 63 -63 60 -61 60 -58 63 -26 67 -68 26 -57 26 -58 56 -57 56 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/PTP1B_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/PTP1B_MFP.txt deleted file mode 100644 index 99c6678e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/PTP1B_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -23476 20670-2qbs- -23476 23474 -23330-2qbq- 23476 -23476 23475 -23479 23476 -23482 23476 -20670-2qbs- 23475 -20670-2qbs- 23477 -23477 23475 -23479 23475 -23330-2qbq- 23475 -23480 23479 -23482 23479 -23480 23482 -23483 23482 -20667-2qbp- 23482 -20667-2qbp- 23483 -20667-2qbp- 23486 -20667-2qbp- 23485 -20667-2qbp- 23484 -23486 23485 -23486 23484 -23474 20669-2qbr- -23469 20669-2qbr- -20669-2qbr- 23473 -23472 20669-2qbr- -23469 23471 -23471 23468 -23470 23471 -23471 23467 -23472 23471 -23471 23466 -23470 23468 -23467 23466 -23473 23467 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/Thrombin_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/Thrombin_MFP.txt deleted file mode 100644 index 87ece8d6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/Thrombin_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,16 +0,0 @@ -6e 6a -6e 6b -6a 6b -6a 1b -6b 7a -7a 3a -1b 5 -1b 1d -1b 1a -1b 1c -1d 5 -1a 5 -3a 5 -1c 5 -3b 5 -3b 3a diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/Tyk2_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/Tyk2_MFP.txt deleted file mode 100644 index 3486c782..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/Tyk2_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -ejm-48 ejm-47 -ejm-47 ejm-46 -ejm-47 jmc-27 -ejm-48 ejm-46 -jmc-27 ejm-46 -ejm-45 ejm-46 -ejm-49 ejm-46 -jmc-27 jmc-28 -jmc-27 jmc-23 -jmc-30 jmc-27 -jmc-28 jmc-23 -jmc-30 jmc-28 -ejm-45 ejm-50 -ejm-50 ejm-42 -ejm-42 ejm-31 -ejm-54 ejm-42 -ejm-42 ejm-55 -ejm-55 ejm-31 -ejm-54 ejm-31 -ejm-43 ejm-31 -ejm-44 ejm-31 -ejm-49 ejm-31 -ejm-43 ejm-55 -ejm-44 ejm-55 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/cdk8_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/cdk8_MFP.txt deleted file mode 100644 index cce8cadb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/cdk8_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,49 +0,0 @@ -41 37 -40 37 -39 37 -37 35 -34 37 -37 32 -30 37 -31 37 -36 37 -37 19 -38 37 -37 26 -41 40 -39 28 -30 35 -31 35 -36 35 -30 42 -30 13 -38 34 -38 43 -19 32 -33 19 -20 19 -19 24 -22 19 -19 17 -20 33 -29 33 -43 42 -43 44 -42 44 -42 45 -42 13 -45 44 -44 18 -18 17 -17 15 -27 24 -25 24 -27 25 -29 25 -28 26 -23 21 -21 22 -23 22 -15 14 -15 16 -16 14 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/cmet_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/cmet_MFP.txt deleted file mode 100644 index dc66de0b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/cmet_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,33 +0,0 @@ -CHEMBL3402745-200 CHEMBL3402744-300 -CHEMBL3402755-4200 CHEMBL3402745-200 -CHEMBL3402755-4200 CHEMBL3402744-300 -CHEMBL3402755-4200 CHEMBL3402753-200 -CHEMBL3402755-4200 CHEMBL3402752-30000 -CHEMBL3402753-200 CHEMBL3402754-40 -CHEMBL3402753-200 CHEMBL3402749-500 -CHEMBL3402753-200 CHEMBL3402750-400 -CHEMBL3402753-200 CHEMBL3402748-5300 -CHEMBL3402761-1 CHEMBL3402753-200 -CHEMBL3402754-40 CHEMBL3402750-400 -CHEMBL3402754-40 CHEMBL3402748-5300 -CHEMBL3402761-1 CHEMBL3402754-40 -CHEMBL3402754-40 CHEMBL3402747-3400 -CHEMBL3402749-500 CHEMBL3402747-3400 -CHEMBL3402750-400 CHEMBL3402751-2100 -CHEMBL3402752-30000 CHEMBL3402751-2100 -CHEMBL3402756-2-7 CHEMBL3402757-6-5 -CHEMBL3402756-2-7 CHEMBL3402758-10 -CHEMBL3402756-2-7 CHEMBL3402743-42 -CHEMBL3402759-5-7 CHEMBL3402757-6-5 -CHEMBL3402757-6-5 CHEMBL3402758-10 -CHEMBL3402760-1 CHEMBL3402757-6-5 -CHEMBL3402762-1 CHEMBL3402757-6-5 -CHEMBL3402759-5-7 CHEMBL3402758-10 -CHEMBL3402762-1 CHEMBL3402760-1 -CHEMBL3402743-42 CHEMBL3402764-90 -CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 CHEMBL3402743-42 -CHEMBL3402743-42 CHEMBL3402742-23 -CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 CHEMBL3402764-90 -CHEMBL3402741-400 CHEMBL3402742-23 -CHEMBL3402763-90 CHEMBL3402742-23 -CHEMBL3402741-400 CHEMBL3402763-90 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/eg5_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/eg5_MFP.txt deleted file mode 100644 index 926b1c22..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/eg5_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,40 +0,0 @@ -CHEMBL1078691 CHEMBL1089056 -CHEMBL1089056 CHEMBL1084115 -CHEMBL1089056 CHEMBL1088740 -CHEMBL1078774 CHEMBL1089056 -CHEMBL1085895 CHEMBL1089056 -CHEMBL1093088 CHEMBL1089056 -CHEMBL1089056 CHEMBL1089393 -CHEMBL1089056 CHEMBL1078998 -CHEMBL1078774 CHEMBL1078691 -CHEMBL1078691 CHEMBL1084115 -CHEMBL1084115 CHEMBL1078998 -CHEMBL1088740 CHEMBL1089393 -CHEMBL1085895 CHEMBL1093088 -CHEMBL1083517 CHEMBL1086409 -CHEMBL1083517 CHEMBL1086410 -CHEMBL1086409 CHEMBL1086410 -CHEMBL1086409 CHEMBL1077227 -CHEMBL1086409 CHEMBL1085666 -CHEMBL1086410 CHEMBL1083836 -CHEMBL1086410 CHEMBL1077227 -CHEMBL1086410 CHEMBL1085666 -CHEMBL1084677 CHEMBL1086410 -CHEMBL1084935 CHEMBL1086410 -CHEMBL1083836 CHEMBL1082248 -CHEMBL1084935 CHEMBL1085666 -CHEMBL1084676 CHEMBL1085666 -CHEMBL1077204 CHEMBL1085666 -CHEMBL1084677 CHEMBL1085666 -CHEMBL1093087 CHEMBL1085666 -CHEMBL1093087 CHEMBL1084678 -CHEMBL1084431 CHEMBL1093087 -CHEMBL1084431 CHEMBL1084678 -CHEMBL1084143 CHEMBL1084677 -CHEMBL1077204 CHEMBL1084676 -CHEMBL1085692 CHEMBL1082248 -CHEMBL1096002 CHEMBL1082248 -CHEMBL1082249 CHEMBL1096002 -CHEMBL1085692 CHEMBL1082249 -CHEMBL1085692 CHEMBL1096003 -CHEMBL1084143 CHEMBL1096003 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/hif2a_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/hif2a_MFP.txt deleted file mode 100644 index abddfd7d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/hif2a_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,66 +0,0 @@ -215 206 -215 252 -215 167 -237 215 -206 163 -163 252 -254 163 -163 234 -163 165 -15 163 -163 164 -237 163 -252 256 -237 252 -15 252 -290 252 -252 67 -338 252 -254 251 -251 256 -256 67 -167 234 -237 155 -237 25 -15 25 -235 167 -290 165 -290 164 -290 227 -290 235 -290 57 -155 156 -57 155 -155 1 -155 61 -155 23 -155 30 -156 31 -156 1 -227 57 -1 61 -1 84 -23 1 -7b 1 -7a 1 -227 231 -289 231 -289 336 -338 336 -7b 41 -7a 41 -266 235 -235 224 -266 224 -30 42 -42 43 -42 41 -42 35 -43 31 -35 41 -124 41 -84 41 -41 54 -35 50 -124 54 -54 50 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/p38_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/p38_MFP.txt deleted file mode 100644 index 0efb86d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/p38_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,48 +0,0 @@ -p38a-2p p38a-2o -p38a-2o p38a-2l -p38a-2p p38a-2n -p38a-2s p38a-2n -p38a-2r p38a-2n -p38a-2n p38a-2t -p38a-2r p38a-2l -p38a-2t p38a-2l -p38a-2l p38a-3fln -p38a-2s p38a-2l -p38a-3fln p38a-2x -p38a-3fln p38a-2g -p38a-2ff p38a-3fln -p38a-3fln p38a-2e -p38a-2m p38a-3fln -p38a-2gg p38a-3fln -p38a-2ee p38a-3fln -p38a-3fln p38a-2k -p38a-3fln p38a-2v -p38a-3fln p38a-2j -p38a-2x p38a-2g -p38a-2gg p38a-2ff -p38a-2ee p38a-2ff -p38a-2e p38a-3flz -p38a-2e p38a-2f -p38a-2f p38a-3flz -p38a-3flz p38a-2c -p38a-2q p38a-2m -p38a-2m p38a-2k -p38a-2u p38a-2m -p38a-2u p38a-2q -p38a-2j p38a-2i -p38a-2i p38a-2h -p38a-3fly p38a-2v -p38a-2y p38a-2v -p38a-2aa p38a-3fly -p38a-3flq p38a-3fly -p38a-3flw p38a-3fly -p38a-3fmh p38a-3fly -p38a-3fmk p38a-3fly -p38a-3flw p38a-2aa -p38a-2aa p38a-2z -p38a-3flq p38a-2bb -p38a-3fmh p38a-3flq -p38a-3fmk p38a-3flq -p38a-2bb p38a-2y -p38a-2y p38a-2z -p38a-2h p38a-2c diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/pfkfb3_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/pfkfb3_MFP.txt deleted file mode 100644 index c1bb6dc2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/pfkfb3_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,59 +0,0 @@ -53 52 -53 35 -52 35 -35 29 -54 35 -56 35 -35 33 -35 34 -57 35 -55 35 -37 35 -36 35 -35 49 -29 19 -29 26 -36 29 -54 57 -56 55 -33 24 -33 31 -24 19 -31 23 -31 30 -19 23 -30 19 -34 26 -37 34 -49 44 -49 39 -48 49 -47 49 -46 49 -67 49 -68 49 -62 49 -44 43 -47 44 -46 44 -42 43 -38 43 -43 39 -41 43 -42 39 -38 39 -48 20 -41 20 -67 68 -67 65 -65 64 -65 63 -69 65 -64 63 -63 62 -59 62 -70 62 -69 70 -59 58 -60 59 -60 58 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/shp2_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/shp2_MFP.txt deleted file mode 100644 index 626a9984..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/shp2_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -Example-9 Example-14 -Example-8 Example-9 -Example-8 Example-14 -Example-8 SHP099-1-Example-7 -11 SHP099-1-Example-7 -SHP099-1-Example-7 Example-29 -SHP099-1-Example-7 Example-27 -SHP099-1-Example-7 10 -Example-28 SHP099-1-Example-7 -SHP099-1-Example-7 Example-30 -11 10 -Example-23 Example-30 -Example-30 Example-1 -Example-1 Example-2 -Example-1 Example-3 -Example-5 Example-1 -7 Example-1 -Example-1 6 -Example-6 Example-1 -Example-2 Example-4 -Example-5 Example-6 -Example-23 Example-24 -Example-23 Example-22 -Example-25 Example-23 -Example-26 Example-23 -Example-24 Example-22 -Example-25 Example-24 -Example-26 Example-24 -7 6 -Example-28 Example-29 -SHP836-2 Example-27 -SHP836-2 4 -SHP836-2 3 -4 3 -Example-3 Example-4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/syk_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/syk_MFP.txt deleted file mode 100644 index 5387215f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/syk_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,66 +0,0 @@ -CHEMBL3265036 CHEMBL3265032 -CHEMBL3265033 CHEMBL3265032 -CHEMBL3265031 CHEMBL3265032 -CHEMBL3265032 CHEMBL3265034 -CHEMBL3265037 CHEMBL3265032 -CHEMBL3265032 CHEMBL3265030 -CHEMBL3265033 CHEMBL3265036 -CHEMBL3265036 CHEMBL3265034 -CHEMBL3265033 CHEMBL3265031 -CHEMBL3265031 CHEMBL3265030 -CHEMBL3265037 CHEMBL3265017 -CHEMBL3265017 CHEMBL3265021 -CHEMBL3265017 CHEMBL3265029 -CHEMBL3265017 CHEMBL3265019 -CHEMBL3265017 CHEMBL3265020 -CHEMBL3265022 CHEMBL3265017 -CHEMBL3265021 CHEMBL3265020 -CHEMBL3265023 CHEMBL3265021 -CHEMBL3265029 CHEMBL3265028 -CHEMBL3265029 CHEMBL3265027 -CHEMBL3265035 CHEMBL3265029 -CHEMBL3265028 CHEMBL3265027 -CHEMBL3265035 CHEMBL3265027 -CHEMBL3265020 CHEMBL3265016 -CHEMBL3265010 CHEMBL3265020 -CHEMBL3265016 CHEMBL3265018 -CHEMBL3265024 CHEMBL3265016 -CHEMBL3265026 CHEMBL3265016 -CHEMBL3265018 CHEMBL3265019 -CHEMBL3265010 CHEMBL3265019 -CHEMBL3265023 CHEMBL3265022 -CHEMBL3265024 CHEMBL3265026 -CHEMBL3265025 CHEMBL3265026 -CHEMBL3265024 CHEMBL3265025 -CHEMBL3265010 CHEMBL3265009 -CHEMBL3265010 CHEMBL3265014 -CHEMBL3265010 CHEMBL3265008 -CHEMBL3265010 CHEMBL3259820 -CHEMBL3265010 CHEMBL3265005 -CHEMBL3265009 CHEMBL3265013 -CHEMBL3265014 CHEMBL3265013 -CHEMBL3265014 CHEMBL3265012 -CHEMBL3265008 CHEMBL3265012 -CHEMBL3265015 CHEMBL3259820 -CHEMBL3265011 CHEMBL3259820 -CHEMBL3259820 CHEMBL3265005 -CHEMBL3265006 CHEMBL3265005 -CHEMBL3264996 CHEMBL3265005 -CHEMBL3264999 CHEMBL3265005 -CHEMBL3264996 CHEMBL3264999 -CHEMBL3265002 CHEMBL3264999 -CHEMBL3264999 CHEMBL3265006 -CHEMBL3265002 CHEMBL3264996 -CHEMBL3265004 CHEMBL3264996 -CHEMBL3265003 CHEMBL3264996 -CHEMBL3265004 CHEMBL3265003 -CHEMBL3265015 CHEMBL3265011 -CHEMBL3264995 CHEMBL3264997 -CHEMBL3264998 CHEMBL3264995 -CHEMBL3265000 CHEMBL3264995 -CHEMBL3265001 CHEMBL3264995 -CHEMBL3264995 CHEMBL3264994 -CHEMBL3264998 CHEMBL3264997 -CHEMBL3264997 CHEMBL3264994 -CHEMBL3265000 CHEMBL3264998 -CHEMBL3265001 CHEMBL3264998 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/tnks2_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/tnks2_MFP.txt deleted file mode 100644 index a82fc117..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/maps/tnks2_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,34 +0,0 @@ -5m 5k -5o 5m -5k 5f -5k 5d -5f 5i -5f 5g -5h 5f -5i 5g -5h 5i -5g 5c -5d 3b -5d 5e -5d 7 -3b 7 -5p 3b -5e 5a -5o 5n -5p 5n -5l 5j -5l 5b -5b 5c -5j 5b -5b 5a -5a 3a -3a 1a -3a 1b -1b 1a -8f 8e -8f 8d -8f 8b -8e 8c -8e 8a -8d 8c -8b 8a diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/merge_results.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/merge_results.py deleted file mode 100644 index b90c7d5b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/OPLS2015/merge_results.py +++ /dev/null @@ -1,88 +0,0 @@ -import glob -import os -import numpy as np - -results = {'old':{}, 'new':{}} -target_edges = {} -for i, target in enumerate(['BACE', 'CDK2', 'JNK1', 'MCL1', 'PTP1B', 'Thrombin', 'Tyk2', 'p38'], start=1): - target_edges[target] = [] - with open('maps/{}_MFP.txt'.format(target), 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - target_edges[target].append((line[0], line[1])) - - results['old'][target] = {} - for leg in ['protein', 'water']: - results['old'][target][leg] = {} - with open('{}.{}/no-vs/2fs/{}.txt'.format(i, target, leg), 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - if line[0] == 'FEP': - continue - else: - try: - fep = line[0].split('FEP_')[1] - l1, l2 = fep.split('_')[0], fep.split('_')[1] - except: - fep = line[0].split('FEP_')[1] - l1, l2 = fep.split('-')[0], fep.split('-')[1] - if (l1, l2) in target_edges[target]: - fep = line[0] - if target == 'CDK2': - fep = line[0].replace('-', '_') - results['old'][target][leg][fep] = [float(line[1]), float(line[2]), int(line[3])] - elif (l2, l1) in target_edges[target]: - if target == 'CDK2': - print(line[0]) - results['old'][target][leg]['FEP_{}_{}'.format(l2, l1)] = [-1*float(line[1]), float(line[2]), int(line[3])] - results['new'][target] = {} - for leg in ['protein', 'water']: - results['new'][target][leg] = {} - with open('{}.{}/benchmark/2fs/{}.txt'.format(i, target, leg), 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - if line[0] == 'FEP': - continue - else: - try: - fep = line[0].split('FEP_')[1] - l1, l2 = fep.split('_')[0], fep.split('_')[1] - except: - fep = line[0].split('FEP_')[1] - l1, l2 = fep.split('-')[0], fep.split('-')[1] - if (l1, l2) in target_edges[target]: - #fep = line[0].replace('') - results['new'][target][leg][line[0]] = [float(line[1]), float(line[2]), int(line[4])] - elif (l2, l1) in target_edges[target]: - results['new'][target][leg]['FEP_{}_{}'.format(l2, l1)] = [-1*float(line[1]), float(line[2]), int(line[4])] -print(results['old']['CDK2']['protein']) -results['merged'] = {} -for i, target in enumerate(['BACE', 'CDK2', 'JNK1', 'MCL1', 'PTP1B', 'Thrombin', 'Tyk2', 'p38'], start=1): - results['merged'][target] = {} - for leg in ['protein', 'water']: - results['merged'][target][leg] = {} - n, o = results['new'][target][leg], results['old'][target][leg] - for edge in target_edges[target]: - try: - fep = 'FEP_{}_{}'.format(edge[0], edge[1]) - ddG = sum([n[fep][0], o[fep][0]])/2 - sem = np.sqrt(sum([n[fep][1]**2, o[fep][1]**2])) - crashes = sum([n[fep][2], o[fep][2]]) - std = sem*np.sqrt(20 - crashes) - results['merged'][target][leg][fep] = [ddG, sem, std, crashes] - except: - fep = 'FEP_{}_{}'.format(edge[1], edge[0]) - ddG = sum([n[fep][0], o[fep][0]])/2 - sem = np.sqrt(sum([n[fep][1]**2, o[fep][1]**2])) - crashes = sum([n[fep][2], o[fep][2]]) - std = sem*np.sqrt(20 - crashes) - results['merged'][target][leg][fep] = [ddG, sem, std, crashes] - - merged_dir = os.path.join(os.getcwd(), '{}.{}'.format(i, target), 'merged', '2fs') - if not os.path.exists(merged_dir): - os.mkdir(os.path.join(os.getcwd(), '{}.{}'.format(i, target), 'merged', '2fs')) - - with open('{}/{}.txt'.format(merged_dir, leg), 'w') as outfile: - outfile.write('{:<50}{:<10}{:<10}{:<10}{:<10}\n'.format('FEP','dG','sem', 'std', 'crashes')) - for fep, v in results['merged'][target][leg].items(): - outfile.write('{:<50}{:<10.3}{:<10.3}{:<10.3}{:<10}\n'.format(fep, v[0], v[1], v[2], v[3])) diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/1.BACE/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/1.BACE/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/1.BACE/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/1.BACE/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 2603413a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/1.BACE/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,59 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CAT-13k_CAT-13o -2.66 0.34 1.07 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a 14.21 0.26 0.81 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13b -7.68 0.20 0.65 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 4.83 0.18 0.56 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17i -18.70 0.38 1.20 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13d 2.07 0.70 2.22 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 74.63 0.29 0.93 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -12.67 0.33 1.05 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b -3.09 0.66 2.08 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 78.31 0.13 0.42 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -3.02 0.54 1.72 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m 9.02 0.28 0.89 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -5.31 0.58 1.82 0 -FEP_CAT-13k_CAT-4j 12.63 0.55 1.73 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 17.62 0.16 0.50 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4j 5.97 0.38 1.21 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b -18.31 0.17 0.53 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4b 2.77 0.28 0.89 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 13.21 0.12 0.37 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -8.55 0.77 2.42 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -5.08 0.62 1.96 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -9.01 0.27 0.85 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -2.93 0.28 0.88 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13d 7.29 0.43 1.37 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -3.50 0.20 0.62 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -3.73 0.22 0.70 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13d -1.96 0.65 2.06 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17i 9.88 0.79 2.49 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13d 4.87 0.84 2.65 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17f 1.61 0.29 0.92 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13n -10.75 0.27 0.86 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -17.33 0.22 0.71 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -71.23 0.39 1.22 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 16.21 0.53 1.68 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -81.02 0.43 1.37 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -14.43 0.61 1.92 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13a -8.39 0.34 1.08 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4a 17.54 0.38 1.19 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 18.05 0.72 2.27 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13d 3.13 0.87 2.76 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4a 15.06 0.13 0.40 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13a -19.84 0.84 2.66 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13d 8.30 0.34 1.07 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 75.09 0.34 1.07 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e 0.48 0.20 0.63 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13b -9.08 0.21 0.68 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 11.74 0.18 0.56 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 27.99 0.21 0.65 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j -6.63 0.28 0.88 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 16.59 0.16 0.51 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -76.42 0.25 0.80 0 -FEP_CAT-13e_CAT-17a -2.29 0.86 2.73 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4a 10.44 0.38 1.19 0 -FEP_CAT-24_CAT-17i 2.71 0.50 1.60 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17d 0.48 0.22 0.69 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13m -91.64 0.14 0.46 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13a -1.29 0.35 1.10 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17d -13.39 0.70 2.21 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/1.BACE/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/1.BACE/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index c83e0972..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/1.BACE/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,59 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CAT-13k_CAT-13o -2.46 0.20 0.62 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a 9.97 0.21 0.68 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13b -6.21 0.19 0.61 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 5.50 0.12 0.38 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17i -19.82 0.34 1.08 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13d -0.89 0.38 1.19 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 74.93 0.30 0.94 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -13.83 0.13 0.40 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b 0.23 0.21 0.66 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 80.47 0.34 1.07 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -5.65 0.20 0.64 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m 8.99 0.29 0.91 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -6.51 0.24 0.77 0 -FEP_CAT-13k_CAT-4j 10.85 0.30 0.95 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 17.13 0.32 1.03 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4j 2.58 0.23 0.74 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b -19.51 0.31 0.99 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4b 3.30 0.29 0.93 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 10.71 0.22 0.70 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -8.90 0.21 0.65 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -3.09 0.25 0.78 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -11.30 0.20 0.65 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -2.99 0.14 0.45 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13d 6.34 0.18 0.58 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -6.51 0.21 0.68 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -3.07 0.18 0.58 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13d 0.26 0.26 0.83 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17i 7.80 0.34 1.09 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13d 4.19 0.15 0.48 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17f -0.12 0.16 0.49 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13n -12.49 0.26 0.84 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -17.18 0.20 0.64 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -69.59 0.18 0.58 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 16.91 0.23 0.72 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -81.98 0.31 0.97 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -13.14 0.12 0.39 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13a -8.17 0.16 0.49 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4a 13.33 0.17 0.52 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 16.05 0.29 0.93 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13d 2.63 0.24 0.76 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4a 15.34 0.23 0.73 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13a -13.32 0.25 0.79 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13d 7.55 0.20 0.62 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 72.76 0.23 0.72 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -0.59 0.29 0.92 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13b -9.53 0.21 0.65 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 9.74 0.16 0.51 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 29.20 0.22 0.68 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j -7.43 0.18 0.58 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 15.21 0.20 0.62 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -75.07 0.28 0.87 0 -FEP_CAT-13e_CAT-17a -2.14 0.23 0.74 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4a 10.24 0.17 0.54 0 -FEP_CAT-24_CAT-17i -1.73 0.23 0.72 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17d -14.89 0.14 0.46 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17d -1.53 0.20 0.62 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13a -1.73 0.21 0.66 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13m -92.77 0.25 0.79 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/2.CDK2/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/2.CDK2/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/2.CDK2/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/2.CDK2/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index c256d1e5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/2.CDK2/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,29 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_32_1oiu 88.16 0.97 3.07 0 -FEP_1oiy_1oi9 41.11 0.41 1.30 0 -FEP_30_1h1s -99.15 0.28 0.89 0 -FEP_21_22 9.97 0.15 0.47 0 -FEP_20_17 8.47 0.31 0.97 0 -FEP_17_1h1q 0.11 0.50 1.59 0 -FEP_30_31 48.77 0.28 0.88 0 -FEP_26_21 -15.48 0.35 1.12 0 -FEP_1oi9_1h1q 16.95 0.25 0.80 0 -FEP_1h1s_1oiy 127.26 0.33 1.05 0 -FEP_1h1r_1h1q 5.20 0.34 1.09 0 -FEP_28_1h1s -46.47 0.22 0.69 0 -FEP_32_1h1s 47.17 0.41 1.28 0 -FEP_29_28 -45.77 0.23 0.73 0 -FEP_20_1h1r 3.21 0.36 1.14 0 -FEP_1h1s_1oiu 40.53 0.76 2.39 0 -FEP_1h1r_17 5.03 0.10 0.32 0 -FEP_1oiu_1h1r 143.89 0.53 1.67 0 -FEP_22_1h1r 1.16 0.32 1.03 0 -FEP_29_30 6.10 0.36 1.15 0 -FEP_26_1oi9 -16.02 0.40 1.27 0 -FEP_31_26 36.82 0.30 0.94 0 -FEP_28_30 51.70 0.31 0.98 0 -FEP_21_1h1r 12.87 0.33 1.04 0 -FEP_32_30 147.61 0.55 1.74 0 -FEP_26_1h1q 1.19 0.27 0.87 0 -FEP_30_26 86.08 0.38 1.19 0 -FEP_32_30 147.61 0.55 1.74 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/2.CDK2/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/2.CDK2/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 3fba18e6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/2.CDK2/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,29 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_32_1oiu 91.08 0.94 2.97 0 -FEP_1oiy_1oi9 41.69 0.21 0.66 0 -FEP_30_1h1s -99.66 0.55 1.72 0 -FEP_21_22 9.43 0.14 0.44 0 -FEP_20_17 5.15 0.18 0.58 0 -FEP_17_1h1q 2.05 0.17 0.52 0 -FEP_30_31 49.29 0.27 0.84 0 -FEP_26_21 -19.15 0.16 0.49 0 -FEP_1oi9_1h1q 14.49 0.24 0.75 0 -FEP_1h1s_1oiy 130.43 0.44 1.38 0 -FEP_1h1r_1h1q 6.46 0.18 0.55 0 -FEP_28_1h1s -48.45 0.30 0.95 0 -FEP_32_1h1s 51.18 0.56 1.76 0 -FEP_29_28 -45.08 0.23 0.73 0 -FEP_20_1h1r 1.03 0.10 0.31 0 -FEP_1h1s_1oiu 40.20 0.79 2.50 0 -FEP_1h1r_17 3.99 0.20 0.63 0 -FEP_1oiu_1h1r 138.96 0.44 1.39 0 -FEP_22_1h1r 3.35 0.18 0.57 0 -FEP_29_30 5.49 0.18 0.57 0 -FEP_26_1oi9 -13.43 0.10 0.31 0 -FEP_31_26 35.50 0.30 0.96 0 -FEP_28_30 50.81 0.36 1.13 0 -FEP_21_1h1r 12.77 0.16 0.49 0 -FEP_32_30 149.54 0.84 2.65 0 -FEP_30_26 85.07 0.17 0.53 0 -FEP_26_1h1q 0.12 0.19 0.59 0 -FEP_32_30 149.54 0.84 2.65 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/3.JNK1/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/3.JNK1/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/3.JNK1/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/3.JNK1/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 2ba0c528..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/3.JNK1/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,41 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_18660-1_18658-1 120.19 0.75 2.36 0 -FEP_18658-1_18634-1 -5.66 0.38 1.21 0 -FEP_18652-1_17124-1 90.27 0.59 1.85 0 -FEP_18631-1_18625-1 3.17 0.49 1.55 0 -FEP_18652-1_18638-1 3.03 0.75 2.38 0 -FEP_18639-1_17124-1 -6.92 0.19 0.59 0 -FEP_17124-1_18636-1 16.74 0.24 0.76 0 -FEP_18633-1_18632-1 -8.45 0.36 1.14 0 -FEP_18636-1_18628-1 -2.89 0.32 1.00 0 -FEP_18629-1_18624-1 5.35 0.18 0.57 0 -FEP_18638-1_17124-1 85.78 0.22 0.70 0 -FEP_18628-1_18625-1 -4.08 0.20 0.62 0 -FEP_18634-1_18633-1 16.52 0.58 1.83 0 -FEP_17124-1_18634-1 -4.60 0.21 0.65 0 -FEP_18630-1_18624-1 4.75 0.14 0.45 0 -FEP_18635-1_18628-1 4.57 0.26 0.83 0 -FEP_18635-1_18630-1 0.39 0.47 1.50 0 -FEP_18637-1_18638-1 -28.81 0.18 0.56 0 -FEP_18629-1_18626-1 0.83 0.15 0.47 0 -FEP_18634-1_18631-1 11.36 0.21 0.65 0 -FEP_18660-1_18634-1 114.97 0.66 2.08 2 -FEP_18660-1_18659-1 127.29 0.45 1.42 0 -FEP_18633-1_18630-1 -3.90 0.19 0.59 0 -FEP_18627-1_18624-1 3.19 0.17 0.54 0 -FEP_18630-1_18627-1 1.22 0.10 0.31 0 -FEP_18659-1_18658-1 -5.64 0.48 1.53 0 -FEP_18631-1_18628-1 6.41 0.33 1.04 0 -FEP_18632-1_18629-1 3.88 0.19 0.61 0 -FEP_18637-1_17124-1 57.46 0.14 0.45 0 -FEP_18637-1_18639-1 64.10 0.22 0.71 0 -FEP_18627-1_18626-1 -1.06 0.17 0.53 0 -FEP_18659-1_18634-1 -11.82 0.32 1.00 0 -FEP_18633-1_18627-1 -1.69 0.15 0.49 0 -FEP_18631-1_18624-1 5.76 0.41 1.30 0 -FEP_18638-1_18639-1 92.58 0.23 0.72 0 -FEP_17124-1_18631-1 7.01 0.32 1.01 0 -FEP_18632-1_18626-1 5.14 0.34 1.07 0 -FEP_18635-1_18636-1 6.59 0.44 1.38 0 -FEP_18626-1_18624-1 4.61 0.11 0.34 0 -FEP_18628-1_18624-1 0.43 0.21 0.67 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/3.JNK1/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/3.JNK1/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index e5cecbdf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/3.JNK1/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,41 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_18660-1_18658-1 121.89 0.42 1.32 0 -FEP_18658-1_18634-1 -5.30 0.26 0.82 0 -FEP_18652-1_17124-1 91.62 0.21 0.68 0 -FEP_18631-1_18625-1 -0.18 0.24 0.76 0 -FEP_18652-1_18638-1 5.86 0.17 0.53 0 -FEP_18639-1_17124-1 -5.71 0.22 0.70 0 -FEP_17124-1_18636-1 10.93 0.26 0.83 0 -FEP_18633-1_18632-1 -8.84 0.21 0.67 0 -FEP_18636-1_18628-1 -2.89 0.18 0.56 0 -FEP_18629-1_18624-1 5.08 0.11 0.35 0 -FEP_18638-1_17124-1 86.14 0.21 0.68 0 -FEP_18628-1_18625-1 -3.12 0.19 0.60 0 -FEP_18634-1_18633-1 14.10 0.19 0.61 0 -FEP_17124-1_18634-1 -5.13 0.25 0.80 0 -FEP_18630-1_18624-1 4.34 0.16 0.51 0 -FEP_18635-1_18628-1 3.69 0.10 0.33 0 -FEP_18635-1_18630-1 0.60 0.15 0.47 0 -FEP_18637-1_18638-1 -28.21 0.22 0.71 0 -FEP_18629-1_18626-1 1.52 0.10 0.31 0 -FEP_18634-1_18631-1 10.78 0.25 0.78 0 -FEP_18660-1_18634-1 116.02 0.57 1.79 1 -FEP_18660-1_18659-1 127.61 0.52 1.66 1 -FEP_18633-1_18630-1 -4.06 0.11 0.35 0 -FEP_18627-1_18624-1 2.68 0.13 0.41 0 -FEP_18630-1_18627-1 1.69 0.12 0.37 0 -FEP_18659-1_18658-1 -5.69 0.21 0.66 0 -FEP_18631-1_18628-1 2.61 0.21 0.66 0 -FEP_18632-1_18629-1 3.57 0.17 0.53 0 -FEP_18637-1_17124-1 57.43 0.13 0.43 0 -FEP_18637-1_18639-1 63.63 0.20 0.63 0 -FEP_18627-1_18626-1 -0.99 0.19 0.60 0 -FEP_18632-1_18626-1 5.63 0.23 0.71 0 -FEP_18635-1_18636-1 6.36 0.23 0.71 0 -FEP_18638-1_18639-1 92.18 0.27 0.86 0 -FEP_18631-1_18624-1 3.56 0.08 0.26 0 -FEP_18633-1_18627-1 -2.39 0.13 0.42 0 -FEP_18659-1_18634-1 -11.87 0.16 0.52 0 -FEP_18628-1_18624-1 0.64 0.17 0.53 0 -FEP_18626-1_18624-1 3.12 0.11 0.34 0 -FEP_17124-1_18631-1 5.95 0.25 0.78 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/4.MCL1/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/4.MCL1/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/4.MCL1/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/4.MCL1/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index f2b2d66d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/4.MCL1/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,86 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_33_32 -2.17 0.14 0.45 0 -FEP_27_42 5.46 0.75 2.36 1 -FEP_35_49 9.47 0.26 0.82 0 -FEP_51_54 -13.65 0.24 0.76 0 -FEP_67_26 13.69 0.22 0.68 0 -FEP_46_43 5.58 0.25 0.80 0 -FEP_23_64 -7.40 0.20 0.63 0 -FEP_27_30 -7.50 0.19 0.61 0 -FEP_28_42 0.51 0.27 0.87 0 -FEP_60_63 -4.98 0.21 0.68 0 -FEP_63_64 2.87 0.23 0.73 0 -FEP_53_54 11.01 0.18 0.58 0 -FEP_35_52 -2.07 0.56 1.76 0 -FEP_67_37 -25.93 0.59 1.88 0 -FEP_23_62 9.21 0.31 0.97 0 -FEP_28_45 -0.89 0.44 1.40 0 -FEP_52_53 -5.66 0.62 1.95 0 -FEP_27_41 -4.63 0.68 2.14 3 -FEP_47_43 6.31 0.32 1.01 0 -FEP_30_31 26.33 0.12 0.38 0 -FEP_65_66 12.40 0.21 0.67 0 -FEP_68_54 -35.71 0.26 0.82 0 -FEP_27_43 -4.78 0.22 0.68 0 -FEP_27_34 1.48 0.41 1.30 0 -FEP_48_42 10.18 0.14 0.44 0 -FEP_30_38 5.74 0.45 1.42 0 -FEP_33_36 -1.29 0.14 0.43 0 -FEP_28_29 -7.64 0.72 2.27 2 -FEP_27_39 -1.54 1.21 3.82 0 -FEP_63_53 -3.15 0.19 0.59 0 -FEP_63_58 0.73 0.18 0.58 0 -FEP_68_64 -41.80 0.76 2.39 0 -FEP_26_57 -25.46 0.36 1.14 0 -FEP_28_44 2.68 0.51 1.60 0 -FEP_42_54 -6.93 0.23 0.73 0 -FEP_27_37 -5.41 0.37 1.15 0 -FEP_64_54 5.38 0.18 0.58 0 -FEP_45_42 0.68 0.27 0.85 0 -FEP_38_40 -16.98 0.50 1.58 1 -FEP_27_47 -11.45 0.47 1.49 0 -FEP_29_42 5.85 0.52 1.65 1 -FEP_60_61 7.77 0.37 1.17 0 -FEP_31_34 -14.49 0.57 1.81 0 -FEP_35_37 2.03 0.47 1.48 0 -FEP_26_68 -3.09 0.42 1.34 0 -FEP_66_62 7.32 0.23 0.74 0 -FEP_27_33 -2.78 0.16 0.51 0 -FEP_61_65 -11.96 0.34 1.07 1 -FEP_38_39 -1.02 0.51 1.61 0 -FEP_27_46 -9.49 0.23 0.73 0 -FEP_49_50 -2.22 0.25 0.81 0 -FEP_63_65 0.18 0.24 0.77 0 -FEP_37_50 5.50 0.13 0.40 0 -FEP_33_35 -4.31 0.20 0.62 0 -FEP_37_53 -8.58 0.57 1.80 0 -FEP_42_51 5.71 0.24 0.76 0 -FEP_33_37 -3.86 0.40 1.26 0 -FEP_27_32 -4.53 0.22 0.70 0 -FEP_27_28 3.45 0.32 1.03 0 -FEP_60_65 -4.53 0.11 0.33 0 -FEP_35_36 3.87 0.16 0.51 0 -FEP_53_58 3.55 0.25 0.79 0 -FEP_28_48 -9.72 0.37 1.18 0 -FEP_40_41 12.16 1.15 3.64 2 -FEP_56_57 16.49 0.19 0.59 0 -FEP_56_58 -3.62 0.26 0.82 0 -FEP_66_64 -9.38 0.27 0.84 0 -FEP_42_44 2.84 0.25 0.80 0 -FEP_67_60 -26.72 0.12 0.37 0 -FEP_23_66 2.76 0.19 0.59 0 -FEP_27_40 -16.50 0.78 2.48 7 -FEP_26_23 -36.60 0.59 1.87 0 -FEP_56_43 3.04 0.24 0.77 0 -FEP_61_50 -1.22 0.25 0.79 0 -FEP_30_32 3.05 0.25 0.81 0 -FEP_32_47 -5.76 0.46 1.47 0 -FEP_27_38 -2.05 0.75 2.38 0 -FEP_43_42 7.62 0.21 0.68 0 -FEP_39_41 -2.29 0.97 3.06 0 -FEP_32_43 0.38 0.16 0.51 0 -FEP_33_64 -5.99 0.60 1.89 0 -FEP_60_37 1.31 0.44 1.38 0 -FEP_37_56 -1.25 0.24 0.76 0 -FEP_32_46 -4.66 0.28 0.87 0 -FEP_54_37 -1.97 0.28 0.87 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/4.MCL1/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/4.MCL1/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index f085f36c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/4.MCL1/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,86 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_33_32 -2.99 0.18 0.58 0 -FEP_27_42 7.20 0.63 2.00 0 -FEP_35_49 8.00 0.35 1.11 0 -FEP_51_54 -12.25 0.55 1.74 0 -FEP_67_26 10.53 0.33 1.04 0 -FEP_46_43 5.34 0.26 0.83 0 -FEP_23_64 -6.01 0.23 0.72 0 -FEP_27_30 -7.97 0.25 0.78 0 -FEP_28_42 4.79 0.28 0.89 0 -FEP_60_63 -4.12 0.21 0.67 0 -FEP_63_64 -0.32 0.26 0.81 0 -FEP_53_54 6.97 0.42 1.32 0 -FEP_35_52 -2.75 0.23 0.74 0 -FEP_67_37 -28.45 0.19 0.59 0 -FEP_23_62 10.63 0.36 1.14 0 -FEP_28_45 4.70 0.17 0.54 0 -FEP_52_53 -0.44 0.25 0.78 0 -FEP_27_41 0.11 0.93 2.95 2 -FEP_47_43 9.99 0.35 1.11 0 -FEP_30_31 26.40 0.13 0.43 0 -FEP_65_66 9.42 0.20 0.63 0 -FEP_68_54 -33.01 0.30 0.94 0 -FEP_27_43 -3.21 0.29 0.92 0 -FEP_27_34 4.09 0.31 0.97 0 -FEP_48_42 15.15 0.40 1.27 0 -FEP_30_38 10.94 0.31 0.98 1 -FEP_33_36 -1.25 0.28 0.88 0 -FEP_28_29 -3.82 0.42 1.33 0 -FEP_27_39 0.97 0.36 1.13 0 -FEP_63_53 -1.60 0.19 0.59 0 -FEP_63_58 1.05 0.15 0.48 0 -FEP_68_64 -37.87 0.18 0.58 0 -FEP_26_57 -25.86 0.29 0.92 0 -FEP_28_44 8.93 0.33 1.03 0 -FEP_42_54 -5.94 0.19 0.60 0 -FEP_27_37 -3.37 0.26 0.81 0 -FEP_64_54 5.44 0.14 0.44 0 -FEP_45_42 0.49 0.21 0.67 0 -FEP_38_40 -16.98 0.38 1.19 0 -FEP_27_47 -13.02 0.37 1.16 0 -FEP_29_42 9.13 0.27 0.86 0 -FEP_60_61 7.14 0.20 0.62 0 -FEP_31_34 -14.61 0.34 1.08 0 -FEP_35_37 0.59 0.37 1.18 0 -FEP_26_68 -4.26 0.31 0.98 0 -FEP_66_62 6.96 0.46 1.44 0 -FEP_27_33 -0.47 0.20 0.65 0 -FEP_61_65 -10.04 0.51 1.61 0 -FEP_38_39 -2.82 0.21 0.67 0 -FEP_27_46 -8.73 0.14 0.44 0 -FEP_49_50 -0.17 0.17 0.52 0 -FEP_63_65 0.64 0.16 0.51 0 -FEP_37_50 6.32 0.17 0.53 0 -FEP_33_35 -3.33 0.41 1.30 0 -FEP_37_53 -3.52 0.41 1.28 0 -FEP_42_51 7.76 0.57 1.80 0 -FEP_33_37 -2.98 0.21 0.67 0 -FEP_27_32 -3.36 0.20 0.63 0 -FEP_27_28 -0.45 0.33 1.06 0 -FEP_60_65 -3.34 0.07 0.23 0 -FEP_35_36 3.13 0.20 0.62 0 -FEP_53_58 1.50 0.47 1.47 0 -FEP_28_48 -8.43 0.34 1.07 0 -FEP_40_41 13.81 0.59 1.88 0 -FEP_56_57 13.31 0.39 1.24 0 -FEP_56_58 -2.25 0.34 1.08 0 -FEP_66_64 -10.15 0.38 1.19 0 -FEP_42_44 4.01 0.29 0.92 0 -FEP_26_23 -36.48 0.30 0.94 0 -FEP_39_41 -1.33 0.15 0.48 0 -FEP_60_37 -2.35 0.37 1.16 0 -FEP_61_50 -1.79 0.30 0.96 0 -FEP_32_46 -5.39 0.16 0.52 0 -FEP_33_64 -5.23 0.20 0.62 0 -FEP_32_43 0.52 0.37 1.16 0 -FEP_27_38 3.50 0.37 1.18 0 -FEP_27_40 -10.67 1.05 3.30 5 -FEP_37_56 0.97 0.34 1.07 0 -FEP_23_66 3.39 0.20 0.62 0 -FEP_30_32 4.62 0.32 1.01 0 -FEP_32_47 -10.01 0.32 1.03 0 -FEP_67_60 -26.58 0.24 0.75 0 -FEP_43_42 9.13 0.24 0.76 0 -FEP_56_43 -0.41 0.18 0.56 0 -FEP_54_37 -2.43 0.18 0.57 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/5.PTP1B/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/5.PTP1B/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/5.PTP1B/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/5.PTP1B/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 46e5c350..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/5.PTP1B/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,44 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_23470_23468 40.84 0.41 1.29 0 -FEP_23471_23466 24.39 1.00 3.17 0 -FEP_23330-2qbq-_23475 -2.07 0.44 1.40 0 -FEP_23486_23484 8.62 0.43 1.35 0 -FEP_20667-2qbp-_23482 -7.57 1.13 3.56 3 -FEP_23469_20669-2qbr- 1.00 1.15 3.63 0 -FEP_23476_23475 -3.85 0.28 0.89 0 -FEP_20667-2qbp-_23483 18.86 0.49 1.56 0 -FEP_23467_23466 -23.68 0.13 0.41 0 -FEP_23471_23468 17.22 0.91 2.87 0 -FEP_20667-2qbp-_23484 19.43 0.53 1.67 0 -FEP_23480_23482 -92.07 0.45 1.43 0 -FEP_20669-2qbr-_23473 14.13 0.22 0.69 0 -FEP_23471_23467 45.28 1.04 3.28 0 -FEP_23472_23471 73.00 1.22 3.87 4 -FEP_20667-2qbp-_23485 4.72 0.35 1.12 0 -FEP_23469_23471 -36.14 0.95 3.00 0 -FEP_23482_23476 130.69 0.46 1.46 2 -FEP_23480_23479 -9.98 0.30 0.93 0 -FEP_20667-2qbp-_23486 10.41 0.20 0.64 0 -FEP_23477_23475 12.03 0.67 2.11 0 -FEP_23486_23485 -5.22 0.28 0.89 0 -FEP_23476_20670-2qbs- -2.73 0.27 0.85 0 -FEP_23330-2qbq-_23476 1.02 0.41 1.29 0 -FEP_23470_23471 23.67 0.91 2.89 0 -FEP_23474_20669-2qbr- 1.07 0.33 1.04 0 -FEP_23479_23476 49.03 0.40 1.25 0 -FEP_23479_23475 44.67 0.35 1.11 0 -FEP_23473_23467 -3.00 1.11 3.52 0 -FEP_23483_23482 -26.51 0.64 2.04 1 -FEP_23482_23479 83.13 0.79 2.48 0 -FEP_20670-2qbs-_23477 -9.98 0.48 1.52 0 -FEP_23472_20669-2qbr- 111.12 0.35 1.10 0 -FEP_23476_23474 2.76 0.46 1.45 0 -FEP_20670-2qbs-_23475 -0.43 0.27 0.85 0 -FEP_23475_23468 -10.26 0.24 0.76 0 -FEP_23469_23468 -20.06 0.93 2.93 1 -FEP_23474_23475 -7.67 0.23 0.72 0 -FEP_23482_23475 127.55 0.69 2.17 0 -FEP_23468_23466 7.29 0.56 1.77 0 -FEP_23472_23469 110.12 0.99 3.12 0 -FEP_23476_23477 -14.72 0.34 1.07 0 -FEP_23468_23467 30.71 0.26 0.82 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/5.PTP1B/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/5.PTP1B/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 47f701d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/5.PTP1B/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,44 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_23470_23468 41.17 0.22 0.70 0 -FEP_23471_23466 21.74 1.11 3.51 0 -FEP_23330-2qbq-_23475 -5.30 0.26 0.83 0 -FEP_23486_23484 6.92 0.18 0.56 0 -FEP_20667-2qbp-_23482 -13.43 0.82 2.59 0 -FEP_23469_20669-2qbr- 2.33 0.81 2.55 0 -FEP_23476_23475 -5.30 0.45 1.42 0 -FEP_20667-2qbp-_23483 17.21 0.41 1.29 0 -FEP_23467_23466 -23.65 0.20 0.62 0 -FEP_23471_23468 14.90 0.80 2.53 0 -FEP_20667-2qbp-_23484 18.78 0.20 0.64 0 -FEP_23480_23482 -90.93 0.70 2.21 0 -FEP_20669-2qbr-_23473 15.99 0.30 0.93 0 -FEP_23471_23467 46.26 0.92 2.92 0 -FEP_23472_23471 70.31 1.18 3.75 0 -FEP_20667-2qbp-_23485 2.13 0.18 0.56 0 -FEP_23469_23471 -33.22 0.63 1.98 0 -FEP_23482_23476 134.05 1.04 3.30 0 -FEP_23480_23479 -9.51 0.36 1.12 0 -FEP_20667-2qbp-_23486 11.85 0.28 0.89 0 -FEP_23477_23475 14.60 0.53 1.66 0 -FEP_23486_23485 -9.50 0.16 0.50 0 -FEP_23476_20670-2qbs- -3.54 0.40 1.26 0 -FEP_23330-2qbq-_23476 -0.06 0.93 2.93 0 -FEP_23470_23471 22.61 0.79 2.49 0 -FEP_23474_20669-2qbr- -2.19 0.19 0.59 0 -FEP_23479_23476 52.32 0.45 1.43 0 -FEP_23479_23475 46.37 0.47 1.49 0 -FEP_23473_23467 -5.24 0.40 1.27 0 -FEP_23483_23482 -30.20 0.95 3.00 0 -FEP_23482_23479 82.07 0.39 1.24 0 -FEP_20670-2qbs-_23477 -13.96 0.49 1.55 0 -FEP_23472_20669-2qbr- 108.61 0.36 1.13 0 -FEP_23476_23474 3.74 0.32 1.01 0 -FEP_20670-2qbs-_23475 -1.21 0.24 0.76 0 -FEP_23475_23468 -12.75 0.18 0.56 0 -FEP_23472_23469 107.78 0.27 0.85 0 -FEP_23474_23475 -9.03 0.42 1.32 0 -FEP_23468_23466 7.33 0.30 0.96 0 -FEP_23482_23475 129.94 0.68 2.16 0 -FEP_23469_23468 -19.37 0.21 0.65 0 -FEP_23468_23467 31.07 0.21 0.68 0 -FEP_23476_23477 -18.44 0.61 1.92 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/6.Thrombin/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/6.Thrombin/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/6.Thrombin/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/6.Thrombin/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 4d5c49ec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/6.Thrombin/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_6e_6b 3.68 0.27 0.85 0 -FEP_3b_5 5.55 0.29 0.93 0 -FEP_1c_5 7.16 0.26 0.81 0 -FEP_3b_3a -3.95 0.33 1.03 0 -FEP_3a_5 7.55 0.17 0.54 0 -FEP_6a_1b 5.87 0.22 0.69 0 -FEP_7a_3a -1.64 0.35 1.10 4 -FEP_6b_7a 1.35 0.19 0.59 0 -FEP_1b_1a 0.41 0.19 0.60 0 -FEP_1b_1c 0.67 0.23 0.72 0 -FEP_1b_5 7.66 0.17 0.54 0 -FEP_6a_6b 5.38 0.25 0.79 0 -FEP_6e_6a -1.24 0.16 0.49 0 -FEP_1b_1d 2.04 0.22 0.70 0 -FEP_1a_5 7.15 0.14 0.44 0 -FEP_1d_5 5.41 0.30 0.95 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/6.Thrombin/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/6.Thrombin/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 3368f2cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/6.Thrombin/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_6e_6b 3.48 0.28 0.89 0 -FEP_3b_5 2.55 0.29 0.93 0 -FEP_1c_5 3.60 0.23 0.73 0 -FEP_3b_3a -5.77 0.32 1.00 0 -FEP_3a_5 9.50 0.22 0.71 0 -FEP_6a_1b 5.20 0.21 0.66 0 -FEP_7a_3a -2.25 0.27 0.85 0 -FEP_6b_7a -1.28 0.22 0.70 0 -FEP_1b_1a -1.50 0.28 0.87 0 -FEP_1b_1c 0.45 0.23 0.73 0 -FEP_1b_5 3.97 0.35 1.12 0 -FEP_6a_6b 4.50 0.32 1.02 0 -FEP_6e_6a -0.96 0.21 0.66 0 -FEP_1b_1d 0.88 0.26 0.83 0 -FEP_1a_5 5.95 0.24 0.75 0 -FEP_1d_5 2.94 0.29 0.92 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/7.Tyk2/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/7.Tyk2/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/7.Tyk2/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/7.Tyk2/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 9c7d50db..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/7.Tyk2/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,37 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_ejm-47_ejm-46 8.13 0.27 0.85 1 -FEP_ejm-48_ejm-46 13.52 0.16 0.52 0 -FEP_ejm-43_ejm-55 -36.84 0.43 1.35 0 -FEP_jmc-27_ejm-46 8.50 0.20 0.64 0 -FEP_ejm-48_ejm-47 5.48 0.17 0.52 0 -FEP_ejm-47_jmc-27 -0.22 0.14 0.45 0 -FEP_ejm-49_ejm-46 -10.19 0.29 0.91 0 -FEP_ejm-43_ejm-31 -23.41 0.30 0.96 0 -FEP_ejm-42_ejm-31 -13.36 0.14 0.46 0 -FEP_ejm-44_ejm-55 -40.56 0.48 1.53 0 -FEP_ejm-50_ejm-42 -33.44 0.34 1.07 0 -FEP_ejm-45_ejm-46 16.39 0.26 0.83 0 -FEP_ejm-54_ejm-31 20.79 0.28 0.88 0 -FEP_ejm-45_ejm-50 40.93 0.34 1.08 1 -FEP_ejm-44_ejm-31 -28.50 0.43 1.37 0 -FEP_jmc-30_jmc-28 -5.45 0.19 0.60 0 -FEP_ejm-49_ejm-31 -32.68 0.41 1.29 0 -FEP_ejm-54_ejm-42 33.28 0.16 0.51 0 -FEP_jmc-30_jmc-27 -1.21 0.11 0.35 0 -FEP_jmc-28_jmc-23 -7.76 0.24 0.77 0 -FEP_jmc-27_jmc-28 -3.77 0.18 0.56 0 -FEP_ejm-42_ejm-55 -25.85 0.16 0.49 0 -FEP_jmc-27_jmc-23 -12.04 0.16 0.52 0 -FEP_ejm-55_ejm-31 12.96 0.15 0.46 0 -FEP_jmc-28_ejm-46 12.62 0.17 0.55 1 -FEP_ejm-46_ejm-42 -9.28 0.11 0.36 0 -FEP_ejm-44_ejm-43 -4.49 0.22 0.69 0 -FEP_ejm-50_ejm-31 -46.71 0.11 0.34 0 -FEP_ejm-45_ejm-42 6.65 0.13 0.42 0 -FEP_ejm-49_ejm-43 -8.91 0.36 1.14 0 -FEP_jmc-28_ejm-46 12.62 0.17 0.55 1 -FEP_ejm-46_ejm-42 -9.28 0.11 0.36 0 -FEP_ejm-44_ejm-43 -4.49 0.22 0.69 0 -FEP_ejm-50_ejm-31 -46.71 0.11 0.34 0 -FEP_ejm-45_ejm-42 6.65 0.13 0.42 0 -FEP_ejm-49_ejm-43 -8.91 0.36 1.14 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/7.Tyk2/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/7.Tyk2/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 0586d3ab..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/7.Tyk2/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,37 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_ejm-47_ejm-46 8.27 0.09 0.28 0 -FEP_ejm-48_ejm-46 15.55 0.06 0.19 1 -FEP_ejm-43_ejm-55 -36.18 0.12 0.37 0 -FEP_jmc-27_ejm-46 7.32 0.08 0.27 0 -FEP_ejm-48_ejm-47 7.15 0.08 0.25 0 -FEP_ejm-47_jmc-27 1.05 0.08 0.27 0 -FEP_ejm-49_ejm-46 -9.20 0.10 0.33 0 -FEP_ejm-43_ejm-31 -23.33 0.12 0.37 0 -FEP_ejm-42_ejm-31 -12.91 0.10 0.30 0 -FEP_ejm-44_ejm-55 -39.71 0.13 0.41 0 -FEP_ejm-50_ejm-42 -34.31 0.08 0.26 0 -FEP_ejm-45_ejm-46 17.62 0.11 0.36 0 -FEP_ejm-54_ejm-31 19.45 0.09 0.30 0 -FEP_ejm-45_ejm-50 41.88 0.19 0.59 0 -FEP_ejm-44_ejm-31 -26.48 0.11 0.34 0 -FEP_jmc-30_jmc-28 -7.36 0.12 0.38 0 -FEP_ejm-49_ejm-31 -32.61 0.18 0.56 0 -FEP_ejm-54_ejm-42 32.43 0.10 0.31 0 -FEP_jmc-30_jmc-27 -1.23 0.14 0.44 0 -FEP_jmc-28_jmc-23 -6.95 0.11 0.36 0 -FEP_jmc-27_jmc-28 -6.27 0.09 0.28 0 -FEP_ejm-42_ejm-55 -25.72 0.10 0.32 0 -FEP_jmc-27_jmc-23 -13.05 0.06 0.20 0 -FEP_ejm-55_ejm-31 11.89 0.09 0.27 0 -FEP_ejm-44_ejm-43 -3.36 0.12 0.38 0 -FEP_jmc-28_ejm-46 13.47 0.07 0.21 0 -FEP_ejm-50_ejm-31 -47.24 0.10 0.31 0 -FEP_ejm-46_ejm-42 -10.21 0.08 0.25 0 -FEP_ejm-45_ejm-42 7.72 0.11 0.36 0 -FEP_ejm-49_ejm-43 -8.93 0.17 0.53 0 -FEP_ejm-44_ejm-43 -3.36 0.12 0.38 0 -FEP_jmc-28_ejm-46 13.47 0.07 0.21 0 -FEP_ejm-50_ejm-31 -47.24 0.10 0.31 0 -FEP_ejm-46_ejm-42 -10.21 0.08 0.25 0 -FEP_ejm-45_ejm-42 7.72 0.11 0.36 0 -FEP_ejm-49_ejm-43 -8.93 0.17 0.53 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/8.p38/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/8.p38/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/8.p38/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/8.p38/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index f4153538..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/8.p38/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,55 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_p38a-2r_p38a-2l 14.56 0.31 0.97 1 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -114.04 0.68 2.16 1 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fly 19.22 0.21 0.67 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2l 7.70 0.17 0.54 1 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ff 33.62 0.17 0.53 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq -123.18 0.80 2.53 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly 4.52 0.30 0.95 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v 21.92 0.34 1.08 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2c 10.87 0.66 2.08 2 -FEP_p38a-2i_p38a-2h -13.84 0.20 0.62 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2v 2.99 0.45 1.43 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2n 8.16 0.35 1.10 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2m 75.42 0.37 1.15 1 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 6.02 0.20 0.64 1 -FEP_p38a-2s_p38a-2n -17.40 0.32 1.01 0 -FEP_p38a-2f_p38a-3flz 7.10 0.22 0.68 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 75.80 0.45 1.42 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2aa 49.42 0.56 1.77 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 8.99 0.23 0.73 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 11.47 0.15 0.46 1 -FEP_p38a-2gg_p38a-3fln 37.57 0.39 1.22 1 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -51.37 0.35 1.09 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-3fln 4.44 0.18 0.56 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-3fln 31.19 0.43 1.36 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2g -13.01 0.28 0.87 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c -22.69 0.73 2.31 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -45.71 0.31 0.98 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 111.25 0.37 1.18 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fly 127.38 0.38 1.21 1 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -5.38 0.16 0.51 1 -FEP_p38a-2ee_p38a-2ff 27.08 0.26 0.81 0 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln 8.15 0.29 0.93 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2m 140.95 1.14 3.59 2 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -0.74 0.36 1.13 2 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb 13.40 0.73 2.29 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2v 16.16 0.19 0.61 2 -FEP_p38a-2bb_p38a-2y 128.96 0.46 1.46 0 -FEP_p38a-2m_p38a-3fln -6.17 0.17 0.55 1 -FEP_p38a-2y_p38a-2z -12.53 0.95 3.02 0 -FEP_p38a-2e_p38a-2f -0.56 0.29 0.93 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-3fly -29.34 0.32 1.01 1 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly 13.32 0.41 1.31 1 -FEP_p38a-2p_p38a-2o -29.83 0.50 1.59 1 -FEP_p38a-2u_p38a-2q 68.01 0.37 1.17 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -29.74 0.19 0.61 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x 22.02 0.31 0.98 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2l -10.31 0.38 1.22 1 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z -23.48 0.24 0.76 2 -FEP_p38a-2n_p38a-2l 6.23 0.29 0.93 1 -FEP_p38a-2ff_p38a-2v 26.41 0.63 1.99 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2n 105.07 0.37 1.16 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2l -14.78 0.14 0.44 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2h -40.09 0.19 0.60 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-3flz 1.12 0.21 0.66 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/8.p38/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/8.p38/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index ef492640..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF/8.p38/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,55 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_p38a-2r_p38a-2l 12.92 0.15 0.47 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -118.14 0.35 1.11 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fly 16.36 0.26 0.83 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2l 6.30 0.09 0.30 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ff 34.22 0.19 0.59 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq -123.63 0.40 1.28 1 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly 4.03 0.39 1.23 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v 20.14 0.17 0.54 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2c 13.02 0.20 0.63 0 -FEP_p38a-2i_p38a-2h -15.16 0.22 0.70 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2v -0.31 0.30 0.96 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2n 7.66 0.37 1.16 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2m 73.98 0.27 0.84 0 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 7.68 0.22 0.70 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2n -15.46 0.18 0.58 1 -FEP_p38a-2f_p38a-3flz 8.53 0.20 0.64 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 77.41 0.53 1.66 1 -FEP_p38a-3flw_p38a-2aa 44.63 0.27 0.86 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 9.89 0.20 0.65 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 12.10 0.22 0.71 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-3fln 37.46 0.23 0.74 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -55.62 0.14 0.43 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-3fln 3.16 0.22 0.69 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-3fln 31.19 0.16 0.49 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2g -12.16 0.22 0.70 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c -22.16 0.30 0.96 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -46.95 0.17 0.55 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 112.67 0.24 0.75 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fly 127.80 1.04 3.30 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -6.33 0.23 0.72 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-2ff 27.80 0.11 0.35 0 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln 5.55 0.08 0.26 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2m 141.78 0.92 2.91 3 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -1.24 0.16 0.51 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb 11.90 0.66 2.08 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2v 13.83 0.16 0.50 0 -FEP_p38a-2bb_p38a-2y 130.17 0.24 0.77 0 -FEP_p38a-2m_p38a-3fln -9.16 0.24 0.76 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2z -7.96 0.28 0.88 0 -FEP_p38a-2e_p38a-2f -1.08 0.22 0.70 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-3fly -27.85 0.37 1.17 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly 8.69 0.36 1.13 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2o -30.19 0.28 0.90 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2q 68.20 0.15 0.48 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -29.39 0.18 0.57 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x 22.28 0.30 0.93 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2l -10.31 0.13 0.41 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z -23.72 0.43 1.36 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2v 23.37 0.36 1.13 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2h -41.84 0.19 0.59 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2l -15.05 0.11 0.36 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2n 107.38 0.18 0.57 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2l 5.42 0.24 0.75 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-3flz 1.32 0.23 0.71 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/1.BACE/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/1.BACE/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/1.BACE/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/1.BACE/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 2dfba115..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/1.BACE/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,59 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CAT-13k_CAT-13o -4.28 0.41 1.29 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a 13.49 0.26 0.81 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13b -7.36 0.23 0.72 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 5.03 0.18 0.58 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17i -19.15 0.20 0.63 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13d -0.26 0.61 1.93 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 75.09 0.30 0.95 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -12.87 0.25 0.80 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b -3.12 0.46 1.45 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 77.98 0.31 0.99 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -3.18 0.89 2.81 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m 9.11 0.35 1.12 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -4.46 0.70 2.21 0 -FEP_CAT-13k_CAT-4j 11.89 0.39 1.23 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 19.62 0.27 0.87 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4j 6.09 0.26 0.82 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17b -17.87 0.22 0.70 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4b 2.57 0.24 0.77 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 13.29 0.13 0.40 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -7.65 0.59 1.86 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -4.53 0.58 1.83 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -8.49 0.22 0.69 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -3.94 0.29 0.93 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13d 7.14 0.29 0.92 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -3.59 0.19 0.59 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -3.56 0.18 0.56 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13d -1.57 0.96 3.05 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17i 10.87 0.64 2.03 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13d 3.23 0.64 2.03 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17f -2.38 0.38 1.19 0 -FEP_CAT-13m_CAT-13n -10.77 0.23 0.72 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -18.10 0.22 0.71 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -71.97 0.30 0.94 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 18.66 0.54 1.70 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -83.22 0.36 1.14 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -13.15 0.64 2.03 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13a -8.86 0.33 1.03 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4a 16.32 0.31 1.00 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 17.22 0.69 2.18 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13d 2.23 0.76 2.41 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4a 15.59 0.27 0.87 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13a -16.79 1.01 3.21 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13d 7.42 0.47 1.49 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 73.78 0.38 1.19 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e 0.17 0.24 0.76 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13b -9.25 0.26 0.83 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 11.38 0.33 1.03 0 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 27.99 0.25 0.78 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j -7.29 0.30 0.94 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 16.60 0.20 0.64 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -76.36 0.28 0.88 0 -FEP_CAT-13e_CAT-17a -3.64 0.69 2.19 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4a 10.14 0.39 1.24 0 -FEP_CAT-24_CAT-17i 2.45 0.47 1.47 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17d -1.65 0.41 1.30 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13m -92.32 0.42 1.33 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13a -1.63 0.38 1.20 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17d -13.68 0.46 1.45 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/1.BACE/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/1.BACE/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index f46d1dcc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/1.BACE/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,59 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CAT-13k_CAT-13o -5.37 0.29 0.93 0 -FEP_CAT-4b_CAT-4a 9.59 0.20 0.65 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13b -6.32 0.17 0.52 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4p 5.45 0.20 0.65 0 -FEP_CAT-17e_CAT-17i -20.79 0.32 1.02 0 -FEP_CAT-17c_CAT-13d -3.28 0.22 0.71 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13j 76.81 0.26 0.81 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4k -13.55 0.14 0.46 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4b -0.22 0.39 1.23 0 -FEP_CAT-13n_CAT-13o 79.34 0.29 0.92 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17i -5.79 0.27 0.86 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4m 8.53 0.13 0.41 4 -FEP_CAT-17i_CAT-17d -6.51 0.14 0.45 0 -FEP_CAT-13k_CAT-4j 10.86 0.28 0.89 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17c 19.13 0.36 1.13 0 -FEP_CAT-4n_CAT-4j 2.29 0.16 0.50 2 -FEP_CAT-17e_CAT-17b -18.27 0.31 0.97 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4b 2.93 0.27 0.86 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17g 11.63 0.24 0.77 0 -FEP_CAT-24_CAT-17f -9.37 0.26 0.83 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17h -3.14 0.28 0.88 0 -FEP_CAT-17h_CAT-17d -11.60 0.25 0.78 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13e -2.73 0.14 0.44 0 -FEP_CAT-17a_CAT-13d 6.47 0.30 0.95 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4j -6.28 0.27 0.86 0 -FEP_CAT-13g_CAT-13f -2.37 0.20 0.64 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13d -0.94 0.30 0.94 0 -FEP_CAT-17f_CAT-17i 7.30 0.19 0.60 0 -FEP_CAT-13e_CAT-13d 3.53 0.27 0.84 0 -FEP_CAT-4n_CAT-17f -2.52 0.11 0.36 1 -FEP_CAT-13m_CAT-13n -13.20 0.13 0.40 0 -FEP_CAT-4a_CAT-4i -17.89 0.14 0.43 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13m -70.78 0.32 1.00 0 -FEP_CAT-17i_CAT-17g 17.06 0.17 0.53 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13n -83.51 0.16 0.52 0 -FEP_CAT-13d_CAT-13a -12.85 0.17 0.55 0 -FEP_CAT-13c_CAT-13a -7.64 0.18 0.58 0 -FEP_CAT-4d_CAT-4a 12.16 0.28 0.90 0 -FEP_CAT-17f_CAT-13d 15.93 0.16 0.51 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13d 2.54 0.30 0.95 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4a 15.56 0.13 0.42 0 -FEP_CAT-13h_CAT-13a -13.60 0.18 0.58 0 -FEP_CAT-17b_CAT-13d 6.82 0.24 0.75 0 -FEP_CAT-4j_CAT-4l 72.35 0.23 0.73 0 -FEP_CAT-13f_CAT-13e -0.29 0.25 0.80 0 -FEP_CAT-13i_CAT-13b -9.38 0.28 0.88 0 -FEP_CAT-4p_CAT-4o 9.36 0.15 0.48 4 -FEP_CAT-4k_CAT-4a 28.88 0.21 0.66 0 -FEP_CAT-13k_CAT-13j -7.37 0.17 0.54 0 -FEP_CAT-4m_CAT-4o 15.09 0.18 0.57 0 -FEP_CAT-4l_CAT-4i -75.35 0.21 0.65 0 -FEP_CAT-13e_CAT-17a -3.11 0.25 0.80 0 -FEP_CAT-4c_CAT-4a 9.46 0.22 0.69 0 -FEP_CAT-24_CAT-17i -1.65 0.21 0.67 0 -FEP_CAT-13d_CAT-17d -15.26 0.19 0.59 0 -FEP_CAT-4j_CAT-17d -3.70 0.21 0.66 0 -FEP_CAT-13b_CAT-13a -1.45 0.21 0.67 0 -FEP_CAT-4p_CAT-13m -93.53 0.19 0.60 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/2.CDK2/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/2.CDK2/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/2.CDK2/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/2.CDK2/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index f7836abb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/2.CDK2/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,28 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_32_1oiu 87.59 0.59 1.86 4 -FEP_1oiy_1oi9 40.62 0.23 0.72 5 -FEP_30_1h1s -97.79 0.30 0.96 3 -FEP_21_22 10.44 0.32 1.01 2 -FEP_20_17 8.45 0.37 1.18 3 -FEP_17_1h1q 0.60 0.36 1.12 2 -FEP_30_31 49.49 0.20 0.63 4 -FEP_26_21 -16.22 0.30 0.95 1 -FEP_1oi9_1h1q 17.24 0.32 1.03 2 -FEP_1h1s_1oiy 126.89 0.23 0.73 4 -FEP_1h1r_1h1q 5.82 0.27 0.85 3 -FEP_28_1h1s -46.40 0.24 0.76 4 -FEP_32_1h1s 47.70 0.43 1.36 5 -FEP_29_28 -45.85 0.25 0.78 3 -FEP_20_1h1r 3.75 0.24 0.76 3 -FEP_1h1s_1oiu 40.93 0.49 1.55 4 -FEP_1h1r_17 4.24 0.09 0.27 3 -FEP_1oiu_1h1r 139.91 0.21 0.66 3 -FEP_22_1h1r 1.00 0.44 1.40 3 -FEP_29_30 5.35 0.19 0.61 3 -FEP_26_1oi9 -16.67 0.39 1.25 3 -FEP_31_26 37.13 0.11 0.34 4 -FEP_28_30 50.99 0.24 0.77 3 -FEP_21_1h1r 11.13 0.26 0.82 0 -FEP_26_1h1q 0.45 0.27 0.84 0 -FEP_30_26 86.19 0.38 1.21 0 -FEP_32_30 145.49 0.50 1.59 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/2.CDK2/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/2.CDK2/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index e8e52321..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/2.CDK2/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,28 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_32_1oiu 90.48 0.29 0.92 4 -FEP_1oiy_1oi9 41.14 0.13 0.41 5 -FEP_30_1h1s -96.90 0.22 0.68 5 -FEP_21_22 8.90 0.14 0.46 5 -FEP_20_17 5.23 0.10 0.33 4 -FEP_17_1h1q 2.53 0.05 0.17 4 -FEP_30_31 50.33 0.20 0.63 3 -FEP_26_21 -18.95 0.09 0.30 4 -FEP_1oi9_1h1q 14.92 0.14 0.43 5 -FEP_1h1s_1oiy 126.44 0.20 0.62 3 -FEP_1h1r_1h1q 6.26 0.17 0.54 6 -FEP_28_1h1s -46.04 0.17 0.55 3 -FEP_32_1h1s 49.83 0.14 0.43 5 -FEP_29_28 -45.07 0.13 0.41 1 -FEP_20_1h1r 1.22 0.14 0.45 0 -FEP_1h1s_1oiu 40.70 0.17 0.55 1 -FEP_1h1r_17 4.17 0.07 0.22 6 -FEP_1oiu_1h1r 133.83 0.16 0.50 6 -FEP_22_1h1r 2.44 0.12 0.38 6 -FEP_29_30 3.93 0.16 0.51 2 -FEP_26_1oi9 -15.10 0.26 0.83 3 -FEP_31_26 34.61 0.16 0.51 2 -FEP_28_30 50.61 0.17 0.54 2 -FEP_21_1h1r 12.20 0.23 0.72 0 -FEP_30_26 85.61 0.18 0.56 0 -FEP_26_1h1q -0.49 0.17 0.54 0 -FEP_32_30 146.22 0.23 0.71 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/3.JNK1/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/3.JNK1/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/3.JNK1/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/3.JNK1/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 8310abd2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/3.JNK1/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,41 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_18660-1_18658-1 123.47 1.19 3.75 7 -FEP_18658-1_18634-1 -12.85 0.43 1.36 3 -FEP_18652-1_17124-1 92.96 0.40 1.25 1 -FEP_18631-1_18625-1 5.02 0.44 1.39 1 -FEP_18652-1_18638-1 4.69 0.43 1.35 6 -FEP_18639-1_17124-1 4.94 0.21 0.65 4 -FEP_17124-1_18636-1 3.80 0.46 1.45 5 -FEP_18633-1_18632-1 -3.39 0.33 1.04 2 -FEP_18636-1_18628-1 7.87 0.22 0.69 4 -FEP_18629-1_18624-1 5.48 0.15 0.48 6 -FEP_18638-1_17124-1 89.71 0.33 1.03 6 -FEP_18628-1_18625-1 -7.83 0.15 0.48 4 -FEP_18634-1_18633-1 10.46 0.61 1.92 5 -FEP_17124-1_18634-1 -9.19 0.19 0.61 2 -FEP_18630-1_18624-1 4.20 0.07 0.21 5 -FEP_18635-1_18628-1 3.63 0.25 0.79 4 -FEP_18635-1_18630-1 -3.29 0.21 0.68 7 -FEP_18637-1_18638-1 -35.40 0.35 1.09 2 -FEP_18629-1_18626-1 0.96 0.31 0.97 3 -FEP_18634-1_18631-1 6.75 0.15 0.47 3 -FEP_18660-1_18634-1 112.67 1.63 5.15 4 -FEP_18660-1_18659-1 125.11 0.63 1.99 6 -FEP_18633-1_18630-1 1.79 0.15 0.48 3 -FEP_18627-1_18624-1 2.89 0.15 0.48 2 -FEP_18630-1_18627-1 1.11 0.16 0.51 1 -FEP_18659-1_18658-1 2.30 0.28 0.88 5 -FEP_18631-1_18628-1 13.46 0.30 0.95 5 -FEP_18632-1_18629-1 3.28 0.42 1.34 5 -FEP_18637-1_17124-1 54.52 0.22 0.69 4 -FEP_18637-1_18639-1 50.39 0.27 0.85 2 -FEP_18627-1_18626-1 -1.06 0.08 0.27 6 -FEP_18659-1_18634-1 -10.34 0.34 1.07 0 -FEP_18633-1_18627-1 2.63 0.20 0.62 0 -FEP_18631-1_18624-1 8.29 0.28 0.88 0 -FEP_18638-1_18639-1 85.35 0.20 0.64 0 -FEP_17124-1_18631-1 -2.69 0.17 0.54 0 -FEP_18632-1_18626-1 4.50 0.23 0.74 0 -FEP_18635-1_18636-1 -4.50 0.20 0.62 0 -FEP_18626-1_18624-1 4.31 0.25 0.78 0 -FEP_18628-1_18624-1 -4.16 0.21 0.66 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/3.JNK1/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/3.JNK1/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index d58645dd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/3.JNK1/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,41 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_18660-1_18658-1 125.05 1.09 3.43 5 -FEP_18658-1_18634-1 -11.28 0.42 1.34 7 -FEP_18652-1_17124-1 94.80 0.54 1.71 6 -FEP_18631-1_18625-1 1.55 0.15 0.48 3 -FEP_18652-1_18638-1 5.12 0.47 1.48 4 -FEP_18639-1_17124-1 5.04 0.09 0.29 2 -FEP_17124-1_18636-1 -2.07 0.15 0.48 3 -FEP_18633-1_18632-1 -2.66 0.13 0.41 7 -FEP_18636-1_18628-1 8.23 0.08 0.24 5 -FEP_18629-1_18624-1 4.89 0.07 0.23 3 -FEP_18638-1_17124-1 90.48 0.15 0.46 2 -FEP_18628-1_18625-1 -8.45 0.13 0.40 2 -FEP_18634-1_18633-1 6.81 0.20 0.64 6 -FEP_17124-1_18634-1 -9.83 0.12 0.39 3 -FEP_18630-1_18624-1 4.34 0.15 0.47 3 -FEP_18635-1_18628-1 3.80 0.17 0.53 4 -FEP_18635-1_18630-1 -3.77 0.25 0.80 3 -FEP_18637-1_18638-1 -36.02 0.30 0.94 4 -FEP_18629-1_18626-1 1.44 0.19 0.61 6 -FEP_18634-1_18631-1 5.54 0.13 0.41 5 -FEP_18660-1_18634-1 113.90 0.25 0.79 6 -FEP_18660-1_18659-1 124.82 0.56 1.76 2 -FEP_18633-1_18630-1 -0.22 0.18 0.56 4 -FEP_18627-1_18624-1 2.73 0.07 0.22 5 -FEP_18630-1_18627-1 2.50 0.09 0.27 6 -FEP_18659-1_18658-1 1.79 0.15 0.46 3 -FEP_18631-1_18628-1 9.67 0.22 0.69 5 -FEP_18632-1_18629-1 3.69 0.15 0.48 4 -FEP_18637-1_17124-1 54.34 0.20 0.63 6 -FEP_18637-1_18639-1 48.96 0.21 0.66 2 -FEP_18627-1_18626-1 -0.77 0.04 0.14 5 -FEP_18632-1_18626-1 4.80 0.10 0.32 0 -FEP_18635-1_18636-1 -4.05 0.32 1.01 0 -FEP_18638-1_18639-1 85.41 0.15 0.46 0 -FEP_18631-1_18624-1 6.07 0.19 0.61 0 -FEP_18633-1_18627-1 2.64 0.22 0.68 0 -FEP_18659-1_18634-1 -10.29 0.23 0.72 0 -FEP_18628-1_18624-1 -3.91 0.18 0.58 0 -FEP_18626-1_18624-1 3.08 0.12 0.39 0 -FEP_17124-1_18631-1 -3.74 0.13 0.42 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/4.MCL1/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/4.MCL1/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/4.MCL1/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/4.MCL1/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 3191914b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/4.MCL1/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,86 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_33_32 -2.22 0.19 0.61 0 -FEP_27_42 6.78 0.44 1.39 1 -FEP_35_49 9.13 0.21 0.65 0 -FEP_51_54 -12.49 0.31 0.99 0 -FEP_67_26 18.35 0.36 1.13 0 -FEP_46_43 7.51 0.20 0.62 0 -FEP_23_64 -12.35 0.25 0.78 0 -FEP_27_30 -6.58 0.22 0.71 0 -FEP_28_42 2.68 0.35 1.09 0 -FEP_60_63 -5.69 0.17 0.53 0 -FEP_63_64 5.68 0.20 0.64 0 -FEP_53_54 13.25 0.15 0.46 0 -FEP_35_52 -3.56 0.45 1.43 0 -FEP_67_37 -25.22 0.19 0.61 0 -FEP_23_62 1.96 0.28 0.89 0 -FEP_28_45 0.26 0.31 1.00 0 -FEP_52_53 -5.01 0.28 0.88 0 -FEP_27_41 2.01 1.31 4.13 3 -FEP_47_43 6.55 0.28 0.88 0 -FEP_30_31 25.98 0.22 0.70 0 -FEP_65_66 12.39 0.28 0.89 0 -FEP_68_54 -36.06 0.29 0.90 0 -FEP_27_43 -3.01 0.32 1.01 0 -FEP_27_34 1.80 0.40 1.26 0 -FEP_48_42 11.52 0.25 0.80 0 -FEP_30_38 7.95 0.41 1.29 1 -FEP_33_36 0.29 0.32 1.01 0 -FEP_28_29 -8.28 0.70 2.22 0 -FEP_27_39 1.07 0.98 3.11 0 -FEP_63_53 -2.91 0.16 0.52 0 -FEP_63_58 1.91 0.12 0.37 0 -FEP_68_64 -40.52 0.71 2.25 0 -FEP_26_57 -26.78 0.24 0.75 0 -FEP_28_44 4.40 0.44 1.38 1 -FEP_42_54 -7.62 0.17 0.53 0 -FEP_27_37 -6.30 0.55 1.74 0 -FEP_64_54 5.35 0.37 1.17 0 -FEP_45_42 3.14 0.26 0.83 0 -FEP_38_40 -16.90 0.54 1.72 0 -FEP_27_47 -9.41 0.59 1.86 0 -FEP_29_42 8.95 0.38 1.20 0 -FEP_60_61 6.28 0.37 1.18 0 -FEP_31_34 -14.29 0.59 1.86 0 -FEP_35_37 2.02 0.17 0.52 0 -FEP_26_68 -3.39 0.34 1.06 0 -FEP_66_62 6.84 0.24 0.75 0 -FEP_27_33 -2.17 0.17 0.53 0 -FEP_61_65 -11.04 0.56 1.76 0 -FEP_38_39 1.20 0.72 2.28 0 -FEP_27_46 -9.17 0.21 0.67 0 -FEP_49_50 -2.80 0.28 0.89 0 -FEP_63_65 0.44 0.20 0.63 0 -FEP_37_50 5.04 0.10 0.32 0 -FEP_33_35 -5.19 0.34 1.08 0 -FEP_37_53 -8.53 0.40 1.25 0 -FEP_42_51 5.33 0.35 1.10 0 -FEP_33_37 -4.26 0.58 1.84 0 -FEP_27_32 -5.18 0.20 0.64 0 -FEP_27_28 5.08 0.25 0.80 0 -FEP_60_65 -4.87 0.17 0.54 0 -FEP_35_36 5.86 0.17 0.55 0 -FEP_53_58 4.47 0.17 0.55 0 -FEP_28_48 -8.43 0.36 1.12 0 -FEP_40_41 14.87 0.47 1.48 3 -FEP_56_57 16.82 0.40 1.28 0 -FEP_56_58 -3.88 0.40 1.27 0 -FEP_66_64 -7.15 0.32 1.00 0 -FEP_42_44 1.32 0.25 0.79 0 -FEP_67_60 -25.89 0.10 0.32 0 -FEP_23_66 -5.81 0.23 0.73 0 -FEP_27_40 -12.23 1.92 6.08 7 -FEP_26_23 -32.80 0.23 0.72 0 -FEP_56_43 3.47 0.20 0.65 0 -FEP_61_50 -0.67 0.15 0.48 0 -FEP_30_32 2.81 0.30 0.96 0 -FEP_32_47 -5.12 0.47 1.48 0 -FEP_27_38 -0.23 0.56 1.77 0 -FEP_43_42 8.40 0.32 1.03 0 -FEP_39_41 0.26 0.68 2.14 1 -FEP_32_43 2.43 0.25 0.80 0 -FEP_33_64 -2.60 0.40 1.28 1 -FEP_60_37 0.72 0.38 1.21 0 -FEP_37_56 0.98 0.36 1.14 0 -FEP_32_46 -5.41 0.17 0.53 0 -FEP_54_37 -5.89 0.27 0.85 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/4.MCL1/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/4.MCL1/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index c83927c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/4.MCL1/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,86 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_33_32 -4.27 0.22 0.70 0 -FEP_27_42 10.87 0.38 1.20 0 -FEP_35_49 7.43 0.31 0.99 0 -FEP_51_54 -12.84 0.48 1.52 1 -FEP_67_26 15.44 0.38 1.21 0 -FEP_46_43 7.64 0.22 0.69 0 -FEP_23_64 -11.50 0.21 0.68 0 -FEP_27_30 -6.91 0.24 0.76 0 -FEP_28_42 7.54 0.14 0.45 0 -FEP_60_63 -4.23 0.13 0.41 0 -FEP_63_64 4.74 0.22 0.69 0 -FEP_53_54 11.66 0.41 1.30 0 -FEP_35_52 -2.16 0.36 1.15 0 -FEP_67_37 -28.04 0.31 0.99 0 -FEP_23_62 3.10 0.29 0.91 0 -FEP_28_45 5.68 0.28 0.90 0 -FEP_52_53 -0.85 0.26 0.81 0 -FEP_27_41 3.10 1.20 3.79 5 -FEP_47_43 9.65 0.23 0.73 0 -FEP_30_31 27.74 0.18 0.57 0 -FEP_65_66 11.80 0.16 0.50 0 -FEP_68_54 -32.73 0.16 0.51 0 -FEP_27_43 -1.41 0.22 0.71 0 -FEP_27_34 4.28 0.35 1.11 0 -FEP_48_42 16.16 0.20 0.62 0 -FEP_30_38 15.37 0.50 1.60 0 -FEP_33_36 1.25 0.20 0.63 0 -FEP_28_29 -3.43 0.70 2.20 0 -FEP_27_39 4.69 0.56 1.76 0 -FEP_63_53 -2.34 0.18 0.56 0 -FEP_63_58 1.91 0.22 0.71 0 -FEP_68_64 -37.67 0.21 0.66 0 -FEP_26_57 -25.87 0.59 1.85 0 -FEP_28_44 9.35 0.28 0.89 0 -FEP_42_54 -6.24 0.16 0.50 0 -FEP_27_37 -3.69 0.30 0.94 0 -FEP_64_54 5.22 0.10 0.31 0 -FEP_45_42 1.92 0.22 0.69 0 -FEP_38_40 -16.77 0.39 1.25 0 -FEP_27_47 -11.07 0.26 0.82 0 -FEP_29_42 12.47 0.44 1.39 0 -FEP_60_61 5.00 0.43 1.35 0 -FEP_31_34 -14.27 0.13 0.42 0 -FEP_35_37 1.53 0.30 0.95 0 -FEP_26_68 -4.13 0.42 1.33 0 -FEP_66_62 6.62 0.54 1.72 0 -FEP_27_33 -0.61 0.15 0.46 0 -FEP_61_65 -7.23 1.13 3.58 0 -FEP_38_39 -2.12 0.40 1.27 0 -FEP_27_46 -8.81 0.21 0.67 0 -FEP_49_50 -0.11 0.19 0.62 0 -FEP_63_65 0.58 0.25 0.79 0 -FEP_37_50 5.57 0.09 0.28 0 -FEP_33_35 -4.59 0.29 0.91 0 -FEP_37_53 -4.35 0.35 1.11 0 -FEP_42_51 6.00 0.30 0.93 0 -FEP_33_37 -4.31 0.31 0.97 0 -FEP_27_32 -3.51 0.23 0.73 0 -FEP_27_28 1.53 0.37 1.17 0 -FEP_60_65 -3.61 0.22 0.70 0 -FEP_35_36 7.19 0.18 0.56 0 -FEP_53_58 4.19 0.34 1.08 0 -FEP_28_48 -9.66 0.37 1.16 0 -FEP_40_41 11.65 0.69 2.17 0 -FEP_56_57 16.11 0.26 0.83 0 -FEP_56_58 -1.80 0.36 1.13 0 -FEP_66_64 -6.66 0.39 1.22 0 -FEP_42_44 2.17 0.20 0.63 0 -FEP_26_23 -30.85 0.33 1.04 0 -FEP_39_41 -0.49 0.41 1.30 0 -FEP_60_37 -1.87 0.21 0.65 0 -FEP_61_50 -2.01 0.15 0.48 0 -FEP_32_46 -2.95 0.22 0.68 0 -FEP_33_64 -1.90 0.27 0.87 0 -FEP_32_43 3.38 0.18 0.56 0 -FEP_27_38 6.44 0.69 2.18 0 -FEP_27_40 -8.81 1.11 3.52 4 -FEP_37_56 2.95 0.38 1.22 0 -FEP_23_66 -4.60 0.22 0.68 0 -FEP_30_32 3.18 0.44 1.40 0 -FEP_32_47 -7.06 0.27 0.85 0 -FEP_67_60 -25.89 0.30 0.96 0 -FEP_43_42 9.93 0.42 1.32 0 -FEP_56_43 1.05 0.27 0.85 0 -FEP_54_37 -7.68 0.21 0.66 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/5.PTP1B/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/5.PTP1B/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/5.PTP1B/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/5.PTP1B/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 9fd7c2c7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/5.PTP1B/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,44 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_23470_23468 39.98 0.43 1.36 0 -FEP_23486_23484 14.45 0.43 1.35 0 -FEP_23469_23471 -34.94 0.60 1.89 0 -FEP_23467_23466 -24.59 0.46 1.46 1 -FEP_20667-2qbp-_23486 8.92 0.32 1.02 0 -FEP_20670-2qbs-_23477 -10.88 0.75 2.38 0 -FEP_23330-2qbq-_23476 1.63 0.36 1.14 0 -FEP_23477_23475 12.00 0.20 0.62 0 -FEP_23471_23468 16.87 0.60 1.89 0 -FEP_20667-2qbp-_23483 18.78 0.49 1.54 0 -FEP_23472_23471 64.41 1.25 3.95 1 -FEP_23330-2qbq-_23475 -3.41 0.48 1.53 0 -FEP_23469_20669-2qbr- -0.85 0.32 1.00 0 -FEP_23479_23475 47.35 0.51 1.61 0 -FEP_23480_23479 -10.28 0.29 0.91 0 -FEP_20670-2qbs-_23475 -0.93 0.12 0.39 0 -FEP_23472_20669-2qbr- 103.95 0.52 1.65 0 -FEP_20667-2qbp-_23484 23.69 0.53 1.66 0 -FEP_20669-2qbr-_23473 14.26 0.28 0.88 0 -FEP_23482_23479 85.32 0.79 2.51 0 -FEP_23470_23471 23.13 0.46 1.47 0 -FEP_23480_23482 -94.23 0.63 1.98 0 -FEP_23476_20670-2qbs- -3.86 0.19 0.59 0 -FEP_23486_23485 16.88 0.26 0.83 0 -FEP_23474_20669-2qbr- 2.90 0.47 1.50 0 -FEP_23471_23466 22.59 0.76 2.40 0 -FEP_23473_23467 -5.63 0.43 1.37 3 -FEP_23476_23474 2.82 0.62 1.97 0 -FEP_23471_23467 46.72 0.48 1.50 0 -FEP_23482_23476 132.93 1.03 3.25 1 -FEP_23476_23475 -4.48 0.33 1.04 0 -FEP_20667-2qbp-_23485 25.68 0.18 0.56 0 -FEP_20667-2qbp-_23482 -13.08 1.34 4.24 1 -FEP_23483_23482 -29.67 1.15 3.62 0 -FEP_23479_23476 49.93 0.49 1.56 0 -FEP_23469_23468 -22.10 0.59 1.87 0 -FEP_23475_23468 -9.26 0.24 0.77 0 -FEP_23468_23466 6.29 0.44 1.38 1 -FEP_23472_23469 103.52 0.59 1.88 0 -FEP_23474_23475 -7.15 0.52 1.65 0 -FEP_23482_23475 130.43 1.30 4.10 1 -FEP_23476_23477 -15.98 0.65 2.05 0 -FEP_23468_23467 29.94 0.55 1.73 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/5.PTP1B/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/5.PTP1B/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 5624621d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/5.PTP1B/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,44 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_23467_23466 -24.98 0.31 0.98 0 -FEP_23476_23474 2.34 0.34 1.06 0 -FEP_23469_23471 -37.17 0.43 1.36 0 -FEP_23477_23475 13.66 0.47 1.50 0 -FEP_23471_23466 21.81 0.46 1.45 0 -FEP_20667-2qbp-_23486 8.82 0.13 0.41 0 -FEP_23330-2qbq-_23475 -5.07 0.61 1.93 0 -FEP_20667-2qbp-_23484 21.46 0.12 0.37 0 -FEP_23471_23468 16.23 0.40 1.27 0 -FEP_23479_23476 51.88 0.25 0.80 0 -FEP_20670-2qbs-_23475 -1.13 0.10 0.33 0 -FEP_20669-2qbr-_23473 16.17 0.12 0.37 0 -FEP_20667-2qbp-_23485 21.79 0.17 0.55 0 -FEP_23476_23475 -6.34 0.37 1.17 0 -FEP_23480_23479 -10.41 0.28 0.88 0 -FEP_23486_23485 13.12 0.14 0.45 0 -FEP_20670-2qbs-_23477 -13.62 0.52 1.64 0 -FEP_23479_23475 47.62 0.37 1.18 0 -FEP_20667-2qbp-_23483 17.62 0.26 0.82 0 -FEP_20667-2qbp-_23482 -16.76 1.02 3.24 0 -FEP_23473_23467 -6.54 0.35 1.09 0 -FEP_23482_23479 82.44 0.46 1.45 0 -FEP_23476_20670-2qbs- -4.45 0.60 1.89 0 -FEP_23483_23482 -33.95 0.98 3.11 0 -FEP_23482_23476 134.80 0.61 1.92 0 -FEP_23474_20669-2qbr- 0.51 0.24 0.77 0 -FEP_23480_23482 -91.85 0.27 0.87 0 -FEP_23470_23471 24.00 0.27 0.86 0 -FEP_23472_23471 65.27 0.44 1.40 0 -FEP_23330-2qbq-_23476 1.33 0.41 1.31 0 -FEP_23486_23484 12.14 0.25 0.78 0 -FEP_23471_23467 46.86 0.57 1.80 0 -FEP_23470_23468 40.06 0.28 0.90 0 -FEP_23469_20669-2qbr- 1.30 0.71 2.26 0 -FEP_23472_20669-2qbr- 102.76 0.20 0.63 0 -FEP_23475_23468 -12.24 0.19 0.60 0 -FEP_23469_23468 -21.20 0.33 1.03 0 -FEP_23474_23475 -7.74 0.18 0.57 0 -FEP_23482_23475 129.30 0.73 2.31 0 -FEP_23468_23466 6.73 0.19 0.59 0 -FEP_23472_23469 102.01 0.35 1.09 0 -FEP_23476_23477 -18.74 0.66 2.08 0 -FEP_23468_23467 31.33 0.22 0.70 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/6.Thrombin/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/6.Thrombin/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/6.Thrombin/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/6.Thrombin/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index e529faa6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/6.Thrombin/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_1b_1a -2.19 0.13 0.40 0 -FEP_1c_5 3.36 0.33 1.03 0 -FEP_6a_6b 5.33 0.18 0.58 0 -FEP_1b_5 1.28 0.20 0.64 0 -FEP_3b_3a -8.49 0.18 0.58 0 -FEP_3a_5 5.45 0.30 0.95 0 -FEP_1b_1c -2.57 0.17 0.55 0 -FEP_6a_1b 9.42 0.27 0.87 0 -FEP_1a_5 3.67 0.18 0.58 0 -FEP_7a_3a 6.45 0.30 0.96 0 -FEP_6e_6b 5.15 0.23 0.73 0 -FEP_6e_6a 0.15 0.21 0.67 0 -FEP_1b_1d -1.96 0.17 0.54 0 -FEP_1d_5 2.68 0.39 1.23 0 -FEP_3b_5 -1.43 0.31 0.97 0 -FEP_6b_7a -9.64 0.26 0.83 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/6.Thrombin/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/6.Thrombin/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 63971477..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/6.Thrombin/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,17 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_6e_6b 4.83 0.26 0.82 0 -FEP_6a_6b 4.53 0.23 0.72 0 -FEP_1b_1d -0.90 0.24 0.75 0 -FEP_1d_5 -0.02 0.25 0.81 0 -FEP_7a_3a 8.70 0.28 0.88 0 -FEP_1a_5 2.14 0.14 0.43 0 -FEP_6e_6a 0.53 0.09 0.29 0 -FEP_6b_7a -12.40 0.26 0.83 0 -FEP_1c_5 0.39 0.23 0.74 0 -FEP_1b_1c -1.55 0.27 0.84 0 -FEP_6a_1b 7.47 0.22 0.68 0 -FEP_1b_5 -1.16 0.17 0.55 0 -FEP_3a_5 4.87 0.27 0.85 0 -FEP_3b_3a -10.43 0.26 0.81 0 -FEP_3b_5 -3.64 0.22 0.69 0 -FEP_1b_1a -3.09 0.24 0.76 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/7.Tyk2/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/7.Tyk2/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/7.Tyk2/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/7.Tyk2/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index ad5cfbd1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/7.Tyk2/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,31 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_ejm-47_ejm-46 0.02 0.25 0.78 1 -FEP_ejm-48_ejm-46 1.98 0.34 1.08 1 -FEP_ejm-43_ejm-55 -37.63 0.28 0.89 0 -FEP_jmc-27_ejm-46 8.25 0.16 0.50 0 -FEP_ejm-48_ejm-47 2.06 0.13 0.40 0 -FEP_ejm-47_jmc-27 -8.38 0.23 0.71 0 -FEP_ejm-49_ejm-46 -11.89 0.33 1.05 0 -FEP_ejm-43_ejm-31 -24.57 0.31 0.97 0 -FEP_ejm-42_ejm-31 -13.26 0.16 0.49 0 -FEP_ejm-44_ejm-55 -41.47 0.42 1.32 0 -FEP_ejm-50_ejm-42 -31.94 0.18 0.56 0 -FEP_ejm-45_ejm-46 9.19 0.25 0.79 0 -FEP_ejm-54_ejm-31 22.00 0.22 0.68 0 -FEP_ejm-45_ejm-50 32.65 0.59 1.87 0 -FEP_ejm-44_ejm-31 -28.87 0.33 1.05 0 -FEP_jmc-30_jmc-28 5.42 0.11 0.36 1 -FEP_ejm-49_ejm-31 -35.32 0.33 1.05 0 -FEP_ejm-54_ejm-42 35.02 0.13 0.42 0 -FEP_jmc-30_jmc-27 -1.58 0.14 0.43 0 -FEP_jmc-28_jmc-23 -19.48 0.20 0.64 0 -FEP_jmc-27_jmc-28 7.18 0.25 0.79 0 -FEP_ejm-42_ejm-55 -25.93 0.13 0.42 0 -FEP_jmc-27_jmc-23 -12.24 0.21 0.67 0 -FEP_ejm-55_ejm-31 11.71 0.15 0.48 0 -FEP_ejm-44_ejm-43 -3.93 0.22 0.68 2 -FEP_ejm-49_ejm-43 -9.83 0.28 0.87 0 -FEP_ejm-46_ejm-42 -9.11 0.13 0.42 0 -FEP_ejm-45_ejm-42 -0.15 0.26 0.83 0 -FEP_jmc-28_ejm-46 1.52 0.21 0.68 0 -FEP_ejm-50_ejm-31 -45.74 0.10 0.31 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/7.Tyk2/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/7.Tyk2/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index be9b6427..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/7.Tyk2/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,31 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_ejm-50_ejm-42 -31.98 0.13 0.41 0 -FEP_ejm-54_ejm-42 34.74 0.10 0.32 0 -FEP_ejm-48_ejm-47 2.66 0.10 0.33 0 -FEP_jmc-27_jmc-23 -12.36 0.14 0.45 0 -FEP_jmc-30_jmc-27 -1.28 0.10 0.31 0 -FEP_ejm-43_ejm-31 -26.18 0.14 0.46 0 -FEP_jmc-27_ejm-46 7.58 0.14 0.45 0 -FEP_jmc-30_jmc-28 3.89 0.12 0.39 0 -FEP_ejm-43_ejm-55 -36.63 0.13 0.42 0 -FEP_ejm-49_ejm-31 -35.78 0.16 0.50 0 -FEP_ejm-47_jmc-27 -6.54 0.09 0.27 0 -FEP_ejm-44_ejm-31 -27.11 0.14 0.45 0 -FEP_ejm-48_ejm-46 4.16 0.10 0.30 0 -FEP_ejm-54_ejm-31 20.59 0.11 0.36 0 -FEP_ejm-45_ejm-50 31.94 0.13 0.42 0 -FEP_ejm-42_ejm-55 -25.05 0.19 0.61 0 -FEP_ejm-47_ejm-46 1.29 0.13 0.42 0 -FEP_jmc-28_jmc-23 -17.54 0.13 0.42 0 -FEP_jmc-27_jmc-28 5.21 0.09 0.27 0 -FEP_ejm-44_ejm-55 -39.08 0.12 0.37 0 -FEP_ejm-42_ejm-31 -14.85 0.11 0.34 0 -FEP_ejm-55_ejm-31 10.01 0.24 0.75 0 -FEP_ejm-45_ejm-46 10.26 0.13 0.40 0 -FEP_ejm-49_ejm-46 -10.91 0.10 0.32 0 -FEP_jmc-28_ejm-46 2.18 0.08 0.25 0 -FEP_ejm-46_ejm-42 -10.20 0.10 0.32 0 -FEP_ejm-44_ejm-43 -1.97 0.17 0.53 0 -FEP_ejm-50_ejm-31 -46.08 0.20 0.64 0 -FEP_ejm-45_ejm-42 -0.03 0.12 0.38 0 -FEP_ejm-49_ejm-43 -9.52 0.12 0.39 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/8.p38/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/8.p38/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/8.p38/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/8.p38/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 3e0684e2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/8.p38/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,55 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_p38a-2ff_p38a-3fln 5.36 0.17 0.54 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-3fln 30.12 0.60 1.89 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2m 142.95 1.25 3.94 3 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 9.04 0.12 0.39 2 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -46.46 0.25 0.80 0 -FEP_p38a-2bb_p38a-2y 127.54 0.66 2.10 7 -FEP_p38a-2s_p38a-2n -16.97 0.27 0.87 1 -FEP_p38a-2e_p38a-2f -0.58 0.24 0.77 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v 22.11 0.36 1.14 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2l -9.41 0.30 0.96 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-3fln 36.32 0.26 0.82 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 76.68 0.28 0.89 1 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb 12.40 1.26 3.99 2 -FEP_p38a-3fly_p38a-2v 15.96 0.23 0.73 1 -FEP_p38a-2ee_p38a-2ff 25.23 0.30 0.96 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x 23.61 0.26 0.83 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fly 126.69 0.56 1.77 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly 3.96 0.53 1.67 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq -122.76 0.40 1.26 2 -FEP_p38a-2y_p38a-2v 0.60 0.25 0.78 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c -22.48 1.09 3.44 1 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 11.39 0.27 0.86 1 -FEP_p38a-2i_p38a-2h -15.51 0.13 0.41 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2l 15.54 0.26 0.83 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fly 18.72 0.49 1.56 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z -23.06 0.26 0.81 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ff 30.73 0.11 0.34 1 -FEP_p38a-2r_p38a-2n 7.25 0.35 1.11 1 -FEP_p38a-2y_p38a-2z -8.60 0.14 0.43 8 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 112.81 0.76 2.42 1 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -115.26 0.46 1.45 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2l 11.15 0.18 0.58 1 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -53.84 0.41 1.29 1 -FEP_p38a-2q_p38a-2m 75.43 0.52 1.65 0 -FEP_p38a-2m_p38a-3fln -7.04 0.22 0.71 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -30.41 0.24 0.76 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2c 10.91 1.19 3.77 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly 12.79 0.55 1.74 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2g -14.24 0.43 1.35 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2aa 47.10 0.59 1.86 0 -FEP_p38a-2f_p38a-3flz 6.85 0.22 0.71 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -5.47 0.23 0.73 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2o -31.73 0.47 1.50 0 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln 7.94 0.31 0.98 1 -FEP_p38a-2aa_p38a-3fly -27.08 0.32 1.00 1 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 6.78 0.15 0.46 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -4.53 0.23 0.73 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2q 69.60 0.47 1.48 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2n 106.90 0.32 1.03 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2v 27.69 0.57 1.81 1 -FEP_p38a-2g_p38a-2h -43.12 0.20 0.63 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2l 7.17 0.29 0.91 1 -FEP_p38a-2m_p38a-2l -15.22 0.21 0.66 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-3flz 1.34 0.27 0.87 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/8.p38/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/8.p38/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index a3da04bf..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/JACS/openFF2/8.p38/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,55 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_p38a-2i_p38a-2h -15.70 0.19 0.59 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2x 22.32 0.20 0.64 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2l 113.66 0.21 0.68 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-2bb 12.69 0.72 2.29 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-3fly 16.33 0.31 0.98 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3fly 8.78 0.37 1.15 0 -FEP_p38a-2m_p38a-3fln -10.02 0.11 0.36 0 -FEP_p38a-3flz_p38a-2c -24.20 1.03 3.26 2 -FEP_p38a-2aa_p38a-2z -23.84 0.35 1.12 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2z -8.50 0.16 0.50 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2g 9.85 0.11 0.34 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-3fln 36.28 0.18 0.56 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2n 76.92 0.38 1.21 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2m 139.07 0.94 2.97 4 -FEP_p38a-2r_p38a-2l 13.93 0.12 0.39 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2e -6.57 0.34 1.09 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2n -15.20 0.09 0.28 0 -FEP_p38a-2e_p38a-2f -0.86 0.16 0.51 0 -FEP_p38a-3flw_p38a-2aa 43.92 0.21 0.68 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2j -29.54 0.19 0.61 0 -FEP_p38a-2x_p38a-2g -12.66 0.16 0.50 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-3fln 30.23 0.21 0.65 0 -FEP_p38a-2h_p38a-2c 11.03 1.16 3.68 0 -FEP_p38a-2q_p38a-2m 73.62 0.28 0.90 0 -FEP_p38a-2ee_p38a-2ff 25.68 0.15 0.47 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-3fln 4.28 0.30 0.96 0 -FEP_p38a-2aa_p38a-3fly -27.30 0.35 1.11 0 -FEP_p38a-2l_p38a-3fln 5.51 0.23 0.73 0 -FEP_p38a-2u_p38a-2q 66.83 0.50 1.57 0 -FEP_p38a-2j_p38a-2i 12.58 0.19 0.61 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3flq -122.67 0.66 2.09 0 -FEP_p38a-3fmh_p38a-3fly 3.68 0.55 1.73 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2v 20.41 0.20 0.64 0 -FEP_p38a-2s_p38a-2l -9.87 0.22 0.70 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-2k -48.00 0.15 0.49 0 -FEP_p38a-2gg_p38a-2ff 32.05 0.27 0.87 0 -FEP_p38a-2bb_p38a-2y 128.23 0.22 0.71 0 -FEP_p38a-3flq_p38a-3fly 126.30 0.33 1.03 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2k -57.35 0.51 1.63 0 -FEP_p38a-2e_p38a-3flz 8.00 0.23 0.72 0 -FEP_p38a-3fmk_p38a-3flq -117.86 0.49 1.56 0 -FEP_p38a-2y_p38a-2v 1.06 0.15 0.47 0 -FEP_p38a-2f_p38a-3flz 9.05 0.16 0.51 0 -FEP_p38a-2t_p38a-2l 10.10 0.11 0.35 0 -FEP_p38a-2r_p38a-2n 8.54 0.24 0.76 0 -FEP_p38a-3fly_p38a-2v 13.96 0.15 0.48 0 -FEP_p38a-2p_p38a-2o -33.05 0.84 2.64 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2t -4.31 0.13 0.42 0 -FEP_p38a-2n_p38a-2l 5.46 0.23 0.74 0 -FEP_p38a-2ff_p38a-2v 23.54 0.52 1.64 0 -FEP_p38a-2o_p38a-2n 108.84 0.31 0.97 0 -FEP_p38a-2m_p38a-2l -15.57 0.19 0.59 0 -FEP_p38a-2g_p38a-2h -43.35 0.20 0.62 0 -FEP_p38a-3fln_p38a-3flz 1.33 0.16 0.50 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligand_matrix-checkpoint.ipynb b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligand_matrix-checkpoint.ipynb deleted file mode 100755 index e8c79573..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligand_matrix-checkpoint.ipynb +++ /dev/null @@ -1,53 +0,0 @@ -{ - "cells": [ - { - "cell_type": "code", - "execution_count": null, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "import os\n", - "os.chdir(r'/home/alejand/fep_uppsala/1.JACS/2.CDK2/1.Q/1.ligprep/')" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": null, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "import pandas as pd\n", - "\n", - "ligands = pd.DataFrame()" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": null, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [] - } - ], - "metadata": { - "kernelspec": { - "display_name": "Python [conda env:rdkit_env]", - "language": "python", - "name": "conda-env-rdkit_env-py" - }, - "language_info": { - "codemirror_mode": { - "name": "ipython", - "version": 3 - }, - "file_extension": ".py", - "mimetype": "text/x-python", - "name": "python", - "nbconvert_exporter": "python", - "pygments_lexer": "ipython3", - "version": "3.7.3" - } - }, - "nbformat": 4, - "nbformat_minor": 2 -} diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligands-checkpoint.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligands-checkpoint.sdf deleted file mode 100755 index d3ce7932..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligands-checkpoint.sdf +++ /dev/null @@ -1,3692 +0,0 @@ -43 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3694 12.3608 -12.0100 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5170 11.8053 -10.7333 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7298 10.5799 -13.0278 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9915 11.7687 -13.1228 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8213 10.0100 -11.7550 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2397 10.6196 -10.6003 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6092 9.7471 -9.5124 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2773 8.7308 -9.9855 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4143 8.8607 -11.2979 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3268 9.8907 -8.0257 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3565 13.7183 -11.5055 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5483 13.6363 -12.1897 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9477 14.5322 -12.9368 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9513 10.4999 -7.7281 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8738 11.7695 -7.1531 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6094 12.3134 -6.9136 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4376 11.5622 -7.2444 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5099 10.2841 -7.8101 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7961 9.7769 -8.0457 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0914 13.5427 -6.3707 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7880 13.5314 -6.3772 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3819 12.3721 -6.8788 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9505 12.1058 -6.9728 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7111 12.5665 -10.8449 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2188 12.9372 -10.9792 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1852 14.4611 -10.9536 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5089 14.9092 -11.5986 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7019 12.4742 -12.1199 F 0 0 0 0 0 0 - -1.4726 12.4435 -9.9943 F 0 0 0 0 0 0 - -6.0887 12.2893 -9.8700 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1938 10.1290 -13.8927 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8742 12.2301 -14.0952 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9091 8.1541 -11.8345 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0898 10.5513 -7.6049 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4625 8.9415 -7.5064 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7657 12.3184 -6.9082 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6226 9.7123 -8.0525 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9028 8.7968 -8.4854 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6421 14.3891 -5.9955 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3702 12.9568 -6.6055 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6665 11.9284 -8.0015 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7037 11.2249 -6.3851 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9410 12.5478 -9.7815 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8926 11.6034 -11.3224 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1199 14.8153 -9.9199 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3204 14.8723 -11.4772 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3224 15.2093 -12.6316 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9605 15.7276 -11.0393 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 27 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 25 29 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 -M END -> -43 - -> -0.002 - -$$$$ -17 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 44 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3808 12.3686 -12.0119 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5112 11.8116 -10.7365 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7301 10.5824 -13.0300 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9992 11.7782 -13.1263 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8250 10.0166 -11.7542 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2407 10.6266 -10.6010 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6094 9.7513 -9.5103 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2849 8.7404 -9.9846 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4192 8.8674 -11.2983 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3225 9.8872 -8.0242 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3834 13.6199 -11.4933 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4237 14.7282 -11.5789 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5369 13.6139 -12.1980 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8771 14.5161 -12.9653 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9516 10.5005 -7.7272 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8803 11.7722 -7.1539 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6129 12.3159 -6.9118 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4418 11.5625 -7.2429 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5059 10.2842 -7.8062 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7935 9.7780 -8.0417 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0936 13.5458 -6.3664 N 0 0 0 0 0 0 - -2.7885 13.5288 -6.3742 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3831 12.3683 -6.8823 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0562 12.2861 -9.8790 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1818 10.1228 -13.8979 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8754 12.2375 -14.0963 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9135 8.1599 -11.8328 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0847 10.5486 -7.6052 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4513 8.9399 -7.4976 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1150 12.8057 -10.9566 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8208 14.7394 -10.6724 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8878 15.7111 -11.6718 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7196 14.6037 -12.4046 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7772 12.3192 -6.9132 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6153 9.7128 -8.0447 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8994 8.7979 -8.4799 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3694 12.0252 -7.0275 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0479 14.6272 -5.8866 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4767 15.4758 -5.5103 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6764 14.9519 -6.7159 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6761 14.2304 -5.0891 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 27 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 28 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 38 40 1 0 0 0 - 38 41 1 0 0 0 -M END -> -17 - -> -0.28 - -$$$$ -28 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 55 0 0 1 0 999 V2000 - -6.4084 12.3297 -11.9887 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5165 11.7544 -10.7314 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7418 10.5517 -13.0215 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0245 11.7463 -13.1093 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8268 9.9859 -11.7428 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2396 10.5800 -10.6042 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6095 9.7151 -9.5092 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2849 8.7010 -9.9773 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4373 8.8403 -11.2922 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3311 9.8727 -8.0225 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6734 13.4955 -12.1182 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9616 10.4819 -7.7358 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8034 9.7678 -8.0459 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5615 10.3255 -7.7934 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4526 11.6006 -7.2315 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6161 12.3136 -6.9153 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8662 11.7565 -7.1617 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1079 12.1894 -6.9634 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7834 13.4363 -6.4469 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4443 13.4911 -6.3955 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1636 12.4174 -6.8067 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8107 11.6018 -7.1804 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3735 14.6113 -5.9298 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8857 14.5071 -13.1620 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6042 14.8313 -13.9092 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6374 15.2080 -12.9343 O 0 0 0 0 0 0 - -3.2854 14.1223 -12.1198 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5109 13.8217 -11.2574 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0682 12.2161 -9.8713 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2010 10.1101 -13.8868 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9267 12.2174 -14.0767 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9595 8.1575 -11.8226 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0925 10.5250 -7.5864 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4209 8.9193 -7.5085 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8800 8.7854 -8.4838 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6672 9.7633 -8.0389 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5421 13.2992 -6.4778 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7571 12.3125 -6.9195 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3892 14.2694 -6.1271 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6149 10.6243 -7.5849 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0200 14.9384 -6.7449 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9846 14.2825 -5.0890 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2640 15.4377 -5.6195 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2295 15.4249 -12.6765 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6795 14.2190 -13.8644 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6857 15.5804 -14.6607 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3009 13.9383 -14.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3629 14.3192 -11.5703 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0794 13.2286 -12.7328 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6912 14.6543 -10.5882 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2185 12.9480 -10.6599 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 25 47 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 28 51 1 0 0 0 -M END -> -28 - -> -30 - -$$$$ -22 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3943 12.3306 -11.9839 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5449 11.7624 -10.7224 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7389 10.5318 -13.0493 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9892 11.7416 -13.1218 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8445 9.9757 -11.7834 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2758 10.5697 -10.6136 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6401 9.7111 -9.5254 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3075 8.6850 -10.0132 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4539 8.8245 -11.3160 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3472 9.8680 -8.0446 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5569 13.6094 -12.1739 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9691 10.4796 -7.7443 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8622 11.7497 -7.1624 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6000 12.2988 -6.9070 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4496 11.5829 -7.2293 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5554 10.3089 -7.8035 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8209 9.7667 -8.0554 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0956 12.1660 -6.9654 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7384 13.4130 -6.4683 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4069 13.4502 -6.4129 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1813 12.3566 -6.8171 N 0 0 0 0 0 0 - -0.7988 11.5478 -7.1867 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4282 14.5550 -5.9664 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7714 14.2106 -11.2027 N 0 0 0 0 0 0 - -4.2061 15.2849 -11.7862 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6883 15.3268 -13.0997 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5027 14.2765 -13.3098 N 0 0 0 0 0 0 - -4.5364 13.8232 -9.7989 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1220 12.1694 -9.8642 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1658 10.0922 -13.9365 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8689 12.2077 -14.0813 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9525 8.1221 -11.8662 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4314 8.9174 -7.5157 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0944 10.5330 -7.6015 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7507 12.3127 -6.9154 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5195 13.2804 -6.4580 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6726 9.7529 -8.0470 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8924 8.7835 -8.5028 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3320 14.2647 -6.1602 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6146 10.5716 -7.5810 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0432 14.2275 -5.1327 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1881 15.4011 -5.6571 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0785 14.8647 -6.7815 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5385 15.9338 -11.2484 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4386 16.0565 -13.8570 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0519 14.6585 -9.2909 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8437 12.9692 -9.7547 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4214 13.7994 -9.1880 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 27 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 28 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 -M END -> -22 - -> -0.032 - -$$$$ -16 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3886 12.3706 -12.0044 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5217 11.8105 -10.7338 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7267 10.5778 -13.0331 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9997 11.7772 -13.1264 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8245 10.0105 -11.7588 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2447 10.6240 -10.5997 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6157 9.7479 -9.5130 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2818 8.7335 -9.9900 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4155 8.8614 -11.3010 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3377 9.8874 -8.0251 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4115 13.6449 -11.4457 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4644 14.7678 -11.5034 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5490 13.6243 -12.1808 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8784 14.5204 -12.9613 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9596 10.4818 -7.7362 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8460 11.7538 -7.1602 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5819 12.3007 -6.9160 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4335 11.5746 -7.2403 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5461 10.3067 -7.8068 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8068 9.7600 -8.0558 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4568 13.6807 -6.3006 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0743 12.2887 -9.8728 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1728 10.1132 -13.9065 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8713 12.2373 -14.0952 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9100 8.1539 -11.8356 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0973 10.5468 -7.6004 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4473 8.9276 -7.5184 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1460 12.8361 -10.8988 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4475 14.4022 -11.3420 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6702 15.4633 -10.6915 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4486 15.3231 -12.4449 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7333 12.3169 -6.9116 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4555 11.9950 -7.0528 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6550 9.7463 -8.0534 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8912 8.7783 -8.5004 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4890 14.4469 -7.0749 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5248 13.7811 -5.7425 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2684 13.8625 -5.5988 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 4 24 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 33 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 34 1 0 0 0 - 20 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 -M END -> -16 - -> -0.17 - -$$$$ -30 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3720 12.3564 -12.0094 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5328 11.8103 -10.7336 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7318 10.5755 -13.0290 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9898 11.7633 -13.1279 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8210 10.0065 -11.7558 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2477 10.6184 -10.6026 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6140 9.7458 -9.5136 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2690 8.7218 -9.9879 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4092 8.8538 -11.2990 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3381 9.8926 -8.0280 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3458 13.7121 -11.5140 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5478 13.6364 -12.1864 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9572 14.5395 -12.9136 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9581 10.4851 -7.7363 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8068 9.7633 -8.0566 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5506 10.3101 -7.8085 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4405 11.5856 -7.2383 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5911 12.3019 -6.9155 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8461 11.7538 -7.1583 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0993 12.1777 -6.9729 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7708 13.4214 -6.4416 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4313 13.4856 -6.3949 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1723 12.4145 -6.8299 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8042 11.6008 -7.2039 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3889 14.5981 -5.9187 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6987 12.5799 -10.8351 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1930 12.9387 -10.9658 C 0 0 2 0 0 0 - -2.1862 14.4653 -10.9438 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5086 14.9068 -11.5988 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6500 12.4417 -12.1854 O 0 0 0 0 0 0 - -6.1228 12.3020 -9.8704 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1946 10.1248 -13.8941 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8719 12.2188 -14.1038 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9012 8.1471 -11.8351 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1102 10.5319 -7.5935 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4404 8.9270 -7.5371 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8882 8.7805 -8.5006 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6630 9.7449 -8.0588 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5090 13.2838 -6.4768 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7306 12.3145 -6.9043 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3781 14.2464 -6.1018 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6071 10.6213 -7.6157 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2361 15.4217 -5.5765 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0353 14.9583 -6.7244 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0204 14.2664 -5.0904 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9494 12.5468 -9.7772 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8987 11.6278 -11.3169 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6028 12.5034 -10.1600 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1219 14.8241 -9.9090 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3279 14.8751 -11.4738 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3274 15.2143 -12.6293 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 15.7190 -11.0435 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7819 12.8449 -12.3329 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -30 - -> -0.003 - -$$$$ -21 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3865 12.3338 -12.0432 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4856 11.7841 -10.7704 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7472 10.5643 -13.0426 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0167 11.7500 -13.1460 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8303 10.0081 -11.7598 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2256 10.6149 -10.6156 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6010 9.7518 -9.5145 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2842 8.7423 -9.9828 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4323 8.8733 -11.2925 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3270 9.8938 -8.0225 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5587 13.5285 -12.2266 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9618 10.4909 -7.7327 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8582 11.7635 -7.1652 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6045 12.3140 -6.9191 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4477 11.5945 -7.2362 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5614 10.3184 -7.7958 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8112 9.7685 -8.0438 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1002 12.1716 -6.9783 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7494 13.4275 -6.4902 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4141 13.4605 -6.4332 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1744 12.3664 -6.8143 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8092 11.5630 -7.1796 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4176 14.5730 -6.0003 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4279 13.9049 -11.5130 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0090 15.0294 -12.0677 N 0 0 0 0 0 0 - -4.8449 15.3445 -13.0534 C 0 0 0 0 0 0 - -5.7816 14.4464 -13.2081 N 0 0 0 0 0 0 - -2.9003 15.7800 -11.6435 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0033 12.2571 -9.9302 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2085 10.1086 -13.9036 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9107 12.2133 -14.1195 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9502 8.1807 -11.8157 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4150 8.9297 -7.5146 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0903 10.5352 -7.5767 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7489 12.3218 -6.9239 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5244 13.2981 -6.4811 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6700 9.7533 -8.0396 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8938 8.7844 -8.4823 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3367 14.2768 -6.1925 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6184 10.5668 -7.5609 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0791 14.8637 -6.8199 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0264 14.2592 -5.1502 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1971 15.4244 -5.7161 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8953 13.4661 -10.6706 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6948 16.2656 -13.6196 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2685 16.3921 -10.8459 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6068 16.4484 -12.4038 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0360 15.1571 -11.3689 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 24 2 0 0 0 - 11 27 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 -M END -> -21 - -> -0.078 - -$$$$ -24 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3515 12.3530 -11.9813 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5085 11.7912 -10.7247 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6802 10.5716 -13.0438 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9296 11.7657 -13.1245 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7980 10.0044 -11.7669 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2328 10.6109 -10.5989 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6209 9.7375 -9.5162 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2754 8.7446 -9.9970 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4233 8.8800 -11.3218 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3328 9.8812 -8.0296 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3004 14.2773 -13.1499 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4346 15.5261 -12.8998 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5896 13.5586 -12.0343 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9706 10.4906 -7.7317 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8616 11.7632 -7.1684 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6051 12.3126 -6.9180 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4544 11.5948 -7.2294 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5626 10.3128 -7.8011 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8160 9.7710 -8.0425 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1083 12.1736 -6.9694 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7503 13.4247 -6.4858 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4131 13.4674 -6.4189 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1758 12.3735 -6.8057 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8094 11.5620 -7.1791 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4060 14.5705 -5.9896 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6528 14.0066 -14.2746 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0624 12.2581 -9.8612 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1172 10.1173 -13.9162 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8256 12.2012 -14.0958 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9432 8.1901 -11.8473 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0986 10.5389 -7.5828 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4252 8.9299 -7.5158 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1820 15.6085 -11.8419 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9911 16.4102 -13.1903 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4935 15.4841 -13.4268 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2195 13.8866 -11.1438 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7535 12.3213 -6.9230 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5307 13.2966 -6.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6732 9.7534 -8.0369 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8952 8.7834 -8.4850 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3455 14.2746 -6.1808 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6187 10.5735 -7.5589 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2064 15.4259 -5.7003 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0748 14.8695 -6.8055 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0202 14.2589 -5.1325 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 -M END -> -24 - -> -0.029 - -$$$$ -38 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 56 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3676 12.3632 -12.0183 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5148 11.8066 -10.7373 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7147 10.5754 -13.0306 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9819 11.7689 -13.1253 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8143 10.0109 -11.7564 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2414 10.6177 -10.6023 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6126 9.7466 -9.5122 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2846 8.7319 -9.9810 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4146 8.8618 -11.2972 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3363 9.8918 -8.0268 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3648 13.7196 -11.5032 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5453 13.6325 -12.1937 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9402 14.5231 -12.9481 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9634 10.4852 -7.7356 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8111 9.7655 -8.0524 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5521 10.3143 -7.8018 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4442 11.5871 -7.2318 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5964 12.3037 -6.9134 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8531 11.7536 -7.1622 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1000 12.1772 -6.9659 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7711 13.4213 -6.4318 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4319 13.4866 -6.3915 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1707 12.4146 -6.8487 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8042 11.5996 -7.2054 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3852 14.5927 -5.9060 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7189 12.5724 -10.8441 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2354 12.9457 -10.9732 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1905 14.4637 -10.9533 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5123 14.9092 -11.5998 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7098 12.4700 -12.1164 F 0 0 0 0 0 0 - -1.5166 12.4356 -9.9564 F 0 0 0 0 0 0 - -6.0854 12.2873 -9.8679 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1679 10.1186 -13.8995 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8666 12.2247 -14.0971 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9103 8.1575 -11.8383 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0986 10.5466 -7.5979 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4470 8.9289 -7.5188 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8883 8.7824 -8.4957 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6652 9.7513 -8.0474 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5192 13.2882 -6.4744 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7396 12.3174 -6.9137 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3784 14.2455 -6.0873 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6046 10.6289 -7.6232 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2453 15.4154 -5.5642 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0272 14.9481 -6.7089 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0083 14.2549 -5.0808 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9411 12.5479 -9.7813 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8894 11.5999 -11.3211 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1219 14.8121 -9.9254 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3187 14.8698 -11.4768 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3209 15.2060 -12.6318 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9535 15.7329 -11.0386 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 10 37 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 27 31 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 -M END -> -38 - -> -0.005 - -$$$$ -31 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3709 12.3579 -12.0062 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5187 11.8083 -10.7296 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7194 10.5704 -13.0321 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9838 11.7645 -13.1240 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8186 10.0073 -11.7576 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2434 10.6206 -10.5991 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6160 9.7494 -9.5117 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2808 8.7336 -9.9894 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4141 8.8594 -11.3008 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3385 9.8886 -8.0248 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3631 13.7190 -11.4993 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5500 13.6364 -12.1907 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9462 14.5251 -12.9474 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9607 10.4852 -7.7356 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8097 9.7639 -8.0527 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5522 10.3124 -7.8024 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4444 11.5885 -7.2376 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5952 12.3052 -6.9174 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8509 11.7557 -7.1626 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1000 12.1783 -6.9759 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7654 13.4353 -6.4786 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4305 13.4892 -6.4172 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1699 12.4025 -6.8093 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8029 11.5856 -7.1770 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3883 14.6074 -5.9669 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5134 14.9066 -11.6049 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2037 14.4678 -10.9376 C 0 0 1 0 0 0 - -2.2231 12.9442 -10.9826 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7200 12.5740 -10.8214 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0475 15.0410 -11.4860 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0905 12.2941 -9.8658 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1712 10.1113 -13.9056 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8587 12.2252 -14.0930 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9068 8.1511 -11.8353 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1007 10.5426 -7.5968 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4435 8.9253 -7.5227 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8934 8.7808 -8.4968 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6611 9.7503 -8.0475 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5122 13.2860 -6.4777 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7378 12.3164 -6.9148 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3612 14.2786 -6.1713 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6010 10.5907 -7.5580 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2314 15.4494 -5.6631 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0518 14.9316 -6.7715 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0048 14.2986 -5.1213 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3147 15.1479 -12.6510 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9414 15.7669 -11.0946 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2172 14.7609 -9.8839 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8304 12.6225 -11.9538 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5481 12.4842 -10.2524 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9432 12.6118 -9.7567 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9036 11.5934 -11.2745 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2694 15.5207 -12.3068 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -31 - -> -0.002 - -$$$$ -41 - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 59 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3365 12.3514 -12.0169 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4737 11.7818 -10.7533 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7043 10.5771 -13.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9700 11.7706 -13.1413 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8117 10.0060 -11.7679 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2142 10.6153 -10.6085 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6079 9.7475 -9.5180 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2848 8.7450 -9.9896 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4180 8.8715 -11.3012 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3345 9.8877 -8.0248 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3847 13.7235 -11.4418 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5533 13.6485 -12.1711 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9795 14.5724 -12.8566 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9627 10.4850 -7.7364 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8552 11.7581 -7.1652 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5966 12.3060 -6.9181 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4424 11.5865 -7.2381 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5593 10.3139 -7.8013 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8122 9.7647 -8.0513 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0942 12.1662 -6.9781 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7414 13.4274 -6.4937 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4089 13.4560 -6.4321 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1814 12.3590 -6.8068 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8029 11.5527 -7.1728 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4236 14.5699 -5.9945 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7594 15.0422 -11.2114 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3424 15.0924 -11.7154 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5130 13.9202 -11.2644 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1771 12.5990 -11.6641 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6239 12.4833 -11.0641 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0203 12.2640 -9.8874 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1715 10.1187 -13.9133 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8628 12.2427 -14.1041 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9193 8.1643 -11.8362 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0961 10.5380 -7.5913 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4318 8.9209 -7.5184 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7443 12.3180 -6.9210 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5105 13.2878 -6.4761 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6670 9.7505 -8.0456 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8966 8.7819 -8.4933 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3275 14.2803 -6.2000 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6107 10.5549 -7.5458 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1867 15.4238 -5.7057 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0912 14.8675 -6.8032 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0319 14.2596 -5.1462 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6902 15.1046 -10.1315 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3521 15.8883 -11.5628 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4316 15.1240 -12.7851 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8360 16.0057 -11.4240 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2586 13.9646 -10.2112 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5771 14.0998 -11.7264 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1550 12.4998 -12.7567 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5317 11.7847 -11.3278 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5224 12.4160 -9.9808 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0278 11.5608 -11.5111 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 28 51 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 29 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 - 30 55 1 0 0 0 -M END -> -41 - -> -0.006 - -$$$$ -29 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3727 12.3493 -11.9877 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5190 11.8167 -10.7261 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6919 10.5755 -13.0077 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9476 11.7646 -13.1157 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8131 10.0080 -11.7494 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2399 10.6155 -10.5946 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6088 9.7430 -9.5107 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2764 8.7286 -9.9647 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4188 8.8758 -11.2882 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3326 9.8988 -8.0180 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4060 13.8057 -12.2007 S 0 0 0 0 0 0 - -5.9763 10.4855 -7.7248 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8692 11.7523 -7.1523 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6115 12.3005 -6.8946 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4415 11.5837 -7.2014 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5677 10.3182 -7.7642 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8209 9.7630 -8.0308 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1027 12.1584 -6.9334 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7604 13.4248 -6.4226 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4260 13.4533 -6.3925 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1594 12.3444 -6.7934 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8210 11.5507 -7.1379 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4194 14.5816 -5.9703 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4605 13.4170 -13.2280 O 0 0 0 0 0 0 - -6.3362 14.9020 -12.4291 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5495 14.1196 -10.6911 N 0 0 0 0 0 0 - -3.3000 13.4420 -10.3686 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0717 13.9935 -11.0748 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2627 14.2439 -9.6094 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0958 12.2837 -9.8431 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1384 10.1166 -13.9015 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8216 12.2011 -14.0642 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9542 8.2051 -11.8388 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1029 10.5216 -7.5592 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4192 8.9159 -7.5103 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7593 12.3241 -6.9156 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5452 13.3016 -6.4614 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6739 9.7489 -8.0044 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8885 8.7827 -8.4653 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3647 14.2437 -6.1001 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6238 10.5910 -7.5497 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0441 14.8389 -6.8193 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0232 14.2959 -5.1361 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2125 15.4354 -5.7291 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8494 14.9008 -10.1205 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3804 12.3527 -10.1831 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2874 13.2998 -11.3738 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1931 14.8215 -11.7603 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5807 15.2116 -9.2431 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5514 13.7432 -8.9374 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 24 2 0 0 0 - 11 25 2 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 -M END -> -29 - -> -0.18 - -$$$$ -26 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3961 12.3155 -12.0234 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5478 11.7864 -10.7392 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7431 10.5278 -13.0269 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0034 11.6993 -13.1368 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8411 9.9886 -11.7443 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2672 10.6062 -10.5986 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6276 9.7408 -9.5022 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2893 8.7195 -9.9713 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4361 8.8492 -11.2847 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3404 9.8857 -8.0208 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4704 14.2158 -13.3316 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5218 15.3458 -13.0035 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5814 13.4696 -12.1774 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9630 10.4847 -7.7359 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8538 11.7563 -7.1621 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5953 12.3060 -6.9160 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4449 11.5852 -7.2379 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5560 10.3115 -7.8043 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8130 9.7655 -8.0531 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0905 12.1634 -6.9778 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7398 13.4211 -6.5005 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4007 13.4556 -6.4362 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1858 12.3500 -6.8082 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8018 11.5473 -7.1675 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4333 14.5672 -6.0053 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0131 14.0330 -14.4162 O 0 0 0 0 0 0 - -4.6790 13.9767 -11.1295 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0830 15.2556 -11.5883 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0962 12.2658 -9.8826 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1870 10.0577 -13.8855 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8795 12.1118 -14.1147 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9222 8.1396 -11.8208 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0988 10.5399 -7.5898 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4364 8.9228 -7.5168 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9540 16.3099 -13.2674 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6823 15.2203 -13.6539 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7414 12.3166 -6.9126 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5135 13.2868 -6.4745 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6700 9.7492 -8.0515 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8944 8.7825 -8.4962 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3279 14.2814 -6.2111 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6186 10.5482 -7.5365 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0982 14.8611 -6.8185 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0414 14.2576 -5.1551 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1781 15.4224 -5.7186 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1658 14.0954 -10.1642 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8858 13.2419 -10.9644 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9931 15.3118 -11.4698 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5445 16.0482 -11.0233 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 12 28 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -26 - -> -0.036 - -$$$$ -20 - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 58 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3740 12.3524 -12.0161 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5100 11.8065 -10.7374 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7222 10.5841 -13.0265 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9887 11.7756 -13.1353 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8163 10.0177 -11.7563 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2425 10.6185 -10.6022 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6172 9.7487 -9.5090 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2846 8.7289 -9.9848 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4176 8.8659 -11.2967 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3368 9.8884 -8.0257 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4023 13.6480 -11.4578 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4623 14.7747 -11.4948 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5331 13.6158 -12.1961 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8776 14.5022 -12.9731 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9585 10.4860 -7.7354 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8494 11.7555 -7.1596 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5968 12.3068 -6.9148 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4468 11.5860 -7.2370 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5513 10.3089 -7.8057 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8090 9.7654 -8.0523 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0901 12.1669 -6.9801 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7479 13.4121 -6.4872 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3990 13.4663 -6.4328 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1869 12.3691 -6.8386 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8034 11.5628 -7.1902 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4389 14.5894 -5.9640 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5042 14.2139 -4.8744 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6302 13.6295 -5.4977 O 0 0 0 0 0 0 - 0.9501 13.1612 -3.9053 C 0 0 0 0 0 0 - 2.0179 15.4484 -4.1037 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0870 12.2815 -9.8767 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1782 10.1403 -13.8916 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8882 12.2326 -14.1065 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9139 8.1642 -11.8383 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4382 8.9312 -7.5247 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1000 10.5369 -7.5915 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1602 12.8736 -10.8739 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4435 14.3983 -11.3392 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6800 15.4678 -10.6811 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4649 15.3194 -12.4306 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7363 12.3155 -6.9060 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5225 13.2880 -6.4780 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6716 9.7462 -8.0565 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8874 8.7809 -8.4938 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3463 14.2645 -6.1724 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6294 10.5673 -7.5714 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2274 15.3656 -5.5864 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9266 15.0143 -6.8422 H 0 0 0 0 0 0 - 3.2101 13.2860 -4.8126 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6553 12.2750 -4.4689 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0795 13.5454 -3.3665 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6833 12.8594 -3.1584 H 0 0 0 0 0 0 - 2.5210 16.1617 -4.7561 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7337 15.1648 -3.3313 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2023 15.9748 -3.6071 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 12 39 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 41 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 43 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 25 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 45 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 - 30 55 1 0 0 0 -M END -> -20 - -> -0.016 - -$$$$ -42 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3691 12.3596 -12.0090 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5082 11.8040 -10.7325 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7289 10.5800 -13.0272 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9931 11.7723 -13.1223 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8208 10.0120 -11.7545 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2366 10.6190 -10.6002 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6071 9.7463 -9.5106 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2820 8.7349 -9.9857 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4162 8.8630 -11.2985 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3216 9.8824 -8.0245 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3612 13.7214 -11.5083 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5493 13.6373 -12.1980 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9470 14.5254 -12.9531 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9509 10.4995 -7.7283 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8798 11.7709 -7.1545 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6121 12.3149 -6.9130 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4406 11.5618 -7.2441 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5052 10.2836 -7.8087 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7939 9.7786 -8.0440 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0930 13.5444 -6.3685 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7888 13.5284 -6.3764 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3823 12.3688 -6.8823 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9528 12.1034 -6.9863 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7146 12.5761 -10.8355 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2074 12.9376 -10.9559 C 0 0 2 0 0 0 - -2.1889 14.4652 -10.9572 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5166 14.9141 -11.6000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6730 12.4527 -12.1791 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0709 12.2831 -9.8701 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1905 10.1280 -13.8946 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8760 12.2352 -14.0903 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9104 8.1559 -11.8349 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0978 10.5174 -7.5878 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4227 8.9225 -7.5162 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7759 12.3187 -6.9121 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6149 9.7115 -8.0486 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9008 8.7994 -8.4826 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6404 14.3931 -5.9911 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3733 12.9511 -6.6100 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6843 11.9368 -8.0290 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7041 11.2248 -6.3903 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9481 12.5593 -9.7730 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8897 11.6058 -11.3143 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6065 12.4889 -10.1604 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1357 14.8163 -9.9239 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3181 14.8871 -11.4678 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3218 15.2079 -12.6331 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9608 15.7340 -11.0358 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8094 12.8612 -12.3391 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 27 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -42 - -> -0.004 - -$$$$ -35 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3895 12.3678 -12.0373 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4824 11.8098 -10.7511 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7271 10.5745 -13.0290 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0179 11.7711 -13.1287 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8170 10.0145 -11.7522 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2238 10.6236 -10.6024 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6044 9.7508 -9.5065 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2828 8.7443 -9.9813 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4172 8.8704 -11.2949 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3303 9.8854 -8.0203 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3418 13.6528 -11.7950 N 0 0 0 0 0 0 - -5.6106 13.6402 -12.2589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1045 14.5768 -12.8828 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9605 10.4846 -7.7337 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8084 9.7674 -8.0514 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5547 10.3189 -7.8020 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4471 11.5931 -7.2348 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6026 12.3073 -6.9145 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8562 11.7556 -7.1614 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1021 12.1835 -6.9708 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7710 13.4390 -6.4702 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4354 13.4950 -6.4103 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1709 12.4112 -6.8070 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5943 -7.1763 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3771 14.6141 -5.9576 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4422 12.5360 -11.3947 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3230 13.6139 -11.4067 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2958 14.6820 -11.9593 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7380 13.9356 -10.1565 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0183 12.2923 -9.8986 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1782 10.1163 -13.8942 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9208 12.2371 -14.0985 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9179 8.1685 -11.8303 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0933 10.5376 -7.5920 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4329 8.9217 -7.5144 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8892 8.7843 -8.4947 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6640 9.7586 -8.0484 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5243 13.2889 -6.4732 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7461 12.3134 -6.9147 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3729 14.2791 -6.1621 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6003 10.6048 -7.5653 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2500 15.4509 -5.6516 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0339 14.9382 -6.7662 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9933 14.2991 -5.1147 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5851 12.0468 -10.4273 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4005 11.8265 -12.2289 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4937 13.3796 -12.0785 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2410 14.9062 -13.0151 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3493 15.5966 -11.3682 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0327 13.3119 -9.9644 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 -M END -> -35 - -> -0.004 - -$$$$ -44 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 50 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3932 12.3500 -12.0125 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5644 11.7828 -10.7394 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7358 10.5711 -13.0331 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9954 11.7572 -13.1322 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8242 9.9989 -11.7591 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2585 10.6059 -10.6150 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6168 9.7386 -9.5213 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2709 8.7166 -9.9884 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4108 8.8490 -11.3012 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3306 9.8912 -8.0312 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5413 13.8555 -11.3648 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5934 13.6525 -12.1835 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9232 14.4812 -13.0224 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9508 10.4991 -7.7310 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8673 11.7672 -7.1520 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6035 12.3102 -6.9134 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4392 11.5630 -7.2455 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5146 10.2834 -7.8141 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7998 9.7761 -8.0492 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0885 13.5395 -6.3720 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7847 13.5343 -6.3770 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3791 12.3751 -6.8806 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9494 12.1118 -6.9818 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7091 15.0460 -11.2252 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1570 14.3608 -9.9755 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1684 13.2423 -10.1016 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8246 13.9322 -10.0585 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2039 12.2411 -9.8798 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2037 10.1279 -13.8914 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8803 12.2184 -14.1069 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9014 8.1446 -11.8359 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1132 10.5144 -7.5862 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4298 8.9292 -7.5318 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7510 12.3165 -6.9042 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6383 9.7136 -8.0589 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9045 8.7930 -8.4905 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6440 14.3809 -6.0010 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3673 12.9607 -6.6056 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6856 11.9435 -8.0238 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7046 11.2327 -6.3874 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9665 15.3166 -11.9738 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4384 15.8239 -11.0314 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2969 14.9531 -9.0651 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0216 13.4609 -9.4801 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7904 12.2246 -10.0500 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7501 13.4251 -10.8742 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 -M END -> -44 - -> -0.004 - -$$$$ -18 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 44 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3808 12.3686 -12.0119 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5112 11.8116 -10.7365 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7301 10.5824 -13.0300 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9992 11.7782 -13.1263 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8250 10.0166 -11.7542 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2407 10.6266 -10.6010 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6094 9.7513 -9.5103 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2849 8.7404 -9.9846 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4192 8.8674 -11.2983 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3225 9.8872 -8.0242 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3834 13.6199 -11.4933 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4237 14.7282 -11.5789 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5369 13.6139 -12.1980 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8771 14.5161 -12.9653 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9516 10.5005 -7.7272 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8803 11.7722 -7.1539 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6129 12.3159 -6.9118 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4418 11.5625 -7.2429 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5059 10.2842 -7.8062 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7935 9.7780 -8.0417 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0936 13.5458 -6.3664 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7885 13.5288 -6.3742 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3831 12.3683 -6.8823 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9539 12.1016 -6.9897 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0562 12.2861 -9.8790 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1818 10.1228 -13.8979 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8754 12.2375 -14.0963 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9135 8.1599 -11.8328 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0847 10.5486 -7.6052 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4513 8.9399 -7.4976 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1150 12.8057 -10.9566 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8208 14.7394 -10.6724 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8878 15.7111 -11.6718 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7196 14.6037 -12.4046 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7772 12.3192 -6.9132 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6153 9.7128 -8.0447 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8994 8.7979 -8.4799 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6399 14.3943 -5.9889 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3748 12.9484 -6.6129 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6859 11.9386 -8.0328 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7035 11.2217 -6.3964 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 -M END -> -18 - -> -0.01 - -$$$$ -40 - 3D - Structure written by MMmdl. - 54 58 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3583 12.3628 -12.0152 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5007 11.8020 -10.7383 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7096 10.5772 -13.0382 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9777 11.7759 -13.1307 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8132 10.0130 -11.7619 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2338 10.6200 -10.6051 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6121 9.7513 -9.5135 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2831 8.7414 -9.9888 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4159 8.8683 -11.3018 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3364 9.8882 -8.0249 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3745 13.7307 -11.4480 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5401 13.6479 -12.1823 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9305 14.5456 -12.9289 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9622 10.4857 -7.7364 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8106 9.7658 -8.0516 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5548 10.3163 -7.8015 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4456 11.5910 -7.2371 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5995 12.3069 -6.9174 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8550 11.7570 -7.1647 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1008 12.1810 -6.9758 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7660 13.4388 -6.4773 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4314 13.4905 -6.4174 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1713 12.4042 -6.8124 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5879 -7.1791 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3850 14.6084 -5.9658 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6973 12.5089 -10.9175 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2248 12.4637 -11.4426 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4987 13.7622 -11.0653 N 0 0 0 0 0 0 - -2.2038 14.9363 -11.7527 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6757 15.0331 -11.3164 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0576 12.2794 -9.8741 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1618 10.1180 -13.9096 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8627 12.2402 -14.0994 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9144 8.1615 -11.8374 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0961 10.5439 -7.5948 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4395 8.9258 -7.5160 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8927 8.7818 -8.4930 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6634 9.7542 -8.0449 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5193 13.2884 -6.4757 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7435 12.3170 -6.9183 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3645 14.2802 -6.1683 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6001 10.5957 -7.5620 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2377 15.4493 -5.6626 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0462 14.9289 -6.7713 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9992 14.2960 -5.1216 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1358 11.5686 -11.2816 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6934 12.5388 -9.8270 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1213 12.3537 -12.5312 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6337 11.6737 -10.9669 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5199 13.7316 -11.3435 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1273 14.7832 -12.8186 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6221 15.8316 -11.5127 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1533 15.8523 -11.8646 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6812 15.2813 -10.2566 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 -M END -> -40 - -> -0.007 - -$$$$ -19 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3863 12.3686 -12.0106 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5303 11.8179 -10.7351 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7274 10.5747 -13.0322 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9939 11.7717 -13.1290 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8233 10.0108 -11.7572 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2504 10.6246 -10.6026 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6148 9.7488 -9.5126 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2772 8.7301 -9.9866 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4133 8.8585 -11.2996 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3367 9.8906 -8.0265 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3739 13.6178 -11.5022 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4056 14.7196 -11.5963 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5407 13.6198 -12.1903 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8948 14.5296 -12.9394 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9610 10.4852 -7.7361 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8098 9.7648 -8.0558 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5520 10.3132 -7.8064 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4430 11.5871 -7.2363 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5944 12.3027 -6.9144 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8504 11.7539 -7.1603 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0991 12.1752 -6.9687 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7663 13.4191 -6.4362 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4291 13.4776 -6.3870 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1723 12.4029 -6.8190 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8029 11.5945 -7.2007 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3904 14.5868 -5.9117 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0929 12.2989 -9.8733 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1755 10.1118 -13.9031 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8667 12.2221 -14.1016 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9059 8.1512 -11.8355 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1020 10.5408 -7.5966 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4436 8.9262 -7.5252 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1038 12.8034 -10.9679 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8050 14.7371 -10.6877 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8600 15.7058 -11.7050 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7006 14.5748 -12.4189 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8910 8.7823 -8.5005 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6630 9.7506 -8.0539 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5131 13.2839 -6.4722 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7367 12.3149 -6.9092 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3680 14.2475 -6.0985 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6030 10.6174 -7.6170 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2329 15.4126 -5.5710 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0372 14.9418 -6.7159 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0194 14.2522 -5.0866 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 25 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 26 43 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 -M END -> -19 - -> -0.015 - -$$$$ -33 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3918 12.3765 -12.0158 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5335 11.8201 -10.7317 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7273 10.5795 -13.0319 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0082 11.7773 -13.1176 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8294 10.0116 -11.7546 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2533 10.6299 -10.5984 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6133 9.7501 -9.5115 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2802 8.7340 -9.9853 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4149 8.8602 -11.2994 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3368 9.8898 -8.0240 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3580 13.5891 -11.5451 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5327 13.6029 -12.2131 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8791 14.5089 -12.9726 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9622 10.4818 -7.7351 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8525 11.7570 -7.1642 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5920 12.3049 -6.9193 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4386 11.5825 -7.2408 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5579 10.3128 -7.8038 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8126 9.7642 -8.0521 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0919 12.1643 -6.9829 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7362 13.4287 -6.5051 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4017 13.4552 -6.4435 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1850 12.3496 -6.8156 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8078 11.5460 -7.1722 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4351 14.5688 -6.0125 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3172 14.5865 -11.7755 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8924 14.0513 -11.7355 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3932 14.9579 -10.6450 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0761 12.2984 -9.8711 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1698 10.1086 -13.9039 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8733 12.2288 -14.0942 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9079 8.1545 -11.8361 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0997 10.5389 -7.5945 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4394 8.9219 -7.5215 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1267 12.7910 -10.9599 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7395 12.3169 -6.9150 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5095 13.2881 -6.4791 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6661 9.7465 -8.0484 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8936 8.7803 -8.4947 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3246 14.2793 -6.2163 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6152 10.5460 -7.5374 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1734 15.4251 -5.7269 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1032 14.8639 -6.8228 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0431 14.2630 -5.1616 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5076 15.3404 -12.5551 H 0 0 0 0 0 0 - -1.1365 14.4228 -12.4281 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7094 13.0055 -11.4933 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5847 14.5469 -9.6579 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9864 15.9623 -10.6317 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 28 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -33 - -> -0.008 - -$$$$ -27 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 56 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3855 12.3606 -12.0031 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5214 11.8004 -10.7171 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6991 10.5797 -13.0384 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9626 11.7779 -13.1031 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8238 10.0198 -11.7523 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2557 10.6213 -10.5956 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6268 9.7501 -9.5073 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3057 8.7491 -9.9816 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4330 8.8776 -11.2917 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3352 9.8817 -8.0196 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6205 13.5372 -12.2095 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9727 10.4835 -7.7324 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8611 11.7523 -7.1657 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5946 12.2988 -6.9068 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4432 11.5806 -7.2147 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5570 10.3109 -7.7899 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8253 9.7663 -8.0483 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0926 12.1556 -6.9444 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7338 13.4204 -6.4594 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4064 13.4584 -6.4114 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1793 12.3493 -6.7865 N 0 0 0 0 0 0 - -0.7954 11.5387 -7.1512 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4205 14.5767 -6.0073 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6894 13.8945 -11.1046 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7822 15.1171 -11.3990 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3310 14.9579 -11.2532 N 0 0 0 0 0 0 - -1.8099 14.4326 -10.1320 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5019 14.0442 -9.2076 O 0 0 0 0 0 0 - -0.2869 14.3494 -10.0364 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0445 12.2494 -9.8378 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1252 10.1075 -13.9125 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8195 12.2403 -14.0555 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9253 8.1691 -11.8449 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0887 10.5401 -7.5861 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4260 8.9087 -7.5002 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3500 13.7423 -13.1711 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7538 12.3208 -6.9277 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5110 13.2853 -6.4615 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6704 9.7539 -8.0335 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8995 8.7870 -8.4986 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3188 14.2725 -6.1705 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5952 10.5614 -7.5429 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1976 15.4335 -5.7330 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0772 14.8589 -6.8237 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0239 14.2765 -5.1673 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0839 13.0222 -10.9241 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1507 14.0138 -10.1183 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1427 15.9632 -10.8055 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9117 15.4187 -12.3919 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7181 15.3243 -11.9869 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1612 14.8056 -10.9074 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0542 13.3103 -9.9607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0768 14.8908 -9.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 46 1 0 0 0 - 24 47 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 48 1 0 0 0 - 25 49 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 50 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 29 53 1 0 0 0 -M END -> -27 - -> -0.68 - -$$$$ -13 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - -2.2088 12.9419 -10.9697 C 0 0 1 0 0 0 - -2.1904 14.4671 -10.9424 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6992 12.5876 -10.8377 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6826 12.4744 -12.1795 O 0 0 0 0 0 0 - -3.5107 14.9139 -11.6089 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3443 13.7200 -11.5243 N 0 0 0 0 0 0 - -6.3525 12.3601 -12.0338 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9727 11.7556 -13.1375 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7097 10.5633 -13.0339 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5001 11.8056 -10.7491 C 0 0 0 0 0 0 - -6.8506 12.3073 -14.3824 O 0 0 0 0 0 0 - -5.5377 13.6382 -12.2001 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9500 14.5444 -12.9177 O 0 0 0 0 0 0 - -7.2308 10.6159 -10.6131 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8083 10.0113 -11.7524 C 0 0 0 0 0 0 - -8.4200 8.8675 -11.2880 N 0 0 0 0 0 0 - -8.2847 8.7400 -9.9757 N 0 0 0 0 0 0 - -7.6047 9.7473 -9.5145 C 0 0 0 0 0 0 - -7.3264 9.8951 -8.0245 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9604 10.4805 -7.7353 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8075 9.7596 -8.0491 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4358 11.5809 -7.2415 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5835 12.3061 -6.9225 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5481 10.3107 -7.8024 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8471 11.7541 -7.1666 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4650 13.6954 -6.3241 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6125 12.4839 -10.1621 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1549 14.8184 -9.9245 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3157 14.8975 -11.4569 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9463 12.5683 -9.7744 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8737 11.6025 -11.2997 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8317 12.8970 -12.3310 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3143 15.2104 -12.6382 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9412 15.7445 -11.0416 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1761 10.1015 -13.8960 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0592 12.2786 -9.8757 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3831 11.8565 -15.0461 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9260 8.1741 -11.8308 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0952 10.5284 -7.5802 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4226 8.9158 -7.5190 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8834 8.7772 -8.4902 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4582 12.0019 -7.0535 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6526 9.7492 -8.0472 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7368 12.3185 -6.9225 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5360 14.1747 -6.6301 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5030 13.6559 -5.2327 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2731 14.3301 -6.6809 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 12 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 9 15 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 14 2 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 18 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 24 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 25 2 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 -M END -> -13 - -> -0.006 - -$$$$ -39 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3502 12.3553 -12.0171 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4935 11.7977 -10.7426 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7106 10.5751 -13.0385 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9725 11.7720 -13.1357 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8130 10.0109 -11.7654 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2309 10.6170 -10.6058 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6111 9.7517 -9.5147 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2865 8.7392 -9.9897 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4152 8.8682 -11.3006 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3373 9.8888 -8.0252 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3541 13.7129 -11.4635 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5361 13.6428 -12.1728 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9526 14.5668 -12.8773 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9623 10.4854 -7.7364 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8532 11.7571 -7.1646 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5945 12.3064 -6.9180 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4446 11.5858 -7.2382 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5555 10.3115 -7.8022 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8126 9.7649 -8.0516 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0930 12.1652 -6.9785 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7427 13.4236 -6.4970 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4061 13.4591 -6.4324 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1810 12.3567 -6.8070 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5520 -7.1701 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4260 14.5701 -5.9973 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6444 15.0059 -11.3286 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1848 14.8660 -11.7465 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5251 13.6965 -11.2881 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2131 12.5012 -11.6333 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6517 12.4721 -11.0120 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0533 12.2782 -9.8788 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1683 10.1179 -13.9100 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8596 12.2364 -14.1027 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9137 8.1596 -11.8366 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0978 10.5418 -7.5943 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4385 8.9249 -7.5194 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7416 12.3179 -6.9181 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5106 13.2874 -6.4775 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6670 9.7484 -8.0467 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8951 8.7812 -8.4943 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3284 14.2801 -6.2040 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6137 10.5521 -7.5405 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1842 15.4249 -5.7096 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0950 14.8685 -6.8061 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0338 14.2620 -5.1464 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1459 15.8371 -11.8396 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5784 15.1813 -10.2625 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2664 14.7763 -12.8186 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5962 15.7735 -11.5993 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2364 12.3970 -12.7259 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6061 11.6676 -11.2795 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1100 11.5362 -11.3555 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5548 12.5406 -9.9299 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -39 - -> -0.004 - -$$$$ -32 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 45 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3767 12.3649 -12.0150 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5300 11.8201 -10.7355 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7235 10.5758 -13.0283 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9848 11.7731 -13.1297 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8178 10.0121 -11.7526 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2522 10.6205 -10.6098 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6101 9.7439 -9.5117 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2784 8.7249 -9.9778 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4134 8.8570 -11.2978 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3337 9.8935 -8.0288 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4165 13.6746 -11.4876 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5534 13.6276 -12.1919 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9234 14.5178 -12.9405 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9640 10.4853 -7.7356 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8116 9.7640 -8.0536 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5500 10.3127 -7.8058 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4411 11.5873 -7.2364 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5925 12.3023 -6.9174 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8510 11.7510 -7.1622 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0968 12.1763 -6.9669 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7702 13.4221 -6.4317 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4283 13.4864 -6.3849 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1730 12.4042 -6.8287 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8019 11.5974 -7.2024 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3914 14.5951 -5.9029 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0971 12.2907 -9.8695 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1793 10.1210 -13.8973 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8799 12.2200 -14.1007 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9071 8.1535 -11.8388 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1037 10.5390 -7.5949 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4435 8.9258 -7.5263 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8100 14.4821 -11.5579 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1203 12.8861 -10.9327 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8859 8.7811 -8.4956 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6665 9.7473 -8.0499 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5168 13.2894 -6.4781 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7359 12.3175 -6.9096 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3834 14.2452 -6.0920 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6064 10.6335 -7.6221 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2430 15.4167 -5.5635 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0295 14.9490 -6.7075 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0108 14.2566 -5.0798 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 29 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 25 40 1 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 -M END -> -32 - -> -0.11 - -$$$$ -37 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 56 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3714 12.3591 -12.0053 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5147 11.8055 -10.7304 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7273 10.5756 -13.0301 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9920 11.7699 -13.1223 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8210 10.0087 -11.7569 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2407 10.6185 -10.5997 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6132 9.7471 -9.5123 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2794 8.7320 -9.9893 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4144 8.8594 -11.3005 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3370 9.8875 -8.0251 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3570 13.7205 -11.5014 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5485 13.6383 -12.1900 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9462 14.5274 -12.9449 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9602 10.4847 -7.7357 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8090 9.7649 -8.0550 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5517 10.3138 -7.8050 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4444 11.5886 -7.2367 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5954 12.3038 -6.9144 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8508 11.7543 -7.1602 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1010 12.1799 -6.9735 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7694 13.4361 -6.4722 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4342 13.4933 -6.4118 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1686 12.4094 -6.8087 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5907 -7.1765 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3824 14.6122 -5.9578 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5015 14.9079 -11.6138 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1980 14.4648 -10.9240 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2178 12.9422 -10.9897 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7152 12.5763 -10.8194 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0843 12.2887 -9.8671 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1823 10.1184 -13.9027 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8710 12.2321 -14.0913 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9081 8.1519 -11.8353 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1025 10.5369 -7.5942 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4387 8.9228 -7.5261 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8924 8.7824 -8.5002 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6608 9.7523 -8.0520 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5130 13.2841 -6.4735 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7376 12.3146 -6.9110 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3680 14.2762 -6.1614 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5997 10.5977 -7.5606 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0415 14.9434 -6.7630 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0029 14.3010 -5.1158 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2397 15.4500 -5.6469 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3040 15.1510 -12.6593 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9447 15.7573 -11.0941 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2028 14.7688 -9.8743 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3076 14.9095 -11.3795 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8316 12.6262 -11.9647 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5512 12.4812 -10.2522 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9417 12.6132 -9.7555 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9032 11.5968 -11.2722 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 -M END -> -37 - -> -0.004 - -$$$$ -23 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3775 12.3296 -12.0018 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5098 11.7629 -10.7403 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7247 10.5660 -13.0266 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9942 11.7487 -13.1193 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8312 10.0057 -11.7538 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2443 10.6021 -10.6070 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6167 9.7449 -9.5151 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2961 8.7374 -9.9786 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4404 8.8724 -11.2937 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3318 9.8946 -8.0252 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5478 13.5112 -12.1572 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9707 10.4870 -7.7351 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8642 11.7588 -7.1694 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6019 12.3141 -6.9186 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4503 11.5963 -7.2357 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5604 10.3220 -7.8000 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8213 9.7719 -8.0443 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0996 12.1710 -6.9757 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7487 13.4240 -6.4767 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4123 13.4674 -6.4260 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1713 12.3664 -6.8217 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8093 11.5624 -7.1930 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4224 14.5657 -5.9816 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6966 14.2423 -13.2612 N 0 0 0 0 0 0 - -4.9506 15.3153 -13.5405 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9383 15.6899 -12.6782 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7261 14.9536 -11.5366 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5508 13.8769 -11.2437 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6976 15.2614 -10.7139 N 0 0 0 0 0 0 - -6.0413 12.2163 -9.8757 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1733 10.1082 -13.8992 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8809 12.2018 -14.0912 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9536 8.1815 -11.8284 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4130 8.9234 -7.5092 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0893 10.5342 -7.5733 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7528 12.3249 -6.9255 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5328 13.2988 -6.4768 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6748 9.7543 -8.0412 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8926 8.7851 -8.4839 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3413 14.2681 -6.1710 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6174 10.5819 -7.5829 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0693 14.8635 -6.8057 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0251 14.2426 -5.1445 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2033 15.4153 -5.6884 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1686 15.8110 -14.4274 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3134 16.5389 -12.9221 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3780 13.3123 -10.3528 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6917 14.8692 -9.7891 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2693 16.1577 -10.8793 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 24 2 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 -M END -> -23 - -> -0.27 - -$$$$ -15 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3730 12.3647 -12.0124 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5249 11.8167 -10.7375 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7225 10.5819 -13.0270 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9871 11.7813 -13.1320 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8205 10.0150 -11.7538 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2514 10.6217 -10.6093 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6113 9.7463 -9.5119 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2838 8.7282 -9.9768 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4166 8.8609 -11.2984 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3282 9.8959 -8.0269 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4004 13.6489 -11.4541 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4592 14.7715 -11.4916 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5363 13.6231 -12.1917 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8861 14.5056 -12.9557 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9554 10.4909 -7.7390 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8447 11.7612 -7.1661 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5697 12.3054 -6.9214 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4308 11.5801 -7.2259 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5429 10.3015 -7.8076 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8018 9.7661 -8.0596 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4352 13.5609 -6.3638 O 0 0 0 0 0 0 - -3.6839 14.5445 -7.0766 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1928 12.1397 -6.9410 O 0 0 0 0 0 0 - -1.0568 11.8071 -7.7386 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0865 12.2817 -9.8717 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1761 10.1266 -13.8989 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8862 12.2301 -14.1010 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9109 8.1585 -11.8401 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0978 10.5402 -7.5937 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4435 8.9306 -7.5162 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1544 12.8539 -10.8932 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4485 14.4035 -11.3387 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6772 15.4626 -10.6827 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4583 15.3250 -12.4323 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7296 12.3147 -6.9189 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6623 9.7270 -8.0552 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8859 8.7827 -8.5028 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6209 15.4399 -6.4624 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1459 14.7973 -8.0279 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6551 14.2645 -7.2771 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2132 12.3981 -7.3814 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2092 12.0638 -8.7945 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7777 10.7513 -7.6419 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 -M END -> -15 - -> -2.5 - -$$$$ -34 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.4024 12.3461 -12.0147 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5825 11.7781 -10.7426 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7347 10.5660 -13.0395 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9966 11.7550 -13.1361 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8265 9.9936 -11.7632 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2675 10.6024 -10.6199 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6234 9.7358 -9.5255 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2741 8.7136 -9.9910 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4130 8.8453 -11.3044 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3406 9.8933 -8.0338 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5538 13.8407 -11.3379 N 0 0 0 0 0 0 - -5.6005 13.6490 -12.1765 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9196 14.4808 -13.0199 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9590 10.4855 -7.7382 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8075 9.7636 -8.0570 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5513 10.3099 -7.8070 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4406 11.5840 -7.2355 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5915 12.3007 -6.9126 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8470 11.7538 -7.1581 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0979 12.1738 -6.9691 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7666 13.4166 -6.4372 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4273 13.4768 -6.3903 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1744 12.4049 -6.8247 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8040 11.5944 -7.2012 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3946 14.5874 -5.9129 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1104 13.1199 -10.1564 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1547 14.2611 -9.9254 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7686 15.0454 -11.0979 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3454 14.7999 -8.7258 F 0 0 0 0 0 0 - -1.8808 13.9286 -10.0717 F 0 0 0 0 0 0 - -6.2371 12.2377 -9.8825 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1965 10.1201 -13.9011 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8777 12.2189 -14.1082 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9048 8.1432 -11.8372 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1066 10.5395 -7.5982 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4470 8.9316 -7.5331 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8888 8.7812 -8.5015 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6633 9.7451 -8.0571 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5093 13.2831 -6.4741 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7314 12.3149 -6.9053 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3717 14.2432 -6.0985 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6084 10.6151 -7.6146 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2286 15.4127 -5.5721 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0434 14.9448 -6.7174 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0235 14.2533 -5.0839 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7139 12.1065 -10.2127 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9207 13.2607 -9.4790 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5371 15.7574 -10.8202 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0553 15.4231 -11.8251 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -34 - -> -0.007 - -$$$$ -25 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3861 12.3623 -11.9697 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5480 11.8020 -10.7080 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6869 10.5726 -13.0325 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9529 11.7665 -13.1047 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8210 10.0086 -11.7556 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2636 10.6177 -10.5919 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6330 9.7421 -9.5104 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3023 8.7332 -9.9897 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4342 8.8678 -11.3051 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3415 9.8758 -8.0215 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1211 13.8754 -11.2000 S 0 0 0 0 0 0 - -2.9188 12.5402 -11.7675 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6382 13.5428 -12.1051 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9683 10.4827 -7.7344 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8123 9.7690 -8.0490 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5592 10.3237 -7.7969 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4543 11.5962 -7.2288 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6126 12.3085 -6.9084 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8671 11.7538 -7.1613 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1058 12.1871 -6.9644 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7745 13.4406 -6.4637 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4394 13.4976 -6.4041 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1691 12.4146 -6.8015 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8034 11.5995 -7.1773 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3694 14.6144 -5.9538 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6497 15.1720 -11.6865 O 0 0 0 0 0 0 - -4.3650 13.6745 -9.7698 O 0 0 0 0 0 0 - -6.1192 12.2649 -9.8433 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1122 10.1144 -13.9155 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8144 12.2368 -14.0685 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9325 8.1663 -11.8458 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4236 8.9164 -7.5059 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0908 10.5346 -7.5820 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9692 12.6827 -11.2486 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7669 12.6240 -12.8324 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3306 11.5652 -11.5235 H 0 0 0 0 0 0 - -5.9058 14.2159 -12.8076 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8881 8.7864 -8.4918 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6674 9.7660 -8.0419 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5385 13.2901 -6.4661 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7582 12.3115 -6.9184 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3766 14.2799 -6.1559 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5994 10.6146 -7.5758 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9849 14.2943 -5.1133 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2624 15.4490 -5.6481 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0212 14.9347 -6.7673 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 11 27 2 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 -M END -> -25 - -> -0.073 - -$$$$ -14 - 3D - Structure written by MMmdl. - 34 35 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3887 12.3647 -12.0798 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4962 11.8202 -10.8023 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7456 10.5858 -13.0568 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0126 11.7716 -13.1776 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8340 10.0285 -11.7877 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2471 10.6293 -10.6255 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6099 9.7738 -9.5366 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2971 8.7499 -9.9997 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4324 8.8805 -11.3156 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3321 9.9039 -8.0386 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4077 13.6374 -11.5161 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4400 14.7362 -11.5603 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5080 13.5935 -12.2349 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8585 14.4899 -13.0509 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9274 10.4444 -7.6346 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7880 9.9988 -8.5813 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9224 11.9644 -7.3345 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0382 12.2728 -9.9607 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2100 10.1267 -13.9275 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9074 12.2361 -14.1520 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9323 8.1670 -11.8392 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0901 10.5612 -7.6086 H 0 0 0 0 0 0 - -7.5048 8.9551 -7.5303 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1635 12.8367 -10.9301 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4281 14.3561 -11.4328 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6222 15.4408 -10.7497 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4529 15.2842 -12.5019 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6875 9.9831 -6.6758 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8140 10.3484 -8.2443 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8951 10.4012 -9.5779 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7479 8.9096 -8.6828 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9281 12.3070 -7.0401 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6508 12.2215 -6.5656 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2266 12.5877 -8.1480 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 19 1 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 21 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 22 1 0 0 0 - 10 23 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 28 1 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 16 31 1 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 17 33 1 0 0 0 - 17 34 1 0 0 0 -M END -> -14 - -> -0.84 - -$$$$ -45 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.4275 12.3453 -12.0176 C 0 0 0 0 0 0 - -6.6105 11.7832 -10.7429 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7405 10.5587 -13.0479 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0073 11.7527 -13.1387 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8357 9.9872 -11.7695 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2848 10.5993 -10.6252 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6281 9.7307 -9.5318 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2830 8.7083 -9.9969 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4214 8.8369 -11.3125 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3299 9.8861 -8.0415 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6020 13.8371 -11.3112 N 0 0 0 0 0 0 - -5.6232 13.6419 -12.1798 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9069 14.4516 -13.0592 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9473 10.4903 -7.7303 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8632 11.7421 -7.1195 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5901 12.2560 -6.8332 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4296 11.5300 -7.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5045 10.2730 -7.8164 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7945 9.7703 -8.0537 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0643 13.4351 -6.1976 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7662 13.4536 -6.2615 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3669 12.3336 -6.8391 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9435 12.0941 -6.9881 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0340 12.9997 -10.2404 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1550 14.1929 -9.9451 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8070 15.0441 -11.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4251 14.7437 -8.6708 O 0 0 0 0 0 0 - -4.8009 14.9943 -8.3397 C 0 0 0 0 0 0 - -6.2751 12.2510 -9.8808 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1947 10.1119 -13.9118 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8796 12.2190 -14.1080 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9146 8.1352 -11.8444 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1022 10.5167 -7.5911 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4243 8.9304 -7.5266 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7518 12.2958 -6.8714 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6233 9.7099 -8.0738 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9015 8.7955 -8.5026 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6122 14.2555 -5.7697 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3704 12.9492 -6.6128 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6882 11.9370 -8.0353 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6930 11.2211 -6.3917 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7681 12.9512 -9.5114 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5878 12.0194 -10.4228 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0910 13.9881 -10.0141 H 0 0 0 0 0 0 - -3.1162 15.4759 -11.7546 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5864 15.7240 -10.7221 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7653 15.4448 -7.3800 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4372 14.1236 -8.2286 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3333 15.6922 -8.9422 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -45 - -> -0.007 - -$$$$ -36 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3988 12.3548 -12.0167 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5634 11.7828 -10.7362 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7338 10.5694 -13.0370 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9985 11.7556 -13.1278 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8247 9.9971 -11.7595 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2595 10.6059 -10.6156 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6196 9.7377 -9.5218 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2737 8.7166 -9.9897 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4125 8.8485 -11.3029 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3396 9.8926 -8.0318 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5445 13.8618 -11.3707 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5979 13.6472 -12.1806 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9190 14.4711 -13.0424 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9590 10.4852 -7.7375 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8471 11.7541 -7.1585 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5907 12.3017 -6.9141 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4394 11.5818 -7.2374 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5527 10.3083 -7.8066 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8082 9.7633 -8.0562 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0898 12.1596 -6.9778 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7390 13.4130 -6.4881 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3978 13.4480 -6.4305 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1868 12.3491 -6.8198 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8044 11.5467 -7.1770 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4420 14.5581 -5.9859 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7035 15.0408 -11.2447 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1688 14.3872 -9.9709 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1668 13.2516 -10.0984 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8336 13.9158 -10.0706 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8619 14.9477 -10.1504 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1975 12.2414 -9.8778 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1955 10.1215 -13.8981 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8803 12.2209 -14.1051 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9046 8.1451 -11.8366 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1070 10.5375 -7.5971 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4451 8.9300 -7.5335 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7321 12.3147 -6.9056 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5096 13.2839 -6.4750 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6650 9.7438 -8.0571 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8891 8.7810 -8.5010 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3299 14.2629 -6.1859 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6250 10.5486 -7.5510 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1676 15.4074 -5.6822 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1055 14.8718 -6.7964 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0560 14.2422 -5.1385 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9547 15.2933 -11.9951 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4087 15.8406 -11.0592 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2749 14.9753 -9.0608 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0117 13.4714 -9.4655 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7929 12.2315 -10.0358 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1264 14.5023 -10.2505 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8642 15.5647 -9.2515 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0194 15.5931 -11.0166 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -36 - -> -0.006 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/.ipynb_checkpoints/test1-checkpoint.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/.ipynb_checkpoints/test1-checkpoint.png deleted file mode 100755 index 681b1a56..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/.ipynb_checkpoints/test1-checkpoint.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 81f960d6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,83 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_42_13 -0.65 0.57 1.81 0 -FEP_17_15 5.00 0.40 1.27 4 -FEP_33_29 -4.04 0.50 1.58 1 -FEP_19_20 0.44 0.26 0.82 0 -FEP_33_20 -3.55 0.26 0.83 1 -FEP_37_35 -18.40 0.49 1.54 0 -FEP_37_40 1.18 0.25 0.80 1 -FEP_37_34 -17.76 0.36 1.14 2 -FEP_28_26 -16.20 0.79 2.51 0 -FEP_37_19 -25.07 0.32 1.01 1 -FEP_37_30 -15.14 0.46 1.44 1 -FEP_28_21 -25.45 0.64 2.02 2 -FEP_25_29 54.91 1.92 6.06 0 -FEP_37_39 -6.65 0.27 0.85 1 -FEP_23_22 41.79 0.33 1.05 1 -FEP_30_42 4.95 0.22 0.71 1 -FEP_35_36 2.95 0.41 1.30 1 -FEP_34_38 5.80 0.39 1.24 2 -FEP_19_22 12.47 0.28 0.89 0 -FEP_19_33 4.99 0.19 0.60 1 -FEP_19_24 -2.65 0.57 1.82 1 -FEP_24_27 -19.32 1.05 3.32 3 -FEP_30_13 4.45 0.74 2.33 2 -FEP_18_16 2.63 0.39 1.23 2 -FEP_18_17 4.52 0.25 0.78 1 -FEP_38_43 5.22 0.37 1.18 3 -FEP_32_19 20.96 0.49 1.55 0 -FEP_19_17 10.23 0.53 1.67 0 -FEP_35_31 1.16 0.38 1.20 3 -FEP_21_23 -34.29 0.29 0.91 1 -FEP_27_25 -27.59 0.70 2.21 1 -FEP_16_14 -0.49 0.32 1.01 1 -FEP_37_41 7.12 0.28 0.87 1 -FEP_44_18 -1.35 0.19 0.61 1 -FEP_43_42 -3.45 0.26 0.82 1 -FEP_42_45 0.55 0.46 1.46 0 -FEP_37_26 -9.77 0.41 1.29 2 -FEP_24_25 -49.99 1.40 4.42 3 -FEP_44_45 8.06 0.23 0.74 1 -FEP_37_31 -17.93 0.34 1.07 1 -FEP_42_44 -8.55 0.17 0.55 0 -FEP_37_36 -17.76 0.56 1.78 3 -FEP_39_28 11.27 0.61 1.93 1 -FEP_35_30 4.03 0.40 1.26 0 -FEP_41_40 -6.03 0.30 0.95 2 -FEP_37_32 -45.94 0.57 1.81 0 -FEP_15_14 -9.99 0.87 2.76 3 -FEP_37_32 -45.94 0.57 1.81 0 -FEP_41_37 -7.08 0.20 0.62 0 -FEP_38_37 11.23 0.09 0.29 0 -FEP_44_43 11.95 0.27 0.84 1 -FEP_22_21 -9.00 0.10 0.30 1 -FEP_16_15 8.04 0.48 1.50 0 -FEP_39_19 -18.59 0.93 2.95 0 -FEP_35_44 3.55 0.20 0.64 0 -FEP_21_32 -24.00 0.54 1.72 0 -FEP_18_15 10.11 0.29 0.91 1 -FEP_25_19 52.23 0.54 1.71 0 -FEP_30_35 -4.66 0.43 1.36 0 -FEP_38_34 -5.91 0.21 0.66 0 -FEP_21_22 7.66 0.29 0.91 0 -FEP_34_37 17.14 0.14 0.45 0 -FEP_20_19 0.12 0.39 1.23 0 -FEP_40_37 -1.77 0.59 1.88 0 -FEP_36_37 17.10 0.35 1.10 1 -FEP_36_35 -2.68 0.28 0.88 0 -FEP_30_37 14.45 0.33 1.03 1 -FEP_29_25 -53.63 1.20 3.81 0 -FEP_33_19 -4.61 0.20 0.64 0 -FEP_20_33 3.18 0.35 1.12 0 -FEP_25_24 46.95 1.42 4.50 0 -FEP_19_32 -20.85 0.24 0.74 0 -FEP_39_37 6.78 0.29 0.91 0 -FEP_31_35 -2.69 0.33 1.04 1 -FEP_43_44 -11.61 0.27 0.86 1 -FEP_29_33 4.55 0.51 1.61 0 -FEP_31_37 16.86 0.39 1.23 0 -FEP_27_24 22.46 1.32 4.18 1 -FEP_23_21 34.26 0.49 1.56 0 -FEP_15_16 -7.88 0.48 1.53 0 -FEP_45_44 -7.32 0.36 1.12 0 -FEP_35_19 -5.64 0.55 1.73 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 3ce9fe92..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,83 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_39_28 5.81 0.43 1.35 1 -FEP_30_42 3.05 0.26 0.82 0 -FEP_37_39 -8.86 0.20 0.62 1 -FEP_24_25 -48.16 0.20 0.64 1 -FEP_44_18 -5.46 0.16 0.51 2 -FEP_18_17 2.36 0.15 0.48 0 -FEP_18_16 1.38 0.11 0.36 1 -FEP_19_20 2.01 0.17 0.55 1 -FEP_17_15 5.55 0.09 0.28 1 -FEP_33_29 -7.18 0.18 0.58 0 -FEP_19_22 12.28 0.23 0.74 0 -FEP_37_35 -20.86 0.27 0.86 1 -FEP_27_25 -26.37 0.41 1.31 0 -FEP_37_30 -17.41 0.10 0.30 1 -FEP_37_36 -17.71 0.19 0.61 1 -FEP_28_26 -12.08 0.19 0.59 1 -FEP_44_45 6.58 0.17 0.53 1 -FEP_37_40 -0.67 0.18 0.57 5 -FEP_38_43 3.26 0.20 0.64 0 -FEP_23_22 43.74 0.10 0.32 1 -FEP_37_32 -51.34 0.37 1.16 0 -FEP_35_31 3.05 0.28 0.87 2 -FEP_42_45 0.94 0.21 0.66 1 -FEP_37_19 -28.62 0.26 0.83 5 -FEP_19_33 6.42 0.08 0.25 2 -FEP_30_13 2.40 0.67 2.12 0 -FEP_15_14 -10.05 0.59 1.86 1 -FEP_32_19 22.51 0.11 0.34 2 -FEP_34_38 5.41 0.24 0.76 2 -FEP_42_13 -1.27 0.14 0.43 0 -FEP_35_30 3.42 0.37 1.18 1 -FEP_41_40 -6.20 0.22 0.70 1 -FEP_43_42 -4.36 0.10 0.31 1 -FEP_19_24 -4.82 0.19 0.60 0 -FEP_24_27 -19.85 1.32 4.18 3 -FEP_25_29 54.74 0.54 1.71 1 -FEP_33_20 -3.98 0.21 0.66 1 -FEP_35_36 3.10 0.17 0.55 3 -FEP_37_26 -15.00 0.24 0.76 2 -FEP_37_41 5.41 0.41 1.29 0 -FEP_21_23 -34.21 0.13 0.40 1 -FEP_37_34 -18.03 0.18 0.58 1 -FEP_28_21 -21.50 0.19 0.60 2 -FEP_19_17 6.21 0.37 1.18 2 -FEP_37_31 -17.51 0.16 0.52 1 -FEP_42_44 -5.76 0.18 0.57 0 -FEP_16_14 -3.07 0.21 0.65 2 -FEP_37_32 -45.94 0.57 1.81 0 -FEP_41_37 -5.80 0.29 0.91 0 -FEP_38_37 13.05 0.25 0.79 0 -FEP_44_43 10.16 0.18 0.57 1 -FEP_22_21 -9.00 0.10 0.30 1 -FEP_16_15 6.28 0.23 0.72 1 -FEP_39_19 -19.84 0.41 1.31 0 -FEP_18_15 8.13 0.08 0.27 0 -FEP_25_19 54.50 0.26 0.81 0 -FEP_21_32 -26.27 0.38 1.21 0 -FEP_35_44 0.60 0.19 0.60 0 -FEP_29_33 7.19 0.24 0.76 0 -FEP_20_33 4.35 0.30 0.93 0 -FEP_21_22 9.26 0.18 0.57 0 -FEP_36_37 17.39 0.22 0.69 0 -FEP_36_35 -2.69 0.30 0.94 0 -FEP_33_19 -6.27 0.11 0.35 0 -FEP_31_35 -2.69 0.39 1.24 0 -FEP_27_24 21.29 0.49 1.54 1 -FEP_34_37 18.32 0.21 0.67 0 -FEP_30_37 17.32 0.25 0.80 0 -FEP_40_37 0.96 0.22 0.71 0 -FEP_30_35 -2.52 0.28 0.89 0 -FEP_39_37 9.06 0.25 0.79 0 -FEP_19_32 -22.68 0.10 0.31 0 -FEP_23_21 34.41 0.15 0.46 0 -FEP_25_24 48.78 0.20 0.63 0 -FEP_45_44 -6.92 0.18 0.57 0 -FEP_29_25 -53.12 0.37 1.16 0 -FEP_43_44 -9.79 0.16 0.52 0 -FEP_20_19 -2.02 0.27 0.86 0 -FEP_15_16 -6.53 0.21 0.65 0 -FEP_31_37 17.81 0.20 0.62 0 -FEP_38_34 -5.09 0.22 0.68 0 -FEP_35_19 -7.60 0.22 0.69 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index bac64fc2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,49 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_41_37 -7.05 0.233 1.04 0 -FEP_40_37 -1.8 0.48 2.09 1 -FEP_39_37 6.51 0.336 1.43 2 -FEP_37_35 -19.0 0.752 3.36 0 -FEP_34_37 17.6 0.412 1.7 3 -FEP_37_32 -45.9 0.772 3.36 1 -FEP_30_37 15.0 0.519 2.26 1 -FEP_31_37 17.5 0.46 2.01 1 -FEP_36_37 17.3 0.757 3.12 3 -FEP_37_19 -25.4 0.446 1.94 1 -FEP_37_26 -10.1 0.485 2.06 2 -FEP_41_40 -5.4 0.361 1.53 2 -FEP_39_28 11.2 0.795 3.47 1 -FEP_30_35 -3.92 0.602 2.69 0 -FEP_31_35 -1.73 0.581 2.4 3 -FEP_36_35 -3.38 0.573 2.5 1 -FEP_30_42 5.01 0.341 1.48 1 -FEP_30_13 3.77 1.21 5.14 2 -FEP_38_34 -6.28 0.453 1.87 3 -FEP_38_43 4.97 0.575 2.37 3 -FEP_19_32 -21.0 0.602 2.62 1 -FEP_33_19 -5.08 0.283 1.23 1 -FEP_20_19 -0.93 0.555 2.48 0 -FEP_19_24 -2.9 0.664 2.89 1 -FEP_22_19 -12.8 0.433 1.94 0 -FEP_19_17 9.71 0.854 3.82 0 -FEP_20_33 3.46 0.485 2.12 1 -FEP_29_33 4.89 1.02 4.33 2 -FEP_43_42 -3.97 0.405 1.76 1 -FEP_43_44 -11.8 0.375 1.63 1 -FEP_42_44 -8.31 0.362 1.58 1 -FEP_42_45 0.555 0.519 2.32 0 -FEP_42_13 -1.25 0.792 3.45 1 -FEP_45_44 -7.92 0.479 2.09 1 -FEP_44_18 -1.74 0.364 1.58 1 -FEP_18_17 4.44 0.361 1.57 1 -FEP_17_15 5.46 0.477 1.85 5 -FEP_27_24 20.1 1.6 6.61 3 -FEP_25_24 49.7 1.74 6.95 4 -FEP_27_25 -26.9 0.806 3.32 3 -FEP_29_25 -53.2 1.99 8.88 0 -FEP_28_26 -16.2 0.924 4.13 0 -FEP_23_21 33.9 0.462 1.96 2 -FEP_21_22 8.66 0.403 1.75 1 -FEP_23_22 41.8 0.566 2.47 1 -FEP_15_14 -8.61 1.61 5.79 7 -FEP_15_16 -7.83 0.672 3.0 0 -FEP_16_14 0.04 0.425 1.85 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index ba07f34c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,49 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_41_37 -5.69 0.326 1.46 0 -FEP_40_37 0.52 0.269 1.04 5 -FEP_39_37 8.84 0.244 1.06 1 -FEP_37_35 -20.6 0.348 1.52 1 -FEP_34_37 18.2 0.216 0.943 1 -FEP_37_32 -48.4 0.644 2.88 0 -FEP_30_37 17.3 0.117 0.508 1 -FEP_31_37 17.6 0.213 0.927 1 -FEP_36_37 17.6 0.322 1.4 1 -FEP_37_19 -28.5 0.311 1.2 5 -FEP_37_26 -15.0 0.288 1.22 2 -FEP_41_40 -6.11 0.242 1.05 1 -FEP_39_28 5.32 0.574 2.5 1 -FEP_30_35 -2.95 0.399 1.74 1 -FEP_31_35 -2.92 0.301 1.28 2 -FEP_36_35 -3.08 0.345 1.42 3 -FEP_30_42 3.52 0.341 1.52 0 -FEP_30_13 2.48 0.962 4.3 0 -FEP_38_34 -5.38 0.268 1.14 2 -FEP_38_43 3.76 0.305 1.36 0 -FEP_19_32 -22.4 0.136 0.577 2 -FEP_33_19 -6.3 0.136 0.577 2 -FEP_20_19 -2.13 0.248 1.08 1 -FEP_19_24 -4.72 0.225 1.0 0 -FEP_22_19 -12.5 0.259 1.16 0 -FEP_19_17 6.37 0.552 2.34 2 -FEP_20_33 4.21 0.319 1.39 1 -FEP_29_33 7.37 0.376 1.68 0 -FEP_43_42 -4.24 0.172 0.75 1 -FEP_43_44 -9.84 0.222 0.968 1 -FEP_42_44 -5.71 0.234 1.05 0 -FEP_42_45 0.99 0.277 1.21 1 -FEP_42_13 -1.19 0.295 1.32 0 -FEP_45_44 -6.42 0.208 0.907 1 -FEP_44_18 -5.42 0.213 0.902 2 -FEP_18_17 2.32 0.166 0.74 0 -FEP_17_15 5.55 0.184 0.8 1 -FEP_27_24 20.6 1.39 5.74 3 -FEP_25_24 48.5 0.256 1.12 1 -FEP_27_25 -26.5 0.526 2.35 0 -FEP_29_25 -54.2 0.644 2.8 1 -FEP_28_26 -11.8 0.202 0.81 4 -FEP_23_21 34.4 0.17 0.742 1 -FEP_21_22 9.1 0.135 0.586 1 -FEP_23_22 43.8 0.172 0.75 1 -FEP_15_14 -10.1 1.07 4.65 1 -FEP_15_16 -6.62 0.378 1.65 1 -FEP_16_14 -3.13 0.27 1.15 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 7b36b269..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,86 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_41_27 -56.25 0.72 0 -FEP_27_25 -26.16 0.40 2 -FEP_34_38 6.76 0.23 1 -FEP_37_39 -6.36 0.20 1 -FEP_44_17 2.24 0.30 0 -FEP_21_22 8.31 0.39 0 -FEP_41_40 -4.77 0.20 0 -FEP_21_23 -33.53 0.36 1 -FEP_17_15 5.93 0.26 1 -FEP_33_27 -28.48 0.80 0 -FEP_35_30 3.82 0.45 0 -FEP_19_20 1.42 0.49 0 -FEP_30_13 3.09 0.96 0 -FEP_37_40 2.42 0.41 0 -FEP_29_21 4.98 0.50 0 -FEP_37_35 -19.60 0.57 0 -FEP_44_18 -2.12 0.31 0 -FEP_34_27 -30.95 0.70 0 -FEP_19_16 7.18 0.56 1 -FEP_19_33 5.16 0.21 0 -FEP_42_13 -1.84 0.55 1 -FEP_37_30 -14.87 0.24 0 -FEP_37_34 -17.40 0.20 1 -FEP_42_18 -9.91 0.58 0 -FEP_42_45 0.56 0.24 0 -FEP_33_20 -3.37 0.41 0 -FEP_28_21 -24.57 0.58 0 -FEP_19_24 -3.15 0.34 0 -FEP_35_27 -30.41 0.97 1 -FEP_33_29 -5.74 0.89 1 -FEP_35_31 2.29 0.44 0 -FEP_24_27 -20.92 1.21 0 -FEP_37_31 -17.04 0.31 0 -FEP_15_16 -7.63 0.47 0 -FEP_24_25 -49.43 1.03 1 -FEP_39_28 11.09 0.51 0 -FEP_37_41 7.03 0.12 0 -FEP_15_14 -7.22 1.35 4 -FEP_28_26 -16.18 0.48 0 -FEP_19_18 5.52 0.26 0 -FEP_38_43 4.73 0.44 0 -FEP_37_27 -50.24 1.11 0 -FEP_42_44 -8.07 0.32 1 -FEP_45_18 -10.31 0.53 1 -FEP_24_29 1.47 0.89 1 -FEP_19_17 9.18 0.67 0 -FEP_18_17 4.36 0.26 0 -FEP_42_17 -6.93 0.45 1 -FEP_32_29 23.23 0.71 0 -FEP_23_22 41.71 0.46 0 -FEP_19_29 2.56 0.78 0 -FEP_43_42 -4.49 0.31 0 -FEP_16_14 0.57 0.28 0 -FEP_37_32 -45.82 0.52 1 -FEP_43_18 -14.88 0.29 0 -FEP_35_36 3.80 0.40 0 -FEP_25_29 51.51 0.51 0 -FEP_32_19 21.12 0.35 1 -FEP_40_27 -50.73 0.54 0 -FEP_37_36 -16.85 0.51 0 -FEP_19_27 -23.76 0.88 0 -FEP_44_45 7.77 0.42 0 -FEP_32_27 -3.22 0.91 1 -FEP_45_17 -6.90 0.56 0 -FEP_37_26 -10.43 0.26 0 -FEP_19_15 14.63 0.31 1 -FEP_25_19 51.83 0.71 0 -FEP_22_24 -14.49 0.61 0 -FEP_25_37 76.52 0.54 0 -FEP_25_32 30.14 0.76 0 -FEP_44_31 0.90 0.61 0 -FEP_45_36 -6.86 0.41 0 -FEP_22_32 -35.02 0.51 0 -FEP_44_35 -2.29 0.63 0 -FEP_22_19 -13.16 0.33 0 -FEP_44_43 11.65 0.26 0 -FEP_23_32 8.97 0.71 0 -FEP_21_25 -55.14 0.62 0 -FEP_25_33 56.03 0.38 0 -FEP_44_30 2.98 0.64 0 -FEP_45_43 3.47 0.39 0 -FEP_22_28 17.63 0.46 1 -FEP_42_30 -5.07 0.26 0 -FEP_16_18 -1.26 0.24 0 -FEP_19_37 25.83 0.31 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index 534b9995..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_42_30 -5.07 0.26 0 -FEP_16_18 -1.26 0.24 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 709def5d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,86 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_41_27 -61.56 0.45 0 -FEP_27_25 -26.56 0.33 0 -FEP_34_38 5.36 0.12 0 -FEP_37_39 -8.81 0.14 0 -FEP_44_17 -3.12 0.11 0 -FEP_21_22 9.20 0.09 0 -FEP_41_40 -6.01 0.10 0 -FEP_21_23 -34.49 0.11 0 -FEP_17_15 5.55 0.16 0 -FEP_33_27 -33.52 0.22 0 -FEP_35_30 2.47 0.15 0 -FEP_19_20 2.25 0.18 0 -FEP_30_13 2.57 0.69 0 -FEP_37_40 -0.37 0.20 0 -FEP_29_21 3.81 0.30 1 -FEP_37_35 -20.26 0.22 0 -FEP_44_18 -5.37 0.14 0 -FEP_34_27 -37.17 0.24 0 -FEP_19_16 4.92 0.48 1 -FEP_19_33 6.19 0.11 0 -FEP_42_13 -1.10 0.26 0 -FEP_37_30 -17.16 0.06 0 -FEP_37_34 -18.47 0.12 0 -FEP_42_18 -10.87 0.12 0 -FEP_42_45 1.04 0.18 0 -FEP_33_20 -4.44 0.24 0 -FEP_28_21 -21.18 0.14 0 -FEP_19_24 -4.62 0.12 0 -FEP_35_27 -35.04 0.21 0 -FEP_33_29 -7.56 0.33 0 -FEP_35_31 2.79 0.11 0 -FEP_24_27 -21.39 0.44 0 -FEP_37_31 -17.76 0.14 0 -FEP_15_16 -6.95 0.30 0 -FEP_24_25 -48.88 0.16 0 -FEP_39_28 4.84 0.38 0 -FEP_37_41 5.58 0.15 0 -FEP_15_14 -10.07 0.89 0 -FEP_28_26 -11.49 0.07 3 -FEP_19_18 4.35 0.20 0 -FEP_38_43 4.26 0.23 0 -FEP_37_27 -55.30 0.14 0 -FEP_42_44 -5.66 0.15 0 -FEP_45_18 -11.59 0.17 0 -FEP_24_29 4.44 0.36 0 -FEP_19_17 6.53 0.41 0 -FEP_18_17 2.28 0.07 0 -FEP_42_17 -8.75 0.32 0 -FEP_32_29 23.05 0.35 0 -FEP_23_22 43.77 0.14 0 -FEP_19_29 -0.43 0.43 0 -FEP_43_42 -4.11 0.14 0 -FEP_16_14 -3.20 0.17 0 -FEP_37_32 -50.86 0.30 0 -FEP_43_18 -15.04 0.19 0 -FEP_35_36 3.07 0.30 0 -FEP_25_29 53.63 0.35 0 -FEP_32_19 22.38 0.08 0 -FEP_40_27 -54.63 0.26 0 -FEP_37_36 -17.55 0.26 0 -FEP_19_27 -27.88 0.35 0 -FEP_44_45 6.26 0.12 0 -FEP_32_27 -4.25 0.95 1 -FEP_45_17 -9.56 0.32 0 -FEP_37_26 -15.08 0.16 0 -FEP_19_15 11.88 0.24 0 -FEP_25_19 53.45 0.24 0 -FEP_22_24 -17.07 0.24 0 -FEP_25_37 81.45 0.22 0 -FEP_25_32 31.10 0.20 0 -FEP_44_31 0.92 0.16 0 -FEP_45_36 -5.38 0.22 0 -FEP_22_32 -35.03 0.14 0 -FEP_44_35 -1.76 0.28 0 -FEP_22_19 -12.78 0.12 0 -FEP_44_43 9.52 0.13 0 -FEP_23_32 8.52 0.19 0 -FEP_21_25 -56.92 0.41 0 -FEP_25_33 59.79 0.30 0 -FEP_44_30 1.48 0.34 0 -FEP_45_43 3.06 0.15 0 -FEP_22_28 12.84 0.13 0 -FEP_16_18 -1.22 0.12 0 -FEP_42_30 -3.99 0.22 0 -FEP_19_37 28.28 0.17 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index 8df1639e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cdk8/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_16_18 -1.22 0.12 0 -FEP_42_30 -3.99 0.22 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 35913e90..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,38 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200 -29.61 0.20 0.64 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -20.40 0.18 0.57 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -6.64 0.19 0.59 3 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -31.55 0.53 1.66 0 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40 -63.12 0.92 2.91 7 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1 -1.58 0.21 0.66 0 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 6.47 0.14 0.45 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 95.97 0.11 0.36 1 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -17.81 0.18 0.57 2 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42 0.08 1.49 4.71 3 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90 11.61 0.40 1.28 2 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23 -18.47 0.93 2.95 0 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90 -4.61 0.25 0.78 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 63.22 1.29 4.07 5 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -11.90 0.37 1.17 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 12.30 1.54 4.87 7 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -40.98 0.13 0.40 1 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -6.22 0.21 0.66 2 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200 7.48 0.37 1.18 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 37.67 0.31 0.97 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 -2.36 0.07 0.21 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 90.83 0.12 0.38 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 36.30 0.15 0.46 0 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23 -13.65 1.04 3.28 0 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5 -4.77 0.76 2.39 7 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5 -5.15 0.59 1.86 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 87.20 0.21 0.66 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300 -32.20 0.27 0.86 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -59.84 0.08 0.27 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5 -5.75 0.54 1.71 3 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 10.72 0.41 1.30 1 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -38.43 0.62 1.96 4 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 26.83 0.24 0.77 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90 21.90 0.39 1.23 7 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42 52.77 0.84 2.67 1 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7 2.63 0.31 0.99 0 -FEP_CHEMBL3402751-2100_CHEMBL3402752-30000 -6.77 0.13 0.42 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 4f940bce..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,38 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 11.63 0.43 1.35 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 87.09 0.23 0.74 1 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23 -14.71 0.66 2.08 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -39.65 0.13 0.40 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 9.27 1.29 4.07 2 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -17.82 0.15 0.48 0 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -7.06 0.11 0.35 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 35.91 0.20 0.62 1 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23 -18.18 0.89 2.81 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 24.67 0.22 0.70 1 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -59.41 0.11 0.36 1 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200 3.23 0.25 0.79 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -20.22 0.15 0.48 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200 -25.19 0.18 0.57 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 83.68 0.17 0.55 0 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42 -0.29 1.38 4.37 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 -4.50 0.19 0.59 2 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 7.40 0.08 0.26 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -7.15 0.13 0.42 2 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1 -2.84 0.18 0.56 1 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5 -7.47 0.43 1.35 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 95.24 0.22 0.70 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5 -6.01 0.36 1.14 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -38.25 1.28 4.05 2 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90 -5.19 0.30 0.95 1 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -10.25 0.24 0.75 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 35.49 0.27 0.86 1 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 63.73 0.71 2.26 2 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5 -4.65 0.77 2.44 3 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40 -62.85 1.05 3.31 7 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -31.97 0.60 1.88 2 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300 -30.69 0.21 0.67 0 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90 10.75 0.17 0.53 3 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7 -0.36 0.40 1.28 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90 21.55 1.01 3.18 3 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42 51.84 0.53 1.68 0 -FEP_CHEMBL3402751-2100_CHEMBL3402752-30000 -7.73 0.10 0.30 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index f9d227c3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,34 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 -2.7 0.157 0.7 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200 -29.3 0.386 1.73 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300 -32.1 0.304 1.36 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -41.0 0.164 0.715 1 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -17.6 0.228 0.967 2 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -60.0 0.144 0.645 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 37.3 0.349 1.56 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 36.2 0.18 0.806 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 26.9 0.306 1.37 0 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200 2.35 0.638 2.21 8 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 96.3 0.178 0.776 1 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 87.3 0.342 1.53 0 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40 -63.0 1.44 3.81 13 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 90.7 0.268 1.2 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -6.38 0.22 0.905 3 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -6.32 0.27 1.15 2 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 6.49 0.191 0.854 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 11.2 0.58 2.53 1 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -20.4 0.255 1.14 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 63.6 2.01 6.66 9 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5 -6.32 0.697 2.87 3 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -31.6 0.793 3.55 0 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5 -4.14 1.03 3.1 11 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5 -5.41 0.813 3.64 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -39.8 1.47 4.64 10 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1 -2.18 0.358 1.6 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 8.28 1.6 5.77 7 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42 1.16 1.6 6.38 4 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -11.6 0.56 2.5 0 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90 12.2 1.16 4.19 7 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23 -18.1 1.08 4.02 6 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23 -14.4 1.59 7.1 0 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90 -4.47 0.515 2.3 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 38fbd9c1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,34 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 -4.2 0.196 0.834 2 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200 -25.7 0.579 2.59 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300 -30.5 0.277 1.24 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -39.7 0.17 0.762 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -17.8 0.162 0.722 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -59.4 0.142 0.62 1 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 35.7 0.309 1.35 1 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 36.4 0.206 0.899 1 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 24.8 0.256 1.11 1 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200 -0.165 0.25 0.866 8 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 95.5 0.246 1.1 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 84.0 0.192 0.86 0 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40 -62.6 1.22 3.23 13 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 87.4 0.247 1.08 1 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -7.16 0.164 0.696 2 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -7.01 0.142 0.636 0 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 7.46 0.12 0.539 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 11.5 0.567 2.54 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -20.1 0.18 0.806 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 62.7 1.05 4.19 4 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5 -6.0 0.469 2.1 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -31.9 0.658 2.79 2 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5 -4.91 1.64 6.36 5 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5 -7.6 0.452 2.02 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -39.1 1.99 8.22 3 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1 -3.12 0.308 1.34 1 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 7.72 1.66 7.06 2 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42 0.065 1.54 6.9 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -10.1 0.332 1.49 0 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90 11.1 1.22 4.89 4 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23 -17.8 0.956 3.31 8 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23 -14.4 1.02 4.57 0 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90 -4.95 0.508 2.21 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index bc8c3d41..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,36 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -31.74 0.59 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 36.96 0.16 0 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402762-1 2.78 0.29 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 -3.04 0.14 0 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402741-400 4.33 0.45 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402761-1 62.80 1.11 6 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -41.20 1.33 6 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -41.00 0.10 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -6.13 0.11 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402763-90 15.18 1.20 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 26.99 0.19 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402761-1 2.79 0.52 8 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 36.18 0.10 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 -2.24 0.57 1 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 11.69 0.41 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 63.92 1.54 4 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 6.51 0.13 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -60.22 0.12 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -11.31 0.42 0 -FEP_CHEMBL3402744-300_CHEMBL3402755-4200 32.07 0.14 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402755-4200 29.08 0.33 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402762-1 5.67 0.56 0 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -6.43 0.17 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 4.25 0.44 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 96.54 0.14 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -17.49 0.14 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402759-5-7 6.89 0.44 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -20.33 0.18 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402760-1 3.52 0.70 4 -FEP_CHEMBL3402764-90_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 -12.76 1.09 5 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402741-400 17.77 0.54 6 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 90.66 0.24 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 87.34 0.27 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90 21.59 0.90 0 -FEP_CHEMBL3402764-90_CHEMBL3402756-2-7 -74.96 0.28 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index 00cc8f80..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3402742_23-CHEMBL3402764_90 21.59 0.90 0 -FEP_CHEMBL3402764_90-CHEMBL3402756_2_7 -71.57 1.57 4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index b4a8b9be..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,36 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -31.90 0.27 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 35.91 0.15 0 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402762-1 3.40 0.25 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 -3.90 0.05 0 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402741-400 4.71 0.41 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402761-1 62.39 0.62 6 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -40.04 1.53 1 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -39.81 0.11 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -7.16 0.10 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402763-90 14.16 0.78 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 24.98 0.13 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402761-1 3.56 0.00 8 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 36.98 0.05 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 -0.42 0.69 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 11.46 0.37 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 61.72 0.77 2 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 7.52 0.09 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -59.31 0.09 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -10.01 0.23 0 -FEP_CHEMBL3402744-300_CHEMBL3402755-4200 30.33 0.18 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402755-4200 26.28 0.55 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402762-1 7.73 0.14 0 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -6.96 0.09 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 6.18 1.05 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 95.85 0.11 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -17.83 0.06 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402759-5-7 6.00 0.30 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -20.03 0.10 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402760-1 5.16 1.45 2 -FEP_CHEMBL3402764-90_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 -11.48 1.21 1 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402741-400 17.36 0.35 8 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 87.80 0.09 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 84.28 0.09 0 -FEP_CHEMBL3402764-90_CHEMBL3402756-2-7 -74.70 0.33 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90 21.11 0.77 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index 5b3d61b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/cmet/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3402764_90-CHEMBL3402756_2_7 -73.45 0.37 3 -FEP_CHEMBL3402742_23-CHEMBL3402764_90 20.78 0.90 3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/do_qfep.sh b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/do_qfep.sh deleted file mode 100644 index 9498a4f6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/do_qfep.sh +++ /dev/null @@ -1,23 +0,0 @@ -#!/bin/bash -cwd=$(pwd) -for leg in */ ; do - echo $(pwd) - cd $leg - for d in */ ; do - cd $d - for rep in FEP1/298/*/; do - cd $rep - echo $(pwd) - qfep < qfep.FEP1.inp > qfep1.out - qfep < qfep.FEP2.inp > qfep2.out - qfep < qfep.FEP3.inp > qfep3.out - qfep < qfep.FEP4.inp > qfep4.out - qfep < qfep.FEP5.inp > qfep5.out - cd ../../.. - continue - done - cd .. - continue - done - cd $cwd -done diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index d286ba9c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,28 +0,0 @@ -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 water/ -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 water/ -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056 water/ -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 water/ -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248 water/ -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 water/ -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 water/ -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410 water/ -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 water/ -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 water/ -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666 water/ -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 water/ -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 water/ -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 water/ -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 water/ -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 water/ -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 water/ -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 water/ -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678 water/ -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 water/ -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 water/ -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666 water/ -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 water/ -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 water/ -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 water/ -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 water/ -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 water/ -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 water/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 7b874d99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,41 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 5.40 0.38 1.21 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 -12.29 0.72 2.26 0 -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056 1.60 0.36 1.14 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 11.35 0.46 1.47 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -5.57 0.22 0.71 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248 26.56 0.79 2.50 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 17.98 1.02 3.23 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 4.12 0.45 1.44 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 6.87 0.56 1.76 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 12.57 0.71 2.24 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 42.93 1.06 3.34 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -1.27 0.80 2.53 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 12.47 0.83 2.62 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410 71.77 1.21 3.83 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 15.94 0.48 1.51 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -21.81 1.44 4.56 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 58.44 1.33 4.21 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666 11.10 1.27 4.00 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 59.52 0.60 1.90 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -59.94 2.44 7.70 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 -3.08 0.57 1.81 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 -6.15 0.98 3.08 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -2.21 0.52 1.65 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 30.13 0.79 2.51 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 33.22 0.63 1.99 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 12.22 0.95 3.01 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -32.46 0.63 1.98 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 59.41 1.49 4.72 1 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 9.20 0.38 1.19 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678 -60.86 1.55 4.91 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -9.34 0.49 1.54 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 0.35 0.45 1.42 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666 -10.25 0.68 2.14 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 -1.14 0.63 1.98 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 6.83 0.51 1.61 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -0.03 0.49 1.54 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -11.61 0.63 2.00 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 13.03 0.57 1.79 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -0.24 0.59 1.86 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 10.35 0.83 2.63 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/run_analysis.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/run_analysis.py deleted file mode 100644 index a7f32827..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/run_analysis.py +++ /dev/null @@ -1,51 +0,0 @@ -import os -import shlex -import math -from subprocess import check_output -import glob - -executable = 'python /home/diazalej/private/software/qligfep_Nicolas/analyze_FEP.py ' -options = {'-C':'RACKHAM', - '-F':None} - -curdir = os.getcwd() -failed = [] -legdirs = glob.glob('*/') -results = {} -fepfiles = [] - -for i, topdir in enumerate(legdirs): - results[topdir] = {} - os.chdir(topdir) - with open(topdir.split('/')[0] + '.txt', 'w') as outfile: - outfile.write('{:<50}{:<10}{:<10}{:<10}{:<10}\n'.format('FEP','dG','sem', 'std', 'crashes')) - for fep in glob.glob('FEP_*'): - print('Analysing {}'.format(fep)) - options['-F']=fep - option_list = ' '.join(['{} {}'.format(k,v) for k,v in options.items()]) - args = shlex.split(executable + option_list) - try: - out = check_output(args) - out = out.splitlines() - out = [line for line in out if '>>' in line.decode('utf-8')] - out = out[-1].strip().decode("utf-8") - out = out.split() - outfile.write('{:<50}{:<10}{:<10}{:<10}{:<10}\n'.format(out[1],out[-4],out[-3], out[-2], out[-1])) - fep = out[1] - if i == 0: - fepfiles.append(fep) - results[topdir][fep] = (float(out[-4]), float(out[-3])) - except: - print('Failed to read {}'.format(fep)) - failed.append('{} {}\n'.format(fep,topdir.split('.')[1])) - - os.chdir(curdir) -with open('failed.txt', 'w') as outfile: - for line in failed: - outfile.write(line) -print('\nddG summary...\n') -print('{:<50}{:<20}{:<30}'.format('FEP', 'ddG(kcal/mol)', 'SEM')) -for fep in fepfiles: - rp, rw = results['1.protein/'], results['2.water/'] - sem_var = rp[fep][1]**2 + rw[fep][1]**2 - print('{:<50}{:<20.4}{:<30.4}'.format(fep, rp[fep][0] - rw[fep][0], math.sqrt(sem_var))) diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/runjobs.sh b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/runjobs.sh deleted file mode 100644 index 8501118a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/runjobs.sh +++ /dev/null @@ -1,14 +0,0 @@ -#!/bin/bash -cwd=$(pwd) -for leg in */ ; do - echo $(pwd) - cd $leg - for d in */ ; do - cd $d - echo "Submitting $leg$d ..." - ./FEP_submit.sh - cd .. - continue - done - cd $cwd -done diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 041fdd36..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/5fepstage/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,13 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 8.76 0.18 0.55 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 0.56 0.12 0.39 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 7.26 nan nan 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 nan nan nan 3 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -2.29 0.27 0.86 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 nan nan nan 1 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 11.07 0.09 0.29 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 nan nan nan 3 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 26.92 nan nan 5 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 29.14 0.43 1.28 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 7.12 0.22 0.45 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 9.58 0.16 0.40 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 85f04afe..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,48 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056 -0.83 0.67 2.13 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 -0.84 0.28 0.89 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410 63.02 1.38 4.35 3 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -32.65 0.97 3.06 3 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 -1.95 1.91 6.05 6 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 49.64 1.11 3.51 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 2.60 0.53 1.67 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 4.34 0.42 1.31 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -4.00 0.33 1.05 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 29.04 0.36 1.15 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 5.25 0.45 1.43 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -37.26 0.76 2.40 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 6.57 0.41 1.29 6 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 -7.01 0.34 1.08 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 50.13 0.35 1.10 5 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 26.18 0.29 0.92 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 -4.82 0.57 1.81 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666 -12.92 0.49 1.54 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -2.67 0.50 1.58 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678 -63.93 1.66 5.24 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 8.59 0.29 0.90 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 0.89 0.29 0.93 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -14.27 0.45 1.42 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 -11.01 0.53 1.67 1 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -4.05 0.43 1.36 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -7.56 0.10 0.31 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -2.67 0.51 1.60 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 12.83 0.46 1.46 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 4.67 0.36 1.15 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 2.80 0.69 2.19 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248 26.25 0.47 1.47 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666 13.36 0.97 3.08 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 10.25 0.53 1.67 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 8.58 0.35 1.11 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 -18.70 0.75 2.37 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 9.68 0.43 1.37 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 41.98 0.58 1.84 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -11.45 0.26 0.81 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -72.62 1.26 3.99 1 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 52.56 1.00 3.16 7 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677 23.32 0.91 2.87 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248 31.93 0.39 1.25 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677 -45.85 0.37 1.16 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677 -19.44 0.60 1.91 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836 68.59 1.20 3.79 6 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248 -6.03 0.45 1.43 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666 77.48 1.21 3.83 7 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 687cd975..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,48 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056 -1.48 0.61 1.93 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 -1.06 0.13 0.41 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410 62.28 0.91 2.87 1 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -33.03 0.46 1.45 2 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 -4.55 1.13 3.58 4 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 51.49 0.45 1.44 3 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 2.63 0.13 0.42 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 4.13 0.21 0.67 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -3.84 0.11 0.35 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 28.42 0.17 0.55 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 5.13 0.33 1.06 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -37.08 0.31 0.98 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 1.39 1.08 3.42 7 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 -6.40 0.21 0.67 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 47.34 0.81 2.55 5 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 26.29 0.34 1.07 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 -4.95 0.10 0.33 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666 -14.93 0.24 0.76 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -1.93 0.20 0.65 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678 -69.73 0.70 2.21 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 8.99 0.13 0.42 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 -0.29 0.06 0.18 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -15.14 0.24 0.77 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 -12.54 0.43 1.34 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -4.00 0.07 0.21 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -5.64 0.15 0.47 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -3.63 0.11 0.33 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 11.23 0.11 0.33 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 3.05 0.14 0.43 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 1.31 0.69 2.19 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248 24.33 0.49 1.56 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666 8.81 0.62 1.95 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 8.59 0.16 0.52 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 7.43 0.08 0.25 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 -18.11 0.37 1.17 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 9.24 0.16 0.50 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 39.13 0.39 1.25 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -11.02 0.09 0.29 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -74.39 0.73 2.30 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 49.94 0.55 1.74 6 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677 -16.78 0.34 1.07 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248 30.71 0.24 0.75 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677 -45.40 0.40 1.25 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836 63.80 1.00 3.15 2 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677 24.70 0.32 1.01 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666 70.23 1.48 4.68 4 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248 -4.00 0.11 0.34 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 56f2d900..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,38 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 12.8 0.498 2.23 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -11.3 0.316 1.41 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 4.63 0.488 2.18 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 8.01 0.64 2.86 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 54.5 1.17 4.22 7 -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056 -1.18 0.765 3.42 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -2.48 0.582 2.6 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -4.12 0.42 1.88 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -4.04 0.743 3.32 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 1.2 0.569 2.55 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 7.76 0.474 2.12 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -7.36 0.135 0.602 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 50.0 1.73 7.75 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 10.3 0.524 2.34 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 9.34 0.729 3.26 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 -1.12 0.539 2.41 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 -5.35 0.696 3.11 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -15.0 0.602 2.69 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 2.13 0.619 2.77 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -4.03 0.548 2.45 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 -18.7 1.21 5.41 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 -7.05 0.481 2.15 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -33.4 1.39 5.37 5 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 8.33 0.777 2.91 6 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 41.1 0.734 3.28 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 52.9 0.695 2.69 5 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666 12.3 1.1 4.92 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -72.5 1.56 6.62 2 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 1.6 2.5 9.37 6 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678 -64.3 2.8 12.5 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 3.24 0.783 3.5 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 28.4 0.482 2.15 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 4.36 0.601 2.69 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 26.0 0.64 2.86 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 -11.6 0.742 3.15 2 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -37.1 0.91 4.07 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 5.29 0.988 4.42 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 9edc1e2b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,38 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 11.0 0.13 0.583 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -11.0 0.108 0.484 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 3.1 0.191 0.854 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 8.87 0.17 0.762 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 52.8 0.622 2.33 6 -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056 -1.5 0.959 4.29 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -3.47 0.163 0.728 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -3.89 0.163 0.728 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -2.38 0.305 1.36 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 -0.15 0.152 0.681 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 7.32 0.113 0.506 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -6.13 0.166 0.74 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 50.7 0.918 3.67 4 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 9.25 0.189 0.844 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 7.72 0.189 0.844 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 -1.8 0.17 0.762 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 -5.88 0.189 0.844 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -15.6 0.306 1.37 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 2.6 0.191 0.854 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -3.94 0.193 0.864 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 -18.2 0.483 2.16 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 -6.43 0.258 1.15 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -32.4 0.748 3.08 3 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 6.11 1.14 4.12 7 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 39.4 0.595 2.66 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 51.2 0.985 3.81 5 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666 8.47 0.778 3.48 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -73.8 1.12 4.88 1 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 -1.69 1.75 6.98 4 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678 -68.5 1.38 6.17 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 2.1 1.04 4.66 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 28.4 0.202 0.906 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 4.29 0.27 1.21 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 26.2 0.481 2.15 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 -12.1 0.644 2.88 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -37.0 0.49 2.19 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 5.46 0.624 2.72 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/no-vs/2fs/missing.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/no-vs/2fs/missing.py deleted file mode 100644 index e2da82c2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/no-vs/2fs/missing.py +++ /dev/null @@ -1,19 +0,0 @@ -import os -import glob - -cwd = os.getcwd() -missing = [] -for leg in ['protein', 'water']: - f = glob.glob('*{}.txt'.format(leg))[0] - with open(f, 'r') as infile: - for line in infile: - frg = line.split() - if frg[0] == 'FEP': - continue - if int(frg[3]) > 2: - missing.append(frg[0][4:]) - -missing = list(set(missing)) - -for i in missing: - print(i.replace('_', ' ')) diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index b3a81f88..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 25.90 0.57 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -7.16 0.09 0 -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1084143 -5.34 0.88 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -4.23 0.26 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 4.38 0.43 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 10.91 0.30 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 27.85 0.32 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078691 -12.80 0.19 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -37.03 0.50 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1093088 1.53 0.37 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1078774 5.41 0.55 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 1.51 0.49 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 6.94 0.32 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 -7.09 0.34 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1084143 -3.68 0.37 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 1.66 0.32 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1085692 12.26 0.52 1 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 -1.41 0.46 0 -FEP_CHEMBL1082248_CHEMBL1082249 -29.50 0.55 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -72.46 0.92 1 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -15.79 0.40 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 8.43 0.50 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -2.30 0.28 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -4.00 0.34 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 4.59 0.33 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -34.07 0.99 2 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078774 -7.43 0.57 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 -5.88 0.40 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1084935 18.72 0.95 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -11.12 0.18 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1093087 -11.25 0.52 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084431 -12.87 0.40 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 58.08 0.47 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666 81.98 0.71 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 50.39 1.33 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084431 nan nan 3 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 7.91 1.80 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 55.72 0.60 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 40.28 0.45 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 10.09 0.66 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1089393 1.32 0.24 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084431 65.35 0.64 0 -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1096002 49.05 1.17 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1077204 -21.58 0.32 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084676 48.90 0.34 0 -FEP_CHEMBL1077227_CHEMBL1083836 5.55 0.50 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1085895 -56.47 0.61 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084431 -5.15 1.62 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678 -64.58 2.26 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index d394c374..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 26.05 0.34 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -6.63 0.07 0 -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1084143 -5.80 0.53 1 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -3.94 0.12 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 4.46 0.17 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 9.27 0.10 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 28.43 0.11 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078691 -10.69 0.07 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -36.89 0.38 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1093088 1.52 0.74 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1078774 2.84 0.23 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 -0.01 0.14 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 7.22 0.08 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 -6.45 0.15 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1084143 -2.89 0.78 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 2.58 0.14 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1085692 11.71 0.48 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 -2.55 0.11 0 -FEP_CHEMBL1082248_CHEMBL1082249 -30.27 0.32 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -73.25 0.85 1 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -16.12 0.19 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 6.85 0.10 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -3.32 0.12 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -3.87 0.18 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 3.16 0.13 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -31.71 0.59 1 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078774 -8.74 0.11 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 -6.82 0.16 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1084935 18.33 0.31 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -11.04 0.06 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1093087 -8.13 0.47 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 39.60 0.45 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 10.83 0.37 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666 80.84 0.85 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084431 68.51 0.51 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 48.68 0.68 3 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 49.92 0.80 1 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 -2.36 1.05 3 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 55.12 0.56 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084431 -12.15 0.53 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1089393 0.45 0.11 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084676 48.35 0.30 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1077204 -22.57 0.63 0 -FEP_CHEMBL1077227_CHEMBL1083836 6.45 0.09 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084431 68.03 0.82 0 -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1096002 49.91 0.78 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1085895 -55.56 0.29 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084431 -1.17 1.33 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678 -67.23 1.19 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5_alternative/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5_alternative/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e622f7f4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5_alternative/no-vs/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP_CHEMBL1082248-CHEMBL1096002 water/ -FEP_CHEMBL1082248-CHEMBL1096002 protein/ -FEP_CHEMBL1085666-CHEMBL1077204 protein/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5_alternative/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5_alternative/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 1ca9d543..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5_alternative/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,38 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL1082249-CHEMBL1096002 26.34 0.31 0 -FEP_CHEMBL1088740-CHEMBL1089393 -7.20 0.13 0 -FEP_CHEMBL1096003-CHEMBL1084143 -5.66 0.62 0 -FEP_CHEMBL1093088-CHEMBL1085895 -49.93 1.29 2 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1078998 -4.52 0.16 0 -FEP_CHEMBL1083517-CHEMBL1086409 7.81 0.19 0 -FEP_CHEMBL1077204-CHEMBL1084676 28.31 0.32 0 -FEP_CHEMBL1085666-CHEMBL1093087 1.96 1.30 7 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1078691 -8.55 0.14 0 -FEP_CHEMBL1085692-CHEMBL1096003 -36.60 0.60 0 -FEP_CHEMBL1085666-CHEMBL1084677 -46.73 0.31 7 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1093088 2.49 0.38 0 -FEP_CHEMBL1078691-CHEMBL1078774 4.89 0.29 0 -FEP_CHEMBL1078691-CHEMBL1084115 -1.67 0.15 0 -FEP_CHEMBL1084115-CHEMBL1078998 5.31 0.14 0 -FEP_CHEMBL1083836-CHEMBL1082248 -6.99 0.44 0 -FEP_CHEMBL1093087-CHEMBL1084431 -9.72 0.03 8 -FEP_CHEMBL1084677-CHEMBL1084143 -2.81 0.48 0 -FEP_CHEMBL1086410-CHEMBL1083836 2.35 0.20 0 -FEP_CHEMBL1082249-CHEMBL1085692 13.25 0.83 1 -FEP_CHEMBL1086409-CHEMBL1086410 -3.97 0.47 0 -FEP_CHEMBL1085666-CHEMBL1084676 -3.92 1.09 6 -FEP_CHEMBL1082248-CHEMBL1082249 -30.68 0.33 0 -FEP_CHEMBL1093087-CHEMBL1084678 -73.24 0.93 0 -FEP_CHEMBL1086409-CHEMBL1085666 -18.15 0.26 0 -FEP_CHEMBL1083517-CHEMBL1086410 3.33 0.60 0 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1089393 -3.28 0.27 0 -FEP_CHEMBL1086410-CHEMBL1077227 -4.41 0.30 0 -FEP_CHEMBL1085666-CHEMBL1084431 nan nan 3 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1088740 3.73 0.22 1 -FEP_CHEMBL1084935-CHEMBL1085666 -35.02 0.86 3 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1078774 -2.86 0.28 0 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1085895 -50.79 1.18 6 -FEP_CHEMBL1086409-CHEMBL1077227 -8.94 0.80 0 -FEP_CHEMBL1085666-CHEMBL1084678 -68.70 1.00 8 -FEP_CHEMBL1086410-CHEMBL1084935 20.95 0.64 0 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1084115 -10.16 0.17 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5_alternative/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5_alternative/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index e950466b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/eg5_alternative/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,39 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL1082249-CHEMBL1096002 25.89 0.33 0 -FEP_CHEMBL1088740-CHEMBL1089393 -6.57 0.06 0 -FEP_CHEMBL1096003-CHEMBL1084143 -5.74 0.24 0 -FEP_CHEMBL1093088-CHEMBL1085895 -50.00 0.60 3 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1078998 -3.97 0.17 0 -FEP_CHEMBL1083517-CHEMBL1086409 9.25 0.08 0 -FEP_CHEMBL1077204-CHEMBL1084676 28.24 0.14 0 -FEP_CHEMBL1085666-CHEMBL1093087 -1.39 0.94 3 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1078691 -10.75 0.07 0 -FEP_CHEMBL1085692-CHEMBL1096003 -37.30 0.38 0 -FEP_CHEMBL1085666-CHEMBL1084677 -46.02 1.12 1 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1093088 1.01 0.22 0 -FEP_CHEMBL1078691-CHEMBL1078774 3.28 0.29 0 -FEP_CHEMBL1078691-CHEMBL1084115 -0.25 0.09 0 -FEP_CHEMBL1084115-CHEMBL1078998 7.21 0.15 0 -FEP_CHEMBL1083836-CHEMBL1082248 -6.53 0.18 0 -FEP_CHEMBL1093087-CHEMBL1084431 2.28 0.69 3 -FEP_CHEMBL1084677-CHEMBL1084143 -3.54 0.28 1 -FEP_CHEMBL1086410-CHEMBL1083836 2.61 0.08 0 -FEP_CHEMBL1082249-CHEMBL1085692 12.61 0.64 0 -FEP_CHEMBL1086409-CHEMBL1086410 -2.65 0.12 0 -FEP_CHEMBL1085666-CHEMBL1084676 -4.63 0.94 8 -FEP_CHEMBL1082248-CHEMBL1082249 -30.66 0.49 0 -FEP_CHEMBL1093087-CHEMBL1084678 -74.04 1.35 0 -FEP_CHEMBL1086409-CHEMBL1085666 -16.07 0.11 0 -FEP_CHEMBL1083517-CHEMBL1086410 6.63 0.17 0 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1089393 -3.64 0.21 0 -FEP_CHEMBL1086410-CHEMBL1077227 -3.67 0.12 0 -FEP_CHEMBL1085666-CHEMBL1084431 nan nan 5 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1088740 3.22 0.07 0 -FEP_CHEMBL1084935-CHEMBL1085666 -30.66 0.66 1 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1078774 -8.49 0.17 0 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1085895 -50.14 0.49 4 -FEP_CHEMBL1086409-CHEMBL1077227 -6.48 0.17 0 -FEP_CHEMBL1085666-CHEMBL1084678 -72.73 0.70 6 -FEP_CHEMBL1086410-CHEMBL1084935 18.34 0.31 0 -FEP_CHEMBL1085666-CHEMBL1077204 -33.64 nan 9 -FEP_CHEMBL1089056-CHEMBL1084115 -11.16 0.07 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index d615ec41..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/benchmark/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -FEP_254_251 protein/ -FEP_290_57 protein/ -FEP_254_251 water/ -FEP_290_57 water/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 5302b482..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,84 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_54_50 15.02 0.32 1.00 0 -FEP_7a_1 -4.15 0.16 0.51 0 -FEP_42_43 8.43 0.15 0.48 0 -FEP_156_31 48.01 0.30 0.96 0 -FEP_290_235 -22.49 0.19 0.60 0 -FEP_1_84 13.27 0.30 0.96 0 -FEP_35_41 -4.78 0.18 0.57 0 -FEP_237_155 -4.05 0.37 1.16 0 -FEP_338_336 3.54 0.12 0.37 0 -FEP_163_164 6.50 0.20 0.62 0 -FEP_266_224 -4.46 0.34 1.08 0 -FEP_256_67 49.98 0.15 0.49 0 -FEP_163_165 2.39 0.14 0.45 0 -FEP_155_156 8.48 0.21 0.65 0 -FEP_235_167 4.33 0.42 1.32 1 -FEP_7b_1 -11.47 0.56 1.77 0 -FEP_290_164 -30.62 0.46 1.46 0 -FEP_266_235 -28.59 0.15 0.48 0 -FEP_235_224 25.85 0.34 1.08 0 -FEP_30_42 -13.68 0.46 1.47 0 -FEP_155_30 24.63 0.21 0.68 0 -FEP_252_155 41.60 0.35 1.11 0 -FEP_252_336 7.70 0.13 0.43 0 -FEP_289_336 -11.62 0.14 0.44 0 -FEP_155_1 3.61 0.17 0.53 0 -FEP_252_256 4.99 0.16 0.51 0 -FEP_42_35 8.99 0.25 0.79 1 -FEP_124_54 -49.13 0.24 0.75 0 -FEP_155_61 -2.96 0.23 0.72 0 -FEP_163_234 0.44 0.10 0.32 1 -FEP_15_25 -11.39 0.14 0.43 1 -FEP_167_234 -16.88 0.20 0.65 0 -FEP_254_163 -10.39 0.32 1.00 0 -FEP_7b_41 -3.32 0.32 1.02 0 -FEP_163_252 -11.58 0.22 0.69 2 -FEP_206_163 -12.18 0.32 1.02 1 -FEP_7a_41 4.81 0.20 0.62 0 -FEP_1_61 -6.27 0.14 0.45 0 -FEP_237_163 -32.19 0.41 1.31 0 -FEP_215_206 -3.41 0.18 0.56 1 -FEP_338_252 -4.03 0.09 0.28 0 -FEP_23_1 5.61 0.18 0.58 0 -FEP_155_23 -1.36 0.22 0.70 1 -FEP_156_1 -5.22 0.17 0.53 0 -FEP_215_167 3.45 0.33 1.04 2 -FEP_215_252 -26.44 0.46 1.47 0 -FEP_42_41 3.62 0.11 0.35 1 -FEP_251_256 -22.00 0.52 1.65 0 -FEP_84_41 -3.58 0.20 0.63 0 -FEP_227_231 -37.54 0.30 0.96 1 -FEP_15_252 -35.71 0.40 1.27 1 -FEP_124_41 -35.61 0.28 0.87 0 -FEP_41_54 -13.18 0.23 0.74 0 -FEP_35_50 -4.54 0.41 1.31 0 -FEP_43_31 38.10 0.38 1.19 0 -FEP_289_231 -1.16 0.16 0.50 0 -FEP_290_165 -33.49 0.42 1.33 0 -FEP_57_155 -11.42 0.13 0.41 0 -FEP_227_57 -2.13 0.12 0.36 0 -FEP_15_163 -23.54 0.19 0.59 0 -FEP_252_67 55.15 0.17 0.53 0 -FEP_237_252 -43.86 0.34 1.06 0 -FEP_290_252 -47.67 0.31 0.97 0 -FEP_237_25 -20.10 0.37 1.17 0 -FEP_290_227 7.51 0.20 0.62 0 -FEP_237_215 -19.33 0.25 0.80 1 -FEP_254_251 4.55 0.21 0.65 0 -FEP_57_290 -4.49 0.11 0.34 0 -FEP_163_231 -4.49 0.11 0.34 0 -FEP_35_54 -18.18 0.45 1.41 0 -FEP_163_54 28.82 0.18 0.58 0 -FEP_237_235 -19.21 0.38 1.20 0 -FEP_155_42 9.51 0.14 0.45 0 -FEP_35_54 -18.18 0.45 1.41 0 -FEP_163_54 28.82 0.18 0.58 0 -FEP_237_235 -19.21 0.38 1.20 0 -FEP_155_42 9.51 0.14 0.45 0 -FEP_290_57 4.57 0.08 0.25 0 -FEP_206_252 -22.90 0.51 1.62 0 -FEP_237_164 -25.63 0.30 0.95 0 -FEP_164_231 -0.94 0.47 1.48 0 -FEP_254_252 -21.86 0.44 1.40 0 -FEP_252_164 18.08 0.10 0.32 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 4363d994..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,85 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_338_336 4.16 0.07 0.21 0 -FEP_215_252 -21.95 0.11 0.36 0 -FEP_124_54 -48.72 0.15 0.48 0 -FEP_7a_41 7.46 0.06 0.20 0 -FEP_30_42 -13.89 0.12 0.39 0 -FEP_290_164 -35.74 0.09 0.29 0 -FEP_290_252 -46.60 0.14 0.43 0 -FEP_227_231 -39.51 0.10 0.32 0 -FEP_42_35 9.97 0.09 0.28 0 -FEP_84_41 -0.35 0.26 0.82 0 -FEP_252_256 4.49 0.08 0.24 0 -FEP_235_224 20.25 0.10 0.31 0 -FEP_289_231 -2.16 0.14 0.43 0 -FEP_338_252 -3.10 0.08 0.26 0 -FEP_235_167 3.43 0.12 0.39 0 -FEP_215_167 4.47 0.07 0.21 0 -FEP_227_57 -3.13 0.09 0.29 0 -FEP_155_156 9.14 0.10 0.33 0 -FEP_163_234 0.83 0.05 0.17 0 -FEP_266_224 -10.85 0.23 0.71 0 -FEP_237_25 -14.77 0.21 0.66 0 -FEP_42_41 4.90 0.12 0.38 0 -FEP_237_163 -28.75 0.09 0.27 0 -FEP_15_252 -33.99 0.11 0.34 0 -FEP_43_31 36.43 0.10 0.32 0 -FEP_23_1 8.20 0.11 0.36 0 -FEP_237_252 -36.68 0.17 0.54 0 -FEP_15_163 -25.79 0.09 0.29 0 -FEP_215_206 -5.02 0.15 0.47 0 -FEP_7b_1 -6.32 0.09 0.28 0 -FEP_167_234 -17.32 0.11 0.34 0 -FEP_156_31 47.43 0.11 0.34 0 -FEP_42_43 9.01 0.09 0.28 0 -FEP_7a_1 -3.48 0.07 0.22 0 -FEP_124_41 -32.79 0.17 0.54 0 -FEP_1_61 -8.26 0.06 0.20 0 -FEP_163_165 1.29 0.13 0.40 0 -FEP_155_30 25.16 0.09 0.30 0 -FEP_155_61 -3.45 0.14 0.45 0 -FEP_290_165 -37.03 0.05 0.16 0 -FEP_156_1 -4.34 0.15 0.48 0 -FEP_252_336 7.53 0.09 0.28 0 -FEP_7b_41 4.23 0.29 0.93 0 -FEP_35_41 -5.66 0.09 0.27 0 -FEP_266_235 -30.61 0.15 0.48 0 -FEP_237_155 0.60 0.15 0.49 0 -FEP_256_67 51.79 0.18 0.58 0 -FEP_163_252 -8.36 0.08 0.24 0 -FEP_54_50 13.44 0.18 0.57 0 -FEP_290_235 -23.58 0.14 0.43 0 -FEP_1_84 11.64 0.09 0.28 0 -FEP_41_54 -16.00 0.15 0.48 0 -FEP_252_67 56.55 0.12 0.37 0 -FEP_206_163 -8.76 0.13 0.41 0 -FEP_252_155 38.04 0.12 0.39 1 -FEP_251_256 -17.59 0.28 0.87 0 -FEP_155_1 4.72 0.13 0.40 0 -FEP_15_25 -11.58 0.13 0.42 0 -FEP_155_23 -3.41 0.11 0.35 0 -FEP_163_164 2.97 0.12 0.37 0 -FEP_289_336 -8.70 0.13 0.42 0 -FEP_254_163 -10.03 0.30 0.95 0 -FEP_57_155 -11.90 0.06 0.20 0 -FEP_35_50 -8.25 0.20 0.63 0 -FEP_290_227 6.54 0.09 0.29 0 -FEP_237_215 -15.07 0.10 0.31 0 -FEP_254_251 4.33 0.11 0.35 0 -FEP_57_290 -3.37 0.09 0.28 0 -FEP_163_231 -4.49 0.11 0.34 0 -FEP_35_54 -21.41 0.17 0.55 0 -FEP_155_42 10.98 0.10 0.33 0 -FEP_163_54 29.92 0.16 0.51 0 -FEP_237_235 -14.14 0.13 0.42 0 -FEP_290_57 3.47 0.13 0.42 0 -FEP_35_54 -21.41 0.17 0.55 0 -FEP_155_42 10.98 0.10 0.33 0 -FEP_163_54 29.92 0.16 0.51 0 -FEP_290_57 3.47 0.13 0.42 0 -FEP_237_235 -14.14 0.13 0.42 0 -FEP_237_164 -26.13 0.09 0.28 0 -FEP_164_231 2.79 0.14 0.44 0 -FEP_206_252 -17.16 0.18 0.57 0 -FEP_252_164 10.55 0.32 1.02 0 -FEP_254_252 -18.17 0.27 0.85 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index ae34803e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,64 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_215_206 -3.48 0.262 1.14 1 -FEP_215_252 -26.3 0.506 2.26 0 -FEP_215_167 3.6 0.408 1.73 2 -FEP_206_163 -11.3 0.489 2.13 1 -FEP_163_252 -11.9 0.311 1.32 2 -FEP_254_163 -10.4 0.33 1.48 0 -FEP_163_234 0.545 0.206 0.898 1 -FEP_163_165 2.56 0.213 0.951 0 -FEP_15_163 -23.4 0.242 1.08 0 -FEP_163_164 6.73 0.32 1.43 0 -FEP_237_163 -32.8 0.573 2.56 0 -FEP_252_256 4.88 0.213 0.951 0 -FEP_237_252 -44.3 0.38 1.7 0 -FEP_15_252 -35.7 0.545 2.38 1 -FEP_252_67 54.9 0.362 1.62 0 -FEP_338_252 -4.11 0.192 0.86 0 -FEP_254_251 4.49 0.258 1.15 0 -FEP_251_256 -22.2 0.611 2.73 0 -FEP_256_67 50.3 0.25 1.12 0 -FEP_167_234 -16.9 0.224 1.0 0 -FEP_237_155 -4.0 0.538 2.4 0 -FEP_237_25 -21.0 0.538 2.4 0 -FEP_15_25 -11.4 0.236 1.03 1 -FEP_235_167 4.3 0.499 2.18 1 -FEP_290_165 -33.5 0.645 2.89 0 -FEP_290_164 -29.9 1.03 4.6 0 -FEP_290_235 -22.8 0.255 1.14 0 -FEP_290_57 4.45 0.156 0.696 0 -FEP_155_156 8.54 0.242 1.08 0 -FEP_57_155 -11.2 0.273 1.22 0 -FEP_155_1 3.67 0.208 0.931 0 -FEP_155_61 -2.71 0.269 1.2 0 -FEP_155_23 -1.59 0.238 1.04 1 -FEP_155_30 24.4 0.636 2.84 0 -FEP_156_31 47.9 0.469 2.1 0 -FEP_156_1 -5.09 0.202 0.906 0 -FEP_227_57 -2.25 0.144 0.645 0 -FEP_1_61 -6.21 0.178 0.796 0 -FEP_1_84 13.2 0.476 2.13 0 -FEP_23_1 5.72 0.284 1.27 0 -FEP_7b_1 -12.0 0.677 3.03 0 -FEP_7a_1 -4.21 0.272 1.22 0 -FEP_227_231 -37.1 0.5 2.18 1 -FEP_289_231 -1.08 0.219 0.981 0 -FEP_289_336 -11.9 0.228 1.02 0 -FEP_338_336 3.49 0.225 1.0 0 -FEP_7b_41 -3.23 0.544 2.43 0 -FEP_7a_41 4.35 0.276 1.23 0 -FEP_266_235 -28.8 0.283 1.27 0 -FEP_235_224 25.7 0.416 1.86 0 -FEP_266_224 -4.69 0.453 2.03 0 -FEP_30_42 -14.4 0.549 2.46 0 -FEP_42_43 8.52 0.212 0.949 0 -FEP_42_41 3.71 0.17 0.742 1 -FEP_42_35 8.96 0.302 1.32 1 -FEP_43_31 38.2 0.425 1.9 0 -FEP_35_41 -4.89 0.3 1.34 0 -FEP_124_41 -36.0 0.333 1.49 0 -FEP_84_41 -3.98 0.312 1.4 0 -FEP_41_54 -13.9 0.444 1.99 0 -FEP_35_50 -4.12 0.514 2.3 0 -FEP_124_54 -50.0 0.628 2.81 0 -FEP_54_50 15.5 0.383 1.71 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index cfa00852..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,64 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_215_206 -5.17 0.192 0.859 0 -FEP_215_252 -22.3 0.149 0.665 0 -FEP_215_167 4.5 0.114 0.51 0 -FEP_206_163 -8.73 0.206 0.922 0 -FEP_163_252 -8.71 0.136 0.608 0 -FEP_254_163 -10.2 0.372 1.66 0 -FEP_163_234 0.915 0.121 0.54 0 -FEP_163_165 1.36 0.153 0.683 0 -FEP_15_163 -25.5 0.12 0.539 0 -FEP_163_164 2.94 0.17 0.759 0 -FEP_237_163 -28.8 0.158 0.707 0 -FEP_252_256 4.34 0.12 0.539 0 -FEP_237_252 -37.0 0.286 1.28 0 -FEP_15_252 -34.2 0.142 0.636 0 -FEP_252_67 56.4 0.225 0.98 1 -FEP_338_252 -3.1 0.128 0.573 0 -FEP_254_251 4.31 0.142 0.636 0 -FEP_251_256 -18.2 0.396 1.77 0 -FEP_256_67 52.1 0.241 1.08 0 -FEP_167_234 -17.3 0.136 0.608 0 -FEP_237_155 0.725 0.175 0.782 0 -FEP_237_25 -15.0 0.264 1.18 0 -FEP_15_25 -11.7 0.184 0.822 0 -FEP_235_167 3.54 0.139 0.621 0 -FEP_290_165 -37.0 0.0781 0.349 0 -FEP_290_164 -35.6 0.15 0.671 0 -FEP_290_235 -23.7 0.191 0.854 0 -FEP_290_57 3.37 0.114 0.51 0 -FEP_155_156 9.04 0.149 0.665 0 -FEP_57_155 -12.1 0.1 0.447 0 -FEP_155_1 4.64 0.158 0.707 0 -FEP_155_61 -3.5 0.184 0.825 0 -FEP_155_23 -3.59 0.186 0.832 0 -FEP_155_30 25.2 0.12 0.539 0 -FEP_156_31 47.4 0.136 0.608 0 -FEP_156_1 -4.44 0.227 1.01 0 -FEP_227_57 -3.07 0.135 0.602 0 -FEP_1_61 -8.22 0.125 0.56 0 -FEP_1_84 11.9 0.12 0.539 0 -FEP_23_1 8.21 0.149 0.665 0 -FEP_7b_1 -6.38 0.166 0.744 0 -FEP_7a_1 -3.45 0.106 0.475 0 -FEP_227_231 -39.3 0.117 0.508 1 -FEP_289_231 -2.09 0.184 0.825 0 -FEP_289_336 -9.0 0.164 0.715 1 -FEP_338_336 4.2 0.106 0.475 0 -FEP_7b_41 3.78 0.322 1.44 0 -FEP_7a_41 6.92 0.0849 0.379 0 -FEP_266_235 -30.7 0.205 0.918 0 -FEP_235_224 20.7 0.197 0.882 0 -FEP_266_224 -10.5 0.292 1.31 0 -FEP_30_42 -14.1 0.216 0.967 0 -FEP_42_43 8.93 0.127 0.555 1 -FEP_42_41 4.87 0.163 0.728 0 -FEP_42_35 10.0 0.127 0.569 0 -FEP_43_31 36.6 0.135 0.602 0 -FEP_35_41 -5.64 0.108 0.484 0 -FEP_124_41 -33.2 0.197 0.882 0 -FEP_84_41 -0.945 0.272 1.22 0 -FEP_41_54 -16.1 0.242 1.06 1 -FEP_35_50 -7.88 0.224 1.0 0 -FEP_124_54 -49.1 0.18 0.806 0 -FEP_54_50 13.9 0.262 1.17 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 057ba0b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,69 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30_42 -15.10 0.30 0 -FEP_57_61 -14.22 0.18 0 -FEP_251_256 -22.34 0.32 0 -FEP_156_1 -4.96 0.11 0 -FEP_42_43 8.62 0.15 0 -FEP_7b_41 -3.15 0.44 0 -FEP_215_167 3.75 0.24 0 -FEP_235_224 25.63 0.24 0 -FEP_1_23 -5.84 0.22 0 -FEP_252_338 4.18 0.17 0 -FEP_163_289 7.35 0.19 0 -FEP_1_7b 12.44 0.38 0 -FEP_54_124 50.82 0.58 0 -FEP_163_252 -12.25 0.22 0 -FEP_252_237 44.77 0.17 0 -FEP_155_1 3.73 0.12 0 -FEP_35_50 -3.69 0.31 0 -FEP_41_84 4.39 0.24 0 -FEP_237_25 -21.94 0.39 0 -FEP_215_252 -26.20 0.21 0 -FEP_41_54 -14.54 0.38 0 -FEP_227_231 -36.60 0.40 0 -FEP_256_67 50.55 0.20 0 -FEP_163_254 10.35 0.08 0 -FEP_163_234 0.65 0.18 0 -FEP_1_84 13.19 0.37 0 -FEP_206_163 -10.39 0.37 0 -FEP_252_256 4.78 0.14 0 -FEP_234_167 17.01 0.10 0 -FEP_41_124 36.32 0.18 0 -FEP_215_206 -3.54 0.19 0 -FEP_235_266 29.04 0.24 0 -FEP_237_155 -3.94 0.39 0 -FEP_289_336 -12.26 0.18 0 -FEP_155_156 8.59 0.12 0 -FEP_251_254 -4.43 0.15 0 -FEP_1_61 -6.14 0.11 0 -FEP_252_67 54.71 0.32 0 -FEP_155_30 24.16 0.60 0 -FEP_41_35 5.01 0.24 0 -FEP_290_235 -23.20 0.17 0 -FEP_155_57 11.04 0.24 0 -FEP_42_41 3.80 0.13 0 -FEP_336_338 -3.44 0.19 0 -FEP_1_7a 4.27 0.22 0 -FEP_224_266 4.92 0.30 0 -FEP_252_235 25.23 0.37 0 -FEP_43_31 38.30 0.19 0 -FEP_234_15 22.63 0.31 0 -FEP_163_15 23.16 0.15 0 -FEP_57_227 2.36 0.08 0 -FEP_15_25 -11.48 0.19 0 -FEP_206_164 -3.60 0.42 0 -FEP_231_289 1.01 0.15 0 -FEP_7a_41 3.89 0.19 0 -FEP_156_31 47.79 0.36 0 -FEP_155_23 -1.82 0.09 0 -FEP_163_165 2.73 0.16 0 -FEP_54_50 15.99 0.21 0 -FEP_165_290 33.53 0.49 0 -FEP_163_164 6.96 0.25 0 -FEP_15_252 -35.61 0.37 0 -FEP_164_290 29.20 0.92 0 -FEP_237_163 -33.36 0.40 0 -FEP_35_42 -8.92 0.17 0 -FEP_57_290 -4.40 0.11 0 -FEP_235_167 4.28 0.27 0 -FEP_61_155 2.47 0.14 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index d873bcfa..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,69 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30_42 -14.33 0.18 0 -FEP_57_61 -15.63 0.14 0 -FEP_251_256 -18.90 0.28 0 -FEP_156_1 -4.54 0.17 0 -FEP_42_43 8.85 0.09 1 -FEP_7b_41 3.32 0.14 0 -FEP_215_167 4.54 0.09 0 -FEP_235_224 21.09 0.17 0 -FEP_1_23 -8.23 0.10 0 -FEP_252_338 3.10 0.10 0 -FEP_163_289 7.78 0.12 0 -FEP_1_7b 6.44 0.14 0 -FEP_54_124 49.52 0.10 0 -FEP_163_252 -9.06 0.11 0 -FEP_252_237 37.36 0.23 0 -FEP_155_1 4.56 0.09 0 -FEP_35_50 -7.52 0.10 0 -FEP_41_84 1.54 0.08 0 -FEP_237_25 -15.20 0.16 0 -FEP_215_252 -22.70 0.10 0 -FEP_41_54 -16.28 0.19 1 -FEP_227_231 -39.15 0.06 1 -FEP_256_67 52.33 0.16 0 -FEP_163_254 10.35 0.22 0 -FEP_163_234 1.00 0.11 0 -FEP_1_84 12.20 0.08 0 -FEP_206_163 -8.71 0.16 0 -FEP_252_256 4.19 0.09 0 -FEP_234_167 17.27 0.08 0 -FEP_41_124 33.70 0.10 0 -FEP_215_206 -5.33 0.12 0 -FEP_235_266 30.86 0.14 0 -FEP_237_155 0.85 0.09 0 -FEP_289_336 -9.30 0.10 1 -FEP_155_156 8.93 0.11 0 -FEP_251_254 -4.29 0.09 0 -FEP_1_61 -8.19 0.11 0 -FEP_252_67 56.31 0.19 1 -FEP_155_30 25.19 0.08 0 -FEP_41_35 5.62 0.06 0 -FEP_290_235 -23.87 0.13 0 -FEP_155_57 12.30 0.08 0 -FEP_42_41 4.84 0.11 0 -FEP_336_338 -4.23 0.08 0 -FEP_1_7a 3.42 0.08 0 -FEP_224_266 10.21 0.18 0 -FEP_252_235 23.47 0.06 0 -FEP_43_31 36.80 0.09 0 -FEP_234_15 24.18 0.08 0 -FEP_163_15 25.20 0.08 0 -FEP_57_227 3.01 0.10 0 -FEP_15_25 -11.84 0.13 0 -FEP_206_164 -6.21 0.20 0 -FEP_231_289 2.03 0.12 0 -FEP_7a_41 6.37 0.06 0 -FEP_156_31 47.44 0.08 0 -FEP_155_23 -3.77 0.15 0 -FEP_163_165 1.43 0.08 0 -FEP_54_50 14.33 0.19 0 -FEP_165_290 36.91 0.06 0 -FEP_163_164 2.90 0.12 0 -FEP_15_252 -34.34 0.09 0 -FEP_164_290 35.47 0.12 0 -FEP_57_290 -3.36 0.07 0 -FEP_235_167 3.65 0.07 0 -FEP_35_42 -10.11 0.09 0 -FEP_237_163 -28.85 0.13 0 -FEP_61_155 3.55 0.12 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index 6af51080..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/vs/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1 +0,0 @@ -FEP_7b-41 water/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 54518f02..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,60 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_252-338 30.00 0.13 0 -FEP_163-289 19.31 0.17 0 -FEP_1-7a 4.70 0.18 0 -FEP_252-67 12.99 0.52 0 -FEP_41-124 35.53 0.29 0 -FEP_156-1 -36.05 0.22 0 -FEP_252-237 32.92 0.27 0 -FEP_1-7b nan nan 10 -FEP_224-266 -2.50 0.23 0 -FEP_289-336 -8.28 0.16 1 -FEP_227-231 -35.40 0.29 0 -FEP_155-30 -4.02 0.31 0 -FEP_42-43 8.53 0.09 0 -FEP_155-1 -31.20 0.17 0 -FEP_163-164 1.91 0.23 0 -FEP_206-164 -5.03 0.37 0 -FEP_234-15 52.64 0.34 0 -FEP_54-124 50.68 0.54 2 -FEP_206-163 -8.77 0.18 0 -FEP_231-289 16.39 0.30 0 -FEP_290-235 5.54 0.14 0 -FEP_7a-41 4.92 0.28 0 -FEP_256-67 15.14 0.22 0 -FEP_54-50 15.84 0.40 4 -FEP_215-167 -21.25 0.26 0 -FEP_41-35 4.30 0.13 0 -FEP_35-50 -3.32 0.23 0 -FEP_163-252 -8.16 0.09 0 -FEP_155-57 14.52 0.18 0 -FEP_155-156 4.08 0.17 0 -FEP_163-15 19.90 0.39 0 -FEP_237-155 4.00 0.37 0 -FEP_30-42 -20.43 0.34 0 -FEP_336-338 10.38 0.23 0 -FEP_215-206 3.98 0.29 0 -FEP_41-84 3.11 0.47 2 -FEP_251-256 -12.42 0.19 0 -FEP_43-31 47.88 0.23 2 -FEP_235-224 0.93 0.36 0 -FEP_235-266 -4.25 0.40 0 -FEP_252-235 48.45 0.36 0 -FEP_1-84 13.42 0.28 0 -FEP_252-256 -1.20 0.20 0 -FEP_57-227 -6.50 0.08 1 -FEP_163-254 4.82 0.19 0 -FEP_163-234 -34.45 0.39 0 -FEP_155-23 -11.05 0.18 0 -FEP_215-252 -12.09 0.35 0 -FEP_234-167 16.86 0.23 0 -FEP_7b-41 nan nan 10 -FEP_156-31 27.05 0.35 0 -FEP_57-61 -52.66 0.56 0 -FEP_251-254 1.39 0.53 0 -FEP_1-23 19.19 0.17 0 -FEP_165-290 33.93 0.16 0 -FEP_42-41 4.99 0.15 0 -FEP_41-54 -14.70 0.36 0 -FEP_163-165 1.53 0.22 0 -FEP_1-61 -6.16 0.17 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 45547f8f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/hif2a/vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,59 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_235-224 -3.84 0.30 0 -FEP_251-256 -10.12 0.38 0 -FEP_252-67 11.33 0.22 3 -FEP_1-7b nan nan 10 -FEP_163-254 5.03 0.32 0 -FEP_54-124 49.53 0.13 0 -FEP_336-338 10.19 0.22 1 -FEP_1-84 12.05 0.09 0 -FEP_155-156 5.74 0.13 0 -FEP_42-41 5.42 0.11 0 -FEP_227-231 -34.48 0.34 0 -FEP_251-254 3.20 0.24 0 -FEP_252-237 28.22 0.43 0 -FEP_1-61 -7.97 0.08 0 -FEP_234-15 56.44 0.20 0 -FEP_206-163 -7.10 0.22 0 -FEP_234-167 17.41 0.08 0 -FEP_155-1 -32.44 0.21 0 -FEP_156-1 -39.58 0.25 0 -FEP_30-42 -20.82 0.11 0 -FEP_163-165 0.17 0.14 1 -FEP_235-266 -3.27 0.26 0 -FEP_57-227 -8.23 0.27 1 -FEP_163-15 19.85 0.21 0 -FEP_215-206 1.63 0.16 0 -FEP_215-167 -24.00 0.20 0 -FEP_41-35 6.14 0.07 2 -FEP_155-23 -12.30 0.18 0 -FEP_252-235 48.95 0.23 0 -FEP_163-252 -5.73 0.16 0 -FEP_290-235 7.67 0.44 1 -FEP_42-43 8.99 0.08 2 -FEP_163-234 -36.23 0.18 0 -FEP_41-84 1.56 0.10 0 -FEP_155-57 15.07 0.14 0 -FEP_231-289 15.14 0.11 0 -FEP_41-124 33.68 0.14 1 -FEP_41-54 -15.82 0.07 0 -FEP_289-336 -5.68 0.16 1 -FEP_35-50 -7.38 0.09 2 -FEP_165-290 34.93 0.10 0 -FEP_156-31 25.00 0.18 0 -FEP_1-7a 3.83 0.09 0 -FEP_163-164 1.00 0.27 0 -FEP_163-289 16.89 0.16 0 -FEP_252-338 27.89 0.20 0 -FEP_43-31 49.69 0.10 0 -FEP_57-61 -55.78 0.25 1 -FEP_224-266 0.19 0.24 0 -FEP_155-30 -6.45 0.13 0 -FEP_256-67 13.52 0.23 0 -FEP_252-256 -2.88 0.23 0 -FEP_1-23 20.09 0.21 0 -FEP_237-155 7.08 0.14 0 -FEP_215-252 -10.55 0.24 0 -FEP_54-50 14.25 0.19 0 -FEP_206-164 -5.13 0.20 0 -FEP_7a-41 6.07 0.10 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/BACE_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/BACE_MFP.txt deleted file mode 100644 index e59784d4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/BACE_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,53 +0,0 @@ -CAT-13g CAT-13f -CAT-13g CAT-13e -CAT-13f CAT-13e -CAT-13e CAT-13d -CAT-13e CAT-17a -CAT-17a CAT-13d -CAT-13d CAT-17h -CAT-17b CAT-13d -CAT-17c CAT-13d -CAT-17f CAT-13d -CAT-13h CAT-13d -CAT-13i CAT-13d -CAT-13d CAT-13a -CAT-17h CAT-17i -CAT-17h CAT-17g -CAT-17h CAT-17d -CAT-17i CAT-17g -CAT-17i CAT-17d -CAT-24 CAT-17i -CAT-17e CAT-17i -CAT-24 CAT-17f -CAT-17f CAT-17c -CAT-4n CAT-17f -CAT-17e CAT-17b -CAT-4n CAT-4m -CAT-4n CAT-4j -CAT-4m CAT-4p -CAT-4m CAT-4o -CAT-4m CAT-4j -CAT-4p CAT-4o -CAT-4j CAT-4k -CAT-4j CAT-4l -CAT-13k CAT-4j -CAT-4j CAT-4a -CAT-4k CAT-4a -CAT-4c CAT-4a -CAT-4d CAT-4a -CAT-4a CAT-4i -CAT-4b CAT-4a -CAT-4c CAT-4b -CAT-4d CAT-4b -CAT-4l CAT-4i -CAT-13k CAT-13m -CAT-13k CAT-13n -CAT-13k CAT-13j -CAT-13k CAT-13o -CAT-13m CAT-13n -CAT-13n CAT-13j -CAT-13n CAT-13o -CAT-13c CAT-13a -CAT-13h CAT-13a -CAT-13i CAT-13b -CAT-13c CAT-13b diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/CDK2_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/CDK2_MFP.txt deleted file mode 100644 index 1bf66b85..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/CDK2_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -28 30 -28 1h1s -29 28 -30 1h1s -29 30 -30 31 -32 1h1s -1h1s 1oiy -1h1s 1oiu -1oiu 1h1r -32 1oiu -31 26 -26 21 -26 1oi9 -21 22 -21 1h1r -1oi9 1h1q -1oiy 1oi9 -1h1r 1h1q -17 1h1q -1h1r 17 -20 1h1r -22 1h1r -20 17 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/JNK1_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/JNK1_MFP.txt deleted file mode 100644 index 9d70b76a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/JNK1_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,31 +0,0 @@ -18659-1 18658-1 -18658-1 18634-1 -18660-1 18658-1 -18660-1 18659-1 -18634-1 18631-1 -17124-1 18634-1 -18660-1 18634-1 -18634-1 18633-1 -18631-1 18628-1 -18631-1 18625-1 -18628-1 18625-1 -18635-1 18628-1 -18636-1 18628-1 -18635-1 18630-1 -18630-1 18627-1 -18630-1 18624-1 -18633-1 18630-1 -18627-1 18624-1 -18627-1 18626-1 -18629-1 18624-1 -18629-1 18626-1 -18632-1 18629-1 -18633-1 18632-1 -18637-1 17124-1 -18638-1 17124-1 -18639-1 17124-1 -17124-1 18636-1 -18652-1 17124-1 -18637-1 18638-1 -18637-1 18639-1 -18652-1 18638-1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/MCL1_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/MCL1_MFP.txt deleted file mode 100644 index 87e97811..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/MCL1_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,68 +0,0 @@ -32 27 -33 27 -30 27 -34 27 -43 27 -28 27 -37 27 -47 27 -46 27 -42 27 -39 27 -41 27 -41 40 -39 38 -40 38 -32 33 -35 33 -36 33 -37 33 -38 30 -31 30 -34 31 -43 47 -43 46 -36 35 -37 35 -52 35 -49 35 -53 37 -50 37 -37 67 -53 52 -58 53 -54 53 -53 63 -50 49 -42 28 -29 28 -48 28 -45 28 -44 28 -54 42 -42 48 -51 42 -44 42 -42 29 -42 45 -54 68 -54 64 -54 51 -64 23 -64 63 -64 68 -64 66 -62 23 -62 66 -66 65 -65 60 -65 61 -65 63 -63 60 -61 60 -58 63 -26 67 -68 26 -57 26 -58 56 -57 56 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/PTP1B_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/PTP1B_MFP.txt deleted file mode 100644 index 99c6678e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/PTP1B_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -23476 20670-2qbs- -23476 23474 -23330-2qbq- 23476 -23476 23475 -23479 23476 -23482 23476 -20670-2qbs- 23475 -20670-2qbs- 23477 -23477 23475 -23479 23475 -23330-2qbq- 23475 -23480 23479 -23482 23479 -23480 23482 -23483 23482 -20667-2qbp- 23482 -20667-2qbp- 23483 -20667-2qbp- 23486 -20667-2qbp- 23485 -20667-2qbp- 23484 -23486 23485 -23486 23484 -23474 20669-2qbr- -23469 20669-2qbr- -20669-2qbr- 23473 -23472 20669-2qbr- -23469 23471 -23471 23468 -23470 23471 -23471 23467 -23472 23471 -23471 23466 -23470 23468 -23467 23466 -23473 23467 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/Thrombin_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/Thrombin_MFP.txt deleted file mode 100644 index 87ece8d6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/Thrombin_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,16 +0,0 @@ -6e 6a -6e 6b -6a 6b -6a 1b -6b 7a -7a 3a -1b 5 -1b 1d -1b 1a -1b 1c -1d 5 -1a 5 -3a 5 -1c 5 -3b 5 -3b 3a diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/Tyk2_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/Tyk2_MFP.txt deleted file mode 100644 index 3486c782..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/Tyk2_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,24 +0,0 @@ -ejm-48 ejm-47 -ejm-47 ejm-46 -ejm-47 jmc-27 -ejm-48 ejm-46 -jmc-27 ejm-46 -ejm-45 ejm-46 -ejm-49 ejm-46 -jmc-27 jmc-28 -jmc-27 jmc-23 -jmc-30 jmc-27 -jmc-28 jmc-23 -jmc-30 jmc-28 -ejm-45 ejm-50 -ejm-50 ejm-42 -ejm-42 ejm-31 -ejm-54 ejm-42 -ejm-42 ejm-55 -ejm-55 ejm-31 -ejm-54 ejm-31 -ejm-43 ejm-31 -ejm-44 ejm-31 -ejm-49 ejm-31 -ejm-43 ejm-55 -ejm-44 ejm-55 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/cdk8_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/cdk8_MFP.txt deleted file mode 100644 index cce8cadb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/cdk8_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,49 +0,0 @@ -41 37 -40 37 -39 37 -37 35 -34 37 -37 32 -30 37 -31 37 -36 37 -37 19 -38 37 -37 26 -41 40 -39 28 -30 35 -31 35 -36 35 -30 42 -30 13 -38 34 -38 43 -19 32 -33 19 -20 19 -19 24 -22 19 -19 17 -20 33 -29 33 -43 42 -43 44 -42 44 -42 45 -42 13 -45 44 -44 18 -18 17 -17 15 -27 24 -25 24 -27 25 -29 25 -28 26 -23 21 -21 22 -23 22 -15 14 -15 16 -16 14 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/cmet_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/cmet_MFP.txt deleted file mode 100644 index dc66de0b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/cmet_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,33 +0,0 @@ -CHEMBL3402745-200 CHEMBL3402744-300 -CHEMBL3402755-4200 CHEMBL3402745-200 -CHEMBL3402755-4200 CHEMBL3402744-300 -CHEMBL3402755-4200 CHEMBL3402753-200 -CHEMBL3402755-4200 CHEMBL3402752-30000 -CHEMBL3402753-200 CHEMBL3402754-40 -CHEMBL3402753-200 CHEMBL3402749-500 -CHEMBL3402753-200 CHEMBL3402750-400 -CHEMBL3402753-200 CHEMBL3402748-5300 -CHEMBL3402761-1 CHEMBL3402753-200 -CHEMBL3402754-40 CHEMBL3402750-400 -CHEMBL3402754-40 CHEMBL3402748-5300 -CHEMBL3402761-1 CHEMBL3402754-40 -CHEMBL3402754-40 CHEMBL3402747-3400 -CHEMBL3402749-500 CHEMBL3402747-3400 -CHEMBL3402750-400 CHEMBL3402751-2100 -CHEMBL3402752-30000 CHEMBL3402751-2100 -CHEMBL3402756-2-7 CHEMBL3402757-6-5 -CHEMBL3402756-2-7 CHEMBL3402758-10 -CHEMBL3402756-2-7 CHEMBL3402743-42 -CHEMBL3402759-5-7 CHEMBL3402757-6-5 -CHEMBL3402757-6-5 CHEMBL3402758-10 -CHEMBL3402760-1 CHEMBL3402757-6-5 -CHEMBL3402762-1 CHEMBL3402757-6-5 -CHEMBL3402759-5-7 CHEMBL3402758-10 -CHEMBL3402762-1 CHEMBL3402760-1 -CHEMBL3402743-42 CHEMBL3402764-90 -CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 CHEMBL3402743-42 -CHEMBL3402743-42 CHEMBL3402742-23 -CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 CHEMBL3402764-90 -CHEMBL3402741-400 CHEMBL3402742-23 -CHEMBL3402763-90 CHEMBL3402742-23 -CHEMBL3402741-400 CHEMBL3402763-90 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/eg5_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/eg5_MFP.txt deleted file mode 100644 index 926b1c22..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/eg5_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,40 +0,0 @@ -CHEMBL1078691 CHEMBL1089056 -CHEMBL1089056 CHEMBL1084115 -CHEMBL1089056 CHEMBL1088740 -CHEMBL1078774 CHEMBL1089056 -CHEMBL1085895 CHEMBL1089056 -CHEMBL1093088 CHEMBL1089056 -CHEMBL1089056 CHEMBL1089393 -CHEMBL1089056 CHEMBL1078998 -CHEMBL1078774 CHEMBL1078691 -CHEMBL1078691 CHEMBL1084115 -CHEMBL1084115 CHEMBL1078998 -CHEMBL1088740 CHEMBL1089393 -CHEMBL1085895 CHEMBL1093088 -CHEMBL1083517 CHEMBL1086409 -CHEMBL1083517 CHEMBL1086410 -CHEMBL1086409 CHEMBL1086410 -CHEMBL1086409 CHEMBL1077227 -CHEMBL1086409 CHEMBL1085666 -CHEMBL1086410 CHEMBL1083836 -CHEMBL1086410 CHEMBL1077227 -CHEMBL1086410 CHEMBL1085666 -CHEMBL1084677 CHEMBL1086410 -CHEMBL1084935 CHEMBL1086410 -CHEMBL1083836 CHEMBL1082248 -CHEMBL1084935 CHEMBL1085666 -CHEMBL1084676 CHEMBL1085666 -CHEMBL1077204 CHEMBL1085666 -CHEMBL1084677 CHEMBL1085666 -CHEMBL1093087 CHEMBL1085666 -CHEMBL1093087 CHEMBL1084678 -CHEMBL1084431 CHEMBL1093087 -CHEMBL1084431 CHEMBL1084678 -CHEMBL1084143 CHEMBL1084677 -CHEMBL1077204 CHEMBL1084676 -CHEMBL1085692 CHEMBL1082248 -CHEMBL1096002 CHEMBL1082248 -CHEMBL1082249 CHEMBL1096002 -CHEMBL1085692 CHEMBL1082249 -CHEMBL1085692 CHEMBL1096003 -CHEMBL1084143 CHEMBL1096003 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/hif2a_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/hif2a_MFP.txt deleted file mode 100644 index abddfd7d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/hif2a_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,66 +0,0 @@ -215 206 -215 252 -215 167 -237 215 -206 163 -163 252 -254 163 -163 234 -163 165 -15 163 -163 164 -237 163 -252 256 -237 252 -15 252 -290 252 -252 67 -338 252 -254 251 -251 256 -256 67 -167 234 -237 155 -237 25 -15 25 -235 167 -290 165 -290 164 -290 227 -290 235 -290 57 -155 156 -57 155 -155 1 -155 61 -155 23 -155 30 -156 31 -156 1 -227 57 -1 61 -1 84 -23 1 -7b 1 -7a 1 -227 231 -289 231 -289 336 -338 336 -7b 41 -7a 41 -266 235 -235 224 -266 224 -30 42 -42 43 -42 41 -42 35 -43 31 -35 41 -124 41 -84 41 -41 54 -35 50 -124 54 -54 50 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/p38_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/p38_MFP.txt deleted file mode 100644 index 0efb86d3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/p38_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,48 +0,0 @@ -p38a-2p p38a-2o -p38a-2o p38a-2l -p38a-2p p38a-2n -p38a-2s p38a-2n -p38a-2r p38a-2n -p38a-2n p38a-2t -p38a-2r p38a-2l -p38a-2t p38a-2l -p38a-2l p38a-3fln -p38a-2s p38a-2l -p38a-3fln p38a-2x -p38a-3fln p38a-2g -p38a-2ff p38a-3fln -p38a-3fln p38a-2e -p38a-2m p38a-3fln -p38a-2gg p38a-3fln -p38a-2ee p38a-3fln -p38a-3fln p38a-2k -p38a-3fln p38a-2v -p38a-3fln p38a-2j -p38a-2x p38a-2g -p38a-2gg p38a-2ff -p38a-2ee p38a-2ff -p38a-2e p38a-3flz -p38a-2e p38a-2f -p38a-2f p38a-3flz -p38a-3flz p38a-2c -p38a-2q p38a-2m -p38a-2m p38a-2k -p38a-2u p38a-2m -p38a-2u p38a-2q -p38a-2j p38a-2i -p38a-2i p38a-2h -p38a-3fly p38a-2v -p38a-2y p38a-2v -p38a-2aa p38a-3fly -p38a-3flq p38a-3fly -p38a-3flw p38a-3fly -p38a-3fmh p38a-3fly -p38a-3fmk p38a-3fly -p38a-3flw p38a-2aa -p38a-2aa p38a-2z -p38a-3flq p38a-2bb -p38a-3fmh p38a-3flq -p38a-3fmk p38a-3flq -p38a-2bb p38a-2y -p38a-2y p38a-2z -p38a-2h p38a-2c diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/pfkfb3_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/pfkfb3_MFP.txt deleted file mode 100644 index c1bb6dc2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/pfkfb3_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,59 +0,0 @@ -53 52 -53 35 -52 35 -35 29 -54 35 -56 35 -35 33 -35 34 -57 35 -55 35 -37 35 -36 35 -35 49 -29 19 -29 26 -36 29 -54 57 -56 55 -33 24 -33 31 -24 19 -31 23 -31 30 -19 23 -30 19 -34 26 -37 34 -49 44 -49 39 -48 49 -47 49 -46 49 -67 49 -68 49 -62 49 -44 43 -47 44 -46 44 -42 43 -38 43 -43 39 -41 43 -42 39 -38 39 -48 20 -41 20 -67 68 -67 65 -65 64 -65 63 -69 65 -64 63 -63 62 -59 62 -70 62 -69 70 -59 58 -60 59 -60 58 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/shp2_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/shp2_MFP.txt deleted file mode 100644 index 626a9984..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/shp2_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -Example-9 Example-14 -Example-8 Example-9 -Example-8 Example-14 -Example-8 SHP099-1-Example-7 -11 SHP099-1-Example-7 -SHP099-1-Example-7 Example-29 -SHP099-1-Example-7 Example-27 -SHP099-1-Example-7 10 -Example-28 SHP099-1-Example-7 -SHP099-1-Example-7 Example-30 -11 10 -Example-23 Example-30 -Example-30 Example-1 -Example-1 Example-2 -Example-1 Example-3 -Example-5 Example-1 -7 Example-1 -Example-1 6 -Example-6 Example-1 -Example-2 Example-4 -Example-5 Example-6 -Example-23 Example-24 -Example-23 Example-22 -Example-25 Example-23 -Example-26 Example-23 -Example-24 Example-22 -Example-25 Example-24 -Example-26 Example-24 -7 6 -Example-28 Example-29 -SHP836-2 Example-27 -SHP836-2 4 -SHP836-2 3 -4 3 -Example-3 Example-4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/syk_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/syk_MFP.txt deleted file mode 100644 index 5387215f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/syk_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,66 +0,0 @@ -CHEMBL3265036 CHEMBL3265032 -CHEMBL3265033 CHEMBL3265032 -CHEMBL3265031 CHEMBL3265032 -CHEMBL3265032 CHEMBL3265034 -CHEMBL3265037 CHEMBL3265032 -CHEMBL3265032 CHEMBL3265030 -CHEMBL3265033 CHEMBL3265036 -CHEMBL3265036 CHEMBL3265034 -CHEMBL3265033 CHEMBL3265031 -CHEMBL3265031 CHEMBL3265030 -CHEMBL3265037 CHEMBL3265017 -CHEMBL3265017 CHEMBL3265021 -CHEMBL3265017 CHEMBL3265029 -CHEMBL3265017 CHEMBL3265019 -CHEMBL3265017 CHEMBL3265020 -CHEMBL3265022 CHEMBL3265017 -CHEMBL3265021 CHEMBL3265020 -CHEMBL3265023 CHEMBL3265021 -CHEMBL3265029 CHEMBL3265028 -CHEMBL3265029 CHEMBL3265027 -CHEMBL3265035 CHEMBL3265029 -CHEMBL3265028 CHEMBL3265027 -CHEMBL3265035 CHEMBL3265027 -CHEMBL3265020 CHEMBL3265016 -CHEMBL3265010 CHEMBL3265020 -CHEMBL3265016 CHEMBL3265018 -CHEMBL3265024 CHEMBL3265016 -CHEMBL3265026 CHEMBL3265016 -CHEMBL3265018 CHEMBL3265019 -CHEMBL3265010 CHEMBL3265019 -CHEMBL3265023 CHEMBL3265022 -CHEMBL3265024 CHEMBL3265026 -CHEMBL3265025 CHEMBL3265026 -CHEMBL3265024 CHEMBL3265025 -CHEMBL3265010 CHEMBL3265009 -CHEMBL3265010 CHEMBL3265014 -CHEMBL3265010 CHEMBL3265008 -CHEMBL3265010 CHEMBL3259820 -CHEMBL3265010 CHEMBL3265005 -CHEMBL3265009 CHEMBL3265013 -CHEMBL3265014 CHEMBL3265013 -CHEMBL3265014 CHEMBL3265012 -CHEMBL3265008 CHEMBL3265012 -CHEMBL3265015 CHEMBL3259820 -CHEMBL3265011 CHEMBL3259820 -CHEMBL3259820 CHEMBL3265005 -CHEMBL3265006 CHEMBL3265005 -CHEMBL3264996 CHEMBL3265005 -CHEMBL3264999 CHEMBL3265005 -CHEMBL3264996 CHEMBL3264999 -CHEMBL3265002 CHEMBL3264999 -CHEMBL3264999 CHEMBL3265006 -CHEMBL3265002 CHEMBL3264996 -CHEMBL3265004 CHEMBL3264996 -CHEMBL3265003 CHEMBL3264996 -CHEMBL3265004 CHEMBL3265003 -CHEMBL3265015 CHEMBL3265011 -CHEMBL3264995 CHEMBL3264997 -CHEMBL3264998 CHEMBL3264995 -CHEMBL3265000 CHEMBL3264995 -CHEMBL3265001 CHEMBL3264995 -CHEMBL3264995 CHEMBL3264994 -CHEMBL3264998 CHEMBL3264997 -CHEMBL3264997 CHEMBL3264994 -CHEMBL3265000 CHEMBL3264998 -CHEMBL3265001 CHEMBL3264998 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/tnks2_MFP.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/tnks2_MFP.txt deleted file mode 100644 index a82fc117..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/maps/tnks2_MFP.txt +++ /dev/null @@ -1,34 +0,0 @@ -5m 5k -5o 5m -5k 5f -5k 5d -5f 5i -5f 5g -5h 5f -5i 5g -5h 5i -5g 5c -5d 3b -5d 5e -5d 7 -3b 7 -5p 3b -5e 5a -5o 5n -5p 5n -5l 5j -5l 5b -5b 5c -5j 5b -5b 5a -5a 3a -3a 1a -3a 1b -1b 1a -8f 8e -8f 8d -8f 8b -8e 8c -8e 8a -8d 8c -8b 8a diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/merge_results.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/merge_results.py deleted file mode 100644 index f6e59a07..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/merge_results.py +++ /dev/null @@ -1,89 +0,0 @@ -import glob -import os -import numpy as np - -results = {'old':{}, 'new':{}} -target_edges = {} -for i, target in enumerate(['cdk8', 'cmet', 'eg5', 'hif2a', 'pfkfb3', 'shp2', 'syk', 'tnks2'], start=1): - target_edges[target] = [] - with open('maps/{}_MFP.txt'.format(target), 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - target_edges[target].append((line[0], line[1])) - - results['old'][target] = {} - for leg in ['protein', 'water']: - results['old'][target][leg] = {} - with open('{}/no-vs/2fs/{}.txt'.format(target, leg), 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - if line[0] == 'FEP': - continue - else: - try: - fep = line[0].split('FEP_')[1] - l1, l2 = fep.split('_')[0], fep.split('_')[1] - except: - fep = line[0].split('FEP_')[1] - l1, l2 = fep.split('-')[0], fep.split('-')[1] - if (l1, l2) in target_edges[target]: - fep = line[0] - if target == 'CDK2': - fep = line[0].replace('-', '_') - results['old'][target][leg][fep] = [float(line[1]), float(line[2]), int(line[3])] - elif (l2, l1) in target_edges[target]: - results['old'][target][leg]['FEP_{}_{}'.format(l2, l1)] = [-1*float(line[1]), float(line[2]), int(line[3])] - results['new'][target] = {} - for leg in ['protein', 'water']: - results['new'][target][leg] = {} - with open('{}/benchmark/2fs/{}.txt'.format(target, leg), 'r') as infile: - for line in infile: - line = line.split() - if line[0] == 'FEP': - continue - else: - try: - fep = line[0].split('FEP_')[1] - l1, l2 = fep.split('_')[0], fep.split('_')[1] - except: - fep = line[0].split('FEP_')[1] - l1, l2 = fep.split('-')[0], fep.split('-')[1] - if (l1, l2) in target_edges[target]: - results['new'][target][leg][line[0]] = [float(line[1]), float(line[2]), int(line[4])] - elif (l2, l1) in target_edges[target]: - results['new'][target][leg]['FEP_{}_{}'.format(l2, l1)] = [-1*float(line[1]), float(line[2]), int(line[4])] - -results['merged'] = {} -for i, target in enumerate(['cdk8', 'cmet', 'eg5', 'hif2a', 'pfkfb3', 'shp2', 'syk', 'tnks2'], start=1): - results['merged'][target] = {} - for leg in ['protein', 'water']: - results['merged'][target][leg] = {} - n, o = results['new'][target][leg], results['old'][target][leg] - for edge in target_edges[target]: - try: - try: - fep = 'FEP_{}_{}'.format(edge[0], edge[1]) - ddG = sum([n[fep][0], o[fep][0]])/2 - sem = np.sqrt(sum([n[fep][1]**2, o[fep][1]**2])) - crashes = sum([n[fep][2], o[fep][2]]) - std = sem*np.sqrt(20 - crashes) - results['merged'][target][leg][fep] = [ddG, sem, std, crashes] - except: - fep = 'FEP_{}_{}'.format(edge[1], edge[0]) - ddG = sum([n[fep][0], o[fep][0]])/2 - sem = np.sqrt(sum([n[fep][1]**2, o[fep][1]**2])) - crashes = sum([n[fep][2], o[fep][2]]) - std = sem*np.sqrt(20 - crashes) - results['merged'][target][leg][fep] = [ddG, sem, std, crashes] - except: - continue - - merged_dir = os.path.join(os.getcwd(), target, 'merged', '2fs') - if not os.path.exists(merged_dir): - os.mkdir(os.path.join(os.getcwd(), target, 'merged')) - os.mkdir(os.path.join(os.getcwd(), target, 'merged', '2fs')) - - with open('{}/{}.txt'.format(merged_dir, leg), 'w') as outfile: - outfile.write('{:<70}{:<10}{:<10}{:<10}{:<10}\n'.format('FEP','dG','sem', 'std', 'crashes')) - for fep, v in results['merged'][target][leg].items(): - outfile.write('{:<70}{:<10.3}{:<10.3}{:<10.3}{:<10}\n'.format(fep, v[0], v[1], v[2], v[3])) diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index f5874d1f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,71 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_35_33 29.20 0.19 0.59 0 -FEP_57_35 -1.39 0.14 0.44 0 -FEP_54_35 -4.35 0.22 0.69 0 -FEP_41_43 -10.41 0.29 0.91 0 -FEP_31_23 6.24 0.22 0.69 1 -FEP_59_62 -6.22 0.32 1.02 1 -FEP_52_35 -2.86 0.23 0.72 0 -FEP_56_55 2.16 0.13 0.41 1 -FEP_48_20 1.80 0.38 1.21 1 -FEP_37_35 -19.66 1.38 4.36 3 -FEP_42_43 -1.76 0.20 0.62 0 -FEP_67_49 22.82 0.42 1.32 0 -FEP_37_34 -22.85 0.67 2.13 6 -FEP_24_19 -16.83 0.18 0.57 0 -FEP_19_23 -29.75 0.38 1.20 0 -FEP_29_26 -16.84 0.23 0.72 2 -FEP_60_59 14.51 0.56 1.79 0 -FEP_30_19 34.36 0.42 1.34 1 -FEP_41_20 -5.06 0.34 1.07 0 -FEP_69_70 11.68 0.11 0.34 0 -FEP_55_35 -2.95 0.15 0.47 0 -FEP_54_57 -3.13 0.21 0.65 0 -FEP_35_29 58.01 0.30 0.95 0 -FEP_34_26 44.67 0.32 1.01 1 -FEP_46_49 -19.94 0.23 0.74 1 -FEP_70_62 1.84 0.28 0.88 0 -FEP_65_64 2.07 0.18 0.58 1 -FEP_68_49 11.75 0.29 0.93 0 -FEP_53_35 -5.97 0.55 1.73 0 -FEP_29_19 -5.73 0.32 1.00 0 -FEP_63_62 6.66 0.13 0.41 0 -FEP_64_63 8.50 0.11 0.36 0 -FEP_49_39 6.34 0.25 0.80 0 -FEP_67_68 10.21 0.24 0.77 0 -FEP_38_43 -11.75 0.39 1.23 0 -FEP_47_44 -6.12 0.19 0.59 0 -FEP_53_52 -2.57 0.23 0.72 1 -FEP_59_58 -14.99 0.13 0.43 0 -FEP_43_39 -0.84 0.09 0.29 1 -FEP_36_29 50.81 0.58 1.83 0 -FEP_48_49 -12.20 0.28 0.88 0 -FEP_65_63 10.57 0.14 0.43 0 -FEP_36_35 -7.10 0.58 1.85 0 -FEP_67_65 18.26 0.17 0.53 0 -FEP_60_58 0.31 0.56 1.77 0 -FEP_42_39 -2.59 0.47 1.49 0 -FEP_33_31 -12.33 0.13 0.41 0 -FEP_35_34 -3.27 0.28 0.90 0 -FEP_69_65 -2.75 0.10 0.32 0 -FEP_62_49 -12.76 0.27 0.85 0 -FEP_56_35 -0.69 0.17 0.55 0 -FEP_47_49 -13.39 0.34 1.06 0 -FEP_44_43 -0.47 0.46 1.44 1 -FEP_49_44 7.09 0.21 0.68 1 -FEP_46_44 -12.59 0.12 0.37 0 -FEP_38_39 -12.00 0.27 0.86 0 -FEP_31_30 0.38 0.50 1.57 1 -FEP_35_49 -3.84 0.45 1.41 1 -FEP_33_24 40.64 0.30 0.95 0 -FEP_62_44 -5.26 0.27 0.87 1 -FEP_35_62 8.92 0.34 1.07 0 -FEP_62_58 -8.68 0.34 1.08 0 -FEP_24_30 -51.23 0.69 2.17 1 -FEP_62_33 20.50 0.24 0.76 1 -FEP_68_65 8.22 0.28 0.90 0 -FEP_63_64 -8.74 0.11 0.36 1 -FEP_62_63 -6.36 0.26 0.83 0 -FEP_63_65 -10.82 0.13 0.41 0 -FEP_35_63 2.49 0.25 0.80 0 -FEP_35_31 16.91 0.28 0.88 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 3b1ed16c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,71 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_70_62 -1.92 0.10 0.32 0 -FEP_67_68 10.05 0.18 0.58 0 -FEP_30_19 32.11 0.26 0.82 0 -FEP_33_24 38.71 0.14 0.43 0 -FEP_57_35 -1.99 0.19 0.61 0 -FEP_44_43 2.82 0.13 0.42 0 -FEP_46_49 -19.40 0.10 0.32 0 -FEP_19_23 -27.42 0.10 0.32 0 -FEP_54_57 0.19 0.19 0.59 0 -FEP_36_35 -3.51 0.18 0.57 0 -FEP_52_35 -2.20 0.14 0.43 0 -FEP_67_49 19.42 0.16 0.50 0 -FEP_54_35 -1.81 0.06 0.20 0 -FEP_64_63 8.58 0.11 0.36 0 -FEP_35_49 -9.37 0.25 0.79 0 -FEP_37_35 -21.82 1.06 3.35 4 -FEP_31_30 -0.77 0.37 1.16 0 -FEP_24_19 -18.71 0.12 0.36 0 -FEP_38_39 -14.17 0.11 0.34 0 -FEP_41_43 -8.93 0.12 0.38 0 -FEP_38_43 -8.57 0.28 0.90 0 -FEP_56_55 3.24 0.14 0.46 0 -FEP_53_52 -0.86 0.19 0.60 0 -FEP_47_44 -1.76 0.10 0.33 0 -FEP_47_49 -11.18 0.12 0.38 0 -FEP_34_26 42.53 0.11 0.36 0 -FEP_68_49 9.22 0.11 0.36 0 -FEP_65_64 1.38 0.10 0.33 0 -FEP_42_43 0.78 0.17 0.52 0 -FEP_33_31 -11.85 0.18 0.57 0 -FEP_59_58 -12.77 0.10 0.31 0 -FEP_48_49 -12.92 0.08 0.26 0 -FEP_49_44 9.35 0.07 0.21 0 -FEP_55_35 -4.74 0.20 0.64 0 -FEP_65_63 10.10 0.09 0.28 0 -FEP_69_65 -5.63 0.20 0.62 0 -FEP_53_35 -3.35 0.17 0.52 0 -FEP_43_39 -5.95 0.08 0.26 0 -FEP_41_20 -5.47 0.15 0.48 0 -FEP_67_65 18.02 0.07 0.24 0 -FEP_48_20 2.78 0.22 0.69 0 -FEP_35_33 27.70 0.20 0.63 0 -FEP_35_29 55.61 0.09 0.30 0 -FEP_36_29 51.50 0.26 0.82 0 -FEP_56_35 -1.75 0.22 0.71 0 -FEP_29_19 -7.67 0.20 0.62 0 -FEP_35_34 -3.71 0.22 0.69 0 -FEP_31_23 4.82 0.18 0.56 0 -FEP_63_62 4.25 0.07 0.23 0 -FEP_49_39 6.36 0.11 0.35 0 -FEP_42_39 -5.59 0.17 0.55 0 -FEP_60_58 0.50 0.28 0.87 0 -FEP_69_70 10.77 0.13 0.42 0 -FEP_37_34 -26.09 0.74 2.33 5 -FEP_62_49 -12.75 0.12 0.39 0 -FEP_59_62 -6.11 0.09 0.29 0 -FEP_29_26 -17.17 0.23 0.72 0 -FEP_60_59 12.35 0.47 1.48 0 -FEP_46_44 -9.89 0.07 0.22 0 -FEP_35_62 4.14 0.09 0.30 0 -FEP_62_58 -6.54 0.10 0.33 0 -FEP_62_33 23.48 0.19 0.59 0 -FEP_24_30 -50.93 0.37 1.16 0 -FEP_68_65 7.87 0.12 0.39 0 -FEP_62_44 -3.32 0.11 0.35 0 -FEP_62_63 -4.22 0.07 0.23 0 -FEP_63_64 -8.40 0.11 0.33 0 -FEP_63_65 -9.88 0.09 0.29 0 -FEP_35_31 16.02 0.18 0.57 0 -FEP_35_63 -0.26 0.10 0.31 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index ca4a7537..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,60 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_53_52 -2.38 0.402 1.71 2 -FEP_53_35 -6.24 0.636 2.7 2 -FEP_52_35 -2.81 0.255 1.11 1 -FEP_35_29 58.1 0.461 2.06 0 -FEP_54_35 -4.72 0.348 1.52 1 -FEP_56_35 -0.96 0.208 0.931 0 -FEP_35_33 29.0 0.262 1.17 0 -FEP_35_34 -3.46 0.35 1.57 0 -FEP_57_35 -1.65 0.22 0.985 0 -FEP_55_35 -2.92 0.219 0.981 0 -FEP_37_35 -16.8 1.39 5.73 3 -FEP_36_35 -7.27 0.759 3.4 0 -FEP_35_49 -4.23 0.673 2.93 1 -FEP_29_19 -5.6 0.52 2.33 0 -FEP_29_26 -16.6 0.41 1.74 2 -FEP_36_29 50.7 0.932 4.17 0 -FEP_54_57 -3.09 0.334 1.49 0 -FEP_56_55 2.1 0.256 1.11 1 -FEP_33_24 40.7 0.424 1.85 1 -FEP_33_31 -12.2 0.291 1.3 0 -FEP_24_19 -16.9 0.284 1.27 0 -FEP_31_23 6.21 0.261 1.14 1 -FEP_31_30 1.1 0.714 3.11 1 -FEP_19_23 -29.4 0.537 2.4 0 -FEP_30_19 34.5 0.573 2.5 1 -FEP_34_26 44.9 0.467 2.04 1 -FEP_37_34 -22.7 0.854 2.7 10 -FEP_49_44 7.31 0.35 1.53 1 -FEP_49_39 6.28 0.354 1.58 0 -FEP_48_49 -12.6 0.456 2.04 0 -FEP_47_49 -13.8 0.69 3.08 0 -FEP_46_49 -20.1 0.28 1.22 1 -FEP_67_49 22.4 0.54 2.42 0 -FEP_68_49 11.5 0.494 2.21 0 -FEP_62_49 -12.8 0.295 1.32 0 -FEP_44_43 -0.505 0.572 2.43 2 -FEP_47_44 -6.27 0.269 1.2 0 -FEP_46_44 -12.9 0.184 0.825 0 -FEP_42_43 -1.05 0.336 1.5 0 -FEP_38_43 -12.2 0.642 2.8 1 -FEP_43_39 -1.13 0.21 0.892 2 -FEP_41_43 -10.6 0.417 1.87 0 -FEP_42_39 -2.81 0.574 2.57 0 -FEP_38_39 -13.0 0.533 2.39 0 -FEP_48_20 1.27 0.66 2.88 1 -FEP_41_20 -4.59 0.54 2.29 2 -FEP_67_68 10.2 0.3 1.34 0 -FEP_67_65 17.9 0.233 1.04 0 -FEP_65_64 2.29 0.228 0.994 1 -FEP_65_63 10.5 0.22 0.985 0 -FEP_69_65 -3.26 0.26 1.16 0 -FEP_64_63 8.26 0.246 1.1 0 -FEP_63_62 6.31 0.318 1.42 0 -FEP_59_62 -6.66 0.46 1.95 2 -FEP_70_62 1.42 0.505 2.26 0 -FEP_69_70 11.6 0.186 0.832 0 -FEP_59_58 -15.1 0.239 1.04 1 -FEP_60_59 14.1 0.757 3.39 0 -FEP_60_58 -0.505 0.655 2.93 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 6aeaff0f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,60 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_53_52 -0.785 0.298 1.33 0 -FEP_53_35 -2.62 0.311 1.39 0 -FEP_52_35 -1.58 0.184 0.825 0 -FEP_35_29 55.7 0.135 0.602 0 -FEP_54_35 -1.18 0.162 0.722 0 -FEP_56_35 -1.66 0.256 1.14 0 -FEP_35_33 27.9 0.297 1.33 0 -FEP_35_34 -3.59 0.272 1.22 0 -FEP_57_35 -1.53 0.23 1.03 0 -FEP_55_35 -4.87 0.215 0.963 0 -FEP_37_35 -19.0 1.07 4.27 4 -FEP_36_35 -3.28 0.241 1.08 0 -FEP_35_49 -9.38 0.32 1.43 0 -FEP_29_19 -7.59 0.352 1.58 0 -FEP_29_26 -17.0 0.298 1.33 0 -FEP_36_29 51.6 0.322 1.44 0 -FEP_54_57 0.29 0.21 0.94 0 -FEP_56_55 3.11 0.172 0.769 0 -FEP_33_24 38.7 0.184 0.825 0 -FEP_33_31 -11.9 0.292 1.31 0 -FEP_24_19 -18.8 0.184 0.825 0 -FEP_31_23 4.83 0.201 0.9 0 -FEP_31_30 -0.52 0.441 1.97 0 -FEP_19_23 -27.3 0.128 0.573 0 -FEP_30_19 32.2 0.347 1.55 0 -FEP_34_26 42.4 0.136 0.608 0 -FEP_37_34 -24.5 0.745 2.24 11 -FEP_49_44 9.43 0.13 0.583 0 -FEP_49_39 6.26 0.156 0.696 0 -FEP_48_49 -12.9 0.0943 0.422 0 -FEP_47_49 -11.3 0.144 0.645 0 -FEP_46_49 -19.5 0.156 0.699 0 -FEP_67_49 19.3 0.189 0.822 1 -FEP_68_49 8.91 0.246 1.1 0 -FEP_62_49 -12.8 0.15 0.671 0 -FEP_44_43 2.76 0.206 0.922 0 -FEP_47_44 -1.75 0.149 0.665 0 -FEP_46_44 -10.0 0.13 0.583 0 -FEP_42_43 0.765 0.233 1.04 0 -FEP_38_43 -8.49 0.338 1.51 0 -FEP_43_39 -6.03 0.179 0.8 0 -FEP_41_43 -9.0 0.225 1.0 0 -FEP_42_39 -5.58 0.286 1.28 0 -FEP_38_39 -14.3 0.186 0.832 0 -FEP_48_20 2.42 0.388 1.74 0 -FEP_41_20 -5.56 0.186 0.832 0 -FEP_67_68 10.2 0.211 0.943 0 -FEP_67_65 18.0 0.106 0.475 0 -FEP_65_64 1.42 0.135 0.602 0 -FEP_65_63 10.0 0.166 0.744 0 -FEP_69_65 -5.54 0.224 1.0 0 -FEP_64_63 8.52 0.125 0.56 0 -FEP_63_62 4.21 0.099 0.443 0 -FEP_59_62 -6.15 0.158 0.707 0 -FEP_70_62 -1.96 0.18 0.806 0 -FEP_69_70 10.7 0.206 0.922 0 -FEP_59_58 -12.6 0.156 0.699 0 -FEP_60_59 12.3 0.563 2.52 0 -FEP_60_58 0.2 0.564 2.52 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index 7ed3b887..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/no-vs/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -FEP_43-41 protein/ -FEP_39-42 protein/ -FEP_20-41 protein/ -FEP_43-42 protein/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 69abf8c8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,65 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_31_30 1.82 0.51 0 -FEP_53_52 -2.20 0.33 1 -FEP_44_62 4.89 0.25 0 -FEP_34_37 22.56 0.53 4 -FEP_49_39 6.22 0.25 0 -FEP_49_67 -21.98 0.34 0 -FEP_49_47 14.20 0.60 0 -FEP_35_37 13.96 0.16 0 -FEP_49_44 7.54 0.28 0 -FEP_56_55 2.05 0.22 0 -FEP_67_68 10.12 0.18 0 -FEP_62_70 -1.00 0.42 0 -FEP_24_19 -17.00 0.22 0 -FEP_69_70 11.48 0.15 0 -FEP_54_57 -3.05 0.26 0 -FEP_19_30 -34.61 0.39 0 -FEP_67_65 17.54 0.16 0 -FEP_19_23 -29.08 0.38 0 -FEP_33_24 40.77 0.30 1 -FEP_62_59 7.10 0.33 1 -FEP_59_58 -15.15 0.20 1 -FEP_35_56 1.23 0.12 0 -FEP_34_26 45.09 0.34 0 -FEP_58_60 1.32 0.34 0 -FEP_49_48 12.98 0.36 0 -FEP_64_63 8.02 0.22 0 -FEP_44_46 13.17 0.14 0 -FEP_35_34 -3.65 0.21 0 -FEP_35_49 -4.62 0.50 0 -FEP_29_26 -16.31 0.34 0 -FEP_49_68 -11.29 0.40 0 -FEP_35_54 5.10 0.27 1 -FEP_44_43 -0.54 0.34 1 -FEP_35_55 2.89 0.16 0 -FEP_48_20 0.73 0.54 0 -FEP_65_63 10.38 0.17 0 -FEP_59_60 -13.70 0.51 0 -FEP_65_64 2.50 0.14 0 -FEP_63_62 5.96 0.29 0 -FEP_29_36 -50.63 0.73 0 -FEP_35_57 1.90 0.17 0 -FEP_29_19 -5.46 0.41 0 -FEP_43_39 -1.42 0.19 1 -FEP_35_33 28.79 0.18 0 -FEP_65_69 3.78 0.24 0 -FEP_39_38 13.98 0.46 0 -FEP_31_23 6.17 0.14 0 -FEP_35_36 7.44 0.49 0 -FEP_35_29 58.13 0.35 0 -FEP_52_35 -2.77 0.11 1 -FEP_49_46 20.24 0.16 0 -FEP_44_47 6.42 0.19 0 -FEP_49_62 12.83 0.12 0 -FEP_33_31 -12.12 0.26 0 -FEP_43_38 12.68 0.51 1 -FEP_53_35 -6.51 0.32 2 -FEP_42_39 -3.04 0.33 0 -FEP_41_20 -4.13 0.42 2 -FEP_42_43 -0.34 0.27 0 -FEP_41_43 -10.73 0.30 0 -FEP_37_29 44.34 0.46 0 -FEP_65_35 8.80 0.24 0 -FEP_58_63 2.08 0.32 0 -FEP_60_44 3.48 0.19 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 5fb125b2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/pfkfb3/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,65 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_31_30 -0.27 0.24 0 -FEP_53_52 -0.71 0.23 0 -FEP_44_62 3.45 0.13 0 -FEP_34_37 22.86 0.09 6 -FEP_49_39 6.15 0.11 0 -FEP_49_67 -19.16 0.10 1 -FEP_49_47 11.39 0.08 0 -FEP_35_37 16.12 0.13 0 -FEP_49_44 9.51 0.11 0 -FEP_56_55 2.97 0.10 0 -FEP_67_68 10.28 0.11 0 -FEP_62_70 1.99 0.15 0 -FEP_24_19 -18.97 0.14 0 -FEP_69_70 10.64 0.16 0 -FEP_54_57 0.39 0.09 0 -FEP_19_30 -32.26 0.23 0 -FEP_67_65 17.93 0.08 0 -FEP_19_23 -27.23 0.08 0 -FEP_33_24 38.66 0.12 0 -FEP_62_59 6.19 0.13 0 -FEP_59_58 -12.50 0.12 0 -FEP_35_56 1.56 0.13 0 -FEP_34_26 42.28 0.08 0 -FEP_58_60 0.10 0.49 0 -FEP_49_48 12.91 0.05 0 -FEP_64_63 8.45 0.06 0 -FEP_44_46 10.10 0.11 0 -FEP_35_34 -3.48 0.16 0 -FEP_35_49 -9.38 0.20 0 -FEP_29_26 -16.92 0.19 0 -FEP_49_68 -8.59 0.22 0 -FEP_35_54 0.54 0.15 0 -FEP_44_43 2.71 0.16 0 -FEP_35_55 4.99 0.08 0 -FEP_48_20 2.07 0.32 0 -FEP_65_63 9.94 0.14 0 -FEP_59_60 -12.26 0.31 0 -FEP_65_64 1.46 0.09 0 -FEP_63_62 4.16 0.07 0 -FEP_29_36 -51.78 0.19 0 -FEP_35_57 1.07 0.13 0 -FEP_29_19 -7.52 0.29 0 -FEP_43_39 -6.11 0.16 0 -FEP_41_20 -5.65 0.11 0 -FEP_35_33 28.13 0.22 0 -FEP_65_69 5.44 0.10 0 -FEP_39_38 14.37 0.15 0 -FEP_31_23 4.84 0.09 0 -FEP_35_36 3.05 0.16 0 -FEP_35_29 55.86 0.10 0 -FEP_52_35 -0.97 0.12 0 -FEP_49_46 19.58 0.12 0 -FEP_44_47 1.74 0.11 0 -FEP_49_62 12.94 0.09 0 -FEP_33_31 -12.03 0.23 0 -FEP_43_38 8.41 0.19 0 -FEP_53_35 -1.88 0.26 0 -FEP_42_39 -5.58 0.23 0 -FEP_41_43 -9.08 0.19 0 -FEP_42_43 0.75 0.16 0 -FEP_37_29 39.07 0.19 0 -FEP_58_63 2.06 0.12 0 -FEP_65_35 10.27 0.13 0 -FEP_60_44 2.67 0.70 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 41b86a1b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,44 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_Example-1_6 -4.50 0.19 0.59 0 -FEP_7_6 -30.10 0.53 1.69 0 -FEP_Example-23_Example-22 -0.38 0.30 0.93 0 -FEP_SHP836-2_Example-27 158.41 0.47 1.48 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_10 9.63 0.20 0.64 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30 -24.87 0.18 0.56 0 -FEP_4_3 -0.00 0.17 0.55 0 -FEP_Example-6_Example-1 2.49 0.29 0.91 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27 17.04 0.98 3.11 1 -FEP_Example-28_Example-29 14.42 0.56 1.77 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29 1.53 0.43 1.36 0 -FEP_Example-3_Example-4 -4.28 0.30 0.94 0 -FEP_SHP836-2_4 4.28 0.16 0.49 0 -FEP_11_10 -6.83 0.35 1.10 0 -FEP_SHP836-2_3 4.07 0.57 1.80 0 -FEP_Example-25_Example-23 -13.12 0.37 1.16 0 -FEP_Example-26_Example-24 -5.74 0.44 1.40 0 -FEP_Example-30_Example-1 -114.34 0.33 1.03 0 -FEP_11_SHP099-1-Example-7 -16.97 0.58 1.84 0 -FEP_Example-2_Example-4 -5.38 0.50 1.58 0 -FEP_Example-5_Example-1 -7.80 0.37 1.16 0 -FEP_Example-23_Example-30 -34.40 0.37 1.17 0 -FEP_Example-9_Example-14 -1.13 0.33 1.06 1 -FEP_Example-1_Example-3 -7.99 0.42 1.34 0 -FEP_Example-26_Example-23 9.51 0.38 1.22 0 -FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7 10.39 0.37 1.16 0 -FEP_Example-5_Example-6 -10.76 0.41 1.28 0 -FEP_Example-8_Example-9 -1.81 0.28 0.90 0 -FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7 8.02 0.43 1.35 0 -FEP_7_Example-1 -24.60 0.42 1.32 0 -FEP_Example-25_Example-24 -27.56 0.31 0.98 0 -FEP_Example-23_Example-24 -13.56 0.38 1.19 0 -FEP_Example-1_Example-2 -6.78 0.27 0.85 0 -FEP_Example-24_Example-22 13.46 0.34 1.06 0 -FEP_Example-8_Example-14 -2.88 0.56 1.77 0 -FEP_Example-6_Example-2 -3.42 0.32 1.01 0 -FEP_SHP836-2_6 0.38 0.89 2.81 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1 -138.94 0.30 0.95 0 -FEP_Example-27_Example-14 -26.73 0.66 2.10 0 -FEP_Example-24_Example-30 -20.68 0.68 2.16 0 -FEP_Example-8_Example-28 -2.22 0.63 2.00 0 -FEP_Example-8_6 -2.22 0.63 2.00 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14 -11.66 0.31 0.99 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 83c33cf0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,44 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_SHP836-2_3 5.17 0.14 0.45 0 -FEP_Example-23_Example-30 -30.88 0.12 0.38 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29 2.52 0.14 0.45 0 -FEP_Example-28_Example-29 14.09 0.18 0.57 4 -FEP_Example-30_Example-1 -118.10 0.12 0.39 0 -FEP_11_SHP099-1-Example-7 -11.86 0.15 0.47 0 -FEP_7_Example-1 -27.59 0.21 0.66 0 -FEP_4_3 -1.70 0.08 0.26 0 -FEP_Example-1_Example-2 -8.76 0.13 0.42 0 -FEP_Example-26_Example-24 -4.53 0.39 1.25 0 -FEP_Example-2_Example-4 -5.02 0.22 0.68 0 -FEP_Example-24_Example-22 14.18 0.28 0.89 0 -FEP_Example-8_Example-14 -2.00 0.27 0.84 0 -FEP_Example-1_Example-3 -8.25 0.12 0.38 0 -FEP_Example-8_Example-9 -2.32 0.19 0.62 0 -FEP_SHP836-2_Example-27 161.05 0.18 0.56 0 -FEP_Example-1_6 -5.03 0.18 0.57 0 -FEP_Example-23_Example-24 -13.93 0.22 0.69 0 -FEP_Example-23_Example-22 0.11 0.19 0.61 0 -FEP_7_6 -32.25 0.22 0.70 0 -FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7 11.77 0.11 0.34 1 -FEP_Example-26_Example-23 9.73 0.39 1.25 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27 12.27 0.35 1.12 0 -FEP_Example-5_Example-6 -6.60 0.27 0.86 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30 -23.95 0.11 0.33 0 -FEP_Example-25_Example-24 -26.19 0.28 0.89 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_10 8.67 0.14 0.43 0 -FEP_11_10 -2.97 0.18 0.57 0 -FEP_Example-5_Example-1 -2.97 0.11 0.34 0 -FEP_Example-6_Example-1 3.81 0.09 0.28 0 -FEP_SHP836-2_4 6.88 0.09 0.28 0 -FEP_Example-9_Example-14 0.39 0.16 0.51 0 -FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7 5.21 0.44 1.38 0 -FEP_Example-3_Example-4 -5.81 0.14 0.46 0 -FEP_Example-25_Example-23 -12.34 0.19 0.61 0 -FEP_SHP836-2_6 2.17 0.17 0.55 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1 -141.88 0.13 0.41 0 -FEP_Example-8_Example-28 -6.84 0.18 0.58 2 -FEP_Example-24_Example-30 -16.62 0.17 0.52 0 -FEP_Example-27_Example-14 -19.74 0.32 1.01 0 -FEP_Example-6_Example-2 -4.44 0.14 0.45 0 -FEP_Example-8_6 -2.22 0.63 2.00 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14 -8.07 0.20 0.64 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index ef0b70a0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,36 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_Example-9_Example-14 -0.935 0.481 2.1 1 -FEP_Example-8_Example-9 -1.61 0.448 2.0 0 -FEP_Example-8_Example-14 -2.85 0.626 2.8 0 -FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7 7.21 0.659 2.95 0 -FEP_11_SHP099-1-Example-7 -17.2 0.917 4.1 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29 1.5 0.548 2.45 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27 16.4 1.28 5.57 1 -FEP_SHP099-1-Example-7_10 9.7 0.262 1.17 0 -FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7 10.8 0.509 2.28 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30 -25.1 0.376 1.68 0 -FEP_11_10 -6.8 0.468 2.09 0 -FEP_Example-23_Example-30 -34.4 0.655 2.93 0 -FEP_Example-30_Example-1 -1.15e+02 0.42 1.88 0 -FEP_Example-1_Example-2 -7.0 0.396 1.77 0 -FEP_Example-1_Example-3 -8.46 0.547 2.44 0 -FEP_Example-5_Example-1 -7.62 0.68 3.04 0 -FEP_7_Example-1 -25.8 0.749 3.35 0 -FEP_Example-1_6 -4.65 0.262 1.17 0 -FEP_Example-6_Example-1 2.89 0.47 2.1 0 -FEP_Example-2_Example-4 -5.11 0.542 2.43 0 -FEP_Example-5_Example-6 -10.9 0.837 3.74 0 -FEP_Example-23_Example-24 -14.2 0.693 3.1 0 -FEP_Example-23_Example-22 -0.215 0.431 1.93 0 -FEP_Example-25_Example-23 -13.8 0.464 2.08 0 -FEP_Example-26_Example-23 8.65 0.744 3.33 0 -FEP_Example-24_Example-22 13.7 0.502 2.25 0 -FEP_Example-25_Example-24 -28.1 0.498 2.23 0 -FEP_Example-26_Example-24 -5.79 0.608 2.72 0 -FEP_7_6 -30.9 0.976 4.37 0 -FEP_Example-28_Example-29 13.5 0.631 2.82 0 -FEP_SHP836-2_Example-27 1.58e+02 0.574 2.57 0 -FEP_SHP836-2_4 4.86 0.525 2.35 0 -FEP_SHP836-2_3 4.51 0.72 3.22 0 -FEP_4_3 -0.365 0.27 1.21 0 -FEP_Example-3_Example-4 -4.48 0.469 2.1 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index a46f7504..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,36 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_Example-9_Example-14 0.11 0.28 1.25 0 -FEP_Example-8_Example-9 -2.79 0.255 1.14 0 -FEP_Example-8_Example-14 -2.05 0.324 1.45 0 -FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7 4.9 0.511 2.29 0 -FEP_11_SHP099-1-Example-7 -12.0 0.266 1.19 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29 2.38 0.278 1.24 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27 12.1 0.448 2.0 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_10 8.51 0.261 1.17 0 -FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7 11.3 0.202 0.883 1 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30 -24.0 0.194 0.868 0 -FEP_11_10 -3.27 0.292 1.31 0 -FEP_Example-23_Example-30 -31.0 0.259 1.16 0 -FEP_Example-30_Example-1 -1.18e+02 0.216 0.967 0 -FEP_Example-1_Example-2 -8.43 0.206 0.922 0 -FEP_Example-1_Example-3 -8.1 0.192 0.859 0 -FEP_Example-5_Example-1 -2.85 0.228 1.02 0 -FEP_7_Example-1 -27.6 0.27 1.21 0 -FEP_Example-1_6 -4.96 0.241 1.08 0 -FEP_Example-6_Example-1 3.91 0.219 0.981 0 -FEP_Example-2_Example-4 -4.95 0.272 1.22 0 -FEP_Example-5_Example-6 -6.85 0.348 1.56 0 -FEP_Example-23_Example-24 -13.9 0.326 1.46 0 -FEP_Example-23_Example-22 0.03 0.347 1.55 0 -FEP_Example-25_Example-23 -12.3 0.248 1.11 0 -FEP_Example-26_Example-23 9.69 0.504 2.26 0 -FEP_Example-24_Example-22 14.2 0.338 1.51 0 -FEP_Example-25_Example-24 -26.2 0.309 1.38 0 -FEP_Example-26_Example-24 -4.83 0.634 2.84 0 -FEP_7_6 -32.4 0.388 1.74 0 -FEP_Example-28_Example-29 14.0 0.262 1.05 4 -FEP_SHP836-2_Example-27 1.61e+02 0.241 1.08 0 -FEP_SHP836-2_4 6.86 0.192 0.86 0 -FEP_SHP836-2_3 5.25 0.157 0.7 0 -FEP_4_3 -1.62 0.136 0.608 0 -FEP_Example-3_Example-4 -5.52 0.161 0.721 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index ba60cc6a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,40 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_Example-1_Example-5 7.43 0.57 0 -FEP_Example-24_Example-26 5.84 0.42 0 -FEP_Example-23_Example-22 -0.05 0.31 0 -FEP_6_7 31.70 0.82 0 -FEP_Example-23_Example-24 -14.82 0.58 0 -FEP_Example-1_Example-6 -3.29 0.37 0 -FEP_Example-23_Example-26 -7.80 0.64 0 -FEP_Example-2_Example-6 3.15 0.42 0 -FEP_SHP836-2_Example-27 158.32 0.33 0 -FEP_Example-23_Example-25 14.48 0.28 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29 1.47 0.34 0 -FEP_Example-1_Example-3 -8.93 0.35 0 -FEP_6_SHP836-2 0.40 0.97 0 -FEP_Example-8_Example-28 -3.12 0.53 0 -FEP_Example-24_Example-25 28.61 0.39 0 -FEP_Example-2_Example-4 -4.84 0.21 0 -FEP_SHP836-2_4 5.44 0.50 0 -FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7 6.40 0.50 0 -FEP_Example-30_Example-23 34.47 0.54 0 -FEP_Example-1_6 -4.80 0.18 0 -FEP_Example-1_7 26.92 0.62 0 -FEP_Example-24_Example-22 13.97 0.37 0 -FEP_Example-9_Example-8 1.42 0.35 0 -FEP_Example-6_Example-5 11.04 0.73 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-28 -11.12 0.35 0 -FEP_Example-9_Example-14 -0.74 0.35 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_11 17.51 0.71 0 -FEP_Example-14_Example-8 2.83 0.28 0 -FEP_SHP836-2_3 4.94 0.44 0 -FEP_Example-30_Example-1 -114.83 0.26 0 -FEP_11_10 -6.77 0.31 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27 15.81 0.82 0 -FEP_Example-3_Example-4 -4.68 0.36 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_10 9.76 0.17 0 -FEP_3_4 0.73 0.21 0 -FEP_Example-28_Example-29 12.62 0.29 0 -FEP_Example-1_Example-2 -7.22 0.29 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30 -25.25 0.33 0 -FEP_Example-22_SHP099-1-Example-7 -8.41 0.42 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index ddf02567..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,40 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_Example-1_Example-5 2.72 0.20 0 -FEP_Example-24_Example-26 5.13 0.50 0 -FEP_Example-23_Example-22 -0.05 0.29 0 -FEP_6_7 32.52 0.32 0 -FEP_Example-23_Example-24 -13.96 0.24 0 -FEP_Example-1_Example-6 -4.01 0.20 0 -FEP_Example-23_Example-26 -9.65 0.32 0 -FEP_Example-2_Example-6 4.14 0.25 0 -FEP_SHP836-2_Example-27 161.01 0.16 0 -FEP_Example-23_Example-25 12.23 0.16 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29 2.25 0.24 0 -FEP_Example-1_Example-3 -7.95 0.15 0 -FEP_6_SHP836-2 -2.56 0.22 0 -FEP_Example-8_Example-28 -6.40 0.31 0 -FEP_Example-24_Example-25 26.13 0.13 0 -FEP_Example-2_Example-4 -4.88 0.16 0 -FEP_SHP836-2_4 6.83 0.17 0 -FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7 4.60 0.26 0 -FEP_Example-30_Example-23 31.20 0.23 0 -FEP_Example-1_6 -4.90 0.16 0 -FEP_Example-1_7 27.68 0.17 0 -FEP_Example-24_Example-22 14.21 0.19 0 -FEP_Example-9_Example-8 3.27 0.17 0 -FEP_Example-6_Example-5 7.10 0.22 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-28 -10.86 0.17 0 -FEP_Example-9_Example-14 -0.17 0.23 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_11 12.06 0.22 0 -FEP_Example-14_Example-8 2.10 0.18 0 -FEP_SHP836-2_3 5.34 0.07 0 -FEP_Example-30_Example-1 -117.99 0.18 0 -FEP_11_10 -3.57 0.23 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27 11.84 0.28 0 -FEP_Example-3_Example-4 -5.23 0.08 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_10 8.35 0.22 0 -FEP_3_4 1.55 0.11 0 -FEP_Example-28_Example-29 13.93 0.19 0 -FEP_Example-1_Example-2 -8.09 0.16 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30 -24.15 0.16 0 -FEP_Example-22_SHP099-1-Example-7 -6.88 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 2c112f4e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_Example_1-Example_5 6.84 0.53 0 -FEP_Example_24-Example_26 5.65 0.53 0 -FEP_Example_23-Example_22 -2.11 0.16 0 -FEP_Example_23-Example_24 16.86 0.29 0 -FEP_Example_1-Example_6 -3.28 0.19 0 -FEP_Example_23-Example_26 22.93 0.77 1 -FEP_Example_2-Example_6 4.47 0.25 0 -FEP_SHP836-2-Example_27 161.74 0.54 0 -FEP_Example_23-Example_25 44.77 0.42 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_29 1.92 0.39 0 -FEP_Example_1-Example_3 0.04 0.51 0 -FEP_6-SHP836-2 1.10 0.62 0 -FEP_Example_8-Example_28 -1.44 1.29 0 -FEP_Example_24-Example_25 28.07 0.56 0 -FEP_Example_2-Example_4 -2.17 0.32 0 -FEP_SHP836-2-4 7.50 0.27 0 -FEP_Example_8-SHP099-1_Example_7 8.19 0.55 0 -FEP_Example_30-Example_23 4.12 0.48 0 -FEP_Example_24-Example_22 -19.41 0.22 0 -FEP_Example_9-Example_8 2.59 0.26 0 -FEP_Example_6-Example_5 10.77 0.58 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_28 -10.02 0.36 0 -FEP_Example_9-Example_14 -0.92 0.33 0 -FEP_Example_14-Example_8 3.27 0.40 0 -FEP_SHP836-2-3 6.74 0.27 0 -FEP_Example_30-Example_1 -116.79 0.19 0 -FEP_11-10 -7.13 0.58 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_27 17.02 0.84 0 -FEP_Example_3-Example_4 -9.72 0.32 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-10 9.31 0.19 0 -FEP_3-4 0.40 0.24 0 -FEP_Example_28-Example_29 12.58 0.34 0 -FEP_Example_1-Example_2 -7.09 0.18 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_30 -25.33 0.22 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index c5286b13..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_Example_1-Example_5 3.25 0.24 0 -FEP_Example_24-Example_26 4.44 0.37 0 -FEP_Example_23-Example_22 -1.52 0.24 0 -FEP_Example_23-Example_24 3.53 0.33 0 -FEP_Example_1-Example_6 -3.12 0.19 0 -FEP_Example_23-Example_26 8.86 0.64 0 -FEP_Example_2-Example_6 5.44 0.15 0 -FEP_SHP836-2-Example_27 164.07 0.26 0 -FEP_Example_23-Example_25 30.38 0.22 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_29 2.55 0.33 0 -FEP_Example_1-Example_3 -3.55 0.17 0 -FEP_6-SHP836-2 -2.49 0.15 0 -FEP_Example_8-Example_28 -5.83 0.41 0 -FEP_Example_24-Example_25 26.07 0.16 0 -FEP_Example_2-Example_4 -1.86 0.24 0 -FEP_SHP836-2-4 8.72 0.10 0 -FEP_Example_8-SHP099-1_Example_7 4.78 0.38 0 -FEP_Example_30-Example_23 13.24 0.14 0 -FEP_Example_24-Example_22 -5.42 0.28 0 -FEP_Example_9-Example_8 3.20 0.34 0 -FEP_Example_6-Example_5 6.23 0.21 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_28 -10.86 0.22 0 -FEP_Example_9-Example_14 0.25 0.23 0 -FEP_Example_14-Example_8 2.27 0.28 0 -FEP_SHP836-2-3 7.38 0.07 0 -FEP_Example_30-Example_1 -120.18 0.24 0 -FEP_11-10 -3.84 0.18 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_27 12.49 0.30 0 -FEP_Example_3-Example_4 -6.87 0.13 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-10 8.05 0.17 0 -FEP_3-4 1.13 0.09 0 -FEP_Example_28-Example_29 13.92 0.25 0 -FEP_Example_1-Example_2 -8.48 0.22 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_30 -23.56 0.24 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/failed.txt deleted file mode 100644 index 183165fb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -FEP_6-7 water/ -FEP_Example_1-6 water/ -FEP_Example_1-7 water/ -FEP_SHP099-1_Example_7-11 water/ -FEP_6-7 protein/ -FEP_Example_1-6 protein/ -FEP_Example_1-7 protein/ -FEP_SHP099-1_Example_7-11 protein/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/protein.txt deleted file mode 100644 index 2c112f4e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_Example_1-Example_5 6.84 0.53 0 -FEP_Example_24-Example_26 5.65 0.53 0 -FEP_Example_23-Example_22 -2.11 0.16 0 -FEP_Example_23-Example_24 16.86 0.29 0 -FEP_Example_1-Example_6 -3.28 0.19 0 -FEP_Example_23-Example_26 22.93 0.77 1 -FEP_Example_2-Example_6 4.47 0.25 0 -FEP_SHP836-2-Example_27 161.74 0.54 0 -FEP_Example_23-Example_25 44.77 0.42 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_29 1.92 0.39 0 -FEP_Example_1-Example_3 0.04 0.51 0 -FEP_6-SHP836-2 1.10 0.62 0 -FEP_Example_8-Example_28 -1.44 1.29 0 -FEP_Example_24-Example_25 28.07 0.56 0 -FEP_Example_2-Example_4 -2.17 0.32 0 -FEP_SHP836-2-4 7.50 0.27 0 -FEP_Example_8-SHP099-1_Example_7 8.19 0.55 0 -FEP_Example_30-Example_23 4.12 0.48 0 -FEP_Example_24-Example_22 -19.41 0.22 0 -FEP_Example_9-Example_8 2.59 0.26 0 -FEP_Example_6-Example_5 10.77 0.58 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_28 -10.02 0.36 0 -FEP_Example_9-Example_14 -0.92 0.33 0 -FEP_Example_14-Example_8 3.27 0.40 0 -FEP_SHP836-2-3 6.74 0.27 0 -FEP_Example_30-Example_1 -116.79 0.19 0 -FEP_11-10 -7.13 0.58 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_27 17.02 0.84 0 -FEP_Example_3-Example_4 -9.72 0.32 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-10 9.31 0.19 0 -FEP_3-4 0.40 0.24 0 -FEP_Example_28-Example_29 12.58 0.34 0 -FEP_Example_1-Example_2 -7.09 0.18 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_30 -25.33 0.22 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/water.txt deleted file mode 100644 index c5286b13..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/shp2/vs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_Example_1-Example_5 3.25 0.24 0 -FEP_Example_24-Example_26 4.44 0.37 0 -FEP_Example_23-Example_22 -1.52 0.24 0 -FEP_Example_23-Example_24 3.53 0.33 0 -FEP_Example_1-Example_6 -3.12 0.19 0 -FEP_Example_23-Example_26 8.86 0.64 0 -FEP_Example_2-Example_6 5.44 0.15 0 -FEP_SHP836-2-Example_27 164.07 0.26 0 -FEP_Example_23-Example_25 30.38 0.22 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_29 2.55 0.33 0 -FEP_Example_1-Example_3 -3.55 0.17 0 -FEP_6-SHP836-2 -2.49 0.15 0 -FEP_Example_8-Example_28 -5.83 0.41 0 -FEP_Example_24-Example_25 26.07 0.16 0 -FEP_Example_2-Example_4 -1.86 0.24 0 -FEP_SHP836-2-4 8.72 0.10 0 -FEP_Example_8-SHP099-1_Example_7 4.78 0.38 0 -FEP_Example_30-Example_23 13.24 0.14 0 -FEP_Example_24-Example_22 -5.42 0.28 0 -FEP_Example_9-Example_8 3.20 0.34 0 -FEP_Example_6-Example_5 6.23 0.21 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_28 -10.86 0.22 0 -FEP_Example_9-Example_14 0.25 0.23 0 -FEP_Example_14-Example_8 2.27 0.28 0 -FEP_SHP836-2-3 7.38 0.07 0 -FEP_Example_30-Example_1 -120.18 0.24 0 -FEP_11-10 -3.84 0.18 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_27 12.49 0.30 0 -FEP_Example_3-Example_4 -6.87 0.13 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-10 8.05 0.17 0 -FEP_3-4 1.13 0.09 0 -FEP_Example_28-Example_29 13.92 0.25 0 -FEP_Example_1-Example_2 -8.48 0.22 0 -FEP_SHP099-1_Example_7-Example_30 -23.56 0.24 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index f6abcc15..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,77 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 -6.17 0.35 1.10 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -2.02 0.37 1.16 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -13.94 0.24 0.76 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 -8.15 0.27 0.85 0 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995 -10.15 0.30 0.95 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019 -2.85 0.30 0.93 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -3.60 0.32 1.00 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005 -12.27 0.32 1.01 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 -5.44 0.83 2.62 0 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 -5.86 0.14 0.43 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020 2.35 0.26 0.83 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036 74.51 0.31 0.98 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032 10.52 0.26 0.82 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -11.04 0.40 1.25 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 1.41 0.75 2.37 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995 -7.36 0.43 1.36 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998 67.42 0.60 1.90 0 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 -3.57 0.32 1.01 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -15.39 0.31 0.98 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -5.94 0.13 0.40 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820 -5.68 0.58 1.83 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032 84.29 0.37 1.16 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 -5.99 0.50 1.59 0 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005 -21.73 0.46 1.45 0 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027 7.61 0.24 0.76 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016 -5.89 0.17 0.53 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 -10.48 0.62 1.96 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -1.81 0.28 0.89 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032 -14.56 0.32 1.01 0 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029 3.46 0.23 0.72 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999 -26.24 0.53 1.67 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997 -13.45 0.52 1.65 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016 -20.85 0.25 0.78 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -4.24 0.35 1.10 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031 62.99 0.19 0.59 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 8.28 0.60 1.90 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996 8.14 0.17 0.54 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 13.32 0.15 0.47 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030 43.30 0.30 0.96 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005 17.77 0.40 1.28 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 -17.48 0.31 0.99 0 -FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017 -0.97 0.30 0.96 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021 -0.50 0.23 0.73 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 3.67 0.12 0.38 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030 65.64 0.42 1.34 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -5.04 1.07 3.38 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 -5.28 0.45 1.42 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 8.69 0.23 0.72 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 36.16 0.50 1.60 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 10.17 0.41 1.28 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 -7.69 1.02 3.21 0 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998 -2.79 0.33 1.05 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820 -7.38 0.47 1.49 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018 -12.00 0.28 0.89 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995 59.91 1.06 3.35 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 4.10 0.50 1.57 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -2.63 0.58 1.84 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 7.25 0.23 0.73 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -10.26 0.31 0.98 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032 21.77 0.15 0.46 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 -7.79 0.25 0.78 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020 13.56 0.65 2.04 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999 -35.17 0.23 0.72 0 -FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026 16.94 0.24 0.77 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 2.94 0.28 0.88 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026 15.47 0.16 0.51 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005 -8.28 0.26 0.84 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017 13.13 0.34 1.07 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020 -15.20 0.27 0.86 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035 -58.64 0.32 1.00 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003 0.92 0.31 0.98 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820 -13.14 0.58 1.84 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004 5.39 0.48 1.51 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005 -7.89 0.34 1.07 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001 71.36 0.42 1.34 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3265004 4.03 0.27 0.86 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 39d8d71d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,78 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 -6.90 0.11 0.35 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -2.61 0.29 0.91 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -14.95 0.12 0.38 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 -10.23 0.10 0.30 0 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995 -9.52 0.18 0.58 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019 -0.20 0.35 1.12 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -4.30 0.17 0.53 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005 -12.39 0.11 0.36 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 -3.82 0.32 1.00 0 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 -5.55 0.11 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020 2.24 0.12 0.39 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036 74.19 0.16 0.49 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032 10.61 0.21 0.65 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -8.26 0.21 0.67 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 1.09 0.33 1.03 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995 -7.40 0.28 0.87 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998 66.60 0.32 1.01 0 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 -2.93 0.13 0.42 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -17.15 0.15 0.47 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -6.44 0.13 0.40 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820 -2.79 0.18 0.56 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032 84.80 0.13 0.42 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 -4.48 0.19 0.62 0 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005 -21.51 0.14 0.44 0 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027 5.15 0.56 1.78 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016 -6.00 0.12 0.39 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 -10.07 0.28 0.90 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -1.02 0.06 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032 -13.78 0.15 0.46 0 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029 2.23 0.28 0.88 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999 -26.93 0.29 0.92 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997 -12.65 0.25 0.79 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016 -21.37 0.26 0.81 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -3.38 0.28 0.87 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031 63.24 0.11 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 11.31 0.21 0.66 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996 7.81 0.28 0.89 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 13.60 0.09 0.30 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030 43.47 0.15 0.47 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005 10.87 0.18 0.57 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 -23.55 0.28 0.88 0 -FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017 0.80 0.10 0.32 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021 -0.34 0.11 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 3.45 0.07 0.23 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030 64.94 0.17 0.55 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -7.45 0.54 1.72 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 -5.25 0.22 0.71 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 9.17 0.24 0.75 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 29.35 0.14 0.43 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 9.31 0.18 0.57 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 -12.09 0.33 1.03 0 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998 -1.91 0.16 0.50 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820 -5.70 0.27 0.86 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018 -11.01 0.39 1.23 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995 64.09 0.23 0.72 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 3.75 0.15 0.46 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -2.71 0.12 0.37 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 6.33 0.14 0.43 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -9.69 0.36 1.14 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032 21.72 0.08 0.25 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 -6.99 0.20 0.64 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020 14.44 0.19 0.59 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999 -34.63 0.34 1.09 0 -FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026 15.86 0.11 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 2.12 0.20 0.63 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026 14.41 0.20 0.64 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020 -15.70 0.13 0.41 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001 69.31 0.28 0.90 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035 -59.96 0.40 1.26 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003 1.58 0.22 0.70 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017 11.93 0.18 0.57 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820 -10.94 0.21 0.65 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004 5.86 0.18 0.57 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005 -14.59 0.27 0.87 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005 -5.63 0.27 0.86 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3265004 3.07 0.51 1.60 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3265004 3.07 0.51 1.60 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index e6c8e09f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,67 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032 10.3 0.311 1.39 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032 84.1 0.407 1.82 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032 21.3 0.335 1.5 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -14.0 0.294 1.32 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032 -14.6 0.377 1.69 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030 43.0 0.453 2.03 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036 74.1 0.418 1.87 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -3.46 0.358 1.6 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031 62.9 0.276 1.23 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030 65.0 0.51 2.28 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -16.2 0.438 1.96 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 8.75 0.292 1.31 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -10.2 0.506 2.26 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019 nan nan nan 10 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020 2.54 0.347 1.55 0 -FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017 -1.09 0.439 1.96 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -6.04 0.222 0.993 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021 -0.695 0.275 1.23 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 10.2 0.485 2.17 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 3.56 0.17 0.759 0 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029 3.19 0.355 1.59 0 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 -5.93 0.304 1.36 0 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027 6.83 0.332 1.49 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016 -5.84 0.227 1.01 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020 13.9 0.7 3.13 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018 -12.4 0.382 1.71 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 -6.21 0.424 1.9 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016 -21.0 0.308 1.38 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 13.2 0.234 1.05 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 8.57 0.835 3.73 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 -8.22 0.342 1.53 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026 15.3 0.241 1.08 0 -FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026 16.3 0.326 1.46 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -1.72 0.344 1.54 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 -7.25 0.489 2.19 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 1.97 1.02 4.56 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 -5.33 0.686 3.07 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 -9.78 1.03 4.6 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005 -11.9 0.619 2.77 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 4.54 0.673 3.01 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 -5.47 0.876 3.92 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -10.8 0.617 2.76 0 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 -3.83 0.474 2.12 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820 -7.29 0.528 2.36 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820 -5.33 0.734 3.28 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -2.35 0.786 3.51 0 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005 -22.0 0.506 2.26 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 -17.4 0.555 2.48 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005 17.5 0.457 2.04 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999 -35.5 0.427 1.91 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999 -26.7 1.02 4.56 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 33.1 0.935 4.08 1 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996 8.0 0.294 1.32 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 3.36 0.418 1.87 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 7.33 0.362 1.62 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -4.07 0.481 2.15 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -2.14 0.523 2.34 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 -5.3 0.602 2.69 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995 -7.39 0.615 2.75 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995 59.5 1.17 5.24 0 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995 -10.3 0.439 1.96 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 -8.05 1.2 5.39 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997 -12.8 0.779 3.48 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -4.9 1.37 6.14 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998 67.2 0.762 3.41 0 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998 -2.5 0.474 2.12 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 02e121c0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,66 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032 10.7 0.29 1.3 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032 84.5 0.247 1.1 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032 21.6 0.161 0.721 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -14.9 0.184 0.825 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032 -13.7 0.212 0.949 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030 43.6 0.234 1.05 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036 73.8 0.189 0.844 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -4.52 0.248 1.11 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031 63.0 0.178 0.796 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030 65.1 0.197 0.882 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -17.1 0.283 1.27 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 9.04 0.25 1.12 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -10.1 0.433 1.93 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020 2.37 0.144 0.645 0 -FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017 0.31 0.135 0.602 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -6.36 0.148 0.66 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021 -0.87 0.156 0.696 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 9.42 0.402 1.8 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 3.38 0.175 0.781 0 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029 2.24 0.403 1.8 0 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 -5.7 0.163 0.728 0 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027 5.22 0.7 3.13 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016 -6.0 0.144 0.645 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020 14.8 0.516 2.31 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018 -10.8 0.418 1.87 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 -6.84 0.136 0.608 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016 -21.5 0.272 1.22 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 13.6 0.103 0.46 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 11.5 0.258 1.15 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 -10.2 0.135 0.602 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026 14.6 0.215 0.963 0 -FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026 15.8 0.149 0.665 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -0.995 0.108 0.484 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 -6.89 0.233 1.04 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 1.37 0.433 1.94 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 -4.47 0.276 1.23 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 -9.55 0.396 1.77 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005 -12.5 0.246 1.1 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 3.78 0.318 1.42 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 -4.04 0.362 1.62 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -8.35 0.4 1.79 0 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 -2.93 0.239 1.07 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820 -5.41 0.319 1.43 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820 -2.79 0.376 1.68 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -2.67 0.225 1.0 0 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005 -21.5 0.358 1.6 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 -23.4 0.309 1.38 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005 10.7 0.222 0.993 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999 -34.5 0.416 1.86 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999 -26.9 0.417 1.87 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 27.1 0.832 3.72 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996 7.86 0.289 1.29 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 2.53 0.483 2.16 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 6.39 0.252 1.13 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -3.58 0.344 1.54 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -2.68 0.341 1.53 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 -5.17 0.256 1.14 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995 -7.38 0.294 1.32 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995 61.4 0.68 2.96 1 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995 -9.91 0.228 1.02 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 -11.9 0.474 2.12 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997 -12.7 0.43 1.92 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -7.35 0.618 2.76 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998 66.3 0.388 1.74 0 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998 -2.11 0.226 1.01 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/no-vs/2fs/missing.py b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/no-vs/2fs/missing.py deleted file mode 100644 index e2da82c2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/no-vs/2fs/missing.py +++ /dev/null @@ -1,19 +0,0 @@ -import os -import glob - -cwd = os.getcwd() -missing = [] -for leg in ['protein', 'water']: - f = glob.glob('*{}.txt'.format(leg))[0] - with open(f, 'r') as infile: - for line in infile: - frg = line.split() - if frg[0] == 'FEP': - continue - if int(frg[3]) > 2: - missing.append(frg[0][4:]) - -missing = list(set(missing)) - -for i in missing: - print(i.replace('_', ' ')) diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 38b2932b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,80 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 -5.33 0.40 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265037 14.66 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265023 0.89 0.15 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265001 10.42 0.32 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -3.90 0.33 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265011 26.64 1.01 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031 62.83 0.20 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 -8.41 0.64 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265004 32.16 0.28 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 4.98 0.45 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265033 -83.97 0.17 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265024 -15.10 0.18 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -1.63 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -6.14 0.18 0 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 -4.08 0.35 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -14.00 0.17 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -3.31 0.16 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265010 -8.80 0.42 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -10.21 0.40 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265033 -73.73 0.28 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265031 -20.80 0.30 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -17.01 0.31 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 3.45 0.12 0 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 -5.99 0.27 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265002 -7.85 0.24 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -10.61 0.47 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 -4.68 0.47 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3264996 35.80 0.36 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265001 2.20 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265036 -10.14 0.17 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265020 5.79 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265035 -2.91 0.27 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 -9.08 0.82 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264998 7.43 0.44 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265015 7.21 0.24 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265003 28.72 0.28 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265022 1.22 0.32 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -2.26 0.37 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 2.53 0.69 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265025 -15.75 0.22 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265016 -3.15 0.11 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 10.16 0.26 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265002 27.11 0.87 0 -FEP_CHEMBL3265027_CHEMBL3265035 -6.05 0.23 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 8.81 0.18 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 -6.71 0.42 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265011 4.98 0.45 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3265006 22.21 0.21 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -2.07 0.53 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 -5.50 0.28 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264998 12.23 0.58 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -4.77 0.86 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265026 21.07 0.18 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 12.98 0.18 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 -8.29 0.21 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995 59.01 0.50 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265000 -67.04 0.47 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265030 111.75 1.00 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265016 12.85 0.26 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265031 -64.36 0.29 0 -FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265021 6.91 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020 14.22 0.26 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265032 -42.76 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265033 -100.16 0.75 0 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3259820 -18.84 0.73 0 -FEP_CHEMBL3265019_CHEMBL3265017 nan nan 10 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265035 -23.22 0.51 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265033 -37.10 0.54 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265037 59.00 0.53 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 30.11 0.79 1 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3265010 11.51 0.53 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 -6.24 0.24 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 8.86 0.58 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 -17.29 0.46 0 -FEP_CHEMBL3265019_CHEMBL3265017 nan nan 10 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 3.78 0.31 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265017 -2.72 0.23 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005 17.31 0.22 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 7.42 0.28 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index be089b61..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/syk/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,79 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 3.32 0.16 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265002 -7.90 0.07 0 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 -5.84 0.12 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -2.75 0.18 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 -11.62 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265011 27.43 0.25 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3264996 34.33 0.24 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 9.53 0.36 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -8.44 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265023 1.40 0.11 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265022 0.18 0.09 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265000 -58.35 0.85 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265031 -21.43 0.14 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -17.15 0.24 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265004 32.81 0.16 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265024 -14.82 0.08 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265001 10.31 0.14 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -2.62 0.19 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264998 12.71 0.35 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265035 -2.25 0.29 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 -9.04 0.28 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -3.79 0.20 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265001 2.31 0.16 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -4.73 0.18 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264998 7.35 0.09 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265033 -84.29 0.21 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265036 -10.85 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 3.81 0.28 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265037 13.68 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 -2.93 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -0.97 0.09 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -10.51 0.24 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -7.24 0.30 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265020 6.01 0.08 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265000 -65.37 0.49 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -14.80 0.14 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265015 5.12 0.17 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265026 21.60 0.08 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265016 -3.41 0.06 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 -10.19 0.09 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265033 -73.48 0.10 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 8.90 0.07 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 -4.47 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 1.65 0.28 0 -FEP_CHEMBL3265027_CHEMBL3265035 -5.30 0.42 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -6.27 0.07 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3265006 21.44 0.33 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265003 28.54 0.17 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031 62.83 0.14 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 -5.09 0.13 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 13.52 0.05 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265010 -8.59 0.13 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 -4.25 0.17 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 -6.79 0.12 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265002 26.87 0.30 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265011 2.78 0.33 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265025 -15.76 0.10 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265000 -66.05 0.22 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995 58.62 0.64 1 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265016 10.64 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265031 -65.24 0.10 0 -FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265021 6.21 0.07 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020 15.21 0.48 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265032 -43.71 0.18 0 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3259820 -18.39 0.24 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265035 -21.37 0.60 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265033 -99.30 0.31 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265037 51.74 0.18 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265033 -46.40 0.47 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265017 -2.50 0.08 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 -23.32 0.13 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 2.93 0.44 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 11.67 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 6.46 0.21 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3265010 12.56 0.22 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005 10.52 0.13 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 24.89 0.82 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 -6.78 0.08 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 56bdbda1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,43 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_5l_5f -3.18 0.12 0.37 0 -FEP_5m_5k -4.85 0.13 0.41 0 -FEP_5b_5c 1.35 0.13 0.42 0 -FEP_5f_5i 0.01 0.11 0.36 0 -FEP_5k_5f 12.06 0.14 0.45 0 -FEP_5i_5g 0.05 0.09 0.29 0 -FEP_5d_7 -34.62 0.12 0.38 0 -FEP_5d_5e 1.97 0.19 0.59 0 -FEP_8e_8a 11.81 0.34 1.08 0 -FEP_1b_1a 2.22 0.09 0.29 0 -FEP_5f_5g -0.25 0.13 0.42 0 -FEP_8f_8e -4.94 0.19 0.61 0 -FEP_5g_5c 14.42 0.17 0.53 0 -FEP_5o_5m -12.49 0.36 1.15 0 -FEP_5p_3b -2.86 0.47 1.49 0 -FEP_5d_5a 10.19 0.12 0.39 0 -FEP_8e_8c -13.19 0.41 1.29 0 -FEP_5p_5n -5.11 0.26 0.82 0 -FEP_8b_8a 2.16 0.18 0.58 0 -FEP_5k_5d 6.96 0.14 0.45 0 -FEP_5e_5a 8.02 0.08 0.26 0 -FEP_3b_7 -48.99 0.16 0.51 0 -FEP_3a_1b 6.90 0.19 0.61 0 -FEP_5l_5b 9.34 0.12 0.39 0 -FEP_5l_5j 4.50 0.25 0.80 0 -FEP_5d_3b 13.94 0.33 1.03 0 -FEP_5h_5f -2.00 0.23 0.72 0 -FEP_5o_5n 2.42 0.30 0.96 0 -FEP_5a_3a 14.27 0.24 0.75 0 -FEP_8f_8b 5.04 0.17 0.52 0 -FEP_8f_8d -14.31 0.21 0.67 0 -FEP_5h_5i -1.85 0.15 0.48 0 -FEP_3a_1a 9.37 0.21 0.67 0 -FEP_5j_5b 4.91 0.10 0.33 0 -FEP_8d_8c -4.73 0.53 1.67 0 -FEP_5b_5a -7.64 0.12 0.39 0 -FEP_3b_3a 10.09 0.12 0.38 0 -FEP_5n_5d -12.22 0.32 1.02 0 -FEP_5i_5a 4.88 0.14 0.44 0 -FEP_5m_5d 2.27 0.09 0.29 0 -FEP_5k_5m 4.65 0.12 0.38 0 -FEP_5m_5i 7.78 0.17 0.53 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index ca937f47..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,43 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_8f_8d -14.04 0.11 0.33 0 -FEP_5k_5f 13.59 0.07 0.23 0 -FEP_3b_7 -50.95 0.09 0.27 0 -FEP_5p_3b -2.58 0.13 0.42 0 -FEP_8e_8c -13.98 0.13 0.42 0 -FEP_5l_5j 4.50 0.11 0.34 0 -FEP_5k_5d 7.53 0.12 0.37 0 -FEP_5f_5i 0.39 0.10 0.33 0 -FEP_5g_5c 13.42 0.06 0.20 0 -FEP_8d_8c -5.82 0.17 0.53 0 -FEP_5j_5b 5.75 0.12 0.38 0 -FEP_5o_5n 1.90 0.20 0.63 0 -FEP_8b_8a 1.80 0.10 0.33 0 -FEP_5d_7 -35.77 0.12 0.39 0 -FEP_5h_5i -0.05 0.11 0.34 0 -FEP_5d_3b 15.01 0.13 0.42 0 -FEP_5o_5m -12.03 0.25 0.78 0 -FEP_5f_5g 1.22 0.10 0.33 0 -FEP_5d_5a 10.99 0.08 0.26 0 -FEP_5a_3a 15.25 0.08 0.24 0 -FEP_8f_8b 4.62 0.07 0.22 0 -FEP_8e_8a 12.30 0.11 0.35 0 -FEP_5l_5f -3.64 0.11 0.34 0 -FEP_5i_5g 1.29 0.19 0.60 0 -FEP_5m_5k -6.07 0.08 0.27 0 -FEP_5d_5e 1.36 0.05 0.14 0 -FEP_5l_5b 10.04 0.15 0.47 0 -FEP_8f_8e -6.29 0.09 0.30 0 -FEP_5b_5c 1.01 0.10 0.33 0 -FEP_5p_5n -4.99 0.19 0.60 0 -FEP_1b_1a 1.23 0.13 0.40 0 -FEP_3a_1a 5.06 0.13 0.42 0 -FEP_5e_5a 9.63 0.13 0.40 0 -FEP_3a_1b 4.30 0.08 0.25 0 -FEP_5h_5f -0.56 0.08 0.26 0 -FEP_5b_5a -8.63 0.12 0.37 0 -FEP_3b_3a 10.87 0.10 0.32 0 -FEP_5n_5d -12.23 0.34 1.08 0 -FEP_5i_5a 4.62 0.07 0.23 0 -FEP_5m_5d 1.72 0.09 0.28 0 -FEP_5k_5m 5.98 0.08 0.25 0 -FEP_5m_5i 8.27 0.11 0.34 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/merged/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/merged/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 42bb7bd2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/merged/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_5m_5k -4.71 0.214 0.957 0 -FEP_5o_5m -12.5 0.584 2.61 0 -FEP_5k_5f 12.1 0.228 1.02 0 -FEP_5k_5d 6.69 0.184 0.825 0 -FEP_5f_5i 0.16 0.149 0.665 0 -FEP_5f_5g 0.08 0.184 0.822 0 -FEP_5h_5f -1.98 0.28 1.25 0 -FEP_5i_5g 0.03 0.142 0.636 0 -FEP_5h_5i -1.83 0.234 1.05 0 -FEP_5g_5c 14.0 0.248 1.11 0 -FEP_5d_3b 13.9 0.414 1.85 0 -FEP_5d_5e 2.01 0.242 1.08 0 -FEP_5d_7 -34.6 0.2 0.894 0 -FEP_3b_7 -49.0 0.219 0.981 0 -FEP_5p_3b -3.66 0.658 2.94 0 -FEP_5e_5a 8.07 0.301 1.35 0 -FEP_5o_5n 2.15 0.476 2.13 0 -FEP_5p_5n -5.19 0.382 1.71 0 -FEP_5l_5j 4.47 0.302 1.35 0 -FEP_5l_5b 9.37 0.163 0.728 0 -FEP_5b_5c 1.5 0.164 0.733 0 -FEP_5j_5b 4.98 0.172 0.769 0 -FEP_5b_5a -7.72 0.13 0.581 0 -FEP_5a_3a 14.1 0.347 1.55 0 -FEP_3a_1a 9.39 0.304 1.36 0 -FEP_3a_1b 6.78 0.298 1.33 0 -FEP_1b_1a 2.18 0.135 0.602 0 -FEP_8f_8e -4.92 0.206 0.922 0 -FEP_8f_8d -14.4 0.225 1.0 0 -FEP_8f_8b 5.11 0.255 1.14 0 -FEP_8e_8c -13.8 0.491 2.2 0 -FEP_8e_8a 11.9 0.4 1.79 0 -FEP_8d_8c -4.71 0.664 2.97 0 -FEP_8b_8a 2.15 0.211 0.943 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/merged/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/merged/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 9ff7c151..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/merged/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_5m_5k -6.15 0.144 0.645 0 -FEP_5o_5m -12.3 0.398 1.78 0 -FEP_5k_5f 13.5 0.099 0.443 0 -FEP_5k_5d 7.63 0.134 0.6 0 -FEP_5f_5i 0.585 0.149 0.665 0 -FEP_5f_5g 1.31 0.149 0.665 0 -FEP_5h_5f -0.47 0.0894 0.4 0 -FEP_5i_5g 0.945 0.22 0.982 0 -FEP_5h_5i 0.08 0.163 0.728 0 -FEP_5g_5c 13.4 0.1 0.447 0 -FEP_5d_3b 15.2 0.143 0.64 0 -FEP_5d_5e 1.41 0.13 0.581 0 -FEP_5d_7 -35.9 0.216 0.967 0 -FEP_3b_7 -51.2 0.114 0.51 0 -FEP_5p_3b -2.27 0.327 1.43 1 -FEP_5e_5a 9.54 0.164 0.733 0 -FEP_5o_5n 1.62 0.32 1.43 0 -FEP_5p_5n -5.21 0.347 1.55 0 -FEP_5l_5j 4.43 0.125 0.56 0 -FEP_5l_5b 10.0 0.175 0.782 0 -FEP_5b_5c 0.98 0.122 0.546 0 -FEP_5j_5b 5.71 0.156 0.699 0 -FEP_5b_5a -8.62 0.134 0.6 0 -FEP_5a_3a 15.3 0.106 0.475 0 -FEP_3a_1a 4.88 0.264 1.18 0 -FEP_3a_1b 4.08 0.106 0.475 0 -FEP_1b_1a 1.08 0.17 0.762 0 -FEP_8f_8e -6.21 0.114 0.51 0 -FEP_8f_8d -14.2 0.142 0.636 0 -FEP_8f_8b 4.74 0.099 0.443 0 -FEP_8e_8c -14.0 0.158 0.707 0 -FEP_8e_8a 12.4 0.149 0.665 0 -FEP_8d_8c -5.83 0.214 0.957 0 -FEP_8b_8a 1.67 0.117 0.522 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e7ac46d4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/no-vs/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,2 +0,0 @@ -FEP_8d-8c protein/ -FEP_8e-8c protein/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 3674c6ef..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,37 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_5d_5e 2.05 0.15 0 -FEP_5a_3a 13.92 0.25 0 -FEP_5d_7 -34.62 0.16 0 -FEP_8e_8a 11.96 0.21 0 -FEP_5k_5d 6.41 0.12 0 -FEP_3a_1b 6.65 0.23 0 -FEP_5n_5p 5.27 0.28 0 -FEP_1a_1b -2.14 0.10 0 -FEP_5b_5j -5.06 0.14 0 -FEP_8b_8a 2.13 0.11 0 -FEP_5e_5a 8.12 0.29 0 -FEP_5m_5k -4.57 0.17 0 -FEP_5o_5n 1.87 0.37 0 -FEP_5f_5l 3.22 0.11 0 -FEP_5f_5i 0.31 0.10 0 -FEP_5g_5c 13.56 0.18 0 -FEP_8f_8d -14.45 0.08 0 -FEP_5f_5g 0.41 0.13 0 -FEP_5a_1a 22.97 0.24 0 -FEP_3b_7 -48.97 0.15 0 -FEP_5k_5f 12.06 0.18 0 -FEP_5p_3b -4.46 0.46 0 -FEP_3a_1a 9.41 0.22 0 -FEP_5l_5j 4.45 0.17 0 -FEP_5f_5h 1.97 0.16 0 -FEP_5i_5h 1.81 0.18 0 -FEP_8f_8e -4.89 0.08 0 -FEP_8f_8b 5.18 0.19 0 -FEP_5l_5b 9.39 0.11 0 -FEP_5m_5o 12.46 0.46 0 -FEP_5b_5c 1.65 0.10 0 -FEP_5d_3b 13.85 0.25 0 -FEP_5i_5g 0.01 0.11 0 -FEP_8c_8d 4.69 0.40 0 -FEP_8c_8e 14.31 0.27 0 -FEP_5a_5b 7.81 0.05 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 3ac53069..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/OPLS2015/tnks2/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,39 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_8d_8c -5.89 0.28 0 -FEP_5d_5e 1.46 0.12 0 -FEP_5a_3a 15.45 0.07 0 -FEP_5d_7 -36.00 0.18 0 -FEP_8e_8a 12.47 0.10 0 -FEP_5k_5d 7.73 0.06 0 -FEP_3a_1b 3.86 0.07 0 -FEP_5n_5p 5.42 0.29 0 -FEP_1a_1b -0.94 0.11 0 -FEP_5b_5j -5.68 0.10 0 -FEP_8b_8a 1.53 0.06 0 -FEP_5e_5a 9.45 0.10 0 -FEP_5m_5k -6.23 0.12 0 -FEP_5o_5n 1.35 0.25 0 -FEP_5f_5l 3.71 0.04 0 -FEP_5f_5i 0.78 0.11 0 -FEP_5g_5c 13.40 0.08 0 -FEP_8f_8d -14.35 0.09 0 -FEP_5f_5g 1.41 0.11 0 -FEP_8e_8c -14.12 0.18 0 -FEP_5a_1a 20.30 0.11 0 -FEP_3b_7 -51.48 0.07 0 -FEP_5k_5f 13.46 0.07 0 -FEP_5p_3b -1.96 0.30 1 -FEP_3a_1a 4.69 0.23 0 -FEP_5l_5j 4.36 0.06 0 -FEP_5f_5h 0.38 0.04 0 -FEP_5i_5h -0.21 0.12 0 -FEP_8f_8e -6.12 0.07 0 -FEP_8f_8b 4.86 0.07 0 -FEP_5l_5b 10.04 0.09 0 -FEP_5m_5o 12.49 0.31 0 -FEP_5b_5c 0.95 0.07 0 -FEP_5d_3b 15.36 0.06 0 -FEP_5i_5g 0.60 0.11 0 -FEP_8c_8d 5.83 0.13 0 -FEP_8c_8e 14.09 0.09 0 -FEP_5a_5b 8.60 0.06 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligand_matrix-checkpoint.ipynb b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligand_matrix-checkpoint.ipynb deleted file mode 100755 index e8c79573..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligand_matrix-checkpoint.ipynb +++ /dev/null @@ -1,53 +0,0 @@ -{ - "cells": [ - { - "cell_type": "code", - "execution_count": null, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "import os\n", - "os.chdir(r'/home/alejand/fep_uppsala/1.JACS/2.CDK2/1.Q/1.ligprep/')" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": null, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "import pandas as pd\n", - "\n", - "ligands = pd.DataFrame()" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": null, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [] - } - ], - "metadata": { - "kernelspec": { - "display_name": "Python [conda env:rdkit_env]", - "language": "python", - "name": "conda-env-rdkit_env-py" - }, - "language_info": { - "codemirror_mode": { - "name": "ipython", - "version": 3 - }, - "file_extension": ".py", - "mimetype": "text/x-python", - "name": "python", - "nbconvert_exporter": "python", - "pygments_lexer": "ipython3", - "version": "3.7.3" - } - }, - "nbformat": 4, - "nbformat_minor": 2 -} diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligands-checkpoint.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligands-checkpoint.sdf deleted file mode 100755 index d3ce7932..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligands-checkpoint.sdf +++ /dev/null @@ -1,3692 +0,0 @@ -43 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3694 12.3608 -12.0100 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5170 11.8053 -10.7333 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7298 10.5799 -13.0278 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9915 11.7687 -13.1228 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8213 10.0100 -11.7550 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2397 10.6196 -10.6003 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6092 9.7471 -9.5124 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2773 8.7308 -9.9855 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4143 8.8607 -11.2979 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3268 9.8907 -8.0257 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3565 13.7183 -11.5055 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5483 13.6363 -12.1897 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9477 14.5322 -12.9368 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9513 10.4999 -7.7281 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8738 11.7695 -7.1531 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6094 12.3134 -6.9136 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4376 11.5622 -7.2444 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5099 10.2841 -7.8101 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7961 9.7769 -8.0457 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0914 13.5427 -6.3707 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7880 13.5314 -6.3772 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3819 12.3721 -6.8788 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9505 12.1058 -6.9728 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7111 12.5665 -10.8449 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2188 12.9372 -10.9792 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1852 14.4611 -10.9536 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5089 14.9092 -11.5986 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7019 12.4742 -12.1199 F 0 0 0 0 0 0 - -1.4726 12.4435 -9.9943 F 0 0 0 0 0 0 - -6.0887 12.2893 -9.8700 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1938 10.1290 -13.8927 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8742 12.2301 -14.0952 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9091 8.1541 -11.8345 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0898 10.5513 -7.6049 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4625 8.9415 -7.5064 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7657 12.3184 -6.9082 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6226 9.7123 -8.0525 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9028 8.7968 -8.4854 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6421 14.3891 -5.9955 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3702 12.9568 -6.6055 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6665 11.9284 -8.0015 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7037 11.2249 -6.3851 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9410 12.5478 -9.7815 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8926 11.6034 -11.3224 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1199 14.8153 -9.9199 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3204 14.8723 -11.4772 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3224 15.2093 -12.6316 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9605 15.7276 -11.0393 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 27 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 25 29 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 -M END -> -43 - -> -0.002 - -$$$$ -17 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 44 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3808 12.3686 -12.0119 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5112 11.8116 -10.7365 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7301 10.5824 -13.0300 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9992 11.7782 -13.1263 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8250 10.0166 -11.7542 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2407 10.6266 -10.6010 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6094 9.7513 -9.5103 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2849 8.7404 -9.9846 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4192 8.8674 -11.2983 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3225 9.8872 -8.0242 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3834 13.6199 -11.4933 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4237 14.7282 -11.5789 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5369 13.6139 -12.1980 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8771 14.5161 -12.9653 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9516 10.5005 -7.7272 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8803 11.7722 -7.1539 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6129 12.3159 -6.9118 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4418 11.5625 -7.2429 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5059 10.2842 -7.8062 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7935 9.7780 -8.0417 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0936 13.5458 -6.3664 N 0 0 0 0 0 0 - -2.7885 13.5288 -6.3742 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3831 12.3683 -6.8823 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0562 12.2861 -9.8790 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1818 10.1228 -13.8979 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8754 12.2375 -14.0963 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9135 8.1599 -11.8328 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0847 10.5486 -7.6052 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4513 8.9399 -7.4976 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1150 12.8057 -10.9566 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8208 14.7394 -10.6724 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8878 15.7111 -11.6718 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7196 14.6037 -12.4046 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7772 12.3192 -6.9132 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6153 9.7128 -8.0447 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8994 8.7979 -8.4799 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3694 12.0252 -7.0275 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0479 14.6272 -5.8866 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4767 15.4758 -5.5103 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6764 14.9519 -6.7159 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6761 14.2304 -5.0891 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 27 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 28 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 38 40 1 0 0 0 - 38 41 1 0 0 0 -M END -> -17 - -> -0.28 - -$$$$ -28 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 55 0 0 1 0 999 V2000 - -6.4084 12.3297 -11.9887 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5165 11.7544 -10.7314 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7418 10.5517 -13.0215 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0245 11.7463 -13.1093 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8268 9.9859 -11.7428 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2396 10.5800 -10.6042 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6095 9.7151 -9.5092 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2849 8.7010 -9.9773 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4373 8.8403 -11.2922 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3311 9.8727 -8.0225 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6734 13.4955 -12.1182 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9616 10.4819 -7.7358 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8034 9.7678 -8.0459 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5615 10.3255 -7.7934 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4526 11.6006 -7.2315 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6161 12.3136 -6.9153 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8662 11.7565 -7.1617 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1079 12.1894 -6.9634 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7834 13.4363 -6.4469 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4443 13.4911 -6.3955 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1636 12.4174 -6.8067 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8107 11.6018 -7.1804 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3735 14.6113 -5.9298 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8857 14.5071 -13.1620 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6042 14.8313 -13.9092 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6374 15.2080 -12.9343 O 0 0 0 0 0 0 - -3.2854 14.1223 -12.1198 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5109 13.8217 -11.2574 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0682 12.2161 -9.8713 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2010 10.1101 -13.8868 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9267 12.2174 -14.0767 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9595 8.1575 -11.8226 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0925 10.5250 -7.5864 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4209 8.9193 -7.5085 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8800 8.7854 -8.4838 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6672 9.7633 -8.0389 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5421 13.2992 -6.4778 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7571 12.3125 -6.9195 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3892 14.2694 -6.1271 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6149 10.6243 -7.5849 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0200 14.9384 -6.7449 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9846 14.2825 -5.0890 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2640 15.4377 -5.6195 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2295 15.4249 -12.6765 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6795 14.2190 -13.8644 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6857 15.5804 -14.6607 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3009 13.9383 -14.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3629 14.3192 -11.5703 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0794 13.2286 -12.7328 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6912 14.6543 -10.5882 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2185 12.9480 -10.6599 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 25 47 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 28 51 1 0 0 0 -M END -> -28 - -> -30 - -$$$$ -22 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3943 12.3306 -11.9839 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5449 11.7624 -10.7224 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7389 10.5318 -13.0493 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9892 11.7416 -13.1218 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8445 9.9757 -11.7834 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2758 10.5697 -10.6136 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6401 9.7111 -9.5254 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3075 8.6850 -10.0132 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4539 8.8245 -11.3160 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3472 9.8680 -8.0446 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5569 13.6094 -12.1739 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9691 10.4796 -7.7443 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8622 11.7497 -7.1624 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6000 12.2988 -6.9070 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4496 11.5829 -7.2293 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5554 10.3089 -7.8035 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8209 9.7667 -8.0554 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0956 12.1660 -6.9654 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7384 13.4130 -6.4683 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4069 13.4502 -6.4129 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1813 12.3566 -6.8171 N 0 0 0 0 0 0 - -0.7988 11.5478 -7.1867 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4282 14.5550 -5.9664 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7714 14.2106 -11.2027 N 0 0 0 0 0 0 - -4.2061 15.2849 -11.7862 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6883 15.3268 -13.0997 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5027 14.2765 -13.3098 N 0 0 0 0 0 0 - -4.5364 13.8232 -9.7989 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1220 12.1694 -9.8642 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1658 10.0922 -13.9365 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8689 12.2077 -14.0813 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9525 8.1221 -11.8662 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4314 8.9174 -7.5157 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0944 10.5330 -7.6015 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7507 12.3127 -6.9154 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5195 13.2804 -6.4580 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6726 9.7529 -8.0470 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8924 8.7835 -8.5028 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3320 14.2647 -6.1602 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6146 10.5716 -7.5810 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0432 14.2275 -5.1327 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1881 15.4011 -5.6571 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0785 14.8647 -6.7815 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5385 15.9338 -11.2484 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4386 16.0565 -13.8570 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0519 14.6585 -9.2909 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8437 12.9692 -9.7547 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4214 13.7994 -9.1880 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 27 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 28 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 -M END -> -22 - -> -0.032 - -$$$$ -16 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3886 12.3706 -12.0044 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5217 11.8105 -10.7338 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7267 10.5778 -13.0331 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9997 11.7772 -13.1264 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8245 10.0105 -11.7588 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2447 10.6240 -10.5997 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6157 9.7479 -9.5130 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2818 8.7335 -9.9900 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4155 8.8614 -11.3010 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3377 9.8874 -8.0251 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4115 13.6449 -11.4457 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4644 14.7678 -11.5034 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5490 13.6243 -12.1808 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8784 14.5204 -12.9613 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9596 10.4818 -7.7362 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8460 11.7538 -7.1602 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5819 12.3007 -6.9160 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4335 11.5746 -7.2403 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5461 10.3067 -7.8068 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8068 9.7600 -8.0558 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4568 13.6807 -6.3006 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0743 12.2887 -9.8728 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1728 10.1132 -13.9065 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8713 12.2373 -14.0952 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9100 8.1539 -11.8356 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0973 10.5468 -7.6004 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4473 8.9276 -7.5184 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1460 12.8361 -10.8988 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4475 14.4022 -11.3420 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6702 15.4633 -10.6915 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4486 15.3231 -12.4449 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7333 12.3169 -6.9116 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4555 11.9950 -7.0528 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6550 9.7463 -8.0534 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8912 8.7783 -8.5004 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4890 14.4469 -7.0749 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5248 13.7811 -5.7425 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2684 13.8625 -5.5988 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 4 24 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 33 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 34 1 0 0 0 - 20 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 -M END -> -16 - -> -0.17 - -$$$$ -30 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3720 12.3564 -12.0094 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5328 11.8103 -10.7336 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7318 10.5755 -13.0290 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9898 11.7633 -13.1279 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8210 10.0065 -11.7558 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2477 10.6184 -10.6026 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6140 9.7458 -9.5136 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2690 8.7218 -9.9879 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4092 8.8538 -11.2990 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3381 9.8926 -8.0280 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3458 13.7121 -11.5140 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5478 13.6364 -12.1864 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9572 14.5395 -12.9136 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9581 10.4851 -7.7363 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8068 9.7633 -8.0566 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5506 10.3101 -7.8085 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4405 11.5856 -7.2383 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5911 12.3019 -6.9155 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8461 11.7538 -7.1583 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0993 12.1777 -6.9729 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7708 13.4214 -6.4416 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4313 13.4856 -6.3949 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1723 12.4145 -6.8299 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8042 11.6008 -7.2039 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3889 14.5981 -5.9187 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6987 12.5799 -10.8351 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1930 12.9387 -10.9658 C 0 0 2 0 0 0 - -2.1862 14.4653 -10.9438 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5086 14.9068 -11.5988 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6500 12.4417 -12.1854 O 0 0 0 0 0 0 - -6.1228 12.3020 -9.8704 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1946 10.1248 -13.8941 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8719 12.2188 -14.1038 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9012 8.1471 -11.8351 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1102 10.5319 -7.5935 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4404 8.9270 -7.5371 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8882 8.7805 -8.5006 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6630 9.7449 -8.0588 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5090 13.2838 -6.4768 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7306 12.3145 -6.9043 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3781 14.2464 -6.1018 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6071 10.6213 -7.6157 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2361 15.4217 -5.5765 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0353 14.9583 -6.7244 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0204 14.2664 -5.0904 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9494 12.5468 -9.7772 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8987 11.6278 -11.3169 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6028 12.5034 -10.1600 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1219 14.8241 -9.9090 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3279 14.8751 -11.4738 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3274 15.2143 -12.6293 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 15.7190 -11.0435 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7819 12.8449 -12.3329 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -30 - -> -0.003 - -$$$$ -21 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3865 12.3338 -12.0432 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4856 11.7841 -10.7704 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7472 10.5643 -13.0426 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0167 11.7500 -13.1460 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8303 10.0081 -11.7598 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2256 10.6149 -10.6156 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6010 9.7518 -9.5145 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2842 8.7423 -9.9828 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4323 8.8733 -11.2925 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3270 9.8938 -8.0225 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5587 13.5285 -12.2266 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9618 10.4909 -7.7327 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8582 11.7635 -7.1652 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6045 12.3140 -6.9191 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4477 11.5945 -7.2362 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5614 10.3184 -7.7958 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8112 9.7685 -8.0438 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1002 12.1716 -6.9783 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7494 13.4275 -6.4902 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4141 13.4605 -6.4332 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1744 12.3664 -6.8143 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8092 11.5630 -7.1796 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4176 14.5730 -6.0003 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4279 13.9049 -11.5130 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0090 15.0294 -12.0677 N 0 0 0 0 0 0 - -4.8449 15.3445 -13.0534 C 0 0 0 0 0 0 - -5.7816 14.4464 -13.2081 N 0 0 0 0 0 0 - -2.9003 15.7800 -11.6435 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0033 12.2571 -9.9302 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2085 10.1086 -13.9036 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9107 12.2133 -14.1195 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9502 8.1807 -11.8157 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4150 8.9297 -7.5146 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0903 10.5352 -7.5767 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7489 12.3218 -6.9239 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5244 13.2981 -6.4811 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6700 9.7533 -8.0396 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8938 8.7844 -8.4823 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3367 14.2768 -6.1925 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6184 10.5668 -7.5609 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0791 14.8637 -6.8199 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0264 14.2592 -5.1502 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1971 15.4244 -5.7161 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8953 13.4661 -10.6706 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6948 16.2656 -13.6196 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2685 16.3921 -10.8459 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6068 16.4484 -12.4038 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0360 15.1571 -11.3689 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 24 2 0 0 0 - 11 27 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 -M END -> -21 - -> -0.078 - -$$$$ -24 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3515 12.3530 -11.9813 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5085 11.7912 -10.7247 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6802 10.5716 -13.0438 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9296 11.7657 -13.1245 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7980 10.0044 -11.7669 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2328 10.6109 -10.5989 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6209 9.7375 -9.5162 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2754 8.7446 -9.9970 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4233 8.8800 -11.3218 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3328 9.8812 -8.0296 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3004 14.2773 -13.1499 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4346 15.5261 -12.8998 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5896 13.5586 -12.0343 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9706 10.4906 -7.7317 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8616 11.7632 -7.1684 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6051 12.3126 -6.9180 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4544 11.5948 -7.2294 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5626 10.3128 -7.8011 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8160 9.7710 -8.0425 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1083 12.1736 -6.9694 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7503 13.4247 -6.4858 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4131 13.4674 -6.4189 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1758 12.3735 -6.8057 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8094 11.5620 -7.1791 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4060 14.5705 -5.9896 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6528 14.0066 -14.2746 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0624 12.2581 -9.8612 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1172 10.1173 -13.9162 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8256 12.2012 -14.0958 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9432 8.1901 -11.8473 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0986 10.5389 -7.5828 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4252 8.9299 -7.5158 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1820 15.6085 -11.8419 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9911 16.4102 -13.1903 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4935 15.4841 -13.4268 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2195 13.8866 -11.1438 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7535 12.3213 -6.9230 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5307 13.2966 -6.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6732 9.7534 -8.0369 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8952 8.7834 -8.4850 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3455 14.2746 -6.1808 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6187 10.5735 -7.5589 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2064 15.4259 -5.7003 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0748 14.8695 -6.8055 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0202 14.2589 -5.1325 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 -M END -> -24 - -> -0.029 - -$$$$ -38 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 56 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3676 12.3632 -12.0183 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5148 11.8066 -10.7373 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7147 10.5754 -13.0306 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9819 11.7689 -13.1253 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8143 10.0109 -11.7564 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2414 10.6177 -10.6023 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6126 9.7466 -9.5122 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2846 8.7319 -9.9810 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4146 8.8618 -11.2972 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3363 9.8918 -8.0268 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3648 13.7196 -11.5032 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5453 13.6325 -12.1937 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9402 14.5231 -12.9481 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9634 10.4852 -7.7356 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8111 9.7655 -8.0524 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5521 10.3143 -7.8018 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4442 11.5871 -7.2318 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5964 12.3037 -6.9134 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8531 11.7536 -7.1622 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1000 12.1772 -6.9659 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7711 13.4213 -6.4318 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4319 13.4866 -6.3915 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1707 12.4146 -6.8487 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8042 11.5996 -7.2054 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3852 14.5927 -5.9060 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7189 12.5724 -10.8441 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2354 12.9457 -10.9732 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1905 14.4637 -10.9533 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5123 14.9092 -11.5998 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7098 12.4700 -12.1164 F 0 0 0 0 0 0 - -1.5166 12.4356 -9.9564 F 0 0 0 0 0 0 - -6.0854 12.2873 -9.8679 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1679 10.1186 -13.8995 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8666 12.2247 -14.0971 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9103 8.1575 -11.8383 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0986 10.5466 -7.5979 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4470 8.9289 -7.5188 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8883 8.7824 -8.4957 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6652 9.7513 -8.0474 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5192 13.2882 -6.4744 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7396 12.3174 -6.9137 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3784 14.2455 -6.0873 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6046 10.6289 -7.6232 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2453 15.4154 -5.5642 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0272 14.9481 -6.7089 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0083 14.2549 -5.0808 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9411 12.5479 -9.7813 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8894 11.5999 -11.3211 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1219 14.8121 -9.9254 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3187 14.8698 -11.4768 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3209 15.2060 -12.6318 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9535 15.7329 -11.0386 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 10 37 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 27 31 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 -M END -> -38 - -> -0.005 - -$$$$ -31 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3709 12.3579 -12.0062 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5187 11.8083 -10.7296 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7194 10.5704 -13.0321 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9838 11.7645 -13.1240 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8186 10.0073 -11.7576 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2434 10.6206 -10.5991 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6160 9.7494 -9.5117 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2808 8.7336 -9.9894 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4141 8.8594 -11.3008 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3385 9.8886 -8.0248 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3631 13.7190 -11.4993 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5500 13.6364 -12.1907 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9462 14.5251 -12.9474 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9607 10.4852 -7.7356 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8097 9.7639 -8.0527 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5522 10.3124 -7.8024 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4444 11.5885 -7.2376 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5952 12.3052 -6.9174 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8509 11.7557 -7.1626 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1000 12.1783 -6.9759 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7654 13.4353 -6.4786 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4305 13.4892 -6.4172 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1699 12.4025 -6.8093 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8029 11.5856 -7.1770 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3883 14.6074 -5.9669 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5134 14.9066 -11.6049 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2037 14.4678 -10.9376 C 0 0 1 0 0 0 - -2.2231 12.9442 -10.9826 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7200 12.5740 -10.8214 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0475 15.0410 -11.4860 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0905 12.2941 -9.8658 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1712 10.1113 -13.9056 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8587 12.2252 -14.0930 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9068 8.1511 -11.8353 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1007 10.5426 -7.5968 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4435 8.9253 -7.5227 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8934 8.7808 -8.4968 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6611 9.7503 -8.0475 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5122 13.2860 -6.4777 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7378 12.3164 -6.9148 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3612 14.2786 -6.1713 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6010 10.5907 -7.5580 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2314 15.4494 -5.6631 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0518 14.9316 -6.7715 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0048 14.2986 -5.1213 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3147 15.1479 -12.6510 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9414 15.7669 -11.0946 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2172 14.7609 -9.8839 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8304 12.6225 -11.9538 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5481 12.4842 -10.2524 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9432 12.6118 -9.7567 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9036 11.5934 -11.2745 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2694 15.5207 -12.3068 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -31 - -> -0.002 - -$$$$ -41 - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 59 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3365 12.3514 -12.0169 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4737 11.7818 -10.7533 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7043 10.5771 -13.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9700 11.7706 -13.1413 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8117 10.0060 -11.7679 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2142 10.6153 -10.6085 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6079 9.7475 -9.5180 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2848 8.7450 -9.9896 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4180 8.8715 -11.3012 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3345 9.8877 -8.0248 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3847 13.7235 -11.4418 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5533 13.6485 -12.1711 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9795 14.5724 -12.8566 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9627 10.4850 -7.7364 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8552 11.7581 -7.1652 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5966 12.3060 -6.9181 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4424 11.5865 -7.2381 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5593 10.3139 -7.8013 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8122 9.7647 -8.0513 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0942 12.1662 -6.9781 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7414 13.4274 -6.4937 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4089 13.4560 -6.4321 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1814 12.3590 -6.8068 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8029 11.5527 -7.1728 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4236 14.5699 -5.9945 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7594 15.0422 -11.2114 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3424 15.0924 -11.7154 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5130 13.9202 -11.2644 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1771 12.5990 -11.6641 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6239 12.4833 -11.0641 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0203 12.2640 -9.8874 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1715 10.1187 -13.9133 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8628 12.2427 -14.1041 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9193 8.1643 -11.8362 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0961 10.5380 -7.5913 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4318 8.9209 -7.5184 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7443 12.3180 -6.9210 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5105 13.2878 -6.4761 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6670 9.7505 -8.0456 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8966 8.7819 -8.4933 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3275 14.2803 -6.2000 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6107 10.5549 -7.5458 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1867 15.4238 -5.7057 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0912 14.8675 -6.8032 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0319 14.2596 -5.1462 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6902 15.1046 -10.1315 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3521 15.8883 -11.5628 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4316 15.1240 -12.7851 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8360 16.0057 -11.4240 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2586 13.9646 -10.2112 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5771 14.0998 -11.7264 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1550 12.4998 -12.7567 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5317 11.7847 -11.3278 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5224 12.4160 -9.9808 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0278 11.5608 -11.5111 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 28 51 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 29 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 - 30 55 1 0 0 0 -M END -> -41 - -> -0.006 - -$$$$ -29 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3727 12.3493 -11.9877 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5190 11.8167 -10.7261 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6919 10.5755 -13.0077 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9476 11.7646 -13.1157 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8131 10.0080 -11.7494 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2399 10.6155 -10.5946 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6088 9.7430 -9.5107 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2764 8.7286 -9.9647 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4188 8.8758 -11.2882 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3326 9.8988 -8.0180 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4060 13.8057 -12.2007 S 0 0 0 0 0 0 - -5.9763 10.4855 -7.7248 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8692 11.7523 -7.1523 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6115 12.3005 -6.8946 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4415 11.5837 -7.2014 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5677 10.3182 -7.7642 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8209 9.7630 -8.0308 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1027 12.1584 -6.9334 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7604 13.4248 -6.4226 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4260 13.4533 -6.3925 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1594 12.3444 -6.7934 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8210 11.5507 -7.1379 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4194 14.5816 -5.9703 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4605 13.4170 -13.2280 O 0 0 0 0 0 0 - -6.3362 14.9020 -12.4291 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5495 14.1196 -10.6911 N 0 0 0 0 0 0 - -3.3000 13.4420 -10.3686 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0717 13.9935 -11.0748 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2627 14.2439 -9.6094 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0958 12.2837 -9.8431 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1384 10.1166 -13.9015 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8216 12.2011 -14.0642 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9542 8.2051 -11.8388 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1029 10.5216 -7.5592 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4192 8.9159 -7.5103 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7593 12.3241 -6.9156 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5452 13.3016 -6.4614 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6739 9.7489 -8.0044 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8885 8.7827 -8.4653 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3647 14.2437 -6.1001 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6238 10.5910 -7.5497 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0441 14.8389 -6.8193 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0232 14.2959 -5.1361 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2125 15.4354 -5.7291 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8494 14.9008 -10.1205 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3804 12.3527 -10.1831 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2874 13.2998 -11.3738 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1931 14.8215 -11.7603 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5807 15.2116 -9.2431 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5514 13.7432 -8.9374 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 24 2 0 0 0 - 11 25 2 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 -M END -> -29 - -> -0.18 - -$$$$ -26 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3961 12.3155 -12.0234 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5478 11.7864 -10.7392 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7431 10.5278 -13.0269 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0034 11.6993 -13.1368 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8411 9.9886 -11.7443 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2672 10.6062 -10.5986 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6276 9.7408 -9.5022 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2893 8.7195 -9.9713 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4361 8.8492 -11.2847 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3404 9.8857 -8.0208 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4704 14.2158 -13.3316 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5218 15.3458 -13.0035 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5814 13.4696 -12.1774 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9630 10.4847 -7.7359 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8538 11.7563 -7.1621 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5953 12.3060 -6.9160 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4449 11.5852 -7.2379 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5560 10.3115 -7.8043 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8130 9.7655 -8.0531 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0905 12.1634 -6.9778 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7398 13.4211 -6.5005 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4007 13.4556 -6.4362 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1858 12.3500 -6.8082 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8018 11.5473 -7.1675 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4333 14.5672 -6.0053 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0131 14.0330 -14.4162 O 0 0 0 0 0 0 - -4.6790 13.9767 -11.1295 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0830 15.2556 -11.5883 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0962 12.2658 -9.8826 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1870 10.0577 -13.8855 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8795 12.1118 -14.1147 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9222 8.1396 -11.8208 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0988 10.5399 -7.5898 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4364 8.9228 -7.5168 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9540 16.3099 -13.2674 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6823 15.2203 -13.6539 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7414 12.3166 -6.9126 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5135 13.2868 -6.4745 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6700 9.7492 -8.0515 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8944 8.7825 -8.4962 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3279 14.2814 -6.2111 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6186 10.5482 -7.5365 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0982 14.8611 -6.8185 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0414 14.2576 -5.1551 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1781 15.4224 -5.7186 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1658 14.0954 -10.1642 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8858 13.2419 -10.9644 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9931 15.3118 -11.4698 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5445 16.0482 -11.0233 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 12 28 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -26 - -> -0.036 - -$$$$ -20 - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 58 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3740 12.3524 -12.0161 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5100 11.8065 -10.7374 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7222 10.5841 -13.0265 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9887 11.7756 -13.1353 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8163 10.0177 -11.7563 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2425 10.6185 -10.6022 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6172 9.7487 -9.5090 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2846 8.7289 -9.9848 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4176 8.8659 -11.2967 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3368 9.8884 -8.0257 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4023 13.6480 -11.4578 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4623 14.7747 -11.4948 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5331 13.6158 -12.1961 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8776 14.5022 -12.9731 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9585 10.4860 -7.7354 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8494 11.7555 -7.1596 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5968 12.3068 -6.9148 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4468 11.5860 -7.2370 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5513 10.3089 -7.8057 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8090 9.7654 -8.0523 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0901 12.1669 -6.9801 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7479 13.4121 -6.4872 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3990 13.4663 -6.4328 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1869 12.3691 -6.8386 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8034 11.5628 -7.1902 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4389 14.5894 -5.9640 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5042 14.2139 -4.8744 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6302 13.6295 -5.4977 O 0 0 0 0 0 0 - 0.9501 13.1612 -3.9053 C 0 0 0 0 0 0 - 2.0179 15.4484 -4.1037 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0870 12.2815 -9.8767 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1782 10.1403 -13.8916 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8882 12.2326 -14.1065 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9139 8.1642 -11.8383 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4382 8.9312 -7.5247 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1000 10.5369 -7.5915 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1602 12.8736 -10.8739 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4435 14.3983 -11.3392 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6800 15.4678 -10.6811 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4649 15.3194 -12.4306 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7363 12.3155 -6.9060 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5225 13.2880 -6.4780 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6716 9.7462 -8.0565 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8874 8.7809 -8.4938 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3463 14.2645 -6.1724 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6294 10.5673 -7.5714 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2274 15.3656 -5.5864 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9266 15.0143 -6.8422 H 0 0 0 0 0 0 - 3.2101 13.2860 -4.8126 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6553 12.2750 -4.4689 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0795 13.5454 -3.3665 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6833 12.8594 -3.1584 H 0 0 0 0 0 0 - 2.5210 16.1617 -4.7561 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7337 15.1648 -3.3313 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2023 15.9748 -3.6071 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 12 39 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 41 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 43 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 25 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 45 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 - 30 55 1 0 0 0 -M END -> -20 - -> -0.016 - -$$$$ -42 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3691 12.3596 -12.0090 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5082 11.8040 -10.7325 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7289 10.5800 -13.0272 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9931 11.7723 -13.1223 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8208 10.0120 -11.7545 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2366 10.6190 -10.6002 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6071 9.7463 -9.5106 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2820 8.7349 -9.9857 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4162 8.8630 -11.2985 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3216 9.8824 -8.0245 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3612 13.7214 -11.5083 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5493 13.6373 -12.1980 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9470 14.5254 -12.9531 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9509 10.4995 -7.7283 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8798 11.7709 -7.1545 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6121 12.3149 -6.9130 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4406 11.5618 -7.2441 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5052 10.2836 -7.8087 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7939 9.7786 -8.0440 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0930 13.5444 -6.3685 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7888 13.5284 -6.3764 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3823 12.3688 -6.8823 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9528 12.1034 -6.9863 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7146 12.5761 -10.8355 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2074 12.9376 -10.9559 C 0 0 2 0 0 0 - -2.1889 14.4652 -10.9572 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5166 14.9141 -11.6000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6730 12.4527 -12.1791 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0709 12.2831 -9.8701 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1905 10.1280 -13.8946 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8760 12.2352 -14.0903 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9104 8.1559 -11.8349 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0978 10.5174 -7.5878 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4227 8.9225 -7.5162 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7759 12.3187 -6.9121 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6149 9.7115 -8.0486 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9008 8.7994 -8.4826 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6404 14.3931 -5.9911 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3733 12.9511 -6.6100 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6843 11.9368 -8.0290 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7041 11.2248 -6.3903 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9481 12.5593 -9.7730 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8897 11.6058 -11.3143 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6065 12.4889 -10.1604 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1357 14.8163 -9.9239 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3181 14.8871 -11.4678 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3218 15.2079 -12.6331 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9608 15.7340 -11.0358 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8094 12.8612 -12.3391 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 27 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -42 - -> -0.004 - -$$$$ -35 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3895 12.3678 -12.0373 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4824 11.8098 -10.7511 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7271 10.5745 -13.0290 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0179 11.7711 -13.1287 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8170 10.0145 -11.7522 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2238 10.6236 -10.6024 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6044 9.7508 -9.5065 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2828 8.7443 -9.9813 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4172 8.8704 -11.2949 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3303 9.8854 -8.0203 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3418 13.6528 -11.7950 N 0 0 0 0 0 0 - -5.6106 13.6402 -12.2589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1045 14.5768 -12.8828 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9605 10.4846 -7.7337 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8084 9.7674 -8.0514 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5547 10.3189 -7.8020 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4471 11.5931 -7.2348 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6026 12.3073 -6.9145 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8562 11.7556 -7.1614 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1021 12.1835 -6.9708 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7710 13.4390 -6.4702 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4354 13.4950 -6.4103 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1709 12.4112 -6.8070 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5943 -7.1763 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3771 14.6141 -5.9576 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4422 12.5360 -11.3947 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3230 13.6139 -11.4067 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2958 14.6820 -11.9593 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7380 13.9356 -10.1565 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0183 12.2923 -9.8986 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1782 10.1163 -13.8942 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9208 12.2371 -14.0985 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9179 8.1685 -11.8303 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0933 10.5376 -7.5920 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4329 8.9217 -7.5144 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8892 8.7843 -8.4947 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6640 9.7586 -8.0484 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5243 13.2889 -6.4732 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7461 12.3134 -6.9147 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3729 14.2791 -6.1621 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6003 10.6048 -7.5653 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2500 15.4509 -5.6516 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0339 14.9382 -6.7662 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9933 14.2991 -5.1147 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5851 12.0468 -10.4273 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4005 11.8265 -12.2289 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4937 13.3796 -12.0785 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2410 14.9062 -13.0151 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3493 15.5966 -11.3682 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0327 13.3119 -9.9644 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 -M END -> -35 - -> -0.004 - -$$$$ -44 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 50 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3932 12.3500 -12.0125 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5644 11.7828 -10.7394 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7358 10.5711 -13.0331 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9954 11.7572 -13.1322 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8242 9.9989 -11.7591 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2585 10.6059 -10.6150 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6168 9.7386 -9.5213 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2709 8.7166 -9.9884 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4108 8.8490 -11.3012 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3306 9.8912 -8.0312 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5413 13.8555 -11.3648 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5934 13.6525 -12.1835 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9232 14.4812 -13.0224 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9508 10.4991 -7.7310 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8673 11.7672 -7.1520 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6035 12.3102 -6.9134 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4392 11.5630 -7.2455 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5146 10.2834 -7.8141 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7998 9.7761 -8.0492 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0885 13.5395 -6.3720 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7847 13.5343 -6.3770 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3791 12.3751 -6.8806 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9494 12.1118 -6.9818 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7091 15.0460 -11.2252 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1570 14.3608 -9.9755 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1684 13.2423 -10.1016 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8246 13.9322 -10.0585 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2039 12.2411 -9.8798 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2037 10.1279 -13.8914 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8803 12.2184 -14.1069 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9014 8.1446 -11.8359 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1132 10.5144 -7.5862 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4298 8.9292 -7.5318 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7510 12.3165 -6.9042 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6383 9.7136 -8.0589 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9045 8.7930 -8.4905 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6440 14.3809 -6.0010 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3673 12.9607 -6.6056 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6856 11.9435 -8.0238 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7046 11.2327 -6.3874 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9665 15.3166 -11.9738 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4384 15.8239 -11.0314 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2969 14.9531 -9.0651 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0216 13.4609 -9.4801 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7904 12.2246 -10.0500 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7501 13.4251 -10.8742 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 -M END -> -44 - -> -0.004 - -$$$$ -18 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 44 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3808 12.3686 -12.0119 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5112 11.8116 -10.7365 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7301 10.5824 -13.0300 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9992 11.7782 -13.1263 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8250 10.0166 -11.7542 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2407 10.6266 -10.6010 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6094 9.7513 -9.5103 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2849 8.7404 -9.9846 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4192 8.8674 -11.2983 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3225 9.8872 -8.0242 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3834 13.6199 -11.4933 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4237 14.7282 -11.5789 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5369 13.6139 -12.1980 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8771 14.5161 -12.9653 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9516 10.5005 -7.7272 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8803 11.7722 -7.1539 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6129 12.3159 -6.9118 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4418 11.5625 -7.2429 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5059 10.2842 -7.8062 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7935 9.7780 -8.0417 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0936 13.5458 -6.3664 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7885 13.5288 -6.3742 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3831 12.3683 -6.8823 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9539 12.1016 -6.9897 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0562 12.2861 -9.8790 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1818 10.1228 -13.8979 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8754 12.2375 -14.0963 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9135 8.1599 -11.8328 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0847 10.5486 -7.6052 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4513 8.9399 -7.4976 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1150 12.8057 -10.9566 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8208 14.7394 -10.6724 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8878 15.7111 -11.6718 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7196 14.6037 -12.4046 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7772 12.3192 -6.9132 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6153 9.7128 -8.0447 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8994 8.7979 -8.4799 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6399 14.3943 -5.9889 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3748 12.9484 -6.6129 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6859 11.9386 -8.0328 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7035 11.2217 -6.3964 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 -M END -> -18 - -> -0.01 - -$$$$ -40 - 3D - Structure written by MMmdl. - 54 58 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3583 12.3628 -12.0152 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5007 11.8020 -10.7383 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7096 10.5772 -13.0382 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9777 11.7759 -13.1307 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8132 10.0130 -11.7619 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2338 10.6200 -10.6051 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6121 9.7513 -9.5135 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2831 8.7414 -9.9888 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4159 8.8683 -11.3018 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3364 9.8882 -8.0249 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3745 13.7307 -11.4480 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5401 13.6479 -12.1823 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9305 14.5456 -12.9289 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9622 10.4857 -7.7364 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8106 9.7658 -8.0516 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5548 10.3163 -7.8015 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4456 11.5910 -7.2371 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5995 12.3069 -6.9174 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8550 11.7570 -7.1647 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1008 12.1810 -6.9758 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7660 13.4388 -6.4773 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4314 13.4905 -6.4174 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1713 12.4042 -6.8124 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5879 -7.1791 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3850 14.6084 -5.9658 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6973 12.5089 -10.9175 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2248 12.4637 -11.4426 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4987 13.7622 -11.0653 N 0 0 0 0 0 0 - -2.2038 14.9363 -11.7527 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6757 15.0331 -11.3164 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0576 12.2794 -9.8741 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1618 10.1180 -13.9096 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8627 12.2402 -14.0994 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9144 8.1615 -11.8374 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0961 10.5439 -7.5948 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4395 8.9258 -7.5160 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8927 8.7818 -8.4930 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6634 9.7542 -8.0449 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5193 13.2884 -6.4757 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7435 12.3170 -6.9183 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3645 14.2802 -6.1683 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6001 10.5957 -7.5620 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2377 15.4493 -5.6626 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0462 14.9289 -6.7713 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9992 14.2960 -5.1216 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1358 11.5686 -11.2816 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6934 12.5388 -9.8270 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1213 12.3537 -12.5312 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6337 11.6737 -10.9669 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5199 13.7316 -11.3435 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1273 14.7832 -12.8186 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6221 15.8316 -11.5127 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1533 15.8523 -11.8646 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6812 15.2813 -10.2566 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 -M END -> -40 - -> -0.007 - -$$$$ -19 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3863 12.3686 -12.0106 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5303 11.8179 -10.7351 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7274 10.5747 -13.0322 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9939 11.7717 -13.1290 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8233 10.0108 -11.7572 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2504 10.6246 -10.6026 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6148 9.7488 -9.5126 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2772 8.7301 -9.9866 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4133 8.8585 -11.2996 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3367 9.8906 -8.0265 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3739 13.6178 -11.5022 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4056 14.7196 -11.5963 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5407 13.6198 -12.1903 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8948 14.5296 -12.9394 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9610 10.4852 -7.7361 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8098 9.7648 -8.0558 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5520 10.3132 -7.8064 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4430 11.5871 -7.2363 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5944 12.3027 -6.9144 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8504 11.7539 -7.1603 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0991 12.1752 -6.9687 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7663 13.4191 -6.4362 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4291 13.4776 -6.3870 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1723 12.4029 -6.8190 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8029 11.5945 -7.2007 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3904 14.5868 -5.9117 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0929 12.2989 -9.8733 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1755 10.1118 -13.9031 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8667 12.2221 -14.1016 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9059 8.1512 -11.8355 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1020 10.5408 -7.5966 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4436 8.9262 -7.5252 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1038 12.8034 -10.9679 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8050 14.7371 -10.6877 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8600 15.7058 -11.7050 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7006 14.5748 -12.4189 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8910 8.7823 -8.5005 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6630 9.7506 -8.0539 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5131 13.2839 -6.4722 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7367 12.3149 -6.9092 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3680 14.2475 -6.0985 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6030 10.6174 -7.6170 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2329 15.4126 -5.5710 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0372 14.9418 -6.7159 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0194 14.2522 -5.0866 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 25 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 26 43 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 -M END -> -19 - -> -0.015 - -$$$$ -33 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3918 12.3765 -12.0158 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5335 11.8201 -10.7317 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7273 10.5795 -13.0319 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0082 11.7773 -13.1176 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8294 10.0116 -11.7546 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2533 10.6299 -10.5984 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6133 9.7501 -9.5115 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2802 8.7340 -9.9853 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4149 8.8602 -11.2994 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3368 9.8898 -8.0240 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3580 13.5891 -11.5451 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5327 13.6029 -12.2131 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8791 14.5089 -12.9726 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9622 10.4818 -7.7351 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8525 11.7570 -7.1642 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5920 12.3049 -6.9193 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4386 11.5825 -7.2408 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5579 10.3128 -7.8038 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8126 9.7642 -8.0521 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0919 12.1643 -6.9829 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7362 13.4287 -6.5051 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4017 13.4552 -6.4435 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1850 12.3496 -6.8156 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8078 11.5460 -7.1722 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4351 14.5688 -6.0125 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3172 14.5865 -11.7755 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8924 14.0513 -11.7355 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3932 14.9579 -10.6450 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0761 12.2984 -9.8711 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1698 10.1086 -13.9039 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8733 12.2288 -14.0942 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9079 8.1545 -11.8361 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0997 10.5389 -7.5945 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4394 8.9219 -7.5215 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1267 12.7910 -10.9599 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7395 12.3169 -6.9150 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5095 13.2881 -6.4791 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6661 9.7465 -8.0484 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8936 8.7803 -8.4947 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3246 14.2793 -6.2163 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6152 10.5460 -7.5374 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1734 15.4251 -5.7269 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1032 14.8639 -6.8228 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0431 14.2630 -5.1616 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5076 15.3404 -12.5551 H 0 0 0 0 0 0 - -1.1365 14.4228 -12.4281 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7094 13.0055 -11.4933 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5847 14.5469 -9.6579 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9864 15.9623 -10.6317 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 28 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -33 - -> -0.008 - -$$$$ -27 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 56 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3855 12.3606 -12.0031 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5214 11.8004 -10.7171 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6991 10.5797 -13.0384 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9626 11.7779 -13.1031 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8238 10.0198 -11.7523 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2557 10.6213 -10.5956 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6268 9.7501 -9.5073 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3057 8.7491 -9.9816 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4330 8.8776 -11.2917 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3352 9.8817 -8.0196 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6205 13.5372 -12.2095 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9727 10.4835 -7.7324 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8611 11.7523 -7.1657 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5946 12.2988 -6.9068 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4432 11.5806 -7.2147 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5570 10.3109 -7.7899 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8253 9.7663 -8.0483 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0926 12.1556 -6.9444 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7338 13.4204 -6.4594 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4064 13.4584 -6.4114 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1793 12.3493 -6.7865 N 0 0 0 0 0 0 - -0.7954 11.5387 -7.1512 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4205 14.5767 -6.0073 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6894 13.8945 -11.1046 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7822 15.1171 -11.3990 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3310 14.9579 -11.2532 N 0 0 0 0 0 0 - -1.8099 14.4326 -10.1320 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5019 14.0442 -9.2076 O 0 0 0 0 0 0 - -0.2869 14.3494 -10.0364 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0445 12.2494 -9.8378 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1252 10.1075 -13.9125 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8195 12.2403 -14.0555 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9253 8.1691 -11.8449 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0887 10.5401 -7.5861 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4260 8.9087 -7.5002 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3500 13.7423 -13.1711 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7538 12.3208 -6.9277 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5110 13.2853 -6.4615 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6704 9.7539 -8.0335 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8995 8.7870 -8.4986 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3188 14.2725 -6.1705 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5952 10.5614 -7.5429 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1976 15.4335 -5.7330 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0772 14.8589 -6.8237 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0239 14.2765 -5.1673 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0839 13.0222 -10.9241 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1507 14.0138 -10.1183 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1427 15.9632 -10.8055 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9117 15.4187 -12.3919 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7181 15.3243 -11.9869 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1612 14.8056 -10.9074 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0542 13.3103 -9.9607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0768 14.8908 -9.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 46 1 0 0 0 - 24 47 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 48 1 0 0 0 - 25 49 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 50 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 29 53 1 0 0 0 -M END -> -27 - -> -0.68 - -$$$$ -13 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - -2.2088 12.9419 -10.9697 C 0 0 1 0 0 0 - -2.1904 14.4671 -10.9424 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6992 12.5876 -10.8377 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6826 12.4744 -12.1795 O 0 0 0 0 0 0 - -3.5107 14.9139 -11.6089 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3443 13.7200 -11.5243 N 0 0 0 0 0 0 - -6.3525 12.3601 -12.0338 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9727 11.7556 -13.1375 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7097 10.5633 -13.0339 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5001 11.8056 -10.7491 C 0 0 0 0 0 0 - -6.8506 12.3073 -14.3824 O 0 0 0 0 0 0 - -5.5377 13.6382 -12.2001 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9500 14.5444 -12.9177 O 0 0 0 0 0 0 - -7.2308 10.6159 -10.6131 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8083 10.0113 -11.7524 C 0 0 0 0 0 0 - -8.4200 8.8675 -11.2880 N 0 0 0 0 0 0 - -8.2847 8.7400 -9.9757 N 0 0 0 0 0 0 - -7.6047 9.7473 -9.5145 C 0 0 0 0 0 0 - -7.3264 9.8951 -8.0245 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9604 10.4805 -7.7353 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8075 9.7596 -8.0491 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4358 11.5809 -7.2415 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5835 12.3061 -6.9225 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5481 10.3107 -7.8024 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8471 11.7541 -7.1666 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4650 13.6954 -6.3241 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6125 12.4839 -10.1621 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1549 14.8184 -9.9245 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3157 14.8975 -11.4569 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9463 12.5683 -9.7744 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8737 11.6025 -11.2997 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8317 12.8970 -12.3310 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3143 15.2104 -12.6382 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9412 15.7445 -11.0416 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1761 10.1015 -13.8960 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0592 12.2786 -9.8757 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3831 11.8565 -15.0461 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9260 8.1741 -11.8308 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0952 10.5284 -7.5802 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4226 8.9158 -7.5190 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8834 8.7772 -8.4902 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4582 12.0019 -7.0535 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6526 9.7492 -8.0472 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7368 12.3185 -6.9225 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5360 14.1747 -6.6301 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5030 13.6559 -5.2327 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2731 14.3301 -6.6809 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 12 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 9 15 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 14 2 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 18 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 24 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 25 2 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 -M END -> -13 - -> -0.006 - -$$$$ -39 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3502 12.3553 -12.0171 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4935 11.7977 -10.7426 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7106 10.5751 -13.0385 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9725 11.7720 -13.1357 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8130 10.0109 -11.7654 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2309 10.6170 -10.6058 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6111 9.7517 -9.5147 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2865 8.7392 -9.9897 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4152 8.8682 -11.3006 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3373 9.8888 -8.0252 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3541 13.7129 -11.4635 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5361 13.6428 -12.1728 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9526 14.5668 -12.8773 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9623 10.4854 -7.7364 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8532 11.7571 -7.1646 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5945 12.3064 -6.9180 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4446 11.5858 -7.2382 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5555 10.3115 -7.8022 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8126 9.7649 -8.0516 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0930 12.1652 -6.9785 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7427 13.4236 -6.4970 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4061 13.4591 -6.4324 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1810 12.3567 -6.8070 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5520 -7.1701 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4260 14.5701 -5.9973 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6444 15.0059 -11.3286 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1848 14.8660 -11.7465 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5251 13.6965 -11.2881 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2131 12.5012 -11.6333 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6517 12.4721 -11.0120 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0533 12.2782 -9.8788 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1683 10.1179 -13.9100 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8596 12.2364 -14.1027 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9137 8.1596 -11.8366 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0978 10.5418 -7.5943 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4385 8.9249 -7.5194 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7416 12.3179 -6.9181 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5106 13.2874 -6.4775 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6670 9.7484 -8.0467 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8951 8.7812 -8.4943 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3284 14.2801 -6.2040 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6137 10.5521 -7.5405 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1842 15.4249 -5.7096 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0950 14.8685 -6.8061 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0338 14.2620 -5.1464 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1459 15.8371 -11.8396 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5784 15.1813 -10.2625 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2664 14.7763 -12.8186 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5962 15.7735 -11.5993 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2364 12.3970 -12.7259 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6061 11.6676 -11.2795 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1100 11.5362 -11.3555 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5548 12.5406 -9.9299 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -39 - -> -0.004 - -$$$$ -32 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 45 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3767 12.3649 -12.0150 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5300 11.8201 -10.7355 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7235 10.5758 -13.0283 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9848 11.7731 -13.1297 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8178 10.0121 -11.7526 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2522 10.6205 -10.6098 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6101 9.7439 -9.5117 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2784 8.7249 -9.9778 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4134 8.8570 -11.2978 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3337 9.8935 -8.0288 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4165 13.6746 -11.4876 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5534 13.6276 -12.1919 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9234 14.5178 -12.9405 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9640 10.4853 -7.7356 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8116 9.7640 -8.0536 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5500 10.3127 -7.8058 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4411 11.5873 -7.2364 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5925 12.3023 -6.9174 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8510 11.7510 -7.1622 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0968 12.1763 -6.9669 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7702 13.4221 -6.4317 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4283 13.4864 -6.3849 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1730 12.4042 -6.8287 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8019 11.5974 -7.2024 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3914 14.5951 -5.9029 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0971 12.2907 -9.8695 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1793 10.1210 -13.8973 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8799 12.2200 -14.1007 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9071 8.1535 -11.8388 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1037 10.5390 -7.5949 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4435 8.9258 -7.5263 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8100 14.4821 -11.5579 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1203 12.8861 -10.9327 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8859 8.7811 -8.4956 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6665 9.7473 -8.0499 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5168 13.2894 -6.4781 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7359 12.3175 -6.9096 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3834 14.2452 -6.0920 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6064 10.6335 -7.6221 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2430 15.4167 -5.5635 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0295 14.9490 -6.7075 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0108 14.2566 -5.0798 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 29 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 25 40 1 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 -M END -> -32 - -> -0.11 - -$$$$ -37 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 56 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3714 12.3591 -12.0053 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5147 11.8055 -10.7304 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7273 10.5756 -13.0301 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9920 11.7699 -13.1223 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8210 10.0087 -11.7569 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2407 10.6185 -10.5997 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6132 9.7471 -9.5123 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2794 8.7320 -9.9893 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4144 8.8594 -11.3005 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3370 9.8875 -8.0251 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3570 13.7205 -11.5014 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5485 13.6383 -12.1900 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9462 14.5274 -12.9449 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9602 10.4847 -7.7357 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8090 9.7649 -8.0550 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5517 10.3138 -7.8050 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4444 11.5886 -7.2367 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5954 12.3038 -6.9144 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8508 11.7543 -7.1602 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1010 12.1799 -6.9735 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7694 13.4361 -6.4722 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4342 13.4933 -6.4118 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1686 12.4094 -6.8087 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5907 -7.1765 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3824 14.6122 -5.9578 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5015 14.9079 -11.6138 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1980 14.4648 -10.9240 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2178 12.9422 -10.9897 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7152 12.5763 -10.8194 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0843 12.2887 -9.8671 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1823 10.1184 -13.9027 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8710 12.2321 -14.0913 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9081 8.1519 -11.8353 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1025 10.5369 -7.5942 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4387 8.9228 -7.5261 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8924 8.7824 -8.5002 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6608 9.7523 -8.0520 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5130 13.2841 -6.4735 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7376 12.3146 -6.9110 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3680 14.2762 -6.1614 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5997 10.5977 -7.5606 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0415 14.9434 -6.7630 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0029 14.3010 -5.1158 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2397 15.4500 -5.6469 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3040 15.1510 -12.6593 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9447 15.7573 -11.0941 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2028 14.7688 -9.8743 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3076 14.9095 -11.3795 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8316 12.6262 -11.9647 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5512 12.4812 -10.2522 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9417 12.6132 -9.7555 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9032 11.5968 -11.2722 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 -M END -> -37 - -> -0.004 - -$$$$ -23 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3775 12.3296 -12.0018 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5098 11.7629 -10.7403 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7247 10.5660 -13.0266 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9942 11.7487 -13.1193 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8312 10.0057 -11.7538 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2443 10.6021 -10.6070 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6167 9.7449 -9.5151 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2961 8.7374 -9.9786 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4404 8.8724 -11.2937 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3318 9.8946 -8.0252 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5478 13.5112 -12.1572 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9707 10.4870 -7.7351 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8642 11.7588 -7.1694 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6019 12.3141 -6.9186 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4503 11.5963 -7.2357 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5604 10.3220 -7.8000 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8213 9.7719 -8.0443 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0996 12.1710 -6.9757 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7487 13.4240 -6.4767 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4123 13.4674 -6.4260 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1713 12.3664 -6.8217 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8093 11.5624 -7.1930 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4224 14.5657 -5.9816 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6966 14.2423 -13.2612 N 0 0 0 0 0 0 - -4.9506 15.3153 -13.5405 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9383 15.6899 -12.6782 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7261 14.9536 -11.5366 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5508 13.8769 -11.2437 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6976 15.2614 -10.7139 N 0 0 0 0 0 0 - -6.0413 12.2163 -9.8757 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1733 10.1082 -13.8992 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8809 12.2018 -14.0912 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9536 8.1815 -11.8284 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4130 8.9234 -7.5092 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0893 10.5342 -7.5733 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7528 12.3249 -6.9255 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5328 13.2988 -6.4768 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6748 9.7543 -8.0412 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8926 8.7851 -8.4839 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3413 14.2681 -6.1710 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6174 10.5819 -7.5829 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0693 14.8635 -6.8057 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0251 14.2426 -5.1445 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2033 15.4153 -5.6884 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1686 15.8110 -14.4274 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3134 16.5389 -12.9221 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3780 13.3123 -10.3528 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6917 14.8692 -9.7891 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2693 16.1577 -10.8793 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 24 2 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 -M END -> -23 - -> -0.27 - -$$$$ -15 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3730 12.3647 -12.0124 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5249 11.8167 -10.7375 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7225 10.5819 -13.0270 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9871 11.7813 -13.1320 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8205 10.0150 -11.7538 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2514 10.6217 -10.6093 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6113 9.7463 -9.5119 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2838 8.7282 -9.9768 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4166 8.8609 -11.2984 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3282 9.8959 -8.0269 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4004 13.6489 -11.4541 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4592 14.7715 -11.4916 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5363 13.6231 -12.1917 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8861 14.5056 -12.9557 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9554 10.4909 -7.7390 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8447 11.7612 -7.1661 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5697 12.3054 -6.9214 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4308 11.5801 -7.2259 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5429 10.3015 -7.8076 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8018 9.7661 -8.0596 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4352 13.5609 -6.3638 O 0 0 0 0 0 0 - -3.6839 14.5445 -7.0766 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1928 12.1397 -6.9410 O 0 0 0 0 0 0 - -1.0568 11.8071 -7.7386 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0865 12.2817 -9.8717 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1761 10.1266 -13.8989 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8862 12.2301 -14.1010 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9109 8.1585 -11.8401 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0978 10.5402 -7.5937 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4435 8.9306 -7.5162 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1544 12.8539 -10.8932 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4485 14.4035 -11.3387 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6772 15.4626 -10.6827 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4583 15.3250 -12.4323 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7296 12.3147 -6.9189 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6623 9.7270 -8.0552 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8859 8.7827 -8.5028 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6209 15.4399 -6.4624 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1459 14.7973 -8.0279 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6551 14.2645 -7.2771 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2132 12.3981 -7.3814 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2092 12.0638 -8.7945 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7777 10.7513 -7.6419 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 -M END -> -15 - -> -2.5 - -$$$$ -34 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.4024 12.3461 -12.0147 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5825 11.7781 -10.7426 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7347 10.5660 -13.0395 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9966 11.7550 -13.1361 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8265 9.9936 -11.7632 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2675 10.6024 -10.6199 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6234 9.7358 -9.5255 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2741 8.7136 -9.9910 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4130 8.8453 -11.3044 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3406 9.8933 -8.0338 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5538 13.8407 -11.3379 N 0 0 0 0 0 0 - -5.6005 13.6490 -12.1765 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9196 14.4808 -13.0199 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9590 10.4855 -7.7382 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8075 9.7636 -8.0570 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5513 10.3099 -7.8070 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4406 11.5840 -7.2355 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5915 12.3007 -6.9126 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8470 11.7538 -7.1581 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0979 12.1738 -6.9691 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7666 13.4166 -6.4372 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4273 13.4768 -6.3903 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1744 12.4049 -6.8247 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8040 11.5944 -7.2012 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3946 14.5874 -5.9129 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1104 13.1199 -10.1564 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1547 14.2611 -9.9254 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7686 15.0454 -11.0979 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3454 14.7999 -8.7258 F 0 0 0 0 0 0 - -1.8808 13.9286 -10.0717 F 0 0 0 0 0 0 - -6.2371 12.2377 -9.8825 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1965 10.1201 -13.9011 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8777 12.2189 -14.1082 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9048 8.1432 -11.8372 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1066 10.5395 -7.5982 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4470 8.9316 -7.5331 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8888 8.7812 -8.5015 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6633 9.7451 -8.0571 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5093 13.2831 -6.4741 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7314 12.3149 -6.9053 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3717 14.2432 -6.0985 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6084 10.6151 -7.6146 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2286 15.4127 -5.5721 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0434 14.9448 -6.7174 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0235 14.2533 -5.0839 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7139 12.1065 -10.2127 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9207 13.2607 -9.4790 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5371 15.7574 -10.8202 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0553 15.4231 -11.8251 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -34 - -> -0.007 - -$$$$ -25 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3861 12.3623 -11.9697 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5480 11.8020 -10.7080 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6869 10.5726 -13.0325 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9529 11.7665 -13.1047 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8210 10.0086 -11.7556 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2636 10.6177 -10.5919 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6330 9.7421 -9.5104 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3023 8.7332 -9.9897 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4342 8.8678 -11.3051 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3415 9.8758 -8.0215 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1211 13.8754 -11.2000 S 0 0 0 0 0 0 - -2.9188 12.5402 -11.7675 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6382 13.5428 -12.1051 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9683 10.4827 -7.7344 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8123 9.7690 -8.0490 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5592 10.3237 -7.7969 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4543 11.5962 -7.2288 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6126 12.3085 -6.9084 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8671 11.7538 -7.1613 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1058 12.1871 -6.9644 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7745 13.4406 -6.4637 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4394 13.4976 -6.4041 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1691 12.4146 -6.8015 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8034 11.5995 -7.1773 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3694 14.6144 -5.9538 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6497 15.1720 -11.6865 O 0 0 0 0 0 0 - -4.3650 13.6745 -9.7698 O 0 0 0 0 0 0 - -6.1192 12.2649 -9.8433 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1122 10.1144 -13.9155 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8144 12.2368 -14.0685 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9325 8.1663 -11.8458 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4236 8.9164 -7.5059 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0908 10.5346 -7.5820 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9692 12.6827 -11.2486 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7669 12.6240 -12.8324 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3306 11.5652 -11.5235 H 0 0 0 0 0 0 - -5.9058 14.2159 -12.8076 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8881 8.7864 -8.4918 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6674 9.7660 -8.0419 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5385 13.2901 -6.4661 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7582 12.3115 -6.9184 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3766 14.2799 -6.1559 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5994 10.6146 -7.5758 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9849 14.2943 -5.1133 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2624 15.4490 -5.6481 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0212 14.9347 -6.7673 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 11 27 2 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 -M END -> -25 - -> -0.073 - -$$$$ -14 - 3D - Structure written by MMmdl. - 34 35 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3887 12.3647 -12.0798 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4962 11.8202 -10.8023 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7456 10.5858 -13.0568 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0126 11.7716 -13.1776 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8340 10.0285 -11.7877 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2471 10.6293 -10.6255 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6099 9.7738 -9.5366 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2971 8.7499 -9.9997 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4324 8.8805 -11.3156 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3321 9.9039 -8.0386 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4077 13.6374 -11.5161 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4400 14.7362 -11.5603 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5080 13.5935 -12.2349 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8585 14.4899 -13.0509 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9274 10.4444 -7.6346 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7880 9.9988 -8.5813 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9224 11.9644 -7.3345 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0382 12.2728 -9.9607 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2100 10.1267 -13.9275 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9074 12.2361 -14.1520 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9323 8.1670 -11.8392 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0901 10.5612 -7.6086 H 0 0 0 0 0 0 - -7.5048 8.9551 -7.5303 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1635 12.8367 -10.9301 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4281 14.3561 -11.4328 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6222 15.4408 -10.7497 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4529 15.2842 -12.5019 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6875 9.9831 -6.6758 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8140 10.3484 -8.2443 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8951 10.4012 -9.5779 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7479 8.9096 -8.6828 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9281 12.3070 -7.0401 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6508 12.2215 -6.5656 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2266 12.5877 -8.1480 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 19 1 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 21 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 22 1 0 0 0 - 10 23 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 28 1 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 16 31 1 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 17 33 1 0 0 0 - 17 34 1 0 0 0 -M END -> -14 - -> -0.84 - -$$$$ -45 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.4275 12.3453 -12.0176 C 0 0 0 0 0 0 - -6.6105 11.7832 -10.7429 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7405 10.5587 -13.0479 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0073 11.7527 -13.1387 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8357 9.9872 -11.7695 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2848 10.5993 -10.6252 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6281 9.7307 -9.5318 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2830 8.7083 -9.9969 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4214 8.8369 -11.3125 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3299 9.8861 -8.0415 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6020 13.8371 -11.3112 N 0 0 0 0 0 0 - -5.6232 13.6419 -12.1798 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9069 14.4516 -13.0592 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9473 10.4903 -7.7303 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8632 11.7421 -7.1195 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5901 12.2560 -6.8332 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4296 11.5300 -7.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5045 10.2730 -7.8164 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7945 9.7703 -8.0537 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0643 13.4351 -6.1976 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7662 13.4536 -6.2615 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3669 12.3336 -6.8391 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9435 12.0941 -6.9881 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0340 12.9997 -10.2404 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1550 14.1929 -9.9451 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8070 15.0441 -11.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4251 14.7437 -8.6708 O 0 0 0 0 0 0 - -4.8009 14.9943 -8.3397 C 0 0 0 0 0 0 - -6.2751 12.2510 -9.8808 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1947 10.1119 -13.9118 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8796 12.2190 -14.1080 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9146 8.1352 -11.8444 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1022 10.5167 -7.5911 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4243 8.9304 -7.5266 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7518 12.2958 -6.8714 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6233 9.7099 -8.0738 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9015 8.7955 -8.5026 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6122 14.2555 -5.7697 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3704 12.9492 -6.6128 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6882 11.9370 -8.0353 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6930 11.2211 -6.3917 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7681 12.9512 -9.5114 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5878 12.0194 -10.4228 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0910 13.9881 -10.0141 H 0 0 0 0 0 0 - -3.1162 15.4759 -11.7546 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5864 15.7240 -10.7221 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7653 15.4448 -7.3800 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4372 14.1236 -8.2286 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3333 15.6922 -8.9422 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -45 - -> -0.007 - -$$$$ -36 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3988 12.3548 -12.0167 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5634 11.7828 -10.7362 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7338 10.5694 -13.0370 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9985 11.7556 -13.1278 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8247 9.9971 -11.7595 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2595 10.6059 -10.6156 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6196 9.7377 -9.5218 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2737 8.7166 -9.9897 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4125 8.8485 -11.3029 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3396 9.8926 -8.0318 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5445 13.8618 -11.3707 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5979 13.6472 -12.1806 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9190 14.4711 -13.0424 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9590 10.4852 -7.7375 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8471 11.7541 -7.1585 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5907 12.3017 -6.9141 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4394 11.5818 -7.2374 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5527 10.3083 -7.8066 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8082 9.7633 -8.0562 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0898 12.1596 -6.9778 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7390 13.4130 -6.4881 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3978 13.4480 -6.4305 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1868 12.3491 -6.8198 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8044 11.5467 -7.1770 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4420 14.5581 -5.9859 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7035 15.0408 -11.2447 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1688 14.3872 -9.9709 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1668 13.2516 -10.0984 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8336 13.9158 -10.0706 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8619 14.9477 -10.1504 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1975 12.2414 -9.8778 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1955 10.1215 -13.8981 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8803 12.2209 -14.1051 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9046 8.1451 -11.8366 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1070 10.5375 -7.5971 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4451 8.9300 -7.5335 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7321 12.3147 -6.9056 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5096 13.2839 -6.4750 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6650 9.7438 -8.0571 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8891 8.7810 -8.5010 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3299 14.2629 -6.1859 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6250 10.5486 -7.5510 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1676 15.4074 -5.6822 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1055 14.8718 -6.7964 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0560 14.2422 -5.1385 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9547 15.2933 -11.9951 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4087 15.8406 -11.0592 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2749 14.9753 -9.0608 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0117 13.4714 -9.4655 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7929 12.2315 -10.0358 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1264 14.5023 -10.2505 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8642 15.5647 -9.2515 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0194 15.5931 -11.0166 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -36 - -> -0.006 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/.ipynb_checkpoints/test1-checkpoint.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/.ipynb_checkpoints/test1-checkpoint.png deleted file mode 100755 index 681b1a56..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/.ipynb_checkpoints/test1-checkpoint.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 9f77747b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,57 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_39_28 16.35 0.46 1.47 0 -FEP_30_42 9.80 0.49 1.55 0 -FEP_21_22 2.00 0.37 1.17 0 -FEP_34_37 -6.98 0.17 0.53 0 -FEP_37_26 -9.23 0.34 1.06 0 -FEP_40_37 -32.12 0.36 1.14 0 -FEP_37_35 5.93 0.35 1.11 0 -FEP_28_26 -46.97 0.35 1.10 0 -FEP_39_37 -20.51 0.20 0.62 0 -FEP_36_37 -7.14 0.36 1.13 0 -FEP_17_15 16.76 0.26 0.82 0 -FEP_30_35 11.56 0.40 1.27 0 -FEP_20_33 11.60 0.37 1.16 0 -FEP_30_13 -20.57 0.66 2.08 1 -FEP_19_17 8.00 0.44 1.40 0 -FEP_43_42 -3.66 0.25 0.80 0 -FEP_37_32 -36.41 0.34 1.09 0 -FEP_44_18 -20.87 0.46 1.47 0 -FEP_37_19 -14.29 0.27 0.85 0 -FEP_19_24 -20.27 0.18 0.58 0 -FEP_25_24 98.35 0.92 2.92 0 -FEP_15_14 -5.57 1.55 4.91 6 -FEP_19_32 -23.19 0.21 0.67 0 -FEP_23_22 88.84 0.46 1.45 0 -FEP_33_19 4.08 0.36 1.15 0 -FEP_15_16 -8.90 0.38 1.19 0 -FEP_31_37 3.25 0.33 1.03 0 -FEP_31_35 9.64 0.45 1.41 0 -FEP_41_37 -5.70 0.20 0.63 0 -FEP_42_45 10.57 0.34 1.07 0 -FEP_16_14 6.46 0.60 1.91 0 -FEP_41_40 26.51 0.36 1.14 0 -FEP_23_21 87.30 0.35 1.11 0 -FEP_42_13 -33.34 0.40 1.25 0 -FEP_27_24 -2.32 1.46 4.61 4 -FEP_36_35 -2.45 0.29 0.91 0 -FEP_18_17 -1.20 0.30 0.95 0 -FEP_38_34 5.82 0.18 0.57 0 -FEP_38_43 7.24 0.36 1.13 0 -FEP_45_44 -3.13 0.41 1.30 0 -FEP_22_19 -21.24 0.16 0.52 0 -FEP_20_19 14.75 0.37 1.16 0 -FEP_30_37 6.17 0.24 0.76 0 -FEP_27_25 -103.50 0.95 3.01 0 -FEP_29_25 -16.22 1.52 4.81 0 -FEP_29_33 98.98 0.69 2.19 0 -FEP_42_44 8.39 0.27 0.86 0 -FEP_38_37 -0.77 0.13 0.42 0 -FEP_44_43 -5.01 0.34 1.06 0 -FEP_39_19 -34.76 0.63 1.99 0 -FEP_35_44 9.29 0.43 1.37 0 -FEP_28_21 -31.85 0.51 1.61 0 -FEP_21_32 -41.07 0.43 1.37 0 -FEP_18_15 16.01 0.29 0.91 0 -FEP_25_19 120.81 0.63 2.00 0 -FEP_35_19 -19.75 0.28 0.87 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 9220a892..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,57 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_39_28 10.57 0.43 1.37 0 -FEP_30_42 8.05 0.27 0.85 0 -FEP_21_22 4.79 0.25 0.80 0 -FEP_34_37 -6.46 0.22 0.69 0 -FEP_37_26 -12.86 0.40 1.26 0 -FEP_40_37 -32.53 0.25 0.79 0 -FEP_37_35 5.13 0.15 0.49 0 -FEP_28_26 -43.61 0.21 0.67 0 -FEP_39_37 -19.78 0.28 0.88 0 -FEP_36_37 -6.08 0.30 0.95 0 -FEP_17_15 20.26 0.28 0.88 0 -FEP_30_35 10.32 0.21 0.65 0 -FEP_20_33 9.72 0.37 1.17 0 -FEP_30_13 -23.04 0.40 1.27 0 -FEP_19_17 2.74 0.24 0.77 0 -FEP_43_42 -3.18 0.39 1.25 0 -FEP_37_32 -42.91 0.27 0.86 0 -FEP_44_18 -23.40 0.21 0.66 0 -FEP_37_19 -19.00 0.22 0.68 0 -FEP_19_24 -21.28 0.09 0.30 0 -FEP_25_24 102.63 0.82 2.60 0 -FEP_15_14 -7.42 0.40 1.27 0 -FEP_19_32 -23.89 0.11 0.35 0 -FEP_23_22 90.22 0.23 0.72 0 -FEP_33_19 3.24 0.27 0.87 0 -FEP_15_16 -9.39 0.31 0.97 0 -FEP_31_37 2.95 0.27 0.84 0 -FEP_31_35 7.65 0.28 0.87 0 -FEP_41_37 -5.32 0.23 0.72 0 -FEP_42_45 9.20 0.29 0.91 0 -FEP_16_14 2.68 0.31 0.98 0 -FEP_41_40 27.49 0.20 0.62 0 -FEP_23_21 84.73 0.34 1.08 0 -FEP_42_13 -32.05 0.26 0.81 0 -FEP_27_24 2.39 0.58 1.85 0 -FEP_36_35 -1.40 0.19 0.60 0 -FEP_18_17 -4.55 0.26 0.83 0 -FEP_38_34 6.49 0.27 0.84 0 -FEP_38_43 5.87 0.26 0.81 0 -FEP_45_44 -2.16 0.34 1.08 0 -FEP_22_19 -22.04 0.34 1.08 0 -FEP_20_19 13.61 0.16 0.51 0 -FEP_30_37 5.05 0.35 1.10 0 -FEP_27_25 -100.72 0.83 2.61 0 -FEP_29_25 -18.95 0.26 0.83 1 -FEP_29_33 102.75 0.28 0.88 0 -FEP_42_44 8.08 0.26 0.83 0 -FEP_38_37 -0.77 0.23 0.74 0 -FEP_44_43 -4.36 0.59 1.86 0 -FEP_39_19 -38.28 0.34 1.09 1 -FEP_28_21 -31.24 0.15 0.47 0 -FEP_18_15 17.02 0.28 0.90 0 -FEP_25_19 125.49 0.48 1.53 0 -FEP_21_32 -42.10 0.28 0.88 0 -FEP_35_44 5.04 0.29 0.93 0 -FEP_35_19 -22.88 0.19 0.62 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 02f60535..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,100 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_41_27 -38.72 0.27 7 -FEP_27_25 -102.36 1.60 7 -FEP_37_39 20.31 0.11 6 -FEP_21_22 3.01 nan 9 -FEP_41_40 26.53 0.17 7 -FEP_21_23 -84.85 0.77 8 -FEP_17_15 16.74 0.26 8 -FEP_33_27 -16.21 0.12 7 -FEP_35_30 -11.10 nan 9 -FEP_19_20 -15.02 0.21 8 -FEP_30_13 -20.21 nan 9 -FEP_37_40 32.39 nan 9 -FEP_29_21 121.12 0.77 6 -FEP_37_35 5.07 0.14 8 -FEP_44_18 -21.31 0.22 4 -FEP_34_27 -42.56 nan 9 -FEP_19_16 12.99 0.40 7 -FEP_42_13 -33.10 0.50 5 -FEP_37_30 -5.65 0.23 8 -FEP_37_34 7.43 0.24 7 -FEP_42_18 -13.27 0.27 7 -FEP_42_45 11.40 0.42 5 -FEP_33_20 -9.85 nan 9 -FEP_28_21 -33.70 nan 9 -FEP_19_24 -19.37 0.15 7 -FEP_35_27 -41.00 nan 9 -FEP_33_29 -98.83 0.58 6 -FEP_35_31 -10.84 0.03 8 -FEP_24_27 -0.85 0.23 8 -FEP_37_31 -5.17 nan 9 -FEP_15_16 -9.91 0.14 8 -FEP_24_25 -100.34 0.40 8 -FEP_39_28 15.70 1.63 7 -FEP_37_41 6.43 0.07 8 -FEP_28_26 -46.66 nan 9 -FEP_19_18 8.61 nan 9 -FEP_38_43 7.87 0.16 7 -FEP_37_27 -35.12 0.43 8 -FEP_42_44 7.95 0.31 7 -FEP_45_18 -23.13 0.70 7 -FEP_24_29 -87.26 nan 9 -FEP_42_17 -13.08 0.59 7 -FEP_32_29 -78.60 0.38 8 -FEP_23_22 87.86 0.50 7 -FEP_19_29 -102.43 0.13 8 -FEP_43_42 -4.36 0.22 5 -FEP_16_14 4.67 0.93 5 -FEP_37_32 -38.70 0.33 7 -FEP_43_18 -17.68 0.70 6 -FEP_35_36 2.53 0.24 7 -FEP_25_29 17.53 0.82 6 -FEP_40_27 -69.44 0.96 6 -FEP_37_36 6.03 nan 9 -FEP_19_27 -19.03 1.07 7 -FEP_44_45 3.92 0.69 8 -FEP_32_27 2.02 1.68 8 -FEP_45_17 -25.09 0.21 5 -FEP_19_15 24.55 nan 9 -FEP_28_26 -46.59 0.28 7 -FEP_21_22 2.63 0.33 7 -FEP_35_27 -38.95 0.67 6 -FEP_33_20 -10.69 0.63 7 -FEP_37_26 -8.90 0.27 6 -FEP_37_31 -4.34 0.32 6 -FEP_32_19 22.71 0.04 8 -FEP_19_33 -4.15 0.30 7 -FEP_37_36 6.07 0.26 7 -FEP_34_27 -42.11 0.54 6 -FEP_37_40 33.20 0.17 6 -FEP_19_18 7.18 0.24 8 -FEP_19_17 5.21 0.41 8 -FEP_24_29 -85.24 1.06 6 -FEP_18_17 -0.98 0.52 8 -FEP_35_30 -11.64 0.64 7 -FEP_28_21 -32.59 0.52 0 -FEP_15_14 -6.42 0.48 5 -FEP_19_15 24.20 0.30 0 -FEP_30_13 -23.47 0.96 0 -FEP_44_17 -21.25 0.28 0 -FEP_34_38 -6.26 0.24 0 -FEP_25_19 120.01 0.29 0 -FEP_22_24 -41.99 0.33 0 -FEP_25_37 134.31 1.25 0 -FEP_25_32 96.08 0.68 0 -FEP_44_31 -16.83 0.41 0 -FEP_45_36 -8.96 0.31 0 -FEP_22_32 -44.35 0.43 0 -FEP_44_35 -8.74 0.69 0 -FEP_22_19 -21.30 0.21 0 -FEP_44_43 -4.41 0.25 0 -FEP_23_32 44.30 0.66 0 -FEP_21_25 -138.86 0.88 0 -FEP_25_33 116.51 1.26 0 -FEP_44_30 -18.32 0.20 0 -FEP_45_43 -7.64 0.18 0 -FEP_22_28 30.49 0.74 0 -FEP_42_30 -9.16 0.29 0 -FEP_16_18 -6.19 0.27 0 -FEP_19_37 14.57 0.22 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index d2824a8c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_42_30 -9.16 0.29 0 -FEP_16_18 -6.19 0.27 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 34c449a6..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,110 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_41_27 -49.45 0.50 0 -FEP_27_25 -99.95 0.43 0 -FEP_34_38 -6.42 0.19 0 -FEP_37_39 20.73 0.14 0 -FEP_44_17 -27.59 0.21 0 -FEP_21_22 4.93 0.11 0 -FEP_41_40 27.08 0.18 0 -FEP_21_23 -85.10 0.06 0 -FEP_17_15 20.28 0.31 0 -FEP_33_27 -22.28 0.23 0 -FEP_35_30 -11.04 0.19 0 -FEP_19_20 -13.35 0.12 0 -FEP_30_13 -24.03 0.76 0 -FEP_37_40 32.46 0.14 0 -FEP_29_21 122.52 0.37 0 -FEP_37_35 4.75 0.15 0 -FEP_44_18 -23.42 0.21 0 -FEP_34_27 -49.16 0.35 0 -FEP_19_16 11.52 0.62 0 -FEP_19_33 -3.27 0.11 0 -FEP_42_13 -31.87 0.26 0 -FEP_37_30 -6.18 0.11 0 -FEP_37_34 5.78 0.16 0 -FEP_42_18 -15.51 0.17 0 -FEP_42_45 9.22 0.16 0 -FEP_33_20 -10.11 0.19 0 -FEP_28_21 -30.83 0.13 0 -FEP_19_24 -20.96 0.13 0 -FEP_35_27 -48.57 0.26 0 -FEP_33_29 -102.59 0.29 0 -FEP_35_31 -7.85 0.15 0 -FEP_24_27 -3.31 0.44 1 -FEP_37_31 -3.04 0.14 0 -FEP_15_16 -10.16 0.32 0 -FEP_24_25 -103.23 1.19 0 -FEP_39_28 10.05 0.32 0 -FEP_37_41 5.07 0.17 0 -FEP_15_14 -7.37 0.35 0 -FEP_28_26 -43.45 0.16 0 -FEP_19_18 6.59 0.17 0 -FEP_38_43 6.29 0.25 0 -FEP_37_27 -43.82 0.21 0 -FEP_42_44 8.37 0.17 0 -FEP_45_18 -24.51 0.22 0 -FEP_24_29 -82.74 0.55 0 -FEP_19_17 2.49 0.13 0 -FEP_18_17 -3.74 0.08 0 -FEP_42_17 -19.62 0.39 0 -FEP_32_29 -81.13 0.42 0 -FEP_23_22 90.27 0.13 0 -FEP_19_29 -105.02 0.33 0 -FEP_43_42 -3.21 0.15 0 -FEP_16_14 2.52 0.27 0 -FEP_37_32 -42.69 0.27 0 -FEP_43_18 -18.73 0.50 0 -FEP_35_36 1.80 0.36 0 -FEP_25_29 19.35 0.80 0 -FEP_32_19 23.94 0.10 0 -FEP_40_27 -76.63 0.36 1 -FEP_37_36 5.57 0.12 0 -FEP_19_27 -25.75 0.19 0 -FEP_44_45 1.36 0.26 0 -FEP_32_27 -0.90 0.42 1 -FEP_45_17 -28.49 0.27 0 -FEP_37_26 -12.60 0.30 0 -FEP_19_15 22.79 0.18 0 -FEP_44_17 -26.76 0.21 0 -FEP_15_14 -8.29 0.69 0 -FEP_37_36 5.54 0.24 0 -FEP_24_29 -83.65 0.56 0 -FEP_35_30 -10.67 0.15 0 -FEP_37_26 -12.91 0.40 0 -FEP_33_20 -10.06 0.22 0 -FEP_34_27 -49.99 0.48 0 -FEP_32_19 23.84 0.09 0 -FEP_35_27 -48.29 0.20 0 -FEP_19_18 6.43 0.12 0 -FEP_37_31 -3.23 0.20 0 -FEP_21_22 4.92 0.46 0 -FEP_28_26 -43.59 0.14 0 -FEP_37_40 32.46 0.13 0 -FEP_19_33 -3.18 0.18 0 -FEP_18_17 -3.90 0.10 0 -FEP_19_17 2.26 0.26 0 -FEP_44_17 -26.93 0.16 0 -FEP_15_14 -8.07 0.43 0 -FEP_28_21 -31.55 0.18 0 -FEP_19_15 22.46 0.21 0 -FEP_34_38 -5.85 0.33 0 -FEP_30_13 -23.38 0.49 0 -FEP_25_19 124.93 0.58 0 -FEP_22_24 -43.93 0.22 0 -FEP_25_37 143.64 0.89 0 -FEP_25_32 100.37 0.33 0 -FEP_44_31 -13.56 0.50 0 -FEP_45_36 -6.86 0.17 0 -FEP_22_32 -46.64 0.23 0 -FEP_44_35 -7.09 0.27 0 -FEP_22_19 -22.83 0.17 0 -FEP_44_43 -5.14 0.22 0 -FEP_23_32 43.78 0.29 0 -FEP_21_25 -143.06 0.29 0 -FEP_25_33 121.74 0.16 0 -FEP_44_30 -17.27 0.34 0 -FEP_45_43 -5.93 0.14 0 -FEP_22_28 26.62 0.13 0 -FEP_42_30 -9.08 0.19 0 -FEP_16_18 -6.54 0.10 0 -FEP_19_37 18.70 0.30 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index 22e963ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cdk8/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_42_30 -9.08 0.19 0 -FEP_16_18 -6.54 0.10 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index fdd4a80a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,37 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 76.81 0.15 0.49 0 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 2.34 0.10 0.30 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -10.60 0.14 0.46 0 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40 -88.98 0.90 2.84 4 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 9.15 0.12 0.37 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5 0.21 0.39 1.24 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -23.97 0.17 0.54 0 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -16.29 0.16 0.50 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -4.95 0.63 2.01 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 57.61 0.16 0.51 0 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90 0.59 0.40 1.25 4 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -31.04 0.32 1.00 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -67.58 0.19 0.61 0 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90 -18.88 0.41 1.29 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -20.92 0.23 0.74 0 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200 -20.07 0.81 2.57 7 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23 9.14 1.47 4.64 6 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200 -83.27 0.53 1.67 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 4.80 0.12 0.37 0 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5 -4.74 0.43 1.37 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300 -78.83 0.25 0.79 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -30.80 1.58 4.98 4 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 -3.78 2.55 8.06 5 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 63.11 0.34 1.06 0 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1 -5.86 0.23 0.73 0 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23 -8.59 1.56 4.94 6 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 -5.00 0.25 0.77 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 9.73 0.41 1.31 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 0.62 0.25 0.78 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 -5.00 2.35 7.44 5 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5 0.65 1.17 3.70 1 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42 4.66 1.02 3.22 1 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -34.06 0.11 0.34 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90 -2.53 1.97 6.23 8 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42 -11.82 0.97 3.06 1 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7 -4.52 0.84 2.65 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 19cb5f47..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,37 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 75.53 0.12 0.37 0 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 4.77 0.11 0.35 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -11.31 0.12 0.39 0 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40 -92.79 0.78 2.45 6 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 9.38 0.11 0.36 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5 -0.34 0.30 0.96 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -24.73 0.09 0.27 0 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -17.83 0.13 0.41 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -3.93 0.34 1.09 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 54.06 0.13 0.42 0 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90 -3.72 0.69 2.19 1 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -30.01 0.23 0.72 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -66.28 0.09 0.29 0 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90 -20.20 0.20 0.63 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -20.77 0.21 0.67 0 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200 -28.52 0.94 2.96 5 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23 4.91 0.50 1.59 6 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200 -82.67 0.24 0.75 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 3.54 0.09 0.29 0 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5 -7.07 0.34 1.07 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300 -79.16 0.13 0.42 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -30.30 0.96 3.03 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 -4.72 1.16 3.68 1 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 58.99 0.08 0.26 0 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1 -6.29 0.12 0.39 0 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23 -9.74 1.58 5.00 4 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 -7.26 0.10 0.32 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 9.01 0.42 1.33 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 -0.62 0.11 0.36 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 -4.04 1.03 3.27 1 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5 -2.10 0.81 2.58 2 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42 3.22 1.79 5.67 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -36.53 0.09 0.29 0 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7 -8.13 0.37 1.18 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90 -2.03 1.30 4.11 1 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42 -13.22 1.01 3.21 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 30218d6b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,38 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -29.76 0.34 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 0.20 0.21 0 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402762-1 5.94 0.26 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 4.49 0.12 0 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402741-400 19.45 0.51 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402761-1 89.74 nan 7 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -31.09 1.11 5 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -24.57 0.10 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -10.31 0.15 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402763-90 -4.75 1.86 4 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 -4.98 0.24 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402761-1 23.66 1.39 8 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 9.09 0.12 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 -4.19 1.39 1 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 9.43 0.51 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 -3.39 1.61 4 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 2.51 0.16 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -68.08 0.16 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -3.82 0.43 0 -FEP_CHEMBL3402744-300_CHEMBL3402755-4200 78.75 0.32 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402755-4200 82.53 0.40 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402762-1 5.19 0.58 0 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -16.68 0.16 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 -6.47 1.51 5 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 76.95 0.06 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -34.12 0.20 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402759-5-7 0.94 0.23 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -20.67 0.41 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402760-1 -2.05 0.89 4 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 57.86 0.13 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 62.68 0.32 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402761-1 92.35 0.86 7 -FEP_CHEMBL3402764-90_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 2.98 1.04 6 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402741-400 13.13 3.03 7 -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3402764-90_CHEMBL3402756-2-7 12.57 0.86 3 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90 5.19 0.59 4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index 2f96c0a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3402764_90_CHEMBL3402756_2_7 12.57 0.86 3 -FEP_CHEMBL3402742_23_CHEMBL3402764_90 5.19 0.59 4 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index f0945af7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,38 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -30.03 0.33 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 -0.66 0.11 0 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402762-1 6.68 0.22 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 4.02 0.06 0 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402741-400 20.16 0.39 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402761-1 93.15 1.09 6 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -30.47 1.50 4 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -24.60 0.05 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -11.37 0.06 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402763-90 -6.24 1.54 4 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 -7.23 0.09 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402761-1 27.04 1.08 7 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 9.55 0.10 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 9.85 0.37 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 -2.81 1.91 2 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 3.84 0.10 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -66.22 0.07 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -4.42 0.39 0 -FEP_CHEMBL3402744-300_CHEMBL3402755-4200 78.98 0.06 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402755-4200 82.56 0.22 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402762-1 8.29 0.19 0 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -17.66 0.05 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 -6.02 1.52 3 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 75.58 0.05 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -36.48 0.08 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402759-5-7 0.08 0.23 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -20.69 0.17 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402760-1 0.30 0.40 3 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402741-400 7.81 2.10 6 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 53.90 0.13 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 58.91 0.12 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 -6.94 0.80 1 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402761-1 92.29 0.36 8 -FEP_CHEMBL3402764-90_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 2.07 0.53 2 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402741-400 11.15 2.11 7 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90 0.75 1.78 3 -FEP_CHEMBL3402764-90_CHEMBL3402756-2-7 15.52 0.99 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index c9e4dfbb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/cmet/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3402742_23_CHEMBL3402764_90 0.75 1.78 3 -FEP_CHEMBL3402764_90_CHEMBL3402756_2_7 15.52 0.99 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 434325d1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,48 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056 9.89 0.78 2.45 1 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 11.78 0.43 1.35 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410 186.86 1.08 3.40 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -52.61 1.16 3.67 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 1.70 1.04 3.28 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 70.62 1.24 3.91 4 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 2.75 0.30 0.95 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 -1.98 0.30 0.94 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -7.21 0.18 0.56 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 22.98 0.17 0.54 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 -7.94 0.57 1.79 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -106.67 0.67 2.13 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 8.40 0.66 2.09 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 7.05 0.40 1.26 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 147.44 0.67 2.12 4 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 52.48 0.58 1.83 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 5.78 0.43 1.36 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666 -40.54 0.33 1.05 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -18.18 0.58 1.84 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678 -111.48 1.42 4.48 6 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 10.43 0.64 2.04 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 21.67 0.49 1.56 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -27.81 0.38 1.19 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 -33.32 1.25 3.97 1 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -5.99 0.20 0.64 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -1.84 0.07 0.23 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -0.24 0.48 1.53 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 28.78 0.31 0.99 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 0.20 0.57 1.80 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 -80.01 0.63 1.98 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248 17.70 0.59 1.87 5 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666 -6.41 0.29 0.91 8 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 43.18 0.60 1.90 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 -1.14 0.35 1.11 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 -12.24 0.96 3.05 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 30.16 0.38 1.21 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 24.28 0.40 1.26 7 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -6.65 0.22 0.70 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -104.87 1.53 4.85 3 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 84.02 0.97 3.05 7 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677 -50.42 0.64 2.03 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248 50.57 0.82 2.59 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677 -148.41 0.59 1.87 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677 -125.73 0.33 1.05 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836 190.71 0.73 2.30 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248 9.36 0.43 1.36 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666 93.06 0.77 2.45 7 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 9a2d0be9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,48 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056 11.28 0.39 1.23 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 11.79 0.18 0.57 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410 185.58 1.08 3.43 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -54.43 0.89 2.80 1 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 -4.25 1.31 4.13 2 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 72.12 0.91 2.89 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 3.25 0.15 0.48 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 -2.38 0.27 0.84 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -7.51 0.12 0.39 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 22.49 0.14 0.45 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 -7.84 0.46 1.47 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -105.78 0.34 1.06 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 7.07 0.53 1.67 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 8.03 0.16 0.49 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 144.03 1.13 3.56 2 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 50.64 0.36 1.13 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 5.43 0.13 0.42 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666 -40.59 0.15 0.49 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -18.38 0.13 0.41 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678 -108.21 0.45 1.43 5 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 8.40 0.15 0.46 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 20.47 0.10 0.30 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -29.02 0.25 0.79 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 -29.71 0.60 1.89 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -6.27 0.24 0.75 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -0.71 0.12 0.38 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -1.71 0.07 0.22 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 27.01 0.14 0.43 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 -0.81 0.19 0.60 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 -80.09 0.46 1.45 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248 16.12 0.88 2.77 1 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666 -7.08 0.14 0.45 7 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 39.99 0.12 0.37 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 -0.86 0.13 0.42 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 -12.91 0.50 1.58 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 28.38 0.18 0.57 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 17.43 1.23 3.88 5 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -6.64 0.08 0.27 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -102.05 1.21 3.83 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 83.81 0.76 2.41 6 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677 -123.34 0.22 0.69 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248 47.41 0.28 0.88 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677 -144.74 0.33 1.04 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1083836 189.38 0.50 1.58 2 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677 -51.10 0.72 2.27 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666 93.39 0.40 1.26 7 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248 11.00 0.12 0.38 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 9e876903..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,55 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1078691 -17.03 0.78 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084431 3.64 0.83 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1078774 80.40 0.72 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677 -50.37 0.51 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677 -125.77 0.43 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086409 174.20 0.78 2 -FEP_CHEMBL1082248_CHEMBL1083836 -6.97 0.39 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 -10.24 0.66 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078691 -21.82 0.58 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1089056 7.72 0.15 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 89.80 0.51 0 -FEP_CHEMBL1082248_CHEMBL1083836 -6.97 0.39 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 -10.24 0.66 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078691 -21.82 0.58 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666 104.31 0.98 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1089056 7.72 0.15 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 -2.83 0.33 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1089056 6.48 0.14 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 71.95 0.83 3 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1086409 -12.37 0.75 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084431 104.72 1.40 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 -34.30 0.87 3 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084935 55.52 1.03 2 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083517 -42.40 0.55 0 -FEP_CHEMBL1077227_CHEMBL1086409 -5.90 0.63 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 -14.36 0.75 0 -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1085692 108.04 0.75 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1083517 -30.72 0.32 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666 2.35 1.18 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1086409 28.90 0.39 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1084115 1.65 0.26 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1077204 -22.17 0.23 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1086410 -2.89 0.30 0 -FEP_CHEMBL1077227_CHEMBL1086410 6.27 0.31 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 -2.69 1.23 1 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -19.52 0.55 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082249 -50.03 0.33 0 -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056 8.80 0.51 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 144.50 1.30 4 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 27.71 0.40 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089056 -1.14 0.43 0 -FEP_CHEMBL1089393_CHEMBL1088740 1.92 0.15 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 -79.90 0.58 1 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 9.56 0.59 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -99.91 1.68 3 -FEP_CHEMBL1089393_CHEMBL1089056 -0.47 0.35 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 29.76 0.85 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 7.43 0.54 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1089393 6.91 0.51 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084431 102.31 1.09 0 -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1096002 127.14 0.57 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1077204 -53.62 0.35 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084676 66.70 0.55 0 -FEP_CHEMBL1077227_CHEMBL1083836 8.65 0.37 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 60ab4fec..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/eg5/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,81 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677 -50.24 0.51 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1078774 79.54 0.20 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084431 7.30 0.60 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677 -123.97 0.25 0 -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1078691 -16.65 0.59 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086409 174.12 0.73 1 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084935 51.80 0.49 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1086409 -10.24 0.16 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 -78.74 0.22 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -18.33 0.15 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083517 -38.43 0.12 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082249 -49.88 0.27 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 26.68 0.08 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 8.63 0.16 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1084115 1.39 0.13 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089056 0.87 0.10 0 -FEP_CHEMBL1077227_CHEMBL1086410 6.31 0.08 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078691 -20.33 0.09 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 -29.81 0.44 2 -FEP_CHEMBL1089393_CHEMBL1088740 0.62 0.06 0 -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1085692 106.28 0.37 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1089056 6.09 0.07 0 -FEP_CHEMBL1082248_CHEMBL1083836 -8.24 0.05 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -103.04 0.65 3 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 -3.27 0.18 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 70.34 0.82 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 -7.21 0.24 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1077204 -22.91 0.28 0 -FEP_CHEMBL1077227_CHEMBL1086409 -3.82 0.07 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1089056 7.23 0.11 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 -4.29 1.99 2 -FEP_CHEMBL1089393_CHEMBL1089056 1.38 0.11 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1083517 -28.34 0.11 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1086409 29.28 0.13 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1086410 -3.09 0.06 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 -12.69 0.74 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084935 51.80 0.49 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 28.27 0.51 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1086409 -10.24 0.16 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 -78.74 0.22 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -18.33 0.15 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083517 -38.43 0.12 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082249 -49.88 0.27 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 26.68 0.08 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 8.63 0.16 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666 4.42 0.46 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 8.18 0.33 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1084115 1.39 0.13 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089056 0.87 0.10 0 -FEP_CHEMBL1077227_CHEMBL1086410 6.31 0.08 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078691 -20.33 0.09 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 -29.81 0.44 2 -FEP_CHEMBL1089393_CHEMBL1088740 0.62 0.06 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666 103.56 0.92 0 -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1085692 106.28 0.37 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1089056 6.09 0.07 0 -FEP_CHEMBL1082248_CHEMBL1083836 -8.24 0.05 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -103.04 0.65 3 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084431 103.91 0.53 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 -3.27 0.18 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 88.49 0.11 0 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 70.34 0.82 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 -7.21 0.24 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1077204 -22.91 0.28 0 -FEP_CHEMBL1077227_CHEMBL1086409 -3.82 0.07 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1089056 7.23 0.11 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 -4.29 1.99 2 -FEP_CHEMBL1089393_CHEMBL1089056 1.38 0.11 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1083517 -28.34 0.11 0 -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056 10.78 0.20 1 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 143.82 1.35 4 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1086409 29.28 0.13 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1086410 -3.09 0.06 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 -12.69 0.74 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1089393 6.01 0.08 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084676 66.71 0.18 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1077204 -53.28 0.33 0 -FEP_CHEMBL1077227_CHEMBL1083836 9.29 0.14 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084431 103.98 0.67 0 -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1096002 126.13 0.40 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 69729bd0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,78 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_290_57 -27.33 0.27 0.87 0 -FEP_42_35 -19.03 0.21 0.65 0 -FEP_251_256 -58.12 0.70 2.21 0 -FEP_30_42 27.60 0.18 0.57 0 -FEP_7b_1 -5.06 0.67 2.13 0 -FEP_266_224 -1.40 0.26 0.82 0 -FEP_7a_41 19.29 0.26 0.82 0 -FEP_15_163 -86.70 0.25 0.80 0 -FEP_54_50 -7.08 0.31 0.98 0 -FEP_7b_41 10.17 0.41 1.29 0 -FEP_163_252 -99.64 0.64 2.03 0 -FEP_252_155 178.84 0.50 1.59 0 -FEP_167_234 -47.98 0.33 1.03 0 -FEP_237_25 19.56 0.47 1.50 0 -FEP_290_165 -138.18 0.24 0.76 0 -FEP_290_164 -132.00 0.34 1.07 0 -FEP_155_61 -55.93 0.20 0.64 0 -FEP_227_57 -3.99 0.13 0.42 0 -FEP_1_61 -46.96 0.12 0.39 0 -FEP_237_155 -22.28 0.31 0.97 0 -FEP_338_336 -11.30 0.40 1.25 0 -FEP_42_41 -2.55 0.16 0.49 0 -FEP_252_256 -10.66 0.49 1.53 0 -FEP_237_252 -203.13 0.37 1.16 0 -FEP_256_67 156.66 0.37 1.17 0 -FEP_35_50 -105.98 0.59 1.86 0 -FEP_43_31 -29.49 0.23 0.73 0 -FEP_1_84 -23.36 0.54 1.69 0 -FEP_252_336 -10.79 0.41 1.31 0 -FEP_15_25 34.03 0.45 1.43 0 -FEP_235_167 -96.58 0.24 0.75 0 -FEP_156_1 -23.31 0.17 0.53 0 -FEP_215_252 -124.26 0.49 1.54 0 -FEP_254_163 42.54 0.41 1.30 0 -FEP_289_336 -86.03 0.41 1.28 0 -FEP_266_235 -1.45 0.24 0.76 0 -FEP_163_164 20.57 0.46 1.47 0 -FEP_23_1 -0.38 0.26 0.82 0 -FEP_124_54 -140.61 0.34 1.08 0 -FEP_35_41 17.40 0.12 0.39 0 -FEP_227_231 -139.54 0.29 0.91 0 -FEP_124_41 -25.44 0.50 1.59 0 -FEP_41_54 -114.83 0.63 1.99 0 -FEP_7a_1 3.51 0.22 0.70 0 -FEP_57_155 -46.67 0.18 0.56 0 -FEP_84_41 38.37 0.26 0.82 0 -FEP_235_224 1.62 0.18 0.56 0 -FEP_215_206 -0.02 0.32 1.02 0 -FEP_155_23 -8.42 0.16 0.49 0 -FEP_252_67 147.23 0.57 1.81 0 -FEP_163_234 6.02 0.18 0.56 0 -FEP_156_31 -12.46 0.25 0.80 0 -FEP_289_231 15.76 0.17 0.53 0 -FEP_42_43 22.30 0.16 0.50 0 -FEP_155_1 -8.81 0.11 0.34 0 -FEP_155_156 14.48 0.10 0.30 0 -FEP_290_252 -253.69 0.62 1.97 0 -FEP_15_252 -186.79 0.84 2.65 0 -FEP_338_252 -1.08 0.55 1.73 0 -FEP_215_167 30.30 0.20 0.63 0 -FEP_155_30 -18.22 0.28 0.90 0 -FEP_254_251 -9.35 0.25 0.80 0 -FEP_237_163 -102.30 0.34 1.06 0 -FEP_163_165 15.13 0.27 0.85 0 -FEP_290_235 -2.18 0.26 0.81 0 -FEP_206_163 -24.17 0.26 0.83 0 -FEP_290_227 -23.18 0.37 1.17 0 -FEP_237_215 -77.61 0.51 1.62 0 -FEP_163_231 -7.81 0.15 0.47 0 -FEP_206_252 -125.20 0.40 1.26 0 -FEP_237_164 -80.83 0.49 1.55 0 -FEP_155_42 8.77 0.18 0.57 0 -FEP_164_231 -28.86 0.38 1.19 0 -FEP_254_252 -58.07 0.58 1.83 0 -FEP_237_235 49.18 0.34 1.08 0 -FEP_252_164 121.05 0.73 2.31 0 -FEP_35_54 -98.76 0.71 2.25 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index d04d3f09..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,78 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_290_57 -28.42 0.28 0.89 0 -FEP_42_35 -18.63 0.11 0.34 0 -FEP_251_256 -58.56 0.32 1.01 0 -FEP_30_42 27.47 0.18 0.57 0 -FEP_7b_1 1.46 0.14 0.44 0 -FEP_266_224 -7.37 0.25 0.78 0 -FEP_7a_41 18.37 0.12 0.37 0 -FEP_15_163 -90.88 0.23 0.73 0 -FEP_54_50 -10.14 0.38 1.22 0 -FEP_7b_41 15.14 0.18 0.56 0 -FEP_163_252 -101.00 0.73 2.32 0 -FEP_252_155 182.08 0.49 1.53 0 -FEP_167_234 -50.16 0.21 0.66 0 -FEP_237_25 23.73 0.19 0.61 0 -FEP_290_165 -144.05 0.31 0.97 0 -FEP_290_164 -140.09 0.23 0.73 0 -FEP_155_61 -58.37 0.13 0.41 0 -FEP_227_57 -6.79 0.17 0.52 0 -FEP_1_61 -49.02 0.12 0.37 0 -FEP_237_155 -17.68 0.19 0.61 0 -FEP_338_336 -11.19 0.54 1.70 0 -FEP_42_41 -3.44 0.16 0.50 0 -FEP_252_256 -12.28 0.94 2.97 0 -FEP_237_252 -199.91 0.33 1.05 0 -FEP_256_67 163.51 0.48 1.52 0 -FEP_35_50 -110.46 0.17 0.53 0 -FEP_43_31 -30.75 0.12 0.39 0 -FEP_1_84 -28.42 0.11 0.36 0 -FEP_252_336 -9.78 0.91 2.88 0 -FEP_15_25 32.92 0.14 0.43 0 -FEP_235_167 -99.34 0.18 0.56 0 -FEP_156_1 -23.22 0.17 0.55 0 -FEP_215_252 -124.69 0.31 0.98 0 -FEP_254_163 44.54 0.24 0.77 0 -FEP_289_336 -86.01 0.42 1.32 0 -FEP_266_235 -2.72 0.25 0.80 0 -FEP_163_164 18.36 0.29 0.92 0 -FEP_23_1 0.78 0.11 0.34 0 -FEP_124_54 -142.79 0.11 0.36 0 -FEP_35_41 15.33 0.09 0.30 0 -FEP_227_231 -145.95 0.20 0.63 0 -FEP_124_41 -27.53 0.18 0.56 0 -FEP_41_54 -115.74 0.27 0.86 0 -FEP_7a_1 4.97 0.08 0.25 0 -FEP_57_155 -47.83 0.10 0.32 0 -FEP_84_41 41.66 0.12 0.39 0 -FEP_235_224 -3.73 0.30 0.94 0 -FEP_215_206 -1.68 0.16 0.51 0 -FEP_155_23 -10.66 0.11 0.34 0 -FEP_252_67 151.93 0.74 2.34 0 -FEP_163_234 5.81 0.27 0.85 0 -FEP_156_31 -14.55 0.24 0.77 0 -FEP_289_231 15.20 0.18 0.56 0 -FEP_42_43 22.43 0.19 0.60 0 -FEP_155_1 -9.27 0.13 0.41 0 -FEP_155_156 13.93 0.13 0.40 0 -FEP_290_252 -257.30 0.33 1.05 0 -FEP_15_252 -190.23 0.26 0.84 0 -FEP_338_252 -1.28 0.61 1.92 0 -FEP_215_167 30.57 0.19 0.61 0 -FEP_155_30 -19.79 0.12 0.39 0 -FEP_254_251 -9.47 0.16 0.49 0 -FEP_237_163 -99.93 0.24 0.76 0 -FEP_163_165 14.83 0.27 0.86 0 -FEP_290_235 -2.56 0.17 0.53 0 -FEP_206_163 -24.27 0.20 0.62 0 -FEP_290_227 -21.68 0.25 0.79 0 -FEP_237_215 -74.47 0.18 0.58 0 -FEP_163_231 -8.10 0.32 1.01 0 -FEP_237_164 -81.55 0.17 0.54 0 -FEP_35_54 -100.94 0.30 0.96 0 -FEP_164_231 -26.38 0.29 0.92 0 -FEP_237_235 55.34 0.15 0.49 0 -FEP_155_42 7.92 0.13 0.40 0 -FEP_206_252 -123.42 0.49 1.55 0 -FEP_252_164 121.03 0.54 1.69 0 -FEP_254_252 -55.55 0.52 1.66 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 06cc3e8a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,70 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30_42 26.76 0.28 0 -FEP_57_61 -102.31 0.29 0 -FEP_251_256 -57.54 0.60 0 -FEP_156_1 -23.51 0.22 0 -FEP_42_43 22.27 0.22 0 -FEP_7b_41 10.57 0.25 0 -FEP_215_167 30.56 0.18 0 -FEP_235_224 1.45 0.42 0 -FEP_1_23 -0.41 0.22 0 -FEP_252_338 0.42 1.01 0 -FEP_163_289 -24.29 0.29 0 -FEP_1_7b 4.56 0.62 0 -FEP_54_124 142.05 0.47 0 -FEP_163_252 -100.21 0.32 0 -FEP_252_237 204.13 0.81 0 -FEP_155_1 -8.86 0.13 0 -FEP_35_50 -103.84 0.36 0 -FEP_41_84 -37.71 0.40 0 -FEP_237_25 18.74 0.34 0 -FEP_215_252 -124.12 0.58 0 -FEP_41_54 -115.95 0.31 0 -FEP_227_231 -139.59 0.44 0 -FEP_256_67 157.51 0.58 0 -FEP_163_254 -43.65 0.60 0 -FEP_163_234 6.56 0.18 0 -FEP_1_84 -23.36 0.71 0 -FEP_206_163 -24.21 0.32 0 -FEP_252_256 -10.64 0.27 0 -FEP_234_167 47.39 0.34 0 -FEP_41_124 26.51 0.20 0 -FEP_215_206 0.50 0.20 0 -FEP_235_266 1.92 0.51 0 -FEP_237_155 -23.06 0.35 0 -FEP_289_336 -85.57 0.58 0 -FEP_155_156 14.50 0.17 0 -FEP_251_254 10.45 0.28 0 -FEP_1_61 -47.02 0.27 0 -FEP_252_67 147.51 0.47 0 -FEP_155_30 -17.56 0.23 0 -FEP_41_35 -17.23 0.15 0 -FEP_290_235 -2.56 0.30 0 -FEP_155_57 46.33 0.21 0 -FEP_42_41 -2.39 0.15 0 -FEP_336_338 11.24 0.49 0 -FEP_1_7a -3.66 0.29 0 -FEP_224_266 1.56 0.36 0 -FEP_252_235 250.38 0.51 0 -FEP_43_31 -28.86 0.13 0 -FEP_234_15 80.12 0.33 0 -FEP_163_15 86.50 0.20 0 -FEP_57_227 4.22 0.18 0 -FEP_15_25 34.11 0.42 0 -FEP_206_164 -4.06 0.49 0 -FEP_231_289 -15.78 0.21 0 -FEP_7a_41 18.27 0.19 0 -FEP_156_31 -12.24 0.16 0 -FEP_155_23 -8.90 0.21 0 -FEP_163_165 15.86 0.30 0 -FEP_54_50 -6.17 0.46 0 -FEP_165_290 138.17 0.47 0 -FEP_163_164 21.57 0.21 0 -FEP_15_252 -185.93 0.52 0 -FEP_164_290 133.24 0.82 0 -FEP dG sem crashes -FEP_57_290 28.19 0.33 0 -FEP_237_163 -102.26 0.35 0 -FEP_235_167 -97.06 0.24 0 -FEP_35_42 19.48 0.16 0 -FEP_61_155 56.24 0.17 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index 2bd95d12..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_57_290 28.19 0.33 0 -FEP_237_163 -102.26 0.35 0 -FEP_235_167 -97.06 0.24 0 -FEP_35_42 19.48 0.16 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index b55d0b1a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,70 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_30_42 27.11 0.34 0 -FEP_57_61 -106.28 0.15 0 -FEP_251_256 -59.65 0.70 0 -FEP_156_1 -23.33 0.20 0 -FEP_42_43 22.46 0.15 0 -FEP_7b_41 14.48 0.23 0 -FEP_215_167 30.10 0.23 0 -FEP_235_224 -3.50 0.20 0 -FEP_1_23 -1.01 0.13 0 -FEP_252_338 1.65 0.82 0 -FEP_163_289 -23.75 0.20 0 -FEP_1_7b -1.30 0.14 0 -FEP_54_124 143.02 0.08 0 -FEP_163_252 -100.99 0.29 0 -FEP_252_237 200.28 0.31 0 -FEP_155_1 -9.39 0.14 0 -FEP_35_50 -109.31 0.09 0 -FEP_41_84 -40.71 0.13 0 -FEP_237_25 23.82 0.22 0 -FEP_215_252 -126.62 0.76 0 -FEP_41_54 -115.08 0.14 0 -FEP_227_231 -144.08 0.24 0 -FEP_256_67 163.33 0.41 0 -FEP_163_254 -44.82 0.37 0 -FEP_163_234 6.42 0.19 0 -FEP_1_84 -28.12 0.22 0 -FEP_206_163 -22.57 0.12 0 -FEP_252_256 -9.93 0.60 0 -FEP_234_167 48.62 0.16 0 -FEP_41_124 27.77 0.25 0 -FEP_215_206 -2.07 0.17 0 -FEP_235_266 2.54 0.69 0 -FEP_237_155 -17.82 0.21 0 -FEP_289_336 -86.31 0.29 0 -FEP_155_156 13.71 0.20 0 -FEP_251_254 9.44 0.16 0 -FEP_1_61 -49.18 0.08 0 -FEP_252_67 151.37 0.62 0 -FEP_155_30 -19.81 0.06 0 -FEP_41_35 -15.23 0.11 0 -FEP_290_235 -3.53 0.29 0 -FEP_155_57 48.22 0.14 0 -FEP_42_41 -3.40 0.16 0 -FEP_336_338 11.87 0.51 0 -FEP_1_7a -5.07 0.20 0 -FEP_224_266 7.32 0.53 0 -FEP_252_235 255.50 0.51 0 -FEP_43_31 -30.51 0.13 0 -FEP_234_15 82.91 0.27 0 -FEP_163_15 89.87 0.21 0 -FEP_57_227 6.79 0.18 0 -FEP_15_25 32.86 0.33 0 -FEP_206_164 -3.67 0.26 0 -FEP_231_289 -15.62 0.19 0 -FEP_7a_41 17.44 0.19 0 -FEP_156_31 -14.69 0.13 0 -FEP_155_23 -10.49 0.15 0 -FEP_163_165 14.99 0.32 0 -FEP_54_50 -9.14 0.15 0 -FEP_165_290 143.25 0.29 0 -FEP_163_164 18.65 0.10 0 -FEP_15_252 -190.08 0.38 0 -FEP_164_290 138.83 0.28 0 -FEP dG sem crashes -FEP_237_163 -99.13 0.22 0 -FEP_35_42 18.24 0.20 0 -FEP_57_290 28.77 0.34 0 -FEP_235_167 -99.53 0.37 0 -FEP_61_155 58.07 0.11 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index 22d4c376..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/hif2a/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,5 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_237_163 -99.13 0.22 0 -FEP_35_42 18.24 0.20 0 -FEP_57_290 28.77 0.34 0 -FEP_235_167 -99.53 0.37 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index e15b899d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,73 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_56_55 2.78 0.13 0.42 0 -FEP_29_19 109.65 0.75 2.36 0 -FEP_48_49 -29.23 0.29 0.90 0 -FEP_29_26 45.46 0.19 0.60 0 -FEP_35_49 -20.85 0.26 0.82 0 -FEP_70_62 5.13 0.29 0.92 0 -FEP_46_49 -50.66 0.24 0.77 0 -FEP_53_52 -3.47 0.48 1.51 0 -FEP_24_19 -1.89 0.14 0.46 0 -FEP_48_20 -2.91 0.39 1.23 0 -FEP_65_63 -2.58 0.17 0.53 0 -FEP_69_65 0.61 0.19 0.61 0 -FEP_47_44 -2.85 0.30 0.94 0 -FEP_37_35 -19.79 0.48 1.52 7 -FEP_62_49 -27.79 0.15 0.48 0 -FEP_54_35 -7.34 0.47 1.48 0 -FEP_33_31 -21.32 0.22 0.70 0 -FEP_60_59 11.94 0.56 1.77 0 -FEP_68_49 -5.79 0.39 1.23 0 -FEP_49_44 34.42 0.20 0.64 0 -FEP_67_68 43.17 0.31 0.99 0 -FEP_36_29 -105.26 0.86 2.72 0 -FEP_56_35 2.67 0.28 0.88 0 -FEP_41_20 -5.41 0.37 1.16 0 -FEP_59_58 -14.20 0.17 0.52 0 -FEP_35_29 -72.17 0.33 1.06 0 -FEP_67_65 63.45 0.19 0.60 0 -FEP_30_19 -29.42 1.18 3.73 1 -FEP_31_30 23.00 0.49 1.54 0 -FEP_41_43 0.04 0.20 0.65 0 -FEP_69_70 -2.27 0.15 0.48 0 -FEP_53_35 -8.18 0.38 1.21 0 -FEP_67_49 36.32 0.50 1.60 0 -FEP_60_58 -3.41 0.52 1.65 0 -FEP_59_62 -8.94 0.25 0.78 0 -FEP_64_63 -1.15 0.19 0.61 0 -FEP_33_24 -24.60 0.20 0.64 0 -FEP_35_34 10.77 0.14 0.44 0 -FEP_34_26 -37.88 0.63 2.01 0 -FEP_38_39 -22.28 0.19 0.61 0 -FEP_63_62 4.49 0.19 0.59 0 -FEP_31_23 18.94 0.31 0.99 0 -FEP_47_49 -37.47 0.49 1.54 0 -FEP_55_35 0.11 0.11 0.34 0 -FEP_49_39 1.27 0.19 0.59 0 -FEP_36_35 -31.80 0.66 2.08 1 -FEP_52_35 -3.69 0.25 0.80 0 -FEP_42_43 0.87 0.36 1.13 0 -FEP_38_43 8.52 0.63 2.00 0 -FEP_42_39 -30.60 0.34 1.07 0 -FEP_65_64 -1.80 0.17 0.55 0 -FEP_54_57 0.55 0.37 1.17 0 -FEP_46_44 -14.71 0.16 0.50 0 -FEP_35_33 64.08 0.31 0.99 0 -FEP_37_34 -11.01 0.56 1.78 6 -FEP_19_23 24.73 0.42 1.34 0 -FEP_43_39 -31.25 0.31 0.97 0 -FEP_57_35 -7.89 0.20 0.64 0 -FEP_44_43 -3.26 0.43 1.35 0 -FEP_62_44 7.04 0.30 0.96 0 -FEP_35_62 6.92 0.27 0.84 0 -FEP_62_58 -5.22 0.22 0.70 0 -FEP_24_30 25.26 0.79 2.49 2 -FEP_62_33 57.33 0.46 1.46 0 -FEP_68_65 20.67 0.15 0.49 0 -FEP_35_62 6.86 0.26 0.83 0 -FEP_68_65 20.30 0.30 0.94 0 -FEP_35_31 43.14 0.59 1.88 0 -FEP_35_63 2.21 0.23 0.74 0 -FEP_62_44 6.75 0.26 0.83 0 -FEP_62_58 -5.19 0.19 0.61 0 -FEP_24_30 24.71 0.74 2.33 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 70b476d5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,73 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_56_55 4.59 0.25 0.81 0 -FEP_29_19 107.74 0.51 1.62 0 -FEP_48_49 -29.46 0.17 0.54 0 -FEP_29_26 45.62 0.16 0.52 0 -FEP_35_49 -24.23 0.23 0.74 0 -FEP_70_62 3.91 0.16 0.51 0 -FEP_46_49 -47.54 0.16 0.50 0 -FEP_53_52 -1.33 0.24 0.75 0 -FEP_24_19 -3.90 0.18 0.57 0 -FEP_48_20 -1.12 0.16 0.51 0 -FEP_65_63 -1.80 0.19 0.60 0 -FEP_69_65 -0.23 0.16 0.52 0 -FEP_47_44 0.12 0.16 0.49 0 -FEP_37_35 -21.59 0.52 1.63 3 -FEP_62_49 -30.65 0.22 0.70 0 -FEP_54_35 -3.30 0.27 0.86 0 -FEP_33_31 -20.12 0.20 0.62 0 -FEP_60_59 9.21 0.40 1.27 0 -FEP_68_49 -10.04 0.30 0.95 0 -FEP_49_44 35.05 0.13 0.41 0 -FEP_67_68 42.79 0.20 0.64 0 -FEP_36_29 -104.97 0.14 0.44 0 -FEP_56_35 2.87 0.19 0.60 0 -FEP_41_20 -6.48 0.26 0.83 0 -FEP_59_58 -11.85 0.17 0.53 0 -FEP_35_29 -75.56 0.16 0.50 0 -FEP_67_65 60.95 0.26 0.82 0 -FEP_30_19 -29.34 0.58 1.82 0 -FEP_31_30 16.29 0.67 2.12 0 -FEP_41_43 1.54 0.21 0.65 0 -FEP_69_70 -2.26 0.28 0.90 0 -FEP_53_35 -2.74 0.20 0.62 0 -FEP_67_49 33.23 0.27 0.85 0 -FEP_60_58 -1.36 0.40 1.28 0 -FEP_59_62 -6.82 0.13 0.41 0 -FEP_64_63 0.22 0.15 0.49 0 -FEP_33_24 -27.18 0.15 0.46 0 -FEP_35_34 10.76 0.44 1.39 0 -FEP_34_26 -41.43 0.23 0.72 0 -FEP_38_39 -24.66 0.10 0.33 0 -FEP_63_62 4.97 0.21 0.66 0 -FEP_31_23 16.74 0.38 1.21 0 -FEP_47_49 -34.98 0.23 0.72 0 -FEP_55_35 -1.57 0.16 0.50 0 -FEP_49_39 1.86 0.21 0.68 0 -FEP_36_35 -28.58 0.46 1.44 0 -FEP_52_35 -1.42 0.22 0.71 0 -FEP_42_43 2.91 0.21 0.67 0 -FEP_38_43 8.82 0.18 0.57 0 -FEP_42_39 -30.58 0.17 0.54 0 -FEP_65_64 -2.31 0.20 0.62 0 -FEP_54_57 4.49 0.18 0.58 0 -FEP_46_44 -12.41 0.20 0.64 0 -FEP_35_33 62.43 0.34 1.07 0 -FEP_37_34 -13.90 0.99 3.12 3 -FEP_19_23 28.01 0.14 0.45 0 -FEP_43_39 -33.36 0.22 0.70 0 -FEP_57_35 -7.77 0.17 0.53 0 -FEP_44_43 0.24 0.16 0.52 0 -FEP_35_62 6.53 0.22 0.69 0 -FEP_62_58 -5.03 0.15 0.48 0 -FEP_62_33 55.81 0.13 0.40 0 -FEP_24_30 25.79 0.36 1.14 0 -FEP_68_65 18.73 0.25 0.80 0 -FEP_62_44 4.53 0.21 0.66 0 -FEP_62_44 4.82 0.20 0.63 0 -FEP_35_63 1.89 0.17 0.55 0 -FEP_35_62 6.44 0.28 0.89 0 -FEP_62_58 -4.71 0.19 0.61 0 -FEP_24_30 26.00 0.78 2.47 0 -FEP_35_31 42.70 0.22 0.68 0 -FEP_68_65 18.49 0.15 0.47 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 887f7cd5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,65 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_49_68 7.13 0.44 0 -FEP_59_58 -14.42 0.23 0 -FEP_59_60 -11.67 0.77 0 -FEP_44_47 3.36 0.23 0 -FEP_49_44 35.31 0.34 0 -FEP_34_26 -37.78 0.42 0 -FEP_35_36 30.60 0.83 0 -FEP_49_48 29.28 0.38 0 -FEP_49_39 0.86 0.16 0 -FEP_35_29 -72.53 0.36 0 -FEP_43_38 -8.89 0.40 0 -FEP_49_47 38.99 0.68 0 -FEP_31_30 22.13 0.76 0 -FEP_44_62 -7.30 0.16 0 -FEP_39_42 29.97 0.41 0 -FEP_35_34 10.57 0.29 0 -FEP_53_35 -8.66 0.65 0 -FEP_62_59 9.68 0.21 0 -FEP_49_46 51.93 0.43 0 -FEP_49_62 28.02 0.16 0 -FEP_67_65 63.16 0.21 0 -FEP_54_57 -0.39 0.31 0 -FEP_35_49 -21.04 0.25 0 -FEP_67_68 43.49 0.16 0 -FEP_65_63 -2.95 0.22 0 -FEP_31_23 18.99 0.29 0 -FEP_29_36 104.46 0.84 0 -FEP_44_43 -3.39 0.49 0 -FEP_29_26 45.88 0.35 0 -FEP_52_35 -3.78 0.28 0 -FEP_39_38 22.84 0.22 0 -FEP_19_30 26.88 0.42 3 -FEP_43_42 0.39 0.44 0 -FEP_29_19 109.02 0.59 0 -FEP_35_37 21.50 1.50 6 -FEP_33_24 -24.69 0.29 0 -FEP_35_57 8.12 0.19 0 -FEP_35_55 0.24 0.14 0 -FEP_64_63 -1.49 0.15 0 -FEP_58_60 3.75 0.61 0 -FEP_56_55 2.66 0.29 0 -FEP_43_39 -31.51 0.40 0 -FEP_44_46 14.71 0.19 0 -FEP_63_62 4.69 0.16 0 -FEP_35_56 -2.38 0.27 0 -FEP_35_54 7.13 0.41 0 -FEP_24_19 -3.15 0.35 0 -FEP_65_64 -1.89 0.30 0 -FEP_19_23 24.79 0.44 0 -FEP_35_33 63.65 0.34 0 -FEP_49_67 -36.16 0.47 0 -FEP_65_69 -0.69 0.26 0 -FEP_34_37 8.56 0.99 5 -FEP_69_70 -2.00 0.16 0 -FEP_62_70 -4.53 0.18 0 -FEP_41_20 -5.19 0.25 0 -FEP_52_53 3.59 0.29 0 -FEP_20_48 3.50 0.72 0 -FEP_31_33 21.56 0.20 0 -FEP_41_43 -0.83 0.56 0 -FEP_58_63 -0.09 0.24 0 -FEP_37_29 -88.55 0.52 0 -FEP_60_44 7.55 0.84 2 -FEP_65_35 -5.53 0.31 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index 5fd9b116..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_58_63 -0.09 0.24 0 -FEP_37_29 -92.15 0.57 8 -FEP_65_35 -5.53 0.31 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 2697c197..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,68 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_67_68 42.83 0.17 0 -FEP_39_38 24.27 0.19 0 -FEP_29_36 104.06 0.14 0 -FEP_63_62 5.07 0.09 0 -FEP_43_38 -8.92 0.61 0 -FEP_44_43 0.43 0.12 0 -FEP_35_29 -75.31 0.12 0 -FEP_35_54 2.68 0.11 0 -FEP_29_19 107.32 0.52 0 -FEP_20_41 6.08 0.16 0 -FEP_31_23 17.24 0.17 0 -FEP_19_23 27.81 0.24 0 -FEP_43_41 -1.06 0.34 0 -FEP_65_63 -2.38 0.21 0 -FEP_49_39 2.08 0.08 0 -FEP_43_39 -33.28 0.12 0 -FEP_59_60 -9.07 0.67 0 -FEP_65_69 0.24 0.18 0 -FEP_35_55 1.82 0.20 0 -FEP_49_48 29.31 0.19 0 -FEP_49_62 30.73 0.15 0 -FEP_67_65 60.83 0.12 0 -FEP_35_34 11.11 0.13 0 -FEP_35_37 22.54 1.03 5 -FEP_24_19 -3.51 0.22 0 -FEP_49_68 10.10 0.18 0 -FEP_69_70 -1.38 0.16 0 -FEP_39_42 30.82 0.13 0 -FEP_31_30 18.18 0.47 0 -FEP_35_56 -3.39 0.18 0 -FEP_64_63 0.25 0.15 0 -FEP_53_35 -2.60 0.16 0 -FEP_65_64 -2.86 0.13 0 -FEP_35_36 28.01 0.09 0 -FEP_52_35 -0.99 0.18 0 -FEP_48_20 -0.89 0.22 0 -FEP_34_37 10.66 0.91 7 -FEP_35_33 62.93 0.18 0 -FEP_59_58 -11.45 0.11 0 -FEP_49_67 -32.72 0.28 0 -FEP_44_47 -0.45 0.12 0 -FEP_19_30 29.54 0.93 3 -FEP_49_47 34.94 0.15 0 -FEP_44_62 -4.41 0.13 0 -FEP_49_44 34.96 0.13 0 -FEP_35_57 7.16 0.23 0 -FEP_62_59 6.50 0.15 0 -FEP_58_60 1.97 0.55 0 -FEP_35_49 -24.43 0.16 0 -FEP_29_26 45.34 0.31 0 -FEP_54_57 4.61 0.21 0 -FEP_33_24 -27.01 0.07 0 -FEP_56_55 4.81 0.18 0 -FEP_49_46 47.67 0.17 0 -FEP_44_46 12.35 0.15 0 -FEP_34_26 -41.61 0.19 0 -FEP_62_70 -3.66 0.22 0 -FEP_43_42 -2.88 0.20 0 -FEP_41_20 -6.23 0.24 0 -FEP_52_53 1.27 0.21 0 -FEP_20_48 1.26 0.15 0 -FEP_31_33 19.86 0.19 0 -FEP_41_43 1.47 0.22 0 -FEP_37_29 -92.31 0.14 0 -FEP_65_35 -3.99 0.16 0 -FEP_58_63 -0.14 0.13 0 -FEP_60_44 6.74 0.76 1 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index 2d1ef905..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/pfkfb3/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_37_29 -95.83 0.06 8 -FEP_65_35 -3.99 0.16 0 -FEP_58_63 -0.14 0.13 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index f8a19e8f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/benchmark/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,10 +0,0 @@ -FEP_SHP836-2_Example-27 protein/ -FEP_SHP836-2_4 protein/ -FEP_SHP836-2_3 protein/ -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30 protein/ -FEP_7_6 water/ -FEP_4_3 water/ -FEP_11_10 water/ -FEP_11_SHP099-1-Example-7 water/ -FEP_7_Example-1 water/ -FEP_Example-24_Example-22 water/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 7d1d5bc0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_Example-23_Example-22 -0.16 0.32 1.00 1 -FEP_Example-30_Example-1 -198.07 0.39 1.23 0 -FEP_Example-24_Example-22 6.78 0.21 0.66 2 -FEP_Example-6_Example-1 40.21 0.30 0.94 2 -FEP_Example-1_Example-3 -7.37 0.61 1.94 0 -FEP_7_6 -45.85 0.56 1.76 0 -FEP_Example-1_Example-2 4.39 0.22 0.71 0 -FEP_7_Example-1 -74.15 0.63 2.00 0 -FEP_Example-8_Example-9 -5.35 0.44 1.40 5 -FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7 -51.11 0.28 0.88 2 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29 8.07 0.27 0.85 3 -FEP_Example-8_Example-14 -20.19 0.47 1.50 3 -FEP_Example-5_Example-1 21.59 1.03 3.25 3 -FEP_Example-26_Example-23 40.70 1.07 3.40 4 -FEP_Example-25_Example-24 1.02 0.22 0.71 2 -FEP_Example-2_Example-4 -1.11 0.57 1.80 0 -FEP_Example-26_Example-24 32.70 0.79 2.49 1 -FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7 4.81 0.46 1.47 0 -FEP_Example-3_Example-4 10.19 0.22 0.69 1 -FEP_11_10 18.97 0.26 0.83 0 -FEP_Example-1_6 26.23 0.19 0.59 0 -FEP_Example-28_Example-29 12.66 0.23 0.74 0 -FEP_Example-5_Example-6 -16.52 0.44 1.40 3 -FEP_Example-23_Example-24 -8.14 0.25 0.78 3 -FEP_11_SHP099-1-Example-7 -32.34 0.65 2.07 0 -FEP_Example-23_Example-30 -120.02 0.41 1.29 2 -FEP_Example-9_Example-14 -14.41 0.52 1.64 2 -FEP_Example-25_Example-23 9.47 0.22 0.71 3 -FEP_4_3 -5.32 0.29 0.92 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27 94.99 1.37 4.33 2 -FEP_SHP099-1-Example-7_10 51.20 0.16 0.51 4 -FEP_7_Example-1 -72.19 0.59 1.86 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30 -97.55 0.31 0.99 0 -FEP_Example-24_Example-22 7.38 0.32 1.02 0 -FEP_4_3 -5.19 0.21 0.66 0 -FEP_SHP836-2_3 -8.95 0.43 1.37 0 -FEP_7_6 -46.23 0.79 2.50 0 -FEP_Example-23_Example-30 -119.28 0.29 0.91 0 -FEP_SHP836-2_4 -3.52 0.42 1.31 0 -FEP_11_10 19.13 0.36 1.14 0 -FEP_SHP836-2_Example-27 306.29 0.39 1.23 0 -FEP_11_SHP099-1-Example-7 -31.34 0.54 1.70 0 -FEP_Example-27_Example-14 -63.72 0.97 3.06 0 -FEP_Example-6_Example-2 43.66 0.41 1.29 0 -FEP_Example-24_Example-30 -109.79 0.43 1.36 0 -FEP_SHP836-2_6 -57.74 0.55 1.73 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1 -295.09 0.50 1.57 0 -FEP_Example-8_Example-28 -56.27 0.35 1.11 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14 30.40 0.46 1.46 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 7e6c4b08..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,48 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_Example-1_6 25.61 0.23 0.72 2 -FEP_Example-23_Example-22 -3.62 0.32 1.00 0 -FEP_SHP836-2_Example-27 309.05 0.12 0.38 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_10 49.43 0.25 0.80 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30 -95.97 0.43 1.37 0 -FEP_Example-6_Example-1 39.68 0.19 0.61 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27 91.73 0.24 0.77 0 -FEP_Example-28_Example-29 11.09 0.31 0.98 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29 8.45 0.31 0.97 0 -FEP_Example-3_Example-4 10.19 0.27 0.87 0 -FEP_SHP836-2_4 -1.13 0.12 0.38 0 -FEP_SHP836-2_3 -7.36 0.14 0.45 0 -FEP_Example-25_Example-23 12.24 0.14 0.46 4 -FEP_Example-26_Example-24 33.85 1.05 3.31 1 -FEP_Example-30_Example-1 -200.97 0.14 0.44 0 -FEP_Example-2_Example-4 -0.42 0.35 1.11 0 -FEP_Example-5_Example-1 24.18 0.16 0.49 0 -FEP_Example-23_Example-30 -117.30 nan nan 9 -FEP_Example-9_Example-14 -16.15 0.38 1.20 0 -FEP_Example-1_Example-3 -7.84 0.23 0.73 0 -FEP_Example-26_Example-23 44.25 1.00 3.15 3 -FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7 2.52 0.22 0.69 0 -FEP_Example-5_Example-6 -15.88 0.21 0.66 0 -FEP_Example-8_Example-9 -3.29 0.23 0.74 0 -FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7 -54.75 0.25 0.78 0 -FEP_Example-25_Example-24 1.83 0.21 0.66 0 -FEP_Example-23_Example-24 -10.09 0.22 0.71 0 -FEP_Example-1_Example-2 2.87 0.15 0.46 0 -FEP_Example-8_Example-14 -19.45 0.33 1.04 0 -FEP_7_Example-1 -71.75 0.20 0.62 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30 -96.43 0.38 1.20 0 -FEP_Example-24_Example-22 6.51 0.10 0.32 0 -FEP_4_3 -6.17 0.08 0.25 0 -FEP_SHP836-2_3 -7.15 0.15 0.46 0 -FEP_7_6 -46.31 0.14 0.46 0 -FEP_Example-23_Example-30 -117.22 0.18 0.58 0 -FEP_SHP836-2_4 -1.16 0.15 0.48 0 -FEP_11_10 24.27 0.25 0.79 0 -FEP_SHP836-2_Example-27 309.06 0.18 0.56 0 -FEP_11_SHP099-1-Example-7 -25.07 0.35 1.11 0 -FEP_Example-6_Example-2 42.25 0.23 0.72 0 -FEP_SHP836-2_6 -54.53 0.13 0.41 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1 -297.76 0.19 0.61 0 -FEP_Example-27_Example-14 -56.74 0.40 1.27 0 -FEP_Example-24_Example-30 -107.51 0.59 1.88 0 -FEP_Example-8_Example-28 -57.19 0.36 1.14 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14 35.45 0.29 0.93 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index 8eb07ada..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,8 +0,0 @@ -FEP_SHP836_2-4 water/ -FEP_SHP836_2-Example_27 water/ -FEP_SHP836_2-3 water/ -FEP_6-SHP836_2 water/ -FEP_SHP836_2-4 protein/ -FEP_SHP836_2-Example_27 protein/ -FEP_SHP836_2-3 protein/ -FEP_6-SHP836_2 protein/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 074f56a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,41 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_Example-1_Example-5 -21.45 0.60 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_11 31.25 0.77 0 -FEP_Example-24_Example-26 -35.28 0.44 2 -FEP_Example-23_Example-22 -1.43 0.28 0 -FEP-6_7 45.48 0.61 0 -FEP_Example-23_Example-24 -8.28 0.30 0 -FEP_Example-1_Example-6 -39.96 0.27 0 -FEP_Example-23_Example-26 -43.16 0.93 2 -FEP_Example-2_Example-6 -43.91 0.30 0 -FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7 -52.06 0.39 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-29 6.56 0.47 0 -FEP_Example-23_Example-25 -10.13 0.27 0 -FEP_Example-1_Example-3 -7.51 0.57 0 -FEP_Example-8_Example-28 -54.29 0.97 0 -FEP_Example-24_Example-25 -2.03 0.47 0 -FEP_Example-2_Example-4 -1.33 0.38 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-28 -3.12 0.64 0 -FEP_Example-30_Example-23 120.41 0.33 0 -FEP_Example-1_6 25.83 0.26 0 -FEP_Example-1_7 71.90 0.73 0 -FEP_Example-24_Example-22 6.74 0.37 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-30 -97.84 0.22 0 -FEP_Example-9_Example-8 5.50 0.17 0 -FEP_Example-6_Example-5 16.93 0.46 1 -FEP-SHP099-1-Example-7_10 50.94 0.35 0 -FEP_Example-9_Example-14 -16.82 0.56 0 -FEP_Example-14_Example-8 21.43 0.53 0 -FEP_Example-30_Example-1 -199.08 0.49 0 -FEP-11_10 18.72 0.55 0 -FEP_Example-3_Example-4 10.29 0.18 0 -FEP-3_4 5.30 0.29 0 -FEP_Example-28_Example-29 11.54 0.33 0 -FEP_Example-1_Example-2 4.22 0.27 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-27 94.96 0.83 1 -FEP_SHP836-2_Example-27 308.21 0.49 0 -FEP_6_SHP836-2 56.91 0.50 0 -FEP_SHP836-2_4 -4.01 0.55 0 -FEP_SHP836-2_3 -8.52 0.36 0 -FEP dG sem crashes -FEP_Example-22_SHP099-1-Example-7 -20.51 0.42 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index 391504d9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,2 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_Example-22_SHP099-1-Example-7 -20.51 0.42 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index aa0c5543..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,41 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_Example-1_Example-5 -23.96 0.13 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_11 23.95 0.32 0 -FEP_Example-24_Example-26 -32.78 0.98 3 -FEP_Example-23_Example-22 -3.42 0.24 0 -FEP-6_7 45.55 0.16 0 -FEP_Example-23_Example-24 -10.14 0.16 0 -FEP_Example-1_Example-6 -39.81 0.16 0 -FEP_Example-23_Example-26 -43.71 0.87 2 -FEP_Example-2_Example-6 -42.28 0.09 0 -FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7 -53.72 0.46 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-29 8.39 0.28 0 -FEP_Example-23_Example-25 -11.83 0.18 0 -FEP_Example-1_Example-3 -7.60 0.18 0 -FEP_Example-8_Example-28 -57.23 0.61 0 -FEP_Example-24_Example-25 -1.93 0.16 0 -FEP_Example-2_Example-4 -0.26 0.27 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-28 -3.13 0.48 0 -FEP_Example-30_Example-23 117.08 0.27 0 -FEP_Example-1_6 25.05 0.18 0 -FEP_Example-1_7 71.23 0.32 0 -FEP_Example-24_Example-22 7.28 0.16 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-30 -97.17 0.31 0 -FEP_Example-9_Example-8 3.14 0.52 0 -FEP_Example-6_Example-5 15.99 0.27 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_10 48.82 0.28 0 -FEP_Example-9_Example-14 -15.20 0.36 0 -FEP_Example-14_Example-8 18.38 0.35 0 -FEP_Example-30_Example-1 -201.35 0.11 0 -FEP-11_10 23.92 0.74 0 -FEP_Example-3_Example-4 10.31 0.08 0 -FEP-3_4 6.14 0.07 0 -FEP_Example-28_Example-29 10.96 0.39 0 -FEP_Example-1_Example-2 2.72 0.14 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-27 91.16 0.33 0 -FEP_SHP836-2_Example-27 309.04 0.19 0 -FEP_SHP836-2_4 -1.36 0.37 0 -FEP_6_SHP836-2 54.40 0.11 0 -FEP_SHP836-2_3 -7.34 0.23 0 -FEP dG sem crashes -FEP_Example-22_SHP099-1-Example-7 -17.31 0.19 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index 5694d777..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/shp2/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,2 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_Example-22_SHP099-1-Example-7 -17.31 0.19 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index c60d13e0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,76 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027 -3.92 0.59 1.87 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -10.18 0.25 0.80 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030 32.98 0.27 0.86 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -2.14 0.52 1.66 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016 -15.83 0.21 0.67 0 -FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026 35.28 0.40 1.27 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032 -5.31 0.16 0.52 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030 -21.23 0.30 0.93 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 13.34 0.26 0.82 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 59.34 0.49 1.55 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032 53.41 0.21 0.67 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 13.08 0.36 1.13 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995 41.81 0.31 0.99 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996 6.79 0.15 0.47 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820 8.43 0.55 1.75 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -8.17 0.19 0.61 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 21.89 0.24 0.74 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020 -18.00 0.28 0.90 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -4.52 0.30 0.95 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 6.79 0.43 1.35 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 15.30 0.36 1.14 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005 31.70 0.32 1.00 8 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997 30.84 0.34 1.08 0 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 9.47 0.18 0.57 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 59.32 1.10 3.49 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031 124.64 0.18 0.56 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 10.39 0.27 0.85 0 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005 -25.38 0.15 0.48 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032 17.16 0.20 0.63 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 -10.21 0.30 0.93 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 35.35 0.49 1.56 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998 131.91 0.81 2.56 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -16.59 0.49 1.54 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020 55.97 0.44 1.39 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999 -33.03 0.53 1.67 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995 175.15 0.94 2.97 3 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 21.72 0.27 0.87 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021 8.60 0.19 0.62 0 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995 10.64 0.28 0.89 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 -9.99 0.16 0.49 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 -21.02 0.30 0.94 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820 2.95 0.57 1.81 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005 25.28 0.22 0.69 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 0.40 0.91 2.87 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 5.68 0.91 2.87 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 -10.72 0.37 1.17 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016 6.89 0.21 0.65 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -5.08 0.50 1.57 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -2.46 0.51 1.62 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -10.49 0.46 1.46 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999 -39.66 0.33 1.04 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -21.13 0.20 0.64 0 -FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017 7.92 0.24 0.76 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026 30.48 0.36 1.15 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032 178.24 0.25 0.80 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 19.63 0.34 1.06 0 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998 -30.69 0.43 1.36 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 8.64 0.42 1.31 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 -11.40 0.77 2.43 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019 -15.19 0.35 1.10 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 0.22 0.15 0.48 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018 -16.88 0.52 1.63 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 -0.56 0.43 1.38 0 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029 -3.10 0.26 0.82 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036 161.25 0.13 0.41 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -4.73 0.42 1.33 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017 74.26 0.37 1.19 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020 -22.22 0.24 0.77 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035 8.25 0.33 1.06 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003 6.85 0.42 1.34 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820 17.99 0.30 0.96 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004 17.35 0.24 0.75 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005 -1.95 0.84 2.67 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001 162.55 1.06 3.35 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005 -0.96 0.22 0.70 7 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index e140839f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,77 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999 -36.49 0.19 0.61 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 13.77 0.19 0.59 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 -21.74 0.19 0.59 0 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 9.07 0.21 0.67 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 -0.51 0.32 1.01 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 57.02 0.31 0.97 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -4.81 0.10 0.31 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996 3.94 0.37 1.18 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019 -14.22 0.27 0.87 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 -1.61 0.33 1.03 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 -10.78 0.26 0.83 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016 -15.54 0.15 0.48 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030 -20.84 0.11 0.35 0 -FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017 9.42 0.14 0.45 0 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029 -4.07 0.19 0.59 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 -0.52 0.12 0.38 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032 17.06 0.26 0.81 0 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005 -24.89 0.33 1.04 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032 178.29 0.11 0.35 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 5.38 0.20 0.64 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 22.23 0.33 1.03 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005 31.74 0.32 1.00 5 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -9.46 0.12 0.37 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030 32.30 0.25 0.78 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -17.60 0.33 1.04 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -1.43 0.23 0.74 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021 8.88 0.14 0.44 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820 6.96 0.58 1.82 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 -10.81 0.20 0.62 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 -13.77 0.70 2.20 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995 41.41 0.29 0.91 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -3.62 0.18 0.56 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 -10.03 0.23 0.74 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -1.57 0.14 0.45 0 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998 -30.99 0.24 0.75 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 14.73 0.19 0.60 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 12.37 0.31 0.99 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032 -6.07 0.19 0.62 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031 124.70 0.22 0.68 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -3.36 0.18 0.58 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997 29.75 0.16 0.49 0 -FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026 33.92 0.22 0.69 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036 161.14 0.31 0.97 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020 52.81 0.52 1.64 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 16.07 0.31 0.98 0 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 21.57 0.12 0.38 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999 -40.82 0.15 0.47 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026 29.76 0.25 0.79 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032 53.50 0.17 0.55 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995 174.27 0.26 0.81 1 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018 -15.38 0.21 0.66 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820 12.25 0.21 0.66 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005 23.83 0.13 0.40 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 8.75 0.20 0.62 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020 -18.97 0.21 0.67 0 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027 -4.71 0.34 1.07 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -5.41 0.18 0.57 0 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995 10.27 0.30 0.95 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -9.02 0.21 0.66 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 33.90 0.42 1.34 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998 132.63 0.42 1.31 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 57.34 0.84 2.64 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -11.24 0.18 0.56 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 6.86 0.15 0.48 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -21.38 0.15 0.48 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016 6.49 0.14 0.44 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020 -22.52 0.21 0.65 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001 162.63 0.28 0.90 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035 8.27 0.25 0.78 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003 5.50 0.26 0.81 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017 70.75 0.25 0.80 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820 18.25 0.40 1.25 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004 14.43 0.21 0.68 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005 -6.21 0.74 2.34 5 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005 0.39 0.72 2.29 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005 -9.21 0.45 1.42 7 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index a7dc5718..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,79 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 0.08 0.16 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265002 -6.13 0.18 0 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 21.71 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -4.14 0.39 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 -11.41 1.01 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3264996 39.98 0.44 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 -21.56 0.31 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -3.15 0.64 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265023 -7.96 0.23 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265022 -8.15 0.38 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265000 -171.57 0.73 3 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265031 -52.68 0.17 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -17.28 0.25 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265004 49.76 0.25 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265024 -30.15 0.35 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265001 -10.77 0.33 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -11.24 0.33 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264998 -30.07 0.36 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265035 3.84 0.32 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 35.33 0.35 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -10.37 0.55 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265001 30.46 0.40 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -4.74 0.29 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264998 -41.81 0.52 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265033 -178.02 0.12 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265036 -16.58 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 6.93 0.29 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265037 4.75 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 8.67 0.48 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -4.59 0.53 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -2.87 0.30 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 4.09 0.99 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 57.63 1.17 3 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265020 -6.68 0.19 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265000 -132.51 0.83 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -20.89 0.18 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265015 -4.30 0.77 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265026 15.66 0.25 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265016 -12.02 0.32 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 10.34 0.32 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265033 -160.86 0.29 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 -9.86 0.28 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 5.51 0.28 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 18.65 0.62 0 -FEP_CHEMBL3265027_CHEMBL3265035 4.82 0.29 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -8.45 0.28 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3265006 25.61 0.30 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265003 40.40 0.36 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031 125.59 0.11 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 -10.58 0.32 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 12.41 0.11 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265010 -62.11 0.43 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 12.43 0.43 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005 31.82 0.58 6 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265016 17.04 0.22 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 22.85 0.41 1 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265002 33.78 0.59 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265011 -6.95 0.68 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265025 -35.06 0.29 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265030 -55.44 0.66 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265031 -32.32 0.33 0 -FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265021 20.68 0.26 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020 55.69 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265032 21.11 0.32 0 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3259820 -15.68 0.37 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265035 18.99 0.25 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265033 -169.82 0.52 0 -FEP_CHEMBL3265019_CHEMBL3265017 nan nan 10 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265037 107.27 0.85 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265033 -74.06 1.17 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3265010 -24.65 0.27 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 15.20 0.23 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 58.70 0.57 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 1.08 1.14 0 -FEP_CHEMBL3265019_CHEMBL3265017 nan nan 10 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 -10.71 0.37 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265017 18.08 0.30 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 -1.10 0.35 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index 478054f7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3259820 -15.68 0.37 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265035 18.99 0.25 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265033 -169.82 0.52 0 -FEP_CHEMBL3265019_CHEMBL3265017 nan nan 10 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265037 107.27 0.85 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265033 -74.06 1.17 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index be8d6556..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,79 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265023 -7.78 0.13 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3264999 -31.36 0.70 4 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265026 15.58 0.08 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265025 -33.88 0.11 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 -13.64 0.71 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -2.36 0.30 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 -21.41 0.18 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 9.15 0.13 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 33.06 0.53 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -8.89 0.08 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264998 -41.48 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -21.89 0.21 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3265006 24.92 0.65 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 -0.93 0.09 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265000 -131.71 0.40 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3264996 40.67 0.27 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -5.49 0.26 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265016 -12.38 0.22 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265037 5.65 0.20 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265002 37.46 0.62 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265020 -6.44 0.06 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 13.56 0.11 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -4.07 0.12 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265001 30.90 0.23 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -3.42 0.24 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265011 -11.76 0.16 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265022 -8.97 0.05 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 17.20 0.42 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265033 -160.33 0.13 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265031 -53.30 0.13 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -4.14 0.18 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -2.19 0.21 0 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 20.84 0.09 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -11.43 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265036 -17.80 0.16 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264998 -30.33 0.15 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 -10.99 0.26 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -17.48 0.21 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 6.47 0.23 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -8.98 0.18 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 57.67 0.93 2 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005 31.55 1.25 6 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265016 15.15 0.09 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265035 3.76 0.25 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 21.77 0.31 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265003 42.44 0.16 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265010 -58.58 0.49 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031 124.71 0.28 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265015 -6.12 0.87 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 4.82 0.26 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265002 -3.62 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265027_CHEMBL3265035 4.43 0.29 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265001 -10.01 0.27 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265024 -30.13 0.06 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265000 -169.68 0.41 2 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265033 -178.14 0.10 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265004 51.61 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 11.82 0.32 0 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 9.00 0.25 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 -9.68 0.23 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265030 -53.63 0.74 1 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265031 -33.43 0.29 0 -FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265021 20.59 0.07 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020 51.46 0.84 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265032 21.03 0.23 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265033 -77.24 0.26 0 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3259820 -14.61 0.45 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265033 -170.15 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265035 17.90 0.18 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265037 106.05 0.43 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265017 18.79 0.12 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 -0.29 0.37 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 -11.08 0.26 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 56.59 0.14 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 -1.90 0.13 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3265010 -23.55 0.13 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 14.37 0.08 0 -FEP_CHEMBL3265019_CHEMBL3265017 nan nan 10 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index 91d63540..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/syk/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265033 -77.24 0.26 0 -FEP_CHEMBL3265019_CHEMBL3265017 nan nan 10 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3259820 -14.61 0.45 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265033 -170.15 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265035 17.90 0.18 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265037 106.05 0.43 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index ae9f3457..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/benchmark/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,2 +0,0 @@ -FEP_8e_8c protein/ -FEP_8d_8c protein/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 440d95f5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,41 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_5m_5k 9.83 0.19 0.59 0 -FEP_5a_3a 19.84 0.20 0.63 0 -FEP_3b_7 8.16 0.21 0.66 0 -FEP_5h_5f -7.46 0.29 0.92 0 -FEP_5k_5f 5.66 0.08 0.25 0 -FEP_5l_5j -13.82 0.23 0.74 0 -FEP_5f_5g -11.91 0.11 0.35 0 -FEP_5d_5e -4.73 0.25 0.78 0 -FEP_5p_3b -1.16 0.51 1.61 0 -FEP_5o_5m -20.00 0.31 0.98 0 -FEP_5h_5i -23.69 0.22 0.69 0 -FEP_5b_5c 19.28 0.19 0.59 0 -FEP_5l_5b -26.14 0.15 0.48 0 -FEP_5f_5i -16.10 0.12 0.38 0 -FEP_5p_5n -0.85 0.27 0.84 0 -FEP_1b_1a 15.41 0.07 0.24 0 -FEP_8f_8d -21.48 0.10 0.31 0 -FEP_5g_5c -19.25 0.29 0.93 0 -FEP_5o_5n -4.12 0.14 0.44 0 -FEP_5k_5d -14.76 0.17 0.54 0 -FEP_5e_5a 2.35 0.18 0.55 0 -FEP_5b_5a 26.71 0.18 0.57 0 -FEP_3a_1a 2.20 0.26 0.82 0 -FEP_5d_3b 18.95 0.24 0.77 0 -FEP_8e_8a 13.87 0.27 0.87 0 -FEP_5d_7 27.76 0.25 0.78 0 -FEP_5j_5b -11.85 0.24 0.75 0 -FEP_8f_8e 8.87 0.17 0.53 0 -FEP_8b_8a -3.75 0.10 0.32 0 -FEP_5i_5g 3.93 0.14 0.45 0 -FEP_3a_1b -13.66 0.23 0.74 0 -FEP_8f_8b 26.22 0.25 0.78 0 -FEP_8e_8c -19.79 0.37 1.16 2 -FEP_8d_8c 10.31 0.41 1.29 0 -FEP_5n_3b -0.61 0.48 1.53 0 -FEP_5a_1a 21.98 0.24 0.75 0 -FEP_5l_5f 22.83 0.09 0.27 0 -FEP_3b_3a -1.97 0.13 0.41 0 -FEP_5m_5i -1.21 0.22 0.69 0 -FEP_5m_5d -4.84 0.25 0.78 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index dc7fc41a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,43 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_5m_5k 10.16 0.11 0.36 0 -FEP_5a_3a 19.96 0.10 0.31 0 -FEP_3b_7 5.70 0.09 0.27 0 -FEP_5h_5f -6.04 0.17 0.53 0 -FEP_5k_5f 5.45 0.10 0.33 0 -FEP_5l_5j -14.49 0.15 0.47 0 -FEP_5f_5g -11.26 0.17 0.53 0 -FEP_5d_5e -5.97 0.09 0.29 0 -FEP_5p_3b -1.36 0.19 0.61 0 -FEP_5o_5m -19.85 0.25 0.78 0 -FEP_5h_5i -21.82 0.10 0.32 0 -FEP_5b_5c 18.40 0.11 0.34 0 -FEP_8e_8c -20.87 0.17 0.53 0 -FEP_5l_5b -26.86 0.13 0.42 0 -FEP_5f_5i -15.87 0.11 0.36 0 -FEP_5p_5n -0.70 0.14 0.45 0 -FEP_1b_1a 13.11 0.13 0.42 0 -FEP_8f_8d -20.57 0.10 0.32 0 -FEP_5g_5c -18.87 0.15 0.49 0 -FEP_5o_5n -5.24 0.24 0.75 0 -FEP_5k_5d -15.24 0.12 0.38 0 -FEP_5e_5a 4.00 0.14 0.46 0 -FEP_5b_5a 25.73 0.14 0.45 0 -FEP_3a_1a -2.15 0.17 0.54 0 -FEP_5d_3b 19.89 0.11 0.35 0 -FEP_8e_8a 11.60 0.21 0.67 0 -FEP_5d_7 25.67 0.10 0.33 0 -FEP_5j_5b -12.14 0.14 0.44 0 -FEP_8f_8e 9.12 0.14 0.43 0 -FEP_8b_8a -4.66 0.16 0.52 0 -FEP_8d_8c 8.99 0.23 0.73 0 -FEP_5i_5g 4.67 0.12 0.37 0 -FEP_3a_1b -14.95 0.08 0.26 0 -FEP_8f_8b 25.43 0.27 0.85 0 -FEP_8e_8c -20.60 0.13 0.40 0 -FEP_8d_8c 9.18 0.19 0.59 0 -FEP_5n_3b -0.04 0.19 0.60 0 -FEP_5a_1a 17.83 0.11 0.34 0 -FEP_5l_5f 21.96 0.12 0.37 0 -FEP_5m_5d -4.83 0.14 0.43 0 -FEP_3b_3a -2.07 0.10 0.30 0 -FEP_5m_5i -0.13 0.12 0.37 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 031e1e95..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,39 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_5b_5c 19.46 0.12 0 -FEP_8b_8a -3.93 0.10 0 -FEP_5k_5d -14.76 0.18 0 -FEP_3a_1b -13.60 0.25 0 -FEP_8f_8e 8.84 0.10 0 -FEP_8d_8c 10.40 0.31 0 -FEP_5d_3b 19.31 0.14 0 -FEP_5m_5o 18.96 0.29 0 -FEP_5a_1a 21.52 0.20 0 -FEP_1a_1b -15.52 0.16 0 -FEP_5n_5p 1.01 0.12 0 -FEP_5a_3a 19.50 0.19 0 -FEP_5l_5j -13.83 0.21 0 -FEP_5k_5f 4.91 0.18 0 -FEP_8f_8b 26.24 0.33 0 -FEP_5g_5c -17.76 0.15 0 -FEP_5o_5n -4.46 0.22 0 -FEP_3a_1a 2.01 0.22 0 -FEP_5e_5a 1.86 0.19 0 -FEP_5b_5j 12.83 0.14 0 -FEP_5f_5l -22.54 0.08 0 -FEP_8e_8a 13.24 0.38 0 -FEP_5l_5b -25.93 0.17 0 -FEP_5i_5h 23.57 0.11 0 -FEP_5m_5k 9.60 0.16 0 -FEP_8e_8c -20.69 0.33 0 -FEP_5i_5g 3.99 0.14 0 -FEP_8f_8d -21.75 0.09 0 -FEP_5f_5h 7.84 0.14 0 -FEP_3b_7 8.39 0.28 0 -FEP_5d_7 27.22 0.25 0 -FEP_5d_5e -4.49 0.08 0 -FEP_5f_5g -11.77 0.22 0 -FEP_5p_3b -2.40 0.39 0 -FEP_5f_5i -15.93 0.13 0 -FEP dG sem crashes -FEP_5a_5b -26.75 0.15 0 -FEP_3a_3b 2.04 0.13 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/no-vs/2fs/protein_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/no-vs/2fs/protein_missing.txt deleted file mode 100644 index be516ed0..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/no-vs/2fs/protein_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_5a_5b -26.75 0.15 0 -FEP_3a_3b 2.04 0.13 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 231cc905..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,39 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_3a_1a -2.02 0.19 0 -FEP_8e_8a 11.94 0.07 0 -FEP_5m_5o 20.42 0.22 0 -FEP_8f_8d -21.33 0.10 0 -FEP_5f_5h 6.19 0.06 0 -FEP_5d_5e -5.95 0.13 0 -FEP_5a_1a 18.04 0.17 0 -FEP_5m_5k 9.99 0.12 0 -FEP_8e_8c -21.15 0.10 0 -FEP_3a_1b -15.01 0.08 0 -FEP_5n_5p 0.80 0.18 0 -FEP_5l_5b -26.98 0.13 0 -FEP_5i_5h 21.88 0.19 0 -FEP_5d_7 25.27 0.11 0 -FEP_5g_5c -19.26 0.10 0 -FEP_8d_8c 9.13 0.17 0 -FEP_5e_5a 3.33 0.13 0 -FEP_5o_5n -5.08 0.29 0 -FEP_5a_3a 20.21 0.09 0 -FEP_8f_8e 8.79 0.06 0 -FEP_1a_1b -12.84 0.09 0 -FEP_5p_3b -0.65 0.31 0 -FEP_5l_5j -14.68 0.18 0 -FEP_5k_5d -15.50 0.15 0 -FEP_5b_5j 12.20 0.14 0 -FEP_5f_5g -11.11 0.16 0 -FEP_8b_8a -5.01 0.07 0 -FEP_5f_5i -15.33 0.10 0 -FEP_5b_5c 18.37 0.15 0 -FEP_8f_8b 25.67 0.09 0 -FEP_5i_5g 4.72 0.12 0 -FEP_5d_3b 20.31 0.07 0 -FEP_5f_5l -21.69 0.19 0 -FEP_3b_7 5.36 0.10 0 -FEP_5k_5f 5.46 0.13 0 -FEP dG sem crashes -FEP_3a_3b 2.22 0.05 0 -FEP_5a_5b -25.82 0.13 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/no-vs/2fs/water_missing.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/no-vs/2fs/water_missing.txt deleted file mode 100644 index bc9f69c4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF/tnks2/no-vs/2fs/water_missing.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_3a_3b 2.22 0.05 0 -FEP_5a_5b -25.82 0.13 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligand_matrix-checkpoint.ipynb b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligand_matrix-checkpoint.ipynb deleted file mode 100755 index e8c79573..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligand_matrix-checkpoint.ipynb +++ /dev/null @@ -1,53 +0,0 @@ -{ - "cells": [ - { - "cell_type": "code", - "execution_count": null, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "import os\n", - "os.chdir(r'/home/alejand/fep_uppsala/1.JACS/2.CDK2/1.Q/1.ligprep/')" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": null, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [ - "import pandas as pd\n", - "\n", - "ligands = pd.DataFrame()" - ] - }, - { - "cell_type": "code", - "execution_count": null, - "metadata": {}, - "outputs": [], - "source": [] - } - ], - "metadata": { - "kernelspec": { - "display_name": "Python [conda env:rdkit_env]", - "language": "python", - "name": "conda-env-rdkit_env-py" - }, - "language_info": { - "codemirror_mode": { - "name": "ipython", - "version": 3 - }, - "file_extension": ".py", - "mimetype": "text/x-python", - "name": "python", - "nbconvert_exporter": "python", - "pygments_lexer": "ipython3", - "version": "3.7.3" - } - }, - "nbformat": 4, - "nbformat_minor": 2 -} diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligands-checkpoint.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligands-checkpoint.sdf deleted file mode 100755 index d3ce7932..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/.ipynb_checkpoints/ligands-checkpoint.sdf +++ /dev/null @@ -1,3692 +0,0 @@ -43 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3694 12.3608 -12.0100 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5170 11.8053 -10.7333 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7298 10.5799 -13.0278 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9915 11.7687 -13.1228 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8213 10.0100 -11.7550 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2397 10.6196 -10.6003 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6092 9.7471 -9.5124 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2773 8.7308 -9.9855 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4143 8.8607 -11.2979 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3268 9.8907 -8.0257 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3565 13.7183 -11.5055 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5483 13.6363 -12.1897 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9477 14.5322 -12.9368 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9513 10.4999 -7.7281 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8738 11.7695 -7.1531 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6094 12.3134 -6.9136 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4376 11.5622 -7.2444 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5099 10.2841 -7.8101 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7961 9.7769 -8.0457 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0914 13.5427 -6.3707 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7880 13.5314 -6.3772 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3819 12.3721 -6.8788 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9505 12.1058 -6.9728 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7111 12.5665 -10.8449 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2188 12.9372 -10.9792 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1852 14.4611 -10.9536 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5089 14.9092 -11.5986 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7019 12.4742 -12.1199 F 0 0 0 0 0 0 - -1.4726 12.4435 -9.9943 F 0 0 0 0 0 0 - -6.0887 12.2893 -9.8700 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1938 10.1290 -13.8927 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8742 12.2301 -14.0952 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9091 8.1541 -11.8345 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0898 10.5513 -7.6049 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4625 8.9415 -7.5064 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7657 12.3184 -6.9082 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6226 9.7123 -8.0525 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9028 8.7968 -8.4854 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6421 14.3891 -5.9955 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3702 12.9568 -6.6055 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6665 11.9284 -8.0015 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7037 11.2249 -6.3851 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9410 12.5478 -9.7815 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8926 11.6034 -11.3224 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1199 14.8153 -9.9199 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3204 14.8723 -11.4772 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3224 15.2093 -12.6316 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9605 15.7276 -11.0393 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 27 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 25 29 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 -M END -> -43 - -> -0.002 - -$$$$ -17 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 44 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3808 12.3686 -12.0119 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5112 11.8116 -10.7365 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7301 10.5824 -13.0300 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9992 11.7782 -13.1263 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8250 10.0166 -11.7542 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2407 10.6266 -10.6010 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6094 9.7513 -9.5103 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2849 8.7404 -9.9846 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4192 8.8674 -11.2983 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3225 9.8872 -8.0242 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3834 13.6199 -11.4933 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4237 14.7282 -11.5789 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5369 13.6139 -12.1980 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8771 14.5161 -12.9653 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9516 10.5005 -7.7272 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8803 11.7722 -7.1539 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6129 12.3159 -6.9118 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4418 11.5625 -7.2429 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5059 10.2842 -7.8062 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7935 9.7780 -8.0417 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0936 13.5458 -6.3664 N 0 0 0 0 0 0 - -2.7885 13.5288 -6.3742 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3831 12.3683 -6.8823 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0562 12.2861 -9.8790 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1818 10.1228 -13.8979 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8754 12.2375 -14.0963 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9135 8.1599 -11.8328 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0847 10.5486 -7.6052 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4513 8.9399 -7.4976 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1150 12.8057 -10.9566 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8208 14.7394 -10.6724 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8878 15.7111 -11.6718 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7196 14.6037 -12.4046 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7772 12.3192 -6.9132 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6153 9.7128 -8.0447 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8994 8.7979 -8.4799 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3694 12.0252 -7.0275 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0479 14.6272 -5.8866 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4767 15.4758 -5.5103 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6764 14.9519 -6.7159 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6761 14.2304 -5.0891 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 27 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 28 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 38 40 1 0 0 0 - 38 41 1 0 0 0 -M END -> -17 - -> -0.28 - -$$$$ -28 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 55 0 0 1 0 999 V2000 - -6.4084 12.3297 -11.9887 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5165 11.7544 -10.7314 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7418 10.5517 -13.0215 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0245 11.7463 -13.1093 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8268 9.9859 -11.7428 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2396 10.5800 -10.6042 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6095 9.7151 -9.5092 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2849 8.7010 -9.9773 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4373 8.8403 -11.2922 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3311 9.8727 -8.0225 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6734 13.4955 -12.1182 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9616 10.4819 -7.7358 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8034 9.7678 -8.0459 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5615 10.3255 -7.7934 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4526 11.6006 -7.2315 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6161 12.3136 -6.9153 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8662 11.7565 -7.1617 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1079 12.1894 -6.9634 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7834 13.4363 -6.4469 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4443 13.4911 -6.3955 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1636 12.4174 -6.8067 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8107 11.6018 -7.1804 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3735 14.6113 -5.9298 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8857 14.5071 -13.1620 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6042 14.8313 -13.9092 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6374 15.2080 -12.9343 O 0 0 0 0 0 0 - -3.2854 14.1223 -12.1198 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5109 13.8217 -11.2574 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0682 12.2161 -9.8713 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2010 10.1101 -13.8868 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9267 12.2174 -14.0767 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9595 8.1575 -11.8226 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0925 10.5250 -7.5864 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4209 8.9193 -7.5085 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8800 8.7854 -8.4838 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6672 9.7633 -8.0389 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5421 13.2992 -6.4778 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7571 12.3125 -6.9195 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3892 14.2694 -6.1271 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6149 10.6243 -7.5849 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0200 14.9384 -6.7449 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9846 14.2825 -5.0890 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2640 15.4377 -5.6195 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2295 15.4249 -12.6765 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6795 14.2190 -13.8644 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6857 15.5804 -14.6607 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3009 13.9383 -14.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3629 14.3192 -11.5703 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0794 13.2286 -12.7328 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6912 14.6543 -10.5882 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2185 12.9480 -10.6599 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 25 47 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 28 51 1 0 0 0 -M END -> -28 - -> -30 - -$$$$ -22 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3943 12.3306 -11.9839 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5449 11.7624 -10.7224 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7389 10.5318 -13.0493 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9892 11.7416 -13.1218 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8445 9.9757 -11.7834 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2758 10.5697 -10.6136 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6401 9.7111 -9.5254 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3075 8.6850 -10.0132 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4539 8.8245 -11.3160 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3472 9.8680 -8.0446 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5569 13.6094 -12.1739 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9691 10.4796 -7.7443 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8622 11.7497 -7.1624 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6000 12.2988 -6.9070 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4496 11.5829 -7.2293 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5554 10.3089 -7.8035 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8209 9.7667 -8.0554 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0956 12.1660 -6.9654 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7384 13.4130 -6.4683 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4069 13.4502 -6.4129 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1813 12.3566 -6.8171 N 0 0 0 0 0 0 - -0.7988 11.5478 -7.1867 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4282 14.5550 -5.9664 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7714 14.2106 -11.2027 N 0 0 0 0 0 0 - -4.2061 15.2849 -11.7862 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6883 15.3268 -13.0997 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5027 14.2765 -13.3098 N 0 0 0 0 0 0 - -4.5364 13.8232 -9.7989 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1220 12.1694 -9.8642 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1658 10.0922 -13.9365 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8689 12.2077 -14.0813 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9525 8.1221 -11.8662 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4314 8.9174 -7.5157 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0944 10.5330 -7.6015 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7507 12.3127 -6.9154 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5195 13.2804 -6.4580 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6726 9.7529 -8.0470 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8924 8.7835 -8.5028 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3320 14.2647 -6.1602 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6146 10.5716 -7.5810 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0432 14.2275 -5.1327 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1881 15.4011 -5.6571 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0785 14.8647 -6.7815 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5385 15.9338 -11.2484 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4386 16.0565 -13.8570 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0519 14.6585 -9.2909 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8437 12.9692 -9.7547 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4214 13.7994 -9.1880 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 27 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 28 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 -M END -> -22 - -> -0.032 - -$$$$ -16 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3886 12.3706 -12.0044 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5217 11.8105 -10.7338 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7267 10.5778 -13.0331 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9997 11.7772 -13.1264 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8245 10.0105 -11.7588 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2447 10.6240 -10.5997 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6157 9.7479 -9.5130 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2818 8.7335 -9.9900 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4155 8.8614 -11.3010 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3377 9.8874 -8.0251 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4115 13.6449 -11.4457 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4644 14.7678 -11.5034 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5490 13.6243 -12.1808 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8784 14.5204 -12.9613 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9596 10.4818 -7.7362 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8460 11.7538 -7.1602 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5819 12.3007 -6.9160 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4335 11.5746 -7.2403 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5461 10.3067 -7.8068 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8068 9.7600 -8.0558 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4568 13.6807 -6.3006 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0743 12.2887 -9.8728 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1728 10.1132 -13.9065 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8713 12.2373 -14.0952 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9100 8.1539 -11.8356 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0973 10.5468 -7.6004 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4473 8.9276 -7.5184 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1460 12.8361 -10.8988 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4475 14.4022 -11.3420 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6702 15.4633 -10.6915 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4486 15.3231 -12.4449 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7333 12.3169 -6.9116 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4555 11.9950 -7.0528 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6550 9.7463 -8.0534 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8912 8.7783 -8.5004 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4890 14.4469 -7.0749 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5248 13.7811 -5.7425 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2684 13.8625 -5.5988 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 4 24 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 33 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 34 1 0 0 0 - 20 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 -M END -> -16 - -> -0.17 - -$$$$ -30 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3720 12.3564 -12.0094 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5328 11.8103 -10.7336 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7318 10.5755 -13.0290 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9898 11.7633 -13.1279 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8210 10.0065 -11.7558 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2477 10.6184 -10.6026 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6140 9.7458 -9.5136 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2690 8.7218 -9.9879 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4092 8.8538 -11.2990 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3381 9.8926 -8.0280 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3458 13.7121 -11.5140 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5478 13.6364 -12.1864 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9572 14.5395 -12.9136 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9581 10.4851 -7.7363 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8068 9.7633 -8.0566 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5506 10.3101 -7.8085 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4405 11.5856 -7.2383 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5911 12.3019 -6.9155 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8461 11.7538 -7.1583 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0993 12.1777 -6.9729 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7708 13.4214 -6.4416 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4313 13.4856 -6.3949 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1723 12.4145 -6.8299 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8042 11.6008 -7.2039 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3889 14.5981 -5.9187 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6987 12.5799 -10.8351 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1930 12.9387 -10.9658 C 0 0 2 0 0 0 - -2.1862 14.4653 -10.9438 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5086 14.9068 -11.5988 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6500 12.4417 -12.1854 O 0 0 0 0 0 0 - -6.1228 12.3020 -9.8704 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1946 10.1248 -13.8941 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8719 12.2188 -14.1038 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9012 8.1471 -11.8351 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1102 10.5319 -7.5935 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4404 8.9270 -7.5371 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8882 8.7805 -8.5006 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6630 9.7449 -8.0588 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5090 13.2838 -6.4768 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7306 12.3145 -6.9043 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3781 14.2464 -6.1018 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6071 10.6213 -7.6157 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2361 15.4217 -5.5765 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0353 14.9583 -6.7244 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0204 14.2664 -5.0904 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9494 12.5468 -9.7772 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8987 11.6278 -11.3169 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6028 12.5034 -10.1600 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1219 14.8241 -9.9090 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3279 14.8751 -11.4738 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3274 15.2143 -12.6293 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 15.7190 -11.0435 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7819 12.8449 -12.3329 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -30 - -> -0.003 - -$$$$ -21 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3865 12.3338 -12.0432 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4856 11.7841 -10.7704 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7472 10.5643 -13.0426 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0167 11.7500 -13.1460 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8303 10.0081 -11.7598 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2256 10.6149 -10.6156 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6010 9.7518 -9.5145 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2842 8.7423 -9.9828 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4323 8.8733 -11.2925 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3270 9.8938 -8.0225 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5587 13.5285 -12.2266 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9618 10.4909 -7.7327 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8582 11.7635 -7.1652 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6045 12.3140 -6.9191 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4477 11.5945 -7.2362 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5614 10.3184 -7.7958 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8112 9.7685 -8.0438 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1002 12.1716 -6.9783 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7494 13.4275 -6.4902 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4141 13.4605 -6.4332 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1744 12.3664 -6.8143 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8092 11.5630 -7.1796 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4176 14.5730 -6.0003 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4279 13.9049 -11.5130 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0090 15.0294 -12.0677 N 0 0 0 0 0 0 - -4.8449 15.3445 -13.0534 C 0 0 0 0 0 0 - -5.7816 14.4464 -13.2081 N 0 0 0 0 0 0 - -2.9003 15.7800 -11.6435 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0033 12.2571 -9.9302 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2085 10.1086 -13.9036 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9107 12.2133 -14.1195 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9502 8.1807 -11.8157 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4150 8.9297 -7.5146 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0903 10.5352 -7.5767 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7489 12.3218 -6.9239 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5244 13.2981 -6.4811 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6700 9.7533 -8.0396 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8938 8.7844 -8.4823 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3367 14.2768 -6.1925 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6184 10.5668 -7.5609 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0791 14.8637 -6.8199 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0264 14.2592 -5.1502 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1971 15.4244 -5.7161 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8953 13.4661 -10.6706 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6948 16.2656 -13.6196 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2685 16.3921 -10.8459 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6068 16.4484 -12.4038 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0360 15.1571 -11.3689 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 24 2 0 0 0 - 11 27 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 -M END -> -21 - -> -0.078 - -$$$$ -24 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3515 12.3530 -11.9813 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5085 11.7912 -10.7247 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6802 10.5716 -13.0438 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9296 11.7657 -13.1245 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7980 10.0044 -11.7669 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2328 10.6109 -10.5989 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6209 9.7375 -9.5162 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2754 8.7446 -9.9970 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4233 8.8800 -11.3218 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3328 9.8812 -8.0296 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3004 14.2773 -13.1499 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4346 15.5261 -12.8998 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5896 13.5586 -12.0343 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9706 10.4906 -7.7317 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8616 11.7632 -7.1684 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6051 12.3126 -6.9180 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4544 11.5948 -7.2294 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5626 10.3128 -7.8011 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8160 9.7710 -8.0425 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1083 12.1736 -6.9694 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7503 13.4247 -6.4858 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4131 13.4674 -6.4189 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1758 12.3735 -6.8057 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8094 11.5620 -7.1791 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4060 14.5705 -5.9896 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6528 14.0066 -14.2746 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0624 12.2581 -9.8612 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1172 10.1173 -13.9162 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8256 12.2012 -14.0958 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9432 8.1901 -11.8473 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0986 10.5389 -7.5828 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4252 8.9299 -7.5158 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1820 15.6085 -11.8419 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9911 16.4102 -13.1903 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4935 15.4841 -13.4268 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2195 13.8866 -11.1438 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7535 12.3213 -6.9230 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5307 13.2966 -6.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6732 9.7534 -8.0369 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8952 8.7834 -8.4850 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3455 14.2746 -6.1808 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6187 10.5735 -7.5589 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2064 15.4259 -5.7003 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0748 14.8695 -6.8055 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0202 14.2589 -5.1325 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 -M END -> -24 - -> -0.029 - -$$$$ -38 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 56 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3676 12.3632 -12.0183 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5148 11.8066 -10.7373 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7147 10.5754 -13.0306 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9819 11.7689 -13.1253 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8143 10.0109 -11.7564 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2414 10.6177 -10.6023 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6126 9.7466 -9.5122 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2846 8.7319 -9.9810 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4146 8.8618 -11.2972 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3363 9.8918 -8.0268 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3648 13.7196 -11.5032 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5453 13.6325 -12.1937 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9402 14.5231 -12.9481 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9634 10.4852 -7.7356 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8111 9.7655 -8.0524 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5521 10.3143 -7.8018 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4442 11.5871 -7.2318 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5964 12.3037 -6.9134 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8531 11.7536 -7.1622 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1000 12.1772 -6.9659 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7711 13.4213 -6.4318 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4319 13.4866 -6.3915 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1707 12.4146 -6.8487 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8042 11.5996 -7.2054 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3852 14.5927 -5.9060 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7189 12.5724 -10.8441 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2354 12.9457 -10.9732 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1905 14.4637 -10.9533 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5123 14.9092 -11.5998 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7098 12.4700 -12.1164 F 0 0 0 0 0 0 - -1.5166 12.4356 -9.9564 F 0 0 0 0 0 0 - -6.0854 12.2873 -9.8679 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1679 10.1186 -13.8995 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8666 12.2247 -14.0971 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9103 8.1575 -11.8383 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0986 10.5466 -7.5979 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4470 8.9289 -7.5188 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8883 8.7824 -8.4957 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6652 9.7513 -8.0474 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5192 13.2882 -6.4744 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7396 12.3174 -6.9137 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3784 14.2455 -6.0873 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6046 10.6289 -7.6232 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2453 15.4154 -5.5642 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0272 14.9481 -6.7089 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0083 14.2549 -5.0808 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9411 12.5479 -9.7813 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8894 11.5999 -11.3211 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1219 14.8121 -9.9254 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3187 14.8698 -11.4768 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3209 15.2060 -12.6318 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9535 15.7329 -11.0386 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 10 37 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 27 31 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 -M END -> -38 - -> -0.005 - -$$$$ -31 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3709 12.3579 -12.0062 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5187 11.8083 -10.7296 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7194 10.5704 -13.0321 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9838 11.7645 -13.1240 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8186 10.0073 -11.7576 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2434 10.6206 -10.5991 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6160 9.7494 -9.5117 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2808 8.7336 -9.9894 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4141 8.8594 -11.3008 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3385 9.8886 -8.0248 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3631 13.7190 -11.4993 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5500 13.6364 -12.1907 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9462 14.5251 -12.9474 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9607 10.4852 -7.7356 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8097 9.7639 -8.0527 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5522 10.3124 -7.8024 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4444 11.5885 -7.2376 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5952 12.3052 -6.9174 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8509 11.7557 -7.1626 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1000 12.1783 -6.9759 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7654 13.4353 -6.4786 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4305 13.4892 -6.4172 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1699 12.4025 -6.8093 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8029 11.5856 -7.1770 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3883 14.6074 -5.9669 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5134 14.9066 -11.6049 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2037 14.4678 -10.9376 C 0 0 1 0 0 0 - -2.2231 12.9442 -10.9826 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7200 12.5740 -10.8214 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0475 15.0410 -11.4860 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0905 12.2941 -9.8658 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1712 10.1113 -13.9056 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8587 12.2252 -14.0930 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9068 8.1511 -11.8353 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1007 10.5426 -7.5968 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4435 8.9253 -7.5227 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8934 8.7808 -8.4968 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6611 9.7503 -8.0475 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5122 13.2860 -6.4777 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7378 12.3164 -6.9148 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3612 14.2786 -6.1713 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6010 10.5907 -7.5580 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2314 15.4494 -5.6631 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0518 14.9316 -6.7715 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0048 14.2986 -5.1213 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3147 15.1479 -12.6510 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9414 15.7669 -11.0946 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2172 14.7609 -9.8839 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8304 12.6225 -11.9538 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5481 12.4842 -10.2524 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9432 12.6118 -9.7567 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9036 11.5934 -11.2745 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2694 15.5207 -12.3068 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -31 - -> -0.002 - -$$$$ -41 - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 59 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3365 12.3514 -12.0169 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4737 11.7818 -10.7533 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7043 10.5771 -13.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9700 11.7706 -13.1413 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8117 10.0060 -11.7679 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2142 10.6153 -10.6085 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6079 9.7475 -9.5180 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2848 8.7450 -9.9896 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4180 8.8715 -11.3012 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3345 9.8877 -8.0248 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3847 13.7235 -11.4418 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5533 13.6485 -12.1711 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9795 14.5724 -12.8566 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9627 10.4850 -7.7364 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8552 11.7581 -7.1652 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5966 12.3060 -6.9181 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4424 11.5865 -7.2381 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5593 10.3139 -7.8013 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8122 9.7647 -8.0513 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0942 12.1662 -6.9781 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7414 13.4274 -6.4937 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4089 13.4560 -6.4321 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1814 12.3590 -6.8068 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8029 11.5527 -7.1728 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4236 14.5699 -5.9945 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7594 15.0422 -11.2114 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3424 15.0924 -11.7154 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5130 13.9202 -11.2644 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1771 12.5990 -11.6641 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6239 12.4833 -11.0641 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0203 12.2640 -9.8874 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1715 10.1187 -13.9133 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8628 12.2427 -14.1041 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9193 8.1643 -11.8362 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0961 10.5380 -7.5913 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4318 8.9209 -7.5184 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7443 12.3180 -6.9210 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5105 13.2878 -6.4761 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6670 9.7505 -8.0456 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8966 8.7819 -8.4933 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3275 14.2803 -6.2000 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6107 10.5549 -7.5458 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1867 15.4238 -5.7057 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0912 14.8675 -6.8032 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0319 14.2596 -5.1462 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6902 15.1046 -10.1315 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3521 15.8883 -11.5628 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4316 15.1240 -12.7851 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8360 16.0057 -11.4240 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2586 13.9646 -10.2112 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5771 14.0998 -11.7264 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1550 12.4998 -12.7567 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5317 11.7847 -11.3278 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5224 12.4160 -9.9808 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0278 11.5608 -11.5111 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 28 51 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 29 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 - 30 55 1 0 0 0 -M END -> -41 - -> -0.006 - -$$$$ -29 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3727 12.3493 -11.9877 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5190 11.8167 -10.7261 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6919 10.5755 -13.0077 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9476 11.7646 -13.1157 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8131 10.0080 -11.7494 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2399 10.6155 -10.5946 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6088 9.7430 -9.5107 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2764 8.7286 -9.9647 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4188 8.8758 -11.2882 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3326 9.8988 -8.0180 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4060 13.8057 -12.2007 S 0 0 0 0 0 0 - -5.9763 10.4855 -7.7248 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8692 11.7523 -7.1523 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6115 12.3005 -6.8946 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4415 11.5837 -7.2014 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5677 10.3182 -7.7642 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8209 9.7630 -8.0308 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1027 12.1584 -6.9334 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7604 13.4248 -6.4226 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4260 13.4533 -6.3925 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1594 12.3444 -6.7934 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8210 11.5507 -7.1379 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4194 14.5816 -5.9703 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4605 13.4170 -13.2280 O 0 0 0 0 0 0 - -6.3362 14.9020 -12.4291 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5495 14.1196 -10.6911 N 0 0 0 0 0 0 - -3.3000 13.4420 -10.3686 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0717 13.9935 -11.0748 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2627 14.2439 -9.6094 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0958 12.2837 -9.8431 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1384 10.1166 -13.9015 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8216 12.2011 -14.0642 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9542 8.2051 -11.8388 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1029 10.5216 -7.5592 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4192 8.9159 -7.5103 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7593 12.3241 -6.9156 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5452 13.3016 -6.4614 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6739 9.7489 -8.0044 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8885 8.7827 -8.4653 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3647 14.2437 -6.1001 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6238 10.5910 -7.5497 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0441 14.8389 -6.8193 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0232 14.2959 -5.1361 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2125 15.4354 -5.7291 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8494 14.9008 -10.1205 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3804 12.3527 -10.1831 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2874 13.2998 -11.3738 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1931 14.8215 -11.7603 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5807 15.2116 -9.2431 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5514 13.7432 -8.9374 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 24 2 0 0 0 - 11 25 2 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 -M END -> -29 - -> -0.18 - -$$$$ -26 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3961 12.3155 -12.0234 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5478 11.7864 -10.7392 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7431 10.5278 -13.0269 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0034 11.6993 -13.1368 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8411 9.9886 -11.7443 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2672 10.6062 -10.5986 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6276 9.7408 -9.5022 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2893 8.7195 -9.9713 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4361 8.8492 -11.2847 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3404 9.8857 -8.0208 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4704 14.2158 -13.3316 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5218 15.3458 -13.0035 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5814 13.4696 -12.1774 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9630 10.4847 -7.7359 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8538 11.7563 -7.1621 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5953 12.3060 -6.9160 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4449 11.5852 -7.2379 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5560 10.3115 -7.8043 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8130 9.7655 -8.0531 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0905 12.1634 -6.9778 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7398 13.4211 -6.5005 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4007 13.4556 -6.4362 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1858 12.3500 -6.8082 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8018 11.5473 -7.1675 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4333 14.5672 -6.0053 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0131 14.0330 -14.4162 O 0 0 0 0 0 0 - -4.6790 13.9767 -11.1295 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0830 15.2556 -11.5883 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0962 12.2658 -9.8826 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1870 10.0577 -13.8855 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8795 12.1118 -14.1147 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9222 8.1396 -11.8208 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0988 10.5399 -7.5898 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4364 8.9228 -7.5168 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9540 16.3099 -13.2674 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6823 15.2203 -13.6539 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7414 12.3166 -6.9126 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5135 13.2868 -6.4745 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6700 9.7492 -8.0515 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8944 8.7825 -8.4962 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3279 14.2814 -6.2111 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6186 10.5482 -7.5365 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0982 14.8611 -6.8185 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0414 14.2576 -5.1551 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1781 15.4224 -5.7186 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1658 14.0954 -10.1642 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8858 13.2419 -10.9644 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9931 15.3118 -11.4698 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5445 16.0482 -11.0233 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 12 28 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -26 - -> -0.036 - -$$$$ -20 - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 58 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3740 12.3524 -12.0161 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5100 11.8065 -10.7374 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7222 10.5841 -13.0265 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9887 11.7756 -13.1353 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8163 10.0177 -11.7563 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2425 10.6185 -10.6022 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6172 9.7487 -9.5090 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2846 8.7289 -9.9848 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4176 8.8659 -11.2967 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3368 9.8884 -8.0257 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4023 13.6480 -11.4578 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4623 14.7747 -11.4948 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5331 13.6158 -12.1961 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8776 14.5022 -12.9731 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9585 10.4860 -7.7354 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8494 11.7555 -7.1596 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5968 12.3068 -6.9148 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4468 11.5860 -7.2370 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5513 10.3089 -7.8057 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8090 9.7654 -8.0523 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0901 12.1669 -6.9801 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7479 13.4121 -6.4872 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3990 13.4663 -6.4328 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1869 12.3691 -6.8386 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8034 11.5628 -7.1902 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4389 14.5894 -5.9640 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5042 14.2139 -4.8744 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6302 13.6295 -5.4977 O 0 0 0 0 0 0 - 0.9501 13.1612 -3.9053 C 0 0 0 0 0 0 - 2.0179 15.4484 -4.1037 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0870 12.2815 -9.8767 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1782 10.1403 -13.8916 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8882 12.2326 -14.1065 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9139 8.1642 -11.8383 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4382 8.9312 -7.5247 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1000 10.5369 -7.5915 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1602 12.8736 -10.8739 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4435 14.3983 -11.3392 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6800 15.4678 -10.6811 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4649 15.3194 -12.4306 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7363 12.3155 -6.9060 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5225 13.2880 -6.4780 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6716 9.7462 -8.0565 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8874 8.7809 -8.4938 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3463 14.2645 -6.1724 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6294 10.5673 -7.5714 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2274 15.3656 -5.5864 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9266 15.0143 -6.8422 H 0 0 0 0 0 0 - 3.2101 13.2860 -4.8126 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6553 12.2750 -4.4689 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0795 13.5454 -3.3665 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6833 12.8594 -3.1584 H 0 0 0 0 0 0 - 2.5210 16.1617 -4.7561 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7337 15.1648 -3.3313 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2023 15.9748 -3.6071 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 12 39 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 41 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 43 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 25 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 45 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 - 30 55 1 0 0 0 -M END -> -20 - -> -0.016 - -$$$$ -42 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3691 12.3596 -12.0090 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5082 11.8040 -10.7325 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7289 10.5800 -13.0272 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9931 11.7723 -13.1223 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8208 10.0120 -11.7545 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2366 10.6190 -10.6002 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6071 9.7463 -9.5106 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2820 8.7349 -9.9857 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4162 8.8630 -11.2985 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3216 9.8824 -8.0245 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3612 13.7214 -11.5083 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5493 13.6373 -12.1980 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9470 14.5254 -12.9531 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9509 10.4995 -7.7283 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8798 11.7709 -7.1545 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6121 12.3149 -6.9130 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4406 11.5618 -7.2441 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5052 10.2836 -7.8087 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7939 9.7786 -8.0440 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0930 13.5444 -6.3685 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7888 13.5284 -6.3764 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3823 12.3688 -6.8823 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9528 12.1034 -6.9863 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7146 12.5761 -10.8355 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2074 12.9376 -10.9559 C 0 0 2 0 0 0 - -2.1889 14.4652 -10.9572 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5166 14.9141 -11.6000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6730 12.4527 -12.1791 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0709 12.2831 -9.8701 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1905 10.1280 -13.8946 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8760 12.2352 -14.0903 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9104 8.1559 -11.8349 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0978 10.5174 -7.5878 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4227 8.9225 -7.5162 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7759 12.3187 -6.9121 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6149 9.7115 -8.0486 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9008 8.7994 -8.4826 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6404 14.3931 -5.9911 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3733 12.9511 -6.6100 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6843 11.9368 -8.0290 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7041 11.2248 -6.3903 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9481 12.5593 -9.7730 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8897 11.6058 -11.3143 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6065 12.4889 -10.1604 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1357 14.8163 -9.9239 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3181 14.8871 -11.4678 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3218 15.2079 -12.6331 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9608 15.7340 -11.0358 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8094 12.8612 -12.3391 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 27 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -42 - -> -0.004 - -$$$$ -35 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3895 12.3678 -12.0373 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4824 11.8098 -10.7511 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7271 10.5745 -13.0290 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0179 11.7711 -13.1287 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8170 10.0145 -11.7522 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2238 10.6236 -10.6024 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6044 9.7508 -9.5065 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2828 8.7443 -9.9813 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4172 8.8704 -11.2949 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3303 9.8854 -8.0203 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3418 13.6528 -11.7950 N 0 0 0 0 0 0 - -5.6106 13.6402 -12.2589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1045 14.5768 -12.8828 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9605 10.4846 -7.7337 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8084 9.7674 -8.0514 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5547 10.3189 -7.8020 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4471 11.5931 -7.2348 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6026 12.3073 -6.9145 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8562 11.7556 -7.1614 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1021 12.1835 -6.9708 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7710 13.4390 -6.4702 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4354 13.4950 -6.4103 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1709 12.4112 -6.8070 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5943 -7.1763 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3771 14.6141 -5.9576 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4422 12.5360 -11.3947 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3230 13.6139 -11.4067 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2958 14.6820 -11.9593 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7380 13.9356 -10.1565 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0183 12.2923 -9.8986 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1782 10.1163 -13.8942 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9208 12.2371 -14.0985 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9179 8.1685 -11.8303 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0933 10.5376 -7.5920 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4329 8.9217 -7.5144 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8892 8.7843 -8.4947 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6640 9.7586 -8.0484 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5243 13.2889 -6.4732 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7461 12.3134 -6.9147 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3729 14.2791 -6.1621 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6003 10.6048 -7.5653 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2500 15.4509 -5.6516 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0339 14.9382 -6.7662 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9933 14.2991 -5.1147 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5851 12.0468 -10.4273 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4005 11.8265 -12.2289 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4937 13.3796 -12.0785 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2410 14.9062 -13.0151 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3493 15.5966 -11.3682 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0327 13.3119 -9.9644 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 -M END -> -35 - -> -0.004 - -$$$$ -44 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 50 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3932 12.3500 -12.0125 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5644 11.7828 -10.7394 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7358 10.5711 -13.0331 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9954 11.7572 -13.1322 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8242 9.9989 -11.7591 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2585 10.6059 -10.6150 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6168 9.7386 -9.5213 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2709 8.7166 -9.9884 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4108 8.8490 -11.3012 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3306 9.8912 -8.0312 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5413 13.8555 -11.3648 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5934 13.6525 -12.1835 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9232 14.4812 -13.0224 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9508 10.4991 -7.7310 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8673 11.7672 -7.1520 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6035 12.3102 -6.9134 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4392 11.5630 -7.2455 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5146 10.2834 -7.8141 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7998 9.7761 -8.0492 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0885 13.5395 -6.3720 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7847 13.5343 -6.3770 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3791 12.3751 -6.8806 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9494 12.1118 -6.9818 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7091 15.0460 -11.2252 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1570 14.3608 -9.9755 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1684 13.2423 -10.1016 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8246 13.9322 -10.0585 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2039 12.2411 -9.8798 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2037 10.1279 -13.8914 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8803 12.2184 -14.1069 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9014 8.1446 -11.8359 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1132 10.5144 -7.5862 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4298 8.9292 -7.5318 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7510 12.3165 -6.9042 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6383 9.7136 -8.0589 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9045 8.7930 -8.4905 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6440 14.3809 -6.0010 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3673 12.9607 -6.6056 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6856 11.9435 -8.0238 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7046 11.2327 -6.3874 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9665 15.3166 -11.9738 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4384 15.8239 -11.0314 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2969 14.9531 -9.0651 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0216 13.4609 -9.4801 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7904 12.2246 -10.0500 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7501 13.4251 -10.8742 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 -M END -> -44 - -> -0.004 - -$$$$ -18 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 44 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3808 12.3686 -12.0119 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5112 11.8116 -10.7365 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7301 10.5824 -13.0300 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9992 11.7782 -13.1263 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8250 10.0166 -11.7542 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2407 10.6266 -10.6010 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6094 9.7513 -9.5103 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2849 8.7404 -9.9846 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4192 8.8674 -11.2983 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3225 9.8872 -8.0242 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3834 13.6199 -11.4933 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4237 14.7282 -11.5789 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5369 13.6139 -12.1980 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8771 14.5161 -12.9653 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9516 10.5005 -7.7272 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8803 11.7722 -7.1539 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6129 12.3159 -6.9118 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4418 11.5625 -7.2429 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5059 10.2842 -7.8062 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7935 9.7780 -8.0417 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0936 13.5458 -6.3664 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7885 13.5288 -6.3742 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3831 12.3683 -6.8823 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9539 12.1016 -6.9897 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0562 12.2861 -9.8790 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1818 10.1228 -13.8979 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8754 12.2375 -14.0963 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9135 8.1599 -11.8328 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0847 10.5486 -7.6052 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4513 8.9399 -7.4976 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1150 12.8057 -10.9566 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8208 14.7394 -10.6724 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8878 15.7111 -11.6718 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7196 14.6037 -12.4046 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7772 12.3192 -6.9132 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6153 9.7128 -8.0447 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8994 8.7979 -8.4799 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6399 14.3943 -5.9889 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3748 12.9484 -6.6129 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6859 11.9386 -8.0328 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7035 11.2217 -6.3964 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 -M END -> -18 - -> -0.01 - -$$$$ -40 - 3D - Structure written by MMmdl. - 54 58 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3583 12.3628 -12.0152 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5007 11.8020 -10.7383 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7096 10.5772 -13.0382 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9777 11.7759 -13.1307 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8132 10.0130 -11.7619 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2338 10.6200 -10.6051 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6121 9.7513 -9.5135 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2831 8.7414 -9.9888 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4159 8.8683 -11.3018 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3364 9.8882 -8.0249 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3745 13.7307 -11.4480 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5401 13.6479 -12.1823 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9305 14.5456 -12.9289 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9622 10.4857 -7.7364 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8106 9.7658 -8.0516 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5548 10.3163 -7.8015 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4456 11.5910 -7.2371 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5995 12.3069 -6.9174 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8550 11.7570 -7.1647 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1008 12.1810 -6.9758 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7660 13.4388 -6.4773 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4314 13.4905 -6.4174 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1713 12.4042 -6.8124 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5879 -7.1791 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3850 14.6084 -5.9658 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6973 12.5089 -10.9175 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2248 12.4637 -11.4426 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4987 13.7622 -11.0653 N 0 0 0 0 0 0 - -2.2038 14.9363 -11.7527 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6757 15.0331 -11.3164 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0576 12.2794 -9.8741 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1618 10.1180 -13.9096 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8627 12.2402 -14.0994 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9144 8.1615 -11.8374 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0961 10.5439 -7.5948 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4395 8.9258 -7.5160 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8927 8.7818 -8.4930 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6634 9.7542 -8.0449 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5193 13.2884 -6.4757 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7435 12.3170 -6.9183 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3645 14.2802 -6.1683 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6001 10.5957 -7.5620 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2377 15.4493 -5.6626 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0462 14.9289 -6.7713 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9992 14.2960 -5.1216 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1358 11.5686 -11.2816 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6934 12.5388 -9.8270 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1213 12.3537 -12.5312 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6337 11.6737 -10.9669 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5199 13.7316 -11.3435 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1273 14.7832 -12.8186 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6221 15.8316 -11.5127 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1533 15.8523 -11.8646 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6812 15.2813 -10.2566 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 -M END -> -40 - -> -0.007 - -$$$$ -19 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3863 12.3686 -12.0106 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5303 11.8179 -10.7351 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7274 10.5747 -13.0322 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9939 11.7717 -13.1290 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8233 10.0108 -11.7572 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2504 10.6246 -10.6026 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6148 9.7488 -9.5126 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2772 8.7301 -9.9866 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4133 8.8585 -11.2996 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3367 9.8906 -8.0265 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3739 13.6178 -11.5022 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4056 14.7196 -11.5963 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5407 13.6198 -12.1903 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8948 14.5296 -12.9394 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9610 10.4852 -7.7361 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8098 9.7648 -8.0558 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5520 10.3132 -7.8064 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4430 11.5871 -7.2363 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5944 12.3027 -6.9144 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8504 11.7539 -7.1603 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0991 12.1752 -6.9687 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7663 13.4191 -6.4362 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4291 13.4776 -6.3870 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1723 12.4029 -6.8190 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8029 11.5945 -7.2007 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3904 14.5868 -5.9117 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0929 12.2989 -9.8733 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1755 10.1118 -13.9031 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8667 12.2221 -14.1016 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9059 8.1512 -11.8355 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1020 10.5408 -7.5966 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4436 8.9262 -7.5252 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1038 12.8034 -10.9679 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8050 14.7371 -10.6877 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8600 15.7058 -11.7050 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7006 14.5748 -12.4189 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8910 8.7823 -8.5005 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6630 9.7506 -8.0539 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5131 13.2839 -6.4722 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7367 12.3149 -6.9092 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3680 14.2475 -6.0985 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6030 10.6174 -7.6170 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2329 15.4126 -5.5710 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0372 14.9418 -6.7159 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0194 14.2522 -5.0866 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 25 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 26 43 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 -M END -> -19 - -> -0.015 - -$$$$ -33 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3918 12.3765 -12.0158 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5335 11.8201 -10.7317 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7273 10.5795 -13.0319 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0082 11.7773 -13.1176 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8294 10.0116 -11.7546 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2533 10.6299 -10.5984 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6133 9.7501 -9.5115 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2802 8.7340 -9.9853 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4149 8.8602 -11.2994 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3368 9.8898 -8.0240 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3580 13.5891 -11.5451 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5327 13.6029 -12.2131 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8791 14.5089 -12.9726 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9622 10.4818 -7.7351 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8525 11.7570 -7.1642 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5920 12.3049 -6.9193 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4386 11.5825 -7.2408 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5579 10.3128 -7.8038 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8126 9.7642 -8.0521 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0919 12.1643 -6.9829 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7362 13.4287 -6.5051 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4017 13.4552 -6.4435 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1850 12.3496 -6.8156 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8078 11.5460 -7.1722 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4351 14.5688 -6.0125 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3172 14.5865 -11.7755 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8924 14.0513 -11.7355 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3932 14.9579 -10.6450 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0761 12.2984 -9.8711 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1698 10.1086 -13.9039 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8733 12.2288 -14.0942 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9079 8.1545 -11.8361 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0997 10.5389 -7.5945 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4394 8.9219 -7.5215 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1267 12.7910 -10.9599 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7395 12.3169 -6.9150 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5095 13.2881 -6.4791 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6661 9.7465 -8.0484 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8936 8.7803 -8.4947 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3246 14.2793 -6.2163 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6152 10.5460 -7.5374 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1734 15.4251 -5.7269 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1032 14.8639 -6.8228 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0431 14.2630 -5.1616 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5076 15.3404 -12.5551 H 0 0 0 0 0 0 - -1.1365 14.4228 -12.4281 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7094 13.0055 -11.4933 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5847 14.5469 -9.6579 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9864 15.9623 -10.6317 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 28 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -33 - -> -0.008 - -$$$$ -27 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 56 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3855 12.3606 -12.0031 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5214 11.8004 -10.7171 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6991 10.5797 -13.0384 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9626 11.7779 -13.1031 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8238 10.0198 -11.7523 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2557 10.6213 -10.5956 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6268 9.7501 -9.5073 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3057 8.7491 -9.9816 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4330 8.8776 -11.2917 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3352 9.8817 -8.0196 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6205 13.5372 -12.2095 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9727 10.4835 -7.7324 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8611 11.7523 -7.1657 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5946 12.2988 -6.9068 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4432 11.5806 -7.2147 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5570 10.3109 -7.7899 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8253 9.7663 -8.0483 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0926 12.1556 -6.9444 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7338 13.4204 -6.4594 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4064 13.4584 -6.4114 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1793 12.3493 -6.7865 N 0 0 0 0 0 0 - -0.7954 11.5387 -7.1512 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4205 14.5767 -6.0073 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6894 13.8945 -11.1046 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7822 15.1171 -11.3990 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3310 14.9579 -11.2532 N 0 0 0 0 0 0 - -1.8099 14.4326 -10.1320 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5019 14.0442 -9.2076 O 0 0 0 0 0 0 - -0.2869 14.3494 -10.0364 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0445 12.2494 -9.8378 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1252 10.1075 -13.9125 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8195 12.2403 -14.0555 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9253 8.1691 -11.8449 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0887 10.5401 -7.5861 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4260 8.9087 -7.5002 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3500 13.7423 -13.1711 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7538 12.3208 -6.9277 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5110 13.2853 -6.4615 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6704 9.7539 -8.0335 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8995 8.7870 -8.4986 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3188 14.2725 -6.1705 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5952 10.5614 -7.5429 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1976 15.4335 -5.7330 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0772 14.8589 -6.8237 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0239 14.2765 -5.1673 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0839 13.0222 -10.9241 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1507 14.0138 -10.1183 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1427 15.9632 -10.8055 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9117 15.4187 -12.3919 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7181 15.3243 -11.9869 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1612 14.8056 -10.9074 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0542 13.3103 -9.9607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0768 14.8908 -9.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 46 1 0 0 0 - 24 47 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 48 1 0 0 0 - 25 49 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 50 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 29 53 1 0 0 0 -M END -> -27 - -> -0.68 - -$$$$ -13 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - -2.2088 12.9419 -10.9697 C 0 0 1 0 0 0 - -2.1904 14.4671 -10.9424 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6992 12.5876 -10.8377 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6826 12.4744 -12.1795 O 0 0 0 0 0 0 - -3.5107 14.9139 -11.6089 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3443 13.7200 -11.5243 N 0 0 0 0 0 0 - -6.3525 12.3601 -12.0338 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9727 11.7556 -13.1375 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7097 10.5633 -13.0339 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5001 11.8056 -10.7491 C 0 0 0 0 0 0 - -6.8506 12.3073 -14.3824 O 0 0 0 0 0 0 - -5.5377 13.6382 -12.2001 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9500 14.5444 -12.9177 O 0 0 0 0 0 0 - -7.2308 10.6159 -10.6131 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8083 10.0113 -11.7524 C 0 0 0 0 0 0 - -8.4200 8.8675 -11.2880 N 0 0 0 0 0 0 - -8.2847 8.7400 -9.9757 N 0 0 0 0 0 0 - -7.6047 9.7473 -9.5145 C 0 0 0 0 0 0 - -7.3264 9.8951 -8.0245 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9604 10.4805 -7.7353 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8075 9.7596 -8.0491 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4358 11.5809 -7.2415 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5835 12.3061 -6.9225 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5481 10.3107 -7.8024 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8471 11.7541 -7.1666 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4650 13.6954 -6.3241 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6125 12.4839 -10.1621 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1549 14.8184 -9.9245 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3157 14.8975 -11.4569 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9463 12.5683 -9.7744 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8737 11.6025 -11.2997 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8317 12.8970 -12.3310 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3143 15.2104 -12.6382 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9412 15.7445 -11.0416 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1761 10.1015 -13.8960 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0592 12.2786 -9.8757 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3831 11.8565 -15.0461 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9260 8.1741 -11.8308 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0952 10.5284 -7.5802 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4226 8.9158 -7.5190 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8834 8.7772 -8.4902 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4582 12.0019 -7.0535 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6526 9.7492 -8.0472 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7368 12.3185 -6.9225 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5360 14.1747 -6.6301 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5030 13.6559 -5.2327 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2731 14.3301 -6.6809 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 12 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 9 15 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 14 2 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 18 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 24 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 25 2 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 -M END -> -13 - -> -0.006 - -$$$$ -39 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3502 12.3553 -12.0171 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4935 11.7977 -10.7426 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7106 10.5751 -13.0385 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9725 11.7720 -13.1357 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8130 10.0109 -11.7654 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2309 10.6170 -10.6058 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6111 9.7517 -9.5147 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2865 8.7392 -9.9897 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4152 8.8682 -11.3006 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3373 9.8888 -8.0252 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3541 13.7129 -11.4635 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5361 13.6428 -12.1728 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9526 14.5668 -12.8773 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9623 10.4854 -7.7364 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8532 11.7571 -7.1646 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5945 12.3064 -6.9180 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4446 11.5858 -7.2382 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5555 10.3115 -7.8022 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8126 9.7649 -8.0516 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0930 12.1652 -6.9785 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7427 13.4236 -6.4970 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4061 13.4591 -6.4324 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1810 12.3567 -6.8070 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5520 -7.1701 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4260 14.5701 -5.9973 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6444 15.0059 -11.3286 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1848 14.8660 -11.7465 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5251 13.6965 -11.2881 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2131 12.5012 -11.6333 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6517 12.4721 -11.0120 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0533 12.2782 -9.8788 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1683 10.1179 -13.9100 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8596 12.2364 -14.1027 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9137 8.1596 -11.8366 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0978 10.5418 -7.5943 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4385 8.9249 -7.5194 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7416 12.3179 -6.9181 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5106 13.2874 -6.4775 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6670 9.7484 -8.0467 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8951 8.7812 -8.4943 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3284 14.2801 -6.2040 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6137 10.5521 -7.5405 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1842 15.4249 -5.7096 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0950 14.8685 -6.8061 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0338 14.2620 -5.1464 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1459 15.8371 -11.8396 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5784 15.1813 -10.2625 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2664 14.7763 -12.8186 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5962 15.7735 -11.5993 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2364 12.3970 -12.7259 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6061 11.6676 -11.2795 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1100 11.5362 -11.3555 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5548 12.5406 -9.9299 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -39 - -> -0.004 - -$$$$ -32 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 45 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3767 12.3649 -12.0150 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5300 11.8201 -10.7355 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7235 10.5758 -13.0283 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9848 11.7731 -13.1297 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8178 10.0121 -11.7526 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2522 10.6205 -10.6098 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6101 9.7439 -9.5117 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2784 8.7249 -9.9778 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4134 8.8570 -11.2978 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3337 9.8935 -8.0288 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4165 13.6746 -11.4876 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5534 13.6276 -12.1919 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9234 14.5178 -12.9405 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9640 10.4853 -7.7356 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8116 9.7640 -8.0536 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5500 10.3127 -7.8058 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4411 11.5873 -7.2364 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5925 12.3023 -6.9174 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8510 11.7510 -7.1622 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0968 12.1763 -6.9669 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7702 13.4221 -6.4317 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4283 13.4864 -6.3849 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1730 12.4042 -6.8287 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8019 11.5974 -7.2024 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3914 14.5951 -5.9029 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0971 12.2907 -9.8695 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1793 10.1210 -13.8973 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8799 12.2200 -14.1007 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9071 8.1535 -11.8388 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1037 10.5390 -7.5949 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4435 8.9258 -7.5263 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8100 14.4821 -11.5579 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1203 12.8861 -10.9327 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8859 8.7811 -8.4956 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6665 9.7473 -8.0499 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5168 13.2894 -6.4781 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7359 12.3175 -6.9096 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3834 14.2452 -6.0920 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6064 10.6335 -7.6221 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2430 15.4167 -5.5635 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0295 14.9490 -6.7075 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0108 14.2566 -5.0798 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 29 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 25 40 1 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 -M END -> -32 - -> -0.11 - -$$$$ -37 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 56 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3714 12.3591 -12.0053 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5147 11.8055 -10.7304 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7273 10.5756 -13.0301 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9920 11.7699 -13.1223 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8210 10.0087 -11.7569 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2407 10.6185 -10.5997 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6132 9.7471 -9.5123 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2794 8.7320 -9.9893 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4144 8.8594 -11.3005 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3370 9.8875 -8.0251 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3570 13.7205 -11.5014 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5485 13.6383 -12.1900 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9462 14.5274 -12.9449 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9602 10.4847 -7.7357 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8090 9.7649 -8.0550 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5517 10.3138 -7.8050 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4444 11.5886 -7.2367 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5954 12.3038 -6.9144 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8508 11.7543 -7.1602 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1010 12.1799 -6.9735 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7694 13.4361 -6.4722 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4342 13.4933 -6.4118 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1686 12.4094 -6.8087 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5907 -7.1765 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3824 14.6122 -5.9578 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5015 14.9079 -11.6138 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1980 14.4648 -10.9240 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2178 12.9422 -10.9897 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7152 12.5763 -10.8194 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0843 12.2887 -9.8671 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1823 10.1184 -13.9027 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8710 12.2321 -14.0913 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9081 8.1519 -11.8353 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1025 10.5369 -7.5942 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4387 8.9228 -7.5261 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8924 8.7824 -8.5002 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6608 9.7523 -8.0520 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5130 13.2841 -6.4735 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7376 12.3146 -6.9110 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3680 14.2762 -6.1614 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5997 10.5977 -7.5606 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0415 14.9434 -6.7630 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0029 14.3010 -5.1158 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2397 15.4500 -5.6469 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3040 15.1510 -12.6593 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9447 15.7573 -11.0941 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2028 14.7688 -9.8743 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3076 14.9095 -11.3795 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8316 12.6262 -11.9647 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5512 12.4812 -10.2522 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9417 12.6132 -9.7555 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9032 11.5968 -11.2722 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 -M END -> -37 - -> -0.004 - -$$$$ -23 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3775 12.3296 -12.0018 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5098 11.7629 -10.7403 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7247 10.5660 -13.0266 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9942 11.7487 -13.1193 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8312 10.0057 -11.7538 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2443 10.6021 -10.6070 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6167 9.7449 -9.5151 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2961 8.7374 -9.9786 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4404 8.8724 -11.2937 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3318 9.8946 -8.0252 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5478 13.5112 -12.1572 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9707 10.4870 -7.7351 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8642 11.7588 -7.1694 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6019 12.3141 -6.9186 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4503 11.5963 -7.2357 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5604 10.3220 -7.8000 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8213 9.7719 -8.0443 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0996 12.1710 -6.9757 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7487 13.4240 -6.4767 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4123 13.4674 -6.4260 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1713 12.3664 -6.8217 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8093 11.5624 -7.1930 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4224 14.5657 -5.9816 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6966 14.2423 -13.2612 N 0 0 0 0 0 0 - -4.9506 15.3153 -13.5405 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9383 15.6899 -12.6782 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7261 14.9536 -11.5366 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5508 13.8769 -11.2437 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6976 15.2614 -10.7139 N 0 0 0 0 0 0 - -6.0413 12.2163 -9.8757 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1733 10.1082 -13.8992 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8809 12.2018 -14.0912 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9536 8.1815 -11.8284 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4130 8.9234 -7.5092 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0893 10.5342 -7.5733 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7528 12.3249 -6.9255 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5328 13.2988 -6.4768 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6748 9.7543 -8.0412 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8926 8.7851 -8.4839 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3413 14.2681 -6.1710 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6174 10.5819 -7.5829 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0693 14.8635 -6.8057 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0251 14.2426 -5.1445 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2033 15.4153 -5.6884 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1686 15.8110 -14.4274 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3134 16.5389 -12.9221 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3780 13.3123 -10.3528 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6917 14.8692 -9.7891 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2693 16.1577 -10.8793 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 24 2 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 -M END -> -23 - -> -0.27 - -$$$$ -15 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3730 12.3647 -12.0124 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5249 11.8167 -10.7375 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7225 10.5819 -13.0270 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9871 11.7813 -13.1320 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8205 10.0150 -11.7538 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2514 10.6217 -10.6093 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6113 9.7463 -9.5119 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2838 8.7282 -9.9768 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4166 8.8609 -11.2984 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3282 9.8959 -8.0269 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4004 13.6489 -11.4541 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4592 14.7715 -11.4916 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5363 13.6231 -12.1917 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8861 14.5056 -12.9557 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9554 10.4909 -7.7390 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8447 11.7612 -7.1661 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5697 12.3054 -6.9214 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4308 11.5801 -7.2259 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5429 10.3015 -7.8076 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8018 9.7661 -8.0596 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4352 13.5609 -6.3638 O 0 0 0 0 0 0 - -3.6839 14.5445 -7.0766 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1928 12.1397 -6.9410 O 0 0 0 0 0 0 - -1.0568 11.8071 -7.7386 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0865 12.2817 -9.8717 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1761 10.1266 -13.8989 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8862 12.2301 -14.1010 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9109 8.1585 -11.8401 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0978 10.5402 -7.5937 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4435 8.9306 -7.5162 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1544 12.8539 -10.8932 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4485 14.4035 -11.3387 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6772 15.4626 -10.6827 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4583 15.3250 -12.4323 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7296 12.3147 -6.9189 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6623 9.7270 -8.0552 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8859 8.7827 -8.5028 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6209 15.4399 -6.4624 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1459 14.7973 -8.0279 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6551 14.2645 -7.2771 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2132 12.3981 -7.3814 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2092 12.0638 -8.7945 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7777 10.7513 -7.6419 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 -M END -> -15 - -> -2.5 - -$$$$ -34 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.4024 12.3461 -12.0147 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5825 11.7781 -10.7426 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7347 10.5660 -13.0395 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9966 11.7550 -13.1361 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8265 9.9936 -11.7632 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2675 10.6024 -10.6199 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6234 9.7358 -9.5255 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2741 8.7136 -9.9910 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4130 8.8453 -11.3044 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3406 9.8933 -8.0338 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5538 13.8407 -11.3379 N 0 0 0 0 0 0 - -5.6005 13.6490 -12.1765 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9196 14.4808 -13.0199 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9590 10.4855 -7.7382 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8075 9.7636 -8.0570 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5513 10.3099 -7.8070 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4406 11.5840 -7.2355 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5915 12.3007 -6.9126 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8470 11.7538 -7.1581 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0979 12.1738 -6.9691 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7666 13.4166 -6.4372 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4273 13.4768 -6.3903 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1744 12.4049 -6.8247 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8040 11.5944 -7.2012 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3946 14.5874 -5.9129 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1104 13.1199 -10.1564 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1547 14.2611 -9.9254 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7686 15.0454 -11.0979 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3454 14.7999 -8.7258 F 0 0 0 0 0 0 - -1.8808 13.9286 -10.0717 F 0 0 0 0 0 0 - -6.2371 12.2377 -9.8825 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1965 10.1201 -13.9011 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8777 12.2189 -14.1082 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9048 8.1432 -11.8372 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1066 10.5395 -7.5982 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4470 8.9316 -7.5331 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8888 8.7812 -8.5015 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6633 9.7451 -8.0571 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5093 13.2831 -6.4741 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7314 12.3149 -6.9053 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3717 14.2432 -6.0985 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6084 10.6151 -7.6146 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2286 15.4127 -5.5721 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0434 14.9448 -6.7174 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0235 14.2533 -5.0839 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7139 12.1065 -10.2127 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9207 13.2607 -9.4790 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5371 15.7574 -10.8202 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0553 15.4231 -11.8251 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -34 - -> -0.007 - -$$$$ -25 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3861 12.3623 -11.9697 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5480 11.8020 -10.7080 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6869 10.5726 -13.0325 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9529 11.7665 -13.1047 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8210 10.0086 -11.7556 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2636 10.6177 -10.5919 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6330 9.7421 -9.5104 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3023 8.7332 -9.9897 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4342 8.8678 -11.3051 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3415 9.8758 -8.0215 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1211 13.8754 -11.2000 S 0 0 0 0 0 0 - -2.9188 12.5402 -11.7675 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6382 13.5428 -12.1051 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9683 10.4827 -7.7344 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8123 9.7690 -8.0490 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5592 10.3237 -7.7969 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4543 11.5962 -7.2288 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6126 12.3085 -6.9084 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8671 11.7538 -7.1613 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1058 12.1871 -6.9644 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7745 13.4406 -6.4637 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4394 13.4976 -6.4041 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1691 12.4146 -6.8015 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8034 11.5995 -7.1773 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3694 14.6144 -5.9538 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6497 15.1720 -11.6865 O 0 0 0 0 0 0 - -4.3650 13.6745 -9.7698 O 0 0 0 0 0 0 - -6.1192 12.2649 -9.8433 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1122 10.1144 -13.9155 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8144 12.2368 -14.0685 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9325 8.1663 -11.8458 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4236 8.9164 -7.5059 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0908 10.5346 -7.5820 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9692 12.6827 -11.2486 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7669 12.6240 -12.8324 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3306 11.5652 -11.5235 H 0 0 0 0 0 0 - -5.9058 14.2159 -12.8076 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8881 8.7864 -8.4918 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6674 9.7660 -8.0419 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5385 13.2901 -6.4661 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7582 12.3115 -6.9184 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3766 14.2799 -6.1559 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5994 10.6146 -7.5758 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9849 14.2943 -5.1133 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2624 15.4490 -5.6481 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0212 14.9347 -6.7673 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 11 27 2 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 -M END -> -25 - -> -0.073 - -$$$$ -14 - 3D - Structure written by MMmdl. - 34 35 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3887 12.3647 -12.0798 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4962 11.8202 -10.8023 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7456 10.5858 -13.0568 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0126 11.7716 -13.1776 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8340 10.0285 -11.7877 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2471 10.6293 -10.6255 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6099 9.7738 -9.5366 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2971 8.7499 -9.9997 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4324 8.8805 -11.3156 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3321 9.9039 -8.0386 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4077 13.6374 -11.5161 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4400 14.7362 -11.5603 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5080 13.5935 -12.2349 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8585 14.4899 -13.0509 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9274 10.4444 -7.6346 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7880 9.9988 -8.5813 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9224 11.9644 -7.3345 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0382 12.2728 -9.9607 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2100 10.1267 -13.9275 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9074 12.2361 -14.1520 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9323 8.1670 -11.8392 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0901 10.5612 -7.6086 H 0 0 0 0 0 0 - -7.5048 8.9551 -7.5303 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1635 12.8367 -10.9301 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4281 14.3561 -11.4328 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6222 15.4408 -10.7497 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4529 15.2842 -12.5019 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6875 9.9831 -6.6758 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8140 10.3484 -8.2443 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8951 10.4012 -9.5779 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7479 8.9096 -8.6828 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9281 12.3070 -7.0401 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6508 12.2215 -6.5656 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2266 12.5877 -8.1480 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 19 1 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 21 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 22 1 0 0 0 - 10 23 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 28 1 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 16 31 1 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 17 33 1 0 0 0 - 17 34 1 0 0 0 -M END -> -14 - -> -0.84 - -$$$$ -45 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.4275 12.3453 -12.0176 C 0 0 0 0 0 0 - -6.6105 11.7832 -10.7429 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7405 10.5587 -13.0479 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0073 11.7527 -13.1387 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8357 9.9872 -11.7695 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2848 10.5993 -10.6252 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6281 9.7307 -9.5318 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2830 8.7083 -9.9969 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4214 8.8369 -11.3125 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3299 9.8861 -8.0415 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6020 13.8371 -11.3112 N 0 0 0 0 0 0 - -5.6232 13.6419 -12.1798 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9069 14.4516 -13.0592 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9473 10.4903 -7.7303 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8632 11.7421 -7.1195 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5901 12.2560 -6.8332 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4296 11.5300 -7.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5045 10.2730 -7.8164 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7945 9.7703 -8.0537 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0643 13.4351 -6.1976 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7662 13.4536 -6.2615 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3669 12.3336 -6.8391 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9435 12.0941 -6.9881 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0340 12.9997 -10.2404 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1550 14.1929 -9.9451 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8070 15.0441 -11.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4251 14.7437 -8.6708 O 0 0 0 0 0 0 - -4.8009 14.9943 -8.3397 C 0 0 0 0 0 0 - -6.2751 12.2510 -9.8808 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1947 10.1119 -13.9118 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8796 12.2190 -14.1080 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9146 8.1352 -11.8444 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1022 10.5167 -7.5911 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4243 8.9304 -7.5266 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7518 12.2958 -6.8714 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6233 9.7099 -8.0738 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9015 8.7955 -8.5026 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6122 14.2555 -5.7697 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3704 12.9492 -6.6128 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6882 11.9370 -8.0353 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6930 11.2211 -6.3917 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7681 12.9512 -9.5114 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5878 12.0194 -10.4228 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0910 13.9881 -10.0141 H 0 0 0 0 0 0 - -3.1162 15.4759 -11.7546 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5864 15.7240 -10.7221 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7653 15.4448 -7.3800 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4372 14.1236 -8.2286 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3333 15.6922 -8.9422 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -45 - -> -0.007 - -$$$$ -36 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3988 12.3548 -12.0167 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5634 11.7828 -10.7362 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7338 10.5694 -13.0370 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9985 11.7556 -13.1278 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8247 9.9971 -11.7595 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2595 10.6059 -10.6156 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6196 9.7377 -9.5218 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2737 8.7166 -9.9897 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4125 8.8485 -11.3029 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3396 9.8926 -8.0318 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5445 13.8618 -11.3707 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5979 13.6472 -12.1806 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9190 14.4711 -13.0424 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9590 10.4852 -7.7375 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8471 11.7541 -7.1585 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5907 12.3017 -6.9141 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4394 11.5818 -7.2374 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5527 10.3083 -7.8066 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8082 9.7633 -8.0562 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0898 12.1596 -6.9778 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7390 13.4130 -6.4881 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3978 13.4480 -6.4305 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1868 12.3491 -6.8198 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8044 11.5467 -7.1770 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4420 14.5581 -5.9859 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7035 15.0408 -11.2447 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1688 14.3872 -9.9709 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1668 13.2516 -10.0984 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8336 13.9158 -10.0706 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8619 14.9477 -10.1504 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1975 12.2414 -9.8778 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1955 10.1215 -13.8981 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8803 12.2209 -14.1051 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9046 8.1451 -11.8366 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1070 10.5375 -7.5971 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4451 8.9300 -7.5335 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7321 12.3147 -6.9056 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5096 13.2839 -6.4750 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6650 9.7438 -8.0571 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8891 8.7810 -8.5010 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3299 14.2629 -6.1859 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6250 10.5486 -7.5510 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1676 15.4074 -5.6822 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1055 14.8718 -6.7964 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0560 14.2422 -5.1385 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9547 15.2933 -11.9951 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4087 15.8406 -11.0592 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2749 14.9753 -9.0608 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0117 13.4714 -9.4655 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7929 12.2315 -10.0358 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1264 14.5023 -10.2505 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8642 15.5647 -9.2515 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0194 15.5931 -11.0166 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -36 - -> -0.006 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/.ipynb_checkpoints/test1-checkpoint.png b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/.ipynb_checkpoints/test1-checkpoint.png deleted file mode 100755 index 681b1a56..00000000 Binary files a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/.ipynb_checkpoints/test1-checkpoint.png and /dev/null differ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 56b4c4e1..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,58 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_39_28 14.90 0.57 1.80 0 -FEP_30_42 7.71 0.16 0.50 0 -FEP_21_22 1.54 0.34 1.08 0 -FEP_34_37 -7.30 0.24 0.77 0 -FEP_37_26 -8.22 0.20 0.65 0 -FEP_40_37 -32.60 0.34 1.08 0 -FEP_37_35 5.08 0.29 0.91 0 -FEP_28_26 -44.27 0.76 2.41 0 -FEP_39_37 -21.25 0.14 0.43 0 -FEP_36_37 -6.95 0.32 1.02 0 -FEP_17_15 17.99 0.43 1.37 0 -FEP_30_35 9.06 0.37 1.17 0 -FEP_20_33 12.84 0.58 1.85 0 -FEP_30_13 -24.60 1.14 3.61 0 -FEP_19_17 7.82 0.37 1.17 0 -FEP_43_42 -4.10 0.18 0.56 0 -FEP_37_32 -37.75 0.39 1.25 0 -FEP_44_18 -18.77 0.41 1.30 0 -FEP_37_19 -15.00 0.37 1.17 0 -FEP_19_24 -20.43 0.35 1.11 0 -FEP_25_24 99.79 1.38 4.37 0 -FEP_15_14 -7.74 0.66 2.10 2 -FEP_19_32 -23.88 0.23 0.74 0 -FEP_23_22 87.51 0.28 0.88 0 -FEP_33_19 3.50 0.30 0.94 0 -FEP_15_16 -11.41 0.29 0.92 0 -FEP_31_37 3.67 0.38 1.19 0 -FEP_31_35 9.47 0.54 1.71 0 -FEP_41_37 -6.30 0.25 0.80 0 -FEP_42_45 11.29 0.34 1.08 0 -FEP_16_14 5.30 0.68 2.15 1 -FEP_41_40 26.12 0.13 0.42 0 -FEP_23_21 85.99 0.53 1.68 0 -FEP_42_13 -32.30 0.50 1.57 0 -FEP_27_24 0.66 0.89 2.82 3 -FEP_36_35 -2.37 0.31 0.99 0 -FEP_18_17 -1.51 0.21 0.67 0 -FEP_38_34 6.51 0.14 0.43 0 -FEP_38_43 7.20 0.17 0.54 0 -FEP_45_44 -3.81 0.30 0.95 0 -FEP_22_19 -19.75 0.31 0.98 0 -FEP_20_19 16.45 0.36 1.14 0 -FEP_30_37 4.17 0.28 0.89 0 -FEP_27_25 -101.60 1.00 3.15 0 -FEP_29_25 -15.87 0.91 2.89 0 -FEP_29_33 98.59 0.47 1.48 0 -FEP_42_44 8.40 0.41 1.28 0 -FEP_41_37 -5.87 0.22 0.69 0 -FEP_38_37 -1.01 0.19 0.59 0 -FEP_43_44 4.24 0.21 0.66 0 -FEP_39_19 -35.78 0.35 1.11 0 -FEP_35_44 9.60 0.27 0.87 0 -FEP_28_21 -30.39 0.31 0.97 0 -FEP_21_32 -41.11 0.58 1.84 0 -FEP_18_15 16.68 0.25 0.78 0 -FEP_25_19 121.67 0.69 2.19 0 -FEP_35_19 -19.20 0.25 0.78 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index cbaaff1c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,58 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_39_28 8.88 0.31 0.97 0 -FEP_30_42 4.56 0.18 0.55 0 -FEP_21_22 4.24 0.12 0.38 0 -FEP_34_37 -5.75 0.24 0.75 0 -FEP_37_26 -13.59 0.16 0.49 0 -FEP_40_37 -32.48 0.42 1.32 0 -FEP_37_35 4.94 0.16 0.50 0 -FEP_28_26 -42.99 0.15 0.47 0 -FEP_39_37 -21.32 0.19 0.62 0 -FEP_36_37 -5.96 0.22 0.70 0 -FEP_17_15 21.80 0.37 1.16 0 -FEP_30_35 7.79 0.21 0.67 0 -FEP_20_33 11.77 0.28 0.90 0 -FEP_30_13 -26.92 0.40 1.25 0 -FEP_19_17 2.63 0.28 0.88 0 -FEP_43_42 -4.20 0.18 0.58 0 -FEP_37_32 -43.13 0.29 0.92 0 -FEP_44_18 -22.43 0.16 0.49 0 -FEP_37_19 -18.29 0.29 0.90 0 -FEP_19_24 -22.14 0.17 0.55 0 -FEP_25_24 102.09 0.22 0.70 0 -FEP_15_14 -11.49 0.61 1.94 2 -FEP_19_32 -24.31 0.14 0.43 0 -FEP_23_22 89.46 0.14 0.46 0 -FEP_33_19 3.00 0.14 0.43 0 -FEP_15_16 -11.67 0.25 0.78 0 -FEP_31_37 3.91 0.16 0.51 0 -FEP_31_35 7.58 0.21 0.65 0 -FEP_41_37 -5.67 0.30 0.96 0 -FEP_42_45 10.63 0.24 0.76 0 -FEP_16_14 0.95 0.14 0.45 0 -FEP_41_40 26.95 0.23 0.73 0 -FEP_23_21 84.88 0.10 0.30 0 -FEP_42_13 -33.26 0.27 0.86 0 -FEP_27_24 1.91 0.34 1.09 1 -FEP_36_35 -2.70 0.24 0.77 0 -FEP_18_17 -4.11 0.14 0.43 0 -FEP_38_34 5.81 0.21 0.66 0 -FEP_38_43 4.90 0.24 0.75 0 -FEP_45_44 -2.33 0.21 0.66 0 -FEP_22_19 -20.91 0.17 0.52 0 -FEP_20_19 14.75 0.15 0.47 0 -FEP_30_37 4.26 0.26 0.82 0 -FEP_27_25 -100.50 0.28 0.87 0 -FEP_29_25 -20.41 0.60 1.89 0 -FEP_29_33 102.34 0.29 0.91 0 -FEP_42_44 8.42 0.12 0.39 0 -FEP_41_37 -5.61 0.27 0.87 0 -FEP_38_37 0.57 0.19 0.60 0 -FEP_43_44 4.77 0.20 0.64 0 -FEP_39_19 -39.35 0.27 0.87 0 -FEP_28_21 -30.60 0.18 0.56 1 -FEP_18_15 17.10 0.13 0.40 0 -FEP_25_19 125.54 0.49 1.56 1 -FEP_21_32 -41.88 0.23 0.72 0 -FEP_35_44 6.02 0.19 0.60 0 -FEP_35_19 -22.54 0.28 0.87 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index b804faa4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,87 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_33_20 -12.20 0.62 0 -FEP_19_18 7.94 0.40 0 -FEP_37_40 33.12 0.32 0 -FEP_35_30 -9.25 0.34 0 -FEP_21_23 -85.80 0.48 0 -FEP_42_18 -10.29 0.36 0 -FEP_43_18 -15.01 0.18 0 -FEP_23_22 87.74 0.45 0 -FEP_27_25 -102.87 1.11 0 -FEP_32_27 7.75 1.16 1 -FEP_35_36 3.10 0.47 0 -FEP_19_17 7.29 0.41 0 -FEP_32_19 23.39 0.23 0 -FEP_19_24 -20.40 0.29 0 -FEP_37_30 -3.38 0.17 0 -FEP_45_18 -21.70 0.59 0 -FEP_32_25 -95.25 1.01 0 -FEP_44_45 3.21 0.35 0 -FEP_15_16 -11.60 0.25 0 -FEP_18_17 -1.36 0.28 0 -FEP_44_18 -18.88 0.40 0 -FEP_15_14 -10.42 1.10 3 -FEP_41_40 26.15 0.20 0 -FEP_24_25 -100.38 1.66 0 -FEP_19_27 -20.82 0.83 0 -FEP_37_39 21.16 0.19 0 -FEP_30_13 -26.03 0.64 0 -FEP_19_33 -3.98 0.22 0 -FEP_21_22 1.54 0.44 0 -FEP_17_15 18.77 0.32 0 -FEP_37_31 -4.68 0.28 0 -FEP_25_21 138.34 0.78 0 -FEP_28_26 -44.95 0.44 0 -FEP_24_27 -0.82 1.00 2 -FEP_16_14 4.12 0.64 0 -FEP_19_20 -15.54 0.20 0 -FEP_28_21 -32.01 0.57 0 -FEP_37_35 5.57 0.36 0 -FEP_25_29 15.96 0.99 0 -FEP_37_41 6.65 0.33 0 -FEP_37_32 -38.61 0.54 0 -FEP_37_36 6.85 0.29 0 -FEP_33_29 -98.09 0.36 0 -FEP_37_26 -8.16 0.33 0 -FEP_39_28 14.76 0.69 0 -FEP_34_38 -5.92 0.34 0 -FEP_43_42 -4.02 0.16 0 -FEP_42_44 8.41 0.22 0 -FEP_42_45 11.63 0.25 0 -FEP_37_34 6.83 0.15 0 -FEP_42_13 -33.40 0.48 0 -FEP_38_43 6.02 0.25 0 -FEP_35_31 -10.34 0.48 0 -FEP_25_19 121.50 0.57 0 -FEP_22_24 -40.77 0.42 0 -FEP_25_37 133.73 0.96 0 -FEP_29_32 79.64 0.62 0 -FEP_44_31 -15.35 0.29 0 -FEP_45_36 -8.50 0.36 0 -FEP_27_34 41.25 0.86 0 -FEP_22_32 -44.45 0.24 0 -FEP_44_35 -8.83 0.42 0 -FEP_22_19 -21.38 0.28 0 -FEP_29_24 81.69 0.84 1 -FEP_29_19 102.93 0.50 1 -FEP_44_43 -3.94 0.23 0 -FEP_23_32 42.92 0.70 0 -FEP_25_33 116.21 0.65 0 -FEP_44_30 -15.30 0.40 0 -FEP_45_43 -7.51 0.26 0 -FEP_15_19 -24.70 0.45 0 -FEP_27_37 33.44 0.74 0 -FEP_27_33 17.67 1.06 0 -FEP_22_28 29.67 0.53 0 -FEP_19_37 14.33 0.32 0 -FEP_42_30 -6.92 0.24 0 -FEP_16_18 -4.80 0.45 0 -FEP_27_25 -101.85 0.88 1 -FEP_33_20 -12.17 0.40 0 -FEP_19_20 -15.59 0.34 0 -FEP_24_27 0.89 1.74 1 -FEP_24_25 -99.27 1.38 0 -FEP_33_29 -98.08 0.57 0 -FEP_19_24 -20.80 0.38 0 -FEP_25_29 16.62 1.27 1 -FEP_19_33 -3.44 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/protein2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/protein2.txt deleted file mode 100644 index d2762741..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/protein2.txt +++ /dev/null @@ -1,22 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_25_19 121.50 0.57 0 -FEP_22_24 -40.77 0.42 0 -FEP_25_37 133.73 0.96 0 -FEP_29_32 79.64 0.62 0 -FEP_44_31 -15.35 0.29 0 -FEP_45_36 -8.50 0.36 0 -FEP_27_34 41.25 0.86 0 -FEP_22_32 -44.45 0.24 0 -FEP_44_35 -8.83 0.42 0 -FEP_22_19 -21.38 0.28 0 -FEP_29_24 81.69 0.84 1 -FEP_29_19 102.93 0.50 1 -FEP_44_43 -3.94 0.23 0 -FEP_23_32 42.92 0.70 0 -FEP_25_33 116.21 0.65 0 -FEP_44_30 -15.30 0.40 0 -FEP_45_43 -7.51 0.26 0 -FEP_15_19 -24.70 0.45 0 -FEP_27_37 33.44 0.74 0 -FEP_27_33 17.67 1.06 0 -FEP_22_28 29.67 0.53 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/protein_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/protein_1.txt deleted file mode 100644 index 4c9cda2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/protein_1.txt +++ /dev/null @@ -1,54 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_33_20 -12.20 0.62 0 -FEP_19_18 7.94 0.40 0 -FEP_37_40 33.12 0.32 0 -FEP_35_30 -9.25 0.34 0 -FEP_21_23 -85.80 0.48 0 -FEP_42_18 -10.29 0.36 0 -FEP_43_18 -15.01 0.18 0 -FEP_23_22 87.74 0.45 0 -FEP_27_25 -102.87 1.11 0 -FEP_32_27 7.75 1.16 1 -FEP_35_36 3.10 0.47 0 -FEP_19_17 7.29 0.41 0 -FEP_32_19 23.39 0.23 0 -FEP_19_24 -20.40 0.29 0 -FEP_37_30 -3.38 0.17 0 -FEP_45_18 -21.70 0.59 0 -FEP_32_25 -95.25 1.01 0 -FEP_44_45 3.21 0.35 0 -FEP_15_16 -11.60 0.25 0 -FEP_18_17 -1.36 0.28 0 -FEP_44_18 -18.88 0.40 0 -FEP_15_14 -10.42 1.10 3 -FEP_41_40 26.15 0.20 0 -FEP_24_25 -100.38 1.66 0 -FEP_19_27 -20.82 0.83 0 -FEP_37_39 21.16 0.19 0 -FEP_30_13 -26.03 0.64 0 -FEP_19_33 -3.98 0.22 0 -FEP_21_22 1.54 0.44 0 -FEP_17_15 18.77 0.32 0 -FEP_37_31 -4.68 0.28 0 -FEP_25_21 138.34 0.78 0 -FEP_28_26 -44.95 0.44 0 -FEP_24_27 -0.82 1.00 2 -FEP_16_14 4.12 0.64 0 -FEP_19_20 -15.54 0.20 0 -FEP_28_21 -32.01 0.57 0 -FEP_37_35 5.57 0.36 0 -FEP_25_29 15.96 0.99 0 -FEP_37_41 6.65 0.33 0 -FEP_37_32 -38.61 0.54 0 -FEP_37_36 6.85 0.29 0 -FEP_33_29 -98.09 0.36 0 -FEP_37_26 -8.16 0.33 0 -FEP_39_28 14.76 0.69 0 -FEP_34_38 -5.92 0.34 0 -FEP_43_42 -4.02 0.16 0 -FEP_42_44 8.41 0.22 0 -FEP_42_45 11.63 0.25 0 -FEP_37_34 6.83 0.15 0 -FEP_42_13 -33.40 0.48 0 -FEP_38_43 6.02 0.25 0 -FEP_35_31 -10.34 0.48 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 253366ae..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,87 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_33_20 -11.97 0.23 0 -FEP_19_18 6.93 0.18 0 -FEP_37_40 32.56 0.19 0 -FEP_35_30 -8.44 0.18 0 -FEP_21_23 -84.55 0.10 0 -FEP_42_18 -13.70 0.18 0 -FEP_43_18 -17.47 0.21 0 -FEP_23_22 89.14 0.17 0 -FEP_27_25 -100.45 0.27 0 -FEP_32_27 1.10 0.70 1 -FEP_35_36 2.25 0.19 0 -FEP_19_17 2.85 0.19 0 -FEP_32_19 24.35 0.05 0 -FEP_19_24 -22.00 0.16 0 -FEP_37_30 -4.19 0.12 0 -FEP_45_18 -23.82 0.23 0 -FEP_32_25 -100.38 0.23 0 -FEP_44_45 2.58 0.13 0 -FEP_15_16 -11.08 0.14 0 -FEP_18_17 -3.67 0.09 0 -FEP_44_18 -21.86 0.13 0 -FEP_15_14 -11.31 0.53 1 -FEP_41_40 26.93 0.16 0 -FEP_24_25 -102.05 0.12 0 -FEP_19_27 -25.23 0.27 0 -FEP_37_39 21.06 0.10 0 -FEP_30_13 -28.08 0.57 0 -FEP_19_33 -2.86 0.12 0 -FEP_21_22 4.38 0.15 0 -FEP_17_15 20.39 0.18 0 -FEP_37_31 -3.57 0.06 0 -FEP_25_21 142.16 0.42 0 -FEP_28_26 -42.97 0.11 0 -FEP_24_27 -1.92 0.38 0 -FEP_16_14 0.68 0.29 0 -FEP_19_20 -14.99 0.20 0 -FEP_28_21 -30.63 0.14 0 -FEP_37_35 4.05 0.11 0 -FEP_25_29 21.10 0.87 0 -FEP_37_41 5.62 0.06 0 -FEP_37_32 -43.46 0.27 0 -FEP_37_36 5.46 0.19 0 -FEP_33_29 -101.92 0.33 0 -FEP_37_26 -13.43 0.27 0 -FEP_39_28 8.45 0.27 0 -FEP_34_38 -6.18 0.11 0 -FEP_43_42 -3.88 0.13 0 -FEP_42_44 8.27 0.24 0 -FEP_42_45 10.64 0.28 0 -FEP_37_34 5.48 0.12 0 -FEP_42_13 -33.11 0.20 0 -FEP_38_43 6.28 0.24 0 -FEP_35_31 -7.97 0.13 0 -FEP_25_19 124.63 0.44 0 -FEP_22_24 -43.75 0.23 0 -FEP_25_37 143.39 0.34 0 -FEP_29_32 80.18 0.30 0 -FEP_44_31 -13.51 0.17 0 -FEP_45_36 -7.34 0.14 0 -FEP_27_34 49.17 0.17 0 -FEP_22_32 -45.90 0.12 0 -FEP_44_35 -6.96 0.27 0 -FEP_22_19 -21.43 0.15 0 -FEP_29_24 82.19 0.48 0 -FEP_29_19 104.75 0.24 0 -FEP_44_43 -4.81 0.09 0 -FEP_23_32 42.73 0.19 0 -FEP_25_33 121.91 0.63 0 -FEP_44_30 -14.59 0.27 0 -FEP_45_43 -6.79 0.16 0 -FEP_15_19 -23.82 0.20 0 -FEP_27_37 44.00 0.16 0 -FEP_27_33 21.99 0.30 0 -FEP_22_28 26.11 0.15 0 -FEP_19_37 18.60 0.14 0 -FEP_42_30 -6.34 0.15 0 -FEP_16_18 -5.70 0.08 0 -FEP_24_25 -102.31 0.23 0 -FEP_19_20 -14.70 0.19 0 -FEP_33_20 -11.83 0.26 0 -FEP_27_25 -100.78 0.33 0 -FEP_25_29 19.85 0.21 0 -FEP_24_27 -2.89 0.55 1 -FEP_19_24 -22.16 0.12 0 -FEP_33_29 -102.41 0.29 0 -FEP_19_33 -2.84 0.13 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/water2.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/water2.txt deleted file mode 100644 index 3151b7a3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/water2.txt +++ /dev/null @@ -1,22 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_25_19 124.63 0.44 0 -FEP_22_24 -43.75 0.23 0 -FEP_25_37 143.39 0.34 0 -FEP_29_32 80.18 0.30 0 -FEP_44_31 -13.51 0.17 0 -FEP_45_36 -7.34 0.14 0 -FEP_27_34 49.17 0.17 0 -FEP_22_32 -45.90 0.12 0 -FEP_44_35 -6.96 0.27 0 -FEP_22_19 -21.43 0.15 0 -FEP_29_24 82.19 0.48 0 -FEP_29_19 104.75 0.24 0 -FEP_44_43 -4.81 0.09 0 -FEP_23_32 42.73 0.19 0 -FEP_25_33 121.91 0.63 0 -FEP_44_30 -14.59 0.27 0 -FEP_45_43 -6.79 0.16 0 -FEP_15_19 -23.82 0.20 0 -FEP_27_37 44.00 0.16 0 -FEP_27_33 21.99 0.30 0 -FEP_22_28 26.11 0.15 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/water_1.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/water_1.txt deleted file mode 100644 index 5e93e16f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cdk8/no-vs/2fs/water_1.txt +++ /dev/null @@ -1,54 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_33_20 -11.97 0.23 0 -FEP_19_18 6.93 0.18 0 -FEP_37_40 32.56 0.19 0 -FEP_35_30 -8.44 0.18 0 -FEP_21_23 -84.55 0.10 0 -FEP_42_18 -13.70 0.18 0 -FEP_43_18 -17.47 0.21 0 -FEP_23_22 89.14 0.17 0 -FEP_27_25 -100.45 0.27 0 -FEP_32_27 1.10 0.70 1 -FEP_35_36 2.25 0.19 0 -FEP_19_17 2.85 0.19 0 -FEP_32_19 24.35 0.05 0 -FEP_19_24 -22.00 0.16 0 -FEP_37_30 -4.19 0.12 0 -FEP_45_18 -23.82 0.23 0 -FEP_32_25 -100.38 0.23 0 -FEP_44_45 2.58 0.13 0 -FEP_15_16 -11.08 0.14 0 -FEP_18_17 -3.67 0.09 0 -FEP_44_18 -21.86 0.13 0 -FEP_15_14 -11.31 0.53 1 -FEP_41_40 26.93 0.16 0 -FEP_24_25 -102.05 0.12 0 -FEP_19_27 -25.23 0.27 0 -FEP_37_39 21.06 0.10 0 -FEP_30_13 -28.08 0.57 0 -FEP_19_33 -2.86 0.12 0 -FEP_21_22 4.38 0.15 0 -FEP_17_15 20.39 0.18 0 -FEP_37_31 -3.57 0.06 0 -FEP_25_21 142.16 0.42 0 -FEP_28_26 -42.97 0.11 0 -FEP_24_27 -1.92 0.38 0 -FEP_16_14 0.68 0.29 0 -FEP_19_20 -14.99 0.20 0 -FEP_28_21 -30.63 0.14 0 -FEP_37_35 4.05 0.11 0 -FEP_25_29 21.10 0.87 0 -FEP_37_41 5.62 0.06 0 -FEP_37_32 -43.46 0.27 0 -FEP_37_36 5.46 0.19 0 -FEP_33_29 -101.92 0.33 0 -FEP_37_26 -13.43 0.27 0 -FEP_39_28 8.45 0.27 0 -FEP_34_38 -6.18 0.11 0 -FEP_43_42 -3.88 0.13 0 -FEP_42_44 8.27 0.24 0 -FEP_42_45 10.64 0.28 0 -FEP_37_34 5.48 0.12 0 -FEP_42_13 -33.11 0.20 0 -FEP_38_43 6.28 0.24 0 -FEP_35_31 -7.97 0.13 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 6cf00fc2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,37 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 75.66 0.13 0.41 0 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 2.97 0.16 0.49 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -10.28 0.20 0.64 0 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40 -82.66 0.32 1.02 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 7.05 0.11 0.36 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5 8.20 0.29 0.91 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -23.29 0.11 0.33 0 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -15.46 0.21 0.66 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -6.17 0.77 2.44 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 57.03 0.20 0.65 0 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90 7.34 0.62 1.96 3 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -40.10 0.58 1.82 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -68.66 0.11 0.35 0 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90 -9.63 0.51 1.62 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -20.31 0.24 0.74 0 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200 -14.55 0.19 0.60 0 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23 9.50 1.14 3.62 6 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200 -81.77 0.27 0.85 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 1.76 0.08 0.26 0 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5 10.93 0.48 1.53 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300 -80.17 0.27 0.85 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -28.95 1.43 4.52 3 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 2.20 2.47 7.81 6 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 61.98 0.39 1.22 0 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1 4.61 0.35 1.12 0 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23 -1.77 0.99 3.13 5 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 -7.07 0.31 0.97 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 19.41 0.36 1.14 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 -1.35 0.19 0.60 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 -2.51 1.25 3.95 5 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5 6.00 0.35 1.09 0 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42 2.95 1.14 3.60 3 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -35.22 0.14 0.44 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90 14.86 1.21 3.83 7 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42 -21.00 1.40 4.43 0 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7 2.51 0.77 2.44 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index ad8d992a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,37 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 75.00 0.14 0.46 0 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 4.41 0.12 0.38 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -11.34 0.04 0.12 0 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402754-40 -88.87 0.16 0.51 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 7.78 0.21 0.67 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402757-6-5 9.24 0.18 0.58 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -23.70 0.15 0.46 0 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -17.66 0.08 0.25 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -5.02 0.60 1.90 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 52.26 0.25 0.80 0 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402764-90 6.26 0.37 1.16 1 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -39.34 0.31 0.99 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -67.65 0.13 0.40 0 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402763-90 -9.63 0.30 0.96 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -21.13 0.21 0.67 0 -FEP_CHEMBL3402761-1_CHEMBL3402753-200 -21.50 0.23 0.72 0 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402742-23 8.08 1.95 6.15 5 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402745-200 -80.31 0.20 0.62 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 1.09 0.21 0.68 0 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402757-6-5 7.62 0.30 0.95 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402744-300 -80.90 0.23 0.74 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -32.55 0.59 1.86 3 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 6.18 1.10 3.49 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 57.94 0.14 0.44 0 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402760-1 4.95 0.30 0.93 0 -FEP_CHEMBL3402741-400_CHEMBL3402742-23 -3.77 0.53 1.66 4 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 -9.38 0.15 0.48 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 18.62 0.27 0.85 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 -2.66 0.17 0.52 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 -6.95 1.41 4.44 0 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402757-6-5 4.09 0.36 1.13 0 -FEP_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1_CHEMBL3402743-42 -0.04 0.98 3.11 1 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -37.56 0.17 0.54 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402743-42 -27.02 0.94 2.97 0 -FEP_CHEMBL3402762-1_CHEMBL3402759-5-7 -0.65 0.28 0.87 1 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90 12.85 0.93 2.95 2 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index bc4b8f58..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 57.36 0.18 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 5.45 1.20 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402763-90 -7.03 0.71 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 19.16 0.33 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402762-1 -10.47 0.60 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402755-4200 81.49 0.34 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -10.07 0.14 0 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 3.00 0.09 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402761-1 15.61 0.24 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -23.93 0.12 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -5.87 0.69 0 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402741-400 9.05 0.51 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -30.61 0.22 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 0.33 0.83 4 -FEP_CHEMBL3402764-90_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 -6.99 0.64 2 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 -6.41 0.15 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -35.14 0.11 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 7.49 0.14 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -21.59 0.35 0 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402762-1 -3.87 0.20 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402759-5-7 -7.81 0.32 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402760-1 -5.09 1.16 1 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 -1.05 0.20 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402741-400 1.45 0.51 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 61.58 0.30 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -68.53 0.13 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402761-1 84.07 0.27 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 76.21 0.18 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 1.29 0.13 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -40.38 0.66 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 -2.37 1.34 3 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -15.90 0.22 0 -FEP_CHEMBL3402744-300_CHEMBL3402755-4200 80.08 0.21 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90 13.76 0.37 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index f040319c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/cmet/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,35 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402747-3400 52.77 0.11 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402764-90 4.65 0.92 1 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402763-90 -6.65 0.61 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402757-6-5 18.89 0.48 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402762-1 -7.72 0.30 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402755-4200 81.70 0.29 0 -FEP_CHEMBL3402749-500_CHEMBL3402747-3400 -11.43 0.06 0 -FEP_CHEMBL3402752-30000_CHEMBL3402751-2100 3.51 0.10 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402761-1 20.29 0.21 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402753-200 -23.80 0.10 0 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402742-23 -5.21 0.38 0 -FEP_CHEMBL3402763-90_CHEMBL3402741-400 9.50 0.41 0 -FEP_CHEMBL3402759-5-7_CHEMBL3402758-10 -31.18 1.53 4 -FEP_CHEMBL3402743-42_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 -2.66 1.07 2 -FEP_CHEMBL3402764-90_CHEMBL3402765-11-charged-pKa-8-1 -7.25 0.59 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402748-5300 -9.47 0.07 0 -FEP_CHEMBL3402755-4200_CHEMBL3402752-30000 -37.79 0.08 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402750-400 7.27 0.06 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402758-10 -20.68 0.22 0 -FEP_CHEMBL3402760-1_CHEMBL3402762-1 -3.99 0.19 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402759-5-7 -8.66 0.30 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402760-1 -4.13 0.29 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402749-500 -2.87 0.18 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402741-400 0.23 0.71 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402748-5300 57.70 0.12 0 -FEP_CHEMBL3402753-200_CHEMBL3402754-40 -67.21 0.05 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402761-1 87.21 0.25 0 -FEP_CHEMBL3402754-40_CHEMBL3402750-400 74.55 0.06 0 -FEP_CHEMBL3402745-200_CHEMBL3402744-300 1.13 0.06 0 -FEP_CHEMBL3402757-6-5_CHEMBL3402758-10 -39.28 0.34 0 -FEP_CHEMBL3402756-2-7_CHEMBL3402743-42 -5.79 1.05 0 -FEP_CHEMBL3402750-400_CHEMBL3402751-2100 -17.71 0.07 0 -FEP_CHEMBL3402744-300_CHEMBL3402755-4200 81.20 0.10 0 -FEP_CHEMBL3402742-23_CHEMBL3402764-90 11.77 0.17 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 47b67e89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,47 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056 9.85 0.60 1.91 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 14.87 0.35 1.10 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410 178.76 1.11 3.51 2 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -53.49 0.68 2.14 2 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 -3.39 0.94 2.98 3 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 74.37 0.62 1.95 3 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 1.99 0.31 0.97 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 -4.63 0.20 0.63 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -9.56 0.20 0.65 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 25.55 0.30 0.95 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 -8.70 0.49 1.55 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -111.26 0.76 2.42 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 -9.31 0.13 0.40 8 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 6.71 0.43 1.36 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 138.90 1.99 6.29 7 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 63.14 0.77 2.44 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 7.04 0.39 1.24 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666 -40.67 0.26 0.83 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -18.79 0.57 1.79 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678 -108.12 0.88 2.79 8 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 9.62 0.48 1.52 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 20.83 0.37 1.18 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -24.34 0.25 0.79 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 -48.23 1.00 3.16 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -8.34 0.20 0.63 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -2.15 0.23 0.72 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -1.21 0.61 1.94 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 29.07 0.43 1.36 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 -0.13 0.56 1.78 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 -74.62 0.34 1.07 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248 10.93 1.21 3.81 5 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666 1.42 0.45 1.44 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 43.51 0.33 1.06 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 -1.34 0.32 1.02 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 -10.37 0.55 1.75 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 27.34 0.59 1.86 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 19.87 0.64 2.03 8 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -8.47 0.25 0.78 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -103.39 1.33 4.21 2 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 87.85 0.14 0.43 8 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666 100.79 0.91 2.87 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248 59.06 1.02 3.22 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248 8.87 0.67 2.13 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677 -123.45 0.40 1.27 1 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677 -148.39 0.85 2.69 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677 -46.31 0.52 1.65 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index df21ce5a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,47 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1089056 11.98 0.25 0.80 1 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 16.28 0.10 0.32 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1086410 176.85 0.87 2.75 1 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -53.58 0.69 2.19 1 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1093087 -8.51 0.88 2.78 1 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1093088 72.46 0.58 1.83 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 2.59 0.27 0.84 0 -FEP_CHEMBL1096002_CHEMBL1082248 -4.86 0.26 0.83 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -9.39 0.15 0.48 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 24.92 0.19 0.60 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1096003 -7.91 0.36 1.13 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -111.08 0.35 1.09 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1085666 -12.10 0.82 2.60 5 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 7.46 0.20 0.63 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1085666 137.12 0.64 2.03 4 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 60.35 0.37 1.18 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 7.48 0.17 0.55 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1085666 -40.88 0.11 0.34 0 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1078691 -18.58 0.12 0.38 0 -FEP_CHEMBL1084431_CHEMBL1084678 -107.00 1.41 4.44 4 -FEP_CHEMBL1078774_CHEMBL1089056 9.22 0.14 0.43 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 18.52 0.13 0.40 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -25.15 0.21 0.67 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082249 -44.45 0.74 2.36 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -8.78 0.24 0.75 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -0.09 0.18 0.58 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -2.70 0.13 0.41 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1089056 27.48 0.11 0.35 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 -1.82 0.09 0.28 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084677 -74.95 0.31 0.99 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1082248 11.24 0.62 1.95 4 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1085666 -0.34 0.47 1.50 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 41.29 0.16 0.50 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 -0.63 0.10 0.33 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1086410 -11.33 0.29 0.92 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 25.34 0.14 0.46 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1085666 14.22 1.15 3.65 5 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -8.87 0.08 0.25 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -102.09 0.52 1.63 1 -FEP_CHEMBL1085895_CHEMBL1089056 80.64 1.05 3.31 7 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084677 -46.60 0.65 2.05 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084677 -121.56 0.44 1.38 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1082248 9.84 0.20 0.64 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1085666 98.64 0.74 2.34 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1082248 53.93 0.64 2.01 0 -FEP_CHEMBL1084676_CHEMBL1084677 -146.70 0.33 1.06 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 80f9b0b7..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,47 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1084143 10.93 0.65 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1078774 18.98 0.53 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -25.48 0.20 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1085895 -90.39 0.72 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078774 -10.33 0.51 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1084935 13.90 0.73 0 -FEP_CHEMBL1082248_CHEMBL1082249 -55.05 1.02 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084678 -99.90 0.76 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1085692 46.71 0.75 1 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 2.78 0.47 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1084143 75.62 0.25 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -9.17 0.17 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078691 -28.51 0.50 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 6.13 0.27 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 6.83 0.25 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1093087 0.55 0.81 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 26.59 0.48 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1077204 -23.32 0.22 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -111.92 0.78 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1093088 -9.46 0.80 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084431 3.59 1.43 4 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084431 2.66 0.81 0 -FEP_CHEMBL1082248_CHEMBL1085692 -5.54 0.63 2 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -103.62 1.73 2 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -9.06 0.21 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084676 1.30 0.51 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 0.88 0.45 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 19.32 0.35 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 -1.14 0.27 0 -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1085895 -75.72 0.26 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -52.96 1.07 2 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 25.32 0.55 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 14.75 0.40 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -0.50 0.45 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -8.13 0.33 0 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -1.99 0.19 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 42.34 0.45 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 61.34 0.76 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084677 -142.80 0.82 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084431 103.29 0.59 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1089393 8.27 0.43 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084431 112.29 1.25 5 -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1096002 127.66 0.43 1 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1077204 -54.25 0.51 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084676 73.47 0.70 0 -FEP_CHEMBL1077227_CHEMBL1083836 10.07 0.48 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index f763a824..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/eg5/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,48 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1096002 59.56 0.43 0 -FEP_CHEMBL1082248_CHEMBL1082249 -55.59 0.34 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1084935 11.94 0.37 0 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086409 25.43 0.10 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078998 -9.51 0.10 0 -FEP_CHEMBL1077204_CHEMBL1084676 24.36 0.31 0 -FEP_CHEMBL1082248_CHEMBL1085692 -9.65 1.09 3 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084678 -100.42 0.81 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084676 1.35 0.22 0 -FEP_CHEMBL1083836_CHEMBL1082248 7.38 0.09 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084678 -99.34 0.60 1 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1084115 -8.71 0.08 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1088740 -1.41 0.09 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1093088 -9.87 0.36 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078774 -8.94 0.20 0 -FEP_CHEMBL1084677_CHEMBL1084143 74.39 0.26 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1086410 14.09 0.09 0 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1085666 -25.74 0.12 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1083836 2.68 0.10 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084677 -137.58 0.84 4 -FEP_CHEMBL1083517_CHEMBL1086410 39.58 0.09 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1077204 -23.10 0.26 0 -FEP_CHEMBL1082248_CHEMBL1096002 nan nan 10 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1096003 -110.98 0.29 0 -FEP_CHEMBL1082249_CHEMBL1085692 45.14 0.36 1 -FEP_CHEMBL1086409_CHEMBL1077227 5.50 0.18 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1084431 5.18 0.54 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1078774 18.47 0.14 0 -FEP_CHEMBL1086410_CHEMBL1077227 -8.54 0.15 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1078691 -27.11 0.07 0 -FEP_CHEMBL1078691_CHEMBL1084115 18.13 0.08 0 -FEP_CHEMBL1093088_CHEMBL1085895 -72.66 0.58 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1089393 -2.30 0.14 0 -FEP_CHEMBL1085666_CHEMBL1093087 -1.15 0.44 0 -FEP_CHEMBL1093087_CHEMBL1084431 7.41 0.86 4 -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1084143 8.19 0.24 0 -FEP_CHEMBL1084935_CHEMBL1085666 -51.94 0.86 2 -FEP_CHEMBL1088740_CHEMBL1089393 -0.83 0.08 0 -FEP_CHEMBL1084115_CHEMBL1078998 -0.81 0.14 0 -FEP_CHEMBL1089056_CHEMBL1085895 -88.42 0.12 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084431 104.17 0.92 0 -FEP_CHEMBL1078998_CHEMBL1089393 7.31 0.10 0 -FEP_CHEMBL1084143_CHEMBL1084676 72.59 0.44 0 -FEP_CHEMBL1085692_CHEMBL1077204 -54.23 0.41 0 -FEP_CHEMBL1077227_CHEMBL1083836 11.27 0.07 0 -FEP_CHEMBL1084678_CHEMBL1084431 114.42 1.30 7 -FEP_CHEMBL1096003_CHEMBL1096002 126.54 0.47 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 5aa2ce99..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,78 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_163_234 6.40 0.13 0.41 0 -FEP_167_234 -47.75 0.21 0.67 0 -FEP_1_84 -23.37 0.55 1.74 0 -FEP_237_163 -103.21 0.30 0.95 0 -FEP_7b_1 -6.02 0.40 1.28 0 -FEP_42_41 -2.84 0.22 0.70 0 -FEP_15_252 -186.67 0.53 1.69 0 -FEP_155_61 -56.54 0.37 1.18 0 -FEP_23_1 0.92 0.13 0.42 0 -FEP_289_231 6.79 0.17 0.53 0 -FEP_290_235 -6.35 0.26 0.81 0 -FEP_290_165 -140.41 0.49 1.54 0 -FEP_163_252 -98.63 0.40 1.28 0 -FEP_266_224 -2.84 0.35 1.12 0 -FEP_290_164 -135.30 0.37 1.18 0 -FEP_35_50 -113.85 0.20 0.64 1 -FEP_252_336 -9.43 0.22 0.70 0 -FEP_7a_41 18.00 0.25 0.79 0 -FEP_7b_41 9.49 0.41 1.30 0 -FEP_227_231 -147.11 0.41 1.30 0 -FEP_84_41 38.31 0.44 1.38 0 -FEP_256_67 154.02 0.22 0.68 0 -FEP_155_30 -19.79 0.47 1.48 0 -FEP_215_252 -121.62 0.35 1.10 0 -FEP_254_251 -10.27 0.42 1.31 0 -FEP_15_163 -88.57 0.27 0.86 0 -FEP_1_61 -47.31 0.26 0.83 0 -FEP_124_41 -26.78 0.34 1.06 0 -FEP_251_256 -55.61 0.58 1.85 0 -FEP_235_224 2.92 0.23 0.74 0 -FEP_289_336 -89.88 0.20 0.62 0 -FEP_156_1 -26.61 0.11 0.35 7 -FEP_155_23 -10.39 0.15 0.47 0 -FEP_156_31 -17.27 0.23 0.73 4 -FEP_57_155 -48.17 0.23 0.72 0 -FEP_237_252 -201.65 0.59 1.88 0 -FEP_290_252 -255.17 0.32 1.01 0 -FEP_163_164 19.16 0.35 1.11 0 -FEP_7a_1 3.06 0.22 0.70 0 -FEP_43_31 -28.09 0.16 0.52 0 -FEP_235_167 -95.93 0.18 0.58 0 -FEP_41_54 -115.76 0.37 1.16 2 -FEP_252_67 143.47 0.40 1.25 0 -FEP_215_167 30.68 0.19 0.61 0 -FEP_237_25 17.06 0.54 1.71 0 -FEP_42_35 -9.93 0.19 0.60 0 -FEP_338_336 -16.87 0.17 0.55 0 -FEP_155_1 -9.24 0.19 0.59 0 -FEP_124_54 -142.43 0.45 1.43 0 -FEP_254_163 41.51 0.48 1.53 0 -FEP_15_25 31.53 0.21 0.66 0 -FEP_35_41 6.28 0.12 0.39 0 -FEP_252_256 -11.28 0.37 1.17 0 -FEP_252_155 178.26 0.59 1.87 0 -FEP_227_57 -6.87 0.07 0.21 0 -FEP_237_155 -23.75 0.33 1.05 0 -FEP_42_43 20.11 0.17 0.53 0 -FEP_206_163 -24.61 0.40 1.26 0 -FEP_30_42 28.75 0.29 0.91 0 -FEP_54_50 -4.68 0.29 0.92 0 -FEP_163_165 15.54 0.24 0.76 0 -FEP_215_206 0.58 0.25 0.79 0 -FEP_338_252 -7.73 0.30 0.96 0 -FEP_290_57 -28.80 0.28 0.89 0 -FEP_155_156 18.89 0.18 0.58 0 -FEP_266_235 -4.47 0.26 0.82 0 -FEP_290_227 -21.66 0.25 0.79 0 -FEP_237_215 -80.20 0.31 0.98 0 -FEP_206_252 -123.62 0.44 1.39 0 -FEP_237_164 -81.73 0.42 1.33 0 -FEP_254_252 -56.99 0.54 1.70 0 -FEP_163_231 -11.63 0.15 0.47 0 -FEP_155_42 8.63 0.24 0.77 0 -FEP_252_164 118.07 0.27 0.84 0 -FEP_164_231 -32.35 0.30 0.96 0 -FEP_237_235 46.74 0.28 0.90 0 -FEP_35_54 -109.42 0.58 1.83 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index edf815c4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,82 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_54_50 -7.57 0.14 0.43 0 -FEP_7a_1 4.82 0.12 0.37 0 -FEP_42_43 21.04 0.24 0.76 0 -FEP_156_31 -19.55 0.21 0.66 0 -FEP_290_235 -8.52 0.14 0.45 0 -FEP_1_84 -26.89 0.26 0.82 0 -FEP_35_41 4.01 0.16 0.51 0 -FEP_237_155 -21.37 0.32 1.00 0 -FEP_338_336 -17.16 0.14 0.44 0 -FEP_163_164 17.43 0.12 0.37 3 -FEP_266_224 -9.34 0.41 1.30 1 -FEP_256_67 158.25 0.20 0.62 0 -FEP_163_165 15.29 0.13 0.40 0 -FEP_155_156 19.05 0.18 0.58 0 -FEP_235_167 -97.59 0.22 0.70 0 -FEP_7b_1 0.63 0.14 0.46 0 -FEP_290_164 -144.35 0.11 0.33 0 -FEP_266_235 -5.61 0.17 0.54 0 -FEP_254_251 -8.90 0.20 0.63 0 -FEP_235_224 -3.35 0.24 0.75 0 -FEP_30_42 28.06 0.23 0.74 0 -FEP_155_30 -20.50 0.21 0.65 0 -FEP_252_155 178.44 0.14 0.43 0 -FEP_252_336 -9.06 0.07 0.23 0 -FEP_289_336 -89.33 0.18 0.57 0 -FEP_155_1 -9.30 0.14 0.44 0 -FEP_252_256 -11.90 0.13 0.40 0 -FEP_42_35 -7.76 0.13 0.42 0 -FEP_124_54 -144.03 0.17 0.52 0 -FEP_155_61 -58.87 0.16 0.50 0 -FEP_163_234 6.00 0.26 0.83 0 -FEP_15_25 30.99 0.20 0.63 0 -FEP_167_234 -49.24 0.15 0.47 0 -FEP_254_163 43.60 0.23 0.71 1 -FEP_7b_41 13.99 0.24 0.75 0 -FEP_163_252 -97.72 0.17 0.54 0 -FEP_206_163 -23.78 0.13 0.40 0 -FEP_7a_41 18.26 0.11 0.34 0 -FEP_1_61 -49.36 0.10 0.32 0 -FEP_237_163 -102.42 0.19 0.60 0 -FEP_215_206 -1.42 0.15 0.49 0 -FEP_338_252 -8.40 0.10 0.33 0 -FEP_23_1 3.66 0.15 0.48 0 -FEP_155_23 -12.66 0.12 0.38 0 -FEP_156_1 -28.25 0.16 0.50 0 -FEP_215_167 30.69 0.18 0.56 0 -FEP_215_252 -122.05 0.12 0.38 0 -FEP_42_41 -3.74 0.12 0.37 0 -FEP_290_57 -30.61 0.11 0.36 0 -FEP_251_256 -56.84 0.24 0.75 0 -FEP_84_41 40.32 0.12 0.37 0 -FEP_227_231 -151.40 0.09 0.29 0 -FEP_15_252 -188.55 0.20 0.62 0 -FEP_124_41 -28.35 0.18 0.57 0 -FEP_41_54 -116.29 0.14 0.44 0 -FEP_35_50 -119.50 0.10 0.31 0 -FEP_43_31 -29.10 0.23 0.72 0 -FEP_289_231 6.01 0.12 0.37 0 -FEP_290_165 -146.55 0.13 0.40 0 -FEP_57_155 -50.20 0.11 0.36 0 -FEP_227_57 -7.72 0.09 0.27 0 -FEP_15_163 -91.78 0.13 0.43 0 -FEP_252_67 146.30 0.25 0.78 1 -FEP_237_252 -199.44 0.28 0.87 0 -FEP_290_252 -258.66 0.17 0.54 0 -FEP_237_25 20.77 0.25 0.80 0 -FEP_290_227 -22.46 0.14 0.45 0 -FEP_237_215 -77.28 0.10 0.33 0 -FEP_35_54 -112.27 0.16 0.51 0 -FEP_163_54 -30.67 0.29 0.91 0 -FEP_237_235 50.49 0.25 0.78 0 -FEP_155_42 7.85 0.15 0.47 0 -FEP_237_164 -85.24 0.15 0.49 0 -FEP_35_54 -112.02 0.19 0.61 0 -FEP_164_231 -28.46 0.15 0.46 1 -FEP_163_231 -11.51 0.16 0.49 0 -FEP_155_42 7.96 0.14 0.43 0 -FEP_206_252 -120.49 0.26 0.83 0 -FEP_254_252 -54.24 0.33 1.05 0 -FEP_237_235 50.36 0.26 0.81 0 -FEP_252_164 115.04 0.20 0.64 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index d438cf09..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,67 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_237_25 16.74 0.50 0 -FEP_235_224 3.70 0.27 0 -FEP_251_256 -56.25 0.34 0 -FEP_252_67 142.02 0.53 0 -FEP_1_7b 5.56 0.44 0 -FEP_163_254 -42.03 0.38 0 -FEP_252_15 186.57 0.38 0 -FEP_54_124 143.85 0.32 0 -FEP_336_338 17.59 0.17 0 -FEP_1_84 -22.86 0.50 0 -FEP_155_156 18.38 0.13 0 -FEP_42_41 -2.91 0.20 0 -FEP_227_231 -147.75 0.52 0 -FEP_252_237 201.66 0.88 0 -FEP_1_61 -47.25 0.23 0 -FEP_206_163 -24.43 0.37 0 -FEP_234_167 47.09 0.11 0 -FEP_155_1 -9.73 0.30 0 -FEP_156_1 -27.68 0.28 0 -FEP_15_25 31.33 0.64 0 -FEP_30_42 27.28 0.25 0 -FEP_163_165 16.42 0.11 0 -FEP_235_266 4.18 0.28 0 -FEP_57_227 6.82 0.15 0 -FEP_163_15 87.99 0.16 0 -FEP_215_206 0.30 0.18 0 -FEP_215_167 30.65 0.13 0 -FEP_41_35 -6.58 0.19 0 -FEP_155_23 -10.36 0.16 0 -FEP_252_235 246.73 0.81 0 -FEP_163_252 -98.97 0.49 0 -FEP_290_235 -6.95 0.19 0 -FEP_42_43 20.41 0.24 0 -FEP_163_234 6.65 0.17 0 -FEP_41_84 -37.50 0.53 0 -FEP_155_57 47.60 0.21 0 -FEP_231_289 -6.71 0.19 0 -FEP_41_124 27.70 0.32 0 -FEP_41_54 -116.64 0.72 0 -FEP_289_336 -90.43 0.34 0 -FEP_35_50 -113.69 0.28 0 -FEP_290_164 -135.04 0.41 0 -FEP_165_290 140.44 0.20 0 -FEP_156_31 -17.55 0.42 0 -FEP_1_7a -2.82 0.28 0 -FEP_163_164 19.57 0.39 0 -FEP_163_289 -18.55 0.24 0 -FEP_7b_41 9.10 0.35 0 -FEP_252_338 7.97 0.33 0 -FEP_254_251 nan nan 10 -FEP_43_31 -27.22 0.12 0 -FEP_57_61 -105.02 0.34 0 -FEP_224_266 3.15 0.67 0 -FEP_155_30 -19.07 0.36 0 -FEP_256_67 153.77 0.39 0 -FEP_252_256 -11.60 0.89 0 -FEP_1_23 -1.20 0.12 0 -FEP_237_155 -24.59 0.37 0 -FEP_215_252 -121.13 0.46 0 -FEP_54_50 -3.70 0.25 0 -FEP_7a_41 17.76 0.37 0 -FEP_237_163 -103.96 0.28 0 -FEP_61_155 56.49 0.29 1 -FEP_57_290 29.62 0.17 0 -FEP_235_167 -96.21 0.49 0 -FEP_35_42 9.40 0.17 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 7a6af3a2..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/hif2a/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,67 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_227_231 -150.09 0.24 0 -FEP_57_61 -108.98 0.12 0 -FEP_252_15 189.65 0.21 0 -FEP_163_289 -17.60 0.17 0 -FEP_237_25 20.34 0.64 0 -FEP_1_7b -1.36 0.18 0 -FEP_42_41 -3.87 0.10 0 -FEP_163_165 15.07 0.16 0 -FEP_290_164 -143.93 0.31 0 -FEP_252_67 146.68 0.45 0 -FEP_163_252 -98.60 0.16 0 -FEP_155_30 -20.72 0.26 0 -FEP_231_289 -5.74 0.14 0 -FEP_251_256 -57.41 0.16 0 -FEP_1_84 -27.26 0.16 0 -FEP_156_31 -19.65 0.28 0 -FEP_35_50 -119.16 0.09 0 -FEP_252_338 8.10 0.12 0 -FEP_1_23 -3.73 0.33 0 -FEP_254_251 nan nan 10 -FEP_235_266 5.82 0.25 0 -FEP_156_1 -28.73 0.22 0 -FEP_234_167 48.39 0.17 0 -FEP_224_266 8.09 0.23 0 -FEP_215_167 30.47 0.28 0 -FEP_43_31 -28.42 0.28 0 -FEP_290_235 -9.20 0.30 0 -FEP_163_15 90.94 0.17 0 -FEP_41_35 -4.03 0.15 0 -FEP_42_43 21.17 0.21 0 -FEP_155_156 19.04 0.23 0 -FEP_163_164 17.33 0.22 0 -FEP_57_227 7.81 0.22 0 -FEP_289_336 -90.00 0.17 0 -FEP_155_57 49.83 0.23 0 -FEP_15_25 30.61 0.20 0 -FEP_163_254 -44.47 0.24 0 -FEP_252_235 251.05 0.24 0 -FEP_30_42 27.51 0.21 0 -FEP_1_7a -5.15 0.14 0 -FEP_252_237 199.46 0.32 0 -FEP_237_155 -20.25 0.17 0 -FEP_54_124 144.95 0.09 0 -FEP_163_234 6.19 0.27 0 -FEP_155_23 -13.21 0.13 0 -FEP_41_54 -116.49 0.11 0 -FEP_256_67 158.73 0.32 0 -FEP_54_50 -6.59 0.16 0 -FEP_252_256 -12.45 0.28 0 -FEP_206_163 -22.93 0.15 0 -FEP_215_206 -1.19 0.20 0 -FEP_7a_41 17.41 0.12 0 -FEP_41_124 29.14 0.17 0 -FEP_235_224 -2.82 0.30 0 -FEP_41_84 -39.90 0.27 0 -FEP_7b_41 13.31 0.25 0 -FEP_165_290 145.53 0.20 0 -FEP_215_252 -122.66 0.14 0 -FEP_155_1 -9.46 0.33 0 -FEP_336_338 17.41 0.13 0 -FEP_1_61 -49.48 0.16 0 -FEP_237_163 -101.34 0.29 0 -FEP_61_155 58.86 0.22 0 -FEP_57_290 30.71 0.15 0 -FEP_235_167 -97.43 0.33 0 -FEP_35_42 7.71 0.23 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 990e2526..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,68 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_37_34 -7.61 0.75 2.37 5 -FEP_46_44 -16.88 0.20 0.64 0 -FEP_69_65 1.50 0.13 0.41 0 -FEP_35_33 62.38 0.15 0.48 0 -FEP_29_19 110.22 0.48 1.52 0 -FEP_43_39 -30.20 0.24 0.76 0 -FEP_63_62 4.36 0.23 0.74 0 -FEP_52_35 -3.89 0.22 0.71 0 -FEP_56_35 2.90 0.23 0.73 0 -FEP_48_20 -4.36 0.14 0.44 3 -FEP_33_24 -22.56 0.42 1.34 0 -FEP_59_58 -15.61 0.24 0.76 0 -FEP_41_43 -0.17 0.24 0.75 0 -FEP_53_35 -9.32 0.26 0.81 0 -FEP_24_19 -1.88 0.27 0.86 0 -FEP_36_35 -30.66 0.33 1.06 0 -FEP_60_58 -3.80 0.54 1.69 0 -FEP_57_35 -7.17 0.20 0.65 0 -FEP_49_44 32.94 0.25 0.78 0 -FEP_35_34 11.04 0.32 1.02 0 -FEP_33_31 -20.24 0.15 0.49 0 -FEP_67_65 63.44 0.18 0.56 0 -FEP_41_20 -5.47 0.36 1.14 0 -FEP_59_62 -10.06 0.53 1.67 0 -FEP_70_62 5.29 0.22 0.69 0 -FEP_47_49 -37.82 0.31 0.97 0 -FEP_46_49 -51.45 0.32 1.01 0 -FEP_34_26 -37.17 0.31 0.99 0 -FEP_65_63 -2.43 0.17 0.55 0 -FEP_48_49 -29.87 0.35 1.10 0 -FEP_30_19 -27.53 0.77 2.44 1 -FEP_19_23 24.48 0.35 1.11 0 -FEP_65_64 -2.07 0.14 0.45 0 -FEP_31_23 18.64 0.19 0.59 0 -FEP_29_26 46.03 0.24 0.76 0 -FEP_47_44 -4.51 0.29 0.93 0 -FEP_37_35 -21.38 0.73 2.31 6 -FEP_67_68 42.60 0.28 0.88 0 -FEP_56_55 3.02 0.18 0.56 0 -FEP_36_29 -104.04 0.63 2.00 0 -FEP_35_29 -72.88 0.39 1.24 0 -FEP_31_30 21.73 0.45 1.43 0 -FEP_68_49 -5.44 0.28 0.88 0 -FEP_49_39 0.91 0.27 0.84 0 -FEP_44_43 -1.32 0.28 0.88 0 -FEP_54_57 0.71 0.22 0.69 0 -FEP_54_35 -7.22 0.38 1.20 0 -FEP_67_49 37.69 0.29 0.90 0 -FEP_38_43 6.24 0.45 1.44 0 -FEP_62_49 -28.25 0.15 0.47 0 -FEP_42_43 -0.68 0.35 1.12 0 -FEP_60_59 11.95 0.46 1.45 0 -FEP_35_49 -21.62 0.55 1.75 0 -FEP_69_70 -2.21 0.13 0.42 0 -FEP_64_63 -1.03 0.15 0.47 0 -FEP_38_39 -23.74 0.35 1.11 0 -FEP_55_35 0.40 0.20 0.64 0 -FEP_53_52 -4.06 0.45 1.43 0 -FEP_42_39 -31.55 0.41 1.30 0 -FEP_35_62 7.30 0.38 1.20 0 -FEP_68_65 21.42 0.24 0.77 1 -FEP_62_44 5.16 0.10 0.33 3 -FEP_62_58 -4.61 0.04 0.14 0 -FEP_62_33 55.26 0.29 0.91 0 -FEP_24_30 25.26 1.07 3.38 1 -FEP_35_63 2.12 0.22 0.70 0 -FEP_35_31 42.89 0.44 1.38 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index a6d5986b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,68 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_35_33 61.17 0.16 0.49 0 -FEP_57_35 -7.86 0.18 0.57 1 -FEP_54_35 -3.91 0.19 0.60 0 -FEP_41_43 0.36 0.20 0.64 1 -FEP_31_23 16.62 0.19 0.59 0 -FEP_59_62 -7.80 0.16 0.50 0 -FEP_52_35 -2.19 0.22 0.69 0 -FEP_56_55 4.23 0.17 0.52 0 -FEP_48_20 -0.92 0.19 0.62 0 -FEP_37_35 -24.59 1.39 4.41 7 -FEP_42_43 2.30 0.17 0.53 0 -FEP_67_49 33.26 0.25 0.78 3 -FEP_37_34 -13.41 0.82 2.60 4 -FEP_24_19 -2.87 0.20 0.63 0 -FEP_19_23 27.43 0.26 0.81 0 -FEP_29_26 45.57 0.17 0.55 0 -FEP_60_59 10.82 0.34 1.07 3 -FEP_30_19 -28.24 0.62 1.96 0 -FEP_41_20 -5.85 0.26 0.81 0 -FEP_69_70 -1.57 0.10 0.31 0 -FEP_55_35 -1.62 0.14 0.44 0 -FEP_54_57 4.14 0.17 0.53 0 -FEP_35_29 -75.87 0.24 0.76 0 -FEP_34_26 -41.16 0.16 0.51 0 -FEP_46_49 -47.90 0.11 0.35 0 -FEP_70_62 4.16 0.16 0.50 0 -FEP_65_64 -2.80 0.15 0.46 5 -FEP_68_49 -9.70 0.14 0.44 2 -FEP_53_35 -4.02 0.28 0.87 0 -FEP_29_19 107.80 0.31 1.00 0 -FEP_63_62 4.79 0.12 0.39 1 -FEP_64_63 0.44 0.07 0.22 3 -FEP_49_39 2.03 0.13 0.43 0 -FEP_67_68 42.83 0.10 0.32 1 -FEP_38_43 7.68 0.19 0.61 0 -FEP_47_44 -0.57 0.12 0.37 0 -FEP_53_52 -1.76 0.13 0.41 1 -FEP_59_58 -12.48 0.11 0.36 0 -FEP_43_39 -33.50 0.15 0.47 1 -FEP_36_29 -104.16 0.15 0.47 0 -FEP_48_49 -30.00 0.07 0.23 1 -FEP_65_63 -2.12 0.15 0.47 1 -FEP_36_35 -27.76 0.17 0.52 0 -FEP_67_65 61.25 0.11 0.36 0 -FEP_60_58 -2.25 0.46 1.46 1 -FEP_42_39 -31.48 0.18 0.56 0 -FEP_33_31 -18.51 0.20 0.65 0 -FEP_35_34 11.39 0.23 0.74 0 -FEP_69_65 0.00 0.09 0.28 5 -FEP_62_49 -30.66 0.14 0.44 5 -FEP_56_35 3.02 0.25 0.78 0 -FEP_47_49 -35.54 0.12 0.38 0 -FEP_44_43 0.62 0.14 0.46 0 -FEP_49_44 35.02 0.12 0.39 0 -FEP_46_44 -13.16 0.13 0.40 0 -FEP_38_39 -25.31 0.15 0.46 0 -FEP_31_30 16.38 0.60 1.89 0 -FEP_35_49 -24.71 0.20 0.64 0 -FEP_33_24 -26.63 0.11 0.34 0 -FEP_62_44 4.00 0.13 0.41 4 -FEP_35_62 6.33 0.18 0.57 3 -FEP_62_58 -4.71 0.09 0.28 3 -FEP_24_30 23.42 0.91 2.87 4 -FEP_62_33 55.20 0.14 0.45 1 -FEP_68_65 18.33 0.10 0.31 1 -FEP_35_31 42.30 0.38 1.19 0 -FEP_35_63 1.39 0.09 0.27 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index 2471a8cc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/no-vs/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,4 +0,0 @@ -FEP_53-52 protein/ -FEP_33-31 protein/ -FEP_53-52 water/ -FEP_33-31 water/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index b32fa33e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,76 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_49_39 1.41 0.32 0 -FEP_19_23 24.91 0.31 0 -FEP_49_47 39.49 0.34 0 -FEP_58_60 2.95 0.56 0 -FEP_59_60 -12.18 0.60 0 -FEP_35_36 31.18 0.47 0 -FEP_67_65 63.33 0.17 0 -FEP_35_29 -72.55 0.17 0 -FEP_62_70 -4.67 0.30 0 -FEP_56_55 2.51 0.17 0 -FEP_65_63 -2.80 0.12 0 -FEP_35_56 -2.64 0.24 0 -FEP_49_44 33.18 0.18 0 -FEP_49_46 50.72 0.26 0 -FEP_64_63 -0.78 0.21 0 -FEP_54_57 0.52 0.32 0 -FEP_62_59 10.69 0.24 0 -FEP_67_68 43.22 0.35 0 -FEP_43_39 -30.77 0.16 0 -FEP_34_26 -38.23 0.43 0 -FEP_44_47 5.34 0.29 0 -FEP_35_37 15.48 0.34 0 -FEP_35_33 60.80 0.56 0 -FEP_49_67 -36.83 0.36 0 -FEP_35_57 7.88 0.16 0 -FEP_31_23 18.47 0.22 0 -FEP_44_46 17.82 0.25 0 -FEP_63_62 4.40 0.18 0 -FEP_49_68 4.78 0.31 0 -FEP_35_55 -0.22 0.13 0 -FEP_33_24 -23.63 0.34 0 -FEP_35_49 -22.16 0.51 0 -FEP_39_38 23.59 0.33 0 -FEP_49_62 28.66 0.23 0 -FEP_59_58 -15.84 0.22 0 -FEP_29_19 109.91 0.38 0 -FEP_39_42 31.50 0.35 0 -FEP_49_48 30.50 0.48 0 -FEP_44_43 -2.30 0.32 0 -FEP_52_35 -3.78 0.18 0 -FEP_34_37 11.63 1.17 4 -FEP_44_62 -4.96 0.17 0 -FEP_43_41 1.65 0.90 0 -FEP_31_30 19.53 0.33 0 -FEP_19_30 28.30 0.98 1 -FEP_43_38 -5.99 0.20 0 -FEP_48_20 -2.73 0.44 8 -FEP_29_26 45.52 0.38 0 -FEP_65_69 -0.87 0.30 0 -FEP_65_64 -1.77 0.22 0 -FEP_24_19 -2.89 0.34 0 -FEP_53_35 -8.55 0.57 0 -FEP_35_54 7.07 0.26 0 -FEP_69_70 -2.32 0.15 0 -FEP_35_34 10.73 0.35 0 -FEP_20_41 4.97 0.29 0 -FEP_43_42 1.87 0.23 0 -FEP_29_36 104.97 0.73 0 -FEP_65_35 -5.18 0.18 0 -FEP_60_44 5.41 0.71 2 -FEP_52_53 5.25 0.39 0 -FEP_31_33 20.50 0.26 0 -EP_35_37 22.16 1.14 7 -FEP_29_36 105.45 0.38 0 -FEP_35_36 30.61 0.74 0 -FEP_34_37 9.99 0.93 4 -FEP_29_19 108.70 0.88 0 -FEP_35_29 -72.86 0.46 0 -FEP_29_26 45.64 0.29 0 -FEP_19_30 27.40 0.66 1 -FEP_31_33 20.15 0.27 0 -FEP_35_34 10.39 0.23 0 -FEP_31_30 20.85 1.03 0 -FEP_34_26 -38.03 0.47 0 -FEP_35_33 62.24 0.30 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index f2940ccd..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/pfkfb3/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,63 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_49_39 2.10 0.09 0 -FEP_19_23 27.41 0.15 0 -FEP_49_47 35.52 0.12 0 -FEP_58_60 1.84 0.45 0 -FEP_59_60 -10.33 0.32 0 -FEP_35_36 27.81 0.21 0 -FEP_67_65 61.41 0.11 0 -FEP_35_29 -75.97 0.12 0 -FEP_62_70 -3.85 0.27 0 -FEP_56_55 4.32 0.11 0 -FEP_65_63 -2.01 0.04 0 -FEP_35_56 -2.98 0.13 0 -FEP_49_44 34.93 0.10 0 -FEP_49_46 47.94 0.09 0 -FEP_64_63 0.64 0.09 0 -FEP_54_57 4.14 0.17 0 -FEP_62_59 7.91 0.15 0 -FEP_67_68 43.16 0.12 0 -FEP_43_39 -33.11 0.09 0 -FEP_34_26 -41.36 0.10 0 -FEP_44_47 0.50 0.10 0 -FEP_35_37 17.27 0.16 0 -FEP_35_33 61.17 0.23 0 -FEP_49_67 -33.03 0.12 0 -FEP_35_57 7.11 0.09 0 -FEP_31_23 16.29 0.27 0 -FEP_44_46 13.12 0.12 0 -FEP_63_62 5.09 0.15 0 -FEP_49_68 10.42 0.25 0 -FEP_35_55 1.55 0.12 0 -FEP_33_24 -26.46 0.06 0 -FEP_35_49 -25.03 0.08 0 -FEP_39_38 25.75 0.19 0 -FEP_49_62 31.02 0.08 0 -FEP_59_58 -12.64 0.16 0 -FEP_29_19 107.06 0.35 0 -FEP_39_42 31.47 0.18 0 -FEP_49_48 30.42 0.09 0 -FEP_44_43 0.32 0.10 0 -FEP_52_35 -1.33 0.14 0 -FEP_34_37 12.64 1.24 1 -FEP_44_62 -4.00 0.08 0 -FEP_43_41 -0.11 0.28 0 -FEP_31_30 17.94 0.81 0 -FEP_19_30 27.99 0.48 0 -FEP_43_38 -7.78 0.16 0 -FEP_48_20 -1.03 0.19 0 -FEP_29_26 45.65 0.25 0 -FEP_65_69 0.44 0.18 0 -FEP_65_64 -2.72 0.10 0 -FEP_24_19 -2.92 0.11 0 -FEP_53_35 -2.37 0.16 0 -FEP_35_54 3.09 0.14 0 -FEP_69_70 -1.65 0.10 0 -FEP_35_34 11.12 0.10 0 -FEP_20_41 5.98 0.15 0 -FEP_43_42 -2.23 0.13 0 -FEP_29_36 103.72 0.16 0 -FEP_65_35 -3.28 0.09 0 -FEP_60_44 5.50 0.74 0 -FEP_52_53 1.44 0.12 0 -FEP_31_33 18.76 0.11 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 36e23e2d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,43 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_Example-23_Example-22 -4.33 0.20 0.64 0 -FEP_Example-30_Example-1 -198.32 0.21 0.68 0 -FEP_Example-24_Example-22 2.66 0.32 1.02 5 -FEP_Example-6_Example-1 40.52 0.39 1.23 2 -FEP_Example-1_Example-3 -8.50 0.38 1.22 6 -FEP_7_6 -47.99 0.64 2.03 3 -FEP_Example-1_Example-2 4.81 0.21 0.67 6 -FEP_SHP836-2_Example-27 307.75 0.46 1.47 0 -FEP_7_Example-1 -71.86 0.76 2.40 0 -FEP_Example-8_Example-9 -5.15 0.23 0.71 3 -FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7 -50.25 0.36 1.12 0 -FEP_SHP836-2_4 -2.50 0.59 1.86 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29 5.93 0.28 0.89 4 -FEP_Example-8_Example-14 -19.32 0.44 1.38 3 -FEP_Example-5_Example-1 20.23 0.76 2.40 1 -FEP_Example-26_Example-23 42.55 0.65 2.06 0 -FEP_Example-25_Example-24 0.13 0.40 1.27 2 -FEP_Example-2_Example-4 -0.92 0.45 1.42 1 -FEP_Example-26_Example-24 35.03 0.58 1.83 2 -FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7 4.05 0.67 2.12 4 -FEP_Example-3_Example-4 10.64 0.16 0.51 0 -FEP_11_10 18.64 0.18 0.58 3 -FEP_Example-1_6 25.49 0.37 1.19 0 -FEP_Example-28_Example-29 10.67 0.46 1.45 6 -FEP_Example-5_Example-6 -18.60 1.24 3.91 5 -FEP_SHP836-2_3 -7.91 0.30 0.96 0 -FEP_Example-23_Example-24 -7.14 0.25 0.79 4 -FEP_11_SHP099-1-Example-7 -33.31 0.65 2.07 2 -FEP_Example-23_Example-30 -118.65 0.42 1.33 2 -FEP_Example-9_Example-14 -14.06 0.40 1.27 0 -FEP_Example-25_Example-23 7.08 0.28 0.89 1 -FEP_4_3 -5.01 0.27 0.86 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30 -98.99 0.36 1.12 2 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27 92.71 0.69 2.17 3 -FEP_SHP099-1-Example-7_10 51.16 0.19 0.60 0 -FEP_Example-27_Example-14 -64.76 0.59 1.87 0 -FEP_Example-6_Example-2 45.76 0.33 1.03 0 -FEP_Example-24_Example-30 -110.98 0.66 2.08 0 -FEP_SHP836-2_6 -56.30 0.68 2.15 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1 -296.51 0.53 1.67 0 -FEP_Example-8_Example-28 -54.24 0.58 1.84 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14 30.43 0.46 1.46 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 9d723567..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,43 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_Example-1_6 25.16 0.17 0.55 0 -FEP_7_6 -46.06 0.31 0.98 3 -FEP_Example-23_Example-22 -5.49 0.29 0.92 2 -FEP_SHP099-1-Example-7_10 49.73 0.32 1.00 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-30 -97.40 0.19 0.62 0 -FEP_4_3 -6.17 0.05 0.14 4 -FEP_Example-6_Example-1 40.25 0.16 0.50 4 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-27 92.31 0.33 1.04 0 -FEP_Example-28_Example-29 9.66 0.30 0.94 4 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-29 7.46 0.20 0.62 0 -FEP_Example-3_Example-4 11.36 0.27 0.85 0 -FEP_11_10 23.88 0.49 1.54 0 -FEP_Example-25_Example-23 8.45 0.48 1.51 3 -FEP_Example-26_Example-24 35.10 0.87 2.74 3 -FEP_Example-30_Example-1 -201.09 0.22 0.70 1 -FEP_11_SHP099-1-Example-7 -24.74 0.18 0.56 3 -FEP_Example-2_Example-4 -1.76 0.33 1.04 1 -FEP_Example-5_Example-1 22.66 0.34 1.07 0 -FEP_Example-23_Example-30 -115.81 0.41 1.31 4 -FEP_Example-9_Example-14 -13.10 0.32 1.03 2 -FEP_Example-1_Example-3 -9.46 0.34 1.06 1 -FEP_Example-26_Example-23 43.94 0.67 2.11 2 -FEP_Example-28_SHP099-1-Example-7 1.99 0.24 0.76 4 -FEP_Example-5_Example-6 -16.33 0.30 0.95 0 -FEP_Example-8_Example-9 -3.04 0.39 1.24 1 -FEP_Example-8_SHP099-1-Example-7 -53.29 0.58 1.82 2 -FEP_7_Example-1 -71.25 0.24 0.76 1 -FEP_Example-25_Example-24 -0.16 0.21 0.65 1 -FEP_Example-23_Example-24 -10.32 0.38 1.21 2 -FEP_Example-1_Example-2 2.85 0.16 0.50 2 -FEP_Example-24_Example-22 4.91 0.66 2.09 3 -FEP_Example-8_Example-14 -17.29 0.15 0.49 5 -FEP_SHP836-2_3 -6.42 0.12 0.38 0 -FEP_SHP836-2_4 -0.74 0.19 0.60 0 -FEP_SHP836-2_Example-27 310.09 0.22 0.71 0 -FEP_Example-6_Example-2 43.08 0.45 1.43 0 -FEP_SHP836-2_6 -54.91 0.25 0.78 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-1 -298.83 0.23 0.72 0 -FEP_Example-27_Example-14 -56.43 0.36 1.15 0 -FEP_Example-24_Example-30 -106.12 0.27 0.85 0 -FEP_Example-8_Example-28 -55.15 0.40 1.27 0 -FEP_SHP099-1-Example-7_Example-14 35.78 0.39 1.24 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 9fcfbb89..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,40 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP-Example-24_Example-22 3.32 0.35 0 -FEP-Example-28_Example-29 10.01 0.34 0 -FEP-Example-23_Example-26 -41.75 0.49 2 -FEP-Example-6_Example-5 18.28 0.60 0 -FEP-Example-2_Example-6 -45.20 0.52 0 -FEP-Example-8_Example-28 -52.53 0.88 0 -FEP-Example-1_Example-5 -21.73 0.87 0 -FEP-Example-24_Example-26 -36.75 0.37 0 -FEP-11_10 18.30 0.39 0 -FEP-Example-14_Example-8 20.34 0.41 0 -FEP-Example-23_Example-25 -7.30 0.40 0 -FEP-Example-2_Example-4 -2.13 0.32 0 -FEP-Example-1_6 25.43 0.16 0 -FEP-Example-1_Example-6 -39.97 0.28 0 -FEP-Example-30_Example-23 120.08 0.52 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-28 -1.48 0.48 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_11 31.43 0.52 0 -FEP-SHP836-2_Example-27 308.26 0.37 0 -FEP-Example-23_Example-24 -7.32 0.28 0 -FEP-Example-1_Example-2 4.49 0.25 0 -FEP-SHP836-2_3 -7.56 0.23 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_10 50.93 0.34 0 -FEP-Example-3_Example-4 10.93 0.35 0 -FEP-Example-1_Example-3 -8.19 0.34 0 -FEP-Example-23_Example-22 -4.74 0.16 0 -FEP-Example-24_Example-25 0.36 0.53 0 -FEP-Example-8_SHP099-1-Example-7 -51.33 0.38 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-29 6.95 0.44 0 -FEP-3_4 4.71 0.23 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-27 93.60 0.72 0 -FEP-Example-9_Example-14 -15.67 0.82 0 -FEP-SHP836-2_4 -2.34 0.35 0 -FEP-6_7 46.11 0.75 0 -FEP-Example-30_Example-1 -198.52 0.25 0 -FEP-Example-9_Example-8 4.62 0.27 0 -FEP-6_SHP836-2 56.99 0.28 0 -FEP-Example-1_7 71.97 0.33 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-30 -99.79 0.28 0 -FEP_Example-22_SHP099-1-Example-7 -14.77 0.37 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 7731572c..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/shp2/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,40 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP-Example-1_Example-2 2.92 0.25 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-29 7.52 0.18 0 -FEP-Example-28_Example-29 9.29 0.21 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-28 -2.48 0.26 0 -FEP-Example-24_Example-22 4.32 0.37 0 -FEP-Example-1_Example-3 -10.70 0.46 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-27 91.21 0.35 0 -FEP-Example-30_Example-1 -200.37 0.35 0 -FEP-Example-23_Example-24 -8.94 0.40 0 -FEP-Example-23_Example-25 -9.47 0.48 0 -FEP-SHP836-2_4 -1.21 0.25 0 -FEP-11_10 23.14 0.58 0 -FEP-3_4 5.81 0.08 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_Example-30 -98.14 0.26 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_11 24.92 0.63 0 -FEP-Example-2_Example-4 -2.46 0.58 0 -FEP-Example-8_Example-28 -54.06 0.35 0 -FEP-Example-9_Example-8 2.33 0.23 0 -FEP-6_7 45.41 0.28 0 -FEP-Example-2_Example-6 -42.69 0.16 0 -FEP-Example-24_Example-26 -34.73 0.73 3 -FEP-Example-30_Example-23 116.40 0.30 0 -FEP-Example-3_Example-4 10.74 0.06 0 -FEP-Example-1_7 71.40 0.27 0 -FEP-Example-1_6 25.57 0.20 0 -FEP-Example-24_Example-25 -0.45 0.41 0 -FEP-Example-14_Example-8 16.85 0.29 0 -FEP-Example-1_Example-5 -22.98 0.19 0 -FEP-SHP836-2_3 -7.52 0.23 0 -FEP-Example-9_Example-14 -14.32 0.45 0 -FEP-6_SHP836-2 54.57 0.35 0 -FEP-Example-6_Example-5 17.36 0.36 0 -FEP-Example-1_Example-6 -39.97 0.20 0 -FEP-SHP099-1-Example-7_10 47.21 0.91 0 -FEP-SHP836-2_Example-27 310.06 0.15 0 -FEP-Example-8_SHP099-1-Example-7 -52.80 0.36 0 -FEP-Example-23_Example-26 -43.10 1.06 5 -FEP-Example-23_Example-22 -5.16 0.58 0 -FEP_Example-22_SHP099-1-Example-7 -14.28 0.36 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index a1f84b2f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,76 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027 -3.37 0.31 0.98 3 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -7.46 0.47 1.50 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030 34.20 0.36 1.14 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -3.41 0.27 0.87 3 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016 -16.23 0.17 0.53 5 -FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026 34.72 0.23 0.73 3 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032 -5.41 0.34 1.08 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030 -20.66 0.43 1.35 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 13.52 0.15 0.47 1 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 56.88 0.62 1.96 1 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032 54.61 0.26 0.82 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 11.84 0.52 1.65 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995 24.52 0.30 0.94 5 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996 6.72 0.34 1.06 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820 7.77 0.42 1.32 1 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -8.56 0.15 0.49 2 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 22.18 0.65 2.06 5 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020 -18.82 0.24 0.75 5 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -4.86 0.30 0.94 2 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 5.25 0.32 1.02 1 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 13.97 0.40 1.26 7 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005 33.46 0.68 2.17 7 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997 29.09 0.47 1.49 3 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 9.30 0.16 0.52 4 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 56.18 0.74 2.33 3 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031 122.87 0.26 0.81 2 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 11.76 0.22 0.70 4 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005 -25.52 0.19 0.60 2 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032 16.49 0.16 0.50 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 -7.84 0.37 1.18 3 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 34.75 0.28 0.89 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998 134.31 1.11 3.52 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -14.83 0.32 1.02 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020 54.35 0.24 0.74 6 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999 -33.29 0.52 1.65 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995 165.00 0.63 2.01 0 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 21.08 0.28 0.88 3 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021 8.26 0.30 0.94 0 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995 -3.67 0.17 0.54 3 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 -10.34 0.30 0.93 6 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 -21.30 0.25 0.80 4 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820 2.11 0.91 2.88 2 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005 23.87 0.30 0.96 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -0.80 1.29 4.07 1 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 3.76 0.85 2.68 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 4.42 0.50 1.58 3 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016 6.78 0.10 0.33 5 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -4.16 0.29 0.93 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -3.70 0.54 1.70 1 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -11.20 0.22 0.69 3 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999 -39.33 0.24 0.77 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -20.19 0.43 1.37 6 -FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017 6.83 0.27 0.87 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026 29.56 0.17 0.53 2 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032 177.34 0.21 0.68 2 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 19.00 0.37 1.17 6 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998 -27.88 0.25 0.80 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 7.40 0.20 0.63 1 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 6.37 1.21 3.83 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019 -14.83 0.22 0.69 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 -0.05 0.15 0.47 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018 -16.01 0.60 1.88 5 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 -0.62 0.50 1.58 0 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029 -1.65 0.20 0.65 1 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036 161.47 0.15 0.47 3 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -4.12 0.35 1.10 2 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005 9.77 1.02 3.22 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017 72.55 0.65 2.05 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020 -23.42 0.24 0.76 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035 7.66 0.34 1.06 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003 6.66 0.62 1.97 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820 16.12 0.37 1.17 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004 15.07 0.36 1.14 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005 -0.92 0.35 1.10 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001 162.18 0.78 2.48 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 9e755512..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,76 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264999 -34.73 0.53 1.69 2 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 13.68 0.15 0.48 2 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 -21.97 0.21 0.65 2 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 9.81 0.32 1.02 7 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 -2.76 0.39 1.23 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 56.36 0.12 0.38 7 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -5.26 0.22 0.68 3 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3264996 4.78 0.14 0.45 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265019 -13.68 0.23 0.71 2 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 -1.96 0.35 1.12 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 -8.98 0.32 1.03 3 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265016 -16.25 0.20 0.63 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030 -20.31 0.22 0.68 2 -FEP_CHEMBL3265022_CHEMBL3265017 9.45 0.15 0.48 1 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265029 -2.62 0.15 0.48 5 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 -1.11 0.05 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265032 16.50 0.17 0.53 1 -FEP_CHEMBL3265006_CHEMBL3265005 -24.56 0.27 0.86 2 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265032 177.35 0.16 0.49 2 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 4.10 0.24 0.75 4 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 20.97 0.36 1.13 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265005 31.47 1.37 4.35 5 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -6.63 0.21 0.68 3 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030 33.75 0.13 0.41 1 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -16.14 0.20 0.63 1 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -3.49 0.32 1.02 2 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265021 7.81 0.19 0.59 4 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3259820 6.07 0.10 0.31 5 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 5.06 0.31 0.97 2 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 2.70 0.73 2.31 1 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264995 25.26 0.15 0.48 6 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -3.61 0.22 0.69 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 -9.67 0.24 0.77 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -3.15 0.42 1.32 1 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264998 -27.99 0.32 1.03 4 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 12.69 0.36 1.15 2 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 12.63 0.38 1.20 2 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265032 -6.10 0.20 0.62 3 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265031 122.67 0.17 0.54 2 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -4.42 0.25 0.79 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3264997 29.02 0.29 0.92 0 -FEP_CHEMBL3265025_CHEMBL3265026 32.91 0.11 0.36 0 -FEP_CHEMBL3265033_CHEMBL3265036 161.11 0.19 0.59 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265020 52.21 0.22 0.69 1 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 17.39 0.32 1.00 1 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 20.79 0.14 0.43 3 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3264999 -40.48 0.38 1.20 1 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265026 29.17 0.23 0.74 1 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265032 54.87 0.11 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264995 161.88 0.19 0.60 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265018 -15.31 0.18 0.58 2 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3259820 11.79 0.33 1.04 5 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265005 22.90 0.17 0.54 2 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 9.49 0.18 0.57 2 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265020 -18.71 0.14 0.43 1 -FEP_CHEMBL3265035_CHEMBL3265027 -4.45 0.18 0.58 7 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -5.69 0.22 0.71 3 -FEP_CHEMBL3265001_CHEMBL3264995 -3.01 0.25 0.78 2 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -9.21 0.34 1.09 2 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 33.99 0.07 0.23 5 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3264998 133.87 0.45 1.41 1 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 55.20 0.77 2.42 2 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -10.89 0.26 0.82 2 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 6.63 0.24 0.74 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -21.24 0.14 0.45 3 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265016 5.57 0.16 0.51 4 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265020 -22.96 0.14 0.44 0 -FEP_CHEMBL3265000_CHEMBL3265001 161.47 0.39 1.23 0 -FEP_CHEMBL3265030_CHEMBL3265035 8.26 0.19 0.60 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265003 5.82 0.20 0.64 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265017 69.59 0.29 0.91 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3259820 17.51 0.26 0.83 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265004 13.73 0.32 1.01 0 -FEP_CHEMBL3265002_CHEMBL3265005 1.62 0.25 0.80 0 -FEP_CHEMBL3265011_CHEMBL3265005 -0.06 0.21 0.68 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index 741ddc93..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,78 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265024 -29.87 0.26 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265000 -133.27 0.92 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265010 -54.02 0.27 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -4.24 0.24 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030 -20.14 0.33 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265003 40.58 0.32 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265001 3.00 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 34.71 0.28 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 7.24 0.35 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -8.22 0.12 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265011 -8.29 0.59 0 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 20.51 0.22 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -7.55 0.29 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 4.83 0.56 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -3.88 0.25 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265035 2.76 0.38 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265000 -157.36 0.84 2 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265022 -7.25 0.31 0 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 8.99 0.18 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -20.81 0.29 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3265006 26.05 0.19 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 56.65 0.71 2 -FEP_CHEMBL3265027_CHEMBL3265035 4.39 0.72 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265025 -19.50 0.34 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -4.46 0.48 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265004 48.16 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 21.35 0.35 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 -10.02 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265031 -53.98 0.28 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 19.38 0.44 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265025 -33.74 0.29 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 8.68 0.98 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265015 -4.22 0.38 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 12.85 0.17 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264998 -28.81 0.69 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3264999 -31.34 1.45 4 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265033 -160.78 0.31 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 10.90 0.52 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 4.95 0.35 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265033 -177.01 0.20 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265002 -6.10 0.23 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -4.70 0.16 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265023 -7.22 0.25 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -1.39 0.79 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 -21.07 0.33 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -16.21 0.21 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030 33.93 0.39 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -4.73 0.29 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 -0.89 0.09 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265037 5.99 0.41 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265026 16.08 0.24 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264998 -25.18 0.53 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3264996 39.15 0.31 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265002 33.81 0.64 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 10.86 0.29 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -9.77 0.42 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265036 -15.94 0.30 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265001 27.49 0.25 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 1.29 1.05 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 -7.29 0.26 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265017 17.87 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3265010 -23.84 0.22 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 13.05 0.21 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265033 -123.04 0.14 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265016 16.79 0.40 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265020 -7.04 0.31 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 -1.07 0.49 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 56.26 0.60 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 4.81 0.34 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265001 2.79 0.35 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 4.61 0.59 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265000 -133.82 0.69 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265000 -154.80 0.94 3 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265001 27.70 0.31 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264998 -24.01 0.46 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264998 -28.86 0.47 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -0.61 1.24 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 84166b1e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/syk/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,78 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265024 -29.10 0.08 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265000 -132.95 0.50 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265010 -51.94 0.09 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265029 -4.41 0.09 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265030 -20.31 0.20 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265003 42.56 0.18 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265001 4.09 0.17 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3259820 34.00 0.37 0 -FEP_CHEMBL3265009_CHEMBL3265013 7.32 0.32 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265020 -8.81 0.08 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265011 -10.90 0.36 0 -FEP_CHEMBL3265028_CHEMBL3265027 20.54 0.11 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3265003 -7.59 0.13 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 4.89 0.18 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265012 -3.31 0.18 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265035 2.70 0.15 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265000 -156.60 0.69 2 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265022 -8.08 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265008_CHEMBL3265012 9.10 0.21 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265034 -21.47 0.17 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3265006 24.98 0.12 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265006 55.67 0.73 0 -FEP_CHEMBL3265027_CHEMBL3265035 3.78 0.24 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265025 -18.45 0.11 0 -FEP_CHEMBL3265015_CHEMBL3265011 -5.63 0.18 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265004 50.06 0.16 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265009 20.51 0.32 0 -FEP_CHEMBL3265017_CHEMBL3265021 -9.86 0.07 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265031 -54.34 0.16 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265014 16.82 0.20 0 -FEP_CHEMBL3265026_CHEMBL3265025 -32.99 0.10 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 1.22 0.81 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265015 -4.86 0.49 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265019 13.81 0.11 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264998 -28.30 0.37 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3264999 -30.40 0.45 6 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265033 -160.42 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265014_CHEMBL3265013 11.11 0.19 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265008 4.69 0.17 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265033 -177.24 0.08 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265002 -4.51 0.14 0 -FEP_CHEMBL3265036_CHEMBL3265034 -4.59 0.24 0 -FEP_CHEMBL3265021_CHEMBL3265023 -7.37 0.08 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -2.56 0.23 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265028 -21.64 0.16 0 -FEP_CHEMBL3265037_CHEMBL3265017 -16.80 0.16 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265030 34.17 0.17 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265025 -3.93 0.07 0 -FEP_CHEMBL3265029_CHEMBL3265027 -1.37 0.08 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265037 6.36 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265026 16.15 0.08 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264998 -24.16 0.14 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3264996 40.85 0.29 0 -FEP_CHEMBL3264999_CHEMBL3265002 35.81 0.64 0 -FEP_CHEMBL3265023_CHEMBL3265022 9.23 0.21 0 -FEP_CHEMBL3259820_CHEMBL3265005 -11.42 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265032_CHEMBL3265036 -16.62 0.15 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265001 27.77 0.28 0 -FEP_CHEMBL3264996_CHEMBL3265005 -2.79 0.33 0 -FEP_CHEMBL3265004_CHEMBL3264996 -9.09 0.16 0 -FEP_CHEMBL3265020_CHEMBL3265017 18.73 0.05 0 -FEP_CHEMBL3265005_CHEMBL3265010 -22.65 0.15 0 -FEP_CHEMBL3265024_CHEMBL3265016 12.63 0.08 0 -FEP_CHEMBL3265031_CHEMBL3265033 -122.54 0.14 0 -FEP_CHEMBL3265018_CHEMBL3265016 15.72 0.09 0 -FEP_CHEMBL3265016_CHEMBL3265020 -6.62 0.08 0 -FEP_CHEMBL3265003_CHEMBL3264996 -1.58 0.18 0 -FEP_CHEMBL3265010_CHEMBL3265019 55.55 0.39 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264994 2.14 0.80 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265000 -156.48 0.81 2 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3265001 3.95 0.15 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264998 -28.96 0.22 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265001 28.04 0.22 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264998 -24.30 0.12 0 -FEP_CHEMBL3264997_CHEMBL3264994 -2.96 0.29 0 -FEP_CHEMBL3264998_CHEMBL3265000 -132.95 0.41 0 -FEP_CHEMBL3264995_CHEMBL3264997 5.04 0.14 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/benchmark/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/benchmark/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index ae9f3457..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/benchmark/2fs/failed.txt +++ /dev/null @@ -1,2 +0,0 @@ -FEP_8e_8c protein/ -FEP_8d_8c protein/ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/benchmark/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/benchmark/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index a11360ea..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/benchmark/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,42 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_5m_5k 10.33 0.10 0.31 0 -FEP_5a_3a 20.91 0.17 0.52 0 -FEP_3b_7 7.34 0.19 0.59 0 -FEP_5h_5f -8.33 0.31 1.00 0 -FEP_5k_5f 4.94 0.21 0.66 1 -FEP_5l_5j -13.89 0.15 0.48 0 -FEP_5f_5g -12.28 0.10 0.33 0 -FEP_5d_5e -4.09 0.06 0.21 0 -FEP_5p_3b -4.86 1.02 3.24 0 -FEP_5o_5m -19.97 0.29 0.91 0 -FEP_5h_5i -25.01 0.11 0.34 0 -FEP_5b_5c 18.09 0.11 0.35 0 -FEP_5l_5b -26.07 0.10 0.33 2 -FEP_5f_5i -15.98 0.15 0.48 0 -FEP_5p_5n -1.65 0.31 0.99 0 -FEP_1b_1a 16.39 0.13 0.41 0 -FEP_8f_8d -21.42 0.10 0.32 1 -FEP_5d_5a -2.68 0.12 0.38 0 -FEP_5g_5c -19.90 0.24 0.77 0 -FEP_5o_5n -4.45 0.30 0.94 0 -FEP_5l_5f 22.96 0.13 0.40 0 -FEP_5k_5d -14.81 0.15 0.46 1 -FEP_5e_5a 1.05 0.28 0.89 0 -FEP_3a_1a 3.46 0.27 0.85 0 -FEP_5d_3b 20.50 0.17 0.54 0 -FEP_8e_8a 12.22 0.35 1.09 0 -FEP_5d_7 27.15 0.17 0.54 0 -FEP_5j_5b -11.81 0.20 0.63 2 -FEP_8f_8e 8.73 0.09 0.28 1 -FEP_8b_8a -3.51 0.09 0.30 0 -FEP_5i_5g 4.04 0.19 0.60 0 -FEP_3a_1b -13.59 0.20 0.63 0 -FEP_8f_8b 24.85 0.27 0.85 0 -FEP_8e_8c -19.87 0.41 1.28 2 -FEP_8d_8c 10.33 0.31 0.99 2 -FEP_5a_5b -26.44 0.15 0.46 4 -FEP_5n_5d -21.56 0.54 1.71 0 -FEP_3b_3a -1.91 0.19 0.61 0 -FEP_5i_5a -6.59 0.09 0.29 0 -FEP_5m_5i -0.93 0.16 0.51 0 -FEP_5m_5d -4.84 0.13 0.40 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/benchmark/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/benchmark/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index 8abd02d8..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/benchmark/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,42 +0,0 @@ -FEP dG sem std crashes -FEP_5m_5k 10.34 0.12 0.39 0 -FEP_5a_3a 21.15 0.11 0.35 0 -FEP_3b_7 4.04 0.13 0.40 0 -FEP_5h_5f -7.12 0.27 0.86 0 -FEP_5k_5f 5.38 0.08 0.26 0 -FEP_5l_5j -14.49 0.08 0.26 0 -FEP_5f_5g -11.50 0.13 0.43 0 -FEP_5d_5e -4.67 0.06 0.19 0 -FEP_5p_3b -1.65 0.16 0.50 0 -FEP_5o_5m -21.01 0.38 1.21 0 -FEP_5h_5i -22.95 0.10 0.30 0 -FEP_5b_5c 17.66 0.10 0.31 0 -FEP_8e_8c -20.97 0.17 0.53 0 -FEP_5l_5b -26.81 0.12 0.39 0 -FEP_5f_5i -15.67 0.08 0.26 0 -FEP_5p_5n -1.66 0.13 0.40 0 -FEP_1b_1a 14.64 0.16 0.49 0 -FEP_8f_8d -21.27 0.10 0.30 0 -FEP_5d_5a -1.95 0.12 0.37 0 -FEP_5g_5c -19.44 0.11 0.34 0 -FEP_5o_5n -4.90 0.31 0.99 0 -FEP_5l_5f 21.66 0.12 0.38 0 -FEP_5k_5d -15.35 0.12 0.39 0 -FEP_5e_5a 2.56 0.11 0.36 0 -FEP_3a_1a -0.59 0.14 0.43 0 -FEP_5d_3b 20.94 0.05 0.17 0 -FEP_8e_8a 11.48 0.20 0.64 0 -FEP_5d_7 24.94 0.09 0.29 0 -FEP_5j_5b -12.14 0.17 0.54 0 -FEP_8f_8e 8.66 0.16 0.52 0 -FEP_8b_8a -4.41 0.29 0.91 0 -FEP_8d_8c 9.01 0.16 0.50 0 -FEP_5i_5g 5.15 0.16 0.51 0 -FEP_3a_1b -15.04 0.09 0.27 0 -FEP_8f_8b 25.10 0.06 0.19 0 -FEP_5a_5b -25.89 0.12 0.38 2 -FEP_3b_3a -2.06 0.13 0.40 0 -FEP_5n_5d -21.03 0.29 0.91 0 -FEP_5i_5a -6.97 0.15 0.47 0 -FEP_5m_5d -4.85 0.12 0.37 0 -FEP_5m_5i 0.12 0.13 0.41 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/no-vs/2fs/failed.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/no-vs/2fs/failed.txt deleted file mode 100644 index e69de29b..00000000 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/no-vs/2fs/protein.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/no-vs/2fs/protein.txt deleted file mode 100644 index b12f1377..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/no-vs/2fs/protein.txt +++ /dev/null @@ -1,36 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_5i_5h 24.55 0.15 0 -FEP_5b_5j 12.31 0.20 0 -FEP_8e_8c -21.42 0.21 8 -FEP_8d_8c 9.20 nan 9 -FEP_5f_5i -15.92 0.11 0 -FEP_5f_5h 8.71 0.13 0 -FEP_5n_5p 1.70 0.20 0 -FEP_5g_5c -18.79 0.19 0 -FEP_5b_5c 18.18 0.14 0 -FEP_5k_5d -14.74 0.18 0 -FEP_8e_8a 12.24 0.15 0 -FEP_8b_8a -3.76 0.11 0 -FEP_5m_5o 20.59 0.33 0 -FEP_8f_8b 24.66 0.23 0 -FEP_5l_5j -13.98 0.17 0 -FEP_5d_7 26.89 0.15 0 -FEP_5a_3a 20.52 0.22 0 -FEP_5o_5n -3.70 0.53 0 -FEP_5p_3b -4.38 0.33 0 -FEP_5a_1a 23.69 0.36 0 -FEP_5l_5b -26.31 0.12 0 -FEP_5e_5a 1.09 0.20 0 -FEP_5i_5g 3.43 0.16 0 -FEP_8f_8e 9.21 0.12 0 -FEP_3a_1b -13.96 0.12 0 -FEP_5m_5k 10.03 0.15 0 -FEP_5f_5l -22.66 0.16 0 -FEP_3b_7 7.51 0.22 0 -FEP_5d_3b 19.86 0.28 0 -FEP_5f_5g -12.17 0.18 0 -FEP_3a_1a 3.20 0.31 0 -FEP_5d_5e -3.60 0.17 0 -FEP_5k_5f 5.17 0.17 0 -FEP_1a_1b -17.11 0.23 0 -FEP_8f_8d -21.75 0.09 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/no-vs/2fs/water.txt b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/no-vs/2fs/water.txt deleted file mode 100644 index cc2d9694..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/raw/Merck/openFF2/tnks2/no-vs/2fs/water.txt +++ /dev/null @@ -1,36 +0,0 @@ -FEP dG sem crashes -FEP_5i_5h 22.79 0.12 0 -FEP_5b_5j 12.26 0.07 0 -FEP_8e_8c -21.26 0.17 0 -FEP_8d_8c 9.04 0.14 0 -FEP_5f_5i -15.77 0.07 0 -FEP_5f_5h 6.88 0.06 0 -FEP_5n_5p 2.02 0.12 0 -FEP_5g_5c -19.66 0.10 0 -FEP_5b_5c 17.43 0.09 0 -FEP_5k_5d -15.29 0.09 0 -FEP_8e_8a 11.52 0.07 0 -FEP_8b_8a -4.85 0.05 0 -FEP_5m_5o 20.83 0.16 0 -FEP_8f_8b 25.24 0.09 0 -FEP_5l_5j -14.56 0.08 0 -FEP_5d_7 24.84 0.08 0 -FEP_5a_3a 21.15 0.07 0 -FEP_5o_5n -4.40 0.27 0 -FEP_5p_3b -2.36 0.38 1 -FEP_5a_1a 20.80 0.20 0 -FEP_5l_5b -26.72 0.09 0 -FEP_5e_5a 2.46 0.10 0 -FEP_5i_5g 4.06 0.10 0 -FEP_8f_8e 8.92 0.05 0 -FEP_3a_1b -15.06 0.04 0 -FEP_5m_5k 10.30 0.14 0 -FEP_5f_5l -21.66 0.11 0 -FEP_3b_7 3.69 0.07 0 -FEP_5d_3b 21.37 0.06 0 -FEP_5f_5g -11.51 0.13 0 -FEP_3a_1a -0.65 0.18 0 -FEP_5d_5e -4.48 0.12 0 -FEP_5k_5f 5.55 0.07 0 -FEP_1a_1b -14.46 0.10 0 -FEP_8f_8d -21.47 0.07 0 diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/BACE_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/BACE_ligands.sdf deleted file mode 100755 index 1fc009c5..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/BACE_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,3730 +0,0 @@ -CAT-13f - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 52 0 0 1 0 999 V2000 - 11.8157 -1.9869 1.1350 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0892 -2.4266 0.5571 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2593 -2.5968 1.1965 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4700 -2.4087 2.5072 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2262 -2.9956 0.3604 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7421 -3.1088 -1.0217 C 0 0 1 0 0 0 - 15.3912 -2.0431 -1.9333 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9757 -2.3788 -3.1775 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4916 -1.3794 -4.0129 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3751 -0.0274 -3.6532 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8017 0.3581 -2.4240 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5995 1.7924 -2.0988 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3381 2.7307 -3.1262 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0417 4.0765 -2.8331 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0158 4.5162 -1.5001 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3137 3.6154 -0.4660 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3090 4.1775 1.1646 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.6022 2.2676 -0.7658 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3586 -0.6707 -1.5583 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8186 -4.5906 -1.5373 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1991 -5.2608 -1.5318 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9158 -6.7438 -1.7752 C 0 0 0 0 0 0 - 14.5202 -7.0043 -1.1990 C 0 0 0 0 0 0 - 13.9603 -5.6347 -0.7926 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2678 -2.7202 -0.8247 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3711 -2.6827 -1.6743 O 0 0 0 0 0 0 - 11.7133 -0.9107 1.0003 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9703 -2.4711 0.6458 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7672 -2.2188 2.1980 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7670 -2.0582 3.1557 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2091 -3.0726 0.6185 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0314 -3.3898 -3.5469 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9446 -1.6507 -4.9560 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7175 0.7188 -4.3522 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3104 2.4107 -4.1575 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8046 4.7704 -3.6259 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7669 5.5420 -1.2680 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8209 1.5921 0.0436 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9086 -0.3862 -0.6190 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4542 -4.6004 -2.5656 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8694 -4.8720 -2.2913 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6839 -5.1340 -0.5622 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9010 -6.9414 -2.8481 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6784 -7.3836 -1.3290 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8876 -7.4731 -1.9550 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5574 -7.6812 -0.3442 H 0 0 0 0 0 0 - 14.0657 -5.5161 0.2871 H 0 0 0 0 0 0 - 12.8984 -5.5578 -1.0319 H 0 0 0 0 0 0 - 15.4198 -2.4955 2.8755 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 49 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 19 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 23 46 1 0 0 0 - 24 47 1 0 0 0 - 24 48 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.093 - -$$$$ -CAT-13d - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7860 -2.3271 1.0538 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1444 -2.5995 0.5661 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2729 -2.5333 1.2874 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3652 -2.2938 2.6004 N 0 0 0 0 0 0 - 15.3469 -2.7616 0.5345 N 0 3 0 0 0 0 - 15.0192 -3.0683 -0.8497 C 0 0 1 0 0 0 - 15.5634 -1.9948 -1.8100 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1894 -2.3496 -3.0284 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6159 -1.3547 -3.9204 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4013 0.0015 -3.6209 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8080 0.4004 -2.4044 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5587 1.8326 -2.1090 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2649 2.7464 -3.1489 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9444 4.0910 -2.8732 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9243 4.5522 -1.5465 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2486 3.6732 -0.5009 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2426 4.2511 1.1245 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.5647 2.3288 -0.7836 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4125 -0.6168 -1.5039 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5900 -4.4689 -1.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3463 -5.2332 -2.4204 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7355 -4.7539 -2.0801 C 0 0 0 0 0 0 - 13.4812 -2.9579 -0.7768 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6571 -3.1079 -1.6844 O 0 0 0 0 0 0 - 11.0292 -2.7766 0.4106 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6524 -2.7177 2.0625 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6181 -1.2506 1.0770 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5838 -2.0392 3.2009 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3098 -2.7539 0.8773 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3451 -3.3789 -3.3174 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0896 -1.6334 -4.8519 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6981 0.7398 -4.3492 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2371 2.4076 -4.1742 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6865 4.7672 -3.6749 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6583 5.5769 -1.3284 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8089 1.6730 0.0351 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9319 -0.3282 -0.5818 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5716 -5.0931 -0.2434 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1570 -6.3019 -2.3389 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8362 -4.7371 -3.2436 H 0 0 0 0 0 0 - 17.1286 -3.9418 -2.6801 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4697 -5.4962 -1.7713 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2860 -2.2903 3.0398 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 23 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 19 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --10.473 - -$$$$ -CAT-4c - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 53 0 0 1 0 999 V2000 - 12.5711 5.3513 -2.7657 C 0 0 0 0 0 0 - 13.7081 5.1549 -1.9289 O 0 0 0 0 0 0 - 14.3525 3.9582 -2.1070 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8801 3.2992 -0.9813 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4000 1.9956 -1.1053 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4241 1.3431 -2.3579 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7606 -0.0825 -2.4958 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4104 -0.5580 -3.6479 C 0 0 0 0 0 0 - 16.5936 -1.9307 -3.8581 C 0 0 0 0 0 0 - 16.0899 -2.8628 -2.9346 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4302 -2.4158 -1.7641 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8180 -3.3955 -0.7510 C 0 0 1 0 0 0 - 15.1632 -4.8768 -1.0176 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3265 -5.7683 -1.7334 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7023 -7.1138 -1.9228 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9322 -7.5796 -1.4262 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7922 -6.7001 -0.7600 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3964 -5.3713 -0.5455 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2313 -3.0387 0.6068 N 0 3 0 0 0 0 - 14.2081 -2.6970 1.3866 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3761 -2.3746 2.6722 N 0 0 0 0 0 0 - 13.0452 -2.7268 0.7206 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7303 -2.3304 1.2406 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2977 -3.1408 -0.6221 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4259 -3.2223 -1.4953 O 0 0 0 0 0 0 - 15.3168 -1.0203 -1.5415 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0015 2.0596 -3.4966 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4602 3.3469 -3.3731 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9724 6.1855 -2.4058 H 0 0 0 0 0 0 - 12.8593 5.5867 -3.7903 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9234 4.4734 -2.7734 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8193 3.7674 -0.0099 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7378 1.4794 -0.2207 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7419 0.1377 -4.4013 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0959 -2.2498 -4.7563 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2160 -3.9144 -3.1523 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3830 -5.4459 -2.1401 H 0 0 0 0 0 0 - 14.0449 -7.7904 -2.4492 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2289 -8.6066 -1.5336 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7478 -7.0430 -0.3881 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0549 -4.7250 0.0063 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2103 -3.0095 0.8918 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6321 -2.0604 3.2929 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9201 -2.8078 0.6888 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6300 -2.5995 2.2917 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6158 -1.2514 1.1443 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8061 -0.6509 -0.6635 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0098 1.5949 -4.4724 H 0 0 0 0 0 0 - 14.0883 3.8355 -4.2589 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3185 -2.3684 3.0651 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 34 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 21 50 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 23 46 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M CHG 1 19 1 -M END -> --7.853 - -$$$$ -CAT-13b - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 44 0 0 1 0 999 V2000 - 14.8880 -5.3200 -2.2411 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5152 -4.5191 -1.0878 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0250 -3.0580 -0.8408 C 0 0 2 0 0 0 - 15.5972 -1.9892 -1.7961 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2813 -2.3331 -2.9861 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6931 -1.3359 -3.8827 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4366 0.0163 -3.6011 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8215 0.4094 -2.3948 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5584 1.8393 -2.1031 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2599 2.7489 -3.1451 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9356 4.0932 -2.8723 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9160 4.5575 -1.5465 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2425 3.6816 -0.4989 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2357 4.2626 1.1255 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.5620 2.3374 -0.7787 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4202 -0.6110 -1.5012 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3485 -2.7407 0.5435 N 0 3 0 0 0 0 - 14.2748 -2.5004 1.2924 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3659 -2.2678 2.6058 N 0 0 0 0 0 0 - 13.1492 -2.5542 0.5669 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7915 -2.2624 1.0450 C 0 0 0 0 0 0 - 13.4891 -2.9216 -0.7722 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6678 -3.0625 -1.6834 O 0 0 0 0 0 0 - 14.9642 -4.8005 -3.1912 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3880 -6.2814 -2.3613 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8332 -5.5295 -2.0640 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5958 -4.5023 -1.2260 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3696 -5.1062 -0.1795 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5020 -3.3529 -3.2560 H 0 0 0 0 0 0 - 17.1954 -1.6103 -4.8005 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7286 0.7571 -4.3282 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2342 2.4069 -4.1695 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6762 4.7669 -3.6756 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6486 5.5822 -1.3307 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8089 1.6832 0.0405 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9145 -0.3233 -0.5923 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3102 -2.7378 0.8907 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5848 -2.0116 3.2058 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6537 -2.6250 2.0635 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6291 -1.1849 1.0382 H 0 0 0 0 0 0 - 11.0342 -2.7257 0.4122 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2856 -2.2732 3.0472 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 17 1 0 0 0 - 3 22 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 31 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 16 2 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 15 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 15 2 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 36 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 -M CHG 1 17 1 -M END -> --9.123 - -$$$$ -CAT-4l - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 47 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7113 -2.3112 1.2622 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0352 -2.6402 0.7179 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2035 -2.6174 1.3751 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3765 -2.3591 2.6742 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2269 -2.8949 0.5700 N 0 3 0 0 0 0 - 14.8063 -3.2175 -0.7951 C 0 0 2 0 0 0 - 15.1524 -4.6977 -1.0845 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3046 -5.5761 -1.8014 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6497 -6.9306 -1.9839 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8625 -7.4264 -1.4792 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7308 -6.5656 -0.7973 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3649 -5.2251 -0.5912 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3844 -2.1979 -1.7957 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9241 -2.5916 -3.0422 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3874 -1.6183 -3.9470 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3038 -0.2493 -3.6280 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8001 0.1816 -2.3818 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7084 1.6222 -2.0291 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7056 2.0785 -0.6865 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5288 3.3733 -0.3397 N 0 0 0 0 0 0 - 15.3497 4.2346 -1.3629 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3873 3.8092 -2.7078 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5688 2.5097 -3.0474 N 0 0 0 0 0 0 - 15.3588 -0.8146 -1.4792 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2854 -2.9804 -0.6448 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4099 -3.0279 -1.5170 O 0 0 0 0 0 0 - 10.9248 -2.8724 0.7569 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6571 -2.5377 2.3265 H 0 0 0 0 0 0 - 11.5141 -1.2490 1.1211 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3205 -2.3643 3.0635 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2054 -2.8992 0.8580 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3663 -5.2373 -2.2023 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9797 -7.5967 -2.5060 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1272 -8.4631 -1.5949 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6704 -6.9318 -0.4070 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0276 -4.6014 -0.0205 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9843 -3.6329 -3.3297 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7976 -1.9165 -4.9021 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6290 0.4808 -4.3551 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8527 1.3926 0.1280 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1811 5.2706 -1.1089 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2465 4.5234 -3.5029 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9460 -0.5019 -0.5323 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6343 -2.0707 3.3097 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 44 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 24 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 24 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.343 - -$$$$ -CAT-13m - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 47 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7748 -2.0496 1.1864 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0810 -2.4046 0.6207 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2515 -2.5116 1.2702 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4441 -2.3222 2.5814 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2422 -2.8670 0.4444 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7739 -3.0857 -0.9270 C 0 0 2 0 0 0 - 14.8997 -4.5948 -1.2714 C 0 0 0 0 0 0 - 16.0472 -5.1640 -1.8459 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1698 -6.4826 -2.0817 N 0 0 0 0 0 0 - 15.1536 -7.2493 -1.7242 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0437 -6.8476 -1.1288 N 0 0 0 0 0 0 - 13.9102 -5.5340 -0.9211 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3786 -2.0452 -1.9004 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8325 -2.3836 -3.1970 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3422 -1.3953 -4.0510 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3043 -0.0420 -3.6752 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7978 0.3539 -2.4198 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5968 1.7919 -2.0984 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2949 2.7191 -3.1262 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9736 4.0603 -2.8365 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9642 4.5099 -1.5062 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3030 3.6222 -0.4730 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3087 4.1915 1.1559 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.6158 2.2792 -0.7695 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4019 -0.6710 -1.5264 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2877 -2.7178 -0.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3957 -2.7761 -1.6055 O 0 0 0 0 0 0 - 10.9783 -2.6474 0.7436 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7566 -2.2173 2.2632 H 0 0 0 0 0 0 - 11.5613 -1.0002 0.9842 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3896 -2.3984 2.9629 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2251 -2.9096 0.7184 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8880 -4.5572 -2.1237 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2631 -8.3091 -1.8724 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9970 -5.2634 -0.4146 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7947 -3.3853 -3.5936 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7239 -1.6738 -5.0224 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6360 0.6965 -4.3901 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2470 2.3932 -4.1556 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7005 4.7394 -3.6311 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6919 5.5292 -1.2778 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8575 1.6173 0.0455 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0174 -0.3786 -0.5614 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7269 -2.0003 3.2305 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 44 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 25 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 24 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --8.763 - -$$$$ -CAT-4k - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7087 -2.3257 1.2760 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0268 -2.6680 0.7261 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2004 -2.6361 1.3737 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3830 -2.3568 2.6674 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2173 -2.9288 0.5653 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7842 -3.2713 -0.7916 C 0 0 2 0 0 0 - 15.1329 -4.7525 -1.0673 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2837 -5.6424 -1.7688 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6395 -6.9945 -1.9475 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8632 -7.4748 -1.4526 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7337 -6.6012 -0.7899 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3585 -5.2630 -0.5886 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3568 -2.2699 -1.8111 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9115 -2.6866 -3.0438 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3923 -1.7309 -3.9571 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3151 -0.3584 -3.6589 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7903 0.0946 -2.4312 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7052 1.5402 -2.1087 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6969 1.9913 -0.7745 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5589 3.3571 -0.4899 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4374 4.2916 -1.4442 N 0 0 0 0 0 0 - 15.4666 3.8814 -2.7239 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5980 2.5333 -3.1039 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3231 -0.8816 -1.5215 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2648 -3.0328 -0.6326 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3816 -3.0977 -1.4960 O 0 0 0 0 0 0 - 11.5213 -1.2620 1.1331 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9140 -2.8804 0.7766 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6583 -2.5490 2.3412 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3295 -2.3605 3.0509 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1982 -2.9235 0.8445 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3388 -5.3138 -2.1640 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9699 -7.6687 -2.4605 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1378 -8.5093 -1.5608 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6820 -6.9557 -0.4103 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0246 -4.6267 -0.0348 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9759 -3.7327 -3.3123 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8183 -2.0431 -4.9001 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6698 0.3519 -4.3887 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8060 1.3012 0.0416 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5470 3.7065 0.5323 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3627 4.6606 -3.4623 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5837 2.2733 -4.1516 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8941 -0.5486 -0.5886 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6449 -2.0632 3.3051 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 45 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 24 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 24 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --7.853 - -$$$$ -CAT-13n - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 47 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7505 -2.1054 1.1746 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0754 -2.4192 0.6266 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2390 -2.4823 1.2955 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4006 -2.3325 2.6153 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2678 -2.7183 0.4810 N 0 3 0 0 0 0 - 14.8335 -2.9708 -0.8899 C 0 0 1 0 0 0 - 15.4350 -1.9353 -1.8793 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9253 -2.2767 -3.1639 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4040 -1.2874 -4.0316 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3188 0.0686 -3.6777 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8043 0.4637 -2.4251 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5944 1.8953 -2.0972 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2922 2.8269 -3.1186 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9797 4.1676 -2.8198 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9709 4.6063 -1.4854 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3020 3.7099 -0.4571 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2993 4.2576 1.1787 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.6141 2.3700 -0.7636 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4167 -0.5574 -1.5263 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0325 -4.4912 -1.1330 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1933 -5.3344 -0.5177 N 0 0 0 0 0 0 - 14.3980 -6.6537 -0.6631 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4737 -7.1474 -1.4002 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3282 -6.1963 -1.9576 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1149 -4.8884 -1.7939 N 0 0 0 0 0 0 - 13.3292 -2.6538 -0.7567 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4696 -2.5729 -1.6463 O 0 0 0 0 0 0 - 10.9706 -2.6750 0.6661 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6995 -2.3376 2.2387 H 0 0 0 0 0 0 - 11.5418 -1.0440 1.0335 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3413 -2.3802 3.0106 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2384 -2.8277 0.7732 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9512 -3.2887 -3.5363 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8058 -1.5771 -4.9912 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6347 0.8051 -4.4004 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2450 2.5045 -4.1481 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7178 4.8557 -3.6102 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7085 5.6275 -1.2482 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8539 1.7016 0.0459 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0131 -0.2646 -0.5696 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6949 -7.3190 -0.1836 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6326 -8.2070 -1.5234 H 0 0 0 0 0 0 - 17.1962 -6.4808 -2.5297 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6599 -2.0568 3.2578 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 44 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 19 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --8.543 - -$$$$ -CAT-13o - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 45 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7744 -2.0618 1.1343 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0790 -2.4524 0.5877 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2431 -2.5421 1.2539 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4169 -2.3498 2.5687 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2561 -2.8530 0.4409 N 0 3 0 0 0 0 - 14.8080 -3.0850 -0.9332 C 0 0 1 0 0 0 - 15.4265 -2.0582 -1.9126 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8985 -2.3994 -3.2015 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3932 -1.4095 -4.0612 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3356 -0.0554 -3.6934 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8305 0.3417 -2.4379 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6352 1.7780 -2.1098 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3646 2.7170 -3.1346 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0637 4.0615 -2.8394 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0416 4.5010 -1.5065 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3459 3.6006 -0.4746 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3403 4.1597 1.1570 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.6382 2.2541 -0.7761 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4351 -0.6823 -1.5449 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8980 -4.5908 -1.1993 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0678 -5.4772 -0.6139 N 0 0 0 0 0 0 - 14.3911 -6.8147 -0.8480 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5272 -6.9668 -1.5932 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2112 -5.4292 -2.0461 S 0 0 0 0 0 0 - 13.3123 -2.7371 -0.7906 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4481 -2.6727 -1.6750 O 0 0 0 0 0 0 - 10.9567 -2.5358 0.5853 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6873 -2.3480 2.1847 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6583 -0.9791 1.0515 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3579 -2.4095 2.9620 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2309 -2.9314 0.7292 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8825 -3.4030 -3.5906 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7794 -1.6903 -5.0303 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6583 0.6820 -4.4118 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3304 2.4001 -4.1665 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8193 4.7549 -3.6303 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7893 5.5257 -1.2732 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8546 1.5828 0.0371 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0403 -0.3905 -0.5831 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7694 -7.5955 -0.4287 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9903 -7.8907 -1.9004 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6835 -2.0468 3.2074 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 19 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --8.543 - -$$$$ -CAT-13a - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 41 0 0 1 0 999 V2000 - 11.8131 -2.0987 1.0830 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1334 -2.4685 0.5575 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2851 -2.5312 1.2456 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4325 -2.3246 2.5605 N 0 0 0 0 0 0 - 15.3127 -2.8534 0.4546 N 0 3 0 0 0 0 - 14.9092 -3.0355 -0.9381 C 0 0 2 0 0 0 - 15.1892 -4.4889 -1.3783 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5119 -1.9635 -1.8624 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1763 -2.3128 -3.0620 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6330 -1.3124 -3.9325 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4138 0.0423 -3.6288 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7987 0.4335 -2.4212 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5499 1.8627 -2.1170 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2538 2.7805 -3.1519 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9338 4.1236 -2.8692 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9160 4.5776 -1.5397 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2415 3.6932 -0.4988 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2369 4.2623 1.1298 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.5569 2.3502 -0.7887 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3759 -0.5881 -1.5399 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3951 -2.8048 -0.8053 C 0 0 0 0 0 0 - 12.5342 -2.8850 -1.6872 O 0 0 0 0 0 0 - 11.6713 -1.0230 0.9798 H 0 0 0 0 0 0 - 11.0133 -2.6016 0.5387 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7238 -2.3620 2.1367 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3677 -2.3767 2.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2865 -2.8882 0.7611 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2597 -4.6769 -1.4694 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8010 -5.2068 -0.6550 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7220 -4.7157 -2.3385 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3361 -3.3388 -3.3593 H 0 0 0 0 0 0 - 17.1291 -1.5869 -4.8533 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7243 0.7863 -4.3449 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2245 2.4443 -4.1780 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6756 4.8036 -3.6677 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6511 5.6013 -1.3159 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8011 1.6882 0.0253 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8782 -0.3031 -0.6255 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6878 -2.0197 3.1842 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 21 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 4 39 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 8 1 0 0 0 - 6 21 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 7 30 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 20 2 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 19 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 36 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> -2 - -> --8.843 - -$$$$ -CAT-13k - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7400 -2.2126 1.2313 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0684 -2.5561 0.7089 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2256 -2.5677 1.3847 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3832 -2.3337 2.6889 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2563 -2.8608 0.5934 N 0 3 0 0 0 0 - 14.8533 -3.1586 -0.7802 C 0 0 2 0 0 0 - 15.1438 -4.6467 -1.0923 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2637 -5.4798 -1.8166 C 0 0 0 0 0 0 - 14.5645 -6.8432 -1.9699 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7571 -7.3361 -1.4317 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6213 -6.5577 -0.7672 N 0 0 0 0 0 0 - 16.3169 -5.2546 -0.6052 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4647 -2.1399 -1.7601 C 0 0 0 0 0 0 - 16.0954 -2.5444 -2.9592 C 0 0 0 0 0 0 - 16.5717 -1.5778 -3.8628 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4066 -0.2072 -3.5903 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8150 0.2377 -2.3895 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6040 1.6830 -2.1188 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3466 2.5922 -3.1729 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0379 3.9438 -2.9130 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0066 4.4209 -1.5932 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3052 3.5500 -0.5350 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2910 4.1515 1.0816 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.6001 2.1968 -0.7994 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3711 -0.7498 -1.4798 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3361 -2.8874 -0.6508 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4745 -2.9293 -1.5356 O 0 0 0 0 0 0 - 11.5520 -1.1511 1.0727 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9569 -2.7751 0.7224 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6699 -2.4254 2.2974 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3226 -2.3540 3.0886 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2325 -2.8545 0.8935 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3408 -5.1092 -2.2189 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8937 -7.5087 -2.4902 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0228 -8.3769 -1.5218 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0106 -4.6876 -0.0139 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2119 -3.5881 -3.2166 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0459 -1.8830 -4.7859 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7356 0.5091 -4.3263 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3303 2.2450 -4.1961 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7905 4.6180 -3.7185 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7494 5.4510 -1.3903 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8201 1.5472 0.0303 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8910 -0.4239 -0.5697 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6384 -2.0384 3.3180 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 45 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 25 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 24 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.703 - -$$$$ -CAT-17a - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7268 -2.5836 1.3295 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0531 -2.6452 0.7063 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2316 -2.5932 1.3460 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4073 -2.4121 2.6584 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2573 -2.7748 0.5129 N 0 3 0 0 0 0 - 14.8116 -3.0762 -0.8432 C 0 0 1 0 0 0 - 15.3587 -2.0157 -1.8435 C 0 0 0 0 0 0 - 16.0195 -2.3189 -3.0601 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4383 -1.2952 -3.9239 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1807 0.0504 -3.6165 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5427 0.4050 -2.4118 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2156 1.8211 -2.1137 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3567 2.3665 -0.8156 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9849 3.7006 -0.5364 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1555 4.3443 1.0546 Cl 0 0 0 0 0 0 - 14.4606 4.5126 -1.5547 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3209 3.9933 -2.8516 C 0 0 0 0 0 0 - 13.6519 4.9766 -4.0966 Cl 0 0 0 0 0 0 - 14.7046 2.6647 -3.1281 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1679 -0.6375 -1.5331 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0322 -4.5979 -1.0297 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8677 -5.3412 -2.3307 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2127 -5.2990 -1.6572 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2933 -2.8878 -0.6768 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4116 -2.9823 -1.5385 O 0 0 0 0 0 0 - 11.4700 -3.5572 1.7452 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7369 -1.8709 2.1445 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9529 -2.2895 0.6209 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6644 -2.1505 3.3042 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2403 -2.7836 0.7874 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2291 -3.3147 -3.3988 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9460 -1.5531 -4.8431 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4785 0.8091 -4.3260 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7506 1.7585 -0.0167 H 0 0 0 0 0 0 - 14.1590 5.5304 -1.3431 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5644 2.2798 -4.1277 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6627 -0.3618 -0.6207 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6222 -5.1529 -0.1846 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3021 -6.2723 -2.3064 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7452 -4.7530 -3.2261 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9717 -4.7217 -2.1490 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5741 -6.2027 -1.1702 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3568 -2.4023 3.0357 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 21 1 0 0 0 - 6 24 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 20 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --10.733 - -$$$$ -CAT-17f - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7867 -2.3695 1.0808 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1391 -2.6647 0.5894 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2724 -2.5929 1.3025 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3735 -2.3189 2.6079 N 0 0 0 0 0 0 - 15.3400 -2.8503 0.5494 N 0 3 0 0 0 0 - 15.0019 -3.1745 -0.8288 C 0 0 1 0 0 0 - 15.5499 -2.1167 -1.8053 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1751 -2.4939 -3.0176 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6123 -1.5162 -3.9228 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4089 -0.1561 -3.6430 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8123 0.2668 -2.4363 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5764 1.7076 -2.1750 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3708 2.6232 -3.2325 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0914 3.9313 -3.0640 N 0 0 0 0 0 0 - 15.0096 4.4072 -1.8089 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2273 3.6080 -0.6782 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1482 4.1902 0.6471 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0876 4.6561 1.7026 N 0 0 0 0 0 0 - 15.5205 2.2442 -0.8684 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4068 -0.7330 -1.5195 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5580 -4.5843 -1.0987 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8986 -5.8590 -0.6073 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9623 -5.5654 -2.0855 C 0 0 0 0 0 0 - 13.4651 -3.0501 -0.7487 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6345 -3.2045 -1.6492 O 0 0 0 0 0 0 - 11.6499 -2.7584 2.0897 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6364 -1.2905 1.1052 H 0 0 0 0 0 0 - 11.0202 -2.8063 0.4400 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5959 -2.0527 3.2086 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3057 -2.8324 0.8841 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3244 -3.5281 -3.2917 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0863 -1.8073 -4.8504 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7167 0.5624 -4.3857 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3884 2.2933 -4.2597 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7672 5.4560 -1.7113 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7081 1.6131 -0.0155 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9272 -0.4331 -0.5998 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6440 -4.6020 -1.0415 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5493 -6.6459 -0.2306 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9221 -5.8027 -0.1306 H 0 0 0 0 0 0 - 14.0276 -5.3112 -2.5720 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6526 -6.1497 -2.6918 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2970 -2.3098 3.0423 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 21 1 0 0 0 - 6 24 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 20 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 19 2 0 0 0 - 17 18 3 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.423 - -$$$$ -CAT-13i - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7066 -2.3243 1.1522 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0800 -2.5317 0.6754 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2034 -2.4301 1.3983 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2886 -2.2311 2.7108 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2911 -2.5895 0.6543 N 0 3 0 0 0 0 - 14.9789 -2.9821 -0.7080 C 0 0 2 0 0 0 - 15.4754 -4.4511 -0.8097 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0159 -5.2708 -1.9954 C 0 0 0 0 0 0 - 16.0514 -5.9027 -2.8811 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1860 -6.7771 -2.0216 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5532 -1.9672 -1.7162 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2219 -2.3572 -2.8994 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6507 -1.3904 -3.8245 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4179 -0.0251 -3.5806 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8037 0.4089 -2.3876 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5510 1.8451 -2.1204 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2562 2.7420 -3.1736 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9250 4.0879 -2.9144 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8974 4.5661 -1.5934 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2242 3.7028 -0.5356 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2032 4.2948 1.0849 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.5515 2.3585 -0.8014 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3871 -0.5807 -1.4698 C 0 0 0 0 0 0 - 13.4407 -2.8723 -0.6618 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6320 -3.0299 -1.5816 O 0 0 0 0 0 0 - 11.6045 -2.6345 2.1919 H 0 0 0 0 0 0 - 11.4528 -1.2670 1.0806 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9882 -2.8880 0.5564 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5001 -2.0136 3.3166 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2490 -2.5893 1.0094 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1583 -4.9961 0.0813 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5650 -4.4616 -0.7696 H 0 0 0 0 0 0 - 14.1142 -4.9159 -2.4837 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8387 -5.7722 -3.9334 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0974 -5.8246 -2.6005 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6529 -7.2541 -1.1618 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4212 -7.3678 -2.5220 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4112 -3.3885 -3.1398 H 0 0 0 0 0 0 - 17.1458 -1.6957 -4.7368 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7204 0.6932 -4.3262 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2353 2.3868 -4.1937 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6630 4.7530 -3.7239 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6225 5.5912 -1.3891 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7971 1.7149 0.0269 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8794 -0.2617 -0.5736 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2059 -2.2088 3.1539 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 46 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 1 0 0 0 - 6 24 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 31 1 0 0 0 - 7 32 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 10 37 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 23 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 23 2 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 22 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 41 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 42 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 43 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.273 - -$$$$ -CAT-17d - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 45 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7977 -2.3768 1.0760 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1459 -2.6842 0.5802 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2820 -2.6162 1.2890 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3880 -2.3333 2.5929 N 0 0 0 0 0 0 - 15.3451 -2.8870 0.5330 N 0 3 0 0 0 0 - 15.0000 -3.2006 -0.8473 C 0 0 1 0 0 0 - 15.5362 -2.1321 -1.8176 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1095 -2.4879 -3.0612 C 0 0 0 0 0 0 - 16.5405 -1.4924 -3.9515 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3829 -0.1350 -3.6257 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8368 0.2631 -2.3866 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6544 1.6970 -2.0542 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2127 2.1200 -0.7816 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1203 3.4931 -0.4934 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4606 4.4145 -1.4945 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8427 4.0423 -2.7276 N 0 0 0 0 0 0 - 15.9326 2.7223 -2.9846 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4332 -0.7556 -1.4907 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5628 -4.6033 -1.1362 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9337 -5.8832 -0.6203 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9467 -5.5942 -2.1006 C 0 0 0 0 0 0 - 13.4637 -3.0777 -0.7576 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6273 -3.2367 -1.6520 O 0 0 0 0 0 0 - 11.6615 -1.2961 1.1107 H 0 0 0 0 0 0 - 11.0248 -2.7976 0.4323 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6576 -2.7733 2.0815 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6132 -2.0582 3.1930 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3125 -2.8621 0.8622 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2237 -3.5177 -3.3675 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9793 -1.7687 -4.9004 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6906 0.6002 -4.3526 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9814 1.4015 -0.0100 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8167 3.8387 0.4829 H 0 0 0 0 0 0 - 15.4210 5.4767 -1.3017 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2303 2.4767 -3.9890 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9900 -0.4732 -0.5474 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6502 -4.6083 -1.1158 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9732 -5.8335 -0.1114 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6051 -6.6610 -0.2611 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9926 -5.3553 -2.5563 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6238 -6.1725 -2.7271 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3135 -2.3235 3.0234 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 19 1 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 18 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 29 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 18 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 17 35 1 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.423 - -$$$$ -CAT-13c - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 47 0 0 1 0 999 V2000 - 14.8243 -5.5742 -0.0947 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4101 -4.5803 -1.1308 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0445 -5.1774 -2.5045 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9998 -3.0811 -0.8556 C 0 0 2 0 0 0 - 15.6258 -1.9906 -1.7553 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4955 -2.2936 -2.8279 C 0 0 0 0 0 0 - 16.9111 -1.2926 -3.7153 C 0 0 0 0 0 0 - 16.5206 0.0385 -3.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7885 0.4123 -2.3599 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4739 1.8324 -2.0914 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1414 2.7151 -3.1458 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7981 4.0583 -2.8917 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7943 4.5475 -1.5747 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1524 3.6968 -0.5157 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1667 4.3072 1.0977 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.4905 2.3531 -0.7758 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3469 -0.6200 -1.5014 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3359 -2.7757 0.5285 N 0 3 0 0 0 0 - 14.2637 -2.5233 1.2771 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3552 -2.2987 2.5928 N 0 0 0 0 0 0 - 13.1359 -2.5504 0.5500 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7814 -2.2577 1.0358 C 0 0 0 0 0 0 - 13.4689 -2.8905 -0.7989 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6469 -3.0008 -1.7148 O 0 0 0 0 0 0 - 14.9202 -5.2280 0.9322 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7610 -5.7564 -0.2621 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3243 -6.5432 -0.1594 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4947 -4.6261 -1.0370 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5206 -6.1495 -2.6416 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9725 -5.3529 -2.5664 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3121 -4.5773 -3.3684 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8570 -3.2884 -3.0200 H 0 0 0 0 0 0 - 17.5257 -1.5537 -4.5674 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8153 0.7851 -4.2160 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1171 2.3517 -4.1629 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5198 4.7129 -3.7050 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5170 5.5730 -1.3742 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7714 1.7167 0.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7438 -0.3437 -0.6505 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2978 -2.7814 0.8714 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5760 -2.0345 3.1926 H 0 0 0 0 0 0 - 11.0172 -2.6393 0.3588 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6229 -2.7045 2.0161 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6547 -1.1800 1.1210 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2760 -2.3086 3.0316 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 18 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 17 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 34 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 17 2 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 16 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 20 45 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 -M CHG 1 18 1 -M END -> --9.323 - -$$$$ -CAT-17c - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 47 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7853 -2.3455 1.0634 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1441 -2.6062 0.5704 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2744 -2.5302 1.2878 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3686 -2.2901 2.6004 N 0 0 0 0 0 0 - 15.3478 -2.7494 0.5312 N 0 3 0 0 0 0 - 15.0177 -3.0661 -0.8502 C 0 0 1 0 0 0 - 15.5551 -1.9961 -1.8186 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2098 -2.3561 -3.0209 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6298 -1.3669 -3.9225 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3789 -0.0114 -3.6497 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7538 0.3922 -2.4512 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4596 1.8218 -2.1925 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1111 2.6867 -3.2564 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7531 4.0293 -3.0229 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7533 4.5399 -1.7148 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1249 3.7078 -0.6437 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1349 4.2481 0.7044 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1438 4.6818 1.7758 N 0 0 0 0 0 0 - 15.4757 2.3610 -0.8842 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3690 -0.6167 -1.5375 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5917 -4.4671 -1.1260 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9497 -5.7532 -0.6412 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0113 -5.4514 -2.1181 C 0 0 0 0 0 0 - 13.4793 -2.9638 -0.7730 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6533 -3.1192 -1.6780 O 0 0 0 0 0 0 - 11.6561 -2.7472 2.0690 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6120 -1.2696 1.0974 H 0 0 0 0 0 0 - 11.0290 -2.7929 0.4170 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5877 -2.0398 3.2034 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3113 -2.7407 0.8724 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3937 -3.3859 -3.2910 H 0 0 0 0 0 0 - 17.1250 -1.6496 -4.8417 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6709 0.7238 -4.3837 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0741 2.3090 -4.2679 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4546 4.6661 -3.8431 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4627 5.5666 -1.5361 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7579 1.7345 -0.0524 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8680 -0.3210 -0.6281 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6771 -4.4708 -1.0657 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6117 -6.5318 -0.2669 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9721 -5.7129 -0.1653 H 0 0 0 0 0 0 - 14.0736 -5.2076 -2.6034 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7105 -6.0225 -2.7268 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2904 -2.2843 3.0382 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 44 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 21 1 0 0 0 - 6 24 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 20 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 19 2 0 0 0 - 17 18 3 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.863 - -$$$$ -CAT-24 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - 15.3153 5.5063 2.8950 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2763 4.6943 1.6710 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2920 4.0725 0.6202 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3508 3.4487 -0.6906 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1653 4.2390 -1.8343 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2379 3.7478 -3.0807 N 0 0 0 0 0 0 - 15.4741 2.4308 -3.2306 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6500 1.5168 -2.1649 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8251 0.0635 -2.4272 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3445 -0.3778 -3.6611 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4139 -1.7402 -3.9775 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9405 -2.7037 -3.0749 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4459 -2.3239 -1.8037 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8513 -3.3203 -0.7684 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0823 -4.8499 -0.8614 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8182 -5.7095 -2.0747 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2251 -5.5702 -1.5443 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2665 -2.9519 0.5806 N 0 3 0 0 0 0 - 14.2391 -2.5906 1.3479 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3969 -2.2856 2.6385 N 0 0 0 0 0 0 - 13.0817 -2.6029 0.6692 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7632 -2.2010 1.1743 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3393 -3.0536 -0.6601 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4758 -3.1864 -1.5335 O 0 0 0 0 0 0 - 15.4218 -0.9298 -1.5003 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6013 2.0714 -0.8642 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7230 6.4085 2.7703 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9101 4.9397 3.7303 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3443 5.7817 3.1250 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9637 5.2976 -1.7524 H 0 0 0 0 0 0 - 15.4797 2.0984 -4.2571 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6786 0.3258 -4.4064 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8075 -2.0384 -4.9385 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9686 -3.7185 -3.4242 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7743 -5.3363 0.0640 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3147 -6.6618 -1.9195 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5666 -5.2132 -3.0007 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9323 -5.0170 -2.1448 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6531 -6.4222 -1.0195 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2430 -2.9601 0.8794 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6498 -1.9784 3.2585 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9579 -2.6949 0.6300 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6593 -2.4477 2.2305 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6439 -1.1246 1.0545 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0153 -0.6036 -0.5544 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7574 1.4435 -0.0039 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3336 -2.3087 3.0440 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 3 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 31 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 26 2 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 25 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 18 1 0 0 0 - 14 23 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 36 1 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 20 47 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 -M CHG 1 18 1 -M END -> --11.35 - -$$$$ -CAT-17i - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 15.2932 4.2915 1.0147 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2616 3.7480 -0.3995 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9085 4.5739 -1.4751 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8944 4.1495 -2.7538 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2063 2.8612 -2.9971 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5301 1.9161 -2.0030 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7496 0.4844 -2.3447 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2883 0.1102 -3.5962 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4392 -1.2422 -3.9406 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9908 -2.2528 -3.0810 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4339 -1.9362 -1.8222 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8689 -2.9894 -0.8318 C 0 0 1 0 0 0 - 15.1312 -4.5068 -0.9958 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8281 -5.2744 -2.2582 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2398 -5.2146 -1.7420 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2808 -2.6745 0.5323 N 0 3 0 0 0 0 - 14.2359 -2.5141 1.3440 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3825 -2.3702 2.6646 N 0 0 0 0 0 0 - 13.0741 -2.5549 0.6745 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7278 -2.4944 1.2586 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3510 -2.7948 -0.7027 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4937 -2.8958 -1.5869 O 0 0 0 0 0 0 - 15.3607 -0.5585 -1.4665 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5842 2.4020 -0.6755 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4087 3.9655 1.5522 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1711 3.9455 1.5624 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3062 5.3818 1.0335 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6629 5.6160 -1.3152 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1107 2.5630 -4.0300 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5894 0.8517 -4.3192 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8753 -1.5226 -4.8866 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0871 -3.2506 -3.4660 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8189 -5.0590 -0.1094 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2625 -6.1991 -2.1472 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5937 -4.6809 -3.1257 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9418 -4.6586 -2.3398 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6559 -6.1052 -1.2662 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2575 -2.7098 0.8299 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6314 -2.1095 3.3027 H 0 0 0 0 0 0 - 11.0150 -2.0181 0.5837 H 0 0 0 0 0 0 - 11.3726 -3.5009 1.4847 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7558 -1.9447 2.1954 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9119 -0.3026 -0.5173 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8494 1.7412 0.1319 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3265 -2.3620 3.0533 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 24 2 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 23 2 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 12 21 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 1 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 18 45 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 -M CHG 1 16 1 -M END -> --9.473 - -$$$$ -CAT-13g - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 55 0 0 1 0 999 V2000 - 11.6820 -2.1707 1.3298 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9759 -2.4302 0.6898 N 0 0 0 0 0 0 - 14.1857 -2.5033 1.2745 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4361 -2.3451 2.5798 N 0 0 0 0 0 0 - 15.1499 -2.7842 0.3899 N 0 3 0 0 0 0 - 14.6008 -2.9822 -0.9565 C 0 0 1 0 0 0 - 15.1276 -1.9196 -1.9457 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4911 -2.2559 -3.2691 C 0 0 0 0 0 0 - 16.0026 -1.2814 -4.1316 C 0 0 0 0 0 0 - 16.0562 0.0656 -3.7342 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6099 0.4645 -2.4549 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4769 1.9021 -2.1038 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1741 2.8578 -3.1038 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9081 4.2029 -2.7794 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9471 4.6239 -1.4406 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2835 3.7048 -0.4343 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3415 4.2337 1.2070 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.5532 2.3613 -0.7659 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2059 -0.5552 -1.5583 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7887 -4.4804 -1.3903 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2630 -4.8725 -1.6061 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3888 -6.2770 -2.2013 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8131 -7.2996 -1.2236 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3456 -6.9746 -0.9188 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1673 -5.5282 -0.4194 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1177 -2.6879 -0.7028 C 0 0 0 0 0 0 - 12.1860 -2.7189 -1.5139 O 0 0 0 0 0 0 - 11.3564 -1.1585 1.0940 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9228 -2.8632 0.9660 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7457 -2.2845 2.4102 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7416 -2.0408 3.2608 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1420 -2.8464 0.6123 H 0 0 0 0 0 0 - 15.4232 -3.2618 -3.6536 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3339 -1.5765 -5.1141 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4155 0.7934 -4.4473 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0829 2.5513 -4.1351 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6436 4.9090 -3.5548 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7210 5.6482 -1.1823 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7987 1.6737 0.0263 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8764 -0.2706 -0.5717 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2658 -4.6096 -2.3387 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7767 -4.1756 -2.2561 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7869 -4.8372 -0.6499 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4336 -6.5015 -2.4013 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8707 -6.3310 -3.1600 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9010 -8.3040 -1.6298 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4015 -7.2923 -0.3053 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7480 -7.1276 -1.8192 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9654 -7.6729 -0.1726 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6309 -5.4382 0.5640 H 0 0 0 0 0 0 - 13.1008 -5.3581 -0.2716 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3986 -2.4098 2.9173 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 52 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 19 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 22 45 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 46 1 0 0 0 - 23 47 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 48 1 0 0 0 - 24 49 1 0 0 0 - 25 50 1 0 0 0 - 25 51 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.093 - -$$$$ -CAT-4j - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7106 -2.3098 1.2658 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0313 -2.6523 0.7225 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2010 -2.6281 1.3773 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3777 -2.3568 2.6732 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2217 -2.9197 0.5738 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7965 -3.2519 -0.7875 C 0 0 2 0 0 0 - 15.1409 -4.7334 -1.0690 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3619 -5.2517 -0.5871 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7322 -6.5909 -0.7921 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8605 -7.4582 -1.4613 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6405 -6.9706 -1.9577 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2904 -5.6173 -1.7762 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3794 -2.2443 -1.7949 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9522 -2.6550 -3.0208 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4340 -1.6937 -3.9273 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3364 -0.3224 -3.6308 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7943 0.1250 -2.4073 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6711 1.5693 -2.0915 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3832 2.0354 -0.7903 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3534 3.4188 -0.5357 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5968 4.3049 -1.5946 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8275 3.8920 -2.8511 N 0 0 0 0 0 0 - 15.8598 2.5642 -3.0762 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3327 -0.8573 -1.5012 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2767 -3.0094 -0.6368 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3981 -3.0674 -1.5055 O 0 0 0 0 0 0 - 10.9186 -2.8652 0.7627 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6549 -2.5324 2.3309 H 0 0 0 0 0 0 - 11.5236 -1.2463 1.1212 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3227 -2.3603 3.0599 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2013 -2.9156 0.8573 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0269 -4.6213 -0.0258 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6766 -6.9514 -0.4085 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1303 -8.4936 -1.5737 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9707 -7.6399 -2.4763 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3494 -5.2829 -2.1753 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0279 -3.7000 -3.2902 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8721 -2.0019 -4.8662 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6873 0.3855 -4.3650 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2242 1.3425 0.0224 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1720 3.8040 0.4552 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6063 5.3721 -1.4290 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0319 2.2854 -4.1007 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8915 -0.5357 -0.5697 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6376 -2.0619 3.3080 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 45 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 24 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 24 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.023 - -$$$$ -CAT-17b - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - 14.8884 4.7758 1.2264 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4957 3.5598 0.8392 O 0 0 0 0 0 0 - 15.4238 3.2070 -0.4882 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1334 4.1078 -1.5370 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1104 3.6468 -2.8636 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3679 2.2912 -3.1537 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6266 1.3615 -2.1168 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8148 -0.0835 -2.3955 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3949 -0.4894 -3.6079 C 0 0 0 0 0 0 - 16.5054 -1.8465 -3.9388 C 0 0 0 0 0 0 - 16.0401 -2.8367 -3.0545 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4687 -2.4844 -1.8058 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8765 -3.4953 -0.7767 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0969 -5.0253 -0.8826 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8831 -5.8408 -2.1342 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2579 -5.7566 -1.5174 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2831 -3.1271 0.5768 N 0 3 0 0 0 0 - 14.2456 -2.7938 1.3470 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3920 -2.4607 2.6335 N 0 0 0 0 0 0 - 13.0879 -2.8500 0.6736 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7608 -2.5496 1.2227 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3577 -3.2550 -0.6672 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4975 -3.3906 -1.5423 O 0 0 0 0 0 0 - 15.3879 -1.0935 -1.4999 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6597 1.8544 -0.7971 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9248 4.8682 2.3123 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3955 5.6327 0.7976 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8484 4.8040 0.9119 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9345 5.1528 -1.3550 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8807 4.3379 -3.6572 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3228 1.9594 -4.1830 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7454 0.2546 -4.3045 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9433 -2.1069 -4.8912 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1427 -3.8499 -3.3919 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7320 -5.5257 0.0163 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3435 -6.7811 -2.0394 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6921 -5.3031 -3.0518 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0103 -5.2043 -2.0606 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6257 -6.6394 -0.9948 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2616 -3.0818 0.8652 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6434 -2.1215 3.2365 H 0 0 0 0 0 0 - 11.8062 -1.5722 1.6900 H 0 0 0 0 0 0 - 11.4779 -3.2829 1.9791 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9878 -2.5218 0.4540 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9339 -0.7828 -0.5721 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8580 1.1777 0.0148 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3342 -2.4335 3.0256 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 25 2 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 24 2 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 17 1 0 0 0 - 13 22 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 19 47 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 21 44 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 -M CHG 1 17 1 -M END -> --10.023 - -$$$$ -CAT-4p - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7149 -2.1704 1.1859 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0472 -2.4713 0.6536 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2073 -2.4898 1.3303 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3600 -2.2952 2.6436 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2417 -2.7547 0.5321 N 0 3 0 0 0 0 - 14.8171 -3.0611 -0.8292 C 0 0 2 0 0 0 - 15.0768 -4.5789 -1.0201 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2713 -5.5612 -0.3782 C 0 0 0 0 0 0 - 14.5686 -6.9356 -0.4681 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6910 -7.3652 -1.1928 C 0 0 0 0 0 0 - 16.5199 -6.4110 -1.8044 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2187 -5.0421 -1.7029 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3780 -2.0329 -1.8475 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7357 -2.3799 -3.1722 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2339 -1.4073 -4.0511 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2513 -0.0546 -3.6768 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7990 0.3581 -2.4048 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6221 1.8005 -2.0870 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3734 2.7533 -3.1057 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0850 4.0531 -2.8896 N 0 0 0 0 0 0 - 15.0307 4.4848 -1.6166 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2978 3.6534 -0.5188 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2309 4.2780 1.0891 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.6053 2.3015 -0.7646 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4326 -0.6575 -1.4875 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3072 -2.7857 -0.7105 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4451 -2.8374 -1.5962 O 0 0 0 0 0 0 - 11.5254 -1.1038 1.0825 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9386 -2.7031 0.6371 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6394 -2.4492 2.2396 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2990 -2.3284 3.0413 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2148 -2.8176 0.8299 H 0 0 0 0 0 0 - 13.4192 -5.2900 0.2243 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9459 -7.6597 0.0349 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9302 -8.4166 -1.2496 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4132 -6.7098 -2.3269 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9005 -4.3392 -2.1394 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6492 -3.3892 -3.5499 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5692 -1.6944 -5.0379 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5827 0.6667 -4.4089 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3362 2.4537 -4.1431 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7753 5.5228 -1.4712 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8106 1.6512 0.0680 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0959 -0.3618 -0.5079 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6147 -2.0122 3.2793 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 45 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 40 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 25 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 24 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --10.083 - -$$$$ -CAT-17h - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 45 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7876 -2.3629 1.0753 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1411 -2.6519 0.5831 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2738 -2.5824 1.2973 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3737 -2.3175 2.6048 N 0 0 0 0 0 0 - 15.3423 -2.8322 0.5428 N 0 3 0 0 0 0 - 15.0054 -3.1469 -0.8380 C 0 0 1 0 0 0 - 15.5491 -2.0803 -1.8069 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1588 -2.4454 -3.0305 C 0 0 0 0 0 0 - 16.5920 -1.4580 -3.9273 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4001 -0.0996 -3.6280 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8193 0.3104 -2.4088 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5975 1.7479 -2.1182 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3876 2.6890 -3.1521 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1194 3.9953 -2.9527 N 0 0 0 0 0 0 - 15.0499 4.4405 -1.6849 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2748 3.6152 -0.5724 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1922 4.2577 1.0276 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.5592 2.2562 -0.8005 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4167 -0.6999 -1.5023 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5681 -4.5517 -1.1183 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9253 -5.8313 -0.6183 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9664 -5.5372 -2.0971 C 0 0 0 0 0 0 - 13.4684 -3.0281 -0.7573 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6385 -3.1793 -1.6592 O 0 0 0 0 0 0 - 11.0228 -2.8008 0.4334 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6523 -2.7549 2.0833 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6336 -1.2845 1.1023 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5957 -2.0540 3.2061 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3077 -2.8168 0.8784 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2986 -3.4771 -3.3189 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0552 -1.7421 -4.8626 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7063 0.6263 -4.3648 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3927 2.3806 -4.1861 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8134 5.4864 -1.5542 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7498 1.6090 0.0382 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9482 -0.4103 -0.5739 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6547 -4.5613 -1.0761 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5873 -6.6129 -0.2503 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9555 -5.7814 -0.1275 H 0 0 0 0 0 0 - 14.0224 -5.2918 -2.5696 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6527 -6.1160 -2.7131 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2970 -2.3102 3.0396 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 23 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 19 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --10.333 - -$$$$ -CAT-4b - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 53 0 0 1 0 999 V2000 - 14.8899 4.8693 1.3571 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4910 3.6586 0.9338 O 0 0 0 0 0 0 - 15.4559 3.3612 -0.4093 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2031 4.3048 -1.4284 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2285 3.9017 -2.7752 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4668 2.5539 -3.1146 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6673 1.5796 -2.1106 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7986 0.1373 -2.4299 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3443 -0.3086 -3.6508 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4510 -1.6809 -3.9432 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9729 -2.6431 -3.0346 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3929 -2.2324 -1.8118 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8068 -3.2363 -0.8026 C 0 0 1 0 0 0 - 15.1478 -4.7199 -1.0797 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3640 -5.2427 -0.5907 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7306 -6.5834 -0.7927 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8591 -7.4486 -1.4649 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6428 -6.9571 -1.9662 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2970 -5.6023 -1.7883 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2301 -2.9023 0.5590 N 0 3 0 0 0 0 - 14.2089 -2.6079 1.3610 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3832 -2.3403 2.6584 N 0 0 0 0 0 0 - 13.0407 -2.6284 0.7035 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7206 -2.2789 1.2434 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2873 -2.9901 -0.6544 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4095 -3.0491 -1.5239 O 0 0 0 0 0 0 - 15.3375 -0.8450 -1.5242 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6869 2.0224 -0.7698 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8788 4.9111 2.4463 H 0 0 0 0 0 0 - 15.4282 5.7406 0.9982 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8628 4.9310 1.0041 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0044 5.3416 -1.2030 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0424 4.6344 -3.5450 H 0 0 0 0 0 0 - 15.4460 2.2647 -4.1552 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6912 0.4067 -4.3795 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8947 -1.9888 -4.8795 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0546 -3.6885 -3.3003 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0284 -4.6144 -0.0264 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6721 -6.9466 -0.4046 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1254 -8.4852 -1.5758 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9725 -7.6251 -2.4858 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3587 -5.2647 -2.1904 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2092 -2.9002 0.8445 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6426 -2.0451 3.2923 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9257 -2.8241 0.7338 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6592 -2.5072 2.3069 H 0 0 0 0 0 0 - 11.5441 -1.2128 1.1041 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8871 -0.5182 -0.5990 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8627 1.3168 0.0227 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3275 -2.3481 3.0471 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 34 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 28 2 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 27 2 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 20 1 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 22 50 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 24 46 1 0 0 0 - 24 47 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M CHG 1 20 1 -M END -> --9.633 - -$$$$ -CAT-17g - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 45 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7983 -2.3992 1.0873 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1443 -2.7114 0.5887 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2829 -2.6375 1.2928 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3925 -2.3414 2.5935 N 0 0 0 0 0 0 - 15.3435 -2.9154 0.5357 N 0 3 0 0 0 0 - 14.9934 -3.2409 -0.8409 C 0 0 1 0 0 0 - 15.5293 -2.1817 -1.8225 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1088 -2.5505 -3.0596 C 0 0 0 0 0 0 - 16.5416 -1.5649 -3.9599 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3804 -0.2048 -3.6507 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8269 0.2069 -2.4200 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6415 1.6448 -2.1094 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4595 2.6157 -3.1212 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2266 3.9242 -2.8892 N 0 0 0 0 0 0 - 15.1698 4.3401 -1.6094 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3731 3.4813 -0.5178 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3297 3.9442 0.7545 F 0 0 0 0 0 0 - 15.6171 2.1235 -0.7816 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4212 -0.8013 -1.5126 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5511 -4.6479 -1.1200 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9107 -5.9232 -0.6062 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9367 -5.6375 -2.0871 C 0 0 0 0 0 0 - 13.4575 -3.1148 -0.7473 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6184 -3.2763 -1.6385 O 0 0 0 0 0 0 - 11.6583 -2.7981 2.0920 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6668 -1.3181 1.1257 H 0 0 0 0 0 0 - 11.0222 -2.8146 0.4440 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6188 -2.0644 3.1944 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3119 -2.8865 0.8616 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2272 -3.5834 -3.3537 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9848 -1.8491 -4.9043 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6901 0.5209 -4.3861 H 0 0 0 0 0 0 - 15.4607 2.3332 -4.1627 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9602 5.3877 -1.4506 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7909 1.4551 0.0429 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9728 -0.5100 -0.5744 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6384 -4.6589 -1.0912 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5745 -6.7044 -0.2407 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9463 -5.8678 -0.1054 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9883 -5.3931 -2.5517 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6154 -6.2214 -2.7067 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3190 -2.3296 3.0221 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 23 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 19 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.743 - -$$$$ -CAT-4d - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 56 0 0 1 0 999 V2000 - 15.3108 5.3150 2.5947 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9695 5.0166 1.1353 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4867 3.7530 0.7556 O 0 0 0 0 0 0 - 15.3578 3.3823 -0.5664 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9827 4.2577 -1.6137 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9085 3.7845 -2.9347 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1871 2.4352 -3.2242 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5189 1.5300 -2.1923 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7100 0.0902 -2.4691 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2931 -0.3588 -3.6707 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4451 -1.7318 -3.9338 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9768 -2.6888 -3.0146 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3665 -2.2720 -1.8078 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7938 -3.2738 -0.7900 C 0 0 1 0 0 0 - 15.1445 -4.7550 -1.0654 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3023 -5.6423 -1.7785 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6606 -6.9934 -1.9603 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8808 -7.4748 -1.4583 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7449 -6.6035 -0.7847 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3663 -5.2668 -0.5791 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2242 -2.9268 0.5660 N 0 3 0 0 0 0 - 14.2063 -2.6297 1.3714 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3866 -2.3466 2.6644 N 0 0 0 0 0 0 - 13.0337 -2.6641 0.7225 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7158 -2.3156 1.2686 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2730 -3.0392 -0.6331 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3895 -3.1129 -1.4956 O 0 0 0 0 0 0 - 15.2700 -0.8819 -1.5451 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6147 2.0341 -0.8762 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9231 6.2866 2.8965 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8805 4.5681 3.2559 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3871 5.3163 2.7612 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8916 5.0226 0.9896 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3901 5.8038 0.5183 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7479 5.2966 -1.4414 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6159 4.4614 -3.7233 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0996 2.0870 -4.2435 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6339 0.3564 -4.4035 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9147 -2.0429 -4.8560 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0919 -3.7359 -3.2602 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3612 -5.3121 -2.1813 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9960 -7.6656 -2.4822 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1584 -8.5082 -1.5702 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6914 -6.9583 -0.4009 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0280 -4.6320 -0.0186 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2050 -2.9147 0.8451 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6481 -2.0490 3.2996 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9192 -2.8646 0.7659 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6611 -2.5397 2.3334 H 0 0 0 0 0 0 - 11.5357 -1.2504 1.1266 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8040 -0.5415 -0.6317 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8747 1.3712 -0.0684 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3329 -2.3473 3.0483 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 33 1 0 0 0 - 2 34 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 36 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 37 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 29 2 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 38 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 39 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 21 1 0 0 0 - 14 26 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 41 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 44 1 0 0 0 - 20 45 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 46 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 23 47 1 0 0 0 - 23 53 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 25 48 1 0 0 0 - 25 49 1 0 0 0 - 25 50 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 28 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 -M CHG 1 21 1 -M END -> --9.113 - -$$$$ -CAT-4m - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - 15.2085 4.1243 0.7011 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3093 3.5222 -0.6861 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1283 4.3252 -1.8220 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2147 3.8466 -3.0718 N 0 0 0 0 0 0 - 15.4530 2.5306 -3.2366 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6153 1.6087 -2.1788 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7868 0.1570 -2.4348 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3707 -0.3092 -3.6317 C 0 0 0 0 0 0 - 16.5066 -1.6828 -3.8950 C 0 0 0 0 0 0 - 16.0172 -2.6317 -2.9816 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4025 -2.2056 -1.7814 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8026 -3.2086 -0.7801 C 0 0 1 0 0 0 - 15.1320 -4.6947 -1.0609 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2712 -5.5707 -1.7659 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6073 -6.9273 -1.9484 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8240 -7.4275 -1.4572 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7057 -6.5689 -0.7893 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3487 -5.2261 -0.5817 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2233 -2.8833 0.5825 N 0 3 0 0 0 0 - 14.1991 -2.6017 1.3845 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3717 -2.3498 2.6843 N 0 0 0 0 0 0 - 13.0321 -2.6160 0.7246 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7078 -2.2824 1.2642 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2839 -2.9557 -0.6374 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4104 -2.9973 -1.5122 O 0 0 0 0 0 0 - 15.3260 -0.8127 -1.5146 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5648 2.1498 -0.8756 C 0 0 0 0 0 0 - 16.0316 3.7903 1.3335 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2299 5.2141 0.6616 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2698 3.8305 1.1666 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9149 5.3799 -1.7273 H 0 0 0 0 0 0 - 15.4710 2.1996 -4.2636 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7223 0.3878 -4.3751 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9757 -2.0017 -4.8152 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1174 -3.6800 -3.2289 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3311 -5.2285 -2.1606 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9284 -7.5908 -2.4623 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0818 -8.4658 -1.5745 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6490 -6.9379 -0.4113 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0227 -4.6017 -0.0248 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2018 -2.8881 0.8703 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6303 -2.0608 3.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9229 -2.8522 0.7663 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6536 -2.4945 2.3313 H 0 0 0 0 0 0 - 11.5087 -1.2228 1.1074 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8550 -0.4759 -0.6034 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7154 1.5136 -0.0204 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3155 -2.3598 3.0735 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 27 2 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 48 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 -M CHG 1 19 1 -M END -> --9.153 - -$$$$ -CAT-13e - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 11.8366 -2.0143 1.1169 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1188 -2.4437 0.5483 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2835 -2.6029 1.1994 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4756 -2.4186 2.5137 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2647 -2.9842 0.3717 N 0 3 0 0 0 0 - 14.8037 -3.0771 -1.0176 C 0 0 1 0 0 0 - 15.4609 -2.0005 -1.9043 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1507 -2.3399 -3.0923 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6412 -1.3353 -3.9384 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4312 0.0173 -3.6223 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8006 0.4013 -2.4216 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5617 1.8313 -2.1119 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2806 2.7552 -3.1459 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9680 4.0995 -2.8611 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9450 4.5495 -1.5306 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2585 3.6600 -0.4907 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2530 4.2287 1.1379 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.5642 2.3147 -0.7822 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3492 -0.6258 -1.5607 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9081 -4.5247 -1.5628 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2085 -5.3448 -1.4851 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3498 -6.6076 -1.3805 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2260 -5.7116 -0.8517 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3175 -2.7297 -0.8331 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4290 -2.7005 -1.6920 O 0 0 0 0 0 0 - 10.9979 -2.4909 0.6089 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7343 -0.9359 1.0001 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7740 -2.2620 2.1758 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7626 -2.0742 3.1546 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2456 -3.0537 0.6408 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3017 -3.3615 -3.4049 H 0 0 0 0 0 0 - 17.1519 -1.6038 -4.8532 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7592 0.7670 -4.3239 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2563 2.4232 -4.1736 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7191 4.7841 -3.6584 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6860 5.5743 -1.3054 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7996 1.6478 0.0301 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8418 -0.3405 -0.6514 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5534 -4.5487 -2.5962 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7847 -5.1575 -0.5771 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8343 -5.3103 -2.3764 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1204 -7.0484 -2.3536 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7159 -7.3538 -0.6741 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2345 -5.6344 0.2373 H 0 0 0 0 0 0 - 13.2338 -5.9638 -1.2299 H 0 0 0 0 0 0 - 15.4219 -2.4979 2.8926 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 46 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 6 24 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 19 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.963 - -$$$$ -CAT-4n - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 11.6953 -2.1436 1.3064 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0025 -2.3990 0.6999 N 0 0 0 0 0 0 - 14.1917 -2.4863 1.3202 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4011 -2.3559 2.6348 N 0 0 0 0 0 0 - 15.1812 -2.7373 0.4600 N 0 3 0 0 0 0 - 14.6758 -2.9528 -0.8941 C 0 0 2 0 0 0 - 14.8451 -4.4626 -1.1964 C 0 0 0 0 0 0 - 16.0866 -4.9310 -1.6683 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3077 -6.2911 -1.9317 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3010 -7.2305 -1.6613 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0785 -6.8053 -1.1182 C 0 0 0 0 0 0 - 13.8521 -5.4364 -0.8930 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2714 -1.9272 -1.8915 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7220 -2.2895 -3.1819 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2633 -1.3220 -4.0414 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2448 0.0372 -3.6846 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7216 0.4597 -2.4444 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5143 1.8981 -2.1461 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2248 2.8239 -3.1772 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9106 4.1194 -2.9755 N 0 0 0 0 0 0 - 14.8694 4.5737 -1.7085 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1718 3.7657 -0.6025 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1261 4.3202 0.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0921 4.7635 1.8043 N 0 0 0 0 0 0 - 15.5071 2.4172 -0.8297 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3076 -0.5489 -1.5396 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1927 -2.6018 -0.6954 C 0 0 0 0 0 0 - 12.2932 -2.5477 -1.5429 O 0 0 0 0 0 0 - 11.3749 -1.1305 1.0630 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9510 -2.8405 0.9208 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7360 -2.2652 2.3861 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3521 -2.4194 2.9993 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1636 -2.8377 0.7119 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8740 -4.2216 -1.8420 H 0 0 0 0 0 0 - 17.2613 -6.6012 -2.3267 H 0 0 0 0 0 0 - 15.4672 -8.2799 -1.8381 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3211 -7.5360 -0.8632 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9015 -5.1786 -0.4575 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6765 -3.3054 -3.5439 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6581 -1.6222 -5.0016 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6034 0.7570 -4.4053 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1797 2.5037 -4.2055 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5905 5.6109 -1.5790 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7415 1.7791 0.0069 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9206 -0.2492 -0.5793 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6860 -2.0579 3.2949 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 4 46 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 34 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 40 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 41 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 26 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 25 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 2 0 0 0 - 23 24 3 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.093 - -$$$$ -CAT-4o - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7084 -2.3338 1.2794 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0266 -2.6810 0.7326 N 0 0 0 0 0 0 - 14.1992 -2.6485 1.3818 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3805 -2.3629 2.6740 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2171 -2.9463 0.5767 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7859 -3.2915 -0.7797 C 0 0 2 0 0 0 - 15.1324 -4.7732 -1.0532 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3613 -5.2807 -0.5804 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7387 -6.6176 -0.7849 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8669 -7.4924 -1.4441 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6403 -7.0146 -1.9346 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2822 -5.6634 -1.7534 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3657 -2.2949 -1.7994 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9428 -2.7229 -3.0177 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4289 -1.7756 -3.9354 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3313 -0.4018 -3.6588 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7806 0.0634 -2.4467 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6535 1.5125 -2.1627 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5223 2.4731 -3.1915 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3349 3.7923 -2.9798 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2791 4.2298 -1.7075 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4382 3.3818 -0.6010 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3969 3.8651 0.6639 F 0 0 0 0 0 0 - 15.6332 2.0125 -0.8425 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3159 -0.9039 -1.5258 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2665 -3.0500 -0.6247 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3849 -3.1140 -1.4898 O 0 0 0 0 0 0 - 11.6546 -2.5575 2.3444 H 0 0 0 0 0 0 - 11.5253 -1.2693 1.1369 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9127 -2.8852 0.7778 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3266 -2.3640 3.0584 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1979 -2.9384 0.8564 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0279 -4.6431 -0.0286 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6887 -6.9709 -0.4083 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1441 -8.5259 -1.5531 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9717 -7.6887 -2.4493 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3373 -5.3355 -2.1499 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0205 -3.7712 -3.2733 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8708 -2.0939 -4.8684 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6871 0.2931 -4.4026 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5278 2.1752 -4.2289 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1001 5.2853 -1.5665 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7726 1.3513 -0.0059 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8706 -0.5694 -0.6006 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6417 -2.0667 3.3098 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 45 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 40 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 25 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 24 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.383 - -$$$$ -CAT-4a - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7155 -2.2816 1.2489 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0381 -2.6195 0.7079 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2057 -2.6014 1.3666 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3786 -2.3437 2.6660 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2286 -2.8858 0.5635 N 0 3 0 0 0 0 - 14.8076 -3.2129 -0.8000 C 0 0 2 0 0 0 - 15.1467 -4.6965 -1.0818 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3603 -5.2248 -0.5917 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7228 -6.5667 -0.7953 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8495 -7.4280 -1.4705 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6354 -6.9314 -1.9715 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2942 -5.5755 -1.7923 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3967 -2.2027 -1.8015 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9974 -2.6085 -3.0157 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4805 -1.6424 -3.9173 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3578 -0.2708 -3.6263 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7919 0.1718 -2.4127 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6399 1.6146 -2.0981 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4538 2.5838 -3.1120 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2099 3.9358 -2.7897 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1604 4.3485 -1.4470 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3892 3.4118 -0.4273 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6325 2.0660 -0.7583 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3278 -0.8153 -1.5134 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2876 -2.9675 -0.6530 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4113 -3.0211 -1.5243 O 0 0 0 0 0 0 - 11.5248 -1.2189 1.1026 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9265 -2.8405 0.7450 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6590 -2.5032 2.3142 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3225 -2.3533 3.0553 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2073 -2.8876 0.8505 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0256 -4.6002 -0.0248 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6623 -6.9337 -0.4062 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1115 -8.4656 -1.5844 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9632 -7.5967 -2.4917 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3568 -5.2350 -2.1940 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0917 -3.6532 -3.2801 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9372 -1.9475 -4.8486 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7044 0.4465 -4.3531 H 0 0 0 0 0 0 - 15.4494 2.2872 -4.1504 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0281 4.6607 -3.5680 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9459 5.3789 -1.2001 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3642 3.7204 0.6078 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8121 1.3687 0.0406 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8644 -0.4921 -0.5938 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6372 -2.0531 3.3011 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 46 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 24 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 24 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --7.933 - -$$$$ -CAT-13j - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 11.6961 -2.2645 1.2649 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0215 -2.5154 0.6888 N 0 0 0 0 0 0 - 14.1987 -2.5219 1.3336 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3751 -2.3542 2.6485 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2238 -2.7253 0.5042 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7664 -3.0195 -0.8502 C 0 0 1 0 0 0 - 15.3113 -1.9904 -1.8759 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6769 -2.3426 -3.1986 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1753 -1.3675 -4.0760 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1926 -0.0120 -3.7018 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7284 0.3995 -2.4340 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5348 1.8413 -2.1135 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2021 2.7617 -3.1388 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8789 4.1032 -2.8499 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8908 4.5603 -1.5223 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2551 3.6784 -0.4913 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2846 4.2505 1.1365 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.5764 2.3370 -0.7867 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3578 -0.6128 -1.5167 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0379 -4.5318 -1.0582 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1911 -4.9954 -1.7182 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4400 -6.3687 -1.8207 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5365 -7.2607 -1.2303 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4411 -6.7307 -0.5352 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2062 -5.4075 -0.4355 N 0 0 0 0 0 0 - 13.2558 -2.7592 -0.6949 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3797 -2.7353 -1.5715 O 0 0 0 0 0 0 - 11.6759 -2.5192 2.3233 H 0 0 0 0 0 0 - 11.4474 -1.2118 1.1456 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9325 -2.8547 0.7588 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3191 -2.3803 3.0344 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1999 -2.8167 0.7852 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6011 -3.3569 -3.5737 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5117 -1.6644 -5.0572 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5310 0.7127 -4.4277 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1296 2.4285 -4.1639 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5891 4.7792 -3.6409 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6215 5.5821 -1.2918 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8355 1.6817 0.0279 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0131 -0.3137 -0.5390 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8852 -4.2982 -2.1487 H 0 0 0 0 0 0 - 17.3214 -6.7175 -2.3297 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6892 -8.3285 -1.2778 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7478 -7.3825 -0.0239 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6328 -2.0835 3.2913 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 45 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 19 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --8.733 - -$$$$ -CAT-13h - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 11.7684 -1.9959 1.1324 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0773 -2.4188 0.6254 N 0 0 0 0 0 0 - 14.2291 -2.5040 1.3137 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3929 -2.2698 2.6191 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2451 -2.8865 0.5393 N 0 3 0 0 0 0 - 14.8082 -3.1964 -0.8186 C 0 0 1 0 0 0 - 15.4852 -2.1794 -1.7990 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1731 -2.5185 -2.9932 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6532 -1.5251 -3.8618 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4491 -0.1688 -3.5713 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8247 0.2326 -2.3765 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5945 1.6726 -2.0932 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3339 2.5855 -3.1442 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0299 3.9370 -2.8820 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0030 4.4103 -1.5608 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3015 3.5355 -0.5053 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2995 4.1388 1.1106 Cl 0 0 0 0 0 0 - 15.5922 2.1813 -0.7728 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3791 -0.7861 -1.4997 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9144 -4.7626 -0.9856 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1547 -5.5339 0.1086 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8874 -5.4504 -2.3330 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1530 -5.4449 -1.5196 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3202 -2.8066 -0.7246 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4613 -2.8390 -1.6128 O 0 0 0 0 0 0 - 11.6694 -2.2266 2.1924 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6575 -0.9215 0.9898 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9559 -2.4934 0.6024 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6578 -1.9498 3.2470 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2187 -2.9494 0.8388 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3613 -3.5214 -3.3226 H 0 0 0 0 0 0 - 17.1603 -1.8031 -4.7762 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7780 0.5693 -4.2846 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3170 2.2428 -4.1689 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7867 4.6128 -3.6877 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7514 5.4411 -1.3547 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8182 1.5269 0.0513 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8801 -0.4710 -0.5956 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4413 -5.2246 1.1136 H 0 0 0 0 0 0 - 13.0753 -5.4266 -0.0014 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3669 -6.6018 0.0392 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3561 -6.3971 -2.4158 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8225 -4.8302 -3.2131 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9645 -4.8200 -1.8430 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4620 -6.3805 -1.0573 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3286 -2.3341 3.0225 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 46 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 6 24 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 19 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --9.633 - -$$$$ -CAT-4i - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 11.6799 -2.2515 1.3709 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9871 -2.4645 0.7394 N 0 0 0 0 0 0 - 14.1849 -2.5408 1.3426 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4085 -2.4164 2.6556 N 0 0 0 0 0 0 - 15.1680 -2.7715 0.4653 N 0 3 0 0 0 0 - 14.6502 -2.9656 -0.8909 C 0 0 2 0 0 0 - 14.8475 -4.4552 -1.2486 C 0 0 0 0 0 0 - 13.8636 -5.4580 -1.0220 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1122 -6.8048 -1.3507 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3438 -7.1712 -1.9163 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3455 -6.2032 -2.0969 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1027 -4.8702 -1.7351 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2192 -1.9235 -1.8834 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5984 -2.2557 -3.2072 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1188 -1.2726 -4.0620 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1734 0.0730 -3.6556 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7349 0.4623 -2.3714 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6381 1.8956 -1.9854 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6686 2.3241 -0.6448 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3940 3.6637 -0.3351 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0983 4.5443 -1.3837 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1361 4.0514 -2.6961 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4016 2.7638 -2.9930 N 0 0 0 0 0 0 - 15.3176 -0.5642 -1.4872 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1637 -2.6425 -0.6619 C 0 0 0 0 0 0 - 12.2501 -2.5949 -1.4964 O 0 0 0 0 0 0 - 11.7437 -2.3618 2.4529 H 0 0 0 0 0 0 - 11.3123 -1.2542 1.1296 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9552 -2.9810 1.0088 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3668 -2.4681 3.0041 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1551 -2.8599 0.7041 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9016 -5.2397 -0.5855 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3537 -7.5586 -1.1781 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5208 -8.1951 -2.1987 H 0 0 0 0 0 0 - 17.3016 -6.4672 -2.5163 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8780 -4.1347 -1.8690 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5199 -3.2608 -3.5989 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4500 -1.5558 -5.0471 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5221 0.8208 -4.3560 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8684 1.6239 0.1454 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3941 4.0062 0.6886 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8564 5.5796 -1.1863 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9279 4.7142 -3.5247 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9877 -0.2835 -0.5003 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6998 -2.1133 3.3230 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 45 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 24 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 24 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 -M CHG 1 5 1 -M END -> --8.263 - -$$$$ -CAT-17e - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 14.8618 4.8350 1.1620 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5063 3.6190 0.8241 O 0 0 0 0 0 0 - 15.5034 3.2547 -0.5041 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3203 4.1381 -1.5911 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3573 3.7398 -2.8754 N 0 0 0 0 0 0 - 15.5484 2.4300 -3.1296 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7091 1.4388 -2.1356 C 0 0 0 0 0 0 - 15.8420 -0.0010 -2.4606 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3311 -0.4075 -3.7129 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3915 -1.7640 -4.0583 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9457 -2.7515 -3.1643 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4719 -2.3986 -1.8776 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9084 -3.4068 -0.8336 C 0 0 1 0 0 0 - 15.1744 -4.9292 -0.9309 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8727 -5.7780 -2.1409 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2960 -5.6354 -1.6617 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3119 -3.0245 0.5181 N 0 3 0 0 0 0 - 14.2748 -2.7106 1.2950 C 0 0 0 0 0 0 - 14.4147 -2.3941 2.5875 N 0 0 0 0 0 0 - 13.1175 -2.7746 0.6184 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7851 -2.4926 1.1586 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3894 -3.1875 -0.7204 C 0 0 0 0 0 0 - 12.5284 -3.3363 -1.5934 O 0 0 0 0 0 0 - 15.4440 -1.0125 -1.5544 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7028 1.8991 -0.8055 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8380 4.9423 2.2474 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3759 5.6992 0.7519 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8375 4.8355 0.7946 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1541 5.1939 -1.4430 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5345 2.1696 -4.1770 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6513 0.3205 -4.4416 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7660 -2.0344 -5.0341 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9804 -3.7597 -3.5293 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9009 -5.4265 -0.0010 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3799 -6.7349 -1.9832 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5834 -5.2655 -3.0454 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9751 -5.0800 -2.2915 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7462 -6.4903 -1.1620 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2886 -2.9965 0.8161 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6579 -2.0901 3.1972 H 0 0 0 0 0 0 - 11.0202 -2.4653 0.3819 H 0 0 0 0 0 0 - 11.5052 -3.2432 1.8970 H 0 0 0 0 0 0 - 11.8047 -1.5231 1.6422 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0485 -0.7087 -0.5980 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8443 1.2081 0.0055 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3520 -2.3780 2.9947 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 25 2 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 24 2 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 17 1 0 0 0 - 13 22 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 19 46 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 -M CHG 1 17 1 -M END -> --10.023 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/CDK2_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/CDK2_ligands.sdf deleted file mode 100755 index 318b2919..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/CDK2_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,1772 +0,0 @@ -30 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 54 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9402 25.3397 9.1502 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 5.4311 23.8790 7.4001 S 0 0 0 0 0 0 - 5.8108 23.2938 6.1199 O 0 0 0 0 0 0 - 6.4234 24.1721 8.4274 O 0 0 0 0 0 0 - 4.4921 22.8906 8.0257 C 0 0 0 0 0 0 - 5.0598 21.9809 8.2212 H 0 0 0 0 0 0 - 4.1195 23.3347 8.9487 H 0 0 0 0 0 0 - 3.6856 22.7126 7.3144 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 45 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 45 46 2 0 0 0 - 45 47 2 0 0 0 - 45 48 1 0 0 0 - 48 49 1 0 0 0 - 48 50 1 0 0 0 - 48 51 1 0 0 0 -M END -> --9.812 - -$$$$ -28 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 56 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9402 25.3397 9.1502 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 5.4311 23.8790 7.4001 S 0 0 0 0 0 0 - 5.8108 23.2938 6.1199 O 0 0 0 0 0 0 - 6.4234 24.1721 8.4274 O 0 0 0 0 0 0 - 4.3520 22.7432 8.1190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.7946 22.1535 7.5176 H 0 0 0 0 0 0 - 4.1627 22.7723 9.5553 C 0 0 0 0 0 0 - 3.4517 21.9850 9.8059 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1346 22.5937 10.0154 H 0 0 0 0 0 0 - 3.7743 23.7577 9.8125 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 45 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 45 46 2 0 0 0 - 45 47 2 0 0 0 - 45 48 1 0 0 0 - 48 49 1 0 0 0 - 48 50 1 0 0 0 - 50 51 1 0 0 0 - 50 52 1 0 0 0 - 50 53 1 0 0 0 -M END -> --11.112 - -$$$$ -1oiy - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 52 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9402 25.3397 9.1502 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 6.1562 23.4726 6.4890 O 0 0 0 0 0 0 - 5.4123 23.9101 7.3933 C 0 0 0 0 0 0 - 5.2289 23.2655 8.7353 N 0 0 0 0 0 0 - 4.5210 23.8580 9.3336 H 0 0 0 0 0 0 - 5.7263 22.4156 8.9596 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 46 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 45 46 2 0 0 0 - 46 47 1 0 0 0 - 47 48 1 0 0 0 - 47 49 1 0 0 0 -M END -> --9.785 - -$$$$ -1oi9 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9402 25.3397 9.1502 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 5.3618 23.9933 7.3750 O 0 0 0 0 0 0 - 5.2464 23.7368 8.2772 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 45 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 45 46 1 0 0 0 -M END -> --9.741 - -$$$$ -32 - 3D - Structure written by MMmdl. - 54 57 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 5.4311 23.8790 7.4001 S 0 0 0 0 0 0 - 5.8108 23.2938 6.1199 O 0 0 0 0 0 0 - 6.4234 24.1721 8.4274 O 0 0 0 0 0 0 - 4.3520 22.7432 8.1190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.7946 22.1535 7.5176 H 0 0 0 0 0 0 - 4.2201 22.7635 9.1201 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9378 25.2278 9.4110 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1574 26.0269 10.2715 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1538 25.5780 11.2963 H 0 0 0 0 0 0 - 3.5899 27.0578 10.3175 H 0 0 0 0 0 0 - 2.1092 26.0792 9.8835 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 44 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 50 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 44 45 2 0 0 0 - 44 46 2 0 0 0 - 44 47 1 0 0 0 - 47 49 1 0 0 0 - 47 48 1 0 0 0 - 50 51 1 0 0 0 - 51 52 1 0 0 0 - 51 53 1 0 0 0 - 51 54 1 0 0 0 -M END -> --9.75 - -$$$$ -1oiu - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 53 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2165 24.2329 7.3224 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9402 25.3397 9.1502 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 5.4755 25.0595 4.7396 S 0 0 0 0 0 0 - 4.8842 23.7521 4.4815 O 0 0 0 0 0 0 - 5.6556 26.0375 3.6734 O 0 0 0 0 0 0 - 7.0609 24.7342 5.3329 N 0 0 0 0 0 0 - 7.2273 23.8701 5.8287 H 0 0 0 0 0 0 - 7.7630 25.4573 5.2675 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 45 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 39 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 45 46 2 0 0 0 - 45 47 2 0 0 0 - 45 48 1 0 0 0 - 48 49 1 0 0 0 - 48 50 1 0 0 0 -M END -> --9.083 - -$$$$ -29 - 3D - Structure written by MMmdl. - 56 59 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9402 25.3397 9.1502 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 5.4311 23.8790 7.4001 S 0 0 0 0 0 0 - 5.8108 23.2938 6.1199 O 0 0 0 0 0 0 - 6.4234 24.1721 8.4274 O 0 0 0 0 0 0 - 4.4921 22.8906 8.0257 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8604 21.8742 7.2087 C 0 0 0 0 0 0 - 4.1949 21.9880 6.1470 H 0 0 0 0 0 0 - 4.1498 20.8607 7.5843 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7488 21.9890 7.2639 H 0 0 0 0 0 0 - 4.2167 22.9522 9.4469 C 0 0 0 0 0 0 - 3.4990 22.1395 9.7233 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1697 22.8182 10.0177 H 0 0 0 0 0 0 - 3.7687 23.9465 9.6972 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 45 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 45 46 2 0 0 0 - 45 47 2 0 0 0 - 45 48 1 0 0 0 - 48 49 1 0 0 0 - 48 53 1 0 0 0 - 49 50 1 0 0 0 - 49 51 1 0 0 0 - 49 52 1 0 0 0 - 53 54 1 0 0 0 - 53 55 1 0 0 0 - 53 56 1 0 0 0 -M END -> --9.882 - -$$$$ -1h1r - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2165 24.2329 7.3224 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9346 25.0834 9.7473 Cl 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 40 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 45 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 -M END -> --7.669 - -$$$$ -21 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 52 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2165 24.2329 7.3224 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9378 25.2278 9.4110 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1574 26.0269 10.2715 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1538 25.5780 11.2963 H 0 0 0 0 0 0 - 3.5899 27.0578 10.3175 H 0 0 0 0 0 0 - 2.1092 26.0792 9.8835 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 40 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 45 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 45 46 1 0 0 0 - 46 47 1 0 0 0 - 46 48 1 0 0 0 - 46 49 1 0 0 0 -M END -> --7.828 - -$$$$ -26 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 52 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9402 25.3397 9.1502 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 5.3618 23.9933 7.3750 O 0 0 0 0 0 0 - 5.1896 23.6106 8.7211 C 0 0 0 0 0 0 - 5.7631 22.6702 8.9179 H 0 0 0 0 0 0 - 5.5658 24.4239 9.3912 H 0 0 0 0 0 0 - 4.1033 23.4340 8.9226 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 45 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 45 46 1 0 0 0 - 46 47 1 0 0 0 - 46 48 1 0 0 0 - 46 49 1 0 0 0 -M END -> --8.431 - -$$$$ -1h1s - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 53 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9402 25.3397 9.1502 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 5.4311 23.8790 7.4001 S 0 0 0 0 0 0 - 5.8108 23.2938 6.1199 O 0 0 0 0 0 0 - 6.4234 24.1721 8.4274 O 0 0 0 0 0 0 - 4.3520 22.7432 8.1190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.7946 22.1535 7.5176 H 0 0 0 0 0 0 - 4.2201 22.7635 9.1201 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 45 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 45 46 2 0 0 0 - 45 47 2 0 0 0 - 45 48 1 0 0 0 - 48 49 1 0 0 0 - 48 50 1 0 0 0 -M END -> --11.246 - -$$$$ -31 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 53 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9402 25.3397 9.1502 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 5.4311 23.8790 7.4001 S 0 0 3 0 0 0 - 6.1203 23.3067 6.4581 O 0 0 0 0 0 0 - 5.3902 23.2873 8.7779 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7484 23.9231 9.4380 H 0 0 0 0 0 0 - 4.9646 22.2537 8.7275 H 0 0 0 0 0 0 - 6.4272 23.2436 9.1960 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 45 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 45 46 2 0 0 0 - 45 47 1 0 0 0 - 47 48 1 0 0 0 - 47 49 1 0 0 0 - 47 50 1 0 0 0 -M END -> --9.539 - -$$$$ -20 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 52 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2165 24.2329 7.3224 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9402 25.3397 9.1502 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 5.4871 25.0499 4.7235 C 0 0 0 0 0 0 - 5.3633 25.6590 3.8281 H 0 0 0 0 0 0 - 6.5286 25.0171 5.0431 H 0 0 0 0 0 0 - 4.9612 23.7541 4.5433 O 0 0 0 0 0 0 - 5.1091 23.2899 5.3674 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 45 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 39 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 45 46 1 0 0 0 - 45 47 1 0 0 0 - 45 48 1 0 0 0 - 48 49 1 0 0 0 -M END -> --8.718 - -$$$$ -22 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 52 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2165 24.2329 7.3224 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9347 25.0874 9.7381 S 0 0 0 0 0 0 - 2.9329 26.1133 10.8427 C 0 0 0 0 0 0 - 2.9293 25.6643 11.8676 H 0 0 0 0 0 0 - 3.3655 27.1441 10.8887 H 0 0 0 0 0 0 - 1.8848 26.1655 10.4547 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 40 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 45 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 45 46 1 0 0 0 - 46 47 1 0 0 0 - 46 48 1 0 0 0 - 46 49 1 0 0 0 -M END -> --7.862 - -$$$$ -17 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2165 24.2329 7.3224 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9332 25.0203 9.8943 Br 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 40 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 45 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 -M END -> --7.041 - -$$$$ -1h1q - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 1.3901 29.1077 6.7935 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6911 31.9130 8.0794 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7437 26.3748 8.8319 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3142 25.5567 9.9914 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1214 24.0589 9.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5824 23.1795 10.8502 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8551 23.5463 12.1491 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0780 25.0277 12.4857 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6321 25.9351 11.3273 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6903 25.7129 5.8380 C 0 0 0 0 0 0 - 4.6667 25.1395 7.1233 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9496 25.7658 8.1576 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2460 26.9556 7.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6302 28.2313 7.4508 N 0 0 0 0 0 0 - -0.4898 28.6252 8.0923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1796 27.7315 8.8832 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8660 29.9818 8.0000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9251 30.7129 8.5212 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5542 32.0464 7.3306 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0249 30.7863 7.2610 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1172 30.4049 6.6113 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5827 28.6807 6.3360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.2365 27.5251 6.6032 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9871 26.9068 5.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3542 32.7337 8.2866 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3421 26.2813 8.8885 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0533 25.9544 7.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3846 25.7536 10.0698 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6745 23.7903 8.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0713 23.8531 9.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6489 23.3294 10.9949 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4335 22.1247 10.6147 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2175 22.9242 12.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 23.3446 12.0504 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1337 25.2025 12.7004 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5350 25.2900 13.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4518 25.8639 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8463 26.9766 11.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2554 25.2427 5.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2165 24.2329 7.3224 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9402 25.3397 9.1502 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7083 27.4238 8.7079 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1784 32.8770 6.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0167 29.2655 5.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 4.0234 27.3389 4.5933 H 0 0 0 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 21 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 40 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 41 1 0 0 0 - 13 23 2 0 0 0 - 13 42 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 43 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 -M END -> --8.179 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/JNK1_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/JNK1_ligands.sdf deleted file mode 100755 index 4434d773..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/JNK1_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,2138 +0,0 @@ -18629-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 42 0 0 1 0 999 V2000 - 24.0510 12.2016 30.2637 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3159 10.8864 30.5326 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1655 11.1828 31.3207 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3477 10.1523 31.7514 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6919 8.8874 31.3853 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8972 7.8767 31.7648 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7610 8.0525 32.5388 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4157 9.3373 32.9151 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2588 9.4438 33.6763 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2113 10.4260 32.5218 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8989 11.8070 32.8723 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6587 12.9061 33.1464 N 0 0 0 0 0 0 - 21.3873 6.6638 31.3301 N 0 0 0 0 0 0 - 20.7487 5.5080 31.1215 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5319 5.3796 31.2433 O 0 0 0 0 0 0 - 21.5762 4.2864 30.6944 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0915 4.4911 30.6827 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6888 5.3698 29.7694 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0671 5.5919 29.8016 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7101 6.5802 28.8490 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8566 4.9019 30.7231 C 0 0 0 0 0 0 - 25.2705 4.0092 31.6200 C 0 0 0 0 0 0 - 23.8912 3.8073 31.6026 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9431 12.0347 29.6609 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4095 12.8989 29.7244 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3546 12.6790 31.1949 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0222 10.4181 29.5906 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9768 10.1935 31.0585 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1563 7.2141 32.8416 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7834 8.6037 33.9927 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8900 10.3575 33.9302 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3762 6.6961 31.1563 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3185 3.4656 31.3622 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2476 3.9881 29.7032 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0789 5.8960 29.0477 H 0 0 0 0 0 0 - 24.9881 7.3051 28.4726 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5045 7.1383 29.3471 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1450 6.0542 27.9989 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9251 5.0640 30.7500 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8856 3.4782 32.3328 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4493 3.1153 32.3060 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 23 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 2 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --8.67377 - -$$$$ -18634-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 47 0 0 1 0 999 V2000 - 24.0733 12.4028 30.2323 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3271 11.0818 30.4341 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2086 11.3387 31.2785 O 0 0 0 0 0 0 - 21.4076 10.2889 31.6938 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7457 9.0394 31.2730 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9690 8.0101 31.6444 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8628 8.1544 32.4699 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5194 9.4254 32.8937 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3843 9.5057 33.6914 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2911 10.5310 32.5018 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9686 11.9007 32.8839 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7198 12.9914 33.1811 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4264 6.8283 31.0989 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8492 5.6257 31.0244 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7218 5.3642 31.4396 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6453 4.5492 30.2959 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0487 4.3416 30.8592 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1093 5.1752 30.4706 C 0 0 0 0 0 0 - 23.8251 6.2111 29.5994 O 0 0 0 0 0 0 - 24.7824 7.2540 29.4258 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3879 4.9247 30.9874 C 0 0 0 0 0 0 - 25.5914 3.9088 31.9220 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5221 3.1087 32.3472 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2656 3.3183 31.7864 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6165 2.1143 33.2977 O 0 0 0 0 0 0 - 25.8225 1.9829 34.0425 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9321 12.2709 29.5744 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4201 13.1517 29.7829 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4313 12.7993 31.1825 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9923 10.6829 29.4737 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9965 10.3468 30.8876 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2675 7.3077 32.7672 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9995 10.4112 33.9502 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9030 8.6579 33.9746 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3340 6.9317 30.6726 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0986 3.6093 30.2959 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7112 4.8755 29.2640 H 0 0 0 0 0 0 - 25.6789 6.8955 28.9178 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3494 8.0402 28.8073 H 0 0 0 0 0 0 - 25.0654 7.7073 30.3780 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2335 5.5260 30.6895 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5850 3.7612 32.3164 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4552 2.6724 32.0911 H 0 0 0 0 0 0 - 26.6593 1.6972 33.4036 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0724 2.9044 34.5706 H 0 0 0 0 0 0 - 25.6996 1.2001 34.7908 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 32 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 36 1 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 24 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --9.993231 - -$$$$ -18628-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 42 0 0 1 0 999 V2000 - 23.9605 12.3163 30.2947 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2559 10.9824 30.5536 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1036 11.2446 31.3514 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3110 10.1914 31.7754 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6913 8.9382 31.4088 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9227 7.9051 31.7793 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7725 8.0448 32.5397 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3904 9.3202 32.9187 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2233 9.3985 33.6687 N 0 0 0 0 0 0 - 20.1628 10.4312 32.5383 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8175 11.8036 32.8910 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5528 12.8968 33.1655 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4664 6.7163 31.3474 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9017 5.5224 31.1455 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7006 5.3105 31.3000 O 0 0 0 0 0 0 - 21.8103 4.3697 30.6812 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2677 4.7656 30.3673 C 0 0 0 0 0 0 - 24.3654 4.2247 31.0652 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1953 3.1869 32.1607 C 0 0 0 0 0 0 - 25.6604 4.6622 30.7690 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8785 5.6251 29.7872 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8016 6.1467 29.0788 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5087 5.7102 29.3592 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2592 12.7902 31.2292 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8528 12.1755 29.6855 H 0 0 0 0 0 0 - 23.3008 13.0052 29.7667 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9669 10.5177 29.6084 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9355 10.2989 31.0678 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1895 7.1877 32.8320 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8428 10.3048 33.9318 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7717 8.5486 33.9946 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4445 6.8125 31.1370 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7436 3.5904 31.4370 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3668 3.9449 29.7835 H 0 0 0 0 0 0 - 23.5756 2.3534 31.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1503 2.7671 32.4785 H 0 0 0 0 0 0 - 23.7383 3.6561 33.0277 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5075 4.2624 31.3084 H 0 0 0 0 0 0 - 26.8826 5.9668 29.5753 H 0 0 0 0 0 0 - 24.9756 6.8924 28.3166 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6795 6.1271 28.8055 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 23 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --8.702592 - -$$$$ -18660-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 53 0 0 1 0 999 V2000 - 21.2242 13.7577 29.7743 C 0 0 0 0 0 0 - 22.9858 13.4243 29.4250 S 0 0 0 0 0 0 - 23.3325 14.1347 28.1853 O 0 0 0 0 0 0 - 23.7515 13.6655 30.6540 O 0 0 0 0 0 0 - 23.0345 11.6250 29.1007 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2416 10.8260 30.3896 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1374 11.0915 31.2625 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3481 10.0698 31.7543 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6928 8.8106 31.3991 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9169 7.7999 31.7865 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7851 7.9631 32.5715 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4339 9.2500 32.9461 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2722 9.3640 33.7009 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2235 10.3414 32.5432 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9110 11.7214 32.8945 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6714 12.8208 33.1675 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4154 6.6269 31.2767 N 0 0 0 0 0 0 - 20.7987 5.4740 31.0443 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6158 5.2719 31.3028 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6200 4.4088 30.3253 C 0 0 0 0 0 0 - 22.9824 4.1291 30.9583 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0821 4.9595 30.6887 C 0 0 0 0 0 0 - 23.8687 6.0491 29.8635 O 0 0 0 0 0 0 - 24.9419 6.9455 29.5869 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3204 4.6479 31.2676 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4495 3.5512 32.1202 C 0 0 0 0 0 0 - 24.3619 2.7258 32.3925 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1276 3.0227 31.8010 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5822 1.6654 33.2461 O 0 0 0 0 0 0 - 23.6524 0.5847 33.2552 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6224 13.4455 28.9242 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9239 13.2060 30.6603 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0976 14.8220 29.9576 H 0 0 0 0 0 0 - 22.1221 11.3399 28.5828 H 0 0 0 0 0 0 - 23.8612 11.4529 28.4152 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4140 9.7837 30.1198 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1564 11.1350 30.8975 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1830 7.1215 32.8686 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9080 10.2805 33.9495 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7984 8.5273 34.0307 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3652 6.7216 30.9520 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0528 3.4878 30.2402 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7618 4.7818 29.3166 H 0 0 0 0 0 0 - 25.7707 6.4417 29.0871 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5889 7.7313 28.9191 H 0 0 0 0 0 0 - 25.3079 7.4296 30.4933 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1942 5.2498 31.0718 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4048 3.3255 32.5717 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2756 2.3889 31.9880 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0231 -0.2004 33.9140 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6722 0.8804 33.6279 H 0 0 0 0 0 0 - 23.5373 0.1485 32.2627 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 4 2 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 36 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 14 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 38 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 14 2 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 3 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 41 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 21 28 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 24 46 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 47 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 50 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --8.702592 - -$$$$ -18624-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 39 0 0 1 0 999 V2000 - 24.0164 12.2539 30.2762 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2908 10.9314 30.5359 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1419 11.2134 31.3311 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3323 10.1743 31.7566 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6855 8.9139 31.3839 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8979 7.8953 31.7573 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7602 8.0588 32.5320 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4059 9.3393 32.9154 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2480 9.4343 33.6766 N 0 0 0 0 0 0 - 20.1940 10.4357 32.5279 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8720 11.8131 32.8833 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6248 12.9098 33.1606 N 0 0 0 0 0 0 - 21.3998 6.6892 31.3168 N 0 0 0 0 0 0 - 20.7829 5.5176 31.1304 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5708 5.3642 31.2684 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6349 4.3090 30.7130 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1282 4.5971 30.5483 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5814 5.4159 29.5068 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9398 5.7006 29.3735 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8537 5.1673 30.2817 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4095 4.3457 31.3184 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0502 4.0609 31.4520 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9074 12.0984 29.6688 H 0 0 0 0 0 0 - 23.3684 12.9520 29.7458 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3206 12.7248 31.2106 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9961 10.4697 29.5909 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9583 10.2381 31.0529 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1613 7.2149 32.8307 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7801 8.5900 33.9930 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8746 10.3449 33.9353 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3839 6.7405 31.1200 H 0 0 0 0 0 0 - 21.4790 3.5192 31.4477 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2427 3.9300 29.7726 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8769 5.8379 28.8038 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2864 6.3344 28.5687 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9068 5.3922 30.1824 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1194 3.9318 32.0207 H 0 0 0 0 0 0 - 23.7188 3.4238 32.2602 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 29 1 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 34 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 -M END -> -2 - -> --8.49337 - -$$$$ -18633-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 43 0 0 1 0 999 V2000 - 24.0387 12.2179 30.2669 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3044 10.9016 30.5332 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1563 11.1951 31.3256 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3390 10.1633 31.7540 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6823 8.8992 31.3837 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8867 7.8880 31.7599 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7522 8.0618 32.5365 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4083 9.3453 32.9173 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2524 9.4490 33.6800 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2035 10.4351 32.5260 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8910 11.8152 32.8794 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6510 12.9138 33.1554 N 0 0 0 0 0 0 - 21.3748 6.6763 31.3202 N 0 0 0 0 0 0 - 20.7393 5.5159 31.1264 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5238 5.3827 31.2542 O 0 0 0 0 0 0 - 21.5737 4.2933 30.7142 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0754 4.5499 30.5850 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9617 4.0062 31.5176 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3276 4.2685 31.4147 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8300 5.0672 30.3878 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9363 5.6034 29.4476 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5696 5.3480 29.5477 C 0 0 0 0 0 0 - 27.1928 5.2764 30.3815 O 0 0 0 0 0 0 - 27.7622 6.0804 29.3514 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9291 12.0530 29.6611 H 0 0 0 0 0 0 - 23.3956 12.9170 29.7318 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3449 12.6920 31.1989 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0079 10.4366 29.5904 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9667 10.2069 31.0548 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1471 7.2232 32.8380 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7774 8.6080 33.9939 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8829 10.3621 33.9354 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3609 6.7127 31.1322 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3859 3.5003 31.4380 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1948 3.9318 29.7615 H 0 0 0 0 0 0 - 23.5982 3.3827 32.3233 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0138 3.8530 32.1380 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2874 6.2225 28.6362 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8915 5.7767 28.8218 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8350 6.1759 29.5197 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6209 5.6285 28.3678 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3422 7.0878 29.3414 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 30 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --9.174299 - -$$$$ -18635-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 45 0 0 1 0 999 V2000 - 23.9496 12.4061 30.2951 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2519 11.0659 30.5395 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1059 11.3120 31.3507 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3257 10.2498 31.7750 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7076 9.0020 31.3906 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9482 7.9622 31.7631 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8115 8.0884 32.5458 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4246 9.3586 32.9354 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2605 9.4247 33.6906 N 0 0 0 0 0 0 - 20.1835 10.4770 32.5507 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8271 11.8457 32.9062 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5534 12.9361 33.1819 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4602 6.7905 31.2552 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8690 5.6163 31.0257 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7072 5.3517 31.3317 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6960 4.6002 30.2412 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0923 4.3587 30.8149 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3320 3.5009 31.9082 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2245 2.7564 32.6419 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6378 3.3402 32.3790 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7007 4.0060 31.7729 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4683 4.8553 30.6932 C 0 0 0 0 0 0 - 26.6266 5.5872 30.0438 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1669 5.0304 30.2231 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8368 12.2785 29.6758 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2828 13.1011 29.7843 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2552 12.8660 31.2344 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9560 10.6141 29.5902 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9386 10.3777 31.0378 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2323 7.2271 32.8336 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8088 8.5700 34.0033 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8688 10.3268 33.9516 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4122 6.9078 30.9611 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1583 3.6552 30.1892 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7531 4.9685 29.2242 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3553 2.5384 32.0255 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5860 1.7998 33.0229 H 0 0 0 0 0 0 - 21.8978 3.3487 33.4963 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8349 2.6931 33.2226 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7047 3.8657 32.1475 H 0 0 0 0 0 0 - 27.2822 6.0176 30.8015 H 0 0 0 0 0 0 - 27.2127 4.8995 29.4338 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2815 6.4018 29.4053 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9868 5.7101 29.4031 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 30 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 24 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --7.286071 - -$$$$ -17124-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 47 0 0 1 0 999 V2000 - 24.0816 12.3916 30.2423 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3500 11.0657 30.4628 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2121 11.3274 31.2794 O 0 0 0 0 0 0 - 21.4127 10.2773 31.6976 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7567 9.0266 31.2850 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9811 7.9971 31.6572 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8706 8.1421 32.4769 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5217 9.4143 32.8937 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3827 9.4958 33.6863 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2923 10.5202 32.5003 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9657 11.8905 32.8774 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7135 12.9814 33.1712 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4435 6.8153 31.1146 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8639 5.6146 31.0308 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7396 5.3500 31.4512 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6499 4.5466 30.2798 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0247 4.2587 30.8770 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1218 5.0797 30.5737 C 0 0 0 0 0 0 - 23.8940 6.1755 29.7600 O 0 0 0 0 0 0 - 24.9260 7.1419 29.5741 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3756 4.7488 31.1028 C 0 0 0 0 0 0 - 25.5283 3.6468 31.9432 C 0 0 0 0 0 0 - 27.2648 3.2511 32.6230 Br 0 0 0 0 0 0 - 24.4329 2.8399 32.2701 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1819 3.1565 31.7231 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6457 1.7801 33.1306 O 0 0 0 0 0 0 - 23.7084 0.7066 33.1601 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9658 12.2529 29.6210 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4330 13.1123 29.7438 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3974 12.8270 31.1900 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0415 10.6380 29.5063 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0190 10.3518 30.9488 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2757 7.2952 32.7747 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9031 8.6482 33.9732 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9977 10.4016 33.9433 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3516 6.9230 30.6906 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0717 3.6287 30.2152 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7630 4.9135 29.2646 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5476 7.9548 28.9541 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2471 7.5788 30.5210 H 0 0 0 0 0 0 - 25.7903 6.7169 29.0616 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2494 5.3384 30.8749 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3237 2.5419 31.9463 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0776 -0.0691 33.8306 H 0 0 0 0 0 0 - 22.7306 1.0102 33.5310 H 0 0 0 0 0 0 - 23.5885 0.2529 32.1771 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 25 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 44 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --9.675922 - -$$$$ -18625-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 39 0 0 1 0 999 V2000 - 23.9836 12.4667 30.2867 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2737 11.1272 30.4972 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1371 11.3623 31.3251 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3544 10.2954 31.7327 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7200 9.0555 31.3102 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9619 8.0098 31.6663 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8426 8.1238 32.4782 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4695 9.3867 32.9059 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3212 9.4436 33.6872 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2252 10.5101 32.5303 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8753 11.8722 32.9144 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6057 12.9576 33.2124 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4575 6.8521 31.1054 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9156 5.6355 31.0009 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8099 5.3226 31.4377 O 0 0 0 0 0 0 - 21.7255 4.6155 30.2083 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0587 4.2602 30.8639 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1402 3.3559 31.9374 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7341 2.5734 32.5724 Cl 0 0 0 0 0 0 - 24.3761 3.0744 32.5186 C 0 0 0 0 0 0 - 25.5378 3.6730 32.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4624 4.5663 30.9649 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2283 4.8614 30.3873 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8633 12.3484 29.6549 H 0 0 0 0 0 0 - 23.3197 13.1844 29.8043 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3036 12.8938 31.2365 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9649 10.7062 29.5378 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9573 10.4175 30.9690 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2603 7.2626 32.7589 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9290 10.3428 33.9568 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8636 8.5866 33.9837 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3528 7.0201 30.6785 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1373 3.7123 30.0604 H 0 0 0 0 0 0 - 21.8841 5.0365 29.2197 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4287 2.3849 33.3488 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4943 3.4488 32.4838 H 0 0 0 0 0 0 - 26.3590 5.0424 30.5919 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1838 5.5759 29.5770 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 23 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 35 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --8.105004 - -$$$$ -18659-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 51 0 0 1 0 999 V2000 - 25.3050 12.1344 28.3533 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3255 12.3475 29.7610 O 0 0 0 0 0 0 - 24.0339 12.4868 30.3516 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3142 11.1388 30.5400 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1418 11.3640 31.3238 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3619 10.2949 31.7280 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7291 9.0548 31.3049 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9668 8.0091 31.6649 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8501 8.1315 32.4812 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4780 9.3944 32.9057 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3316 9.4546 33.6892 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2337 10.5143 32.5251 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8862 11.8780 32.9066 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6195 12.9648 33.2019 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4412 6.8348 31.1127 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8679 5.6312 31.0118 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7432 5.3541 31.4246 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6641 4.5751 30.2539 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0297 4.2834 30.8691 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1299 5.1089 30.5871 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9130 6.2046 29.7697 O 0 0 0 0 0 0 - 24.9454 7.1747 29.6060 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3741 4.7857 31.1456 C 0 0 0 0 0 0 - 25.5056 3.6911 32.0008 C 0 0 0 0 0 0 - 24.4142 2.8780 32.2954 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1745 3.1802 31.7177 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6372 1.8269 33.1598 O 0 0 0 0 0 0 - 23.7198 0.7356 33.1705 C 0 0 0 0 0 0 - 26.3276 12.0663 27.9821 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7968 11.2069 28.0860 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8188 12.9601 27.8307 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1841 12.9412 31.3310 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4112 13.1869 29.7908 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0447 10.7045 29.5760 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9826 10.4389 31.0456 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2656 7.2744 32.7693 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8696 8.5990 33.9826 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9384 10.3545 33.9550 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3546 6.9473 30.7003 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0888 3.6569 30.1676 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7922 4.9565 29.2453 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8243 6.7515 29.1175 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2403 7.6161 30.5591 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5798 7.9840 28.9737 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2495 5.3806 30.9352 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4650 3.4600 32.4406 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3175 2.5586 31.9244 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0868 -0.0315 33.8520 H 0 0 0 0 0 0 - 22.7275 1.0218 33.5161 H 0 0 0 0 0 0 - 23.6316 0.2777 32.1859 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 12 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 15 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 36 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 12 2 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 11 38 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 3 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 26 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 46 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --9.465222 - -$$$$ -18637-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 54 0 0 1 0 999 V2000 - 24.0679 12.3974 30.2299 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3159 11.0783 30.4227 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2074 11.3318 31.2810 O 0 0 0 0 0 0 - 21.4078 10.2815 31.6977 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7477 9.0318 31.2791 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9736 8.0017 31.6536 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8665 8.1461 32.4779 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5200 9.4177 32.8981 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3829 9.4988 33.6931 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2909 10.5235 32.5051 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9670 11.8935 32.8853 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7174 12.9843 33.1812 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4331 6.8194 31.1098 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8527 5.6189 31.0281 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7272 5.3573 31.4476 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6390 4.5479 30.2799 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0290 4.2861 30.8549 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1071 5.1197 30.5266 C 0 0 0 0 0 0 - 23.8494 6.2028 29.7043 O 0 0 0 0 0 0 - 24.8536 7.1989 29.5184 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3718 4.8226 31.0461 C 0 0 0 0 0 0 - 25.5645 3.7381 31.9139 C 0 0 0 0 0 0 - 24.4775 2.9179 32.2550 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2164 3.1999 31.7130 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7079 1.8722 33.1347 O 0 0 0 0 0 0 - 23.7954 0.7759 33.1653 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8105 3.4129 32.4986 N 0 0 0 0 0 0 - 28.0304 3.9580 32.3626 C 0 0 0 0 0 0 - 28.3090 4.8809 31.6038 O 0 0 0 0 0 0 - 29.1268 3.3864 33.2444 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9126 12.2714 29.5531 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4120 13.1593 29.8075 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4475 12.7735 31.1798 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9679 10.6939 29.4613 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9861 10.3339 30.8590 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2723 7.2992 32.7769 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9982 10.4045 33.9508 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9022 8.6511 33.9777 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3411 6.9232 30.6839 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0716 3.6218 30.2389 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7296 4.9031 29.2587 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1766 7.6318 30.4670 H 0 0 0 0 0 0 - 25.7221 6.8023 28.9901 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4470 8.0095 28.9134 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2052 5.4494 30.7818 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3705 2.5750 31.9549 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1826 0.0083 33.8350 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8116 1.0576 33.5378 H 0 0 0 0 0 0 - 23.6827 0.3201 32.1822 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7329 2.6375 33.1392 H 0 0 0 0 0 0 - 28.7666 2.6002 33.9071 H 0 0 0 0 0 0 - 29.9206 2.9779 32.6211 H 0 0 0 0 0 0 - 29.5482 4.1842 33.8561 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 34 1 0 0 0 - 2 35 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 40 1 0 0 0 - 16 41 1 0 0 0 - 17 24 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 45 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 24 46 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 26 49 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 50 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 30 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --10.141692 - -$$$$ -18638-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 53 0 0 1 0 999 V2000 - 24.0828 12.3868 30.2428 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3511 11.0608 30.4631 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2130 11.3224 31.2794 O 0 0 0 0 0 0 - 21.4137 10.2724 31.6978 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7583 9.0214 31.2860 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9833 7.9917 31.6587 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8720 8.1371 32.4777 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5223 9.4096 32.8934 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3826 9.4917 33.6852 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2930 10.5154 32.4999 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9661 11.8857 32.8768 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7139 12.9766 33.1706 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4471 6.8094 31.1176 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8648 5.6102 31.0302 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7384 5.3480 31.4462 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6493 4.5406 30.2812 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0099 4.2326 30.8981 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1205 5.0418 30.6147 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9162 6.1432 29.8018 O 0 0 0 0 0 0 - 24.9744 7.0761 29.5922 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3630 4.6931 31.1582 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4887 3.5794 31.9953 C 0 0 0 0 0 0 - 27.1113 3.1594 32.6460 S 0 0 0 0 0 0 - 28.0639 4.2094 32.2494 O 0 0 0 0 0 0 - 26.9781 2.8102 34.0695 O 0 0 0 0 0 0 - 27.5657 1.6315 31.7313 C 0 0 0 0 0 0 - 24.3792 2.7781 32.2959 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1415 3.1205 31.7349 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5589 1.6919 33.1307 O 0 0 0 0 0 0 - 23.5930 0.6441 33.1472 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9667 12.2481 29.6211 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4340 13.1077 29.7447 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3990 12.8219 31.1906 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0429 10.6331 29.5065 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0201 10.3469 30.9492 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2773 7.2904 32.7761 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9032 8.6443 33.9735 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9980 10.3977 33.9421 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3581 6.9165 30.6994 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0631 3.6295 30.2004 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7824 4.9132 29.2703 H 0 0 0 0 0 0 - 24.6154 7.8880 28.9593 H 0 0 0 0 0 0 - 25.3134 7.5216 30.5284 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8233 6.6177 29.0824 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2396 5.2813 30.9372 H 0 0 0 0 0 0 - 27.5804 1.8413 30.6637 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5481 1.2980 32.0584 H 0 0 0 0 0 0 - 26.8259 0.8607 31.9422 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2718 2.5149 31.9348 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4748 0.1971 32.1618 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6191 0.9694 33.5092 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9356 -0.1431 33.8184 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 34 1 0 0 0 - 2 35 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 40 1 0 0 0 - 16 41 1 0 0 0 - 17 28 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 45 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 2 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 50 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --10.093111 - -$$$$ -18652-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 56 0 0 1 0 999 V2000 - 24.4145 10.2466 30.7179 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2191 11.0461 30.1836 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7154 10.5298 28.8282 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1815 11.2380 31.1572 O 0 0 0 0 0 0 - 21.4027 10.2023 31.6505 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7305 8.9413 31.2769 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9695 7.9245 31.6884 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8692 8.0881 32.5165 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5323 9.3739 32.9065 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4017 9.4816 33.7079 N 0 0 0 0 0 0 - 20.3042 10.4681 32.4772 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9961 11.8471 32.8385 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7584 12.9445 33.1218 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4458 6.7432 31.1644 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8524 5.5564 31.0443 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7091 5.3135 31.4219 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6443 4.4872 30.3016 C 0 0 0 0 0 0 - 22.9984 4.1711 30.9304 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1219 4.9619 30.6449 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9394 6.0555 29.8171 O 0 0 0 0 0 0 - 25.0655 6.8325 29.4151 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3547 4.6081 31.2081 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4606 3.5028 32.0584 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0696 3.0792 32.7393 S 0 0 0 0 0 0 - 26.9129 2.7675 34.1691 O 0 0 0 0 0 0 - 28.0400 4.1078 32.3298 O 0 0 0 0 0 0 - 27.5188 1.5242 31.8684 C 0 0 0 0 0 0 - 24.3410 2.7135 32.3514 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1128 3.0637 31.7753 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5003 1.6315 33.1956 O 0 0 0 0 0 0 - 23.5378 0.5806 33.1826 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7415 10.6621 31.6655 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1782 9.1987 30.8859 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2497 10.2777 30.0192 H 0 0 0 0 0 0 - 23.5910 12.0560 30.0010 H 0 0 0 0 0 0 - 21.9551 11.1992 28.4337 H 0 0 0 0 0 0 - 23.5254 10.4948 28.1009 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2876 9.5305 28.8821 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2798 7.2464 32.8395 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9105 8.6432 34.0020 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0224 10.3951 33.9434 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3664 6.8521 30.7686 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0572 3.5783 30.2104 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7884 4.8643 29.2940 H 0 0 0 0 0 0 - 25.7830 6.2359 28.8495 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7303 7.6423 28.7665 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5715 7.2882 30.2675 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2391 5.1874 30.9959 H 0 0 0 0 0 0 - 27.5468 1.7068 30.7961 H 0 0 0 0 0 0 - 28.4945 1.1899 32.2143 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7698 0.7657 32.0904 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2363 2.4667 31.9693 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5553 0.9010 33.5259 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4436 0.1422 32.1903 H 0 0 0 0 0 0 - 23.8677 -0.2111 33.8548 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 35 1 0 0 0 - 3 36 1 0 0 0 - 3 37 1 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 14 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 39 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 11 2 0 0 0 - 10 40 1 0 0 0 - 10 41 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 3 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 17 44 1 0 0 0 - 18 29 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 45 1 0 0 0 - 21 46 1 0 0 0 - 21 47 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 48 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 24 27 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 27 50 1 0 0 0 - 27 51 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 30 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 31 53 1 0 0 0 - 31 54 1 0 0 0 - 31 55 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --10.682977 - -$$$$ -18627-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 39 0 0 1 0 999 V2000 - 24.0455 12.2310 30.2644 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3145 10.9118 30.5250 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1664 11.2000 31.3187 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3513 10.1659 31.7455 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6956 8.9024 31.3722 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9003 7.8904 31.7476 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7671 8.0627 32.5273 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4228 9.3455 32.9112 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2685 9.4486 33.6770 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2166 10.4359 32.5197 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9034 11.8154 32.8755 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6627 12.9133 33.1535 N 0 0 0 0 0 0 - 21.3886 6.6799 31.3021 N 0 0 0 0 0 0 - 20.7526 5.5183 31.1147 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5388 5.3838 31.2541 O 0 0 0 0 0 0 - 21.5779 4.2945 30.6927 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0905 4.5085 30.6435 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6658 5.3064 29.6460 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0464 5.5098 29.6200 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8561 4.9156 30.5871 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5599 5.1731 30.5675 Cl 0 0 0 0 0 0 - 25.2884 4.1164 31.5778 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9087 3.9120 31.6076 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9364 12.0713 29.6579 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4006 12.9310 29.7325 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3505 12.7019 31.1984 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0186 10.4502 29.5804 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9785 10.2165 31.0438 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1622 7.2240 32.8293 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7921 8.6077 33.9893 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8985 10.3613 33.9326 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3727 6.7236 31.1098 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3384 3.4827 31.3789 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2281 3.9764 29.7145 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0434 5.7716 28.8932 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4959 6.1265 28.8545 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9236 3.6580 32.3215 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4814 3.2862 32.3792 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 23 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --8.483096 - -$$$$ -18658-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 48 0 0 1 0 999 V2000 - 24.2852 12.3288 28.3276 O 0 0 0 0 0 0 - 23.5037 12.4810 29.5025 C 0 0 0 0 0 0 - 22.9866 11.1257 30.0090 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1131 11.3519 31.1177 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3839 10.2942 31.6329 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7293 9.0437 31.2234 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9896 8.0072 31.6469 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9094 8.1489 32.5070 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5594 9.4227 32.9202 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4400 9.5048 33.7395 N 0 0 0 0 0 0 - 20.3035 10.5324 32.4890 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9761 11.9037 32.8617 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7239 12.9956 33.1512 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4466 6.8222 31.1057 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8624 5.6231 31.0276 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7368 5.3649 31.4500 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6464 4.5487 30.2818 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0171 4.2597 30.8878 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1155 5.0842 30.5962 C 0 0 0 0 0 0 - 23.8945 6.1740 29.7723 O 0 0 0 0 0 0 - 24.9287 7.1387 29.5901 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3625 4.7657 31.1517 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4998 3.6732 32.0086 C 0 0 0 0 0 0 - 24.4115 2.8577 32.3080 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1685 3.1576 31.7364 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6403 1.8060 33.1700 O 0 0 0 0 0 0 - 23.7219 0.7155 33.1863 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6925 12.1645 27.5705 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1054 12.9602 30.2767 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6668 13.1501 29.2937 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4486 10.6181 29.2048 H 0 0 0 0 0 0 - 23.8206 10.4854 30.3032 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3382 7.2973 32.8365 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9523 8.6584 34.0161 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0427 10.4109 33.9760 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3576 6.9198 30.6835 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0656 3.6325 30.2173 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7673 4.9118 29.2660 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8009 6.7077 29.0963 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5598 7.9441 28.9547 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2352 7.5868 30.5365 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2360 5.3618 30.9363 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4616 3.4445 32.4445 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3141 2.5340 31.9474 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0963 -0.0558 33.8590 H 0 0 0 0 0 0 - 22.7347 1.0021 33.5460 H 0 0 0 0 0 0 - 23.6203 0.2633 32.2001 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 14 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 11 2 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 3 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 25 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --9.699398 - -$$$$ -18630-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 42 0 0 1 0 999 V2000 - 24.0212 12.2423 30.2763 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2929 10.9217 30.5380 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1435 11.2077 31.3313 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3312 10.1711 31.7577 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6809 8.9094 31.3858 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8904 7.8933 31.7600 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7538 8.0604 32.5352 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4031 9.3419 32.9176 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2457 9.4395 33.6789 N 0 0 0 0 0 0 - 20.1936 10.4361 32.5290 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8748 11.8145 32.8832 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6299 12.9119 33.1596 N 0 0 0 0 0 0 - 21.3867 6.6852 31.3195 N 0 0 0 0 0 0 - 20.7626 5.5181 31.1286 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5491 5.3722 31.2624 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6082 4.3050 30.7113 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1035 4.5843 30.5577 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0149 4.0448 31.4691 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3756 4.3277 31.3494 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8350 5.1529 30.3201 C 0 0 0 0 0 0 - 27.3129 5.4673 30.1984 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9278 5.6839 29.4014 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5681 5.4012 29.5204 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9125 12.0836 29.6701 H 0 0 0 0 0 0 - 23.3751 12.9405 29.7437 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3253 12.7145 31.2099 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9984 10.4586 29.5936 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9584 10.2281 31.0572 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1525 7.2183 32.8345 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7760 8.5960 33.9948 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8735 10.3508 33.9369 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3717 6.7302 31.1256 H 0 0 0 0 0 0 - 21.4430 3.5138 31.4423 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2203 3.9323 29.7668 H 0 0 0 0 0 0 - 23.6745 3.4074 32.2732 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0730 3.9081 32.0605 H 0 0 0 0 0 0 - 27.8096 4.7114 29.5901 H 0 0 0 0 0 0 - 27.4730 6.4405 29.7324 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7937 5.4911 31.1768 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2772 6.3171 28.5974 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8717 5.8252 28.8104 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 23 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --9.142359 - -$$$$ -18639-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 49 0 0 1 0 999 V2000 - 24.2764 10.8583 30.5311 C 0 0 0 0 0 0 - 22.8724 11.1948 30.0242 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9935 11.3729 31.1346 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3005 10.2943 31.6577 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6713 9.0502 31.2482 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9501 8.0000 31.6666 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8665 8.1184 32.5257 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4926 9.3843 32.9417 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3660 9.4440 33.7525 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2180 10.5087 32.5170 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8684 11.8729 32.8958 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5992 12.9596 33.1898 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4272 6.8285 31.1136 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8583 5.6230 31.0220 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7390 5.3452 31.4465 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6500 4.5669 30.2607 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0147 4.2719 30.8751 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1184 5.0810 30.5810 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9097 6.1670 29.7482 O 0 0 0 0 0 0 - 24.9546 7.1169 29.5477 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3567 4.7546 31.1456 C 0 0 0 0 0 0 - 25.5076 3.6737 32.0309 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8469 3.4094 32.6231 N 0 3 0 0 0 0 - 26.9382 2.7388 33.6465 O 0 5 0 0 0 0 - 27.8303 3.9025 32.0768 O 0 0 0 0 0 0 - 24.3855 2.8726 32.3281 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1530 3.1840 31.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5282 1.8156 33.2068 O 0 0 0 0 0 0 - 23.6287 0.7111 33.1397 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9811 10.7710 29.7049 H 0 0 0 0 0 0 - 24.6265 11.6406 31.2026 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2796 9.9166 31.0795 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9068 12.1390 29.4793 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5079 10.4570 29.3055 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3078 7.2565 32.8493 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8988 8.5880 34.0374 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9566 10.3437 33.9935 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3301 6.9544 30.6849 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0732 3.6498 30.1768 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7742 4.9478 29.2516 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2823 7.5646 30.4872 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8130 6.6724 29.0416 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5873 7.9254 28.9151 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2202 5.3584 30.9137 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2857 2.5791 31.9490 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9634 -0.0596 33.8336 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6108 0.9729 33.4250 H 0 0 0 0 0 0 - 23.6162 0.2649 32.1465 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 33 1 0 0 0 - 2 34 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 35 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 36 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 16 40 1 0 0 0 - 17 27 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 44 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 26 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 2 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 28 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 -M CHG 2 23 1 24 -1 -M END -> -0 - -> --9.740725 - -$$$$ -18631-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 43 0 0 1 0 999 V2000 - 24.0755 12.4055 30.2451 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3424 11.0801 30.4647 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2047 11.3422 31.2813 O 0 0 0 0 0 0 - 21.4058 10.2921 31.7002 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7494 9.0415 31.2875 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9744 8.0116 31.6611 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8654 8.1565 32.4823 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5167 9.4285 32.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3785 9.5086 33.6918 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2859 10.5348 32.5034 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9577 11.9052 32.8782 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7043 12.9964 33.1698 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4335 6.8284 31.1203 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8529 5.6284 31.0363 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7241 5.3670 31.4482 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6449 4.5576 30.2938 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0457 4.3201 30.8547 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1118 5.1697 30.5127 C 0 0 0 0 0 0 - 23.8316 6.2511 29.6969 O 0 0 0 0 0 0 - 24.8029 7.2847 29.5518 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3922 4.8833 31.0087 C 0 0 0 0 0 0 - 25.6006 3.7978 31.8588 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5324 2.9786 32.2141 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2600 3.2339 31.7089 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9598 12.2663 29.6240 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4276 13.1271 29.7470 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3914 12.8398 31.1933 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0335 10.6532 29.5079 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0108 10.3654 30.9504 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2721 7.3090 32.7814 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8994 8.6601 33.9762 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9919 10.4140 33.9478 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3442 6.9276 30.6984 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0871 3.6245 30.2719 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7205 4.9000 29.2670 H 0 0 0 0 0 0 - 25.0949 7.7043 30.5163 H 0 0 0 0 0 0 - 25.6927 6.9310 29.0289 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3775 8.0953 28.9600 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2390 5.4990 30.7480 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5905 3.5910 32.2418 H 0 0 0 0 0 0 - 24.6928 2.1325 32.8676 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4448 2.5727 31.9713 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 30 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 24 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --9.413821 - -$$$$ -18632-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 43 0 0 1 0 999 V2000 - 22.8348 10.6133 29.0685 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2564 10.8543 30.5245 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1208 11.1384 31.3461 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3028 10.1143 31.7943 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6562 8.8449 31.4620 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8562 7.8405 31.8366 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7056 8.0208 32.5847 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3552 9.3103 32.9399 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1854 9.4218 33.6784 N 0 0 0 0 0 0 - 20.1562 10.3962 32.5462 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8394 11.7813 32.8754 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5962 12.8840 33.1326 N 0 0 0 0 0 0 - 21.3594 6.6315 31.4180 N 0 0 0 0 0 0 - 20.7263 5.4857 31.1542 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5060 5.3615 31.2301 O 0 0 0 0 0 0 - 21.5718 4.2763 30.7231 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0667 4.5575 30.5721 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9662 4.1691 31.5713 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3371 4.3576 31.4206 C 0 0 0 0 0 0 - 26.1329 3.8953 32.4456 O 0 0 0 0 0 0 - 27.5411 4.0836 32.3620 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8096 4.9784 30.2546 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9199 5.3917 29.2621 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5514 5.1788 29.4197 C 0 0 0 0 0 0 - 23.7034 10.4793 28.4246 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2151 9.7218 28.9748 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2619 11.4575 28.6854 H 0 0 0 0 0 0 - 23.8512 10.0252 30.9148 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9087 11.7271 30.5637 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0962 7.1839 32.8816 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7193 8.5829 34.0117 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8208 10.3375 33.9319 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3511 6.6746 31.2616 H 0 0 0 0 0 0 - 21.4061 3.4780 31.4455 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1892 3.9164 29.7717 H 0 0 0 0 0 0 - 23.6107 3.6888 32.4714 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0177 3.6454 33.2382 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9621 3.5934 31.4852 H 0 0 0 0 0 0 - 27.8009 5.1430 32.3415 H 0 0 0 0 0 0 - 26.8653 5.1405 30.1016 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2923 5.8694 28.3662 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8725 5.4956 28.6399 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 30 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 24 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 22 2 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --9.083236 - -$$$$ -18636-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 39 0 0 1 0 999 V2000 - 23.9795 12.4589 30.2880 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2747 11.1170 30.5005 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1368 11.3490 31.3273 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3560 10.2807 31.7346 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7259 9.0407 31.3145 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9683 7.9946 31.6702 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8451 8.1072 32.4773 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4687 9.3702 32.9032 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3178 9.4274 33.6812 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2247 10.4942 32.5296 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8737 11.8560 32.9146 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6036 12.9410 33.2135 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4728 6.8392 31.1131 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9423 5.6177 31.0115 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8423 5.2962 31.4542 O 0 0 0 0 0 0 - 21.7561 4.6026 30.2160 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0783 4.2283 30.8823 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1375 3.3173 31.9518 C 0 0 0 0 0 0 - 21.5740 2.4705 32.6412 Br 0 0 0 0 0 0 - 24.3634 3.0176 32.5456 C 0 0 0 0 0 0 - 25.5365 3.6080 32.0767 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4840 4.5100 31.0173 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0825 5.3242 30.3860 Br 0 0 0 0 0 0 - 24.2614 4.8204 30.4251 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8608 12.3428 29.6579 H 0 0 0 0 0 0 - 23.3134 13.1725 29.8027 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2960 12.8898 31.2373 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9681 10.6932 29.5416 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9606 10.4107 30.9741 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2630 7.2454 32.7565 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8620 8.5711 33.9829 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9267 10.3270 33.9514 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3648 7.0193 30.6863 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1607 3.7065 30.0526 H 0 0 0 0 0 0 - 21.9267 5.0299 29.2321 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3992 2.3224 33.3727 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4874 3.3749 32.5341 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2431 5.5409 29.6199 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 30 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 24 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 24 38 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --7.512318 - -$$$$ -18626-1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 39 0 0 1 0 999 V2000 - 23.9635 12.4497 30.2903 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2574 11.1110 30.5189 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1169 11.3548 31.3379 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3337 10.2929 31.7571 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7030 9.0460 31.3553 N 0 0 0 0 0 0 - 20.9397 8.0077 31.7246 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8167 8.1342 32.5272 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4419 9.4023 32.9317 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2880 9.4650 33.7017 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2000 10.5200 32.5451 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8477 11.8875 32.9079 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5764 12.9770 33.1888 N 0 0 0 0 0 0 - 21.4299 6.8386 31.1872 N 0 0 0 0 0 0 - 20.8469 5.6461 31.0336 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7112 5.3701 31.4141 O 0 0 0 0 0 0 - 21.6405 4.6099 30.2450 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0890 4.4692 30.6919 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4115 3.6311 31.7625 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7308 3.5231 32.1964 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1131 2.5196 33.5455 Cl 0 0 0 0 0 0 - 25.7377 4.2389 31.5498 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4251 5.0710 30.4731 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1019 5.1880 30.0463 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8475 12.3245 29.6656 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2997 13.1565 29.7922 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2763 12.8938 31.2348 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9540 10.6743 29.5648 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9412 10.4115 31.0051 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2327 7.2769 32.8172 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8294 8.6094 34.0005 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8922 10.3658 33.9622 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3541 6.9752 30.8225 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1451 3.6416 30.2910 H 0 0 0 0 0 0 - 21.5984 4.9434 29.2151 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6442 3.0568 32.2589 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7584 4.1509 31.8923 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2071 5.6291 29.9754 H 0 0 0 0 0 0 - 23.8712 5.8362 29.2115 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 13 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 3 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 23 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 -M END -> -0 - -> --8.872536 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/MCL1_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/MCL1_ligands.sdf deleted file mode 100755 index fea8f7f4..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/MCL1_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,4178 +0,0 @@ -26 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 3.8290 -49.9082 7.3567 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1153 -49.0416 6.8012 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5513 -47.8977 6.5562 O 0 5 0 0 0 0 - 1.7057 -49.3580 6.4403 C 0 0 0 0 0 0 - -0.1076 -50.6487 6.3793 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0211 -51.7084 6.5402 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3348 -51.5531 6.0492 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6993 -50.3586 5.3936 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7635 -49.3099 5.2420 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4423 -49.4338 5.7433 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7328 -48.6071 5.8015 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8592 -47.2049 5.2675 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9701 -46.1519 6.3924 C 0 0 0 0 0 0 - -0.0852 -45.0395 6.3276 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4118 -45.4805 6.0441 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2386 -45.8040 7.0949 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0387 -46.5572 9.1587 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7241 -47.0517 9.1502 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8288 -46.6752 8.1339 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7241 -52.6191 7.0419 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0568 -52.3474 6.1618 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7027 -50.2338 5.0158 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0623 -48.3873 4.7602 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0186 -46.9829 4.6116 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7413 -47.1366 4.6230 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9528 -45.6851 6.3456 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9550 -46.6329 7.3658 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1913 -44.3765 5.5164 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0677 -44.4348 7.2308 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8492 -47.1142 8.1369 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4644 -45.6869 8.1312 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5686 -45.3157 7.0918 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0196 -44.4491 6.0697 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3473 -43.9766 6.0646 C 0 0 0 0 0 0 - -6.2357 -44.3575 7.0895 C 0 0 0 0 0 0 - -5.7910 -45.2055 8.1244 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3603 -44.1405 5.2743 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6744 -43.3185 5.2717 H 0 0 0 0 0 0 - -7.2548 -43.9991 7.0843 H 0 0 0 0 0 0 - -6.4744 -45.4962 8.9093 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4004 -47.7370 9.9189 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7163 -46.8570 9.9410 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2056 -50.5983 6.7955 O 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 19 2 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 31 1 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 30 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 36 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 2 0 0 0 - 33 37 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.23584030891924 - -$$$$ -48 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 45 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5962 -50.2382 7.2860 O 0 0 0 0 0 0 - 2.9915 -49.1832 6.9785 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5468 -48.0563 6.9856 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5667 -49.2814 6.6034 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3493 -50.4961 6.2933 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3483 -51.4866 6.2008 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6508 -51.1171 5.7985 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9320 -49.7715 5.4886 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9224 -48.7928 5.5781 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6057 -49.1301 5.9783 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6128 -48.3833 6.1734 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8068 -46.9172 5.9622 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7034 -46.1229 7.2813 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7224 -46.0877 7.8568 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5391 -45.3745 6.9378 O 0 0 0 0 0 0 - -2.8810 -45.1822 7.1989 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6349 -44.5517 7.4221 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8882 -44.0528 6.3462 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5272 -44.3675 6.2431 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1221 -52.5127 6.4406 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4286 -51.8679 5.7409 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9393 -49.4941 5.1917 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1655 -47.7639 5.3407 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0812 -46.5361 5.2444 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7755 -46.7461 5.5008 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0481 -45.1065 7.1031 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3929 -46.5497 8.0104 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7254 -45.5871 8.8270 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0854 -47.1044 7.9921 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9494 -43.9742 5.4116 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3617 -43.4242 5.5988 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6821 -44.3169 7.5187 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9807 -50.5349 6.6696 N 0 0 0 0 0 0 - 1.5294 -51.3275 6.9752 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5301 -46.7432 10.1164 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5194 -46.0063 9.4887 N 0 0 0 0 0 0 - -5.0107 -45.3807 8.3736 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6231 -45.7297 8.3012 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3547 -46.5895 9.4315 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4801 -45.9639 9.8176 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4128 -47.0461 9.6996 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7507 -47.3116 11.0075 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 19 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 31 1 0 0 0 - 19 30 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 39 2 0 0 0 - 35 42 1 0 0 0 - 36 37 1 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 - 37 38 2 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 39 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --6.6626190630157 - -$$$$ -33 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 3.6157 -50.1315 7.3800 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0170 -49.1138 6.9676 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5644 -47.9851 6.9019 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6043 -49.2459 6.5419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3113 -50.4722 6.2833 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3178 -51.4535 6.2650 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5967 -51.1141 5.7749 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8523 -49.8053 5.3101 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8339 -48.8336 5.3312 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5363 -49.1416 5.8192 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6789 -48.3880 5.9873 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8824 -46.9418 5.6154 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6891 -45.9795 6.8002 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7339 -45.9723 7.3808 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6585 -45.6662 6.3443 O 0 0 0 0 0 0 - -2.9587 -45.3534 6.6806 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4415 -45.2780 8.0126 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7727 -44.8870 8.2638 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6345 -44.5827 7.1953 C 0 0 0 0 0 0 - -5.1783 -44.6966 5.8690 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8496 -45.0887 5.6179 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0976 -52.4485 6.6218 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3720 -51.8638 5.7580 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8398 -49.5448 4.9387 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0372 -47.8283 4.9825 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2119 -46.6666 4.8034 H 0 0 0 0 0 0 - 1.8875 -46.8041 5.2117 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9411 -44.9683 6.4741 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3987 -46.2206 7.5935 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7710 -45.2292 8.1737 H 0 0 0 0 0 0 - -0.9778 -46.9317 7.8279 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8136 -45.5076 8.8532 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5008 -45.1803 4.6040 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0091 -50.4890 6.6902 N 0 0 0 0 0 0 - 1.5399 -51.2626 7.0744 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8318 -44.4759 5.0392 H 0 0 0 0 0 0 - -7.2450 -44.0498 7.5067 Cl 0 0 0 0 0 0 - -5.1205 -44.8093 9.2815 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --6.8752436973459 - -$$$$ -46 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5634 -47.8222 6.3169 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0096 -48.8325 6.8076 C 0 0 0 0 0 0 - 3.6259 -49.6047 7.5794 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5978 -49.1187 6.4846 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2687 -50.4180 6.6086 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2477 -51.4049 6.8705 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5242 -51.2927 6.2695 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8029 -50.2046 5.4177 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8160 -49.2240 5.1702 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5328 -49.3025 5.7596 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6485 -48.4818 5.7196 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7914 -47.1830 4.9813 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8856 -45.9530 5.9079 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3043 -45.7921 6.8650 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4475 -45.4189 6.1063 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6442 -45.2630 6.7712 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8922 -44.2571 6.6999 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6327 -44.4906 6.1102 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0201 -52.2377 7.5251 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2785 -52.0456 6.4598 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7773 -50.1193 4.9545 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0556 -48.3850 4.5239 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0599 -47.0510 4.3183 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6673 -47.2161 4.3353 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9959 -45.0491 5.3038 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7930 -46.0181 6.5046 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0852 -45.0058 7.5899 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4512 -46.7216 7.4182 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4149 -44.0650 5.1406 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9379 -45.8450 8.0360 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6352 -43.6555 6.1979 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2387 -46.4637 8.5728 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0287 -50.2522 7.0341 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2177 -45.7257 9.9160 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7395 -46.1893 9.8810 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2087 -45.6259 8.5912 C 0 0 0 0 0 0 - -5.1536 -44.8350 7.9542 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4175 -44.7160 8.7624 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5036 -43.6968 9.1386 H 0 0 0 0 0 0 - -7.2948 -44.9463 8.1570 H 0 0 0 0 0 0 - -6.5029 -45.3113 10.8847 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8566 -46.5933 9.7373 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6544 -47.2763 9.8998 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1716 -45.7891 10.7160 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5629 -50.8425 7.6515 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 19 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 21 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 22 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 23 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 27 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 31 1 0 0 0 - 17 37 2 0 0 0 - 18 29 1 0 0 0 - 30 32 1 0 0 0 - 30 36 2 0 0 0 - 33 45 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 34 41 1 0 0 0 - 34 42 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 43 1 0 0 0 - 35 44 1 0 0 0 - 36 37 1 0 0 0 - 37 38 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 38 40 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --7.60113429727595 - -$$$$ -35 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5648 -47.8113 6.2796 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0310 -48.8242 6.8004 C 0 0 0 0 0 0 - 3.6630 -49.5724 7.5811 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6183 -49.1519 6.4787 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2217 -50.4968 6.5938 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1816 -51.5029 6.8463 C 0 0 0 0 0 0 - -2.4635 -51.3995 6.2697 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7770 -50.2885 5.4590 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8231 -49.2850 5.2249 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5246 -49.3637 5.7854 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6491 -48.5159 5.7434 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7691 -47.1896 5.0377 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8370 -45.9992 6.0190 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4250 -45.8461 6.8783 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5112 -45.4316 6.0568 O 0 0 0 0 0 0 - -2.7184 -45.2208 6.6770 C 0 0 0 0 0 0 - -3.0811 -45.7923 7.9227 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3343 -45.5354 8.5139 C 0 0 0 0 0 0 - -5.2346 -44.6602 7.8591 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8952 -44.1086 6.6071 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6498 -44.3988 6.0191 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9320 -52.3460 7.4726 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2041 -52.1633 6.4560 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7614 -50.2034 5.0261 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0759 -48.4336 4.6099 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0638 -47.0515 4.3496 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6702 -47.1961 4.4252 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0075 -45.0787 5.4596 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6919 -46.1052 6.6889 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2486 -45.0926 7.6503 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6237 -46.7925 7.3796 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4111 -46.4591 8.4420 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4103 -43.9697 5.0602 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0877 -50.3279 6.9944 N 0 0 0 0 0 0 - 1.6574 -50.9325 7.5789 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5902 -43.4580 6.0977 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7603 -44.2478 8.5596 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.6696 -46.2368 9.8281 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6654 -45.9873 10.2010 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6293 -47.3190 9.6861 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9434 -45.9806 10.6004 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 38 40 1 0 0 0 - 38 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.81264617449463 - -$$$$ -31 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5641 -47.7534 6.2143 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0122 -48.7554 6.7454 C 0 0 0 0 0 0 - 3.6123 -49.5070 7.5449 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5969 -49.0608 6.3966 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2442 -50.4134 6.4643 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2037 -51.4312 6.6788 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5043 -51.2795 6.1613 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8377 -50.1268 5.4226 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8793 -49.1151 5.2073 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5657 -49.2279 5.7279 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6141 -48.3957 5.7009 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7301 -47.0351 5.0529 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7552 -45.8921 6.0871 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5322 -45.7699 6.9086 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5383 -45.2373 6.0607 O 0 0 0 0 0 0 - -2.7966 -45.0645 6.5801 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2770 -45.7162 7.7440 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5937 -45.5045 8.1936 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4351 -44.6171 7.4875 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9679 -43.9681 6.3316 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6549 -44.1973 5.8830 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9293 -52.3080 7.2373 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2343 -52.0545 6.3287 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8309 -50.0299 5.0245 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1597 -48.2368 4.6387 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0757 -46.8844 4.3251 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6496 -47.0026 4.4706 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9511 -44.9495 5.5770 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5892 -46.0434 6.7679 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3754 -45.0980 7.7560 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8071 -46.7438 7.3136 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6512 -46.4014 8.2886 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3054 -43.7005 4.9910 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0786 -50.2786 6.8435 N 0 0 0 0 0 0 - 1.6576 -50.9409 7.3678 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6168 -43.2999 5.7853 H 0 0 0 0 0 0 - -6.4444 -44.4497 7.8279 H 0 0 0 0 0 0 - -5.7749 -45.4084 10.2138 F 0 0 0 0 0 0 - -5.1355 -46.2506 9.4023 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9929 -47.1821 8.9848 F 0 0 0 0 0 0 - -4.1591 -46.8446 10.0908 F 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 39 40 1 0 0 0 - 39 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --7.91951688961355 - -$$$$ -52 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 3.6519 -50.1731 7.5910 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0433 -49.1959 7.1015 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5655 -48.0687 6.9870 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6483 -49.3725 6.6570 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3320 -50.4839 6.5819 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4113 -51.3646 6.7488 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6844 -50.9778 6.2976 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8676 -49.7470 5.6359 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7777 -48.8758 5.4639 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4901 -49.2182 5.9483 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7777 -48.5424 5.9916 C 0 0 0 0 0 0 - 1.0475 -47.1566 5.5153 C 0 0 0 0 0 0 - 1.0218 -46.1839 6.7045 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4477 -44.8206 6.3095 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8651 -44.8822 5.7760 O 0 0 0 0 0 0 - -1.9430 -45.1814 6.5878 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2160 -45.1421 5.9801 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3936 -45.3534 6.7336 C 0 0 0 0 0 0 - -5.7495 -45.1797 6.0705 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2869 -45.6872 8.1025 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6898 -46.0040 9.0603 Cl 0 0 0 0 0 0 - -3.0245 -45.7414 8.7159 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8648 -45.4531 7.9752 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2649 -52.3092 7.2560 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0424 -51.9828 6.5895 Cl 0 0 0 0 0 0 - -3.8532 -49.4576 5.2953 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9286 -47.9157 4.9823 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2992 -46.8849 4.7743 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0104 -47.0970 4.9985 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0265 -46.0516 7.1041 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4504 -46.6226 7.5182 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1107 -44.4322 5.5444 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4854 -44.0896 7.0996 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2893 -44.9075 4.9284 H 0 0 0 0 0 0 - -6.4354 -45.9830 6.3550 H 0 0 0 0 0 0 - -6.1890 -44.2318 6.3827 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6734 -45.1750 4.9829 H 0 0 0 0 0 0 - -0.9262 -45.4276 8.5063 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9412 -45.9827 9.7646 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9956 -50.5546 6.9557 N 0 0 0 0 0 0 - 1.4807 -51.2969 7.4419 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 40 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 40 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 24 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 26 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 27 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 28 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 30 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 32 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 23 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 34 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 40 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --9.22585200324184 - -$$$$ -68 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 3.7726 -49.6838 6.9455 O 0 0 0 0 0 0 - 2.9100 -48.7925 6.7501 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2295 -47.5839 6.7163 O 0 5 0 0 0 0 - 1.4913 -49.1838 6.5587 C 0 0 0 0 0 0 - -0.1868 -50.6387 6.5133 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9631 -51.8099 6.5963 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3546 -51.7196 6.4061 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9393 -50.4632 6.1302 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1382 -49.2957 6.0374 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7392 -49.3608 6.2408 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3626 -48.4393 6.2579 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2858 -46.9624 5.9975 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3099 -46.1147 7.2841 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9470 -46.2726 8.1526 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0339 -45.7606 7.3984 O 0 0 0 0 0 0 - -3.2649 -45.6384 8.0063 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8320 -45.2982 9.1520 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8424 -46.0260 9.8383 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5646 -46.1963 9.2720 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4810 -52.7477 6.8125 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9631 -52.6053 6.4682 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6522 -50.3570 5.9185 Cl 0 0 0 0 0 0 - -2.6129 -48.3489 5.8313 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6031 -46.7219 5.4163 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1268 -46.6655 5.3667 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4122 -45.0603 7.0052 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1933 -46.3513 7.8811 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8331 -45.6975 9.0727 H 0 0 0 0 0 0 - -1.1059 -47.3195 8.4132 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8349 -46.7583 9.8317 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5501 -44.7469 7.8897 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2682 -44.9219 7.3124 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0002 -44.3707 6.0384 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9987 -43.6492 5.3557 C 0 0 0 0 0 0 - -6.2700 -43.4716 5.9396 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5447 -44.0200 7.2054 C 0 0 0 0 0 0 - -3.0325 -44.4979 5.5704 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7838 -43.2318 4.3761 H 0 0 0 0 0 0 - -7.0328 -42.9142 5.4103 H 0 0 0 0 0 0 - -7.5187 -43.8845 7.6476 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0576 -46.4517 10.8107 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8040 -45.1697 9.6054 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1760 -50.5215 6.6916 O 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 19 2 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 31 1 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 30 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 36 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 2 0 0 0 - 33 37 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --7.6896119149271 - -$$$$ -32 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5631 -47.8126 6.2553 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0220 -48.8134 6.7746 C 0 0 0 0 0 0 - 3.6456 -49.5539 7.5776 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6132 -49.1482 6.4568 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2315 -50.4988 6.6095 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1869 -51.5016 6.8846 C 0 0 0 0 0 0 - -2.4765 -51.4084 6.3236 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8024 -50.3149 5.4953 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8441 -49.3159 5.2323 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5398 -49.3743 5.7791 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6317 -48.5299 5.7107 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7399 -47.2203 4.9660 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8620 -45.9947 5.8916 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3438 -45.7995 6.8144 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4784 -45.4115 6.0512 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6600 -45.1948 6.7290 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8553 -45.5250 8.0921 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0865 -45.2606 8.7177 C 0 0 0 0 0 0 - -5.1349 -44.6543 8.0064 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9501 -44.3373 6.6470 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7260 -44.6100 6.0126 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9210 -52.3321 7.5184 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2056 -52.1744 6.5387 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7891 -50.2438 5.0714 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1041 -48.4784 4.5977 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1267 -47.0932 4.3200 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6015 -47.2535 4.3013 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0037 -45.1044 5.2821 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7575 -46.0686 6.5120 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1118 -45.0203 7.5436 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5318 -46.7227 7.3641 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0818 -45.9790 8.6894 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6033 -44.3562 4.9706 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0888 -50.3185 6.9933 N 0 0 0 0 0 0 - 1.6676 -50.9262 7.5783 H 0 0 0 0 0 0 - -5.7468 -43.8723 6.0826 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2172 -45.5201 9.7567 H 0 0 0 0 0 0 - -6.4399 -44.3423 8.7154 C 0 0 0 0 0 0 - -7.1513 -43.8475 8.0470 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8942 -45.2648 9.0853 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2534 -43.6836 9.5682 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 38 40 1 0 0 0 - 38 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --6.58301699393044 - -$$$$ -38 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5933 -49.9991 7.5555 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0001 -49.0713 6.9544 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5624 -47.9815 6.7110 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5917 -49.2744 6.5446 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3051 -50.5537 6.4875 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2894 -51.5592 6.6189 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5514 -51.3707 6.0210 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8162 -50.1743 5.3187 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8241 -49.1776 5.2080 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5385 -49.3399 5.7780 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6726 -48.5474 5.8120 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9017 -47.2144 5.1306 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4907 -45.9835 5.9602 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0329 -45.8412 6.1442 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4399 -46.5418 7.3177 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6980 -46.2729 7.8035 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7548 -45.7256 7.0283 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0251 -45.4767 7.6009 C 0 0 0 0 0 0 - -5.2110 -45.7620 8.9755 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1688 -46.3092 9.7409 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9221 -46.5642 9.1578 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0643 -52.4685 7.1557 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3107 -52.1386 6.1032 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7870 -50.0270 4.8621 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0525 -48.2620 4.6806 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3591 -47.1826 4.1860 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9571 -47.1197 4.8545 H 0 0 0 0 0 0 - 0.8383 -45.1152 5.4100 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0193 -45.9535 6.9119 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5694 -46.2175 5.2579 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2608 -44.7804 6.2555 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6128 -45.5208 5.9804 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1258 -46.9747 9.7432 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0006 -50.4682 6.9462 N 0 0 0 0 0 0 - 1.5289 -51.1452 7.4978 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3285 -46.5246 10.7852 H 0 0 0 0 0 0 - -6.1596 -45.5763 9.4591 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2961 -43.9825 5.1869 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9685 -43.6324 4.8677 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9075 -44.1038 5.6742 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1471 -44.9439 6.7916 C 0 0 0 0 0 0 - -7.4945 -45.2646 7.0984 C 0 0 0 0 0 0 - -8.5569 -44.7797 6.3153 C 0 0 0 0 0 0 - -9.1038 -43.6280 4.5606 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7448 -43.0106 4.0128 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8944 -43.8110 5.4066 H 0 0 0 0 0 0 - -7.7356 -45.9131 7.9203 H 0 0 0 0 0 0 - -9.5750 -45.0472 6.5536 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 38 39 2 0 0 0 - 38 43 1 0 0 0 - 38 44 1 0 0 0 - 39 40 1 0 0 0 - 39 45 1 0 0 0 - 40 41 2 0 0 0 - 40 46 1 0 0 0 - 41 42 1 0 0 0 - 42 43 2 0 0 0 - 42 47 1 0 0 0 - 43 48 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --7.01900763427615 - -$$$$ -51 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 47 0 0 1 0 999 V2000 - 3.7527 -49.6152 6.8636 O 0 0 0 0 0 0 - 2.8848 -48.7317 6.6600 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1745 -47.5142 6.7244 O 0 5 0 0 0 0 - 1.4963 -49.1647 6.3449 C 0 0 0 0 0 0 - -0.1706 -50.7326 6.1724 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9638 -51.8980 6.1848 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3385 -51.8063 5.8920 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8945 -50.5470 5.5892 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1048 -49.3755 5.5930 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7152 -49.4395 5.8829 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3471 -48.4704 6.0111 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2138 -46.9863 5.9181 C 0 0 0 0 0 0 - -0.0845 -46.4209 7.3062 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6144 -44.9916 7.3052 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9032 -44.9246 6.7062 O 0 0 0 0 0 0 - -3.0236 -45.1515 7.4787 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3750 -45.5596 9.0081 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1326 -45.9972 9.4926 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9744 -45.8157 8.7239 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5176 -52.8580 6.4257 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9480 -52.6929 5.8996 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9451 -50.4849 5.3600 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8919 -47.8611 5.2687 Cl 0 0 0 0 0 0 - -0.5735 -46.7018 5.2184 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1226 -46.5310 5.5107 H 0 0 0 0 0 0 - 0.8231 -46.4830 7.8976 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8063 -47.0664 7.8111 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0691 -44.3813 6.7142 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6277 -44.5694 8.3150 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0412 -46.1723 9.1262 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4558 -44.9041 7.7675 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2759 -44.6954 7.0025 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3683 -44.0049 5.7701 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6111 -43.5273 5.3116 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7775 -43.7552 6.0709 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7018 -44.4463 7.2927 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4833 -43.8281 5.1811 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6684 -42.9880 4.3736 H 0 0 0 0 0 0 - -7.7319 -43.3883 5.7175 H 0 0 0 0 0 0 - -7.5959 -44.6138 7.8717 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0734 -46.4936 10.4507 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2681 -45.7131 9.5988 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1745 -50.5105 6.4276 N 0 0 0 0 0 0 - 1.8793 -51.1829 6.6898 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 19 2 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 31 1 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 30 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 36 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 2 0 0 0 - 33 37 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.44846494324944 - -$$$$ -50 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 46 0 0 1 0 999 V2000 - 3.7793 -49.8551 7.0486 O 0 0 0 0 0 0 - 2.9869 -48.9536 6.6755 C 0 0 0 0 0 0 - 3.3674 -47.7712 6.5283 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5743 -49.3351 6.4116 C 0 0 0 0 0 0 - -0.1186 -50.8654 6.3660 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9353 -52.0079 6.4726 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2983 -51.9243 6.1497 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8394 -50.6992 5.7155 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0219 -49.5504 5.6229 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6359 -49.6058 5.9539 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4437 -48.6413 6.0163 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3299 -47.1710 5.7539 C 0 0 0 0 0 0 - -0.1581 -46.4326 7.0125 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6377 -45.0064 6.7266 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8216 -45.0466 5.9392 O 0 0 0 0 0 0 - -3.0478 -45.1371 6.5648 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2350 -45.4603 7.9288 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5322 -45.6029 8.4606 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6965 -46.0234 9.9032 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6613 -45.3986 7.6394 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2509 -45.6153 8.2746 Cl 0 0 0 0 0 0 - -5.4842 -45.0381 6.2876 C 0 0 0 0 0 0 - -6.6772 -44.8280 5.3721 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1811 -44.9222 5.7571 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5074 -52.9447 6.8061 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9294 -52.8025 6.2356 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8920 -50.6527 5.4647 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7591 -48.0672 5.1129 Cl 0 0 0 0 0 0 - -0.3547 -46.9813 4.9224 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2818 -46.7549 5.4393 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6482 -46.4140 7.7546 H 0 0 0 0 0 0 - -0.9697 -47.0031 7.4646 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1311 -44.4722 6.1648 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7740 -44.4350 7.6482 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3878 -45.6249 8.5742 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3628 -45.3425 10.4435 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1215 -47.0319 9.9632 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7378 -46.0406 10.4320 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3693 -44.5230 4.3710 H 0 0 0 0 0 0 - -7.2388 -45.7616 5.2796 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3363 -44.0653 5.7749 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0437 -44.6634 4.7162 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2283 -50.6666 6.6110 N 0 0 0 0 0 0 - 1.9287 -51.3488 6.9074 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 24 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 35 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --9.32829709690352 - -$$$$ -28 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 3.9028 -50.1313 6.9252 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1380 -49.1612 6.7262 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5633 -47.9815 6.7264 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6985 -49.4262 6.5058 C 0 0 0 0 0 0 - -0.0745 -50.8648 6.3721 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9478 -51.9675 6.3522 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3225 -51.7622 6.1429 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8137 -50.4555 5.9479 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9309 -49.3561 5.9665 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5423 -49.5315 6.1792 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5894 -48.6424 6.2612 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5190 -47.1480 6.1437 C 0 0 0 0 0 0 - 0.1328 -46.5094 7.4893 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4950 -45.1179 7.3420 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7518 -45.1827 6.6677 O 0 0 0 0 0 0 - -2.9007 -45.4447 7.3863 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1347 -45.3236 6.7054 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3517 -45.5713 7.3725 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3529 -45.9452 8.7282 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1342 -46.0720 9.4200 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9148 -45.8260 8.7539 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5638 -52.9671 6.5011 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0050 -52.6004 6.1330 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8700 -50.2982 5.7799 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3259 -48.3598 5.8190 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2135 -46.8785 5.3815 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4649 -46.7366 5.7895 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0182 -46.4639 8.1280 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5765 -47.1565 8.0046 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1695 -44.4859 6.7482 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5828 -44.6195 8.3070 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0028 -45.9352 9.3219 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2866 -50.7509 6.5622 N 0 0 0 0 0 0 - 1.9623 -51.4847 6.7363 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1392 -46.3569 10.4611 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2867 -46.1359 9.2357 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2915 -45.4738 6.8474 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1627 -44.9217 5.2458 C 0 0 0 0 0 0 - -5.1786 -44.9286 4.8507 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7525 -43.9155 5.1252 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5599 -45.6141 4.6558 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 35 1 0 0 0 - 21 32 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 38 40 1 0 0 0 - 38 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --6.62149034253618 - -$$$$ -66 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5632 -47.8394 5.6651 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0547 -48.6446 6.4687 C 0 0 0 0 0 0 - 3.7176 -49.0437 7.4483 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6404 -49.0782 6.2866 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2183 -50.6024 7.0271 S 0 0 0 0 0 0 - -0.4520 -50.4734 6.4812 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5140 -51.3853 6.6849 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8051 -51.0838 6.2163 C 0 0 0 0 0 0 - -3.0350 -49.8729 5.5476 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9701 -48.9821 5.3251 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6468 -49.2498 5.7659 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5741 -48.4756 5.6336 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6517 -47.1469 4.9149 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7584 -45.9333 5.8538 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2819 -45.9205 6.9846 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5969 -45.7351 6.4764 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6622 -45.8427 7.3608 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8922 -46.0665 9.1171 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6002 -46.3844 9.5752 C 0 0 0 0 0 0 - -2.4954 -46.2648 8.7080 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2466 -52.8788 7.5124 Cl 0 0 0 0 0 0 - -3.6235 -51.7836 6.3815 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0332 -49.6215 5.1991 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1703 -48.0560 4.8113 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2390 -47.0225 4.3158 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4901 -47.1452 4.2148 H 0 0 0 0 0 0 - 0.7050 -45.0106 5.2760 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7451 -45.9429 6.3140 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0489 -45.1139 7.6769 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1866 -46.8551 7.5316 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5239 -46.5195 9.1169 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0761 -45.6435 7.7862 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9716 -45.5347 6.9092 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1999 -45.1108 5.5812 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4996 -44.7947 5.1453 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5848 -44.9082 6.0206 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3755 -45.3310 7.3422 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3775 -45.0164 4.8790 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6642 -44.4657 4.1260 H 0 0 0 0 0 0 - -7.5884 -44.6716 5.6855 H 0 0 0 0 0 0 - -7.2209 -45.4118 8.0212 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4519 -46.7173 10.5975 H 0 0 0 0 0 0 - -5.7306 -46.1549 9.7980 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 12 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 27 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 29 1 0 0 0 - 15 30 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 17 33 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 32 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 37 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 36 37 2 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 - 37 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.43167143836328 - -$$$$ -39 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - 3.8280 -50.6234 7.4838 O 0 0 0 0 0 0 - 3.3210 -49.6151 6.9243 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9054 -48.5248 6.8176 O 0 5 0 0 0 0 - 1.9393 -49.7707 6.3969 C 0 0 0 0 0 0 - -0.0209 -50.9269 6.3143 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0754 -51.8407 6.4953 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3593 -51.5145 6.0248 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5689 -50.3046 5.3500 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5021 -49.4040 5.1503 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2163 -49.6827 5.6368 C 0 0 0 0 0 0 - 1.0640 -48.9793 5.6739 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3228 -47.6243 5.1362 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4437 -46.5592 5.8286 C 0 0 0 0 0 0 - 0.1816 -46.7275 7.3595 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4798 -45.6317 7.9896 O 0 0 0 0 0 0 - -1.8076 -45.4558 7.6772 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8302 -45.7085 8.6264 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1835 -45.4281 8.3011 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5494 -44.9452 7.0122 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5003 -44.7379 6.0858 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1611 -44.9745 6.4195 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8704 -52.7535 7.0353 H 0 0 0 0 0 0 - -3.1578 -52.2073 6.1966 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5590 -50.0501 5.0068 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6958 -48.4565 4.6509 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1281 -47.6472 4.0542 H 0 0 0 0 0 0 - 2.3865 -47.3967 5.2048 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5469 -46.5763 5.3452 H 0 0 0 0 0 0 - 0.8593 -45.5949 5.5863 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1167 -46.8600 7.9082 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4138 -47.6220 7.5773 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5705 -46.1051 9.6013 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3614 -44.7848 5.7081 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2913 -50.9433 6.7123 N 0 0 0 0 0 0 - 1.7986 -51.6652 7.2257 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7247 -44.3925 5.0868 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9356 -45.6033 9.0596 H 0 0 0 0 0 0 - -8.6255 -44.3363 5.6579 C 0 0 0 0 0 0 - -7.5720 -43.6313 5.0628 C 0 0 0 0 0 0 - -6.2570 -43.7913 5.5445 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9622 -44.6926 6.6073 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0522 -45.3703 7.2070 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3685 -45.1909 6.7365 C 0 0 0 0 0 0 - -9.6276 -44.2281 5.2749 H 0 0 0 0 0 0 - -7.7574 -42.9771 4.2289 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4770 -43.2223 5.0608 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8793 -46.0650 8.0204 H 0 0 0 0 0 0 - -9.1764 -45.7346 7.1984 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 38 39 2 0 0 0 - 38 43 1 0 0 0 - 38 44 1 0 0 0 - 39 40 1 0 0 0 - 39 45 1 0 0 0 - 40 41 2 0 0 0 - 40 46 1 0 0 0 - 41 42 1 0 0 0 - 42 43 2 0 0 0 - 42 47 1 0 0 0 - 43 48 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --7.02680029426089 - -$$$$ -37 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 46 0 0 1 0 999 V2000 - 3.8718 -50.2361 7.2245 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1316 -49.2780 6.8995 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5610 -48.1075 6.8535 O 0 5 0 0 0 0 - 1.7186 -49.5691 6.5705 C 0 0 0 0 0 0 - -0.0592 -50.9948 6.4011 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9536 -52.0849 6.4146 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3089 -51.8726 6.0773 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7528 -50.5878 5.7200 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8514 -49.5039 5.7068 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4753 -49.6825 6.0507 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6554 -48.7964 6.1719 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6195 -47.3137 5.9496 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2592 -46.5733 7.2461 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2682 -45.1542 7.0159 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4266 -45.1828 6.1895 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6770 -45.3015 6.7518 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9170 -45.6759 8.0958 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2343 -45.8324 8.5752 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4648 -46.3044 9.9964 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3341 -45.5816 7.7206 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9496 -45.7880 8.3010 Cl 0 0 0 0 0 0 - -5.0974 -45.1838 6.3837 C 0 0 0 0 0 0 - -6.2586 -44.9543 5.4353 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7754 -45.0569 5.9068 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6099 -53.0639 6.6886 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0079 -52.6920 6.0927 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7876 -50.4245 5.4565 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2150 -48.5192 5.4339 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1070 -47.0886 5.1675 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5805 -46.9587 5.5729 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1251 -46.5601 7.9062 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5106 -47.1361 7.7765 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4899 -44.5605 6.4974 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4532 -44.6511 7.9623 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1047 -45.8852 8.7746 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0633 -45.5829 10.5539 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9883 -47.2627 9.9924 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5238 -46.4500 10.5302 H 0 0 0 0 0 0 - -5.9144 -44.6062 4.4587 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8176 -45.8821 5.2865 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9402 -44.2052 5.8399 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6027 -44.7867 4.8774 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2925 -50.8807 6.6907 N 0 0 0 0 0 0 - 1.9238 -51.5961 7.0008 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 24 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 35 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.95356461676206 - -$$$$ -30 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 3.7086 -50.0138 7.0134 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0488 -49.0009 6.6642 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5629 -47.8679 6.6025 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6061 -49.1679 6.3503 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3127 -50.3896 6.2492 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3056 -51.3826 6.3084 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6361 -51.0463 5.9759 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9446 -49.7367 5.5736 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9388 -48.7516 5.5050 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5911 -49.0537 5.8486 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6353 -48.2926 5.9041 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8089 -46.8342 5.5612 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8737 -45.9328 6.8109 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4305 -45.9192 7.6156 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3927 -45.1905 6.8684 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6929 -45.1866 7.3131 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1490 -45.8766 8.4660 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5087 -45.8424 8.8313 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4211 -45.0930 8.0629 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9781 -44.3962 6.9226 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6217 -44.4510 6.5497 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0551 -52.3834 6.6110 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4056 -51.7983 6.0255 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9643 -49.4862 5.3115 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1991 -47.7505 5.1961 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0010 -46.5000 4.9071 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7256 -46.6956 4.9795 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1203 -44.9133 6.5123 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6903 -46.2673 7.4466 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2709 -45.4377 8.5803 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7619 -46.9401 7.8074 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4734 -46.4519 9.0781 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2874 -43.9302 5.6654 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0444 -50.4156 6.5272 N 0 0 0 0 0 0 - 1.6065 -51.2074 6.8324 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6766 -43.8255 6.3274 H 0 0 0 0 0 0 - -6.4649 -45.0576 8.3356 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9806 -46.6345 10.0352 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0496 -46.4952 10.2062 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7949 -47.6981 9.8697 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4404 -46.3264 10.9326 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 38 40 1 0 0 0 - 38 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --7.85321195175529 - -$$$$ -54 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 47 0 0 1 0 999 V2000 - 3.6008 -50.1426 7.0953 O 0 0 0 0 0 0 - 2.9945 -49.0877 6.7720 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5637 -47.9827 6.7380 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5546 -49.1833 6.4462 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4163 -50.3312 6.3666 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4599 -51.2734 6.4649 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7720 -50.8647 6.1354 C 0 0 0 0 0 0 - -3.0153 -49.5600 5.6849 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9719 -48.6268 5.5970 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6362 -48.9893 5.9458 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6049 -48.2698 6.0108 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7928 -46.8042 5.7026 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7659 -45.9154 6.9617 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4547 -46.1428 7.8719 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6482 -45.7967 7.1768 O 0 0 0 0 0 0 - -2.8653 -46.0089 7.8013 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3919 -46.3961 9.0422 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2120 -46.7521 9.7091 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9640 -46.5642 9.0973 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2657 -52.2717 6.8071 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0633 -51.9831 6.3229 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0227 -49.2605 5.4253 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1803 -47.6183 5.2861 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0004 -46.4776 5.0287 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7311 -46.6449 5.1622 H 0 0 0 0 0 0 - 0.8103 -44.8658 6.6678 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6726 -46.1131 7.5350 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3610 -45.5323 8.7700 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4705 -47.1845 8.1904 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0870 -46.8540 9.6464 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3220 -45.8538 7.7419 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0586 -45.6657 7.1236 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0089 -45.1257 5.8153 C 0 0 0 0 0 0 - -5.1957 -44.7666 5.1494 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4462 -44.9616 5.7683 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5086 -45.5045 7.0675 C 0 0 0 0 0 0 - -3.0572 -44.9736 5.3238 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1460 -44.3459 4.1528 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3538 -44.6861 5.2492 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4693 -45.6476 7.5385 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2660 -47.1681 10.6999 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3463 -46.5386 9.5257 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9431 -50.4141 6.6339 N 0 0 0 0 0 0 - 1.4728 -51.2281 6.9597 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 19 2 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 31 1 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 30 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 36 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 2 0 0 0 - 33 37 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --9.77997627425646 - -$$$$ -44 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 47 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5638 -47.8398 6.3294 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0055 -48.8795 6.7362 C 0 0 0 0 0 0 - 3.6001 -49.7033 7.4706 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6002 -49.1348 6.3550 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2707 -50.4496 6.3395 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2446 -51.4534 6.4978 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5290 -51.2642 5.9573 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8264 -50.0751 5.2634 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8457 -49.0732 5.1109 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5465 -49.2371 5.6460 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6398 -48.4122 5.6803 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7658 -47.0204 5.1109 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8382 -45.9174 6.1894 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2514 -46.0044 7.2636 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5116 -45.6953 6.6849 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6160 -45.6893 7.5101 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9357 -45.6105 9.1489 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7951 -46.3194 9.5617 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6431 -46.3574 8.7572 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0077 -52.3586 7.0271 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2862 -52.0252 6.0738 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8126 -49.9204 4.8501 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0817 -48.1638 4.5782 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0880 -46.8183 4.4620 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6452 -46.9604 4.4630 H 0 0 0 0 0 0 - 0.8127 -44.9396 5.7098 H 0 0 0 0 0 0 - 1.8058 -45.9783 6.6859 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0397 -45.2807 8.0530 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2389 -46.9911 7.7216 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8003 -46.9189 9.1152 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9328 -44.9377 7.9019 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7720 -44.9848 7.0812 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7720 -44.3169 5.8386 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9088 -43.6148 5.4042 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0601 -43.5677 6.2105 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0722 -44.2246 7.4561 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9025 -44.3383 5.2009 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9003 -43.1136 4.4481 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9301 -43.0279 5.8753 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9613 -44.1701 8.0625 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7969 -46.8284 10.5131 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3143 -45.5879 10.1970 Cl 0 0 0 0 0 0 - 1.0415 -50.3407 6.7514 N 0 0 0 0 0 0 - 1.5788 -51.0058 7.2849 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 19 2 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 31 1 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 30 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 36 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 2 0 0 0 - 33 37 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.6733813532598 - -$$$$ -23 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 3.9452 -49.5972 7.0411 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1365 -48.7364 6.6226 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5094 -47.5621 6.3942 O 0 5 0 0 0 0 - 1.7049 -49.1070 6.4070 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3259 -50.7950 6.6839 S 0 0 0 0 0 0 - -0.3704 -50.5332 6.3111 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4069 -51.4759 6.3365 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7213 -51.0964 6.0060 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9841 -49.7599 5.6503 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9354 -48.8209 5.6277 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6073 -49.1678 5.9622 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5988 -48.3581 6.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5988 -46.8757 5.7329 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5107 -45.9949 6.9975 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7268 -46.2231 7.8886 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9204 -45.8789 7.1949 O 0 0 0 0 0 0 - -3.1305 -45.9365 7.8645 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6581 -45.9747 9.1652 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5054 -46.3958 9.8517 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2501 -46.3737 9.2104 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1976 -52.5010 6.6101 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5249 -51.8146 6.0318 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9856 -49.4504 5.3944 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1614 -47.8019 5.3568 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2263 -46.6286 5.0692 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5004 -46.6009 5.1714 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5403 -44.9448 6.6976 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4018 -46.1649 7.6017 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6289 -45.5830 8.7627 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7629 -47.2543 8.2399 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3982 -46.7023 9.7956 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5579 -45.5466 7.8298 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3029 -45.5385 7.1795 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2262 -45.1320 5.8356 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3873 -44.7274 5.1423 C 0 0 0 0 0 0 - -6.6341 -44.7213 5.7969 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7133 -45.1304 7.1466 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2840 -45.1204 5.2971 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3241 -44.4188 4.1042 H 0 0 0 0 0 0 - -7.5218 -44.4074 5.2696 H 0 0 0 0 0 0 - -7.6788 -45.1188 7.6403 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5730 -46.7368 10.8723 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6110 -45.9950 9.6786 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 12 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 27 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 29 1 0 0 0 - 15 30 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 17 33 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 32 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 37 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 36 37 2 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 - 37 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.82854391662772 - -$$$$ -29 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 3.4235 -47.4990 6.3034 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0281 -48.6146 6.7306 C 0 0 0 0 0 0 - 3.7777 -49.3670 7.3880 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6462 -49.0711 6.4354 C 0 0 0 0 0 0 - -0.0124 -50.6359 6.4318 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8349 -51.7756 6.5605 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1553 -51.7463 6.0659 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6490 -50.5721 5.4633 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8305 -49.4302 5.3533 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4988 -49.4369 5.8254 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5621 -48.4620 5.8353 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4741 -47.0549 5.3074 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2593 -45.9878 6.3953 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9490 -46.2558 7.3130 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1030 -46.5044 6.5056 O 0 0 0 0 0 0 - -3.2262 -45.7691 6.7833 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9083 -45.8174 8.0302 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0388 -45.0029 8.2360 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5258 -44.1802 7.2022 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8795 -44.1671 5.9535 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7380 -44.9715 5.7491 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4485 -52.6682 7.0285 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7847 -52.6214 6.1499 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6651 -50.5448 5.0945 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2263 -48.5307 4.8977 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3446 -46.9804 4.5798 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3764 -46.8128 4.7403 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1490 -45.0086 5.9257 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1532 -45.9271 7.0191 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0828 -45.4053 7.9823 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7338 -47.1268 7.9398 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2615 -44.9721 4.7823 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2854 -50.3610 6.7961 N 0 0 0 0 0 0 - 1.9552 -50.9988 7.2443 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2563 -43.5482 5.1476 H 0 0 0 0 0 0 - -6.4020 -43.5721 7.3503 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5568 -45.0126 9.1813 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4349 -46.1863 9.7809 F 0 0 0 0 0 0 - -3.4514 -46.7482 9.1429 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4113 -46.9759 10.0447 F 0 0 0 0 0 0 - -3.0629 -47.9301 8.6622 F 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 35 1 0 0 0 - 21 32 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 39 40 1 0 0 0 - 39 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --6.93940556519089 - -$$$$ -40 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 52 0 0 1 0 999 V2000 - 4.0796 -49.9641 6.0933 O 0 0 0 0 0 0 - 3.2341 -49.1036 6.4140 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5646 -47.9824 6.8520 O 0 5 0 0 0 0 - 1.7941 -49.4291 6.2845 C 0 0 0 0 0 0 - 0.0692 -50.8734 5.8701 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7526 -51.9804 5.5646 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1510 -51.8509 5.6383 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7100 -50.6161 6.0102 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8819 -49.5164 6.3113 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4706 -49.6138 6.2528 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6346 -48.7012 6.4799 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5503 -47.2487 6.8757 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4937 -46.4439 6.0758 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4675 -45.6591 6.9570 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0460 -46.5551 7.8997 O 0 0 0 0 0 0 - -3.1695 -46.1729 8.5970 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9070 -44.9994 8.3258 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0862 -44.7046 9.0367 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5323 -45.5822 10.0518 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7880 -46.7393 10.3421 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6196 -47.0355 9.6144 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3074 -52.9198 5.2755 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7968 -52.6896 5.4151 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7866 -50.5028 6.0695 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3475 -48.5823 6.5781 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5075 -46.7429 6.7351 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3789 -47.1839 7.9537 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0773 -47.0996 5.4235 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0194 -45.7661 5.3980 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2151 -45.2222 6.2970 H 0 0 0 0 0 0 - -0.9701 -44.8474 7.4911 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6263 -44.3407 7.5286 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0603 -47.9329 9.8264 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4413 -50.7114 5.8907 N 0 0 0 0 0 0 - 2.1511 -51.4007 5.6695 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1306 -47.4237 11.1122 H 0 0 0 0 0 0 - -6.4481 -45.3764 10.5887 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8559 -43.6367 8.6703 O 0 0 0 0 0 0 - -7.7006 -44.6618 5.0827 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3132 -44.9852 6.3148 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7288 -44.5868 7.5197 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5230 -43.8614 7.5003 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9538 -43.4664 6.2722 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5349 -43.8779 5.0621 C 0 0 0 0 0 0 - -8.1027 -45.0222 4.1484 H 0 0 0 0 0 0 - -9.2203 -45.5728 6.3260 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1689 -44.8792 8.4685 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0287 -42.9029 6.2496 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0777 -43.6154 4.1209 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 38 42 1 0 0 0 - 39 40 2 0 0 0 - 39 44 1 0 0 0 - 39 45 1 0 0 0 - 40 41 1 0 0 0 - 40 46 1 0 0 0 - 41 42 2 0 0 0 - 41 47 1 0 0 0 - 42 43 1 0 0 0 - 43 44 2 0 0 0 - 43 48 1 0 0 0 - 44 49 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --7.25302544244784 - -$$$$ -62 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5438 -47.5772 5.7905 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1835 -48.5307 6.5190 C 0 0 0 0 0 0 - 3.9583 -48.9716 7.3983 O 0 5 0 0 0 0 - 1.8205 -49.1108 6.3417 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6677 -50.7691 6.8730 S 0 0 0 0 0 0 - -0.0534 -50.7822 6.5135 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9252 -51.8582 6.7331 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2931 -51.7406 6.4181 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7610 -50.5248 5.8913 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8910 -49.4330 5.6876 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4943 -49.5299 5.9753 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6271 -48.5701 5.8889 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4730 -47.1115 5.5285 C 0 0 0 0 0 0 - 0.1924 -46.3223 6.8187 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5189 -44.9864 6.6239 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8770 -45.1797 6.2416 O 0 0 0 0 0 0 - -2.8344 -45.2637 7.2315 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9255 -45.4944 9.1209 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6260 -45.9830 9.4207 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5867 -45.7933 8.5093 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5445 -52.7829 7.1443 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9629 -52.5707 6.5722 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8074 -50.4318 5.6453 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6124 -47.9686 5.0985 Cl 0 0 0 0 0 0 - -0.3095 -46.9567 4.7865 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3663 -46.7329 5.0246 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1354 -46.1804 7.3386 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4110 -46.9370 7.4640 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0242 -44.4093 5.8295 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4473 -44.3726 7.5269 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6007 -46.1009 8.7965 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1778 -44.8765 7.8875 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1442 -44.7749 6.9318 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4214 -44.1639 5.6900 C 0 0 0 0 0 0 - -5.7020 -43.6469 5.4010 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7289 -43.7443 6.3621 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4652 -44.3618 7.6033 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6486 -44.0600 4.9342 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8890 -43.1675 4.4469 H 0 0 0 0 0 0 - -7.7027 -43.3379 6.1482 H 0 0 0 0 0 0 - -7.2573 -44.4288 8.3269 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4577 -46.4365 10.3980 H 0 0 0 0 0 0 - -5.7255 -45.5994 9.8513 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 12 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 27 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 29 1 0 0 0 - 15 30 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 17 33 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 32 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 37 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 36 37 2 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 - 37 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --7.95565704541698 - -$$$$ -61 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 3.8815 -49.5255 6.8965 O 0 0 0 0 0 0 - 2.9282 -48.7315 6.8254 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1342 -47.4910 6.9198 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5361 -49.2540 6.6236 C 0 0 0 0 0 0 - 1.4251 -50.9973 6.6970 S 0 0 0 0 0 0 - -0.3094 -50.9694 6.4244 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1509 -52.0864 6.3706 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5142 -51.9293 6.1225 C 0 0 0 0 0 0 - -3.0254 -50.6311 5.9294 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1817 -49.5063 5.9843 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7821 -49.6253 6.2498 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3084 -48.6541 6.3900 C 0 0 0 0 0 0 - 0.1210 -47.1523 6.2826 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4501 -46.5529 7.5729 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8431 -45.0778 7.3833 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8680 -44.9577 6.4022 O 0 0 0 0 0 0 - -3.1956 -44.8477 6.7661 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7127 -45.1304 8.0498 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0949 -44.9814 8.3077 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6273 -45.2973 9.7021 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9651 -44.5579 7.2880 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6628 -44.3657 7.6086 Cl 0 0 0 0 0 0 - -5.4616 -44.2951 6.0024 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3759 -43.8528 4.8618 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0824 -44.4393 5.7601 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7430 -53.0870 6.5090 H 0 0 0 0 0 0 - -3.1757 -52.7798 6.0762 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0808 -50.5038 5.7246 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9292 -47.9598 5.6975 Cl 0 0 0 0 0 0 - -0.5261 -46.9314 5.4468 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0628 -46.6617 6.0132 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2860 -46.6477 8.3768 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3235 -47.1179 7.8959 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0265 -44.5324 7.0297 H 0 0 0 0 0 0 - -1.1174 -44.6109 8.3212 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0668 -45.4819 8.8414 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2638 -44.4906 10.0769 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2145 -46.2158 9.6761 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8148 -45.4370 10.4139 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8052 -43.6609 3.9503 H 0 0 0 0 0 0 - -7.1109 -44.6277 4.6383 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9047 -42.9346 5.1216 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6927 -44.2334 4.7674 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 12 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 30 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 32 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 25 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.07943709994224 - -$$$$ -49 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 3.7483 -50.0541 7.1170 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0006 -49.1057 6.7954 C 0 0 0 0 0 0 - 3.4290 -47.9343 6.7113 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5768 -49.4207 6.4879 C 0 0 0 0 0 0 - -0.1297 -50.9210 6.2861 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9519 -52.0650 6.2906 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3129 -51.9374 5.9451 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8209 -50.6854 5.5793 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9989 -49.5403 5.5815 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6224 -49.6228 5.9597 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4706 -48.6823 6.1245 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3811 -47.1915 5.9728 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2096 -46.5273 7.2339 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7304 -45.1005 6.9792 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8882 -45.1382 6.1518 O 0 0 0 0 0 0 - -3.1367 -45.2529 6.7348 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3729 -45.5902 8.0931 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6916 -45.7161 8.5834 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9112 -46.1093 10.0362 C 0 0 0 0 0 0 - -5.7883 -45.5041 7.7218 C 0 0 0 0 0 0 - -7.4049 -45.7013 8.2786 Cl 0 0 0 0 0 0 - -5.5577 -45.1489 6.3816 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2425 -45.0326 5.8932 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5470 -53.0187 6.5853 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9489 -52.8070 5.9633 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8615 -50.6005 5.3069 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6995 -48.0386 5.1160 Cl 0 0 0 0 0 0 - -0.2419 -46.9394 5.1146 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3536 -46.7639 5.7460 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5347 -46.5325 8.0286 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0434 -47.1256 7.5991 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0419 -44.5299 6.4634 H 0 0 0 0 0 0 - -0.9160 -44.5739 7.9150 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5431 -45.7658 8.7612 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5897 -45.4169 10.5401 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3477 -47.1100 10.0915 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9767 -46.1161 10.6002 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0872 -44.7713 4.8560 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3952 -44.9810 5.7191 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2122 -50.7518 6.5733 N 0 0 0 0 0 0 - 1.8907 -51.4663 6.8340 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 40 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 40 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 24 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 26 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 27 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 28 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 30 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 32 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 23 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 34 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 40 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.36145743731744 - -$$$$ -64 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 3.7996 -50.0339 7.1693 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0736 -49.0720 6.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5568 -47.9281 6.7106 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6291 -49.2883 6.5306 C 0 0 0 0 0 0 - 1.0906 -50.9347 6.7544 S 0 0 0 0 0 0 - -0.5531 -50.5009 6.3439 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6748 -51.3471 6.3184 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9396 -50.8176 5.9964 C 0 0 0 0 0 0 - -3.0703 -49.4498 5.6863 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9354 -48.6227 5.6975 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6477 -49.1138 6.0302 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6267 -48.4212 6.1334 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7576 -46.9454 5.8670 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6927 -46.0787 7.1424 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4919 -46.3659 8.0891 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7426 -45.9685 7.5206 O 0 0 0 0 0 0 - -2.9139 -46.2506 8.2081 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3832 -46.7623 9.5425 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2148 -47.4264 9.9411 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9951 -47.1799 9.2808 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5571 -52.3930 6.5589 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3321 -51.8139 5.9914 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0419 -49.0428 5.4468 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0589 -47.5784 5.4692 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0323 -46.6216 5.1911 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6817 -46.7381 5.3245 H 0 0 0 0 0 0 - 0.7202 -45.0228 6.8726 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6078 -46.2705 7.7046 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3459 -45.8119 9.0163 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4790 -47.4239 8.3357 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1519 -47.7522 9.6092 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3384 -45.8553 8.4662 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1071 -45.6003 7.7993 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0955 -44.6862 6.7189 C 0 0 0 0 0 0 - -5.2802 -44.0441 6.3080 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4964 -44.3049 6.9742 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5207 -45.2090 8.0541 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1805 -44.4680 6.1938 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2589 -43.3516 5.4831 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4007 -43.8160 6.6574 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4574 -45.3993 8.5577 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2479 -48.1459 10.7491 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3129 -46.9661 10.0585 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 12 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 27 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 29 1 0 0 0 - 15 30 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 17 33 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 32 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 37 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 36 37 2 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 - 37 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --9.4997930107542 - -$$$$ -41 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 52 0 0 1 0 999 V2000 - 3.6188 -50.0261 7.1261 O 0 0 0 0 0 0 - 2.9664 -49.0185 6.7704 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5028 -47.8881 6.7185 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5378 -49.1785 6.4066 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3286 -50.4688 6.1368 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2909 -51.4982 6.0796 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6052 -51.1970 5.6648 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9395 -49.8757 5.3061 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9616 -48.8533 5.3588 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6371 -49.1247 5.7873 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5443 -48.3227 5.9852 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6195 -46.8348 5.7937 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6544 -46.0387 7.1131 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2727 -46.5426 8.2488 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1995 -45.5833 8.7170 O 0 0 0 0 0 0 - -2.4514 -45.6189 8.1601 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5606 -45.8237 9.0088 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8673 -45.7979 8.4847 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0701 -45.5418 7.1156 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9629 -45.3736 6.2631 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6590 -45.4011 6.7853 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0321 -52.5072 6.3509 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3583 -51.9726 5.6232 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9447 -49.6401 4.9833 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2394 -47.8446 5.0911 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2165 -46.4977 5.1782 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5009 -46.5787 5.2024 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4617 -44.9798 6.9165 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6838 -46.0610 7.4877 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3637 -46.7558 9.1142 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7804 -47.4835 8.0268 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4052 -45.9777 10.0674 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8256 -45.2075 6.1295 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0071 -50.4487 6.4916 N 0 0 0 0 0 0 - 1.5851 -51.2218 6.7936 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1090 -45.1870 5.2114 H 0 0 0 0 0 0 - -5.7131 -45.9475 9.1405 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3410 -45.4189 6.6163 O 0 0 0 0 0 0 - -7.7336 -41.4738 6.7170 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0295 -41.9323 5.5886 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5719 -43.2667 5.5411 C 0 0 0 0 0 0 - -6.8370 -44.1375 6.6183 C 0 0 0 0 0 0 - -7.5850 -43.6840 7.7222 C 0 0 0 0 0 0 - -8.0381 -42.3539 7.7682 C 0 0 0 0 0 0 - -8.0407 -40.4397 6.7738 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8347 -41.2580 4.7659 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0100 -43.6068 4.6861 H 0 0 0 0 0 0 - -7.7915 -44.3537 8.5460 H 0 0 0 0 0 0 - -8.5855 -42.0032 8.6387 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 38 42 1 0 0 0 - 39 40 2 0 0 0 - 39 44 1 0 0 0 - 39 45 1 0 0 0 - 40 41 1 0 0 0 - 40 46 1 0 0 0 - 41 42 2 0 0 0 - 41 47 1 0 0 0 - 42 43 1 0 0 0 - 43 44 2 0 0 0 - 43 48 1 0 0 0 - 44 49 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --7.12924538792258 - -$$$$ -65 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 3.9461 -49.6120 7.0490 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1658 -48.7770 6.5329 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5657 -47.6377 6.1960 O 0 5 0 0 0 0 - 1.7275 -49.1194 6.3295 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2733 -50.7336 6.7953 S 0 0 0 0 0 0 - -0.4025 -50.4753 6.3317 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4791 -51.3860 6.4178 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7670 -51.0046 6.0094 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9812 -49.7061 5.5114 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8984 -48.8064 5.4280 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5804 -49.1464 5.8290 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6605 -48.3675 5.8411 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7551 -46.9299 5.3888 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8986 -45.9247 6.5503 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2812 -45.9301 7.5188 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3961 -45.3197 6.8689 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6319 -45.4537 7.4519 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8737 -46.1426 8.6635 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1934 -46.3025 9.1484 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4214 -47.0948 10.4168 C 0 0 0 0 0 0 - -5.2826 -45.7389 8.4364 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9050 -45.9428 9.0118 Cl 0 0 0 0 0 0 - -5.0340 -45.0050 7.2491 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1758 -44.3662 6.4856 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7162 -44.8717 6.7646 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2372 -52.9829 7.0303 Cl 0 0 0 0 0 0 - -3.5909 -51.6994 6.0856 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9674 -49.3971 5.1973 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0864 -47.8164 5.0511 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1302 -46.6598 4.8168 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5882 -46.8012 4.6903 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0376 -44.9168 6.1530 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7899 -46.1465 7.1282 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0338 -45.3645 8.4141 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4930 -46.9559 7.8179 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0618 -46.5754 9.2316 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1478 -46.6091 11.0729 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7955 -48.0883 10.1684 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4946 -47.2165 10.9839 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8060 -43.7551 5.6573 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8417 -45.1281 6.0706 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7594 -43.7154 7.1422 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5302 -44.3248 5.8485 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 12 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 30 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 32 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 25 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.40733622276992 - -$$$$ -58 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 49 0 0 1 0 999 V2000 - 3.8903 -49.8262 7.1167 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1444 -48.9593 6.6057 C 0 0 0 0 0 0 - 3.6298 -47.8564 6.2829 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6967 -49.2066 6.4083 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2621 -50.3558 6.4457 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3367 -51.2906 6.5989 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6513 -50.8979 6.3447 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9186 -49.5838 5.8919 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8522 -48.6553 5.7234 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5269 -49.0254 6.0090 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7199 -48.3234 5.9886 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8738 -46.8713 5.6025 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9587 -45.9342 6.8261 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3001 -45.9593 7.7126 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3807 -45.3771 6.9944 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6485 -45.4526 7.5319 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9716 -46.1370 8.7274 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3042 -46.2018 9.1838 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6224 -46.9920 10.4412 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3304 -45.5556 8.4565 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9729 -45.6522 8.9915 Cl 0 0 0 0 0 0 - -5.0112 -44.8439 7.2771 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0922 -44.1321 6.4827 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6781 -44.8065 6.8249 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1147 -52.2741 6.9367 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0048 -51.9682 6.5931 Cl 0 0 0 0 0 0 - -3.9346 -49.2814 5.6866 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0598 -47.6477 5.3945 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0381 -46.5720 4.9674 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7616 -46.7426 4.9764 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1428 -44.9192 6.4756 H 0 0 0 0 0 0 - 1.8303 -46.1999 7.4255 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1097 -45.3926 8.6243 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5365 -46.9808 8.0128 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2029 -46.6280 9.3000 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3073 -46.4448 11.0889 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0863 -47.9404 10.1735 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7224 -47.2055 11.0150 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6783 -43.5913 5.6304 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8229 -44.8477 6.1042 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6130 -43.4123 7.1142 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4366 -44.2788 5.9162 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7839 -51.7162 7.0809 C 0 0 0 0 0 0 - 1.0620 -52.5158 7.1329 H 0 0 0 0 0 0 - 2.5411 -52.0046 6.3525 H 0 0 0 0 0 0 - 2.2130 -51.5907 8.0744 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1078 -50.4699 6.6570 N 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 47 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 47 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 24 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 35 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 45 1 0 0 0 - 43 46 1 0 0 0 - 43 47 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --9.40789916598878 - -$$$$ -63 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 3.8904 -49.9128 7.2593 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1473 -49.0461 6.7409 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5646 -47.8962 6.4882 O 0 5 0 0 0 0 - 1.7208 -49.3609 6.4386 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1474 -50.8838 7.0571 S 0 0 0 0 0 0 - -0.4833 -50.5334 6.5324 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6406 -51.2952 6.7763 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8824 -50.8186 6.3195 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9595 -49.6440 5.5579 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7949 -48.9052 5.3019 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5283 -49.2970 5.8096 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7542 -48.6240 5.7715 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9557 -47.2723 5.1257 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9944 -46.0835 6.1170 C 0 0 0 0 0 0 - -0.1952 -46.0031 7.0806 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3623 -45.5679 6.3922 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5506 -45.5270 7.0930 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7548 -46.1613 8.3473 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0188 -46.1288 8.9720 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2211 -46.8876 10.2713 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0918 -45.4247 8.3755 C 0 0 0 0 0 0 - -6.6499 -45.3836 9.1387 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.8818 -44.7661 7.1412 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0115 -43.9984 6.4841 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6224 -44.8331 6.5031 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5795 -52.2143 7.3495 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3386 -51.6470 6.7125 Cl 0 0 0 0 0 0 - -3.9194 -49.3012 5.2017 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8832 -47.9909 4.7442 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1640 -47.0922 4.3960 H 0 0 0 0 0 0 - 1.8698 -47.2667 4.5291 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0868 -45.1511 5.5646 H 0 0 0 0 0 0 - 1.8922 -46.1450 6.7293 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0117 -45.2867 7.8785 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3308 -46.9792 7.5505 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9638 -46.7103 8.8408 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7411 -46.2780 11.0120 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8108 -47.7889 10.0844 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2644 -47.1869 10.7059 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6796 -43.4841 5.5791 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8222 -44.6778 6.2118 H 0 0 0 0 0 0 - -6.4107 -43.2477 7.1690 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4707 -44.3451 5.5472 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 12 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 30 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 32 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 25 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --9.06225196641364 - -$$$$ -27 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5620 -47.7655 6.2857 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0106 -48.7677 6.7913 C 0 0 0 0 0 0 - 3.6267 -49.5212 7.5837 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5987 -49.0922 6.4610 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2460 -50.4444 6.5734 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2006 -51.4538 6.8287 C 0 0 0 0 0 0 - -2.4848 -51.3550 6.2582 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8075 -50.2415 5.4534 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8538 -49.2332 5.2139 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5510 -49.3043 5.7662 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6244 -48.4626 5.7171 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7436 -47.1491 4.9892 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8629 -45.9369 5.9353 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3435 -45.7461 6.8598 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4738 -45.3700 6.0783 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6659 -45.1791 6.7323 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8936 -45.5089 8.0957 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1486 -45.2841 8.6877 C 0 0 0 0 0 0 - -5.1945 -44.7219 7.9306 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9832 -44.3904 6.5801 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7285 -44.6254 5.9884 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9288 -52.3015 7.4431 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2130 -52.1247 6.4483 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7943 -50.1701 5.0203 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1170 -48.3840 4.5924 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1082 -47.0091 4.3235 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6134 -47.1680 4.3352 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0219 -45.0317 5.3513 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7514 -46.0358 6.5559 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1280 -44.9553 7.5803 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5288 -46.6684 7.4145 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1221 -45.9412 8.7152 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5750 -44.3709 4.9495 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0676 -50.2717 6.9802 N 0 0 0 0 0 0 - 1.6380 -50.8971 7.5486 H 0 0 0 0 0 0 - -5.7824 -43.9588 5.9956 H 0 0 0 0 0 0 - -6.1592 -44.5447 8.3870 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3155 -45.5485 9.7199 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --6.11639066902356 - -$$$$ -47 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 3.8686 -50.1190 7.0932 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1190 -49.1589 6.7946 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5527 -47.9843 6.7208 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6856 -49.4320 6.5286 C 0 0 0 0 0 0 - -0.0809 -50.8763 6.3515 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9511 -51.9836 6.3183 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3175 -51.7852 6.0387 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8023 -50.4802 5.8114 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9249 -49.3776 5.8612 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5419 -49.5476 6.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5818 -48.6544 6.2494 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5070 -47.1632 6.1421 C 0 0 0 0 0 0 - 0.1148 -46.5415 7.4889 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4072 -45.1038 7.3461 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5468 -45.0525 6.4949 O 0 0 0 0 0 0 - -2.8067 -45.2692 7.0109 C 0 0 0 0 0 0 - -5.2211 -45.1826 6.5885 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8922 -45.0084 6.1504 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5745 -52.9772 6.4996 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9954 -52.6270 6.0061 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8516 -50.3275 5.5997 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3147 -48.3846 5.6922 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2249 -46.8991 5.3792 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4539 -46.7474 5.7898 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9728 -46.5654 8.1598 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6489 -47.1566 7.9613 H 0 0 0 0 0 0 - 0.3680 -44.4929 6.8836 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6002 -44.6497 8.3160 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7003 -44.6602 5.1441 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0729 -45.7272 8.3225 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0370 -44.9748 5.9117 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4026 -45.9169 8.7511 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5002 -45.6402 7.8903 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7807 -45.8063 8.2927 N 0 0 0 0 0 0 - -7.0196 -46.2339 9.5524 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9967 -46.5463 10.4671 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6620 -46.3937 10.0496 C 0 0 0 0 0 0 - -8.0581 -46.3378 9.8379 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2280 -46.8986 11.4632 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8505 -46.6326 10.7173 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2731 -45.9438 9.0132 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2731 -50.7546 6.5922 N 0 0 0 0 0 0 - 1.9414 -51.4821 6.8006 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 42 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 19 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 21 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 22 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 23 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 27 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 31 1 0 0 0 - 17 33 2 0 0 0 - 18 29 1 0 0 0 - 30 32 2 0 0 0 - 30 41 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 37 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 38 1 0 0 0 - 36 37 2 0 0 0 - 36 39 1 0 0 0 - 37 40 1 0 0 0 - 42 43 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --5.77553168796231 - -$$$$ -57 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5644 -47.6678 5.9794 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1061 -48.6748 6.5602 C 0 0 0 0 0 0 - 3.8451 -49.2908 7.3808 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6967 -49.0920 6.3186 C 0 0 0 0 0 0 - -0.1535 -50.4335 6.3918 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1205 -51.4551 6.5735 C 0 0 0 0 0 0 - -2.4473 -51.2528 6.1514 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8077 -50.0288 5.5584 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8532 -49.0185 5.3763 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4989 -49.1915 5.7783 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6696 -48.3728 5.7223 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7299 -46.9821 5.1515 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8228 -45.8723 6.2201 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3002 -45.9030 7.2643 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5339 -45.4785 6.6854 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6539 -45.4735 7.4912 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0024 -45.4171 9.0952 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8541 -46.0855 9.5449 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6939 -46.1087 8.7532 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8445 -52.3872 7.0350 H 0 0 0 0 0 0 - -3.1800 -52.0331 6.2924 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8316 -49.8714 5.2455 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1448 -48.0802 4.9232 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1474 -46.7977 4.5314 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5785 -46.8906 4.4715 H 0 0 0 0 0 0 - 0.8564 -44.8926 5.7363 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7722 -45.9688 6.7479 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0344 -45.2375 8.0851 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3785 -46.9095 7.6717 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8362 -46.6348 9.1369 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9934 -44.7821 7.8391 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8237 -44.8117 7.0307 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8421 -44.1736 5.7733 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0054 -43.5186 5.3209 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1590 -43.4918 6.1266 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1539 -44.1210 7.3843 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9702 -44.1816 5.1360 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0097 -43.0370 4.3537 H 0 0 0 0 0 0 - -7.0512 -42.9879 5.7771 H 0 0 0 0 0 0 - -7.0438 -44.0981 7.9957 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8631 -46.5752 10.5084 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8881 -45.3965 9.7122 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9363 -51.4455 7.3369 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3189 -52.3385 7.4455 H 0 0 0 0 0 0 - 2.8013 -51.7103 6.7182 H 0 0 0 0 0 0 - 2.2782 -51.1417 8.3335 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1956 -50.3552 6.7086 N 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 47 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 47 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 19 2 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 31 1 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 30 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 36 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 2 0 0 0 - 33 37 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 45 1 0 0 0 - 43 46 1 0 0 0 - 43 47 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --9.03887132268158 - -$$$$ -56 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 49 0 0 1 0 999 V2000 - 3.8860 -49.6912 7.1567 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1152 -48.8646 6.6079 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5628 -47.7316 6.3168 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6860 -49.2230 6.3249 C 0 0 0 0 0 0 - -0.1971 -50.5147 6.2703 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1985 -51.5173 6.3677 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5251 -51.2521 5.9892 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8500 -49.9692 5.4926 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 -48.9599 5.3776 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5124 -49.2088 5.7723 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6850 -48.4219 5.8067 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7943 -46.9841 5.3695 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7867 -45.9897 6.5468 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5620 -45.9184 7.2689 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5108 -45.3393 6.3843 O 0 0 0 0 0 0 - -2.7734 -45.0766 6.8667 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2521 -45.5115 8.1245 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5558 -45.1862 8.5488 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0405 -45.6887 9.8958 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3922 -44.4078 7.7183 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9812 -43.9831 8.2402 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.9232 -43.9759 6.4562 C 0 0 0 0 0 0 - -5.7953 -43.1306 5.5483 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6246 -44.3209 6.0415 C 0 0 0 0 0 0 - -0.9461 -52.4911 6.7461 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2977 -52.0166 6.0792 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8727 -49.7548 5.2030 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1315 -47.9796 4.9971 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0129 -46.7422 4.6760 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7136 -46.8490 4.7959 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0429 -44.9982 6.1728 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5694 -46.2498 7.2605 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4587 -45.3076 8.1660 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8794 -46.9154 7.5776 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6285 -46.0979 8.7785 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5447 -44.8979 10.4490 H 0 0 0 0 0 0 - -5.7400 -46.5119 9.7544 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2150 -46.0488 10.5105 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2719 -42.8544 4.6316 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6997 -43.6722 5.2707 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0850 -42.2110 6.0560 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2624 -43.9924 5.0819 H 0 0 0 0 0 0 - 1.8852 -51.6780 7.1113 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2409 -52.5557 7.2050 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7069 -51.9461 6.4349 H 0 0 0 0 0 0 - 2.2851 -51.4578 8.1087 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1675 -50.5139 6.5888 N 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 47 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 47 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 24 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 35 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 45 1 0 0 0 - 43 46 1 0 0 0 - 43 47 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --9.25808309585768 - -$$$$ -53 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 46 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5633 -47.7725 6.2912 O 0 0 0 0 0 0 - 2.9990 -48.7572 6.8105 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5991 -49.5249 7.5965 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5779 -49.0223 6.4966 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3475 -50.2345 6.7439 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3726 -51.1291 7.1185 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6775 -50.9471 6.6123 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9184 -49.8992 5.6921 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8916 -49.0147 5.3222 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5857 -49.1422 5.8567 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6255 -48.3732 5.7579 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7780 -47.0671 5.0307 C 0 0 0 0 0 0 - 0.7971 -45.8570 5.9948 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4751 -45.7293 6.8378 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5902 -45.4593 5.9971 O 0 0 0 0 0 0 - -2.8366 -45.4835 6.5820 C 0 0 0 0 0 0 - -3.0790 -45.8230 7.9355 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3932 -45.8530 8.4569 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6030 -46.2695 9.9009 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4830 -45.5150 7.6284 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0947 -45.5514 8.2641 Cl 0 0 0 0 0 0 - -5.2572 -45.1565 6.2816 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4197 -44.7794 5.3753 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9414 -45.1545 5.7667 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1746 -51.9204 7.8217 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9554 -51.9815 7.1109 Cl 0 0 0 0 0 0 - -3.9172 -49.7603 5.2947 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0998 -48.2000 4.6420 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0541 -46.9554 4.3227 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6867 -47.0741 4.4237 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9692 -44.9414 5.4362 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6544 -45.9582 6.6661 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3569 -44.9148 7.5568 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6037 -46.6484 7.4050 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2739 -46.0799 8.6015 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1155 -45.4823 10.4590 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2126 -47.1749 9.9474 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6578 -46.4782 10.4009 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0752 -44.5140 4.3756 H 0 0 0 0 0 0 - -7.1156 -45.6150 5.2839 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9557 -43.9220 5.7856 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7745 -44.8949 4.7279 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9882 -50.1295 7.0836 N 0 0 0 0 0 0 - 1.5182 -50.7414 7.6866 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 24 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 35 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --9.96486893166623 - -$$$$ -36 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 46 0 0 1 0 999 V2000 - 3.6486 -50.1155 7.2936 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0238 -49.1116 6.8696 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5639 -47.9877 6.7459 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5940 -49.2664 6.5154 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3066 -50.5037 6.2446 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 -51.5082 6.1819 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5933 -51.1778 5.7270 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8850 -49.8590 5.3326 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8855 -48.8628 5.3863 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5718 -49.1585 5.8504 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6453 -48.4011 6.0244 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8699 -46.9540 5.7115 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8705 -46.0612 6.9633 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5079 -45.9153 7.6192 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3791 -45.2890 6.6807 O 0 0 0 0 0 0 - -2.7075 -45.1673 7.0098 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2736 -45.5369 8.2558 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6559 -45.3670 8.4996 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4813 -44.8248 7.4876 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9225 -44.4588 6.2513 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5495 -44.6330 6.0174 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0647 -52.5224 6.4767 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3582 -51.9397 5.6845 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8813 -49.6149 4.9781 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1244 -47.8593 5.0781 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1213 -46.6056 4.9961 H 0 0 0 0 0 0 - 1.8239 -46.8346 5.2003 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2319 -45.0664 6.6877 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5862 -46.4384 7.6933 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4291 -45.2978 8.5207 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8854 -46.8978 7.9215 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6600 -45.9640 9.0405 H 0 0 0 0 0 0 - -3.1406 -44.3521 5.0597 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0171 -50.5153 6.6494 N 0 0 0 0 0 0 - 1.5629 -51.3024 6.9815 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5584 -44.0499 5.4821 H 0 0 0 0 0 0 - -7.1836 -44.6085 7.7292 Cl 0 0 0 0 0 0 - -5.2272 -45.7987 9.8469 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4603 -45.6871 10.6188 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0455 -45.1381 10.1444 H 0 0 0 0 0 0 - -5.7150 -47.2564 9.8165 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5051 -47.3917 9.0744 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8998 -47.9404 9.5631 H 0 0 0 0 0 0 - -6.1126 -47.5448 10.7931 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 38 40 1 0 0 0 - 38 41 1 0 0 0 - 41 42 1 0 0 0 - 41 43 1 0 0 0 - 41 44 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.17902305143249 - -$$$$ -60 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 3.9650 -49.5043 7.2172 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1647 -48.6934 6.6860 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5469 -47.5550 6.3203 O 0 5 0 0 0 0 - 1.7422 -49.1031 6.4894 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3189 -50.6778 7.1278 S 0 0 0 0 0 0 - -0.3298 -50.5386 6.5641 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3498 -51.5036 6.6886 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6263 -51.2396 6.1671 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8774 -50.0178 5.5363 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8563 -49.0471 5.4330 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5461 -49.2759 5.9301 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6515 -48.4545 5.9075 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6868 -47.0728 5.3244 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5835 -45.9866 6.4079 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7243 -46.0605 7.2196 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8113 -45.6523 6.3994 O 0 0 0 0 0 0 - -3.0550 -45.5539 6.9867 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3644 -46.1029 8.2530 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6428 -45.9429 8.8135 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9320 -46.5613 10.1729 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6327 -45.2134 8.1178 C 0 0 0 0 0 0 - -7.1917 -44.9681 8.8275 Cl 0 0 0 0 0 0 - -5.3388 -44.6781 6.8441 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3832 -43.8851 6.0760 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0597 -44.8664 6.2827 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1424 -52.4466 7.1745 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4063 -51.9819 6.2486 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8514 -49.8125 5.1274 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0736 -48.1199 4.9316 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1280 -46.9348 4.6049 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5994 -46.9269 4.7493 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6858 -44.9928 5.9616 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4224 -46.0973 7.0973 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6429 -45.3940 8.0846 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8680 -47.0856 7.5733 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6280 -46.6551 8.8154 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3736 -45.8282 10.8491 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6216 -47.4013 10.0689 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0182 -46.9333 10.6390 H 0 0 0 0 0 0 - -5.9783 -43.4834 5.1451 H 0 0 0 0 0 0 - -7.2409 -44.5132 5.8279 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7338 -43.0439 6.6758 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8301 -44.4518 5.3108 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 12 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 30 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 32 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 25 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.91509126815632 - -$$$$ -45 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - 3.4855 -49.9426 7.0276 O 0 0 0 0 0 0 - 2.8121 -48.9262 6.7501 C 0 0 0 0 0 0 - 3.3387 -47.7912 6.7250 O 0 5 0 0 0 0 - 1.3656 -49.0984 6.4616 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4570 -50.4272 6.2251 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3771 -51.4933 6.1604 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7279 -51.2247 5.8404 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1252 -49.8960 5.5731 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1902 -48.8426 5.6378 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8351 -49.0777 5.9738 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3360 -48.2451 6.1279 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4043 -46.7612 5.9387 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3098 -45.9594 7.2517 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0292 -46.0969 7.9995 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0793 -45.5604 7.1983 O 0 0 0 0 0 0 - -3.3471 -45.4671 7.7380 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9796 -45.1890 8.7400 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9970 -45.8216 9.5182 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6869 -45.9651 9.0246 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0554 -52.5071 6.3622 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4470 -52.0325 5.7976 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1577 -49.6923 5.3194 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5225 -47.8288 5.4348 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3771 -46.4300 5.2566 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3389 -46.5012 5.4412 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4800 -44.9035 7.0314 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1237 -46.2551 7.9089 H 0 0 0 0 0 0 - -0.9544 -45.5410 8.9393 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2201 -47.1415 8.2503 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9571 -46.4543 9.6540 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6697 -44.7035 7.4607 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3510 -44.8400 6.9519 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0014 -44.3412 5.5513 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0175 -43.3336 4.9872 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4494 -43.8370 5.1794 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7716 -44.0165 6.6646 C 0 0 0 0 0 0 - -5.2476 -46.1918 10.5005 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9807 -45.0767 9.1327 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9511 -45.2097 4.8939 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0095 -43.8903 5.5414 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8323 -43.1458 3.9293 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9028 -42.3788 5.4995 H 0 0 0 0 0 0 - -6.5591 -44.7912 4.6611 H 0 0 0 0 0 0 - -7.1629 -43.1518 4.7184 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9448 -43.0401 7.1156 H 0 0 0 0 0 0 - -7.7010 -44.5764 6.7714 H 0 0 0 0 0 0 - 0.8791 -50.3882 6.5090 N 0 0 0 0 0 0 - 1.5076 -51.1532 6.7164 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 47 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 47 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 19 2 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 31 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 30 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 36 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 39 1 0 0 0 - 33 40 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 41 1 0 0 0 - 34 42 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 43 1 0 0 0 - 35 44 1 0 0 0 - 36 45 1 0 0 0 - 36 46 1 0 0 0 - 47 48 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.95356461676206 - -$$$$ -42 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 47 0 0 1 0 999 V2000 - 3.6010 -50.1309 7.2173 O 0 0 0 0 0 0 - 2.9795 -49.0944 6.8829 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5582 -47.9830 6.8122 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5366 -49.2034 6.5537 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3472 -50.4577 6.2991 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3179 -51.4749 6.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6289 -51.1468 5.8278 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9455 -49.8148 5.4839 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9618 -48.8114 5.5555 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6358 -49.1065 5.9640 C 0 0 0 0 0 0 - 0.5554 -48.3244 6.1538 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6833 -46.8447 5.9557 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6911 -46.0461 7.2731 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5530 -46.2446 8.1393 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6886 -45.7642 7.4384 O 0 0 0 0 0 0 - -2.9365 -45.9351 8.0039 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5641 -46.2439 9.0369 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4526 -46.6108 9.8135 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1512 -46.4560 9.3053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0725 -52.4891 6.4965 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4006 -51.9114 5.7850 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9567 -49.5554 5.1726 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2180 -47.7978 5.2884 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1373 -46.4896 5.3358 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5901 -46.6136 5.3924 H 0 0 0 0 0 0 - 0.8003 -44.9837 7.0497 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5657 -46.3279 7.8552 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4371 -45.6845 9.0679 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6725 -47.3005 8.3938 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3433 -46.7548 9.9541 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3751 -45.7201 7.7432 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0606 -45.5636 7.2263 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8918 -45.0359 5.9226 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0075 -44.6755 5.1465 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3050 -44.8355 5.6606 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4926 -45.3504 6.9558 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9091 -44.8987 5.5003 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8459 -44.2745 4.1548 H 0 0 0 0 0 0 - -7.1620 -44.5617 5.0630 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4912 -45.4674 7.3450 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5861 -47.0164 10.8082 H 0 0 0 0 0 0 - -6.5536 -46.3721 9.4430 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9870 -50.4703 6.6481 N 0 0 0 0 0 0 - 1.5565 -51.2517 6.9442 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 22 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 19 2 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 31 1 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 30 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 36 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 2 0 0 0 - 33 37 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --8.89674735927531 - -$$$$ -67 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5644 -47.8285 6.1892 O 0 0 0 0 0 0 - 3.0362 -48.8080 6.7428 C 0 0 0 0 0 0 - 3.6696 -49.4562 7.6245 O 0 5 0 0 0 0 - 1.6425 -49.1600 6.4068 C 0 0 0 0 0 0 - -0.1840 -50.4273 6.5471 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0943 -51.4430 6.8742 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3945 -51.3656 6.3648 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7687 -50.2873 5.5289 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8174 -49.2864 5.2062 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4966 -49.3367 5.7159 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6834 -48.5264 5.6415 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8055 -47.2137 4.9079 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8087 -45.9824 5.8366 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4323 -45.8572 6.7332 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5675 -45.5507 5.9368 O 0 0 0 0 0 0 - -2.8022 -45.4950 6.5528 C 0 0 0 0 0 0 - -3.0327 -45.8036 7.9119 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3369 -45.7633 8.4552 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5594 -46.1410 9.9070 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4287 -45.3910 7.6286 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0379 -45.3587 8.2748 Cl 0 0 0 0 0 0 - -5.2055 -45.0557 6.2744 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3500 -44.6517 5.3655 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8961 -45.1147 5.7492 C 0 0 0 0 0 0 - -0.7929 -52.2665 7.5077 H 0 0 0 0 0 0 - -3.1325 -52.1281 6.6074 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7691 -50.2255 5.1378 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1044 -48.4656 4.5637 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0274 -47.1393 4.2087 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7050 -47.1979 4.3028 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9167 -45.0844 5.2419 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6917 -46.0260 6.4709 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2792 -45.0497 7.4537 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5700 -46.7818 7.2955 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2274 -46.0944 8.5689 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1508 -45.3838 10.4243 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0939 -47.0887 9.9694 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6172 -46.2594 10.4265 H 0 0 0 0 0 0 - -5.9980 -44.3903 4.3728 H 0 0 0 0 0 0 - -7.0611 -45.4708 5.2673 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8728 -43.7882 5.7746 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7237 -44.8700 4.7154 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1314 -50.3169 6.9579 O 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 24 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 35 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --7.58092456527552 - -$$$$ -34 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 3.8542 -50.1657 7.1652 O 0 0 0 0 0 0 - 3.1289 -49.1923 6.8519 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5613 -48.0246 6.8255 O 0 5 0 0 0 0 - 1.7066 -49.4720 6.5208 C 0 0 0 0 0 0 - -0.0964 -50.8628 6.3290 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0022 -51.9381 6.3224 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3608 -51.6992 5.9962 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7795 -50.3974 5.6675 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8647 -49.3287 5.6661 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4959 -49.5353 6.0071 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6533 -48.6750 6.1162 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6653 -47.2011 5.8557 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2404 -46.4057 7.0971 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3171 -45.0238 6.7322 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5243 -45.1759 5.9865 O 0 0 0 0 0 0 - -2.7274 -45.1910 6.6616 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8647 -45.3931 8.0557 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1364 -45.3621 8.6632 C 0 0 0 0 0 0 - -5.2914 -45.1174 7.8895 C 0 0 0 0 0 0 - -5.1599 -44.9490 6.4967 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8904 -44.9919 5.8885 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6669 -52.9299 6.5668 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0649 -52.5176 5.9992 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8207 -50.2190 5.4109 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2076 -48.3361 5.4103 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0009 -46.9824 5.0179 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6525 -46.8644 5.5315 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0842 -46.3136 7.7804 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5256 -46.9611 7.6395 H 0 0 0 0 0 0 - 0.4056 -44.4957 6.1065 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4475 -44.4035 7.6182 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0036 -45.5774 8.6831 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8070 -44.8518 4.8205 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2567 -50.7778 6.6179 N 0 0 0 0 0 0 - 1.8853 -51.5328 6.8799 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0378 -44.7693 5.8959 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2092 -45.5129 9.7298 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6672 -45.0309 8.5319 C 0 0 0 0 0 0 - -7.4786 -45.9218 7.9588 F 0 0 0 0 0 0 - -6.6158 -45.2723 9.8435 F 0 0 0 0 0 0 - -7.1584 -43.8055 8.3407 F 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 38 40 1 0 0 0 - 38 41 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --6.86919156414505 - -$$$$ -43 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 47 0 0 1 0 999 V2000 - 3.5643 -47.8843 6.3334 O 0 0 0 0 0 0 - 2.9990 -48.9049 6.7868 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5887 -49.7095 7.5467 O 0 5 0 0 0 0 - 1.5874 -49.1583 6.4235 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3136 -50.4258 6.4859 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3036 -51.4031 6.6994 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5845 -51.2164 6.1482 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8632 -50.0626 5.3949 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8627 -49.0917 5.1852 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5602 -49.2479 5.7208 C 0 0 0 0 0 0 - 0.6473 -48.4594 5.6954 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8265 -47.1229 5.0263 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8821 -45.9477 6.0225 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3512 -45.8393 6.9293 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4585 -45.3868 6.1598 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6734 -45.2518 6.7942 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9576 -44.3709 6.6682 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6845 -44.5617 6.0974 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0808 -52.2831 7.2830 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3514 -51.9594 6.3077 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8475 -49.9191 4.9764 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0911 -48.2065 4.6076 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0168 -46.9558 4.3169 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7408 -47.1287 4.4309 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0222 -45.0114 5.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 1.7641 -46.0601 6.6515 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1558 -45.1260 7.7294 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5515 -46.8060 7.3926 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4773 -44.1655 5.1146 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9615 -45.7676 8.0827 C 0 0 0 0 0 0 - -5.7169 -43.8324 6.1167 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2421 -45.6033 8.6496 C 0 0 0 0 0 0 - -5.2428 -44.8900 7.9458 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5177 -44.7121 8.5223 C 0 0 0 0 0 0 - -6.8021 -45.2571 9.7910 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8102 -45.9817 10.4853 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5321 -46.1533 9.9158 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2854 -44.1649 7.9948 H 0 0 0 0 0 0 - -7.7781 -45.1176 10.2340 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0317 -46.4019 11.4577 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7793 -46.7042 10.4587 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2210 -46.3075 8.6524 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0036 -50.3231 6.8929 N 0 0 0 0 0 0 - 1.5367 -50.9666 7.4620 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 11 2 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 19 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 21 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 22 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 23 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 27 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 31 1 0 0 0 - 17 33 2 0 0 0 - 18 29 1 0 0 0 - 30 32 2 0 0 0 - 30 42 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 37 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 36 37 2 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 - 37 41 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 -M CHG 1 3 -1 -M END -> --7.03469617128338 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/PTP1B_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/PTP1B_ligands.sdf deleted file mode 100755 index 742e5be3..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/PTP1B_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,2489 +0,0 @@ -23469 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 39.1680 17.5120 12.6949 O 0 0 0 0 0 0 - 40.3245 17.0339 12.6933 C 0 0 0 0 0 0 - 41.2000 17.2665 11.8308 O 0 5 0 0 0 0 - 40.7257 16.1090 13.8445 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0919 15.7294 13.7437 O 0 0 0 0 0 0 - 42.5145 14.9212 14.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1856 13.5746 14.8668 C 0 0 0 0 0 0 - 41.2053 12.6509 13.5174 Br 0 0 0 0 0 0 - 42.6245 12.9340 16.0147 C 0 0 0 0 0 0 - 42.3443 11.5877 16.4784 C 0 0 0 0 0 0 - 43.3652 10.7569 16.9470 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0859 9.4573 17.3660 C 0 0 0 0 0 0 - 41.7792 8.9724 17.3118 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7401 9.7888 16.8448 C 0 0 0 0 0 0 - 39.3981 9.3768 16.7741 N 0 0 0 0 0 0 - 38.9977 7.9742 16.7120 C 0 0 0 0 0 0 - 38.6112 7.3065 17.6711 O 0 0 0 0 0 0 - 39.0447 7.4076 15.2989 C 0 0 0 0 0 0 - 40.2643 7.0598 14.7072 C 0 0 0 0 0 0 - 40.2940 6.5235 13.4197 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1061 6.3134 12.7236 C 0 0 0 0 0 0 - 37.8875 6.6562 13.3069 C 0 0 0 0 0 0 - 37.8553 7.2050 14.5894 C 0 0 0 0 0 0 - 41.0347 11.0942 16.4477 C 0 0 0 0 0 0 - 43.6360 14.0254 16.9149 S 0 0 0 0 0 0 - 43.3652 15.3253 15.7666 C 0 0 0 0 0 0 - 44.0484 16.6109 16.0386 C 0 0 0 0 0 0 - 43.8753 17.5608 15.2444 O 0 0 0 0 0 0 - 44.7768 16.7159 17.0509 O 0 5 0 0 0 0 - 40.5589 16.6193 14.7942 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0731 15.2344 13.8224 H 0 0 0 0 0 0 - 44.3829 11.1171 16.9883 H 0 0 0 0 0 0 - 43.8822 8.8280 17.7354 H 0 0 0 0 0 0 - 41.5946 7.9649 17.6501 H 0 0 0 0 0 0 - 38.7229 10.1212 16.6814 H 0 0 0 0 0 0 - 41.1959 7.1942 15.2378 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2391 6.2673 12.9638 H 0 0 0 0 0 0 - 39.1282 5.8806 11.7343 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9663 6.4952 12.7665 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9054 7.4761 15.0276 H 0 0 0 0 0 0 - 40.2344 11.7364 16.1095 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 26 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 24 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 24 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 29 -1 -M END -> -2 - -> --7.72301857947764 - -$$$$ -23472 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 44 0 0 1 0 999 V2000 - 41.3359 17.7345 12.0655 O 0 0 0 0 0 0 - 40.5033 17.5778 12.9865 C 0 0 0 0 0 0 - 39.4360 18.2181 13.1106 O 0 5 0 0 0 0 - 40.8111 16.5423 14.0704 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0187 15.8482 13.7866 O 0 0 0 0 0 0 - 42.3640 14.9373 14.7216 C 0 0 0 0 0 0 - 41.8832 13.5947 14.7447 C 0 0 0 0 0 0 - 40.6955 12.9322 13.4088 Br 0 0 0 0 0 0 - 42.3216 12.8413 15.8032 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0378 11.4574 16.1718 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0880 10.5560 16.4532 C 0 0 0 0 0 0 - 42.8137 9.2218 16.8103 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4823 8.7730 16.8894 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4256 9.6609 16.6100 C 0 0 0 0 0 0 - 39.0856 9.2639 16.6793 N 0 0 0 0 0 0 - 38.4178 7.6851 16.9540 S 0 0 0 0 0 0 - 39.0080 7.1971 18.2103 O 0 0 0 0 0 0 - 36.9627 7.8421 16.8089 O 0 0 0 0 0 0 - 39.0362 6.7270 15.5748 C 0 0 0 0 0 0 - 38.2852 6.6759 14.3838 C 0 0 0 0 0 0 - 38.7667 5.9320 13.2887 C 0 0 0 0 0 0 - 39.9924 5.2434 13.3877 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4534 4.5292 12.3340 F 0 0 0 0 0 0 - 40.7391 5.2967 14.5820 C 0 0 0 0 0 0 - 40.2622 6.0390 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7049 10.9955 16.2530 C 0 0 0 0 0 0 - 43.3793 13.7909 16.8146 S 0 0 0 0 0 0 - 43.2010 15.1994 15.7834 C 0 0 0 0 0 0 - 43.9423 16.4178 16.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 43.8332 17.4437 15.4767 O 0 0 0 0 0 0 - 44.6565 16.3915 17.2103 O 0 5 0 0 0 0 - 40.8732 17.0602 15.0292 H 0 0 0 0 0 0 - 39.9877 15.8296 14.1346 H 0 0 0 0 0 0 - 44.1148 10.8877 16.4045 H 0 0 0 0 0 0 - 43.6260 8.5439 17.0270 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2937 7.7490 17.1714 H 0 0 0 0 0 0 - 38.4177 9.9669 16.3987 H 0 0 0 0 0 0 - 37.3473 7.2064 14.3086 H 0 0 0 0 0 0 - 38.1969 5.8898 12.3721 H 0 0 0 0 0 0 - 41.6780 4.7680 14.6546 H 0 0 0 0 0 0 - 40.8379 6.0779 16.5932 H 0 0 0 0 0 0 - 39.8926 11.6719 16.0292 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 28 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 27 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 26 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 16 19 1 0 0 0 - 19 25 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 - 26 42 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 31 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 31 -1 -M END -> -2 - -> --8.64628903953511 - -$$$$ -23474 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 50 0 0 1 0 999 V2000 - 39.1872 17.7319 12.9711 O 0 0 0 0 0 0 - 40.3302 17.2264 12.9065 C 0 0 0 0 0 0 - 41.1481 17.4091 11.9779 O 0 5 0 0 0 0 - 40.7697 16.2873 14.0319 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0557 15.7410 13.7696 O 0 0 0 0 0 0 - 42.5145 14.9212 14.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1856 13.5746 14.8668 C 0 0 0 0 0 0 - 41.1590 12.6662 13.5413 Br 0 0 0 0 0 0 - 42.6245 12.9340 16.0147 C 0 0 0 0 0 0 - 42.3443 11.5877 16.4784 C 0 0 0 0 0 0 - 43.3652 10.7569 16.9470 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0859 9.4573 17.3660 C 0 0 0 0 0 0 - 41.7792 8.9724 17.3118 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7401 9.7888 16.8448 C 0 0 0 0 0 0 - 39.4485 9.2406 16.7948 N 0 0 0 0 0 0 - 39.1815 7.8314 17.0618 C 0 0 0 0 0 0 - 39.6686 6.9137 15.9440 C 0 0 0 0 0 0 - 41.1881 7.0661 15.7647 C 0 0 0 0 0 0 - 41.7017 6.2017 14.6013 C 0 0 0 0 0 0 - 40.9517 6.5196 13.2971 C 0 0 0 0 0 0 - 39.4321 6.3672 13.4765 C 0 0 0 0 0 0 - 38.9186 7.2316 14.6399 C 0 0 0 0 0 0 - 41.0347 11.0942 16.4477 C 0 0 0 0 0 0 - 43.6360 14.0254 16.9149 S 0 0 0 0 0 0 - 43.3652 15.3253 15.7666 C 0 0 0 0 0 0 - 44.0486 16.6108 16.0385 C 0 0 0 0 0 0 - 43.8781 17.5598 15.2428 O 0 0 0 0 0 0 - 44.7767 16.7158 17.0512 O 0 5 0 0 0 0 - 40.0442 15.4789 14.1331 H 0 0 0 0 0 0 - 40.7670 16.8505 14.9669 H 0 0 0 0 0 0 - 44.3826 11.1175 16.9916 H 0 0 0 0 0 0 - 43.8816 8.8264 17.7339 H 0 0 0 0 0 0 - 41.5761 7.9619 17.6355 H 0 0 0 0 0 0 - 38.7190 9.7741 16.3443 H 0 0 0 0 0 0 - 38.1330 7.6479 17.2935 H 0 0 0 0 0 0 - 39.7226 7.5861 17.9760 H 0 0 0 0 0 0 - 39.4374 5.8967 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - 41.4318 8.1121 15.5789 H 0 0 0 0 0 0 - 41.7008 6.7916 16.6866 H 0 0 0 0 0 0 - 42.7712 6.3608 14.4636 H 0 0 0 0 0 0 - 41.5784 5.1468 14.8467 H 0 0 0 0 0 0 - 41.1828 7.5366 12.9805 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2996 5.8641 12.4988 H 0 0 0 0 0 0 - 38.9194 6.6417 12.5546 H 0 0 0 0 0 0 - 39.1885 5.3212 13.6622 H 0 0 0 0 0 0 - 37.8491 7.0725 14.7776 H 0 0 0 0 0 0 - 39.0419 8.2865 14.3944 H 0 0 0 0 0 0 - 40.2540 11.7471 16.0927 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 25 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 23 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 23 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 16 36 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 44 1 0 0 0 - 21 45 1 0 0 0 - 22 46 1 0 0 0 - 22 47 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 28 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 28 -1 -M END -> -2 - -> --9.11205847715563 - -$$$$ -23480 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 52 0 0 1 0 999 V2000 - 34.9009 4.9769 11.4174 C 0 0 0 0 0 0 - 35.7432 5.3667 12.4886 O 0 0 0 0 0 0 - 37.0750 5.4456 12.2999 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6240 5.2031 11.2233 O 0 0 0 0 0 0 - 37.7153 5.8364 13.4582 N 0 0 0 0 0 0 - 37.0173 6.1412 14.7978 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3829 7.5402 15.3340 C 0 0 0 0 0 0 - 38.9114 7.7621 15.4291 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1835 9.1385 15.8446 N 0 0 0 0 0 0 - 40.4829 9.5699 16.1594 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4815 8.7321 16.6725 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7506 9.2417 16.9424 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0417 10.5800 16.6715 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0577 11.4350 16.1601 C 0 0 0 0 0 0 - 42.3473 12.8247 15.8292 C 0 0 0 0 0 0 - 43.4366 13.7822 16.8006 S 0 0 0 0 0 0 - 43.2082 15.1991 15.7938 C 0 0 0 0 0 0 - 43.9488 16.4202 16.1914 C 0 0 0 0 0 0 - 44.6955 16.3700 17.1931 O 0 0 0 0 0 0 - 43.8161 17.4656 15.5160 O 0 5 0 0 0 0 - 42.3248 14.9326 14.7526 C 0 0 0 0 0 0 - 41.9117 15.8500 13.8469 O 0 0 0 0 0 0 - 40.9786 16.8101 14.3368 C 0 0 0 0 0 0 - 40.2316 17.4946 13.1897 C 0 0 0 0 0 0 - 40.8772 17.7240 12.1431 O 0 0 0 0 0 0 - 39.0259 17.7704 13.3758 O 0 5 0 0 0 0 - 41.8775 13.6145 14.7795 C 0 0 0 0 0 0 - 40.6623 12.9713 13.4584 Br 0 0 0 0 0 0 - 40.7764 10.9164 15.9496 C 0 0 0 0 0 0 - 39.6099 7.4194 14.0884 C 0 0 0 0 0 0 - 39.2402 6.0199 13.5606 C 0 0 0 0 0 0 - 33.8622 4.9680 11.7475 H 0 0 0 0 0 0 - 34.9868 5.6730 10.5821 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1554 3.9760 11.0666 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9326 6.0668 14.7205 H 0 0 0 0 0 0 - 37.3194 5.3852 15.5226 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9559 8.3026 14.6823 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9346 7.6919 16.3159 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3608 7.6369 14.4440 H 0 0 0 0 0 0 - 38.3877 9.7586 15.8969 H 0 0 0 0 0 0 - 41.3038 7.6884 16.8704 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5100 8.5997 17.3637 H 0 0 0 0 0 0 - 44.0359 10.9552 16.8655 H 0 0 0 0 0 0 - 40.2570 16.2936 14.9701 H 0 0 0 0 0 0 - 41.4591 17.5609 14.9666 H 0 0 0 0 0 0 - 39.9957 11.5812 15.6086 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3376 8.1595 13.3359 H 0 0 0 0 0 0 - 40.6918 7.4850 14.2037 H 0 0 0 0 0 0 - 39.7045 5.2681 14.1988 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6700 5.8781 12.5690 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 35 1 0 0 0 - 6 36 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 37 1 0 0 0 - 7 38 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 8 39 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 40 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 41 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 42 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 43 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 29 2 0 0 0 - 15 27 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 21 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 27 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 47 1 0 0 0 - 30 48 1 0 0 0 - 31 49 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 -M CHG 2 20 -1 26 -1 -M END -> -2 - -> --8.71754822596421 - -$$$$ -23470 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 43 0 0 1 0 999 V2000 - 37.0574 6.0201 15.5715 C 0 0 0 0 0 0 - 36.6613 6.9917 16.6944 C 0 0 0 0 0 0 - 36.7264 6.3206 18.0727 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5298 8.1657 16.6845 N 0 0 0 0 0 0 - 38.8613 8.1465 16.8451 C 0 0 0 0 0 0 - 39.5077 7.1124 17.0110 O 0 0 0 0 0 0 - 39.3777 9.3863 16.7836 N 0 0 0 0 0 0 - 40.7401 9.7888 16.8448 C 0 0 0 0 0 0 - 41.7792 8.9724 17.3118 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0859 9.4573 17.3660 C 0 0 0 0 0 0 - 43.3652 10.7569 16.9470 C 0 0 0 0 0 0 - 42.3443 11.5877 16.4784 C 0 0 0 0 0 0 - 42.6245 12.9340 16.0147 C 0 0 0 0 0 0 - 43.6360 14.0254 16.9149 S 0 0 0 0 0 0 - 43.3652 15.3253 15.7666 C 0 0 0 0 0 0 - 44.0434 16.6123 16.0511 C 0 0 0 0 0 0 - 44.7708 16.6963 17.0648 O 0 0 0 0 0 0 - 43.8790 17.5779 15.2720 O 0 5 0 0 0 0 - 42.5145 14.9212 14.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0386 15.7416 13.7736 O 0 0 0 0 0 0 - 40.7906 16.3656 14.0670 C 0 0 0 0 0 0 - 40.3516 17.2925 12.9309 C 0 0 0 0 0 0 - 41.1068 17.3767 11.9372 O 0 0 0 0 0 0 - 39.2649 17.8954 13.0716 O 0 5 0 0 0 0 - 42.1856 13.5746 14.8668 C 0 0 0 0 0 0 - 41.1521 12.7037 13.5216 Br 0 0 0 0 0 0 - 41.0347 11.0942 16.4477 C 0 0 0 0 0 0 - 36.9735 6.4916 14.5918 H 0 0 0 0 0 0 - 38.0852 5.6749 15.6884 H 0 0 0 0 0 0 - 36.4104 5.1425 15.5677 H 0 0 0 0 0 0 - 35.6305 7.3110 16.5295 H 0 0 0 0 0 0 - 36.4222 7.0102 18.8608 H 0 0 0 0 0 0 - 36.0625 5.4568 18.1188 H 0 0 0 0 0 0 - 37.7356 5.9760 18.3013 H 0 0 0 0 0 0 - 37.0794 9.0573 16.5417 H 0 0 0 0 0 0 - 38.7197 10.1329 16.6175 H 0 0 0 0 0 0 - 41.5991 7.9639 17.6500 H 0 0 0 0 0 0 - 43.8791 8.8263 17.7392 H 0 0 0 0 0 0 - 44.3805 11.1222 16.9988 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0404 15.5854 14.1974 H 0 0 0 0 0 0 - 40.8239 16.9207 15.0061 H 0 0 0 0 0 0 - 40.2377 11.7353 16.0992 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 3 34 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 38 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 39 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 27 2 0 0 0 - 13 25 2 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 19 2 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 25 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 27 42 1 0 0 0 -M CHG 2 18 -1 24 -1 -M END -> -2 - -> --7.72301857947764 - -$$$$ -23486 - 3D - Structure written by MMmdl. - 60 63 0 0 1 0 999 V2000 - 41.3719 17.7859 11.8178 O 0 0 0 0 0 0 - 40.5610 17.6340 12.7587 C 0 0 0 0 0 0 - 39.4799 18.2504 12.8841 O 0 5 0 0 0 0 - 40.9135 16.6417 13.8689 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1428 15.9801 13.5995 O 0 0 0 0 0 0 - 42.5067 15.0961 14.5535 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1050 13.7638 14.6029 C 0 0 0 0 0 0 - 41.1936 13.1078 13.3221 Cl 0 0 0 0 0 0 - 42.4736 13.0428 15.7309 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1345 11.6814 16.1187 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0991 10.8232 16.6550 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7730 9.5138 17.0059 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4767 9.0403 16.8075 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4943 9.8795 16.2662 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1733 9.4611 16.0229 N 0 0 0 0 0 0 - 38.8803 8.0706 15.6816 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3499 7.8627 15.5714 C 0 0 0 0 0 0 - 36.9746 6.4537 15.0726 C 0 0 0 0 0 0 - 37.7104 6.1236 13.8434 N 0 0 0 0 0 0 - 36.9761 5.2050 12.5892 S 0 0 0 0 0 0 - 37.8364 5.3259 11.4042 O 0 0 0 0 0 0 - 35.5548 5.5863 12.5166 O 0 0 0 0 0 0 - 37.1037 3.4728 13.2183 C 0 0 0 0 0 0 - 36.7137 2.5266 12.0998 C 0 0 0 0 0 0 - 35.3715 2.1867 11.9063 C 0 0 0 0 0 0 - 35.0075 1.3509 10.8514 C 0 0 0 0 0 0 - 35.9839 0.8540 9.9894 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3260 1.1810 10.1830 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6914 2.0147 11.2396 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1749 6.2318 13.9220 C 0 0 0 0 0 0 - 39.5890 7.6410 14.3716 C 0 0 0 0 0 0 - 40.8302 11.1974 15.9487 C 0 0 0 0 0 0 - 43.4983 14.0501 16.7177 S 0 0 0 0 0 0 - 43.3217 15.4163 15.6304 C 0 0 0 0 0 0 - 44.0366 16.6604 15.9998 C 0 0 0 0 0 0 - 44.7231 16.6703 17.0446 O 0 0 0 0 0 0 - 43.9382 17.6666 15.2618 O 0 5 0 0 0 0 - 40.1097 15.9098 13.9588 H 0 0 0 0 0 0 - 40.9711 17.1834 14.8146 H 0 0 0 0 0 0 - 44.1107 11.1702 16.8078 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5251 8.8657 17.4310 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2433 8.0195 17.0736 H 0 0 0 0 0 0 - 38.4432 10.1496 16.1366 H 0 0 0 0 0 0 - 39.2589 7.4686 16.5076 H 0 0 0 0 0 0 - 36.8766 8.0462 16.5360 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9348 8.6028 14.8873 H 0 0 0 0 0 0 - 37.2043 5.6975 15.8233 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9002 6.3859 14.9017 H 0 0 0 0 0 0 - 38.1412 3.3049 13.5075 H 0 0 0 0 0 0 - 36.4977 3.3763 14.1188 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6147 2.5649 12.5777 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9702 1.0888 10.7035 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7015 0.2167 9.1646 H 0 0 0 0 0 0 - 38.0784 0.7898 9.5143 H 0 0 0 0 0 0 - 38.7325 2.2599 11.3891 H 0 0 0 0 0 0 - 39.5253 5.4655 14.6134 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6129 5.9826 12.9555 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3499 8.3541 13.5828 H 0 0 0 0 0 0 - 40.6706 7.6852 14.4991 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0961 11.8770 15.5523 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 38 1 0 0 0 - 4 39 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 34 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 40 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 41 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 42 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 32 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 43 1 0 0 0 - 16 31 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 44 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 45 1 0 0 0 - 17 46 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 47 1 0 0 0 - 18 48 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 30 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 49 1 0 0 0 - 23 50 1 0 0 0 - 24 29 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 51 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 52 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 53 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 54 1 0 0 0 - 29 55 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 56 1 0 0 0 - 30 57 1 0 0 0 - 31 58 1 0 0 0 - 31 59 1 0 0 0 - 32 60 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 37 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 37 -1 -M END -> -2 - -> --12.4697848806838 - -$$$$ -20669(2qbr) - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 44 0 0 1 0 999 V2000 - 39.2345 17.6631 12.7846 O 0 0 0 0 0 0 - 40.3521 17.1021 12.7361 C 0 0 0 0 0 0 - 41.1778 17.2187 11.8038 O 0 5 0 0 0 0 - 40.7693 16.2193 13.9145 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0927 15.7293 13.7433 O 0 0 0 0 0 0 - 42.5145 14.9212 14.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1856 13.5746 14.8668 C 0 0 0 0 0 0 - 41.2068 12.6501 13.5170 Br 0 0 0 0 0 0 - 42.6245 12.9340 16.0147 C 0 0 0 0 0 0 - 42.3443 11.5877 16.4784 C 0 0 0 0 0 0 - 43.3652 10.7569 16.9470 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0859 9.4573 17.3660 C 0 0 0 0 0 0 - 41.7792 8.9724 17.3118 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7401 9.7888 16.8448 C 0 0 0 0 0 0 - 39.3981 9.3768 16.7741 N 0 0 0 0 0 0 - 38.9977 7.9742 16.7120 C 0 0 0 0 0 0 - 39.0447 7.4076 15.2989 C 0 0 0 0 0 0 - 40.2643 7.0598 14.7072 C 0 0 0 0 0 0 - 40.2940 6.5235 13.4197 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1061 6.3134 12.7236 C 0 0 0 0 0 0 - 37.8875 6.6562 13.3069 C 0 0 0 0 0 0 - 37.8553 7.2050 14.5894 C 0 0 0 0 0 0 - 41.0347 11.0942 16.4477 C 0 0 0 0 0 0 - 43.6360 14.0254 16.9149 S 0 0 0 0 0 0 - 43.3652 15.3253 15.7666 C 0 0 0 0 0 0 - 44.0487 16.6108 16.0384 C 0 0 0 0 0 0 - 43.8748 17.5611 15.2449 O 0 0 0 0 0 0 - 44.7784 16.7153 17.0499 O 0 5 0 0 0 0 - 40.7112 16.7969 14.8381 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0553 15.3978 13.9950 H 0 0 0 0 0 0 - 44.3838 11.1152 16.9827 H 0 0 0 0 0 0 - 43.8828 8.8262 17.7310 H 0 0 0 0 0 0 - 41.5909 7.9603 17.6367 H 0 0 0 0 0 0 - 38.6574 10.0626 16.8096 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6610 7.3813 17.3429 H 0 0 0 0 0 0 - 37.9898 7.8713 17.1160 H 0 0 0 0 0 0 - 41.1892 7.2050 15.2463 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2390 6.2704 12.9621 H 0 0 0 0 0 0 - 39.1291 5.8845 11.7326 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9665 6.4969 12.7658 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9062 7.4739 15.0296 H 0 0 0 0 0 0 - 40.2333 11.7381 16.1154 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 25 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 23 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 23 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 16 36 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 28 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 28 -1 -M END -> -3 - -> --8.60732535283582 - -$$$$ -23482 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 52 0 0 1 0 999 V2000 - 37.0780 3.6786 13.1303 C 0 0 0 0 0 0 - 37.0507 5.4588 12.6717 S 0 0 0 0 0 0 - 35.6546 5.9158 12.6058 O 0 0 0 0 0 0 - 37.9320 5.6292 11.5065 O 0 0 0 0 0 0 - 37.7104 6.1236 13.8434 N 0 0 0 0 0 0 - 36.9746 6.4537 15.0726 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3499 7.8627 15.5714 C 0 0 0 0 0 0 - 38.8803 8.0706 15.6816 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1733 9.4611 16.0229 N 0 0 0 0 0 0 - 40.4943 9.8795 16.2662 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4767 9.0403 16.8075 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7730 9.5138 17.0059 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0991 10.8232 16.6550 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1345 11.6814 16.1187 C 0 0 0 0 0 0 - 42.4736 13.0428 15.7309 C 0 0 0 0 0 0 - 43.4983 14.0501 16.7177 S 0 0 0 0 0 0 - 43.3217 15.4163 15.6304 C 0 0 0 0 0 0 - 44.0475 16.6549 16.0000 C 0 0 0 0 0 0 - 44.7297 16.6609 17.0479 O 0 0 0 0 0 0 - 43.9566 17.6625 15.2632 O 0 5 0 0 0 0 - 42.5067 15.0961 14.5535 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1804 15.9554 13.5598 O 0 0 0 0 0 0 - 40.9447 16.6448 13.7339 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4718 17.2776 12.4231 C 0 0 0 0 0 0 - 39.2380 17.3278 12.2242 O 0 0 0 0 0 0 - 41.3522 17.7070 11.6450 O 0 5 0 0 0 0 - 42.1050 13.7638 14.6029 C 0 0 0 0 0 0 - 41.1293 12.9991 13.1540 Br 0 0 0 0 0 0 - 40.8302 11.1974 15.9487 C 0 0 0 0 0 0 - 39.5890 7.6410 14.3716 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1749 6.2318 13.9220 C 0 0 0 0 0 0 - 36.4460 3.5062 13.9999 H 0 0 0 0 0 0 - 36.7015 3.0894 12.2947 H 0 0 0 0 0 0 - 38.1011 3.3773 13.3530 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9104 6.3727 14.8514 H 0 0 0 0 0 0 - 37.1777 5.7010 15.8344 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9229 8.6168 14.9102 H 0 0 0 0 0 0 - 36.8994 8.0309 16.5496 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3485 7.8874 14.7145 H 0 0 0 0 0 0 - 38.3818 10.0875 16.0647 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2695 8.0208 17.0833 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5238 8.8638 17.4304 H 0 0 0 0 0 0 - 44.1117 11.1724 16.7954 H 0 0 0 0 0 0 - 40.1664 15.9916 14.1324 H 0 0 0 0 0 0 - 41.0935 17.4322 14.4731 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0667 11.8609 15.5685 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3781 8.3587 13.5789 H 0 0 0 0 0 0 - 40.6684 7.6671 14.5215 H 0 0 0 0 0 0 - 39.5623 5.4723 14.6010 H 0 0 0 0 0 0 - 39.5768 5.9846 12.9394 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 4 2 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 35 1 0 0 0 - 6 36 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 37 1 0 0 0 - 7 38 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 8 39 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 40 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 41 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 42 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 43 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 29 2 0 0 0 - 15 27 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 21 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 27 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 47 1 0 0 0 - 30 48 1 0 0 0 - 31 49 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 -M CHG 2 20 -1 26 -1 -M END -> -2 - -> --10.0065068747035 - -$$$$ -23483 - 3D - Structure written by MMmdl. - 57 60 0 0 1 0 999 V2000 - 41.5076 17.6533 11.6485 O 0 0 0 0 0 0 - 40.5987 17.4811 12.4903 C 0 0 0 0 0 0 - 39.4797 18.0394 12.4716 O 0 5 0 0 0 0 - 40.8849 16.5382 13.6616 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1831 15.9568 13.5607 O 0 0 0 0 0 0 - 42.5067 15.0961 14.5535 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1050 13.7638 14.6029 C 0 0 0 0 0 0 - 41.1305 12.9484 13.1815 Br 0 0 0 0 0 0 - 42.4736 13.0428 15.7309 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1345 11.6814 16.1187 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0991 10.8232 16.6550 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7730 9.5138 17.0059 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4767 9.0403 16.8075 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4943 9.8795 16.2662 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1733 9.4611 16.0229 N 0 0 0 0 0 0 - 38.8803 8.0706 15.6816 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3499 7.8627 15.5714 C 0 0 0 0 0 0 - 36.9746 6.4537 15.0726 C 0 0 0 0 0 0 - 37.7104 6.1236 13.8434 N 0 0 0 0 0 0 - 36.9907 5.9581 12.5378 S 0 0 0 0 0 0 - 35.7144 6.6849 12.6224 O 0 0 0 0 0 0 - 37.9478 6.2523 11.4601 O 0 0 0 0 0 0 - 36.6716 4.1994 12.4996 C 0 0 0 0 0 0 - 37.7586 3.3029 12.4915 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5162 1.9153 12.4802 C 0 0 0 0 0 0 - 36.1926 1.4309 12.4791 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1089 2.3322 12.4905 C 0 0 0 0 0 0 - 35.3462 3.7207 12.5036 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1749 6.2318 13.9220 C 0 0 0 0 0 0 - 39.5890 7.6410 14.3716 C 0 0 0 0 0 0 - 40.8302 11.1974 15.9487 C 0 0 0 0 0 0 - 43.4983 14.0501 16.7177 S 0 0 0 0 0 0 - 43.3217 15.4163 15.6304 C 0 0 0 0 0 0 - 44.0454 16.6569 15.9983 C 0 0 0 0 0 0 - 44.7330 16.6641 17.0426 O 0 0 0 0 0 0 - 43.9488 17.6647 15.2624 O 0 5 0 0 0 0 - 40.0978 15.7842 13.7296 H 0 0 0 0 0 0 - 40.8414 17.1162 14.5847 H 0 0 0 0 0 0 - 44.1129 11.1673 16.7997 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5255 8.8665 17.4316 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2413 8.0207 17.0763 H 0 0 0 0 0 0 - 38.4390 10.1449 16.1373 H 0 0 0 0 0 0 - 39.2589 7.4686 16.5076 H 0 0 0 0 0 0 - 36.8766 8.0462 16.5360 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9348 8.6028 14.8873 H 0 0 0 0 0 0 - 37.2043 5.6975 15.8233 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9002 6.3859 14.9017 H 0 0 0 0 0 0 - 38.7715 3.6780 12.4933 H 0 0 0 0 0 0 - 38.3450 1.2228 12.4717 H 0 0 0 0 0 0 - 36.0080 0.3668 12.4686 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0953 1.9593 12.4874 H 0 0 0 0 0 0 - 34.5143 4.4097 12.5081 H 0 0 0 0 0 0 - 39.5253 5.4655 14.6134 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6129 5.9826 12.9555 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3499 8.3541 13.5828 H 0 0 0 0 0 0 - 40.6706 7.6852 14.4991 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0962 11.8860 15.5702 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 37 1 0 0 0 - 4 38 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 33 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 39 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 31 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 42 1 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 43 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 44 1 0 0 0 - 17 45 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 46 1 0 0 0 - 18 47 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 29 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 48 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 49 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 50 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 51 1 0 0 0 - 28 52 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 53 1 0 0 0 - 29 54 1 0 0 0 - 30 55 1 0 0 0 - 30 56 1 0 0 0 - 31 57 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 36 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 36 -1 -M END -> -2 - -> --9.8746881466035 - -$$$$ -23473 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 41.1487 17.2240 11.7776 O 0 0 0 0 0 0 - 40.3529 17.1026 12.7358 C 0 0 0 0 0 0 - 39.2219 17.6321 12.8053 O 0 5 0 0 0 0 - 40.7697 16.2194 13.9140 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0931 15.7293 13.7432 O 0 0 0 0 0 0 - 42.5145 14.9212 14.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1856 13.5746 14.8668 C 0 0 0 0 0 0 - 41.2074 12.6499 13.5167 Br 0 0 0 0 0 0 - 42.6245 12.9340 16.0147 C 0 0 0 0 0 0 - 42.3443 11.5877 16.4784 C 0 0 0 0 0 0 - 43.3652 10.7569 16.9470 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0859 9.4573 17.3660 C 0 0 0 0 0 0 - 41.7792 8.9724 17.3118 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7401 9.7888 16.8448 C 0 0 0 0 0 0 - 39.3981 9.3768 16.7741 O 0 0 0 0 0 0 - 38.9977 7.9742 16.7120 C 0 0 0 0 0 0 - 39.0447 7.4076 15.2989 C 0 0 0 0 0 0 - 40.2643 7.0598 14.7072 C 0 0 0 0 0 0 - 40.2940 6.5235 13.4197 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1061 6.3134 12.7236 C 0 0 0 0 0 0 - 37.8875 6.6562 13.3069 C 0 0 0 0 0 0 - 37.8553 7.2050 14.5894 C 0 0 0 0 0 0 - 41.0347 11.0942 16.4477 C 0 0 0 0 0 0 - 43.6360 14.0254 16.9149 S 0 0 0 0 0 0 - 43.3652 15.3253 15.7666 C 0 0 0 0 0 0 - 44.0488 16.6108 16.0384 C 0 0 0 0 0 0 - 43.8750 17.5611 15.2449 O 0 0 0 0 0 0 - 44.7786 16.7152 17.0498 O 0 5 0 0 0 0 - 40.7111 16.7969 14.8377 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0558 15.3977 13.9940 H 0 0 0 0 0 0 - 44.3838 11.1150 16.9829 H 0 0 0 0 0 0 - 43.8832 8.8267 17.7310 H 0 0 0 0 0 0 - 41.5990 7.9598 17.6387 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6605 7.3657 17.3291 H 0 0 0 0 0 0 - 37.9822 7.8643 17.0961 H 0 0 0 0 0 0 - 41.1904 7.2050 15.2442 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2391 6.2694 12.9628 H 0 0 0 0 0 0 - 39.1289 5.8824 11.7335 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9663 6.4955 12.7664 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9065 7.4735 15.0304 H 0 0 0 0 0 0 - 40.2305 11.7346 16.1160 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 25 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 23 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 23 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 28 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 28 -1 -M END -> -2 - -> --8.3891313751788 - -$$$$ -20670(2qbs) - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 47 0 0 1 0 999 V2000 - 41.1639 17.7415 12.1780 O 0 0 0 0 0 0 - 40.3722 17.6063 13.1368 C 0 0 0 0 0 0 - 39.3254 18.2679 13.3145 O 0 5 0 0 0 0 - 40.7175 16.5469 14.1863 C 0 0 0 0 0 0 - 41.9134 15.8492 13.8454 O 0 0 0 0 0 0 - 42.3248 14.9326 14.7526 C 0 0 0 0 0 0 - 41.8775 13.6145 14.7795 C 0 0 0 0 0 0 - 40.6644 12.9348 13.4743 Br 0 0 0 0 0 0 - 42.3473 12.8247 15.8292 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0577 11.4350 16.1601 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0417 10.5800 16.6715 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7506 9.2417 16.9424 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4815 8.7321 16.6725 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4829 9.5699 16.1594 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1835 9.1385 15.8446 N 0 0 0 0 0 0 - 38.9114 7.7621 15.4291 C 0 0 0 0 0 0 - 39.6099 7.4194 14.0884 C 0 0 0 0 0 0 - 39.2402 6.0199 13.5606 C 0 0 0 0 0 0 - 37.7153 5.8364 13.4582 C 0 0 0 0 0 0 - 37.0173 6.1412 14.7978 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3829 7.5402 15.3340 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7764 10.9164 15.9496 C 0 0 0 0 0 0 - 43.4366 13.7822 16.8006 S 0 0 0 0 0 0 - 43.2082 15.1991 15.7938 C 0 0 0 0 0 0 - 43.9470 16.4235 16.1845 C 0 0 0 0 0 0 - 44.6954 16.3793 17.1852 O 0 0 0 0 0 0 - 43.8111 17.4654 15.5045 O 0 5 0 0 0 0 - 39.9034 15.8237 14.2410 H 0 0 0 0 0 0 - 40.7838 17.0107 15.1721 H 0 0 0 0 0 0 - 44.0372 10.9517 16.8661 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5096 8.5994 17.3640 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2784 7.6884 16.8636 H 0 0 0 0 0 0 - 38.4190 9.7958 15.9008 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3330 7.1201 16.2024 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3536 8.1638 13.3345 H 0 0 0 0 0 0 - 40.6913 7.4722 14.2150 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6904 5.8679 12.5796 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6604 5.2538 14.2121 H 0 0 0 0 0 0 - 37.3186 6.4933 12.6841 H 0 0 0 0 0 0 - 37.4834 4.8187 13.1442 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9367 6.0761 14.6707 H 0 0 0 0 0 0 - 37.2845 5.3857 15.5367 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9252 7.6795 16.3134 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9434 8.2942 14.6809 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0054 11.5887 15.6068 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 24 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 22 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 22 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 33 1 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 35 1 0 0 0 - 17 36 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 21 44 1 0 0 0 - 22 45 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 27 -1 -M END -> -3 - -> --9.08323641464599 - -$$$$ -23468 - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 38 0 0 1 0 999 V2000 - 37.3038 6.0207 14.7782 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5441 7.3857 15.4416 C 0 0 0 0 0 0 - 39.0107 7.6228 15.8168 C 0 0 0 0 0 0 - 39.7628 6.6642 15.9916 O 0 0 0 0 0 0 - 39.3847 8.9129 15.9015 N 0 0 0 0 0 0 - 40.6707 9.4518 16.1790 C 0 0 0 0 0 0 - 41.6984 8.7040 16.7853 C 0 0 0 0 0 0 - 42.9338 9.3143 17.0710 C 0 0 0 0 0 0 - 43.1410 10.6700 16.7518 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1184 11.4322 16.1450 C 0 0 0 0 0 0 - 42.3322 12.8383 15.8154 C 0 0 0 0 0 0 - 43.1854 13.8565 16.9461 S 0 0 0 0 0 0 - 43.0171 15.2585 15.9044 C 0 0 0 0 0 0 - 43.6041 16.5277 16.3926 C 0 0 0 0 0 0 - 43.5028 17.5484 15.6779 O 0 0 0 0 0 0 - 44.1829 16.5486 17.5021 O 0 5 0 0 0 0 - 42.3335 14.9436 14.7511 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0634 15.8257 13.7651 O 0 0 0 0 0 0 - 40.9041 16.6162 13.9936 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4217 17.2724 12.6981 C 0 0 0 0 0 0 - 41.2809 17.6281 11.8606 O 0 0 0 0 0 0 - 39.1845 17.3898 12.5564 O 0 5 0 0 0 0 - 41.9618 13.5670 14.7145 C 0 0 0 0 0 0 - 40.9942 12.8290 13.2469 Br 0 0 0 0 0 0 - 40.8826 10.8086 15.8614 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2433 5.8732 14.5739 H 0 0 0 0 0 0 - 37.8350 5.9382 13.8292 H 0 0 0 0 0 0 - 37.6330 5.2034 15.4210 H 0 0 0 0 0 0 - 37.2252 8.1837 14.7705 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9244 7.4622 16.3363 H 0 0 0 0 0 0 - 38.6703 9.5922 15.6841 H 0 0 0 0 0 0 - 41.5611 7.6677 17.0526 H 0 0 0 0 0 0 - 43.7203 8.7432 17.5419 H 0 0 0 0 0 0 - 44.0904 11.1286 16.9871 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0889 16.0102 14.3930 H 0 0 0 0 0 0 - 41.1295 17.3893 14.7294 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0924 11.3709 15.3855 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 32 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 25 2 0 0 0 - 11 23 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 17 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 23 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 25 37 1 0 0 0 -M CHG 2 16 -1 22 -1 -M END -> -2 - -> --7.75184064198728 - -$$$$ -23475 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 44 0 0 1 0 999 V2000 - 41.4191 17.6003 11.9575 O 0 0 0 0 0 0 - 40.5356 17.4939 12.8367 C 0 0 0 0 0 0 - 39.4594 18.1303 12.8671 O 0 5 0 0 0 0 - 40.7983 16.5073 13.9770 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0652 15.8703 13.8290 O 0 0 0 0 0 0 - 42.3682 14.9604 14.7843 C 0 0 0 0 0 0 - 41.8945 13.6150 14.7768 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7639 12.9503 13.3926 Br 0 0 0 0 0 0 - 42.3354 12.8406 15.8190 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0585 11.4474 16.1564 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0853 10.6026 16.6322 C 0 0 0 0 0 0 - 42.8174 9.2595 16.9591 C 0 0 0 0 0 0 - 41.5160 8.7447 16.8124 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4830 9.5756 16.3374 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1988 9.0234 16.2104 N 0 0 0 0 0 0 - 38.9954 7.6289 15.8731 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1357 7.3709 14.3719 C 0 0 0 0 0 0 - 38.2665 6.1411 14.1220 C 0 0 0 0 0 0 - 37.0665 6.3370 15.0501 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5932 7.1312 16.2550 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7558 10.9195 16.0117 C 0 0 0 0 0 0 - 43.3865 13.7731 16.8529 S 0 0 0 0 0 0 - 43.2022 15.2033 15.8529 C 0 0 0 0 0 0 - 43.9483 16.4111 16.2795 C 0 0 0 0 0 0 - 44.6544 16.3479 17.3096 O 0 0 0 0 0 0 - 43.8504 17.4622 15.6071 O 0 5 0 0 0 0 - 39.9832 15.7838 14.0366 H 0 0 0 0 0 0 - 40.7969 17.0507 14.9222 H 0 0 0 0 0 0 - 44.0910 10.9807 16.7453 H 0 0 0 0 0 0 - 43.6120 8.6235 17.3205 H 0 0 0 0 0 0 - 41.3230 7.7123 17.0655 H 0 0 0 0 0 0 - 38.4086 9.5436 16.5632 H 0 0 0 0 0 0 - 39.7460 7.0528 16.4141 H 0 0 0 0 0 0 - 38.8366 8.2279 13.7684 H 0 0 0 0 0 0 - 40.1741 7.1434 14.1309 H 0 0 0 0 0 0 - 37.9338 6.1297 13.0841 H 0 0 0 0 0 0 - 38.7950 5.2065 14.3099 H 0 0 0 0 0 0 - 36.3000 6.9185 14.5378 H 0 0 0 0 0 0 - 36.6125 5.3899 15.3419 H 0 0 0 0 0 0 - 37.6410 6.5071 17.1474 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9279 7.9643 16.4817 H 0 0 0 0 0 0 - 39.9765 11.5733 15.6517 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 23 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 22 1 0 0 0 - 10 21 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 21 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 32 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 34 1 0 0 0 - 17 35 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 26 -1 -M END -> -2 - -> --8.71754822596421 - -$$$$ -20667(2qbp) - 3D - Structure written by MMmdl. - 60 63 0 0 1 0 999 V2000 - 41.2756 17.6314 11.7392 O 0 0 0 0 0 0 - 40.5209 17.5798 12.7363 C 0 0 0 0 0 0 - 39.5112 18.2966 12.9137 O 0 5 0 0 0 0 - 40.8718 16.5948 13.8531 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1284 15.9801 13.6057 O 0 0 0 0 0 0 - 42.5067 15.0961 14.5535 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1050 13.7638 14.6029 C 0 0 0 0 0 0 - 41.0604 12.9703 13.2195 Br 0 0 0 0 0 0 - 42.4736 13.0428 15.7309 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1345 11.6814 16.1187 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0991 10.8232 16.6550 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7730 9.5138 17.0059 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4767 9.0403 16.8075 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4943 9.8795 16.2662 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1733 9.4611 16.0229 N 0 0 0 0 0 0 - 38.8803 8.0706 15.6816 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3499 7.8627 15.5714 C 0 0 0 0 0 0 - 36.9746 6.4537 15.0726 C 0 0 0 0 0 0 - 37.7104 6.1236 13.8434 N 0 0 0 0 0 0 - 36.9761 5.2050 12.5892 S 0 0 0 0 0 0 - 37.8364 5.3259 11.4042 O 0 0 0 0 0 0 - 35.5548 5.5863 12.5166 O 0 0 0 0 0 0 - 37.1037 3.4728 13.2183 C 0 0 0 0 0 0 - 36.7137 2.5266 12.0998 C 0 0 0 0 0 0 - 35.3715 2.1867 11.9063 C 0 0 0 0 0 0 - 35.0075 1.3509 10.8514 C 0 0 0 0 0 0 - 35.9839 0.8540 9.9894 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3260 1.1810 10.1830 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6914 2.0147 11.2396 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1749 6.2318 13.9220 C 0 0 0 0 0 0 - 39.5890 7.6410 14.3716 C 0 0 0 0 0 0 - 40.8302 11.1974 15.9487 C 0 0 0 0 0 0 - 43.4983 14.0501 16.7177 S 0 0 0 0 0 0 - 43.3217 15.4163 15.6304 C 0 0 0 0 0 0 - 44.0307 16.6631 16.0010 C 0 0 0 0 0 0 - 44.7160 16.6749 17.0464 O 0 0 0 0 0 0 - 43.9282 17.6692 15.2634 O 0 5 0 0 0 0 - 40.0886 15.8379 13.9235 H 0 0 0 0 0 0 - 40.8969 17.1346 14.8012 H 0 0 0 0 0 0 - 44.1104 11.1712 16.8083 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5244 8.8661 17.4327 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2432 8.0198 17.0746 H 0 0 0 0 0 0 - 38.4441 10.1521 16.1264 H 0 0 0 0 0 0 - 39.2589 7.4686 16.5076 H 0 0 0 0 0 0 - 36.8766 8.0462 16.5360 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9348 8.6028 14.8873 H 0 0 0 0 0 0 - 37.2043 5.6975 15.8233 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9002 6.3859 14.9017 H 0 0 0 0 0 0 - 38.1271 3.3079 13.5550 H 0 0 0 0 0 0 - 36.4608 3.3486 14.0877 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6091 2.5781 12.5626 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9697 1.0939 10.6989 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7040 0.2213 9.1599 H 0 0 0 0 0 0 - 38.0756 0.8016 9.5040 H 0 0 0 0 0 0 - 38.7321 2.2645 11.3849 H 0 0 0 0 0 0 - 39.5253 5.4655 14.6134 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6129 5.9826 12.9555 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3499 8.3541 13.5828 H 0 0 0 0 0 0 - 40.6706 7.6852 14.4991 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0955 11.8787 15.5559 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 38 1 0 0 0 - 4 39 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 34 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 40 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 41 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 42 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 32 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 43 1 0 0 0 - 16 31 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 44 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 45 1 0 0 0 - 17 46 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 47 1 0 0 0 - 18 48 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 30 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 49 1 0 0 0 - 23 50 1 0 0 0 - 24 29 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 51 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 52 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 53 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 54 1 0 0 0 - 29 55 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 56 1 0 0 0 - 30 57 1 0 0 0 - 31 58 1 0 0 0 - 31 59 1 0 0 0 - 32 60 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 37 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 37 -1 -M END -> -3 - -> --11.4230277784695 - -$$$$ -23477 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 41.2295 17.5367 11.9444 O 0 0 0 0 0 0 - 40.3854 17.4296 12.8614 C 0 0 0 0 0 0 - 39.3048 18.0555 12.9318 O 0 5 0 0 0 0 - 40.7069 16.4569 13.9988 C 0 0 0 0 0 0 - 41.9716 15.8287 13.8015 O 0 0 0 0 0 0 - 42.3248 14.9326 14.7526 C 0 0 0 0 0 0 - 41.8775 13.6145 14.7795 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7150 12.9156 13.4386 Br 0 0 0 0 0 0 - 42.3473 12.8247 15.8292 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0577 11.4350 16.1601 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0417 10.5800 16.6715 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7506 9.2417 16.9424 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4815 8.7321 16.6725 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4829 9.5699 16.1594 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1835 9.1385 15.8446 N 0 0 0 0 0 0 - 38.9114 7.7621 15.4291 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3829 7.5402 15.3340 C 0 0 0 0 0 0 - 37.0173 6.1412 14.7978 C 0 0 0 0 0 0 - 37.7153 5.8364 13.4582 O 0 0 0 0 0 0 - 39.2402 6.0199 13.5606 C 0 0 0 0 0 0 - 39.6099 7.4194 14.0884 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7764 10.9164 15.9496 C 0 0 0 0 0 0 - 43.4366 13.7822 16.8006 S 0 0 0 0 0 0 - 43.2082 15.1991 15.7938 C 0 0 0 0 0 0 - 43.9621 16.4179 16.1726 C 0 0 0 0 0 0 - 44.7100 16.3742 17.1738 O 0 0 0 0 0 0 - 43.8292 17.4586 15.4900 O 0 5 0 0 0 0 - 39.9017 15.7273 14.1010 H 0 0 0 0 0 0 - 40.7422 17.0094 14.9380 H 0 0 0 0 0 0 - 44.0401 10.9492 16.8558 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5114 8.5980 17.3587 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2791 7.6877 16.8608 H 0 0 0 0 0 0 - 38.4027 9.7252 16.1016 H 0 0 0 0 0 0 - 37.8321 7.6816 15.3000 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9300 7.6611 16.3180 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9314 8.2958 14.6910 H 0 0 0 0 0 0 - 37.3180 5.3761 15.5136 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9396 6.0447 14.6663 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6441 5.2655 14.2357 H 0 0 0 0 0 0 - 39.7049 5.8553 12.5885 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3560 8.1607 13.3306 H 0 0 0 0 0 0 - 40.6918 7.4634 14.2136 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0030 11.5907 15.6162 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 24 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 10 22 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 22 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 33 1 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 35 1 0 0 0 - 17 36 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 27 -1 -M END -> -2 - -> --8.85316590670652 - -$$$$ -23471 - 3D - Structure written by MMmdl. - 35 36 0 0 1 0 999 V2000 - 37.0448 9.0699 15.8294 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5083 8.2225 16.8671 O 0 0 0 0 0 0 - 38.8187 8.1726 17.1493 C 0 0 0 0 0 0 - 39.3752 7.2244 17.7047 O 0 0 0 0 0 0 - 39.3913 9.3618 16.7178 N 0 0 0 0 0 0 - 40.7401 9.7888 16.8448 C 0 0 0 0 0 0 - 41.7792 8.9724 17.3118 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0859 9.4573 17.3660 C 0 0 0 0 0 0 - 43.3652 10.7569 16.9470 C 0 0 0 0 0 0 - 42.3443 11.5877 16.4784 C 0 0 0 0 0 0 - 42.6245 12.9340 16.0147 C 0 0 0 0 0 0 - 43.6360 14.0254 16.9149 S 0 0 0 0 0 0 - 43.3652 15.3253 15.7666 C 0 0 0 0 0 0 - 44.0464 16.6111 16.0505 C 0 0 0 0 0 0 - 44.7740 16.6941 17.0640 O 0 0 0 0 0 0 - 43.8841 17.5767 15.2709 O 0 5 0 0 0 0 - 42.5145 14.9212 14.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0409 15.7421 13.7728 O 0 0 0 0 0 0 - 40.7605 16.3124 14.0330 C 0 0 0 0 0 0 - 40.3270 17.2432 12.8986 C 0 0 0 0 0 0 - 39.2130 17.8008 13.0106 O 0 0 0 0 0 0 - 41.1154 17.3805 11.9374 O 0 5 0 0 0 0 - 42.1856 13.5746 14.8668 C 0 0 0 0 0 0 - 41.1965 12.6902 13.4976 Br 0 0 0 0 0 0 - 41.0347 11.0942 16.4477 C 0 0 0 0 0 0 - 35.9619 8.9862 15.7386 H 0 0 0 0 0 0 - 37.2894 10.1118 16.0395 H 0 0 0 0 0 0 - 37.4891 8.7922 14.8727 H 0 0 0 0 0 0 - 38.7407 10.0195 16.3138 H 0 0 0 0 0 0 - 41.6050 7.9561 17.6278 H 0 0 0 0 0 0 - 43.8812 8.8223 17.7275 H 0 0 0 0 0 0 - 44.3841 11.1146 16.9778 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0358 15.5022 14.1145 H 0 0 0 0 0 0 - 40.7356 16.8455 14.9852 H 0 0 0 0 0 0 - 40.2344 11.7412 16.1190 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 30 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 25 2 0 0 0 - 11 23 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 17 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 16 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 23 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 33 1 0 0 0 - 19 34 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 25 35 1 0 0 0 -M CHG 2 16 -1 22 -1 -M END -> -2 - -> --7.75184064198728 - -$$$$ -23485 - 3D - Structure written by MMmdl. - 63 66 0 0 1 0 999 V2000 - 41.3040 13.2036 13.4628 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1050 13.7638 14.6029 C 0 0 0 0 0 0 - 42.5067 15.0961 14.5535 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1497 15.9428 13.5632 O 0 0 0 0 0 0 - 41.1085 16.8483 13.9109 C 0 0 0 0 0 0 - 40.5926 17.5867 12.6738 C 0 0 0 0 0 0 - 41.2437 17.4781 11.6105 O 0 0 0 0 0 0 - 39.5308 18.2342 12.8065 O 0 5 0 0 0 0 - 43.3217 15.4163 15.6304 C 0 0 0 0 0 0 - 44.0363 16.6612 16.0003 C 0 0 0 0 0 0 - 44.7190 16.6734 17.0477 O 0 0 0 0 0 0 - 43.9409 17.6673 15.2623 O 0 5 0 0 0 0 - 43.4983 14.0501 16.7177 S 0 0 0 0 0 0 - 42.4736 13.0428 15.7309 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1345 11.6814 16.1187 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0991 10.8232 16.6550 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7730 9.5138 17.0059 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4767 9.0403 16.8075 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4943 9.8795 16.2662 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1733 9.4611 16.0229 N 0 0 0 0 0 0 - 38.8803 8.0706 15.6816 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3499 7.8627 15.5714 C 0 0 0 0 0 0 - 36.9746 6.4537 15.0726 C 0 0 0 0 0 0 - 37.7104 6.1236 13.8434 N 0 0 0 0 0 0 - 36.9761 5.2050 12.5892 S 0 0 0 0 0 0 - 37.8364 5.3259 11.4042 O 0 0 0 0 0 0 - 35.5548 5.5863 12.5166 O 0 0 0 0 0 0 - 37.1037 3.4728 13.2183 C 0 0 0 0 0 0 - 36.7137 2.5266 12.0998 C 0 0 0 0 0 0 - 35.3715 2.1867 11.9063 C 0 0 0 0 0 0 - 35.0075 1.3509 10.8514 C 0 0 0 0 0 0 - 35.9839 0.8540 9.9894 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3260 1.1810 10.1830 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6914 2.0147 11.2396 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1749 6.2318 13.9220 C 0 0 0 0 0 0 - 39.5890 7.6410 14.3716 C 0 0 0 0 0 0 - 40.8302 11.1974 15.9487 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7756 13.9858 12.9180 H 0 0 0 0 0 0 - 41.9462 12.6879 12.7491 H 0 0 0 0 0 0 - 40.5530 12.4943 13.8108 H 0 0 0 0 0 0 - 40.2650 16.3316 14.3730 H 0 0 0 0 0 0 - 41.4848 17.5702 14.6364 H 0 0 0 0 0 0 - 44.1102 11.1712 16.8072 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5249 8.8662 17.4322 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2420 8.0208 17.0774 H 0 0 0 0 0 0 - 38.4546 10.1706 16.0360 H 0 0 0 0 0 0 - 39.2589 7.4686 16.5076 H 0 0 0 0 0 0 - 36.8766 8.0462 16.5360 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9348 8.6028 14.8873 H 0 0 0 0 0 0 - 37.2043 5.6975 15.8233 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9002 6.3859 14.9017 H 0 0 0 0 0 0 - 38.1418 3.3069 13.5060 H 0 0 0 0 0 0 - 36.4999 3.3814 14.1208 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6108 2.5601 12.5771 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9697 1.0902 10.7043 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7021 0.2157 9.1651 H 0 0 0 0 0 0 - 38.0787 0.7895 9.5148 H 0 0 0 0 0 0 - 38.7326 2.2586 11.3919 H 0 0 0 0 0 0 - 39.5253 5.4655 14.6134 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6129 5.9826 12.9555 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3499 8.3541 13.5828 H 0 0 0 0 0 0 - 40.6706 7.6852 14.4991 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0952 11.8772 15.5562 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 38 1 0 0 0 - 1 39 1 0 0 0 - 1 40 1 0 0 0 - 2 14 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 9 2 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 41 1 0 0 0 - 5 42 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 8 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 43 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 44 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 45 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 37 2 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 46 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 47 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 48 1 0 0 0 - 22 49 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 50 1 0 0 0 - 23 51 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 35 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 27 2 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 52 1 0 0 0 - 28 53 1 0 0 0 - 29 34 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 55 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 56 1 0 0 0 - 33 34 2 0 0 0 - 33 57 1 0 0 0 - 34 58 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 59 1 0 0 0 - 35 60 1 0 0 0 - 36 61 1 0 0 0 - 36 62 1 0 0 0 - 37 63 1 0 0 0 -M CHG 2 8 -1 12 -1 -M END -> -2 - -> --11.0135614094467 - -$$$$ -23467 - 3D - Structure written by MMmdl. - 31 32 0 0 1 0 999 V2000 - 38.8521 7.7940 16.4845 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1640 9.1368 16.1433 O 0 0 0 0 0 0 - 40.4581 9.5713 16.3352 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4772 8.7481 16.8518 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7760 9.2630 17.0197 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0552 10.5988 16.6723 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0423 11.4358 16.1546 C 0 0 0 0 0 0 - 42.3308 12.8213 15.7959 C 0 0 0 0 0 0 - 43.3748 13.7665 16.8257 S 0 0 0 0 0 0 - 43.2102 15.1796 15.7984 C 0 0 0 0 0 0 - 43.9500 16.3947 16.2107 C 0 0 0 0 0 0 - 43.8582 17.4209 15.5026 O 0 0 0 0 0 0 - 44.6456 16.3657 17.2508 O 0 5 0 0 0 0 - 42.3876 14.9221 14.7244 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0603 15.8348 13.7845 O 0 0 0 0 0 0 - 40.8300 16.5041 14.0279 C 0 0 0 0 0 0 - 40.5470 17.5475 12.9448 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4120 17.7291 12.0588 O 0 0 0 0 0 0 - 39.4649 18.1683 13.0342 O 0 5 0 0 0 0 - 41.9066 13.5794 14.7351 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7855 12.9055 13.3482 Br 0 0 0 0 0 0 - 40.7422 10.9077 15.9890 C 0 0 0 0 0 0 - 37.7989 7.6056 16.2764 H 0 0 0 0 0 0 - 39.4361 7.0866 15.8943 H 0 0 0 0 0 0 - 39.0174 7.6034 17.5457 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2913 7.7209 17.1261 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5590 8.6323 17.4140 H 0 0 0 0 0 0 - 44.0580 10.9795 16.7993 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0173 15.7767 14.0510 H 0 0 0 0 0 0 - 40.8450 17.0109 14.9945 H 0 0 0 0 0 0 - 39.9464 11.5255 15.5989 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 22 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 28 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 22 2 0 0 0 - 8 20 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 14 2 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 20 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 19 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 22 31 1 0 0 0 -M CHG 2 13 -1 19 -1 -M END -> -2 - -> --7.34237427296449 - -$$$$ -23466 - 3D - Structure written by MMmdl. - 29 30 0 0 1 0 999 V2000 - 39.2136 9.0772 15.8610 N 0 0 0 0 0 0 - 40.4829 9.5699 16.1594 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4815 8.7321 16.6725 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7506 9.2417 16.9424 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0417 10.5800 16.6715 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0577 11.4350 16.1601 C 0 0 0 0 0 0 - 42.3473 12.8247 15.8292 C 0 0 0 0 0 0 - 43.4366 13.7822 16.8006 S 0 0 0 0 0 0 - 43.2082 15.1991 15.7938 C 0 0 0 0 0 0 - 43.9543 16.4193 16.1786 C 0 0 0 0 0 0 - 43.8122 17.4512 15.4873 O 0 0 0 0 0 0 - 44.7036 16.3893 17.1807 O 0 5 0 0 0 0 - 42.3248 14.9326 14.7526 C 0 0 0 0 0 0 - 41.9652 15.8350 13.8147 O 0 0 0 0 0 0 - 40.7723 16.5454 14.1198 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4157 17.5289 13.0030 C 0 0 0 0 0 0 - 39.4252 18.2758 13.1672 O 0 0 0 0 0 0 - 41.1620 17.5310 11.9993 O 0 5 0 0 0 0 - 41.8775 13.6145 14.7795 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7114 12.9632 13.4193 Br 0 0 0 0 0 0 - 40.7764 10.9164 15.9496 C 0 0 0 0 0 0 - 38.9878 8.0990 15.9708 H 0 0 0 0 0 0 - 38.5005 9.6676 15.4573 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2762 7.6884 16.8616 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5121 8.6004 17.3610 H 0 0 0 0 0 0 - 44.0397 10.9502 16.8547 H 0 0 0 0 0 0 - 39.9326 15.8609 14.2528 H 0 0 0 0 0 0 - 40.9025 17.0914 15.0552 H 0 0 0 0 0 0 - 39.9956 11.5864 15.6198 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 21 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 25 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 26 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 21 2 0 0 0 - 7 19 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 13 2 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 19 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 27 1 0 0 0 - 15 28 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 21 29 1 0 0 0 -M CHG 2 12 -1 18 -1 -M END -> -2 - -> --7.84784627805605 - -$$$$ -23476 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 50 0 0 1 0 999 V2000 - 41.4867 17.7482 12.0673 O 0 0 0 0 0 0 - 40.5664 17.5761 12.8964 C 0 0 0 0 0 0 - 39.4855 18.2052 12.9246 O 0 5 0 0 0 0 - 40.7845 16.5110 13.9735 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0386 15.8543 13.8050 O 0 0 0 0 0 0 - 42.3405 14.9357 14.7523 C 0 0 0 0 0 0 - 41.9226 13.5730 14.6979 C 0 0 0 0 0 0 - 40.9097 12.8861 13.2359 Br 0 0 0 0 0 0 - 42.2783 12.8150 15.7837 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0207 11.4118 16.0935 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0285 10.6016 16.6613 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7790 9.2486 16.9615 C 0 0 0 0 0 0 - 41.5154 8.6893 16.6954 C 0 0 0 0 0 0 - 40.5019 9.4854 16.1279 C 0 0 0 0 0 0 - 39.2615 8.8686 15.8845 N 0 0 0 0 0 0 - 39.0017 7.4432 15.9074 C 0 0 0 0 0 0 - 37.8800 7.0952 16.9015 C 0 0 0 0 0 0 - 37.8402 5.6235 17.3408 C 0 0 0 0 0 0 - 37.7134 4.6087 16.1910 C 0 0 0 0 0 0 - 39.0143 4.4568 15.3854 C 0 0 0 0 0 0 - 39.2002 5.4613 14.2336 C 0 0 0 0 0 0 - 38.7313 6.9046 14.4928 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7562 10.8392 15.8293 C 0 0 0 0 0 0 - 43.1753 13.7863 16.9220 S 0 0 0 0 0 0 - 43.0446 15.2094 15.9038 C 0 0 0 0 0 0 - 43.6741 16.4501 16.4156 C 0 0 0 0 0 0 - 44.2669 16.4128 17.5159 O 0 0 0 0 0 0 - 43.6044 17.4989 15.7361 O 0 5 0 0 0 0 - 39.9941 15.7641 13.8960 H 0 0 0 0 0 0 - 40.6889 16.9590 14.9642 H 0 0 0 0 0 0 - 44.0021 11.0173 16.8767 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5573 8.6409 17.3989 H 0 0 0 0 0 0 - 41.3381 7.6508 16.9346 H 0 0 0 0 0 0 - 38.4969 9.4598 15.5920 H 0 0 0 0 0 0 - 39.9194 6.9819 16.2723 H 0 0 0 0 0 0 - 38.0023 7.7112 17.7924 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9147 7.3799 16.4828 H 0 0 0 0 0 0 - 38.7221 5.3947 17.9391 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9923 5.4937 18.0133 H 0 0 0 0 0 0 - 37.4767 3.6403 16.6318 H 0 0 0 0 0 0 - 36.8729 4.8501 15.5405 H 0 0 0 0 0 0 - 39.8635 4.5619 16.0606 H 0 0 0 0 0 0 - 39.0851 3.4400 14.9992 H 0 0 0 0 0 0 - 40.2534 5.4934 13.9545 H 0 0 0 0 0 0 - 38.6832 5.0699 13.3574 H 0 0 0 0 0 0 - 37.6678 6.9895 14.2695 H 0 0 0 0 0 0 - 39.2244 7.5514 13.7672 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0032 11.4699 15.3891 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 25 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 23 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 23 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 22 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 36 1 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 44 1 0 0 0 - 21 45 1 0 0 0 - 22 46 1 0 0 0 - 22 47 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 28 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 28 -1 -M END -> -2 - -> --9.4138211030936 - -$$$$ -23484 - 3D - Structure written by MMmdl. - 60 63 0 0 1 0 999 V2000 - 39.4259 18.2063 12.7913 O 0 0 0 0 0 0 - 40.5386 17.6364 12.7356 C 0 0 0 0 0 0 - 41.3997 17.8212 11.8476 O 0 5 0 0 0 0 - 40.8943 16.6402 13.8461 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1348 15.9824 13.6021 O 0 0 0 0 0 0 - 42.5067 15.0961 14.5535 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1050 13.7638 14.6029 C 0 0 0 0 0 0 - 42.4736 13.0428 15.7309 C 0 0 0 0 0 0 - 42.1345 11.6814 16.1187 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0991 10.8232 16.6550 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7730 9.5138 17.0059 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4767 9.0403 16.8075 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4943 9.8795 16.2662 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1733 9.4611 16.0229 N 0 0 0 0 0 0 - 38.8803 8.0706 15.6816 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3499 7.8627 15.5714 C 0 0 0 0 0 0 - 36.9746 6.4537 15.0726 C 0 0 0 0 0 0 - 37.7104 6.1236 13.8434 N 0 0 0 0 0 0 - 36.9761 5.2050 12.5892 S 0 0 0 0 0 0 - 37.8364 5.3259 11.4042 O 0 0 0 0 0 0 - 35.5548 5.5863 12.5166 O 0 0 0 0 0 0 - 37.1037 3.4728 13.2183 C 0 0 0 0 0 0 - 36.7137 2.5266 12.0998 C 0 0 0 0 0 0 - 35.3715 2.1867 11.9063 C 0 0 0 0 0 0 - 35.0075 1.3509 10.8514 C 0 0 0 0 0 0 - 35.9839 0.8540 9.9894 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3260 1.1810 10.1830 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6914 2.0147 11.2396 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1749 6.2318 13.9220 C 0 0 0 0 0 0 - 39.5890 7.6410 14.3716 C 0 0 0 0 0 0 - 40.8302 11.1974 15.9487 C 0 0 0 0 0 0 - 43.4983 14.0501 16.7177 S 0 0 0 0 0 0 - 43.3217 15.4163 15.6304 C 0 0 0 0 0 0 - 44.0369 16.6621 15.9952 C 0 0 0 0 0 0 - 44.7246 16.6743 17.0397 O 0 0 0 0 0 0 - 43.9393 17.6669 15.2557 O 0 5 0 0 0 0 - 40.1114 15.8832 13.8904 H 0 0 0 0 0 0 - 40.8959 17.1443 14.8148 H 0 0 0 0 0 0 - 41.5362 13.3167 13.8010 H 0 0 0 0 0 0 - 44.1102 11.1702 16.8114 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5245 8.8663 17.4330 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2435 8.0196 17.0741 H 0 0 0 0 0 0 - 38.4495 10.1616 16.0962 H 0 0 0 0 0 0 - 39.2589 7.4686 16.5076 H 0 0 0 0 0 0 - 36.8766 8.0462 16.5360 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9348 8.6028 14.8873 H 0 0 0 0 0 0 - 37.2043 5.6975 15.8233 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9002 6.3859 14.9017 H 0 0 0 0 0 0 - 38.1417 3.3051 13.5054 H 0 0 0 0 0 0 - 36.4997 3.3778 14.1203 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6122 2.5581 12.5796 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9695 1.0894 10.7059 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7021 0.2151 9.1655 H 0 0 0 0 0 0 - 38.0786 0.7889 9.5150 H 0 0 0 0 0 0 - 38.7325 2.2595 11.3901 H 0 0 0 0 0 0 - 39.5253 5.4655 14.6134 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6129 5.9826 12.9555 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3499 8.3541 13.5828 H 0 0 0 0 0 0 - 40.6706 7.6852 14.4991 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0876 11.8684 15.5552 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 37 1 0 0 0 - 4 38 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 33 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 39 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 40 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 41 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 42 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 31 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 43 1 0 0 0 - 15 30 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 44 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 45 1 0 0 0 - 16 46 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 47 1 0 0 0 - 17 48 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 29 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 21 2 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 49 1 0 0 0 - 22 50 1 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 51 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 52 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 53 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 54 1 0 0 0 - 28 55 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 56 1 0 0 0 - 29 57 1 0 0 0 - 30 58 1 0 0 0 - 30 59 1 0 0 0 - 31 60 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 36 1 0 0 0 -M CHG 2 3 -1 36 -1 -M END -> -2 - -> --7.75184064198728 - -$$$$ -23479 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 51 0 0 1 0 999 V2000 - 35.5544 5.2757 12.3072 C 0 0 0 0 0 0 - 37.0750 5.4456 12.2999 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6775 5.2201 11.2503 O 0 0 0 0 0 0 - 37.7153 5.8364 13.4582 N 0 0 0 0 0 0 - 37.0173 6.1412 14.7978 C 0 0 0 0 0 0 - 37.3829 7.5402 15.3340 C 0 0 0 0 0 0 - 38.9114 7.7621 15.4291 C 0 0 0 0 0 0 - 39.1835 9.1385 15.8446 N 0 0 0 0 0 0 - 40.4829 9.5699 16.1594 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4815 8.7321 16.6725 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7506 9.2417 16.9424 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0417 10.5800 16.6715 C 0 0 0 0 0 0 - 42.0577 11.4350 16.1601 C 0 0 0 0 0 0 - 42.3473 12.8247 15.8292 C 0 0 0 0 0 0 - 43.4366 13.7822 16.8006 S 0 0 0 0 0 0 - 43.2082 15.1991 15.7938 C 0 0 0 0 0 0 - 43.9665 16.4136 16.1781 C 0 0 0 0 0 0 - 44.7099 16.3644 17.1823 O 0 0 0 0 0 0 - 43.8413 17.4562 15.4971 O 0 5 0 0 0 0 - 42.3248 14.9326 14.7526 C 0 0 0 0 0 0 - 41.9730 15.8282 13.8005 O 0 0 0 0 0 0 - 40.8053 16.5939 14.0882 C 0 0 0 0 0 0 - 40.2683 17.2823 12.8312 C 0 0 0 0 0 0 - 40.8644 17.0551 11.7554 O 0 0 0 0 0 0 - 39.2662 18.0188 12.9662 O 0 5 0 0 0 0 - 41.8775 13.6145 14.7795 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7166 12.9520 13.4196 Br 0 0 0 0 0 0 - 40.7764 10.9164 15.9496 C 0 0 0 0 0 0 - 39.6099 7.4194 14.0884 C 0 0 0 0 0 0 - 39.2402 6.0199 13.5606 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2034 4.9236 11.3366 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2500 4.5439 13.0560 H 0 0 0 0 0 0 - 35.0608 6.2251 12.5156 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9326 6.0668 14.7205 H 0 0 0 0 0 0 - 37.3194 5.3852 15.5226 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9559 8.3025 14.6823 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9346 7.6919 16.3159 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3608 7.6369 14.4440 H 0 0 0 0 0 0 - 38.3890 9.7609 15.8895 H 0 0 0 0 0 0 - 41.3037 7.6885 16.8710 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5109 8.5989 17.3609 H 0 0 0 0 0 0 - 44.0390 10.9524 16.8549 H 0 0 0 0 0 0 - 40.0208 15.9856 14.5418 H 0 0 0 0 0 0 - 41.0679 17.3551 14.8233 H 0 0 0 0 0 0 - 39.9928 11.5836 15.6204 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3376 8.1595 13.3359 H 0 0 0 0 0 0 - 40.6918 7.4850 14.2037 H 0 0 0 0 0 0 - 39.7045 5.2681 14.1988 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6700 5.8781 12.5690 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 36 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 7 38 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 39 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 40 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 41 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 42 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 2 0 0 0 - 14 26 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 19 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 28 45 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 30 48 1 0 0 0 - 30 49 1 0 0 0 -M CHG 2 19 -1 25 -1 -M END -> -2 - -> --9.14235922654499 - -$$$$ -23330(2qbq) - 3D - Structure written by MMmdl. - 57 59 0 0 1 0 999 V2000 - 43.3233 13.7400 16.9527 S 0 0 0 0 0 0 - 43.2030 15.1929 15.9762 C 0 0 0 0 0 0 - 42.4447 14.9739 14.8477 C 0 0 0 0 0 0 - 41.9770 13.6283 14.7765 C 0 0 0 0 0 0 - 42.3482 12.8303 15.8279 C 0 0 0 0 0 0 - 43.9057 16.4430 16.4763 C 0 0 0 0 0 0 - 44.5237 16.3493 17.5596 O 0 0 0 0 0 0 - 43.7737 17.4605 15.7592 O 0 5 0 0 0 0 - 42.0535 11.4291 16.1130 C 0 0 0 0 0 0 - 40.7754 10.8941 15.8359 C 0 0 0 0 0 0 - 40.4853 9.5424 16.1107 C 0 0 0 0 0 0 - 41.4762 8.7108 16.6670 C 0 0 0 0 0 0 - 42.7530 9.2326 16.9457 C 0 0 0 0 0 0 - 43.0383 10.5835 16.6694 C 0 0 0 0 0 0 - 40.9483 13.0395 13.2971 Br 0 0 0 0 0 0 - 42.2170 15.8802 13.8703 O 0 0 0 0 0 0 - 41.2561 16.8862 14.1750 C 0 0 0 0 0 0 - 40.9764 17.7598 12.9456 C 0 0 0 0 0 0 - 40.0382 17.4490 12.1783 O 0 0 0 0 0 0 - 41.7122 18.7575 12.7906 O 0 5 0 0 0 0 - 39.1897 9.0765 15.8167 N 0 0 0 0 0 0 - 38.9258 7.6726 15.5737 C 0 0 0 0 0 0 - 37.4107 7.4354 15.4606 C 0 0 0 0 0 0 - 37.0992 5.9646 15.1380 C 0 0 0 0 0 0 - 37.8320 5.5053 13.8665 C 0 0 0 0 0 0 - 39.3470 5.7425 13.9797 C 0 0 0 0 0 0 - 39.6585 7.2133 14.3023 C 0 0 0 0 0 0 - 35.5944 5.7760 14.9686 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5116 5.0835 16.3137 C 0 0 0 0 0 0 - 40.0361 5.3373 12.6798 C 0 0 0 0 0 0 - 39.9263 4.8450 15.0695 C 0 0 0 0 0 0 - 40.0223 11.5284 15.3918 H 0 0 0 0 0 0 - 41.2785 7.6723 16.8842 H 0 0 0 0 0 0 - 43.5204 8.5921 17.3560 H 0 0 0 0 0 0 - 44.0255 10.9664 16.8787 H 0 0 0 0 0 0 - 40.3174 16.4390 14.5068 H 0 0 0 0 0 0 - 41.6234 17.5201 14.9838 H 0 0 0 0 0 0 - 38.6249 9.7034 15.2558 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3172 7.1339 16.4367 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9186 7.7249 16.3890 H 0 0 0 0 0 0 - 36.9969 8.0765 14.6822 H 0 0 0 0 0 0 - 37.6335 4.4493 13.6837 H 0 0 0 0 0 0 - 37.4405 6.0440 13.0036 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3640 7.8427 13.4625 H 0 0 0 0 0 0 - 40.7334 7.3480 14.4233 H 0 0 0 0 0 0 - 35.3442 4.7449 14.7157 H 0 0 0 0 0 0 - 35.0533 6.0262 15.8811 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1963 6.4082 14.1751 H 0 0 0 0 0 0 - 37.4373 4.0237 16.0675 H 0 0 0 0 0 0 - 38.5225 5.2716 16.6604 H 0 0 0 0 0 0 - 36.8724 5.2577 17.1806 H 0 0 0 0 0 0 - 41.1045 5.5542 12.7107 H 0 0 0 0 0 0 - 39.9233 4.2707 12.4802 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6277 5.8674 11.8225 H 0 0 0 0 0 0 - 41.0117 4.8712 15.0469 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6557 5.1477 16.0756 H 0 0 0 0 0 0 - 39.6249 3.8045 14.9423 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 15 1 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 8 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 14 2 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 21 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 36 1 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 28 1 0 0 0 - 24 29 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 26 31 1 0 0 0 - 27 44 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 - 31 55 1 0 0 0 - 31 56 1 0 0 0 - 31 57 1 0 0 0 -M CHG 2 8 -1 20 -1 -M END -> -3 - -> --10.1250500980544 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/Thrombin_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/Thrombin_ligands.sdf deleted file mode 100755 index 8bcfc65e..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/Thrombin_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,1312 +0,0 @@ -1b - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 54 0 0 1 0 999 V2000 - 18.2653 -13.2407 21.7065 N 0 0 0 0 0 0 - 18.0666 -11.9445 21.0290 C 0 0 2 0 0 0 - 17.3965 -13.7802 22.5963 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3982 -13.1682 22.9797 O 0 0 0 0 0 0 - 16.6625 -11.7536 20.4056 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1638 -12.6466 19.7188 O 0 0 0 0 0 0 - 19.1633 -11.8944 19.9556 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6504 -15.1803 23.1883 C 0 0 2 0 0 0 - 16.0423 -10.5938 20.6504 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2631 -12.8149 20.4461 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4086 -15.9682 23.1113 N 0 3 0 0 0 0 - 18.1359 -15.1116 24.6549 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7042 -10.2162 20.2151 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5455 -13.8412 21.3148 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5607 -14.6147 24.8273 C 0 0 0 0 0 0 - 13.6411 -10.3567 21.2915 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8041 -13.3098 25.2934 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9051 -11.5528 21.4232 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1138 -12.8171 25.3982 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8942 -11.6572 22.4010 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2000 -13.6406 25.0541 C 0 0 0 0 0 0 - 11.6200 -10.5698 23.2551 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9704 -14.9618 24.6258 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3724 -9.3839 23.1465 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6532 -15.4491 24.5107 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3735 -9.2784 22.1614 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2473 -11.1607 21.7642 H 0 0 0 0 0 0 - 18.7918 -12.2521 18.9936 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5370 -10.8863 19.8145 H 0 0 0 0 0 0 - 18.3784 -15.7341 22.5976 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5623 -9.8919 21.1770 H 0 0 0 0 0 0 - 20.8307 -13.2708 19.6333 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9665 -12.2499 21.0595 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5518 -16.8840 23.5090 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6837 -15.4790 23.6232 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1247 -16.0522 22.1464 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4587 -14.4914 25.2462 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0854 -16.1036 25.1053 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7425 -9.1642 19.9392 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4054 -10.7643 19.3193 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1632 -14.1035 22.1724 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3599 -14.7477 20.7373 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9902 -12.6794 25.5932 H 0 0 0 0 0 0 - 13.1151 -12.3914 20.7737 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2718 -11.8120 25.7585 H 0 0 0 0 0 0 - 11.3295 -12.5741 22.5024 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2097 -13.2677 25.1383 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8078 -15.6009 24.3847 H 0 0 0 0 0 0 - 12.1062 -8.0755 24.2428 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.4886 -16.4600 24.1662 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9512 -8.3702 22.0898 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8471 -10.6549 24.0065 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 8 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 25 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 26 2 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 44 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 46 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 21 47 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 52 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 24 49 1 0 0 0 - 25 50 1 0 0 0 - 26 51 1 0 0 0 -M CHG 1 11 1 -M END -> --8.46 - -$$$$ -1d - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 54 0 0 1 0 999 V2000 - 18.2724 -13.2441 21.7072 N 0 0 0 0 0 0 - 18.0753 -11.9483 21.0285 C 0 0 2 0 0 0 - 17.4016 -13.7827 22.5957 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4030 -13.1700 22.9772 O 0 0 0 0 0 0 - 16.6731 -11.7594 20.4013 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1781 -12.6531 19.7125 O 0 0 0 0 0 0 - 19.1739 -11.8989 19.9568 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6534 -15.1828 23.1886 C 0 0 2 0 0 0 - 16.0509 -10.6004 20.6443 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2726 -12.8189 20.4503 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4103 -15.9689 23.1123 N 0 3 0 0 0 0 - 18.1391 -15.1142 24.6551 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7145 -10.2250 20.2026 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5531 -13.8450 21.3178 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5631 -14.6147 24.8265 C 0 0 0 0 0 0 - 13.6469 -10.3699 21.2731 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6572 -15.4491 24.5148 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9112 -11.5669 21.3982 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9737 -14.9613 24.6353 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8983 -11.6758 22.3733 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2010 -13.6398 25.0643 C 0 0 0 0 0 0 - 11.6219 -10.5921 23.2310 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1131 -12.8168 25.4045 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3743 -9.4058 23.1282 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8041 -13.3100 25.2945 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3767 -9.2950 22.1455 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2537 -11.1637 21.7634 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8042 -12.2583 18.9947 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5472 -10.8908 19.8140 H 0 0 0 0 0 0 - 18.3806 -15.7377 22.5980 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5668 -9.8981 21.1739 H 0 0 0 0 0 0 - 20.8421 -13.2750 19.6390 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9743 -12.2534 21.0652 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5521 -16.8846 23.5108 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6862 -15.4781 23.6239 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1261 -16.0532 22.1476 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4612 -14.4952 25.2468 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0904 -16.1065 25.1051 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7520 -9.1718 19.9317 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4212 -10.7708 19.3037 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1692 -14.1076 22.1763 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3681 -14.7514 20.7399 H 0 0 0 0 0 0 - 20.4945 -16.4621 24.1755 H 0 0 0 0 0 0 - 13.1236 -12.4028 20.7462 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8124 -15.6000 24.3977 H 0 0 0 0 0 0 - 11.3346 -12.5937 22.4705 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2098 -13.2642 25.1457 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2689 -11.8094 25.7595 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0627 -7.8307 24.4709 I 0 0 0 0 0 0 - 18.9889 -12.6799 25.5910 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9552 -8.3868 22.0794 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8491 -10.6816 23.9820 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 8 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 25 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 26 2 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 44 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 46 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 21 47 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 52 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 24 49 1 0 0 0 - 25 50 1 0 0 0 - 26 51 1 0 0 0 -M CHG 1 11 1 -M END -> --8.25 - -$$$$ -3b - 3D - Structure written by MMmdl. - 58 60 0 0 1 0 999 V2000 - 18.2837 -13.2167 21.6711 N 0 0 0 0 0 0 - 18.1069 -11.9189 20.9899 C 0 0 2 0 0 0 - 17.4006 -13.7476 22.5524 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4058 -13.1272 22.9305 O 0 0 0 0 0 0 - 16.7158 -11.7247 20.3399 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2540 -12.5979 19.6030 O 0 0 0 0 0 0 - 19.2212 -11.8811 19.9329 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6347 -15.1514 23.1434 C 0 0 2 0 0 0 - 16.0668 -10.5871 20.6174 N 0 0 0 0 0 0 - 20.3031 -12.8141 20.4369 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3852 -15.9256 23.0521 N 0 3 0 0 0 0 - 18.1081 -15.0916 24.6149 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7238 -10.2228 20.1805 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5622 -13.8312 21.2959 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5374 -14.6118 24.8032 C 0 0 0 0 0 0 - 13.6222 -10.7255 21.0990 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7921 -13.3153 25.2875 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0747 -9.8945 22.1043 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1061 -12.8369 25.4050 C 0 0 0 0 0 0 - 12.0629 -10.3884 22.9643 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1857 -13.6674 25.0566 C 0 0 0 0 0 0 - 11.5859 -11.7025 22.7805 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9450 -14.9812 24.6113 C 0 0 0 0 0 0 - 12.1277 -12.5291 21.7812 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6234 -15.4537 24.4832 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1479 -12.0435 20.9456 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2787 -11.1344 21.7266 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8614 -12.2338 18.9646 H 0 0 0 0 0 0 - 19.6100 -10.8785 19.7968 H 0 0 0 0 0 0 - 18.3615 -15.7122 22.5580 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5622 -9.8958 21.1794 H 0 0 0 0 0 0 - 20.8744 -13.2769 19.6309 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0054 -12.2575 21.0592 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5154 -16.8455 23.4447 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6617 -15.4323 23.5622 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1072 -15.9998 22.0847 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4321 -14.4653 25.2010 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0416 -16.0842 25.0622 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6655 -9.1359 20.1194 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5403 -10.6032 19.1745 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1661 -14.0999 22.1609 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3741 -14.7354 20.7158 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9835 -12.6802 25.5913 H 0 0 0 0 0 0 - 13.4616 -8.8945 22.2257 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2725 -11.8372 25.7775 H 0 0 0 0 0 0 - 23.1985 -13.3054 25.1500 H 0 0 0 0 0 0 - 22.7770 -15.6258 24.3660 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7679 -13.5422 21.6724 H 0 0 0 0 0 0 - 20.4505 -16.4585 24.1250 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5747 -12.6868 20.1893 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8150 -12.0976 23.4283 H 0 0 0 0 0 0 - 11.5078 -9.6034 24.1479 C 0 0 0 0 0 0 - 11.6961 -10.2111 25.0299 H 0 0 0 0 0 0 - 10.4220 -9.5550 24.0585 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0810 -8.1961 24.3903 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7103 -7.4962 23.6679 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7719 -7.8011 25.3536 H 0 0 0 0 0 0 - 13.1666 -8.1549 24.3557 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 8 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 25 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 26 2 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 44 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 52 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 21 46 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 51 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 47 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 24 48 1 0 0 0 - 25 49 1 0 0 0 - 26 50 1 0 0 0 - 52 53 1 0 0 0 - 52 54 1 0 0 0 - 52 55 1 0 0 0 - 55 56 1 0 0 0 - 55 57 1 0 0 0 - 55 58 1 0 0 0 -M CHG 1 11 1 -M END -> --7.86 - -$$$$ -1a - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 54 0 0 1 0 999 V2000 - 18.3477 -13.2695 21.7072 N 0 0 0 0 0 0 - 18.1765 -11.9782 21.0132 C 0 0 2 0 0 0 - 17.4561 -13.7932 22.5862 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4566 -13.1696 22.9501 O 0 0 0 0 0 0 - 16.7891 -11.7919 20.3607 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3129 -12.6820 19.6534 O 0 0 0 0 0 0 - 19.2877 -11.9490 19.9528 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6818 -15.1940 23.1883 C 0 0 2 0 0 0 - 16.1564 -10.6408 20.6065 N 0 0 0 0 0 0 - 20.3708 -12.8696 20.4764 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4280 -15.9626 23.1045 N 0 3 0 0 0 0 - 18.1548 -15.1270 24.6591 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8280 -10.2760 20.1411 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6283 -13.8844 21.3391 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5750 -14.6212 24.8423 C 0 0 0 0 0 0 - 13.7200 -10.6282 21.1183 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6767 -15.4490 24.5360 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2089 -11.9431 21.1732 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9890 -14.9496 24.6571 C 0 0 0 0 0 0 - 12.1531 -12.2553 22.0546 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2038 -13.6243 25.0836 C 0 0 0 0 0 0 - 11.6074 -11.2561 22.8870 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1084 -12.8096 25.4224 C 0 0 0 0 0 0 - 12.1303 -9.9484 22.8494 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8037 -13.3135 25.3100 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1834 -9.6356 21.9677 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3473 -11.1866 21.7427 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9283 -12.3278 18.9940 H 0 0 0 0 0 0 - 19.6663 -10.9449 19.7868 H 0 0 0 0 0 0 - 18.4070 -15.7607 22.6062 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6541 -9.9374 21.1520 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9506 -13.3366 19.6790 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0642 -12.3021 21.0991 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5546 -16.8799 23.5049 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7068 -15.4618 23.6107 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1495 -16.0443 22.1377 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4693 -14.5110 25.2456 H 0 0 0 0 0 0 - 18.1057 -16.1206 25.1069 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8206 -9.1968 19.9898 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6149 -10.7331 19.1722 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2303 -14.1483 22.2066 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4426 -14.7918 20.7627 H 0 0 0 0 0 0 - 20.5231 -16.4639 24.1961 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6273 -12.7128 20.5372 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8339 -15.5815 24.4209 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7602 -13.2621 22.0956 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2093 -13.2396 25.1644 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2545 -11.7997 25.7767 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6288 -8.9896 23.6636 F 0 0 0 0 0 0 - 18.9815 -12.6889 25.6020 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5784 -8.6306 21.9529 H 0 0 0 0 0 0 - 10.7939 -11.4932 23.5600 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 8 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 25 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 26 2 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 44 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 46 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 21 47 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 52 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 24 49 1 0 0 0 - 25 50 1 0 0 0 - 26 51 1 0 0 0 -M CHG 1 11 1 -M END -> --7.48 - -$$$$ -6a - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 54 0 0 1 0 999 V2000 - 18.2157 -13.2003 21.6863 N 0 0 0 0 0 0 - 18.0087 -11.9014 21.0167 C 0 0 2 0 0 0 - 17.3504 -13.7474 22.5740 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3550 -13.1366 22.9677 O 0 0 0 0 0 0 - 16.6062 -11.7346 20.3818 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1572 -12.6195 19.6529 O 0 0 0 0 0 0 - 19.1142 -11.8355 19.9533 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6071 -15.1533 23.1501 C 0 0 2 0 0 0 - 15.9284 -10.6140 20.6664 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2121 -12.7673 20.4270 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3676 -15.9435 23.0624 N 0 3 0 0 0 0 - 18.0947 -15.1005 24.6172 C 0 0 0 0 0 0 - 14.5615 -10.3074 20.2469 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4961 -13.7972 21.2906 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5224 -14.6112 24.7960 C 0 0 0 0 0 0 - 13.5216 -10.3907 21.3623 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7728 -13.3212 25.2992 C 0 0 0 0 0 0 - 12.7061 -11.5351 21.5535 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0848 -12.8362 25.4155 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7284 -11.5437 22.5691 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1672 -13.6542 25.0464 C 0 0 0 0 0 0 - 11.5492 -10.4209 23.3986 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9309 -14.9609 24.5786 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3658 -9.2886 23.2270 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6114 -15.4396 24.4521 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3428 -9.2754 22.2113 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1730 -11.1184 21.7562 H 0 0 0 0 0 0 - 18.7508 -12.1659 18.9784 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4937 -10.8268 19.8451 H 0 0 0 0 0 0 - 18.3351 -15.7000 22.5532 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4243 -9.9023 21.2009 H 0 0 0 0 0 0 - 20.7720 -13.2186 19.6062 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9234 -12.2129 21.0409 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5136 -16.8648 23.4463 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6419 -15.4639 23.5823 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0827 -16.0137 22.0966 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4195 -14.4847 25.2152 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0410 -16.0970 25.0572 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5615 -9.2765 19.8995 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2593 -10.9054 19.3856 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1147 -14.0626 22.1463 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3114 -14.7010 20.7086 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9623 -12.6976 25.6212 H 0 0 0 0 0 0 - 12.8565 -12.9335 20.5533 Cl 0 0 0 0 0 0 - 21.2481 -11.8420 25.8042 H 0 0 0 0 0 0 - 11.1072 -12.4173 22.7110 H 0 0 0 0 0 0 - 23.1789 -13.2889 25.1412 H 0 0 0 0 0 0 - 22.7647 -15.5963 24.3164 H 0 0 0 0 0 0 - 12.1952 -7.9330 24.2824 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.4423 -16.4395 24.0787 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9669 -8.4033 22.0925 H 0 0 0 0 0 0 - 10.7951 -10.4367 24.1734 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 8 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 25 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 26 2 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 44 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 46 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 21 47 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 52 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 24 49 1 0 0 0 - 25 50 1 0 0 0 - 26 51 1 0 0 0 -M CHG 1 11 1 -M END -> --9.18 - -$$$$ -7a - 3D - Structure written by MMmdl. - 58 60 0 0 1 0 999 V2000 - 18.3714 -13.1884 21.6150 N 0 0 0 0 0 0 - 18.2376 -11.8958 20.9137 C 0 0 2 0 0 0 - 17.4535 -13.6998 22.4744 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4564 -13.0653 22.8232 O 0 0 0 0 0 0 - 16.8822 -11.7251 20.1933 C 0 0 0 0 0 0 - 16.5597 -12.5203 19.3090 O 0 0 0 0 0 0 - 19.3957 -11.8806 19.9002 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6438 -15.1075 23.0722 C 0 0 2 0 0 0 - 16.1070 -10.7041 20.5768 N 0 0 0 0 0 0 - 20.4400 -12.8262 20.4504 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3782 -15.8524 22.9564 N 0 3 0 0 0 0 - 18.0887 -15.0599 24.5536 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7606 -10.4180 20.0946 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6520 -13.8246 21.2876 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5204 -14.6005 24.7756 C 0 0 0 0 0 0 - 13.6484 -10.9027 21.0223 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7809 -13.3155 25.2861 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1225 -12.2215 20.9619 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0968 -12.8490 25.4254 C 0 0 0 0 0 0 - 12.0912 -12.6033 21.8422 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1731 -13.6821 25.0741 C 0 0 0 0 0 0 - 11.5685 -11.6941 22.7743 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9269 -14.9875 24.6077 C 0 0 0 0 0 0 - 12.0837 -10.3888 22.8432 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6031 -15.4477 24.4583 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1193 -9.9960 21.9695 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3734 -11.0983 21.6443 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0784 -12.2392 18.9195 H 0 0 0 0 0 0 - 19.8046 -10.8864 19.7618 H 0 0 0 0 0 0 - 18.3684 -15.6849 22.5004 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5078 -10.0402 21.2346 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0275 -13.3043 19.6664 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1295 -12.2772 21.0928 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4826 -16.7785 23.3421 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6587 -15.3490 23.4622 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1117 -15.9119 21.9847 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4088 -14.4266 25.1274 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9991 -16.0532 24.9949 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6771 -9.3349 20.0093 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6113 -10.7985 19.0847 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2228 -14.0966 22.1726 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4702 -14.7290 20.7056 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9751 -12.6789 25.5923 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2663 -11.8561 25.8144 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6934 -13.6069 21.8142 H 0 0 0 0 0 0 - 23.1872 -13.3284 25.1807 H 0 0 0 0 0 0 - 22.7565 -15.6343 24.3606 H 0 0 0 0 0 0 - 20.4262 -16.4446 24.0808 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5196 -8.9948 22.0333 H 0 0 0 0 0 0 - 10.7772 -12.0109 23.4403 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6358 -13.2672 19.9913 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9012 -14.0601 19.8494 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8513 -12.8508 19.0091 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5410 -13.7246 20.3895 H 0 0 0 0 0 0 - 11.5359 -9.4383 23.8829 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8364 -8.4090 23.6897 H 0 0 0 0 0 0 - 10.4482 -9.4991 23.9130 H 0 0 0 0 0 0 - 11.8982 -9.7214 24.8678 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 8 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 25 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 26 2 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 51 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 44 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 45 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 21 46 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 50 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 47 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 24 55 1 0 0 0 - 25 48 1 0 0 0 - 26 49 1 0 0 0 - 51 52 1 0 0 0 - 51 53 1 0 0 0 - 51 54 1 0 0 0 - 55 56 1 0 0 0 - 55 57 1 0 0 0 - 55 58 1 0 0 0 -M CHG 1 11 1 -M END -> --8.22 - -$$$$ -3a - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 57 0 0 1 0 999 V2000 - 18.3586 -13.2433 21.6782 N 0 0 0 0 0 0 - 18.1955 -11.9531 20.9799 C 0 0 2 0 0 0 - 17.4601 -13.7625 22.5530 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4632 -13.1349 22.9149 O 0 0 0 0 0 0 - 16.8176 -11.7793 20.3045 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3847 -12.6581 19.5563 O 0 0 0 0 0 0 - 19.3213 -11.9263 19.9342 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6743 -15.1650 23.1542 C 0 0 2 0 0 0 - 16.1459 -10.6550 20.5743 N 0 0 0 0 0 0 - 20.3937 -12.8539 20.4646 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4158 -15.9247 23.0599 N 0 3 0 0 0 0 - 18.1376 -15.1029 24.6287 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8056 -10.3296 20.1078 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6396 -13.8634 21.3222 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5621 -14.6136 24.8242 C 0 0 0 0 0 0 - 13.7048 -10.8483 21.0151 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8032 -13.3127 25.3021 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2757 -12.1872 20.9048 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1122 -12.8206 25.4158 C 0 0 0 0 0 0 - 12.2474 -12.6715 21.7347 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1996 -13.6407 25.0687 C 0 0 0 0 0 0 - 11.6484 -11.8212 22.6817 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9724 -14.9597 24.6331 C 0 0 0 0 0 0 - 12.0807 -10.4868 22.8072 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6559 -15.4473 24.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1054 -9.9983 21.9692 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3513 -11.1579 21.7090 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9738 -12.2977 18.9684 H 0 0 0 0 0 0 - 19.7085 -10.9248 19.7784 H 0 0 0 0 0 0 - 18.3994 -15.7356 22.5759 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6121 -9.9542 21.1482 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9742 -13.3247 19.6706 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0870 -12.2912 21.0912 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5325 -16.8438 23.4588 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6949 -15.4200 23.5622 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1429 -16.0014 22.0912 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4545 -14.4794 25.2096 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0738 -16.0956 25.0759 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7242 -9.2447 20.0427 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6468 -10.7188 19.1008 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2332 -14.1270 22.1951 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4557 -14.7713 20.7464 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9874 -12.6835 25.5989 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7415 -12.8460 20.1858 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2679 -11.8171 25.7811 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9202 -13.6985 21.6578 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2085 -13.2665 25.1547 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8108 -15.5961 24.3898 H 0 0 0 0 0 0 - 20.4927 -16.4552 24.1578 H 0 0 0 0 0 0 - 13.4444 -8.9775 22.0683 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8638 -12.2037 23.3202 H 0 0 0 0 0 0 - 11.4642 -9.6050 23.8704 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7626 -8.5635 23.7535 H 0 0 0 0 0 0 - 10.3771 -9.6708 23.8407 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7848 -9.9408 24.8546 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 8 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 25 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 26 2 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 44 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 46 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 21 47 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 51 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 24 52 1 0 0 0 - 25 49 1 0 0 0 - 26 50 1 0 0 0 - 52 53 1 0 0 0 - 52 54 1 0 0 0 - 52 55 1 0 0 0 -M CHG 1 11 1 -M END -> --8.32 - -$$$$ -5 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 54 0 0 1 0 999 V2000 - 18.3833 -13.2487 21.6777 N 0 0 0 0 0 0 - 18.2278 -11.9595 20.9752 C 0 0 2 0 0 0 - 17.4784 -13.7664 22.5477 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4768 -13.1400 22.8994 O 0 0 0 0 0 0 - 16.8531 -11.7833 20.2962 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4281 -12.6525 19.5327 O 0 0 0 0 0 0 - 19.3563 -11.9389 19.9323 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6879 -15.1677 23.1537 C 0 0 2 0 0 0 - 16.1691 -10.6729 20.5899 N 0 0 0 0 0 0 - 20.4245 -12.8650 20.4723 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4280 -15.9253 23.0586 N 0 3 0 0 0 0 - 18.1459 -15.1031 24.6296 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8261 -10.3435 20.1328 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6649 -13.8715 21.3288 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5691 -14.6122 24.8281 C 0 0 0 0 0 0 - 13.7216 -10.7958 21.0762 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8071 -13.3109 25.3061 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8500 -9.8475 21.6537 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1149 -12.8161 25.4203 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8084 -10.2645 22.5058 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2043 -13.6341 25.0731 C 0 0 0 0 0 0 - 11.6256 -11.6332 22.7778 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9802 -14.9539 24.6379 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4938 -12.5824 22.2070 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6648 -15.4443 24.5158 C 0 0 0 0 0 0 - 13.5398 -12.1656 21.3620 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3841 -11.1629 21.7027 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0117 -12.3169 18.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 19.7448 -10.9387 19.7693 H 0 0 0 0 0 0 - 18.4137 -15.7409 22.5791 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6314 -9.9767 21.1728 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0079 -13.3389 19.6825 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1150 -12.3008 21.1005 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5428 -16.8438 23.4593 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7072 -15.4188 23.5592 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1568 -16.0037 22.0896 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4605 -14.4793 25.2074 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0818 -16.0952 25.0780 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7758 -9.2606 20.0240 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6390 -10.7685 19.1451 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2544 -14.1337 22.2048 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4825 -14.7805 20.7542 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9898 -12.6833 25.6026 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9733 -8.7971 21.4417 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2679 -11.8121 25.7857 H 0 0 0 0 0 0 - 11.1429 -9.5393 22.9496 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2123 -13.2576 25.1589 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8202 -15.5886 24.3944 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3607 -13.6325 22.4239 H 0 0 0 0 0 0 - 20.5038 -16.4527 24.1624 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2011 -12.9039 20.9321 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8208 -11.9584 23.4233 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 8 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 25 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 26 2 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 44 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 46 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 21 47 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 52 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 24 49 1 0 0 0 - 25 50 1 0 0 0 - 26 51 1 0 0 0 -M CHG 1 11 1 -M END -> --7.58 - -$$$$ -6b - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 57 0 0 1 0 999 V2000 - 18.2326 -13.2133 21.6902 N 0 0 0 0 0 0 - 18.0295 -11.9153 21.0170 C 0 0 2 0 0 0 - 17.3649 -13.7582 22.5771 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3644 -13.1506 22.9608 O 0 0 0 0 0 0 - 16.6275 -11.7387 20.3833 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1735 -12.6139 19.6444 O 0 0 0 0 0 0 - 19.1347 -11.8556 19.9527 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6230 -15.1593 23.1645 C 0 0 2 0 0 0 - 15.9572 -10.6181 20.6810 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2327 -12.7823 20.4359 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3841 -15.9514 23.0833 N 0 3 0 0 0 0 - 18.1081 -15.0943 24.6316 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6005 -10.2793 20.2619 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5144 -13.8108 21.3000 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5371 -14.6090 24.8070 C 0 0 0 0 0 0 - 13.5525 -10.3776 21.3703 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7917 -13.3123 25.2901 C 0 0 0 0 0 0 - 12.7721 -11.5442 21.5857 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1054 -12.8312 25.4007 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7792 -11.5483 22.5905 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1850 -13.6592 25.0464 C 0 0 0 0 0 0 - 11.5701 -10.4151 23.3971 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9443 -14.9725 24.6001 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3694 -9.2730 23.2182 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6231 -15.4476 24.4787 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3447 -9.2541 22.2017 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1987 -11.1319 21.7552 H 0 0 0 0 0 0 - 18.7713 -12.1966 18.9815 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5119 -10.8469 19.8329 H 0 0 0 0 0 0 - 18.3523 -15.7097 22.5722 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4535 -9.9185 21.2309 H 0 0 0 0 0 0 - 20.7979 -13.2353 19.6198 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9390 -12.2232 21.0514 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5305 -16.8685 23.4768 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6578 -15.4670 23.5979 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1005 -16.0317 22.1180 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4346 -14.4699 25.2226 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0499 -16.0861 25.0816 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6229 -9.2395 19.9408 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2982 -10.8463 19.3811 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1305 -14.0741 22.1584 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3317 -14.7162 20.7198 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9836 -12.6796 25.5998 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2718 -11.8319 25.7737 H 0 0 0 0 0 0 - 11.1758 -12.4294 22.7620 H 0 0 0 0 0 0 - 23.1977 -13.2959 25.1364 H 0 0 0 0 0 0 - 22.7761 -15.6154 24.3500 H 0 0 0 0 0 0 - 12.1866 -7.9177 24.2734 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.4503 -16.4525 24.1211 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9540 -8.3729 22.0762 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8148 -10.4350 24.1703 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9870 -12.8115 20.7791 C 0 0 0 0 0 0 - 12.2300 -13.5615 21.0116 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9422 -12.6183 19.7085 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9602 -13.2416 21.0165 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 8 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 25 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 26 2 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 52 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 44 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 45 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 21 46 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 51 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 47 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 24 48 1 0 0 0 - 25 49 1 0 0 0 - 26 50 1 0 0 0 - 52 53 1 0 0 0 - 52 54 1 0 0 0 - 52 55 1 0 0 0 -M CHG 1 11 1 -M END -> --8.89 - -$$$$ -6e - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 54 0 0 1 0 999 V2000 - 18.2497 -13.2104 21.6962 N 0 0 0 0 0 0 - 18.0488 -11.9126 21.0217 C 0 0 2 0 0 0 - 17.3792 -13.7553 22.5811 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3817 -13.1440 22.9691 O 0 0 0 0 0 0 - 16.6479 -11.7402 20.3852 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1896 -12.6294 19.6672 O 0 0 0 0 0 0 - 19.1544 -11.8553 19.9573 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6313 -15.1609 23.1609 C 0 0 2 0 0 0 - 15.9835 -10.6080 20.6535 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2512 -12.7816 20.4429 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3889 -15.9469 23.0741 N 0 3 0 0 0 0 - 18.1164 -15.1072 24.6285 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6257 -10.2861 20.2180 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5309 -13.8096 21.3059 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5409 -14.6106 24.8076 C 0 0 0 0 0 0 - 13.5701 -10.3803 21.3113 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6348 -15.4379 24.4770 C 0 0 0 0 0 0 - 12.7537 -11.5266 21.4406 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9515 -14.9527 24.6066 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7654 -11.5815 22.4439 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1796 -13.6411 25.0642 C 0 0 0 0 0 0 - 11.5676 -10.4862 23.3077 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0922 -12.8253 25.4224 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3755 -9.3399 23.1820 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7830 -13.3164 25.3030 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3727 -9.2906 22.1874 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2159 -11.1277 21.7585 H 0 0 0 0 0 0 - 18.7909 -12.1998 18.9874 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5318 -10.8473 19.8328 H 0 0 0 0 0 0 - 18.3588 -15.7104 22.5659 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4831 -9.8962 21.1854 H 0 0 0 0 0 0 - 20.8176 -13.2352 19.6279 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9566 -12.2225 21.0594 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5312 -16.8677 23.4605 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6642 -15.4635 23.5916 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1051 -16.0186 22.1081 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4379 -14.4943 25.2258 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0667 -16.1041 25.0680 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6345 -9.2506 19.8866 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3280 -10.8826 19.3533 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1464 -14.0746 22.1639 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3469 -14.7139 20.7244 H 0 0 0 0 0 0 - 20.4719 -16.4432 24.1160 H 0 0 0 0 0 0 - 12.8930 -12.5678 20.5872 F 0 0 0 0 0 0 - 22.7897 -15.5863 24.3539 H 0 0 0 0 0 0 - 11.1484 -12.4637 22.5428 H 0 0 0 0 0 0 - 23.1887 -13.2680 25.1534 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2485 -11.8254 25.7984 H 0 0 0 0 0 0 - 12.1698 -8.0089 24.2632 Cl 0 0 0 0 0 0 - 18.9680 -12.6934 25.6145 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9932 -8.4120 22.1036 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8009 -10.5310 24.0689 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 8 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 25 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 26 2 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 44 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 46 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 21 47 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 52 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 24 49 1 0 0 0 - 25 50 1 0 0 0 - 26 51 1 0 0 0 -M CHG 1 11 1 -M END -> --8.91 - -$$$$ -1c - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 54 0 0 1 0 999 V2000 - 18.2567 -13.2370 21.7047 N 0 0 0 0 0 0 - 18.0563 -11.9400 21.0292 C 0 0 2 0 0 0 - 17.3896 -13.7779 22.5952 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3917 -13.1666 22.9805 O 0 0 0 0 0 0 - 16.6512 -11.7486 20.4074 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1521 -12.6411 19.7201 O 0 0 0 0 0 0 - 19.1524 -11.8879 19.9553 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6454 -15.1784 23.1855 C 0 0 2 0 0 0 - 16.0303 -10.5893 20.6541 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2529 -12.8095 20.4423 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4042 -15.9674 23.1089 N 0 3 0 0 0 0 - 18.1324 -15.1110 24.6516 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6909 -10.2121 20.2216 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5366 -13.8367 21.3109 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5574 -14.6140 24.8234 C 0 0 0 0 0 0 - 13.6305 -10.3468 21.3020 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8009 -13.3110 25.2946 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8881 -11.5388 21.4361 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1106 -12.8184 25.4002 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8799 -11.6379 22.4174 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1968 -13.6402 25.0518 C 0 0 0 0 0 0 - 11.6148 -10.5494 23.2729 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9671 -14.9595 24.6177 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3735 -9.3681 23.1621 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6499 -15.4468 24.5018 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3715 -9.2675 22.1733 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2374 -11.1573 21.7653 H 0 0 0 0 0 0 - 18.7803 -12.2424 18.9923 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5264 -10.8796 19.8178 H 0 0 0 0 0 0 - 18.3731 -15.7311 22.5934 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5517 -9.8879 21.1798 H 0 0 0 0 0 0 - 20.8191 -13.2644 19.6280 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9575 -12.2457 21.0555 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5487 -16.8835 23.5056 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6795 -15.4794 23.6220 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1194 -16.0508 22.1442 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4555 -14.4917 25.2441 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0825 -16.1035 25.1011 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7289 -9.1614 19.9406 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3887 -10.7636 19.3291 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1554 -14.0995 22.1675 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3507 -14.7429 20.7328 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9872 -12.6824 25.5984 H 0 0 0 0 0 0 - 13.0911 -12.3786 20.7858 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2684 -11.8147 25.7648 H 0 0 0 0 0 0 - 11.3106 -12.5518 22.5207 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2064 -13.2675 25.1372 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8043 -15.5975 24.3729 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0950 -7.9251 24.3750 Br 0 0 0 0 0 0 - 20.4851 -16.4562 24.1532 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9534 -8.3622 22.1014 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8447 -10.6298 24.0277 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 14 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 8 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 25 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 26 2 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 44 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 46 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 21 47 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 52 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 24 49 1 0 0 0 - 25 50 1 0 0 0 - 26 51 1 0 0 0 -M CHG 1 11 1 -M END -> --8.56 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/Tyk2_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/Tyk2_ligands.sdf deleted file mode 100755 index bae31c9b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/Tyk2_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,1356 +0,0 @@ -ejm_31 - 3D - Structure written by MMmdl. - 32 33 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2319 30.8471 -31.0310 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -7.3054 30.9413 -31.1624 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -5.7229 31.5232 -31.7179 H 0 0 0 0 0 0 - -5.9579 31.1937 -30.0346 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 21 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 20 32 1 0 0 0 -M END -> --9.54 - -$$$$ -jmc_30 - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2319 30.8471 -31.0310 C 0 0 1 0 0 0 - -5.5787 31.7462 -29.9763 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3636 32.0236 -31.4653 C 0 0 1 0 0 0 - -4.0190 31.7003 -32.0462 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -7.3054 30.9413 -31.1624 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8627 32.8962 -31.8829 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3523 32.2035 -29.3584 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9174 31.1488 -29.3474 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7003 31.3832 -32.6159 N 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 34 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 26 1 0 0 0 - 23 37 3 0 0 0 -M END -> --10.94 - -$$$$ -ejm_50 - 3D - Structure written by MMmdl. - 33 34 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2319 30.8471 -31.0310 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -6.7611 31.2474 -31.8901 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8876 30.8681 -30.1605 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4617 32.7685 -30.5367 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0874 31.8048 -30.6730 O 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 21 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 -M END -> --8.98 - -$$$$ -ejm_46 - 3D - Structure written by MMmdl. - 36 38 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2319 30.8471 -31.0310 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5787 31.7462 -29.9763 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3636 32.0236 -31.4653 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3865 31.7887 -31.8874 H 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -7.3054 30.9413 -31.1624 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8627 32.8962 -31.8829 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3523 32.2035 -29.3584 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9174 31.1488 -29.3474 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 34 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 26 1 0 0 0 -M END -> --11.31 - -$$$$ -ejm_55 - 3D - Structure written by MMmdl. - 33 34 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1871 31.8542 -30.6778 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5878 32.8578 -30.8199 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9066 31.7200 -29.6331 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2503 30.8477 -31.0335 O 0 0 0 0 0 0 - -4.3149 31.7110 -31.3157 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 20 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 27 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 28 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 32 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 31 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 - 29 33 1 0 0 0 -M END -> --9.21 - -$$$$ -ejm_43 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 39 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2319 30.8471 -31.0310 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -6.9632 31.4003 -32.2181 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0894 31.7546 -30.6833 C 0 0 0 0 0 0 - -6.8876 30.8681 -30.1605 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4617 32.7685 -30.5367 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6143 31.4065 -29.7661 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3607 31.7493 -31.4939 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3052 32.4111 -31.9961 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2945 31.4242 -33.0786 H 0 0 0 0 0 0 - -7.8219 30.7680 -32.4435 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 21 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 20 32 1 0 0 0 - 22 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 31 33 1 0 0 0 - 31 34 1 0 0 0 - 31 35 1 0 0 0 -M END -> --8.26 - -$$$$ -jmc_28 - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 41 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2319 30.8471 -31.0310 C 0 0 1 0 0 0 - -5.5787 31.7462 -29.9763 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3636 32.0236 -31.4653 C 0 0 1 0 0 0 - -4.0190 31.7003 -32.0462 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -7.3054 30.9413 -31.1624 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8627 32.8962 -31.8829 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3523 32.2035 -29.3584 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9174 31.1488 -29.3474 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5059 32.6244 -32.3125 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4266 31.1553 -31.3112 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1459 31.0859 -32.9375 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 34 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 26 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 -M END -> --10.98 - -$$$$ -ejm_49 - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 41 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -7.0259 33.5314 -30.6164 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2461 32.9020 -31.8526 C 0 0 0 0 0 0 - -6.8210 31.5783 -32.0524 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1757 30.8841 -31.0159 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9555 31.5134 -29.7797 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3806 32.8371 -29.5799 C 0 0 0 0 0 0 - -7.3599 34.5712 -30.4595 H 0 0 0 0 0 0 - -7.7531 33.4475 -32.6669 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9940 31.0839 -33.0235 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4486 30.9679 -28.9655 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2076 33.3315 -28.6088 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 20 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 27 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 28 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 32 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 34 1 0 0 0 - 29 35 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 36 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 37 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 2 0 0 0 - 33 38 1 0 0 0 - 34 39 1 0 0 0 -M END -> --7.75 - -$$$$ -ejm_45 - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 41 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2319 30.8471 -31.0310 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -6.7611 31.2474 -31.8901 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8876 30.8681 -30.1605 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4617 32.7685 -30.5367 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1449 31.7586 -30.6906 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0146 31.2150 -29.8569 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7999 31.5051 -31.3190 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5458 31.9321 -29.1428 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0876 30.1375 -29.5784 H 0 0 0 0 0 0 - -3.1919 32.4103 -31.5532 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7337 30.6157 -31.9888 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 21 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 35 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 36 1 0 0 0 - 34 37 1 0 0 0 - 35 38 1 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 -M END -> --9.56 - -$$$$ -ejm_44 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 42 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2319 30.8471 -31.0310 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -6.9632 31.4003 -32.2181 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0894 31.7546 -30.6833 C 0 0 0 0 0 0 - -7.1343 30.8760 -29.8331 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4617 32.7685 -30.5367 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6143 31.4065 -29.7661 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3607 31.7493 -31.4939 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3052 32.4111 -31.9961 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2945 31.4242 -33.0786 H 0 0 0 0 0 0 - -7.8219 30.7680 -32.4435 H 0 0 0 0 0 0 - -7.5101 31.8884 -29.6851 H 0 0 0 0 0 0 - -7.9724 30.1975 -29.9924 H 0 0 0 0 0 0 - -6.5770 30.5632 -28.9501 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 21 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 20 32 1 0 0 0 - 22 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 31 33 1 0 0 0 - 31 34 1 0 0 0 - 31 35 1 0 0 0 - 32 39 1 0 0 0 - 32 40 1 0 0 0 - 32 41 1 0 0 0 -M END -> --7.42 - -$$$$ -jmc_27 - 3D - Structure written by MMmdl. - 36 38 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2319 30.8471 -31.0310 C 0 0 1 0 0 0 - -5.5787 31.7462 -29.9763 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3636 32.0236 -31.4653 C 0 0 1 0 0 0 - -3.7545 31.6367 -32.1604 Cl 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -7.3054 30.9413 -31.1624 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8627 32.8962 -31.8829 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3523 32.2035 -29.3584 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9174 31.1488 -29.3474 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 34 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 26 1 0 0 0 -M END -> -2 - -> --11.28 - -$$$$ -ejm_48 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 44 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -7.2836 30.9672 -31.1542 H 0 0 0 0 0 0 - -6.1757 30.8841 -31.0159 C 0 0 0 0 0 0 - -5.7758 31.3307 -29.6033 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4024 31.9768 -29.7974 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5846 32.7530 -31.1037 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4197 31.8126 -31.9835 C 0 0 0 0 0 0 - -5.7582 30.4902 -28.8683 H 0 0 0 0 0 0 - -6.4960 32.1001 -29.2320 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1038 32.6292 -28.9417 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6249 31.1857 -29.9296 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1602 33.6882 -30.8978 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6133 33.0421 -31.5729 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7457 31.2109 -32.6405 H 0 0 0 0 0 0 - -6.1117 32.3846 -32.6475 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 20 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 27 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 28 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 30 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 34 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 35 1 0 0 0 - 31 36 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 37 1 0 0 0 - 32 38 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 39 1 0 0 0 - 33 40 1 0 0 0 - 34 41 1 0 0 0 - 34 42 1 0 0 0 -M END -> --9 - -$$$$ -ejm_47 - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 41 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2070 30.8552 -31.0259 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6712 31.4766 -29.7311 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5282 32.0864 -30.5505 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3815 31.8833 -31.8076 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3587 32.2529 -29.3152 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3503 30.7399 -28.9565 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2966 33.1512 -30.3093 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6135 31.4450 -30.5483 H 0 0 0 0 0 0 - -5.9737 32.7930 -32.0718 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8299 31.4702 -32.6855 H 0 0 0 0 0 0 - -7.2836 30.9672 -31.1542 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 20 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 27 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 28 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 - 29 39 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 33 1 0 0 0 - 30 34 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 35 1 0 0 0 - 31 36 1 0 0 0 - 32 37 1 0 0 0 - 32 38 1 0 0 0 -M END -> --9.7 - -$$$$ -jmc_23 - 3D - Structure written by MMmdl. - 36 38 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2319 30.8471 -31.0310 C 0 0 1 0 0 0 - -5.5787 31.7462 -29.9763 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3636 32.0236 -31.4653 C 0 0 1 0 0 0 - -4.1127 31.7229 -32.0057 F 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -7.3054 30.9413 -31.1624 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8627 32.8962 -31.8829 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3523 32.2035 -29.3584 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9174 31.1488 -29.3474 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 34 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 26 1 0 0 0 -M END -> --11.7 - -$$$$ -ejm_42 - 3D - Structure written by MMmdl. - 35 36 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2319 30.8471 -31.0310 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -6.7611 31.2474 -31.8901 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0894 31.7546 -30.6833 C 0 0 0 0 0 0 - -6.8876 30.8681 -30.1605 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4617 32.7685 -30.5367 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6143 31.4065 -29.7661 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3607 31.7493 -31.4939 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 21 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 20 32 1 0 0 0 - 31 33 1 0 0 0 - 31 34 1 0 0 0 - 31 35 1 0 0 0 -M END -> --9.78 - -$$$$ -ejm_54 - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 38 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9612 21.5502 -27.3300 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2942 22.4120 -28.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9550 22.9520 -29.2938 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2998 22.6223 -29.5426 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 21.7588 -28.6534 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2917 21.2292 -27.5624 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6403 21.3533 -28.9190 Cl 0 0 0 0 0 0 - -4.0401 23.1522 -30.7110 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2265 22.4198 -31.6685 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5133 24.4119 -30.6476 N 0 0 0 0 0 0 - -5.2869 25.1112 -31.5800 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9620 24.5479 -32.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7806 25.3609 -33.4589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9234 26.6542 -33.1828 N 0 0 0 0 0 0 - -6.2984 27.2317 -32.1577 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5070 26.4571 -31.3066 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5391 28.5828 -31.8838 N 0 0 0 0 0 0 - -5.7134 29.4445 -31.2331 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6156 29.1218 -30.8098 O 0 0 0 0 0 0 - -1.1124 24.0506 -30.3318 Cl 0 0 0 0 0 0 - -1.4436 21.1321 -26.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2591 22.6635 -28.0157 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8111 20.5610 -26.8909 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3168 24.9848 -29.8393 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8400 23.4993 -32.9094 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3119 24.9439 -34.3018 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0645 26.9093 -30.4313 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4045 29.0126 -32.1802 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1871 31.8542 -30.6778 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5878 32.8578 -30.8199 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9066 31.7200 -29.6331 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9781 31.6716 -31.5468 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1554 30.8245 -31.0242 N 0 0 0 0 0 0 - -7.1324 31.0619 -31.1205 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5766 30.6681 -31.4054 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2573 31.8068 -32.5917 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2207 32.4070 -31.2756 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 20 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 24 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 26 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 16 27 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 28 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 33 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 31 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 - 29 33 1 0 0 0 - 32 35 1 0 0 0 - 32 36 1 0 0 0 - 32 37 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 -M END -> --10.53 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/cdk8_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/cdk8_ligands.sdf deleted file mode 100755 index d3ce7932..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/cdk8_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,3692 +0,0 @@ -43 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3694 12.3608 -12.0100 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5170 11.8053 -10.7333 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7298 10.5799 -13.0278 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9915 11.7687 -13.1228 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8213 10.0100 -11.7550 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2397 10.6196 -10.6003 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6092 9.7471 -9.5124 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2773 8.7308 -9.9855 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4143 8.8607 -11.2979 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3268 9.8907 -8.0257 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3565 13.7183 -11.5055 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5483 13.6363 -12.1897 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9477 14.5322 -12.9368 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9513 10.4999 -7.7281 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8738 11.7695 -7.1531 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6094 12.3134 -6.9136 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4376 11.5622 -7.2444 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5099 10.2841 -7.8101 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7961 9.7769 -8.0457 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0914 13.5427 -6.3707 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7880 13.5314 -6.3772 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3819 12.3721 -6.8788 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9505 12.1058 -6.9728 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7111 12.5665 -10.8449 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2188 12.9372 -10.9792 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1852 14.4611 -10.9536 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5089 14.9092 -11.5986 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7019 12.4742 -12.1199 F 0 0 0 0 0 0 - -1.4726 12.4435 -9.9943 F 0 0 0 0 0 0 - -6.0887 12.2893 -9.8700 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1938 10.1290 -13.8927 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8742 12.2301 -14.0952 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9091 8.1541 -11.8345 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0898 10.5513 -7.6049 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4625 8.9415 -7.5064 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7657 12.3184 -6.9082 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6226 9.7123 -8.0525 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9028 8.7968 -8.4854 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6421 14.3891 -5.9955 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3702 12.9568 -6.6055 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6665 11.9284 -8.0015 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7037 11.2249 -6.3851 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9410 12.5478 -9.7815 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8926 11.6034 -11.3224 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1199 14.8153 -9.9199 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3204 14.8723 -11.4772 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3224 15.2093 -12.6316 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9605 15.7276 -11.0393 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 27 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 25 29 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 -M END -> -43 - -> -0.002 - -$$$$ -17 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 44 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3808 12.3686 -12.0119 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5112 11.8116 -10.7365 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7301 10.5824 -13.0300 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9992 11.7782 -13.1263 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8250 10.0166 -11.7542 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2407 10.6266 -10.6010 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6094 9.7513 -9.5103 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2849 8.7404 -9.9846 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4192 8.8674 -11.2983 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3225 9.8872 -8.0242 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3834 13.6199 -11.4933 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4237 14.7282 -11.5789 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5369 13.6139 -12.1980 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8771 14.5161 -12.9653 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9516 10.5005 -7.7272 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8803 11.7722 -7.1539 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6129 12.3159 -6.9118 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4418 11.5625 -7.2429 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5059 10.2842 -7.8062 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7935 9.7780 -8.0417 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0936 13.5458 -6.3664 N 0 0 0 0 0 0 - -2.7885 13.5288 -6.3742 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3831 12.3683 -6.8823 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0562 12.2861 -9.8790 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1818 10.1228 -13.8979 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8754 12.2375 -14.0963 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9135 8.1599 -11.8328 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0847 10.5486 -7.6052 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4513 8.9399 -7.4976 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1150 12.8057 -10.9566 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8208 14.7394 -10.6724 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8878 15.7111 -11.6718 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7196 14.6037 -12.4046 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7772 12.3192 -6.9132 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6153 9.7128 -8.0447 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8994 8.7979 -8.4799 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3694 12.0252 -7.0275 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0479 14.6272 -5.8866 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4767 15.4758 -5.5103 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6764 14.9519 -6.7159 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6761 14.2304 -5.0891 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 27 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 28 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 38 40 1 0 0 0 - 38 41 1 0 0 0 -M END -> -17 - -> -0.28 - -$$$$ -28 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 55 0 0 1 0 999 V2000 - -6.4084 12.3297 -11.9887 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5165 11.7544 -10.7314 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7418 10.5517 -13.0215 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0245 11.7463 -13.1093 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8268 9.9859 -11.7428 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2396 10.5800 -10.6042 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6095 9.7151 -9.5092 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2849 8.7010 -9.9773 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4373 8.8403 -11.2922 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3311 9.8727 -8.0225 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6734 13.4955 -12.1182 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9616 10.4819 -7.7358 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8034 9.7678 -8.0459 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5615 10.3255 -7.7934 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4526 11.6006 -7.2315 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6161 12.3136 -6.9153 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8662 11.7565 -7.1617 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1079 12.1894 -6.9634 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7834 13.4363 -6.4469 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4443 13.4911 -6.3955 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1636 12.4174 -6.8067 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8107 11.6018 -7.1804 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3735 14.6113 -5.9298 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8857 14.5071 -13.1620 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6042 14.8313 -13.9092 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6374 15.2080 -12.9343 O 0 0 0 0 0 0 - -3.2854 14.1223 -12.1198 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5109 13.8217 -11.2574 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0682 12.2161 -9.8713 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2010 10.1101 -13.8868 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9267 12.2174 -14.0767 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9595 8.1575 -11.8226 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0925 10.5250 -7.5864 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4209 8.9193 -7.5085 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8800 8.7854 -8.4838 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6672 9.7633 -8.0389 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5421 13.2992 -6.4778 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7571 12.3125 -6.9195 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3892 14.2694 -6.1271 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6149 10.6243 -7.5849 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0200 14.9384 -6.7449 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9846 14.2825 -5.0890 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2640 15.4377 -5.6195 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2295 15.4249 -12.6765 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6795 14.2190 -13.8644 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6857 15.5804 -14.6607 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3009 13.9383 -14.4740 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3629 14.3192 -11.5703 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0794 13.2286 -12.7328 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6912 14.6543 -10.5882 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2185 12.9480 -10.6599 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 25 47 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 28 51 1 0 0 0 -M END -> -28 - -> -30 - -$$$$ -22 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3943 12.3306 -11.9839 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5449 11.7624 -10.7224 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7389 10.5318 -13.0493 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9892 11.7416 -13.1218 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8445 9.9757 -11.7834 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2758 10.5697 -10.6136 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6401 9.7111 -9.5254 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3075 8.6850 -10.0132 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4539 8.8245 -11.3160 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3472 9.8680 -8.0446 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5569 13.6094 -12.1739 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9691 10.4796 -7.7443 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8622 11.7497 -7.1624 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6000 12.2988 -6.9070 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4496 11.5829 -7.2293 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5554 10.3089 -7.8035 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8209 9.7667 -8.0554 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0956 12.1660 -6.9654 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7384 13.4130 -6.4683 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4069 13.4502 -6.4129 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1813 12.3566 -6.8171 N 0 0 0 0 0 0 - -0.7988 11.5478 -7.1867 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4282 14.5550 -5.9664 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7714 14.2106 -11.2027 N 0 0 0 0 0 0 - -4.2061 15.2849 -11.7862 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6883 15.3268 -13.0997 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5027 14.2765 -13.3098 N 0 0 0 0 0 0 - -4.5364 13.8232 -9.7989 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1220 12.1694 -9.8642 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1658 10.0922 -13.9365 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8689 12.2077 -14.0813 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9525 8.1221 -11.8662 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4314 8.9174 -7.5157 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0944 10.5330 -7.6015 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7507 12.3127 -6.9154 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5195 13.2804 -6.4580 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6726 9.7529 -8.0470 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8924 8.7835 -8.5028 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3320 14.2647 -6.1602 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6146 10.5716 -7.5810 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0432 14.2275 -5.1327 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1881 15.4011 -5.6571 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0785 14.8647 -6.7815 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5385 15.9338 -11.2484 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4386 16.0565 -13.8570 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0519 14.6585 -9.2909 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8437 12.9692 -9.7547 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4214 13.7994 -9.1880 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 27 2 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 28 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 -M END -> -22 - -> -0.032 - -$$$$ -16 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3886 12.3706 -12.0044 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5217 11.8105 -10.7338 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7267 10.5778 -13.0331 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9997 11.7772 -13.1264 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8245 10.0105 -11.7588 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2447 10.6240 -10.5997 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6157 9.7479 -9.5130 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2818 8.7335 -9.9900 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4155 8.8614 -11.3010 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3377 9.8874 -8.0251 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4115 13.6449 -11.4457 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4644 14.7678 -11.5034 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5490 13.6243 -12.1808 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8784 14.5204 -12.9613 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9596 10.4818 -7.7362 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8460 11.7538 -7.1602 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5819 12.3007 -6.9160 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4335 11.5746 -7.2403 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5461 10.3067 -7.8068 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8068 9.7600 -8.0558 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4568 13.6807 -6.3006 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0743 12.2887 -9.8728 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1728 10.1132 -13.9065 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8713 12.2373 -14.0952 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9100 8.1539 -11.8356 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0973 10.5468 -7.6004 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4473 8.9276 -7.5184 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1460 12.8361 -10.8988 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4475 14.4022 -11.3420 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6702 15.4633 -10.6915 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4486 15.3231 -12.4449 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7333 12.3169 -6.9116 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4555 11.9950 -7.0528 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6550 9.7463 -8.0534 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8912 8.7783 -8.5004 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4890 14.4469 -7.0749 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5248 13.7811 -5.7425 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2684 13.8625 -5.5988 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 4 24 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 33 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 34 1 0 0 0 - 20 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 -M END -> -16 - -> -0.17 - -$$$$ -30 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3720 12.3564 -12.0094 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5328 11.8103 -10.7336 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7318 10.5755 -13.0290 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9898 11.7633 -13.1279 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8210 10.0065 -11.7558 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2477 10.6184 -10.6026 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6140 9.7458 -9.5136 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2690 8.7218 -9.9879 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4092 8.8538 -11.2990 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3381 9.8926 -8.0280 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3458 13.7121 -11.5140 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5478 13.6364 -12.1864 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9572 14.5395 -12.9136 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9581 10.4851 -7.7363 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8068 9.7633 -8.0566 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5506 10.3101 -7.8085 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4405 11.5856 -7.2383 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5911 12.3019 -6.9155 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8461 11.7538 -7.1583 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0993 12.1777 -6.9729 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7708 13.4214 -6.4416 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4313 13.4856 -6.3949 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1723 12.4145 -6.8299 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8042 11.6008 -7.2039 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3889 14.5981 -5.9187 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6987 12.5799 -10.8351 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1930 12.9387 -10.9658 C 0 0 2 0 0 0 - -2.1862 14.4653 -10.9438 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5086 14.9068 -11.5988 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6500 12.4417 -12.1854 O 0 0 0 0 0 0 - -6.1228 12.3020 -9.8704 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1946 10.1248 -13.8941 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8719 12.2188 -14.1038 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9012 8.1471 -11.8351 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1102 10.5319 -7.5935 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4404 8.9270 -7.5371 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8882 8.7805 -8.5006 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6630 9.7449 -8.0588 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5090 13.2838 -6.4768 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7306 12.3145 -6.9043 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3781 14.2464 -6.1018 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6071 10.6213 -7.6157 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2361 15.4217 -5.5765 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0353 14.9583 -6.7244 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0204 14.2664 -5.0904 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9494 12.5468 -9.7772 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8987 11.6278 -11.3169 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6028 12.5034 -10.1600 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1219 14.8241 -9.9090 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3279 14.8751 -11.4738 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3274 15.2143 -12.6293 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9689 15.7190 -11.0435 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7819 12.8449 -12.3329 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -30 - -> -0.003 - -$$$$ -21 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3865 12.3338 -12.0432 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4856 11.7841 -10.7704 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7472 10.5643 -13.0426 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0167 11.7500 -13.1460 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8303 10.0081 -11.7598 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2256 10.6149 -10.6156 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6010 9.7518 -9.5145 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2842 8.7423 -9.9828 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4323 8.8733 -11.2925 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3270 9.8938 -8.0225 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5587 13.5285 -12.2266 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9618 10.4909 -7.7327 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8582 11.7635 -7.1652 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6045 12.3140 -6.9191 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4477 11.5945 -7.2362 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5614 10.3184 -7.7958 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8112 9.7685 -8.0438 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1002 12.1716 -6.9783 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7494 13.4275 -6.4902 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4141 13.4605 -6.4332 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1744 12.3664 -6.8143 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8092 11.5630 -7.1796 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4176 14.5730 -6.0003 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4279 13.9049 -11.5130 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0090 15.0294 -12.0677 N 0 0 0 0 0 0 - -4.8449 15.3445 -13.0534 C 0 0 0 0 0 0 - -5.7816 14.4464 -13.2081 N 0 0 0 0 0 0 - -2.9003 15.7800 -11.6435 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0033 12.2571 -9.9302 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2085 10.1086 -13.9036 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9107 12.2133 -14.1195 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9502 8.1807 -11.8157 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4150 8.9297 -7.5146 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0903 10.5352 -7.5767 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7489 12.3218 -6.9239 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5244 13.2981 -6.4811 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6700 9.7533 -8.0396 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8938 8.7844 -8.4823 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3367 14.2768 -6.1925 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6184 10.5668 -7.5609 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0791 14.8637 -6.8199 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0264 14.2592 -5.1502 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1971 15.4244 -5.7161 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8953 13.4661 -10.6706 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6948 16.2656 -13.6196 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2685 16.3921 -10.8459 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6068 16.4484 -12.4038 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0360 15.1571 -11.3689 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 24 2 0 0 0 - 11 27 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 -M END -> -21 - -> -0.078 - -$$$$ -24 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3515 12.3530 -11.9813 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5085 11.7912 -10.7247 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6802 10.5716 -13.0438 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9296 11.7657 -13.1245 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7980 10.0044 -11.7669 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2328 10.6109 -10.5989 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6209 9.7375 -9.5162 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2754 8.7446 -9.9970 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4233 8.8800 -11.3218 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3328 9.8812 -8.0296 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3004 14.2773 -13.1499 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4346 15.5261 -12.8998 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5896 13.5586 -12.0343 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9706 10.4906 -7.7317 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8616 11.7632 -7.1684 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6051 12.3126 -6.9180 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4544 11.5948 -7.2294 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5626 10.3128 -7.8011 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8160 9.7710 -8.0425 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1083 12.1736 -6.9694 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7503 13.4247 -6.4858 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4131 13.4674 -6.4189 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1758 12.3735 -6.8057 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8094 11.5620 -7.1791 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4060 14.5705 -5.9896 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6528 14.0066 -14.2746 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0624 12.2581 -9.8612 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1172 10.1173 -13.9162 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8256 12.2012 -14.0958 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9432 8.1901 -11.8473 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0986 10.5389 -7.5828 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4252 8.9299 -7.5158 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1820 15.6085 -11.8419 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9911 16.4102 -13.1903 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4935 15.4841 -13.4268 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2195 13.8866 -11.1438 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7535 12.3213 -6.9230 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5307 13.2966 -6.4786 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6732 9.7534 -8.0369 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8952 8.7834 -8.4850 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3455 14.2746 -6.1808 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6187 10.5735 -7.5589 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2064 15.4259 -5.7003 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0748 14.8695 -6.8055 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0202 14.2589 -5.1325 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 -M END -> -24 - -> -0.029 - -$$$$ -38 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 56 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3676 12.3632 -12.0183 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5148 11.8066 -10.7373 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7147 10.5754 -13.0306 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9819 11.7689 -13.1253 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8143 10.0109 -11.7564 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2414 10.6177 -10.6023 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6126 9.7466 -9.5122 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2846 8.7319 -9.9810 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4146 8.8618 -11.2972 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3363 9.8918 -8.0268 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3648 13.7196 -11.5032 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5453 13.6325 -12.1937 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9402 14.5231 -12.9481 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9634 10.4852 -7.7356 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8111 9.7655 -8.0524 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5521 10.3143 -7.8018 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4442 11.5871 -7.2318 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5964 12.3037 -6.9134 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8531 11.7536 -7.1622 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1000 12.1772 -6.9659 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7711 13.4213 -6.4318 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4319 13.4866 -6.3915 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1707 12.4146 -6.8487 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8042 11.5996 -7.2054 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3852 14.5927 -5.9060 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7189 12.5724 -10.8441 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2354 12.9457 -10.9732 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1905 14.4637 -10.9533 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5123 14.9092 -11.5998 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7098 12.4700 -12.1164 F 0 0 0 0 0 0 - -1.5166 12.4356 -9.9564 F 0 0 0 0 0 0 - -6.0854 12.2873 -9.8679 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1679 10.1186 -13.8995 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8666 12.2247 -14.0971 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9103 8.1575 -11.8383 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0986 10.5466 -7.5979 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4470 8.9289 -7.5188 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8883 8.7824 -8.4957 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6652 9.7513 -8.0474 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5192 13.2882 -6.4744 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7396 12.3174 -6.9137 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3784 14.2455 -6.0873 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6046 10.6289 -7.6232 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2453 15.4154 -5.5642 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0272 14.9481 -6.7089 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0083 14.2549 -5.0808 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9411 12.5479 -9.7813 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8894 11.5999 -11.3211 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1219 14.8121 -9.9254 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3187 14.8698 -11.4768 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3209 15.2060 -12.6318 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9535 15.7329 -11.0386 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 10 37 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 27 31 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 -M END -> -38 - -> -0.005 - -$$$$ -31 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3709 12.3579 -12.0062 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5187 11.8083 -10.7296 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7194 10.5704 -13.0321 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9838 11.7645 -13.1240 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8186 10.0073 -11.7576 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2434 10.6206 -10.5991 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6160 9.7494 -9.5117 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2808 8.7336 -9.9894 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4141 8.8594 -11.3008 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3385 9.8886 -8.0248 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3631 13.7190 -11.4993 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5500 13.6364 -12.1907 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9462 14.5251 -12.9474 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9607 10.4852 -7.7356 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8097 9.7639 -8.0527 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5522 10.3124 -7.8024 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4444 11.5885 -7.2376 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5952 12.3052 -6.9174 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8509 11.7557 -7.1626 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1000 12.1783 -6.9759 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7654 13.4353 -6.4786 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4305 13.4892 -6.4172 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1699 12.4025 -6.8093 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8029 11.5856 -7.1770 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3883 14.6074 -5.9669 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5134 14.9066 -11.6049 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2037 14.4678 -10.9376 C 0 0 1 0 0 0 - -2.2231 12.9442 -10.9826 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7200 12.5740 -10.8214 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0475 15.0410 -11.4860 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0905 12.2941 -9.8658 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1712 10.1113 -13.9056 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8587 12.2252 -14.0930 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9068 8.1511 -11.8353 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1007 10.5426 -7.5968 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4435 8.9253 -7.5227 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8934 8.7808 -8.4968 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6611 9.7503 -8.0475 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5122 13.2860 -6.4777 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7378 12.3164 -6.9148 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3612 14.2786 -6.1713 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6010 10.5907 -7.5580 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2314 15.4494 -5.6631 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0518 14.9316 -6.7715 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0048 14.2986 -5.1213 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3147 15.1479 -12.6510 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9414 15.7669 -11.0946 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2172 14.7609 -9.8839 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8304 12.6225 -11.9538 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5481 12.4842 -10.2524 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9432 12.6118 -9.7567 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9036 11.5934 -11.2745 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2694 15.5207 -12.3068 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -31 - -> -0.002 - -$$$$ -41 - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 59 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3365 12.3514 -12.0169 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4737 11.7818 -10.7533 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7043 10.5771 -13.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9700 11.7706 -13.1413 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8117 10.0060 -11.7679 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2142 10.6153 -10.6085 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6079 9.7475 -9.5180 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2848 8.7450 -9.9896 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4180 8.8715 -11.3012 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3345 9.8877 -8.0248 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3847 13.7235 -11.4418 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5533 13.6485 -12.1711 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9795 14.5724 -12.8566 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9627 10.4850 -7.7364 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8552 11.7581 -7.1652 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5966 12.3060 -6.9181 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4424 11.5865 -7.2381 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5593 10.3139 -7.8013 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8122 9.7647 -8.0513 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0942 12.1662 -6.9781 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7414 13.4274 -6.4937 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4089 13.4560 -6.4321 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1814 12.3590 -6.8068 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8029 11.5527 -7.1728 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4236 14.5699 -5.9945 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7594 15.0422 -11.2114 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3424 15.0924 -11.7154 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5130 13.9202 -11.2644 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1771 12.5990 -11.6641 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6239 12.4833 -11.0641 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0203 12.2640 -9.8874 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1715 10.1187 -13.9133 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8628 12.2427 -14.1041 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9193 8.1643 -11.8362 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0961 10.5380 -7.5913 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4318 8.9209 -7.5184 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7443 12.3180 -6.9210 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5105 13.2878 -6.4761 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6670 9.7505 -8.0456 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8966 8.7819 -8.4933 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3275 14.2803 -6.2000 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6107 10.5549 -7.5458 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1867 15.4238 -5.7057 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0912 14.8675 -6.8032 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0319 14.2596 -5.1462 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6902 15.1046 -10.1315 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3521 15.8883 -11.5628 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4316 15.1240 -12.7851 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8360 16.0057 -11.4240 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2586 13.9646 -10.2112 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5771 14.0998 -11.7264 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1550 12.4998 -12.7567 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5317 11.7847 -11.3278 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5224 12.4160 -9.9808 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0278 11.5608 -11.5111 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 28 51 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 29 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 - 30 55 1 0 0 0 -M END -> -41 - -> -0.006 - -$$$$ -29 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3727 12.3493 -11.9877 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5190 11.8167 -10.7261 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6919 10.5755 -13.0077 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9476 11.7646 -13.1157 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8131 10.0080 -11.7494 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2399 10.6155 -10.5946 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6088 9.7430 -9.5107 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2764 8.7286 -9.9647 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4188 8.8758 -11.2882 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3326 9.8988 -8.0180 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4060 13.8057 -12.2007 S 0 0 0 0 0 0 - -5.9763 10.4855 -7.7248 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8692 11.7523 -7.1523 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6115 12.3005 -6.8946 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4415 11.5837 -7.2014 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5677 10.3182 -7.7642 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8209 9.7630 -8.0308 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1027 12.1584 -6.9334 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7604 13.4248 -6.4226 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4260 13.4533 -6.3925 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1594 12.3444 -6.7934 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8210 11.5507 -7.1379 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4194 14.5816 -5.9703 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4605 13.4170 -13.2280 O 0 0 0 0 0 0 - -6.3362 14.9020 -12.4291 O 0 0 0 0 0 0 - -4.5495 14.1196 -10.6911 N 0 0 0 0 0 0 - -3.3000 13.4420 -10.3686 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0717 13.9935 -11.0748 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2627 14.2439 -9.6094 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0958 12.2837 -9.8431 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1384 10.1166 -13.9015 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8216 12.2011 -14.0642 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9542 8.2051 -11.8388 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1029 10.5216 -7.5592 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4192 8.9159 -7.5103 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7593 12.3241 -6.9156 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5452 13.3016 -6.4614 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6739 9.7489 -8.0044 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8885 8.7827 -8.4653 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3647 14.2437 -6.1001 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6238 10.5910 -7.5497 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0441 14.8389 -6.8193 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0232 14.2959 -5.1361 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2125 15.4354 -5.7291 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8494 14.9008 -10.1205 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3804 12.3527 -10.1831 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2874 13.2998 -11.3738 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1931 14.8215 -11.7603 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5807 15.2116 -9.2431 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5514 13.7432 -8.9374 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 24 2 0 0 0 - 11 25 2 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 -M END -> -29 - -> -0.18 - -$$$$ -26 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3961 12.3155 -12.0234 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5478 11.7864 -10.7392 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7431 10.5278 -13.0269 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0034 11.6993 -13.1368 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8411 9.9886 -11.7443 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2672 10.6062 -10.5986 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6276 9.7408 -9.5022 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2893 8.7195 -9.9713 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4361 8.8492 -11.2847 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3404 9.8857 -8.0208 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4704 14.2158 -13.3316 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5218 15.3458 -13.0035 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5814 13.4696 -12.1774 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9630 10.4847 -7.7359 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8538 11.7563 -7.1621 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5953 12.3060 -6.9160 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4449 11.5852 -7.2379 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5560 10.3115 -7.8043 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8130 9.7655 -8.0531 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0905 12.1634 -6.9778 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7398 13.4211 -6.5005 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4007 13.4556 -6.4362 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1858 12.3500 -6.8082 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8018 11.5473 -7.1675 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4333 14.5672 -6.0053 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0131 14.0330 -14.4162 O 0 0 0 0 0 0 - -4.6790 13.9767 -11.1295 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0830 15.2556 -11.5883 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0962 12.2658 -9.8826 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1870 10.0577 -13.8855 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8795 12.1118 -14.1147 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9222 8.1396 -11.8208 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0988 10.5399 -7.5898 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4364 8.9228 -7.5168 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9540 16.3099 -13.2674 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6823 15.2203 -13.6539 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7414 12.3166 -6.9126 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5135 13.2868 -6.4745 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6700 9.7492 -8.0515 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8944 8.7825 -8.4962 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3279 14.2814 -6.2111 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6186 10.5482 -7.5365 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0982 14.8611 -6.8185 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0414 14.2576 -5.1551 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1781 15.4224 -5.7186 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1658 14.0954 -10.1642 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8858 13.2419 -10.9644 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9931 15.3118 -11.4698 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5445 16.0482 -11.0233 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 12 28 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -26 - -> -0.036 - -$$$$ -20 - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 58 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3740 12.3524 -12.0161 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5100 11.8065 -10.7374 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7222 10.5841 -13.0265 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9887 11.7756 -13.1353 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8163 10.0177 -11.7563 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2425 10.6185 -10.6022 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6172 9.7487 -9.5090 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2846 8.7289 -9.9848 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4176 8.8659 -11.2967 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3368 9.8884 -8.0257 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4023 13.6480 -11.4578 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4623 14.7747 -11.4948 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5331 13.6158 -12.1961 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8776 14.5022 -12.9731 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9585 10.4860 -7.7354 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8494 11.7555 -7.1596 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5968 12.3068 -6.9148 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4468 11.5860 -7.2370 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5513 10.3089 -7.8057 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8090 9.7654 -8.0523 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0901 12.1669 -6.9801 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7479 13.4121 -6.4872 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3990 13.4663 -6.4328 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1869 12.3691 -6.8386 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8034 11.5628 -7.1902 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4389 14.5894 -5.9640 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5042 14.2139 -4.8744 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6302 13.6295 -5.4977 O 0 0 0 0 0 0 - 0.9501 13.1612 -3.9053 C 0 0 0 0 0 0 - 2.0179 15.4484 -4.1037 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0870 12.2815 -9.8767 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1782 10.1403 -13.8916 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8882 12.2326 -14.1065 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9139 8.1642 -11.8383 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4382 8.9312 -7.5247 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1000 10.5369 -7.5915 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1602 12.8736 -10.8739 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4435 14.3983 -11.3392 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6800 15.4678 -10.6811 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4649 15.3194 -12.4306 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7363 12.3155 -6.9060 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5225 13.2880 -6.4780 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6716 9.7462 -8.0565 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8874 8.7809 -8.4938 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3463 14.2645 -6.1724 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6294 10.5673 -7.5714 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2274 15.3656 -5.5864 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9266 15.0143 -6.8422 H 0 0 0 0 0 0 - 3.2101 13.2860 -4.8126 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6553 12.2750 -4.4689 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0795 13.5454 -3.3665 H 0 0 0 0 0 0 - 1.6833 12.8594 -3.1584 H 0 0 0 0 0 0 - 2.5210 16.1617 -4.7561 H 0 0 0 0 0 0 - 2.7337 15.1648 -3.3313 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2023 15.9748 -3.6071 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 12 39 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 41 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 43 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 25 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 45 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 - 30 55 1 0 0 0 -M END -> -20 - -> -0.016 - -$$$$ -42 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3691 12.3596 -12.0090 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5082 11.8040 -10.7325 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7289 10.5800 -13.0272 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9931 11.7723 -13.1223 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8208 10.0120 -11.7545 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2366 10.6190 -10.6002 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6071 9.7463 -9.5106 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2820 8.7349 -9.9857 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4162 8.8630 -11.2985 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3216 9.8824 -8.0245 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3612 13.7214 -11.5083 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5493 13.6373 -12.1980 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9470 14.5254 -12.9531 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9509 10.4995 -7.7283 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8798 11.7709 -7.1545 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6121 12.3149 -6.9130 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4406 11.5618 -7.2441 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5052 10.2836 -7.8087 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7939 9.7786 -8.0440 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0930 13.5444 -6.3685 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7888 13.5284 -6.3764 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3823 12.3688 -6.8823 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9528 12.1034 -6.9863 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7146 12.5761 -10.8355 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2074 12.9376 -10.9559 C 0 0 2 0 0 0 - -2.1889 14.4652 -10.9572 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5166 14.9141 -11.6000 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6730 12.4527 -12.1791 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0709 12.2831 -9.8701 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1905 10.1280 -13.8946 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8760 12.2352 -14.0903 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9104 8.1559 -11.8349 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0978 10.5174 -7.5878 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4227 8.9225 -7.5162 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7759 12.3187 -6.9121 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6149 9.7115 -8.0486 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9008 8.7994 -8.4826 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6404 14.3931 -5.9911 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3733 12.9511 -6.6100 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6843 11.9368 -8.0290 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7041 11.2248 -6.3903 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9481 12.5593 -9.7730 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8897 11.6058 -11.3143 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6065 12.4889 -10.1604 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1357 14.8163 -9.9239 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3181 14.8871 -11.4678 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3218 15.2079 -12.6331 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9608 15.7340 -11.0358 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8094 12.8612 -12.3391 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 27 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 28 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -42 - -> -0.004 - -$$$$ -35 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3895 12.3678 -12.0373 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4824 11.8098 -10.7511 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7271 10.5745 -13.0290 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0179 11.7711 -13.1287 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8170 10.0145 -11.7522 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2238 10.6236 -10.6024 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6044 9.7508 -9.5065 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2828 8.7443 -9.9813 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4172 8.8704 -11.2949 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3303 9.8854 -8.0203 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3418 13.6528 -11.7950 N 0 0 0 0 0 0 - -5.6106 13.6402 -12.2589 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1045 14.5768 -12.8828 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9605 10.4846 -7.7337 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8084 9.7674 -8.0514 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5547 10.3189 -7.8020 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4471 11.5931 -7.2348 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6026 12.3073 -6.9145 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8562 11.7556 -7.1614 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1021 12.1835 -6.9708 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7710 13.4390 -6.4702 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4354 13.4950 -6.4103 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1709 12.4112 -6.8070 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5943 -7.1763 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3771 14.6141 -5.9576 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4422 12.5360 -11.3947 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3230 13.6139 -11.4067 C 0 0 0 0 0 0 - -3.2958 14.6820 -11.9593 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7380 13.9356 -10.1565 O 0 0 0 0 0 0 - -6.0183 12.2923 -9.8986 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1782 10.1163 -13.8942 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9208 12.2371 -14.0985 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9179 8.1685 -11.8303 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0933 10.5376 -7.5920 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4329 8.9217 -7.5144 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8892 8.7843 -8.4947 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6640 9.7586 -8.0484 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5243 13.2889 -6.4732 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7461 12.3134 -6.9147 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3729 14.2791 -6.1621 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6003 10.6048 -7.5653 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2500 15.4509 -5.6516 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0339 14.9382 -6.7662 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9933 14.2991 -5.1147 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5851 12.0468 -10.4273 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4005 11.8265 -12.2289 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4937 13.3796 -12.0785 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2410 14.9062 -13.0151 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3493 15.5966 -11.3682 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0327 13.3119 -9.9644 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 -M END -> -35 - -> -0.004 - -$$$$ -44 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 50 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3932 12.3500 -12.0125 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5644 11.7828 -10.7394 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7358 10.5711 -13.0331 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9954 11.7572 -13.1322 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8242 9.9989 -11.7591 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2585 10.6059 -10.6150 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6168 9.7386 -9.5213 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2709 8.7166 -9.9884 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4108 8.8490 -11.3012 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3306 9.8912 -8.0312 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5413 13.8555 -11.3648 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5934 13.6525 -12.1835 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9232 14.4812 -13.0224 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9508 10.4991 -7.7310 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8673 11.7672 -7.1520 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6035 12.3102 -6.9134 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4392 11.5630 -7.2455 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5146 10.2834 -7.8141 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7998 9.7761 -8.0492 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0885 13.5395 -6.3720 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7847 13.5343 -6.3770 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3791 12.3751 -6.8806 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9494 12.1118 -6.9818 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7091 15.0460 -11.2252 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1570 14.3608 -9.9755 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1684 13.2423 -10.1016 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8246 13.9322 -10.0585 O 0 0 0 0 0 0 - -6.2039 12.2411 -9.8798 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2037 10.1279 -13.8914 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8803 12.2184 -14.1069 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9014 8.1446 -11.8359 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1132 10.5144 -7.5862 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4298 8.9292 -7.5318 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7510 12.3165 -6.9042 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6383 9.7136 -8.0589 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9045 8.7930 -8.4905 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6440 14.3809 -6.0010 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3673 12.9607 -6.6056 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6856 11.9435 -8.0238 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7046 11.2327 -6.3874 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9665 15.3166 -11.9738 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4384 15.8239 -11.0314 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2969 14.9531 -9.0651 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0216 13.4609 -9.4801 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7904 12.2246 -10.0500 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7501 13.4251 -10.8742 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 -M END -> -44 - -> -0.004 - -$$$$ -18 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 44 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3808 12.3686 -12.0119 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5112 11.8116 -10.7365 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7301 10.5824 -13.0300 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9992 11.7782 -13.1263 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8250 10.0166 -11.7542 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2407 10.6266 -10.6010 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6094 9.7513 -9.5103 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2849 8.7404 -9.9846 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4192 8.8674 -11.2983 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3225 9.8872 -8.0242 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3834 13.6199 -11.4933 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4237 14.7282 -11.5789 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5369 13.6139 -12.1980 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8771 14.5161 -12.9653 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9516 10.5005 -7.7272 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8803 11.7722 -7.1539 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6129 12.3159 -6.9118 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4418 11.5625 -7.2429 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5059 10.2842 -7.8062 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7935 9.7780 -8.0417 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0936 13.5458 -6.3664 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7885 13.5288 -6.3742 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3831 12.3683 -6.8823 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9539 12.1016 -6.9897 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0562 12.2861 -9.8790 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1818 10.1228 -13.8979 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8754 12.2375 -14.0963 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9135 8.1599 -11.8328 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0847 10.5486 -7.6052 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4513 8.9399 -7.4976 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1150 12.8057 -10.9566 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8208 14.7394 -10.6724 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8878 15.7111 -11.6718 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7196 14.6037 -12.4046 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7772 12.3192 -6.9132 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6153 9.7128 -8.0447 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8994 8.7979 -8.4799 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6399 14.3943 -5.9889 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3748 12.9484 -6.6129 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6859 11.9386 -8.0328 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7035 11.2217 -6.3964 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 -M END -> -18 - -> -0.01 - -$$$$ -40 - 3D - Structure written by MMmdl. - 54 58 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3583 12.3628 -12.0152 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5007 11.8020 -10.7383 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7096 10.5772 -13.0382 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9777 11.7759 -13.1307 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8132 10.0130 -11.7619 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2338 10.6200 -10.6051 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6121 9.7513 -9.5135 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2831 8.7414 -9.9888 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4159 8.8683 -11.3018 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3364 9.8882 -8.0249 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3745 13.7307 -11.4480 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5401 13.6479 -12.1823 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9305 14.5456 -12.9289 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9622 10.4857 -7.7364 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8106 9.7658 -8.0516 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5548 10.3163 -7.8015 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4456 11.5910 -7.2371 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5995 12.3069 -6.9174 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8550 11.7570 -7.1647 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1008 12.1810 -6.9758 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7660 13.4388 -6.4773 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4314 13.4905 -6.4174 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1713 12.4042 -6.8124 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5879 -7.1791 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3850 14.6084 -5.9658 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6973 12.5089 -10.9175 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2248 12.4637 -11.4426 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4987 13.7622 -11.0653 N 0 0 0 0 0 0 - -2.2038 14.9363 -11.7527 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6757 15.0331 -11.3164 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0576 12.2794 -9.8741 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1618 10.1180 -13.9096 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8627 12.2402 -14.0994 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9144 8.1615 -11.8374 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0961 10.5439 -7.5948 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4395 8.9258 -7.5160 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8927 8.7818 -8.4930 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6634 9.7542 -8.0449 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5193 13.2884 -6.4757 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7435 12.3170 -6.9183 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3645 14.2802 -6.1683 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6001 10.5957 -7.5620 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2377 15.4493 -5.6626 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0462 14.9289 -6.7713 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9992 14.2960 -5.1216 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1358 11.5686 -11.2816 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6934 12.5388 -9.8270 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1213 12.3537 -12.5312 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6337 11.6737 -10.9669 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5199 13.7316 -11.3435 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1273 14.7832 -12.8186 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6221 15.8316 -11.5127 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1533 15.8523 -11.8646 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6812 15.2813 -10.2566 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 - 30 54 1 0 0 0 -M END -> -40 - -> -0.007 - -$$$$ -19 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3863 12.3686 -12.0106 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5303 11.8179 -10.7351 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7274 10.5747 -13.0322 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9939 11.7717 -13.1290 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8233 10.0108 -11.7572 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2504 10.6246 -10.6026 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6148 9.7488 -9.5126 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2772 8.7301 -9.9866 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4133 8.8585 -11.2996 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3367 9.8906 -8.0265 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3739 13.6178 -11.5022 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4056 14.7196 -11.5963 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5407 13.6198 -12.1903 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8948 14.5296 -12.9394 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9610 10.4852 -7.7361 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8098 9.7648 -8.0558 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5520 10.3132 -7.8064 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4430 11.5871 -7.2363 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5944 12.3027 -6.9144 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8504 11.7539 -7.1603 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0991 12.1752 -6.9687 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7663 13.4191 -6.4362 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4291 13.4776 -6.3870 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1723 12.4029 -6.8190 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8029 11.5945 -7.2007 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3904 14.5868 -5.9117 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0929 12.2989 -9.8733 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1755 10.1118 -13.9031 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8667 12.2221 -14.1016 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9059 8.1512 -11.8355 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1020 10.5408 -7.5966 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4436 8.9262 -7.5252 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1038 12.8034 -10.9679 H 0 0 0 0 0 0 - -2.8050 14.7371 -10.6877 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8600 15.7058 -11.7050 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7006 14.5748 -12.4189 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8910 8.7823 -8.5005 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6630 9.7506 -8.0539 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5131 13.2839 -6.4722 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7367 12.3149 -6.9092 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3680 14.2475 -6.0985 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6030 10.6174 -7.6170 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2329 15.4126 -5.5710 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0372 14.9418 -6.7159 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0194 14.2522 -5.0866 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 25 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 26 43 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 -M END -> -19 - -> -0.015 - -$$$$ -33 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3918 12.3765 -12.0158 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5335 11.8201 -10.7317 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7273 10.5795 -13.0319 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0082 11.7773 -13.1176 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8294 10.0116 -11.7546 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2533 10.6299 -10.5984 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6133 9.7501 -9.5115 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2802 8.7340 -9.9853 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4149 8.8602 -11.2994 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3368 9.8898 -8.0240 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3580 13.5891 -11.5451 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5327 13.6029 -12.2131 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8791 14.5089 -12.9726 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9622 10.4818 -7.7351 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8525 11.7570 -7.1642 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5920 12.3049 -6.9193 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4386 11.5825 -7.2408 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5579 10.3128 -7.8038 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8126 9.7642 -8.0521 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0919 12.1643 -6.9829 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7362 13.4287 -6.5051 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4017 13.4552 -6.4435 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1850 12.3496 -6.8156 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8078 11.5460 -7.1722 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4351 14.5688 -6.0125 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3172 14.5865 -11.7755 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8924 14.0513 -11.7355 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3932 14.9579 -10.6450 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0761 12.2984 -9.8711 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1698 10.1086 -13.9039 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8733 12.2288 -14.0942 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9079 8.1545 -11.8361 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0997 10.5389 -7.5945 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4394 8.9219 -7.5215 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1267 12.7910 -10.9599 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7395 12.3169 -6.9150 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5095 13.2881 -6.4791 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6661 9.7465 -8.0484 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8936 8.7803 -8.4947 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3246 14.2793 -6.2163 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6152 10.5460 -7.5374 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1734 15.4251 -5.7269 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1032 14.8639 -6.8228 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0431 14.2630 -5.1616 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5076 15.3404 -12.5551 H 0 0 0 0 0 0 - -1.1365 14.4228 -12.4281 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7094 13.0055 -11.4933 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5847 14.5469 -9.6579 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9864 15.9623 -10.6317 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 28 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -33 - -> -0.008 - -$$$$ -27 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 56 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3855 12.3606 -12.0031 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5214 11.8004 -10.7171 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6991 10.5797 -13.0384 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9626 11.7779 -13.1031 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8238 10.0198 -11.7523 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2557 10.6213 -10.5956 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6268 9.7501 -9.5073 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3057 8.7491 -9.9816 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4330 8.8776 -11.2917 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3352 9.8817 -8.0196 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6205 13.5372 -12.2095 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9727 10.4835 -7.7324 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8611 11.7523 -7.1657 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5946 12.2988 -6.9068 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4432 11.5806 -7.2147 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5570 10.3109 -7.7899 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8253 9.7663 -8.0483 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0926 12.1556 -6.9444 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7338 13.4204 -6.4594 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4064 13.4584 -6.4114 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1793 12.3493 -6.7865 N 0 0 0 0 0 0 - -0.7954 11.5387 -7.1512 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4205 14.5767 -6.0073 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6894 13.8945 -11.1046 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7822 15.1171 -11.3990 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3310 14.9579 -11.2532 N 0 0 0 0 0 0 - -1.8099 14.4326 -10.1320 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5019 14.0442 -9.2076 O 0 0 0 0 0 0 - -0.2869 14.3494 -10.0364 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0445 12.2494 -9.8378 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1252 10.1075 -13.9125 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8195 12.2403 -14.0555 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9253 8.1691 -11.8449 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0887 10.5401 -7.5861 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4260 8.9087 -7.5002 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3500 13.7423 -13.1711 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7538 12.3208 -6.9277 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5110 13.2853 -6.4615 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6704 9.7539 -8.0335 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8995 8.7870 -8.4986 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3188 14.2725 -6.1705 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5952 10.5614 -7.5429 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1976 15.4335 -5.7330 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0772 14.8589 -6.8237 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0239 14.2765 -5.1673 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0839 13.0222 -10.9241 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1507 14.0138 -10.1183 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1427 15.9632 -10.8055 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9117 15.4187 -12.3919 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7181 15.3243 -11.9869 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1612 14.8056 -10.9074 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0542 13.3103 -9.9607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.0768 14.8908 -9.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 46 1 0 0 0 - 24 47 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 48 1 0 0 0 - 25 49 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 50 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 - 29 53 1 0 0 0 -M END -> -27 - -> -0.68 - -$$$$ -13 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - -2.2088 12.9419 -10.9697 C 0 0 1 0 0 0 - -2.1904 14.4671 -10.9424 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6992 12.5876 -10.8377 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6826 12.4744 -12.1795 O 0 0 0 0 0 0 - -3.5107 14.9139 -11.6089 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3443 13.7200 -11.5243 N 0 0 0 0 0 0 - -6.3525 12.3601 -12.0338 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9727 11.7556 -13.1375 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7097 10.5633 -13.0339 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5001 11.8056 -10.7491 C 0 0 0 0 0 0 - -6.8506 12.3073 -14.3824 O 0 0 0 0 0 0 - -5.5377 13.6382 -12.2001 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9500 14.5444 -12.9177 O 0 0 0 0 0 0 - -7.2308 10.6159 -10.6131 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8083 10.0113 -11.7524 C 0 0 0 0 0 0 - -8.4200 8.8675 -11.2880 N 0 0 0 0 0 0 - -8.2847 8.7400 -9.9757 N 0 0 0 0 0 0 - -7.6047 9.7473 -9.5145 C 0 0 0 0 0 0 - -7.3264 9.8951 -8.0245 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9604 10.4805 -7.7353 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8075 9.7596 -8.0491 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4358 11.5809 -7.2415 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5835 12.3061 -6.9225 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5481 10.3107 -7.8024 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8471 11.7541 -7.1666 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4650 13.6954 -6.3241 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6125 12.4839 -10.1621 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1549 14.8184 -9.9245 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3157 14.8975 -11.4569 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9463 12.5683 -9.7744 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8737 11.6025 -11.2997 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8317 12.8970 -12.3310 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3143 15.2104 -12.6382 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9412 15.7445 -11.0416 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1761 10.1015 -13.8960 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0592 12.2786 -9.8757 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3831 11.8565 -15.0461 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9260 8.1741 -11.8308 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0952 10.5284 -7.5802 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4226 8.9158 -7.5190 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8834 8.7772 -8.4902 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4582 12.0019 -7.0535 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6526 9.7492 -8.0472 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7368 12.3185 -6.9225 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5360 14.1747 -6.6301 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5030 13.6559 -5.2327 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2731 14.3301 -6.6809 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 12 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 9 15 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 14 2 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 18 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 24 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 25 2 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 -M END -> -13 - -> -0.006 - -$$$$ -39 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3502 12.3553 -12.0171 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4935 11.7977 -10.7426 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7106 10.5751 -13.0385 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9725 11.7720 -13.1357 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8130 10.0109 -11.7654 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2309 10.6170 -10.6058 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6111 9.7517 -9.5147 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2865 8.7392 -9.9897 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4152 8.8682 -11.3006 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3373 9.8888 -8.0252 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3541 13.7129 -11.4635 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5361 13.6428 -12.1728 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9526 14.5668 -12.8773 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9623 10.4854 -7.7364 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8532 11.7571 -7.1646 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5945 12.3064 -6.9180 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4446 11.5858 -7.2382 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5555 10.3115 -7.8022 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8126 9.7649 -8.0516 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0930 12.1652 -6.9785 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7427 13.4236 -6.4970 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4061 13.4591 -6.4324 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1810 12.3567 -6.8070 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5520 -7.1701 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4260 14.5701 -5.9973 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6444 15.0059 -11.3286 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1848 14.8660 -11.7465 C 0 0 0 0 0 0 - -1.5251 13.6965 -11.2881 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2131 12.5012 -11.6333 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6517 12.4721 -11.0120 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0533 12.2782 -9.8788 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1683 10.1179 -13.9100 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8596 12.2364 -14.1027 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9137 8.1596 -11.8366 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0978 10.5418 -7.5943 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4385 8.9249 -7.5194 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7416 12.3179 -6.9181 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5106 13.2874 -6.4775 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6670 9.7484 -8.0467 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8951 8.7812 -8.4943 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3284 14.2801 -6.2040 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6137 10.5521 -7.5405 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1842 15.4249 -5.7096 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0950 14.8685 -6.8061 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0338 14.2620 -5.1464 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1459 15.8371 -11.8396 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5784 15.1813 -10.2625 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2664 14.7763 -12.8186 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5962 15.7735 -11.5993 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2364 12.3970 -12.7259 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6061 11.6676 -11.2795 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1100 11.5362 -11.3555 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5548 12.5406 -9.9299 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -39 - -> -0.004 - -$$$$ -32 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 45 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3767 12.3649 -12.0150 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5300 11.8201 -10.7355 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7235 10.5758 -13.0283 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9848 11.7731 -13.1297 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8178 10.0121 -11.7526 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2522 10.6205 -10.6098 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6101 9.7439 -9.5117 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2784 8.7249 -9.9778 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4134 8.8570 -11.2978 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3337 9.8935 -8.0288 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4165 13.6746 -11.4876 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5534 13.6276 -12.1919 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9234 14.5178 -12.9405 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9640 10.4853 -7.7356 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8116 9.7640 -8.0536 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5500 10.3127 -7.8058 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4411 11.5873 -7.2364 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5925 12.3023 -6.9174 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8510 11.7510 -7.1622 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0968 12.1763 -6.9669 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7702 13.4221 -6.4317 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4283 13.4864 -6.3849 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1730 12.4042 -6.8287 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8019 11.5974 -7.2024 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3914 14.5951 -5.9029 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0971 12.2907 -9.8695 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1793 10.1210 -13.8973 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8799 12.2200 -14.1007 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9071 8.1535 -11.8388 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1037 10.5390 -7.5949 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4435 8.9258 -7.5263 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8100 14.4821 -11.5579 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1203 12.8861 -10.9327 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8859 8.7811 -8.4956 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6665 9.7473 -8.0499 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5168 13.2894 -6.4781 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7359 12.3175 -6.9096 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3834 14.2452 -6.0920 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6064 10.6335 -7.6221 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2430 15.4167 -5.5635 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0295 14.9490 -6.7075 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0108 14.2566 -5.0798 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 29 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 25 40 1 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 -M END -> -32 - -> -0.11 - -$$$$ -37 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 56 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3714 12.3591 -12.0053 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5147 11.8055 -10.7304 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7273 10.5756 -13.0301 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9920 11.7699 -13.1223 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8210 10.0087 -11.7569 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2407 10.6185 -10.5997 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6132 9.7471 -9.5123 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2794 8.7320 -9.9893 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4144 8.8594 -11.3005 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3370 9.8875 -8.0251 C 0 0 0 0 0 0 - -4.3570 13.7205 -11.5014 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5485 13.6383 -12.1900 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9462 14.5274 -12.9449 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9602 10.4847 -7.7357 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8090 9.7649 -8.0550 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5517 10.3138 -7.8050 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4444 11.5886 -7.2367 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5954 12.3038 -6.9144 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8508 11.7543 -7.1602 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1010 12.1799 -6.9735 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7694 13.4361 -6.4722 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4342 13.4933 -6.4118 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1686 12.4094 -6.8087 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8030 11.5907 -7.1765 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3824 14.6122 -5.9578 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5015 14.9079 -11.6138 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1980 14.4648 -10.9240 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2178 12.9422 -10.9897 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7152 12.5763 -10.8194 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0843 12.2887 -9.8671 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1823 10.1184 -13.9027 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8710 12.2321 -14.0913 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9081 8.1519 -11.8353 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1025 10.5369 -7.5942 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4387 8.9228 -7.5261 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8924 8.7824 -8.5002 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6608 9.7523 -8.0520 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5130 13.2841 -6.4735 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7376 12.3146 -6.9110 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3680 14.2762 -6.1614 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5997 10.5977 -7.5606 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0415 14.9434 -6.7630 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0029 14.3010 -5.1158 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2397 15.4500 -5.6469 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3040 15.1510 -12.6593 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9447 15.7573 -11.0941 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2028 14.7688 -9.8743 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3076 14.9095 -11.3795 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8316 12.6262 -11.9647 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5512 12.4812 -10.2522 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9417 12.6132 -9.7555 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9032 11.5968 -11.2722 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 29 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 29 52 1 0 0 0 -M END -> -37 - -> -0.004 - -$$$$ -23 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3775 12.3296 -12.0018 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5098 11.7629 -10.7403 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7247 10.5660 -13.0266 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9942 11.7487 -13.1193 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8312 10.0057 -11.7538 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2443 10.6021 -10.6070 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6167 9.7449 -9.5151 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2961 8.7374 -9.9786 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4404 8.8724 -11.2937 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3318 9.8946 -8.0252 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5478 13.5112 -12.1572 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9707 10.4870 -7.7351 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8642 11.7588 -7.1694 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6019 12.3141 -6.9186 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4503 11.5963 -7.2357 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5604 10.3220 -7.8000 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8213 9.7719 -8.0443 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0996 12.1710 -6.9757 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7487 13.4240 -6.4767 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4123 13.4674 -6.4260 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1713 12.3664 -6.8217 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8093 11.5624 -7.1930 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4224 14.5657 -5.9816 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6966 14.2423 -13.2612 N 0 0 0 0 0 0 - -4.9506 15.3153 -13.5405 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9383 15.6899 -12.6782 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7261 14.9536 -11.5366 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5508 13.8769 -11.2437 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6976 15.2614 -10.7139 N 0 0 0 0 0 0 - -6.0413 12.2163 -9.8757 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1733 10.1082 -13.8992 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8809 12.2018 -14.0912 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9536 8.1815 -11.8284 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4130 8.9234 -7.5092 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0893 10.5342 -7.5733 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7528 12.3249 -6.9255 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5328 13.2988 -6.4768 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6748 9.7543 -8.0412 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8926 8.7851 -8.4839 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3413 14.2681 -6.1710 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6174 10.5819 -7.5829 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0693 14.8635 -6.8057 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0251 14.2426 -5.1445 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2033 15.4153 -5.6884 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1686 15.8110 -14.4274 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3134 16.5389 -12.9221 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3780 13.3123 -10.3528 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6917 14.8692 -9.7891 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2693 16.1577 -10.8793 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 24 2 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 -M END -> -23 - -> -0.27 - -$$$$ -15 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3730 12.3647 -12.0124 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5249 11.8167 -10.7375 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7225 10.5819 -13.0270 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9871 11.7813 -13.1320 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8205 10.0150 -11.7538 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2514 10.6217 -10.6093 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6113 9.7463 -9.5119 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2838 8.7282 -9.9768 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4166 8.8609 -11.2984 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3282 9.8959 -8.0269 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4004 13.6489 -11.4541 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4592 14.7715 -11.4916 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5363 13.6231 -12.1917 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8861 14.5056 -12.9557 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9554 10.4909 -7.7390 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8447 11.7612 -7.1661 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5697 12.3054 -6.9214 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4308 11.5801 -7.2259 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5429 10.3015 -7.8076 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8018 9.7661 -8.0596 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4352 13.5609 -6.3638 O 0 0 0 0 0 0 - -3.6839 14.5445 -7.0766 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1928 12.1397 -6.9410 O 0 0 0 0 0 0 - -1.0568 11.8071 -7.7386 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0865 12.2817 -9.8717 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1761 10.1266 -13.8989 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8862 12.2301 -14.1010 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9109 8.1585 -11.8401 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0978 10.5402 -7.5937 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4435 8.9306 -7.5162 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1544 12.8539 -10.8932 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4485 14.4035 -11.3387 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6772 15.4626 -10.6827 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4583 15.3250 -12.4323 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7296 12.3147 -6.9189 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6623 9.7270 -8.0552 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8859 8.7827 -8.5028 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6209 15.4399 -6.4624 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1459 14.7973 -8.0279 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6551 14.2645 -7.2771 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2132 12.3981 -7.3814 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2092 12.0638 -8.7945 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7777 10.7513 -7.6419 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 -M END -> -15 - -> -2.5 - -$$$$ -34 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.4024 12.3461 -12.0147 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5825 11.7781 -10.7426 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7347 10.5660 -13.0395 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9966 11.7550 -13.1361 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8265 9.9936 -11.7632 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2675 10.6024 -10.6199 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6234 9.7358 -9.5255 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2741 8.7136 -9.9910 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4130 8.8453 -11.3044 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3406 9.8933 -8.0338 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5538 13.8407 -11.3379 N 0 0 0 0 0 0 - -5.6005 13.6490 -12.1765 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9196 14.4808 -13.0199 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9590 10.4855 -7.7382 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8075 9.7636 -8.0570 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5513 10.3099 -7.8070 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4406 11.5840 -7.2355 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5915 12.3007 -6.9126 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8470 11.7538 -7.1581 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0979 12.1738 -6.9691 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7666 13.4166 -6.4372 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4273 13.4768 -6.3903 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1744 12.4049 -6.8247 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8040 11.5944 -7.2012 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3946 14.5874 -5.9129 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1104 13.1199 -10.1564 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1547 14.2611 -9.9254 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7686 15.0454 -11.0979 C 0 0 0 0 0 0 - -3.3454 14.7999 -8.7258 F 0 0 0 0 0 0 - -1.8808 13.9286 -10.0717 F 0 0 0 0 0 0 - -6.2371 12.2377 -9.8825 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1965 10.1201 -13.9011 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8777 12.2189 -14.1082 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9048 8.1432 -11.8372 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1066 10.5395 -7.5982 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4470 8.9316 -7.5331 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8888 8.7812 -8.5015 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6633 9.7451 -8.0571 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5093 13.2831 -6.4741 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7314 12.3149 -6.9053 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3717 14.2432 -6.0985 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6084 10.6151 -7.6146 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2286 15.4127 -5.5721 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0434 14.9448 -6.7174 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0235 14.2533 -5.0839 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7139 12.1065 -10.2127 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9207 13.2607 -9.4790 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5371 15.7574 -10.8202 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0553 15.4231 -11.8251 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -34 - -> -0.007 - -$$$$ -25 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3861 12.3623 -11.9697 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5480 11.8020 -10.7080 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6869 10.5726 -13.0325 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9529 11.7665 -13.1047 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8210 10.0086 -11.7556 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2636 10.6177 -10.5919 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6330 9.7421 -9.5104 C 0 0 0 0 0 0 - -8.3023 8.7332 -9.9897 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4342 8.8678 -11.3051 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3415 9.8758 -8.0215 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1211 13.8754 -11.2000 S 0 0 0 0 0 0 - -2.9188 12.5402 -11.7675 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6382 13.5428 -12.1051 N 0 0 0 0 0 0 - -5.9683 10.4827 -7.7344 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8123 9.7690 -8.0490 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5592 10.3237 -7.7969 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4543 11.5962 -7.2288 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6126 12.3085 -6.9084 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8671 11.7538 -7.1613 C 0 0 0 0 0 0 - -2.1058 12.1871 -6.9644 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7745 13.4406 -6.4637 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4394 13.4976 -6.4041 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1691 12.4146 -6.8015 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8034 11.5995 -7.1773 C 0 0 0 0 0 0 - 0.3694 14.6144 -5.9538 C 0 0 0 0 0 0 - -3.6497 15.1720 -11.6865 O 0 0 0 0 0 0 - -4.3650 13.6745 -9.7698 O 0 0 0 0 0 0 - -6.1192 12.2649 -9.8433 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1122 10.1144 -13.9155 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8144 12.2368 -14.0685 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9325 8.1663 -11.8458 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4236 8.9164 -7.5059 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0908 10.5346 -7.5820 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9692 12.6827 -11.2486 H 0 0 0 0 0 0 - -2.7669 12.6240 -12.8324 H 0 0 0 0 0 0 - -3.3306 11.5652 -11.5235 H 0 0 0 0 0 0 - -5.9058 14.2159 -12.8076 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8881 8.7864 -8.4918 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6674 9.7660 -8.0419 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5385 13.2901 -6.4661 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7582 12.3115 -6.9184 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3766 14.2799 -6.1559 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5994 10.6146 -7.5758 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9849 14.2943 -5.1133 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2624 15.4490 -5.6481 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0212 14.9347 -6.7673 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 26 2 0 0 0 - 11 27 2 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 39 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 -M END -> -25 - -> -0.073 - -$$$$ -14 - 3D - Structure written by MMmdl. - 34 35 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3887 12.3647 -12.0798 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4962 11.8202 -10.8023 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7456 10.5858 -13.0568 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0126 11.7716 -13.1776 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8340 10.0285 -11.7877 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2471 10.6293 -10.6255 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6099 9.7738 -9.5366 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2971 8.7499 -9.9997 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4324 8.8805 -11.3156 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3321 9.9039 -8.0386 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4077 13.6374 -11.5161 N 0 0 0 0 0 0 - -3.4400 14.7362 -11.5603 C 0 0 0 0 0 0 - -5.5080 13.5935 -12.2349 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8585 14.4899 -13.0509 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9274 10.4444 -7.6346 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7880 9.9988 -8.5813 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9224 11.9644 -7.3345 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0382 12.2728 -9.9607 H 0 0 0 0 0 0 - -8.2100 10.1267 -13.9275 H 0 0 0 0 0 0 - -6.9074 12.2361 -14.1520 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9323 8.1670 -11.8392 H 0 0 0 0 0 0 - -8.0901 10.5612 -7.6086 H 0 0 0 0 0 0 - -7.5048 8.9551 -7.5303 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1635 12.8367 -10.9301 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4281 14.3561 -11.4328 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6222 15.4408 -10.7497 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4529 15.2842 -12.5019 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6875 9.9831 -6.6758 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8140 10.3484 -8.2443 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8951 10.4012 -9.5779 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7479 8.9096 -8.6828 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9281 12.3070 -7.0401 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6508 12.2215 -6.5656 H 0 0 0 0 0 0 - -6.2266 12.5877 -8.1480 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 19 1 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 21 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 10 22 1 0 0 0 - 10 23 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 12 25 1 0 0 0 - 12 26 1 0 0 0 - 12 27 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 17 1 0 0 0 - 15 28 1 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 16 31 1 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 17 33 1 0 0 0 - 17 34 1 0 0 0 -M END -> -14 - -> -0.84 - -$$$$ -45 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - -6.4275 12.3453 -12.0176 C 0 0 0 0 0 0 - -6.6105 11.7832 -10.7429 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7405 10.5587 -13.0479 C 0 0 0 0 0 0 - -7.0073 11.7527 -13.1387 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8357 9.9872 -11.7695 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2848 10.5993 -10.6252 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6281 9.7307 -9.5318 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2830 8.7083 -9.9969 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4214 8.8369 -11.3125 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3299 9.8861 -8.0415 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6020 13.8371 -11.3112 N 0 0 0 0 0 0 - -5.6232 13.6419 -12.1798 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9069 14.4516 -13.0592 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9473 10.4903 -7.7303 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8632 11.7421 -7.1195 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5901 12.2560 -6.8332 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4296 11.5300 -7.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5045 10.2730 -7.8164 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7945 9.7703 -8.0537 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0643 13.4351 -6.1976 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7662 13.4536 -6.2615 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3669 12.3336 -6.8391 N 0 0 0 0 0 0 - -0.9435 12.0941 -6.9881 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0340 12.9997 -10.2404 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1550 14.1929 -9.9451 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8070 15.0441 -11.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4251 14.7437 -8.6708 O 0 0 0 0 0 0 - -4.8009 14.9943 -8.3397 C 0 0 0 0 0 0 - -6.2751 12.2510 -9.8808 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1947 10.1119 -13.9118 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8796 12.2190 -14.1080 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9146 8.1352 -11.8444 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1022 10.5167 -7.5911 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4243 8.9304 -7.5266 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7518 12.2958 -6.8714 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6233 9.7099 -8.0738 H 0 0 0 0 0 0 - -4.9015 8.7955 -8.5026 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6122 14.2555 -5.7697 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3704 12.9492 -6.6128 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6882 11.9370 -8.0353 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6930 11.2211 -6.3917 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7681 12.9512 -9.5114 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5878 12.0194 -10.4228 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0910 13.9881 -10.0141 H 0 0 0 0 0 0 - -3.1162 15.4759 -11.7546 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5864 15.7240 -10.7221 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7653 15.4448 -7.3800 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4372 14.1236 -8.2286 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3333 15.6922 -8.9422 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 -M END -> -45 - -> -0.007 - -$$$$ -36 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.3988 12.3548 -12.0167 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5634 11.7828 -10.7362 C 0 0 0 0 0 0 - -7.7338 10.5694 -13.0370 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9985 11.7556 -13.1278 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8247 9.9971 -11.7595 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2595 10.6059 -10.6156 C 0 0 0 0 0 0 - -7.6196 9.7377 -9.5218 C 0 0 0 0 0 0 - -8.2737 8.7166 -9.9897 N 0 0 0 0 0 0 - -8.4125 8.8485 -11.3029 N 0 0 0 0 0 0 - -7.3396 9.8926 -8.0318 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5445 13.8618 -11.3707 N 0 0 0 0 0 0 - -5.5979 13.6472 -12.1806 C 0 0 0 0 0 0 - -5.9190 14.4711 -13.0424 O 0 0 0 0 0 0 - -5.9590 10.4852 -7.7375 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8471 11.7541 -7.1585 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5907 12.3017 -6.9141 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4394 11.5818 -7.2374 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5527 10.3083 -7.8066 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8082 9.7633 -8.0562 C 0 0 0 0 0 0 - -2.0898 12.1596 -6.9778 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7390 13.4130 -6.4881 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3978 13.4480 -6.4305 N 0 0 0 0 0 0 - 0.1868 12.3491 -6.8198 N 0 0 0 0 0 0 - -0.8044 11.5467 -7.1770 C 0 0 0 0 0 0 - 0.4420 14.5581 -5.9859 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7035 15.0408 -11.2447 C 0 0 0 0 0 0 - -3.1688 14.3872 -9.9709 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1668 13.2516 -10.0984 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8336 13.9158 -10.0706 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8619 14.9477 -10.1504 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1975 12.2414 -9.8778 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1955 10.1215 -13.8981 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8803 12.2209 -14.1051 H 0 0 0 0 0 0 - -8.9046 8.1451 -11.8366 H 0 0 0 0 0 0 - -8.1070 10.5375 -7.5971 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4451 8.9300 -7.5335 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7321 12.3147 -6.9056 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5096 13.2839 -6.4750 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6650 9.7438 -8.0571 H 0 0 0 0 0 0 - -4.8891 8.7810 -8.5010 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3299 14.2629 -6.1859 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6250 10.5486 -7.5510 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1676 15.4074 -5.6822 H 0 0 0 0 0 0 - 1.1055 14.8718 -6.7964 H 0 0 0 0 0 0 - 1.0560 14.2422 -5.1385 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9547 15.2933 -11.9951 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4087 15.8406 -11.0592 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2749 14.9753 -9.0608 H 0 0 0 0 0 0 - -5.0117 13.4714 -9.4655 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7929 12.2315 -10.0358 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1264 14.5023 -10.2505 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8642 15.5647 -9.2515 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0194 15.5931 -11.0166 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 12 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 9 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 10 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 11 28 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 -M END -> -36 - -> -0.006 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/cmet_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/cmet_ligands.sdf deleted file mode 100755 index 4cf3751b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/cmet_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,2939 +0,0 @@ -CHEMBL3402753_200 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 24.6440 33.7566 50.5299 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1955 33.6079 51.9712 C 0 0 0 0 0 0 - 22.9269 33.1279 52.2874 C 0 0 0 0 0 0 - 22.5559 32.9819 53.6250 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4682 33.3170 54.6402 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7033 33.8055 54.3290 N 0 0 0 0 0 0 - 25.0501 33.9349 53.0237 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1953 33.0558 56.0977 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2278 33.1076 57.0532 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0151 32.7150 58.3740 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7600 32.2678 58.7755 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7005 32.2521 57.8672 C 0 0 0 0 0 0 - 20.3107 31.8110 58.3229 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9717 30.4315 57.9305 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4379 30.2705 56.6488 N 0 0 0 0 0 0 - 19.0713 29.1173 56.1871 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3100 27.9722 57.0534 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8477 28.1160 58.2858 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2087 29.4111 58.8309 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6466 29.5360 59.9757 O 0 0 0 0 0 0 - 18.4362 28.9570 54.8556 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9522 30.0911 54.1748 C 0 0 0 0 0 0 - 17.2982 29.9692 52.9506 C 0 0 0 0 0 0 - 16.8364 31.0762 52.3231 F 0 0 0 0 0 0 - 17.1097 28.7125 52.3844 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5833 27.5775 53.0396 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3892 26.3557 52.4989 F 0 0 0 0 0 0 - 18.2471 27.6988 54.2596 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9191 32.6673 56.5497 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1758 32.8594 50.2079 H 0 0 0 0 0 0 - 25.3161 34.6083 50.4144 H 0 0 0 0 0 0 - 23.7921 33.9111 49.8659 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2301 32.8651 51.5047 H 0 0 0 0 0 0 - 21.5777 32.5756 53.8360 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0426 34.3121 52.8220 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2268 33.4061 56.7732 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8331 32.7337 59.0783 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6120 31.9260 59.7898 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2103 31.9631 59.4002 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5697 32.4933 57.8958 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0659 26.9644 56.7514 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0179 27.2423 58.8982 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0622 31.0791 54.5954 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5959 28.6119 51.4403 H 0 0 0 0 0 0 - 18.5991 26.7871 54.7204 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0819 32.6371 55.8707 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 8 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 35 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 29 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 36 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 37 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 38 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 29 2 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 41 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 42 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 28 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 2 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 28 2 0 0 0 - 28 45 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL3402753_200 - -> -200 - -$$$$ -CHEMBL3402759_5.7 - 3D - Structure written by MMmdl. - 65 68 0 0 1 0 999 V2000 - 15.8252 31.3725 51.3891 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6336 31.3985 52.5609 O 0 0 0 0 0 0 - 17.1600 30.2110 53.0332 C 0 0 0 0 0 0 - 17.0411 28.9713 52.3865 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5894 27.8236 52.9554 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2507 27.8961 54.1798 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3948 29.1224 54.8472 C 0 0 0 0 0 0 - 17.8475 30.2695 54.2458 C 0 0 0 0 0 0 - 19.0486 29.2328 56.1755 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4293 30.3667 56.6722 N 0 0 0 0 0 0 - 19.9686 30.4824 57.9555 N 0 0 0 0 0 0 - 20.3331 31.8461 58.3786 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7206 32.2720 57.9089 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7963 32.2649 58.7941 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0522 32.6951 58.3785 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2472 33.0977 57.0600 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1958 33.0793 56.1281 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9239 32.6937 56.5928 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4330 33.3796 54.6769 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6802 33.7794 54.2962 N 0 0 0 0 0 0 - 24.9031 33.9133 52.9625 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9128 33.6533 51.9985 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0590 33.7624 50.6310 O 0 0 0 0 0 0 - 25.3682 33.8936 50.0961 C 0 0 0 0 0 0 - 25.2906 34.1837 48.5896 C 0 0 0 0 0 0 - 24.4426 33.2044 47.7586 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0473 31.7801 47.8070 N 0 3 0 0 0 0 - 24.2954 30.8488 48.7809 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1638 31.1328 46.4103 C 0 0 0 0 0 0 - 22.6661 33.2759 52.4938 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4069 33.1346 53.8163 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2003 29.4356 58.8239 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6470 29.5261 59.9699 O 0 0 0 0 0 0 - 19.8279 28.1599 58.2375 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2824 28.0585 57.0032 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4607 32.3773 51.1753 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9536 30.7288 51.5196 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3925 31.0382 50.5195 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5238 28.8765 51.4445 H 0 0 0 0 0 0 - 17.5001 26.8726 52.4500 H 0 0 0 0 0 0 - 18.6505 26.9777 54.5828 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9226 31.2309 54.7333 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2542 31.9744 59.4611 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5997 32.5483 57.9772 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6550 31.9262 59.8103 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8822 32.7074 59.0703 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2435 33.3963 56.7680 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0817 32.6749 55.9159 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9011 34.2229 52.6925 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9545 32.9947 50.2961 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8725 34.7261 50.5758 H 0 0 0 0 0 0 - 26.3021 34.2342 48.1833 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8764 35.1844 48.4581 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4351 33.5175 46.7129 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4051 33.1450 48.0939 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3216 31.2958 49.7746 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8287 29.9003 48.7760 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2708 30.7319 48.4224 H 0 0 0 0 0 0 - 25.7776 31.7918 45.7935 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1577 31.0240 46.0012 H 0 0 0 0 0 0 - 25.6512 30.1646 46.5354 H 0 0 0 0 0 0 - 21.8477 33.0829 51.8173 H 0 0 0 0 0 0 - 19.9866 27.2680 58.8255 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0200 27.0669 56.6661 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9970 31.8662 48.1636 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 1 37 1 0 0 0 - 1 38 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 8 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 39 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 40 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 41 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 9 1 0 0 0 - 8 42 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 43 1 0 0 0 - 12 44 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 45 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 46 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 47 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 19 1 0 0 0 - 18 48 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 31 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 49 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 30 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 50 1 0 0 0 - 24 51 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 52 1 0 0 0 - 25 53 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 54 1 0 0 0 - 26 55 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 65 1 0 0 0 - 28 56 1 0 0 0 - 28 57 1 0 0 0 - 28 58 1 0 0 0 - 29 59 1 0 0 0 - 29 60 1 0 0 0 - 29 61 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 62 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 34 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 63 1 0 0 0 - 35 64 1 0 0 0 -M CHG 1 27 1 -M END -> -CHEMBL3402759_5.7 - -> -5.7 - -$$$$ -CHEMBL3402747_3400 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 45 0 0 1 0 999 V2000 - 25.5431 34.0167 52.0099 C 0 0 0 0 0 0 - 24.4529 33.6951 52.9986 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2283 33.4386 52.6013 N 0 0 0 0 0 0 - 22.5648 33.1682 53.7948 O 0 0 0 0 0 0 - 23.5069 33.3110 54.7624 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6793 33.6555 54.2948 N 0 0 0 0 0 0 - 23.1484 32.9710 56.1722 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1344 32.9719 57.1665 C 0 0 0 0 0 0 - 23.8296 32.5724 58.4640 C 0 0 0 0 0 0 - 22.5336 32.1634 58.7765 C 0 0 0 0 0 0 - 21.5356 32.1524 57.8009 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1190 31.7033 58.1537 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8547 30.2890 57.8266 N 0 0 0 0 0 0 - 19.3939 30.0363 56.5265 N 0 0 0 0 0 0 - 19.1443 28.8364 56.1040 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3793 27.7544 57.0439 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8517 27.9868 58.2887 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1318 29.3242 58.7773 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5581 29.5291 59.9176 O 0 0 0 0 0 0 - 18.6470 28.5427 54.7422 C 0 0 0 0 0 0 - 18.9989 29.3821 53.6736 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5680 29.1037 52.3782 C 0 0 0 0 0 0 - 18.9207 29.9232 51.3580 F 0 0 0 0 0 0 - 17.7745 27.9883 52.1293 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4160 27.1433 53.1780 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6527 26.0569 52.9396 F 0 0 0 0 0 0 - 17.8499 27.4178 54.4732 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8443 32.5788 56.5052 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3046 34.9123 51.4367 H 0 0 0 0 0 0 - 25.6690 33.2106 51.2865 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5130 34.1784 52.4818 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1478 33.2695 56.9375 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5978 32.5697 59.2236 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3124 31.8481 59.7866 H 0 0 0 0 0 0 - 19.9234 31.9198 59.2077 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3994 32.3301 57.6206 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2155 26.7259 56.7598 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0350 27.1557 58.9509 H 0 0 0 0 0 0 - 19.6206 30.2537 53.8274 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4481 27.7728 51.1249 H 0 0 0 0 0 0 - 17.5620 26.7298 55.2564 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0727 32.5628 55.7483 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 28 2 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 27 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 2 0 0 0 - 27 41 1 0 0 0 - 28 42 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL3402747_3400 - -> -3400 - -$$$$ -CHEMBL3402744_300 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 44 0 0 1 0 999 V2000 - 25.1164 34.0885 51.5934 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1301 33.7369 52.5533 O 0 0 0 0 0 0 - 24.3822 33.8574 53.8672 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4212 34.3253 54.3389 O 0 0 0 0 0 0 - 23.2845 33.3698 54.5611 N 0 0 0 0 0 0 - 23.1453 33.1032 55.9319 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2134 33.1207 56.8434 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0130 32.7263 58.1651 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7541 32.3009 58.5857 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6774 32.2902 57.6945 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2905 31.8639 58.1736 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9601 30.4564 57.8723 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4739 30.2001 56.5844 N 0 0 0 0 0 0 - 19.1911 29.0032 56.1719 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4025 27.9265 57.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8697 28.1685 58.3739 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2016 29.5029 58.8403 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6427 29.7018 59.9757 O 0 0 0 0 0 0 - 18.6876 28.7180 54.8040 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8911 29.6524 53.7735 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4516 29.3961 52.4744 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6544 30.3132 51.5022 F 0 0 0 0 0 0 - 17.8112 28.1968 52.1757 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5967 27.2584 53.1819 C 0 0 0 0 0 0 - 16.9685 26.0957 52.8982 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0276 27.5199 54.4833 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8774 32.7029 56.3720 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7176 33.9666 50.5869 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9984 33.4536 51.6874 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4266 35.1259 51.7108 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4934 33.1213 53.9845 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2119 33.4073 56.5509 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8450 32.7315 58.8552 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6174 31.9774 59.6070 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1987 32.0823 59.2391 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5424 32.5108 57.7099 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2125 26.8963 56.8666 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0246 27.3442 59.0538 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4020 30.5850 53.9648 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4868 27.9916 51.1669 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8297 26.7622 55.2275 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0463 32.6822 55.6804 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 32 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 27 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 26 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 26 41 1 0 0 0 - 27 42 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL3402744_300 - -> -300 - -$$$$ -CHEMBL3402745_200 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 47 0 0 1 0 999 V2000 - 25.0527 33.1189 50.3652 C 0 0 0 0 0 0 - 25.2375 33.9564 51.6334 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2400 33.5921 52.5819 O 0 0 0 0 0 0 - 24.4282 33.8098 53.8972 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4390 34.3263 54.3763 O 0 0 0 0 0 0 - 23.3098 33.3499 54.5803 N 0 0 0 0 0 0 - 23.1429 33.1003 55.9525 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1938 33.1211 56.8848 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9667 32.7324 58.2058 C 0 0 0 0 0 0 - 22.6972 32.3172 58.6060 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6398 32.2993 57.6938 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2464 31.8624 58.1398 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9426 30.4543 57.8241 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4473 30.2067 56.5407 N 0 0 0 0 0 0 - 19.1631 29.0149 56.1226 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4188 27.9275 57.0571 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9112 28.1569 58.2948 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2164 29.4915 58.7783 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6462 29.6922 59.9173 O 0 0 0 0 0 0 - 18.5969 28.7490 54.7746 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6632 29.7346 53.7733 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1274 29.5090 52.5051 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1820 30.4830 51.5669 F 0 0 0 0 0 0 - 17.5325 28.2870 52.2075 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4615 27.2957 53.1803 C 0 0 0 0 0 0 - 16.8723 26.1122 52.8989 F 0 0 0 0 0 0 - 17.9871 27.5251 54.4501 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8673 32.7053 56.3737 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8043 33.3794 49.6188 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0682 33.2847 49.9236 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1529 32.0538 50.5802 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2436 33.7973 52.0292 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1414 35.0188 51.4060 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5298 33.0978 53.9939 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1966 33.4091 56.6086 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7839 32.7419 58.9129 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5404 31.9926 59.6252 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1165 32.0758 59.2041 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5061 32.5002 57.6515 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2516 26.8958 56.7834 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1112 27.3275 58.9566 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1246 30.6921 53.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 17.1261 28.1055 51.2210 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8873 26.7273 55.1702 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0500 32.6764 55.6678 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 2 33 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 34 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 36 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 37 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 28 2 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 12 39 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 40 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 41 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 27 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 2 0 0 0 - 27 44 1 0 0 0 - 28 45 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL3402745_200 - -> -200 - -$$$$ -CHEMBL3402761_1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 63 67 0 0 1 0 999 V2000 - 20.6270 29.5265 59.9403 O 0 0 0 0 0 0 - 20.1829 29.3653 58.8001 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8506 28.0457 58.2897 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3754 27.8491 57.0403 C 0 0 0 0 0 0 - 19.1767 28.9531 56.1176 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4497 30.1369 56.5714 N 0 0 0 0 0 0 - 19.9289 30.3529 57.8691 N 0 0 0 0 0 0 - 20.2272 31.7541 58.2201 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6335 32.2198 57.8298 C 0 0 0 0 0 0 - 22.6557 32.2345 58.7758 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9255 32.6947 58.4300 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1809 33.1262 57.1291 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1796 33.1186 56.1459 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8982 32.6757 56.5339 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4866 33.4885 54.7188 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7735 33.7939 54.3763 N 0 0 0 0 0 0 - 25.0455 33.9261 53.0474 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0793 33.7512 52.0531 C 0 0 0 0 0 0 - 24.4620 33.8044 50.7208 O 0 0 0 0 0 0 - 23.5165 33.5647 49.6672 C 0 0 0 0 0 0 - 22.8204 32.1758 49.7068 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1410 31.3200 48.5625 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2179 30.1779 48.5055 C 0 0 0 0 0 0 - 22.5690 29.2456 47.3242 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9278 28.8247 47.3937 O 0 0 0 0 0 0 - 24.8503 29.9097 47.4537 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5319 30.8525 48.6318 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7764 33.5181 52.5153 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4655 33.3787 53.8269 N 0 0 0 0 0 0 - 18.7029 28.7100 54.7362 C 0 0 0 0 0 0 - 18.9902 29.6554 53.7347 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5804 29.4532 52.4203 C 0 0 0 0 0 0 - 17.8711 28.3033 52.0789 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5750 27.3490 53.0531 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9978 27.5468 54.3733 C 0 0 0 0 0 0 - 16.8353 26.1529 52.6794 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2471 25.2029 52.3739 N 0 0 0 0 0 0 - 20.0054 27.1985 58.9415 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1747 26.8274 56.7472 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0624 31.9423 59.2831 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5002 32.4009 57.7262 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4704 31.8955 59.7838 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7161 32.7081 59.1652 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1811 33.4579 56.8889 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0942 32.6452 55.8119 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0725 34.1248 52.7752 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0621 33.6894 48.7289 H 0 0 0 0 0 0 - 22.7678 34.3543 49.6289 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7449 32.3447 49.7367 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0711 31.6427 50.6256 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2387 29.6086 49.4364 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1943 30.5352 48.3859 H 0 0 0 0 0 0 - 21.9285 28.3638 47.3407 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3764 29.7434 46.3695 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8514 29.5045 47.5698 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8528 30.4604 46.5109 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7139 30.3366 49.5754 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2195 31.6992 48.6085 H 0 0 0 0 0 0 - 21.9441 33.3882 51.8472 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5448 30.5542 53.9657 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8169 30.1842 51.6597 H 0 0 0 0 0 0 - 17.5652 28.1587 51.0520 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7611 26.7954 55.1128 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 39 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 40 1 0 0 0 - 8 41 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 14 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 42 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 43 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 44 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 14 45 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 29 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 46 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 28 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 47 1 0 0 0 - 20 48 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 49 1 0 0 0 - 21 50 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 51 1 0 0 0 - 23 52 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 53 1 0 0 0 - 24 54 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 55 1 0 0 0 - 26 56 1 0 0 0 - 27 57 1 0 0 0 - 27 58 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 59 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 35 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 60 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 61 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 62 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 36 1 0 0 0 - 35 63 1 0 0 0 - 36 37 3 0 0 0 -M END -> -CHEMBL3402761_1 - -> -1 - -$$$$ -CHEMBL3402750_400 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 23.7416 33.4339 50.5656 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9419 33.5262 52.0577 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0472 33.9262 52.8109 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9413 33.8882 54.1251 N 0 0 0 0 0 0 - 23.7703 33.4371 54.5091 C 0 0 0 0 0 0 - 22.6918 33.0941 53.1909 S 0 0 0 0 0 0 - 23.3991 33.1258 55.9322 C 0 0 0 0 0 0 - 24.3940 33.1223 56.9191 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1066 32.7375 58.2267 C 0 0 0 0 0 0 - 22.8110 32.3634 58.5715 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7948 32.3802 57.6162 C 0 0 0 0 0 0 - 20.3655 32.0248 58.0262 C 0 0 0 0 0 0 - 20.0019 30.6204 57.7683 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4474 30.3566 56.5137 N 0 0 0 0 0 0 - 19.0638 29.1726 56.1515 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2956 28.1043 57.1128 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8470 28.3480 58.3259 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2312 29.6832 58.7547 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6849 29.9063 59.8819 O 0 0 0 0 0 0 - 18.4133 28.9105 54.8422 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9351 29.9898 54.0754 C 0 0 0 0 0 0 - 17.2559 29.7777 52.8782 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7949 30.8353 52.1707 F 0 0 0 0 0 0 - 17.0400 28.4827 52.4202 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5120 27.4001 53.1582 C 0 0 0 0 0 0 - 17.2881 26.1399 52.7214 F 0 0 0 0 0 0 - 18.2026 27.6096 54.3522 C 0 0 0 0 0 0 - 22.0909 32.7664 56.3023 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6844 32.3960 50.2370 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5565 33.9022 50.0124 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8173 33.9215 50.2539 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9799 34.2599 52.3772 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4112 33.3943 56.6782 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8920 32.7270 58.9682 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5972 32.0572 59.5827 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2132 32.2909 59.0739 H 0 0 0 0 0 0 - 19.6776 32.6821 57.4901 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0342 27.0804 56.8932 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0092 27.5307 59.0138 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0667 31.0101 54.4070 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4995 28.3179 51.4996 H 0 0 0 0 0 0 - 18.5540 26.7358 54.8749 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2972 32.7657 55.5704 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 28 2 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 27 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 2 0 0 0 - 27 42 1 0 0 0 - 28 43 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL3402750_400 - -> -400 - -$$$$ -CHEMBL3402743_42 - 3D - Structure written by MMmdl. - 57 59 0 0 1 0 999 V2000 - 24.1307 31.2988 47.8294 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0469 32.2887 48.5804 N 0 3 0 0 0 0 - 25.1226 33.6645 47.8845 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7621 32.3673 50.0986 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4022 33.0226 50.4217 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1284 33.0780 51.9260 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1634 33.8263 52.5697 O 0 0 0 0 0 0 - 24.3524 33.8857 53.9176 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4033 34.3257 54.3776 O 0 0 0 0 0 0 - 23.2482 33.4270 54.6434 N 0 0 0 0 0 0 - 23.1370 33.1250 56.0094 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2143 33.1248 56.9090 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0253 32.7062 58.2246 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7705 32.2714 58.6521 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6863 32.2743 57.7701 C 0 0 0 0 0 0 - 20.3025 31.8402 58.2496 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9634 30.4477 57.9026 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4463 30.2402 56.6192 N 0 0 0 0 0 0 - 19.1308 29.0660 56.1704 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3736 27.9499 57.0773 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8766 28.1437 58.3179 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2104 29.4566 58.8326 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6463 29.6206 59.9751 O 0 0 0 0 0 0 - 18.5497 28.8548 54.8168 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0818 27.5994 54.3835 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5074 27.4408 53.1218 C 0 0 0 0 0 0 - 17.0467 26.2296 52.7384 F 0 0 0 0 0 0 - 17.4033 28.5299 52.2618 C 0 0 0 0 0 0 - 17.8673 29.7781 52.6646 C 0 0 0 0 0 0 - 17.7609 30.8419 51.8371 F 0 0 0 0 0 0 - 18.4356 29.9375 53.9275 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8747 32.7140 56.4546 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1876 30.3383 48.3460 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5150 31.2115 46.8123 H 0 0 0 0 0 0 - 23.1151 31.6971 47.8315 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8108 34.2890 48.4583 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1211 34.0936 47.8521 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5049 33.4937 46.8770 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8307 31.3415 50.4685 H 0 0 0 0 0 0 - 25.6021 32.9259 50.5162 H 0 0 0 0 0 0 - 23.3634 34.0403 50.0275 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5892 32.4739 49.9457 H 0 0 0 0 0 0 - 22.1627 33.5458 52.1190 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0888 32.0635 52.3319 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4154 33.2522 54.1019 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2089 33.4237 56.6125 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8630 32.7065 58.9086 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6414 31.9261 59.6686 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2139 32.0303 59.3222 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5576 32.5036 57.8026 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1728 26.9292 56.7918 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0565 27.2935 58.9600 H 0 0 0 0 0 0 - 18.1260 26.7262 55.0106 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9594 28.4049 51.2856 H 0 0 0 0 0 0 - 18.7785 30.9226 54.2072 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0345 32.6999 55.7730 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9892 31.8985 48.5302 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 57 1 0 0 0 - 3 36 1 0 0 0 - 3 37 1 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 39 1 0 0 0 - 4 40 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 41 1 0 0 0 - 5 42 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 43 1 0 0 0 - 6 44 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 45 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 46 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 47 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 48 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 32 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 49 1 0 0 0 - 16 50 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 24 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 51 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 52 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 31 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 53 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 28 2 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 54 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 31 2 0 0 0 - 31 55 1 0 0 0 - 32 56 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL3402743_42 - -> -42 - -$$$$ -CHEMBL3402752_30000 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 25.8234 33.9368 52.0874 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5773 33.5529 52.8371 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5033 33.5215 54.1481 N 0 0 0 0 0 0 - 23.3141 33.1507 54.6047 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3783 32.9204 53.5909 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1081 33.1260 52.0358 S 0 0 0 0 0 0 - 23.0782 32.9428 56.0753 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1214 33.0156 57.0120 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9060 32.6758 58.3464 C 0 0 0 0 0 0 - 22.6470 32.2458 58.7660 C 0 0 0 0 0 0 - 21.5865 32.1977 57.8576 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1983 31.7432 58.2997 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9103 30.3472 57.9267 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4457 30.1367 56.6240 N 0 0 0 0 0 0 - 19.1955 28.9527 56.1602 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4462 27.8387 57.0634 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9156 28.0338 58.3163 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1990 29.3563 58.8423 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6466 29.5307 59.9757 O 0 0 0 0 0 0 - 18.6782 28.7120 54.7928 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8686 29.6755 53.7873 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4018 29.4581 52.4919 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5947 30.3979 51.5403 F 0 0 0 0 0 0 - 17.7355 28.2754 52.1779 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5376 27.3094 53.1591 C 0 0 0 0 0 0 - 16.8840 26.1648 52.8599 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0078 27.5260 54.4534 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8052 32.5682 56.5284 C 0 0 0 0 0 0 - 25.6127 34.7585 51.4074 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1895 33.1263 51.4574 H 0 0 0 0 0 0 - 26.6381 34.2399 52.7438 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3476 32.6089 53.6669 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1167 33.3023 56.7016 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7283 32.7185 59.0468 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4998 31.9283 59.7886 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0766 31.9170 59.3695 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4477 32.3927 57.8405 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2890 26.8170 56.7517 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1073 27.1837 58.9532 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3903 30.5998 53.9954 H 0 0 0 0 0 0 - 17.3745 28.1070 51.1755 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8281 26.7513 55.1826 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9769 32.5013 55.8382 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 7 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 28 2 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 27 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 2 0 0 0 - 27 42 1 0 0 0 - 28 43 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL3402752_30000 - -> -30000 - -$$$$ -CHEMBL3402755_4200 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 24.9268 34.0387 50.7958 C 0 0 0 0 0 0 - 24.3292 33.7968 52.1682 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0499 33.2693 52.3344 C 0 0 0 0 0 0 - 22.6036 33.0410 53.6347 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4538 33.3556 54.7057 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6754 33.9192 54.4700 N 0 0 0 0 0 0 - 25.1181 34.1276 53.2212 N 0 0 0 0 0 0 - 23.1239 33.0265 56.1337 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1214 33.0302 57.1236 C 0 0 0 0 0 0 - 23.8473 32.6424 58.4326 C 0 0 0 0 0 0 - 22.5704 32.2174 58.7761 C 0 0 0 0 0 0 - 21.5526 32.2075 57.8229 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1497 31.7465 58.2043 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8854 30.3397 57.8543 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4128 30.1090 56.5605 N 0 0 0 0 0 0 - 19.1571 28.9176 56.1180 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4059 27.8195 57.0375 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8870 28.0345 58.2822 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1852 29.3636 58.7850 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6460 29.5449 59.9141 O 0 0 0 0 0 0 - 18.6463 28.6600 54.7513 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9441 27.4851 54.4303 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4733 27.2606 53.1364 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7942 26.1288 52.8531 F 0 0 0 0 0 0 - 17.7086 28.2024 52.1378 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4025 29.3727 52.4339 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6243 30.2907 51.4676 F 0 0 0 0 0 0 - 18.8686 29.6005 53.7292 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8292 32.6350 56.5192 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0400 35.1100 50.6219 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2962 33.6273 50.0037 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9117 33.5709 50.7171 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4207 33.0324 51.4858 H 0 0 0 0 0 0 - 21.6343 32.5922 53.7757 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1348 33.3176 56.8881 H 0 0 0 0 0 0 - 24.6327 32.6583 59.1741 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3648 31.8897 59.7856 H 0 0 0 0 0 0 - 19.9758 31.9310 59.2706 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4176 32.3850 57.7063 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2305 26.7935 56.7551 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0775 27.1977 58.9349 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7396 26.7272 55.1728 H 0 0 0 0 0 0 - 17.3583 28.0202 51.1328 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4080 30.5144 53.9261 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0233 32.6247 55.8023 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 8 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 29 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 29 2 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 28 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 2 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 28 2 0 0 0 - 28 44 1 0 0 0 - 29 45 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL3402755_4200 - -> -4200 - -$$$$ -CHEMBL3402758_10 - 3D - Structure written by MMmdl. - 60 63 0 0 1 0 999 V2000 - 22.9152 29.8931 48.1561 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2551 30.6483 48.3008 N 0 3 0 0 0 0 - 25.1218 30.4724 47.0330 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0434 32.1319 48.6858 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3059 32.6758 49.3763 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1552 34.0797 49.9601 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9394 34.1774 50.6857 O 0 0 0 0 0 0 - 23.8832 33.7800 52.0009 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9026 33.9265 52.9536 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7110 33.6572 54.2732 N 0 0 0 0 0 0 - 23.4739 33.2169 54.6422 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4457 33.0003 53.7775 N 0 0 0 0 0 0 - 22.6711 33.2812 52.4732 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2175 32.9270 56.0926 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2484 32.9698 57.0452 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0210 32.6233 58.3754 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7528 32.2188 58.7787 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6995 32.1904 57.8666 C 0 0 0 0 0 0 - 20.3003 31.7816 58.3130 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9556 30.3998 57.9322 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4383 30.2304 56.6462 N 0 0 0 0 0 0 - 19.0792 29.0738 56.1867 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3118 27.9338 57.0630 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8456 28.0864 58.2961 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1994 29.3881 58.8358 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6461 29.5264 59.9758 O 0 0 0 0 0 0 - 18.4684 28.9016 54.8476 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2473 27.6429 54.2625 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6426 27.5449 53.0095 C 0 0 0 0 0 0 - 17.2575 28.7188 52.3615 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4530 29.9497 52.8941 N 0 0 0 0 0 0 - 18.0494 30.0246 54.1102 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9345 32.5596 56.5416 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3844 29.9730 49.1064 H 0 0 0 0 0 0 - 23.1448 28.8479 47.9357 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3491 30.3567 47.3451 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0669 30.9958 47.1787 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5712 30.8895 46.1875 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2982 29.4030 46.9013 H 0 0 0 0 0 0 - 23.7656 32.6740 47.7807 H 0 0 0 0 0 0 - 23.1997 32.1424 49.3791 H 0 0 0 0 0 0 - 25.6010 31.9984 50.1797 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1285 32.7270 48.6630 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0407 34.3279 50.5421 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1051 34.8078 49.1483 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8688 34.3330 52.6953 H 0 0 0 0 0 0 - 21.8477 33.1258 51.7966 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2516 33.2562 56.7614 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8370 32.6599 59.0843 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5869 31.9258 59.8043 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1888 31.9511 59.3862 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5784 32.4646 57.8623 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0698 26.9259 56.7633 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0130 27.2201 58.9200 H 0 0 0 0 0 0 - 18.5430 26.7263 54.7473 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4839 26.5810 52.5493 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7860 28.6808 51.3901 H 0 0 0 0 0 0 - 18.1755 31.0262 54.4931 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1066 32.5214 55.8496 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7582 30.2204 49.0693 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 60 1 0 0 0 - 3 37 1 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 3 39 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 40 1 0 0 0 - 4 41 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 42 1 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 44 1 0 0 0 - 6 45 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 46 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 13 47 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 48 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 49 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 50 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 33 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 51 1 0 0 0 - 19 52 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 53 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 54 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 32 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 55 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 56 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 57 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 32 58 1 0 0 0 - 33 59 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL3402758_10 - -> -10 - -$$$$ -CHEMBL3402749_500 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 23.1880 32.9654 51.3241 C 0 0 0 0 0 0 - 23.7323 33.2938 52.6892 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0073 32.9075 53.7669 O 0 0 0 0 0 0 - 23.7531 33.3159 54.8274 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8721 33.9267 54.4916 N 0 0 0 0 0 0 - 24.8644 33.9263 53.1729 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2892 32.9610 56.2041 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2048 32.9742 57.2615 C 0 0 0 0 0 0 - 23.8221 32.5836 58.5407 C 0 0 0 0 0 0 - 22.5149 32.1657 58.7756 C 0 0 0 0 0 0 - 21.5818 32.1409 57.7366 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1455 31.7068 58.0189 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8732 30.2933 57.7046 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4074 30.0305 56.4136 N 0 0 0 0 0 0 - 19.1391 28.8313 56.0058 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3681 27.7586 56.9585 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8455 28.0025 58.1991 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1419 29.3425 58.6718 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5653 29.5511 59.8118 O 0 0 0 0 0 0 - 18.6372 28.5332 54.6463 C 0 0 0 0 0 0 - 17.8474 27.4018 54.3854 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4031 27.1223 53.0956 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6416 26.0297 52.8665 F 0 0 0 0 0 0 - 17.7375 27.9725 52.0441 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5167 29.1012 52.2829 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8413 29.9267 51.2621 F 0 0 0 0 0 0 - 18.9657 29.3808 53.5740 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9709 32.5531 56.4542 C 0 0 0 0 0 0 - 22.9983 31.8957 51.2119 H 0 0 0 0 0 0 - 23.8766 33.2580 50.5307 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2474 33.4816 51.1371 H 0 0 0 0 0 0 - 25.6629 34.3552 52.5844 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2268 33.2791 57.0912 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5411 32.6009 59.3448 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2263 31.8517 59.7692 H 0 0 0 0 0 0 - 19.8857 31.9387 59.0540 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4697 32.3355 57.4353 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1925 26.7263 56.6886 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0255 27.1780 58.8725 H 0 0 0 0 0 0 - 17.5634 26.7263 55.1785 H 0 0 0 0 0 0 - 17.3976 27.7504 51.0440 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5782 30.2568 53.7298 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2542 32.5276 55.6465 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 2 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 7 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 28 2 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 27 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 2 0 0 0 - 27 42 1 0 0 0 - 28 43 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL3402749_500 - -> -500 - -$$$$ -CHEMBL3402757_6.5 - 3D - Structure written by MMmdl. - 61 64 0 0 1 0 999 V2000 - 25.3721 31.2219 46.6644 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2292 31.6762 47.5975 N 0 3 0 0 0 0 - 24.1603 30.8253 48.8811 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1810 33.2089 47.8252 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4044 33.8076 48.5650 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4494 33.6181 50.0927 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1499 33.8272 50.6358 O 0 0 0 0 0 0 - 23.9715 33.6722 51.9928 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9553 33.9009 52.9691 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7187 33.7452 54.2980 N 0 0 0 0 0 0 - 23.4638 33.3512 54.6606 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4436 33.1319 53.7852 N 0 0 0 0 0 0 - 22.7129 33.2993 52.4668 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2073 33.0414 56.1083 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2462 33.0690 57.0560 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0331 32.6782 58.3749 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7722 32.2476 58.7759 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7116 32.2359 57.8728 C 0 0 0 0 0 0 - 20.3201 31.8105 58.3284 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9672 30.4340 57.9355 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4198 30.2849 56.6582 N 0 0 0 0 0 0 - 19.0471 29.1359 56.1903 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2945 27.9828 57.0432 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8472 28.1166 58.2711 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2070 29.4083 58.8283 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6472 29.5276 59.9744 O 0 0 0 0 0 0 - 18.3925 28.9878 54.8648 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2472 27.7417 54.2309 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5890 27.6339 53.0045 C 0 0 0 0 0 0 - 17.0562 28.7685 52.3958 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1910 30.0122 53.0059 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6720 31.1185 52.4235 F 0 0 0 0 0 0 - 17.8573 30.1210 54.2252 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9312 32.6478 56.5553 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3080 31.8113 45.7470 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2244 30.1595 46.4546 H 0 0 0 0 0 0 - 26.3194 31.3882 47.1758 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4080 31.2663 49.5382 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1453 30.8109 49.3438 H 0 0 0 0 0 0 - 23.8709 29.8206 48.5750 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0971 33.6212 46.8176 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2361 33.4125 48.3360 H 0 0 0 0 0 0 - 26.3385 33.4600 48.1276 H 0 0 0 0 0 0 - 25.3938 34.8815 48.3778 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8116 32.6248 50.3571 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1665 34.3265 50.5072 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9519 34.2201 52.7070 H 0 0 0 0 0 0 - 21.8874 33.1258 51.7883 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2443 33.3742 56.7757 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8506 32.7011 59.0815 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6205 31.9255 59.7949 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2231 31.9635 59.4069 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5887 32.4978 57.8996 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0401 26.9809 56.7320 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0179 27.2405 58.8787 H 0 0 0 0 0 0 - 18.6474 26.8346 54.6590 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4965 26.6686 52.5287 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5387 28.6851 51.4518 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9339 31.1003 54.6757 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0980 32.6179 55.8680 H 0 0 0 0 0 0 - 23.3734 31.4683 47.0969 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 1 37 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 61 1 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 3 39 1 0 0 0 - 3 40 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 41 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 5 44 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 45 1 0 0 0 - 6 46 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 47 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 13 48 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 49 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 50 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 51 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 34 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 52 1 0 0 0 - 19 53 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 54 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 55 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 33 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 56 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 57 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 58 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 33 2 0 0 0 - 33 59 1 0 0 0 - 34 60 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL3402757_6.5 - -> -6.5 - -$$$$ -CHEMBL3402765_11-charged-pKa-8.1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 62 65 0 0 1 0 999 V2000 - 17.2816 31.0754 52.1112 F 0 0 0 0 0 0 - 17.5663 29.9576 52.8176 C 0 0 0 0 0 0 - 17.2204 28.7069 52.3169 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5045 27.5609 53.0572 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1492 26.3482 52.5773 F 0 0 0 0 0 0 - 18.1372 27.6641 54.2964 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4805 28.9202 54.8291 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1932 30.0628 54.0561 C 0 0 0 0 0 0 - 19.0915 29.0865 56.1754 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4480 30.2440 56.6384 N 0 0 0 0 0 0 - 19.9872 30.4154 57.9169 N 0 0 0 0 0 0 - 20.3516 31.7988 58.2814 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7041 32.2478 57.7248 C 0 0 0 0 0 0 - 22.8361 32.2592 58.5463 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0614 32.6950 58.0440 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1708 33.1134 56.7180 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0463 33.1012 55.8772 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0717 33.4390 54.5115 N 0 0 0 0 0 0 - 24.1496 33.7673 53.6964 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3229 33.9268 54.0317 O 0 0 0 0 0 0 - 23.6922 33.9229 52.4360 O 0 0 0 0 0 0 - 24.5555 34.3241 51.3706 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9605 33.1210 50.5062 C 0 0 0 0 0 0 - 23.7698 32.4740 49.7769 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2474 31.2754 48.9228 N 0 3 0 0 0 0 - 24.9826 31.7341 47.6405 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3999 30.4887 46.8374 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2725 29.6655 46.5504 O 0 0 0 0 0 0 - 23.5838 29.1848 47.7005 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0596 30.3553 48.5561 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8149 32.6843 56.3986 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2116 29.4040 58.8272 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6467 29.5340 59.9745 O 0 0 0 0 0 0 - 19.8462 28.1043 58.2906 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3150 27.9488 57.0557 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7228 28.6247 51.3638 H 0 0 0 0 0 0 - 18.3289 26.7384 54.8198 H 0 0 0 0 0 0 - 18.4373 31.0512 54.4133 H 0 0 0 0 0 0 - 20.3352 31.9552 59.3633 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5785 32.4740 57.9083 H 0 0 0 0 0 0 - 22.7680 31.9276 59.5733 H 0 0 0 0 0 0 - 24.9369 32.7045 58.6794 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1406 33.4331 56.3730 H 0 0 0 0 0 0 - 22.1815 33.4019 54.0390 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4474 34.8305 51.7432 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0329 35.0555 50.7548 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4479 32.3780 51.1334 H 0 0 0 0 0 0 - 25.7125 33.4630 49.7972 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2443 33.1592 49.1097 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0627 32.0705 50.5030 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8476 32.3258 47.9311 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2873 32.3578 47.0764 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1483 29.9176 47.3875 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8649 30.7828 45.8963 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2465 28.5388 48.2809 H 0 0 0 0 0 0 - 22.7528 28.5585 47.3733 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5999 30.0141 49.4822 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3468 30.9683 48.0008 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9378 32.6688 55.7673 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0003 27.2406 58.9192 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0693 26.9394 56.7608 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8973 30.7375 49.4781 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 8 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 36 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 6 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 9 1 0 0 0 - 8 38 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 39 1 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 42 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 43 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 31 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 44 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 45 1 0 0 0 - 22 46 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 47 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 49 1 0 0 0 - 24 50 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 30 1 0 0 0 - 25 62 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 51 1 0 0 0 - 26 52 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 53 1 0 0 0 - 27 54 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 55 1 0 0 0 - 29 56 1 0 0 0 - 30 57 1 0 0 0 - 30 58 1 0 0 0 - 31 59 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 34 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 60 1 0 0 0 - 35 61 1 0 0 0 -M CHG 1 25 1 -M END -> -CHEMBL3402765_11-charged-pKa-8.1 - -> -11 - -$$$$ -CHEMBL3402762_1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 66 70 0 0 1 0 999 V2000 - 25.2972 29.3647 46.7015 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0472 30.5455 47.6646 N 0 3 2 0 0 0 - 23.6340 30.4434 48.2818 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4401 31.5920 49.2829 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6806 32.9771 48.6432 C 0 0 1 0 0 0 - 23.5016 34.1241 49.6598 C 0 0 0 0 0 0 - 24.4712 34.0336 50.7092 O 0 0 0 0 0 0 - 24.0941 33.7587 52.0109 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0463 33.9328 53.0156 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7792 33.7416 54.3338 N 0 0 0 0 0 0 - 23.5184 33.3355 54.6583 C 0 0 0 0 0 0 - 22.5278 33.1163 53.7486 N 0 0 0 0 0 0 - 22.8299 33.3247 52.4399 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2238 33.0313 56.1029 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2415 33.0442 57.0710 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9955 32.6644 58.3898 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7234 32.2550 58.7744 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6814 32.2510 57.8432 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2776 31.8222 58.2633 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9596 30.4283 57.9055 N 0 0 0 0 0 0 - 19.5057 30.2203 56.5990 N 0 0 0 0 0 0 - 19.2468 29.0387 56.1349 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4363 27.9257 57.0492 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8875 28.1176 58.3104 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2068 29.4347 58.8316 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6455 29.5966 59.9728 O 0 0 0 0 0 0 - 18.7906 28.8114 54.7456 C 0 0 0 0 0 0 - 19.1078 29.7541 53.7518 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7040 29.5653 52.4326 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9727 28.4346 52.0806 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6452 27.4857 53.0540 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0626 27.6673 54.3751 C 0 0 0 0 0 0 - 16.8662 26.3141 52.6780 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2469 25.3833 52.3771 N 0 0 0 0 0 0 - 21.9323 32.6609 56.5280 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0622 33.0303 47.9539 C 0 0 0 0 0 0 - 25.2640 31.8925 46.9387 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1789 28.4422 47.2750 H 0 0 0 0 0 0 - 26.3189 29.4533 46.3281 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5692 29.4223 45.8884 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9124 30.4809 47.4607 H 0 0 0 0 0 0 - 23.5641 29.4777 48.7758 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1182 31.4437 50.1259 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4311 31.5422 49.6918 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9233 33.1220 47.8691 H 0 0 0 0 0 0 - 23.6730 35.0747 49.1549 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4649 34.1812 49.9843 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0449 34.2630 52.7644 H 0 0 0 0 0 0 - 22.0200 33.1298 51.7544 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2505 33.3245 56.8032 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8048 32.6723 59.1083 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5475 31.9264 59.7879 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1415 32.0069 59.3313 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5506 32.4823 57.7863 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2477 26.9076 56.7408 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0324 27.2661 58.9593 H 0 0 0 0 0 0 - 19.6758 30.6403 53.9934 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9589 30.2997 51.6786 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6668 28.3038 51.0519 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7985 26.9210 55.1130 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1162 32.6438 55.8207 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8511 32.9816 48.7062 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1907 33.9891 47.4494 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5527 31.9411 46.1113 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2809 31.8898 46.5439 H 0 0 0 0 0 0 - 25.7364 30.5092 48.4103 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 38 1 0 0 0 - 1 39 1 0 0 0 - 1 40 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 37 1 0 0 0 - 2 66 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 41 1 0 0 0 - 3 42 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 4 44 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 5 45 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 46 1 0 0 0 - 6 47 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 48 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 13 49 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 50 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 51 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 52 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 35 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 53 1 0 0 0 - 19 54 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 55 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 56 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 32 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 57 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 58 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 59 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 33 1 0 0 0 - 32 60 1 0 0 0 - 33 34 3 0 0 0 - 35 61 1 0 0 0 - 36 37 1 0 0 0 - 36 62 1 0 0 0 - 36 63 1 0 0 0 - 37 64 1 0 0 0 - 37 65 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL3402762_1 - -> -1 - -$$$$ -CHEMBL3402742_23 - 3D - Structure written by MMmdl. - 57 59 0 0 1 0 999 V2000 - 24.0986 34.7063 49.0484 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6432 33.2826 48.7886 N 0 3 0 0 0 0 - 25.8543 33.3451 47.8288 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0189 32.4927 50.0695 C 0 0 0 0 0 0 - 23.8157 32.1161 50.9601 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1879 33.2288 51.8121 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2114 33.9262 52.5318 O 0 0 0 0 0 0 - 24.4007 33.9085 53.8846 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4467 34.3262 54.3754 O 0 0 0 0 0 0 - 23.2923 33.4328 54.5845 N 0 0 0 0 0 0 - 23.1560 33.1247 55.9447 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2128 33.1260 56.8689 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9896 32.7237 58.1852 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7192 32.3122 58.5862 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6582 32.3108 57.6778 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2579 31.8951 58.1203 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9237 30.4965 57.7849 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4310 30.2906 56.5316 N 0 0 0 0 0 0 - 19.0502 29.1758 56.0241 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2185 27.8061 56.7105 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9746 27.7611 58.3757 S 0 0 0 0 0 0 - 20.2175 29.5288 58.7582 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6471 29.7895 59.8854 O 0 0 0 0 0 0 - 18.3886 29.1760 54.6905 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2431 27.9972 53.9358 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5693 28.0071 52.7145 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4239 26.8610 52.0143 F 0 0 0 0 0 0 - 17.0348 29.1930 52.2188 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1737 30.3718 52.9443 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6469 31.5248 52.4740 F 0 0 0 0 0 0 - 17.8471 30.3641 54.1637 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8822 32.7264 56.3625 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0449 34.6088 49.3014 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1862 35.2925 48.1323 H 0 0 0 0 0 0 - 24.6791 35.1545 49.8572 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1448 32.3237 47.5759 H 0 0 0 0 0 0 - 26.6631 33.8707 48.3419 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5459 33.8749 46.9260 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4471 31.5649 49.6903 H 0 0 0 0 0 0 - 25.7990 33.0494 50.5947 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0435 31.6278 50.3649 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1756 31.3658 51.6605 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6454 33.9289 51.1891 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4243 32.7875 52.4523 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4656 33.2745 54.0316 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2150 33.4159 56.5938 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8092 32.7233 58.8896 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5614 31.9838 59.6014 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1211 32.1147 59.1822 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5349 32.5541 57.6362 H 0 0 0 0 0 0 - 19.8520 27.1631 56.0983 H 0 0 0 0 0 0 - 18.2473 27.3171 56.7973 H 0 0 0 0 0 0 - 18.6283 27.0467 54.2749 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5075 29.1938 51.2769 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9220 31.2953 54.7066 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0593 32.7116 55.6611 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9191 32.7591 48.3116 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 57 1 0 0 0 - 3 36 1 0 0 0 - 3 37 1 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 39 1 0 0 0 - 4 40 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 41 1 0 0 0 - 5 42 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 43 1 0 0 0 - 6 44 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 45 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 46 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 47 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 48 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 32 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 49 1 0 0 0 - 16 50 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 24 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 51 1 0 0 0 - 20 52 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 31 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 53 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 28 2 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 54 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 31 2 0 0 0 - 31 55 1 0 0 0 - 32 56 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL3402742_23 - -> -23 - -$$$$ -CHEMBL3402754_40 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 24.6590 34.1762 50.5924 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2746 33.9253 52.0374 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1740 34.1478 53.0785 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8532 33.9262 54.3784 N 0 0 0 0 0 0 - 23.5930 33.4702 54.6400 C 0 0 0 0 0 0 - 22.6476 33.2371 53.6867 N 0 0 0 0 0 0 - 23.0058 33.4672 52.3948 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2543 33.1190 56.0657 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2471 33.1094 57.0597 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9733 32.6953 58.3618 C 0 0 0 0 0 0 - 22.6941 32.2720 58.7023 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6732 32.2882 57.7495 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2574 31.8714 58.1483 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9320 30.4722 57.8106 N 0 0 0 0 0 0 - 19.3972 30.2588 56.5379 N 0 0 0 0 0 0 - 19.0692 29.0834 56.0994 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3270 27.9712 57.0049 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8506 28.1673 58.2382 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1920 29.4850 58.7426 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6445 29.6519 59.8792 O 0 0 0 0 0 0 - 18.4743 28.8707 54.7531 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0358 27.6132 54.3055 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4494 27.4603 53.0498 C 0 0 0 0 0 0 - 17.0192 26.2455 52.6483 F 0 0 0 0 0 0 - 17.2973 28.5621 52.2108 C 0 0 0 0 0 0 - 17.7324 29.8153 52.6298 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5797 30.8932 51.8228 F 0 0 0 0 0 0 - 18.3167 29.9673 53.8856 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9564 32.7247 56.4484 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1190 33.5086 49.9195 H 0 0 0 0 0 0 - 25.7260 34.0116 50.4396 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4303 35.2047 50.3131 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1753 34.5025 52.8776 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2484 33.2806 51.6443 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2609 33.4009 56.8192 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7626 32.6937 59.1005 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4923 31.9266 59.7076 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0950 32.0730 59.2091 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5442 32.5305 57.6458 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1172 26.9479 56.7312 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0395 27.3195 58.8782 H 0 0 0 0 0 0 - 18.1211 26.7275 54.9114 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8419 28.4425 51.2385 H 0 0 0 0 0 0 - 18.6407 30.9590 54.1723 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1592 32.7249 55.7179 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 8 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 29 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 29 2 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 28 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 2 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 28 2 0 0 0 - 28 44 1 0 0 0 - 29 45 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL3402754_40 - -> -40 - -$$$$ -CHEMBL3402748_5300 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 47 0 0 1 0 999 V2000 - 24.3564 33.6113 52.8448 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0183 33.4975 52.5099 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3767 33.2602 53.6894 N 0 0 0 0 0 0 - 23.3432 33.2295 54.6627 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5366 33.4320 54.1451 N 0 0 0 0 0 0 - 23.0804 32.9514 56.1082 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1299 32.9871 57.0396 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9111 32.6334 58.3678 C 0 0 0 0 0 0 - 22.6434 32.2299 58.7760 C 0 0 0 0 0 0 - 21.5787 32.2132 57.8761 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1881 31.7866 58.3387 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8602 30.4029 57.9603 N 0 0 0 0 0 0 - 19.3499 30.2301 56.6724 N 0 0 0 0 0 0 - 19.0474 29.0660 56.1901 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3238 27.9262 57.0522 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8480 28.0844 58.2899 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1660 29.3879 58.8437 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6457 29.5266 59.9726 O 0 0 0 0 0 0 - 18.4259 28.8961 54.8518 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2460 27.6349 54.2566 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5752 27.5079 53.0404 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3791 26.2837 52.5028 F 0 0 0 0 0 0 - 17.0894 28.6363 52.3852 C 0 0 0 0 0 0 - 17.2733 29.8953 52.9468 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7952 30.9967 52.3254 F 0 0 0 0 0 0 - 17.9353 30.0226 54.1664 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8002 32.5881 56.5482 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2516 33.6272 51.1806 C 0 0 0 0 0 0 - 21.3852 33.1297 53.8181 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1266 33.2707 56.7329 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7309 32.6529 59.0725 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4875 31.9256 59.8004 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0883 31.9468 59.4152 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4496 32.4622 57.9040 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1182 26.9124 56.7412 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0418 27.2166 58.9026 H 0 0 0 0 0 0 - 18.6020 26.7265 54.7163 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5637 28.5315 51.4477 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0368 31.0133 54.5841 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9726 32.5554 55.8558 H 0 0 0 0 0 0 - 25.0887 33.8206 52.0791 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1887 33.4612 51.3559 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4001 34.6264 50.7710 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6227 32.8861 50.4728 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 41 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 30 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 27 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 36 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 26 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 26 39 1 0 0 0 - 27 40 1 0 0 0 - 28 42 1 0 0 0 - 28 43 1 0 0 0 - 28 44 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL3402748_5300 - -> -5300 - -$$$$ -CHEMBL3402741_400 - 3D - Structure written by MMmdl. - 71 73 0 0 1 0 999 V2000 - 24.3934 31.0600 48.1947 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5318 32.4351 47.5178 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8474 33.1258 47.9679 N 0 3 0 0 0 0 - 26.5614 33.7965 46.7640 C 0 0 0 0 0 0 - 27.9647 34.3057 47.1323 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7058 34.0801 49.1798 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9918 33.4384 50.3755 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0659 34.3430 51.6089 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1175 33.9028 52.5724 O 0 0 0 0 0 0 - 24.3859 33.9251 53.8856 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4468 34.3252 54.3755 O 0 0 0 0 0 0 - 23.2712 33.4382 54.5535 N 0 0 0 0 0 0 - 23.1060 33.1249 55.9113 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1478 33.1259 56.8531 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9046 32.7376 58.1696 C 0 0 0 0 0 0 - 22.6221 32.3505 58.5593 C 0 0 0 0 0 0 - 21.5763 32.3408 57.6345 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1645 31.9343 58.0656 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8549 30.5223 57.7688 N 0 0 0 0 0 0 - 19.5510 30.2568 56.4647 N 0 0 0 0 0 0 - 19.2595 29.1097 55.9735 C 0 0 0 0 0 0 - 19.1563 27.8215 56.8125 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1073 27.8033 58.3756 S 0 0 0 0 0 0 - 20.2026 29.5875 58.7616 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6464 29.8843 59.8760 O 0 0 0 0 0 0 - 18.9915 28.9833 54.5231 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6332 29.8252 53.6061 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4012 29.7031 52.2393 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5163 28.7296 51.7479 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2446 28.5625 50.4000 O 0 0 0 0 0 0 - 19.1055 29.1560 49.4367 C 0 0 0 0 0 0 - 17.8607 27.8802 52.6511 C 0 0 0 0 0 0 - 16.9971 26.9398 52.1194 O 0 0 0 0 0 0 - 16.4627 25.9229 52.9609 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1083 28.0139 54.0302 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8257 32.7275 56.3134 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5731 30.4984 47.7502 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1797 31.1335 49.2598 H 0 0 0 0 0 0 - 25.3026 30.4604 48.0820 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5871 32.2964 46.4354 H 0 0 0 0 0 0 - 23.7064 33.1249 47.7224 H 0 0 0 0 0 0 - 26.6370 33.0231 45.9988 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9021 34.5928 46.4106 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5048 34.6092 46.2369 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5529 33.5272 47.6204 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9289 35.1715 47.7906 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7289 34.3265 49.4695 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1999 34.9802 48.8207 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9440 33.2598 50.1306 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4418 32.4741 50.6173 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0877 34.3355 51.9943 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8319 35.3723 51.3382 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4685 33.2708 53.9673 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1545 33.4074 56.5882 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7114 32.7470 58.8868 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4449 32.0462 59.5784 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0051 32.1810 59.1196 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4401 32.5650 57.5477 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5363 26.9752 56.2387 H 0 0 0 0 0 0 - 18.1120 27.6206 57.0577 H 0 0 0 0 0 0 - 20.3227 30.5828 53.9471 H 0 0 0 0 0 0 - 19.9142 30.3790 51.5732 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8121 28.8229 48.4420 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1452 28.8590 49.5904 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0323 30.2450 49.4516 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8022 26.3401 53.7205 H 0 0 0 0 0 0 - 17.2616 25.3568 53.4427 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8754 25.2286 52.3598 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6031 27.3567 54.7209 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0158 32.7074 55.5985 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4631 32.3739 48.2748 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 37 1 0 0 0 - 1 38 1 0 0 0 - 1 39 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 40 1 0 0 0 - 2 41 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 71 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 44 1 0 0 0 - 5 45 1 0 0 0 - 5 46 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 47 1 0 0 0 - 6 48 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 49 1 0 0 0 - 7 50 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 51 1 0 0 0 - 8 52 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 53 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 54 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 55 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 56 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 36 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 57 1 0 0 0 - 18 58 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 24 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 26 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 59 1 0 0 0 - 22 60 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 35 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 61 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 62 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 31 63 1 0 0 0 - 31 64 1 0 0 0 - 31 65 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 35 2 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 66 1 0 0 0 - 34 67 1 0 0 0 - 34 68 1 0 0 0 - 35 69 1 0 0 0 - 36 70 1 0 0 0 -M CHG 1 3 1 -M END -> -CHEMBL3402741_400 - -> -400 - -$$$$ -CHEMBL3402763_90 - 3D - Structure written by MMmdl. - 63 65 0 0 1 0 999 V2000 - 24.4727 31.0016 48.0036 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5300 32.4421 47.4625 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8471 33.1263 47.9174 N 0 3 0 0 0 0 - 26.5582 33.8236 46.7267 C 0 0 0 0 0 0 - 27.9680 34.3135 47.0983 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7037 34.0574 49.1505 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0196 33.3694 50.3406 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1207 34.2204 51.6096 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2089 33.7070 52.5694 O 0 0 0 0 0 0 - 24.4274 33.8425 53.8818 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4468 34.3262 54.3758 O 0 0 0 0 0 0 - 23.3143 33.3489 54.5431 N 0 0 0 0 0 0 - 23.1199 33.0979 55.9090 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1414 33.1258 56.8692 C 0 0 0 0 0 0 - 23.8696 32.7659 58.1897 C 0 0 0 0 0 0 - 22.5879 32.3615 58.5569 C 0 0 0 0 0 0 - 21.5635 32.3202 57.6077 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1562 31.8850 58.0078 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8644 30.4717 57.6936 N 0 0 0 0 0 0 - 19.3890 30.2278 56.4402 N 0 0 0 0 0 0 - 19.0442 29.0918 55.9519 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2131 27.7463 56.6825 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8987 27.7561 58.3757 S 0 0 0 0 0 0 - 20.1827 29.5317 58.6864 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6467 29.8222 59.7923 O 0 0 0 0 0 0 - 18.4155 29.0391 54.5996 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9456 30.2139 53.9817 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3441 30.1691 52.7261 C 0 0 0 0 0 0 - 17.2051 28.9511 52.0696 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4736 28.8975 50.5073 Cl 0 0 0 0 0 0 - 17.6526 27.7758 52.6640 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2471 27.8189 53.9222 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8327 32.7061 56.2913 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5968 30.4811 47.6104 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4033 30.9609 49.0891 H 0 0 0 0 0 0 - 25.3532 30.4260 47.7088 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5177 32.4252 46.3705 H 0 0 0 0 0 0 - 23.6976 33.0693 47.7875 H 0 0 0 0 0 0 - 26.6196 33.0663 45.9418 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9002 34.6318 46.3996 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5062 34.6317 46.2047 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5571 33.5279 47.5728 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9415 35.1731 47.7690 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7217 34.3261 49.4276 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1693 34.9484 48.8141 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9675 33.2044 50.1122 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4667 32.3939 50.5322 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1498 34.2162 51.9755 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8575 35.2572 51.3965 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5395 33.1075 53.9443 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1537 33.4086 56.6205 H 0 0 0 0 0 0 - 24.6629 32.7886 58.9236 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3957 32.0656 59.5762 H 0 0 0 0 0 0 - 19.9788 32.1176 59.0609 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4347 32.5167 57.4888 H 0 0 0 0 0 0 - 18.2473 27.2434 56.7524 H 0 0 0 0 0 0 - 19.8772 27.1004 56.1068 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0354 31.1729 54.4712 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9904 31.0770 52.2615 H 0 0 0 0 0 0 - 17.5495 26.8304 52.1502 H 0 0 0 0 0 0 - 18.5791 26.8796 54.3375 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0378 32.6610 55.5594 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4658 32.3740 48.2108 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 37 1 0 0 0 - 2 38 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 63 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 39 1 0 0 0 - 4 40 1 0 0 0 - 5 41 1 0 0 0 - 5 42 1 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 44 1 0 0 0 - 6 45 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 46 1 0 0 0 - 7 47 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 48 1 0 0 0 - 8 49 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 50 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 51 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 52 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 53 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 33 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 54 1 0 0 0 - 18 55 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 24 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 26 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 56 1 0 0 0 - 22 57 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 32 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 58 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 59 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 31 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 60 1 0 0 0 - 32 61 1 0 0 0 - 33 62 1 0 0 0 -M CHG 1 3 1 -M END -> -CHEMBL3402763_90 - -> -90 - -$$$$ -CHEMBL3402764_90 - 3D - Structure written by MMmdl. - 57 59 0 0 1 0 999 V2000 - 24.4983 32.6426 47.4000 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8477 33.1265 47.9776 N 0 3 0 0 0 0 - 26.7282 33.7516 46.8757 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7070 34.0817 49.1846 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9669 33.4120 50.3525 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0476 34.2680 51.6221 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1442 33.7553 52.5943 O 0 0 0 0 0 0 - 24.4004 33.8646 53.9094 C 0 0 0 0 0 0 - 25.4439 34.3239 54.3765 O 0 0 0 0 0 0 - 23.2956 33.3782 54.5987 N 0 0 0 0 0 0 - 23.1427 33.0843 55.9651 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1938 33.1130 56.8977 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9701 32.7046 58.2133 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7094 32.2562 58.6081 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6523 32.2304 57.6940 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2620 31.7774 58.1408 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9517 30.3721 57.8100 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4515 30.1430 56.5234 N 0 0 0 0 0 0 - 19.1719 28.9566 56.0882 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4049 27.8574 57.0122 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8897 28.0688 58.2559 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2101 29.3962 58.7559 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6471 29.5714 59.8944 O 0 0 0 0 0 0 - 18.6411 28.7040 54.7248 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9457 27.5247 54.4124 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4541 27.3084 53.1266 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6594 28.2659 52.1380 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1816 28.0564 50.8899 F 0 0 0 0 0 0 - 18.3519 29.4381 52.4270 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8414 29.6559 53.7125 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8740 32.6562 56.3786 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9868 32.0683 48.1732 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7173 32.0099 46.5367 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9268 33.5257 47.1104 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6879 34.0173 47.3235 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2116 34.6326 46.4901 H 0 0 0 0 0 0 - 26.8650 32.9982 46.0986 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7316 34.3260 49.4693 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2033 34.9796 48.8228 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9164 33.2654 50.0932 H 0 0 0 0 0 0 - 25.3859 32.4241 50.5579 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0764 34.2786 51.9887 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7726 35.2996 51.4025 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4979 33.1553 54.0205 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1884 33.4288 56.6266 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7862 32.7203 58.9219 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5539 31.9248 59.6252 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1375 31.9754 59.2077 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5167 32.4201 57.6663 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2194 26.8341 56.7260 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0661 27.2285 58.9091 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7647 26.7541 55.1486 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9208 26.3981 52.8933 H 0 0 0 0 0 0 - 18.5097 30.1723 51.6504 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3813 30.5702 53.9102 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0578 32.6204 55.6701 H 0 0 0 0 0 0 - 26.3475 32.3089 48.3217 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 57 1 0 0 0 - 3 35 1 0 0 0 - 3 36 1 0 0 0 - 3 37 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 38 1 0 0 0 - 4 39 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 40 1 0 0 0 - 5 41 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 42 1 0 0 0 - 6 43 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 44 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 45 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 46 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 47 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 31 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 48 1 0 0 0 - 16 49 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 24 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 50 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 51 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 30 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 52 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 53 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 54 1 0 0 0 - 30 55 1 0 0 0 - 31 56 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL3402764_90 - -> -90 - -$$$$ -CHEMBL3402751_2100 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 25.4546 34.0626 51.8681 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2458 33.5655 52.6084 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0466 33.1217 52.0694 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9546 32.7270 53.3515 S 0 0 0 0 0 0 - 23.1994 33.1657 54.4892 C 0 0 0 0 0 0 - 24.3147 33.5726 53.9283 N 0 0 0 0 0 0 - 23.0109 32.9868 55.9672 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0904 33.1252 56.8524 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9482 32.8025 58.2023 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7220 32.3503 58.6876 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6224 32.2538 57.8330 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2645 31.7859 58.3460 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9383 30.4029 57.9522 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4243 30.2333 56.6662 N 0 0 0 0 0 0 - 19.0833 29.0741 56.1949 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3233 27.9339 57.0667 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8505 28.0858 58.3019 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1983 29.3876 58.8430 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6466 29.5267 59.9800 O 0 0 0 0 0 0 - 18.4707 28.9052 54.8520 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2408 27.6408 54.2812 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5943 27.5179 53.0509 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3595 26.2922 52.5332 F 0 0 0 0 0 0 - 17.1807 28.6542 52.3604 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4067 29.9163 52.9017 C 0 0 0 0 0 0 - 16.9990 31.0230 52.2407 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0491 30.0411 54.1333 C 0 0 0 0 0 0 - 21.7707 32.5908 56.4850 C 0 0 0 0 0 0 - 25.6022 35.1228 52.0676 H 0 0 0 0 0 0 - 25.3498 33.9567 50.7902 H 0 0 0 0 0 0 - 26.3609 33.5264 52.1496 H 0 0 0 0 0 0 - 22.7549 33.0415 51.0331 H 0 0 0 0 0 0 - 25.0615 33.4345 56.4916 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8015 32.8789 58.8636 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6301 32.0620 59.7238 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2058 31.9337 59.4280 H 0 0 0 0 0 0 - 19.4974 32.4531 57.9494 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0880 26.9238 56.7639 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0252 27.2181 58.9207 H 0 0 0 0 0 0 - 18.5424 26.7267 54.7670 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6799 28.5527 51.4100 H 0 0 0 0 0 0 - 18.1922 31.0351 54.5284 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9150 32.4861 55.8355 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 28 2 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 27 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 2 0 0 0 - 27 42 1 0 0 0 - 28 43 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL3402751_2100 - -> -2100 - -$$$$ -CHEMBL3402756_2.7 - 3D - Structure written by MMmdl. - 61 64 0 0 1 0 999 V2000 - 22.9982 29.9362 47.9072 C 0 0 0 0 0 0 - 24.3278 30.6778 48.1609 N 0 3 0 0 0 0 - 25.2664 30.5513 46.9393 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0978 32.1445 48.6051 C 0 0 0 0 0 0 - 25.3345 32.6707 49.3599 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1667 34.0667 49.9645 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9434 34.1323 50.6770 O 0 0 0 0 0 0 - 23.8842 33.7706 52.0053 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9032 33.9262 52.9577 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7082 33.6761 54.2810 N 0 0 0 0 0 0 - 23.4676 33.2411 54.6519 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4407 33.0212 53.7890 N 0 0 0 0 0 0 - 22.6702 33.2865 52.4828 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2133 32.9433 56.1005 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2471 32.9703 57.0489 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0213 32.6080 58.3754 C 0 0 0 0 0 0 - 22.7536 32.2027 58.7775 C 0 0 0 0 0 0 - 21.6963 32.1902 57.8694 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2957 31.7807 58.3139 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9551 30.3978 57.9357 N 0 0 0 0 0 0 - 19.4349 30.2277 56.6502 N 0 0 0 0 0 0 - 19.0827 29.0695 56.1873 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3170 27.9301 57.0633 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8474 28.0856 58.2968 C 0 0 0 0 0 0 - 20.1991 29.3867 58.8373 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6471 29.5265 59.9760 O 0 0 0 0 0 0 - 18.4608 28.9036 54.8502 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0110 30.0386 54.1489 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3558 29.9185 52.9254 C 0 0 0 0 0 0 - 16.9185 31.0287 52.2852 F 0 0 0 0 0 0 - 17.1385 28.6589 52.3755 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5843 27.5222 53.0461 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3561 26.2982 52.5187 F 0 0 0 0 0 0 - 18.2471 27.6433 54.2679 C 0 0 0 0 0 0 - 21.9285 32.5770 56.5496 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4084 29.9823 48.8233 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2350 28.9005 47.6614 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4853 30.4335 47.0812 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2201 31.0264 47.1753 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7849 31.0399 46.0894 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4169 29.4867 46.7506 H 0 0 0 0 0 0 - 23.8475 32.7233 47.7129 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2308 32.1204 49.2703 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5937 31.9729 50.1566 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1821 32.7267 48.6768 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0431 34.3269 50.5594 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1075 34.8007 49.1596 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8727 34.3172 52.6928 H 0 0 0 0 0 0 - 21.8471 33.1264 51.8062 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2516 33.2553 56.7722 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8402 32.6301 59.0814 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5933 31.8934 59.7997 H 0 0 0 0 0 0 - 20.1839 31.9493 59.3885 H 0 0 0 0 0 0 - 19.5726 32.4652 57.8639 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0791 26.9217 56.7594 H 0 0 0 0 0 0 - 20.0182 27.2186 58.9202 H 0 0 0 0 0 0 - 18.1470 31.0302 54.5541 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6177 28.5582 51.4351 H 0 0 0 0 0 0 - 18.5720 26.7303 54.7431 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0976 32.5492 55.8598 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7827 30.2113 48.9368 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 1 37 1 0 0 0 - 1 38 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 61 1 0 0 0 - 3 39 1 0 0 0 - 3 40 1 0 0 0 - 3 41 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 44 1 0 0 0 - 5 45 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 46 1 0 0 0 - 6 47 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 48 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 13 49 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 50 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 51 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 52 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 35 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 53 1 0 0 0 - 19 54 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 55 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 56 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 34 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 57 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 31 2 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 58 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 34 2 0 0 0 - 34 59 1 0 0 0 - 35 60 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL3402756_2.7 - -> -2.7 - -$$$$ -CHEMBL3402760_1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 62 65 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5142 29.6953 47.9585 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0478 30.9914 47.3121 N 0 3 0 0 0 0 - 25.0352 30.8721 45.7714 C 0 0 0 0 0 0 - 24.2814 32.2462 47.7916 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6889 32.6254 49.2268 C 0 0 0 0 0 0 - 24.0700 33.9609 49.6661 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6994 34.3776 50.8698 O 0 0 0 0 0 0 - 24.2676 33.9261 52.0991 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0957 34.1824 53.1917 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7495 33.8877 54.4681 N 0 0 0 0 0 0 - 23.5277 33.3148 54.6599 C 0 0 0 0 0 0 - 22.6559 33.0070 53.6557 N 0 0 0 0 0 0 - 23.0377 33.3162 52.3872 C 0 0 0 0 0 0 - 23.1444 32.9496 56.0657 C 0 0 0 0 0 0 - 24.1013 32.9515 57.0936 C 0 0 0 0 0 0 - 23.7807 32.5462 58.3864 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4873 32.1321 58.6834 C 0 0 0 0 0 0 - 21.5035 32.1395 57.6943 C 0 0 0 0 0 0 - 20.0756 31.7262 58.0418 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7788 30.3264 57.6974 N 0 0 0 0 0 0 - 19.3220 30.1063 56.3970 N 0 0 0 0 0 0 - 19.0578 28.9232 55.9396 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2639 27.8190 56.8630 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7247 28.0235 58.1197 C 0 0 0 0 0 0 - 20.0267 29.3467 58.6401 C 0 0 0 0 0 0 - 20.4528 29.5258 59.7830 O 0 0 0 0 0 0 - 18.5859 28.6953 54.5539 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8374 29.6707 53.5722 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4128 29.4909 52.2572 C 0 0 0 0 0 0 - 17.7329 28.3325 51.8947 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4785 27.3446 52.8514 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9055 27.5253 54.1718 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7887 26.1237 52.4583 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2471 25.1517 52.1433 N 0 0 0 0 0 0 - 21.8349 32.5514 56.3972 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0981 28.8539 47.5794 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4604 29.5878 47.6995 H 0 0 0 0 0 0 - 24.6463 29.8069 49.0319 H 0 0 0 0 0 0 - 25.6208 29.9926 45.4977 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4917 31.7762 45.3646 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9979 30.7731 45.4452 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2138 32.0440 47.6748 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5642 33.0446 47.1048 H 0 0 0 0 0 0 - 25.7769 32.7183 49.2815 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4097 31.8543 49.9454 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9769 33.9265 49.7093 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3180 34.7240 48.9251 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0425 34.6825 53.0470 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2995 33.1186 51.6219 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1196 33.2487 56.8940 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5425 32.5454 59.1518 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2477 31.8032 59.6837 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3795 32.3699 57.5020 H 0 0 0 0 0 0 - 19.8732 31.9406 59.0947 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0824 26.7951 56.5699 H 0 0 0 0 0 0 - 19.8855 27.1800 58.7735 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3708 30.5777 53.8186 H 0 0 0 0 0 0 - 18.6160 30.2516 51.5169 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4168 28.2056 50.8690 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6976 26.7470 54.8942 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0682 32.5367 55.6344 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0123 31.1088 47.6156 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 1 37 1 0 0 0 - 1 38 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 62 1 0 0 0 - 3 39 1 0 0 0 - 3 40 1 0 0 0 - 3 41 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 44 1 0 0 0 - 5 45 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 46 1 0 0 0 - 6 47 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 48 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 13 49 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 50 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 51 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 52 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 35 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 53 1 0 0 0 - 19 54 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 55 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 56 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 32 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 57 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 58 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 59 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 33 1 0 0 0 - 32 60 1 0 0 0 - 33 34 3 0 0 0 - 35 61 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL3402760_1 - -> -1 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/eg5_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/eg5_ligands.sdf deleted file mode 100755 index b8f6a98f..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/eg5_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,3623 +0,0 @@ -CHEMBL1078774 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 55 0 0 1 0 999 V2000 - 12.8146 0.8080 0.0689 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9194 -0.1474 -0.7542 C 0 0 0 0 0 0 - 10.4685 0.3660 -0.7781 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4753 -0.2208 -2.1781 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8886 -1.5790 -0.1851 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8516 -2.4541 -0.5469 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7947 -3.7435 -0.0550 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8117 -4.2036 0.7644 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8807 -3.3692 1.1329 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8820 -2.0552 0.6763 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0286 -3.8741 1.9864 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8076 -3.4485 3.3326 O 0 0 0 0 0 0 - 14.8758 -3.7894 4.2165 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0715 -5.3181 4.2567 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2314 -5.9009 2.8436 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1181 -5.4079 1.8901 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7185 -6.0488 2.1265 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7612 -7.5479 2.0351 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2453 -8.1893 0.8854 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3212 -9.5776 0.8297 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9274 -10.3120 1.9477 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9755 -11.6650 2.0910 O 0 0 0 0 0 0 - 12.4304 -9.6686 3.0444 C 0 0 0 0 0 0 - 12.0577 -10.4439 4.0695 F 0 0 0 0 0 0 - 12.3226 -8.3021 3.1210 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7434 -5.5361 1.1782 N 0 0 0 0 0 0 - 12.5325 0.8833 1.1150 H 0 0 0 0 0 0 - 12.8684 1.8169 -0.3389 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8143 0.4106 0.0939 H 0 0 0 0 0 0 - 10.1312 0.3291 0.2282 H 0 0 0 0 0 0 - 9.7854 -0.1994 -1.3984 H 0 0 0 0 0 0 - 10.2936 1.3645 -1.1331 H 0 0 0 0 0 0 - 13.4726 -0.6589 -2.2247 H 0 0 0 0 0 0 - 12.5251 0.7329 -2.6948 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7885 -0.8617 -2.7053 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0577 -2.1640 -1.2118 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9636 -4.3765 -0.3287 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7110 -1.4397 0.9847 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9568 -3.4397 1.6082 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7982 -3.3159 3.8733 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6645 -3.3991 5.2118 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9448 -5.5693 4.8582 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2132 -5.7780 4.7478 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2000 -5.6073 2.4333 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2545 -6.9886 2.8964 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4360 -5.6292 0.8705 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3626 -5.7833 3.1259 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5633 -7.5865 0.0421 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6945 -10.0446 -0.0712 H 0 0 0 0 0 0 - 13.1617 -12.2032 1.3104 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9305 -7.8479 4.0169 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8870 -6.0695 1.1050 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 36 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 37 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 26 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 10 38 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 11 39 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 14 43 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 44 1 0 0 0 - 15 45 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 46 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 26 1 0 0 0 - 17 47 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 25 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 48 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 49 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 50 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 2 0 0 0 - 25 51 1 0 0 0 - 26 52 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL1078774 - -> -17 - -$$$$ -CHEMBL1093087 - 3D - Structure written by MMmdl. - 66 70 0 0 1 0 999 V2000 - 17.0595 -4.3278 9.3015 N 0 3 0 0 0 0 - 16.4111 -3.6781 8.0642 C 0 0 0 0 0 0 - 15.4283 -4.6540 7.4209 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3173 -3.9632 6.7098 N 0 0 0 0 0 0 - 14.6711 -3.1205 5.5672 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8777 -3.7953 4.1876 C 0 0 1 0 0 0 - 15.1008 -5.3295 4.2145 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2228 -5.9222 2.8121 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1174 -5.4218 1.8557 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7216 -6.0747 2.0945 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7729 -7.6008 2.0278 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2706 -8.2220 0.8801 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3326 -9.6058 0.8050 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9181 -10.3802 1.8839 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4178 -9.7705 3.0309 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3383 -8.3811 3.1031 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7413 -5.5300 1.1481 N 0 0 0 0 0 0 - 11.8102 -4.1920 0.7296 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7818 -3.7078 -0.0824 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8015 -2.3932 -0.5399 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8482 -1.5380 -0.1822 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8927 -0.1087 -0.7182 C 0 0 0 0 0 0 - 10.6612 0.3848 -0.9020 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5434 0.7151 0.1022 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5269 -0.1156 -1.8900 F 0 0 0 0 0 0 - 12.8592 -2.0214 0.6553 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8763 -3.3505 1.0997 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0264 -3.8788 1.9517 C 0 0 1 0 0 0 - 13.7985 -3.4740 3.3022 O 0 0 0 0 0 0 - 13.3153 -3.3837 7.5227 C 0 0 0 0 0 0 - 13.5260 -3.1620 8.8770 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6670 -2.3578 9.6181 C 0 0 0 0 0 0 - 11.5921 -1.7940 8.9796 C 0 0 0 0 0 0 - 11.2437 -2.1161 7.6763 C 0 0 0 0 0 0 - 12.1204 -2.9427 6.9433 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6568 -3.6617 9.7565 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6101 -5.1312 9.0447 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9195 -2.7926 8.4434 H 0 0 0 0 0 0 - 17.2377 -3.4059 7.4424 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9313 -5.3216 6.7606 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9812 -5.2759 8.1921 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9247 -2.3268 5.4426 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5691 -2.5567 5.8165 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7729 -3.3247 3.7794 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0240 -5.5622 4.7373 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2903 -5.8199 4.7564 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1958 -5.6425 2.4082 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2434 -7.0086 2.8819 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4469 -5.6561 0.8431 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3742 -5.8039 3.0944 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6090 -7.6310 0.0429 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7259 -10.0642 -0.0889 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9744 -11.4583 1.8259 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0836 -10.3775 3.8617 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9448 -7.9147 3.9942 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8681 -6.0360 1.1026 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9645 -4.3552 -0.3654 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0037 -2.0394 -1.1794 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6697 -1.3617 0.9363 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9580 -3.4381 1.5896 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3767 -3.5863 9.3810 H 0 0 0 0 0 0 - 12.8478 -2.1791 10.6617 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9180 -1.1483 9.5397 H 0 0 0 0 0 0 - 10.3539 -1.7242 7.2367 H 0 0 0 0 0 0 - 11.8461 -3.2038 5.9297 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3405 -4.6101 9.9418 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 1 37 1 0 0 0 - 1 66 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 38 1 0 0 0 - 2 39 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 40 1 0 0 0 - 3 41 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 42 1 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 6 44 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 45 1 0 0 0 - 7 46 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 47 1 0 0 0 - 8 48 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 9 49 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 10 50 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 51 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 52 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 53 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 54 1 0 0 0 - 16 55 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 56 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 27 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 57 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 58 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 26 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 59 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 60 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 35 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 61 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 62 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 63 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 64 1 0 0 0 - 35 65 1 0 0 0 -M CHG 1 1 1 -M END -> -CHEMBL1093087 - -> -19 - -$$$$ -CHEMBL1082249 - 3D - Structure written by MMmdl. - 58 61 0 0 1 0 999 V2000 - 16.4793 -7.2843 11.3165 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3531 -6.5124 10.6819 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3425 -6.2284 11.3248 O 0 0 0 0 0 0 - 15.5705 -6.1542 9.4074 N 0 0 0 0 0 0 - 14.6248 -5.4276 8.5868 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3309 -4.6310 7.4948 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2349 -3.9683 6.6666 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7037 -3.0483 5.5326 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9054 -3.7819 4.1884 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0841 -5.3250 4.2406 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2163 -5.9084 2.8271 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0959 -5.4139 1.8851 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7047 -6.0683 2.1278 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7518 -7.5911 2.0333 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3185 -8.3767 3.1031 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3947 -9.7647 3.0181 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8984 -10.3649 1.8672 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3180 -9.5891 0.7918 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2433 -8.2036 0.8752 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7323 -5.5141 1.1851 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7964 -4.1649 0.7844 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7831 -3.6789 -0.0372 C 0 0 0 0 0 0 - 9.7490 -4.4602 -0.3161 F 0 0 0 0 0 0 - 10.8205 -2.3838 -0.5398 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8667 -1.5519 -0.1779 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9398 0.2253 -0.8395 Br 0 0 0 0 0 0 - 12.8708 -2.0181 0.6698 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8692 -3.3398 1.1350 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0156 -3.8713 1.9784 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8110 -3.4596 3.3295 O 0 0 0 0 0 0 - 17.2860 -7.4122 10.5963 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1209 -8.2634 11.6274 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8684 -6.7396 12.1761 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4618 -6.3688 8.9839 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9298 -6.1630 8.1684 H 0 0 0 0 0 0 - 14.0418 -4.7470 9.2039 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0166 -3.8888 7.8979 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8487 -5.2672 6.7726 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6134 -4.6809 6.3124 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8909 -2.3248 5.4758 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5997 -2.5296 5.8821 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8101 -3.3391 3.7698 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9741 -5.5907 4.8114 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2386 -5.8006 4.7402 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1810 -5.6068 2.4136 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2464 -6.9959 2.8761 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4070 -5.6435 0.8654 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3679 -5.8170 3.1367 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9257 -7.9159 3.9980 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0597 -10.3748 3.8454 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9444 -11.4421 1.8009 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6837 -10.0591 -0.1086 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5566 -7.6057 0.0323 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9526 -6.1058 0.9333 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0263 -2.0396 -1.1886 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6827 -1.3602 0.9293 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9414 -3.4345 1.5999 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7266 -3.3987 7.3300 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 6 38 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 39 1 0 0 0 - 7 58 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 40 1 0 0 0 - 8 41 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 9 42 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 43 1 0 0 0 - 10 44 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 45 1 0 0 0 - 11 46 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 12 47 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 20 1 0 0 0 - 13 48 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 49 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 50 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 51 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 52 1 0 0 0 - 19 53 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 54 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 28 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 55 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 56 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 57 1 0 0 0 -M CHG 1 7 1 -M END -> -CHEMBL1082249 - -> -6 - -$$$$ -CHEMBL1089393 - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 42 0 0 1 0 999 V2000 - 14.8893 -3.7981 4.1945 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0804 -5.3249 4.2412 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2239 -5.9068 2.8287 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1049 -5.4146 1.8817 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7106 -6.0702 2.1171 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7580 -7.5939 2.0347 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3194 -8.3766 3.1039 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3978 -9.7673 3.0196 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9042 -10.3679 1.8692 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3260 -9.5937 0.7962 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2507 -8.2088 0.8795 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7473 -5.5319 1.1616 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7944 -4.1869 0.7523 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7727 -3.7107 -0.0610 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8032 -2.4026 -0.5353 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8552 -1.5670 -0.1635 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9379 0.0314 -0.7672 Cl 0 0 0 0 0 0 - 12.8564 -2.0281 0.6785 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8661 -3.3474 1.1339 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0119 -3.8725 1.9814 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8062 -3.4544 3.3298 O 0 0 0 0 0 0 - 15.8089 -3.3291 3.8337 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2305 -5.7850 4.7470 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9612 -5.5785 4.8331 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2499 -6.9950 2.8822 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1888 -5.6094 2.4116 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4180 -5.6334 0.8605 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3624 -5.8151 3.1221 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9273 -7.9173 3.9994 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0644 -10.3748 3.8484 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9482 -11.4459 1.8023 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6939 -10.0609 -0.1057 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5643 -7.6077 0.0384 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9613 -6.1290 0.9493 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9479 -4.3538 -0.3413 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0267 -2.0394 -1.1925 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6764 -1.3643 0.9323 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9419 -3.4369 1.6042 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7142 -3.3943 5.1913 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 1 39 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 23 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 12 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 11 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 19 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL1089393 - -> -720 - -$$$$ -CHEMBL1078691 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 55 0 0 1 0 999 V2000 - 10.5284 0.3945 -0.7005 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9546 -0.1757 -0.7407 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4165 -0.1649 -2.1966 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8844 0.7521 0.0824 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8943 -1.5960 -0.1952 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8356 -2.4428 -0.5504 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7698 -3.7406 -0.0534 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7883 -4.2157 0.7713 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8596 -3.3846 1.1392 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8744 -2.0732 0.6730 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0135 -3.8879 1.9819 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8030 -3.4515 3.3286 O 0 0 0 0 0 0 - 14.8803 -3.7868 4.2124 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0742 -5.3209 4.2479 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2231 -5.9051 2.8405 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1110 -5.4142 1.8892 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7111 -6.0630 2.1315 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7590 -7.5693 2.0352 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2481 -8.1881 0.8802 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3233 -9.5851 0.8265 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9107 -10.3576 1.9488 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9634 -11.6728 2.0898 O 0 0 0 0 0 0 - 12.3943 -9.6942 3.0615 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3151 -8.3134 3.1219 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7105 -5.5421 1.2053 N 0 0 0 0 0 0 - 10.5280 1.4627 -0.8455 H 0 0 0 0 0 0 - 10.1643 0.2463 0.2887 H 0 0 0 0 0 0 - 9.8005 -0.0342 -1.3977 H 0 0 0 0 0 0 - 11.5237 -0.4812 -2.7197 H 0 0 0 0 0 0 - 13.2176 -0.8646 -2.4082 H 0 0 0 0 0 0 - 12.7087 0.8049 -2.5906 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9374 1.7755 -0.3054 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8795 0.3348 0.0963 H 0 0 0 0 0 0 - 12.5806 0.8015 1.1253 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0396 -2.1260 -1.1991 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9353 -4.3746 -0.3205 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7039 -1.4652 0.9955 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9427 -3.4482 1.6054 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7960 -3.3137 3.8697 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6678 -3.4019 5.2085 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9512 -5.5698 4.8485 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2195 -5.7746 4.7481 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1903 -5.6151 2.4214 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2455 -6.9935 2.8950 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4209 -5.6374 0.8659 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3698 -5.8077 3.1400 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5669 -7.5944 0.0360 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6985 -10.0555 -0.0752 H 0 0 0 0 0 0 - 13.1844 -12.1816 1.2794 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0817 -10.3093 3.8845 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9231 -7.8651 4.0186 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8078 -5.9877 1.2726 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 35 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 25 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 10 37 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 11 38 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 43 1 0 0 0 - 15 44 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 45 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 25 1 0 0 0 - 17 46 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 24 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 47 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 48 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 49 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 50 1 0 0 0 - 24 51 1 0 0 0 - 25 52 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL1078691 - -> -34 - -$$$$ -CHEMBL1086409 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 54 0 0 1 0 999 V2000 - 15.2852 -4.6386 7.5377 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2140 -3.9638 6.6838 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7229 -3.0568 5.5568 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9031 -3.7791 4.1930 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0673 -5.3233 4.2376 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2106 -5.9104 2.8268 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0964 -5.4064 1.8821 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7040 -6.0577 2.1299 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7501 -7.5747 2.0307 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2481 -8.1929 0.8744 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3274 -9.5772 0.8022 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9065 -10.3273 1.8986 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9781 -11.6576 1.9122 F 0 0 0 0 0 0 - 12.4005 -9.7294 3.0355 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3196 -8.3522 3.1084 C 0 0 0 0 0 0 - 11.6986 -5.5069 1.2248 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7870 -4.1773 0.7812 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7766 -3.7112 -0.0571 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8176 -2.4109 -0.5470 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8604 -1.5556 -0.1863 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9094 -0.1390 -0.7460 C 0 0 0 0 0 0 - 12.5320 -0.1612 -1.9254 F 0 0 0 0 0 0 - 10.6767 0.3334 -0.9239 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5676 0.6891 0.0651 F 0 0 0 0 0 0 - 12.8548 -2.0208 0.6812 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8610 -3.3416 1.1411 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0088 -3.8657 1.9891 C 0 0 1 0 0 0 - 13.7932 -3.4672 3.3434 O 0 0 0 0 0 0 - 14.6948 -5.2041 8.2632 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8829 -3.8490 8.0065 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8800 -5.2958 6.9019 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6178 -4.6706 6.2820 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9311 -2.3052 5.5033 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6440 -2.5855 5.9141 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8092 -3.3451 3.7550 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9506 -5.6016 4.8084 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2088 -5.7825 4.7320 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1820 -5.6237 2.4174 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2320 -6.9982 2.8820 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4096 -5.6240 0.8610 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3673 -5.8233 3.1411 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5784 -7.5954 0.0345 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7093 -10.0600 -0.0884 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0946 -10.3597 3.8597 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9422 -7.8995 4.0140 H 0 0 0 0 0 0 - 10.7765 -5.8854 1.4070 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9543 -4.3549 -0.3328 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0329 -2.0650 -1.2044 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6650 -1.3653 0.9686 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9422 -3.4219 1.6325 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6785 -3.3900 7.3163 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 2 51 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 3 34 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 5 37 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 38 1 0 0 0 - 6 39 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 7 40 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 8 41 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 15 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 42 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 43 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 14 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 44 1 0 0 0 - 15 45 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 46 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 26 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 47 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 48 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 21 24 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 49 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 50 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL1086409 - -> -58 - -$$$$ -CHEMBL1082248 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - 15.2950 -4.6489 7.5427 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2431 -3.9717 6.6832 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7152 -3.0566 5.5506 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8996 -3.7854 4.1962 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0784 -5.3263 4.2419 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2145 -5.9089 2.8275 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0958 -5.4103 1.8854 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7046 -6.0664 2.1334 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7522 -7.5891 2.0319 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2426 -8.2016 0.8733 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3140 -9.5878 0.7904 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8993 -10.3629 1.8685 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3976 -9.7624 3.0199 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3188 -8.3746 3.1014 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7003 -5.5083 1.2297 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7953 -4.1716 0.7885 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7805 -3.6907 -0.0459 C 0 0 0 0 0 0 - 9.7395 -4.4635 -0.3381 F 0 0 0 0 0 0 - 10.8168 -2.3885 -0.5402 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8588 -1.5562 -0.1789 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9219 0.2266 -0.8239 Br 0 0 0 0 0 0 - 12.8579 -2.0181 0.6739 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8701 -3.3425 1.1348 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0136 -3.8673 1.9896 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8021 -3.4602 3.3414 O 0 0 0 0 0 0 - 14.6722 -5.3376 8.1135 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7378 -3.8667 8.1578 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9889 -5.1440 6.8693 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6986 -4.7078 6.2653 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9006 -2.3314 5.5188 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6229 -2.5742 5.9093 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8010 -3.3533 3.7592 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9669 -5.5897 4.8122 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2332 -5.7983 4.7432 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1816 -5.6138 2.4140 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2390 -6.9966 2.8739 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4023 -5.6396 0.8642 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3631 -5.8282 3.1420 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5605 -7.6046 0.0315 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6817 -10.0581 -0.1090 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9563 -11.4399 1.8085 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0729 -10.3710 3.8527 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9266 -7.9115 3.9950 H 0 0 0 0 0 0 - 10.7715 -5.8527 1.4458 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0125 -2.0341 -1.1684 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6352 -1.3316 0.9629 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9508 -3.4231 1.6469 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6821 -3.4293 7.3237 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 2 48 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 25 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 35 1 0 0 0 - 6 36 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 24 1 0 0 0 - 7 37 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 15 1 0 0 0 - 8 38 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 14 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 40 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 41 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 42 1 0 0 0 - 14 43 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 44 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 23 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 46 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 47 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL1082248 - -> -3 - -$$$$ -CHEMBL1084678 - 3D - Structure written by MMmdl. - 65 68 0 0 1 0 999 V2000 - 13.9216 -5.2248 6.2140 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3931 -3.9357 6.7113 N 0 0 0 0 0 0 - 14.7292 -3.0772 5.5493 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9090 -3.7899 4.1939 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0802 -5.3264 4.2516 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2184 -5.9103 2.8356 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1038 -5.4145 1.8827 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7108 -6.0690 2.1214 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7593 -7.5926 2.0373 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2528 -8.2067 0.8813 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3297 -9.5928 0.7978 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9076 -10.3673 1.8725 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4034 -9.7655 3.0228 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3256 -8.3763 3.1078 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7374 -5.5233 1.1763 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7936 -4.1831 0.7614 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7743 -3.7096 -0.0570 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8089 -2.4050 -0.5396 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8578 -1.5536 -0.1865 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9038 -0.1354 -0.7457 C 0 0 0 0 0 0 - 12.5538 0.6943 0.0706 F 0 0 0 0 0 0 - 10.6704 0.3354 -0.9312 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5323 -0.1555 -1.9215 F 0 0 0 0 0 0 - 12.8594 -2.0221 0.6688 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8662 -3.3440 1.1312 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0156 -3.8719 1.9779 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8095 -3.4697 3.3345 O 0 0 0 0 0 0 - 15.6866 -4.1881 7.8512 S 0 0 0 0 0 0 - 15.9605 -2.8994 8.4965 O 0 0 0 0 0 0 - 16.7692 -4.9053 7.1723 O 0 0 0 0 0 0 - 14.8572 -5.3740 9.0989 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9171 -5.9921 10.0050 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3038 -6.9160 11.0151 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3534 -7.4821 11.8573 N 0 3 0 0 0 0 - 13.1126 -5.0654 5.5011 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5579 -5.8251 7.0480 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7422 -5.7465 5.7215 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9642 -2.3054 5.4592 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6464 -2.5325 5.7827 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8063 -3.3644 3.7396 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9574 -5.5924 4.8413 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2186 -5.7837 4.7374 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1824 -5.6023 2.4292 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2504 -6.9993 2.8747 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4142 -5.6578 0.8660 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3696 -5.7939 3.1206 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5731 -7.6058 0.0429 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7135 -10.0635 -0.0957 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9663 -11.4447 1.8125 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0731 -10.3767 3.8503 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9367 -7.9121 4.0023 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9629 -6.1171 0.9159 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9574 -4.3554 -0.3440 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0263 -2.0526 -1.1952 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6706 -1.3642 0.9426 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9395 -3.4278 1.6031 H 0 0 0 0 0 0 - 14.1288 -4.7959 9.6664 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3347 -6.1489 8.5436 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6439 -6.5608 9.4235 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4631 -5.2166 10.5437 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6002 -6.3607 11.6353 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7780 -7.7200 10.5000 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9405 -8.1042 12.5374 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8406 -6.7371 12.3345 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0054 -7.9967 11.2826 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 1 37 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 3 39 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 4 40 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 41 1 0 0 0 - 5 42 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 43 1 0 0 0 - 6 44 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 7 45 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 15 1 0 0 0 - 8 46 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 14 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 47 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 48 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 49 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 50 1 0 0 0 - 14 51 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 52 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 25 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 53 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 54 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 24 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 55 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 56 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 30 2 0 0 0 - 28 31 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 57 1 0 0 0 - 31 58 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 59 1 0 0 0 - 32 60 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 61 1 0 0 0 - 33 62 1 0 0 0 - 34 63 1 0 0 0 - 34 64 1 0 0 0 - 34 65 1 0 0 0 -M CHG 1 34 1 -M END -> -CHEMBL1084678 - -> -7 - -$$$$ -CHEMBL1084115 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - 12.7905 0.8113 0.0884 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9263 -0.1652 -0.7557 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4938 -0.2209 -2.1702 C 0 0 0 0 0 0 - 10.4639 0.3327 -0.8178 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8952 -1.5870 -0.1857 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8567 -2.4703 -0.5485 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8008 -3.7530 -0.0487 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8122 -4.2238 0.7871 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8826 -3.3657 1.1452 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8768 -2.0583 0.6771 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0286 -3.8762 1.9932 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8036 -3.4388 3.3367 O 0 0 0 0 0 0 - 14.8743 -3.7832 4.2226 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0676 -5.3199 4.2586 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2317 -5.8973 2.8508 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1288 -5.4003 1.8929 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7338 -6.0798 2.1298 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7833 -7.5758 1.9513 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3328 -8.2240 0.8368 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3036 -9.5996 0.9042 C 0 0 0 0 0 0 - 12.5533 -10.1505 2.3594 S 0 0 0 0 0 0 - 12.2835 -8.5069 2.8549 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7330 -5.5400 1.2141 N 0 0 0 0 0 0 - 12.8774 1.8196 -0.3202 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7853 0.3992 0.1623 H 0 0 0 0 0 0 - 12.5316 0.8875 1.1493 H 0 0 0 0 0 0 - 12.5396 0.7334 -2.7014 H 0 0 0 0 0 0 - 11.8012 -0.8731 -2.7045 H 0 0 0 0 0 0 - 13.4817 -0.6704 -2.2071 H 0 0 0 0 0 0 - 9.7760 -0.2126 -1.4624 H 0 0 0 0 0 0 - 10.2442 1.3554 -1.1064 H 0 0 0 0 0 0 - 10.1299 0.2315 0.2170 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0702 -2.1959 -1.2188 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9698 -4.3894 -0.3253 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7147 -1.4524 0.9854 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9578 -3.4374 1.6153 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7930 -3.3245 3.8765 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6628 -3.3951 5.2148 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9430 -5.5641 4.8625 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2109 -5.7763 4.7551 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2014 -5.6107 2.4371 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2555 -6.9840 2.9015 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4523 -5.5955 0.8708 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3885 -5.8052 3.1269 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7581 -7.6897 0.0035 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6812 -10.3029 0.1651 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7910 -8.3088 3.7910 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8761 -6.0660 1.1786 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 33 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 23 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 41 1 0 0 0 - 15 42 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 43 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 23 1 0 0 0 - 17 44 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 22 2 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 46 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 47 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL1084115 - -> -120 - -$$$$ -CHEMBL1084431 - 3D - Structure written by MMmdl. - 71 75 0 0 1 0 999 V2000 - 20.4061 -3.7657 7.9254 C 0 0 0 0 0 0 - 18.9124 -3.9931 7.7765 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0258 -2.9250 7.9026 C 0 0 0 0 0 0 - 16.6577 -3.1320 7.7478 C 0 0 0 0 0 0 - 16.1648 -4.4081 7.4449 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6878 -4.6643 7.2329 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1939 -5.6634 7.7631 O 0 0 0 0 0 0 - 13.9487 -3.8243 6.4460 N 0 0 0 0 0 0 - 12.4795 -4.0242 6.4012 C 0 0 0 0 0 0 - 11.6019 -2.8223 6.0038 C 0 0 0 0 0 0 - 11.3321 -2.8831 4.4934 N 0 3 0 0 0 0 - 14.5613 -2.9978 5.3800 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7961 -3.6692 4.0001 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0811 -5.1931 4.0309 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2403 -5.7746 2.6172 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1077 -5.3260 1.6628 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7413 -6.0318 1.9021 C 0 0 2 0 0 0 - 12.8422 -7.5568 1.8513 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4533 -8.3229 2.9526 C 0 0 0 0 0 0 - 12.5253 -9.7125 2.8926 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9477 -10.3381 1.7271 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3353 -9.5811 0.6254 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3108 -8.1934 0.6978 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7319 -5.5273 0.9660 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7370 -4.1806 0.5580 C 0 0 0 0 0 0 - 10.6892 -3.7238 -0.2418 C 0 0 0 0 0 0 - 10.6688 -2.4058 -0.6876 C 0 0 0 0 0 0 - 11.6907 -1.5255 -0.3218 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7117 -0.0976 -0.8567 C 0 0 0 0 0 0 - 12.2908 0.7357 0.0080 F 0 0 0 0 0 0 - 12.4102 -0.0772 -1.9917 F 0 0 0 0 0 0 - 10.4766 0.3334 -1.1054 F 0 0 0 0 0 0 - 12.7176 -1.9787 0.5071 C 0 0 0 0 0 0 - 12.7770 -3.3077 0.9323 C 0 0 0 0 0 0 - 13.9477 -3.7906 1.7717 C 0 0 1 0 0 0 - 13.6969 -3.4009 3.1267 O 0 0 0 0 0 0 - 17.0605 -5.4838 7.3765 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4268 -5.2802 7.5326 C 0 0 0 0 0 0 - 20.8966 -4.6385 8.3533 H 0 0 0 0 0 0 - 20.6157 -2.9273 8.5942 H 0 0 0 0 0 0 - 20.8541 -3.5552 6.9542 H 0 0 0 0 0 0 - 18.3892 -1.9293 8.1145 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9889 -2.2922 7.8543 H 0 0 0 0 0 0 - 12.2659 -4.8647 5.7368 H 0 0 0 0 0 0 - 12.1472 -4.3462 7.3894 H 0 0 0 0 0 0 - 10.6031 -2.8770 6.4480 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0431 -1.8456 6.2206 H 0 0 0 0 0 0 - 10.7298 -2.1320 4.1414 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8553 -3.7530 4.2874 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9811 -2.0922 5.2324 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5298 -2.6261 5.6945 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6700 -3.1564 3.5927 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9914 -5.3897 4.6001 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2785 -5.7188 4.5518 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1963 -5.4430 2.2066 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3123 -6.8623 2.6711 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4375 -5.5427 0.6447 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3821 -5.7716 2.9017 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0964 -7.8495 3.8566 H 0 0 0 0 0 0 - 12.2295 -10.3081 3.7462 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9787 -11.4176 1.6762 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6722 -10.0595 -0.2817 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6137 -7.6139 -0.1606 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8780 -6.0664 0.9477 H 0 0 0 0 0 0 - 9.8977 -4.3963 -0.5354 H 0 0 0 0 0 0 - 9.8632 -2.0699 -1.3224 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5136 -1.3007 0.7868 H 0 0 0 0 0 0 - 14.8593 -3.3099 1.4053 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7009 -6.4861 7.1830 H 0 0 0 0 0 0 - 19.1055 -6.1201 7.4605 H 0 0 0 0 0 0 - 12.1955 -2.8872 3.9543 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 39 1 0 0 0 - 1 40 1 0 0 0 - 1 41 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 38 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 42 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 37 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 8 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 44 1 0 0 0 - 9 45 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 46 1 0 0 0 - 10 47 1 0 0 0 - 11 48 1 0 0 0 - 11 49 1 0 0 0 - 11 71 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 50 1 0 0 0 - 12 51 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 13 52 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 53 1 0 0 0 - 14 54 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 55 1 0 0 0 - 15 56 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 16 57 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 24 1 0 0 0 - 17 58 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 59 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 60 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 61 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 62 1 0 0 0 - 23 63 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 64 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 34 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 65 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 66 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 31 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 - 33 34 2 0 0 0 - 33 67 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 68 1 0 0 0 - 37 38 2 0 0 0 - 37 69 1 0 0 0 - 38 70 1 0 0 0 -M CHG 1 11 1 -M END -> -CHEMBL1084431 - -> -65 - -$$$$ -CHEMBL1085895 - 3D - Structure written by MMmdl. - 61 64 0 0 1 0 999 V2000 - 16.4467 -4.4109 7.4249 O 0 0 0 0 0 0 - 15.2351 -4.6139 7.4730 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6650 -5.5529 8.2387 N 0 0 0 0 0 0 - 15.3869 -6.4361 9.1585 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2668 -6.0328 10.6455 C 0 0 0 0 0 0 - 13.8226 -5.9803 11.1627 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1566 -4.8684 10.5881 O 0 0 0 0 0 0 - 14.3343 -3.9820 6.7011 N 0 0 0 0 0 0 - 14.6936 -3.0974 5.5864 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8991 -3.7794 4.2042 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0796 -5.3216 4.2396 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2170 -5.9056 2.8282 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0982 -5.4118 1.8834 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7071 -6.0676 2.1263 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7538 -7.5905 2.0348 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3222 -8.3753 3.1056 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3985 -9.7635 3.0200 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9019 -10.3648 1.8691 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3224 -9.5891 0.7939 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2458 -8.2037 0.8776 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7300 -5.5199 1.1852 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7894 -4.1781 0.7704 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7703 -3.7089 -0.0567 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8105 -2.4059 -0.5418 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8590 -1.5551 -0.1897 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9086 -0.1381 -0.7474 C 0 0 0 0 0 0 - 10.6756 0.3312 -0.9261 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5656 0.6893 0.0654 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5316 -0.1600 -1.9259 F 0 0 0 0 0 0 - 12.8601 -2.0232 0.6679 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8600 -3.3430 1.1355 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0117 -3.8696 1.9810 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8055 -3.4605 3.3355 O 0 0 0 0 0 0 - 13.6582 -5.5705 8.3023 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9279 -7.4158 9.0362 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4371 -6.5451 8.8797 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8294 -6.7485 11.2505 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7509 -5.0717 10.8267 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3103 -6.8986 10.8617 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8037 -5.9486 12.2545 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3548 -4.6854 11.0876 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3526 -4.1690 6.8347 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9202 -2.3332 5.5075 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5994 -2.5443 5.8485 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8025 -3.3267 3.7880 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9600 -5.5867 4.8260 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2304 -5.7872 4.7430 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1836 -5.6053 2.4186 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2476 -6.9928 2.8841 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4127 -5.6391 0.8639 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3723 -5.8162 3.1365 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9359 -7.9127 4.0028 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0683 -10.3720 3.8500 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9496 -11.4422 1.8040 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6904 -10.0586 -0.1062 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5615 -7.6046 0.0370 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9273 -6.1033 0.9966 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9481 -4.3512 -0.3337 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0229 -2.0607 -1.1956 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6834 -1.3760 0.9343 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9403 -3.4348 1.6035 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 8 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 34 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 4 36 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 37 1 0 0 0 - 5 38 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 39 1 0 0 0 - 6 40 1 0 0 0 - 7 41 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 42 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 43 1 0 0 0 - 9 44 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 45 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 46 1 0 0 0 - 11 47 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 48 1 0 0 0 - 12 49 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 13 50 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 21 1 0 0 0 - 14 51 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 52 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 53 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 54 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 55 1 0 0 0 - 20 56 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 57 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 31 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 58 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 59 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 30 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 28 1 0 0 0 - 26 29 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 60 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 61 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL1085895 - -> -11 - -$$$$ -CHEMBL1084677 - 3D - Structure written by MMmdl. - 62 65 0 0 1 0 999 V2000 - 16.1912 -7.7412 11.8466 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1910 -6.9123 11.0170 N 0 3 0 0 0 0 - 15.9171 -5.9921 10.0050 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8572 -5.3740 9.0989 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6866 -4.1881 7.8512 S 0 0 0 0 0 0 - 15.9605 -2.8994 8.4965 O 0 0 0 0 0 0 - 16.7692 -4.9053 7.1723 O 0 0 0 0 0 0 - 14.3931 -3.9357 6.7113 N 0 0 0 0 0 0 - 14.7292 -3.0772 5.5493 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9090 -3.7899 4.1939 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0802 -5.3264 4.2516 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2184 -5.9103 2.8356 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1038 -5.4145 1.8827 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7108 -6.0690 2.1214 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7593 -7.5926 2.0373 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3256 -8.3763 3.1078 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4034 -9.7655 3.0228 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9076 -10.3673 1.8725 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3297 -9.5928 0.7978 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2528 -8.2067 0.8813 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7374 -5.5233 1.1763 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7936 -4.1831 0.7614 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7743 -3.7096 -0.0570 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8089 -2.4050 -0.5396 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8578 -1.5536 -0.1865 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9038 -0.1354 -0.7457 C 0 0 0 0 0 0 - 10.6704 0.3354 -0.9312 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5538 0.6943 0.0706 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5323 -0.1555 -1.9215 F 0 0 0 0 0 0 - 12.8594 -2.0221 0.6688 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8662 -3.3440 1.1312 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0156 -3.8719 1.9779 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8095 -3.4697 3.3345 O 0 0 0 0 0 0 - 15.6079 -8.3192 12.5593 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8422 -7.0180 12.3360 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7252 -8.3672 11.1323 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5471 -7.5260 10.5314 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4848 -5.2614 10.5795 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6028 -6.6401 9.4590 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3005 -6.1177 8.5318 H 0 0 0 0 0 0 - 14.1328 -4.8034 9.6822 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9458 -4.8155 6.4388 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9602 -2.3095 5.4481 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6378 -2.5432 5.8251 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8078 -3.3352 3.7720 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9578 -5.5895 4.8417 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2267 -5.7829 4.7558 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1860 -5.6147 2.4228 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2464 -6.9974 2.8926 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4218 -5.6358 0.8626 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3662 -5.8168 3.1277 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9339 -7.9169 4.0042 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0706 -10.3738 3.8521 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9509 -11.4449 1.8045 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6962 -10.0604 -0.1030 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5656 -7.6086 0.0393 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8964 -6.0776 1.0669 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9514 -4.3520 -0.3355 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0217 -2.0639 -1.1957 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6843 -1.3740 0.9344 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9446 -3.4365 1.6004 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6360 -6.3283 11.6396 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 37 1 0 0 0 - 2 62 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 3 39 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 40 1 0 0 0 - 4 41 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 7 2 0 0 0 - 5 8 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 42 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 43 1 0 0 0 - 9 44 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 45 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 46 1 0 0 0 - 11 47 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 48 1 0 0 0 - 12 49 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 13 50 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 21 1 0 0 0 - 14 51 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 52 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 53 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 54 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 55 1 0 0 0 - 20 56 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 57 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 31 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 58 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 59 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 30 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 28 1 0 0 0 - 26 29 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 60 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 61 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL1084677 - -> -4 - -$$$$ -CHEMBL1077227 - 3D - Structure written by MMmdl. - 57 60 0 0 1 0 999 V2000 - 15.2899 -4.6440 7.5351 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2408 -3.9683 6.6690 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7206 -3.0566 5.5418 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8984 -3.7855 4.1902 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0728 -5.3257 4.2388 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2134 -5.9104 2.8261 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0958 -5.4095 1.8827 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7022 -6.0636 2.1368 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7070 -7.5842 2.0907 C 0 0 0 0 0 0 - 12.2595 -8.4762 3.0628 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4745 -9.8243 2.7647 C 0 0 0 0 0 0 - 13.0252 -10.0075 1.5129 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3330 -8.4922 0.7364 S 0 0 0 0 0 0 - 11.6991 -5.5164 1.2216 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7868 -4.1856 0.7799 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7738 -3.7177 -0.0535 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8219 -2.4249 -0.5507 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8669 -1.5627 -0.1974 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9198 -0.1294 -0.7526 C 0 0 0 0 0 0 - 10.4882 0.3797 -0.9919 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6705 -0.0930 -2.0912 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6599 0.8143 0.2183 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8580 -2.0372 0.6716 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8622 -3.3514 1.1382 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0094 -3.8677 1.9934 C 0 0 1 0 0 0 - 13.7960 -3.4623 3.3445 O 0 0 0 0 0 0 - 14.6664 -5.2237 8.2169 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8523 -3.8448 8.0176 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8748 -5.2649 6.8653 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7110 -4.7018 6.2296 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9057 -2.3303 5.5154 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6371 -2.5924 5.9000 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7935 -3.3529 3.7429 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9485 -5.5941 4.8268 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2142 -5.7907 4.7217 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1837 -5.6238 2.4135 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2279 -6.9978 2.8763 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4053 -5.6215 0.8588 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3641 -5.7750 3.1321 H 0 0 0 0 0 0 - 11.8117 -8.1486 3.9889 H 0 0 0 0 0 0 - 12.2118 -10.6326 3.4332 H 0 0 0 0 0 0 - 13.2650 -10.9429 1.0257 H 0 0 0 0 0 0 - 10.7720 -5.8918 1.3809 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9477 -4.3525 -0.3357 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0337 -2.1012 -1.2145 H 0 0 0 0 0 0 - 10.4127 1.4448 -1.0125 H 0 0 0 0 0 0 - 9.8181 0.0700 -0.2204 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0518 0.0158 -1.8864 H 0 0 0 0 0 0 - 12.1527 -0.6813 -2.8327 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6843 -0.4720 -2.0012 H 0 0 0 0 0 0 - 12.7560 0.9141 -2.4864 H 0 0 0 0 0 0 - 12.5165 1.8671 -0.0212 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7282 0.6208 0.2096 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3734 0.6364 1.2460 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6663 -1.3913 0.9779 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9478 -3.4140 1.6615 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6614 -3.4199 7.2878 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 2 57 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 36 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 7 38 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 14 1 0 0 0 - 8 39 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 40 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 41 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 42 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 43 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 24 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 44 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 45 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 20 46 1 0 0 0 - 20 47 1 0 0 0 - 20 48 1 0 0 0 - 21 49 1 0 0 0 - 21 50 1 0 0 0 - 21 51 1 0 0 0 - 22 52 1 0 0 0 - 22 53 1 0 0 0 - 22 54 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 55 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 56 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL1077227 - -> -5 - -$$$$ -CHEMBL1086410 - 3D - Structure written by MMmdl. - 60 63 0 0 1 0 999 V2000 - 15.2901 -4.6437 7.5383 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2345 -3.9601 6.6829 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7221 -3.0583 5.5490 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8999 -3.7840 4.1926 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0700 -5.3255 4.2383 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2153 -5.9091 2.8263 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0983 -5.4050 1.8842 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7057 -6.0670 2.1305 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7531 -7.5892 2.0317 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3225 -8.3747 3.1029 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3958 -9.7629 3.0192 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8972 -10.3629 1.8676 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3187 -9.5874 0.7926 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2445 -8.2014 0.8739 C 0 0 0 0 0 0 - 11.6991 -5.5133 1.2256 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7858 -4.1845 0.7833 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7712 -3.7187 -0.0475 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8197 -2.4274 -0.5442 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8648 -1.5641 -0.1926 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9169 -0.1315 -0.7463 C 0 0 0 0 0 0 - 12.7557 -0.1019 -2.0369 C 0 0 0 0 0 0 - 12.5803 0.8318 0.2570 C 0 0 0 0 0 0 - 10.4805 0.3432 -1.0380 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8556 -2.0349 0.6769 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8619 -3.3505 1.1396 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0087 -3.8650 1.9951 C 0 0 1 0 0 0 - 13.7947 -3.4627 3.3473 O 0 0 0 0 0 0 - 14.6735 -5.1814 8.2598 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8828 -3.8437 7.9841 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8509 -5.3019 6.8818 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6389 -4.6718 6.2894 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9254 -2.3118 5.5211 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6389 -2.6096 5.9280 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7954 -3.3483 3.7468 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9375 -5.6020 4.8343 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2035 -5.7885 4.7085 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1861 -5.6234 2.4153 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2297 -6.9971 2.8750 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4101 -5.6090 0.8598 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3692 -5.8348 3.1428 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9399 -7.9122 4.0011 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0683 -10.3730 3.8497 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9497 -11.4400 1.8049 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6958 -10.0580 -0.1024 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5651 -7.6033 0.0339 H 0 0 0 0 0 0 - 10.7785 -5.9107 1.3696 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9359 -4.3468 -0.3168 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0178 -2.1019 -1.1900 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9019 0.9045 -2.4236 H 0 0 0 0 0 0 - 12.2955 -0.6969 -2.8131 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7493 -0.5034 -1.8678 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6597 0.7317 0.2362 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3141 0.5827 1.2765 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3525 1.8791 0.0573 H 0 0 0 0 0 0 - 10.3454 1.4034 -1.0795 H 0 0 0 0 0 0 - 9.7702 0.0204 -0.3014 H 0 0 0 0 0 0 - 10.1013 -0.0683 -1.9475 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6541 -1.3803 0.9921 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9440 -3.4101 1.6563 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7216 -3.3684 7.3194 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 2 60 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 6 38 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 7 39 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 15 1 0 0 0 - 8 40 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 14 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 41 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 42 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 43 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 44 1 0 0 0 - 14 45 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 46 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 25 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 47 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 48 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 24 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 49 1 0 0 0 - 21 50 1 0 0 0 - 21 51 1 0 0 0 - 22 52 1 0 0 0 - 22 53 1 0 0 0 - 22 54 1 0 0 0 - 23 55 1 0 0 0 - 23 56 1 0 0 0 - 23 57 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 58 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 59 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL1086410 - -> -4 - -$$$$ -CHEMBL1083517 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 55 0 0 1 0 999 V2000 - 15.2945 -4.6456 7.5469 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2188 -3.9772 6.6830 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7170 -3.0548 5.5563 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9062 -3.7815 4.1963 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0762 -5.3257 4.2405 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2119 -5.9103 2.8279 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0958 -5.4085 1.8831 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7022 -6.0556 2.1309 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7494 -7.5720 2.0320 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3122 -8.3407 3.1105 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3858 -9.7169 3.0355 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8953 -10.3167 1.9053 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9346 -11.6580 1.9834 O 0 0 0 0 0 0 - 13.3254 -9.5761 0.8020 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2462 -8.1884 0.8749 C 0 0 0 0 0 0 - 11.6994 -5.5075 1.2212 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7844 -4.1764 0.7815 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7699 -3.7067 -0.0503 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8150 -2.4088 -0.5447 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8616 -1.5558 -0.1890 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9106 -0.1398 -0.7467 C 0 0 0 0 0 0 - 10.6754 0.3322 -0.9250 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5663 0.6893 0.0656 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5325 -0.1603 -1.9255 F 0 0 0 0 0 0 - 12.8587 -2.0233 0.6738 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8627 -3.3435 1.1365 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0125 -3.8687 1.9839 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8063 -3.4625 3.3381 O 0 0 0 0 0 0 - 14.7131 -5.3408 8.1571 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7717 -3.8634 8.1459 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9993 -5.1648 6.8954 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6481 -4.6984 6.2609 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9150 -2.3146 5.4984 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6272 -2.5637 5.9148 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8145 -3.3482 3.7701 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9685 -5.5977 4.8005 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2301 -5.7976 4.7439 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1813 -5.6195 2.4167 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2366 -6.9982 2.8824 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4092 -5.6329 0.8632 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3643 -5.8188 3.1418 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9255 -7.8983 4.0140 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0629 -10.3482 3.8517 H 0 0 0 0 0 0 - 13.1991 -12.1433 1.1685 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7047 -10.0489 -0.0940 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5679 -7.5941 0.0318 H 0 0 0 0 0 0 - 10.7811 -5.9070 1.3745 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9416 -4.3450 -0.3209 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0299 -2.0650 -1.2027 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6742 -1.3708 0.9526 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9439 -3.4301 1.6181 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6443 -3.4278 7.3100 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 2 52 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 3 34 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 5 37 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 38 1 0 0 0 - 6 39 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 7 40 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 8 41 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 15 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 42 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 43 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 14 1 0 0 0 - 13 44 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 45 1 0 0 0 - 15 46 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 47 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 26 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 48 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 49 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 21 24 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 50 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 51 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL1083517 - -> -4 - -$$$$ -CHEMBL1096003 - 3D - Structure written by MMmdl. - 62 65 0 0 1 0 999 V2000 - 16.1912 -7.7412 11.8466 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1910 -6.9123 11.0170 N 0 3 0 0 0 0 - 14.3191 -7.8539 10.3207 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9171 -5.9921 10.0050 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8572 -5.3740 9.0989 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6866 -4.1881 7.8512 S 0 0 0 0 0 0 - 15.9605 -2.8994 8.4965 O 0 0 0 0 0 0 - 16.7692 -4.9053 7.1723 O 0 0 0 0 0 0 - 14.3931 -3.9357 6.7113 N 0 0 0 0 0 0 - 14.7292 -3.0772 5.5493 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9090 -3.7899 4.1939 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0802 -5.3264 4.2516 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2184 -5.9103 2.8356 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1038 -5.4145 1.8827 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7108 -6.0690 2.1214 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7593 -7.5926 2.0373 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3256 -8.3763 3.1078 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4034 -9.7655 3.0228 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9076 -10.3673 1.8725 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3297 -9.5928 0.7978 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2528 -8.2067 0.8813 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7374 -5.5233 1.1763 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7936 -4.1831 0.7614 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7743 -3.7096 -0.0570 C 0 0 0 0 0 0 - 9.7529 -4.5301 -0.4068 F 0 0 0 0 0 0 - 10.8089 -2.4050 -0.5396 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8578 -1.5536 -0.1865 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9057 0.0650 -0.7794 Cl 0 0 0 0 0 0 - 12.8594 -2.0221 0.6688 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8662 -3.3440 1.1312 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0156 -3.8719 1.9779 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8095 -3.4697 3.3345 O 0 0 0 0 0 0 - 15.6635 -8.3780 12.5584 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8639 -7.0917 12.4097 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7956 -8.3831 11.2033 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9112 -8.4558 9.6313 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5612 -7.3034 9.7634 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8340 -8.5055 11.0474 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4788 -5.2144 10.5267 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6310 -6.5641 9.4086 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3317 -6.1203 8.5046 H 0 0 0 0 0 0 - 14.1257 -4.7632 9.6310 H 0 0 0 0 0 0 - 14.0692 -4.8219 6.3319 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9634 -2.3059 5.4562 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6452 -2.5288 5.7797 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8059 -3.3643 3.7387 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9589 -5.5929 4.8383 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2174 -5.7845 4.7339 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1814 -5.6012 2.4271 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2511 -6.9994 2.8712 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4140 -5.6583 0.8657 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3674 -5.7942 3.1196 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9279 -7.9120 3.9977 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0653 -10.3792 3.8449 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9611 -11.4448 1.8082 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7098 -10.0636 -0.0974 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5699 -7.6070 0.0406 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9548 -6.0948 0.8815 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0204 -2.0535 -1.1875 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6663 -1.3598 0.9462 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9393 -3.4276 1.6025 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6358 -6.3567 11.6552 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 62 1 0 0 0 - 3 36 1 0 0 0 - 3 37 1 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 39 1 0 0 0 - 4 40 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 41 1 0 0 0 - 5 42 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 8 2 0 0 0 - 6 9 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 43 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 44 1 0 0 0 - 10 45 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 11 46 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 47 1 0 0 0 - 12 48 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 49 1 0 0 0 - 13 50 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 14 51 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 22 1 0 0 0 - 15 52 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 53 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 54 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 55 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 56 1 0 0 0 - 21 57 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 58 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 30 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 59 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 60 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 61 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL1096003 - -> -2 - -$$$$ -CHEMBL1077204 - 3D - Structure written by MMmdl. - 66 69 0 0 1 0 999 V2000 - 17.1208 -7.6407 11.4944 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6242 -7.2482 11.5606 N 0 3 0 0 0 0 - 15.1903 -7.0165 13.0246 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2858 -6.0369 10.6535 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3687 -6.4451 9.1688 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6307 -5.5382 8.2833 N 0 0 0 0 0 0 - 15.2046 -4.6148 7.4955 C 0 0 0 0 0 0 - 16.4171 -4.3982 7.4780 O 0 0 0 0 0 0 - 14.3250 -3.9893 6.6937 N 0 0 0 0 0 0 - 14.7079 -3.1014 5.5887 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9053 -3.7799 4.2057 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0866 -5.3225 4.2389 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2182 -5.9111 2.8299 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1067 -5.4122 1.8780 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7152 -6.0685 2.1272 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7619 -7.5943 2.0392 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2585 -8.2080 0.8850 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3325 -9.5936 0.8010 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9111 -10.3707 1.8760 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4042 -9.7694 3.0248 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3240 -8.3811 3.1077 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7146 -5.5161 1.2136 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7897 -4.1790 0.7828 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7767 -3.7118 -0.0511 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8134 -2.4087 -0.5370 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8546 -1.5518 -0.1784 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8961 -0.1327 -0.7370 C 0 0 0 0 0 0 - 12.5327 -0.1525 -1.9080 F 0 0 0 0 0 0 - 10.6622 0.3290 -0.9348 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5354 0.7038 0.0806 F 0 0 0 0 0 0 - 12.8578 -2.0201 0.6775 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8617 -3.3430 1.1425 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0142 -3.8707 1.9829 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8081 -3.4639 3.3402 O 0 0 0 0 0 0 - 17.7113 -6.7969 11.8567 H 0 0 0 0 0 0 - 17.3740 -7.8767 10.4603 H 0 0 0 0 0 0 - 17.2673 -8.5191 12.1246 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8080 -6.2212 13.4462 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3361 -7.9568 13.5567 H 0 0 0 0 0 0 - 14.1337 -6.7438 13.0292 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2726 -5.7239 10.9114 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9845 -5.2443 10.9348 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4162 -6.5231 8.8640 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9420 -7.4387 9.0363 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6294 -5.6568 8.2395 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3355 -4.1464 6.8108 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9461 -2.3268 5.5168 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6254 -2.5650 5.8439 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8025 -3.3200 3.7819 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9692 -5.5863 4.8210 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2376 -5.7853 4.7452 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1874 -5.6240 2.4207 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2392 -6.9986 2.8928 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4252 -5.6330 0.8574 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3880 -5.8136 3.1374 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5758 -7.6098 0.0450 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7099 -10.0616 -0.0950 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9588 -11.4481 1.8080 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0706 -10.3802 3.8519 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9249 -7.9218 4.0012 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8052 -5.9499 1.3121 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9603 -4.3577 -0.3382 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0317 -2.0700 -1.2005 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6772 -1.3689 0.9476 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9369 -3.4306 1.5995 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0791 -8.0358 11.2257 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 1 37 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 66 1 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 3 39 1 0 0 0 - 3 40 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 41 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 5 44 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 45 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 9 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 46 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 47 1 0 0 0 - 10 48 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 49 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 50 1 0 0 0 - 12 51 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 52 1 0 0 0 - 13 53 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 14 54 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 22 1 0 0 0 - 15 55 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 56 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 57 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 58 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 59 1 0 0 0 - 21 60 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 61 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 32 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 62 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 63 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 31 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 64 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 65 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL1077204 - -> -8 - -$$$$ -CHEMBL1083836 - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 59 0 0 1 0 999 V2000 - 15.2821 -4.6350 7.5364 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1932 -3.9714 6.6802 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7173 -3.0545 5.5540 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9175 -3.7786 4.1872 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0874 -5.3228 4.2360 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2206 -5.9197 2.8310 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1088 -5.4312 1.8792 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7176 -6.0847 2.1226 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7637 -7.6040 2.0348 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2571 -8.2154 0.8775 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3310 -9.5999 0.7947 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9090 -10.3740 1.8712 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4010 -9.7717 3.0201 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3216 -8.3846 3.1028 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7445 -5.5529 1.1675 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7783 -4.2163 0.7637 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7564 -3.7313 -0.0600 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7840 -2.4218 -0.5217 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8218 -1.5818 -0.1229 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8894 -0.1791 -0.6884 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9842 0.7528 -0.3261 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9393 0.1563 -1.7215 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8260 -2.0751 0.7222 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8412 -3.3893 1.1509 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0126 -3.8975 1.9757 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8215 -3.4695 3.3243 O 0 0 0 0 0 0 - 14.7432 -5.2224 8.2879 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8954 -3.8612 8.0164 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9091 -5.2980 6.9311 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6118 -3.4115 7.2986 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6259 -2.5534 5.9128 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9360 -2.2914 5.4675 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8232 -3.3411 3.7607 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2483 -5.7949 4.7546 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9900 -5.5952 4.7784 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1879 -5.6256 2.4157 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2426 -7.0073 2.8962 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4245 -5.6435 0.8559 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3752 -5.8170 3.1268 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5704 -7.6127 0.0382 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6962 -10.0654 -0.1078 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9524 -11.4515 1.8058 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0676 -10.3758 3.8514 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9274 -7.9213 3.9964 H 0 0 0 0 0 0 - 11.1139 -6.2188 0.7581 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9362 -4.3709 -0.3457 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0223 -2.0493 -1.1963 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9154 0.2829 -0.8331 H 0 0 0 0 0 0 - 12.8587 1.8276 -0.1827 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7896 0.3985 0.3059 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6590 -0.6004 -2.0043 H 0 0 0 0 0 0 - 12.8015 0.8402 -2.5636 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6855 -1.4988 1.0279 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9341 -3.4492 1.5902 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5724 -4.6652 6.2709 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 2 55 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 36 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 7 38 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 15 1 0 0 0 - 8 39 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 14 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 40 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 41 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 42 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 43 1 0 0 0 - 14 44 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 45 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 24 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 46 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 47 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 23 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 48 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 49 1 0 0 0 - 21 50 1 0 0 0 - 22 51 1 0 0 0 - 22 52 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 53 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 54 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL1083836 - -> -11 - -$$$$ -CHEMBL1085666 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - 14.3165 -4.0041 6.7057 N 0 3 0 0 0 0 - 14.6800 -3.0520 5.5568 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9014 -3.7767 4.2034 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0794 -5.3204 4.2560 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2134 -5.9116 2.8388 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1000 -5.4138 1.8842 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7075 -6.0661 2.1333 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7523 -7.5906 2.0360 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3188 -8.3771 3.1048 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4038 -9.7653 3.0219 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9145 -10.3670 1.8742 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3307 -9.5915 0.7997 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2510 -8.2048 0.8812 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7043 -5.5100 1.2252 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7866 -4.1781 0.7837 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7799 -3.7112 -0.0569 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8200 -2.4096 -0.5450 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8586 -1.5528 -0.1813 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9069 -0.1362 -0.7423 C 0 0 0 0 0 0 - 12.5326 -0.1571 -1.9193 F 0 0 0 0 0 0 - 10.6732 0.3298 -0.9284 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5588 0.6950 0.0707 F 0 0 0 0 0 0 - 12.8553 -2.0181 0.6851 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8601 -3.3413 1.1433 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0134 -3.8725 1.9818 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8054 -3.4743 3.3377 O 0 0 0 0 0 0 - 14.1083 -3.4755 7.5374 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0831 -4.6260 6.9124 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8569 -2.3375 5.5186 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5810 -2.5393 5.9003 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8116 -3.3319 3.7907 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9615 -5.5868 4.8374 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2305 -5.7943 4.7513 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1803 -5.6225 2.4218 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2376 -7.0003 2.8944 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4183 -5.6311 0.8642 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3776 -5.8170 3.1448 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9279 -7.9184 4.0017 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0698 -10.3730 3.8508 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9571 -11.4450 1.8081 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7008 -10.0609 -0.1014 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5635 -7.6082 0.0379 H 0 0 0 0 0 0 - 10.7857 -5.9114 1.3751 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9547 -4.3494 -0.3318 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0333 -2.0723 -1.2046 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6741 -1.3662 0.9573 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9381 -3.4355 1.5965 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5054 -4.5515 6.4618 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 48 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 6 36 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 14 1 0 0 0 - 7 37 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 38 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 40 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 41 1 0 0 0 - 13 42 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 43 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 24 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 44 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 45 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 46 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 47 1 0 0 0 -M CHG 1 1 1 -M END -> -CHEMBL1085666 - -> -20 - -$$$$ -CHEMBL1085692 - 3D - Structure written by MMmdl. - 64 67 0 0 1 0 999 V2000 - 14.6834 -7.3008 11.7225 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2774 -5.9316 11.3172 N 0 3 0 0 0 0 - 15.9300 -5.2530 12.5352 C 0 0 0 0 0 0 - 16.2923 -6.0375 10.1526 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5993 -6.5692 8.8893 C 0 0 0 0 0 0 - 14.5542 -5.5430 8.4001 C 0 0 0 0 0 0 - 15.1836 -4.5449 7.4457 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3859 -4.3594 7.3886 O 0 0 0 0 0 0 - 14.2892 -3.9272 6.6441 N 0 0 0 0 0 0 - 14.6882 -3.0589 5.5552 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9040 -3.7684 4.1917 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0828 -5.3154 4.2390 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2204 -5.9077 2.8305 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1059 -5.4133 1.8829 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7128 -6.0662 2.1226 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7576 -7.5912 2.0355 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3242 -8.3770 3.1068 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4016 -9.7648 3.0219 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9059 -10.3676 1.8713 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3272 -9.5913 0.7967 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2504 -8.2070 0.8802 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7486 -5.5145 1.1710 N 0 0 0 0 0 0 - 11.8124 -4.1554 0.7867 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7992 -3.6430 -0.0245 C 0 0 0 0 0 0 - 9.7452 -4.3940 -0.3088 F 0 0 0 0 0 0 - 10.8386 -2.3622 -0.5273 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8857 -1.5286 -0.1663 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9570 0.2431 -0.8266 Br 0 0 0 0 0 0 - 12.8902 -2.0069 0.6804 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8881 -3.3301 1.1337 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0302 -3.8699 1.9787 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8099 -3.4603 3.3270 O 0 0 0 0 0 0 - 15.5394 -7.9357 11.9678 H 0 0 0 0 0 0 - 14.1006 -7.7185 10.9004 H 0 0 0 0 0 0 - 14.0029 -7.1559 12.5615 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7606 -5.9038 12.8225 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1664 -5.1905 13.3147 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2746 -4.2620 12.2253 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6811 -5.0218 9.9915 H 0 0 0 0 0 0 - 17.1086 -6.6770 10.4988 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3506 -6.8049 8.1366 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1239 -7.5412 9.0226 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7453 -6.0592 7.8902 H 0 0 0 0 0 0 - 14.0786 -4.9761 9.2045 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3183 -4.1244 6.7845 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9105 -2.3007 5.4765 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5982 -2.5169 5.8278 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8080 -3.3177 3.7778 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9629 -5.5825 4.8242 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2348 -5.7823 4.7443 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1869 -5.6111 2.4180 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2476 -6.9947 2.8898 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4209 -5.6382 0.8628 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3657 -5.8150 3.1282 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9332 -7.9157 4.0028 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0690 -10.3741 3.8509 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9502 -11.4447 1.8040 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6941 -10.0604 -0.1045 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5641 -7.6077 0.0384 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9203 -6.0734 1.0265 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0428 -2.0189 -1.1799 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7007 -1.3465 0.9386 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9571 -3.4356 1.6023 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5055 -5.3295 11.0089 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 64 1 0 0 0 - 3 36 1 0 0 0 - 3 37 1 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 39 1 0 0 0 - 4 40 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 41 1 0 0 0 - 5 42 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 43 1 0 0 0 - 6 44 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 9 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 45 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 46 1 0 0 0 - 10 47 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 11 48 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 49 1 0 0 0 - 12 50 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 51 1 0 0 0 - 13 52 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 14 53 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 22 1 0 0 0 - 15 54 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 55 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 56 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 57 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 58 1 0 0 0 - 21 59 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 60 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 30 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 61 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 62 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 63 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL1085692 - -> -5 - -$$$$ -CHEMBL1084143 - 3D - Structure written by MMmdl. - 74 77 0 0 1 0 999 V2000 - 11.3979 -0.1021 -2.1574 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9038 -0.1354 -0.7457 C 0 0 0 0 0 0 - 11.0501 0.7757 0.0856 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8578 -1.5536 -0.1865 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8089 -2.4050 -0.5396 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7743 -3.7096 -0.0570 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7936 -4.1831 0.7614 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8662 -3.3440 1.1312 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8594 -2.0221 0.6688 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0156 -3.8719 1.9779 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8095 -3.4697 3.3345 O 0 0 0 0 0 0 - 14.9090 -3.7899 4.1939 C 0 0 1 0 0 0 - 14.7292 -3.0772 5.5493 C 0 0 0 0 0 0 - 14.3931 -3.9357 6.7113 N 0 0 0 0 0 0 - 15.6866 -4.1881 7.8512 S 0 0 0 0 0 0 - 15.9605 -2.8994 8.4965 O 0 0 0 0 0 0 - 16.7692 -4.9053 7.1723 O 0 0 0 0 0 0 - 14.8572 -5.3740 9.0989 C 0 0 0 0 0 0 - 15.9171 -5.9921 10.0050 C 0 0 0 0 0 0 - 15.3040 -6.9172 11.0141 C 0 0 0 0 0 0 - 16.3536 -7.4832 11.8564 N 0 3 0 0 0 0 - 15.7569 -8.3836 12.8386 C 0 0 0 0 0 0 - 17.2969 -8.2258 11.0254 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0802 -5.3264 4.2516 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2184 -5.9103 2.8356 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1038 -5.4145 1.8827 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7108 -6.0690 2.1214 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7593 -7.5926 2.0373 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2528 -8.2067 0.8813 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3297 -9.5928 0.7978 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9076 -10.3673 1.8725 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4034 -9.7655 3.0228 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3256 -8.3763 3.1078 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7374 -5.5233 1.1763 N 0 0 0 0 0 0 - 12.0073 -0.7596 -2.7774 H 0 0 0 0 0 0 - 11.4572 0.9166 -2.5407 H 0 0 0 0 0 0 - 10.3615 -0.4390 -2.1801 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9225 0.2532 -0.7443 H 0 0 0 0 0 0 - 11.4035 0.7643 1.1166 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0154 0.4346 0.0524 H 0 0 0 0 0 0 - 11.1110 1.7902 -0.3082 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0204 -2.0579 -1.1913 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9573 -4.3549 -0.3431 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6721 -1.3692 0.9509 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9390 -3.4275 1.6025 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8061 -3.3644 3.7393 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6460 -2.5318 5.7826 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9634 -2.3063 5.4584 H 0 0 0 0 0 0 - 14.0645 -4.8324 6.3635 H 0 0 0 0 0 0 - 14.1276 -4.7955 9.6643 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3350 -6.1477 8.5414 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6443 -6.5599 9.4232 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4626 -5.2168 10.5445 H 0 0 0 0 0 0 - 14.5998 -6.3628 11.6345 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7790 -7.7211 10.4983 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2319 -9.1875 12.3228 H 0 0 0 0 0 0 - 15.0527 -7.8292 13.4590 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5405 -8.8062 13.4674 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7719 -9.0297 10.5095 H 0 0 0 0 0 0 - 18.0805 -8.6484 11.6542 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7424 -7.5536 10.2921 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9570 -5.5928 4.8416 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2182 -5.7833 4.7368 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1821 -5.6020 2.4289 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2502 -6.9993 2.8743 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4134 -5.6570 0.8656 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3692 -5.7931 3.1202 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5722 -7.6049 0.0431 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7130 -10.0631 -0.0960 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9657 -11.4445 1.8120 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0728 -10.3765 3.8502 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9366 -7.9114 4.0019 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9582 -6.1105 0.9179 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8401 -6.7382 12.3344 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 1 37 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 38 1 0 0 0 - 3 39 1 0 0 0 - 3 40 1 0 0 0 - 3 41 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 42 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 43 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 10 1 0 0 0 - 9 44 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 10 45 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 24 1 0 0 0 - 12 46 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 47 1 0 0 0 - 13 48 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 49 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 17 2 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 50 1 0 0 0 - 18 51 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 52 1 0 0 0 - 19 53 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 54 1 0 0 0 - 20 55 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 21 74 1 0 0 0 - 22 56 1 0 0 0 - 22 57 1 0 0 0 - 22 58 1 0 0 0 - 23 59 1 0 0 0 - 23 60 1 0 0 0 - 23 61 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 62 1 0 0 0 - 24 63 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 64 1 0 0 0 - 25 65 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 66 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 34 1 0 0 0 - 27 67 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 68 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 69 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 70 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 71 1 0 0 0 - 33 72 1 0 0 0 - 34 73 1 0 0 0 -M CHG 1 21 1 -M END -> -CHEMBL1084143 - -> -2 - -$$$$ -CHEMBL1096002 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 55 0 0 1 0 999 V2000 - 14.9398 -6.5745 8.8289 O 0 0 0 0 0 0 - 14.5278 -5.2354 8.6990 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2970 -4.6432 7.5290 C 0 0 0 0 0 0 - 14.2597 -3.9478 6.6599 N 0 3 0 0 0 0 - 14.7233 -3.0473 5.5240 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9007 -3.7858 4.1855 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0793 -5.3248 4.2415 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2121 -5.9083 2.8276 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0921 -5.4092 1.8855 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7002 -6.0672 2.1302 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7513 -7.5891 2.0317 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2402 -8.2009 0.8726 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3148 -9.5869 0.7909 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8991 -10.3621 1.8687 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3947 -9.7617 3.0192 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3191 -8.3736 3.1017 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7089 -5.5107 1.2081 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7887 -4.1714 0.7851 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7851 -3.6834 -0.0443 C 0 0 0 0 0 0 - 9.7425 -4.4576 -0.3412 F 0 0 0 0 0 0 - 10.8182 -2.3939 -0.5448 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8627 -1.5566 -0.1858 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9178 0.0446 -0.8143 Cl 0 0 0 0 0 0 - 12.8576 -2.0189 0.6758 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8659 -3.3411 1.1370 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0100 -3.8683 1.9858 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8029 -3.4589 3.3367 O 0 0 0 0 0 0 - 14.7621 -6.8963 9.7167 H 0 0 0 0 0 0 - 13.4445 -5.1921 8.5389 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7695 -4.6581 9.5903 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0064 -3.8769 7.8397 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7569 -5.4005 6.8992 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6953 -4.6762 6.2499 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8991 -2.3346 5.4864 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6255 -2.5530 5.8731 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7943 -3.3455 3.7481 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9690 -5.5846 4.8129 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2339 -5.7908 4.7491 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1789 -5.6110 2.4141 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2359 -6.9961 2.8742 H 0 0 0 0 0 0 - 14.3995 -5.6237 0.8615 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3710 -5.8212 3.1419 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5515 -7.6017 0.0296 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6844 -10.0576 -0.1073 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9569 -11.4391 1.8078 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0632 -10.3709 3.8491 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9276 -7.9067 3.9936 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8156 -5.9913 1.1612 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0246 -2.0468 -1.1894 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6495 -1.3525 0.9762 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9406 -3.4307 1.6172 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7207 -3.3716 7.2905 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 4 52 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 6 36 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 37 1 0 0 0 - 7 38 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 39 1 0 0 0 - 8 40 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 9 41 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 10 42 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 43 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 44 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 45 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 46 1 0 0 0 - 16 47 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 48 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 25 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 49 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 50 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 51 1 0 0 0 -M CHG 1 4 1 -M END -> -CHEMBL1096002 - -> -7 - -$$$$ -CHEMBL1089056 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 54 0 0 1 0 999 V2000 - 12.8440 0.7919 0.0923 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9510 -0.1740 -0.7292 C 0 0 0 0 0 0 - 10.5043 0.3281 -0.7907 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4899 -0.2213 -2.1417 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8886 -1.5912 -0.1659 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8674 -2.4721 -0.5416 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7974 -3.7635 -0.0404 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8031 -4.2332 0.7903 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8759 -3.4004 1.1456 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8695 -2.0850 0.7008 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0244 -3.9056 1.9931 C 0 0 1 0 0 0 - 13.7945 -3.4603 3.3342 O 0 0 0 0 0 0 - 14.8679 -3.7921 4.2158 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0733 -5.3223 4.2605 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2307 -5.9110 2.8490 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1153 -5.4365 1.8937 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7183 -6.0874 2.1403 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7673 -7.6067 2.0472 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3297 -8.3923 3.1162 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4058 -9.7806 3.0303 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9252 -10.3773 1.8827 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3326 -9.5998 0.8058 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2534 -8.2136 0.8875 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7244 -5.5627 1.2182 N 0 0 0 0 0 0 - 12.9419 1.8039 -0.3195 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8412 0.3849 0.0936 H 0 0 0 0 0 0 - 12.5513 0.8599 1.1381 H 0 0 0 0 0 0 - 10.1585 0.2508 0.1995 H 0 0 0 0 0 0 - 9.8173 -0.1840 -1.4404 H 0 0 0 0 0 0 - 10.2881 1.3288 -1.0813 H 0 0 0 0 0 0 - 12.7546 0.7362 -2.5815 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6835 -0.6584 -2.7076 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3441 -0.8652 -2.2592 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0789 -2.1827 -1.2109 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9625 -4.3964 -0.3281 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7124 -1.5054 1.0214 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9481 -3.4636 1.6062 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7885 -3.3233 3.8717 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6565 -3.4018 5.2084 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9488 -5.5615 4.8654 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2172 -5.7782 4.7576 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1993 -5.6154 2.4368 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2605 -6.9979 2.9035 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4350 -5.6514 0.8706 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3839 -5.8281 3.1467 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9266 -7.9256 4.0075 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0849 -10.3883 3.8589 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9621 -11.4564 1.8116 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7105 -10.0654 -0.0977 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5752 -7.6146 0.0540 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8173 -5.9953 1.3112 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 34 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 35 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 42 1 0 0 0 - 15 43 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 44 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 24 1 0 0 0 - 17 45 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 46 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 47 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 48 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 49 1 0 0 0 - 23 50 1 0 0 0 - 24 51 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL1089056 - -> -120 - -$$$$ -CHEMBL1093088 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 55 0 0 1 0 999 V2000 - 10.6683 0.3259 -0.9315 F 0 0 0 0 0 0 - 11.9092 -0.1373 -0.7426 C 0 0 0 0 0 0 - 12.5572 0.6970 0.0708 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5317 -0.1562 -1.9180 F 0 0 0 0 0 0 - 11.8546 -1.5518 -0.1871 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8042 -2.4028 -0.5323 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7730 -3.7099 -0.0542 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8144 -4.1935 0.7396 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8923 -3.3560 1.0946 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8665 -2.0258 0.6545 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0494 -3.8568 1.9562 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8553 -3.4173 3.2710 O 0 0 0 0 0 0 - 14.8976 -3.7605 4.1929 C 0 0 1 0 0 0 - 14.6578 -3.1005 5.5680 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2465 -2.9226 5.9121 N 0 0 0 0 0 0 - 12.6204 -3.1518 7.1038 C 0 0 0 0 0 0 - 11.3473 -2.8639 7.0012 N 0 0 0 0 0 0 - 11.2559 -2.4452 5.7470 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3327 -2.4354 5.0401 N 0 0 0 0 0 0 - 15.0684 -5.3101 4.2439 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2209 -5.9171 2.8316 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1192 -5.4200 1.8687 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7212 -6.0707 2.1169 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7592 -7.5954 2.0346 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3228 -8.3777 3.1055 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4048 -9.7653 3.0253 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9049 -10.3677 1.8739 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3264 -9.5938 0.7972 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2517 -8.2084 0.8785 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7331 -5.5251 1.1808 N 0 0 0 0 0 0 - 10.0213 -2.0601 -1.1960 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9490 -4.3496 -0.3314 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6823 -1.3752 0.9329 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9905 -3.4672 1.5172 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8414 -3.3531 3.8085 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1289 -3.6931 6.3577 H 0 0 0 0 0 0 - 15.1239 -2.1134 5.5876 H 0 0 0 0 0 0 - 13.1580 -3.5076 7.9813 H 0 0 0 0 0 0 - 10.2992 -2.1530 5.3209 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9422 -5.5750 4.8418 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2208 -5.7508 4.7597 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1877 -5.6158 2.4310 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2476 -7.0045 2.9003 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4309 -5.6815 0.8489 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3740 -5.8074 3.1180 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9307 -7.9163 4.0008 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0690 -10.3755 3.8528 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9609 -11.4432 1.8091 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6968 -10.0592 -0.1007 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5613 -7.6079 0.0375 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8982 -6.0840 1.0444 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 32 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 22 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 20 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 30 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 29 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL1093088 - -> -6 - -$$$$ -CHEMBL1084676 - 3D - Structure written by MMmdl. - 65 68 0 0 1 0 999 V2000 - 16.7713 -6.3756 12.0443 C 0 0 0 0 0 0 - 15.7514 -7.3133 11.3477 N 0 3 0 0 0 0 - 14.9672 -8.1032 12.4119 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7574 -6.5424 10.4444 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5368 -5.7840 9.4103 C 0 0 0 0 0 0 - 14.7381 -5.4520 8.2799 O 0 0 0 0 0 0 - 15.2652 -4.5977 7.4117 C 0 0 0 0 0 0 - 16.5030 -4.3780 7.3160 O 0 0 0 0 0 0 - 14.3099 -3.9820 6.6658 N 0 0 0 0 0 0 - 14.6677 -3.0872 5.5706 C 0 0 0 0 0 0 - 14.8962 -3.7746 4.1958 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0805 -5.3187 4.2370 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2182 -5.9065 2.8281 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1002 -5.4125 1.8825 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7104 -6.0683 2.1249 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7572 -7.5912 2.0353 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3235 -8.3758 3.1056 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4000 -9.7638 3.0213 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9028 -10.3655 1.8703 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3226 -9.5904 0.7944 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2483 -8.2048 0.8778 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7296 -5.5214 1.1862 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7939 -4.1799 0.7662 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7709 -3.7099 -0.0572 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8098 -2.4057 -0.5391 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8576 -1.5528 -0.1908 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9120 -0.1390 -0.7465 C 0 0 0 0 0 0 - 10.6726 0.3357 -0.9277 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5628 0.6909 0.0665 F 0 0 0 0 0 0 - 12.5294 -0.1587 -1.9235 F 0 0 0 0 0 0 - 12.8610 -2.0226 0.6675 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8607 -3.3461 1.1326 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0132 -3.8683 1.9789 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8046 -3.4607 3.3297 O 0 0 0 0 0 0 - 16.1866 -5.6689 12.6268 H 0 0 0 0 0 0 - 17.3506 -5.8769 11.2816 H 0 0 0 0 0 0 - 17.4106 -6.9779 12.6615 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4470 -7.3620 12.9985 H 0 0 0 0 0 0 - 15.6920 -8.6413 13.0058 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2920 -8.7629 11.8873 H 0 0 0 0 0 0 - 14.1090 -7.2702 9.9857 H 0 0 0 0 0 0 - 14.1835 -5.9006 11.1076 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9172 -4.8470 9.8432 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3874 -6.3647 9.0642 H 0 0 0 0 0 0 - 13.3335 -4.2030 6.8284 H 0 0 0 0 0 0 - 13.9024 -2.3150 5.4890 H 0 0 0 0 0 0 - 15.5773 -2.5399 5.8417 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8009 -3.3231 3.7840 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9617 -5.5860 4.8205 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2325 -5.7873 4.7380 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1842 -5.6070 2.4181 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2471 -6.9941 2.8842 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4141 -5.6391 0.8636 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3709 -5.8147 3.1322 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9359 -7.9140 4.0022 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0685 -10.3734 3.8509 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9503 -11.4423 1.8044 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6920 -10.0586 -0.1044 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5628 -7.6049 0.0369 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9190 -6.0992 1.0077 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9498 -4.3509 -0.3344 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0227 -2.0600 -1.1958 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6823 -1.3748 0.9343 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9410 -3.4338 1.6028 H 0 0 0 0 0 0 - 16.2598 -7.9645 10.7739 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 1 37 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 65 1 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 3 39 1 0 0 0 - 3 40 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 41 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 5 44 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 9 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 45 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 46 1 0 0 0 - 10 47 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 11 48 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 49 1 0 0 0 - 12 50 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 51 1 0 0 0 - 13 52 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 14 53 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 22 1 0 0 0 - 15 54 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 55 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 56 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 57 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 58 1 0 0 0 - 21 59 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 60 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 32 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 61 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 62 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 31 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 63 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 64 1 0 0 0 -M CHG 1 2 1 -M END -> -CHEMBL1084676 - -> -14 - -$$$$ -CHEMBL1084935 - 3D - Structure written by MMmdl. - 70 73 0 0 1 0 999 V2000 - 11.8941 -2.8870 6.6585 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1611 -3.1833 7.4914 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1889 -3.9556 6.6529 N 0 3 2 0 0 0 - 15.2831 -4.6170 7.5349 C 0 0 0 0 0 0 - 14.6484 -5.6321 8.4883 C 0 0 0 0 0 0 - 15.6314 -6.4882 9.0155 O 0 0 0 0 0 0 - 14.7830 -3.0434 5.5472 C 0 0 0 0 0 0 - 14.9397 -3.7821 4.1936 C 0 0 1 0 0 0 - 15.0827 -5.3316 4.2335 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2131 -5.9184 2.8241 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0995 -5.4193 1.8815 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7089 -6.0737 2.1363 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7560 -7.5938 2.0385 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3233 -8.3792 3.1082 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4013 -9.7662 3.0214 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9053 -10.3669 1.8706 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3256 -9.5903 0.7954 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2476 -8.2058 0.8797 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7083 -5.5287 1.2201 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7889 -4.1985 0.7863 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7777 -3.7353 -0.0458 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8328 -2.4457 -0.5434 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8762 -1.5795 -0.1948 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9234 -0.1516 -0.7693 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6677 0.8246 0.1645 C 0 0 0 0 0 0 - 10.4765 0.3389 -0.9933 C 0 0 0 0 0 0 - 12.6705 -0.1459 -2.1072 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8668 -2.0505 0.6751 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8600 -3.3611 1.1455 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0148 -3.8794 1.9822 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8256 -3.4715 3.3390 O 0 0 0 0 0 0 - 11.1742 -2.2996 7.2500 H 0 0 0 0 0 0 - 11.4154 -3.8259 6.3623 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0785 -2.3275 5.7398 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6696 -2.2854 7.8652 H 0 0 0 0 0 0 - 12.8526 -3.7729 8.3489 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9752 -5.1154 6.8759 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8111 -3.8259 8.0549 H 0 0 0 0 0 0 - 14.1682 -5.1616 9.3545 H 0 0 0 0 0 0 - 13.8946 -6.2297 7.9694 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1600 -5.9879 9.6528 H 0 0 0 0 0 0 - 14.1503 -2.1969 5.3703 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7253 -2.6313 5.9175 H 0 0 0 0 0 0 - 15.8458 -3.3513 3.7378 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9744 -5.6136 4.7825 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2321 -5.7899 4.7451 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1795 -5.6227 2.4155 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2373 -7.0043 2.8858 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4132 -5.6373 0.8604 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3738 -5.8192 3.1443 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9358 -7.9185 4.0054 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0658 -10.3743 3.8490 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9492 -11.4443 1.8028 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6945 -10.0591 -0.1044 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5566 -7.6057 0.0367 H 0 0 0 0 0 0 - 10.7987 -5.9708 1.2887 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9449 -4.3656 -0.3156 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0342 -2.1354 -1.1967 H 0 0 0 0 0 0 - 12.5901 1.8750 -0.1283 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7299 0.5873 0.1975 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3721 0.7011 1.1918 H 0 0 0 0 0 0 - 9.7853 -0.0025 -0.2578 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0269 -0.0771 -1.9126 H 0 0 0 0 0 0 - 10.3268 1.3824 -1.0970 H 0 0 0 0 0 0 - 12.6130 0.8052 -2.6352 H 0 0 0 0 0 0 - 12.2275 -0.8945 -2.7357 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7202 -0.4120 -1.9978 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6877 -1.4191 0.9735 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9392 -3.4400 1.6016 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6941 -4.7009 6.2036 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 35 1 0 0 0 - 2 36 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 7 1 0 0 0 - 3 70 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 37 1 0 0 0 - 4 38 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 39 1 0 0 0 - 5 40 1 0 0 0 - 6 41 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 42 1 0 0 0 - 7 43 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 8 44 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 45 1 0 0 0 - 9 46 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 47 1 0 0 0 - 10 48 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 11 49 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 12 50 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 51 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 52 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 53 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 54 1 0 0 0 - 18 55 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 56 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 29 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 57 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 58 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 24 27 1 0 0 0 - 25 59 1 0 0 0 - 25 60 1 0 0 0 - 25 61 1 0 0 0 - 26 62 1 0 0 0 - 26 63 1 0 0 0 - 26 64 1 0 0 0 - 27 65 1 0 0 0 - 27 66 1 0 0 0 - 27 67 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 68 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 69 1 0 0 0 -M CHG 1 3 1 -M END -> -CHEMBL1084935 - -> -19 - -$$$$ -CHEMBL1078998 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - 12.7976 0.8124 0.0757 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9223 -0.1613 -0.7525 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4837 -0.2199 -2.1743 C 0 0 0 0 0 0 - 10.4601 0.3453 -0.8043 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8888 -1.5853 -0.1835 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8508 -2.4597 -0.5444 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7949 -3.7505 -0.0484 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8123 -4.2146 0.7836 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8780 -3.3664 1.1426 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8759 -2.0519 0.6772 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0261 -3.8755 1.9883 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8055 -3.4421 3.3329 O 0 0 0 0 0 0 - 14.8759 -3.7853 4.2185 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0685 -5.3210 4.2539 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2293 -5.8998 2.8448 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1243 -5.4049 1.8889 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7346 -6.0749 2.1322 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7930 -7.5766 1.9454 C 0 0 0 0 0 0 - 12.2219 -8.5635 2.7386 C 0 0 0 0 0 0 - 12.4438 -9.8621 2.2888 C 0 0 0 0 0 0 - 13.1981 -9.8931 1.1291 C 0 0 0 0 0 0 - 13.6519 -8.2955 0.6241 S 0 0 0 0 0 0 - 11.7340 -5.5417 1.2135 N 0 0 0 0 0 0 - 12.8648 1.8235 -0.3318 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7971 0.4041 0.0942 H 0 0 0 0 0 0 - 12.5322 0.8833 1.1341 H 0 0 0 0 0 0 - 12.5385 0.7348 -2.6951 H 0 0 0 0 0 0 - 11.7899 -0.8645 -2.7036 H 0 0 0 0 0 0 - 13.4739 -0.6659 -2.2106 H 0 0 0 0 0 0 - 9.7744 -0.1972 -1.4501 H 0 0 0 0 0 0 - 10.2698 1.3637 -1.1111 H 0 0 0 0 0 0 - 10.1339 0.2754 0.2174 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0622 -2.1793 -1.2124 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9663 -4.3825 -0.3261 H 0 0 0 0 0 0 - 13.7100 -1.4444 0.9812 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9558 -3.4395 1.6104 H 0 0 0 0 0 0 - 15.7951 -3.3212 3.8743 H 0 0 0 0 0 0 - 14.6645 -3.3979 5.2121 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9431 -5.5680 4.8576 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2113 -5.7762 4.7508 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1982 -5.6115 2.4315 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2512 -6.9867 2.8952 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4370 -5.6167 0.8661 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3917 -5.8158 3.1334 H 0 0 0 0 0 0 - 11.6528 -8.3432 3.6240 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0628 -10.7452 2.7870 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5002 -10.7531 0.5568 H 0 0 0 0 0 0 - 10.8774 -6.0654 1.1650 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 33 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 23 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 41 1 0 0 0 - 15 42 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 43 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 23 1 0 0 0 - 17 44 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 46 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 47 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL1078998 - -> -25 - -$$$$ -CHEMBL1088740 - 3D - Structure written by MMmdl. - 42 45 0 0 1 0 999 V2000 - 14.8892 -3.7991 4.1929 C 0 0 0 0 0 0 - 15.0808 -5.3250 4.2402 C 0 0 0 0 0 0 - 15.2237 -5.9069 2.8274 C 0 0 0 0 0 0 - 14.1038 -5.4118 1.8796 C 0 0 1 0 0 0 - 12.7087 -6.0667 2.1153 C 0 0 2 0 0 0 - 12.7572 -7.5920 2.0339 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3194 -8.3758 3.1038 C 0 0 0 0 0 0 - 12.3980 -9.7668 3.0196 C 0 0 0 0 0 0 - 12.9045 -10.3679 1.8688 C 0 0 0 0 0 0 - 13.3260 -9.5931 0.7968 C 0 0 0 0 0 0 - 13.2504 -8.2090 0.8799 C 0 0 0 0 0 0 - 11.7397 -5.5251 1.1637 N 0 0 0 0 0 0 - 11.7924 -4.1803 0.7520 C 0 0 0 0 0 0 - 10.7746 -3.7011 -0.0615 C 0 0 0 0 0 0 - 10.8035 -2.4006 -0.5426 C 0 0 0 0 0 0 - 11.8593 -1.5510 -0.1937 C 0 0 0 0 0 0 - 11.9084 -0.1473 -0.7566 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8529 -2.0176 0.6651 C 0 0 0 0 0 0 - 12.8644 -3.3330 1.1272 C 0 0 0 0 0 0 - 14.0098 -3.8678 1.9787 C 0 0 1 0 0 0 - 13.8065 -3.4533 3.3284 O 0 0 0 0 0 0 - 15.8099 -3.3288 3.8333 H 0 0 0 0 0 0 - 14.2311 -5.7855 4.7467 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9615 -5.5791 4.8331 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2499 -6.9959 2.8809 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1893 -5.6105 2.4108 H 0 0 0 0 0 0 - 14.4171 -5.6329 0.8595 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3631 -5.8134 3.1215 H 0 0 0 0 0 0 - 11.9272 -7.9179 3.9995 H 0 0 0 0 0 0 - 12.0645 -10.3747 3.8484 H 0 0 0 0 0 0 - 12.9482 -11.4455 1.8024 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6941 -10.0607 -0.1056 H 0 0 0 0 0 0 - 13.5643 -7.6071 0.0381 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9595 -6.1267 0.9492 H 0 0 0 0 0 0 - 9.9494 -4.3500 -0.3377 H 0 0 0 0 0 0 - 10.0192 -2.0503 -1.1980 H 0 0 0 0 0 0 - 12.3953 0.5387 -0.0602 H 0 0 0 0 0 0 - 13.6797 -1.3606 0.9301 H 0 0 0 0 0 0 - 14.9415 -3.4345 1.6021 H 0 0 0 0 0 0 - 10.9014 0.2420 -0.9190 H 0 0 0 0 0 0 - 12.4520 -0.1379 -1.7028 H 0 0 0 0 0 0 - 14.7141 -3.3944 5.1910 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 1 42 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 23 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 12 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 11 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 29 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 19 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 17 41 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 -M END -> -CHEMBL1088740 - -> -420 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/hif2a_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/hif2a_ligands.sdf deleted file mode 100755 index 994b644a..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/hif2a_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,3676 +0,0 @@ -338 - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - 27.6451 1.5396 -11.1263 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1573 0.3054 -11.6394 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5145 0.3811 -13.0370 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0296 0.6292 -12.8066 C 0 0 1 0 0 0 - 24.8033 -0.0375 -11.4699 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0149 -0.2195 -10.7892 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0208 -0.7620 -9.4965 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8017 -1.0822 -8.8969 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6059 -0.9366 -9.5941 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6020 -0.4342 -10.9000 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4861 -0.2954 -11.6940 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2424 -0.5775 -11.1970 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6737 -1.8297 -11.4038 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4234 -2.1113 -10.8674 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8511 -3.3118 -11.0589 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7462 -1.1423 -10.1427 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2860 0.1245 -9.9701 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5760 1.1643 -9.2539 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5501 0.3903 -10.4736 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5283 -1.0639 -8.5710 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2110 -1.9989 -7.4925 O 0 0 0 0 0 0 - 28.6000 -1.3708 -9.5178 O 0 0 0 0 0 0 - 27.0777 1.2809 -13.8505 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0176 1.9927 -8.6784 N 0 0 0 0 0 0 - 24.8400 1.9615 -12.6525 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6372 -0.7929 -13.6486 F 0 0 0 0 0 0 - 27.9360 0.4657 -7.8636 N 0 0 0 0 0 0 - 28.3611 1.8550 -11.6954 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9701 -0.4195 -11.7119 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3886 0.2707 -13.6271 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7736 -1.4789 -7.8939 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6914 -1.2459 -9.1138 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2074 -2.5951 -11.9425 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8099 -1.4198 -9.7083 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0016 1.3428 -10.2620 H 0 0 0 0 0 0 - 27.2694 0.7696 -7.1547 H 0 0 0 0 0 0 - 28.1746 1.1824 -8.5552 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 25 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 24 3 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 27 1 0 0 0 - 27 36 1 0 0 0 - 27 37 1 0 0 0 -M END -> -338 - -> -0.013 - -$$$$ -43 - 3D - Structure written by MMmdl. - 34 35 0 0 1 0 999 V2000 - 27.3206 0.2092 -11.5444 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8104 -0.0377 -11.5023 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0342 -0.2249 -10.8317 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0391 -0.7726 -9.5293 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8129 -1.0870 -8.9213 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6118 -0.9391 -9.6083 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6108 -0.4248 -10.9220 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4761 -0.3049 -11.6918 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2375 -0.5838 -11.1900 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6642 -1.8394 -11.3980 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4099 -2.1222 -10.8637 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7315 -1.1370 -10.1413 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2646 0.1136 -9.9710 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5795 1.1649 -9.2431 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5604 0.4002 -10.4797 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5401 -1.0912 -8.5545 S 0 0 0 0 0 0 - 27.1859 -2.0084 -7.4841 O 0 0 0 0 0 0 - 28.6206 -1.4509 -9.4586 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9627 0.5938 -7.7916 C 0 0 0 0 0 0 - 27.7984 1.5671 -8.6677 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0861 0.7983 -6.7353 F 0 0 0 0 0 0 - 24.7409 0.7017 -13.0762 Cl 0 0 0 0 0 0 - 27.6879 1.5242 -11.1857 O 0 0 0 0 0 0 - 18.0013 1.9953 -8.6849 N 0 0 0 0 0 0 - 28.1313 -0.4949 -11.3851 H 0 0 0 0 0 0 - 27.2003 0.1946 -12.6299 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7742 -1.4735 -7.9133 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6888 -1.2338 -9.1280 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2029 -2.5876 -11.9606 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9769 -3.1014 -11.0060 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7565 -1.3858 -9.7173 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0066 1.3603 -10.3264 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9730 0.5924 -7.4558 H 0 0 0 0 0 0 - 28.4959 1.7705 -11.6621 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 28 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 15 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 15 2 0 0 0 - 14 24 3 0 0 0 - 15 32 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 16 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 33 1 0 0 0 - 23 34 1 0 0 0 -M END -> -43 - -> -0.42 - -$$$$ -235 - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5822 1.5627 -11.2551 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1468 0.2863 -11.6761 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5086 0.3643 -13.0642 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0265 0.6075 -12.8332 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7967 -0.0605 -11.4946 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0077 -0.2336 -10.8115 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0091 -0.7786 -9.5174 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7944 -1.0867 -8.9034 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5936 -0.9312 -9.5951 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5911 -0.4269 -10.8990 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4730 -0.2997 -11.6967 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2211 -0.5557 -11.2088 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5807 -1.7704 -11.4636 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3293 -2.0485 -11.0244 N 0 0 0 0 0 0 - 18.6868 -1.0883 -10.3158 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2441 0.1607 -10.0304 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5232 1.1702 -9.2782 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5375 0.4137 -10.4764 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5181 -1.0772 -8.5972 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2199 -2.0291 -7.5251 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5736 -1.4146 -9.5547 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9098 0.6015 -7.8247 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0599 1.2997 -13.8390 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6397 -0.8135 -13.6733 F 0 0 0 0 0 0 - 17.9557 1.9748 -8.6688 N 0 0 0 0 0 0 - 29.1729 0.5500 -7.4603 F 0 0 0 0 0 0 - 27.7563 1.5773 -8.6957 F 0 0 0 0 0 0 - 27.1098 0.7930 -6.7781 F 0 0 0 0 0 0 - 28.3814 1.8217 -11.7482 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9776 -0.4206 -11.7025 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4121 0.1832 -13.6241 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8083 1.6771 -12.7815 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7762 -1.4676 -7.8938 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6785 -1.2385 -9.1186 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0644 -2.5457 -12.0352 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7081 -1.3631 -9.9794 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0111 1.3563 -10.2603 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 17 25 3 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 21 2 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 22 26 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 22 28 1 0 0 0 -M END -> -235 - -> -0.038 - -$$$$ -234 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5728 1.5601 -11.1459 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1536 0.3088 -11.6552 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5252 0.3787 -13.0559 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0351 0.5810 -12.8466 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8123 -0.0916 -11.5082 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0213 -0.2538 -10.8166 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0217 -0.7899 -9.5190 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8061 -1.1035 -8.9088 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6060 -0.9317 -9.5917 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6085 -0.4312 -10.8990 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4887 -0.2465 -11.6759 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2536 -0.5375 -11.1765 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6850 -1.7900 -11.3895 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4306 -2.0624 -10.8562 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6842 -3.5700 -11.0979 Cl 0 0 0 0 0 0 - 18.7499 -1.1042 -10.1192 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2995 0.1632 -9.9426 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5790 1.1976 -9.2292 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5645 0.4307 -10.4478 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5212 -1.0658 -8.5765 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2091 -1.9751 -7.4734 O 0 0 0 0 0 0 - 28.6014 -1.4067 -9.5003 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9046 0.6147 -7.8636 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0583 1.3232 -13.8300 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6754 -0.7993 -13.6647 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0104 2.0266 -8.6666 N 0 0 0 0 0 0 - 28.3370 1.8866 -11.6617 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0013 -0.3730 -11.7036 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4365 0.1828 -13.6670 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7950 1.6418 -12.7665 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7820 -1.4948 -7.9039 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6892 -1.2153 -9.0980 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2216 -2.5514 -11.9357 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8153 -1.3857 -9.6829 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0238 1.3833 -10.2559 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8492 0.5007 -7.3454 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1052 0.9088 -7.1861 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0235 1.3382 -8.6638 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 26 3 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 36 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 -M END -> -234 - -> -0.026 - -$$$$ -30 - 3D - Structure written by MMmdl. - 31 32 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5485 0.3136 -11.5391 Cl 0 0 0 0 0 0 - 24.8372 -0.0289 -11.4983 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0452 -0.2007 -10.8100 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0339 -0.7721 -9.5247 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8128 -1.0812 -8.9236 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6194 -0.9276 -9.6191 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6217 -0.4318 -10.9248 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4810 -0.3037 -11.6892 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2399 -0.5885 -11.1701 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6662 -1.8374 -11.3902 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4091 -2.1170 -10.8684 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8393 -3.3237 -11.0680 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7264 -1.1511 -10.1393 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2825 0.1244 -9.9582 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5614 1.1690 -9.2489 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5500 0.3803 -10.4464 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5166 -1.0965 -8.5685 S 0 0 0 0 0 0 - 27.1757 -2.0254 -7.4877 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5973 -1.4633 -9.4875 O 0 0 0 0 0 0 - 27.8897 0.6007 -7.8518 C 0 0 0 0 0 0 - 27.7354 1.5229 -8.8032 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0123 0.7944 -6.8835 F 0 0 0 0 0 0 - 24.8330 0.6084 -12.8132 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8420 1.1182 -13.8525 N 0 0 0 0 0 0 - 18.0078 2.0075 -8.6709 N 0 0 0 0 0 0 - 24.7836 -1.4731 -7.9183 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6985 -1.2282 -9.1371 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1987 -2.5965 -11.9433 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7864 -1.4317 -9.6991 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0075 1.3441 -10.2726 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8873 0.6401 -7.4156 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 23 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 17 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 26 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 16 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 28 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 2 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 15 25 3 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 17 20 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 23 24 3 0 0 0 -M END -> -30 - -> -0.018 - -$$$$ -1 - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5742 1.5579 -11.2202 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1479 0.2994 -11.6692 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5267 0.4129 -13.0689 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0255 0.5956 -12.8327 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8103 -0.0581 -11.4965 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0181 -0.2298 -10.8141 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0198 -0.7704 -9.5145 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8035 -1.0882 -8.9011 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6009 -0.9385 -9.5957 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6036 -0.4366 -10.9003 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4827 -0.2805 -11.6905 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2459 -0.5698 -11.1900 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6773 -1.8289 -11.4014 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4177 -2.1113 -10.8689 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8580 -3.3210 -11.0596 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7347 -1.1397 -10.1326 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2914 0.1220 -9.9508 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4240 1.3427 -9.0840 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.5582 0.4039 -10.4599 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5319 -1.0654 -8.5874 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2277 -2.0226 -7.5192 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5861 -1.3956 -9.5458 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9385 0.6243 -7.8274 C 0 0 0 0 0 0 - 27.8181 1.5522 -8.7360 F 0 0 0 0 0 0 - 27.1029 0.8106 -6.7934 F 0 0 0 0 0 0 - 28.3584 1.8102 -11.7281 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9789 -0.4080 -11.7029 H 0 0 0 0 0 0 - 26.6995 -0.5291 -13.6482 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9532 1.2021 -13.6359 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7973 1.6781 -12.7806 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4358 0.1715 -13.6220 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7794 -1.4657 -7.8911 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6812 -1.2310 -9.1144 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2080 -2.5850 -11.9555 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7898 -1.3917 -9.6972 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9983 1.3636 -10.2576 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9678 0.5905 -7.4583 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 -M END -> -1 - -> -0.005 - -$$$$ -237 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.8741 -0.4334 -11.8881 O 0 0 0 0 0 0 - 26.9533 0.5103 -11.4691 C 0 0 1 0 0 0 - 26.2123 1.1350 -12.6505 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8814 0.4428 -12.7971 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6562 -0.1013 -11.4106 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8419 -0.1153 -10.6575 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8608 -0.7137 -9.3921 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6666 -1.1821 -8.8556 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4957 -1.1640 -9.6018 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4866 -0.6454 -10.8961 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3959 -0.6294 -11.7424 O 0 0 0 0 0 0 - 21.1512 -0.8062 -11.2113 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5139 -2.0346 -11.3575 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2861 -2.2462 -10.7434 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6869 -1.2275 -9.9984 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2935 0.0276 -9.9139 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6677 1.1330 -9.2217 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5431 0.2205 -10.5011 C 0 0 0 0 0 0 - 27.3544 -0.9316 -8.4201 S 0 0 0 0 0 0 - 27.0859 -2.0306 -7.4835 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5108 -1.0162 -9.3142 O 0 0 0 0 0 0 - 27.4424 0.7020 -7.4764 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9408 2.3663 -12.2653 F 0 0 0 0 0 0 - 26.9134 1.1664 -13.7919 F 0 0 0 0 0 0 - 18.1713 2.0136 -8.6640 N 0 0 0 0 0 0 - 27.4016 1.6993 -8.3556 F 0 0 0 0 0 0 - 26.4012 0.7578 -6.6504 F 0 0 0 0 0 0 - 18.6855 -3.4418 -10.8633 F 0 0 0 0 0 0 - 28.6720 0.0152 -12.1950 H 0 0 0 0 0 0 - 27.5009 1.2650 -10.9032 H 0 0 0 0 0 0 - 24.9483 -0.3583 -13.5290 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0975 1.1265 -13.1204 H 0 0 0 0 0 0 - 24.6404 -1.6102 -7.8694 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6040 -1.6081 -9.1858 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9886 -2.8350 -11.8914 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7800 -1.4545 -9.4636 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0611 1.1592 -10.3869 H 0 0 0 0 0 0 - 28.3614 0.7441 -6.8868 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 17 25 3 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 21 2 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 22 26 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 -M END -> -237 - -> -0.1 - -$$$$ -227 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.8272 1.5641 -11.0613 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1196 0.5197 -11.7089 C 0 0 2 0 0 0 - 26.4410 0.9322 -13.0322 C 0 0 1 0 0 0 - 25.0569 0.3132 -13.0465 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8031 -0.0378 -11.5948 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9821 -0.0054 -10.8391 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9756 -0.4108 -9.4860 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7523 -0.7639 -8.9047 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5893 -0.8199 -9.6602 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6070 -0.4713 -11.0162 C 0 0 0 0 0 0 - 22.5129 -0.5291 -11.8499 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2693 -0.7597 -11.3270 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6685 -2.0051 -11.4862 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4249 -2.2461 -10.9160 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8269 -3.4424 -11.0720 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7871 -1.2517 -10.1791 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3542 0.0199 -10.0730 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6860 1.1030 -9.3771 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6055 0.2435 -10.6245 C 0 0 0 0 0 0 - 27.4540 -0.4504 -8.4410 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2130 -1.3677 -7.3228 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5784 -0.6917 -9.3508 O 0 0 0 0 0 0 - 27.6740 1.2644 -7.6619 C 0 0 0 0 0 0 - 26.2395 2.2465 -13.0641 F 0 0 0 0 0 0 - 18.1663 1.9675 -8.8128 N 0 0 0 0 0 0 - 27.2225 1.2103 -6.4199 F 0 0 0 0 0 0 - 28.9768 1.5534 -7.6702 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0318 2.1940 -8.3234 F 0 0 0 0 0 0 - 28.5149 1.9300 -11.6463 H 0 0 0 0 0 0 - 27.8025 -0.3009 -11.9316 H 0 0 0 0 0 0 - 27.0306 0.7186 -13.9241 H 0 0 0 0 0 0 - 25.0758 -0.5870 -13.6585 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3018 0.9764 -13.4758 H 0 0 0 0 0 0 - 24.6649 -1.0110 -7.8636 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6896 -1.1518 -9.1671 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1858 -2.7906 -12.0103 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8819 -1.5039 -9.6760 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0827 1.1859 -10.4602 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 34 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 25 3 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 23 27 1 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 -M END -> -227 - -> -0.013 - -$$$$ -266 - 3D - Structure written by MMmdl. - 40 43 0 0 1 0 999 V2000 - 27.8850 0.9567 -11.2360 O 0 0 0 0 0 0 - 26.9261 0.0753 -11.8170 C 0 0 2 0 0 0 - 26.2094 0.6442 -13.0561 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7392 0.3196 -12.9441 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5470 -0.0317 -11.5054 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7726 -0.2517 -10.8650 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7777 -0.7392 -9.5446 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5645 -0.9350 -8.8805 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3575 -0.7307 -9.5431 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3449 -0.3000 -10.8665 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1962 -0.0469 -11.5824 O 0 0 0 0 0 0 - 21.0227 -0.6665 -11.2348 C 0 0 0 0 0 0 - 20.7734 -2.0189 -11.4693 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5565 -2.5922 -11.1030 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5893 -1.8651 -10.4156 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8672 -0.5266 -10.1509 C 0 0 0 0 0 0 - 20.0493 0.0994 -10.5813 C 0 0 0 0 0 0 - 27.2967 -1.1713 -8.6869 S 0 0 0 0 0 0 - 28.2927 -1.4686 -9.7151 O 0 0 0 0 0 0 - 26.9743 -2.2137 -7.7071 O 0 0 0 0 0 0 - 27.7762 0.4223 -7.7641 C 0 0 0 0 0 0 - 26.6880 0.1745 -14.2084 F 0 0 0 0 0 0 - 26.3100 1.9665 -13.0637 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0858 0.4659 -6.6244 F 0 0 0 0 0 0 - 29.0853 0.3799 -7.5200 F 0 0 0 0 0 0 - 27.4854 1.4761 -8.5193 F 0 0 0 0 0 0 - 17.4363 -2.4330 -10.0129 F 0 0 0 0 0 0 - 19.8832 1.4504 -10.1680 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7801 1.6341 -9.4994 N 0 0 0 0 0 0 - 18.1820 0.4453 -9.4619 N 0 0 0 0 0 0 - 28.4717 1.3190 -11.9120 H 0 0 0 0 0 0 - 27.4183 -0.8521 -12.0998 H 0 0 0 0 0 0 - 24.0911 1.1044 -13.3289 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5073 -0.5967 -13.4710 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5427 -1.2805 -7.8640 H 0 0 0 0 0 0 - 22.4170 -0.9153 -9.0626 H 0 0 0 0 0 0 - 21.5226 -2.6299 -11.9472 H 0 0 0 0 0 0 - 19.3705 -3.6281 -11.3315 H 0 0 0 0 0 0 - 20.5664 2.2737 -10.2644 H 0 0 0 0 0 0 - 17.2735 0.3439 -9.0291 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 22 1 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 18 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 36 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 27 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 17 28 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 24 1 0 0 0 - 21 25 1 0 0 0 - 21 26 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 39 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 40 1 0 0 0 -M END -> -266 - -> -0.019 - -$$$$ -206 - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 27.8905 0.7814 -11.2833 O 0 0 0 0 0 0 - 26.9193 -0.0282 -11.8984 C 0 0 2 0 0 0 - 26.2553 0.6485 -13.1070 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7743 0.3619 -13.0634 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5513 -0.0833 -11.6435 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7571 -0.3137 -10.9611 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7304 -0.7838 -9.6350 C 0 0 0 0 0 0 - 24.4955 -0.9388 -8.9991 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3088 -0.7555 -9.6942 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3376 -0.3678 -11.0366 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2312 -0.2289 -11.8473 O 0 0 0 0 0 0 - 21.0019 -0.5424 -11.3497 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5026 -1.8363 -11.4599 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3111 -2.1637 -10.8207 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8034 -3.4051 -10.9256 F 0 0 0 0 0 0 - 18.6360 -1.2092 -10.0655 C 0 0 0 0 0 0 - 19.1032 0.1048 -10.0073 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4198 1.1400 -9.2611 C 0 0 0 0 0 0 - 20.2891 0.4299 -10.6551 C 0 0 0 0 0 0 - 27.1782 -1.3347 -8.7177 S 0 0 0 0 0 0 - 26.7390 -2.4320 -7.8613 O 0 0 0 0 0 0 - 28.2843 -1.5524 -9.6512 O 0 0 0 0 0 0 - 27.6153 0.0506 -7.5323 C 0 0 0 0 0 0 - 26.3933 1.9664 -13.0190 F 0 0 0 0 0 0 - 26.7651 0.2478 -14.2653 F 0 0 0 0 0 0 - 17.8859 1.9702 -8.6637 N 0 0 0 0 0 0 - 28.2838 1.1998 -8.2640 C 0 0 0 0 0 0 - 28.4344 1.2213 -11.9476 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3623 -0.9733 -12.2077 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5370 -0.4389 -13.7581 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1815 1.2313 -13.3494 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4471 -1.2650 -7.9726 H 0 0 0 0 0 0 - 22.3722 -0.9488 -9.1964 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0600 -2.5906 -11.9949 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7638 -1.5211 -9.5283 H 0 0 0 0 0 0 - 20.6808 1.4261 -10.5650 H 0 0 0 0 0 0 - 26.6995 0.3531 -7.0244 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2860 -0.3848 -6.7955 H 0 0 0 0 0 0 - 28.6278 1.9639 -7.5645 H 0 0 0 0 0 0 - 27.5819 1.6805 -8.9401 H 0 0 0 0 0 0 - 29.1450 0.8679 -8.8468 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 26 3 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 27 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 27 39 1 0 0 0 - 27 40 1 0 0 0 - 27 41 1 0 0 0 -M END -> -206 - -> -0.038 - -$$$$ -67 - 3D - Structure written by MMmdl. - 32 34 0 0 1 0 999 V2000 - 27.6053 1.5453 -11.1389 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1460 0.3053 -11.6573 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5192 0.3788 -13.0582 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0264 0.5970 -12.8539 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7883 -0.0701 -11.5149 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9960 -0.2256 -10.8222 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0002 -0.7558 -9.5268 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7931 -1.0825 -8.9108 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5922 -0.9249 -9.5980 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5873 -0.4230 -10.9073 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4670 -0.2684 -11.6890 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2316 -0.5645 -11.1870 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5410 0.3964 -10.4526 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2824 0.1162 -9.9401 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6064 1.0626 -9.2523 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7355 -1.1452 -10.1366 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4128 -2.1057 -10.8754 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8450 -3.3093 -11.0745 F 0 0 0 0 0 0 - 20.6682 -1.8203 -11.4037 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0666 1.3156 -13.8300 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6710 -0.8011 -13.6632 F 0 0 0 0 0 0 - 27.2485 -0.9801 -8.8196 C 0 0 0 0 0 0 - 28.2434 -1.1601 -8.2628 N 0 0 0 0 0 0 - 28.3557 1.8615 -11.6733 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9699 -0.4119 -11.6750 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7968 1.6599 -12.7799 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4187 0.1942 -13.6651 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7714 -1.4809 -7.9067 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6829 -1.2318 -9.1072 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9775 1.3594 -10.2558 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7995 -1.4050 -9.6932 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2054 -2.5816 -11.9461 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 20 1 0 0 0 - 3 21 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 22 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 28 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 29 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 30 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 31 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 19 32 1 0 0 0 - 22 23 3 0 0 0 -M END -> -67 - -> -0.035 - -$$$$ -156 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5805 1.5534 -11.2532 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1501 0.2775 -11.6687 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5293 0.4064 -13.0572 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0376 0.6062 -12.8261 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8055 -0.0621 -11.4896 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0115 -0.2357 -10.8045 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0133 -0.7776 -9.5085 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7953 -1.0889 -8.8985 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5968 -0.9351 -9.5925 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5998 -0.4290 -10.8992 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4856 -0.2941 -11.6969 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2434 -0.5785 -11.2009 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6719 -1.8357 -11.4023 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4175 -2.1171 -10.8625 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7315 -1.1381 -10.1404 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2888 0.1333 -9.9695 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5741 1.1692 -9.2318 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5530 0.4006 -10.4887 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5308 -1.0719 -8.5932 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2326 -2.0223 -7.5182 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5832 -1.4111 -9.5503 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9414 0.6033 -7.8192 C 0 0 0 0 0 0 - 27.8101 1.5688 -8.7107 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0858 0.8173 -6.8182 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0126 1.9813 -8.6297 N 0 0 0 0 0 0 - 28.3766 1.8137 -11.7472 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9769 -0.4329 -11.6977 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9654 1.2263 -13.6309 H 0 0 0 0 0 0 - 26.6920 -0.5061 -13.6310 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4251 0.1733 -13.6149 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8057 1.6727 -12.7825 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7760 -1.4711 -7.8880 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6732 -1.2370 -9.1205 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2057 -2.5939 -11.9585 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9791 -3.0947 -11.0040 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7706 -1.3798 -9.7130 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0174 1.3656 -10.3389 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9665 0.5981 -7.4687 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 17 25 3 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 21 2 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 -M END -> -156 - -> -0.073 - -$$$$ -31 - 3D - Structure written by MMmdl. - 34 35 0 0 1 0 999 V2000 - 27.3687 0.2213 -11.4876 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8311 -0.0329 -11.4879 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0513 -0.2060 -10.8090 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0346 -0.7690 -9.5108 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8065 -1.0848 -8.9114 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6126 -0.9312 -9.6030 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6048 -0.4328 -10.9121 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4609 -0.3198 -11.6757 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2233 -0.5921 -11.1719 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6530 -1.8418 -11.3921 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3963 -2.1272 -10.8608 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7071 -1.1442 -10.1414 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2670 0.1229 -9.9620 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5714 1.1621 -9.2281 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5386 0.3929 -10.4709 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5350 -1.0864 -8.5576 S 0 0 0 0 0 0 - 27.1968 -2.0245 -7.4788 O 0 0 0 0 0 0 - 28.6157 -1.4679 -9.4665 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9318 0.6142 -7.8020 C 0 0 0 0 0 0 - 27.7568 1.5787 -8.6983 F 0 0 0 0 0 0 - 27.1155 0.8088 -6.7700 F 0 0 0 0 0 0 - 24.8004 0.6001 -12.7879 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7996 1.1238 -13.8126 N 0 0 0 0 0 0 - 18.0264 1.9917 -8.6305 N 0 0 0 0 0 0 - 28.1184 0.5861 -10.8006 H 0 0 0 0 0 0 - 27.2481 1.0576 -12.1796 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7954 -0.6318 -12.0131 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7776 -1.4910 -7.9124 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6867 -1.2338 -9.1282 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1960 -2.5887 -11.9550 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9723 -3.1105 -11.0023 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7461 -1.3892 -9.7168 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0038 1.3570 -10.3207 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9726 0.6087 -7.4924 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 15 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 15 2 0 0 0 - 14 24 3 0 0 0 - 15 33 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 16 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 34 1 0 0 0 - 22 23 3 0 0 0 -M END -> -31 - -> -0.33 - -$$$$ -289 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.9755 1.1669 -10.8324 O 0 0 0 0 0 0 - 27.2390 0.1841 -11.5554 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5477 0.7660 -12.7999 C 0 0 1 0 0 0 - 25.2049 0.0635 -12.9045 C 0 0 1 0 0 0 - 24.8937 -0.3001 -11.4771 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0788 -0.3727 -10.7381 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0458 -0.8976 -9.4395 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8156 -1.2035 -8.8587 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6292 -1.0361 -9.5643 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6659 -0.6025 -10.8934 C 0 0 0 0 0 0 - 22.5632 -0.4733 -11.7055 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3077 -0.7045 -11.2158 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6819 -1.9238 -11.4625 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4032 -2.1541 -10.9696 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7805 -3.3217 -11.2165 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7532 -1.1722 -10.2314 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3626 0.0638 -10.0081 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6843 1.1242 -9.2858 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6520 0.2828 -10.4822 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5268 -1.2129 -8.4905 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2281 -2.2833 -7.5336 O 0 0 0 0 0 0 - 28.6527 -1.3615 -9.4143 O 0 0 0 0 0 0 - 26.2783 2.0422 -12.5491 F 0 0 0 0 0 0 - 18.1517 1.9670 -8.7031 N 0 0 0 0 0 0 - 24.3119 0.8426 -13.5117 F 0 0 0 0 0 0 - 27.7464 0.3832 -7.5445 C 0 0 0 0 0 0 - 28.6278 1.5780 -11.4159 H 0 0 0 0 0 0 - 27.8865 -0.6394 -11.8578 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1456 0.7501 -13.7119 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2774 -0.8290 -13.5267 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7771 -1.6047 -7.8636 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6940 -1.2991 -9.0913 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1919 -2.6924 -12.0201 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7867 -1.4057 -9.8300 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1501 1.2108 -10.2637 H 0 0 0 0 0 0 - 28.7144 0.3301 -7.0642 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9498 0.4724 -6.8102 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7216 1.2218 -8.2383 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 25 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 24 3 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 26 36 1 0 0 0 - 26 37 1 0 0 0 - 26 38 1 0 0 0 -M END -> -289 - -> -0.01 - -$$$$ -61 - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - 27.6141 1.5314 -11.1645 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1537 0.2857 -11.6482 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5383 0.4235 -13.0455 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0405 0.6014 -12.8272 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8079 -0.0680 -11.4919 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0128 -0.2402 -10.8022 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0160 -0.7777 -9.5061 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7980 -1.0852 -8.8991 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6016 -0.9305 -9.5931 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6009 -0.4247 -10.8990 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4839 -0.2869 -11.6927 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2424 -0.5716 -11.1962 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6732 -1.8275 -11.4044 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4230 -2.1091 -10.8655 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8559 -3.3155 -11.0537 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7437 -1.1402 -10.1389 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2905 0.1241 -9.9552 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4313 1.3474 -9.0928 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.5489 0.3957 -10.4700 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5325 -1.0709 -8.5888 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2354 -2.0179 -7.5103 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5854 -1.4059 -9.5449 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9315 0.6133 -7.8461 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0964 0.8246 -6.8331 F 0 0 0 0 0 0 - 28.3683 1.8194 -11.7071 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9719 -0.4315 -11.7022 H 0 0 0 0 0 0 - 26.6895 -0.4969 -13.6161 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9723 1.2325 -13.6362 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8029 1.6660 -12.7801 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4290 0.1742 -13.6223 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7779 -1.4665 -7.8901 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6843 -1.2383 -9.1176 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2051 -2.5890 -11.9516 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8031 -1.3878 -9.7030 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9911 1.3546 -10.2655 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9528 0.5965 -7.4752 H 0 0 0 0 0 0 - 27.8095 1.3876 -8.6011 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 36 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 -M END -> -61 - -> -0.039 - -$$$$ -167 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.6174 1.5478 -11.1379 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1576 0.3016 -11.6549 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5229 0.3791 -13.0512 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0317 0.5852 -12.8454 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8099 -0.0815 -11.5012 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0230 -0.2460 -10.8113 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0229 -0.7786 -9.5060 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8037 -1.0879 -8.9007 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6089 -0.9192 -9.5831 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6054 -0.4269 -10.8974 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4927 -0.2591 -11.6812 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2585 -0.5430 -11.1867 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6891 -1.7973 -11.3987 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4288 -2.0656 -10.8661 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7466 -1.1093 -10.1294 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3039 0.1671 -9.9553 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5747 1.1946 -9.2462 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5607 0.4183 -10.4590 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5352 -1.0636 -8.5830 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2233 -2.0141 -7.4936 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5909 -1.3989 -9.5185 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9412 0.6140 -7.8295 C 0 0 0 0 0 0 - 27.1179 0.8438 -6.8093 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0155 2.0188 -8.6719 N 0 0 0 0 0 0 - 18.6828 -3.5869 -11.1124 Cl 0 0 0 0 0 0 - 27.0640 1.3150 -13.8239 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6730 -0.7998 -13.6562 F 0 0 0 0 0 0 - 28.3618 1.8681 -11.6713 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9828 -0.4090 -11.7192 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4208 0.1923 -13.6623 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7995 1.6472 -12.7681 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7791 -1.4880 -7.8979 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6949 -1.2250 -9.0991 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2136 -2.5719 -11.9366 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8151 -1.3988 -9.6937 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0174 1.3729 -10.2677 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9709 0.5746 -7.4730 H 0 0 0 0 0 0 - 27.8363 1.3925 -8.5883 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 25 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 17 24 3 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 21 2 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 -M END -> -167 - -> -0.015 - -$$$$ -165 - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 41 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5836 1.5568 -11.1222 N 0 0 0 0 0 0 - 27.1600 0.2656 -11.6609 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5184 0.3567 -13.0592 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0297 0.5910 -12.8413 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8052 -0.0654 -11.5002 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0146 -0.2437 -10.8064 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0168 -0.7770 -9.5128 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7994 -1.0910 -8.8981 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6068 -0.9245 -9.5924 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5979 -0.4259 -10.8920 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4815 -0.2804 -11.6866 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2483 -0.5736 -11.1926 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6741 -1.8286 -11.3993 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4240 -2.1099 -10.8753 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8513 -3.3170 -11.0668 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7373 -1.1448 -10.1406 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2884 0.1262 -9.9662 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5751 1.1667 -9.2345 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5446 0.3954 -10.4628 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5234 -1.0682 -8.5880 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2169 -1.9994 -7.4943 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5933 -1.3900 -9.5234 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9099 0.6030 -7.8462 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0617 1.2852 -13.8476 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6509 -0.8260 -13.6655 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0232 1.9902 -8.6670 N 0 0 0 0 0 0 - 28.1780 1.3732 -10.3208 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2339 1.9505 -11.7936 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9972 -0.4377 -11.7205 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4163 0.1879 -13.6481 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8098 1.6549 -12.7768 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7791 -1.4892 -7.9000 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6845 -1.2350 -9.1033 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2126 -2.5935 -11.9444 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8017 -1.4265 -9.7043 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0067 1.3483 -10.2588 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8501 0.4838 -7.3200 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1027 0.8984 -7.1794 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0467 1.3492 -8.6202 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 26 3 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 -M END -> -165 - -> -0.17 - -$$$$ -41 - 3D - Structure written by MMmdl. - 33 34 0 0 1 0 999 V2000 - 27.3160 0.2119 -11.5679 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8220 -0.0323 -11.5026 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0361 -0.2219 -10.8310 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0397 -0.7735 -9.5325 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8104 -1.0828 -8.9203 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6135 -0.9357 -9.6149 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6068 -0.4317 -10.9153 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4766 -0.2993 -11.6901 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2357 -0.5744 -11.1818 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6684 -1.8291 -11.3974 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4181 -2.1063 -10.8643 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7365 -1.1464 -10.1377 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2879 0.1264 -9.9486 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4235 1.3441 -9.0874 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.5478 0.3920 -10.4587 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5365 -1.0750 -8.5540 S 0 0 0 0 0 0 - 27.1819 -2.0141 -7.4668 O 0 0 0 0 0 0 - 28.6395 -1.4886 -9.4342 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9537 0.5878 -7.7603 C 0 0 0 0 0 0 - 27.8618 1.5770 -8.6716 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0945 0.8268 -6.7955 F 0 0 0 0 0 0 - 24.7431 0.7028 -13.0772 Cl 0 0 0 0 0 0 - 27.6785 1.5088 -11.1977 O 0 0 0 0 0 0 - 18.8518 -3.3193 -11.0584 F 0 0 0 0 0 0 - 28.1256 -0.4939 -11.4275 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1998 0.1919 -12.6248 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7747 -1.4609 -7.9094 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6917 -1.2340 -9.1288 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2039 -2.5877 -11.9510 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7946 -1.3928 -9.6999 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9897 1.3596 -10.2596 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9741 0.5773 -7.4253 H 0 0 0 0 0 0 - 28.4604 1.8112 -11.7624 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 28 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 15 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 15 2 0 0 0 - 15 31 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 16 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 32 1 0 0 0 - 23 33 1 0 0 0 -M END -> -41 - -> -0.067 - -$$$$ -7b - 3D - Structure written by MMmdl. - 40 42 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5013 -1.6332 -11.4637 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1568 -0.2839 -11.3999 C 0 0 1 0 0 0 - 26.6886 0.3329 -12.7025 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1969 0.0379 -12.7689 C 0 0 1 0 0 0 - 24.8105 -0.1505 -11.3108 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9592 -0.2656 -10.5261 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8971 -0.6307 -9.1854 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6408 -0.8548 -8.6218 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4840 -0.6750 -9.3761 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5563 -0.3395 -10.7327 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4601 -0.1883 -11.5559 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2105 -0.5483 -11.1220 C 0 0 0 0 0 0 - 20.7413 -1.8392 -11.3555 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4788 -2.2099 -10.9043 C 0 0 0 0 0 0 - 19.0081 -3.4457 -11.1600 F 0 0 0 0 0 0 - 18.6981 -1.3070 -10.1890 C 0 0 0 0 0 0 - 19.1613 -0.0124 -9.9545 C 0 0 0 0 0 0 - 18.2132 1.1216 -9.0640 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.4100 0.3677 -10.4377 C 0 0 0 0 0 0 - 27.3936 -0.9854 -8.2325 S 0 0 0 0 0 0 - 26.9547 -1.8191 -7.1140 O 0 0 0 0 0 0 - 28.4729 -1.4925 -9.0809 O 0 0 0 0 0 0 - 28.0024 0.7179 -7.6900 C 0 0 0 0 0 0 - 28.1774 1.4774 -8.7679 F 0 0 0 0 0 0 - 27.1642 1.2786 -6.8272 F 0 0 0 0 0 0 - 24.4433 1.1364 -13.4936 C 0 0 0 0 0 0 - 26.7744 -2.1461 -11.8362 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9807 0.3158 -11.0121 H 0 0 0 0 0 0 - 26.8561 1.4115 -12.6450 H 0 0 0 0 0 0 - 27.2249 -0.0134 -13.5849 H 0 0 0 0 0 0 - 25.0496 -0.9005 -13.3053 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5542 -1.2332 -7.6122 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5271 -0.8333 -8.9186 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3595 -2.5583 -11.8687 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7450 -1.6335 -9.8144 H 0 0 0 0 0 0 - 20.7599 1.3719 -10.2636 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9671 0.5600 -7.2227 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4853 0.7668 -13.8302 H 0 0 0 0 0 0 - 24.9806 1.4869 -14.3669 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2853 1.9691 -12.8189 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 26 38 1 0 0 0 - 26 39 1 0 0 0 - 26 40 1 0 0 0 -M END -> -7b - -> -3.8 - -$$$$ -54 - 3D - Structure written by MMmdl. - 36 37 0 0 1 0 999 V2000 - 27.3739 0.2021 -11.5257 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8166 -0.0727 -11.5403 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0692 -0.2356 -10.8548 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0425 -0.7765 -9.5491 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8317 -1.0884 -8.9403 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6267 -0.9347 -9.6164 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6229 -0.4433 -10.9232 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4601 -0.2995 -11.6659 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2313 -0.5849 -11.1558 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6536 -1.8315 -11.3749 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3870 -2.1109 -10.8587 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7018 -1.1325 -10.1312 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2617 0.1200 -9.9382 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4013 1.3488 -9.0779 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.5319 0.3986 -10.4453 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5413 -1.0868 -8.5786 S 0 0 0 0 0 0 - 27.1521 -2.0097 -7.4995 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9317 0.5862 -7.8045 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7489 0.5863 -12.9072 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8205 -3.3078 -11.0704 F 0 0 0 0 0 0 - 28.6431 -1.4626 -9.4346 O 0 0 0 0 0 0 - 27.8838 1.4066 -10.9877 O 0 0 0 0 0 0 - 25.0512 1.8655 -12.6953 F 0 0 0 0 0 0 - 25.5439 0.0623 -13.8379 F 0 0 0 0 0 0 - 28.0990 -0.6021 -11.4607 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3066 0.3708 -12.5896 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7932 -1.4850 -7.9329 H 0 0 0 0 0 0 - 22.7096 -1.2257 -9.1246 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1835 -2.5849 -11.9420 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7315 -1.3728 -9.7222 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9738 1.3666 -10.2947 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9058 0.4975 -7.3383 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1560 0.8615 -7.0926 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9947 1.3445 -8.5786 H 0 0 0 0 0 0 - 23.7601 0.5443 -13.3706 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5336 1.7915 -11.6096 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 28 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 15 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 20 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 15 2 0 0 0 - 15 31 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 18 32 1 0 0 0 - 18 33 1 0 0 0 - 18 34 1 0 0 0 - 19 23 1 0 0 0 - 19 24 1 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 22 36 1 0 0 0 -M END -> -54 - -> -0.15 - -$$$$ -215 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.6091 1.5498 -11.1508 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1523 0.3007 -11.6520 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5179 0.3762 -13.0497 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0307 0.5974 -12.8369 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8058 -0.0760 -11.4979 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0140 -0.2422 -10.8075 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0179 -0.7821 -9.5113 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8010 -1.0892 -8.9002 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6017 -0.9289 -9.5882 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6015 -0.4265 -10.8963 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4844 -0.2813 -11.6858 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2443 -0.5742 -11.1910 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6757 -1.8294 -11.4027 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4222 -2.1115 -10.8707 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8538 -3.3158 -11.0650 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7401 -1.1454 -10.1430 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2855 0.1245 -9.9643 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5738 1.1651 -9.2478 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5517 0.3924 -10.4677 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5336 -1.0789 -8.5968 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2337 -2.0296 -7.5210 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5907 -1.4009 -9.5499 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9246 0.5996 -7.8590 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0644 1.3127 -13.8260 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6596 -0.8019 -13.6597 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0143 1.9955 -8.6715 N 0 0 0 0 0 0 - 27.0855 0.7673 -6.3061 Cl 0 0 0 0 0 0 - 28.3441 1.8680 -11.7060 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9773 -0.4094 -11.7093 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4193 0.1887 -13.6438 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8032 1.6619 -12.7725 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7795 -1.4796 -7.8938 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6896 -1.2331 -9.1081 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2108 -2.5926 -11.9445 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8042 -1.4221 -9.7064 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0078 1.3477 -10.2751 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9969 0.6434 -7.6857 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6251 1.3933 -8.5421 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 26 3 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 27 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 -M END -> -215 - -> -0.017 - -$$$$ -57 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5460 1.5662 -11.2420 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1417 0.2930 -11.6885 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5175 0.3923 -13.0762 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0389 0.6092 -12.8376 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8019 -0.0696 -11.4987 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0104 -0.2420 -10.8202 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0127 -0.7818 -9.5245 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7956 -1.0891 -8.9065 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6024 -0.9292 -9.5909 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5998 -0.4338 -10.9040 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4840 -0.2835 -11.6909 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2455 -0.5724 -11.1935 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6764 -1.8302 -11.4013 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4221 -2.1085 -10.8691 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8546 -3.3219 -11.0584 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7416 -1.1432 -10.1420 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2911 0.1307 -9.9727 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5770 1.1677 -9.2377 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5543 0.3924 -10.4659 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5112 -1.0831 -8.6116 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2088 -2.0204 -7.5319 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5710 -1.4325 -9.5653 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9471 0.5775 -7.8607 C 0 0 0 0 0 0 - 28.0885 1.5196 -8.8246 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0049 0.9273 -6.9820 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0078 1.9897 -8.6610 N 0 0 0 0 0 0 - 29.1051 0.3677 -7.2549 F 0 0 0 0 0 0 - 28.3249 1.8309 -11.7526 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9812 -0.4065 -11.7115 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9660 1.2243 -13.6577 H 0 0 0 0 0 0 - 26.6903 -0.5132 -13.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4319 0.1682 -13.6370 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7947 1.6584 -12.7761 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7771 -1.4712 -7.8943 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6821 -1.2262 -9.1101 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2086 -2.5941 -11.9485 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7930 -1.4100 -9.7040 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0142 1.3550 -10.2678 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 34 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 26 3 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 27 1 0 0 0 -M END -> -57 - -> -0.015 - -$$$$ -42 - 3D - Structure written by MMmdl. - 34 35 0 0 1 0 999 V2000 - 27.3181 0.2176 -11.5431 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8173 -0.0332 -11.4982 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0316 -0.2203 -10.8241 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0328 -0.7764 -9.5277 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8083 -1.0836 -8.9200 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6105 -0.9378 -9.6088 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6080 -0.4325 -10.9159 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4782 -0.3027 -11.6931 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2413 -0.5786 -11.1883 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6684 -1.8341 -11.3988 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4219 -2.1085 -10.8663 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7432 -1.1382 -10.1421 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2836 0.1206 -9.9615 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5727 1.1637 -9.2506 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5566 0.3950 -10.4703 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5391 -1.0763 -8.5681 S 0 0 0 0 0 0 - 27.1919 -2.0237 -7.4724 O 0 0 0 0 0 0 - 28.6309 -1.4696 -9.4479 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9381 0.5939 -7.7835 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5845 1.5769 -8.6192 F 0 0 0 0 0 0 - 27.2323 0.7221 -6.6748 F 0 0 0 0 0 0 - 24.7447 0.7035 -13.0743 Cl 0 0 0 0 0 0 - 27.7285 1.4980 -11.1377 O 0 0 0 0 0 0 - 18.8540 -3.3240 -11.0570 F 0 0 0 0 0 0 - 17.9992 1.9902 -8.6618 N 0 0 0 0 0 0 - 28.1192 -0.5047 -11.4029 H 0 0 0 0 0 0 - 27.2079 0.2157 -12.6078 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7733 -1.4610 -7.9041 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6894 -1.2359 -9.1283 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2059 -2.5899 -11.9543 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7913 -1.4035 -9.7072 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0082 1.3546 -10.2735 H 0 0 0 0 0 0 - 29.0034 0.6658 -7.6024 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5462 1.7462 -11.6214 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 15 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 15 2 0 0 0 - 14 25 3 0 0 0 - 15 32 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 16 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 33 1 0 0 0 - 23 34 1 0 0 0 -M END -> -42 - -> -0.28 - -$$$$ -35 - 3D - Structure written by MMmdl. - 34 35 0 0 1 0 999 V2000 - 27.3436 0.2181 -11.4886 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8143 -0.0349 -11.4934 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0359 -0.2157 -10.8128 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0279 -0.7798 -9.5188 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8027 -1.0842 -8.9107 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6077 -0.9361 -9.6066 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6033 -0.4369 -10.9127 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4684 -0.3083 -11.6869 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2346 -0.5820 -11.1843 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6688 -1.8348 -11.3989 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4172 -2.1128 -10.8633 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7392 -1.1398 -10.1370 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2891 0.1256 -9.9557 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4298 1.3495 -9.0945 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.5490 0.3955 -10.4695 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5361 -1.1002 -8.5609 S 0 0 0 0 0 0 - 27.1915 -2.0165 -7.4763 O 0 0 0 0 0 0 - 28.6294 -1.4923 -9.4625 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9209 0.6056 -7.8457 C 0 0 0 0 0 0 - 27.8955 1.4798 -8.8507 F 0 0 0 0 0 0 - 26.9875 0.8733 -6.9434 F 0 0 0 0 0 0 - 24.7678 0.5910 -12.8118 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7397 1.0868 -13.8577 N 0 0 0 0 0 0 - 27.7506 1.4985 -11.0563 O 0 0 0 0 0 0 - 18.8551 -3.3220 -11.0512 F 0 0 0 0 0 0 - 28.1384 -0.4849 -11.3364 H 0 0 0 0 0 0 - 27.2792 0.1852 -12.5694 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7669 -1.4583 -7.8977 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6880 -1.2361 -9.1232 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2037 -2.5885 -11.9555 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7939 -1.3817 -9.7021 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9933 1.3586 -10.2824 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8931 0.6288 -7.3559 H 0 0 0 0 0 0 - 28.4520 1.8114 -11.6736 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 15 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 25 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 15 2 0 0 0 - 15 32 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 16 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 33 1 0 0 0 - 22 23 3 0 0 0 - 24 34 1 0 0 0 -M END -> -35 - -> -5.7 - -$$$$ -252 - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - 27.6272 1.5392 -11.1203 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1560 0.3040 -11.6456 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5217 0.3806 -13.0460 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0330 0.5955 -12.8364 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8086 -0.0746 -11.4954 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0176 -0.2341 -10.8015 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0221 -0.7646 -9.5003 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8023 -1.0839 -8.8976 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6037 -0.9285 -9.5871 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6033 -0.4271 -10.8952 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4845 -0.2768 -11.6823 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2452 -0.5718 -11.1881 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6754 -1.8264 -11.4017 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4205 -2.1096 -10.8738 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8538 -3.3152 -11.0677 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7369 -1.1453 -10.1422 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2852 0.1248 -9.9603 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5778 1.1653 -9.2362 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5515 0.3943 -10.4623 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5325 -1.0603 -8.5700 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2148 -1.9861 -7.4807 O 0 0 0 0 0 0 - 28.6045 -1.3793 -9.5081 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9346 0.4720 -7.8610 N 0 0 0 0 0 0 - 27.0654 1.3180 -13.8219 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6664 -0.7984 -13.6558 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0227 1.9941 -8.6522 N 0 0 0 0 0 0 - 28.3555 1.8653 -11.6765 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9781 -0.4091 -11.7063 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4242 0.1890 -13.6462 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8013 1.6590 -12.7701 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7765 -1.4822 -7.8947 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6850 -1.2325 -9.1075 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2121 -2.5898 -11.9431 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8013 -1.4259 -9.7039 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0089 1.3503 -10.2685 H 0 0 0 0 0 0 - 27.2535 0.7935 -7.1729 H 0 0 0 0 0 0 - 28.1763 1.1767 -8.5625 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 26 3 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 36 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 -M END -> -252 - -> -0.076 - -$$$$ -336 - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - 28.0017 1.1554 -10.7561 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1887 0.2094 -11.4461 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5170 0.8013 -12.6963 C 0 0 1 0 0 0 - 25.1920 0.0739 -12.8350 C 0 0 1 0 0 0 - 24.8410 -0.2394 -11.4041 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9976 -0.2708 -10.6132 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9018 -0.7012 -9.2751 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6420 -0.9417 -8.7237 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4967 -0.8363 -9.5019 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5906 -0.5071 -10.8564 C 0 0 0 0 0 0 - 22.5177 -0.4372 -11.7191 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2475 -0.6509 -11.2594 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6133 -1.8570 -11.5324 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3358 -2.0915 -11.0377 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7005 -3.2450 -11.3168 F 0 0 0 0 0 0 - 18.6966 -1.1280 -10.2666 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3124 0.1012 -10.0242 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6517 1.1490 -9.2706 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5958 0.3258 -10.5084 C 0 0 0 0 0 0 - 27.3000 -1.0274 -8.2059 S 0 0 0 0 0 0 - 26.8468 -1.9518 -7.1631 O 0 0 0 0 0 0 - 28.4307 -1.3569 -9.0788 O 0 0 0 0 0 0 - 26.2251 2.0652 -12.4186 F 0 0 0 0 0 0 - 18.1329 1.9838 -8.6644 N 0 0 0 0 0 0 - 24.3006 0.8164 -13.4952 F 0 0 0 0 0 0 - 27.7092 0.4639 -7.4488 N 0 0 0 0 0 0 - 28.5314 1.6554 -11.3951 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7885 -0.6501 -11.7494 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1367 0.8148 -13.5962 H 0 0 0 0 0 0 - 25.3024 -0.8318 -13.4322 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5459 -1.2350 -7.6890 H 0 0 0 0 0 0 - 22.5403 -1.0632 -9.0641 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1114 -2.6124 -12.1160 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7386 -1.3762 -9.8563 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0990 1.2456 -10.2714 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9316 0.7997 -6.8682 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0360 1.1649 -8.1144 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 25 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 24 3 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 26 36 1 0 0 0 - 26 37 1 0 0 0 -M END -> -336 - -> -0.063 - -$$$$ -290 - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 41 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5740 1.5625 -11.2291 N 0 0 0 0 0 0 - 27.1541 0.2576 -11.6910 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5095 0.3461 -13.0777 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0290 0.5954 -12.8450 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8037 -0.0602 -11.4984 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0092 -0.2240 -10.8090 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0109 -0.7777 -9.5207 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7959 -1.0889 -8.9045 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5992 -0.9223 -9.5915 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5984 -0.4194 -10.8961 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4824 -0.2843 -11.6898 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2448 -0.5748 -11.1956 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6740 -1.8289 -11.4024 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4243 -2.1094 -10.8700 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8514 -3.3146 -11.0611 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7414 -1.1444 -10.1434 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2871 0.1244 -9.9694 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5764 1.1678 -9.2409 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5463 0.3914 -10.4687 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5079 -1.0807 -8.5946 S 0 0 0 0 0 0 - 28.5661 -1.4034 -9.5526 O 0 0 0 0 0 0 - 27.2082 -2.0475 -7.5362 O 0 0 0 0 0 0 - 27.8937 0.5866 -7.7878 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0532 1.2780 -13.8693 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6434 -0.8310 -13.6723 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0158 1.9913 -8.6668 N 0 0 0 0 0 0 - 29.1657 0.5265 -7.4607 F 0 0 0 0 0 0 - 27.7528 1.6123 -8.6183 F 0 0 0 0 0 0 - 27.1110 0.7689 -6.7327 F 0 0 0 0 0 0 - 28.0811 1.4599 -10.3770 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2888 1.9365 -11.8603 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0018 -0.4423 -11.7297 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4058 0.1882 -13.6467 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8104 1.6599 -12.7803 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7747 -1.4836 -7.9003 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6851 -1.2365 -9.1107 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2092 -2.5946 -11.9437 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8072 -1.4207 -9.7067 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0053 1.3469 -10.2638 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 36 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 26 3 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 27 1 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 23 29 1 0 0 0 -M END -> -290 - -> -0.018 - -$$$$ -155 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5494 1.5659 -11.2067 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1387 0.3127 -11.6756 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5195 0.3859 -13.0738 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0304 0.6044 -12.8406 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8061 -0.0723 -11.5018 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0164 -0.2280 -10.8172 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0250 -0.7653 -9.5189 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8069 -1.0884 -8.9105 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6125 -0.9394 -9.5957 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6090 -0.4330 -10.9057 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4875 -0.2786 -11.6860 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2486 -0.5699 -11.1809 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6770 -1.8256 -11.3995 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4179 -2.1080 -10.8727 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7289 -1.1532 -10.1417 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3023 0.1333 -9.9545 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5710 1.1634 -9.2382 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5526 0.3882 -10.4464 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5350 -1.0542 -8.5888 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2245 -2.0103 -7.5175 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5876 -1.3949 -9.5469 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9675 0.6084 -7.8120 C 0 0 0 0 0 0 - 27.8916 1.5374 -8.7619 F 0 0 0 0 0 0 - 27.1087 0.8486 -6.8235 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0096 1.9978 -8.6641 N 0 0 0 0 0 0 - 18.8612 -3.3248 -11.0680 F 0 0 0 0 0 0 - 28.3285 1.8440 -11.7146 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9831 -0.3652 -11.7079 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9486 1.2013 -13.6586 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7016 -0.5357 -13.6445 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4372 0.1594 -13.6425 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7828 1.6653 -12.7799 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7866 -1.4665 -7.8955 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6845 -1.2110 -9.1051 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2122 -2.5863 -11.9511 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7861 -1.4111 -9.7045 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0278 1.3625 -10.2649 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9817 0.5496 -7.4392 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 26 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 17 25 3 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 21 2 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 -M END -> -155 - -> -0.02 - -$$$$ -164 - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 41 0 0 1 0 999 V2000 - 27.6126 -0.7221 -11.8575 N 0 0 0 0 0 0 - 26.8627 0.4834 -11.6485 C 0 0 1 0 0 0 - 26.1047 0.9544 -12.9037 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7399 0.3045 -12.8887 C 0 0 0 0 0 0 - 24.5521 0.0154 -11.4229 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7582 0.0913 -10.7061 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8158 -0.3193 -9.3720 C 0 0 0 0 0 0 - 24.6669 -0.8401 -8.7767 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4728 -0.8983 -9.5001 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4127 -0.4346 -10.8069 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3203 -0.4472 -11.6365 O 0 0 0 0 0 0 - 21.0931 -0.6646 -11.1188 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5226 -1.9214 -11.2703 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2978 -2.1862 -10.6822 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7173 -3.3953 -10.8100 F 0 0 0 0 0 0 - 18.6466 -1.1917 -9.9592 C 0 0 0 0 0 0 - 19.1729 0.0954 -9.8802 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4511 1.1750 -9.2307 C 0 0 0 0 0 0 - 20.4149 0.3549 -10.4427 C 0 0 0 0 0 0 - 27.3832 -0.4357 -8.4930 S 0 0 0 0 0 0 - 27.1650 -1.2520 -7.3169 O 0 0 0 0 0 0 - 28.4060 -0.7807 -9.4815 O 0 0 0 0 0 0 - 27.7560 1.2677 -7.8424 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9199 2.2501 -12.6967 F 0 0 0 0 0 0 - 26.7393 0.7426 -14.0688 F 0 0 0 0 0 0 - 17.8847 2.0403 -8.7170 N 0 0 0 0 0 0 - 28.4254 -0.5246 -12.4360 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9605 -1.1018 -10.9738 H 0 0 0 0 0 0 - 27.4864 1.2911 -11.3381 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7677 -0.6258 -13.4628 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9668 0.9440 -13.3228 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7064 -1.2424 -7.7690 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6069 -1.3623 -9.0644 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0440 -2.6868 -11.8270 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7233 -1.4644 -9.4868 H 0 0 0 0 0 0 - 20.8568 1.3336 -10.3269 H 0 0 0 0 0 0 - 28.7359 1.1864 -7.3802 H 0 0 0 0 0 0 - 27.0414 1.4910 -7.0641 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7898 1.9666 -8.6384 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 26 3 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 -M END -> -164 - -> -11 - -$$$$ -7a - 3D - Structure written by MMmdl. - 40 42 0 0 1 0 999 V2000 - 27.8986 1.1686 -10.8159 O 0 0 0 0 0 0 - 27.3063 0.0821 -11.4967 C 0 0 2 0 0 0 - 26.7543 0.5309 -12.8435 C 0 0 0 0 0 0 - 25.2972 0.0902 -12.9073 C 0 0 1 0 0 0 - 24.9356 -0.2719 -11.4777 C 0 0 0 0 0 0 - 26.1058 -0.4336 -10.7289 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0415 -0.9623 -9.4361 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8001 -1.2235 -8.8639 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6290 -0.9777 -9.5693 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6838 -0.5129 -10.8898 C 0 0 0 0 0 0 - 22.5621 -0.2401 -11.6444 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3109 -0.5861 -11.1952 C 0 0 0 0 0 0 - 20.8154 -1.8606 -11.4562 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5537 -2.2243 -11.0029 C 0 0 0 0 0 0 - 19.0721 -3.4508 -11.2863 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7894 -1.3253 -10.2644 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2720 -0.0424 -10.0060 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3130 1.0837 -9.1138 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.5312 0.3270 -10.4759 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5140 -1.2559 -8.4651 S 0 0 0 0 0 0 - 27.1933 -2.2794 -7.4639 O 0 0 0 0 0 0 - 28.6255 -1.4828 -9.3950 O 0 0 0 0 0 0 - 27.7388 0.4232 -7.6234 C 0 0 0 0 0 0 - 27.7231 1.3759 -8.5583 F 0 0 0 0 0 0 - 26.7479 0.5754 -6.7503 F 0 0 0 0 0 0 - 24.4377 1.1669 -13.5390 C 0 0 0 0 0 0 - 28.6114 1.5312 -11.3627 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0280 -0.7165 -11.6685 H 0 0 0 0 0 0 - 26.8240 1.6206 -12.9191 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3250 0.1428 -13.6861 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2257 -0.8173 -13.5111 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7387 -1.6083 -7.8634 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6833 -1.1799 -9.0869 H 0 0 0 0 0 0 - 21.4160 -2.5775 -11.9946 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8284 -1.6333 -9.8958 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9029 1.3142 -10.2637 H 0 0 0 0 0 0 - 28.6860 0.4534 -7.0836 H 0 0 0 0 0 0 - 23.4853 0.7664 -13.8251 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8788 1.5661 -14.4435 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2853 1.9768 -12.8310 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 26 38 1 0 0 0 - 26 39 1 0 0 0 - 26 40 1 0 0 0 -M END -> -7a - -> -0.047 - -$$$$ -224 - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5892 1.5543 -11.2505 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1498 0.2833 -11.6710 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5108 0.3676 -13.0595 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0274 0.6124 -12.8307 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7998 -0.0567 -11.4929 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0087 -0.2305 -10.8088 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0111 -0.7788 -9.5159 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7936 -1.0867 -8.9039 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5969 -0.9365 -9.5976 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5942 -0.4360 -10.9066 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4686 -0.2925 -11.6835 O 0 0 0 0 0 0 - 21.3282 -0.9881 -11.3963 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5230 -1.0757 -8.5998 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2255 -2.0253 -7.5211 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5744 -1.4184 -9.5570 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9214 0.6061 -7.8350 C 0 0 0 0 0 0 - 26.6364 -0.8101 -13.6721 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0633 1.3020 -13.8343 F 0 0 0 0 0 0 - 29.1867 0.5592 -7.4973 F 0 0 0 0 0 0 - 27.7524 1.5709 -8.7021 F 0 0 0 0 0 0 - 27.1266 0.7997 -6.7875 F 0 0 0 0 0 0 - 21.0786 -2.3612 -11.5124 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8428 -2.6747 -11.1890 N 0 0 0 0 0 0 - 19.2863 -1.5151 -10.8350 N 0 0 0 0 0 0 - 20.1395 -0.4523 -10.9690 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9093 -1.4982 -10.3984 C 0 0 0 0 0 0 - 28.3645 1.8361 -11.7694 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9763 -0.4257 -11.6958 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8087 1.6838 -12.7839 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4133 0.1809 -13.6152 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7772 -1.4629 -7.8914 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6752 -1.2335 -9.1264 H 0 0 0 0 0 0 - 21.7723 -3.1162 -11.8587 H 0 0 0 0 0 0 - 19.8418 0.5586 -10.7467 H 0 0 0 0 0 0 - 17.2620 -1.8736 -11.1914 H 0 0 0 0 0 0 - 17.6284 -0.4741 -10.1584 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7963 -2.1168 -9.5078 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 17 1 0 0 0 - 3 18 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 22 1 0 0 0 - 12 25 2 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 15 2 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 16 19 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 33 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 25 34 1 0 0 0 - 26 35 1 0 0 0 - 26 36 1 0 0 0 - 26 37 1 0 0 0 -M END -> -224 - -> -0.083 - -$$$$ -84 - 3D - Structure written by MMmdl. - 33 35 0 0 1 0 999 V2000 - 27.1519 0.2532 -11.6800 C 0 0 0 0 0 0 - 26.5130 0.7426 -12.8412 O 0 0 0 0 0 0 - 25.1762 0.6269 -12.7600 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8499 -0.0311 -11.4770 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0340 -0.2215 -10.7968 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0242 -0.7693 -9.5082 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8040 -1.0944 -8.9127 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6145 -0.9327 -9.6143 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6192 -0.4161 -10.9195 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4850 -0.2560 -11.6856 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2418 -0.5594 -11.1731 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6764 -1.8121 -11.3952 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4207 -2.1058 -10.8708 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8527 -3.3055 -11.0912 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7389 -1.1582 -10.1193 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2846 0.1056 -9.9175 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4076 1.3130 -9.0524 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.5427 0.3982 -10.4386 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5368 -1.0620 -8.6071 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2401 -2.0061 -7.5205 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5629 -1.4048 -9.5884 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9655 0.6177 -7.8733 C 0 0 0 0 0 0 - 27.8644 1.5436 -8.8222 F 0 0 0 0 0 0 - 27.1261 0.8718 -6.8704 F 0 0 0 0 0 0 - 24.4444 1.0443 -13.6419 O 0 0 0 0 0 0 - 27.7351 1.0614 -11.2340 H 0 0 0 0 0 0 - 27.8490 -0.5450 -11.9454 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7810 -1.4921 -7.9071 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6871 -1.2236 -9.1360 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2083 -2.5725 -11.9463 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8032 -1.4332 -9.6854 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9779 1.3673 -10.2624 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9894 0.5501 -7.5409 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 25 2 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 19 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 29 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 18 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 30 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 31 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 18 32 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 21 2 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 22 33 1 0 0 0 -M END -> -84 - -> -2.8 - -$$$$ -254 - 3D - Structure written by MMmdl. - 40 42 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5290 1.5702 -11.4140 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1452 0.2616 -11.7016 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5035 0.3509 -13.0777 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0278 0.6163 -12.8283 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8030 -0.0491 -11.4879 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0132 -0.2224 -10.8071 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0189 -0.7643 -9.5084 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8007 -1.0836 -8.9010 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6021 -0.9380 -9.5968 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6010 -0.4271 -10.9002 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4865 -0.2951 -11.6981 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2462 -0.5782 -11.2011 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6750 -1.8342 -11.4016 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4231 -2.1130 -10.8638 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8605 -3.3235 -11.0484 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7415 -1.1394 -10.1398 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2943 0.1296 -9.9653 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5740 1.1648 -9.2440 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5558 0.3964 -10.4841 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5377 -1.0695 -8.5948 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2346 -2.0117 -7.5154 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5882 -1.4038 -9.5540 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9451 0.4615 -7.8301 N 0 0 0 0 0 0 - 27.0549 1.2897 -13.8570 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6287 -0.8235 -13.6847 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0045 1.9857 -8.6629 N 0 0 0 0 0 0 - 28.5002 1.5466 -8.6218 C 0 0 0 0 0 0 - 28.4232 1.7635 -11.7473 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9845 -0.4335 -11.6910 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4120 0.1762 -13.6053 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8119 1.6889 -12.7872 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7814 -1.4584 -7.8884 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6799 -1.2369 -9.1253 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2052 -2.5946 -11.9528 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7929 -1.3901 -9.7095 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0125 1.3565 -10.3126 H 0 0 0 0 0 0 - 28.3572 0.4001 -6.9030 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5305 2.4836 -8.0830 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7869 1.7713 -9.3533 H 0 0 0 0 0 0 - 29.4618 1.2797 -9.0473 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 26 3 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 27 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 27 38 1 0 0 0 - 27 39 1 0 0 0 - 27 40 1 0 0 0 -M END -> -254 - -> -0.1 - -$$$$ -23 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5798 1.5235 -11.1849 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1359 0.2965 -11.6771 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5177 0.4046 -13.0685 C 0 0 1 0 0 0 - 25.0171 0.5901 -12.8411 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8195 -0.0696 -11.5047 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0204 -0.2306 -10.8289 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0077 -0.7642 -9.5085 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8269 -1.0884 -8.9088 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5995 -0.9354 -9.6045 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5962 -0.4510 -10.8982 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4844 -0.2684 -11.6800 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2404 -0.5613 -11.1739 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5576 0.3996 -10.4453 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2837 0.1051 -9.9375 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6058 1.0679 -9.2497 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7338 -1.1345 -10.1306 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4232 -2.1096 -10.8804 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8528 -3.3134 -11.0758 F 0 0 0 0 0 0 - 20.6704 -1.8200 -11.3967 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5347 -1.0647 -8.5760 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2199 -2.0185 -7.5306 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5959 -1.3615 -9.5279 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9440 0.6097 -7.7719 C 0 0 0 0 0 0 - 27.8264 1.5664 -8.6650 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0972 0.7943 -6.7402 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0792 1.3725 -13.8825 O 0 0 0 0 0 0 - 28.4196 1.7763 -11.5732 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9878 -0.3852 -11.7231 H 0 0 0 0 0 0 - 26.6601 -0.5701 -13.6036 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7751 1.6572 -12.7727 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4463 0.1629 -13.6523 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7825 -1.4708 -7.9005 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6825 -1.2208 -9.1092 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9920 1.3609 -10.2837 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7876 -1.4003 -9.6966 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2084 -2.5776 -11.9529 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9652 0.5721 -7.4332 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6651 1.9280 -13.3465 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 35 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 26 38 1 0 0 0 -M END -> -23 - -> -6.6 - -$$$$ -251 - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 41 0 0 1 0 999 V2000 - 27.4945 1.5901 -11.4326 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1374 0.2686 -11.7191 C 0 0 2 0 0 0 - 26.4953 0.3323 -13.0981 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0217 0.5994 -12.8429 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8020 -0.0597 -11.4964 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0153 -0.2255 -10.8167 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0241 -0.7593 -9.5118 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8061 -1.0787 -8.9024 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6060 -0.9317 -9.5932 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6016 -0.4258 -10.8989 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4847 -0.2873 -11.6913 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2447 -0.5730 -11.1948 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5522 0.3978 -10.4720 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2931 0.1248 -9.9600 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6203 1.0830 -9.2845 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7413 -1.1375 -10.1417 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4210 -2.1088 -10.8684 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8530 -3.3145 -11.0601 F 0 0 0 0 0 0 - 20.6751 -1.8286 -11.4013 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5391 -1.0647 -8.5878 S 0 0 0 0 0 0 - 28.5975 -1.3882 -9.5392 O 0 0 0 0 0 0 - 27.2312 -2.0153 -7.5145 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9407 0.4584 -7.8059 N 0 0 0 0 0 0 - 27.0378 1.2658 -13.8907 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6284 -0.8376 -13.6973 F 0 0 0 0 0 0 - 28.4928 1.5464 -8.6066 C 0 0 0 0 0 0 - 28.3741 1.7859 -11.8038 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9892 -0.4124 -11.7122 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8113 1.6720 -12.7864 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3984 0.1783 -13.6254 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7828 -1.4635 -7.8934 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6875 -1.2371 -9.1179 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9875 1.3612 -10.2718 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7955 -1.3802 -9.7072 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2077 -2.5898 -11.9503 H 0 0 0 0 0 0 - 28.3589 0.3734 -6.8803 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5484 2.4694 -8.0394 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7523 1.7872 -9.3272 H 0 0 0 0 0 0 - 29.4721 1.2647 -9.0380 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 23 36 1 0 0 0 - 26 37 1 0 0 0 - 26 38 1 0 0 0 - 26 39 1 0 0 0 -M END -> -251 - -> -0.031 - -$$$$ -256 - 3D - Structure written by MMmdl. - 36 38 0 0 1 0 999 V2000 - 27.6349 1.5390 -11.1120 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1610 0.3080 -11.6434 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5246 0.3818 -13.0435 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0349 0.5918 -12.8363 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8128 -0.0780 -11.4926 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0207 -0.2330 -10.7985 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0265 -0.7616 -9.4949 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8081 -1.0797 -8.8934 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6071 -0.9271 -9.5818 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6051 -0.4285 -10.8927 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4843 -0.2729 -11.6739 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2426 -0.5644 -11.1778 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5460 0.3947 -10.4507 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2853 0.1164 -9.9393 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6069 1.0601 -9.2520 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7375 -1.1466 -10.1378 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4161 -2.1029 -10.8774 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8465 -3.3080 -11.0783 F 0 0 0 0 0 0 - 20.6729 -1.8221 -11.4011 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5432 -1.0730 -8.5723 S 0 0 0 0 0 0 - 28.5992 -1.4076 -9.5147 O 0 0 0 0 0 0 - 27.2219 -1.9934 -7.4762 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9698 0.4559 -7.8597 N 0 0 0 0 0 0 - 27.0650 1.3224 -13.8196 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6750 -0.7960 -13.6529 F 0 0 0 0 0 0 - 28.3650 1.8699 -11.6666 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9821 -0.4047 -11.7081 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7980 1.6524 -12.7661 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4281 0.1890 -13.6510 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7791 -1.4795 -7.8909 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6905 -1.2302 -9.1017 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9792 1.3620 -10.2594 H 0 0 0 0 0 0 - 17.8013 -1.4072 -9.6924 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2096 -2.5824 -11.9444 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3130 0.7844 -7.1551 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2244 1.1712 -8.5468 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 19 34 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 35 1 0 0 0 - 23 36 1 0 0 0 -M END -> -256 - -> -0.015 - -$$$$ -50 - 3D - Structure written by MMmdl. - 33 34 0 0 1 0 999 V2000 - 27.3390 0.1920 -11.4897 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8115 -0.0320 -11.4904 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0318 -0.2159 -10.8097 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0227 -0.7765 -9.5149 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7999 -1.0827 -8.9074 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6041 -0.9361 -9.6042 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6047 -0.4331 -10.9129 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4696 -0.3076 -11.6887 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2371 -0.5820 -11.1896 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6706 -1.8347 -11.4004 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4200 -2.1133 -10.8631 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7409 -1.1381 -10.1380 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2928 0.1262 -9.9592 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4329 1.3500 -9.0987 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.5510 0.3973 -10.4761 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5371 -1.0872 -8.5685 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2050 -2.0060 -7.4766 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9344 0.6067 -7.8551 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7666 0.6009 -12.8075 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7316 1.1052 -13.8442 N 0 0 0 0 0 0 - 18.8585 -3.3227 -11.0488 F 0 0 0 0 0 0 - 28.6335 -1.4776 -9.4489 O 0 0 0 0 0 0 - 28.1506 -0.4789 -11.3067 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6428 1.1924 -11.1938 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3039 0.1099 -12.5710 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7642 -1.4526 -7.8916 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6854 -1.2290 -9.1184 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2054 -2.5880 -11.9589 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7935 -1.3751 -9.7040 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9967 1.3605 -10.2973 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8630 0.5151 -7.3041 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1256 0.9197 -7.1987 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0617 1.3257 -8.6644 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 1 25 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 26 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 15 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 28 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 21 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 15 2 0 0 0 - 15 30 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 16 22 2 0 0 0 - 18 31 1 0 0 0 - 18 32 1 0 0 0 - 18 33 1 0 0 0 - 19 20 3 0 0 0 -M END -> -50 - -> -0.078 - -$$$$ -231 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.8943 1.1788 -11.0631 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1609 0.1641 -11.7029 C 0 0 2 0 0 0 - 26.4962 0.6274 -13.0105 C 0 0 1 0 0 0 - 25.0720 0.1050 -12.9974 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8103 -0.1873 -11.5381 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0092 -0.2725 -10.8246 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0063 -0.6974 -9.4871 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7861 -0.9464 -8.8596 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5916 -0.8530 -9.5671 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6031 -0.5017 -10.9219 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4930 -0.4333 -11.7294 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2454 -0.6638 -11.2213 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6244 -1.8866 -11.4633 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3585 -2.1311 -10.9427 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7399 -3.3039 -11.1763 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7159 -1.1569 -10.1866 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3156 0.0868 -9.9795 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6351 1.1380 -9.2464 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5951 0.3214 -10.4759 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5155 -0.9389 -8.5422 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2187 -1.8839 -7.4633 O 0 0 0 0 0 0 - 28.6096 -1.2396 -9.4636 O 0 0 0 0 0 0 - 27.8361 0.7467 -7.7905 C 0 0 0 0 0 0 - 26.3889 1.9565 -13.0245 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0971 1.9749 -8.6636 N 0 0 0 0 0 0 - 28.5017 1.6054 -11.6875 H 0 0 0 0 0 0 - 27.8028 -0.6923 -11.9073 H 0 0 0 0 0 0 - 27.0542 0.3687 -13.9106 H 0 0 0 0 0 0 - 25.0170 -0.8251 -13.5618 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3529 0.7937 -13.4436 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7564 -1.2393 -7.8226 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6707 -1.0996 -9.0644 H 0 0 0 0 0 0 - 21.1293 -2.6489 -12.0348 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7656 -1.4057 -9.7616 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0858 1.2560 -10.2638 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8700 0.7613 -7.4646 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1544 0.8944 -6.9586 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6817 1.5165 -8.5435 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 25 3 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 36 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 -M END -> -231 - -> -0.045 - -$$$$ -15 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5645 1.5617 -11.2470 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1438 0.2894 -11.6866 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5069 0.3556 -13.0757 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0262 0.5977 -12.8413 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8031 -0.0727 -11.5007 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0146 -0.2359 -10.8163 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0213 -0.7692 -9.5151 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8049 -1.0873 -8.9042 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6051 -0.9368 -9.5930 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6014 -0.4415 -10.9017 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4836 -0.2868 -11.6891 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2430 -0.5721 -11.1917 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6758 -1.8287 -11.4014 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4200 -2.1085 -10.8706 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8549 -3.3186 -11.0589 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7372 -1.1390 -10.1439 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2837 0.1313 -9.9594 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5786 1.1709 -9.2254 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5524 0.3981 -10.4669 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5332 -1.0635 -8.5894 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2225 -2.0202 -7.5218 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5866 -1.4048 -9.5424 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9649 0.6070 -7.8096 C 0 0 0 0 0 0 - 27.9127 1.5706 -8.7312 F 0 0 0 0 0 0 - 27.1075 0.8491 -6.8159 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0532 1.2940 -13.8508 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6473 -0.8235 -13.6788 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0226 1.9829 -8.6098 N 0 0 0 0 0 0 - 28.3466 1.8345 -11.7534 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9838 -0.4055 -11.7093 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4086 0.1833 -13.6391 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8053 1.6637 -12.7779 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7815 -1.4717 -7.8954 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6864 -1.2351 -9.1095 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2089 -2.5934 -11.9466 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7966 -1.4127 -9.7040 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0132 1.3531 -10.2641 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9783 0.5461 -7.4245 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 36 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 28 3 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 -M END -> -15 - -> -0.008 - -$$$$ -124 - 3D - Structure written by MMmdl. - 32 33 0 0 1 0 999 V2000 - 24.8310 -0.0580 -11.4927 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0235 -0.2330 -10.7891 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9987 -0.7743 -9.5096 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7856 -1.0874 -8.8994 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6010 -0.9335 -9.6065 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6090 -0.4396 -10.9170 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4819 -0.2891 -11.6902 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2436 -0.5778 -11.1838 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6717 -1.8245 -11.3930 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4142 -2.1154 -10.8705 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7356 -1.1376 -10.1307 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2836 0.1166 -9.9443 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4182 1.3429 -9.0771 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.5528 0.3972 -10.4460 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5088 -1.0841 -8.6332 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2224 -2.0236 -7.5339 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5286 -1.4187 -9.6099 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9364 0.5884 -7.9114 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0434 0.9305 -6.9901 F 0 0 0 0 0 0 - 29.1248 0.3945 -7.3800 F 0 0 0 0 0 0 - 24.8632 0.5892 -12.8609 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8482 -3.3161 -11.0632 F 0 0 0 0 0 0 - 28.0161 1.4963 -8.8897 F 0 0 0 0 0 0 - 24.9720 1.8976 -12.6428 F 0 0 0 0 0 0 - 25.8923 0.1745 -13.6008 F 0 0 0 0 0 0 - 26.9738 0.0481 -11.2370 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7621 -1.4743 -7.8944 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6769 -1.2285 -9.1344 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2027 -2.5903 -11.9465 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7913 -1.4073 -9.6929 H 0 0 0 0 0 0 - 20.9858 1.3555 -10.2466 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9655 0.4033 -13.4518 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 15 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 14 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 29 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 22 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 14 2 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 17 2 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 21 24 1 0 0 0 - 21 25 1 0 0 0 - 21 32 1 0 0 0 -M END -> -124 - -> -0.038 - -$$$$ -25 - 3D - Structure written by MMmdl. - 36 38 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5859 1.5623 -11.2324 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1492 0.2971 -11.6733 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5076 0.3637 -13.0705 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0245 0.6054 -12.8334 C 0 0 0 0 0 0 - 24.7996 -0.0551 -11.4938 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0078 -0.2311 -10.8127 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0108 -0.7709 -9.5133 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8035 -1.0874 -8.9001 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5881 -0.9333 -9.6008 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5951 -0.4351 -10.8957 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4690 -0.2899 -11.6964 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2387 -0.6920 -11.2605 C 0 0 0 0 0 0 - 20.3852 0.2262 -10.6417 C 0 0 0 0 0 0 - 19.1164 -0.1734 -10.2278 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0692 0.9590 -9.4559 Cl 0 0 0 0 0 0 - 18.7285 -1.4968 -10.4568 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5276 -2.4069 -11.0647 N 0 0 0 0 0 0 - 20.7667 -1.9978 -11.4607 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5322 -1.0704 -8.5909 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2287 -2.0196 -7.5193 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5815 -1.4021 -9.5453 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9369 0.6210 -7.8282 C 0 0 0 0 0 0 - 27.8067 1.5658 -8.7311 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0921 0.8174 -6.7982 F 0 0 0 0 0 0 - 27.0574 1.2966 -13.8388 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6394 -0.8195 -13.6770 F 0 0 0 0 0 0 - 28.3654 1.8186 -11.7483 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9795 -0.4193 -11.6983 H 0 0 0 0 0 0 - 24.8071 1.6777 -12.7817 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4128 0.1822 -13.6214 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7768 -1.4645 -7.8942 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6768 -1.2344 -9.1176 H 0 0 0 0 0 0 - 20.7002 1.2442 -10.4779 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7565 -1.8493 -10.1507 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3860 -2.7416 -11.9336 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9749 0.6019 -7.4639 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 19 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 18 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 21 2 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 22 36 1 0 0 0 -M END -> -25 - -> -0.029 - -$$$$ -163 - 3D - Structure written by MMmdl. - 38 40 0 0 1 0 999 V2000 - 27.5787 1.5603 -11.1550 O 0 0 0 0 0 0 - 27.1514 0.3087 -11.6602 C 0 0 2 0 0 0 - 26.5211 0.3751 -13.0576 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0338 0.5863 -12.8456 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8061 -0.0850 -11.5041 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0164 -0.2498 -10.8166 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0198 -0.7868 -9.5184 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8022 -1.0984 -8.9082 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6047 -0.9287 -9.5876 C 0 0 0 0 0 0 - 23.6011 -0.4346 -10.8994 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4804 -0.2663 -11.6771 O 0 0 0 0 0 0 - 21.2449 -0.5687 -11.1803 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6785 -1.8246 -11.3976 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4221 -2.1093 -10.8761 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8542 -3.3170 -11.0822 F 0 0 0 0 0 0 - 18.7363 -1.1524 -10.1388 C 0 0 0 0 0 0 - 19.2883 0.1230 -9.9547 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5697 1.1665 -9.2401 C 0 0 0 0 0 0 - 20.5476 0.3902 -10.4511 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5198 -1.0658 -8.5788 S 0 0 0 0 0 0 - 27.2106 -1.9783 -7.4776 O 0 0 0 0 0 0 - 28.5996 -1.4049 -9.5080 O 0 0 0 0 0 0 - 27.9060 0.6119 -7.8645 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0587 1.3217 -13.8292 F 0 0 0 0 0 0 - 26.6743 -0.8002 -13.6631 F 0 0 0 0 0 0 - 18.0197 2.0048 -8.6626 N 0 0 0 0 0 0 - 28.3401 1.8773 -11.6535 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9965 -0.3807 -11.7030 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4304 0.1815 -13.6650 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7949 1.6423 -12.7675 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7812 -1.4913 -7.9023 H 0 0 0 0 0 0 - 22.6852 -1.2202 -9.0977 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2178 -2.5834 -11.9440 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7955 -1.4363 -9.7044 H 0 0 0 0 0 0 - 21.0080 1.3516 -10.2626 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9206 0.5438 -7.4820 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1930 0.8396 -7.0713 H 0 0 0 0 0 0 - 27.8723 1.3668 -8.6460 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 20 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 19 2 0 0 0 - 18 26 3 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 22 2 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 23 36 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 -M END -> -163 - -> -0.0085 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/p38_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/p38_ligands.sdf deleted file mode 100755 index 5d737d19..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/p38_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,3682 +0,0 @@ -p38a_2n - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 56 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 O 0 0 0 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6777 34.8441 23.4439 C 0 0 0 0 0 0 - 33.4618 35.5234 24.3064 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7328 34.3390 23.1214 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6979 33.7917 23.8682 C 0 0 0 0 0 0 - 34.9138 33.1124 23.0057 H 0 0 0 0 0 0 - 35.6428 34.2968 24.1907 H 0 0 0 0 0 0 - 34.1351 32.9766 25.0291 C 0 0 0 0 0 0 - 33.9193 33.6559 25.8916 H 0 0 0 0 0 0 - 33.1903 32.4715 24.7066 H 0 0 0 0 0 0 - 35.0778 32.0042 25.4212 O 0 0 0 0 0 0 - 35.2265 31.4528 24.6529 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 17 2 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 14 1 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 4 19 2 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 23 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 25 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 20 30 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 28 34 1 0 0 0 - 28 35 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 36 1 0 0 0 - 29 37 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 38 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 39 1 0 0 0 - 31 40 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 41 1 0 0 0 - 32 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 45 1 0 0 0 - 43 46 1 0 0 0 - 46 47 1 0 0 0 - 46 48 1 0 0 0 - 46 49 1 0 0 0 - 49 50 1 0 0 0 - 49 51 1 0 0 0 - 49 52 1 0 0 0 - 52 53 1 0 0 0 -M END -> --11.854 - -$$$$ -p38a_3flz - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 35.5410 34.9770 19.0020 O 0 0 0 0 0 0 - 35.2381 37.0312 20.2150 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0764 36.9949 22.3869 C 0 0 0 0 0 0 - 34.7541 37.7332 21.3955 C 0 0 0 0 0 0 - 34.9549 39.1098 21.6309 C 0 0 0 0 0 0 - 33.9384 38.9146 23.6636 C 0 0 0 0 0 0 - 35.0645 35.6968 20.0743 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3624 35.5471 18.0621 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0864 34.8683 23.1909 C 0 0 0 0 0 0 - 33.5064 39.5490 27.3259 C 0 0 0 0 0 0 - 35.8921 35.7389 16.7478 C 0 0 0 0 0 0 - 38.0806 36.5759 16.0760 C 0 0 0 0 0 0 - 36.7488 36.2542 15.7562 C 0 0 0 0 0 0 - 38.5585 36.3724 17.3849 C 0 0 0 0 0 0 - 34.2139 33.6973 20.9781 O 0 0 0 0 0 0 - 34.3461 34.9166 21.0904 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6988 35.8680 18.3785 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5481 39.7018 22.7746 N 0 0 0 0 0 0 - 33.8517 35.5974 22.1657 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6772 37.6157 23.5208 N 0 0 0 0 0 0 - 33.5515 39.5037 24.8493 N 0 0 0 0 0 0 - 33.0326 38.8504 26.0442 C 0 0 0 0 0 0 - 31.4988 38.8068 26.0424 C 0 0 0 0 0 0 - 30.9892 38.1529 27.3378 C 0 0 0 0 0 0 - 31.4825 38.8627 28.4691 O 0 0 0 0 0 0 - 32.9035 38.8579 28.5588 C 0 0 0 0 0 0 - 35.7604 37.6200 19.4779 H 0 0 0 0 0 0 - 35.4683 39.7296 20.9127 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7071 33.8985 22.8651 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7080 34.7028 24.0714 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2108 35.4409 23.4994 H 0 0 0 0 0 0 - 34.5954 39.5419 27.3851 H 0 0 0 0 0 0 - 33.1935 40.5928 27.3234 H 0 0 0 0 0 0 - 34.8749 35.4820 16.4973 H 0 0 0 0 0 0 - 38.7330 36.9835 15.3193 H 0 0 0 0 0 0 - 36.3830 36.4040 14.7507 H 0 0 0 0 0 0 - 39.5825 36.6103 17.6281 H 0 0 0 0 0 0 - 38.0635 35.7238 19.3847 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7980 40.4789 24.9530 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4090 37.8267 26.0679 H 0 0 0 0 0 0 - 31.1007 39.8178 25.9566 H 0 0 0 0 0 0 - 31.1334 38.2508 25.1782 H 0 0 0 0 0 0 - 29.9009 38.1662 27.3675 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2938 37.1068 27.3914 H 0 0 0 0 0 0 - 33.2710 37.8346 28.6511 H 0 0 0 0 0 0 - 33.1993 39.3862 29.4654 H 0 0 0 0 0 0 - 1 7 1 0 0 0 - 1 8 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 7 2 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 19 1 0 0 0 - 3 20 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 5 18 2 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 18 1 0 0 0 - 6 20 2 0 0 0 - 6 21 1 0 0 0 - 7 16 1 0 0 0 - 8 11 1 0 0 0 - 8 17 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 9 29 1 0 0 0 - 9 30 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 22 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 13 2 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 14 2 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 17 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 19 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 -M END -> --9.4871 - -$$$$ -p38a_2h - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 31.6235 38.9529 26.1544 C 0 0 0 0 0 0 - 31.0952 38.3551 27.4684 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0541 38.9788 28.6539 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6809 39.6144 27.4031 C 0 0 0 0 0 0 - 38.5466 36.6894 16.4814 C 0 0 0 0 0 0 - 31.6350 39.0631 28.5784 O 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.8804 36.1637 17.6053 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.9066 36.7177 15.2274 C 0 0 0 0 0 0 - 36.6106 36.1914 15.0908 C 0 0 0 0 0 0 - 35.9553 35.6435 16.2076 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.5766 35.6391 17.4708 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.4795 36.1719 18.7960 F 0 0 0 0 0 0 - 35.7698 34.8837 18.7887 S 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 31.2200 38.3997 25.3053 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2771 39.9808 26.0536 H 0 0 0 0 0 0 - 30.0102 38.4341 27.5066 H 0 0 0 0 0 0 - 31.3432 37.2955 27.5444 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3652 37.9383 28.7608 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3890 39.5054 29.5480 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4274 40.6742 27.3922 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7681 39.5450 27.4512 H 0 0 0 0 0 0 - 39.5419 37.0909 16.5846 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4882 37.8909 26.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 36.1209 36.2000 14.1283 H 0 0 0 0 0 0 - 34.9751 35.2055 16.0909 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.4035 37.1485 14.3707 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 10 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 8 1 0 0 0 - 5 13 2 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 7 18 1 0 0 0 - 7 24 2 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 19 2 0 0 0 - 8 21 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 9 26 2 0 0 0 - 9 27 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 10 37 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 17 1 0 0 0 - 12 18 2 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 46 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 15 40 1 0 0 0 - 16 25 1 0 0 0 - 16 26 1 0 0 0 - 17 23 2 0 0 0 - 17 41 1 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 -M END -> --9.477 - -$$$$ -p38a_2s - 3D - Structure written by MMmdl. - 54 57 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 O 0 0 0 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6777 34.8441 23.4439 C 0 0 0 0 0 0 - 33.4618 35.5234 24.3064 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7328 34.3390 23.1214 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6979 33.7917 23.8682 C 0 0 2 0 0 0 - 34.9700 32.9357 22.7813 O 0 0 0 0 0 0 - 34.1349 32.5312 22.5457 H 0 0 0 0 0 0 - 34.1351 32.9773 25.0295 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1902 32.4720 24.7073 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9192 33.6570 25.8917 H 0 0 0 0 0 0 - 35.6184 34.2833 24.1829 H 0 0 0 0 0 0 - 35.0777 32.0050 25.4221 O 0 0 0 0 0 0 - 35.8619 32.4861 25.6866 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 17 2 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 14 1 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 4 19 2 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 23 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 25 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 20 30 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 28 34 1 0 0 0 - 28 35 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 36 1 0 0 0 - 29 37 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 38 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 39 1 0 0 0 - 31 40 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 41 1 0 0 0 - 32 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 45 1 0 0 0 - 43 46 1 0 0 0 - 46 47 1 0 0 0 - 46 49 1 0 0 0 - 46 52 1 0 0 0 - 47 48 1 0 0 0 - 49 50 1 0 0 0 - 49 51 1 0 0 0 - 49 53 1 0 0 0 - 53 54 1 0 0 0 -M END -> --11.112 - -$$$$ -p38a_2bb - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 46 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4882 37.8909 26.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 33.6752 39.6520 27.3409 C 0 0 0 0 0 0 - 32.0669 38.9679 26.1277 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7645 39.6136 27.3476 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3490 40.6916 27.3110 H 0 0 0 0 0 0 - 33.5527 39.5830 30.0407 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0280 38.8532 28.8398 S 0 0 0 0 0 0 - 31.5525 38.9898 28.8329 O 0 0 0 0 0 0 - 33.5502 37.4673 28.8828 O 0 0 0 0 0 0 - 34.6390 39.4992 30.0715 H 0 0 0 0 0 0 - 33.2715 40.6343 29.9791 H 0 0 0 0 0 0 - 33.1293 39.1467 30.9454 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 8 2 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 13 1 0 0 0 - 2 19 2 0 0 0 - 2 20 1 0 0 0 - 3 14 2 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 4 18 1 0 0 0 - 4 21 2 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 5 22 1 0 0 0 - 5 24 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 6 12 1 0 0 0 - 7 13 2 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 11 20 1 0 0 0 - 11 21 1 0 0 0 - 12 18 2 0 0 0 - 12 28 1 0 0 0 - 13 17 1 0 0 0 - 14 17 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 15 29 1 0 0 0 - 15 30 1 0 0 0 - 15 31 1 0 0 0 - 22 32 1 0 0 0 - 34 36 1 0 0 0 - 34 37 1 0 0 0 - 34 39 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 38 42 1 0 0 0 - 38 43 1 0 0 0 - 38 44 1 0 0 0 - 39 40 2 0 0 0 - 39 41 2 0 0 0 -M END -> --9.064 - -$$$$ -p38a_2q - 3D - Structure written by MMmdl. - 59 63 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 O 0 0 0 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 32.9681 35.0145 25.8880 C 0 0 0 0 0 0 - 33.4304 35.8030 24.6521 C 0 0 0 0 0 0 - 33.7352 34.8576 23.4790 C 0 0 0 0 0 0 - 34.7786 33.8023 23.8798 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3163 33.0139 25.1157 C 0 0 0 0 0 0 - 31.9966 34.5109 25.6656 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7852 35.7135 26.7403 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3472 36.3879 24.9060 H 0 0 0 0 0 0 - 32.6455 36.5404 24.3542 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7949 34.3477 23.1587 H 0 0 0 0 0 0 - 34.9615 33.1034 23.0275 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7500 34.3060 24.1023 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3996 32.4290 24.8619 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1011 32.2765 25.4136 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0211 33.9577 26.3095 S 0 0 0 0 0 0 - 35.2753 34.6740 26.6406 O 0 0 0 0 0 0 - 33.4335 33.1427 27.3984 O 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 17 2 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 14 1 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 4 19 2 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 23 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 25 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 18 45 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 20 30 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 28 34 1 0 0 0 - 28 35 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 36 1 0 0 0 - 29 37 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 38 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 39 1 0 0 0 - 31 40 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 41 1 0 0 0 - 32 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 48 1 0 0 0 - 43 49 1 0 0 0 - 43 57 1 0 0 0 - 44 45 1 0 0 0 - 44 50 1 0 0 0 - 44 51 1 0 0 0 - 45 46 1 0 0 0 - 45 52 1 0 0 0 - 46 47 1 0 0 0 - 46 53 1 0 0 0 - 46 54 1 0 0 0 - 47 55 1 0 0 0 - 47 56 1 0 0 0 - 47 57 1 0 0 0 - 57 58 2 0 0 0 - 57 59 2 0 0 0 -M END -> --12.264 - -$$$$ -p38a_2z - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 47 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6129 37.5010 26.1619 C 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 33.6752 39.6520 27.3409 C 0 0 0 0 0 0 - 31.6571 38.9824 26.1256 C 0 0 0 0 0 0 - 35.0843 39.6023 27.3496 O 0 0 0 0 0 0 - 35.4164 40.0648 28.1225 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3490 40.6916 27.3110 H 0 0 0 0 0 0 - 33.2898 39.1766 28.2429 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2717 38.5070 27.0276 H 0 0 0 0 0 0 - 31.3299 40.0216 26.0951 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2789 38.4570 25.2487 H 0 0 0 0 0 0 - 33.2328 37.0154 27.0607 H 0 0 0 0 0 0 - 33.2359 36.9806 25.2814 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7024 37.4673 26.1645 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 8 2 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 13 1 0 0 0 - 2 19 2 0 0 0 - 2 20 1 0 0 0 - 3 14 2 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 4 18 1 0 0 0 - 4 21 2 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 5 22 1 0 0 0 - 5 24 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 6 12 1 0 0 0 - 7 13 2 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 11 20 1 0 0 0 - 11 21 1 0 0 0 - 12 18 2 0 0 0 - 12 28 1 0 0 0 - 13 17 1 0 0 0 - 14 17 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 15 29 1 0 0 0 - 15 30 1 0 0 0 - 15 31 1 0 0 0 - 22 32 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 34 36 1 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 34 39 1 0 0 0 - 35 40 1 0 0 0 - 35 41 1 0 0 0 - 35 42 1 0 0 0 - 36 37 1 0 0 0 -M END -> --10.359 - -$$$$ -p38a_3fmh - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 38.1822 37.2781 14.6780 F 0 0 0 0 0 0 - 37.6121 36.6927 15.7561 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3306 36.1234 15.6494 C 0 0 0 0 0 0 - 35.7306 35.5282 16.7729 C 0 0 0 0 0 0 - 38.2935 36.6633 16.9880 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6845 36.0889 18.1187 C 0 0 0 0 0 0 - 38.3244 36.1063 19.3118 F 0 0 0 0 0 0 - 36.3984 35.5157 18.0135 C 0 0 0 0 0 0 - 35.8110 34.8859 19.0798 O 0 0 0 0 0 0 - 35.2195 35.5980 20.0991 C 0 0 0 0 0 0 - 34.4802 34.7957 21.0797 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3267 33.5841 20.9220 O 0 0 0 0 0 0 - 33.9629 35.4463 22.1618 N 0 0 0 0 0 0 - 33.2518 34.6745 23.1957 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0492 36.8642 22.3395 C 0 0 0 0 0 0 - 33.5187 37.4796 23.4172 N 0 0 0 0 0 0 - 35.3129 36.9423 20.2265 C 0 0 0 0 0 0 - 34.7216 37.6302 21.3651 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8051 39.0231 21.5733 C 0 0 0 0 0 0 - 34.2844 39.6080 22.6737 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6693 38.7965 23.5368 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1669 39.3731 24.6802 N 0 0 0 0 0 0 - 32.3829 38.7485 25.7392 C 0 0 2 0 0 0 - 31.2835 39.7010 26.2143 C 0 0 0 0 0 0 - 33.2806 38.2181 26.8795 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1195 39.2305 27.5029 N 0 0 0 0 0 0 - 35.4196 39.3870 27.1864 N 0 0 0 0 0 0 - 35.7283 40.3837 28.0005 C 0 0 0 0 0 0 - 34.6917 40.8108 28.7755 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6769 40.0724 28.4600 N 0 0 0 0 0 0 - 35.8087 36.1396 14.7051 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7581 35.0717 16.6856 H 0 0 0 0 0 0 - 39.2725 37.1079 17.0714 H 0 0 0 0 0 0 - 33.5091 35.0233 24.1968 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1747 34.7905 23.0693 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4769 33.6071 23.1940 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8510 37.5522 19.5179 H 0 0 0 0 0 0 - 35.3118 39.6636 20.8677 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3603 40.3585 24.7950 H 0 0 0 0 0 0 - 31.8690 37.8864 25.3123 H 0 0 0 0 0 0 - 30.6714 39.2416 26.9915 H 0 0 0 0 0 0 - 31.6923 40.6282 26.6121 H 0 0 0 0 0 0 - 30.6253 39.9573 25.3848 H 0 0 0 0 0 0 - 32.6658 37.7582 27.6539 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9263 37.4259 26.4972 H 0 0 0 0 0 0 - 36.7183 40.8135 28.0374 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 33 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 17 2 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 2 0 0 0 - 16 21 2 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 -M END -> --10.8254 - -$$$$ -p38a_2f - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 31.6235 38.9529 26.1544 C 0 0 0 0 0 0 - 31.0952 38.3551 27.4684 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0541 38.9788 28.6539 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6809 39.6144 27.4031 C 0 0 0 0 0 0 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 31.6350 39.0631 28.5784 O 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.0824 36.1953 19.1020 H 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 31.2200 38.3997 25.3053 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2771 39.9808 26.0536 H 0 0 0 0 0 0 - 30.0102 38.4341 27.5066 H 0 0 0 0 0 0 - 31.3432 37.2955 27.5444 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3652 37.9383 28.7608 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3890 39.5054 29.5480 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4274 40.6742 27.3922 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7681 39.5450 27.4512 H 0 0 0 0 0 0 - 39.4938 37.2107 17.1409 F 0 0 0 0 0 0 - 33.4882 37.8909 26.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.1201 37.1734 14.9026 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 10 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 8 1 0 0 0 - 5 13 2 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 7 18 1 0 0 0 - 7 24 2 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 19 2 0 0 0 - 8 21 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 9 26 2 0 0 0 - 9 27 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 10 37 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 17 1 0 0 0 - 12 18 2 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 46 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 15 40 1 0 0 0 - 16 25 1 0 0 0 - 16 26 1 0 0 0 - 17 23 2 0 0 0 - 17 41 1 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 -M END -> --8.484 - -$$$$ -p38a_2v - 3D - Structure written by MMmdl. - 35 37 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4882 37.8909 26.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 33.5333 39.4545 27.0108 H 0 0 0 0 0 0 - 32.0669 38.9679 26.1277 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 8 2 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 13 1 0 0 0 - 2 19 2 0 0 0 - 2 20 1 0 0 0 - 3 14 2 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 4 18 1 0 0 0 - 4 21 2 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 5 22 1 0 0 0 - 5 24 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 6 12 1 0 0 0 - 7 13 2 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 11 20 1 0 0 0 - 11 21 1 0 0 0 - 12 18 2 0 0 0 - 12 28 1 0 0 0 - 13 17 1 0 0 0 - 14 17 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 15 29 1 0 0 0 - 15 30 1 0 0 0 - 15 31 1 0 0 0 - 22 32 1 0 0 0 -M END -> --8.973 - -$$$$ -p38a_3fln - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 31.6235 38.9529 26.1544 C 0 0 0 0 0 0 - 31.0952 38.3551 27.4684 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0541 38.9788 28.6539 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6809 39.6144 27.4031 C 0 0 0 0 0 0 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 31.6350 39.0631 28.5784 O 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.2058 36.1970 19.3473 F 0 0 0 0 0 0 - 38.2455 37.2821 14.6863 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 31.2200 38.3997 25.3053 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2771 39.9808 26.0536 H 0 0 0 0 0 0 - 30.0102 38.4341 27.5066 H 0 0 0 0 0 0 - 31.3432 37.2955 27.5444 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3652 37.9383 28.7608 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3890 39.5054 29.5480 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4274 40.6742 27.3922 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7681 39.5450 27.4512 H 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4882 37.8909 26.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8385 36.2249 14.6624 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6956 35.2322 16.6233 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 10 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 3 34 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 4 36 1 0 0 0 - 5 8 1 0 0 0 - 5 13 2 0 0 0 - 5 37 1 0 0 0 - 7 18 1 0 0 0 - 7 25 2 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 19 2 0 0 0 - 8 21 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 9 27 2 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 28 1 0 0 0 - 10 38 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 17 1 0 0 0 - 12 18 2 0 0 0 - 12 39 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 22 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 15 41 1 0 0 0 - 16 26 1 0 0 0 - 16 27 1 0 0 0 - 17 24 2 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 23 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 20 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 -M END -> --10.8817 - -$$$$ -p38a_2t - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 O 0 0 0 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6777 34.8441 23.4439 C 0 0 0 0 0 0 - 33.4618 35.5234 24.3064 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7328 34.3390 23.1214 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6979 33.7914 23.8675 C 0 0 0 0 0 0 - 34.9812 32.8987 22.7331 N 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 17 2 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 14 1 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 4 19 2 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 23 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 25 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 20 30 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 28 34 1 0 0 0 - 28 35 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 36 1 0 0 0 - 29 37 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 38 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 39 1 0 0 0 - 31 40 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 41 1 0 0 0 - 32 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 45 1 0 0 0 - 43 46 1 0 0 0 - 46 47 3 0 0 0 -M END -> --11.854 - -$$$$ -p38a_2r - 3D - Structure written by MMmdl. - 56 59 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 O 0 0 0 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6777 34.8441 23.4439 C 0 0 0 0 0 0 - 33.4618 35.5234 24.3064 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7328 34.3390 23.1214 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6979 33.7917 23.8682 C 0 0 0 0 0 0 - 34.9700 32.9357 22.7813 O 0 0 0 0 0 0 - 34.1349 32.5312 22.5457 H 0 0 0 0 0 0 - 34.1351 32.9773 25.0295 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1902 32.4720 24.7073 H 0 0 0 0 0 0 - 34.8831 32.2057 25.3411 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9192 33.6570 25.8917 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9866 34.4807 24.3080 C 0 0 0 0 0 0 - 36.7346 33.7090 24.6191 H 0 0 0 0 0 0 - 36.3992 35.0783 23.4568 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7707 35.1599 25.1705 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 17 2 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 14 1 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 4 19 2 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 23 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 25 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 20 30 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 28 34 1 0 0 0 - 28 35 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 36 1 0 0 0 - 29 37 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 38 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 39 1 0 0 0 - 31 40 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 41 1 0 0 0 - 32 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 45 1 0 0 0 - 43 46 1 0 0 0 - 46 47 1 0 0 0 - 46 49 1 0 0 0 - 46 53 1 0 0 0 - 47 48 1 0 0 0 - 49 50 1 0 0 0 - 49 51 1 0 0 0 - 49 52 1 0 0 0 - 53 54 1 0 0 0 - 53 55 1 0 0 0 - 53 56 1 0 0 0 -M END -> --10.793 - -$$$$ -p38a_3fly - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 34.9076 39.1154 21.5907 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0709 36.9986 22.3846 C 0 0 0 0 0 0 - 34.4455 39.7277 22.7024 N 0 0 0 0 0 0 - 34.7548 37.7275 21.3918 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2950 37.0103 20.2460 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1390 35.6721 20.1250 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3682 34.9095 21.1164 C 0 0 0 0 0 0 - 33.8227 38.9512 23.5893 C 0 0 0 0 0 0 - 32.6093 38.9831 25.8341 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0071 39.6254 27.1688 C 0 0 0 0 0 0 - 31.1036 39.1058 25.5754 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3552 35.5188 18.0595 C 0 0 0 0 0 0 - 35.7370 35.5446 16.7957 C 0 0 0 0 0 0 - 36.4063 36.0920 15.6859 C 0 0 0 0 0 0 - 37.7125 36.5912 15.8323 C 0 0 0 0 0 0 - 38.3545 36.5250 17.0835 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6744 36.0012 18.1998 C 0 0 0 0 0 0 - 38.3423 37.1505 14.7742 F 0 0 0 0 0 0 - 38.2865 35.9641 19.4063 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6958 34.9289 19.1092 O 0 0 0 0 0 0 - 34.1461 33.7090 20.9621 O 0 0 0 0 0 0 - 33.9060 35.5872 22.2067 N 0 0 0 0 0 0 - 33.1842 34.8573 23.2623 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6031 37.6404 23.4789 N 0 0 0 0 0 0 - 33.3560 39.5693 24.7304 N 0 0 0 0 0 0 - 35.4259 39.7257 20.8689 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8585 37.5898 19.5322 H 0 0 0 0 0 0 - 32.8600 37.9243 25.9000 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0800 39.5427 27.3436 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7423 40.6808 27.1972 H 0 0 0 0 0 0 - 32.4989 39.1386 28.0016 H 0 0 0 0 0 0 - 30.8133 38.5729 24.6694 H 0 0 0 0 0 0 - 30.5297 38.6851 26.4010 H 0 0 0 0 0 0 - 30.8112 40.1484 25.4520 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7428 35.1444 16.6797 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9140 36.1326 14.7266 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3585 36.9029 17.1929 H 0 0 0 0 0 0 - 33.2503 33.7705 23.1972 H 0 0 0 0 0 0 - 33.5836 35.1186 24.2423 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1271 35.1256 23.2468 H 0 0 0 0 0 0 - 33.5759 40.5519 24.8165 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 4 2 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 2 24 2 0 0 0 - 3 8 2 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 7 21 2 0 0 0 - 7 22 1 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 8 25 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 29 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 17 2 0 0 0 - 12 20 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 19 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 -M END -> -2 - -> --11.423 - -$$$$ -p38a_2u - 3D - Structure written by MMmdl. - 64 68 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 O 0 0 0 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 32.9681 35.0145 25.8880 C 0 0 0 0 0 0 - 33.4304 35.8030 24.6521 C 0 0 0 0 0 0 - 33.7352 34.8576 23.4790 C 0 0 0 0 0 0 - 34.7786 33.8023 23.8798 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3163 33.0139 25.1157 C 0 0 0 0 0 0 - 31.9966 34.5109 25.6656 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7852 35.7135 26.7403 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3472 36.3879 24.9060 H 0 0 0 0 0 0 - 32.6455 36.5404 24.3542 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7949 34.3477 23.1587 H 0 0 0 0 0 0 - 34.9615 33.1034 23.0275 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7500 34.3060 24.1023 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3996 32.4290 24.8619 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1011 32.2765 25.4136 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9817 33.9636 26.2255 N 0 0 0 0 0 0 - 34.6175 33.8688 27.5807 S 0 0 0 0 0 0 - 35.5626 32.7276 27.5688 O 0 0 0 0 0 0 - 33.5397 33.8069 28.5956 O 0 0 0 0 0 0 - 35.4031 35.1261 27.8086 C 0 0 0 0 0 0 - 34.7082 36.0030 27.8214 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9376 35.0594 28.7893 H 0 0 0 0 0 0 - 36.1496 35.2538 26.9849 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 17 2 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 14 1 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 4 19 2 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 23 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 25 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 18 45 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 20 30 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 28 34 1 0 0 0 - 28 35 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 36 1 0 0 0 - 29 37 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 38 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 39 1 0 0 0 - 31 40 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 41 1 0 0 0 - 32 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 48 1 0 0 0 - 43 49 1 0 0 0 - 43 57 1 0 0 0 - 44 45 1 0 0 0 - 44 50 1 0 0 0 - 44 51 1 0 0 0 - 45 46 1 0 0 0 - 45 52 1 0 0 0 - 46 47 1 0 0 0 - 46 53 1 0 0 0 - 46 54 1 0 0 0 - 47 55 1 0 0 0 - 47 56 1 0 0 0 - 47 57 1 0 0 0 - 57 58 1 0 0 0 - 58 59 2 0 0 0 - 58 60 2 0 0 0 - 58 61 1 0 0 0 - 61 62 1 0 0 0 - 61 63 1 0 0 0 - 61 64 1 0 0 0 -M END -> --12.264 - -$$$$ -p38a_2l - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 52 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 O 0 0 0 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6777 34.8441 23.4439 C 0 0 0 0 0 0 - 33.4618 35.5234 24.3064 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7328 34.3390 23.1214 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6979 33.7917 23.8682 C 0 0 0 0 0 0 - 34.9138 33.1124 23.0057 H 0 0 0 0 0 0 - 35.6428 34.2968 24.1907 H 0 0 0 0 0 0 - 34.2853 33.1941 24.7194 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 17 2 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 14 1 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 4 19 2 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 23 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 25 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 20 30 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 28 34 1 0 0 0 - 28 35 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 36 1 0 0 0 - 29 37 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 38 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 39 1 0 0 0 - 31 40 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 41 1 0 0 0 - 32 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 45 1 0 0 0 - 43 46 1 0 0 0 - 46 47 1 0 0 0 - 46 48 1 0 0 0 - 46 49 1 0 0 0 -M END -> --12.264 - -$$$$ -p38a_2aa - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6129 37.5010 26.1619 C 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 33.6752 39.6520 27.3409 C 0 0 0 0 0 0 - 35.0843 39.6023 27.3496 O 0 0 0 0 0 0 - 35.4164 40.0648 28.1225 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3490 40.6916 27.3110 H 0 0 0 0 0 0 - 33.2898 39.1766 28.2429 H 0 0 0 0 0 0 - 33.1212 36.8729 27.3246 O 0 0 0 0 0 0 - 33.2359 36.9806 25.2814 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7024 37.4673 26.1645 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4135 35.9587 27.3430 H 0 0 0 0 0 0 - 32.0669 38.9679 26.1277 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 8 2 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 13 1 0 0 0 - 2 19 2 0 0 0 - 2 20 1 0 0 0 - 3 14 2 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 4 18 1 0 0 0 - 4 21 2 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 5 22 1 0 0 0 - 5 24 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 6 12 1 0 0 0 - 7 13 2 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 11 20 1 0 0 0 - 11 21 1 0 0 0 - 12 18 2 0 0 0 - 12 28 1 0 0 0 - 13 17 1 0 0 0 - 14 17 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 15 29 1 0 0 0 - 15 30 1 0 0 0 - 15 31 1 0 0 0 - 22 32 1 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 37 1 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 39 42 1 0 0 0 -M END -> --9.268 - -$$$$ -p38a_2gg - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3005 38.7924 28.3926 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8106 39.6388 27.2153 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1506 38.7518 26.0069 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1728 37.6694 26.3893 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6627 36.8230 27.5666 C 0 0 0 0 0 0 - 31.3343 38.3084 28.1113 H 0 0 0 0 0 0 - 32.0921 39.4486 29.2726 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7214 40.2029 27.5303 H 0 0 0 0 0 0 - 32.0411 40.3965 26.9283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2190 38.2662 25.6285 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3813 37.0132 25.5094 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1389 38.1535 26.6707 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7520 36.2589 27.2517 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4322 36.0653 27.8536 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3316 37.7073 28.7960 S 0 0 0 0 0 0 - 34.5778 38.3960 29.2065 O 0 0 0 0 0 0 - 32.7013 36.8428 29.8209 O 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 15 1 0 0 0 - 4 17 1 0 0 0 - 4 20 2 0 0 0 - 4 21 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 31 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 10 20 1 0 0 0 - 11 17 2 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 14 27 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 21 30 1 0 0 0 - 21 34 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 37 1 0 0 0 - 32 38 1 0 0 0 - 32 46 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 39 1 0 0 0 - 33 40 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 41 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 42 1 0 0 0 - 35 43 1 0 0 0 - 36 44 1 0 0 0 - 36 45 1 0 0 0 - 36 46 1 0 0 0 - 46 47 2 0 0 0 - 46 48 2 0 0 0 -M END -> --10.661 - -$$$$ -p38a_2k - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.8396 35.0786 23.1099 H 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 O 0 0 0 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 15 1 0 0 0 - 4 17 1 0 0 0 - 4 20 2 0 0 0 - 4 21 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 10 20 1 0 0 0 - 11 17 2 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 21 27 1 0 0 0 - 21 31 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 34 1 0 0 0 - 29 35 1 0 0 0 - 29 36 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 37 1 0 0 0 - 30 38 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 39 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 40 1 0 0 0 - 32 41 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 42 1 0 0 0 - 33 43 1 0 0 0 -M END -> --10.553 - -$$$$ -p38a_3flq - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 49 0 0 1 0 999 V2000 - 34.7622 38.7439 23.9476 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2499 37.4721 21.6405 C 0 0 0 0 0 0 - 35.5348 36.7418 20.4146 C 0 0 0 0 0 0 - 35.0227 36.7418 22.8250 C 0 0 0 0 0 0 - 35.5320 35.3906 20.3880 C 0 0 0 0 0 0 - 33.7846 38.8689 26.3037 C 0 0 1 0 0 0 - 34.5670 39.3018 27.5511 C 0 0 0 0 0 0 - 31.2859 36.7201 25.6423 C 0 0 0 0 0 0 - 35.0422 35.3092 22.7534 N 0 0 0 0 0 0 - 32.3083 39.3132 26.3897 C 0 0 0 0 0 0 - 37.8707 37.0007 14.6632 F 0 0 0 0 0 0 - 37.3947 36.4157 15.7863 C 0 0 0 0 0 0 - 36.1114 35.8372 15.7886 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6038 35.2536 16.9651 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1736 36.4029 16.9581 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6618 35.8347 18.1396 C 0 0 0 0 0 0 - 38.4005 35.8692 19.2738 F 0 0 0 0 0 0 - 36.3715 35.2572 18.1466 C 0 0 0 0 0 0 - 35.8696 34.6526 19.2728 O 0 0 0 0 0 0 - 35.1741 34.6161 21.5814 C 0 0 0 0 0 0 - 34.9911 33.3993 21.5227 O 0 0 0 0 0 0 - 35.2021 38.8782 21.7163 C 0 0 0 0 0 0 - 34.9714 39.5160 22.8825 N 0 0 0 0 0 0 - 34.7792 37.4089 23.9779 N 0 0 0 0 0 0 - 34.8399 34.5573 24.0019 C 0 0 0 0 0 0 - 34.4255 39.4035 25.1103 N 0 0 0 0 0 0 - 31.1922 38.4913 25.1558 S 0 0 0 0 0 0 - 29.8236 38.9620 25.4069 O 0 0 0 0 0 0 - 31.7563 38.6165 23.8041 O 0 0 0 0 0 0 - 35.7861 37.3321 19.5486 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8193 37.7810 26.2763 H 0 0 0 0 0 0 - 35.6071 38.9786 27.4924 H 0 0 0 0 0 0 - 34.5610 40.3853 27.6733 H 0 0 0 0 0 0 - 34.1393 38.8652 28.4538 H 0 0 0 0 0 0 - 30.5644 36.1528 25.0545 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2855 36.3331 25.4509 H 0 0 0 0 0 0 - 31.0443 36.6182 26.6999 H 0 0 0 0 0 0 - 31.9029 39.0851 27.3757 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2151 40.3909 26.2613 H 0 0 0 0 0 0 - 35.5110 35.8478 14.8913 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6201 34.8071 16.9608 H 0 0 0 0 0 0 - 39.1521 36.8577 16.9609 H 0 0 0 0 0 0 - 35.3678 39.4918 20.8442 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2765 33.5576 23.9769 H 0 0 0 0 0 0 - 35.3035 35.0572 24.8531 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7742 34.4569 24.2090 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4408 40.4123 25.0493 H 0 0 0 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 1 24 2 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 2 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 5 2 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 4 24 1 0 0 0 - 5 19 1 0 0 0 - 5 20 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 10 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 32 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 8 37 1 0 0 0 - 9 20 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 10 38 1 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 15 2 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 40 1 0 0 0 - 14 18 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 42 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 2 0 0 0 -M END -> --9.93099 - -$$$$ -p38a_2p - 3D - Structure written by MMmdl. - 58 61 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 O 0 0 0 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6777 34.8441 23.4439 C 0 0 0 0 0 0 - 33.4618 35.5234 24.3064 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7328 34.3390 23.1214 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6979 33.7917 23.8682 C 0 0 0 0 0 0 - 34.9138 33.1124 23.0057 H 0 0 0 0 0 0 - 35.6428 34.2968 24.1907 H 0 0 0 0 0 0 - 34.1351 32.9773 25.0295 C 0 0 0 0 0 0 - 33.9194 33.6570 25.8917 H 0 0 0 0 0 0 - 34.8830 32.2056 25.3410 H 0 0 0 0 0 0 - 32.8683 32.3001 24.5976 S 0 0 0 0 0 0 - 33.1864 31.4091 23.4572 O 0 0 0 0 0 0 - 31.8488 33.3438 24.3397 O 0 0 0 0 0 0 - 32.3899 31.4503 25.7374 C 0 0 0 0 0 0 - 32.1433 32.1036 26.6117 H 0 0 0 0 0 0 - 31.4761 30.8860 25.4240 H 0 0 0 0 0 0 - 33.1936 30.7277 26.0268 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 17 2 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 14 1 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 4 19 2 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 23 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 25 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 20 30 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 28 34 1 0 0 0 - 28 35 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 36 1 0 0 0 - 29 37 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 38 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 39 1 0 0 0 - 31 40 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 41 1 0 0 0 - 32 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 45 1 0 0 0 - 43 46 1 0 0 0 - 46 47 1 0 0 0 - 46 48 1 0 0 0 - 46 49 1 0 0 0 - 49 50 1 0 0 0 - 49 51 1 0 0 0 - 49 52 1 0 0 0 - 52 53 2 0 0 0 - 52 54 2 0 0 0 - 52 55 1 0 0 0 - 55 56 1 0 0 0 - 55 57 1 0 0 0 - 55 58 1 0 0 0 -M END -> --11.204 - -$$$$ -p38a_3fmk - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 37.4499 36.1830 18.1487 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1696 36.6865 17.0471 C 0 0 0 0 0 0 - 33.9960 34.9417 23.6436 C 0 0 0 0 0 0 - 36.1722 36.5213 15.6625 C 0 0 0 0 0 0 - 34.9655 39.3394 21.6756 C 0 0 0 0 0 0 - 33.7550 39.0892 26.3355 C 0 0 1 0 0 0 - 32.2216 39.1946 26.4393 C 0 0 0 0 0 0 - 34.4641 39.1128 23.8852 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5805 35.1104 21.2894 C 0 0 0 0 0 0 - 35.0705 35.9158 20.1637 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1769 37.2591 20.2658 C 0 0 0 0 0 0 - 36.0947 35.8168 17.9992 C 0 0 0 0 0 0 - 35.4579 36.0034 16.7577 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8891 37.9415 21.5155 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5405 37.1689 22.6422 C 0 0 0 0 0 0 - 34.2339 39.7075 25.1064 N 0 0 0 0 0 0 - 37.5311 36.8528 15.8039 C 0 0 0 0 0 0 - 38.2117 37.3536 14.7474 F 0 0 0 0 0 0 - 38.0544 36.0747 19.3543 F 0 0 0 0 0 0 - 35.4035 35.2192 19.0260 O 0 0 0 0 0 0 - 34.3338 33.9107 21.1622 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4048 35.7500 22.4822 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3407 37.7866 23.8262 N 0 0 0 0 0 0 - 34.7556 39.9268 22.8724 N 0 0 0 0 0 0 - 34.4411 39.7232 27.5517 C 0 0 0 0 0 0 - 31.5339 38.4194 25.4203 N 0 0 0 0 0 0 - 30.8990 38.9813 24.3738 N 0 0 0 0 0 0 - 30.4889 37.8869 23.7525 C 0 0 0 0 0 0 - 30.8476 36.7261 24.3686 N 0 0 0 0 0 0 - 31.4960 37.0716 25.4318 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2046 36.9661 17.1643 H 0 0 0 0 0 0 - 34.2102 35.4192 24.5993 H 0 0 0 0 0 0 - 32.9242 34.7447 23.6046 H 0 0 0 0 0 0 - 34.5135 33.9818 23.6761 H 0 0 0 0 0 0 - 35.6788 36.6645 14.7142 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2216 39.9823 20.8479 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0323 38.0349 26.3317 H 0 0 0 0 0 0 - 31.8876 38.8317 27.4111 H 0 0 0 0 0 0 - 31.9109 40.2361 26.3605 H 0 0 0 0 0 0 - 35.5210 37.8681 19.4457 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4186 35.7470 16.6436 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3199 40.7153 25.1238 H 0 0 0 0 0 0 - 35.5262 39.6672 27.4624 H 0 0 0 0 0 0 - 34.1651 40.7716 27.6668 H 0 0 0 0 0 0 - 34.1597 39.2064 28.4698 H 0 0 0 0 0 0 - 29.9080 37.9177 22.8450 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 12 2 0 0 0 - 1 19 1 0 0 0 - 2 17 2 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 22 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 3 34 1 0 0 0 - 4 13 2 0 0 0 - 4 17 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 14 1 0 0 0 - 5 24 2 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 16 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 7 38 1 0 0 0 - 7 39 1 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 8 23 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 21 2 0 0 0 - 9 22 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 20 1 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 11 40 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 20 1 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 22 1 0 0 0 - 15 23 1 0 0 0 - 16 42 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 -M END -> --11.8325 - -$$$$ -p38a_2j - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - 31.6235 38.9529 26.1544 C 0 0 0 0 0 0 - 31.0952 38.3551 27.4684 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0541 38.9788 28.6539 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6809 39.6144 27.4031 C 0 0 0 0 0 0 - 38.3660 36.7077 16.8209 C 0 0 0 0 0 0 - 31.6350 39.0631 28.5784 O 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6997 36.1819 17.9448 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 36.4300 36.2096 15.4303 C 0 0 0 0 0 0 - 35.7747 35.6617 16.5471 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3960 35.6573 17.8103 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.2989 36.1901 19.1355 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6924 34.9985 18.9596 C 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 31.2200 38.3997 25.3053 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2771 39.9808 26.0536 H 0 0 0 0 0 0 - 30.0102 38.4341 27.5066 H 0 0 0 0 0 0 - 31.3432 37.2955 27.5444 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3652 37.9383 28.7608 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3890 39.5054 29.5480 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4274 40.6742 27.3922 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7681 39.5450 27.4512 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3613 37.1091 16.9241 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4882 37.8909 26.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9403 36.2182 14.4678 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7945 35.2237 16.4304 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 36.4277 34.2745 19.3107 H 0 0 0 0 0 0 - 34.8709 34.4738 18.4718 H 0 0 0 0 0 0 - 37.7595 36.7642 15.5101 C 0 0 0 0 0 0 - 38.3816 37.2891 14.4545 F 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 10 1 0 0 0 - 1 27 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 8 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 5 47 2 0 0 0 - 7 17 1 0 0 0 - 7 23 2 0 0 0 - 7 24 1 0 0 0 - 8 18 2 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 22 1 0 0 0 - 9 25 2 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 15 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 12 17 2 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 13 47 1 0 0 0 - 14 18 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 24 1 0 0 0 - 15 25 1 0 0 0 - 16 22 2 0 0 0 - 16 40 1 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 24 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 19 43 1 0 0 0 - 21 45 1 0 0 0 - 21 46 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 47 48 1 0 0 0 -M END -> --10.081 - -$$$$ -p38a_2g - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 31.6235 38.9529 26.1544 C 0 0 0 0 0 0 - 31.0952 38.3551 27.4684 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0541 38.9788 28.6539 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6809 39.6144 27.4031 C 0 0 0 0 0 0 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 31.6350 39.0631 28.5784 O 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 31.2200 38.3997 25.3053 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2771 39.9808 26.0536 H 0 0 0 0 0 0 - 30.0102 38.4341 27.5066 H 0 0 0 0 0 0 - 31.3432 37.2955 27.5444 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3652 37.9383 28.7608 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3890 39.5054 29.5480 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4274 40.6742 27.3922 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7681 39.5450 27.4512 H 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4882 37.8909 26.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.1201 37.1734 14.9026 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 10 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 8 1 0 0 0 - 5 13 2 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 7 18 1 0 0 0 - 7 24 2 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 19 2 0 0 0 - 8 21 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 9 26 2 0 0 0 - 9 27 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 10 37 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 17 1 0 0 0 - 12 18 2 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 46 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 15 40 1 0 0 0 - 16 25 1 0 0 0 - 16 26 1 0 0 0 - 17 23 2 0 0 0 - 17 41 1 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 -M END -> --10.661 - -$$$$ -p38a_2c - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 31.6235 38.9529 26.1544 C 0 0 0 0 0 0 - 31.0952 38.3551 27.4684 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0541 38.9788 28.6539 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6809 39.6144 27.4031 C 0 0 0 0 0 0 - 31.6350 39.0631 28.5784 O 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 31.2200 38.3997 25.3053 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2771 39.9808 26.0536 H 0 0 0 0 0 0 - 30.0102 38.4341 27.5066 H 0 0 0 0 0 0 - 31.3432 37.2955 27.5444 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3652 37.9383 28.7608 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3890 39.5054 29.5480 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4274 40.6742 27.3922 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7681 39.5450 27.4512 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4882 37.8909 26.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1939 35.7469 20.0596 C 0 0 0 0 0 0 - 36.7445 33.8221 16.5753 C 0 0 0 0 0 0 - 36.8299 35.2183 16.7031 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3201 35.8511 17.8486 C 0 0 0 0 0 0 - 35.7249 35.0878 18.8664 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6395 33.6916 18.7387 C 0 0 0 0 0 0 - 36.1494 33.0588 17.5931 C 0 0 0 0 0 0 - 37.1451 33.3249 15.6754 H 0 0 0 0 0 0 - 37.2975 35.8179 15.9034 H 0 0 0 0 0 0 - 36.4252 37.5707 18.0060 Cl 0 0 0 0 0 0 - 35.1720 33.0921 19.5382 H 0 0 0 0 0 0 - 36.0823 31.9620 17.4927 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 8 1 0 0 0 - 1 19 1 0 0 0 - 1 20 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 2 21 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 4 25 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 6 15 2 0 0 0 - 6 16 1 0 0 0 - 6 34 1 0 0 0 - 7 14 1 0 0 0 - 7 17 2 0 0 0 - 7 18 1 0 0 0 - 8 18 1 0 0 0 - 8 27 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 11 2 0 0 0 - 9 12 1 0 0 0 - 10 28 1 0 0 0 - 10 34 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 11 17 1 0 0 0 - 12 14 2 0 0 0 - 12 29 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 13 30 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 18 33 1 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 40 1 0 0 0 - 35 41 1 0 0 0 - 36 37 1 0 0 0 - 36 42 1 0 0 0 - 37 38 2 0 0 0 - 37 43 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 39 40 2 0 0 0 - 39 44 1 0 0 0 - 40 45 1 0 0 0 -M END -> --10.462 - -$$$$ -p38a_2x - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.2505 36.7435 25.4774 O 0 0 0 0 0 0 - 31.2662 37.8710 25.1390 C 0 0 0 0 0 0 - 31.6299 38.9841 26.1241 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1592 38.9286 26.1346 C 0 0 1 0 0 0 - 33.4787 37.4276 26.1047 C 0 0 0 0 0 0 - 30.1978 37.5560 25.2177 H 0 0 0 0 0 0 - 31.4455 38.2289 24.0958 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2328 39.9820 25.8186 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2328 38.7387 27.1390 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6039 39.4522 27.0150 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6334 37.0527 27.1457 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4151 37.2225 25.5320 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 15 1 0 0 0 - 4 17 1 0 0 0 - 4 20 2 0 0 0 - 4 21 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 31 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 10 20 1 0 0 0 - 11 17 2 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 14 27 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 21 30 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 36 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 37 1 0 0 0 - 33 38 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 39 1 0 0 0 - 34 40 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 41 1 0 0 0 - 36 42 1 0 0 0 - 36 43 1 0 0 0 -M END -> --10.232 - -$$$$ -p38a_3flw - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 51 0 0 1 0 999 V2000 - 38.3390 36.6732 17.0574 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6670 36.6212 15.8212 C 0 0 0 0 0 0 - 33.5281 39.4364 27.3316 C 0 0 0 0 0 0 - 34.9049 38.7976 27.5610 C 0 0 0 0 0 0 - 31.4189 39.4188 25.9024 C 0 0 0 0 0 0 - 33.4672 34.8125 23.3952 C 0 0 0 0 0 0 - 38.3758 36.2250 19.4044 F 0 0 0 0 0 0 - 37.7408 36.1338 18.2118 C 0 0 0 0 0 0 - 38.2121 37.1987 14.7266 F 0 0 0 0 0 0 - 36.4167 35.9838 15.7308 C 0 0 0 0 0 0 - 35.8281 35.4259 16.8797 C 0 0 0 0 0 0 - 36.4736 35.5188 18.1281 C 0 0 0 0 0 0 - 35.8847 34.9357 19.2218 O 0 0 0 0 0 0 - 35.3223 35.6836 20.2329 C 0 0 0 0 0 0 - 35.4160 37.0309 20.3178 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8964 37.7486 21.4749 C 0 0 0 0 0 0 - 35.0144 39.1441 21.6469 C 0 0 0 0 0 0 - 34.6050 39.7559 22.7793 N 0 0 0 0 0 0 - 34.6208 34.9125 21.2655 C 0 0 0 0 0 0 - 34.4686 33.6966 21.1598 O 0 0 0 0 0 0 - 34.1449 35.5950 22.3469 N 0 0 0 0 0 0 - 34.2884 37.0112 22.5117 C 0 0 0 0 0 0 - 33.8757 37.6552 23.6268 N 0 0 0 0 0 0 - 34.0662 38.9716 23.7113 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6452 39.5897 24.8695 N 0 0 0 0 0 0 - 32.9030 39.0189 25.9874 C 0 0 0 0 0 0 - 30.6868 38.8865 24.6577 C 0 0 0 0 0 0 - 30.6837 37.4753 24.6295 O 0 0 0 0 0 0 - 35.4267 39.1835 28.8127 O 0 0 0 0 0 0 - 39.2980 37.1604 17.1263 H 0 0 0 0 0 0 - 32.8679 39.1262 28.1438 H 0 0 0 0 0 0 - 33.5949 40.5219 27.3993 H 0 0 0 0 0 0 - 34.8153 37.7129 27.5367 H 0 0 0 0 0 0 - 35.6091 39.0891 26.7798 H 0 0 0 0 0 0 - 30.8951 39.0627 26.7900 H 0 0 0 0 0 0 - 31.3400 40.5063 25.9193 H 0 0 0 0 0 0 - 32.9976 35.4153 24.1717 H 0 0 0 0 0 0 - 32.6714 34.1983 22.9705 H 0 0 0 0 0 0 - 34.1778 34.1485 23.8896 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9016 35.9332 14.7836 H 0 0 0 0 0 0 - 34.8741 34.9279 16.8079 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9270 37.6189 19.5731 H 0 0 0 0 0 0 - 35.4697 39.7635 20.8904 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8423 40.5802 24.9319 H 0 0 0 0 0 0 - 32.9571 37.9315 25.9403 H 0 0 0 0 0 0 - 29.6539 39.2323 24.6588 H 0 0 0 0 0 0 - 31.1447 39.2612 23.7430 H 0 0 0 0 0 0 - 31.5770 37.1767 24.5410 H 0 0 0 0 0 0 - 35.5690 40.1184 28.8033 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 8 2 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 9 1 0 0 0 - 2 10 2 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 26 1 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 6 21 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 6 38 1 0 0 0 - 6 39 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 40 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 41 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 42 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 22 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 43 1 0 0 0 - 18 24 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 -M END -> --10.683 - -$$$$ -p38a_2e - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 31.6235 38.9529 26.1544 C 0 0 0 0 0 0 - 31.0952 38.3551 27.4684 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0541 38.9788 28.6539 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6809 39.6144 27.4031 C 0 0 0 0 0 0 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 31.6350 39.0631 28.5784 O 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.0824 36.1953 19.1020 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2455 37.2821 14.6863 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 31.2200 38.3997 25.3053 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2771 39.9808 26.0536 H 0 0 0 0 0 0 - 30.0102 38.4341 27.5066 H 0 0 0 0 0 0 - 31.3432 37.2955 27.5444 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3652 37.9383 28.7608 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3890 39.5054 29.5480 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4274 40.6742 27.3922 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7681 39.5450 27.4512 H 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4882 37.8909 26.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8385 36.2249 14.6624 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6956 35.2322 16.6233 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 10 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 3 34 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 4 36 1 0 0 0 - 5 8 1 0 0 0 - 5 13 2 0 0 0 - 5 37 1 0 0 0 - 7 18 1 0 0 0 - 7 25 2 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 19 2 0 0 0 - 8 21 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 9 27 2 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 10 28 1 0 0 0 - 10 38 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 17 1 0 0 0 - 12 18 2 0 0 0 - 12 39 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 22 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 15 41 1 0 0 0 - 16 26 1 0 0 0 - 16 27 1 0 0 0 - 17 24 2 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 23 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 20 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 -M END -> --10.702 - -$$$$ -p38a_2ee - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 55 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 N 0 0 0 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0185 38.2191 30.2384 C 0 0 0 0 0 0 - 34.7890 37.3195 30.4753 O 0 0 0 0 0 0 - 33.7272 39.2812 31.2889 C 0 0 0 0 0 0 - 32.9940 40.0202 30.8788 H 0 0 0 0 0 0 - 33.2971 38.7958 32.2007 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6763 39.8083 31.5596 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 15 1 0 0 0 - 4 17 1 0 0 0 - 4 20 2 0 0 0 - 4 21 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 31 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 10 20 1 0 0 0 - 11 17 2 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 14 27 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 21 30 1 0 0 0 - 21 34 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 37 1 0 0 0 - 32 38 1 0 0 0 - 32 39 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 40 1 0 0 0 - 33 41 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 42 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 43 1 0 0 0 - 35 44 1 0 0 0 - 36 37 1 0 0 0 - 36 45 1 0 0 0 - 36 46 1 0 0 0 - 37 47 1 0 0 0 - 47 48 2 0 0 0 - 47 49 1 0 0 0 - 49 50 1 0 0 0 - 49 51 1 0 0 0 - 49 52 1 0 0 0 -M END -> --12.264 - -$$$$ -p38a_2y - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 47 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4882 37.8909 26.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 33.6752 39.6520 27.3409 C 0 0 0 0 0 0 - 32.0669 38.9679 26.1277 H 0 0 0 0 0 0 - 33.1448 38.9978 28.5821 C 0 0 0 0 0 0 - 35.0843 39.6023 27.3496 O 0 0 0 0 0 0 - 33.2263 41.0827 27.2997 C 0 0 0 0 0 0 - 35.4164 40.0648 28.1225 H 0 0 0 0 0 0 - 33.5219 39.5229 29.4597 H 0 0 0 0 0 0 - 32.0555 39.0363 28.5766 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4710 37.9583 28.6133 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6034 41.6078 28.1773 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6117 41.5592 26.3983 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1370 41.1222 27.2935 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 8 2 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 13 1 0 0 0 - 2 19 2 0 0 0 - 2 20 1 0 0 0 - 3 14 2 0 0 0 - 3 16 1 0 0 0 - 4 18 1 0 0 0 - 4 21 2 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 5 22 1 0 0 0 - 5 24 1 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 6 12 1 0 0 0 - 7 13 2 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 10 14 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 11 20 1 0 0 0 - 11 21 1 0 0 0 - 12 18 2 0 0 0 - 12 28 1 0 0 0 - 13 17 1 0 0 0 - 14 17 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 15 29 1 0 0 0 - 15 30 1 0 0 0 - 15 31 1 0 0 0 - 22 32 1 0 0 0 - 34 36 1 0 0 0 - 34 37 1 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 36 40 1 0 0 0 - 36 41 1 0 0 0 - 36 42 1 0 0 0 - 37 39 1 0 0 0 - 38 43 1 0 0 0 - 38 44 1 0 0 0 - 38 45 1 0 0 0 -M END -> --9.776 - -$$$$ -p38a_2i - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - 31.6235 38.9529 26.1544 C 0 0 0 0 0 0 - 31.0952 38.3551 27.4684 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0541 38.9788 28.6539 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6809 39.6144 27.4031 C 0 0 0 0 0 0 - 38.3660 36.7077 16.8209 C 0 0 0 0 0 0 - 31.6350 39.0631 28.5784 O 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6997 36.1819 17.9448 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1562 38.9294 26.1332 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.7260 36.7360 15.5669 C 0 0 0 0 0 0 - 36.4300 36.2096 15.4303 C 0 0 0 0 0 0 - 35.7747 35.6617 16.5471 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3960 35.6573 17.8103 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.2989 36.1901 19.1355 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6924 34.9985 18.9596 C 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 31.2200 38.3997 25.3053 H 0 0 0 0 0 0 - 31.2771 39.9808 26.0536 H 0 0 0 0 0 0 - 30.0102 38.4341 27.5066 H 0 0 0 0 0 0 - 31.3432 37.2955 27.5444 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3652 37.9383 28.7608 H 0 0 0 0 0 0 - 33.3890 39.5054 29.5480 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4274 40.6742 27.3922 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7681 39.5450 27.4512 H 0 0 0 0 0 0 - 39.3613 37.1091 16.9241 H 0 0 0 0 0 0 - 33.4882 37.8909 26.1541 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.9403 36.2182 14.4678 H 0 0 0 0 0 0 - 34.7945 35.2237 16.4304 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2229 37.1667 14.7102 H 0 0 0 0 0 0 - 36.4277 34.2745 19.3107 H 0 0 0 0 0 0 - 34.8709 34.4738 18.4718 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 10 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 10 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 8 1 0 0 0 - 5 13 2 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 7 18 1 0 0 0 - 7 24 2 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 19 2 0 0 0 - 8 21 1 0 0 0 - 9 23 1 0 0 0 - 9 26 2 0 0 0 - 9 27 1 0 0 0 - 10 27 1 0 0 0 - 10 37 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 17 1 0 0 0 - 12 18 2 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 46 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 15 40 1 0 0 0 - 16 25 1 0 0 0 - 16 26 1 0 0 0 - 17 23 2 0 0 0 - 17 41 1 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 22 47 1 0 0 0 - 22 48 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 -M END -> --10.052 - -$$$$ -p38a_2o - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 58 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 O 0 0 0 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6777 34.8441 23.4439 C 0 0 0 0 0 0 - 33.4618 35.5234 24.3064 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7328 34.3390 23.1214 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6979 33.7917 23.8682 C 0 0 0 0 0 0 - 34.9138 33.1124 23.0057 H 0 0 0 0 0 0 - 35.6428 34.2968 24.1907 H 0 0 0 0 0 0 - 34.1447 32.9912 25.0097 S 0 0 0 0 0 0 - 33.8700 33.9174 26.1332 O 0 0 0 0 0 0 - 35.0852 31.8834 25.2984 O 0 0 0 0 0 0 - 32.8423 32.3951 24.5642 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0258 31.6906 23.7145 H 0 0 0 0 0 0 - 32.3760 31.8389 25.4157 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1536 33.2112 24.2300 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 17 2 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 14 1 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 4 19 2 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 23 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 25 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 20 30 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 28 34 1 0 0 0 - 28 35 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 36 1 0 0 0 - 29 37 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 38 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 39 1 0 0 0 - 31 40 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 41 1 0 0 0 - 32 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 45 1 0 0 0 - 43 46 1 0 0 0 - 46 47 1 0 0 0 - 46 48 1 0 0 0 - 46 49 1 0 0 0 - 49 50 2 0 0 0 - 49 51 2 0 0 0 - 49 52 1 0 0 0 - 52 53 1 0 0 0 - 52 54 1 0 0 0 - 52 55 1 0 0 0 -M END -> --10.491 - -$$$$ -p38a_2ff - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 52 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6690 34.8315 23.4618 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 34.0543 35.1876 24.4176 H 0 0 0 0 0 0 - 32.5822 34.9190 23.4834 H 0 0 0 0 0 0 - 33.9197 33.7705 23.4230 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 2 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 C 0 0 2 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3461 38.8039 29.2910 H 0 0 0 0 0 0 - 32.8955 37.6816 30.1795 O 0 0 0 0 0 0 - 33.5278 37.0299 30.4913 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 18 2 0 0 0 - 2 19 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 15 1 0 0 0 - 4 17 1 0 0 0 - 4 20 2 0 0 0 - 4 21 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 31 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 25 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 10 20 1 0 0 0 - 11 17 2 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 16 1 0 0 0 - 14 19 1 0 0 0 - 14 27 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 21 30 1 0 0 0 - 21 34 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 37 1 0 0 0 - 32 38 1 0 0 0 - 32 39 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 40 1 0 0 0 - 33 41 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 34 42 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 43 1 0 0 0 - 35 44 1 0 0 0 - 36 37 1 0 0 0 - 36 45 1 0 0 0 - 36 46 1 0 0 0 - 37 47 1 0 0 0 - 37 48 1 0 0 0 - 48 49 1 0 0 0 -M END -> --11.443 - -$$$$ -p38a_2m - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - 38.2632 36.7144 17.0134 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5448 34.9770 21.1828 C 0 0 0 0 0 0 - 37.5969 36.1886 18.1373 C 0 0 0 0 0 0 - 34.0445 38.9756 23.7378 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8025 37.8108 21.4407 C 0 0 0 0 0 0 - 35.2536 37.1252 20.2344 C 0 0 0 0 0 0 - 37.6232 36.7427 15.7594 C 0 0 0 0 0 0 - 36.3272 36.2163 15.6228 C 0 0 0 0 0 0 - 35.6719 35.6684 16.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 34.3067 37.0366 22.5109 C 0 0 0 0 0 0 - 34.8522 39.2088 21.6169 C 0 0 0 0 0 0 - 35.1646 35.7815 20.1251 C 0 0 0 0 0 0 - 36.2931 35.6640 18.0028 C 0 0 0 0 0 0 - 38.1961 36.1968 19.3280 F 0 0 0 0 0 0 - 35.6498 35.0616 19.0536 O 0 0 0 0 0 0 - 34.4789 39.7925 22.7772 N 0 0 0 0 0 0 - 34.3290 33.7761 21.0235 O 0 0 0 0 0 0 - 34.2121 35.6181 22.3415 N 0 0 0 0 0 0 - 33.9306 37.6499 23.6560 N 0 0 0 0 0 0 - 33.6717 39.5652 24.9268 N 0 0 0 0 0 0 - 39.2585 37.1158 17.1165 H 0 0 0 0 0 0 - 35.7026 37.7356 19.4667 H 0 0 0 0 0 0 - 35.8375 36.2249 14.6602 H 0 0 0 0 0 0 - 34.6916 35.2304 16.6228 H 0 0 0 0 0 0 - 35.2183 39.8565 20.8356 H 0 0 0 0 0 0 - 33.7904 40.5685 24.9712 H 0 0 0 0 0 0 - 38.2365 37.2743 14.7019 F 0 0 0 0 0 0 - 32.3864 39.3434 28.5029 C 0 0 0 0 0 0 - 32.8826 39.9949 27.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 33.1625 38.9326 26.1269 C 0 0 0 0 0 0 - 34.1671 37.8864 26.6357 C 0 0 0 0 0 0 - 33.6709 37.2349 27.9364 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3911 38.2971 29.0117 O 0 0 0 0 0 0 - 31.3999 38.8533 28.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2221 40.1260 29.2833 H 0 0 0 0 0 0 - 33.8171 40.5707 27.4078 H 0 0 0 0 0 0 - 32.1249 40.7262 26.8283 H 0 0 0 0 0 0 - 32.2074 38.4259 25.8477 H 0 0 0 0 0 0 - 34.3315 37.1039 25.8553 H 0 0 0 0 0 0 - 35.1537 38.3766 26.8183 H 0 0 0 0 0 0 - 32.7366 36.6591 27.7308 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4286 36.5036 28.3103 H 0 0 0 0 0 0 - 33.6777 34.8441 23.4439 C 0 0 0 0 0 0 - 33.3339 35.6194 24.6885 C 0 0 0 0 0 0 - 34.5558 34.7394 24.6629 C 0 0 0 0 0 0 - 33.0352 33.9585 23.2271 H 0 0 0 0 0 0 - 33.5224 36.7179 24.6471 H 0 0 0 0 0 0 - 32.4686 35.2366 25.2788 H 0 0 0 0 0 0 - 35.5367 35.2671 24.6050 H 0 0 0 0 0 0 - 34.4829 33.7858 25.2367 H 0 0 0 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 7 2 0 0 0 - 1 21 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 2 17 2 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 13 2 0 0 0 - 3 14 1 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 4 19 2 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 5 11 1 0 0 0 - 6 12 2 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 23 1 0 0 0 - 9 13 1 0 0 0 - 9 24 1 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 10 19 1 0 0 0 - 11 16 2 0 0 0 - 11 25 1 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 15 1 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 20 30 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 28 34 1 0 0 0 - 28 35 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 36 1 0 0 0 - 29 37 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 38 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 39 1 0 0 0 - 31 40 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 41 1 0 0 0 - 32 42 1 0 0 0 - 43 44 1 0 0 0 - 43 45 1 0 0 0 - 43 46 1 0 0 0 - 44 45 1 0 0 0 - 44 47 1 0 0 0 - 44 48 1 0 0 0 - 45 49 1 0 0 0 - 45 50 1 0 0 0 -M END -> --10.963 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/pfkfb3_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/pfkfb3_ligands.sdf deleted file mode 100755 index f297749d..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/pfkfb3_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,4508 +0,0 @@ -43 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 93.2801 49.7948 267.6926 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5697 47.3273 266.4879 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6101 48.3227 266.6794 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9699 49.5231 267.2872 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8968 47.5279 266.9313 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2695 48.7730 267.5260 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5576 48.9586 267.9485 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4495 47.9531 267.7601 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0662 46.7381 267.2124 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7965 46.5169 266.7871 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5926 51.1080 268.3254 C 0 0 0 0 0 0 - 93.0431 51.4518 269.5675 C 0 0 0 0 0 0 - 93.3489 52.6803 270.1568 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2002 53.5732 269.5104 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7102 53.2574 268.2528 C 0 0 0 0 0 0 - 94.4268 52.0279 267.6749 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2713 48.1126 266.3137 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7145 47.3382 265.2871 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4125 47.1278 264.0926 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9049 46.4459 263.0330 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6524 45.9395 263.1609 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8830 46.0841 264.3170 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4216 46.7951 265.3953 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4809 46.8875 266.9255 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1229 46.4026 266.6623 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6858 48.2236 267.4941 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3659 45.6223 267.9978 C 0 0 0 0 0 0 - 95.7702 54.5153 267.3088 Br 0 0 0 0 0 0 - 92.2845 46.3806 266.0483 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2071 50.2769 267.4318 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4743 48.1503 268.0502 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7761 45.9410 267.0505 H 0 0 0 0 0 0 - 92.3934 50.7654 270.0803 H 0 0 0 0 0 0 - 92.9287 52.9349 271.1181 H 0 0 0 0 0 0 - 94.4175 54.5360 269.9608 H 0 0 0 0 0 0 - 94.8274 51.7986 266.6985 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5702 48.5863 266.8724 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4072 47.5171 263.9719 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2658 45.3835 262.3188 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9009 45.6304 264.3829 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8375 45.5096 268.9490 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3862 45.9688 268.1678 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3764 44.6703 267.4706 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 17 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 28 1 0 0 0 - 16 36 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 24 27 1 0 0 0 - 27 41 1 0 0 0 - 27 42 1 0 0 0 - 27 43 1 0 0 0 -M END -> -43 - -> -1.373 - -$$$$ -30 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - 90.3246 48.2158 265.9106 N 0 0 0 0 0 0 - 91.6410 48.3483 266.3682 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9415 49.5214 267.0589 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1916 49.7577 267.6267 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2090 48.7633 267.4940 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8920 47.5406 266.8142 C 0 0 0 0 0 0 - 92.6020 47.3493 266.2505 C 0 0 0 0 0 0 - 93.3887 51.0078 268.4028 C 0 0 0 0 0 0 - 94.3856 51.9191 268.0632 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5800 53.0959 268.7844 C 0 0 0 0 0 0 - 93.7588 53.3624 269.8875 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7502 52.4132 270.2359 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5445 51.2472 269.4912 C 0 0 0 0 0 0 - 93.6590 54.4296 270.8315 C 0 0 0 0 0 0 - 92.6607 54.0993 271.7192 C 0 0 0 0 0 0 - 92.1109 52.8876 271.3697 N 0 0 0 0 0 0 - 94.8307 46.5542 266.6953 N 0 0 0 0 0 0 - 96.0576 46.7723 267.2282 C 0 0 0 0 0 0 - 96.3687 47.9683 267.8707 C 0 0 0 0 0 0 - 95.4525 48.9489 268.0267 N 0 0 0 0 0 0 - 91.0015 52.2516 272.0349 C 0 0 0 0 0 0 - 89.6285 47.2718 265.1312 C 0 0 0 0 0 0 - 90.0658 46.7271 263.9099 C 0 0 0 0 0 0 - 89.2897 45.8581 263.1888 N 0 0 0 0 0 0 - 88.0679 45.5254 263.6665 C 0 0 0 0 0 0 - 87.5646 46.0381 264.8536 C 0 0 0 0 0 0 - 88.3537 46.9259 265.5834 C 0 0 0 0 0 0 - 91.2814 47.0908 263.3524 O 0 0 0 0 0 0 - 91.5717 46.7276 261.9951 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7054 48.8989 266.3314 H 0 0 0 0 0 0 - 91.1742 50.2745 267.1733 H 0 0 0 0 0 0 - 92.3704 46.4313 265.7346 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0268 51.7132 267.2178 H 0 0 0 0 0 0 - 95.3510 53.7912 268.4891 H 0 0 0 0 0 0 - 91.7728 50.5401 269.7642 H 0 0 0 0 0 0 - 94.2567 55.3288 270.8709 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2753 54.6395 272.5720 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7837 45.9839 267.1326 H 0 0 0 0 0 0 - 97.3426 48.1426 268.2967 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2213 51.1967 272.1960 H 0 0 0 0 0 0 - 90.0975 52.3505 271.4345 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8589 52.7256 273.0100 H 0 0 0 0 0 0 - 87.4937 44.8108 263.0830 H 0 0 0 0 0 0 - 86.5893 45.7382 265.2184 H 0 0 0 0 0 0 - 87.9673 47.3300 266.5091 H 0 0 0 0 0 0 - 92.5406 47.1233 261.6761 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8369 47.1301 261.2988 H 0 0 0 0 0 0 - 91.5927 45.6483 261.8513 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 20 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 17 1 0 0 0 - 7 32 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 2 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 -M END -> -30 - -> -0.181 - -$$$$ -65 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 49 0 0 1 0 999 V2000 - 93.2872 49.7956 267.6944 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5687 47.3376 266.4857 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6146 48.3304 266.6749 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9729 49.5341 267.2820 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8980 47.5350 266.9247 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2694 48.7811 267.5256 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5628 48.9608 267.9474 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4512 47.9559 267.7583 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0630 46.7394 267.2050 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7992 46.5230 266.7822 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7144 47.3441 265.2867 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4092 47.1460 264.0888 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9096 46.4507 263.0377 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6543 45.9413 263.1621 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8854 46.0879 264.3158 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4232 46.7977 265.3980 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4784 46.8853 266.9220 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1276 46.3963 266.6637 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3703 45.6287 268.0030 C 0 0 0 0 0 0 - 87.6748 48.2291 267.4909 O 0 0 0 0 0 0 - 90.2732 48.1194 266.3138 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5885 51.1029 268.3430 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5710 51.9460 267.8128 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8648 53.1857 268.4025 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8911 51.4690 269.4891 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1676 52.6956 270.0909 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1496 53.5503 269.5479 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2519 54.9826 270.5782 S 0 0 0 0 0 0 - 93.0165 54.3044 271.5748 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5431 53.1496 271.2157 N 0 0 0 0 0 0 - 92.2833 46.3865 266.0492 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2132 50.2842 267.4310 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4754 48.1488 268.0479 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7730 45.9425 267.0419 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4107 47.5214 263.9722 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2682 45.3847 262.3195 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9002 45.6358 264.3812 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8462 45.5122 268.9561 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3922 45.9759 268.1641 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3733 44.6715 267.4858 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5715 48.5931 266.8725 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0968 51.6566 266.9236 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6212 53.8241 267.9680 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1446 50.8081 269.9236 H 0 0 0 0 0 0 - 92.6755 54.8393 272.4460 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 21 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 11 21 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 19 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 27 2 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 45 1 0 0 0 -M END -> -65 - -> -0.111 - -$$$$ -49 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 93.2820 49.7787 267.6942 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5593 47.3370 266.4888 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6047 48.3296 266.6732 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9709 49.5231 267.2782 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8953 47.5304 266.9261 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2750 48.7673 267.5290 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5619 48.9626 267.9535 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4516 47.9533 267.7695 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0598 46.7392 267.2106 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7989 46.5188 266.7897 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5952 51.0844 268.3313 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5719 51.9301 267.7852 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8427 53.1540 268.3966 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1433 53.5318 269.5201 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1746 52.7091 270.0775 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9084 51.4788 269.4813 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2697 48.1106 266.3099 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7103 47.3327 265.2784 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4172 47.1253 264.0922 C 0 0 0 0 0 0 - 89.8957 46.4495 263.0389 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6529 45.9439 263.1611 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8862 46.0847 264.3178 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4170 46.8009 265.3996 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4738 46.8803 266.9122 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1325 46.4072 266.6648 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6872 48.2303 267.4905 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3692 45.6214 267.9982 C 0 0 0 0 0 0 - 94.4021 54.7489 270.1265 N 0 0 0 0 0 0 - 92.2854 46.3918 266.0511 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2104 50.2821 267.4244 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4787 48.1515 268.0470 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7743 45.9391 267.0464 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1082 51.6414 266.9089 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6103 53.8120 267.9571 H 0 0 0 0 0 0 - 92.6490 53.0121 270.9964 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1657 50.8433 269.9430 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5675 48.5840 266.8654 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4129 47.5223 263.9807 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2686 45.3827 262.3187 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9071 45.6337 264.3890 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8387 45.5102 268.9412 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3864 45.9742 268.1594 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3749 44.6677 267.4664 H 0 0 0 0 0 0 - 93.8999 55.0302 270.9569 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0881 55.3795 269.6841 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 17 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 36 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 24 27 1 0 0 0 - 27 41 1 0 0 0 - 27 42 1 0 0 0 - 27 43 1 0 0 0 - 28 44 1 0 0 0 - 28 45 1 0 0 0 -M END -> -49 - -> -1.528 - -$$$$ -24 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 50 0 0 1 0 999 V2000 - 94.7934 46.5310 266.7559 N 0 0 0 0 0 0 - 95.5582 48.9639 267.9334 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4466 47.9569 267.7437 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0618 46.7455 267.1837 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2697 48.7791 267.5052 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8901 47.5407 266.8989 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5600 47.3451 266.4593 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6063 48.3396 266.6555 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9699 49.5311 267.2767 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2841 49.7958 267.6804 C 0 0 0 0 0 0 - 93.5907 51.0925 268.3264 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2614 48.1538 266.3036 N 0 0 0 0 0 0 - 94.5668 51.9472 267.7977 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8663 53.1821 268.3739 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8923 51.4433 269.4840 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2012 52.6678 270.0771 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1512 53.5677 269.5161 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1492 54.7274 270.3470 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2774 54.4889 271.3839 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7265 53.2453 271.2434 N 0 0 0 0 0 0 - 91.8100 52.6331 272.1856 C 0 0 0 0 0 0 - 89.6457 47.3771 265.3001 C 0 0 0 0 0 0 - 90.3572 47.0310 264.1425 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7478 46.3118 263.1147 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4149 45.9293 263.2275 C 0 0 0 0 0 0 - 87.6884 46.2695 264.3653 C 0 0 0 0 0 0 - 88.2903 46.9920 265.4020 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4679 47.3024 266.5683 C 0 0 0 0 0 0 - 86.8158 47.5543 267.4897 N 0 0 0 0 0 0 - 97.4675 48.1440 268.0431 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7682 45.9462 267.0194 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2766 46.3948 266.0294 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2125 50.2847 267.4445 H 0 0 0 0 0 0 - 89.6053 48.6279 266.9087 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0978 51.6559 266.8992 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6195 53.8279 267.9323 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1459 50.7815 269.9121 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7662 55.6216 270.2424 H 0 0 0 0 0 0 - 93.0084 55.0959 272.2349 H 0 0 0 0 0 0 - 91.6210 53.3091 273.0208 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2505 51.7171 272.5757 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8739 52.3970 271.6835 H 0 0 0 0 0 0 - 91.3873 47.3281 264.0266 H 0 0 0 0 0 0 - 90.3077 46.0365 262.2339 H 0 0 0 0 0 0 - 87.9440 45.3507 262.4475 H 0 0 0 0 0 0 - 86.6579 45.9419 264.4385 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 32 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 13 2 0 0 0 - 11 15 1 0 0 0 - 12 22 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 17 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 3 0 0 0 -M END -> -24 - -> -0.315 - -$$$$ -67 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 51 0 0 1 0 999 V2000 - 93.1004 49.7216 267.7155 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5890 47.2745 266.3896 C 0 0 0 0 0 0 - 91.5683 48.2049 266.5759 C 0 0 0 0 0 0 - 91.8300 49.4026 267.2297 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8878 47.5400 266.8820 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1599 48.7802 267.5411 C 0 0 0 0 0 0 - 95.4145 49.0346 268.0280 N 0 0 0 0 0 0 - 96.3713 48.0905 267.8536 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0910 46.8809 267.2282 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8599 46.5971 266.7393 N 0 0 0 0 0 0 - 93.2846 50.9778 268.4857 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2454 51.9199 268.1045 C 0 0 0 0 0 0 - 94.4590 53.0941 268.8278 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5073 51.1876 269.6303 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2493 47.9429 266.1975 N 0 0 0 0 0 0 - 89.6938 47.1846 265.1577 C 0 0 0 0 0 0 - 90.3836 46.9926 263.9558 C 0 0 0 0 0 0 - 89.8604 46.3316 262.8928 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6069 45.8318 263.0224 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8451 45.9660 264.1837 C 0 0 0 0 0 0 - 88.3928 46.6627 265.2677 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4640 46.8258 266.7979 S 0 0 0 0 0 0 - 87.6173 48.2190 267.2276 O 0 0 0 0 0 0 - 86.1278 46.2817 266.5368 O 0 0 0 0 0 0 - 88.2895 45.7139 268.0726 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7122 52.3451 270.3867 C 0 0 0 0 0 0 - 93.6742 53.3006 269.9675 C 0 0 0 0 0 0 - 93.6619 54.6467 271.0869 S 0 0 0 0 0 0 - 92.4847 53.7751 272.0143 C 0 0 0 0 0 0 - 92.0618 52.6441 271.5401 N 0 0 0 0 0 0 - 92.0618 54.3270 273.1729 N 0 0 0 0 0 0 - 92.3771 46.3274 265.9191 H 0 0 0 0 0 0 - 91.0166 50.1019 267.3766 H 0 0 0 0 0 0 - 97.3578 48.3186 268.2289 H 0 0 0 0 0 0 - 96.8555 46.1283 267.0976 H 0 0 0 0 0 0 - 94.8420 51.7360 267.2204 H 0 0 0 0 0 0 - 95.2043 53.8135 268.5140 H 0 0 0 0 0 0 - 91.7753 50.4604 269.9472 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5427 48.3411 266.8073 H 0 0 0 0 0 0 - 91.3786 47.3860 263.8271 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2110 45.2945 262.1738 H 0 0 0 0 0 0 - 86.8592 45.5273 264.2271 H 0 0 0 0 0 0 - 87.7064 45.7620 268.9919 H 0 0 0 0 0 0 - 89.2978 46.0801 268.2656 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3046 44.6950 267.6961 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2225 55.3228 273.3257 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2849 53.9294 273.6848 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 15 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 34 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 27 2 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 26 2 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 31 1 0 0 0 - 31 46 1 0 0 0 - 31 47 1 0 0 0 -M END -> -67 - -> -0.031 - -$$$$ -62 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 48 0 0 1 0 999 V2000 - 92.5616 47.3431 266.4810 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6083 48.3378 266.6788 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9675 49.5360 267.2894 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2833 49.8036 267.6841 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8906 47.5426 266.9050 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2692 48.7834 267.5054 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5582 48.9676 267.9253 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4459 47.9593 267.7336 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0546 46.7511 267.1656 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7960 46.5357 266.7462 N 0 0 0 0 0 0 - 93.6000 51.1078 268.3203 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2728 48.1334 266.3179 N 0 0 0 0 0 0 - 94.5796 51.9508 267.7841 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8793 53.1855 268.3642 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9122 51.4860 269.4818 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2219 52.7049 270.0921 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1726 53.5723 269.5148 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2452 54.7250 270.2335 N 0 0 0 0 0 0 - 93.3558 54.4935 271.2868 O 0 0 0 0 0 0 - 92.7185 53.2485 271.2321 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7162 47.3504 265.2906 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4248 46.8034 265.3985 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8890 46.0969 264.3132 C 0 0 0 0 0 0 - 88.6624 45.9387 263.1651 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9162 46.4364 263.0442 N 0 0 0 0 0 0 - 90.4181 47.1285 264.0963 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4804 46.8895 266.9250 S 0 0 0 0 0 0 - 88.3878 45.6691 268.0379 C 0 0 0 0 0 0 - 86.1403 46.3593 266.6660 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6424 48.2387 267.4798 O 0 0 0 0 0 0 - 92.2854 46.3950 266.0421 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2053 50.2860 267.4565 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4627 48.1378 268.0449 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7700 45.9486 267.0128 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5943 48.6264 266.8885 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1084 51.6478 266.8879 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6245 53.8350 267.9323 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1553 50.8472 269.9070 H 0 0 0 0 0 0 - 86.8985 45.6634 264.3535 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2735 45.3947 262.3179 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4051 47.5333 263.9482 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8829 45.6238 268.9999 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4189 45.9985 268.1656 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3528 44.6799 267.5881 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 4 11 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 15 2 0 0 0 - 12 21 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 17 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 26 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 26 41 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 2 0 0 0 - 27 30 2 0 0 0 - 28 42 1 0 0 0 - 28 43 1 0 0 0 - 28 44 1 0 0 0 -M END -> -62 - -> -2.301 - -$$$$ -56 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - 93.2875 49.7899 267.6817 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5639 47.3419 266.4806 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6077 48.3343 266.6701 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9668 49.5310 267.2780 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8923 47.5378 266.9074 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2733 48.7754 267.5078 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5604 48.9644 267.9352 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4505 47.9552 267.7478 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0626 46.7471 267.1815 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7984 46.5302 266.7568 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5872 51.0916 268.3371 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5607 51.9338 267.7811 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8501 53.1823 268.3498 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8941 51.4456 269.4876 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2744 48.1264 266.3145 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7159 47.3451 265.2886 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4198 47.1284 264.0960 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9137 46.4353 263.0457 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6627 45.9369 263.1677 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8911 46.0926 264.3161 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4236 46.8007 265.4015 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4795 46.8934 266.9237 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1396 46.3756 266.6690 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6540 48.2479 267.4799 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3811 45.6759 268.0440 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1885 52.6594 270.0906 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1456 53.5742 269.5213 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1354 54.7290 270.3575 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2772 54.4881 271.4048 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7219 53.2385 271.2473 N 0 0 0 0 0 0 - 91.7905 52.6217 272.1984 C 0 0 0 0 0 0 - 95.8952 54.0681 267.6802 C 0 0 0 0 0 0 - 92.2925 46.4013 266.0331 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2134 50.2862 267.4482 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4693 48.1426 268.0450 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7702 45.9454 267.0266 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0864 51.6342 266.8950 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1681 50.7999 269.9073 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5875 48.6177 266.8787 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4203 47.5082 263.9713 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2769 45.3851 262.3238 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9026 45.6536 264.3652 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8674 45.6321 268.9993 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4061 46.0126 268.1806 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3636 44.6924 267.5725 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7512 55.6085 270.2439 H 0 0 0 0 0 0 - 93.0100 55.0853 272.2451 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2515 51.6982 272.5723 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8611 52.3901 271.6746 H 0 0 0 0 0 0 - 91.6098 53.3004 273.0211 H 0 0 0 0 0 0 - 96.2694 53.6372 266.7661 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7532 54.2169 268.3024 H 0 0 0 0 0 0 - 95.4728 55.0506 267.4370 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 33 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 15 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 36 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 13 27 2 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 26 2 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 31 48 1 0 0 0 - 31 49 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 - 32 51 1 0 0 0 - 32 52 1 0 0 0 - 32 53 1 0 0 0 -M END -> -56 - -> -0.018 - -$$$$ -59 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - 94.8018 46.5109 266.7810 N 0 0 0 0 0 0 - 95.5594 48.9562 267.9425 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4498 47.9500 267.7562 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0677 46.7343 267.2047 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2682 48.7611 267.5159 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8962 47.5221 266.9192 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5694 47.3244 266.4788 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6134 48.3190 266.6708 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9660 49.5150 267.2751 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2855 49.7790 267.6840 C 0 0 0 0 0 0 - 93.5879 51.0782 268.3122 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2737 48.1142 266.3097 N 0 0 0 0 0 0 - 94.5752 51.9225 267.7816 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8653 53.1505 268.3816 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8985 51.4691 269.4627 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7155 47.3452 265.2853 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4138 47.1285 264.0886 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9106 46.4419 263.0368 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6568 45.9347 263.1618 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8875 46.0867 264.3143 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4223 46.8005 265.3926 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4801 46.8993 266.9179 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1285 46.4001 266.6610 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6734 48.2433 267.4795 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3715 45.6618 268.0181 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1809 52.6785 270.0639 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1584 53.5252 269.5157 C 0 0 0 0 0 0 - 94.4333 54.7672 270.0482 O 0 0 0 0 0 0 - 94.0133 54.9117 271.4001 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5929 54.3553 271.5885 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5255 52.9762 271.2421 O 0 0 0 0 0 0 - 97.4701 48.1438 268.0547 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7793 45.9370 267.0484 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2874 46.3752 266.0453 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2144 50.2757 267.4253 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5843 48.5996 266.8791 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1184 51.6380 266.8951 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6084 53.8097 267.9625 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1529 50.8186 269.9099 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4082 47.5286 263.9600 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2722 45.3793 262.3200 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9047 45.6369 264.3728 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3558 44.6887 267.5313 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8534 45.6061 268.9764 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3985 45.9973 268.1617 H 0 0 0 0 0 0 - 94.6915 54.3763 272.0652 H 0 0 0 0 0 0 - 94.0495 55.9651 271.6740 H 0 0 0 0 0 0 - 91.9903 54.9200 270.8846 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1930 54.5411 272.5852 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 13 2 0 0 0 - 11 15 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 27 2 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 26 2 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 31 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 48 1 0 0 0 - 30 49 1 0 0 0 -M END -> -59 - -> -1.126 - -$$$$ -38 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 54 0 0 1 0 999 V2000 - 93.2867 49.7938 267.6782 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5654 47.3311 266.4816 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6089 48.3230 266.6726 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9718 49.5238 267.2764 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8961 47.5281 266.9156 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2745 48.7732 267.5111 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5637 48.9600 267.9394 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4525 47.9510 267.7602 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0664 46.7362 267.2062 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7996 46.5168 266.7811 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7127 47.3363 265.2872 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4139 47.1275 264.0953 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9037 46.4485 263.0367 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6507 45.9427 263.1625 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8846 46.0870 264.3185 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4205 46.7962 265.3983 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4819 46.8918 266.9282 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1279 46.3929 266.6697 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3703 45.6406 268.0228 C 0 0 0 0 0 0 - 87.6772 48.2349 267.4843 O 0 0 0 0 0 0 - 90.2707 48.1110 266.3142 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5987 51.1027 268.3120 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9194 51.5074 269.4662 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2015 52.7233 270.1079 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1623 53.5590 269.5218 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8605 53.1670 268.3804 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5797 51.9421 267.7804 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5677 53.0728 271.3295 N 0 0 0 0 0 0 - 92.8524 54.3513 271.9762 C 0 0 0 0 0 0 - 91.4472 52.2880 271.8453 C 0 0 0 0 0 0 - 92.2797 46.3851 266.0467 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2121 50.2761 267.4285 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4763 48.1494 268.0460 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7758 45.9385 267.0386 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4110 47.5227 263.9794 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2698 45.3853 262.3211 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9033 45.6379 264.3878 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8420 45.5238 268.9687 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3912 45.9889 268.1760 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3713 44.6834 267.5060 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5657 48.5886 266.8661 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1906 50.8306 269.8810 H 0 0 0 0 0 0 - 94.4187 54.5084 269.9653 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6109 53.8148 267.9531 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1248 51.6489 266.8935 H 0 0 0 0 0 0 - 92.3418 54.4587 272.9342 H 0 0 0 0 0 0 - 92.5305 55.1700 271.3335 H 0 0 0 0 0 0 - 93.9219 54.4733 272.1494 H 0 0 0 0 0 0 - 91.1227 52.6357 272.8266 H 0 0 0 0 0 0 - 91.7109 51.2343 271.9398 H 0 0 0 0 0 0 - 90.6011 52.3612 271.1620 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 31 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 21 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 11 21 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 19 1 0 0 0 - 17 20 2 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 28 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 30 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 - 30 49 1 0 0 0 - 30 50 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 -M END -> -38 - -> -0.38 - -$$$$ -31 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - 90.2734 48.1373 266.3119 N 0 0 0 0 0 0 - 91.6117 48.3398 266.6726 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9712 49.5358 267.2869 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2859 49.8045 267.6861 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5671 47.3483 266.4685 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8944 47.5452 266.9039 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2720 48.7853 267.5093 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5613 48.9672 267.9330 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4474 47.9577 267.7413 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0603 46.7471 267.1804 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7948 46.5347 266.7539 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5898 51.1081 268.3324 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5658 51.9591 267.8021 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8582 53.1934 268.3840 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8861 51.4597 269.4865 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7260 53.2479 271.2608 N 0 0 0 0 0 0 - 93.1982 52.6767 270.0937 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1524 53.5738 269.5353 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1575 54.7293 270.3755 C 0 0 0 0 0 0 - 93.3428 54.4594 271.4429 C 0 0 0 0 0 0 - 91.7409 52.6665 272.1542 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4241 47.1199 264.0974 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7187 47.3508 265.2862 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4205 46.8190 265.4083 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8923 46.0966 264.3222 C 0 0 0 0 0 0 - 88.6643 45.9320 263.1722 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9182 46.4295 263.0460 N 0 0 0 0 0 0 - 87.7289 47.0297 266.5905 O 0 0 0 0 0 0 - 86.6417 46.1641 266.9159 C 0 0 0 0 0 0 - 89.5868 48.6125 266.8810 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2113 50.2874 267.4491 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2845 46.4012 266.0294 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4673 48.1422 268.0436 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7683 45.9465 267.0190 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0959 51.6639 266.9069 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6099 53.8355 267.9427 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1435 50.7994 269.9124 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7478 55.6229 270.2556 H 0 0 0 0 0 0 - 93.1309 55.0547 272.3177 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1012 51.7055 272.5204 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8126 52.5158 271.6044 H 0 0 0 0 0 0 - 91.5524 53.3252 273.0018 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4231 47.5030 263.9698 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9039 45.6606 264.3509 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2760 45.3830 262.3272 H 0 0 0 0 0 0 - 86.2357 46.4597 267.8831 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9586 45.1221 266.9987 H 0 0 0 0 0 0 - 85.8268 46.2288 266.1940 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 12 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 11 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 18 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 17 2 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 28 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 -M END -> -31 - -> -0.157 - -$$$$ -48 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - 93.2891 49.7935 267.6637 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5608 47.3405 266.4814 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6077 48.3332 266.6707 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9710 49.5295 267.2722 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8940 47.5337 266.9045 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2774 48.7739 267.4976 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5626 48.9634 267.9320 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4502 47.9550 267.7462 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0648 46.7470 267.1768 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7990 46.5280 266.7549 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5991 51.0971 268.3145 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5753 51.9457 267.7785 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8348 53.1676 268.4112 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1285 53.5217 269.5605 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1788 52.6604 270.1058 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9139 51.4668 269.4673 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2715 48.1257 266.3145 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7152 47.3459 265.2879 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4202 47.1272 264.0964 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9129 46.4356 263.0461 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6622 45.9374 263.1674 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8909 46.0945 264.3162 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4225 46.8019 265.4011 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4807 46.8954 266.9247 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1397 46.3717 266.6686 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6511 48.2450 267.4794 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3821 45.6757 268.0448 C 0 0 0 0 0 0 - 94.3897 54.7426 270.1571 O 0 0 0 0 0 0 - 93.7287 55.0566 271.4029 C 0 0 0 0 0 0 - 92.2928 46.4025 266.0289 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2152 50.2846 267.4485 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4706 48.1430 268.0444 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7729 45.9446 267.0248 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1201 51.6805 266.8911 H 0 0 0 0 0 0 - 95.5945 53.8384 267.9783 H 0 0 0 0 0 0 - 92.6588 52.9130 271.0228 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1743 50.8105 269.8846 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5886 48.6199 266.8796 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4216 47.5070 263.9713 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2783 45.3853 262.3241 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9043 45.6552 264.3634 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8696 45.6335 269.0001 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4070 46.0124 268.1807 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3643 44.6916 267.5753 H 0 0 0 0 0 0 - 94.0299 56.0094 271.7452 H 0 0 0 0 0 0 - 94.0028 54.3161 272.1675 H 0 0 0 0 0 0 - 92.6363 55.0361 271.2683 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 17 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 24 27 1 0 0 0 - 27 42 1 0 0 0 - 27 43 1 0 0 0 - 27 44 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 45 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 -M END -> -48 - -> -1.353 - -$$$$ -58 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - 94.8013 46.5214 266.7826 N 0 0 0 0 0 0 - 95.5604 48.9616 267.9505 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4513 47.9564 267.7616 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0690 46.7404 267.2068 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2685 48.7751 267.5275 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8968 47.5294 266.9259 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5695 47.3323 266.4865 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6129 48.3253 266.6755 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9685 49.5269 267.2835 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2847 49.7945 267.6974 C 0 0 0 0 0 0 - 93.5894 51.1028 268.3276 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2782 48.1195 266.3117 N 0 0 0 0 0 0 - 94.5708 51.9469 267.7831 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8595 53.1857 268.3749 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9123 51.4978 269.4953 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2007 52.7289 270.0653 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1307 53.5569 269.5027 C 0 0 0 0 0 0 - 94.3320 54.7281 270.1938 O 0 0 0 0 0 0 - 93.3593 54.7303 271.2476 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7695 53.3637 271.3461 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7154 47.3416 265.2852 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4167 47.1271 264.0903 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9109 46.4408 263.0386 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6582 45.9328 263.1640 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8902 46.0836 264.3159 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4237 46.7992 265.3955 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4810 46.9013 266.9181 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1283 46.4027 266.6622 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6749 48.2444 267.4795 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3720 45.6610 268.0177 C 0 0 0 0 0 0 - 97.4731 48.1493 268.0540 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7777 45.9432 267.0489 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2898 46.3840 266.0487 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2125 50.2818 267.4334 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5786 48.5968 266.8753 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1133 51.6481 266.8964 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6205 53.8235 267.9539 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2001 50.8363 269.9501 H 0 0 0 0 0 0 - 92.5718 55.4402 270.9517 H 0 0 0 0 0 0 - 93.7774 55.1040 272.1881 H 0 0 0 0 0 0 - 91.6885 53.3869 271.5159 H 0 0 0 0 0 0 - 93.2195 52.8220 272.1848 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4074 47.5284 263.9644 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2716 45.3808 262.3215 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9028 45.6381 264.3764 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8533 45.6063 268.9724 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3975 45.9996 268.1589 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3561 44.6887 267.5271 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 32 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 12 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 13 2 0 0 0 - 11 15 1 0 0 0 - 12 21 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 17 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 26 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 2 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 30 46 1 0 0 0 - 30 47 1 0 0 0 - 30 48 1 0 0 0 -M END -> -58 - -> -0.202 - -$$$$ -41 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - 93.2782 49.7896 267.6853 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5645 47.3279 266.4843 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6114 48.3242 266.6766 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9687 49.5189 267.2814 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8940 47.5285 266.9239 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2716 48.7689 267.5195 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5595 48.9594 267.9444 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4507 47.9529 267.7597 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0667 46.7376 267.2079 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7985 46.5177 266.7833 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5961 51.0950 268.3176 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8354 51.5850 269.3805 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1459 52.8020 269.9772 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2185 53.5485 269.5127 C 0 0 0 0 0 0 - 94.9646 53.1033 268.4055 C 0 0 0 0 0 0 - 94.6620 51.8657 267.8407 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2696 48.1131 266.3141 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7134 47.3365 265.2841 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4132 47.1201 264.0930 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9020 46.4455 263.0351 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6551 45.9413 263.1596 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8824 46.0848 264.3154 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4203 46.7966 265.3977 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4762 46.8845 266.9224 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1286 46.4001 266.6639 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6817 48.2276 267.4906 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3690 45.6249 268.0119 C 0 0 0 0 0 0 - 95.9690 53.8069 267.7995 O 0 0 0 0 0 0 - 96.3470 55.0729 268.3310 C 0 0 0 0 0 0 - 97.3096 55.5398 267.5396 F 0 0 0 0 0 0 - 95.3611 55.9453 268.3259 F 0 0 0 0 0 0 - 96.7836 54.9621 269.5556 F 0 0 0 0 0 0 - 92.2832 46.3844 266.0477 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2070 50.2776 267.4316 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4740 48.1497 268.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7752 45.9403 267.0447 H 0 0 0 0 0 0 - 91.9978 51.0151 269.7584 H 0 0 0 0 0 0 - 92.5604 53.1755 270.8094 H 0 0 0 0 0 0 - 94.4210 54.4921 269.9893 H 0 0 0 0 0 0 - 95.2451 51.5271 266.9975 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5686 48.5877 266.8693 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4091 47.5207 263.9742 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2678 45.3844 262.3197 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9024 45.6345 264.3838 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8428 45.5077 268.9515 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3884 45.9738 268.1659 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3746 44.6716 267.4801 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 33 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 17 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 36 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 28 1 0 0 0 - 16 40 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 41 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 24 27 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 31 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 -M END -> -41 - -> -3.844 - -$$$$ -29 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 55 0 0 1 0 999 V2000 - 90.2429 48.1499 266.3259 N 0 0 0 0 0 0 - 91.5915 48.3463 266.6440 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9574 49.5395 267.2559 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2671 49.7858 267.6847 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2480 48.7609 267.5164 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8706 47.5246 266.9023 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5420 47.3500 266.4404 C 0 0 0 0 0 0 - 93.5621 51.0725 268.3476 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5377 51.9183 267.8084 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8189 53.1557 268.3917 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1002 53.5562 269.5191 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1598 52.6544 270.0934 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8672 51.4224 269.5078 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1039 54.7259 270.3250 C 0 0 0 0 0 0 - 93.3196 54.4659 271.4136 C 0 0 0 0 0 0 - 92.6997 53.2477 271.2657 N 0 0 0 0 0 0 - 91.7777 52.6682 272.2304 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7782 46.5125 266.7757 N 0 0 0 0 0 0 - 96.0421 46.7292 267.2110 C 0 0 0 0 0 0 - 96.4257 47.9449 267.7634 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5326 48.9464 267.9520 N 0 0 0 0 0 0 - 89.6492 47.3982 265.3040 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4421 46.7054 265.5047 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8175 46.0683 264.4281 C 0 0 0 0 0 0 - 88.3808 46.1261 263.1569 C 0 0 0 0 0 0 - 89.5836 46.7997 262.9557 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2205 47.4179 264.0292 C 0 0 0 0 0 0 - 87.7197 46.6216 267.1428 S 0 0 0 0 0 0 - 88.7306 45.3939 268.1466 C 0 0 0 0 0 0 - 87.9054 47.9440 267.7429 O 0 0 0 0 0 0 - 86.3737 46.0712 266.9700 O 0 0 0 0 0 0 - 89.5840 48.5333 266.9901 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2097 50.3066 267.4086 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2450 46.4152 265.9897 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0846 51.6072 266.9221 H 0 0 0 0 0 0 - 95.5694 53.7889 267.9491 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1532 50.7460 269.9468 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7104 55.6146 270.1889 H 0 0 0 0 0 0 - 93.1476 55.0537 272.3082 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2250 51.7647 272.6332 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8371 52.4249 271.7437 H 0 0 0 0 0 0 - 91.6020 53.3826 273.0374 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7605 45.9327 267.0668 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4448 48.1466 268.0543 H 0 0 0 0 0 0 - 86.8897 45.5275 264.5487 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8747 45.6506 262.3311 H 0 0 0 0 0 0 - 90.0062 46.8648 261.9658 H 0 0 0 0 0 0 - 91.1366 47.9651 263.8709 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2859 45.3378 269.1377 H 0 0 0 0 0 0 - 89.7578 45.7535 268.2181 H 0 0 0 0 0 0 - 88.7027 44.4150 267.6714 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 7 2 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 21 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 18 2 0 0 0 - 7 34 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 17 41 1 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 43 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 30 2 0 0 0 - 28 31 2 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 -M END -> -29 - -> -0.085 - -$$$$ -54 - 3D - Structure written by MMmdl. - 56 60 0 0 1 0 999 V2000 - 91.6126 48.3353 266.6703 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9733 49.5324 267.2808 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2894 49.7956 267.6797 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5692 47.3436 266.4692 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8975 47.5406 266.9051 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2749 48.7798 267.5080 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5631 48.9638 267.9368 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4503 47.9554 267.7480 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0641 46.7442 267.1890 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7980 46.5299 266.7611 N 0 0 0 0 0 0 - 90.2745 48.1250 266.3159 N 0 0 0 0 0 0 - 93.6036 51.0937 268.3225 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5719 51.9443 267.7904 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8678 53.1797 268.3665 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9154 51.4322 269.4867 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2133 52.6617 270.0729 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1579 53.5698 269.5118 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1541 54.7093 270.3309 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2816 54.4947 271.3567 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7302 53.2407 271.2278 N 0 0 0 0 0 0 - 91.7687 52.6196 272.1281 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6695 53.3551 273.4819 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4002 52.4193 271.3856 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7164 47.3465 265.2896 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4207 47.1272 264.0986 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9174 46.4367 263.0451 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6611 45.9399 263.1652 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8879 46.0951 264.3148 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4239 46.8032 265.3975 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4822 46.8958 266.9257 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1360 46.3755 266.6687 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6578 48.2428 267.4781 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3798 45.6764 268.0436 C 0 0 0 0 0 0 - 91.2145 50.2854 267.4442 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2845 46.3951 266.0360 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4713 48.1452 268.0452 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7707 45.9444 267.0243 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5780 48.6109 266.8719 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1002 51.6545 266.8958 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6157 53.8276 267.9300 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1877 50.7543 269.9089 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7529 55.6243 270.2202 H 0 0 0 0 0 0 - 93.0161 55.0955 272.1922 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1536 51.6237 272.3554 H 0 0 0 0 0 0 - 92.5476 53.6471 274.0500 H 0 0 0 0 0 0 - 91.1124 52.7122 274.1928 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2885 54.3558 273.2473 H 0 0 0 0 0 0 - 90.5061 51.8838 270.4532 H 0 0 0 0 0 0 - 89.8247 53.2499 271.0095 H 0 0 0 0 0 0 - 89.6958 51.8977 272.0227 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4171 47.5177 263.9750 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2766 45.3843 262.3234 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9020 45.6504 264.3737 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8636 45.6303 269.0016 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4070 46.0138 268.1769 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3633 44.6962 267.5702 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 34 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 12 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 11 24 1 0 0 0 - 11 38 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 17 2 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 41 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 42 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 43 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 21 44 1 0 0 0 - 22 45 1 0 0 0 - 22 46 1 0 0 0 - 22 47 1 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 23 49 1 0 0 0 - 23 50 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 29 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 51 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 52 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 53 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 32 2 0 0 0 - 30 33 1 0 0 0 - 33 54 1 0 0 0 - 33 55 1 0 0 0 - 33 56 1 0 0 0 -M END -> -54 - -> -1.01 - -$$$$ -47 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 52 0 0 1 0 999 V2000 - 91.6083 48.3334 266.6744 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9770 49.5235 267.2704 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2888 49.7910 267.6682 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5616 47.3282 266.4823 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8964 47.5326 266.9181 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2747 48.7648 267.5031 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5582 48.9607 267.9334 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4450 47.9497 267.7524 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0650 46.7377 267.1987 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7919 46.5129 266.7751 N 0 0 0 0 0 0 - 90.2641 48.1146 266.3110 N 0 0 0 0 0 0 - 93.6036 51.0836 268.3078 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5822 51.9426 267.7946 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8311 53.1648 268.4135 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9139 51.4502 269.4609 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1683 52.6744 270.0993 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1199 53.5419 269.5356 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7151 47.3380 265.2859 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4155 47.1252 264.0962 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9070 46.4429 263.0387 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6553 45.9399 263.1634 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8846 46.0881 264.3216 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4235 46.7973 265.3979 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4819 46.9001 266.9260 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1337 46.3858 266.6708 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6636 48.2432 267.4756 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3745 45.6750 268.0367 C 0 0 0 0 0 0 - 94.3537 54.9171 270.1798 C 0 0 0 0 0 0 - 93.3263 55.3509 271.2282 C 0 0 0 0 0 0 - 91.2153 50.2843 267.4284 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2808 46.3800 266.0508 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4713 48.1443 268.0472 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7709 45.9398 267.0374 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5797 48.5996 266.8736 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1217 51.6636 266.9061 H 0 0 0 0 0 0 - 95.5765 53.8258 267.9781 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1686 50.7946 269.8997 H 0 0 0 0 0 0 - 92.6234 52.9039 270.9908 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4081 47.5271 263.9663 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2685 45.3871 262.3178 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9030 45.6439 264.3753 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8677 45.6377 269.0039 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4074 46.0025 268.1649 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3453 44.6912 267.5702 H 0 0 0 0 0 0 - 94.5106 55.6469 269.3723 H 0 0 0 0 0 0 - 95.2617 54.9789 270.8007 H 0 0 0 0 0 0 - 93.6635 56.3169 271.6265 H 0 0 0 0 0 0 - 93.3324 54.6666 272.0834 H 0 0 0 0 0 0 - 92.3099 55.4448 270.8648 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 12 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 11 18 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 17 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 28 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 24 27 1 0 0 0 - 27 42 1 0 0 0 - 27 43 1 0 0 0 - 27 44 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 -M END -> -47 - -> -0.779 - -$$$$ -26 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - 92.5604 47.3400 266.4645 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6033 48.3329 266.6623 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9663 49.5284 267.2832 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2809 49.8044 267.6816 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8899 47.5440 266.9028 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2681 48.7863 267.5062 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5594 48.9658 267.9286 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4477 47.9579 267.7347 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0603 46.7470 267.1752 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7960 46.5358 266.7511 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5929 51.1046 268.3258 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2555 48.1502 266.3103 N 0 0 0 0 0 0 - 94.5796 51.9524 267.7970 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8788 53.1903 268.3744 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8914 51.4478 269.4799 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2168 52.6679 270.0678 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1655 53.5690 269.5124 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1737 54.7307 270.3540 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2736 54.4902 271.3621 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7449 53.2407 271.2292 N 0 0 0 0 0 0 - 91.8199 52.6411 272.1840 C 0 0 0 0 0 0 - 89.6226 47.3651 265.3242 C 0 0 0 0 0 0 - 88.2891 46.8965 265.4752 C 0 0 0 0 0 0 - 87.7104 46.1731 264.4151 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4109 45.9091 263.2455 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7142 46.3643 263.1048 C 0 0 0 0 0 0 - 90.3116 47.0903 264.1333 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4576 47.1549 266.7210 C 0 0 0 0 0 0 - 87.7195 48.0491 267.5179 O 0 0 0 0 0 0 - 86.4083 46.3619 266.9362 N 0 0 0 0 0 0 - 92.2719 46.3892 266.0366 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2102 50.2834 267.4508 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4642 48.1404 268.0445 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7697 45.9473 267.0116 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5894 48.6322 266.9039 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1034 51.6528 266.8935 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6282 53.8303 267.9247 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1307 50.7998 269.9141 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7826 55.6082 270.2355 H 0 0 0 0 0 0 - 92.9910 55.0873 272.2131 H 0 0 0 0 0 0 - 91.6021 53.3023 273.0329 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2499 51.7252 272.5857 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8831 52.3860 271.6903 H 0 0 0 0 0 0 - 86.6936 45.8078 264.4722 H 0 0 0 0 0 0 - 87.9337 45.3443 262.4572 H 0 0 0 0 0 0 - 90.2509 46.1545 262.1925 H 0 0 0 0 0 0 - 91.3188 47.4451 263.9869 H 0 0 0 0 0 0 - 85.8413 46.4915 267.7584 H 0 0 0 0 0 0 - 86.1993 45.6153 266.2911 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 4 11 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 11 13 2 0 0 0 - 11 15 1 0 0 0 - 12 22 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 17 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 30 1 0 0 0 - 30 48 1 0 0 0 - 30 49 1 0 0 0 -M END -> -26 - -> -0.19 - -$$$$ -55 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - 91.6118 48.3366 266.6739 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9698 49.5336 267.2864 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2850 49.8006 267.6832 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5678 47.3462 266.4685 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8944 47.5432 266.9034 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2719 48.7828 267.5077 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5609 48.9661 267.9314 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4476 47.9576 267.7393 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0612 46.7472 267.1782 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7955 46.5340 266.7522 N 0 0 0 0 0 0 - 90.2745 48.1296 266.3175 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5938 51.0998 268.3264 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5697 51.9459 267.7912 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8659 53.1774 268.3682 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8971 51.4508 269.4842 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2083 52.6701 270.0801 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1610 53.5698 269.5192 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1614 54.7332 270.3565 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2770 54.4957 271.3795 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7328 53.2443 271.2449 N 0 0 0 0 0 0 - 91.8103 52.6326 272.1899 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7167 47.3494 265.2904 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4217 47.1254 264.0999 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9191 46.4337 263.0465 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6626 45.9393 263.1648 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8878 46.0972 264.3127 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4240 46.8050 265.3972 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4806 46.8913 266.9254 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1391 46.3662 266.6675 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6492 48.2412 267.4790 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3838 45.6765 268.0468 C 0 0 0 0 0 0 - 95.8038 53.9727 267.8010 F 0 0 0 0 0 0 - 91.2097 50.2861 267.4498 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2873 46.4001 266.0276 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4668 48.1419 268.0435 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7689 45.9467 267.0182 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5852 48.6214 266.8768 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1005 51.6570 266.8939 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1487 50.7992 269.9119 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7728 55.6120 270.2423 H 0 0 0 0 0 0 - 92.9987 55.1122 272.2199 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8758 52.3918 271.6861 H 0 0 0 0 0 0 - 91.6098 53.2996 273.0302 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2492 51.7136 272.5787 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4224 47.5032 263.9725 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2774 45.3841 262.3232 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9004 45.6554 264.3643 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8695 45.6352 269.0056 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4113 46.0126 268.1793 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3656 44.6930 267.5796 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 33 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 12 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 36 1 0 0 0 - 11 22 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 17 2 0 0 0 - 14 32 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 21 44 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 30 2 0 0 0 - 28 31 1 0 0 0 - 31 48 1 0 0 0 - 31 49 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 -M END -> -55 - -> -0.016 - -$$$$ -20 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - 92.5739 47.3336 266.4565 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6324 48.3172 266.6741 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9632 49.5168 267.2998 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2765 49.7975 267.6776 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8958 47.5362 266.9051 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2730 48.7873 267.5121 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5665 48.9603 267.9405 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4572 47.9542 267.7463 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0617 46.7355 267.2061 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8014 46.5336 266.7720 N 0 0 0 0 0 0 - 90.2859 48.1283 266.3232 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7235 47.3483 265.2931 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4123 47.1279 264.0929 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9113 46.4423 263.0351 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6625 45.9485 263.1520 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8836 46.0962 264.3010 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4186 46.7903 265.3979 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4853 46.8968 266.9278 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1266 46.3735 266.6676 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6689 48.2339 267.4731 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3809 45.6744 268.0584 C 0 0 0 0 0 0 - 93.5881 51.1129 268.3403 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8836 51.4776 269.4978 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2031 52.6955 270.1335 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1885 53.5265 269.6279 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8277 53.1962 268.4343 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5514 51.9702 267.8248 C 0 0 0 0 0 0 - 95.7310 53.9715 267.7910 O 0 0 0 0 0 0 - 96.0567 55.2652 268.3379 C 0 0 0 0 0 0 - 92.2595 46.3832 266.0442 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2173 50.2889 267.4385 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4708 48.1510 268.0435 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7711 45.9434 267.0164 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5459 48.5927 266.8588 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4056 47.5266 263.9863 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2721 45.3859 262.3253 H 0 0 0 0 0 0 - 86.8893 45.6433 264.3947 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8667 45.6399 269.0059 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4103 46.0058 268.1533 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3460 44.7025 267.5724 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1602 50.8128 269.9492 H 0 0 0 0 0 0 - 92.6820 52.9469 271.0560 H 0 0 0 0 0 0 - 94.3579 54.4739 270.1171 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0346 51.7174 266.8952 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7832 55.7693 267.6972 H 0 0 0 0 0 0 - 96.5109 55.1557 269.3242 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1871 55.9195 268.4266 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 11 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 37 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 28 1 0 0 0 - 27 44 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 45 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 -M END -> -20 - -> -0.572 - -$$$$ -57 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - 93.2863 49.8046 267.6850 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5683 47.3483 266.4663 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6135 48.3386 266.6756 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9715 49.5355 267.2896 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8941 47.5445 266.9029 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2723 48.7844 267.5084 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5616 48.9663 267.9305 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4473 47.9576 267.7370 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0606 46.7470 267.1769 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7945 46.5353 266.7507 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5945 51.1040 268.3281 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5736 51.9510 267.7909 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8742 53.1838 268.3688 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8962 51.4518 269.4841 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2751 48.1321 266.3186 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7173 47.3514 265.2910 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4223 47.1244 264.1010 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9202 46.4330 263.0469 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6631 45.9395 263.1640 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8875 46.0982 264.3114 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4234 46.8064 265.3954 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4813 46.8916 266.9240 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1376 46.3636 266.6658 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6482 48.2377 267.4791 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3853 45.6716 268.0379 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2144 52.6711 270.0767 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1671 53.5709 269.5134 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1722 54.7295 270.3422 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2836 54.5053 271.3550 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7499 53.2450 271.2433 N 0 0 0 0 0 0 - 91.7998 52.6492 272.1755 C 0 0 0 0 0 0 - 91.8677 53.3117 273.3272 F 0 0 0 0 0 0 - 90.5872 52.7234 271.6286 F 0 0 0 0 0 0 - 92.2862 46.4014 266.0263 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2115 50.2889 267.4523 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4660 48.1411 268.0432 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7683 45.9468 267.0162 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0991 51.6553 266.8907 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6230 53.8288 267.9270 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1446 50.8014 269.9124 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5853 48.6236 266.8775 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4232 47.5010 263.9727 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2775 45.3841 262.3232 H 0 0 0 0 0 0 - 86.8996 45.6560 264.3634 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8728 45.6348 268.9986 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4116 46.0106 268.1755 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3662 44.6870 267.5758 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7837 55.6164 270.2260 H 0 0 0 0 0 0 - 92.9998 55.1255 272.1927 H 0 0 0 0 0 0 - 92.0494 51.6144 272.3981 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 34 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 15 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 27 2 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 26 2 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 41 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 43 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 25 47 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 33 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 -M END -> -57 - -> -0.021 - -$$$$ -42 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - 93.2875 49.7838 267.6770 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5724 47.3125 266.4966 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6143 48.3091 266.6745 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9734 49.5126 267.2693 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8983 47.5150 266.9402 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2747 48.7631 267.5237 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5632 48.9601 267.9551 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4531 47.9523 267.7789 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0721 46.7327 267.2263 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8009 46.4988 266.8238 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5911 51.0854 268.3137 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8469 51.5645 269.4014 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1400 52.7949 269.9867 C 0 0 0 0 0 0 - 94.6339 51.8738 267.8239 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2801 48.1021 266.3129 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7132 47.3295 265.2851 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4095 47.1212 264.0895 C 0 0 0 0 0 0 - 89.8943 46.4354 263.0351 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6421 45.9295 263.1649 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8836 46.0722 264.3230 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4211 46.7936 265.3951 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4795 46.9124 266.9240 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1188 46.4328 266.6652 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6945 48.2548 267.4760 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3552 45.6686 268.0255 C 0 0 0 0 0 0 - 94.9298 53.1047 268.3962 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2024 53.5588 269.5010 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0833 55.7215 268.3802 C 0 0 0 0 0 0 - 96.1817 54.0755 267.6506 S 0 0 0 0 0 0 - 92.2931 46.3625 266.0674 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2162 50.2704 267.4061 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4741 48.1517 268.0664 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7829 45.9289 267.0901 H 0 0 0 0 0 0 - 92.0296 50.9757 269.8043 H 0 0 0 0 0 0 - 92.5765 53.1471 270.8375 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1927 51.5424 266.9621 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5863 48.5720 266.8822 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4058 47.5156 263.9586 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2563 45.3792 262.3224 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9089 45.6181 264.3929 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8313 45.6086 268.9799 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3842 45.9944 268.1686 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3348 44.7037 267.5293 H 0 0 0 0 0 0 - 94.4208 54.5069 269.9694 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7764 56.3647 267.8329 H 0 0 0 0 0 0 - 96.3260 55.6602 269.4465 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0813 56.1420 268.2849 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 30 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 15 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 27 2 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 26 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 29 1 0 0 0 - 27 44 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 45 1 0 0 0 - 28 46 1 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 -M END -> -42 - -> -0.622 - -$$$$ -35 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - 91.6086 48.3265 266.6693 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9732 49.5289 267.2740 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2849 49.7831 267.6765 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2756 48.7716 267.5148 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8941 47.5269 266.9163 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5664 47.3356 266.4869 C 0 0 0 0 0 0 - 93.5944 51.0830 268.3283 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9019 51.4420 269.4800 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1886 52.6739 270.0653 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1369 53.5702 269.4983 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8396 53.1647 268.3583 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5632 51.9211 267.7840 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8011 46.5237 266.7692 N 0 0 0 0 0 0 - 96.0655 46.7425 267.1959 C 0 0 0 0 0 0 - 96.4524 47.9539 267.7595 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5606 48.9571 267.9440 N 0 0 0 0 0 0 - 90.2742 48.1229 266.3119 N 0 0 0 0 0 0 - 94.1551 54.7196 270.3381 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2925 54.4888 271.3906 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7216 53.2581 271.2260 N 0 0 0 0 0 0 - 91.8085 52.6518 272.1779 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7147 47.3400 265.2872 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4272 46.7998 265.4019 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8901 46.0853 264.3199 C 0 0 0 0 0 0 - 88.6593 45.9358 263.1678 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9101 46.4426 263.0385 N 0 0 0 0 0 0 - 90.4183 47.1199 264.0947 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4704 46.8899 266.9209 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1418 46.3963 266.6721 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6670 48.2589 267.4823 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3758 45.6752 268.0371 C 0 0 0 0 0 0 - 91.2142 50.2817 267.4378 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2918 46.3918 266.0429 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1734 50.7821 269.9163 H 0 0 0 0 0 0 - 95.5918 53.7986 267.9326 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1026 51.6249 266.8951 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7742 45.9445 267.0407 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4746 48.1476 268.0493 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5809 48.6035 266.8760 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7866 55.6032 270.1906 H 0 0 0 0 0 0 - 93.0402 55.0710 272.2767 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8575 52.4402 271.6717 H 0 0 0 0 0 0 - 91.6483 53.3577 272.9998 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2609 51.7273 272.5708 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9053 45.6446 264.3755 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2754 45.3851 262.3251 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4087 47.5286 263.9693 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8581 45.6244 268.9917 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3988 46.0130 268.1794 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3595 44.6958 267.5571 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 17 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 7 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 13 1 0 0 0 - 6 33 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 34 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 20 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 21 44 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 2 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 30 2 0 0 0 - 28 31 1 0 0 0 - 31 48 1 0 0 0 - 31 49 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 -M END -> -35 - -> -0.037 - -$$$$ -44 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - 93.2882 49.7977 267.6708 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5637 47.3335 266.4846 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6081 48.3294 266.6725 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9709 49.5300 267.2741 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8914 47.5333 266.9162 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2731 48.7764 267.5081 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5591 48.9636 267.9347 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4502 47.9543 267.7521 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0585 46.7408 267.1942 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7973 46.5201 266.7745 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5906 51.0998 268.3213 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5720 51.9589 267.8003 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8352 53.1750 268.4354 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1267 53.5136 269.5887 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1672 52.6613 270.1091 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8955 51.4622 269.4718 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2709 48.1207 266.3138 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7141 47.3423 265.2863 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4157 47.1268 264.0944 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9080 46.4425 263.0386 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6564 45.9405 263.1630 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8865 46.0900 264.3151 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4211 46.7995 265.3973 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4806 46.8874 266.9241 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1316 46.3840 266.6643 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6664 48.2322 267.4864 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3761 45.6411 268.0196 C 0 0 0 0 0 0 - 94.4648 55.1135 270.5550 Br 0 0 0 0 0 0 - 92.2813 46.3855 266.0517 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2136 50.2850 267.4304 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4700 48.1448 268.0461 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7717 45.9421 267.0347 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1086 51.6832 266.9117 H 0 0 0 0 0 0 - 95.5873 53.8378 268.0181 H 0 0 0 0 0 0 - 92.6500 52.9364 271.0211 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1555 50.8050 269.8997 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5786 48.6031 266.8763 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4089 47.5246 263.9655 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2700 45.3879 262.3187 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9013 45.6455 264.3724 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8571 45.5438 268.9719 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4007 45.9839 268.1650 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3665 44.6742 267.5195 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 17 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 36 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 24 27 1 0 0 0 - 27 41 1 0 0 0 - 27 42 1 0 0 0 - 27 43 1 0 0 0 -M END -> -44 - -> -0.051 - -$$$$ -63 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 48 0 0 1 0 999 V2000 - 92.5635 47.3408 266.4808 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6075 48.3335 266.6743 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9695 49.5319 267.2848 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2834 49.7950 267.6878 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8922 47.5381 266.9103 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2715 48.7791 267.5122 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5600 48.9654 267.9352 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4479 47.9572 267.7463 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0599 46.7469 267.1846 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7947 46.5302 266.7602 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5954 51.0976 268.3318 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2720 48.1244 266.3145 N 0 0 0 0 0 0 - 94.5752 51.9450 267.7933 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8768 53.1820 268.3621 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9001 51.4735 269.4880 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1999 52.6985 270.0791 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1534 53.5481 269.5013 C 0 0 0 0 0 0 - 94.3301 54.7275 270.1391 N 0 0 0 0 0 0 - 93.3222 54.6345 271.4618 S 0 0 0 0 0 0 - 92.6192 53.1453 271.2154 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7145 47.3441 265.2879 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4225 46.8014 265.3965 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8867 46.0933 264.3141 C 0 0 0 0 0 0 - 88.6573 45.9409 263.1630 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9107 46.4413 263.0402 N 0 0 0 0 0 0 - 90.4172 47.1261 264.0958 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4804 46.8886 266.9234 S 0 0 0 0 0 0 - 88.3814 45.6524 268.0226 C 0 0 0 0 0 0 - 86.1349 46.3742 266.6655 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6601 48.2354 267.4816 O 0 0 0 0 0 0 - 92.2828 46.3935 266.0450 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2085 50.2841 267.4433 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4692 48.1447 268.0448 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7697 45.9473 267.0232 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5800 48.6088 266.8767 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1051 51.6472 266.8997 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6283 53.8309 267.9272 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1531 50.8275 269.9218 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9004 45.6524 264.3687 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2720 45.3899 262.3191 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4083 47.5277 263.9633 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8668 45.5727 268.9784 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4077 45.9918 268.1612 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3602 44.6759 267.5447 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 4 11 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 11 13 1 0 0 0 - 11 15 2 0 0 0 - 12 21 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 17 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 38 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 26 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 26 41 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 29 2 0 0 0 - 27 30 2 0 0 0 - 28 42 1 0 0 0 - 28 43 1 0 0 0 - 28 44 1 0 0 0 -M END -> -63 - -> -0.53 - -$$$$ -69 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - 92.5766 47.3309 266.4823 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6148 48.3287 266.6699 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9741 49.5270 267.2715 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2916 49.7960 267.6866 C 0 0 0 0 0 0 - 93.9014 47.5331 266.9271 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2765 48.7751 267.5225 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5666 48.9639 267.9549 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4588 47.9530 267.7690 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0739 46.7411 267.2208 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8067 46.5203 266.7924 N 0 0 0 0 0 0 - 93.6005 51.1028 268.3248 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2860 48.1138 266.3106 N 0 0 0 0 0 0 - 94.5623 51.9414 267.7983 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8762 53.1779 268.3684 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9054 51.4651 269.4885 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1902 52.6828 270.1257 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1684 53.5476 269.5283 C 0 0 0 0 0 0 - 94.3714 55.0131 270.4720 S 0 0 0 0 0 0 - 93.2135 54.4474 271.6124 C 0 0 0 0 0 0 - 92.6673 53.2239 271.3361 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6712 52.4815 272.2020 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7166 47.3368 265.2886 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4227 46.7955 265.3959 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8901 46.0818 264.3157 C 0 0 0 0 0 0 - 88.6567 45.9315 263.1642 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9099 46.4368 263.0398 N 0 0 0 0 0 0 - 90.4190 47.1179 264.0901 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4814 46.9006 266.9167 S 0 0 0 0 0 0 - 88.3689 45.6582 268.0136 C 0 0 0 0 0 0 - 86.1255 46.4116 266.6625 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6845 48.2469 267.4796 O 0 0 0 0 0 0 - 92.2862 46.3816 266.0648 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2203 50.2856 267.4256 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4800 48.1539 268.0556 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7815 45.9404 267.0540 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5700 48.5859 266.8683 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1014 51.6480 266.9015 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6230 53.8125 267.9390 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1852 50.8006 269.9165 H 0 0 0 0 0 0 - 93.0079 55.0675 272.4571 H 0 0 0 0 0 0 - 90.7466 52.2293 271.6900 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4133 53.0763 273.0778 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1070 51.5533 272.5792 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9017 45.6336 264.3868 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2688 45.3809 262.3227 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4028 47.5361 263.9698 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8476 45.5993 268.9654 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3932 45.9992 268.1524 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3540 44.6911 267.5145 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 4 11 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 34 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 11 13 2 0 0 0 - 11 15 1 0 0 0 - 12 22 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 17 2 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 30 2 0 0 0 - 28 31 2 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 -M END -> -69 - -> -0.014 - -$$$$ -52 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - 93.3114 49.8130 267.6412 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5675 47.3461 266.4704 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6140 48.3391 266.6758 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9831 49.5402 267.2762 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8959 47.5397 266.9028 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2808 48.7816 267.4948 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5663 48.9631 267.9272 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4496 47.9536 267.7395 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0619 46.7444 267.1779 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7952 46.5297 266.7538 N 0 0 0 0 0 0 - 90.2754 48.1313 266.3198 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7170 47.3507 265.2914 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4214 47.1275 264.1002 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9190 46.4350 263.0469 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6628 45.9396 263.1653 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8883 46.0973 264.3134 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4249 46.8053 265.3978 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4805 46.8913 266.9255 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1396 46.3665 266.6677 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6492 48.2417 267.4792 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3838 45.6765 268.0465 C 0 0 0 0 0 0 - 93.6501 51.1190 268.2585 C 0 0 0 0 0 0 - 94.6211 51.9736 267.7509 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8963 53.2015 268.3556 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9588 51.4516 269.4041 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2230 52.6641 270.0467 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1745 53.5756 269.5049 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1617 54.7286 270.3490 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2720 54.4750 271.3665 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7072 53.2287 271.2146 N 0 0 0 0 0 0 - 91.8097 52.6164 272.2119 C 0 0 0 0 0 0 - 90.7891 51.6506 271.6176 C 0 0 0 0 0 0 - 92.2865 46.4011 266.0282 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2205 50.2896 267.4479 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4683 48.1407 268.0439 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7697 45.9448 267.0181 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5855 48.6227 266.8783 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4226 47.5040 263.9727 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2778 45.3844 262.3233 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9011 45.6556 264.3639 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8696 45.6352 269.0056 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4113 46.0126 268.1796 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3656 44.6930 267.5796 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1401 51.6698 266.8558 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6429 53.8541 267.9250 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2336 50.7237 269.7011 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7721 55.6146 270.2457 H 0 0 0 0 0 0 - 93.0024 55.0952 272.2130 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2696 53.4001 272.7426 H 0 0 0 0 0 0 - 92.4113 52.0715 272.9378 H 0 0 0 0 0 0 - 90.1336 51.1695 272.3208 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2619 50.7266 271.3302 H 0 0 0 0 0 0 - 90.2101 52.0773 270.7922 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 33 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 11 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 40 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 24 27 2 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 49 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 - 32 51 1 0 0 0 - 32 52 1 0 0 0 - 32 53 1 0 0 0 -M END -> -52 - -> -0.024 - -$$$$ -19 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 49 0 0 1 0 999 V2000 - 91.5919 48.3113 266.7137 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9737 49.5382 267.2740 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2784 49.7908 267.6730 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2680 48.7772 267.5133 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8795 47.5270 266.9201 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5376 47.3212 266.5200 C 0 0 0 0 0 0 - 93.5872 51.0945 268.3284 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9105 51.4581 269.4749 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2075 52.6695 270.0688 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1599 53.5455 269.4884 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8806 53.1831 268.3564 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5635 51.9339 267.7910 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7950 46.5293 266.7603 N 0 0 0 0 0 0 - 96.0527 46.7456 267.1808 C 0 0 0 0 0 0 - 96.4462 47.9586 267.7463 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5547 48.9614 267.9316 N 0 0 0 0 0 0 - 90.2589 48.1474 266.3192 N 0 0 0 0 0 0 - 94.1772 54.7621 270.3164 C 0 0 0 0 0 0 - 93.3120 54.5077 271.3434 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7370 53.2548 271.2326 N 0 0 0 0 0 0 - 91.8268 52.6667 272.1752 C 0 0 0 0 0 0 - 89.6772 47.3563 265.3181 C 0 0 0 0 0 0 - 90.3332 47.0353 264.1264 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7129 46.1911 263.1996 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4539 45.6752 263.4709 C 0 0 0 0 0 0 - 87.7916 45.9887 264.6598 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4119 46.8267 265.5812 C 0 0 0 0 0 0 - 91.2132 50.2928 267.4221 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2566 46.3915 266.0369 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1423 50.7879 269.9234 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6232 53.8155 267.9172 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0955 51.6431 266.8918 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7693 45.9460 267.0194 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4666 48.1445 268.0428 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5994 48.7349 266.8131 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7896 55.6124 270.1980 H 0 0 0 0 0 0 - 93.0519 55.1114 272.1894 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8903 52.4251 271.6725 H 0 0 0 0 0 0 - 91.6273 53.3426 273.0207 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2598 51.7480 272.5656 H 0 0 0 0 0 0 - 91.3238 47.4127 263.9170 H 0 0 0 0 0 0 - 90.1981 45.9412 262.2667 H 0 0 0 0 0 0 - 87.9450 45.0518 262.7518 H 0 0 0 0 0 0 - 86.8041 45.5972 264.8462 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8892 47.0596 266.4896 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 17 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 7 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 16 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 13 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 20 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 33 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 17 35 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 2 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 -M END -> -19 - -> -2.919 - -$$$$ -68 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - 92.5906 47.2900 266.3444 C 0 0 0 0 0 0 - 91.5700 48.2152 266.5159 C 0 0 0 0 0 0 - 91.8167 49.4248 267.1546 C 0 0 0 0 0 0 - 93.0889 49.7623 267.6340 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8920 47.5770 266.8285 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1480 48.8244 267.4865 C 0 0 0 0 0 0 - 95.3850 49.0832 268.0126 N 0 0 0 0 0 0 - 96.3430 48.1354 267.8658 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0897 46.9257 267.2216 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8705 46.6478 266.6904 N 0 0 0 0 0 0 - 93.2613 51.0285 268.3807 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2520 47.9338 266.1399 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7015 47.1928 265.0832 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4532 46.9549 263.9208 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9543 46.3298 262.8373 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6785 45.8812 262.8956 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8678 46.0387 264.0101 C 0 0 0 0 0 0 - 88.3733 46.7249 265.1240 C 0 0 0 0 0 0 - 87.3145 46.9352 266.5561 S 0 0 0 0 0 0 - 87.5376 48.2780 267.1026 O 0 0 0 0 0 0 - 85.9614 46.5209 266.1752 O 0 0 0 0 0 0 - 88.0033 45.6830 267.7810 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2676 51.9515 268.0760 C 0 0 0 0 0 0 - 94.4607 53.0907 268.8507 C 0 0 0 0 0 0 - 92.4286 51.2390 269.4665 C 0 0 0 0 0 0 - 92.6104 52.3297 270.2980 C 0 0 0 0 0 0 - 93.6343 53.2671 269.9747 C 0 0 0 0 0 0 - 93.6567 54.5790 271.1456 S 0 0 0 0 0 0 - 92.4470 53.7602 272.0760 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9259 52.6515 271.4883 C 0 0 0 0 0 0 - 92.0631 54.2673 273.2652 N 0 0 0 0 0 0 - 92.3935 46.3273 265.8991 H 0 0 0 0 0 0 - 90.9990 50.1186 267.2856 H 0 0 0 0 0 0 - 97.3205 48.3625 268.2827 H 0 0 0 0 0 0 - 96.8504 46.1676 267.1458 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5363 48.3371 266.7430 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4671 47.3133 263.8480 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3025 45.3523 262.0332 H 0 0 0 0 0 0 - 86.8652 45.6243 264.0193 H 0 0 0 0 0 0 - 87.4147 45.7414 268.6992 H 0 0 0 0 0 0 - 89.0405 45.9170 267.9869 H 0 0 0 0 0 0 - 87.9100 44.6873 267.3524 H 0 0 0 0 0 0 - 94.9129 51.7823 267.2254 H 0 0 0 0 0 0 - 95.2369 53.8087 268.6088 H 0 0 0 0 0 0 - 91.6707 50.5120 269.7113 H 0 0 0 0 0 0 - 91.1413 52.0603 271.9230 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2887 55.2418 273.4713 H 0 0 0 0 0 0 - 91.1958 53.9428 273.7133 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 4 11 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 34 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 11 23 2 0 0 0 - 11 25 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 38 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 39 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 21 2 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 27 2 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 31 1 0 0 0 - 30 46 1 0 0 0 - 31 47 1 0 0 0 - 31 48 1 0 0 0 -M END -> -68 - -> -0.068 - -$$$$ -33 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 49 0 0 1 0 999 V2000 - 90.2783 48.1451 266.3142 N 0 0 0 0 0 0 - 91.6169 48.3446 266.6738 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9745 49.5378 267.2907 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2869 49.8041 267.6905 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2733 48.7861 267.5115 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8958 47.5470 266.9048 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5700 47.3545 266.4704 C 0 0 0 0 0 0 - 93.5906 51.1033 268.3373 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5701 51.9485 267.7930 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8766 53.1828 268.3625 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1744 53.5766 269.5033 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2113 52.6777 270.0810 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8959 51.4563 269.4914 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1946 54.7419 270.3240 C 0 0 0 0 0 0 - 93.3205 54.5041 271.3412 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7610 53.2794 271.2415 N 0 0 0 0 0 0 - 94.7935 46.5354 266.7547 N 0 0 0 0 0 0 - 96.0594 46.7465 267.1790 C 0 0 0 0 0 0 - 96.4464 47.9594 267.7361 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5618 48.9678 267.9325 N 0 0 0 0 0 0 - 91.8513 52.7306 272.2454 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7124 47.3504 265.2983 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4077 46.8215 265.3936 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8831 46.1009 264.3157 C 0 0 0 0 0 0 - 88.6642 45.9359 263.1759 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9193 46.4305 263.0542 N 0 0 0 0 0 0 - 90.4194 47.1175 264.1115 C 0 0 0 0 0 0 - 87.5851 46.9636 266.5914 C 0 0 0 0 0 0 - 86.9354 47.0770 267.5414 N 0 0 0 0 0 0 - 89.6015 48.6327 266.8831 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2174 50.2910 267.4543 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2810 46.4076 266.0446 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0908 51.6545 266.8941 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6296 53.8262 267.9201 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1406 50.8044 269.9242 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7923 55.6373 270.2448 H 0 0 0 0 0 0 - 93.0701 55.1130 272.1869 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7637 45.9455 267.0078 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4654 48.1560 268.0273 H 0 0 0 0 0 0 - 91.7086 53.4652 273.0442 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2994 51.8408 272.6822 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8902 52.5152 271.7871 H 0 0 0 0 0 0 - 86.8922 45.6690 264.3571 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2724 45.3817 262.3429 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4167 47.4986 263.9885 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 31 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 20 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 17 1 0 0 0 - 7 32 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 2 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 - 28 29 3 0 0 0 -M END -> -33 - -> -0.491 - -$$$$ -70 - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 53 0 0 1 0 999 V2000 - 92.5684 47.3375 266.4935 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6136 48.3329 266.6765 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9733 49.5322 267.2840 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2855 49.7940 267.6992 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8953 47.5338 266.9323 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2739 48.7755 267.5320 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5614 48.9635 267.9566 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4518 47.9561 267.7687 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0633 46.7420 267.2148 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7981 46.5237 266.7912 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5930 51.0971 268.3380 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5710 51.9416 267.7904 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8596 53.1861 268.3482 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9081 51.4764 269.4972 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1896 52.7106 270.0994 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1337 53.5561 269.4819 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2615 54.7258 270.1672 O 0 0 0 0 0 0 - 93.4410 54.6109 271.2476 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7688 53.3968 271.2795 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2757 48.1225 266.3106 N 0 0 0 0 0 0 - 91.8224 52.8717 272.3311 C 0 0 0 0 0 0 - 89.7186 47.3442 265.2867 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4245 46.7994 265.3959 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8911 46.0836 264.3198 C 0 0 0 0 0 0 - 88.6587 45.9347 263.1648 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9086 46.4447 263.0371 N 0 0 0 0 0 0 - 90.4154 47.1288 264.0910 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4827 46.9058 266.9203 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1267 46.4095 266.6609 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6798 48.2451 267.4815 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3687 45.6595 268.0154 C 0 0 0 0 0 0 - 92.2904 46.3890 266.0570 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2163 50.2898 267.4341 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4746 48.1493 268.0557 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7729 45.9425 267.0563 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1085 51.6289 266.9063 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6078 53.8357 267.9219 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1810 50.8180 269.9489 H 0 0 0 0 0 0 - 93.4544 55.4578 271.9264 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5785 48.5935 266.8778 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8419 52.6483 271.9125 H 0 0 0 0 0 0 - 91.6772 53.5934 273.1357 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2075 51.9568 272.7842 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9075 45.6346 264.3807 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2723 45.3818 262.3229 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4056 47.5358 263.9631 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8495 45.6002 268.9694 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3946 45.9969 268.1579 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3540 44.6896 267.5193 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 20 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 33 1 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 4 11 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 34 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 16 2 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 30 2 0 0 0 - 28 31 1 0 0 0 - 31 47 1 0 0 0 - 31 48 1 0 0 0 - 31 49 1 0 0 0 -M END -> -70 - -> -0.028 - -$$$$ -53 - 3D - Structure written by MMmdl. - 56 60 0 0 1 0 999 V2000 - 93.3094 49.8018 267.6715 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5663 47.3465 266.4764 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6141 48.3425 266.6765 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9847 49.5423 267.2840 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8976 47.5374 266.9026 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2817 48.7776 267.4988 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5685 48.9601 267.9272 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4515 47.9520 267.7392 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0722 46.7442 267.1750 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7966 46.5286 266.7520 N 0 0 0 0 0 0 - 93.6558 51.0878 268.3201 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5958 51.9639 267.7545 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8801 53.1908 268.3506 C 0 0 0 0 0 0 - 93.0752 51.3916 269.5378 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2756 48.1331 266.3189 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7176 47.3508 265.2916 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4208 47.1280 264.0996 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9177 46.4358 263.0468 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6627 45.9387 263.1665 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8896 46.0967 264.3155 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4252 46.8051 265.3987 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4830 46.8956 266.9271 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1384 46.3667 266.6674 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6481 48.2411 267.4789 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3835 45.6760 268.0451 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2883 52.6417 270.1079 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1853 53.5555 269.5070 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1740 54.7256 270.3504 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2801 54.4760 271.3702 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7561 53.2209 271.2520 N 0 0 0 0 0 0 - 91.8097 52.5822 272.1667 C 0 0 0 0 0 0 - 90.3901 52.3401 271.5852 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2277 52.2740 270.0518 C 0 0 0 0 0 0 - 92.2891 46.4042 266.0275 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2251 50.2934 267.4554 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4710 48.1402 268.0447 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7729 45.9434 267.0197 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1080 51.6781 266.8507 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6264 53.8508 267.9180 H 0 0 0 0 0 0 - 92.4379 50.6737 270.0168 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5894 48.6242 266.8810 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4232 47.5028 263.9711 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2782 45.3848 262.3238 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9026 45.6563 264.3619 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8704 45.6353 269.0044 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4106 46.0123 268.1808 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3655 44.6919 267.5793 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7587 55.6055 270.2364 H 0 0 0 0 0 0 - 92.9922 55.1042 272.2065 H 0 0 0 0 0 0 - 91.7407 53.1842 273.0797 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2553 51.6380 272.4817 H 0 0 0 0 0 0 - 89.7237 53.1198 271.9416 H 0 0 0 0 0 0 - 90.0417 51.4211 272.0281 H 0 0 0 0 0 0 - 89.1959 52.1688 269.7495 H 0 0 0 0 0 0 - 90.6886 51.4066 269.6298 H 0 0 0 0 0 0 - 90.6529 53.1482 269.5728 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 34 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 15 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 36 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 37 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 27 2 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 26 2 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 41 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 43 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 25 47 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 - 31 51 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 52 1 0 0 0 - 32 53 1 0 0 0 - 33 54 1 0 0 0 - 33 55 1 0 0 0 - 33 56 1 0 0 0 -M END -> -53 - -> -7.425 - -$$$$ -64 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 49 0 0 1 0 999 V2000 - 92.5649 47.3357 266.4780 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6096 48.3267 266.6685 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9706 49.5255 267.2755 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2850 49.7849 267.6888 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8962 47.5315 266.9149 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2730 48.7725 267.5157 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5623 48.9611 267.9440 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4530 47.9549 267.7607 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0604 46.7398 267.2043 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8009 46.5220 266.7799 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5830 51.0799 268.3394 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5627 51.9319 267.8062 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8597 53.1715 268.3735 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8765 51.4421 269.4881 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1675 52.6783 270.0741 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1347 53.5526 269.5062 C 0 0 0 0 0 0 - 94.3115 54.7222 270.1528 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5858 54.7561 271.2381 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5123 53.4088 271.5255 S 0 0 0 0 0 0 - 90.2698 48.1142 266.3113 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7130 47.3380 265.2849 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4197 46.7984 265.3938 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8833 46.0898 264.3143 C 0 0 0 0 0 0 - 88.6520 45.9437 263.1599 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9057 46.4470 263.0359 N 0 0 0 0 0 0 - 90.4150 47.1276 264.0943 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4814 46.8888 266.9221 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1277 46.3901 266.6642 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6791 48.2295 267.4834 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3741 45.6337 268.0075 C 0 0 0 0 0 0 - 92.2772 46.3870 266.0471 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2167 50.2829 267.4282 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4752 48.1511 268.0450 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7724 45.9411 267.0337 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0979 51.6435 266.9149 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6126 53.8190 267.9423 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1404 50.7736 269.9238 H 0 0 0 0 0 0 - 93.6220 55.5864 271.9137 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5638 48.5895 266.8627 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9016 45.6396 264.3864 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2700 45.3840 262.3199 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4114 47.5220 263.9807 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8479 45.5178 268.9549 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3964 45.9846 268.1559 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3682 44.6731 267.4983 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 20 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 4 11 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 33 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 34 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 16 2 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 26 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 26 42 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 2 0 0 0 - 27 30 1 0 0 0 - 30 43 1 0 0 0 - 30 44 1 0 0 0 - 30 45 1 0 0 0 -M END -> -64 - -> -0.124 - -$$$$ -39 - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - 93.2802 49.7985 267.6875 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5744 47.3376 266.4723 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6199 48.3263 266.6804 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9714 49.5220 267.2872 C 0 0 0 0 0 0 - 93.9019 47.5331 266.9251 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2659 48.7775 267.5222 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5666 48.9595 267.9453 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4488 47.9549 267.7510 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0765 46.7394 267.2041 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7993 46.5295 266.7714 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5961 51.1154 268.3351 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5698 51.9449 267.8031 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8585 53.1669 268.3850 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1392 53.5776 269.5454 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2374 52.7442 270.0633 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9105 51.5224 269.5097 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2895 48.1235 266.3187 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7108 47.3399 265.2871 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4200 47.1068 264.0926 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9178 46.4353 263.0435 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6596 45.9305 263.1598 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8887 46.0861 264.3126 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4246 46.7965 265.3987 C 0 0 0 0 0 0 - 87.4849 46.9002 266.9304 S 0 0 0 0 0 0 - 86.1214 46.3894 266.6610 O 0 0 0 0 0 0 - 87.6704 48.2235 267.4846 O 0 0 0 0 0 0 - 88.3749 45.6310 268.0078 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5599 53.1152 271.2532 N 0 0 0 0 0 0 - 92.2846 46.3852 266.0479 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2071 50.2822 267.4406 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4762 48.1500 268.0507 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7765 45.9460 267.0392 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1122 51.6526 266.8983 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6095 53.8251 267.9556 H 0 0 0 0 0 0 - 94.4033 54.5265 269.9861 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1768 50.8602 269.9347 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5718 48.6003 266.8710 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4072 47.5191 263.9725 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2712 45.3832 262.3244 H 0 0 0 0 0 0 - 86.8931 45.6417 264.3768 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8403 45.5136 268.9559 H 0 0 0 0 0 0 - 89.3890 45.9893 268.1772 H 0 0 0 0 0 0 - 88.3862 44.6843 267.4915 H 0 0 0 0 0 0 - 91.9435 52.4651 271.7202 H 0 0 0 0 0 0 - 92.8326 53.9673 271.7255 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 29 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 17 1 0 0 0 - 4 30 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 34 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 35 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 28 1 0 0 0 - 16 36 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 24 27 1 0 0 0 - 27 41 1 0 0 0 - 27 42 1 0 0 0 - 27 43 1 0 0 0 - 28 44 1 0 0 0 - 28 45 1 0 0 0 -M END -> -39 - -> -5.299 - -$$$$ -37 - 3D - Structure written by MMmdl. - 62 67 0 0 1 0 999 V2000 - 92.5682 47.3462 266.4833 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6181 48.3452 266.6664 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9789 49.5400 267.2763 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2937 49.7963 267.6790 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8967 47.5399 266.9140 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2761 48.7809 267.5103 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5636 48.9666 267.9328 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4501 47.9585 267.7397 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0608 46.7452 267.1831 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7948 46.5277 266.7655 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5976 51.0957 268.3217 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2871 48.1511 266.2958 N 0 0 0 0 0 0 - 94.5711 51.9448 267.7868 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8615 53.1780 268.3681 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8931 51.4384 269.4756 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1961 52.6578 270.0710 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1500 53.5596 269.5095 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1496 54.7271 270.3451 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2853 54.4571 271.3772 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7216 53.2230 271.2344 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7168 47.3542 265.2854 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4155 46.8174 265.3915 C 0 0 0 0 0 0 - 87.9008 46.1080 264.2919 C 0 0 0 0 0 0 - 88.6799 45.9426 263.1569 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9312 46.4387 263.0407 N 0 0 0 0 0 0 - 90.4252 47.1278 264.0989 C 0 0 0 0 0 0 - 87.5601 46.9683 266.6297 C 0 0 0 0 0 0 - 87.6700 47.9323 267.3876 O 0 0 0 0 0 0 - 86.6670 45.9862 266.8167 N 0 0 0 0 0 0 - 85.5963 45.9500 267.7902 C 0 0 0 0 0 0 - 91.8041 52.6238 272.1856 C 0 0 0 0 0 0 - 85.8697 44.9843 268.9505 C 0 0 0 0 0 0 - 84.6496 44.8209 269.8728 C 0 0 0 0 0 0 - 83.4889 44.4695 269.1237 O 0 0 0 0 0 0 - 83.1249 45.4242 268.1288 C 0 0 0 0 0 0 - 84.2584 45.6197 267.1140 C 0 0 0 0 0 0 - 92.2770 46.3996 266.0578 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2242 50.2942 267.4384 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4700 48.1595 268.0271 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7659 45.9451 267.0116 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5946 48.5928 266.8897 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0958 51.6551 266.8939 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6155 53.8250 267.9345 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1478 50.7838 269.9041 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7390 55.6112 270.2761 H 0 0 0 0 0 0 - 93.0455 55.0371 272.2307 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9050 45.6848 264.3020 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2773 45.3912 262.3250 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4139 47.5230 263.9796 H 0 0 0 0 0 0 - 86.7305 45.1658 266.2195 H 0 0 0 0 0 0 - 85.4687 46.9437 268.2348 H 0 0 0 0 0 0 - 91.6215 53.3064 273.0147 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2473 51.7095 272.5766 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8673 52.3927 271.6850 H 0 0 0 0 0 0 - 86.7428 45.3049 269.5229 H 0 0 0 0 0 0 - 86.1061 44.0003 268.5380 H 0 0 0 0 0 0 - 84.4589 45.7637 270.3907 H 0 0 0 0 0 0 - 84.8389 44.0692 270.6375 H 0 0 0 0 0 0 - 82.9089 46.3828 268.6064 H 0 0 0 0 0 0 - 82.2144 45.0974 267.6290 H 0 0 0 0 0 0 - 83.9940 46.3812 266.3802 H 0 0 0 0 0 0 - 84.3720 44.6839 266.5609 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 37 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 12 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 4 11 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 39 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 40 1 0 0 0 - 11 13 2 0 0 0 - 11 15 1 0 0 0 - 12 21 1 0 0 0 - 12 41 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 42 1 0 0 0 - 14 17 2 0 0 0 - 14 43 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 44 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 45 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 46 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 26 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 47 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 48 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 26 49 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 30 32 1 0 0 0 - 30 36 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 - 31 52 1 0 0 0 - 31 53 1 0 0 0 - 31 54 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 55 1 0 0 0 - 32 56 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 57 1 0 0 0 - 33 58 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 59 1 0 0 0 - 35 60 1 0 0 0 - 36 61 1 0 0 0 - 36 62 1 0 0 0 -M END -> -37 - -> -0.047 - -$$$$ -23 - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 48 0 0 1 0 999 V2000 - 90.2666 48.1240 266.3159 N 0 0 0 0 0 0 - 91.6053 48.3302 266.6785 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9655 49.5283 267.2824 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2798 49.7880 267.6955 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2675 48.7692 267.5233 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8901 47.5291 266.9246 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5604 47.3362 266.4923 C 0 0 0 0 0 0 - 93.5816 51.0865 268.3410 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5539 51.9289 267.7999 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8419 53.1599 268.3769 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1340 53.5695 269.5200 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1794 52.6828 270.0955 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8885 51.4503 269.4975 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1379 54.7246 270.3295 C 0 0 0 0 0 0 - 93.3231 54.5023 271.3969 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7270 53.2828 271.2572 N 0 0 0 0 0 0 - 91.8143 52.7068 272.2360 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7937 46.5216 266.7799 N 0 0 0 0 0 0 - 96.0626 46.7418 267.2021 C 0 0 0 0 0 0 - 96.4462 47.9561 267.7601 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5561 48.9613 267.9464 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7286 47.3554 265.2768 C 0 0 0 0 0 0 - 90.4324 47.1276 264.0879 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9168 46.4329 263.0385 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6627 45.9292 263.1762 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8956 46.1024 264.3286 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4329 46.8391 265.3862 C 0 0 0 0 0 0 - 89.5840 48.5534 266.9215 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2103 50.2872 267.4331 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2824 46.3904 266.0527 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0948 51.6267 266.9152 H 0 0 0 0 0 0 - 95.5936 53.8009 267.9420 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1679 50.7900 269.9332 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7495 55.6177 270.1967 H 0 0 0 0 0 0 - 93.1003 55.1251 272.2562 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8685 52.4626 271.7679 H 0 0 0 0 0 0 - 91.6486 53.4244 273.0386 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2600 51.8084 272.6499 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7703 45.9439 267.0454 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4696 48.1484 268.0483 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4251 47.5215 263.9542 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2698 45.3722 262.3401 H 0 0 0 0 0 0 - 86.9082 45.6692 264.4068 H 0 0 0 0 0 0 - 87.8553 46.9873 266.2876 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 7 2 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 21 2 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 18 2 0 0 0 - 7 30 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 36 1 0 0 0 - 17 37 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 39 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 43 1 0 0 0 - 27 44 1 0 0 0 -M END -> -23 - -> -1.58 - -$$$$ -60 - 3D - Structure written by MMmdl. - 54 58 0 0 1 0 999 V2000 - 92.6660 47.2613 266.3406 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6770 48.2220 266.5146 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9879 49.4167 267.1425 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2709 49.6946 267.6279 C 0 0 0 0 0 0 - 93.9719 47.4800 266.8354 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2913 48.7152 267.4805 C 0 0 0 0 0 0 - 95.5450 48.9221 267.9883 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4599 47.9343 267.8372 C 0 0 0 0 0 0 - 96.1350 46.7275 267.2279 C 0 0 0 0 0 0 - 94.9013 46.4918 266.7230 N 0 0 0 0 0 0 - 90.3487 47.9881 266.1437 N 0 0 0 0 0 0 - 89.8102 47.2444 265.0862 C 0 0 0 0 0 0 - 90.5239 47.0994 263.8922 C 0 0 0 0 0 0 - 90.0430 46.4477 262.8068 N 0 0 0 0 0 0 - 88.8025 45.9112 262.8993 C 0 0 0 0 0 0 - 88.0213 45.9914 264.0502 C 0 0 0 0 0 0 - 88.5247 46.6790 265.1618 C 0 0 0 0 0 0 - 87.5572 46.7485 266.6776 S 0 0 0 0 0 0 - 87.9494 45.5860 267.4786 O 0 0 0 0 0 0 - 87.7078 48.0995 267.2278 O 0 0 0 0 0 0 - 85.7583 46.5374 266.1602 C 0 0 0 0 0 0 - 93.4545 50.9305 268.4147 C 0 0 0 0 0 0 - 94.4202 51.9117 268.1364 C 0 0 0 0 0 0 - 94.4695 53.0834 268.9040 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5838 51.1138 269.4835 C 0 0 0 0 0 0 - 92.6365 52.2501 270.2532 C 0 0 0 0 0 0 - 93.5640 53.2265 269.9558 C 0 0 0 0 0 0 - 93.4148 54.3422 270.7273 O 0 0 0 0 0 0 - 92.4599 54.0057 271.7365 C 0 0 0 0 0 0 - 91.7186 52.6858 271.3365 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6600 51.7353 272.5275 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2882 52.7274 270.7487 C 0 0 0 0 0 0 - 92.4190 46.3273 265.8706 H 0 0 0 0 0 0 - 91.1990 50.1424 267.2856 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4509 48.1344 268.2160 H 0 0 0 0 0 0 - 96.8601 45.9347 267.1210 H 0 0 0 0 0 0 - 89.6448 48.3730 266.7646 H 0 0 0 0 0 0 - 91.5092 47.5215 263.7899 H 0 0 0 0 0 0 - 88.4352 45.3922 262.0288 H 0 0 0 0 0 0 - 87.0510 45.5181 264.0657 H 0 0 0 0 0 0 - 85.1315 46.6853 267.0371 H 0 0 0 0 0 0 - 85.6122 45.5261 265.7792 H 0 0 0 0 0 0 - 85.5191 47.2723 265.3933 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1056 51.7814 267.3114 H 0 0 0 0 0 0 - 95.1829 53.8593 268.6701 H 0 0 0 0 0 0 - 91.8355 50.3646 269.6999 H 0 0 0 0 0 0 - 91.8441 54.8559 272.0034 H 0 0 0 0 0 0 - 93.0585 53.8331 272.6315 H 0 0 0 0 0 0 - 92.6717 51.5280 272.8282 H 0 0 0 0 0 0 - 91.1837 50.7813 272.3000 H 0 0 0 0 0 0 - 91.1571 52.1856 273.3830 H 0 0 0 0 0 0 - 90.2017 53.5269 270.0147 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5374 52.9139 271.5165 H 0 0 0 0 0 0 - 89.9978 51.8184 270.2314 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 11 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 34 1 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 36 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 40 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 20 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 24 27 2 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 32 1 0 0 0 - 31 49 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 - 31 51 1 0 0 0 - 32 52 1 0 0 0 - 32 53 1 0 0 0 - 32 54 1 0 0 0 -M END -> -60 - -> -1.073 - -$$$$ -34 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - 92.5675 47.3476 266.4818 C 0 0 0 0 0 0 - 91.6195 48.3446 266.6702 C 0 0 0 0 0 0 - 91.9774 49.5404 267.2822 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2882 49.8046 267.6879 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2739 48.7854 267.5113 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8948 47.5437 266.9102 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7936 46.5330 266.7587 N 0 0 0 0 0 0 - 95.5623 48.9682 267.9318 N 0 0 0 0 0 0 - 96.4466 47.9594 267.7367 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0613 46.7461 267.1800 C 0 0 0 0 0 0 - 90.2825 48.1494 266.3000 N 0 0 0 0 0 0 - 93.5910 51.1031 268.3371 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5701 51.9487 267.7934 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8764 53.1831 268.3626 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1738 53.5765 269.5033 C 0 0 0 0 0 0 - 93.2106 52.6774 270.0808 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8955 51.4555 269.4914 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1940 54.7417 270.3236 C 0 0 0 0 0 0 - 93.3211 54.5038 271.3418 C 0 0 0 0 0 0 - 92.7601 53.2789 271.2412 N 0 0 0 0 0 0 - 89.7058 47.3516 265.2944 C 0 0 0 0 0 0 - 91.8506 52.7297 272.2448 C 0 0 0 0 0 0 - 88.4003 46.8132 265.3997 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8903 46.1026 264.3004 C 0 0 0 0 0 0 - 88.6717 45.9405 263.1626 C 0 0 0 0 0 0 - 89.9225 46.4384 263.0456 N 0 0 0 0 0 0 - 90.4118 47.1270 264.1049 C 0 0 0 0 0 0 - 87.5461 46.9593 266.6443 C 0 0 0 0 0 0 - 86.6807 45.9742 266.8909 N 0 0 0 0 0 0 - 87.6482 47.9220 267.4000 O 0 0 0 0 0 0 - 92.2748 46.4011 266.0567 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2199 50.2936 267.4430 H 0 0 0 0 0 0 - 97.4656 48.1565 268.0267 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7640 45.9455 267.0078 H 0 0 0 0 0 0 - 89.5926 48.5988 266.8874 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0905 51.6544 266.8946 H 0 0 0 0 0 0 - 95.6297 53.8262 267.9199 H 0 0 0 0 0 0 - 92.1403 50.8031 269.9237 H 0 0 0 0 0 0 - 94.7911 55.6375 270.2450 H 0 0 0 0 0 0 - 93.0724 55.1133 272.1872 H 0 0 0 0 0 0 - 91.7082 53.4641 273.0433 H 0 0 0 0 0 0 - 92.2985 51.8398 272.6819 H 0 0 0 0 0 0 - 90.8892 52.5140 271.7869 H 0 0 0 0 0 0 - 86.8976 45.6795 264.3121 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2724 45.3933 262.3292 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4048 47.5141 263.9802 H 0 0 0 0 0 0 - 86.0899 46.0225 267.7060 H 0 0 0 0 0 0 - 86.6017 45.1896 266.2549 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 11 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 32 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 12 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 8 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 10 2 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 21 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 36 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 38 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 21 27 1 0 0 0 - 21 23 2 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 30 2 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 -M END -> -34 - -> -0.049 - -$$$$ -36 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 57 0 0 1 0 999 V2000 - 92.5019 47.4809 266.5012 C 0 0 0 0 0 0 - 91.4857 48.4054 266.7703 C 0 0 0 0 0 0 - 91.8311 49.6033 267.4005 C 0 0 0 0 0 0 - 93.1329 49.9008 267.8027 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8203 47.7090 266.9243 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1662 48.9379 267.5838 C 0 0 0 0 0 0 - 95.4395 49.1394 268.0247 N 0 0 0 0 0 0 - 96.3424 48.1461 267.8444 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0073 46.9541 267.2235 C 0 0 0 0 0 0 - 94.7573 46.7424 266.7458 N 0 0 0 0 0 0 - 93.3550 51.1745 268.5297 C 0 0 0 0 0 0 - 94.3019 52.0919 268.1026 C 0 0 0 0 0 0 - 94.5054 53.3019 268.7680 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5738 51.4295 269.6693 C 0 0 0 0 0 0 - 92.8404 52.5915 270.3967 C 0 0 0 0 0 0 - 93.7750 53.5611 269.9435 C 0 0 0 0 0 0 - 93.7328 54.6344 270.8820 C 0 0 0 0 0 0 - 92.9093 54.2418 271.9260 C 0 0 0 0 0 0 - 92.3458 53.0191 271.6075 N 0 0 0 0 0 0 - 90.1525 48.0937 266.3996 N 0 0 0 0 0 0 - 91.3984 52.2974 272.4351 C 0 0 0 0 0 0 - 89.8025 47.1713 265.4107 C 0 0 0 0 0 0 - 88.7064 46.2853 265.4708 C 0 0 0 0 0 0 - 88.3920 45.5465 264.3239 C 0 0 0 0 0 0 - 89.1630 45.7166 263.1759 C 0 0 0 0 0 0 - 90.3008 46.4328 263.1436 N 0 0 0 0 0 0 - 90.6083 47.1291 264.2614 C 0 0 0 0 0 0 - 87.7536 46.0522 266.9862 S 0 0 0 0 0 0 - 87.6334 47.3703 267.6019 O 0 0 0 0 0 0 - 86.5414 45.3174 266.6269 O 0 0 0 0 0 0 - 88.7842 44.9495 268.1463 C 0 0 0 0 0 0 - 89.0277 48.5933 267.1930 C 0 0 0 0 0 0 - 92.2739 46.5354 266.0341 H 0 0 0 0 0 0 - 91.0802 50.3370 267.6197 H 0 0 0 0 0 0 - 97.3500 48.3260 268.1900 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7164 46.1616 267.0807 H 0 0 0 0 0 0 - 94.8847 51.8876 267.2116 H 0 0 0 0 0 0 - 95.2293 54.0106 268.4023 H 0 0 0 0 0 0 - 91.8324 50.7201 269.9931 H 0 0 0 0 0 0 - 94.2804 55.5661 270.8313 H 0 0 0 0 0 0 - 92.6568 54.7230 272.8364 H 0 0 0 0 0 0 - 91.2584 52.7970 273.3926 H 0 0 0 0 0 0 - 91.7765 51.2904 272.6187 H 0 0 0 0 0 0 - 90.4452 52.2301 271.9110 H 0 0 0 0 0 0 - 87.6107 44.8283 264.3234 H 0 0 0 0 0 0 - 88.8449 45.2396 262.2594 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4889 47.7368 264.2338 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2085 44.8033 269.0647 H 0 0 0 0 0 0 - 89.7347 45.4322 268.3765 H 0 0 0 0 0 0 - 88.9505 43.9840 267.6632 H 0 0 0 0 0 0 - 88.8013 47.8870 268.0013 H 0 0 0 0 0 0 - 88.1379 48.7100 266.5759 H 0 0 0 0 0 0 - 89.2234 49.5809 267.6275 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 5 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 20 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 34 1 0 0 0 - 4 6 1 0 0 0 - 4 11 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 2 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 35 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 36 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 13 16 2 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 20 32 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 21 44 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 27 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 28 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 30 2 0 0 0 - 28 31 1 0 0 0 - 31 48 1 0 0 0 - 31 49 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 - 32 51 1 0 0 0 - 32 52 1 0 0 0 - 32 53 1 0 0 0 -M END -> -36 - -> -3.516 - -$$$$ -46 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - 93.0435 49.8102 267.7232 C 0 0 0 0 0 0 - 92.5273 47.3329 266.4277 C 0 0 0 0 0 0 - 91.5132 48.2719 266.5844 C 0 0 0 0 0 0 - 91.7777 49.4816 267.2148 C 0 0 0 0 0 0 - 93.8278 47.6124 266.9005 C 0 0 0 0 0 0 - 94.1023 48.8575 267.5509 C 0 0 0 0 0 0 - 95.3591 49.1150 268.0280 N 0 0 0 0 0 0 - 96.3141 48.1685 267.8581 C 0 0 0 0 0 0 - 96.0343 46.9585 267.2294 C 0 0 0 0 0 0 - 94.8031 46.6694 266.7522 N 0 0 0 0 0 0 - 93.2132 51.0616 268.5051 C 0 0 0 0 0 0 - 92.2931 51.3561 269.5168 C 0 0 0 0 0 0 - 92.4526 52.4703 270.3218 C 0 0 0 0 0 0 - 94.2814 51.9348 268.2910 C 0 0 0 0 0 0 - 90.1979 47.9914 266.1949 N 0 0 0 0 0 0 - 89.6525 47.2396 265.1468 C 0 0 0 0 0 0 - 90.3884 46.9960 263.9809 C 0 0 0 0 0 0 - 89.8924 46.3415 262.9026 N 0 0 0 0 0 0 - 88.6191 45.8808 262.9839 C 0 0 0 0 0 0 - 87.8123 46.0650 264.1082 C 0 0 0 0 0 0 - 88.3278 46.7653 265.2033 C 0 0 0 0 0 0 - 87.2988 46.9262 266.6745 S 0 0 0 0 0 0 - 87.6993 48.1509 267.3900 O 0 0 0 0 0 0 - 85.9037 46.7478 266.2781 O 0 0 0 0 0 0 - 87.8417 45.4403 267.6817 C 0 0 0 0 0 0 - 94.4415 53.0681 269.0925 C 0 0 0 0 0 0 - 93.5190 53.3406 270.1122 C 0 0 0 0 0 0 - 93.6396 54.5887 270.9796 C 0 0 0 0 0 0 - 94.4603 55.4970 270.4478 F 0 0 0 0 0 0 - 92.4459 55.1254 271.1248 F 0 0 0 0 0 0 - 94.0622 54.3038 272.1875 F 0 0 0 0 0 0 - 92.3045 46.3748 265.9852 H 0 0 0 0 0 0 - 90.9583 50.1717 267.3621 H 0 0 0 0 0 0 - 97.3055 48.4008 268.2211 H 0 0 0 0 0 0 - 96.7946 46.1974 267.1006 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4475 50.7090 269.6907 H 0 0 0 0 0 0 - 91.7245 52.6732 271.1027 H 0 0 0 0 0 0 - 95.0049 51.7511 267.5041 H 0 0 0 0 0 0 - 89.4779 48.4047 266.7789 H 0 0 0 0 0 0 - 91.4061 47.3503 263.8938 H 0 0 0 0 0 0 - 88.2509 45.3244 262.1374 H 0 0 0 0 0 0 - 86.8142 45.6457 264.1398 H 0 0 0 0 0 0 - 87.2648 45.4223 268.6016 H 0 0 0 0 0 0 - 88.9040 45.5329 267.9000 H 0 0 0 0 0 0 - 87.6573 44.5397 267.0941 H 0 0 0 0 0 0 - 95.2741 53.7341 268.9078 H 0 0 0 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 1 6 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 32 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 15 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 34 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 35 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 14 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 27 2 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 26 2 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 40 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 24 2 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 30 1 0 0 0 - 28 31 1 0 0 0 -M END -> -46 - -> -1.734 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/shp2_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/shp2_ligands.sdf deleted file mode 100755 index a61a9499..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/shp2_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,3293 +0,0 @@ -SHP099_1_Example_7 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5722 41.4017 2.9497 N 0 0 0 0 0 0 - 24.8073 42.5904 2.1071 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8882 43.4955 2.7352 C 0 0 0 0 0 0 - 27.1844 42.7081 3.0173 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8880 41.4066 3.7995 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7788 40.5760 3.1172 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6941 40.5278 5.5181 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4037 40.8004 6.8683 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1005 40.6055 7.3543 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1024 40.1270 6.5070 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3911 39.8460 5.1764 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6755 40.0507 4.6853 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0420 40.7304 4.9310 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0963 41.7469 4.0374 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2680 41.9826 3.4209 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3992 41.2013 3.6601 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3400 40.1644 4.5484 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1710 39.9440 5.2012 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6893 40.9440 9.0001 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.6364 41.3873 7.9395 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.1416 38.8888 6.1136 N 0 0 0 0 0 0 - 28.0989 43.5943 3.8660 N 0 3 0 0 0 0 - 27.9436 42.4192 1.7238 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0503 42.2737 1.0942 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9119 43.1848 1.9547 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4859 43.9463 3.6444 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0860 44.3382 2.0668 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5729 41.6227 4.8160 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7863 40.7975 3.9041 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0871 40.2123 2.1375 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5582 39.6711 3.6882 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0966 39.9833 6.8773 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6181 39.4786 4.5197 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8774 39.8300 3.6455 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2396 42.8343 2.7649 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2965 38.6913 6.6248 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9864 38.3512 6.2928 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9778 43.1202 4.0164 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2718 44.4626 3.3564 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3240 41.8322 1.0495 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8549 41.8535 1.9210 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2173 43.3396 1.2082 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6680 43.8147 4.7509 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -289 - -> -shp2_ligands.1 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -1 - -> -SHP099-1/Example 7 - -> -0.071 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_22 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5395 41.6049 3.1578 N 0 0 0 0 0 0 - 24.8999 42.8662 2.5072 C 0 0 0 0 0 0 - 26.2796 43.3664 2.9523 C 0 0 0 0 0 0 - 27.3815 42.3279 2.6866 C 0 0 0 0 0 0 - 26.9458 40.9995 3.3439 C 0 0 0 0 0 0 - 25.5393 40.5572 2.8667 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6658 40.5877 5.7494 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5101 40.8644 7.1230 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3019 40.5656 7.7663 C 0 0 0 0 0 0 - 17.2448 40.0200 7.0430 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3911 39.7426 5.6865 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5948 40.0214 5.0464 C 0 0 0 0 0 0 - 20.9506 40.8311 5.0393 C 0 0 0 0 0 0 - 20.9222 41.7408 4.0321 N 0 0 0 0 0 0 - 22.0724 42.0023 3.3571 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2821 41.3525 3.6978 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2822 40.4119 4.6800 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1374 40.1598 5.3456 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0811 40.8514 9.4592 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.7877 41.6202 8.0217 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.2064 39.2134 6.3526 N 0 0 0 0 0 0 - 28.6518 42.8205 3.3925 N 0 3 0 0 0 0 - 27.7192 42.1830 1.1873 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8060 42.7849 1.4224 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2071 43.6203 2.8514 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2187 43.6200 4.0124 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4809 44.3100 2.4460 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9083 41.0885 4.4322 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6786 40.2175 3.1547 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5294 40.3513 1.7952 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2850 39.6205 3.3614 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3102 39.7963 7.5376 H 0 0 0 0 0 0 - 18.6982 39.7803 3.9951 H 0 0 0 0 0 0 - 21.8404 43.2207 1.9002 Br 0 0 0 0 0 0 - 23.0751 38.7102 6.5111 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3652 38.9553 6.8422 H 0 0 0 0 0 0 - 29.4272 42.2022 3.1879 H 0 0 0 0 0 0 - 26.8613 41.8500 0.6054 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5187 41.4571 1.0264 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0402 43.1320 0.7525 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8750 43.7542 3.0739 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5761 39.2981 5.1323 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5166 42.8522 4.3941 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 42 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -290 - -> -shp2_ligands.2 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -2 - -> -Example 22 - -> -0.169 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_29 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 47 49 0 0 1 0 999 V2000 - 24.4107 41.3723 2.7009 N 0 0 0 0 0 0 - 24.7838 42.6182 2.0126 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7794 43.4100 2.8966 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0503 42.5825 3.2063 C 0 0 0 0 0 0 - 26.6622 41.1652 3.7013 C 0 0 0 0 0 0 - 25.6079 40.5090 2.7764 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8516 40.7173 5.9010 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7679 40.1939 5.2879 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4557 39.8383 5.9773 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5170 39.9824 7.5197 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5283 41.0246 8.0301 C 0 0 0 0 0 0 - 19.9293 40.8002 7.4266 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0896 40.8699 5.1066 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1118 41.9493 4.2811 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2110 42.1308 3.5040 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3187 41.2685 3.5616 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2859 40.1996 4.4067 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1835 39.9940 5.1662 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1653 38.8572 5.9693 N 0 0 0 0 0 0 - 27.7758 43.2939 4.3522 N 0 3 0 0 0 0 - 28.0247 42.5438 2.0086 C 0 0 0 0 0 0 - 25.2593 42.3635 1.0629 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9239 43.2239 1.7281 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2565 43.6727 3.8197 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0356 44.3662 2.4332 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2316 41.2047 4.7056 H 0 0 0 0 0 0 - 27.5425 40.5253 3.7846 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0191 40.3826 1.7722 H 0 0 0 0 0 0 - 25.3571 39.5018 3.1076 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8198 40.0275 4.2183 H 0 0 0 0 0 0 - 17.1576 38.8236 5.7071 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6743 40.4781 5.5749 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5193 40.1998 7.9100 H 0 0 0 0 0 0 - 17.7737 39.0117 7.9454 H 0 0 0 0 0 0 - 18.5840 40.9789 9.1205 H 0 0 0 0 0 0 - 18.1707 42.0204 7.7852 H 0 0 0 0 0 0 - 20.6237 41.5803 7.7370 H 0 0 0 0 0 0 - 20.3330 39.8688 7.8277 H 0 0 0 0 0 0 - 22.1715 42.9725 2.8339 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3346 38.6403 6.4968 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0121 38.3087 6.0818 H 0 0 0 0 0 0 - 28.6348 42.8196 4.5944 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0010 44.2418 4.0797 H 0 0 0 0 0 0 - 27.5905 42.0350 1.1500 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9484 42.0199 2.2567 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2988 43.5491 1.6812 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1913 43.3357 5.1774 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 22 1 0 0 0 - 2 23 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 4 21 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 26 1 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 6 28 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 31 1 0 0 0 - 9 32 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 12 38 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 39 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 42 1 0 0 0 - 20 43 1 0 0 0 - 20 47 1 0 0 0 - 21 44 1 0 0 0 - 21 45 1 0 0 0 - 21 46 1 0 0 0 -M CHG 1 20 1 -M END -> -291 - -> -shp2_ligands.3 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -3 - -> -Example 29 - -> -2.585 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -11 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 46 48 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5722 41.4017 2.9497 N 0 0 0 0 0 0 - 24.8073 42.5904 2.1071 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8882 43.4955 2.7352 C 0 0 0 0 0 0 - 27.1844 42.7081 3.0173 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8880 41.4066 3.7995 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7788 40.5760 3.1172 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6941 40.5278 5.5181 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4037 40.8004 6.8683 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1005 40.6055 7.3543 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1024 40.1270 6.5070 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3911 39.8460 5.1764 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6755 40.0507 4.6853 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0420 40.7304 4.9310 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0963 41.7469 4.0374 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2680 41.9826 3.4209 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3992 41.2013 3.6601 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3400 40.1644 4.5484 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1710 39.9440 5.2012 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6893 40.9440 9.0001 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.6364 41.3873 7.9395 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.1416 38.8888 6.1136 N 0 0 0 0 0 0 - 28.0989 43.5943 3.8660 N 0 3 0 0 0 0 - 27.9436 42.4192 1.7238 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1346 42.2431 1.1260 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9305 43.1928 1.8932 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4822 43.9052 3.6621 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0760 44.3478 2.0795 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5544 41.6374 4.8131 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7851 40.7941 3.9052 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1033 40.2188 2.1391 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5804 39.6753 3.6998 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1024 39.9768 6.8873 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6136 39.4779 4.5216 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8881 39.8422 3.6459 H 0 0 0 0 0 0 - 23.3418 38.1054 6.3920 C 0 0 0 0 0 0 - 27.6398 43.8120 4.7398 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8803 41.8906 1.9092 H 0 0 0 0 0 0 - 28.1848 43.3317 1.1760 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3675 41.7927 1.0417 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9634 43.1099 4.0623 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2142 42.7915 2.7136 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3339 38.7082 6.6920 H 0 0 0 0 0 0 - 23.1102 37.3347 7.1272 H 0 0 0 0 0 0 - 24.1199 38.7600 6.7847 H 0 0 0 0 0 0 - 23.6913 37.6368 5.4721 H 0 0 0 0 0 0 - 28.3039 44.4537 3.3768 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 41 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 36 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 22 46 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 35 43 1 0 0 0 - 35 44 1 0 0 0 - 35 45 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -292 - -> -shp2_ligands.4 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -4 - -> -11 - -> -22 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -4 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 24.6991 41.2880 3.1084 N 0 0 0 0 0 0 - 24.7544 42.3659 2.0828 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0819 43.1849 2.0777 C 0 0 1 0 0 0 - 27.2540 42.3327 2.4127 N 0 3 0 0 0 0 - 27.1216 41.4947 3.6356 C 0 0 1 0 0 0 - 25.9265 40.5256 3.4438 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7062 40.2071 5.4923 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4758 40.5221 6.8291 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1971 40.3798 7.3797 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1161 39.9866 6.5815 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3356 39.6937 5.2208 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6213 39.8380 4.6722 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0642 40.4372 4.9252 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1830 41.4378 3.9557 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3711 41.6614 3.3749 N 0 0 0 0 0 0 - 23.5007 40.9783 3.7010 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3990 40.0008 4.6377 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2307 39.6970 5.2474 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9740 40.7392 9.0549 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.2239 38.6159 6.2287 N 0 0 0 0 0 0 - 26.2809 43.8707 0.7586 C 0 0 0 0 0 0 - 28.3860 40.7221 3.8693 C 0 0 0 0 0 0 - 15.5237 39.8315 7.2337 Cl 0 0 0 0 0 0 - 23.9259 43.0695 2.1822 H 0 0 0 0 0 0 - 24.6135 41.8868 1.1127 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0130 43.9718 2.8311 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0677 42.9235 2.5068 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9651 42.1293 4.5101 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8056 39.9378 4.3555 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1227 39.8075 2.6465 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2825 40.8574 7.4646 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5083 39.3864 4.5978 H 0 0 0 0 0 0 - 18.7696 39.6318 3.6213 H 0 0 0 0 0 0 - 20.3446 42.0389 3.6350 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3659 38.3670 6.6998 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0771 38.1169 6.4362 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4108 44.4881 0.5352 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4065 43.1229 -0.0244 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1699 44.4995 0.8065 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2786 40.1123 4.7662 H 0 0 0 0 0 0 - 29.2169 41.4157 3.9988 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5813 40.0771 3.0126 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3995 41.7038 1.6361 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 21 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 22 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 23 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 35 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 -M CHG 1 4 1 -M END -> -293 - -> -shp2_ligands.5 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -5 - -> -4 - -> -54 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_2 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 46 48 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5912 41.4412 2.9628 N 0 0 0 0 0 0 - 25.7880 40.5839 3.0947 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8827 41.4187 3.7819 C 0 0 0 0 0 0 - 27.2037 42.7296 3.0208 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8914 43.4984 2.7286 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8146 42.6072 2.0858 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6867 40.5350 5.5377 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4006 40.8261 6.8758 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1051 40.6078 7.3743 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1087 40.0858 6.5430 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4034 39.7629 5.2225 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6796 40.0169 4.7228 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0271 40.7724 4.9478 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1661 41.8108 4.0707 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3393 42.0621 3.4383 N 0 0 0 0 0 0 - 23.4048 41.2182 3.6484 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3416 40.1990 4.5483 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1565 39.9549 5.1862 C 0 0 0 0 0 0 - 17.7286 41.0151 8.7870 C 0 0 0 0 0 0 - 20.6167 41.4952 7.9158 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.0942 38.8874 6.0945 N 0 0 0 0 0 0 - 28.0568 43.6104 3.9321 N 0 3 0 0 0 0 - 27.9976 42.4511 1.7261 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0793 40.2606 2.0975 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5374 39.6817 3.6751 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5304 41.6654 4.7796 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7778 40.8079 3.8955 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4751 43.9072 3.6483 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0824 44.3546 2.0811 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1238 42.2418 1.1104 H 0 0 0 0 0 0 - 23.8669 43.1548 1.9503 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0936 39.9544 6.9083 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6326 39.3650 4.5781 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8818 39.7600 3.6910 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9250 43.1640 4.1754 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9465 41.9493 1.9173 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2119 43.3578 1.1601 H 0 0 0 0 0 0 - 27.4467 41.7986 1.0477 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2553 44.4865 3.4578 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9522 38.3892 6.3063 H 0 0 0 0 0 0 - 20.3269 42.4788 3.8471 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2395 38.7067 6.6030 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6613 40.8809 8.9516 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9571 42.0730 8.9359 H 0 0 0 0 0 0 - 18.2961 40.4417 9.5254 H 0 0 0 0 0 0 - 27.5603 43.8225 4.7842 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 43 1 0 0 0 - 19 44 1 0 0 0 - 19 45 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 35 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 46 1 0 0 0 - 23 36 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -294 - -> -shp2_ligands.6 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -6 - -> -Example 2 - -> -0.858 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_14 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 40 42 0 0 1 0 999 V2000 - 19.8865 40.6092 5.5884 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6598 40.8590 6.9585 C 0 0 0 0 0 0 - 18.4229 40.5299 7.5368 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4200 39.9555 6.7590 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6448 39.6901 5.4111 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8649 40.0233 4.8318 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1867 40.8944 4.9175 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1752 41.8933 3.9934 N 0 0 0 0 0 0 - 22.3245 42.1535 3.3206 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4937 41.4209 3.5525 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5034 40.4202 4.4740 N 0 0 0 0 0 0 - 22.3592 40.1611 5.1522 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0969 40.8222 9.2115 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.8776 41.6192 7.9339 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.3961 39.1265 6.0772 N 0 0 0 0 0 0 - 24.7011 41.7162 2.9087 N 0 0 0 0 0 0 - 25.9868 41.0513 3.1197 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0755 41.9343 2.4916 C 0 0 1 0 0 0 - 26.3258 42.4811 1.2882 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8897 42.6468 1.7944 C 0 0 0 0 0 0 - 27.6156 43.0653 3.4038 C 0 0 0 0 0 0 - 28.0786 42.5076 4.7524 N 0 3 0 0 0 0 - 16.4712 39.6950 7.2057 H 0 0 0 0 0 0 - 16.8784 39.2211 4.8120 H 0 0 0 0 0 0 - 19.0255 39.7992 3.7864 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2991 42.9651 2.6087 H 0 0 0 0 0 0 - 23.2561 38.6114 6.2391 H 0 0 0 0 0 0 - 21.5551 38.8901 6.5802 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1639 40.8905 4.1833 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9729 40.0534 2.6763 H 0 0 0 0 0 0 - 27.9165 41.3129 2.1734 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7503 43.4162 0.9197 H 0 0 0 0 0 0 - 26.3508 41.7778 0.4544 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2023 42.3874 0.9869 H 0 0 0 0 0 0 - 24.7023 43.6767 2.0993 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5093 43.5362 2.9910 H 0 0 0 0 0 0 - 26.8805 43.8348 3.6483 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5580 43.2205 5.2998 H 0 0 0 0 0 0 - 27.2981 42.1725 5.3061 H 0 0 0 0 0 0 - 28.7303 41.7510 4.6055 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 7 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 14 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 13 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 24 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 16 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 12 15 1 0 0 0 - 15 27 1 0 0 0 - 15 28 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 29 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 18 31 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 32 1 0 0 0 - 19 33 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 20 35 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -295 - -> -shp2_ligands.7 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -7 - -> -Example 14 - -> -0.068 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_26 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 47 49 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5435 41.5792 3.1196 N 0 0 0 0 0 0 - 25.5708 40.5464 2.8814 C 0 0 0 0 0 0 - 26.9534 40.9118 3.4847 C 0 0 0 0 0 0 - 27.4593 42.3280 3.1172 C 0 0 0 0 0 0 - 26.2942 43.3330 3.1459 C 0 0 0 0 0 0 - 24.9972 42.8297 2.5111 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6889 40.5703 5.7978 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5320 40.8408 7.1712 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3134 40.5554 7.8069 C 0 0 0 0 0 0 - 17.2570 40.0202 7.0752 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4064 39.7521 5.7172 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6163 40.0206 5.0855 C 0 0 0 0 0 0 - 20.9719 40.8186 5.0870 C 0 0 0 0 0 0 - 20.9540 41.8118 4.1678 N 0 0 0 0 0 0 - 22.0756 42.0762 3.4406 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2791 41.3456 3.6789 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2692 40.3395 4.6027 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1341 40.0692 5.2876 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0784 40.8427 9.4962 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.8203 41.5878 8.0632 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.1669 39.0114 6.1899 N 0 0 0 0 0 0 - 27.9555 42.2509 1.6614 C 0 0 0 0 0 0 - 28.6011 42.7994 3.9160 N 0 3 0 0 0 0 - 21.8219 43.0847 2.3396 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3538 42.8247 1.1534 N 0 0 0 0 0 0 - 21.0327 44.0184 2.4666 O 0 0 0 0 0 0 - 25.2579 39.5917 3.2986 H 0 0 0 0 0 0 - 25.6526 40.3775 1.8069 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6770 40.1611 3.1633 H 0 0 0 0 0 0 - 26.8956 40.7970 4.5696 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5440 44.2572 2.6300 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0824 43.6211 4.1756 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2748 43.6201 2.6763 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1052 42.7110 1.4315 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3185 39.7955 7.5604 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5894 39.3207 5.1563 H 0 0 0 0 0 0 - 18.7190 39.7914 4.0335 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0375 38.5148 6.3535 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3404 38.7890 6.7207 H 0 0 0 0 0 0 - 22.1176 43.4003 0.3593 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9929 42.0544 1.0175 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8653 43.7258 3.6125 H 0 0 0 0 0 0 - 28.3416 42.8266 4.8917 H 0 0 0 0 0 0 - 29.3810 42.1696 3.7926 H 0 0 0 0 0 0 - 28.3665 43.1464 1.1723 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1612 41.8402 1.0380 H 0 0 0 0 0 0 - 28.6769 41.4383 1.5758 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 2 28 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 3 30 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 6 33 1 0 0 0 - 6 34 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 35 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 37 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 24 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 45 1 0 0 0 - 22 46 1 0 0 0 - 22 47 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 25 40 1 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 -M CHG 1 23 1 -M END -> -296 - -> -shp2_ligands.8 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -8 - -> -Example 26 - -> -0.271 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -SHP836_2 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 24.6991 41.2880 3.1084 N 0 0 0 0 0 0 - 24.7544 42.3659 2.0828 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0819 43.1849 2.0777 C 0 0 1 0 0 0 - 27.2540 42.3327 2.4127 N 0 3 0 0 0 0 - 27.1216 41.4947 3.6356 C 0 0 1 0 0 0 - 25.9265 40.5256 3.4438 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7062 40.2071 5.4923 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4758 40.5221 6.8291 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1971 40.3798 7.3797 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1161 39.9866 6.5815 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3356 39.6937 5.2208 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6213 39.8380 4.6722 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0642 40.4372 4.9252 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1830 41.4378 3.9557 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3711 41.6614 3.3749 N 0 0 0 0 0 0 - 23.5007 40.9783 3.7010 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3990 40.0008 4.6377 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2307 39.6970 5.2474 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9053 40.7260 9.0476 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.7793 41.0806 7.8271 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.2243 38.6162 6.2289 N 0 0 0 0 0 0 - 26.2804 43.8713 0.7588 C 0 0 0 0 0 0 - 28.3857 40.7219 3.8699 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9260 43.0695 2.1829 H 0 0 0 0 0 0 - 24.6132 41.8870 1.1126 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0127 43.9714 2.8315 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0684 42.9226 2.5058 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9647 42.1292 4.5101 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8054 39.9385 4.3559 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1227 39.8070 2.6470 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1290 39.8934 7.0111 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5096 39.3856 4.5953 H 0 0 0 0 0 0 - 18.7713 39.6322 3.6215 H 0 0 0 0 0 0 - 20.3447 42.0392 3.6354 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3665 38.3671 6.7002 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0777 38.1175 6.4364 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4101 44.4885 0.5358 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4061 43.1238 -0.0245 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1693 44.5003 0.8067 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2778 40.1122 4.7670 H 0 0 0 0 0 0 - 29.2167 41.4153 3.9996 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5812 40.0767 3.0134 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3969 41.7025 1.6369 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 22 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 23 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 -M CHG 1 4 1 -M END -> -297 - -> -shp2_ligands.9 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -9 - -> -SHP836-2 - -> -12 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_6 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 44 46 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5541 41.4086 2.9391 N 0 0 0 0 0 0 - 24.8162 42.5900 2.0939 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8942 43.4882 2.7380 C 0 0 0 0 0 0 - 27.1958 42.7090 3.0142 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8854 41.4093 3.7822 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7779 40.5804 3.0987 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7564 40.5728 5.6014 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4547 40.9011 6.9415 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1494 40.6979 7.4298 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1817 40.1496 6.5987 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5342 39.8095 5.2908 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7834 40.0332 4.7935 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0555 40.7706 4.9811 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1033 41.7740 4.0767 C 0 0 0 0 0 0 - 22.2526 42.0186 3.4385 N 0 0 0 0 0 0 - 23.4020 41.2202 3.6592 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3305 40.2002 4.5650 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1801 39.9475 5.2152 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6819 41.1426 9.0368 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.6649 41.6022 7.9487 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.1235 38.8853 6.1019 N 0 0 0 0 0 0 - 28.1023 43.5979 3.8918 N 0 3 0 0 0 0 - 27.9589 42.4195 1.7111 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1155 42.2545 1.1021 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9209 43.1944 1.9448 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4809 43.9293 3.6447 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0877 44.3393 2.0844 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5544 41.6337 4.7911 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7848 40.8008 3.9031 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1017 40.2324 2.1198 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5813 39.6721 3.6761 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1633 39.9801 6.9291 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7880 39.2082 4.4520 O 0 0 0 0 0 0 - 18.9577 39.7583 3.7588 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9880 38.3677 6.2895 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2815 38.6983 6.6223 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9810 43.1378 4.0530 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3552 41.8253 1.0198 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8716 41.8497 1.8984 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2274 43.3362 1.1878 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2606 44.4661 3.3879 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9304 38.9893 4.9002 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6643 43.8132 4.7674 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2212 42.3647 3.8785 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 44 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 33 42 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -298 - -> -shp2_ligands.10 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -10 - -> -Example 6 - -> -0.225 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_1 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5492 41.4103 2.9581 N 0 0 0 0 0 0 - 24.8206 42.5674 2.0917 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9010 43.4845 2.7073 C 0 0 0 0 0 0 - 27.2006 42.7197 3.0160 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8994 41.4031 3.7428 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7707 40.5926 3.0746 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6801 40.5131 5.5639 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3880 40.8059 6.9100 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0896 40.6058 7.4051 C 0 0 0 0 0 0 - 17.0975 40.0865 6.5706 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3885 39.7774 5.2446 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6614 40.0160 4.7431 C 0 0 0 0 0 0 - 20.9975 40.7599 4.9628 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1772 41.8132 4.0533 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3346 42.0475 3.4126 N 0 0 0 0 0 0 - 23.3734 41.2177 3.6872 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3126 40.1834 4.5784 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1341 39.9630 5.2013 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6784 41.0592 9.0215 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.6099 41.5010 7.9303 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.0817 38.8852 6.0763 N 0 0 0 0 0 0 - 28.0958 43.6100 3.9243 N 0 3 0 0 0 0 - 27.9161 42.4225 1.7316 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1389 42.2068 1.1124 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9138 43.1447 1.9057 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4862 43.9168 3.6199 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0951 44.3193 2.0317 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5951 41.6002 4.7727 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7967 40.7849 3.8035 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0720 40.2559 2.0816 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5735 39.6851 3.6478 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0997 39.9343 6.9555 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6171 39.3789 4.6006 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8614 39.7882 3.7050 H 0 0 0 0 0 0 - 28.3051 44.4803 3.4555 H 0 0 0 0 0 0 - 27.2841 41.7985 1.0996 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8462 41.8967 1.9471 H 0 0 0 0 0 0 - 28.1378 43.3561 1.2147 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6121 43.8070 4.7896 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2610 38.6962 6.6303 H 0 0 0 0 0 0 - 20.3576 42.4728 3.8082 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9058 38.3372 6.2641 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9615 43.1311 4.1303 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 41 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 40 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 35 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 36 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -299 - -> -shp2_ligands.11 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -11 - -> -Example 1 - -> -0.258 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -3 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 24.6991 41.2880 3.1084 N 0 0 0 0 0 0 - 24.7544 42.3659 2.0828 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0819 43.1849 2.0777 C 0 0 1 0 0 0 - 27.2540 42.3327 2.4127 N 0 3 0 0 0 0 - 27.1216 41.4947 3.6356 C 0 0 1 0 0 0 - 25.9265 40.5256 3.4438 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7062 40.2071 5.4923 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4758 40.5221 6.8291 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1971 40.3798 7.3797 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1161 39.9866 6.5815 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3356 39.6937 5.2208 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6213 39.8380 4.6722 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0642 40.4372 4.9252 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1830 41.4378 3.9557 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3711 41.6614 3.3749 N 0 0 0 0 0 0 - 23.5007 40.9783 3.7010 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3990 40.0008 4.6377 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2307 39.6970 5.2474 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9435 40.7315 9.0488 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.2237 38.6160 6.2287 N 0 0 0 0 0 0 - 26.2804 43.8709 0.7586 C 0 0 0 0 0 0 - 28.3857 40.7218 3.8695 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9259 43.0694 2.1825 H 0 0 0 0 0 0 - 24.6132 41.8868 1.1127 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0127 43.9717 2.8313 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0687 42.9223 2.5049 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9651 42.1292 4.5101 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8054 39.9380 4.3555 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1226 39.8073 2.6466 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2827 40.8574 7.4643 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1290 39.8927 7.0109 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5100 39.3854 4.5956 H 0 0 0 0 0 0 - 18.7705 39.6319 3.6214 H 0 0 0 0 0 0 - 20.3445 42.0389 3.6351 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3657 38.3671 6.6998 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0769 38.1169 6.4362 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4101 44.4881 0.5355 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4059 43.1231 -0.0245 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1694 44.4998 0.8062 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2781 40.1120 4.7665 H 0 0 0 0 0 0 - 29.2168 41.4151 3.9991 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5810 40.0767 3.0129 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3962 41.7024 1.6368 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 23 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 21 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 22 1 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 6 28 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 20 35 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 -M CHG 1 4 1 -M END -> -300 - -> -shp2_ligands.12 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -12 - -> -3 - -> -99 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_9 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5464 41.3949 2.9263 N 0 0 0 0 0 0 - 25.7503 40.5506 3.0678 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8709 41.3386 3.7371 C 0 0 0 0 0 0 - 27.1915 42.6963 3.0590 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8970 43.4712 2.7117 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8154 42.5795 2.0867 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6840 40.5121 5.5351 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3973 40.8099 6.8784 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0967 40.6108 7.3636 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1071 40.1041 6.5219 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3987 39.8007 5.1957 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6780 40.0165 4.7027 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0250 40.7291 4.9494 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0676 41.7591 4.0708 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2387 42.0000 3.4418 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3752 41.2250 3.6683 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3242 40.1927 4.5641 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1526 39.9513 5.2085 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6773 41.0128 8.9912 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.6231 41.4655 7.9185 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.1265 38.8828 6.1041 N 0 0 0 0 0 0 - 28.1625 43.5343 3.8924 C 0 0 0 0 0 0 - 25.5587 39.6764 3.6932 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0969 40.1748 2.1061 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7908 40.7659 3.8607 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5127 41.4833 4.7526 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1111 44.3263 2.0672 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4516 43.9274 3.5976 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9414 43.2111 1.9643 H 0 0 0 0 0 0 - 25.0798 42.2770 1.0727 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0992 39.9731 6.8871 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8916 39.7797 3.6691 H 0 0 0 0 0 0 - 22.1946 42.8157 2.7405 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9841 38.3692 6.2894 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2832 38.6944 6.6229 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6388 39.4078 4.5399 H 0 0 0 0 0 0 - 29.2212 43.2300 3.9016 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6786 43.5174 5.3054 N 0 3 0 0 0 0 - 27.9748 44.5967 3.9512 H 0 0 0 0 0 0 - 28.3182 44.0905 5.8559 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7558 43.9317 5.3912 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6585 42.4680 2.0998 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6933 42.6032 5.7389 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 23 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 33 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 34 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 38 40 1 0 0 0 - 38 41 1 0 0 0 - 38 43 1 0 0 0 -M CHG 1 38 1 -M END -> -301 - -> -shp2_ligands.13 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -13 - -> -Example 9 - -> -0.358 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_8 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 46 48 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5594 41.3986 2.9317 N 0 0 0 0 0 0 - 25.7611 40.5558 3.0894 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8712 41.3609 3.7612 C 0 0 0 0 0 0 - 27.2234 42.6835 3.0209 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8987 43.4737 2.7315 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8053 42.5917 2.0987 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6880 40.5151 5.5295 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3970 40.8120 6.8734 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0969 40.6099 7.3595 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1044 40.1134 6.5151 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3955 39.8141 5.1884 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6784 40.0224 4.6979 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0311 40.7308 4.9444 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0849 41.7512 4.0542 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2536 41.9949 3.4287 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3876 41.2120 3.6562 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3295 40.1869 4.5597 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1602 39.9463 5.2058 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6785 40.9865 8.9940 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.6272 41.4363 7.9277 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.1325 38.8841 6.1087 N 0 0 0 0 0 0 - 28.1713 43.4659 3.9245 C 0 0 0 0 0 0 - 27.9599 42.4153 1.7087 C 0 0 0 0 0 0 - 25.5418 39.6858 3.7105 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1035 40.1645 2.1335 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7839 40.7770 3.8765 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5428 41.5457 4.7791 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0922 44.3272 2.0734 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4755 43.9389 3.6240 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9086 43.1927 1.9970 H 0 0 0 0 0 0 - 25.0548 42.3035 1.0774 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0979 39.9774 6.8828 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8869 39.7946 3.6591 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2197 42.8194 2.7371 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9863 38.3608 6.2905 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2877 38.6934 6.6244 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3855 41.8135 1.0137 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8919 41.8903 1.9260 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2305 43.3531 1.2163 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6291 39.4353 4.5313 H 0 0 0 0 0 0 - 29.2219 43.1499 3.9643 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6581 43.5644 5.3258 N 0 3 0 0 0 0 - 28.1411 44.4660 3.7490 H 0 0 0 0 0 0 - 28.3153 44.1625 5.8628 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7496 43.9973 5.3977 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6704 42.6729 5.7808 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 40 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 42 44 1 0 0 0 - 42 45 1 0 0 0 - 42 46 1 0 0 0 -M CHG 1 42 1 -M END -> -302 - -> -shp2_ligands.14 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -14 - -> -Example 8 - -> -0.076 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -7 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 46 48 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5492 41.4103 2.9581 N 0 0 0 0 0 0 - 25.7707 40.5926 3.0746 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8994 41.4031 3.7428 C 0 0 0 0 0 0 - 27.2006 42.7197 3.0160 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9010 43.4845 2.7073 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8206 42.5674 2.0917 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6801 40.5131 5.5639 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3880 40.8059 6.9100 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0896 40.6058 7.4051 C 0 0 0 0 0 0 - 17.0975 40.0865 6.5706 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3885 39.7774 5.2446 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6614 40.0160 4.7431 C 0 0 0 0 0 0 - 20.9975 40.7599 4.9628 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1772 41.8132 4.0533 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3346 42.0475 3.4126 N 0 0 0 0 0 0 - 23.3734 41.2177 3.6872 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3126 40.1834 4.5784 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1341 39.9630 5.2013 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6784 41.0592 9.0215 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.6099 41.5010 7.9303 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.0817 38.8852 6.0763 N 0 0 0 0 0 0 - 28.0958 43.6100 3.9243 N 0 3 0 0 0 0 - 25.5732 39.6852 3.6479 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0720 40.2556 2.0817 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7967 40.7849 3.8035 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5952 41.6002 4.7727 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0952 44.3191 2.0316 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4862 43.9170 3.6198 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9138 43.1446 1.9056 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1390 42.2068 1.1124 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0996 39.9345 6.9555 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6171 39.3786 4.6007 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8616 39.7878 3.7051 H 0 0 0 0 0 0 - 29.3435 42.9152 4.2277 C 0 0 0 0 0 0 - 28.4040 44.8645 3.2441 C 0 0 0 0 0 0 - 22.9055 38.3365 6.2631 H 0 0 0 0 0 0 - 20.3577 42.4731 3.8087 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7216 42.5033 2.0813 H 0 0 0 0 0 0 - 29.8720 42.6956 3.3001 H 0 0 0 0 0 0 - 29.1231 41.9839 4.7495 H 0 0 0 0 0 0 - 29.9668 43.5472 4.8602 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9282 44.6532 2.3120 H 0 0 0 0 0 0 - 29.0359 45.4796 3.8848 H 0 0 0 0 0 0 - 27.4782 45.3974 3.0274 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6101 43.8110 4.7875 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2604 38.6952 6.6292 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 23 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 38 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 46 1 0 0 0 - 22 34 1 0 0 0 - 22 35 1 0 0 0 - 22 45 1 0 0 0 - 34 39 1 0 0 0 - 34 40 1 0 0 0 - 34 41 1 0 0 0 - 35 42 1 0 0 0 - 35 43 1 0 0 0 - 35 44 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -303 - -> -shp2_ligands.15 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -15 - -> -7 - -> -6.5 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_24 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 46 48 0 0 1 0 999 V2000 - 24.6100 41.5762 3.1805 N 0 0 0 0 0 0 - 25.1012 42.9418 2.9241 C 0 0 0 0 0 0 - 26.5271 43.2119 3.4404 C 0 0 0 0 0 0 - 27.5120 42.1773 2.8862 C 0 0 0 0 0 0 - 27.0075 40.8187 3.4015 C 0 0 0 0 0 0 - 25.5915 40.5142 2.8619 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6895 40.5804 5.6954 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5253 40.8623 7.0657 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3098 40.5691 7.7016 C 0 0 0 0 0 0 - 17.2585 40.0212 6.9710 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4135 39.7425 5.6150 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6218 40.0211 4.9824 C 0 0 0 0 0 0 - 20.9859 40.8084 5.0038 C 0 0 0 0 0 0 - 20.9938 41.7637 4.0398 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1560 42.0156 3.3787 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3435 41.3173 3.7063 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3074 40.3369 4.6515 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1430 40.0739 5.2861 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0795 40.8700 9.3883 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.8043 41.6192 7.9628 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.1461 39.0394 6.2158 N 0 0 0 0 0 0 - 28.8772 42.4513 3.5251 N 0 3 0 0 0 0 - 27.7125 42.2524 1.3549 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0251 43.1641 1.8595 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4482 43.6227 3.4588 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5072 43.2143 4.5307 H 0 0 0 0 0 0 - 26.8355 44.2201 3.1804 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9672 40.7880 4.4945 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6964 40.0229 3.1443 H 0 0 0 0 0 0 - 25.6085 40.3843 1.7784 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2756 39.5545 3.2675 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3244 39.7869 7.4634 H 0 0 0 0 0 0 - 18.7352 39.7751 3.9346 H 0 0 0 0 0 0 - 21.9938 42.9789 2.2034 C 0 0 0 0 0 0 - 23.0100 38.5389 6.4063 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2983 38.8233 6.7146 H 0 0 0 0 0 0 - 29.5591 41.7753 3.1813 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7880 42.0817 0.8050 H 0 0 0 0 0 0 - 28.4324 41.5072 1.0133 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0791 43.2320 1.0448 H 0 0 0 0 0 0 - 29.1960 43.3780 3.2760 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6052 39.2945 5.0545 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2382 43.7363 2.4123 H 0 0 0 0 0 0 - 21.6793 42.4241 1.3190 H 0 0 0 0 0 0 - 22.8897 43.5171 1.9214 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8262 42.3954 4.5336 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 42 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 46 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 34 43 1 0 0 0 - 34 44 1 0 0 0 - 34 45 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -304 - -> -shp2_ligands.16 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -16 - -> -Example 24 - -> -0.222 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_28 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 47 50 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5514 41.4004 2.9329 N 0 0 0 0 0 0 - 24.8291 42.5878 2.0978 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9013 43.4869 2.7358 C 0 0 0 0 0 0 - 27.2025 42.7130 3.0211 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8895 41.4079 3.7802 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7697 40.5859 3.1067 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6794 40.5104 5.5019 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6195 40.0391 4.7203 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3223 39.7888 5.2688 C 0 0 0 0 0 0 - 17.0983 40.0475 6.6166 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1375 40.5477 7.3749 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4091 40.7389 6.8493 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0201 40.7305 4.9348 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0640 41.7682 4.0714 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2386 42.0088 3.4485 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3718 41.2305 3.6715 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3249 40.1985 4.5693 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1491 39.9575 5.2053 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1311 38.8990 6.1150 N 0 0 0 0 0 0 - 28.0744 43.6010 3.9172 N 0 3 0 0 0 0 - 27.9821 42.4323 1.7232 C 0 0 0 0 0 0 - 16.5080 39.3055 4.2140 C 0 0 0 0 0 0 - 17.2883 39.3122 3.1020 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5615 39.7270 3.3961 N 0 0 0 0 0 0 - 25.1019 42.2746 1.0887 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9645 43.2246 1.9476 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4768 43.9409 3.6329 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0940 44.3339 2.0744 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5661 41.6170 4.7921 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7871 40.7997 3.8883 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1030 40.2012 2.1409 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5830 39.6922 3.7042 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1261 39.8633 7.0481 H 0 0 0 0 0 0 - 17.9366 40.7977 8.3897 H 0 0 0 0 0 0 - 20.2028 41.0754 7.4958 H 0 0 0 0 0 0 - 22.1832 42.8209 2.7432 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2808 38.6923 6.6167 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9874 38.3835 6.2927 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9438 43.1329 4.1367 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2765 44.4608 3.4084 H 0 0 0 0 0 0 - 27.4273 41.7698 1.0576 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9404 41.9534 1.9312 H 0 0 0 0 0 0 - 28.1739 43.3532 1.1710 H 0 0 0 0 0 0 - 15.4567 39.0511 4.2584 H 0 0 0 0 0 0 - 17.0853 39.1306 2.0660 H 0 0 0 0 0 0 - 19.2785 39.8207 2.6938 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6026 43.8497 4.7761 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 4 21 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 22 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 33 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 36 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 19 37 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 20 40 1 0 0 0 - 20 47 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 46 1 0 0 0 -M CHG 1 20 1 -M END -> -305 - -> -shp2_ligands.17 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -17 - -> -Example 28 - -> -0.632 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -10 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5557 41.3942 2.9358 N 0 0 0 0 0 0 - 24.8217 42.5879 2.1047 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8975 43.4906 2.7355 C 0 0 0 0 0 0 - 27.1938 42.7114 3.0214 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8897 41.4069 3.7882 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7738 40.5799 3.1148 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6903 40.5200 5.5265 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3824 40.8396 6.8595 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0812 40.6300 7.3396 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1026 40.0983 6.5003 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4075 39.7897 5.1791 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6880 40.0180 4.6931 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0236 40.7425 4.9440 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0730 41.7667 4.0636 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2439 41.9993 3.4410 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3841 41.2146 3.6674 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3208 40.1779 4.5575 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1506 39.9550 5.2090 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6473 41.0428 8.9606 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.5761 41.5664 7.8891 Cl 0 0 0 0 0 0 - 28.0749 43.5997 3.9053 N 0 3 0 0 0 0 - 27.9744 42.4341 1.7292 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0585 42.3021 1.0792 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9442 43.2084 1.9782 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4794 43.9544 3.6310 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0902 44.3302 2.0637 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5783 41.6104 4.8061 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7884 40.7983 3.8871 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1064 40.1787 2.1571 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5597 39.6965 3.7150 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0953 39.9519 6.8631 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6529 39.3881 4.5218 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9075 39.7684 3.6629 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9389 43.1200 4.1164 H 0 0 0 0 0 0 - 27.4154 41.7693 1.0708 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9337 41.9601 1.9428 H 0 0 0 0 0 0 - 28.1654 43.3564 1.1789 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2826 44.4545 3.3885 H 0 0 0 0 0 0 - 22.1353 39.1266 5.9026 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2035 42.8271 2.7583 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6036 43.8514 4.7631 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 23 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 21 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 40 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 21 34 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 35 1 0 0 0 - 22 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 -M CHG 1 21 1 -M END -> -306 - -> -shp2_ligands.18 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -18 - -> -10 - -> -5.7 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_25 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 44 46 0 0 1 0 999 V2000 - 24.7929 41.5142 3.1477 N 0 0 0 0 0 0 - 25.8344 40.4760 3.0612 C 0 0 0 0 0 0 - 27.1748 40.9732 3.6511 C 0 0 0 0 0 0 - 27.7037 42.2764 2.9922 C 0 0 0 0 0 0 - 26.5450 43.2287 2.5702 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1808 42.5876 2.2240 C 0 0 0 0 0 0 - 19.8262 40.5700 5.6738 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5917 40.8481 7.0366 C 0 0 0 0 0 0 - 18.3265 40.5734 7.5966 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3166 40.0191 6.8151 C 0 0 0 0 0 0 - 17.5480 39.7348 5.4706 C 0 0 0 0 0 0 - 18.7902 40.0223 4.9119 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1469 40.7953 5.0104 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1477 41.7025 4.0132 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2993 41.9387 3.3328 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5053 41.2696 3.6590 C 0 0 0 0 0 0 - 23.4706 40.3379 4.6584 N 0 0 0 0 0 0 - 22.3243 40.0948 5.3241 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9779 40.9265 9.2500 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.8097 41.6023 8.0169 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.3429 39.1348 6.3276 N 0 0 0 0 0 0 - 28.3987 41.8105 1.6993 C 0 0 0 0 0 0 - 28.7321 42.9896 3.7652 N 0 3 0 0 0 0 - 22.0782 42.8210 2.2061 C 0 0 0 0 0 0 - 21.8991 43.5262 1.2952 N 0 0 0 0 0 0 - 25.5368 39.5615 3.5507 H 0 0 0 0 0 0 - 25.9715 40.1872 2.0179 H 0 0 0 0 0 0 - 27.8971 40.1658 3.5581 H 0 0 0 0 0 0 - 27.0447 41.1141 4.7328 H 0 0 0 0 0 0 - 26.8505 43.8540 1.7352 H 0 0 0 0 0 0 - 26.3764 43.9599 3.3678 H 0 0 0 0 0 0 - 24.4947 43.4179 2.3116 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1317 42.2639 1.1822 H 0 0 0 0 0 0 - 16.3537 39.7954 7.2470 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7707 39.2857 4.8626 H 0 0 0 0 0 0 - 18.9498 39.7782 3.8664 H 0 0 0 0 0 0 - 21.4774 38.9007 6.7877 H 0 0 0 0 0 0 - 23.1967 38.6071 6.5093 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8686 42.5474 1.0313 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7017 41.2032 1.1219 H 0 0 0 0 0 0 - 29.1298 41.0412 1.9479 H 0 0 0 0 0 0 - 29.0157 43.8194 3.2640 H 0 0 0 0 0 0 - 28.3558 43.2524 4.6649 H 0 0 0 0 0 0 - 29.5317 42.3870 3.8979 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 5 31 1 0 0 0 - 6 32 1 0 0 0 - 6 33 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 34 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 35 1 0 0 0 - 12 36 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 24 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 24 25 3 0 0 0 -M CHG 1 23 1 -M END -> -307 - -> -shp2_ligands.19 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -19 - -> -Example 25 - -> -0.315 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_27 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 24.6991 41.2880 3.1084 N 0 0 0 0 0 0 - 24.7544 42.3659 2.0828 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0819 43.1849 2.0777 C 0 0 1 0 0 0 - 27.2540 42.3327 2.4127 N 0 3 0 0 0 0 - 27.1216 41.4947 3.6356 C 0 0 1 0 0 0 - 25.9265 40.5256 3.4438 C 0 0 0 0 0 0 - 19.7062 40.2071 5.4923 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4758 40.5221 6.8291 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1971 40.3798 7.3797 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1161 39.9866 6.5815 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3356 39.6937 5.2208 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6213 39.8380 4.6722 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0642 40.4372 4.9252 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1830 41.4378 3.9557 N 0 0 0 0 0 0 - 22.3711 41.6614 3.3749 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5007 40.9783 3.7010 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3990 40.0008 4.6377 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2307 39.6970 5.2474 C 0 0 0 0 0 0 - 17.9052 40.7222 9.0484 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.7750 41.0744 7.8377 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.2224 38.6180 6.2309 N 0 0 0 0 0 0 - 26.2822 43.8711 0.7590 C 0 0 0 0 0 0 - 28.3855 40.7216 3.8701 C 0 0 0 0 0 0 - 23.9975 43.1381 2.1866 H 0 0 0 0 0 0 - 24.5965 41.9041 1.1061 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0162 43.9712 2.8322 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0700 42.9204 2.5053 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9639 42.1287 4.5102 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8110 39.9363 4.3552 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1261 39.8086 2.6459 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1286 39.8947 7.0105 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5088 39.3908 4.5936 H 0 0 0 0 0 0 - 18.7827 39.6501 3.6201 H 0 0 0 0 0 0 - 21.3638 38.3701 6.7014 H 0 0 0 0 0 0 - 23.0753 38.1193 6.4406 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4124 44.4886 0.5350 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4084 43.1235 -0.0241 H 0 0 0 0 0 0 - 27.1712 44.4998 0.8079 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2774 40.1120 4.7672 H 0 0 0 0 0 0 - 29.2166 41.4148 3.9999 H 0 0 0 0 0 0 - 28.5810 40.0763 3.0137 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3953 41.6996 1.6390 H 0 0 0 0 0 0 - 22.2830 42.4182 2.6166 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 22 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 27 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 23 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 43 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 34 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 22 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 -M CHG 1 4 1 -M END -> -308 - -> -shp2_ligands.20 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -20 - -> -Example 27 - -> -0.57 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -6 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 40 42 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5492 41.4103 2.9581 N 0 0 0 0 0 0 - 24.8206 42.5674 2.0917 C 0 0 0 0 0 0 - 25.9010 43.4845 2.7073 C 0 0 0 0 0 0 - 27.2006 42.7197 3.0160 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8994 41.4031 3.7428 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7707 40.5926 3.0746 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6801 40.5131 5.5639 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3880 40.8059 6.9100 C 0 0 0 0 0 0 - 18.0896 40.6058 7.4051 C 0 0 0 0 0 0 - 17.0975 40.0865 6.5706 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3885 39.7774 5.2446 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6614 40.0160 4.7431 C 0 0 0 0 0 0 - 20.9975 40.7599 4.9628 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1772 41.8132 4.0533 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3346 42.0475 3.4126 N 0 0 0 0 0 0 - 23.3734 41.2177 3.6872 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3126 40.1834 4.5784 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1341 39.9630 5.2013 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6784 41.0592 9.0215 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.6099 41.5010 7.9303 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.0817 38.8852 6.0763 N 0 0 0 0 0 0 - 28.0958 43.6100 3.9243 N 0 3 0 0 0 0 - 23.9362 43.1801 1.9134 H 0 0 0 0 0 0 - 25.1411 42.2139 1.1097 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1018 44.3579 2.0849 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4758 43.9149 3.6140 H 0 0 0 0 0 0 - 27.8085 40.8158 3.8859 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5566 41.6353 4.7463 H 0 0 0 0 0 0 - 25.6109 39.6728 3.6282 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0829 40.2916 2.0753 H 0 0 0 0 0 0 - 16.0828 39.9773 6.9300 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6300 39.3918 4.5807 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8719 39.7811 3.7086 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2559 44.4914 3.4401 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6465 43.8153 4.7999 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9510 38.4014 6.2942 H 0 0 0 0 0 0 - 20.3640 42.4825 3.8394 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6753 42.4671 2.0654 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2504 38.7041 6.6087 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9838 43.1729 4.1119 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 23 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 38 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 31 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 37 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 34 1 0 0 0 - 22 35 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -309 - -> -shp2_ligands.21 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -21 - -> -6 - -> -1.3 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_30 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 42 44 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5353 41.3991 2.9617 N 0 0 0 0 0 0 - 24.7904 42.5868 2.1178 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8810 43.4864 2.7374 C 0 0 0 0 0 0 - 27.1904 42.7177 3.0202 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8799 41.4106 3.7771 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7613 40.5911 3.1100 C 0 0 0 0 0 0 - 19.6930 40.5254 5.5288 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4034 40.8157 6.8758 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1082 40.6044 7.3696 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1167 40.0887 6.5328 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4098 39.7819 5.2071 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6895 40.0203 4.7125 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0365 40.7490 4.9467 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1333 41.7708 4.0585 N 0 0 0 0 0 0 - 22.2940 41.9986 3.4273 N 0 0 0 0 0 0 - 23.3597 41.1910 3.6865 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3270 40.1643 4.5796 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1528 39.9456 5.2064 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6833 41.0096 8.9986 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.6245 41.4803 7.9166 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.1086 38.8756 6.0941 N 0 0 0 0 0 0 - 28.0640 43.6032 3.9216 N 0 3 0 0 0 0 - 27.9783 42.4349 1.7217 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0622 42.2702 1.1121 H 0 0 0 0 0 0 - 23.8919 43.1904 1.9925 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4681 43.9379 3.6411 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0761 44.3323 2.0760 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5552 41.6277 4.7883 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7778 40.8018 3.8837 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0791 40.2303 2.1341 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5850 39.6899 3.6945 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1095 39.9553 6.9017 H 0 0 0 0 0 0 - 16.6477 39.3919 4.5519 H 0 0 0 0 0 0 - 18.8949 39.7782 3.6715 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9746 38.3788 6.2904 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2689 38.6932 6.6209 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9333 43.1400 4.1444 H 0 0 0 0 0 0 - 27.4275 41.7736 1.0493 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9366 41.9502 1.9281 H 0 0 0 0 0 0 - 28.1799 43.3541 1.1679 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2675 44.4651 3.4205 H 0 0 0 0 0 0 - 27.5917 43.8449 4.7797 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -310 - -> -shp2_ligands.22 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -22 - -> -Example 30 - -> -0.194 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_5 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 47 49 0 0 1 0 999 V2000 - 24.7241 41.2613 2.6346 N 0 0 0 0 0 0 - 25.8333 40.2945 2.6700 C 0 0 0 0 0 0 - 26.9699 40.8429 3.5529 C 0 0 0 0 0 0 - 27.4505 42.2668 3.1409 C 0 0 0 0 0 0 - 26.3237 43.1539 2.5080 C 0 0 0 0 0 0 - 25.1614 42.4028 1.8201 C 0 0 0 0 0 0 - 20.0829 40.6840 5.7737 C 0 0 0 0 0 0 - 20.0391 40.8338 7.1767 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8298 40.7034 7.8687 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6817 40.3910 7.1941 C 0 0 0 0 0 0 - 17.6939 40.2193 5.8132 C 0 0 0 0 0 0 - 18.8855 40.3853 5.1133 C 0 0 0 0 0 0 - 21.3243 40.8337 4.9480 C 0 0 0 0 0 0 - 21.3462 41.8381 4.0268 C 0 0 0 0 0 0 - 22.4822 42.0243 3.3029 N 0 0 0 0 0 0 - 23.6278 41.2327 3.4968 C 0 0 0 0 0 0 - 23.5916 40.2239 4.4038 N 0 0 0 0 0 0 - 22.4598 40.0202 5.1184 C 0 0 0 0 0 0 - 18.6695 40.7956 9.5758 Cl 0 0 0 0 0 0 - 21.4608 41.0419 8.1147 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.4732 38.9282 5.9702 N 0 0 0 0 0 0 - 28.4859 42.0190 2.0282 C 0 0 0 0 0 0 - 28.1467 42.9714 4.2285 N 0 3 0 0 0 0 - 25.5078 39.3196 3.0310 H 0 0 0 0 0 0 - 26.1989 40.1160 1.6558 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7954 40.1259 3.5498 H 0 0 0 0 0 0 - 26.6252 40.8384 4.5927 H 0 0 0 0 0 0 - 26.7345 43.8649 1.7863 H 0 0 0 0 0 0 - 25.8911 43.7981 3.2771 H 0 0 0 0 0 0 - 24.3292 43.0802 1.6218 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4809 42.0664 0.8308 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7922 40.2785 7.7937 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5632 39.9184 5.1087 O 0 0 0 0 0 0 - 18.8724 40.2684 4.0412 H 0 0 0 0 0 0 - 23.3386 38.4221 6.1486 H 0 0 0 0 0 0 - 21.6432 38.7023 6.4991 H 0 0 0 0 0 0 - 15.3468 39.8935 5.8343 C 0 0 0 0 0 0 - 14.5261 39.9323 5.1461 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2219 40.7801 6.4384 H 0 0 0 0 0 0 - 15.2618 39.0000 6.4563 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9929 42.8697 1.5493 H 0 0 0 0 0 0 - 28.0337 41.3963 1.2563 H 0 0 0 0 0 0 - 29.2374 41.3190 2.3934 H 0 0 0 0 0 0 - 28.4351 43.8848 3.9081 H 0 0 0 0 0 0 - 27.5241 43.0729 5.0173 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9594 42.4405 4.5074 H 0 0 0 0 0 0 - 20.4755 42.4616 3.8869 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 33 1 0 0 0 - 12 34 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 47 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 23 46 1 0 0 0 - 33 37 1 0 0 0 - 37 38 1 0 0 0 - 37 39 1 0 0 0 - 37 40 1 0 0 0 -M CHG 1 23 1 -M END -> -311 - -> -shp2_ligands.23 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -23 - -> -Example 5 - -> -2.859 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_4 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5430 41.4114 2.9550 N 0 0 0 0 0 0 - 25.7642 40.5993 3.0891 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8786 41.4166 3.7666 C 0 0 0 0 0 0 - 27.2006 42.7127 3.0029 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8937 43.4892 2.7374 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8050 42.5910 2.1109 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0144 40.7174 4.9510 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1677 41.7795 4.0783 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3249 42.0375 3.4270 N 0 0 0 0 0 0 - 23.3661 41.2020 3.6845 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3235 40.1654 4.5608 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1453 39.9248 5.1862 C 0 0 0 0 0 0 - 22.0944 38.8546 6.0735 N 0 0 0 0 0 0 - 28.0809 43.5947 3.9100 N 0 3 0 0 0 0 - 27.9740 42.4207 1.6938 C 0 0 0 0 0 0 - 26.0828 40.2778 2.0962 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5977 39.6787 3.6476 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5281 41.6511 4.7617 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7693 40.8029 3.8916 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4814 43.9202 3.6497 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0840 44.3456 2.0896 H 0 0 0 0 0 0 - 25.0984 42.2408 1.1213 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9190 43.2070 1.9498 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9707 43.1542 4.0991 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8895 41.8542 1.8809 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2450 43.3369 1.1662 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3855 41.8245 0.9924 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2454 44.4799 3.4324 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9535 38.3533 6.2811 H 0 0 0 0 0 0 - 20.3465 42.4591 3.9019 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2404 38.6627 6.5726 H 0 0 0 0 0 0 - 19.7006 40.4765 5.5478 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5441 40.0185 4.9425 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4703 39.9918 5.8252 C 0 0 0 0 0 0 - 17.7949 40.4352 7.0994 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4745 40.8098 7.2203 S 0 0 0 0 0 0 - 18.4766 39.7097 3.9112 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4831 39.6652 5.5342 H 0 0 0 0 0 0 - 16.9032 40.6023 8.2756 C 0 0 0 0 0 0 - 16.7941 41.6460 8.5777 H 0 0 0 0 0 0 - 17.2872 40.0431 9.1251 H 0 0 0 0 0 0 - 15.9194 40.2081 8.0272 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6324 43.8025 4.7935 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 10 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 16 1 0 0 0 - 2 17 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 18 1 0 0 0 - 3 19 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 14 1 0 0 0 - 4 15 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 20 1 0 0 0 - 5 21 1 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 32 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 14 24 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 43 1 0 0 0 - 15 25 1 0 0 0 - 15 26 1 0 0 0 - 15 27 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 36 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 37 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 - 39 40 1 0 0 0 - 39 41 1 0 0 0 - 39 42 1 0 0 0 -M CHG 1 14 1 -M END -> -312 - -> -shp2_ligands.24 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -24 - -> -Example 4 - -> -0.974 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_23 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 43 45 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5404 41.5885 3.3090 N 0 0 0 0 0 0 - 24.8982 42.8207 2.6006 C 0 0 0 0 0 0 - 26.2819 43.3367 3.0100 C 0 0 0 0 0 0 - 27.3971 42.2987 2.8091 C 0 0 0 0 0 0 - 26.9514 40.9750 3.4735 C 0 0 0 0 0 0 - 25.5365 40.5417 3.0039 C 0 0 0 0 0 0 - 19.5908 40.5482 5.7796 C 0 0 0 0 0 0 - 19.3934 40.8482 7.1425 C 0 0 0 0 0 0 - 18.1521 40.5813 7.7423 C 0 0 0 0 0 0 - 17.1217 40.0191 6.9875 C 0 0 0 0 0 0 - 17.3078 39.7413 5.6358 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5344 40.0192 5.0382 C 0 0 0 0 0 0 - 20.9028 40.7687 5.1073 C 0 0 0 0 0 0 - 20.9078 41.7188 4.1417 N 0 0 0 0 0 0 - 22.0632 41.9854 3.4794 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2624 41.3076 3.8120 C 0 0 0 0 0 0 - 23.2282 40.3206 4.7525 N 0 0 0 0 0 0 - 22.0678 40.0524 5.3940 C 0 0 0 0 0 0 - 17.8605 40.9445 9.4073 Cl 0 0 0 0 0 0 - 20.6492 41.6069 8.0667 Cl 0 0 0 0 0 0 - 22.0799 39.0352 6.3399 N 0 0 0 0 0 0 - 28.6403 42.8202 3.5448 N 0 3 0 0 0 0 - 27.7928 42.1290 1.3299 C 0 0 0 0 0 0 - 24.8178 42.6857 1.5203 H 0 0 0 0 0 0 - 24.2286 43.6152 2.9029 H 0 0 0 0 0 0 - 26.2161 43.6207 4.0603 H 0 0 0 0 0 0 - 26.4810 44.2580 2.4609 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9134 41.0715 4.5641 H 0 0 0 0 0 0 - 27.6822 40.1891 3.2852 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5245 40.3383 1.9332 H 0 0 0 0 0 0 - 25.2946 39.5971 3.4899 H 0 0 0 0 0 0 - 16.1718 39.8031 7.4535 H 0 0 0 0 0 0 - 18.6691 39.7720 3.9920 H 0 0 0 0 0 0 - 21.9002 43.1348 2.1934 Cl 0 0 0 0 0 0 - 21.2246 38.7897 6.8170 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9415 38.5372 6.5292 H 0 0 0 0 0 0 - 29.4267 42.2097 3.3639 H 0 0 0 0 0 0 - 26.9724 41.7611 0.7163 H 0 0 0 0 0 0 - 28.6122 41.4170 1.2248 H 0 0 0 0 0 0 - 28.1175 43.0722 0.8894 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8625 43.7498 3.2184 H 0 0 0 0 0 0 - 16.5085 39.3000 5.0566 H 0 0 0 0 0 0 - 28.4824 42.8752 4.5419 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 2 25 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 22 1 0 0 0 - 4 23 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 6 31 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 13 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 19 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 32 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 42 1 0 0 0 - 12 33 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -313 - -> -shp2_ligands.25 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -25 - -> -Example 23 - -> -0.392 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ -Example_3 - 3D - Schrodinger Suite 2019-4. - 40 42 0 0 1 0 999 V2000 - 24.5401 41.3989 2.9532 N 0 0 0 0 0 0 - 24.8051 42.5811 2.1091 C 0 0 0 0 0 0 - 25.8867 43.4859 2.7414 C 0 0 0 0 0 0 - 27.1959 42.7112 3.0057 C 0 0 0 0 0 0 - 26.8794 41.4168 3.7759 C 0 0 0 0 0 0 - 25.7664 40.5923 3.1008 C 0 0 0 0 0 0 - 21.0145 40.7222 4.9516 C 0 0 0 0 0 0 - 21.1622 41.7734 4.0578 C 0 0 0 0 0 0 - 22.3208 42.0228 3.4091 N 0 0 0 0 0 0 - 23.3684 41.1984 3.6775 C 0 0 0 0 0 0 - 23.3236 40.1664 4.5710 N 0 0 0 0 0 0 - 22.1459 39.9363 5.1958 C 0 0 0 0 0 0 - 22.1027 38.8666 6.0810 N 0 0 0 0 0 0 - 28.0896 43.5958 3.9002 N 0 3 0 0 0 0 - 27.9640 42.4179 1.7000 C 0 0 0 0 0 0 - 25.0995 42.2499 1.1137 H 0 0 0 0 0 0 - 23.9127 43.1864 1.9546 H 0 0 0 0 0 0 - 25.4693 43.9239 3.6497 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0748 44.3406 2.0903 H 0 0 0 0 0 0 - 26.5404 41.6483 4.7775 H 0 0 0 0 0 0 - 27.7726 40.8054 3.9001 H 0 0 0 0 0 0 - 26.0868 40.2603 2.1152 H 0 0 0 0 0 0 - 25.5901 39.6802 3.6671 H 0 0 0 0 0 0 - 28.9764 43.1472 4.0723 H 0 0 0 0 0 0 - 27.3702 41.8206 1.0036 H 0 0 0 0 0 0 - 28.8797 41.8544 1.8898 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2303 43.3358 1.1767 H 0 0 0 0 0 0 - 28.2507 44.4725 3.4086 H 0 0 0 0 0 0 - 22.9628 38.3587 6.2652 H 0 0 0 0 0 0 - 20.3462 42.4465 3.8573 H 0 0 0 0 0 0 - 21.2513 38.6714 6.5822 H 0 0 0 0 0 0 - 19.6898 40.4893 5.5418 C 0 0 0 0 0 0 - 18.5442 40.0172 4.9256 C 0 0 0 0 0 0 - 17.4539 39.9740 5.7859 C 0 0 0 0 0 0 - 17.7753 40.4507 7.0396 C 0 0 0 0 0 0 - 19.4367 40.8750 7.2092 S 0 0 0 0 0 0 - 18.5049 39.6859 3.8981 H 0 0 0 0 0 0 - 16.4770 39.6243 5.4935 H 0 0 0 0 0 0 - 16.7315 40.6794 8.3518 Cl 0 0 0 0 0 0 - 27.6528 43.8098 4.7840 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 10 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 16 1 0 0 0 - 2 17 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 18 1 0 0 0 - 3 19 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 14 1 0 0 0 - 4 15 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 20 1 0 0 0 - 5 21 1 0 0 0 - 6 22 1 0 0 0 - 6 23 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 12 1 0 0 0 - 7 32 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 14 24 1 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 25 1 0 0 0 - 15 26 1 0 0 0 - 15 27 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 36 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 37 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 38 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 39 1 0 0 0 -M CHG 1 14 1 -M END -> -314 - -> -shp2_ligands.26 - -> -C:\Users\Alejandro\Desktop\tmp\Merck\shp2 - -> -shp2_ligands.sdf - -> -26 - -> -Example 3 - -> -0.95 - -> -shp2_ligands - -> -shp2_ligands - -> -0 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/syk_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/syk_ligands.sdf deleted file mode 100755 index bbaa4ce9..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/syk_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,5254 +0,0 @@ -CHEMBL3264999 - 3D - Structure written by MMmdl. - 62 66 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5783 3.7648 10.8956 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2921 3.6116 9.9088 O 0 0 0 0 0 0 - -1.0169 4.3144 12.0284 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3720 4.8041 12.2640 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4192 4.3632 11.4637 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7092 4.8293 11.6879 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9520 5.7363 12.7126 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9048 6.1772 13.5130 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6148 5.7111 13.2887 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3442 6.2394 12.9547 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2606 6.2094 12.1385 O 0 0 0 0 0 0 - -6.4851 6.7362 14.1839 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6991 -0.3052 13.2021 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0020 0.6746 12.5251 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7528 -4.0708 13.5508 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0179 -2.5675 12.6505 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3306 -3.2808 13.5889 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2100 -3.6528 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1911 -3.2101 16.5029 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0246 -1.8858 16.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1701 2.0030 13.3719 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7656 0.9739 15.2897 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2089 -0.8330 17.3301 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5934 2.3309 11.2002 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8342 3.7939 9.3845 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4564 4.4350 9.2166 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6053 2.2130 12.7811 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4654 4.4592 12.8620 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2302 3.6570 10.6659 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5245 4.4860 11.0648 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0938 6.8834 14.3107 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7995 6.0544 13.9118 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3345 7.1291 14.5640 H 0 0 0 0 0 0 - -5.7598 6.7805 14.8854 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1547 -0.0168 13.6337 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6851 1.2257 11.8787 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2218 0.2131 11.9198 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5485 1.3591 13.2420 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 39 1 0 0 0 - 1 40 1 0 0 0 - 1 41 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 36 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 35 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 44 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 45 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 46 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 47 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 48 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 49 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 50 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 51 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 52 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 31 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 53 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 54 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 55 1 0 0 0 - 31 56 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 34 1 0 0 0 - 34 57 1 0 0 0 - 34 58 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 59 1 0 0 0 - 36 37 1 0 0 0 - 37 38 1 0 0 0 - 38 60 1 0 0 0 - 38 61 1 0 0 0 - 38 62 1 0 0 0 -M END -> -4.3 - -$$$$ -CHEMBL3265014 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 55 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3279 4.6787 8.9005 C 0 0 0 0 0 0 - 0.1733 5.0540 8.7192 O 0 0 0 0 0 0 - 2.3332 5.0113 8.0903 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4627 3.7335 10.9031 O 0 0 0 0 0 0 - -1.2689 3.2382 11.9077 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6991 -0.3052 13.2022 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0020 0.6747 12.5251 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3281 -3.2944 13.5971 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7409 -4.0644 13.5414 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0324 -2.5598 12.6514 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2100 -3.6528 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1910 -3.2101 16.5030 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0247 -1.8856 16.0476 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1702 2.0029 13.3720 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7655 0.9739 15.2896 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2092 -0.8329 17.3299 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5935 2.3311 11.2005 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8342 3.7941 9.3846 H 0 0 0 0 0 0 - 2.2554 5.5897 7.2660 H 0 0 0 0 0 0 - 3.2955 4.7255 8.2018 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2930 3.5778 11.7524 H 0 0 0 0 0 0 - -0.9095 3.5968 12.8721 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2412 2.1486 11.8919 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6053 2.2127 12.7810 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1548 -0.0169 13.6336 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6852 1.2257 11.8788 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2219 0.2131 11.9198 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5485 1.3591 13.2420 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 28 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 37 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 38 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 27 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 27 2 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 - 31 51 1 0 0 0 - 31 52 1 0 0 0 -M END -> -23.8 - -$$$$ -CHEMBL3265034 - 3D - Structure written by MMmdl. - 53 58 0 0 1 0 999 V2000 - -5.7484 -4.1352 14.0916 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2467 -3.7965 14.1043 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0046 -2.3867 14.6667 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7211 -2.2350 16.0203 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1989 -2.6529 15.9141 C 0 0 0 0 0 0 - -6.2949 -3.9790 15.3990 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5163 -2.1019 14.8026 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7444 -2.8650 15.6773 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3947 -2.6068 15.8182 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2168 -1.5789 15.0929 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5959 -1.3413 15.3408 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5346 -0.4433 14.7633 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1825 0.3683 13.7202 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1144 1.2372 13.2163 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4190 1.2837 13.7018 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7465 0.4877 14.7594 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8977 0.3771 15.4862 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5879 -0.5237 16.5292 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3754 -1.0416 16.3746 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8361 -0.3925 15.3266 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6384 2.1617 12.1197 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5461 2.6405 11.1618 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1445 3.4623 10.1105 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7985 3.8158 10.0184 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9907 4.5934 9.1205 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2502 4.6054 9.5128 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3377 3.8946 10.6262 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8856 3.3616 10.9945 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2735 2.5429 12.0624 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5534 -0.8155 14.1947 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9224 -1.0793 14.0569 C 0 0 0 0 0 0 - -6.2805 -3.4837 13.3942 H 0 0 0 0 0 0 - -5.9038 -5.1578 13.7553 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8408 -3.8755 13.0976 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7264 -4.5315 14.7202 H 0 0 0 0 0 0 - -4.4085 -1.6510 13.9680 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6501 -1.2085 16.3760 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2346 -2.8646 16.7675 H 0 0 0 0 0 0 - -6.7408 -1.9682 15.2574 H 0 0 0 0 0 0 - -6.6781 -2.6070 16.8893 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1988 -3.6577 16.2587 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1892 -3.2031 16.5076 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9651 -1.8647 16.1167 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1809 1.9629 13.3422 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7856 0.9487 15.2757 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2292 -0.7937 17.3519 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5884 2.3469 11.2223 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8528 3.8060 9.3832 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3017 5.1139 8.2368 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2272 3.7941 11.0903 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5743 2.2194 12.8032 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1159 -0.0226 13.6276 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5226 -0.4866 13.3791 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 34 1 0 0 0 - 2 35 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 7 1 0 0 0 - 3 36 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 37 1 0 0 0 - 4 38 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 39 1 0 0 0 - 5 40 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 31 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 41 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 42 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 43 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 20 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 21 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 44 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 45 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 46 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 29 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 47 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 48 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 28 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 49 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 50 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 - 31 53 1 0 0 0 -M END -> -3.8 - -$$$$ -CHEMBL3265015 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 54 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2658 -3.1175 13.5713 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8897 -2.4164 14.7436 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5439 -2.1718 14.8418 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7693 -2.9126 15.7244 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4086 -2.6509 15.8610 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2048 -1.6479 15.1096 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6017 -1.4006 15.3489 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5425 -0.4814 14.7772 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1966 0.3306 13.7372 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1151 1.2253 13.2359 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4125 1.2753 13.7158 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7468 0.4823 14.7726 N 0 0 0 0 0 0 - 5.9017 0.3875 15.4968 C 0 0 0 0 0 0 - 5.6113 -0.5378 16.5263 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3968 -1.0589 16.3854 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8461 -0.4133 15.3411 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6468 2.1713 12.1254 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2968 2.6023 12.0851 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8699 3.4876 11.0892 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7721 3.9706 10.1365 C 0 0 0 0 0 0 - 3.0808 3.5379 10.1569 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5135 2.6334 11.0944 C 0 0 0 0 0 0 - 4.9035 2.1468 10.9601 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3475 4.9212 9.0657 C 0 0 0 0 0 0 - 0.1679 5.0957 8.8335 O 0 0 0 0 0 0 - 2.3260 5.5415 8.3940 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5697 -0.9333 14.1871 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9604 -1.1834 14.0595 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7686 -0.4755 13.1689 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2961 0.5699 12.3655 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3441 -3.2619 13.5806 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7878 -4.0957 13.5514 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0115 -2.5871 12.6508 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2259 -3.6928 16.3199 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1739 -3.2287 16.5652 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9820 -1.9375 16.1133 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1700 1.9545 13.3487 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7839 0.9785 15.2881 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2593 -0.8148 17.3315 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5957 2.2582 12.8300 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1662 3.8085 11.0690 H 0 0 0 0 0 0 - 3.7700 3.8907 9.4150 H 0 0 0 0 0 0 - 5.2620 2.3460 11.8705 H 0 0 0 0 0 0 - 5.3949 2.8482 10.3208 H 0 0 0 0 0 0 - 5.0504 1.1199 10.6395 H 0 0 0 0 0 0 - 2.1194 6.2002 7.6574 H 0 0 0 0 0 0 - 3.2889 5.3426 8.6184 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1342 -0.2419 13.6061 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0776 1.0040 11.7462 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4823 0.2640 11.7134 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0380 1.3248 13.0744 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 49 1 0 0 0 - 30 50 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 -M END -> -113 - -$$$$ -CHEMBL3265036 - 3D - Structure written by MMmdl. - 55 60 0 0 1 0 999 V2000 - -4.7688 -2.7849 12.3431 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3846 -4.1377 12.6456 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4594 -4.9732 13.3425 O 0 0 0 0 0 0 - -4.3771 -4.8619 14.7737 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4823 -3.4746 15.4482 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8932 -2.3265 14.7696 N 0 0 0 0 0 0 - -4.5743 -1.9363 13.5651 C 0 0 0 0 0 0 - -2.4838 -2.1095 14.8521 C 0 0 0 0 0 0 - -1.6944 -2.8761 15.7249 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3386 -2.6335 15.8473 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2634 -1.6168 15.1140 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6446 -1.3934 15.3516 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5467 -0.4494 14.7774 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1622 0.3813 13.7703 N 0 0 0 0 0 0 - 3.0905 1.2361 13.2368 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3967 1.2828 13.6973 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7322 0.4976 14.7555 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8998 0.3887 15.4576 C 0 0 0 0 0 0 - 5.6143 -0.5477 16.4779 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4157 -1.0782 16.3290 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8521 -0.4000 15.3224 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6115 2.1334 12.1178 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5406 2.6292 11.1800 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1477 3.4565 10.1243 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8039 3.8086 10.0214 C 0 0 0 0 0 0 - 1.0010 4.6077 9.1343 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2411 4.6153 9.5215 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3421 3.8665 10.6189 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8809 3.3298 10.9772 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2478 2.4836 12.0372 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4905 -0.8517 14.2206 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8442 -1.1028 14.0951 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4655 -2.2112 11.7306 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8535 -2.8315 11.7616 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6106 -4.5931 11.6807 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3420 -4.0330 13.1669 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4412 -5.3258 15.0901 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1781 -5.4795 15.1894 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1424 -3.5352 16.4845 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5391 -3.2263 15.6236 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1926 -0.9915 13.1890 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5588 -1.6067 13.9319 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1452 -3.6541 16.3212 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2418 -3.2285 16.5309 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0461 -1.9727 16.0611 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1489 1.9535 13.3193 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7638 0.9944 15.2597 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2642 -0.8294 17.2788 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5777 2.3521 11.2618 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8741 3.8108 9.4106 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3139 5.1535 8.2666 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2254 3.7567 11.0774 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5353 2.1303 12.7513 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0514 -0.0690 13.6498 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4203 -0.4773 13.4210 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 7 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 35 1 0 0 0 - 2 36 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 37 1 0 0 0 - 4 38 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 39 1 0 0 0 - 5 40 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 8 1 0 0 0 - 7 41 1 0 0 0 - 7 42 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 32 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 43 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 44 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 31 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 45 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 21 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 22 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 46 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 21 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 47 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 48 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 30 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 49 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 50 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 29 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 51 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 52 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 30 53 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 54 1 0 0 0 - 32 55 1 0 0 0 -M END -> -23.1 - -$$$$ -CHEMBL3265020 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2567 -3.1041 13.5694 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8737 -2.3598 14.7157 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5259 -2.1106 14.8172 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7455 -2.8698 15.6821 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3904 -2.6103 15.8138 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2204 -1.5845 15.0865 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6043 -1.3599 15.3203 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5377 -0.4463 14.7588 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1842 0.3709 13.7215 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1172 1.2388 13.2173 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4204 1.2848 13.7037 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7469 0.4890 14.7614 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8976 0.3763 15.4868 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5864 -0.5217 16.5304 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3754 -1.0422 16.3738 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8369 -0.3917 15.3265 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6436 2.1633 12.1173 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5480 2.6409 11.1599 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1566 3.4683 10.0981 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8094 3.8079 10.0262 C 0 0 0 0 0 0 - 1.1129 4.5678 9.1158 N 0 0 0 0 0 0 - -0.1959 4.6369 9.4439 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4233 3.9255 10.6079 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8581 3.3610 11.0052 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2923 2.5453 12.0556 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5553 -0.8190 14.1924 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9451 -1.0886 14.0616 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7542 -0.3572 13.2046 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2337 0.6443 12.3523 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3357 -3.2522 13.5867 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7894 -4.0896 13.5592 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0126 -2.5803 12.6439 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1924 -3.6626 16.2629 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1988 -3.2075 16.4976 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9903 -1.9328 16.0524 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1821 1.9636 13.3436 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7861 0.9459 15.2758 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2270 -0.7893 17.3529 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5880 2.3439 11.2255 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8575 3.8116 9.3742 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4893 5.0309 8.2959 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8811 5.2047 8.8100 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3687 3.8093 11.1106 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6011 2.2181 12.8040 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1076 -0.0335 13.6255 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0510 1.0731 11.7700 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5106 0.2345 11.6499 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7825 1.4496 12.9275 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 35 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 25 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 -M END -> -8.6 - -$$$$ -CHEMBL3265023 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2567 -3.1059 13.5673 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8729 -2.3613 14.7130 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5249 -2.1099 14.8153 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7517 -2.8690 15.6822 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3919 -2.6091 15.8186 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2189 -1.5847 15.0927 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6018 -1.3585 15.3330 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5269 -0.4362 14.7717 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1589 0.3947 13.7415 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1051 1.2383 13.2191 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4090 1.2795 13.7014 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7388 0.4912 14.7576 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8975 0.3852 15.4842 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5969 -0.5378 16.5183 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3825 -1.0459 16.3661 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8333 -0.3893 15.3272 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6571 2.1471 12.1112 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5899 2.6392 11.1753 C 0 0 0 0 0 0 - 3.2345 3.5009 10.1325 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8924 3.8376 10.0551 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9171 3.3423 10.9725 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3038 3.9315 10.5288 C 0 0 0 0 0 0 - -0.0986 4.6050 9.4408 N 0 0 0 0 0 0 - 1.1962 4.6448 9.1980 N 0 0 0 0 0 0 - 1.7045 5.4754 8.0961 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3025 2.4943 12.0076 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5544 -0.8156 14.1936 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9395 -1.0837 14.0623 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7429 -0.3421 13.2117 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2131 0.6368 12.3357 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3375 -3.2479 13.5825 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7907 -4.0919 13.5609 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0043 -2.5870 12.6413 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2103 -3.6575 16.2628 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1961 -3.2002 16.5072 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9973 -1.9477 16.0590 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1715 1.9507 13.3355 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7782 0.9732 15.2765 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2398 -0.8227 17.3413 H 0 0 0 0 0 0 - 4.6155 2.3316 11.2554 H 0 0 0 0 0 0 - 3.9649 3.8698 9.4220 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2802 3.8493 10.9568 H 0 0 0 0 0 0 - 2.1994 4.8389 7.3819 H 0 0 0 0 0 0 - 2.4134 6.2165 8.4892 H 0 0 0 0 0 0 - 0.9332 5.9474 7.4753 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5767 2.1227 12.7182 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1144 -0.0216 13.6244 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0360 1.0624 11.7579 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5052 0.1989 11.6324 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7487 1.4445 12.8985 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 26 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 26 2 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 48 1 0 0 0 - 30 49 1 0 0 0 - 30 50 1 0 0 0 -M END -> -20.9 - -$$$$ -CHEMBL3265002 - 3D - Structure written by MMmdl. - 65 70 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5783 3.7648 10.8956 C 0 0 0 0 0 0 - -1.3033 3.5740 9.9236 O 0 0 0 0 0 0 - -1.0030 4.3609 12.0101 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3543 4.8635 12.2406 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5836 5.8118 13.2304 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8699 6.2902 13.4498 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9269 5.8204 12.6794 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6976 4.8721 11.6896 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4113 4.3936 11.4701 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3151 6.3368 12.9162 C 0 0 0 0 0 0 - -6.6950 7.2261 13.8051 N 0 0 0 0 0 0 - -8.0029 7.3574 13.6369 C 0 0 0 0 0 0 - -8.4734 6.5379 12.6216 C 0 0 0 0 0 0 - -7.3627 5.8801 12.1626 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6991 -0.3052 13.2021 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0020 0.6746 12.5251 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7528 -4.0708 13.5508 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0179 -2.5675 12.6505 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3306 -3.2808 13.5889 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2100 -3.6528 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1911 -3.2101 16.5029 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0246 -1.8858 16.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1701 2.0030 13.3719 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7656 0.9739 15.2897 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2089 -0.8330 17.3301 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5934 2.3309 11.2002 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8342 3.7939 9.3845 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4564 4.4350 9.2166 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6053 2.2130 12.7811 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4420 4.5376 12.8311 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7606 6.1776 13.8302 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0484 7.0285 14.2205 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5206 4.5063 11.0897 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2328 3.6553 10.6995 H 0 0 0 0 0 0 - -8.6003 8.0331 14.2384 H 0 0 0 0 0 0 - -9.4586 6.3714 12.2026 H 0 0 0 0 0 0 - -7.3154 5.1912 11.4150 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1547 -0.0168 13.6337 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6851 1.2257 11.8787 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2218 0.2131 11.9198 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5485 1.3591 13.2420 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 41 1 0 0 0 - 1 42 1 0 0 0 - 1 43 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 44 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 45 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 46 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 47 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 48 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 49 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 50 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 51 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 52 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 53 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 54 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 31 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 55 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 56 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 57 1 0 0 0 - 31 58 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 36 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 59 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 60 1 0 0 0 - 36 61 1 0 0 0 - 37 38 2 0 0 0 - 37 62 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 39 40 1 0 0 0 - 40 63 1 0 0 0 - 40 64 1 0 0 0 - 40 65 1 0 0 0 -M END -> -16.5 - -$$$$ -CHEMBL3265033 - 3D - Structure written by MMmdl. - 54 59 0 0 1 0 999 V2000 - -6.7377 -5.5954 13.7078 O 0 0 0 0 0 0 - -6.4109 -4.1827 13.9768 S 0 0 0 0 0 0 - -7.4853 -3.1691 13.9645 O 0 0 0 0 0 0 - -5.0718 -3.6553 12.8024 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5093 -2.3051 13.2740 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8452 -2.4085 14.5766 N 0 0 0 0 0 0 - -4.8019 -2.6733 15.6705 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4613 -4.0603 15.5733 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5026 -2.1121 14.7721 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7498 -2.8472 15.6821 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3947 -2.5947 15.8318 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2287 -1.5788 15.1039 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6093 -1.3648 15.3339 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5318 -0.4383 14.7801 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1634 0.3921 13.7540 N 0 0 0 0 0 0 - 3.0974 1.2392 13.2246 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4044 1.2817 13.6944 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7423 0.4925 14.7592 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8954 0.3870 15.4778 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5990 -0.5412 16.5094 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3871 -1.0534 16.3565 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8359 -0.3945 15.3234 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6253 2.1534 12.1201 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5412 2.6427 11.1681 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1527 3.4644 10.1100 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8061 3.8184 10.0146 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9967 4.6031 9.1196 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2439 4.6096 9.5190 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3333 3.8812 10.6311 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8847 3.3487 10.9898 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2610 2.5149 12.0531 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5302 -0.8124 14.2060 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8875 -1.0872 14.0350 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2870 -4.4115 12.7932 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5077 -3.5615 11.8091 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7877 -1.9706 12.5239 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3210 -1.5976 13.2696 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3225 -2.5661 16.6462 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5749 -1.8980 15.6876 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6888 -4.8310 15.5950 H 0 0 0 0 0 0 - -6.1589 -4.2289 16.3924 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2114 -3.6432 16.2513 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1860 -3.1935 16.5202 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0087 -1.9701 16.0399 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1653 1.9492 13.3186 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7769 0.9748 15.2739 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2430 -0.8293 17.3244 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5805 2.3555 11.2394 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8720 3.8097 9.3836 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3028 5.1343 8.2328 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2191 3.7739 11.0972 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5545 2.1699 12.7872 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0886 -0.0159 13.6433 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4699 -0.4961 13.3471 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 8 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 5 37 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 9 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 38 1 0 0 0 - 7 39 1 0 0 0 - 8 40 1 0 0 0 - 8 41 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 42 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 43 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 44 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 22 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 23 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 45 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 46 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 47 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 31 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 48 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 49 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 50 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 31 52 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 53 1 0 0 0 - 33 54 1 0 0 0 -M END -> -2.1 - -$$$$ -CHEMBL3265027 - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 43 0 0 1 0 999 V2000 - 1.6124 -1.3917 15.3063 N 0 0 0 0 0 0 - 0.2249 -1.5978 15.0814 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5442 -0.8150 14.1982 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9142 -1.0738 14.0573 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5121 -2.0998 14.7912 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7536 -2.8696 15.6610 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3955 -2.6216 15.8033 C 0 0 0 0 0 0 - 2.5315 -0.4491 14.7651 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1583 0.3961 13.7551 N 0 0 0 0 0 0 - 3.0948 1.2419 13.2245 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4047 1.2813 13.6954 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7386 0.4915 14.7531 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8960 0.3859 15.4809 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5970 -0.5411 16.5116 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3870 -1.0586 16.3541 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8354 -0.3959 15.3220 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6241 2.1558 12.1223 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5409 2.6448 11.1668 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1526 3.4655 10.1090 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8070 3.8204 10.0137 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9973 4.6040 9.1190 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2435 4.6079 9.5202 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3316 3.8816 10.6309 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8832 3.3484 10.9943 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2619 2.5173 12.0545 C 0 0 0 0 0 0 - 2.0176 -2.0162 15.9915 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1036 -0.0170 13.6342 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5121 -0.4793 13.3847 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5698 -2.2967 14.6864 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2195 -3.6606 16.2340 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1884 -3.2203 16.4893 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1658 1.9496 13.3207 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7756 0.9786 15.2759 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2399 -0.8270 17.3309 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5780 2.3565 11.2387 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8751 3.8096 9.3796 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3042 5.1362 8.2332 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2186 3.7731 11.1004 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5529 2.1690 12.7938 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 8 1 0 0 0 - 1 26 1 0 0 0 - 2 3 2 0 0 0 - 2 7 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 28 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 7 31 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 32 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 33 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 34 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 25 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 39 1 0 0 0 -M END -> -26.8 - -$$$$ -CHEMBL3265028 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 47 0 0 1 0 999 V2000 - -1.9509 0.6794 12.3551 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6175 -0.2972 13.1574 O 0 0 0 0 0 0 - -1.8696 -1.0545 14.0449 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5006 -2.0822 14.7698 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7540 -2.8524 15.6585 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3950 -2.6038 15.8322 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2324 -1.5851 15.1260 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6168 -1.3648 15.3699 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5420 -0.4570 14.7968 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1720 0.3831 13.7786 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1103 1.2383 13.2419 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3968 1.2792 13.7037 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7381 0.4944 14.7692 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8928 0.3893 15.4752 C 0 0 0 0 0 0 - 5.6110 -0.5494 16.5068 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4002 -1.0741 16.3612 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8444 -0.3918 15.3407 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6282 2.1384 12.1226 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5442 2.6282 11.1721 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1497 3.4552 10.1130 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8035 3.8107 10.0226 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9910 4.6054 9.1269 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2498 4.6130 9.5297 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3276 3.8827 10.6287 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8922 3.3455 10.9868 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2628 2.5119 12.0466 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5121 -0.8124 14.2226 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6470 1.2080 11.7073 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2045 0.2004 11.7318 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4794 1.4174 12.9913 H 0 0 0 0 0 0 - -3.5460 -2.2812 14.6470 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2312 -3.6425 16.2160 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1711 -3.2085 16.5377 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9989 -1.9290 16.1054 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1566 1.9436 13.3074 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7779 0.9754 15.2698 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2564 -0.8382 17.2944 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5845 2.3474 11.2386 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8685 3.8054 9.3873 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3045 5.1360 8.2411 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2156 3.7788 11.0960 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5640 2.1751 12.7727 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0605 -0.0305 13.6582 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 33 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 27 2 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 34 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 17 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 18 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 35 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 17 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 37 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 26 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 25 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 26 42 1 0 0 0 - 27 43 1 0 0 0 -M END -> -8.5 - -$$$$ -CHEMBL3264997 - 3D - Structure written by MMmdl. - 60 64 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5783 3.7648 10.8956 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2610 3.7179 9.8765 O 0 0 0 0 0 0 - -1.0553 4.1831 12.0683 N 0 0 0 0 0 0 - -2.4212 4.6362 12.3150 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7024 5.4228 13.4257 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0026 5.8541 13.6606 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0215 5.4987 12.7847 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7403 4.7121 11.6740 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4401 4.2808 11.4391 C 0 0 0 0 0 0 - -5.8399 4.3286 10.7287 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6116 3.6277 9.7316 O 0 0 0 0 0 0 - -6.9848 4.7354 10.9767 O 0 5 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6991 -0.3052 13.2021 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0020 0.6746 12.5251 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7528 -4.0708 13.5508 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0179 -2.5675 12.6505 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3306 -3.2808 13.5889 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2100 -3.6528 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1911 -3.2101 16.5029 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0246 -1.8858 16.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1701 2.0030 13.3719 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7656 0.9739 15.2897 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2089 -0.8330 17.3301 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5934 2.3309 11.2002 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8342 3.7939 9.3845 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4564 4.4350 9.2166 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6053 2.2130 12.7811 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5302 4.2377 12.9293 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9091 5.6994 14.1077 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2216 6.4665 14.5254 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0338 5.8345 12.9676 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2211 3.6684 10.5743 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1547 -0.0168 13.6337 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6851 1.2257 11.8787 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2218 0.2131 11.9198 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5485 1.3591 13.2420 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 39 1 0 0 0 - 1 40 1 0 0 0 - 1 41 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 36 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 35 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 44 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 45 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 46 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 47 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 48 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 49 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 50 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 51 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 52 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 31 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 53 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 54 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 55 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 32 1 0 0 0 - 31 56 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 34 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 57 1 0 0 0 - 36 37 1 0 0 0 - 37 38 1 0 0 0 - 38 58 1 0 0 0 - 38 59 1 0 0 0 - 38 60 1 0 0 0 -M CHG 1 34 -1 -M END -> -8.9 - -$$$$ -CHEMBL3264996 - 3D - Structure written by MMmdl. - 64 68 0 0 1 0 999 V2000 - -8.4523 6.1854 12.2890 C 0 0 0 0 0 0 - -7.1802 5.7049 12.0537 O 0 0 0 0 0 0 - -6.3297 6.2883 12.9360 C 0 0 0 0 0 0 - -6.6901 7.1009 13.7801 O 0 0 0 0 0 0 - -4.9394 5.7785 12.6965 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7034 4.8507 11.6890 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4153 4.3784 11.4671 C 0 0 0 0 0 0 - -2.3631 4.8339 12.2526 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0100 4.3378 12.0195 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5783 3.7648 10.8956 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2977 3.5927 9.9160 O 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6991 -0.3052 13.2022 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0020 0.6747 12.5251 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - -2.5991 5.7618 13.2601 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8873 6.2341 13.4820 C 0 0 0 0 0 0 - -9.1495 5.7265 11.5880 H 0 0 0 0 0 0 - -8.4625 7.2672 12.1559 H 0 0 0 0 0 0 - -8.7497 5.9420 13.3091 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5226 4.4960 11.0774 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2316 3.6560 10.6827 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4537 4.4986 12.8470 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4564 4.4350 9.2166 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8342 3.7939 9.3845 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5934 2.3309 11.2002 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6053 2.2130 12.7811 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1701 2.0030 13.3719 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7656 0.9739 15.2897 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2088 -0.8330 17.3301 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0245 -1.8852 16.0480 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1911 -3.2101 16.5029 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2100 -3.6528 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3306 -3.2805 13.5887 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7531 -4.0710 13.5510 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0176 -2.5677 12.6505 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6851 1.2257 11.8788 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2219 0.2131 11.9198 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5485 1.3591 13.2420 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1547 -0.0168 13.6337 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7800 6.1164 13.8717 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0710 6.9565 14.2664 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 40 1 0 0 0 - 1 41 1 0 0 0 - 1 42 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 39 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 43 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 44 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 38 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 45 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 46 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 47 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 48 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 18 1 0 0 0 - 17 49 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 50 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 51 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 52 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 37 2 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 53 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 36 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 54 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 55 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 33 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 32 56 1 0 0 0 - 32 57 1 0 0 0 - 32 58 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 36 2 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 35 59 1 0 0 0 - 35 60 1 0 0 0 - 35 61 1 0 0 0 - 36 62 1 0 0 0 - 38 39 2 0 0 0 - 38 63 1 0 0 0 - 39 64 1 0 0 0 -M END -> -15.2 - -$$$$ -CHEMBL3264994 - 3D - Structure written by MMmdl. - 64 68 0 0 1 0 999 V2000 - -4.1531 -3.4266 13.5369 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9919 -2.3907 14.6629 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6875 -1.0646 14.3101 C 0 0 0 0 0 0 - -4.4873 -2.9438 16.0103 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5399 3.7537 10.8977 N 0 0 0 0 0 0 - -1.2550 4.3141 11.8736 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8140 4.4931 13.0050 O 0 0 0 0 0 0 - -2.6333 4.6854 11.4124 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5436 5.2295 12.3108 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8206 5.5735 11.8835 C 0 0 0 0 0 0 - -5.1873 5.3735 10.5579 C 0 0 0 0 0 0 - -4.2770 4.8294 9.6596 C 0 0 0 0 0 0 - -3.0000 4.4854 10.0869 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5655 5.7447 10.0968 C 0 0 0 0 0 0 - -6.9139 5.5749 8.9190 O 0 0 0 0 0 0 - -7.3451 6.2270 10.9318 O 0 5 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -5.2013 -3.6828 13.3771 H 0 0 0 0 0 0 - -3.6186 -4.3486 13.7684 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7570 -3.0497 12.5933 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2998 -0.6503 13.3787 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5308 -0.3167 15.0883 H 0 0 0 0 0 0 - -5.7636 -1.1975 14.1906 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5529 -3.1749 15.9796 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3275 -2.2256 16.8153 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9581 -3.8582 16.2809 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5303 -0.4809 13.3780 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1531 -0.0197 13.6305 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0242 -1.8881 16.0458 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1702 2.0027 13.3717 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7657 0.9737 15.2895 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2091 -0.8330 17.3300 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5934 2.3308 11.2002 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8342 3.7938 9.3845 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4564 4.4348 9.2165 H 0 0 0 0 0 0 - -0.8833 3.5257 9.9756 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2580 5.3853 13.3428 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5293 5.9971 12.5829 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5625 4.6736 8.6276 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2913 4.0618 9.3875 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6052 2.2121 12.7807 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1929 -3.2118 16.5002 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2057 -3.6608 16.2538 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 39 1 0 0 0 - 1 40 1 0 0 0 - 1 41 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 42 1 0 0 0 - 3 43 1 0 0 0 - 3 44 1 0 0 0 - 4 45 1 0 0 0 - 4 46 1 0 0 0 - 4 47 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 38 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 48 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 49 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 37 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 50 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 18 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 51 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 18 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 52 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 53 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 54 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 55 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 56 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 36 2 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 57 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 32 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 58 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 59 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 33 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 60 1 0 0 0 - 32 61 1 0 0 0 - 33 34 2 0 0 0 - 33 35 1 0 0 0 - 36 62 1 0 0 0 - 37 38 2 0 0 0 - 37 63 1 0 0 0 - 38 64 1 0 0 0 -M CHG 1 35 -1 -M END -> -65 - -$$$$ -CHEMBL3264995 - 3D - Structure written by MMmdl. - 60 64 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2563 -3.1062 13.5664 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8728 -2.3593 14.7106 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5249 -2.1101 14.8131 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7501 -2.8737 15.6749 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3910 -2.6176 15.8092 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2227 -1.5905 15.0869 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6077 -1.3711 15.3228 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5318 -0.4406 14.7752 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1656 0.3957 13.7562 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1117 1.2369 13.2296 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4129 1.2745 13.7026 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7445 0.4891 14.7604 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8979 0.3839 15.4837 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5998 -0.5411 16.5157 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3864 -1.0537 16.3628 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8368 -0.3920 15.3291 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6550 2.1423 12.1326 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5650 2.6308 11.1723 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1221 3.4386 10.1249 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7757 3.7777 10.0261 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8680 3.3392 10.9975 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3092 2.5240 12.0437 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5769 3.7618 10.9126 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1111 3.9318 9.8164 O 0 0 0 0 0 0 - -1.1792 4.0031 12.1232 N 0 0 0 0 0 0 - -2.4941 4.5708 12.2428 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4732 4.3742 11.2553 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7281 4.9504 11.3975 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0306 5.7263 12.5247 C 0 0 0 0 0 0 - -4.0556 5.9172 13.5169 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7906 5.3372 13.3771 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3945 6.3441 12.6680 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2177 6.1258 11.7478 O 0 0 0 0 0 0 - -6.6066 7.0283 13.6967 O 0 5 0 0 0 0 - -0.5540 -0.8141 14.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9401 -1.0806 14.0641 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7443 -0.3364 13.2160 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2132 0.6462 12.3458 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3361 -3.2549 13.5857 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7839 -4.0892 13.5560 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0102 -2.5844 12.6405 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2076 -3.6642 16.2534 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1980 -3.2129 16.4943 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0049 -1.9718 16.0350 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1749 1.9434 13.3291 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7778 0.9747 15.2766 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2427 -0.8274 17.3331 H 0 0 0 0 0 0 - 4.6093 2.3606 11.2287 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8254 3.8001 9.3864 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4370 4.4087 9.2133 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6084 2.1782 12.7883 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6284 3.9274 12.9685 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2732 3.7726 10.3909 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4737 4.7957 10.6329 H 0 0 0 0 0 0 - -4.2825 6.5166 14.3929 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0386 5.4914 14.1417 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1130 -0.0178 13.6310 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0333 1.0720 11.7646 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4951 0.2209 11.6444 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7591 1.4508 12.9195 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 39 1 0 0 0 - 1 40 1 0 0 0 - 1 41 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 36 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 42 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 43 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 35 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 44 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 45 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 46 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 47 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 48 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 49 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 50 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 51 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 52 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 31 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 53 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 54 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 55 1 0 0 0 - 31 56 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 34 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 57 1 0 0 0 - 36 37 1 0 0 0 - 37 38 1 0 0 0 - 38 58 1 0 0 0 - 38 59 1 0 0 0 - 38 60 1 0 0 0 -M CHG 1 34 -1 -M END -> -0.84 - -$$$$ -CHEMBL3265032 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 57 0 0 1 0 999 V2000 - -5.2528 -4.0279 13.4883 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5590 -2.6369 13.4544 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8919 -2.2470 14.7137 N 0 0 0 0 0 0 - -4.7198 -2.6287 15.8665 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4261 -3.9885 15.8402 C 0 0 0 0 0 0 - -6.1177 -4.1508 14.6092 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5101 -2.0763 14.8035 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8815 -1.1097 14.0182 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5196 -0.8466 14.1763 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2358 -1.5888 15.0999 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6095 -1.3595 15.3505 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5288 -0.4326 14.7915 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1515 0.4038 13.7773 N 0 0 0 0 0 0 - 3.0856 1.2408 13.2315 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3919 1.2835 13.6955 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7346 0.4998 14.7545 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8922 0.3978 15.4788 C 0 0 0 0 0 0 - 5.6049 -0.5481 16.4962 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3940 -1.0599 16.3510 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8344 -0.3880 15.3306 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6174 2.1451 12.1221 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5375 2.6360 11.1692 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1548 3.4584 10.1087 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8089 3.8176 10.0151 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9999 4.6108 9.1243 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2405 4.6150 9.5301 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3274 3.8782 10.6339 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8831 3.3398 10.9927 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2567 2.5006 12.0460 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3865 -2.5955 15.8355 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7498 -2.8337 15.7040 C 0 0 0 0 0 0 - -4.5051 -4.8201 13.5326 H 0 0 0 0 0 0 - -5.8382 -4.1961 12.5835 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8574 -2.6184 12.6184 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3171 -1.8948 13.2323 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1680 -2.4954 16.7966 H 0 0 0 0 0 0 - -5.4757 -1.8452 15.9095 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6783 -4.7685 15.9759 H 0 0 0 0 0 0 - -6.1259 -4.0493 16.6787 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4632 -0.5270 13.3256 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0772 -0.0608 13.5996 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0056 -1.9485 16.0686 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1492 1.9467 13.3043 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7687 0.9973 15.2711 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2551 -0.8495 17.2990 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5745 2.3502 11.2465 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8814 3.8031 9.3814 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3048 5.1494 8.2407 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2122 3.7667 11.1066 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5434 2.1468 12.7781 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1974 -3.1804 16.5382 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2129 -3.6048 16.3012 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 6 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 34 1 0 0 0 - 2 35 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 7 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 36 1 0 0 0 - 4 37 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 38 1 0 0 0 - 5 39 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 31 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 40 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 41 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 42 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 20 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 21 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 43 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 44 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 45 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 29 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 46 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 47 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 28 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 48 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 - 31 52 1 0 0 0 -M END -> -10000 - -$$$$ -CHEMBL3265031 - 3D - Structure written by MMmdl. - 58 63 0 0 1 0 999 V2000 - -6.8350 -5.5126 14.3646 C 0 0 0 0 0 0 - -6.2469 -4.1256 14.5196 C 0 0 0 0 0 0 - -7.2986 -3.1815 14.6326 O 0 0 0 0 0 0 - -5.3943 -4.0373 15.7957 C 0 0 0 0 0 0 - -4.6708 -2.7036 15.9246 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8604 -2.3511 14.7445 N 0 0 0 0 0 0 - -4.6320 -2.3959 13.4920 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3661 -3.7377 13.3163 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5090 -2.1078 14.8185 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9132 -1.0937 14.0521 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5452 -0.8202 14.1949 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2267 -1.5891 15.0857 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6093 -1.3706 15.3172 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5356 -0.4465 14.7610 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1744 0.3801 13.7331 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1091 1.2393 13.2182 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4162 1.2819 13.6993 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7443 0.4889 14.7568 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8980 0.3793 15.4854 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5914 -0.5292 16.5255 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3788 -1.0451 16.3697 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8374 -0.3956 15.3255 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6339 2.1607 12.1207 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5443 2.6413 11.1620 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1470 3.4630 10.1086 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8016 3.8175 10.0163 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9929 4.5961 9.1183 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2479 4.6060 9.5144 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3355 3.8922 10.6289 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8848 3.3596 10.9956 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2708 2.5377 12.0624 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3834 -2.6137 15.8106 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7318 -2.8604 15.6854 C 0 0 0 0 0 0 - -6.0467 -6.2631 14.3371 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4067 -5.5754 13.4421 H 0 0 0 0 0 0 - -7.4975 -5.7395 15.1969 H 0 0 0 0 0 0 - -7.8476 -3.4517 15.3749 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0063 -4.2224 16.6815 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6544 -4.8417 15.8115 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0494 -2.7060 16.8283 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3818 -1.8934 16.0953 H 0 0 0 0 0 0 - -3.9484 -2.2562 12.6532 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3571 -1.5966 13.4338 H 0 0 0 0 0 0 - -5.9794 -3.7294 12.4113 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6376 -4.5315 13.1300 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5174 -0.4949 13.3813 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1094 -0.0194 13.6338 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0065 -1.9728 16.0216 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1781 1.9583 13.3366 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7839 0.9561 15.2754 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2312 -0.8046 17.3482 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5843 2.3478 11.2246 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8596 3.8053 9.3796 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3020 5.1188 8.2316 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2247 3.7893 11.0947 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5687 2.2070 12.8051 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2004 -3.2162 16.4903 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1848 -3.6574 16.2613 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 8 1 0 0 0 - 3 37 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 38 1 0 0 0 - 4 39 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 40 1 0 0 0 - 5 41 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 9 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 42 1 0 0 0 - 7 43 1 0 0 0 - 8 44 1 0 0 0 - 8 45 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 33 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 46 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 47 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 32 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 48 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 22 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 23 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 49 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 50 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 51 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 31 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 52 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 53 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 30 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 54 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 55 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 31 56 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 57 1 0 0 0 - 33 58 1 0 0 0 -M END -> -1.4 - -$$$$ -CHEMBL3265037 - 3D - Structure written by MMmdl. - 56 61 0 0 1 0 999 V2000 - -2.1744 0.6943 12.3856 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7023 -0.3474 13.1823 O 0 0 0 0 0 0 - -1.9098 -1.0981 14.0384 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5310 -0.8294 14.1803 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2355 -1.5834 15.0946 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6117 -1.3596 15.3361 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5319 -0.4372 14.7774 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1598 0.3941 13.7549 N 0 0 0 0 0 0 - 3.0944 1.2396 13.2243 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4043 1.2833 13.6944 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7385 0.4947 14.7556 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8973 0.3913 15.4817 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5996 -0.5416 16.5121 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3864 -1.0493 16.3602 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8356 -0.3858 15.3271 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6225 2.1542 12.1213 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5396 2.6409 11.1644 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1535 3.4630 10.1051 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8086 3.8199 10.0132 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9978 4.6054 9.1182 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2423 4.6093 9.5224 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3299 3.8832 10.6368 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8842 3.3496 10.9964 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2618 2.5164 12.0586 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3784 -2.5892 15.8339 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7343 -2.8306 15.7168 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5117 -2.0982 14.8261 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8736 -2.3467 14.7445 N 0 0 0 0 0 0 - -4.6489 -2.3804 13.4950 C 0 0 0 0 0 0 - -5.4028 -3.7252 13.3613 C 0 0 0 0 0 0 - -6.2201 -3.9495 14.5061 O 0 0 0 0 0 0 - -5.4732 -4.0046 15.7182 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7007 -2.7060 15.8980 C 0 0 0 0 0 0 - -2.9904 1.1363 11.8091 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4428 0.2907 11.6870 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7364 1.4787 13.0041 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0893 -0.0406 13.6077 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0034 -1.9475 16.0618 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1625 1.9521 13.3194 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7773 0.9830 15.2753 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2437 -0.8354 17.3270 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5739 2.3509 11.2352 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8782 3.8039 9.3734 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3039 5.1373 8.2326 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2154 3.7754 11.1065 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5533 2.1677 12.8004 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2091 -3.1801 16.5238 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1890 -3.6122 16.3096 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3854 -1.6032 13.4697 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0001 -2.2760 12.6217 H 0 0 0 0 0 0 - -6.0319 -3.7256 12.4721 H 0 0 0 0 0 0 - -4.6910 -4.5475 13.2566 H 0 0 0 0 0 0 - -6.1314 -4.1557 16.5745 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7486 -4.8187 15.6925 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3882 -1.8709 16.0634 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1072 -2.7162 16.8113 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 1 35 1 0 0 0 - 1 36 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 37 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 25 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 38 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 15 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 16 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 39 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 15 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 40 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 41 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 24 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 42 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 43 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 23 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 44 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 45 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 24 46 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 47 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 33 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 49 1 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 - 30 52 1 0 0 0 - 31 32 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 53 1 0 0 0 - 32 54 1 0 0 0 - 33 55 1 0 0 0 - 33 56 1 0 0 0 -M END -> -0.44 - -$$$$ -CHEMBL3265026 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 55 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2568 -3.1047 13.5691 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8735 -2.3611 14.7159 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5255 -2.1111 14.8166 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7467 -2.8699 15.6815 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3906 -2.6103 15.8137 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2208 -1.5857 15.0868 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6032 -1.3595 15.3238 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5348 -0.4457 14.7641 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1779 0.3778 13.7292 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1185 1.2359 13.2212 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4181 1.2809 13.7047 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7461 0.4870 14.7618 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8981 0.3788 15.4858 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5910 -0.5280 16.5270 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3781 -1.0445 16.3723 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8363 -0.3925 15.3256 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6611 2.1501 12.1240 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5712 2.6353 11.1629 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1347 3.4612 10.1202 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7926 3.8149 10.0376 C 0 0 0 0 0 0 - 1.4009 4.6318 8.9894 O 0 0 0 0 0 0 - 0.0085 4.5902 8.6762 C 0 0 0 0 0 0 - -0.8186 4.7372 9.9574 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4761 3.7058 10.9290 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8817 3.3521 10.9992 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3168 2.5380 12.0350 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5547 -0.8194 14.1898 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9431 -1.0889 14.0597 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7507 -0.3535 13.2059 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2107 0.5014 12.2156 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3360 -3.2526 13.5865 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7882 -4.0895 13.5586 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0119 -2.5815 12.6433 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1972 -3.6612 16.2628 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1988 -3.2050 16.4994 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9921 -1.9379 16.0547 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1792 1.9587 13.3427 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7836 0.9552 15.2767 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2332 -0.8019 17.3497 H 0 0 0 0 0 0 - 4.6084 2.3515 11.2173 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8361 3.8129 9.3818 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2487 3.6561 8.1758 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2439 5.4020 7.9931 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8882 4.6243 9.7487 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7133 5.7290 10.3994 H 0 0 0 0 0 0 - -1.1280 3.4995 11.6583 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6104 2.2087 12.7810 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1096 -0.0303 13.6230 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0323 0.9527 11.6561 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5950 -0.0476 11.5044 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6381 1.3072 12.6663 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 26 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 46 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 49 1 0 0 0 - 30 50 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 -M END -> -4.7 - -$$$$ -CHEMBL3265012 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2558 -3.1075 13.5651 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8718 -2.3575 14.7067 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5253 -2.1086 14.8120 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7526 -2.8682 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3955 -2.6067 15.8218 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2199 -1.5810 15.0999 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6019 -1.3576 15.3437 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5286 -0.4382 14.7882 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1607 0.3911 13.7686 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1048 1.2259 13.2324 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4053 1.2717 13.7035 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7404 0.4886 14.7629 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8950 0.3907 15.4847 C 0 0 0 0 0 0 - 5.6038 -0.5479 16.5103 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3901 -1.0599 16.3616 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8363 -0.3960 15.3347 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6462 2.1273 12.1323 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5538 2.6360 11.1838 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1137 3.4699 10.1556 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7615 3.8212 10.0639 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3043 4.7272 8.9268 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1134 5.3522 8.2339 O 0 0 0 0 0 0 - -0.0095 4.7686 8.7196 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8533 3.3219 11.0251 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4584 3.6572 10.9807 F 0 0 0 0 0 0 - 1.2985 2.4859 12.0366 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5548 -0.8117 14.1978 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9397 -1.0798 14.0626 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7418 -0.3359 13.2115 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2196 0.7089 12.4090 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3371 -3.2496 13.5811 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7876 -4.0927 13.5589 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0021 -2.5904 12.6387 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2126 -3.6572 16.2596 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1938 -3.1989 16.5120 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9968 -1.9524 16.0600 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1643 1.9375 13.3203 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7745 0.9863 15.2762 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2506 -0.8438 17.3184 H 0 0 0 0 0 0 - 4.6006 2.3663 11.2383 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8176 3.8358 9.4198 H 0 0 0 0 0 0 - -0.3831 5.3154 7.9569 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6305 4.2313 9.2991 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5971 2.1203 12.7706 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1130 -0.0200 13.6277 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0413 1.1202 11.8191 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4622 0.3434 11.7132 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8206 1.5118 13.0307 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 26 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 46 1 0 0 0 - 30 47 1 0 0 0 - 30 48 1 0 0 0 -M END -> -18.6 - -$$$$ -CHEMBL3265003 - 3D - Structure written by MMmdl. - 65 70 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5881 3.7303 10.8428 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1092 3.7021 9.7263 O 0 0 0 0 0 0 - -1.2179 4.0963 11.9826 N 0 0 0 0 0 0 - -2.5548 4.5074 12.1308 C 0 0 0 0 0 0 - -3.5938 4.0626 11.3021 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8906 4.5243 11.5030 C 0 0 0 0 0 0 - -5.1795 5.4211 12.5413 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1385 5.8321 13.3869 C 0 0 0 0 0 0 - -2.8376 5.3818 13.1807 C 0 0 0 0 0 0 - -6.5795 5.9152 12.7554 C 0 0 0 0 0 0 - -7.8001 5.5757 12.2009 C 0 0 0 0 0 0 - -8.7342 6.4074 12.8268 C 0 0 0 0 0 0 - -8.1709 7.2095 13.7036 N 0 0 0 0 0 0 - -6.8624 6.9071 13.6570 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7621 -0.3534 13.2116 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2029 0.6764 12.4028 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7319 -4.0591 13.5349 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0488 -2.5587 12.6486 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3256 -3.3057 13.6062 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2115 -3.6525 16.2595 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1907 -3.2107 16.5029 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0263 -1.8894 16.0446 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1725 2.0000 13.3704 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7667 0.9724 15.2895 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2096 -0.8335 17.3296 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5932 2.3291 11.1982 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8321 3.7889 9.3800 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4532 4.4207 9.2055 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6102 2.1883 12.7736 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6256 4.1766 12.7928 H 0 0 0 0 0 0 - -3.4137 3.3677 10.4946 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6833 4.1870 10.8507 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3476 6.5138 14.1986 H 0 0 0 0 0 0 - -2.0539 5.7265 13.8396 H 0 0 0 0 0 0 - -7.9941 4.8267 11.4440 H 0 0 0 0 0 0 - -9.8018 6.4182 12.6378 H 0 0 0 0 0 0 - -6.1655 7.3743 14.2366 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1266 -0.0266 13.6477 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4235 0.2925 11.7430 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7941 1.4768 13.0196 H 0 0 0 0 0 0 - -2.9831 1.1078 11.7761 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 41 1 0 0 0 - 1 42 1 0 0 0 - 1 43 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 44 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 45 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 46 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 47 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 48 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 49 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 50 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 51 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 52 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 53 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 54 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 31 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 55 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 56 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 57 1 0 0 0 - 31 58 1 0 0 0 - 32 36 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 33 59 1 0 0 0 - 34 60 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 36 61 1 0 0 0 - 37 38 2 0 0 0 - 37 62 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 39 40 1 0 0 0 - 40 63 1 0 0 0 - 40 64 1 0 0 0 - 40 65 1 0 0 0 -M END -> -11.7 - -$$$$ -CHEMBL3264998 - 3D - Structure written by MMmdl. - 63 67 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5783 3.7648 10.8956 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2695 3.6885 9.8840 O 0 0 0 0 0 0 - -1.0448 4.2194 12.0590 N 0 0 0 0 0 0 - -2.4077 4.6825 12.3031 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6783 5.5030 13.3918 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9757 5.9439 13.6242 C 0 0 0 0 0 0 - -5.0025 5.5643 12.7679 C 0 0 0 0 0 0 - -6.4027 6.0402 13.0187 C 0 0 0 0 0 0 - -6.6249 7.3398 12.3033 C 0 0 0 0 0 0 - -7.5065 7.4520 11.4386 O 0 0 0 0 0 0 - -5.8982 8.2982 12.6048 O 0 5 0 0 0 0 - -4.7319 4.7439 11.6792 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4345 4.3030 11.4468 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6991 -0.3052 13.2021 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0020 0.6746 12.5251 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7528 -4.0708 13.5508 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0179 -2.5675 12.6505 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3306 -3.2808 13.5889 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2100 -3.6528 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1911 -3.2101 16.5029 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0246 -1.8858 16.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1701 2.0030 13.3719 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7656 0.9739 15.2897 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2089 -0.8330 17.3301 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5934 2.3309 11.2002 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8342 3.7939 9.3845 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4564 4.4350 9.2166 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6053 2.2130 12.7811 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5125 4.2989 12.9136 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8789 5.7984 14.0585 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1864 6.5826 14.4718 H 0 0 0 0 0 0 - -6.5512 6.1845 14.0889 H 0 0 0 0 0 0 - -7.1104 5.2973 12.6507 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5313 4.4485 11.0125 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2239 3.6643 10.5991 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1547 -0.0168 13.6337 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6851 1.2257 11.8787 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2218 0.2131 11.9198 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5485 1.3591 13.2420 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 40 1 0 0 0 - 1 41 1 0 0 0 - 1 42 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 37 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 43 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 44 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 36 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 45 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 46 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 47 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 48 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 49 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 50 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 51 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 52 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 53 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 35 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 54 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 55 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 34 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 30 56 1 0 0 0 - 30 57 1 0 0 0 - 31 32 2 0 0 0 - 31 33 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 34 58 1 0 0 0 - 35 59 1 0 0 0 - 36 37 2 0 0 0 - 36 60 1 0 0 0 - 37 38 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 39 61 1 0 0 0 - 39 62 1 0 0 0 - 39 63 1 0 0 0 -M CHG 1 33 -1 -M END -> -2.6 - -$$$$ -CHEMBL3265029 - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 47 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2507 -3.1011 13.5632 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8673 -2.3305 14.6902 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5168 -2.0957 14.8067 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9172 -1.0702 14.0633 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5491 -0.8101 14.2065 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2199 -1.5870 15.0928 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6080 -1.3729 15.3230 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5324 -0.4358 14.7759 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1663 0.3860 13.7470 N 0 0 0 0 0 0 - 3.0989 1.2355 13.2241 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4088 1.2797 13.7018 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7449 0.4891 14.7567 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8960 0.3776 15.4790 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5960 -0.5292 16.5069 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3874 -1.0583 16.3532 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8346 -0.3857 15.3305 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6263 2.1555 12.1187 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5439 2.6382 11.1639 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1468 3.4593 10.1107 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8029 3.8136 10.0160 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9932 4.6001 9.1195 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2428 4.6141 9.5158 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3351 3.8865 10.6250 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8815 3.3478 10.9920 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2640 2.5243 12.0473 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3962 -2.6164 15.8132 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7505 -2.8679 15.6748 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3298 -3.2473 13.5826 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7850 -4.0873 13.5638 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0025 -2.5878 12.6346 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5171 -0.4778 13.3832 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1065 -0.0198 13.6433 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0019 -1.9714 16.0327 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1639 1.9590 13.3284 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7685 0.9695 15.2724 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2504 -0.7908 17.3182 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5902 2.3441 11.2391 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8565 3.8021 9.3952 H 0 0 0 0 0 0 - 1.2988 5.1235 8.2486 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2242 3.7838 11.0912 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5635 2.1916 12.7791 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1890 -3.2156 16.4997 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2053 -3.6566 16.2497 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 28 1 0 0 0 - 1 29 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 31 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 32 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 33 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 34 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 35 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 36 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 25 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 37 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 38 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 42 1 0 0 0 - 27 43 1 0 0 0 -M END -> -7 - -$$$$ -CHEMBL3265035 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 55 0 0 1 0 999 V2000 - -4.5368 -3.3612 15.6406 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9561 -2.3810 14.7221 N 0 0 0 0 0 0 - -4.6759 -2.0519 13.4970 C 0 0 0 0 0 0 - -4.8094 -3.1968 12.4731 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3909 -2.7945 11.2538 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5380 -2.1167 14.8106 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9279 -1.0927 14.0460 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5515 -0.8247 14.1929 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2181 -1.5869 15.0916 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6005 -1.3598 15.3303 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5326 -0.4516 14.7667 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1715 0.3794 13.7341 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1060 1.2367 13.2184 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4145 1.2803 13.6968 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7440 0.4821 14.7570 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8987 0.3805 15.4839 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5936 -0.5339 16.5243 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3807 -1.0510 16.3702 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8367 -0.4037 15.3198 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6315 2.1595 12.1222 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5425 2.6427 11.1618 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1486 3.4642 10.1071 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8051 3.8185 10.0149 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9940 4.5977 9.1169 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2465 4.6060 9.5156 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3325 3.8910 10.6299 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8808 3.3589 10.9978 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2718 2.5352 12.0615 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3941 -2.6060 15.8167 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7488 -2.8660 15.6892 C 0 0 0 0 0 0 - -4.1278 -4.3576 15.4842 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6178 -3.4125 15.4956 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3606 -3.0644 16.6771 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3056 -1.1886 12.9786 H 0 0 0 0 0 0 - -5.6839 -1.7325 13.7631 H 0 0 0 0 0 0 - -5.1990 -4.1205 12.9069 H 0 0 0 0 0 0 - -3.8094 -3.5657 12.2747 H 0 0 0 0 0 0 - -4.7580 -2.2447 10.7741 H 0 0 0 0 0 0 - -2.5097 -0.4888 13.3742 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1087 -0.0249 13.6285 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9936 -1.9427 16.0592 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1750 1.9595 13.3389 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7815 0.9622 15.2772 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2344 -0.8078 17.3485 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5815 2.3487 11.2258 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8643 3.8051 9.3767 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3025 5.1220 8.2278 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2233 3.7862 11.0983 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5648 2.1990 12.8082 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1950 -3.1981 16.5054 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1858 -3.6564 16.2764 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 34 1 0 0 0 - 3 35 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 36 1 0 0 0 - 4 37 1 0 0 0 - 5 38 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 39 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 40 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 29 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 41 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 19 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 20 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 42 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 43 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 17 44 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 28 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 45 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 46 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 27 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 47 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 30 2 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 -M END -> -7.6 - -$$$$ -CHEMBL3265024 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2568 -3.1054 13.5684 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8727 -2.3625 14.7149 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5248 -2.1122 14.8155 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7475 -2.8704 15.6805 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3908 -2.6105 15.8142 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2212 -1.5850 15.0876 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6034 -1.3608 15.3283 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5312 -0.4403 14.7667 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1675 0.3842 13.7368 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1076 1.2383 13.2220 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4125 1.2788 13.7032 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7426 0.4894 14.7579 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8974 0.3808 15.4860 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5940 -0.5330 16.5234 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3802 -1.0455 16.3684 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8358 -0.3914 15.3289 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6478 2.1536 12.1231 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5652 2.6370 11.1626 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1327 3.4633 10.1244 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7965 3.8161 10.0403 C 0 0 0 0 0 0 - 1.4003 4.6403 9.0163 O 0 0 0 0 0 0 - 0.0245 4.4666 8.5995 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0306 4.3224 9.7544 C 0 0 0 0 0 0 - -2.2095 4.6594 9.6693 O 0 0 0 0 0 0 - -0.4630 3.7540 10.8496 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8760 3.3777 10.9729 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2936 2.5512 12.0256 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5545 -0.8186 14.1904 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9414 -1.0869 14.0597 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7479 -0.3495 13.2074 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2257 0.6484 12.3503 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3364 -3.2530 13.5862 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7871 -4.0896 13.5579 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0111 -2.5827 12.6426 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2013 -3.6605 16.2619 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1985 -3.2029 16.5011 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9936 -1.9428 16.0565 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1741 1.9556 13.3388 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7812 0.9637 15.2765 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2349 -0.8119 17.3458 H 0 0 0 0 0 0 - 4.6048 2.3508 11.2165 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8336 3.8213 9.3866 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2884 5.2770 7.9386 H 0 0 0 0 0 0 - -0.0356 3.5427 8.0188 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0932 3.5716 11.6149 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5806 2.2143 12.7659 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1112 -0.0266 13.6222 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0472 1.0725 11.7697 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5042 0.2337 11.6479 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7772 1.4543 12.9275 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 28 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 37 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 38 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 27 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 31 48 1 0 0 0 - 31 49 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 -M END -> -2.3 - -$$$$ -CHEMBL3265018 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 51 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2567 -3.1043 13.5693 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8736 -2.3603 14.7157 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5257 -2.1109 14.8170 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7457 -2.8699 15.6819 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3904 -2.6103 15.8138 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2205 -1.5845 15.0866 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6039 -1.3601 15.3216 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5369 -0.4474 14.7595 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1817 0.3719 13.7240 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1138 1.2387 13.2179 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4187 1.2840 13.7027 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7466 0.4880 14.7600 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8977 0.3770 15.4865 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5876 -0.5233 16.5295 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3760 -1.0434 16.3734 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8370 -0.3940 15.3257 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6359 2.1614 12.1223 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3054 2.6314 12.1303 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8262 3.5165 11.1628 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7006 3.9330 10.1707 C 0 0 0 0 0 0 - 1.4948 4.8131 9.1162 N 0 0 0 0 0 0 - 2.6280 4.8521 8.4793 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5731 4.0579 9.0246 N 0 0 0 0 0 0 - 3.0312 3.4473 10.1317 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5261 2.5537 11.0860 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5552 -0.8189 14.1920 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9445 -1.0884 14.0613 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7533 -0.3562 13.2050 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2327 0.6448 12.3521 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3358 -3.2523 13.5866 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7891 -4.0896 13.5591 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0124 -2.5806 12.6438 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1936 -3.6623 16.2628 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1988 -3.2068 16.4980 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9908 -1.9341 16.0530 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1808 1.9634 13.3425 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7856 0.9484 15.2760 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2287 -0.7926 17.3523 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6366 2.3172 12.9226 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1813 3.8713 11.1916 H 0 0 0 0 0 0 - 2.8538 5.4380 7.6007 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5054 3.9747 8.6412 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5263 2.1799 11.0411 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1081 -0.0326 13.6249 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0507 1.0730 11.7701 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5099 0.2344 11.6497 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7820 1.4500 12.9277 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 35 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 25 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 45 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 -M END -> -6.3 - -$$$$ -CHEMBL3265008 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3747 4.5939 9.0109 F 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5765 3.7694 10.8883 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4448 3.1424 10.2886 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8228 4.9083 11.5365 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6996 -0.3055 13.2024 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0030 0.6746 12.5250 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3279 -3.2950 13.5978 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7404 -4.0640 13.5409 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0334 -2.5595 12.6514 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2101 -3.6528 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1909 -3.2102 16.5030 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0243 -1.8859 16.0479 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1721 2.0017 13.3734 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7662 0.9734 15.2903 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2091 -0.8330 17.3299 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5936 2.3316 11.1997 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8293 3.7971 9.3821 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6045 2.2130 12.7803 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7221 5.3634 11.6017 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1401 5.4552 12.0414 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1548 -0.0169 13.6338 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6866 1.2254 11.8789 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2230 0.2132 11.9195 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5495 1.3592 13.2418 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 23 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 26 43 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 45 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 46 1 0 0 0 - 30 47 1 0 0 0 - 30 48 1 0 0 0 -M END -> -67.3 - -$$$$ -CHEMBL3265016 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 52 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2568 -3.1050 13.5687 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8730 -2.3616 14.7152 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5250 -2.1116 14.8158 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7470 -2.8700 15.6807 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3902 -2.6106 15.8144 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2207 -1.5844 15.0868 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6046 -1.3596 15.3257 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5329 -0.4401 14.7638 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1751 0.3788 13.7311 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1086 1.2387 13.2176 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4159 1.2831 13.6998 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7435 0.4926 14.7566 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8975 0.3810 15.4862 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5917 -0.5286 16.5249 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3780 -1.0408 16.3703 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8370 -0.3906 15.3278 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6350 2.1602 12.1213 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5425 2.6402 11.1650 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1493 3.4616 10.1117 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8041 3.8212 10.0117 C 0 0 0 0 0 0 - 1.0219 4.6165 9.0806 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2682 4.5927 9.5377 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3496 3.8668 10.6667 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8806 3.3533 11.0064 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2701 2.5323 12.0703 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5547 -0.8186 14.1912 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9427 -1.0874 14.0603 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7500 -0.3519 13.2066 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2281 0.6471 12.3512 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3362 -3.2528 13.5863 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7878 -4.0896 13.5583 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0115 -2.5819 12.6430 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1984 -3.6612 16.2623 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1986 -3.2043 16.5000 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9930 -1.9388 16.0550 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1768 1.9603 13.3373 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7836 0.9581 15.2759 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2317 -0.8060 17.3476 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5826 2.3470 11.2271 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8655 3.8013 9.3845 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3655 5.1278 8.2063 H 0 0 0 0 0 0 - -1.1634 5.0533 9.1382 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2206 3.7428 11.1558 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5744 2.1993 12.8125 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1099 -0.0288 13.6231 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0484 1.0726 11.7702 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5061 0.2341 11.6487 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7788 1.4529 12.9278 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 35 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 25 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 -M END -> -2.7 - -$$$$ -CHEMBL3265025 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2554 -3.1070 13.5667 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8739 -2.3555 14.7096 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5267 -2.1066 14.8132 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7520 -2.8715 15.6749 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3933 -2.6145 15.8117 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2196 -1.5878 15.0897 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6042 -1.3666 15.3298 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5249 -0.4338 14.7828 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1518 0.4044 13.7691 N 0 0 0 0 0 0 - 3.0983 1.2388 13.2332 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4000 1.2764 13.7009 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7368 0.4928 14.7596 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8926 0.3911 15.4808 C 0 0 0 0 0 0 - 5.6027 -0.5483 16.5053 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3885 -1.0602 16.3544 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8325 -0.3883 15.3309 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6407 2.1399 12.1271 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5584 2.6399 11.1674 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1117 3.4654 10.1220 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7626 3.8038 10.0403 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2975 4.6116 9.0072 N 0 0 0 0 0 0 - -0.0065 4.8513 8.7182 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4123 5.6311 7.8553 O 0 0 0 0 0 0 - -0.9274 3.9668 9.6249 C 0 0 0 0 0 0 - -0.4391 3.7019 10.9584 O 0 0 0 0 0 0 - 0.8806 3.3365 10.9991 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2955 2.5129 12.0280 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5548 -0.8136 14.1938 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9407 -1.0774 14.0650 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7433 -0.3209 13.2263 O 0 0 0 0 0 0 - -2.1991 0.3702 12.1141 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3362 -3.2511 13.5814 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7862 -4.0919 13.5584 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0024 -2.5902 12.6400 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2087 -3.6617 16.2534 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1948 -3.2083 16.4987 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9997 -1.9671 16.0417 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1597 1.9397 13.3158 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7704 0.9889 15.2738 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2524 -0.8465 17.3109 H 0 0 0 0 0 0 - 4.6017 2.3682 11.2211 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8116 3.8283 9.3793 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9664 5.0550 8.3957 H 0 0 0 0 0 0 - -1.0255 3.0007 9.1213 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9053 4.4356 9.6360 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5824 2.1742 12.7618 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1140 -0.0195 13.6280 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0255 0.8261 11.5653 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6971 -0.3166 11.4335 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5230 1.1664 12.4132 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 28 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 37 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 38 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 27 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 26 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 27 46 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 47 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 31 48 1 0 0 0 - 31 49 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 -M END -> -33.4 - -$$$$ -CHEMBL3265013 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 54 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2553 -3.1063 13.5659 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8742 -2.3531 14.7065 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5276 -2.1063 14.8134 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7534 -2.8662 15.6836 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3974 -2.6067 15.8226 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2193 -1.5855 15.0957 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6033 -1.3619 15.3321 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5310 -0.4394 14.7826 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1681 0.3851 13.7534 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1084 1.2291 13.2323 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4111 1.2775 13.7062 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7446 0.4849 14.7663 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8943 0.3819 15.4817 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5914 -0.5326 16.5146 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3838 -1.0600 16.3570 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8360 -0.3910 15.3315 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6494 2.1359 12.1286 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5584 2.6335 11.1783 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1269 3.4578 10.1469 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7725 3.8115 10.0354 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3343 4.6941 8.8847 C 0 0 0 0 0 0 - 2.0989 5.5193 8.3952 O 0 0 0 0 0 0 - 0.0978 4.4815 8.4258 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8524 3.3384 11.0121 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6224 3.7518 10.9890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2991 2.5101 12.0360 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5507 -0.8158 14.1957 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9415 -1.0842 14.0609 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7452 -0.3406 13.2070 O 0 0 0 0 0 0 - -2.1924 0.4470 12.1700 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3356 -3.2496 13.5811 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7889 -4.0922 13.5603 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0032 -2.5893 12.6399 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2026 -3.6557 16.2609 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1866 -3.2024 16.5111 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9910 -1.9452 16.0564 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1687 1.9466 13.3246 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7729 0.9741 15.2789 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2395 -0.8158 17.3246 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5960 2.3576 11.2295 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8409 3.8102 9.4155 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2537 5.0105 7.6461 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4831 3.7720 8.8458 H 0 0 0 0 0 0 - -1.1053 3.5651 11.9422 H 0 0 0 0 0 0 - -1.1697 3.2135 10.2168 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7255 4.8289 10.8204 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6002 2.1680 12.7776 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1045 -0.0276 13.6335 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0148 0.9031 11.6158 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6244 -0.1596 11.4651 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5752 1.2513 12.5580 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 26 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 26 2 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 49 1 0 0 0 - 30 50 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 -M END -> -64.1 - -$$$$ -CHEMBL3259820 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2559 -3.1060 13.5669 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8726 -2.3561 14.7087 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1090 14.8139 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8677 15.6812 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3968 -2.6084 15.8204 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2208 -1.5821 15.0957 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6029 -1.3570 15.3324 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5301 -0.4418 14.7814 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1713 0.3833 13.7481 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1089 1.2308 13.2274 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4101 1.2783 13.7032 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7426 0.4910 14.7676 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8953 0.3872 15.4836 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5954 -0.5343 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3825 -1.0512 16.3664 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8364 -0.4021 15.3289 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6465 2.1385 12.1256 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5557 2.6368 11.1745 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1190 3.4676 10.1463 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7635 3.8248 10.0594 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8615 3.3448 11.0110 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2990 2.5127 12.0324 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2918 4.7293 8.9608 C 0 0 0 0 0 0 - 2.0878 5.3456 8.2497 O 0 0 0 0 0 0 - -0.0320 4.8143 8.7824 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5541 -0.8144 14.1977 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9430 -1.0833 14.0624 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7475 -0.3431 13.2088 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2164 0.6551 12.3579 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3366 -3.2485 13.5818 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7903 -4.0925 13.5604 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0039 -2.5877 12.6407 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2037 -3.6575 16.2628 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1911 -3.2025 16.5100 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9934 -1.9421 16.0553 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1714 1.9452 13.3228 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7795 0.9683 15.2756 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2400 -0.8202 17.3279 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5974 2.3606 11.2253 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8290 3.8282 9.4160 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1777 3.6239 10.9656 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5906 2.1614 12.7684 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4213 5.3894 8.0510 H 0 0 0 0 0 0 - -0.6482 4.2950 9.3843 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1068 -0.0259 13.6327 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0358 1.0794 11.7746 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4924 0.2406 11.6554 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7680 1.4642 12.9342 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 35 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 -M END -> -17.7 - -$$$$ -CHEMBL3265001 - 3D - Structure written by MMmdl. - 62 67 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5783 3.7648 10.8956 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2780 3.6594 9.8925 O 0 0 0 0 0 0 - -1.0343 4.2553 12.0485 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3943 4.7285 12.2897 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6544 5.5820 13.3553 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9490 6.0325 13.5849 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9835 5.6294 12.7489 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7235 4.7759 11.6833 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4289 4.3254 11.4537 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3808 6.1155 12.9967 C 0 0 0 0 0 0 - -7.4427 5.4157 12.6869 N 0 5 0 0 0 0 - -8.5101 6.1905 13.0642 N 0 0 0 0 0 0 - -8.0145 7.3480 13.5959 N 0 0 0 0 0 0 - -6.6463 7.2766 13.5417 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6991 -0.3052 13.2021 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0020 0.6746 12.5251 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7528 -4.0708 13.5508 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0179 -2.5675 12.6505 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3306 -3.2808 13.5889 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2100 -3.6528 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1911 -3.2101 16.5029 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0246 -1.8858 16.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1701 2.0030 13.3719 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7656 0.9739 15.2897 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2089 -0.8330 17.3301 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5934 2.3309 11.2002 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8342 3.7939 9.3845 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4564 4.4350 9.2166 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6053 2.2130 12.7811 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4948 4.3595 12.8959 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8489 5.8959 14.0061 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1515 6.6970 14.4145 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5289 4.4620 11.0325 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2264 3.6609 10.6241 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1547 -0.0168 13.6337 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6851 1.2257 11.8787 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2218 0.2131 11.9198 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5485 1.3591 13.2420 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 41 1 0 0 0 - 1 42 1 0 0 0 - 1 43 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 44 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 45 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 46 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 47 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 48 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 49 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 50 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 51 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 52 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 53 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 54 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 31 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 55 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 56 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 57 1 0 0 0 - 31 58 1 0 0 0 - 32 36 2 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 33 34 1 0 0 0 - 34 35 2 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 37 38 2 0 0 0 - 37 59 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 39 40 1 0 0 0 - 40 60 1 0 0 0 - 40 61 1 0 0 0 - 40 62 1 0 0 0 -M CHG 1 33 -1 -M END -> -1.5 - -$$$$ -CHEMBL3265006 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 54 0 0 1 0 999 V2000 - -2.4212 4.6361 12.3150 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0554 4.1831 12.0682 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5783 3.7648 10.8955 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2609 3.7178 9.8765 O 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6991 -0.3052 13.2022 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0020 0.6747 12.5251 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - -2.5270 4.9174 13.3627 H 0 0 0 0 0 0 - -3.1185 3.8312 12.0826 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6378 5.4979 11.6837 H 0 0 0 0 0 0 - -0.5302 4.2377 12.9293 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4564 4.4350 9.2166 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8342 3.7939 9.3845 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5934 2.3309 11.2002 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6053 2.2130 12.7810 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1701 2.0030 13.3719 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7656 0.9739 15.2897 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2089 -0.8330 17.3301 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0245 -1.8853 16.0480 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1911 -3.2101 16.5029 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2100 -3.6528 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0223 -2.5652 12.6508 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3298 -3.2850 13.5913 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7492 -4.0689 13.5480 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6852 1.2258 11.8788 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2219 0.2131 11.9198 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5484 1.3591 13.2420 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1547 -0.0168 13.6337 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 34 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 10 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 35 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 37 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 10 38 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 30 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 39 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 17 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 41 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 30 2 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 29 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 25 47 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 26 29 2 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 48 1 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 28 50 1 0 0 0 - 29 51 1 0 0 0 -M END -> -50.2 - -$$$$ -CHEMBL3265030 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 57 0 0 1 0 999 V2000 - -6.0443 -4.4602 16.2962 C 0 0 0 0 0 0 - -5.6240 -3.4001 15.2728 C 0 0 0 0 0 0 - -6.7329 -2.9884 14.5080 O 0 0 0 0 0 0 - -4.7833 -2.2666 15.8350 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8370 -2.3937 14.7064 N 0 0 0 0 0 0 - -4.3873 -3.7457 14.4627 C 0 0 0 0 0 0 - -2.4739 -2.0989 14.7890 C 0 0 0 0 0 0 - -1.8935 -1.0737 14.0433 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5352 -0.8073 14.1963 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2332 -1.5617 15.0991 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5948 -1.3216 15.3436 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5323 -0.4320 14.7835 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1832 0.3856 13.7527 N 0 0 0 0 0 0 - 3.0997 1.2392 13.2138 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4085 1.2886 13.6971 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7393 0.4966 14.7557 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8912 0.3843 15.4874 C 0 0 0 0 0 0 - 5.6000 -0.5403 16.4969 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3900 -1.0499 16.3863 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8285 -0.3910 15.3363 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6272 2.1508 12.1213 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5370 2.6346 11.1631 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1492 3.4622 10.1085 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8011 3.8208 10.0156 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9990 4.5979 9.1271 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2497 4.6170 9.5128 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3315 3.8838 10.6343 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8874 3.3527 10.9946 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2729 2.5247 12.0514 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3672 -2.5916 15.8262 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7168 -2.8552 15.6739 C 0 0 0 0 0 0 - -5.2050 -4.7984 16.9035 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8054 -4.0661 16.9698 H 0 0 0 0 0 0 - -6.4675 -5.3321 15.7974 H 0 0 0 0 0 0 - -6.4046 -2.3323 13.8881 H 0 0 0 0 0 0 - -4.3284 -2.4863 16.8029 H 0 0 0 0 0 0 - -5.2892 -1.3024 15.8976 H 0 0 0 0 0 0 - -4.5733 -3.9761 13.4129 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7850 -4.5482 14.8924 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4933 -0.4925 13.3604 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1177 -0.0073 13.6132 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0095 -1.8739 16.0815 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1692 1.9645 13.3454 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7768 0.9622 15.2769 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2732 -0.8674 17.2818 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5724 2.3319 11.2116 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8628 3.8049 9.3741 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3157 5.1254 8.2407 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2162 3.7634 11.1025 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5632 2.1669 12.7820 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2126 -3.1777 16.5228 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1693 -3.6422 16.2570 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 3 35 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 36 1 0 0 0 - 4 37 1 0 0 0 - 5 6 1 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 6 38 1 0 0 0 - 6 39 1 0 0 0 - 7 8 2 0 0 0 - 7 31 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 40 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 41 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 30 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 42 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 20 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 21 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 43 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 20 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 44 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 45 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 29 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 46 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 47 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 28 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 48 1 0 0 0 - 26 27 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 49 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 29 50 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 - 31 52 1 0 0 0 -M END -> -3.9 - -$$$$ -CHEMBL3265022 - 3D - Structure written by MMmdl. - 50 54 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2567 -3.1047 13.5688 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8734 -2.3604 14.7149 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5253 -2.1111 14.8171 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7475 -2.8730 15.6782 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3907 -2.6182 15.8081 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2216 -1.5894 15.0857 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6073 -1.3712 15.3149 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5355 -0.4471 14.7615 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1757 0.3798 13.7323 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1108 1.2385 13.2179 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4177 1.2796 13.6973 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7459 0.4877 14.7580 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8989 0.3777 15.4842 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5905 -0.5278 16.5266 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3783 -1.0442 16.3710 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8361 -0.3924 15.3256 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6345 2.1599 12.1209 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5455 2.6449 11.1653 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1472 3.4641 10.1113 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8026 3.8166 10.0162 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9964 4.5969 9.1149 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2457 4.6110 9.5049 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3357 3.9010 10.6180 N 0 0 0 0 0 0 - -1.6267 3.7825 11.2689 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8830 3.3583 10.9929 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2696 2.5335 12.0602 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5547 -0.8145 14.1988 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9437 -1.0858 14.0662 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7514 -0.3534 13.2139 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2220 0.6070 12.3331 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3359 -3.2534 13.5870 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7874 -4.0892 13.5581 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0127 -2.5809 12.6432 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1986 -3.6652 16.2573 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1975 -3.2194 16.4879 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0047 -1.9732 16.0205 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1816 1.9533 13.3327 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7844 0.9544 15.2754 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2308 -0.8005 17.3497 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5872 2.3567 11.2306 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8598 3.8084 9.3838 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3099 5.1193 8.2308 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5635 4.1826 12.2778 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8990 2.7466 11.2882 H 0 0 0 0 0 0 - -2.4088 4.3136 10.7194 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5682 2.1998 12.8003 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1091 -0.0207 13.6374 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0436 1.0382 11.7546 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5161 0.1773 11.6242 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7468 1.4118 12.8931 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 26 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 24 45 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 48 1 0 0 0 - 30 49 1 0 0 0 - 30 50 1 0 0 0 -M END -> -12.3 - -$$$$ -CHEMBL3265019 - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 50 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2567 -3.1043 13.5693 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8736 -2.3605 14.7157 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5257 -2.1110 14.8169 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7458 -2.8699 15.6818 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3904 -2.6103 15.8137 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2206 -1.5847 15.0868 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6037 -1.3593 15.3213 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5361 -0.4486 14.7616 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1814 0.3735 13.7239 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1138 1.2388 13.2174 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4183 1.2844 13.7022 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7470 0.4870 14.7610 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8980 0.3781 15.4861 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5879 -0.5236 16.5289 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3760 -1.0435 16.3736 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8368 -0.3913 15.3236 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6373 2.1616 12.1208 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3117 2.6428 12.1323 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8392 3.5282 11.1613 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7204 3.9285 10.1646 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5424 4.7860 9.1151 N 0 0 0 0 0 0 - 2.7143 4.8525 8.3999 N 0 0 0 0 0 0 - 3.5904 4.0382 9.0000 N 0 0 0 0 0 0 - 3.0324 3.4382 10.1221 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5249 2.5426 11.0797 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5551 -0.8189 14.1919 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9443 -1.0883 14.0612 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7530 -0.3558 13.2052 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2324 0.6450 12.3520 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3358 -3.2523 13.5866 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7890 -4.0896 13.5590 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0124 -2.5807 12.6437 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1941 -3.6622 16.2628 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1988 -3.2066 16.4982 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9911 -1.9346 16.0533 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1807 1.9631 13.3423 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7854 0.9491 15.2761 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2290 -0.7940 17.3521 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6437 2.3379 12.9285 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1664 3.8943 11.1902 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5235 3.9296 8.6264 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5235 2.1590 11.0319 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1083 -0.0321 13.6247 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0506 1.0729 11.7701 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5096 0.2343 11.6496 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7818 1.4502 12.9278 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 35 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 25 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 43 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 44 1 0 0 0 - 29 45 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 -M END -> -12.6 - -$$$$ -CHEMBL3265004 - 3D - Structure written by MMmdl. - 65 70 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5783 3.7648 10.8956 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2780 3.6594 9.8925 O 0 0 0 0 0 0 - -1.0343 4.2553 12.0485 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3943 4.7285 12.2897 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6544 5.5820 13.3553 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9490 6.0325 13.5849 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9835 5.6294 12.7489 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7235 4.7759 11.6833 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4289 4.3254 11.4537 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3808 6.1155 12.9967 C 0 0 0 0 0 0 - -7.5270 5.8082 12.2567 C 0 0 0 0 0 0 - -8.5983 6.3994 12.7385 N 0 0 0 0 0 0 - -8.1591 7.0985 13.7988 N 0 0 0 0 0 0 - -6.8114 6.9611 14.0027 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6991 -0.3052 13.2021 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0020 0.6746 12.5251 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7528 -4.0708 13.5508 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0179 -2.5675 12.6505 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3306 -3.2808 13.5889 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2100 -3.6528 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1911 -3.2101 16.5029 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0246 -1.8858 16.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1701 2.0030 13.3719 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7656 0.9739 15.2897 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2089 -0.8330 17.3301 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5934 2.3309 11.2002 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8342 3.7939 9.3845 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4564 4.4350 9.2166 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6053 2.2130 12.7811 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4948 4.3595 12.8959 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8489 5.8959 14.0061 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1515 6.6970 14.4145 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5289 4.4620 11.0325 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2264 3.6609 10.6241 H 0 0 0 0 0 0 - -7.5663 5.1644 11.3851 H 0 0 0 0 0 0 - -8.7747 7.6664 14.3806 H 0 0 0 0 0 0 - -6.3056 7.4629 14.8185 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1547 -0.0168 13.6337 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6851 1.2257 11.8787 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2218 0.2131 11.9198 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5485 1.3591 13.2420 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 41 1 0 0 0 - 1 42 1 0 0 0 - 1 43 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 38 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 44 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 45 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 37 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 46 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 47 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 48 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 49 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 50 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 51 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 52 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 53 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 54 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 31 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 55 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 56 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 57 1 0 0 0 - 31 58 1 0 0 0 - 32 33 1 0 0 0 - 32 36 2 0 0 0 - 33 34 2 0 0 0 - 33 59 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 35 36 1 0 0 0 - 35 60 1 0 0 0 - 36 61 1 0 0 0 - 37 38 2 0 0 0 - 37 62 1 0 0 0 - 38 39 1 0 0 0 - 39 40 1 0 0 0 - 40 63 1 0 0 0 - 40 64 1 0 0 0 - 40 65 1 0 0 0 -M END -> -11 - -$$$$ -CHEMBL3265009 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 54 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3278 4.6785 8.9004 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5782 3.7649 10.8956 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4474 3.1358 10.2993 O 0 0 0 0 0 0 - -0.8250 4.9023 11.5462 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6991 -0.3051 13.2023 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0021 0.6747 12.5252 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7566 -4.0728 13.5537 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0132 -2.5700 12.6504 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3313 -3.2764 13.5862 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2100 -3.6528 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1911 -3.2101 16.5029 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0245 -1.8852 16.0481 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1701 2.0029 13.3719 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7656 0.9739 15.2896 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2090 -0.8330 17.3300 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5935 2.3310 11.2004 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8342 3.7938 9.3845 H 0 0 0 0 0 0 - 0.2554 4.8524 8.9886 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5389 4.1839 7.9522 H 0 0 0 0 0 0 - 1.8548 5.6319 8.9381 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6052 2.2126 12.7809 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7254 5.3545 11.6162 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1417 5.4508 12.0485 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1546 -0.0169 13.6336 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6852 1.2258 11.8789 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2220 0.2132 11.9198 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5484 1.3591 13.2421 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 23 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 41 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 22 1 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 21 43 1 0 0 0 - 21 44 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 22 24 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 49 1 0 0 0 - 30 50 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 -M END -> -28.3 - -$$$$ -CHEMBL3265021 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 51 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2567 -3.1041 13.5694 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8737 -2.3599 14.7156 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5258 -2.1107 14.8171 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7454 -2.8698 15.6820 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3904 -2.6103 15.8138 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2204 -1.5845 15.0865 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6042 -1.3599 15.3206 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5373 -0.4464 14.7592 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1833 0.3714 13.7220 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1157 1.2390 13.2179 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4197 1.2848 13.7036 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7466 0.4890 14.7613 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8976 0.3767 15.4867 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5868 -0.5220 16.5302 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3755 -1.0422 16.3738 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8369 -0.3923 15.3263 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6420 2.1628 12.1182 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5476 2.6405 11.1603 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1538 3.4680 10.0985 C 0 0 0 0 0 0 - 1.8053 3.8044 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 1.0883 4.5643 9.1320 N 0 0 0 0 0 0 - -0.2025 4.6328 9.4561 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3779 3.9489 10.5598 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8670 3.3654 10.9941 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2880 2.5471 12.0527 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5552 -0.8189 14.1923 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9451 -1.0886 14.0616 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7540 -0.3570 13.2047 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2335 0.6444 12.3522 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3357 -3.2522 13.5867 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7893 -4.0896 13.5592 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0126 -2.5804 12.6439 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1927 -3.6625 16.2629 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1988 -3.2074 16.4977 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9904 -1.9330 16.0525 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1817 1.9635 13.3434 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7861 0.9464 15.2759 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2273 -0.7901 17.3528 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5880 2.3444 11.2252 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8539 3.8134 9.3727 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4372 5.0378 8.3060 H 0 0 0 0 0 0 - -1.3472 3.8635 11.0272 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5928 2.2220 12.7999 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1077 -0.0333 13.6254 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0510 1.0731 11.7700 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5105 0.2345 11.6498 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7824 1.4497 12.9275 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 35 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 25 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 2 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 45 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 -M END -> -10.4 - -$$$$ -CHEMBL3265011 - 3D - Structure written by MMmdl. - 51 54 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 4.9972 2.2126 11.2105 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5881 3.7303 10.8428 C 0 0 0 0 0 0 - -1.1092 3.7021 9.7263 O 0 0 0 0 0 0 - -1.2179 4.0963 11.9826 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6987 -0.3081 13.1992 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0021 0.6722 12.5223 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3290 -3.2895 13.5939 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7452 -4.0667 13.5449 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0270 -2.5627 12.6510 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2099 -3.6533 16.2602 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1911 -3.2106 16.5025 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0257 -1.8895 16.0445 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1717 2.0006 13.3700 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7663 0.9729 15.2892 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2094 -0.8335 17.3296 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6068 2.1879 12.7700 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4521 4.4207 9.2063 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8319 3.7891 9.3801 H 0 0 0 0 0 0 - 5.5347 2.6775 10.3840 H 0 0 0 0 0 0 - 5.0655 1.1282 11.1241 H 0 0 0 0 0 0 - 5.4384 2.5303 12.1552 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1896 4.3530 11.9274 H 0 0 0 0 0 0 - -0.7063 4.1173 12.8487 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1540 -0.0199 13.6303 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6849 1.2208 11.8735 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2195 0.2114 11.9195 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5517 1.3587 13.2392 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 34 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 35 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 27 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 36 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 37 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 38 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 39 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 40 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 24 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 42 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 23 44 1 0 0 0 - 23 45 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 24 26 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 27 28 2 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 49 1 0 0 0 - 30 50 1 0 0 0 - 30 51 1 0 0 0 -M END -> -466 - -$$$$ -CHEMBL3265005 - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2567 -3.1050 13.5684 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8734 -2.3611 14.7148 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5247 -2.1101 14.8166 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7507 -2.8683 15.6828 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3911 -2.6099 15.8185 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2170 -1.5863 15.0905 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6046 -1.3615 15.3286 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5322 -0.4485 14.7676 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1746 0.3813 13.7360 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1152 1.2349 13.2220 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4162 1.2784 13.7032 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7450 0.4849 14.7598 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8984 0.3795 15.4856 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5934 -0.5343 16.5244 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3805 -1.0504 16.3702 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8378 -0.3985 15.3258 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6545 2.1505 12.1229 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5650 2.6332 11.1660 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1279 3.4532 10.1263 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7853 3.8163 10.0263 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8655 3.3670 10.9906 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3076 2.5389 12.0352 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6125 3.7616 10.9140 C 0 0 0 0 0 0 - -1.4124 3.3703 11.7502 O 0 0 0 0 0 0 - -0.9623 4.5440 9.8958 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5525 -0.8154 14.1926 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9431 -1.0889 14.0634 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7491 -0.3514 13.2105 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2119 0.5324 12.2516 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3371 -3.2473 13.5828 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7923 -4.0918 13.5617 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0053 -2.5854 12.6423 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2045 -3.6577 16.2649 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1939 -3.2023 16.5060 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9934 -1.9429 16.0579 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1774 1.9554 13.3408 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7817 0.9624 15.2771 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2343 -0.8101 17.3474 H 0 0 0 0 0 0 - 4.6048 2.3502 11.2176 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8359 3.8027 9.3872 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4656 4.4411 9.2087 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6085 2.2013 12.7854 H 0 0 0 0 0 0 - -1.9282 4.8274 9.7978 H 0 0 0 0 0 0 - -0.2850 4.8642 9.2301 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1105 -0.0248 13.6275 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0285 0.9892 11.6884 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5629 0.0226 11.5419 H 0 0 0 0 0 0 - -1.6668 1.3176 12.7602 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 35 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 41 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 - 29 48 1 0 0 0 -M END -> -27.1 - -$$$$ -CHEMBL3265017 - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 51 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2568 -3.1045 13.5692 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8735 -2.3609 14.7157 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5254 -2.1112 14.8167 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7461 -2.8700 15.6816 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3903 -2.6103 15.8137 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2206 -1.5848 15.0868 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6038 -1.3598 15.3228 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5359 -0.4458 14.7609 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1794 0.3745 13.7258 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1126 1.2387 13.2174 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4180 1.2838 13.7013 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7460 0.4885 14.7593 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8978 0.3783 15.4862 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5892 -0.5252 16.5282 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3768 -1.0429 16.3726 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8366 -0.3928 15.3256 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6368 2.1616 12.1201 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5454 2.6408 11.1618 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1453 3.4625 10.1097 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7994 3.8163 10.0176 C 0 0 0 0 0 0 - 0.9914 4.5941 9.1197 C 0 0 0 0 0 0 - -0.2494 4.6053 9.5133 N 0 0 0 0 0 0 - -0.3372 3.8935 10.6271 N 0 0 0 0 0 0 - 0.8851 3.3607 10.9950 C 0 0 0 0 0 0 - 1.2726 2.5413 12.0626 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5549 -0.8187 14.1915 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9439 -1.0882 14.0610 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7521 -0.3548 13.2056 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2313 0.6456 12.3518 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3359 -3.2524 13.5865 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7887 -4.0896 13.5588 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0122 -2.5810 12.6435 H 0 0 0 0 0 0 - -2.1953 -3.6619 16.2627 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1988 -3.2059 16.4986 H 0 0 0 0 0 0 - 1.9915 -1.9358 16.0538 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1799 1.9624 13.3414 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7849 0.9516 15.2761 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2311 -0.7975 17.3512 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5870 2.3473 11.2231 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8550 3.8058 9.3820 H 0 0 0 0 0 0 - 1.3018 5.1155 8.2351 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2265 3.7931 11.0919 H 0 0 0 0 0 0 - 0.5730 2.2156 12.8045 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1088 -0.0311 13.6242 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0501 1.0729 11.7701 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5087 0.2343 11.6493 H 0 0 0 0 0 0 - -1.7811 1.4509 12.9278 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 30 1 0 0 0 - 1 31 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 33 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 34 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 26 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 35 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 36 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 37 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 38 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 25 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 39 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 40 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 41 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 42 1 0 0 0 - 24 25 2 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 29 45 1 0 0 0 - 29 46 1 0 0 0 - 29 47 1 0 0 0 -M END -> -3.8 - -$$$$ -CHEMBL3265000 - 3D - Structure written by MMmdl. - 67 71 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2555 -3.1029 13.5707 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8740 -2.3535 14.7166 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5261 -2.1057 14.8053 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7497 -2.8673 15.6804 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3863 -2.6106 15.8150 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2220 -1.5829 15.0890 C 0 0 0 0 0 0 - 1.5930 -1.3491 15.3060 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5452 -0.4689 14.7536 C 0 0 0 0 0 0 - 2.2178 0.3551 13.7190 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 1.2406 13.2181 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4207 1.3039 13.7175 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7482 0.4921 14.7654 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8898 0.3836 15.5035 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5715 -0.5089 16.5177 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3818 -1.0543 16.3920 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8330 -0.4170 15.3252 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6564 2.1560 12.1340 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6280 11.1666 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1294 3.4499 10.1277 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7879 3.8078 10.0318 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8660 3.3707 10.9895 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3140 2.5576 12.0419 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5783 3.7648 10.8956 C 0 0 0 0 0 0 - -1.2780 3.6594 9.8925 O 0 0 0 0 0 0 - -1.0343 4.2553 12.0485 N 0 0 0 0 0 0 - -2.3943 4.7285 12.2897 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6544 5.5820 13.3553 C 0 0 0 0 0 0 - -3.9490 6.0325 13.5849 C 0 0 0 0 0 0 - -4.9835 5.6294 12.7489 C 0 0 0 0 0 0 - -4.7235 4.7759 11.6833 C 0 0 0 0 0 0 - -3.4289 4.3254 11.4537 C 0 0 0 0 0 0 - -6.3808 6.1155 12.9967 C 0 0 0 0 0 0 - -7.3335 5.7936 12.2928 O 0 0 0 0 0 0 - -6.3969 6.9226 14.0705 N 0 5 0 0 0 0 - -7.9316 7.5992 14.5333 S 0 0 0 0 0 0 - -8.7871 6.4947 14.9809 O 0 0 0 0 0 0 - -8.3522 8.5161 13.4681 O 0 0 0 0 0 0 - -7.5285 8.5816 15.9619 C 0 0 0 0 0 0 - -0.5664 -0.8256 14.2115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9389 -1.0760 14.0580 C 0 0 0 0 0 0 - -2.6991 -0.3052 13.2021 O 0 0 0 0 0 0 - -2.0020 0.6746 12.5251 C 0 0 0 0 0 0 - -3.7528 -4.0708 13.5508 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0179 -2.5675 12.6505 H 0 0 0 0 0 0 - -5.3306 -3.2808 13.5889 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2100 -3.6528 16.2607 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1911 -3.2101 16.5029 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0246 -1.8858 16.0475 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1701 2.0030 13.3719 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7656 0.9739 15.2897 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2089 -0.8330 17.3301 H 0 0 0 0 0 0 - 4.5934 2.3309 11.2002 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8342 3.7939 9.3845 H 0 0 0 0 0 0 - 1.4564 4.4350 9.2166 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6053 2.2130 12.7811 H 0 0 0 0 0 0 - -0.4948 4.3595 12.8959 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8489 5.8959 14.0061 H 0 0 0 0 0 0 - -4.1515 6.6970 14.4145 H 0 0 0 0 0 0 - -5.5289 4.4620 11.0325 H 0 0 0 0 0 0 - -3.2264 3.6609 10.6241 H 0 0 0 0 0 0 - -8.4319 9.0596 16.3408 H 0 0 0 0 0 0 - -6.8023 9.3456 15.6843 H 0 0 0 0 0 0 - -7.1045 7.9412 16.7353 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1547 -0.0168 13.6337 H 0 0 0 0 0 0 - -2.6851 1.2257 11.8787 H 0 0 0 0 0 0 - -1.2218 0.2131 11.9198 H 0 0 0 0 0 0 - -1.5485 1.3591 13.2420 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 43 1 0 0 0 - 1 44 1 0 0 0 - 1 45 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 40 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 46 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 47 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 39 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 48 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 49 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 50 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 51 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 22 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 52 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 53 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 54 1 0 0 0 - 21 22 2 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 22 55 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 56 1 0 0 0 - 26 27 2 0 0 0 - 26 31 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 27 57 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 58 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 29 32 1 0 0 0 - 30 31 2 0 0 0 - 30 59 1 0 0 0 - 31 60 1 0 0 0 - 32 33 2 0 0 0 - 32 34 1 0 0 0 - 34 35 1 0 0 0 - 35 36 2 0 0 0 - 35 37 2 0 0 0 - 35 38 1 0 0 0 - 38 61 1 0 0 0 - 38 62 1 0 0 0 - 38 63 1 0 0 0 - 39 40 2 0 0 0 - 39 64 1 0 0 0 - 40 41 1 0 0 0 - 41 42 1 0 0 0 - 42 65 1 0 0 0 - 42 66 1 0 0 0 - 42 67 1 0 0 0 -M CHG 1 34 -1 -M END -> -2.2 - -$$$$ -CHEMBL3265010 - 3D - Structure written by MMmdl. - 52 55 0 0 1 0 999 V2000 - -4.2561 -3.1063 13.5675 C 0 0 0 0 0 0 - -3.8710 -2.3586 14.7108 O 0 0 0 0 0 0 - -2.5237 -2.1120 14.8115 C 0 0 0 0 0 0 - -1.7479 -2.8731 15.6758 C 0 0 0 0 0 0 - -0.3907 -2.6159 15.8114 C 0 0 0 0 0 0 - 0.2188 -1.5872 15.0906 C 0 0 0 0 0 0 - 1.6061 -1.3639 15.3275 N 0 0 0 0 0 0 - 2.5365 -0.4468 14.7698 C 0 0 0 0 0 0 - 2.1734 0.3862 13.7543 N 0 0 0 0 0 0 - 3.1090 1.2399 13.2318 C 0 0 0 0 0 0 - 4.4091 1.2828 13.7040 C 0 0 0 0 0 0 - 4.7384 0.4983 14.7655 N 0 0 0 0 0 0 - 5.8943 0.3897 15.4869 C 0 0 0 0 0 0 - 5.5998 -0.5422 16.5164 C 0 0 0 0 0 0 - 4.3902 -1.0596 16.3683 N 0 0 0 0 0 0 - 3.8368 -0.3957 15.3337 C 0 0 0 0 0 0 - 2.6487 2.1497 12.1257 C 0 0 0 0 0 0 - 3.5566 2.6396 11.1692 C 0 0 0 0 0 0 - 3.1227 3.4570 10.1283 C 0 0 0 0 0 0 - 1.7703 3.8176 10.0234 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3292 4.6020 8.9846 O 0 0 0 0 0 0 - 2.1136 5.6875 8.5183 C 0 0 0 0 0 0 - 0.8614 3.3613 10.9917 C 0 0 0 0 0 0 - 1.3049 2.5285 12.0328 C 0 0 0 0 0 0 - -0.6146 3.7607 10.8922 C 0 0 0 0 0 0 - -1.0753 4.3040 9.8978 O 0 0 0 0 0 0 - -1.3527 3.4740 11.9629 N 0 0 0 0 0 0 - -0.5555 -0.8165 14.1949 C 0 0 0 0 0 0 - -1.9469 -1.0910 14.0631 C 0 0 0 0 0 0 - -2.7598 -0.3552 13.2170 O 0 0 0 0 0 0 - -2.2311 0.6451 12.3776 C 0 0 0 0 0 0 - -5.3364 -3.2553 13.5856 H 0 0 0 0 0 0 - -3.7839 -4.0901 13.5556 H 0 0 0 0 0 0 - -4.0101 -2.5845 12.6407 H 0 0 0 0 0 0 - -2.2034 -3.6660 16.2562 H 0 0 0 0 0 0 - 0.1971 -3.2189 16.4942 H 0 0 0 0 0 0 - 2.0037 -1.9659 16.0267 H 0 0 0 0 0 0 - 5.1760 1.9362 13.3182 H 0 0 0 0 0 0 - 6.7838 0.9709 15.2741 H 0 0 0 0 0 0 - 6.2446 -0.8293 17.3211 H 0 0 0 0 0 0 - 4.6039 2.3672 11.2287 H 0 0 0 0 0 0 - 3.8363 3.8116 9.4024 H 0 0 0 0 0 0 - 1.5354 6.2089 7.7566 H 0 0 0 0 0 0 - 3.0460 5.3492 8.0564 H 0 0 0 0 0 0 - 2.3213 6.4278 9.2942 H 0 0 0 0 0 0 - 0.6057 2.1603 12.7711 H 0 0 0 0 0 0 - -2.3373 3.7022 11.9713 H 0 0 0 0 0 0 - -0.9395 3.0411 12.7709 H 0 0 0 0 0 0 - -0.1099 -0.0241 13.6351 H 0 0 0 0 0 0 - -3.0414 1.0912 11.7946 H 0 0 0 0 0 0 - -1.4766 0.2728 11.6770 H 0 0 0 0 0 0 - -1.8063 1.4100 13.0251 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 32 1 0 0 0 - 1 33 1 0 0 0 - 1 34 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 3 4 2 0 0 0 - 3 29 1 0 0 0 - 4 5 1 0 0 0 - 4 35 1 0 0 0 - 5 6 2 0 0 0 - 5 36 1 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 28 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 37 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 16 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 17 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 38 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 12 16 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 39 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 40 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 24 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 41 1 0 0 0 - 19 20 2 0 0 0 - 19 42 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 23 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 22 43 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 22 45 1 0 0 0 - 23 24 2 0 0 0 - 23 25 1 0 0 0 - 24 46 1 0 0 0 - 25 26 2 0 0 0 - 25 27 1 0 0 0 - 27 47 1 0 0 0 - 27 48 1 0 0 0 - 28 29 2 0 0 0 - 28 49 1 0 0 0 - 29 30 1 0 0 0 - 30 31 1 0 0 0 - 31 50 1 0 0 0 - 31 51 1 0 0 0 - 31 52 1 0 0 0 -M END -> -37.4 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/tnks2_ligands.sdf b/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/tnks2_ligands.sdf deleted file mode 100755 index b03f77cb..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/benchmark/qligfep/sdf/tnks2_ligands.sdf +++ /dev/null @@ -1,2546 +0,0 @@ -3a - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 41 0 0 1 0 999 V2000 - -14.9816 -16.8848 -26.7516 N 0 0 0 0 0 0 - -15.4574 -17.7370 -25.9019 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1716 -17.2489 -24.8288 N 0 0 0 0 0 0 - -16.4816 -15.9693 -24.5201 C 0 0 0 0 0 0 - -17.2339 -15.7049 -23.5851 O 0 0 0 0 0 0 - -15.3028 -19.1965 -26.0227 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7965 -20.0495 -25.0297 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5658 -21.4095 -25.0956 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8063 -21.9515 -26.1302 C 0 0 0 0 0 0 - -14.3983 -21.1196 -27.1811 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6397 -19.7519 -27.1232 C 0 0 0 0 0 0 - -14.3680 -23.4201 -26.0124 C 0 0 0 0 0 0 - -15.1526 -15.5000 -26.5810 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8439 -14.9900 -25.4754 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9352 -13.6164 -25.2666 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3329 -12.7479 -26.1806 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6736 -13.2481 -27.3060 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5950 -14.6270 -27.5156 C 0 0 0 0 0 0 - -13.4015 -23.7780 -27.1663 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6399 -24.3094 -26.0018 C 0 0 0 0 0 0 - -13.6628 -23.7212 -24.6935 C 0 0 0 0 0 0 - -16.6288 -17.9244 -24.2312 H 0 0 0 0 0 0 - -16.3148 -19.6807 -24.1585 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9160 -22.0334 -24.2877 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8381 -21.4999 -28.0219 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2700 -19.1240 -27.9229 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4540 -13.2266 -24.4025 H 0 0 0 0 0 0 - -15.3779 -11.6800 -26.0215 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2191 -12.5644 -28.0101 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0707 -15.0162 -28.3762 H 0 0 0 0 0 0 - -12.6996 -22.9672 -27.3675 H 0 0 0 0 0 0 - -13.9402 -23.9935 -28.0868 H 0 0 0 0 0 0 - -12.7933 -24.6547 -26.9473 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4310 -23.8550 -25.4054 H 0 0 0 0 0 0 - -15.4994 -25.3013 -25.5827 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0260 -24.4398 -27.0037 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2630 -23.3726 -23.8575 H 0 0 0 0 0 0 - -12.6754 -23.2637 -24.6380 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5382 -24.7984 -24.5916 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 13 1 0 0 0 - 2 3 1 0 0 0 - 2 6 1 0 0 0 - 3 4 1 0 0 0 - 3 22 1 0 0 0 - 4 5 2 0 0 0 - 4 14 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 11 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 7 23 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 24 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 12 1 0 0 0 - 10 11 2 0 0 0 - 10 25 1 0 0 0 - 11 26 1 0 0 0 - 12 19 1 0 0 0 - 12 20 1 0 0 0 - 12 21 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 27 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 28 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 29 1 0 0 0 - 18 30 1 0 0 0 - 19 31 1 0 0 0 - 19 32 1 0 0 0 - 19 33 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 20 35 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 -M END -> -3a - -> -8.7 - -$$$$ -5f - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - -14.5642 -14.6384 -27.5273 C 0 0 0 0 0 0 - -15.1482 -15.5111 -26.6015 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6521 -13.2595 -27.3238 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8827 -14.9938 -25.5273 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9607 -16.8981 -26.7338 N 0 0 0 0 0 0 - -15.3427 -12.7540 -26.2229 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9780 -13.6190 -25.3283 C 0 0 0 0 0 0 - -16.5556 -15.9641 -24.5881 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1974 -17.2475 -24.8411 N 0 0 0 0 0 0 - -17.3643 -15.6757 -23.7122 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4538 -17.7454 -25.8883 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2992 -19.2055 -26.0279 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8269 -20.1007 -25.0850 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6451 -21.4700 -25.2387 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9295 -21.9653 -26.3318 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4231 -21.0764 -27.2810 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6078 -19.7133 -27.1328 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5764 -23.4515 -26.4059 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2382 -23.8893 -27.6950 O 0 0 0 0 0 0 - -15.7378 -24.3889 -26.0561 C 0 0 0 0 0 0 - -13.3308 -23.6575 -25.5430 C 0 0 0 0 0 0 - -13.8633 -15.1104 -28.5859 F 0 0 0 0 0 0 - -14.1704 -12.5789 -28.0136 H 0 0 0 0 0 0 - -15.3804 -11.6856 -26.0675 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5260 -13.2239 -24.4843 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6798 -17.9151 -24.2551 H 0 0 0 0 0 0 - -16.3566 -19.7562 -24.2096 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0208 -22.1393 -24.4788 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8443 -21.4300 -28.1202 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1924 -19.0573 -27.8847 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0150 -24.8240 -27.6454 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6699 -24.0548 -26.5050 H 0 0 0 0 0 0 - -15.8750 -24.4385 -24.9779 H 0 0 0 0 0 0 - -15.5735 -25.4220 -26.3718 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5376 -22.9611 -25.8134 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9378 -24.6629 -25.6817 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5408 -23.5212 -24.4800 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 24 1 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 31 1 0 0 0 - 20 32 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 -M END -> -5f - -> -30 - -$$$$ -8e - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - -14.7440 -14.5488 -27.6397 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2222 -15.4109 -26.6401 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8591 -13.1692 -27.4748 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8582 -14.8736 -25.5086 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0518 -16.8036 -26.7731 N 0 0 0 0 0 0 - -15.4628 -12.6413 -26.3347 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9779 -13.4879 -25.3505 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4074 -15.8323 -24.4721 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1816 -17.1328 -24.8095 N 0 0 0 0 0 0 - -17.0140 -15.5193 -23.4454 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4957 -17.6480 -25.8989 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3321 -19.1204 -26.0396 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8398 -19.9770 -25.0510 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6725 -21.3559 -25.1428 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0037 -21.9226 -26.2340 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5169 -21.0751 -27.2353 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6698 -19.6915 -27.1368 C 0 0 0 0 0 0 - -14.1579 -15.0195 -28.7614 F 0 0 0 0 0 0 - -15.5478 -11.2992 -26.1973 F 0 0 0 0 0 0 - -14.7101 -23.4149 -26.2936 C 0 0 1 0 0 0 - -15.9534 -24.1911 -26.7469 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6342 -25.6857 -26.9262 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5516 -25.8523 -27.9018 N 0 3 1 0 0 0 - -13.3243 -25.2116 -27.4171 C 0 0 0 0 0 0 - -13.5505 -23.6979 -27.2575 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2997 -27.2875 -28.1026 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4707 -12.5054 -28.2336 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4556 -13.0654 -24.4762 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6413 -17.7854 -24.1871 H 0 0 0 0 0 0 - -16.3480 -19.5775 -24.1847 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0409 -21.9665 -24.3328 H 0 0 0 0 0 0 - -13.9848 -21.4818 -28.0842 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2604 -19.0777 -27.9262 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4329 -23.7212 -25.2849 H 0 0 0 0 0 0 - -16.7537 -24.0684 -26.0171 H 0 0 0 0 0 0 - -16.3288 -23.7780 -27.6831 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5279 -26.2064 -27.2702 H 0 0 0 0 0 0 - -15.3598 -26.1293 -25.9692 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5120 -25.3822 -28.1236 H 0 0 0 0 0 0 - -13.0131 -25.6477 -26.4678 H 0 0 0 0 0 0 - -12.6398 -23.2241 -26.8912 H 0 0 0 0 0 0 - -13.7573 -23.2503 -28.2296 H 0 0 0 0 0 0 - -15.2336 -27.7482 -28.4257 H 0 0 0 0 0 0 - -13.9580 -27.7278 -27.1672 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5429 -27.3868 -28.8818 H 0 0 0 0 0 0 - -14.8253 -25.4208 -28.7730 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 18 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 19 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 29 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 30 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 33 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 23 46 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 26 43 1 0 0 0 - 26 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 -M CHG 1 23 1 -M END -> -8e - -> -31 - -$$$$ -5l - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - -15.3002 -19.2006 -26.0265 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7139 -20.0866 -25.0199 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7328 -19.7204 -27.1959 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5262 -21.4548 -25.1704 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5510 -21.0858 -27.3440 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9761 -16.8867 -26.7340 N 0 0 0 0 0 0 - -14.9308 -21.9629 -26.3290 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5881 -23.4511 -26.4179 C 0 0 0 0 0 0 - -16.5444 -15.9689 -24.5640 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1761 -17.2463 -24.8220 N 0 0 0 0 0 0 - -15.4513 -17.7394 -25.8850 C 0 0 0 0 0 0 - -17.3758 -15.7040 -23.6992 O 0 0 0 0 0 0 - -15.7761 -24.3593 -26.0992 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2360 -23.8967 -27.6992 O 0 0 0 0 0 0 - -13.3505 -23.6941 -25.5581 C 0 0 0 0 0 0 - -15.1508 -15.4985 -26.5840 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8726 -14.9888 -25.4979 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9461 -13.6145 -25.2800 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3326 -12.7448 -26.1831 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6579 -13.2427 -27.2994 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5674 -14.6209 -27.5072 C 0 0 0 0 0 0 - -13.8810 -15.0871 -28.5782 F 0 0 0 0 0 0 - -16.5760 -13.1269 -24.1896 F 0 0 0 0 0 0 - -16.1615 -19.7384 -24.0998 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4118 -19.0716 -27.9995 H 0 0 0 0 0 0 - -15.8081 -22.1136 -24.3616 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0716 -21.4524 -28.2397 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6579 -17.9163 -24.2374 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6617 -24.0400 -26.6490 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0045 -24.3593 -25.0354 H 0 0 0 0 0 0 - -15.5956 -25.4051 -26.3563 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1133 -24.8528 -27.6650 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5490 -23.0067 -25.8239 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9761 -24.7077 -25.6991 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5598 -23.5591 -24.4960 H 0 0 0 0 0 0 - -15.3724 -11.6781 -26.0178 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1860 -12.5585 -27.9922 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 3 2 0 0 0 - 1 11 1 0 0 0 - 2 4 2 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 7 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 5 7 2 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 6 11 2 0 0 0 - 6 16 1 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 8 14 1 0 0 0 - 8 15 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 12 2 0 0 0 - 9 17 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 13 30 1 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 14 32 1 0 0 0 - 15 33 1 0 0 0 - 15 34 1 0 0 0 - 15 35 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 21 1 0 0 0 - 17 18 1 0 0 0 - 18 19 2 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 21 2 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 -M END -> -5l - -> -40 - -$$$$ -8b - 3D - Structure written by MMmdl. - 48 51 0 0 1 0 999 V2000 - -14.4976 -14.8078 -27.6041 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0860 -15.6146 -26.6121 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5776 -13.4189 -27.4910 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7974 -15.0175 -25.5617 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9497 -17.0161 -26.6693 N 0 0 0 0 0 0 - -15.2599 -12.8300 -26.4299 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8868 -13.6238 -25.4651 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4709 -15.9214 -24.5493 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1516 -17.2326 -24.7414 N 0 0 0 0 0 0 - -17.2464 -15.5613 -23.6634 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4317 -17.8110 -25.7710 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2745 -19.2883 -25.8445 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7650 -19.8714 -27.0158 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6263 -21.2503 -27.1285 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9818 -22.0879 -26.0683 C 0 0 0 0 0 0 - -15.4738 -21.5135 -24.8915 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6247 -20.1316 -24.7809 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3111 -11.4823 -26.3542 F 0 0 0 0 0 0 - -14.9414 -23.4608 -26.2022 N 0 0 0 0 0 0 - -16.1549 -23.9516 -26.9975 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1562 -25.4776 -27.1371 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9559 -25.8533 -28.0095 N 0 3 0 0 0 0 - -13.6649 -25.5179 -27.2581 C 0 0 0 0 0 0 - -13.6349 -24.0190 -26.8149 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0017 -27.3550 -28.3866 C 0 0 0 0 0 0 - -14.1111 -12.7839 -28.2306 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4256 -13.1525 -24.6535 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6444 -17.8520 -24.1113 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4912 -19.2630 -27.8667 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2683 -21.6534 -28.0631 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7622 -22.1415 -24.0621 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0195 -19.7338 -23.8570 H 0 0 0 0 0 0 - -16.1744 -23.5056 -27.9908 H 0 0 0 0 0 0 - -17.0548 -23.6031 -26.5107 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0869 -25.9943 -26.1808 H 0 0 0 0 0 0 - -17.0436 -25.8381 -27.6479 H 0 0 0 0 0 0 - -13.6062 -26.2295 -26.4479 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9176 -25.7930 -27.9867 H 0 0 0 0 0 0 - -13.3563 -23.4082 -27.6679 H 0 0 0 0 0 0 - -12.8301 -23.8764 -26.0908 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1546 -27.5535 -29.0464 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9427 -27.5530 -28.9013 H 0 0 0 0 0 0 - -14.9324 -27.9489 -27.4754 H 0 0 0 0 0 0 - -14.9940 -25.2862 -28.8479 H 0 0 0 0 0 0 - -13.7753 -15.4592 -28.7980 C 0 0 0 0 0 0 - -13.3869 -14.6821 -29.4563 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9506 -16.0720 -28.4340 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4764 -16.0853 -29.3499 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 45 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 18 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 31 1 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 24 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 45 46 1 0 0 0 - 45 47 1 0 0 0 - 45 48 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -8b - -> -1.8 - -$$$$ -5g - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - -14.5341 -14.6449 -27.5575 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0978 -15.5129 -26.6098 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6077 -13.2658 -27.3516 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7922 -14.9870 -25.5133 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9372 -16.9036 -26.7424 N 0 0 0 0 0 0 - -15.2582 -12.7538 -26.2292 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8700 -13.6113 -25.3131 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4499 -15.9479 -24.5524 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1281 -17.2371 -24.8190 N 0 0 0 0 0 0 - -17.2230 -15.6491 -23.6483 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4171 -17.7439 -25.8846 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2774 -19.2043 -26.0251 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6087 -19.7171 -27.1419 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4337 -21.0811 -27.2917 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9292 -21.9658 -26.3338 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6249 -21.4650 -25.2296 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7964 -20.0948 -25.0737 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5885 -23.4535 -26.4129 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2371 -23.8914 -27.6993 O 0 0 0 0 0 0 - -15.7678 -24.3783 -26.0824 C 0 0 0 0 0 0 - -13.3532 -23.6779 -25.5405 C 0 0 0 0 0 0 - -13.7154 -15.2314 -28.9661 Cl 0 0 0 0 0 0 - -14.1531 -12.5859 -28.0597 H 0 0 0 0 0 0 - -15.2871 -11.6840 -26.0800 H 0 0 0 0 0 0 - -16.3869 -13.2090 -24.4531 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5942 -17.8981 -24.2121 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2015 -19.0645 -27.9021 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8728 -21.4398 -28.1422 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9928 -22.1311 -24.4624 H 0 0 0 0 0 0 - -16.3100 -19.7464 -24.1901 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0256 -24.8281 -27.6507 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6748 -24.0465 -26.5885 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9524 -24.4080 -25.0103 H 0 0 0 0 0 0 - -15.5930 -25.4162 -26.3733 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5499 -22.9849 -25.7929 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9687 -24.6845 -25.6920 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5732 -23.5575 -24.4788 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 24 1 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 31 1 0 0 0 - 20 32 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 -M END -> -5g - -> -12 - -$$$$ -1b - 3D - Structure written by MMmdl. - 31 33 0 0 1 0 999 V2000 - -15.3524 -19.2206 -25.9684 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6526 -19.7081 -27.0823 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8555 -20.1235 -25.0241 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4541 -21.0636 -27.2485 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6357 -21.4854 -25.1840 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0526 -16.9445 -26.6871 N 0 0 0 0 0 0 - -14.9347 -21.9631 -26.2988 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2162 -15.5610 -26.5929 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9031 -15.0059 -25.5037 C 0 0 0 0 0 0 - -15.4462 -12.8187 -26.3599 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7773 -13.3552 -27.4525 C 0 0 0 0 0 0 - -16.0203 -13.6235 -25.3815 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6768 -14.7359 -27.5934 C 0 0 0 0 0 0 - -16.5313 -15.9392 -24.4895 C 0 0 0 0 0 0 - -16.2584 -17.2435 -24.7671 N 0 0 0 0 0 0 - -15.5317 -17.7669 -25.8203 C 0 0 0 0 0 0 - -17.2406 -15.6098 -23.5374 O 0 0 0 0 0 0 - -14.2525 -19.0464 -27.8382 H 0 0 0 0 0 0 - -16.3981 -19.7943 -24.1510 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8938 -21.4078 -28.1049 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9903 -22.1635 -24.4209 H 0 0 0 0 0 0 - -14.3604 -12.6891 -28.1964 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5458 -13.1713 -24.5494 H 0 0 0 0 0 0 - -16.7352 -17.8915 -24.1540 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1941 -15.1755 -28.4537 H 0 0 0 0 0 0 - -15.5319 -11.7476 -26.2520 H 0 0 0 0 0 0 - -14.7216 -23.3010 -26.4574 O 0 0 0 0 0 0 - -15.3339 -24.0453 -25.3080 C 0 0 0 0 0 0 - -15.1636 -25.1144 -25.4348 H 0 0 0 0 0 0 - -14.8779 -23.7133 -24.3753 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4058 -23.8498 -25.2776 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 3 2 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 4 2 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 19 1 0 0 0 - 4 7 1 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 7 2 0 0 0 - 5 21 1 0 0 0 - 6 8 1 0 0 0 - 6 16 2 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 9 12 1 0 0 0 - 9 14 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 12 2 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 11 13 2 0 0 0 - 11 22 1 0 0 0 - 12 23 1 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 17 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 24 1 0 0 0 - 27 28 1 0 0 0 - 28 29 1 0 0 0 - 28 30 1 0 0 0 - 28 31 1 0 0 0 -M END -> -1b - -> -52 - -$$$$ -5e - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - -14.6145 -14.8753 -27.6783 C 0 0 0 0 0 0 - -15.1464 -15.6452 -26.6477 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7773 -13.4982 -27.6334 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8626 -15.0639 -25.5930 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9335 -17.0116 -26.6934 N 0 0 0 0 0 0 - -15.4592 -12.9286 -26.5614 C 0 0 0 0 0 0 - -16.0212 -13.6877 -25.5413 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4561 -15.9663 -24.5344 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1772 -17.2727 -24.7852 N 0 0 0 0 0 0 - -17.1375 -15.6099 -23.5713 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4463 -17.8122 -25.8274 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3013 -19.2577 -25.9685 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7883 -20.1437 -25.0032 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5853 -21.5050 -25.1666 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9212 -21.9889 -26.3002 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4497 -21.1036 -27.2603 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6471 -19.7514 -27.1044 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5675 -23.4595 -26.4211 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2543 -23.8948 -27.7188 O 0 0 0 0 0 0 - -15.5911 -11.2537 -26.4871 Cl 0 0 0 0 0 0 - -15.7371 -24.3734 -26.1449 C 0 0 0 0 0 0 - -13.3528 -23.6876 -25.5352 C 0 0 0 0 0 0 - -14.0725 -15.3349 -28.4916 H 0 0 0 0 0 0 - -14.3582 -12.8718 -28.4085 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5533 -13.2093 -24.7301 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6582 -17.9076 -24.1598 H 0 0 0 0 0 0 - -16.2939 -19.7994 -24.1117 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9101 -22.1690 -24.3811 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8986 -21.4549 -28.1189 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2620 -19.0974 -27.8744 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0506 -24.8357 -27.6678 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5721 -24.0859 -26.7829 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0738 -24.2984 -25.1148 H 0 0 0 0 0 0 - -15.5257 -25.4267 -26.3342 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5483 -22.9937 -25.7771 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9750 -24.6916 -25.6788 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5852 -23.5615 -24.4766 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 31 1 0 0 0 - 21 32 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 21 34 1 0 0 0 - 22 35 1 0 0 0 - 22 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 -M END -> -5e - -> -39 - -$$$$ -5i - 3D - Structure written by MMmdl. - 40 42 0 0 1 0 999 V2000 - -14.6297 -14.6110 -27.5812 C 0 0 0 0 0 0 - -15.1557 -15.4829 -26.6107 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7061 -13.2297 -27.3681 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8175 -14.9591 -25.4923 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9969 -16.8771 -26.7477 N 0 0 0 0 0 0 - -15.3270 -12.7227 -26.2281 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9055 -13.5829 -25.2945 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4244 -15.9205 -24.4984 C 0 0 0 0 0 0 - -16.0725 -17.2059 -24.7576 N 0 0 0 0 0 0 - -17.1821 -15.6197 -23.5774 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4152 -17.7178 -25.8578 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2565 -19.1843 -25.9941 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6319 -19.7039 -27.1360 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4496 -21.0707 -27.2868 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8843 -21.9604 -26.3031 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5283 -21.4500 -25.1676 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7167 -20.0783 -25.0163 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5831 -23.4642 -26.4242 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2264 -23.8803 -27.7268 O 0 0 0 0 0 0 - -15.8049 -24.3384 -26.1355 C 0 0 0 0 0 0 - -13.4007 -23.8019 -25.5129 C 0 0 0 0 0 0 - -13.9366 -15.1262 -28.8376 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2766 -12.5394 -28.0816 H 0 0 0 0 0 0 - -15.3596 -11.6517 -26.0808 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4005 -13.1831 -24.4207 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5043 -17.8684 -24.1280 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2723 -19.0519 -27.9195 H 0 0 0 0 0 0 - -13.9353 -21.4333 -28.1648 H 0 0 0 0 0 0 - -15.8641 -22.1087 -24.3790 H 0 0 0 0 0 0 - -16.2078 -19.7294 -24.1199 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0472 -24.8289 -27.7070 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6360 -24.0017 -26.7470 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0765 -24.2907 -25.0828 H 0 0 0 0 0 0 - -15.6404 -25.3866 -26.3851 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5084 -23.2486 -25.8057 H 0 0 0 0 0 0 - -13.1740 -24.8577 -25.5627 H 0 0 0 0 0 0 - -13.6102 -23.5638 -24.4695 H 0 0 0 0 0 0 - -13.7369 -14.3270 -29.5522 H 0 0 0 0 0 0 - -14.5474 -15.8740 -29.3431 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9894 -15.5908 -28.5755 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 24 1 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 31 1 0 0 0 - 20 32 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 -M END -> -5i - -> -1.4 - -$$$$ -8d - 3D - Structure written by MMmdl. - 46 49 0 0 1 0 999 V2000 - -14.5244 -14.7755 -27.5404 C 0 0 0 0 0 0 - -15.1162 -15.5856 -26.5557 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6126 -13.3870 -27.4243 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8507 -14.9969 -25.5184 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9512 -16.9828 -26.6050 N 0 0 0 0 0 0 - -15.3071 -12.8055 -26.3678 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9466 -13.6049 -25.4160 C 0 0 0 0 0 0 - -16.5334 -15.9075 -24.5193 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1785 -17.2137 -24.6942 N 0 0 0 0 0 0 - -17.3476 -15.5543 -23.6635 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4432 -17.7838 -25.7187 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2778 -19.2588 -25.8075 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7706 -19.8268 -26.9878 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6315 -21.2044 -27.1217 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9891 -22.0562 -26.0731 C 0 0 0 0 0 0 - -15.4751 -21.4979 -24.8861 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6240 -20.1168 -24.7536 C 0 0 0 0 0 0 - -13.7517 -15.3550 -28.7136 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3512 -11.4588 -26.2838 F 0 0 0 0 0 0 - -14.9424 -23.5841 -26.2418 C 0 0 0 0 0 0 - -13.6275 -24.1410 -26.8461 C 0 0 0 0 0 0 - -13.6510 -25.6466 -27.2708 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9478 -25.9976 -27.9976 N 0 3 0 0 0 0 - -16.1519 -25.5972 -27.1498 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1496 -24.0686 -27.0565 C 0 0 0 0 0 0 - -14.1335 -12.7478 -28.1517 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4955 -13.1480 -24.6047 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6654 -17.8407 -24.0677 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4992 -19.2033 -27.8299 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2711 -21.5952 -28.0614 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7622 -22.1352 -24.0637 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0174 -19.7330 -23.8227 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1988 -16.2900 -29.0479 H 0 0 0 0 0 0 - -12.7236 -15.5508 -28.4141 H 0 0 0 0 0 0 - -13.7339 -14.6772 -29.5672 H 0 0 0 0 0 0 - -15.0303 -23.9956 -25.2342 H 0 0 0 0 0 0 - -13.3518 -23.5408 -27.7063 H 0 0 0 0 0 0 - -12.8282 -23.9831 -26.1195 H 0 0 0 0 0 0 - -13.6092 -26.3608 -26.4633 H 0 0 0 0 0 0 - -12.8978 -25.9512 -27.9876 H 0 0 0 0 0 0 - -14.9695 -26.9907 -28.1948 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0851 -26.0882 -26.1788 H 0 0 0 0 0 0 - -17.0202 -25.9948 -27.6634 H 0 0 0 0 0 0 - -16.1265 -23.6473 -28.0623 H 0 0 0 0 0 0 - -17.0653 -23.7009 -26.6092 H 0 0 0 0 0 0 - -14.9828 -25.4999 -28.8775 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 18 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 19 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 31 1 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 18 33 1 0 0 0 - 18 34 1 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 20 36 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 23 46 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 -M CHG 1 23 1 -M END -> -8d - -> -0.7 - -$$$$ -5b - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - -14.7375 -14.6323 -27.5622 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2209 -15.5030 -26.5843 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8052 -13.2521 -27.3541 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8290 -14.9959 -25.4322 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0637 -16.8857 -26.7646 N 0 0 0 0 0 0 - -15.3769 -12.7497 -26.1825 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8955 -13.6216 -25.2220 C 0 0 0 0 0 0 - -16.3909 -15.9775 -24.4274 C 0 0 0 0 0 0 - -16.0862 -17.2568 -24.7503 N 0 0 0 0 0 0 - -17.0800 -15.7139 -23.4429 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4531 -17.7422 -25.8760 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2977 -19.2017 -26.0254 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7218 -19.7203 -27.1921 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5398 -21.0868 -27.3404 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9310 -21.9625 -26.3286 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5262 -21.4542 -25.1705 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7136 -20.0876 -25.0202 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6142 -23.4546 -26.4203 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2412 -23.9050 -27.6919 O 0 0 0 0 0 0 - -15.8331 -24.3311 -26.1345 C 0 0 0 0 0 0 - -13.3967 -23.7268 -25.5432 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4397 -13.1379 -24.0896 F 0 0 0 0 0 0 - -14.2807 -15.0241 -28.4595 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4099 -12.5699 -28.0945 H 0 0 0 0 0 0 - -15.4149 -11.6823 -26.0197 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4975 -17.9291 -24.1171 H 0 0 0 0 0 0 - -14.3964 -19.0698 -27.9924 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0590 -21.4564 -28.2342 H 0 0 0 0 0 0 - -15.8125 -22.1120 -24.3626 H 0 0 0 0 0 0 - -16.1645 -19.7415 -24.1011 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0527 -24.8497 -27.6378 H 0 0 0 0 0 0 - -16.7037 -23.9737 -26.6848 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0714 -24.3463 -25.0730 H 0 0 0 0 0 0 - -15.6834 -25.3773 -26.4099 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5749 -23.0602 -25.7999 H 0 0 0 0 0 0 - -13.0449 -24.7489 -25.6799 H 0 0 0 0 0 0 - -13.6168 -23.5810 -24.4847 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 22 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 31 1 0 0 0 - 20 32 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 -M END -> -5b - -> -21 - -$$$$ -5h - 3D - Structure written by MMmdl. - 41 43 0 0 1 0 999 V2000 - -14.6321 -14.6131 -27.5789 C 0 0 0 0 0 0 - -15.1582 -15.4760 -26.5985 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7198 -13.2263 -27.3566 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8099 -14.9532 -25.4732 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0163 -16.8727 -26.7418 N 0 0 0 0 0 0 - -15.3338 -12.7191 -26.2121 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8975 -13.5773 -25.2707 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4124 -15.9145 -24.4748 C 0 0 0 0 0 0 - -16.0704 -17.2031 -24.7417 N 0 0 0 0 0 0 - -17.1581 -15.6132 -23.5452 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4259 -17.7159 -25.8489 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2670 -19.1828 -25.9921 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6478 -19.7009 -27.1380 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4645 -21.0679 -27.2901 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8926 -21.9587 -26.3028 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5322 -21.4499 -25.1653 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7215 -20.0777 -25.0122 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5807 -23.4613 -26.4256 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2589 -23.8828 -27.7351 O 0 0 0 0 0 0 - -15.7774 -24.3541 -26.0965 C 0 0 0 0 0 0 - -13.3649 -23.7811 -25.5544 C 0 0 0 0 0 0 - -14.0089 -15.1610 -28.6904 O 0 0 0 0 0 0 - -13.4790 -14.2957 -29.6929 C 0 0 0 0 0 0 - -14.3038 -12.5168 -28.0559 H 0 0 0 0 0 0 - -15.3670 -11.6496 -26.0662 H 0 0 0 0 0 0 - -16.3822 -13.1806 -24.3897 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5117 -17.8636 -24.1170 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2910 -19.0470 -27.9228 H 0 0 0 0 0 0 - -13.9561 -21.4294 -28.1721 H 0 0 0 0 0 0 - -15.8610 -22.1093 -24.3753 H 0 0 0 0 0 0 - -16.2079 -19.7296 -24.1121 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0757 -24.8295 -27.7157 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6353 -24.0351 -26.6807 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0154 -24.3110 -25.0354 H 0 0 0 0 0 0 - -15.6023 -25.4031 -26.3485 H 0 0 0 0 0 0 - -12.4970 -23.2035 -25.8704 H 0 0 0 0 0 0 - -13.1139 -24.8310 -25.6259 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5469 -23.5576 -24.5025 H 0 0 0 0 0 0 - -13.0965 -14.8894 -30.5215 H 0 0 0 0 0 0 - -12.6505 -13.6919 -29.3183 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2476 -13.6342 -30.0951 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 26 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 27 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 28 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 29 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 17 31 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 32 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 20 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 23 39 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 -M END -> -5h - -> -43 - -$$$$ -8c - 3D - Structure written by MMmdl. - 43 46 0 0 1 0 999 V2000 - -14.7211 -14.6025 -27.6629 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2227 -15.4419 -26.6577 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8753 -13.2206 -27.5411 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9006 -14.8913 -25.5607 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0367 -16.8328 -26.7554 N 0 0 0 0 0 0 - -15.5348 -12.6758 -26.4366 C 0 0 0 0 0 0 - -16.0572 -13.5069 -25.4443 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4664 -15.8352 -24.5203 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1535 -17.1340 -24.7829 N 0 0 0 0 0 0 - -17.1585 -15.5152 -23.5539 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4774 -17.6632 -25.8670 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3194 -19.1319 -26.0027 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6738 -19.6479 -27.1346 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5210 -21.0162 -27.3081 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9958 -21.9117 -26.3456 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6361 -21.4060 -25.2096 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8086 -20.0317 -25.0439 C 0 0 0 0 0 0 - -14.0699 -15.1067 -28.7383 F 0 0 0 0 0 0 - -15.6737 -11.3360 -26.3349 F 0 0 0 0 0 0 - -14.8817 -23.4147 -26.5564 C 0 0 0 0 0 0 - -16.2724 -24.0629 -26.5806 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1618 -25.5955 -26.6685 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3848 -26.1077 -25.5404 N 0 3 0 0 0 0 - -14.0195 -25.5854 -25.5808 C 0 0 0 0 0 0 - -14.0367 -24.0524 -25.4454 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4760 -12.5688 -28.3035 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5727 -13.0701 -24.5997 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5893 -17.7842 -24.1422 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2967 -18.9915 -27.9079 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0472 -21.3597 -28.2139 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0174 -22.0763 -24.4526 H 0 0 0 0 0 0 - -16.3278 -19.6857 -24.1613 H 0 0 0 0 0 0 - -14.3921 -23.5606 -27.5193 H 0 0 0 0 0 0 - -16.8293 -23.7815 -25.6869 H 0 0 0 0 0 0 - -16.8439 -23.6831 -27.4275 H 0 0 0 0 0 0 - -15.6993 -25.8939 -27.6093 H 0 0 0 0 0 0 - -17.1563 -26.0413 -26.6534 H 0 0 0 0 0 0 - -15.3470 -27.1149 -25.6055 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5305 -25.8836 -26.5082 H 0 0 0 0 0 0 - -13.4414 -26.0237 -24.7672 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4317 -23.7701 -24.4695 H 0 0 0 0 0 0 - -13.0186 -23.6650 -25.4853 H 0 0 0 0 0 0 - -15.8240 -25.8182 -24.6781 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 18 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 19 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 31 1 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 34 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 23 43 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 -M CHG 1 23 1 -M END -> -8c - -> -38 - -$$$$ -5a - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - -14.4887 -14.6549 -27.5068 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0784 -15.5105 -26.5765 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5574 -13.2734 -27.3136 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7939 -14.9851 -25.4970 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9153 -16.8955 -26.7252 N 0 0 0 0 0 0 - -15.2379 -12.7551 -26.2102 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8736 -13.6081 -25.3035 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4670 -15.9501 -24.5521 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1428 -17.2389 -24.8228 N 0 0 0 0 0 0 - -17.2507 -15.6565 -23.6551 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4124 -17.7404 -25.8797 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2750 -19.2019 -26.0235 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8060 -20.0944 -25.0806 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6365 -21.4652 -25.2376 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9291 -21.9656 -26.3345 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4216 -21.0786 -27.2845 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5948 -19.7141 -27.1334 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5885 -23.4545 -26.4120 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2373 -23.8906 -27.6995 O 0 0 0 0 0 0 - -15.7670 -24.3817 -26.0807 C 0 0 0 0 0 0 - -13.3520 -23.6762 -25.5380 C 0 0 0 0 0 0 - -13.9461 -15.0592 -28.3490 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0765 -12.6015 -28.0118 H 0 0 0 0 0 0 - -15.2675 -11.6846 -26.0655 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4083 -13.2023 -24.4560 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6142 -17.9038 -24.2244 H 0 0 0 0 0 0 - -16.3283 -19.7466 -24.2019 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0140 -22.1325 -24.4762 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8515 -21.4355 -28.1296 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1785 -19.0600 -27.8872 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0218 -24.8268 -27.6517 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6776 -24.0445 -26.5749 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9457 -24.4280 -25.0079 H 0 0 0 0 0 0 - -15.5953 -25.4165 -26.3853 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5514 -22.9776 -25.7877 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9573 -24.6793 -25.6884 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5749 -23.5582 -24.4761 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 22 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 24 1 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 31 1 0 0 0 - 20 32 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 -M END -> -5a - -> -13 - -$$$$ -5k - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - -14.4532 -14.7787 -27.4312 C 0 0 0 0 0 0 - -15.1418 -15.5967 -26.5280 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5909 -13.3992 -27.3291 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9826 -15.0410 -25.5537 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9735 -16.9774 -26.6084 N 0 0 0 0 0 0 - -15.4131 -12.8584 -26.3442 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1201 -13.6612 -25.4553 C 0 0 0 0 0 0 - -16.7396 -15.9720 -24.6306 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4336 -17.2753 -24.8698 N 0 0 0 0 0 0 - -17.5633 -15.6368 -23.7781 O 0 0 0 0 0 0 - -15.5834 -17.7992 -25.8267 C 0 0 0 0 0 0 - -15.4138 -19.2509 -25.9685 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7847 -20.1437 -24.9565 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5471 -21.5021 -25.1160 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9582 -21.9835 -26.2915 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6239 -21.0987 -27.3099 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8497 -19.7472 -27.1519 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5900 -23.4561 -26.4138 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2444 -23.8763 -27.7078 O 0 0 0 0 0 0 - -13.6455 -15.3006 -28.3854 F 0 0 0 0 0 0 - -15.5384 -11.5358 -26.2611 F 0 0 0 0 0 0 - -15.7758 -24.3565 -26.1019 C 0 0 0 0 0 0 - -13.3488 -23.6919 -25.5595 C 0 0 0 0 0 0 - -14.0597 -12.7443 -28.0056 H 0 0 0 0 0 0 - -16.7581 -13.2074 -24.7085 H 0 0 0 0 0 0 - -16.9858 -17.9241 -24.3249 H 0 0 0 0 0 0 - -16.2302 -19.8058 -24.0320 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7900 -22.1726 -24.3047 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1524 -21.4456 -28.2174 H 0 0 0 0 0 0 - -14.5605 -19.0924 -27.9627 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0247 -24.8146 -27.6747 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6761 -24.0007 -26.6015 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9684 -24.3857 -25.0310 H 0 0 0 0 0 0 - -15.6227 -25.3956 -26.4010 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5457 -23.0123 -25.8405 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9804 -24.7062 -25.6843 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5498 -23.5431 -24.4981 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 20 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 21 1 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 31 1 0 0 0 - 22 32 1 0 0 0 - 22 33 1 0 0 0 - 22 34 1 0 0 0 - 23 35 1 0 0 0 - 23 36 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 -M END -> -5k - -> -9.2 - -$$$$ -7 - 3D - Structure written by MMmdl. - 36 38 0 0 1 0 999 V2000 - -15.1391 -19.1877 -26.0186 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5010 -20.0128 -24.9471 N 0 0 0 0 0 0 - -14.5525 -19.7739 -27.1523 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3503 -17.7235 -25.9544 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2829 -21.3817 -25.0113 C 0 0 0 0 0 0 - -14.3643 -21.1508 -27.2261 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7323 -21.9756 -26.1583 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1184 -17.1836 -24.9340 N 0 0 0 0 0 0 - -16.3992 -15.8795 -24.6695 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8462 -16.9083 -26.8217 N 0 0 0 0 0 0 - -15.0124 -15.5202 -26.7198 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7518 -14.9489 -25.6748 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8744 -13.5587 -25.5758 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2543 -12.7508 -26.5345 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5303 -13.3235 -27.5816 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4104 -14.7092 -27.6795 C 0 0 0 0 0 0 - -17.1164 -15.5510 -23.7222 O 0 0 0 0 0 0 - -14.4845 -23.5033 -26.2094 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2410 -23.9010 -27.5752 O 0 0 0 0 0 0 - -15.3500 -11.4050 -26.4634 F 0 0 0 0 0 0 - -15.6962 -24.2267 -25.5810 C 0 0 0 0 0 0 - -13.1775 -23.7773 -25.4569 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2540 -19.1694 -27.9974 H 0 0 0 0 0 0 - -15.5470 -21.9658 -24.1433 H 0 0 0 0 0 0 - -13.9130 -21.5646 -28.1156 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6018 -17.8247 -24.3203 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4327 -13.1137 -24.7651 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0553 -12.6884 -28.3147 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8444 -15.1517 -28.4863 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7515 -24.0311 -24.5112 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7512 -25.3036 -25.6753 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5797 -23.8430 -26.0634 H 0 0 0 0 0 0 - -13.2909 -23.6779 -24.3763 H 0 0 0 0 0 0 - -12.4611 -23.0266 -25.7707 H 0 0 0 0 0 0 - -12.7391 -24.7495 -25.6787 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0869 -24.8479 -27.6106 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 3 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 23 1 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 4 10 2 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 5 24 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 18 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 26 1 0 0 0 - 9 12 1 0 0 0 - 9 17 2 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 20 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 28 1 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 21 30 1 0 0 0 - 21 31 1 0 0 0 - 21 32 1 0 0 0 - 22 33 1 0 0 0 - 22 34 1 0 0 0 - 22 35 1 0 0 0 -M END -> -7 - -> -700 - -$$$$ -5p - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 49 0 0 1 0 999 V2000 - -15.1391 -19.1877 -26.0186 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5010 -20.0128 -24.9471 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5525 -19.7739 -27.1523 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3503 -17.7235 -25.9544 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2829 -21.3817 -25.0113 C 0 0 0 0 0 0 - -14.3643 -21.1508 -27.2261 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7323 -21.9756 -26.1583 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1184 -17.1836 -24.9340 N 0 0 0 0 0 0 - -16.3992 -15.8795 -24.6695 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8462 -16.9083 -26.8217 N 0 0 0 0 0 0 - -15.0124 -15.5202 -26.7198 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7518 -14.9489 -25.6748 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8744 -13.5587 -25.5758 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2543 -12.7508 -26.5345 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5303 -13.3235 -27.5816 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4104 -14.7092 -27.6795 C 0 0 0 0 0 0 - -17.1164 -15.5510 -23.7222 O 0 0 0 0 0 0 - -14.4845 -23.5033 -26.2094 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2410 -23.9010 -27.5752 O 0 0 0 0 0 0 - -15.3500 -11.4050 -26.4634 F 0 0 0 0 0 0 - -14.6693 -25.1645 -28.1103 C 0 0 0 0 0 0 - -13.9892 -26.4251 -27.5377 C 0 0 0 0 0 0 - -12.6044 -26.5401 -27.8382 O 0 0 0 0 0 0 - -12.3229 -27.1506 -29.0924 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6962 -24.2267 -25.5810 C 0 0 0 0 0 0 - -13.1775 -23.7773 -25.4569 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9389 -19.6120 -24.0438 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2540 -19.1694 -27.9974 H 0 0 0 0 0 0 - -15.5470 -21.9658 -24.1433 H 0 0 0 0 0 0 - -13.9130 -21.5646 -28.1156 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6018 -17.8247 -24.3203 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4327 -13.1137 -24.7651 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0553 -12.6884 -28.3147 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8444 -15.1517 -28.4863 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4895 -25.1509 -29.1832 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7505 -25.2469 -28.0138 H 0 0 0 0 0 0 - -14.5352 -27.3238 -27.8299 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0516 -26.3877 -26.4633 H 0 0 0 0 0 0 - -11.2445 -27.1849 -29.2440 H 0 0 0 0 0 0 - -12.7529 -26.5894 -29.9224 H 0 0 0 0 0 0 - -12.6953 -28.1753 -29.1292 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7515 -24.0311 -24.5112 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7512 -25.3036 -25.6753 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5797 -23.8430 -26.0634 H 0 0 0 0 0 0 - -13.2909 -23.6779 -24.3763 H 0 0 0 0 0 0 - -12.4611 -23.0266 -25.7707 H 0 0 0 0 0 0 - -12.7391 -24.7495 -25.6787 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 3 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 4 10 2 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 5 29 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 30 1 0 0 0 - 7 18 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 31 1 0 0 0 - 9 12 1 0 0 0 - 9 17 2 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 20 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 33 1 0 0 0 - 16 34 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 25 1 0 0 0 - 18 26 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 24 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 26 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 -M END -> -5p - -> -20 - -$$$$ -1a - 3D - Structure written by MMmdl. - 27 29 0 0 1 0 999 V2000 - -15.3524 -19.2206 -25.9684 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6526 -19.7081 -27.0823 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8555 -20.1235 -25.0241 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4541 -21.0636 -27.2485 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6357 -21.4854 -25.1840 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0526 -16.9445 -26.6871 N 0 0 0 0 0 0 - -14.9347 -21.9631 -26.2988 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2162 -15.5610 -26.5929 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9031 -15.0059 -25.5037 C 0 0 0 0 0 0 - -15.4462 -12.8187 -26.3599 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7773 -13.3552 -27.4525 C 0 0 0 0 0 0 - -16.0203 -13.6235 -25.3815 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6768 -14.7359 -27.5934 C 0 0 0 0 0 0 - -16.5313 -15.9392 -24.4895 C 0 0 0 0 0 0 - -16.2584 -17.2435 -24.7671 N 0 0 0 0 0 0 - -15.5317 -17.7669 -25.8203 C 0 0 0 0 0 0 - -17.2406 -15.6098 -23.5374 O 0 0 0 0 0 0 - -14.2525 -19.0464 -27.8382 H 0 0 0 0 0 0 - -16.3981 -19.7943 -24.1510 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8938 -21.4078 -28.1049 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9903 -22.1635 -24.4209 H 0 0 0 0 0 0 - -14.3604 -12.6891 -28.1964 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5458 -13.1713 -24.5494 H 0 0 0 0 0 0 - -16.7352 -17.8915 -24.1540 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1941 -15.1755 -28.4537 H 0 0 0 0 0 0 - -15.5319 -11.7476 -26.2520 H 0 0 0 0 0 0 - -14.7660 -23.0224 -26.4244 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 3 2 0 0 0 - 1 16 1 0 0 0 - 2 4 2 0 0 0 - 2 18 1 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 19 1 0 0 0 - 4 7 1 0 0 0 - 4 20 1 0 0 0 - 5 7 2 0 0 0 - 5 21 1 0 0 0 - 6 8 1 0 0 0 - 6 16 2 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 2 0 0 0 - 8 13 1 0 0 0 - 9 12 1 0 0 0 - 9 14 1 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 10 12 2 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 11 13 2 0 0 0 - 11 22 1 0 0 0 - 12 23 1 0 0 0 - 13 25 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 17 2 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 24 1 0 0 0 -M END -> -1a - -> -540 - -$$$$ -5j - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - -14.7191 -14.7437 -27.6392 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2100 -15.5576 -26.6217 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8546 -13.3638 -27.5278 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8634 -15.0119 -25.5100 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0155 -16.9311 -26.7330 N 0 0 0 0 0 0 - -15.4818 -12.8157 -26.4108 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9953 -13.6326 -25.3960 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4010 -15.9560 -24.4529 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1237 -17.2489 -24.7503 N 0 0 0 0 0 0 - -17.0404 -15.6548 -23.4436 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4465 -17.7571 -25.8425 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2799 -19.2057 -25.9856 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7256 -20.0944 -24.9990 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5412 -21.4568 -25.1662 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9164 -21.9424 -26.3174 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4855 -21.0603 -27.3040 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6633 -19.7033 -27.1404 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5856 -23.4201 -26.4266 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2271 -23.8386 -27.7106 O 0 0 0 0 0 0 - -15.5915 -11.4816 -26.3335 F 0 0 0 0 0 0 - -16.6030 -13.1004 -24.3145 F 0 0 0 0 0 0 - -15.7860 -24.3161 -26.1231 C 0 0 0 0 0 0 - -13.3500 -23.6601 -25.5696 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2230 -15.1759 -28.4962 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4673 -12.7104 -28.2984 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5489 -17.9042 -24.1082 H 0 0 0 0 0 0 - -16.1937 -19.7543 -24.0872 H 0 0 0 0 0 0 - -15.8509 -22.1245 -24.3761 H 0 0 0 0 0 0 - -13.9755 -21.4159 -28.1877 H 0 0 0 0 0 0 - -14.3101 -19.0466 -27.9244 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0222 -24.7810 -27.6785 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6618 -23.9901 -26.6844 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0289 -24.3088 -25.0631 H 0 0 0 0 0 0 - -15.6110 -25.3634 -26.3774 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5475 -22.9733 -25.8340 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9786 -24.6668 -25.7243 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5559 -23.5311 -24.5063 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 24 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 20 1 0 0 0 - 7 21 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 22 1 0 0 0 - 18 23 1 0 0 0 - 19 31 1 0 0 0 - 22 32 1 0 0 0 - 22 33 1 0 0 0 - 22 34 1 0 0 0 - 23 35 1 0 0 0 - 23 36 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 -M END -> -5j - -> -7.5 - -$$$$ -8f - 3D - Structure written by MMmdl. - 49 52 0 0 1 0 999 V2000 - -14.4976 -14.8078 -27.6041 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0860 -15.6146 -26.6121 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5776 -13.4189 -27.4910 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7974 -15.0175 -25.5617 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9497 -17.0161 -26.6693 N 0 0 0 0 0 0 - -15.2599 -12.8300 -26.4299 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8868 -13.6238 -25.4651 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4709 -15.9214 -24.5493 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1516 -17.2326 -24.7414 N 0 0 0 0 0 0 - -17.2464 -15.5613 -23.6634 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4317 -17.8110 -25.7710 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2745 -19.2883 -25.8445 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7650 -19.8714 -27.0158 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6263 -21.2503 -27.1285 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9818 -22.0879 -26.0683 C 0 0 0 0 0 0 - -15.4738 -21.5135 -24.8915 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6247 -20.1316 -24.7809 C 0 0 0 0 0 0 - -13.7514 -15.3866 -28.7929 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3111 -11.4823 -26.3542 F 0 0 0 0 0 0 - -14.9368 -23.6188 -26.2176 C 0 0 1 0 0 0 - -16.1502 -24.1096 -27.0129 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1516 -25.6356 -27.1525 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9512 -26.0113 -28.0249 N 0 3 1 0 0 0 - -13.6603 -25.6760 -27.2735 C 0 0 0 0 0 0 - -13.6303 -24.1771 -26.8303 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9970 -27.5130 -28.4020 C 0 0 0 0 0 0 - -14.1111 -12.7839 -28.2306 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4256 -13.1525 -24.6535 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6444 -17.8520 -24.1113 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4912 -19.2630 -27.8667 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2683 -21.6534 -28.0631 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7622 -22.1415 -24.0621 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0195 -19.7338 -23.8570 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1621 -16.3516 -29.0752 H 0 0 0 0 0 0 - -12.6990 -15.5158 -28.5462 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8228 -14.7393 -29.6666 H 0 0 0 0 0 0 - -15.0135 -24.0196 -25.2058 H 0 0 0 0 0 0 - -16.1698 -23.6636 -28.0062 H 0 0 0 0 0 0 - -17.0502 -23.7611 -26.5261 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0823 -26.1523 -26.1962 H 0 0 0 0 0 0 - -17.0390 -25.9961 -27.6633 H 0 0 0 0 0 0 - -13.6015 -26.3876 -26.4633 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9129 -25.9511 -28.0021 H 0 0 0 0 0 0 - -13.3516 -23.5663 -27.6833 H 0 0 0 0 0 0 - -12.8254 -24.0344 -26.1062 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1499 -27.7115 -29.0618 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9380 -27.7110 -28.9167 H 0 0 0 0 0 0 - -14.9278 -28.1070 -27.4908 H 0 0 0 0 0 0 - -14.9894 -25.4443 -28.8633 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 18 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 19 1 0 0 0 - 7 28 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 29 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 30 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 31 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 20 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 32 1 0 0 0 - 17 33 1 0 0 0 - 18 34 1 0 0 0 - 18 35 1 0 0 0 - 18 36 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 25 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 26 1 0 0 0 - 23 49 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 26 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 - 26 48 1 0 0 0 -M CHG 1 23 1 -M END -> -8f - -> -2.2 - -$$$$ -3b - 3D - Structure written by MMmdl. - 39 41 0 0 1 0 999 V2000 - -14.5843 -14.7116 -27.5536 C 0 0 0 0 0 0 - -15.1563 -15.5168 -26.5725 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6839 -13.3308 -27.4341 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8704 -14.9642 -25.5050 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9849 -16.8888 -26.6806 N 0 0 0 0 0 0 - -15.3785 -12.7815 -26.3579 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9898 -13.5830 -25.3915 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4951 -15.9110 -24.5008 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1292 -17.2016 -24.7265 N 0 0 0 0 0 0 - -17.2749 -15.6059 -23.5994 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4369 -17.7151 -25.8030 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2562 -19.1608 -25.9636 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5830 -19.6077 -27.1049 C 0 0 0 0 0 0 - -14.3265 -20.9447 -27.2876 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7480 -21.8824 -26.3421 C 0 0 0 0 0 0 - -15.4530 -21.4469 -25.2145 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7105 -20.0928 -25.0243 C 0 0 0 0 0 0 - -15.4673 -11.4547 -26.2714 F 0 0 0 0 0 0 - -14.3949 -23.3652 -26.5136 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5854 -24.2010 -26.0389 C 0 0 0 0 0 0 - -13.1695 -23.7636 -25.6881 C 0 0 0 0 0 0 - -14.0156 -23.6918 -27.9583 C 0 0 0 0 0 0 - -14.0466 -15.1535 -28.3807 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2301 -12.6806 -28.1699 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5321 -13.1395 -24.5694 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5900 -17.8635 -24.1166 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2270 -18.9240 -27.8639 H 0 0 0 0 0 0 - -13.7744 -21.2114 -28.1733 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7825 -22.1540 -24.4698 H 0 0 0 0 0 0 - -16.2395 -19.7878 -24.1323 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4452 -24.1248 -26.7063 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9076 -23.8895 -25.0475 H 0 0 0 0 0 0 - -15.2786 -25.2372 -25.9762 H 0 0 0 0 0 0 - -12.3282 -23.1165 -25.9090 H 0 0 0 0 0 0 - -12.7992 -24.7579 -25.8883 H 0 0 0 0 0 0 - -13.3872 -23.7048 -24.6291 H 0 0 0 0 0 0 - -13.2997 -22.9543 -28.2921 H 0 0 0 0 0 0 - -14.8831 -23.6893 -28.6146 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5115 -24.6565 -28.0471 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 18 1 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 20 32 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 21 34 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 -M END -> -3b - -> -3.6 - -$$$$ -8a - 3D - Structure written by MMmdl. - 45 48 0 0 1 0 999 V2000 - -14.4976 -14.8078 -27.6041 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0860 -15.6146 -26.6121 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5776 -13.4189 -27.4910 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7974 -15.0175 -25.5617 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9497 -17.0161 -26.6693 N 0 0 0 0 0 0 - -15.2599 -12.8300 -26.4299 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8868 -13.6238 -25.4651 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4709 -15.9214 -24.5493 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1516 -17.2326 -24.7414 N 0 0 0 0 0 0 - -17.2464 -15.5613 -23.6634 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4317 -17.8110 -25.7710 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2745 -19.2883 -25.8445 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7650 -19.8714 -27.0158 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6263 -21.2503 -27.1285 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9818 -22.0879 -26.0683 C 0 0 0 0 0 0 - -15.4738 -21.5135 -24.8915 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6247 -20.1316 -24.7809 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3111 -11.4823 -26.3542 F 0 0 0 0 0 0 - -14.9414 -23.4608 -26.2022 N 0 0 0 0 0 0 - -16.1549 -23.9516 -26.9975 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1562 -25.4776 -27.1371 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9559 -25.8533 -28.0095 N 0 3 0 0 0 0 - -13.6649 -25.5179 -27.2581 C 0 0 0 0 0 0 - -13.6349 -24.0190 -26.8149 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0017 -27.3550 -28.3866 C 0 0 0 0 0 0 - -14.1111 -12.7839 -28.2306 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4256 -13.1525 -24.6535 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6444 -17.8520 -24.1113 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4912 -19.2630 -27.8667 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2683 -21.6534 -28.0631 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7622 -22.1415 -24.0621 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0195 -19.7338 -23.8570 H 0 0 0 0 0 0 - -16.1744 -23.5056 -27.9908 H 0 0 0 0 0 0 - -17.0548 -23.6031 -26.5107 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0869 -25.9943 -26.1808 H 0 0 0 0 0 0 - -17.0436 -25.8381 -27.6479 H 0 0 0 0 0 0 - -13.6062 -26.2295 -26.4479 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9176 -25.7930 -27.9867 H 0 0 0 0 0 0 - -13.3563 -23.4082 -27.6679 H 0 0 0 0 0 0 - -12.8301 -23.8764 -26.0908 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1546 -27.5535 -29.0464 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9427 -27.5530 -28.9013 H 0 0 0 0 0 0 - -14.9324 -27.9489 -27.4754 H 0 0 0 0 0 0 - -14.9940 -25.2862 -28.8479 H 0 0 0 0 0 0 - -13.9911 -15.2646 -28.4414 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 45 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 26 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 18 1 0 0 0 - 7 27 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 28 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 30 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 19 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 31 1 0 0 0 - 17 32 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 24 1 0 0 0 - 20 21 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 21 22 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 22 23 1 0 0 0 - 22 25 1 0 0 0 - 22 44 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 37 1 0 0 0 - 23 38 1 0 0 0 - 24 39 1 0 0 0 - 24 40 1 0 0 0 - 25 41 1 0 0 0 - 25 42 1 0 0 0 - 25 43 1 0 0 0 -M CHG 1 22 1 -M END -> -8a - -> -12 - -$$$$ -5o - 3D - Structure written by MMmdl. - 47 49 0 0 1 0 999 V2000 - -15.3450 -19.1365 -26.0277 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8287 -20.0041 -25.0403 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6494 -19.6781 -27.1161 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6114 -21.3734 -25.1437 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4534 -21.0504 -27.2249 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0797 -16.8396 -26.7962 N 0 0 0 0 0 0 - -14.9411 -21.9202 -26.2491 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7174 -23.4472 -26.3565 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2121 -15.4451 -26.6641 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8856 -14.9026 -25.5597 C 0 0 0 0 0 0 - -15.4771 -12.6758 -26.3957 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8064 -13.2106 -27.4898 C 0 0 0 0 0 0 - -16.0203 -13.5169 -25.4209 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6721 -14.5903 -27.6396 C 0 0 0 0 0 0 - -16.4601 -15.8518 -24.5285 C 0 0 0 0 0 0 - -16.2181 -17.1526 -24.8371 N 0 0 0 0 0 0 - -15.5316 -17.6723 -25.9177 C 0 0 0 0 0 0 - -17.0968 -15.5416 -23.5233 O 0 0 0 0 0 0 - -16.0886 -24.1459 -26.3732 C 0 0 0 0 0 0 - -13.9745 -23.7493 -27.5590 O 0 0 0 0 0 0 - -13.8348 -23.8741 -25.1800 C 0 0 0 0 0 0 - -13.9391 -15.1231 -28.8574 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6115 -11.3343 -26.3138 F 0 0 0 0 0 0 - -12.5786 -23.4229 -27.6930 C 0 0 0 0 0 0 - -11.5993 -24.0909 -26.7047 C 0 0 0 0 0 0 - -10.2664 -23.7087 -26.9378 O 0 0 0 0 0 0 - -16.3593 -19.6397 -24.1712 H 0 0 0 0 0 0 - -14.2603 -19.0378 -27.8948 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9770 -21.9973 -24.3439 H 0 0 0 0 0 0 - -13.9076 -21.4302 -28.0753 H 0 0 0 0 0 0 - -14.3905 -12.5391 -28.2267 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5404 -13.0953 -24.5734 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6563 -17.8081 -24.2063 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6433 -24.0186 -25.4478 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0953 -25.2082 -26.5876 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6148 -23.6851 -27.1907 H 0 0 0 0 0 0 - -14.3494 -23.7841 -24.2225 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9787 -23.2079 -25.1484 H 0 0 0 0 0 0 - -13.4451 -24.8835 -25.2653 H 0 0 0 0 0 0 - -13.7952 -14.3631 -29.6261 H 0 0 0 0 0 0 - -14.5198 -15.9337 -29.2895 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9647 -15.5167 -28.5732 H 0 0 0 0 0 0 - -12.4676 -22.3457 -27.5952 H 0 0 0 0 0 0 - -12.2697 -23.6429 -28.7147 H 0 0 0 0 0 0 - -11.6557 -25.1731 -26.8146 H 0 0 0 0 0 0 - -11.8403 -23.8769 -25.6698 H 0 0 0 0 0 0 - -10.1870 -22.7599 -26.8041 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 3 2 0 0 0 - 1 17 1 0 0 0 - 2 4 2 0 0 0 - 2 27 1 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 28 1 0 0 0 - 4 7 1 0 0 0 - 4 29 1 0 0 0 - 5 7 2 0 0 0 - 5 30 1 0 0 0 - 6 9 1 0 0 0 - 6 17 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 19 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 8 21 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 14 1 0 0 0 - 10 13 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 2 0 0 0 - 11 23 1 0 0 0 - 12 14 2 0 0 0 - 12 31 1 0 0 0 - 13 32 1 0 0 0 - 14 22 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 19 34 1 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 24 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 21 38 1 0 0 0 - 21 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 - 22 41 1 0 0 0 - 22 42 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 24 44 1 0 0 0 - 25 26 1 0 0 0 - 25 45 1 0 0 0 - 25 46 1 0 0 0 - 26 47 1 0 0 0 -M END -> -5o - -> -1.5 - -$$$$ -5d - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - -14.3086 -14.7921 -27.4784 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0167 -15.5896 -26.5804 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4209 -13.4086 -27.3834 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8598 -15.0204 -25.6172 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8572 -16.9685 -26.6643 N 0 0 0 0 0 0 - -15.2467 -12.8486 -26.4112 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9778 -13.6371 -25.5261 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3497 -11.5222 -26.3368 F 0 0 0 0 0 0 - -16.6344 -15.9439 -24.7010 C 0 0 0 0 0 0 - -16.3378 -17.2491 -24.9375 N 0 0 0 0 0 0 - -17.4603 -15.6053 -23.8520 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4812 -17.7825 -25.8835 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3281 -19.2368 -26.0128 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7173 -20.1149 -24.9948 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5045 -21.4792 -25.1435 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9173 -21.9782 -26.3122 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5597 -21.1078 -27.3352 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7654 -19.7512 -27.1884 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5723 -23.4575 -26.4180 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2296 -23.8957 -27.7059 O 0 0 0 0 0 0 - -15.7738 -24.3383 -26.1013 C 0 0 0 0 0 0 - -13.3357 -23.7020 -25.5598 C 0 0 0 0 0 0 - -13.6666 -15.2372 -28.2250 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8693 -12.7659 -28.0555 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6179 -13.1711 -24.7897 H 0 0 0 0 0 0 - -16.8986 -17.8932 -24.3961 H 0 0 0 0 0 0 - -16.1594 -19.7615 -24.0734 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7659 -22.1386 -24.3295 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0863 -21.4707 -28.2353 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4611 -19.1052 -28.0006 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0254 -24.8372 -27.6632 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6686 -23.9680 -26.6026 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9590 -24.3559 -25.0291 H 0 0 0 0 0 0 - -15.6385 -25.3819 -26.3933 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5229 -23.0398 -25.8496 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9848 -24.7235 -25.6730 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5341 -23.5351 -24.4994 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 9 1 0 0 0 - 5 12 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 8 1 0 0 0 - 7 25 1 0 0 0 - 9 10 1 0 0 0 - 9 11 2 0 0 0 - 10 12 1 0 0 0 - 10 26 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 18 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 27 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 28 1 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 19 1 0 0 0 - 17 18 2 0 0 0 - 17 29 1 0 0 0 - 18 30 1 0 0 0 - 19 20 1 0 0 0 - 19 21 1 0 0 0 - 19 22 1 0 0 0 - 20 31 1 0 0 0 - 21 32 1 0 0 0 - 21 33 1 0 0 0 - 21 34 1 0 0 0 - 22 35 1 0 0 0 - 22 36 1 0 0 0 - 22 37 1 0 0 0 -M END -> -5d - -> -10.5 - -$$$$ -5m - 3D - Structure written by MMmdl. - 40 42 0 0 1 0 999 V2000 - -15.3524 -19.2206 -25.9684 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6526 -19.7081 -27.0823 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8555 -20.1235 -25.0241 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4541 -21.0636 -27.2485 C 0 0 0 0 0 0 - -15.6357 -21.4854 -25.1840 C 0 0 0 0 0 0 - -15.0526 -16.9445 -26.6871 N 0 0 0 0 0 0 - -14.9347 -21.9631 -26.2988 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5888 -23.4446 -26.4247 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2162 -15.5610 -26.5929 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9031 -15.0059 -25.5037 C 0 0 0 0 0 0 - -15.4462 -12.8187 -26.3599 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7773 -13.3552 -27.4525 C 0 0 0 0 0 0 - -16.0203 -13.6235 -25.3815 C 0 0 0 0 0 0 - -14.6768 -14.7359 -27.5934 C 0 0 0 0 0 0 - -16.5313 -15.9392 -24.4895 C 0 0 0 0 0 0 - -16.2584 -17.2435 -24.7671 N 0 0 0 0 0 0 - -15.5317 -17.7669 -25.8203 C 0 0 0 0 0 0 - -17.2406 -15.6098 -23.5374 O 0 0 0 0 0 0 - -15.7674 -24.3602 -26.0940 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2652 -23.8414 -27.7410 O 0 0 0 0 0 0 - -13.3585 -23.6997 -25.5565 C 0 0 0 0 0 0 - -13.9802 -15.2817 -28.8279 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5606 -11.4961 -26.2801 F 0 0 0 0 0 0 - -14.2525 -19.0464 -27.8382 H 0 0 0 0 0 0 - -16.3981 -19.7943 -24.1510 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8938 -21.4078 -28.1049 H 0 0 0 0 0 0 - -15.9903 -22.1635 -24.4209 H 0 0 0 0 0 0 - -14.3604 -12.6891 -28.1964 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5458 -13.1713 -24.5494 H 0 0 0 0 0 0 - -16.7352 -17.8915 -24.1540 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6293 -24.0551 -26.6777 H 0 0 0 0 0 0 - -16.0069 -24.3345 -25.0330 H 0 0 0 0 0 0 - -15.5729 -25.4035 -26.3467 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0509 -24.7825 -27.7322 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5192 -23.0885 -25.8861 H 0 0 0 0 0 0 - -13.0630 -24.7313 -25.6290 H 0 0 0 0 0 0 - -13.5418 -23.4778 -24.5056 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0711 -14.5965 -29.6735 H 0 0 0 0 0 0 - -14.4139 -16.2335 -29.1342 H 0 0 0 0 0 0 - -12.9197 -15.4294 -28.6265 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 3 2 0 0 0 - 1 17 1 0 0 0 - 2 4 2 0 0 0 - 2 24 1 0 0 0 - 3 5 1 0 0 0 - 3 25 1 0 0 0 - 4 7 1 0 0 0 - 4 26 1 0 0 0 - 5 7 2 0 0 0 - 5 27 1 0 0 0 - 6 9 1 0 0 0 - 6 17 2 0 0 0 - 7 8 1 0 0 0 - 8 19 1 0 0 0 - 8 20 1 0 0 0 - 8 21 1 0 0 0 - 9 10 2 0 0 0 - 9 14 1 0 0 0 - 10 13 1 0 0 0 - 10 15 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 11 13 2 0 0 0 - 11 23 1 0 0 0 - 12 14 2 0 0 0 - 12 28 1 0 0 0 - 13 29 1 0 0 0 - 14 22 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 2 0 0 0 - 16 17 1 0 0 0 - 16 30 1 0 0 0 - 19 31 1 0 0 0 - 19 32 1 0 0 0 - 19 33 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 - 22 38 1 0 0 0 - 22 39 1 0 0 0 - 22 40 1 0 0 0 -M END -> -5m - -> -0.5 - -$$$$ -5n - 3D - Structure written by MMmdl. - 44 46 0 0 1 0 999 V2000 - -15.1971 -19.2586 -25.9604 C 0 0 0 0 0 0 - -15.4619 -20.0875 -24.8625 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7320 -19.8457 -27.1467 C 0 0 0 0 0 0 - -15.3732 -17.7885 -25.8846 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2356 -21.4582 -24.9463 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5189 -21.2175 -27.2320 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7643 -22.0441 -26.1317 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1228 -17.2312 -24.8599 N 0 0 0 0 0 0 - -16.3920 -15.9186 -24.6105 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8661 -16.9841 -26.7605 N 0 0 0 0 0 0 - -15.0231 -15.5933 -26.6800 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7490 -15.0059 -25.6350 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8668 -13.6148 -25.5520 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2558 -12.8198 -26.5261 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5498 -13.4080 -27.5783 C 0 0 0 0 0 0 - -14.4351 -14.7960 -27.6619 C 0 0 0 0 0 0 - -17.0983 -15.5613 -23.6650 O 0 0 0 0 0 0 - -14.4776 -23.5653 -26.1895 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7149 -24.3179 -25.6602 C 0 0 0 0 0 0 - -13.2176 -23.8359 -25.3472 C 0 0 0 0 0 0 - -14.1517 -23.9464 -27.5429 O 0 0 0 0 0 0 - -15.3497 -11.4734 -26.4630 F 0 0 0 0 0 0 - -14.5501 -25.2004 -28.1255 C 0 0 0 0 0 0 - -13.9103 -26.4874 -27.5451 C 0 0 0 0 0 0 - -12.5968 -26.7509 -28.0034 O 0 0 0 0 0 0 - -15.8196 -19.6850 -23.9247 H 0 0 0 0 0 0 - -14.5225 -19.2408 -28.0188 H 0 0 0 0 0 0 - -15.4176 -22.0605 -24.0678 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1391 -21.6264 -28.1554 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6125 -17.8632 -24.2414 H 0 0 0 0 0 0 - -16.4177 -13.1519 -24.7449 H 0 0 0 0 0 0 - -14.0836 -12.7847 -28.3266 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8819 -15.2499 -28.4711 H 0 0 0 0 0 0 - -15.8115 -24.1761 -24.5859 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7466 -25.3887 -25.8320 H 0 0 0 0 0 0 - -16.5770 -23.9172 -26.1750 H 0 0 0 0 0 0 - -13.4391 -23.9417 -24.2857 H 0 0 0 0 0 0 - -12.5508 -22.9864 -25.4295 H 0 0 0 0 0 0 - -12.6588 -24.7122 -25.6687 H 0 0 0 0 0 0 - -14.3407 -25.1537 -29.1933 H 0 0 0 0 0 0 - -15.6352 -25.2750 -28.0624 H 0 0 0 0 0 0 - -14.5229 -27.3485 -27.8131 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8881 -26.4540 -26.4637 H 0 0 0 0 0 0 - -12.6445 -27.1725 -28.8674 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 1 0 0 0 - 1 3 2 0 0 0 - 1 4 1 0 0 0 - 2 5 2 0 0 0 - 2 26 1 0 0 0 - 3 6 1 0 0 0 - 3 27 1 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 4 10 2 0 0 0 - 5 7 1 0 0 0 - 5 28 1 0 0 0 - 6 7 2 0 0 0 - 6 29 1 0 0 0 - 7 18 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 30 1 0 0 0 - 9 12 1 0 0 0 - 9 17 2 0 0 0 - 10 11 1 0 0 0 - 11 12 2 0 0 0 - 11 16 1 0 0 0 - 12 13 1 0 0 0 - 13 14 2 0 0 0 - 13 31 1 0 0 0 - 14 15 1 0 0 0 - 14 22 1 0 0 0 - 15 16 2 0 0 0 - 15 32 1 0 0 0 - 16 33 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 34 1 0 0 0 - 19 35 1 0 0 0 - 19 36 1 0 0 0 - 20 37 1 0 0 0 - 20 38 1 0 0 0 - 20 39 1 0 0 0 - 21 23 1 0 0 0 - 23 24 1 0 0 0 - 23 40 1 0 0 0 - 23 41 1 0 0 0 - 24 25 1 0 0 0 - 24 42 1 0 0 0 - 24 43 1 0 0 0 - 25 44 1 0 0 0 -M END -> -5n - -> -14 - -$$$$ -5c - 3D - Structure written by MMmdl. - 37 39 0 0 1 0 999 V2000 - -14.6402 -14.6836 -27.5547 C 0 0 0 0 0 0 - -15.1755 -15.5552 -26.6036 C 0 0 0 0 0 0 - -14.7438 -13.3055 -27.3562 C 0 0 0 0 0 0 - -15.8696 -15.0613 -25.4918 C 0 0 0 0 0 0 - -14.9688 -16.9303 -26.7569 N 0 0 0 0 0 0 - -15.3733 -12.8094 -26.2126 C 0 0 0 0 0 0 - -15.9336 -13.6874 -25.2804 C 0 0 0 0 0 0 - -16.5077 -16.0631 -24.5388 C 0 0 0 0 0 0 - -16.1797 -17.3276 -24.8519 N 0 0 0 0 0 0 - -17.2756 -15.8537 -23.5980 O 0 0 0 0 0 0 - -15.4325 -17.7880 -25.9083 C 0 0 0 0 0 0 - -15.2347 -19.2298 -26.0215 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5685 -19.7364 -27.1395 C 0 0 0 0 0 0 - -14.3729 -21.0966 -27.2695 C 0 0 0 0 0 0 - -14.8512 -21.9648 -26.2915 C 0 0 0 0 0 0 - -15.5073 -21.4630 -25.1657 C 0 0 0 0 0 0 - -15.7070 -20.1036 -25.0334 C 0 0 0 0 0 0 - -14.5890 -23.4530 -26.4105 C 0 0 0 0 0 0 - -14.2420 -23.8777 -27.6930 O 0 0 0 0 0 0 - -15.8426 -24.2713 -26.2211 C 0 0 0 0 0 0 - -13.4461 -23.8224 -25.4773 C 0 0 0 0 0 0 - -16.6478 -13.0758 -23.8537 Cl 0 0 0 0 0 0 - -14.1211 -15.0714 -28.4191 H 0 0 0 0 0 0 - -14.3123 -12.6194 -28.0725 H 0 0 0 0 0 0 - -15.4161 -11.7422 -26.0453 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6484 -18.0051 -24.2667 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1921 -19.0860 -27.9170 H 0 0 0 0 0 0 - -13.8366 -21.4662 -28.1300 H 0 0 0 0 0 0 - -15.8567 -22.1134 -24.3782 H 0 0 0 0 0 0 - -16.2216 -19.7579 -24.1478 H 0 0 0 0 0 0 - -14.1117 -24.8317 -27.6615 H 0 0 0 0 0 0 - -16.6408 -23.8913 -26.8628 H 0 0 0 0 0 0 - -16.1710 -24.2634 -25.1835 H 0 0 0 0 0 0 - -15.7129 -25.3281 -26.4654 H 0 0 0 0 0 0 - -12.6022 -23.1441 -25.5977 H 0 0 0 0 0 0 - -13.0927 -24.8196 -25.7118 H 0 0 0 0 0 0 - -13.7424 -23.7925 -24.4280 H 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 0 0 - 1 3 1 0 0 0 - 1 23 1 0 0 0 - 2 4 1 0 0 0 - 2 5 1 0 0 0 - 3 6 2 0 0 0 - 3 24 1 0 0 0 - 4 7 2 0 0 0 - 4 8 1 0 0 0 - 5 11 2 0 0 0 - 6 7 1 0 0 0 - 6 25 1 0 0 0 - 7 22 1 0 0 0 - 8 9 1 0 0 0 - 8 10 2 0 0 0 - 9 11 1 0 0 0 - 9 26 1 0 0 0 - 11 12 1 0 0 0 - 12 13 2 0 0 0 - 12 17 1 0 0 0 - 13 14 1 0 0 0 - 13 27 1 0 0 0 - 14 15 2 0 0 0 - 14 28 1 0 0 0 - 15 16 1 0 0 0 - 15 18 1 0 0 0 - 16 17 2 0 0 0 - 16 29 1 0 0 0 - 17 30 1 0 0 0 - 18 19 1 0 0 0 - 18 20 1 0 0 0 - 18 21 1 0 0 0 - 19 31 1 0 0 0 - 20 32 1 0 0 0 - 20 33 1 0 0 0 - 20 34 1 0 0 0 - 21 35 1 0 0 0 - 21 36 1 0 0 0 - 21 37 1 0 0 0 -M END -> -5c - -> -50 - -$$$$ diff --git a/benchmark-data-shevsea/ff/OPLS2005.lib b/benchmark-data-shevsea/ff/OPLS2005.lib deleted file mode 100644 index bc544a44..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/ff/OPLS2005.lib +++ /dev/null @@ -1,4784 +0,0 @@ -*------------------------------------------------------------- -* Q-library: -* Qgui version of the OPLS-2001 potential. -* -* Name convention on basic and acidic a.a.: -* AR+, ARG, HIP, HID, HIE, LY+, LYS, AS-, ASP, GL-, GLU -* +1 0 +1 0 0 +1 0 -1 0 -1 0 -* -* Standard N- and C- terminals: NRES and CRES -* Neutral N- and C- terminals: nRES and cRES <-- Not included in this lib! -* NOTE: lib entries for neutral terminals have not been added to this lib. -* Consequently, they will not be togglable in Qgui topology prepare. -* -*[toggle_residues] ! This is for topology prepare in Qgui -* QGUI_TOGGLE AR+ ARG -H12 radius_to CZ -* QGUI_TOGGLE ARG AR+ +H12 NH1 radius_to CZ -* QGUI_TOGGLE HIP HID -HE2 radius_to CE1 -* QGUI_TOGGLE LY+ LYS -HZ3 radius_to NZ -* QGUI_TOGGLE LYS LY+ +HZ3 NZ radius_to NZ -* QGUI_TOGGLE AS- ASP +HD2 OD2 radius_to CG -* QGUI_TOGGLE ASP AS- -HD2 radius_to CG -* QGUI_TOGGLE GL- GLU +HE2 OE2 radius_to CD -* QGUI_TOGGLE GLU GL- -HE2 radius_to CD -* QGUI_TOGGLE HID HIE -HD1 +HE2 NE2 radius_to CE1 -* QGUI_TOGGLE HIE HIP +HD1 ND1 radius_to CE1 -* QGUI_TOGGLE CYS CYX -HG1 radius_to SG -* QGUI_TOGGLE CYX CYS +HG1 SG radius_to SG -* !N- and C- terms: only atom to add/delete can be modified! -* !If you have something special, use toggle insted. -* ##QGUI_N-TERM NRES nRES -HT3 radius_to N -* ##QGUI_N-TERM nRES NRES +HT3 N radius_to N -* ##QGUI_C-TERM CRES cRES +HO2 OT2 radius_to C -* ##QGUI_C-TERM cRES CRES -HO2 radius_to C -* -*---------------------------------------------------------------------- -{ALA} ! Alanine - [info] - SYBYLtype RESIDUE !SYBYL substructure type - [atoms] - 1 N N -0.5000 !At. no., name, type, charge - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1800 - 6 HB1 HC 0.0600 - 7 HB2 HC 0.0600 - 8 HB3 HC 0.0600 - 9 C C 0.5000 - 10 O O -0.5000 - [bonds] !connect i -- j - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB1 - CB HB2 - CB HB3 - CA C - C O - [connections] !tail and head connections - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] !charge groups, with switch atom first - N H CA HA - CB HB1 HB2 HB3 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{AR+} ! Arginine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.0500 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD CT 0.1900 - 12 HD2 HC 0.0600 - 13 HD3 HC 0.0600 - 14 NE N2 -0.7000 - 15 HE H3 0.4400 - 16 CZ CAr 0.6400 - 17 NH1 N2 -0.8000 - 18 HH11 H3 0.4600 - 19 HH12 H3 0.4600 - 20 NH2 N2 -0.8000 - 21 HH21 H3 0.4600 - 22 HH22 H3 0.4600 - 23 C C 0.5000 - 24 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD NE - NE HE - NE CZ - CZ NH1 - NH1 HH11 - NH1 HH12 - CZ NH2 - NH2 HH21 - NH2 HH22 - CA C - C O - [build_rules] - torsion HH11 NH1 CZ NE 0 !keep Hs in plane - torsion HH21 NH2 CZ NE 0 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - HE NE CD CZ - NH2 CZ NH1 NE - HH11 NH1 CZ HH12 - HH21 NH2 CZ HH22 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CZ CG HG2 HG3 CD HD2 HD3 NE HE NH1 HH11 HH12 NH2 HH21 HH22 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{ARG} !Deprotonated!! - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.1200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD CT 0.0400 - 12 HD2 HC 0.0600 - 13 HD3 HC 0.0600 - 14 NE NY -0.6200 - 15 HE H 0.3800 - 16 CZ CAr 0.5500 - 17 NH1 NZ -0.7850 - 18 HH11 H 0.3800 - 19 NH2 NY -0.7850 - 20 HH21 H 0.3600 - 21 HH22 H 0.3600 - 22 C C 0.5000 - 23 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD NE - NE HE - NE CZ - CZ NH1 - NH1 HH11 - CZ NH2 - NH2 HH21 - NH2 HH22 - CA C - C O - [build_rules] - torsion HH11 NH1 CZ NE 0 !keep Hs in plane - torsion HH21 NH2 CZ NE 0 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - HE NE CD CZ - NH2 CZ NH1 NE - HH21 NH2 CZ HH22 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 NE HE CZ NH1 HH11 NH2 HH21 HH22 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{ASN} ! Asparagine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG C2 0.5000 - 9 OD1 O -0.5000 - 10 ND2 N -0.7600 - 11 HD21 H 0.3800 - 12 HD22 H 0.3800 - 13 C C 0.5000 - 14 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG OD1 - CG ND2 - ND2 HD21 - ND2 HD22 - CA C - C O - [build_rules] - torsion HD21 ND2 CG OD1 0 !keep amide H in plane - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - HD22 ND2 CG HD21 - OD1 CG CB ND2 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG OD1 - ND2 HD21 HD22 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{ASP} ! Aspartate, -1 charge - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.2200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG C2 0.7000 - 9 OD1 O2 -0.8000 - 10 OD2 O2 -0.8000 - 11 C C 0.5000 - 12 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG OD1 - CG OD2 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - OD1 CG CB OD2 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 CG OD1 OD2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{ASH} !Protonated, neutral!! - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG C2 0.5200 - 9 OD1 OH -0.5300 - 10 OD2 O1 -0.4400 - 11 HD1 HO 0.4500 - 12 C C 0.5000 - 13 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG OD1 - CG OD2 - OD1 HD1 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [build_rules] - torsion HD1 OD1 CG OD2 0 - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - OD1 CG CB OD2 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG OD1 OD2 HD1 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{CYS} ! Cysteine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT 0.0600 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 SG SH -0.3350 - 9 HG HS 0.1550 - 10 C C 0.5000 - 11 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB SG - SG HG - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 SG HG - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{CYX} ! Cysteine within S-S Bond - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT 0.0975 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 SG S -0.2175 - 9 C C 0.5000 - 10 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB SG - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 SG - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{GLN} !Glutamine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC2 0.0600 - 7 HB3 HC2 0.0600 - 8 CG CT -0.1200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD C21 0.5000 - 12 OE1 O -0.5000 - 13 NE2 N -0.7600 - 14 HE21 H 0.3800 - 15 HE22 H 0.3800 - 16 C C 0.5000 - 17 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD OE1 - CD NE2 - NE2 HE21 - NE2 HE22 - CA C - C O - [build_rules] - torsion HE21 NE2 CD OE1 0 !keep amide H in plane - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - HE22 NE2 CD HE21 - OE1 CD CG NE2 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD OE1 - NE2 HE21 HE22 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{GLU} !Glutamate -1 charge - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC1 0.0600 - 7 HB3 HC1 0.0600 - 8 CG CT -0.2200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD C2 0.7000 - 12 OE1 O2 -0.8000 - 13 OE2 O2 -0.8000 - 14 C C 0.5000 - 15 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD OE1 - CD OE2 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - OE1 CD CG OE2 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD OE1 OE2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{GLH} !Protonated, (neutral) - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.1200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD C2 0.5200 - 12 OE1 OH -0.5300 - 13 OE2 O -0.4400 - 14 HE1 HO 0.4500 - 15 C C 0.5000 - 16 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD OE1 - CD OE2 - OE1 HE1 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [build_rules] - torsion HE1 OE1 CD OE2 0 - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - OE1 CD CG OE2 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD OE1 OE2 HE1 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{GLY} !Glycine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0800 - 4 HA2 HC 0.0600 - 5 HA3 HC 0.0600 - 6 C C 0.5000 - 7 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA2 - CA HA3 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA2 HA3 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{HIP} ! Protonated HIS - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0050 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CX 0.2150 - 9 ND1 NA -0.5400 - 10 HD1 H 0.4600 - 11 CE1 CR 0.3850 - 12 HE1 HA 0.1150 - 13 NE2 NA -0.5400 - 14 HE2 H 0.4600 - 15 CD2 CX 0.2150 - 16 HD2 HA 0.1150 - 17 C C 0.5000 - 18 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG ND1 - ND1 HD1 - ND1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 NE2 - NE2 HE2 - NE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - CG CD2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - CB CG ND1 CD2 - HD1 ND1 CG CE1 - HE1 CE1 ND1 NE2 - HE2 NE2 CE1 CD2 - HD2 CD2 NE2 CG - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 CG ND1 HD1 CE1 HE1 NE2 HE2 CD2 HD2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{HID} ! neutral HIS, proton on ND1 - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0050 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CW 0.0150 - 9 ND1 NA -0.5700 - 10 HD1 H 0.4200 - 11 CE1 CR 0.2950 - 12 HE1 HA 0.1150 - 13 NE2 NB -0.4900 - 14 CD2 CV -0.0150 - 15 HD2 HA 0.1150 - 16 C C 0.5000 - 17 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG ND1 - CG CD2 - ND1 HD1 - ND1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 NE2 - NE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - HD1 ND1 CG CE1 - CB CG ND1 CD2 - HD2 CD2 NE2 CG - HE1 CE1 ND1 NE2 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 CG ND1 HD1 CE1 HE1 NE2 CD2 HD2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{HIE} ! neutral HIS, proton on NE1 - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0050 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CV -0.0150 - 9 ND1 NB -0.4900 - 10 CE1 CR 0.2950 - 11 HE1 HA 0.1150 - 12 NE2 NA -0.5700 - 13 HE2 H 0.4200 - 14 CD2 CW 0.0150 - 15 HD2 HA 0.1150 - 16 C C 0.5000 - 17 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG ND1 - ND1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 NE2 - NE2 HE2 - NE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - CG CD2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - CB CG ND1 CD2 - HE1 CE1 ND1 NE2 - HD2 CD2 NE2 CG - HE2 NE2 CD2 CE1 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 CG ND1 CE1 HE1 NE2 HE2 CD2 HD2 - C O - -*---------------------------------------------------------------------- -{ILE} ! Isoleucine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0600 - 6 HB HC 0.0600 - 7 CG2 CT -0.1800 - 8 HG21 HC 0.0600 - 9 HG22 HC 0.0600 - 10 HG23 HC 0.0600 - 11 CG1 CT -0.1200 - 12 HG12 HC 0.0600 - 13 HG13 HC 0.0600 - 14 CD1 CT -0.1800 - 15 HD11 HC 0.0600 - 16 HD12 HC 0.0600 - 17 HD13 HC 0.0600 - 18 C C 0.5000 - 19 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB - CB CG2 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - CB CG1 - CG1 HG12 - CG1 HG13 - CG1 CD1 - CD1 HD11 - CD1 HD12 - CD1 HD13 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB - CG2 HG21 HG22 HG23 - CG1 HG12 HG13 - CD1 HD11 HD12 HD13 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{LEU} ! Leucine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.0600 - 9 HG HC 0.0600 - 10 CD1 CT -0.1800 - 11 HD11 HC 0.0600 - 12 HD12 HC 0.0600 - 13 HD13 HC 0.0600 - 14 CD2 CT -0.1800 - 15 HD21 HC 0.0600 - 16 HD22 HC 0.0600 - 17 HD23 HC 0.0600 - 18 C C 0.5000 - 19 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG - CG CD1 - CD1 HD11 - CD1 HD12 - CD1 HD13 - CG CD2 - CD2 HD21 - CD2 HD22 - CD2 HD23 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG - CD1 HD11 HD12 HD13 - CD2 HD21 HD22 HD23 - C O - -*---------------------------------------------------------------------- -{LYS} !Lysine +1 charge - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.1200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD CT -0.1200 - 12 HD2 HC 0.0600 - 13 HD3 HC 0.0600 - 14 CE CT 0.1900 - 15 HE2 HC 0.0600 - 16 HE3 HC 0.0600 - 17 NZ N3 -0.3000 - 18 HZ1 H3 0.3300 - 19 HZ2 H3 0.3300 - 20 HZ3 H3 0.3300 - 21 C C 0.5000 - 22 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD CE - CE HE2 - CE HE3 - CE NZ - NZ HZ1 - NZ HZ2 - NZ HZ3 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ1 HZ2 HZ3 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{KCX} ! KCX: atoms 30 charge -1.0000 - -[info] -SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 N TN -0.5000 - 2 CA TCT1 0.1400 - 3 C TCO4 0.4700 - 4 O TO -0.4700 - 5 CB TCT -0.1200 - 6 CG TCT -0.1200 - 7 CD TCT -0.1200 - 8 CE TCT 0.0320 - 9 NZ TN -0.5657 - 10 CX TCO3 0.7225 - 11 OX1 TO2Z -0.8000 - 12 OX2 TO2Z -0.8000 - 13 H TH 0.3000 - 14 HA THC 0.0600 - 15 HB3 THC 0.0600 - 16 HB2 THC 0.0600 - 17 HG3 THC 0.0600 - 18 HG2 THC 0.0600 - 19 HD3 THC 0.0600 - 20 HD2 THC 0.0600 - 21 HE3 THC 0.0600 - 22 HE2 THC 0.0600 - 23 HZ TH 0.2912 - -[bonds] -N CA -N H -CA C -CA CB -CA HA -C O -CB CG -CB HB3 -CB HB2 -CG CD -CG HG3 -CG HG2 -CD CE -CD HD3 -CD HD2 -CE NZ -CE HE3 -CE HE2 -NZ CX -NZ HZ -CX OX1 -CX OX2 - -[connections] - head N - tail C - -[impropers] -HZ CE NZ CX -OX1 NZ CX OX2 -H N -C CA -O C CA +N - -[charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ CX OX1 OX2 - C O - -*---------------------------------------------------------------------- -{LYN} !Deprotonated, neutral - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.1200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD CT -0.1200 - 12 HD2 HC 0.0600 - 13 HD3 HC 0.0600 - 14 CE CT 0.0600 - 15 HE2 HC 0.0600 - 16 HE3 HC 0.0600 - 17 NZ NT -0.9000 - 18 HZ1 H 0.3600 - 19 HZ2 H 0.3600 - 20 C C 0.5000 - 21 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD CE - CE HE2 - CE HE3 - CE NZ - NZ HZ1 - NZ HZ2 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ1 HZ2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{MET} !Methionine - [info] - SYBYLtype GROUP - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT 0.0975 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 SD S -0.4350 - 12 CE CT 0.0375 - 13 HE1 HC 0.0600 - 14 HE2 HC 0.0600 - 15 HE3 HC 0.0600 - 16 C C 0.5000 - 17 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG SD - SD CE - CE HE1 - CE HE2 - CE HE3 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 SD CE HE1 HE2 HE3 - C O - -*---------------------------------------------------------------------- -{PHE} !Phenylalanine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0050 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CA -0.1150 - 9 CD1 CA -0.1150 - 10 HD1 HA 0.1150 - 11 CE1 CA -0.1150 - 12 HE1 HA 0.1150 - 13 CZ CA -0.1150 - 14 HZ HA 0.1150 - 15 CE2 CA -0.1150 - 16 HE2 HA 0.1150 - 17 CD2 CA -0.1150 - 18 HD2 HA 0.1150 - 19 C C 0.5000 - 20 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG CD1 - CD1 HD1 - CD1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 CZ - CZ HZ - CZ CE2 - CE2 HE2 - CE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - CG CD2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CE1 CG - HE1 CE1 CZ CD1 - HZ CZ CE2 CE1 - HE2 CE2 CD2 CZ - HD2 CD2 CG CE2 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 CG - CD1 HD1 - CE1 HE1 - CZ HZ - CE2 HE2 - CD2 HD2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{PRO} !Proline - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.1400 - 2 CD CP1 -0.0500 - 3 HD2 HC 0.0600 - 4 HD3 HC 0.0600 - 5 CG CT -0.1200 - 6 HG2 HC 0.0600 - 7 HG3 HC 0.0600 - 8 CB CT -0.1200 - 9 HB2 HC 0.0600 - 10 HB3 HC 0.0600 - 11 CA CT 0.0100 - 12 HA HC 0.0600 - 13 C C 0.5000 - 14 O O -0.5000 - [bonds] - N CD - CD HD2 - CD HD3 - CD CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CB - CB HB2 - CB HB3 - N CA - CA HA - CA C - C O - CB CA - [connections] - head N - tail C - [impropers] - -C N CA CD - O C CA +N - [charge_groups] - N CA HA CD HD2 HD3 - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{SEB} !Serine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT 0.1450 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 OG OH -0.6830 - 9 C C 0.5000 - 10 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB OG - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 OG - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{SER} !Serine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT 0.1450 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 OG OH -0.6830 - 9 HG HO 0.4180 - 10 C C 0.5000 - 11 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB OG - OG HG - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 OG HG - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{THR} !Threonine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT 0.2050 - 6 HB HC 0.0600 - 7 CG2 CT -0.1800 - 8 HG21 HC 0.0600 - 9 HG22 HC 0.0600 - 10 HG23 HC 0.0600 - 11 OG1 OH -0.6830 - 12 HG1 HO 0.4180 - 13 C C 0.5000 - 14 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB - CB CG2 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - CB OG1 - OG1 HG1 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB OG1 HG1 - 7 8 9 10 !CG2 HG21 HG22 HG22 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{TRP} !Tryptophane - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG Cstar 0.0750 - 9 CD1 CW -0.1150 - 10 HD1 HA 0.1150 - 11 NE1 NA -0.5700 - 12 HE1 H 0.4200 - 13 CE2 CN 0.1300 - 14 CZ2 CA -0.1150 - 15 HZ2 HA 0.1150 - 16 CH2 CA -0.1150 - 17 HH2 HA 0.1150 - 18 CZ3 CA -0.1150 - 19 HZ3 HA 0.1150 - 20 CE3 CA -0.1150 - 21 HE3 HA 0.1150 - 22 CD2 CB -0.0550 - 23 C C 0.5000 - 24 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG CD1 - CD1 HD1 - CD1 NE1 - NE1 HE1 - NE1 CE2 - CE2 CZ2 - CZ2 HZ2 - CZ2 CH2 - CH2 HH2 - CH2 CZ3 - CZ3 HZ3 - CZ3 CE3 - CE3 HE3 - CE3 CD2 - CA C - C O - CG CD2 - CE2 CD2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CG NE1 - HE1 NE1 CD1 CE2 - HZ2 CZ2 CE2 CH2 - HH2 CH2 CE2 CZ3 - HZ3 CZ3 CH2 CE3 - HE3 CE3 CZ3 CD2 - CE2 CD2 CG CE3 - CZ2 CE2 CD2 NE1 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG CD2 CD1 HD1 NE1 HE1 CE2 - CZ2 HZ2 - CH2 HH2 - CZ3 HZ3 - CE3 HE3 - C O - -*---------------------------------------------------------------------- -{TYR} !Tyrosine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0050 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CA -0.1150 - 9 CD1 CA -0.1150 - 10 HD1 HA 0.1150 - 11 CE1 CA -0.1150 - 12 HE1 HA 0.1150 - 13 CZ CA 0.1500 - 14 OH OTY -0.5850 - 15 HH HO 0.4350 - 16 CE2 CA -0.1150 - 17 HE2 HA 0.1150 - 18 CD2 CA -0.1150 - 19 HD2 HA 0.1150 - 20 C C 0.5000 - 21 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG CD1 - CD1 HD1 - CD1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 CZ - CZ OH - OH HH - CZ CE2 - CE2 HE2 - CE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - CG CD2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CE1 CG - HE1 CE1 CZ CD1 - OH CZ CE2 CE1 - HE2 CE2 CD2 CZ - HD2 CD2 CG CE2 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 CG - CD1 HD1 - CE1 HE1 - CZ OH HH - CE2 HE2 - CD2 HD2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{VAL} !Valine - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.1400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0600 - 6 HB HC 0.0600 - 7 CG1 CT -0.1800 - 8 HG11 HC 0.0600 - 9 HG12 HC 0.0600 - 10 HG13 HC 0.0600 - 11 CG2 CT -0.1800 - 12 HG21 HC 0.0600 - 13 HG22 HC 0.0600 - 14 HG23 HC 0.0600 - 15 C C 0.5000 - 16 O O -0.5000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB - CB CG1 - CG1 HG11 - CG1 HG12 - CG1 HG13 - CB CG2 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB - CG1 HG11 HG12 HG13 - CG2 HG21 HG22 HG23 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NALA} ! Alanine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE !SYBYL substructure type - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 !At. no., name, type, charge - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1800 - 8 HB1 HC 0.0600 - 9 HB2 HC 0.0600 - 10 HB3 HC 0.0600 - 11 C C 0.5000 - 12 O O -0.5000 - [bonds] !connect i -- j - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB1 - CB HB2 - CB HB3 - CA C - C O - [connections] !tail and head connections - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] !charge groups, with switch atom first - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB1 HB2 HB3 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NAR+} ! Arginine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CT -0.0500 - 11 HG2 HC 0.0600 - 12 HG3 HC 0.0600 - 13 CD CT 0.1900 - 14 HD2 HC 0.0600 - 15 HD3 HC 0.0600 - 16 NE N2 -0.7000 - 17 HE H3 0.4400 - 18 CZ CAr 0.6400 - 19 NH1 N2 -0.8000 - 20 HH11 H3 0.4600 - 21 HH12 H3 0.4600 - 22 NH2 N2 -0.8000 - 23 HH21 H3 0.4600 - 24 HH22 H3 0.4600 - 25 C C 0.5000 - 26 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD NE - NE HE - NE CZ - CZ NH1 - NH1 HH11 - NH1 HH12 - CZ NH2 - NH2 HH21 - NH2 HH22 - CA C - C O - [build_rules] - torsion HH11 NH1 CZ NE 0 !keep Hs in plane - torsion HH21 NH2 CZ NE 0 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - HE NE CD CZ - NH2 CZ NH1 NE - HH11 NH1 CZ HH12 - HH21 NH2 CZ HH22 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CZ CG HG2 HG3 CD HD2 HD3 NE HE NH1 HH11 HH12 NH2 HH21 HH22 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NARG} ! Arginine neutral in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CT -0.1200 - 11 HG2 HC 0.0600 - 12 HG3 HC 0.0600 - 13 CD CT 0.0400 - 14 HD2 HC 0.0600 - 15 HD3 HC 0.0600 - 16 NE NY -0.6200 - 17 HE H 0.3800 - 18 CZ CAr 0.5500 - 19 NH1 NZ -0.7850 - 20 HH11 H 0.3800 - 21 NH2 NY -0.7850 - 22 HH21 H 0.3600 - 23 HH22 H 0.3600 - 24 C C 0.5000 - 25 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD NE - NE HE - NE CZ - CZ NH1 - NH1 HH11 - CZ NH2 - NH2 HH21 - NH2 HH22 - CA C - C O - [build_rules] - torsion HH11 NH1 CZ NE 0 !keep Hs in plane - torsion HH21 NH2 CZ NE 0 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - HE NE CD CZ - NH2 CZ NH1 NE - HH21 NH2 CZ HH22 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 NE HE CZ NH1 HH11 NH2 HH21 HH22 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NASN} ! Asparagine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG C2 0.5000 - 11 OD1 O -0.5000 - 12 ND2 N -0.7600 - 13 HD21 H 0.3800 - 14 HD22 H 0.3800 - 15 C C 0.5000 - 16 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG OD1 - CG ND2 - ND2 HD21 - ND2 HD22 - CA C - C O - [build_rules] - torsion HD21 ND2 CG OD1 0 !keep amide H in plane - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - HD22 ND2 CG HD21 - OD1 CG CB ND2 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG OD1 - ND2 HD21 HD22 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NAS-} ! Aspartate, -1 charge in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.2200 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG C2 0.7000 - 11 OD1 O2 -0.8000 - 12 OD2 O2 -0.8000 - 13 C C 0.5000 - 14 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG OD1 - CG OD2 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - OD1 CG CB OD2 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 CG OD1 OD2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NASP} ! Aspartic acid, neutral in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG C2 0.5200 - 11 OD1 OH -0.5300 - 12 OD2 O1 -0.4400 - 13 HD1 HO 0.4500 - 14 C C 0.5000 - 15 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG OD1 - CG OD2 - OD1 HD1 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [build_rules] - torsion HD1 OD1 CG OD2 0 - [impropers] - O C CA +N - OD1 CG CB OD2 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG OD1 OD2 HD1 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NCYS} ! Cysteine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT 0.0600 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 SG SH -0.3350 - 11 HG HS 0.1550 - 12 C C 0.5000 - 13 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB SG - SG HG - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 SG HG - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NCYX} ! Cysteine within S-S Bond - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT 0.0975 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 SG S -0.2175 - 11 C C 0.5000 - 12 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB SG - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 SG - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NGLN} !Glutamine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC2 0.0600 - 9 HB3 HC2 0.0600 - 10 CG CT -0.1200 - 11 HG2 HC 0.0600 - 12 HG3 HC 0.0600 - 13 CD C21 0.5000 - 14 OE1 O -0.5000 - 15 NE2 N -0.7600 - 16 HE21 H 0.3800 - 17 HE22 H 0.3800 - 18 C C 0.5000 - 19 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD OE1 - CD NE2 - NE2 HE21 - NE2 HE22 - CA C - C O - [build_rules] - torsion HE21 NE2 CD OE1 0 !keep amide H in plane - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - HE22 NE2 CD HE21 - OE1 CD CG NE2 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD OE1 - NE2 HE21 HE22 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NGL-} !Glutamate, -1 charge in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC1 0.0600 - 9 HB3 HC1 0.0600 - 10 CG CT -0.2200 - 11 HG2 HC 0.0600 - 12 HG3 HC 0.0600 - 13 CD C2 0.7000 - 14 OE1 O2 -0.8000 - 15 OE2 O2 -0.8000 - 16 C C 0.5000 - 17 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD OE1 - CD OE2 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - OE1 CD CG OE2 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD OE1 OE2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NGLU} !Glutamic acid, neutral in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CT -0.1200 - 11 HG2 HC 0.0600 - 12 HG3 HC 0.0600 - 13 CD C2 0.5200 - 14 OE1 OH -0.5300 - 15 OE2 O -0.4400 - 16 HE1 HO 0.4500 - 17 C C 0.5000 - 18 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD OE1 - CD OE2 - OE1 HE1 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [build_rules] - torsion HE1 OE1 CD OE2 0 - [impropers] - O C CA +N - OE1 CD CG OE2 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD OE1 OE2 HE1 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NGLY} !Glycine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.1900 - 6 HA2 HC 0.0600 - 7 HA3 HC 0.0600 - 8 C C 0.5000 - 9 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA2 - CA HA3 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA2 HA3 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NHIP} ! Histidine protonated, charge +2 in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.0050 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CX 0.2150 - 11 ND1 NA -0.5400 - 12 HD1 H 0.4600 - 13 CE1 CR 0.3850 - 14 HE1 HA 0.1150 - 15 NE2 NA -0.5400 - 16 HE2 H 0.4600 - 17 CD2 CX 0.2150 - 18 HD2 HA 0.1150 - 19 C C 0.5000 - 20 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG ND1 - ND1 HD1 - ND1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 NE2 - NE2 HE2 - NE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - CG CD2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - CB CG ND1 CD2 - HD1 ND1 CG CE1 - HE1 CE1 ND1 NE2 - HE2 NE2 CE1 CD2 - HD2 CD2 NE2 CG - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 CG ND1 HD1 CE1 HE1 NE2 HE2 CD2 HD2 - C O - -*---------------------------------------------------------------------- -{NHID} ! neutral histidine, proton on ND1, in N-term - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.0050 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CW 0.0150 - 11 ND1 NA -0.5700 - 12 HD1 H 0.4200 - 13 CE1 CR 0.2950 - 14 HE1 HA 0.1150 - 15 NE2 NB -0.4900 - 16 CD2 CV -0.0150 - 17 HD2 HA 0.1150 - 18 C C 0.5000 - 19 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG ND1 - CG CD2 - ND1 HD1 - ND1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 NE2 - NE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - HD1 ND1 CG CE1 - CB CG ND1 CD2 - HD2 CD2 NE2 CG - HE1 CE1 ND1 NE2 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 CG ND1 HD1 CE1 HE1 NE2 CD2 HD2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NHIE} ! neutral HIS, proton on NE1, in N-term - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.0050 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CV -0.0150 - 11 ND1 NB -0.4900 - 12 CE1 CR 0.2950 - 13 HE1 HA 0.1150 - 14 NE2 NA -0.5700 - 15 HE2 H 0.4200 - 16 CD2 CW 0.0150 - 17 HD2 HA 0.1150 - 18 C C 0.5000 - 19 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG ND1 - ND1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 NE2 - NE2 HE2 - NE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - CG CD2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - CB CG ND1 CD2 - HE1 CE1 ND1 NE2 - HD2 CD2 NE2 CG - HE2 NE2 CD2 CE1 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 CG ND1 CE1 HE1 NE2 HE2 CD2 HD2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NILE} ! Isoleucine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.0600 - 8 HB HC 0.0600 - 9 CG2 CT -0.1800 - 10 HG21 HC 0.0600 - 11 HG22 HC 0.0600 - 12 HG23 HC 0.0600 - 13 CG1 CT -0.1200 - 14 HG12 HC 0.0600 - 15 HG13 HC 0.0600 - 16 CD1 CT -0.1800 - 17 HD11 HC 0.0600 - 18 HD12 HC 0.0600 - 19 HD13 HC 0.0600 - 20 C C 0.5000 - 21 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB - CB CG2 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - CB CG1 - CG1 HG12 - CG1 HG13 - CG1 CD1 - CD1 HD11 - CD1 HD12 - CD1 HD13 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB - CG2 HG21 HG22 HG23 - CG1 HG12 HG13 - CD1 HD11 HD12 HD13 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NLEU} ! Leucine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CT -0.0600 - 11 HG HC 0.0600 - 12 CD1 CT -0.1800 - 13 HD11 HC 0.0600 - 14 HD12 HC 0.0600 - 15 HD13 HC 0.0600 - 16 CD2 CT -0.1800 - 17 HD21 HC 0.0600 - 18 HD22 HC 0.0600 - 19 HD23 HC 0.0600 - 20 C C 0.5000 - 21 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG - CG CD1 - CD1 HD11 - CD1 HD12 - CD1 HD13 - CG CD2 - CD2 HD21 - CD2 HD22 - CD2 HD23 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG - CD1 HD11 HD12 HD13 - CD2 HD21 HD22 HD23 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NLYP} !Lysine, +2 charge, in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CT -0.1200 - 11 HG2 HC 0.0600 - 12 HG3 HC 0.0600 - 13 CD CT -0.1200 - 14 HD2 HC 0.0600 - 15 HD3 HC 0.0600 - 16 CE CT 0.1900 - 17 HE2 HC 0.0600 - 18 HE3 HC 0.0600 - 19 NZ N3 -0.3000 - 20 HZ1 H3 0.3300 - 21 HZ2 H3 0.3300 - 22 HZ3 H3 0.3300 - 23 C C 0.5000 - 24 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD CE - CE HE2 - CE HE3 - CE NZ - NZ HZ1 - NZ HZ2 - NZ HZ3 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ1 HZ2 HZ3 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NLY+} !Lysine, +1 charge, in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CT -0.1200 - 11 HG2 HC 0.0600 - 12 HG3 HC 0.0600 - 13 CD CT -0.1200 - 14 HD2 HC 0.0600 - 15 HD3 HC 0.0600 - 16 CE CT 0.1900 - 17 HE2 HC 0.0600 - 18 HE3 HC 0.0600 - 19 NZ N3 -0.3000 - 20 HZ1 H3 0.3300 - 21 HZ2 H3 0.3300 - 22 HZ3 H3 0.3300 - 23 C C 0.5000 - 24 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD CE - CE HE2 - CE HE3 - CE NZ - NZ HZ1 - NZ HZ2 - NZ HZ3 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ1 HZ2 HZ3 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NLYS} !Lysine Deprotonated, neutral, in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CT -0.1200 - 11 HG2 HC 0.0600 - 12 HG3 HC 0.0600 - 13 CD CT -0.1200 - 14 HD2 HC 0.0600 - 15 HD3 HC 0.0600 - 16 CE CT 0.0600 - 17 HE2 HC 0.0600 - 18 HE3 HC 0.0600 - 19 NZ NT -0.9000 - 20 HZ1 H 0.3600 - 21 HZ2 H 0.3600 - 22 C C 0.5000 - 23 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD CE - CE HE2 - CE HE3 - CE NZ - NZ HZ1 - NZ HZ2 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ1 HZ2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NMET} !Methionine in N-term - [info] - SYBYLtype GROUP - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CT 0.0975 - 11 HG2 HC 0.0600 - 12 HG3 HC 0.0600 - 13 SD S -0.4350 - 14 CE CT 0.0375 - 15 HE1 HC 0.0600 - 16 HE2 HC 0.0600 - 17 HE3 HC 0.0600 - 18 C C 0.5000 - 19 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG SD - SD CE - CE HE1 - CE HE2 - CE HE3 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 SD CE HE1 HE2 HE3 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NPHE} !Phenylalanine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.0050 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CA -0.1150 - 11 CD1 CA -0.1150 - 12 HD1 HA 0.1150 - 13 CE1 CA -0.1150 - 14 HE1 HA 0.1150 - 15 CZ CA -0.1150 - 16 HZ HA 0.1150 - 17 CE2 CA -0.1150 - 18 HE2 HA 0.1150 - 19 CD2 CA -0.1150 - 20 HD2 HA 0.1150 - 21 C C 0.5000 - 22 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG CD1 - CD1 HD1 - CD1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 CZ - CZ HZ - CZ CE2 - CE2 HE2 - CE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - CG CD2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CE1 CG - HE1 CE1 CZ CD1 - HZ CZ CE2 CE1 - HE2 CE2 CD2 CZ - HD2 CD2 CG CE2 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 CG - CD1 HD1 - CE1 HE1 - CZ HZ - CE2 HE2 - CD2 HD2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NPRO} !Proline in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.2000 - 2 H1 H 0.3100 - 3 H2 H 0.3100 - 4 CD CP1 0.1700 - 5 HD2 HC 0.0600 - 6 HD3 HC 0.0600 - 7 CG CT -0.1200 - 8 HG2 HC 0.0600 - 9 HG3 HC 0.0600 - 10 CB CT -0.1200 - 11 HB2 HC 0.0600 - 12 HB3 HC 0.0600 - 13 CA CT 0.2300 - 14 HA HC 0.0600 - 15 C C 0.5000 - 16 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N CD - CD HD2 - CD HD3 - CD CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CA - CA N - CA HA - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 CA HA CD HD2 HD3 - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NSER} !Serine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT 0.1450 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 OG OH -0.6830 - 11 HG HO 0.4180 - 12 C C 0.5000 - 13 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB OG - OG HG - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 OG HG - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NTHR} !Threonine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT 0.2050 - 8 HB HC 0.0600 - 9 CG2 CT -0.1800 - 10 HG21 HC 0.0600 - 11 HG22 HC 0.0600 - 12 HG23 HC 0.0600 - 13 OG1 OH -0.6830 - 14 HG1 HO 0.4180 - 15 C C 0.5000 - 16 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB - CB CG2 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - CB OG1 - OG1 HG1 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB OG1 HG1 - CG2 HG21 HG22 HG22 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NTRP} !Tryptophane in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.1200 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG Cstar 0.0750 - 11 CD1 CW -0.1150 - 12 HD1 HA 0.1150 - 13 NE1 NA -0.5700 - 14 HE1 H 0.4200 - 15 CE2 CN 0.1300 - 16 CZ2 CA -0.1150 - 17 HZ2 HA 0.1150 - 18 CH2 CA -0.1150 - 19 HH2 HA 0.1150 - 20 CZ3 CA -0.1150 - 21 HZ3 HA 0.1150 - 22 CE3 CA -0.1150 - 23 HE3 HA 0.1150 - 24 CD2 CB -0.0550 - 25 C C 0.5000 - 26 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG CD1 - CD1 HD1 - CD1 NE1 - NE1 HE1 - NE1 CE2 - CE2 CZ2 - CZ2 HZ2 - CZ2 CH2 - CH2 HH2 - CH2 CZ3 - CZ3 HZ3 - CZ3 CE3 - CE3 HE3 - CE3 CD2 - CA C - C O - CG CD2 - CE2 CD2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CG NE1 - HE1 NE1 CD1 CE2 - HZ2 CZ2 CE2 CH2 - HH2 CH2 CE2 CZ3 - HZ3 CZ3 CH2 CE3 - HE3 CE3 CZ3 CD2 - CE2 CD2 CG CE3 - CZ2 CE2 CD2 NE1 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG CD2 CD1 HD1 NE1 HE1 CE2 - CZ2 HZ2 - CH2 HH2 - CZ3 HZ3 - CE3 HE3 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NTYR} !Tyrosine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.0050 - 8 HB2 HC 0.0600 - 9 HB3 HC 0.0600 - 10 CG CA -0.1150 - 11 CD1 CA -0.1150 - 12 HD1 HA 0.1150 - 13 CE1 CA -0.1150 - 14 HE1 HA 0.1150 - 15 CZ CA 0.1500 - 16 OH OTY -0.5850 - 17 HH HO 0.4350 - 18 CE2 CA -0.1150 - 19 HE2 HA 0.1150 - 20 CD2 CA -0.1150 - 21 HD2 HA 0.1150 - 22 C C 0.5000 - 23 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG CD1 - CD1 HD1 - CD1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 CZ - CZ OH - OH HH - CZ CE2 - CE2 HE2 - CE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - CG CD2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CE1 CG - HE1 CE1 CZ CD1 - OH CZ CE2 CE1 - HE2 CE2 CD2 CZ - HD2 CD2 CG CE2 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 CG - CD1 HD1 - CE1 HE1 - CZ OH HH - CE2 HE2 - CD2 HD2 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NVAL} !Valine in N-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N3 -0.3000 - 2 H1 H3 0.3300 - 3 H2 H3 0.3300 - 4 H3 H3 0.3300 - 5 CA CT 0.2500 - 6 HA HC 0.0600 - 7 CB CT -0.0600 - 8 HB HC 0.0600 - 9 CG1 CT -0.1800 - 10 HG11 HC 0.0600 - 11 HG12 HC 0.0600 - 12 HG13 HC 0.0600 - 13 CG2 CT -0.1800 - 14 HG21 HC 0.0600 - 15 HG22 HC 0.0600 - 16 HG23 HC 0.0600 - 17 C C 0.5000 - 18 O O -0.5000 - [bonds] - N H1 - N H2 - N H3 - N CA - CA HA - CA CB - CB HB - CB CG1 - CG1 HG11 - CG1 HG12 - CG1 HG13 - CB CG2 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - CA C - C O - [connections] - head N - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB - CG1 HG11 HG12 HG13 - CG2 HG21 HG22 HG23 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{CALA} ! Alanine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE !SYBYL substructure type - [atoms] - 1 N N -0.5000 !At. no., name, type, charge - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1800 - 6 HB1 HC 0.0600 - 7 HB2 HC 0.0600 - 8 HB3 HC 0.0600 - 9 C C 0.7000 - 10 O O2 -0.8000 - 11 OXT O2 -0.8000 - [bonds] !connect i -- j - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB1 - CB HB2 - CB HB3 - CA C - C O - C OXT - [connections] !tail and head connections - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] !charge groups, with switch atom first - N H CA HA C O OXT - CB HB1 HB2 HB3 -*---------------------------------------------------------------------- -{CAR+} ! Arginine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.0500 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD CT 0.1900 - 12 HD2 HC 0.0600 - 13 HD3 HC 0.0600 - 14 NE N2 -0.7000 - 15 HE H3 0.4400 - 16 CZ CAr 0.6400 - 17 NH1 N2 -0.8000 - 18 HH11 H3 0.4600 - 19 HH12 H3 0.4600 - 20 NH2 N2 -0.8000 - 21 HH21 H3 0.4600 - 22 HH22 H3 0.4600 - 23 C C 0.7000 - 24 O O2 -0.8000 - 25 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD NE - NE HE - NE CZ - CZ NH1 - NH1 HH11 - NH1 HH12 - CZ NH2 - NH2 HH21 - NH2 HH22 - CA C - C O - C OXT - [build_rules] - torsion HH11 NH1 CZ NE 0 !keep Hs in plane - torsion HH21 NH2 CZ NE 0 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - HE NE CD CZ - NH2 CZ NH1 NE - HH11 NH1 CZ HH12 - HH21 NH2 CZ HH22 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CZ CG HG2 HG3 CD HD2 HD3 NE HE NH1 HH11 HH12 NH2 HH21 HH22 -*---------------------------------------------------------------------- -{CARG} ! Arginine Deprotonated in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.1200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD CT 0.0400 - 12 HD2 HC 0.0600 - 13 HD3 HC 0.0600 - 14 NE NY -0.6200 - 15 HE H 0.3800 - 16 CZ CAr 0.5500 - 17 NH1 NZ -0.7850 - 18 HH11 H 0.3800 - 19 NH2 NY -0.7850 - 20 HH21 H 0.3600 - 21 HH22 H 0.3600 - 22 C C 0.7000 - 23 O O2 -0.8000 - 24 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD NE - NE HE - NE CZ - CZ NH1 - NH1 HH11 - CZ NH2 - NH2 HH21 - NH2 HH22 - CA C - C O - C OXT - [build_rules] - torsion HH11 NH1 CZ NE 0 !keep Hs in plane - torsion HH21 NH2 CZ NE 0 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - HE NE CD CZ - NH2 CZ NH1 NE - HH21 NH2 CZ HH22 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 NE HE CZ NH1 HH11 NH2 HH21 HH22 -*---------------------------------------------------------------------- -{CASN} ! Asparagine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG C2 0.5000 - 9 OD1 O -0.5000 - 10 ND2 N -0.7600 - 11 HD21 H 0.3800 - 12 HD22 H 0.3800 - 13 C C 0.7000 - 14 O O2 -0.8000 - 15 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG OD1 - CG ND2 - ND2 HD21 - ND2 HD22 - CA C - C O - C OXT - [build_rules] - torsion HD21 ND2 CG OD1 0 !keep amide H in plane - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - HD22 ND2 CG HD21 - OD1 CG CB ND2 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG OD1 - ND2 HD21 HD22 -*---------------------------------------------------------------------- -{CAS-} ! Aspartate, -2 charge in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.2200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG C2 0.7000 - 9 OD1 O2 -0.8000 - 10 OD2 O2 -0.8000 - 11 C C 0.7000 - 12 O O2 -0.8000 - 13 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG OD1 - CG OD2 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - OD1 CG CB OD2 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 CG OD1 OD2 -*---------------------------------------------------------------------- -{CASP} !Aspartic acid, neutral in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG C2 0.5200 - 9 OD1 OH -0.5300 - 10 OD2 O1 -0.4400 - 11 HD1 HO 0.4500 - 12 C C 0.7000 - 13 O O2 -0.8000 - 14 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG OD1 - CG OD2 - OD1 HD1 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [build_rules] - torsion HD1 OD1 CG OD2 0 - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - OD1 CG CB OD2 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG OD1 OD2 HD1 -*---------------------------------------------------------------------- -{CCYS} ! Cysteine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT 0.0600 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 SG SH -0.3350 - 9 HG HS 0.1550 - 10 C C 0.7000 - 11 O O2 -0.8000 - 12 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB SG - SG HG - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 SG HG -*---------------------------------------------------------------------- -{CCYX} ! Cysteine within S-S Bond in C-term - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT 0.0975 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 SG S -0.2175 - 9 C C 0.7000 - 10 O O2 -0.8000 - 11 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB SG - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 SG -*---------------------------------------------------------------------- -{CGLN} !Glutamine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC2 0.0600 - 7 HB3 HC2 0.0600 - 8 CG CT -0.1200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD C21 0.5000 - 12 OE1 O -0.5000 - 13 NE2 N -0.7600 - 14 HE21 H 0.3800 - 15 HE22 H 0.3800 - 16 C C 0.7000 - 17 O O2 -0.8000 - 18 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD OE1 - CD NE2 - NE2 HE21 - NE2 HE22 - CA C - C O - C OXT - [build_rules] - torsion HE21 NE2 CD OE1 0 !keep amide H in plane - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - HE22 NE2 CD HE21 - OE1 CD CG NE2 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD OE1 - NE2 HE21 HE22 -*---------------------------------------------------------------------- -{CGL-} !Glutamate -1 charge in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC1 0.0600 - 7 HB3 HC1 0.0600 - 8 CG CT -0.2200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD C2 0.7000 - 12 OE1 O2 -0.8000 - 13 OE2 O2 -0.8000 - 14 C C 0.7000 - 15 O O2 -0.8000 - 16 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD OE1 - CD OE2 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - OE1 CD CG OE2 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD OE1 OE2 -*---------------------------------------------------------------------- -{CGLU} !Glutamix acid, (neutral) in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.1200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD C2 0.5200 - 12 OE1 OH -0.5300 - 13 OE2 O -0.4400 - 14 HE1 HO 0.4500 - 15 C C 0.7000 - 16 O O2 -0.8000 - 17 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD OE1 - CD OE2 - OE1 HE1 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [build_rules] - torsion HE1 OE1 CD OE2 0 - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - OE1 CD CG OE2 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD OE1 OE2 HE1 -*---------------------------------------------------------------------- -{CGLY} !Glycine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT -0.0200 - 4 HA2 HC 0.0600 - 5 HA3 HC 0.0600 - 6 C C 0.7000 - 7 O O2 -0.8000 - 8 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA2 - CA HA3 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] - N H CA HA2 HA3 C O OXT -*---------------------------------------------------------------------- -{CHIP} ! Protonated HIS in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0050 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CX 0.2150 - 9 ND1 NA -0.5400 - 10 HD1 H 0.4600 - 11 CE1 CR 0.3850 - 12 HE1 HA 0.1150 - 13 NE2 NA -0.5400 - 14 HE2 H 0.4600 - 15 CD2 CX 0.2150 - 16 HD2 HA 0.1150 - 17 C C 0.7000 - 18 O O2 -0.8000 - 19 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG ND1 - CG CD2 - ND1 HD1 - ND1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 NE2 - NE2 HE2 - NE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - CB CG ND1 CD2 - HD1 ND1 CG CE1 - HE1 CE1 ND1 NE2 - HE2 NE2 CE1 CD2 - HD2 CD2 NE2 CG - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 CG ND1 HD1 CE1 HE1 NE2 HE2 CD2 HD2 - -*---------------------------------------------------------------------- -{CHID} ! neutral HIS in C-term, proton on ND1 - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0050 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CW 0.0150 - 9 ND1 NA -0.5700 - 10 HD1 H 0.4200 - 11 CE1 CR 0.2950 - 12 HE1 HA 0.1150 - 13 NE2 NB -0.4900 - 14 CD2 CV -0.0150 - 15 HD2 HA 0.1150 - 16 C C 0.7000 - 17 O O2 -0.8000 - 18 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG ND1 - CG CD2 - ND1 HD1 - ND1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 NE2 - NE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - HD1 ND1 CG CE1 - CB CG ND1 CD2 - HD2 CD2 NE2 CG - HE1 CE1 ND1 NE2 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 CG ND1 HD1 CE1 HE1 NE2 CD2 HD2 -*---------------------------------------------------------------------- -{CHIE} ! neutral HIS in C-term, proton on NE1 - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0050 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CV -0.0150 - 9 ND1 NB -0.4900 - 10 CE1 CR 0.2950 - 11 HE1 HA 0.1150 - 12 NE2 NA -0.5700 - 13 HE2 H 0.4200 - 14 CD2 CW 0.0150 - 15 HD2 HA 0.1150 - 16 C C 0.7000 - 17 O O2 -0.8000 - 18 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG CD2 - CG ND1 - ND1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 NE2 - NE2 HE2 - NE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - CB CG ND1 CD2 - HE1 CE1 ND1 NE2 - HD2 CD2 NE2 CG - HE2 NE2 CD2 CE1 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 CG ND1 CE1 HE1 NE2 HE2 CD2 HD2 -*---------------------------------------------------------------------- -{CILE} ! Isoleucine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0600 - 6 HB HC 0.0600 - 7 CG2 CT -0.1800 - 8 HG21 HC 0.0600 - 9 HG22 HC 0.0600 - 10 HG23 HC 0.0600 - 11 CG1 CT -0.1200 - 12 HG12 HC 0.0600 - 13 HG13 HC 0.0600 - 14 CD1 CT -0.1800 - 15 HD11 HC 0.0600 - 16 HD12 HC 0.0600 - 17 HD13 HC 0.0600 - 18 C C 0.7000 - 19 O O2 -0.8000 - 20 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB - CB CG2 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - CB CG1 - CG1 HG12 - CG1 HG13 - CG1 CD1 - CD1 HD11 - CD1 HD12 - CD1 HD13 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB - CG2 HG21 HG22 HG23 - CG1 HG12 HG13 - CD1 HD11 HD12 HD13 -*---------------------------------------------------------------------- -{CLEU} ! Leucine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.0600 - 9 HG HC 0.0600 - 10 CD1 CT -0.1800 - 11 HD11 HC 0.0600 - 12 HD12 HC 0.0600 - 13 HD13 HC 0.0600 - 14 CD2 CT -0.1800 - 15 HD21 HC 0.0600 - 16 HD22 HC 0.0600 - 17 HD23 HC 0.0600 - 18 C C 0.7000 - 19 O O2 -0.8000 - 20 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG - CG CD1 - CD1 HD11 - CD1 HD12 - CD1 HD13 - CG CD2 - CD2 HD21 - CD2 HD22 - CD2 HD23 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG - CD1 HD11 HD12 HD13 - CD2 HD21 HD22 HD23 -*---------------------------------------------------------------------- -{CLYP} !Lysine +1 charge in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.1200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD CT -0.1200 - 12 HD2 HC 0.0600 - 13 HD3 HC 0.0600 - 14 CE CT 0.1900 - 15 HE2 HC 0.0600 - 16 HE3 HC 0.0600 - 17 NZ N3 -0.3000 - 18 HZ1 H3 0.3300 - 19 HZ2 H3 0.3300 - 20 HZ3 H3 0.3300 - 21 C C 0.7000 - 22 O O2 -0.8000 - 23 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD CE - CE HE2 - CE HE3 - CE NZ - NZ HZ1 - NZ HZ2 - NZ HZ3 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ1 HZ2 HZ3 -*---------------------------------------------------------------------- -{CLY+} !Lysine +1 charge in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.1200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD CT -0.1200 - 12 HD2 HC 0.0600 - 13 HD3 HC 0.0600 - 14 CE CT 0.1900 - 15 HE2 HC 0.0600 - 16 HE3 HC 0.0600 - 17 NZ N3 -0.3000 - 18 HZ1 H3 0.3300 - 19 HZ2 H3 0.3300 - 20 HZ3 H3 0.3300 - 21 C C 0.7000 - 22 O O2 -0.8000 - 23 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD CE - CE HE2 - CE HE3 - CE NZ - NZ HZ1 - NZ HZ2 - NZ HZ3 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ1 HZ2 HZ3 -*---------------------------------------------------------------------- -{CLYS} ! Lysine in C-term, neutral - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT -0.1200 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 CD CT -0.1200 - 12 HD2 HC 0.0600 - 13 HD3 HC 0.0600 - 14 CE CT 0.0600 - 15 HE2 HC 0.0600 - 16 HE3 HC 0.0600 - 17 NZ NT -0.9000 - 18 HZ1 H 0.3600 - 19 HZ2 H 0.3600 - 20 C C 0.7000 - 21 O O2 -0.8000 - 22 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CD - CD HD2 - CD HD3 - CD CE - CE HE2 - CE HE3 - CE NZ - NZ HZ1 - NZ HZ2 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ1 HZ2 -*---------------------------------------------------------------------- -{CMET} !Methionine in C-term - [info] - SYBYLtype GROUP - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CT 0.0975 - 9 HG2 HC 0.0600 - 10 HG3 HC 0.0600 - 11 SD S -0.4350 - 12 CE CT 0.0375 - 13 HE1 HC 0.0600 - 14 HE2 HC 0.0600 - 15 HE3 HC 0.0600 - 16 C C 0.7000 - 17 O O2 -0.8000 - 18 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG HG2 - CG HG3 - CG SD - SD CE - CE HE1 - CE HE2 - CE HE3 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 SD CE HE1 HE2 HE3 -*---------------------------------------------------------------------- -{CPHE} !Phenylalanine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0050 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CA -0.1150 - 9 CD1 CA -0.1150 - 10 HD1 HA 0.1150 - 11 CE1 CA -0.1150 - 12 HE1 HA 0.1150 - 13 CZ CA -0.1150 - 14 HZ HA 0.1150 - 15 CE2 CA -0.1150 - 16 HE2 HA 0.1150 - 17 CD2 CA -0.1150 - 18 HD2 HA 0.1150 - 19 C C 0.7000 - 20 O O2 -0.8000 - 21 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG CD1 - CG CD2 - CD1 HD1 - CD1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 CZ - CZ HZ - CZ CE2 - CE2 HE2 - CE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CE1 CG - HE1 CE1 CZ CD1 - HZ CZ CE2 CE1 - HE2 CE2 CD2 CZ - HD2 CD2 CG CE2 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 CG - CD1 HD1 - CE1 HE1 - CZ HZ - CE2 HE2 - CD2 HD2 -*---------------------------------------------------------------------- -{CPRO} !Proline in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.1400 - 2 CD CP1 -0.0500 - 3 HD2 HC 0.0600 - 4 HD3 HC 0.0600 - 5 CG CT -0.1200 - 6 HG2 HC 0.0600 - 7 HG3 HC 0.0600 - 8 CB CT -0.1200 - 9 HB2 HC 0.0600 - 10 HB3 HC 0.0600 - 11 CA CT 0.0100 - 12 HA HC 0.0600 - 13 C C 0.6000 - 14 O O2 -0.8000 - 15 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N CD - CD HD2 - CD HD3 - CD CG - CG HG2 - CG HG3 - CG CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CA - N CA - CA HA - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - -C N CA CD - [charge_groups] - N CA HA C O OXT CD HD2 HD3 - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 -*---------------------------------------------------------------------- -{CSER} !Serine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT 0.1450 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 OG OH -0.6830 - 9 HG HO 0.4180 - 10 C C 0.7000 - 11 O O2 -0.8000 - 12 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB OG - OG HG - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 OG HG -*---------------------------------------------------------------------- -{CTHR} !Threonine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT 0.2050 - 6 HB HC 0.0600 - 7 CG2 CT -0.1800 - 8 HG21 HC 0.0600 - 9 HG22 HC 0.0600 - 10 HG23 HC 0.0600 - 11 OG1 OH -0.6830 - 12 HG1 HO 0.4180 - 13 C C 0.7000 - 14 O O2 -0.8000 - 15 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB - CB CG2 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - CB OG1 - OG1 HG1 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB OG1 HG1 - 7 8 9 10 !CG2 HG21 HG22 HG22 -*---------------------------------------------------------------------- -{CTRP} !Tryptophane in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.1200 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG Cstar 0.0750 - 9 CD1 CW -0.1150 - 10 HD1 HA 0.1150 - 11 NE1 NA -0.5700 - 12 HE1 H 0.4200 - 13 CE2 CN 0.1300 - 14 CZ2 CA -0.1150 - 15 HZ2 HA 0.1150 - 16 CH2 CA -0.1150 - 17 HH2 HA 0.1150 - 18 CZ3 CA -0.1150 - 19 HZ3 HA 0.1150 - 20 CE3 CA -0.1150 - 21 HE3 HA 0.1150 - 22 CD2 CB -0.0550 - 23 C C 0.7000 - 24 O O2 -0.8000 - 25 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG CD1 - CD1 HD1 - CD1 NE1 - NE1 HE1 - NE1 CE2 - CE2 CZ2 - CZ2 HZ2 - CZ2 CH2 - CH2 HH2 - CH2 CZ3 - CZ3 HZ3 - CZ3 CE3 - CE3 HE3 - CE3 CD2 - CA C - C O - C OXT - CG CD2 - CE2 CD2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CG NE1 - HE1 NE1 CD1 CE2 - HZ2 CZ2 CE2 CH2 - HH2 CH2 CE2 CZ3 - HZ3 CZ3 CH2 CE3 - HE3 CE3 CZ3 CD2 - CE2 CD2 CG CE3 - CZ2 CE2 CD2 NE1 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG CD2 CD1 HD1 NE1 HE1 CE2 - CZ2 HZ2 - CH2 HH2 - CZ3 HZ3 - CE3 HE3 -*---------------------------------------------------------------------- -{CTYR} !Tyrosine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0050 - 6 HB2 HC 0.0600 - 7 HB3 HC 0.0600 - 8 CG CA -0.1150 - 9 CD1 CA -0.1150 - 10 HD1 HA 0.1150 - 11 CE1 CA -0.1150 - 12 HE1 HA 0.1150 - 13 CZ CA 0.1500 - 14 OH OTY -0.5850 - 15 HH HO 0.4350 - 16 CE2 CA -0.1150 - 17 HE2 HA 0.1150 - 18 CD2 CA -0.1150 - 19 HD2 HA 0.1150 - 20 C C 0.7000 - 21 O O2 -0.8000 - 22 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB2 - CB HB3 - CB CG - CG CD2 - CG CD1 - CD1 HD1 - CD1 CE1 - CE1 HE1 - CE1 CZ - CZ OH - OH HH - CZ CE2 - CE2 HE2 - CE2 CD2 - CD2 HD2 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CE1 CG - HE1 CE1 CZ CD1 - OH CZ CE2 CE1 - HE2 CE2 CD2 CZ - HD2 CD2 CG CE2 - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 CG - CD1 HD1 - CE1 HE1 - CZ OH HH - CE2 HE2 - CD2 HD2 -*---------------------------------------------------------------------- -{CVAL} !Valine in C-term - [info] - SYBYLtype RESIDUE - [atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 H H 0.3000 - 3 CA CT 0.0400 - 4 HA HC 0.0600 - 5 CB CT -0.0600 - 6 HB HC 0.0600 - 7 CG1 CT -0.1800 - 8 HG11 HC 0.0600 - 9 HG12 HC 0.0600 - 10 HG13 HC 0.0600 - 11 CG2 CT -0.1800 - 12 HG21 HC 0.0600 - 13 HG22 HC 0.0600 - 14 HG23 HC 0.0600 - 15 C C 0.7000 - 16 O O2 -0.8000 - 17 OXT O2 -0.8000 - [bonds] - N H - N CA - CA HA - CA CB - CB HB - CB CG1 - CG1 HG11 - CG1 HG12 - CG1 HG13 - CB CG2 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - CA C - C O - C OXT - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - CA C O OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB - CG1 HG11 HG12 HG13 - CG2 HG21 HG22 HG23 -*---------------------------------------------------------------------- - -{HOH} !TIP3P water - [info] - solvent 1 - density 0.0335 - [atoms] - 1 O OW -0.8340 - 2 H1 HW 0.4170 - 3 H2 HW 0.4170 - [bonds] - O H1 - O H2 - H1 H2 !for shake - [charge_groups] - O H1 H2 - -*---------------------------------------------------------------------- -{SPC} !SPC water - [info] - solvent 1 - density 0.0335 - [atoms] - 1 O O.spc -0.82 - 2 H1 HW 0.41 - 3 H2 HW 0.41 - [bonds] - O H1 - O H2 - H1 H2 !for shake - [charge_groups] - O H1 H2 - -*---------------------------------------------------------------------- -{K+} !potassium ion - [info] - SYBYLtype GROUP - [atoms] - 1 K K 1.000 -*---------------------------------------------------------------------- -{Na+} !Sodium ion - [info] - SYBYLtype GROUP - [atoms] - 1 Na+ Na+ 1.000 -*---------------------------------------------------------------------- -{Ca2} !Ca2+ - [atoms] -! # name type charge - 1 Ca2 Ca2 2.0000 - [connections] - head Ca2 -*---------------------------------------------------------------------- -{Cl-} !Chlorine ion - [info] - SYBYLtype GROUP - [atoms] - 1 Cl Cl -1.000 - -*---------------------------------------------------------------------- -{ZN2} !Zn - [atoms] -! # name type charge - 1 Zn2 Zn -0.6 - 2 HZN1 HZn 0.65 - 3 HZN2 HZn 0.65 - 4 HZN3 HZn 0.65 - 5 HZN4 HZn 0.65 - [bonds] - HZN1 Zn2 - HZN2 Zn2 - HZN3 Zn2 - HZN4 Zn2 - -*---------------------------------------------------------------------- -{POP} ! POPC - [info] - SYBYLtype RESIDUE !SYBYL substructure type - [atoms] - 1 N4 LNL -0.5000 - 2 P8 LP 1.700 - 3 C12 LC2 0.400 - 4 O7 LOS -0.800 - 5 C13 LH1 0.300 - 6 O11 LOS -0.700 - 7 C32 LC2 0.50 - 8 O9 LOM -0.800 - 9 O10 LOM -0.800 - 10 C5 LH2 0.3000 - 11 C1 LC3 0.4000 - 12 C2 LC3 0.4000 - 13 C3 LC3 0.4000 - 14 C6 LC2 0.4000 - 15 C15 LC 0.7000 - 16 O14 LOS -0.700 - 17 C17 LP2 0.0 - 18 O16 LO -0.700 - 19 C18 LP2 0.0 - 20 C19 LP2 0.0 - 21 C20 LP2 0.0 - 22 C21 LP2 0.0 - 23 C22 LP2 0.0 - 24 C23 LP2 0.0 - 25 C24 LH1 0.0 - 26 C34 LC 0.800 - 27 O33 LOS -0.70 - 28 C36 LP2 0.0 - 29 O35 LO -0.60 - 30 C37 LP2 0.0 - 31 C38 LP2 0.0 - 32 C39 LP2 0.0 - 33 C40 LP2 0.0 - 34 C41 LP2 0.0 - 35 C42 LP2 0.0 - 36 C43 LP2 0.0 - 37 C25 LH1 0.0 - 38 C26 LP2 0.0 - 39 C27 LP2 0.0 - 40 C28 LP2 0.0 - 41 C29 LP2 0.0 - 42 C30 LP2 0.0 - 43 C31 LP2 0.0 - 44 CA1 LP2 0.0 - 45 CA2 LP3 0.0 - 46 C44 LP2 0.0 - 47 C45 LP2 0.0 - 48 C46 LP2 0.0 - 49 C47 LP2 0.0 - 50 C48 LP2 0.0 - 51 C49 LP2 0.0 - 52 C50 LP3 0.0 - - [bonds] !connect i -- j - N4 C1 - N4 C2 - N4 C3 - N4 C5 - C5 C6 - C6 O7 - P8 O7 - P8 O11 - P8 O9 - P8 O10 - C12 O11 - C12 C13 - C13 O14 - C15 O14 - C15 O16 - C15 C17 - C17 C18 - C18 C19 - C19 C20 - C20 C21 - C21 C22 - C22 C23 - C23 C24 - C24 C25 - C25 C26 - C26 C27 - C27 C28 - C28 C29 - C29 C30 - C30 C31 - C31 CA1 - CA1 CA2 - C13 C32 - C32 O33 - C34 O33 - C34 O35 - C34 C36 - C36 C37 - C37 C38 - C38 C39 - C39 C40 - C40 C41 - C41 C42 - C42 C43 - C43 C44 - C44 C45 - C45 C46 - C46 C47 - C47 C48 - C48 C49 - C49 C50 - - [connections] !tail and head connections - - [impropers] - O14 C15 O16 C17 - O33 C34 O35 C36 - O14 C13 C12 C32 - [charge_groups] !charge groups, with switch atom first - C6 N4 C1 C2 C3 C5 P8 O7 O9 O10 O11 - O14 C12 C13 C15 O16 - C17 C18 C19 - C20 C21 - C22 C23 - C24 C25 - C26 C27 - C28 C29 - C30 C31 - CA1 CA2 - O33 C32 C34 O35 - C36 C37 C38 - C39 C40 - C41 C42 - C43 C44 - C45 C46 - C47 C48 - C49 C50 diff --git a/benchmark-data-shevsea/ff/OPLS2005.prm b/benchmark-data-shevsea/ff/OPLS2005.prm deleted file mode 100644 index 8ef607cc..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/ff/OPLS2005.prm +++ /dev/null @@ -1,981 +0,0 @@ -*------------------------------------------------------------- -* -* Q-FF params: -*Translation of OplsAA force field parameters. -*Use CAREFULLY!! -*Only natural amino acid parameters have been adopted. -*------------------------------------------------------------- -[options] force-field options -name Q-OPLSAA -type AMBER -vdw_rule geometric !vdW combination rule -scale_14 0.5 !electrostatic 1-4 scaling factor -switch_atoms on -improper_potential periodic -improper_definition explicit - -[atom_types] atom type definitions -*tac-----------Avdw1---Avdw2---Bvdw1----Avdw3---Bvdw2&3---mass----SYBYL-name-old-comment -H 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.008 ! Peptide -H2 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.008 ! -HA 69.58 69.58 4.91 49.20 3.47 1.008 ! Aromatic -HC 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.008 ! Nonpolar H -HC1 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.008 ! Nonpolar H, GLU - HG1, HG2 -HC2 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.008 ! Nonpolar H, GLN - HG1, HG2 -HO 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.008 ! Ser/Thr/Tyr -HW 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.008 ! TIP3P -HS 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.008 ! CYS -H3 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.008 ! Arg -C 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.01 ! sp2 carbonyl -C2 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.01 ! sp2 carbonyl -C21 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.01 ! sp2 carbonyl, GLN -CA 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.01 ! Aromatic -CAr 1103.59 1103.59 24.67 780.35 17.44 12.01 ! CZ in ARG J Phys Chem B 2004, 108, 16264 -CB 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.01 ! TRP -CN 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.01 -CR 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.01 ! HIS -Cstar 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.01 ! TRP -CT 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.01 ! sp3 nonpolar -CP1 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.01 ! CD PRO -CV 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.01 ! HIS -CW 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.01 ! HIS -CX 1059.13 1059.13 23.67 748.92 16.74 12.01 ! HIS -N 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.01 ! Peptide -NA 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.01 ! HIS -NB 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.01 ! HIS -N2 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.01 ! Arg -!changed N3 aa -N3 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.01 ! LYS -O 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 16.00 ! Peptide carbonyl -OA 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 16.00 ! ASN/GLN -!OH in ASPH/GLUH is different, OH in Tyr is different -OH 760.65 760.65 25.05 537.86 17.71 16.00 ! Ser/Thr -OTY 690.37 690.37 23.86 488.17 16.87 16.00 ! Tyr -OW 762.89 762.89 24.39 539.45 17.25 16.00 ! TIP3P -!O2 793.35 793.35 25.01 560.99 17.69 16.00 ! ASP/GLU -O2 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 16.00 ! ASP/GLU -O1 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 16.00 ! ASH -OS 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 16.00 ! -ODE 601.15 601.15 22.27 425.08 15.74 16.00 ! ASPH/GLUH -S 2001.57 2001.57 44.74 1415.32 31.64 32.06 ! Met/CYX -SH 2001.57 2001.57 44.74 1415.32 31.64 32.06 ! CYS -NY 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.01 -NZ 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.01 -NT 1064.97 1064.97 29.63 753.05 20.96 14.01 -CAL 264.10 264.10 18.82 186.75 13.31 40.08 !CA2+ -P 2447.79 2447.79 46.79 1730.85 33.09 30.97 !P -Zn 3518.74 3518.74 59.32 2488.13 41.95 53.37 !Zn2+ -MG2+ 37.00 0.00 8.32 26.16 5.88 24.31 !Mg+2 -NA+ 143.69 0.00 3.89 101.61 2.75 23.000 !Aqvist's cation added by henrik - -!popc -LC 1802.25 1802.25 34.18 1274.38 24.17 12.01 -LC2 2068.38 2068.38 37.70 1462.57 26.66 14.03 -LC3 2936.96 2936.96 47.29 2076.74 33.44 15.04 -LH1 1703.39 1703.39 31.04 1204.48 21.95 13.02 -LH2 2436.09 2436.09 40.91 1722.57 28.93 14.03 -LNL 971.76 971.76 28.31 687.14 20.02 14.01 -LO 616.46 616.46 23.77 435.90 16.81 16.00 -LOM 616.46 616.46 23.77 435.90 16.81 16.00 -LOS 668.18 668.18 24.75 472.47 17.50 16.00 -LP 2447.83 2447.83 46.79 1730.88 33.09 30.97 -LP2 2326.69 2326.69 37.47 1645.22 26.49 14.03 -LP3 2844.35 2844.35 45.80 2011.26 32.39 15.04 - -! Ligand vdW parameters - - -*----------------------------------------------------------------------- -[bonds] bond type definitions -*iaci iacj force.c. dist. SYBYL -*----------------------------------------------------------------------- -CA NT 962.0 1.34 !anilines -OS C2 600.0 1.55 -CT OS 640.0 1.410 -P O2 1050.0 1.480 -P OS 630.0 1.610 -HW OW 1106.0 0.957 -!HW HW 1106.0 1.514 -HW HW 0.0 1.5183 -H N 868.0 1.010 -H NA 868.0 1.010 -H3 N2 868.0 1.010 -H3 N3 868.0 1.010 -Cstar CB 776.0 1.459 -Cstar CT 634.0 1.495 -Cstar CW 1092.0 1.352 -C CT 634.0 1.522 -C2 CT 634.0 1.522 -C21 CT 634.0 1.522 -C N 980.0 1.335 -C O 1140.0 1.229 -C2 N 980.0 1.335 -C21 N 980.0 1.335 !GLN -C2 O 1140.0 1.229 -C2 O1 1140.0 1.229 !ASH -C21 O 1140.0 1.229 !GLN -C OA 1140.0 1.229 !GLN/ASN -C O2 1312.0 1.250 -C2 O2 1312.0 1.250 -C OH 900.0 1.364 -C2 OH 900.0 1.364 -C2 ODE 900.0 1.364 -CA CA 938.0 1.400 -CA CAr 938.0 1.400 -CA CB 938.0 1.404 -CA CT 634.0 1.510 -CA HA 734.0 1.080 -CA N2 962.0 1.340 -CAr N2 962.0 1.340 -CA OH 900.0 1.364 -CA OTY 900.0 1.364 -CN CA 938.0 1.400 -CN CB 894.0 1.419 -CN NA 856.0 1.380 -CR HA 734.0 1.080 -CR NA 954.0 1.343 -CR NB 976.0 1.335 -CT CT 536.0 1.529 -CT N 674.0 1.449 -CT N2 674.0 1.463 -CT N3 734.0 1.471 -CT OH 640.0 1.410 -CT S 454.0 1.810 -CT SH 444.0 1.810 -CP1 CT 536.0 1.529 -CP1 N 674.0 1.449 -CP1 HC 680.0 1.090 -CV CT 634.0 1.504 -CV CW 1040.0 1.370 -CV HA 734.0 1.080 -CV NB 820.0 1.394 -CW CT 634.0 1.504 -CW HA 734.0 1.080 -CW NA 854.0 1.381 -CT CX 634.0 1.504 -CX NA 854.0 1.381 -CX HA 734.0 1.080 -CX CX 1040.0 1.370 -HC CT 680.0 1.090 -HC1 CT 680.0 1.090 ! GLU: HB1 and HB2 -HC2 CT 680.0 1.090 ! GLN: HB1 and HB2 -HO OH 1106.0 0.945 -HO OTY 1106.0 0.945 -HO ODE 1106.0 0.945 -HS SH 548.0 1.336 -S S 332.0 2.038 -NT H 868.0 1.010 -NY H2 868.0 1.010 -NY H 868.0 1.010 -NZ H 868.0 1.010 -CT NY 764.0 1.448 -CA NY 764.0 1.448 -CA NZ 1000.0 1.261 -CAr NY 764.0 1.448 -CAr NZ 1000.0 1.261 -CT NT 764.0 1.448 -CA N3 962.0 1.340 !Aniline -!popc -LNL LC3 895.1 1.47 -LNL LH2 900.1 1.47 -LH2 LC2 800.0 1.53 -LC2 LOS 599.9 1.43 -LP LOS 599.9 1.61 -LP LOM 900.1 1.48 -LC2 LH1 800.0 1.53 -LH1 LOS 599.9 1.435 -LC LOS 900.1 1.36 -LC LO 1200.0 1.23 -LC LP2 800.0 1.53 -LP2 LP2 800.0 1.53 -LP2 LH1 800.0 1.53 -LH1 LH1 1000.0 1.39 -LP2 LP3 800.0 1.53 - -! Ligand bond parameters - -*----------------------------------------------------------------------- -[angles] angle type definitions -* iaci iacj iack forceK angle0 -*----------------------------------------------------------------------- -OS C2 O2 120.000 120.000 0.000 0.000 -OS C2 CT 120.000 120.000 0.000 0.000 -P OS CT 200.000 120.500 0.000 0.000 -OS CT HC 70.000 109.500 0.000 0.000 -CT CT OS 100.000 109.500 0.000 0.000 -CT OS C2 120.000 120.000 0.000 0.000 -O2 P OS 200.000 108.230 0.000 0.000 -O2 P O2 240.000 119.900 0.000 0.000 -OS P OS 90.000 102.600 0.000 0.000 -CA CA N3 140.000 120.100 0.000 0.000 !Aniline -CA N3 H3 70.000 111.000 0.000 0.000 !"" -CA CT N3 120.000 120.000 0.000 0.000 !BENZYLAMINE -CA CAr N2 140.000 120.000 0.000 0.000 !Benzamidine -HW OW HW 200.000 104.520 0.000 0.000 -HW HW OW 0.000 127.740 0.000 0.000 -HC CT OH 70.000 109.500 0.000 0.000 -CT S S 136.000 103.700 0.000 0.000 -C CT N3 160.000 111.200 0.000 0.000 -N2 CA N2 140.000 120.000 0.000 0.000 -N2 CAr N2 140.000 120.000 0.000 0.000 -C CT N 126.000 110.100 0.000 0.000 -C CT CT 126.000 111.100 0.000 0.000 -C2 CT CT 126.000 111.100 0.000 0.000 -C21 CT CT 126.000 111.100 0.000 0.000 -CA CA CA 126.000 120.000 0.000 0.000 -CA CA CAr 126.000 120.000 0.000 0.000 -CA CA CT 140.000 120.000 0.000 0.000 -CA CA HA 70.000 120.000 0.000 0.000 -CA CA OH 140.000 120.000 0.000 0.000 -CA CA OTY 140.000 120.000 0.000 0.000 -CA OH HO 70.000 113.000 0.000 0.000 -CA OTY HO 70.000 113.000 0.000 0.000 -CT C O 160.000 120.400 0.000 0.000 -CT C2 O 160.000 120.400 0.000 0.000 -CT C2 O1 160.000 120.400 0.000 0.000 !ASH -CT C21 O 160.000 120.400 0.000 0.000 !GLN -CT C OA 160.000 120.400 0.000 0.000 !GLN/ASN -CT C O2 140.000 117.000 0.000 0.000 -CT C2 O2 140.000 117.000 0.000 0.000 -CT C N 140.000 116.600 0.000 0.000 -CT C2 N 140.000 116.600 0.000 0.000 -CT C21 N 140.000 116.600 0.000 0.000 !GLN -O2 C O2 160.000 126.000 0.000 0.000 -O2 C2 O2 160.000 126.000 0.000 0.000 -N C O 160.000 122.900 0.000 0.000 -N C2 O 160.000 122.900 0.000 0.000 -N C21 O 160.000 122.900 0.000 0.000 -N C OA 160.000 122.900 0.000 0.000 !GLN/ASN -CA CT CT 126.000 114.000 0.000 0.000 -CT CT CT 116.700 112.700 0.000 0.000 -CT CT CW 126.000 114.000 0.000 0.000 -CT CT CV 126.000 114.000 0.000 0.000 -CT CT N 160.000 109.700 0.000 0.000 -CT CT N2 160.000 111.200 0.000 0.000 -CT CT N3 160.000 111.200 0.000 0.000 -CT CT OH 100.000 109.500 0.000 0.000 -CT CT Cstar 126.000 115.600 0.000 0.000 -HC CT Cstar 70.000 109.500 0.000 0.000 -CT Cstar CW 140.000 125.000 0.000 0.000 -CB Cstar CT 140.000 128.600 0.000 0.000 -CA CN NA 140.000 132.800 0.000 0.000 -CB CN NA 140.000 104.400 0.000 0.000 -Cstar CW NA 140.000 108.700 0.000 0.000 -Cstar CW HA 70.000 120.000 0.000 0.000 -CN NA CW 140.000 111.600 0.000 0.000 -H NA CN 70.000 123.100 0.000 0.000 -CB Cstar CW 170.000 106.400 0.000 0.000 -HA CA CN 70.000 120.000 0.000 0.000 -CA CA CN 170.000 120.000 0.000 0.000 -CA CN CB 170.000 122.700 0.000 0.000 -CA CA CB 126.000 120.000 0.000 0.000 -HA CA CB 70.000 120.000 0.000 0.000 -CA CB Cstar 126.000 134.900 0.000 0.000 -CA CB Cstar 170.000 134.900 0.000 0.000 -CA CB CN 170.000 116.200 0.000 0.000 -CN CB Cstar 170.000 108.800 0.000 0.000 -CT CT S 100.000 114.700 0.000 0.000 -CT CT SH 100.000 108.600 0.000 0.000 -HC CT CA 70.000 109.500 0.000 0.000 -HC CT CV 70.000 109.500 0.000 0.000 -N3 CT HC 70.000 109.500 0.000 0.000 -HA CR NA 70.000 120.000 0.000 0.000 -HA CR NB 70.000 120.000 0.000 0.000 -NA CR NB 140.000 120.000 0.000 0.000 -HA CV NB 70.000 120.000 0.000 0.000 !HIS Amber -NA CR NA 140.000 120.000 0.000 0.000 !HIS Amber -CT CV NB 140.000 124.500 0.000 0.000 !HIS Amber -CT CV CW 140.000 130.700 0.000 0.000 !HIS Amber -CW CV NB 140.000 111.000 0.000 0.000 !HIS Amber -HA CV CW 70.000 128.200 0.000 0.000 !HIE Amber (OPLS2002) -CT CW NA 140.000 121.600 0.000 0.000 -CT CW CV 140.000 130.700 0.000 0.000 -CV CW NA 140.000 106.300 0.000 0.000 !HIS Amber -HA CW CV 70.000 130.700 0.000 0.000 !HIS Amber -HA CW NA 70.000 121.600 0.000 0.000 !HIS Amber -CT N CT 100.000 118.000 0.000 0.000 -H N CT 76.000 118.400 0.000 0.000 -H N C 70.000 119.800 0.000 0.000 -H N C2 70.000 119.800 0.000 0.000 -H N C21 70.000 119.800 0.000 0.000 ! GLN -H N H 70.000 120.000 0.000 0.000 -H NA CR 70.000 120.000 0.000 0.000 -H NA CW 70.000 120.000 0.000 0.000 -CR NA CW 140.000 109.800 0.000 0.000 !HIS Amber -CR NB CV 140.000 110.000 0.000 0.000 !HIS Amber -H3 N3 CT 70.000 109.500 0.000 0.000 -H3 N3 H3 70.000 109.500 0.000 0.000 -HC CT CT 75.000 110.700 0.000 0.000 -HC1 CT CT 75.000 110.700 0.000 0.000 ! GLU: HB1 HB2 -HC2 CT CT 75.000 110.700 0.000 0.000 ! GLN: HB1 HB2 -HC CT C 70.000 109.500 0.000 0.000 -HC CT C2 70.000 109.500 0.000 0.000 ! GLN -HC CT C21 70.000 109.500 0.000 0.000 ! GLN -HC CT HC 66.000 107.800 0.000 0.000 -HC1 CT HC1 66.000 107.800 0.000 0.000 ! GLU: HB1 HB2 -HC2 CT HC2 66.000 107.800 0.000 0.000 ! GLN: HB1 HB2 -HC CT N2 70.000 109.500 0.000 0.000 -HC CT S 70.000 109.500 0.000 0.000 -HC CT SH 70.000 109.500 0.000 0.000 -HC CT CW 70.000 109.500 0.000 0.000 -H3 N2 CA 70.000 120.000 0.000 0.000 -H3 N2 CAr 70.000 120.000 0.000 0.000 -H3 N2 CT 70.000 118.400 0.000 0.000 -CA N2 CT 100.000 123.200 0.000 0.000 -CAr N2 CT 100.000 123.200 0.000 0.000 -H3 N2 H3 70.000 120.000 0.000 0.000 -HO OH CT 110.000 108.500 0.000 0.000 -N CT HC 70.000 109.500 0.000 0.000 -HS SH CT 88.000 96.000 0.000 0.000 -CX CT CT 126.000 114.000 0.000 0.000 -CX CT HC 70.000 109.500 0.000 0.000 -CT CX NA 140.000 121.600 0.000 0.000 !HIS Amber -CX NA H 70.000 120.000 0.000 0.000 -CX NA CR 140.000 109.800 0.000 0.000 -HA CX NA 70.000 120.000 0.000 0.000 -CT CX CX 140.000 130.700 0.000 0.000 !HIS Amber -NA CX CX 140.000 106.300 0.000 0.000 !HIS Amber -HA CX CX 70.000 130.700 0.000 0.000 !HIS Amber -CT S CT 124.000 98.900 0.000 0.000 -C N CT 100.000 121.900 0.000 0.000 -CT CT NY 160.000 111.200 0.000 0.000 -HC CT NY 70.000 109.500 0.000 0.000 -H2 CT NY 70.000 109.500 0.000 0.000 -CT NY CA 100.000 120.500 0.000 0.000 -CT NY CAr 100.000 120.500 0.000 0.000 -H NY CA 100.000 112.500 0.000 0.000 -H NY CAr 100.000 112.500 0.000 0.000 -H2 NY CA 100.000 112.500 0.000 0.000 -NY CA NY 140.000 111.800 0.000 0.000 -NY CAr NY 140.000 111.800 0.000 0.000 -CT NY H 70.000 109.500 0.000 0.000 -CT NY H2 70.000 109.500 0.000 0.000 -NY CA NZ 140.000 124.100 0.000 0.000 -NY CAr NZ 140.000 124.100 0.000 0.000 -CA NZ H 70.000 112.500 0.000 0.000 -CAr NZ H 70.000 112.500 0.000 0.000 -H NY H 87.200 106.400 0.000 0.000 -H2 NY H2 87.200 106.400 0.000 0.000 -CT C OH 140.000 117.000 0.000 0.000 -CT C2 OH 140.000 108.000 0.000 0.000 -CT C2 ODE 140.000 117.000 0.000 0.000 -O C OH 160.000 126.000 0.000 0.000 -O C2 OH 160.000 121.000 0.000 0.000 -O1 C2 OH 160.000 121.000 0.000 0.000 ! ASH -O C2 ODE 160.000 126.000 0.000 0.000 -HO OH C 70.000 113.000 0.000 0.000 -HO OH C2 70.000 113.000 0.000 0.000 -HO ODE C2 70.000 113.000 0.000 0.000 -CT CT NT 112.400 109.470 0.000 0.000 -HC CT NT 70.000 109.500 0.000 0.000 -H NT CT 70.000 109.500 0.000 0.000 -H NT H 87.200 106.400 0.000 0.000 -CA CT N 160.0 111.2 0.000 0.000! Amino terminal -CA CT CA 80.0 109.5 0.000 0.000! DIP -CA CA NT 140.0 120.1 0.000 0.000!aniline -CA NT H 70.0 111.0 0.000 0.000! aniline -C N CP1 100.000 121.900 0.000 0.000 -CP1 CT CT 116.700 112.700 0.000 0.000 -CP1 CT HC 75.000 110.700 0.000 0.000 -CP1 N CT 100.000 118.000 0.000 0.000 -CT CP1 HC 75.000 110.700 0.000 0.000 -CT CP1 N 160.000 109.700 0.000 0.000 -HC CP1 HC 66.000 107.800 0.000 0.000 -HC CP1 N 70.000 109.500 0.000 0.000 - -* Added C-ter Leu -C2 CT N 126.000 110.100 0.000 0.000 -!popc -LC3 LNL LC3 80.00 109.500 0.000 0.000 -LC3 LNL LH2 90.01 109.500 0.000 0.000 -LNL LH2 LC2 110.0 109.500 0.000 0.000 -LH2 LC2 LOS 110.0 109.500 0.000 0.000 -LC2 LOS LP 95.00 120.0 0.000 0.000 -LOS LP LOM 95.00 109.6 0.000 0.000 -LOS LP LOS 95.00 103.0 0.000 0.000 -LOS LC2 LH1 110.0 111.0 0.000 0.000 -LC2 LH1 LOS 110.0 109.500 0.000 0.000 -LC2 LH1 LC2 110.0 109.500 0.000 0.000 -LH1 LOS LC 100.0 120.0 0.000 0.000 -LOS LC LO 120.0 124.0 0.000 0.000 -LOS LC LP2 120.0 115.0 0.000 0.000 -LO LC LP2 120.0 121.0 0.000 0.000 -LC LP2 LP2 110.0 111.0 0.000 0.000 -LP2 LP2 LP2 110.0 111.0 0.000 0.000 -LP2 LP2 LH1 110.0 111.0 0.000 0.000 -LP2 LH1 LH1 120.0 120.0 0.000 0.000 -LP2 LP2 LP3 110.0 111.0 0.000 0.000 -LC2 LOS LC 100.0 120.0 0.000 0.000 -LOM LP LOM 140.01 120.0 0.000 0.000 !Hugo - -! Ligand angle parameters - - -*----------------------------------------------------------------------- -[torsions] torsion type definitions -*iaci iacj iack iacl forceK minima phase paths comment -*----------------------------------------------------------------- -OS CT CT N3 0.000 2.000 0.000 1.000 -HC CT OS C2 0.066 3.000 0.000 1.000 -CT OS C2 O2 2.562 2.00 180.000 1.000 -CT OS C2 CT 2.335 -1.00 0.000 1.000 -CT OS C2 CT 2.562 2.00 180.000 1.000 -CT CT OS C2 -0.610 -1.000 0.000 1.000 -CT CT OS C2 -0.063 -2.000 180.000 1.000 -CT CT OS C2 0.211 3.000 0.000 1.000 -P OS CT HC 0.150 3.000 0.000 1.000 -P OS CT CT 0.000 1.000 0.000 1.000 -OS CT CT HC 0.066 3.000 0.000 1.000 -OS P OS CT 0.000 1.000 0.000 1.000 -O2 P OS CT 0.281 3.000 0.000 1.000 -OS CT CT CT -0.277 3.000 0.000 1.000 -OS C2 CT HC 0.066 3.000 0.000 1.000 -OS C2 CT CT -0.277 3.000 0.000 1.000 -OS CT CT OS -0.275 1.000 0.000 1.000 -CA CT N3 H3 1.400 3.000 0.000 1 !BENZYLAMINE -OA C N H 2.450 2.000 180.000 1 -HC CT C2 OH 0.000 1.000 0.000 1 -HC CT C2 ODE 0.000 1.000 0.000 1 -CT CT C2 OH 0.500 -1.000 0.000 1.000 !096 ASH -CT CT C2 OH 0.273 -2.000 180.000 1.000 !096 ASH -CT CT C2 OH 0.225 3.000 0.000 1.000 !096 ASH -CT CT C2 ODE 0.583 2.000 180.000 1 -HC CT CT HC 0.150 3.000 0.000 1.000 !001 -HC1 CT CT HC 0.150 3.000 0.000 1.000 !001 GLU -HC2 CT CT HC 0.150 3.000 0.000 1.000 !001 GLN -C2 CT CT HC 0.150 3.000 0.000 1.000 !002 ASP/ASH/GLH -C2 CT CT HC1 -0.113 3.000 0.000 1.000 !092 GLU -C21 CT CT HC2 -0.050 3.000 0.000 1.000 !070 GLN -HC CP1 CT HC 0.150 3.000 0.000 1.000 !001 -CT CT CT HC 0.150 3.000 0.000 1.000 !002 -CT CT CP1 HC 0.150 3.000 0.000 1.000 !002 -CP1 CT CT HC 0.150 3.000 0.000 1.000 !002 -CT CT CT CT 0.650 -1.000 0.000 1.000 !003 -CT CT CT CT -0.025 -2.000 180.000 1.000 !003 -CT CT CT CT 0.100 3.000 0.000 1.000 !003 -CT CT CT CP1 0.650 -1.000 0.000 1.000 !003 -CT CT CT CP1 -0.025 -2.000 180.000 1.000 !003 -CT CT CT CP1 0.100 3.000 0.000 1.000 !003 -HC CT CT OH 0.234 3.000 0.000 1.000 !005 -HO OH CT HC 0.225 3.000 0.000 1.000 !008 -HO OH CT CT -0.178 -1.000 0.000 1.000 !009 -HO OH CT CT -0.087 -2.000 180.000 1.000 !009 -HO OH CT CT 0.246 3.000 0.000 1.000 !009 -CA CA CT HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !020 -CV CW CT HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !020 -CW CV CT HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !020 -CX CX CT HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !020 -CT CT CA CA 0.000 1.000 0.000 1.000 !021 -CT CT CV CW 0.000 1.000 0.000 1.000 !021 -CT CT CW CV 0.000 1.000 0.000 1.000 !021 -CT CT CX CX 0.000 1.000 0.000 1.000 !021 -N3 CT CA CA 0.000 1.000 0.000 1.000 !021 -CA CT CT HC 0.231 3.000 0.000 1.000 !022 -CV CT CT H 0.231 3.000 0.000 1.000 !022 -CW CT CT H 0.231 3.000 0.000 1.000 !022 -CX CT CT H 0.231 3.000 0.000 1.000 !022 -HC CT CT Cstar 0.231 3.000 0.000 1.000 !022 -HC CT CT CV 0.231 3.000 0.000 1.000 !022 -HC CT CT CW 0.231 3.000 0.000 1.000 !022 -HC CT CT CX 0.231 3.000 0.000 1.000 !022 -CT S S CT -3.707 -2.000 180.000 1.000 !023 -CT S S CT 0.853 3.000 0.000 1.000 !023 -S S CT HC 0.279 3.000 0.000 1.000 !024 -CT CT S S 0.971 -1.000 0.000 1.000 !025 -CT CT S S -0.418 -2.000 180.000 1.000 !025 -CT CT S S 0.468 3.000 0.000 1.000 !025 -HS SH CT HC 0.24 3.000 0.000 1.000 !026 -CT CT SH HS -0.380 -1.000 0.000 1.000 !027 -CT CT SH HS -0.141 -2.000 180.000 1.000 !027 -CT CT SH HS 0.340 3.000 0.000 1.000 !027 -HC CT CT S 0.226 3.000 0.000 1.000 !028 -HC CT CT SH 0.226 3.000 0.000 1.000 !028 -HC CT NT H 0.2 3.000 0.000 1.000 !030 -HC CT CT NT -0.507 -1.000 0.000 1.000 !031 -HC CT CT NT -0.355 -2.000 180.000 1.000 !031 -HC CT CT NT 0.237 3.000 0.000 1.000 !031 -CT CT NT H -0.095 -1.000 0.000 1.000 !032 -CT CT NT H -0.209 -2.000 180.000 1.000 !032 -CT CT NT H 0.209 3.000 0.000 1.000 !032 -H NY CA NY -0.095 -1.000 0.000 1.000 !032 -H NY CA NY -0.209 -2.000 180.000 1.000 !032 -H NY CA NY 0.209 3.000 0.000 1.000 !032 -H NY CAr NY -0.095 -1.000 0.000 1.000 !032 -H NY CAr NY -0.209 -2.000 180.000 1.000 !032 -H NY CAr NY 0.209 3.000 0.000 1.000 !032 -H NY CA NZ -0.095 -1.000 0.000 1.000 !032 -H NY CA NZ -0.209 -2.000 180.000 1.000 !032 -H NY CA NZ 0.209 3.000 0.000 1.000 !032 -H NY CAr NZ -0.095 -1.000 0.000 1.000 !032 -H NY CAr NZ -0.209 -2.000 180.000 1.000 !032 -H NY CAr NZ 0.209 3.000 0.000 1.000 !032 -H NY CT CT -0.095 -1.000 0.000 1.000 !032 -H NY CT CT -0.209 -2.000 180.000 1.000 !032 -H NY CT CT 0.209 3.000 0.000 1.000 !032 -H3 N2 CT CT -0.095 -1.000 0.000 1.000 !032 -H3 N2 CT CT -0.209 -2.000 180.000 1.000 !032 -H3 N2 CT CT 0.209 3.000 0.000 1.000 !032 -H3 N2 CAr CA -0.095 -1.000 0.000 1.000 !032 Benzamidine -H3 N2 CAr CA -0.209 -2.000 180.000 1.000 !032 Benzamidine -H3 N2 CAr CA 0.209 3.000 0.000 1.000 !032 Benzamidine -CT CT CT NT 1.196 -1.000 0.000 1.000 !033 -CT CT CT NT -0.337 -2.000 180.000 1.000 !033 -CT CT CT NT 0.275 3.000 0.000 1.000 !033 -CA CA OH HO 0.841 2.000 180.000 1.000 !034 -CA CA OTY HO 0.841 2.000 180.000 1.000 !034 -C CT CT N 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -C CT CT N -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -C CT CT N 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -C2 CT CT N 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -C2 CT CT N -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -C2 CT CT N 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -CA CT CT N 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -CA CT CT N -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -CA CT CT N 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -CT CT CT N 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -CT CT CT N -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -CT CT CT N 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -CT CT CP1 N 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -CT CT CP1 N -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -CT CT CP1 N 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -CV CT CT N 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -CV CT CT N -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -CV CT CT N 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -CW CT CT N 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -CW CT CT N -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -CW CT CT N 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -CX CT CT N 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -CX CT CT N -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -CX CT CT N 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -N CT CT Cstar 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -N CT CT Cstar -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -N CT CT Cstar 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -N3 CT CT C 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -N3 CT CT C -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -N3 CT CT C 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -N3 CT CT CA 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -N3 CT CT CA -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -N3 CT CT CA 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -N3 CT CT CV 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -N3 CT CT CV -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -N3 CT CT CV 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -N3 CT CT CW 0.423 -1.000 0.000 1.000 !035 -N3 CT CT CW -0.481 -2.000 180.000 1.000 !035 -N3 CT CT CW 0.357 3.000 0.000 1.000 !035 -C CT N C -1.183 -1.000 0.000 1.000 !036 -C CT N C 0.456 -2.000 180.000 1.000 !036 -C CT N C -0.425 3.000 0.000 1.000 !036 -N C CT N 0.908 -1.000 0.000 1.000 !037 -N C CT N 0.611 -2.000 180.000 1.000 !037 -N C CT N 0.791 3.000 0.000 1.000 !037 -N3 CT C N 0.908 -1.000 0.000 1.000 !037 -N3 CT C N 0.611 -2.000 180.000 1.000 !037 -N3 CT C N 0.791 3.000 0.000 1.000 !037 -CT CT N C 0.231 2.000 180.000 1.000 !038 -CT CP1 N C 0.231 2.000 180.000 1.000 !038 -CT CT C N 0.587 -1.000 0.000 1.000 !039 -CT CT C N 0.095 -2.000 180.000 1.000 !039 -CT CT C N -0.6 3.000 0.000 1.000 !039 -HC CT N C 0.000 1.000 0.000 1.000 !040 -HC CP1 N C 0.000 1.000 0.000 1.000 !040 -HC CT C N 0.000 1.000 0.000 1.000 !041 -H N CT C 0.000 1.000 0.000 1.000 !042 -H N CT CT 0.000 1.000 0.000 1.000 !042 -H N CT HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !042 -CT CT C O 0.000 1.000 0.000 1.000 !043 -HC CT C O 0.000 1.000 0.000 1.000 !043 -N CT C O 0.000 1.000 0.000 1.000 !043 -N3 CT C O 0.000 1.000 0.000 1.000 !043 -CT C2 N H 2.45 2.000 180.000 1.000 !044 -CT C21 N H 2.45 2.000 180.000 1.000 !044 GLN -CT C N H 2.45 2.000 180.000 1.000 !044 -CT C N CT 1.15 -1.000 0.000 1.000 !045 -CT C N CT 3.045 2.000 180.000 1.000 !045 -CT C N CP1 3.045 2.000 180.000 1.000 !045 -H N C2 O 2.45 2.000 180.000 1.000 !046 -H N C21 O 2.45 2.000 180.000 1.000 !046 GLN -H N C O 2.45 2.000 180.000 1.000 !046 -CT N C O 3.045 2.000 180.000 1.000 !047 -CP1 N C O 3.045 2.000 180.000 1.000 !047 -CT N CT HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !048 -CT N CP1 HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !048 -CP1 N CT HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !048 -CT S CT HC 0.324 3.000 0.000 1.000 !051 -CT CT CT S 1.310 -1.000 0.000 1.000 !052 -CT CT CT S -0.31 -2.000 180.000 1.000 !052 -CT CT CT S 0.129 3.000 0.000 1.000 !052 -CT S CT CT 0.463 -1.000 0.000 1.000 !053 -CT S CT CT -0.288 -2.000 180.000 1.000 !053 -CT S CT CT 0.339 3.000 0.000 1.000 !053 -N2 CA N2 H3 1.95 2.000 180.000 1.000 !054 -N2 CAr N2 H3 1.95 2.000 180.000 1.000 !054 -NY CA NZ H 1.95 2.000 180.000 1.000 !054 -NY CAr NZ H 1.95 2.000 180.000 1.000 !054 -N2 CA N2 CT 3.968 2.000 180.000 1.000 !055 -N2 CAr N2 CT 3.968 2.000 180.000 1.000 !055 -CA N2 CT HC 0.089 3.000 0.000 1.000 !056 -CAr N2 CT HC 0.089 3.000 0.000 1.000 !056 -CA NY CT HC 0.089 3.000 0.000 1.000 !056 -CAr NY CT HC 0.089 3.000 0.000 1.000 !056 -H NY CT HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !057 -H3 N2 CT HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !057 -CA N2 CT CT 0.915 -1.000 0.000 1.000 !058 -CA N2 CT CT 0.122 -2.000 180.000 1.000 !058 -CA N2 CT CT -0.249 3.000 0.000 1.000 !058 -CAr N2 CT CT 0.915 -1.000 0.000 1.000 !058 -CAr N2 CT CT 0.122 -2.000 180.000 1.000 !058 -CAr N2 CT CT -0.249 3.000 0.000 1.000 !058 -CA NY CT CT 0.915 -1.000 0.000 1.000 !058 -CA NY CT CT 0.122 -2.000 180.000 1.000 !058 -CA NY CT CT -0.249 3.000 0.000 1.000 !058 -CAr NY CT CT 0.915 -1.000 0.000 1.000 !058 -CAr NY CT CT 0.122 -2.000 180.000 1.000 !058 -CAr NY CT CT -0.249 3.000 0.000 1.000 !058 -N2 CT CT HC -0.291 3.000 0.000 1.000 !059 -NY CT CT HC -0.291 3.000 0.000 1.000 !059 -N CT CT HC 0.232 3.000 0.000 1.000 !064 -N CT CT HC1 0.232 3.000 0.000 1.000 !064 GLU -N CT CT HC2 0.232 3.000 0.000 1.000 !064 GLN -N CP1 CT HC 0.232 3.000 0.000 1.000 !064 -HC CT C2 N 0.000 1.000 0.000 1.000 !066 -HC CT C21 N 0.000 1.000 0.000 1.000 !066 GLN -HC CT C2 O 0.000 2.000 180.000 1.000 !067 ASH -HC CT C2 O1 0.000 2.000 180.000 1.000 !067 -HC CT C21 O 0.000 2.000 180.000 1.000 !067 GLN -CT CT C2 N 1.625 -1.000 0.000 1.000 !068 -CT CT C2 N -0.201 -2.000 180.000 1.000 !068 -CT CT C2 N -0.068 3.000 0.000 1.000 !068 -CT CT C21 N 1.625 -1.000 0.000 1.000 !068 GLN -CT CT C21 N -0.201 -2.000 180.000 1.000 !068 GLN -CT CT C21 N -0.068 3.000 0.000 1.000 !068 GLN -!CT CT C O 0.583 2.000 180.000 1.000 !069 -N CT CT OH 3.14 -1.000 0.000 1.000 !072 -N CT CT OH -0.734 -2.000 180.000 1.000 !072 -N CT CT OH 1.015 3.000 0.000 1.000 !072 -N3 CT CT OH 3.14 -1.000 0.000 1.000 !072 -N3 CT CT OH -0.734 -2.000 180.000 1.000 !072 -N3 CT CT OH 1.015 3.000 0.000 1.000 !072 -C CT CT OH -3.09 1.000 0.000 1.000 !074 -N CT CT S 0.015 -3 0.000 1.000 !076 -N CT CT S 0.043 -2 180.000 1.000 !076 -N CT CT S 0.714 1 0.000 1.000 !076 -N CT CT SH 0.015 -3 0.000 1.000 !076 -N CT CT SH 0.043 -2 180.000 1.000 !076 -N CT CT SH 0.714 1 0.000 1.000 !076 -N3 CT CT S 0.015 -3 0.000 1.000 !076 -N3 CT CT S 0.043 -2 180.000 1.000 !076 -N3 CT CT S 0.714 1 0.000 1.000 !076 -N3 CT CT SH 0.015 -3 0.000 1.000 !076 -N3 CT CT SH 0.043 -2 180.000 1.000 !076 -N3 CT CT SH 0.714 1 0.000 1.000 !076 -C CT CT S -2.172 -1.000 0.000 1.000 !078 -C CT CT S -0.857 -2.000 180.000 1.000 !078 -C CT CT SH -2.172 -1.000 0.000 1.000 !078 -C CT CT SH -0.857 -2.000 180.000 1.000 !078 -HC CT Cstar CW -0.24 3.000 0.000 1.000 !080 -HC CT Cstar CB 0.000 1.000 0.000 1.000 !081 -CT CT Cstar CW -0.357 1.000 0.000 1.000 !082 -CT CT Cstar CB 0.000 1.000 0.000 1.000 !083 -NA CW CT HC 0.210 3.000 0.000 1.000 !084 -NA CX CT HC 0.210 3.000 0.000 1.000 !084 -NB CV CT HC 0.210 3.000 0.000 1.000 !084 -CT CT CA NA 1.183 -1.000 0.000 1.000 !085 -CT CT CA NA -0.131 -2.000 180.000 1.000 !085 -CT CT CA NA 0.253 3.000 0.000 1.000 !085 -CT CT CV NB 1.183 -1.000 0.000 1.000 !085 -CT CT CV NB -0.131 -2.000 180.000 1.000 !085 -CT CT CV NB 0.253 3.000 0.000 1.000 !085 -CT CT CW NA 1.183 -1.000 0.000 1.000 !085 -CT CT CW NA -0.131 -2.000 180.000 1.000 !085 -CT CT CW NA 0.253 3.000 0.000 1.000 !085 -CT CT CX NA 1.183 -1.000 0.000 1.000 !085 -CT CT CX NA -0.131 -2.000 180.000 1.000 !085 -CT CT CX NA 0.253 3.000 0.000 1.000 !085 -H3 N3 CT HC 0.131 3.000 0.000 1.000 !086 -H3 N3 CT C 0.174 3.000 0.000 1.000 !087 -H3 N3 CT CT 0.174 3.000 0.000 1.000 !087 -N3 CT CT HC 0.192 3.000 0.000 1.000 !088 -N2 CT CT CT 1.366 -1.000 0.000 1.000 !089 -N2 CT CT CT -0.115 -2.000 180.000 1.000 !089 -N2 CT CT CT 0.243 3.000 0.000 1.000 !089 -N3 CT CT CT 1.366 -1.000 0.000 1.000 !089 -N3 CT CT CT -0.115 -2.000 180.000 1.000 !089 -N3 CT CT CT 0.243 3.000 0.000 1.000 !089 -NY CT CT CT 1.366 -1.000 0.000 1.000 !089 -NY CT CT CT -0.115 -2.000 180.000 1.000 !089 -NY CT CT CT 0.243 3.000 0.000 1.000 !089 -HC CT C O2 0.000 1.000 0.000 1.000 !090 -N CT C O2 0.410 2.000 180.000 1.000 !091 -CT CT C O2 0.410 2.000 180.000 1.000 !091 -O2 C2 CT HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !094 -O2 C CT HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !094 -OH C CT HC 0.000 1.000 0.000 1.000 !094 -CT CT C2 O2 0.273 2.000 180.000 1.000 !095 ASP/GLU -CT CT C2 O1 0.273 2.000 180.000 1.000 !095 ASH -CT CT C2 O 0.583 2.000 180.000 1.000 !069 ASN -CT CT C21 O 0.583 2.000 180.000 1.000 !069 GLN -OH C CT CT 0.5 -1.000 0.000 1.000 !096 -OH C CT CT 0.273 -2.000 180.000 1.000 !096 -OH C CT CT 0.225 3.000 0.000 1.000 !096 -O C2 OH HO 2.45 2.000 180.000 1.000 !102 -O1 C2 OH HO 2.75 2.000 180.000 1.000 !102 ASH -O C2 ODE HO 2.45 2.000 180.000 1.000 !102 -CT C2 OH HO 0.75 -1.000 0.000 1.000 !103 ASH -CT C2 OH HO 2.75 2.000 180.000 1.000 !103 ASH -CT C2 ODE HO 1.5 -1.000 0.000 1.000 !103 -CT C2 ODE HO 2.45 2.000 180.000 1.000 !103 -C CT N CT -0.869 -1.000 0.000 1.000 !107 -C CT N CT 0.626 -2.000 180.000 1.000 !107 -C CT N CT -1.751 3.000 0.000 1.000 !107 -C CT N CP1 -0.869 -1.000 0.000 1.000 !107 -C CT N CP1 0.626 -2.000 180.000 1.000 !107 -C CT N CP1 -1.751 3.000 0.000 1.000 !107 -CT CT N CP1 2.377 -1.000 0.000 1.000 !108 -CT CT N CP1 -0.367 2.000 180.000 1.000 !108 -CT CT N CT 1.430 -1.000 0.000 1.000 !109 -CT CT N CT 1.029 -2.000 180.000 1.000 !109 -CT CT N CT -5.633 3.000 0.000 1.000 !109 -CT CP1 N CT 1.430 -1.000 0.000 1.000 !109 -CT CP1 N CT 1.029 -2.000 180.000 1.000 !109 -CT CP1 N CT -5.633 3.000 0.000 1.000 !109 -C CT CT HC -0.038 3.000 0.000 1.000 !115 -C CT CT HC1 -0.038 3.000 0.000 1.000 !115 GLU -C CT CT HC2 -0.038 3.000 0.000 1.000 !115 GLN -C CT CT C2 -0.849 -1.000 0.000 1.000 !116 -C CT CT C2 -0.228 -2.000 180.000 1.000 !116 -C CT CT C2 0.293 3.000 0.000 1.000 !116 -C CT CT CA -0.849 -1.000 0.000 1.000 !116 -C CT CT CA -0.228 -2.000 180.000 1.000 !116 -C CT CT CA 0.293 3.000 0.000 1.000 !116 -C2 CT CT CT -1.593 -1.000 0.000 1.000 !093 -C2 CT CT CT -0.413 -2.000 180.000 1.000 !093 -C2 CT CT CT 0.247 3.000 0.000 1.000 !093 -C21 CT CT CT -1.030 -1.000 0.000 1.000 !093 GLN -C21 CT CT CT -0.157 -2.000 180.000 1.000 !093 GLN -C21 CT CT CT 0.158 3.000 0.000 1.000 !093 GLN -C CT CT CT -0.849 -1.000 0.000 1.000 !116 -C CT CT CT -0.228 -2.000 180.000 1.000 !116 -C CT CT CT 0.293 3.000 0.000 1.000 !116 -C CT CT Cstar -0.849 -1.000 0.000 1.000 !116 -C CT CT Cstar -0.228 -2.000 180.000 1.000 !116 -C CT CT Cstar 0.293 3.000 0.000 1.000 !116 -C CT CT CV -0.849 -1.000 0.000 1.000 !116 -C CT CT CV -0.228 -2.000 180.000 1.000 !116 -C CT CT CV 0.293 3.000 0.000 1.000 !116 -C CT CT CW -0.849 -1.000 0.000 1.000 !116 -C CT CT CW -0.228 -2.000 180.000 1.000 !116 -C CT CT CW 0.293 3.000 0.000 1.000 !116 -C CT CT CX -0.849 -1.000 0.000 1.000 !116 -C CT CT CX -0.228 -2.000 180.000 1.000 !116 -C CT CT CX 0.293 3.000 0.000 1.000 !116 -CA CA CA CA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -CA CA CA CAr 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -CA CA CA CB 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -CA CA CA HA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -CAr CA CA HA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -CA CA CA OH 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -CA CA CA OTY 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -CB CN CA CA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -CB CN CA HA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -CN CA CA CA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -CN CA CA HA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -CT CA CA CA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -HA CA CA CB 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -HA CA CA CT 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -HA CA CA HA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -HA CA CA OH 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -HA CA CA OTY 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -NA CN CA CA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -NA CN CA HA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 -NT CA CA CA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 aniline -NT CA CA HA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 aniline -CR NA CW CT 1.4 2.000 180.000 1.000 !166 -CR NA CW CV 1.4 2.000 180.000 1.000 !166 -CT CX NA CR 1.4 2.000 180.000 1.000 !166 -CT CX NA H 1.4 2.000 180.000 1.000 !166 -CX CX NA CR 1.4 2.000 180.000 1.000 !166 -CX CX NA H 1.4 2.000 180.000 1.000 !166 -H NA CW CT 1.4 2.000 180.000 1.000 !166 -H NA CW CV 1.4 2.000 180.000 1.000 !166 -CW NA CR HA 2.325 2.000 180.000 1.000 !167 -CW NA CR NB 2.325 2.000 180.000 1.000 !167 -CX NA CR HA 2.325 2.000 180.000 1.000 !167 -CX NA CR NA 2.325 2.000 180.000 1.000 !167 -H NA CR HA 2.325 2.000 180.000 1.000 !167 -H NA CR HC 2.325 2.000 180.000 1.000 !167 -H NA CR NA 2.325 2.000 180.000 1.000 !167 -H NA CR NB 2.325 2.000 180.000 1.000 !167 -HA CR NB CV 5 2.000 180.000 1.000 !168 -NA CR NB CV 5 2.000 180.000 1.000 !168 -CR NB CV CT 2.4 2.000 180.000 1.000 !169 -CR NB CV CW 2.4 2.000 180.000 1.000 !169 -CR NB CV HA 2.4 2.000 180.000 1.000 !169 -CT CW CV HA 5.375 2.000 180.000 1.000 !170 -CT CW CV NB 5.375 2.000 180.000 1.000 !170 -CT CX CX HA 5.375 2.000 180.000 1.000 !170 -CT CX CX NA 5.375 2.000 180.000 1.000 !170 -HA CW CV CT 5.375 2.000 180.000 1.000 !170 -HA CW CV NB 5.375 2.000 180.000 1.000 !170 -NA CW CV CT 5.375 2.000 180.000 1.000 !170 -NA CW CV HA 5.375 2.000 180.000 1.000 !170 -NA CW CV NB 5.375 2.000 180.000 1.000 !170 -NA CX CX HA 5.375 2.000 180.000 1.000 !170 -NA CX CX NA 5.375 2.000 180.000 1.000 !170 -CR NA CW HA 1.6 2.000 180.000 1.000 !171 -CR NA CX HA 1.6 2.000 180.000 1.000 !171 -H NA CW HA 1.6 2.000 180.000 1.000 !171 -H NA CX HA 1.6 2.000 180.000 1.000 !171 -CB Cstar CW HA 6.525 2.000 180.000 1.000 !172 -CB Cstar CW NA 6.525 2.000 180.000 1.000 !172 -CT Cstar CW HA 6.525 2.000 180.000 1.000 !172 -CT Cstar CW NA 6.525 2.000 180.000 1.000 !172 -CT Cstar CB CA 1.675 2.000 180.000 1.000 !173 -CT Cstar CB CN 1.675 2.000 180.000 1.000 !173 -CW Cstar CB CA 1.675 2.000 180.000 1.000 !173 -CW Cstar CB CN 1.675 2.000 180.000 1.000 !173 -CA CA CB CN 3.5 2.000 180.000 1.000 !174 -CA CA CB Cstar 3.5 2.000 180.000 1.000 !174 -HA CA CB CN 3.5 2.000 180.000 1.000 !174 -HA CA CB Cstar 3.5 2.000 180.000 1.000 !174 -CA CB CN CA 3 2.000 180.000 1.000 !175 -CA CB CN NA 3 2.000 180.000 1.000 !175 -Cstar CB CN CA 3 2.000 180.000 1.000 !175 -Cstar CB CN NA 3 2.000 180.000 1.000 !175 -CW NA CN CA 1.525 2.000 180.000 1.000 !176 -CW NA CN CB 1.525 2.000 180.000 1.000 !176 -H NA CN CA 1.525 2.000 180.000 1.000 !176 -H NA CN CB 1.525 2.000 180.000 1.000 !176 -Cstar CW NA CN 1.5 2.000 180.000 1.000 !177 -Cstar CW NA H 1.5 2.000 180.000 1.000 !177 -HA CW NA CN 1.5 2.000 180.000 1.000 !177 -CT NY CA NY 1.826 2.000 180.000 1.000 !191 -CT NY CAr NY 1.826 2.000 180.000 1.000 !191 -CT NY CA NZ 1.826 2.000 180.000 1.000 !191 -CT NY CAr NZ 1.826 2.000 180.000 1.000 !191 -CA CA CAr N2 0.839 2.000 180.000 1.000 !190 Benzamidine -CA CA CA N3 3.625 2.000 180.000 1.000 !Aniline charged -CA CA N3 H3 1.050 2.000 180.000 1.000 !Aniline charged -N3 CA CA HA 3.625 2.000 180.000 1.000 !165 Aniline -H N CT CA 0.000 1.000 0.000 1.000 !DIP -N CT CA CA 0.000 1.000 0.000 1.000 !" -CA CT CA CA 0.000 1.000 0.000 1.000 !" -C N CT CA 0.000 1.000 0.000 1.000 !" -CA CA NT H 1.015 2.000 180.000 1.000 ! Aniline -*adopted from biovitrum -C2 CT CT N3 0.356 -3 0.000 1 !0 * - ASPB,ASNB -C2 CT CT N3 -0.481 -2 180.000 1 !0 * - ASPB,ASNB -C2 CT CT N3 0.422 1 0.000 1 !0 * - ASPB,ASNB -* For C-terminal -N CT C2 O2 0.410 2.000 180.000 1.000 !091 -H N CT C2 0.000 1.000 0.000 1.000 !042 -C2 CT N C -1.183 -1.000 0.000 1.000 !036 -C2 CT N C 0.456 -2.000 180.000 1.000 !036 -C2 CT N C -0.425 3.000 0.000 1.000 !036 - -!popc -!CT CT OS C2 -0.610 -1.000 0.000 1.000 -!CT CT OS C2 -0.063 -2.000 180.000 1.000 -!CT CT OS C2 0.211 3.000 0.000 1.000 -LC3 LNL LH2 LC2 0.449 1.000 0.000 3.00 -!LOS LC2 LH1 LC2 0.050 -1.000 0.000 2.00!Is this correct? -LOS LC2 LH1 LC2 0.699 1.000 0.000 3.00 -LOS LC2 LH1 LOS 0.250 1.000 0.000 2.00 -LH1 LC2 LOS LC 0.449 1.000 0.000 3.00 -LH1 LC2 LOS LP 0.449 1.000 0.000 3.00 -LH2 LC2 LOS LP 0.449 1.000 0.000 3.00 -LO LC LOS LC2 0.000 1.000 0.000 1.00 !!! Missing in Tieleman -LP2 LC LOS LC2 2.000 2.000 180.000 2.00 !!! -LO LC LOS LH1 0.000 1.000 0.000 1.00 !!! Missing in Tieleman -LP2 LC LOS LH1 2.000 2.000 180.000 2.00 !!! -LO LC LP2 LP2 0.000 1.000 0.000 1.00 !!! Missing in Tieleman -LOS LC LP2 LP2 0.050 1.000 0.000 6.00 -LOS LH1 LC2 LOS 0.250 1.000 0.000 2.00 -LP2 LH1 LH1 LP2 19.96 2.000 180.000 1.00 !!! Tieleman models as a harmonic improper -LC2 LH1 LOS LC 0.451 1.000 0.000 3.00 -LH1 LH1 LP2 LP2 0.700 1.000 0.000 3.00 -LNL LH2 LC2 LOS 0.699 1.000 0.000 3.00 -LC LP2 LP2 LP2 0.700 1.000 0.000 3.00 -!LH1 LP2 LP2 LP2 !!!! Ryckaert-Bellemans -LH1 LP2 LP2 LP2 -1.700 -1.000 0.000 1.00 !OPLS 404 -LH1 LP2 LP2 LP2 0.625 -2.000 180.000 1.00 ! -LH1 LP2 LP2 LP2 1.550 3.000 0.000 1.00 ! -!LP2 LP2 LP2 LP2 !!!! Ryckaert-Bellemans -LP2 LP2 LP2 LP2 -1.700 -1.000 0.000 1.00 !OPLS 404 -LP2 LP2 LP2 LP2 0.625 -2.000 180.000 1.00 ! -LP2 LP2 LP2 LP2 1.550 3.000 0.000 1.00 ! -!LP2 LP2 LP2 LP3 !!!! Ryckaert-Bellemans -LP2 LP2 LP2 LP3 -1.700 -1.000 0.000 1.00 !OPLS 404 -LP2 LP2 LP2 LP3 0.625 -2.000 180.000 1.00 ! -LP2 LP2 LP2 LP3 1.550 3.000 0.000 1.00 ! -LOM LP LOS LC2 0.000 1.000 0.000 1.00 !!! Missing in Tieleman -!LOS LP LOS LC2 0.125 -1.000 0.000 3.00 !Is this correct? -LOS LP LOS LC2 0.375 1.000 0.000 3.00 ! - -! Ligand torsion parameters - -*----------------------------------------------------------------------- -[impropers] improper type definitions -*taci tacj tack tacl forceK phase -*----------------------------------------------------------------- -N2 CAr N2 N2 10.5 180.000 !160 -CA CAr N2 N2 10.5 180.000 !160 -NY CAr NZ NY 10.5 180.000 !160 -O C CT N 10.5 180.000 !160 -O C2 CT N 10.5 180.000 !160 -O C21 CT N 10.5 180.000 !160 GLN -O C CT OH 10.5 180.000 !160 -O C CT N 10.5 180.000 !160 -O2 C CT O2 10.5 180.000 !160 -O2 C2 CT O2 10.5 180.000 !160 -OH C2 CT O 10.5 180.000 !160 -OH C2 CT O1 10.5 180.000 !160 ASH -ODE C2 CT O 10.5 180.000 !160 -CT N C CT 1 180.000 !161 -H N C CT 1 180.000 !161 -CT N C CP1 1 180.000 !161 PRO -H N C H 1 180.000 !161 -H N C2 H 1 180.000 !161 -H N C21 H 1 180.000 !161 GLN -H NA CA CX 1 180.000 !161 -H NA CR CW 1 180.000 !161 -H NA CW CN 1 180.000 !161 -H NA CW CR 1 180.000 !161 -H NA CX CA 1 180.000 !161 -H NA CR CX 1 180.000 !161 -H NA CX CR 1 180.000 !161 -H3 N2 CA H3 1 180.000 !161 -H3 N2 CAr H3 1 180.000 !161 -H NY CA H 1 180.000 !161 -H NY CAr H 1 180.000 !161 -H3 N2 CT CA 1 180.000 !161 -H3 N2 CT CAr 1 180.000 !161 -H NY CT CA 1 180.000 !161 -H NY CT CAr 1 180.000 !161 -CA CN CB NA 1.1 180.000 !162 -CN CB CA Cstar 1.1 180.000 !162 -CT CA CA CA 1.1 180.000 !162 -CA CA N3 CA 1.1 180.000 ! Aniline -CT Cstar CW CB 1.1 180.000 !162 -CT CV NB CW 1.1 180.000 !162 -CT CW NA CA 1.1 180.000 !162 -CT CW NA CV 1.1 180.000 !162 -CT CX NA CX 1.1 180.000 !162 -HA CA CA CA 1.1 180.000 !162 -HA CA CA CB 1.1 180.000 !162 -HA CA CN CA 1.1 180.000 !162 -HA CR NA NA 1.1 180.000 !162 -HA CR NA NB 1.1 180.000 !162 -HA CR NB NA 1.1 180.000 !162 -HA CV NB CW 1.1 180.000 !162 -HA CW Cstar NA 1.1 180.000 !162 -HA CW NA CV 1.1 180.000 !162 -HA CX NA CX 1.1 180.000 !162 -OH CA CA CA 1.1 180.000 !162 -OTY CA CA CA 1.1 180.000 !162 -CA CA NT CA 1.1 180.000 ! Aniline (neutral) -!popc -!N2 CAr N2 N2 10.5 180.000 !160 -LOS LC LP2 LO 20.005 180.000 !!! Tieleman models as a harmonic improper -LOS LH1 LC2 LC2 39.998 35.264 !!! Tieleman models as a harmonic improper - -! Ligand improper parameters diff --git a/benchmark-data-shevsea/ff/OPLS2015.lib b/benchmark-data-shevsea/ff/OPLS2015.lib deleted file mode 100644 index 8d44d481..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/ff/OPLS2015.lib +++ /dev/null @@ -1,4296 +0,0 @@ -*------------------------------------------------------------------ -* Q fragment library file for OPLS-AA/M 2015 -* Extracted from: CHARMM topologyparameter files for OPLS-AA (opls.rtf, opls.prm) -* (http://zarbi.chem.yale.edu/oplsaam.html) -* -* Converted with charmm_Q_par.py (Geir V. Isaksen, 2015) -* -* Name convention on basic and acidic a.a.: -* ARG, ARN, HIP, HID, HIE, LYS, LYN, ASP, ASH, GLU, GLH -* +1 0 +1 0 0 +1 0 -1 0 -1 0 -* -* Standard N- and C- terminals: NRES and CRES -* ##Neutral N- and C- terminals: nRES and cRES -*[toggle_residues] ! This is for topology prepare in Qgui -* QGUI_TOGGLE ARG ARN -HH12 radius_to CZ #Netural arg not present in original FF! -* QGUI_TOGGLE ARN ARG +HH12 NH1 radius_to CZ #Adapted from Qoplsaa! -* QGUI_TOGGLE HIP HID -HE2 radius_to CE1 -* QGUI_TOGGLE LYS LYN -HZ3 radius_to NZ #Neutral LYS not present in original FF! -* QGUI_TOGGLE LYN LYS +HZ3 NZ radius_to NZ #Adapted from Qoplsaa! -* QGUI_TOGGLE ASP ASH +HD1 OD1 radius_to CG -* QGUI_TOGGLE ASH ASP -HD1 radius_to CG -* QGUI_TOGGLE GLU GLH +HE1 OE1 radius_to CD -* QGUI_TOGGLE GLH GLU -HE1 radius_to CD -* QGUI_TOGGLE HID HIE -HD2 +HE2 NE2 radius_to CE1 -* QGUI_TOGGLE HIE HIP +HD2 ND1 radius_to CE1 -* QGUI_TOGGLE CYS CYX -HG2 radius_to SG -* QGUI_TOGGLE CYX CYS +HG2 SG radius_to SG -* !N- and C- terms: only atom to add/delete can be modified! -* !If you have something special, use toggle insted. -* QGUI_N-TERM NRES nRES -HT3 radius_to N -* QGUI_N-TERM nRES NRES +HT3 N radius_to N -* QGUI_C-TERM CRES cRES +HO2 OXT radius_to C -* QGUI_C-TERM cRES CRES -HO2 radius_to C -* -*------------------------------------------------------------------ -{ALA} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C135 -0.180 - 6 HB1 H140 0.060 - 7 HB2 H140 0.060 - 8 HB3 H140 0.060 - 9 C C235 0.500 - 10 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB1 - CB HB2 - CB HB3 - O C - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB1 HB2 HB3 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{ARG} !charge: 1.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C308 -0.050 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD C307 0.190 - 12 HD2 H140 0.060 - 13 HD3 H140 0.060 - 14 NE N303 -0.700 - 15 HE H304 0.440 - 16 CZ C302 0.640 - 17 NH1 N300 -0.800 - 18 HH11 H301 0.460 - 19 HH12 H301 0.460 - 20 NH2 N300 -0.800 - 21 HH21 H301 0.460 - 22 HH22 H301 0.460 - 23 C C235 0.500 - 24 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - NE CD - CZ NE - NH2 CZ - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CD HD2 - CD HD3 - NE HE - NH1 HH11 - NH1 HH12 - NH2 HH21 - NH2 HH22 - O C - CZ NH1 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - NH2 CZ NE NH1 - HE NE CD CZ - HH12 NH1 CZ HH11 - HH22 NH2 CZ HH21 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD HD2 HD3 NE HE CZ NH1 HH11 HH12 NH2 HH21 HH22 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{ARN} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C308 -0.120 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD C307 0.040 - 12 HD2 H140 0.060 - 13 HD3 H140 0.060 - 14 NE N303 -0.620 - 15 HE H304 0.380 - 16 CZ C302 0.550 - 17 NH1 N300 -0.785 - 18 HH11 H301 0.380 - 19 NH2 N300 -0.785 - 20 HH21 H301 0.360 - 21 HH22 H301 0.360 - 22 C C235 0.500 - 23 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - NE CD - CZ NE - NH2 CZ - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CD HD2 - CD HD3 - NE HE - NH1 HH11 - NH2 HH21 - NH2 HH22 - O C - CZ NH1 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - NH2 CZ NE NH1 - HE NE CD CZ - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD HD2 HD3 NE HE CZ NH1 HH11 NH2 HH21 HH22 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{ASH} !charge: 0.0 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C267 0.520 - 9 OD2 O269 -0.440 - 10 OD1 O268 -0.530 - 11 C C235 0.500 - 12 O O236 -0.500 - 13 HD1 H270 0.450 - [bonds] - CB CA - CG CB - OD2 CG - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - O C - CG OD1 - OD1 HD1 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - OD2 CG CB OD1 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 CG OD1 OD2 HD1 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{ASN} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C235 0.500 - 9 OD1 O236 -0.500 - 10 ND2 N237 -0.760 - 11 HD21 H240 0.380 - 12 HD22 H240 0.380 - 13 C C235 0.500 - 14 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - ND2 CG - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - ND2 HD21 - ND2 HD22 - C O - CG OD1 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - OD1 CG CB ND2 - HD22 ND2 CG HD21 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG OD1 - ND2 HD21 HD22 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{ASP} !charge: -1.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C274 -0.220 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C271 0.700 - 9 OD1 O272 -0.800 - 10 OD2 O272 -0.800 - 11 C C235 0.500 - 12 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - OD2 CG - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - O C - CG OD1 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - OD2 CG CB OD1 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 CG OD1 OD2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{CALA} !charge: -1.1 || ALA C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C135 -0.180 - 6 HB1 H140 0.060 - 7 HB2 H140 0.060 - 8 HB3 H140 0.060 - 9 C C271 0.700 - 10 O O272 -0.800 - 11 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB1 - CB HB2 - CB HB3 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB1 HB2 HB3 -*------------------------------------------------------------------ -{CARG} !charge: -0.1 || ARG C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C308 -0.050 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD C307 0.190 - 12 HD2 H140 0.060 - 13 HD3 H140 0.060 - 14 NE N303 -0.700 - 15 HE H304 0.440 - 16 CZ C302 0.640 - 17 NH1 N300 -0.800 - 18 HH11 H301 0.460 - 19 HH12 H301 0.460 - 20 NH2 N300 -0.800 - 21 HH21 H301 0.460 - 22 HH22 H301 0.460 - 23 C C271 0.700 - 24 O O272 -0.800 - 25 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - NE CD - CZ NE - NH2 CZ - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CD HD2 - CD HD3 - NE HE - NH1 HH11 - NH1 HH12 - NH2 HH21 - NH2 HH22 - CZ NH1 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - NH2 CZ NE NH1 - HE NE CD CZ - HH12 NH1 CZ HH11 - HH22 NH2 CZ HH21 - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD HD2 HD3 NE HE CZ NH1 HH11 HH12 NH2 HH21 HH22 -*------------------------------------------------------------------*------------------------------------------------------------------ -{CARN} !charge: -0.1 || ARG C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C308 -0.120 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD C307 0.040 - 12 HD2 H140 0.060 - 13 HD3 H140 0.060 - 14 NE N303 -0.620 - 15 HE H304 0.380 - 16 CZ C302 0.550 - 17 NH1 N300 -0.785 - 18 HH11 H301 0.380 - 19 NH2 N300 -0.785 - 20 HH21 H301 0.360 - 21 HH22 H301 0.360 - 22 C C271 0.700 - 23 O O272 -0.800 - 24 OXT O272 -0.800 - - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - NE CD - CZ NE - NH2 CZ - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CD HD2 - CD HD3 - NE HE - NH1 HH11 - NH2 HH21 - NH2 HH22 - CZ NH1 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - NH2 CZ NE NH1 - HE NE CD CZ - HH22 NH2 CZ HH21 - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD HD2 HD3 NE HE CZ NH1 HH11 NH2 HH21 HH22 -*------------------------------------------------------------------ -{CASH} !charge: -1.1 || ASH C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C267 0.520 - 9 OD2 O269 -0.440 - 10 OD1 O268 -0.530 - 11 C C271 0.700 - 12 HD1 H270 0.450 - 13 O O272 -0.800 - 14 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - OD2 CG - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG OD1 - OD1 HD1 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - OD2 CG CB OD1 - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG OD1 OD2 HD1 -*------------------------------------------------------------------ -{CASN} !charge: -0.9 || ASN C-terminal (deprotonated) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C235 0.500 - 9 OD1 O236 -0.500 - 10 ND2 N237 -0.760 - 11 HD21 H240 0.380 - 12 HD22 H240 0.380 - 13 C C271 0.700 - 14 O O272 -0.800 - 15 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - ND2 CG - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - ND2 HD21 - ND2 HD22 - CG OD1 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - OD1 CG CB ND2 - HD22 ND2 CG HD21 - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG OD1 - ND2 HD21 HD22 -*------------------------------------------------------------------ -{CASP} !charge: -2.1 || ASP C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C274 -0.220 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C271 0.700 - 9 OD1 O272 -0.800 - 10 OD2 O272 -0.800 - 11 C C271 0.700 - 12 O O272 -0.800 - 13 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - OD2 CG - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG OD1 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - OD2 CG CB OD1 - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 CG OD1 OD2 -*------------------------------------------------------------------ -{CCYS} !charge: -1.1 || CYS C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C206 0.060 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 SG S200 -0.335 - 9 HG H204 0.155 - 10 C C271 0.700 - 11 O O272 -0.800 - 12 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - SG CB - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - SG HG - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 SG HG -*------------------------------------------------------------------ -{CCYX} !charge: -1.1 || CYX C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C214 0.0975 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 SG S203 -0.2175 - 9 C C271 0.700 - 10 O O272 -0.800 - 11 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - SG CB - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 SG -*------------------------------------------------------------------ -{CGLH} !charge: -1.1 || GLH C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C136 -0.120 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD1 C267 0.520 - 12 OE2 O269 -0.440 - 13 OE1 O268 -0.530 - 14 C C271 0.700 - 15 HE1 H270 0.450 - 16 O O272 -0.800 - 17 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD1 CG - OE2 CD1 - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CD1 OE1 - OE1 HE1 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - OE2 CD1 CG OE1 - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD1 OE1 OE2 HE1 -*------------------------------------------------------------------ -{CGLN} !charge: -1.1 || GLN C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C136 -0.120 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD C235 0.500 - 12 OE1 O236 -0.500 - 13 NE2 N237 -0.760 - 14 HE21 H240 0.380 - 15 HE22 H240 0.380 - 16 C C271 0.700 - 17 O O272 -0.800 - 18 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - NE2 CD - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - NE2 HE21 - NE2 HE22 - CD OE1 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - OE1 CD CG NE2 - HE22 NE2 CD HE21 - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD OE1 - NE2 HE21 HE22 -*------------------------------------------------------------------ -{CGLU} !charge: -2.1 || GLU C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C274 -0.220 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD1 C271 0.700 - 12 OE1 O272 -0.800 - 13 OE2 O272 -0.800 - 14 C C271 0.700 - 15 O O272 -0.800 - 16 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD1 CG - OE2 CD1 - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CD1 OE1 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - OE2 CD1 CG OE1 - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD1 OE1 OE2 -*------------------------------------------------------------------ -{CGLY} !charge: -1.0 || GLY C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C284 -0.020 - 4 HA1 H140 0.060 - 5 HA2 H140 0.060 - 6 C C271 0.700 - 7 O O272 -0.800 - 8 OXT O272 -0.800 - [bonds] - N H - N CA - C CA - CA HA1 - CA HA2 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA1 HA2 C O OXT -*------------------------------------------------------------------ -{CHID} !charge: -1.1 || HID C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C505 -0.005 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 ND1 N503 -0.570 - 9 HD1 H504 0.420 - 10 CG C508 0.015 - 11 CE1 C506 0.295 - 12 HE1 H146 0.115 - 13 NE2 N511 -0.490 - 14 CD2 C507 -0.015 - 15 HD2 H146 0.115 - 16 C C271 0.700 - 17 O O272 -0.800 - 18 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - ND1 CG - CE1 ND1 - NE2 CD2 - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - ND1 HD1 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - CG CD2 - CE1 NE2 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - HD1 ND1 CG CE1 - HD2 CD2 NE2 CG - HE1 CE1 ND1 NE2 - CB CG ND1 CD2 - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 ND1 HD1 CG CE1 HE1 NE2 CD2 HD2 -*------------------------------------------------------------------ -{CHIE} !charge: -1.1 || HIE C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C505 -0.005 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 ND1 N511 -0.490 - 9 CG C507 -0.015 - 10 CE1 C506 0.295 - 11 HE1 H146 0.115 - 12 NE2 N503 -0.570 - 13 HE2 H504 0.420 - 14 CD2 C508 0.015 - 15 HD3 H146 0.115 - 16 C C271 0.700 - 17 O O272 -0.800 - 18 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - ND1 CG - NE2 CD2 - N H - N CA - C CA - NE2 CE1 - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - NE2 HE2 - CD2 HD3 - CE1 HE1 - CD2 CG - CE1 ND1 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - HE2 NE2 CE1 CD2 - HD3 CD2 NE2 CG - HE1 CE1 ND1 NE2 - CB CG ND1 CD2 - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 ND1 CG CE1 HE1 NE2 HE2 CD2 HD3 -*------------------------------------------------------------------ -{CHIP} !charge: -0.1 || HIP C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C505 -0.005 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CD2 C510 0.215 - 9 HD3 H146 0.115 - 10 CG C510 0.215 - 11 NE2 N512 -0.540 - 12 HE2 H513 0.460 - 13 ND1 N512 -0.540 - 14 HD2 H513 0.460 - 15 CE1 C509 0.385 - 16 HE1 H146 0.115 - 17 C C271 0.700 - 18 O O272 -0.800 - 19 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - ND1 CG - CE1 ND1 - NE2 CD2 - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - ND1 HD2 - NE2 HE2 - CD2 HD3 - CE1 HE1 - CD2 CG - NE2 CE1 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - HD2 ND1 CG CE1 - HE1 CE1 ND1 NE2 - HE2 NE2 CE1 CD2 - HD3 CD2 NE2 CG - CB CG ND1 CD2 - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 CD2 HD3 CG NE2 HE2 ND1 HD2 CE1 HE1 -*------------------------------------------------------------------ -{CILE} !charge: -1.1 || ILE C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C137 -0.060 - 6 HB H140 0.060 - 7 CG2 C135 -0.180 - 8 HG21 H140 0.060 - 9 HG22 H140 0.060 - 10 HG23 H140 0.060 - 11 CG1 C136 -0.120 - 12 HG12 H140 0.060 - 13 HG13 H140 0.060 - 14 CD1 C135 -0.180 - 15 HD11 H140 0.060 - 16 HD12 H140 0.060 - 17 HD13 H140 0.060 - 18 C C271 0.700 - 19 O O272 -0.800 - 20 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG1 CB - CG2 CB - CD1 CG1 - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB - CG1 HG12 - CG1 HG13 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - CD1 HD11 - CD1 HD12 - CD1 HD13 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB - CG2 HG21 HG22 HG23 - CG1 HG12 HG13 - CD1 HD11 HD12 HD13 -*------------------------------------------------------------------ -{CLA} !charge: -1.00 || Chloride Ion, adm jr. - [atoms] - 1 CLA CLA -1.00 -*------------------------------------------------------------------ -{CLEU} !charge: -1.1 || LEU C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C137 -0.060 - 9 HG H140 0.060 - 10 CD1 C135 -0.180 - 11 HD11 H140 0.060 - 12 HD12 H140 0.060 - 13 HD13 H140 0.060 - 14 CD2 C135 -0.180 - 15 HD21 H140 0.060 - 16 HD22 H140 0.060 - 17 HD23 H140 0.060 - 18 C C271 0.700 - 19 O O272 -0.800 - 20 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD1 CG - CD2 CG - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG - CD1 HD11 - CD1 HD12 - CD1 HD13 - CD2 HD21 - CD2 HD22 - CD2 HD23 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG - CD1 HD11 HD12 HD13 - CD2 HD21 HD22 HD23 -*------------------------------------------------------------------ -{CLYS} !charge: -0.1 || LYS C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C136 -0.120 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD C136 -0.120 - 12 HD2 H140 0.060 - 13 HD3 H140 0.060 - 14 CE C292 0.190 - 15 HE2 H140 0.060 - 16 HE3 H140 0.060 - 17 NZ N287 -0.300 - 18 HZ1 H290 0.330 - 19 HZ2 H290 0.330 - 20 HZ3 H290 0.330 - 21 C C271 0.700 - 22 O O272 -0.800 - 23 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - CE CD - NZ CE - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CD HD2 - CD HD3 - CE HE2 - CE HE3 - NZ HZ1 - NZ HZ2 - NZ HZ3 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ1 HZ2 HZ3 -*------------------------------------------------------------------ -{CMET} !charge: -1.1 || MET C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C210 0.0475 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 SD S202 -0.335 - 12 CE C209 -0.0125 - 13 HE1 H140 0.060 - 14 HE2 H140 0.060 - 15 HE3 H140 0.060 - 16 C C271 0.700 - 17 O O272 -0.800 - 18 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - SD CG - CE SD - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CE HE1 - CE HE2 - CE HE3 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 SD CE HE1 HE2 HE3 -*------------------------------------------------------------------ -{CPHE} !charge: -1.1 || PHE C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C149 -0.005 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C145 -0.115 - 9 CD1 C145 -0.115 - 10 HD1 H146 0.115 - 11 CE1 C145 -0.115 - 12 HE1 H146 0.115 - 13 CZ C145 -0.115 - 14 HZ H146 0.115 - 15 CD2 C145 -0.115 - 16 HD2 H146 0.115 - 17 CE2 C145 -0.115 - 18 HE2 H146 0.115 - 19 C C271 0.700 - 20 O O272 -0.800 - 21 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD2 CG - CE1 CD1 - CZ CE2 - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CD1 HD1 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - CD1 CG - CZ CE1 - CE2 CD2 - CE2 HE2 - CZ HZ - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - HD1 CD1 CG CE1 - HE1 CE1 CD1 CZ - HZ CZ CE1 CE2 - CB CG CD1 CD2 - HD2 CD2 CE2 CG - HE2 CE2 CZ CD2 - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 CG - CD1 HD1 - CE1 HE1 - CZ HZ - CD2 HD2 - CE2 HE2 -*------------------------------------------------------------------ -{CPRO} !charge: -1.0 || PRO C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N239 -0.140 - 2 CD C245 -0.050 - 3 HD2 H140 0.060 - 4 HD3 H140 0.060 - 5 CA C283 0.040 - 6 HA H140 0.060 - 7 CB C136 -0.120 - 8 HB2 H140 0.060 - 9 HB3 H140 0.060 - 10 CG C136 -0.120 - 11 HG2 H140 0.060 - 12 HG3 H140 0.060 - 13 C C271 0.700 - 14 O O272 -0.800 - 15 OXT O272 -0.800 - [bonds] - C CA - N CA - CA CB - CB CG - CG CD - N CD - HA CA - HG2 CG - HG3 CG - HD2 CD - HD3 CD - HB2 CB - HB3 CB - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - CD N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N CA HA C O OXT CD HD2 HD3 - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 -*------------------------------------------------------------------ -{CSER} !charge: -1.1 || SER C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C157 0.145 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 OG O154 -0.683 - 9 HG H155 0.418 - 10 C C271 0.700 - 11 O O272 -0.800 - 12 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - OG CB - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - OG HG - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 OG HG -*------------------------------------------------------------------ -{CTHR} !charge: -1.1 || THR C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C158 0.205 - 6 HB H140 0.060 - 7 OG1 O154 -0.683 - 8 HG1 H155 0.418 - 9 CG2 C135 -0.180 - 10 HG21 H140 0.060 - 11 HG22 H140 0.060 - 12 HG23 H140 0.060 - 13 C C271 0.700 - 14 O O272 -0.800 - 15 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - OG1 CB - CG2 CB - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB - OG1 HG1 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB OG1 HG1 - CG2 HG21 HG22 HG23 -*------------------------------------------------------------------ -{CTRP} !charge: -1.1 || TRP C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C500 0.075 - 9 CD1 C514 -0.115 - 10 HD1 H146 0.115 - 11 NE1 N503 -0.570 - 12 HE1 H504 0.420 - 13 CE2 C502 0.130 - 14 CD2 C501 -0.055 - 15 CE3 C145 -0.115 - 16 HE3 H146 0.115 - 17 CZ3 C145 -0.115 - 18 HZ3 H146 0.115 - 19 CZ2 C145 -0.115 - 20 HZ2 H146 0.115 - 21 CH2 C145 -0.115 - 22 HH2 H146 0.115 - 23 C C271 0.700 - 24 O O272 -0.800 - 25 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD2 CG - NE1 CD1 - CZ2 CE2 - N H - N CA - C CA - CZ3 CH2 - CD2 CE3 - NE1 CE2 - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CD1 HD1 - NE1 HE1 - CE3 HE3 - CZ2 HZ2 - CZ3 HZ3 - CH2 HH2 - CD1 CG - CE2 CD2 - CZ3 CE3 - CH2 CZ2 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CG NE1 - HE1 NE1 CD1 CE2 - HZ2 CZ2 CE2 CH2 - HH2 CH2 CZ2 CZ3 - HZ3 CZ3 CH2 CE3 - HE3 CE3 CZ3 CD2 - CE2 CD2 CE3 CG - CZ2 CE2 CD2 NE1 - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG CD1 HD1 NE1 HE1 CE2 CD2 - CE3 HE3 - CZ3 HZ3 - CZ2 HZ2 - CH2 HH2 -*------------------------------------------------------------------ -{CTYR} !charge: -1.1 || TYR C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C149 -0.005 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C145 -0.115 - 9 CD1 C145 -0.115 - 10 HD1 H146 0.115 - 11 CE1 C145 -0.115 - 12 HE1 H146 0.115 - 13 CZ C166 0.150 - 14 OH O167 -0.585 - 15 HH H168 0.435 - 16 CD2 C145 -0.115 - 17 HD2 H146 0.115 - 18 CE2 C145 -0.115 - 19 HE2 H146 0.115 - 20 C C271 0.700 - 21 O O272 -0.800 - 22 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD2 CG - CE1 CD1 - CZ CE2 - OH CZ - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CD1 HD1 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - CE2 HE2 - OH HH - CD1 CG - CE1 CZ - CE2 CD2 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - HD1 CD1 CG CE1 - HE1 CE1 CD1 CZ - OH CZ CE1 CE2 - CB CG CD1 CD2 - HD2 CD2 CE2 CG - HE2 CE2 CZ CD2 - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 CG - CD1 HD1 - CE1 HE1 - CZ OH HH - CD2 HD2 - CE2 HE2 -*------------------------------------------------------------------ -{CVAL} !charge: -1.1 || VAL C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C137 -0.060 - 6 HB H140 0.060 - 7 CG1 C135 -0.180 - 8 HG11 H140 0.060 - 9 HG12 H140 0.060 - 10 HG13 H140 0.060 - 11 CG2 C135 -0.180 - 12 HG21 H140 0.060 - 13 HG22 H140 0.060 - 14 HG23 H140 0.060 - 15 C C271 0.700 - 16 O O272 -0.800 - 17 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG1 CB - CG2 CB - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB - CG1 HG11 - CG1 HG12 - CG1 HG13 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB - CG1 HG11 HG12 HG13 - CG2 HG21 HG22 HG23 -*------------------------------------------------------------------ -{CYS} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C206 0.060 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 SG S200 -0.335 - 9 HG H204 0.155 - 10 C C235 0.500 - 11 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - SG CB - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - SG HG - O C - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 SG HG - C O -*------------------------------------------------------------------ -{CYX} !charge: 0.0 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C214 0.0975 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 SG S203 -0.2175 - 9 C C235 0.500 - 10 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - SG CB - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - O C - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 SG - C O -*------------------------------------------------------------------ -{GLH} !charge: 0.0 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C136 -0.120 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD C267 0.520 - 12 OE2 O269 -0.440 - 13 OE1 O268 -0.530 - 14 C C235 0.500 - 15 O O236 -0.500 - 16 HE1 H270 0.450 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - OE2 CD - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - O C - CD OE1 - OE1 HE1 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - OE2 CD CG OE1 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD OE1 OE2 HE1 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{GLN} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C136 -0.120 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD C235 0.500 - 12 OE1 O236 -0.500 - 13 NE2 N237 -0.760 - 14 HE21 H240 0.380 - 15 HE22 H240 0.380 - 16 C C235 0.500 - 17 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - NE2 CD - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - NE2 HE21 - NE2 HE22 - O C - CD OE1 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - OE1 CD CG NE2 - HE22 NE2 CD HE21 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD OE1 - NE2 HE21 HE22 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{GLU} !charge: -1.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C274 -0.220 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD C271 0.700 - 12 OE1 O272 -0.800 - 13 OE2 O272 -0.800 - 14 C C235 0.500 - 15 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - OE2 CD - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - O C - CD OE1 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - OE2 CD CG OE1 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD OE1 OE2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{GLY} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C223 0.080 - 4 HA2 H140 0.060 - 5 HA3 H140 0.060 - 6 C C235 0.500 - 7 O O236 -0.500 - [bonds] - N H - N CA - C CA - CA HA2 - CA HA3 - O C - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA2 HA3 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{HID} !charge: 0.00 || neutral HIS, proton on ND1 - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C505 -0.005 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 ND1 N503 -0.570 - 9 HD1 H504 0.420 - 10 CG C508 0.015 - 11 CE1 C506 0.295 - 12 HE1 H146 0.115 - 13 NE2 N511 -0.490 - 14 CD2 C507 -0.015 - 15 HD2 H146 0.115 - 16 C C235 0.500 - 17 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - ND1 CG - CE1 ND1 - NE2 CD2 - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - ND1 HD1 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - O C - CG CD2 - CE1 NE2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - HD1 ND1 CG CE1 - HD2 CD2 NE2 CG - HE1 CE1 ND1 NE2 - CB CG ND1 CD2 - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 ND1 HD1 CG CE1 HE1 NE2 CD2 HD2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{HIE} !charge: 0.00 || neutral His, proton on NE2 - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C505 -0.005 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 ND1 N511 -0.490 - 9 CG C507 -0.015 - 10 CE1 C506 0.295 - 11 HE1 H146 0.115 - 12 NE2 N503 -0.570 - 13 HE2 H504 0.420 - 14 CD2 C508 0.015 - 15 HD2 H146 0.115 - 16 C C235 0.500 - 17 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - ND1 CG - NE2 CD2 - N H - N CA - C CA - NE2 CE1 - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - NE2 HE2 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - O C - CD2 CG - CE1 ND1 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - HE2 NE2 CE1 CD2 - HD2 CD2 NE2 CG - HE1 CE1 ND1 NE2 - CB CG ND1 CD2 - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 ND1 CG CE1 HE1 NE2 HE2 CD2 HD2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{HIP} !charge: 1.00 || Protonated His - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C505 -0.005 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CD2 C510 0.215 - 9 HD2 H146 0.115 - 10 CG C510 0.215 - 11 NE2 N512 -0.540 - 12 HE2 H513 0.460 - 13 ND1 N512 -0.540 - 14 HD1 H513 0.460 - 15 CE1 C509 0.385 - 16 HE1 H146 0.115 - 17 C C235 0.500 - 18 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - ND1 CG - CE1 ND1 - NE2 CD2 - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - ND1 HD1 - NE2 HE2 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - O C - CD2 CG - NE2 CE1 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - HD1 ND1 CG CE1 - HE1 CE1 ND1 NE2 - HE2 NE2 CE1 CD2 - HD2 CD2 NE2 CG - CB CG ND1 CD2 - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 CD2 HD2 CG NE2 HE2 ND1 HD1 CE1 HE1 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{ILE} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C137 -0.060 - 6 HB H140 0.060 - 7 CG2 C135 -0.180 - 8 HG21 H140 0.060 - 9 HG22 H140 0.060 - 10 HG23 H140 0.060 - 11 CG1 C136 -0.120 - 12 HG12 H140 0.060 - 13 HG13 H140 0.060 - 14 CD1 C135 -0.180 - 15 HD11 H140 0.060 - 16 HD12 H140 0.060 - 17 HD13 H140 0.060 - 18 C C235 0.500 - 19 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG1 CB - CG2 CB - CD1 CG1 - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB - CG1 HG12 - CG1 HG13 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - CD1 HD11 - CD1 HD12 - CD1 HD13 - O C - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB - CG2 HG21 HG22 HG23 - CG1 HG12 HG13 - CD1 HD11 HD12 HD13 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{LEU} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C137 -0.060 - 9 HG H140 0.060 - 10 CD1 C135 -0.180 - 11 HD11 H140 0.060 - 12 HD12 H140 0.060 - 13 HD13 H140 0.060 - 14 CD2 C135 -0.180 - 15 HD21 H140 0.060 - 16 HD22 H140 0.060 - 17 HD23 H140 0.060 - 18 C C235 0.500 - 19 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD1 CG - CD2 CG - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG - CD1 HD11 - CD1 HD12 - CD1 HD13 - CD2 HD21 - CD2 HD22 - CD2 HD23 - O C - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG - CD1 HD11 HD12 HD13 - CD2 HD21 HD22 HD23 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{LYS} !charge: 1.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C136 -0.120 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD C136 -0.120 - 12 HD2 H140 0.060 - 13 HD3 H140 0.060 - 14 CE C292 0.190 - 15 HE2 H140 0.060 - 16 HE3 H140 0.060 - 17 NZ N287 -0.300 - 18 HZ1 H290 0.330 - 19 HZ2 H290 0.330 - 20 HZ3 H290 0.330 - 21 C C235 0.500 - 22 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - CE CD - NZ CE - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CD HD2 - CD HD3 - CE HE2 - CE HE3 - O C - NZ HZ1 - NZ HZ2 - NZ HZ3 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ1 HZ2 HZ3 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{LYN} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C136 -0.120 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 CD C136 -0.120 - 12 HD2 H140 0.060 - 13 HD3 H140 0.060 - 14 CE C292 0.060 - 15 HE2 H140 0.060 - 16 HE3 H140 0.060 - 17 NZ N287 -0.900 - 18 HZ1 H241 0.360 - 19 HZ2 H241 0.360 - 20 C C235 0.500 - 21 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - CE CD - NZ CE - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CD HD2 - CD HD3 - CE HE2 - CE HE3 - O C - NZ HZ1 - NZ HZ2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ1 HZ2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{MET} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C210 0.0475 - 9 HG2 H140 0.060 - 10 HG3 H140 0.060 - 11 SD S202 -0.335 - 12 CE C209 -0.0125 - 13 HE1 H140 0.060 - 14 HE2 H140 0.060 - 15 HE3 H140 0.060 - 16 C C235 0.500 - 17 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - SD CG - CE SD - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CE HE1 - CE HE2 - CE HE3 - O C - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 SD CE HE1 HE2 HE3 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NALA} !charge: 1.0 || ALA N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C135 -0.180 - 5 HB1 H140 0.060 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 C C235 0.500 - 9 O O236 -0.500 - 10 HT1 H290 0.330 - 11 HT2 H290 0.330 - 12 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - N CA - C CA - CA HA - CB HB1 - CB HB2 - CB HB3 - O C - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB1 HB2 HB3 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NARG} !charge: 2.0 || ARG N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C136 -0.120 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C308 -0.050 - 8 HG2 H140 0.060 - 9 HG3 H140 0.060 - 10 CD C307 0.190 - 11 HD2 H140 0.060 - 12 HD3 H140 0.060 - 13 NE N303 -0.700 - 14 HE H304 0.440 - 15 CZ C302 0.640 - 16 NH1 N300 -0.800 - 17 HH11 H301 0.460 - 18 HH12 H301 0.460 - 19 NH2 N300 -0.800 - 20 HH21 H301 0.460 - 21 HH22 H301 0.460 - 22 C C235 0.500 - 23 O O236 -0.500 - 24 HT1 H290 0.330 - 25 HT2 H290 0.330 - 26 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - NE CD - CZ NE - NH2 CZ - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CD HD2 - CD HD3 - NE HE - NH1 HH11 - NH1 HH12 - NH2 HH21 - NH2 HH22 - O C - CZ NH1 - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - NH2 CZ NE NH1 - HE NE CD CZ - HH12 NH1 CZ HH11 - HH22 NH2 CZ HH21 - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD HD2 HD3 NE HE CZ NH1 HH11 HH12 NH2 HH21 HH22 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NASH} !charge: 1.0 || ASH N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C136 -0.120 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C267 0.520 - 8 OD2 O269 -0.440 - 9 OD1 O268 -0.530 - 10 C C235 0.500 - 11 O O236 -0.500 - 12 HD1 H270 0.450 - 13 HT1 H290 0.330 - 14 HT2 H290 0.330 - 15 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - OD2 CG - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - O C - CG OD1 - OD1 HD1 - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - OD2 CG CB OD1 - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 CG OD1 OD2 HD1 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NASN} !charge: 1.0 || ASN N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C136 -0.120 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C235 0.500 - 8 OD1 O236 -0.500 - 9 ND2 N237 -0.760 - 10 HD21 H240 0.380 - 11 HD22 H240 0.380 - 12 C C235 0.500 - 13 O O236 -0.500 - 14 HT1 H290 0.330 - 15 HT2 H290 0.330 - 16 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - ND2 CG - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - ND2 HD21 - ND2 HD22 - C O - CG OD1 - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - OD1 CG CB ND2 - HD22 ND2 CG HD21 - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG OD1 - ND2 HD21 HD22 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NASP} !charge: -0.0 || ASP N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C274 -0.220 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C271 0.700 - 8 OD1 O272 -0.800 - 9 OD2 O272 -0.800 - 10 C C235 0.500 - 11 O O236 -0.500 - 12 HT1 H290 0.330 - 13 HT2 H290 0.330 - 14 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - OD2 CG - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - O C - CG OD1 - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - OD2 CG CB OD1 - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 CG OD1 OD2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NCYS} !charge: 1.0 || CYS N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C206 0.060 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 SG S200 -0.335 - 8 HG H204 0.155 - 9 C C235 0.500 - 10 O O236 -0.500 - 11 HT1 H290 0.330 - 12 HT2 H290 0.330 - 13 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - SG CB - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - SG HG - O C - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 SG HG - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NCYX} !charge: 1.0 || CYX N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C214 0.0975 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 SG S203 -0.2175 - 8 C C235 0.500 - 9 O O236 -0.500 - 10 HT1 H290 0.330 - 11 HT2 H290 0.330 - 12 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - SG CB - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - O C - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 SG - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NGLH} !charge: 1.0 || GLH N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C136 -0.120 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C136 -0.120 - 8 HG2 H140 0.060 - 9 HG3 H140 0.060 - 10 CD1 C267 0.520 - 11 OE2 O269 -0.440 - 12 OE1 O268 -0.530 - 13 C C235 0.500 - 14 O O236 -0.500 - 15 HE1 H270 0.450 - 16 HT1 H290 0.330 - 17 HT2 H290 0.330 - 18 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD1 CG - OE2 CD1 - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - O C - CD1 OE1 - OE1 HE1 - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - OE2 CD1 CG OE1 - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD1 OE1 OE2 HE1 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NGLN} !charge: 1.0 || GLN N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C136 -0.120 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C136 -0.120 - 8 HG2 H140 0.060 - 9 HG3 H140 0.060 - 10 CD C235 0.500 - 11 OE1 O236 -0.500 - 12 NE2 N237 -0.760 - 13 HE21 H240 0.380 - 14 HE22 H240 0.380 - 15 C C235 0.500 - 16 O O236 -0.500 - 17 HT1 H290 0.330 - 18 HT2 H290 0.330 - 19 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - NE2 CD - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - NE2 HE21 - NE2 HE22 - O C - CD OE1 - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - OE1 CD CG NE2 - HE22 NE2 CD HE21 - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD OE1 - NE2 HE21 HE22 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NGLU} !charge: -0.0 || GLU N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C136 -0.120 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C274 -0.220 - 8 HG2 H140 0.060 - 9 HG3 H140 0.060 - 10 CD C271 0.700 - 11 OE1 O272 -0.800 - 12 OE2 O272 -0.800 - 13 C C235 0.500 - 14 O O236 -0.500 - 15 H1 H290 0.330 - 16 H2 H290 0.330 - 17 H3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - OE2 CD - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - O C - CD OE1 - H1 N - H2 N - H3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - OE2 CD CG OE1 - [charge_groups] - N H1 H2 H3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 CD OE1 OE2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NGLY} !charge: 1.0 || GLY N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C292 0.190 - 3 HA1 H140 0.060 - 4 HA2 H140 0.060 - 5 C C235 0.500 - 6 O O236 -0.500 - 7 HT1 H290 0.330 - 8 HT2 H290 0.330 - 9 HT3 H290 0.330 - [bonds] - N CA - C CA - CA HA1 - CA HA2 - O C - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA1 HA2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NHID} !charge: 1.0 || HID N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C505 -0.005 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 ND1 N503 -0.570 - 8 HD1 H504 0.420 - 9 CG C508 0.015 - 10 CE1 C506 0.295 - 11 HE1 H146 0.115 - 12 NE2 N511 -0.490 - 13 CD2 C507 -0.015 - 14 HD2 H146 0.115 - 15 C C235 0.500 - 16 O O236 -0.500 - 17 HT1 H290 0.330 - 18 HT2 H290 0.330 - 19 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - ND1 CG - CE1 ND1 - NE2 CD2 - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - ND1 HD1 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - O C - CG CD2 - CE1 NE2 - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - HD1 ND1 CG CE1 - HD2 CD2 NE2 CG - HE1 CE1 ND1 NE2 - CB CG ND1 CD2 - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 ND1 HD1 CG CE1 HE1 NE2 CD2 HD2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NHIE} !charge: 1.0 || HIE N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C505 -0.005 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 ND1 N511 -0.490 - 8 CG C507 -0.015 - 9 CE1 C506 0.295 - 10 HE1 H146 0.115 - 11 NE2 N503 -0.570 - 12 HE2 H504 0.420 - 13 CD2 C508 0.015 - 14 HD2 H146 0.115 - 15 C C235 0.500 - 16 O O236 -0.500 - 17 HT1 H290 0.330 - 18 HT2 H290 0.330 - 19 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - ND1 CG - NE2 CD2 - N CA - C CA - NE2 CE1 - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - NE2 HE2 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - O C - CD2 CG - CE1 ND1 - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - HE2 NE2 CE1 CD2 - HD2 CD2 NE2 CG - HE1 CE1 ND1 NE2 - CB CG ND1 CD2 - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 ND1 CG CE1 HE1 NE2 HE2 CD2 HD2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NHIP} !charge: 2.0 || HIP N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C505 -0.005 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CD2 C510 0.215 - 8 HD2 H146 0.115 - 9 CG C510 0.215 - 10 NE2 N512 -0.540 - 11 HE2 H513 0.460 - 12 ND1 N512 -0.540 - 13 HD1 H513 0.460 - 14 CE1 C509 0.385 - 15 HE1 H146 0.115 - 16 C C235 0.500 - 17 O O236 -0.500 - 18 HT1 H290 0.330 - 19 HT2 H290 0.330 - 20 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - ND1 CG - CE1 ND1 - NE2 CD2 - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - ND1 HD1 - NE2 HE2 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - O C - CD2 CG - NE2 CE1 - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - HD1 ND1 CG CE1 - HE1 CE1 ND1 NE2 - HE2 NE2 CE1 CD2 - HD2 CD2 NE2 CG - CB CG ND1 CD2 - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 CG ND1 HD1 CE1 HE1 NE2 HE2 CD2 HD2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NILE} !charge: 1.0 || ILE N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C137 -0.060 - 5 HB H140 0.060 - 6 CG2 C135 -0.180 - 7 HG21 H140 0.060 - 8 HG22 H140 0.060 - 9 HG23 H140 0.060 - 10 CG1 C136 -0.120 - 11 HG12 H140 0.060 - 12 HG13 H140 0.060 - 13 CD1 C135 -0.180 - 14 HD11 H140 0.060 - 15 HD12 H140 0.060 - 16 HD13 H140 0.060 - 17 C C235 0.500 - 18 O O236 -0.500 - 19 HT1 H290 0.330 - 20 HT2 H290 0.330 - 21 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG1 CB - CG2 CB - CD1 CG1 - N CA - C CA - CA HA - CB HB - CG1 HG12 - CG1 HG13 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - CD1 HD11 - CD1 HD12 - CD1 HD13 - O C - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB - CG2 HG21 HG22 HG23 - CG1 HG12 HG13 - CD1 HD11 HD12 HD13 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NLEU} !charge: 1.0 || LEU N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C136 -0.120 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C137 -0.060 - 8 HG H140 0.060 - 9 CD1 C135 -0.180 - 10 HD11 H140 0.060 - 11 HD12 H140 0.060 - 12 HD13 H140 0.060 - 13 CD2 C135 -0.180 - 14 HD21 H140 0.060 - 15 HD22 H140 0.060 - 16 HD23 H140 0.060 - 17 C C235 0.500 - 18 O O236 -0.500 - 19 HT1 H290 0.330 - 20 HT2 H290 0.330 - 21 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD1 CG - CD2 CG - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG - CD1 HD11 - CD1 HD12 - CD1 HD13 - CD2 HD21 - CD2 HD22 - CD2 HD23 - O C - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG - CD1 HD11 HD12 HD13 - CD2 HD21 HD22 HD23 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NLYS} !charge: 2.0 || LYS N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C136 -0.120 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C136 -0.120 - 8 HG2 H140 0.060 - 9 HG3 H140 0.060 - 10 CD C136 -0.120 - 11 HD2 H140 0.060 - 12 HD3 H140 0.060 - 13 CE C292 0.190 - 14 HE2 H140 0.060 - 15 HE3 H140 0.060 - 16 NZ N287 -0.300 - 17 HZ1 H290 0.330 - 18 HZ2 H290 0.330 - 19 HZ3 H290 0.330 - 20 C C235 0.500 - 21 O O236 -0.500 - 22 HT1 H290 0.330 - 23 HT2 H290 0.330 - 24 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD CG - CE CD - NZ CE - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CD HD2 - CD HD3 - CE HE2 - CE HE3 - O C - NZ HZ1 - NZ HZ2 - NZ HZ3 - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - CD HD2 HD3 - CE HE2 HE3 NZ HZ1 HZ2 HZ3 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NMET} !charge: 1.0 || MET N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C136 -0.120 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C210 0.0475 - 8 HG2 H140 0.060 - 9 HG3 H140 0.060 - 10 SD S202 -0.335 - 11 CE C209 -0.0125 - 12 HE1 H140 0.060 - 13 HE2 H140 0.060 - 14 HE3 H140 0.060 - 15 C C235 0.500 - 16 O O236 -0.500 - 17 HT1 H290 0.330 - 18 HT2 H290 0.330 - 19 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - SD CG - CE SD - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CG HG2 - CG HG3 - CE HE1 - CE HE2 - CE HE3 - O C - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 SD CE HE1 HE2 HE3 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NPHE} !charge: 1.0 || PHE N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C149 -0.005 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C145 -0.115 - 8 CD1 C145 -0.115 - 9 HD1 H146 0.115 - 10 CE1 C145 -0.115 - 11 HE1 H146 0.115 - 12 CZ C145 -0.115 - 13 HZ H146 0.115 - 14 CD2 C145 -0.115 - 15 HD2 H146 0.115 - 16 CE2 C145 -0.115 - 17 HE2 H146 0.115 - 18 C C235 0.500 - 19 O O236 -0.500 - 20 HT1 H290 0.330 - 21 HT2 H290 0.330 - 22 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD2 CG - CE1 CD1 - CZ CE2 - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CD1 HD1 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - O C - CD1 CG - CZ CE1 - CE2 CD2 - CE2 HE2 - CZ HZ - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - HD1 CD1 CG CE1 - HE1 CE1 CD1 CZ - HZ CZ CE1 CE2 - CB CG CD1 CD2 - HD2 CD2 CE2 CG - HE2 CE2 CZ CD2 - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 CG - CD1 HD1 - CE1 HE1 - CZ HZ - CD2 HD2 - CE2 HE2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NPRO} !charge: 1.1 || PRO N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CD C245 -0.050 - 3 HD2 H140 0.060 - 4 HD3 H140 0.060 - 5 CA C293 0.250 - 6 HA H140 0.060 - 7 CB C136 -0.120 - 8 HB2 H140 0.060 - 9 HB3 H140 0.060 - 10 CG C136 -0.120 - 11 HG2 H140 0.060 - 12 HG3 H140 0.060 - 13 C C235 0.500 - 14 O O236 -0.500 - 15 HT1 H290 0.330 - 16 HT2 H290 0.330 - 17 HT3 H290 0.330 - [bonds] - C CA - N CA - CA CB - CB CG - CG CD - N CD - HA CA - HG2 CG - HG3 CG - HD2 CD - HD3 CD - HB2 CB - HB3 CB - O C - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA CD HD2 HD3 - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NSER} !charge: 1.0 || SER N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C157 0.145 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 OG O154 -0.683 - 8 HG H155 0.418 - 9 C C235 0.500 - 10 O O236 -0.500 - 11 HT1 H290 0.330 - 12 HT2 H290 0.330 - 13 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - OG CB - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - OG HG - O C - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 OG HG - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NTHR} !charge: 1.0 || THR N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C158 0.205 - 5 HB H140 0.060 - 6 OG1 O154 -0.683 - 7 HG1 H155 0.418 - 8 CG2 C135 -0.180 - 9 HG21 H140 0.060 - 10 HG22 H140 0.060 - 11 HG23 H140 0.060 - 12 C C235 0.500 - 13 O O236 -0.500 - 14 HT1 H290 0.330 - 15 HT2 H290 0.330 - 16 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - OG1 CB - CG2 CB - N CA - C CA - CA HA - CB HB - OG1 HG1 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - O C - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB OG1 HG1 - CG2 HG21 HG22 HG23 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NTRP} !charge: 1.0 || TRP N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C136 -0.120 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C500 0.075 - 8 CD1 C514 -0.115 - 9 HD1 H146 0.115 - 10 NE1 N503 -0.570 - 11 HE1 H504 0.420 - 12 CE2 C502 0.130 - 13 CD2 C501 -0.055 - 14 CE3 C145 -0.115 - 15 HE3 H146 0.115 - 16 CZ3 C145 -0.115 - 17 HZ3 H146 0.115 - 18 CZ2 C145 -0.115 - 19 HZ2 H146 0.115 - 20 CH2 C145 -0.115 - 21 HH2 H146 0.115 - 22 C C235 0.500 - 23 O O236 -0.500 - 24 HT1 H290 0.330 - 25 HT2 H290 0.330 - 26 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD2 CG - NE1 CD1 - CZ2 CE2 - N CA - C CA - CZ3 CH2 - CD2 CE3 - NE1 CE2 - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CD1 HD1 - NE1 HE1 - CE3 HE3 - CZ2 HZ2 - CZ3 HZ3 - CH2 HH2 - O C - CD1 CG - CE2 CD2 - CZ3 CE3 - CH2 CZ2 - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CG NE1 - HE1 NE1 CD1 CE2 - HZ2 CZ2 CE2 CH2 - HH2 CH2 CZ2 CZ3 - HZ3 CZ3 CH2 CE3 - HE3 CE3 CZ3 CD2 - CE2 CD2 CE3 CG - CZ2 CE2 CD2 NE1 - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG CD1 HD1 NE1 HE1 CE2 CD2 - CE3 HE3 - CZ3 HZ3 - CZ2 HZ2 - CH2 HH2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NTYR} !charge: 1.0 || TYR N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C149 -0.005 - 5 HB2 H140 0.060 - 6 HB3 H140 0.060 - 7 CG C145 -0.115 - 8 CD1 C145 -0.115 - 9 HD1 H146 0.115 - 10 CE1 C145 -0.115 - 11 HE1 H146 0.115 - 12 CZ C166 0.150 - 13 OH O167 -0.585 - 14 HH H168 0.435 - 15 CD2 C145 -0.115 - 16 HD2 H146 0.115 - 17 CE2 C145 -0.115 - 18 HE2 H146 0.115 - 19 C C235 0.500 - 20 O O236 -0.500 - 21 HT1 H290 0.330 - 22 HT2 H290 0.330 - 23 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD2 CG - CE1 CD1 - CZ CE2 - OH CZ - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CD1 HD1 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - CE2 HE2 - OH HH - O C - CD1 CG - CE1 CZ - CE2 CD2 - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - HD1 CD1 CG CE1 - HE1 CE1 CD1 CZ - OH CZ CE1 CE2 - CB CG CD1 CD2 - HD2 CD2 CE2 CG - HE2 CE2 CZ CD2 - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB2 HB3 CG - CD1 HD1 - CE1 HE1 - CZ OH HH - CD2 HD2 - CE2 HE2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{NVAL} !charge: 1.0 || VAL N-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N287 -0.300 - 2 CA C293 0.250 - 3 HA H140 0.060 - 4 CB C137 -0.060 - 5 HB H140 0.060 - 6 CG1 C135 -0.180 - 7 HG11 H140 0.060 - 8 HG12 H140 0.060 - 9 HG13 H140 0.060 - 10 CG2 C135 -0.180 - 11 HG21 H140 0.060 - 12 HG22 H140 0.060 - 13 HG23 H140 0.060 - 14 C C235 0.500 - 15 O O236 -0.500 - 16 HT1 H290 0.330 - 17 HT2 H290 0.330 - 18 HT3 H290 0.330 - [bonds] - CB CA - CG1 CB - CG2 CB - N CA - C CA - CA HA - CB HB - CG1 HG11 - CG1 HG12 - CG1 HG13 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - O C - HT1 N - HT2 N - HT3 N - [connections] - tail C - [impropers] - O C CA +N - [charge_groups] - N HT1 HT2 HT3 CA HA - CB HB - CG1 HG11 HG12 HG13 - CG2 HG21 HG22 HG23 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{PHE} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C149 -0.005 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C145 -0.115 - 9 CD1 C145 -0.115 - 10 HD1 H146 0.115 - 11 CE1 C145 -0.115 - 12 HE1 H146 0.115 - 13 CZ C145 -0.115 - 14 HZ H146 0.115 - 15 CE2 C145 -0.115 - 16 HE2 H146 0.115 - 17 CD2 C145 -0.115 - 18 HD2 H146 0.115 - 19 C C235 0.500 - 20 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD2 CG - CE1 CD1 - CZ CE2 - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CD1 HD1 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - O C - CD1 CG - CZ CE1 - CE2 CD2 - CE2 HE2 - CZ HZ - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - HD1 CD1 CG CE1 - HE1 CE1 CD1 CZ - HZ CZ CE1 CE2 - CB CG CD1 CD2 - HD2 CD2 CE2 CG - HE2 CE2 CZ CD2 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 CG - CD1 HD1 - CE1 HE1 - CZ HZ - CD2 HD2 - CE2 HE2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{PRO} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N239 -0.140 - 2 CD C245 -0.050 - 3 HD2 H140 0.060 - 4 HD3 H140 0.060 - 5 CA C246 0.010 - 6 HA H140 0.060 - 7 CB C136 -0.120 - 8 HB2 H140 0.060 - 9 HB3 H140 0.060 - 10 CG C136 -0.120 - 11 HG2 H140 0.060 - 12 HG3 H140 0.060 - 13 C C235 0.500 - 14 O O236 -0.500 - [bonds] - C CA - N CA - CA CB - CB CG - CG CD - N CD - HA CA - HG2 CG - HG3 CG - HD2 CD - HD3 CD - HB2 CB - HB3 CB - O C - [connections] - head N - tail C - [impropers] - CD N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N CD HD2 HD3 CA HA - CB HB2 HB3 - CG HG2 HG3 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{SER} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C157 0.145 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 OG O154 -0.683 - 9 HG H155 0.418 - 10 C C235 0.500 - 11 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - OG CB - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - OG HG - O C - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 OG HG - C O -*------------------------------------------------------------------ -{SOD} !charge: 1.00 || Sodium Ion, adm jr. - [atoms] - 1 SOD SOD 1.00 - [charge_groups] - SOD -*------------------------------------------------------------------ -{THR} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.5000 - 2 H H241 0.3000 - 3 CA C224 0.1400 - 4 HA H140 0.0600 - 5 CB C158 0.2050 - 6 HB H140 0.0600 - 7 CG2 C135 -0.1800 - 8 HG21 H140 0.0600 - 9 HG22 H140 0.0600 - 10 HG23 H140 0.0600 - 11 OG1 O154 -0.6830 - 12 HG1 H155 0.4180 - 13 C C235 0.5000 - 14 O O236 -0.5000 - [bonds] - CB CA - OG1 CB - CG2 CB - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB - OG1 HG1 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - O C - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB OG1 HG1 - CG2 HG21 HG22 HG23 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{TIP3} !charge: 0.000 || tip3p water model, generate using noangle nodihedral - [atoms] - 1 OH2 OT -0.834 - 2 H1 HT 0.417 - 3 H2 HT 0.417 - [bonds] - OH2 H1 - OH2 H2 - H1 H2 - [charge_groups] - OH2 H1 H2 -*------------------------------------------------------------------ -{HOH} !charge: 0.000 || tip3p water model, generate using noangle nodihedral - [info] - solvent 1 - density 0.0335 - [atoms] - 1 O OT -0.834 - 2 H1 HT 0.417 - 3 H2 HT 0.417 - [bonds] - O H1 - O H2 - H1 H2 - [charge_groups] - O H1 H2 -*------------------------------------------------------------------ -{WAT} !charge: 0.000 || tip3p water model, generate using noangle nodihedral - [atoms] - 1 O OT -0.834 - 2 H1 HT 0.417 - 3 H2 HT 0.417 - [bonds] - O H1 - O H2 - H1 H2 - [charge_groups] - O H1 H2 -*------------------------------------------------------------------ -{TRP} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C500 0.075 - 9 CD1 C514 -0.115 - 10 HD1 H146 0.115 - 11 NE1 N503 -0.570 - 12 HE1 H504 0.420 - 13 CE2 C502 0.130 - 14 CZ2 C145 -0.115 - 15 HZ2 H146 0.115 - 16 CH2 C145 -0.115 - 17 HH2 H146 0.115 - 18 CZ3 C145 -0.115 - 19 HZ3 H146 0.115 - 20 CE3 C145 -0.115 - 21 HE3 H146 0.115 - 22 CD2 C501 -0.055 - 23 C C235 0.500 - 24 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD2 CG - NE1 CD1 - CZ2 CE2 - N H - N CA - C CA - CZ3 CH2 - CD2 CE3 - NE1 CE2 - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CD1 HD1 - NE1 HE1 - CE3 HE3 - CZ2 HZ2 - CZ3 HZ3 - CH2 HH2 - O C - CD1 CG - CE2 CD2 - CZ3 CE3 - CH2 CZ2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CG NE1 - HE1 NE1 CD1 CE2 - HZ2 CZ2 CE2 CH2 - HH2 CH2 CZ2 CZ3 - HZ3 CZ3 CH2 CE3 - HE3 CE3 CZ3 CD2 - CE2 CD2 CE3 CG - CZ2 CE2 CD2 NE1 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 - CG CD1 HD1 NE1 HE1 CE2 CD2 - CE3 HE3 - CZ3 HZ3 - CZ2 HZ2 - CH2 HH2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{TYR} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C149 -0.005 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C145 -0.115 - 9 CD1 C145 -0.115 - 10 HD1 H146 0.115 - 11 CE1 C145 -0.115 - 12 HE1 H146 0.115 - 13 CZ C166 0.150 - 14 OH O167 -0.585 - 15 HH H168 0.435 - 16 CD2 C145 -0.115 - 17 HD2 H146 0.115 - 18 CE2 C145 -0.115 - 19 HE2 H146 0.115 - 20 C C235 0.500 - 21 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD2 CG - CE1 CD1 - CZ CE2 - OH CZ - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CD1 HD1 - CD2 HD2 - CE1 HE1 - CE2 HE2 - OH HH - O C - CD1 CG - CE1 CZ - CE2 CD2 - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - HD1 CD1 CG CE1 - HE1 CE1 CD1 CZ - OH CZ CE1 CE2 - CB CG CD1 CD2 - HD2 CD2 CE2 CG - HE2 CE2 CZ CD2 - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB2 HB3 CG - CD1 HD1 - CE1 HE1 - CZ OH HH - CD2 HD2 - CE2 HE2 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{VAL} !charge: 0.00 || - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C224 0.140 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C137 -0.060 - 6 HB H140 0.060 - 7 CG1 C135 -0.180 - 8 HG11 H140 0.060 - 9 HG12 H140 0.060 - 10 HG13 H140 0.060 - 11 CG2 C135 -0.180 - 12 HG21 H140 0.060 - 13 HG22 H140 0.060 - 14 HG23 H140 0.060 - 15 C C235 0.500 - 16 O O236 -0.500 - [bonds] - CB CA - CG1 CB - CG2 CB - N H - N CA - C CA - CA HA - CB HB - CG1 HG11 - CG1 HG12 - CG1 HG13 - CG2 HG21 - CG2 HG22 - CG2 HG23 - O C - [connections] - head N - tail C - [impropers] - H N -C CA - O C CA +N - [charge_groups] - N H CA HA - CB HB - CG1 HG11 HG12 HG13 - CG2 HG21 HG22 HG23 - C O -*------------------------------------------------------------------ -{MG2} !Magnesium Kamerlin et al 2014, J Phys Chem - [info] - SYBYLtype GROUP !SYBYL substructure type - [atoms] - 1 DMG DMG -1.00 - 2 H1 DH1 0.50 - 3 H2 DH2 0.50 - 4 H3 DH3 0.50 - 5 H4 DH4 0.50 - 6 H5 DH5 0.50 - 7 H6 DH6 0.50 - [bonds] - DMG H1 - DMG H2 - DMG H3 - DMG H4 - DMG H5 - DMG H6 - H1 H2 - H1 H4 - H1 H5 - H1 H6 - H2 H3 - H2 H5 - H2 H6 - H3 H4 - H3 H5 - H3 H6 - H4 H5 - H4 H6 - - [charge_groups] !charge groups, with switch atom first - DMG H1 H2 H3 H4 H5 H6 - -*------------------------------------------------------------- - - -*------------------------------------------------------------------ -! Manually adding single amoni acid entry -{LTRP} !charge: -1.1 || TRP C-terminal (standard) - [atoms] - 1 N N238 -0.500 - 2 H H241 0.300 - 3 CA C283 0.040 - 4 HA H140 0.060 - 5 CB C136 -0.120 - 6 HB2 H140 0.060 - 7 HB3 H140 0.060 - 8 CG C500 0.075 - 9 CD1 C514 -0.115 - 10 HD1 H146 0.115 - 11 NE1 N503 -0.570 - 12 HE1 H504 0.420 - 13 CE2 C502 0.130 - 14 CD2 C501 -0.055 - 15 CE3 C145 -0.115 - 16 HE3 H146 0.115 - 17 CZ3 C145 -0.115 - 18 HZ3 H146 0.115 - 19 CZ2 C145 -0.115 - 20 HZ2 H146 0.115 - 21 CH2 C145 -0.115 - 22 HH2 H146 0.115 - 23 C C271 0.700 - 24 O O272 -0.800 - 25 OXT O272 -0.800 - [bonds] - CB CA - CG CB - CD2 CG - NE1 CD1 - CZ2 CE2 - N H - N CA - C CA - CZ3 CH2 - CD2 CE3 - NE1 CE2 - CA HA - CB HB2 - CB HB3 - CD1 HD1 - NE1 HE1 - CE3 HE3 - CZ2 HZ2 - CZ3 HZ3 - CH2 HH2 - CD1 CG - CE2 CD2 - CZ3 CE3 - CH2 CZ2 - C OXT - C O - [connections] - head N - [impropers] - H N -C CA - CB CG CD1 CD2 - HD1 CD1 CG NE1 - HE1 NE1 CD1 CE2 - HZ2 CZ2 CE2 CH2 - HH2 CH2 CZ2 CZ3 - HZ3 CZ3 CH2 CE3 - HE3 CE3 CZ3 CD2 - CE2 CD2 CE3 CG - CZ2 CE2 CD2 NE1 - O C CA OXT - [charge_groups] - N H CA HA C O OXT - CB HB2 HB3 - CG CD1 HD1 NE1 HE1 CE2 CD2 - CE3 HE3 - CZ3 HZ3 - CZ2 HZ2 - CH2 HH2 -*------------------------------------------------------------------ -{Na+} !Sodium ion - [info] - SYBYLtype GROUP - [atoms] - 1 SOD SOD 1.000 -*---------------------------------------------------------------------- - -{POP} ! POPC - [info] - SYBYLtype RESIDUE !SYBYL substructure type - [atoms] - 1 N4 LNL -0.5000 - 2 P8 LP 1.700 - 3 C12 LC2 0.400 - 4 O7 LOS -0.800 - 5 C13 LH1 0.300 - 6 O11 LOS -0.700 - 7 C32 LC2 0.50 - 8 O9 LOM -0.800 - 9 O10 LOM -0.800 - 10 C5 LH2 0.3000 - 11 C1 LC3 0.4000 - 12 C2 LC3 0.4000 - 13 C3 LC3 0.4000 - 14 C6 LC2 0.4000 - 15 C15 LC 0.7000 - 16 O14 LOS -0.700 - 17 C17 LP2 0.0 - 18 O16 LO -0.700 - 19 C18 LP2 0.0 - 20 C19 LP2 0.0 - 21 C20 LP2 0.0 - 22 C21 LP2 0.0 - 23 C22 LP2 0.0 - 24 C23 LP2 0.0 - 25 C24 LH1 0.0 - 26 C34 LC 0.800 - 27 O33 LOS -0.70 - 28 C36 LP2 0.0 - 29 O35 LO -0.60 - 30 C37 LP2 0.0 - 31 C38 LP2 0.0 - 32 C39 LP2 0.0 - 33 C40 LP2 0.0 - 34 C41 LP2 0.0 - 35 C42 LP2 0.0 - 36 C43 LP2 0.0 - 37 C25 LH1 0.0 - 38 C26 LP2 0.0 - 39 C27 LP2 0.0 - 40 C28 LP2 0.0 - 41 C29 LP2 0.0 - 42 C30 LP2 0.0 - 43 C31 LP2 0.0 - 44 CA1 LP2 0.0 - 45 CA2 LP3 0.0 - 46 C44 LP2 0.0 - 47 C45 LP2 0.0 - 48 C46 LP2 0.0 - 49 C47 LP2 0.0 - 50 C48 LP2 0.0 - 51 C49 LP2 0.0 - 52 C50 LP3 0.0 - - [bonds] - N4 C1 - N4 C2 - N4 C3 - N4 C5 - C5 C6 - C6 O7 - P8 O7 - P8 O11 - P8 O9 - P8 O10 - C12 O11 - C12 C13 - C13 O14 - C15 O14 - C15 O16 - C15 C17 - C17 C18 - C18 C19 - C19 C20 - C20 C21 - C21 C22 - C22 C23 - C23 C24 - C24 C25 - C25 C26 - C26 C27 - C27 C28 - C28 C29 - C29 C30 - C30 C31 - C31 CA1 - CA1 CA2 - C13 C32 - C32 O33 - C34 O33 - C34 O35 - C34 C36 - C36 C37 - C37 C38 - C38 C39 - C39 C40 - C40 C41 - C41 C42 - C42 C43 - C43 C44 - C44 C45 - C45 C46 - C46 C47 - C47 C48 - C48 C49 - C49 C50 - - [connections] !tail and head connections - - [impropers] - O14 C15 O16 C17 - O33 C34 O35 C36 - O14 C13 C12 C32 - [charge_groups] !charge groups, with switch atom first - C6 N4 C1 C2 C3 C5 P8 O7 O9 O10 O11 - O14 C12 C13 C15 O16 - C17 C18 C19 - C20 C21 - C22 C23 - C24 C25 - C26 C27 - C28 C29 - C30 C31 - CA1 CA2 - O33 C32 C34 O35 - C36 C37 C38 - C39 C40 - C41 C42 - C43 C44 - C45 C46 - C47 C48 - C49 C50 - -*---------------------------------------------------------------------- -{PO4} ! PO4: atoms 6 charge -2.0000 - -[info] -SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 P1 TP3 1.9180 - 2 O1 TO2Z -1.1200 - 3 O2 TOS -0.9380 - 4 O3 TO2Z -1.1200 - 5 O4 TO2Z -1.1200 - 6 HO2 THO 0.3800 - -[bonds] -P1 O1 -P1 O2 -P1 O3 -P1 O4 -O2 HO2 - -[charge_groups] -P1 O1 O2 O3 O4 HO2 - -*---------------------------------------------------------------------- -{ACE} ! acetylated N-terminus: atoms 6 charge 0.0000 - -[info] -SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 C C 0.5000 - 2 O O -0.5000 - 3 CH3 CT -0.1800 - 4 HH31 HC 0.0600 - 5 HH32 HC 0.0600 - 6 HH33 HC 0.0600 - -[bonds] -C O -C CH3 -CH3 HH31 -CH3 HH32 -CH3 HH33 - -[connections] - tail C - -[impropers] -O C CH3 +N - -[charge_groups] - CH3 HH31 HH32 HH33 - C O -*---------------------------------------------------------------------- -{NMA} ! C-term N-methyl amide: atoms 6 charge 0.0000 - -[info] -SYBYLtype RESIDUE - -[atoms] - 1 N N -0.5000 - 2 CA CT 0.0200 - 3 H H 0.3000 - 4 HA1 HC 0.0600 - 5 HA2 HC 0.0600 - 6 HA3 HC 0.0600 - -[bonds] -N H -N CA -CA HA1 -CA HA2 -CA HA3 - -[connections] - head N - -[impropers] - H N -C CA - -[charge_groups] - N H CA HA1 HA2 HA3 diff --git a/benchmark-data-shevsea/ff/OPLS2015.prm b/benchmark-data-shevsea/ff/OPLS2015.prm deleted file mode 100644 index 796a334b..00000000 --- a/benchmark-data-shevsea/ff/OPLS2015.prm +++ /dev/null @@ -1,2681 +0,0 @@ -*------------------------------------------------ -* -*Q-FF parameters: OPLS-AA/M 2015 parameters -* -*------------------------------------------------ -* OPLS-AA/M 2015 -*Parameters translated for Q with charmm_Q_par.py (Geir V. Isaksen, 2015) -*________________________________________________ -[options] -name OPLS-AA/M 2015 -vdw_rule geometric ! vdW combination rule (geometric or arithmetic ) -scale_14 0.5 ! electrostatic 1-4 scaling factor -switch_atoms on ! on = use switch atom; off = use charge group -improper_definition explicit ! improper representation by 2 or four atoms -improper_potential periodic -coulomb_constant 332.0716 ! Constant in electrostatic energy calculation; default = 332. -force_field AMBER ! Force Field Type (GROMOS (default), AMBER or CHARMM) - - -[atom_types] -*-iac------Avdw1------Avdw2-----Bvdw1------Avdw3-----Bvdw2&3----mass---SYBYL-name-old-comment -C135 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C136 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C137 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C145 1059.1296 1059.1296 23.6736 748.9177 16.7398 12.0110 1 -C149 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C157 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C158 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C166 1059.1296 1059.1296 23.6736 748.9177 16.7398 12.0110 1 -C206 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C209 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C210 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C214 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C223 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C224 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C235 1802.2382 1802.2382 34.1758 1274.3749 24.1659 12.0110 1 -C242 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C245 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C246 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C267 1802.2382 1802.2382 34.1758 1274.3749 24.1659 12.0110 1 -C271 1802.2382 1802.2382 34.1758 1274.3749 24.1659 12.0110 1 -C274 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C283 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C284 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C285 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C292 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C293 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C295 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C296 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C302 58.0243 58.0243 5.0940 41.0294 3.6020 12.0110 1 -C307 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C308 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C500 1059.1296 1059.1296 23.6736 748.9177 16.7398 12.0110 1 -C501 1059.1296 1059.1296 23.6736 748.9177 16.7398 12.0110 1 -C502 1059.1296 1059.1296 23.6736 748.9177 16.7398 12.0110 1 -C505 944.5180 944.5180 22.0296 667.8751 15.5773 12.0110 1 -C506 1059.1296 1059.1296 23.6736 748.9177 16.7398 12.0110 1 -C507 1059.1296 1059.1296 23.6736 748.9177 16.7398 12.0110 1 -C508 1059.1296 1059.1296 23.6736 748.9177 16.7398 12.0110 1 -C509 1059.1296 1059.1296 23.6736 748.9177 16.7398 12.0110 1 -C510 1059.1296 1059.1296 23.6736 748.9177 16.7398 12.0110 1 -C514 1059.1296 1059.1296 23.6736 748.9177 16.7398 12.0110 1 -H140 84.5728 84.5728 5.4127 59.8020 3.8273 1.0080 1 -H146 69.5797 69.5797 4.9095 49.2003 3.4715 1.0080 1 -H155 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0080 1 -H168 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0080 1 -H204 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0080 1 -H240 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0080 1 -H241 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0080 1 -H270 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0080 1 -H290 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0080 1 -H301 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0080 1 -H304 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0080 1 -H310 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0080 1 -H504 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0080 1 -H513 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 1.0080 1 -N237 971.7501 971.7501 28.3077 687.1311 20.0166 14.0070 1 -N238 971.7501 971.7501 28.3077 687.1311 20.0166 14.0070 1 -N239 971.7501 971.7501 28.3077 687.1311 20.0166 14.0070 1 -N287 971.7501 971.7501 28.3077 687.1311 20.0166 14.0070 1 -N300 971.7501 971.7501 28.3077 687.1311 20.0166 14.0070 1 -N303 971.7501 971.7501 28.3077 687.1311 20.0166 14.0070 1 -N309 971.7501 971.7501 28.3077 687.1311 20.0166 14.0070 1 -N503 971.7501 971.7501 28.3077 687.1311 20.0166 14.0070 1 -N511 971.7501 971.7501 28.3077 687.1311 20.0166 14.0070 1 -N512 971.7501 971.7501 28.3077 687.1311 20.0166 14.0070 1 -O154 760.6450 760.6450 25.0448 537.8573 17.7094 15.9994 1 -O167 690.3743 690.3743 23.8600 488.1684 16.8715 15.9994 1 -O236 616.4386 616.4386 23.7692 435.8879 16.8074 15.9994 1 -O268 601.1489 601.1489 22.2648 425.0764 15.7436 15.9994 1 -O269 616.4386 616.4386 23.7692 435.8879 16.8074 15.9994 1 -O272 616.4386 616.4386 23.7692 435.8879 16.8074 15.9994 1 -S200 2838.1770 2838.1770 60.8320 2006.8942 43.0147 32.0600 1 -S202 2593.9356 2593.9356 55.5970 1834.1895 39.3130 32.0600 1 -S203 2593.9356 2593.9356 55.5970 1834.1895 39.3130 32.0600 1 -OT 762.8390 762.8390 24.3929 539.4086 17.2484 15.9994 1 -HT 0.00 0.00 0.00 0.00 0.00 1.0080 1 -SOD 1036.9613 1036.9613 6.8099 733.2424 4.8153 22.9898 1 -CLA 7112.3885 7112.3885 109.4806 5029.2181 77.4145 35.4500 1 -ZN 53.50 0.00 7.19 37.83 5.09 65.38 !ZN2+ from Hugo-QOPLSAA2001.prm - -!popc -LC 1802.25 1802.25 34.18 1274.38 24.17 12.01 -LC2 2068.38 2068.38 37.70 1462.57 26.66 14.03 -LC3 2936.96 2936.96 47.29 2076.74 33.44 15.04 -LH1 1703.39 1703.39 31.04 1204.48 21.95 13.02 -LH2 2436.09 2436.09 40.91 1722.57 28.93 14.03 -LNL 971.76 971.76 28.31 687.14 20.02 14.01 -LO 616.46 616.46 23.77 435.90 16.81 16.00 -LOM 616.46 616.46 23.77 435.90 16.81 16.00 -LOS 668.18 668.18 24.75 472.47 17.50 16.00 -LP 2447.83 2447.83 46.79 1730.88 33.09 30.97 -LP2 2326.69 2326.69 37.47 1645.22 26.49 14.03 -LP3 2844.35 2844.35 45.80 2011.26 32.39 15.04 - -!PO4 -TP3 2447.79 2447.79 46.79 1730.85 33.09 30.97 ! high P in PO3-- -TO2Z 626.39 626.39 23.67 442.92 16.74 16.00 ! high O= in OP -TOS 401.02 401.02 17.32 283.56 12.25 16.00 ! high OR in P=O or P=S -THO 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.01 ! high H(O): alcohols - -!ACE-NMA capping - C 1802.24 1802.24 34.18 1274.38 24.17 12.01 ! high C: C=O in amide or unsaturated amide. - O 616.44 616.44 23.77 435.89 16.81 16.00 ! high O: C=O in amide. - CT 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.01 ! high C: alkanes - HC 84.57 84.57 5.41 59.80 3.83 1.01 ! high H on C-alpha in amide - N 971.75 971.75 28.31 687.13 20.02 14.01 ! high N: secondary amide - CT1G 944.52 944.52 22.03 667.88 15.58 12.01 ! high C alpha glycin - H 0.01 0.01 0.04 0.00 0.03 1.01 ! high H on neutral N - -! Ligand vdW parameters -! End ligand vdW parameters - -[bonds] -*iaci iacj force.c. dist. -*------------------------------------------------ -OT HT 1106.000 0.957 -HT HT 0.000 1.514 -S203 S203 332.000 2.038 -C135 C136 536.000 1.529 -C135 C137 536.000 1.529 -C135 C158 536.000 1.529 -C135 C224 536.000 1.529 -C135 C235 634.000 1.522 -C135 C283 536.000 1.529 -C135 C293 536.000 1.529 -C135 H140 680.000 1.090 -C136 C136 536.000 1.529 -C136 C137 536.000 1.529 -C136 C210 536.000 1.529 -C136 C224 536.000 1.529 -C136 C235 634.000 1.522 -C136 C245 536.000 1.529 -C136 C246 536.000 1.529 -C136 C267 634.000 1.522 -C136 C274 536.000 1.529 -C136 C283 536.000 1.529 -C136 C285 536.000 1.529 -C136 C292 536.000 1.529 -C136 C293 536.000 1.529 -C136 C295 536.000 1.529 -C136 C296 536.000 1.529 -C136 C308 536.000 1.529 -C136 C500 634.000 1.495 -C136 H140 680.000 1.090 -C137 C224 536.000 1.529 -C137 C283 536.000 1.529 -C137 C293 536.000 1.529 -C137 H140 680.000 1.090 -C145 C145 938.000 1.400 -C145 C149 634.000 1.510 -C145 C166 938.000 1.400 -C145 C501 938.000 1.404 -C145 C502 938.000 1.400 -C145 H146 734.000 1.080 -C149 C224 536.000 1.529 -C149 C283 536.000 1.529 -C149 C293 536.000 1.529 -C149 H140 680.000 1.090 -C157 C224 536.000 1.529 -C157 C283 536.000 1.529 -C157 C293 536.000 1.529 -C157 H140 680.000 1.090 -C157 O154 640.000 1.410 -C158 C224 536.000 1.529 -C158 C283 536.000 1.529 -C158 C293 536.000 1.529 -C158 H140 680.000 1.090 -C158 O154 640.000 1.410 -C166 O167 900.000 1.364 -C206 C224 536.000 1.529 -C206 C283 536.000 1.529 -C206 C293 536.000 1.529 -C206 H140 680.000 1.090 -C206 S200 444.000 1.810 -C209 H140 680.000 1.090 -C209 S202 444.000 1.810 -C210 H140 680.000 1.090 -C210 S202 444.000 1.810 -C214 C224 536.000 1.529 -C214 C283 536.000 1.529 -C214 C293 536.000 1.529 -C214 H140 680.000 1.090 -C214 S203 444.000 1.810 -C223 C235 634.000 1.522 -C223 H140 680.000 1.090 -C223 N238 674.000 1.449 -C223 C267 634.000 1.522 ! phosphorylated C-terminal Gly, adm jr. -C224 C235 634.000 1.522 -C224 C267 634.000 1.522 -C224 C274 536.000 1.529 -C224 C505 536.000 1.529 -C224 H140 680.000 1.090 -C224 N238 674.000 1.449 -C235 C246 634.000 1.522 -C235 C292 634.000 1.522 -C235 C293 634.000 1.522 -C235 C295 634.000 1.522 -C235 N237 980.000 1.335 -C235 N238 980.000 1.335 -C235 N239 980.000 1.335 -C235 O236 1140.000 1.229 -C242 H140 680.000 1.090 -C242 N238 674.000 1.449 -C245 H140 680.000 1.090 -C245 N239 674.000 1.449 -C246 H140 680.000 1.090 -C246 N239 674.000 1.449 -C267 O268 900.000 1.364 -C267 O269 1140.000 1.229 -C271 C274 634.000 1.522 -C271 C283 634.000 1.522 -C271 C246 634.000 1.522 -C271 C284 634.000 1.522 -C271 C285 634.000 1.522 -C271 O272 1312.000 1.250 -C274 C283 536.000 1.529 -C274 C293 536.000 1.529 -C274 H140 680.000 1.090 -C283 C505 536.000 1.529 -C283 H140 680.000 1.090 -C283 N238 674.000 1.449 -C284 H140 680.000 1.090 -C284 N238 674.000 1.449 -C285 H140 680.000 1.090 -C285 N239 674.000 1.449 -C292 H140 680.000 1.090 -C292 N287 734.000 1.471 -C293 C505 536.000 1.529 -C293 H140 680.000 1.090 -C293 N287 734.000 1.471 -C295 H140 680.000 1.090 -C295 N309 734.000 1.471 -C296 H140 680.000 1.090 -C296 N309 734.000 1.471 -C302 N300 962.000 1.340 -C302 N303 962.000 1.340 -C307 C308 536.000 1.529 -C307 H140 680.000 1.090 -C307 N303 674.000 1.463 -C308 H140 680.000 1.090 -C500 C501 776.000 1.459 -C500 C514 1092.000 1.352 -C501 C502 894.000 1.419 -C502 N503 856.000 1.380 -C505 C507 634.000 1.504 -C505 C508 634.000 1.504 -C505 C510 634.000 1.504 -C505 H140 680.000 1.090 -C506 H146 734.000 1.080 -C506 N503 954.000 1.343 -C506 N511 976.000 1.335 -C507 C508 1040.000 1.370 -C507 H146 734.000 1.080 -C507 N511 820.000 1.394 -C508 H146 734.000 1.080 -C508 N503 854.000 1.381 -C509 H146 734.000 1.080 -C509 N512 954.000 1.343 -C510 C510 1040.000 1.370 -C510 H146 734.000 1.080 -C510 N512 854.000 1.381 -C514 H146 734.000 1.080 -C514 N503 854.000 1.381 -H155 O154 1106.000 0.945 -H168 O167 1106.000 0.945 -H204 S200 548.000 1.336 -H240 N237 868.000 1.010 -H241 N238 868.000 1.010 -H270 O268 1106.000 0.945 -H290 N287 868.000 1.010 -H301 N300 868.000 1.010 -H304 N303 868.000 1.010 -H310 N309 868.000 1.010 -H504 N503 868.000 1.010 -H513 N512 868.000 1.010 -N287 H241 868.000 1.010 -!Below here are manually added parameters by analogy -C283 N239 674.000 1.449 - -!popc -LNL LC3 895.1 1.47 -LNL LH2 900.1 1.47 -LH2 LC2 800.0 1.53 -LC2 LOS 599.9 1.43 -LP LOS 599.9 1.61 -LP LOM 900.1 1.48 -LC2 LH1 800.0 1.53 -LH1 LOS 599.9 1.435 -LC LOS 900.1 1.36 -LC LO 1200.0 1.23 -LC LP2 800.0 1.53 -LP2 LP2 800.0 1.53 -LP2 LH1 800.0 1.53 -LH1 LH1 1000.0 1.39 -LP2 LP3 800.0 1.53 - -!PO4 - TP3 TO2Z 1050.00 1.52 !high 0 => 0 P3-O2Z ==> P3-O2Z - TP3 TOS 460.00 1.63 !high 0 => 0 P3-OS ==> P3-OS - TOS THO 1106.00 0.94 !high 0 => 0 OS-HO ==> OS-HO - -!ACE-NMA capping -! Ligand bond parameters for TER - C O 1140.00 1.23 !high 0 => 0 C-O ==> O-C - C CT 634.00 1.52 !high 0 => 0 C-CT ==> CT-C - C N 980.00 1.33 !high 0 => 0 C-N ==> N-C - C N238 980.00 1.33 !high 0 => 0 C-N ==> N-C - CT HC 680.00 1.09 !high 0 => 0 CT-HC ==> HC-CT - N CT1G 674.00 1.45 !high 0 => 0 N-CT1G ==> CT1G-N - C235 N 980.00 1.33 !high 0 => 0 N-C ==> C-N - N H 868.00 1.01 !high 0 => 0 N-H ==> N-H - CT1G C 634.00 1.52 !high 0 => 0 CT1G-C ==> C-CT1G - CT1G HC 680.00 1.09 !high 0 => 0 CT1G-HC ==> HC-CT1G - N CT 674.00 1.45 !high 0 => 0 N-CT ==> N-CT - -! Ligand bond parameters -! End ligand bond parameters - -[angles] -*iaci iacj iack forceK angle0 forceUB Stheta -*------------------------------------------------------------ -HT OT HT 200.00 104.5 0.00 0.00 -HT HT OT 0.00 127.740 0.00 0.00 -H140 C135 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C136 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C149 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C157 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C206 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C209 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C210 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C214 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C223 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C224 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C242 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C245 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C274 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C284 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C292 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C296 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C307 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C308 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H140 C505 H140 66.00 107.8 0.00 0.00 -H290 N287 H290 70.00 109.5 0.00 0.00 -H310 N309 H310 70.00 109.5 0.00 0.00 -C135 C136 C137 116.70 112.7 0.00 0.00 -C135 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C135 C137 C135 116.70 112.7 0.00 0.00 -C135 C137 C136 116.70 112.7 0.00 0.00 -C135 C137 C224 116.70 112.7 0.00 0.00 -C135 C137 C283 116.70 112.7 0.00 0.00 -C135 C137 C293 116.70 112.7 0.00 0.00 -C135 C137 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C135 C158 C224 116.70 112.7 0.00 0.00 -C135 C158 C283 116.70 112.7 0.00 0.00 -C135 C158 C293 116.70 112.7 0.00 0.00 -C135 C158 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C135 C158 O154 100.00 109.5 0.00 0.00 -C135 C224 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C135 C224 C267 126.00 111.1 0.00 0.00 -C135 C224 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C135 C224 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C135 C235 N238 140.00 116.6 0.00 0.00 -C135 C235 N239 140.00 116.6 0.00 0.00 -C135 C235 O236 160.00 120.4 0.00 0.00 -C135 C283 C271 126.00 111.1 0.00 0.00 -C135 C283 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C135 C283 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C135 C293 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C135 C293 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C135 C293 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C136 C135 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C136 C136 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C136 C224 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C136 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C136 C136 C245 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C136 C246 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C136 C267 126.00 111.1 0.00 0.00 -C136 C136 C283 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C136 C285 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C136 C292 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C136 C293 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C136 C295 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C136 C296 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C137 C224 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C137 C283 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C137 C293 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C137 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C210 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C210 S202 100.00 114.7 0.00 0.00 -C136 C224 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C136 C224 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C224 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C136 C235 N237 140.00 116.6 0.00 0.00 -C136 C235 O236 160.00 120.4 0.00 0.00 -C136 C245 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C245 N239 160.00 109.7 0.00 0.00 -C136 C246 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C136 C246 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C246 N239 160.00 109.7 0.00 0.00 -C136 C267 O268 140.00 108.0 0.00 0.00 -C136 C267 O269 160.00 120.4 0.00 0.00 -C136 C274 C271 126.00 111.1 0.00 0.00 -C136 C274 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C283 C271 126.00 111.1 0.00 0.00 -C136 C283 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C283 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C136 C285 C271 126.00 111.1 0.00 0.00 -C136 C285 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C285 N239 160.00 109.7 0.00 0.00 -C136 C292 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C292 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C136 C293 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C136 C293 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C293 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C136 C295 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C136 C295 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C295 N309 160.00 111.2 0.00 0.00 -C136 C296 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C296 N309 160.00 111.2 0.00 0.00 -C136 C308 C307 116.70 112.7 0.00 0.00 -C136 C308 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C136 C500 C501 140.00 128.6 0.00 0.00 -C136 C500 C514 140.00 125.0 0.00 0.00 -C137 C135 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C137 C136 C224 116.70 112.7 0.00 0.00 -C137 C136 C283 116.70 112.7 0.00 0.00 -C137 C136 C293 116.70 112.7 0.00 0.00 -C137 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C137 C224 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C137 C224 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C137 C224 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C137 C283 C271 126.00 111.1 0.00 0.00 -C137 C283 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C137 C283 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C137 C293 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C137 C293 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C137 C293 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C145 C145 C145 126.00 120.0 0.00 0.00 -C145 C145 C149 140.00 120.0 0.00 0.00 -C145 C145 C166 126.00 120.0 0.00 0.00 -C145 C145 C501 126.00 120.0 0.00 0.00 -C145 C145 C502 170.00 120.0 0.00 0.00 -C145 C145 H146 70.00 120.0 0.00 0.00 -C145 C149 C224 126.00 114.0 0.00 0.00 -C145 C149 C283 126.00 114.0 0.00 0.00 -C145 C149 C293 126.00 114.0 0.00 0.00 -C145 C149 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C145 C166 C145 126.00 120.0 0.00 0.00 -C145 C166 O167 140.00 120.0 0.00 0.00 -C145 C501 C500 170.00 134.9 0.00 0.00 -C145 C501 C502 170.00 116.2 0.00 0.00 -C145 C502 C501 170.00 122.7 0.00 0.00 -C145 C502 N503 140.00 132.8 0.00 0.00 -C149 C224 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C149 C224 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C149 C224 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C149 C283 C271 126.00 111.1 0.00 0.00 -C149 C283 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C149 C283 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C149 C293 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C149 C293 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C149 C293 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C157 C224 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C157 C224 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C157 C224 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C157 C283 C271 126.00 111.1 0.00 0.00 -C157 C283 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C157 C283 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C157 C293 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C157 C293 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C157 C293 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C157 O154 H155 110.00 108.5 0.00 0.00 -C158 C135 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C158 C224 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C158 C224 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C158 C224 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C158 C283 C271 126.00 111.1 0.00 0.00 -C158 C283 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C158 C283 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C158 C293 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C158 C293 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C158 C293 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C158 O154 H155 110.00 108.5 0.00 0.00 -C166 C145 H146 70.00 120.0 0.00 0.00 -C166 O167 H168 70.00 113.0 0.00 0.00 -C206 C224 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C206 C224 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C206 C224 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C206 C283 C271 126.00 111.1 0.00 0.00 -C206 C283 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C206 C283 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C206 C293 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C206 C293 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C206 C293 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C206 S200 H204 88.00 96.0 0.00 0.00 -C209 S202 C210 124.00 98.9 0.00 0.00 -C210 C136 C224 116.70 112.7 0.00 0.00 -C210 C136 C283 116.70 112.7 0.00 0.00 -C210 C136 C293 116.70 112.7 0.00 0.00 -C210 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C214 C224 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C214 C224 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C214 C224 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C214 C283 C271 126.00 111.1 0.00 0.00 -C214 C283 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C214 C283 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C214 C293 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C214 C293 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C214 C293 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C214 S203 S203 136.00 103.7 0.00 0.00 -C223 C235 N238 140.00 116.6 0.00 0.00 -C223 C235 N239 140.00 116.6 0.00 0.00 -C223 C235 O236 160.00 120.4 0.00 0.00 -C223 N238 C235 100.00 121.9 0.00 0.00 -C223 N238 H241 76.00 118.4 0.00 0.00 -C224 C135 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C224 C136 C235 126.00 111.1 0.00 0.00 -C224 C136 C267 126.00 111.1 0.00 0.00 -C224 C136 C274 116.70 112.7 0.00 0.00 -C224 C136 C308 116.70 112.7 0.00 0.00 -C224 C136 C500 126.00 115.6 0.00 0.00 -C224 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C224 C137 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C224 C149 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C224 C157 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C224 C157 O154 100.00 109.5 0.00 0.00 -C224 C158 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C224 C158 O154 100.00 109.5 0.00 0.00 -C224 C206 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C224 C206 S200 100.00 108.6 0.00 0.00 -C224 C214 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C224 C214 S203 100.00 114.7 0.00 0.00 -C224 C235 N238 140.00 116.6 0.00 0.00 -C224 C235 N239 140.00 116.6 0.00 0.00 -C224 C235 O236 160.00 120.4 0.00 0.00 -C223 C267 O268 140.00 108.0 0.00 0.00 ! protonated C-terminal Gly, adm jr. -C224 C267 O268 140.00 108.0 0.00 0.00 -C223 C267 O269 160.00 120.4 0.00 0.00 ! protonated C-terminal Gly, adm jr. -C224 C267 O269 160.00 120.4 0.00 0.00 -C224 C274 C271 126.00 111.1 0.00 0.00 -C224 C274 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C224 C505 C507 126.00 114.0 0.00 0.00 -C224 C505 C508 126.00 114.0 0.00 0.00 -C224 C505 C510 126.00 114.0 0.00 0.00 -C224 C505 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C224 N238 C235 100.00 121.9 0.00 0.00 -C224 N238 H241 76.00 118.4 0.00 0.00 -C235 C135 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C235 C136 C283 126.00 111.1 0.00 0.00 -C235 C136 C293 126.00 111.1 0.00 0.00 -C235 C136 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C235 C223 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C235 C223 N238 126.00 110.1 0.00 0.00 -C235 C224 C274 126.00 111.1 0.00 0.00 -C235 C224 C505 126.00 111.1 0.00 0.00 -C235 C224 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C235 C224 N238 126.00 110.1 0.00 0.00 -C235 C246 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C235 C246 N239 126.00 110.1 0.00 0.00 -C235 C292 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C235 C292 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C235 C293 C274 126.00 111.1 0.00 0.00 -C235 C293 C505 126.00 111.1 0.00 0.00 -C235 C293 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C235 C293 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C235 C295 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C235 C295 N309 160.00 111.2 0.00 0.00 -C235 N237 H240 70.00 119.8 0.00 0.00 -C235 N238 C242 100.00 121.9 0.00 0.00 -C235 N238 C283 100.00 121.9 0.00 0.00 -C235 N238 C284 100.00 121.9 0.00 0.00 -C235 N238 H241 70.00 119.8 0.00 0.00 -C235 N239 C245 100.00 121.9 0.00 0.00 -C235 N239 C246 100.00 121.9 0.00 0.00 -C235 N239 C285 100.00 121.9 0.00 0.00 -C242 N238 H241 76.00 118.4 0.00 0.00 -C245 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C245 N238 C285 100.00 118.0 0.00 0.00 -C245 N239 C246 100.00 118.0 0.00 0.00 -C245 N239 C285 100.00 118.0 0.00 0.00 -C246 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C246 C235 N238 140.00 116.6 0.00 0.00 -C246 C235 N239 140.00 116.6 0.00 0.00 -C246 C235 O236 160.00 120.4 0.00 0.00 -C267 C136 C283 126.00 111.1 0.00 0.00 -C267 C136 C293 126.00 111.1 0.00 0.00 -C267 C136 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C267 C223 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 !protonated C-terminal Gly, adm jr. -C267 C224 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C267 C223 N238 126.00 110.1 0.00 0.00 !protonated C-terminal Gly, adm jr. -C267 C224 N238 126.00 110.1 0.00 0.00 -C267 O268 H270 70.00 113.0 0.00 0.00 -C271 C274 C283 126.00 111.1 0.00 0.00 -C271 C274 C293 126.00 111.1 0.00 0.00 -C271 C274 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C271 C283 C274 126.00 111.1 0.00 0.00 -C271 C283 C505 126.00 111.1 0.00 0.00 -C271 C283 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C271 C283 N238 126.00 110.1 0.00 0.00 -C271 C284 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C271 C284 N238 126.00 110.1 0.00 0.00 -C271 C285 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C271 C285 N239 126.00 110.1 0.00 0.00 -C274 C136 C283 116.70 112.7 0.00 0.00 -C274 C136 C293 116.70 112.7 0.00 0.00 -C274 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C274 C224 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C274 C224 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C274 C271 O272 140.00 117.0 0.00 0.00 -C274 C283 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C274 C283 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C274 C293 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C274 C293 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C283 C135 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C283 C136 C308 116.70 112.7 0.00 0.00 -C283 C136 C500 126.00 115.6 0.00 0.00 -C283 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C283 C137 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C283 C149 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C283 C157 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C283 C157 O154 100.00 109.5 0.00 0.00 -C283 C158 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C283 C158 O154 100.00 109.5 0.00 0.00 -C283 C206 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C283 C206 S200 100.00 108.6 0.00 0.00 -C283 C214 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C283 C214 S203 100.00 114.7 0.00 0.00 -C283 C271 O272 140.00 117.0 0.00 0.00 -C283 C274 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C283 C505 C507 126.00 114.0 0.00 0.00 -C283 C505 C508 126.00 114.0 0.00 0.00 -C283 C505 C510 126.00 114.0 0.00 0.00 -C283 C505 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C283 N238 H241 76.00 118.4 0.00 0.00 -C284 C271 O272 140.00 117.0 0.00 0.00 -C284 N238 H241 76.00 118.4 0.00 0.00 -C285 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C285 C271 O272 140.00 117.0 0.00 0.00 -C292 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C292 C235 N238 140.00 116.6 0.00 0.00 -C292 C235 N239 140.00 116.6 0.00 0.00 -C292 C235 O236 160.00 120.4 0.00 0.00 -C292 N287 H290 70.00 109.5 0.00 0.00 -C293 C135 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C293 C136 C308 116.70 112.7 0.00 0.00 -C293 C136 C500 126.00 115.6 0.00 0.00 -C293 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C293 C137 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C293 C149 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C293 C157 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C293 C157 O154 100.00 109.5 0.00 0.00 -C293 C158 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C293 C158 O154 100.00 109.5 0.00 0.00 -C293 C206 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C293 C206 S200 100.00 108.6 0.00 0.00 -C293 C214 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C293 C214 S203 100.00 114.7 0.00 0.00 -C293 C235 N238 140.00 116.6 0.00 0.00 -C293 C235 N239 140.00 116.6 0.00 0.00 -C293 C235 O236 160.00 120.4 0.00 0.00 -C293 C274 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C293 C505 C507 126.00 114.0 0.00 0.00 -C293 C505 C508 126.00 114.0 0.00 0.00 -C293 C505 C510 126.00 114.0 0.00 0.00 -C293 C505 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C293 N287 H290 70.00 109.5 0.00 0.00 -C295 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C295 C235 N238 140.00 116.6 0.00 0.00 -C295 C235 N239 140.00 116.6 0.00 0.00 -C295 C235 O236 160.00 120.4 0.00 0.00 -C295 N309 C296 100.00 113.0 0.00 0.00 -C295 N309 H310 70.00 109.5 0.00 0.00 -C296 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C296 N309 H310 70.00 109.5 0.00 0.00 -C302 N300 H301 70.00 120.0 0.00 0.00 -C302 N303 C307 100.00 123.2 0.00 0.00 -C302 N303 H304 70.00 120.0 0.00 0.00 -C307 C308 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C307 N303 H304 70.00 118.4 0.00 0.00 -C308 C136 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C308 C307 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C308 C307 N303 160.00 111.2 0.00 0.00 -C500 C136 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C500 C501 C502 170.00 108.8 0.00 0.00 -C500 C514 H146 70.00 120.0 0.00 0.00 -C500 C514 N503 140.00 108.7 0.00 0.00 -C501 C145 H146 70.00 120.0 0.00 0.00 -C501 C500 C514 170.00 106.4 0.00 0.00 -C501 C502 N503 140.00 104.4 0.00 0.00 -C502 C145 H146 70.00 120.0 0.00 0.00 -C502 N503 C514 140.00 111.6 0.00 0.00 -C502 N503 H504 70.00 123.1 0.00 0.00 -C505 C224 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C505 C224 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C505 C283 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C505 C283 N238 160.00 109.7 0.00 0.00 -C505 C293 H140 75.00 110.7 0.00 0.00 -C505 C293 N287 160.00 111.2 0.00 0.00 -C505 C507 C508 140.00 130.7 0.00 0.00 -C505 C507 N511 140.00 124.5 0.00 0.00 -C505 C508 C507 140.00 130.7 0.00 0.00 -C505 C508 N503 140.00 121.6 0.00 0.00 -C505 C510 C510 140.00 130.7 0.00 0.00 -C505 C510 N512 140.00 121.6 0.00 0.00 -C506 N503 C508 140.00 109.8 0.00 0.00 -C506 N503 H504 70.00 124.0 0.00 0.00 -C506 N511 C507 140.00 110.0 0.00 0.00 -C507 C505 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C507 C508 H146 70.00 130.7 0.00 0.00 -C507 C508 N503 140.00 106.3 0.00 0.00 -C508 C505 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C508 C507 H146 70.00 128.2 0.00 0.00 -C508 C507 N511 140.00 111.0 0.00 0.00 -C508 N503 H504 70.00 124.0 0.00 0.00 -C509 N512 C510 140.00 109.8 0.00 0.00 -C509 N512 H513 70.00 124.0 0.00 0.00 -C510 C505 H140 70.00 109.5 0.00 0.00 -C510 C510 H146 70.00 130.7 0.00 0.00 -C510 C510 N512 140.00 106.3 0.00 0.00 -C510 N512 H513 70.00 124.0 0.00 0.00 -C514 N503 H504 70.00 124.0 0.00 0.00 -H140 C157 O154 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C158 O154 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C206 S200 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C209 S202 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C210 S202 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C214 S203 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C223 N238 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C224 N238 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C242 N238 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C245 N239 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C246 N239 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C283 N238 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C284 N238 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C285 N239 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C292 N287 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C293 N287 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C295 N309 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C296 N309 70.00 109.5 0.00 0.00 -H140 C307 N303 70.00 109.5 0.00 0.00 -H146 C506 N503 70.00 120.0 0.00 0.00 -H146 C506 N511 70.00 120.0 0.00 0.00 -H146 C507 N511 70.00 120.0 0.00 0.00 -H146 C508 N503 70.00 121.6 0.00 0.00 -H146 C509 N512 70.00 120.0 0.00 0.00 -H146 C510 N512 70.00 120.0 0.00 0.00 -H146 C514 N503 70.00 121.6 0.00 0.00 -H240 N237 H240 70.00 120.0 0.00 0.00 -H301 N300 H301 70.00 120.0 0.00 0.00 -N237 C235 O236 160.00 122.9 0.00 0.00 -N238 C235 O236 160.00 122.9 0.00 0.00 -N239 C235 O236 160.00 122.9 0.00 0.00 -N300 C302 N300 140.00 120.0 0.00 0.00 -N300 C302 N303 140.00 120.0 0.00 0.00 -N503 C506 N511 140.00 120.0 0.00 0.00 -N512 C509 N512 140.00 120.0 0.00 0.00 -O268 C267 O269 160.00 121.0 0.00 0.00 -O272 C271 O272 160.00 126.0 0.00 0.00 -C292 N287 H241 70.000 109.500 0.000 0.000 -H241 N287 H241 87.200 106.400 0.000 0.000 -!Below here are manually added parameters by analogy -C235 N239 C283 100.00 121.9 0.00 0.00 -C271 C283 N239 126.00 110.1 0.00 0.00 -C136 C283 N239 160.00 109.7 0.00 0.00 -C245 N239 C283 100.00 118.0 0.00 0.00 -H140 C283 N239 70.00 109.5 0.00 0.00 - -!popc -LC3 LNL LC3 80.00 109.500 0.000 0.000 -LC3 LNL LH2 90.01 109.500 0.000 0.000 -LNL LH2 LC2 110.0 109.500 0.000 0.000 -LH2 LC2 LOS 110.0 109.500 0.000 0.000 -LC2 LOS LP 95.00 120.0 0.000 0.000 -LOS LP LOM 95.00 109.6 0.000 0.000 -LOS LP LOS 95.00 103.0 0.000 0.000 -LOS LC2 LH1 110.0 111.0 0.000 0.000 -LC2 LH1 LOS 110.0 109.500 0.000 0.000 -LC2 LH1 LC2 110.0 109.500 0.000 0.000 -LH1 LOS LC 100.0 120.0 0.000 0.000 -LOS LC LO 120.0 124.0 0.000 0.000 -LOS LC LP2 120.0 115.0 0.000 0.000 -LO LC LP2 120.0 121.0 0.000 0.000 -LC LP2 LP2 110.0 111.0 0.000 0.000 -LP2 LP2 LP2 110.0 111.0 0.000 0.000 -LP2 LP2 LH1 110.0 111.0 0.000 0.000 -LP2 LH1 LH1 120.0 120.0 0.000 0.000 -LP2 LP2 LP3 110.0 111.0 0.000 0.000 -LC2 LOS LC 100.0 120.0 0.000 0.000 -LOM LP LOM 140.01 120.0 0.000 0.000 !Hugo - -!PO4 -TO2Z TP3 TOS 200.00 107.00 !high 0 O2Z-P3-OS ==> OS-P3-O2Z -TO2Z TP3 TO2Z 280.00 114.00 !high 0 O2Z-P3-O2Z ==> O2Z-P3-O2Z - TP3 TOS THO 130.00 92.75 !high 0 P3-OS-HO ==> P3-OS-HO - -!ACE-NMA Ter cards - O C CT 160.00 120.40 !high 0 O-C-CT ==> O-C-CT - O C N 160.00 122.90 !high 0 O-C-N ==> O-C-N - O C N238 160.00 122.90 !high 0 O-C-N ==> O-C-N - O236 C235 N 160.00 122.90 !high 0 O-C-N ==> O-C-N - CT C N 140.00 116.60 !high 0 CT-C-N ==> N-C-CT - CT C N238 140.00 116.60 !high 0 CT-C-N ==> N-C-CT - C224 C235 N 140.00 116.60 !high 0 CT-C-N ==> N-C-CT - C CT HC 70.00 109.50 !high 0 C-CT-HC ==> HC-CT-C - HC CT HC 66.00 107.80 !high 0 HC-CT-HC ==> HC-CT-HC - C N CT1G 100.00 121.90 !high 0 C-N-CT1G ==> CT1G-N-C - C N H 70.00 119.80 !high 0 C-N-H ==> H-N-C - C235 N H 70.00 119.80 !high 0 C-N-H ==> H-N-C - C N238 H241 70.00 119.80 !high 0 C-N-H ==> H-N-C - CT1G N H 76.00 118.40 !high 0 CT1G-N-H ==> H-N-CT1G - N CT1G C 126.00 110.10 !high 0 N-CT1G-C ==> C-CT1G-N - N CT1G HC 70.00 109.50 !high 0 N-CT1G-HC ==> HC-CT1G-N - C CT1G HC 70.00 109.50 !high 0 C-CT1G-HC ==> HC-CT1G-C - HC CT1G HC 66.00 107.80 !high 0 HC-CT1G-HC ==> HC-CT1G-HC - CT1G C O 160.00 120.40 !high 0 CT1G-C-O ==> O-C-CT1G - CT1G C N 140.00 116.60 !high 0 CT1G-C-N ==> N-C-CT1G - C N CT 100.00 121.90 !high 0 C-N-CT ==> CT-N-C - C N238 C224 100.00 121.90 !high 0 C-N-CT ==> CT-N-C - CT N H 76.00 118.40 !high 0 CT-N-H ==> H-N-CT - N CT HC 70.00 109.50 !high 0 N-CT-HC ==> N-CT-HC - C235 N CT 100.00 121.90 !high 0 C-N-CT ==> CT-N-C - C223 C235 N 140.00 116.6 ! 0.00 0.00 - C223 N238 C 100.00 121.9 ! 0.00 0.00 - C246 C235 N 140.00 116.6 0.00 0.00 - N239 C O 160.00 122.9 0.00 0.00 - CT C N239 140.00 116.6 0.00 0.00 - C N239 C245 100.00 121.9 0.00 0.00 - C N239 C246 100.00 121.9 0.00 0.00 - -! Dual topology zero forceK angles -!C158 C224 C157 0.00 118.0 0.00 0.00 -!C136 C224 C149 0.00 118.0 0.00 0.00 -!C137 C224 C136 0.00 118.0 0.00 0.00 - -! Ligand angle parameters -! End ligand angle parameters - -[torsions] -*iaci iacj iack iacl forceK #minima phase #paths -*----------------------------------------------------------------- -H140 C292 N287 H241 0.2 3.000 0.000 1.000 !030 -? C145 C145 ? 3.625 2.000 180.000 1 -? C145 C166 ? 3.625 2.000 180.000 1 -? C145 C501 ? 3.500 2.000 180.000 1 -? C145 C502 ? 3.625 2.000 180.000 1 -? C302 N300 ? 1.950 2.000 180.000 1 -? C500 C501 ? 1.675 2.000 180.000 1 -? C500 C514 ? 6.525 2.000 180.000 1 -? C501 C502 ? 3.000 2.000 180.000 1 -? C502 N503 ? 1.525 2.000 180.000 1 -? C506 N503 ? 2.325 2.000 180.000 1 -? C506 N511 ? 5.000 2.000 180.000 1 -? C507 C508 ? 5.375 2.000 180.000 1 -? C507 N511 ? 2.400 2.000 180.000 1 -? C509 N512 ? 2.325 2.000 180.000 1 -? C510 C510 ? 5.375 2.000 180.000 1 -? C514 N503 ? 1.500 2.000 180.000 1 -C135 C136 C137 C135 0.650 -1.000 0.000 1 -C135 C136 C137 C135 -0.100 -2.000 180.000 1 -C135 C136 C137 C135 0.100 3.000 0.000 1 -C135 C136 C137 C224 0.650 -1.000 0.000 1 -C135 C136 C137 C224 -0.100 -2.000 180.000 1 -C135 C136 C137 C224 0.100 3.000 0.000 1 -C135 C136 C137 C283 0.650 -1.000 0.000 1 -C135 C136 C137 C283 -0.100 -2.000 180.000 1 -C135 C136 C137 C283 0.100 3.000 0.000 1 -C135 C136 C137 C293 0.650 -1.000 0.000 1 -C135 C136 C137 C293 -0.100 -2.000 180.000 1 -C135 C136 C137 C293 0.100 3.000 0.000 1 -C135 C136 C137 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C137 C135 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C137 C136 C224 0.650 -1.000 0.000 1 -C135 C137 C136 C224 -0.100 -2.000 180.000 1 -C135 C137 C136 C224 0.100 3.000 0.000 1 -C135 C137 C136 C283 0.650 -1.000 0.000 1 -C135 C137 C136 C283 -0.100 -2.000 180.000 1 -C135 C137 C136 C283 0.100 3.000 0.000 1 -C135 C137 C136 C293 0.650 -1.000 0.000 1 -C135 C137 C136 C293 -0.100 -2.000 180.000 1 -C135 C137 C136 C293 0.100 3.000 0.000 1 -C135 C137 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C137 C224 C235 -0.711 -1.000 0.000 1 -C135 C137 C224 C235 0.534 -2.000 180.000 1 -C135 C137 C224 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C135 C137 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C137 C224 N238 1.497 -1.000 0.000 1 -C135 C137 C224 N238 0.126 -2.000 180.000 1 -C135 C137 C224 N238 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C137 C283 C271 -0.711 -1.000 0.000 1 -C135 C137 C283 C271 0.534 -2.000 180.000 1 -C135 C137 C283 C271 0.000 3.000 0.000 1 -C135 C137 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C137 C283 N238 1.497 -1.000 0.000 1 -C135 C137 C283 N238 0.126 -2.000 180.000 1 -C135 C137 C283 N238 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C137 C293 C235 -0.711 -1.000 0.000 1 -C135 C137 C293 C235 0.534 -2.000 180.000 1 -C135 C137 C293 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C135 C137 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C137 C293 N287 1.497 -1.000 0.000 1 -C135 C137 C293 N287 0.126 -2.000 180.000 1 -C135 C137 C293 N287 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C158 C224 C235 -0.711 -1.000 0.000 1 -C135 C158 C224 C235 0.534 -2.000 180.000 1 -C135 C158 C224 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C135 C158 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C158 C224 N238 1.497 -1.000 0.000 1 -C135 C158 C224 N238 0.126 -2.000 180.000 1 -C135 C158 C224 N238 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C158 C283 C271 -0.711 -1.000 0.000 1 -C135 C158 C283 C271 0.534 -2.000 180.000 1 -C135 C158 C283 C271 0.000 3.000 0.000 1 -C135 C158 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C158 C283 N238 1.497 -1.000 0.000 1 -C135 C158 C283 N238 0.126 -2.000 180.000 1 -C135 C158 C283 N238 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C158 C293 C235 -0.711 -1.000 0.000 1 -C135 C158 C293 C235 0.534 -2.000 180.000 1 -C135 C158 C293 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C135 C158 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C158 C293 N287 1.497 -1.000 0.000 1 -C135 C158 C293 N287 0.126 -2.000 180.000 1 -C135 C158 C293 N287 0.150 3.000 0.000 1 -C135 C158 O154 H155 -0.178 -1.000 0.000 1 -C135 C158 O154 H155 -0.087 -2.000 180.000 1 -C135 C158 O154 H155 0.246 3.000 0.000 1 -C135 C224 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C135 C224 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C135 C224 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C135 C224 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C135 C224 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C135 C224 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C135 C224 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C135 C224 C267 O268 0.500 -1.000 0.000 1 -C135 C224 C267 O268 0.273 -2.000 180.000 1 -C135 C224 C267 O268 0.225 3.000 0.000 1 -C135 C224 C267 O269 0.273 2.000 180.000 1 -C135 C224 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C135 C224 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C135 C224 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C135 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C135 C235 N238 C223 1.150 -1.000 0.000 1 -C135 C235 N238 C223 3.045 2.000 180.000 1 -C135 C235 N238 C224 1.150 -1.000 0.000 1 -C135 C235 N238 C224 3.045 2.000 180.000 1 -C135 C235 N238 H241 2.450 2.000 180.000 1 -C135 C235 N239 C245 1.150 -1.000 0.000 1 -C135 C235 N239 C245 3.045 2.000 180.000 1 -C135 C235 N239 C246 1.150 -1.000 0.000 1 -C135 C235 N239 C246 3.045 2.000 180.000 1 -C135 C283 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -C135 C283 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C135 C283 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C135 C283 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C135 C283 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C135 C293 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C135 C293 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C135 C293 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C135 C293 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C135 C293 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C135 C293 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C135 C293 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C135 C293 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C136 C136 C136 C224 0.650 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C136 C224 -0.100 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C136 C224 0.100 3.000 0.000 1 -C267 C136 C136 C224 0.650 -1.000 0.000 1 -C267 C136 C136 C224 -0.100 -2.000 180.000 1 -C267 C136 C136 C224 0.100 3.000 0.000 1 -C136 C136 C136 C283 0.650 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C136 C283 -0.100 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C136 C283 0.100 3.000 0.000 1 -C136 C136 C136 C292 0.650 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C136 C292 -0.100 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C136 C292 0.100 3.000 0.000 1 -C136 C136 C136 C293 0.650 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C136 C293 -0.100 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C136 C293 0.100 3.000 0.000 1 -C136 C136 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C267 C136 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C136 C224 C235 -1.179 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C224 C235 0.456 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C224 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C136 C136 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C136 C224 N238 0.442 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C224 N238 0.449 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C224 N238 0.440 3.000 0.000 1 -C136 C136 C235 N237 1.422 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C235 N237 -0.180 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C235 N237 -0.163 3.000 0.000 1 -C136 C136 C235 O236 0.203 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C235 O236 0.652 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C235 O236 0.070 3.000 0.000 1 -C136 C136 C245 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C136 C245 N239 0.422 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C245 N239 -0.481 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C245 N239 0.356 3.000 0.000 1 -C136 C136 C246 C235 -0.875 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C246 C235 0.803 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C246 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C136 C136 C246 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C136 C246 N239 0.786 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C246 N239 0.080 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C246 N239 0.100 3.000 0.000 1 -C136 C136 C267 O268 0.500 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C267 O268 0.273 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C267 O268 0.225 3.000 0.000 1 -C136 C136 C267 O269 0.273 2.000 180.000 1 -C136 C136 C283 C271 -1.179 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C283 C271 0.456 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C283 C271 0.000 3.000 0.000 1 -C136 C136 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C136 C283 N238 0.442 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C283 N238 0.449 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C283 N238 0.440 3.000 0.000 1 -C136 C136 C285 C271 -0.875 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C285 C271 0.803 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C285 C271 0.000 3.000 0.000 1 -C136 C136 C285 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C136 C285 N239 0.786 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C285 N239 0.080 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C285 N239 0.100 3.000 0.000 1 -C136 C136 C292 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C136 C292 N287 1.366 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C292 N287 -0.115 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C292 N287 0.242 3.000 0.000 1 -C136 C136 C293 C235 -1.179 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C293 C235 0.456 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C293 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C136 C136 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C136 C293 N287 0.442 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C293 N287 0.449 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C293 N287 0.440 3.000 0.000 1 -C136 C136 C295 C235 -0.875 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C295 C235 0.803 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C295 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C136 C136 C295 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C136 C295 N309 1.366 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C295 N309 -0.115 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C295 N309 0.242 3.000 0.000 1 -C136 C136 C296 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C136 C296 N309 1.366 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C296 N309 -0.115 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C296 N309 0.242 3.000 0.000 1 -C136 C137 C135 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C137 C224 C235 -0.711 -1.000 0.000 1 -C136 C137 C224 C235 0.534 -2.000 180.000 1 -C136 C137 C224 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C136 C137 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C137 C224 N238 1.497 -1.000 0.000 1 -C136 C137 C224 N238 0.126 -2.000 180.000 1 -C136 C137 C224 N238 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C137 C283 C271 -0.711 -1.000 0.000 1 -C136 C137 C283 C271 0.534 -2.000 180.000 1 -C136 C137 C283 C271 0.000 3.000 0.000 1 -C136 C137 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C137 C283 N238 1.497 -1.000 0.000 1 -C136 C137 C283 N238 0.126 -2.000 180.000 1 -C136 C137 C283 N238 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C137 C293 C235 -0.711 -1.000 0.000 1 -C136 C137 C293 C235 0.534 -2.000 180.000 1 -C136 C137 C293 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C136 C137 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C137 C293 N287 1.497 -1.000 0.000 1 -C136 C137 C293 N287 0.126 -2.000 180.000 1 -C136 C137 C293 N287 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C210 S202 C209 0.463 -1.000 0.000 1 -C136 C210 S202 C209 -0.288 -2.000 180.000 1 -C136 C210 S202 C209 0.339 3.000 0.000 1 -C136 C224 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C136 C224 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C136 C224 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C136 C224 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C136 C224 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C136 C224 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C136 C224 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C136 C224 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C136 C224 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C136 C224 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C136 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C136 C235 N237 H240 2.450 2.000 180.000 1 -C136 C245 N239 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C136 C245 N239 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C136 C245 N239 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C136 C245 N239 C246 1.429 -1.000 0.000 1 -C136 C245 N239 C246 1.029 -2.000 180.000 1 -C136 C245 N239 C246 -5.633 3.000 0.000 1 -C136 C245 N239 C285 1.429 -1.000 0.000 1 -C136 C245 N239 C285 1.029 -2.000 180.000 1 -C136 C245 N239 C285 -5.633 3.000 0.000 1 -C136 C246 C235 N238 2.514 -1.000 0.000 1 -C136 C246 C235 N238 0.359 -2.000 180.000 1 -C136 C246 C235 N238 1.120 3.000 0.000 1 -C136 C246 C235 N239 2.514 -1.000 0.000 1 -C136 C246 C235 N239 0.359 -2.000 180.000 1 -C136 C246 C235 N239 1.120 3.000 0.000 1 -C136 C246 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C136 C246 N239 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C136 C246 N239 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C136 C246 N239 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C136 C246 N239 C245 2.377 -1.000 0.000 1 -C136 C246 N239 C245 -0.367 2.000 180.000 1 -C136 C267 O268 H270 0.750 -1.000 0.000 1 -C136 C267 O268 H270 2.750 2.000 180.000 1 -C136 C274 C271 O272 0.273 2.000 180.000 1 -C136 C283 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -C136 C283 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C136 C283 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C136 C283 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C136 C283 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C136 C285 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -C136 C285 N239 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C136 C285 N239 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C136 C285 N239 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C136 C285 N239 C245 2.377 -1.000 0.000 1 -C136 C285 N239 C245 -0.367 2.000 180.000 1 -C136 C292 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C136 C292 N287 H241 0.173 3.000 0.000 1 -C136 C293 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C136 C293 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C136 C293 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C136 C293 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C136 C293 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C136 C293 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C136 C293 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C136 C293 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C136 C295 C235 N238 2.514 -1.000 0.000 1 -C136 C295 C235 N238 0.359 -2.000 180.000 1 -C136 C295 C235 N238 1.120 3.000 0.000 1 -C136 C295 C235 N239 2.514 -1.000 0.000 1 -C136 C295 C235 N239 0.359 -2.000 180.000 1 -C136 C295 C235 N239 1.120 3.000 0.000 1 -C136 C295 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C136 C295 N309 C296 0.719 -1.000 0.000 1 -C136 C295 N309 C296 -0.062 -2.000 180.000 1 -C136 C295 N309 C296 0.132 3.000 0.000 1 -C136 C295 N309 H310 0.173 3.000 0.000 1 -C136 C296 N309 C295 0.719 -1.000 0.000 1 -C136 C296 N309 C295 -0.062 -2.000 180.000 1 -C136 C296 N309 C295 0.132 3.000 0.000 1 -C136 C296 N309 H310 0.173 3.000 0.000 1 -C136 C308 C307 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C136 C308 C307 N303 1.366 -1.000 0.000 1 -C136 C308 C307 N303 -0.115 -2.000 180.000 1 -C136 C308 C307 N303 0.242 3.000 0.000 1 -C137 C136 C135 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C137 C136 C224 C235 -0.875 -1.000 0.000 1 -C137 C136 C224 C235 0.803 -2.000 180.000 1 -C137 C136 C224 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C137 C136 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C137 C136 C224 N238 0.786 -1.000 0.000 1 -C137 C136 C224 N238 0.080 -2.000 180.000 1 -C137 C136 C224 N238 0.100 3.000 0.000 1 -C137 C136 C283 C271 -0.875 -1.000 0.000 1 -C137 C136 C283 C271 0.803 -2.000 180.000 1 -C137 C136 C283 C271 0.000 3.000 0.000 1 -C137 C136 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C137 C136 C283 N238 0.786 -1.000 0.000 1 -C137 C136 C283 N238 0.080 -2.000 180.000 1 -C137 C136 C283 N238 0.100 3.000 0.000 1 -C137 C136 C293 C235 -0.875 -1.000 0.000 1 -C137 C136 C293 C235 0.803 -2.000 180.000 1 -C137 C136 C293 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C137 C136 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C137 C136 C293 N287 0.786 -1.000 0.000 1 -C137 C136 C293 N287 0.080 -2.000 180.000 1 -C137 C136 C293 N287 0.100 3.000 0.000 1 -C137 C224 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C137 C224 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C137 C224 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C137 C224 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C137 C224 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C137 C224 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C137 C224 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C137 C224 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C137 C224 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C137 C224 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C137 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C137 C283 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -C137 C283 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C137 C283 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C137 C283 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C137 C283 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C137 C293 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C137 C293 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C137 C293 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C137 C293 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C137 C293 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C137 C293 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C137 C293 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C137 C293 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C145 C145 C149 C224 0.000 1.000 0.000 1 -C145 C145 C149 C283 0.000 1.000 0.000 1 -C145 C145 C149 C293 0.000 1.000 0.000 1 -C145 C145 C149 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C145 C149 C224 C235 -0.703 -1.000 0.000 1 -C145 C149 C224 C235 0.888 -2.000 180.000 1 -C145 C149 C224 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C145 C149 C224 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C145 C149 C224 N238 0.856 -1.000 0.000 1 -C145 C149 C224 N238 0.362 -2.000 180.000 1 -C145 C149 C224 N238 0.183 3.000 0.000 1 -C145 C149 C283 C271 -0.703 -1.000 0.000 1 -C145 C149 C283 C271 0.888 -2.000 180.000 1 -C145 C149 C283 C271 0.000 3.000 0.000 1 -C145 C149 C283 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C145 C149 C283 N238 0.856 -1.000 0.000 1 -C145 C149 C283 N238 0.362 -2.000 180.000 1 -C145 C149 C283 N238 0.183 3.000 0.000 1 -C145 C149 C293 C235 -0.703 -1.000 0.000 1 -C145 C149 C293 C235 0.888 -2.000 180.000 1 -C145 C149 C293 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C145 C149 C293 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C145 C149 C293 N287 0.856 -1.000 0.000 1 -C145 C149 C293 N287 0.362 -2.000 180.000 1 -C145 C149 C293 N287 0.183 3.000 0.000 1 -C145 C166 C145 H146 3.625 2.000 180.000 1 -C145 C166 O167 H168 0.841 2.000 180.000 1 -C145 C501 C500 C514 1.675 2.000 180.000 1 -C145 C502 C501 C500 3.000 2.000 180.000 1 -C149 C224 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C149 C224 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C149 C224 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C149 C224 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C149 C224 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C149 C224 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C149 C224 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C149 C224 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C149 C224 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C149 C224 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C149 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C149 C283 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -C149 C283 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C149 C283 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C149 C283 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C149 C283 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C149 C293 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C149 C293 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C149 C293 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C149 C293 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C149 C293 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C149 C293 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C149 C293 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C149 C293 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C157 C224 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C157 C224 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C157 C224 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C157 C224 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C157 C224 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C157 C224 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C157 C224 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C157 C224 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C157 C224 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C157 C224 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C157 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C157 C283 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -C157 C283 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C157 C283 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C157 C283 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C157 C283 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C157 C293 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C157 C293 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C157 C293 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C157 C293 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C157 C293 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C158 C224 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C158 C224 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C158 C224 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C158 C224 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C158 C224 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C158 C224 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C158 C224 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C158 C224 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C158 C224 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C158 C224 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C158 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C158 C283 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -C158 C283 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C158 C283 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C158 C283 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C158 C283 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C158 C293 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C158 C293 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C158 C293 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C158 C293 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C158 C293 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C158 C293 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C158 C293 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C158 C293 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C206 C224 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C206 C224 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C206 C224 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C206 C224 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C206 C224 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C206 C224 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C206 C224 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C206 C224 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C206 C224 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C206 C224 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C206 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C206 C283 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -C206 C283 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C206 C283 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C206 C283 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C206 C283 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C206 C293 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C206 C293 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C206 C293 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C206 C293 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C206 C293 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C206 C293 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C206 C293 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C206 C293 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C209 S202 C210 H140 0.324 3.000 0.000 1 -C210 C136 C224 C235 -0.456 -1.000 0.000 1 -C210 C136 C224 C235 0.349 -2.000 180.000 1 -C210 C136 C224 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C210 C136 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C210 C136 C224 N238 0.107 -1.000 0.000 1 -C210 C136 C224 N238 0.271 -2.000 180.000 1 -C210 C136 C224 N238 0.196 3.000 0.000 1 -C210 C136 C283 C271 -0.456 -1.000 0.000 1 -C210 C136 C283 C271 0.349 -2.000 180.000 1 -C210 C136 C283 C271 0.000 3.000 0.000 1 -C210 C136 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C210 C136 C283 N238 0.107 -1.000 0.000 1 -C210 C136 C283 N238 0.271 -2.000 180.000 1 -C210 C136 C283 N238 0.196 3.000 0.000 1 -C210 C136 C293 C235 -0.456 -1.000 0.000 1 -C210 C136 C293 C235 0.349 -2.000 180.000 1 -C210 C136 C293 C235 0.000 3.000 0.000 1 -C210 C136 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C210 C136 C293 N287 0.107 -1.000 0.000 1 -C210 C136 C293 N287 0.271 -2.000 180.000 1 -C210 C136 C293 N287 0.196 3.000 0.000 1 -C210 S202 C209 H140 0.324 3.000 0.000 1 -C214 C224 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C214 C224 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C214 C224 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C214 C224 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C214 C224 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C214 C224 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C214 C224 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C214 C224 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C214 C224 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C214 C224 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C214 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C214 C283 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -C214 C283 N238 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C214 C283 N238 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C214 C283 N238 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C214 C283 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C214 C293 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C214 C293 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C214 C293 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C214 C293 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C214 C293 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C214 C293 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C214 C293 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C214 C293 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C214 S203 S203 C214 -3.707 -2.000 180.000 1 -C214 S203 S203 C214 0.853 3.000 0.000 1 -C223 C235 N238 C223 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 C235 N238 C223 3.045 2.000 180.000 1 -C223 C235 N238 C224 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 C235 N238 C224 3.045 2.000 180.000 1 -C223 C235 N238 C242 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 C235 N238 C242 3.045 2.000 180.000 1 -C223 C235 N238 C283 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 C235 N238 C283 3.045 2.000 180.000 1 -C295 C235 N238 C283 1.150 -1.000 0.000 1 -C295 C235 N238 C283 3.045 2.000 180.000 1 -C223 C235 N238 C284 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 C235 N238 C284 3.045 2.000 180.000 1 -C223 C235 N238 H241 2.450 2.000 180.000 1 -C223 C235 N239 C245 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 C235 N239 C245 3.045 2.000 180.000 1 -C223 C235 N239 C246 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 C235 N239 C246 3.045 2.000 180.000 1 -C223 C235 N239 C285 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 C235 N239 C285 3.045 2.000 180.000 1 -C223 N238 C235 C224 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 N238 C235 C224 3.045 2.000 180.000 1 -C223 N238 C235 C246 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 N238 C235 C246 3.045 2.000 180.000 1 -C223 N238 C235 C292 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 N238 C235 C292 3.045 2.000 180.000 1 -C223 N238 C235 C293 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 N238 C235 C293 3.045 2.000 180.000 1 -C223 N238 C235 C295 1.150 -1.000 0.000 1 -C223 N238 C235 C295 3.045 2.000 180.000 1 -C223 N238 C235 O236 3.045 2.000 180.000 1 -C224 C136 C136 C235 -0.633 -1.000 0.000 1 -C224 C136 C136 C235 0.239 -2.000 180.000 1 -C224 C136 C136 C235 -0.243 3.000 0.000 1 -C224 C136 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C224 C136 C137 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C224 C136 C210 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C224 C136 C210 S202 -0.782 -1.000 0.000 1 -C224 C136 C210 S202 -0.004 -2.000 180.000 1 -C224 C136 C210 S202 -0.225 3.000 0.000 1 -C224 C136 C235 N237 0.747 -1.000 0.000 1 -C224 C136 C235 N237 -0.256 -2.000 180.000 1 -C224 C136 C235 N237 0.062 3.000 0.000 1 -C224 C136 C235 O236 0.828 -1.000 0.000 1 -C224 C136 C235 O236 0.652 -2.000 180.000 1 -C224 C136 C235 O236 0.220 3.000 0.000 1 -C224 C136 C267 O268 0.500 -1.000 0.000 1 -C224 C136 C267 O268 0.273 -2.000 180.000 1 -C224 C136 C267 O268 0.225 3.000 0.000 1 -C224 C136 C267 O269 0.273 2.000 180.000 1 -C224 C136 C274 C271 -0.443 -1.000 0.000 1 -C224 C136 C274 C271 0.512 -2.000 180.000 1 -C224 C136 C274 C271 -0.646 3.000 0.000 1 -C224 C136 C274 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C224 C136 C308 C307 0.650 -1.000 0.000 1 -C224 C136 C308 C307 -0.100 -2.000 180.000 1 -C224 C136 C308 C307 0.100 3.000 0.000 1 -C224 C136 C308 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C224 C136 C500 C501 0.000 1.000 0.000 1 -C224 C136 C500 C514 -0.357 1.000 0.000 1 -C224 C137 C135 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C224 C137 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C224 C157 O154 H155 -0.178 -1.000 0.000 1 -C224 C157 O154 H155 -0.087 -2.000 180.000 1 -C224 C157 O154 H155 0.246 3.000 0.000 1 -C224 C158 C135 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C224 C158 O154 H155 -0.178 -1.000 0.000 1 -C224 C158 O154 H155 -0.087 -2.000 180.000 1 -C224 C158 O154 H155 0.246 3.000 0.000 1 -C224 C206 S200 H204 -0.380 -1.000 0.000 1 -C224 C206 S200 H204 -0.141 -2.000 180.000 1 -C224 C206 S200 H204 0.340 3.000 0.000 1 -C224 C214 S203 S203 0.971 -1.000 0.000 1 -C224 C214 S203 S203 -0.418 -2.000 180.000 1 -C224 C214 S203 S203 0.468 3.000 0.000 1 -C224 C235 N238 C224 1.150 -1.000 0.000 1 -C224 C235 N238 C224 3.045 2.000 180.000 1 -C224 C235 N238 C242 1.150 -1.000 0.000 1 -C224 C235 N238 C242 3.045 2.000 180.000 1 -C224 C235 N238 C283 1.150 -1.000 0.000 1 -C224 C235 N238 C283 3.045 2.000 180.000 1 -C224 C235 N238 C284 1.150 -1.000 0.000 1 -C224 C235 N238 C284 3.045 2.000 180.000 1 -C224 C235 N238 H241 2.450 2.000 180.000 1 -C224 C235 N239 C245 1.150 -1.000 0.000 1 -C224 C235 N239 C245 3.045 2.000 180.000 1 -C224 C235 N239 C246 1.150 -1.000 0.000 1 -C224 C235 N239 C246 3.045 2.000 180.000 1 -C224 C235 N239 C285 1.150 -1.000 0.000 1 -C224 C235 N239 C285 3.045 2.000 180.000 1 -C223 C267 O268 H270 0.750 -1.000 0.000 1 -C223 C267 O268 H270 2.750 2.000 180.000 1 -C224 C267 O268 H270 0.750 -1.000 0.000 1 -C224 C267 O268 H270 2.750 2.000 180.000 1 -C224 C274 C271 O272 1.250 -1.000 0.000 1 -C224 C274 C271 O272 0.500 -2.000 180.000 1 -C224 C274 C271 O272 0.675 3.000 0.000 1 -C224 C505 C507 C508 0.000 1.000 0.000 1 -C224 C505 C507 N511 -0.280 -1.000 0.000 1 -C224 C505 C507 N511 -0.370 -2.000 180.000 1 -C224 C505 C507 N511 0.174 3.000 0.000 1 -C224 C505 C508 C507 0.000 1.000 0.000 1 -C224 C505 C508 N503 -0.280 -1.000 0.000 1 -C224 C505 C508 N503 -0.370 -2.000 180.000 1 -C224 C505 C508 N503 0.174 3.000 0.000 1 -C224 C505 C510 C510 0.000 1.000 0.000 1 -C224 C505 C510 N512 -1.995 -1.000 0.000 1 -C224 C505 C510 N512 0.840 -2.000 180.000 1 -C224 C505 C510 N512 0.145 3.000 0.000 1 -C224 N238 C235 C246 1.150 -1.000 0.000 1 -C224 N238 C235 C246 3.045 2.000 180.000 1 -C224 N238 C235 C292 1.150 -1.000 0.000 1 -C224 N238 C235 C292 3.045 2.000 180.000 1 -C224 N238 C235 C293 1.150 -1.000 0.000 1 -C224 N238 C235 C293 3.045 2.000 180.000 1 -C224 N238 C235 C295 1.150 -1.000 0.000 1 -C224 N238 C235 C295 3.045 2.000 180.000 1 -C224 N238 C235 O236 3.045 2.000 180.000 1 -C235 C136 C136 C283 -0.633 -1.000 0.000 1 -C235 C136 C136 C283 0.239 -2.000 180.000 1 -C235 C136 C136 C283 -0.243 3.000 0.000 1 -C235 C136 C136 C293 -0.633 -1.000 0.000 1 -C235 C136 C136 C293 0.239 -2.000 180.000 1 -C235 C136 C136 C293 -0.243 3.000 0.000 1 -C235 C136 C136 H140 -0.050 3.000 0.000 1 -C235 C136 C224 C235 0.299 -1.000 0.000 1 -C235 C136 C224 C235 0.779 -2.000 180.000 1 -C235 C136 C224 C235 0.128 3.000 0.000 1 -C235 C136 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C235 C136 C224 N238 -2.751 -1.000 0.000 1 -C235 C136 C224 N238 0.763 -2.000 180.000 1 -C235 C136 C224 N238 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C136 C283 C271 0.299 -1.000 0.000 1 -C235 C136 C283 C271 0.779 -2.000 180.000 1 -C235 C136 C283 C271 0.128 3.000 0.000 1 -C235 C136 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C235 C136 C283 N238 -2.751 -1.000 0.000 1 -C235 C136 C283 N238 0.763 -2.000 180.000 1 -C235 C136 C283 N238 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C136 C293 C235 0.299 -1.000 0.000 1 -C235 C136 C293 C235 0.779 -2.000 180.000 1 -C235 C136 C293 C235 0.128 3.000 0.000 1 -C235 C136 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C235 C136 C293 N287 -2.751 -1.000 0.000 1 -C235 C136 C293 N287 0.763 -2.000 180.000 1 -C235 C136 C293 N287 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C223 N238 C235 -1.256 -1.000 0.000 1 -C235 C223 N238 C235 0.105 -2.000 180.000 1 -C235 C223 N238 C235 -0.100 3.000 0.000 1 -C235 C223 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C235 C224 C135 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C224 C136 C267 0.299 -1.000 0.000 1 -C235 C224 C136 C267 0.779 -2.000 180.000 1 -C235 C224 C136 C267 0.128 3.000 0.000 1 -C235 C224 C136 C274 -0.882 -1.000 0.000 1 -C235 C224 C136 C274 0.350 -2.000 180.000 1 -C235 C224 C136 C274 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C224 C136 C308 -0.986 -1.000 0.000 1 -C235 C224 C136 C308 0.385 -2.000 180.000 1 -C235 C224 C136 C308 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C224 C136 C500 -0.253 -1.000 0.000 1 -C235 C224 C136 C500 0.487 -2.000 180.000 1 -C235 C224 C136 C500 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C224 C136 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C224 C137 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C224 C149 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C224 C157 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C224 C157 O154 -2.897 -1.000 0.000 1 -C235 C224 C157 O154 0.203 -2.000 180.000 1 -C235 C224 C157 O154 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C224 C158 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C224 C158 O154 -2.897 -1.000 0.000 1 -C235 C224 C158 O154 0.203 -2.000 180.000 1 -C235 C224 C158 O154 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C224 C206 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C224 C206 S200 -1.661 -1.000 0.000 1 -C235 C224 C206 S200 0.265 -2.000 180.000 1 -C235 C224 C206 S200 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C224 C214 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C224 C214 S203 -1.661 -1.000 0.000 1 -C235 C224 C214 S203 0.265 -2.000 180.000 1 -C235 C224 C214 S203 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C224 C274 C271 0.771 -1.000 0.000 1 -C235 C224 C274 C271 0.348 -2.000 180.000 1 -C235 C224 C274 C271 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C224 C274 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C224 C505 C507 -0.641 -1.000 0.000 1 -C235 C224 C505 C507 0.823 -2.000 180.000 1 -C235 C224 C505 C507 -0.009 3.000 0.000 1 -C235 C224 C505 C508 -0.641 -1.000 0.000 1 -C235 C224 C505 C508 0.823 -2.000 180.000 1 -C235 C224 C505 C508 -0.009 3.000 0.000 1 -C235 C224 C505 C510 -0.854 -1.000 0.000 1 -C235 C224 C505 C510 0.758 -2.000 180.000 1 -C235 C224 C505 C510 -0.251 3.000 0.000 1 -C235 C224 C505 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C224 N238 C235 -1.256 -1.000 0.000 1 -C235 C224 N238 C235 0.105 -2.000 180.000 1 -C235 C224 N238 C235 -0.100 3.000 0.000 1 -C235 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C235 N238 C223 C267 -1.256 -1.000 0.000 1 -C235 N238 C223 C267 0.105 -2.000 180.000 1 -C235 N238 C223 C267 -0.100 3.000 0.000 1 -C235 N238 C224 C267 -1.256 -1.000 0.000 1 -C235 N238 C224 C267 0.105 -2.000 180.000 1 -C235 N238 C224 C267 -0.100 3.000 0.000 1 -C235 C246 C136 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C246 N239 C235 -1.256 -1.000 0.000 1 -C235 C246 N239 C235 0.105 -2.000 180.000 1 -C235 C246 N239 C235 -0.100 3.000 0.000 1 -C235 C246 N239 C245 -0.869 -1.000 0.000 1 -C235 C246 N239 C245 0.625 -2.000 180.000 1 -C235 C246 N239 C245 -1.750 3.000 0.000 1 -C235 C292 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C235 C293 C135 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C293 C136 C274 -0.882 -1.000 0.000 1 -C235 C293 C136 C274 0.350 -2.000 180.000 1 -C235 C293 C136 C274 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C293 C136 C308 -0.986 -1.000 0.000 1 -C235 C293 C136 C308 0.385 -2.000 180.000 1 -C235 C293 C136 C308 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C293 C136 C500 -0.253 -1.000 0.000 1 -C235 C293 C136 C500 0.487 -2.000 180.000 1 -C235 C293 C136 C500 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C293 C136 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C293 C137 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C293 C149 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C293 C157 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C293 C157 O154 -2.897 -1.000 0.000 1 -C235 C293 C157 O154 0.203 -2.000 180.000 1 -C235 C293 C157 O154 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C293 C158 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C293 C158 O154 -2.897 -1.000 0.000 1 -C235 C293 C158 O154 0.203 -2.000 180.000 1 -C235 C293 C158 O154 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C293 C206 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C293 C206 S200 -1.661 -1.000 0.000 1 -C235 C293 C206 S200 0.265 -2.000 180.000 1 -C235 C293 C206 S200 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C293 C214 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C293 C214 S203 -1.661 -1.000 0.000 1 -C235 C293 C214 S203 0.265 -2.000 180.000 1 -C235 C293 C214 S203 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C293 C274 C271 0.771 -1.000 0.000 1 -C235 C293 C274 C271 0.348 -2.000 180.000 1 -C235 C293 C274 C271 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C293 C274 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C293 C505 C507 -0.641 -1.000 0.000 1 -C235 C293 C505 C507 0.823 -2.000 180.000 1 -C235 C293 C505 C507 -0.009 3.000 0.000 1 -C235 C293 C505 C508 -0.641 -1.000 0.000 1 -C235 C293 C505 C508 0.823 -2.000 180.000 1 -C235 C293 C505 C508 -0.009 3.000 0.000 1 -C235 C293 C505 C510 -0.854 -1.000 0.000 1 -C235 C293 C505 C510 0.758 -2.000 180.000 1 -C235 C293 C505 C510 -0.251 3.000 0.000 1 -C235 C293 C505 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C293 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C235 C295 C136 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C235 C295 N309 C296 0.719 -1.000 0.000 1 -C235 C295 N309 C296 -0.062 -2.000 180.000 1 -C235 C295 N309 C296 0.132 3.000 0.000 1 -C235 C295 N309 H310 0.173 3.000 0.000 1 -C235 N238 C223 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C235 N238 C224 C274 -0.341 -1.000 0.000 1 -C235 N238 C224 C274 0.065 -2.000 180.000 1 -C235 N238 C224 C274 0.169 3.000 0.000 1 -C235 N238 C224 C505 -0.341 -1.000 0.000 1 -C235 N238 C224 C505 0.065 -2.000 180.000 1 -C235 N238 C224 C505 0.169 3.000 0.000 1 -C235 N238 C224 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C235 N238 C242 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C235 N238 C283 C271 -1.256 -1.000 0.000 1 -C235 N238 C283 C271 0.105 -2.000 180.000 1 -C235 N238 C283 C271 -0.100 3.000 0.000 1 -C235 N238 C283 C274 -0.341 -1.000 0.000 1 -C235 N238 C283 C274 0.065 -2.000 180.000 1 -C235 N238 C283 C274 0.169 3.000 0.000 1 -C235 N238 C283 C505 -0.341 -1.000 0.000 1 -C235 N238 C283 C505 0.065 -2.000 180.000 1 -C235 N238 C283 C505 0.169 3.000 0.000 1 -C235 N238 C283 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C235 N238 C284 C271 -1.256 -1.000 0.000 1 -C235 N238 C284 C271 0.105 -2.000 180.000 1 -C235 N238 C284 C271 -0.100 3.000 0.000 1 -C235 N238 C284 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C235 N239 C245 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C235 N239 C246 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C235 N239 C285 C271 -1.256 -1.000 0.000 1 -C235 N239 C285 C271 0.105 -2.000 180.000 1 -C235 N239 C285 C271 -0.100 3.000 0.000 1 -C235 N239 C285 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C242 N238 C235 C246 1.150 -1.000 0.000 1 -C242 N238 C235 C246 3.045 2.000 180.000 1 -C242 N238 C235 O236 3.045 2.000 180.000 1 -C245 C136 C136 C246 0.650 -1.000 0.000 1 -C245 C136 C136 C246 -0.100 -2.000 180.000 1 -C245 C136 C136 C246 0.100 3.000 0.000 1 -C245 C136 C136 C285 0.650 -1.000 0.000 1 -C245 C136 C136 C285 -0.100 -2.000 180.000 1 -C245 C136 C136 C285 0.100 3.000 0.000 1 -C245 C136 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C245 N239 C235 C246 1.150 -1.000 0.000 1 -C245 N239 C235 C246 3.045 2.000 180.000 1 -C245 N239 C235 C292 1.150 -1.000 0.000 1 -C245 N239 C235 C292 3.045 2.000 180.000 1 -C245 N239 C235 C293 1.150 -1.000 0.000 1 -C245 N239 C235 C293 3.045 2.000 180.000 1 -C245 N239 C235 C295 1.150 -1.000 0.000 1 -C245 N239 C235 C295 3.045 2.000 180.000 1 -C245 N239 C235 O236 3.045 2.000 180.000 1 -C245 N239 C246 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C245 N239 C285 C271 -0.869 -1.000 0.000 1 -C245 N239 C285 C271 0.625 -2.000 180.000 1 -C245 N239 C285 C271 -1.750 3.000 0.000 1 -C245 N239 C285 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C246 C136 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C246 C235 N238 C283 1.150 -1.000 0.000 1 -C246 C235 N238 C283 3.045 2.000 180.000 1 -C246 C235 N238 C284 1.150 -1.000 0.000 1 -C246 C235 N238 C284 3.045 2.000 180.000 1 -C246 C235 N238 H241 2.450 2.000 180.000 1 -C246 C235 N239 C246 1.150 -1.000 0.000 1 -C246 C235 N239 C246 3.045 2.000 180.000 1 -C246 C235 N239 C285 1.150 -1.000 0.000 1 -C246 C235 N239 C285 3.045 2.000 180.000 1 -C246 N239 C235 C292 1.150 -1.000 0.000 1 -C246 N239 C235 C292 3.045 2.000 180.000 1 -C246 N239 C235 C293 1.150 -1.000 0.000 1 -C246 N239 C235 C293 3.045 2.000 180.000 1 -C246 N239 C235 C295 1.150 -1.000 0.000 1 -C246 N239 C235 C295 3.045 2.000 180.000 1 -C246 N239 C235 O236 3.045 2.000 180.000 1 -C246 N239 C245 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C267 C136 C224 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C267 C136 C224 N238 -2.751 -1.000 0.000 1 -C267 C136 C224 N238 0.763 -2.000 180.000 1 -C267 C136 C224 N238 0.000 3.000 0.000 1 -C267 C224 C135 H140 0.037 3.000 0.000 1 -C267 C223 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C267 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C271 C274 C136 C283 -0.443 -1.000 0.000 1 -C271 C274 C136 C283 0.512 -2.000 180.000 1 -C271 C274 C136 C283 -0.646 3.000 0.000 1 -C271 C274 C136 C293 -0.443 -1.000 0.000 1 -C271 C274 C136 C293 0.512 -2.000 180.000 1 -C271 C274 C136 C293 -0.646 3.000 0.000 1 -C271 C274 C136 H140 -0.113 3.000 0.000 1 -C271 C274 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C271 C274 C224 N238 -3.945 -1.000 0.000 1 -C271 C274 C224 N238 0.331 -2.000 180.000 1 -C271 C274 C224 N238 0.498 3.000 0.000 1 -C271 C274 C283 C271 0.771 -1.000 0.000 1 -C271 C274 C283 C271 0.348 -2.000 180.000 1 -C271 C274 C283 C271 0.000 3.000 0.000 1 -C271 C274 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C271 C274 C283 N238 -3.945 -1.000 0.000 1 -C271 C274 C283 N238 0.331 -2.000 180.000 1 -C271 C274 C283 N238 0.498 3.000 0.000 1 -C271 C274 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C271 C274 C293 N287 -3.945 -1.000 0.000 1 -C271 C274 C293 N287 0.331 -2.000 180.000 1 -C271 C274 C293 N287 0.498 3.000 0.000 1 -C271 C283 C135 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C271 C283 C136 C274 -0.882 -1.000 0.000 1 -C271 C283 C136 C274 0.350 -2.000 180.000 1 -C271 C283 C136 C274 0.000 3.000 0.000 1 -C271 C283 C136 C308 -0.986 -1.000 0.000 1 -C271 C283 C136 C308 0.385 -2.000 180.000 1 -C271 C283 C136 C308 0.000 3.000 0.000 1 -C271 C283 C136 C500 -0.253 -1.000 0.000 1 -C271 C283 C136 C500 0.487 -2.000 180.000 1 -C271 C283 C136 C500 0.000 3.000 0.000 1 -C271 C283 C136 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C271 C283 C137 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C271 C283 C149 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C271 C283 C157 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C271 C283 C157 O154 -2.897 -1.000 0.000 1 -C271 C283 C157 O154 0.203 -2.000 180.000 1 -C271 C283 C157 O154 0.000 3.000 0.000 1 -C271 C283 C158 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C271 C283 C158 O154 -2.897 -1.000 0.000 1 -C271 C283 C158 O154 0.203 -2.000 180.000 1 -C271 C283 C158 O154 0.000 3.000 0.000 1 -C271 C283 C206 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C271 C283 C206 S200 -1.661 -1.000 0.000 1 -C271 C283 C206 S200 0.265 -2.000 180.000 1 -C271 C283 C206 S200 0.000 3.000 0.000 1 -C271 C283 C214 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C271 C283 C214 S203 -1.661 -1.000 0.000 1 -C271 C283 C214 S203 0.265 -2.000 180.000 1 -C271 C283 C214 S203 0.000 3.000 0.000 1 -C271 C283 C274 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C271 C283 C505 C507 -0.641 -1.000 0.000 1 -C271 C283 C505 C507 0.823 -2.000 180.000 1 -C271 C283 C505 C507 -0.009 3.000 0.000 1 -C271 C283 C505 C508 -0.641 -1.000 0.000 1 -C271 C283 C505 C508 0.823 -2.000 180.000 1 -C271 C283 C505 C508 -0.009 3.000 0.000 1 -C271 C283 C505 C510 -0.854 -1.000 0.000 1 -C271 C283 C505 C510 0.758 -2.000 180.000 1 -C271 C283 C505 C510 -0.251 3.000 0.000 1 -C271 C283 C505 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C271 C283 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C271 C284 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C271 C285 C136 H140 -0.038 3.000 0.000 1 -C274 C136 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C274 C136 C224 N238 0.994 -1.000 0.000 1 -C274 C136 C224 N238 0.229 -2.000 180.000 1 -C274 C136 C224 N238 0.410 3.000 0.000 1 -C274 C136 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C274 C136 C283 N238 0.994 -1.000 0.000 1 -C274 C136 C283 N238 0.229 -2.000 180.000 1 -C274 C136 C283 N238 0.410 3.000 0.000 1 -C274 C136 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C274 C136 C293 N287 0.994 -1.000 0.000 1 -C274 C136 C293 N287 0.229 -2.000 180.000 1 -C274 C136 C293 N287 0.410 3.000 0.000 1 -C274 C224 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C274 C224 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C274 C224 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C274 C224 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C274 C224 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C274 C224 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C274 C224 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C274 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C274 C283 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -C274 C283 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C274 C293 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C274 C293 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C274 C293 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C274 C293 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C274 C293 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C274 C293 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C274 C293 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C274 C293 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C283 C136 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C283 C136 C137 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C283 C136 C210 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C283 C136 C210 S202 -0.782 -1.000 0.000 1 -C283 C136 C210 S202 -0.004 -2.000 180.000 1 -C283 C136 C210 S202 -0.225 3.000 0.000 1 -C283 C136 C235 N237 0.747 -1.000 0.000 1 -C283 C136 C235 N237 -0.256 -2.000 180.000 1 -C283 C136 C235 N237 0.062 3.000 0.000 1 -C283 C136 C235 O236 0.828 -1.000 0.000 1 -C283 C136 C235 O236 0.652 -2.000 180.000 1 -C283 C136 C235 O236 0.220 3.000 0.000 1 -C283 C136 C267 O268 0.500 -1.000 0.000 1 -C283 C136 C267 O268 0.273 -2.000 180.000 1 -C283 C136 C267 O268 0.225 3.000 0.000 1 -C283 C136 C267 O269 0.273 2.000 180.000 1 -C283 C136 C274 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C283 C136 C308 C307 0.650 -1.000 0.000 1 -C283 C136 C308 C307 -0.100 -2.000 180.000 1 -C283 C136 C308 C307 0.100 3.000 0.000 1 -C283 C136 C308 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C283 C136 C500 C501 0.000 1.000 0.000 1 -C283 C136 C500 C514 -0.357 1.000 0.000 1 -C283 C137 C135 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C283 C137 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C283 C157 O154 H155 -0.178 -1.000 0.000 1 -C283 C157 O154 H155 -0.087 -2.000 180.000 1 -C283 C157 O154 H155 0.246 3.000 0.000 1 -C283 C158 C135 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C283 C158 O154 H155 -0.178 -1.000 0.000 1 -C283 C158 O154 H155 -0.087 -2.000 180.000 1 -C283 C158 O154 H155 0.246 3.000 0.000 1 -C283 C206 S200 H204 -0.380 -1.000 0.000 1 -C283 C206 S200 H204 -0.141 -2.000 180.000 1 -C283 C206 S200 H204 0.340 3.000 0.000 1 -C283 C214 S203 S203 0.971 -1.000 0.000 1 -C283 C214 S203 S203 -0.418 -2.000 180.000 1 -C283 C214 S203 S203 0.468 3.000 0.000 1 -C283 C274 C271 O272 1.250 -1.000 0.000 1 -C283 C274 C271 O272 0.500 -2.000 180.000 1 -C283 C274 C271 O272 0.675 3.000 0.000 1 -C283 C505 C507 C508 0.000 1.000 0.000 1 -C283 C505 C507 N511 -0.280 -1.000 0.000 1 -C283 C505 C507 N511 -0.370 -2.000 180.000 1 -C283 C505 C507 N511 0.174 3.000 0.000 1 -C283 C505 C508 C507 0.000 1.000 0.000 1 -C283 C505 C508 N503 -0.280 -1.000 0.000 1 -C283 C505 C508 N503 -0.370 -2.000 180.000 1 -C283 C505 C508 N503 0.174 3.000 0.000 1 -C283 C505 C510 C510 0.000 1.000 0.000 1 -C283 C505 C510 N512 -1.995 -1.000 0.000 1 -C283 C505 C510 N512 0.840 -2.000 180.000 1 -C283 C505 C510 N512 0.145 3.000 0.000 1 -C283 N238 C235 O236 3.045 2.000 180.000 1 -C284 N238 C235 O236 3.045 2.000 180.000 1 -C285 C136 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C285 N239 C235 O236 3.045 2.000 180.000 1 -C285 N239 C245 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C292 C136 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C292 C235 N238 H241 2.450 2.000 180.000 1 -C293 C136 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C293 C136 C137 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C293 C136 C210 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C293 C136 C210 S202 -0.782 -1.000 0.000 1 -C293 C136 C210 S202 -0.004 -2.000 180.000 1 -C293 C136 C210 S202 -0.225 3.000 0.000 1 -C293 C136 C235 N237 0.747 -1.000 0.000 1 -C293 C136 C235 N237 -0.256 -2.000 180.000 1 -C293 C136 C235 N237 0.062 3.000 0.000 1 -C293 C136 C235 O236 0.828 -1.000 0.000 1 -C293 C136 C235 O236 0.652 -2.000 180.000 1 -C293 C136 C235 O236 0.220 3.000 0.000 1 -C293 C136 C267 O268 0.500 -1.000 0.000 1 -C293 C136 C267 O268 0.273 -2.000 180.000 1 -C293 C136 C267 O268 0.225 3.000 0.000 1 -C293 C136 C267 O269 0.273 2.000 180.000 1 -C293 C136 C274 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C293 C136 C308 C307 0.650 -1.000 0.000 1 -C293 C136 C308 C307 -0.100 -2.000 180.000 1 -C293 C136 C308 C307 0.100 3.000 0.000 1 -C293 C136 C308 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C293 C136 C500 C501 0.000 1.000 0.000 1 -C293 C136 C500 C514 -0.357 1.000 0.000 1 -C293 C137 C135 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C293 C137 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C293 C157 O154 H155 -0.178 -1.000 0.000 1 -C293 C157 O154 H155 -0.087 -2.000 180.000 1 -C293 C157 O154 H155 0.246 3.000 0.000 1 -C293 C158 C135 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C293 C158 O154 H155 -0.178 -1.000 0.000 1 -C293 C158 O154 H155 -0.087 -2.000 180.000 1 -C293 C158 O154 H155 0.246 3.000 0.000 1 -C293 C206 S200 H204 -0.380 -1.000 0.000 1 -C293 C206 S200 H204 -0.141 -2.000 180.000 1 -C293 C206 S200 H204 0.340 3.000 0.000 1 -C293 C214 S203 S203 0.971 -1.000 0.000 1 -C293 C214 S203 S203 -0.418 -2.000 180.000 1 -C293 C214 S203 S203 0.468 3.000 0.000 1 -C293 C235 N238 H241 2.450 2.000 180.000 1 -C293 C274 C271 O272 1.250 -1.000 0.000 1 -C293 C274 C271 O272 0.500 -2.000 180.000 1 -C293 C274 C271 O272 0.675 3.000 0.000 1 -C293 C505 C507 C508 0.000 1.000 0.000 1 -C293 C505 C507 N511 -0.280 -1.000 0.000 1 -C293 C505 C507 N511 -0.370 -2.000 180.000 1 -C293 C505 C507 N511 0.174 3.000 0.000 1 -C293 C505 C508 C507 0.000 1.000 0.000 1 -C293 C505 C508 N503 -0.280 -1.000 0.000 1 -C293 C505 C508 N503 -0.370 -2.000 180.000 1 -C293 C505 C508 N503 0.174 3.000 0.000 1 -C293 C505 C510 C510 0.000 1.000 0.000 1 -C293 C505 C510 N512 -1.995 -1.000 0.000 1 -C293 C505 C510 N512 0.840 -2.000 180.000 1 -C293 C505 C510 N512 0.145 3.000 0.000 1 -C295 C136 C136 C296 0.650 -1.000 0.000 1 -C295 C136 C136 C296 -0.100 -2.000 180.000 1 -C295 C136 C136 C296 0.100 3.000 0.000 1 -C295 C136 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C295 C235 N238 H241 2.450 2.000 180.000 1 -C295 N309 C296 H140 0.151 3.000 0.000 1 -C296 C136 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C296 N309 C295 H140 0.151 3.000 0.000 1 -C302 N303 C307 C308 0.914 -1.000 0.000 1 -C302 N303 C307 C308 0.121 -2.000 180.000 1 -C302 N303 C307 C308 -0.249 3.000 0.000 1 -C302 N303 C307 H140 0.088 3.000 0.000 1 -C307 C308 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C307 N303 C302 N300 3.968 2.000 180.000 1 -C308 C136 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C308 C136 C224 N238 0.051 -1.000 0.000 1 -C308 C136 C224 N238 0.327 -2.000 180.000 1 -C308 C136 C224 N238 0.281 3.000 0.000 1 -C308 C136 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C308 C136 C283 N238 0.051 -1.000 0.000 1 -C308 C136 C283 N238 0.327 -2.000 180.000 1 -C308 C136 C283 N238 0.281 3.000 0.000 1 -C308 C136 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -C308 C136 C293 N287 0.051 -1.000 0.000 1 -C308 C136 C293 N287 0.327 -2.000 180.000 1 -C308 C136 C293 N287 0.281 3.000 0.000 1 -C308 C307 N303 H304 -0.095 -1.000 0.000 1 -C308 C307 N303 H304 -0.208 -2.000 180.000 1 -C308 C307 N303 H304 0.209 3.000 0.000 1 -C500 C136 C224 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C500 C136 C224 N238 -0.294 -1.000 0.000 1 -C500 C136 C224 N238 0.510 -2.000 180.000 1 -C500 C136 C224 N238 0.333 3.000 0.000 1 -C500 C136 C283 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C500 C136 C283 N238 -0.294 -1.000 0.000 1 -C500 C136 C283 N238 0.510 -2.000 180.000 1 -C500 C136 C283 N238 0.333 3.000 0.000 1 -C500 C136 C293 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C500 C136 C293 N287 -0.294 -1.000 0.000 1 -C500 C136 C293 N287 0.510 -2.000 180.000 1 -C500 C136 C293 N287 0.333 3.000 0.000 1 -C500 C501 C145 H146 3.500 2.000 180.000 1 -C501 C500 C136 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C501 C502 C145 H146 3.625 2.000 180.000 1 -C502 C501 C145 H146 3.500 2.000 180.000 1 -C502 C501 C500 C514 1.675 2.000 180.000 1 -C502 N503 C514 H146 1.500 2.000 180.000 1 -C505 C224 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C505 C224 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C505 C224 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C505 C224 C235 N239 0.889 -1.000 0.000 1 -C505 C224 C235 N239 0.209 -2.000 180.000 1 -C505 C224 C235 N239 -0.055 3.000 0.000 1 -C505 C224 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C505 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C505 C283 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -C505 C283 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -C505 C293 C235 N238 0.889 -1.000 0.000 1 -C505 C293 C235 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C505 C293 C235 N238 -0.055 3.000 0.000 1 -C505 C293 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -C505 C293 N287 H290 0.173 3.000 0.000 1 -C505 C508 C507 H146 5.375 2.000 180.000 1 -C505 C508 C507 N511 5.375 2.000 180.000 1 -C505 C508 N503 C506 1.400 2.000 180.000 1 -C505 C508 N503 H504 1.400 2.000 180.000 1 -C505 C510 N512 C509 1.400 2.000 180.000 1 -C505 C510 N512 H513 1.400 2.000 180.000 1 -C506 N503 C508 C507 1.400 2.000 180.000 1 -C506 N503 C508 H146 2.500 2.000 180.000 1 -C506 N511 C507 C508 2.400 2.000 180.000 1 -C506 N511 C507 H146 2.400 2.000 180.000 1 -C507 C505 C224 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C507 C505 C224 N238 -0.271 -1.000 0.000 1 -C507 C505 C224 N238 0.217 -2.000 180.000 1 -C507 C505 C224 N238 0.000 3.000 0.000 1 -C507 C505 C283 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C507 C505 C283 N238 -0.271 -1.000 0.000 1 -C507 C505 C283 N238 0.217 -2.000 180.000 1 -C507 C505 C283 N238 0.000 3.000 0.000 1 -C507 C505 C293 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C507 C505 C293 N287 -0.271 -1.000 0.000 1 -C507 C505 C293 N287 0.217 -2.000 180.000 1 -C507 C505 C293 N287 0.000 3.000 0.000 1 -C507 C508 C505 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C507 C508 N503 H504 1.400 2.000 180.000 1 -C507 N511 C506 H146 5.000 2.000 180.000 1 -C507 N511 C506 N503 5.000 2.000 180.000 1 -C508 C505 C224 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C508 C505 C224 N238 -0.271 -1.000 0.000 1 -C508 C505 C224 N238 0.217 -2.000 180.000 1 -C508 C505 C224 N238 0.000 3.000 0.000 1 -C508 C505 C283 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C508 C505 C283 N238 -0.271 -1.000 0.000 1 -C508 C505 C283 N238 0.217 -2.000 180.000 1 -C508 C505 C283 N238 0.000 3.000 0.000 1 -C508 C505 C293 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C508 C505 C293 N287 -0.271 -1.000 0.000 1 -C508 C505 C293 N287 0.217 -2.000 180.000 1 -C508 C505 C293 N287 0.000 3.000 0.000 1 -C508 C507 C505 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C508 N503 C506 H146 2.325 2.000 180.000 1 -C508 N503 C506 N511 2.325 2.000 180.000 1 -C509 N512 C510 C510 1.400 2.000 180.000 1 -C509 N512 C510 H146 2.500 2.000 180.000 1 -C510 C505 C224 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C510 C505 C224 N238 -1.519 -1.000 0.000 1 -C510 C505 C224 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C510 C505 C224 N238 0.000 3.000 0.000 1 -C510 C505 C283 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C510 C505 C283 N238 -1.519 -1.000 0.000 1 -C510 C505 C283 N238 0.209 -2.000 180.000 1 -C510 C505 C283 N238 0.000 3.000 0.000 1 -C510 C505 C293 H140 0.231 3.000 0.000 1 -C510 C505 C293 N287 -1.519 -1.000 0.000 1 -C510 C505 C293 N287 0.209 -2.000 180.000 1 -C510 C505 C293 N287 0.000 3.000 0.000 1 -C510 C510 C505 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C510 C510 N512 H513 1.400 2.000 180.000 1 -C510 N512 C509 H146 2.325 2.000 180.000 1 -C510 N512 C509 N512 2.325 2.000 180.000 1 -C514 C500 C136 H140 -0.240 3.000 0.000 1 -H140 C135 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C135 C137 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C135 C158 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C135 C158 O154 0.234 3.000 0.000 1 -H140 C135 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C135 C224 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C135 C235 N238 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C135 C235 N239 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C135 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C135 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C135 C283 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C135 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C135 C293 N287 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C136 C136 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C137 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C210 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C210 S202 0.226 3.000 0.000 1 -H140 C136 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C224 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C136 C235 N237 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C136 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C136 C245 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C245 N239 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C136 C246 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C246 N239 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C136 C267 O268 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C136 C267 O269 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C136 C274 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C283 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C136 C285 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C285 N239 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C136 C292 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C292 N287 0.192 3.000 0.000 1 -H140 C136 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C293 N287 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C136 C295 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C295 N309 0.192 3.000 0.000 1 -H140 C136 C296 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C136 C296 N309 0.192 3.000 0.000 1 -H140 C136 C308 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C137 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C137 C224 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C137 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C137 C283 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C137 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C137 C293 N287 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C149 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C149 C224 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C149 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C149 C283 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C149 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C149 C293 N287 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C157 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C157 C224 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C157 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C157 C283 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C157 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C157 C293 N287 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C157 O154 H155 0.176 3.000 0.000 1 -H140 C158 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C158 C224 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C158 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C158 C283 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C158 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C158 C293 N287 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C158 O154 H155 0.176 3.000 0.000 1 -H140 C206 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C206 C224 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C206 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C206 C283 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C206 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C206 C293 N287 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C206 S200 H204 0.240 3.000 0.000 1 -H140 C214 C224 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C214 C224 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C214 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C214 C283 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C214 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C214 C293 N287 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C214 S203 S203 0.279 3.000 0.000 1 -H140 C223 C235 N238 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C223 C235 N239 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C223 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C223 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C223 N238 H290 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C224 C157 O154 0.234 3.000 0.000 1 -H140 C224 C158 O154 0.234 3.000 0.000 1 -H140 C224 C206 S200 0.226 3.000 0.000 1 -H140 C224 C214 S203 0.226 3.000 0.000 1 -H140 C224 C235 N238 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C224 C235 N239 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C224 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C223 C267 O268 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C223 C267 O269 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C224 C267 O268 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C224 C267 O269 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C224 C274 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C224 C505 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C224 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C242 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C246 C235 N238 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C246 C235 N239 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C246 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C274 C224 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C274 C271 O272 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C274 C283 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C274 C283 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C274 C293 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C274 C293 N287 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C283 C157 O154 0.234 3.000 0.000 1 -H140 C283 C158 O154 0.234 3.000 0.000 1 -H140 C283 C206 S200 0.226 3.000 0.000 1 -H140 C283 C214 S203 0.226 3.000 0.000 1 -H140 C283 C271 O272 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C283 C505 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C283 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C284 C271 O272 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C284 N238 H241 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C285 C271 O272 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C292 C235 N238 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C292 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C292 N287 H290 0.131 3.000 0.000 1 -H140 C293 C157 O154 0.234 3.000 0.000 1 -H140 C293 C158 O154 0.234 3.000 0.000 1 -H140 C293 C206 S200 0.226 3.000 0.000 1 -H140 C293 C214 S203 0.226 3.000 0.000 1 -H140 C293 C235 N238 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C293 C235 N239 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C293 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C293 C505 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C293 N287 H290 0.131 3.000 0.000 1 -H140 C295 C235 N238 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C295 C235 N239 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C295 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C295 N309 H310 0.131 3.000 0.000 1 -H140 C296 N309 H310 0.192 3.000 0.000 1 -H140 C307 C308 H140 0.150 3.000 0.000 1 -H140 C307 N303 H304 0.000 1.000 0.000 1 -H140 C308 C307 N303 -0.291 3.000 0.000 1 -H140 C505 C224 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C505 C283 N238 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C505 C293 N287 0.232 3.000 0.000 1 -H140 C505 C507 N511 0.209 3.000 0.000 1 -H140 C505 C508 N503 0.209 3.000 0.000 1 -H140 C505 C510 N512 0.209 3.000 0.000 1 -H146 C508 C507 N511 5.375 2.000 180.000 1 -H146 C508 N503 H504 2.500 2.000 180.000 1 -H146 C510 N512 H513 2.500 2.000 180.000 1 -H240 N237 C235 O236 2.450 2.000 180.000 1 -H241 N238 C235 O236 2.450 2.000 180.000 1 -H270 O268 C267 O269 2.750 2.000 180.000 1 -H301 N300 C302 N300 1.950 2.000 180.000 1 -H301 N300 C302 N303 1.950 2.000 180.000 1 -H304 N303 C302 N300 1.950 2.000 180.000 1 -H504 N503 C506 N511 2.325 2.000 180.000 1 -H513 N512 C509 N512 2.325 2.000 180.000 1 -N238 C223 C235 N238 0.905 -1.000 0.000 1 -N238 C223 C235 N238 1.077 -2.000 180.000 1 -N238 C223 C235 N238 -0.235 3.000 0.000 1 -N238 C223 C235 N239 0.905 -1.000 0.000 1 -N238 C223 C235 N239 1.077 -2.000 180.000 1 -N238 C223 C235 N239 -0.235 3.000 0.000 1 -N238 C223 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -N238 C224 C157 O154 3.129 -1.000 0.000 1 -N238 C224 C157 O154 -0.518 -2.000 180.000 1 -N238 C224 C157 O154 0.683 3.000 0.000 1 -N238 C224 C158 O154 3.129 -1.000 0.000 1 -N238 C224 C158 O154 -0.518 -2.000 180.000 1 -N238 C224 C158 O154 0.683 3.000 0.000 1 -N238 C224 C206 S200 1.028 -1.000 0.000 1 -N238 C224 C206 S200 0.265 -2.000 180.000 1 -N238 C224 C206 S200 0.272 3.000 0.000 1 -N238 C224 C214 S203 1.028 -1.000 0.000 1 -N238 C224 C214 S203 0.265 -2.000 180.000 1 -N238 C224 C214 S203 0.272 3.000 0.000 1 -N238 C224 C235 N238 0.905 -1.000 0.000 1 -N238 C224 C235 N238 1.077 -2.000 180.000 1 -N238 C224 C235 N238 -0.235 3.000 0.000 1 -N238 C224 C235 N239 0.905 -1.000 0.000 1 -N238 C224 C235 N239 1.077 -2.000 180.000 1 -N238 C224 C235 N239 -0.235 3.000 0.000 1 -N238 C224 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -N238 C223 C267 O268 2.630 -1.000 0.000 1 -N238 C223 C267 O268 0.410 -2.000 180.000 1 -N238 C223 C267 O268 0.000 3.000 0.000 1 -N238 C224 C267 O268 2.630 -1.000 0.000 1 -N238 C224 C267 O268 0.410 -2.000 180.000 1 -N238 C224 C267 O268 0.000 3.000 0.000 1 -N238 C223 C267 O269 0.000 1.000 0.000 1 -N238 C224 C267 O269 0.000 1.000 0.000 1 -N238 C235 C246 N239 -0.470 -1.000 0.000 1 -N238 C235 C246 N239 1.377 -2.000 180.000 1 -N238 C235 C246 N239 -1.335 3.000 0.000 1 -N238 C235 C292 N287 0.905 -1.000 0.000 1 -N238 C235 C292 N287 1.077 -2.000 180.000 1 -N238 C235 C292 N287 -0.235 3.000 0.000 1 -N238 C235 C293 N287 0.905 -1.000 0.000 1 -N238 C235 C293 N287 1.077 -2.000 180.000 1 -N238 C235 C293 N287 -0.235 3.000 0.000 1 -N238 C235 C295 N309 -0.470 -1.000 0.000 1 -N238 C235 C295 N309 1.377 -2.000 180.000 1 -N238 C235 C295 N309 -1.335 3.000 0.000 1 -N238 C283 C157 O154 3.129 -1.000 0.000 1 -N238 C283 C157 O154 -0.518 -2.000 180.000 1 -N238 C283 C157 O154 0.683 3.000 0.000 1 -N238 C283 C158 O154 3.129 -1.000 0.000 1 -N238 C283 C158 O154 -0.518 -2.000 180.000 1 -N238 C283 C158 O154 0.683 3.000 0.000 1 -N238 C283 C206 S200 1.028 -1.000 0.000 1 -N238 C283 C206 S200 0.265 -2.000 180.000 1 -N238 C283 C206 S200 0.272 3.000 0.000 1 -N238 C283 C214 S203 1.028 -1.000 0.000 1 -N238 C283 C214 S203 0.265 -2.000 180.000 1 -N238 C283 C214 S203 0.272 3.000 0.000 1 -N238 C283 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -N239 C246 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -N238 C284 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -N239 C235 C246 N239 -0.470 -1.000 0.000 1 -N239 C235 C246 N239 1.377 -2.000 180.000 1 -N239 C235 C246 N239 -1.335 3.000 0.000 1 -N239 C235 C293 N287 0.905 -1.000 0.000 1 -N239 C235 C293 N287 1.077 -2.000 180.000 1 -N239 C235 C293 N287 -0.235 3.000 0.000 1 -N239 C235 C295 N309 -0.470 -1.000 0.000 1 -N239 C235 C295 N309 1.377 -2.000 180.000 1 -N239 C235 C295 N309 -1.335 3.000 0.000 1 -N239 C246 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -N239 C285 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -N287 C292 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -N287 C293 C157 O154 3.129 -1.000 0.000 1 -N287 C293 C157 O154 -0.518 -2.000 180.000 1 -N287 C293 C157 O154 0.683 3.000 0.000 1 -N287 C293 C158 O154 3.129 -1.000 0.000 1 -N287 C293 C158 O154 -0.518 -2.000 180.000 1 -N287 C293 C158 O154 0.683 3.000 0.000 1 -N287 C293 C206 S200 1.028 -1.000 0.000 1 -N287 C293 C206 S200 0.265 -2.000 180.000 1 -N287 C293 C206 S200 0.272 3.000 0.000 1 -N287 C293 C214 S203 1.028 -1.000 0.000 1 -N287 C293 C214 S203 0.265 -2.000 180.000 1 -N287 C293 C214 S203 0.272 3.000 0.000 1 -N287 C293 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -N309 C295 C235 O236 0.000 1.000 0.000 1 -N503 C508 C507 N511 5.375 2.000 180.000 1 -C267 C136 C293 N287 -2.751 -1.000 0.000 1 -C267 C136 C293 N287 0.763 -2.000 180.000 1 -C267 C136 C293 N287 0.000 3.000 0.000 1 -C235 C293 C136 C267 0.299 -1.000 0.000 1 -C235 C293 C136 C267 0.779 -2.000 180.000 1 -C235 C293 C136 C267 0.128 3.000 0.000 1 -C267 C136 C283 N238 -2.751 -1.000 0.000 1 -C267 C136 C283 N238 0.763 -2.000 180.000 1 -C267 C136 C283 N238 0.000 3.000 0.000 1 -C267 C136 C283 C271 0.299 -1.000 0.000 1 -C267 C136 C283 C271 0.779 -2.000 180.000 1 -C267 C136 C283 C271 0.128 3.000 0.000 1 -!Below here are manually added parameters by analogy -C224 C235 N239 C283 1.150 -1.000 0.000 1 -C224 C235 N239 C283 3.045 2.000 180.000 1 -C283 N239 C235 O236 3.045 2.000 180.000 1 -N239 C283 C271 O272 0.410 2.000 180.000 1 -C235 N239 C283 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C136 C283 N239 C235 -0.341 -1.000 0.000 1 -C136 C283 N239 C235 0.065 -2.000 180.000 1 -C136 C283 N239 C235 0.169 3.000 0.000 1 -C235 C283 N239 C235 -1.256 -1.000 0.000 1 -C235 C283 N239 C235 0.105 -2.000 180.000 1 -C235 C283 N239 C235 -0.100 3.000 0.000 1 -C245 N239 C283 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C136 C283 N239 C245 2.377 -1.000 0.000 1 -C136 C283 N239 C245 -0.367 2.000 180.000 1 -C271 C283 N239 C245 -0.869 -1.000 0.000 1 -C271 C283 N239 C245 0.625 -2.000 180.000 1 -C271 C283 N239 C245 -1.750 3.000 0.000 1 -C245 N239 C283 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C136 C136 C283 N239 0.786 -1.000 0.000 1 -C136 C136 C283 N239 0.080 -2.000 180.000 1 -C136 C136 C283 N239 0.100 3.000 0.000 1 -C271 C283 N239 C235 -1.256 -1.000 0.000 1 -C271 C283 N239 C235 0.105 -2.000 180.000 1 -C271 C283 N239 C235 -0.100 3.000 0.000 1 -H140 C136 C283 N239 0.232 3.000 0.000 1 -C245 C136 C136 C283 0.650 -1.000 0.000 1 -C245 C136 C136 C283 -0.100 -2.000 180.000 1 -C245 C136 C136 C283 0.100 3.000 0.000 1 -C283 N239 C245 H140 0.000 1.000 0.000 1 -C136 C245 N239 C283 1.429 -1.000 0.000 1 -C136 C245 N239 C283 1.029 -2.000 180.000 1 -C136 C245 N239 C283 -5.633 3.000 0.000 1 - -!popc -!CT CT OS C2 -0.610 -1.000 0.000 1.000 -!CT CT OS C2 -0.063 -2.000 180.000 1.000 -!CT CT OS C2 0.211 3.000 0.000 1.000 -LC3 LNL LH2 LC2 0.449 1.000 0.000 3.00 -!LOS LC2 LH1 LC2 0.050 -1.000 0.000 2.00!Is this correct? -LOS LC2 LH1 LC2 0.699 1.000 0.000 3.00 -LOS LC2 LH1 LOS 0.250 1.000 0.000 2.00 -LH1 LC2 LOS LC 0.449 1.000 0.000 3.00 -LH1 LC2 LOS LP 0.449 1.000 0.000 3.00 -LH2 LC2 LOS LP 0.449 1.000 0.000 3.00 -LO LC LOS LC2 0.000 1.000 0.000 1.00 !!! Missing in Tieleman -LP2 LC LOS LC2 2.000 2.000 180.000 2.00 !!! -LO LC LOS LH1 0.000 1.000 0.000 1.00 !!! Missing in Tieleman -LP2 LC LOS LH1 2.000 2.000 180.000 2.00 !!! -LO LC LP2 LP2 0.000 1.000 0.000 1.00 !!! Missing in Tieleman -LOS LC LP2 LP2 0.050 1.000 0.000 6.00 -LOS LH1 LC2 LOS 0.250 1.000 0.000 2.00 -LP2 LH1 LH1 LP2 19.96 2.000 180.000 1.00 !!! Tieleman models as a harmonic improper -LC2 LH1 LOS LC 0.451 1.000 0.000 3.00 -LH1 LH1 LP2 LP2 0.700 1.000 0.000 3.00 -LNL LH2 LC2 LOS 0.699 1.000 0.000 3.00 -LC LP2 LP2 LP2 0.700 1.000 0.000 3.00 -!LH1 LP2 LP2 LP2 !!!! Ryckaert-Bellemans -LH1 LP2 LP2 LP2 -1.700 -1.000 0.000 1.00 !OPLS 404 -LH1 LP2 LP2 LP2 0.625 -2.000 180.000 1.00 ! -LH1 LP2 LP2 LP2 1.550 3.000 0.000 1.00 ! -!LP2 LP2 LP2 LP2 !!!! Ryckaert-Bellemans -LP2 LP2 LP2 LP2 -1.700 -1.000 0.000 1.00 !OPLS 404 -LP2 LP2 LP2 LP2 0.625 -2.000 180.000 1.00 ! -LP2 LP2 LP2 LP2 1.550 3.000 0.000 1.00 ! -!LP2 LP2 LP2 LP3 !!!! Ryckaert-Bellemans -LP2 LP2 LP2 LP3 -1.700 -1.000 0.000 1.00 !OPLS 404 -LP2 LP2 LP2 LP3 0.625 -2.000 180.000 1.00 ! -LP2 LP2 LP2 LP3 1.550 3.000 0.000 1.00 ! -LOM LP LOS LC2 0.000 1.000 0.000 1.00 !!! Missing in Tieleman -!LOS LP LOS LC2 0.125 -1.000 0.000 3.00 !Is this correct? -LOS LP LOS LC2 0.375 1.000 0.000 3.00 ! - -!PO4 -TO2Z TP3 TOS THO 0.000 1 0.000 1 !high 0 O2Z-P3-OS-HO ==> O2Z-P2-OS-HO - -!ACE-NMA Ter -O C CT HC 0.000 1 0.000 1 !high 0 O-C-CT-HC ==> HC-CT-C-O - N C CT HC 0.000 1 0.000 1 !high 0 N-C-CT-HC ==> HC-CT-C-N - N238 C CT HC 0.000 1 0.000 1 !high 0 N-C-CT-HC ==> HC-CT-C-N - O C N CT1G 3.045 2 180.000 1 !high 0 O-C-N-CT1G ==> O-C-N-CT1G - O C N H 2.450 2 180.000 1 !high 0 O-C-N-H ==> H-N-C-O - O C N238 H241 2.450 2 180.000 1 !high 0 O-C-N-H ==> H-N-C-O - CT C N CT1G 1.150 -1 0.000 1 !high 0 CT-C-N-CT1G ==> CT-C-N-CT1G - CT C N CT1G 3.045 2 180.000 1 !high 0 CT-C-N-CT1G ==> CT-C-N-CT1G - CT C N H 2.450 2 180.000 1 !high 0 CT-C-N-H ==> H-N-C-CT - CT C N238 H241 2.450 2 180.000 1 !high 0 CT-C-N-H ==> H-N-C-CT - C N CT1G C -1.558 -1 0.000 1 !high 0 C-N-CT1G-C ==> C-N-CT1G-C - C N CT1G C -0.124 -2 180.000 1 !high 0 C-N-CT1G-C ==> C-N-CT1G-C - C N CT1G C -0.144 3 0.000 1 !high 0 C-N-CT1G-C ==> C-N-CT1G-C - C N238 C224 C157 -1.183 2 0.231 1 - C N238 C224 C235 -1.183 -1 0.000 1 - C N238 C224 C235 0.456 -2 180.000 1 - C N238 C224 C235 -0.425 3 0.000 1 - C N CT1G HC 0.000 1 0.000 1 !high 0 C-N-CT1G-HC ==> C-N-CT1G-HC - H N CT1G C 0.000 1 0.000 1 !high 0 H-N-CT1G-C ==> H-N-CT1G-C - H N CT1G HC 0.000 1 0.000 1 !high 0 H-N-CT1G-HC ==> H-N-CT1-HC - N CT1G C O 0.000 1 0.000 1 !high 0 N-CT1G-C-O ==> N-CT1G-C-O - N CT1G C N 0.447 -1 0.000 1 !high 0 N-CT1G-C-N ==> N-CT1G-C-N - N CT1G C N 1.538 -2 180.000 1 !high 0 N-CT1G-C-N ==> N-CT1G-C-N - N CT1G C N -0.474 3 0.000 1 !high 0 N-CT1G-C-N ==> N-CT1G-C-N - HC CT1G C O 0.000 1 0.000 1 !high 0 HC-CT1G-C-O ==> HC-CT1G-C-O - HC CT1G C N 0.000 1 0.000 1 !high 0 HC-CT1G-C-N ==> HC-CT1G-C-N - CT1G C N CT 1.150 -1 0.000 1 !high 0 CT1G-C-N-CT ==> CT1G-C-N-CT - CT1G C N CT 3.045 2 180.000 1 !high 0 CT1G-C-N-CT ==> CT1G-C-N-CT - CT C N238 C224 3.045 2 180.000 1 - C N238 C224 C157 0.231 2 180.000 1 !0 * - Phi' peptides AA - CT1G C N H 2.450 2 180.000 1 !high 0 CT1G-C-N-H ==> CT1G-C-N-H - O C N CT 3.045 2 180.000 1 !high 0 O-C-N-CT ==> CT-N-C-O - O C N238 C224 3.045 2 180.000 1 !high 0 O-C-N-CT ==> CT-N-C-O - C N CT HC 0.000 1 0.000 1 !high 0 C-N-CT-HC ==> C-N-CT-HC - H N CT HC 0.000 1 0.000 1 !high 0 H-N-CT-HC ==> H-N-CT-HC - C N238 C224 H140 0.000 1 0.000 1 - C158 C224 C235 N 0.587 -1 0.000 1 !0 * - Psi' peptides AA - C158 C224 C235 N 0.095 -2 180.000 1 !0 * - Psi' peptides AA - C158 C224 C235 N -0.600 3 0.000 1 !0 * - Psi' peptides AA - N238 C224 C235 N 0.905 -1 0.000 1 - N238 C224 C235 N 1.077 -2 180.000 1 - N238 C224 C235 N -0.235 3 0.000 1 - H140 C224 C235 N 0.000 1 0.000 1 - C224 C235 N H 2.450 2 180.000 1 !0 * - peptide H or C C(O) N H rzhou - C224 C235 N CT 1.150 -1.000 0.000 1 - C224 C235 N CT 3.045 2.000 180.000 1 - H N C235 O236 2.450 2.000 180.000 1 - CT N C235 O236 3.045 2.000 180.000 1 - C235 N CT HC 0.000 1 0.000 1 !high 0 C-N-CT-HC ==> C-N-CT-HC - C135 C224 N238 C -0.341 -1.000 0.000 1 - C135 C224 N238 C 0.065 -2.000 180.000 1 - C135 C224 N238 C 0.169 3.000 0.000 1 - C136 C224 N238 C -0.341 -1.000 0.000 1 - C136 C224 N238 C 0.065 -2.000 180.000 1 - C136 C224 N238 C 0.169 3.000 0.000 1 - C137 C224 C235 N 0.889 -1.000 0.000 1 - C137 C224 C235 N 0.209 -2.000 180.000 1 - C137 C224 C235 N -0.055 3.000 0.000 1 - C136 C224 C235 N 0.889 -1.000 0.000 1 - C136 C224 C235 N 0.209 -2.000 180.000 1 - C136 C224 C235 N -0.055 3.000 0.000 1 - C206 C224 N238 C -0.341 -1.000 0.000 1 - C206 C224 N238 C 0.065 -2.000 180.000 1 - C206 C224 N238 C 0.169 3.000 0.000 1 - C135 C224 C235 N 0.889 -1.000 0.000 1 - C135 C224 C235 N 0.209 -2.000 180.000 1 - C135 C224 C235 N -0.055 3.000 0.000 1 - C137 C224 N238 C -0.341 -1.000 0.000 1 - C137 C224 N238 C 0.065 -2.000 180.000 1 - C137 C224 N238 C 0.169 3.000 0.000 1 - N238 C223 C235 N 0.905 -1.000 0.000 1 - N238 C223 C235 N 1.077 -2.000 180.000 1 - N238 C223 C235 N -0.235 3.000 0.000 1 - H140 C223 C235 N 0.000 1.000 0.000 1 - C223 C235 N H 2.450 2.000 180.000 1 - C223 C235 N CT 1.150 -1.000 0.000 1 - C223 C235 N CT 3.045 2.000 180.000 1 - C157 C224 C235 N 0.889 -1.000 0.000 1 - C157 C224 C235 N 0.209 -2.000 180.000 1 - C157 C224 C235 N -0.055 3.000 0.000 1 - C223 N238 C O 3.045 2.000 180.000 1 - C223 N238 C CT 1.150 -1.000 0.000 1 - C223 N238 C CT 3.045 2.000 180.000 1 - C235 C223 N238 C -1.256 -1.000 0.000 1 - C235 C223 N238 C 0.105 -2.000 180.000 1 - C235 C223 N238 C -0.100 3.000 0.000 1 - C N238 C223 H140 0.000 1.000 0.000 1 - C274 C224 C235 N 0.889 -1.000 0.000 1 - C274 C224 C235 N 0.209 -2.000 180.000 1 - C274 C224 C235 N -0.055 3.000 0.000 1 - C149 C224 C235 N 0.889 -1.000 0.000 1 - C149 C224 C235 N 0.209 -2.000 180.000 1 - C149 C224 C235 N -0.055 3.000 0.000 1 - C N238 C224 C274 -0.341 -1.000 0.000 1 - C N238 C224 C274 0.065 -2.000 180.000 1 - C N238 C224 C274 0.169 3.000 0.000 1 - C149 C224 N238 C -0.341 -1.000 0.000 1 - C149 C224 N238 C 0.065 -2.000 180.000 1 - C149 C224 N238 C 0.169 3.000 0.000 1 - N C235 C246 N239 -0.470 -1.000 0.000 1 - N C235 C246 N239 1.377 -2.000 180.000 1 - N C235 C246 N239 -1.335 3.000 0.000 1 - C136 C246 C235 N 2.514 -1.000 0.000 1 - C136 C246 C235 N 0.359 -2.000 180.000 1 - C136 C246 C235 N 1.120 3.000 0.000 1 - H140 C246 C235 N 0.000 1.000 0.000 1 - C246 C235 N H 2.450 2.000 180.000 1 - C246 C235 N CT 1.150 -1.000 0.000 1 - C246 C235 N CT 3.045 2.000 180.000 1 - C158 C224 N238 C -0.341 -1.000 0.000 1 - C158 C224 N238 C 0.065 -2.000 180.000 1 - C158 C224 N238 C 0.169 3.000 0.000 1 - HC CT C N239 0.000 1.000 0.000 1 - C246 N239 C O 3.045 2.000 180.000 1 - C245 N239 C O 3.045 2.000 180.000 1 - CT C N239 C246 1.150 -1.000 0.000 1 - CT C N239 C246 3.045 2.000 180.000 1 - CT C N239 C245 1.150 -1.000 0.000 1 - CT C N239 C245 3.045 2.000 180.000 1 - C235 C246 N239 C -1.256 -1.000 0.000 1 - C235 C246 N239 C 0.105 -2.000 180.000 1 - C235 C246 N239 C -0.100 3.000 0.000 1 - CT C N239 C245 1.150 -1.000 0.000 1 - CT C N239 C245 3.045 2.000 180.000 1 - C136 C246 N239 C -0.341 -1.000 0.000 1 - C136 C246 N239 C 0.065 -2.000 180.000 1 - C136 C246 N239 C 0.169 3.000 0.000 1 - C N239 C246 H140 0.000 1.000 0.000 1 - C136 C245 N239 C -0.341 -1.000 0.000 1 - C136 C245 N239 C 0.065 -2.000 180.000 1 - C136 C245 N239 C 0.169 3.000 0.000 1 - C N239 C245 H140 0.000 1.000 0.000 1 - C N238 C224 C505 -0.341 -1.000 0.000 1 - C N238 C224 C505 0.065 -2.000 180.000 1 - C N238 C224 C505 0.169 3.000 0.000 1 - -! Dual topology zero forceK torsions -!O154 C158 C224 C157 0.000 1.000 0.000 1 -!C135 C158 C224 C157 0.000 1.000 0.000 1 -!H140 C158 C224 C157 0.000 1.000 0.000 1 -!O154 C157 C224 C158 0.000 1.000 0.000 1 -!H140 C157 C224 C158 0.000 1.000 0.000 1 - -!C500 C136 C224 C149 0.000 1.000 0.000 1 -!H140 C136 C224 C149 0.000 1.000 0.000 1 -!C136 C224 C149 C145 0.000 1.000 0.000 1 -!C136 C224 C149 H140 0.000 1.000 0.000 1 -!H140 C157 C224 C158 0.000 1.000 0.000 1 - -!C135 C137 C224 C136 0.000 1.000 0.000 1 -!H140 C137 C224 C136 0.000 1.000 0.000 1 -!C137 C224 C136 C137 0.000 1.000 0.000 1 -!C137 C224 C136 H140 0.000 1.000 0.000 1 - -! Ligand torsion parameters - - - - -[impropers] -*iaci iacj iack iacl forceK imp0 -*---------------------------------------------- -C136 C500 C501 C514 1.100 180.000 -C136 C500 C514 C501 1.100 180.000 -C145 C502 C501 N503 1.100 180.000 -C145 C502 N503 C501 1.100 180.000 -C149 C145 C145 C145 1.100 180.000 -C245 N238 C235 C285 2.500 180.000 -C245 N238 C285 C235 2.500 180.000 -C245 N239 C235 C246 2.500 180.000 -C245 N239 C235 C285 2.500 180.000 -C245 N239 C246 C235 2.500 180.000 -C245 N239 C285 C235 2.500 180.000 -C502 C501 C145 C500 1.100 180.000 -C502 C501 C500 C145 1.100 180.000 -C505 C507 C508 N511 1.100 180.000 -C505 C507 N511 C508 1.100 180.000 -C505 C508 C507 N503 1.100 180.000 -C505 C508 N503 C507 1.100 180.000 -C505 C510 C510 N512 1.100 180.000 -C505 C510 N512 C510 1.100 180.000 -H146 C145 C145 C145 1.100 180.000 -H146 C145 C166 C145 1.100 180.000 -H146 C145 C145 C166 1.100 180.000 -H146 C145 C145 C501 1.100 180.000 -H146 C145 C501 C145 1.100 180.000 -H146 C145 C145 C502 1.100 180.000 -H146 C145 C502 C145 1.100 180.000 -H146 C506 N503 N511 1.100 180.000 -H146 C506 N511 N503 1.100 180.000 -H146 C507 C508 N511 1.100 180.000 -H146 C507 N511 C508 1.100 180.000 -H146 C508 C507 N503 1.100 180.000 -H146 C508 N503 C507 1.100 180.000 -H146 C509 N512 N512 1.100 180.000 -H146 C510 C510 N512 1.100 180.000 -H146 C510 N512 C510 1.100 180.000 -H146 C514 C500 N503 1.100 180.000 -H146 C514 N503 C500 1.100 180.000 -H240 N237 C235 H240 2.500 180.000 -H240 N237 H240 C235 2.500 180.000 -H241 N238 C223 C235 2.500 180.000 -H241 N238 C224 C235 2.500 180.000 -H241 N238 C235 C223 2.500 180.000 -H241 N238 C235 C224 2.500 180.000 -H241 N238 C235 C242 2.500 180.000 -H241 N238 C235 C283 2.500 180.000 -H241 N238 C235 C284 2.500 180.000 -H241 N238 C242 C235 2.500 180.000 -H241 N238 C283 C235 2.500 180.000 -H241 N238 C284 C235 2.500 180.000 -H301 N300 C302 H301 2.500 180.000 -H301 N300 H301 C302 2.500 180.000 -H304 N303 C302 C307 2.500 180.000 -H304 N303 C307 C302 2.500 180.000 -H504 N503 C502 C514 2.500 180.000 -H504 N503 C506 C508 2.500 180.000 -H504 N503 C508 C506 2.500 180.000 -H504 N503 C514 C502 2.500 180.000 -H513 N512 C509 C510 2.500 180.000 -H513 N512 C510 C509 2.500 180.000 -N300 C302 N300 N303 10.500 180.000 -N300 C302 N303 N300 10.500 180.000 -O167 C166 C145 C145 1.100 180.000 -O236 C235 C135 N239 10.500 180.000 -O236 C235 C135 N238 10.500 180.000 -O236 C235 C136 N237 10.500 180.000 -O236 C235 C223 N238 10.500 180.000 -O236 C235 C223 N239 10.500 180.000 -O236 C235 C224 N238 10.500 180.000 -O236 C235 C224 N239 10.500 180.000 -O236 C235 C246 N238 10.500 180.000 -O236 C235 C246 N239 10.500 180.000 -O236 C235 C292 N238 10.500 180.000 -O236 C235 C293 N238 10.500 180.000 -O236 C235 C293 N239 10.500 180.000 -O236 C235 C295 N238 10.500 180.000 -O236 C235 C295 N239 10.500 180.000 -O236 C235 N237 C136 10.500 180.000 -O236 C235 N238 C135 10.500 180.000 -O236 C235 N238 C223 10.500 180.000 -O236 C235 N238 C224 10.500 180.000 -O236 C235 N238 C246 10.500 180.000 -O236 C235 N238 C292 10.500 180.000 -O236 C235 N238 C293 10.500 180.000 -O236 C235 N238 C295 10.500 180.000 -O236 C235 N239 C135 10.500 180.000 -O236 C235 N239 C223 10.500 180.000 -O236 C235 N239 C224 10.500 180.000 -O236 C235 N239 C246 10.500 180.000 -O236 C235 N239 C293 10.500 180.000 -O236 C235 N239 C295 10.500 180.000 -O269 C267 C136 O268 10.500 180.000 -O269 C267 O268 C136 10.500 180.000 -O269 C267 C224 O268 10.500 180.000 -O269 C267 O268 C224 10.500 180.000 -O272 C271 C274 O272 10.500 180.000 -O272 C271 C283 O272 10.500 180.000 -O272 C271 C284 O272 10.500 180.000 -O272 C271 C285 O272 10.500 180.000 -O272 C271 O272 C274 10.500 180.000 -O272 C271 O272 C283 10.500 180.000 -O272 C271 O272 C284 10.500 180.000 -O272 C271 O272 C285 10.500 180.000 -O268 C267 C136 O269 10.500 180.000 -O268 C267 C223 O269 10.500 180.000 ! Gly -O268 C267 C224 O269 10.500 180.000 -!Below here are manually added parameters by analogy -C245 N239 C235 C283 2.500 180.000 - -!popc -!N2 CAr N2 N2 10.5 180.000 !160 -LOS LC LP2 LO 20.005 180.000 !!! Tieleman models as a harmonic improper -LOS LH1 LC2 LC2 39.998 35.264 !!! Tieleman models as a harmonic improper - -!ACE-NMA Ter - O CT C N 10.500 180.000 !high carbonyl and analogs - H C N CT1G 1.000 180.000 !high amide, amidine-,guanidinium - O CT1G C N 10.500 180.000 !high carbonyl and analogs - H C N CT 1.000 180.000 !high amide, amidine-,guanidinium - O C CT N238 10.500 180.000 - H241 N238 C C224 2.500 180.000 - O236 C235 C224 N 10.500 180.000 - H N C235 CT 2.500 180.000 - O236 C235 C223 N 10.500 180.000 - H241 N238 C C223 2.500 180.000 - O236 C235 C246 N 10.500 180.000 - O C CT N239 10.500 180.000 - C245 N239 C C246 2.500 180.000 - -! Ligand improper parameters -! End ligand improper parameters diff --git a/build.py b/build.py new file mode 100644 index 00000000..408c37ae --- /dev/null +++ b/build.py @@ -0,0 +1,175 @@ +"""Custom build script to compile Fortran qprep binary during pip installation. +It detects the gfortran compiler and runs make to build the qprep executable. +""" + +import platform +import shutil +import subprocess +import sys +from pathlib import Path + +from setuptools.command.build_py import build_py as _build_py + + +def find_gfortran(): + """ + Find gfortran compiler in environment or system PATH. + + Returns: + Path to gfortran executable or None if not found + """ + # Check if gfortran is available + gfortran = shutil.which("gfortran") + if gfortran: + return gfortran + + # On macOS, check common homebrew locations + if platform.system() == "Darwin": + homebrew_paths = [ + "/opt/homebrew/bin/gfortran", # Apple Silicon + "/usr/local/bin/gfortran", # Intel Mac + ] + for path in homebrew_paths: + if Path(path).exists(): + return path + + return None + + +def compile_qprep(src_dir): + """ + Compile qprep binary using make. + + Args: + src_dir: Path to the Q source directory + """ + q6_dir = src_dir / "q6" + + if not q6_dir.exists(): + raise FileNotFoundError(f"Q6 source directory not found: {q6_dir}") + + # Check for gfortran + gfortran = find_gfortran() + if not gfortran: + # Determine the appropriate COMP flag for the platform + system = platform.system() + comp_flag = "osx" if system == "Darwin" else "gcc" + + print( + "\n" + "="*70, + "\nWARNING: gfortran compiler not found!", + "\n" + "="*70, + "\nThe qprep binary could not be compiled automatically.", + "\nYou have two options:", + "\n 1. Install gfortran and reinstall this package:", + "\n - On macOS: micromamba install gfortran -c conda-forge", + "\n - On Linux: micromamba install gfortran -c conda-forge", + "\n 2. Manually compile qprep after installation:", + f"\n cd {q6_dir}", + f"\n make qprep COMP={comp_flag}", + "\n" + "="*70 + "\n", + file=sys.stderr + ) + return False + + print(f"Found gfortran: {gfortran}") + print(f"Compiling qprep in {q6_dir}...") + + # Determine the appropriate COMP flag for the platform + system = platform.system() + comp_flag = "osx" if system == "Darwin" else "gcc" + print(f"Using compiler configuration: COMP={comp_flag}") + + try: + # Clean any previous build artifacts + subprocess.run( + ["make", "clean"], + cwd=q6_dir, + check=False, # Don't fail if clean fails + capture_output=True + ) + + # Compile qprep only + result = subprocess.run( + ["make", "qprep", f"COMP={comp_flag}"], + cwd=q6_dir, + check=True, + capture_output=True, + text=True + ) + + print("Compilation output:") + print(result.stdout) + + # Create bin directory structure + bin_dir = q6_dir / "bin" / "q6" + bin_dir.mkdir(parents=True, exist_ok=True) + + # Move qprep binary to bin directory + qprep_binary = q6_dir / "qprep" + if qprep_binary.exists(): + shutil.move(str(qprep_binary), str(bin_dir / "qprep")) + print(f"Successfully compiled qprep -> {bin_dir / 'qprep'}") + + # Move object files to obj directory + obj_dir = q6_dir / "obj" + obj_dir.mkdir(exist_ok=True) + for pattern in ["*.o", "*.mod"]: + for obj_file in q6_dir.glob(pattern): + shutil.move(str(obj_file), str(obj_dir / obj_file.name)) + + return True + else: + print("ERROR: qprep binary not found after compilation", file=sys.stderr) + return False + + except subprocess.CalledProcessError as e: + print( + f"\nERROR: Compilation failed!\n" + f"Command: {' '.join(e.cmd)}\n" + f"Return code: {e.returncode}\n" + f"Output: {e.stdout}\n" + f"Error: {e.stderr}", + file=sys.stderr + ) + return False + + +def build(): + """Main build function called by setuptools.""" + # Get the source directory + src_dir = Path(__file__).parent / "src" + + print("\n" + "="*70) + print("Building QligFEP - Compiling Fortran qprep binary") + print("="*70 + "\n") + + success = compile_qprep(src_dir) + + if not success: + print( + "\nWARNING: Package installed but qprep compilation failed.", + "\nYou will need to compile qprep manually before using QligFEP.", + file=sys.stderr + ) + # Don't fail the installation - let users install and compile manually + # This is important for HPC environments where they may need specific compilers + else: + print("\n" + "="*70) + print("QligFEP build completed successfully!") + print("="*70 + "\n") + + +class BuildWithFortran(_build_py): + """Custom build_py command that compiles Fortran code before building Python package.""" + + def run(self): + """Execute the build, including Fortran compilation.""" + # Compile Fortran first + build() + # Then run the standard build_py + super().run() + + +if __name__ == "__main__": + build() diff --git a/pyproject.toml b/pyproject.toml index 741ebaa6..5bc58c8c 100644 --- a/pyproject.toml +++ b/pyproject.toml @@ -10,7 +10,14 @@ readme = { file = "README.md", content-type = "text/markdown" } requires-python = ">=3.10" license = { file = "LICENSE" } # keywords = [""] -authors = [{ name = "Willem Jespers", email = "w.jespers@lacdr.leidenuniv.nl" }] +authors = [{ name = "Willem Jespers", email = "w.jespers@rug.nl" }, + { name = "Chiel Jespers", email = "m.jespers@lacdr.leidenuniv.nl" }, + { name = "David Araripe", email = "david.araripe@rug.nl" }, + { name = "Shen Guo", email = "g.shen@rug.nl" }, + { name = "Mauricio Esguerra" }, + { name = "Johan Åqvist" }, + { name = "Hugo Gutiérrez de Terán" } +] # maintainers = [{ name = "", email = "" }] # TODO classifiers = [ "License :: OSI Approved :: GNU General Public License v2 (GPLv2)", @@ -38,7 +45,10 @@ include-package-data = true [tool.setuptools.packages.find] where = ["src"] -include = ["QligFEP", "Qgpu"] +include = ["QligFEP", "Qgpu", "q6"] + +[tool.setuptools.package-data] +q6 = ["bin/q6/*", "**/*.f90"] [tool.setuptools.dynamic] version = {attr = "QligFEP.__version__"} @@ -87,13 +97,13 @@ ignore = [ ] [project.scripts] -qligfep = "QligFEP.CLI.qligfep_cli:main_exe" -qmapfep = "QligFEP.CLI.qmapfep_cli:main_exe" -setupFEP = "QligFEP.CLI.setupFEP:main_exe" +qcog = "QligFEP.CLI.cog_cli:main_exe" +pdb2amber = "QligFEP.CLI.pdb_to_amber:main_exe" +qprep_prot = "QligFEP.CLI.qprep_cli:main_exe" qparams = "QligFEP.CLI.qparams_cli:main_exe" qlomap = "QligFEP.CLI.lomap_wrap_cli:main_exe" -pdb2amber = "QligFEP.CLI.pdb_to_amber:main_exe" +qmapfep = "QligFEP.CLI.qmapfep_cli:main_exe" +qligfep = "QligFEP.CLI.qligfep_cli:main_exe" +setupFEP = "QligFEP.CLI.setupFEP:main_exe" qligfep_analyze = "QligFEP.analyze_FEP:main_exe" -qprep_prot = "QligFEP.CLI.qprep_cli:main_exe" -qcog = "QligFEP.CLI.cog_cli:main_exe" ligalign = "QligFEP.CLI.lig_align_cli:main_exe" \ No newline at end of file diff --git a/setup.py b/setup.py new file mode 100644 index 00000000..fdca805a --- /dev/null +++ b/setup.py @@ -0,0 +1,133 @@ +"""Setup script to build and install the QligFEP package with Fortran compilation. +It integrates the Fortran compilation step into the setuptools build process. +""" + +import platform +import shutil +import subprocess +import sys +from pathlib import Path + +from setuptools import setup +from setuptools.command.build_py import build_py as _build_py + + +def find_gfortran(): + """Find gfortran compiler in environment or system PATH.""" + gfortran = shutil.which("gfortran") + if gfortran: + return gfortran + + if platform.system() == "Darwin": + homebrew_paths = [ + "/opt/homebrew/bin/gfortran", + "/usr/local/bin/gfortran", + ] + for path in homebrew_paths: + if Path(path).exists(): + return path + + return None + + +def compile_qprep(): + """Compile qprep binary using make.""" + src_dir = Path(__file__).parent / "src" + q6_dir = src_dir / "q6" + + if not q6_dir.exists(): + print(f"WARNING: Q6 source directory not found: {q6_dir}", file=sys.stderr) + return False + + gfortran = find_gfortran() + if not gfortran: + system = platform.system() + comp_flag = "osx" if system == "Darwin" else "gcc" + print( + f"\nWARNING: gfortran compiler not found!\n" + f"The qprep binary could not be compiled automatically.\n" + f"Please install gfortran and manually compile:\n" + f" cd {q6_dir}\n" + f" make qprep COMP={comp_flag}\n", + file=sys.stderr + ) + return False + + print(f"\nFound gfortran: {gfortran}") + print(f"Compiling qprep in {q6_dir}...") + + system = platform.system() + comp_flag = "osx" if system == "Darwin" else "gcc" + print(f"Using compiler configuration: COMP={comp_flag}\n") + + try: + subprocess.run( + ["make", "clean"], + cwd=q6_dir, + check=False, + capture_output=True + ) + + result = subprocess.run( + ["make", "qprep", f"COMP={comp_flag}"], + cwd=q6_dir, + check=True, + capture_output=True, + text=True + ) + + print(result.stdout) + + bin_dir = q6_dir / "bin" / "q6" + bin_dir.mkdir(parents=True, exist_ok=True) + + qprep_binary = q6_dir / "qprep" + if qprep_binary.exists(): + shutil.move(str(qprep_binary), str(bin_dir / "qprep")) + print(f"Successfully compiled qprep -> {bin_dir / 'qprep'}\n") + + obj_dir = q6_dir / "obj" + obj_dir.mkdir(exist_ok=True) + for pattern in ["*.o", "*.mod"]: + for obj_file in q6_dir.glob(pattern): + shutil.move(str(obj_file), str(obj_dir / obj_file.name)) + + return True + else: + print("ERROR: qprep binary not found after compilation", file=sys.stderr) + return False + + except subprocess.CalledProcessError as e: + print( + f"\nERROR: Compilation failed!\n" + f"Command: {' '.join(e.cmd)}\n" + f"Output: {e.stdout}\n" + f"Error: {e.stderr}", + file=sys.stderr + ) + return False + + +class BuildWithFortran(_build_py): + """Custom build_py command that compiles Fortran code before building Python package.""" + + def run(self): + """Execute the build, including Fortran compilation.""" + print("\n" + "="*70) + print("Building QligFEP - Compiling Fortran qprep binary") + print("="*70) + + compile_qprep() + + print("="*70) + print("Continuing with Python package build") + print("="*70 + "\n") + + super().run() + + +setup( + cmdclass={ + 'build_py': BuildWithFortran, + } +) diff --git a/src/QligFEP/CLI/_popc_utils.py b/src/QligFEP/CLI/_popc_utils.py new file mode 100644 index 00000000..f270415d --- /dev/null +++ b/src/QligFEP/CLI/_popc_utils.py @@ -0,0 +1,340 @@ +from ..logger import logger +from ..pdb_utils import write_dataframe_to_pdb + + +def atom_element_mapping(): + """ + Create a mapping of POPC atom names to their correct elements. + + Returns: + dict: {atom_name: element_symbol} + """ + # Based on AMBER14sb_popc-only.lib atom types and molecular weights + element_mapping = { + # Carbon atoms (molecular weight ~12.01) + "C1": "C", + "C2": "C", + "C3": "C", + "C11": "C", + "C12": "C", + "C13": "C", + "C14": "C", + "C15": "C", + "C16": "C", + "C17": "C", + "C18": "C", + "C19": "C", + "C21": "C", + "C22": "C", + "C23": "C", + "C24": "C", + "C25": "C", + "C26": "C", + "C27": "C", + "C28": "C", + "C29": "C", + "C31": "C", + "C32": "C", + "C33": "C", + "C34": "C", + "C35": "C", + "C110": "C", + "C111": "C", + "C112": "C", + "C113": "C", + "C114": "C", + "C115": "C", + "C116": "C", + "C210": "C", + "C211": "C", + "C212": "C", + "C213": "C", + "C214": "C", + "C215": "C", + "C216": "C", + "C217": "C", + "C218": "C", + "CA1": "C", + "CA2": "C", + # Nitrogen atoms (molecular weight ~14.01) + "N4": "N", + "N31": "N", + # Oxygen atoms (molecular weight ~16.00) + "O7": "O", + "O9": "O", + "O10": "O", + "O11": "O", + "O12": "O", + "O14": "O", + "O16": "O", + "O21": "O", + "O22": "O", + "O31": "O", + "O32": "O", + "O33": "O", + "O34": "O", + "O35": "O", + # Phosphorus atoms (molecular weight ~30.97) + "P8": "P", + "P31": "P", + # Hydrogen atoms (molecular weight ~1.01) - all H atoms start with H + "HR": "H", + "HS": "H", + "HX": "H", + "HA": "H", + "HB": "H", + "H1A": "H", + "H1B": "H", + "H2A": "H", + "H2B": "H", + "H2R": "H", + "H2S": "H", + "H3A": "H", + "H3B": "H", + "H3C": "H", + "H3R": "H", + "H3S": "H", + "H4A": "H", + "H4B": "H", + "H4C": "H", + "H4R": "H", + "H4S": "H", + "H5A": "H", + "H5B": "H", + "H5C": "H", + "H5R": "H", + "H5S": "H", + "H6R": "H", + "H6S": "H", + "H7R": "H", + "H7S": "H", + "H8R": "H", + "H8S": "H", + "H9R": "H", + "H9S": "H", + "H10R": "H", + "H10S": "H", + "H11R": "H", + "H11S": "H", + "H12R": "H", + "H12S": "H", + "H13R": "H", + "H13S": "H", + "H14R": "H", + "H14S": "H", + "H15R": "H", + "H15S": "H", + "H16R": "H", + "H16S": "H", + "H16T": "H", + "H22R": "H", + "H22S": "H", + "H23R": "H", + "H23S": "H", + "H24R": "H", + "H24S": "H", + "H25R": "H", + "H25S": "H", + "H26R": "H", + "H26S": "H", + "H27R": "H", + "H27S": "H", + "H28R": "H", + "H28S": "H", + "H29R": "H", + "H20R": "H", + "H21R": "H", + "H21S": "H", + "H22A": "H", + "H22B": "H", + "H23A": "H", + "H23B": "H", + "H24A": "H", + "H24B": "H", + "H25A": "H", + "H25B": "H", + "H26A": "H", + "H26B": "H", + "H26C": "H", + "H27A": "H", + "H27B": "H", + "H28A": "H", + "H28B": "H", + "H28C": "H", + } + + return element_mapping + + +def pymemdyn_to_amber_mapping(): + """ + Direct mapping from pymemdyn POPC atom names to unified format. + This skips the buildH step and only handles heavy atoms. + """ + return { + # Choline head group - direct mapping from pymemdyn to unified + "C1": "C34", # Choline methyl carbon + "C2": "C35", # Choline methyl carbon + "C3": "C33", # Choline methyl carbon + "N4": "N31", # Choline nitrogen + "C5": "C31", # Choline CH2 carbon + "C6": "C32", # Choline CH2 carbon (connected to phosphate) + # Phosphate group + "O7": "O32", # Phosphate-choline oxygen + "P8": "P31", # Phosphorus + "O9": "O34", # Phosphate oxygen + "O10": "O33", # Phosphate oxygen + "O11": "O31", # Phosphate-glycerol oxygen + # Glycerol backbone + "C12": "C3", # Glycerol CH2 (sn-3 position) + "C13": "C2", # Glycerol CH (sn-2 position) + "C32": "C1", # Glycerol CH2 (sn-1 position) + # sn-2 ester linkage and carbonyl + "O14": "O21", # sn-2 ester oxygen + "C15": "C21", # sn-2 ester carbonyl carbon + "O16": "O22", # sn-2 ester carbonyl oxygen + # sn-1 ester linkage and carbonyl + "O33": "O11", # sn-1 ester oxygen + "C34": "C11", # sn-1 ester carbonyl carbon + "O35": "O12", # sn-1 ester carbonyl oxygen + # sn-2 fatty acid chain (oleic acid chain) + "C17": "C22", # First carbon of sn-2 chain + "C18": "C23", + "C19": "C24", + "C20": "C25", + "C21": "C26", + "C22": "C27", + "C23": "C28", + "C24": "C29", # Before double bond + "C25": "C210", # Double bond carbon + "C26": "C211", # Double bond carbon + "C27": "C212", # After double bond + "C28": "C213", + "C29": "C214", + "C30": "C215", + "C31": "C216", + "CA1": "C217", # Additional carbons in oleic chain + "CA2": "C218", # Terminal methyl + # sn-1 fatty acid chain (palmitic acid chain) + "C36": "C12", # First carbon of sn-1 chain + "C37": "C13", + "C38": "C14", + "C39": "C15", + "C40": "C16", + "C41": "C17", + "C42": "C18", + "C43": "C19", + "C44": "C110", + "C45": "C111", + "C46": "C112", + "C47": "C113", + "C48": "C114", + "C49": "C115", + "C50": "C116", # Terminal methyl of palmitic chain + } + + +def has_pop_residues(pdb_data): + """ + Check if the PDB data contains any POP residues. + + Args: + pdb_data: DataFrame containing PDB data + + Returns: + tuple: (bool: True if POP residues are found, int: Number of POP residues found) + """ + # Use value_counts for more efficient counting + residue_counts = pdb_data["residue_name"].value_counts() + has_pop = "POP" in residue_counts + + if has_pop: + # Count unique residue instances (chain_id + residue_seq_number combinations) + pop_residues = pdb_data[pdb_data["residue_name"] == "POP"] + pop_count = len(pop_residues.groupby(["chain_id", "residue_seq_number"])) + return True, pop_count + else: + return False, 0 + + +def convert_pymemdyn_to_unified_dataframe(pdb_data): + """Convert pymemdyn POPC format directly to unified format for DataFrame using vectorized operations.""" + logger.info("Converting POP residues from pymemdyn to unified format...") + + # Get mapping + mapping = pymemdyn_to_amber_mapping() + + # Create a mask for POP residues + pop_mask = pdb_data["residue_name"] == "POP" + + if not pop_mask.any(): + return pdb_data + + pop_residues_count = len(pdb_data[pop_mask].groupby(["chain_id", "residue_seq_number"])) + pdb_data_corrected = pdb_data.copy() + + # Apply atom name mapping only to the POPC atoms + pop_atoms = pdb_data_corrected.loc[pop_mask, "atom_name"] + mapped_atoms = pop_atoms.map(mapping) + + # keep original for unmapped atoms + unmapped_mask = mapped_atoms.isna() + mapped_atoms.loc[unmapped_mask] = pop_atoms.loc[unmapped_mask] + pdb_data_corrected.loc[pop_mask, "atom_name"] = mapped_atoms + + # Set default values for missing fields + occupancy_mask = pop_mask & ( + pdb_data_corrected["occupancy"].isna() | (pdb_data_corrected["occupancy"] == "") + ) + temp_factor_mask = pop_mask & ( + pdb_data_corrected["temp_factor"].isna() | (pdb_data_corrected["temp_factor"] == "") + ) + charge_mask = pop_mask & (pdb_data_corrected["charge"].isna() | (pdb_data_corrected["charge"] == "")) + + pdb_data_corrected.loc[occupancy_mask, "occupancy"] = 1.00 + pdb_data_corrected.loc[temp_factor_mask, "temp_factor"] = 0.00 + pdb_data_corrected.loc[charge_mask, "charge"] = "" + + logger.debug(f"POP lipid conversion completed for {pop_residues_count} residue(s)") + logger.debug("Element symbols will be corrected based on atom names during file writing") + + unmapped_atoms = set(pop_atoms.loc[unmapped_mask].unique()) if unmapped_mask.any() else set() + if unmapped_atoms: + logger.warning(f"Unmapped atoms (kept original names): {unmapped_atoms}") + + return pdb_data_corrected + + +def correct_popc_elements(df): + """ + Correct element symbols for POP residues using vectorized operations. + """ + element_mapping = atom_element_mapping() + pop_mask = df["residue_name"] == "POP" + + if not pop_mask.any(): + return df + + df_corrected = df.copy() + + pop_atoms = df_corrected.loc[pop_mask, "atom_name"] + corrected_elements = pop_atoms.map(element_mapping) + + # For atoms not in mapping, guess from first character (fallback) + missing_mask = corrected_elements.isna() + corrected_elements.loc[missing_mask] = pop_atoms.loc[missing_mask].str[0].fillna("C") + + df_corrected.loc[pop_mask, "element_symbol"] = corrected_elements + return df_corrected + + +def df_to_pdb_corrected_element(df, output_file, header=None): + """ + Write DataFrame to PDB with element correction for lipid atoms using vectorized operations. + """ + has_pop, _ = has_pop_residues(df) + if has_pop: + df_corrected = correct_popc_elements(df) + write_dataframe_to_pdb(df_corrected, output_file, header=header) + else: + write_dataframe_to_pdb(df, output_file, header=header) diff --git a/src/QligFEP/CLI/cog_cli.py b/src/QligFEP/CLI/cog_cli.py index 8b2e7520..d9e258c8 100644 --- a/src/QligFEP/CLI/cog_cli.py +++ b/src/QligFEP/CLI/cog_cli.py @@ -4,7 +4,7 @@ import re from pathlib import Path -from loguru import logger +from ..logger import logger, setup_logger class MolecularCOG: @@ -107,10 +107,20 @@ def parse_arguments(): help="For PDB files, specify the atom types to include (e.g., 'ATOM,HETATM').", type=str, ) + parser.add_argument( + "-log", + "--log-level", + dest="log", + required=False, + default="info", + help="Set the log level for the logger. Defaults to `info`.", + choices=["trace", "debug", "info", "warning", "error", "critical"], + ) return parser.parse_args() def main(args: argparse.Namespace) -> None: + setup_logger(args.log) cog = MolecularCOG(args.input) center = cog(args.include) logger.info(f"Center of geometry: {center}") diff --git a/src/QligFEP/CLI/pdb_to_amber.py b/src/QligFEP/CLI/pdb_to_amber.py index fc9c0d50..1b3f6f80 100644 --- a/src/QligFEP/CLI/pdb_to_amber.py +++ b/src/QligFEP/CLI/pdb_to_amber.py @@ -286,9 +286,8 @@ def asp_search(npdb): for i in range(len(npdb)): resname = npdb[i][0][17:21].rstrip() if resname == "ASP": - OD1_present = atom_is_present(npdb[i], "OD1") - OD2_present = atom_is_present(npdb[i], "OD2") - if all([OD1_present, OD2_present]): + HD2_present = atom_is_present(npdb[i], "HD2") + if HD2_present: npdb[i] = [x.replace("ASP", "ASH") for x in npdb[i]] return npdb diff --git a/src/QligFEP/CLI/qprep_cli.py b/src/QligFEP/CLI/qprep_cli.py index 021750d3..76b443b9 100644 --- a/src/QligFEP/CLI/qprep_cli.py +++ b/src/QligFEP/CLI/qprep_cli.py @@ -15,6 +15,11 @@ write_dataframe_to_pdb, ) from ..settings.settings import CONFIGS, FF_DIR +from ._popc_utils import ( + convert_pymemdyn_to_unified_dataframe, + df_to_pdb_corrected_element, + has_pop_residues, +) from .utils import handle_cysbonds # NOTE: cysbonds will have \n after each bond -> `maketop MKC_p` is in a different line @@ -46,6 +51,254 @@ class QprepAtomLibMissingError(Exception): pass +class ProteinNeutralizer: + """Protein neutralizer for out-of-sphere charged residues in qprep workflow""" + + def __init__(self, center_coords, radius=25.0, boundary_offset=3.0): + self.center = np.array(center_coords) + self.radius = float(radius) + self.boundary_offset = boundary_offset + self.rest_bound = self.radius - self.boundary_offset # Neutralize residues OUTSIDE this boundary + + # Define charged residues and their neutral forms + key atoms for distance calculation + # Format: 'charged': ['neutral', 'key_atom', charge] + self.charged_residues = { + "GLU": ["GLH", "CD", -1], # Glutamic acid -> neutral glutamic acid + "ASP": ["ASH", "CG", -1], # Aspartic acid -> neutral aspartic acid + "ARG": ["ARN", "CZ", +1], # Arginine -> neutral arginine + "LYS": ["LYN", "NZ", +1], # Lysine -> neutral lysine + "HIP": ["HID", "CG", +1], # Histidine (protonated) -> histidine (delta protonated) + } + + # Statistics tracking + self.stats = { + "total_charged_residues": 0, + "residues_outside_boundary": 0, + "residues_neutralized": 0, + "salt_bridges_neutralized": 0, + "original_total_charge": 0, + "final_total_charge": 0, + "modifications": {}, + "remaining_outside_charged": [], + } + + def neutralize_outside_residues(self, pdb_file, salt_bridge_cutoff=4.0): + """Find and neutralize charged residues outside the sphere boundary""" + logger.info(f"Neutralizing charged residues outside {self.rest_bound:.1f}Å boundary") + + df = read_pdb_to_dataframe(pdb_file) + return self.neutralize_outside_residues_dataframe(df, salt_bridge_cutoff) + + def neutralize_outside_residues_dataframe(self, df, salt_bridge_cutoff=4.0): + """Find and neutralize charged residues outside the sphere boundary for a DataFrame""" + logger.info(f"Neutralizing charged residues outside {self.rest_bound:.1f}Å boundary") + + charged_residues_info = self._find_charged_residues(df) + + if not charged_residues_info: + logger.info("No charged residues found in the PDB data") + return df, self.stats + + self.stats["total_charged_residues"] = len(charged_residues_info) + logger.info(f"Found {len(charged_residues_info)} charged residues") + + # Classify residues by distance to center + outside_residues, inside_residues = self._classify_residues_by_distance(charged_residues_info) + self.stats["residues_outside_boundary"] = len(outside_residues) + + # Track original charge + self.stats["original_total_charge"] = sum(res["charge"] for res in charged_residues_info) + + # Find salt bridges between outside and inside residues + salt_bridge_pairs = self._find_salt_bridges(outside_residues, inside_residues, salt_bridge_cutoff) + self.stats["salt_bridges_neutralized"] = len(salt_bridge_pairs) + + # Neutralize residues outside boundary and their salt bridge partners + residues_to_modify = outside_residues + salt_bridge_pairs + self.stats["residues_neutralized"] = len(residues_to_modify) + + # Modify the dataframe + modified_df = self._modify_residues(df, residues_to_modify) + + # Track final charge and remaining outside charged residues + self.stats["final_total_charge"] = sum( + res["charge"] for res in inside_residues if res not in salt_bridge_pairs + ) + + # Check for remaining charged residues outside boundary + self._check_remaining_outside_charged(inside_residues, salt_bridge_pairs) + + # Log statistics + self._log_neutralization_stats() + + return modified_df, self.stats + + def _find_charged_residues(self, df): + """Find all charged residues in the PDB""" + charged_residues_info = [] + + for res_name in self.charged_residues: + residues = df[df["residue_name"] == res_name] + + if len(residues) == 0: + continue + + for (chain, res_num), group in residues.groupby(["chain_id", "residue_seq_number"]): + key_atom = self.charged_residues[res_name][1] + charge = self.charged_residues[res_name][2] + key_atom_row = group[group["atom_name"] == key_atom] # atom for distance calculation + + if len(key_atom_row) == 0: + logger.warning(f"Key atom {key_atom} not found in {res_name} {chain}:{res_num}") + continue + + key_atom_coords = key_atom_row[["x", "y", "z"]].values[0] + distance = np.linalg.norm(key_atom_coords - self.center) + + residues_info = { + "residue_name": res_name, + "chain_id": chain, + "residue_seq_number": res_num, + "key_atom": key_atom, + "key_atom_coords": key_atom_coords, + "distance": distance, + "charge": charge, + "neutral_form": self.charged_residues[res_name][0], + } + charged_residues_info.append(residues_info) + + return charged_residues_info + + def _classify_residues_by_distance(self, charged_residues_info): + """Classify residues as inside or outside the boundary""" + outside_residues = [] + inside_residues = [] + + for res_info in charged_residues_info: + if res_info["distance"] > self.rest_bound: + outside_residues.append(res_info) + logger.debug( + f"Residue {res_info['chain_id']}:{res_info['residue_seq_number']} ({res_info['residue_name']}) " + f"outside boundary: {res_info['distance']:.2f}Å > {self.rest_bound:.1f}Å" + ) + else: + inside_residues.append(res_info) + logger.debug( + f"Residue {res_info['chain_id']}:{res_info['residue_seq_number']} ({res_info['residue_name']}) " + f"inside boundary: {res_info['distance']:.2f}Å <= {self.rest_bound:.1f}Å" + ) + + return outside_residues, inside_residues + + def _find_salt_bridges(self, outside_residues, inside_residues, cutoff): + """Find salt bridges between outside and inside residues""" + salt_bridge_partners = [] + + for outside_res in outside_residues: + for inside_res in inside_residues: + # Only consider oppositely charged residues + if outside_res["charge"] * inside_res["charge"] >= 0: + continue + + distance = np.linalg.norm(outside_res["key_atom_coords"] - inside_res["key_atom_coords"]) + + if distance <= cutoff: + salt_bridge_partners.append(inside_res) + logger.info( + f"Salt bridge detected: {outside_res['chain_id']}:{outside_res['residue_seq_number']} " + f"({outside_res['residue_name']}) <-> {inside_res['chain_id']}:{inside_res['residue_seq_number']} " + f"({inside_res['residue_name']}) at {distance:.2f}Å - neutralizing both" + ) + + return salt_bridge_partners + + def _modify_residues(self, df, residues_to_modify): + """Modify residues to their neutral forms and remove appropriate atoms""" + modified_df = df.copy() + + for res_info in residues_to_modify: + chain = res_info["chain_id"] + res_num = res_info["residue_seq_number"] + old_name = res_info["residue_name"] + new_name = res_info["neutral_form"] + distance = res_info["distance"] + + # Change residue name and remove atoms based on residue type + mask = (modified_df["chain_id"] == chain) & (modified_df["residue_seq_number"] == res_num) + modified_df.loc[mask, "residue_name"] = new_name + atoms_to_remove = self._get_atoms_to_remove(old_name, new_name) + + for atom_name in atoms_to_remove: + atom_mask = mask & (modified_df["atom_name"] == atom_name) + indices_to_remove = modified_df[atom_mask].index + modified_df = modified_df.drop(indices_to_remove) + + mod_key = f"{chain}:{res_num}" + self.stats["modifications"][mod_key] = { + "original": old_name, + "modified": new_name, + "distance": distance, + "atoms_removed": atoms_to_remove, + } + + logger.debug( + f"Neutralized {old_name} -> {new_name} at {chain}:{res_num} (distance: {distance:.2f}Å)" + ) + if atoms_to_remove: + logger.debug(f"Removed atoms: {', '.join(atoms_to_remove)}") + + return modified_df + + def _get_atoms_to_remove(self, old_name, new_name): + """Get atoms to remove when converting charged to neutral form""" + atoms_to_remove = [] + + if old_name == "ASP" and new_name == "ASH": + # ASP -> ASH: No atoms removed, HD2 is added (handled by forcefield) + pass + elif old_name == "GLU" and new_name == "GLH": + # GLU -> GLH: No atoms removed, HE2 is added (handled by forcefield) + pass + elif old_name == "LYS" and new_name == "LYN": + # LYS -> LYN: Remove HZ1 hydrogen from NZ + atoms_to_remove = ["HZ1"] + elif old_name == "ARG" and new_name == "ARN": + # ARG -> ARN: Remove HH22 hydrogen from NH2 + atoms_to_remove = ["HH22"] + elif old_name == "HIP" and new_name == "HID": + # HIP -> HID: Remove HE2 hydrogen from NE2 + atoms_to_remove = ["HE2"] + + return atoms_to_remove + + def _check_remaining_outside_charged(self, inside_residues, salt_bridge_partners): + """Check for remaining charged residues outside the boundary""" + for res in inside_residues: + if res not in salt_bridge_partners and res["distance"] > self.rest_bound: + self.stats["remaining_outside_charged"].append(res) + + def _log_neutralization_stats(self): + """Log neutralization statistics""" + stats = self.stats + + if stats["remaining_outside_charged"]: + for res in stats["remaining_outside_charged"]: + logger.warning( + f"Charged residue {res['chain_id']}:{res['residue_seq_number']} ({res['residue_name']}) " + f"remains outside boundary at {res['distance']:.2f}Å" + ) + + if stats["modifications"]: + logger.debug("Detailed modifications:") + for res_id, mod_info in stats["modifications"].items(): + logger.debug( + f" {res_id}: {mod_info['original']} -> {mod_info['modified']} " + f"(distance: {mod_info['distance']:.2f}Å)" + ) + if mod_info["atoms_removed"]: + logger.debug(f" Atoms removed: {', '.join(mod_info['atoms_removed'])}") + + def qprep_error_check(qprep_out_path: Path, ff_name) -> None: """Check for errors in the qprep.out file and raise an exception if any are found. @@ -59,6 +312,7 @@ def qprep_error_check(qprep_out_path: Path, ff_name) -> None: error_pat = re.compile(r"ERROR\:\s", re.IGNORECASE) missing_lib_pat = re.compile( r">>> Atom ...?.? in residue no\.\s+\d+ not found in library entry for [A-Z]+" + r"|>>> Heavy atom ...?.? missing in residue\s+ [0-9]+" ) outfile_lines = qprep_out_path.read_text().split("\n") error_lines = [] @@ -187,6 +441,39 @@ def parse_arguments() -> argparse.Namespace: "pdb files containing the cofactors to be added." ), ) + parser.add_argument( + "-skip-n", + "--skip-neutralization", + dest="skip_neutralization", + action="store_true", + help=( + "Skip neutralizing charged residues outside the spherical boundary. Highly advised against." + "This neutralization is crucial for maintaining the stability of the system and prevents " + "electrostatic interference from distant charges. Defaults to False." + ), + ) + parser.add_argument( + "-nbo", + "--neutralize_boundary_offset", + dest="neutralize_boundary_offset", + type=float, + default=3.0, + help=( + "Distance offset from sphere radius to define neutralization boundary. " + "Residues outside (radius - offset) will be neutralized. Defaults to 3.0Å." + ), + ) + parser.add_argument( + "-sbc", + "--salt_bridge_cutoff", + dest="salt_bridge_cutoff", + type=float, + default=4.0, + help=( + "Distance cutoff for detecting salt bridges between inside and outside " + "residues. Salt bridge partners will also be neutralized. Defaults to 4.0Å." + ), + ) return parser.parse_args() @@ -211,31 +498,74 @@ def main(args: Optional[argparse.Namespace] = None, **kwargs) -> None: pdb_file = str(cwd / args.input_pdb_file) pdb_path = cwd / args.input_pdb_file + # Track processing steps for file naming + processing_steps = [] + original_stem = pdb_path.stem + ff_lib_path, ff_prm_path = get_force_field_paths(args.FF) - if args.cofactors: # append cofactors to the protein if any are passed... - pdb_data = read_pdb_to_dataframe(pdb_file) + # Step 1: Remove crystal waters first (they will be replaced by sphere waters) + pdb_data = read_pdb_to_dataframe(pdb_file) + crystal_waters_df = pdb_data.query("residue_name == 'HOH'") + if not crystal_waters_df.empty: + logger.info(f"Removing {len(crystal_waters_df)} crystal water molecules") + pdb_data = pdb_data.query("residue_name != 'HOH'") + processing_steps.append("noHOH") + + # Step 2: Add cofactors if provided + if args.cofactors: + logger.info(f"Adding {len(args.cofactors)} cofactor(s)") for cofactor in args.cofactors: pdb_data = append_pdb_to_another(pdb_data, cwd / cofactor, ignore_waters=True) - cofactor_path = pdb_path.with_name(f"{pdb_path.stem}_plus_cofactors.pdb") - write_dataframe_to_pdb(pdb_data, cofactor_path) - pdb_path = cofactor_path - pdb_file = str(pdb_path) + processing_steps.append("cofactors") + + # Step 3: Neutralization + neutralization_stats = None + if not args.skip_neutralization: + logger.info("Neutralizing charged residues outside spherical boundary") + center_coords = [float(coord) for coord in args.cog] + neutralizer = ProteinNeutralizer(center_coords, args.sphereradius, args.neutralize_boundary_offset) + # Neutralize the protein and get statistics + pdb_data, neutralization_stats = neutralizer.neutralize_outside_residues_dataframe( + pdb_data, args.salt_bridge_cutoff + ) + processing_steps.append("neutralized") + logger.info("Charged residues neutralized") + + # Step 4: POPC lipid renaming (only for AMBER14sb with POP residues) + lipid_conversion_performed = False + pop_count = 0 + if args.FF == "AMBER14sb": + has_pop, pop_count = has_pop_residues(pdb_data) + if has_pop: + logger.info(f"Detected {pop_count} POP lipid residue(s) with AMBER14sb forcefield") + logger.info("Converting pymemdyn POPC atom names to unified format compatible with AMBER14sb") + logger.info("Note: Qprep will add missing hydrogens automatically during topology generation") + pdb_data = convert_pymemdyn_to_unified_dataframe(pdb_data) + processing_steps.append("lipid_renamed") + lipid_conversion_performed = True + + # Create final processed PDB file with descriptive name + if processing_steps: + processed_stem = f"{original_stem}_{'_'.join(processing_steps)}" + processed_pdb_path = pdb_path.with_name(f"{processed_stem}.pdb") + else: + processed_pdb_path = pdb_path + + # Use element-corrected writing if lipids were converted + if lipid_conversion_performed: + df_to_pdb_corrected_element(pdb_data, processed_pdb_path) + else: + write_dataframe_to_pdb(pdb_data, processed_pdb_path) + pdb_file = str(processed_pdb_path) + pdb_path = processed_pdb_path + logger.info(f"Final processed protein saved as: {processed_pdb_path}") qprep_inp_path = cwd / "qprep.inp" qprep_out_path = cwd / "qprep.out" cysbonds = handle_cysbonds(args.cysbond, pdb_file, comment_out=True) - # write out without crystal waters - (will be in sphere) - protein_df = read_pdb_to_dataframe(pdb_file) - crystal_waters_df = protein_df.query("residue_name == 'HOH'") - if not crystal_waters_df.empty: - fname = args.input_pdb_file.split(".")[0] - write_dataframe_to_pdb( - protein_df.query("residue_name != 'HOH'"), Path(pdb_file).with_stem(f"{fname}_noHOH") - ) - if args is not None: param_dict = { "pdb_file_path": pdb_file, @@ -260,6 +590,30 @@ def main(args: Optional[argparse.Namespace] = None, **kwargs) -> None: qprep_error_check(qprep_out_path, args.FF) logger.info("qprep run finished. Check the output `qprep.out` for more information.") + # Log lipid conversion summary if performed + if lipid_conversion_performed: + logger.info( + "LIPID CONVERSION SUMMARY\n" + f"Converted {pop_count} POP lipid residue(s) from pymemdyn to Amber-unified format. " + "With the correct heavy atom naming, qprep will add the missing hydrogen atoms. " + "For this, check the output top_p.pdb from this program." + ) + + # Log neutralization summary if performed and charged residues were found + if neutralization_stats and not args.skip_neutralization and neutralization_stats['total_charged_residues'] > 0: + logger.info( + "NEUTRALIZATION SUMMARY\n" + f"Total charged residues processed: {neutralization_stats['total_charged_residues']}\n" + f"Residues outside boundary: {neutralization_stats['residues_outside_boundary']}\n" + f"Salt bridge pairs neutralized: {neutralization_stats['salt_bridges_neutralized']}\n" + f"Total residues neutralized: {neutralization_stats['residues_neutralized']}\n" + f"Charge change: {neutralization_stats['original_total_charge']:+d} -> {neutralization_stats['final_total_charge']:+d}\n" + ) + if neutralization_stats["remaining_outside_charged"]: + logger.warning( + f"Warning: {len(neutralization_stats['remaining_outside_charged'])} charged residues remain outside boundary" + ) + waterfile = Path(cwd / "water.pdb") # Write water file and deal with possible errors if not Path("complexnotexcluded.pdb").exists(): @@ -289,8 +643,8 @@ def main(args: Optional[argparse.Namespace] = None, **kwargs) -> None: oxygen_subset = water_df.query('atom_name == "O"') euclidean_distances = oxygen_subset[["x", "y", "z"]].sub(cog).pow(2).sum(1).apply(np.sqrt) outside = np.where(euclidean_distances > args.sphereradius * 1.05)[0] # we add a tolerance of 5% - outside_HOH_residues = oxygen_subset.iloc[outside].residue_seq_number.unique() # noqa: F841 if outside.shape[0] > 0: + outside_HOH_residues = oxygen_subset.iloc[outside].residue_seq_number.unique() logger.warning(f"Found {outside.shape[0]} water molecules outside the sphere radius.") logger.warning("Removing these water molecules from the water.pdb file.") todrop_idxs = water_df.query("residue_seq_number in @outside_HOH_residues").index diff --git a/src/QligFEP/FF/AMBER14sb.lib b/src/QligFEP/FF/AMBER14sb.lib index 56ce8a2d..6bcc70da 100644 --- a/src/QligFEP/FF/AMBER14sb.lib +++ b/src/QligFEP/FF/AMBER14sb.lib @@ -1,7 +1,6 @@ *-------------------------------------------------------------------------------- * Q-library: Amber ff14SB ported from AmberTools16 by M. Purg (October 2016) -* by D. Araripe: N- & C- terminus amino acids, TPO -* and by Wessel Porschen, POPC +* by D. Araripe: N- & C- terminus amino acids, TPO, POPC (Lipid21) * v0.2 * Minor formatting changes * v0.1 @@ -3453,141 +3452,291 @@ head N tail C *-------------------------------------------------------------------------------- -{POP} ! POPC values from Cordomí et al., 2012 https://doi.org/10.1021/ct200491c (Berger Lipid Parameters) - [info] - SYBYLtype RESIDUE !SYBYL substructure type - [atoms] - 1 N4 LNL -0.5000 - 2 P8 LP 1.700 - 3 C12 LC2 0.400 - 4 O7 LOS -0.800 - 5 C13 LH1 0.300 - 6 O11 LOS -0.700 - 7 C32 LC2 0.50 - 8 O9 LOM -0.800 - 9 O10 LOM -0.800 - 10 C5 LH2 0.3000 - 11 C1 LC3 0.4000 - 12 C2 LC3 0.4000 - 13 C3 LC3 0.4000 - 14 C6 LC2 0.4000 - 15 C15 LC 0.7000 - 16 O14 LOS -0.700 - 17 C17 LP2 0.0 - 18 O16 LO -0.700 - 19 C18 LP2 0.0 - 20 C19 LP2 0.0 - 21 C20 LP2 0.0 - 22 C21 LP2 0.0 - 23 C22 LP2 0.0 - 24 C23 LP2 0.0 - 25 C24 LH1 0.0 - 26 C34 LC 0.800 - 27 O33 LOS -0.70 - 28 C36 LP2 0.0 - 29 O35 LO -0.60 - 30 C37 LP2 0.0 - 31 C38 LP2 0.0 - 32 C39 LP2 0.0 - 33 C40 LP2 0.0 - 34 C41 LP2 0.0 - 35 C42 LP2 0.0 - 36 C43 LP2 0.0 - 37 C25 LH1 0.0 - 38 C26 LP2 0.0 - 39 C27 LP2 0.0 - 40 C28 LP2 0.0 - 41 C29 LP2 0.0 - 42 C30 LP2 0.0 - 43 C31 LP2 0.0 - 44 CA1 LP2 0.0 - 45 CA2 LP3 0.0 - 46 C44 LP2 0.0 - 47 C45 LP2 0.0 - 48 C46 LP2 0.0 - 49 C47 LP2 0.0 - 50 C48 LP2 0.0 - 51 C49 LP2 0.0 - 52 C50 LP3 0.0 - - [bonds] !connect i -- j - N4 C1 - N4 C2 - N4 C3 - N4 C5 - C5 C6 - C6 O7 - P8 O7 - P8 O11 - P8 O9 - P8 O10 - C12 O11 - C12 C13 - C13 O14 - C15 O14 - C15 O16 - C15 C17 - C17 C18 - C18 C19 - C19 C20 - C20 C21 - C21 C22 - C22 C23 - C23 C24 - C24 C25 - C25 C26 - C26 C27 - C27 C28 - C28 C29 - C29 C30 - C30 C31 - C31 CA1 - CA1 CA2 - C13 C32 - C32 O33 - C34 O33 - C34 O35 - C34 C36 - C36 C37 - C37 C38 - C38 C39 - C39 C40 - C40 C41 - C41 C42 - C42 C43 - C43 C44 - C44 C45 - C45 C46 - C46 C47 - C47 C48 - C48 C49 - C49 C50 - - [connections] !tail and head connections - - [impropers] - O14 C15 O16 C17 - O33 C34 O35 C36 - O14 C13 C12 C32 - [charge_groups] !charge groups, with switch atom first - C6 N4 C1 C2 C3 C5 P8 O7 O9 O10 O11 - O14 C12 C13 C15 O16 - C17 C18 C19 - C20 C21 - C22 C23 - C24 C25 - C26 C27 - C28 C29 - C30 C31 - CA1 CA2 - O33 C32 C34 O35 - C36 C37 C38 - C39 C40 - C41 C42 - C43 C44 - C45 C46 - C47 C48 - C49 C50 +{POP} + [atoms] + ! Phosphocholine head group (PC residue atoms) + 1 C11 cC 0.910403 + 2 O12 oC -0.671566 + 3 O11 oS -0.575489 + 4 C1 cA 0.196939 + 5 HR hE 0.070469 + 6 HS hE 0.070469 + 7 C2 cA 0.281242 + 8 HX hE 0.063253 + 9 C3 cA 0.017459 + 10 HA hE 0.095591 + 11 HB hE 0.095591 + 12 O31 oT -0.509480 + 13 P31 pA 1.339721 + 14 O32 oT -0.508176 + 15 C31 cA 0.166801 + 16 H1A hE 0.078534 + 17 H1B hE 0.078534 + 18 C32 cA -0.170824 + 19 H2A hX 0.136415 + 20 H2B hX 0.136415 + 21 N31 nA 0.245262 + 22 C33 cA -0.338973 + 23 H3A hX 0.172230 + 24 H3B hX 0.172230 + 25 H3C hX 0.172230 + 26 C34 cA -0.338973 + 27 H4A hX 0.172230 + 28 H4B hX 0.172230 + 29 H4C hX 0.172230 + 30 C35 cA -0.338973 + 31 H5A hX 0.172230 + 32 H5B hX 0.172230 + 33 H5C hX 0.172230 + 34 O33 oP -0.875812 + 35 O34 oP -0.875812 + 36 O21 oS -0.552948 + 37 C21 cC 0.897613 + 38 O22 oC -0.673755 + ! Palmitic acid chain (PA residue atoms) - sn-1 position + 39 C12 cD -0.149259 ! Connection point to PC.C11 via O11 + 40 H2R hL 0.047345 + 41 H2S hL 0.047345 + 42 C13 cD -0.004882 + 43 H3R hL 0.019007 + 44 H3S hL 0.019007 + 45 C14 cD -0.030099 + 46 H4R hL 0.020877 + 47 H4S hL 0.020877 + 48 C15 cD -0.029387 + 49 H5R hL 0.016763 + 50 H5S hL 0.016763 + 51 C16 cD -0.024427 + 52 H6R hL 0.013334 + 53 H6S hL 0.013334 + 54 C17 cD -0.019630 + 55 H7R hL 0.011041 + 56 H7S hL 0.011041 + 57 C18 cD -0.015793 + 58 H8R hL 0.009067 + 59 H8S hL 0.009067 + 60 C19 cD -0.030472 + 61 H9R hL 0.013897 + 62 H9S hL 0.013897 + 63 C110 cD -0.028831 + 64 H10R hL 0.014691 + 65 H10S hL 0.014691 + 66 C111 cD -0.025206 + 67 H11R hL 0.014334 + 68 H11S hL 0.014334 + 69 C112 cD -0.027633 + 70 H12R hL 0.011368 + 71 H12S hL 0.011368 + 72 C113 cD -0.033096 + 73 H13R hL 0.014621 + 74 H13S hL 0.014621 + 75 C114 cD -0.020086 + 76 H14R hL 0.015929 + 77 H14S hL 0.015929 + 78 C115 cD 0.013975 + 79 H15R hL 0.009292 + 80 H15S hL 0.009292 + 81 C116 cD -0.125447 + 82 H16R hL 0.029047 + 83 H16S hL 0.029047 + 84 H16T hL 0.029047 + ! Oleic acid chain (OL residue atoms) - sn-2 position + 85 C22 cD -0.143418 ! Connection point to PC.C21 via O21 (renamed from C12) + 86 H22R hL 0.042861 ! Renamed from H2R + 87 H22S hL 0.042861 ! Renamed from H2S + 88 C23 cD 0.001619 ! Renamed from C13 + 89 H23R hL 0.019529 ! Renamed from H3R + 90 H23S hL 0.019529 ! Renamed from H3S + 91 C24 cD -0.022960 ! Renamed from C14 + 92 H24R hL 0.018134 ! Renamed from H4R + 93 H24S hL 0.018134 ! Renamed from H4S + 94 C25 cD -0.016692 ! Renamed from C15 + 95 H25R hL 0.008690 ! Renamed from H5R + 96 H25S hL 0.008690 ! Renamed from H5S + 97 C26 cD -0.023789 ! Renamed from C16 + 98 H26R hL 0.009266 ! Renamed from H6R + 99 H26S hL 0.009266 ! Renamed from H6S + 100 C27 cD -0.017495 ! Renamed from C17 + 101 H27R hL 0.019598 ! Renamed from H7R + 102 H27S hL 0.019598 ! Renamed from H7S + 103 C28 cD 0.031775 ! Renamed from C18 + 104 H28R hL 0.032685 ! Renamed from H8R + 105 H28S hL 0.032685 ! Renamed from H8S + 106 C29 cB -0.244228 ! Renamed from C19 + 107 H29R hB 0.131512 ! Renamed from H9R + 108 C210 cB -0.239284 ! Renamed from C110 + 109 H20R hB 0.126878 ! Renamed from H10R + 110 C211 cD 0.029059 ! Renamed from C111 + 111 H21R hL 0.033531 ! Renamed from H11R + 112 H21S hL 0.033531 ! Renamed from H11S + 113 C212 cD -0.026353 ! Renamed from C112 + 114 H22A hL 0.019717 ! Renamed from H12R + 115 H22B hL 0.019717 ! Renamed from H12S + 116 C213 cD -0.018257 ! Renamed from C113 + 117 H23A hL 0.013800 ! Renamed from H13R + 118 H23B hL 0.013800 ! Renamed from H13S + 119 C214 cD -0.024849 ! Renamed from C114 + 120 H24A hL 0.008572 ! Renamed from H14R + 121 H24B hL 0.008572 ! Renamed from H14S + 122 C215 cD -0.023247 ! Renamed from C115 + 123 H25A hL 0.010403 ! Renamed from H15R + 124 H25B hL 0.010403 ! Renamed from H15S + 125 C216 cD -0.012488 ! Renamed from C116 + 126 H26A hL 0.013659 ! Renamed from H16R + 127 H26B hL 0.013659 ! Renamed from H16S + 128 C217 cD 0.008684 ! Renamed from C117 + 129 H27A hL 0.010026 ! Renamed from H17R + 130 H27B hL 0.010026 ! Renamed from H17S + 131 C218 cD -0.117290 ! Renamed from C118 + 132 H28A hL 0.026627 ! Renamed from H18R + 133 H28B hL 0.026627 ! Renamed from H18S + 134 H28C hL 0.026627 ! Renamed from H18T + [bonds] + ! PC head group bonds + C11 O12 + C11 O11 + O11 C1 + C1 HR + C1 HS + C1 C2 + C2 HX + C2 C3 + C2 O21 + C3 HA + C3 HB + C3 O31 + O31 P31 + P31 O32 + P31 O33 + P31 O34 + O32 C31 + C31 H1A + C31 H1B + C31 C32 + C32 H2A + C32 H2B + C32 N31 + N31 C33 + N31 C34 + N31 C35 + C33 H3A + C33 H3B + C33 H3C + C34 H4A + C34 H4B + C34 H4C + C35 H5A + C35 H5B + C35 H5C + O21 C21 + C21 O22 + ! Connection: PC.C11 connects to PA chain + C11 C12 + ! PA chain bonds (sn-1) + C12 H2R + C12 H2S + C12 C13 + C13 H3R + C13 H3S + C13 C14 + C14 H4R + C14 H4S + C14 C15 + C15 H5R + C15 H5S + C15 C16 + C16 H6R + C16 H6S + C16 C17 + C17 H7R + C17 H7S + C17 C18 + C18 H8R + C18 H8S + C18 C19 + C19 H9R + C19 H9S + C19 C110 + C110 H10R + C110 H10S + C110 C111 + C111 H11R + C111 H11S + C111 C112 + C112 H12R + C112 H12S + C112 C113 + C113 H13R + C113 H13S + C113 C114 + C114 H14R + C114 H14S + C114 C115 + C115 H15R + C115 H15S + C115 C116 + C116 H16R + C116 H16S + C116 H16T + ! Connection: PC.C21 connects to OL chain + C21 C22 + ! OL chain bonds (sn-2) + C22 H22R + C22 H22S + C22 C23 + C23 H23R + C23 H23S + C23 C24 + C24 H24R + C24 H24S + C24 C25 + C25 H25R + C25 H25S + C25 C26 + C26 H26R + C26 H26S + C26 C27 + C27 H27R + C27 H27S + C27 C28 + C28 H28R + C28 H28S + C28 C29 + C29 H29R + C29 C210 + C210 H20R + C210 C211 + C211 H21R + C211 H21S + C211 C212 + C212 H22A + C212 H22B + C212 C213 + C213 H23A + C213 H23B + C213 C214 + C214 H24A + C214 H24B + C214 C215 + C215 H25A + C215 H25B + C215 C216 + C216 H26A + C216 H26B + C216 C217 + C217 H27A + C217 H27B + C217 C218 + C218 H28A + C218 H28B + C218 H28C + [impropers] + ! Double bond impropers for oleic acid + C211 C210 C29 H20R + C210 C29 C28 H29R + [connections] + head + tail *-------------------------------------------------------------------------------- {HOH} !TIP3P water [info] diff --git a/src/QligFEP/__init__.py b/src/QligFEP/__init__.py index 4d1ab626..f0cea42b 100644 --- a/src/QligFEP/__init__.py +++ b/src/QligFEP/__init__.py @@ -4,7 +4,7 @@ def get_version(): if (Path(__file__).parent / "_version.py").exists(): from ._version import __version__ # noqa F401 else: - __version__ = "1.0.1" + __version__ = "2.1.0" return __version__ SRC = Path(__file__).parents[1] diff --git a/src/QligFEP/analyze_FEP.py b/src/QligFEP/analyze_FEP.py index 1bd656a5..b9c945ad 100644 --- a/src/QligFEP/analyze_FEP.py +++ b/src/QligFEP/analyze_FEP.py @@ -7,6 +7,8 @@ from pathlib import Path from typing import Optional +import matplotlib.cm as cm +import matplotlib.colors as mcolors import matplotlib.pyplot as plt import numpy as np import pandas as pd @@ -414,9 +416,9 @@ def calculate_ddG(self, water_sys: str = "1.water", protein_sys: str = "2.protei self.data["result"][delta_method].update( { fep: { - f"{delta_method}_avg": ddG, - f"{delta_method}_sem": ddG_sem, - f"{delta_method}_std": ddG_std, + f"{delta_method}_avg": (ddG if not np.isnan(ddG) else None), + f"{delta_method}_sem": (ddG_sem if not np.isnan(ddG_sem) else None), + f"{delta_method}_std": (ddG_std if not np.isnan(ddG_std) else None), "from": w_fep["from"], # the same for protein & water; can use either "to": w_fep["to"], } @@ -470,11 +472,15 @@ def populate_mapping_dictionary(self, method, output_file: str | Path | None = N for fep in self.feps: fep_dict = self.data["result"][method][fep] if fep_dict["from"] == _from and fep_dict["to"] == _to: + avg_val = fep_dict[f"{method}_avg"] if not np.isnan(fep_dict[f"{method}_avg"]) else None + sem_val = fep_dict[f"{method}_sem"] if not np.isnan(fep_dict[f"{method}_sem"]) else None + std_val = fep_dict[f"{method}_std"] if not np.isnan(fep_dict[f"{method}_std"]) else None + edge.update( { - "Q_ddG_avg": fep_dict[f"{method}_avg"], - "Q_ddG_sem": fep_dict[f"{method}_sem"], - "Q_ddG_std": fep_dict[f"{method}_std"], + "Q_ddG_avg": avg_val, + "Q_ddG_sem": sem_val, + "Q_ddG_std": std_val, } ) if output_file is not None: @@ -510,10 +516,12 @@ def create_ddG_plot( output_path: str | None = None, target_name: str | None = None, savefig: bool = False, + font: str | None = None, ): """Creates the ddG plot for the FEP that has already been analyzed. The plot will show the experimental (X axis) vs mean predicted values (Y axis), with error bars - representing the standard error of the mean (SEM). + representing the standard error of the mean (SEM). Points are colored based on + their deviation from experimental values (blue = 0 deviation, red = 3+ kcal/mol). Args: reuslts_df: pd.DataFrame with the results from the FEP, output from `prepare_df`. @@ -538,6 +546,13 @@ def create_ddG_plot( sem_values = sem_values[mask] exp_values = exp_values[mask] + # Calculate absolute deviations for coloring + deviations = np.abs(avg_values - exp_values) + + # Create colormap from blue to red, with max at 3 kcal/mol + norm = mcolors.Normalize(vmin=0, vmax=4) + cmap = cm.RdBu_r + ## CALCULATE STATISTICS def result_to_latex(res, latexify_each=False): # TODO: move this out of this method? """Round cinnabar's output to one decimal case and return a LaTeX string.""" @@ -566,19 +581,39 @@ def result_to_latex(res, latexify_each=False): # TODO: move this out of this me min_val = min(all_values) - margin max_val = max(all_values) + margin - fig, ax = plt.subplots() + fig, ax = plt.subplots(figsize=(7, 4.5)) - plt.errorbar( + # Plot colored points with error bars + scatter = plt.errorbar( exp_values, avg_values, - yerr=sem_values, fmt="o", - color="black", - ecolor="black", - elinewidth=2.0, - capsize=0, + yerr=sem_values, + ecolor="gray", + elinewidth=1.5, + capsize=2, zorder=4, + linestyle="None", + markersize=8, + ) + + # Remove the default markers and add colored ones + scatter[0].remove() + + # Add the colored scatter points + scatter_points = plt.scatter( + exp_values, + avg_values, + c=deviations, + cmap=cmap, + norm=norm, + s=45, + zorder=5, + edgecolors="black", + linewidths=0.5, + alpha=0.8, ) + plt.plot([min_val, max_val], [min_val, max_val], "k-", linewidth=1.5, zorder=3) # Black identity line # Highlight predictions within 1 and 2 kcal/mol of the experimental affinity @@ -587,7 +622,7 @@ def result_to_latex(res, latexify_each=False): # TODO: move this out of this me [min_val - 1, max_val - 1], [min_val + 1, max_val + 1], color="darkgray", - alpha=0.5, + alpha=0.3, zorder=2, ) ax.fill_between( @@ -595,17 +630,27 @@ def result_to_latex(res, latexify_each=False): # TODO: move this out of this me [min_val - 2, max_val - 2], [min_val + 2, max_val + 2], color="lightgray", - alpha=0.5, + alpha=0.3, zorder=1, ) + # Add colorbar + cbar = plt.colorbar(scatter_points, ax=ax, shrink=0.40, aspect=10, anchor=(0.0, 0.85), pad=0.05) + + cbar.set_label("|Deviation| (kcal/mol)", rotation=270, labelpad=20) + cbar.ax.tick_params(labelsize=10) + cbar.set_ticks([0, 1, 2, 3, 4]) + cbar.set_ticklabels(["0", "1", "2", "3", "≥4"]) + cbar.ax.tick_params(labelsize=10) + # set labels, make it square and add legend plt.title( - f"{(target_name + ' - ' if target_name is not None else '')}" - rf"$\Delta\Delta Gbar$ plot ($N={len(exp_values)}$)" + f"{(target_name + ' ' if target_name is not None else '')}" + r"$\Delta\Delta \text{G}_{\text{BAR}}$ ($\mathrm{N}=" + f"{len(exp_values)}$)" ) - plt.xlabel("$\Delta\Delta G_{exp} [kcal/mol]$") # noqa: W605 - plt.ylabel("$\Delta\Delta G_{pred} [kcal/mol]$") # noqa: W605 + plt.xlabel("$\Delta\Delta G_{exp} (kcal/mol)$") # noqa: W605 + plt.ylabel("$\Delta\Delta G_{calc} (kcal/mol)$") # noqa: W605 plt.xlim(min_val, max_val) plt.ylim(min_val, max_val) ax.set_aspect("equal", adjustable="box") @@ -613,7 +658,7 @@ def result_to_latex(res, latexify_each=False): # TODO: move this out of this me # add statistics to the plot unit = r"\frac{kcal}{mol}" text_body = ( - f"$\\tau = {stats_dict['KTAU']}$ (Kendall's $\\tau$)", + f"$\\tau = {stats_dict['KTAU']}$", f"RMSE = ${stats_dict['RMSE']} {unit}$", f"MUE = ${stats_dict['MUE']} {unit}$", ) @@ -633,12 +678,13 @@ def result_to_latex(res, latexify_each=False): # TODO: move this out of this me verticalalignment="bottom", horizontalalignment="left", transform=ax.transAxes, + fontproperties=font, ) legend_elements = [ Line2D([0], [0], color="k", linestyle="-", label="Identity line"), - Patch(facecolor="darkgray", alpha=0.5, label="Within 1 kcal/mol"), - Patch(facecolor="lightgray", alpha=0.5, label="Within 2 kcal/mol"), + Patch(facecolor="darkgray", alpha=0.3, label="Within 1 kcal/mol"), + Patch(facecolor="lightgray", alpha=0.3, label="Within 2 kcal/mol"), ] ax.legend( @@ -648,6 +694,12 @@ def result_to_latex(res, latexify_each=False): # TODO: move this out of this me borderaxespad=0, frameon=False, ) + # Remove top and right spines using matplotlib + ax.spines["top"].set_visible(False) + ax.spines["right"].set_visible(False) + ax.grid(True, linestyle="--", linewidth=0.5, alpha=0.5) + ax.set_axisbelow(True) + if savefig: if output_path is None: output_path = Path().cwd() @@ -660,7 +712,7 @@ def result_to_latex(res, latexify_each=False): # TODO: move this out of this me if output_path.isdir(): output_path = output_path / f"{target_name}_ddG_plot.png" logger.info(f"Using default name to save the plot at {output_path}") - elif output_path.exits(): + elif output_path.exists(): # Fixed typo: exits() -> exists() logger.warning(f"File {output_path} already exists. Overwriting...") fig.savefig(output_path, dpi=300, bbox_inches="tight") return fig, ax diff --git a/src/QligFEP/pdb_utils.py b/src/QligFEP/pdb_utils.py index e96b9d12..23b1e9fc 100644 --- a/src/QligFEP/pdb_utils.py +++ b/src/QligFEP/pdb_utils.py @@ -420,13 +420,14 @@ def write_dataframe_to_pdb(df, output_file, header: Optional[str] = None): output_file: name of the output file (include .pdb extension). header: if desired, a header to be added to the PDB file. Defaults to None. """ + df = df.copy() with open(output_file, "w") as file: if header is not None: file.write(f"{header}\n") - if df.temp_factor.dtype == "float64": - df.loc[:, "temp_factor"] = df.temp_factor.apply(lambda x: f"{x:.2f}") - if df.occupancy.dtype == "float64": - df.loc[:, "occupancy"] = df.occupancy.apply(lambda x: f"{x:.2f}") + if df["temp_factor"].dtype == "float64": + df["temp_factor"] = df["temp_factor"].apply(lambda x: f"{x:.2f}") + if df["occupancy"].dtype == "float64": + df["occupancy"] = df["occupancy"].apply(lambda x: f"{x:.2f}") for _, row in df.iterrows(): pdb_line = ( f"{row['record_type']:<6}{row['atom_serial_number']:>5} " diff --git a/src/QligFEP/qligfep.py b/src/QligFEP/qligfep.py index 6daa1197..1ffc38a0 100644 --- a/src/QligFEP/qligfep.py +++ b/src/QligFEP/qligfep.py @@ -515,8 +515,10 @@ def set_restraints(self, writedir, restraint_method, strict_check: bool = True) f"System {self.system} not supported by this distance " "restraint method. Please use 'protein' or 'water'." ) - subset_lig1 = pdb_df.query("residue_name == 'LIG'") - subset_lig2 = pdb_df.query("residue_name == 'LID'") + subset_lig1 = pdb_df.query("residue_name == 'LIG'").reset_index() + subset_lig2 = pdb_df.query("residue_name == 'LID'").reset_index() + logger.debug(f"Subset LIG shape: {subset_lig1.shape}") + logger.debug(f"Subset LID shape: {subset_lig2.shape}") lig1_path = parent_write_dir / f"{self.lig1}.sdf" lig2_path = parent_write_dir / f"{self.lig2}.sdf" if not lig1_path.exists() or not lig2_path.exists(): @@ -545,8 +547,17 @@ def set_restraints(self, writedir, restraint_method, strict_check: bool = True) rdLig1 = rsetter.molA.to_rdkit() rdLig2 = rsetter.molB.to_rdkit() for AtomIdx_Lig1, AtomIdx_Lig2 in restraints.items(): - rowLig1 = subset_lig1.iloc[AtomIdx_Lig1] - rowLig2 = subset_lig2.iloc[AtomIdx_Lig2] + try: + rowLig1 = subset_lig1.iloc[AtomIdx_Lig1] + rowLig2 = subset_lig2.iloc[AtomIdx_Lig2] + except IndexError: + qprep_out_path = Path(writedir) / "qprep.out" + logger.error( + f"Index error for atom {AtomIdx_Lig1} in LIG or {AtomIdx_Lig2} in LID. " + "It's likely coming from a qprep failure.\nPlease check the qprep output at " + f"{qprep_out_path}." + ) + qprep_error_check(qprep_out_path, self.FF) atom1_in_pdb = rowLig1["atom_name"].strip("1234567890") atom1_in_rdkit = rdLig1.GetAtomWithIdx(AtomIdx_Lig1).GetSymbol() atom2_in_pdb = rowLig2["atom_name"].strip("1234567890") diff --git a/src/QligFEP/settings/settings.py b/src/QligFEP/settings/settings.py index b7929c78..ac348876 100644 --- a/src/QligFEP/settings/settings.py +++ b/src/QligFEP/settings/settings.py @@ -19,8 +19,18 @@ def nljoin(list_strings): # nl for new line if not BIN.exists(): raise FileNotFoundError( f"Could not find {BIN}.\n" - "Please make sure you have compiled q6 by running " - f"`make all && make mpi` in the {Q_DIR} directory." + "The qprep binary was not compiled during installation.\n" + "This can happen if gfortran was not available during pip install.\n\n" + "To fix this, please:\n" + " 1. Install gfortran:\n" + " micromamba install gfortran -c conda-forge\n" + " 2. Recompile qprep manually:\n" + f" cd {Q_DIR}\n" + " make qprep COMP=gcc\n" + " mkdir -p bin/q6 && mv qprep bin/q6/\n\n" + "For HPC users who need MPI support, also run:\n" + f" cd {Q_DIR}\n" + " make mpi COMP=gcc\n" ) # some example schrodinger directory diff --git a/tutorials/CCR2/README.md b/tutorials/CCR2/README.md index a694008f..7fd4c7fd 100644 --- a/tutorials/CCR2/README.md +++ b/tutorials/CCR2/README.md @@ -25,6 +25,12 @@ Once in the perturbation directory, we move the ligands to it and generate the p cp ../aligned_ligands.sdf . qlomap -i aligned_ligands.sdf ``` + +To generate the QmapFEP html file: +```bash +qmapfep -i aligned_ligands.sdf -wd . -l aligned_ligands/lomap.json +``` + ## create ligand parameters ```bash @@ -42,4 +48,4 @@ cp ../qprep/protein.pdb . ```bash setupFEP -c SNELLIUS -FF OPLS2015 -rs 42 -j lomap.json -rest hybridization_p -clean .dcd -``` \ No newline at end of file +``` diff --git a/tutorials/Tyk2/README.md b/tutorials/Tyk2/README.md index e030c35f..4f64845b 100644 --- a/tutorials/Tyk2/README.md +++ b/tutorials/Tyk2/README.md @@ -16,7 +16,13 @@ The workflow consists of the following steps: # Tutorial -We start this tutorial preparing the ligands for the simulations. For this, go to the directory with the ligand files: +## Prerequisites + +Before starting this tutorial, ensure that: + +**Q6 is compiled**: Navigate to `src/q6` directory and run `make all && make mpi` to compile the Q6 binaries before proceeding. + +We start this tutorial preparing the ligands for the simulations. Navigate to the directory with the ligand files: ```bash cd tutorials/Tyk2/ligprep ``` @@ -44,20 +50,25 @@ cp ligprep/tyk2_ligands/*.sdf ligprep/tyk2_ligands/lomap.json setupFEP/ Visualizing and interacting with the generated perturbation network from `qlomap` is possible by using the `qmapfep` program. For this, _make sure you're working locally (not on a remote machine)_. -Now that the `lomap.json` was created under `tyk2_ligands/lomap.json`, let's use both the input `.sdf` file and the generated mapping `.json` file to crate the visualizer. Run: +Now that the `lomap.json` was created under `tyk2_ligands/lomap.json`, let's use both the input `.sdf` file and the generated mapping `.json` file to crate the visualizer. From the main Tyk2 directory, run: ```bash -qmapfep -i tyk2_ligands.sdf -wd . -l tyk2_ligands/lomap.json +cd ../ # Go back to tutorials/Tyk2 directory +qmapfep -i ligprep/tyk2_ligands.sdf -wd . -l ligprep/tyk2_ligands/lomap.json ``` -Two new files should be created: **qmapfep.html** and **tyk2_ligands.json**. To visualize the perturbation network, open the `qmapfep.html` file in your browser. +A new file is created: `qmapfep.html`. To visualize the perturbation network, open the `qmapfep.html` file in your browser and upload the generated `ligprep/tyk2_ligands.json` file through the button on the top right corner of the screen. Upon loading the file, the perturbation network will be available as an interactive graph: + +

+ +

- How to open the file? + How to open the qmapfep.html? If you're working on Windows WSL, you can open the current directory using the `explorer.exe .` command. In the new folder displayed to you, click on the file `qmapfep.html` to open it in your default browser. -For macOS, simply type `open .` on the terminal. +For macOS, type `open .` on the terminal to open the current directory in Finder. Then, double click on the `qmapfep.html` file to open it in your default browser.
@@ -67,21 +78,23 @@ To add new edges to the system, press *edit* on the top left corner and proceed ## Water sphere -Now we just need to prepare our water sphere. The first step is to calculate the center of geometry of the ligand. For this, we can use the `qcog` command: +Now we just need to prepare our water sphere. The first step is to calculate the center of geometry of the ligand. For this, we can use the `qcog` command (make sure you're in the main Tyk2 directory): ```bash qcog -i ligprep/tyk2_ligands.sdf ``` -The final value printed by this function is the geometric center of all ligands within the series (in the sdf file). You should see an output like like this: +The final value printed by this function is the geometric center of all ligands within the series (in the sdf file). You should see an output like this: ```text -| INFO | QligFEP.CLI.cog_cli:main:116 - Center of geometry: [-4.727 26.163 -30.542] +| INFO | QligFEP.CLI.cog_cli:main:116 - Center of geometry: [-4.689 26.119 -30.570] ``` +**Note**: Use the center of geometry values from your own `qcog` calculation, as they may differ slightly from this example. + We'll use this value as the center of our water sphere. We also use the Amber forcefield for this tutorial, so let's prepare the protein in: ```bash cd setupFEP/amber ``` -To generate the water sphere, we then run: +To generate the water sphere, we then run (replace the coordinates with your own values from `qcog`): ```bash -qprep_prot -cog -4.727 26.163 -30.542 -i protein.pdb -FF AMBER14sb -r 25 +qprep_prot -cog -4.689 26.119 -30.570 -i protein.pdb -FF AMBER14sb -r 25 ``` Done! No we move both the protein and the water `.pdb` files to the same directory containing our ligand files. To do this, run the command: ```bash @@ -91,8 +104,9 @@ The next step is creating the job submission files to run the FEP calculations o ## Setup FEP -For preparing the files, we run: +For preparing the files, navigate to the setupFEP directory and run: ```bash +cd ../ # Go back to setupFEP directory if you're still in setupFEP/amber setupFEP -FF AMBER14sb -r 25 -ts 2fs -j lomap.json -clean dcd -rs 42 -c SNELLIUS ``` The explanation of the flags is as follows: @@ -102,7 +116,7 @@ The explanation of the flags is as follows: - `-j lomap.json`: The perturbation network generated by lomap; - `-clean dcd`: The suffix of the files to be removed within the job run. Removing the `.dcd` files will save a lot of space, since they are the largest files generated by the simulation; - `-rs 42`: The random seed for the simulation. -- `-c CSB`: The cluster for which the job submission files will be generated. This takes configurations from the `CLUSTER_DICT` global variable within the [settings.py](../../src/QligFEP/settings/settings.py#L139-L150) module. +- `-c SNELLIUS`: The cluster for which the job submission files will be generated. This takes configurations from the `CLUSTER_DICT` global variable within the [settings.py](../../src/QligFEP/settings/settings.py#L139-L150) module. ## Restraint setting diff --git a/tutorials/Tyk2/imgs/Tyk2-qmapfep.png b/tutorials/Tyk2/imgs/Tyk2-qmapfep.png new file mode 100644 index 00000000..875e49c2 Binary files /dev/null and b/tutorials/Tyk2/imgs/Tyk2-qmapfep.png differ diff --git a/tutorials/Tyk2/imgs/Tyk2_ddGbar_ddG_plot.svg b/tutorials/Tyk2/imgs/Tyk2_ddGbar_ddG_plot.svg index c3ce6147..cce2aa93 100644 --- a/tutorials/Tyk2/imgs/Tyk2_ddGbar_ddG_plot.svg +++ b/tutorials/Tyk2/imgs/Tyk2_ddGbar_ddG_plot.svg @@ -1,16 +1,16 @@ - + - 2025-01-28T18:58:16.006431 + 2025-11-06T14:17:29.814679 image/svg+xml - Matplotlib v3.7.1, https://matplotlib.org/ + Matplotlib v3.10.6, https://matplotlib.org/ @@ -21,230 +21,210 @@ - - - - - + + + - - + - + - - - - + + - + + + + - + - + - - - + + - + + + + - + - + - - + - + + + + - + - - + + - + + + + - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + - - - + + + - - @@ -548,7 +532,7 @@ z - + @@ -557,213 +541,174 @@ z - + - + + + + - - + - + - - - + + + - + + + + - + - + - - - + + + - + + + + - + - + - - + + - + + + + - + - + - - + + - - - - + + - - - - - - - - - + - + - - - - + + + + - - - - - - - + + + - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + - + + + + - + - - + + - - - - - - - - - - + + - - - + + + + - - - - - - - - - - - - - @@ -1053,36 +900,21 @@ z - - + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + - - - + + + - + + @@ -1235,37 +1079,37 @@ z - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - + + + - - @@ -1333,338 +1137,1128 @@ z - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - + + + - - - - - + - - + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - + - + - + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - +" style="fill: none; stroke: #000000; stroke-width: 0.8; stroke-linejoin: miter; stroke-linecap: square"/> - - + + diff --git a/tutorials/Tyk2/ligprep/tyk2_ligands.sdf b/tutorials/Tyk2/ligprep/tyk2_ligands.sdf index 58c60716..bcb74309 100644 --- a/tutorials/Tyk2/ligprep/tyk2_ligands.sdf +++ b/tutorials/Tyk2/ligprep/tyk2_ligands.sdf @@ -1,1353 +1,1353 @@ jmc_23 - RDKit 3D - - 36 38 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.4988 28.5008 -32.0863 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.7411 29.3967 -31.4167 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.6909 29.1205 -30.8370 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.2881 30.8318 -31.3542 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9454 31.6312 -30.0918 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.3154 32.0048 -31.3977 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0080 31.7808 -31.5241 F 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6931 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8816 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3629 24.7668 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0742 24.9351 -29.9291 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9688 26.8462 -30.5394 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3737 28.8295 -32.4673 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.2445 30.9740 -31.8498 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2961 31.2120 -29.3217 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7001 32.2970 -29.6740 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.5735 32.9649 -31.8417 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 25 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 26 1 0 - 7 14 2 0 - 7 27 1 0 - 8 10 2 0 - 8 23 1 0 - 9 10 1 0 - 9 28 1 0 - 10 29 1 0 - 13 30 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 31 1 0 - 17 18 1 0 - 17 32 1 0 - 18 19 2 0 - 18 20 1 0 - 20 21 1 0 - 20 22 1 0 - 20 33 1 6 - 21 22 1 0 - 21 34 1 0 - 21 35 1 0 - 22 36 1 6 - 22 24 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 36 38 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.4988 28.5008 -32.0863 N 0 0 0 0 0 0 + -5.7411 29.3967 -31.4167 C 0 0 0 0 0 0 + -4.6909 29.1205 -30.8370 O 0 0 0 0 0 0 + -6.2881 30.8318 -31.3542 C 0 0 1 0 0 0 + -5.9454 31.6312 -30.0918 C 0 0 0 0 0 0 + -5.3154 32.0048 -31.3977 C 0 0 1 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6931 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8816 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3629 24.7668 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0742 24.9351 -29.9291 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9688 26.8462 -30.5394 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3737 28.8295 -32.4673 H 0 0 0 0 0 0 + -7.2445 30.9740 -31.8498 H 0 0 0 0 0 0 + -5.2961 31.2120 -29.3217 H 0 0 0 0 0 0 + -6.7001 32.2970 -29.6740 H 0 0 0 0 0 0 + -5.5735 32.9649 -31.8417 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0080 31.7808 -31.5241 F 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 24 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 25 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 26 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 23 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 27 1 0 0 0 + 10 28 1 0 0 0 + 13 29 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 30 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 31 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 20 1 0 0 0 + 20 21 1 0 0 0 + 20 22 1 0 0 0 + 20 32 1 0 0 0 + 21 22 1 0 0 0 + 21 33 1 0 0 0 + 21 34 1 0 0 0 + 22 35 1 0 0 0 + 22 36 1 0 0 0 M END -> (1) --11.699999999999999 +> +-11.7 $$$$ ejm_47 - RDKit 3D - - 39 41 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.4185 28.5322 -32.1112 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.7086 29.4005 -31.3330 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.8536 29.0548 -30.5166 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9685 30.9252 -31.4769 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.6653 31.7421 -31.7244 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2294 32.8201 -30.7999 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.0402 31.7038 -30.1379 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6932 20.4911 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8817 23.3628 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3630 24.7668 -34.2729 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0751 24.9349 -29.9285 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9495 26.8233 -30.5425 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.1480 28.9246 -32.6840 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.8035 31.1426 -32.1435 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.7484 31.2985 -31.3317 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4733 32.0741 -32.7418 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.5048 33.3251 -30.1593 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8411 33.5693 -31.3089 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.5304 31.2456 -29.2875 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.0315 32.0197 -29.8312 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 25 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 26 1 0 - 7 14 2 0 - 7 27 1 0 - 8 10 2 0 - 8 20 1 0 - 9 10 1 0 - 9 28 1 0 - 10 29 1 0 - 13 30 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 31 1 0 - 17 18 1 0 - 17 32 1 0 - 18 19 2 0 - 18 21 1 0 - 33 21 1 0 - 21 22 1 0 - 21 24 1 0 - 22 23 1 0 - 22 34 1 0 - 22 35 1 0 - 23 24 1 0 - 23 36 1 0 - 23 37 1 0 - 24 38 1 0 - 24 39 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 39 41 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.4185 28.5322 -32.1112 N 0 0 0 0 0 0 + -5.7086 29.4005 -31.3330 C 0 0 0 0 0 0 + -4.8536 29.0548 -30.5166 O 0 0 0 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6932 20.4911 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8817 23.3628 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3630 24.7668 -34.2729 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0751 24.9349 -29.9285 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9495 26.8233 -30.5425 H 0 0 0 0 0 0 + -7.1480 28.9246 -32.6840 H 0 0 0 0 0 0 + -6.8035 31.1426 -32.1435 H 0 0 0 0 0 0 + -5.9685 30.9252 -31.4769 C 0 0 0 0 0 0 + -4.6653 31.7421 -31.7244 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2294 32.8201 -30.7999 C 0 0 0 0 0 0 + -6.0402 31.7038 -30.1379 C 0 0 0 0 0 0 + -3.7484 31.2985 -31.3317 H 0 0 0 0 0 0 + -4.4733 32.0741 -32.7418 H 0 0 0 0 0 0 + -4.5048 33.3251 -30.1593 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8411 33.5693 -31.3089 H 0 0 0 0 0 0 + -5.5304 31.2456 -29.2875 H 0 0 0 0 0 0 + -7.0315 32.0197 -29.8312 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 21 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 22 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 23 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 20 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 24 1 0 0 0 + 10 25 1 0 0 0 + 13 26 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 27 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 28 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 30 1 0 0 0 + 29 30 1 0 0 0 + 30 31 1 0 0 0 + 30 33 1 0 0 0 + 31 32 1 0 0 0 + 31 34 1 0 0 0 + 31 35 1 0 0 0 + 32 33 1 0 0 0 + 32 36 1 0 0 0 + 32 37 1 0 0 0 + 33 38 1 0 0 0 + 33 39 1 0 0 0 M END -> (2) --9.6999999999999993 +> +-9.7 $$$$ ejm_49 - RDKit 3D - - 39 41 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3814 28.5347 -31.9613 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.3968 29.2410 -31.3041 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.2902 28.7611 -31.0721 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4799 33.2390 -29.6999 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.1585 32.9579 -30.8791 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.2366 31.6488 -31.3623 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.5656 30.6217 -30.7081 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.8726 30.9284 -29.5176 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.8442 32.2202 -29.0053 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6932 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8816 23.3629 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3629 24.7670 -34.2731 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0692 24.9356 -29.9321 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.0255 26.7731 -30.4748 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.2733 28.9719 -32.1463 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4453 34.2529 -29.3260 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.6463 33.7594 -31.4153 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7978 31.4535 -32.2600 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.3203 30.1629 -28.9871 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.3071 32.4338 -28.0913 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 27 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 28 1 0 - 7 14 2 0 - 7 29 1 0 - 8 10 2 0 - 8 20 1 0 - 9 10 1 0 - 9 30 1 0 - 10 31 1 0 - 13 32 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 33 1 0 - 17 18 1 0 - 17 34 1 0 - 18 19 2 0 - 18 24 1 0 - 21 22 2 0 - 21 26 1 0 - 21 35 1 0 - 22 23 1 0 - 22 36 1 0 - 23 24 2 0 - 23 37 1 0 - 24 25 1 0 - 25 26 2 0 - 25 38 1 0 - 26 39 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 39 41 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.3814 28.5347 -31.9613 N 0 0 0 0 0 0 + -5.3968 29.2410 -31.3041 C 0 0 0 0 0 0 + -4.2902 28.7611 -31.0721 O 0 0 0 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6932 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8816 23.3629 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3629 24.7670 -34.2731 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0692 24.9356 -29.9321 H 0 0 0 0 0 0 + -5.0255 26.7731 -30.4748 H 0 0 0 0 0 0 + -7.2733 28.9719 -32.1463 H 0 0 0 0 0 0 + -5.4799 33.2390 -29.6999 C 0 0 0 0 0 0 + -6.1585 32.9579 -30.8791 C 0 0 0 0 0 0 + -6.2366 31.6488 -31.3623 C 0 0 0 0 0 0 + -5.5656 30.6217 -30.7081 C 0 0 0 0 0 0 + -4.8726 30.9284 -29.5176 C 0 0 0 0 0 0 + -4.8442 32.2202 -29.0053 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4453 34.2529 -29.3260 H 0 0 0 0 0 0 + -6.6463 33.7594 -31.4153 H 0 0 0 0 0 0 + -6.7978 31.4535 -32.2600 H 0 0 0 0 0 0 + -4.3203 30.1629 -28.9871 H 0 0 0 0 0 0 + -4.3071 32.4338 -28.0913 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 21 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 22 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 23 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 20 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 24 1 0 0 0 + 10 25 1 0 0 0 + 13 26 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 27 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 28 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 32 1 0 0 0 + 29 30 2 0 0 0 + 29 34 1 0 0 0 + 29 35 1 0 0 0 + 30 31 1 0 0 0 + 30 36 1 0 0 0 + 31 32 2 0 0 0 + 31 37 1 0 0 0 + 32 33 1 0 0 0 + 33 34 2 0 0 0 + 33 38 1 0 0 0 + 34 39 1 0 0 0 M END -> (3) +> -7.75 $$$$ ejm_31 - RDKit 3D - - 32 33 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.5300 28.4905 -32.1011 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8268 29.4130 -31.4193 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.8002 29.1966 -30.7784 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3693 30.8303 -31.4415 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6932 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8817 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3629 24.7668 -34.2729 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0754 24.9350 -29.9284 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9657 26.8592 -30.5476 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3939 28.7961 -32.5242 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.2408 30.9107 -32.0881 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6119 31.5212 -31.8101 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.6529 31.1516 -30.4412 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 22 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 23 1 0 - 7 14 2 0 - 7 24 1 0 - 8 10 2 0 - 8 21 1 0 - 9 10 1 0 - 9 25 1 0 - 10 26 1 0 - 13 27 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 28 1 0 - 17 18 1 0 - 17 29 1 0 - 18 19 2 0 - 18 20 1 0 - 20 30 1 0 - 20 31 1 0 - 20 32 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 32 33 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.5300 28.4905 -32.1011 N 0 0 0 0 0 0 + -5.8268 29.4130 -31.4193 C 0 0 0 0 0 0 + -4.8002 29.1966 -30.7784 O 0 0 0 0 0 0 + -6.3693 30.8303 -31.4415 C 0 0 0 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6932 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8817 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3629 24.7668 -34.2729 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0754 24.9350 -29.9284 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9657 26.8592 -30.5476 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3939 28.7961 -32.5242 H 0 0 0 0 0 0 + -7.2408 30.9107 -32.0881 H 0 0 0 0 0 0 + -5.6119 31.5212 -31.8101 H 0 0 0 0 0 0 + -6.6529 31.1516 -30.4412 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 22 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 23 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 24 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 21 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 25 1 0 0 0 + 10 26 1 0 0 0 + 13 27 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 28 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 29 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 20 1 0 0 0 + 20 30 1 0 0 0 + 20 31 1 0 0 0 + 20 32 1 0 0 0 M END -> (4) --9.5399999999999991 +> +-9.54 $$$$ ejm_45 - RDKit 3D - - 39 41 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.5259 28.4955 -32.0641 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.7720 29.3930 -31.3912 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.6848 29.1320 -30.8777 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3437 30.8090 -31.2353 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.5880 31.7306 -30.2453 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.3346 32.4212 -30.7315 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6045 33.2185 -30.5057 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6932 20.4911 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8817 23.3629 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3629 24.7669 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0741 24.9351 -29.9293 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9727 26.8492 -30.5384 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.4237 28.8078 -32.4078 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3751 31.2872 -32.2038 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3831 30.7270 -30.9462 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6127 31.3899 -29.2089 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.5031 32.5428 -30.0357 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9974 32.2203 -31.7492 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6589 33.8971 -29.6532 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.1541 33.5976 -31.3692 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 25 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 26 1 0 - 7 14 2 0 - 7 27 1 0 - 8 10 2 0 - 8 21 1 0 - 9 10 1 0 - 9 28 1 0 - 10 29 1 0 - 13 30 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 31 1 0 - 17 18 1 0 - 17 32 1 0 - 18 19 2 0 - 18 20 1 0 - 20 33 1 0 - 20 34 1 0 - 20 22 1 0 - 35 22 1 0 - 22 23 1 0 - 22 24 1 0 - 23 24 1 0 - 23 36 1 0 - 23 37 1 0 - 24 38 1 0 - 24 39 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 39 41 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.5259 28.4955 -32.0641 N 0 0 0 0 0 0 + -5.7720 29.3930 -31.3912 C 0 0 0 0 0 0 + -4.6848 29.1320 -30.8777 O 0 0 0 0 0 0 + -6.3437 30.8090 -31.2353 C 0 0 0 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6932 20.4911 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8817 23.3629 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3629 24.7669 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0741 24.9351 -29.9293 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9727 26.8492 -30.5384 H 0 0 0 0 0 0 + -7.4237 28.8078 -32.4078 H 0 0 0 0 0 0 + -6.3751 31.2872 -32.2038 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3831 30.7270 -30.9462 H 0 0 0 0 0 0 + -5.6127 31.3899 -29.2089 H 0 0 0 0 0 0 + -5.5880 31.7306 -30.2453 C 0 0 0 0 0 0 + -4.3346 32.4212 -30.7315 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6045 33.2185 -30.5057 C 0 0 0 0 0 0 + -3.5031 32.5428 -30.0357 H 0 0 0 0 0 0 + -3.9974 32.2203 -31.7492 H 0 0 0 0 0 0 + -5.6589 33.8971 -29.6532 H 0 0 0 0 0 0 + -6.1541 33.5976 -31.3692 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 22 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 23 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 24 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 21 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 25 1 0 0 0 + 10 26 1 0 0 0 + 13 27 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 28 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 29 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 20 1 0 0 0 + 20 30 1 0 0 0 + 20 31 1 0 0 0 + 20 33 1 0 0 0 + 32 33 1 0 0 0 + 33 34 1 0 0 0 + 33 35 1 0 0 0 + 34 35 1 0 0 0 + 34 36 1 0 0 0 + 34 37 1 0 0 0 + 35 38 1 0 0 0 + 35 39 1 0 0 0 M END -> (5) --9.5600000000000005 +> +-9.56 $$$$ ejm_44 - RDKit 3D - - 41 42 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.2389 28.5581 -32.0296 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2352 29.2679 -31.3652 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.2116 28.7280 -30.9501 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2786 30.8018 -30.9910 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.6205 31.3961 -31.3134 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9999 31.0472 -29.4635 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.2009 31.6686 -31.7099 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6932 20.4911 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8816 23.3629 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3629 24.7670 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5720 -28.1611 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0680 24.9373 -29.9339 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.0268 26.7698 -30.4752 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.0536 29.0634 -32.3425 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.6274 32.4555 -31.0546 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9036 31.3008 -32.3496 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.4006 30.9008 -30.7591 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.2077 31.7741 -29.2769 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8604 31.4632 -28.9387 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.6815 30.1530 -28.9262 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.3750 32.7328 -31.5433 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2012 31.4776 -31.3191 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1546 31.5390 -32.7814 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 25 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 26 1 0 - 7 14 2 0 - 7 27 1 0 - 8 10 2 0 - 8 21 1 0 - 9 10 1 0 - 9 28 1 0 - 10 29 1 0 - 13 30 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 31 1 0 - 17 18 1 0 - 17 32 1 0 - 18 19 2 0 - 18 20 1 0 - 20 22 1 0 - 20 23 1 0 - 20 24 1 0 - 22 33 1 0 - 22 34 1 0 - 22 35 1 0 - 23 36 1 0 - 23 37 1 0 - 23 38 1 0 - 24 39 1 0 - 24 40 1 0 - 24 41 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 41 42 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.2389 28.5581 -32.0296 N 0 0 0 0 0 0 + -5.2352 29.2679 -31.3652 C 0 0 0 0 0 0 + -4.2116 28.7280 -30.9501 O 0 0 0 0 0 0 + -5.2786 30.8018 -30.9910 C 0 0 0 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6932 20.4911 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8816 23.3629 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3629 24.7670 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5720 -28.1611 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0680 24.9373 -29.9339 H 0 0 0 0 0 0 + -5.0268 26.7698 -30.4752 H 0 0 0 0 0 0 + -7.0536 29.0634 -32.3425 H 0 0 0 0 0 0 + -6.6205 31.3961 -31.3134 C 0 0 0 0 0 0 + -6.6274 32.4555 -31.0546 H 0 0 0 0 0 0 + -6.9036 31.3008 -32.3496 H 0 0 0 0 0 0 + -7.4006 30.9008 -30.7591 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9999 31.0472 -29.4635 C 0 0 0 0 0 0 + -4.2077 31.7741 -29.2769 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8604 31.4632 -28.9387 H 0 0 0 0 0 0 + -4.6815 30.1530 -28.9262 H 0 0 0 0 0 0 + -4.2009 31.6686 -31.7099 C 0 0 0 0 0 0 + -4.3750 32.7328 -31.5433 H 0 0 0 0 0 0 + -3.2012 31.4776 -31.3191 H 0 0 0 0 0 0 + -4.1546 31.5390 -32.7814 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 22 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 23 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 24 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 21 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 25 1 0 0 0 + 10 26 1 0 0 0 + 13 27 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 28 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 29 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 20 1 0 0 0 + 20 30 1 0 0 0 + 20 34 1 0 0 0 + 20 38 1 0 0 0 + 30 31 1 0 0 0 + 30 32 1 0 0 0 + 30 33 1 0 0 0 + 34 35 1 0 0 0 + 34 36 1 0 0 0 + 34 37 1 0 0 0 + 38 39 1 0 0 0 + 38 40 1 0 0 0 + 38 41 1 0 0 0 M END -> (6) --7.4199999999999999 +> +-7.42 $$$$ ejm_43 - RDKit 3D - - 38 39 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3646 28.5536 -32.1223 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6052 29.4139 -31.3614 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.7664 29.0362 -30.5440 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.7542 30.9703 -31.4833 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4316 31.6973 -31.8568 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.1758 31.6691 -30.1793 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6932 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8817 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3630 24.7668 -34.2729 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5720 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0749 24.9350 -29.9287 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9487 26.8198 -30.5418 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.0810 28.9644 -32.6986 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.5332 31.1968 -32.2066 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.5694 32.7785 -31.8890 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6419 31.4986 -31.1299 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0469 31.4438 -32.8306 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.0090 32.7473 -30.1973 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.2379 31.5811 -30.0735 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6684 31.2840 -29.2950 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 24 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 25 1 0 - 7 14 2 0 - 7 26 1 0 - 8 10 2 0 - 8 21 1 0 - 9 10 1 0 - 9 27 1 0 - 10 28 1 0 - 13 29 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 30 1 0 - 17 18 1 0 - 17 31 1 0 - 18 19 2 0 - 18 20 1 0 - 20 32 1 0 - 20 22 1 0 - 20 23 1 0 - 22 33 1 0 - 22 34 1 0 - 22 35 1 0 - 23 36 1 0 - 23 37 1 0 - 23 38 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 38 39 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.3646 28.5536 -32.1223 N 0 0 0 0 0 0 + -5.6052 29.4139 -31.3614 C 0 0 0 0 0 0 + -4.7664 29.0362 -30.5440 O 0 0 0 0 0 0 + -5.7542 30.9703 -31.4833 C 0 0 0 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6932 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8817 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3630 24.7668 -34.2729 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5720 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0749 24.9350 -29.9287 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9487 26.8198 -30.5418 H 0 0 0 0 0 0 + -7.0810 28.9644 -32.6986 H 0 0 0 0 0 0 + -6.5332 31.1968 -32.2066 H 0 0 0 0 0 0 + -4.4316 31.6973 -31.8568 C 0 0 0 0 0 0 + -4.5694 32.7785 -31.8890 H 0 0 0 0 0 0 + -3.6419 31.4986 -31.1299 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0469 31.4438 -32.8306 H 0 0 0 0 0 0 + -6.1758 31.6691 -30.1793 C 0 0 0 0 0 0 + -6.0090 32.7473 -30.1973 H 0 0 0 0 0 0 + -7.2379 31.5811 -30.0735 H 0 0 0 0 0 0 + -5.6684 31.2840 -29.2950 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 22 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 23 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 24 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 21 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 25 1 0 0 0 + 10 26 1 0 0 0 + 13 27 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 28 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 29 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 20 1 0 0 0 + 20 30 1 0 0 0 + 20 31 1 0 0 0 + 20 35 1 0 0 0 + 31 32 1 0 0 0 + 31 33 1 0 0 0 + 31 34 1 0 0 0 + 35 36 1 0 0 0 + 35 37 1 0 0 0 + 35 38 1 0 0 0 M END -> (7) --8.2599999999999998 +> +-8.26 $$$$ ejm_50 - RDKit 3D - - 33 34 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.5593 28.4830 -32.0869 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8346 29.4343 -31.4648 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.7615 29.2252 -30.8953 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.4450 30.8541 -31.4659 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4767 31.8699 -31.7388 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6931 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8816 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3628 24.7667 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0135 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0750 24.9344 -29.9282 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9706 26.8649 -30.5473 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.4581 28.7575 -32.4588 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.2592 30.9169 -32.1868 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.8722 31.0541 -30.4872 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8430 32.4321 -32.4465 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 23 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 24 1 0 - 7 14 2 0 - 7 25 1 0 - 8 10 2 0 - 8 21 1 0 - 9 10 1 0 - 9 26 1 0 - 10 27 1 0 - 13 28 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 29 1 0 - 17 18 1 0 - 17 30 1 0 - 18 19 2 0 - 18 20 1 0 - 20 31 1 0 - 20 32 1 0 - 20 22 1 0 - 22 33 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 33 34 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.5593 28.4830 -32.0869 N 0 0 0 0 0 0 + -5.8346 29.4343 -31.4648 C 0 0 0 0 0 0 + -4.7615 29.2252 -30.8953 O 0 0 0 0 0 0 + -6.4450 30.8541 -31.4659 C 0 0 0 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6931 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8816 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3628 24.7667 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0135 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0750 24.9344 -29.9282 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9706 26.8649 -30.5473 H 0 0 0 0 0 0 + -7.4581 28.7575 -32.4588 H 0 0 0 0 0 0 + -7.2592 30.9169 -32.1868 H 0 0 0 0 0 0 + -6.8722 31.0541 -30.4872 H 0 0 0 0 0 0 + -5.4767 31.8699 -31.7388 O 0 0 0 0 0 0 + -5.8430 32.4321 -32.4465 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 22 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 23 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 24 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 21 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 25 1 0 0 0 + 10 26 1 0 0 0 + 13 27 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 28 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 29 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 20 1 0 0 0 + 20 30 1 0 0 0 + 20 31 1 0 0 0 + 20 32 1 0 0 0 + 32 33 1 0 0 0 M END -> (8) --8.9800000000000004 +> +-8.98 $$$$ ejm_42 - RDKit 3D - - 35 36 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.5114 28.4991 -32.0914 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.7841 29.4035 -31.4013 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.7596 29.1438 -30.7710 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3006 30.8459 -31.3744 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.1914 31.9218 -31.3986 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6932 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8817 23.3629 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3629 24.7669 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5719 -28.1611 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0748 24.9352 -29.9289 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9666 26.8491 -30.5423 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3722 28.8226 -32.5074 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.0107 31.0090 -32.1826 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.8689 30.9789 -30.4607 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6263 32.9212 -31.4320 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.5635 31.8699 -30.5079 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.5399 31.8172 -32.2660 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 23 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 24 1 0 - 7 14 2 0 - 7 25 1 0 - 8 10 2 0 - 8 21 1 0 - 9 10 1 0 - 9 26 1 0 - 10 27 1 0 - 13 28 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 29 1 0 - 17 18 1 0 - 17 30 1 0 - 18 19 2 0 - 18 20 1 0 - 20 31 1 0 - 20 32 1 0 - 20 22 1 0 - 22 33 1 0 - 22 34 1 0 - 22 35 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 35 36 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.5114 28.4991 -32.0914 N 0 0 0 0 0 0 + -5.7841 29.4035 -31.4013 C 0 0 0 0 0 0 + -4.7596 29.1438 -30.7710 O 0 0 0 0 0 0 + -6.3006 30.8459 -31.3744 C 0 0 0 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6932 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8817 23.3629 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3629 24.7669 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5719 -28.1611 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0748 24.9352 -29.9289 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9666 26.8491 -30.5423 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3722 28.8226 -32.5074 H 0 0 0 0 0 0 + -7.0107 31.0090 -32.1826 H 0 0 0 0 0 0 + -6.8689 30.9789 -30.4607 H 0 0 0 0 0 0 + -5.1914 31.9218 -31.3986 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6263 32.9212 -31.4320 H 0 0 0 0 0 0 + -4.5635 31.8699 -30.5079 H 0 0 0 0 0 0 + -4.5399 31.8172 -32.2660 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 22 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 23 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 24 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 21 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 25 1 0 0 0 + 10 26 1 0 0 0 + 13 27 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 28 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 29 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 20 1 0 0 0 + 20 30 1 0 0 0 + 20 31 1 0 0 0 + 20 32 1 0 0 0 + 32 33 1 0 0 0 + 32 34 1 0 0 0 + 32 35 1 0 0 0 M END -> (9) --9.7799999999999994 +> +-9.78 $$$$ ejm_55 - RDKit 3D - - 33 34 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.5259 28.4887 -32.1148 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8350 29.4299 -31.3784 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.8498 29.2468 -30.6620 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.4225 30.6171 -31.5471 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8853 31.7824 -30.9334 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6931 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8817 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3630 24.7665 -34.2729 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0755 24.9339 -29.9276 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9603 26.8646 -30.5534 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3731 28.8191 -32.5504 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.8258 31.9036 -31.1650 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.4030 32.6700 -31.2948 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.0014 31.7410 -29.8495 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 23 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 24 1 0 - 7 14 2 0 - 7 25 1 0 - 8 10 2 0 - 8 20 1 0 - 9 10 1 0 - 9 26 1 0 - 10 27 1 0 - 13 28 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 29 1 0 - 17 18 1 0 - 17 30 1 0 - 18 19 2 0 - 18 21 1 0 - 21 22 1 0 - 22 31 1 0 - 22 32 1 0 - 22 33 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 33 34 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.5259 28.4887 -32.1148 N 0 0 0 0 0 0 + -5.8350 29.4299 -31.3784 C 0 0 0 0 0 0 + -4.8498 29.2468 -30.6620 O 0 0 0 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6931 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8817 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3630 24.7665 -34.2729 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0755 24.9339 -29.9276 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9603 26.8646 -30.5534 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3731 28.8191 -32.5504 H 0 0 0 0 0 0 + -6.4225 30.6171 -31.5471 O 0 0 0 0 0 0 + -5.8853 31.7824 -30.9334 C 0 0 0 0 0 0 + -4.8258 31.9036 -31.1650 H 0 0 0 0 0 0 + -6.4030 32.6700 -31.2948 H 0 0 0 0 0 0 + -6.0014 31.7410 -29.8495 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 21 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 22 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 23 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 20 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 24 1 0 0 0 + 10 25 1 0 0 0 + 13 26 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 27 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 28 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 29 1 0 0 0 + 29 30 1 0 0 0 + 30 31 1 0 0 0 + 30 32 1 0 0 0 + 30 33 1 0 0 0 M END -> (10) --9.2100000000000009 +> +-9.21 $$$$ ejm_48 - RDKit 3D - - 42 44 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3804 28.5549 -32.1142 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6757 29.4279 -31.3118 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.8824 29.0502 -30.4508 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8593 30.9883 -31.4525 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.0419 31.7843 -30.1371 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.6620 32.0760 -29.5331 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6943 32.0016 -30.7094 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.5923 31.7490 -31.9254 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6932 20.4911 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8817 23.3628 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3630 24.7667 -34.2729 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5720 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0753 24.9350 -29.9284 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9417 26.8242 -30.5484 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.0712 28.9591 -32.7249 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7190 31.1409 -32.1044 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.6734 31.3252 -29.4138 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.5267 32.7343 -30.3713 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.6397 33.0476 -29.0368 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4038 31.3231 -28.7857 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.0993 32.9098 -30.8176 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -2.9989 31.1728 -30.5655 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0556 31.2891 -32.7331 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9028 32.7199 -32.3082 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 26 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 27 1 0 - 7 14 2 0 - 7 28 1 0 - 8 10 2 0 - 8 20 1 0 - 9 10 1 0 - 9 29 1 0 - 10 30 1 0 - 13 31 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 32 1 0 - 17 18 1 0 - 17 33 1 0 - 18 19 2 0 - 18 21 1 0 - 34 21 1 0 - 21 22 1 0 - 21 25 1 0 - 22 23 1 0 - 22 35 1 0 - 22 36 1 0 - 23 24 1 0 - 23 37 1 0 - 23 38 1 0 - 24 25 1 0 - 24 39 1 0 - 24 40 1 0 - 25 41 1 0 - 25 42 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 42 44 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.3804 28.5549 -32.1142 N 0 0 0 0 0 0 + -5.6757 29.4279 -31.3118 C 0 0 0 0 0 0 + -4.8824 29.0502 -30.4508 O 0 0 0 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6932 20.4911 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8817 23.3628 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3630 24.7667 -34.2729 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5720 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0753 24.9350 -29.9284 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9417 26.8242 -30.5484 H 0 0 0 0 0 0 + -7.0712 28.9591 -32.7249 H 0 0 0 0 0 0 + -6.7190 31.1409 -32.1044 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8593 30.9883 -31.4525 C 0 0 0 0 0 0 + -6.0419 31.7843 -30.1371 C 0 0 0 0 0 0 + -4.6620 32.0760 -29.5331 C 0 0 0 0 0 0 + -3.6943 32.0016 -30.7094 C 0 0 0 0 0 0 + -4.5923 31.7490 -31.9254 C 0 0 0 0 0 0 + -6.6734 31.3252 -29.4138 H 0 0 0 0 0 0 + -6.5267 32.7343 -30.3713 H 0 0 0 0 0 0 + -4.6397 33.0476 -29.0368 H 0 0 0 0 0 0 + -4.4038 31.3231 -28.7857 H 0 0 0 0 0 0 + -3.0993 32.9098 -30.8176 H 0 0 0 0 0 0 + -2.9989 31.1728 -30.5655 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0556 31.2891 -32.7331 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9028 32.7199 -32.3082 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 21 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 22 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 23 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 20 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 24 1 0 0 0 + 10 25 1 0 0 0 + 13 26 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 27 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 28 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 30 1 0 0 0 + 29 30 1 0 0 0 + 30 31 1 0 0 0 + 30 34 1 0 0 0 + 31 32 1 0 0 0 + 31 35 1 0 0 0 + 31 36 1 0 0 0 + 32 33 1 0 0 0 + 32 37 1 0 0 0 + 32 38 1 0 0 0 + 33 34 1 0 0 0 + 33 39 1 0 0 0 + 33 40 1 0 0 0 + 34 41 1 0 0 0 + 34 42 1 0 0 0 M END -> (11) +> -9 $$$$ ejm_54 - RDKit 3D - - 37 38 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.5390 28.4919 -32.0819 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8030 29.4034 -31.4218 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.7340 29.1786 -30.8574 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3441 30.6271 -31.4713 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6623 31.8675 -31.0876 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.5295 32.0712 -29.5716 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6932 20.4911 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8816 23.3628 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3629 24.7666 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5720 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0745 24.9350 -29.9289 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9694 26.8580 -30.5443 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.4183 28.7969 -32.4706 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.2691 30.7291 -31.8623 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.2234 32.7041 -31.5051 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.6768 31.9050 -31.5578 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.0029 33.0001 -29.3516 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.5046 32.1323 -29.0929 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9708 31.2609 -29.1025 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 24 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 25 1 0 - 7 14 2 0 - 7 26 1 0 - 8 10 2 0 - 8 20 1 0 - 9 10 1 0 - 9 27 1 0 - 10 28 1 0 - 13 29 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 30 1 0 - 17 18 1 0 - 17 31 1 0 - 18 19 2 0 - 18 21 1 0 - 32 21 1 0 - 21 22 1 0 - 22 33 1 0 - 22 34 1 0 - 22 23 1 0 - 23 35 1 0 - 23 36 1 0 - 23 37 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 37 38 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.5390 28.4919 -32.0819 N 0 0 0 0 0 0 + -5.8030 29.4034 -31.4218 C 0 0 0 0 0 0 + -4.7340 29.1786 -30.8574 O 0 0 0 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6932 20.4911 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8816 23.3628 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3629 24.7666 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5720 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0745 24.9350 -29.9289 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9694 26.8580 -30.5443 H 0 0 0 0 0 0 + -7.4183 28.7969 -32.4706 H 0 0 0 0 0 0 + -7.2691 30.7291 -31.8623 H 0 0 0 0 0 0 + -6.3441 30.6271 -31.4713 N 0 0 0 0 0 0 + -5.6623 31.8675 -31.0876 C 0 0 0 0 0 0 + -6.2234 32.7041 -31.5051 H 0 0 0 0 0 0 + -4.6768 31.9050 -31.5578 H 0 0 0 0 0 0 + -5.5295 32.0712 -29.5716 C 0 0 0 0 0 0 + -5.0029 33.0001 -29.3516 H 0 0 0 0 0 0 + -6.5046 32.1323 -29.0929 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9708 31.2609 -29.1025 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 21 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 22 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 23 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 20 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 24 1 0 0 0 + 10 25 1 0 0 0 + 13 26 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 27 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 28 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 30 1 0 0 0 + 29 30 1 0 0 0 + 30 31 1 0 0 0 + 31 32 1 0 0 0 + 31 33 1 0 0 0 + 31 34 1 0 0 0 + 34 35 1 0 0 0 + 34 36 1 0 0 0 + 34 37 1 0 0 0 M END -> (12) --10.529999999999999 +> +-10.53 $$$$ jmc_28 - RDKit 3D - - 39 41 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.4842 28.5082 -32.0882 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.7312 29.4036 -31.4041 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.6924 29.1158 -30.8104 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.2806 30.8475 -31.3355 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.0034 31.6204 -30.0381 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.3679 32.0855 -31.3078 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.8362 32.0422 -31.3893 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6932 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8819 23.3629 -32.9128 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3629 24.7668 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0743 24.9351 -29.9291 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9665 26.8454 -30.5406 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3498 28.8446 -32.4827 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.2395 30.9688 -31.8339 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.3601 31.1951 -29.2659 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7902 32.2426 -29.6128 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.7691 32.9987 -31.7470 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.5174 31.9345 -32.4236 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.3935 31.2378 -30.8043 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.4109 32.9712 -31.0091 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 25 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 26 1 0 - 7 14 2 0 - 7 27 1 0 - 8 10 2 0 - 8 23 1 0 - 9 10 1 0 - 9 28 1 0 - 10 29 1 0 - 13 30 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 31 1 0 - 17 18 1 0 - 17 32 1 0 - 18 19 2 0 - 18 20 1 0 - 20 21 1 0 - 20 22 1 0 - 20 33 1 6 - 21 22 1 0 - 21 34 1 0 - 21 35 1 0 - 22 36 1 6 - 22 24 1 0 - 24 37 1 0 - 24 38 1 0 - 24 39 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 39 41 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.4842 28.5082 -32.0882 N 0 0 0 0 0 0 + -5.7312 29.4036 -31.4041 C 0 0 0 0 0 0 + -4.6924 29.1158 -30.8104 O 0 0 0 0 0 0 + -6.2806 30.8475 -31.3355 C 0 0 1 0 0 0 + -6.0034 31.6204 -30.0381 C 0 0 0 0 0 0 + -5.3679 32.0855 -31.3078 C 0 0 1 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6932 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8819 23.3629 -32.9128 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3629 24.7668 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0743 24.9351 -29.9291 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9665 26.8454 -30.5406 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3498 28.8446 -32.4827 H 0 0 0 0 0 0 + -7.2395 30.9688 -31.8339 H 0 0 0 0 0 0 + -5.3601 31.1951 -29.2659 H 0 0 0 0 0 0 + -6.7902 32.2426 -29.6128 H 0 0 0 0 0 0 + -5.7691 32.9987 -31.7470 H 0 0 0 0 0 0 + -3.8362 32.0422 -31.3893 C 0 0 0 0 0 0 + -3.5174 31.9345 -32.4236 H 0 0 0 0 0 0 + -3.3935 31.2378 -30.8043 H 0 0 0 0 0 0 + -3.4109 32.9712 -31.0091 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 24 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 25 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 26 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 23 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 27 1 0 0 0 + 10 28 1 0 0 0 + 13 29 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 30 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 31 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 20 1 0 0 0 + 20 21 1 0 0 0 + 20 22 1 0 0 0 + 20 32 1 0 0 0 + 21 22 1 0 0 0 + 21 33 1 0 0 0 + 21 34 1 0 0 0 + 22 35 1 0 0 0 + 22 36 1 0 0 0 + 36 37 1 0 0 0 + 36 38 1 0 0 0 + 36 39 1 0 0 0 M END -> (13) +> -10.98 $$$$ jmc_27 - RDKit 3D - - 36 38 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.5061 28.4999 -32.0789 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.7409 29.4041 -31.4257 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.6551 29.1451 -30.9087 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3480 30.8113 -31.2740 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9277 31.5796 -30.0153 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4977 32.0811 -31.3560 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.7666 32.1420 -31.7726 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6931 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8816 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3629 24.7669 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5719 -28.1611 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0740 24.9351 -29.9293 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9684 26.8537 -30.5430 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.4039 28.8141 -32.4185 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3665 30.8855 -31.6383 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.1588 31.1817 -29.3505 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.6706 32.1636 -29.4737 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9673 33.0048 -31.6947 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 25 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 26 1 0 - 7 14 2 0 - 7 27 1 0 - 8 10 2 0 - 8 23 1 0 - 9 10 1 0 - 9 28 1 0 - 10 29 1 0 - 13 30 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 31 1 0 - 17 18 1 0 - 17 32 1 0 - 18 19 2 0 - 18 20 1 0 - 20 21 1 0 - 20 22 1 0 - 20 33 1 6 - 21 22 1 0 - 21 34 1 0 - 21 35 1 0 - 22 36 1 6 - 22 24 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 36 38 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.5061 28.4999 -32.0789 N 0 0 0 0 0 0 + -5.7409 29.4041 -31.4257 C 0 0 0 0 0 0 + -4.6551 29.1451 -30.9087 O 0 0 0 0 0 0 + -6.3480 30.8113 -31.2740 C 0 0 1 0 0 0 + -5.9277 31.5796 -30.0153 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4977 32.0811 -31.3560 C 0 0 1 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6931 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8816 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3629 24.7669 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5719 -28.1611 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0740 24.9351 -29.9293 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9684 26.8537 -30.5430 H 0 0 0 0 0 0 + -7.4039 28.8141 -32.4185 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3665 30.8855 -31.6383 H 0 0 0 0 0 0 + -5.1588 31.1817 -29.3505 H 0 0 0 0 0 0 + -6.6706 32.1636 -29.4737 H 0 0 0 0 0 0 + -5.9673 33.0048 -31.6947 H 0 0 0 0 0 0 + -3.7666 32.1420 -31.7726 Cl 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 24 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 25 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 26 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 23 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 27 1 0 0 0 + 10 28 1 0 0 0 + 13 29 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 30 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 31 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 20 1 0 0 0 + 20 21 1 0 0 0 + 20 22 1 0 0 0 + 20 32 1 0 0 0 + 21 22 1 0 0 0 + 21 33 1 0 0 0 + 21 34 1 0 0 0 + 22 35 1 0 0 0 + 22 36 1 0 0 0 M END -> (14) --11.279999999999999 +> +-11.28 $$$$ jmc_30 - RDKit 3D - - 37 39 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.5232 28.4940 -32.0720 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.7656 29.4107 -31.4311 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.6545 29.1901 -30.9554 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.4203 30.7868 -31.2397 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9968 31.5713 -29.9935 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6260 32.0891 -31.3489 C 0 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1936 32.2029 -31.6597 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.0685 32.3257 -31.9034 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6931 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8816 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3629 24.7669 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0135 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1902 22.5719 -28.1611 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0743 24.9350 -29.9290 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9684 26.8617 -30.5466 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.4390 28.7892 -32.3816 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.4496 30.8212 -31.5744 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2004 31.1955 -29.3473 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7295 32.1509 -29.4347 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.1786 32.9686 -31.6735 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 26 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 27 1 0 - 7 14 2 0 - 7 28 1 0 - 8 10 2 0 - 8 23 1 0 - 9 10 1 0 - 9 29 1 0 - 10 30 1 0 - 13 31 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 32 1 0 - 17 18 1 0 - 17 33 1 0 - 18 19 2 0 - 18 20 1 0 - 20 21 1 0 - 20 22 1 0 - 20 34 1 6 - 21 22 1 0 - 21 35 1 0 - 21 36 1 0 - 22 24 1 0 - 22 37 1 6 - 24 25 3 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 37 39 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.5232 28.4940 -32.0720 N 0 0 0 0 0 0 + -5.7656 29.4107 -31.4311 C 0 0 0 0 0 0 + -4.6545 29.1901 -30.9554 O 0 0 0 0 0 0 + -6.4203 30.7868 -31.2397 C 0 0 1 0 0 0 + -5.9968 31.5713 -29.9935 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6260 32.0891 -31.3489 C 0 0 1 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6931 20.4910 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8816 23.3628 -32.9125 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3629 24.7669 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0135 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1902 22.5719 -28.1611 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0743 24.9350 -29.9290 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9684 26.8617 -30.5466 H 0 0 0 0 0 0 + -7.4390 28.7892 -32.3816 H 0 0 0 0 0 0 + -7.4496 30.8212 -31.5744 H 0 0 0 0 0 0 + -5.2004 31.1955 -29.3473 H 0 0 0 0 0 0 + -6.7295 32.1509 -29.4347 H 0 0 0 0 0 0 + -4.1936 32.2029 -31.6597 C 0 0 0 0 0 0 + -3.0685 32.3257 -31.9034 N 0 0 0 0 0 0 + -6.1786 32.9686 -31.6735 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 24 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 25 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 26 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 23 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 27 1 0 0 0 + 10 28 1 0 0 0 + 13 29 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 30 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 31 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 20 1 0 0 0 + 20 21 1 0 0 0 + 20 22 1 0 0 0 + 20 32 1 0 0 0 + 21 22 1 0 0 0 + 21 33 1 0 0 0 + 21 34 1 0 0 0 + 22 35 1 0 0 0 + 22 37 1 0 0 0 + 35 36 3 0 0 0 M END -> (15) +> -10.94 $$$$ ejm_46 - RDKit 3D - - 36 38 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 - -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.4935 28.5024 -32.0877 N 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.7410 29.3927 -31.4053 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.7130 29.1087 -30.7881 O 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.2261 30.8526 -31.4064 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.9465 31.6762 -30.1512 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.1392 31.9250 -31.3944 C 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -3.6932 20.4911 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.8817 23.3629 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3630 24.7668 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0744 24.9351 -29.9290 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.9676 26.8422 -30.5384 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.3482 28.8436 -32.5018 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -7.1314 31.0429 -31.9814 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.4329 31.2354 -29.2953 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -6.6880 32.4155 -29.8451 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -5.3071 32.8596 -31.9267 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - -4.0875 31.6318 -31.4083 H 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 - 1 2 2 0 - 1 5 1 0 - 1 8 1 0 - 2 3 1 0 - 2 11 1 0 - 3 9 2 0 - 3 24 1 0 - 4 6 2 0 - 4 13 1 0 - 4 16 1 0 - 5 12 2 0 - 5 13 1 0 - 6 7 1 0 - 6 25 1 0 - 7 14 2 0 - 7 26 1 0 - 8 10 2 0 - 8 23 1 0 - 9 10 1 0 - 9 27 1 0 - 10 28 1 0 - 13 29 1 0 - 14 15 1 0 - 15 16 2 0 - 15 17 1 0 - 16 30 1 0 - 17 18 1 0 - 17 31 1 0 - 18 19 2 0 - 18 20 1 0 - 20 21 1 0 - 20 22 1 0 - 20 32 1 0 - 21 22 1 0 - 21 33 1 0 - 21 34 1 0 - 22 35 1 0 - 22 36 1 0 + 3D + Schrodinger Suite 2022-3. + 36 38 0 0 1 0 999 V2000 + -3.2903 22.5712 -29.5240 C 0 0 0 0 0 0 + -3.9192 21.7173 -28.5965 C 0 0 0 0 0 0 + -3.2025 21.1503 -27.5518 C 0 0 0 0 0 0 + -5.2582 25.0245 -31.6039 C 0 0 0 0 0 0 + -4.1053 23.0704 -30.6507 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9452 24.4099 -32.6722 C 0 0 0 0 0 0 + -6.7996 25.1874 -33.4514 C 0 0 0 0 0 0 + -1.9269 22.8784 -29.3601 C 0 0 0 0 0 0 + -1.8593 21.4510 -27.4045 C 0 0 0 0 0 0 + -1.2252 22.3093 -28.3025 C 0 0 0 0 0 0 + -5.6128 21.4071 -28.7312 Cl 0 0 0 0 0 0 + -4.4756 22.2608 -31.5073 O 0 0 0 0 0 0 + -4.4499 24.3695 -30.6718 N 0 0 0 0 0 0 + -6.9355 26.4911 -33.2090 N 0 0 0 0 0 0 + -6.3008 27.1207 -32.2194 C 0 0 0 0 0 0 + -5.4625 26.3854 -31.3778 C 0 0 0 0 0 0 + -6.4935 28.5024 -32.0877 N 0 0 0 0 0 0 + -5.7410 29.3927 -31.4053 C 0 0 0 0 0 0 + -4.7130 29.1087 -30.7881 O 0 0 0 0 0 0 + -6.2261 30.8526 -31.4064 C 0 0 0 0 0 0 + -5.9465 31.6762 -30.1512 C 0 0 0 0 0 0 + -5.1392 31.9250 -31.3944 C 0 0 0 0 0 0 + -1.0986 23.9892 -30.4092 Cl 0 0 0 0 0 0 + -3.6932 20.4911 -26.8557 H 0 0 0 0 0 0 + -5.8817 23.3629 -32.9126 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3630 24.7668 -34.2730 H 0 0 0 0 0 0 + -1.2990 21.0136 -26.5902 H 0 0 0 0 0 0 + -0.1903 22.5719 -28.1610 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0744 24.9351 -29.9290 H 0 0 0 0 0 0 + -4.9676 26.8422 -30.5384 H 0 0 0 0 0 0 + -7.3482 28.8436 -32.5018 H 0 0 0 0 0 0 + -7.1314 31.0429 -31.9814 H 0 0 0 0 0 0 + -5.4329 31.2354 -29.2953 H 0 0 0 0 0 0 + -6.6880 32.4155 -29.8451 H 0 0 0 0 0 0 + -5.3071 32.8596 -31.9267 H 0 0 0 0 0 0 + -4.0875 31.6318 -31.4083 H 0 0 0 0 0 0 + 1 2 2 0 0 0 + 1 5 1 0 0 0 + 1 8 1 0 0 0 + 2 3 1 0 0 0 + 2 11 1 0 0 0 + 3 9 2 0 0 0 + 3 24 1 0 0 0 + 4 6 1 0 0 0 + 4 13 1 0 0 0 + 4 16 2 0 0 0 + 5 12 2 0 0 0 + 5 13 1 0 0 0 + 6 7 2 0 0 0 + 6 25 1 0 0 0 + 7 14 1 0 0 0 + 7 26 1 0 0 0 + 8 10 2 0 0 0 + 8 23 1 0 0 0 + 9 10 1 0 0 0 + 9 27 1 0 0 0 + 10 28 1 0 0 0 + 13 29 1 0 0 0 + 14 15 2 0 0 0 + 15 16 1 0 0 0 + 15 17 1 0 0 0 + 16 30 1 0 0 0 + 17 18 1 0 0 0 + 17 31 1 0 0 0 + 18 19 2 0 0 0 + 18 20 1 0 0 0 + 20 21 1 0 0 0 + 20 22 1 0 0 0 + 20 32 1 0 0 0 + 21 22 1 0 0 0 + 21 33 1 0 0 0 + 21 34 1 0 0 0 + 22 35 1 0 0 0 + 22 36 1 0 0 0 M END -> (16) +> -11.31 $$$$ diff --git a/tutorials/Tyk2/setupFEP/amber/protein.pdb b/tutorials/Tyk2/setupFEP/amber/protein.pdb index d31c7502..9138463b 100644 --- a/tutorials/Tyk2/setupFEP/amber/protein.pdb +++ b/tutorials/Tyk2/setupFEP/amber/protein.pdb @@ -93,30 +93,29 @@ ATOM 92 HE3 LYS A 6 4.158 22.810 -44.901 1.00 0.00 H ATOM 93 HZ1 LYS A 6 6.287 22.198 -44.127 1.00 0.00 H ATOM 94 HZ2 LYS A 6 5.674 20.909 -44.945 1.00 0.00 H ATOM 95 HZ3 LYS A 6 6.823 21.837 -45.644 1.00 0.00 H -ATOM 96 N ARG A 7 2.042 24.993 -51.387 1.00 51.74 N -ATOM 97 CA ARG A 7 2.350 26.187 -52.199 1.00 52.94 C -ATOM 98 C ARG A 7 1.301 27.325 -52.006 1.00 55.31 C -ATOM 99 O ARG A 7 1.579 28.443 -52.441 1.00 55.61 O -ATOM 100 CB ARG A 7 2.461 25.743 -53.683 1.00 57.62 C -ATOM 101 CG ARG A 7 1.149 25.255 -54.346 1.00 70.70 C -ATOM 102 CD ARG A 7 1.394 24.392 -55.596 1.00 85.20 C -ATOM 103 NE ARG A 7 0.143 23.800 -56.100 1.00 97.62 N -ATOM 104 CZ ARG A 7 -0.575 24.173 -57.169 1.00116.87 C -ATOM 105 NH1 ARG A 7 -0.214 25.183 -57.965 1.00109.22 N -ATOM 106 NH2 ARG A 7 -1.692 23.500 -57.451 1.00103.80 N1+ -ATOM 107 H ARG A 7 1.703 24.197 -51.907 1.00 0.00 H -ATOM 108 HA ARG A 7 3.320 26.573 -51.879 1.00 0.00 H -ATOM 109 HB2 ARG A 7 2.873 26.559 -54.280 1.00 0.00 H -ATOM 110 HB3 ARG A 7 3.211 24.952 -53.739 1.00 0.00 H -ATOM 111 HG2 ARG A 7 0.579 24.670 -53.625 1.00 0.00 H -ATOM 112 HG3 ARG A 7 0.518 26.108 -54.600 1.00 0.00 H -ATOM 113 HD2 ARG A 7 1.886 24.975 -56.374 1.00 0.00 H -ATOM 114 HD3 ARG A 7 2.068 23.569 -55.355 1.00 0.00 H -ATOM 115 HE ARG A 7 -0.209 23.019 -55.568 1.00 0.00 H -ATOM 116 HH12 ARG A 7 -0.800 25.449 -58.741 1.00 0.00 H -ATOM 117 HH11 ARG A 7 0.629 25.710 -57.775 1.00 0.00 H -ATOM 118 HH22 ARG A 7 -2.236 23.749 -58.263 1.00 0.00 H -ATOM 119 HH21 ARG A 7 -1.989 22.737 -56.863 1.00 0.00 H +ATOM 96 N ARN A 7 2.042 24.993 -51.387 1.00 51.74 N +ATOM 97 CA ARN A 7 2.350 26.187 -52.199 1.00 52.94 C +ATOM 98 C ARN A 7 1.301 27.325 -52.006 1.00 55.31 C +ATOM 99 O ARN A 7 1.579 28.443 -52.441 1.00 55.61 O +ATOM 100 CB ARN A 7 2.461 25.743 -53.683 1.00 57.62 C +ATOM 101 CG ARN A 7 1.149 25.255 -54.346 1.00 70.70 C +ATOM 102 CD ARN A 7 1.394 24.392 -55.596 1.00 85.20 C +ATOM 103 NE ARN A 7 0.143 23.800 -56.100 1.00 97.62 N +ATOM 104 CZ ARN A 7 -0.575 24.173 -57.169 1.00116.87 C +ATOM 105 NH1 ARN A 7 -0.214 25.183 -57.965 1.00109.22 N +ATOM 106 NH2 ARN A 7 -1.692 23.500 -57.451 1.00103.80 N1+ +ATOM 107 H ARN A 7 1.703 24.197 -51.907 1.00 0.00 H +ATOM 108 HA ARN A 7 3.320 26.573 -51.879 1.00 0.00 H +ATOM 109 HB2 ARN A 7 2.873 26.559 -54.280 1.00 0.00 H +ATOM 110 HB3 ARN A 7 3.211 24.952 -53.739 1.00 0.00 H +ATOM 111 HG2 ARN A 7 0.579 24.670 -53.625 1.00 0.00 H +ATOM 112 HG3 ARN A 7 0.518 26.108 -54.600 1.00 0.00 H +ATOM 113 HD2 ARN A 7 1.886 24.975 -56.374 1.00 0.00 H +ATOM 114 HD3 ARN A 7 2.068 23.569 -55.355 1.00 0.00 H +ATOM 115 HE ARN A 7 -0.209 23.019 -55.568 1.00 0.00 H +ATOM 116 HH12 ARN A 7 -0.800 25.449 -58.741 1.00 0.00 H +ATOM 117 HH11 ARN A 7 0.629 25.710 -57.775 1.00 0.00 H +ATOM 119 HH21 ARN A 7 -1.989 22.737 -56.863 1.00 0.00 H ATOM 120 N TYR A 8 0.141 27.045 -51.376 1.00 49.98 N ATOM 121 CA TYR A 8 -0.930 28.009 -51.074 1.00 49.28 C ATOM 122 C TYR A 8 -1.027 28.273 -49.546 1.00 50.16 C @@ -157,28 +156,27 @@ ATOM 156 HD13 LEU A 9 -0.150 24.141 -44.788 1.00 0.00 H ATOM 157 HD21 LEU A 9 -3.028 25.110 -45.492 1.00 0.00 H ATOM 158 HD22 LEU A 9 -1.896 25.993 -44.482 1.00 0.00 H ATOM 159 HD23 LEU A 9 -2.638 26.773 -45.868 1.00 0.00 H -ATOM 160 N LYS A 10 0.404 29.982 -46.517 1.00 44.15 N -ATOM 161 CA LYS A 10 1.242 31.102 -46.056 1.00 44.11 C -ATOM 162 C LYS A 10 1.157 31.045 -44.511 1.00 46.50 C -ATOM 163 O LYS A 10 0.061 31.172 -43.963 1.00 45.72 O -ATOM 164 CB LYS A 10 0.635 32.447 -46.546 1.00 48.28 C -ATOM 165 CG LYS A 10 0.901 32.810 -48.022 1.00 70.59 C -ATOM 166 CD LYS A 10 0.102 31.993 -49.057 1.00 82.83 C -ATOM 167 CE LYS A 10 0.211 32.586 -50.472 1.00 97.68 C -ATOM 168 NZ LYS A 10 -0.510 31.776 -51.467 1.00107.26 N1+ -ATOM 169 H LYS A 10 -0.593 30.133 -46.432 1.00 0.00 H -ATOM 170 HA LYS A 10 2.277 31.012 -46.393 1.00 0.00 H -ATOM 171 HB2 LYS A 10 -0.439 32.485 -46.352 1.00 0.00 H -ATOM 172 HB3 LYS A 10 1.058 33.259 -45.951 1.00 0.00 H -ATOM 173 HG2 LYS A 10 0.645 33.863 -48.150 1.00 0.00 H -ATOM 174 HG3 LYS A 10 1.969 32.740 -48.235 1.00 0.00 H -ATOM 175 HD2 LYS A 10 0.467 30.966 -49.065 1.00 0.00 H -ATOM 176 HD3 LYS A 10 -0.948 31.949 -48.762 1.00 0.00 H -ATOM 177 HE2 LYS A 10 -0.198 33.597 -50.488 1.00 0.00 H -ATOM 178 HE3 LYS A 10 1.256 32.656 -50.776 1.00 0.00 H -ATOM 179 HZ1 LYS A 10 -0.413 32.197 -52.380 1.00 0.00 H -ATOM 180 HZ2 LYS A 10 -0.125 30.843 -51.487 1.00 0.00 H -ATOM 181 HZ3 LYS A 10 -1.494 31.730 -51.232 1.00 0.00 H +ATOM 160 N LYN A 10 0.404 29.982 -46.517 1.00 44.15 N +ATOM 161 CA LYN A 10 1.242 31.102 -46.056 1.00 44.11 C +ATOM 162 C LYN A 10 1.157 31.045 -44.511 1.00 46.50 C +ATOM 163 O LYN A 10 0.061 31.172 -43.963 1.00 45.72 O +ATOM 164 CB LYN A 10 0.635 32.447 -46.546 1.00 48.28 C +ATOM 165 CG LYN A 10 0.901 32.810 -48.022 1.00 70.59 C +ATOM 166 CD LYN A 10 0.102 31.993 -49.057 1.00 82.83 C +ATOM 167 CE LYN A 10 0.211 32.586 -50.472 1.00 97.68 C +ATOM 168 NZ LYN A 10 -0.510 31.776 -51.467 1.00107.26 N1+ +ATOM 169 H LYN A 10 -0.593 30.133 -46.432 1.00 0.00 H +ATOM 170 HA LYN A 10 2.277 31.012 -46.393 1.00 0.00 H +ATOM 171 HB2 LYN A 10 -0.439 32.485 -46.352 1.00 0.00 H +ATOM 172 HB3 LYN A 10 1.058 33.259 -45.951 1.00 0.00 H +ATOM 173 HG2 LYN A 10 0.645 33.863 -48.150 1.00 0.00 H +ATOM 174 HG3 LYN A 10 1.969 32.740 -48.235 1.00 0.00 H +ATOM 175 HD2 LYN A 10 0.467 30.966 -49.065 1.00 0.00 H +ATOM 176 HD3 LYN A 10 -0.948 31.949 -48.762 1.00 0.00 H +ATOM 177 HE2 LYN A 10 -0.198 33.597 -50.488 1.00 0.00 H +ATOM 178 HE3 LYN A 10 1.256 32.656 -50.776 1.00 0.00 H +ATOM 180 HZ2 LYN A 10 -0.125 30.843 -51.487 1.00 0.00 H +ATOM 181 HZ3 LYN A 10 -1.494 31.730 -51.232 1.00 0.00 H ATOM 182 N LYS A 11 2.310 30.879 -43.830 1.00 42.86 N ATOM 183 CA LYS A 11 2.408 30.737 -42.363 1.00 42.35 C ATOM 184 C LYS A 11 2.279 32.149 -41.738 1.00 45.75 C @@ -244,18 +242,18 @@ ATOM 243 HH12 ARG A 13 -2.648 36.108 -35.787 1.00 0.00 H ATOM 244 HH11 ARG A 13 -0.973 35.667 -35.553 1.00 0.00 H ATOM 245 HH22 ARG A 13 -4.288 35.060 -34.603 1.00 0.00 H ATOM 246 HH21 ARG A 13 -3.902 33.807 -33.456 1.00 0.00 H -ATOM 247 N ASH A 14 3.180 30.325 -35.003 1.00 41.92 N -ATOM 248 CA ASH A 14 3.147 29.044 -34.272 1.00 41.86 C -ATOM 249 C ASH A 14 2.019 29.169 -33.192 1.00 43.46 C -ATOM 250 O ASH A 14 1.868 30.257 -32.608 1.00 42.68 O -ATOM 251 CB ASH A 14 4.496 28.791 -33.544 1.00 46.10 C -ATOM 252 CG ASH A 14 5.697 28.545 -34.473 1.00 63.12 C -ATOM 253 OD1 ASH A 14 5.497 27.972 -35.567 1.00 62.46 O -ATOM 254 OD2 ASH A 14 6.820 28.903 -34.061 1.00 75.36 O1- -ATOM 255 H ASH A 14 3.686 31.062 -34.533 1.00 0.00 H -ATOM 256 HA ASH A 14 2.926 28.219 -34.951 1.00 0.00 H -ATOM 257 HB2 ASH A 14 4.733 29.623 -32.877 1.00 0.00 H -ATOM 258 HB3 ASH A 14 4.414 27.907 -32.908 1.00 0.00 H +ATOM 247 N ASP A 14 3.180 30.325 -35.003 1.00 41.92 N +ATOM 248 CA ASP A 14 3.147 29.044 -34.272 1.00 41.86 C +ATOM 249 C ASP A 14 2.019 29.169 -33.192 1.00 43.46 C +ATOM 250 O ASP A 14 1.868 30.257 -32.608 1.00 42.68 O +ATOM 251 CB ASP A 14 4.496 28.791 -33.544 1.00 46.10 C +ATOM 252 CG ASP A 14 5.697 28.545 -34.473 1.00 63.12 C +ATOM 253 OD1 ASP A 14 5.497 27.972 -35.567 1.00 62.46 O +ATOM 254 OD2 ASP A 14 6.820 28.903 -34.061 1.00 75.36 O1- +ATOM 255 H ASP A 14 3.686 31.062 -34.533 1.00 0.00 H +ATOM 256 HA ASP A 14 2.926 28.219 -34.951 1.00 0.00 H +ATOM 257 HB2 ASP A 14 4.733 29.623 -32.877 1.00 0.00 H +ATOM 258 HB3 ASP A 14 4.414 27.907 -32.908 1.00 0.00 H ATOM 259 N LEU A 15 1.233 28.101 -32.923 1.00 39.42 N ATOM 260 CA LEU A 15 0.172 28.033 -31.875 1.00 38.97 C ATOM 261 C LEU A 15 0.702 27.317 -30.612 1.00 45.51 C @@ -470,18 +468,18 @@ ATOM 469 HD2 TYR A 28 -7.600 26.882 -48.442 1.00 0.00 H ATOM 470 HE1 TYR A 28 -3.428 24.668 -50.015 1.00 0.00 H ATOM 471 HE2 TYR A 28 -7.659 25.393 -50.426 1.00 0.00 H ATOM 472 HH TYR A 28 -6.440 23.983 -51.809 1.00 0.00 H -ATOM 473 N ASH A 29 -4.579 30.269 -49.044 1.00 46.60 N -ATOM 474 CA ASH A 29 -5.006 31.368 -49.914 1.00 48.33 C -ATOM 475 C ASH A 29 -4.495 31.003 -51.336 1.00 54.57 C -ATOM 476 O ASH A 29 -3.395 31.429 -51.695 1.00 54.85 O -ATOM 477 CB ASH A 29 -4.607 32.743 -49.295 1.00 50.11 C -ATOM 478 CG ASH A 29 -4.563 33.958 -50.225 1.00 62.07 C -ATOM 479 OD1 ASH A 29 -5.521 34.112 -51.013 1.00 63.23 O -ATOM 480 OD2 ASH A 29 -3.585 34.729 -50.115 1.00 69.60 O1- -ATOM 481 H ASH A 29 -3.617 29.970 -49.141 1.00 0.00 H -ATOM 482 HA ASH A 29 -6.095 31.391 -49.974 1.00 0.00 H -ATOM 483 HB2 ASH A 29 -5.298 32.988 -48.490 1.00 0.00 H -ATOM 484 HB3 ASH A 29 -3.628 32.653 -48.819 1.00 0.00 H +ATOM 473 N ASP A 29 -4.579 30.269 -49.044 1.00 46.60 N +ATOM 474 CA ASP A 29 -5.006 31.368 -49.914 1.00 48.33 C +ATOM 475 C ASP A 29 -4.495 31.003 -51.336 1.00 54.57 C +ATOM 476 O ASP A 29 -3.395 31.429 -51.695 1.00 54.85 O +ATOM 477 CB ASP A 29 -4.607 32.743 -49.295 1.00 50.11 C +ATOM 478 CG ASP A 29 -4.563 33.958 -50.225 1.00 62.07 C +ATOM 479 OD1 ASP A 29 -5.521 34.112 -51.013 1.00 63.23 O +ATOM 480 OD2 ASP A 29 -3.585 34.729 -50.115 1.00 69.60 O1- +ATOM 481 H ASP A 29 -3.617 29.970 -49.141 1.00 0.00 H +ATOM 482 HA ASP A 29 -6.095 31.391 -49.974 1.00 0.00 H +ATOM 483 HB2 ASP A 29 -5.298 32.988 -48.490 1.00 0.00 H +ATOM 484 HB3 ASP A 29 -3.628 32.653 -48.819 1.00 0.00 H ATOM 485 N PRO A 30 -5.286 30.218 -52.123 1.00 52.47 N ATOM 486 CA PRO A 30 -4.938 29.841 -53.515 1.00 54.47 C ATOM 487 C PRO A 30 -4.967 31.010 -54.532 1.00 61.35 C @@ -721,18 +719,18 @@ ATOM 720 HA ALA A 46 10.690 14.953 -40.250 1.00 0.00 H ATOM 721 HB1 ALA A 46 12.775 15.982 -41.054 1.00 0.00 H ATOM 722 HB2 ALA A 46 11.725 17.288 -40.526 1.00 0.00 H ATOM 723 HB3 ALA A 46 13.048 16.780 -39.508 1.00 0.00 H -ATOM 724 N ASH A 47 12.659 14.413 -37.632 1.00 72.17 N -ATOM 725 CA ASH A 47 13.590 13.555 -36.883 1.00 73.50 C -ATOM 726 C ASH A 47 12.830 12.508 -36.007 1.00 75.83 C -ATOM 727 O ASH A 47 13.505 11.825 -35.234 1.00 76.32 O -ATOM 728 CB ASH A 47 14.546 14.445 -36.029 1.00 76.23 C -ATOM 729 CG ASH A 47 13.876 15.317 -34.951 1.00 89.05 C -ATOM 730 OD1 ASH A 47 13.092 16.205 -35.351 1.00 88.80 O -ATOM 731 OD2 ASH A 47 14.146 15.080 -33.753 1.00 97.21 O1- -ATOM 732 H ASH A 47 12.420 15.272 -37.153 1.00 0.00 H -ATOM 733 HA ASH A 47 14.203 12.992 -37.590 1.00 0.00 H -ATOM 734 HB2 ASH A 47 15.306 13.820 -35.557 1.00 0.00 H -ATOM 735 HB3 ASH A 47 15.105 15.112 -36.687 1.00 0.00 H +ATOM 724 N ASP A 47 12.659 14.413 -37.632 1.00 72.17 N +ATOM 725 CA ASP A 47 13.590 13.555 -36.883 1.00 73.50 C +ATOM 726 C ASP A 47 12.830 12.508 -36.007 1.00 75.83 C +ATOM 727 O ASP A 47 13.505 11.825 -35.234 1.00 76.32 O +ATOM 728 CB ASP A 47 14.546 14.445 -36.029 1.00 76.23 C +ATOM 729 CG ASP A 47 13.876 15.317 -34.951 1.00 89.05 C +ATOM 730 OD1 ASP A 47 13.092 16.205 -35.351 1.00 88.80 O +ATOM 731 OD2 ASP A 47 14.146 15.080 -33.753 1.00 97.21 O1- +ATOM 732 H ASP A 47 12.420 15.272 -37.153 1.00 0.00 H +ATOM 733 HA ASP A 47 14.203 12.992 -37.590 1.00 0.00 H +ATOM 734 HB2 ASP A 47 15.306 13.820 -35.557 1.00 0.00 H +ATOM 735 HB3 ASP A 47 15.105 15.112 -36.687 1.00 0.00 H ATOM 736 N CYS A 48 11.488 12.357 -36.112 1.00 70.25 N ATOM 737 CA CYS A 48 10.696 11.338 -35.385 1.00 69.55 C ATOM 738 C CYS A 48 10.960 9.951 -36.026 1.00 73.05 C @@ -799,30 +797,29 @@ ATOM 798 HB3 HIE A 52 6.314 10.347 -33.440 1.00 0.00 H ATOM 799 HD2 HIE A 52 5.698 9.814 -30.444 1.00 0.00 H ATOM 800 HE1 HIE A 52 9.839 9.494 -29.794 1.00 0.00 H ATOM 801 HE2 HIE A 52 7.582 9.843 -28.705 1.00 0.00 H -ATOM 802 N ARG A 53 5.674 7.859 -35.996 1.00 57.11 N -ATOM 803 CA ARG A 53 5.136 7.971 -37.365 1.00 55.94 C -ATOM 804 C ARG A 53 3.924 7.021 -37.549 1.00 58.15 C -ATOM 805 O ARG A 53 3.005 7.401 -38.275 1.00 56.90 O -ATOM 806 CB ARG A 53 6.246 7.611 -38.383 1.00 56.27 C -ATOM 807 CG ARG A 53 7.247 8.760 -38.595 1.00 60.46 C -ATOM 808 CD ARG A 53 8.472 8.367 -39.432 1.00 68.18 C -ATOM 809 NE ARG A 53 9.347 9.529 -39.650 1.00 73.45 N -ATOM 810 CZ ARG A 53 9.260 10.436 -40.635 1.00 81.37 C -ATOM 811 NH1 ARG A 53 8.340 10.360 -41.602 1.00 62.04 N -ATOM 812 NH2 ARG A 53 10.120 11.453 -40.659 1.00 66.65 N1+ -ATOM 813 H ARG A 53 6.518 7.311 -35.899 1.00 0.00 H -ATOM 814 HA ARG A 53 4.801 8.995 -37.549 1.00 0.00 H -ATOM 815 HB2 ARG A 53 6.772 6.714 -38.055 1.00 0.00 H -ATOM 816 HB3 ARG A 53 5.816 7.360 -39.355 1.00 0.00 H -ATOM 817 HG2 ARG A 53 6.723 9.582 -39.086 1.00 0.00 H -ATOM 818 HG3 ARG A 53 7.583 9.144 -37.630 1.00 0.00 H -ATOM 819 HD2 ARG A 53 9.046 7.594 -38.919 1.00 0.00 H -ATOM 820 HD3 ARG A 53 8.170 7.949 -40.392 1.00 0.00 H -ATOM 821 HE ARG A 53 10.067 9.671 -38.951 1.00 0.00 H -ATOM 822 HH12 ARG A 53 8.333 11.053 -42.339 1.00 0.00 H -ATOM 823 HH11 ARG A 53 7.682 9.597 -41.616 1.00 0.00 H -ATOM 824 HH22 ARG A 53 10.066 12.128 -41.409 1.00 0.00 H -ATOM 825 HH21 ARG A 53 10.826 11.555 -39.944 1.00 0.00 H +ATOM 802 N ARN A 53 5.674 7.859 -35.996 1.00 57.11 N +ATOM 803 CA ARN A 53 5.136 7.971 -37.365 1.00 55.94 C +ATOM 804 C ARN A 53 3.924 7.021 -37.549 1.00 58.15 C +ATOM 805 O ARN A 53 3.005 7.401 -38.275 1.00 56.90 O +ATOM 806 CB ARN A 53 6.246 7.611 -38.383 1.00 56.27 C +ATOM 807 CG ARN A 53 7.247 8.760 -38.595 1.00 60.46 C +ATOM 808 CD ARN A 53 8.472 8.367 -39.432 1.00 68.18 C +ATOM 809 NE ARN A 53 9.347 9.529 -39.650 1.00 73.45 N +ATOM 810 CZ ARN A 53 9.260 10.436 -40.635 1.00 81.37 C +ATOM 811 NH1 ARN A 53 8.340 10.360 -41.602 1.00 62.04 N +ATOM 812 NH2 ARN A 53 10.120 11.453 -40.659 1.00 66.65 N1+ +ATOM 813 H ARN A 53 6.518 7.311 -35.899 1.00 0.00 H +ATOM 814 HA ARN A 53 4.801 8.995 -37.549 1.00 0.00 H +ATOM 815 HB2 ARN A 53 6.772 6.714 -38.055 1.00 0.00 H +ATOM 816 HB3 ARN A 53 5.816 7.360 -39.355 1.00 0.00 H +ATOM 817 HG2 ARN A 53 6.723 9.582 -39.086 1.00 0.00 H +ATOM 818 HG3 ARN A 53 7.583 9.144 -37.630 1.00 0.00 H +ATOM 819 HD2 ARN A 53 9.046 7.594 -38.919 1.00 0.00 H +ATOM 820 HD3 ARN A 53 8.170 7.949 -40.392 1.00 0.00 H +ATOM 821 HE ARN A 53 10.067 9.671 -38.951 1.00 0.00 H +ATOM 822 HH12 ARN A 53 8.333 11.053 -42.339 1.00 0.00 H +ATOM 823 HH11 ARN A 53 7.682 9.597 -41.616 1.00 0.00 H +ATOM 825 HH21 ARN A 53 10.826 11.555 -39.944 1.00 0.00 H ATOM 826 N SER A 54 3.902 5.847 -36.883 1.00 54.55 N ATOM 827 CA SER A 54 2.775 4.892 -36.874 1.00 53.96 C ATOM 828 C SER A 54 1.641 5.405 -35.943 1.00 53.99 C @@ -865,28 +862,27 @@ ATOM 864 HE3 TRP A 56 0.350 13.063 -35.134 1.00 0.00 H ATOM 865 HZ2 TRP A 56 0.378 15.809 -39.301 1.00 0.00 H ATOM 866 HZ3 TRP A 56 -0.761 15.277 -35.171 1.00 0.00 H ATOM 867 HH2 TRP A 56 -0.738 16.658 -37.237 1.00 0.00 H -ATOM 868 N LYS A 57 -0.118 8.655 -37.869 1.00 43.92 N -ATOM 869 CA LYS A 57 -1.086 8.163 -38.869 1.00 44.34 C -ATOM 870 C LYS A 57 -2.410 7.742 -38.178 1.00 46.56 C -ATOM 871 O LYS A 57 -3.463 7.921 -38.786 1.00 45.36 O -ATOM 872 CB LYS A 57 -0.486 6.970 -39.650 1.00 49.05 C -ATOM 873 CG LYS A 57 0.600 7.376 -40.663 1.00 67.10 C -ATOM 874 CD LYS A 57 1.215 6.159 -41.384 1.00 82.17 C -ATOM 875 CE LYS A 57 2.398 6.506 -42.303 1.00 95.75 C -ATOM 876 NZ LYS A 57 3.567 6.974 -41.536 1.00106.63 N1+ -ATOM 877 H LYS A 57 0.705 8.084 -37.736 1.00 0.00 H -ATOM 878 HA LYS A 57 -1.315 8.972 -39.567 1.00 0.00 H -ATOM 879 HB2 LYS A 57 -0.080 6.236 -38.949 1.00 0.00 H -ATOM 880 HB3 LYS A 57 -1.275 6.450 -40.199 1.00 0.00 H -ATOM 881 HG2 LYS A 57 0.173 8.056 -41.402 1.00 0.00 H -ATOM 882 HG3 LYS A 57 1.376 7.944 -40.153 1.00 0.00 H -ATOM 883 HD2 LYS A 57 1.535 5.418 -40.650 1.00 0.00 H -ATOM 884 HD3 LYS A 57 0.438 5.672 -41.976 1.00 0.00 H -ATOM 885 HE2 LYS A 57 2.693 5.627 -42.877 1.00 0.00 H -ATOM 886 HE3 LYS A 57 2.110 7.272 -43.023 1.00 0.00 H -ATOM 887 HZ1 LYS A 57 4.319 7.207 -42.168 1.00 0.00 H -ATOM 888 HZ2 LYS A 57 3.308 7.788 -40.996 1.00 0.00 H -ATOM 889 HZ3 LYS A 57 3.867 6.243 -40.907 1.00 0.00 H +ATOM 868 N LYN A 57 -0.118 8.655 -37.869 1.00 43.92 N +ATOM 869 CA LYN A 57 -1.086 8.163 -38.869 1.00 44.34 C +ATOM 870 C LYN A 57 -2.410 7.742 -38.178 1.00 46.56 C +ATOM 871 O LYN A 57 -3.463 7.921 -38.786 1.00 45.36 O +ATOM 872 CB LYN A 57 -0.486 6.970 -39.650 1.00 49.05 C +ATOM 873 CG LYN A 57 0.600 7.376 -40.663 1.00 67.10 C +ATOM 874 CD LYN A 57 1.215 6.159 -41.384 1.00 82.17 C +ATOM 875 CE LYN A 57 2.398 6.506 -42.303 1.00 95.75 C +ATOM 876 NZ LYN A 57 3.567 6.974 -41.536 1.00106.63 N1+ +ATOM 877 H LYN A 57 0.705 8.084 -37.736 1.00 0.00 H +ATOM 878 HA LYN A 57 -1.315 8.972 -39.567 1.00 0.00 H +ATOM 879 HB2 LYN A 57 -0.080 6.236 -38.949 1.00 0.00 H +ATOM 880 HB3 LYN A 57 -1.275 6.450 -40.199 1.00 0.00 H +ATOM 881 HG2 LYN A 57 0.173 8.056 -41.402 1.00 0.00 H +ATOM 882 HG3 LYN A 57 1.376 7.944 -40.153 1.00 0.00 H +ATOM 883 HD2 LYN A 57 1.535 5.418 -40.650 1.00 0.00 H +ATOM 884 HD3 LYN A 57 0.438 5.672 -41.976 1.00 0.00 H +ATOM 885 HE2 LYN A 57 2.693 5.627 -42.877 1.00 0.00 H +ATOM 886 HE3 LYN A 57 2.110 7.272 -43.023 1.00 0.00 H +ATOM 888 HZ2 LYN A 57 3.308 7.788 -40.996 1.00 0.00 H +ATOM 889 HZ3 LYN A 57 3.867 6.243 -40.907 1.00 0.00 H ATOM 890 N GLN A 58 -2.344 7.271 -36.913 1.00 43.11 N ATOM 891 CA GLN A 58 -3.488 6.881 -36.081 1.00 42.59 C ATOM 892 C GLN A 58 -4.262 8.141 -35.608 1.00 44.21 C @@ -938,18 +934,18 @@ ATOM 937 HG23 ILE A 60 -5.174 12.719 -41.208 1.00 0.00 H ATOM 938 HD11 ILE A 60 -0.917 13.123 -40.245 1.00 0.00 H ATOM 939 HD12 ILE A 60 -1.247 11.414 -40.507 1.00 0.00 H ATOM 940 HD13 ILE A 60 -1.993 12.647 -41.530 1.00 0.00 H -ATOM 941 N ASH A 61 -6.217 9.306 -38.764 1.00 41.37 N -ATOM 942 CA ASH A 61 -7.295 8.329 -39.019 1.00 43.58 C -ATOM 943 C ASH A 61 -8.463 8.545 -38.020 1.00 46.27 C -ATOM 944 O ASH A 61 -9.613 8.503 -38.457 1.00 45.58 O -ATOM 945 CB ASH A 61 -6.800 6.857 -38.918 1.00 47.36 C -ATOM 946 CG ASH A 61 -5.923 6.359 -40.077 1.00 66.46 C -ATOM 947 OD1 ASH A 61 -5.911 7.015 -41.142 1.00 66.64 O -ATOM 948 OD2 ASH A 61 -5.285 5.303 -39.879 1.00 76.34 O1- -ATOM 949 H ASH A 61 -5.344 8.909 -38.442 1.00 0.00 H -ATOM 950 HA ASH A 61 -7.688 8.511 -40.023 1.00 0.00 H -ATOM 951 HB2 ASH A 61 -6.253 6.712 -37.985 1.00 0.00 H -ATOM 952 HB3 ASH A 61 -7.650 6.174 -38.876 1.00 0.00 H +ATOM 941 N ASP A 61 -6.217 9.306 -38.764 1.00 41.37 N +ATOM 942 CA ASP A 61 -7.295 8.329 -39.019 1.00 43.58 C +ATOM 943 C ASP A 61 -8.463 8.545 -38.020 1.00 46.27 C +ATOM 944 O ASP A 61 -9.613 8.503 -38.457 1.00 45.58 O +ATOM 945 CB ASP A 61 -6.800 6.857 -38.918 1.00 47.36 C +ATOM 946 CG ASP A 61 -5.923 6.359 -40.077 1.00 66.46 C +ATOM 947 OD1 ASP A 61 -5.911 7.015 -41.142 1.00 66.64 O +ATOM 948 OD2 ASP A 61 -5.285 5.303 -39.879 1.00 76.34 O1- +ATOM 949 H ASP A 61 -5.344 8.909 -38.442 1.00 0.00 H +ATOM 950 HA ASP A 61 -7.688 8.511 -40.023 1.00 0.00 H +ATOM 951 HB2 ASP A 61 -6.253 6.712 -37.985 1.00 0.00 H +ATOM 952 HB3 ASP A 61 -7.650 6.174 -38.876 1.00 0.00 H ATOM 953 N ILE A 62 -8.167 8.804 -36.728 1.00 42.07 N ATOM 954 CA ILE A 62 -9.144 8.984 -35.638 1.00 41.21 C ATOM 955 C ILE A 62 -9.893 10.336 -35.813 1.00 44.57 C @@ -1247,33 +1243,33 @@ ATOM 1246 HA CYS A 78 -1.991 18.615 -47.754 1.00 0.00 H ATOM 1247 HB2 CYS A 78 -2.025 20.507 -46.109 1.00 0.00 H ATOM 1248 HB3 CYS A 78 -0.649 19.837 -45.284 1.00 0.00 H ATOM 1249 HG CYS A 78 -0.893 20.851 -48.403 1.00 0.00 H -ATOM 1250 N GLU A 79 0.086 17.333 -48.225 1.00 64.28 N -ATOM 1251 CA GLU A 79 1.238 16.528 -48.655 1.00 65.86 C -ATOM 1252 C GLU A 79 2.499 17.358 -48.316 1.00 70.57 C -ATOM 1253 O GLU A 79 2.717 18.421 -48.903 1.00 70.73 O -ATOM 1254 CB GLU A 79 1.088 16.228 -50.175 1.00 69.10 C -ATOM 1255 CG GLU A 79 2.247 15.436 -50.848 1.00 81.26 C -ATOM 1256 CD GLU A 79 3.368 16.269 -51.498 1.00 98.19 C -ATOM 1257 OE1 GLU A 79 4.511 15.760 -51.519 1.00 78.88 O -ATOM 1258 OE2 GLU A 79 3.072 17.377 -51.998 1.00 93.22 O1- -ATOM 1259 H GLU A 79 -0.405 17.806 -48.970 1.00 0.00 H -ATOM 1260 HA GLU A 79 1.249 15.580 -48.112 1.00 0.00 H -ATOM 1261 HB2 GLU A 79 0.174 15.646 -50.306 1.00 0.00 H -ATOM 1262 HB3 GLU A 79 0.894 17.155 -50.718 1.00 0.00 H -ATOM 1263 HG2 GLU A 79 2.678 14.731 -50.135 1.00 0.00 H -ATOM 1264 HG3 GLU A 79 1.832 14.825 -51.649 1.00 0.00 H -ATOM 1265 N ASH A 80 3.291 16.840 -47.358 1.00 66.99 N -ATOM 1266 CA ASH A 80 4.573 17.400 -46.927 1.00 67.07 C -ATOM 1267 C ASH A 80 5.634 16.579 -47.691 1.00 72.70 C -ATOM 1268 O ASH A 80 5.822 15.388 -47.426 1.00 72.95 O -ATOM 1269 CB ASH A 80 4.770 17.311 -45.383 1.00 67.90 C -ATOM 1270 CG ASH A 80 5.549 18.490 -44.779 1.00 83.41 C -ATOM 1271 OD1 ASH A 80 6.351 19.108 -45.516 1.00 85.94 O -ATOM 1272 OD2 ASH A 80 5.328 18.773 -43.584 1.00 90.83 O1- -ATOM 1273 H ASH A 80 3.048 15.952 -46.940 1.00 0.00 H -ATOM 1274 HA ASH A 80 4.619 18.449 -47.236 1.00 0.00 H -ATOM 1275 HB2 ASH A 80 3.792 17.285 -44.900 1.00 0.00 H -ATOM 1276 HB3 ASH A 80 5.261 16.388 -45.072 1.00 0.00 H +ATOM 1250 N GLH A 79 0.086 17.333 -48.225 1.00 64.28 N +ATOM 1251 CA GLH A 79 1.238 16.528 -48.655 1.00 65.86 C +ATOM 1252 C GLH A 79 2.499 17.358 -48.316 1.00 70.57 C +ATOM 1253 O GLH A 79 2.717 18.421 -48.903 1.00 70.73 O +ATOM 1254 CB GLH A 79 1.088 16.228 -50.175 1.00 69.10 C +ATOM 1255 CG GLH A 79 2.247 15.436 -50.848 1.00 81.26 C +ATOM 1256 CD GLH A 79 3.368 16.269 -51.498 1.00 98.19 C +ATOM 1257 OE1 GLH A 79 4.511 15.760 -51.519 1.00 78.88 O +ATOM 1258 OE2 GLH A 79 3.072 17.377 -51.998 1.00 93.22 O1- +ATOM 1259 H GLH A 79 -0.405 17.806 -48.970 1.00 0.00 H +ATOM 1260 HA GLH A 79 1.249 15.580 -48.112 1.00 0.00 H +ATOM 1261 HB2 GLH A 79 0.174 15.646 -50.306 1.00 0.00 H +ATOM 1262 HB3 GLH A 79 0.894 17.155 -50.718 1.00 0.00 H +ATOM 1263 HG2 GLH A 79 2.678 14.731 -50.135 1.00 0.00 H +ATOM 1264 HG3 GLH A 79 1.832 14.825 -51.649 1.00 0.00 H +ATOM 1265 N ASP A 80 3.291 16.840 -47.358 1.00 66.99 N +ATOM 1266 CA ASP A 80 4.573 17.400 -46.927 1.00 67.07 C +ATOM 1267 C ASP A 80 5.634 16.579 -47.691 1.00 72.70 C +ATOM 1268 O ASP A 80 5.822 15.388 -47.426 1.00 72.95 O +ATOM 1269 CB ASP A 80 4.770 17.311 -45.383 1.00 67.90 C +ATOM 1270 CG ASP A 80 5.549 18.490 -44.779 1.00 83.41 C +ATOM 1271 OD1 ASP A 80 6.351 19.108 -45.516 1.00 85.94 O +ATOM 1272 OD2 ASP A 80 5.328 18.773 -43.584 1.00 90.83 O1- +ATOM 1273 H ASP A 80 3.048 15.952 -46.940 1.00 0.00 H +ATOM 1274 HA ASP A 80 4.619 18.449 -47.236 1.00 0.00 H +ATOM 1275 HB2 ASP A 80 3.792 17.285 -44.900 1.00 0.00 H +ATOM 1276 HB3 ASP A 80 5.261 16.388 -45.072 1.00 0.00 H ATOM 1277 N GLN A 81 6.308 17.265 -48.631 1.00 69.93 N ATOM 1278 CA GLN A 81 7.346 16.730 -49.523 1.00 70.98 C ATOM 1279 C GLN A 81 8.682 16.576 -48.739 1.00 74.28 C @@ -1313,28 +1309,27 @@ ATOM 1312 HG2 GLU A 83 10.089 17.208 -41.949 1.00 0.00 H ATOM 1313 HG3 GLU A 83 8.889 17.838 -43.034 1.00 0.00 H ATOM 1314 H GLU A 83 11.023 15.864 -44.862 1.00 0.00 H ATOM 1315 HA GLU A 83 10.529 14.831 -42.994 1.00 0.00 H -ATOM 1316 N LYS A 84 8.412 13.556 -45.179 1.00 64.62 N -ATOM 1317 CA LYS A 84 7.812 12.390 -45.854 1.00 64.42 C -ATOM 1318 C LYS A 84 6.641 11.863 -44.991 1.00 65.37 C -ATOM 1319 O LYS A 84 6.675 10.724 -44.518 1.00 65.17 O -ATOM 1320 CB LYS A 84 8.858 11.334 -46.306 1.00 0.00 C -ATOM 1321 CG LYS A 84 9.635 11.768 -47.567 1.00 0.00 C -ATOM 1322 CD LYS A 84 10.515 10.650 -48.158 1.00 0.00 C -ATOM 1323 CE LYS A 84 11.162 11.047 -49.496 1.00 0.00 C -ATOM 1324 NZ LYS A 84 11.959 9.944 -50.061 1.00 0.00 N1+ -ATOM 1325 HB2 LYS A 84 9.551 11.095 -45.499 1.00 0.00 H -ATOM 1326 HB3 LYS A 84 8.345 10.399 -46.538 1.00 0.00 H -ATOM 1327 HG2 LYS A 84 8.923 12.088 -48.330 1.00 0.00 H -ATOM 1328 HG3 LYS A 84 10.247 12.642 -47.340 1.00 0.00 H -ATOM 1329 HD2 LYS A 84 11.287 10.378 -47.436 1.00 0.00 H -ATOM 1330 HD3 LYS A 84 9.905 9.757 -48.307 1.00 0.00 H -ATOM 1331 HE2 LYS A 84 10.394 11.324 -50.221 1.00 0.00 H -ATOM 1332 HE3 LYS A 84 11.805 11.919 -49.366 1.00 0.00 H -ATOM 1333 HZ1 LYS A 84 12.361 10.233 -50.942 1.00 0.00 H -ATOM 1334 HZ2 LYS A 84 12.700 9.698 -49.419 1.00 0.00 H -ATOM 1335 HZ3 LYS A 84 11.365 9.141 -50.210 1.00 0.00 H -ATOM 1336 H LYS A 84 8.231 14.438 -45.641 1.00 0.00 H -ATOM 1337 HA LYS A 84 7.336 12.777 -46.757 1.00 0.00 H +ATOM 1316 N LYN A 84 8.412 13.556 -45.179 1.00 64.62 N +ATOM 1317 CA LYN A 84 7.812 12.390 -45.854 1.00 64.42 C +ATOM 1318 C LYN A 84 6.641 11.863 -44.991 1.00 65.37 C +ATOM 1319 O LYN A 84 6.675 10.724 -44.518 1.00 65.17 O +ATOM 1320 CB LYN A 84 8.858 11.334 -46.306 1.00 0.00 C +ATOM 1321 CG LYN A 84 9.635 11.768 -47.567 1.00 0.00 C +ATOM 1322 CD LYN A 84 10.515 10.650 -48.158 1.00 0.00 C +ATOM 1323 CE LYN A 84 11.162 11.047 -49.496 1.00 0.00 C +ATOM 1324 NZ LYN A 84 11.959 9.944 -50.061 1.00 0.00 N1+ +ATOM 1325 HB2 LYN A 84 9.551 11.095 -45.499 1.00 0.00 H +ATOM 1326 HB3 LYN A 84 8.345 10.399 -46.538 1.00 0.00 H +ATOM 1327 HG2 LYN A 84 8.923 12.088 -48.330 1.00 0.00 H +ATOM 1328 HG3 LYN A 84 10.247 12.642 -47.340 1.00 0.00 H +ATOM 1329 HD2 LYN A 84 11.287 10.378 -47.436 1.00 0.00 H +ATOM 1330 HD3 LYN A 84 9.905 9.757 -48.307 1.00 0.00 H +ATOM 1331 HE2 LYN A 84 10.394 11.324 -50.221 1.00 0.00 H +ATOM 1332 HE3 LYN A 84 11.805 11.919 -49.366 1.00 0.00 H +ATOM 1334 HZ2 LYN A 84 12.700 9.698 -49.419 1.00 0.00 H +ATOM 1335 HZ3 LYN A 84 11.365 9.141 -50.210 1.00 0.00 H +ATOM 1336 H LYN A 84 8.231 14.438 -45.641 1.00 0.00 H +ATOM 1337 HA LYN A 84 7.336 12.777 -46.757 1.00 0.00 H ATOM 1338 N SER A 85 5.632 12.729 -44.797 1.00 59.44 N ATOM 1339 CA SER A 85 4.426 12.491 -43.995 1.00 57.90 C ATOM 1340 C SER A 85 3.307 13.433 -44.506 1.00 59.01 C @@ -1580,18 +1575,18 @@ ATOM 1579 HH12 ARG A 99 1.596 25.399 -18.281 1.00 0.00 H ATOM 1580 HH11 ARG A 99 0.485 24.586 -17.193 1.00 0.00 H ATOM 1581 HH22 ARG A 99 0.931 26.066 -20.330 1.00 0.00 H ATOM 1582 HH21 ARG A 99 -0.724 25.831 -20.858 1.00 0.00 H -ATOM 1583 N ASH A 100 -4.986 29.060 -21.844 1.00 32.33 N -ATOM 1584 CA ASH A 100 -4.413 30.339 -22.294 1.00 32.03 C -ATOM 1585 C ASH A 100 -5.473 31.462 -22.131 1.00 34.79 C -ATOM 1586 O ASH A 100 -5.070 32.591 -21.851 1.00 33.45 O -ATOM 1587 CB ASH A 100 -3.988 30.280 -23.788 1.00 34.09 C -ATOM 1588 CG ASH A 100 -2.780 29.378 -24.085 1.00 50.64 C -ATOM 1589 OD1 ASH A 100 -1.945 29.181 -23.175 1.00 52.94 O -ATOM 1590 OD2 ASH A 100 -2.714 28.900 -25.239 1.00 55.56 O1- -ATOM 1591 H ASH A 100 -5.527 28.554 -22.532 1.00 0.00 H -ATOM 1592 HA ASH A 100 -3.544 30.602 -21.685 1.00 0.00 H -ATOM 1593 HB2 ASH A 100 -4.829 29.957 -24.406 1.00 0.00 H -ATOM 1594 HB3 ASH A 100 -3.717 31.276 -24.145 1.00 0.00 H +ATOM 1583 N ASP A 100 -4.986 29.060 -21.844 1.00 32.33 N +ATOM 1584 CA ASP A 100 -4.413 30.339 -22.294 1.00 32.03 C +ATOM 1585 C ASP A 100 -5.473 31.462 -22.131 1.00 34.79 C +ATOM 1586 O ASP A 100 -5.070 32.591 -21.851 1.00 33.45 O +ATOM 1587 CB ASP A 100 -3.988 30.280 -23.788 1.00 34.09 C +ATOM 1588 CG ASP A 100 -2.780 29.378 -24.085 1.00 50.64 C +ATOM 1589 OD1 ASP A 100 -1.945 29.181 -23.175 1.00 52.94 O +ATOM 1590 OD2 ASP A 100 -2.714 28.900 -25.239 1.00 55.56 O1- +ATOM 1591 H ASP A 100 -5.527 28.554 -22.532 1.00 0.00 H +ATOM 1592 HA ASP A 100 -3.544 30.602 -21.685 1.00 0.00 H +ATOM 1593 HB2 ASP A 100 -4.829 29.957 -24.406 1.00 0.00 H +ATOM 1594 HB3 ASP A 100 -3.717 31.276 -24.145 1.00 0.00 H ATOM 1595 N TYR A 101 -6.781 31.168 -22.291 1.00 30.87 N ATOM 1596 CA TYR A 101 -7.867 32.157 -22.346 1.00 30.93 C ATOM 1597 C TYR A 101 -8.284 32.564 -20.908 1.00 31.61 C @@ -2152,18 +2147,18 @@ ATOM 2151 HH12 ARG A 134 -1.316 6.684 -25.615 1.00 0.00 H ATOM 2152 HH11 ARG A 134 -3.048 6.566 -25.825 1.00 0.00 H ATOM 2153 HH22 ARG A 134 -0.409 6.628 -23.525 1.00 0.00 H ATOM 2154 HH21 ARG A 134 -1.418 6.383 -22.124 1.00 0.00 H -ATOM 2155 N ASH A 135 -5.999 12.256 -22.865 1.00 25.28 N -ATOM 2156 CA ASH A 135 -5.348 13.574 -22.789 1.00 24.95 C -ATOM 2157 C ASH A 135 -6.410 14.672 -22.513 1.00 27.49 C -ATOM 2158 O ASH A 135 -6.297 15.759 -23.077 1.00 27.32 O -ATOM 2159 CB ASH A 135 -4.432 13.836 -24.022 1.00 0.00 C -ATOM 2160 CG ASH A 135 -3.477 15.031 -23.912 1.00 0.00 C -ATOM 2161 OD1 ASH A 135 -2.829 15.182 -22.852 1.00 0.00 O -ATOM 2162 OD2 ASH A 135 -3.372 15.768 -24.915 1.00 0.00 O1- -ATOM 2163 HB2 ASH A 135 -3.820 12.962 -24.234 1.00 0.00 H -ATOM 2164 HB3 ASH A 135 -5.060 13.972 -24.903 1.00 0.00 H -ATOM 2165 H ASH A 135 -6.946 12.255 -23.218 1.00 0.00 H -ATOM 2166 HA ASH A 135 -4.724 13.576 -21.892 1.00 0.00 H +ATOM 2155 N ASP A 135 -5.999 12.256 -22.865 1.00 25.28 N +ATOM 2156 CA ASP A 135 -5.348 13.574 -22.789 1.00 24.95 C +ATOM 2157 C ASP A 135 -6.410 14.672 -22.513 1.00 27.49 C +ATOM 2158 O ASP A 135 -6.297 15.759 -23.077 1.00 27.32 O +ATOM 2159 CB ASP A 135 -4.432 13.836 -24.022 1.00 0.00 C +ATOM 2160 CG ASP A 135 -3.477 15.031 -23.912 1.00 0.00 C +ATOM 2161 OD1 ASP A 135 -2.829 15.182 -22.852 1.00 0.00 O +ATOM 2162 OD2 ASP A 135 -3.372 15.768 -24.915 1.00 0.00 O1- +ATOM 2163 HB2 ASP A 135 -3.820 12.962 -24.234 1.00 0.00 H +ATOM 2164 HB3 ASP A 135 -5.060 13.972 -24.903 1.00 0.00 H +ATOM 2165 H ASP A 135 -6.946 12.255 -23.218 1.00 0.00 H +ATOM 2166 HA ASP A 135 -4.724 13.576 -21.892 1.00 0.00 H ATOM 2167 N LEU A 136 -7.444 14.418 -21.683 1.00 23.70 N ATOM 2168 CA LEU A 136 -8.511 15.399 -21.421 1.00 23.85 C ATOM 2169 C LEU A 136 -7.988 16.324 -20.291 1.00 29.77 C @@ -2295,18 +2290,18 @@ ATOM 2294 HD13 LEU A 143 -14.604 28.716 -24.016 1.00 0.00 H ATOM 2295 HD21 LEU A 143 -14.190 31.821 -24.707 1.00 0.00 H ATOM 2296 HD22 LEU A 143 -13.005 30.812 -23.880 1.00 0.00 H ATOM 2297 HD23 LEU A 143 -12.567 31.662 -25.361 1.00 0.00 H -ATOM 2298 N ASH A 144 -14.153 28.311 -29.112 1.00 33.70 N -ATOM 2299 CA ASH A 144 -14.479 28.845 -30.447 1.00 35.49 C -ATOM 2300 C ASH A 144 -15.050 30.277 -30.257 1.00 42.98 C -ATOM 2301 O ASH A 144 -14.546 31.218 -30.871 1.00 43.01 O -ATOM 2302 CB ASH A 144 -15.500 27.925 -31.172 1.00 38.24 C -ATOM 2303 CG ASH A 144 -15.751 28.302 -32.639 1.00 57.45 C -ATOM 2304 OD1 ASH A 144 -16.733 29.040 -32.882 1.00 62.50 O -ATOM 2305 OD2 ASH A 144 -14.946 27.855 -33.484 1.00 62.05 O1- -ATOM 2306 H ASH A 144 -14.901 27.814 -28.646 1.00 0.00 H -ATOM 2307 HA ASH A 144 -13.568 28.900 -31.045 1.00 0.00 H -ATOM 2308 HB2 ASH A 144 -15.147 26.894 -31.146 1.00 0.00 H -ATOM 2309 HB3 ASH A 144 -16.453 27.908 -30.641 1.00 0.00 H +ATOM 2298 N ASP A 144 -14.153 28.311 -29.112 1.00 33.70 N +ATOM 2299 CA ASP A 144 -14.479 28.845 -30.447 1.00 35.49 C +ATOM 2300 C ASP A 144 -15.050 30.277 -30.257 1.00 42.98 C +ATOM 2301 O ASP A 144 -14.546 31.218 -30.871 1.00 43.01 O +ATOM 2302 CB ASP A 144 -15.500 27.925 -31.172 1.00 38.24 C +ATOM 2303 CG ASP A 144 -15.751 28.302 -32.639 1.00 57.45 C +ATOM 2304 OD1 ASP A 144 -16.733 29.040 -32.882 1.00 62.50 O +ATOM 2305 OD2 ASP A 144 -14.946 27.855 -33.484 1.00 62.05 O1- +ATOM 2306 H ASP A 144 -14.901 27.814 -28.646 1.00 0.00 H +ATOM 2307 HA ASP A 144 -13.568 28.900 -31.045 1.00 0.00 H +ATOM 2308 HB2 ASP A 144 -15.147 26.894 -31.146 1.00 0.00 H +ATOM 2309 HB3 ASP A 144 -16.453 27.908 -30.641 1.00 0.00 H ATOM 2310 N ASN A 145 -16.070 30.400 -29.390 1.00 43.24 N ATOM 2311 CA ASN A 145 -16.727 31.642 -28.965 1.00 46.44 C ATOM 2312 C ASN A 145 -17.116 31.461 -27.475 1.00 51.69 C @@ -2321,42 +2316,41 @@ ATOM 2320 HB2 ASN A 145 -18.304 33.003 -29.609 1.00 0.00 H ATOM 2321 HB3 ASN A 145 -17.450 32.263 -30.919 1.00 0.00 H ATOM 2322 HD22 ASN A 145 -19.819 29.653 -31.324 1.00 0.00 H ATOM 2323 HD21 ASN A 145 -18.355 30.403 -31.900 1.00 0.00 H -ATOM 2324 N ASH A 146 -17.650 32.537 -26.873 1.00 52.34 N -ATOM 2325 CA ASH A 146 -18.063 32.657 -25.459 1.00 53.71 C -ATOM 2326 C ASH A 146 -19.101 31.578 -25.006 1.00 56.50 C -ATOM 2327 O ASH A 146 -19.232 31.390 -23.798 1.00 55.06 O -ATOM 2328 CB ASH A 146 -18.501 34.116 -25.132 1.00 59.25 C -ATOM 2329 CG ASH A 146 -19.814 34.636 -25.750 1.00 77.62 C -ATOM 2330 OD1 ASH A 146 -20.335 33.990 -26.685 1.00 79.51 O -ATOM 2331 OD2 ASH A 146 -20.262 35.704 -25.279 1.00 88.40 O1- -ATOM 2332 H ASH A 146 -17.766 33.382 -27.413 1.00 0.00 H -ATOM 2333 HA ASH A 146 -17.162 32.459 -24.873 1.00 0.00 H -ATOM 2334 HB2 ASH A 146 -18.588 34.224 -24.051 1.00 0.00 H -ATOM 2335 HB3 ASH A 146 -17.707 34.805 -25.423 1.00 0.00 H -ATOM 2336 N ARG A 147 -19.796 30.884 -25.931 1.00 52.42 N -ATOM 2337 CA ARG A 147 -20.836 29.881 -25.643 1.00 52.12 C -ATOM 2338 C ARG A 147 -20.595 28.585 -26.473 1.00 53.91 C -ATOM 2339 O ARG A 147 -21.554 27.828 -26.636 1.00 54.42 O -ATOM 2340 CB ARG A 147 -22.243 30.516 -25.847 1.00 56.06 C -ATOM 2341 CG ARG A 147 -22.626 31.660 -24.878 1.00 68.03 C -ATOM 2342 CD ARG A 147 -22.699 31.239 -23.400 1.00 74.26 C -ATOM 2343 NE ARG A 147 -23.154 32.336 -22.532 1.00 83.22 N -ATOM 2344 CZ ARG A 147 -24.411 32.575 -22.127 1.00103.41 C -ATOM 2345 NH1 ARG A 147 -25.446 31.815 -22.499 1.00 95.23 N -ATOM 2346 NH2 ARG A 147 -24.638 33.607 -21.313 1.00 92.56 N1+ -ATOM 2347 H ARG A 147 -19.634 31.080 -26.910 1.00 0.00 H -ATOM 2348 HA ARG A 147 -20.751 29.539 -24.610 1.00 0.00 H -ATOM 2349 HB2 ARG A 147 -22.318 30.889 -26.870 1.00 0.00 H -ATOM 2350 HB3 ARG A 147 -23.012 29.747 -25.763 1.00 0.00 H -ATOM 2351 HG2 ARG A 147 -21.929 32.491 -24.988 1.00 0.00 H -ATOM 2352 HG3 ARG A 147 -23.598 32.052 -25.181 1.00 0.00 H -ATOM 2353 HD2 ARG A 147 -23.370 30.393 -23.283 1.00 0.00 H -ATOM 2354 HD3 ARG A 147 -21.725 30.912 -23.040 1.00 0.00 H -ATOM 2355 HE ARG A 147 -22.430 32.960 -22.203 1.00 0.00 H -ATOM 2356 HH12 ARG A 147 -26.376 32.025 -22.170 1.00 0.00 H -ATOM 2357 HH11 ARG A 147 -25.304 31.037 -23.133 1.00 0.00 H -ATOM 2358 HH22 ARG A 147 -25.572 33.797 -20.983 1.00 0.00 H -ATOM 2359 HH21 ARG A 147 -23.871 34.195 -21.024 1.00 0.00 H +ATOM 2324 N ASP A 146 -17.650 32.537 -26.873 1.00 52.34 N +ATOM 2325 CA ASP A 146 -18.063 32.657 -25.459 1.00 53.71 C +ATOM 2326 C ASP A 146 -19.101 31.578 -25.006 1.00 56.50 C +ATOM 2327 O ASP A 146 -19.232 31.390 -23.798 1.00 55.06 O +ATOM 2328 CB ASP A 146 -18.501 34.116 -25.132 1.00 59.25 C +ATOM 2329 CG ASP A 146 -19.814 34.636 -25.750 1.00 77.62 C +ATOM 2330 OD1 ASP A 146 -20.335 33.990 -26.685 1.00 79.51 O +ATOM 2331 OD2 ASP A 146 -20.262 35.704 -25.279 1.00 88.40 O1- +ATOM 2332 H ASP A 146 -17.766 33.382 -27.413 1.00 0.00 H +ATOM 2333 HA ASP A 146 -17.162 32.459 -24.873 1.00 0.00 H +ATOM 2334 HB2 ASP A 146 -18.588 34.224 -24.051 1.00 0.00 H +ATOM 2335 HB3 ASP A 146 -17.707 34.805 -25.423 1.00 0.00 H +ATOM 2336 N ARN A 147 -19.796 30.884 -25.931 1.00 52.42 N +ATOM 2337 CA ARN A 147 -20.836 29.881 -25.643 1.00 52.12 C +ATOM 2338 C ARN A 147 -20.595 28.585 -26.473 1.00 53.91 C +ATOM 2339 O ARN A 147 -21.554 27.828 -26.636 1.00 54.42 O +ATOM 2340 CB ARN A 147 -22.243 30.516 -25.847 1.00 56.06 C +ATOM 2341 CG ARN A 147 -22.626 31.660 -24.878 1.00 68.03 C +ATOM 2342 CD ARN A 147 -22.699 31.239 -23.400 1.00 74.26 C +ATOM 2343 NE ARN A 147 -23.154 32.336 -22.532 1.00 83.22 N +ATOM 2344 CZ ARN A 147 -24.411 32.575 -22.127 1.00103.41 C +ATOM 2345 NH1 ARN A 147 -25.446 31.815 -22.499 1.00 95.23 N +ATOM 2346 NH2 ARN A 147 -24.638 33.607 -21.313 1.00 92.56 N1+ +ATOM 2347 H ARN A 147 -19.634 31.080 -26.910 1.00 0.00 H +ATOM 2348 HA ARN A 147 -20.751 29.539 -24.610 1.00 0.00 H +ATOM 2349 HB2 ARN A 147 -22.318 30.889 -26.870 1.00 0.00 H +ATOM 2350 HB3 ARN A 147 -23.012 29.747 -25.763 1.00 0.00 H +ATOM 2351 HG2 ARN A 147 -21.929 32.491 -24.988 1.00 0.00 H +ATOM 2352 HG3 ARN A 147 -23.598 32.052 -25.181 1.00 0.00 H +ATOM 2353 HD2 ARN A 147 -23.370 30.393 -23.283 1.00 0.00 H +ATOM 2354 HD3 ARN A 147 -21.725 30.912 -23.040 1.00 0.00 H +ATOM 2355 HE ARN A 147 -22.430 32.960 -22.203 1.00 0.00 H +ATOM 2356 HH12 ARN A 147 -26.376 32.025 -22.170 1.00 0.00 H +ATOM 2357 HH11 ARN A 147 -25.304 31.037 -23.133 1.00 0.00 H +ATOM 2359 HH21 ARN A 147 -23.871 34.195 -21.024 1.00 0.00 H ATOM 2360 N LEU A 148 -19.366 28.310 -26.969 1.00 47.46 N ATOM 2361 CA LEU A 148 -19.034 27.112 -27.765 1.00 44.95 C ATOM 2362 C LEU A 148 -17.585 26.705 -27.427 1.00 44.87 C @@ -2440,18 +2434,18 @@ ATOM 2439 O GLY A 152 -7.577 17.617 -27.826 1.00 40.24 O ATOM 2440 H GLY A 152 -9.475 19.340 -27.754 1.00 0.00 H ATOM 2441 HA2 GLY A 152 -8.941 18.389 -30.548 1.00 0.00 H ATOM 2442 HA3 GLY A 152 -8.209 19.844 -29.897 1.00 0.00 H -ATOM 2443 N ASH A 153 -6.490 17.690 -29.818 1.00 37.60 N -ATOM 2444 CA ASH A 153 -5.267 16.912 -29.535 1.00 37.19 C -ATOM 2445 C ASH A 153 -5.663 15.444 -29.250 1.00 39.90 C -ATOM 2446 O ASH A 153 -5.839 15.070 -28.090 1.00 40.83 O -ATOM 2447 CB ASH A 153 -4.290 17.535 -28.493 1.00 38.16 C -ATOM 2448 CG ASH A 153 -2.826 17.053 -28.595 1.00 45.68 C -ATOM 2449 OD1 ASH A 153 -1.944 17.826 -28.164 1.00 47.53 O -ATOM 2450 OD2 ASH A 153 -2.584 15.940 -29.115 1.00 46.86 O1- -ATOM 2451 H ASH A 153 -6.557 18.004 -30.776 1.00 0.00 H -ATOM 2452 HA ASH A 153 -4.734 16.919 -30.489 1.00 0.00 H -ATOM 2453 HB2 ASH A 153 -4.283 18.615 -28.627 1.00 0.00 H -ATOM 2454 HB3 ASH A 153 -4.639 17.368 -27.473 1.00 0.00 H +ATOM 2443 N ASP A 153 -6.490 17.690 -29.818 1.00 37.60 N +ATOM 2444 CA ASP A 153 -5.267 16.912 -29.535 1.00 37.19 C +ATOM 2445 C ASP A 153 -5.663 15.444 -29.250 1.00 39.90 C +ATOM 2446 O ASP A 153 -5.839 15.070 -28.090 1.00 40.83 O +ATOM 2447 CB ASP A 153 -4.290 17.535 -28.493 1.00 38.16 C +ATOM 2448 CG ASP A 153 -2.826 17.053 -28.595 1.00 45.68 C +ATOM 2449 OD1 ASP A 153 -1.944 17.826 -28.164 1.00 47.53 O +ATOM 2450 OD2 ASP A 153 -2.584 15.940 -29.115 1.00 46.86 O1- +ATOM 2451 H ASP A 153 -6.557 18.004 -30.776 1.00 0.00 H +ATOM 2452 HA ASP A 153 -4.734 16.919 -30.489 1.00 0.00 H +ATOM 2453 HB2 ASP A 153 -4.283 18.615 -28.627 1.00 0.00 H +ATOM 2454 HB3 ASP A 153 -4.639 17.368 -27.473 1.00 0.00 H ATOM 2455 N PHE A 154 -5.785 14.649 -30.326 1.00 32.99 N ATOM 2456 CA PHE A 154 -6.101 13.212 -30.302 1.00 32.48 C ATOM 2457 C PHE A 154 -4.786 12.414 -30.538 1.00 35.62 C @@ -2508,28 +2502,27 @@ ATOM 2507 HA ALA A 157 -6.827 8.671 -27.556 1.00 0.00 H ATOM 2508 HB1 ALA A 157 -8.232 9.256 -29.526 1.00 0.00 H ATOM 2509 HB2 ALA A 157 -7.326 10.664 -29.008 1.00 0.00 H ATOM 2510 HB3 ALA A 157 -6.814 9.760 -30.436 1.00 0.00 H -ATOM 2511 N LYS A 158 -6.989 6.424 -28.708 1.00 39.67 N -ATOM 2512 CA LYS A 158 -6.879 4.992 -29.000 1.00 41.51 C -ATOM 2513 C LYS A 158 -8.303 4.428 -29.133 1.00 46.70 C -ATOM 2514 O LYS A 158 -9.189 4.789 -28.359 1.00 45.21 O -ATOM 2515 CB LYS A 158 -6.052 4.285 -27.893 1.00 43.95 C -ATOM 2516 CG LYS A 158 -4.532 4.247 -28.149 1.00 52.94 C -ATOM 2517 CD LYS A 158 -4.086 3.490 -29.419 1.00 61.30 C -ATOM 2518 CE LYS A 158 -4.796 2.141 -29.659 1.00 72.46 C -ATOM 2519 NZ LYS A 158 -4.248 1.430 -30.826 1.00 80.50 N1+ -ATOM 2520 H LYS A 158 -7.709 6.682 -28.046 1.00 0.00 H -ATOM 2521 HA LYS A 158 -6.403 4.860 -29.975 1.00 0.00 H -ATOM 2522 HB2 LYS A 158 -6.232 4.766 -26.929 1.00 0.00 H -ATOM 2523 HB3 LYS A 158 -6.399 3.261 -27.743 1.00 0.00 H -ATOM 2524 HG2 LYS A 158 -4.139 5.264 -28.181 1.00 0.00 H -ATOM 2525 HG3 LYS A 158 -4.057 3.791 -27.286 1.00 0.00 H -ATOM 2526 HD2 LYS A 158 -4.241 4.143 -30.277 1.00 0.00 H -ATOM 2527 HD3 LYS A 158 -3.007 3.334 -29.364 1.00 0.00 H -ATOM 2528 HE2 LYS A 158 -4.710 1.499 -28.785 1.00 0.00 H -ATOM 2529 HE3 LYS A 158 -5.861 2.290 -29.835 1.00 0.00 H -ATOM 2530 HZ1 LYS A 158 -4.751 0.565 -30.963 1.00 0.00 H -ATOM 2531 HZ2 LYS A 158 -4.358 2.016 -31.645 1.00 0.00 H -ATOM 2532 HZ3 LYS A 158 -3.269 1.232 -30.677 1.00 0.00 H +ATOM 2511 N LYN A 158 -6.989 6.424 -28.708 1.00 39.67 N +ATOM 2512 CA LYN A 158 -6.879 4.992 -29.000 1.00 41.51 C +ATOM 2513 C LYN A 158 -8.303 4.428 -29.133 1.00 46.70 C +ATOM 2514 O LYN A 158 -9.189 4.789 -28.359 1.00 45.21 O +ATOM 2515 CB LYN A 158 -6.052 4.285 -27.893 1.00 43.95 C +ATOM 2516 CG LYN A 158 -4.532 4.247 -28.149 1.00 52.94 C +ATOM 2517 CD LYN A 158 -4.086 3.490 -29.419 1.00 61.30 C +ATOM 2518 CE LYN A 158 -4.796 2.141 -29.659 1.00 72.46 C +ATOM 2519 NZ LYN A 158 -4.248 1.430 -30.826 1.00 80.50 N1+ +ATOM 2520 H LYN A 158 -7.709 6.682 -28.046 1.00 0.00 H +ATOM 2521 HA LYN A 158 -6.403 4.860 -29.975 1.00 0.00 H +ATOM 2522 HB2 LYN A 158 -6.232 4.766 -26.929 1.00 0.00 H +ATOM 2523 HB3 LYN A 158 -6.399 3.261 -27.743 1.00 0.00 H +ATOM 2524 HG2 LYN A 158 -4.139 5.264 -28.181 1.00 0.00 H +ATOM 2525 HG3 LYN A 158 -4.057 3.791 -27.286 1.00 0.00 H +ATOM 2526 HD2 LYN A 158 -4.241 4.143 -30.277 1.00 0.00 H +ATOM 2527 HD3 LYN A 158 -3.007 3.334 -29.364 1.00 0.00 H +ATOM 2528 HE2 LYN A 158 -4.710 1.499 -28.785 1.00 0.00 H +ATOM 2529 HE3 LYN A 158 -5.861 2.290 -29.835 1.00 0.00 H +ATOM 2531 HZ2 LYN A 158 -4.358 2.016 -31.645 1.00 0.00 H +ATOM 2532 HZ3 LYN A 158 -3.269 1.232 -30.677 1.00 0.00 H ATOM 2533 N ALA A 159 -8.460 3.464 -30.060 1.00 45.97 N ATOM 2534 CA ALA A 159 -9.658 2.635 -30.236 1.00 47.89 C ATOM 2535 C ALA A 159 -9.557 1.487 -29.204 1.00 53.43 C @@ -2570,21 +2563,21 @@ ATOM 2569 HG2 PRO A 161 -9.216 -4.570 -28.665 1.00 0.00 H ATOM 2570 HG3 PRO A 161 -9.569 -3.591 -30.088 1.00 0.00 H ATOM 2571 HD3 PRO A 161 -9.232 -1.893 -28.492 1.00 0.00 H ATOM 2572 HD2 PRO A 161 -10.000 -2.809 -27.186 1.00 0.00 H -ATOM 2573 N GLU A 162 -14.633 -3.559 -29.246 1.00 75.69 N -ATOM 2574 CA GLU A 162 -16.039 -3.692 -28.809 1.00 77.51 C -ATOM 2575 C GLU A 162 -16.271 -4.784 -27.721 1.00 84.15 C -ATOM 2576 O GLU A 162 -17.216 -4.634 -26.946 1.00 83.15 O -ATOM 2577 CB GLU A 162 -16.982 -3.857 -30.033 1.00 82.22 C -ATOM 2578 CG GLU A 162 -16.781 -5.102 -30.944 1.00 97.93 C -ATOM 2579 CD GLU A 162 -15.581 -5.076 -31.908 1.00120.70 C -ATOM 2580 OE1 GLU A 162 -14.946 -4.007 -32.055 1.00108.26 O -ATOM 2581 OE2 GLU A 162 -15.322 -6.147 -32.497 1.00119.67 O1- -ATOM 2582 H GLU A 162 -14.515 -3.576 -30.254 1.00 0.00 H -ATOM 2583 HA GLU A 162 -16.301 -2.741 -28.343 1.00 0.00 H -ATOM 2584 HB2 GLU A 162 -18.013 -3.869 -29.673 1.00 0.00 H -ATOM 2585 HB3 GLU A 162 -16.928 -2.951 -30.640 1.00 0.00 H -ATOM 2586 HG2 GLU A 162 -16.726 -6.006 -30.337 1.00 0.00 H -ATOM 2587 HG3 GLU A 162 -17.669 -5.219 -31.566 1.00 0.00 H +ATOM 2573 N GLH A 162 -14.633 -3.559 -29.246 1.00 75.69 N +ATOM 2574 CA GLH A 162 -16.039 -3.692 -28.809 1.00 77.51 C +ATOM 2575 C GLH A 162 -16.271 -4.784 -27.721 1.00 84.15 C +ATOM 2576 O GLH A 162 -17.216 -4.634 -26.946 1.00 83.15 O +ATOM 2577 CB GLH A 162 -16.982 -3.857 -30.033 1.00 82.22 C +ATOM 2578 CG GLH A 162 -16.781 -5.102 -30.944 1.00 97.93 C +ATOM 2579 CD GLH A 162 -15.581 -5.076 -31.908 1.00120.70 C +ATOM 2580 OE1 GLH A 162 -14.946 -4.007 -32.055 1.00108.26 O +ATOM 2581 OE2 GLH A 162 -15.322 -6.147 -32.497 1.00119.67 O1- +ATOM 2582 H GLH A 162 -14.515 -3.576 -30.254 1.00 0.00 H +ATOM 2583 HA GLH A 162 -16.301 -2.741 -28.343 1.00 0.00 H +ATOM 2584 HB2 GLH A 162 -18.013 -3.869 -29.673 1.00 0.00 H +ATOM 2585 HB3 GLH A 162 -16.928 -2.951 -30.640 1.00 0.00 H +ATOM 2586 HG2 GLH A 162 -16.726 -6.006 -30.337 1.00 0.00 H +ATOM 2587 HG3 GLH A 162 -17.669 -5.219 -31.566 1.00 0.00 H ATOM 2588 N GLY A 163 -15.410 -5.820 -27.645 1.00 83.36 N ATOM 2589 CA GLY A 163 -15.444 -6.876 -26.620 1.00 84.58 C ATOM 2590 C GLY A 163 -14.607 -6.559 -25.358 1.00 86.36 C @@ -2609,21 +2602,21 @@ ATOM 2608 HB3 HID A 164 -10.962 -4.171 -24.027 1.00 0.00 H ATOM 2609 HD1 HID A 164 -12.079 -6.686 -26.737 1.00 0.00 H ATOM 2610 HD2 HID A 164 -8.754 -5.811 -24.300 1.00 0.00 H ATOM 2611 HE1 HID A 164 -10.266 -8.382 -27.228 1.00 0.00 H -ATOM 2612 N GLU A 165 -13.313 -3.436 -22.393 1.00 70.38 N -ATOM 2613 CA GLU A 165 -13.685 -2.214 -21.661 1.00 67.41 C -ATOM 2614 C GLU A 165 -12.425 -1.357 -21.344 1.00 65.39 C -ATOM 2615 O GLU A 165 -12.603 -0.306 -20.726 1.00 62.86 O -ATOM 2616 CB GLU A 165 -14.502 -2.583 -20.387 1.00 69.51 C -ATOM 2617 CG GLU A 165 -13.772 -3.298 -19.217 1.00 81.78 C -ATOM 2618 CD GLU A 165 -13.478 -4.787 -19.443 1.00109.48 C -ATOM 2619 OE1 GLU A 165 -12.528 -5.081 -20.201 1.00107.26 O -ATOM 2620 OE2 GLU A 165 -14.200 -5.609 -18.838 1.00107.68 O1- -ATOM 2621 H GLU A 165 -12.760 -4.100 -21.861 1.00 0.00 H -ATOM 2622 HA GLU A 165 -14.326 -1.586 -22.284 1.00 0.00 H -ATOM 2623 HB2 GLU A 165 -14.933 -1.663 -19.989 1.00 0.00 H -ATOM 2624 HB3 GLU A 165 -15.370 -3.174 -20.685 1.00 0.00 H -ATOM 2625 HG2 GLU A 165 -12.841 -2.787 -18.980 1.00 0.00 H -ATOM 2626 HG3 GLU A 165 -14.383 -3.207 -18.317 1.00 0.00 H +ATOM 2612 N GLH A 165 -13.313 -3.436 -22.393 1.00 70.38 N +ATOM 2613 CA GLH A 165 -13.685 -2.214 -21.661 1.00 67.41 C +ATOM 2614 C GLH A 165 -12.425 -1.357 -21.344 1.00 65.39 C +ATOM 2615 O GLH A 165 -12.603 -0.306 -20.726 1.00 62.86 O +ATOM 2616 CB GLH A 165 -14.502 -2.583 -20.387 1.00 69.51 C +ATOM 2617 CG GLH A 165 -13.772 -3.298 -19.217 1.00 81.78 C +ATOM 2618 CD GLH A 165 -13.478 -4.787 -19.443 1.00109.48 C +ATOM 2619 OE1 GLH A 165 -12.528 -5.081 -20.201 1.00107.26 O +ATOM 2620 OE2 GLH A 165 -14.200 -5.609 -18.838 1.00107.68 O1- +ATOM 2621 H GLH A 165 -12.760 -4.100 -21.861 1.00 0.00 H +ATOM 2622 HA GLH A 165 -14.326 -1.586 -22.284 1.00 0.00 H +ATOM 2623 HB2 GLH A 165 -14.933 -1.663 -19.989 1.00 0.00 H +ATOM 2624 HB3 GLH A 165 -15.370 -3.174 -20.685 1.00 0.00 H +ATOM 2625 HG2 GLH A 165 -12.841 -2.787 -18.980 1.00 0.00 H +ATOM 2626 HG3 GLH A 165 -14.383 -3.207 -18.317 1.00 0.00 H ATOM 2627 N TYR A 166 -11.201 -1.778 -21.738 1.00 59.91 N ATOM 2628 CA TYR A 166 -9.938 -1.058 -21.497 1.00 57.06 C ATOM 2629 C TYR A 166 -8.932 -1.332 -22.640 1.00 59.88 C @@ -2666,30 +2659,29 @@ ATOM 2665 HD2 TYR A 167 -4.936 2.577 -24.002 1.00 0.00 H ATOM 2666 HE1 TYR A 167 -3.177 -0.479 -27.528 1.00 0.00 H ATOM 2667 HE2 TYR A 167 -2.730 3.029 -25.039 1.00 0.00 H ATOM 2668 HH TYR A 167 -1.160 2.331 -26.569 1.00 0.00 H -ATOM 2669 N ARG A 168 -4.437 -1.321 -22.549 1.00 56.46 N -ATOM 2670 CA ARG A 168 -3.184 -1.225 -21.779 1.00 57.19 C -ATOM 2671 C ARG A 168 -2.304 -0.150 -22.464 1.00 61.89 C -ATOM 2672 O ARG A 168 -2.017 -0.249 -23.658 1.00 62.29 O -ATOM 2673 CB ARG A 168 -2.419 -2.575 -21.774 1.00 60.29 C -ATOM 2674 CG ARG A 168 -2.816 -3.513 -20.618 1.00 71.82 C -ATOM 2675 CD ARG A 168 -1.895 -4.744 -20.536 1.00 85.08 C -ATOM 2676 NE ARG A 168 -2.132 -5.546 -19.325 1.00 93.43 N -ATOM 2677 CZ ARG A 168 -3.116 -6.435 -19.121 1.00108.81 C -ATOM 2678 NH1 ARG A 168 -4.069 -6.661 -20.029 1.00 96.57 N -ATOM 2679 NH2 ARG A 168 -3.141 -7.121 -17.977 1.00 96.30 N1+ -ATOM 2680 H ARG A 168 -4.451 -2.008 -23.289 1.00 0.00 H -ATOM 2681 HA ARG A 168 -3.416 -0.937 -20.755 1.00 0.00 H -ATOM 2682 HB2 ARG A 168 -2.535 -3.089 -22.730 1.00 0.00 H -ATOM 2683 HB3 ARG A 168 -1.346 -2.392 -21.674 1.00 0.00 H -ATOM 2684 HG2 ARG A 168 -2.764 -2.965 -19.675 1.00 0.00 H -ATOM 2685 HG3 ARG A 168 -3.854 -3.821 -20.739 1.00 0.00 H -ATOM 2686 HD2 ARG A 168 -2.011 -5.372 -21.420 1.00 0.00 H -ATOM 2687 HD3 ARG A 168 -0.851 -4.429 -20.517 1.00 0.00 H -ATOM 2688 HE ARG A 168 -1.450 -5.431 -18.591 1.00 0.00 H -ATOM 2689 HH12 ARG A 168 -4.818 -7.310 -19.838 1.00 0.00 H -ATOM 2690 HH11 ARG A 168 -4.050 -6.161 -20.904 1.00 0.00 H -ATOM 2691 HH22 ARG A 168 -3.856 -7.816 -17.826 1.00 0.00 H -ATOM 2692 HH21 ARG A 168 -2.393 -7.014 -17.308 1.00 0.00 H +ATOM 2669 N ARN A 168 -4.437 -1.321 -22.549 1.00 56.46 N +ATOM 2670 CA ARN A 168 -3.184 -1.225 -21.779 1.00 57.19 C +ATOM 2671 C ARN A 168 -2.304 -0.150 -22.464 1.00 61.89 C +ATOM 2672 O ARN A 168 -2.017 -0.249 -23.658 1.00 62.29 O +ATOM 2673 CB ARN A 168 -2.419 -2.575 -21.774 1.00 60.29 C +ATOM 2674 CG ARN A 168 -2.816 -3.513 -20.618 1.00 71.82 C +ATOM 2675 CD ARN A 168 -1.895 -4.744 -20.536 1.00 85.08 C +ATOM 2676 NE ARN A 168 -2.132 -5.546 -19.325 1.00 93.43 N +ATOM 2677 CZ ARN A 168 -3.116 -6.435 -19.121 1.00108.81 C +ATOM 2678 NH1 ARN A 168 -4.069 -6.661 -20.029 1.00 96.57 N +ATOM 2679 NH2 ARN A 168 -3.141 -7.121 -17.977 1.00 96.30 N1+ +ATOM 2680 H ARN A 168 -4.451 -2.008 -23.289 1.00 0.00 H +ATOM 2681 HA ARN A 168 -3.416 -0.937 -20.755 1.00 0.00 H +ATOM 2682 HB2 ARN A 168 -2.535 -3.089 -22.730 1.00 0.00 H +ATOM 2683 HB3 ARN A 168 -1.346 -2.392 -21.674 1.00 0.00 H +ATOM 2684 HG2 ARN A 168 -2.764 -2.965 -19.675 1.00 0.00 H +ATOM 2685 HG3 ARN A 168 -3.854 -3.821 -20.739 1.00 0.00 H +ATOM 2686 HD2 ARN A 168 -2.011 -5.372 -21.420 1.00 0.00 H +ATOM 2687 HD3 ARN A 168 -0.851 -4.429 -20.517 1.00 0.00 H +ATOM 2688 HE ARN A 168 -1.450 -5.431 -18.591 1.00 0.00 H +ATOM 2689 HH12 ARN A 168 -4.818 -7.310 -19.838 1.00 0.00 H +ATOM 2690 HH11 ARN A 168 -4.050 -6.161 -20.904 1.00 0.00 H +ATOM 2692 HH21 ARN A 168 -2.393 -7.014 -17.308 1.00 0.00 H ATOM 2693 N VAL A 169 -1.849 0.817 -21.649 1.00 58.85 N ATOM 2694 CA VAL A 169 -0.914 1.893 -22.013 1.00 59.44 C ATOM 2695 C VAL A 169 0.523 1.437 -21.626 1.00 68.20 C @@ -2706,57 +2698,56 @@ ATOM 2705 HG13 VAL A 169 -3.402 2.911 -20.978 1.00 0.00 H ATOM 2706 HG21 VAL A 169 -1.140 4.304 -19.351 1.00 0.00 H ATOM 2707 HG22 VAL A 169 -1.474 2.598 -19.164 1.00 0.00 H ATOM 2708 HG23 VAL A 169 0.152 3.146 -19.548 1.00 0.00 H -ATOM 2709 N ARG A 170 1.515 2.157 -22.179 1.00 67.56 N -ATOM 2710 CA ARG A 170 2.953 1.943 -21.951 1.00 70.37 C -ATOM 2711 C ARG A 170 3.397 2.847 -20.769 1.00 74.80 C -ATOM 2712 O ARG A 170 2.739 3.835 -20.429 1.00 72.29 O -ATOM 2713 CB ARG A 170 3.726 2.379 -23.223 1.00 73.21 C -ATOM 2714 CG ARG A 170 3.368 1.571 -24.487 1.00 89.24 C -ATOM 2715 CD ARG A 170 4.293 1.888 -25.674 1.00105.70 C -ATOM 2716 NE ARG A 170 3.750 1.355 -26.935 1.00119.40 N -ATOM 2717 CZ ARG A 170 2.903 1.985 -27.765 1.00134.49 C -ATOM 2718 NH1 ARG A 170 2.456 3.222 -27.527 1.00120.12 N -ATOM 2719 NH2 ARG A 170 2.494 1.364 -28.871 1.00122.85 N1+ -ATOM 2720 H ARG A 170 1.281 2.947 -22.760 1.00 0.00 H -ATOM 2721 HA ARG A 170 3.164 0.894 -21.724 1.00 0.00 H -ATOM 2722 HB2 ARG A 170 3.571 3.442 -23.422 1.00 0.00 H -ATOM 2723 HB3 ARG A 170 4.797 2.266 -23.042 1.00 0.00 H -ATOM 2724 HG2 ARG A 170 3.411 0.502 -24.273 1.00 0.00 H -ATOM 2725 HG3 ARG A 170 2.334 1.786 -24.761 1.00 0.00 H -ATOM 2726 HD2 ARG A 170 4.440 2.963 -25.775 1.00 0.00 H -ATOM 2727 HD3 ARG A 170 5.282 1.459 -25.506 1.00 0.00 H -ATOM 2728 HE ARG A 170 4.052 0.426 -27.188 1.00 0.00 H -ATOM 2729 HH12 ARG A 170 1.853 3.682 -28.199 1.00 0.00 H -ATOM 2730 HH11 ARG A 170 2.764 3.715 -26.704 1.00 0.00 H -ATOM 2731 HH22 ARG A 170 1.866 1.835 -29.505 1.00 0.00 H -ATOM 2732 HH21 ARG A 170 2.818 0.433 -29.082 1.00 0.00 H -ATOM 2733 N GLU A 171 4.581 2.517 -20.220 1.00 74.50 N -ATOM 2734 CA GLU A 171 5.343 3.328 -19.256 1.00 74.23 C -ATOM 2735 C GLU A 171 6.081 4.383 -20.117 1.00 77.46 C -ATOM 2736 O GLU A 171 6.951 4.027 -20.916 1.00 79.77 O -ATOM 2737 CB GLU A 171 6.355 2.413 -18.519 1.00 78.25 C -ATOM 2738 CG GLU A 171 5.678 1.358 -17.609 1.00 89.76 C -ATOM 2739 CD GLU A 171 6.611 0.280 -17.038 1.00113.50 C -ATOM 2740 OE1 GLU A 171 7.848 0.440 -17.136 1.00107.60 O -ATOM 2741 OE2 GLU A 171 6.055 -0.704 -16.500 1.00107.56 O1- -ATOM 2742 H GLU A 171 5.071 1.707 -20.570 1.00 0.00 H -ATOM 2743 HA GLU A 171 4.680 3.805 -18.530 1.00 0.00 H -ATOM 2744 HB2 GLU A 171 7.001 1.910 -19.243 1.00 0.00 H -ATOM 2745 HB3 GLU A 171 7.018 3.028 -17.906 1.00 0.00 H -ATOM 2746 HG2 GLU A 171 5.195 1.864 -16.775 1.00 0.00 H -ATOM 2747 HG3 GLU A 171 4.886 0.843 -18.154 1.00 0.00 H -ATOM 2748 N ASH A 172 5.673 5.657 -19.967 1.00 70.23 N -ATOM 2749 CA ASH A 172 6.059 6.764 -20.853 1.00 68.85 C -ATOM 2750 C ASH A 172 6.083 8.053 -19.985 1.00 68.50 C -ATOM 2751 O ASH A 172 5.207 8.253 -19.138 1.00 66.16 O -ATOM 2752 CB ASH A 172 5.214 6.760 -22.168 1.00 69.42 C -ATOM 2753 CG ASH A 172 5.100 8.083 -22.934 1.00 81.45 C -ATOM 2754 OD1 ASH A 172 4.262 8.915 -22.526 1.00 81.04 O -ATOM 2755 OD2 ASH A 172 5.864 8.237 -23.912 1.00 89.83 O1- -ATOM 2756 H ASH A 172 4.961 5.874 -19.284 1.00 0.00 H -ATOM 2757 HA ASH A 172 7.098 6.594 -21.150 1.00 0.00 H -ATOM 2758 HB2 ASH A 172 5.594 5.991 -22.843 1.00 0.00 H -ATOM 2759 HB3 ASH A 172 4.193 6.449 -21.936 1.00 0.00 H +ATOM 2709 N ARN A 170 1.515 2.157 -22.179 1.00 67.56 N +ATOM 2710 CA ARN A 170 2.953 1.943 -21.951 1.00 70.37 C +ATOM 2711 C ARN A 170 3.397 2.847 -20.769 1.00 74.80 C +ATOM 2712 O ARN A 170 2.739 3.835 -20.429 1.00 72.29 O +ATOM 2713 CB ARN A 170 3.726 2.379 -23.223 1.00 73.21 C +ATOM 2714 CG ARN A 170 3.368 1.571 -24.487 1.00 89.24 C +ATOM 2715 CD ARN A 170 4.293 1.888 -25.674 1.00105.70 C +ATOM 2716 NE ARN A 170 3.750 1.355 -26.935 1.00119.40 N +ATOM 2717 CZ ARN A 170 2.903 1.985 -27.765 1.00134.49 C +ATOM 2718 NH1 ARN A 170 2.456 3.222 -27.527 1.00120.12 N +ATOM 2719 NH2 ARN A 170 2.494 1.364 -28.871 1.00122.85 N1+ +ATOM 2720 H ARN A 170 1.281 2.947 -22.760 1.00 0.00 H +ATOM 2721 HA ARN A 170 3.164 0.894 -21.724 1.00 0.00 H +ATOM 2722 HB2 ARN A 170 3.571 3.442 -23.422 1.00 0.00 H +ATOM 2723 HB3 ARN A 170 4.797 2.266 -23.042 1.00 0.00 H +ATOM 2724 HG2 ARN A 170 3.411 0.502 -24.273 1.00 0.00 H +ATOM 2725 HG3 ARN A 170 2.334 1.786 -24.761 1.00 0.00 H +ATOM 2726 HD2 ARN A 170 4.440 2.963 -25.775 1.00 0.00 H +ATOM 2727 HD3 ARN A 170 5.282 1.459 -25.506 1.00 0.00 H +ATOM 2728 HE ARN A 170 4.052 0.426 -27.188 1.00 0.00 H +ATOM 2729 HH12 ARN A 170 1.853 3.682 -28.199 1.00 0.00 H +ATOM 2730 HH11 ARN A 170 2.764 3.715 -26.704 1.00 0.00 H +ATOM 2732 HH21 ARN A 170 2.818 0.433 -29.082 1.00 0.00 H +ATOM 2733 N GLH A 171 4.581 2.517 -20.220 1.00 74.50 N +ATOM 2734 CA GLH A 171 5.343 3.328 -19.256 1.00 74.23 C +ATOM 2735 C GLH A 171 6.081 4.383 -20.117 1.00 77.46 C +ATOM 2736 O GLH A 171 6.951 4.027 -20.916 1.00 79.77 O +ATOM 2737 CB GLH A 171 6.355 2.413 -18.519 1.00 78.25 C +ATOM 2738 CG GLH A 171 5.678 1.358 -17.609 1.00 89.76 C +ATOM 2739 CD GLH A 171 6.611 0.280 -17.038 1.00113.50 C +ATOM 2740 OE1 GLH A 171 7.848 0.440 -17.136 1.00107.60 O +ATOM 2741 OE2 GLH A 171 6.055 -0.704 -16.500 1.00107.56 O1- +ATOM 2742 H GLH A 171 5.071 1.707 -20.570 1.00 0.00 H +ATOM 2743 HA GLH A 171 4.680 3.805 -18.530 1.00 0.00 H +ATOM 2744 HB2 GLH A 171 7.001 1.910 -19.243 1.00 0.00 H +ATOM 2745 HB3 GLH A 171 7.018 3.028 -17.906 1.00 0.00 H +ATOM 2746 HG2 GLH A 171 5.195 1.864 -16.775 1.00 0.00 H +ATOM 2747 HG3 GLH A 171 4.886 0.843 -18.154 1.00 0.00 H +ATOM 2748 N ASP A 172 5.673 5.657 -19.967 1.00 70.23 N +ATOM 2749 CA ASP A 172 6.059 6.764 -20.853 1.00 68.85 C +ATOM 2750 C ASP A 172 6.083 8.053 -19.985 1.00 68.50 C +ATOM 2751 O ASP A 172 5.207 8.253 -19.138 1.00 66.16 O +ATOM 2752 CB ASP A 172 5.214 6.760 -22.168 1.00 69.42 C +ATOM 2753 CG ASP A 172 5.100 8.083 -22.934 1.00 81.45 C +ATOM 2754 OD1 ASP A 172 4.262 8.915 -22.526 1.00 81.04 O +ATOM 2755 OD2 ASP A 172 5.864 8.237 -23.912 1.00 89.83 O1- +ATOM 2756 H ASP A 172 4.961 5.874 -19.284 1.00 0.00 H +ATOM 2757 HA ASP A 172 7.098 6.594 -21.150 1.00 0.00 H +ATOM 2758 HB2 ASP A 172 5.594 5.991 -22.843 1.00 0.00 H +ATOM 2759 HB3 ASP A 172 4.193 6.449 -21.936 1.00 0.00 H ATOM 2760 N GLY A 173 7.078 8.922 -20.248 1.00 63.47 N ATOM 2761 CA GLY A 173 7.334 10.166 -19.506 1.00 61.92 C ATOM 2762 C GLY A 173 6.492 11.373 -19.975 1.00 61.80 C @@ -2764,18 +2755,18 @@ ATOM 2763 O GLY A 173 6.375 12.335 -19.215 1.00 61.49 O ATOM 2764 H GLY A 173 7.733 8.695 -20.983 1.00 0.00 H ATOM 2765 HA2 GLY A 173 7.183 10.010 -18.436 1.00 0.00 H ATOM 2766 HA3 GLY A 173 8.386 10.422 -19.632 1.00 0.00 H -ATOM 2767 N ASH A 174 5.898 11.329 -21.185 1.00 55.28 N -ATOM 2768 CA ASH A 174 5.042 12.377 -21.779 1.00 52.23 C -ATOM 2769 C ASH A 174 3.545 12.124 -21.422 1.00 50.35 C -ATOM 2770 O ASH A 174 2.699 12.889 -21.891 1.00 49.00 O -ATOM 2771 CB ASH A 174 5.214 12.413 -23.326 1.00 54.90 C -ATOM 2772 CG ASH A 174 6.545 13.022 -23.789 1.00 73.36 C -ATOM 2773 OD1 ASH A 174 6.894 14.108 -23.274 1.00 75.14 O -ATOM 2774 OD2 ASH A 174 7.184 12.404 -24.668 1.00 82.10 O1- -ATOM 2775 H ASH A 174 6.000 10.495 -21.748 1.00 0.00 H -ATOM 2776 HA ASH A 174 5.299 13.352 -21.357 1.00 0.00 H -ATOM 2777 HB2 ASH A 174 5.105 11.409 -23.742 1.00 0.00 H -ATOM 2778 HB3 ASH A 174 4.437 13.016 -23.798 1.00 0.00 H +ATOM 2767 N ASP A 174 5.898 11.329 -21.185 1.00 55.28 N +ATOM 2768 CA ASP A 174 5.042 12.377 -21.779 1.00 52.23 C +ATOM 2769 C ASP A 174 3.545 12.124 -21.422 1.00 50.35 C +ATOM 2770 O ASP A 174 2.699 12.889 -21.891 1.00 49.00 O +ATOM 2771 CB ASP A 174 5.214 12.413 -23.326 1.00 54.90 C +ATOM 2772 CG ASP A 174 6.545 13.022 -23.789 1.00 73.36 C +ATOM 2773 OD1 ASP A 174 6.894 14.108 -23.274 1.00 75.14 O +ATOM 2774 OD2 ASP A 174 7.184 12.404 -24.668 1.00 82.10 O1- +ATOM 2775 H ASP A 174 6.000 10.495 -21.748 1.00 0.00 H +ATOM 2776 HA ASP A 174 5.299 13.352 -21.357 1.00 0.00 H +ATOM 2777 HB2 ASP A 174 5.105 11.409 -23.742 1.00 0.00 H +ATOM 2778 HB3 ASP A 174 4.437 13.016 -23.798 1.00 0.00 H ATOM 2779 N SER A 175 3.214 11.100 -20.605 1.00 43.08 N ATOM 2780 CA SER A 175 1.854 10.752 -20.159 1.00 39.71 C ATOM 2781 C SER A 175 1.421 11.804 -19.094 1.00 36.74 C @@ -2906,21 +2897,21 @@ ATOM 2905 HG2 PRO A 182 -7.411 5.826 -7.647 1.00 0.00 H ATOM 2906 HG3 PRO A 182 -6.006 6.840 -7.973 1.00 0.00 H ATOM 2907 HD3 PRO A 182 -7.422 7.423 -9.764 1.00 0.00 H ATOM 2908 HD2 PRO A 182 -7.976 5.770 -10.022 1.00 0.00 H -ATOM 2909 N GLU A 183 -5.739 3.273 -11.548 1.00 30.48 N -ATOM 2910 CA GLU A 183 -5.588 2.052 -12.367 1.00 31.43 C -ATOM 2911 C GLU A 183 -4.770 2.327 -13.664 1.00 36.54 C -ATOM 2912 O GLU A 183 -4.338 1.358 -14.285 1.00 37.63 O -ATOM 2913 CB GLU A 183 -6.975 1.425 -12.699 1.00 32.56 C -ATOM 2914 CG GLU A 183 -7.934 2.173 -13.665 1.00 35.76 C -ATOM 2915 CD GLU A 183 -8.582 3.467 -13.159 1.00 37.74 C -ATOM 2916 OE1 GLU A 183 -8.598 3.708 -11.931 1.00 31.58 O -ATOM 2917 OE2 GLU A 183 -9.092 4.200 -14.031 1.00 25.56 O1- -ATOM 2918 H GLU A 183 -6.646 3.723 -11.601 1.00 0.00 H -ATOM 2919 HA GLU A 183 -5.033 1.315 -11.782 1.00 0.00 H -ATOM 2920 HB2 GLU A 183 -6.797 0.437 -13.128 1.00 0.00 H -ATOM 2921 HB3 GLU A 183 -7.501 1.209 -11.770 1.00 0.00 H -ATOM 2922 HG2 GLU A 183 -7.433 2.377 -14.611 1.00 0.00 H -ATOM 2923 HG3 GLU A 183 -8.760 1.505 -13.908 1.00 0.00 H +ATOM 2909 N GLH A 183 -5.739 3.273 -11.548 1.00 30.48 N +ATOM 2910 CA GLH A 183 -5.588 2.052 -12.367 1.00 31.43 C +ATOM 2911 C GLH A 183 -4.770 2.327 -13.664 1.00 36.54 C +ATOM 2912 O GLH A 183 -4.338 1.358 -14.285 1.00 37.63 O +ATOM 2913 CB GLH A 183 -6.975 1.425 -12.699 1.00 32.56 C +ATOM 2914 CG GLH A 183 -7.934 2.173 -13.665 1.00 35.76 C +ATOM 2915 CD GLH A 183 -8.582 3.467 -13.159 1.00 37.74 C +ATOM 2916 OE1 GLH A 183 -8.598 3.708 -11.931 1.00 31.58 O +ATOM 2917 OE2 GLH A 183 -9.092 4.200 -14.031 1.00 25.56 O1- +ATOM 2918 H GLH A 183 -6.646 3.723 -11.601 1.00 0.00 H +ATOM 2919 HA GLH A 183 -5.033 1.315 -11.782 1.00 0.00 H +ATOM 2920 HB2 GLH A 183 -6.797 0.437 -13.128 1.00 0.00 H +ATOM 2921 HB3 GLH A 183 -7.501 1.209 -11.770 1.00 0.00 H +ATOM 2922 HG2 GLH A 183 -7.433 2.377 -14.611 1.00 0.00 H +ATOM 2923 HG3 GLH A 183 -8.760 1.505 -13.908 1.00 0.00 H ATOM 2924 N CYS A 184 -4.543 3.598 -14.050 1.00 32.49 N ATOM 2925 CA CYS A 184 -3.709 4.012 -15.197 1.00 32.58 C ATOM 2926 C CYS A 184 -2.251 4.249 -14.716 1.00 37.39 C @@ -2951,43 +2942,42 @@ ATOM 2950 HD13 LEU A 185 -0.867 8.307 -10.222 1.00 0.00 H ATOM 2951 HD21 LEU A 185 -0.948 9.004 -13.280 1.00 0.00 H ATOM 2952 HD22 LEU A 185 0.446 8.209 -12.582 1.00 0.00 H ATOM 2953 HD23 LEU A 185 -0.391 7.492 -13.958 1.00 0.00 H -ATOM 2954 N LYS A 186 -0.958 2.579 -11.792 1.00 42.49 N -ATOM 2955 CA LYS A 186 -0.551 1.372 -11.053 1.00 45.58 C -ATOM 2956 C LYS A 186 -0.609 0.169 -12.029 1.00 51.72 C -ATOM 2957 O LYS A 186 0.422 -0.476 -12.217 1.00 52.85 O -ATOM 2958 CB LYS A 186 -1.511 1.186 -9.847 1.00 49.18 C -ATOM 2959 CG LYS A 186 -1.049 0.135 -8.817 1.00 71.38 C -ATOM 2960 CD LYS A 186 -1.876 0.089 -7.511 1.00 85.44 C -ATOM 2961 CE LYS A 186 -3.336 -0.386 -7.662 1.00 97.19 C -ATOM 2962 NZ LYS A 186 -4.244 0.687 -8.107 1.00104.18 N1+ -ATOM 2963 H LYS A 186 -1.954 2.714 -11.893 1.00 0.00 H -ATOM 2964 HA LYS A 186 0.468 1.480 -10.673 1.00 0.00 H -ATOM 2965 HB2 LYS A 186 -1.606 2.141 -9.330 1.00 0.00 H -ATOM 2966 HB3 LYS A 186 -2.514 0.937 -10.196 1.00 0.00 H -ATOM 2967 HG2 LYS A 186 -1.043 -0.854 -9.277 1.00 0.00 H -ATOM 2968 HG3 LYS A 186 -0.012 0.343 -8.549 1.00 0.00 H -ATOM 2969 HD2 LYS A 186 -1.373 -0.606 -6.837 1.00 0.00 H -ATOM 2970 HD3 LYS A 186 -1.842 1.053 -7.002 1.00 0.00 H -ATOM 2971 HE2 LYS A 186 -3.395 -1.226 -8.355 1.00 0.00 H -ATOM 2972 HE3 LYS A 186 -3.708 -0.748 -6.703 1.00 0.00 H -ATOM 2973 HZ1 LYS A 186 -5.151 0.298 -8.322 1.00 0.00 H -ATOM 2974 HZ2 LYS A 186 -4.361 1.366 -7.359 1.00 0.00 H -ATOM 2975 HZ3 LYS A 186 -3.869 1.146 -8.924 1.00 0.00 H -ATOM 2976 N GLU A 187 -1.795 -0.138 -12.597 1.00 48.00 N -ATOM 2977 CA GLU A 187 -2.052 -1.324 -13.439 1.00 49.76 C -ATOM 2978 C GLU A 187 -1.792 -1.029 -14.940 1.00 53.28 C -ATOM 2979 O GLU A 187 -1.664 -1.994 -15.697 1.00 53.10 O -ATOM 2980 CB GLU A 187 -3.528 -1.774 -13.239 1.00 51.48 C -ATOM 2981 CG GLU A 187 -3.775 -2.578 -11.940 1.00 66.34 C -ATOM 2982 CD GLU A 187 -3.130 -3.972 -11.927 1.00 98.88 C -ATOM 2983 OE1 GLU A 187 -3.168 -4.641 -12.984 1.00 95.63 O -ATOM 2984 OE2 GLU A 187 -2.621 -4.353 -10.851 1.00 98.68 O1- -ATOM 2985 H GLU A 187 -2.597 0.446 -12.409 1.00 0.00 H -ATOM 2986 HA GLU A 187 -1.383 -2.139 -13.155 1.00 0.00 H -ATOM 2987 HB2 GLU A 187 -4.194 -0.912 -13.232 1.00 0.00 H -ATOM 2988 HB3 GLU A 187 -3.874 -2.372 -14.085 1.00 0.00 H -ATOM 2989 HG2 GLU A 187 -3.431 -2.003 -11.078 1.00 0.00 H -ATOM 2990 HG3 GLU A 187 -4.847 -2.719 -11.802 1.00 0.00 H +ATOM 2954 N LYN A 186 -0.958 2.579 -11.792 1.00 42.49 N +ATOM 2955 CA LYN A 186 -0.551 1.372 -11.053 1.00 45.58 C +ATOM 2956 C LYN A 186 -0.609 0.169 -12.029 1.00 51.72 C +ATOM 2957 O LYN A 186 0.422 -0.476 -12.217 1.00 52.85 O +ATOM 2958 CB LYN A 186 -1.511 1.186 -9.847 1.00 49.18 C +ATOM 2959 CG LYN A 186 -1.049 0.135 -8.817 1.00 71.38 C +ATOM 2960 CD LYN A 186 -1.876 0.089 -7.511 1.00 85.44 C +ATOM 2961 CE LYN A 186 -3.336 -0.386 -7.662 1.00 97.19 C +ATOM 2962 NZ LYN A 186 -4.244 0.687 -8.107 1.00104.18 N1+ +ATOM 2963 H LYN A 186 -1.954 2.714 -11.893 1.00 0.00 H +ATOM 2964 HA LYN A 186 0.468 1.480 -10.673 1.00 0.00 H +ATOM 2965 HB2 LYN A 186 -1.606 2.141 -9.330 1.00 0.00 H +ATOM 2966 HB3 LYN A 186 -2.514 0.937 -10.196 1.00 0.00 H +ATOM 2967 HG2 LYN A 186 -1.043 -0.854 -9.277 1.00 0.00 H +ATOM 2968 HG3 LYN A 186 -0.012 0.343 -8.549 1.00 0.00 H +ATOM 2969 HD2 LYN A 186 -1.373 -0.606 -6.837 1.00 0.00 H +ATOM 2970 HD3 LYN A 186 -1.842 1.053 -7.002 1.00 0.00 H +ATOM 2971 HE2 LYN A 186 -3.395 -1.226 -8.355 1.00 0.00 H +ATOM 2972 HE3 LYN A 186 -3.708 -0.748 -6.703 1.00 0.00 H +ATOM 2974 HZ2 LYN A 186 -4.361 1.366 -7.359 1.00 0.00 H +ATOM 2975 HZ3 LYN A 186 -3.869 1.146 -8.924 1.00 0.00 H +ATOM 2976 N GLH A 187 -1.795 -0.138 -12.597 1.00 48.00 N +ATOM 2977 CA GLH A 187 -2.052 -1.324 -13.439 1.00 49.76 C +ATOM 2978 C GLH A 187 -1.792 -1.029 -14.940 1.00 53.28 C +ATOM 2979 O GLH A 187 -1.664 -1.994 -15.697 1.00 53.10 O +ATOM 2980 CB GLH A 187 -3.528 -1.774 -13.239 1.00 51.48 C +ATOM 2981 CG GLH A 187 -3.775 -2.578 -11.940 1.00 66.34 C +ATOM 2982 CD GLH A 187 -3.130 -3.972 -11.927 1.00 98.88 C +ATOM 2983 OE1 GLH A 187 -3.168 -4.641 -12.984 1.00 95.63 O +ATOM 2984 OE2 GLH A 187 -2.621 -4.353 -10.851 1.00 98.68 O1- +ATOM 2985 H GLH A 187 -2.597 0.446 -12.409 1.00 0.00 H +ATOM 2986 HA GLH A 187 -1.383 -2.139 -13.155 1.00 0.00 H +ATOM 2987 HB2 GLH A 187 -4.194 -0.912 -13.232 1.00 0.00 H +ATOM 2988 HB3 GLH A 187 -3.874 -2.372 -14.085 1.00 0.00 H +ATOM 2989 HG2 GLH A 187 -3.431 -2.003 -11.078 1.00 0.00 H +ATOM 2990 HG3 GLH A 187 -4.847 -2.719 -11.802 1.00 0.00 H ATOM 2991 N TYR A 188 -1.733 0.254 -15.360 1.00 50.13 N ATOM 2992 CA TYR A 188 -1.485 0.739 -16.735 1.00 50.19 C ATOM 2993 C TYR A 188 -2.677 0.408 -17.677 1.00 52.11 C @@ -3009,28 +2999,27 @@ ATOM 3008 HD2 TYR A 188 0.953 2.832 -17.028 1.00 0.00 H ATOM 3009 HE1 TYR A 188 3.392 -0.484 -14.209 1.00 0.00 H ATOM 3010 HE2 TYR A 188 2.853 3.572 -15.607 1.00 0.00 H ATOM 3011 HH TYR A 188 4.738 1.271 -13.598 1.00 0.00 H -ATOM 3012 N LYS A 189 -3.906 0.281 -17.141 1.00 44.81 N -ATOM 3013 CA LYS A 189 -5.144 0.007 -17.884 1.00 43.60 C -ATOM 3014 C LYS A 189 -5.907 1.348 -17.915 1.00 41.76 C -ATOM 3015 O LYS A 189 -6.128 1.955 -16.865 1.00 38.21 O -ATOM 3016 CB LYS A 189 -5.969 -1.049 -17.114 1.00 46.62 C -ATOM 3017 CG LYS A 189 -5.315 -2.442 -17.086 1.00 58.33 C -ATOM 3018 CD LYS A 189 -6.178 -3.481 -16.344 1.00 67.59 C -ATOM 3019 CE LYS A 189 -5.570 -4.892 -16.312 1.00 79.50 C -ATOM 3020 NZ LYS A 189 -4.274 -4.925 -15.610 1.00 87.69 N1+ -ATOM 3021 H LYS A 189 -4.020 0.434 -16.147 1.00 0.00 H -ATOM 3022 HA LYS A 189 -4.946 -0.351 -18.897 1.00 0.00 H -ATOM 3023 HB2 LYS A 189 -6.146 -0.719 -16.087 1.00 0.00 H -ATOM 3024 HB3 LYS A 189 -6.954 -1.142 -17.577 1.00 0.00 H -ATOM 3025 HG2 LYS A 189 -5.130 -2.779 -18.107 1.00 0.00 H -ATOM 3026 HG3 LYS A 189 -4.337 -2.370 -16.610 1.00 0.00 H -ATOM 3027 HD2 LYS A 189 -6.360 -3.141 -15.322 1.00 0.00 H -ATOM 3028 HD3 LYS A 189 -7.159 -3.535 -16.819 1.00 0.00 H -ATOM 3029 HE2 LYS A 189 -6.255 -5.582 -15.817 1.00 0.00 H -ATOM 3030 HE3 LYS A 189 -5.428 -5.263 -17.328 1.00 0.00 H -ATOM 3031 HZ1 LYS A 189 -3.901 -5.862 -15.618 1.00 0.00 H -ATOM 3032 HZ2 LYS A 189 -3.624 -4.298 -16.062 1.00 0.00 H -ATOM 3033 HZ3 LYS A 189 -4.379 -4.637 -14.643 1.00 0.00 H +ATOM 3012 N LYN A 189 -3.906 0.281 -17.141 1.00 44.81 N +ATOM 3013 CA LYN A 189 -5.144 0.007 -17.884 1.00 43.60 C +ATOM 3014 C LYN A 189 -5.907 1.348 -17.915 1.00 41.76 C +ATOM 3015 O LYN A 189 -6.128 1.955 -16.865 1.00 38.21 O +ATOM 3016 CB LYN A 189 -5.969 -1.049 -17.114 1.00 46.62 C +ATOM 3017 CG LYN A 189 -5.315 -2.442 -17.086 1.00 58.33 C +ATOM 3018 CD LYN A 189 -6.178 -3.481 -16.344 1.00 67.59 C +ATOM 3019 CE LYN A 189 -5.570 -4.892 -16.312 1.00 79.50 C +ATOM 3020 NZ LYN A 189 -4.274 -4.925 -15.610 1.00 87.69 N1+ +ATOM 3021 H LYN A 189 -4.020 0.434 -16.147 1.00 0.00 H +ATOM 3022 HA LYN A 189 -4.946 -0.351 -18.897 1.00 0.00 H +ATOM 3023 HB2 LYN A 189 -6.146 -0.719 -16.087 1.00 0.00 H +ATOM 3024 HB3 LYN A 189 -6.954 -1.142 -17.577 1.00 0.00 H +ATOM 3025 HG2 LYN A 189 -5.130 -2.779 -18.107 1.00 0.00 H +ATOM 3026 HG3 LYN A 189 -4.337 -2.370 -16.610 1.00 0.00 H +ATOM 3027 HD2 LYN A 189 -6.360 -3.141 -15.322 1.00 0.00 H +ATOM 3028 HD3 LYN A 189 -7.159 -3.535 -16.819 1.00 0.00 H +ATOM 3029 HE2 LYN A 189 -6.255 -5.582 -15.817 1.00 0.00 H +ATOM 3030 HE3 LYN A 189 -5.428 -5.263 -17.328 1.00 0.00 H +ATOM 3032 HZ2 LYN A 189 -3.624 -4.298 -16.062 1.00 0.00 H +ATOM 3033 HZ3 LYN A 189 -4.379 -4.637 -14.643 1.00 0.00 H ATOM 3034 N PHE A 190 -6.337 1.758 -19.121 1.00 36.93 N ATOM 3035 CA PHE A 190 -7.111 2.980 -19.363 1.00 34.49 C ATOM 3036 C PHE A 190 -8.471 2.501 -19.916 1.00 39.60 C @@ -3114,18 +3103,18 @@ ATOM 3113 HA SER A 194 -10.317 6.874 -15.725 1.00 0.00 H ATOM 3114 HB2 SER A 194 -9.478 5.767 -18.457 1.00 0.00 H ATOM 3115 HB3 SER A 194 -8.390 6.343 -17.238 1.00 0.00 H ATOM 3116 HG SER A 194 -9.129 4.664 -15.862 1.00 0.00 H -ATOM 3117 N ASH A 195 -11.211 8.403 -18.562 1.00 23.13 N -ATOM 3118 CA ASH A 195 -11.423 9.728 -19.182 1.00 22.18 C -ATOM 3119 C ASH A 195 -12.390 10.585 -18.313 1.00 25.02 C -ATOM 3120 O ASH A 195 -12.269 11.808 -18.369 1.00 23.63 O -ATOM 3121 CB ASH A 195 -12.021 9.621 -20.611 1.00 24.19 C -ATOM 3122 CG ASH A 195 -11.035 9.369 -21.756 1.00 28.00 C -ATOM 3123 OD1 ASH A 195 -9.897 9.881 -21.694 1.00 27.87 O -ATOM 3124 OD2 ASH A 195 -11.460 8.701 -22.721 1.00 31.18 O1- -ATOM 3125 H ASH A 195 -11.739 7.643 -18.968 1.00 0.00 H -ATOM 3126 HA ASH A 195 -10.466 10.255 -19.218 1.00 0.00 H -ATOM 3127 HB2 ASH A 195 -12.791 8.850 -20.627 1.00 0.00 H -ATOM 3128 HB3 ASH A 195 -12.518 10.550 -20.881 1.00 0.00 H +ATOM 3117 N ASP A 195 -11.211 8.403 -18.562 1.00 23.13 N +ATOM 3118 CA ASP A 195 -11.423 9.728 -19.182 1.00 22.18 C +ATOM 3119 C ASP A 195 -12.390 10.585 -18.313 1.00 25.02 C +ATOM 3120 O ASP A 195 -12.269 11.808 -18.369 1.00 23.63 O +ATOM 3121 CB ASP A 195 -12.021 9.621 -20.611 1.00 24.19 C +ATOM 3122 CG ASP A 195 -11.035 9.369 -21.756 1.00 28.00 C +ATOM 3123 OD1 ASP A 195 -9.897 9.881 -21.694 1.00 27.87 O +ATOM 3124 OD2 ASP A 195 -11.460 8.701 -22.721 1.00 31.18 O1- +ATOM 3125 H ASP A 195 -11.739 7.643 -18.968 1.00 0.00 H +ATOM 3126 HA ASP A 195 -10.466 10.255 -19.218 1.00 0.00 H +ATOM 3127 HB2 ASP A 195 -12.791 8.850 -20.627 1.00 0.00 H +ATOM 3128 HB3 ASP A 195 -12.518 10.550 -20.881 1.00 0.00 H ATOM 3129 N VAL A 196 -13.290 9.974 -17.509 1.00 23.20 N ATOM 3130 CA VAL A 196 -14.211 10.660 -16.576 1.00 22.46 C ATOM 3131 C VAL A 196 -13.414 11.233 -15.369 1.00 25.25 C @@ -3369,18 +3358,18 @@ ATOM 3368 HA CYS A 210 -6.470 26.688 -14.808 1.00 0.00 H ATOM 3369 HB2 CYS A 210 -6.571 28.604 -17.183 1.00 0.00 H ATOM 3370 HB3 CYS A 210 -5.587 27.157 -17.057 1.00 0.00 H ATOM 3371 HG CYS A 210 -7.687 26.842 -18.628 1.00 0.00 H -ATOM 3372 N ASH A 211 -5.396 28.863 -13.295 1.00 28.20 N -ATOM 3373 CA ASH A 211 -4.358 29.536 -12.500 1.00 29.09 C -ATOM 3374 C ASH A 211 -3.219 28.505 -12.277 1.00 32.04 C -ATOM 3375 O ASH A 211 -3.471 27.411 -11.768 1.00 29.80 O -ATOM 3376 CB ASH A 211 -4.972 30.082 -11.178 1.00 31.01 C -ATOM 3377 CG ASH A 211 -4.042 30.795 -10.181 1.00 42.86 C -ATOM 3378 OD1 ASH A 211 -2.818 30.874 -10.426 1.00 44.82 O -ATOM 3379 OD2 ASH A 211 -4.592 31.261 -9.160 1.00 55.40 O1- -ATOM 3380 H ASH A 211 -6.273 28.724 -12.815 1.00 0.00 H -ATOM 3381 HA ASH A 211 -3.988 30.381 -13.084 1.00 0.00 H -ATOM 3382 HB2 ASH A 211 -5.772 30.781 -11.419 1.00 0.00 H -ATOM 3383 HB3 ASH A 211 -5.460 29.269 -10.640 1.00 0.00 H +ATOM 3372 N ASP A 211 -5.396 28.863 -13.295 1.00 28.20 N +ATOM 3373 CA ASP A 211 -4.358 29.536 -12.500 1.00 29.09 C +ATOM 3374 C ASP A 211 -3.219 28.505 -12.277 1.00 32.04 C +ATOM 3375 O ASP A 211 -3.471 27.411 -11.768 1.00 29.80 O +ATOM 3376 CB ASP A 211 -4.972 30.082 -11.178 1.00 31.01 C +ATOM 3377 CG ASP A 211 -4.042 30.795 -10.181 1.00 42.86 C +ATOM 3378 OD1 ASP A 211 -2.818 30.874 -10.426 1.00 44.82 O +ATOM 3379 OD2 ASP A 211 -4.592 31.261 -9.160 1.00 55.40 O1- +ATOM 3380 H ASP A 211 -6.273 28.724 -12.815 1.00 0.00 H +ATOM 3381 HA ASP A 211 -3.988 30.381 -13.084 1.00 0.00 H +ATOM 3382 HB2 ASP A 211 -5.772 30.781 -11.419 1.00 0.00 H +ATOM 3383 HB3 ASP A 211 -5.460 29.269 -10.640 1.00 0.00 H ATOM 3384 N SER A 212 -1.990 28.898 -12.662 1.00 30.26 N ATOM 3385 CA SER A 212 -0.757 28.092 -12.625 1.00 30.30 C ATOM 3386 C SER A 212 -0.342 27.714 -11.176 1.00 34.31 C @@ -3473,28 +3462,27 @@ ATOM 3472 HG1 THR A 218 2.757 24.570 -9.642 1.00 0.00 H ATOM 3473 HG21 THR A 218 1.360 25.715 -7.896 1.00 0.00 H ATOM 3474 HG22 THR A 218 0.927 24.469 -6.748 1.00 0.00 H ATOM 3475 HG23 THR A 218 2.587 24.598 -7.311 1.00 0.00 H -ATOM 3476 N LYS A 219 -0.234 21.421 -7.194 1.00 27.48 N -ATOM 3477 CA LYS A 219 -0.967 21.065 -5.969 1.00 28.03 C -ATOM 3478 C LYS A 219 -0.722 19.587 -5.559 1.00 32.41 C -ATOM 3479 O LYS A 219 -0.846 19.308 -4.366 1.00 32.90 O -ATOM 3480 CB LYS A 219 -2.476 21.336 -6.186 1.00 29.00 C -ATOM 3481 CG LYS A 219 -2.840 22.824 -6.415 1.00 40.91 C -ATOM 3482 CD LYS A 219 -2.399 23.814 -5.318 1.00 47.46 C -ATOM 3483 CE LYS A 219 -3.082 23.593 -3.961 1.00 56.00 C -ATOM 3484 NZ LYS A 219 -2.524 24.492 -2.937 1.00 65.65 N1+ -ATOM 3485 H LYS A 219 -0.796 21.540 -8.027 1.00 0.00 H -ATOM 3486 HA LYS A 219 -0.611 21.682 -5.142 1.00 0.00 H -ATOM 3487 HB2 LYS A 219 -2.827 20.762 -7.045 1.00 0.00 H -ATOM 3488 HB3 LYS A 219 -3.050 20.963 -5.335 1.00 0.00 H -ATOM 3489 HG2 LYS A 219 -2.399 23.156 -7.354 1.00 0.00 H -ATOM 3490 HG3 LYS A 219 -3.915 22.906 -6.556 1.00 0.00 H -ATOM 3491 HD2 LYS A 219 -1.314 23.788 -5.212 1.00 0.00 H -ATOM 3492 HD3 LYS A 219 -2.621 24.827 -5.649 1.00 0.00 H -ATOM 3493 HE2 LYS A 219 -4.156 23.760 -4.043 1.00 0.00 H -ATOM 3494 HE3 LYS A 219 -2.940 22.567 -3.623 1.00 0.00 H -ATOM 3495 HZ1 LYS A 219 -3.000 24.348 -2.058 1.00 0.00 H -ATOM 3496 HZ2 LYS A 219 -1.538 24.277 -2.825 1.00 0.00 H -ATOM 3497 HZ3 LYS A 219 -2.623 25.454 -3.229 1.00 0.00 H +ATOM 3476 N LYN A 219 -0.234 21.421 -7.194 1.00 27.48 N +ATOM 3477 CA LYN A 219 -0.967 21.065 -5.969 1.00 28.03 C +ATOM 3478 C LYN A 219 -0.722 19.587 -5.559 1.00 32.41 C +ATOM 3479 O LYN A 219 -0.846 19.308 -4.366 1.00 32.90 O +ATOM 3480 CB LYN A 219 -2.476 21.336 -6.186 1.00 29.00 C +ATOM 3481 CG LYN A 219 -2.840 22.824 -6.415 1.00 40.91 C +ATOM 3482 CD LYN A 219 -2.399 23.814 -5.318 1.00 47.46 C +ATOM 3483 CE LYN A 219 -3.082 23.593 -3.961 1.00 56.00 C +ATOM 3484 NZ LYN A 219 -2.524 24.492 -2.937 1.00 65.65 N1+ +ATOM 3485 H LYN A 219 -0.796 21.540 -8.027 1.00 0.00 H +ATOM 3486 HA LYN A 219 -0.611 21.682 -5.142 1.00 0.00 H +ATOM 3487 HB2 LYN A 219 -2.827 20.762 -7.045 1.00 0.00 H +ATOM 3488 HB3 LYN A 219 -3.050 20.963 -5.335 1.00 0.00 H +ATOM 3489 HG2 LYN A 219 -2.399 23.156 -7.354 1.00 0.00 H +ATOM 3490 HG3 LYN A 219 -3.915 22.906 -6.556 1.00 0.00 H +ATOM 3491 HD2 LYN A 219 -1.314 23.788 -5.212 1.00 0.00 H +ATOM 3492 HD3 LYN A 219 -2.621 24.827 -5.649 1.00 0.00 H +ATOM 3493 HE2 LYN A 219 -4.156 23.760 -4.043 1.00 0.00 H +ATOM 3494 HE3 LYN A 219 -2.940 22.567 -3.623 1.00 0.00 H +ATOM 3496 HZ2 LYN A 219 -1.538 24.277 -2.825 1.00 0.00 H +ATOM 3497 HZ3 LYN A 219 -2.623 25.454 -3.229 1.00 0.00 H ATOM 3498 N PHE A 220 -0.330 18.685 -6.486 1.00 27.91 N ATOM 3499 CA PHE A 220 0.070 17.300 -6.170 1.00 26.74 C ATOM 3500 C PHE A 220 1.576 17.246 -5.790 1.00 30.76 C @@ -3534,21 +3522,21 @@ ATOM 3533 HD13 LEU A 221 6.488 19.061 -9.354 1.00 0.00 H ATOM 3534 HD21 LEU A 221 6.025 16.053 -8.944 1.00 0.00 H ATOM 3535 HD22 LEU A 221 6.825 16.983 -7.687 1.00 0.00 H ATOM 3536 HD23 LEU A 221 5.415 15.998 -7.307 1.00 0.00 H -ATOM 3537 N GLU A 222 3.105 19.627 -4.114 1.00 32.96 N -ATOM 3538 CA GLU A 222 3.087 20.184 -2.749 1.00 35.44 C -ATOM 3539 C GLU A 222 2.792 19.056 -1.717 1.00 38.81 C -ATOM 3540 O GLU A 222 3.280 19.166 -0.592 1.00 38.69 O -ATOM 3541 CB GLU A 222 1.979 21.263 -2.652 1.00 36.99 C -ATOM 3542 CG GLU A 222 2.390 22.644 -3.217 1.00 47.30 C -ATOM 3543 CD GLU A 222 1.236 23.646 -3.382 1.00 70.21 C -ATOM 3544 OE1 GLU A 222 0.114 23.364 -2.902 1.00 64.58 O -ATOM 3545 OE2 GLU A 222 1.499 24.703 -3.996 1.00 65.32 O1- -ATOM 3546 H GLU A 222 2.225 19.663 -4.608 1.00 0.00 H -ATOM 3547 HA GLU A 222 4.053 20.632 -2.506 1.00 0.00 H -ATOM 3548 HB2 GLU A 222 1.084 20.903 -3.164 1.00 0.00 H -ATOM 3549 HB3 GLU A 222 1.682 21.415 -1.611 1.00 0.00 H -ATOM 3550 HG2 GLU A 222 3.139 23.095 -2.566 1.00 0.00 H -ATOM 3551 HG3 GLU A 222 2.874 22.523 -4.184 1.00 0.00 H +ATOM 3537 N GLH A 222 3.105 19.627 -4.114 1.00 32.96 N +ATOM 3538 CA GLH A 222 3.087 20.184 -2.749 1.00 35.44 C +ATOM 3539 C GLH A 222 2.792 19.056 -1.717 1.00 38.81 C +ATOM 3540 O GLH A 222 3.280 19.166 -0.592 1.00 38.69 O +ATOM 3541 CB GLH A 222 1.979 21.263 -2.652 1.00 36.99 C +ATOM 3542 CG GLH A 222 2.390 22.644 -3.217 1.00 47.30 C +ATOM 3543 CD GLH A 222 1.236 23.646 -3.382 1.00 70.21 C +ATOM 3544 OE1 GLH A 222 0.114 23.364 -2.902 1.00 64.58 O +ATOM 3545 OE2 GLH A 222 1.499 24.703 -3.996 1.00 65.32 O1- +ATOM 3546 H GLH A 222 2.225 19.663 -4.608 1.00 0.00 H +ATOM 3547 HA GLH A 222 4.053 20.632 -2.506 1.00 0.00 H +ATOM 3548 HB2 GLH A 222 1.084 20.903 -3.164 1.00 0.00 H +ATOM 3549 HB3 GLH A 222 1.682 21.415 -1.611 1.00 0.00 H +ATOM 3550 HG2 GLH A 222 3.139 23.095 -2.566 1.00 0.00 H +ATOM 3551 HG3 GLH A 222 2.874 22.523 -4.184 1.00 0.00 H ATOM 3552 N LEU A 223 2.043 17.998 -2.097 1.00 35.92 N ATOM 3553 CA LEU A 223 1.673 16.857 -1.238 1.00 37.14 C ATOM 3554 C LEU A 223 2.776 15.764 -1.311 1.00 40.62 C @@ -3730,30 +3718,29 @@ ATOM 3729 HD13 LEU A 234 4.726 2.419 -6.393 1.00 0.00 H ATOM 3730 HD21 LEU A 234 6.749 2.946 -3.992 1.00 0.00 H ATOM 3731 HD22 LEU A 234 7.249 3.054 -5.677 1.00 0.00 H ATOM 3732 HD23 LEU A 234 7.478 4.424 -4.594 1.00 0.00 H -ATOM 3733 N ARG A 235 4.041 7.784 -5.300 1.00 32.17 N -ATOM 3734 CA ARG A 235 3.571 8.629 -4.190 1.00 32.60 C -ATOM 3735 C ARG A 235 2.272 9.388 -4.587 1.00 33.95 C -ATOM 3736 O ARG A 235 1.480 9.681 -3.691 1.00 32.13 O -ATOM 3737 CB ARG A 235 4.712 9.603 -3.816 1.00 37.04 C -ATOM 3738 CG ARG A 235 4.728 10.041 -2.334 1.00 59.77 C -ATOM 3739 CD ARG A 235 6.130 10.364 -1.781 1.00 74.58 C -ATOM 3740 NE ARG A 235 7.041 9.207 -1.889 1.00 91.08 N -ATOM 3741 CZ ARG A 235 7.130 8.168 -1.044 1.00107.84 C -ATOM 3742 NH1 ARG A 235 6.409 8.100 0.078 1.00 95.16 N -ATOM 3743 NH2 ARG A 235 7.960 7.166 -1.335 1.00 96.44 N1+ -ATOM 3744 H ARG A 235 4.862 8.120 -5.786 1.00 0.00 H -ATOM 3745 HA ARG A 235 3.364 7.975 -3.341 1.00 0.00 H -ATOM 3746 HB2 ARG A 235 5.656 9.097 -4.006 1.00 0.00 H -ATOM 3747 HB3 ARG A 235 4.726 10.467 -4.481 1.00 0.00 H -ATOM 3748 HG2 ARG A 235 4.074 10.905 -2.207 1.00 0.00 H -ATOM 3749 HG3 ARG A 235 4.306 9.251 -1.711 1.00 0.00 H -ATOM 3750 HD2 ARG A 235 6.562 11.203 -2.322 1.00 0.00 H -ATOM 3751 HD3 ARG A 235 6.062 10.678 -0.739 1.00 0.00 H -ATOM 3752 HE ARG A 235 7.590 9.161 -2.734 1.00 0.00 H -ATOM 3753 HH12 ARG A 235 6.480 7.294 0.679 1.00 0.00 H -ATOM 3754 HH11 ARG A 235 5.763 8.842 0.301 1.00 0.00 H -ATOM 3755 HH22 ARG A 235 8.018 6.370 -0.719 1.00 0.00 H -ATOM 3756 HH21 ARG A 235 8.509 7.182 -2.182 1.00 0.00 H +ATOM 3733 N ARN A 235 4.041 7.784 -5.300 1.00 32.17 N +ATOM 3734 CA ARN A 235 3.571 8.629 -4.190 1.00 32.60 C +ATOM 3735 C ARN A 235 2.272 9.388 -4.587 1.00 33.95 C +ATOM 3736 O ARN A 235 1.480 9.681 -3.691 1.00 32.13 O +ATOM 3737 CB ARN A 235 4.712 9.603 -3.816 1.00 37.04 C +ATOM 3738 CG ARN A 235 4.728 10.041 -2.334 1.00 59.77 C +ATOM 3739 CD ARN A 235 6.130 10.364 -1.781 1.00 74.58 C +ATOM 3740 NE ARN A 235 7.041 9.207 -1.889 1.00 91.08 N +ATOM 3741 CZ ARN A 235 7.130 8.168 -1.044 1.00107.84 C +ATOM 3742 NH1 ARN A 235 6.409 8.100 0.078 1.00 95.16 N +ATOM 3743 NH2 ARN A 235 7.960 7.166 -1.335 1.00 96.44 N1+ +ATOM 3744 H ARN A 235 4.862 8.120 -5.786 1.00 0.00 H +ATOM 3745 HA ARN A 235 3.364 7.975 -3.341 1.00 0.00 H +ATOM 3746 HB2 ARN A 235 5.656 9.097 -4.006 1.00 0.00 H +ATOM 3747 HB3 ARN A 235 4.726 10.467 -4.481 1.00 0.00 H +ATOM 3748 HG2 ARN A 235 4.074 10.905 -2.207 1.00 0.00 H +ATOM 3749 HG3 ARN A 235 4.306 9.251 -1.711 1.00 0.00 H +ATOM 3750 HD2 ARN A 235 6.562 11.203 -2.322 1.00 0.00 H +ATOM 3751 HD3 ARN A 235 6.062 10.678 -0.739 1.00 0.00 H +ATOM 3752 HE ARN A 235 7.590 9.161 -2.734 1.00 0.00 H +ATOM 3753 HH12 ARN A 235 6.480 7.294 0.679 1.00 0.00 H +ATOM 3754 HH11 ARN A 235 5.763 8.842 0.301 1.00 0.00 H +ATOM 3756 HH21 ARN A 235 8.509 7.182 -2.182 1.00 0.00 H ATOM 3757 N LEU A 236 2.032 9.621 -5.897 1.00 29.63 N ATOM 3758 CA LEU A 236 0.787 10.151 -6.481 1.00 27.63 C ATOM 3759 C LEU A 236 -0.314 9.061 -6.434 1.00 32.17 C @@ -3787,21 +3774,21 @@ ATOM 3786 HG1 THR A 237 0.833 5.965 -8.530 1.00 0.00 H ATOM 3787 HG21 THR A 237 -0.743 3.206 -7.467 1.00 0.00 H ATOM 3788 HG22 THR A 237 -1.480 3.803 -6.000 1.00 0.00 H ATOM 3789 HG23 THR A 237 -2.163 4.247 -7.560 1.00 0.00 H -ATOM 3790 N GLU A 238 -0.271 6.486 -4.105 1.00 33.17 N -ATOM 3791 CA GLU A 238 -0.421 6.256 -2.656 1.00 34.02 C -ATOM 3792 C GLU A 238 -1.365 7.293 -1.991 1.00 37.28 C -ATOM 3793 O GLU A 238 -2.191 6.864 -1.187 1.00 35.08 O -ATOM 3794 CB GLU A 238 0.964 6.224 -1.968 1.00 36.83 C -ATOM 3795 CG GLU A 238 1.738 4.902 -2.204 1.00 44.51 C -ATOM 3796 CD GLU A 238 3.212 4.908 -1.770 1.00 58.80 C -ATOM 3797 OE1 GLU A 238 3.817 3.816 -1.846 1.00 49.54 O -ATOM 3798 OE2 GLU A 238 3.723 5.980 -1.373 1.00 45.75 O1- -ATOM 3799 H GLU A 238 0.678 6.635 -4.423 1.00 0.00 H -ATOM 3800 HA GLU A 238 -0.884 5.274 -2.526 1.00 0.00 H -ATOM 3801 HB2 GLU A 238 1.548 7.084 -2.300 1.00 0.00 H -ATOM 3802 HB3 GLU A 238 0.851 6.349 -0.890 1.00 0.00 H -ATOM 3803 HG2 GLU A 238 1.230 4.092 -1.678 1.00 0.00 H -ATOM 3804 HG3 GLU A 238 1.709 4.628 -3.258 1.00 0.00 H +ATOM 3790 N GLH A 238 -0.271 6.486 -4.105 1.00 33.17 N +ATOM 3791 CA GLH A 238 -0.421 6.256 -2.656 1.00 34.02 C +ATOM 3792 C GLH A 238 -1.365 7.293 -1.991 1.00 37.28 C +ATOM 3793 O GLH A 238 -2.191 6.864 -1.187 1.00 35.08 O +ATOM 3794 CB GLH A 238 0.964 6.224 -1.968 1.00 36.83 C +ATOM 3795 CG GLH A 238 1.738 4.902 -2.204 1.00 44.51 C +ATOM 3796 CD GLH A 238 3.212 4.908 -1.770 1.00 58.80 C +ATOM 3797 OE1 GLH A 238 3.817 3.816 -1.846 1.00 49.54 O +ATOM 3798 OE2 GLH A 238 3.723 5.980 -1.373 1.00 45.75 O1- +ATOM 3799 H GLH A 238 0.678 6.635 -4.423 1.00 0.00 H +ATOM 3800 HA GLH A 238 -0.884 5.274 -2.526 1.00 0.00 H +ATOM 3801 HB2 GLH A 238 1.548 7.084 -2.300 1.00 0.00 H +ATOM 3802 HB3 GLH A 238 0.851 6.349 -0.890 1.00 0.00 H +ATOM 3803 HG2 GLH A 238 1.230 4.092 -1.678 1.00 0.00 H +ATOM 3804 HG3 GLH A 238 1.709 4.628 -3.258 1.00 0.00 H ATOM 3805 N LEU A 239 -1.290 8.598 -2.344 1.00 34.11 N ATOM 3806 CA LEU A 239 -2.180 9.647 -1.793 1.00 33.79 C ATOM 3807 C LEU A 239 -3.625 9.499 -2.344 1.00 35.23 C @@ -3840,45 +3827,44 @@ ATOM 3839 HD13 LEU A 240 -5.147 9.418 -8.510 1.00 0.00 H ATOM 3840 HD21 LEU A 240 -5.432 12.030 -7.007 1.00 0.00 H ATOM 3841 HD22 LEU A 240 -6.625 10.844 -6.472 1.00 0.00 H ATOM 3842 HD23 LEU A 240 -5.552 11.615 -5.320 1.00 0.00 H -ATOM 3843 N GLU A 241 -5.042 6.542 -3.286 1.00 37.30 N -ATOM 3844 CA GLU A 241 -5.528 5.309 -2.638 1.00 38.66 C -ATOM 3845 C GLU A 241 -5.860 5.573 -1.138 1.00 42.10 C -ATOM 3846 O GLU A 241 -6.690 4.839 -0.602 1.00 42.78 O -ATOM 3847 CB GLU A 241 -4.446 4.203 -2.761 1.00 41.41 C -ATOM 3848 CG GLU A 241 -4.218 3.652 -4.197 1.00 54.54 C -ATOM 3849 CD GLU A 241 -5.296 2.721 -4.770 1.00 90.90 C -ATOM 3850 OE1 GLU A 241 -6.279 2.422 -4.057 1.00 94.26 O -ATOM 3851 OE2 GLU A 241 -5.103 2.312 -5.937 1.00 91.13 O1- -ATOM 3852 H GLU A 241 -4.038 6.614 -3.381 1.00 0.00 H -ATOM 3853 HA GLU A 241 -6.442 4.972 -3.132 1.00 0.00 H -ATOM 3854 HB2 GLU A 241 -3.494 4.584 -2.384 1.00 0.00 H -ATOM 3855 HB3 GLU A 241 -4.688 3.364 -2.105 1.00 0.00 H -ATOM 3856 HG2 GLU A 241 -4.114 4.472 -4.904 1.00 0.00 H -ATOM 3857 HG3 GLU A 241 -3.274 3.107 -4.219 1.00 0.00 H -ATOM 3858 N ARG A 242 -5.293 6.625 -0.500 1.00 37.87 N -ATOM 3859 CA ARG A 242 -5.673 7.115 0.844 1.00 37.84 C -ATOM 3860 C ARG A 242 -6.929 8.037 0.765 1.00 41.63 C -ATOM 3861 O ARG A 242 -7.420 8.424 1.826 1.00 42.60 O -ATOM 3862 CB ARG A 242 -4.501 7.918 1.474 1.00 37.09 C -ATOM 3863 CG ARG A 242 -3.354 7.046 2.025 1.00 43.14 C -ATOM 3864 CD ARG A 242 -2.383 7.805 2.951 1.00 47.74 C -ATOM 3865 NE ARG A 242 -1.809 9.010 2.327 1.00 51.85 N -ATOM 3866 CZ ARG A 242 -0.684 9.102 1.608 1.00 60.61 C -ATOM 3867 NH1 ARG A 242 0.071 8.039 1.317 1.00 54.41 N -ATOM 3868 NH2 ARG A 242 -0.311 10.304 1.177 1.00 41.74 N1+ -ATOM 3869 H ARG A 242 -4.619 7.190 -0.998 1.00 0.00 H -ATOM 3870 HA ARG A 242 -5.926 6.273 1.492 1.00 0.00 H -ATOM 3871 HB2 ARG A 242 -4.103 8.639 0.759 1.00 0.00 H -ATOM 3872 HB3 ARG A 242 -4.870 8.517 2.309 1.00 0.00 H -ATOM 3873 HG2 ARG A 242 -3.775 6.215 2.593 1.00 0.00 H -ATOM 3874 HG3 ARG A 242 -2.802 6.587 1.207 1.00 0.00 H -ATOM 3875 HD2 ARG A 242 -2.909 8.118 3.854 1.00 0.00 H -ATOM 3876 HD3 ARG A 242 -1.581 7.145 3.282 1.00 0.00 H -ATOM 3877 HE ARG A 242 -2.319 9.877 2.459 1.00 0.00 H -ATOM 3878 HH12 ARG A 242 0.934 8.156 0.804 1.00 0.00 H -ATOM 3879 HH11 ARG A 242 -0.218 7.124 1.626 1.00 0.00 H -ATOM 3880 HH22 ARG A 242 0.515 10.413 0.599 1.00 0.00 H -ATOM 3881 HH21 ARG A 242 -0.892 11.107 1.397 1.00 0.00 H +ATOM 3843 N GLH A 241 -5.042 6.542 -3.286 1.00 37.30 N +ATOM 3844 CA GLH A 241 -5.528 5.309 -2.638 1.00 38.66 C +ATOM 3845 C GLH A 241 -5.860 5.573 -1.138 1.00 42.10 C +ATOM 3846 O GLH A 241 -6.690 4.839 -0.602 1.00 42.78 O +ATOM 3847 CB GLH A 241 -4.446 4.203 -2.761 1.00 41.41 C +ATOM 3848 CG GLH A 241 -4.218 3.652 -4.197 1.00 54.54 C +ATOM 3849 CD GLH A 241 -5.296 2.721 -4.770 1.00 90.90 C +ATOM 3850 OE1 GLH A 241 -6.279 2.422 -4.057 1.00 94.26 O +ATOM 3851 OE2 GLH A 241 -5.103 2.312 -5.937 1.00 91.13 O1- +ATOM 3852 H GLH A 241 -4.038 6.614 -3.381 1.00 0.00 H +ATOM 3853 HA GLH A 241 -6.442 4.972 -3.132 1.00 0.00 H +ATOM 3854 HB2 GLH A 241 -3.494 4.584 -2.384 1.00 0.00 H +ATOM 3855 HB3 GLH A 241 -4.688 3.364 -2.105 1.00 0.00 H +ATOM 3856 HG2 GLH A 241 -4.114 4.472 -4.904 1.00 0.00 H +ATOM 3857 HG3 GLH A 241 -3.274 3.107 -4.219 1.00 0.00 H +ATOM 3858 N ARN A 242 -5.293 6.625 -0.500 1.00 37.87 N +ATOM 3859 CA ARN A 242 -5.673 7.115 0.844 1.00 37.84 C +ATOM 3860 C ARN A 242 -6.929 8.037 0.765 1.00 41.63 C +ATOM 3861 O ARN A 242 -7.420 8.424 1.826 1.00 42.60 O +ATOM 3862 CB ARN A 242 -4.501 7.918 1.474 1.00 37.09 C +ATOM 3863 CG ARN A 242 -3.354 7.046 2.025 1.00 43.14 C +ATOM 3864 CD ARN A 242 -2.383 7.805 2.951 1.00 47.74 C +ATOM 3865 NE ARN A 242 -1.809 9.010 2.327 1.00 51.85 N +ATOM 3866 CZ ARN A 242 -0.684 9.102 1.608 1.00 60.61 C +ATOM 3867 NH1 ARN A 242 0.071 8.039 1.317 1.00 54.41 N +ATOM 3868 NH2 ARN A 242 -0.311 10.304 1.177 1.00 41.74 N1+ +ATOM 3869 H ARN A 242 -4.619 7.190 -0.998 1.00 0.00 H +ATOM 3870 HA ARN A 242 -5.926 6.273 1.492 1.00 0.00 H +ATOM 3871 HB2 ARN A 242 -4.103 8.639 0.759 1.00 0.00 H +ATOM 3872 HB3 ARN A 242 -4.870 8.517 2.309 1.00 0.00 H +ATOM 3873 HG2 ARN A 242 -3.775 6.215 2.593 1.00 0.00 H +ATOM 3874 HG3 ARN A 242 -2.802 6.587 1.207 1.00 0.00 H +ATOM 3875 HD2 ARN A 242 -2.909 8.118 3.854 1.00 0.00 H +ATOM 3876 HD3 ARN A 242 -1.581 7.145 3.282 1.00 0.00 H +ATOM 3877 HE ARN A 242 -2.319 9.877 2.459 1.00 0.00 H +ATOM 3878 HH12 ARN A 242 0.934 8.156 0.804 1.00 0.00 H +ATOM 3879 HH11 ARN A 242 -0.218 7.124 1.626 1.00 0.00 H +ATOM 3881 HH21 ARN A 242 -0.892 11.107 1.397 1.00 0.00 H ATOM 3882 N GLY A 243 -7.435 8.381 -0.438 1.00 36.22 N ATOM 3883 CA GLY A 243 -8.628 9.213 -0.636 1.00 35.40 C ATOM 3884 C GLY A 243 -8.345 10.731 -0.642 1.00 37.10 C @@ -3886,45 +3872,44 @@ ATOM 3885 O GLY A 243 -9.306 11.500 -0.614 1.00 36.00 O ATOM 3886 H GLY A 243 -6.988 8.020 -1.269 1.00 0.00 H ATOM 3887 HA2 GLY A 243 -9.070 8.943 -1.595 1.00 0.00 H ATOM 3888 HA3 GLY A 243 -9.386 8.989 0.118 1.00 0.00 H -ATOM 3889 N GLU A 244 -7.068 11.174 -0.701 1.00 32.13 N -ATOM 3890 CA GLU A 244 -6.659 12.589 -0.808 1.00 31.71 C -ATOM 3891 C GLU A 244 -6.902 13.035 -2.268 1.00 33.67 C -ATOM 3892 O GLU A 244 -6.636 12.280 -3.206 1.00 31.64 O -ATOM 3893 CB GLU A 244 -5.158 12.766 -0.476 1.00 33.82 C -ATOM 3894 CG GLU A 244 -4.759 12.301 0.943 1.00 48.90 C -ATOM 3895 CD GLU A 244 -3.316 12.658 1.324 1.00 65.96 C -ATOM 3896 OE1 GLU A 244 -2.883 13.789 1.006 1.00 51.67 O -ATOM 3897 OE2 GLU A 244 -2.662 11.791 1.943 1.00 68.15 O1- -ATOM 3898 H GLU A 244 -6.315 10.500 -0.742 1.00 0.00 H -ATOM 3899 HA GLU A 244 -7.258 13.183 -0.115 1.00 0.00 H -ATOM 3900 HB2 GLU A 244 -4.538 12.250 -1.209 1.00 0.00 H -ATOM 3901 HB3 GLU A 244 -4.911 13.822 -0.594 1.00 0.00 H -ATOM 3902 HG2 GLU A 244 -5.415 12.762 1.682 1.00 0.00 H -ATOM 3903 HG3 GLU A 244 -4.901 11.223 1.034 1.00 0.00 H -ATOM 3904 N ARG A 245 -7.390 14.275 -2.419 1.00 30.19 N -ATOM 3905 CA ARG A 245 -7.807 14.875 -3.693 1.00 28.71 C -ATOM 3906 C ARG A 245 -7.296 16.332 -3.734 1.00 31.32 C -ATOM 3907 O ARG A 245 -6.873 16.905 -2.726 1.00 31.52 O -ATOM 3908 CB ARG A 245 -9.353 14.779 -3.837 1.00 28.69 C -ATOM 3909 CG ARG A 245 -9.925 13.353 -3.978 1.00 29.69 C -ATOM 3910 CD ARG A 245 -9.469 12.601 -5.237 1.00 29.80 C -ATOM 3911 NE ARG A 245 -10.046 11.251 -5.276 1.00 30.88 N -ATOM 3912 CZ ARG A 245 -9.536 10.130 -4.754 1.00 38.38 C -ATOM 3913 NH1 ARG A 245 -8.374 10.105 -4.103 1.00 29.25 N -ATOM 3914 NH2 ARG A 245 -10.217 8.996 -4.897 1.00 30.33 N1+ -ATOM 3915 H ARG A 245 -7.534 14.848 -1.597 1.00 0.00 H -ATOM 3916 HA ARG A 245 -7.319 14.366 -4.527 1.00 0.00 H -ATOM 3917 HB2 ARG A 245 -9.825 15.257 -2.975 1.00 0.00 H -ATOM 3918 HB3 ARG A 245 -9.685 15.361 -4.698 1.00 0.00 H -ATOM 3919 HG2 ARG A 245 -9.684 12.770 -3.089 1.00 0.00 H -ATOM 3920 HG3 ARG A 245 -11.013 13.422 -3.997 1.00 0.00 H -ATOM 3921 HD2 ARG A 245 -9.789 13.138 -6.129 1.00 0.00 H -ATOM 3922 HD3 ARG A 245 -8.384 12.525 -5.295 1.00 0.00 H -ATOM 3923 HE ARG A 245 -10.952 11.165 -5.719 1.00 0.00 H -ATOM 3924 HH12 ARG A 245 -8.006 9.225 -3.767 1.00 0.00 H -ATOM 3925 HH11 ARG A 245 -7.853 10.961 -3.955 1.00 0.00 H -ATOM 3926 HH22 ARG A 245 -9.872 8.120 -4.525 1.00 0.00 H -ATOM 3927 HH21 ARG A 245 -11.092 9.017 -5.404 1.00 0.00 H +ATOM 3889 N GLH A 244 -7.068 11.174 -0.701 1.00 32.13 N +ATOM 3890 CA GLH A 244 -6.659 12.589 -0.808 1.00 31.71 C +ATOM 3891 C GLH A 244 -6.902 13.035 -2.268 1.00 33.67 C +ATOM 3892 O GLH A 244 -6.636 12.280 -3.206 1.00 31.64 O +ATOM 3893 CB GLH A 244 -5.158 12.766 -0.476 1.00 33.82 C +ATOM 3894 CG GLH A 244 -4.759 12.301 0.943 1.00 48.90 C +ATOM 3895 CD GLH A 244 -3.316 12.658 1.324 1.00 65.96 C +ATOM 3896 OE1 GLH A 244 -2.883 13.789 1.006 1.00 51.67 O +ATOM 3897 OE2 GLH A 244 -2.662 11.791 1.943 1.00 68.15 O1- +ATOM 3898 H GLH A 244 -6.315 10.500 -0.742 1.00 0.00 H +ATOM 3899 HA GLH A 244 -7.258 13.183 -0.115 1.00 0.00 H +ATOM 3900 HB2 GLH A 244 -4.538 12.250 -1.209 1.00 0.00 H +ATOM 3901 HB3 GLH A 244 -4.911 13.822 -0.594 1.00 0.00 H +ATOM 3902 HG2 GLH A 244 -5.415 12.762 1.682 1.00 0.00 H +ATOM 3903 HG3 GLH A 244 -4.901 11.223 1.034 1.00 0.00 H +ATOM 3904 N ARN A 245 -7.390 14.275 -2.419 1.00 30.19 N +ATOM 3905 CA ARN A 245 -7.807 14.875 -3.693 1.00 28.71 C +ATOM 3906 C ARN A 245 -7.296 16.332 -3.734 1.00 31.32 C +ATOM 3907 O ARN A 245 -6.873 16.905 -2.726 1.00 31.52 O +ATOM 3908 CB ARN A 245 -9.353 14.779 -3.837 1.00 28.69 C +ATOM 3909 CG ARN A 245 -9.925 13.353 -3.978 1.00 29.69 C +ATOM 3910 CD ARN A 245 -9.469 12.601 -5.237 1.00 29.80 C +ATOM 3911 NE ARN A 245 -10.046 11.251 -5.276 1.00 30.88 N +ATOM 3912 CZ ARN A 245 -9.536 10.130 -4.754 1.00 38.38 C +ATOM 3913 NH1 ARN A 245 -8.374 10.105 -4.103 1.00 29.25 N +ATOM 3914 NH2 ARN A 245 -10.217 8.996 -4.897 1.00 30.33 N1+ +ATOM 3915 H ARN A 245 -7.534 14.848 -1.597 1.00 0.00 H +ATOM 3916 HA ARN A 245 -7.319 14.366 -4.527 1.00 0.00 H +ATOM 3917 HB2 ARN A 245 -9.825 15.257 -2.975 1.00 0.00 H +ATOM 3918 HB3 ARN A 245 -9.685 15.361 -4.698 1.00 0.00 H +ATOM 3919 HG2 ARN A 245 -9.684 12.770 -3.089 1.00 0.00 H +ATOM 3920 HG3 ARN A 245 -11.013 13.422 -3.997 1.00 0.00 H +ATOM 3921 HD2 ARN A 245 -9.789 13.138 -6.129 1.00 0.00 H +ATOM 3922 HD3 ARN A 245 -8.384 12.525 -5.295 1.00 0.00 H +ATOM 3923 HE ARN A 245 -10.952 11.165 -5.719 1.00 0.00 H +ATOM 3924 HH12 ARN A 245 -8.006 9.225 -3.767 1.00 0.00 H +ATOM 3925 HH11 ARN A 245 -7.853 10.961 -3.955 1.00 0.00 H +ATOM 3927 HH21 ARN A 245 -11.092 9.017 -5.404 1.00 0.00 H ATOM 3928 N LEU A 246 -7.423 16.936 -4.931 1.00 26.90 N ATOM 3929 CA LEU A 246 -7.258 18.370 -5.219 1.00 26.48 C ATOM 3930 C LEU A 246 -8.412 19.123 -4.485 1.00 31.07 C @@ -3958,30 +3943,29 @@ ATOM 3957 HG2 PRO A 247 -7.501 23.049 -4.275 1.00 0.00 H ATOM 3958 HG3 PRO A 247 -6.223 22.917 -3.068 1.00 0.00 H ATOM 3959 HD3 PRO A 247 -6.094 20.517 -3.385 1.00 0.00 H ATOM 3960 HD2 PRO A 247 -6.450 21.066 -5.028 1.00 0.00 H -ATOM 3961 N ARG A 248 -11.244 22.208 -3.127 1.00 30.63 N -ATOM 3962 CA ARG A 248 -12.380 22.937 -3.712 1.00 30.68 C -ATOM 3963 C ARG A 248 -11.821 24.326 -4.141 1.00 36.51 C -ATOM 3964 O ARG A 248 -11.321 25.053 -3.277 1.00 36.37 O -ATOM 3965 CB ARG A 248 -13.502 23.090 -2.652 1.00 28.69 C -ATOM 3966 CG ARG A 248 -14.801 23.712 -3.219 1.00 33.51 C -ATOM 3967 CD ARG A 248 -15.947 23.851 -2.201 1.00 37.56 C -ATOM 3968 NE ARG A 248 -15.588 24.762 -1.101 1.00 52.22 N -ATOM 3969 CZ ARG A 248 -15.531 26.103 -1.152 1.00 71.16 C -ATOM 3970 NH1 ARG A 248 -15.111 26.775 -0.081 1.00 60.58 N -ATOM 3971 NH2 ARG A 248 -15.874 26.802 -2.237 1.00 53.25 N1+ -ATOM 3972 H ARG A 248 -11.188 22.211 -2.117 1.00 0.00 H -ATOM 3973 HA ARG A 248 -12.787 22.364 -4.540 1.00 0.00 H -ATOM 3974 HB2 ARG A 248 -13.741 22.106 -2.245 1.00 0.00 H -ATOM 3975 HB3 ARG A 248 -13.146 23.677 -1.803 1.00 0.00 H -ATOM 3976 HG2 ARG A 248 -14.586 24.695 -3.634 1.00 0.00 H -ATOM 3977 HG3 ARG A 248 -15.145 23.114 -4.062 1.00 0.00 H -ATOM 3978 HD2 ARG A 248 -16.851 24.216 -2.691 1.00 0.00 H -ATOM 3979 HD3 ARG A 248 -16.200 22.876 -1.783 1.00 0.00 H -ATOM 3980 HE ARG A 248 -15.326 24.321 -0.233 1.00 0.00 H -ATOM 3981 HH12 ARG A 248 -15.048 27.783 -0.124 1.00 0.00 H -ATOM 3982 HH11 ARG A 248 -14.840 26.286 0.758 1.00 0.00 H -ATOM 3983 HH22 ARG A 248 -15.793 27.810 -2.221 1.00 0.00 H -ATOM 3984 HH21 ARG A 248 -16.250 26.333 -3.051 1.00 0.00 H +ATOM 3961 N ARN A 248 -11.244 22.208 -3.127 1.00 30.63 N +ATOM 3962 CA ARN A 248 -12.380 22.937 -3.712 1.00 30.68 C +ATOM 3963 C ARN A 248 -11.821 24.326 -4.141 1.00 36.51 C +ATOM 3964 O ARN A 248 -11.321 25.053 -3.277 1.00 36.37 O +ATOM 3965 CB ARN A 248 -13.502 23.090 -2.652 1.00 28.69 C +ATOM 3966 CG ARN A 248 -14.801 23.712 -3.219 1.00 33.51 C +ATOM 3967 CD ARN A 248 -15.947 23.851 -2.201 1.00 37.56 C +ATOM 3968 NE ARN A 248 -15.588 24.762 -1.101 1.00 52.22 N +ATOM 3969 CZ ARN A 248 -15.531 26.103 -1.152 1.00 71.16 C +ATOM 3970 NH1 ARN A 248 -15.111 26.775 -0.081 1.00 60.58 N +ATOM 3971 NH2 ARN A 248 -15.874 26.802 -2.237 1.00 53.25 N1+ +ATOM 3972 H ARN A 248 -11.188 22.211 -2.117 1.00 0.00 H +ATOM 3973 HA ARN A 248 -12.787 22.364 -4.540 1.00 0.00 H +ATOM 3974 HB2 ARN A 248 -13.741 22.106 -2.245 1.00 0.00 H +ATOM 3975 HB3 ARN A 248 -13.146 23.677 -1.803 1.00 0.00 H +ATOM 3976 HG2 ARN A 248 -14.586 24.695 -3.634 1.00 0.00 H +ATOM 3977 HG3 ARN A 248 -15.145 23.114 -4.062 1.00 0.00 H +ATOM 3978 HD2 ARN A 248 -16.851 24.216 -2.691 1.00 0.00 H +ATOM 3979 HD3 ARN A 248 -16.200 22.876 -1.783 1.00 0.00 H +ATOM 3980 HE ARN A 248 -15.326 24.321 -0.233 1.00 0.00 H +ATOM 3981 HH12 ARN A 248 -15.048 27.783 -0.124 1.00 0.00 H +ATOM 3982 HH11 ARN A 248 -14.840 26.286 0.758 1.00 0.00 H +ATOM 3984 HH21 ARN A 248 -16.250 26.333 -3.051 1.00 0.00 H ATOM 3985 N PRO A 249 -11.950 24.694 -5.447 1.00 34.19 N ATOM 3986 CA PRO A 249 -11.639 26.059 -5.950 1.00 34.79 C ATOM 3987 C PRO A 249 -12.532 27.121 -5.265 1.00 39.69 C @@ -4008,28 +3992,27 @@ ATOM 4007 H ASH A 250 -11.014 28.489 -5.289 1.00 0.00 H ATOM 4008 HA ASH A 250 -13.061 29.036 -3.410 1.00 0.00 H ATOM 4009 HB2 ASH A 250 -10.857 30.201 -3.393 1.00 0.00 H ATOM 4010 HB3 ASH A 250 -11.227 30.990 -4.901 1.00 0.00 H -ATOM 4011 N LYS A 251 -15.049 29.887 -4.681 1.00 45.46 N -ATOM 4012 CA LYS A 251 -16.343 30.284 -5.271 1.00 46.10 C -ATOM 4013 C LYS A 251 -16.987 29.130 -6.095 1.00 48.03 C -ATOM 4014 O LYS A 251 -18.012 29.376 -6.733 1.00 49.27 O -ATOM 4015 CB LYS A 251 -16.316 31.678 -5.971 1.00 50.14 C -ATOM 4016 CG LYS A 251 -15.821 32.844 -5.080 1.00 69.71 C -ATOM 4017 CD LYS A 251 -16.810 33.294 -3.981 1.00 83.93 C -ATOM 4018 CE LYS A 251 -17.909 34.259 -4.466 1.00 98.25 C -ATOM 4019 NZ LYS A 251 -17.356 35.571 -4.852 1.00107.70 N1+ -ATOM 4020 H LYS A 251 -15.104 29.587 -3.717 1.00 0.00 H -ATOM 4021 HA LYS A 251 -17.005 30.366 -4.409 1.00 0.00 H -ATOM 4022 HB2 LYS A 251 -15.691 31.628 -6.863 1.00 0.00 H -ATOM 4023 HB3 LYS A 251 -17.311 31.923 -6.348 1.00 0.00 H -ATOM 4024 HG2 LYS A 251 -14.879 32.564 -4.609 1.00 0.00 H -ATOM 4025 HG3 LYS A 251 -15.563 33.692 -5.714 1.00 0.00 H -ATOM 4026 HD2 LYS A 251 -17.271 32.426 -3.511 1.00 0.00 H -ATOM 4027 HD3 LYS A 251 -16.249 33.780 -3.180 1.00 0.00 H -ATOM 4028 HE2 LYS A 251 -18.452 33.832 -5.310 1.00 0.00 H -ATOM 4029 HE3 LYS A 251 -18.639 34.418 -3.671 1.00 0.00 H -ATOM 4030 HZ1 LYS A 251 -18.103 36.182 -5.151 1.00 0.00 H -ATOM 4031 HZ2 LYS A 251 -16.884 35.983 -4.060 1.00 0.00 H -ATOM 4032 HZ3 LYS A 251 -16.695 35.450 -5.606 1.00 0.00 H +ATOM 4011 N LYN A 251 -15.049 29.887 -4.681 1.00 45.46 N +ATOM 4012 CA LYN A 251 -16.343 30.284 -5.271 1.00 46.10 C +ATOM 4013 C LYN A 251 -16.987 29.130 -6.095 1.00 48.03 C +ATOM 4014 O LYN A 251 -18.012 29.376 -6.733 1.00 49.27 O +ATOM 4015 CB LYN A 251 -16.316 31.678 -5.971 1.00 50.14 C +ATOM 4016 CG LYN A 251 -15.821 32.844 -5.080 1.00 69.71 C +ATOM 4017 CD LYN A 251 -16.810 33.294 -3.981 1.00 83.93 C +ATOM 4018 CE LYN A 251 -17.909 34.259 -4.466 1.00 98.25 C +ATOM 4019 NZ LYN A 251 -17.356 35.571 -4.852 1.00107.70 N1+ +ATOM 4020 H LYN A 251 -15.104 29.587 -3.717 1.00 0.00 H +ATOM 4021 HA LYN A 251 -17.005 30.366 -4.409 1.00 0.00 H +ATOM 4022 HB2 LYN A 251 -15.691 31.628 -6.863 1.00 0.00 H +ATOM 4023 HB3 LYN A 251 -17.311 31.923 -6.348 1.00 0.00 H +ATOM 4024 HG2 LYN A 251 -14.879 32.564 -4.609 1.00 0.00 H +ATOM 4025 HG3 LYN A 251 -15.563 33.692 -5.714 1.00 0.00 H +ATOM 4026 HD2 LYN A 251 -17.271 32.426 -3.511 1.00 0.00 H +ATOM 4027 HD3 LYN A 251 -16.249 33.780 -3.180 1.00 0.00 H +ATOM 4028 HE2 LYN A 251 -18.452 33.832 -5.310 1.00 0.00 H +ATOM 4029 HE3 LYN A 251 -18.639 34.418 -3.671 1.00 0.00 H +ATOM 4031 HZ2 LYN A 251 -16.884 35.983 -4.060 1.00 0.00 H +ATOM 4032 HZ3 LYN A 251 -16.695 35.450 -5.606 1.00 0.00 H ATOM 4033 N CYS A 252 -16.431 27.895 -6.054 1.00 40.64 N ATOM 4034 CA CYS A 252 -17.016 26.664 -6.622 1.00 37.44 C ATOM 4035 C CYS A 252 -18.105 26.222 -5.600 1.00 40.28 C @@ -4066,21 +4049,21 @@ ATOM 4065 HB3 CYS A 254 -20.761 21.664 -0.654 1.00 0.00 H ATOM 4066 HG CYS A 254 -21.217 23.738 0.803 1.00 0.00 H ATOM 4067 H CYS A 254 -21.182 24.394 -2.998 1.00 0.00 H ATOM 4068 HA CYS A 254 -19.240 22.440 -2.467 1.00 0.00 H -ATOM 4069 N GLU A 255 -21.923 21.260 -4.064 1.00 34.04 N -ATOM 4070 CA GLU A 255 -22.522 20.130 -4.793 1.00 34.34 C -ATOM 4071 C GLU A 255 -21.857 19.942 -6.189 1.00 35.13 C -ATOM 4072 O GLU A 255 -21.857 18.813 -6.678 1.00 31.94 O -ATOM 4073 CB GLU A 255 -24.041 20.392 -4.911 1.00 37.10 C -ATOM 4074 CG GLU A 255 -24.856 19.209 -5.486 1.00 51.53 C -ATOM 4075 CD GLU A 255 -26.370 19.337 -5.270 1.00 70.35 C -ATOM 4076 OE1 GLU A 255 -26.879 20.477 -5.364 1.00 77.38 O -ATOM 4077 OE2 GLU A 255 -26.994 18.281 -5.025 1.00 51.45 O1- -ATOM 4078 H GLU A 255 -22.474 22.109 -4.046 1.00 0.00 H -ATOM 4079 HA GLU A 255 -22.378 19.218 -4.210 1.00 0.00 H -ATOM 4080 HB2 GLU A 255 -24.427 20.635 -3.918 1.00 0.00 H -ATOM 4081 HB3 GLU A 255 -24.214 21.282 -5.518 1.00 0.00 H -ATOM 4082 HG2 GLU A 255 -24.673 19.106 -6.556 1.00 0.00 H -ATOM 4083 HG3 GLU A 255 -24.516 18.281 -5.025 1.00 0.00 H +ATOM 4069 N GLH A 255 -21.923 21.260 -4.064 1.00 34.04 N +ATOM 4070 CA GLH A 255 -22.522 20.130 -4.793 1.00 34.34 C +ATOM 4071 C GLH A 255 -21.857 19.942 -6.189 1.00 35.13 C +ATOM 4072 O GLH A 255 -21.857 18.813 -6.678 1.00 31.94 O +ATOM 4073 CB GLH A 255 -24.041 20.392 -4.911 1.00 37.10 C +ATOM 4074 CG GLH A 255 -24.856 19.209 -5.486 1.00 51.53 C +ATOM 4075 CD GLH A 255 -26.370 19.337 -5.270 1.00 70.35 C +ATOM 4076 OE1 GLH A 255 -26.879 20.477 -5.364 1.00 77.38 O +ATOM 4077 OE2 GLH A 255 -26.994 18.281 -5.025 1.00 51.45 O1- +ATOM 4078 H GLH A 255 -22.474 22.109 -4.046 1.00 0.00 H +ATOM 4079 HA GLH A 255 -22.378 19.218 -4.210 1.00 0.00 H +ATOM 4080 HB2 GLH A 255 -24.427 20.635 -3.918 1.00 0.00 H +ATOM 4081 HB3 GLH A 255 -24.214 21.282 -5.518 1.00 0.00 H +ATOM 4082 HG2 GLH A 255 -24.673 19.106 -6.556 1.00 0.00 H +ATOM 4083 HG3 GLH A 255 -24.516 18.281 -5.025 1.00 0.00 H ATOM 4084 N VAL A 256 -21.240 20.993 -6.775 1.00 32.23 N ATOM 4085 CA VAL A 256 -20.411 20.927 -7.999 1.00 30.46 C ATOM 4086 C VAL A 256 -19.015 20.327 -7.644 1.00 31.37 C @@ -4171,28 +4154,27 @@ ATOM 4170 HG3 MET A 260 -14.407 17.784 -10.875 1.00 0.00 H ATOM 4171 HE1 MET A 260 -13.308 21.351 -8.155 1.00 0.00 H ATOM 4172 HE2 MET A 260 -13.781 19.722 -7.626 1.00 0.00 H ATOM 4173 HE3 MET A 260 -12.194 19.990 -8.326 1.00 0.00 H -ATOM 4174 N LYS A 261 -15.716 15.119 -7.124 1.00 27.88 N -ATOM 4175 CA LYS A 261 -15.187 14.033 -6.276 1.00 27.39 C -ATOM 4176 C LYS A 261 -15.871 12.680 -6.617 1.00 30.73 C -ATOM 4177 O LYS A 261 -15.232 11.653 -6.390 1.00 30.19 O -ATOM 4178 CB LYS A 261 -15.397 14.354 -4.774 1.00 30.13 C -ATOM 4179 CG LYS A 261 -14.379 15.370 -4.210 1.00 40.57 C -ATOM 4180 CD LYS A 261 -14.323 15.412 -2.669 1.00 49.92 C -ATOM 4181 CE LYS A 261 -13.572 14.220 -2.049 1.00 55.31 C -ATOM 4182 NZ LYS A 261 -13.503 14.319 -0.581 1.00 61.18 N1+ -ATOM 4183 H LYS A 261 -16.444 15.685 -6.710 1.00 0.00 H -ATOM 4184 HA LYS A 261 -14.119 13.913 -6.461 1.00 0.00 H -ATOM 4185 HB2 LYS A 261 -16.414 14.709 -4.595 1.00 0.00 H -ATOM 4186 HB3 LYS A 261 -15.310 13.434 -4.194 1.00 0.00 H -ATOM 4187 HG2 LYS A 261 -13.380 15.154 -4.586 1.00 0.00 H -ATOM 4188 HG3 LYS A 261 -14.621 16.364 -4.588 1.00 0.00 H -ATOM 4189 HD2 LYS A 261 -13.810 16.323 -2.370 1.00 0.00 H -ATOM 4190 HD3 LYS A 261 -15.334 15.486 -2.264 1.00 0.00 H -ATOM 4191 HE2 LYS A 261 -14.056 13.279 -2.303 1.00 0.00 H -ATOM 4192 HE3 LYS A 261 -12.554 14.172 -2.435 1.00 0.00 H -ATOM 4193 HZ1 LYS A 261 -12.986 13.532 -0.216 1.00 0.00 H -ATOM 4194 HZ2 LYS A 261 -13.039 15.177 -0.320 1.00 0.00 H -ATOM 4195 HZ3 LYS A 261 -14.438 14.309 -0.199 1.00 0.00 H +ATOM 4174 N LYN A 261 -15.716 15.119 -7.124 1.00 27.88 N +ATOM 4175 CA LYN A 261 -15.187 14.033 -6.276 1.00 27.39 C +ATOM 4176 C LYN A 261 -15.871 12.680 -6.617 1.00 30.73 C +ATOM 4177 O LYN A 261 -15.232 11.653 -6.390 1.00 30.19 O +ATOM 4178 CB LYN A 261 -15.397 14.354 -4.774 1.00 30.13 C +ATOM 4179 CG LYN A 261 -14.379 15.370 -4.210 1.00 40.57 C +ATOM 4180 CD LYN A 261 -14.323 15.412 -2.669 1.00 49.92 C +ATOM 4181 CE LYN A 261 -13.572 14.220 -2.049 1.00 55.31 C +ATOM 4182 NZ LYN A 261 -13.503 14.319 -0.581 1.00 61.18 N1+ +ATOM 4183 H LYN A 261 -16.444 15.685 -6.710 1.00 0.00 H +ATOM 4184 HA LYN A 261 -14.119 13.913 -6.461 1.00 0.00 H +ATOM 4185 HB2 LYN A 261 -16.414 14.709 -4.595 1.00 0.00 H +ATOM 4186 HB3 LYN A 261 -15.310 13.434 -4.194 1.00 0.00 H +ATOM 4187 HG2 LYN A 261 -13.380 15.154 -4.586 1.00 0.00 H +ATOM 4188 HG3 LYN A 261 -14.621 16.364 -4.588 1.00 0.00 H +ATOM 4189 HD2 LYN A 261 -13.810 16.323 -2.370 1.00 0.00 H +ATOM 4190 HD3 LYN A 261 -15.334 15.486 -2.264 1.00 0.00 H +ATOM 4191 HE2 LYN A 261 -14.056 13.279 -2.303 1.00 0.00 H +ATOM 4192 HE3 LYN A 261 -12.554 14.172 -2.435 1.00 0.00 H +ATOM 4194 HZ2 LYN A 261 -13.039 15.177 -0.320 1.00 0.00 H +ATOM 4195 HZ3 LYN A 261 -14.438 14.309 -0.199 1.00 0.00 H ATOM 4196 N ASN A 262 -17.093 12.670 -7.194 1.00 27.52 N ATOM 4197 CA ASN A 262 -17.764 11.466 -7.723 1.00 27.53 C ATOM 4198 C ASN A 262 -17.179 11.115 -9.126 1.00 29.61 C @@ -4242,21 +4224,21 @@ ATOM 4241 HE3 TRP A 264 -11.947 14.826 -6.357 1.00 0.00 H ATOM 4242 HZ2 TRP A 264 -10.116 17.486 -10.153 1.00 0.00 H ATOM 4243 HZ3 TRP A 264 -11.465 17.244 -6.061 1.00 0.00 H ATOM 4244 HH2 TRP A 264 -10.521 18.570 -7.949 1.00 0.00 H -ATOM 4245 N GLU A 265 -13.794 8.879 -7.981 1.00 25.75 N -ATOM 4246 CA GLU A 265 -13.897 7.651 -7.156 1.00 26.82 C -ATOM 4247 C GLU A 265 -12.686 6.761 -7.538 1.00 30.62 C -ATOM 4248 O GLU A 265 -12.408 6.580 -8.727 1.00 26.79 O -ATOM 4249 CB GLU A 265 -15.220 6.900 -7.449 1.00 28.38 C -ATOM 4250 CG GLU A 265 -16.507 7.665 -7.063 1.00 35.13 C -ATOM 4251 CD GLU A 265 -16.803 7.802 -5.564 1.00 54.88 C -ATOM 4252 OE1 GLU A 265 -16.103 7.160 -4.749 1.00 51.30 O -ATOM 4253 OE2 GLU A 265 -17.754 8.558 -5.260 1.00 50.04 O1- -ATOM 4254 H GLU A 265 -14.324 8.892 -8.840 1.00 0.00 H -ATOM 4255 HA GLU A 265 -13.855 7.908 -6.094 1.00 0.00 H -ATOM 4256 HB2 GLU A 265 -15.282 6.633 -8.500 1.00 0.00 H -ATOM 4257 HB3 GLU A 265 -15.213 5.940 -6.931 1.00 0.00 H -ATOM 4258 HG2 GLU A 265 -16.464 8.665 -7.484 1.00 0.00 H -ATOM 4259 HG3 GLU A 265 -17.368 7.180 -7.519 1.00 0.00 H +ATOM 4245 N GLH A 265 -13.794 8.879 -7.981 1.00 25.75 N +ATOM 4246 CA GLH A 265 -13.897 7.651 -7.156 1.00 26.82 C +ATOM 4247 C GLH A 265 -12.686 6.761 -7.538 1.00 30.62 C +ATOM 4248 O GLH A 265 -12.408 6.580 -8.727 1.00 26.79 O +ATOM 4249 CB GLH A 265 -15.220 6.900 -7.449 1.00 28.38 C +ATOM 4250 CG GLH A 265 -16.507 7.665 -7.063 1.00 35.13 C +ATOM 4251 CD GLH A 265 -16.803 7.802 -5.564 1.00 54.88 C +ATOM 4252 OE1 GLH A 265 -16.103 7.160 -4.749 1.00 51.30 O +ATOM 4253 OE2 GLH A 265 -17.754 8.558 -5.260 1.00 50.04 O1- +ATOM 4254 H GLH A 265 -14.324 8.892 -8.840 1.00 0.00 H +ATOM 4255 HA GLH A 265 -13.855 7.908 -6.094 1.00 0.00 H +ATOM 4256 HB2 GLH A 265 -15.282 6.633 -8.500 1.00 0.00 H +ATOM 4257 HB3 GLH A 265 -15.213 5.940 -6.931 1.00 0.00 H +ATOM 4258 HG2 GLH A 265 -16.464 8.665 -7.484 1.00 0.00 H +ATOM 4259 HG3 GLH A 265 -17.368 7.180 -7.519 1.00 0.00 H ATOM 4260 N THR A 266 -12.006 6.198 -6.517 1.00 30.88 N ATOM 4261 CA THR A 266 -10.835 5.297 -6.640 1.00 31.88 C ATOM 4262 C THR A 266 -11.269 3.969 -7.327 1.00 35.93 C @@ -4271,21 +4253,21 @@ ATOM 4270 HG1 THR A 266 -8.807 6.181 -4.809 1.00 0.00 H ATOM 4271 HG21 THR A 266 -8.626 3.826 -4.246 1.00 0.00 H ATOM 4272 HG22 THR A 266 -9.309 2.970 -5.607 1.00 0.00 H ATOM 4273 HG23 THR A 266 -8.217 4.321 -5.886 1.00 0.00 H -ATOM 4274 N GLU A 267 -12.507 3.501 -7.064 1.00 34.13 N -ATOM 4275 CA GLU A 267 -13.175 2.391 -7.750 1.00 35.75 C -ATOM 4276 C GLU A 267 -13.814 3.014 -9.021 1.00 37.89 C -ATOM 4277 O GLU A 267 -14.637 3.928 -8.923 1.00 35.58 O -ATOM 4278 CB GLU A 267 -14.252 1.833 -6.782 1.00 38.82 C -ATOM 4279 CG GLU A 267 -15.016 0.573 -7.253 1.00 56.26 C -ATOM 4280 CD GLU A 267 -14.219 -0.734 -7.147 1.00 89.36 C -ATOM 4281 OE1 GLU A 267 -13.118 -0.792 -7.738 1.00 94.02 O -ATOM 4282 OE2 GLU A 267 -14.734 -1.668 -6.494 1.00 89.74 O1- -ATOM 4283 H GLU A 267 -13.084 4.008 -6.407 1.00 0.00 H -ATOM 4284 HA GLU A 267 -12.446 1.621 -8.005 1.00 0.00 H -ATOM 4285 HB2 GLU A 267 -13.785 1.612 -5.820 1.00 0.00 H -ATOM 4286 HB3 GLU A 267 -14.979 2.615 -6.556 1.00 0.00 H -ATOM 4287 HG2 GLU A 267 -15.921 0.469 -6.656 1.00 0.00 H -ATOM 4288 HG3 GLU A 267 -15.356 0.698 -8.280 1.00 0.00 H +ATOM 4274 N GLH A 267 -12.507 3.501 -7.064 1.00 34.13 N +ATOM 4275 CA GLH A 267 -13.175 2.391 -7.750 1.00 35.75 C +ATOM 4276 C GLH A 267 -13.814 3.014 -9.021 1.00 37.89 C +ATOM 4277 O GLH A 267 -14.637 3.928 -8.923 1.00 35.58 O +ATOM 4278 CB GLH A 267 -14.252 1.833 -6.782 1.00 38.82 C +ATOM 4279 CG GLH A 267 -15.016 0.573 -7.253 1.00 56.26 C +ATOM 4280 CD GLH A 267 -14.219 -0.734 -7.147 1.00 89.36 C +ATOM 4281 OE1 GLH A 267 -13.118 -0.792 -7.738 1.00 94.02 O +ATOM 4282 OE2 GLH A 267 -14.734 -1.668 -6.494 1.00 89.74 O1- +ATOM 4283 H GLH A 267 -13.084 4.008 -6.407 1.00 0.00 H +ATOM 4284 HA GLH A 267 -12.446 1.621 -8.005 1.00 0.00 H +ATOM 4285 HB2 GLH A 267 -13.785 1.612 -5.820 1.00 0.00 H +ATOM 4286 HB3 GLH A 267 -14.979 2.615 -6.556 1.00 0.00 H +ATOM 4287 HG2 GLH A 267 -15.921 0.469 -6.656 1.00 0.00 H +ATOM 4288 HG3 GLH A 267 -15.356 0.698 -8.280 1.00 0.00 H ATOM 4289 N ALA A 268 -13.410 2.496 -10.197 1.00 35.19 N ATOM 4290 CA ALA A 268 -13.748 3.013 -11.535 1.00 35.22 C ATOM 4291 C ALA A 268 -15.237 2.777 -11.903 1.00 38.77 C @@ -4327,30 +4309,29 @@ ATOM 4326 HD2 PHE A 270 -16.928 4.028 -5.063 1.00 0.00 H ATOM 4327 HE1 PHE A 270 -19.180 -0.207 -6.327 1.00 0.00 H ATOM 4328 HE2 PHE A 270 -16.965 2.125 -3.496 1.00 0.00 H ATOM 4329 HZ PHE A 270 -18.087 0.015 -4.124 1.00 0.00 H -ATOM 4330 N ARG A 271 -17.742 5.710 -10.712 1.00 27.94 N -ATOM 4331 CA ARG A 271 -17.645 6.982 -11.447 1.00 27.11 C -ATOM 4332 C ARG A 271 -18.803 7.014 -12.495 1.00 29.97 C -ATOM 4333 O ARG A 271 -19.077 5.988 -13.123 1.00 28.45 O -ATOM 4334 CB ARG A 271 -16.266 7.063 -12.157 1.00 27.28 C -ATOM 4335 CG ARG A 271 -15.084 7.178 -11.165 1.00 37.58 C -ATOM 4336 CD ARG A 271 -13.766 7.700 -11.757 1.00 43.51 C -ATOM 4337 NE ARG A 271 -13.126 6.773 -12.697 1.00 43.50 N -ATOM 4338 CZ ARG A 271 -12.065 5.976 -12.502 1.00 45.54 C -ATOM 4339 NH1 ARG A 271 -11.461 5.817 -11.322 1.00 36.88 N -ATOM 4340 NH2 ARG A 271 -11.572 5.331 -13.555 1.00 30.01 N1+ -ATOM 4341 H ARG A 271 -17.155 4.960 -11.047 1.00 0.00 H -ATOM 4342 HA ARG A 271 -17.726 7.797 -10.730 1.00 0.00 H -ATOM 4343 HB2 ARG A 271 -16.111 6.217 -12.828 1.00 0.00 H -ATOM 4344 HB3 ARG A 271 -16.259 7.950 -12.791 1.00 0.00 H -ATOM 4345 HG2 ARG A 271 -15.369 7.877 -10.378 1.00 0.00 H -ATOM 4346 HG3 ARG A 271 -14.911 6.216 -10.681 1.00 0.00 H -ATOM 4347 HD2 ARG A 271 -13.956 8.619 -12.307 1.00 0.00 H -ATOM 4348 HD3 ARG A 271 -13.071 7.957 -10.959 1.00 0.00 H -ATOM 4349 HE ARG A 271 -13.457 6.840 -13.651 1.00 0.00 H -ATOM 4350 HH12 ARG A 271 -10.655 5.211 -11.252 1.00 0.00 H -ATOM 4351 HH11 ARG A 271 -11.841 6.249 -10.488 1.00 0.00 H -ATOM 4352 HH22 ARG A 271 -10.709 4.797 -13.484 1.00 0.00 H -ATOM 4353 HH21 ARG A 271 -11.994 5.462 -14.461 1.00 0.00 H +ATOM 4330 N ARN A 271 -17.742 5.710 -10.712 1.00 27.94 N +ATOM 4331 CA ARN A 271 -17.645 6.982 -11.447 1.00 27.11 C +ATOM 4332 C ARN A 271 -18.803 7.014 -12.495 1.00 29.97 C +ATOM 4333 O ARN A 271 -19.077 5.988 -13.123 1.00 28.45 O +ATOM 4334 CB ARN A 271 -16.266 7.063 -12.157 1.00 27.28 C +ATOM 4335 CG ARN A 271 -15.084 7.178 -11.165 1.00 37.58 C +ATOM 4336 CD ARN A 271 -13.766 7.700 -11.757 1.00 43.51 C +ATOM 4337 NE ARN A 271 -13.126 6.773 -12.697 1.00 43.50 N +ATOM 4338 CZ ARN A 271 -12.065 5.976 -12.502 1.00 45.54 C +ATOM 4339 NH1 ARN A 271 -11.461 5.817 -11.322 1.00 36.88 N +ATOM 4340 NH2 ARN A 271 -11.572 5.331 -13.555 1.00 30.01 N1+ +ATOM 4341 H ARN A 271 -17.155 4.960 -11.047 1.00 0.00 H +ATOM 4342 HA ARN A 271 -17.726 7.797 -10.730 1.00 0.00 H +ATOM 4343 HB2 ARN A 271 -16.111 6.217 -12.828 1.00 0.00 H +ATOM 4344 HB3 ARN A 271 -16.259 7.950 -12.791 1.00 0.00 H +ATOM 4345 HG2 ARN A 271 -15.369 7.877 -10.378 1.00 0.00 H +ATOM 4346 HG3 ARN A 271 -14.911 6.216 -10.681 1.00 0.00 H +ATOM 4347 HD2 ARN A 271 -13.956 8.619 -12.307 1.00 0.00 H +ATOM 4348 HD3 ARN A 271 -13.071 7.957 -10.959 1.00 0.00 H +ATOM 4349 HE ARN A 271 -13.457 6.840 -13.651 1.00 0.00 H +ATOM 4350 HH12 ARN A 271 -10.655 5.211 -11.252 1.00 0.00 H +ATOM 4351 HH11 ARN A 271 -11.841 6.249 -10.488 1.00 0.00 H +ATOM 4353 HH21 ARN A 271 -11.994 5.462 -14.461 1.00 0.00 H ATOM 4354 N PRO A 272 -19.457 8.193 -12.687 1.00 26.80 N ATOM 4355 CA PRO A 272 -20.580 8.360 -13.644 1.00 26.98 C ATOM 4356 C PRO A 272 -20.040 8.453 -15.093 1.00 32.02 C @@ -4399,21 +4380,21 @@ ATOM 4398 HD2 PHE A 274 -17.052 9.604 -21.220 1.00 0.00 H ATOM 4399 HE1 PHE A 274 -16.250 14.117 -19.326 1.00 0.00 H ATOM 4400 HE2 PHE A 274 -14.771 10.285 -20.544 1.00 0.00 H ATOM 4401 HZ PHE A 274 -14.364 12.539 -19.639 1.00 0.00 H -ATOM 4402 N GLU A 275 -22.584 10.035 -20.584 1.00 27.87 N -ATOM 4403 CA GLU A 275 -24.033 10.050 -20.860 1.00 28.69 C -ATOM 4404 C GLU A 275 -24.863 10.292 -19.568 1.00 33.26 C -ATOM 4405 O GLU A 275 -25.992 10.767 -19.702 1.00 32.51 O -ATOM 4406 CB GLU A 275 -24.455 8.715 -21.517 1.00 31.37 C -ATOM 4407 CG GLU A 275 -23.994 8.596 -22.989 1.00 44.54 C -ATOM 4408 CD GLU A 275 -24.326 7.263 -23.673 1.00 68.84 C -ATOM 4409 OE1 GLU A 275 -24.892 6.366 -23.009 1.00 67.02 O -ATOM 4410 OE2 GLU A 275 -23.973 7.154 -24.869 1.00 62.94 O1- -ATOM 4411 H GLU A 275 -22.153 9.120 -20.545 1.00 0.00 H -ATOM 4412 HA GLU A 275 -24.259 10.862 -21.552 1.00 0.00 H -ATOM 4413 HB2 GLU A 275 -24.072 7.876 -20.931 1.00 0.00 H -ATOM 4414 HB3 GLU A 275 -25.543 8.619 -21.499 1.00 0.00 H -ATOM 4415 HG2 GLU A 275 -24.444 9.397 -23.577 1.00 0.00 H -ATOM 4416 HG3 GLU A 275 -22.916 8.742 -23.054 1.00 0.00 H +ATOM 4402 N GLH A 275 -22.584 10.035 -20.584 1.00 27.87 N +ATOM 4403 CA GLH A 275 -24.033 10.050 -20.860 1.00 28.69 C +ATOM 4404 C GLH A 275 -24.863 10.292 -19.568 1.00 33.26 C +ATOM 4405 O GLH A 275 -25.992 10.767 -19.702 1.00 32.51 O +ATOM 4406 CB GLH A 275 -24.455 8.715 -21.517 1.00 31.37 C +ATOM 4407 CG GLH A 275 -23.994 8.596 -22.989 1.00 44.54 C +ATOM 4408 CD GLH A 275 -24.326 7.263 -23.673 1.00 68.84 C +ATOM 4409 OE1 GLH A 275 -24.892 6.366 -23.009 1.00 67.02 O +ATOM 4410 OE2 GLH A 275 -23.973 7.154 -24.869 1.00 62.94 O1- +ATOM 4411 H GLH A 275 -22.153 9.120 -20.545 1.00 0.00 H +ATOM 4412 HA GLH A 275 -24.259 10.862 -21.552 1.00 0.00 H +ATOM 4413 HB2 GLH A 275 -24.072 7.876 -20.931 1.00 0.00 H +ATOM 4414 HB3 GLH A 275 -25.543 8.619 -21.499 1.00 0.00 H +ATOM 4415 HG2 GLH A 275 -24.444 9.397 -23.577 1.00 0.00 H +ATOM 4416 HG3 GLH A 275 -22.916 8.742 -23.054 1.00 0.00 H ATOM 4417 N ASN A 276 -24.324 10.016 -18.360 1.00 30.86 N ATOM 4418 CA ASN A 276 -24.959 10.334 -17.062 1.00 30.74 C ATOM 4419 C ASN A 276 -24.661 11.811 -16.683 1.00 32.00 C @@ -4518,28 +4499,27 @@ ATOM 4517 HD13 LEU A 281 -20.538 18.694 -17.320 1.00 0.00 H ATOM 4518 HD21 LEU A 281 -20.793 19.044 -14.294 1.00 0.00 H ATOM 4519 HD22 LEU A 281 -21.133 20.395 -15.371 1.00 0.00 H ATOM 4520 HD23 LEU A 281 -22.317 19.895 -14.167 1.00 0.00 H -ATOM 4521 N LYS A 282 -26.626 20.027 -17.423 1.00 32.29 N -ATOM 4522 CA LYS A 282 -27.678 20.854 -18.047 1.00 33.11 C -ATOM 4523 C LYS A 282 -28.574 21.489 -16.949 1.00 37.39 C -ATOM 4524 O LYS A 282 -28.944 22.654 -17.098 1.00 37.67 O -ATOM 4525 CB LYS A 282 -28.552 19.970 -18.977 1.00 37.22 C -ATOM 4526 CG LYS A 282 -27.958 19.807 -20.386 1.00 43.25 C -ATOM 4527 CD LYS A 282 -28.748 18.846 -21.290 1.00 49.41 C -ATOM 4528 CE LYS A 282 -28.200 18.824 -22.728 1.00 57.38 C -ATOM 4529 NZ LYS A 282 -28.912 17.847 -23.568 1.00 64.71 N1+ -ATOM 4530 H LYS A 282 -26.816 19.035 -17.391 1.00 0.00 H -ATOM 4531 HA LYS A 282 -27.226 21.662 -18.626 1.00 0.00 H -ATOM 4532 HB2 LYS A 282 -28.710 18.989 -18.526 1.00 0.00 H -ATOM 4533 HB3 LYS A 282 -29.550 20.397 -19.094 1.00 0.00 H -ATOM 4534 HG2 LYS A 282 -27.916 20.789 -20.860 1.00 0.00 H -ATOM 4535 HG3 LYS A 282 -26.930 19.456 -20.311 1.00 0.00 H -ATOM 4536 HD2 LYS A 282 -28.713 17.843 -20.861 1.00 0.00 H -ATOM 4537 HD3 LYS A 282 -29.799 19.140 -21.305 1.00 0.00 H -ATOM 4538 HE2 LYS A 282 -28.294 19.811 -23.183 1.00 0.00 H -ATOM 4539 HE3 LYS A 282 -27.137 18.579 -22.730 1.00 0.00 H -ATOM 4540 HZ1 LYS A 282 -28.522 17.860 -24.500 1.00 0.00 H -ATOM 4541 HZ2 LYS A 282 -28.808 16.923 -23.174 1.00 0.00 H -ATOM 4542 HZ3 LYS A 282 -29.892 18.087 -23.609 1.00 0.00 H +ATOM 4521 N LYN A 282 -26.626 20.027 -17.423 1.00 32.29 N +ATOM 4522 CA LYN A 282 -27.678 20.854 -18.047 1.00 33.11 C +ATOM 4523 C LYN A 282 -28.574 21.489 -16.949 1.00 37.39 C +ATOM 4524 O LYN A 282 -28.944 22.654 -17.098 1.00 37.67 O +ATOM 4525 CB LYN A 282 -28.552 19.970 -18.977 1.00 37.22 C +ATOM 4526 CG LYN A 282 -27.958 19.807 -20.386 1.00 43.25 C +ATOM 4527 CD LYN A 282 -28.748 18.846 -21.290 1.00 49.41 C +ATOM 4528 CE LYN A 282 -28.200 18.824 -22.728 1.00 57.38 C +ATOM 4529 NZ LYN A 282 -28.912 17.847 -23.568 1.00 64.71 N1+ +ATOM 4530 H LYN A 282 -26.816 19.035 -17.391 1.00 0.00 H +ATOM 4531 HA LYN A 282 -27.226 21.662 -18.626 1.00 0.00 H +ATOM 4532 HB2 LYN A 282 -28.710 18.989 -18.526 1.00 0.00 H +ATOM 4533 HB3 LYN A 282 -29.550 20.397 -19.094 1.00 0.00 H +ATOM 4534 HG2 LYN A 282 -27.916 20.789 -20.860 1.00 0.00 H +ATOM 4535 HG3 LYN A 282 -26.930 19.456 -20.311 1.00 0.00 H +ATOM 4536 HD2 LYN A 282 -28.713 17.843 -20.861 1.00 0.00 H +ATOM 4537 HD3 LYN A 282 -29.799 19.140 -21.305 1.00 0.00 H +ATOM 4538 HE2 LYN A 282 -28.294 19.811 -23.183 1.00 0.00 H +ATOM 4539 HE3 LYN A 282 -27.137 18.579 -22.730 1.00 0.00 H +ATOM 4541 HZ2 LYN A 282 -28.808 16.923 -23.174 1.00 0.00 H +ATOM 4542 HZ3 LYN A 282 -29.892 18.087 -23.609 1.00 0.00 H ATOM 4543 N THR A 283 -28.875 20.747 -15.862 1.00 34.80 N ATOM 4544 CA THR A 283 -29.728 21.177 -14.734 1.00 35.33 C ATOM 4545 C THR A 283 -28.898 22.091 -13.785 1.00 39.05 C @@ -4587,43 +4567,42 @@ ATOM 4586 HB3 HID A 285 -26.572 23.965 -17.506 1.00 0.00 H ATOM 4587 HD1 HID A 285 -24.046 26.842 -17.871 1.00 0.00 H ATOM 4588 HD2 HID A 285 -27.865 25.730 -19.281 1.00 0.00 H ATOM 4589 HE1 HID A 285 -24.751 28.493 -19.639 1.00 0.00 H -ATOM 4590 N GLU A 286 -28.482 25.489 -15.608 1.00 37.68 N -ATOM 4591 CA GLU A 286 -29.778 26.182 -15.462 1.00 39.70 C -ATOM 4592 C GLU A 286 -29.950 26.844 -14.069 1.00 42.94 C -ATOM 4593 O GLU A 286 -30.608 27.882 -13.996 1.00 44.72 O -ATOM 4594 CB GLU A 286 -30.939 25.186 -15.756 1.00 42.32 C -ATOM 4595 CG GLU A 286 -31.481 25.242 -17.205 1.00 60.01 C -ATOM 4596 CD GLU A 286 -32.250 26.525 -17.574 1.00 92.87 C -ATOM 4597 OE1 GLU A 286 -32.618 27.291 -16.655 1.00 94.43 O -ATOM 4598 OE2 GLU A 286 -32.467 26.711 -18.790 1.00 90.73 O1- -ATOM 4599 H GLU A 286 -28.552 24.506 -15.831 1.00 0.00 H -ATOM 4600 HA GLU A 286 -29.795 26.993 -16.194 1.00 0.00 H -ATOM 4601 HB2 GLU A 286 -30.626 24.164 -15.541 1.00 0.00 H -ATOM 4602 HB3 GLU A 286 -31.781 25.343 -15.077 1.00 0.00 H -ATOM 4603 HG2 GLU A 286 -30.659 25.105 -17.908 1.00 0.00 H -ATOM 4604 HG3 GLU A 286 -32.161 24.404 -17.363 1.00 0.00 H -ATOM 4605 N LYS A 287 -29.342 26.275 -13.007 1.00 37.93 N -ATOM 4606 CA LYS A 287 -29.421 26.745 -11.614 1.00 37.53 C -ATOM 4607 C LYS A 287 -28.641 28.077 -11.442 1.00 41.18 C -ATOM 4608 O LYS A 287 -29.167 28.972 -10.780 1.00 39.68 O -ATOM 4609 CB LYS A 287 -28.854 25.645 -10.678 1.00 38.66 C -ATOM 4610 CG LYS A 287 -28.948 25.978 -9.173 1.00 48.52 C -ATOM 4611 CD LYS A 287 -28.440 24.843 -8.265 1.00 57.93 C -ATOM 4612 CE LYS A 287 -28.351 25.229 -6.776 1.00 71.38 C -ATOM 4613 NZ LYS A 287 -29.659 25.615 -6.216 1.00 86.87 N1+ -ATOM 4614 H LYS A 287 -28.826 25.418 -13.151 1.00 0.00 H -ATOM 4615 HA LYS A 287 -30.471 26.912 -11.362 1.00 0.00 H -ATOM 4616 HB2 LYS A 287 -29.393 24.714 -10.862 1.00 0.00 H -ATOM 4617 HB3 LYS A 287 -27.813 25.436 -10.932 1.00 0.00 H -ATOM 4618 HG2 LYS A 287 -28.362 26.874 -8.961 1.00 0.00 H -ATOM 4619 HG3 LYS A 287 -29.981 26.220 -8.922 1.00 0.00 H -ATOM 4620 HD2 LYS A 287 -29.075 23.964 -8.383 1.00 0.00 H -ATOM 4621 HD3 LYS A 287 -27.447 24.540 -8.599 1.00 0.00 H -ATOM 4622 HE2 LYS A 287 -27.957 24.393 -6.197 1.00 0.00 H -ATOM 4623 HE3 LYS A 287 -27.658 26.060 -6.641 1.00 0.00 H -ATOM 4624 HZ1 LYS A 287 -29.553 25.856 -5.241 1.00 0.00 H -ATOM 4625 HZ2 LYS A 287 -30.018 26.413 -6.721 1.00 0.00 H -ATOM 4626 HZ3 LYS A 287 -30.304 24.843 -6.305 1.00 0.00 H +ATOM 4590 N GLH A 286 -28.482 25.489 -15.608 1.00 37.68 N +ATOM 4591 CA GLH A 286 -29.778 26.182 -15.462 1.00 39.70 C +ATOM 4592 C GLH A 286 -29.950 26.844 -14.069 1.00 42.94 C +ATOM 4593 O GLH A 286 -30.608 27.882 -13.996 1.00 44.72 O +ATOM 4594 CB GLH A 286 -30.939 25.186 -15.756 1.00 42.32 C +ATOM 4595 CG GLH A 286 -31.481 25.242 -17.205 1.00 60.01 C +ATOM 4596 CD GLH A 286 -32.250 26.525 -17.574 1.00 92.87 C +ATOM 4597 OE1 GLH A 286 -32.618 27.291 -16.655 1.00 94.43 O +ATOM 4598 OE2 GLH A 286 -32.467 26.711 -18.790 1.00 90.73 O1- +ATOM 4599 H GLH A 286 -28.552 24.506 -15.831 1.00 0.00 H +ATOM 4600 HA GLH A 286 -29.795 26.993 -16.194 1.00 0.00 H +ATOM 4601 HB2 GLH A 286 -30.626 24.164 -15.541 1.00 0.00 H +ATOM 4602 HB3 GLH A 286 -31.781 25.343 -15.077 1.00 0.00 H +ATOM 4603 HG2 GLH A 286 -30.659 25.105 -17.908 1.00 0.00 H +ATOM 4604 HG3 GLH A 286 -32.161 24.404 -17.363 1.00 0.00 H +ATOM 4605 N LYN A 287 -29.342 26.275 -13.007 1.00 37.93 N +ATOM 4606 CA LYN A 287 -29.421 26.745 -11.614 1.00 37.53 C +ATOM 4607 C LYN A 287 -28.641 28.077 -11.442 1.00 41.18 C +ATOM 4608 O LYN A 287 -29.167 28.972 -10.780 1.00 39.68 O +ATOM 4609 CB LYN A 287 -28.854 25.645 -10.678 1.00 38.66 C +ATOM 4610 CG LYN A 287 -28.948 25.978 -9.173 1.00 48.52 C +ATOM 4611 CD LYN A 287 -28.440 24.843 -8.265 1.00 57.93 C +ATOM 4612 CE LYN A 287 -28.351 25.229 -6.776 1.00 71.38 C +ATOM 4613 NZ LYN A 287 -29.659 25.615 -6.216 1.00 86.87 N1+ +ATOM 4614 H LYN A 287 -28.826 25.418 -13.151 1.00 0.00 H +ATOM 4615 HA LYN A 287 -30.471 26.912 -11.362 1.00 0.00 H +ATOM 4616 HB2 LYN A 287 -29.393 24.714 -10.862 1.00 0.00 H +ATOM 4617 HB3 LYN A 287 -27.813 25.436 -10.932 1.00 0.00 H +ATOM 4618 HG2 LYN A 287 -28.362 26.874 -8.961 1.00 0.00 H +ATOM 4619 HG3 LYN A 287 -29.981 26.220 -8.922 1.00 0.00 H +ATOM 4620 HD2 LYN A 287 -29.075 23.964 -8.383 1.00 0.00 H +ATOM 4621 HD3 LYN A 287 -27.447 24.540 -8.599 1.00 0.00 H +ATOM 4622 HE2 LYN A 287 -27.957 24.393 -6.197 1.00 0.00 H +ATOM 4623 HE3 LYN A 287 -27.658 26.060 -6.641 1.00 0.00 H +ATOM 4625 HZ2 LYN A 287 -30.018 26.413 -6.721 1.00 0.00 H +ATOM 4626 HZ3 LYN A 287 -30.304 24.843 -6.305 1.00 0.00 H ATOM 4627 N TYR A 288 -27.425 28.188 -12.014 1.00 37.88 N ATOM 4628 CA TYR A 288 -26.502 29.318 -11.792 1.00 38.84 C ATOM 4629 C TYR A 288 -26.541 30.330 -12.970 1.00 43.27 C diff --git a/tutorials/Tyk2/setupFEP/opls/protein.pdb b/tutorials/Tyk2/setupFEP/opls/protein.pdb deleted file mode 100644 index 647d2044..00000000 --- a/tutorials/Tyk2/setupFEP/opls/protein.pdb +++ /dev/null @@ -1,4670 +0,0 @@ -ATOM 1 C ACE A 1 -11.428 14.683 -48.309 1.00 0.00 C -ATOM 2 O ACE A 1 -12.334 15.445 -48.549 1.00 0.00 O -ATOM 3 CH3 ACE A 1 -11.713 13.288 -47.837 1.00 0.00 C -ATOM 4 HH31 ACE A 1 -12.791 13.140 -47.770 1.00 0.00 H -ATOM 5 HH32 ACE A 1 -11.292 12.572 -48.543 1.00 0.00 H -ATOM 6 HH33 ACE A 1 -11.264 13.137 -46.855 1.00 0.00 H -ATOM 7 N THR A 2 -10.117 15.085 -48.465 1.00 62.43 N -ATOM 8 CA THR A 2 -9.808 16.482 -48.932 1.00 60.76 C -ATOM 9 C THR A 2 -8.261 16.607 -48.892 1.00 61.63 C -ATOM 10 O THR A 2 -7.594 15.928 -48.104 1.00 59.62 O -ATOM 11 CB THR A 2 -10.433 17.569 -48.008 1.00 68.55 C -ATOM 12 OG1 THR A 2 -11.819 17.318 -47.869 1.00 68.98 O -ATOM 13 CG2 THR A 2 -10.285 19.024 -48.497 1.00 67.10 C -ATOM 14 H THR A 2 -9.364 14.441 -48.266 1.00 0.00 H -ATOM 15 HA THR A 2 -10.193 16.537 -49.952 1.00 0.00 H -ATOM 16 HB THR A 2 -10.006 17.485 -47.008 1.00 0.00 H -ATOM 17 HG1 THR A 2 -12.113 17.691 -47.033 1.00 0.00 H -ATOM 18 HG21 THR A 2 -10.802 19.718 -47.833 1.00 0.00 H -ATOM 19 HG22 THR A 2 -9.243 19.339 -48.525 1.00 0.00 H -ATOM 20 HG23 THR A 2 -10.699 19.154 -49.498 1.00 0.00 H -ATOM 21 N VAL A 3 -7.720 17.481 -49.765 1.00 57.37 N -ATOM 22 CA VAL A 3 -6.278 17.720 -49.939 1.00 55.39 C -ATOM 23 C VAL A 3 -6.053 19.248 -50.088 1.00 56.21 C -ATOM 24 O VAL A 3 -6.791 19.930 -50.802 1.00 57.24 O -ATOM 25 CB VAL A 3 -5.659 16.905 -51.120 1.00 60.85 C -ATOM 26 CG1 VAL A 3 -6.267 17.214 -52.507 1.00 62.96 C -ATOM 27 CG2 VAL A 3 -4.118 17.005 -51.171 1.00 59.88 C -ATOM 28 H VAL A 3 -8.320 18.027 -50.366 1.00 0.00 H -ATOM 29 HA VAL A 3 -5.773 17.398 -49.029 1.00 0.00 H -ATOM 30 HB VAL A 3 -5.883 15.857 -50.915 1.00 0.00 H -ATOM 31 HG11 VAL A 3 -5.874 16.536 -53.266 1.00 0.00 H -ATOM 32 HG12 VAL A 3 -7.351 17.101 -52.504 1.00 0.00 H -ATOM 33 HG13 VAL A 3 -6.039 18.229 -52.834 1.00 0.00 H -ATOM 34 HG21 VAL A 3 -3.702 16.316 -51.907 1.00 0.00 H -ATOM 35 HG22 VAL A 3 -3.784 18.008 -51.440 1.00 0.00 H -ATOM 36 HG23 VAL A 3 -3.671 16.756 -50.207 1.00 0.00 H -ATOM 37 N PHE A 4 -4.992 19.725 -49.417 1.00 49.19 N -ATOM 38 CA PHE A 4 -4.479 21.102 -49.397 1.00 47.07 C -ATOM 39 C PHE A 4 -3.056 21.031 -50.006 1.00 52.74 C -ATOM 40 O PHE A 4 -2.299 20.101 -49.715 1.00 53.11 O -ATOM 41 CB PHE A 4 -4.437 21.604 -47.928 1.00 45.10 C -ATOM 42 CG PHE A 4 -5.795 21.914 -47.304 1.00 44.18 C -ATOM 43 CD1 PHE A 4 -6.172 23.256 -47.053 1.00 44.87 C -ATOM 44 CD2 PHE A 4 -6.707 20.879 -46.975 1.00 45.07 C -ATOM 45 CE1 PHE A 4 -7.435 23.553 -46.544 1.00 45.27 C -ATOM 46 CE2 PHE A 4 -7.968 21.196 -46.473 1.00 46.87 C -ATOM 47 CZ PHE A 4 -8.335 22.526 -46.269 1.00 44.38 C -ATOM 48 H PHE A 4 -4.450 19.070 -48.868 1.00 0.00 H -ATOM 49 HA PHE A 4 -5.102 21.766 -50.000 1.00 0.00 H -ATOM 50 HB2 PHE A 4 -3.940 20.869 -47.295 1.00 0.00 H -ATOM 51 HB3 PHE A 4 -3.816 22.501 -47.865 1.00 0.00 H -ATOM 52 HD1 PHE A 4 -5.482 24.056 -47.257 1.00 0.00 H -ATOM 53 HD2 PHE A 4 -6.443 19.843 -47.129 1.00 0.00 H -ATOM 54 HE1 PHE A 4 -7.717 24.581 -46.368 1.00 0.00 H -ATOM 55 HE2 PHE A 4 -8.670 20.408 -46.256 1.00 0.00 H -ATOM 56 HZ PHE A 4 -9.319 22.761 -45.891 1.00 0.00 H -ATOM 57 N HIE A 5 -2.692 22.048 -50.808 1.00 50.80 N -ATOM 58 CA HIE A 5 -1.376 22.175 -51.462 1.00 51.86 C -ATOM 59 C HIE A 5 -0.553 23.178 -50.613 1.00 53.50 C -ATOM 60 O HIE A 5 -1.028 24.278 -50.320 1.00 52.26 O -ATOM 61 CB HIE A 5 -1.566 22.712 -52.903 1.00 55.68 C -ATOM 62 CG HIE A 5 -2.532 21.926 -53.761 1.00 61.81 C -ATOM 63 ND1 HIE A 5 -3.827 22.376 -54.043 1.00 65.50 N -ATOM 64 CD2 HIE A 5 -2.346 20.705 -54.377 1.00 65.19 C -ATOM 65 CE1 HIE A 5 -4.368 21.424 -54.790 1.00 67.02 C -ATOM 66 NE2 HIE A 5 -3.535 20.409 -55.022 1.00 67.16 N -ATOM 67 H HIE A 5 -3.347 22.797 -50.988 1.00 0.00 H -ATOM 68 HA HIE A 5 -0.869 21.207 -51.512 1.00 0.00 H -ATOM 69 HB2 HIE A 5 -1.891 23.754 -52.893 1.00 0.00 H -ATOM 70 HB3 HIE A 5 -0.604 22.703 -53.415 1.00 0.00 H -ATOM 71 HD2 HIE A 5 -1.494 20.041 -54.394 1.00 0.00 H -ATOM 72 HE1 HIE A 5 -5.378 21.466 -55.170 1.00 0.00 H -ATOM 73 HE2 HIE A 5 -3.739 19.577 -55.558 1.00 0.00 H -ATOM 74 N LYS A 6 0.697 22.801 -50.267 1.00 50.22 N -ATOM 75 CA LYS A 6 1.600 23.567 -49.377 1.00 49.02 C -ATOM 76 C LYS A 6 2.114 24.878 -50.045 1.00 53.09 C -ATOM 77 O LYS A 6 2.514 25.786 -49.316 1.00 51.68 O -ATOM 78 CB LYS A 6 2.774 22.667 -48.900 1.00 52.12 C -ATOM 79 CG LYS A 6 3.393 23.147 -47.568 1.00 67.25 C -ATOM 80 CD LYS A 6 4.459 22.208 -46.972 1.00 79.06 C -ATOM 81 CE LYS A 6 4.977 22.730 -45.617 1.00 86.18 C -ATOM 82 NZ LYS A 6 6.015 21.860 -45.038 1.00 95.28 N1+ -ATOM 83 H LYS A 6 1.027 21.886 -50.539 1.00 0.00 H -ATOM 84 HA LYS A 6 1.007 23.856 -48.508 1.00 0.00 H -ATOM 85 HB2 LYS A 6 2.420 21.645 -48.757 1.00 0.00 H -ATOM 86 HB3 LYS A 6 3.547 22.595 -49.668 1.00 0.00 H -ATOM 87 HG2 LYS A 6 3.833 24.136 -47.705 1.00 0.00 H -ATOM 88 HG3 LYS A 6 2.597 23.273 -46.833 1.00 0.00 H -ATOM 89 HD2 LYS A 6 4.039 21.208 -46.845 1.00 0.00 H -ATOM 90 HD3 LYS A 6 5.287 22.106 -47.674 1.00 0.00 H -ATOM 91 HE2 LYS A 6 5.396 23.731 -45.731 1.00 0.00 H -ATOM 92 HE3 LYS A 6 4.158 22.810 -44.901 1.00 0.00 H -ATOM 93 HZ1 LYS A 6 6.287 22.198 -44.127 1.00 0.00 H -ATOM 94 HZ2 LYS A 6 5.674 20.909 -44.945 1.00 0.00 H -ATOM 95 HZ3 LYS A 6 6.823 21.837 -45.644 1.00 0.00 H -ATOM 96 N ARG A 7 2.042 24.993 -51.387 1.00 51.74 N -ATOM 97 CA ARG A 7 2.350 26.187 -52.199 1.00 52.94 C -ATOM 98 C ARG A 7 1.301 27.325 -52.006 1.00 55.31 C -ATOM 99 O ARG A 7 1.579 28.443 -52.441 1.00 55.61 O -ATOM 100 CB ARG A 7 2.461 25.743 -53.683 1.00 57.62 C -ATOM 101 CG ARG A 7 1.149 25.255 -54.346 1.00 70.70 C -ATOM 102 CD ARG A 7 1.394 24.392 -55.596 1.00 85.20 C -ATOM 103 NE ARG A 7 0.143 23.800 -56.100 1.00 97.62 N -ATOM 104 CZ ARG A 7 -0.575 24.173 -57.169 1.00116.87 C -ATOM 105 NH1 ARG A 7 -0.214 25.183 -57.965 1.00109.22 N -ATOM 106 NH2 ARG A 7 -1.692 23.500 -57.451 1.00103.80 N1+ -ATOM 107 H ARG A 7 1.703 24.197 -51.907 1.00 0.00 H -ATOM 108 HA ARG A 7 3.320 26.573 -51.879 1.00 0.00 H -ATOM 109 HB2 ARG A 7 2.873 26.559 -54.280 1.00 0.00 H -ATOM 110 HB3 ARG A 7 3.211 24.952 -53.739 1.00 0.00 H -ATOM 111 HG2 ARG A 7 0.579 24.670 -53.625 1.00 0.00 H -ATOM 112 HG3 ARG A 7 0.518 26.108 -54.600 1.00 0.00 H -ATOM 113 HD2 ARG A 7 1.886 24.975 -56.374 1.00 0.00 H -ATOM 114 HD3 ARG A 7 2.068 23.569 -55.355 1.00 0.00 H -ATOM 115 HE ARG A 7 -0.209 23.019 -55.568 1.00 0.00 H -ATOM 116 HH12 ARG A 7 -0.800 25.449 -58.741 1.00 0.00 H -ATOM 117 HH11 ARG A 7 0.629 25.710 -57.775 1.00 0.00 H -ATOM 118 HH22 ARG A 7 -2.236 23.749 -58.263 1.00 0.00 H -ATOM 119 HH21 ARG A 7 -1.989 22.737 -56.863 1.00 0.00 H -ATOM 120 N TYR A 8 0.141 27.045 -51.376 1.00 49.98 N -ATOM 121 CA TYR A 8 -0.930 28.009 -51.074 1.00 49.28 C -ATOM 122 C TYR A 8 -1.027 28.273 -49.546 1.00 50.16 C -ATOM 123 O TYR A 8 -1.784 29.174 -49.181 1.00 48.17 O -ATOM 124 CB TYR A 8 -2.274 27.470 -51.623 1.00 51.36 C -ATOM 125 CG TYR A 8 -2.373 27.211 -53.125 1.00 55.87 C -ATOM 126 CD1 TYR A 8 -1.709 28.040 -54.067 1.00 59.63 C -ATOM 127 CD2 TYR A 8 -3.195 26.157 -53.594 1.00 57.59 C -ATOM 128 CE1 TYR A 8 -1.880 27.827 -55.453 1.00 63.33 C -ATOM 129 CE2 TYR A 8 -3.366 25.942 -54.979 1.00 61.39 C -ATOM 130 CZ TYR A 8 -2.718 26.786 -55.910 1.00 71.07 C -ATOM 131 OH TYR A 8 -2.918 26.606 -57.247 1.00 74.22 O -ATOM 132 H TYR A 8 -0.016 26.103 -51.045 1.00 0.00 H -ATOM 133 HA TYR A 8 -0.725 28.975 -51.537 1.00 0.00 H -ATOM 134 HB2 TYR A 8 -2.510 26.540 -51.108 1.00 0.00 H -ATOM 135 HB3 TYR A 8 -3.083 28.158 -51.373 1.00 0.00 H -ATOM 136 HD1 TYR A 8 -1.085 28.859 -53.741 1.00 0.00 H -ATOM 137 HD2 TYR A 8 -3.714 25.519 -52.893 1.00 0.00 H -ATOM 138 HE1 TYR A 8 -1.385 28.475 -56.162 1.00 0.00 H -ATOM 139 HE2 TYR A 8 -4.008 25.142 -55.320 1.00 0.00 H -ATOM 140 HH TYR A 8 -3.593 25.949 -57.432 1.00 0.00 H -ATOM 141 N LEU A 9 -0.288 27.542 -48.681 1.00 46.72 N -ATOM 142 CA LEU A 9 -0.259 27.720 -47.219 1.00 44.74 C -ATOM 143 C LEU A 9 0.840 28.777 -46.933 1.00 48.16 C -ATOM 144 O LEU A 9 2.030 28.485 -47.070 1.00 48.59 O -ATOM 145 CB LEU A 9 0.101 26.367 -46.532 1.00 44.20 C -ATOM 146 CG LEU A 9 -1.048 25.337 -46.386 1.00 48.88 C -ATOM 147 CD1 LEU A 9 -0.524 24.011 -45.804 1.00 51.85 C -ATOM 148 CD2 LEU A 9 -2.215 25.837 -45.511 1.00 47.58 C -ATOM 149 H LEU A 9 0.349 26.848 -49.046 1.00 0.00 H -ATOM 150 HA LEU A 9 -1.217 28.085 -46.847 1.00 0.00 H -ATOM 151 HB2 LEU A 9 0.933 25.901 -47.063 1.00 0.00 H -ATOM 152 HB3 LEU A 9 0.485 26.552 -45.531 1.00 0.00 H -ATOM 153 HG LEU A 9 -1.431 25.125 -47.386 1.00 0.00 H -ATOM 154 HD11 LEU A 9 -1.310 23.255 -45.773 1.00 0.00 H -ATOM 155 HD12 LEU A 9 0.292 23.604 -46.397 1.00 0.00 H -ATOM 156 HD13 LEU A 9 -0.150 24.141 -44.788 1.00 0.00 H -ATOM 157 HD21 LEU A 9 -3.028 25.110 -45.492 1.00 0.00 H -ATOM 158 HD22 LEU A 9 -1.896 25.993 -44.482 1.00 0.00 H -ATOM 159 HD23 LEU A 9 -2.638 26.773 -45.868 1.00 0.00 H -ATOM 160 N LYS A 10 0.404 29.982 -46.517 1.00 44.15 N -ATOM 161 CA LYS A 10 1.242 31.102 -46.056 1.00 44.11 C -ATOM 162 C LYS A 10 1.157 31.045 -44.511 1.00 46.50 C -ATOM 163 O LYS A 10 0.061 31.172 -43.963 1.00 45.72 O -ATOM 164 CB LYS A 10 0.635 32.447 -46.546 1.00 48.28 C -ATOM 165 CG LYS A 10 0.901 32.810 -48.022 1.00 70.59 C -ATOM 166 CD LYS A 10 0.102 31.993 -49.057 1.00 82.83 C -ATOM 167 CE LYS A 10 0.211 32.586 -50.472 1.00 97.68 C -ATOM 168 NZ LYS A 10 -0.510 31.776 -51.467 1.00107.26 N1+ -ATOM 169 H LYS A 10 -0.593 30.133 -46.432 1.00 0.00 H -ATOM 170 HA LYS A 10 2.277 31.012 -46.393 1.00 0.00 H -ATOM 171 HB2 LYS A 10 -0.439 32.485 -46.352 1.00 0.00 H -ATOM 172 HB3 LYS A 10 1.058 33.259 -45.951 1.00 0.00 H -ATOM 173 HG2 LYS A 10 0.645 33.863 -48.150 1.00 0.00 H -ATOM 174 HG3 LYS A 10 1.969 32.740 -48.235 1.00 0.00 H -ATOM 175 HD2 LYS A 10 0.467 30.966 -49.065 1.00 0.00 H -ATOM 176 HD3 LYS A 10 -0.948 31.949 -48.762 1.00 0.00 H -ATOM 177 HE2 LYS A 10 -0.198 33.597 -50.488 1.00 0.00 H -ATOM 178 HE3 LYS A 10 1.256 32.656 -50.776 1.00 0.00 H -ATOM 179 HZ1 LYS A 10 -0.413 32.197 -52.380 1.00 0.00 H -ATOM 180 HZ2 LYS A 10 -0.125 30.843 -51.487 1.00 0.00 H -ATOM 181 HZ3 LYS A 10 -1.494 31.730 -51.232 1.00 0.00 H -ATOM 182 N LYS A 11 2.310 30.879 -43.830 1.00 42.86 N -ATOM 183 CA LYS A 11 2.408 30.737 -42.363 1.00 42.35 C -ATOM 184 C LYS A 11 2.279 32.149 -41.738 1.00 45.75 C -ATOM 185 O LYS A 11 2.962 33.084 -42.165 1.00 46.24 O -ATOM 186 CB LYS A 11 3.776 30.107 -41.998 1.00 45.46 C -ATOM 187 CG LYS A 11 3.824 29.566 -40.553 1.00 54.73 C -ATOM 188 CD LYS A 11 5.210 29.040 -40.142 1.00 64.90 C -ATOM 189 CE LYS A 11 5.222 28.520 -38.697 1.00 74.92 C -ATOM 190 NZ LYS A 11 6.576 28.166 -38.243 1.00 84.51 N1+ -ATOM 191 H LYS A 11 3.180 30.817 -44.337 1.00 0.00 H -ATOM 192 HA LYS A 11 1.605 30.084 -42.013 1.00 0.00 H -ATOM 193 HB2 LYS A 11 3.994 29.281 -42.676 1.00 0.00 H -ATOM 194 HB3 LYS A 11 4.584 30.824 -42.155 1.00 0.00 H -ATOM 195 HG2 LYS A 11 3.529 30.354 -39.857 1.00 0.00 H -ATOM 196 HG3 LYS A 11 3.081 28.774 -40.439 1.00 0.00 H -ATOM 197 HD2 LYS A 11 5.519 28.245 -40.824 1.00 0.00 H -ATOM 198 HD3 LYS A 11 5.940 29.844 -40.250 1.00 0.00 H -ATOM 199 HE2 LYS A 11 4.820 29.273 -38.016 1.00 0.00 H -ATOM 200 HE3 LYS A 11 4.590 27.638 -38.612 1.00 0.00 H -ATOM 201 HZ1 LYS A 11 6.516 27.913 -37.263 1.00 0.00 H -ATOM 202 HZ2 LYS A 11 6.932 27.389 -38.781 1.00 0.00 H -ATOM 203 HZ3 LYS A 11 7.189 28.962 -38.341 1.00 0.00 H -ATOM 204 N ILE A 12 1.431 32.246 -40.698 1.00 41.32 N -ATOM 205 CA ILE A 12 1.157 33.469 -39.930 1.00 41.22 C -ATOM 206 C ILE A 12 2.009 33.390 -38.631 1.00 44.92 C -ATOM 207 O ILE A 12 2.772 34.323 -38.382 1.00 45.41 O -ATOM 208 CB ILE A 12 -0.366 33.590 -39.561 1.00 44.36 C -ATOM 209 CG1 ILE A 12 -1.231 33.727 -40.847 1.00 45.50 C -ATOM 210 CG2 ILE A 12 -0.683 34.752 -38.579 1.00 46.17 C -ATOM 211 CD1 ILE A 12 -2.743 33.513 -40.658 1.00 56.14 C -ATOM 212 H ILE A 12 0.941 31.416 -40.388 1.00 0.00 H -ATOM 213 HA ILE A 12 1.447 34.360 -40.494 1.00 0.00 H -ATOM 214 HB ILE A 12 -0.665 32.663 -39.068 1.00 0.00 H -ATOM 215 HG12 ILE A 12 -1.064 34.713 -41.284 1.00 0.00 H -ATOM 216 HG13 ILE A 12 -0.903 33.018 -41.608 1.00 0.00 H -ATOM 217 HG21 ILE A 12 -1.735 34.775 -38.299 1.00 0.00 H -ATOM 218 HG22 ILE A 12 -0.130 34.675 -37.644 1.00 0.00 H -ATOM 219 HG23 ILE A 12 -0.438 35.718 -39.020 1.00 0.00 H -ATOM 220 HD11 ILE A 12 -3.290 33.838 -41.540 1.00 0.00 H -ATOM 221 HD12 ILE A 12 -2.980 32.461 -40.511 1.00 0.00 H -ATOM 222 HD13 ILE A 12 -3.148 34.076 -39.820 1.00 0.00 H -ATOM 223 N ARG A 13 1.868 32.312 -37.829 1.00 40.97 N -ATOM 224 CA ARG A 13 2.540 32.124 -36.528 1.00 41.13 C -ATOM 225 C ARG A 13 2.487 30.632 -36.115 1.00 44.46 C -ATOM 226 O ARG A 13 1.837 29.812 -36.762 1.00 43.07 O -ATOM 227 CB ARG A 13 1.989 33.106 -35.452 1.00 41.29 C -ATOM 228 CG ARG A 13 0.503 32.918 -35.070 1.00 52.38 C -ATOM 229 CD ARG A 13 0.053 33.886 -33.961 1.00 59.92 C -ATOM 230 NE ARG A 13 -1.408 33.865 -33.779 1.00 68.07 N -ATOM 231 CZ ARG A 13 -2.306 34.633 -34.418 1.00 83.41 C -ATOM 232 NH1 ARG A 13 -1.949 35.540 -35.332 1.00 64.57 N -ATOM 233 NH2 ARG A 13 -3.600 34.492 -34.132 1.00 77.22 N1+ -ATOM 234 H ARG A 13 1.231 31.575 -38.099 1.00 0.00 H -ATOM 235 HA ARG A 13 3.599 32.350 -36.681 1.00 0.00 H -ATOM 236 HB2 ARG A 13 2.594 33.014 -34.548 1.00 0.00 H -ATOM 237 HB3 ARG A 13 2.144 34.133 -35.783 1.00 0.00 H -ATOM 238 HG2 ARG A 13 -0.110 33.067 -35.958 1.00 0.00 H -ATOM 239 HG3 ARG A 13 0.319 31.893 -34.745 1.00 0.00 H -ATOM 240 HD2 ARG A 13 0.528 33.617 -33.017 1.00 0.00 H -ATOM 241 HD3 ARG A 13 0.371 34.905 -34.186 1.00 0.00 H -ATOM 242 HE ARG A 13 -1.757 33.210 -33.096 1.00 0.00 H -ATOM 243 HH12 ARG A 13 -2.648 36.108 -35.787 1.00 0.00 H -ATOM 244 HH11 ARG A 13 -0.973 35.667 -35.553 1.00 0.00 H -ATOM 245 HH22 ARG A 13 -4.288 35.060 -34.603 1.00 0.00 H -ATOM 246 HH21 ARG A 13 -3.902 33.807 -33.456 1.00 0.00 H -ATOM 247 N ASH A 14 3.180 30.325 -35.003 1.00 41.92 N -ATOM 248 CA ASH A 14 3.147 29.044 -34.272 1.00 41.86 C -ATOM 249 C ASH A 14 2.019 29.169 -33.192 1.00 43.46 C -ATOM 250 O ASH A 14 1.868 30.257 -32.608 1.00 42.68 O -ATOM 251 CB ASH A 14 4.496 28.791 -33.544 1.00 46.10 C -ATOM 252 CG ASH A 14 5.697 28.545 -34.473 1.00 63.12 C -ATOM 253 OD1 ASH A 14 5.497 27.972 -35.567 1.00 62.46 O -ATOM 254 OD2 ASH A 14 6.820 28.903 -34.061 1.00 75.36 O1- -ATOM 255 H ASH A 14 3.686 31.062 -34.533 1.00 0.00 H -ATOM 256 HA ASH A 14 2.926 28.219 -34.951 1.00 0.00 H -ATOM 257 HB2 ASH A 14 4.733 29.623 -32.877 1.00 0.00 H -ATOM 258 HB3 ASH A 14 4.414 27.907 -32.908 1.00 0.00 H -ATOM 259 N LEU A 15 1.233 28.101 -32.923 1.00 39.42 N -ATOM 260 CA LEU A 15 0.172 28.033 -31.875 1.00 38.97 C -ATOM 261 C LEU A 15 0.702 27.317 -30.612 1.00 45.51 C -ATOM 262 O LEU A 15 0.398 27.706 -29.474 1.00 47.25 O -ATOM 263 CB LEU A 15 -1.082 27.258 -32.380 1.00 37.74 C -ATOM 264 CG LEU A 15 -1.744 27.823 -33.655 1.00 40.14 C -ATOM 265 CD1 LEU A 15 -3.001 27.022 -34.015 1.00 39.42 C -ATOM 266 CD2 LEU A 15 -2.084 29.308 -33.476 1.00 39.39 C -ATOM 267 H LEU A 15 1.412 27.200 -33.360 1.00 0.00 H -ATOM 268 HA LEU A 15 -0.151 29.029 -31.571 1.00 0.00 H -ATOM 269 HB2 LEU A 15 -0.839 26.206 -32.534 1.00 0.00 H -ATOM 270 HB3 LEU A 15 -1.847 27.235 -31.589 1.00 0.00 H -ATOM 271 HG LEU A 15 -1.037 27.712 -34.471 1.00 0.00 H -ATOM 272 HD11 LEU A 15 -3.063 26.754 -35.064 1.00 0.00 H -ATOM 273 HD12 LEU A 15 -3.065 26.110 -33.414 1.00 0.00 H -ATOM 274 HD13 LEU A 15 -3.883 27.593 -33.762 1.00 0.00 H -ATOM 275 HD21 LEU A 15 -2.935 29.621 -34.070 1.00 0.00 H -ATOM 276 HD22 LEU A 15 -2.366 29.459 -32.434 1.00 0.00 H -ATOM 277 HD23 LEU A 15 -1.231 29.955 -33.659 1.00 0.00 H -ATOM 278 N GLY A 16 1.662 26.390 -30.763 1.00 41.87 N -ATOM 279 CA GLY A 16 2.082 25.529 -29.668 1.00 43.49 C -ATOM 280 C GLY A 16 2.489 24.119 -30.130 1.00 48.38 C -ATOM 281 O GLY A 16 2.617 23.847 -31.325 1.00 47.59 O -ATOM 282 H GLY A 16 2.133 26.280 -31.653 1.00 0.00 H -ATOM 283 HA2 GLY A 16 2.950 26.013 -29.219 1.00 0.00 H -ATOM 284 HA3 GLY A 16 1.326 25.436 -28.884 1.00 0.00 H -ATOM 285 N GLU A 17 2.727 23.232 -29.145 1.00 46.73 N -ATOM 286 CA GLU A 17 3.213 21.854 -29.322 1.00 47.46 C -ATOM 287 C GLU A 17 2.104 20.899 -28.826 1.00 51.67 C -ATOM 288 O GLU A 17 1.604 21.055 -27.709 1.00 51.35 O -ATOM 289 CB GLU A 17 4.514 21.652 -28.497 1.00 51.27 C -ATOM 290 CG GLU A 17 5.726 22.506 -28.950 1.00 66.56 C -ATOM 291 CD GLU A 17 6.215 22.244 -30.382 1.00 94.70 C -ATOM 292 OE1 GLU A 17 6.130 21.079 -30.830 1.00 96.75 O -ATOM 293 OE2 GLU A 17 6.676 23.224 -31.010 1.00 86.75 O1- -ATOM 294 H GLU A 17 2.588 23.517 -28.187 1.00 0.00 H -ATOM 295 HA GLU A 17 3.419 21.640 -30.369 1.00 0.00 H -ATOM 296 HB2 GLU A 17 4.322 21.868 -27.444 1.00 0.00 H -ATOM 297 HB3 GLU A 17 4.801 20.598 -28.522 1.00 0.00 H -ATOM 298 HG2 GLU A 17 5.489 23.565 -28.839 1.00 0.00 H -ATOM 299 HG3 GLU A 17 6.567 22.316 -28.282 1.00 0.00 H -ATOM 300 N GLY A 18 1.825 19.869 -29.646 1.00 48.81 N -ATOM 301 CA GLY A 18 1.048 18.676 -29.290 1.00 50.44 C -ATOM 302 C GLY A 18 1.978 17.462 -29.074 1.00 59.13 C -ATOM 303 O GLY A 18 3.201 17.594 -28.994 1.00 59.62 O -ATOM 304 H GLY A 18 2.299 19.829 -30.539 1.00 0.00 H -ATOM 305 HA2 GLY A 18 0.459 18.835 -28.385 1.00 0.00 H -ATOM 306 HA3 GLY A 18 0.342 18.467 -30.093 1.00 0.00 H -ATOM 307 N HIP A 19 1.376 16.262 -28.944 1.00 58.87 N -ATOM 308 CA HIP A 19 2.042 15.006 -28.530 1.00 61.58 C -ATOM 309 C HIP A 19 2.964 14.388 -29.616 1.00 65.75 C -ATOM 310 O HIP A 19 3.871 13.652 -29.226 1.00 67.01 O -ATOM 311 CB HIP A 19 0.978 13.971 -28.090 1.00 64.07 C -ATOM 312 CG HIP A 19 0.527 14.151 -26.663 1.00 71.10 C -ATOM 313 ND1 HIP A 19 1.337 13.804 -25.590 1.00 74.01 N1+ -ATOM 314 CD2 HIP A 19 -0.601 14.753 -26.143 1.00 75.68 C -ATOM 315 CE1 HIP A 19 0.693 14.165 -24.484 1.00 76.67 C -ATOM 316 NE2 HIP A 19 -0.472 14.736 -24.765 1.00 78.22 N -ATOM 317 H HIP A 19 0.367 16.224 -28.992 1.00 0.00 H -ATOM 318 HA HIP A 19 2.692 15.226 -27.678 1.00 0.00 H -ATOM 319 HB2 HIP A 19 0.105 14.014 -28.742 1.00 0.00 H -ATOM 320 HB3 HIP A 19 1.347 12.945 -28.169 1.00 0.00 H -ATOM 321 HD1 HIP A 19 2.246 13.365 -25.636 1.00 0.00 H -ATOM 322 HD2 HIP A 19 -1.464 15.193 -26.622 1.00 0.00 H -ATOM 323 HE1 HIP A 19 1.067 14.022 -23.481 1.00 0.00 H -ATOM 324 HE2 HIP A 19 -1.152 15.100 -24.104 1.00 0.00 H -ATOM 325 N PHE A 20 2.757 14.677 -30.916 1.00 61.05 N -ATOM 326 CA PHE A 20 3.586 14.165 -32.030 1.00 61.65 C -ATOM 327 C PHE A 20 4.342 15.309 -32.753 1.00 63.63 C -ATOM 328 O PHE A 20 5.157 14.992 -33.622 1.00 65.29 O -ATOM 329 CB PHE A 20 2.726 13.313 -33.000 1.00 63.30 C -ATOM 330 CG PHE A 20 2.291 11.955 -32.462 1.00 67.27 C -ATOM 331 CD1 PHE A 20 3.249 11.017 -31.996 1.00 73.63 C -ATOM 332 CD2 PHE A 20 0.921 11.600 -32.439 1.00 68.80 C -ATOM 333 CE1 PHE A 20 2.832 9.785 -31.492 1.00 76.93 C -ATOM 334 CE2 PHE A 20 0.528 10.360 -31.946 1.00 73.69 C -ATOM 335 CZ PHE A 20 1.477 9.462 -31.460 1.00 75.01 C -ATOM 336 H PHE A 20 2.013 15.310 -31.167 1.00 0.00 H -ATOM 337 HA PHE A 20 4.389 13.529 -31.650 1.00 0.00 H -ATOM 338 HB2 PHE A 20 1.846 13.886 -33.303 1.00 0.00 H -ATOM 339 HB3 PHE A 20 3.262 13.114 -33.926 1.00 0.00 H -ATOM 340 HD1 PHE A 20 4.302 11.253 -32.023 1.00 0.00 H -ATOM 341 HD2 PHE A 20 0.175 12.284 -32.807 1.00 0.00 H -ATOM 342 HE1 PHE A 20 3.558 9.077 -31.125 1.00 0.00 H -ATOM 343 HE2 PHE A 20 -0.519 10.094 -31.938 1.00 0.00 H -ATOM 344 HZ PHE A 20 1.159 8.507 -31.067 1.00 0.00 H -ATOM 345 N GLY A 21 4.115 16.585 -32.391 1.00 56.05 N -ATOM 346 CA GLY A 21 4.822 17.736 -32.956 1.00 53.59 C -ATOM 347 C GLY A 21 3.952 19.002 -32.930 1.00 52.99 C -ATOM 348 O GLY A 21 2.870 19.048 -32.338 1.00 51.95 O -ATOM 349 H GLY A 21 3.454 16.781 -31.653 1.00 0.00 H -ATOM 350 HA2 GLY A 21 5.720 17.918 -32.363 1.00 0.00 H -ATOM 351 HA3 GLY A 21 5.147 17.547 -33.981 1.00 0.00 H -ATOM 352 N LYS A 22 4.494 20.056 -33.564 1.00 47.39 N -ATOM 353 CA LYS A 22 4.030 21.448 -33.521 1.00 44.86 C -ATOM 354 C LYS A 22 2.731 21.641 -34.339 1.00 43.37 C -ATOM 355 O LYS A 22 2.559 21.035 -35.397 1.00 42.02 O -ATOM 356 CB LYS A 22 5.163 22.371 -34.033 1.00 48.19 C -ATOM 357 CG LYS A 22 5.625 22.164 -35.498 1.00 70.18 C -ATOM 358 CD LYS A 22 6.844 23.015 -35.914 1.00 80.07 C -ATOM 359 CE LYS A 22 6.541 24.493 -36.231 1.00 90.27 C -ATOM 360 NZ LYS A 22 6.130 25.256 -35.041 1.00 99.37 N1+ -ATOM 361 H LYS A 22 5.385 19.928 -34.021 1.00 0.00 H -ATOM 362 HA LYS A 22 3.836 21.697 -32.480 1.00 0.00 H -ATOM 363 HB2 LYS A 22 4.838 23.399 -33.879 1.00 0.00 H -ATOM 364 HB3 LYS A 22 6.029 22.245 -33.383 1.00 0.00 H -ATOM 365 HG2 LYS A 22 5.890 21.115 -35.634 1.00 0.00 H -ATOM 366 HG3 LYS A 22 4.804 22.349 -36.189 1.00 0.00 H -ATOM 367 HD2 LYS A 22 7.630 22.940 -35.162 1.00 0.00 H -ATOM 368 HD3 LYS A 22 7.266 22.571 -36.817 1.00 0.00 H -ATOM 369 HE2 LYS A 22 7.429 24.970 -36.646 1.00 0.00 H -ATOM 370 HE3 LYS A 22 5.764 24.565 -36.993 1.00 0.00 H -ATOM 371 HZ1 LYS A 22 5.926 26.218 -35.297 1.00 0.00 H -ATOM 372 HZ2 LYS A 22 5.298 24.844 -34.645 1.00 0.00 H -ATOM 373 HZ3 LYS A 22 6.869 25.242 -34.352 1.00 0.00 H -ATOM 374 N VAL A 23 1.886 22.559 -33.838 1.00 37.15 N -ATOM 375 CA VAL A 23 0.714 23.136 -34.512 1.00 34.94 C -ATOM 376 C VAL A 23 1.109 24.601 -34.835 1.00 36.97 C -ATOM 377 O VAL A 23 1.695 25.296 -33.999 1.00 35.74 O -ATOM 378 CB VAL A 23 -0.546 23.163 -33.590 1.00 38.64 C -ATOM 379 CG1 VAL A 23 -1.821 23.645 -34.320 1.00 37.50 C -ATOM 380 CG2 VAL A 23 -0.828 21.798 -32.925 1.00 39.45 C -ATOM 381 H VAL A 23 2.129 23.007 -32.963 1.00 0.00 H -ATOM 382 HA VAL A 23 0.486 22.600 -35.428 1.00 0.00 H -ATOM 383 HB VAL A 23 -0.354 23.866 -32.778 1.00 0.00 H -ATOM 384 HG11 VAL A 23 -2.672 23.697 -33.640 1.00 0.00 H -ATOM 385 HG12 VAL A 23 -1.699 24.639 -34.746 1.00 0.00 H -ATOM 386 HG13 VAL A 23 -2.091 22.972 -35.136 1.00 0.00 H -ATOM 387 HG21 VAL A 23 -1.679 21.853 -32.249 1.00 0.00 H -ATOM 388 HG22 VAL A 23 -1.058 21.041 -33.670 1.00 0.00 H -ATOM 389 HG23 VAL A 23 0.017 21.443 -32.334 1.00 0.00 H -ATOM 390 N SER A 24 0.732 25.051 -36.044 1.00 32.82 N -ATOM 391 CA SER A 24 0.996 26.399 -36.566 1.00 32.44 C -ATOM 392 C SER A 24 -0.270 26.876 -37.302 1.00 36.01 C -ATOM 393 O SER A 24 -0.990 26.084 -37.913 1.00 34.87 O -ATOM 394 CB SER A 24 2.247 26.414 -37.471 1.00 36.04 C -ATOM 395 OG SER A 24 3.403 25.953 -36.801 1.00 45.71 O -ATOM 396 H SER A 24 0.233 24.431 -36.670 1.00 0.00 H -ATOM 397 HA SER A 24 1.152 27.083 -35.729 1.00 0.00 H -ATOM 398 HB2 SER A 24 2.099 25.785 -38.345 1.00 0.00 H -ATOM 399 HB3 SER A 24 2.437 27.423 -37.836 1.00 0.00 H -ATOM 400 HG SER A 24 3.286 25.013 -36.635 1.00 0.00 H -ATOM 401 N LEU A 25 -0.469 28.203 -37.277 1.00 32.94 N -ATOM 402 CA LEU A 25 -1.540 28.934 -37.955 1.00 32.73 C -ATOM 403 C LEU A 25 -0.992 29.303 -39.352 1.00 36.98 C -ATOM 404 O LEU A 25 0.078 29.906 -39.471 1.00 35.71 O -ATOM 405 CB LEU A 25 -1.833 30.216 -37.134 1.00 33.31 C -ATOM 406 CG LEU A 25 -3.024 31.076 -37.617 1.00 38.67 C -ATOM 407 CD1 LEU A 25 -4.299 30.253 -37.876 1.00 39.26 C -ATOM 408 CD2 LEU A 25 -3.289 32.230 -36.637 1.00 40.96 C -ATOM 409 H LEU A 25 0.219 28.785 -36.816 1.00 0.00 H -ATOM 410 HA LEU A 25 -2.431 28.304 -38.015 1.00 0.00 H -ATOM 411 HB2 LEU A 25 -2.037 29.919 -36.109 1.00 0.00 H -ATOM 412 HB3 LEU A 25 -0.940 30.842 -37.072 1.00 0.00 H -ATOM 413 HG LEU A 25 -2.739 31.527 -38.564 1.00 0.00 H -ATOM 414 HD11 LEU A 25 -5.168 30.891 -38.025 1.00 0.00 H -ATOM 415 HD12 LEU A 25 -4.205 29.641 -38.773 1.00 0.00 H -ATOM 416 HD13 LEU A 25 -4.511 29.584 -37.044 1.00 0.00 H -ATOM 417 HD21 LEU A 25 -4.076 32.889 -36.998 1.00 0.00 H -ATOM 418 HD22 LEU A 25 -3.591 31.860 -35.657 1.00 0.00 H -ATOM 419 HD23 LEU A 25 -2.399 32.842 -36.502 1.00 0.00 H -ATOM 420 N TYR A 26 -1.795 28.970 -40.374 1.00 34.34 N -ATOM 421 CA TYR A 26 -1.581 29.297 -41.786 1.00 35.26 C -ATOM 422 C TYR A 26 -2.882 29.950 -42.302 1.00 40.97 C -ATOM 423 O TYR A 26 -3.982 29.559 -41.906 1.00 41.41 O -ATOM 424 CB TYR A 26 -1.261 28.019 -42.599 1.00 36.25 C -ATOM 425 CG TYR A 26 0.088 27.361 -42.349 1.00 37.55 C -ATOM 426 CD1 TYR A 26 1.172 27.613 -43.221 1.00 41.10 C -ATOM 427 CD2 TYR A 26 0.256 26.447 -41.282 1.00 37.73 C -ATOM 428 CE1 TYR A 26 2.408 26.953 -43.043 1.00 42.72 C -ATOM 429 CE2 TYR A 26 1.488 25.776 -41.109 1.00 39.24 C -ATOM 430 CZ TYR A 26 2.567 26.033 -41.983 1.00 49.59 C -ATOM 431 OH TYR A 26 3.758 25.391 -41.807 1.00 54.45 O -ATOM 432 H TYR A 26 -2.660 28.482 -40.174 1.00 0.00 H -ATOM 433 HA TYR A 26 -0.768 30.016 -41.887 1.00 0.00 H -ATOM 434 HB2 TYR A 26 -2.035 27.270 -42.426 1.00 0.00 H -ATOM 435 HB3 TYR A 26 -1.322 28.245 -43.666 1.00 0.00 H -ATOM 436 HD1 TYR A 26 1.055 28.298 -44.046 1.00 0.00 H -ATOM 437 HD2 TYR A 26 -0.566 26.242 -40.612 1.00 0.00 H -ATOM 438 HE1 TYR A 26 3.223 27.152 -43.724 1.00 0.00 H -ATOM 439 HE2 TYR A 26 1.600 25.051 -40.317 1.00 0.00 H -ATOM 440 HH TYR A 26 4.411 25.626 -42.470 1.00 0.00 H -ATOM 441 N CYS A 27 -2.720 30.854 -43.284 1.00 39.05 N -ATOM 442 CA CYS A 27 -3.765 31.296 -44.214 1.00 40.20 C -ATOM 443 C CYS A 27 -3.535 30.413 -45.466 1.00 43.77 C -ATOM 444 O CYS A 27 -2.490 30.524 -46.113 1.00 43.29 O -ATOM 445 CB CYS A 27 -3.618 32.800 -44.560 1.00 41.99 C -ATOM 446 SG CYS A 27 -4.960 33.401 -45.631 1.00 48.59 S -ATOM 447 H CYS A 27 -1.775 31.095 -43.559 1.00 0.00 H -ATOM 448 HA CYS A 27 -4.759 31.131 -43.792 1.00 0.00 H -ATOM 449 HB2 CYS A 27 -3.639 33.400 -43.654 1.00 0.00 H -ATOM 450 HB3 CYS A 27 -2.662 33.009 -45.043 1.00 0.00 H -ATOM 451 HG CYS A 27 -5.946 33.246 -44.741 1.00 0.00 H -ATOM 452 N TYR A 28 -4.541 29.585 -45.805 1.00 39.62 N -ATOM 453 CA TYR A 28 -4.605 28.826 -47.061 1.00 39.96 C -ATOM 454 C TYR A 28 -5.324 29.775 -48.041 1.00 45.20 C -ATOM 455 O TYR A 28 -6.513 30.045 -47.864 1.00 45.42 O -ATOM 456 CB TYR A 28 -5.423 27.527 -46.861 1.00 40.18 C -ATOM 457 CG TYR A 28 -5.471 26.634 -48.094 1.00 41.11 C -ATOM 458 CD1 TYR A 28 -4.285 26.017 -48.562 1.00 41.72 C -ATOM 459 CD2 TYR A 28 -6.690 26.410 -48.782 1.00 43.06 C -ATOM 460 CE1 TYR A 28 -4.326 25.153 -49.676 1.00 42.69 C -ATOM 461 CE2 TYR A 28 -6.724 25.559 -49.912 1.00 44.62 C -ATOM 462 CZ TYR A 28 -5.541 24.924 -50.354 1.00 47.56 C -ATOM 463 OH TYR A 28 -5.563 24.088 -51.431 1.00 49.11 O -ATOM 464 H TYR A 28 -5.385 29.581 -45.245 1.00 0.00 H -ATOM 465 HA TYR A 28 -3.605 28.568 -47.412 1.00 0.00 H -ATOM 466 HB2 TYR A 28 -4.989 26.941 -46.050 1.00 0.00 H -ATOM 467 HB3 TYR A 28 -6.439 27.750 -46.526 1.00 0.00 H -ATOM 468 HD1 TYR A 28 -3.345 26.194 -48.065 1.00 0.00 H -ATOM 469 HD2 TYR A 28 -7.600 26.882 -48.442 1.00 0.00 H -ATOM 470 HE1 TYR A 28 -3.428 24.668 -50.015 1.00 0.00 H -ATOM 471 HE2 TYR A 28 -7.659 25.393 -50.426 1.00 0.00 H -ATOM 472 HH TYR A 28 -6.440 23.983 -51.809 1.00 0.00 H -ATOM 473 N ASH A 29 -4.579 30.269 -49.044 1.00 46.60 N -ATOM 474 CA ASH A 29 -5.006 31.368 -49.914 1.00 48.33 C -ATOM 475 C ASH A 29 -4.495 31.003 -51.336 1.00 54.57 C -ATOM 476 O ASH A 29 -3.395 31.429 -51.695 1.00 54.85 O -ATOM 477 CB ASH A 29 -4.607 32.743 -49.295 1.00 50.11 C -ATOM 478 CG ASH A 29 -4.563 33.958 -50.225 1.00 62.07 C -ATOM 479 OD1 ASH A 29 -5.521 34.112 -51.013 1.00 63.23 O -ATOM 480 OD2 ASH A 29 -3.585 34.729 -50.115 1.00 69.60 O1- -ATOM 481 H ASH A 29 -3.617 29.970 -49.141 1.00 0.00 H -ATOM 482 HA ASH A 29 -6.095 31.391 -49.974 1.00 0.00 H -ATOM 483 HB2 ASH A 29 -5.298 32.988 -48.490 1.00 0.00 H -ATOM 484 HB3 ASH A 29 -3.628 32.653 -48.819 1.00 0.00 H -ATOM 485 N PRO A 30 -5.286 30.218 -52.123 1.00 52.47 N -ATOM 486 CA PRO A 30 -4.938 29.841 -53.515 1.00 54.47 C -ATOM 487 C PRO A 30 -4.967 31.010 -54.532 1.00 61.35 C -ATOM 488 O PRO A 30 -4.182 30.973 -55.479 1.00 62.40 O -ATOM 489 CB PRO A 30 -5.971 28.761 -53.903 1.00 56.45 C -ATOM 490 CG PRO A 30 -6.478 28.226 -52.575 1.00 58.90 C -ATOM 491 CD PRO A 30 -6.472 29.466 -51.690 1.00 53.43 C -ATOM 492 HA PRO A 30 -3.942 29.404 -53.502 1.00 0.00 H -ATOM 493 HB2 PRO A 30 -6.816 29.181 -54.454 1.00 0.00 H -ATOM 494 HB3 PRO A 30 -5.542 27.974 -54.525 1.00 0.00 H -ATOM 495 HG2 PRO A 30 -7.454 27.744 -52.642 1.00 0.00 H -ATOM 496 HG3 PRO A 30 -5.770 27.493 -52.182 1.00 0.00 H -ATOM 497 HD3 PRO A 30 -6.471 29.172 -50.641 1.00 0.00 H -ATOM 498 HD2 PRO A 30 -7.361 30.074 -51.868 1.00 0.00 H -ATOM 499 N THR A 31 -5.852 32.008 -54.332 1.00 59.02 N -ATOM 500 CA THR A 31 -6.049 33.168 -55.227 1.00 61.06 C -ATOM 501 C THR A 31 -4.972 34.268 -54.988 1.00 66.39 C -ATOM 502 O THR A 31 -4.746 35.056 -55.907 1.00 67.71 O -ATOM 503 CB THR A 31 -7.451 33.828 -55.028 1.00 69.24 C -ATOM 504 OG1 THR A 31 -7.726 34.118 -53.669 1.00 68.64 O -ATOM 505 CG2 THR A 31 -8.596 32.923 -55.521 1.00 68.24 C -ATOM 506 H THR A 31 -6.459 31.980 -53.525 1.00 0.00 H -ATOM 507 HA THR A 31 -5.965 32.842 -56.266 1.00 0.00 H -ATOM 508 HB THR A 31 -7.516 34.765 -55.585 1.00 0.00 H -ATOM 509 HG1 THR A 31 -7.520 35.039 -53.477 1.00 0.00 H -ATOM 510 HG21 THR A 31 -9.565 33.411 -55.405 1.00 0.00 H -ATOM 511 HG22 THR A 31 -8.478 32.685 -56.579 1.00 0.00 H -ATOM 512 HG23 THR A 31 -8.634 31.981 -54.973 1.00 0.00 H -ATOM 513 N ASN A 32 -4.305 34.290 -53.813 1.00 62.42 N -ATOM 514 CA ASN A 32 -3.135 35.118 -53.449 1.00 62.48 C -ATOM 515 C ASN A 32 -3.559 36.586 -53.127 1.00 68.30 C -ATOM 516 O ASN A 32 -2.729 37.487 -53.247 1.00 68.75 O -ATOM 517 CB ASN A 32 -1.961 34.939 -54.467 1.00 64.50 C -ATOM 518 CG ASN A 32 -0.552 35.369 -54.011 1.00 90.28 C -ATOM 519 OD1 ASN A 32 0.318 35.591 -54.848 1.00 80.74 O -ATOM 520 ND2 ASN A 32 -0.293 35.479 -52.705 1.00 86.67 N -ATOM 521 H ASN A 32 -4.608 33.654 -53.089 1.00 0.00 H -ATOM 522 HA ASN A 32 -2.811 34.693 -52.502 1.00 0.00 H -ATOM 523 HB2 ASN A 32 -1.882 33.886 -54.745 1.00 0.00 H -ATOM 524 HB3 ASN A 32 -2.189 35.472 -55.391 1.00 0.00 H -ATOM 525 HD22 ASN A 32 0.624 35.776 -52.405 1.00 0.00 H -ATOM 526 HD21 ASN A 32 -1.019 35.328 -52.020 1.00 0.00 H -ATOM 527 N ASH A 33 -4.825 36.811 -52.722 1.00 65.11 N -ATOM 528 CA ASH A 33 -5.427 38.125 -52.424 1.00 65.45 C -ATOM 529 C ASH A 33 -5.606 38.308 -50.884 1.00 68.10 C -ATOM 530 O ASH A 33 -6.057 39.382 -50.484 1.00 68.54 O -ATOM 531 CB ASH A 33 -6.748 38.314 -53.233 1.00 68.72 C -ATOM 532 CG ASH A 33 -7.964 37.448 -52.856 1.00 75.04 C -ATOM 533 OD1 ASH A 33 -7.806 36.514 -52.040 1.00 72.94 O -ATOM 534 OD2 ASH A 33 -9.047 37.725 -53.414 1.00 81.22 O1- -ATOM 535 H ASH A 33 -5.434 36.016 -52.577 1.00 0.00 H -ATOM 536 HA ASH A 33 -4.748 38.919 -52.740 1.00 0.00 H -ATOM 537 HB2 ASH A 33 -7.059 39.357 -53.155 1.00 0.00 H -ATOM 538 HB3 ASH A 33 -6.546 38.151 -54.293 1.00 0.00 H -ATOM 539 N GLY A 34 -5.275 37.299 -50.052 1.00 62.38 N -ATOM 540 CA GLY A 34 -5.333 37.340 -48.585 1.00 60.09 C -ATOM 541 C GLY A 34 -6.734 37.094 -47.984 1.00 63.42 C -ATOM 542 O GLY A 34 -6.858 37.175 -46.762 1.00 62.74 O -ATOM 543 H GLY A 34 -4.918 36.441 -50.454 1.00 0.00 H -ATOM 544 HA2 GLY A 34 -4.661 36.572 -48.202 1.00 0.00 H -ATOM 545 HA3 GLY A 34 -4.949 38.294 -48.220 1.00 0.00 H -ATOM 546 N THR A 35 -7.773 36.798 -48.794 1.00 59.47 N -ATOM 547 CA THR A 35 -9.165 36.561 -48.349 1.00 58.79 C -ATOM 548 C THR A 35 -9.405 35.065 -47.966 1.00 58.95 C -ATOM 549 O THR A 35 -10.532 34.731 -47.595 1.00 58.00 O -ATOM 550 CB THR A 35 -10.204 36.950 -49.455 1.00 71.45 C -ATOM 551 OG1 THR A 35 -10.174 36.106 -50.597 1.00 74.26 O -ATOM 552 CG2 THR A 35 -10.073 38.409 -49.931 1.00 71.82 C -ATOM 553 H THR A 35 -7.612 36.726 -49.791 1.00 0.00 H -ATOM 554 HA THR A 35 -9.371 37.167 -47.464 1.00 0.00 H -ATOM 555 HB THR A 35 -11.207 36.847 -49.036 1.00 0.00 H -ATOM 556 HG1 THR A 35 -9.422 36.353 -51.153 1.00 0.00 H -ATOM 557 HG21 THR A 35 -10.843 38.658 -50.662 1.00 0.00 H -ATOM 558 HG22 THR A 35 -10.179 39.102 -49.096 1.00 0.00 H -ATOM 559 HG23 THR A 35 -9.105 38.604 -50.393 1.00 0.00 H -ATOM 560 N GLY A 36 -8.376 34.196 -48.053 1.00 53.95 N -ATOM 561 CA GLY A 36 -8.444 32.753 -47.795 1.00 52.08 C -ATOM 562 C GLY A 36 -8.630 32.394 -46.306 1.00 53.45 C -ATOM 563 O GLY A 36 -8.425 33.216 -45.411 1.00 52.18 O -ATOM 564 H GLY A 36 -7.483 34.552 -48.362 1.00 0.00 H -ATOM 565 HA2 GLY A 36 -9.246 32.312 -48.391 1.00 0.00 H -ATOM 566 HA3 GLY A 36 -7.514 32.319 -48.148 1.00 0.00 H -ATOM 567 N GLU A 37 -9.016 31.128 -46.060 1.00 49.00 N -ATOM 568 CA GLU A 37 -9.393 30.568 -44.752 1.00 47.60 C -ATOM 569 C GLU A 37 -8.131 30.371 -43.879 1.00 48.02 C -ATOM 570 O GLU A 37 -7.094 29.906 -44.359 1.00 45.98 O -ATOM 571 CB GLU A 37 -10.098 29.203 -44.975 1.00 49.51 C -ATOM 572 CG GLU A 37 -11.476 29.290 -45.676 1.00 66.63 C -ATOM 573 CD GLU A 37 -12.544 30.033 -44.862 1.00 94.52 C -ATOM 574 OE1 GLU A 37 -12.737 29.648 -43.686 1.00 89.72 O -ATOM 575 OE2 GLU A 37 -13.150 30.968 -45.428 1.00 93.17 O1- -ATOM 576 H GLU A 37 -9.145 30.503 -46.844 1.00 0.00 H -ATOM 577 HA GLU A 37 -10.073 31.266 -44.257 1.00 0.00 H -ATOM 578 HB2 GLU A 37 -9.452 28.546 -45.561 1.00 0.00 H -ATOM 579 HB3 GLU A 37 -10.225 28.691 -44.018 1.00 0.00 H -ATOM 580 HG2 GLU A 37 -11.369 29.756 -46.657 1.00 0.00 H -ATOM 581 HG3 GLU A 37 -11.850 28.283 -45.865 1.00 0.00 H -ATOM 582 N MET A 38 -8.299 30.662 -42.576 1.00 43.85 N -ATOM 583 CA MET A 38 -7.321 30.445 -41.503 1.00 42.46 C -ATOM 584 C MET A 38 -7.538 28.989 -41.020 1.00 43.50 C -ATOM 585 O MET A 38 -8.665 28.593 -40.708 1.00 43.72 O -ATOM 586 CB MET A 38 -7.596 31.446 -40.353 1.00 44.66 C -ATOM 587 CG MET A 38 -7.387 32.920 -40.756 1.00 50.18 C -ATOM 588 SD MET A 38 -7.739 34.140 -39.458 1.00 55.18 S -ATOM 589 CE MET A 38 -6.311 33.904 -38.371 1.00 50.66 C -ATOM 590 H MET A 38 -9.210 30.977 -42.267 1.00 0.00 H -ATOM 591 HA MET A 38 -6.309 30.595 -41.881 1.00 0.00 H -ATOM 592 HB2 MET A 38 -8.614 31.324 -39.977 1.00 0.00 H -ATOM 593 HB3 MET A 38 -6.940 31.214 -39.513 1.00 0.00 H -ATOM 594 HG2 MET A 38 -6.366 33.075 -41.109 1.00 0.00 H -ATOM 595 HG3 MET A 38 -8.038 33.166 -41.596 1.00 0.00 H -ATOM 596 HE1 MET A 38 -6.348 34.610 -37.541 1.00 0.00 H -ATOM 597 HE2 MET A 38 -6.308 32.897 -37.961 1.00 0.00 H -ATOM 598 HE3 MET A 38 -5.383 34.063 -38.919 1.00 0.00 H -ATOM 599 N VAL A 39 -6.433 28.228 -40.957 1.00 36.95 N -ATOM 600 CA VAL A 39 -6.396 26.795 -40.632 1.00 34.96 C -ATOM 601 C VAL A 39 -5.209 26.569 -39.663 1.00 36.30 C -ATOM 602 O VAL A 39 -4.121 27.119 -39.856 1.00 35.86 O -ATOM 603 CB VAL A 39 -6.253 25.890 -41.902 1.00 39.31 C -ATOM 604 CG1 VAL A 39 -7.573 25.814 -42.692 1.00 40.52 C -ATOM 605 CG2 VAL A 39 -5.094 26.271 -42.855 1.00 39.38 C -ATOM 606 H VAL A 39 -5.542 28.638 -41.209 1.00 0.00 H -ATOM 607 HA VAL A 39 -7.309 26.516 -40.098 1.00 0.00 H -ATOM 608 HB VAL A 39 -6.053 24.872 -41.560 1.00 0.00 H -ATOM 609 HG11 VAL A 39 -7.506 25.095 -43.511 1.00 0.00 H -ATOM 610 HG12 VAL A 39 -8.393 25.495 -42.049 1.00 0.00 H -ATOM 611 HG13 VAL A 39 -7.844 26.780 -43.121 1.00 0.00 H -ATOM 612 HG21 VAL A 39 -5.028 25.575 -43.692 1.00 0.00 H -ATOM 613 HG22 VAL A 39 -5.225 27.270 -43.271 1.00 0.00 H -ATOM 614 HG23 VAL A 39 -4.130 26.248 -42.351 1.00 0.00 H -ATOM 615 N ALA A 40 -5.441 25.701 -38.661 1.00 33.12 N -ATOM 616 CA ALA A 40 -4.444 25.216 -37.700 1.00 33.29 C -ATOM 617 C ALA A 40 -3.945 23.874 -38.282 1.00 37.02 C -ATOM 618 O ALA A 40 -4.687 22.891 -38.304 1.00 37.68 O -ATOM 619 CB ALA A 40 -5.132 25.002 -36.339 1.00 33.26 C -ATOM 620 H ALA A 40 -6.346 25.255 -38.604 1.00 0.00 H -ATOM 621 HA ALA A 40 -3.626 25.928 -37.569 1.00 0.00 H -ATOM 622 HB1 ALA A 40 -4.435 24.607 -35.598 1.00 0.00 H -ATOM 623 HB2 ALA A 40 -5.508 25.948 -35.949 1.00 0.00 H -ATOM 624 HB3 ALA A 40 -5.978 24.314 -36.399 1.00 0.00 H -ATOM 625 N VAL A 41 -2.693 23.876 -38.769 1.00 32.01 N -ATOM 626 CA VAL A 41 -2.035 22.739 -39.426 1.00 31.43 C -ATOM 627 C VAL A 41 -1.018 22.198 -38.388 1.00 34.06 C -ATOM 628 O VAL A 41 -0.108 22.922 -37.977 1.00 33.04 O -ATOM 629 CB VAL A 41 -1.257 23.190 -40.705 1.00 35.67 C -ATOM 630 CG1 VAL A 41 -0.547 22.030 -41.432 1.00 35.66 C -ATOM 631 CG2 VAL A 41 -2.165 23.942 -41.702 1.00 35.86 C -ATOM 632 H VAL A 41 -2.134 24.716 -38.684 1.00 0.00 H -ATOM 633 HA VAL A 41 -2.757 21.971 -39.705 1.00 0.00 H -ATOM 634 HB VAL A 41 -0.481 23.894 -40.407 1.00 0.00 H -ATOM 635 HG11 VAL A 41 -0.034 22.378 -42.330 1.00 0.00 H -ATOM 636 HG12 VAL A 41 0.208 21.559 -40.802 1.00 0.00 H -ATOM 637 HG13 VAL A 41 -1.260 21.262 -41.735 1.00 0.00 H -ATOM 638 HG21 VAL A 41 -1.611 24.258 -42.587 1.00 0.00 H -ATOM 639 HG22 VAL A 41 -2.992 23.317 -42.036 1.00 0.00 H -ATOM 640 HG23 VAL A 41 -2.589 24.842 -41.257 1.00 0.00 H -ATOM 641 N LYS A 42 -1.186 20.916 -38.017 1.00 30.97 N -ATOM 642 CA LYS A 42 -0.309 20.158 -37.114 1.00 30.96 C -ATOM 643 C LYS A 42 0.585 19.265 -38.007 1.00 37.68 C -ATOM 644 O LYS A 42 0.101 18.643 -38.955 1.00 36.55 O -ATOM 645 CB LYS A 42 -1.190 19.333 -36.146 1.00 33.16 C -ATOM 646 CG LYS A 42 -0.412 18.619 -35.018 1.00 48.15 C -ATOM 647 CD LYS A 42 -1.345 17.967 -33.980 1.00 51.77 C -ATOM 648 CE LYS A 42 -0.583 17.283 -32.833 1.00 60.76 C -ATOM 649 NZ LYS A 42 -1.511 16.740 -31.827 1.00 63.79 N1+ -ATOM 650 H LYS A 42 -1.938 20.384 -38.438 1.00 0.00 H -ATOM 651 HA LYS A 42 0.312 20.833 -36.534 1.00 0.00 H -ATOM 652 HB2 LYS A 42 -1.904 20.012 -35.680 1.00 0.00 H -ATOM 653 HB3 LYS A 42 -1.799 18.614 -36.692 1.00 0.00 H -ATOM 654 HG2 LYS A 42 0.251 17.864 -35.439 1.00 0.00 H -ATOM 655 HG3 LYS A 42 0.244 19.333 -34.517 1.00 0.00 H -ATOM 656 HD2 LYS A 42 -2.010 18.728 -33.568 1.00 0.00 H -ATOM 657 HD3 LYS A 42 -1.990 17.240 -34.477 1.00 0.00 H -ATOM 658 HE2 LYS A 42 0.037 16.471 -33.215 1.00 0.00 H -ATOM 659 HE3 LYS A 42 0.087 17.994 -32.349 1.00 0.00 H -ATOM 660 HZ1 LYS A 42 -1.008 16.266 -31.090 1.00 0.00 H -ATOM 661 HZ2 LYS A 42 -2.062 17.483 -31.423 1.00 0.00 H -ATOM 662 HZ3 LYS A 42 -2.137 16.073 -32.272 1.00 0.00 H -ATOM 663 N ALA A 43 1.879 19.205 -37.647 1.00 37.96 N -ATOM 664 CA ALA A 43 2.942 18.472 -38.346 1.00 40.37 C -ATOM 665 C ALA A 43 3.612 17.504 -37.340 1.00 49.88 C -ATOM 666 O ALA A 43 3.663 17.765 -36.136 1.00 48.28 O -ATOM 667 CB ALA A 43 3.949 19.492 -38.913 1.00 41.64 C -ATOM 668 H ALA A 43 2.179 19.718 -36.827 1.00 0.00 H -ATOM 669 HA ALA A 43 2.527 17.886 -39.170 1.00 0.00 H -ATOM 670 HB1 ALA A 43 4.764 18.995 -39.443 1.00 0.00 H -ATOM 671 HB2 ALA A 43 3.468 20.162 -39.626 1.00 0.00 H -ATOM 672 HB3 ALA A 43 4.392 20.108 -38.129 1.00 0.00 H -ATOM 673 N LEU A 44 4.173 16.417 -37.899 1.00 51.32 N -ATOM 674 CA LEU A 44 5.032 15.415 -37.247 1.00 53.72 C -ATOM 675 C LEU A 44 6.462 15.806 -37.673 1.00 62.30 C -ATOM 676 O LEU A 44 6.745 15.838 -38.871 1.00 63.20 O -ATOM 677 CB LEU A 44 4.611 14.026 -37.802 1.00 54.88 C -ATOM 678 CG LEU A 44 5.408 12.747 -37.425 1.00 61.02 C -ATOM 679 CD1 LEU A 44 6.594 12.463 -38.362 1.00 63.21 C -ATOM 680 CD2 LEU A 44 5.801 12.677 -35.944 1.00 63.43 C -ATOM 681 H LEU A 44 4.114 16.323 -38.905 1.00 0.00 H -ATOM 682 HA LEU A 44 4.919 15.439 -36.163 1.00 0.00 H -ATOM 683 HB2 LEU A 44 3.607 13.881 -37.415 1.00 0.00 H -ATOM 684 HB3 LEU A 44 4.498 14.062 -38.888 1.00 0.00 H -ATOM 685 HG LEU A 44 4.727 11.909 -37.584 1.00 0.00 H -ATOM 686 HD11 LEU A 44 7.142 11.575 -38.051 1.00 0.00 H -ATOM 687 HD12 LEU A 44 6.259 12.304 -39.387 1.00 0.00 H -ATOM 688 HD13 LEU A 44 7.309 13.278 -38.382 1.00 0.00 H -ATOM 689 HD21 LEU A 44 6.222 11.703 -35.697 1.00 0.00 H -ATOM 690 HD22 LEU A 44 6.535 13.440 -35.687 1.00 0.00 H -ATOM 691 HD23 LEU A 44 4.933 12.819 -35.305 1.00 0.00 H -ATOM 692 N LYS A 45 7.346 16.058 -36.683 1.00 61.35 N -ATOM 693 CA LYS A 45 8.737 16.534 -36.851 1.00 63.52 C -ATOM 694 C LYS A 45 9.580 15.541 -37.704 1.00 70.14 C -ATOM 695 O LYS A 45 9.408 14.327 -37.593 1.00 70.50 O -ATOM 696 CB LYS A 45 9.378 16.823 -35.465 1.00 66.45 C -ATOM 697 CG LYS A 45 9.576 15.604 -34.535 1.00 83.56 C -ATOM 698 CD LYS A 45 10.446 15.893 -33.296 1.00 96.14 C -ATOM 699 CE LYS A 45 10.951 14.608 -32.609 1.00107.75 C -ATOM 700 NZ LYS A 45 12.113 14.861 -31.744 1.00116.59 N1+ -ATOM 701 H LYS A 45 7.027 15.990 -35.728 1.00 0.00 H -ATOM 702 HA LYS A 45 8.672 17.478 -37.398 1.00 0.00 H -ATOM 703 HB2 LYS A 45 10.348 17.293 -35.636 1.00 0.00 H -ATOM 704 HB3 LYS A 45 8.786 17.577 -34.942 1.00 0.00 H -ATOM 705 HG2 LYS A 45 8.604 15.217 -34.226 1.00 0.00 H -ATOM 706 HG3 LYS A 45 10.057 14.806 -35.100 1.00 0.00 H -ATOM 707 HD2 LYS A 45 11.301 16.495 -33.600 1.00 0.00 H -ATOM 708 HD3 LYS A 45 9.894 16.509 -32.584 1.00 0.00 H -ATOM 709 HE2 LYS A 45 10.155 14.151 -32.021 1.00 0.00 H -ATOM 710 HE3 LYS A 45 11.267 13.872 -33.351 1.00 0.00 H -ATOM 711 HZ1 LYS A 45 12.396 14.004 -31.294 1.00 0.00 H -ATOM 712 HZ2 LYS A 45 12.880 15.192 -32.322 1.00 0.00 H -ATOM 713 HZ3 LYS A 45 11.888 15.548 -31.038 1.00 0.00 H -ATOM 714 N ALA A 46 10.509 16.086 -38.513 1.00 68.33 N -ATOM 715 CA ALA A 46 11.356 15.384 -39.499 1.00 69.84 C -ATOM 716 C ALA A 46 12.200 14.233 -38.884 1.00 75.29 C -ATOM 717 O ALA A 46 12.398 13.216 -39.550 1.00 75.68 O -ATOM 718 CB ALA A 46 12.275 16.413 -40.186 1.00 71.23 C -ATOM 719 H ALA A 46 10.568 17.095 -38.550 1.00 0.00 H -ATOM 720 HA ALA A 46 10.690 14.953 -40.250 1.00 0.00 H -ATOM 721 HB1 ALA A 46 12.775 15.982 -41.054 1.00 0.00 H -ATOM 722 HB2 ALA A 46 11.725 17.288 -40.526 1.00 0.00 H -ATOM 723 HB3 ALA A 46 13.048 16.780 -39.508 1.00 0.00 H -ATOM 724 N ASH A 47 12.659 14.413 -37.632 1.00 72.17 N -ATOM 725 CA ASH A 47 13.590 13.555 -36.883 1.00 73.50 C -ATOM 726 C ASH A 47 12.830 12.508 -36.007 1.00 75.83 C -ATOM 727 O ASH A 47 13.505 11.825 -35.234 1.00 76.32 O -ATOM 728 CB ASH A 47 14.546 14.445 -36.029 1.00 76.23 C -ATOM 729 CG ASH A 47 13.876 15.317 -34.951 1.00 89.05 C -ATOM 730 OD1 ASH A 47 13.092 16.205 -35.351 1.00 88.80 O -ATOM 731 OD2 ASH A 47 14.146 15.080 -33.753 1.00 97.21 O1- -ATOM 732 H ASH A 47 12.420 15.272 -37.153 1.00 0.00 H -ATOM 733 HA ASH A 47 14.203 12.992 -37.590 1.00 0.00 H -ATOM 734 HB2 ASH A 47 15.306 13.820 -35.557 1.00 0.00 H -ATOM 735 HB3 ASH A 47 15.105 15.112 -36.687 1.00 0.00 H -ATOM 736 N CYS A 48 11.488 12.357 -36.112 1.00 70.25 N -ATOM 737 CA CYS A 48 10.696 11.338 -35.385 1.00 69.55 C -ATOM 738 C CYS A 48 10.960 9.951 -36.026 1.00 73.05 C -ATOM 739 O CYS A 48 11.030 9.824 -37.252 1.00 73.05 O -ATOM 740 CB CYS A 48 9.170 11.624 -35.421 1.00 0.00 C -ATOM 741 SG CYS A 48 8.618 12.328 -33.843 1.00 0.00 S -ATOM 742 HB2 CYS A 48 8.905 12.308 -36.224 1.00 0.00 H -ATOM 743 HB3 CYS A 48 8.568 10.730 -35.591 1.00 0.00 H -ATOM 744 HG CYS A 48 8.839 11.233 -33.108 1.00 0.00 H -ATOM 745 H CYS A 48 10.977 12.944 -36.757 1.00 0.00 H -ATOM 746 HA CYS A 48 11.050 11.309 -34.351 1.00 0.00 H -ATOM 747 N GLY A 49 11.032 8.930 -35.152 1.00 68.94 N -ATOM 748 CA GLY A 49 11.224 7.518 -35.498 1.00 69.45 C -ATOM 749 C GLY A 49 9.901 6.813 -35.889 1.00 71.44 C -ATOM 750 O GLY A 49 8.843 7.448 -35.927 1.00 69.33 O -ATOM 751 H GLY A 49 10.938 9.137 -34.168 1.00 0.00 H -ATOM 752 HA2 GLY A 49 11.951 7.416 -36.306 1.00 0.00 H -ATOM 753 HA3 GLY A 49 11.649 7.025 -34.624 1.00 0.00 H -ATOM 754 N PRO A 50 9.949 5.487 -36.187 1.00 68.74 N -ATOM 755 CA PRO A 50 8.796 4.703 -36.698 1.00 68.21 C -ATOM 756 C PRO A 50 7.629 4.552 -35.683 1.00 71.10 C -ATOM 757 O PRO A 50 6.487 4.429 -36.125 1.00 70.04 O -ATOM 758 CB PRO A 50 9.401 3.329 -37.055 1.00 71.88 C -ATOM 759 CG PRO A 50 10.641 3.214 -36.181 1.00 77.34 C -ATOM 760 CD PRO A 50 11.153 4.649 -36.120 1.00 72.04 C -ATOM 761 HA PRO A 50 8.407 5.171 -37.604 1.00 0.00 H -ATOM 762 HB2 PRO A 50 8.722 2.484 -36.925 1.00 0.00 H -ATOM 763 HB3 PRO A 50 9.697 3.332 -38.106 1.00 0.00 H -ATOM 764 HG2 PRO A 50 10.353 2.884 -35.181 1.00 0.00 H -ATOM 765 HG3 PRO A 50 11.378 2.507 -36.564 1.00 0.00 H -ATOM 766 HD3 PRO A 50 11.781 4.868 -36.986 1.00 0.00 H -ATOM 767 HD2 PRO A 50 11.750 4.807 -35.221 1.00 0.00 H -ATOM 768 N GLN A 51 7.918 4.596 -34.367 1.00 67.61 N -ATOM 769 CA GLN A 51 6.961 4.500 -33.250 1.00 66.36 C -ATOM 770 C GLN A 51 6.050 5.758 -33.174 1.00 68.88 C -ATOM 771 O GLN A 51 4.873 5.605 -32.844 1.00 67.37 O -ATOM 772 CB GLN A 51 7.728 4.257 -31.917 1.00 68.30 C -ATOM 773 CG GLN A 51 8.632 5.397 -31.358 1.00 77.62 C -ATOM 774 CD GLN A 51 9.965 5.615 -32.094 1.00 79.26 C -ATOM 775 OE1 GLN A 51 10.474 4.730 -32.777 1.00 70.91 O -ATOM 776 NE2 GLN A 51 10.552 6.803 -31.948 1.00 67.19 N -ATOM 777 H GLN A 51 8.887 4.676 -34.090 1.00 0.00 H -ATOM 778 HA GLN A 51 6.324 3.631 -33.430 1.00 0.00 H -ATOM 779 HB2 GLN A 51 6.988 4.026 -31.149 1.00 0.00 H -ATOM 780 HB3 GLN A 51 8.311 3.339 -32.005 1.00 0.00 H -ATOM 781 HG2 GLN A 51 8.080 6.335 -31.296 1.00 0.00 H -ATOM 782 HG3 GLN A 51 8.894 5.149 -30.328 1.00 0.00 H -ATOM 783 HE22 GLN A 51 11.443 6.977 -32.388 1.00 0.00 H -ATOM 784 HE21 GLN A 51 10.114 7.530 -31.400 1.00 0.00 H -ATOM 785 N HIE A 52 6.575 6.954 -33.513 1.00 64.95 N -ATOM 786 CA HIE A 52 5.836 8.226 -33.520 1.00 63.06 C -ATOM 787 C HIE A 52 5.151 8.441 -34.896 1.00 62.55 C -ATOM 788 O HIE A 52 4.130 9.124 -34.920 1.00 60.85 O -ATOM 789 CB HIE A 52 6.815 9.393 -33.267 1.00 64.66 C -ATOM 790 CG HIE A 52 7.395 9.470 -31.873 1.00 69.42 C -ATOM 791 ND1 HIE A 52 8.768 9.366 -31.623 1.00 71.01 N -ATOM 792 CD2 HIE A 52 6.743 9.677 -30.673 1.00 73.12 C -ATOM 793 CE1 HIE A 52 8.890 9.518 -30.311 1.00 71.34 C -ATOM 794 NE2 HIE A 52 7.722 9.702 -29.696 1.00 72.94 N -ATOM 795 H HIE A 52 7.539 7.002 -33.810 1.00 0.00 H -ATOM 796 HA HIE A 52 5.067 8.229 -32.745 1.00 0.00 H -ATOM 797 HB2 HIE A 52 7.637 9.351 -33.984 1.00 0.00 H -ATOM 798 HB3 HIE A 52 6.314 10.347 -33.440 1.00 0.00 H -ATOM 799 HD2 HIE A 52 5.698 9.814 -30.444 1.00 0.00 H -ATOM 800 HE1 HIE A 52 9.839 9.494 -29.794 1.00 0.00 H -ATOM 801 HE2 HIE A 52 7.582 9.843 -28.705 1.00 0.00 H -ATOM 802 N ARG A 53 5.674 7.859 -35.996 1.00 57.11 N -ATOM 803 CA ARG A 53 5.136 7.971 -37.365 1.00 55.94 C -ATOM 804 C ARG A 53 3.924 7.021 -37.549 1.00 58.15 C -ATOM 805 O ARG A 53 3.005 7.401 -38.275 1.00 56.90 O -ATOM 806 CB ARG A 53 6.246 7.611 -38.383 1.00 56.27 C -ATOM 807 CG ARG A 53 7.247 8.760 -38.595 1.00 60.46 C -ATOM 808 CD ARG A 53 8.472 8.367 -39.432 1.00 68.18 C -ATOM 809 NE ARG A 53 9.347 9.529 -39.650 1.00 73.45 N -ATOM 810 CZ ARG A 53 9.260 10.436 -40.635 1.00 81.37 C -ATOM 811 NH1 ARG A 53 8.340 10.360 -41.602 1.00 62.04 N -ATOM 812 NH2 ARG A 53 10.120 11.453 -40.659 1.00 66.65 N1+ -ATOM 813 H ARG A 53 6.518 7.311 -35.899 1.00 0.00 H -ATOM 814 HA ARG A 53 4.801 8.995 -37.549 1.00 0.00 H -ATOM 815 HB2 ARG A 53 6.772 6.714 -38.055 1.00 0.00 H -ATOM 816 HB3 ARG A 53 5.816 7.360 -39.355 1.00 0.00 H -ATOM 817 HG2 ARG A 53 6.723 9.582 -39.086 1.00 0.00 H -ATOM 818 HG3 ARG A 53 7.583 9.144 -37.630 1.00 0.00 H -ATOM 819 HD2 ARG A 53 9.046 7.594 -38.919 1.00 0.00 H -ATOM 820 HD3 ARG A 53 8.170 7.949 -40.392 1.00 0.00 H -ATOM 821 HE ARG A 53 10.067 9.671 -38.951 1.00 0.00 H -ATOM 822 HH12 ARG A 53 8.333 11.053 -42.339 1.00 0.00 H -ATOM 823 HH11 ARG A 53 7.682 9.597 -41.616 1.00 0.00 H -ATOM 824 HH22 ARG A 53 10.066 12.128 -41.409 1.00 0.00 H -ATOM 825 HH21 ARG A 53 10.826 11.555 -39.944 1.00 0.00 H -ATOM 826 N SER A 54 3.902 5.847 -36.883 1.00 54.55 N -ATOM 827 CA SER A 54 2.775 4.892 -36.874 1.00 53.96 C -ATOM 828 C SER A 54 1.641 5.405 -35.943 1.00 53.99 C -ATOM 829 O SER A 54 0.474 5.188 -36.274 1.00 53.04 O -ATOM 830 CB SER A 54 3.259 3.485 -36.435 1.00 59.58 C -ATOM 831 OG SER A 54 3.833 3.443 -35.139 1.00 72.10 O -ATOM 832 H SER A 54 4.698 5.595 -36.313 1.00 0.00 H -ATOM 833 HA SER A 54 2.376 4.806 -37.888 1.00 0.00 H -ATOM 834 HB2 SER A 54 2.427 2.779 -36.459 1.00 0.00 H -ATOM 835 HB3 SER A 54 3.995 3.106 -37.145 1.00 0.00 H -ATOM 836 HG SER A 54 4.695 3.868 -35.172 1.00 0.00 H -ATOM 837 N GLY A 55 1.984 6.117 -34.848 1.00 48.43 N -ATOM 838 CA GLY A 55 1.033 6.750 -33.928 1.00 46.49 C -ATOM 839 C GLY A 55 0.430 8.054 -34.493 1.00 48.75 C -ATOM 840 O GLY A 55 -0.718 8.363 -34.174 1.00 47.89 O -ATOM 841 H GLY A 55 2.964 6.244 -34.643 1.00 0.00 H -ATOM 842 HA2 GLY A 55 0.239 6.049 -33.665 1.00 0.00 H -ATOM 843 HA3 GLY A 55 1.561 6.985 -33.004 1.00 0.00 H -ATOM 844 N TRP A 56 1.178 8.794 -35.339 1.00 44.46 N -ATOM 845 CA TRP A 56 0.770 10.045 -36.001 1.00 42.89 C -ATOM 846 C TRP A 56 -0.283 9.753 -37.101 1.00 46.22 C -ATOM 847 O TRP A 56 -1.249 10.511 -37.196 1.00 45.15 O -ATOM 848 CB TRP A 56 2.012 10.740 -36.608 1.00 42.12 C -ATOM 849 CG TRP A 56 1.740 11.910 -37.510 1.00 42.65 C -ATOM 850 CD1 TRP A 56 2.092 12.001 -38.814 1.00 46.33 C -ATOM 851 CD2 TRP A 56 1.016 13.138 -37.197 1.00 41.21 C -ATOM 852 NE1 TRP A 56 1.665 13.211 -39.318 1.00 45.34 N -ATOM 853 CE2 TRP A 56 0.993 13.954 -38.372 1.00 45.67 C -ATOM 854 CE3 TRP A 56 0.367 13.649 -36.041 1.00 41.70 C -ATOM 855 CZ2 TRP A 56 0.372 15.218 -38.399 1.00 44.10 C -ATOM 856 CZ3 TRP A 56 -0.268 14.911 -36.058 1.00 42.27 C -ATOM 857 CH2 TRP A 56 -0.259 15.694 -37.232 1.00 43.10 C -ATOM 858 H TRP A 56 2.124 8.496 -35.532 1.00 0.00 H -ATOM 859 HA TRP A 56 0.320 10.709 -35.259 1.00 0.00 H -ATOM 860 HB2 TRP A 56 2.645 11.110 -35.800 1.00 0.00 H -ATOM 861 HB3 TRP A 56 2.618 10.018 -37.156 1.00 0.00 H -ATOM 862 HD1 TRP A 56 2.633 11.242 -39.358 1.00 0.00 H -ATOM 863 HE1 TRP A 56 1.815 13.505 -40.276 1.00 0.00 H -ATOM 864 HE3 TRP A 56 0.350 13.063 -35.134 1.00 0.00 H -ATOM 865 HZ2 TRP A 56 0.378 15.809 -39.301 1.00 0.00 H -ATOM 866 HZ3 TRP A 56 -0.761 15.277 -35.171 1.00 0.00 H -ATOM 867 HH2 TRP A 56 -0.738 16.658 -37.237 1.00 0.00 H -ATOM 868 N LYS A 57 -0.118 8.655 -37.869 1.00 43.92 N -ATOM 869 CA LYS A 57 -1.086 8.163 -38.869 1.00 44.34 C -ATOM 870 C LYS A 57 -2.410 7.742 -38.178 1.00 46.56 C -ATOM 871 O LYS A 57 -3.463 7.921 -38.786 1.00 45.36 O -ATOM 872 CB LYS A 57 -0.486 6.970 -39.650 1.00 49.05 C -ATOM 873 CG LYS A 57 0.600 7.376 -40.663 1.00 67.10 C -ATOM 874 CD LYS A 57 1.215 6.159 -41.384 1.00 82.17 C -ATOM 875 CE LYS A 57 2.398 6.506 -42.303 1.00 95.75 C -ATOM 876 NZ LYS A 57 3.567 6.974 -41.536 1.00106.63 N1+ -ATOM 877 H LYS A 57 0.705 8.084 -37.736 1.00 0.00 H -ATOM 878 HA LYS A 57 -1.315 8.972 -39.567 1.00 0.00 H -ATOM 879 HB2 LYS A 57 -0.080 6.236 -38.949 1.00 0.00 H -ATOM 880 HB3 LYS A 57 -1.275 6.450 -40.199 1.00 0.00 H -ATOM 881 HG2 LYS A 57 0.173 8.056 -41.402 1.00 0.00 H -ATOM 882 HG3 LYS A 57 1.376 7.944 -40.153 1.00 0.00 H -ATOM 883 HD2 LYS A 57 1.535 5.418 -40.650 1.00 0.00 H -ATOM 884 HD3 LYS A 57 0.438 5.672 -41.976 1.00 0.00 H -ATOM 885 HE2 LYS A 57 2.693 5.627 -42.877 1.00 0.00 H -ATOM 886 HE3 LYS A 57 2.110 7.272 -43.023 1.00 0.00 H -ATOM 887 HZ1 LYS A 57 4.319 7.207 -42.168 1.00 0.00 H -ATOM 888 HZ2 LYS A 57 3.308 7.788 -40.996 1.00 0.00 H -ATOM 889 HZ3 LYS A 57 3.867 6.243 -40.907 1.00 0.00 H -ATOM 890 N GLN A 58 -2.344 7.271 -36.913 1.00 43.11 N -ATOM 891 CA GLN A 58 -3.488 6.881 -36.081 1.00 42.59 C -ATOM 892 C GLN A 58 -4.262 8.141 -35.608 1.00 44.21 C -ATOM 893 O GLN A 58 -5.487 8.074 -35.616 1.00 44.62 O -ATOM 894 CB GLN A 58 -3.006 6.034 -34.872 1.00 44.07 C -ATOM 895 CG GLN A 58 -3.842 4.744 -34.702 1.00 72.22 C -ATOM 896 CD GLN A 58 -3.636 4.024 -33.366 1.00 92.80 C -ATOM 897 OE1 GLN A 58 -4.605 3.618 -32.730 1.00 86.97 O -ATOM 898 NE2 GLN A 58 -2.384 3.844 -32.937 1.00 85.94 N -ATOM 899 H GLN A 58 -1.437 7.176 -36.480 1.00 0.00 H -ATOM 900 HA GLN A 58 -4.151 6.278 -36.709 1.00 0.00 H -ATOM 901 HB2 GLN A 58 -1.960 5.748 -34.996 1.00 0.00 H -ATOM 902 HB3 GLN A 58 -3.024 6.615 -33.946 1.00 0.00 H -ATOM 903 HG2 GLN A 58 -4.902 4.990 -34.788 1.00 0.00 H -ATOM 904 HG3 GLN A 58 -3.624 4.047 -35.512 1.00 0.00 H -ATOM 905 HE22 GLN A 58 -2.203 3.395 -32.054 1.00 0.00 H -ATOM 906 HE21 GLN A 58 -1.611 4.187 -33.488 1.00 0.00 H -ATOM 907 N GLU A 59 -3.591 9.272 -35.275 1.00 38.42 N -ATOM 908 CA GLU A 59 -4.235 10.556 -34.908 1.00 36.42 C -ATOM 909 C GLU A 59 -5.022 11.133 -36.118 1.00 41.24 C -ATOM 910 O GLU A 59 -6.139 11.611 -35.915 1.00 41.44 O -ATOM 911 CB GLU A 59 -3.201 11.583 -34.358 1.00 36.47 C -ATOM 912 CG GLU A 59 -3.815 12.983 -34.058 1.00 37.83 C -ATOM 913 CD GLU A 59 -2.911 14.017 -33.380 1.00 51.81 C -ATOM 914 OE1 GLU A 59 -1.706 13.753 -33.193 1.00 50.51 O -ATOM 915 OE2 GLU A 59 -3.454 15.097 -33.058 1.00 44.67 O1- -ATOM 916 H GLU A 59 -2.581 9.266 -35.277 1.00 0.00 H -ATOM 917 HA GLU A 59 -4.953 10.352 -34.110 1.00 0.00 H -ATOM 918 HB2 GLU A 59 -2.755 11.177 -33.448 1.00 0.00 H -ATOM 919 HB3 GLU A 59 -2.377 11.699 -35.064 1.00 0.00 H -ATOM 920 HG2 GLU A 59 -4.156 13.446 -34.983 1.00 0.00 H -ATOM 921 HG3 GLU A 59 -4.704 12.863 -33.439 1.00 0.00 H -ATOM 922 N ILE A 60 -4.455 11.045 -37.341 1.00 37.07 N -ATOM 923 CA ILE A 60 -5.055 11.518 -38.602 1.00 37.44 C -ATOM 924 C ILE A 60 -6.290 10.641 -38.960 1.00 42.50 C -ATOM 925 O ILE A 60 -7.301 11.215 -39.363 1.00 40.78 O -ATOM 926 CB ILE A 60 -4.029 11.501 -39.790 1.00 40.85 C -ATOM 927 CG1 ILE A 60 -2.872 12.504 -39.531 1.00 40.33 C -ATOM 928 CG2 ILE A 60 -4.666 11.755 -41.182 1.00 41.59 C -ATOM 929 CD1 ILE A 60 -1.693 12.409 -40.511 1.00 45.34 C -ATOM 930 H ILE A 60 -3.533 10.637 -37.419 1.00 0.00 H -ATOM 931 HA ILE A 60 -5.399 12.545 -38.455 1.00 0.00 H -ATOM 932 HB ILE A 60 -3.584 10.504 -39.826 1.00 0.00 H -ATOM 933 HG12 ILE A 60 -3.263 13.518 -39.557 1.00 0.00 H -ATOM 934 HG13 ILE A 60 -2.478 12.375 -38.524 1.00 0.00 H -ATOM 935 HG21 ILE A 60 -3.934 11.737 -41.987 1.00 0.00 H -ATOM 936 HG22 ILE A 60 -5.402 10.997 -41.443 1.00 0.00 H -ATOM 937 HG23 ILE A 60 -5.174 12.719 -41.208 1.00 0.00 H -ATOM 938 HD11 ILE A 60 -0.917 13.123 -40.245 1.00 0.00 H -ATOM 939 HD12 ILE A 60 -1.247 11.414 -40.507 1.00 0.00 H -ATOM 940 HD13 ILE A 60 -1.993 12.647 -41.530 1.00 0.00 H -ATOM 941 N ASH A 61 -6.217 9.306 -38.764 1.00 41.37 N -ATOM 942 CA ASH A 61 -7.295 8.329 -39.019 1.00 43.58 C -ATOM 943 C ASH A 61 -8.463 8.545 -38.020 1.00 46.27 C -ATOM 944 O ASH A 61 -9.613 8.503 -38.457 1.00 45.58 O -ATOM 945 CB ASH A 61 -6.800 6.857 -38.918 1.00 47.36 C -ATOM 946 CG ASH A 61 -5.923 6.359 -40.077 1.00 66.46 C -ATOM 947 OD1 ASH A 61 -5.911 7.015 -41.142 1.00 66.64 O -ATOM 948 OD2 ASH A 61 -5.285 5.303 -39.879 1.00 76.34 O1- -ATOM 949 H ASH A 61 -5.344 8.909 -38.442 1.00 0.00 H -ATOM 950 HA ASH A 61 -7.688 8.511 -40.023 1.00 0.00 H -ATOM 951 HB2 ASH A 61 -6.253 6.712 -37.985 1.00 0.00 H -ATOM 952 HB3 ASH A 61 -7.650 6.174 -38.876 1.00 0.00 H -ATOM 953 N ILE A 62 -8.167 8.804 -36.728 1.00 42.07 N -ATOM 954 CA ILE A 62 -9.144 8.984 -35.638 1.00 41.21 C -ATOM 955 C ILE A 62 -9.893 10.336 -35.813 1.00 44.57 C -ATOM 956 O ILE A 62 -11.114 10.327 -35.683 1.00 44.89 O -ATOM 957 CB ILE A 62 -8.464 8.903 -34.223 1.00 43.50 C -ATOM 958 CG1 ILE A 62 -8.031 7.440 -33.931 1.00 44.25 C -ATOM 959 CG2 ILE A 62 -9.303 9.457 -33.039 1.00 43.82 C -ATOM 960 CD1 ILE A 62 -7.042 7.265 -32.768 1.00 47.81 C -ATOM 961 H ILE A 62 -7.195 8.812 -36.447 1.00 0.00 H -ATOM 962 HA ILE A 62 -9.887 8.184 -35.704 1.00 0.00 H -ATOM 963 HB ILE A 62 -7.555 9.509 -34.265 1.00 0.00 H -ATOM 964 HG12 ILE A 62 -8.915 6.839 -33.737 1.00 0.00 H -ATOM 965 HG13 ILE A 62 -7.587 6.990 -34.819 1.00 0.00 H -ATOM 966 HG21 ILE A 62 -8.794 9.334 -32.084 1.00 0.00 H -ATOM 967 HG22 ILE A 62 -9.489 10.526 -33.136 1.00 0.00 H -ATOM 968 HG23 ILE A 62 -10.266 8.951 -32.966 1.00 0.00 H -ATOM 969 HD11 ILE A 62 -6.709 6.229 -32.694 1.00 0.00 H -ATOM 970 HD12 ILE A 62 -6.156 7.885 -32.901 1.00 0.00 H -ATOM 971 HD13 ILE A 62 -7.496 7.523 -31.812 1.00 0.00 H -ATOM 972 N LEU A 63 -9.204 11.450 -36.143 1.00 41.27 N -ATOM 973 CA LEU A 63 -9.829 12.781 -36.304 1.00 41.85 C -ATOM 974 C LEU A 63 -10.626 12.870 -37.638 1.00 47.62 C -ATOM 975 O LEU A 63 -11.594 13.629 -37.681 1.00 47.54 O -ATOM 976 CB LEU A 63 -8.749 13.892 -36.230 1.00 41.42 C -ATOM 977 CG LEU A 63 -9.299 15.324 -35.975 1.00 46.53 C -ATOM 978 CD1 LEU A 63 -10.034 15.446 -34.626 1.00 46.18 C -ATOM 979 CD2 LEU A 63 -8.183 16.377 -36.071 1.00 49.35 C -ATOM 980 H LEU A 63 -8.198 11.408 -36.243 1.00 0.00 H -ATOM 981 HA LEU A 63 -10.530 12.908 -35.478 1.00 0.00 H -ATOM 982 HB2 LEU A 63 -8.047 13.657 -35.427 1.00 0.00 H -ATOM 983 HB3 LEU A 63 -8.148 13.882 -37.143 1.00 0.00 H -ATOM 984 HG LEU A 63 -10.015 15.569 -36.759 1.00 0.00 H -ATOM 985 HD11 LEU A 63 -10.297 16.479 -34.404 1.00 0.00 H -ATOM 986 HD12 LEU A 63 -10.965 14.880 -34.611 1.00 0.00 H -ATOM 987 HD13 LEU A 63 -9.410 15.085 -33.812 1.00 0.00 H -ATOM 988 HD21 LEU A 63 -8.576 17.383 -35.920 1.00 0.00 H -ATOM 989 HD22 LEU A 63 -7.411 16.207 -35.321 1.00 0.00 H -ATOM 990 HD23 LEU A 63 -7.708 16.363 -37.051 1.00 0.00 H -ATOM 991 N ARG A 64 -10.261 12.082 -38.672 1.00 45.43 N -ATOM 992 CA ARG A 64 -10.940 11.998 -39.978 1.00 47.25 C -ATOM 993 C ARG A 64 -12.300 11.248 -39.859 1.00 52.09 C -ATOM 994 O ARG A 64 -13.201 11.572 -40.635 1.00 53.68 O -ATOM 995 CB ARG A 64 -9.974 11.328 -40.995 1.00 49.60 C -ATOM 996 CG ARG A 64 -10.569 10.928 -42.365 1.00 64.86 C -ATOM 997 CD ARG A 64 -9.538 10.718 -43.491 1.00 76.56 C -ATOM 998 NE ARG A 64 -8.428 9.816 -43.124 1.00 87.65 N -ATOM 999 CZ ARG A 64 -7.137 9.949 -43.472 1.00104.51 C -ATOM 1000 NH1 ARG A 64 -6.697 10.967 -44.218 1.00 93.37 N -ATOM 1001 NH2 ARG A 64 -6.249 9.036 -43.076 1.00 92.17 N1+ -ATOM 1002 H ARG A 64 -9.454 11.484 -38.563 1.00 0.00 H -ATOM 1003 HA ARG A 64 -11.153 13.010 -40.329 1.00 0.00 H -ATOM 1004 HB2 ARG A 64 -9.146 12.018 -41.165 1.00 0.00 H -ATOM 1005 HB3 ARG A 64 -9.529 10.435 -40.551 1.00 0.00 H -ATOM 1006 HG2 ARG A 64 -11.162 10.020 -42.247 1.00 0.00 H -ATOM 1007 HG3 ARG A 64 -11.266 11.699 -42.694 1.00 0.00 H -ATOM 1008 HD2 ARG A 64 -10.033 10.319 -44.377 1.00 0.00 H -ATOM 1009 HD3 ARG A 64 -9.140 11.689 -43.779 1.00 0.00 H -ATOM 1010 HE ARG A 64 -8.673 9.020 -42.553 1.00 0.00 H -ATOM 1011 HH12 ARG A 64 -5.723 11.031 -44.467 1.00 0.00 H -ATOM 1012 HH11 ARG A 64 -7.345 11.682 -44.512 1.00 0.00 H -ATOM 1013 HH22 ARG A 64 -5.283 9.125 -43.347 1.00 0.00 H -ATOM 1014 HH21 ARG A 64 -6.504 8.273 -42.455 1.00 0.00 H -ATOM 1015 N THR A 65 -12.450 10.303 -38.907 1.00 47.85 N -ATOM 1016 CA THR A 65 -13.682 9.521 -38.672 1.00 48.24 C -ATOM 1017 C THR A 65 -14.591 10.179 -37.590 1.00 50.96 C -ATOM 1018 O THR A 65 -15.747 9.764 -37.492 1.00 52.21 O -ATOM 1019 CB THR A 65 -13.364 8.073 -38.177 1.00 56.81 C -ATOM 1020 OG1 THR A 65 -12.510 8.052 -37.045 1.00 60.06 O -ATOM 1021 CG2 THR A 65 -12.704 7.217 -39.274 1.00 56.45 C -ATOM 1022 H THR A 65 -11.676 10.090 -38.293 1.00 0.00 H -ATOM 1023 HA THR A 65 -14.265 9.449 -39.593 1.00 0.00 H -ATOM 1024 HB THR A 65 -14.283 7.558 -37.891 1.00 0.00 H -ATOM 1025 HG1 THR A 65 -13.030 8.231 -36.258 1.00 0.00 H -ATOM 1026 HG21 THR A 65 -12.491 6.209 -38.917 1.00 0.00 H -ATOM 1027 HG22 THR A 65 -13.360 7.124 -40.140 1.00 0.00 H -ATOM 1028 HG23 THR A 65 -11.768 7.650 -39.624 1.00 0.00 H -ATOM 1029 N LEU A 66 -14.106 11.173 -36.815 1.00 45.03 N -ATOM 1030 CA LEU A 66 -14.876 11.888 -35.780 1.00 43.59 C -ATOM 1031 C LEU A 66 -15.466 13.158 -36.439 1.00 47.51 C -ATOM 1032 O LEU A 66 -14.762 13.885 -37.145 1.00 46.90 O -ATOM 1033 CB LEU A 66 -13.926 12.298 -34.623 1.00 41.91 C -ATOM 1034 CG LEU A 66 -13.504 11.134 -33.693 1.00 44.98 C -ATOM 1035 CD1 LEU A 66 -12.323 11.550 -32.799 1.00 43.77 C -ATOM 1036 CD2 LEU A 66 -14.661 10.577 -32.844 1.00 45.62 C -ATOM 1037 H LEU A 66 -13.159 11.493 -36.959 1.00 0.00 H -ATOM 1038 HA LEU A 66 -15.687 11.263 -35.400 1.00 0.00 H -ATOM 1039 HB2 LEU A 66 -13.034 12.768 -35.044 1.00 0.00 H -ATOM 1040 HB3 LEU A 66 -14.392 13.069 -34.006 1.00 0.00 H -ATOM 1041 HG LEU A 66 -13.166 10.308 -34.317 1.00 0.00 H -ATOM 1042 HD11 LEU A 66 -11.969 10.713 -32.198 1.00 0.00 H -ATOM 1043 HD12 LEU A 66 -11.479 11.902 -33.392 1.00 0.00 H -ATOM 1044 HD13 LEU A 66 -12.602 12.356 -32.120 1.00 0.00 H -ATOM 1045 HD21 LEU A 66 -14.345 9.692 -32.295 1.00 0.00 H -ATOM 1046 HD22 LEU A 66 -15.020 11.309 -32.120 1.00 0.00 H -ATOM 1047 HD23 LEU A 66 -15.505 10.264 -33.456 1.00 0.00 H -ATOM 1048 N TYR A 67 -16.748 13.424 -36.129 1.00 44.63 N -ATOM 1049 CA TYR A 67 -17.514 14.585 -36.594 1.00 45.07 C -ATOM 1050 C TYR A 67 -18.523 14.893 -35.467 1.00 45.96 C -ATOM 1051 O TYR A 67 -19.492 14.152 -35.296 1.00 46.41 O -ATOM 1052 CB TYR A 67 -18.138 14.311 -37.986 1.00 49.65 C -ATOM 1053 CG TYR A 67 -18.804 15.518 -38.633 1.00 54.91 C -ATOM 1054 CD1 TYR A 67 -18.067 16.350 -39.511 1.00 57.41 C -ATOM 1055 CD2 TYR A 67 -20.158 15.825 -38.352 1.00 57.57 C -ATOM 1056 CE1 TYR A 67 -18.679 17.477 -40.105 1.00 59.75 C -ATOM 1057 CE2 TYR A 67 -20.768 16.957 -38.939 1.00 60.10 C -ATOM 1058 CZ TYR A 67 -20.029 17.783 -39.816 1.00 68.68 C -ATOM 1059 OH TYR A 67 -20.621 18.873 -40.385 1.00 72.06 O -ATOM 1060 H TYR A 67 -17.257 12.775 -35.542 1.00 0.00 H -ATOM 1061 HA TYR A 67 -16.838 15.437 -36.699 1.00 0.00 H -ATOM 1062 HB2 TYR A 67 -17.365 13.947 -38.666 1.00 0.00 H -ATOM 1063 HB3 TYR A 67 -18.863 13.497 -37.923 1.00 0.00 H -ATOM 1064 HD1 TYR A 67 -17.031 16.129 -39.729 1.00 0.00 H -ATOM 1065 HD2 TYR A 67 -20.730 15.199 -37.682 1.00 0.00 H -ATOM 1066 HE1 TYR A 67 -18.108 18.103 -40.775 1.00 0.00 H -ATOM 1067 HE2 TYR A 67 -21.800 17.187 -38.717 1.00 0.00 H -ATOM 1068 HH TYR A 67 -20.039 19.349 -40.980 1.00 0.00 H -ATOM 1069 N HIE A 68 -18.283 15.999 -34.740 1.00 39.68 N -ATOM 1070 CA HIE A 68 -19.123 16.507 -33.645 1.00 38.26 C -ATOM 1071 C HIE A 68 -18.854 18.023 -33.518 1.00 41.07 C -ATOM 1072 O HIE A 68 -17.742 18.490 -33.779 1.00 39.48 O -ATOM 1073 CB HIE A 68 -18.864 15.706 -32.345 1.00 37.69 C -ATOM 1074 CG HIE A 68 -19.933 15.836 -31.287 1.00 40.30 C -ATOM 1075 ND1 HIE A 68 -19.890 16.811 -30.285 1.00 40.74 N -ATOM 1076 CD2 HIE A 68 -21.074 15.078 -31.118 1.00 42.24 C -ATOM 1077 CE1 HIE A 68 -20.983 16.605 -29.562 1.00 40.29 C -ATOM 1078 NE2 HIE A 68 -21.720 15.587 -30.005 1.00 41.53 N -ATOM 1079 H HIE A 68 -17.461 16.552 -34.947 1.00 0.00 H -ATOM 1080 HA HIE A 68 -20.165 16.373 -33.949 1.00 0.00 H -ATOM 1081 HB2 HIE A 68 -18.792 14.646 -32.580 1.00 0.00 H -ATOM 1082 HB3 HIE A 68 -17.900 15.975 -31.910 1.00 0.00 H -ATOM 1083 HD2 HIE A 68 -21.457 14.241 -31.681 1.00 0.00 H -ATOM 1084 HE1 HIE A 68 -21.242 17.191 -28.695 1.00 0.00 H -ATOM 1085 HE2 HIE A 68 -22.582 15.251 -29.599 1.00 0.00 H -ATOM 1086 N GLU A 69 -19.876 18.764 -33.046 1.00 37.79 N -ATOM 1087 CA GLU A 69 -19.846 20.221 -32.807 1.00 37.07 C -ATOM 1088 C GLU A 69 -18.897 20.604 -31.632 1.00 38.36 C -ATOM 1089 O GLU A 69 -18.444 21.751 -31.610 1.00 38.29 O -ATOM 1090 CB GLU A 69 -21.286 20.742 -32.562 1.00 39.83 C -ATOM 1091 CG GLU A 69 -21.997 20.198 -31.294 1.00 51.33 C -ATOM 1092 CD GLU A 69 -23.345 20.866 -31.002 1.00 75.08 C -ATOM 1093 OE1 GLU A 69 -24.314 20.114 -30.754 1.00 76.02 O -ATOM 1094 OE2 GLU A 69 -23.387 22.116 -31.005 1.00 61.54 O1- -ATOM 1095 H GLU A 69 -20.761 18.311 -32.856 1.00 0.00 H -ATOM 1096 HA GLU A 69 -19.462 20.697 -33.712 1.00 0.00 H -ATOM 1097 HB2 GLU A 69 -21.254 21.832 -32.523 1.00 0.00 H -ATOM 1098 HB3 GLU A 69 -21.896 20.509 -33.437 1.00 0.00 H -ATOM 1099 HG2 GLU A 69 -22.121 19.117 -31.357 1.00 0.00 H -ATOM 1100 HG3 GLU A 69 -21.375 20.371 -30.421 1.00 0.00 H -ATOM 1101 N HID A 70 -18.599 19.665 -30.708 1.00 33.06 N -ATOM 1102 CA HID A 70 -17.712 19.843 -29.543 1.00 30.23 C -ATOM 1103 C HID A 70 -16.443 18.965 -29.705 1.00 34.52 C -ATOM 1104 O HID A 70 -15.843 18.581 -28.701 1.00 33.24 O -ATOM 1105 CB HID A 70 -18.488 19.564 -28.232 1.00 29.49 C -ATOM 1106 CG HID A 70 -19.748 20.377 -28.046 1.00 32.84 C -ATOM 1107 ND1 HID A 70 -19.802 21.743 -28.270 1.00 34.50 N -ATOM 1108 CD2 HID A 70 -21.031 20.012 -27.708 1.00 35.61 C -ATOM 1109 CE1 HID A 70 -21.068 22.125 -28.094 1.00 34.74 C -ATOM 1110 NE2 HID A 70 -21.868 21.126 -27.746 1.00 35.88 N -ATOM 1111 H HID A 70 -18.997 18.741 -30.813 1.00 0.00 H -ATOM 1112 HA HID A 70 -17.355 20.871 -29.513 1.00 0.00 H -ATOM 1113 HB2 HID A 70 -18.753 18.508 -28.163 1.00 0.00 H -ATOM 1114 HB3 HID A 70 -17.844 19.775 -27.378 1.00 0.00 H -ATOM 1115 HD1 HID A 70 -19.023 22.334 -28.530 1.00 0.00 H -ATOM 1116 HD2 HID A 70 -21.425 19.038 -27.466 1.00 0.00 H -ATOM 1117 HE1 HID A 70 -21.412 23.142 -28.212 1.00 0.00 H -ATOM 1118 N ILE A 71 -16.008 18.729 -30.955 1.00 33.55 N -ATOM 1119 CA ILE A 71 -14.689 18.220 -31.351 1.00 33.44 C -ATOM 1120 C ILE A 71 -14.211 19.183 -32.474 1.00 38.25 C -ATOM 1121 O ILE A 71 -15.022 19.650 -33.282 1.00 38.75 O -ATOM 1122 CB ILE A 71 -14.734 16.717 -31.804 1.00 37.20 C -ATOM 1123 CG1 ILE A 71 -15.081 15.792 -30.602 1.00 36.98 C -ATOM 1124 CG2 ILE A 71 -13.453 16.238 -32.532 1.00 38.30 C -ATOM 1125 CD1 ILE A 71 -15.243 14.301 -30.936 1.00 43.20 C -ATOM 1126 H ILE A 71 -16.569 19.072 -31.724 1.00 0.00 H -ATOM 1127 HA ILE A 71 -13.994 18.318 -30.515 1.00 0.00 H -ATOM 1128 HB ILE A 71 -15.549 16.616 -32.525 1.00 0.00 H -ATOM 1129 HG12 ILE A 71 -14.325 15.899 -29.824 1.00 0.00 H -ATOM 1130 HG13 ILE A 71 -16.017 16.122 -30.150 1.00 0.00 H -ATOM 1131 HG21 ILE A 71 -13.493 15.184 -32.804 1.00 0.00 H -ATOM 1132 HG22 ILE A 71 -13.298 16.771 -33.467 1.00 0.00 H -ATOM 1133 HG23 ILE A 71 -12.569 16.391 -31.915 1.00 0.00 H -ATOM 1134 HD11 ILE A 71 -15.628 13.755 -30.075 1.00 0.00 H -ATOM 1135 HD12 ILE A 71 -15.936 14.155 -31.765 1.00 0.00 H -ATOM 1136 HD13 ILE A 71 -14.294 13.837 -31.202 1.00 0.00 H -ATOM 1137 N ILE A 72 -12.885 19.435 -32.541 1.00 34.04 N -ATOM 1138 CA ILE A 72 -12.221 20.263 -33.570 1.00 34.30 C -ATOM 1139 C ILE A 72 -12.368 19.529 -34.934 1.00 39.83 C -ATOM 1140 O ILE A 72 -12.036 18.346 -35.049 1.00 39.81 O -ATOM 1141 CB ILE A 72 -10.703 20.519 -33.263 1.00 35.69 C -ATOM 1142 CG1 ILE A 72 -10.082 21.539 -34.260 1.00 36.05 C -ATOM 1143 CG2 ILE A 72 -9.831 19.242 -33.148 1.00 35.48 C -ATOM 1144 CD1 ILE A 72 -8.660 22.014 -33.927 1.00 37.96 C -ATOM 1145 H ILE A 72 -12.272 19.022 -31.849 1.00 0.00 H -ATOM 1146 HA ILE A 72 -12.739 21.225 -33.603 1.00 0.00 H -ATOM 1147 HB ILE A 72 -10.678 20.991 -32.279 1.00 0.00 H -ATOM 1148 HG12 ILE A 72 -10.077 21.118 -35.266 1.00 0.00 H -ATOM 1149 HG13 ILE A 72 -10.726 22.417 -34.312 1.00 0.00 H -ATOM 1150 HG21 ILE A 72 -8.874 19.458 -32.672 1.00 0.00 H -ATOM 1151 HG22 ILE A 72 -10.316 18.469 -32.554 1.00 0.00 H -ATOM 1152 HG23 ILE A 72 -9.609 18.814 -34.126 1.00 0.00 H -ATOM 1153 HD11 ILE A 72 -8.306 22.726 -34.672 1.00 0.00 H -ATOM 1154 HD12 ILE A 72 -8.624 22.510 -32.960 1.00 0.00 H -ATOM 1155 HD13 ILE A 72 -7.947 21.191 -33.909 1.00 0.00 H -ATOM 1156 N LYS A 73 -12.905 20.247 -35.937 1.00 38.47 N -ATOM 1157 CA LYS A 73 -13.309 19.683 -37.230 1.00 40.15 C -ATOM 1158 C LYS A 73 -12.037 19.494 -38.092 1.00 44.21 C -ATOM 1159 O LYS A 73 -11.181 20.380 -38.177 1.00 42.58 O -ATOM 1160 CB LYS A 73 -14.317 20.628 -37.934 1.00 43.99 C -ATOM 1161 CG LYS A 73 -15.287 19.856 -38.856 1.00 65.82 C -ATOM 1162 CD LYS A 73 -16.075 20.742 -39.836 1.00 82.27 C -ATOM 1163 CE LYS A 73 -15.251 21.144 -41.072 1.00 98.09 C -ATOM 1164 NZ LYS A 73 -16.057 21.934 -42.018 1.00108.33 N1+ -ATOM 1165 H LYS A 73 -13.160 21.215 -35.774 1.00 0.00 H -ATOM 1166 HA LYS A 73 -13.792 18.721 -37.041 1.00 0.00 H -ATOM 1167 HB2 LYS A 73 -14.920 21.160 -37.197 1.00 0.00 H -ATOM 1168 HB3 LYS A 73 -13.796 21.410 -38.490 1.00 0.00 H -ATOM 1169 HG2 LYS A 73 -14.753 19.091 -39.422 1.00 0.00 H -ATOM 1170 HG3 LYS A 73 -15.992 19.308 -38.227 1.00 0.00 H -ATOM 1171 HD2 LYS A 73 -16.956 20.189 -40.168 1.00 0.00 H -ATOM 1172 HD3 LYS A 73 -16.453 21.626 -39.320 1.00 0.00 H -ATOM 1173 HE2 LYS A 73 -14.375 21.726 -40.783 1.00 0.00 H -ATOM 1174 HE3 LYS A 73 -14.885 20.255 -41.590 1.00 0.00 H -ATOM 1175 HZ1 LYS A 73 -15.502 22.164 -42.830 1.00 0.00 H -ATOM 1176 HZ2 LYS A 73 -16.863 21.397 -42.304 1.00 0.00 H -ATOM 1177 HZ3 LYS A 73 -16.365 22.785 -41.568 1.00 0.00 H -ATOM 1178 N TYR A 74 -12.009 18.336 -38.773 1.00 42.43 N -ATOM 1179 CA TYR A 74 -11.019 17.922 -39.771 1.00 43.53 C -ATOM 1180 C TYR A 74 -11.388 18.673 -41.075 1.00 47.09 C -ATOM 1181 O TYR A 74 -12.494 18.504 -41.597 1.00 48.07 O -ATOM 1182 CB TYR A 74 -11.149 16.384 -39.937 1.00 46.00 C -ATOM 1183 CG TYR A 74 -10.254 15.734 -40.982 1.00 48.99 C -ATOM 1184 CD1 TYR A 74 -8.890 15.495 -40.696 1.00 50.72 C -ATOM 1185 CD2 TYR A 74 -10.783 15.351 -42.239 1.00 51.43 C -ATOM 1186 CE1 TYR A 74 -8.058 14.884 -41.662 1.00 52.08 C -ATOM 1187 CE2 TYR A 74 -9.952 14.740 -43.205 1.00 53.15 C -ATOM 1188 CZ TYR A 74 -8.586 14.516 -42.920 1.00 59.98 C -ATOM 1189 OH TYR A 74 -7.772 13.964 -43.864 1.00 63.78 O -ATOM 1190 H TYR A 74 -12.772 17.689 -38.641 1.00 0.00 H -ATOM 1191 HA TYR A 74 -10.009 18.175 -39.435 1.00 0.00 H -ATOM 1192 HB2 TYR A 74 -10.928 15.907 -38.982 1.00 0.00 H -ATOM 1193 HB3 TYR A 74 -12.185 16.108 -40.150 1.00 0.00 H -ATOM 1194 HD1 TYR A 74 -8.486 15.781 -39.736 1.00 0.00 H -ATOM 1195 HD2 TYR A 74 -11.825 15.525 -42.468 1.00 0.00 H -ATOM 1196 HE1 TYR A 74 -7.017 14.703 -41.441 1.00 0.00 H -ATOM 1197 HE2 TYR A 74 -10.360 14.454 -44.163 1.00 0.00 H -ATOM 1198 HH TYR A 74 -6.851 13.962 -43.588 1.00 0.00 H -ATOM 1199 N LYS A 75 -10.434 19.477 -41.578 1.00 42.37 N -ATOM 1200 CA LYS A 75 -10.519 20.204 -42.855 1.00 42.56 C -ATOM 1201 C LYS A 75 -9.996 19.268 -43.978 1.00 48.47 C -ATOM 1202 O LYS A 75 -10.631 19.210 -45.032 1.00 50.00 O -ATOM 1203 CB LYS A 75 -9.630 21.474 -42.781 1.00 43.06 C -ATOM 1204 CG LYS A 75 -10.270 22.696 -42.086 1.00 48.30 C -ATOM 1205 CD LYS A 75 -11.074 23.616 -43.028 1.00 61.25 C -ATOM 1206 CE LYS A 75 -11.555 24.907 -42.334 1.00 72.82 C -ATOM 1207 NZ LYS A 75 -12.125 25.873 -43.293 1.00 84.70 N1+ -ATOM 1208 H LYS A 75 -9.547 19.542 -41.097 1.00 0.00 H -ATOM 1209 HA LYS A 75 -11.549 20.493 -43.079 1.00 0.00 H -ATOM 1210 HB2 LYS A 75 -8.716 21.228 -42.245 1.00 0.00 H -ATOM 1211 HB3 LYS A 75 -9.289 21.779 -43.769 1.00 0.00 H -ATOM 1212 HG2 LYS A 75 -10.877 22.380 -41.236 1.00 0.00 H -ATOM 1213 HG3 LYS A 75 -9.461 23.294 -41.667 1.00 0.00 H -ATOM 1214 HD2 LYS A 75 -10.439 23.885 -43.874 1.00 0.00 H -ATOM 1215 HD3 LYS A 75 -11.925 23.073 -43.443 1.00 0.00 H -ATOM 1216 HE2 LYS A 75 -12.303 24.673 -41.576 1.00 0.00 H -ATOM 1217 HE3 LYS A 75 -10.728 25.396 -41.818 1.00 0.00 H -ATOM 1218 HZ1 LYS A 75 -12.425 26.707 -42.804 1.00 0.00 H -ATOM 1219 HZ2 LYS A 75 -11.425 26.129 -43.975 1.00 0.00 H -ATOM 1220 HZ3 LYS A 75 -12.917 25.463 -43.767 1.00 0.00 H -ATOM 1221 N GLY A 76 -8.883 18.546 -43.739 1.00 44.37 N -ATOM 1222 CA GLY A 76 -8.223 17.672 -44.711 1.00 45.35 C -ATOM 1223 C GLY A 76 -6.800 17.339 -44.237 1.00 49.58 C -ATOM 1224 O GLY A 76 -6.491 17.373 -43.043 1.00 45.71 O -ATOM 1225 H GLY A 76 -8.426 18.635 -42.840 1.00 0.00 H -ATOM 1226 HA2 GLY A 76 -8.792 16.751 -44.836 1.00 0.00 H -ATOM 1227 HA3 GLY A 76 -8.170 18.162 -45.685 1.00 0.00 H -ATOM 1228 N CYS A 77 -5.932 16.999 -45.202 1.00 49.54 N -ATOM 1229 CA CYS A 77 -4.487 16.787 -45.019 1.00 51.02 C -ATOM 1230 C CYS A 77 -3.747 17.590 -46.112 1.00 57.60 C -ATOM 1231 O CYS A 77 -4.328 17.983 -47.125 1.00 57.77 O -ATOM 1232 CB CYS A 77 -4.079 15.294 -44.995 1.00 52.68 C -ATOM 1233 SG CYS A 77 -4.498 14.526 -43.407 1.00 55.96 S -ATOM 1234 H CYS A 77 -6.250 16.982 -46.161 1.00 0.00 H -ATOM 1235 HA CYS A 77 -4.189 17.249 -44.077 1.00 0.00 H -ATOM 1236 HB2 CYS A 77 -4.567 14.741 -45.799 1.00 0.00 H -ATOM 1237 HB3 CYS A 77 -3.004 15.174 -45.132 1.00 0.00 H -ATOM 1238 HG CYS A 77 -3.615 15.220 -42.681 1.00 0.00 H -ATOM 1239 N CYS A 78 -2.444 17.813 -45.873 1.00 56.83 N -ATOM 1240 CA CYS A 78 -1.516 18.494 -46.780 1.00 59.37 C -ATOM 1241 C CYS A 78 -0.326 17.526 -46.955 1.00 64.61 C -ATOM 1242 O CYS A 78 0.224 17.034 -45.967 1.00 62.66 O -ATOM 1243 CB CYS A 78 -1.134 19.898 -46.255 1.00 59.95 C -ATOM 1244 SG CYS A 78 -0.027 20.786 -47.386 1.00 65.77 S -ATOM 1245 H CYS A 78 -2.034 17.454 -45.020 1.00 0.00 H -ATOM 1246 HA CYS A 78 -1.991 18.615 -47.754 1.00 0.00 H -ATOM 1247 HB2 CYS A 78 -2.025 20.507 -46.109 1.00 0.00 H -ATOM 1248 HB3 CYS A 78 -0.649 19.837 -45.284 1.00 0.00 H -ATOM 1249 HG CYS A 78 -0.893 20.851 -48.403 1.00 0.00 H -ATOM 1250 N GLU A 79 0.086 17.333 -48.225 1.00 64.28 N -ATOM 1251 CA GLU A 79 1.238 16.528 -48.655 1.00 65.86 C -ATOM 1252 C GLU A 79 2.499 17.358 -48.316 1.00 70.57 C -ATOM 1253 O GLU A 79 2.717 18.421 -48.903 1.00 70.73 O -ATOM 1254 CB GLU A 79 1.088 16.228 -50.175 1.00 69.10 C -ATOM 1255 CG GLU A 79 2.247 15.436 -50.848 1.00 81.26 C -ATOM 1256 CD GLU A 79 3.368 16.269 -51.498 1.00 98.19 C -ATOM 1257 OE1 GLU A 79 4.511 15.760 -51.519 1.00 78.88 O -ATOM 1258 OE2 GLU A 79 3.072 17.377 -51.998 1.00 93.22 O1- -ATOM 1259 H GLU A 79 -0.405 17.806 -48.970 1.00 0.00 H -ATOM 1260 HA GLU A 79 1.249 15.580 -48.112 1.00 0.00 H -ATOM 1261 HB2 GLU A 79 0.174 15.646 -50.306 1.00 0.00 H -ATOM 1262 HB3 GLU A 79 0.894 17.155 -50.718 1.00 0.00 H -ATOM 1263 HG2 GLU A 79 2.678 14.731 -50.135 1.00 0.00 H -ATOM 1264 HG3 GLU A 79 1.832 14.825 -51.649 1.00 0.00 H -ATOM 1265 N ASH A 80 3.291 16.840 -47.358 1.00 66.99 N -ATOM 1266 CA ASH A 80 4.573 17.400 -46.927 1.00 67.07 C -ATOM 1267 C ASH A 80 5.634 16.579 -47.691 1.00 72.70 C -ATOM 1268 O ASH A 80 5.822 15.388 -47.426 1.00 72.95 O -ATOM 1269 CB ASH A 80 4.770 17.311 -45.383 1.00 67.90 C -ATOM 1270 CG ASH A 80 5.549 18.490 -44.779 1.00 83.41 C -ATOM 1271 OD1 ASH A 80 6.351 19.108 -45.516 1.00 85.94 O -ATOM 1272 OD2 ASH A 80 5.328 18.773 -43.584 1.00 90.83 O1- -ATOM 1273 H ASH A 80 3.048 15.952 -46.940 1.00 0.00 H -ATOM 1274 HA ASH A 80 4.619 18.449 -47.236 1.00 0.00 H -ATOM 1275 HB2 ASH A 80 3.792 17.285 -44.900 1.00 0.00 H -ATOM 1276 HB3 ASH A 80 5.261 16.388 -45.072 1.00 0.00 H -ATOM 1277 N GLN A 81 6.308 17.265 -48.631 1.00 69.93 N -ATOM 1278 CA GLN A 81 7.346 16.730 -49.523 1.00 70.98 C -ATOM 1279 C GLN A 81 8.682 16.576 -48.739 1.00 74.28 C -ATOM 1280 O GLN A 81 9.381 15.585 -48.959 1.00 74.55 O -ATOM 1281 CB GLN A 81 7.488 17.706 -50.714 1.00 0.00 C -ATOM 1282 CG GLN A 81 8.324 17.155 -51.889 1.00 0.00 C -ATOM 1283 CD GLN A 81 8.299 18.087 -53.103 1.00 0.00 C -ATOM 1284 OE1 GLN A 81 9.292 18.739 -53.413 1.00 0.00 O -ATOM 1285 NE2 GLN A 81 7.160 18.157 -53.794 1.00 0.00 N -ATOM 1286 HB2 GLN A 81 6.485 17.940 -51.081 1.00 0.00 H -ATOM 1287 HB3 GLN A 81 7.904 18.659 -50.378 1.00 0.00 H -ATOM 1288 HG2 GLN A 81 9.358 16.996 -51.579 1.00 0.00 H -ATOM 1289 HG3 GLN A 81 7.944 16.178 -52.192 1.00 0.00 H -ATOM 1290 HE22 GLN A 81 7.096 18.758 -54.602 1.00 0.00 H -ATOM 1291 HE21 GLN A 81 6.355 17.615 -53.509 1.00 0.00 H -ATOM 1292 H GLN A 81 6.068 18.235 -48.780 1.00 0.00 H -ATOM 1293 HA GLN A 81 7.024 15.754 -49.897 1.00 0.00 H -ATOM 1294 N GLY A 82 8.959 17.488 -47.783 1.00 69.45 N -ATOM 1295 CA GLY A 82 9.915 17.300 -46.686 1.00 69.02 C -ATOM 1296 C GLY A 82 9.232 16.540 -45.531 1.00 72.14 C -ATOM 1297 O GLY A 82 8.009 16.558 -45.398 1.00 71.87 O -ATOM 1298 H GLY A 82 8.314 18.257 -47.670 1.00 0.00 H -ATOM 1299 HA2 GLY A 82 10.811 16.776 -47.026 1.00 0.00 H -ATOM 1300 HA3 GLY A 82 10.231 18.279 -46.322 1.00 0.00 H -ATOM 1301 N GLU A 83 10.027 15.841 -44.699 1.00 67.87 N -ATOM 1302 CA GLU A 83 9.603 15.015 -43.543 1.00 66.36 C -ATOM 1303 C GLU A 83 9.099 13.621 -44.014 1.00 68.68 C -ATOM 1304 O GLU A 83 9.338 12.641 -43.308 1.00 67.93 O -ATOM 1305 CB GLU A 83 8.627 15.724 -42.552 1.00 0.00 C -ATOM 1306 CG GLU A 83 9.027 17.175 -42.180 1.00 0.00 C -ATOM 1307 CD GLU A 83 8.228 17.775 -41.019 1.00 0.00 C -ATOM 1308 OE1 GLU A 83 6.980 17.730 -41.090 1.00 0.00 O -ATOM 1309 OE2 GLU A 83 8.881 18.289 -40.083 1.00 0.00 O1- -ATOM 1310 HB2 GLU A 83 7.615 15.732 -42.963 1.00 0.00 H -ATOM 1311 HB3 GLU A 83 8.558 15.124 -41.642 1.00 0.00 H -ATOM 1312 HG2 GLU A 83 10.089 17.208 -41.949 1.00 0.00 H -ATOM 1313 HG3 GLU A 83 8.889 17.838 -43.034 1.00 0.00 H -ATOM 1314 H GLU A 83 11.023 15.864 -44.862 1.00 0.00 H -ATOM 1315 HA GLU A 83 10.529 14.831 -42.994 1.00 0.00 H -ATOM 1316 N LYS A 84 8.412 13.556 -45.179 1.00 64.62 N -ATOM 1317 CA LYS A 84 7.812 12.390 -45.854 1.00 64.42 C -ATOM 1318 C LYS A 84 6.641 11.863 -44.991 1.00 65.37 C -ATOM 1319 O LYS A 84 6.675 10.724 -44.518 1.00 65.17 O -ATOM 1320 CB LYS A 84 8.858 11.334 -46.306 1.00 0.00 C -ATOM 1321 CG LYS A 84 9.635 11.768 -47.567 1.00 0.00 C -ATOM 1322 CD LYS A 84 10.515 10.650 -48.158 1.00 0.00 C -ATOM 1323 CE LYS A 84 11.162 11.047 -49.496 1.00 0.00 C -ATOM 1324 NZ LYS A 84 11.959 9.944 -50.061 1.00 0.00 N1+ -ATOM 1325 HB2 LYS A 84 9.551 11.095 -45.499 1.00 0.00 H -ATOM 1326 HB3 LYS A 84 8.345 10.399 -46.538 1.00 0.00 H -ATOM 1327 HG2 LYS A 84 8.923 12.088 -48.330 1.00 0.00 H -ATOM 1328 HG3 LYS A 84 10.247 12.642 -47.340 1.00 0.00 H -ATOM 1329 HD2 LYS A 84 11.287 10.378 -47.436 1.00 0.00 H -ATOM 1330 HD3 LYS A 84 9.905 9.757 -48.307 1.00 0.00 H -ATOM 1331 HE2 LYS A 84 10.394 11.324 -50.221 1.00 0.00 H -ATOM 1332 HE3 LYS A 84 11.805 11.919 -49.366 1.00 0.00 H -ATOM 1333 HZ1 LYS A 84 12.361 10.233 -50.942 1.00 0.00 H -ATOM 1334 HZ2 LYS A 84 12.700 9.698 -49.419 1.00 0.00 H -ATOM 1335 HZ3 LYS A 84 11.365 9.141 -50.210 1.00 0.00 H -ATOM 1336 H LYS A 84 8.231 14.438 -45.641 1.00 0.00 H -ATOM 1337 HA LYS A 84 7.336 12.777 -46.757 1.00 0.00 H -ATOM 1338 N SER A 85 5.632 12.729 -44.797 1.00 59.44 N -ATOM 1339 CA SER A 85 4.426 12.491 -43.995 1.00 57.90 C -ATOM 1340 C SER A 85 3.307 13.433 -44.506 1.00 59.01 C -ATOM 1341 O SER A 85 3.529 14.305 -45.351 1.00 59.49 O -ATOM 1342 CB SER A 85 4.733 12.592 -42.474 1.00 60.76 C -ATOM 1343 OG SER A 85 5.167 13.882 -42.081 1.00 68.97 O -ATOM 1344 H SER A 85 5.681 13.641 -45.230 1.00 0.00 H -ATOM 1345 HA SER A 85 4.082 11.475 -44.207 1.00 0.00 H -ATOM 1346 HB2 SER A 85 3.846 12.344 -41.890 1.00 0.00 H -ATOM 1347 HB3 SER A 85 5.495 11.868 -42.184 1.00 0.00 H -ATOM 1348 HG SER A 85 6.007 14.069 -42.509 1.00 0.00 H -ATOM 1349 N LEU A 86 2.097 13.226 -43.960 1.00 52.28 N -ATOM 1350 CA LEU A 86 0.949 14.129 -44.109 1.00 50.34 C -ATOM 1351 C LEU A 86 0.994 15.071 -42.882 1.00 50.70 C -ATOM 1352 O LEU A 86 1.199 14.614 -41.755 1.00 49.90 O -ATOM 1353 CB LEU A 86 -0.365 13.304 -44.049 1.00 50.33 C -ATOM 1354 CG LEU A 86 -0.657 12.411 -45.278 1.00 55.89 C -ATOM 1355 CD1 LEU A 86 -1.922 11.564 -45.038 1.00 55.99 C -ATOM 1356 CD2 LEU A 86 -0.776 13.209 -46.592 1.00 57.89 C -ATOM 1357 H LEU A 86 1.984 12.493 -43.276 1.00 0.00 H -ATOM 1358 HA LEU A 86 1.006 14.706 -45.032 1.00 0.00 H -ATOM 1359 HB2 LEU A 86 -0.350 12.673 -43.158 1.00 0.00 H -ATOM 1360 HB3 LEU A 86 -1.213 13.980 -43.914 1.00 0.00 H -ATOM 1361 HG LEU A 86 0.175 11.715 -45.394 1.00 0.00 H -ATOM 1362 HD11 LEU A 86 -2.109 10.886 -45.871 1.00 0.00 H -ATOM 1363 HD12 LEU A 86 -1.827 10.954 -44.139 1.00 0.00 H -ATOM 1364 HD13 LEU A 86 -2.806 12.192 -44.916 1.00 0.00 H -ATOM 1365 HD21 LEU A 86 -1.028 12.556 -47.428 1.00 0.00 H -ATOM 1366 HD22 LEU A 86 -1.547 13.977 -46.532 1.00 0.00 H -ATOM 1367 HD23 LEU A 86 0.161 13.701 -46.853 1.00 0.00 H -ATOM 1368 N GLN A 87 0.682 16.355 -43.120 1.00 44.54 N -ATOM 1369 CA GLN A 87 0.287 17.321 -42.085 1.00 42.17 C -ATOM 1370 C GLN A 87 -1.255 17.206 -41.969 1.00 43.56 C -ATOM 1371 O GLN A 87 -1.954 17.072 -42.977 1.00 42.93 O -ATOM 1372 CB GLN A 87 0.655 18.751 -42.531 1.00 43.83 C -ATOM 1373 CG GLN A 87 2.171 19.024 -42.601 1.00 59.19 C -ATOM 1374 CD GLN A 87 2.480 20.410 -43.176 1.00 77.91 C -ATOM 1375 OE1 GLN A 87 2.776 21.348 -42.440 1.00 74.64 O -ATOM 1376 NE2 GLN A 87 2.398 20.548 -44.500 1.00 71.32 N -ATOM 1377 H GLN A 87 0.512 16.645 -44.075 1.00 0.00 H -ATOM 1378 HA GLN A 87 0.774 17.100 -41.133 1.00 0.00 H -ATOM 1379 HB2 GLN A 87 0.192 18.961 -43.494 1.00 0.00 H -ATOM 1380 HB3 GLN A 87 0.220 19.454 -41.823 1.00 0.00 H -ATOM 1381 HG2 GLN A 87 2.614 18.936 -41.608 1.00 0.00 H -ATOM 1382 HG3 GLN A 87 2.660 18.269 -43.214 1.00 0.00 H -ATOM 1383 HE22 GLN A 87 2.563 21.448 -44.923 1.00 0.00 H -ATOM 1384 HE21 GLN A 87 2.159 19.758 -45.082 1.00 0.00 H -ATOM 1385 N LEU A 88 -1.752 17.308 -40.727 1.00 37.72 N -ATOM 1386 CA LEU A 88 -3.166 17.231 -40.345 1.00 36.76 C -ATOM 1387 C LEU A 88 -3.659 18.695 -40.327 1.00 38.66 C -ATOM 1388 O LEU A 88 -3.302 19.454 -39.423 1.00 37.25 O -ATOM 1389 CB LEU A 88 -3.220 16.587 -38.934 1.00 36.56 C -ATOM 1390 CG LEU A 88 -4.613 16.348 -38.305 1.00 41.61 C -ATOM 1391 CD1 LEU A 88 -5.589 15.633 -39.254 1.00 43.42 C -ATOM 1392 CD2 LEU A 88 -4.470 15.580 -36.977 1.00 42.85 C -ATOM 1393 H LEU A 88 -1.110 17.497 -39.968 1.00 0.00 H -ATOM 1394 HA LEU A 88 -3.733 16.624 -41.056 1.00 0.00 H -ATOM 1395 HB2 LEU A 88 -2.698 15.631 -38.983 1.00 0.00 H -ATOM 1396 HB3 LEU A 88 -2.637 17.188 -38.237 1.00 0.00 H -ATOM 1397 HG LEU A 88 -5.050 17.318 -38.067 1.00 0.00 H -ATOM 1398 HD11 LEU A 88 -6.502 15.342 -38.737 1.00 0.00 H -ATOM 1399 HD12 LEU A 88 -5.877 16.285 -40.080 1.00 0.00 H -ATOM 1400 HD13 LEU A 88 -5.158 14.728 -39.679 1.00 0.00 H -ATOM 1401 HD21 LEU A 88 -5.434 15.431 -36.493 1.00 0.00 H -ATOM 1402 HD22 LEU A 88 -4.028 14.595 -37.134 1.00 0.00 H -ATOM 1403 HD23 LEU A 88 -3.834 16.119 -36.273 1.00 0.00 H -ATOM 1404 N VAL A 89 -4.481 19.056 -41.331 1.00 35.03 N -ATOM 1405 CA VAL A 89 -5.089 20.387 -41.478 1.00 34.91 C -ATOM 1406 C VAL A 89 -6.453 20.293 -40.744 1.00 38.85 C -ATOM 1407 O VAL A 89 -7.288 19.437 -41.052 1.00 39.08 O -ATOM 1408 CB VAL A 89 -5.355 20.772 -42.972 1.00 39.71 C -ATOM 1409 CG1 VAL A 89 -5.898 22.211 -43.136 1.00 39.45 C -ATOM 1410 CG2 VAL A 89 -4.091 20.613 -43.844 1.00 39.89 C -ATOM 1411 H VAL A 89 -4.768 18.366 -42.012 1.00 0.00 H -ATOM 1412 HA VAL A 89 -4.449 21.152 -41.032 1.00 0.00 H -ATOM 1413 HB VAL A 89 -6.104 20.098 -43.391 1.00 0.00 H -ATOM 1414 HG11 VAL A 89 -6.119 22.430 -44.179 1.00 0.00 H -ATOM 1415 HG12 VAL A 89 -6.814 22.384 -42.574 1.00 0.00 H -ATOM 1416 HG13 VAL A 89 -5.173 22.950 -42.796 1.00 0.00 H -ATOM 1417 HG21 VAL A 89 -4.299 20.848 -44.888 1.00 0.00 H -ATOM 1418 HG22 VAL A 89 -3.289 21.274 -43.511 1.00 0.00 H -ATOM 1419 HG23 VAL A 89 -3.703 19.595 -43.819 1.00 0.00 H -ATOM 1420 N MET A 90 -6.631 21.206 -39.780 1.00 34.03 N -ATOM 1421 CA MET A 90 -7.809 21.363 -38.917 1.00 34.32 C -ATOM 1422 C MET A 90 -8.301 22.822 -39.091 1.00 36.69 C -ATOM 1423 O MET A 90 -7.613 23.673 -39.667 1.00 35.63 O -ATOM 1424 CB MET A 90 -7.421 21.062 -37.443 1.00 36.81 C -ATOM 1425 CG MET A 90 -6.676 19.729 -37.216 1.00 41.50 C -ATOM 1426 SD MET A 90 -6.105 19.424 -35.519 1.00 45.78 S -ATOM 1427 CE MET A 90 -4.848 20.723 -35.344 1.00 42.96 C -ATOM 1428 H MET A 90 -5.891 21.873 -39.602 1.00 0.00 H -ATOM 1429 HA MET A 90 -8.609 20.690 -39.233 1.00 0.00 H -ATOM 1430 HB2 MET A 90 -6.810 21.876 -37.053 1.00 0.00 H -ATOM 1431 HB3 MET A 90 -8.323 21.059 -36.831 1.00 0.00 H -ATOM 1432 HG2 MET A 90 -7.319 18.901 -37.513 1.00 0.00 H -ATOM 1433 HG3 MET A 90 -5.792 19.669 -37.851 1.00 0.00 H -ATOM 1434 HE1 MET A 90 -4.279 20.574 -34.426 1.00 0.00 H -ATOM 1435 HE2 MET A 90 -4.156 20.703 -36.186 1.00 0.00 H -ATOM 1436 HE3 MET A 90 -5.310 21.709 -35.300 1.00 0.00 H -ATOM 1437 N GLU A 91 -9.500 23.107 -38.549 1.00 33.63 N -ATOM 1438 CA GLU A 91 -10.075 24.462 -38.459 1.00 33.95 C -ATOM 1439 C GLU A 91 -9.286 25.257 -37.385 1.00 35.56 C -ATOM 1440 O GLU A 91 -8.796 24.698 -36.406 1.00 32.73 O -ATOM 1441 CB GLU A 91 -11.582 24.369 -38.088 1.00 36.17 C -ATOM 1442 CG GLU A 91 -11.924 23.748 -36.706 1.00 42.68 C -ATOM 1443 CD GLU A 91 -13.416 23.730 -36.345 1.00 58.73 C -ATOM 1444 OE1 GLU A 91 -14.201 24.475 -36.972 1.00 57.48 O -ATOM 1445 OE2 GLU A 91 -13.758 22.951 -35.430 1.00 43.43 O1- -ATOM 1446 H GLU A 91 -10.025 22.373 -38.092 1.00 0.00 H -ATOM 1447 HA GLU A 91 -9.977 24.949 -39.432 1.00 0.00 H -ATOM 1448 HB2 GLU A 91 -12.004 25.375 -38.143 1.00 0.00 H -ATOM 1449 HB3 GLU A 91 -12.096 23.803 -38.867 1.00 0.00 H -ATOM 1450 HG2 GLU A 91 -11.544 22.728 -36.661 1.00 0.00 H -ATOM 1451 HG3 GLU A 91 -11.425 24.299 -35.910 1.00 0.00 H -ATOM 1452 N TYR A 92 -9.171 26.566 -37.540 1.00 33.04 N -ATOM 1453 CA TYR A 92 -8.594 27.401 -36.499 1.00 34.05 C -ATOM 1454 C TYR A 92 -9.741 27.873 -35.604 1.00 39.90 C -ATOM 1455 O TYR A 92 -10.594 28.653 -36.030 1.00 41.17 O -ATOM 1456 CB TYR A 92 -8.006 28.608 -37.214 1.00 36.60 C -ATOM 1457 CG TYR A 92 -7.671 29.776 -36.325 1.00 38.89 C -ATOM 1458 CD1 TYR A 92 -6.572 29.679 -35.470 1.00 40.20 C -ATOM 1459 CD2 TYR A 92 -8.417 30.964 -36.428 1.00 40.57 C -ATOM 1460 CE1 TYR A 92 -6.059 30.868 -34.954 1.00 41.79 C -ATOM 1461 CE2 TYR A 92 -8.000 32.111 -35.745 1.00 41.35 C -ATOM 1462 CZ TYR A 92 -6.787 32.078 -35.044 1.00 46.65 C -ATOM 1463 OH TYR A 92 -6.381 33.220 -34.424 1.00 46.21 O -ATOM 1464 H TYR A 92 -9.645 27.024 -38.302 1.00 0.00 H -ATOM 1465 HA TYR A 92 -7.812 26.906 -35.922 1.00 0.00 H -ATOM 1466 HB2 TYR A 92 -7.092 28.294 -37.721 1.00 0.00 H -ATOM 1467 HB3 TYR A 92 -8.680 28.951 -38.001 1.00 0.00 H -ATOM 1468 HD1 TYR A 92 -6.043 28.723 -35.366 1.00 0.00 H -ATOM 1469 HD2 TYR A 92 -9.293 30.996 -37.067 1.00 0.00 H -ATOM 1470 HE1 TYR A 92 -5.080 30.775 -34.522 1.00 0.00 H -ATOM 1471 HE2 TYR A 92 -8.587 33.015 -35.849 1.00 0.00 H -ATOM 1472 HH TYR A 92 -6.836 33.954 -34.837 1.00 0.00 H -ATOM 1473 N VAL A 93 -9.712 27.508 -34.341 1.00 35.70 N -ATOM 1474 CA VAL A 93 -10.748 27.673 -33.330 1.00 35.13 C -ATOM 1475 C VAL A 93 -10.338 28.987 -32.624 1.00 39.95 C -ATOM 1476 O VAL A 93 -9.314 29.000 -31.912 1.00 40.49 O -ATOM 1477 CB VAL A 93 -10.678 26.463 -32.337 1.00 37.53 C -ATOM 1478 CG1 VAL A 93 -11.740 26.564 -31.232 1.00 37.76 C -ATOM 1479 CG2 VAL A 93 -10.835 25.105 -33.059 1.00 36.89 C -ATOM 1480 H VAL A 93 -8.869 27.114 -34.100 1.00 0.00 H -ATOM 1481 HA VAL A 93 -11.758 27.681 -33.735 1.00 0.00 H -ATOM 1482 HB VAL A 93 -9.699 26.437 -31.854 1.00 0.00 H -ATOM 1483 HG11 VAL A 93 -11.809 25.656 -30.635 1.00 0.00 H -ATOM 1484 HG12 VAL A 93 -11.494 27.375 -30.558 1.00 0.00 H -ATOM 1485 HG13 VAL A 93 -12.730 26.748 -31.649 1.00 0.00 H -ATOM 1486 HG21 VAL A 93 -10.798 24.272 -32.356 1.00 0.00 H -ATOM 1487 HG22 VAL A 93 -11.787 25.043 -33.588 1.00 0.00 H -ATOM 1488 HG23 VAL A 93 -10.040 24.937 -33.786 1.00 0.00 H -ATOM 1489 N PRO A 94 -11.033 30.128 -32.918 1.00 37.29 N -ATOM 1490 CA PRO A 94 -10.572 31.529 -32.780 1.00 36.67 C -ATOM 1491 C PRO A 94 -10.011 32.067 -31.462 1.00 38.06 C -ATOM 1492 O PRO A 94 -9.157 32.949 -31.535 1.00 37.41 O -ATOM 1493 CB PRO A 94 -11.785 32.410 -33.113 1.00 39.18 C -ATOM 1494 CG PRO A 94 -12.613 31.580 -34.056 1.00 44.96 C -ATOM 1495 CD PRO A 94 -12.315 30.143 -33.653 1.00 40.09 C -ATOM 1496 HA PRO A 94 -9.813 31.669 -33.550 1.00 0.00 H -ATOM 1497 HB2 PRO A 94 -12.387 32.612 -32.224 1.00 0.00 H -ATOM 1498 HB3 PRO A 94 -11.501 33.369 -33.546 1.00 0.00 H -ATOM 1499 HG2 PRO A 94 -13.680 31.808 -34.013 1.00 0.00 H -ATOM 1500 HG3 PRO A 94 -12.277 31.739 -35.082 1.00 0.00 H -ATOM 1501 HD3 PRO A 94 -12.334 29.547 -34.562 1.00 0.00 H -ATOM 1502 HD2 PRO A 94 -13.108 29.763 -33.012 1.00 0.00 H -ATOM 1503 N LEU A 95 -10.453 31.596 -30.297 1.00 33.36 N -ATOM 1504 CA LEU A 95 -10.058 32.120 -28.977 1.00 31.91 C -ATOM 1505 C LEU A 95 -9.095 31.149 -28.236 1.00 34.62 C -ATOM 1506 O LEU A 95 -8.582 31.524 -27.190 1.00 34.03 O -ATOM 1507 CB LEU A 95 -11.318 32.320 -28.090 1.00 31.79 C -ATOM 1508 CG LEU A 95 -12.358 33.343 -28.617 1.00 36.75 C -ATOM 1509 CD1 LEU A 95 -13.587 33.401 -27.693 1.00 37.07 C -ATOM 1510 CD2 LEU A 95 -11.771 34.754 -28.821 1.00 39.07 C -ATOM 1511 H LEU A 95 -11.217 30.944 -30.325 1.00 0.00 H -ATOM 1512 HA LEU A 95 -9.553 33.083 -29.071 1.00 0.00 H -ATOM 1513 HB2 LEU A 95 -11.818 31.367 -27.931 1.00 0.00 H -ATOM 1514 HB3 LEU A 95 -11.008 32.644 -27.096 1.00 0.00 H -ATOM 1515 HG LEU A 95 -12.712 32.993 -29.589 1.00 0.00 H -ATOM 1516 HD11 LEU A 95 -14.350 34.073 -28.088 1.00 0.00 H -ATOM 1517 HD12 LEU A 95 -14.044 32.418 -27.584 1.00 0.00 H -ATOM 1518 HD13 LEU A 95 -13.324 33.755 -26.695 1.00 0.00 H -ATOM 1519 HD21 LEU A 95 -12.540 35.456 -29.145 1.00 0.00 H -ATOM 1520 HD22 LEU A 95 -11.336 35.141 -27.900 1.00 0.00 H -ATOM 1521 HD23 LEU A 95 -10.996 34.762 -29.587 1.00 0.00 H -ATOM 1522 N GLY A 96 -8.852 29.921 -28.750 1.00 30.54 N -ATOM 1523 CA GLY A 96 -7.715 29.135 -28.214 1.00 29.44 C -ATOM 1524 C GLY A 96 -8.078 28.224 -27.103 1.00 30.46 C -ATOM 1525 O GLY A 96 -9.272 28.063 -26.835 1.00 29.51 O -ATOM 1526 H GLY A 96 -9.703 29.374 -28.822 1.00 0.00 H -ATOM 1527 HA2 GLY A 96 -7.193 28.520 -28.940 1.00 0.00 H -ATOM 1528 HA3 GLY A 96 -7.000 29.751 -27.679 1.00 0.00 H -ATOM 1529 N SER A 97 -7.053 27.636 -26.491 1.00 25.72 N -ATOM 1530 CA SER A 97 -7.218 26.806 -25.314 1.00 25.55 C -ATOM 1531 C SER A 97 -7.758 27.612 -24.106 1.00 28.85 C -ATOM 1532 O SER A 97 -7.416 28.785 -23.937 1.00 26.31 O -ATOM 1533 CB SER A 97 -5.905 26.053 -24.983 1.00 29.24 C -ATOM 1534 OG SER A 97 -4.881 26.855 -24.425 1.00 35.45 O -ATOM 1535 H SER A 97 -6.098 27.763 -26.844 1.00 0.00 H -ATOM 1536 HA SER A 97 -7.956 26.057 -25.576 1.00 0.00 H -ATOM 1537 HB2 SER A 97 -6.118 25.257 -24.268 1.00 0.00 H -ATOM 1538 HB3 SER A 97 -5.517 25.555 -25.873 1.00 0.00 H -ATOM 1539 HG SER A 97 -4.580 27.494 -25.079 1.00 0.00 H -ATOM 1540 N LEU A 98 -8.545 26.930 -23.251 1.00 27.52 N -ATOM 1541 CA LEU A 98 -9.083 27.450 -21.979 1.00 27.90 C -ATOM 1542 C LEU A 98 -7.940 27.712 -20.959 1.00 31.20 C -ATOM 1543 O LEU A 98 -8.113 28.583 -20.109 1.00 30.54 O -ATOM 1544 CB LEU A 98 -10.114 26.453 -21.386 1.00 27.75 C -ATOM 1545 CG LEU A 98 -11.462 26.355 -22.144 1.00 32.92 C -ATOM 1546 CD1 LEU A 98 -12.341 25.248 -21.538 1.00 33.36 C -ATOM 1547 CD2 LEU A 98 -12.243 27.684 -22.173 1.00 36.70 C -ATOM 1548 H LEU A 98 -8.782 25.970 -23.466 1.00 0.00 H -ATOM 1549 HA LEU A 98 -9.566 28.409 -22.166 1.00 0.00 H -ATOM 1550 HB2 LEU A 98 -9.660 25.461 -21.335 1.00 0.00 H -ATOM 1551 HB3 LEU A 98 -10.333 26.720 -20.351 1.00 0.00 H -ATOM 1552 HG LEU A 98 -11.249 26.070 -23.175 1.00 0.00 H -ATOM 1553 HD11 LEU A 98 -13.216 25.059 -22.155 1.00 0.00 H -ATOM 1554 HD12 LEU A 98 -11.800 24.307 -21.446 1.00 0.00 H -ATOM 1555 HD13 LEU A 98 -12.705 25.527 -20.551 1.00 0.00 H -ATOM 1556 HD21 LEU A 98 -13.209 27.550 -22.658 1.00 0.00 H -ATOM 1557 HD22 LEU A 98 -12.434 28.059 -21.167 1.00 0.00 H -ATOM 1558 HD23 LEU A 98 -11.716 28.461 -22.724 1.00 0.00 H -ATOM 1559 N ARG A 99 -6.786 27.023 -21.085 1.00 29.06 N -ATOM 1560 CA ARG A 99 -5.573 27.209 -20.274 1.00 29.96 C -ATOM 1561 C ARG A 99 -4.861 28.548 -20.604 1.00 34.81 C -ATOM 1562 O ARG A 99 -4.237 29.104 -19.700 1.00 34.10 O -ATOM 1563 CB ARG A 99 -4.641 25.994 -20.476 1.00 32.11 C -ATOM 1564 CG ARG A 99 -3.416 25.957 -19.541 1.00 46.98 C -ATOM 1565 CD ARG A 99 -2.669 24.618 -19.606 1.00 59.29 C -ATOM 1566 NE ARG A 99 -1.493 24.613 -18.723 1.00 65.62 N -ATOM 1567 CZ ARG A 99 -0.284 25.121 -18.998 1.00 80.85 C -ATOM 1568 NH1 ARG A 99 0.679 25.023 -18.083 1.00 71.30 N -ATOM 1569 NH2 ARG A 99 -0.005 25.721 -20.159 1.00 64.23 N1+ -ATOM 1570 H ARG A 99 -6.723 26.318 -21.807 1.00 0.00 H -ATOM 1571 HA ARG A 99 -5.871 27.238 -19.233 1.00 0.00 H -ATOM 1572 HB2 ARG A 99 -5.222 25.090 -20.294 1.00 0.00 H -ATOM 1573 HB3 ARG A 99 -4.313 25.938 -21.516 1.00 0.00 H -ATOM 1574 HG2 ARG A 99 -2.733 26.770 -19.793 1.00 0.00 H -ATOM 1575 HG3 ARG A 99 -3.737 26.134 -18.513 1.00 0.00 H -ATOM 1576 HD2 ARG A 99 -3.334 23.812 -19.296 1.00 0.00 H -ATOM 1577 HD3 ARG A 99 -2.359 24.393 -20.627 1.00 0.00 H -ATOM 1578 HE ARG A 99 -1.622 24.186 -17.816 1.00 0.00 H -ATOM 1579 HH12 ARG A 99 1.596 25.399 -18.281 1.00 0.00 H -ATOM 1580 HH11 ARG A 99 0.485 24.586 -17.193 1.00 0.00 H -ATOM 1581 HH22 ARG A 99 0.931 26.066 -20.330 1.00 0.00 H -ATOM 1582 HH21 ARG A 99 -0.724 25.831 -20.858 1.00 0.00 H -ATOM 1583 N ASH A 100 -4.986 29.060 -21.844 1.00 32.33 N -ATOM 1584 CA ASH A 100 -4.413 30.339 -22.294 1.00 32.03 C -ATOM 1585 C ASH A 100 -5.473 31.462 -22.131 1.00 34.79 C -ATOM 1586 O ASH A 100 -5.070 32.591 -21.851 1.00 33.45 O -ATOM 1587 CB ASH A 100 -3.988 30.280 -23.788 1.00 34.09 C -ATOM 1588 CG ASH A 100 -2.780 29.378 -24.085 1.00 50.64 C -ATOM 1589 OD1 ASH A 100 -1.945 29.181 -23.175 1.00 52.94 O -ATOM 1590 OD2 ASH A 100 -2.714 28.900 -25.239 1.00 55.56 O1- -ATOM 1591 H ASH A 100 -5.527 28.554 -22.532 1.00 0.00 H -ATOM 1592 HA ASH A 100 -3.544 30.602 -21.685 1.00 0.00 H -ATOM 1593 HB2 ASH A 100 -4.829 29.957 -24.406 1.00 0.00 H -ATOM 1594 HB3 ASH A 100 -3.717 31.276 -24.145 1.00 0.00 H -ATOM 1595 N TYR A 101 -6.781 31.168 -22.291 1.00 30.87 N -ATOM 1596 CA TYR A 101 -7.867 32.157 -22.346 1.00 30.93 C -ATOM 1597 C TYR A 101 -8.284 32.564 -20.908 1.00 31.61 C -ATOM 1598 O TYR A 101 -8.268 33.762 -20.624 1.00 30.88 O -ATOM 1599 CB TYR A 101 -9.056 31.561 -23.141 1.00 32.58 C -ATOM 1600 CG TYR A 101 -10.226 32.510 -23.351 1.00 35.88 C -ATOM 1601 CD1 TYR A 101 -10.213 33.437 -24.421 1.00 38.76 C -ATOM 1602 CD2 TYR A 101 -11.326 32.485 -22.460 1.00 37.33 C -ATOM 1603 CE1 TYR A 101 -11.293 34.333 -24.598 1.00 41.81 C -ATOM 1604 CE2 TYR A 101 -12.406 33.376 -22.640 1.00 39.43 C -ATOM 1605 CZ TYR A 101 -12.391 34.301 -23.708 1.00 47.08 C -ATOM 1606 OH TYR A 101 -13.437 35.160 -23.885 1.00 54.57 O -ATOM 1607 H TYR A 101 -7.037 30.220 -22.533 1.00 0.00 H -ATOM 1608 HA TYR A 101 -7.518 33.043 -22.883 1.00 0.00 H -ATOM 1609 HB2 TYR A 101 -8.711 31.240 -24.126 1.00 0.00 H -ATOM 1610 HB3 TYR A 101 -9.421 30.652 -22.660 1.00 0.00 H -ATOM 1611 HD1 TYR A 101 -9.377 33.468 -25.105 1.00 0.00 H -ATOM 1612 HD2 TYR A 101 -11.345 31.780 -21.642 1.00 0.00 H -ATOM 1613 HE1 TYR A 101 -11.277 35.041 -25.413 1.00 0.00 H -ATOM 1614 HE2 TYR A 101 -13.242 33.330 -21.963 1.00 0.00 H -ATOM 1615 HH TYR A 101 -14.131 35.049 -23.231 1.00 0.00 H -ATOM 1616 N LEU A 102 -8.664 31.600 -20.040 1.00 26.64 N -ATOM 1617 CA LEU A 102 -9.295 31.827 -18.722 1.00 26.55 C -ATOM 1618 C LEU A 102 -8.431 32.644 -17.708 1.00 32.26 C -ATOM 1619 O LEU A 102 -9.047 33.369 -16.925 1.00 32.40 O -ATOM 1620 CB LEU A 102 -9.798 30.501 -18.092 1.00 25.29 C -ATOM 1621 CG LEU A 102 -10.986 29.806 -18.807 1.00 28.64 C -ATOM 1622 CD1 LEU A 102 -11.307 28.456 -18.139 1.00 28.39 C -ATOM 1623 CD2 LEU A 102 -12.252 30.682 -18.853 1.00 27.70 C -ATOM 1624 H LEU A 102 -8.632 30.635 -20.338 1.00 0.00 H -ATOM 1625 HA LEU A 102 -10.162 32.458 -18.916 1.00 0.00 H -ATOM 1626 HB2 LEU A 102 -8.965 29.803 -18.006 1.00 0.00 H -ATOM 1627 HB3 LEU A 102 -10.113 30.692 -17.065 1.00 0.00 H -ATOM 1628 HG LEU A 102 -10.691 29.596 -19.837 1.00 0.00 H -ATOM 1629 HD11 LEU A 102 -12.120 27.942 -18.653 1.00 0.00 H -ATOM 1630 HD12 LEU A 102 -10.445 27.791 -18.154 1.00 0.00 H -ATOM 1631 HD13 LEU A 102 -11.604 28.586 -17.098 1.00 0.00 H -ATOM 1632 HD21 LEU A 102 -13.094 30.143 -19.292 1.00 0.00 H -ATOM 1633 HD22 LEU A 102 -12.549 31.003 -17.854 1.00 0.00 H -ATOM 1634 HD23 LEU A 102 -12.107 31.577 -19.456 1.00 0.00 H -ATOM 1635 N PRO A 103 -7.069 32.587 -17.716 1.00 29.17 N -ATOM 1636 CA PRO A 103 -6.229 33.469 -16.863 1.00 30.32 C -ATOM 1637 C PRO A 103 -6.307 34.982 -17.202 1.00 37.04 C -ATOM 1638 O PRO A 103 -6.073 35.784 -16.298 1.00 39.83 O -ATOM 1639 CB PRO A 103 -4.794 32.936 -17.044 1.00 31.53 C -ATOM 1640 CG PRO A 103 -4.989 31.484 -17.441 1.00 34.07 C -ATOM 1641 CD PRO A 103 -6.234 31.543 -18.319 1.00 29.12 C -ATOM 1642 HA PRO A 103 -6.537 33.321 -15.827 1.00 0.00 H -ATOM 1643 HB2 PRO A 103 -4.264 33.456 -17.846 1.00 0.00 H -ATOM 1644 HB3 PRO A 103 -4.191 33.036 -16.140 1.00 0.00 H -ATOM 1645 HG2 PRO A 103 -4.120 31.056 -17.940 1.00 0.00 H -ATOM 1646 HG3 PRO A 103 -5.194 30.885 -16.553 1.00 0.00 H -ATOM 1647 HD3 PRO A 103 -6.720 30.569 -18.383 1.00 0.00 H -ATOM 1648 HD2 PRO A 103 -5.958 31.851 -19.326 1.00 0.00 H -ATOM 1649 N ARG A 104 -6.637 35.349 -18.459 1.00 33.12 N -ATOM 1650 CA ARG A 104 -6.766 36.743 -18.927 1.00 35.22 C -ATOM 1651 C ARG A 104 -8.262 37.168 -19.008 1.00 42.35 C -ATOM 1652 O ARG A 104 -8.495 38.365 -19.184 1.00 43.35 O -ATOM 1653 CB ARG A 104 -6.129 36.883 -20.337 1.00 36.79 C -ATOM 1654 CG ARG A 104 -4.585 36.816 -20.369 1.00 49.00 C -ATOM 1655 CD ARG A 104 -4.022 35.413 -20.642 1.00 65.39 C -ATOM 1656 NE ARG A 104 -2.551 35.421 -20.678 1.00 83.52 N -ATOM 1657 CZ ARG A 104 -1.752 34.397 -21.014 1.00101.34 C -ATOM 1658 NH1 ARG A 104 -2.234 33.199 -21.355 1.00 87.97 N -ATOM 1659 NH2 ARG A 104 -0.431 34.578 -21.006 1.00 90.05 N1+ -ATOM 1660 H ARG A 104 -6.848 34.634 -19.141 1.00 0.00 H -ATOM 1661 HA ARG A 104 -6.268 37.436 -18.244 1.00 0.00 H -ATOM 1662 HB2 ARG A 104 -6.553 36.156 -21.033 1.00 0.00 H -ATOM 1663 HB3 ARG A 104 -6.401 37.857 -20.751 1.00 0.00 H -ATOM 1664 HG2 ARG A 104 -4.232 37.477 -21.163 1.00 0.00 H -ATOM 1665 HG3 ARG A 104 -4.172 37.221 -19.444 1.00 0.00 H -ATOM 1666 HD2 ARG A 104 -4.354 34.701 -19.887 1.00 0.00 H -ATOM 1667 HD3 ARG A 104 -4.387 35.059 -21.606 1.00 0.00 H -ATOM 1668 HE ARG A 104 -2.110 36.293 -20.429 1.00 0.00 H -ATOM 1669 HH12 ARG A 104 -1.612 32.444 -21.599 1.00 0.00 H -ATOM 1670 HH11 ARG A 104 -3.236 33.054 -21.389 1.00 0.00 H -ATOM 1671 HH22 ARG A 104 0.182 33.817 -21.256 1.00 0.00 H -ATOM 1672 HH21 ARG A 104 -0.043 35.474 -20.753 1.00 0.00 H -ATOM 1673 N HID A 105 -9.237 36.238 -18.919 1.00 39.31 N -ATOM 1674 CA HID A 105 -10.670 36.496 -19.142 1.00 40.02 C -ATOM 1675 C HID A 105 -11.407 35.835 -17.961 1.00 44.39 C -ATOM 1676 O HID A 105 -11.460 34.606 -17.888 1.00 42.90 O -ATOM 1677 CB HID A 105 -11.125 35.951 -20.520 1.00 40.24 C -ATOM 1678 CG HID A 105 -10.405 36.524 -21.721 1.00 43.95 C -ATOM 1679 ND1 HID A 105 -9.214 36.003 -22.195 1.00 44.82 N -ATOM 1680 CD2 HID A 105 -10.714 37.561 -22.574 1.00 46.86 C -ATOM 1681 CE1 HID A 105 -8.856 36.723 -23.260 1.00 45.15 C -ATOM 1682 NE2 HID A 105 -9.721 37.686 -23.551 1.00 46.64 N -ATOM 1683 H HID A 105 -8.986 35.275 -18.747 1.00 0.00 H -ATOM 1684 HA HID A 105 -10.880 37.568 -19.125 1.00 0.00 H -ATOM 1685 HB2 HID A 105 -11.008 34.866 -20.552 1.00 0.00 H -ATOM 1686 HB3 HID A 105 -12.192 36.136 -20.655 1.00 0.00 H -ATOM 1687 HD1 HID A 105 -8.713 35.218 -21.797 1.00 0.00 H -ATOM 1688 HD2 HID A 105 -11.569 38.221 -22.564 1.00 0.00 H -ATOM 1689 HE1 HID A 105 -7.957 36.538 -23.831 1.00 0.00 H -ATOM 1690 N SER A 106 -11.997 36.663 -17.077 1.00 43.61 N -ATOM 1691 CA SER A 106 -12.789 36.242 -15.908 1.00 44.09 C -ATOM 1692 C SER A 106 -14.208 35.897 -16.430 1.00 48.55 C -ATOM 1693 O SER A 106 -15.002 36.793 -16.727 1.00 49.91 O -ATOM 1694 CB SER A 106 -12.806 37.369 -14.839 1.00 50.40 C -ATOM 1695 OG SER A 106 -13.278 38.622 -15.310 1.00 64.99 O -ATOM 1696 H SER A 106 -11.917 37.663 -17.213 1.00 0.00 H -ATOM 1697 HA SER A 106 -12.335 35.360 -15.447 1.00 0.00 H -ATOM 1698 HB2 SER A 106 -13.416 37.069 -13.985 1.00 0.00 H -ATOM 1699 HB3 SER A 106 -11.798 37.518 -14.450 1.00 0.00 H -ATOM 1700 HG SER A 106 -14.182 38.505 -15.618 1.00 0.00 H -ATOM 1701 N ILE A 107 -14.473 34.585 -16.552 1.00 42.04 N -ATOM 1702 CA ILE A 107 -15.720 34.005 -17.072 1.00 40.91 C -ATOM 1703 C ILE A 107 -16.505 33.466 -15.848 1.00 43.90 C -ATOM 1704 O ILE A 107 -15.930 32.837 -14.956 1.00 43.46 O -ATOM 1705 CB ILE A 107 -15.406 32.829 -18.059 1.00 42.36 C -ATOM 1706 CG1 ILE A 107 -14.580 33.300 -19.290 1.00 42.65 C -ATOM 1707 CG2 ILE A 107 -16.648 32.038 -18.524 1.00 41.71 C -ATOM 1708 CD1 ILE A 107 -15.169 34.496 -20.063 1.00 43.19 C -ATOM 1709 H ILE A 107 -13.765 33.918 -16.281 1.00 0.00 H -ATOM 1710 HA ILE A 107 -16.325 34.760 -17.579 1.00 0.00 H -ATOM 1711 HB ILE A 107 -14.777 32.106 -17.534 1.00 0.00 H -ATOM 1712 HG12 ILE A 107 -13.574 33.565 -18.969 1.00 0.00 H -ATOM 1713 HG13 ILE A 107 -14.444 32.465 -19.979 1.00 0.00 H -ATOM 1714 HG21 ILE A 107 -16.397 31.293 -19.278 1.00 0.00 H -ATOM 1715 HG22 ILE A 107 -17.124 31.500 -17.706 1.00 0.00 H -ATOM 1716 HG23 ILE A 107 -17.392 32.709 -18.949 1.00 0.00 H -ATOM 1717 HD11 ILE A 107 -14.575 34.735 -20.943 1.00 0.00 H -ATOM 1718 HD12 ILE A 107 -16.186 34.300 -20.396 1.00 0.00 H -ATOM 1719 HD13 ILE A 107 -15.185 35.399 -19.453 1.00 0.00 H -ATOM 1720 N GLY A 108 -17.831 33.707 -15.861 1.00 39.60 N -ATOM 1721 CA GLY A 108 -18.775 33.361 -14.791 1.00 39.64 C -ATOM 1722 C GLY A 108 -19.057 31.848 -14.684 1.00 40.81 C -ATOM 1723 O GLY A 108 -18.825 31.080 -15.619 1.00 40.20 O -ATOM 1724 H GLY A 108 -18.217 34.208 -16.647 1.00 0.00 H -ATOM 1725 HA2 GLY A 108 -18.400 33.742 -13.839 1.00 0.00 H -ATOM 1726 HA3 GLY A 108 -19.716 33.877 -14.983 1.00 0.00 H -ATOM 1727 N LEU A 109 -19.586 31.447 -13.512 1.00 36.29 N -ATOM 1728 CA LEU A 109 -19.856 30.078 -13.032 1.00 34.21 C -ATOM 1729 C LEU A 109 -20.699 29.250 -14.036 1.00 36.59 C -ATOM 1730 O LEU A 109 -20.310 28.122 -14.333 1.00 34.53 O -ATOM 1731 CB LEU A 109 -20.500 30.174 -11.622 1.00 34.53 C -ATOM 1732 CG LEU A 109 -20.941 28.851 -10.944 1.00 38.00 C -ATOM 1733 CD1 LEU A 109 -19.794 27.837 -10.791 1.00 36.32 C -ATOM 1734 CD2 LEU A 109 -21.607 29.135 -9.587 1.00 39.98 C -ATOM 1735 H LEU A 109 -19.752 32.163 -12.816 1.00 0.00 H -ATOM 1736 HA LEU A 109 -18.886 29.585 -12.935 1.00 0.00 H -ATOM 1737 HB2 LEU A 109 -19.798 30.680 -10.958 1.00 0.00 H -ATOM 1738 HB3 LEU A 109 -21.369 30.833 -11.680 1.00 0.00 H -ATOM 1739 HG LEU A 109 -21.707 28.391 -11.569 1.00 0.00 H -ATOM 1740 HD11 LEU A 109 -20.143 26.918 -10.318 1.00 0.00 H -ATOM 1741 HD12 LEU A 109 -19.377 27.554 -11.758 1.00 0.00 H -ATOM 1742 HD13 LEU A 109 -18.984 28.240 -10.183 1.00 0.00 H -ATOM 1743 HD21 LEU A 109 -22.041 28.229 -9.167 1.00 0.00 H -ATOM 1744 HD22 LEU A 109 -20.895 29.530 -8.862 1.00 0.00 H -ATOM 1745 HD23 LEU A 109 -22.417 29.859 -9.685 1.00 0.00 H -ATOM 1746 N ALA A 110 -21.804 29.817 -14.561 1.00 34.25 N -ATOM 1747 CA ALA A 110 -22.753 29.144 -15.465 1.00 34.26 C -ATOM 1748 C ALA A 110 -22.127 28.875 -16.854 1.00 36.18 C -ATOM 1749 O ALA A 110 -22.422 27.833 -17.435 1.00 35.22 O -ATOM 1750 CB ALA A 110 -23.999 30.020 -15.634 1.00 36.52 C -ATOM 1751 H ALA A 110 -22.052 30.758 -14.282 1.00 0.00 H -ATOM 1752 HA ALA A 110 -23.056 28.196 -15.015 1.00 0.00 H -ATOM 1753 HB1 ALA A 110 -24.777 29.490 -16.182 1.00 0.00 H -ATOM 1754 HB2 ALA A 110 -24.406 30.285 -14.665 1.00 0.00 H -ATOM 1755 HB3 ALA A 110 -23.793 30.952 -16.163 1.00 0.00 H -ATOM 1756 N GLN A 111 -21.262 29.780 -17.346 1.00 32.90 N -ATOM 1757 CA GLN A 111 -20.591 29.707 -18.651 1.00 31.66 C -ATOM 1758 C GLN A 111 -19.388 28.718 -18.595 1.00 31.83 C -ATOM 1759 O GLN A 111 -19.090 28.124 -19.630 1.00 31.42 O -ATOM 1760 CB GLN A 111 -20.179 31.146 -19.036 1.00 33.78 C -ATOM 1761 CG GLN A 111 -19.580 31.313 -20.451 1.00 53.37 C -ATOM 1762 CD GLN A 111 -19.514 32.781 -20.901 1.00 79.04 C -ATOM 1763 OE1 GLN A 111 -20.467 33.539 -20.738 1.00 77.41 O -ATOM 1764 NE2 GLN A 111 -18.395 33.188 -21.499 1.00 70.04 N -ATOM 1765 H GLN A 111 -21.065 30.610 -16.802 1.00 0.00 H -ATOM 1766 HA GLN A 111 -21.303 29.345 -19.398 1.00 0.00 H -ATOM 1767 HB2 GLN A 111 -21.074 31.768 -18.958 1.00 0.00 H -ATOM 1768 HB3 GLN A 111 -19.486 31.547 -18.295 1.00 0.00 H -ATOM 1769 HG2 GLN A 111 -18.593 30.852 -20.493 1.00 0.00 H -ATOM 1770 HG3 GLN A 111 -20.195 30.779 -21.176 1.00 0.00 H -ATOM 1771 HE22 GLN A 111 -18.323 34.139 -21.829 1.00 0.00 H -ATOM 1772 HE21 GLN A 111 -17.631 32.547 -21.650 1.00 0.00 H -ATOM 1773 N LEU A 112 -18.785 28.472 -17.410 1.00 27.73 N -ATOM 1774 CA LEU A 112 -17.774 27.423 -17.158 1.00 27.15 C -ATOM 1775 C LEU A 112 -18.471 26.037 -17.033 1.00 30.03 C -ATOM 1776 O LEU A 112 -17.878 25.045 -17.457 1.00 28.40 O -ATOM 1777 CB LEU A 112 -17.026 27.721 -15.831 1.00 27.39 C -ATOM 1778 CG LEU A 112 -16.114 28.971 -15.844 1.00 31.72 C -ATOM 1779 CD1 LEU A 112 -15.679 29.334 -14.414 1.00 31.24 C -ATOM 1780 CD2 LEU A 112 -14.898 28.830 -16.779 1.00 32.46 C -ATOM 1781 H LEU A 112 -19.086 28.991 -16.596 1.00 0.00 H -ATOM 1782 HA LEU A 112 -17.064 27.379 -17.985 1.00 0.00 H -ATOM 1783 HB2 LEU A 112 -17.757 27.828 -15.028 1.00 0.00 H -ATOM 1784 HB3 LEU A 112 -16.414 26.862 -15.546 1.00 0.00 H -ATOM 1785 HG LEU A 112 -16.695 29.813 -16.212 1.00 0.00 H -ATOM 1786 HD11 LEU A 112 -15.019 30.200 -14.414 1.00 0.00 H -ATOM 1787 HD12 LEU A 112 -16.539 29.583 -13.791 1.00 0.00 H -ATOM 1788 HD13 LEU A 112 -15.152 28.513 -13.931 1.00 0.00 H -ATOM 1789 HD21 LEU A 112 -14.271 29.721 -16.735 1.00 0.00 H -ATOM 1790 HD22 LEU A 112 -14.274 27.981 -16.509 1.00 0.00 H -ATOM 1791 HD23 LEU A 112 -15.198 28.705 -17.820 1.00 0.00 H -ATOM 1792 N LEU A 113 -19.714 25.987 -16.507 1.00 27.18 N -ATOM 1793 CA LEU A 113 -20.555 24.782 -16.377 1.00 26.38 C -ATOM 1794 C LEU A 113 -21.226 24.424 -17.734 1.00 30.80 C -ATOM 1795 O LEU A 113 -21.632 23.271 -17.887 1.00 31.19 O -ATOM 1796 CB LEU A 113 -21.643 25.033 -15.302 1.00 26.55 C -ATOM 1797 CG LEU A 113 -21.127 24.994 -13.842 1.00 30.43 C -ATOM 1798 CD1 LEU A 113 -22.153 25.635 -12.892 1.00 31.54 C -ATOM 1799 CD2 LEU A 113 -20.743 23.572 -13.386 1.00 29.53 C -ATOM 1800 H LEU A 113 -20.133 26.844 -16.175 1.00 0.00 H -ATOM 1801 HA LEU A 113 -19.934 23.936 -16.081 1.00 0.00 H -ATOM 1802 HB2 LEU A 113 -22.117 25.996 -15.495 1.00 0.00 H -ATOM 1803 HB3 LEU A 113 -22.451 24.302 -15.392 1.00 0.00 H -ATOM 1804 HG LEU A 113 -20.222 25.598 -13.775 1.00 0.00 H -ATOM 1805 HD11 LEU A 113 -21.830 25.582 -11.852 1.00 0.00 H -ATOM 1806 HD12 LEU A 113 -22.308 26.687 -13.130 1.00 0.00 H -ATOM 1807 HD13 LEU A 113 -23.124 25.152 -12.970 1.00 0.00 H -ATOM 1808 HD21 LEU A 113 -20.471 23.555 -12.330 1.00 0.00 H -ATOM 1809 HD22 LEU A 113 -21.560 22.864 -13.527 1.00 0.00 H -ATOM 1810 HD23 LEU A 113 -19.884 23.190 -13.938 1.00 0.00 H -ATOM 1811 N LEU A 114 -21.292 25.362 -18.705 1.00 28.48 N -ATOM 1812 CA LEU A 114 -21.724 25.127 -20.092 1.00 29.15 C -ATOM 1813 C LEU A 114 -20.549 24.475 -20.861 1.00 32.78 C -ATOM 1814 O LEU A 114 -20.808 23.532 -21.602 1.00 33.09 O -ATOM 1815 CB LEU A 114 -22.109 26.470 -20.762 1.00 30.13 C -ATOM 1816 CG LEU A 114 -22.729 26.355 -22.180 1.00 35.32 C -ATOM 1817 CD1 LEU A 114 -24.010 25.499 -22.222 1.00 35.94 C -ATOM 1818 CD2 LEU A 114 -22.982 27.747 -22.776 1.00 37.39 C -ATOM 1819 H LEU A 114 -20.947 26.290 -18.506 1.00 0.00 H -ATOM 1820 HA LEU A 114 -22.586 24.457 -20.080 1.00 0.00 H -ATOM 1821 HB2 LEU A 114 -22.811 26.996 -20.118 1.00 0.00 H -ATOM 1822 HB3 LEU A 114 -21.235 27.121 -20.809 1.00 0.00 H -ATOM 1823 HG LEU A 114 -21.997 25.874 -22.829 1.00 0.00 H -ATOM 1824 HD11 LEU A 114 -24.451 25.500 -23.219 1.00 0.00 H -ATOM 1825 HD12 LEU A 114 -23.810 24.457 -21.973 1.00 0.00 H -ATOM 1826 HD13 LEU A 114 -24.765 25.869 -21.529 1.00 0.00 H -ATOM 1827 HD21 LEU A 114 -23.335 27.680 -23.806 1.00 0.00 H -ATOM 1828 HD22 LEU A 114 -23.730 28.293 -22.200 1.00 0.00 H -ATOM 1829 HD23 LEU A 114 -22.067 28.339 -22.785 1.00 0.00 H -ATOM 1830 N PHE A 115 -19.289 24.913 -20.641 1.00 28.23 N -ATOM 1831 CA PHE A 115 -18.072 24.314 -21.226 1.00 28.18 C -ATOM 1832 C PHE A 115 -17.863 22.876 -20.680 1.00 29.97 C -ATOM 1833 O PHE A 115 -17.461 22.018 -21.461 1.00 28.15 O -ATOM 1834 CB PHE A 115 -16.827 25.189 -20.929 1.00 29.26 C -ATOM 1835 CG PHE A 115 -16.839 26.642 -21.399 1.00 30.64 C -ATOM 1836 CD1 PHE A 115 -17.672 27.088 -22.460 1.00 35.83 C -ATOM 1837 CD2 PHE A 115 -15.988 27.581 -20.760 1.00 32.41 C -ATOM 1838 CE1 PHE A 115 -17.675 28.432 -22.829 1.00 37.36 C -ATOM 1839 CE2 PHE A 115 -16.001 28.919 -21.149 1.00 35.63 C -ATOM 1840 CZ PHE A 115 -16.850 29.343 -22.171 1.00 35.58 C -ATOM 1841 H PHE A 115 -19.142 25.703 -20.028 1.00 0.00 H -ATOM 1842 HA PHE A 115 -18.202 24.245 -22.308 1.00 0.00 H -ATOM 1843 HB2 PHE A 115 -16.656 25.200 -19.851 1.00 0.00 H -ATOM 1844 HB3 PHE A 115 -15.941 24.720 -21.359 1.00 0.00 H -ATOM 1845 HD1 PHE A 115 -18.322 26.403 -22.985 1.00 0.00 H -ATOM 1846 HD2 PHE A 115 -15.333 27.266 -19.961 1.00 0.00 H -ATOM 1847 HE1 PHE A 115 -18.317 28.767 -23.630 1.00 0.00 H -ATOM 1848 HE2 PHE A 115 -15.354 29.628 -20.655 1.00 0.00 H -ATOM 1849 HZ PHE A 115 -16.859 30.383 -22.465 1.00 0.00 H -ATOM 1850 N ALA A 116 -18.220 22.613 -19.404 1.00 26.49 N -ATOM 1851 CA ALA A 116 -18.181 21.301 -18.736 1.00 26.36 C -ATOM 1852 C ALA A 116 -19.212 20.325 -19.359 1.00 28.13 C -ATOM 1853 O ALA A 116 -18.871 19.160 -19.570 1.00 27.39 O -ATOM 1854 CB ALA A 116 -18.487 21.499 -17.243 1.00 27.23 C -ATOM 1855 H ALA A 116 -18.548 23.378 -18.831 1.00 0.00 H -ATOM 1856 HA ALA A 116 -17.179 20.884 -18.840 1.00 0.00 H -ATOM 1857 HB1 ALA A 116 -18.402 20.560 -16.698 1.00 0.00 H -ATOM 1858 HB2 ALA A 116 -17.796 22.212 -16.792 1.00 0.00 H -ATOM 1859 HB3 ALA A 116 -19.497 21.872 -17.077 1.00 0.00 H -ATOM 1860 N GLN A 117 -20.425 20.819 -19.684 1.00 24.98 N -ATOM 1861 CA GLN A 117 -21.531 20.087 -20.322 1.00 26.13 C -ATOM 1862 C GLN A 117 -21.156 19.745 -21.790 1.00 30.14 C -ATOM 1863 O GLN A 117 -21.362 18.603 -22.195 1.00 29.23 O -ATOM 1864 CB GLN A 117 -22.802 20.971 -20.253 1.00 27.37 C -ATOM 1865 CG GLN A 117 -24.087 20.359 -20.863 1.00 34.59 C -ATOM 1866 CD GLN A 117 -25.049 21.439 -21.372 1.00 45.52 C -ATOM 1867 OE1 GLN A 117 -25.497 22.286 -20.604 1.00 37.97 O -ATOM 1868 NE2 GLN A 117 -25.378 21.414 -22.665 1.00 40.39 N -ATOM 1869 H GLN A 117 -20.617 21.789 -19.476 1.00 0.00 H -ATOM 1870 HA GLN A 117 -21.710 19.161 -19.770 1.00 0.00 H -ATOM 1871 HB2 GLN A 117 -23.009 21.231 -19.214 1.00 0.00 H -ATOM 1872 HB3 GLN A 117 -22.583 21.926 -20.733 1.00 0.00 H -ATOM 1873 HG2 GLN A 117 -23.857 19.677 -21.682 1.00 0.00 H -ATOM 1874 HG3 GLN A 117 -24.594 19.750 -20.114 1.00 0.00 H -ATOM 1875 HE22 GLN A 117 -26.005 22.109 -23.042 1.00 0.00 H -ATOM 1876 HE21 GLN A 117 -24.965 20.725 -23.286 1.00 0.00 H -ATOM 1877 N GLN A 118 -20.585 20.712 -22.538 1.00 27.56 N -ATOM 1878 CA GLN A 118 -20.183 20.606 -23.952 1.00 27.14 C -ATOM 1879 C GLN A 118 -18.970 19.652 -24.126 1.00 28.50 C -ATOM 1880 O GLN A 118 -18.933 18.952 -25.140 1.00 29.35 O -ATOM 1881 CB GLN A 118 -19.868 22.016 -24.503 1.00 28.20 C -ATOM 1882 CG GLN A 118 -21.131 22.892 -24.705 1.00 30.44 C -ATOM 1883 CD GLN A 118 -20.833 24.330 -25.153 1.00 43.69 C -ATOM 1884 OE1 GLN A 118 -19.704 24.810 -25.084 1.00 40.01 O -ATOM 1885 NE2 GLN A 118 -21.863 25.042 -25.609 1.00 39.19 N -ATOM 1886 H GLN A 118 -20.464 21.629 -22.127 1.00 0.00 H -ATOM 1887 HA GLN A 118 -21.018 20.189 -24.522 1.00 0.00 H -ATOM 1888 HB2 GLN A 118 -19.165 22.517 -23.833 1.00 0.00 H -ATOM 1889 HB3 GLN A 118 -19.353 21.934 -25.461 1.00 0.00 H -ATOM 1890 HG2 GLN A 118 -21.788 22.420 -25.433 1.00 0.00 H -ATOM 1891 HG3 GLN A 118 -21.723 22.939 -23.794 1.00 0.00 H -ATOM 1892 HE22 GLN A 118 -21.720 25.995 -25.918 1.00 0.00 H -ATOM 1893 HE21 GLN A 118 -22.795 24.646 -25.642 1.00 0.00 H -ATOM 1894 N ILE A 119 -18.060 19.547 -23.129 1.00 24.53 N -ATOM 1895 CA ILE A 119 -16.981 18.537 -23.066 1.00 23.52 C -ATOM 1896 C ILE A 119 -17.623 17.131 -22.889 1.00 26.94 C -ATOM 1897 O ILE A 119 -17.204 16.221 -23.598 1.00 25.88 O -ATOM 1898 CB ILE A 119 -15.958 18.790 -21.898 1.00 26.23 C -ATOM 1899 CG1 ILE A 119 -15.086 20.045 -22.164 1.00 26.44 C -ATOM 1900 CG2 ILE A 119 -15.034 17.585 -21.566 1.00 26.63 C -ATOM 1901 CD1 ILE A 119 -14.508 20.681 -20.885 1.00 29.19 C -ATOM 1902 H ILE A 119 -18.143 20.154 -22.325 1.00 0.00 H -ATOM 1903 HA ILE A 119 -16.436 18.548 -24.013 1.00 0.00 H -ATOM 1904 HB ILE A 119 -16.546 18.990 -21.000 1.00 0.00 H -ATOM 1905 HG12 ILE A 119 -14.275 19.797 -22.850 1.00 0.00 H -ATOM 1906 HG13 ILE A 119 -15.666 20.801 -22.689 1.00 0.00 H -ATOM 1907 HG21 ILE A 119 -14.253 17.845 -20.852 1.00 0.00 H -ATOM 1908 HG22 ILE A 119 -15.585 16.753 -21.126 1.00 0.00 H -ATOM 1909 HG23 ILE A 119 -14.544 17.215 -22.467 1.00 0.00 H -ATOM 1910 HD11 ILE A 119 -13.960 21.595 -21.106 1.00 0.00 H -ATOM 1911 HD12 ILE A 119 -15.295 20.945 -20.180 1.00 0.00 H -ATOM 1912 HD13 ILE A 119 -13.821 20.009 -20.373 1.00 0.00 H -ATOM 1913 N CYS A 120 -18.645 16.974 -22.019 1.00 24.96 N -ATOM 1914 CA CYS A 120 -19.333 15.694 -21.749 1.00 26.23 C -ATOM 1915 C CYS A 120 -20.150 15.210 -22.975 1.00 28.78 C -ATOM 1916 O CYS A 120 -20.247 13.998 -23.149 1.00 27.82 O -ATOM 1917 CB CYS A 120 -20.248 15.734 -20.505 1.00 27.44 C -ATOM 1918 SG CYS A 120 -19.266 15.985 -19.005 1.00 31.30 S -ATOM 1919 H CYS A 120 -18.954 17.767 -21.474 1.00 0.00 H -ATOM 1920 HA CYS A 120 -18.556 14.948 -21.578 1.00 0.00 H -ATOM 1921 HB2 CYS A 120 -20.998 16.522 -20.575 1.00 0.00 H -ATOM 1922 HB3 CYS A 120 -20.782 14.791 -20.382 1.00 0.00 H -ATOM 1923 HG CYS A 120 -18.912 17.247 -19.274 1.00 0.00 H -ATOM 1924 N GLU A 121 -20.672 16.119 -23.824 1.00 27.13 N -ATOM 1925 CA GLU A 121 -21.402 15.809 -25.067 1.00 27.79 C -ATOM 1926 C GLU A 121 -20.415 15.361 -26.181 1.00 31.65 C -ATOM 1927 O GLU A 121 -20.755 14.430 -26.913 1.00 32.67 O -ATOM 1928 CB GLU A 121 -22.227 17.043 -25.509 1.00 29.33 C -ATOM 1929 CG GLU A 121 -23.453 17.297 -24.604 1.00 35.16 C -ATOM 1930 CD GLU A 121 -24.265 18.528 -25.005 1.00 58.21 C -ATOM 1931 OE1 GLU A 121 -23.945 19.623 -24.491 1.00 48.70 O -ATOM 1932 OE2 GLU A 121 -25.210 18.360 -25.805 1.00 60.77 O1- -ATOM 1933 H GLU A 121 -20.570 17.102 -23.607 1.00 0.00 H -ATOM 1934 HA GLU A 121 -22.094 14.984 -24.891 1.00 0.00 H -ATOM 1935 HB2 GLU A 121 -21.587 17.927 -25.517 1.00 0.00 H -ATOM 1936 HB3 GLU A 121 -22.576 16.910 -26.536 1.00 0.00 H -ATOM 1937 HG2 GLU A 121 -24.111 16.428 -24.615 1.00 0.00 H -ATOM 1938 HG3 GLU A 121 -23.141 17.427 -23.571 1.00 0.00 H -ATOM 1939 N GLY A 122 -19.206 15.956 -26.259 1.00 27.84 N -ATOM 1940 CA GLY A 122 -18.146 15.567 -27.203 1.00 27.29 C -ATOM 1941 C GLY A 122 -17.419 14.265 -26.799 1.00 30.56 C -ATOM 1942 O GLY A 122 -16.999 13.517 -27.681 1.00 30.70 O -ATOM 1943 H GLY A 122 -18.993 16.712 -25.622 1.00 0.00 H -ATOM 1944 HA2 GLY A 122 -18.552 15.465 -28.211 1.00 0.00 H -ATOM 1945 HA3 GLY A 122 -17.418 16.376 -27.247 1.00 0.00 H -ATOM 1946 N MET A 123 -17.296 13.981 -25.486 1.00 27.80 N -ATOM 1947 CA MET A 123 -16.650 12.790 -24.908 1.00 26.42 C -ATOM 1948 C MET A 123 -17.640 11.595 -24.843 1.00 31.30 C -ATOM 1949 O MET A 123 -17.165 10.461 -24.916 1.00 31.07 O -ATOM 1950 CB MET A 123 -16.151 13.116 -23.480 1.00 27.40 C -ATOM 1951 CG MET A 123 -14.890 14.004 -23.418 1.00 29.13 C -ATOM 1952 SD MET A 123 -13.387 13.356 -24.208 1.00 32.16 S -ATOM 1953 CE MET A 123 -13.278 11.751 -23.386 1.00 29.76 C -ATOM 1954 H MET A 123 -17.658 14.646 -24.815 1.00 0.00 H -ATOM 1955 HA MET A 123 -15.801 12.493 -25.526 1.00 0.00 H -ATOM 1956 HB2 MET A 123 -16.949 13.591 -22.906 1.00 0.00 H -ATOM 1957 HB3 MET A 123 -15.933 12.195 -22.942 1.00 0.00 H -ATOM 1958 HG2 MET A 123 -15.085 14.973 -23.869 1.00 0.00 H -ATOM 1959 HG3 MET A 123 -14.659 14.209 -22.373 1.00 0.00 H -ATOM 1960 HE1 MET A 123 -12.296 11.308 -23.532 1.00 0.00 H -ATOM 1961 HE2 MET A 123 -13.451 11.875 -22.320 1.00 0.00 H -ATOM 1962 HE3 MET A 123 -14.028 11.070 -23.786 1.00 0.00 H -ATOM 1963 N ALA A 124 -18.970 11.826 -24.770 1.00 27.75 N -ATOM 1964 CA ALA A 124 -20.015 10.786 -24.851 1.00 28.69 C -ATOM 1965 C ALA A 124 -20.132 10.274 -26.308 1.00 34.11 C -ATOM 1966 O ALA A 124 -20.310 9.069 -26.486 1.00 34.50 O -ATOM 1967 CB ALA A 124 -21.373 11.354 -24.406 1.00 29.26 C -ATOM 1968 H ALA A 124 -19.302 12.778 -24.698 1.00 0.00 H -ATOM 1969 HA ALA A 124 -19.752 9.951 -24.197 1.00 0.00 H -ATOM 1970 HB1 ALA A 124 -22.176 10.627 -24.538 1.00 0.00 H -ATOM 1971 HB2 ALA A 124 -21.364 11.614 -23.349 1.00 0.00 H -ATOM 1972 HB3 ALA A 124 -21.644 12.249 -24.970 1.00 0.00 H -ATOM 1973 N TYR A 125 -19.944 11.157 -27.315 1.00 31.58 N -ATOM 1974 CA TYR A 125 -19.859 10.818 -28.744 1.00 32.97 C -ATOM 1975 C TYR A 125 -18.566 10.000 -29.009 1.00 36.19 C -ATOM 1976 O TYR A 125 -18.656 9.001 -29.719 1.00 37.27 O -ATOM 1977 CB TYR A 125 -19.909 12.108 -29.605 1.00 34.46 C -ATOM 1978 CG TYR A 125 -19.562 11.912 -31.078 1.00 37.28 C -ATOM 1979 CD1 TYR A 125 -20.505 11.345 -31.971 1.00 41.29 C -ATOM 1980 CD2 TYR A 125 -18.261 12.222 -31.542 1.00 37.10 C -ATOM 1981 CE1 TYR A 125 -20.140 11.074 -33.310 1.00 41.87 C -ATOM 1982 CE2 TYR A 125 -17.902 11.966 -32.883 1.00 38.57 C -ATOM 1983 CZ TYR A 125 -18.835 11.376 -33.763 1.00 45.11 C -ATOM 1984 OH TYR A 125 -18.469 11.092 -35.046 1.00 46.37 O -ATOM 1985 H TYR A 125 -19.800 12.131 -27.086 1.00 0.00 H -ATOM 1986 HA TYR A 125 -20.717 10.196 -29.009 1.00 0.00 H -ATOM 1987 HB2 TYR A 125 -20.907 12.543 -29.542 1.00 0.00 H -ATOM 1988 HB3 TYR A 125 -19.244 12.868 -29.188 1.00 0.00 H -ATOM 1989 HD1 TYR A 125 -21.497 11.093 -31.624 1.00 0.00 H -ATOM 1990 HD2 TYR A 125 -17.534 12.642 -30.863 1.00 0.00 H -ATOM 1991 HE1 TYR A 125 -20.859 10.627 -33.980 1.00 0.00 H -ATOM 1992 HE2 TYR A 125 -16.912 12.216 -33.232 1.00 0.00 H -ATOM 1993 HH TYR A 125 -19.175 10.689 -35.557 1.00 0.00 H -ATOM 1994 N LEU A 126 -17.414 10.395 -28.426 1.00 29.93 N -ATOM 1995 CA LEU A 126 -16.092 9.759 -28.598 1.00 29.88 C -ATOM 1996 C LEU A 126 -16.116 8.284 -28.110 1.00 33.60 C -ATOM 1997 O LEU A 126 -15.558 7.428 -28.796 1.00 34.49 O -ATOM 1998 CB LEU A 126 -15.029 10.599 -27.840 1.00 29.28 C -ATOM 1999 CG LEU A 126 -13.550 10.214 -28.085 1.00 33.67 C -ATOM 2000 CD1 LEU A 126 -13.139 10.375 -29.556 1.00 34.68 C -ATOM 2001 CD2 LEU A 126 -12.616 11.015 -27.167 1.00 34.91 C -ATOM 2002 H LEU A 126 -17.420 11.231 -27.858 1.00 0.00 H -ATOM 2003 HA LEU A 126 -15.872 9.769 -29.667 1.00 0.00 H -ATOM 2004 HB2 LEU A 126 -15.149 11.650 -28.107 1.00 0.00 H -ATOM 2005 HB3 LEU A 126 -15.232 10.548 -26.769 1.00 0.00 H -ATOM 2006 HG LEU A 126 -13.417 9.167 -27.815 1.00 0.00 H -ATOM 2007 HD11 LEU A 126 -12.074 10.189 -29.698 1.00 0.00 H -ATOM 2008 HD12 LEU A 126 -13.668 9.666 -30.187 1.00 0.00 H -ATOM 2009 HD13 LEU A 126 -13.362 11.376 -29.925 1.00 0.00 H -ATOM 2010 HD21 LEU A 126 -11.573 10.738 -27.327 1.00 0.00 H -ATOM 2011 HD22 LEU A 126 -12.706 12.088 -27.336 1.00 0.00 H -ATOM 2012 HD23 LEU A 126 -12.846 10.822 -26.120 1.00 0.00 H -ATOM 2013 N HIE A 127 -16.806 8.014 -26.985 1.00 30.39 N -ATOM 2014 CA HIE A 127 -16.941 6.697 -26.343 1.00 30.40 C -ATOM 2015 C HIE A 127 -18.042 5.846 -27.031 1.00 37.10 C -ATOM 2016 O HIE A 127 -17.954 4.621 -26.943 1.00 37.94 O -ATOM 2017 CB HIE A 127 -17.302 6.917 -24.857 1.00 29.83 C -ATOM 2018 CG HIE A 127 -16.192 7.480 -23.999 1.00 31.72 C -ATOM 2019 ND1 HIE A 127 -16.250 7.427 -22.605 1.00 32.83 N -ATOM 2020 CD2 HIE A 127 -15.006 8.088 -24.365 1.00 32.40 C -ATOM 2021 CE1 HIE A 127 -15.115 7.973 -22.199 1.00 31.99 C -ATOM 2022 NE2 HIE A 127 -14.328 8.366 -23.195 1.00 31.94 N -ATOM 2023 H HIE A 127 -17.251 8.779 -26.497 1.00 0.00 H -ATOM 2024 HA HIE A 127 -16.000 6.145 -26.409 1.00 0.00 H -ATOM 2025 HB2 HIE A 127 -18.169 7.575 -24.762 1.00 0.00 H -ATOM 2026 HB3 HIE A 127 -17.592 5.969 -24.400 1.00 0.00 H -ATOM 2027 HD2 HIE A 127 -14.595 8.329 -25.332 1.00 0.00 H -ATOM 2028 HE1 HIE A 127 -14.873 8.112 -21.162 1.00 0.00 H -ATOM 2029 HE2 HIE A 127 -13.401 8.767 -23.107 1.00 0.00 H -ATOM 2030 N ALA A 128 -19.014 6.467 -27.735 1.00 34.33 N -ATOM 2031 CA ALA A 128 -20.033 5.795 -28.561 1.00 35.70 C -ATOM 2032 C ALA A 128 -19.428 5.372 -29.930 1.00 40.39 C -ATOM 2033 O ALA A 128 -19.902 4.385 -30.492 1.00 42.00 O -ATOM 2034 CB ALA A 128 -21.214 6.758 -28.785 1.00 36.70 C -ATOM 2035 H ALA A 128 -19.023 7.477 -27.767 1.00 0.00 H -ATOM 2036 HA ALA A 128 -20.401 4.906 -28.043 1.00 0.00 H -ATOM 2037 HB1 ALA A 128 -22.001 6.291 -29.380 1.00 0.00 H -ATOM 2038 HB2 ALA A 128 -21.667 7.049 -27.837 1.00 0.00 H -ATOM 2039 HB3 ALA A 128 -20.914 7.672 -29.298 1.00 0.00 H -ATOM 2040 N GLN A 129 -18.368 6.058 -30.410 1.00 37.13 N -ATOM 2041 CA GLN A 129 -17.525 5.664 -31.555 1.00 37.34 C -ATOM 2042 C GLN A 129 -16.405 4.675 -31.101 1.00 40.83 C -ATOM 2043 O GLN A 129 -15.662 4.212 -31.966 1.00 41.85 O -ATOM 2044 CB GLN A 129 -16.897 6.940 -32.185 1.00 37.57 C -ATOM 2045 CG GLN A 129 -17.894 7.938 -32.823 1.00 50.69 C -ATOM 2046 CD GLN A 129 -18.726 7.351 -33.968 1.00 63.42 C -ATOM 2047 OE1 GLN A 129 -18.183 6.946 -34.992 1.00 61.45 O -ATOM 2048 NE2 GLN A 129 -20.049 7.308 -33.806 1.00 53.50 N -ATOM 2049 H GLN A 129 -18.045 6.864 -29.892 1.00 0.00 H -ATOM 2050 HA GLN A 129 -18.129 5.146 -32.303 1.00 0.00 H -ATOM 2051 HB2 GLN A 129 -16.323 7.477 -31.428 1.00 0.00 H -ATOM 2052 HB3 GLN A 129 -16.171 6.657 -32.949 1.00 0.00 H -ATOM 2053 HG2 GLN A 129 -18.559 8.351 -32.068 1.00 0.00 H -ATOM 2054 HG3 GLN A 129 -17.343 8.790 -33.220 1.00 0.00 H -ATOM 2055 HE22 GLN A 129 -20.630 6.927 -34.538 1.00 0.00 H -ATOM 2056 HE21 GLN A 129 -20.472 7.642 -32.953 1.00 0.00 H -ATOM 2057 N HID A 130 -16.295 4.362 -29.790 1.00 43.65 N -ATOM 2058 CA HID A 130 -15.462 3.322 -29.154 1.00 42.72 C -ATOM 2059 C HID A 130 -13.999 3.775 -28.906 1.00 42.39 C -ATOM 2060 O HID A 130 -13.157 2.916 -28.639 1.00 42.28 O -ATOM 2061 CB HID A 130 -15.632 1.910 -29.784 1.00 46.64 C -ATOM 2062 CG HID A 130 -16.990 1.292 -29.557 1.00 52.37 C -ATOM 2063 ND1 HID A 130 -17.334 0.661 -28.372 1.00 54.35 N -ATOM 2064 CD2 HID A 130 -18.102 1.193 -30.364 1.00 56.51 C -ATOM 2065 CE1 HID A 130 -18.589 0.227 -28.506 1.00 55.92 C -ATOM 2066 NE2 HID A 130 -19.120 0.516 -29.688 1.00 57.64 N -ATOM 2067 H HID A 130 -16.919 4.835 -29.152 1.00 0.00 H -ATOM 2068 HA HID A 130 -15.867 3.269 -28.145 1.00 0.00 H -ATOM 2069 HB2 HID A 130 -15.425 1.919 -30.854 1.00 0.00 H -ATOM 2070 HB3 HID A 130 -14.908 1.213 -29.362 1.00 0.00 H -ATOM 2071 HD1 HID A 130 -16.743 0.536 -27.559 1.00 0.00 H -ATOM 2072 HD2 HID A 130 -18.248 1.558 -31.371 1.00 0.00 H -ATOM 2073 HE1 HID A 130 -19.118 -0.310 -27.733 1.00 0.00 H -ATOM 2074 N TYR A 131 -13.707 5.089 -28.959 1.00 35.47 N -ATOM 2075 CA TYR A 131 -12.382 5.668 -28.692 1.00 33.30 C -ATOM 2076 C TYR A 131 -12.367 6.196 -27.235 1.00 34.14 C -ATOM 2077 O TYR A 131 -13.370 6.705 -26.735 1.00 33.14 O -ATOM 2078 CB TYR A 131 -12.130 6.849 -29.660 1.00 34.28 C -ATOM 2079 CG TYR A 131 -12.104 6.488 -31.139 1.00 38.78 C -ATOM 2080 CD1 TYR A 131 -11.012 5.765 -31.674 1.00 41.85 C -ATOM 2081 CD2 TYR A 131 -13.171 6.871 -31.989 1.00 40.74 C -ATOM 2082 CE1 TYR A 131 -10.997 5.407 -33.041 1.00 44.99 C -ATOM 2083 CE2 TYR A 131 -13.147 6.528 -33.360 1.00 43.80 C -ATOM 2084 CZ TYR A 131 -12.061 5.792 -33.886 1.00 51.67 C -ATOM 2085 OH TYR A 131 -12.042 5.452 -35.207 1.00 54.79 O -ATOM 2086 H TYR A 131 -14.448 5.753 -29.139 1.00 0.00 H -ATOM 2087 HA TYR A 131 -11.608 4.916 -28.832 1.00 0.00 H -ATOM 2088 HB2 TYR A 131 -12.886 7.617 -29.505 1.00 0.00 H -ATOM 2089 HB3 TYR A 131 -11.176 7.326 -29.426 1.00 0.00 H -ATOM 2090 HD1 TYR A 131 -10.188 5.480 -31.039 1.00 0.00 H -ATOM 2091 HD2 TYR A 131 -14.007 7.425 -31.590 1.00 0.00 H -ATOM 2092 HE1 TYR A 131 -10.164 4.849 -33.440 1.00 0.00 H -ATOM 2093 HE2 TYR A 131 -13.964 6.825 -34.002 1.00 0.00 H -ATOM 2094 HH TYR A 131 -11.243 4.991 -35.470 1.00 0.00 H -ATOM 2095 N ILE A 132 -11.173 6.140 -26.624 1.00 29.77 N -ATOM 2096 CA ILE A 132 -10.764 6.867 -25.406 1.00 28.07 C -ATOM 2097 C ILE A 132 -9.800 7.996 -25.878 1.00 32.77 C -ATOM 2098 O ILE A 132 -9.093 7.835 -26.878 1.00 34.18 O -ATOM 2099 CB ILE A 132 -9.996 5.931 -24.409 1.00 30.74 C -ATOM 2100 CG1 ILE A 132 -8.891 5.052 -25.072 1.00 31.83 C -ATOM 2101 CG2 ILE A 132 -11.018 5.076 -23.628 1.00 31.74 C -ATOM 2102 CD1 ILE A 132 -8.051 4.197 -24.115 1.00 34.37 C -ATOM 2103 H ILE A 132 -10.408 5.703 -27.123 1.00 0.00 H -ATOM 2104 HA ILE A 132 -11.630 7.319 -24.918 1.00 0.00 H -ATOM 2105 HB ILE A 132 -9.504 6.559 -23.663 1.00 0.00 H -ATOM 2106 HG12 ILE A 132 -9.340 4.384 -25.804 1.00 0.00 H -ATOM 2107 HG13 ILE A 132 -8.203 5.685 -25.632 1.00 0.00 H -ATOM 2108 HG21 ILE A 132 -10.545 4.458 -22.866 1.00 0.00 H -ATOM 2109 HG22 ILE A 132 -11.741 5.708 -23.112 1.00 0.00 H -ATOM 2110 HG23 ILE A 132 -11.577 4.417 -24.292 1.00 0.00 H -ATOM 2111 HD11 ILE A 132 -7.264 3.680 -24.664 1.00 0.00 H -ATOM 2112 HD12 ILE A 132 -7.569 4.813 -23.361 1.00 0.00 H -ATOM 2113 HD13 ILE A 132 -8.646 3.439 -23.607 1.00 0.00 H -ATOM 2114 N HIE A 133 -9.784 9.127 -25.142 1.00 29.57 N -ATOM 2115 CA HIE A 133 -9.019 10.340 -25.491 1.00 28.01 C -ATOM 2116 C HIE A 133 -7.586 10.234 -24.910 1.00 30.31 C -ATOM 2117 O HIE A 133 -6.644 10.449 -25.669 1.00 28.41 O -ATOM 2118 CB HIE A 133 -9.734 11.601 -24.945 1.00 27.19 C -ATOM 2119 CG HIE A 133 -9.219 12.901 -25.521 1.00 29.30 C -ATOM 2120 ND1 HIE A 133 -8.095 13.554 -25.012 1.00 30.35 N -ATOM 2121 CD2 HIE A 133 -9.695 13.623 -26.596 1.00 30.30 C -ATOM 2122 CE1 HIE A 133 -7.934 14.622 -25.779 1.00 29.49 C -ATOM 2123 NE2 HIE A 133 -8.846 14.708 -26.745 1.00 29.77 N -ATOM 2124 H HIE A 133 -10.356 9.181 -24.305 1.00 0.00 H -ATOM 2125 HA HIE A 133 -8.965 10.428 -26.580 1.00 0.00 H -ATOM 2126 HB2 HIE A 133 -10.793 11.552 -25.186 1.00 0.00 H -ATOM 2127 HB3 HIE A 133 -9.687 11.652 -23.856 1.00 0.00 H -ATOM 2128 HD2 HIE A 133 -10.536 13.451 -27.248 1.00 0.00 H -ATOM 2129 HE1 HIE A 133 -7.138 15.341 -25.645 1.00 0.00 H -ATOM 2130 HE2 HIE A 133 -8.898 15.433 -27.447 1.00 0.00 H -ATOM 2131 N ARG A 134 -7.434 9.938 -23.600 1.00 26.88 N -ATOM 2132 CA ARG A 134 -6.159 9.742 -22.869 1.00 26.62 C -ATOM 2133 C ARG A 134 -5.396 11.077 -22.603 1.00 29.84 C -ATOM 2134 O ARG A 134 -4.243 11.007 -22.172 1.00 30.79 O -ATOM 2135 CB ARG A 134 -5.259 8.648 -23.518 1.00 26.30 C -ATOM 2136 CG ARG A 134 -5.850 7.224 -23.476 1.00 34.16 C -ATOM 2137 CD ARG A 134 -4.912 6.116 -23.997 1.00 40.37 C -ATOM 2138 NE ARG A 134 -3.591 6.159 -23.346 1.00 53.37 N -ATOM 2139 CZ ARG A 134 -2.393 6.371 -23.911 1.00 66.01 C -ATOM 2140 NH1 ARG A 134 -2.232 6.519 -25.228 1.00 50.08 N -ATOM 2141 NH2 ARG A 134 -1.317 6.444 -23.127 1.00 58.24 N1+ -ATOM 2142 H ARG A 134 -8.269 9.824 -23.039 1.00 0.00 H -ATOM 2143 HA ARG A 134 -6.445 9.398 -21.877 1.00 0.00 H -ATOM 2144 HB2 ARG A 134 -5.018 8.908 -24.544 1.00 0.00 H -ATOM 2145 HB3 ARG A 134 -4.300 8.626 -23.000 1.00 0.00 H -ATOM 2146 HG2 ARG A 134 -6.113 6.994 -22.447 1.00 0.00 H -ATOM 2147 HG3 ARG A 134 -6.785 7.197 -24.038 1.00 0.00 H -ATOM 2148 HD2 ARG A 134 -5.343 5.137 -23.798 1.00 0.00 H -ATOM 2149 HD3 ARG A 134 -4.813 6.180 -25.078 1.00 0.00 H -ATOM 2150 HE ARG A 134 -3.608 6.080 -22.340 1.00 0.00 H -ATOM 2151 HH12 ARG A 134 -1.316 6.684 -25.615 1.00 0.00 H -ATOM 2152 HH11 ARG A 134 -3.048 6.566 -25.825 1.00 0.00 H -ATOM 2153 HH22 ARG A 134 -0.409 6.628 -23.525 1.00 0.00 H -ATOM 2154 HH21 ARG A 134 -1.418 6.383 -22.124 1.00 0.00 H -ATOM 2155 N ASH A 135 -5.999 12.256 -22.865 1.00 25.28 N -ATOM 2156 CA ASH A 135 -5.348 13.574 -22.789 1.00 24.95 C -ATOM 2157 C ASH A 135 -6.410 14.672 -22.513 1.00 27.49 C -ATOM 2158 O ASH A 135 -6.297 15.759 -23.077 1.00 27.32 O -ATOM 2159 CB ASH A 135 -4.432 13.836 -24.022 1.00 0.00 C -ATOM 2160 CG ASH A 135 -3.477 15.031 -23.912 1.00 0.00 C -ATOM 2161 OD1 ASH A 135 -2.829 15.182 -22.852 1.00 0.00 O -ATOM 2162 OD2 ASH A 135 -3.372 15.768 -24.915 1.00 0.00 O1- -ATOM 2163 HB2 ASH A 135 -3.820 12.962 -24.234 1.00 0.00 H -ATOM 2164 HB3 ASH A 135 -5.060 13.972 -24.903 1.00 0.00 H -ATOM 2165 H ASH A 135 -6.946 12.255 -23.218 1.00 0.00 H -ATOM 2166 HA ASH A 135 -4.724 13.576 -21.892 1.00 0.00 H -ATOM 2167 N LEU A 136 -7.444 14.418 -21.683 1.00 23.70 N -ATOM 2168 CA LEU A 136 -8.511 15.399 -21.421 1.00 23.85 C -ATOM 2169 C LEU A 136 -7.988 16.324 -20.291 1.00 29.77 C -ATOM 2170 O LEU A 136 -7.789 15.888 -19.156 1.00 30.30 O -ATOM 2171 CB LEU A 136 -9.817 14.661 -21.042 1.00 23.60 C -ATOM 2172 CG LEU A 136 -11.090 15.544 -21.001 1.00 28.86 C -ATOM 2173 CD1 LEU A 136 -11.367 16.289 -22.324 1.00 29.18 C -ATOM 2174 CD2 LEU A 136 -12.304 14.698 -20.593 1.00 32.57 C -ATOM 2175 H LEU A 136 -7.526 13.517 -21.228 1.00 0.00 H -ATOM 2176 HA LEU A 136 -8.694 15.968 -22.335 1.00 0.00 H -ATOM 2177 HB2 LEU A 136 -9.985 13.859 -21.765 1.00 0.00 H -ATOM 2178 HB3 LEU A 136 -9.696 14.160 -20.084 1.00 0.00 H -ATOM 2179 HG LEU A 136 -10.954 16.298 -20.225 1.00 0.00 H -ATOM 2180 HD11 LEU A 136 -12.306 16.837 -22.277 1.00 0.00 H -ATOM 2181 HD12 LEU A 136 -10.599 17.028 -22.547 1.00 0.00 H -ATOM 2182 HD13 LEU A 136 -11.427 15.601 -23.168 1.00 0.00 H -ATOM 2183 HD21 LEU A 136 -13.203 15.307 -20.501 1.00 0.00 H -ATOM 2184 HD22 LEU A 136 -12.505 13.913 -21.321 1.00 0.00 H -ATOM 2185 HD23 LEU A 136 -12.133 14.210 -19.635 1.00 0.00 H -ATOM 2186 N ALA A 137 -7.770 17.596 -20.667 1.00 25.59 N -ATOM 2187 CA ALA A 137 -7.228 18.693 -19.851 1.00 24.45 C -ATOM 2188 C ALA A 137 -7.642 20.014 -20.545 1.00 24.35 C -ATOM 2189 O ALA A 137 -7.885 20.036 -21.756 1.00 23.60 O -ATOM 2190 CB ALA A 137 -5.703 18.540 -19.691 1.00 25.60 C -ATOM 2191 H ALA A 137 -7.978 17.852 -21.622 1.00 0.00 H -ATOM 2192 HA ALA A 137 -7.687 18.663 -18.862 1.00 0.00 H -ATOM 2193 HB1 ALA A 137 -5.322 19.267 -18.977 1.00 0.00 H -ATOM 2194 HB2 ALA A 137 -5.433 17.553 -19.315 1.00 0.00 H -ATOM 2195 HB3 ALA A 137 -5.171 18.694 -20.627 1.00 0.00 H -ATOM 2196 N ALA A 138 -7.660 21.124 -19.776 1.00 21.93 N -ATOM 2197 CA ALA A 138 -8.022 22.486 -20.240 1.00 22.59 C -ATOM 2198 C ALA A 138 -6.992 23.074 -21.254 1.00 27.08 C -ATOM 2199 O ALA A 138 -7.337 24.017 -21.966 1.00 26.36 O -ATOM 2200 CB ALA A 138 -8.167 23.412 -19.022 1.00 24.44 C -ATOM 2201 H ALA A 138 -7.434 21.043 -18.791 1.00 0.00 H -ATOM 2202 HA ALA A 138 -8.990 22.428 -20.743 1.00 0.00 H -ATOM 2203 HB1 ALA A 138 -8.520 24.400 -19.319 1.00 0.00 H -ATOM 2204 HB2 ALA A 138 -8.891 23.016 -18.309 1.00 0.00 H -ATOM 2205 HB3 ALA A 138 -7.221 23.545 -18.495 1.00 0.00 H -ATOM 2206 N ARG A 139 -5.787 22.474 -21.345 1.00 25.25 N -ATOM 2207 CA ARG A 139 -4.727 22.646 -22.358 1.00 25.45 C -ATOM 2208 C ARG A 139 -5.236 22.272 -23.777 1.00 28.29 C -ATOM 2209 O ARG A 139 -4.778 22.867 -24.752 1.00 27.42 O -ATOM 2210 CB ARG A 139 -3.576 21.692 -21.940 1.00 27.95 C -ATOM 2211 CG ARG A 139 -2.298 21.640 -22.811 1.00 42.70 C -ATOM 2212 CD ARG A 139 -1.427 20.384 -22.573 1.00 56.67 C -ATOM 2213 NE ARG A 139 -1.310 20.030 -21.144 1.00 69.04 N -ATOM 2214 CZ ARG A 139 -1.632 18.866 -20.557 1.00 82.45 C -ATOM 2215 NH1 ARG A 139 -1.583 18.794 -19.229 1.00 58.12 N -ATOM 2216 NH2 ARG A 139 -1.988 17.778 -21.249 1.00 78.84 N1+ -ATOM 2217 H ARG A 139 -5.609 21.724 -20.692 1.00 0.00 H -ATOM 2218 HA ARG A 139 -4.383 23.681 -22.358 1.00 0.00 H -ATOM 2219 HB2 ARG A 139 -3.259 21.961 -20.936 1.00 0.00 H -ATOM 2220 HB3 ARG A 139 -3.978 20.679 -21.858 1.00 0.00 H -ATOM 2221 HG2 ARG A 139 -2.542 21.673 -23.873 1.00 0.00 H -ATOM 2222 HG3 ARG A 139 -1.710 22.538 -22.619 1.00 0.00 H -ATOM 2223 HD2 ARG A 139 -1.864 19.547 -23.116 1.00 0.00 H -ATOM 2224 HD3 ARG A 139 -0.430 20.528 -22.991 1.00 0.00 H -ATOM 2225 HE ARG A 139 -1.028 20.780 -20.530 1.00 0.00 H -ATOM 2226 HH12 ARG A 139 -1.768 17.921 -18.756 1.00 0.00 H -ATOM 2227 HH11 ARG A 139 -1.292 19.602 -18.695 1.00 0.00 H -ATOM 2228 HH22 ARG A 139 -2.220 16.917 -20.775 1.00 0.00 H -ATOM 2229 HH21 ARG A 139 -1.946 17.790 -22.256 1.00 0.00 H -ATOM 2230 N ASN A 140 -6.141 21.281 -23.857 1.00 25.48 N -ATOM 2231 CA ASN A 140 -6.534 20.557 -25.075 1.00 25.69 C -ATOM 2232 C ASN A 140 -8.029 20.821 -25.396 1.00 31.11 C -ATOM 2233 O ASN A 140 -8.470 20.370 -26.451 1.00 31.65 O -ATOM 2234 CB ASN A 140 -6.236 19.036 -24.902 1.00 25.12 C -ATOM 2235 CG ASN A 140 -4.833 18.717 -24.358 1.00 40.47 C -ATOM 2236 OD1 ASN A 140 -3.828 19.008 -24.996 1.00 35.79 O -ATOM 2237 ND2 ASN A 140 -4.750 18.135 -23.166 1.00 30.20 N -ATOM 2238 H ASN A 140 -6.506 20.892 -22.998 1.00 0.00 H -ATOM 2239 HA ASN A 140 -5.966 20.925 -25.932 1.00 0.00 H -ATOM 2240 HB2 ASN A 140 -6.986 18.573 -24.257 1.00 0.00 H -ATOM 2241 HB3 ASN A 140 -6.322 18.535 -25.864 1.00 0.00 H -ATOM 2242 HD22 ASN A 140 -3.850 17.868 -22.799 1.00 0.00 H -ATOM 2243 HD21 ASN A 140 -5.587 17.850 -22.678 1.00 0.00 H -ATOM 2244 N VAL A 141 -8.785 21.543 -24.539 1.00 26.95 N -ATOM 2245 CA VAL A 141 -10.150 22.018 -24.814 1.00 26.70 C -ATOM 2246 C VAL A 141 -9.968 23.485 -25.287 1.00 31.33 C -ATOM 2247 O VAL A 141 -9.442 24.322 -24.550 1.00 31.48 O -ATOM 2248 CB VAL A 141 -11.055 22.007 -23.541 1.00 30.65 C -ATOM 2249 CG1 VAL A 141 -12.455 22.607 -23.801 1.00 31.45 C -ATOM 2250 CG2 VAL A 141 -11.217 20.581 -22.974 1.00 29.49 C -ATOM 2251 H VAL A 141 -8.361 21.894 -23.693 1.00 0.00 H -ATOM 2252 HA VAL A 141 -10.629 21.409 -25.585 1.00 0.00 H -ATOM 2253 HB VAL A 141 -10.577 22.604 -22.761 1.00 0.00 H -ATOM 2254 HG11 VAL A 141 -13.087 22.558 -22.918 1.00 0.00 H -ATOM 2255 HG12 VAL A 141 -12.399 23.656 -24.086 1.00 0.00 H -ATOM 2256 HG13 VAL A 141 -12.963 22.072 -24.603 1.00 0.00 H -ATOM 2257 HG21 VAL A 141 -11.795 20.587 -22.050 1.00 0.00 H -ATOM 2258 HG22 VAL A 141 -11.728 19.927 -23.681 1.00 0.00 H -ATOM 2259 HG23 VAL A 141 -10.258 20.121 -22.744 1.00 0.00 H -ATOM 2260 N LEU A 142 -10.433 23.739 -26.520 1.00 29.26 N -ATOM 2261 CA LEU A 142 -10.325 24.987 -27.282 1.00 29.87 C -ATOM 2262 C LEU A 142 -11.717 25.664 -27.238 1.00 34.28 C -ATOM 2263 O LEU A 142 -12.741 25.005 -27.410 1.00 33.78 O -ATOM 2264 CB LEU A 142 -9.957 24.631 -28.746 1.00 30.51 C -ATOM 2265 CG LEU A 142 -8.635 23.846 -28.941 1.00 34.35 C -ATOM 2266 CD1 LEU A 142 -8.486 23.400 -30.402 1.00 34.54 C -ATOM 2267 CD2 LEU A 142 -7.396 24.630 -28.474 1.00 35.67 C -ATOM 2268 H LEU A 142 -10.915 22.994 -27.009 1.00 0.00 H -ATOM 2269 HA LEU A 142 -9.575 25.647 -26.858 1.00 0.00 H -ATOM 2270 HB2 LEU A 142 -10.769 24.053 -29.195 1.00 0.00 H -ATOM 2271 HB3 LEU A 142 -9.889 25.555 -29.323 1.00 0.00 H -ATOM 2272 HG LEU A 142 -8.682 22.932 -28.346 1.00 0.00 H -ATOM 2273 HD11 LEU A 142 -7.570 22.829 -30.555 1.00 0.00 H -ATOM 2274 HD12 LEU A 142 -9.320 22.764 -30.702 1.00 0.00 H -ATOM 2275 HD13 LEU A 142 -8.462 24.257 -31.077 1.00 0.00 H -ATOM 2276 HD21 LEU A 142 -6.481 24.064 -28.651 1.00 0.00 H -ATOM 2277 HD22 LEU A 142 -7.303 25.586 -28.989 1.00 0.00 H -ATOM 2278 HD23 LEU A 142 -7.434 24.824 -27.405 1.00 0.00 H -ATOM 2279 N LEU A 143 -11.717 26.996 -27.068 1.00 30.49 N -ATOM 2280 CA LEU A 143 -12.892 27.875 -27.045 1.00 32.51 C -ATOM 2281 C LEU A 143 -12.985 28.486 -28.465 1.00 35.33 C -ATOM 2282 O LEU A 143 -12.035 29.121 -28.929 1.00 35.33 O -ATOM 2283 CB LEU A 143 -12.619 28.978 -25.989 1.00 33.91 C -ATOM 2284 CG LEU A 143 -13.817 29.904 -25.677 1.00 41.72 C -ATOM 2285 CD1 LEU A 143 -14.950 29.174 -24.941 1.00 42.04 C -ATOM 2286 CD2 LEU A 143 -13.369 31.120 -24.860 1.00 45.52 C -ATOM 2287 H LEU A 143 -10.826 27.472 -26.979 1.00 0.00 H -ATOM 2288 HA LEU A 143 -13.792 27.313 -26.788 1.00 0.00 H -ATOM 2289 HB2 LEU A 143 -12.299 28.509 -25.057 1.00 0.00 H -ATOM 2290 HB3 LEU A 143 -11.763 29.582 -26.299 1.00 0.00 H -ATOM 2291 HG LEU A 143 -14.215 30.282 -26.618 1.00 0.00 H -ATOM 2292 HD11 LEU A 143 -15.752 29.865 -24.680 1.00 0.00 H -ATOM 2293 HD12 LEU A 143 -15.393 28.396 -25.555 1.00 0.00 H -ATOM 2294 HD13 LEU A 143 -14.604 28.716 -24.016 1.00 0.00 H -ATOM 2295 HD21 LEU A 143 -14.190 31.821 -24.707 1.00 0.00 H -ATOM 2296 HD22 LEU A 143 -13.005 30.812 -23.880 1.00 0.00 H -ATOM 2297 HD23 LEU A 143 -12.567 31.662 -25.361 1.00 0.00 H -ATOM 2298 N ASH A 144 -14.153 28.311 -29.112 1.00 33.70 N -ATOM 2299 CA ASH A 144 -14.479 28.845 -30.447 1.00 35.49 C -ATOM 2300 C ASH A 144 -15.050 30.277 -30.257 1.00 42.98 C -ATOM 2301 O ASH A 144 -14.546 31.218 -30.871 1.00 43.01 O -ATOM 2302 CB ASH A 144 -15.500 27.925 -31.172 1.00 38.24 C -ATOM 2303 CG ASH A 144 -15.751 28.302 -32.639 1.00 57.45 C -ATOM 2304 OD1 ASH A 144 -16.733 29.040 -32.882 1.00 62.50 O -ATOM 2305 OD2 ASH A 144 -14.946 27.855 -33.484 1.00 62.05 O1- -ATOM 2306 H ASH A 144 -14.901 27.814 -28.646 1.00 0.00 H -ATOM 2307 HA ASH A 144 -13.568 28.900 -31.045 1.00 0.00 H -ATOM 2308 HB2 ASH A 144 -15.147 26.894 -31.146 1.00 0.00 H -ATOM 2309 HB3 ASH A 144 -16.453 27.908 -30.641 1.00 0.00 H -ATOM 2310 N ASN A 145 -16.070 30.400 -29.390 1.00 43.24 N -ATOM 2311 CA ASN A 145 -16.727 31.642 -28.965 1.00 46.44 C -ATOM 2312 C ASN A 145 -17.116 31.461 -27.475 1.00 51.69 C -ATOM 2313 O ASN A 145 -16.943 30.387 -26.894 1.00 49.09 O -ATOM 2314 CB ASN A 145 -17.873 32.055 -29.934 1.00 48.31 C -ATOM 2315 CG ASN A 145 -19.023 31.043 -30.073 1.00 66.28 C -ATOM 2316 OD1 ASN A 145 -19.857 30.917 -29.179 1.00 59.86 O -ATOM 2317 ND2 ASN A 145 -19.075 30.322 -31.194 1.00 59.92 N -ATOM 2318 H ASN A 145 -16.400 29.567 -28.922 1.00 0.00 H -ATOM 2319 HA ASN A 145 -15.984 32.441 -28.979 1.00 0.00 H -ATOM 2320 HB2 ASN A 145 -18.304 33.003 -29.609 1.00 0.00 H -ATOM 2321 HB3 ASN A 145 -17.450 32.263 -30.919 1.00 0.00 H -ATOM 2322 HD22 ASN A 145 -19.819 29.653 -31.324 1.00 0.00 H -ATOM 2323 HD21 ASN A 145 -18.355 30.403 -31.900 1.00 0.00 H -ATOM 2324 N ASH A 146 -17.650 32.537 -26.873 1.00 52.34 N -ATOM 2325 CA ASH A 146 -18.063 32.657 -25.459 1.00 53.71 C -ATOM 2326 C ASH A 146 -19.101 31.578 -25.006 1.00 56.50 C -ATOM 2327 O ASH A 146 -19.232 31.390 -23.798 1.00 55.06 O -ATOM 2328 CB ASH A 146 -18.501 34.116 -25.132 1.00 59.25 C -ATOM 2329 CG ASH A 146 -19.814 34.636 -25.750 1.00 77.62 C -ATOM 2330 OD1 ASH A 146 -20.335 33.990 -26.685 1.00 79.51 O -ATOM 2331 OD2 ASH A 146 -20.262 35.704 -25.279 1.00 88.40 O1- -ATOM 2332 H ASH A 146 -17.766 33.382 -27.413 1.00 0.00 H -ATOM 2333 HA ASH A 146 -17.162 32.459 -24.873 1.00 0.00 H -ATOM 2334 HB2 ASH A 146 -18.588 34.224 -24.051 1.00 0.00 H -ATOM 2335 HB3 ASH A 146 -17.707 34.805 -25.423 1.00 0.00 H -ATOM 2336 N ARG A 147 -19.796 30.884 -25.931 1.00 52.42 N -ATOM 2337 CA ARG A 147 -20.836 29.881 -25.643 1.00 52.12 C -ATOM 2338 C ARG A 147 -20.595 28.585 -26.473 1.00 53.91 C -ATOM 2339 O ARG A 147 -21.554 27.828 -26.636 1.00 54.42 O -ATOM 2340 CB ARG A 147 -22.243 30.516 -25.847 1.00 56.06 C -ATOM 2341 CG ARG A 147 -22.626 31.660 -24.878 1.00 68.03 C -ATOM 2342 CD ARG A 147 -22.699 31.239 -23.400 1.00 74.26 C -ATOM 2343 NE ARG A 147 -23.154 32.336 -22.532 1.00 83.22 N -ATOM 2344 CZ ARG A 147 -24.411 32.575 -22.127 1.00103.41 C -ATOM 2345 NH1 ARG A 147 -25.446 31.815 -22.499 1.00 95.23 N -ATOM 2346 NH2 ARG A 147 -24.638 33.607 -21.313 1.00 92.56 N1+ -ATOM 2347 H ARG A 147 -19.634 31.080 -26.910 1.00 0.00 H -ATOM 2348 HA ARG A 147 -20.751 29.539 -24.610 1.00 0.00 H -ATOM 2349 HB2 ARG A 147 -22.318 30.889 -26.870 1.00 0.00 H -ATOM 2350 HB3 ARG A 147 -23.012 29.747 -25.763 1.00 0.00 H -ATOM 2351 HG2 ARG A 147 -21.929 32.491 -24.988 1.00 0.00 H -ATOM 2352 HG3 ARG A 147 -23.598 32.052 -25.181 1.00 0.00 H -ATOM 2353 HD2 ARG A 147 -23.370 30.393 -23.283 1.00 0.00 H -ATOM 2354 HD3 ARG A 147 -21.725 30.912 -23.040 1.00 0.00 H -ATOM 2355 HE ARG A 147 -22.430 32.960 -22.203 1.00 0.00 H -ATOM 2356 HH12 ARG A 147 -26.376 32.025 -22.170 1.00 0.00 H -ATOM 2357 HH11 ARG A 147 -25.304 31.037 -23.133 1.00 0.00 H -ATOM 2358 HH22 ARG A 147 -25.572 33.797 -20.983 1.00 0.00 H -ATOM 2359 HH21 ARG A 147 -23.871 34.195 -21.024 1.00 0.00 H -ATOM 2360 N LEU A 148 -19.366 28.310 -26.969 1.00 47.46 N -ATOM 2361 CA LEU A 148 -19.034 27.112 -27.765 1.00 44.95 C -ATOM 2362 C LEU A 148 -17.585 26.705 -27.427 1.00 44.87 C -ATOM 2363 O LEU A 148 -16.665 27.513 -27.561 1.00 44.01 O -ATOM 2364 CB LEU A 148 -19.281 27.369 -29.273 1.00 46.48 C -ATOM 2365 CG LEU A 148 -19.005 26.179 -30.232 1.00 50.35 C -ATOM 2366 CD1 LEU A 148 -19.811 24.916 -29.882 1.00 50.69 C -ATOM 2367 CD2 LEU A 148 -19.255 26.589 -31.693 1.00 54.50 C -ATOM 2368 H LEU A 148 -18.605 28.956 -26.802 1.00 0.00 H -ATOM 2369 HA LEU A 148 -19.693 26.302 -27.443 1.00 0.00 H -ATOM 2370 HB2 LEU A 148 -20.312 27.700 -29.411 1.00 0.00 H -ATOM 2371 HB3 LEU A 148 -18.656 28.207 -29.579 1.00 0.00 H -ATOM 2372 HG LEU A 148 -17.948 25.919 -30.156 1.00 0.00 H -ATOM 2373 HD11 LEU A 148 -19.612 24.110 -30.590 1.00 0.00 H -ATOM 2374 HD12 LEU A 148 -19.547 24.538 -28.895 1.00 0.00 H -ATOM 2375 HD13 LEU A 148 -20.884 25.110 -29.892 1.00 0.00 H -ATOM 2376 HD21 LEU A 148 -18.978 25.792 -32.382 1.00 0.00 H -ATOM 2377 HD22 LEU A 148 -20.305 26.829 -31.867 1.00 0.00 H -ATOM 2378 HD23 LEU A 148 -18.670 27.467 -31.964 1.00 0.00 H -ATOM 2379 N VAL A 149 -17.418 25.413 -27.092 1.00 38.25 N -ATOM 2380 CA VAL A 149 -16.158 24.747 -26.739 1.00 36.27 C -ATOM 2381 C VAL A 149 -16.034 23.482 -27.637 1.00 39.75 C -ATOM 2382 O VAL A 149 -17.038 22.875 -28.015 1.00 42.27 O -ATOM 2383 CB VAL A 149 -16.110 24.438 -25.195 1.00 39.78 C -ATOM 2384 CG1 VAL A 149 -16.044 22.960 -24.744 1.00 38.54 C -ATOM 2385 CG2 VAL A 149 -15.003 25.262 -24.517 1.00 38.84 C -ATOM 2386 H VAL A 149 -18.234 24.819 -27.053 1.00 0.00 H -ATOM 2387 HA VAL A 149 -15.331 25.405 -27.017 1.00 0.00 H -ATOM 2388 HB VAL A 149 -17.034 24.809 -24.749 1.00 0.00 H -ATOM 2389 HG11 VAL A 149 -16.045 22.887 -23.657 1.00 0.00 H -ATOM 2390 HG12 VAL A 149 -16.904 22.395 -25.103 1.00 0.00 H -ATOM 2391 HG13 VAL A 149 -15.145 22.463 -25.106 1.00 0.00 H -ATOM 2392 HG21 VAL A 149 -15.006 25.108 -23.441 1.00 0.00 H -ATOM 2393 HG22 VAL A 149 -14.017 25.001 -24.899 1.00 0.00 H -ATOM 2394 HG23 VAL A 149 -15.148 26.327 -24.684 1.00 0.00 H -ATOM 2395 N LYS A 150 -14.775 23.114 -27.942 1.00 33.36 N -ATOM 2396 CA LYS A 150 -14.348 22.035 -28.847 1.00 33.06 C -ATOM 2397 C LYS A 150 -13.161 21.310 -28.173 1.00 35.92 C -ATOM 2398 O LYS A 150 -12.274 21.960 -27.625 1.00 35.20 O -ATOM 2399 CB LYS A 150 -13.954 22.630 -30.222 1.00 36.83 C -ATOM 2400 CG LYS A 150 -15.148 23.026 -31.110 1.00 43.54 C -ATOM 2401 CD LYS A 150 -14.718 23.901 -32.303 1.00 43.25 C -ATOM 2402 CE LYS A 150 -15.866 24.250 -33.265 1.00 48.33 C -ATOM 2403 NZ LYS A 150 -16.302 23.074 -34.037 1.00 58.37 N1+ -ATOM 2404 H LYS A 150 -14.015 23.671 -27.570 1.00 0.00 H -ATOM 2405 HA LYS A 150 -15.155 21.316 -28.972 1.00 0.00 H -ATOM 2406 HB2 LYS A 150 -13.310 23.499 -30.066 1.00 0.00 H -ATOM 2407 HB3 LYS A 150 -13.344 21.917 -30.780 1.00 0.00 H -ATOM 2408 HG2 LYS A 150 -15.647 22.120 -31.457 1.00 0.00 H -ATOM 2409 HG3 LYS A 150 -15.887 23.577 -30.529 1.00 0.00 H -ATOM 2410 HD2 LYS A 150 -14.293 24.828 -31.920 1.00 0.00 H -ATOM 2411 HD3 LYS A 150 -13.910 23.413 -32.849 1.00 0.00 H -ATOM 2412 HE2 LYS A 150 -16.714 24.662 -32.715 1.00 0.00 H -ATOM 2413 HE3 LYS A 150 -15.541 25.018 -33.969 1.00 0.00 H -ATOM 2414 HZ1 LYS A 150 -17.107 23.317 -34.598 1.00 0.00 H -ATOM 2415 HZ2 LYS A 150 -15.537 22.790 -34.640 1.00 0.00 H -ATOM 2416 HZ3 LYS A 150 -16.543 22.320 -33.409 1.00 0.00 H -ATOM 2417 N ILE A 151 -13.116 19.972 -28.298 1.00 32.33 N -ATOM 2418 CA ILE A 151 -12.031 19.104 -27.800 1.00 30.26 C -ATOM 2419 C ILE A 151 -11.040 18.921 -28.987 1.00 36.96 C -ATOM 2420 O ILE A 151 -11.459 18.600 -30.101 1.00 36.41 O -ATOM 2421 CB ILE A 151 -12.587 17.690 -27.412 1.00 32.08 C -ATOM 2422 CG1 ILE A 151 -13.664 17.780 -26.296 1.00 32.40 C -ATOM 2423 CG2 ILE A 151 -11.490 16.672 -27.006 1.00 30.46 C -ATOM 2424 CD1 ILE A 151 -14.584 16.553 -26.227 1.00 32.90 C -ATOM 2425 H ILE A 151 -13.865 19.497 -28.782 1.00 0.00 H -ATOM 2426 HA ILE A 151 -11.533 19.552 -26.936 1.00 0.00 H -ATOM 2427 HB ILE A 151 -13.085 17.282 -28.296 1.00 0.00 H -ATOM 2428 HG12 ILE A 151 -13.190 17.946 -25.327 1.00 0.00 H -ATOM 2429 HG13 ILE A 151 -14.307 18.647 -26.450 1.00 0.00 H -ATOM 2430 HG21 ILE A 151 -11.914 15.705 -26.738 1.00 0.00 H -ATOM 2431 HG22 ILE A 151 -10.789 16.479 -27.818 1.00 0.00 H -ATOM 2432 HG23 ILE A 151 -10.915 17.027 -26.150 1.00 0.00 H -ATOM 2433 HD11 ILE A 151 -15.379 16.708 -25.499 1.00 0.00 H -ATOM 2434 HD12 ILE A 151 -15.054 16.360 -27.191 1.00 0.00 H -ATOM 2435 HD13 ILE A 151 -14.042 15.654 -25.941 1.00 0.00 H -ATOM 2436 N GLY A 152 -9.737 19.078 -28.696 1.00 34.99 N -ATOM 2437 CA GLY A 152 -8.619 18.871 -29.624 1.00 35.46 C -ATOM 2438 C GLY A 152 -7.510 18.004 -28.994 1.00 40.57 C -ATOM 2439 O GLY A 152 -7.577 17.617 -27.826 1.00 40.24 O -ATOM 2440 H GLY A 152 -9.475 19.340 -27.754 1.00 0.00 H -ATOM 2441 HA2 GLY A 152 -8.941 18.389 -30.548 1.00 0.00 H -ATOM 2442 HA3 GLY A 152 -8.209 19.844 -29.897 1.00 0.00 H -ATOM 2443 N ASH A 153 -6.490 17.690 -29.818 1.00 37.60 N -ATOM 2444 CA ASH A 153 -5.267 16.912 -29.535 1.00 37.19 C -ATOM 2445 C ASH A 153 -5.663 15.444 -29.250 1.00 39.90 C -ATOM 2446 O ASH A 153 -5.839 15.070 -28.090 1.00 40.83 O -ATOM 2447 CB ASH A 153 -4.290 17.535 -28.493 1.00 38.16 C -ATOM 2448 CG ASH A 153 -2.826 17.053 -28.595 1.00 45.68 C -ATOM 2449 OD1 ASH A 153 -1.944 17.826 -28.164 1.00 47.53 O -ATOM 2450 OD2 ASH A 153 -2.584 15.940 -29.115 1.00 46.86 O1- -ATOM 2451 H ASH A 153 -6.557 18.004 -30.776 1.00 0.00 H -ATOM 2452 HA ASH A 153 -4.734 16.919 -30.489 1.00 0.00 H -ATOM 2453 HB2 ASH A 153 -4.283 18.615 -28.627 1.00 0.00 H -ATOM 2454 HB3 ASH A 153 -4.639 17.368 -27.473 1.00 0.00 H -ATOM 2455 N PHE A 154 -5.785 14.649 -30.326 1.00 32.99 N -ATOM 2456 CA PHE A 154 -6.101 13.212 -30.302 1.00 32.48 C -ATOM 2457 C PHE A 154 -4.786 12.414 -30.538 1.00 35.62 C -ATOM 2458 O PHE A 154 -4.833 11.346 -31.148 1.00 35.44 O -ATOM 2459 CB PHE A 154 -7.210 12.937 -31.356 1.00 35.36 C -ATOM 2460 CG PHE A 154 -8.569 13.514 -30.972 1.00 36.03 C -ATOM 2461 CD1 PHE A 154 -9.548 12.697 -30.351 1.00 39.47 C -ATOM 2462 CD2 PHE A 154 -8.861 14.883 -31.194 1.00 37.32 C -ATOM 2463 CE1 PHE A 154 -10.771 13.246 -29.969 1.00 39.56 C -ATOM 2464 CE2 PHE A 154 -10.092 15.408 -30.807 1.00 40.21 C -ATOM 2465 CZ PHE A 154 -11.043 14.594 -30.194 1.00 38.02 C -ATOM 2466 H PHE A 154 -5.597 15.040 -31.239 1.00 0.00 H -ATOM 2467 HA PHE A 154 -6.484 12.907 -29.327 1.00 0.00 H -ATOM 2468 HB2 PHE A 154 -6.921 13.339 -32.329 1.00 0.00 H -ATOM 2469 HB3 PHE A 154 -7.335 11.866 -31.517 1.00 0.00 H -ATOM 2470 HD1 PHE A 154 -9.351 11.651 -30.163 1.00 0.00 H -ATOM 2471 HD2 PHE A 154 -8.131 15.527 -31.662 1.00 0.00 H -ATOM 2472 HE1 PHE A 154 -11.509 12.627 -29.485 1.00 0.00 H -ATOM 2473 HE2 PHE A 154 -10.307 16.450 -30.985 1.00 0.00 H -ATOM 2474 HZ PHE A 154 -11.992 15.011 -29.891 1.00 0.00 H -ATOM 2475 N GLY A 155 -3.638 12.917 -30.032 1.00 33.72 N -ATOM 2476 CA GLY A 155 -2.302 12.322 -30.165 1.00 35.61 C -ATOM 2477 C GLY A 155 -1.997 11.197 -29.151 1.00 40.83 C -ATOM 2478 O GLY A 155 -1.020 10.478 -29.353 1.00 42.94 O -ATOM 2479 H GLY A 155 -3.679 13.803 -29.545 1.00 0.00 H -ATOM 2480 HA2 GLY A 155 -2.160 11.936 -31.175 1.00 0.00 H -ATOM 2481 HA3 GLY A 155 -1.566 13.114 -30.040 1.00 0.00 H -ATOM 2482 N LEU A 156 -2.814 11.008 -28.098 1.00 35.95 N -ATOM 2483 CA LEU A 156 -2.802 9.824 -27.218 1.00 35.55 C -ATOM 2484 C LEU A 156 -4.098 8.994 -27.437 1.00 38.20 C -ATOM 2485 O LEU A 156 -4.219 7.953 -26.791 1.00 37.43 O -ATOM 2486 CB LEU A 156 -2.634 10.248 -25.731 1.00 34.71 C -ATOM 2487 CG LEU A 156 -1.276 10.887 -25.342 1.00 41.15 C -ATOM 2488 CD1 LEU A 156 -1.220 11.179 -23.829 1.00 45.80 C -ATOM 2489 CD2 LEU A 156 -0.055 10.041 -25.754 1.00 40.55 C -ATOM 2490 H LEU A 156 -3.592 11.642 -27.958 1.00 0.00 H -ATOM 2491 HA LEU A 156 -1.990 9.145 -27.484 1.00 0.00 H -ATOM 2492 HB2 LEU A 156 -3.442 10.926 -25.453 1.00 0.00 H -ATOM 2493 HB3 LEU A 156 -2.766 9.370 -25.096 1.00 0.00 H -ATOM 2494 HG LEU A 156 -1.197 11.842 -25.863 1.00 0.00 H -ATOM 2495 HD11 LEU A 156 -0.267 11.625 -23.545 1.00 0.00 H -ATOM 2496 HD12 LEU A 156 -2.000 11.874 -23.523 1.00 0.00 H -ATOM 2497 HD13 LEU A 156 -1.341 10.269 -23.241 1.00 0.00 H -ATOM 2498 HD21 LEU A 156 0.875 10.501 -25.417 1.00 0.00 H -ATOM 2499 HD22 LEU A 156 -0.101 9.038 -25.326 1.00 0.00 H -ATOM 2500 HD23 LEU A 156 0.025 9.941 -26.836 1.00 0.00 H -ATOM 2501 N ALA A 157 -5.043 9.413 -28.312 1.00 34.45 N -ATOM 2502 CA ALA A 157 -6.352 8.772 -28.532 1.00 35.33 C -ATOM 2503 C ALA A 157 -6.154 7.372 -29.159 1.00 41.48 C -ATOM 2504 O ALA A 157 -5.279 7.178 -30.007 1.00 41.92 O -ATOM 2505 CB ALA A 157 -7.225 9.663 -29.430 1.00 35.84 C -ATOM 2506 H ALA A 157 -4.887 10.270 -28.822 1.00 0.00 H -ATOM 2507 HA ALA A 157 -6.827 8.671 -27.556 1.00 0.00 H -ATOM 2508 HB1 ALA A 157 -8.232 9.256 -29.526 1.00 0.00 H -ATOM 2509 HB2 ALA A 157 -7.326 10.664 -29.008 1.00 0.00 H -ATOM 2510 HB3 ALA A 157 -6.814 9.760 -30.436 1.00 0.00 H -ATOM 2511 N LYS A 158 -6.989 6.424 -28.708 1.00 39.67 N -ATOM 2512 CA LYS A 158 -6.879 4.992 -29.000 1.00 41.51 C -ATOM 2513 C LYS A 158 -8.303 4.428 -29.133 1.00 46.70 C -ATOM 2514 O LYS A 158 -9.189 4.789 -28.359 1.00 45.21 O -ATOM 2515 CB LYS A 158 -6.052 4.285 -27.893 1.00 43.95 C -ATOM 2516 CG LYS A 158 -4.532 4.247 -28.149 1.00 52.94 C -ATOM 2517 CD LYS A 158 -4.086 3.490 -29.419 1.00 61.30 C -ATOM 2518 CE LYS A 158 -4.796 2.141 -29.659 1.00 72.46 C -ATOM 2519 NZ LYS A 158 -4.248 1.430 -30.826 1.00 80.50 N1+ -ATOM 2520 H LYS A 158 -7.709 6.682 -28.046 1.00 0.00 H -ATOM 2521 HA LYS A 158 -6.403 4.860 -29.975 1.00 0.00 H -ATOM 2522 HB2 LYS A 158 -6.232 4.766 -26.929 1.00 0.00 H -ATOM 2523 HB3 LYS A 158 -6.399 3.261 -27.743 1.00 0.00 H -ATOM 2524 HG2 LYS A 158 -4.139 5.264 -28.181 1.00 0.00 H -ATOM 2525 HG3 LYS A 158 -4.057 3.791 -27.286 1.00 0.00 H -ATOM 2526 HD2 LYS A 158 -4.241 4.143 -30.277 1.00 0.00 H -ATOM 2527 HD3 LYS A 158 -3.007 3.334 -29.364 1.00 0.00 H -ATOM 2528 HE2 LYS A 158 -4.710 1.499 -28.785 1.00 0.00 H -ATOM 2529 HE3 LYS A 158 -5.861 2.290 -29.835 1.00 0.00 H -ATOM 2530 HZ1 LYS A 158 -4.751 0.565 -30.963 1.00 0.00 H -ATOM 2531 HZ2 LYS A 158 -4.358 2.016 -31.645 1.00 0.00 H -ATOM 2532 HZ3 LYS A 158 -3.269 1.232 -30.677 1.00 0.00 H -ATOM 2533 N ALA A 159 -8.460 3.464 -30.060 1.00 45.97 N -ATOM 2534 CA ALA A 159 -9.658 2.635 -30.236 1.00 47.89 C -ATOM 2535 C ALA A 159 -9.557 1.487 -29.204 1.00 53.43 C -ATOM 2536 O ALA A 159 -8.551 0.772 -29.162 1.00 53.75 O -ATOM 2537 CB ALA A 159 -9.647 2.048 -31.661 1.00 51.21 C -ATOM 2538 H ALA A 159 -7.673 3.209 -30.639 1.00 0.00 H -ATOM 2539 HA ALA A 159 -10.566 3.225 -30.091 1.00 0.00 H -ATOM 2540 HB1 ALA A 159 -10.530 1.431 -31.838 1.00 0.00 H -ATOM 2541 HB2 ALA A 159 -9.659 2.838 -32.410 1.00 0.00 H -ATOM 2542 HB3 ALA A 159 -8.767 1.432 -31.856 1.00 0.00 H -ATOM 2543 N VAL A 160 -10.638 1.317 -28.425 1.00 51.14 N -ATOM 2544 CA VAL A 160 -10.867 0.187 -27.516 1.00 52.52 C -ATOM 2545 C VAL A 160 -11.794 -0.765 -28.337 1.00 61.61 C -ATOM 2546 O VAL A 160 -12.888 -0.338 -28.725 1.00 62.08 O -ATOM 2547 CB VAL A 160 -11.645 0.633 -26.233 1.00 54.59 C -ATOM 2548 CG1 VAL A 160 -11.976 -0.531 -25.271 1.00 55.28 C -ATOM 2549 CG2 VAL A 160 -10.909 1.747 -25.462 1.00 51.78 C -ATOM 2550 H VAL A 160 -11.428 1.940 -28.541 1.00 0.00 H -ATOM 2551 HA VAL A 160 -9.925 -0.263 -27.201 1.00 0.00 H -ATOM 2552 HB VAL A 160 -12.595 1.070 -26.538 1.00 0.00 H -ATOM 2553 HG11 VAL A 160 -12.505 -0.179 -24.384 1.00 0.00 H -ATOM 2554 HG12 VAL A 160 -12.617 -1.276 -25.740 1.00 0.00 H -ATOM 2555 HG13 VAL A 160 -11.073 -1.041 -24.937 1.00 0.00 H -ATOM 2556 HG21 VAL A 160 -11.454 2.031 -24.560 1.00 0.00 H -ATOM 2557 HG22 VAL A 160 -9.908 1.435 -25.159 1.00 0.00 H -ATOM 2558 HG23 VAL A 160 -10.810 2.647 -26.069 1.00 0.00 H -ATOM 2559 N PRO A 161 -11.377 -2.042 -28.566 1.00 62.00 N -ATOM 2560 CA PRO A 161 -12.212 -3.087 -29.223 1.00 66.09 C -ATOM 2561 C PRO A 161 -13.552 -3.321 -28.482 1.00 73.83 C -ATOM 2562 O PRO A 161 -13.579 -3.268 -27.254 1.00 71.64 O -ATOM 2563 CB PRO A 161 -11.342 -4.360 -29.162 1.00 69.51 C -ATOM 2564 CG PRO A 161 -9.916 -3.846 -29.085 1.00 71.48 C -ATOM 2565 CD PRO A 161 -10.047 -2.578 -28.251 1.00 63.48 C -ATOM 2566 HA PRO A 161 -12.380 -2.790 -30.262 1.00 0.00 H -ATOM 2567 HB2 PRO A 161 -11.549 -4.948 -28.267 1.00 0.00 H -ATOM 2568 HB3 PRO A 161 -11.498 -5.015 -30.020 1.00 0.00 H -ATOM 2569 HG2 PRO A 161 -9.216 -4.570 -28.665 1.00 0.00 H -ATOM 2570 HG3 PRO A 161 -9.569 -3.591 -30.088 1.00 0.00 H -ATOM 2571 HD3 PRO A 161 -9.232 -1.893 -28.492 1.00 0.00 H -ATOM 2572 HD2 PRO A 161 -10.000 -2.809 -27.186 1.00 0.00 H -ATOM 2573 N GLU A 162 -14.633 -3.559 -29.246 1.00 75.69 N -ATOM 2574 CA GLU A 162 -16.039 -3.692 -28.809 1.00 77.51 C -ATOM 2575 C GLU A 162 -16.271 -4.784 -27.721 1.00 84.15 C -ATOM 2576 O GLU A 162 -17.216 -4.634 -26.946 1.00 83.15 O -ATOM 2577 CB GLU A 162 -16.982 -3.857 -30.033 1.00 82.22 C -ATOM 2578 CG GLU A 162 -16.781 -5.102 -30.944 1.00 97.93 C -ATOM 2579 CD GLU A 162 -15.581 -5.076 -31.908 1.00120.70 C -ATOM 2580 OE1 GLU A 162 -14.946 -4.007 -32.055 1.00108.26 O -ATOM 2581 OE2 GLU A 162 -15.322 -6.147 -32.497 1.00119.67 O1- -ATOM 2582 H GLU A 162 -14.515 -3.576 -30.254 1.00 0.00 H -ATOM 2583 HA GLU A 162 -16.301 -2.741 -28.343 1.00 0.00 H -ATOM 2584 HB2 GLU A 162 -18.013 -3.869 -29.673 1.00 0.00 H -ATOM 2585 HB3 GLU A 162 -16.928 -2.951 -30.640 1.00 0.00 H -ATOM 2586 HG2 GLU A 162 -16.726 -6.006 -30.337 1.00 0.00 H -ATOM 2587 HG3 GLU A 162 -17.669 -5.219 -31.566 1.00 0.00 H -ATOM 2588 N GLY A 163 -15.410 -5.820 -27.645 1.00 83.36 N -ATOM 2589 CA GLY A 163 -15.444 -6.876 -26.620 1.00 84.58 C -ATOM 2590 C GLY A 163 -14.607 -6.559 -25.358 1.00 86.36 C -ATOM 2591 O GLY A 163 -14.669 -7.333 -24.403 1.00 86.86 O -ATOM 2592 H GLY A 163 -14.663 -5.867 -28.324 1.00 0.00 H -ATOM 2593 HA2 GLY A 163 -16.470 -7.104 -26.325 1.00 0.00 H -ATOM 2594 HA3 GLY A 163 -15.046 -7.787 -27.067 1.00 0.00 H -ATOM 2595 N HID A 164 -13.824 -5.462 -25.351 1.00 79.97 N -ATOM 2596 CA HID A 164 -12.962 -4.992 -24.252 1.00 76.91 C -ATOM 2597 C HID A 164 -13.610 -3.706 -23.676 1.00 76.64 C -ATOM 2598 O HID A 164 -14.292 -2.961 -24.385 1.00 75.70 O -ATOM 2599 CB HID A 164 -11.553 -4.650 -24.809 1.00 77.26 C -ATOM 2600 CG HID A 164 -10.728 -5.810 -25.324 1.00 83.91 C -ATOM 2601 ND1 HID A 164 -11.174 -6.698 -26.290 1.00 88.78 N -ATOM 2602 CD2 HID A 164 -9.454 -6.231 -25.008 1.00 86.52 C -ATOM 2603 CE1 HID A 164 -10.192 -7.573 -26.516 1.00 90.57 C -ATOM 2604 NE2 HID A 164 -9.115 -7.350 -25.774 1.00 89.68 N -ATOM 2605 H HID A 164 -13.855 -4.845 -26.153 1.00 0.00 H -ATOM 2606 HA HID A 164 -12.876 -5.744 -23.464 1.00 0.00 H -ATOM 2607 HB2 HID A 164 -11.621 -3.914 -25.612 1.00 0.00 H -ATOM 2608 HB3 HID A 164 -10.962 -4.171 -24.027 1.00 0.00 H -ATOM 2609 HD1 HID A 164 -12.079 -6.686 -26.737 1.00 0.00 H -ATOM 2610 HD2 HID A 164 -8.754 -5.811 -24.300 1.00 0.00 H -ATOM 2611 HE1 HID A 164 -10.266 -8.382 -27.228 1.00 0.00 H -ATOM 2612 N GLU A 165 -13.313 -3.436 -22.393 1.00 70.38 N -ATOM 2613 CA GLU A 165 -13.685 -2.214 -21.661 1.00 67.41 C -ATOM 2614 C GLU A 165 -12.425 -1.357 -21.344 1.00 65.39 C -ATOM 2615 O GLU A 165 -12.603 -0.306 -20.726 1.00 62.86 O -ATOM 2616 CB GLU A 165 -14.502 -2.583 -20.387 1.00 69.51 C -ATOM 2617 CG GLU A 165 -13.772 -3.298 -19.217 1.00 81.78 C -ATOM 2618 CD GLU A 165 -13.478 -4.787 -19.443 1.00109.48 C -ATOM 2619 OE1 GLU A 165 -12.528 -5.081 -20.201 1.00107.26 O -ATOM 2620 OE2 GLU A 165 -14.200 -5.609 -18.838 1.00107.68 O1- -ATOM 2621 H GLU A 165 -12.760 -4.100 -21.861 1.00 0.00 H -ATOM 2622 HA GLU A 165 -14.326 -1.586 -22.284 1.00 0.00 H -ATOM 2623 HB2 GLU A 165 -14.933 -1.663 -19.989 1.00 0.00 H -ATOM 2624 HB3 GLU A 165 -15.370 -3.174 -20.685 1.00 0.00 H -ATOM 2625 HG2 GLU A 165 -12.841 -2.787 -18.980 1.00 0.00 H -ATOM 2626 HG3 GLU A 165 -14.383 -3.207 -18.317 1.00 0.00 H -ATOM 2627 N TYR A 166 -11.201 -1.778 -21.738 1.00 59.91 N -ATOM 2628 CA TYR A 166 -9.938 -1.058 -21.497 1.00 57.06 C -ATOM 2629 C TYR A 166 -8.932 -1.332 -22.640 1.00 59.88 C -ATOM 2630 O TYR A 166 -9.098 -2.243 -23.454 1.00 61.73 O -ATOM 2631 CB TYR A 166 -9.376 -1.335 -20.073 1.00 57.75 C -ATOM 2632 CG TYR A 166 -8.801 -2.726 -19.827 1.00 61.72 C -ATOM 2633 CD1 TYR A 166 -9.640 -3.777 -19.387 1.00 65.51 C -ATOM 2634 CD2 TYR A 166 -7.426 -2.985 -20.052 1.00 63.03 C -ATOM 2635 CE1 TYR A 166 -9.122 -5.078 -19.198 1.00 68.28 C -ATOM 2636 CE2 TYR A 166 -6.906 -4.286 -19.861 1.00 66.37 C -ATOM 2637 CZ TYR A 166 -7.753 -5.334 -19.438 1.00 76.35 C -ATOM 2638 OH TYR A 166 -7.247 -6.589 -19.258 1.00 81.80 O -ATOM 2639 H TYR A 166 -11.118 -2.651 -22.239 1.00 0.00 H -ATOM 2640 HA TYR A 166 -10.169 0.006 -21.569 1.00 0.00 H -ATOM 2641 HB2 TYR A 166 -8.600 -0.603 -19.840 1.00 0.00 H -ATOM 2642 HB3 TYR A 166 -10.153 -1.145 -19.337 1.00 0.00 H -ATOM 2643 HD1 TYR A 166 -10.686 -3.586 -19.203 1.00 0.00 H -ATOM 2644 HD2 TYR A 166 -6.769 -2.193 -20.377 1.00 0.00 H -ATOM 2645 HE1 TYR A 166 -9.781 -5.870 -18.873 1.00 0.00 H -ATOM 2646 HE2 TYR A 166 -5.861 -4.477 -20.037 1.00 0.00 H -ATOM 2647 HH TYR A 166 -7.926 -7.223 -19.014 1.00 0.00 H -ATOM 2648 N TYR A 167 -7.865 -0.517 -22.620 1.00 53.09 N -ATOM 2649 CA TYR A 167 -6.643 -0.613 -23.424 1.00 53.10 C -ATOM 2650 C TYR A 167 -5.482 -0.477 -22.405 1.00 56.32 C -ATOM 2651 O TYR A 167 -5.508 0.427 -21.566 1.00 53.18 O -ATOM 2652 CB TYR A 167 -6.664 0.494 -24.511 1.00 53.04 C -ATOM 2653 CG TYR A 167 -5.329 0.796 -25.182 1.00 55.26 C -ATOM 2654 CD1 TYR A 167 -4.823 -0.069 -26.183 1.00 59.33 C -ATOM 2655 CD2 TYR A 167 -4.566 1.919 -24.775 1.00 54.82 C -ATOM 2656 CE1 TYR A 167 -3.562 0.186 -26.769 1.00 60.69 C -ATOM 2657 CE2 TYR A 167 -3.305 2.173 -25.360 1.00 56.92 C -ATOM 2658 CZ TYR A 167 -2.808 1.312 -26.366 1.00 68.28 C -ATOM 2659 OH TYR A 167 -1.601 1.569 -26.950 1.00 72.13 O -ATOM 2660 H TYR A 167 -7.846 0.211 -21.918 1.00 0.00 H -ATOM 2661 HA TYR A 167 -6.572 -1.592 -23.904 1.00 0.00 H -ATOM 2662 HB2 TYR A 167 -7.386 0.225 -25.284 1.00 0.00 H -ATOM 2663 HB3 TYR A 167 -7.043 1.421 -24.079 1.00 0.00 H -ATOM 2664 HD1 TYR A 167 -5.392 -0.933 -26.494 1.00 0.00 H -ATOM 2665 HD2 TYR A 167 -4.936 2.577 -24.002 1.00 0.00 H -ATOM 2666 HE1 TYR A 167 -3.177 -0.479 -27.528 1.00 0.00 H -ATOM 2667 HE2 TYR A 167 -2.730 3.029 -25.039 1.00 0.00 H -ATOM 2668 HH TYR A 167 -1.160 2.331 -26.569 1.00 0.00 H -ATOM 2669 N ARG A 168 -4.437 -1.321 -22.549 1.00 56.46 N -ATOM 2670 CA ARG A 168 -3.184 -1.225 -21.779 1.00 57.19 C -ATOM 2671 C ARG A 168 -2.304 -0.150 -22.464 1.00 61.89 C -ATOM 2672 O ARG A 168 -2.017 -0.249 -23.658 1.00 62.29 O -ATOM 2673 CB ARG A 168 -2.419 -2.575 -21.774 1.00 60.29 C -ATOM 2674 CG ARG A 168 -2.816 -3.513 -20.618 1.00 71.82 C -ATOM 2675 CD ARG A 168 -1.895 -4.744 -20.536 1.00 85.08 C -ATOM 2676 NE ARG A 168 -2.132 -5.546 -19.325 1.00 93.43 N -ATOM 2677 CZ ARG A 168 -3.116 -6.435 -19.121 1.00108.81 C -ATOM 2678 NH1 ARG A 168 -4.069 -6.661 -20.029 1.00 96.57 N -ATOM 2679 NH2 ARG A 168 -3.141 -7.121 -17.977 1.00 96.30 N1+ -ATOM 2680 H ARG A 168 -4.451 -2.008 -23.289 1.00 0.00 H -ATOM 2681 HA ARG A 168 -3.416 -0.937 -20.755 1.00 0.00 H -ATOM 2682 HB2 ARG A 168 -2.535 -3.089 -22.730 1.00 0.00 H -ATOM 2683 HB3 ARG A 168 -1.346 -2.392 -21.674 1.00 0.00 H -ATOM 2684 HG2 ARG A 168 -2.764 -2.965 -19.675 1.00 0.00 H -ATOM 2685 HG3 ARG A 168 -3.854 -3.821 -20.739 1.00 0.00 H -ATOM 2686 HD2 ARG A 168 -2.011 -5.372 -21.420 1.00 0.00 H -ATOM 2687 HD3 ARG A 168 -0.851 -4.429 -20.517 1.00 0.00 H -ATOM 2688 HE ARG A 168 -1.450 -5.431 -18.591 1.00 0.00 H -ATOM 2689 HH12 ARG A 168 -4.818 -7.310 -19.838 1.00 0.00 H -ATOM 2690 HH11 ARG A 168 -4.050 -6.161 -20.904 1.00 0.00 H -ATOM 2691 HH22 ARG A 168 -3.856 -7.816 -17.826 1.00 0.00 H -ATOM 2692 HH21 ARG A 168 -2.393 -7.014 -17.308 1.00 0.00 H -ATOM 2693 N VAL A 169 -1.849 0.817 -21.649 1.00 58.85 N -ATOM 2694 CA VAL A 169 -0.914 1.893 -22.013 1.00 59.44 C -ATOM 2695 C VAL A 169 0.523 1.437 -21.626 1.00 68.20 C -ATOM 2696 O VAL A 169 0.717 0.484 -20.865 1.00 69.34 O -ATOM 2697 CB VAL A 169 -1.254 3.227 -21.257 1.00 60.80 C -ATOM 2698 CG1 VAL A 169 -2.731 3.618 -21.466 1.00 59.13 C -ATOM 2699 CG2 VAL A 169 -0.906 3.315 -19.749 1.00 60.31 C -ATOM 2700 H VAL A 169 -2.096 0.776 -20.668 1.00 0.00 H -ATOM 2701 HA VAL A 169 -0.960 2.071 -23.091 1.00 0.00 H -ATOM 2702 HB VAL A 169 -0.663 4.009 -21.739 1.00 0.00 H -ATOM 2703 HG11 VAL A 169 -2.945 4.606 -21.058 1.00 0.00 H -ATOM 2704 HG12 VAL A 169 -2.988 3.628 -22.526 1.00 0.00 H -ATOM 2705 HG13 VAL A 169 -3.402 2.911 -20.978 1.00 0.00 H -ATOM 2706 HG21 VAL A 169 -1.140 4.304 -19.351 1.00 0.00 H -ATOM 2707 HG22 VAL A 169 -1.474 2.598 -19.164 1.00 0.00 H -ATOM 2708 HG23 VAL A 169 0.152 3.146 -19.548 1.00 0.00 H -ATOM 2709 N ARG A 170 1.515 2.157 -22.179 1.00 67.56 N -ATOM 2710 CA ARG A 170 2.953 1.943 -21.951 1.00 70.37 C -ATOM 2711 C ARG A 170 3.397 2.847 -20.769 1.00 74.80 C -ATOM 2712 O ARG A 170 2.739 3.835 -20.429 1.00 72.29 O -ATOM 2713 CB ARG A 170 3.726 2.379 -23.223 1.00 73.21 C -ATOM 2714 CG ARG A 170 3.368 1.571 -24.487 1.00 89.24 C -ATOM 2715 CD ARG A 170 4.293 1.888 -25.674 1.00105.70 C -ATOM 2716 NE ARG A 170 3.750 1.355 -26.935 1.00119.40 N -ATOM 2717 CZ ARG A 170 2.903 1.985 -27.765 1.00134.49 C -ATOM 2718 NH1 ARG A 170 2.456 3.222 -27.527 1.00120.12 N -ATOM 2719 NH2 ARG A 170 2.494 1.364 -28.871 1.00122.85 N1+ -ATOM 2720 H ARG A 170 1.281 2.947 -22.760 1.00 0.00 H -ATOM 2721 HA ARG A 170 3.164 0.894 -21.724 1.00 0.00 H -ATOM 2722 HB2 ARG A 170 3.571 3.442 -23.422 1.00 0.00 H -ATOM 2723 HB3 ARG A 170 4.797 2.266 -23.042 1.00 0.00 H -ATOM 2724 HG2 ARG A 170 3.411 0.502 -24.273 1.00 0.00 H -ATOM 2725 HG3 ARG A 170 2.334 1.786 -24.761 1.00 0.00 H -ATOM 2726 HD2 ARG A 170 4.440 2.963 -25.775 1.00 0.00 H -ATOM 2727 HD3 ARG A 170 5.282 1.459 -25.506 1.00 0.00 H -ATOM 2728 HE ARG A 170 4.052 0.426 -27.188 1.00 0.00 H -ATOM 2729 HH12 ARG A 170 1.853 3.682 -28.199 1.00 0.00 H -ATOM 2730 HH11 ARG A 170 2.764 3.715 -26.704 1.00 0.00 H -ATOM 2731 HH22 ARG A 170 1.866 1.835 -29.505 1.00 0.00 H -ATOM 2732 HH21 ARG A 170 2.818 0.433 -29.082 1.00 0.00 H -ATOM 2733 N GLU A 171 4.581 2.517 -20.220 1.00 74.50 N -ATOM 2734 CA GLU A 171 5.343 3.328 -19.256 1.00 74.23 C -ATOM 2735 C GLU A 171 6.081 4.383 -20.117 1.00 77.46 C -ATOM 2736 O GLU A 171 6.951 4.027 -20.916 1.00 79.77 O -ATOM 2737 CB GLU A 171 6.355 2.413 -18.519 1.00 78.25 C -ATOM 2738 CG GLU A 171 5.678 1.358 -17.609 1.00 89.76 C -ATOM 2739 CD GLU A 171 6.611 0.280 -17.038 1.00113.50 C -ATOM 2740 OE1 GLU A 171 7.848 0.440 -17.136 1.00107.60 O -ATOM 2741 OE2 GLU A 171 6.055 -0.704 -16.500 1.00107.56 O1- -ATOM 2742 H GLU A 171 5.071 1.707 -20.570 1.00 0.00 H -ATOM 2743 HA GLU A 171 4.680 3.805 -18.530 1.00 0.00 H -ATOM 2744 HB2 GLU A 171 7.001 1.910 -19.243 1.00 0.00 H -ATOM 2745 HB3 GLU A 171 7.018 3.028 -17.906 1.00 0.00 H -ATOM 2746 HG2 GLU A 171 5.195 1.864 -16.775 1.00 0.00 H -ATOM 2747 HG3 GLU A 171 4.886 0.843 -18.154 1.00 0.00 H -ATOM 2748 N ASH A 172 5.673 5.657 -19.967 1.00 70.23 N -ATOM 2749 CA ASH A 172 6.059 6.764 -20.853 1.00 68.85 C -ATOM 2750 C ASH A 172 6.083 8.053 -19.985 1.00 68.50 C -ATOM 2751 O ASH A 172 5.207 8.253 -19.138 1.00 66.16 O -ATOM 2752 CB ASH A 172 5.214 6.760 -22.168 1.00 69.42 C -ATOM 2753 CG ASH A 172 5.100 8.083 -22.934 1.00 81.45 C -ATOM 2754 OD1 ASH A 172 4.262 8.915 -22.526 1.00 81.04 O -ATOM 2755 OD2 ASH A 172 5.864 8.237 -23.912 1.00 89.83 O1- -ATOM 2756 H ASH A 172 4.961 5.874 -19.284 1.00 0.00 H -ATOM 2757 HA ASH A 172 7.098 6.594 -21.150 1.00 0.00 H -ATOM 2758 HB2 ASH A 172 5.594 5.991 -22.843 1.00 0.00 H -ATOM 2759 HB3 ASH A 172 4.193 6.449 -21.936 1.00 0.00 H -ATOM 2760 N GLY A 173 7.078 8.922 -20.248 1.00 63.47 N -ATOM 2761 CA GLY A 173 7.334 10.166 -19.506 1.00 61.92 C -ATOM 2762 C GLY A 173 6.492 11.373 -19.975 1.00 61.80 C -ATOM 2763 O GLY A 173 6.375 12.335 -19.215 1.00 61.49 O -ATOM 2764 H GLY A 173 7.733 8.695 -20.983 1.00 0.00 H -ATOM 2765 HA2 GLY A 173 7.183 10.010 -18.436 1.00 0.00 H -ATOM 2766 HA3 GLY A 173 8.386 10.422 -19.632 1.00 0.00 H -ATOM 2767 N ASH A 174 5.898 11.329 -21.185 1.00 55.28 N -ATOM 2768 CA ASH A 174 5.042 12.377 -21.779 1.00 52.23 C -ATOM 2769 C ASH A 174 3.545 12.124 -21.422 1.00 50.35 C -ATOM 2770 O ASH A 174 2.699 12.889 -21.891 1.00 49.00 O -ATOM 2771 CB ASH A 174 5.214 12.413 -23.326 1.00 54.90 C -ATOM 2772 CG ASH A 174 6.545 13.022 -23.789 1.00 73.36 C -ATOM 2773 OD1 ASH A 174 6.894 14.108 -23.274 1.00 75.14 O -ATOM 2774 OD2 ASH A 174 7.184 12.404 -24.668 1.00 82.10 O1- -ATOM 2775 H ASH A 174 6.000 10.495 -21.748 1.00 0.00 H -ATOM 2776 HA ASH A 174 5.299 13.352 -21.357 1.00 0.00 H -ATOM 2777 HB2 ASH A 174 5.105 11.409 -23.742 1.00 0.00 H -ATOM 2778 HB3 ASH A 174 4.437 13.016 -23.798 1.00 0.00 H -ATOM 2779 N SER A 175 3.214 11.100 -20.605 1.00 43.08 N -ATOM 2780 CA SER A 175 1.854 10.752 -20.159 1.00 39.71 C -ATOM 2781 C SER A 175 1.421 11.804 -19.094 1.00 36.74 C -ATOM 2782 O SER A 175 2.209 12.082 -18.185 1.00 35.65 O -ATOM 2783 CB SER A 175 1.879 9.343 -19.519 1.00 44.05 C -ATOM 2784 OG SER A 175 2.041 8.343 -20.508 1.00 56.19 O -ATOM 2785 H SER A 175 3.955 10.510 -20.255 1.00 0.00 H -ATOM 2786 HA SER A 175 1.198 10.740 -21.030 1.00 0.00 H -ATOM 2787 HB2 SER A 175 2.672 9.251 -18.774 1.00 0.00 H -ATOM 2788 HB3 SER A 175 0.940 9.137 -19.003 1.00 0.00 H -ATOM 2789 HG SER A 175 2.867 8.503 -20.979 1.00 0.00 H -ATOM 2790 N PRO A 176 0.184 12.364 -19.204 1.00 30.99 N -ATOM 2791 CA PRO A 176 -0.329 13.381 -18.257 1.00 29.59 C -ATOM 2792 C PRO A 176 -0.828 12.696 -16.954 1.00 32.01 C -ATOM 2793 O PRO A 176 -2.030 12.505 -16.761 1.00 29.67 O -ATOM 2794 CB PRO A 176 -1.444 14.090 -19.057 1.00 29.56 C -ATOM 2795 CG PRO A 176 -1.985 13.016 -19.988 1.00 33.51 C -ATOM 2796 CD PRO A 176 -0.745 12.193 -20.331 1.00 30.17 C -ATOM 2797 HA PRO A 176 0.445 14.105 -18.002 1.00 0.00 H -ATOM 2798 HB2 PRO A 176 -2.220 14.549 -18.442 1.00 0.00 H -ATOM 2799 HB3 PRO A 176 -1.004 14.891 -19.653 1.00 0.00 H -ATOM 2800 HG2 PRO A 176 -2.703 12.403 -19.446 1.00 0.00 H -ATOM 2801 HG3 PRO A 176 -2.493 13.414 -20.866 1.00 0.00 H -ATOM 2802 HD3 PRO A 176 -0.278 12.591 -21.234 1.00 0.00 H -ATOM 2803 HD2 PRO A 176 -1.004 11.149 -20.510 1.00 0.00 H -ATOM 2804 N VAL A 177 0.134 12.325 -16.086 1.00 29.66 N -ATOM 2805 CA VAL A 177 -0.040 11.518 -14.865 1.00 29.04 C -ATOM 2806 C VAL A 177 -0.854 12.266 -13.771 1.00 30.30 C -ATOM 2807 O VAL A 177 -1.557 11.590 -13.022 1.00 30.19 O -ATOM 2808 CB VAL A 177 1.322 11.068 -14.246 1.00 34.62 C -ATOM 2809 CG1 VAL A 177 2.038 10.056 -15.162 1.00 34.92 C -ATOM 2810 CG2 VAL A 177 2.280 12.222 -13.863 1.00 35.44 C -ATOM 2811 H VAL A 177 1.095 12.520 -16.334 1.00 0.00 H -ATOM 2812 HA VAL A 177 -0.596 10.623 -15.146 1.00 0.00 H -ATOM 2813 HB VAL A 177 1.111 10.526 -13.321 1.00 0.00 H -ATOM 2814 HG11 VAL A 177 2.942 9.666 -14.695 1.00 0.00 H -ATOM 2815 HG12 VAL A 177 1.399 9.201 -15.388 1.00 0.00 H -ATOM 2816 HG13 VAL A 177 2.334 10.505 -16.109 1.00 0.00 H -ATOM 2817 HG21 VAL A 177 3.211 11.839 -13.445 1.00 0.00 H -ATOM 2818 HG22 VAL A 177 2.539 12.830 -14.730 1.00 0.00 H -ATOM 2819 HG23 VAL A 177 1.847 12.883 -13.112 1.00 0.00 H -ATOM 2820 N PHE A 178 -0.812 13.614 -13.723 1.00 25.62 N -ATOM 2821 CA PHE A 178 -1.574 14.463 -12.783 1.00 24.82 C -ATOM 2822 C PHE A 178 -3.030 14.712 -13.283 1.00 26.45 C -ATOM 2823 O PHE A 178 -3.760 15.432 -12.601 1.00 25.78 O -ATOM 2824 CB PHE A 178 -0.810 15.797 -12.569 1.00 26.47 C -ATOM 2825 CG PHE A 178 0.566 15.654 -11.922 1.00 27.98 C -ATOM 2826 CD1 PHE A 178 0.701 15.057 -10.643 1.00 31.46 C -ATOM 2827 CD2 PHE A 178 1.731 16.124 -12.579 1.00 29.97 C -ATOM 2828 CE1 PHE A 178 1.958 14.938 -10.051 1.00 33.77 C -ATOM 2829 CE2 PHE A 178 2.980 15.994 -11.972 1.00 33.43 C -ATOM 2830 CZ PHE A 178 3.093 15.403 -10.714 1.00 32.31 C -ATOM 2831 H PHE A 178 -0.230 14.109 -14.388 1.00 0.00 H -ATOM 2832 HA PHE A 178 -1.660 13.955 -11.820 1.00 0.00 H -ATOM 2833 HB2 PHE A 178 -0.709 16.322 -13.520 1.00 0.00 H -ATOM 2834 HB3 PHE A 178 -1.388 16.469 -11.933 1.00 0.00 H -ATOM 2835 HD1 PHE A 178 -0.166 14.685 -10.120 1.00 0.00 H -ATOM 2836 HD2 PHE A 178 1.662 16.597 -13.546 1.00 0.00 H -ATOM 2837 HE1 PHE A 178 2.053 14.481 -9.077 1.00 0.00 H -ATOM 2838 HE2 PHE A 178 3.863 16.357 -12.478 1.00 0.00 H -ATOM 2839 HZ PHE A 178 4.063 15.305 -10.251 1.00 0.00 H -ATOM 2840 N TRP A 179 -3.447 14.106 -14.416 1.00 22.72 N -ATOM 2841 CA TRP A 179 -4.831 14.023 -14.914 1.00 23.65 C -ATOM 2842 C TRP A 179 -5.304 12.542 -14.935 1.00 26.48 C -ATOM 2843 O TRP A 179 -6.424 12.317 -15.394 1.00 25.01 O -ATOM 2844 CB TRP A 179 -4.936 14.682 -16.316 1.00 21.85 C -ATOM 2845 CG TRP A 179 -4.892 16.183 -16.326 1.00 23.25 C -ATOM 2846 CD1 TRP A 179 -5.966 16.998 -16.455 1.00 25.76 C -ATOM 2847 CD2 TRP A 179 -3.736 17.065 -16.184 1.00 23.75 C -ATOM 2848 NE1 TRP A 179 -5.563 18.314 -16.357 1.00 25.21 N -ATOM 2849 CE2 TRP A 179 -4.202 18.418 -16.174 1.00 27.61 C -ATOM 2850 CE3 TRP A 179 -2.336 16.863 -16.047 1.00 25.53 C -ATOM 2851 CZ2 TRP A 179 -3.330 19.513 -16.004 1.00 27.61 C -ATOM 2852 CZ3 TRP A 179 -1.451 17.956 -15.895 1.00 27.51 C -ATOM 2853 CH2 TRP A 179 -1.946 19.278 -15.874 1.00 28.26 C -ATOM 2854 H TRP A 179 -2.779 13.547 -14.929 1.00 0.00 H -ATOM 2855 HA TRP A 179 -5.515 14.540 -14.241 1.00 0.00 H -ATOM 2856 HB2 TRP A 179 -4.141 14.316 -16.967 1.00 0.00 H -ATOM 2857 HB3 TRP A 179 -5.864 14.391 -16.813 1.00 0.00 H -ATOM 2858 HD1 TRP A 179 -6.982 16.658 -16.593 1.00 0.00 H -ATOM 2859 HE1 TRP A 179 -6.204 19.101 -16.429 1.00 0.00 H -ATOM 2860 HE3 TRP A 179 -1.940 15.859 -16.055 1.00 0.00 H -ATOM 2861 HZ2 TRP A 179 -3.713 20.520 -15.973 1.00 0.00 H -ATOM 2862 HZ3 TRP A 179 -0.391 17.779 -15.794 1.00 0.00 H -ATOM 2863 HH2 TRP A 179 -1.267 20.109 -15.753 1.00 0.00 H -ATOM 2864 N TYR A 180 -4.485 11.556 -14.505 1.00 25.06 N -ATOM 2865 CA TYR A 180 -4.758 10.115 -14.655 1.00 24.40 C -ATOM 2866 C TYR A 180 -5.245 9.520 -13.313 1.00 29.09 C -ATOM 2867 O TYR A 180 -4.816 9.927 -12.231 1.00 29.03 O -ATOM 2868 CB TYR A 180 -3.481 9.381 -15.145 1.00 25.40 C -ATOM 2869 CG TYR A 180 -3.240 9.308 -16.654 1.00 26.29 C -ATOM 2870 CD1 TYR A 180 -3.982 10.091 -17.578 1.00 27.65 C -ATOM 2871 CD2 TYR A 180 -2.256 8.415 -17.148 1.00 27.90 C -ATOM 2872 CE1 TYR A 180 -3.763 9.960 -18.966 1.00 28.32 C -ATOM 2873 CE2 TYR A 180 -2.033 8.287 -18.539 1.00 27.93 C -ATOM 2874 CZ TYR A 180 -2.792 9.056 -19.450 1.00 32.15 C -ATOM 2875 OH TYR A 180 -2.589 8.929 -20.794 1.00 34.10 O -ATOM 2876 H TYR A 180 -3.593 11.793 -14.093 1.00 0.00 H -ATOM 2877 HA TYR A 180 -5.555 9.968 -15.378 1.00 0.00 H -ATOM 2878 HB2 TYR A 180 -2.602 9.822 -14.684 1.00 0.00 H -ATOM 2879 HB3 TYR A 180 -3.483 8.347 -14.794 1.00 0.00 H -ATOM 2880 HD1 TYR A 180 -4.729 10.796 -17.248 1.00 0.00 H -ATOM 2881 HD2 TYR A 180 -1.677 7.813 -16.461 1.00 0.00 H -ATOM 2882 HE1 TYR A 180 -4.349 10.555 -19.649 1.00 0.00 H -ATOM 2883 HE2 TYR A 180 -1.284 7.598 -18.902 1.00 0.00 H -ATOM 2884 HH TYR A 180 -3.110 9.559 -21.302 1.00 0.00 H -ATOM 2885 N ALA A 181 -6.115 8.501 -13.454 1.00 26.27 N -ATOM 2886 CA ALA A 181 -6.749 7.709 -12.393 1.00 27.33 C -ATOM 2887 C ALA A 181 -5.763 6.614 -11.882 1.00 31.87 C -ATOM 2888 O ALA A 181 -4.817 6.267 -12.595 1.00 30.37 O -ATOM 2889 CB ALA A 181 -7.986 7.038 -13.017 1.00 27.85 C -ATOM 2890 H ALA A 181 -6.387 8.241 -14.394 1.00 0.00 H -ATOM 2891 HA ALA A 181 -7.037 8.388 -11.595 1.00 0.00 H -ATOM 2892 HB1 ALA A 181 -8.557 6.473 -12.281 1.00 0.00 H -ATOM 2893 HB2 ALA A 181 -8.667 7.772 -13.443 1.00 0.00 H -ATOM 2894 HB3 ALA A 181 -7.709 6.361 -13.826 1.00 0.00 H -ATOM 2895 N PRO A 182 -6.000 6.061 -10.658 1.00 28.98 N -ATOM 2896 CA PRO A 182 -5.069 5.115 -9.987 1.00 30.25 C -ATOM 2897 C PRO A 182 -4.783 3.796 -10.751 1.00 34.14 C -ATOM 2898 O PRO A 182 -3.670 3.292 -10.618 1.00 33.30 O -ATOM 2899 CB PRO A 182 -5.718 4.819 -8.618 1.00 33.24 C -ATOM 2900 CG PRO A 182 -6.610 6.019 -8.362 1.00 37.12 C -ATOM 2901 CD PRO A 182 -7.113 6.382 -9.753 1.00 31.16 C -ATOM 2902 HA PRO A 182 -4.130 5.650 -9.827 1.00 0.00 H -ATOM 2903 HB2 PRO A 182 -6.335 3.919 -8.643 1.00 0.00 H -ATOM 2904 HB3 PRO A 182 -4.980 4.681 -7.825 1.00 0.00 H -ATOM 2905 HG2 PRO A 182 -7.411 5.826 -7.647 1.00 0.00 H -ATOM 2906 HG3 PRO A 182 -6.006 6.840 -7.973 1.00 0.00 H -ATOM 2907 HD3 PRO A 182 -7.422 7.423 -9.764 1.00 0.00 H -ATOM 2908 HD2 PRO A 182 -7.976 5.770 -10.022 1.00 0.00 H -ATOM 2909 N GLU A 183 -5.739 3.273 -11.548 1.00 30.48 N -ATOM 2910 CA GLU A 183 -5.588 2.052 -12.367 1.00 31.43 C -ATOM 2911 C GLU A 183 -4.770 2.327 -13.664 1.00 36.54 C -ATOM 2912 O GLU A 183 -4.338 1.358 -14.285 1.00 37.63 O -ATOM 2913 CB GLU A 183 -6.975 1.425 -12.699 1.00 32.56 C -ATOM 2914 CG GLU A 183 -7.934 2.173 -13.665 1.00 35.76 C -ATOM 2915 CD GLU A 183 -8.582 3.467 -13.159 1.00 37.74 C -ATOM 2916 OE1 GLU A 183 -8.598 3.708 -11.931 1.00 31.58 O -ATOM 2917 OE2 GLU A 183 -9.092 4.200 -14.031 1.00 25.56 O1- -ATOM 2918 H GLU A 183 -6.646 3.723 -11.601 1.00 0.00 H -ATOM 2919 HA GLU A 183 -5.033 1.315 -11.782 1.00 0.00 H -ATOM 2920 HB2 GLU A 183 -6.797 0.437 -13.128 1.00 0.00 H -ATOM 2921 HB3 GLU A 183 -7.501 1.209 -11.770 1.00 0.00 H -ATOM 2922 HG2 GLU A 183 -7.433 2.377 -14.611 1.00 0.00 H -ATOM 2923 HG3 GLU A 183 -8.760 1.505 -13.908 1.00 0.00 H -ATOM 2924 N CYS A 184 -4.543 3.598 -14.050 1.00 32.49 N -ATOM 2925 CA CYS A 184 -3.709 4.012 -15.197 1.00 32.58 C -ATOM 2926 C CYS A 184 -2.251 4.249 -14.716 1.00 37.39 C -ATOM 2927 O CYS A 184 -1.344 4.125 -15.539 1.00 38.08 O -ATOM 2928 CB CYS A 184 -4.205 5.328 -15.842 1.00 31.25 C -ATOM 2929 SG CYS A 184 -5.958 5.228 -16.283 1.00 34.42 S -ATOM 2930 H CYS A 184 -4.924 4.352 -13.493 1.00 0.00 H -ATOM 2931 HA CYS A 184 -3.708 3.232 -15.963 1.00 0.00 H -ATOM 2932 HB2 CYS A 184 -4.087 6.174 -15.165 1.00 0.00 H -ATOM 2933 HB3 CYS A 184 -3.638 5.559 -16.745 1.00 0.00 H -ATOM 2934 HG CYS A 184 -5.830 4.226 -17.158 1.00 0.00 H -ATOM 2935 N LEU A 185 -2.040 4.576 -13.424 1.00 33.94 N -ATOM 2936 CA LEU A 185 -0.734 4.861 -12.810 1.00 35.43 C -ATOM 2937 C LEU A 185 -0.128 3.557 -12.216 1.00 43.48 C -ATOM 2938 O LEU A 185 1.099 3.481 -12.142 1.00 44.33 O -ATOM 2939 CB LEU A 185 -0.935 5.880 -11.655 1.00 35.06 C -ATOM 2940 CG LEU A 185 -1.469 7.279 -12.059 1.00 37.87 C -ATOM 2941 CD1 LEU A 185 -1.768 8.129 -10.810 1.00 38.52 C -ATOM 2942 CD2 LEU A 185 -0.534 8.032 -13.022 1.00 39.19 C -ATOM 2943 H LEU A 185 -2.836 4.652 -12.807 1.00 0.00 H -ATOM 2944 HA LEU A 185 -0.036 5.265 -13.546 1.00 0.00 H -ATOM 2945 HB2 LEU A 185 -1.612 5.452 -10.912 1.00 0.00 H -ATOM 2946 HB3 LEU A 185 0.014 6.023 -11.135 1.00 0.00 H -ATOM 2947 HG LEU A 185 -2.415 7.144 -12.582 1.00 0.00 H -ATOM 2948 HD11 LEU A 185 -2.184 9.099 -11.083 1.00 0.00 H -ATOM 2949 HD12 LEU A 185 -2.494 7.638 -10.161 1.00 0.00 H -ATOM 2950 HD13 LEU A 185 -0.867 8.307 -10.222 1.00 0.00 H -ATOM 2951 HD21 LEU A 185 -0.948 9.004 -13.280 1.00 0.00 H -ATOM 2952 HD22 LEU A 185 0.446 8.209 -12.582 1.00 0.00 H -ATOM 2953 HD23 LEU A 185 -0.391 7.492 -13.958 1.00 0.00 H -ATOM 2954 N LYS A 186 -0.958 2.579 -11.792 1.00 42.49 N -ATOM 2955 CA LYS A 186 -0.551 1.372 -11.053 1.00 45.58 C -ATOM 2956 C LYS A 186 -0.609 0.169 -12.029 1.00 51.72 C -ATOM 2957 O LYS A 186 0.422 -0.476 -12.217 1.00 52.85 O -ATOM 2958 CB LYS A 186 -1.511 1.186 -9.847 1.00 49.18 C -ATOM 2959 CG LYS A 186 -1.049 0.135 -8.817 1.00 71.38 C -ATOM 2960 CD LYS A 186 -1.876 0.089 -7.511 1.00 85.44 C -ATOM 2961 CE LYS A 186 -3.336 -0.386 -7.662 1.00 97.19 C -ATOM 2962 NZ LYS A 186 -4.244 0.687 -8.107 1.00104.18 N1+ -ATOM 2963 H LYS A 186 -1.954 2.714 -11.893 1.00 0.00 H -ATOM 2964 HA LYS A 186 0.468 1.480 -10.673 1.00 0.00 H -ATOM 2965 HB2 LYS A 186 -1.606 2.141 -9.330 1.00 0.00 H -ATOM 2966 HB3 LYS A 186 -2.514 0.937 -10.196 1.00 0.00 H -ATOM 2967 HG2 LYS A 186 -1.043 -0.854 -9.277 1.00 0.00 H -ATOM 2968 HG3 LYS A 186 -0.012 0.343 -8.549 1.00 0.00 H -ATOM 2969 HD2 LYS A 186 -1.373 -0.606 -6.837 1.00 0.00 H -ATOM 2970 HD3 LYS A 186 -1.842 1.053 -7.002 1.00 0.00 H -ATOM 2971 HE2 LYS A 186 -3.395 -1.226 -8.355 1.00 0.00 H -ATOM 2972 HE3 LYS A 186 -3.708 -0.748 -6.703 1.00 0.00 H -ATOM 2973 HZ1 LYS A 186 -5.151 0.298 -8.322 1.00 0.00 H -ATOM 2974 HZ2 LYS A 186 -4.361 1.366 -7.359 1.00 0.00 H -ATOM 2975 HZ3 LYS A 186 -3.869 1.146 -8.924 1.00 0.00 H -ATOM 2976 N GLU A 187 -1.795 -0.138 -12.597 1.00 48.00 N -ATOM 2977 CA GLU A 187 -2.052 -1.324 -13.439 1.00 49.76 C -ATOM 2978 C GLU A 187 -1.792 -1.029 -14.940 1.00 53.28 C -ATOM 2979 O GLU A 187 -1.664 -1.994 -15.697 1.00 53.10 O -ATOM 2980 CB GLU A 187 -3.528 -1.774 -13.239 1.00 51.48 C -ATOM 2981 CG GLU A 187 -3.775 -2.578 -11.940 1.00 66.34 C -ATOM 2982 CD GLU A 187 -3.130 -3.972 -11.927 1.00 98.88 C -ATOM 2983 OE1 GLU A 187 -3.168 -4.641 -12.984 1.00 95.63 O -ATOM 2984 OE2 GLU A 187 -2.621 -4.353 -10.851 1.00 98.68 O1- -ATOM 2985 H GLU A 187 -2.597 0.446 -12.409 1.00 0.00 H -ATOM 2986 HA GLU A 187 -1.383 -2.139 -13.155 1.00 0.00 H -ATOM 2987 HB2 GLU A 187 -4.194 -0.912 -13.232 1.00 0.00 H -ATOM 2988 HB3 GLU A 187 -3.874 -2.372 -14.085 1.00 0.00 H -ATOM 2989 HG2 GLU A 187 -3.431 -2.003 -11.078 1.00 0.00 H -ATOM 2990 HG3 GLU A 187 -4.847 -2.719 -11.802 1.00 0.00 H -ATOM 2991 N TYR A 188 -1.733 0.254 -15.360 1.00 50.13 N -ATOM 2992 CA TYR A 188 -1.485 0.739 -16.735 1.00 50.19 C -ATOM 2993 C TYR A 188 -2.677 0.408 -17.677 1.00 52.11 C -ATOM 2994 O TYR A 188 -2.457 0.276 -18.878 1.00 53.52 O -ATOM 2995 CB TYR A 188 -0.094 0.302 -17.278 1.00 54.13 C -ATOM 2996 CG TYR A 188 1.085 0.748 -16.426 1.00 57.78 C -ATOM 2997 CD1 TYR A 188 1.782 -0.186 -15.621 1.00 62.12 C -ATOM 2998 CD2 TYR A 188 1.480 2.109 -16.421 1.00 57.80 C -ATOM 2999 CE1 TYR A 188 2.864 0.236 -14.818 1.00 64.82 C -ATOM 3000 CE2 TYR A 188 2.558 2.532 -15.611 1.00 59.85 C -ATOM 3001 CZ TYR A 188 3.252 1.596 -14.811 1.00 71.28 C -ATOM 3002 OH TYR A 188 4.303 2.002 -14.043 1.00 75.29 O -ATOM 3003 H TYR A 188 -1.889 0.980 -14.676 1.00 0.00 H -ATOM 3004 HA TYR A 188 -1.483 1.825 -16.668 1.00 0.00 H -ATOM 3005 HB2 TYR A 188 -0.057 -0.779 -17.418 1.00 0.00 H -ATOM 3006 HB3 TYR A 188 0.060 0.721 -18.273 1.00 0.00 H -ATOM 3007 HD1 TYR A 188 1.486 -1.226 -15.612 1.00 0.00 H -ATOM 3008 HD2 TYR A 188 0.953 2.832 -17.028 1.00 0.00 H -ATOM 3009 HE1 TYR A 188 3.392 -0.484 -14.209 1.00 0.00 H -ATOM 3010 HE2 TYR A 188 2.853 3.572 -15.607 1.00 0.00 H -ATOM 3011 HH TYR A 188 4.738 1.271 -13.598 1.00 0.00 H -ATOM 3012 N LYS A 189 -3.906 0.281 -17.141 1.00 44.81 N -ATOM 3013 CA LYS A 189 -5.144 0.007 -17.884 1.00 43.60 C -ATOM 3014 C LYS A 189 -5.907 1.348 -17.915 1.00 41.76 C -ATOM 3015 O LYS A 189 -6.128 1.955 -16.865 1.00 38.21 O -ATOM 3016 CB LYS A 189 -5.969 -1.049 -17.114 1.00 46.62 C -ATOM 3017 CG LYS A 189 -5.315 -2.442 -17.086 1.00 58.33 C -ATOM 3018 CD LYS A 189 -6.178 -3.481 -16.344 1.00 67.59 C -ATOM 3019 CE LYS A 189 -5.570 -4.892 -16.312 1.00 79.50 C -ATOM 3020 NZ LYS A 189 -4.274 -4.925 -15.610 1.00 87.69 N1+ -ATOM 3021 H LYS A 189 -4.020 0.434 -16.147 1.00 0.00 H -ATOM 3022 HA LYS A 189 -4.946 -0.351 -18.897 1.00 0.00 H -ATOM 3023 HB2 LYS A 189 -6.146 -0.719 -16.087 1.00 0.00 H -ATOM 3024 HB3 LYS A 189 -6.954 -1.142 -17.577 1.00 0.00 H -ATOM 3025 HG2 LYS A 189 -5.130 -2.779 -18.107 1.00 0.00 H -ATOM 3026 HG3 LYS A 189 -4.337 -2.370 -16.610 1.00 0.00 H -ATOM 3027 HD2 LYS A 189 -6.360 -3.141 -15.322 1.00 0.00 H -ATOM 3028 HD3 LYS A 189 -7.159 -3.535 -16.819 1.00 0.00 H -ATOM 3029 HE2 LYS A 189 -6.255 -5.582 -15.817 1.00 0.00 H -ATOM 3030 HE3 LYS A 189 -5.428 -5.263 -17.328 1.00 0.00 H -ATOM 3031 HZ1 LYS A 189 -3.901 -5.862 -15.618 1.00 0.00 H -ATOM 3032 HZ2 LYS A 189 -3.624 -4.298 -16.062 1.00 0.00 H -ATOM 3033 HZ3 LYS A 189 -4.379 -4.637 -14.643 1.00 0.00 H -ATOM 3034 N PHE A 190 -6.337 1.758 -19.121 1.00 36.93 N -ATOM 3035 CA PHE A 190 -7.111 2.980 -19.363 1.00 34.49 C -ATOM 3036 C PHE A 190 -8.471 2.501 -19.916 1.00 39.60 C -ATOM 3037 O PHE A 190 -8.542 1.976 -21.028 1.00 40.48 O -ATOM 3038 CB PHE A 190 -6.333 3.913 -20.323 1.00 35.26 C -ATOM 3039 CG PHE A 190 -6.816 5.353 -20.282 1.00 34.98 C -ATOM 3040 CD1 PHE A 190 -6.057 6.351 -19.619 1.00 36.30 C -ATOM 3041 CD2 PHE A 190 -8.063 5.703 -20.852 1.00 35.94 C -ATOM 3042 CE1 PHE A 190 -6.562 7.644 -19.505 1.00 35.94 C -ATOM 3043 CE2 PHE A 190 -8.546 7.000 -20.727 1.00 37.30 C -ATOM 3044 CZ PHE A 190 -7.807 7.963 -20.043 1.00 34.53 C -ATOM 3045 H PHE A 190 -6.140 1.194 -19.939 1.00 0.00 H -ATOM 3046 HA PHE A 190 -7.267 3.524 -18.428 1.00 0.00 H -ATOM 3047 HB2 PHE A 190 -5.277 3.909 -20.049 1.00 0.00 H -ATOM 3048 HB3 PHE A 190 -6.365 3.548 -21.352 1.00 0.00 H -ATOM 3049 HD1 PHE A 190 -5.102 6.111 -19.175 1.00 0.00 H -ATOM 3050 HD2 PHE A 190 -8.663 4.962 -21.357 1.00 0.00 H -ATOM 3051 HE1 PHE A 190 -5.996 8.400 -18.983 1.00 0.00 H -ATOM 3052 HE2 PHE A 190 -9.511 7.239 -21.144 1.00 0.00 H -ATOM 3053 HZ PHE A 190 -8.198 8.963 -19.930 1.00 0.00 H -ATOM 3054 N TYR A 191 -9.521 2.728 -19.109 1.00 35.49 N -ATOM 3055 CA TYR A 191 -10.938 2.420 -19.357 1.00 35.71 C -ATOM 3056 C TYR A 191 -11.626 3.691 -19.936 1.00 36.13 C -ATOM 3057 O TYR A 191 -11.002 4.741 -20.106 1.00 33.76 O -ATOM 3058 CB TYR A 191 -11.592 2.051 -17.992 1.00 37.14 C -ATOM 3059 CG TYR A 191 -11.071 0.786 -17.317 1.00 41.82 C -ATOM 3060 CD1 TYR A 191 -11.828 -0.413 -17.366 1.00 45.55 C -ATOM 3061 CD2 TYR A 191 -9.831 0.796 -16.630 1.00 42.95 C -ATOM 3062 CE1 TYR A 191 -11.336 -1.592 -16.760 1.00 48.19 C -ATOM 3063 CE2 TYR A 191 -9.338 -0.384 -16.030 1.00 44.97 C -ATOM 3064 CZ TYR A 191 -10.085 -1.581 -16.103 1.00 54.63 C -ATOM 3065 OH TYR A 191 -9.598 -2.724 -15.538 1.00 58.40 O -ATOM 3066 H TYR A 191 -9.348 3.214 -18.238 1.00 0.00 H -ATOM 3067 HA TYR A 191 -11.037 1.600 -20.067 1.00 0.00 H -ATOM 3068 HB2 TYR A 191 -11.488 2.875 -17.283 1.00 0.00 H -ATOM 3069 HB3 TYR A 191 -12.668 1.929 -18.119 1.00 0.00 H -ATOM 3070 HD1 TYR A 191 -12.778 -0.437 -17.880 1.00 0.00 H -ATOM 3071 HD2 TYR A 191 -9.247 1.703 -16.567 1.00 0.00 H -ATOM 3072 HE1 TYR A 191 -11.914 -2.503 -16.811 1.00 0.00 H -ATOM 3073 HE2 TYR A 191 -8.390 -0.367 -15.514 1.00 0.00 H -ATOM 3074 HH TYR A 191 -10.191 -3.472 -15.643 1.00 0.00 H -ATOM 3075 N TYR A 192 -12.942 3.590 -20.213 1.00 32.40 N -ATOM 3076 CA TYR A 192 -13.814 4.741 -20.533 1.00 30.87 C -ATOM 3077 C TYR A 192 -14.050 5.593 -19.254 1.00 32.51 C -ATOM 3078 O TYR A 192 -14.065 6.818 -19.356 1.00 30.72 O -ATOM 3079 CB TYR A 192 -15.166 4.249 -21.100 1.00 32.98 C -ATOM 3080 CG TYR A 192 -15.093 3.574 -22.464 1.00 35.85 C -ATOM 3081 CD1 TYR A 192 -14.647 4.301 -23.596 1.00 37.45 C -ATOM 3082 CD2 TYR A 192 -15.488 2.222 -22.615 1.00 38.07 C -ATOM 3083 CE1 TYR A 192 -14.610 3.689 -24.869 1.00 40.49 C -ATOM 3084 CE2 TYR A 192 -15.455 1.610 -23.889 1.00 40.41 C -ATOM 3085 CZ TYR A 192 -15.022 2.346 -25.015 1.00 44.30 C -ATOM 3086 OH TYR A 192 -15.002 1.756 -26.242 1.00 44.69 O -ATOM 3087 H TYR A 192 -13.410 2.704 -20.083 1.00 0.00 H -ATOM 3088 HA TYR A 192 -13.326 5.376 -21.277 1.00 0.00 H -ATOM 3089 HB2 TYR A 192 -15.646 3.574 -20.388 1.00 0.00 H -ATOM 3090 HB3 TYR A 192 -15.856 5.087 -21.202 1.00 0.00 H -ATOM 3091 HD1 TYR A 192 -14.335 5.330 -23.496 1.00 0.00 H -ATOM 3092 HD2 TYR A 192 -15.828 1.652 -21.762 1.00 0.00 H -ATOM 3093 HE1 TYR A 192 -14.274 4.254 -25.727 1.00 0.00 H -ATOM 3094 HE2 TYR A 192 -15.764 0.581 -24.000 1.00 0.00 H -ATOM 3095 HH TYR A 192 -14.576 2.298 -26.912 1.00 0.00 H -ATOM 3096 N ALA A 193 -14.129 4.963 -18.063 1.00 29.56 N -ATOM 3097 CA ALA A 193 -14.230 5.623 -16.751 1.00 27.95 C -ATOM 3098 C ALA A 193 -12.930 6.390 -16.380 1.00 27.99 C -ATOM 3099 O ALA A 193 -12.994 7.246 -15.500 1.00 26.14 O -ATOM 3100 CB ALA A 193 -14.542 4.559 -15.684 1.00 28.95 C -ATOM 3101 H ALA A 193 -14.118 3.952 -18.045 1.00 0.00 H -ATOM 3102 HA ALA A 193 -15.047 6.346 -16.787 1.00 0.00 H -ATOM 3103 HB1 ALA A 193 -14.642 5.004 -14.693 1.00 0.00 H -ATOM 3104 HB2 ALA A 193 -15.483 4.052 -15.899 1.00 0.00 H -ATOM 3105 HB3 ALA A 193 -13.764 3.795 -15.630 1.00 0.00 H -ATOM 3106 N SER A 194 -11.786 6.110 -17.034 1.00 25.39 N -ATOM 3107 CA SER A 194 -10.486 6.762 -16.799 1.00 24.95 C -ATOM 3108 C SER A 194 -10.463 8.172 -17.459 1.00 27.35 C -ATOM 3109 O SER A 194 -9.821 9.058 -16.897 1.00 26.99 O -ATOM 3110 CB SER A 194 -9.362 5.883 -17.385 1.00 28.68 C -ATOM 3111 OG SER A 194 -9.335 4.593 -16.804 1.00 33.92 O -ATOM 3112 H SER A 194 -11.793 5.403 -17.756 1.00 0.00 H -ATOM 3113 HA SER A 194 -10.317 6.874 -15.725 1.00 0.00 H -ATOM 3114 HB2 SER A 194 -9.478 5.767 -18.457 1.00 0.00 H -ATOM 3115 HB3 SER A 194 -8.390 6.343 -17.238 1.00 0.00 H -ATOM 3116 HG SER A 194 -9.129 4.664 -15.862 1.00 0.00 H -ATOM 3117 N ASH A 195 -11.211 8.403 -18.562 1.00 23.13 N -ATOM 3118 CA ASH A 195 -11.423 9.728 -19.182 1.00 22.18 C -ATOM 3119 C ASH A 195 -12.390 10.585 -18.313 1.00 25.02 C -ATOM 3120 O ASH A 195 -12.269 11.808 -18.369 1.00 23.63 O -ATOM 3121 CB ASH A 195 -12.021 9.621 -20.611 1.00 24.19 C -ATOM 3122 CG ASH A 195 -11.035 9.369 -21.756 1.00 28.00 C -ATOM 3123 OD1 ASH A 195 -9.897 9.881 -21.694 1.00 27.87 O -ATOM 3124 OD2 ASH A 195 -11.460 8.701 -22.721 1.00 31.18 O1- -ATOM 3125 H ASH A 195 -11.739 7.643 -18.968 1.00 0.00 H -ATOM 3126 HA ASH A 195 -10.466 10.255 -19.218 1.00 0.00 H -ATOM 3127 HB2 ASH A 195 -12.791 8.850 -20.627 1.00 0.00 H -ATOM 3128 HB3 ASH A 195 -12.518 10.550 -20.881 1.00 0.00 H -ATOM 3129 N VAL A 196 -13.290 9.974 -17.509 1.00 23.20 N -ATOM 3130 CA VAL A 196 -14.211 10.660 -16.576 1.00 22.46 C -ATOM 3131 C VAL A 196 -13.414 11.233 -15.369 1.00 25.25 C -ATOM 3132 O VAL A 196 -13.775 12.317 -14.908 1.00 23.49 O -ATOM 3133 CB VAL A 196 -15.332 9.704 -16.049 1.00 25.40 C -ATOM 3134 CG1 VAL A 196 -16.134 10.204 -14.819 1.00 24.52 C -ATOM 3135 CG2 VAL A 196 -16.285 9.307 -17.197 1.00 25.38 C -ATOM 3136 H VAL A 196 -13.340 8.965 -17.512 1.00 0.00 H -ATOM 3137 HA VAL A 196 -14.687 11.494 -17.096 1.00 0.00 H -ATOM 3138 HB VAL A 196 -14.860 8.784 -15.717 1.00 0.00 H -ATOM 3139 HG11 VAL A 196 -16.825 9.442 -14.473 1.00 0.00 H -ATOM 3140 HG12 VAL A 196 -15.502 10.412 -13.957 1.00 0.00 H -ATOM 3141 HG13 VAL A 196 -16.699 11.108 -15.044 1.00 0.00 H -ATOM 3142 HG21 VAL A 196 -17.010 8.562 -16.877 1.00 0.00 H -ATOM 3143 HG22 VAL A 196 -16.843 10.168 -17.568 1.00 0.00 H -ATOM 3144 HG23 VAL A 196 -15.745 8.876 -18.041 1.00 0.00 H -ATOM 3145 N TRP A 197 -12.321 10.571 -14.926 1.00 23.54 N -ATOM 3146 CA TRP A 197 -11.370 11.086 -13.922 1.00 23.20 C -ATOM 3147 C TRP A 197 -10.659 12.342 -14.481 1.00 25.99 C -ATOM 3148 O TRP A 197 -10.587 13.344 -13.768 1.00 26.38 O -ATOM 3149 CB TRP A 197 -10.367 9.982 -13.508 1.00 22.62 C -ATOM 3150 CG TRP A 197 -9.361 10.360 -12.451 1.00 22.84 C -ATOM 3151 CD1 TRP A 197 -8.316 11.199 -12.637 1.00 25.30 C -ATOM 3152 CD2 TRP A 197 -9.282 9.937 -11.053 1.00 22.79 C -ATOM 3153 NE1 TRP A 197 -7.631 11.370 -11.457 1.00 24.54 N -ATOM 3154 CE2 TRP A 197 -8.181 10.622 -10.442 1.00 26.50 C -ATOM 3155 CE3 TRP A 197 -10.018 9.045 -10.228 1.00 24.28 C -ATOM 3156 CZ2 TRP A 197 -7.849 10.456 -9.084 1.00 26.19 C -ATOM 3157 CZ3 TRP A 197 -9.688 8.863 -8.864 1.00 25.94 C -ATOM 3158 CH2 TRP A 197 -8.611 9.573 -8.289 1.00 26.22 C -ATOM 3159 H TRP A 197 -12.081 9.686 -15.349 1.00 0.00 H -ATOM 3160 HA TRP A 197 -11.919 11.398 -13.041 1.00 0.00 H -ATOM 3161 HB2 TRP A 197 -10.919 9.115 -13.144 1.00 0.00 H -ATOM 3162 HB3 TRP A 197 -9.813 9.630 -14.378 1.00 0.00 H -ATOM 3163 HD1 TRP A 197 -8.077 11.681 -13.572 1.00 0.00 H -ATOM 3164 HE1 TRP A 197 -6.816 11.969 -11.382 1.00 0.00 H -ATOM 3165 HE3 TRP A 197 -10.849 8.503 -10.650 1.00 0.00 H -ATOM 3166 HZ2 TRP A 197 -7.016 11.002 -8.674 1.00 0.00 H -ATOM 3167 HZ3 TRP A 197 -10.262 8.182 -8.255 1.00 0.00 H -ATOM 3168 HH2 TRP A 197 -8.365 9.431 -7.247 1.00 0.00 H -ATOM 3169 N SER A 198 -10.199 12.282 -15.745 1.00 23.27 N -ATOM 3170 CA SER A 198 -9.497 13.357 -16.461 1.00 22.29 C -ATOM 3171 C SER A 198 -10.449 14.555 -16.736 1.00 25.76 C -ATOM 3172 O SER A 198 -9.953 15.680 -16.751 1.00 25.35 O -ATOM 3173 CB SER A 198 -8.911 12.807 -17.780 1.00 24.31 C -ATOM 3174 OG SER A 198 -8.114 11.651 -17.589 1.00 27.11 O -ATOM 3175 H SER A 198 -10.294 11.415 -16.257 1.00 0.00 H -ATOM 3176 HA SER A 198 -8.676 13.710 -15.833 1.00 0.00 H -ATOM 3177 HB2 SER A 198 -9.708 12.548 -18.477 1.00 0.00 H -ATOM 3178 HB3 SER A 198 -8.289 13.559 -18.263 1.00 0.00 H -ATOM 3179 HG SER A 198 -7.407 11.866 -16.970 1.00 0.00 H -ATOM 3180 N PHE A 199 -11.780 14.333 -16.856 1.00 22.49 N -ATOM 3181 CA PHE A 199 -12.826 15.372 -16.930 1.00 21.87 C -ATOM 3182 C PHE A 199 -12.985 16.070 -15.554 1.00 26.76 C -ATOM 3183 O PHE A 199 -13.183 17.283 -15.555 1.00 27.22 O -ATOM 3184 CB PHE A 199 -14.188 14.783 -17.397 1.00 24.21 C -ATOM 3185 CG PHE A 199 -15.392 15.701 -17.191 1.00 25.86 C -ATOM 3186 CD1 PHE A 199 -15.494 16.912 -17.919 1.00 28.01 C -ATOM 3187 CD2 PHE A 199 -16.336 15.429 -16.168 1.00 26.70 C -ATOM 3188 CE1 PHE A 199 -16.486 17.836 -17.597 1.00 28.28 C -ATOM 3189 CE2 PHE A 199 -17.322 16.366 -15.864 1.00 28.37 C -ATOM 3190 CZ PHE A 199 -17.389 17.569 -16.568 1.00 26.26 C -ATOM 3191 H PHE A 199 -12.112 13.378 -16.848 1.00 0.00 H -ATOM 3192 HA PHE A 199 -12.518 16.124 -17.660 1.00 0.00 H -ATOM 3193 HB2 PHE A 199 -14.131 14.543 -18.456 1.00 0.00 H -ATOM 3194 HB3 PHE A 199 -14.383 13.833 -16.902 1.00 0.00 H -ATOM 3195 HD1 PHE A 199 -14.770 17.147 -18.684 1.00 0.00 H -ATOM 3196 HD2 PHE A 199 -16.267 14.519 -15.589 1.00 0.00 H -ATOM 3197 HE1 PHE A 199 -16.543 18.767 -18.138 1.00 0.00 H -ATOM 3198 HE2 PHE A 199 -18.028 16.165 -15.071 1.00 0.00 H -ATOM 3199 HZ PHE A 199 -18.149 18.293 -16.318 1.00 0.00 H -ATOM 3200 N GLY A 200 -12.888 15.341 -14.424 1.00 25.20 N -ATOM 3201 CA GLY A 200 -12.969 15.906 -13.068 1.00 24.53 C -ATOM 3202 C GLY A 200 -11.800 16.868 -12.758 1.00 25.56 C -ATOM 3203 O GLY A 200 -12.000 17.862 -12.062 1.00 24.64 O -ATOM 3204 H GLY A 200 -12.737 14.344 -14.495 1.00 0.00 H -ATOM 3205 HA2 GLY A 200 -13.924 16.420 -12.939 1.00 0.00 H -ATOM 3206 HA3 GLY A 200 -12.953 15.090 -12.346 1.00 0.00 H -ATOM 3207 N VAL A 201 -10.601 16.599 -13.311 1.00 22.27 N -ATOM 3208 CA VAL A 201 -9.396 17.437 -13.201 1.00 21.54 C -ATOM 3209 C VAL A 201 -9.459 18.596 -14.246 1.00 25.32 C -ATOM 3210 O VAL A 201 -8.937 19.666 -13.937 1.00 25.91 O -ATOM 3211 CB VAL A 201 -8.090 16.611 -13.435 1.00 24.92 C -ATOM 3212 CG1 VAL A 201 -6.799 17.432 -13.234 1.00 24.42 C -ATOM 3213 CG2 VAL A 201 -8.013 15.379 -12.510 1.00 24.24 C -ATOM 3214 H VAL A 201 -10.510 15.775 -13.889 1.00 0.00 H -ATOM 3215 HA VAL A 201 -9.344 17.869 -12.201 1.00 0.00 H -ATOM 3216 HB VAL A 201 -8.092 16.236 -14.461 1.00 0.00 H -ATOM 3217 HG11 VAL A 201 -5.908 16.830 -13.409 1.00 0.00 H -ATOM 3218 HG12 VAL A 201 -6.742 18.276 -13.917 1.00 0.00 H -ATOM 3219 HG13 VAL A 201 -6.737 17.824 -12.218 1.00 0.00 H -ATOM 3220 HG21 VAL A 201 -7.109 14.804 -12.689 1.00 0.00 H -ATOM 3221 HG22 VAL A 201 -8.016 15.675 -11.460 1.00 0.00 H -ATOM 3222 HG23 VAL A 201 -8.843 14.696 -12.662 1.00 0.00 H -ATOM 3223 N THR A 202 -10.159 18.435 -15.393 1.00 22.27 N -ATOM 3224 CA THR A 202 -10.412 19.499 -16.394 1.00 21.73 C -ATOM 3225 C THR A 202 -11.469 20.487 -15.826 1.00 24.89 C -ATOM 3226 O THR A 202 -11.286 21.688 -16.001 1.00 24.37 O -ATOM 3227 CB THR A 202 -11.001 18.948 -17.732 1.00 26.43 C -ATOM 3228 OG1 THR A 202 -10.097 18.019 -18.288 1.00 23.21 O -ATOM 3229 CG2 THR A 202 -11.218 20.005 -18.838 1.00 26.50 C -ATOM 3230 H THR A 202 -10.589 17.541 -15.581 1.00 0.00 H -ATOM 3231 HA THR A 202 -9.481 20.033 -16.599 1.00 0.00 H -ATOM 3232 HB THR A 202 -11.941 18.423 -17.562 1.00 0.00 H -ATOM 3233 HG1 THR A 202 -10.105 17.212 -17.762 1.00 0.00 H -ATOM 3234 HG21 THR A 202 -11.513 19.539 -19.779 1.00 0.00 H -ATOM 3235 HG22 THR A 202 -12.005 20.713 -18.575 1.00 0.00 H -ATOM 3236 HG23 THR A 202 -10.312 20.580 -19.025 1.00 0.00 H -ATOM 3237 N LEU A 203 -12.501 19.993 -15.106 1.00 21.38 N -ATOM 3238 CA LEU A 203 -13.546 20.764 -14.408 1.00 21.26 C -ATOM 3239 C LEU A 203 -12.906 21.581 -13.255 1.00 25.55 C -ATOM 3240 O LEU A 203 -13.267 22.746 -13.101 1.00 24.92 O -ATOM 3241 CB LEU A 203 -14.636 19.784 -13.891 1.00 21.18 C -ATOM 3242 CG LEU A 203 -15.880 20.421 -13.217 1.00 26.34 C -ATOM 3243 CD1 LEU A 203 -16.606 21.417 -14.136 1.00 27.66 C -ATOM 3244 CD2 LEU A 203 -16.856 19.335 -12.728 1.00 28.91 C -ATOM 3245 H LEU A 203 -12.590 18.988 -15.026 1.00 0.00 H -ATOM 3246 HA LEU A 203 -13.985 21.452 -15.133 1.00 0.00 H -ATOM 3247 HB2 LEU A 203 -14.982 19.180 -14.732 1.00 0.00 H -ATOM 3248 HB3 LEU A 203 -14.182 19.075 -13.197 1.00 0.00 H -ATOM 3249 HG LEU A 203 -15.552 20.970 -12.335 1.00 0.00 H -ATOM 3250 HD11 LEU A 203 -17.519 21.797 -13.675 1.00 0.00 H -ATOM 3251 HD12 LEU A 203 -15.985 22.281 -14.373 1.00 0.00 H -ATOM 3252 HD13 LEU A 203 -16.875 20.934 -15.071 1.00 0.00 H -ATOM 3253 HD21 LEU A 203 -17.702 19.774 -12.198 1.00 0.00 H -ATOM 3254 HD22 LEU A 203 -17.253 18.750 -13.559 1.00 0.00 H -ATOM 3255 HD23 LEU A 203 -16.371 18.642 -12.040 1.00 0.00 H -ATOM 3256 N TYR A 204 -11.919 21.008 -12.532 1.00 23.80 N -ATOM 3257 CA TYR A 204 -11.118 21.666 -11.485 1.00 23.59 C -ATOM 3258 C TYR A 204 -10.302 22.842 -12.090 1.00 28.07 C -ATOM 3259 O TYR A 204 -10.286 23.908 -11.477 1.00 28.26 O -ATOM 3260 CB TYR A 204 -10.217 20.623 -10.775 1.00 24.03 C -ATOM 3261 CG TYR A 204 -9.186 21.194 -9.812 1.00 25.49 C -ATOM 3262 CD1 TYR A 204 -9.591 21.736 -8.569 1.00 27.64 C -ATOM 3263 CD2 TYR A 204 -7.823 21.254 -10.192 1.00 25.28 C -ATOM 3264 CE1 TYR A 204 -8.643 22.351 -7.722 1.00 27.61 C -ATOM 3265 CE2 TYR A 204 -6.872 21.849 -9.335 1.00 25.84 C -ATOM 3266 CZ TYR A 204 -7.286 22.406 -8.103 1.00 31.24 C -ATOM 3267 OH TYR A 204 -6.385 23.017 -7.285 1.00 30.99 O -ATOM 3268 H TYR A 204 -11.687 20.041 -12.712 1.00 0.00 H -ATOM 3269 HA TYR A 204 -11.803 22.086 -10.744 1.00 0.00 H -ATOM 3270 HB2 TYR A 204 -10.838 19.914 -10.229 1.00 0.00 H -ATOM 3271 HB3 TYR A 204 -9.695 20.020 -11.515 1.00 0.00 H -ATOM 3272 HD1 TYR A 204 -10.631 21.719 -8.279 1.00 0.00 H -ATOM 3273 HD2 TYR A 204 -7.508 20.856 -11.145 1.00 0.00 H -ATOM 3274 HE1 TYR A 204 -8.956 22.802 -6.793 1.00 0.00 H -ATOM 3275 HE2 TYR A 204 -5.835 21.881 -9.634 1.00 0.00 H -ATOM 3276 HH TYR A 204 -5.537 23.146 -7.723 1.00 0.00 H -ATOM 3277 N GLU A 205 -9.709 22.667 -13.292 1.00 24.82 N -ATOM 3278 CA GLU A 205 -8.985 23.712 -14.037 1.00 23.87 C -ATOM 3279 C GLU A 205 -9.939 24.856 -14.470 1.00 29.02 C -ATOM 3280 O GLU A 205 -9.508 26.004 -14.412 1.00 29.63 O -ATOM 3281 CB GLU A 205 -8.261 23.130 -15.270 1.00 24.44 C -ATOM 3282 CG GLU A 205 -7.001 22.309 -14.939 1.00 27.04 C -ATOM 3283 CD GLU A 205 -6.312 21.829 -16.216 1.00 39.48 C -ATOM 3284 OE1 GLU A 205 -6.813 20.855 -16.820 1.00 26.77 O -ATOM 3285 OE2 GLU A 205 -5.303 22.468 -16.588 1.00 32.38 O1- -ATOM 3286 H GLU A 205 -9.757 21.762 -13.739 1.00 0.00 H -ATOM 3287 HA GLU A 205 -8.227 24.138 -13.379 1.00 0.00 H -ATOM 3288 HB2 GLU A 205 -8.948 22.525 -15.861 1.00 0.00 H -ATOM 3289 HB3 GLU A 205 -7.959 23.948 -15.928 1.00 0.00 H -ATOM 3290 HG2 GLU A 205 -6.306 22.917 -14.358 1.00 0.00 H -ATOM 3291 HG3 GLU A 205 -7.238 21.450 -14.315 1.00 0.00 H -ATOM 3292 N LEU A 206 -11.208 24.570 -14.838 1.00 26.56 N -ATOM 3293 CA LEU A 206 -12.177 25.579 -15.310 1.00 27.12 C -ATOM 3294 C LEU A 206 -12.637 26.469 -14.122 1.00 29.23 C -ATOM 3295 O LEU A 206 -12.693 27.686 -14.299 1.00 30.58 O -ATOM 3296 CB LEU A 206 -13.407 24.918 -15.993 1.00 27.75 C -ATOM 3297 CG LEU A 206 -13.167 24.086 -17.287 1.00 33.45 C -ATOM 3298 CD1 LEU A 206 -14.408 24.106 -18.200 1.00 34.25 C -ATOM 3299 CD2 LEU A 206 -11.896 24.454 -18.081 1.00 37.20 C -ATOM 3300 H LEU A 206 -11.513 23.606 -14.862 1.00 0.00 H -ATOM 3301 HA LEU A 206 -11.685 26.228 -16.038 1.00 0.00 H -ATOM 3302 HB2 LEU A 206 -13.948 24.295 -15.277 1.00 0.00 H -ATOM 3303 HB3 LEU A 206 -14.107 25.718 -16.240 1.00 0.00 H -ATOM 3304 HG LEU A 206 -13.050 23.050 -16.979 1.00 0.00 H -ATOM 3305 HD11 LEU A 206 -14.284 23.448 -19.061 1.00 0.00 H -ATOM 3306 HD12 LEU A 206 -15.300 23.774 -17.665 1.00 0.00 H -ATOM 3307 HD13 LEU A 206 -14.604 25.110 -18.578 1.00 0.00 H -ATOM 3308 HD21 LEU A 206 -11.800 23.838 -18.975 1.00 0.00 H -ATOM 3309 HD22 LEU A 206 -11.904 25.499 -18.388 1.00 0.00 H -ATOM 3310 HD23 LEU A 206 -10.990 24.288 -17.499 1.00 0.00 H -ATOM 3311 N LEU A 207 -12.903 25.876 -12.938 1.00 26.35 N -ATOM 3312 CA LEU A 207 -13.382 26.569 -11.726 1.00 28.85 C -ATOM 3313 C LEU A 207 -12.228 27.332 -11.005 1.00 32.34 C -ATOM 3314 O LEU A 207 -12.542 28.279 -10.283 1.00 33.48 O -ATOM 3315 CB LEU A 207 -14.055 25.547 -10.761 1.00 29.95 C -ATOM 3316 CG LEU A 207 -15.566 25.257 -10.978 1.00 37.01 C -ATOM 3317 CD1 LEU A 207 -16.458 26.510 -10.926 1.00 41.99 C -ATOM 3318 CD2 LEU A 207 -15.874 24.408 -12.220 1.00 37.43 C -ATOM 3319 H LEU A 207 -12.826 24.870 -12.868 1.00 0.00 H -ATOM 3320 HA LEU A 207 -14.110 27.327 -12.017 1.00 0.00 H -ATOM 3321 HB2 LEU A 207 -13.503 24.605 -10.771 1.00 0.00 H -ATOM 3322 HB3 LEU A 207 -13.972 25.905 -9.734 1.00 0.00 H -ATOM 3323 HG LEU A 207 -15.871 24.644 -10.131 1.00 0.00 H -ATOM 3324 HD11 LEU A 207 -17.509 26.224 -10.891 1.00 0.00 H -ATOM 3325 HD12 LEU A 207 -16.259 27.105 -10.036 1.00 0.00 H -ATOM 3326 HD13 LEU A 207 -16.327 27.150 -11.800 1.00 0.00 H -ATOM 3327 HD21 LEU A 207 -16.948 24.257 -12.340 1.00 0.00 H -ATOM 3328 HD22 LEU A 207 -15.500 24.865 -13.135 1.00 0.00 H -ATOM 3329 HD23 LEU A 207 -15.435 23.418 -12.121 1.00 0.00 H -ATOM 3330 N THR A 208 -10.942 26.977 -11.219 1.00 28.49 N -ATOM 3331 CA THR A 208 -9.764 27.746 -10.749 1.00 28.46 C -ATOM 3332 C THR A 208 -9.347 28.828 -11.797 1.00 34.09 C -ATOM 3333 O THR A 208 -8.455 29.621 -11.487 1.00 34.31 O -ATOM 3334 CB THR A 208 -8.513 26.839 -10.500 1.00 31.93 C -ATOM 3335 OG1 THR A 208 -8.145 26.086 -11.639 1.00 28.23 O -ATOM 3336 CG2 THR A 208 -8.692 25.853 -9.334 1.00 33.74 C -ATOM 3337 H THR A 208 -10.746 26.195 -11.828 1.00 0.00 H -ATOM 3338 HA THR A 208 -9.996 28.261 -9.816 1.00 0.00 H -ATOM 3339 HB THR A 208 -7.653 27.464 -10.249 1.00 0.00 H -ATOM 3340 HG1 THR A 208 -8.723 25.317 -11.684 1.00 0.00 H -ATOM 3341 HG21 THR A 208 -7.803 25.238 -9.186 1.00 0.00 H -ATOM 3342 HG22 THR A 208 -8.888 26.376 -8.401 1.00 0.00 H -ATOM 3343 HG23 THR A 208 -9.527 25.179 -9.501 1.00 0.00 H -ATOM 3344 N HIE A 209 -9.955 28.839 -13.007 1.00 31.69 N -ATOM 3345 CA HIE A 209 -9.710 29.748 -14.150 1.00 31.97 C -ATOM 3346 C HIE A 209 -8.343 29.451 -14.831 1.00 33.69 C -ATOM 3347 O HIE A 209 -7.819 30.319 -15.529 1.00 33.12 O -ATOM 3348 CB HIE A 209 -9.949 31.241 -13.790 1.00 35.14 C -ATOM 3349 CG HIE A 209 -11.379 31.575 -13.447 1.00 40.55 C -ATOM 3350 ND1 HIE A 209 -11.930 31.341 -12.182 1.00 43.74 N -ATOM 3351 CD2 HIE A 209 -12.348 32.122 -14.261 1.00 43.94 C -ATOM 3352 CE1 HIE A 209 -13.189 31.745 -12.278 1.00 44.01 C -ATOM 3353 NE2 HIE A 209 -13.489 32.223 -13.486 1.00 44.57 N -ATOM 3354 H HIE A 209 -10.656 28.133 -13.182 1.00 0.00 H -ATOM 3355 HA HIE A 209 -10.448 29.467 -14.903 1.00 0.00 H -ATOM 3356 HB2 HIE A 209 -9.317 31.556 -12.961 1.00 0.00 H -ATOM 3357 HB3 HIE A 209 -9.669 31.882 -14.627 1.00 0.00 H -ATOM 3358 HD2 HIE A 209 -12.315 32.430 -15.296 1.00 0.00 H -ATOM 3359 HE1 HIE A 209 -13.896 31.687 -11.464 1.00 0.00 H -ATOM 3360 HE2 HIE A 209 -14.395 32.562 -13.789 1.00 0.00 H -ATOM 3361 N CYS A 210 -7.774 28.250 -14.608 1.00 28.70 N -ATOM 3362 CA CYS A 210 -6.530 27.710 -15.180 1.00 27.70 C -ATOM 3363 C CYS A 210 -5.298 28.436 -14.574 1.00 30.22 C -ATOM 3364 O CYS A 210 -4.281 28.576 -15.258 1.00 27.75 O -ATOM 3365 CB CYS A 210 -6.517 27.619 -16.723 1.00 27.86 C -ATOM 3366 SG CYS A 210 -7.899 26.605 -17.330 1.00 31.27 S -ATOM 3367 H CYS A 210 -8.271 27.606 -14.007 1.00 0.00 H -ATOM 3368 HA CYS A 210 -6.470 26.688 -14.808 1.00 0.00 H -ATOM 3369 HB2 CYS A 210 -6.571 28.604 -17.183 1.00 0.00 H -ATOM 3370 HB3 CYS A 210 -5.587 27.157 -17.057 1.00 0.00 H -ATOM 3371 HG CYS A 210 -7.687 26.842 -18.628 1.00 0.00 H -ATOM 3372 N ASH A 211 -5.396 28.863 -13.295 1.00 28.20 N -ATOM 3373 CA ASH A 211 -4.358 29.536 -12.500 1.00 29.09 C -ATOM 3374 C ASH A 211 -3.219 28.505 -12.277 1.00 32.04 C -ATOM 3375 O ASH A 211 -3.471 27.411 -11.768 1.00 29.80 O -ATOM 3376 CB ASH A 211 -4.972 30.082 -11.178 1.00 31.01 C -ATOM 3377 CG ASH A 211 -4.042 30.795 -10.181 1.00 42.86 C -ATOM 3378 OD1 ASH A 211 -2.818 30.874 -10.426 1.00 44.82 O -ATOM 3379 OD2 ASH A 211 -4.592 31.261 -9.160 1.00 55.40 O1- -ATOM 3380 H ASH A 211 -6.273 28.724 -12.815 1.00 0.00 H -ATOM 3381 HA ASH A 211 -3.988 30.381 -13.084 1.00 0.00 H -ATOM 3382 HB2 ASH A 211 -5.772 30.781 -11.419 1.00 0.00 H -ATOM 3383 HB3 ASH A 211 -5.460 29.269 -10.640 1.00 0.00 H -ATOM 3384 N SER A 212 -1.990 28.898 -12.662 1.00 30.26 N -ATOM 3385 CA SER A 212 -0.757 28.092 -12.625 1.00 30.30 C -ATOM 3386 C SER A 212 -0.342 27.714 -11.176 1.00 34.31 C -ATOM 3387 O SER A 212 0.234 26.640 -11.003 1.00 34.07 O -ATOM 3388 CB SER A 212 0.377 28.828 -13.381 1.00 35.14 C -ATOM 3389 OG SER A 212 0.741 30.060 -12.781 1.00 49.21 O -ATOM 3390 H SER A 212 -1.885 29.818 -13.070 1.00 0.00 H -ATOM 3391 HA SER A 212 -0.958 27.165 -13.166 1.00 0.00 H -ATOM 3392 HB2 SER A 212 1.265 28.198 -13.439 1.00 0.00 H -ATOM 3393 HB3 SER A 212 0.074 29.024 -14.410 1.00 0.00 H -ATOM 3394 HG SER A 212 1.403 30.489 -13.329 1.00 0.00 H -ATOM 3395 N SER A 213 -0.681 28.543 -10.165 1.00 31.40 N -ATOM 3396 CA SER A 213 -0.434 28.279 -8.734 1.00 31.93 C -ATOM 3397 C SER A 213 -1.472 27.268 -8.163 1.00 35.91 C -ATOM 3398 O SER A 213 -1.157 26.620 -7.165 1.00 36.89 O -ATOM 3399 CB SER A 213 -0.449 29.610 -7.937 1.00 36.50 C -ATOM 3400 OG SER A 213 -1.721 30.226 -7.834 1.00 42.36 O -ATOM 3401 H SER A 213 -1.175 29.400 -10.381 1.00 0.00 H -ATOM 3402 HA SER A 213 0.563 27.844 -8.630 1.00 0.00 H -ATOM 3403 HB2 SER A 213 -0.086 29.433 -6.923 1.00 0.00 H -ATOM 3404 HB3 SER A 213 0.245 30.325 -8.382 1.00 0.00 H -ATOM 3405 HG SER A 213 -2.017 30.509 -8.709 1.00 0.00 H -ATOM 3406 N GLN A 214 -2.655 27.127 -8.795 1.00 29.85 N -ATOM 3407 CA GLN A 214 -3.730 26.195 -8.419 0.61 28.09 C -ATOM 3408 C GLN A 214 -3.738 24.958 -9.363 1.00 29.55 C -ATOM 3409 O GLN A 214 -4.653 24.148 -9.220 1.00 27.73 O -ATOM 3410 CB GLN A 214 -5.094 26.931 -8.492 0.61 29.07 C -ATOM 3411 CG GLN A 214 -5.234 28.114 -7.507 0.61 37.94 C -ATOM 3412 CD GLN A 214 -6.660 28.677 -7.464 0.61 47.98 C -ATOM 3413 OE1 GLN A 214 -7.566 28.040 -6.934 0.61 45.96 O -ATOM 3414 NE2 GLN A 214 -6.872 29.875 -8.009 0.61 43.70 N -ATOM 3415 H GLN A 214 -2.826 27.675 -9.626 1.00 0.00 H -ATOM 3416 HA GLN A 214 -3.592 25.830 -7.401 0.61 0.00 H -ATOM 3417 HB2 GLN A 214 -5.276 27.277 -9.511 0.61 0.00 H -ATOM 3418 HB3 GLN A 214 -5.891 26.216 -8.276 0.61 0.00 H -ATOM 3419 HG2 GLN A 214 -4.978 27.783 -6.499 0.61 0.00 H -ATOM 3420 HG3 GLN A 214 -4.519 28.901 -7.752 0.61 0.00 H -ATOM 3421 HE22 GLN A 214 -7.798 30.276 -7.998 0.61 0.00 H -ATOM 3422 HE21 GLN A 214 -6.104 30.394 -8.424 0.61 0.00 H -ATOM 3423 N SER A 215 -2.786 24.803 -10.312 1.00 26.76 N -ATOM 3424 CA SER A 215 -2.786 23.744 -11.345 1.00 25.27 C -ATOM 3425 C SER A 215 -2.553 22.341 -10.703 1.00 28.60 C -ATOM 3426 O SER A 215 -1.865 22.260 -9.682 1.00 28.62 O -ATOM 3427 CB SER A 215 -1.749 24.067 -12.449 1.00 27.32 C -ATOM 3428 OG SER A 215 -0.395 23.946 -12.051 1.00 35.29 O -ATOM 3429 H SER A 215 -2.064 25.504 -10.395 1.00 0.00 H -ATOM 3430 HA SER A 215 -3.771 23.782 -11.801 1.00 0.00 H -ATOM 3431 HB2 SER A 215 -1.901 23.392 -13.291 1.00 0.00 H -ATOM 3432 HB3 SER A 215 -1.915 25.071 -12.840 1.00 0.00 H -ATOM 3433 HG SER A 215 -0.177 24.651 -11.432 1.00 0.00 H -ATOM 3434 N PRO A 216 -3.091 21.251 -11.323 1.00 25.17 N -ATOM 3435 CA PRO A 216 -2.938 19.858 -10.827 1.00 24.67 C -ATOM 3436 C PRO A 216 -1.479 19.402 -10.524 1.00 26.87 C -ATOM 3437 O PRO A 216 -1.292 18.859 -9.435 1.00 25.99 O -ATOM 3438 CB PRO A 216 -3.630 18.963 -11.875 1.00 26.01 C -ATOM 3439 CG PRO A 216 -4.626 19.895 -12.545 1.00 29.46 C -ATOM 3440 CD PRO A 216 -3.960 21.265 -12.508 1.00 25.85 C -ATOM 3441 HA PRO A 216 -3.519 19.809 -9.904 1.00 0.00 H -ATOM 3442 HB2 PRO A 216 -2.940 18.561 -12.617 1.00 0.00 H -ATOM 3443 HB3 PRO A 216 -4.125 18.103 -11.422 1.00 0.00 H -ATOM 3444 HG2 PRO A 216 -4.902 19.588 -13.552 1.00 0.00 H -ATOM 3445 HG3 PRO A 216 -5.538 19.926 -11.947 1.00 0.00 H -ATOM 3446 HD3 PRO A 216 -4.733 22.034 -12.487 1.00 0.00 H -ATOM 3447 HD2 PRO A 216 -3.353 21.423 -13.401 1.00 0.00 H -ATOM 3448 N PRO A 217 -0.464 19.671 -11.398 1.00 24.58 N -ATOM 3449 CA PRO A 217 0.956 19.340 -11.114 1.00 24.76 C -ATOM 3450 C PRO A 217 1.534 20.074 -9.883 1.00 29.78 C -ATOM 3451 O PRO A 217 2.243 19.434 -9.111 1.00 30.24 O -ATOM 3452 CB PRO A 217 1.727 19.737 -12.392 1.00 25.88 C -ATOM 3453 CG PRO A 217 0.669 19.741 -13.478 1.00 29.87 C -ATOM 3454 CD PRO A 217 -0.566 20.244 -12.743 1.00 25.57 C -ATOM 3455 HA PRO A 217 1.023 18.262 -10.960 1.00 0.00 H -ATOM 3456 HB2 PRO A 217 2.157 20.740 -12.320 1.00 0.00 H -ATOM 3457 HB3 PRO A 217 2.547 19.053 -12.618 1.00 0.00 H -ATOM 3458 HG2 PRO A 217 0.936 20.347 -14.345 1.00 0.00 H -ATOM 3459 HG3 PRO A 217 0.499 18.720 -13.823 1.00 0.00 H -ATOM 3460 HD3 PRO A 217 -1.468 19.974 -13.283 1.00 0.00 H -ATOM 3461 HD2 PRO A 217 -0.537 21.330 -12.666 1.00 0.00 H -ATOM 3462 N THR A 218 1.196 21.367 -9.694 1.00 26.99 N -ATOM 3463 CA THR A 218 1.666 22.226 -8.590 1.00 27.47 C -ATOM 3464 C THR A 218 1.078 21.721 -7.245 1.00 31.84 C -ATOM 3465 O THR A 218 1.845 21.584 -6.293 1.00 32.09 O -ATOM 3466 CB THR A 218 1.230 23.714 -8.785 1.00 33.90 C -ATOM 3467 OG1 THR A 218 1.900 24.230 -9.919 1.00 35.61 O -ATOM 3468 CG2 THR A 218 1.546 24.678 -7.620 1.00 32.59 C -ATOM 3469 H THR A 218 0.596 21.820 -10.369 1.00 0.00 H -ATOM 3470 HA THR A 218 2.757 22.172 -8.540 1.00 0.00 H -ATOM 3471 HB THR A 218 0.161 23.770 -8.996 1.00 0.00 H -ATOM 3472 HG1 THR A 218 2.757 24.570 -9.642 1.00 0.00 H -ATOM 3473 HG21 THR A 218 1.360 25.715 -7.896 1.00 0.00 H -ATOM 3474 HG22 THR A 218 0.927 24.469 -6.748 1.00 0.00 H -ATOM 3475 HG23 THR A 218 2.587 24.598 -7.311 1.00 0.00 H -ATOM 3476 N LYS A 219 -0.234 21.421 -7.194 1.00 27.48 N -ATOM 3477 CA LYS A 219 -0.967 21.065 -5.969 1.00 28.03 C -ATOM 3478 C LYS A 219 -0.722 19.587 -5.559 1.00 32.41 C -ATOM 3479 O LYS A 219 -0.846 19.308 -4.366 1.00 32.90 O -ATOM 3480 CB LYS A 219 -2.476 21.336 -6.186 1.00 29.00 C -ATOM 3481 CG LYS A 219 -2.840 22.824 -6.415 1.00 40.91 C -ATOM 3482 CD LYS A 219 -2.399 23.814 -5.318 1.00 47.46 C -ATOM 3483 CE LYS A 219 -3.082 23.593 -3.961 1.00 56.00 C -ATOM 3484 NZ LYS A 219 -2.524 24.492 -2.937 1.00 65.65 N1+ -ATOM 3485 H LYS A 219 -0.796 21.540 -8.027 1.00 0.00 H -ATOM 3486 HA LYS A 219 -0.611 21.682 -5.142 1.00 0.00 H -ATOM 3487 HB2 LYS A 219 -2.827 20.762 -7.045 1.00 0.00 H -ATOM 3488 HB3 LYS A 219 -3.050 20.963 -5.335 1.00 0.00 H -ATOM 3489 HG2 LYS A 219 -2.399 23.156 -7.354 1.00 0.00 H -ATOM 3490 HG3 LYS A 219 -3.915 22.906 -6.556 1.00 0.00 H -ATOM 3491 HD2 LYS A 219 -1.314 23.788 -5.212 1.00 0.00 H -ATOM 3492 HD3 LYS A 219 -2.621 24.827 -5.649 1.00 0.00 H -ATOM 3493 HE2 LYS A 219 -4.156 23.760 -4.043 1.00 0.00 H -ATOM 3494 HE3 LYS A 219 -2.940 22.567 -3.623 1.00 0.00 H -ATOM 3495 HZ1 LYS A 219 -3.000 24.348 -2.058 1.00 0.00 H -ATOM 3496 HZ2 LYS A 219 -1.538 24.277 -2.825 1.00 0.00 H -ATOM 3497 HZ3 LYS A 219 -2.623 25.454 -3.229 1.00 0.00 H -ATOM 3498 N PHE A 220 -0.330 18.685 -6.486 1.00 27.91 N -ATOM 3499 CA PHE A 220 0.070 17.300 -6.170 1.00 26.74 C -ATOM 3500 C PHE A 220 1.576 17.246 -5.790 1.00 30.76 C -ATOM 3501 O PHE A 220 1.903 16.437 -4.925 1.00 31.53 O -ATOM 3502 CB PHE A 220 -0.212 16.346 -7.361 1.00 27.18 C -ATOM 3503 CG PHE A 220 -1.661 15.892 -7.540 1.00 27.38 C -ATOM 3504 CD1 PHE A 220 -2.380 15.314 -6.461 1.00 29.59 C -ATOM 3505 CD2 PHE A 220 -2.294 15.978 -8.806 1.00 28.32 C -ATOM 3506 CE1 PHE A 220 -3.685 14.859 -6.649 1.00 30.31 C -ATOM 3507 CE2 PHE A 220 -3.596 15.513 -8.975 1.00 29.39 C -ATOM 3508 CZ PHE A 220 -4.288 14.953 -7.903 1.00 28.52 C -ATOM 3509 H PHE A 220 -0.244 18.969 -7.452 1.00 0.00 H -ATOM 3510 HA PHE A 220 -0.483 16.942 -5.300 1.00 0.00 H -ATOM 3511 HB2 PHE A 220 0.150 16.797 -8.287 1.00 0.00 H -ATOM 3512 HB3 PHE A 220 0.367 15.428 -7.247 1.00 0.00 H -ATOM 3513 HD1 PHE A 220 -1.920 15.206 -5.490 1.00 0.00 H -ATOM 3514 HD2 PHE A 220 -1.770 16.391 -9.652 1.00 0.00 H -ATOM 3515 HE1 PHE A 220 -4.229 14.422 -5.824 1.00 0.00 H -ATOM 3516 HE2 PHE A 220 -4.069 15.585 -9.943 1.00 0.00 H -ATOM 3517 HZ PHE A 220 -5.297 14.594 -8.042 1.00 0.00 H -ATOM 3518 N LEU A 221 2.460 18.102 -6.351 1.00 27.77 N -ATOM 3519 CA LEU A 221 3.899 18.164 -5.997 1.00 28.51 C -ATOM 3520 C LEU A 221 4.130 18.950 -4.673 1.00 34.25 C -ATOM 3521 O LEU A 221 5.244 18.881 -4.152 1.00 34.88 O -ATOM 3522 CB LEU A 221 4.716 18.798 -7.155 1.00 28.11 C -ATOM 3523 CG LEU A 221 4.941 17.864 -8.374 1.00 32.10 C -ATOM 3524 CD1 LEU A 221 5.501 18.650 -9.573 1.00 30.45 C -ATOM 3525 CD2 LEU A 221 5.851 16.660 -8.055 1.00 36.17 C -ATOM 3526 H LEU A 221 2.148 18.755 -7.058 1.00 0.00 H -ATOM 3527 HA LEU A 221 4.270 17.155 -5.814 1.00 0.00 H -ATOM 3528 HB2 LEU A 221 4.227 19.720 -7.472 1.00 0.00 H -ATOM 3529 HB3 LEU A 221 5.700 19.114 -6.800 1.00 0.00 H -ATOM 3530 HG LEU A 221 3.972 17.467 -8.679 1.00 0.00 H -ATOM 3531 HD11 LEU A 221 5.595 18.013 -10.454 1.00 0.00 H -ATOM 3532 HD12 LEU A 221 4.852 19.482 -9.846 1.00 0.00 H -ATOM 3533 HD13 LEU A 221 6.488 19.061 -9.354 1.00 0.00 H -ATOM 3534 HD21 LEU A 221 6.025 16.053 -8.944 1.00 0.00 H -ATOM 3535 HD22 LEU A 221 6.825 16.983 -7.687 1.00 0.00 H -ATOM 3536 HD23 LEU A 221 5.415 15.998 -7.307 1.00 0.00 H -ATOM 3537 N GLU A 222 3.105 19.627 -4.114 1.00 32.96 N -ATOM 3538 CA GLU A 222 3.087 20.184 -2.749 1.00 35.44 C -ATOM 3539 C GLU A 222 2.792 19.056 -1.717 1.00 38.81 C -ATOM 3540 O GLU A 222 3.280 19.166 -0.592 1.00 38.69 O -ATOM 3541 CB GLU A 222 1.979 21.263 -2.652 1.00 36.99 C -ATOM 3542 CG GLU A 222 2.390 22.644 -3.217 1.00 47.30 C -ATOM 3543 CD GLU A 222 1.236 23.646 -3.382 1.00 70.21 C -ATOM 3544 OE1 GLU A 222 0.114 23.364 -2.902 1.00 64.58 O -ATOM 3545 OE2 GLU A 222 1.499 24.703 -3.996 1.00 65.32 O1- -ATOM 3546 H GLU A 222 2.225 19.663 -4.608 1.00 0.00 H -ATOM 3547 HA GLU A 222 4.053 20.632 -2.506 1.00 0.00 H -ATOM 3548 HB2 GLU A 222 1.084 20.903 -3.164 1.00 0.00 H -ATOM 3549 HB3 GLU A 222 1.682 21.415 -1.611 1.00 0.00 H -ATOM 3550 HG2 GLU A 222 3.139 23.095 -2.566 1.00 0.00 H -ATOM 3551 HG3 GLU A 222 2.874 22.523 -4.184 1.00 0.00 H -ATOM 3552 N LEU A 223 2.043 17.998 -2.097 1.00 35.92 N -ATOM 3553 CA LEU A 223 1.673 16.857 -1.238 1.00 37.14 C -ATOM 3554 C LEU A 223 2.776 15.764 -1.311 1.00 40.62 C -ATOM 3555 O LEU A 223 3.035 15.131 -0.287 1.00 41.55 O -ATOM 3556 CB LEU A 223 0.332 16.249 -1.736 1.00 36.92 C -ATOM 3557 CG LEU A 223 -0.919 17.146 -1.560 1.00 41.87 C -ATOM 3558 CD1 LEU A 223 -2.128 16.554 -2.308 1.00 41.05 C -ATOM 3559 CD2 LEU A 223 -1.271 17.405 -0.083 1.00 44.81 C -ATOM 3560 H LEU A 223 1.696 17.961 -3.045 1.00 0.00 H -ATOM 3561 HA LEU A 223 1.571 17.175 -0.198 1.00 0.00 H -ATOM 3562 HB2 LEU A 223 0.428 15.983 -2.790 1.00 0.00 H -ATOM 3563 HB3 LEU A 223 0.142 15.305 -1.221 1.00 0.00 H -ATOM 3564 HG LEU A 223 -0.707 18.113 -2.015 1.00 0.00 H -ATOM 3565 HD11 LEU A 223 -2.998 17.207 -2.236 1.00 0.00 H -ATOM 3566 HD12 LEU A 223 -1.913 16.424 -3.369 1.00 0.00 H -ATOM 3567 HD13 LEU A 223 -2.411 15.580 -1.905 1.00 0.00 H -ATOM 3568 HD21 LEU A 223 -2.162 18.028 0.004 1.00 0.00 H -ATOM 3569 HD22 LEU A 223 -1.468 16.474 0.450 1.00 0.00 H -ATOM 3570 HD23 LEU A 223 -0.471 17.927 0.440 1.00 0.00 H -ATOM 3571 N ILE A 224 3.406 15.559 -2.486 1.00 34.80 N -ATOM 3572 CA ILE A 224 4.411 14.515 -2.761 1.00 34.93 C -ATOM 3573 C ILE A 224 5.828 15.049 -2.406 1.00 40.11 C -ATOM 3574 O ILE A 224 6.627 14.263 -1.897 1.00 41.74 O -ATOM 3575 CB ILE A 224 4.400 14.127 -4.286 1.00 36.99 C -ATOM 3576 CG1 ILE A 224 3.069 13.426 -4.664 1.00 35.84 C -ATOM 3577 CG2 ILE A 224 5.610 13.290 -4.782 1.00 37.00 C -ATOM 3578 CD1 ILE A 224 2.748 13.435 -6.167 1.00 35.00 C -ATOM 3579 H ILE A 224 3.130 16.116 -3.284 1.00 0.00 H -ATOM 3580 HA ILE A 224 4.207 13.621 -2.166 1.00 0.00 H -ATOM 3581 HB ILE A 224 4.434 15.061 -4.852 1.00 0.00 H -ATOM 3582 HG12 ILE A 224 3.066 12.400 -4.293 1.00 0.00 H -ATOM 3583 HG13 ILE A 224 2.235 13.913 -4.159 1.00 0.00 H -ATOM 3584 HG21 ILE A 224 5.495 12.968 -5.815 1.00 0.00 H -ATOM 3585 HG22 ILE A 224 6.539 13.857 -4.746 1.00 0.00 H -ATOM 3586 HG23 ILE A 224 5.750 12.402 -4.171 1.00 0.00 H -ATOM 3587 HD11 ILE A 224 1.745 13.049 -6.338 1.00 0.00 H -ATOM 3588 HD12 ILE A 224 2.785 14.443 -6.580 1.00 0.00 H -ATOM 3589 HD13 ILE A 224 3.439 12.817 -6.737 1.00 0.00 H -ATOM 3590 N GLY A 225 6.123 16.334 -2.686 1.00 36.74 N -ATOM 3591 CA GLY A 225 7.479 16.899 -2.700 1.00 38.59 C -ATOM 3592 C GLY A 225 8.086 16.837 -4.119 1.00 41.94 C -ATOM 3593 O GLY A 225 7.435 16.424 -5.082 1.00 39.30 O -ATOM 3594 H GLY A 225 5.400 16.925 -3.071 1.00 0.00 H -ATOM 3595 HA2 GLY A 225 7.418 17.942 -2.389 1.00 0.00 H -ATOM 3596 HA3 GLY A 225 8.137 16.393 -1.989 1.00 0.00 H -ATOM 3597 N ILE A 226 9.352 17.275 -4.240 1.00 41.30 N -ATOM 3598 CA ILE A 226 10.102 17.397 -5.510 1.00 41.02 C -ATOM 3599 C ILE A 226 11.482 16.674 -5.421 1.00 47.14 C -ATOM 3600 O ILE A 226 12.296 16.855 -6.328 1.00 48.03 O -ATOM 3601 CB ILE A 226 10.267 18.892 -5.951 1.00 43.24 C -ATOM 3602 CG1 ILE A 226 11.060 19.767 -4.937 1.00 44.89 C -ATOM 3603 CG2 ILE A 226 8.896 19.517 -6.300 1.00 42.60 C -ATOM 3604 CD1 ILE A 226 11.478 21.146 -5.473 1.00 50.07 C -ATOM 3605 H ILE A 226 9.839 17.593 -3.414 1.00 0.00 H -ATOM 3606 HA ILE A 226 9.576 16.868 -6.308 1.00 0.00 H -ATOM 3607 HB ILE A 226 10.832 18.896 -6.885 1.00 0.00 H -ATOM 3608 HG12 ILE A 226 10.476 19.898 -4.024 1.00 0.00 H -ATOM 3609 HG13 ILE A 226 11.970 19.252 -4.632 1.00 0.00 H -ATOM 3610 HG21 ILE A 226 9.001 20.502 -6.754 1.00 0.00 H -ATOM 3611 HG22 ILE A 226 8.351 18.898 -7.013 1.00 0.00 H -ATOM 3612 HG23 ILE A 226 8.267 19.628 -5.416 1.00 0.00 H -ATOM 3613 HD11 ILE A 226 12.088 21.676 -4.740 1.00 0.00 H -ATOM 3614 HD12 ILE A 226 12.066 21.055 -6.387 1.00 0.00 H -ATOM 3615 HD13 ILE A 226 10.615 21.775 -5.689 1.00 0.00 H -ATOM 3616 N ALA A 227 11.737 15.872 -4.367 1.00 42.26 N -ATOM 3617 CA ALA A 227 12.998 15.155 -4.127 1.00 43.31 C -ATOM 3618 C ALA A 227 12.622 13.748 -3.613 1.00 48.36 C -ATOM 3619 O ALA A 227 12.942 13.406 -2.474 1.00 49.43 O -ATOM 3620 CB ALA A 227 13.919 15.990 -3.213 1.00 45.24 C -ATOM 3621 H ALA A 227 11.020 15.739 -3.668 1.00 0.00 H -ATOM 3622 HA ALA A 227 13.534 14.994 -5.066 1.00 0.00 H -ATOM 3623 HB1 ALA A 227 14.856 15.470 -3.012 1.00 0.00 H -ATOM 3624 HB2 ALA A 227 14.172 16.944 -3.678 1.00 0.00 H -ATOM 3625 HB3 ALA A 227 13.447 16.205 -2.253 1.00 0.00 H -ATOM 3626 N GLN A 228 11.957 12.957 -4.479 1.00 44.35 N -ATOM 3627 CA GLN A 228 11.456 11.599 -4.197 1.00 44.30 C -ATOM 3628 C GLN A 228 12.088 10.565 -5.170 1.00 49.79 C -ATOM 3629 O GLN A 228 11.664 9.409 -5.137 1.00 49.85 O -ATOM 3630 CB GLN A 228 9.902 11.595 -4.263 1.00 44.27 C -ATOM 3631 CG GLN A 228 9.180 12.595 -3.323 1.00 53.29 C -ATOM 3632 CD GLN A 228 9.537 12.478 -1.833 1.00 72.09 C -ATOM 3633 OE1 GLN A 228 9.812 13.480 -1.179 1.00 65.48 O -ATOM 3634 NE2 GLN A 228 9.531 11.264 -1.278 1.00 65.05 N -ATOM 3635 H GLN A 228 11.763 13.307 -5.408 1.00 0.00 H -ATOM 3636 HA GLN A 228 11.766 11.279 -3.199 1.00 0.00 H -ATOM 3637 HB2 GLN A 228 9.582 11.801 -5.286 1.00 0.00 H -ATOM 3638 HB3 GLN A 228 9.529 10.592 -4.049 1.00 0.00 H -ATOM 3639 HG2 GLN A 228 9.381 13.615 -3.652 1.00 0.00 H -ATOM 3640 HG3 GLN A 228 8.104 12.468 -3.425 1.00 0.00 H -ATOM 3641 HE22 GLN A 228 9.762 11.162 -0.302 1.00 0.00 H -ATOM 3642 HE21 GLN A 228 9.301 10.447 -1.823 1.00 0.00 H -ATOM 3643 N GLY A 229 13.058 10.957 -6.023 1.00 46.41 N -ATOM 3644 CA GLY A 229 13.724 10.089 -7.003 1.00 44.66 C -ATOM 3645 C GLY A 229 12.778 9.760 -8.172 1.00 42.63 C -ATOM 3646 O GLY A 229 12.212 10.663 -8.792 1.00 37.23 O -ATOM 3647 H GLY A 229 13.356 11.922 -6.000 1.00 0.00 H -ATOM 3648 HA2 GLY A 229 14.596 10.611 -7.397 1.00 0.00 H -ATOM 3649 HA3 GLY A 229 14.094 9.184 -6.516 1.00 0.00 H -ATOM 3650 N GLN A 230 12.629 8.455 -8.461 1.00 39.82 N -ATOM 3651 CA GLN A 230 11.752 7.884 -9.500 1.00 38.37 C -ATOM 3652 C GLN A 230 10.326 7.601 -8.932 1.00 40.30 C -ATOM 3653 O GLN A 230 9.514 7.056 -9.681 1.00 41.07 O -ATOM 3654 CB GLN A 230 12.378 6.547 -9.985 1.00 41.27 C -ATOM 3655 CG GLN A 230 13.754 6.697 -10.673 1.00 52.25 C -ATOM 3656 CD GLN A 230 14.369 5.339 -11.032 1.00 66.80 C -ATOM 3657 OE1 GLN A 230 14.809 4.602 -10.152 1.00 64.29 O -ATOM 3658 NE2 GLN A 230 14.409 4.999 -12.321 1.00 50.92 N -ATOM 3659 H GLN A 230 13.123 7.775 -7.896 1.00 0.00 H -ATOM 3660 HA GLN A 230 11.664 8.568 -10.345 1.00 0.00 H -ATOM 3661 HB2 GLN A 230 12.456 5.853 -9.144 1.00 0.00 H -ATOM 3662 HB3 GLN A 230 11.703 6.066 -10.697 1.00 0.00 H -ATOM 3663 HG2 GLN A 230 13.661 7.323 -11.562 1.00 0.00 H -ATOM 3664 HG3 GLN A 230 14.455 7.211 -10.014 1.00 0.00 H -ATOM 3665 HE22 GLN A 230 14.811 4.113 -12.590 1.00 0.00 H -ATOM 3666 HE21 GLN A 230 14.041 5.617 -13.028 1.00 0.00 H -ATOM 3667 N MET A 231 10.032 7.914 -7.651 1.00 34.93 N -ATOM 3668 CA MET A 231 8.817 7.493 -6.925 1.00 34.58 C -ATOM 3669 C MET A 231 7.723 8.601 -6.955 1.00 34.58 C -ATOM 3670 O MET A 231 6.849 8.560 -6.090 1.00 34.71 O -ATOM 3671 CB MET A 231 9.191 7.148 -5.456 1.00 38.63 C -ATOM 3672 CG MET A 231 10.269 6.064 -5.294 1.00 44.95 C -ATOM 3673 SD MET A 231 10.564 5.608 -3.564 1.00 52.97 S -ATOM 3674 CE MET A 231 11.793 4.297 -3.795 1.00 51.70 C -ATOM 3675 H MET A 231 10.729 8.389 -7.093 1.00 0.00 H -ATOM 3676 HA MET A 231 8.391 6.599 -7.385 1.00 0.00 H -ATOM 3677 HB2 MET A 231 9.503 8.046 -4.922 1.00 0.00 H -ATOM 3678 HB3 MET A 231 8.300 6.798 -4.932 1.00 0.00 H -ATOM 3679 HG2 MET A 231 9.972 5.166 -5.838 1.00 0.00 H -ATOM 3680 HG3 MET A 231 11.214 6.398 -5.725 1.00 0.00 H -ATOM 3681 HE1 MET A 231 12.100 3.895 -2.829 1.00 0.00 H -ATOM 3682 HE2 MET A 231 11.378 3.483 -4.390 1.00 0.00 H -ATOM 3683 HE3 MET A 231 12.676 4.685 -4.304 1.00 0.00 H -ATOM 3684 N THR A 232 7.728 9.555 -7.912 1.00 29.62 N -ATOM 3685 CA THR A 232 6.740 10.660 -7.998 1.00 28.01 C -ATOM 3686 C THR A 232 5.335 10.096 -8.364 1.00 30.48 C -ATOM 3687 O THR A 232 4.365 10.514 -7.734 1.00 31.09 O -ATOM 3688 CB THR A 232 7.108 11.730 -9.074 1.00 32.05 C -ATOM 3689 OG1 THR A 232 8.415 12.217 -8.828 1.00 33.94 O -ATOM 3690 CG2 THR A 232 6.183 12.966 -9.121 1.00 34.10 C -ATOM 3691 H THR A 232 8.462 9.559 -8.607 1.00 0.00 H -ATOM 3692 HA THR A 232 6.687 11.148 -7.021 1.00 0.00 H -ATOM 3693 HB THR A 232 7.129 11.269 -10.063 1.00 0.00 H -ATOM 3694 HG1 THR A 232 8.370 12.861 -8.111 1.00 0.00 H -ATOM 3695 HG21 THR A 232 6.530 13.692 -9.857 1.00 0.00 H -ATOM 3696 HG22 THR A 232 5.162 12.701 -9.399 1.00 0.00 H -ATOM 3697 HG23 THR A 232 6.137 13.469 -8.155 1.00 0.00 H -ATOM 3698 N VAL A 233 5.249 9.133 -9.307 1.00 28.98 N -ATOM 3699 CA VAL A 233 4.004 8.471 -9.752 1.00 29.28 C -ATOM 3700 C VAL A 233 3.541 7.411 -8.707 1.00 34.54 C -ATOM 3701 O VAL A 233 2.330 7.222 -8.580 1.00 33.68 O -ATOM 3702 CB VAL A 233 4.195 7.786 -11.149 1.00 33.58 C -ATOM 3703 CG1 VAL A 233 3.113 6.760 -11.575 1.00 33.26 C -ATOM 3704 CG2 VAL A 233 4.338 8.861 -12.247 1.00 32.88 C -ATOM 3705 H VAL A 233 6.093 8.832 -9.776 1.00 0.00 H -ATOM 3706 HA VAL A 233 3.215 9.220 -9.844 1.00 0.00 H -ATOM 3707 HB VAL A 233 5.137 7.236 -11.129 1.00 0.00 H -ATOM 3708 HG11 VAL A 233 3.257 6.424 -12.602 1.00 0.00 H -ATOM 3709 HG12 VAL A 233 3.130 5.865 -10.952 1.00 0.00 H -ATOM 3710 HG13 VAL A 233 2.116 7.191 -11.504 1.00 0.00 H -ATOM 3711 HG21 VAL A 233 4.519 8.415 -13.225 1.00 0.00 H -ATOM 3712 HG22 VAL A 233 3.434 9.466 -12.325 1.00 0.00 H -ATOM 3713 HG23 VAL A 233 5.168 9.540 -12.046 1.00 0.00 H -ATOM 3714 N LEU A 234 4.462 6.794 -7.936 1.00 32.43 N -ATOM 3715 CA LEU A 234 4.176 5.841 -6.844 1.00 33.01 C -ATOM 3716 C LEU A 234 3.515 6.600 -5.664 1.00 36.61 C -ATOM 3717 O LEU A 234 2.517 6.112 -5.139 1.00 35.87 O -ATOM 3718 CB LEU A 234 5.499 5.155 -6.405 1.00 35.17 C -ATOM 3719 CG LEU A 234 5.405 4.144 -5.230 1.00 42.10 C -ATOM 3720 CD1 LEU A 234 4.431 2.984 -5.509 1.00 43.87 C -ATOM 3721 CD2 LEU A 234 6.800 3.611 -4.854 1.00 45.28 C -ATOM 3722 H LEU A 234 5.440 6.985 -8.103 1.00 0.00 H -ATOM 3723 HA LEU A 234 3.483 5.085 -7.219 1.00 0.00 H -ATOM 3724 HB2 LEU A 234 5.923 4.639 -7.267 1.00 0.00 H -ATOM 3725 HB3 LEU A 234 6.229 5.922 -6.141 1.00 0.00 H -ATOM 3726 HG LEU A 234 5.035 4.674 -4.351 1.00 0.00 H -ATOM 3727 HD11 LEU A 234 4.396 2.292 -4.666 1.00 0.00 H -ATOM 3728 HD12 LEU A 234 3.413 3.341 -5.663 1.00 0.00 H -ATOM 3729 HD13 LEU A 234 4.726 2.419 -6.393 1.00 0.00 H -ATOM 3730 HD21 LEU A 234 6.749 2.946 -3.992 1.00 0.00 H -ATOM 3731 HD22 LEU A 234 7.249 3.054 -5.677 1.00 0.00 H -ATOM 3732 HD23 LEU A 234 7.478 4.424 -4.594 1.00 0.00 H -ATOM 3733 N ARG A 235 4.041 7.784 -5.300 1.00 32.17 N -ATOM 3734 CA ARG A 235 3.571 8.629 -4.190 1.00 32.60 C -ATOM 3735 C ARG A 235 2.272 9.388 -4.587 1.00 33.95 C -ATOM 3736 O ARG A 235 1.480 9.681 -3.691 1.00 32.13 O -ATOM 3737 CB ARG A 235 4.712 9.603 -3.816 1.00 37.04 C -ATOM 3738 CG ARG A 235 4.728 10.041 -2.334 1.00 59.77 C -ATOM 3739 CD ARG A 235 6.130 10.364 -1.781 1.00 74.58 C -ATOM 3740 NE ARG A 235 7.041 9.207 -1.889 1.00 91.08 N -ATOM 3741 CZ ARG A 235 7.130 8.168 -1.044 1.00107.84 C -ATOM 3742 NH1 ARG A 235 6.409 8.100 0.078 1.00 95.16 N -ATOM 3743 NH2 ARG A 235 7.960 7.166 -1.335 1.00 96.44 N1+ -ATOM 3744 H ARG A 235 4.862 8.120 -5.786 1.00 0.00 H -ATOM 3745 HA ARG A 235 3.364 7.975 -3.341 1.00 0.00 H -ATOM 3746 HB2 ARG A 235 5.656 9.097 -4.006 1.00 0.00 H -ATOM 3747 HB3 ARG A 235 4.726 10.467 -4.481 1.00 0.00 H -ATOM 3748 HG2 ARG A 235 4.074 10.905 -2.207 1.00 0.00 H -ATOM 3749 HG3 ARG A 235 4.306 9.251 -1.711 1.00 0.00 H -ATOM 3750 HD2 ARG A 235 6.562 11.203 -2.322 1.00 0.00 H -ATOM 3751 HD3 ARG A 235 6.062 10.678 -0.739 1.00 0.00 H -ATOM 3752 HE ARG A 235 7.590 9.161 -2.734 1.00 0.00 H -ATOM 3753 HH12 ARG A 235 6.480 7.294 0.679 1.00 0.00 H -ATOM 3754 HH11 ARG A 235 5.763 8.842 0.301 1.00 0.00 H -ATOM 3755 HH22 ARG A 235 8.018 6.370 -0.719 1.00 0.00 H -ATOM 3756 HH21 ARG A 235 8.509 7.182 -2.182 1.00 0.00 H -ATOM 3757 N LEU A 236 2.032 9.621 -5.897 1.00 29.63 N -ATOM 3758 CA LEU A 236 0.787 10.151 -6.481 1.00 27.63 C -ATOM 3759 C LEU A 236 -0.314 9.061 -6.434 1.00 32.17 C -ATOM 3760 O LEU A 236 -1.460 9.414 -6.171 1.00 30.80 O -ATOM 3761 CB LEU A 236 1.058 10.574 -7.948 1.00 26.83 C -ATOM 3762 CG LEU A 236 -0.116 11.213 -8.733 1.00 30.02 C -ATOM 3763 CD1 LEU A 236 -0.680 12.478 -8.062 1.00 28.94 C -ATOM 3764 CD2 LEU A 236 0.324 11.506 -10.178 1.00 30.63 C -ATOM 3765 H LEU A 236 2.741 9.358 -6.568 1.00 0.00 H -ATOM 3766 HA LEU A 236 0.469 11.016 -5.898 1.00 0.00 H -ATOM 3767 HB2 LEU A 236 1.888 11.282 -7.958 1.00 0.00 H -ATOM 3768 HB3 LEU A 236 1.413 9.709 -8.508 1.00 0.00 H -ATOM 3769 HG LEU A 236 -0.932 10.491 -8.792 1.00 0.00 H -ATOM 3770 HD11 LEU A 236 -1.504 12.896 -8.640 1.00 0.00 H -ATOM 3771 HD12 LEU A 236 -1.070 12.272 -7.065 1.00 0.00 H -ATOM 3772 HD13 LEU A 236 0.083 13.249 -7.973 1.00 0.00 H -ATOM 3773 HD21 LEU A 236 -0.453 12.030 -10.729 1.00 0.00 H -ATOM 3774 HD22 LEU A 236 1.216 12.130 -10.208 1.00 0.00 H -ATOM 3775 HD23 LEU A 236 0.548 10.586 -10.719 1.00 0.00 H -ATOM 3776 N THR A 237 0.027 7.769 -6.624 1.00 30.97 N -ATOM 3777 CA THR A 237 -0.910 6.633 -6.527 1.00 31.58 C -ATOM 3778 C THR A 237 -1.255 6.406 -5.028 1.00 35.29 C -ATOM 3779 O THR A 237 -2.435 6.231 -4.737 1.00 34.46 O -ATOM 3780 CB THR A 237 -0.300 5.309 -7.085 1.00 40.93 C -ATOM 3781 OG1 THR A 237 -0.001 5.489 -8.456 1.00 39.64 O -ATOM 3782 CG2 THR A 237 -1.228 4.076 -7.025 1.00 41.19 C -ATOM 3783 H THR A 237 0.988 7.538 -6.833 1.00 0.00 H -ATOM 3784 HA THR A 237 -1.824 6.867 -7.079 1.00 0.00 H -ATOM 3785 HB THR A 237 0.634 5.064 -6.577 1.00 0.00 H -ATOM 3786 HG1 THR A 237 0.833 5.965 -8.530 1.00 0.00 H -ATOM 3787 HG21 THR A 237 -0.743 3.206 -7.467 1.00 0.00 H -ATOM 3788 HG22 THR A 237 -1.480 3.803 -6.000 1.00 0.00 H -ATOM 3789 HG23 THR A 237 -2.163 4.247 -7.560 1.00 0.00 H -ATOM 3790 N GLU A 238 -0.271 6.486 -4.105 1.00 33.17 N -ATOM 3791 CA GLU A 238 -0.421 6.256 -2.656 1.00 34.02 C -ATOM 3792 C GLU A 238 -1.365 7.293 -1.991 1.00 37.28 C -ATOM 3793 O GLU A 238 -2.191 6.864 -1.187 1.00 35.08 O -ATOM 3794 CB GLU A 238 0.964 6.224 -1.968 1.00 36.83 C -ATOM 3795 CG GLU A 238 1.738 4.902 -2.204 1.00 44.51 C -ATOM 3796 CD GLU A 238 3.212 4.908 -1.770 1.00 58.80 C -ATOM 3797 OE1 GLU A 238 3.817 3.816 -1.846 1.00 49.54 O -ATOM 3798 OE2 GLU A 238 3.723 5.980 -1.373 1.00 45.75 O1- -ATOM 3799 H GLU A 238 0.678 6.635 -4.423 1.00 0.00 H -ATOM 3800 HA GLU A 238 -0.884 5.274 -2.526 1.00 0.00 H -ATOM 3801 HB2 GLU A 238 1.548 7.084 -2.300 1.00 0.00 H -ATOM 3802 HB3 GLU A 238 0.851 6.349 -0.890 1.00 0.00 H -ATOM 3803 HG2 GLU A 238 1.230 4.092 -1.678 1.00 0.00 H -ATOM 3804 HG3 GLU A 238 1.709 4.628 -3.258 1.00 0.00 H -ATOM 3805 N LEU A 239 -1.290 8.598 -2.344 1.00 34.11 N -ATOM 3806 CA LEU A 239 -2.180 9.647 -1.793 1.00 33.79 C -ATOM 3807 C LEU A 239 -3.625 9.499 -2.344 1.00 35.23 C -ATOM 3808 O LEU A 239 -4.562 9.746 -1.586 1.00 34.81 O -ATOM 3809 CB LEU A 239 -1.585 11.075 -1.979 1.00 33.69 C -ATOM 3810 CG LEU A 239 -1.512 11.686 -3.406 1.00 37.11 C -ATOM 3811 CD1 LEU A 239 -2.804 12.417 -3.827 1.00 35.27 C -ATOM 3812 CD2 LEU A 239 -0.323 12.658 -3.536 1.00 40.08 C -ATOM 3813 H LEU A 239 -0.588 8.901 -3.005 1.00 0.00 H -ATOM 3814 HA LEU A 239 -2.237 9.485 -0.714 1.00 0.00 H -ATOM 3815 HB2 LEU A 239 -2.112 11.771 -1.324 1.00 0.00 H -ATOM 3816 HB3 LEU A 239 -0.578 11.044 -1.565 1.00 0.00 H -ATOM 3817 HG LEU A 239 -1.333 10.873 -4.106 1.00 0.00 H -ATOM 3818 HD11 LEU A 239 -2.727 12.766 -4.856 1.00 0.00 H -ATOM 3819 HD12 LEU A 239 -3.687 11.786 -3.779 1.00 0.00 H -ATOM 3820 HD13 LEU A 239 -2.996 13.286 -3.196 1.00 0.00 H -ATOM 3821 HD21 LEU A 239 -0.240 13.051 -4.550 1.00 0.00 H -ATOM 3822 HD22 LEU A 239 -0.429 13.507 -2.861 1.00 0.00 H -ATOM 3823 HD23 LEU A 239 0.622 12.169 -3.301 1.00 0.00 H -ATOM 3824 N LEU A 240 -3.800 9.048 -3.605 1.00 30.68 N -ATOM 3825 CA LEU A 240 -5.112 8.852 -4.251 1.00 29.82 C -ATOM 3826 C LEU A 240 -5.808 7.566 -3.717 1.00 37.95 C -ATOM 3827 O LEU A 240 -7.039 7.559 -3.657 1.00 37.53 O -ATOM 3828 CB LEU A 240 -4.944 8.759 -5.787 1.00 28.63 C -ATOM 3829 CG LEU A 240 -4.567 10.080 -6.502 1.00 31.65 C -ATOM 3830 CD1 LEU A 240 -4.277 9.819 -7.989 1.00 31.42 C -ATOM 3831 CD2 LEU A 240 -5.608 11.200 -6.322 1.00 31.56 C -ATOM 3832 H LEU A 240 -2.992 8.842 -4.175 1.00 0.00 H -ATOM 3833 HA LEU A 240 -5.749 9.702 -4.010 1.00 0.00 H -ATOM 3834 HB2 LEU A 240 -4.197 7.997 -6.022 1.00 0.00 H -ATOM 3835 HB3 LEU A 240 -5.874 8.401 -6.232 1.00 0.00 H -ATOM 3836 HG LEU A 240 -3.650 10.463 -6.060 1.00 0.00 H -ATOM 3837 HD11 LEU A 240 -3.981 10.740 -8.486 1.00 0.00 H -ATOM 3838 HD12 LEU A 240 -3.460 9.107 -8.117 1.00 0.00 H -ATOM 3839 HD13 LEU A 240 -5.147 9.418 -8.510 1.00 0.00 H -ATOM 3840 HD21 LEU A 240 -5.432 12.030 -7.007 1.00 0.00 H -ATOM 3841 HD22 LEU A 240 -6.625 10.844 -6.472 1.00 0.00 H -ATOM 3842 HD23 LEU A 240 -5.552 11.615 -5.320 1.00 0.00 H -ATOM 3843 N GLU A 241 -5.042 6.542 -3.286 1.00 37.30 N -ATOM 3844 CA GLU A 241 -5.528 5.309 -2.638 1.00 38.66 C -ATOM 3845 C GLU A 241 -5.860 5.573 -1.138 1.00 42.10 C -ATOM 3846 O GLU A 241 -6.690 4.839 -0.602 1.00 42.78 O -ATOM 3847 CB GLU A 241 -4.446 4.203 -2.761 1.00 41.41 C -ATOM 3848 CG GLU A 241 -4.218 3.652 -4.197 1.00 54.54 C -ATOM 3849 CD GLU A 241 -5.296 2.721 -4.770 1.00 90.90 C -ATOM 3850 OE1 GLU A 241 -6.279 2.422 -4.057 1.00 94.26 O -ATOM 3851 OE2 GLU A 241 -5.103 2.312 -5.937 1.00 91.13 O1- -ATOM 3852 H GLU A 241 -4.038 6.614 -3.381 1.00 0.00 H -ATOM 3853 HA GLU A 241 -6.442 4.972 -3.132 1.00 0.00 H -ATOM 3854 HB2 GLU A 241 -3.494 4.584 -2.384 1.00 0.00 H -ATOM 3855 HB3 GLU A 241 -4.688 3.364 -2.105 1.00 0.00 H -ATOM 3856 HG2 GLU A 241 -4.114 4.472 -4.904 1.00 0.00 H -ATOM 3857 HG3 GLU A 241 -3.274 3.107 -4.219 1.00 0.00 H -ATOM 3858 N ARG A 242 -5.293 6.625 -0.500 1.00 37.87 N -ATOM 3859 CA ARG A 242 -5.673 7.115 0.844 1.00 37.84 C -ATOM 3860 C ARG A 242 -6.929 8.037 0.765 1.00 41.63 C -ATOM 3861 O ARG A 242 -7.420 8.424 1.826 1.00 42.60 O -ATOM 3862 CB ARG A 242 -4.501 7.918 1.474 1.00 37.09 C -ATOM 3863 CG ARG A 242 -3.354 7.046 2.025 1.00 43.14 C -ATOM 3864 CD ARG A 242 -2.383 7.805 2.951 1.00 47.74 C -ATOM 3865 NE ARG A 242 -1.809 9.010 2.327 1.00 51.85 N -ATOM 3866 CZ ARG A 242 -0.684 9.102 1.608 1.00 60.61 C -ATOM 3867 NH1 ARG A 242 0.071 8.039 1.317 1.00 54.41 N -ATOM 3868 NH2 ARG A 242 -0.311 10.304 1.177 1.00 41.74 N1+ -ATOM 3869 H ARG A 242 -4.619 7.190 -0.998 1.00 0.00 H -ATOM 3870 HA ARG A 242 -5.926 6.273 1.492 1.00 0.00 H -ATOM 3871 HB2 ARG A 242 -4.103 8.639 0.759 1.00 0.00 H -ATOM 3872 HB3 ARG A 242 -4.870 8.517 2.309 1.00 0.00 H -ATOM 3873 HG2 ARG A 242 -3.775 6.215 2.593 1.00 0.00 H -ATOM 3874 HG3 ARG A 242 -2.802 6.587 1.207 1.00 0.00 H -ATOM 3875 HD2 ARG A 242 -2.909 8.118 3.854 1.00 0.00 H -ATOM 3876 HD3 ARG A 242 -1.581 7.145 3.282 1.00 0.00 H -ATOM 3877 HE ARG A 242 -2.319 9.877 2.459 1.00 0.00 H -ATOM 3878 HH12 ARG A 242 0.934 8.156 0.804 1.00 0.00 H -ATOM 3879 HH11 ARG A 242 -0.218 7.124 1.626 1.00 0.00 H -ATOM 3880 HH22 ARG A 242 0.515 10.413 0.599 1.00 0.00 H -ATOM 3881 HH21 ARG A 242 -0.892 11.107 1.397 1.00 0.00 H -ATOM 3882 N GLY A 243 -7.435 8.381 -0.438 1.00 36.22 N -ATOM 3883 CA GLY A 243 -8.628 9.213 -0.636 1.00 35.40 C -ATOM 3884 C GLY A 243 -8.345 10.731 -0.642 1.00 37.10 C -ATOM 3885 O GLY A 243 -9.306 11.500 -0.614 1.00 36.00 O -ATOM 3886 H GLY A 243 -6.988 8.020 -1.269 1.00 0.00 H -ATOM 3887 HA2 GLY A 243 -9.070 8.943 -1.595 1.00 0.00 H -ATOM 3888 HA3 GLY A 243 -9.386 8.989 0.118 1.00 0.00 H -ATOM 3889 N GLU A 244 -7.068 11.174 -0.701 1.00 32.13 N -ATOM 3890 CA GLU A 244 -6.659 12.589 -0.808 1.00 31.71 C -ATOM 3891 C GLU A 244 -6.902 13.035 -2.268 1.00 33.67 C -ATOM 3892 O GLU A 244 -6.636 12.280 -3.206 1.00 31.64 O -ATOM 3893 CB GLU A 244 -5.158 12.766 -0.476 1.00 33.82 C -ATOM 3894 CG GLU A 244 -4.759 12.301 0.943 1.00 48.90 C -ATOM 3895 CD GLU A 244 -3.316 12.658 1.324 1.00 65.96 C -ATOM 3896 OE1 GLU A 244 -2.883 13.789 1.006 1.00 51.67 O -ATOM 3897 OE2 GLU A 244 -2.662 11.791 1.943 1.00 68.15 O1- -ATOM 3898 H GLU A 244 -6.315 10.500 -0.742 1.00 0.00 H -ATOM 3899 HA GLU A 244 -7.258 13.183 -0.115 1.00 0.00 H -ATOM 3900 HB2 GLU A 244 -4.538 12.250 -1.209 1.00 0.00 H -ATOM 3901 HB3 GLU A 244 -4.911 13.822 -0.594 1.00 0.00 H -ATOM 3902 HG2 GLU A 244 -5.415 12.762 1.682 1.00 0.00 H -ATOM 3903 HG3 GLU A 244 -4.901 11.223 1.034 1.00 0.00 H -ATOM 3904 N ARG A 245 -7.390 14.275 -2.419 1.00 30.19 N -ATOM 3905 CA ARG A 245 -7.807 14.875 -3.693 1.00 28.71 C -ATOM 3906 C ARG A 245 -7.296 16.332 -3.734 1.00 31.32 C -ATOM 3907 O ARG A 245 -6.873 16.905 -2.726 1.00 31.52 O -ATOM 3908 CB ARG A 245 -9.353 14.779 -3.837 1.00 28.69 C -ATOM 3909 CG ARG A 245 -9.925 13.353 -3.978 1.00 29.69 C -ATOM 3910 CD ARG A 245 -9.469 12.601 -5.237 1.00 29.80 C -ATOM 3911 NE ARG A 245 -10.046 11.251 -5.276 1.00 30.88 N -ATOM 3912 CZ ARG A 245 -9.536 10.130 -4.754 1.00 38.38 C -ATOM 3913 NH1 ARG A 245 -8.374 10.105 -4.103 1.00 29.25 N -ATOM 3914 NH2 ARG A 245 -10.217 8.996 -4.897 1.00 30.33 N1+ -ATOM 3915 H ARG A 245 -7.534 14.848 -1.597 1.00 0.00 H -ATOM 3916 HA ARG A 245 -7.319 14.366 -4.527 1.00 0.00 H -ATOM 3917 HB2 ARG A 245 -9.825 15.257 -2.975 1.00 0.00 H -ATOM 3918 HB3 ARG A 245 -9.685 15.361 -4.698 1.00 0.00 H -ATOM 3919 HG2 ARG A 245 -9.684 12.770 -3.089 1.00 0.00 H -ATOM 3920 HG3 ARG A 245 -11.013 13.422 -3.997 1.00 0.00 H -ATOM 3921 HD2 ARG A 245 -9.789 13.138 -6.129 1.00 0.00 H -ATOM 3922 HD3 ARG A 245 -8.384 12.525 -5.295 1.00 0.00 H -ATOM 3923 HE ARG A 245 -10.952 11.165 -5.719 1.00 0.00 H -ATOM 3924 HH12 ARG A 245 -8.006 9.225 -3.767 1.00 0.00 H -ATOM 3925 HH11 ARG A 245 -7.853 10.961 -3.955 1.00 0.00 H -ATOM 3926 HH22 ARG A 245 -9.872 8.120 -4.525 1.00 0.00 H -ATOM 3927 HH21 ARG A 245 -11.092 9.017 -5.404 1.00 0.00 H -ATOM 3928 N LEU A 246 -7.423 16.936 -4.931 1.00 26.90 N -ATOM 3929 CA LEU A 246 -7.258 18.370 -5.219 1.00 26.48 C -ATOM 3930 C LEU A 246 -8.412 19.123 -4.485 1.00 31.07 C -ATOM 3931 O LEU A 246 -9.542 18.619 -4.451 1.00 29.22 O -ATOM 3932 CB LEU A 246 -7.366 18.594 -6.752 1.00 25.80 C -ATOM 3933 CG LEU A 246 -6.192 18.022 -7.584 1.00 28.43 C -ATOM 3934 CD1 LEU A 246 -6.569 17.877 -9.071 1.00 27.29 C -ATOM 3935 CD2 LEU A 246 -4.899 18.843 -7.420 1.00 31.24 C -ATOM 3936 H LEU A 246 -7.767 16.383 -5.709 1.00 0.00 H -ATOM 3937 HA LEU A 246 -6.279 18.674 -4.851 1.00 0.00 H -ATOM 3938 HB2 LEU A 246 -8.298 18.151 -7.102 1.00 0.00 H -ATOM 3939 HB3 LEU A 246 -7.459 19.659 -6.971 1.00 0.00 H -ATOM 3940 HG LEU A 246 -5.987 17.014 -7.222 1.00 0.00 H -ATOM 3941 HD11 LEU A 246 -5.764 17.413 -9.642 1.00 0.00 H -ATOM 3942 HD12 LEU A 246 -7.454 17.253 -9.200 1.00 0.00 H -ATOM 3943 HD13 LEU A 246 -6.777 18.842 -9.529 1.00 0.00 H -ATOM 3944 HD21 LEU A 246 -4.079 18.405 -7.989 1.00 0.00 H -ATOM 3945 HD22 LEU A 246 -5.033 19.869 -7.765 1.00 0.00 H -ATOM 3946 HD23 LEU A 246 -4.576 18.884 -6.380 1.00 0.00 H -ATOM 3947 N PRO A 247 -8.114 20.312 -3.897 1.00 29.27 N -ATOM 3948 CA PRO A 247 -9.066 21.061 -3.037 1.00 29.71 C -ATOM 3949 C PRO A 247 -10.254 21.645 -3.845 1.00 33.63 C -ATOM 3950 O PRO A 247 -10.264 21.589 -5.076 1.00 33.51 O -ATOM 3951 CB PRO A 247 -8.195 22.186 -2.438 1.00 32.38 C -ATOM 3952 CG PRO A 247 -7.107 22.424 -3.472 1.00 35.83 C -ATOM 3953 CD PRO A 247 -6.833 21.024 -4.007 1.00 30.45 C -ATOM 3954 HA PRO A 247 -9.461 20.425 -2.243 1.00 0.00 H -ATOM 3955 HB2 PRO A 247 -8.737 23.101 -2.190 1.00 0.00 H -ATOM 3956 HB3 PRO A 247 -7.742 21.831 -1.510 1.00 0.00 H -ATOM 3957 HG2 PRO A 247 -7.501 23.049 -4.275 1.00 0.00 H -ATOM 3958 HG3 PRO A 247 -6.223 22.917 -3.068 1.00 0.00 H -ATOM 3959 HD3 PRO A 247 -6.094 20.517 -3.385 1.00 0.00 H -ATOM 3960 HD2 PRO A 247 -6.450 21.066 -5.028 1.00 0.00 H -ATOM 3961 N ARG A 248 -11.244 22.208 -3.127 1.00 30.63 N -ATOM 3962 CA ARG A 248 -12.380 22.937 -3.712 1.00 30.68 C -ATOM 3963 C ARG A 248 -11.821 24.326 -4.141 1.00 36.51 C -ATOM 3964 O ARG A 248 -11.321 25.053 -3.277 1.00 36.37 O -ATOM 3965 CB ARG A 248 -13.502 23.090 -2.652 1.00 28.69 C -ATOM 3966 CG ARG A 248 -14.801 23.712 -3.219 1.00 33.51 C -ATOM 3967 CD ARG A 248 -15.947 23.851 -2.201 1.00 37.56 C -ATOM 3968 NE ARG A 248 -15.588 24.762 -1.101 1.00 52.22 N -ATOM 3969 CZ ARG A 248 -15.531 26.103 -1.152 1.00 71.16 C -ATOM 3970 NH1 ARG A 248 -15.111 26.775 -0.081 1.00 60.58 N -ATOM 3971 NH2 ARG A 248 -15.874 26.802 -2.237 1.00 53.25 N1+ -ATOM 3972 H ARG A 248 -11.188 22.211 -2.117 1.00 0.00 H -ATOM 3973 HA ARG A 248 -12.787 22.364 -4.540 1.00 0.00 H -ATOM 3974 HB2 ARG A 248 -13.741 22.106 -2.245 1.00 0.00 H -ATOM 3975 HB3 ARG A 248 -13.146 23.677 -1.803 1.00 0.00 H -ATOM 3976 HG2 ARG A 248 -14.586 24.695 -3.634 1.00 0.00 H -ATOM 3977 HG3 ARG A 248 -15.145 23.114 -4.062 1.00 0.00 H -ATOM 3978 HD2 ARG A 248 -16.851 24.216 -2.691 1.00 0.00 H -ATOM 3979 HD3 ARG A 248 -16.200 22.876 -1.783 1.00 0.00 H -ATOM 3980 HE ARG A 248 -15.326 24.321 -0.233 1.00 0.00 H -ATOM 3981 HH12 ARG A 248 -15.048 27.783 -0.124 1.00 0.00 H -ATOM 3982 HH11 ARG A 248 -14.840 26.286 0.758 1.00 0.00 H -ATOM 3983 HH22 ARG A 248 -15.793 27.810 -2.221 1.00 0.00 H -ATOM 3984 HH21 ARG A 248 -16.250 26.333 -3.051 1.00 0.00 H -ATOM 3985 N PRO A 249 -11.950 24.694 -5.447 1.00 34.19 N -ATOM 3986 CA PRO A 249 -11.639 26.059 -5.950 1.00 34.79 C -ATOM 3987 C PRO A 249 -12.532 27.121 -5.265 1.00 39.69 C -ATOM 3988 O PRO A 249 -13.695 26.841 -4.964 1.00 37.63 O -ATOM 3989 CB PRO A 249 -11.952 25.994 -7.461 1.00 35.61 C -ATOM 3990 CG PRO A 249 -11.883 24.518 -7.807 1.00 38.50 C -ATOM 3991 CD PRO A 249 -12.407 23.841 -6.551 1.00 34.62 C -ATOM 3992 HA PRO A 249 -10.577 26.259 -5.787 1.00 0.00 H -ATOM 3993 HB2 PRO A 249 -12.951 26.368 -7.692 1.00 0.00 H -ATOM 3994 HB3 PRO A 249 -11.258 26.588 -8.055 1.00 0.00 H -ATOM 3995 HG2 PRO A 249 -12.430 24.244 -8.707 1.00 0.00 H -ATOM 3996 HG3 PRO A 249 -10.843 24.232 -7.953 1.00 0.00 H -ATOM 3997 HD3 PRO A 249 -12.035 22.818 -6.510 1.00 0.00 H -ATOM 3998 HD2 PRO A 249 -13.497 23.808 -6.550 1.00 0.00 H -ATOM 3999 N ASH A 250 -11.974 28.323 -5.021 1.00 39.28 N -ATOM 4000 CA ASH A 250 -12.659 29.438 -4.345 1.00 41.69 C -ATOM 4001 C ASH A 250 -13.830 29.911 -5.252 1.00 47.14 C -ATOM 4002 O ASH A 250 -13.603 30.269 -6.409 1.00 46.83 O -ATOM 4003 CB ASH A 250 -11.682 30.592 -3.992 1.00 45.59 C -ATOM 4004 CG ASH A 250 -12.320 31.739 -3.190 1.00 68.02 C -ATOM 4005 OD1 ASH A 250 -13.063 31.428 -2.232 1.00 70.17 O -ATOM 4006 OD2 ASH A 250 -12.069 32.907 -3.559 1.00 78.75 O1- -ATOM 4007 H ASH A 250 -11.014 28.489 -5.289 1.00 0.00 H -ATOM 4008 HA ASH A 250 -13.061 29.036 -3.410 1.00 0.00 H -ATOM 4009 HB2 ASH A 250 -10.857 30.201 -3.393 1.00 0.00 H -ATOM 4010 HB3 ASH A 250 -11.227 30.990 -4.901 1.00 0.00 H -ATOM 4011 N LYS A 251 -15.049 29.887 -4.681 1.00 45.46 N -ATOM 4012 CA LYS A 251 -16.343 30.284 -5.271 1.00 46.10 C -ATOM 4013 C LYS A 251 -16.987 29.130 -6.095 1.00 48.03 C -ATOM 4014 O LYS A 251 -18.012 29.376 -6.733 1.00 49.27 O -ATOM 4015 CB LYS A 251 -16.316 31.678 -5.971 1.00 50.14 C -ATOM 4016 CG LYS A 251 -15.821 32.844 -5.080 1.00 69.71 C -ATOM 4017 CD LYS A 251 -16.810 33.294 -3.981 1.00 83.93 C -ATOM 4018 CE LYS A 251 -17.909 34.259 -4.466 1.00 98.25 C -ATOM 4019 NZ LYS A 251 -17.356 35.571 -4.852 1.00107.70 N1+ -ATOM 4020 H LYS A 251 -15.104 29.587 -3.717 1.00 0.00 H -ATOM 4021 HA LYS A 251 -17.005 30.366 -4.409 1.00 0.00 H -ATOM 4022 HB2 LYS A 251 -15.691 31.628 -6.863 1.00 0.00 H -ATOM 4023 HB3 LYS A 251 -17.311 31.923 -6.348 1.00 0.00 H -ATOM 4024 HG2 LYS A 251 -14.879 32.564 -4.609 1.00 0.00 H -ATOM 4025 HG3 LYS A 251 -15.563 33.692 -5.714 1.00 0.00 H -ATOM 4026 HD2 LYS A 251 -17.271 32.426 -3.511 1.00 0.00 H -ATOM 4027 HD3 LYS A 251 -16.249 33.780 -3.180 1.00 0.00 H -ATOM 4028 HE2 LYS A 251 -18.452 33.832 -5.310 1.00 0.00 H -ATOM 4029 HE3 LYS A 251 -18.639 34.418 -3.671 1.00 0.00 H -ATOM 4030 HZ1 LYS A 251 -18.103 36.182 -5.151 1.00 0.00 H -ATOM 4031 HZ2 LYS A 251 -16.884 35.983 -4.060 1.00 0.00 H -ATOM 4032 HZ3 LYS A 251 -16.695 35.450 -5.606 1.00 0.00 H -ATOM 4033 N CYS A 252 -16.431 27.895 -6.054 1.00 40.64 N -ATOM 4034 CA CYS A 252 -17.016 26.664 -6.622 1.00 37.44 C -ATOM 4035 C CYS A 252 -18.105 26.222 -5.600 1.00 40.28 C -ATOM 4036 O CYS A 252 -17.772 26.064 -4.420 1.00 40.75 O -ATOM 4037 CB CYS A 252 -15.951 25.542 -6.761 1.00 35.57 C -ATOM 4038 SG CYS A 252 -16.605 23.976 -7.425 1.00 37.88 S -ATOM 4039 H CYS A 252 -15.583 27.764 -5.520 1.00 0.00 H -ATOM 4040 HA CYS A 252 -17.401 26.884 -7.617 1.00 0.00 H -ATOM 4041 HB2 CYS A 252 -15.154 25.876 -7.423 1.00 0.00 H -ATOM 4042 HB3 CYS A 252 -15.490 25.312 -5.802 1.00 0.00 H -ATOM 4043 HG CYS A 252 -17.394 23.688 -6.384 1.00 0.00 H -ATOM 4044 N PRO A 253 -19.359 25.964 -6.062 1.00 34.69 N -ATOM 4045 CA PRO A 253 -20.437 25.375 -5.226 1.00 34.83 C -ATOM 4046 C PRO A 253 -20.049 23.996 -4.636 1.00 36.98 C -ATOM 4047 O PRO A 253 -19.300 23.239 -5.259 1.00 34.16 O -ATOM 4048 CB PRO A 253 -21.628 25.219 -6.190 1.00 36.57 C -ATOM 4049 CG PRO A 253 -21.377 26.240 -7.283 1.00 40.74 C -ATOM 4050 CD PRO A 253 -19.860 26.261 -7.409 1.00 36.09 C -ATOM 4051 HA PRO A 253 -20.681 26.090 -4.437 1.00 0.00 H -ATOM 4052 HB2 PRO A 253 -21.674 24.223 -6.630 1.00 0.00 H -ATOM 4053 HB3 PRO A 253 -22.580 25.390 -5.688 1.00 0.00 H -ATOM 4054 HG2 PRO A 253 -21.886 26.008 -8.219 1.00 0.00 H -ATOM 4055 HG3 PRO A 253 -21.728 27.217 -6.946 1.00 0.00 H -ATOM 4056 HD3 PRO A 253 -19.540 27.231 -7.791 1.00 0.00 H -ATOM 4057 HD2 PRO A 253 -19.514 25.488 -8.098 1.00 0.00 H -ATOM 4058 N CYS A 254 -20.579 23.710 -3.433 1.00 34.46 N -ATOM 4059 CA CYS A 254 -20.320 22.502 -2.624 1.00 34.01 C -ATOM 4060 C CYS A 254 -20.763 21.222 -3.379 1.00 35.94 C -ATOM 4061 O CYS A 254 -20.016 20.246 -3.362 1.00 33.77 O -ATOM 4062 CB CYS A 254 -21.006 22.553 -1.238 1.00 0.00 C -ATOM 4063 SG CYS A 254 -20.488 24.011 -0.283 1.00 0.00 S -ATOM 4064 HB2 CYS A 254 -22.093 22.578 -1.338 1.00 0.00 H -ATOM 4065 HB3 CYS A 254 -20.761 21.664 -0.654 1.00 0.00 H -ATOM 4066 HG CYS A 254 -21.217 23.738 0.803 1.00 0.00 H -ATOM 4067 H CYS A 254 -21.182 24.394 -2.998 1.00 0.00 H -ATOM 4068 HA CYS A 254 -19.240 22.440 -2.467 1.00 0.00 H -ATOM 4069 N GLU A 255 -21.923 21.260 -4.064 1.00 34.04 N -ATOM 4070 CA GLU A 255 -22.522 20.130 -4.793 1.00 34.34 C -ATOM 4071 C GLU A 255 -21.857 19.942 -6.189 1.00 35.13 C -ATOM 4072 O GLU A 255 -21.857 18.813 -6.678 1.00 31.94 O -ATOM 4073 CB GLU A 255 -24.041 20.392 -4.911 1.00 37.10 C -ATOM 4074 CG GLU A 255 -24.856 19.209 -5.486 1.00 51.53 C -ATOM 4075 CD GLU A 255 -26.370 19.337 -5.270 1.00 70.35 C -ATOM 4076 OE1 GLU A 255 -26.879 20.477 -5.364 1.00 77.38 O -ATOM 4077 OE2 GLU A 255 -26.994 18.281 -5.025 1.00 51.45 O1- -ATOM 4078 H GLU A 255 -22.474 22.109 -4.046 1.00 0.00 H -ATOM 4079 HA GLU A 255 -22.378 19.218 -4.210 1.00 0.00 H -ATOM 4080 HB2 GLU A 255 -24.427 20.635 -3.918 1.00 0.00 H -ATOM 4081 HB3 GLU A 255 -24.214 21.282 -5.518 1.00 0.00 H -ATOM 4082 HG2 GLU A 255 -24.673 19.106 -6.556 1.00 0.00 H -ATOM 4083 HG3 GLU A 255 -24.516 18.281 -5.025 1.00 0.00 H -ATOM 4084 N VAL A 256 -21.240 20.993 -6.775 1.00 32.23 N -ATOM 4085 CA VAL A 256 -20.411 20.927 -7.999 1.00 30.46 C -ATOM 4086 C VAL A 256 -19.015 20.327 -7.644 1.00 31.37 C -ATOM 4087 O VAL A 256 -18.438 19.662 -8.505 1.00 28.93 O -ATOM 4088 CB VAL A 256 -20.212 22.343 -8.644 1.00 34.90 C -ATOM 4089 CG1 VAL A 256 -19.169 22.434 -9.789 1.00 34.06 C -ATOM 4090 CG2 VAL A 256 -21.558 22.901 -9.155 1.00 35.48 C -ATOM 4091 H VAL A 256 -21.253 21.887 -6.305 1.00 0.00 H -ATOM 4092 HA VAL A 256 -20.891 20.272 -8.731 1.00 0.00 H -ATOM 4093 HB VAL A 256 -19.867 23.021 -7.863 1.00 0.00 H -ATOM 4094 HG11 VAL A 256 -19.130 23.441 -10.206 1.00 0.00 H -ATOM 4095 HG12 VAL A 256 -18.159 22.208 -9.451 1.00 0.00 H -ATOM 4096 HG13 VAL A 256 -19.408 21.747 -10.601 1.00 0.00 H -ATOM 4097 HG21 VAL A 256 -21.456 23.924 -9.519 1.00 0.00 H -ATOM 4098 HG22 VAL A 256 -21.939 22.298 -9.978 1.00 0.00 H -ATOM 4099 HG23 VAL A 256 -22.325 22.907 -8.381 1.00 0.00 H -ATOM 4100 N TYR A 257 -18.528 20.486 -6.393 1.00 28.72 N -ATOM 4101 CA TYR A 257 -17.309 19.845 -5.871 1.00 28.17 C -ATOM 4102 C TYR A 257 -17.588 18.353 -5.528 1.00 32.85 C -ATOM 4103 O TYR A 257 -16.664 17.554 -5.671 1.00 32.29 O -ATOM 4104 CB TYR A 257 -16.801 20.614 -4.622 1.00 29.44 C -ATOM 4105 CG TYR A 257 -15.476 20.108 -4.061 1.00 31.74 C -ATOM 4106 CD1 TYR A 257 -14.321 20.153 -4.872 1.00 33.16 C -ATOM 4107 CD2 TYR A 257 -15.393 19.547 -2.762 1.00 33.69 C -ATOM 4108 CE1 TYR A 257 -13.105 19.590 -4.426 1.00 33.08 C -ATOM 4109 CE2 TYR A 257 -14.165 19.023 -2.295 1.00 34.55 C -ATOM 4110 CZ TYR A 257 -13.024 19.027 -3.133 1.00 36.66 C -ATOM 4111 OH TYR A 257 -11.847 18.490 -2.699 1.00 35.20 O -ATOM 4112 H TYR A 257 -19.053 21.042 -5.733 1.00 0.00 H -ATOM 4113 HA TYR A 257 -16.539 19.888 -6.645 1.00 0.00 H -ATOM 4114 HB2 TYR A 257 -16.672 21.665 -4.885 1.00 0.00 H -ATOM 4115 HB3 TYR A 257 -17.551 20.609 -3.832 1.00 0.00 H -ATOM 4116 HD1 TYR A 257 -14.377 20.623 -5.839 1.00 0.00 H -ATOM 4117 HD2 TYR A 257 -16.267 19.507 -2.129 1.00 0.00 H -ATOM 4118 HE1 TYR A 257 -12.237 19.611 -5.070 1.00 0.00 H -ATOM 4119 HE2 TYR A 257 -14.106 18.597 -1.304 1.00 0.00 H -ATOM 4120 HH TYR A 257 -11.154 18.546 -3.367 1.00 0.00 H -ATOM 4121 N HIE A 258 -18.827 17.978 -5.141 1.00 31.34 N -ATOM 4122 CA HIE A 258 -19.239 16.591 -4.847 1.00 31.80 C -ATOM 4123 C HIE A 258 -19.506 15.807 -6.162 1.00 32.90 C -ATOM 4124 O HIE A 258 -19.299 14.594 -6.156 1.00 31.97 O -ATOM 4125 CB HIE A 258 -20.505 16.587 -3.959 1.00 33.81 C -ATOM 4126 CG HIE A 258 -20.349 17.223 -2.594 1.00 37.86 C -ATOM 4127 ND1 HIE A 258 -21.422 17.816 -1.919 1.00 40.76 N -ATOM 4128 CD2 HIE A 258 -19.219 17.333 -1.805 1.00 39.65 C -ATOM 4129 CE1 HIE A 258 -20.909 18.265 -0.782 1.00 40.91 C -ATOM 4130 NE2 HIE A 258 -19.606 18.008 -0.661 1.00 40.63 N -ATOM 4131 H HIE A 258 -19.545 18.682 -5.042 1.00 0.00 H -ATOM 4132 HA HIE A 258 -18.438 16.080 -4.306 1.00 0.00 H -ATOM 4133 HB2 HIE A 258 -21.329 17.082 -4.476 1.00 0.00 H -ATOM 4134 HB3 HIE A 258 -20.837 15.562 -3.787 1.00 0.00 H -ATOM 4135 HD2 HIE A 258 -18.204 17.005 -1.969 1.00 0.00 H -ATOM 4136 HE1 HIE A 258 -21.488 18.784 -0.032 1.00 0.00 H -ATOM 4137 HE2 HIE A 258 -19.019 18.254 0.124 1.00 0.00 H -ATOM 4138 N LEU A 259 -19.862 16.488 -7.274 1.00 29.07 N -ATOM 4139 CA LEU A 259 -19.928 15.956 -8.652 1.00 28.56 C -ATOM 4140 C LEU A 259 -18.487 15.637 -9.132 1.00 31.25 C -ATOM 4141 O LEU A 259 -18.287 14.594 -9.753 1.00 29.28 O -ATOM 4142 CB LEU A 259 -20.610 17.025 -9.554 1.00 29.23 C -ATOM 4143 CG LEU A 259 -20.908 16.642 -11.034 1.00 34.50 C -ATOM 4144 CD1 LEU A 259 -22.108 17.447 -11.568 1.00 34.68 C -ATOM 4145 CD2 LEU A 259 -19.706 16.854 -11.981 1.00 36.84 C -ATOM 4146 H LEU A 259 -20.039 17.480 -7.189 1.00 0.00 H -ATOM 4147 HA LEU A 259 -20.524 15.040 -8.655 1.00 0.00 H -ATOM 4148 HB2 LEU A 259 -21.560 17.267 -9.073 1.00 0.00 H -ATOM 4149 HB3 LEU A 259 -20.051 17.960 -9.535 1.00 0.00 H -ATOM 4150 HG LEU A 259 -21.191 15.589 -11.068 1.00 0.00 H -ATOM 4151 HD11 LEU A 259 -22.372 17.143 -12.583 1.00 0.00 H -ATOM 4152 HD12 LEU A 259 -22.991 17.303 -10.945 1.00 0.00 H -ATOM 4153 HD13 LEU A 259 -21.896 18.517 -11.591 1.00 0.00 H -ATOM 4154 HD21 LEU A 259 -19.982 16.662 -13.018 1.00 0.00 H -ATOM 4155 HD22 LEU A 259 -19.339 17.879 -11.929 1.00 0.00 H -ATOM 4156 HD23 LEU A 259 -18.871 16.194 -11.761 1.00 0.00 H -ATOM 4157 N MET A 260 -17.514 16.510 -8.807 1.00 29.35 N -ATOM 4158 CA MET A 260 -16.106 16.447 -9.218 1.00 30.67 C -ATOM 4159 C MET A 260 -15.337 15.371 -8.398 1.00 31.09 C -ATOM 4160 O MET A 260 -14.452 14.740 -8.972 1.00 28.70 O -ATOM 4161 CB MET A 260 -15.508 17.859 -9.023 1.00 34.60 C -ATOM 4162 CG MET A 260 -14.259 18.157 -9.863 1.00 40.60 C -ATOM 4163 SD MET A 260 -13.921 19.934 -10.010 1.00 46.94 S -ATOM 4164 CE MET A 260 -13.238 20.286 -8.376 1.00 42.17 C -ATOM 4165 H MET A 260 -17.771 17.338 -8.287 1.00 0.00 H -ATOM 4166 HA MET A 260 -16.073 16.185 -10.278 1.00 0.00 H -ATOM 4167 HB2 MET A 260 -16.255 18.596 -9.317 1.00 0.00 H -ATOM 4168 HB3 MET A 260 -15.308 18.055 -7.969 1.00 0.00 H -ATOM 4169 HG2 MET A 260 -13.386 17.638 -9.468 1.00 0.00 H -ATOM 4170 HG3 MET A 260 -14.407 17.784 -10.875 1.00 0.00 H -ATOM 4171 HE1 MET A 260 -13.308 21.351 -8.155 1.00 0.00 H -ATOM 4172 HE2 MET A 260 -13.781 19.722 -7.626 1.00 0.00 H -ATOM 4173 HE3 MET A 260 -12.194 19.990 -8.326 1.00 0.00 H -ATOM 4174 N LYS A 261 -15.716 15.119 -7.124 1.00 27.88 N -ATOM 4175 CA LYS A 261 -15.187 14.033 -6.276 1.00 27.39 C -ATOM 4176 C LYS A 261 -15.871 12.680 -6.617 1.00 30.73 C -ATOM 4177 O LYS A 261 -15.232 11.653 -6.390 1.00 30.19 O -ATOM 4178 CB LYS A 261 -15.397 14.354 -4.774 1.00 30.13 C -ATOM 4179 CG LYS A 261 -14.379 15.370 -4.210 1.00 40.57 C -ATOM 4180 CD LYS A 261 -14.323 15.412 -2.669 1.00 49.92 C -ATOM 4181 CE LYS A 261 -13.572 14.220 -2.049 1.00 55.31 C -ATOM 4182 NZ LYS A 261 -13.503 14.319 -0.581 1.00 61.18 N1+ -ATOM 4183 H LYS A 261 -16.444 15.685 -6.710 1.00 0.00 H -ATOM 4184 HA LYS A 261 -14.119 13.913 -6.461 1.00 0.00 H -ATOM 4185 HB2 LYS A 261 -16.414 14.709 -4.595 1.00 0.00 H -ATOM 4186 HB3 LYS A 261 -15.310 13.434 -4.194 1.00 0.00 H -ATOM 4187 HG2 LYS A 261 -13.380 15.154 -4.586 1.00 0.00 H -ATOM 4188 HG3 LYS A 261 -14.621 16.364 -4.588 1.00 0.00 H -ATOM 4189 HD2 LYS A 261 -13.810 16.323 -2.370 1.00 0.00 H -ATOM 4190 HD3 LYS A 261 -15.334 15.486 -2.264 1.00 0.00 H -ATOM 4191 HE2 LYS A 261 -14.056 13.279 -2.303 1.00 0.00 H -ATOM 4192 HE3 LYS A 261 -12.554 14.172 -2.435 1.00 0.00 H -ATOM 4193 HZ1 LYS A 261 -12.986 13.532 -0.216 1.00 0.00 H -ATOM 4194 HZ2 LYS A 261 -13.039 15.177 -0.320 1.00 0.00 H -ATOM 4195 HZ3 LYS A 261 -14.438 14.309 -0.199 1.00 0.00 H -ATOM 4196 N ASN A 262 -17.093 12.670 -7.194 1.00 27.52 N -ATOM 4197 CA ASN A 262 -17.764 11.466 -7.723 1.00 27.53 C -ATOM 4198 C ASN A 262 -17.179 11.115 -9.126 1.00 29.61 C -ATOM 4199 O ASN A 262 -17.187 9.938 -9.480 1.00 29.79 O -ATOM 4200 CB ASN A 262 -19.298 11.705 -7.770 1.00 28.97 C -ATOM 4201 CG ASN A 262 -20.143 10.485 -8.180 1.00 41.34 C -ATOM 4202 OD1 ASN A 262 -20.968 10.579 -9.085 1.00 34.75 O -ATOM 4203 ND2 ASN A 262 -19.944 9.338 -7.525 1.00 35.14 N -ATOM 4204 H ASN A 262 -17.572 13.546 -7.351 1.00 0.00 H -ATOM 4205 HA ASN A 262 -17.566 10.636 -7.044 1.00 0.00 H -ATOM 4206 HB2 ASN A 262 -19.649 12.006 -6.782 1.00 0.00 H -ATOM 4207 HB3 ASN A 262 -19.532 12.539 -8.434 1.00 0.00 H -ATOM 4208 HD22 ASN A 262 -20.468 8.516 -7.787 1.00 0.00 H -ATOM 4209 HD21 ASN A 262 -19.258 9.270 -6.784 1.00 0.00 H -ATOM 4210 N CYS A 263 -16.598 12.088 -9.857 1.00 24.02 N -ATOM 4211 CA CYS A 263 -15.742 11.868 -11.036 1.00 24.87 C -ATOM 4212 C CYS A 263 -14.330 11.385 -10.587 1.00 28.35 C -ATOM 4213 O CYS A 263 -13.600 10.918 -11.455 1.00 26.56 O -ATOM 4214 CB CYS A 263 -15.592 13.146 -11.898 1.00 25.12 C -ATOM 4215 SG CYS A 263 -17.160 13.584 -12.701 1.00 29.56 S -ATOM 4216 H CYS A 263 -16.634 13.038 -9.514 1.00 0.00 H -ATOM 4217 HA CYS A 263 -16.175 11.079 -11.655 1.00 0.00 H -ATOM 4218 HB2 CYS A 263 -15.257 13.996 -11.305 1.00 0.00 H -ATOM 4219 HB3 CYS A 263 -14.853 13.007 -12.686 1.00 0.00 H -ATOM 4220 HG CYS A 263 -17.812 13.892 -11.573 1.00 0.00 H -ATOM 4221 N TRP A 264 -13.961 11.459 -9.289 1.00 24.56 N -ATOM 4222 CA TRP A 264 -12.676 11.004 -8.740 1.00 24.31 C -ATOM 4223 C TRP A 264 -12.926 9.873 -7.704 1.00 28.86 C -ATOM 4224 O TRP A 264 -12.262 9.873 -6.667 1.00 29.11 O -ATOM 4225 CB TRP A 264 -11.898 12.183 -8.104 1.00 23.52 C -ATOM 4226 CG TRP A 264 -11.496 13.376 -8.912 1.00 23.91 C -ATOM 4227 CD1 TRP A 264 -11.111 13.385 -10.209 1.00 26.64 C -ATOM 4228 CD2 TRP A 264 -11.343 14.747 -8.434 1.00 24.07 C -ATOM 4229 NE1 TRP A 264 -10.712 14.659 -10.557 1.00 25.72 N -ATOM 4230 CE2 TRP A 264 -10.825 15.543 -9.503 1.00 26.84 C -ATOM 4231 CE3 TRP A 264 -11.568 15.398 -7.190 1.00 25.78 C -ATOM 4232 CZ2 TRP A 264 -10.527 16.913 -9.339 1.00 25.92 C -ATOM 4233 CZ3 TRP A 264 -11.290 16.773 -7.018 1.00 27.26 C -ATOM 4234 CH2 TRP A 264 -10.762 17.527 -8.089 1.00 27.17 C -ATOM 4235 H TRP A 264 -14.620 11.822 -8.615 1.00 0.00 H -ATOM 4236 HA TRP A 264 -12.056 10.575 -9.525 1.00 0.00 H -ATOM 4237 HB2 TRP A 264 -12.435 12.546 -7.227 1.00 0.00 H -ATOM 4238 HB3 TRP A 264 -10.949 11.797 -7.735 1.00 0.00 H -ATOM 4239 HD1 TRP A 264 -11.094 12.518 -10.853 1.00 0.00 H -ATOM 4240 HE1 TRP A 264 -10.373 14.887 -11.482 1.00 0.00 H -ATOM 4241 HE3 TRP A 264 -11.947 14.826 -6.357 1.00 0.00 H -ATOM 4242 HZ2 TRP A 264 -10.116 17.486 -10.153 1.00 0.00 H -ATOM 4243 HZ3 TRP A 264 -11.465 17.244 -6.061 1.00 0.00 H -ATOM 4244 HH2 TRP A 264 -10.521 18.570 -7.949 1.00 0.00 H -ATOM 4245 N GLU A 265 -13.794 8.879 -7.981 1.00 25.75 N -ATOM 4246 CA GLU A 265 -13.897 7.651 -7.156 1.00 26.82 C -ATOM 4247 C GLU A 265 -12.686 6.761 -7.538 1.00 30.62 C -ATOM 4248 O GLU A 265 -12.408 6.580 -8.727 1.00 26.79 O -ATOM 4249 CB GLU A 265 -15.220 6.900 -7.449 1.00 28.38 C -ATOM 4250 CG GLU A 265 -16.507 7.665 -7.063 1.00 35.13 C -ATOM 4251 CD GLU A 265 -16.803 7.802 -5.564 1.00 54.88 C -ATOM 4252 OE1 GLU A 265 -16.103 7.160 -4.749 1.00 51.30 O -ATOM 4253 OE2 GLU A 265 -17.754 8.558 -5.260 1.00 50.04 O1- -ATOM 4254 H GLU A 265 -14.324 8.892 -8.840 1.00 0.00 H -ATOM 4255 HA GLU A 265 -13.855 7.908 -6.094 1.00 0.00 H -ATOM 4256 HB2 GLU A 265 -15.282 6.633 -8.500 1.00 0.00 H -ATOM 4257 HB3 GLU A 265 -15.213 5.940 -6.931 1.00 0.00 H -ATOM 4258 HG2 GLU A 265 -16.464 8.665 -7.484 1.00 0.00 H -ATOM 4259 HG3 GLU A 265 -17.368 7.180 -7.519 1.00 0.00 H -ATOM 4260 N THR A 266 -12.006 6.198 -6.517 1.00 30.88 N -ATOM 4261 CA THR A 266 -10.835 5.297 -6.640 1.00 31.88 C -ATOM 4262 C THR A 266 -11.269 3.969 -7.327 1.00 35.93 C -ATOM 4263 O THR A 266 -10.503 3.454 -8.141 1.00 35.75 O -ATOM 4264 CB THR A 266 -10.229 4.934 -5.245 1.00 43.66 C -ATOM 4265 OG1 THR A 266 -9.747 6.109 -4.619 1.00 44.97 O -ATOM 4266 CG2 THR A 266 -9.029 3.962 -5.251 1.00 43.44 C -ATOM 4267 H THR A 266 -12.323 6.365 -5.572 1.00 0.00 H -ATOM 4268 HA THR A 266 -10.074 5.784 -7.256 1.00 0.00 H -ATOM 4269 HB THR A 266 -11.011 4.527 -4.599 1.00 0.00 H -ATOM 4270 HG1 THR A 266 -8.807 6.181 -4.809 1.00 0.00 H -ATOM 4271 HG21 THR A 266 -8.626 3.826 -4.246 1.00 0.00 H -ATOM 4272 HG22 THR A 266 -9.309 2.970 -5.607 1.00 0.00 H -ATOM 4273 HG23 THR A 266 -8.217 4.321 -5.886 1.00 0.00 H -ATOM 4274 N GLU A 267 -12.507 3.501 -7.064 1.00 34.13 N -ATOM 4275 CA GLU A 267 -13.175 2.391 -7.750 1.00 35.75 C -ATOM 4276 C GLU A 267 -13.814 3.014 -9.021 1.00 37.89 C -ATOM 4277 O GLU A 267 -14.637 3.928 -8.923 1.00 35.58 O -ATOM 4278 CB GLU A 267 -14.252 1.833 -6.782 1.00 38.82 C -ATOM 4279 CG GLU A 267 -15.016 0.573 -7.253 1.00 56.26 C -ATOM 4280 CD GLU A 267 -14.219 -0.734 -7.147 1.00 89.36 C -ATOM 4281 OE1 GLU A 267 -13.118 -0.792 -7.738 1.00 94.02 O -ATOM 4282 OE2 GLU A 267 -14.734 -1.668 -6.494 1.00 89.74 O1- -ATOM 4283 H GLU A 267 -13.084 4.008 -6.407 1.00 0.00 H -ATOM 4284 HA GLU A 267 -12.446 1.621 -8.005 1.00 0.00 H -ATOM 4285 HB2 GLU A 267 -13.785 1.612 -5.820 1.00 0.00 H -ATOM 4286 HB3 GLU A 267 -14.979 2.615 -6.556 1.00 0.00 H -ATOM 4287 HG2 GLU A 267 -15.921 0.469 -6.656 1.00 0.00 H -ATOM 4288 HG3 GLU A 267 -15.356 0.698 -8.280 1.00 0.00 H -ATOM 4289 N ALA A 268 -13.410 2.496 -10.197 1.00 35.19 N -ATOM 4290 CA ALA A 268 -13.748 3.013 -11.535 1.00 35.22 C -ATOM 4291 C ALA A 268 -15.237 2.777 -11.903 1.00 38.77 C -ATOM 4292 O ALA A 268 -15.772 3.570 -12.679 1.00 37.90 O -ATOM 4293 CB ALA A 268 -12.827 2.342 -12.574 1.00 36.33 C -ATOM 4294 H ALA A 268 -12.755 1.726 -10.186 1.00 0.00 H -ATOM 4295 HA ALA A 268 -13.566 4.088 -11.550 1.00 0.00 H -ATOM 4296 HB1 ALA A 268 -13.023 2.710 -13.581 1.00 0.00 H -ATOM 4297 HB2 ALA A 268 -11.778 2.548 -12.359 1.00 0.00 H -ATOM 4298 HB3 ALA A 268 -12.951 1.258 -12.592 1.00 0.00 H -ATOM 4299 N SER A 269 -15.893 1.746 -11.331 1.00 35.61 N -ATOM 4300 CA SER A 269 -17.310 1.396 -11.547 1.00 35.08 C -ATOM 4301 C SER A 269 -18.267 2.384 -10.819 1.00 37.46 C -ATOM 4302 O SER A 269 -19.416 2.493 -11.251 1.00 37.36 O -ATOM 4303 CB SER A 269 -17.563 -0.064 -11.092 1.00 40.33 C -ATOM 4304 OG SER A 269 -17.360 -0.270 -9.705 1.00 48.92 O -ATOM 4305 H SER A 269 -15.384 1.134 -10.706 1.00 0.00 H -ATOM 4306 HA SER A 269 -17.519 1.450 -12.618 1.00 0.00 H -ATOM 4307 HB2 SER A 269 -18.582 -0.367 -11.338 1.00 0.00 H -ATOM 4308 HB3 SER A 269 -16.906 -0.744 -11.637 1.00 0.00 H -ATOM 4309 HG SER A 269 -17.486 -1.201 -9.505 1.00 0.00 H -ATOM 4310 N PHE A 270 -17.801 3.098 -9.770 1.00 32.83 N -ATOM 4311 CA PHE A 270 -18.584 4.078 -8.990 1.00 32.10 C -ATOM 4312 C PHE A 270 -18.571 5.478 -9.670 1.00 33.92 C -ATOM 4313 O PHE A 270 -19.335 6.336 -9.223 1.00 31.85 O -ATOM 4314 CB PHE A 270 -17.991 4.206 -7.559 1.00 33.90 C -ATOM 4315 CG PHE A 270 -18.034 3.000 -6.622 1.00 37.34 C -ATOM 4316 CD1 PHE A 270 -18.680 1.781 -6.963 1.00 41.32 C -ATOM 4317 CD2 PHE A 270 -17.420 3.110 -5.349 1.00 39.43 C -ATOM 4318 CE1 PHE A 270 -18.693 0.719 -6.060 1.00 43.51 C -ATOM 4319 CE2 PHE A 270 -17.442 2.035 -4.461 1.00 43.26 C -ATOM 4320 CZ PHE A 270 -18.076 0.845 -4.815 1.00 42.52 C -ATOM 4321 H PHE A 270 -16.842 2.970 -9.479 1.00 0.00 H -ATOM 4322 HA PHE A 270 -19.625 3.756 -8.914 1.00 0.00 H -ATOM 4323 HB2 PHE A 270 -16.948 4.517 -7.630 1.00 0.00 H -ATOM 4324 HB3 PHE A 270 -18.500 5.010 -7.025 1.00 0.00 H -ATOM 4325 HD1 PHE A 270 -19.168 1.656 -7.918 1.00 0.00 H -ATOM 4326 HD2 PHE A 270 -16.928 4.028 -5.063 1.00 0.00 H -ATOM 4327 HE1 PHE A 270 -19.180 -0.207 -6.327 1.00 0.00 H -ATOM 4328 HE2 PHE A 270 -16.965 2.125 -3.496 1.00 0.00 H -ATOM 4329 HZ PHE A 270 -18.087 0.015 -4.124 1.00 0.00 H -ATOM 4330 N ARG A 271 -17.742 5.710 -10.712 1.00 27.94 N -ATOM 4331 CA ARG A 271 -17.645 6.982 -11.447 1.00 27.11 C -ATOM 4332 C ARG A 271 -18.803 7.014 -12.495 1.00 29.97 C -ATOM 4333 O ARG A 271 -19.077 5.988 -13.123 1.00 28.45 O -ATOM 4334 CB ARG A 271 -16.266 7.063 -12.157 1.00 27.28 C -ATOM 4335 CG ARG A 271 -15.084 7.178 -11.165 1.00 37.58 C -ATOM 4336 CD ARG A 271 -13.766 7.700 -11.757 1.00 43.51 C -ATOM 4337 NE ARG A 271 -13.126 6.773 -12.697 1.00 43.50 N -ATOM 4338 CZ ARG A 271 -12.065 5.976 -12.502 1.00 45.54 C -ATOM 4339 NH1 ARG A 271 -11.461 5.817 -11.322 1.00 36.88 N -ATOM 4340 NH2 ARG A 271 -11.572 5.331 -13.555 1.00 30.01 N1+ -ATOM 4341 H ARG A 271 -17.155 4.960 -11.047 1.00 0.00 H -ATOM 4342 HA ARG A 271 -17.726 7.797 -10.730 1.00 0.00 H -ATOM 4343 HB2 ARG A 271 -16.111 6.217 -12.828 1.00 0.00 H -ATOM 4344 HB3 ARG A 271 -16.259 7.950 -12.791 1.00 0.00 H -ATOM 4345 HG2 ARG A 271 -15.369 7.877 -10.378 1.00 0.00 H -ATOM 4346 HG3 ARG A 271 -14.911 6.216 -10.681 1.00 0.00 H -ATOM 4347 HD2 ARG A 271 -13.956 8.619 -12.307 1.00 0.00 H -ATOM 4348 HD3 ARG A 271 -13.071 7.957 -10.959 1.00 0.00 H -ATOM 4349 HE ARG A 271 -13.457 6.840 -13.651 1.00 0.00 H -ATOM 4350 HH12 ARG A 271 -10.655 5.211 -11.252 1.00 0.00 H -ATOM 4351 HH11 ARG A 271 -11.841 6.249 -10.488 1.00 0.00 H -ATOM 4352 HH22 ARG A 271 -10.709 4.797 -13.484 1.00 0.00 H -ATOM 4353 HH21 ARG A 271 -11.994 5.462 -14.461 1.00 0.00 H -ATOM 4354 N PRO A 272 -19.457 8.193 -12.687 1.00 26.80 N -ATOM 4355 CA PRO A 272 -20.580 8.360 -13.644 1.00 26.98 C -ATOM 4356 C PRO A 272 -20.040 8.453 -15.093 1.00 32.02 C -ATOM 4357 O PRO A 272 -19.047 9.139 -15.326 1.00 31.35 O -ATOM 4358 CB PRO A 272 -21.215 9.701 -13.215 1.00 28.34 C -ATOM 4359 CG PRO A 272 -20.065 10.514 -12.637 1.00 31.76 C -ATOM 4360 CD PRO A 272 -19.186 9.453 -11.979 1.00 27.47 C -ATOM 4361 HA PRO A 272 -21.308 7.549 -13.559 1.00 0.00 H -ATOM 4362 HB2 PRO A 272 -21.736 10.230 -14.015 1.00 0.00 H -ATOM 4363 HB3 PRO A 272 -21.954 9.512 -12.434 1.00 0.00 H -ATOM 4364 HG2 PRO A 272 -19.514 10.994 -13.446 1.00 0.00 H -ATOM 4365 HG3 PRO A 272 -20.385 11.297 -11.949 1.00 0.00 H -ATOM 4366 HD3 PRO A 272 -19.467 9.330 -10.932 1.00 0.00 H -ATOM 4367 HD2 PRO A 272 -18.135 9.741 -12.024 1.00 0.00 H -ATOM 4368 N THR A 273 -20.712 7.798 -16.058 1.00 29.10 N -ATOM 4369 CA THR A 273 -20.384 7.878 -17.501 1.00 28.91 C -ATOM 4370 C THR A 273 -20.686 9.312 -18.033 1.00 29.63 C -ATOM 4371 O THR A 273 -21.425 10.074 -17.403 1.00 26.66 O -ATOM 4372 CB THR A 273 -21.184 6.844 -18.364 1.00 34.86 C -ATOM 4373 OG1 THR A 273 -22.553 7.166 -18.543 1.00 34.53 O -ATOM 4374 CG2 THR A 273 -21.116 5.403 -17.828 1.00 35.90 C -ATOM 4375 H THR A 273 -21.542 7.273 -15.819 1.00 0.00 H -ATOM 4376 HA THR A 273 -19.315 7.677 -17.615 1.00 0.00 H -ATOM 4377 HB THR A 273 -20.752 6.836 -19.365 1.00 0.00 H -ATOM 4378 HG1 THR A 273 -23.042 6.848 -17.779 1.00 0.00 H -ATOM 4379 HG21 THR A 273 -21.579 4.700 -18.523 1.00 0.00 H -ATOM 4380 HG22 THR A 273 -20.083 5.087 -17.684 1.00 0.00 H -ATOM 4381 HG23 THR A 273 -21.626 5.301 -16.869 1.00 0.00 H -ATOM 4382 N PHE A 274 -20.125 9.653 -19.208 1.00 26.26 N -ATOM 4383 CA PHE A 274 -20.350 10.940 -19.895 1.00 25.89 C -ATOM 4384 C PHE A 274 -21.826 11.124 -20.335 1.00 30.07 C -ATOM 4385 O PHE A 274 -22.274 12.267 -20.351 1.00 29.53 O -ATOM 4386 CB PHE A 274 -19.368 11.109 -21.073 1.00 27.11 C -ATOM 4387 CG PHE A 274 -17.959 11.481 -20.644 1.00 25.98 C -ATOM 4388 CD1 PHE A 274 -17.715 12.755 -20.081 1.00 26.41 C -ATOM 4389 CD2 PHE A 274 -16.880 10.581 -20.801 1.00 27.86 C -ATOM 4390 CE1 PHE A 274 -16.423 13.131 -19.729 1.00 26.21 C -ATOM 4391 CE2 PHE A 274 -15.595 10.968 -20.423 1.00 29.34 C -ATOM 4392 CZ PHE A 274 -15.365 12.242 -19.905 1.00 25.75 C -ATOM 4393 H PHE A 274 -19.508 9.001 -19.675 1.00 0.00 H -ATOM 4394 HA PHE A 274 -20.155 11.741 -19.180 1.00 0.00 H -ATOM 4395 HB2 PHE A 274 -19.345 10.211 -21.693 1.00 0.00 H -ATOM 4396 HB3 PHE A 274 -19.701 11.907 -21.735 1.00 0.00 H -ATOM 4397 HD1 PHE A 274 -18.534 13.437 -19.932 1.00 0.00 H -ATOM 4398 HD2 PHE A 274 -17.052 9.604 -21.220 1.00 0.00 H -ATOM 4399 HE1 PHE A 274 -16.250 14.117 -19.326 1.00 0.00 H -ATOM 4400 HE2 PHE A 274 -14.771 10.285 -20.544 1.00 0.00 H -ATOM 4401 HZ PHE A 274 -14.364 12.539 -19.639 1.00 0.00 H -ATOM 4402 N GLU A 275 -22.584 10.035 -20.584 1.00 27.87 N -ATOM 4403 CA GLU A 275 -24.033 10.050 -20.860 1.00 28.69 C -ATOM 4404 C GLU A 275 -24.863 10.292 -19.568 1.00 33.26 C -ATOM 4405 O GLU A 275 -25.992 10.767 -19.702 1.00 32.51 O -ATOM 4406 CB GLU A 275 -24.455 8.715 -21.517 1.00 31.37 C -ATOM 4407 CG GLU A 275 -23.994 8.596 -22.989 1.00 44.54 C -ATOM 4408 CD GLU A 275 -24.326 7.263 -23.673 1.00 68.84 C -ATOM 4409 OE1 GLU A 275 -24.892 6.366 -23.009 1.00 67.02 O -ATOM 4410 OE2 GLU A 275 -23.973 7.154 -24.869 1.00 62.94 O1- -ATOM 4411 H GLU A 275 -22.153 9.120 -20.545 1.00 0.00 H -ATOM 4412 HA GLU A 275 -24.259 10.862 -21.552 1.00 0.00 H -ATOM 4413 HB2 GLU A 275 -24.072 7.876 -20.931 1.00 0.00 H -ATOM 4414 HB3 GLU A 275 -25.543 8.619 -21.499 1.00 0.00 H -ATOM 4415 HG2 GLU A 275 -24.444 9.397 -23.577 1.00 0.00 H -ATOM 4416 HG3 GLU A 275 -22.916 8.742 -23.054 1.00 0.00 H -ATOM 4417 N ASN A 276 -24.324 10.016 -18.360 1.00 30.86 N -ATOM 4418 CA ASN A 276 -24.959 10.334 -17.062 1.00 30.74 C -ATOM 4419 C ASN A 276 -24.661 11.811 -16.683 1.00 32.00 C -ATOM 4420 O ASN A 276 -25.510 12.416 -16.031 1.00 31.36 O -ATOM 4421 CB ASN A 276 -24.433 9.421 -15.911 1.00 30.05 C -ATOM 4422 CG ASN A 276 -24.532 7.902 -16.120 1.00 41.44 C -ATOM 4423 OD1 ASN A 276 -23.639 7.162 -15.714 1.00 30.45 O -ATOM 4424 ND2 ASN A 276 -25.605 7.411 -16.742 1.00 30.02 N -ATOM 4425 H ASN A 276 -23.388 9.636 -18.315 1.00 0.00 H -ATOM 4426 HA ASN A 276 -26.042 10.207 -17.139 1.00 0.00 H -ATOM 4427 HB2 ASN A 276 -23.387 9.652 -15.700 1.00 0.00 H -ATOM 4428 HB3 ASN A 276 -24.972 9.647 -14.990 1.00 0.00 H -ATOM 4429 HD22 ASN A 276 -25.678 6.416 -16.901 1.00 0.00 H -ATOM 4430 HD21 ASN A 276 -26.339 8.021 -17.074 1.00 0.00 H -ATOM 4431 N LEU A 277 -23.505 12.377 -17.092 1.00 27.37 N -ATOM 4432 CA LEU A 277 -23.022 13.712 -16.700 1.00 26.17 C -ATOM 4433 C LEU A 277 -23.729 14.838 -17.502 1.00 30.32 C -ATOM 4434 O LEU A 277 -23.896 15.914 -16.930 1.00 29.57 O -ATOM 4435 CB LEU A 277 -21.487 13.784 -16.918 1.00 24.98 C -ATOM 4436 CG LEU A 277 -20.649 13.110 -15.802 1.00 27.47 C -ATOM 4437 CD1 LEU A 277 -19.207 12.842 -16.270 1.00 26.17 C -ATOM 4438 CD2 LEU A 277 -20.647 13.934 -14.499 1.00 28.90 C -ATOM 4439 H LEU A 277 -22.856 11.817 -17.627 1.00 0.00 H -ATOM 4440 HA LEU A 277 -23.247 13.879 -15.645 1.00 0.00 H -ATOM 4441 HB2 LEU A 277 -21.243 13.342 -17.885 1.00 0.00 H -ATOM 4442 HB3 LEU A 277 -21.157 14.822 -16.995 1.00 0.00 H -ATOM 4443 HG LEU A 277 -21.092 12.138 -15.579 1.00 0.00 H -ATOM 4444 HD11 LEU A 277 -18.614 12.388 -15.476 1.00 0.00 H -ATOM 4445 HD12 LEU A 277 -19.182 12.157 -17.117 1.00 0.00 H -ATOM 4446 HD13 LEU A 277 -18.707 13.762 -16.575 1.00 0.00 H -ATOM 4447 HD21 LEU A 277 -20.063 13.442 -13.722 1.00 0.00 H -ATOM 4448 HD22 LEU A 277 -20.216 14.923 -14.659 1.00 0.00 H -ATOM 4449 HD23 LEU A 277 -21.650 14.072 -14.096 1.00 0.00 H -ATOM 4450 N ILE A 278 -24.162 14.600 -18.760 1.00 27.97 N -ATOM 4451 CA ILE A 278 -24.843 15.565 -19.655 1.00 28.85 C -ATOM 4452 C ILE A 278 -26.159 16.123 -19.020 1.00 33.75 C -ATOM 4453 O ILE A 278 -26.233 17.346 -18.889 1.00 32.47 O -ATOM 4454 CB ILE A 278 -25.095 15.002 -21.097 1.00 32.86 C -ATOM 4455 CG1 ILE A 278 -23.757 14.766 -21.837 1.00 32.40 C -ATOM 4456 CG2 ILE A 278 -26.040 15.851 -21.988 1.00 34.79 C -ATOM 4457 CD1 ILE A 278 -23.853 13.756 -22.991 1.00 41.27 C -ATOM 4458 H ILE A 278 -23.968 13.696 -19.168 1.00 0.00 H -ATOM 4459 HA ILE A 278 -24.164 16.416 -19.759 1.00 0.00 H -ATOM 4460 HB ILE A 278 -25.560 14.023 -20.983 1.00 0.00 H -ATOM 4461 HG12 ILE A 278 -23.354 15.710 -22.198 1.00 0.00 H -ATOM 4462 HG13 ILE A 278 -23.005 14.414 -21.140 1.00 0.00 H -ATOM 4463 HG21 ILE A 278 -26.150 15.423 -22.984 1.00 0.00 H -ATOM 4464 HG22 ILE A 278 -27.046 15.922 -21.576 1.00 0.00 H -ATOM 4465 HG23 ILE A 278 -25.654 16.864 -22.110 1.00 0.00 H -ATOM 4466 HD11 ILE A 278 -22.862 13.510 -23.362 1.00 0.00 H -ATOM 4467 HD12 ILE A 278 -24.315 12.824 -22.670 1.00 0.00 H -ATOM 4468 HD13 ILE A 278 -24.431 14.144 -23.828 1.00 0.00 H -ATOM 4469 N PRO A 279 -27.154 15.278 -18.619 1.00 32.13 N -ATOM 4470 CA PRO A 279 -28.425 15.768 -18.024 1.00 32.58 C -ATOM 4471 C PRO A 279 -28.266 16.414 -16.621 1.00 34.66 C -ATOM 4472 O PRO A 279 -29.113 17.235 -16.265 1.00 34.80 O -ATOM 4473 CB PRO A 279 -29.327 14.519 -17.952 1.00 35.43 C -ATOM 4474 CG PRO A 279 -28.356 13.351 -17.904 1.00 39.58 C -ATOM 4475 CD PRO A 279 -27.223 13.822 -18.809 1.00 34.49 C -ATOM 4476 HA PRO A 279 -28.883 16.505 -18.688 1.00 0.00 H -ATOM 4477 HB2 PRO A 279 -30.030 14.507 -17.117 1.00 0.00 H -ATOM 4478 HB3 PRO A 279 -29.925 14.455 -18.863 1.00 0.00 H -ATOM 4479 HG2 PRO A 279 -27.988 13.226 -16.885 1.00 0.00 H -ATOM 4480 HG3 PRO A 279 -28.795 12.404 -18.219 1.00 0.00 H -ATOM 4481 HD3 PRO A 279 -27.478 13.618 -19.850 1.00 0.00 H -ATOM 4482 HD2 PRO A 279 -26.306 13.287 -18.578 1.00 0.00 H -ATOM 4483 N ILE A 280 -27.194 16.084 -15.870 1.00 31.51 N -ATOM 4484 CA ILE A 280 -26.874 16.664 -14.552 1.00 32.13 C -ATOM 4485 C ILE A 280 -26.269 18.080 -14.779 1.00 34.20 C -ATOM 4486 O ILE A 280 -26.726 19.012 -14.121 1.00 33.26 O -ATOM 4487 CB ILE A 280 -25.848 15.796 -13.740 1.00 35.61 C -ATOM 4488 CG1 ILE A 280 -26.405 14.370 -13.473 1.00 36.57 C -ATOM 4489 CG2 ILE A 280 -25.402 16.451 -12.406 1.00 37.22 C -ATOM 4490 CD1 ILE A 280 -25.373 13.361 -12.936 1.00 41.21 C -ATOM 4491 H ILE A 280 -26.531 15.411 -16.228 1.00 0.00 H -ATOM 4492 HA ILE A 280 -27.792 16.756 -13.964 1.00 0.00 H -ATOM 4493 HB ILE A 280 -24.952 15.676 -14.354 1.00 0.00 H -ATOM 4494 HG12 ILE A 280 -27.246 14.426 -12.781 1.00 0.00 H -ATOM 4495 HG13 ILE A 280 -26.818 13.958 -14.393 1.00 0.00 H -ATOM 4496 HG21 ILE A 280 -24.687 15.831 -11.867 1.00 0.00 H -ATOM 4497 HG22 ILE A 280 -24.912 17.412 -12.557 1.00 0.00 H -ATOM 4498 HG23 ILE A 280 -26.253 16.619 -11.746 1.00 0.00 H -ATOM 4499 HD11 ILE A 280 -25.803 12.360 -12.883 1.00 0.00 H -ATOM 4500 HD12 ILE A 280 -24.496 13.305 -13.581 1.00 0.00 H -ATOM 4501 HD13 ILE A 280 -25.035 13.613 -11.931 1.00 0.00 H -ATOM 4502 N LEU A 281 -25.309 18.237 -15.715 1.00 29.74 N -ATOM 4503 CA LEU A 281 -24.609 19.500 -16.019 1.00 29.80 C -ATOM 4504 C LEU A 281 -25.504 20.484 -16.826 1.00 35.11 C -ATOM 4505 O LEU A 281 -25.173 21.668 -16.839 1.00 36.14 O -ATOM 4506 CB LEU A 281 -23.293 19.197 -16.778 1.00 29.09 C -ATOM 4507 CG LEU A 281 -22.190 18.549 -15.901 1.00 32.75 C -ATOM 4508 CD1 LEU A 281 -21.092 17.930 -16.776 1.00 32.66 C -ATOM 4509 CD2 LEU A 281 -21.577 19.528 -14.878 1.00 36.03 C -ATOM 4510 H LEU A 281 -24.981 17.425 -16.223 1.00 0.00 H -ATOM 4511 HA LEU A 281 -24.361 19.998 -15.083 1.00 0.00 H -ATOM 4512 HB2 LEU A 281 -23.519 18.556 -17.633 1.00 0.00 H -ATOM 4513 HB3 LEU A 281 -22.881 20.112 -17.207 1.00 0.00 H -ATOM 4514 HG LEU A 281 -22.638 17.727 -15.339 1.00 0.00 H -ATOM 4515 HD11 LEU A 281 -20.380 17.366 -16.172 1.00 0.00 H -ATOM 4516 HD12 LEU A 281 -21.513 17.242 -17.508 1.00 0.00 H -ATOM 4517 HD13 LEU A 281 -20.538 18.694 -17.320 1.00 0.00 H -ATOM 4518 HD21 LEU A 281 -20.793 19.044 -14.294 1.00 0.00 H -ATOM 4519 HD22 LEU A 281 -21.133 20.395 -15.371 1.00 0.00 H -ATOM 4520 HD23 LEU A 281 -22.317 19.895 -14.167 1.00 0.00 H -ATOM 4521 N LYS A 282 -26.626 20.027 -17.423 1.00 32.29 N -ATOM 4522 CA LYS A 282 -27.678 20.854 -18.047 1.00 33.11 C -ATOM 4523 C LYS A 282 -28.574 21.489 -16.949 1.00 37.39 C -ATOM 4524 O LYS A 282 -28.944 22.654 -17.098 1.00 37.67 O -ATOM 4525 CB LYS A 282 -28.552 19.970 -18.977 1.00 37.22 C -ATOM 4526 CG LYS A 282 -27.958 19.807 -20.386 1.00 43.25 C -ATOM 4527 CD LYS A 282 -28.748 18.846 -21.290 1.00 49.41 C -ATOM 4528 CE LYS A 282 -28.200 18.824 -22.728 1.00 57.38 C -ATOM 4529 NZ LYS A 282 -28.912 17.847 -23.568 1.00 64.71 N1+ -ATOM 4530 H LYS A 282 -26.816 19.035 -17.391 1.00 0.00 H -ATOM 4531 HA LYS A 282 -27.226 21.662 -18.626 1.00 0.00 H -ATOM 4532 HB2 LYS A 282 -28.710 18.989 -18.526 1.00 0.00 H -ATOM 4533 HB3 LYS A 282 -29.550 20.397 -19.094 1.00 0.00 H -ATOM 4534 HG2 LYS A 282 -27.916 20.789 -20.860 1.00 0.00 H -ATOM 4535 HG3 LYS A 282 -26.930 19.456 -20.311 1.00 0.00 H -ATOM 4536 HD2 LYS A 282 -28.713 17.843 -20.861 1.00 0.00 H -ATOM 4537 HD3 LYS A 282 -29.799 19.140 -21.305 1.00 0.00 H -ATOM 4538 HE2 LYS A 282 -28.294 19.811 -23.183 1.00 0.00 H -ATOM 4539 HE3 LYS A 282 -27.137 18.579 -22.730 1.00 0.00 H -ATOM 4540 HZ1 LYS A 282 -28.522 17.860 -24.500 1.00 0.00 H -ATOM 4541 HZ2 LYS A 282 -28.808 16.923 -23.174 1.00 0.00 H -ATOM 4542 HZ3 LYS A 282 -29.892 18.087 -23.609 1.00 0.00 H -ATOM 4543 N THR A 283 -28.875 20.747 -15.862 1.00 34.80 N -ATOM 4544 CA THR A 283 -29.728 21.177 -14.734 1.00 35.33 C -ATOM 4545 C THR A 283 -28.898 22.091 -13.785 1.00 39.05 C -ATOM 4546 O THR A 283 -29.450 23.071 -13.284 1.00 39.67 O -ATOM 4547 CB THR A 283 -30.204 19.954 -13.884 1.00 44.81 C -ATOM 4548 OG1 THR A 283 -30.907 19.047 -14.717 1.00 44.59 O -ATOM 4549 CG2 THR A 283 -31.170 20.298 -12.729 1.00 42.98 C -ATOM 4550 H THR A 283 -28.505 19.810 -15.798 1.00 0.00 H -ATOM 4551 HA THR A 283 -30.598 21.720 -15.112 1.00 0.00 H -ATOM 4552 HB THR A 283 -29.349 19.411 -13.475 1.00 0.00 H -ATOM 4553 HG1 THR A 283 -30.271 18.481 -15.165 1.00 0.00 H -ATOM 4554 HG21 THR A 283 -31.515 19.396 -12.220 1.00 0.00 H -ATOM 4555 HG22 THR A 283 -30.693 20.921 -11.973 1.00 0.00 H -ATOM 4556 HG23 THR A 283 -32.050 20.831 -13.089 1.00 0.00 H -ATOM 4557 N VAL A 284 -27.595 21.800 -13.596 1.00 34.64 N -ATOM 4558 CA VAL A 284 -26.635 22.566 -12.783 1.00 35.04 C -ATOM 4559 C VAL A 284 -26.222 23.870 -13.535 1.00 37.21 C -ATOM 4560 O VAL A 284 -26.022 24.874 -12.854 1.00 35.63 O -ATOM 4561 CB VAL A 284 -25.376 21.689 -12.459 1.00 39.11 C -ATOM 4562 CG1 VAL A 284 -24.102 22.428 -11.999 1.00 39.01 C -ATOM 4563 CG2 VAL A 284 -25.720 20.589 -11.431 1.00 39.06 C -ATOM 4564 H VAL A 284 -27.220 20.969 -14.035 1.00 0.00 H -ATOM 4565 HA VAL A 284 -27.110 22.858 -11.843 1.00 0.00 H -ATOM 4566 HB VAL A 284 -25.096 21.177 -13.379 1.00 0.00 H -ATOM 4567 HG11 VAL A 284 -23.306 21.723 -11.760 1.00 0.00 H -ATOM 4568 HG12 VAL A 284 -23.716 23.066 -12.789 1.00 0.00 H -ATOM 4569 HG13 VAL A 284 -24.286 23.042 -11.119 1.00 0.00 H -ATOM 4570 HG21 VAL A 284 -24.895 19.885 -11.311 1.00 0.00 H -ATOM 4571 HG22 VAL A 284 -25.934 21.018 -10.451 1.00 0.00 H -ATOM 4572 HG23 VAL A 284 -26.594 20.010 -11.725 1.00 0.00 H -ATOM 4573 N HID A 285 -26.198 23.892 -14.888 1.00 33.86 N -ATOM 4574 CA HID A 285 -26.024 25.103 -15.721 1.00 34.98 C -ATOM 4575 C HID A 285 -27.250 26.040 -15.531 1.00 39.49 C -ATOM 4576 O HID A 285 -27.042 27.226 -15.281 1.00 38.50 O -ATOM 4577 CB HID A 285 -25.834 24.712 -17.212 1.00 35.81 C -ATOM 4578 CG HID A 285 -25.919 25.845 -18.214 1.00 39.76 C -ATOM 4579 ND1 HID A 285 -24.928 26.796 -18.367 1.00 41.19 N -ATOM 4580 CD2 HID A 285 -26.910 26.203 -19.102 1.00 42.70 C -ATOM 4581 CE1 HID A 285 -25.341 27.654 -19.302 1.00 41.61 C -ATOM 4582 NE2 HID A 285 -26.539 27.361 -19.790 1.00 43.01 N -ATOM 4583 H HID A 285 -26.367 23.034 -15.395 1.00 0.00 H -ATOM 4584 HA HID A 285 -25.129 25.636 -15.389 1.00 0.00 H -ATOM 4585 HB2 HID A 285 -24.861 24.238 -17.341 1.00 0.00 H -ATOM 4586 HB3 HID A 285 -26.572 23.965 -17.506 1.00 0.00 H -ATOM 4587 HD1 HID A 285 -24.046 26.842 -17.871 1.00 0.00 H -ATOM 4588 HD2 HID A 285 -27.865 25.730 -19.281 1.00 0.00 H -ATOM 4589 HE1 HID A 285 -24.751 28.493 -19.639 1.00 0.00 H -ATOM 4590 N GLU A 286 -28.482 25.489 -15.608 1.00 37.68 N -ATOM 4591 CA GLU A 286 -29.778 26.182 -15.462 1.00 39.70 C -ATOM 4592 C GLU A 286 -29.950 26.844 -14.069 1.00 42.94 C -ATOM 4593 O GLU A 286 -30.608 27.882 -13.996 1.00 44.72 O -ATOM 4594 CB GLU A 286 -30.939 25.186 -15.756 1.00 42.32 C -ATOM 4595 CG GLU A 286 -31.481 25.242 -17.205 1.00 60.01 C -ATOM 4596 CD GLU A 286 -32.250 26.525 -17.574 1.00 92.87 C -ATOM 4597 OE1 GLU A 286 -32.618 27.291 -16.655 1.00 94.43 O -ATOM 4598 OE2 GLU A 286 -32.467 26.711 -18.790 1.00 90.73 O1- -ATOM 4599 H GLU A 286 -28.552 24.506 -15.831 1.00 0.00 H -ATOM 4600 HA GLU A 286 -29.795 26.993 -16.194 1.00 0.00 H -ATOM 4601 HB2 GLU A 286 -30.626 24.164 -15.541 1.00 0.00 H -ATOM 4602 HB3 GLU A 286 -31.781 25.343 -15.077 1.00 0.00 H -ATOM 4603 HG2 GLU A 286 -30.659 25.105 -17.908 1.00 0.00 H -ATOM 4604 HG3 GLU A 286 -32.161 24.404 -17.363 1.00 0.00 H -ATOM 4605 N LYS A 287 -29.342 26.275 -13.007 1.00 37.93 N -ATOM 4606 CA LYS A 287 -29.421 26.745 -11.614 1.00 37.53 C -ATOM 4607 C LYS A 287 -28.641 28.077 -11.442 1.00 41.18 C -ATOM 4608 O LYS A 287 -29.167 28.972 -10.780 1.00 39.68 O -ATOM 4609 CB LYS A 287 -28.854 25.645 -10.678 1.00 38.66 C -ATOM 4610 CG LYS A 287 -28.948 25.978 -9.173 1.00 48.52 C -ATOM 4611 CD LYS A 287 -28.440 24.843 -8.265 1.00 57.93 C -ATOM 4612 CE LYS A 287 -28.351 25.229 -6.776 1.00 71.38 C -ATOM 4613 NZ LYS A 287 -29.659 25.615 -6.216 1.00 86.87 N1+ -ATOM 4614 H LYS A 287 -28.826 25.418 -13.151 1.00 0.00 H -ATOM 4615 HA LYS A 287 -30.471 26.912 -11.362 1.00 0.00 H -ATOM 4616 HB2 LYS A 287 -29.393 24.714 -10.862 1.00 0.00 H -ATOM 4617 HB3 LYS A 287 -27.813 25.436 -10.932 1.00 0.00 H -ATOM 4618 HG2 LYS A 287 -28.362 26.874 -8.961 1.00 0.00 H -ATOM 4619 HG3 LYS A 287 -29.981 26.220 -8.922 1.00 0.00 H -ATOM 4620 HD2 LYS A 287 -29.075 23.964 -8.383 1.00 0.00 H -ATOM 4621 HD3 LYS A 287 -27.447 24.540 -8.599 1.00 0.00 H -ATOM 4622 HE2 LYS A 287 -27.957 24.393 -6.197 1.00 0.00 H -ATOM 4623 HE3 LYS A 287 -27.658 26.060 -6.641 1.00 0.00 H -ATOM 4624 HZ1 LYS A 287 -29.553 25.856 -5.241 1.00 0.00 H -ATOM 4625 HZ2 LYS A 287 -30.018 26.413 -6.721 1.00 0.00 H -ATOM 4626 HZ3 LYS A 287 -30.304 24.843 -6.305 1.00 0.00 H -ATOM 4627 N TYR A 288 -27.425 28.188 -12.014 1.00 37.88 N -ATOM 4628 CA TYR A 288 -26.502 29.318 -11.792 1.00 38.84 C -ATOM 4629 C TYR A 288 -26.541 30.330 -12.970 1.00 43.27 C -ATOM 4630 O TYR A 288 -25.881 31.365 -12.848 1.00 45.60 O -ATOM 4631 CB TYR A 288 -25.070 28.763 -11.554 1.00 39.66 C -ATOM 4632 CG TYR A 288 -24.949 27.886 -10.309 1.00 42.14 C -ATOM 4633 CD1 TYR A 288 -25.164 28.439 -9.022 1.00 44.87 C -ATOM 4634 CD2 TYR A 288 -24.670 26.503 -10.427 1.00 42.46 C -ATOM 4635 CE1 TYR A 288 -25.142 27.611 -7.876 1.00 44.19 C -ATOM 4636 CE2 TYR A 288 -24.660 25.671 -9.284 1.00 43.50 C -ATOM 4637 CZ TYR A 288 -24.910 26.223 -8.009 1.00 49.64 C -ATOM 4638 OH TYR A 288 -24.945 25.413 -6.910 1.00 54.89 O -ATOM 4639 H TYR A 288 -27.073 27.426 -12.577 1.00 0.00 H -ATOM 4640 HA TYR A 288 -26.795 29.880 -10.902 1.00 0.00 H -ATOM 4641 HB2 TYR A 288 -24.734 28.205 -12.431 1.00 0.00 H -ATOM 4642 HB3 TYR A 288 -24.359 29.584 -11.441 1.00 0.00 H -ATOM 4643 HD1 TYR A 288 -25.372 29.493 -8.911 1.00 0.00 H -ATOM 4644 HD2 TYR A 288 -24.483 26.074 -11.395 1.00 0.00 H -ATOM 4645 HE1 TYR A 288 -25.329 28.036 -6.900 1.00 0.00 H -ATOM 4646 HE2 TYR A 288 -24.470 24.613 -9.392 1.00 0.00 H -ATOM 4647 HH TYR A 288 -24.909 24.477 -7.132 1.00 0.00 H -ATOM 4648 N GLN A 289 -27.286 30.065 -14.067 1.00 37.76 N -ATOM 4649 CA GLN A 289 -27.477 30.967 -15.221 1.00 53.07 C -ATOM 4650 C GLN A 289 -28.576 31.979 -14.913 1.00 74.57 C -ATOM 4651 O GLN A 289 -29.217 32.029 -13.861 1.00 46.90 O -ATOM 4652 CB GLN A 289 -27.793 30.137 -16.497 1.00 0.00 C -ATOM 4653 CG GLN A 289 -27.960 30.919 -17.828 1.00 0.00 C -ATOM 4654 CD GLN A 289 -26.716 31.716 -18.249 1.00 0.00 C -ATOM 4655 OE1 GLN A 289 -26.718 32.943 -18.226 1.00 0.00 O -ATOM 4656 NE2 GLN A 289 -25.645 31.024 -18.640 1.00 0.00 N -ATOM 4657 HB2 GLN A 289 -27.009 29.395 -16.645 1.00 0.00 H -ATOM 4658 HB3 GLN A 289 -28.700 29.551 -16.330 1.00 0.00 H -ATOM 4659 HG2 GLN A 289 -28.199 30.216 -18.628 1.00 0.00 H -ATOM 4660 HG3 GLN A 289 -28.817 31.591 -17.769 1.00 0.00 H -ATOM 4661 HE22 GLN A 289 -24.805 31.510 -18.918 1.00 0.00 H -ATOM 4662 HE21 GLN A 289 -25.672 30.015 -18.651 1.00 0.00 H -ATOM 4663 H GLN A 289 -27.793 29.192 -14.109 1.00 0.00 H -ATOM 4664 HA GLN A 289 -26.548 31.512 -15.399 1.00 0.00 H -ATOM 4665 CA NMA A 290 -29.865 33.940 -15.759 1.00 0.00 C -ATOM 4666 N NMA A 290 -28.811 32.886 -15.926 1.00 0.00 N -ATOM 4667 HA1 NMA A 290 -29.906 34.559 -16.655 1.00 0.00 H -ATOM 4668 HA2 NMA A 290 -30.833 33.465 -15.602 1.00 0.00 H -ATOM 4669 HA3 NMA A 290 -29.623 34.564 -14.898 1.00 0.00 H -ATOM 4670 H NMA A 290 -28.273 32.840 -16.780 1.00 0.00 H diff --git a/tutorials/Tyk2/setupFEP/water.pdb b/tutorials/Tyk2/setupFEP/water.pdb index 7e83f2dd..cce909b2 100644 --- a/tutorials/Tyk2/setupFEP/water.pdb +++ b/tutorials/Tyk2/setupFEP/water.pdb @@ -1,2941 +1,2941 @@ TITLE Water Sphere Generated with Qprep: COG -4.689 26.119 -30.570 -ATOM 4687 O HOH 291 -29.506 26.119 -30.570 -ATOM 4688 H1 HOH 291 -28.725 25.862 -30.078 -ATOM 4689 H2 HOH 291 -29.679 25.377 -31.149 -ATOM 4690 O HOH 292 -26.403 16.813 -36.774 -ATOM 4691 H1 HOH 292 -26.037 16.197 -37.408 -ATOM 4692 H2 HOH 292 -26.045 16.533 -35.932 -ATOM 4693 O HOH 293 -26.403 16.813 -33.672 -ATOM 4694 H1 HOH 293 -26.568 17.215 -32.819 -ATOM 4695 H2 HOH 293 -27.204 16.974 -34.171 -ATOM 4696 O HOH 294 -26.403 16.813 -30.570 -ATOM 4697 H1 HOH 294 -26.463 17.436 -29.846 -ATOM 4698 H2 HOH 294 -25.646 16.268 -30.357 -ATOM 4699 O HOH 295 -26.403 19.915 -39.876 -ATOM 4700 H1 HOH 295 -26.703 20.631 -40.437 -ATOM 4701 H2 HOH 295 -26.045 19.268 -40.484 -ATOM 4702 O HOH 296 -26.403 19.915 -36.774 -ATOM 4703 H1 HOH 296 -25.999 19.816 -35.912 -ATOM 4704 H2 HOH 296 -26.014 19.219 -37.303 -ATOM 4705 O HOH 297 -26.403 19.915 -33.672 -ATOM 4706 H1 HOH 297 -26.842 20.499 -33.054 -ATOM 4707 H2 HOH 297 -25.992 19.248 -33.122 -ATOM 4708 O HOH 298 -26.403 23.017 -39.876 -ATOM 4709 H1 HOH 298 -26.028 22.649 -40.676 -ATOM 4710 H2 HOH 298 -27.121 23.571 -40.182 -ATOM 4711 O HOH 299 -26.403 23.017 -36.774 -ATOM 4712 H1 HOH 299 -27.136 22.405 -36.847 -ATOM 4713 H2 HOH 299 -26.732 23.832 -37.154 -ATOM 4714 O HOH 300 -26.403 23.017 -33.672 -ATOM 4715 H1 HOH 300 -25.719 22.661 -34.239 -ATOM 4716 H2 HOH 300 -25.978 23.735 -33.204 -ATOM 4717 O HOH 301 -26.403 23.017 -30.570 -ATOM 4718 H1 HOH 301 -26.564 23.884 -30.198 -ATOM 4719 H2 HOH 301 -27.238 22.768 -30.967 -ATOM 4720 O HOH 302 -26.403 23.017 -27.468 -ATOM 4721 H1 HOH 302 -26.783 22.234 -27.866 -ATOM 4722 H2 HOH 302 -25.885 23.414 -28.168 -ATOM 4723 O HOH 303 -26.403 26.119 -39.876 -ATOM 4724 H1 HOH 303 -25.966 25.864 -39.064 -ATOM 4725 H2 HOH 303 -27.295 26.343 -39.609 -ATOM 4726 O HOH 304 -26.403 26.119 -36.774 -ATOM 4727 H1 HOH 304 -27.246 26.005 -37.214 -ATOM 4728 H2 HOH 304 -25.784 25.623 -37.309 -ATOM 4729 O HOH 305 -26.403 26.119 -33.672 -ATOM 4730 H1 HOH 305 -26.758 26.586 -34.429 -ATOM 4731 H2 HOH 305 -25.500 26.427 -33.601 -ATOM 4732 O HOH 306 -26.403 26.119 -30.570 -ATOM 4733 H1 HOH 306 -25.808 26.376 -31.274 -ATOM 4734 H2 HOH 306 -26.296 26.798 -29.904 -ATOM 4735 O HOH 307 -26.403 26.119 -27.468 -ATOM 4736 H1 HOH 307 -26.015 25.589 -28.164 -ATOM 4737 H2 HOH 307 -27.343 26.106 -27.652 -ATOM 4738 O HOH 308 -26.403 26.119 -24.366 -ATOM 4739 H1 HOH 308 -25.772 26.690 -24.803 -ATOM 4740 H2 HOH 308 -26.100 25.232 -24.559 -ATOM 4741 O HOH 309 -26.403 29.221 -39.876 -ATOM 4742 H1 HOH 309 -25.688 29.849 -39.980 -ATOM 4743 H2 HOH 309 -27.068 29.694 -39.375 -ATOM 4744 O HOH 310 -26.403 29.221 -36.774 -ATOM 4745 H1 HOH 310 -26.555 28.999 -35.855 -ATOM 4746 H2 HOH 310 -27.280 29.287 -37.153 -ATOM 4747 O HOH 311 -26.403 29.221 -33.672 -ATOM 4748 H1 HOH 311 -25.726 28.590 -33.430 -ATOM 4749 H2 HOH 311 -27.023 28.718 -34.201 -ATOM 4750 O HOH 312 -26.403 29.221 -30.570 -ATOM 4751 H1 HOH 312 -25.798 29.914 -30.835 -ATOM 4752 H2 HOH 312 -26.739 28.868 -31.394 -ATOM 4753 O HOH 313 -26.403 29.221 -27.468 -ATOM 4754 H1 HOH 313 -25.878 28.820 -26.775 -ATOM 4755 H2 HOH 313 -26.009 28.906 -28.281 -ATOM 4756 O HOH 314 -26.403 29.221 -24.366 -ATOM 4757 H1 HOH 314 -26.920 29.597 -23.653 -ATOM 4758 H2 HOH 314 -26.868 29.481 -25.161 -ATOM 4759 O HOH 315 -26.403 32.323 -39.876 -ATOM 4760 H1 HOH 315 -25.836 31.838 -39.277 -ATOM 4761 H2 HOH 315 -25.802 32.847 -40.406 -ATOM 4762 O HOH 316 -26.403 32.323 -36.774 -ATOM 4763 H1 HOH 316 -26.202 32.938 -37.480 -ATOM 4764 H2 HOH 316 -27.074 31.747 -37.142 -ATOM 4765 O HOH 317 -26.403 32.323 -33.672 -ATOM 4766 H1 HOH 317 -25.631 32.288 -33.108 -ATOM 4767 H2 HOH 317 -26.869 33.111 -33.392 -ATOM 4768 O HOH 318 -26.403 32.323 -30.570 -ATOM 4769 H1 HOH 318 -27.003 31.642 -30.266 -ATOM 4770 H2 HOH 318 -26.878 33.142 -30.426 -ATOM 4771 O HOH 319 -26.403 32.323 -27.468 -ATOM 4772 H1 HOH 319 -26.569 32.407 -26.529 -ATOM 4773 H2 HOH 319 -26.118 31.417 -27.581 -ATOM 4774 O HOH 320 -26.403 35.425 -36.774 -ATOM 4775 H1 HOH 320 -27.256 35.756 -37.056 -ATOM 4776 H2 HOH 320 -26.610 34.707 -36.176 -ATOM 4777 O HOH 321 -26.403 35.425 -33.672 -ATOM 4778 H1 HOH 321 -26.452 36.237 -33.168 -ATOM 4779 H2 HOH 321 -26.938 35.592 -34.449 -ATOM 4780 O HOH 322 -26.403 35.425 -30.570 -ATOM 4781 H1 HOH 322 -26.050 34.714 -30.035 -ATOM 4782 H2 HOH 322 -25.966 35.328 -31.416 -ATOM 4783 O HOH 323 -26.403 35.425 -27.468 -ATOM 4784 H1 HOH 323 -25.859 34.726 -27.828 -ATOM 4785 H2 HOH 323 -25.833 35.877 -26.846 -ATOM 4786 O HOH 324 -26.403 35.425 -24.366 -ATOM 4787 H1 HOH 324 -26.596 34.725 -24.989 -ATOM 4788 H2 HOH 324 -25.745 35.052 -23.780 -ATOM 4789 O HOH 325 -23.301 10.609 -33.672 -ATOM 4790 H1 HOH 325 -22.994 11.356 -33.159 -ATOM 4791 H2 HOH 325 -23.218 10.892 -34.583 -ATOM 4792 O HOH 326 -23.301 10.609 -30.570 -ATOM 4793 H1 HOH 326 -23.468 10.027 -29.829 -ATOM 4794 H2 HOH 326 -24.171 10.882 -30.861 -ATOM 4795 O HOH 327 -23.301 10.609 -27.468 -ATOM 4796 H1 HOH 327 -23.905 11.176 -26.988 -ATOM 4797 H2 HOH 327 -22.439 10.996 -27.319 -ATOM 4798 O HOH 328 -23.301 13.711 -39.876 -ATOM 4799 H1 HOH 328 -23.286 13.008 -39.227 -ATOM 4800 H2 HOH 328 -22.401 13.760 -40.198 -ATOM 4801 O HOH 329 -23.301 13.711 -36.774 -ATOM 4802 H1 HOH 329 -23.793 13.274 -37.470 -ATOM 4803 H2 HOH 329 -23.833 14.473 -36.547 -ATOM 4804 O HOH 330 -23.301 13.711 -33.672 -ATOM 4805 H1 HOH 330 -22.713 14.156 -34.282 -ATOM 4806 H2 HOH 330 -24.125 13.626 -34.152 -ATOM 4807 O HOH 331 -23.301 16.813 -42.978 -ATOM 4808 H1 HOH 331 -23.567 17.368 -43.711 -ATOM 4809 H2 HOH 331 -23.910 16.075 -43.003 -ATOM 4810 O HOH 332 -23.301 16.813 -36.774 -ATOM 4811 H1 HOH 332 -22.621 16.349 -36.286 -ATOM 4812 H2 HOH 332 -23.469 17.602 -36.260 -ATOM 4813 O HOH 333 -23.301 16.813 -33.672 -ATOM 4814 H1 HOH 333 -23.739 17.653 -33.536 -ATOM 4815 H2 HOH 333 -23.387 16.648 -34.611 -ATOM 4816 O HOH 334 -23.301 19.915 -42.978 -ATOM 4817 H1 HOH 334 -23.261 20.847 -43.191 -ATOM 4818 H2 HOH 334 -23.675 19.886 -42.097 -ATOM 4819 O HOH 335 -23.301 19.915 -36.774 -ATOM 4820 H1 HOH 335 -24.033 19.852 -36.161 -ATOM 4821 H2 HOH 335 -23.089 20.848 -36.799 -ATOM 4822 O HOH 336 -23.301 23.017 -46.080 -ATOM 4823 H1 HOH 336 -22.735 22.261 -46.237 -ATOM 4824 H2 HOH 336 -24.186 22.652 -46.053 -ATOM 4825 O HOH 337 -23.301 23.017 -42.978 -ATOM 4826 H1 HOH 337 -23.665 23.733 -42.456 -ATOM 4827 H2 HOH 337 -23.496 22.228 -42.472 -ATOM 4828 O HOH 338 -23.301 23.017 -39.876 -ATOM 4829 H1 HOH 338 -23.308 22.181 -39.410 -ATOM 4830 H2 HOH 338 -22.683 22.886 -40.595 -ATOM 4831 O HOH 339 -23.301 23.017 -36.774 -ATOM 4832 H1 HOH 339 -22.899 23.670 -37.347 -ATOM 4833 H2 HOH 339 -22.596 22.745 -36.187 -ATOM 4834 O HOH 340 -23.301 26.119 -46.080 -ATOM 4835 H1 HOH 340 -23.011 25.799 -46.934 -ATOM 4836 H2 HOH 340 -22.841 25.567 -45.448 -ATOM 4837 O HOH 341 -23.301 26.119 -42.978 -ATOM 4838 H1 HOH 341 -24.109 25.999 -43.477 -ATOM 4839 H2 HOH 341 -22.824 25.297 -43.094 -ATOM 4840 O HOH 342 -23.301 26.119 -39.876 -ATOM 4841 H1 HOH 342 -23.487 25.180 -39.858 -ATOM 4842 H2 HOH 342 -23.827 26.452 -40.604 -ATOM 4843 O HOH 343 -23.301 26.119 -36.774 -ATOM 4844 H1 HOH 343 -24.124 26.347 -37.206 -ATOM 4845 H2 HOH 343 -23.121 25.223 -37.059 -ATOM 4846 O HOH 344 -23.301 26.119 -33.672 -ATOM 4847 H1 HOH 344 -23.642 26.815 -33.109 -ATOM 4848 H2 HOH 344 -24.023 25.495 -33.744 -ATOM 4849 O HOH 345 -23.301 26.119 -30.570 -ATOM 4850 H1 HOH 345 -23.112 26.912 -30.068 -ATOM 4851 H2 HOH 345 -23.119 26.361 -31.478 -ATOM 4852 O HOH 346 -23.301 29.221 -46.080 -ATOM 4853 H1 HOH 346 -22.625 28.679 -46.486 -ATOM 4854 H2 HOH 346 -24.126 28.814 -46.346 -ATOM 4855 O HOH 347 -23.301 29.221 -42.978 -ATOM 4856 H1 HOH 347 -23.714 28.922 -43.788 -ATOM 4857 H2 HOH 347 -23.672 30.090 -42.827 -ATOM 4858 O HOH 348 -23.301 29.221 -39.876 -ATOM 4859 H1 HOH 348 -24.015 28.889 -40.421 -ATOM 4860 H2 HOH 348 -22.827 28.437 -39.599 -ATOM 4861 O HOH 349 -23.301 29.221 -36.774 -ATOM 4862 H1 HOH 349 -23.808 29.326 -35.969 -ATOM 4863 H2 HOH 349 -23.892 29.514 -37.468 -ATOM 4864 O HOH 350 -23.301 29.221 -33.672 -ATOM 4865 H1 HOH 350 -23.891 28.784 -34.287 -ATOM 4866 H2 HOH 350 -22.785 28.512 -33.290 -ATOM 4867 O HOH 351 -23.301 29.221 -30.570 -ATOM 4868 H1 HOH 351 -22.724 28.619 -31.039 -ATOM 4869 H2 HOH 351 -24.184 28.898 -30.752 -ATOM 4870 O HOH 352 -23.301 32.323 -42.978 -ATOM 4871 H1 HOH 352 -24.131 32.091 -42.562 -ATOM 4872 H2 HOH 352 -23.194 33.256 -42.795 -ATOM 4873 O HOH 353 -23.301 32.323 -39.876 -ATOM 4874 H1 HOH 353 -22.809 33.119 -40.077 -ATOM 4875 H2 HOH 353 -23.268 32.255 -38.922 -ATOM 4876 O HOH 354 -23.301 32.323 -36.774 -ATOM 4877 H1 HOH 354 -22.873 33.009 -37.287 -ATOM 4878 H2 HOH 354 -23.548 32.754 -35.956 -ATOM 4879 O HOH 355 -23.301 32.323 -33.672 -ATOM 4880 H1 HOH 355 -22.442 32.743 -33.624 -ATOM 4881 H2 HOH 355 -23.881 32.907 -33.183 -ATOM 4882 O HOH 356 -23.301 32.323 -30.570 -ATOM 4883 H1 HOH 356 -22.691 31.773 -31.061 -ATOM 4884 H2 HOH 356 -22.751 32.790 -29.941 -ATOM 4885 O HOH 357 -23.301 35.425 -42.978 -ATOM 4886 H1 HOH 357 -22.729 36.016 -42.490 -ATOM 4887 H2 HOH 357 -23.424 35.854 -43.825 -ATOM 4888 O HOH 358 -23.301 35.425 -39.876 -ATOM 4889 H1 HOH 358 -22.856 35.433 -40.723 -ATOM 4890 H2 HOH 358 -24.213 35.634 -40.082 -ATOM 4891 O HOH 359 -23.301 35.425 -36.774 -ATOM 4892 H1 HOH 359 -24.057 35.031 -37.211 -ATOM 4893 H2 HOH 359 -22.549 34.935 -37.107 -ATOM 4894 O HOH 360 -23.301 35.425 -33.672 -ATOM 4895 H1 HOH 360 -22.945 36.268 -33.954 -ATOM 4896 H2 HOH 360 -23.464 35.535 -32.735 -ATOM 4897 O HOH 361 -23.301 35.425 -30.570 -ATOM 4898 H1 HOH 361 -23.187 36.015 -29.824 -ATOM 4899 H2 HOH 361 -23.564 34.592 -30.179 -ATOM 4900 O HOH 362 -23.301 35.425 -27.468 -ATOM 4901 H1 HOH 362 -23.985 34.958 -27.949 -ATOM 4902 H2 HOH 362 -22.487 34.998 -27.733 -ATOM 4903 O HOH 363 -23.301 35.425 -24.366 -ATOM 4904 H1 HOH 363 -22.391 35.186 -24.541 -ATOM 4905 H2 HOH 363 -23.272 35.880 -23.524 -ATOM 4906 O HOH 364 -23.301 35.425 -18.162 -ATOM 4907 H1 HOH 364 -23.882 35.684 -17.446 -ATOM 4908 H2 HOH 364 -23.879 35.011 -18.802 -ATOM 4909 O HOH 365 -23.301 38.527 -39.876 -ATOM 4910 H1 HOH 365 -24.035 38.113 -40.331 -ATOM 4911 H2 HOH 365 -23.699 39.246 -39.385 -ATOM 4912 O HOH 366 -23.301 38.527 -36.774 -ATOM 4913 H1 HOH 366 -23.494 38.877 -37.644 -ATOM 4914 H2 HOH 366 -23.734 37.674 -36.758 -ATOM 4915 O HOH 367 -23.301 38.527 -33.672 -ATOM 4916 H1 HOH 367 -23.798 37.898 -33.149 -ATOM 4917 H2 HOH 367 -23.848 39.313 -33.685 -ATOM 4918 O HOH 368 -23.301 38.527 -30.570 -ATOM 4919 H1 HOH 368 -23.574 39.385 -30.243 -ATOM 4920 H2 HOH 368 -22.422 38.402 -30.213 -ATOM 4921 O HOH 369 -23.301 38.527 -27.468 -ATOM 4922 H1 HOH 369 -22.581 39.082 -27.168 -ATOM 4923 H2 HOH 369 -24.017 38.713 -26.860 -ATOM 4924 O HOH 370 -23.301 38.527 -24.366 -ATOM 4925 H1 HOH 370 -23.083 39.010 -23.569 -ATOM 4926 H2 HOH 370 -24.258 38.534 -24.396 -ATOM 4927 O HOH 371 -23.301 38.527 -21.264 -ATOM 4928 H1 HOH 371 -23.069 38.904 -20.415 -ATOM 4929 H2 HOH 371 -22.507 38.614 -21.791 -ATOM 4930 O HOH 372 -23.301 41.629 -33.672 -ATOM 4931 H1 HOH 372 -22.444 41.433 -34.049 -ATOM 4932 H2 HOH 372 -23.396 41.005 -32.953 -ATOM 4933 O HOH 373 -23.301 41.629 -30.570 -ATOM 4934 H1 HOH 373 -24.201 41.376 -30.365 -ATOM 4935 H2 HOH 373 -22.959 41.986 -29.750 -ATOM 4936 O HOH 374 -23.301 41.629 -27.468 -ATOM 4937 H1 HOH 374 -22.929 41.591 -26.587 -ATOM 4938 H2 HOH 374 -23.397 40.713 -27.729 -ATOM 4939 O HOH 375 -20.199 10.609 -39.876 -ATOM 4940 H1 HOH 375 -19.447 10.151 -40.252 -ATOM 4941 H2 HOH 375 -19.833 11.124 -39.157 -ATOM 4942 O HOH 376 -20.199 13.711 -42.978 -ATOM 4943 H1 HOH 376 -20.756 14.488 -42.939 -ATOM 4944 H2 HOH 376 -19.392 14.014 -43.393 -ATOM 4945 O HOH 377 -20.199 16.813 -46.080 -ATOM 4946 H1 HOH 377 -20.709 16.254 -45.494 -ATOM 4947 H2 HOH 377 -19.322 16.827 -45.697 -ATOM 4948 O HOH 378 -20.199 16.813 -42.978 -ATOM 4949 H1 HOH 378 -20.071 17.405 -42.238 -ATOM 4950 H2 HOH 378 -21.066 16.432 -42.834 -ATOM 4951 O HOH 379 -20.199 19.915 -46.080 -ATOM 4952 H1 HOH 379 -20.542 19.271 -45.461 -ATOM 4953 H2 HOH 379 -19.580 20.434 -45.568 -ATOM 4954 O HOH 380 -20.199 19.915 -36.774 -ATOM 4955 H1 HOH 380 -19.649 20.424 -37.370 -ATOM 4956 H2 HOH 380 -19.773 19.059 -36.726 -ATOM 4957 O HOH 381 -20.199 23.017 -49.182 -ATOM 4958 H1 HOH 381 -19.538 22.610 -48.623 -ATOM 4959 H2 HOH 381 -20.873 22.345 -49.285 -ATOM 4960 O HOH 382 -20.199 23.017 -46.080 -ATOM 4961 H1 HOH 382 -19.508 22.527 -46.526 -ATOM 4962 H2 HOH 382 -19.739 23.723 -45.626 -ATOM 4963 O HOH 383 -20.199 23.017 -42.978 -ATOM 4964 H1 HOH 383 -19.843 22.626 -43.776 -ATOM 4965 H2 HOH 383 -19.429 23.251 -42.461 -ATOM 4966 O HOH 384 -20.199 23.017 -39.876 -ATOM 4967 H1 HOH 384 -20.221 23.947 -39.651 -ATOM 4968 H2 HOH 384 -20.138 22.567 -39.033 -ATOM 4969 O HOH 385 -20.199 23.017 -36.774 -ATOM 4970 H1 HOH 385 -19.651 22.387 -36.307 -ATOM 4971 H2 HOH 385 -20.821 22.478 -37.262 -ATOM 4972 O HOH 386 -20.199 26.119 -49.182 -ATOM 4973 H1 HOH 386 -19.960 25.393 -48.607 -ATOM 4974 H2 HOH 386 -19.363 26.456 -49.504 -ATOM 4975 O HOH 387 -20.199 26.119 -46.080 -ATOM 4976 H1 HOH 387 -19.902 25.653 -45.299 -ATOM 4977 H2 HOH 387 -21.154 26.125 -46.007 -ATOM 4978 O HOH 388 -20.199 26.119 -42.978 -ATOM 4979 H1 HOH 388 -19.346 25.695 -42.884 -ATOM 4980 H2 HOH 388 -20.798 25.567 -42.475 -ATOM 4981 O HOH 389 -20.199 26.119 -39.876 -ATOM 4982 H1 HOH 389 -19.792 25.578 -39.200 -ATOM 4983 H2 HOH 389 -20.806 25.528 -40.323 -ATOM 4984 O HOH 390 -20.199 26.119 -36.774 -ATOM 4985 H1 HOH 390 -20.639 25.282 -36.924 -ATOM 4986 H2 HOH 390 -19.299 25.881 -36.554 -ATOM 4987 O HOH 391 -20.199 29.221 -49.182 -ATOM 4988 H1 HOH 391 -20.099 29.983 -48.612 -ATOM 4989 H2 HOH 391 -20.535 28.533 -48.607 -ATOM 4990 O HOH 392 -20.199 29.221 -46.080 -ATOM 4991 H1 HOH 392 -20.626 28.415 -46.370 -ATOM 4992 H2 HOH 392 -19.506 28.927 -45.489 -ATOM 4993 O HOH 393 -20.199 29.221 -42.978 -ATOM 4994 H1 HOH 393 -20.294 29.717 -43.791 -ATOM 4995 H2 HOH 393 -20.004 28.328 -43.263 -ATOM 4996 O HOH 394 -20.199 29.221 -39.876 -ATOM 4997 H1 HOH 394 -21.096 28.910 -39.751 -ATOM 4998 H2 HOH 394 -19.677 28.698 -39.268 -ATOM 4999 O HOH 395 -20.199 29.221 -36.774 -ATOM 5000 H1 HOH 395 -19.942 30.141 -36.718 -ATOM 5001 H2 HOH 395 -19.405 28.766 -37.054 -ATOM 5002 O HOH 396 -20.199 32.323 -46.080 -ATOM 5003 H1 HOH 396 -19.580 32.972 -46.415 -ATOM 5004 H2 HOH 396 -19.939 31.504 -46.502 -ATOM 5005 O HOH 397 -20.199 32.323 -42.978 -ATOM 5006 H1 HOH 397 -19.846 32.271 -43.866 -ATOM 5007 H2 HOH 397 -20.458 33.239 -42.876 -ATOM 5008 O HOH 398 -20.199 32.323 -39.876 -ATOM 5009 H1 HOH 398 -21.001 32.595 -39.428 -ATOM 5010 H2 HOH 398 -20.457 31.554 -40.384 -ATOM 5011 O HOH 399 -20.199 32.323 -36.774 -ATOM 5012 H1 HOH 399 -19.810 32.844 -36.072 -ATOM 5013 H2 HOH 399 -20.490 31.519 -36.344 -ATOM 5014 O HOH 400 -20.199 32.323 -33.672 -ATOM 5015 H1 HOH 400 -20.373 31.452 -34.029 -ATOM 5016 H2 HOH 400 -20.755 32.909 -34.187 -ATOM 5017 O HOH 401 -20.199 35.425 -46.080 -ATOM 5018 H1 HOH 401 -19.498 34.968 -46.545 -ATOM 5019 H2 HOH 401 -20.225 36.295 -46.480 -ATOM 5020 O HOH 402 -20.199 35.425 -42.978 -ATOM 5021 H1 HOH 402 -20.234 36.300 -43.364 -ATOM 5022 H2 HOH 402 -20.691 35.504 -42.161 -ATOM 5023 O HOH 403 -20.199 35.425 -39.876 -ATOM 5024 H1 HOH 403 -19.811 36.052 -39.266 -ATOM 5025 H2 HOH 403 -19.499 35.232 -40.500 -ATOM 5026 O HOH 404 -20.199 35.425 -36.774 -ATOM 5027 H1 HOH 404 -20.711 34.819 -36.239 -ATOM 5028 H2 HOH 404 -19.697 34.861 -37.361 -ATOM 5029 O HOH 405 -20.199 35.425 -33.672 -ATOM 5030 H1 HOH 405 -19.449 35.115 -33.166 -ATOM 5031 H2 HOH 405 -20.913 34.834 -33.430 -ATOM 5032 O HOH 406 -20.199 35.425 -30.570 -ATOM 5033 H1 HOH 406 -20.935 35.194 -30.002 -ATOM 5034 H2 HOH 406 -20.352 36.342 -30.798 -ATOM 5035 O HOH 407 -20.199 35.425 -18.162 -ATOM 5036 H1 HOH 407 -20.646 35.265 -18.993 -ATOM 5037 H2 HOH 407 -20.192 34.573 -17.726 -ATOM 5038 O HOH 408 -20.199 38.527 -42.978 -ATOM 5039 H1 HOH 408 -20.122 39.477 -43.066 -ATOM 5040 H2 HOH 408 -19.598 38.176 -43.635 -ATOM 5041 O HOH 409 -20.199 38.527 -39.876 -ATOM 5042 H1 HOH 409 -19.532 38.061 -39.372 -ATOM 5043 H2 HOH 409 -20.508 39.216 -39.287 -ATOM 5044 O HOH 410 -20.199 38.527 -36.774 -ATOM 5045 H1 HOH 410 -21.012 38.933 -36.474 -ATOM 5046 H2 HOH 410 -20.003 37.865 -36.112 -ATOM 5047 O HOH 411 -20.199 38.527 -33.672 -ATOM 5048 H1 HOH 411 -20.181 37.573 -33.749 -ATOM 5049 H2 HOH 411 -20.459 38.689 -32.765 -ATOM 5050 O HOH 412 -20.199 38.527 -30.570 -ATOM 5051 H1 HOH 412 -19.663 38.302 -29.810 -ATOM 5052 H2 HOH 412 -19.567 38.755 -31.251 -ATOM 5053 O HOH 413 -20.199 38.527 -27.468 -ATOM 5054 H1 HOH 413 -19.599 39.269 -27.545 -ATOM 5055 H2 HOH 413 -20.821 38.646 -28.186 -ATOM 5056 O HOH 414 -20.199 38.527 -21.264 -ATOM 5057 H1 HOH 414 -20.708 39.335 -21.185 -ATOM 5058 H2 HOH 414 -19.635 38.672 -22.024 -ATOM 5059 O HOH 415 -20.199 38.527 -18.162 -ATOM 5060 H1 HOH 415 -19.358 38.959 -18.013 -ATOM 5061 H2 HOH 415 -20.080 37.643 -17.816 -ATOM 5062 O HOH 416 -20.199 41.629 -39.876 -ATOM 5063 H1 HOH 416 -20.647 42.108 -40.573 -ATOM 5064 H2 HOH 416 -20.323 42.170 -39.096 -ATOM 5065 O HOH 417 -20.199 41.629 -36.774 -ATOM 5066 H1 HOH 417 -19.802 40.761 -36.705 -ATOM 5067 H2 HOH 417 -19.517 42.230 -36.475 -ATOM 5068 O HOH 418 -20.199 41.629 -33.672 -ATOM 5069 H1 HOH 418 -19.625 41.969 -32.986 -ATOM 5070 H2 HOH 418 -20.456 40.761 -33.362 -ATOM 5071 O HOH 419 -20.199 41.629 -30.570 -ATOM 5072 H1 HOH 419 -20.224 40.740 -30.216 -ATOM 5073 H2 HOH 419 -19.687 42.127 -29.933 -ATOM 5074 O HOH 420 -20.199 41.629 -27.468 -ATOM 5075 H1 HOH 420 -20.768 42.120 -26.874 -ATOM 5076 H2 HOH 420 -19.616 41.138 -26.890 -ATOM 5077 O HOH 421 -20.199 41.629 -24.366 -ATOM 5078 H1 HOH 421 -20.064 41.991 -23.490 -ATOM 5079 H2 HOH 421 -19.316 41.507 -24.713 -ATOM 5080 O HOH 422 -20.199 41.629 -21.264 -ATOM 5081 H1 HOH 422 -20.746 41.119 -21.861 -ATOM 5082 H2 HOH 422 -19.402 41.109 -21.163 -ATOM 5083 O HOH 423 -20.199 44.731 -33.672 -ATOM 5084 H1 HOH 423 -19.921 44.872 -32.767 -ATOM 5085 H2 HOH 423 -20.779 43.971 -33.630 -ATOM 5086 O HOH 424 -20.199 44.731 -30.570 -ATOM 5087 H1 HOH 424 -19.262 44.896 -30.472 -ATOM 5088 H2 HOH 424 -20.282 44.321 -31.431 -ATOM 5089 O HOH 425 -20.199 44.731 -27.468 -ATOM 5090 H1 HOH 425 -19.499 44.469 -26.871 -ATOM 5091 H2 HOH 425 -21.002 44.617 -26.960 -ATOM 5092 O HOH 426 -17.097 7.507 -39.876 -ATOM 5093 H1 HOH 426 -16.952 7.554 -38.931 -ATOM 5094 H2 HOH 426 -16.334 7.940 -40.258 -ATOM 5095 O HOH 427 -17.097 10.609 -42.978 -ATOM 5096 H1 HOH 427 -17.609 9.951 -42.507 -ATOM 5097 H2 HOH 427 -17.516 10.669 -43.837 -ATOM 5098 O HOH 428 -17.097 13.711 -46.080 -ATOM 5099 H1 HOH 428 -16.556 13.750 -45.292 -ATOM 5100 H2 HOH 428 -16.808 12.917 -46.531 -ATOM 5101 O HOH 429 -17.097 13.711 -42.978 -ATOM 5102 H1 HOH 429 -18.025 13.915 -43.097 -ATOM 5103 H2 HOH 429 -16.871 14.105 -42.136 -ATOM 5104 O HOH 430 -17.097 16.813 -49.182 -ATOM 5105 H1 HOH 430 -16.387 16.172 -49.220 -ATOM 5106 H2 HOH 430 -17.387 16.796 -48.270 -ATOM 5107 O HOH 431 -17.097 16.813 -46.080 -ATOM 5108 H1 HOH 431 -17.778 16.542 -46.697 -ATOM 5109 H2 HOH 431 -17.136 16.163 -45.379 -ATOM 5110 O HOH 432 -17.097 16.813 -42.978 -ATOM 5111 H1 HOH 432 -17.870 16.965 -42.434 -ATOM 5112 H2 HOH 432 -16.769 17.689 -43.180 -ATOM 5113 O HOH 433 -17.097 19.915 -49.182 -ATOM 5114 H1 HOH 433 -16.158 19.953 -49.363 -ATOM 5115 H2 HOH 433 -17.170 19.353 -48.411 -ATOM 5116 O HOH 434 -17.097 19.915 -46.080 -ATOM 5117 H1 HOH 434 -16.175 20.059 -46.291 -ATOM 5118 H2 HOH 434 -17.083 19.275 -45.369 -ATOM 5119 O HOH 435 -17.097 23.017 -49.182 -ATOM 5120 H1 HOH 435 -16.374 22.398 -49.286 -ATOM 5121 H2 HOH 435 -17.361 22.926 -48.267 -ATOM 5122 O HOH 436 -17.097 23.017 -46.080 -ATOM 5123 H1 HOH 436 -16.400 23.469 -46.556 -ATOM 5124 H2 HOH 436 -16.761 22.928 -45.189 -ATOM 5125 O HOH 437 -17.097 26.119 -49.182 -ATOM 5126 H1 HOH 437 -17.219 25.855 -48.270 -ATOM 5127 H2 HOH 437 -16.923 27.059 -49.139 -ATOM 5128 O HOH 438 -17.097 26.119 -46.080 -ATOM 5129 H1 HOH 438 -17.516 25.538 -45.445 -ATOM 5130 H2 HOH 438 -16.544 25.541 -46.606 -ATOM 5131 O HOH 439 -17.097 26.119 -42.978 -ATOM 5132 H1 HOH 439 -17.937 26.155 -43.437 -ATOM 5133 H2 HOH 439 -16.656 25.353 -43.345 -ATOM 5134 O HOH 440 -17.097 26.119 -39.876 -ATOM 5135 H1 HOH 440 -16.492 26.837 -40.062 -ATOM 5136 H2 HOH 440 -17.529 26.374 -39.061 -ATOM 5137 O HOH 441 -17.097 26.119 -36.774 -ATOM 5138 H1 HOH 441 -16.460 26.629 -37.274 -ATOM 5139 H2 HOH 441 -17.937 26.309 -37.192 -ATOM 5140 O HOH 442 -17.097 29.221 -49.182 -ATOM 5141 H1 HOH 442 -17.358 29.942 -48.609 -ATOM 5142 H2 HOH 442 -17.677 29.295 -49.941 -ATOM 5143 O HOH 443 -17.097 29.221 -46.080 -ATOM 5144 H1 HOH 443 -17.527 28.832 -45.319 -ATOM 5145 H2 HOH 443 -17.431 30.118 -46.113 -ATOM 5146 O HOH 444 -17.097 29.221 -42.978 -ATOM 5147 H1 HOH 444 -16.832 28.370 -42.630 -ATOM 5148 H2 HOH 444 -16.298 29.585 -43.358 -ATOM 5149 O HOH 445 -17.097 29.221 -39.876 -ATOM 5150 H1 HOH 445 -17.096 28.329 -39.529 -ATOM 5151 H2 HOH 445 -17.412 29.128 -40.775 -ATOM 5152 O HOH 446 -17.097 29.221 -36.774 -ATOM 5153 H1 HOH 446 -16.703 28.591 -36.170 -ATOM 5154 H2 HOH 446 -17.965 29.393 -36.409 -ATOM 5155 O HOH 447 -17.097 32.323 -49.182 -ATOM 5156 H1 HOH 447 -16.644 31.728 -49.779 -ATOM 5157 H2 HOH 447 -17.486 31.751 -48.521 -ATOM 5158 O HOH 448 -17.097 32.323 -46.080 -ATOM 5159 H1 HOH 448 -17.007 32.887 -45.312 -ATOM 5160 H2 HOH 448 -17.822 32.705 -46.575 -ATOM 5161 O HOH 449 -17.097 32.323 -42.978 -ATOM 5162 H1 HOH 449 -16.686 32.669 -42.186 -ATOM 5163 H2 HOH 449 -17.694 33.016 -43.261 -ATOM 5164 O HOH 450 -17.097 32.323 -39.876 -ATOM 5165 H1 HOH 450 -18.027 32.505 -39.740 -ATOM 5166 H2 HOH 450 -16.851 31.763 -39.140 -ATOM 5167 O HOH 451 -17.097 32.323 -36.774 -ATOM 5168 H1 HOH 451 -16.897 31.740 -36.042 -ATOM 5169 H2 HOH 451 -17.915 32.752 -36.522 -ATOM 5170 O HOH 452 -17.097 32.323 -33.672 -ATOM 5171 H1 HOH 452 -16.765 32.948 -33.027 -ATOM 5172 H2 HOH 452 -17.996 32.606 -33.840 -ATOM 5173 O HOH 453 -17.097 32.323 -11.958 -ATOM 5174 H1 HOH 453 -17.753 31.687 -12.243 -ATOM 5175 H2 HOH 453 -17.022 32.182 -11.014 -ATOM 5176 O HOH 454 -17.097 35.425 -49.182 -ATOM 5177 H1 HOH 454 -17.459 36.220 -49.574 -ATOM 5178 H2 HOH 454 -17.708 35.205 -48.479 -ATOM 5179 O HOH 455 -17.097 35.425 -46.080 -ATOM 5180 H1 HOH 455 -17.516 35.590 -45.236 -ATOM 5181 H2 HOH 455 -16.784 34.523 -46.021 -ATOM 5182 O HOH 456 -17.097 35.425 -42.978 -ATOM 5183 H1 HOH 456 -16.159 35.258 -42.890 -ATOM 5184 H2 HOH 456 -17.285 36.097 -42.322 -ATOM 5185 O HOH 457 -17.097 35.425 -39.876 -ATOM 5186 H1 HOH 457 -17.129 34.510 -39.597 -ATOM 5187 H2 HOH 457 -17.063 35.383 -40.832 -ATOM 5188 O HOH 458 -17.097 35.425 -36.774 -ATOM 5189 H1 HOH 458 -17.673 36.185 -36.686 -ATOM 5190 H2 HOH 458 -17.312 34.873 -36.022 -ATOM 5191 O HOH 459 -17.097 35.425 -33.672 -ATOM 5192 H1 HOH 459 -17.782 35.479 -33.006 -ATOM 5193 H2 HOH 459 -16.445 34.833 -33.298 -ATOM 5194 O HOH 460 -17.097 35.425 -30.570 -ATOM 5195 H1 HOH 460 -16.601 36.187 -30.272 -ATOM 5196 H2 HOH 460 -17.807 35.792 -31.098 -ATOM 5197 O HOH 461 -17.097 35.425 -27.468 -ATOM 5198 H1 HOH 461 -16.895 36.115 -28.100 -ATOM 5199 H2 HOH 461 -17.463 34.716 -27.997 -ATOM 5200 O HOH 462 -17.097 35.425 -11.958 -ATOM 5201 H1 HOH 462 -16.888 35.622 -11.045 -ATOM 5202 H2 HOH 462 -18.054 35.411 -11.986 -ATOM 5203 O HOH 463 -17.097 38.527 -46.080 -ATOM 5204 H1 HOH 463 -17.125 39.222 -45.422 -ATOM 5205 H2 HOH 463 -17.004 38.990 -46.913 -ATOM 5206 O HOH 464 -17.097 38.527 -42.978 -ATOM 5207 H1 HOH 464 -16.314 38.004 -42.806 -ATOM 5208 H2 HOH 464 -17.628 38.434 -42.187 -ATOM 5209 O HOH 465 -17.097 38.527 -39.876 -ATOM 5210 H1 HOH 465 -16.808 37.787 -40.410 -ATOM 5211 H2 HOH 465 -17.158 38.173 -38.989 -ATOM 5212 O HOH 466 -17.097 38.527 -36.774 -ATOM 5213 H1 HOH 466 -16.373 38.280 -36.198 -ATOM 5214 H2 HOH 466 -17.804 37.924 -36.544 -ATOM 5215 O HOH 467 -17.097 38.527 -33.672 -ATOM 5216 H1 HOH 467 -17.822 37.981 -33.367 -ATOM 5217 H2 HOH 467 -16.341 38.227 -33.167 -ATOM 5218 O HOH 468 -17.097 38.527 -30.570 -ATOM 5219 H1 HOH 468 -16.346 39.117 -30.508 -ATOM 5220 H2 HOH 468 -17.850 39.073 -30.342 -ATOM 5221 O HOH 469 -17.097 38.527 -27.468 -ATOM 5222 H1 HOH 469 -17.831 38.550 -26.854 -ATOM 5223 H2 HOH 469 -16.533 39.251 -27.195 -ATOM 5224 O HOH 470 -17.097 38.527 -24.366 -ATOM 5225 H1 HOH 470 -17.326 39.354 -24.791 -ATOM 5226 H2 HOH 470 -16.204 38.660 -24.048 -ATOM 5227 O HOH 471 -17.097 38.527 -21.264 -ATOM 5228 H1 HOH 471 -17.745 39.094 -21.683 -ATOM 5229 H2 HOH 471 -17.599 38.021 -20.625 -ATOM 5230 O HOH 472 -17.097 38.527 -18.162 -ATOM 5231 H1 HOH 472 -17.587 38.450 -18.980 -ATOM 5232 H2 HOH 472 -16.193 38.680 -18.437 -ATOM 5233 O HOH 473 -17.097 38.527 -15.060 -ATOM 5234 H1 HOH 473 -16.971 39.265 -15.656 -ATOM 5235 H2 HOH 473 -17.641 38.879 -14.355 -ATOM 5236 O HOH 474 -17.097 41.629 -42.978 -ATOM 5237 H1 HOH 474 -16.492 41.539 -43.714 -ATOM 5238 H2 HOH 474 -16.623 41.264 -42.231 -ATOM 5239 O HOH 475 -17.097 41.629 -39.876 -ATOM 5240 H1 HOH 475 -16.835 40.928 -39.280 -ATOM 5241 H2 HOH 475 -16.417 41.640 -40.550 -ATOM 5242 O HOH 476 -17.097 41.629 -36.774 -ATOM 5243 H1 HOH 476 -17.107 40.695 -36.566 -ATOM 5244 H2 HOH 476 -17.724 41.722 -37.491 -ATOM 5245 O HOH 477 -17.097 41.629 -33.672 -ATOM 5246 H1 HOH 477 -16.759 41.075 -34.376 -ATOM 5247 H2 HOH 477 -16.845 42.518 -33.924 -ATOM 5248 O HOH 478 -17.097 41.629 -30.570 -ATOM 5249 H1 HOH 478 -17.729 40.952 -30.329 -ATOM 5250 H2 HOH 478 -17.367 42.398 -30.068 -ATOM 5251 O HOH 479 -17.097 41.629 -27.468 -ATOM 5252 H1 HOH 479 -17.194 42.209 -26.712 -ATOM 5253 H2 HOH 479 -17.428 40.783 -27.166 -ATOM 5254 O HOH 480 -17.097 41.629 -24.366 -ATOM 5255 H1 HOH 480 -17.039 40.762 -23.966 -ATOM 5256 H2 HOH 480 -16.502 41.589 -25.114 -ATOM 5257 O HOH 481 -17.097 41.629 -21.264 -ATOM 5258 H1 HOH 481 -17.109 40.704 -21.019 -ATOM 5259 H2 HOH 481 -16.358 41.709 -21.866 -ATOM 5260 O HOH 482 -17.097 41.629 -18.162 -ATOM 5261 H1 HOH 482 -17.693 42.178 -18.672 -ATOM 5262 H2 HOH 482 -17.595 41.401 -17.376 -ATOM 5263 O HOH 483 -17.097 44.731 -39.876 -ATOM 5264 H1 HOH 483 -17.955 44.487 -40.223 -ATOM 5265 H2 HOH 483 -17.183 44.628 -38.929 -ATOM 5266 O HOH 484 -17.097 44.731 -36.774 -ATOM 5267 H1 HOH 484 -16.350 44.938 -36.212 -ATOM 5268 H2 HOH 484 -17.035 45.357 -37.496 -ATOM 5269 O HOH 485 -17.097 44.731 -33.672 -ATOM 5270 H1 HOH 485 -17.689 44.915 -32.942 -ATOM 5271 H2 HOH 485 -17.575 45.026 -34.448 -ATOM 5272 O HOH 486 -17.097 44.731 -30.570 -ATOM 5273 H1 HOH 486 -16.500 45.044 -31.250 -ATOM 5274 H2 HOH 486 -16.561 44.695 -29.778 -ATOM 5275 O HOH 487 -17.097 44.731 -27.468 -ATOM 5276 H1 HOH 487 -16.559 44.795 -28.257 -ATOM 5277 H2 HOH 487 -17.780 45.391 -27.590 -ATOM 5278 O HOH 488 -17.097 44.731 -24.366 -ATOM 5279 H1 HOH 488 -16.150 44.796 -24.487 -ATOM 5280 H2 HOH 488 -17.204 44.439 -23.461 -ATOM 5281 O HOH 489 -17.097 44.731 -21.264 -ATOM 5282 H1 HOH 489 -17.043 44.105 -20.542 -ATOM 5283 H2 HOH 489 -16.261 44.644 -21.721 -ATOM 5284 O HOH 490 -13.995 7.507 -42.978 -ATOM 5285 H1 HOH 490 -13.892 6.821 -42.318 -ATOM 5286 H2 HOH 490 -13.106 7.674 -43.291 -ATOM 5287 O HOH 491 -13.995 10.609 -46.080 -ATOM 5288 H1 HOH 491 -14.575 11.367 -46.018 -ATOM 5289 H2 HOH 491 -13.194 10.951 -46.477 -ATOM 5290 O HOH 492 -13.995 13.711 -42.978 -ATOM 5291 H1 HOH 492 -13.779 12.821 -42.700 -ATOM 5292 H2 HOH 492 -13.732 14.263 -42.242 -ATOM 5293 O HOH 493 -13.995 13.711 -27.468 -ATOM 5294 H1 HOH 493 -13.941 12.927 -28.015 -ATOM 5295 H2 HOH 493 -13.737 13.413 -26.596 -ATOM 5296 O HOH 494 -13.995 19.915 -52.284 -ATOM 5297 H1 HOH 494 -13.538 19.360 -51.653 -ATOM 5298 H2 HOH 494 -14.372 20.619 -51.757 -ATOM 5299 O HOH 495 -13.995 19.915 -49.182 -ATOM 5300 H1 HOH 495 -14.473 19.255 -49.685 -ATOM 5301 H2 HOH 495 -14.274 20.750 -49.557 -ATOM 5302 O HOH 496 -13.995 19.915 -46.080 -ATOM 5303 H1 HOH 496 -14.180 19.008 -46.326 -ATOM 5304 H2 HOH 496 -13.081 20.049 -46.330 -ATOM 5305 O HOH 497 -13.995 23.017 -52.284 -ATOM 5306 H1 HOH 497 -14.649 22.416 -52.641 -ATOM 5307 H2 HOH 497 -13.426 23.219 -53.027 -ATOM 5308 O HOH 498 -13.995 23.017 -49.182 -ATOM 5309 H1 HOH 498 -14.605 22.389 -49.570 -ATOM 5310 H2 HOH 498 -13.666 23.522 -49.926 -ATOM 5311 O HOH 499 -13.995 23.017 -46.080 -ATOM 5312 H1 HOH 499 -13.770 22.967 -45.151 -ATOM 5313 H2 HOH 499 -14.647 22.327 -46.206 -ATOM 5314 O HOH 500 -13.995 26.119 -52.284 -ATOM 5315 H1 HOH 500 -13.761 26.728 -51.584 -ATOM 5316 H2 HOH 500 -14.945 26.026 -52.214 -ATOM 5317 O HOH 501 -13.995 26.119 -49.182 -ATOM 5318 H1 HOH 501 -13.363 25.761 -48.559 -ATOM 5319 H2 HOH 501 -14.813 26.178 -48.688 -ATOM 5320 O HOH 502 -13.995 26.119 -46.080 -ATOM 5321 H1 HOH 502 -13.535 25.320 -45.823 -ATOM 5322 H2 HOH 502 -14.843 26.060 -45.641 -ATOM 5323 O HOH 503 -13.995 26.119 -39.876 -ATOM 5324 H1 HOH 503 -14.187 25.182 -39.906 -ATOM 5325 H2 HOH 503 -13.059 26.179 -40.067 -ATOM 5326 O HOH 504 -13.995 29.221 -52.284 -ATOM 5327 H1 HOH 504 -14.932 29.037 -52.214 -ATOM 5328 H2 HOH 504 -13.751 29.556 -51.422 -ATOM 5329 O HOH 505 -13.995 29.221 -49.182 -ATOM 5330 H1 HOH 505 -14.639 29.095 -49.880 -ATOM 5331 H2 HOH 505 -13.416 29.909 -49.511 -ATOM 5332 O HOH 506 -13.995 29.221 -39.876 -ATOM 5333 H1 HOH 506 -14.676 28.643 -39.531 -ATOM 5334 H2 HOH 506 -13.550 29.558 -39.099 -ATOM 5335 O HOH 507 -13.995 29.221 -36.774 -ATOM 5336 H1 HOH 507 -14.515 28.643 -36.216 -ATOM 5337 H2 HOH 507 -14.301 29.036 -37.662 -ATOM 5338 O HOH 508 -13.995 32.323 -52.284 -ATOM 5339 H1 HOH 508 -13.222 32.441 -52.836 -ATOM 5340 H2 HOH 508 -13.789 32.796 -51.478 -ATOM 5341 O HOH 509 -13.995 32.323 -49.182 -ATOM 5342 H1 HOH 509 -13.263 31.738 -48.987 -ATOM 5343 H2 HOH 509 -13.969 32.980 -48.487 -ATOM 5344 O HOH 510 -13.995 32.323 -39.876 -ATOM 5345 H1 HOH 510 -13.117 32.657 -40.059 -ATOM 5346 H2 HOH 510 -14.578 33.052 -40.090 -ATOM 5347 O HOH 511 -13.995 32.323 -36.774 -ATOM 5348 H1 HOH 511 -13.216 32.061 -36.284 -ATOM 5349 H2 HOH 511 -13.940 33.278 -36.819 -ATOM 5350 O HOH 512 -13.995 32.323 -8.856 -ATOM 5351 H1 HOH 512 -13.258 32.619 -8.321 -ATOM 5352 H2 HOH 512 -13.589 31.865 -9.591 -ATOM 5353 O HOH 513 -13.995 35.425 -49.182 -ATOM 5354 H1 HOH 513 -13.335 35.341 -48.494 -ATOM 5355 H2 HOH 513 -14.598 34.698 -49.027 -ATOM 5356 O HOH 514 -13.995 35.425 -46.080 -ATOM 5357 H1 HOH 514 -14.377 34.864 -45.406 -ATOM 5358 H2 HOH 514 -14.511 36.231 -46.042 -ATOM 5359 O HOH 515 -13.995 35.425 -42.978 -ATOM 5360 H1 HOH 515 -14.380 36.275 -42.764 -ATOM 5361 H2 HOH 515 -14.269 35.259 -43.880 -ATOM 5362 O HOH 516 -13.995 35.425 -39.876 -ATOM 5363 H1 HOH 516 -13.382 34.783 -39.519 -ATOM 5364 H2 HOH 516 -14.462 34.953 -40.566 -ATOM 5365 O HOH 517 -13.995 35.425 -36.774 -ATOM 5366 H1 HOH 517 -13.370 36.044 -37.151 -ATOM 5367 H2 HOH 517 -13.489 34.940 -36.123 -ATOM 5368 O HOH 518 -13.995 35.425 -33.672 -ATOM 5369 H1 HOH 518 -13.980 34.614 -34.180 -ATOM 5370 H2 HOH 518 -13.680 35.171 -32.805 -ATOM 5371 O HOH 519 -13.995 35.425 -11.958 -ATOM 5372 H1 HOH 519 -13.454 36.037 -12.457 -ATOM 5373 H2 HOH 519 -14.843 35.437 -12.402 -ATOM 5374 O HOH 520 -13.995 38.527 -49.182 -ATOM 5375 H1 HOH 520 -13.979 37.842 -48.514 -ATOM 5376 H2 HOH 520 -14.834 38.970 -49.052 -ATOM 5377 O HOH 521 -13.995 38.527 -46.080 -ATOM 5378 H1 HOH 521 -13.487 39.294 -45.816 -ATOM 5379 H2 HOH 521 -14.671 38.444 -45.408 -ATOM 5380 O HOH 522 -13.995 38.527 -42.978 -ATOM 5381 H1 HOH 522 -14.146 37.653 -42.619 -ATOM 5382 H2 HOH 522 -13.115 38.485 -43.352 -ATOM 5383 O HOH 523 -13.995 38.527 -39.876 -ATOM 5384 H1 HOH 523 -13.319 37.876 -39.690 -ATOM 5385 H2 HOH 523 -13.760 38.878 -40.735 -ATOM 5386 O HOH 524 -13.995 38.527 -36.774 -ATOM 5387 H1 HOH 524 -13.644 37.872 -36.171 -ATOM 5388 H2 HOH 524 -13.608 38.305 -37.621 -ATOM 5389 O HOH 525 -13.995 38.527 -33.672 -ATOM 5390 H1 HOH 525 -13.442 39.250 -33.376 -ATOM 5391 H2 HOH 525 -13.778 38.423 -34.599 -ATOM 5392 O HOH 526 -13.995 38.527 -30.570 -ATOM 5393 H1 HOH 526 -14.702 38.630 -29.932 -ATOM 5394 H2 HOH 526 -13.454 39.309 -30.457 -ATOM 5395 O HOH 527 -13.995 38.527 -27.468 -ATOM 5396 H1 HOH 527 -14.796 38.557 -27.992 -ATOM 5397 H2 HOH 527 -14.000 37.656 -27.072 -ATOM 5398 O HOH 528 -13.995 38.527 -24.366 -ATOM 5399 H1 HOH 528 -13.982 38.335 -25.303 -ATOM 5400 H2 HOH 528 -13.775 39.457 -24.308 -ATOM 5401 O HOH 529 -13.995 38.527 -21.264 -ATOM 5402 H1 HOH 529 -13.866 38.529 -20.315 -ATOM 5403 H2 HOH 529 -14.909 38.787 -21.383 -ATOM 5404 O HOH 530 -13.995 38.527 -11.958 -ATOM 5405 H1 HOH 530 -13.812 39.242 -11.348 -ATOM 5406 H2 HOH 530 -13.152 38.090 -12.075 -ATOM 5407 O HOH 531 -13.995 41.629 -46.080 -ATOM 5408 H1 HOH 531 -14.376 42.462 -46.358 -ATOM 5409 H2 HOH 531 -14.600 40.966 -46.413 -ATOM 5410 O HOH 532 -13.995 41.629 -42.978 -ATOM 5411 H1 HOH 532 -13.959 41.288 -43.872 -ATOM 5412 H2 HOH 532 -14.512 42.432 -43.048 -ATOM 5413 O HOH 533 -13.995 41.629 -39.876 -ATOM 5414 H1 HOH 533 -14.546 42.223 -39.366 -ATOM 5415 H2 HOH 533 -13.441 42.207 -40.401 -ATOM 5416 O HOH 534 -13.995 41.629 -36.774 -ATOM 5417 H1 HOH 534 -14.377 40.882 -36.313 -ATOM 5418 H2 HOH 534 -13.482 41.238 -37.481 -ATOM 5419 O HOH 535 -13.995 41.629 -33.672 -ATOM 5420 H1 HOH 535 -13.546 41.503 -34.508 -ATOM 5421 H2 HOH 535 -14.924 41.526 -33.881 -ATOM 5422 O HOH 536 -13.995 41.629 -30.570 -ATOM 5423 H1 HOH 536 -14.418 41.300 -29.777 -ATOM 5424 H2 HOH 536 -13.061 41.627 -30.362 -ATOM 5425 O HOH 537 -13.995 41.629 -27.468 -ATOM 5426 H1 HOH 537 -14.924 41.709 -27.250 -ATOM 5427 H2 HOH 537 -13.549 41.631 -26.621 -ATOM 5428 O HOH 538 -13.995 41.629 -24.366 -ATOM 5429 H1 HOH 538 -14.838 41.207 -24.200 -ATOM 5430 H2 HOH 538 -13.972 41.753 -25.315 -ATOM 5431 O HOH 539 -13.995 41.629 -21.264 -ATOM 5432 H1 HOH 539 -14.223 42.286 -20.606 -ATOM 5433 H2 HOH 539 -13.749 42.138 -22.036 -ATOM 5434 O HOH 540 -13.995 41.629 -18.162 -ATOM 5435 H1 HOH 540 -14.403 41.458 -17.313 -ATOM 5436 H2 HOH 540 -14.331 40.939 -18.733 -ATOM 5437 O HOH 541 -13.995 41.629 -15.060 -ATOM 5438 H1 HOH 541 -14.252 41.716 -14.142 -ATOM 5439 H2 HOH 541 -13.228 42.194 -15.149 -ATOM 5440 O HOH 542 -13.995 44.731 -42.978 -ATOM 5441 H1 HOH 542 -13.369 44.343 -42.367 -ATOM 5442 H2 HOH 542 -14.001 44.136 -43.728 -ATOM 5443 O HOH 543 -13.995 44.731 -39.876 -ATOM 5444 H1 HOH 543 -14.277 43.828 -39.733 -ATOM 5445 H2 HOH 543 -14.788 45.189 -40.157 -ATOM 5446 O HOH 544 -13.995 44.731 -36.774 -ATOM 5447 H1 HOH 544 -14.719 44.184 -37.077 -ATOM 5448 H2 HOH 544 -13.209 44.223 -36.975 -ATOM 5449 O HOH 545 -13.995 44.731 -33.672 -ATOM 5450 H1 HOH 545 -13.565 44.223 -34.359 -ATOM 5451 H2 HOH 545 -13.635 44.385 -32.856 -ATOM 5452 O HOH 546 -13.995 44.731 -30.570 -ATOM 5453 H1 HOH 546 -13.059 44.753 -30.373 -ATOM 5454 H2 HOH 546 -14.408 45.154 -29.817 -ATOM 5455 O HOH 547 -13.995 44.731 -27.468 -ATOM 5456 H1 HOH 547 -14.744 45.017 -26.944 -ATOM 5457 H2 HOH 547 -13.612 45.543 -27.802 -ATOM 5458 O HOH 548 -13.995 44.731 -24.366 -ATOM 5459 H1 HOH 548 -14.895 44.797 -24.046 -ATOM 5460 H2 HOH 548 -14.082 44.417 -25.266 -ATOM 5461 O HOH 549 -13.995 44.731 -21.264 -ATOM 5462 H1 HOH 549 -14.123 44.110 -21.981 -ATOM 5463 H2 HOH 549 -13.366 45.367 -21.606 -ATOM 5464 O HOH 550 -13.995 44.731 -18.162 -ATOM 5465 H1 HOH 550 -13.605 45.605 -18.190 -ATOM 5466 H2 HOH 550 -13.429 44.235 -17.571 -ATOM 5467 O HOH 551 -13.995 47.833 -36.774 -ATOM 5468 H1 HOH 551 -13.429 47.160 -37.151 -ATOM 5469 H2 HOH 551 -14.090 48.485 -37.469 -ATOM 5470 O HOH 552 -13.995 47.833 -33.672 -ATOM 5471 H1 HOH 552 -14.188 48.668 -34.099 -ATOM 5472 H2 HOH 552 -14.339 47.933 -32.784 -ATOM 5473 O HOH 553 -13.995 47.833 -30.570 -ATOM 5474 H1 HOH 553 -13.295 48.486 -30.552 -ATOM 5475 H2 HOH 553 -14.496 47.997 -29.771 -ATOM 5476 O HOH 554 -13.995 47.833 -27.468 -ATOM 5477 H1 HOH 554 -14.066 47.828 -26.513 -ATOM 5478 H2 HOH 554 -14.329 48.692 -27.728 -ATOM 5479 O HOH 555 -13.995 47.833 -24.366 -ATOM 5480 H1 HOH 555 -14.189 48.552 -24.967 -ATOM 5481 H2 HOH 555 -13.082 47.971 -24.113 -ATOM 5482 O HOH 556 -10.893 4.405 -39.876 -ATOM 5483 H1 HOH 556 -10.521 4.845 -40.640 -ATOM 5484 H2 HOH 556 -11.832 4.586 -39.928 -ATOM 5485 O HOH 557 -10.893 7.507 -42.978 -ATOM 5486 H1 HOH 557 -10.963 6.977 -42.184 -ATOM 5487 H2 HOH 557 -9.988 7.389 -43.267 -ATOM 5488 O HOH 558 -10.893 16.813 -52.284 -ATOM 5489 H1 HOH 558 -11.140 17.712 -52.070 -ATOM 5490 H2 HOH 558 -11.341 16.278 -51.629 -ATOM 5491 O HOH 559 -10.893 19.915 -52.284 -ATOM 5492 H1 HOH 559 -10.161 19.873 -51.669 -ATOM 5493 H2 HOH 559 -10.560 19.502 -53.081 -ATOM 5494 O HOH 560 -10.893 23.017 -52.284 -ATOM 5495 H1 HOH 560 -10.325 23.196 -51.536 -ATOM 5496 H2 HOH 560 -10.572 22.187 -52.637 -ATOM 5497 O HOH 561 -10.893 23.017 -49.182 -ATOM 5498 H1 HOH 561 -10.927 22.193 -48.697 -ATOM 5499 H2 HOH 561 -10.242 23.543 -48.718 -ATOM 5500 O HOH 562 -10.893 26.119 -52.284 -ATOM 5501 H1 HOH 562 -10.655 26.747 -52.966 -ATOM 5502 H2 HOH 562 -10.775 25.263 -52.695 -ATOM 5503 O HOH 563 -10.893 26.119 -49.182 -ATOM 5504 H1 HOH 563 -10.133 26.000 -49.752 -ATOM 5505 H2 HOH 563 -10.728 25.539 -48.439 -ATOM 5506 O HOH 564 -10.893 26.119 -46.080 -ATOM 5507 H1 HOH 564 -11.453 25.427 -45.727 -ATOM 5508 H2 HOH 564 -10.081 25.672 -46.319 -ATOM 5509 O HOH 565 -10.893 29.221 -52.284 -ATOM 5510 H1 HOH 565 -11.641 29.818 -52.322 -ATOM 5511 H2 HOH 565 -11.124 28.591 -51.602 -ATOM 5512 O HOH 566 -10.893 29.221 -49.182 -ATOM 5513 H1 HOH 566 -10.521 28.866 -49.990 -ATOM 5514 H2 HOH 566 -11.379 29.997 -49.463 -ATOM 5515 O HOH 567 -10.893 32.323 -52.284 -ATOM 5516 H1 HOH 567 -10.071 32.137 -52.737 -ATOM 5517 H2 HOH 567 -11.009 31.586 -51.684 -ATOM 5518 O HOH 568 -10.893 32.323 -39.876 -ATOM 5519 H1 HOH 568 -10.705 33.218 -40.160 -ATOM 5520 H2 HOH 568 -11.367 32.427 -39.051 -ATOM 5521 O HOH 569 -10.893 32.323 -8.856 -ATOM 5522 H1 HOH 569 -10.384 31.873 -8.182 -ATOM 5523 H2 HOH 569 -11.499 32.880 -8.366 -ATOM 5524 O HOH 570 -10.893 35.425 -42.978 -ATOM 5525 H1 HOH 570 -10.920 34.811 -43.712 -ATOM 5526 H2 HOH 570 -11.781 35.411 -42.621 -ATOM 5527 O HOH 571 -10.893 35.425 -39.876 -ATOM 5528 H1 HOH 571 -11.712 35.113 -39.492 -ATOM 5529 H2 HOH 571 -10.433 35.846 -39.150 -ATOM 5530 O HOH 572 -10.893 35.425 -36.774 -ATOM 5531 H1 HOH 572 -10.716 35.811 -37.632 -ATOM 5532 H2 HOH 572 -11.621 34.823 -36.928 -ATOM 5533 O HOH 573 -10.893 35.425 -33.672 -ATOM 5534 H1 HOH 573 -11.107 35.674 -32.773 -ATOM 5535 H2 HOH 573 -11.609 34.848 -33.938 -ATOM 5536 O HOH 574 -10.893 35.425 -11.958 -ATOM 5537 H1 HOH 574 -11.161 36.285 -12.281 -ATOM 5538 H2 HOH 574 -10.178 35.610 -11.349 -ATOM 5539 O HOH 575 -10.893 35.425 -8.856 -ATOM 5540 H1 HOH 575 -10.304 35.375 -8.103 -ATOM 5541 H2 HOH 575 -10.758 36.305 -9.207 -ATOM 5542 O HOH 576 -10.893 38.527 -46.080 -ATOM 5543 H1 HOH 576 -11.377 37.795 -45.698 -ATOM 5544 H2 HOH 576 -10.463 38.946 -45.335 -ATOM 5545 O HOH 577 -10.893 38.527 -42.978 -ATOM 5546 H1 HOH 577 -11.566 37.864 -42.826 -ATOM 5547 H2 HOH 577 -10.280 38.419 -42.251 -ATOM 5548 O HOH 578 -10.893 38.527 -39.876 -ATOM 5549 H1 HOH 578 -11.677 38.935 -39.510 -ATOM 5550 H2 HOH 578 -11.196 37.682 -40.208 -ATOM 5551 O HOH 579 -10.893 38.527 -36.774 -ATOM 5552 H1 HOH 579 -11.141 39.169 -36.109 -ATOM 5553 H2 HOH 579 -10.918 37.686 -36.317 -ATOM 5554 O HOH 580 -10.893 38.527 -33.672 -ATOM 5555 H1 HOH 580 -11.461 37.927 -33.188 -ATOM 5556 H2 HOH 580 -11.489 39.187 -34.027 -ATOM 5557 O HOH 581 -10.893 38.527 -30.570 -ATOM 5558 H1 HOH 581 -10.583 37.622 -30.533 -ATOM 5559 H2 HOH 581 -11.274 38.615 -31.444 -ATOM 5560 O HOH 582 -10.893 38.527 -27.468 -ATOM 5561 H1 HOH 582 -10.797 37.620 -27.757 -ATOM 5562 H2 HOH 582 -10.010 38.893 -27.528 -ATOM 5563 O HOH 583 -10.893 38.527 -11.958 -ATOM 5564 H1 HOH 583 -11.393 38.020 -12.597 -ATOM 5565 H2 HOH 583 -11.003 39.437 -12.234 -ATOM 5566 O HOH 584 -10.893 41.629 -46.080 -ATOM 5567 H1 HOH 584 -11.411 42.394 -46.332 -ATOM 5568 H2 HOH 584 -10.820 41.114 -46.884 -ATOM 5569 O HOH 585 -10.893 41.629 -42.978 -ATOM 5570 H1 HOH 585 -10.793 41.967 -42.088 -ATOM 5571 H2 HOH 585 -11.815 41.379 -43.037 -ATOM 5572 O HOH 586 -10.893 41.629 -39.876 -ATOM 5573 H1 HOH 586 -10.042 41.780 -39.465 -ATOM 5574 H2 HOH 586 -10.684 41.382 -40.777 -ATOM 5575 O HOH 587 -10.893 41.629 -36.774 -ATOM 5576 H1 HOH 587 -9.937 41.593 -36.782 -ATOM 5577 H2 HOH 587 -11.160 40.832 -36.317 -ATOM 5578 O HOH 588 -10.893 41.629 -33.672 -ATOM 5579 H1 HOH 588 -10.123 41.598 -34.240 -ATOM 5580 H2 HOH 588 -11.606 41.901 -34.249 -ATOM 5581 O HOH 589 -10.893 41.629 -30.570 -ATOM 5582 H1 HOH 589 -11.111 40.699 -30.629 -ATOM 5583 H2 HOH 589 -11.717 42.079 -30.758 -ATOM 5584 O HOH 590 -10.893 41.629 -27.468 -ATOM 5585 H1 HOH 590 -11.604 42.249 -27.302 -ATOM 5586 H2 HOH 590 -10.303 41.735 -26.721 -ATOM 5587 O HOH 591 -10.893 41.629 -24.366 -ATOM 5588 H1 HOH 591 -10.468 41.498 -23.518 -ATOM 5589 H2 HOH 591 -10.725 40.819 -24.846 -ATOM 5590 O HOH 592 -10.893 41.629 -21.264 -ATOM 5591 H1 HOH 592 -10.979 40.763 -20.865 -ATOM 5592 H2 HOH 592 -11.668 42.107 -20.969 -ATOM 5593 O HOH 593 -10.893 41.629 -18.162 -ATOM 5594 H1 HOH 593 -10.388 41.221 -18.865 -ATOM 5595 H2 HOH 593 -11.807 41.484 -18.407 -ATOM 5596 O HOH 594 -10.893 41.629 -15.060 -ATOM 5597 H1 HOH 594 -11.121 41.000 -14.375 -ATOM 5598 H2 HOH 594 -11.508 41.444 -15.770 -ATOM 5599 O HOH 595 -10.893 44.731 -42.978 -ATOM 5600 H1 HOH 595 -11.605 44.235 -43.383 -ATOM 5601 H2 HOH 595 -10.207 44.083 -42.821 -ATOM 5602 O HOH 596 -10.893 44.731 -39.876 -ATOM 5603 H1 HOH 596 -11.506 45.463 -39.941 -ATOM 5604 H2 HOH 596 -10.887 44.345 -40.752 -ATOM 5605 O HOH 597 -10.893 44.731 -36.774 -ATOM 5606 H1 HOH 597 -11.641 45.319 -36.669 -ATOM 5607 H2 HOH 597 -11.282 43.886 -36.999 -ATOM 5608 O HOH 598 -10.893 44.731 -33.672 -ATOM 5609 H1 HOH 598 -11.188 44.041 -34.266 -ATOM 5610 H2 HOH 598 -10.045 44.426 -33.351 -ATOM 5611 O HOH 599 -10.893 44.731 -30.570 -ATOM 5612 H1 HOH 599 -11.619 44.997 -31.135 -ATOM 5613 H2 HOH 599 -10.613 45.541 -30.142 -ATOM 5614 O HOH 600 -10.893 44.731 -27.468 -ATOM 5615 H1 HOH 600 -11.013 45.491 -28.038 -ATOM 5616 H2 HOH 600 -10.006 44.426 -27.657 -ATOM 5617 O HOH 601 -10.893 44.731 -24.366 -ATOM 5618 H1 HOH 601 -11.693 44.207 -24.404 -ATOM 5619 H2 HOH 601 -10.883 45.090 -23.479 -ATOM 5620 O HOH 602 -10.893 44.731 -21.264 -ATOM 5621 H1 HOH 602 -10.068 44.901 -21.719 -ATOM 5622 H2 HOH 602 -11.305 44.029 -21.767 -ATOM 5623 O HOH 603 -10.893 44.731 -18.162 -ATOM 5624 H1 HOH 603 -10.968 45.248 -18.964 -ATOM 5625 H2 HOH 603 -10.729 43.838 -18.465 -ATOM 5626 O HOH 604 -10.893 47.833 -39.876 -ATOM 5627 H1 HOH 604 -10.538 46.959 -40.032 -ATOM 5628 H2 HOH 604 -10.254 48.426 -40.272 -ATOM 5629 O HOH 605 -10.893 47.833 -36.774 -ATOM 5630 H1 HOH 605 -11.497 48.469 -37.158 -ATOM 5631 H2 HOH 605 -11.328 47.542 -35.973 -ATOM 5632 O HOH 606 -10.893 47.833 -33.672 -ATOM 5633 H1 HOH 606 -10.732 48.524 -33.029 -ATOM 5634 H2 HOH 606 -10.022 47.584 -33.979 -ATOM 5635 O HOH 607 -10.893 47.833 -30.570 -ATOM 5636 H1 HOH 607 -11.289 47.566 -29.741 -ATOM 5637 H2 HOH 607 -11.133 47.141 -31.185 -ATOM 5638 O HOH 608 -10.893 47.833 -27.468 -ATOM 5639 H1 HOH 608 -10.345 48.605 -27.324 -ATOM 5640 H2 HOH 608 -11.784 48.135 -27.288 -ATOM 5641 O HOH 609 -10.893 47.833 -24.366 -ATOM 5642 H1 HOH 609 -10.801 47.009 -23.888 -ATOM 5643 H2 HOH 609 -11.219 47.576 -25.228 -ATOM 5644 O HOH 610 -10.893 47.833 -21.264 -ATOM 5645 H1 HOH 610 -11.287 47.041 -21.628 -ATOM 5646 H2 HOH 610 -10.326 47.519 -20.560 -ATOM 5647 O HOH 611 -7.791 4.405 -36.774 -ATOM 5648 H1 HOH 611 -8.468 5.050 -36.569 -ATOM 5649 H2 HOH 611 -7.735 3.858 -35.990 -ATOM 5650 O HOH 612 -7.791 4.405 -33.672 -ATOM 5651 H1 HOH 612 -7.186 4.841 -33.073 -ATOM 5652 H2 HOH 612 -8.229 5.120 -34.133 -ATOM 5653 O HOH 613 -7.791 7.507 -46.080 -ATOM 5654 H1 HOH 613 -7.519 8.083 -45.366 -ATOM 5655 H2 HOH 613 -7.162 6.786 -46.061 -ATOM 5656 O HOH 614 -7.791 10.609 -49.182 -ATOM 5657 H1 HOH 614 -7.981 10.251 -48.315 -ATOM 5658 H2 HOH 614 -7.680 11.548 -49.036 -ATOM 5659 O HOH 615 -7.791 35.425 -42.978 -ATOM 5660 H1 HOH 615 -7.403 34.737 -42.438 -ATOM 5661 H2 HOH 615 -8.678 35.115 -43.162 -ATOM 5662 O HOH 616 -7.791 35.425 -27.468 -ATOM 5663 H1 HOH 616 -8.001 34.755 -26.817 -ATOM 5664 H2 HOH 616 -6.869 35.277 -27.676 -ATOM 5665 O HOH 617 -7.791 35.425 -11.958 -ATOM 5666 H1 HOH 617 -8.597 35.495 -11.446 -ATOM 5667 H2 HOH 617 -7.090 35.496 -11.310 -ATOM 5668 O HOH 618 -7.791 35.425 -8.856 -ATOM 5669 H1 HOH 618 -8.404 36.103 -8.572 -ATOM 5670 H2 HOH 618 -6.927 35.824 -8.750 -ATOM 5671 O HOH 619 -7.791 38.527 -42.978 -ATOM 5672 H1 HOH 619 -7.646 39.472 -43.036 -ATOM 5673 H2 HOH 619 -7.324 38.261 -42.186 -ATOM 5674 O HOH 620 -7.791 38.527 -39.876 -ATOM 5675 H1 HOH 620 -8.298 37.733 -40.046 -ATOM 5676 H2 HOH 620 -6.878 38.240 -39.906 -ATOM 5677 O HOH 621 -7.791 38.527 -36.774 -ATOM 5678 H1 HOH 621 -8.276 39.336 -36.936 -ATOM 5679 H2 HOH 621 -8.095 38.233 -35.915 -ATOM 5680 O HOH 622 -7.791 38.527 -33.672 -ATOM 5681 H1 HOH 622 -7.510 38.441 -34.583 -ATOM 5682 H2 HOH 622 -7.026 38.879 -33.217 -ATOM 5683 O HOH 623 -7.791 38.527 -30.570 -ATOM 5684 H1 HOH 623 -8.300 37.734 -30.739 -ATOM 5685 H2 HOH 623 -7.163 38.270 -29.895 -ATOM 5686 O HOH 624 -7.791 38.527 -27.468 -ATOM 5687 H1 HOH 624 -8.390 38.143 -28.108 -ATOM 5688 H2 HOH 624 -7.698 39.439 -27.743 -ATOM 5689 O HOH 625 -7.791 38.527 -15.060 -ATOM 5690 H1 HOH 625 -8.179 39.049 -15.762 -ATOM 5691 H2 HOH 625 -8.158 37.651 -15.181 -ATOM 5692 O HOH 626 -7.791 38.527 -11.958 -ATOM 5693 H1 HOH 626 -7.094 38.446 -12.608 -ATOM 5694 H2 HOH 626 -7.429 39.110 -11.290 -ATOM 5695 O HOH 627 -7.791 41.629 -49.182 -ATOM 5696 H1 HOH 627 -8.367 41.296 -48.494 -ATOM 5697 H2 HOH 627 -7.109 40.963 -49.268 -ATOM 5698 O HOH 628 -7.791 41.629 -46.080 -ATOM 5699 H1 HOH 628 -7.492 42.199 -45.372 -ATOM 5700 H2 HOH 628 -7.966 40.790 -45.655 -ATOM 5701 O HOH 629 -7.791 41.629 -42.978 -ATOM 5702 H1 HOH 629 -7.288 42.386 -42.678 -ATOM 5703 H2 HOH 629 -7.184 41.143 -43.536 -ATOM 5704 O HOH 630 -7.791 41.629 -39.876 -ATOM 5705 H1 HOH 630 -8.416 42.138 -39.359 -ATOM 5706 H2 HOH 630 -7.843 42.008 -40.754 -ATOM 5707 O HOH 631 -7.791 41.629 -36.774 -ATOM 5708 H1 HOH 631 -8.269 41.446 -35.965 -ATOM 5709 H2 HOH 631 -8.363 41.304 -37.470 -ATOM 5710 O HOH 632 -7.791 41.629 -33.672 -ATOM 5711 H1 HOH 632 -8.506 42.090 -34.110 -ATOM 5712 H2 HOH 632 -7.921 41.814 -32.742 -ATOM 5713 O HOH 633 -7.791 41.629 -30.570 -ATOM 5714 H1 HOH 633 -8.384 40.999 -30.161 -ATOM 5715 H2 HOH 633 -6.926 41.225 -30.502 -ATOM 5716 O HOH 634 -7.791 41.629 -27.468 -ATOM 5717 H1 HOH 634 -7.587 40.699 -27.375 -ATOM 5718 H2 HOH 634 -7.892 41.944 -26.570 -ATOM 5719 O HOH 635 -7.791 41.629 -24.366 -ATOM 5720 H1 HOH 635 -7.516 40.814 -23.948 -ATOM 5721 H2 HOH 635 -8.563 41.903 -23.871 -ATOM 5722 O HOH 636 -7.791 41.629 -21.264 -ATOM 5723 H1 HOH 636 -7.114 41.268 -20.692 -ATOM 5724 H2 HOH 636 -8.616 41.346 -20.869 -ATOM 5725 O HOH 637 -7.791 41.629 -18.162 -ATOM 5726 H1 HOH 637 -8.429 41.395 -18.836 -ATOM 5727 H2 HOH 637 -7.000 41.146 -18.401 -ATOM 5728 O HOH 638 -7.791 41.629 -15.060 -ATOM 5729 H1 HOH 638 -7.588 40.972 -15.725 -ATOM 5730 H2 HOH 638 -8.461 42.181 -15.464 -ATOM 5731 O HOH 639 -7.791 41.629 -11.958 -ATOM 5732 H1 HOH 639 -6.991 41.385 -12.424 -ATOM 5733 H2 HOH 639 -8.489 41.516 -12.603 -ATOM 5734 O HOH 640 -7.791 44.731 -46.080 -ATOM 5735 H1 HOH 640 -7.150 45.018 -45.429 -ATOM 5736 H2 HOH 640 -8.638 44.843 -45.649 -ATOM 5737 O HOH 641 -7.791 44.731 -42.978 -ATOM 5738 H1 HOH 641 -7.137 45.002 -42.334 -ATOM 5739 H2 HOH 641 -8.420 44.212 -42.477 -ATOM 5740 O HOH 642 -7.791 44.731 -39.876 -ATOM 5741 H1 HOH 642 -8.370 44.739 -40.638 -ATOM 5742 H2 HOH 642 -8.043 45.508 -39.376 -ATOM 5743 O HOH 643 -7.791 44.731 -36.774 -ATOM 5744 H1 HOH 643 -7.705 45.447 -37.405 -ATOM 5745 H2 HOH 643 -8.361 45.082 -36.090 -ATOM 5746 O HOH 644 -7.791 44.731 -33.672 -ATOM 5747 H1 HOH 644 -7.349 44.047 -33.170 -ATOM 5748 H2 HOH 644 -8.364 44.256 -34.274 -ATOM 5749 O HOH 645 -7.791 44.731 -30.570 -ATOM 5750 H1 HOH 645 -8.039 44.375 -29.717 -ATOM 5751 H2 HOH 645 -8.323 45.522 -30.664 -ATOM 5752 O HOH 646 -7.791 44.731 -27.468 -ATOM 5753 H1 HOH 646 -8.406 44.948 -28.168 -ATOM 5754 H2 HOH 646 -8.346 44.535 -26.713 -ATOM 5755 O HOH 647 -7.791 44.731 -24.366 -ATOM 5756 H1 HOH 647 -8.560 44.255 -24.053 -ATOM 5757 H2 HOH 647 -7.516 44.254 -25.148 -ATOM 5758 O HOH 648 -7.791 44.731 -21.264 -ATOM 5759 H1 HOH 648 -6.853 44.896 -21.171 -ATOM 5760 H2 HOH 648 -7.908 44.530 -22.192 -ATOM 5761 O HOH 649 -7.791 44.731 -18.162 -ATOM 5762 H1 HOH 649 -7.467 45.573 -18.482 -ATOM 5763 H2 HOH 649 -7.086 44.398 -17.607 -ATOM 5764 O HOH 650 -7.791 44.731 -15.060 -ATOM 5765 H1 HOH 650 -7.285 44.953 -15.841 -ATOM 5766 H2 HOH 650 -7.597 43.808 -14.902 -ATOM 5767 O HOH 651 -7.791 47.833 -39.876 -ATOM 5768 H1 HOH 651 -8.308 47.304 -40.484 -ATOM 5769 H2 HOH 651 -7.257 47.199 -39.399 -ATOM 5770 O HOH 652 -7.791 47.833 -36.774 -ATOM 5771 H1 HOH 652 -8.309 48.380 -37.365 -ATOM 5772 H2 HOH 652 -7.400 47.169 -37.342 -ATOM 5773 O HOH 653 -7.791 47.833 -33.672 -ATOM 5774 H1 HOH 653 -8.251 47.331 -34.345 -ATOM 5775 H2 HOH 653 -8.217 47.581 -32.853 -ATOM 5776 O HOH 654 -7.791 47.833 -30.570 -ATOM 5777 H1 HOH 654 -8.003 48.038 -31.481 -ATOM 5778 H2 HOH 654 -7.092 47.182 -30.627 -ATOM 5779 O HOH 655 -7.791 47.833 -27.468 -ATOM 5780 H1 HOH 655 -8.470 47.936 -28.135 -ATOM 5781 H2 HOH 655 -6.977 48.063 -27.916 -ATOM 5782 O HOH 656 -7.791 47.833 -24.366 -ATOM 5783 H1 HOH 656 -7.255 47.253 -24.906 -ATOM 5784 H2 HOH 656 -8.007 48.566 -24.943 -ATOM 5785 O HOH 657 -7.791 47.833 -21.264 -ATOM 5786 H1 HOH 657 -7.398 48.137 -20.445 -ATOM 5787 H2 HOH 657 -7.192 47.159 -21.582 -ATOM 5788 O HOH 658 -4.689 7.507 -46.080 -ATOM 5789 H1 HOH 658 -5.298 7.934 -46.683 -ATOM 5790 H2 HOH 658 -5.123 7.552 -45.228 -ATOM 5791 O HOH 659 -4.689 10.609 -49.182 -ATOM 5792 H1 HOH 659 -4.384 9.936 -49.791 -ATOM 5793 H2 HOH 659 -4.490 11.436 -49.620 -ATOM 5794 O HOH 660 -4.689 13.711 -49.182 -ATOM 5795 H1 HOH 660 -4.010 14.341 -49.422 -ATOM 5796 H2 HOH 660 -5.512 14.152 -49.394 -ATOM 5797 O HOH 661 -4.689 23.017 -30.570 -ATOM 5798 H1 HOH 661 -5.368 23.621 -30.271 -ATOM 5799 H2 HOH 661 -3.926 23.573 -30.727 -ATOM 5800 O HOH 662 -4.689 26.119 -30.570 -ATOM 5801 H1 HOH 662 -3.767 25.866 -30.607 -ATOM 5802 H2 HOH 662 -4.780 26.793 -31.243 -ATOM 5803 O HOH 663 -4.689 29.221 -30.570 -ATOM 5804 H1 HOH 663 -5.244 29.816 -31.074 -ATOM 5805 H2 HOH 663 -5.256 28.476 -30.372 -ATOM 5806 O HOH 664 -4.689 32.323 -30.570 -ATOM 5807 H1 HOH 664 -3.922 32.884 -30.686 -ATOM 5808 H2 HOH 664 -4.362 31.435 -30.714 -ATOM 5809 O HOH 665 -4.689 32.323 -27.468 -ATOM 5810 H1 HOH 665 -4.497 31.900 -26.631 -ATOM 5811 H2 HOH 665 -5.259 33.057 -27.240 -ATOM 5812 O HOH 666 -4.689 35.425 -42.978 -ATOM 5813 H1 HOH 666 -5.277 36.181 -42.999 -ATOM 5814 H2 HOH 666 -4.211 35.516 -42.154 -ATOM 5815 O HOH 667 -4.689 35.425 -30.570 -ATOM 5816 H1 HOH 667 -5.228 35.186 -29.816 -ATOM 5817 H2 HOH 667 -4.822 34.713 -31.195 -ATOM 5818 O HOH 668 -4.689 35.425 -27.468 -ATOM 5819 H1 HOH 668 -5.020 34.724 -28.029 -ATOM 5820 H2 HOH 668 -5.397 35.587 -26.844 -ATOM 5821 O HOH 669 -4.689 35.425 -24.366 -ATOM 5822 H1 HOH 669 -4.629 34.543 -24.732 -ATOM 5823 H2 HOH 669 -4.081 35.945 -24.891 -ATOM 5824 O HOH 670 -4.689 35.425 -11.958 -ATOM 5825 H1 HOH 670 -3.976 35.014 -12.447 -ATOM 5826 H2 HOH 670 -5.478 35.206 -12.453 -ATOM 5827 O HOH 671 -4.689 35.425 -8.856 -ATOM 5828 H1 HOH 671 -5.299 35.691 -8.168 -ATOM 5829 H2 HOH 671 -4.318 36.247 -9.178 -ATOM 5830 O HOH 672 -4.689 38.527 -42.978 -ATOM 5831 H1 HOH 672 -4.408 39.380 -43.310 -ATOM 5832 H2 HOH 672 -4.680 37.956 -43.746 -ATOM 5833 O HOH 673 -4.689 38.527 -39.876 -ATOM 5834 H1 HOH 673 -4.725 39.018 -39.055 -ATOM 5835 H2 HOH 673 -4.205 37.731 -39.658 -ATOM 5836 O HOH 674 -4.689 38.527 -36.774 -ATOM 5837 H1 HOH 674 -4.350 38.282 -35.913 -ATOM 5838 H2 HOH 674 -5.549 38.109 -36.822 -ATOM 5839 O HOH 675 -4.689 38.527 -33.672 -ATOM 5840 H1 HOH 675 -4.799 39.471 -33.560 -ATOM 5841 H2 HOH 675 -4.026 38.284 -33.026 -ATOM 5842 O HOH 676 -4.689 38.527 -30.570 -ATOM 5843 H1 HOH 676 -5.043 39.039 -29.843 -ATOM 5844 H2 HOH 676 -5.453 38.305 -31.102 -ATOM 5845 O HOH 677 -4.689 38.527 -27.468 -ATOM 5846 H1 HOH 677 -3.867 38.963 -27.693 -ATOM 5847 H2 HOH 677 -5.023 39.018 -26.717 -ATOM 5848 O HOH 678 -4.689 38.527 -24.366 -ATOM 5849 H1 HOH 678 -4.708 39.244 -25.000 -ATOM 5850 H2 HOH 678 -3.808 38.561 -23.992 -ATOM 5851 O HOH 679 -4.689 38.527 -15.060 -ATOM 5852 H1 HOH 679 -3.899 38.771 -15.542 -ATOM 5853 H2 HOH 679 -5.405 38.686 -15.675 -ATOM 5854 O HOH 680 -4.689 38.527 -11.958 -ATOM 5855 H1 HOH 680 -4.918 38.154 -11.106 -ATOM 5856 H2 HOH 680 -5.397 38.249 -12.539 -ATOM 5857 O HOH 681 -4.689 41.629 -46.080 -ATOM 5858 H1 HOH 681 -5.285 41.135 -45.517 -ATOM 5859 H2 HOH 681 -3.883 41.706 -45.569 -ATOM 5860 O HOH 682 -4.689 41.629 -42.978 -ATOM 5861 H1 HOH 682 -5.101 41.750 -43.834 -ATOM 5862 H2 HOH 682 -4.725 40.685 -42.826 -ATOM 5863 O HOH 683 -4.689 41.629 -39.876 -ATOM 5864 H1 HOH 683 -3.894 41.785 -40.386 -ATOM 5865 H2 HOH 683 -5.286 42.328 -40.143 -ATOM 5866 O HOH 684 -4.689 41.629 -36.774 -ATOM 5867 H1 HOH 684 -4.945 40.822 -37.220 -ATOM 5868 H2 HOH 684 -4.550 41.368 -35.864 -ATOM 5869 O HOH 685 -4.689 41.629 -33.672 -ATOM 5870 H1 HOH 685 -4.158 41.352 -34.418 -ATOM 5871 H2 HOH 685 -4.356 41.115 -32.936 -ATOM 5872 O HOH 686 -4.689 41.629 -30.570 -ATOM 5873 H1 HOH 686 -4.127 41.976 -29.877 -ATOM 5874 H2 HOH 686 -5.188 42.387 -30.875 -ATOM 5875 O HOH 687 -4.689 41.629 -27.468 -ATOM 5876 H1 HOH 687 -4.369 40.823 -27.872 -ATOM 5877 H2 HOH 687 -4.748 41.424 -26.535 -ATOM 5878 O HOH 688 -4.689 41.629 -24.366 -ATOM 5879 H1 HOH 688 -3.804 41.349 -24.131 -ATOM 5880 H2 HOH 688 -4.573 42.145 -25.164 -ATOM 5881 O HOH 689 -4.689 41.629 -21.264 -ATOM 5882 H1 HOH 689 -4.895 42.536 -21.035 -ATOM 5883 H2 HOH 689 -5.525 41.169 -21.196 -ATOM 5884 O HOH 690 -4.689 41.629 -18.162 -ATOM 5885 H1 HOH 690 -3.870 41.942 -17.776 -ATOM 5886 H2 HOH 690 -4.622 41.862 -19.088 -ATOM 5887 O HOH 691 -4.689 41.629 -15.060 -ATOM 5888 H1 HOH 691 -5.085 41.332 -14.241 -ATOM 5889 H2 HOH 691 -5.344 42.211 -15.446 -ATOM 5890 O HOH 692 -4.689 41.629 -11.958 -ATOM 5891 H1 HOH 692 -3.924 42.000 -11.517 -ATOM 5892 H2 HOH 692 -5.304 42.360 -12.026 -ATOM 5893 O HOH 693 -4.689 44.731 -46.080 -ATOM 5894 H1 HOH 693 -3.975 45.218 -46.491 -ATOM 5895 H2 HOH 693 -4.264 43.971 -45.683 -ATOM 5896 O HOH 694 -4.689 44.731 -42.978 -ATOM 5897 H1 HOH 694 -5.071 44.091 -42.378 -ATOM 5898 H2 HOH 694 -3.788 44.432 -43.104 -ATOM 5899 O HOH 695 -4.689 44.731 -39.876 -ATOM 5900 H1 HOH 695 -4.818 44.484 -38.961 -ATOM 5901 H2 HOH 695 -4.838 43.923 -40.366 -ATOM 5902 O HOH 696 -4.689 44.731 -36.774 -ATOM 5903 H1 HOH 696 -3.781 44.604 -37.048 -ATOM 5904 H2 HOH 696 -5.053 45.333 -37.424 -ATOM 5905 O HOH 697 -4.689 44.731 -33.672 -ATOM 5906 H1 HOH 697 -5.188 44.666 -32.858 -ATOM 5907 H2 HOH 697 -4.206 45.554 -33.592 -ATOM 5908 O HOH 698 -4.689 44.731 -30.570 -ATOM 5909 H1 HOH 698 -4.361 44.237 -31.321 -ATOM 5910 H2 HOH 698 -5.126 45.491 -30.955 -ATOM 5911 O HOH 699 -4.689 44.731 -27.468 -ATOM 5912 H1 HOH 699 -5.384 44.086 -27.598 -ATOM 5913 H2 HOH 699 -4.887 45.129 -26.620 -ATOM 5914 O HOH 700 -4.689 44.731 -24.366 -ATOM 5915 H1 HOH 700 -4.261 44.172 -25.014 -ATOM 5916 H2 HOH 700 -4.842 45.557 -24.825 -ATOM 5917 O HOH 701 -4.689 44.731 -21.264 -ATOM 5918 H1 HOH 701 -4.252 43.989 -21.681 -ATOM 5919 H2 HOH 701 -4.002 45.154 -20.748 -ATOM 5920 O HOH 702 -4.689 44.731 -18.162 -ATOM 5921 H1 HOH 702 -5.247 44.326 -18.825 -ATOM 5922 H2 HOH 702 -3.955 44.125 -18.061 -ATOM 5923 O HOH 703 -4.689 44.731 -15.060 -ATOM 5924 H1 HOH 703 -5.567 45.043 -14.839 -ATOM 5925 H2 HOH 703 -4.812 44.207 -15.851 -ATOM 5926 O HOH 704 -4.689 47.833 -39.876 -ATOM 5927 H1 HOH 704 -3.768 48.050 -39.732 -ATOM 5928 H2 HOH 704 -4.996 47.514 -39.028 -ATOM 5929 O HOH 705 -4.689 47.833 -36.774 -ATOM 5930 H1 HOH 705 -4.002 48.327 -37.222 -ATOM 5931 H2 HOH 705 -5.375 47.724 -37.433 -ATOM 5932 O HOH 706 -4.689 47.833 -33.672 -ATOM 5933 H1 HOH 706 -4.178 48.637 -33.767 -ATOM 5934 H2 HOH 706 -4.035 47.145 -33.556 -ATOM 5935 O HOH 707 -4.689 47.833 -30.570 -ATOM 5936 H1 HOH 707 -4.500 46.914 -30.385 -ATOM 5937 H2 HOH 707 -3.932 48.308 -30.227 -ATOM 5938 O HOH 708 -4.689 47.833 -27.468 -ATOM 5939 H1 HOH 708 -4.687 46.878 -27.525 -ATOM 5940 H2 HOH 708 -4.231 48.123 -28.257 -ATOM 5941 O HOH 709 -4.689 47.833 -24.366 -ATOM 5942 H1 HOH 709 -5.346 48.269 -24.909 -ATOM 5943 H2 HOH 709 -5.106 47.016 -24.094 -ATOM 5944 O HOH 710 -4.689 47.833 -21.264 -ATOM 5945 H1 HOH 710 -4.205 47.212 -21.808 -ATOM 5946 H2 HOH 710 -4.165 47.913 -20.467 -ATOM 5947 O HOH 711 -4.689 50.936 -30.570 -ATOM 5948 H1 HOH 711 -5.227 50.786 -29.792 -ATOM 5949 H2 HOH 711 -5.277 51.369 -31.189 -ATOM 5950 O HOH 712 -1.587 7.507 -46.080 -ATOM 5951 H1 HOH 712 -1.298 6.901 -46.763 -ATOM 5952 H2 HOH 712 -0.904 7.459 -45.412 -ATOM 5953 O HOH 713 -1.587 7.507 -42.978 -ATOM 5954 H1 HOH 713 -1.763 6.988 -42.193 -ATOM 5955 H2 HOH 713 -1.808 6.924 -43.705 -ATOM 5956 O HOH 714 -1.587 7.507 -30.570 -ATOM 5957 H1 HOH 714 -0.727 7.464 -30.989 -ATOM 5958 H2 HOH 714 -2.193 7.182 -31.236 -ATOM 5959 O HOH 715 -1.587 10.609 -49.182 -ATOM 5960 H1 HOH 715 -1.791 11.498 -49.471 -ATOM 5961 H2 HOH 715 -1.243 10.717 -48.296 -ATOM 5962 O HOH 716 -1.587 19.915 -30.570 -ATOM 5963 H1 HOH 716 -0.966 19.579 -29.923 -ATOM 5964 H2 HOH 716 -2.428 19.537 -30.314 -ATOM 5965 O HOH 717 -1.587 23.017 -27.468 -ATOM 5966 H1 HOH 717 -1.268 23.859 -27.792 -ATOM 5967 H2 HOH 717 -2.432 22.898 -27.901 -ATOM 5968 O HOH 718 -1.587 26.119 -27.468 -ATOM 5969 H1 HOH 718 -0.897 26.240 -26.815 -ATOM 5970 H2 HOH 718 -2.278 25.649 -27.002 -ATOM 5971 O HOH 719 -1.587 26.119 -24.366 -ATOM 5972 H1 HOH 719 -1.473 27.047 -24.160 -ATOM 5973 H2 HOH 719 -1.177 26.011 -25.224 -ATOM 5974 O HOH 720 -1.587 26.119 -15.060 -ATOM 5975 H1 HOH 720 -1.863 25.458 -15.694 -ATOM 5976 H2 HOH 720 -1.564 25.654 -14.223 -ATOM 5977 O HOH 721 -1.587 29.221 -18.162 -ATOM 5978 H1 HOH 721 -0.963 29.261 -18.887 -ATOM 5979 H2 HOH 721 -2.438 29.103 -18.584 -ATOM 5980 O HOH 722 -1.587 32.323 -30.570 -ATOM 5981 H1 HOH 722 -1.415 32.824 -29.772 -ATOM 5982 H2 HOH 722 -0.930 32.633 -31.194 -ATOM 5983 O HOH 723 -1.587 32.323 -27.468 -ATOM 5984 H1 HOH 723 -2.515 32.152 -27.627 -ATOM 5985 H2 HOH 723 -1.559 32.702 -26.589 -ATOM 5986 O HOH 724 -1.587 32.323 -24.366 -ATOM 5987 H1 HOH 724 -0.774 32.438 -24.858 -ATOM 5988 H2 HOH 724 -1.520 31.444 -23.993 -ATOM 5989 O HOH 725 -1.587 32.323 -18.162 -ATOM 5990 H1 HOH 725 -2.018 32.898 -18.794 -ATOM 5991 H2 HOH 725 -0.661 32.357 -18.400 -ATOM 5992 O HOH 726 -1.587 32.323 -15.060 -ATOM 5993 H1 HOH 726 -2.178 31.634 -15.362 -ATOM 5994 H2 HOH 726 -2.150 32.928 -14.577 -ATOM 5995 O HOH 727 -1.587 35.425 -46.080 -ATOM 5996 H1 HOH 727 -2.112 35.139 -45.333 -ATOM 5997 H2 HOH 727 -2.197 35.922 -46.626 -ATOM 5998 O HOH 728 -1.587 35.425 -30.570 -ATOM 5999 H1 HOH 728 -1.779 36.023 -31.292 -ATOM 6000 H2 HOH 728 -2.009 35.825 -29.809 -ATOM 6001 O HOH 729 -1.587 35.425 -27.468 -ATOM 6002 H1 HOH 729 -1.133 36.253 -27.311 -ATOM 6003 H2 HOH 729 -1.690 35.384 -28.419 -ATOM 6004 O HOH 730 -1.587 35.425 -24.366 -ATOM 6005 H1 HOH 730 -2.168 35.141 -23.660 -ATOM 6006 H2 HOH 730 -1.065 36.128 -23.979 -ATOM 6007 O HOH 731 -1.587 35.425 -15.060 -ATOM 6008 H1 HOH 731 -1.251 36.192 -14.595 -ATOM 6009 H2 HOH 731 -2.315 35.762 -15.582 -ATOM 6010 O HOH 732 -1.587 35.425 -11.958 -ATOM 6011 H1 HOH 732 -2.390 35.433 -11.436 -ATOM 6012 H2 HOH 732 -1.123 36.221 -11.696 -ATOM 6013 O HOH 733 -1.587 35.425 -8.856 -ATOM 6014 H1 HOH 733 -1.288 36.244 -9.250 -ATOM 6015 H2 HOH 733 -2.197 35.698 -8.170 -ATOM 6016 O HOH 734 -1.587 38.527 -49.182 -ATOM 6017 H1 HOH 734 -0.949 38.036 -48.665 -ATOM 6018 H2 HOH 734 -2.200 37.864 -49.499 -ATOM 6019 O HOH 735 -1.587 38.527 -46.080 -ATOM 6020 H1 HOH 735 -1.997 39.132 -46.699 -ATOM 6021 H2 HOH 735 -2.175 37.773 -46.057 -ATOM 6022 O HOH 736 -1.587 38.527 -42.978 -ATOM 6023 H1 HOH 736 -2.332 38.637 -43.569 -ATOM 6024 H2 HOH 736 -1.581 37.593 -42.770 -ATOM 6025 O HOH 737 -1.587 38.527 -39.876 -ATOM 6026 H1 HOH 737 -1.456 39.279 -40.455 -ATOM 6027 H2 HOH 737 -1.797 37.804 -40.466 -ATOM 6028 O HOH 738 -1.587 38.527 -36.774 -ATOM 6029 H1 HOH 738 -2.237 37.824 -36.762 -ATOM 6030 H2 HOH 738 -1.082 38.401 -35.971 -ATOM 6031 O HOH 739 -1.587 38.527 -33.672 -ATOM 6032 H1 HOH 739 -2.054 39.219 -34.142 -ATOM 6033 H2 HOH 739 -0.835 38.324 -34.229 -ATOM 6034 O HOH 740 -1.587 38.527 -30.570 -ATOM 6035 H1 HOH 740 -1.623 38.904 -29.691 -ATOM 6036 H2 HOH 740 -1.044 39.137 -31.070 -ATOM 6037 O HOH 741 -1.587 38.527 -27.468 -ATOM 6038 H1 HOH 741 -1.468 38.101 -26.619 -ATOM 6039 H2 HOH 741 -2.323 38.064 -27.868 -ATOM 6040 O HOH 742 -1.587 38.527 -24.366 -ATOM 6041 H1 HOH 742 -0.966 38.742 -23.670 -ATOM 6042 H2 HOH 742 -2.425 38.866 -24.052 -ATOM 6043 O HOH 743 -1.587 38.527 -21.264 -ATOM 6044 H1 HOH 743 -1.032 39.276 -21.048 -ATOM 6045 H2 HOH 743 -1.319 37.844 -20.649 -ATOM 6046 O HOH 744 -1.587 38.527 -18.162 -ATOM 6047 H1 HOH 744 -1.039 38.033 -18.772 -ATOM 6048 H2 HOH 744 -1.748 39.361 -18.605 -ATOM 6049 O HOH 745 -1.587 38.527 -15.060 -ATOM 6050 H1 HOH 745 -1.949 38.472 -15.944 -ATOM 6051 H2 HOH 745 -0.794 37.992 -15.091 -ATOM 6052 O HOH 746 -1.587 38.527 -11.958 -ATOM 6053 H1 HOH 746 -1.274 37.870 -12.580 -ATOM 6054 H2 HOH 746 -2.373 38.139 -11.573 -ATOM 6055 O HOH 747 -1.587 41.629 -49.182 -ATOM 6056 H1 HOH 747 -2.200 40.907 -49.047 -ATOM 6057 H2 HOH 747 -1.268 41.841 -48.305 -ATOM 6058 O HOH 748 -1.587 41.629 -46.080 -ATOM 6059 H1 HOH 748 -0.921 42.309 -45.974 -ATOM 6060 H2 HOH 748 -1.343 41.179 -46.889 -ATOM 6061 O HOH 749 -1.587 41.629 -42.978 -ATOM 6062 H1 HOH 749 -1.711 40.688 -42.855 -ATOM 6063 H2 HOH 749 -2.130 41.846 -43.736 -ATOM 6064 O HOH 750 -1.587 41.629 -39.876 -ATOM 6065 H1 HOH 750 -1.932 41.439 -40.748 -ATOM 6066 H2 HOH 750 -0.964 40.923 -39.705 -ATOM 6067 O HOH 751 -1.587 41.629 -36.774 -ATOM 6068 H1 HOH 751 -2.252 42.080 -36.254 -ATOM 6069 H2 HOH 751 -2.081 41.191 -37.467 -ATOM 6070 O HOH 752 -1.587 41.629 -33.672 -ATOM 6071 H1 HOH 752 -2.312 41.097 -34.000 -ATOM 6072 H2 HOH 752 -1.925 42.026 -32.869 -ATOM 6073 O HOH 753 -1.587 41.629 -30.570 -ATOM 6074 H1 HOH 753 -2.146 41.084 -30.016 -ATOM 6075 H2 HOH 753 -1.012 41.008 -31.017 -ATOM 6076 O HOH 754 -1.587 41.629 -27.468 -ATOM 6077 H1 HOH 754 -2.302 41.213 -26.988 -ATOM 6078 H2 HOH 754 -1.914 41.710 -28.364 -ATOM 6079 O HOH 755 -1.587 41.629 -24.366 -ATOM 6080 H1 HOH 755 -0.837 41.808 -24.934 -ATOM 6081 H2 HOH 755 -2.092 42.442 -24.373 -ATOM 6082 O HOH 756 -1.587 41.629 -21.264 -ATOM 6083 H1 HOH 756 -0.910 41.332 -21.872 -ATOM 6084 H2 HOH 756 -1.426 41.129 -20.464 -ATOM 6085 O HOH 757 -1.587 41.629 -18.162 -ATOM 6086 H1 HOH 757 -2.387 41.676 -18.685 -ATOM 6087 H2 HOH 757 -1.188 40.794 -18.406 -ATOM 6088 O HOH 758 -1.587 41.629 -15.060 -ATOM 6089 H1 HOH 758 -1.074 40.879 -15.359 -ATOM 6090 H2 HOH 758 -2.149 41.276 -14.371 -ATOM 6091 O HOH 759 -1.587 41.629 -11.958 -ATOM 6092 H1 HOH 759 -1.979 41.858 -11.115 -ATOM 6093 H2 HOH 759 -1.129 42.424 -12.232 -ATOM 6094 O HOH 760 -1.587 44.731 -46.080 -ATOM 6095 H1 HOH 760 -0.855 45.175 -45.653 -ATOM 6096 H2 HOH 760 -1.175 44.079 -46.647 -ATOM 6097 O HOH 761 -1.587 44.731 -42.978 -ATOM 6098 H1 HOH 761 -1.388 44.995 -43.877 -ATOM 6099 H2 HOH 761 -2.270 45.339 -42.695 -ATOM 6100 O HOH 762 -1.587 44.731 -39.876 -ATOM 6101 H1 HOH 762 -0.969 45.361 -40.248 -ATOM 6102 H2 HOH 762 -2.169 45.260 -39.331 -ATOM 6103 O HOH 763 -1.587 44.731 -36.774 -ATOM 6104 H1 HOH 763 -1.810 44.178 -36.025 -ATOM 6105 H2 HOH 763 -2.100 44.373 -37.498 -ATOM 6106 O HOH 764 -1.587 44.731 -33.672 -ATOM 6107 H1 HOH 764 -0.994 44.522 -32.951 -ATOM 6108 H2 HOH 764 -1.646 45.687 -33.664 -ATOM 6109 O HOH 765 -1.587 44.731 -30.570 -ATOM 6110 H1 HOH 765 -2.523 44.910 -30.654 -ATOM 6111 H2 HOH 765 -1.297 45.299 -29.856 -ATOM 6112 O HOH 766 -1.587 44.731 -27.468 -ATOM 6113 H1 HOH 766 -1.238 45.537 -27.849 -ATOM 6114 H2 HOH 766 -2.416 44.588 -27.925 -ATOM 6115 O HOH 767 -1.587 44.731 -24.366 -ATOM 6116 H1 HOH 767 -2.188 44.172 -24.857 -ATOM 6117 H2 HOH 767 -0.715 44.437 -24.629 -ATOM 6118 O HOH 768 -1.587 44.731 -21.264 -ATOM 6119 H1 HOH 768 -2.256 44.499 -20.621 -ATOM 6120 H2 HOH 768 -1.610 45.688 -21.299 -ATOM 6121 O HOH 769 -1.587 44.731 -18.162 -ATOM 6122 H1 HOH 769 -1.251 44.705 -17.266 -ATOM 6123 H2 HOH 769 -0.972 45.294 -18.632 -ATOM 6124 O HOH 770 -1.587 44.731 -15.060 -ATOM 6125 H1 HOH 770 -1.013 44.470 -14.340 -ATOM 6126 H2 HOH 770 -0.995 44.881 -15.797 -ATOM 6127 O HOH 771 -1.587 47.833 -39.876 -ATOM 6128 H1 HOH 771 -1.784 47.968 -38.949 -ATOM 6129 H2 HOH 771 -0.883 48.454 -40.064 -ATOM 6130 O HOH 772 -1.587 47.833 -36.774 -ATOM 6131 H1 HOH 772 -1.589 46.918 -36.496 -ATOM 6132 H2 HOH 772 -0.660 48.062 -36.841 -ATOM 6133 O HOH 773 -1.587 47.833 -33.672 -ATOM 6134 H1 HOH 773 -1.091 47.350 -33.012 -ATOM 6135 H2 HOH 773 -1.072 47.741 -34.474 -ATOM 6136 O HOH 774 -1.587 47.833 -30.570 -ATOM 6137 H1 HOH 774 -2.214 47.825 -29.847 -ATOM 6138 H2 HOH 774 -1.267 48.735 -30.600 -ATOM 6139 O HOH 775 -1.587 47.833 -27.468 -ATOM 6140 H1 HOH 775 -1.154 47.890 -26.616 -ATOM 6141 H2 HOH 775 -1.378 48.662 -27.899 -ATOM 6142 O HOH 776 -1.587 47.833 -24.366 -ATOM 6143 H1 HOH 776 -0.904 47.723 -25.027 -ATOM 6144 H2 HOH 776 -1.638 48.780 -24.230 -ATOM 6145 O HOH 777 -1.587 47.833 -21.264 -ATOM 6146 H1 HOH 777 -2.194 47.192 -20.894 -ATOM 6147 H2 HOH 777 -0.718 47.503 -21.033 -ATOM 6148 O HOH 778 1.515 4.405 -30.570 -ATOM 6149 H1 HOH 778 1.286 4.753 -29.708 -ATOM 6150 H2 HOH 778 2.471 4.443 -30.598 -ATOM 6151 O HOH 779 1.515 4.405 -24.366 -ATOM 6152 H1 HOH 779 1.059 5.135 -23.948 -ATOM 6153 H2 HOH 779 1.687 3.789 -23.653 -ATOM 6154 O HOH 780 1.515 7.507 -27.468 -ATOM 6155 H1 HOH 780 1.440 8.338 -26.999 -ATOM 6156 H2 HOH 780 0.736 7.014 -27.209 -ATOM 6157 O HOH 781 1.515 7.507 -24.366 -ATOM 6158 H1 HOH 781 1.661 7.255 -25.278 -ATOM 6159 H2 HOH 781 0.799 8.141 -24.403 -ATOM 6160 O HOH 782 1.515 16.813 -21.264 -ATOM 6161 H1 HOH 782 0.728 17.099 -21.728 -ATOM 6162 H2 HOH 782 1.801 16.030 -21.735 -ATOM 6163 O HOH 783 1.515 16.813 -18.162 -ATOM 6164 H1 HOH 783 1.131 17.238 -18.928 -ATOM 6165 H2 HOH 783 0.948 17.070 -17.435 -ATOM 6166 O HOH 784 1.515 19.915 -24.366 -ATOM 6167 H1 HOH 784 1.517 18.991 -24.115 -ATOM 6168 H2 HOH 784 0.625 20.213 -24.178 -ATOM 6169 O HOH 785 1.515 19.915 -18.162 -ATOM 6170 H1 HOH 785 0.745 20.069 -18.709 -ATOM 6171 H2 HOH 785 1.403 19.022 -17.836 -ATOM 6172 O HOH 786 1.515 23.017 -24.366 -ATOM 6173 H1 HOH 786 1.384 22.069 -24.394 -ATOM 6174 H2 HOH 786 2.310 23.164 -24.879 -ATOM 6175 O HOH 787 1.515 23.017 -21.264 -ATOM 6176 H1 HOH 787 2.170 22.923 -20.572 -ATOM 6177 H2 HOH 787 0.718 22.637 -20.893 -ATOM 6178 O HOH 788 1.515 23.017 -15.060 -ATOM 6179 H1 HOH 788 2.063 22.439 -14.529 -ATOM 6180 H2 HOH 788 0.631 22.894 -14.714 -ATOM 6181 O HOH 789 1.515 26.119 -24.366 -ATOM 6182 H1 HOH 789 1.477 27.011 -24.710 -ATOM 6183 H2 HOH 789 1.866 25.598 -25.088 -ATOM 6184 O HOH 790 1.515 26.119 -15.060 -ATOM 6185 H1 HOH 790 1.306 26.953 -14.638 -ATOM 6186 H2 HOH 790 1.941 26.366 -15.881 -ATOM 6187 O HOH 791 1.515 29.221 -24.366 -ATOM 6188 H1 HOH 791 2.280 29.583 -23.919 -ATOM 6189 H2 HOH 791 1.868 28.527 -24.923 -ATOM 6190 O HOH 792 1.515 29.221 -21.264 -ATOM 6191 H1 HOH 792 0.730 28.846 -20.866 -ATOM 6192 H2 HOH 792 1.725 28.629 -21.986 -ATOM 6193 O HOH 793 1.515 29.221 -18.162 -ATOM 6194 H1 HOH 793 0.884 28.870 -18.790 -ATOM 6195 H2 HOH 793 2.165 29.672 -18.701 -ATOM 6196 O HOH 794 1.515 32.323 -27.468 -ATOM 6197 H1 HOH 794 1.524 31.410 -27.183 -ATOM 6198 H2 HOH 794 0.640 32.637 -27.240 -ATOM 6199 O HOH 795 1.515 32.323 -24.366 -ATOM 6200 H1 HOH 795 0.762 32.410 -23.782 -ATOM 6201 H2 HOH 795 1.490 33.112 -24.908 -ATOM 6202 O HOH 796 1.515 32.323 -18.162 -ATOM 6203 H1 HOH 796 2.285 32.352 -18.730 -ATOM 6204 H2 HOH 796 1.611 31.508 -17.670 -ATOM 6205 O HOH 797 1.515 32.323 -15.060 -ATOM 6206 H1 HOH 797 0.671 31.874 -15.111 -ATOM 6207 H2 HOH 797 1.869 32.073 -14.206 -ATOM 6208 O HOH 798 1.515 32.323 -8.856 -ATOM 6209 H1 HOH 798 1.274 32.741 -9.682 -ATOM 6210 H2 HOH 798 2.095 31.606 -9.110 -ATOM 6211 O HOH 799 1.515 35.425 -46.080 -ATOM 6212 H1 HOH 799 1.809 34.558 -45.801 -ATOM 6213 H2 HOH 799 1.088 35.274 -46.923 -ATOM 6214 O HOH 800 1.515 35.425 -30.570 -ATOM 6215 H1 HOH 800 2.310 35.684 -30.104 -ATOM 6216 H2 HOH 800 1.746 35.497 -31.496 -ATOM 6217 O HOH 801 1.515 35.425 -27.468 -ATOM 6218 H1 HOH 801 2.098 35.570 -28.213 -ATOM 6219 H2 HOH 801 1.893 35.949 -26.762 -ATOM 6220 O HOH 802 1.515 35.425 -24.366 -ATOM 6221 H1 HOH 802 1.791 34.535 -24.583 -ATOM 6222 H2 HOH 802 1.643 35.920 -25.175 -ATOM 6223 O HOH 803 1.515 35.425 -18.162 -ATOM 6224 H1 HOH 803 0.809 35.008 -18.655 -ATOM 6225 H2 HOH 803 2.220 34.778 -18.160 -ATOM 6226 O HOH 804 1.515 35.425 -15.060 -ATOM 6227 H1 HOH 804 2.197 35.438 -14.388 -ATOM 6228 H2 HOH 804 1.750 34.689 -15.625 -ATOM 6229 O HOH 805 1.515 35.425 -11.958 -ATOM 6230 H1 HOH 805 1.323 34.714 -12.568 -ATOM 6231 H2 HOH 805 2.143 35.978 -12.423 -ATOM 6232 O HOH 806 1.515 35.425 -8.856 -ATOM 6233 H1 HOH 806 1.120 35.915 -9.577 -ATOM 6234 H2 HOH 806 1.768 34.589 -9.247 -ATOM 6235 O HOH 807 1.515 38.527 -49.182 -ATOM 6236 H1 HOH 807 0.911 37.924 -48.750 -ATOM 6237 H2 HOH 807 2.337 38.041 -49.245 -ATOM 6238 O HOH 808 1.515 38.527 -46.080 -ATOM 6239 H1 HOH 808 1.973 39.148 -45.513 -ATOM 6240 H2 HOH 808 0.966 39.075 -46.641 -ATOM 6241 O HOH 809 1.515 38.527 -42.978 -ATOM 6242 H1 HOH 809 1.994 37.806 -43.387 -ATOM 6243 H2 HOH 809 2.112 38.862 -42.309 -ATOM 6244 O HOH 810 1.515 38.527 -39.876 -ATOM 6245 H1 HOH 810 1.115 39.000 -40.606 -ATOM 6246 H2 HOH 810 2.295 39.038 -39.659 -ATOM 6247 O HOH 811 1.515 38.527 -36.774 -ATOM 6248 H1 HOH 811 0.652 38.158 -36.586 -ATOM 6249 H2 HOH 811 2.061 38.247 -36.039 -ATOM 6250 O HOH 812 1.515 38.527 -33.672 -ATOM 6251 H1 HOH 812 0.822 38.168 -34.226 -ATOM 6252 H2 HOH 812 1.975 39.149 -34.236 -ATOM 6253 O HOH 813 1.515 38.527 -30.570 -ATOM 6254 H1 HOH 813 0.560 38.542 -30.504 -ATOM 6255 H2 HOH 813 1.791 37.885 -29.917 -ATOM 6256 O HOH 814 1.515 38.527 -27.468 -ATOM 6257 H1 HOH 814 0.580 38.703 -27.360 -ATOM 6258 H2 HOH 814 1.645 37.666 -27.071 -ATOM 6259 O HOH 815 1.515 38.527 -24.366 -ATOM 6260 H1 HOH 815 0.945 38.414 -25.126 -ATOM 6261 H2 HOH 815 0.967 38.292 -23.617 -ATOM 6262 O HOH 816 1.515 38.527 -21.264 -ATOM 6263 H1 HOH 816 1.446 39.471 -21.118 -ATOM 6264 H2 HOH 816 0.720 38.300 -21.746 -ATOM 6265 O HOH 817 1.515 38.527 -18.162 -ATOM 6266 H1 HOH 817 2.297 38.151 -17.757 -ATOM 6267 H2 HOH 817 0.963 38.785 -17.423 -ATOM 6268 O HOH 818 1.515 38.527 -15.060 -ATOM 6269 H1 HOH 818 2.045 38.348 -15.837 -ATOM 6270 H2 HOH 818 1.281 39.452 -15.136 -ATOM 6271 O HOH 819 1.515 38.527 -11.958 -ATOM 6272 H1 HOH 819 2.168 37.828 -11.980 -ATOM 6273 H2 HOH 819 1.555 38.921 -12.829 -ATOM 6274 O HOH 820 1.515 41.629 -46.080 -ATOM 6275 H1 HOH 820 2.407 41.530 -45.747 -ATOM 6276 H2 HOH 820 0.986 41.806 -45.302 -ATOM 6277 O HOH 821 1.515 41.629 -42.978 -ATOM 6278 H1 HOH 821 2.128 42.350 -42.832 -ATOM 6279 H2 HOH 821 2.058 40.918 -43.318 -ATOM 6280 O HOH 822 1.515 41.629 -39.876 -ATOM 6281 H1 HOH 822 1.283 40.750 -39.579 -ATOM 6282 H2 HOH 822 1.779 41.512 -40.789 -ATOM 6283 O HOH 823 1.515 41.629 -36.774 -ATOM 6284 H1 HOH 823 0.838 42.301 -36.692 -ATOM 6285 H2 HOH 823 1.055 40.867 -37.125 -ATOM 6286 O HOH 824 1.515 41.629 -33.672 -ATOM 6287 H1 HOH 824 0.978 40.851 -33.818 -ATOM 6288 H2 HOH 824 2.287 41.496 -34.222 -ATOM 6289 O HOH 825 1.515 41.629 -30.570 -ATOM 6290 H1 HOH 825 1.953 40.934 -30.079 -ATOM 6291 H2 HOH 825 1.899 42.439 -30.234 -ATOM 6292 O HOH 826 1.515 41.629 -27.468 -ATOM 6293 H1 HOH 826 2.290 42.056 -27.103 -ATOM 6294 H2 HOH 826 0.942 42.352 -27.724 -ATOM 6295 O HOH 827 1.515 41.629 -24.366 -ATOM 6296 H1 HOH 827 0.787 41.978 -24.881 -ATOM 6297 H2 HOH 827 1.734 42.331 -23.753 -ATOM 6298 O HOH 828 1.515 41.629 -21.264 -ATOM 6299 H1 HOH 828 1.704 40.691 -21.248 -ATOM 6300 H2 HOH 828 0.719 41.723 -20.741 -ATOM 6301 O HOH 829 1.515 41.629 -18.162 -ATOM 6302 H1 HOH 829 1.101 41.676 -17.300 -ATOM 6303 H2 HOH 829 0.974 41.012 -18.654 -ATOM 6304 O HOH 830 1.515 41.629 -15.060 -ATOM 6305 H1 HOH 830 0.808 41.055 -14.765 -ATOM 6306 H2 HOH 830 1.088 42.470 -15.224 -ATOM 6307 O HOH 831 1.515 44.731 -42.978 -ATOM 6308 H1 HOH 831 2.054 44.927 -42.212 -ATOM 6309 H2 HOH 831 2.066 44.167 -43.521 -ATOM 6310 O HOH 832 1.515 44.731 -39.876 -ATOM 6311 H1 HOH 832 0.892 45.171 -39.298 -ATOM 6312 H2 HOH 832 1.408 43.801 -39.679 -ATOM 6313 O HOH 833 1.515 44.731 -36.774 -ATOM 6314 H1 HOH 833 2.379 44.359 -36.949 -ATOM 6315 H2 HOH 833 1.664 45.363 -36.070 -ATOM 6316 O HOH 834 1.515 44.731 -33.672 -ATOM 6317 H1 HOH 834 1.986 44.068 -34.176 -ATOM 6318 H2 HOH 834 1.709 45.555 -34.119 -ATOM 6319 O HOH 835 1.515 44.731 -30.570 -ATOM 6320 H1 HOH 835 0.865 45.169 -30.021 -ATOM 6321 H2 HOH 835 2.353 45.103 -30.293 -ATOM 6322 O HOH 836 1.515 44.731 -27.468 -ATOM 6323 H1 HOH 836 0.981 44.166 -26.910 -ATOM 6324 H2 HOH 836 1.828 45.421 -26.882 -ATOM 6325 O HOH 837 1.515 44.731 -24.366 -ATOM 6326 H1 HOH 837 1.449 45.494 -24.941 -ATOM 6327 H2 HOH 837 1.665 43.995 -24.959 -ATOM 6328 O HOH 838 1.515 44.731 -21.264 -ATOM 6329 H1 HOH 838 1.068 45.522 -20.961 -ATOM 6330 H2 HOH 838 1.213 44.615 -22.165 -ATOM 6331 O HOH 839 1.515 44.731 -18.162 -ATOM 6332 H1 HOH 839 2.156 44.204 -17.685 -ATOM 6333 H2 HOH 839 0.787 44.836 -17.549 -ATOM 6334 O HOH 840 1.515 47.833 -39.876 -ATOM 6335 H1 HOH 840 1.066 47.766 -40.719 -ATOM 6336 H2 HOH 840 2.257 47.233 -39.951 -ATOM 6337 O HOH 841 1.515 47.833 -36.774 -ATOM 6338 H1 HOH 841 0.628 47.511 -36.930 -ATOM 6339 H2 HOH 841 1.747 48.296 -37.580 -ATOM 6340 O HOH 842 1.515 47.833 -33.672 -ATOM 6341 H1 HOH 842 1.286 48.202 -32.819 -ATOM 6342 H2 HOH 842 0.860 47.152 -33.823 -ATOM 6343 O HOH 843 1.515 47.833 -30.570 -ATOM 6344 H1 HOH 843 1.054 47.220 -31.142 -ATOM 6345 H2 HOH 843 2.427 47.790 -30.857 -ATOM 6346 O HOH 844 1.515 47.833 -27.468 -ATOM 6347 H1 HOH 844 0.874 47.699 -28.166 -ATOM 6348 H2 HOH 844 1.026 47.677 -26.660 -ATOM 6349 O HOH 845 1.515 47.833 -24.366 -ATOM 6350 H1 HOH 845 1.948 48.107 -23.557 -ATOM 6351 H2 HOH 845 0.810 47.254 -24.077 -ATOM 6352 O HOH 846 1.515 47.833 -21.264 -ATOM 6353 H1 HOH 846 0.837 48.453 -20.994 -ATOM 6354 H2 HOH 846 1.626 47.255 -20.509 -ATOM 6355 O HOH 847 4.617 7.507 -27.468 -ATOM 6356 H1 HOH 847 5.259 8.180 -27.241 -ATOM 6357 H2 HOH 847 4.804 6.785 -26.867 -ATOM 6358 O HOH 848 4.617 10.609 -39.876 -ATOM 6359 H1 HOH 848 3.895 10.734 -39.261 -ATOM 6360 H2 HOH 848 5.284 10.143 -39.371 -ATOM 6361 O HOH 849 4.617 10.609 -27.468 -ATOM 6362 H1 HOH 849 5.170 11.112 -26.870 -ATOM 6363 H2 HOH 849 5.221 10.278 -28.133 -ATOM 6364 O HOH 850 4.617 13.711 -15.060 -ATOM 6365 H1 HOH 850 4.793 13.622 -15.996 -ATOM 6366 H2 HOH 850 5.279 14.329 -14.749 -ATOM 6367 O HOH 851 4.617 16.813 -24.366 -ATOM 6368 H1 HOH 851 4.060 16.314 -23.768 -ATOM 6369 H2 HOH 851 5.197 16.159 -24.756 -ATOM 6370 O HOH 852 4.617 16.813 -21.264 -ATOM 6371 H1 HOH 852 5.310 17.349 -20.879 -ATOM 6372 H2 HOH 852 4.955 16.563 -22.124 -ATOM 6373 O HOH 853 4.617 16.813 -18.162 -ATOM 6374 H1 HOH 853 4.008 16.448 -18.804 -ATOM 6375 H2 HOH 853 5.342 17.154 -18.685 -ATOM 6376 O HOH 854 4.617 16.813 -15.060 -ATOM 6377 H1 HOH 854 4.149 16.523 -14.277 -ATOM 6378 H2 HOH 854 5.530 16.888 -14.780 -ATOM 6379 O HOH 855 4.617 19.915 -24.366 -ATOM 6380 H1 HOH 855 4.302 19.271 -23.731 -ATOM 6381 H2 HOH 855 4.720 19.420 -25.179 -ATOM 6382 O HOH 856 4.617 19.915 -21.264 -ATOM 6383 H1 HOH 856 4.046 20.582 -20.884 -ATOM 6384 H2 HOH 856 5.428 20.381 -21.466 -ATOM 6385 O HOH 857 4.617 19.915 -18.162 -ATOM 6386 H1 HOH 857 5.040 20.553 -18.737 -ATOM 6387 H2 HOH 857 3.682 20.103 -18.241 -ATOM 6388 O HOH 858 4.617 19.915 -15.060 -ATOM 6389 H1 HOH 858 5.260 19.739 -15.746 -ATOM 6390 H2 HOH 858 4.918 19.399 -14.311 -ATOM 6391 O HOH 859 4.617 23.017 -52.284 -ATOM 6392 H1 HOH 859 5.144 23.507 -52.915 -ATOM 6393 H2 HOH 859 5.257 22.531 -51.764 -ATOM 6394 O HOH 860 4.617 23.017 -39.876 -ATOM 6395 H1 HOH 860 5.211 22.523 -40.441 -ATOM 6396 H2 HOH 860 3.921 23.315 -40.462 -ATOM 6397 O HOH 861 4.617 23.017 -24.366 -ATOM 6398 H1 HOH 861 5.215 23.229 -25.082 -ATOM 6399 H2 HOH 861 3.894 23.635 -24.467 -ATOM 6400 O HOH 862 4.617 23.017 -21.264 -ATOM 6401 H1 HOH 862 3.985 23.492 -20.724 -ATOM 6402 H2 HOH 862 4.435 22.093 -21.090 -ATOM 6403 O HOH 863 4.617 23.017 -18.162 -ATOM 6404 H1 HOH 863 4.035 22.261 -18.086 -ATOM 6405 H2 HOH 863 4.254 23.528 -18.885 -ATOM 6406 O HOH 864 4.617 23.017 -15.060 -ATOM 6407 H1 HOH 864 4.896 23.852 -14.685 -ATOM 6408 H2 HOH 864 5.341 22.418 -14.877 -ATOM 6409 O HOH 865 4.617 23.017 -11.958 -ATOM 6410 H1 HOH 865 3.774 23.149 -12.391 -ATOM 6411 H2 HOH 865 4.740 22.068 -11.955 -ATOM 6412 O HOH 866 4.617 23.017 -8.856 -ATOM 6413 H1 HOH 866 4.006 22.640 -8.223 -ATOM 6414 H2 HOH 866 4.583 23.959 -8.691 -ATOM 6415 O HOH 867 4.617 26.119 -46.080 -ATOM 6416 H1 HOH 867 5.150 25.368 -45.820 -ATOM 6417 H2 HOH 867 3.748 25.751 -46.243 -ATOM 6418 O HOH 868 4.617 26.119 -27.468 -ATOM 6419 H1 HOH 868 5.439 26.581 -27.302 -ATOM 6420 H2 HOH 868 4.145 26.682 -28.082 -ATOM 6421 O HOH 869 4.617 26.119 -24.366 -ATOM 6422 H1 HOH 869 3.957 26.625 -24.840 -ATOM 6423 H2 HOH 869 4.161 25.800 -23.587 -ATOM 6424 O HOH 870 4.617 26.119 -21.264 -ATOM 6425 H1 HOH 870 5.340 26.154 -20.638 -ATOM 6426 H2 HOH 870 3.997 25.500 -20.879 -ATOM 6427 O HOH 871 4.617 26.119 -18.162 -ATOM 6428 H1 HOH 871 5.121 25.542 -17.588 -ATOM 6429 H2 HOH 871 5.116 26.139 -18.979 -ATOM 6430 O HOH 872 4.617 26.119 -15.060 -ATOM 6431 H1 HOH 872 4.127 26.095 -14.238 -ATOM 6432 H2 HOH 872 3.958 26.313 -15.726 -ATOM 6433 O HOH 873 4.617 26.119 -11.958 -ATOM 6434 H1 HOH 873 4.605 26.863 -12.560 -ATOM 6435 H2 HOH 873 5.374 26.279 -11.394 -ATOM 6436 O HOH 874 4.617 26.119 -8.856 -ATOM 6437 H1 HOH 874 4.393 26.729 -9.558 -ATOM 6438 H2 HOH 874 3.788 25.956 -8.405 -ATOM 6439 O HOH 875 4.617 29.221 -52.284 -ATOM 6440 H1 HOH 875 4.654 28.869 -51.395 -ATOM 6441 H2 HOH 875 3.902 29.857 -52.262 -ATOM 6442 O HOH 876 4.617 29.221 -49.182 -ATOM 6443 H1 HOH 876 4.866 30.109 -48.925 -ATOM 6444 H2 HOH 876 5.432 28.822 -49.489 -ATOM 6445 O HOH 877 4.617 29.221 -30.570 -ATOM 6446 H1 HOH 877 5.252 28.848 -31.182 -ATOM 6447 H2 HOH 877 3.820 29.331 -31.088 -ATOM 6448 O HOH 878 4.617 29.221 -27.468 -ATOM 6449 H1 HOH 878 5.028 29.756 -26.789 -ATOM 6450 H2 HOH 878 3.779 28.955 -27.090 -ATOM 6451 O HOH 879 4.617 29.221 -24.366 -ATOM 6452 H1 HOH 879 3.958 29.890 -24.552 -ATOM 6453 H2 HOH 879 4.374 28.877 -23.506 -ATOM 6454 O HOH 880 4.617 29.221 -21.264 -ATOM 6455 H1 HOH 880 4.195 28.363 -21.301 -ATOM 6456 H2 HOH 880 5.481 29.048 -20.891 -ATOM 6457 O HOH 881 4.617 29.221 -18.162 -ATOM 6458 H1 HOH 881 4.442 29.327 -17.227 -ATOM 6459 H2 HOH 881 5.537 28.959 -18.205 -ATOM 6460 O HOH 882 4.617 29.221 -15.060 -ATOM 6461 H1 HOH 882 4.663 28.455 -15.632 -ATOM 6462 H2 HOH 882 5.451 29.220 -14.590 -ATOM 6463 O HOH 883 4.617 29.221 -11.958 -ATOM 6464 H1 HOH 883 3.981 29.820 -12.348 -ATOM 6465 H2 HOH 883 4.147 28.391 -11.876 -ATOM 6466 O HOH 884 4.617 29.221 -8.856 -ATOM 6467 H1 HOH 884 4.779 29.922 -9.486 -ATOM 6468 H2 HOH 884 4.492 29.673 -8.021 -ATOM 6469 O HOH 885 4.617 32.323 -52.284 -ATOM 6470 H1 HOH 885 3.788 32.130 -52.721 -ATOM 6471 H2 HOH 885 4.644 33.278 -52.231 -ATOM 6472 O HOH 886 4.617 32.323 -49.182 -ATOM 6473 H1 HOH 886 5.530 32.535 -48.988 -ATOM 6474 H2 HOH 886 4.297 31.894 -48.389 -ATOM 6475 O HOH 887 4.617 32.323 -46.080 -ATOM 6476 H1 HOH 887 4.488 32.197 -47.020 -ATOM 6477 H2 HOH 887 5.009 31.503 -45.780 -ATOM 6478 O HOH 888 4.617 32.323 -30.570 -ATOM 6479 H1 HOH 888 4.819 33.025 -29.951 -ATOM 6480 H2 HOH 888 4.121 31.686 -30.056 -ATOM 6481 O HOH 889 4.617 32.323 -27.468 -ATOM 6482 H1 HOH 889 5.200 32.781 -26.862 -ATOM 6483 H2 HOH 889 4.368 31.524 -27.003 -ATOM 6484 O HOH 890 4.617 32.323 -24.366 -ATOM 6485 H1 HOH 890 4.239 31.731 -25.016 -ATOM 6486 H2 HOH 890 5.502 31.988 -24.222 -ATOM 6487 O HOH 891 4.617 32.323 -21.264 -ATOM 6488 H1 HOH 891 4.348 32.136 -22.163 -ATOM 6489 H2 HOH 891 5.106 31.546 -20.993 -ATOM 6490 O HOH 892 4.617 32.323 -18.162 -ATOM 6491 H1 HOH 892 5.382 32.881 -18.017 -ATOM 6492 H2 HOH 892 3.879 32.839 -17.836 -ATOM 6493 O HOH 893 4.617 32.323 -15.060 -ATOM 6494 H1 HOH 893 4.789 31.555 -15.604 -ATOM 6495 H2 HOH 893 4.069 31.995 -14.347 -ATOM 6496 O HOH 894 4.617 32.323 -11.958 -ATOM 6497 H1 HOH 894 3.946 32.516 -12.612 -ATOM 6498 H2 HOH 894 5.346 31.960 -12.461 -ATOM 6499 O HOH 895 4.617 32.323 -8.856 -ATOM 6500 H1 HOH 895 3.883 32.645 -9.379 -ATOM 6501 H2 HOH 895 4.312 31.488 -8.501 -ATOM 6502 O HOH 896 4.617 35.425 -49.182 -ATOM 6503 H1 HOH 896 4.048 34.922 -48.600 -ATOM 6504 H2 HOH 896 4.227 35.318 -50.050 -ATOM 6505 O HOH 897 4.617 35.425 -46.080 -ATOM 6506 H1 HOH 897 5.026 34.849 -46.726 -ATOM 6507 H2 HOH 897 4.999 36.286 -46.252 -ATOM 6508 O HOH 898 4.617 35.425 -33.672 -ATOM 6509 H1 HOH 898 3.850 35.385 -34.243 -ATOM 6510 H2 HOH 898 4.292 35.813 -32.860 -ATOM 6511 O HOH 899 4.617 35.425 -30.570 -ATOM 6512 H1 HOH 899 5.010 34.932 -29.850 -ATOM 6513 H2 HOH 899 5.039 35.079 -31.356 -ATOM 6514 O HOH 900 4.617 35.425 -27.468 -ATOM 6515 H1 HOH 900 3.972 34.862 -27.041 -ATOM 6516 H2 HOH 900 4.489 35.271 -28.404 -ATOM 6517 O HOH 901 4.617 35.425 -24.366 -ATOM 6518 H1 HOH 901 4.377 34.718 -23.768 -ATOM 6519 H2 HOH 901 3.831 35.572 -24.891 -ATOM 6520 O HOH 902 4.617 35.425 -21.264 -ATOM 6521 H1 HOH 902 5.238 35.526 -21.986 -ATOM 6522 H2 HOH 902 3.757 35.426 -21.685 -ATOM 6523 O HOH 903 4.617 35.425 -18.162 -ATOM 6524 H1 HOH 903 4.821 35.064 -19.025 -ATOM 6525 H2 HOH 903 3.821 34.967 -17.892 -ATOM 6526 O HOH 904 4.617 35.425 -15.060 -ATOM 6527 H1 HOH 904 4.735 36.334 -15.337 -ATOM 6528 H2 HOH 904 5.393 35.232 -14.533 -ATOM 6529 O HOH 905 4.617 35.425 -11.958 -ATOM 6530 H1 HOH 905 4.976 35.924 -11.223 -ATOM 6531 H2 HOH 905 5.381 35.023 -12.371 -ATOM 6532 O HOH 906 4.617 38.527 -49.182 -ATOM 6533 H1 HOH 906 5.178 38.766 -49.921 -ATOM 6534 H2 HOH 906 4.058 37.828 -49.522 -ATOM 6535 O HOH 907 4.617 38.527 -46.080 -ATOM 6536 H1 HOH 907 5.429 39.010 -46.237 -ATOM 6537 H2 HOH 907 4.397 38.718 -45.169 -ATOM 6538 O HOH 908 4.617 38.527 -42.978 -ATOM 6539 H1 HOH 908 5.232 38.553 -42.245 -ATOM 6540 H2 HOH 908 3.927 37.930 -42.691 -ATOM 6541 O HOH 909 4.617 38.527 -39.876 -ATOM 6542 H1 HOH 909 4.280 37.638 -39.768 -ATOM 6543 H2 HOH 909 4.038 38.926 -40.526 -ATOM 6544 O HOH 910 4.617 38.527 -36.774 -ATOM 6545 H1 HOH 910 4.869 37.888 -37.440 -ATOM 6546 H2 HOH 910 3.780 38.207 -36.438 -ATOM 6547 O HOH 911 4.617 38.527 -33.672 -ATOM 6548 H1 HOH 911 5.175 38.397 -32.905 -ATOM 6549 H2 HOH 911 5.108 38.135 -34.394 -ATOM 6550 O HOH 912 4.617 38.527 -30.570 -ATOM 6551 H1 HOH 912 4.019 38.068 -31.160 -ATOM 6552 H2 HOH 912 4.638 37.986 -29.781 -ATOM 6553 O HOH 913 4.617 38.527 -27.468 -ATOM 6554 H1 HOH 913 4.582 38.896 -26.585 -ATOM 6555 H2 HOH 913 3.700 38.450 -27.732 -ATOM 6556 O HOH 914 4.617 38.527 -24.366 -ATOM 6557 H1 HOH 914 4.784 39.005 -25.178 -ATOM 6558 H2 HOH 914 5.484 38.250 -24.069 -ATOM 6559 O HOH 915 4.617 38.527 -21.264 -ATOM 6560 H1 HOH 915 4.116 39.065 -21.877 -ATOM 6561 H2 HOH 915 5.186 39.148 -20.809 -ATOM 6562 O HOH 916 4.617 38.527 -18.162 -ATOM 6563 H1 HOH 916 3.996 37.989 -17.672 -ATOM 6564 H2 HOH 916 4.244 39.408 -18.136 -ATOM 6565 O HOH 917 4.617 38.527 -15.060 -ATOM 6566 H1 HOH 917 5.271 38.439 -15.753 -ATOM 6567 H2 HOH 917 4.056 39.247 -15.349 -ATOM 6568 O HOH 918 4.617 38.527 -11.958 -ATOM 6569 H1 HOH 918 5.111 38.076 -12.642 -ATOM 6570 H2 HOH 918 5.287 38.888 -11.377 -ATOM 6571 O HOH 919 4.617 41.629 -46.080 -ATOM 6572 H1 HOH 919 4.560 41.592 -47.035 -ATOM 6573 H2 HOH 919 5.556 41.621 -45.896 -ATOM 6574 O HOH 920 4.617 41.629 -42.978 -ATOM 6575 H1 HOH 920 5.475 41.920 -43.288 -ATOM 6576 H2 HOH 920 4.086 42.426 -42.958 -ATOM 6577 O HOH 921 4.617 41.629 -39.876 -ATOM 6578 H1 HOH 921 5.079 41.870 -39.073 -ATOM 6579 H2 HOH 921 4.208 42.443 -40.170 -ATOM 6580 O HOH 922 4.617 41.629 -36.774 -ATOM 6581 H1 HOH 922 3.675 41.520 -36.646 -ATOM 6582 H2 HOH 922 4.987 40.766 -36.588 -ATOM 6583 O HOH 923 4.617 41.629 -33.672 -ATOM 6584 H1 HOH 923 4.256 42.268 -33.058 -ATOM 6585 H2 HOH 923 5.452 42.008 -33.949 -ATOM 6586 O HOH 924 4.617 41.629 -30.570 -ATOM 6587 H1 HOH 924 3.939 41.147 -30.098 -ATOM 6588 H2 HOH 924 4.388 41.523 -31.493 -ATOM 6589 O HOH 925 4.617 41.629 -27.468 -ATOM 6590 H1 HOH 925 5.306 41.524 -28.124 -ATOM 6591 H2 HOH 925 4.634 40.813 -26.969 -ATOM 6592 O HOH 926 4.617 41.629 -24.366 -ATOM 6593 H1 HOH 926 5.201 41.099 -24.909 -ATOM 6594 H2 HOH 926 5.156 42.368 -24.084 -ATOM 6595 O HOH 927 4.617 41.629 -21.264 -ATOM 6596 H1 HOH 927 4.360 41.136 -20.485 -ATOM 6597 H2 HOH 927 4.098 41.248 -21.972 -ATOM 6598 O HOH 928 4.617 41.629 -18.162 -ATOM 6599 H1 HOH 928 3.888 41.211 -18.618 -ATOM 6600 H2 HOH 928 5.375 41.470 -18.724 -ATOM 6601 O HOH 929 4.617 41.629 -15.060 -ATOM 6602 H1 HOH 929 5.097 41.827 -14.255 -ATOM 6603 H2 HOH 929 5.266 41.728 -15.756 -ATOM 6604 O HOH 930 4.617 44.731 -42.978 -ATOM 6605 H1 HOH 930 5.404 44.637 -43.515 -ATOM 6606 H2 HOH 930 3.935 44.274 -43.470 -ATOM 6607 O HOH 931 4.617 44.731 -39.876 -ATOM 6608 H1 HOH 931 4.469 44.014 -40.492 -ATOM 6609 H2 HOH 931 5.566 44.857 -39.878 -ATOM 6610 O HOH 932 4.617 44.731 -36.774 -ATOM 6611 H1 HOH 932 4.420 44.586 -37.699 -ATOM 6612 H2 HOH 932 3.821 44.466 -36.314 -ATOM 6613 O HOH 933 4.617 44.731 -33.672 -ATOM 6614 H1 HOH 933 5.139 44.869 -34.462 -ATOM 6615 H2 HOH 933 5.177 45.036 -32.958 -ATOM 6616 O HOH 934 4.617 44.731 -30.570 -ATOM 6617 H1 HOH 934 5.161 44.981 -31.317 -ATOM 6618 H2 HOH 934 4.192 45.545 -30.301 -ATOM 6619 O HOH 935 4.617 44.731 -27.468 -ATOM 6620 H1 HOH 935 5.469 44.565 -27.065 -ATOM 6621 H2 HOH 935 4.138 43.909 -27.365 -ATOM 6622 O HOH 936 4.617 44.731 -24.366 -ATOM 6623 H1 HOH 936 5.376 45.148 -24.774 -ATOM 6624 H2 HOH 936 4.006 44.585 -25.088 -ATOM 6625 O HOH 937 4.617 44.731 -21.264 -ATOM 6626 H1 HOH 937 5.184 45.357 -20.812 -ATOM 6627 H2 HOH 937 3.801 44.743 -20.763 -ATOM 6628 O HOH 938 4.617 44.731 -18.162 -ATOM 6629 H1 HOH 938 4.975 43.994 -18.656 -ATOM 6630 H2 HOH 938 4.918 45.507 -18.636 -ATOM 6631 O HOH 939 4.617 47.833 -36.774 -ATOM 6632 H1 HOH 939 5.013 47.672 -35.918 -ATOM 6633 H2 HOH 939 4.225 48.703 -36.697 -ATOM 6634 O HOH 940 4.617 47.833 -33.672 -ATOM 6635 H1 HOH 940 4.246 47.028 -33.313 -ATOM 6636 H2 HOH 940 4.108 48.535 -33.265 -ATOM 6637 O HOH 941 4.617 47.833 -30.570 -ATOM 6638 H1 HOH 941 4.973 48.632 -30.180 -ATOM 6639 H2 HOH 941 4.389 47.281 -29.822 -ATOM 6640 O HOH 942 4.617 47.833 -27.468 -ATOM 6641 H1 HOH 942 4.513 48.106 -26.556 -ATOM 6642 H2 HOH 942 5.302 48.407 -27.813 -ATOM 6643 O HOH 943 4.617 47.833 -24.366 -ATOM 6644 H1 HOH 943 4.907 46.924 -24.435 -ATOM 6645 H2 HOH 943 3.911 47.812 -23.720 -ATOM 6646 O HOH 944 7.719 7.507 -27.468 -ATOM 6647 H1 HOH 944 8.325 7.999 -28.022 -ATOM 6648 H2 HOH 944 8.081 6.620 -27.447 -ATOM 6649 O HOH 945 7.719 13.711 -30.570 -ATOM 6650 H1 HOH 945 7.454 14.142 -29.758 -ATOM 6651 H2 HOH 945 7.701 12.776 -30.363 -ATOM 6652 O HOH 946 7.719 13.711 -27.468 -ATOM 6653 H1 HOH 946 6.965 14.194 -27.131 -ATOM 6654 H2 HOH 946 7.418 12.804 -27.522 -ATOM 6655 O HOH 947 7.719 13.711 -15.060 -ATOM 6656 H1 HOH 947 7.766 14.409 -14.407 -ATOM 6657 H2 HOH 947 8.621 13.400 -15.143 -ATOM 6658 O HOH 948 7.719 16.813 -30.570 -ATOM 6659 H1 HOH 948 8.284 16.836 -31.342 -ATOM 6660 H2 HOH 948 7.185 17.604 -30.639 -ATOM 6661 O HOH 949 7.719 16.813 -27.468 -ATOM 6662 H1 HOH 949 7.791 17.043 -26.542 -ATOM 6663 H2 HOH 949 6.977 17.326 -27.786 -ATOM 6664 O HOH 950 7.719 16.813 -24.366 -ATOM 6665 H1 HOH 950 7.005 17.406 -24.131 -ATOM 6666 H2 HOH 950 7.566 16.606 -25.288 -ATOM 6667 O HOH 951 7.719 16.813 -21.264 -ATOM 6668 H1 HOH 951 8.594 17.114 -21.018 -ATOM 6669 H2 HOH 951 7.148 17.144 -20.571 -ATOM 6670 O HOH 952 7.719 16.813 -18.162 -ATOM 6671 H1 HOH 952 8.446 17.384 -18.409 -ATOM 6672 H2 HOH 952 7.306 17.257 -17.421 -ATOM 6673 O HOH 953 7.719 16.813 -15.060 -ATOM 6674 H1 HOH 953 7.030 16.421 -14.524 -ATOM 6675 H2 HOH 953 7.527 16.520 -15.950 -ATOM 6676 O HOH 954 7.719 16.813 -11.958 -ATOM 6677 H1 HOH 954 7.564 16.110 -11.327 -ATOM 6678 H2 HOH 954 7.157 16.597 -12.701 -ATOM 6679 O HOH 955 7.719 19.915 -36.774 -ATOM 6680 H1 HOH 955 7.504 20.846 -36.716 -ATOM 6681 H2 HOH 955 8.405 19.868 -37.441 -ATOM 6682 O HOH 956 7.719 19.915 -33.672 -ATOM 6683 H1 HOH 956 7.408 19.093 -34.052 -ATOM 6684 H2 HOH 956 6.966 20.503 -33.725 -ATOM 6685 O HOH 957 7.719 19.915 -27.468 -ATOM 6686 H1 HOH 957 8.238 20.689 -27.249 -ATOM 6687 H2 HOH 957 7.069 20.232 -28.094 -ATOM 6688 O HOH 958 7.719 19.915 -24.366 -ATOM 6689 H1 HOH 958 8.379 19.355 -24.774 -ATOM 6690 H2 HOH 958 8.162 20.294 -23.607 -ATOM 6691 O HOH 959 7.719 19.915 -21.264 -ATOM 6692 H1 HOH 959 7.211 20.664 -20.952 -ATOM 6693 H2 HOH 959 7.593 19.243 -20.594 -ATOM 6694 O HOH 960 7.719 19.915 -18.162 -ATOM 6695 H1 HOH 960 8.368 19.272 -17.875 -ATOM 6696 H2 HOH 960 7.294 19.507 -18.916 -ATOM 6697 O HOH 961 7.719 19.915 -15.060 -ATOM 6698 H1 HOH 961 8.365 20.603 -14.901 -ATOM 6699 H2 HOH 961 7.740 19.379 -14.267 -ATOM 6700 O HOH 962 7.719 19.915 -11.958 -ATOM 6701 H1 HOH 962 8.243 20.150 -12.724 -ATOM 6702 H2 HOH 962 8.119 19.108 -11.632 -ATOM 6703 O HOH 963 7.719 23.017 -49.182 -ATOM 6704 H1 HOH 963 7.168 22.977 -48.401 -ATOM 6705 H2 HOH 963 7.110 22.903 -49.912 -ATOM 6706 O HOH 964 7.719 23.017 -39.876 -ATOM 6707 H1 HOH 964 8.321 23.036 -40.621 -ATOM 6708 H2 HOH 964 7.837 22.147 -39.495 -ATOM 6709 O HOH 965 7.719 23.017 -24.366 -ATOM 6710 H1 HOH 965 6.884 22.612 -24.597 -ATOM 6711 H2 HOH 965 8.317 22.749 -25.063 -ATOM 6712 O HOH 966 7.719 23.017 -21.264 -ATOM 6713 H1 HOH 966 8.168 22.495 -20.599 -ATOM 6714 H2 HOH 966 8.369 23.663 -21.540 -ATOM 6715 O HOH 967 7.719 23.017 -18.162 -ATOM 6716 H1 HOH 967 7.101 23.186 -17.450 -ATOM 6717 H2 HOH 967 8.452 22.567 -17.741 -ATOM 6718 O HOH 968 7.719 23.017 -15.060 -ATOM 6719 H1 HOH 968 8.406 22.566 -15.551 -ATOM 6720 H2 HOH 968 8.118 23.846 -14.794 -ATOM 6721 O HOH 969 7.719 23.017 -11.958 -ATOM 6722 H1 HOH 969 8.471 22.522 -12.283 -ATOM 6723 H2 HOH 969 7.880 23.107 -11.018 -ATOM 6724 O HOH 970 7.719 26.119 -49.182 -ATOM 6725 H1 HOH 970 7.398 26.699 -49.873 -ATOM 6726 H2 HOH 970 7.252 26.401 -48.396 -ATOM 6727 O HOH 971 7.719 26.119 -46.080 -ATOM 6728 H1 HOH 971 7.573 25.440 -45.422 -ATOM 6729 H2 HOH 971 8.286 26.756 -45.646 -ATOM 6730 O HOH 972 7.719 26.119 -42.978 -ATOM 6731 H1 HOH 972 8.236 26.916 -43.094 -ATOM 6732 H2 HOH 972 7.487 26.117 -42.050 -ATOM 6733 O HOH 973 7.719 26.119 -30.570 -ATOM 6734 H1 HOH 973 7.519 27.046 -30.444 -ATOM 6735 H2 HOH 973 8.404 26.110 -31.239 -ATOM 6736 O HOH 974 7.719 26.119 -27.468 -ATOM 6737 H1 HOH 974 6.881 26.326 -27.880 -ATOM 6738 H2 HOH 974 8.364 26.615 -27.972 -ATOM 6739 O HOH 975 7.719 26.119 -24.366 -ATOM 6740 H1 HOH 975 8.600 25.753 -24.290 -ATOM 6741 H2 HOH 975 7.792 26.777 -25.057 -ATOM 6742 O HOH 976 7.719 26.119 -21.264 -ATOM 6743 H1 HOH 976 8.281 25.702 -21.917 -ATOM 6744 H2 HOH 976 8.102 26.987 -21.137 -ATOM 6745 O HOH 977 7.719 26.119 -18.162 -ATOM 6746 H1 HOH 977 7.808 26.056 -17.211 -ATOM 6747 H2 HOH 977 6.821 26.421 -18.299 -ATOM 6748 O HOH 978 7.719 26.119 -15.060 -ATOM 6749 H1 HOH 978 8.434 26.665 -15.387 -ATOM 6750 H2 HOH 978 7.319 26.640 -14.364 -ATOM 6751 O HOH 979 7.719 26.119 -11.958 -ATOM 6752 H1 HOH 979 8.449 25.562 -12.228 -ATOM 6753 H2 HOH 979 7.646 25.978 -11.014 -ATOM 6754 O HOH 980 7.719 29.221 -49.182 -ATOM 6755 H1 HOH 980 8.271 29.189 -49.964 -ATOM 6756 H2 HOH 980 8.245 29.694 -48.537 -ATOM 6757 O HOH 981 7.719 29.221 -46.080 -ATOM 6758 H1 HOH 981 8.292 29.549 -45.387 -ATOM 6759 H2 HOH 981 8.260 28.595 -46.563 -ATOM 6760 O HOH 982 7.719 29.221 -42.978 -ATOM 6761 H1 HOH 982 8.397 28.546 -43.019 -ATOM 6762 H2 HOH 982 8.083 29.957 -43.471 -ATOM 6763 O HOH 983 7.719 29.221 -30.570 -ATOM 6764 H1 HOH 983 7.012 28.668 -30.902 -ATOM 6765 H2 HOH 983 7.961 28.825 -29.733 -ATOM 6766 O HOH 984 7.719 29.221 -27.468 -ATOM 6767 H1 HOH 984 7.675 28.265 -27.478 -ATOM 6768 H2 HOH 984 8.257 29.444 -28.228 -ATOM 6769 O HOH 985 7.719 29.221 -24.366 -ATOM 6770 H1 HOH 985 7.432 30.118 -24.193 -ATOM 6771 H2 HOH 985 8.631 29.201 -24.074 -ATOM 6772 O HOH 986 7.719 29.221 -21.264 -ATOM 6773 H1 HOH 986 7.009 29.022 -21.874 -ATOM 6774 H2 HOH 986 7.849 30.166 -21.347 -ATOM 6775 O HOH 987 7.719 29.221 -18.162 -ATOM 6776 H1 HOH 987 7.705 28.596 -18.887 -ATOM 6777 H2 HOH 987 7.928 28.691 -17.392 -ATOM 6778 O HOH 988 7.719 29.221 -15.060 -ATOM 6779 H1 HOH 988 6.783 29.025 -15.033 -ATOM 6780 H2 HOH 988 7.772 30.089 -15.459 -ATOM 6781 O HOH 989 7.719 29.221 -11.958 -ATOM 6782 H1 HOH 989 6.808 29.053 -11.719 -ATOM 6783 H2 HOH 989 8.231 28.771 -11.285 -ATOM 6784 O HOH 990 7.719 32.323 -49.182 -ATOM 6785 H1 HOH 990 7.417 31.647 -48.576 -ATOM 6786 H2 HOH 990 7.882 31.855 -50.001 -ATOM 6787 O HOH 991 7.719 32.323 -46.080 -ATOM 6788 H1 HOH 991 8.442 32.504 -46.682 -ATOM 6789 H2 HOH 991 6.935 32.369 -46.627 -ATOM 6790 O HOH 992 7.719 32.323 -42.978 -ATOM 6791 H1 HOH 992 7.255 31.544 -43.283 -ATOM 6792 H2 HOH 992 8.054 32.081 -42.115 -ATOM 6793 O HOH 993 7.719 32.323 -39.876 -ATOM 6794 H1 HOH 993 7.117 32.736 -40.495 -ATOM 6795 H2 HOH 993 7.413 31.419 -39.810 -ATOM 6796 O HOH 994 7.719 32.323 -36.774 -ATOM 6797 H1 HOH 994 8.386 31.687 -37.033 -ATOM 6798 H2 HOH 994 7.807 33.035 -37.408 -ATOM 6799 O HOH 995 7.719 32.323 -33.672 -ATOM 6800 H1 HOH 995 7.627 32.847 -34.468 -ATOM 6801 H2 HOH 995 7.225 32.805 -33.008 -ATOM 6802 O HOH 996 7.719 32.323 -30.570 -ATOM 6803 H1 HOH 996 8.245 32.651 -31.299 -ATOM 6804 H2 HOH 996 8.061 31.445 -30.404 -ATOM 6805 O HOH 997 7.719 32.323 -27.468 -ATOM 6806 H1 HOH 997 7.325 31.672 -26.888 -ATOM 6807 H2 HOH 997 7.085 32.428 -28.177 -ATOM 6808 O HOH 998 7.719 32.323 -24.366 -ATOM 6809 H1 HOH 998 7.965 32.646 -23.499 -ATOM 6810 H2 HOH 998 6.852 32.696 -24.524 -ATOM 6811 O HOH 999 7.719 32.323 -21.264 -ATOM 6812 H1 HOH 999 7.317 32.845 -21.957 -ATOM 6813 H2 HOH 999 8.661 32.440 -21.392 -ATOM 6814 O HOH 1000 7.719 32.323 -18.162 -ATOM 6815 H1 HOH 1000 7.113 33.061 -18.102 -ATOM 6816 H2 HOH 1000 8.338 32.461 -17.444 -ATOM 6817 O HOH 1001 7.719 32.323 -15.060 -ATOM 6818 H1 HOH 1001 7.168 31.902 -14.400 -ATOM 6819 H2 HOH 1001 7.797 31.673 -15.758 -ATOM 6820 O HOH 1002 7.719 32.323 -11.958 -ATOM 6821 H1 HOH 1002 7.391 31.692 -11.317 -ATOM 6822 H2 HOH 1002 8.559 32.613 -11.600 -ATOM 6823 O HOH 1003 7.719 35.425 -49.182 -ATOM 6824 H1 HOH 1003 7.836 36.369 -49.289 -ATOM 6825 H2 HOH 1003 8.182 35.041 -49.927 -ATOM 6826 O HOH 1004 7.719 35.425 -46.080 -ATOM 6827 H1 HOH 1004 8.264 36.003 -46.615 -ATOM 6828 H2 HOH 1004 7.782 34.572 -46.509 -ATOM 6829 O HOH 1005 7.719 35.425 -42.978 -ATOM 6830 H1 HOH 1005 8.073 36.008 -43.651 -ATOM 6831 H2 HOH 1005 7.586 35.990 -42.217 -ATOM 6832 O HOH 1006 7.719 35.425 -39.876 -ATOM 6833 H1 HOH 1006 7.673 35.319 -38.926 -ATOM 6834 H2 HOH 1006 7.428 36.324 -40.031 -ATOM 6835 O HOH 1007 7.719 35.425 -36.774 -ATOM 6836 H1 HOH 1007 8.473 35.993 -36.613 -ATOM 6837 H2 HOH 1007 7.000 35.841 -36.298 -ATOM 6838 O HOH 1008 7.719 35.425 -33.672 -ATOM 6839 H1 HOH 1008 7.792 36.367 -33.828 -ATOM 6840 H2 HOH 1008 7.440 35.354 -32.759 -ATOM 6841 O HOH 1009 7.719 35.425 -30.570 -ATOM 6842 H1 HOH 1009 8.191 36.155 -30.971 -ATOM 6843 H2 HOH 1009 7.385 35.779 -29.746 -ATOM 6844 O HOH 1010 7.719 35.425 -27.468 -ATOM 6845 H1 HOH 1010 7.154 35.898 -26.857 -ATOM 6846 H2 HOH 1010 8.330 34.947 -26.908 -ATOM 6847 O HOH 1011 7.719 35.425 -24.366 -ATOM 6848 H1 HOH 1011 6.986 36.039 -24.406 -ATOM 6849 H2 HOH 1011 7.345 34.630 -23.987 -ATOM 6850 O HOH 1012 7.719 35.425 -21.264 -ATOM 6851 H1 HOH 1012 7.916 36.102 -20.616 -ATOM 6852 H2 HOH 1012 6.911 35.020 -20.949 -ATOM 6853 O HOH 1013 7.719 35.425 -18.162 -ATOM 6854 H1 HOH 1013 8.246 35.858 -18.834 -ATOM 6855 H2 HOH 1013 8.352 34.926 -17.645 -ATOM 6856 O HOH 1014 7.719 35.425 -15.060 -ATOM 6857 H1 HOH 1014 6.850 35.727 -14.797 -ATOM 6858 H2 HOH 1014 8.286 36.186 -14.931 -ATOM 6859 O HOH 1015 7.719 35.425 -11.958 -ATOM 6860 H1 HOH 1015 7.314 34.637 -12.319 -ATOM 6861 H2 HOH 1015 8.023 35.911 -12.724 -ATOM 6862 O HOH 1016 7.719 38.527 -46.080 -ATOM 6863 H1 HOH 1016 7.840 38.832 -45.181 -ATOM 6864 H2 HOH 1016 7.935 37.595 -46.049 -ATOM 6865 O HOH 1017 7.719 38.527 -42.978 -ATOM 6866 H1 HOH 1017 7.462 38.486 -43.899 -ATOM 6867 H2 HOH 1017 6.893 38.605 -42.501 -ATOM 6868 O HOH 1018 7.719 38.527 -39.876 -ATOM 6869 H1 HOH 1018 8.395 38.088 -40.392 -ATOM 6870 H2 HOH 1018 8.202 38.988 -39.190 -ATOM 6871 O HOH 1019 7.719 38.527 -36.774 -ATOM 6872 H1 HOH 1019 7.564 37.632 -36.474 -ATOM 6873 H2 HOH 1019 7.029 38.688 -37.418 -ATOM 6874 O HOH 1020 7.719 38.527 -33.672 -ATOM 6875 H1 HOH 1020 8.566 38.925 -33.471 -ATOM 6876 H2 HOH 1020 7.083 39.068 -33.204 -ATOM 6877 O HOH 1021 7.719 38.527 -30.570 -ATOM 6878 H1 HOH 1021 8.376 38.001 -31.026 -ATOM 6879 H2 HOH 1021 7.244 37.900 -30.026 -ATOM 6880 O HOH 1022 7.719 38.527 -27.468 -ATOM 6881 H1 HOH 1022 7.685 39.462 -27.264 -ATOM 6882 H2 HOH 1022 8.570 38.240 -27.135 -ATOM 6883 O HOH 1023 7.719 38.527 -24.366 -ATOM 6884 H1 HOH 1023 8.275 37.819 -24.691 -ATOM 6885 H2 HOH 1023 6.893 38.418 -24.836 -ATOM 6886 O HOH 1024 7.719 38.527 -21.264 -ATOM 6887 H1 HOH 1024 8.094 39.005 -20.523 -ATOM 6888 H2 HOH 1024 6.859 38.925 -21.395 -ATOM 6889 O HOH 1025 7.719 38.527 -18.162 -ATOM 6890 H1 HOH 1025 7.741 37.820 -18.807 -ATOM 6891 H2 HOH 1025 8.582 38.501 -17.749 -ATOM 6892 O HOH 1026 7.719 38.527 -15.060 -ATOM 6893 H1 HOH 1026 7.323 37.687 -14.830 -ATOM 6894 H2 HOH 1026 6.992 39.054 -15.390 -ATOM 6895 O HOH 1027 7.719 41.629 -42.978 -ATOM 6896 H1 HOH 1027 7.699 40.939 -42.315 -ATOM 6897 H2 HOH 1027 7.316 42.385 -42.551 -ATOM 6898 O HOH 1028 7.719 41.629 -39.876 -ATOM 6899 H1 HOH 1028 7.115 42.346 -40.070 -ATOM 6900 H2 HOH 1028 8.355 41.651 -40.592 -ATOM 6901 O HOH 1029 7.719 41.629 -36.774 -ATOM 6902 H1 HOH 1029 8.535 41.136 -36.863 -ATOM 6903 H2 HOH 1029 7.646 41.805 -35.836 -ATOM 6904 O HOH 1030 7.719 41.629 -33.672 -ATOM 6905 H1 HOH 1030 7.307 40.876 -33.250 -ATOM 6906 H2 HOH 1030 6.989 42.200 -33.911 -ATOM 6907 O HOH 1031 7.719 41.629 -30.570 -ATOM 6908 H1 HOH 1031 8.019 42.266 -29.921 -ATOM 6909 H2 HOH 1031 6.894 41.297 -30.217 -ATOM 6910 O HOH 1032 7.719 41.629 -27.468 -ATOM 6911 H1 HOH 1032 6.835 41.976 -27.589 -ATOM 6912 H2 HOH 1032 7.591 40.800 -27.007 -ATOM 6913 O HOH 1033 7.719 41.629 -24.366 -ATOM 6914 H1 HOH 1033 7.352 41.716 -25.246 -ATOM 6915 H2 HOH 1033 7.278 42.308 -23.854 -ATOM 6916 O HOH 1034 7.719 41.629 -21.264 -ATOM 6917 H1 HOH 1034 8.097 42.503 -21.363 -ATOM 6918 H2 HOH 1034 7.024 41.741 -20.616 -ATOM 6919 O HOH 1035 7.719 41.629 -18.162 -ATOM 6920 H1 HOH 1035 7.157 42.202 -18.684 -ATOM 6921 H2 HOH 1035 7.190 41.406 -17.396 -ATOM 6922 O HOH 1036 7.719 44.731 -39.876 -ATOM 6923 H1 HOH 1036 7.692 45.003 -40.794 -ATOM 6924 H2 HOH 1036 6.800 44.658 -39.620 -ATOM 6925 O HOH 1037 7.719 44.731 -36.774 -ATOM 6926 H1 HOH 1037 7.819 44.381 -37.659 -ATOM 6927 H2 HOH 1037 7.697 43.958 -36.211 -ATOM 6928 O HOH 1038 7.719 44.731 -33.672 -ATOM 6929 H1 HOH 1038 7.875 45.388 -34.351 -ATOM 6930 H2 HOH 1038 6.867 44.964 -33.304 -ATOM 6931 O HOH 1039 7.719 44.731 -30.570 -ATOM 6932 H1 HOH 1039 8.062 45.281 -29.866 -ATOM 6933 H2 HOH 1039 8.060 45.128 -31.372 -ATOM 6934 O HOH 1040 7.719 44.731 -27.468 -ATOM 6935 H1 HOH 1040 7.069 44.480 -28.124 -ATOM 6936 H2 HOH 1040 7.850 43.940 -26.945 -ATOM 6937 O HOH 1041 7.719 44.731 -24.366 -ATOM 6938 H1 HOH 1041 6.961 45.295 -24.212 -ATOM 6939 H2 HOH 1041 8.040 44.991 -25.230 -ATOM 6940 O HOH 1042 7.719 44.731 -21.264 -ATOM 6941 H1 HOH 1042 6.895 44.272 -21.422 -ATOM 6942 H2 HOH 1042 7.933 44.534 -20.352 -ATOM 6943 O HOH 1043 10.821 7.507 -27.468 -ATOM 6944 H1 HOH 1043 10.077 7.698 -26.897 -ATOM 6945 H2 HOH 1043 11.564 7.940 -27.047 -ATOM 6946 O HOH 1044 10.821 10.609 -27.468 -ATOM 6947 H1 HOH 1044 11.620 10.459 -26.962 -ATOM 6948 H2 HOH 1044 10.278 11.158 -26.902 -ATOM 6949 O HOH 1045 10.821 10.609 -24.366 -ATOM 6950 H1 HOH 1045 10.515 11.516 -24.368 -ATOM 6951 H2 HOH 1045 10.205 10.148 -23.796 -ATOM 6952 O HOH 1046 10.821 10.609 -21.264 -ATOM 6953 H1 HOH 1046 9.931 10.566 -20.915 -ATOM 6954 H2 HOH 1046 11.276 11.222 -20.686 -ATOM 6955 O HOH 1047 10.821 13.711 -27.468 -ATOM 6956 H1 HOH 1047 11.461 14.213 -27.972 -ATOM 6957 H2 HOH 1047 11.348 13.203 -26.850 -ATOM 6958 O HOH 1048 10.821 13.711 -24.366 -ATOM 6959 H1 HOH 1048 11.316 14.512 -24.196 -ATOM 6960 H2 HOH 1048 11.369 13.011 -24.010 -ATOM 6961 O HOH 1049 10.821 13.711 -21.264 -ATOM 6962 H1 HOH 1049 11.370 14.295 -21.788 -ATOM 6963 H2 HOH 1049 11.093 12.830 -21.523 -ATOM 6964 O HOH 1050 10.821 13.711 -18.162 -ATOM 6965 H1 HOH 1050 10.967 12.828 -17.821 -ATOM 6966 H2 HOH 1050 10.481 14.203 -17.415 -ATOM 6967 O HOH 1051 10.821 16.813 -27.468 -ATOM 6968 H1 HOH 1051 10.048 17.343 -27.274 -ATOM 6969 H2 HOH 1051 11.282 16.744 -26.632 -ATOM 6970 O HOH 1052 10.821 16.813 -24.366 -ATOM 6971 H1 HOH 1052 11.135 17.712 -24.463 -ATOM 6972 H2 HOH 1052 10.773 16.677 -23.420 -ATOM 6973 O HOH 1053 10.821 16.813 -21.264 -ATOM 6974 H1 HOH 1053 10.241 17.007 -20.527 -ATOM 6975 H2 HOH 1053 10.555 17.427 -21.948 -ATOM 6976 O HOH 1054 10.821 16.813 -18.162 -ATOM 6977 H1 HOH 1054 10.255 16.748 -18.930 -ATOM 6978 H2 HOH 1054 10.729 15.967 -17.724 -ATOM 6979 O HOH 1055 10.821 16.813 -15.060 -ATOM 6980 H1 HOH 1055 10.491 16.235 -14.372 -ATOM 6981 H2 HOH 1055 10.853 17.678 -14.652 -ATOM 6982 O HOH 1056 10.821 19.915 -42.978 -ATOM 6983 H1 HOH 1056 9.943 20.063 -43.329 -ATOM 6984 H2 HOH 1056 10.677 19.671 -42.064 -ATOM 6985 O HOH 1057 10.821 19.915 -36.774 -ATOM 6986 H1 HOH 1057 11.338 19.109 -36.773 -ATOM 6987 H2 HOH 1057 10.867 20.231 -35.872 -ATOM 6988 O HOH 1058 10.821 19.915 -33.672 -ATOM 6989 H1 HOH 1058 10.404 20.611 -34.179 -ATOM 6990 H2 HOH 1058 11.594 19.675 -34.184 -ATOM 6991 O HOH 1059 10.821 19.915 -30.570 -ATOM 6992 H1 HOH 1059 11.758 19.815 -30.399 -ATOM 6993 H2 HOH 1059 10.598 19.166 -31.123 -ATOM 6994 O HOH 1060 10.821 19.915 -27.468 -ATOM 6995 H1 HOH 1060 10.996 20.565 -28.149 -ATOM 6996 H2 HOH 1060 11.298 19.135 -27.753 -ATOM 6997 O HOH 1061 10.821 19.915 -24.366 -ATOM 6998 H1 HOH 1061 11.413 19.163 -24.376 -ATOM 6999 H2 HOH 1061 10.630 20.082 -25.289 -ATOM 7000 O HOH 1062 10.821 19.915 -21.264 -ATOM 7001 H1 HOH 1062 11.303 19.233 -21.733 -ATOM 7002 H2 HOH 1062 10.567 20.540 -21.943 -ATOM 7003 O HOH 1063 10.821 19.915 -18.162 -ATOM 7004 H1 HOH 1063 10.055 19.964 -17.590 -ATOM 7005 H2 HOH 1063 10.599 20.470 -18.909 -ATOM 7006 O HOH 1064 10.821 19.915 -15.060 -ATOM 7007 H1 HOH 1064 11.382 20.662 -15.267 -ATOM 7008 H2 HOH 1064 11.342 19.384 -14.457 -ATOM 7009 O HOH 1065 10.821 23.017 -49.182 -ATOM 7010 H1 HOH 1065 10.600 23.845 -48.756 -ATOM 7011 H2 HOH 1065 11.178 23.273 -50.033 -ATOM 7012 O HOH 1066 10.821 23.017 -46.080 -ATOM 7013 H1 HOH 1066 10.249 22.819 -45.339 -ATOM 7014 H2 HOH 1066 10.791 22.230 -46.624 -ATOM 7015 O HOH 1067 10.821 23.017 -42.978 -ATOM 7016 H1 HOH 1067 11.459 22.461 -43.426 -ATOM 7017 H2 HOH 1067 10.028 22.947 -43.509 -ATOM 7018 O HOH 1068 10.821 23.017 -39.876 -ATOM 7019 H1 HOH 1068 11.399 23.589 -39.372 -ATOM 7020 H2 HOH 1068 9.941 23.236 -39.571 -ATOM 7021 O HOH 1069 10.821 23.017 -36.774 -ATOM 7022 H1 HOH 1069 11.536 23.490 -37.200 -ATOM 7023 H2 HOH 1069 10.245 22.756 -37.493 -ATOM 7024 O HOH 1070 10.821 23.017 -33.672 -ATOM 7025 H1 HOH 1070 10.342 23.598 -34.262 -ATOM 7026 H2 HOH 1070 11.523 22.654 -34.212 -ATOM 7027 O HOH 1071 10.821 23.017 -30.570 -ATOM 7028 H1 HOH 1071 10.347 22.224 -30.819 -ATOM 7029 H2 HOH 1071 10.588 23.159 -29.653 -ATOM 7030 O HOH 1072 10.821 23.017 -27.468 -ATOM 7031 H1 HOH 1072 10.269 22.896 -28.240 -ATOM 7032 H2 HOH 1072 11.491 22.338 -27.544 -ATOM 7033 O HOH 1073 10.821 23.017 -24.366 -ATOM 7034 H1 HOH 1073 11.007 22.581 -25.198 -ATOM 7035 H2 HOH 1073 10.777 22.305 -23.727 -ATOM 7036 O HOH 1074 10.821 23.017 -21.264 -ATOM 7037 H1 HOH 1074 10.048 23.576 -21.345 -ATOM 7038 H2 HOH 1074 10.815 22.482 -22.057 -ATOM 7039 O HOH 1075 10.821 23.017 -18.162 -ATOM 7040 H1 HOH 1075 11.492 23.109 -17.485 -ATOM 7041 H2 HOH 1075 11.187 23.465 -18.925 -ATOM 7042 O HOH 1076 10.821 23.017 -15.060 -ATOM 7043 H1 HOH 1076 11.001 22.154 -14.686 -ATOM 7044 H2 HOH 1076 11.339 23.622 -14.528 -ATOM 7045 O HOH 1077 10.821 23.017 -11.958 -ATOM 7046 H1 HOH 1077 10.421 23.621 -12.583 -ATOM 7047 H2 HOH 1077 10.118 22.806 -11.344 -ATOM 7048 O HOH 1078 10.821 26.119 -49.182 -ATOM 7049 H1 HOH 1078 11.522 26.650 -49.561 -ATOM 7050 H2 HOH 1078 10.438 26.675 -48.505 -ATOM 7051 O HOH 1079 10.821 26.119 -46.080 -ATOM 7052 H1 HOH 1079 10.673 25.198 -46.295 -ATOM 7053 H2 HOH 1079 10.032 26.567 -46.385 -ATOM 7054 O HOH 1080 10.821 26.119 -42.978 -ATOM 7055 H1 HOH 1080 10.012 25.682 -43.243 -ATOM 7056 H2 HOH 1080 10.991 26.753 -43.675 -ATOM 7057 O HOH 1081 10.821 26.119 -39.876 -ATOM 7058 H1 HOH 1081 11.457 26.732 -40.246 -ATOM 7059 H2 HOH 1081 10.388 26.613 -39.180 -ATOM 7060 O HOH 1082 10.821 26.119 -36.774 -ATOM 7061 H1 HOH 1082 11.401 25.958 -37.519 -ATOM 7062 H2 HOH 1082 10.263 26.843 -37.057 -ATOM 7063 O HOH 1083 10.821 26.119 -33.672 -ATOM 7064 H1 HOH 1083 11.037 26.175 -32.741 -ATOM 7065 H2 HOH 1083 11.562 26.533 -34.115 -ATOM 7066 O HOH 1084 10.821 26.119 -30.570 -ATOM 7067 H1 HOH 1084 10.561 25.612 -31.339 -ATOM 7068 H2 HOH 1084 11.772 26.203 -30.648 -ATOM 7069 O HOH 1085 10.821 26.119 -27.468 -ATOM 7070 H1 HOH 1085 10.757 26.881 -26.893 -ATOM 7071 H2 HOH 1085 10.865 26.487 -28.351 -ATOM 7072 O HOH 1086 10.821 26.119 -24.366 -ATOM 7073 H1 HOH 1086 10.083 25.961 -24.954 -ATOM 7074 H2 HOH 1086 10.475 26.715 -23.701 -ATOM 7075 O HOH 1087 10.821 26.119 -21.264 -ATOM 7076 H1 HOH 1087 11.688 26.018 -20.870 -ATOM 7077 H2 HOH 1087 10.601 27.040 -21.127 -ATOM 7078 O HOH 1088 10.821 26.119 -18.162 -ATOM 7079 H1 HOH 1088 11.120 26.754 -17.510 -ATOM 7080 H2 HOH 1088 10.378 25.442 -17.651 -ATOM 7081 O HOH 1089 10.821 26.119 -15.060 -ATOM 7082 H1 HOH 1089 10.724 25.423 -15.709 -ATOM 7083 H2 HOH 1089 11.721 26.425 -15.170 -ATOM 7084 O HOH 1090 10.821 26.119 -11.958 -ATOM 7085 H1 HOH 1090 10.957 27.017 -11.654 -ATOM 7086 H2 HOH 1090 11.122 25.573 -11.231 -ATOM 7087 O HOH 1091 10.821 29.221 -49.182 -ATOM 7088 H1 HOH 1091 10.717 28.677 -48.402 -ATOM 7089 H2 HOH 1091 10.104 29.853 -49.132 -ATOM 7090 O HOH 1092 10.821 29.221 -46.080 -ATOM 7091 H1 HOH 1092 10.458 28.860 -46.889 -ATOM 7092 H2 HOH 1092 10.255 28.878 -45.389 -ATOM 7093 O HOH 1093 10.821 29.221 -42.978 -ATOM 7094 H1 HOH 1093 10.988 29.665 -42.147 -ATOM 7095 H2 HOH 1093 11.664 28.834 -43.217 -ATOM 7096 O HOH 1094 10.821 29.221 -39.876 -ATOM 7097 H1 HOH 1094 10.008 29.703 -40.025 -ATOM 7098 H2 HOH 1094 11.399 29.852 -39.447 -ATOM 7099 O HOH 1095 10.821 29.221 -36.774 -ATOM 7100 H1 HOH 1095 10.237 29.911 -37.089 -ATOM 7101 H2 HOH 1095 11.485 29.137 -37.459 -ATOM 7102 O HOH 1096 10.821 29.221 -33.672 -ATOM 7103 H1 HOH 1096 10.113 29.330 -33.037 -ATOM 7104 H2 HOH 1096 11.202 30.095 -33.759 -ATOM 7105 O HOH 1097 10.821 29.221 -30.570 -ATOM 7106 H1 HOH 1097 11.039 28.411 -30.109 -ATOM 7107 H2 HOH 1097 11.245 29.910 -30.057 -ATOM 7108 O HOH 1098 10.821 29.221 -27.468 -ATOM 7109 H1 HOH 1098 10.197 28.527 -27.680 -ATOM 7110 H2 HOH 1098 11.458 29.197 -28.182 -ATOM 7111 O HOH 1099 10.821 29.221 -24.366 -ATOM 7112 H1 HOH 1099 10.363 29.836 -24.938 -ATOM 7113 H2 HOH 1099 10.346 28.397 -24.469 -ATOM 7114 O HOH 1100 10.821 29.221 -21.264 -ATOM 7115 H1 HOH 1100 11.058 29.882 -20.614 -ATOM 7116 H2 HOH 1100 11.632 29.056 -21.745 -ATOM 7117 O HOH 1101 10.821 29.221 -18.162 -ATOM 7118 H1 HOH 1101 10.695 28.885 -17.275 -ATOM 7119 H2 HOH 1101 11.078 30.135 -18.037 -ATOM 7120 O HOH 1102 10.821 29.221 -15.060 -ATOM 7121 H1 HOH 1102 11.146 29.863 -15.691 -ATOM 7122 H2 HOH 1102 11.592 28.705 -14.823 -ATOM 7123 O HOH 1103 10.821 29.221 -11.958 -ATOM 7124 H1 HOH 1103 10.195 28.709 -12.470 -ATOM 7125 H2 HOH 1103 11.042 29.963 -12.521 -ATOM 7126 O HOH 1104 10.821 32.323 -46.080 -ATOM 7127 H1 HOH 1104 10.154 32.437 -45.404 -ATOM 7128 H2 HOH 1104 10.334 32.041 -46.854 -ATOM 7129 O HOH 1105 10.821 32.323 -42.978 -ATOM 7130 H1 HOH 1105 10.537 31.432 -42.775 -ATOM 7131 H2 HOH 1105 11.547 32.209 -43.592 -ATOM 7132 O HOH 1106 10.821 32.323 -39.876 -ATOM 7133 H1 HOH 1106 11.666 32.206 -40.312 -ATOM 7134 H2 HOH 1106 10.865 33.202 -39.501 -ATOM 7135 O HOH 1107 10.821 32.323 -36.774 -ATOM 7136 H1 HOH 1107 10.069 32.044 -37.297 -ATOM 7137 H2 HOH 1107 10.442 32.625 -35.949 -ATOM 7138 O HOH 1108 10.821 32.323 -33.672 -ATOM 7139 H1 HOH 1108 11.596 32.877 -33.571 -ATOM 7140 H2 HOH 1108 10.898 31.673 -32.973 -ATOM 7141 O HOH 1109 10.821 32.323 -30.570 -ATOM 7142 H1 HOH 1109 9.897 32.298 -30.817 -ATOM 7143 H2 HOH 1109 10.964 31.507 -30.091 -ATOM 7144 O HOH 1110 10.821 32.323 -27.468 -ATOM 7145 H1 HOH 1110 10.613 31.963 -26.606 -ATOM 7146 H2 HOH 1110 11.451 31.705 -27.840 -ATOM 7147 O HOH 1111 10.821 32.323 -24.366 -ATOM 7148 H1 HOH 1111 10.176 31.884 -23.812 -ATOM 7149 H2 HOH 1111 11.257 31.613 -24.837 -ATOM 7150 O HOH 1112 10.821 32.323 -21.264 -ATOM 7151 H1 HOH 1112 10.707 31.584 -21.861 -ATOM 7152 H2 HOH 1112 9.931 32.574 -21.019 -ATOM 7153 O HOH 1113 10.821 32.323 -18.162 -ATOM 7154 H1 HOH 1113 10.211 32.675 -17.513 -ATOM 7155 H2 HOH 1113 10.995 31.429 -17.867 -ATOM 7156 O HOH 1114 10.821 32.323 -15.060 -ATOM 7157 H1 HOH 1114 11.757 32.514 -14.996 -ATOM 7158 H2 HOH 1114 10.622 32.410 -15.992 -ATOM 7159 O HOH 1115 10.821 35.425 -46.080 -ATOM 7160 H1 HOH 1115 10.867 34.571 -45.650 -ATOM 7161 H2 HOH 1115 11.539 35.414 -46.714 -ATOM 7162 O HOH 1116 10.821 35.425 -42.978 -ATOM 7163 H1 HOH 1116 9.894 35.657 -42.920 -ATOM 7164 H2 HOH 1116 11.270 36.260 -43.115 -ATOM 7165 O HOH 1117 10.821 35.425 -39.876 -ATOM 7166 H1 HOH 1117 11.627 34.911 -39.930 -ATOM 7167 H2 HOH 1117 11.119 36.322 -39.722 -ATOM 7168 O HOH 1118 10.821 35.425 -36.774 -ATOM 7169 H1 HOH 1118 11.625 35.937 -36.864 -ATOM 7170 H2 HOH 1118 10.546 35.566 -35.868 -ATOM 7171 O HOH 1119 10.821 35.425 -33.672 -ATOM 7172 H1 HOH 1119 11.127 35.781 -32.838 -ATOM 7173 H2 HOH 1119 9.948 35.800 -33.787 -ATOM 7174 O HOH 1120 10.821 35.425 -30.570 -ATOM 7175 H1 HOH 1120 10.762 36.147 -31.196 -ATOM 7176 H2 HOH 1120 11.303 34.742 -31.036 -ATOM 7177 O HOH 1121 10.821 35.425 -27.468 -ATOM 7178 H1 HOH 1121 10.463 34.745 -28.038 -ATOM 7179 H2 HOH 1121 10.661 35.104 -26.581 -ATOM 7180 O HOH 1122 10.821 35.425 -24.366 -ATOM 7181 H1 HOH 1122 11.565 35.306 -23.775 -ATOM 7182 H2 HOH 1122 10.273 36.079 -23.933 -ATOM 7183 O HOH 1123 10.821 35.425 -21.264 -ATOM 7184 H1 HOH 1123 11.179 35.587 -20.391 -ATOM 7185 H2 HOH 1123 9.916 35.731 -21.213 -ATOM 7186 O HOH 1124 10.821 35.425 -18.162 -ATOM 7187 H1 HOH 1124 11.096 35.432 -19.079 -ATOM 7188 H2 HOH 1124 11.192 36.227 -17.794 -ATOM 7189 O HOH 1125 10.821 35.425 -15.060 -ATOM 7190 H1 HOH 1125 11.280 36.185 -14.702 -ATOM 7191 H2 HOH 1125 11.513 34.887 -15.444 -ATOM 7192 O HOH 1126 10.821 38.527 -42.978 -ATOM 7193 H1 HOH 1126 10.349 38.230 -43.756 -ATOM 7194 H2 HOH 1126 11.587 37.956 -42.929 -ATOM 7195 O HOH 1127 10.821 38.527 -39.876 -ATOM 7196 H1 HOH 1127 11.147 37.878 -40.500 -ATOM 7197 H2 HOH 1127 10.328 38.017 -39.235 -ATOM 7198 O HOH 1128 10.821 38.527 -36.774 -ATOM 7199 H1 HOH 1128 11.329 39.010 -36.122 -ATOM 7200 H2 HOH 1128 10.442 39.205 -37.333 -ATOM 7201 O HOH 1129 10.821 38.527 -33.672 -ATOM 7202 H1 HOH 1129 11.219 38.497 -34.542 -ATOM 7203 H2 HOH 1129 11.496 38.911 -33.112 -ATOM 7204 O HOH 1130 10.821 38.527 -30.570 -ATOM 7205 H1 HOH 1130 10.784 37.951 -31.334 -ATOM 7206 H2 HOH 1130 10.329 38.062 -29.894 -ATOM 7207 O HOH 1131 10.821 38.527 -27.468 -ATOM 7208 H1 HOH 1131 10.948 38.885 -26.589 -ATOM 7209 H2 HOH 1131 11.493 38.954 -28.000 -ATOM 7210 O HOH 1132 10.821 38.527 -24.366 -ATOM 7211 H1 HOH 1132 11.357 38.292 -25.123 -ATOM 7212 H2 HOH 1132 10.037 37.986 -24.450 -ATOM 7213 O HOH 1133 10.821 38.527 -21.264 -ATOM 7214 H1 HOH 1133 11.081 38.017 -20.497 -ATOM 7215 H2 HOH 1133 10.370 39.290 -20.903 -ATOM 7216 O HOH 1134 10.821 38.527 -18.162 -ATOM 7217 H1 HOH 1134 10.787 39.271 -18.763 -ATOM 7218 H2 HOH 1134 10.554 38.889 -17.317 -ATOM 7219 O HOH 1135 10.821 41.629 -39.876 -ATOM 7220 H1 HOH 1135 11.443 41.686 -40.602 -ATOM 7221 H2 HOH 1135 11.050 42.363 -39.306 -ATOM 7222 O HOH 1136 10.821 41.629 -36.774 -ATOM 7223 H1 HOH 1136 11.589 42.143 -37.025 -ATOM 7224 H2 HOH 1136 10.112 41.978 -37.315 -ATOM 7225 O HOH 1137 10.821 41.629 -33.672 -ATOM 7226 H1 HOH 1137 11.293 41.610 -34.505 -ATOM 7227 H2 HOH 1137 10.542 40.724 -33.534 -ATOM 7228 O HOH 1138 10.821 41.629 -30.570 -ATOM 7229 H1 HOH 1138 11.082 41.251 -31.410 -ATOM 7230 H2 HOH 1138 11.596 42.104 -30.270 -ATOM 7231 O HOH 1139 10.821 41.629 -27.468 -ATOM 7232 H1 HOH 1139 10.948 42.156 -28.257 -ATOM 7233 H2 HOH 1139 11.557 41.864 -26.902 -ATOM 7234 O HOH 1140 10.821 41.629 -24.366 -ATOM 7235 H1 HOH 1140 11.579 42.175 -24.577 -ATOM 7236 H2 HOH 1140 10.693 41.751 -23.425 -ATOM 7237 O HOH 1141 10.821 41.629 -21.264 -ATOM 7238 H1 HOH 1141 11.159 40.946 -21.843 -ATOM 7239 H2 HOH 1141 10.113 41.205 -20.779 -ATOM 7240 O HOH 1142 10.821 44.731 -33.672 -ATOM 7241 H1 HOH 1142 10.878 45.439 -34.314 -ATOM 7242 H2 HOH 1142 10.327 44.043 -34.117 -ATOM 7243 O HOH 1143 10.821 44.731 -30.570 -ATOM 7244 H1 HOH 1143 11.010 44.001 -31.159 -ATOM 7245 H2 HOH 1143 9.870 44.717 -30.467 -ATOM 7246 O HOH 1144 10.821 44.731 -27.468 -ATOM 7247 H1 HOH 1144 10.382 44.020 -27.934 -ATOM 7248 H2 HOH 1144 10.683 45.501 -28.020 -ATOM 7249 O HOH 1145 13.923 10.609 -30.570 -ATOM 7250 H1 HOH 1145 14.385 11.447 -30.605 -ATOM 7251 H2 HOH 1145 13.757 10.465 -29.638 -ATOM 7252 O HOH 1146 13.923 10.609 -27.468 -ATOM 7253 H1 HOH 1146 13.237 11.272 -27.399 -ATOM 7254 H2 HOH 1146 14.621 10.924 -26.894 -ATOM 7255 O HOH 1147 13.923 13.711 -27.468 -ATOM 7256 H1 HOH 1147 13.376 14.488 -27.356 -ATOM 7257 H2 HOH 1147 14.648 14.005 -28.020 -ATOM 7258 O HOH 1148 13.923 13.711 -24.366 -ATOM 7259 H1 HOH 1148 14.590 13.449 -25.000 -ATOM 7260 H2 HOH 1148 13.586 12.885 -24.018 -ATOM 7261 O HOH 1149 13.923 13.711 -21.264 -ATOM 7262 H1 HOH 1149 14.654 13.567 -21.865 -ATOM 7263 H2 HOH 1149 13.321 14.276 -21.748 -ATOM 7264 O HOH 1150 13.923 16.813 -42.978 -ATOM 7265 H1 HOH 1150 13.461 17.519 -43.430 -ATOM 7266 H2 HOH 1150 14.646 16.586 -43.564 -ATOM 7267 O HOH 1151 13.923 16.813 -27.468 -ATOM 7268 H1 HOH 1151 13.839 17.647 -27.006 -ATOM 7269 H2 HOH 1151 13.025 16.494 -27.553 -ATOM 7270 O HOH 1152 13.923 16.813 -24.366 -ATOM 7271 H1 HOH 1152 14.050 16.281 -23.580 -ATOM 7272 H2 HOH 1152 14.084 17.711 -24.077 -ATOM 7273 O HOH 1153 13.923 16.813 -21.264 -ATOM 7274 H1 HOH 1153 14.671 16.768 -21.859 -ATOM 7275 H2 HOH 1153 14.304 17.058 -20.421 -ATOM 7276 O HOH 1154 13.923 16.813 -18.162 -ATOM 7277 H1 HOH 1154 14.545 16.112 -17.964 -ATOM 7278 H2 HOH 1154 14.259 17.212 -18.964 -ATOM 7279 O HOH 1155 13.923 19.915 -42.978 -ATOM 7280 H1 HOH 1155 14.609 20.340 -43.494 -ATOM 7281 H2 HOH 1155 14.372 19.606 -42.191 -ATOM 7282 O HOH 1156 13.923 19.915 -39.876 -ATOM 7283 H1 HOH 1156 13.479 19.073 -39.775 -ATOM 7284 H2 HOH 1156 13.430 20.366 -40.561 -ATOM 7285 O HOH 1157 13.923 19.915 -36.774 -ATOM 7286 H1 HOH 1157 13.415 20.404 -36.127 -ATOM 7287 H2 HOH 1157 14.834 20.143 -36.586 -ATOM 7288 O HOH 1158 13.923 19.915 -33.672 -ATOM 7289 H1 HOH 1158 13.630 19.029 -33.460 -ATOM 7290 H2 HOH 1158 13.164 20.469 -33.491 -ATOM 7291 O HOH 1159 13.923 19.915 -30.570 -ATOM 7292 H1 HOH 1159 14.550 20.481 -30.119 -ATOM 7293 H2 HOH 1159 13.152 20.467 -30.700 -ATOM 7294 O HOH 1160 13.923 19.915 -27.468 -ATOM 7295 H1 HOH 1160 13.702 19.021 -27.208 -ATOM 7296 H2 HOH 1160 13.362 20.469 -26.926 -ATOM 7297 O HOH 1161 13.923 19.915 -24.366 -ATOM 7298 H1 HOH 1161 13.558 19.229 -23.807 -ATOM 7299 H2 HOH 1161 13.372 20.680 -24.200 -ATOM 7300 O HOH 1162 13.923 19.915 -21.264 -ATOM 7301 H1 HOH 1162 13.739 19.230 -20.621 -ATOM 7302 H2 HOH 1162 14.487 19.491 -21.911 -ATOM 7303 O HOH 1163 13.923 19.915 -18.162 -ATOM 7304 H1 HOH 1163 14.799 19.841 -17.781 -ATOM 7305 H2 HOH 1163 13.914 19.270 -18.869 -ATOM 7306 O HOH 1164 13.923 23.017 -46.080 -ATOM 7307 H1 HOH 1164 13.296 22.855 -46.785 -ATOM 7308 H2 HOH 1164 14.772 22.780 -46.455 -ATOM 7309 O HOH 1165 13.923 23.017 -42.978 -ATOM 7310 H1 HOH 1165 14.506 22.572 -43.594 -ATOM 7311 H2 HOH 1165 13.473 23.676 -43.507 -ATOM 7312 O HOH 1166 13.923 23.017 -39.876 -ATOM 7313 H1 HOH 1166 14.497 22.398 -40.328 -ATOM 7314 H2 HOH 1166 13.072 22.580 -39.852 -ATOM 7315 O HOH 1167 13.923 23.017 -36.774 -ATOM 7316 H1 HOH 1167 13.804 22.781 -37.694 -ATOM 7317 H2 HOH 1167 14.755 22.612 -36.529 -ATOM 7318 O HOH 1168 13.923 23.017 -33.672 -ATOM 7319 H1 HOH 1168 14.825 23.221 -33.921 -ATOM 7320 H2 HOH 1168 13.542 23.863 -33.438 -ATOM 7321 O HOH 1169 13.923 23.017 -30.570 -ATOM 7322 H1 HOH 1169 13.685 23.216 -29.665 -ATOM 7323 H2 HOH 1169 14.820 22.687 -30.515 -ATOM 7324 O HOH 1170 13.923 23.017 -27.468 -ATOM 7325 H1 HOH 1170 13.926 23.955 -27.279 -ATOM 7326 H2 HOH 1170 13.381 22.635 -26.778 -ATOM 7327 O HOH 1171 13.923 23.017 -24.366 -ATOM 7328 H1 HOH 1171 13.488 23.138 -23.522 -ATOM 7329 H2 HOH 1171 13.769 23.836 -24.836 -ATOM 7330 O HOH 1172 13.923 23.017 -21.264 -ATOM 7331 H1 HOH 1172 13.704 22.160 -20.899 -ATOM 7332 H2 HOH 1172 14.663 23.320 -20.737 -ATOM 7333 O HOH 1173 13.923 23.017 -18.162 -ATOM 7334 H1 HOH 1173 13.294 23.642 -17.803 -ATOM 7335 H2 HOH 1173 14.517 23.550 -18.690 -ATOM 7336 O HOH 1174 13.923 23.017 -15.060 -ATOM 7337 H1 HOH 1174 14.620 22.419 -14.789 -ATOM 7338 H2 HOH 1174 13.665 23.464 -14.254 -ATOM 7339 O HOH 1175 13.923 26.119 -46.080 -ATOM 7340 H1 HOH 1175 13.474 26.897 -45.750 -ATOM 7341 H2 HOH 1175 14.002 25.546 -45.318 -ATOM 7342 O HOH 1176 13.923 26.119 -42.978 -ATOM 7343 H1 HOH 1176 14.103 25.664 -43.801 -ATOM 7344 H2 HOH 1176 12.968 26.151 -42.925 -ATOM 7345 O HOH 1177 13.923 26.119 -39.876 -ATOM 7346 H1 HOH 1177 14.744 26.599 -39.986 -ATOM 7347 H2 HOH 1177 14.051 25.605 -39.079 -ATOM 7348 O HOH 1178 13.923 26.119 -36.774 -ATOM 7349 H1 HOH 1178 14.761 26.484 -37.058 -ATOM 7350 H2 HOH 1178 14.038 25.956 -35.838 -ATOM 7351 O HOH 1179 13.923 26.119 -33.672 -ATOM 7352 H1 HOH 1179 14.329 26.364 -32.840 -ATOM 7353 H2 HOH 1179 14.221 25.223 -33.830 -ATOM 7354 O HOH 1180 13.923 26.119 -30.570 -ATOM 7355 H1 HOH 1180 13.027 26.266 -30.267 -ATOM 7356 H2 HOH 1180 14.381 26.935 -30.369 -ATOM 7357 O HOH 1181 13.923 26.119 -27.468 -ATOM 7358 H1 HOH 1181 14.074 25.412 -26.841 -ATOM 7359 H2 HOH 1181 14.669 26.707 -27.349 -ATOM 7360 O HOH 1182 13.923 26.119 -24.366 -ATOM 7361 H1 HOH 1182 14.350 25.433 -23.853 -ATOM 7362 H2 HOH 1182 14.644 26.658 -24.692 -ATOM 7363 O HOH 1183 13.923 26.119 -21.264 -ATOM 7364 H1 HOH 1183 14.401 26.212 -20.439 -ATOM 7365 H2 HOH 1183 14.020 25.195 -21.494 -ATOM 7366 O HOH 1184 13.923 26.119 -18.162 -ATOM 7367 H1 HOH 1184 13.398 25.553 -17.597 -ATOM 7368 H2 HOH 1184 14.652 25.566 -18.444 -ATOM 7369 O HOH 1185 13.923 26.119 -15.060 -ATOM 7370 H1 HOH 1185 13.932 26.226 -16.011 -ATOM 7371 H2 HOH 1185 13.409 25.325 -14.912 -ATOM 7372 O HOH 1186 13.923 29.221 -46.080 -ATOM 7373 H1 HOH 1186 14.730 29.577 -45.708 -ATOM 7374 H2 HOH 1186 13.236 29.502 -45.477 -ATOM 7375 O HOH 1187 13.923 29.221 -42.978 -ATOM 7376 H1 HOH 1187 14.575 29.141 -43.674 -ATOM 7377 H2 HOH 1187 13.115 28.886 -43.366 -ATOM 7378 O HOH 1188 13.923 29.221 -39.876 -ATOM 7379 H1 HOH 1188 13.172 29.028 -40.437 -ATOM 7380 H2 HOH 1188 13.946 28.500 -39.247 -ATOM 7381 O HOH 1189 13.923 29.221 -36.774 -ATOM 7382 H1 HOH 1189 14.685 29.660 -37.152 -ATOM 7383 H2 HOH 1189 13.849 28.403 -37.265 -ATOM 7384 O HOH 1190 13.923 29.221 -33.672 -ATOM 7385 H1 HOH 1190 14.736 29.337 -33.179 -ATOM 7386 H2 HOH 1190 14.175 28.693 -34.430 -ATOM 7387 O HOH 1191 13.923 29.221 -30.570 -ATOM 7388 H1 HOH 1191 14.735 28.842 -30.908 -ATOM 7389 H2 HOH 1191 13.567 28.547 -29.991 -ATOM 7390 O HOH 1192 13.923 29.221 -27.468 -ATOM 7391 H1 HOH 1192 14.809 28.940 -27.238 -ATOM 7392 H2 HOH 1192 13.650 29.775 -26.737 -ATOM 7393 O HOH 1193 13.923 29.221 -24.366 -ATOM 7394 H1 HOH 1193 13.173 29.691 -24.002 -ATOM 7395 H2 HOH 1193 14.189 28.619 -23.671 -ATOM 7396 O HOH 1194 13.923 29.221 -21.264 -ATOM 7397 H1 HOH 1194 14.145 29.413 -22.175 -ATOM 7398 H2 HOH 1194 13.477 30.009 -20.954 -ATOM 7399 O HOH 1195 13.923 29.221 -18.162 -ATOM 7400 H1 HOH 1195 13.545 28.608 -18.791 -ATOM 7401 H2 HOH 1195 13.817 28.790 -17.313 -ATOM 7402 O HOH 1196 13.923 29.221 -15.060 -ATOM 7403 H1 HOH 1196 13.324 28.778 -15.660 -ATOM 7404 H2 HOH 1196 13.728 28.842 -14.203 -ATOM 7405 O HOH 1197 13.923 32.323 -42.978 -ATOM 7406 H1 HOH 1197 14.531 31.705 -42.572 -ATOM 7407 H2 HOH 1197 13.921 33.078 -42.390 -ATOM 7408 O HOH 1198 13.923 32.323 -39.876 -ATOM 7409 H1 HOH 1198 14.478 32.757 -40.525 -ATOM 7410 H2 HOH 1198 13.728 33.004 -39.233 -ATOM 7411 O HOH 1199 13.923 32.323 -36.774 -ATOM 7412 H1 HOH 1199 14.531 31.586 -36.838 -ATOM 7413 H2 HOH 1199 13.188 31.985 -36.264 -ATOM 7414 O HOH 1200 13.923 32.323 -33.672 -ATOM 7415 H1 HOH 1200 14.309 31.817 -34.387 -ATOM 7416 H2 HOH 1200 14.398 33.154 -33.683 -ATOM 7417 O HOH 1201 13.923 32.323 -30.570 -ATOM 7418 H1 HOH 1201 13.344 31.998 -29.881 -ATOM 7419 H2 HOH 1201 14.509 31.589 -30.757 -ATOM 7420 O HOH 1202 13.923 32.323 -27.468 -ATOM 7421 H1 HOH 1202 13.376 33.091 -27.303 -ATOM 7422 H2 HOH 1202 13.655 32.020 -28.335 -ATOM 7423 O HOH 1203 13.923 32.323 -24.366 -ATOM 7424 H1 HOH 1203 14.567 32.678 -24.979 -ATOM 7425 H2 HOH 1203 13.522 33.095 -23.966 -ATOM 7426 O HOH 1204 13.923 32.323 -21.264 -ATOM 7427 H1 HOH 1204 14.522 32.602 -20.571 -ATOM 7428 H2 HOH 1204 13.156 32.885 -21.158 -ATOM 7429 O HOH 1205 13.923 32.323 -18.162 -ATOM 7430 H1 HOH 1205 14.497 33.007 -17.815 -ATOM 7431 H2 HOH 1205 14.261 32.150 -19.041 -ATOM 7432 O HOH 1206 13.923 35.425 -42.978 -ATOM 7433 H1 HOH 1206 14.696 35.310 -43.531 -ATOM 7434 H2 HOH 1206 13.611 36.306 -43.184 -ATOM 7435 O HOH 1207 13.923 35.425 -39.876 -ATOM 7436 H1 HOH 1207 14.759 34.963 -39.945 -ATOM 7437 H2 HOH 1207 13.666 35.322 -38.960 -ATOM 7438 O HOH 1208 13.923 35.425 -36.774 -ATOM 7439 H1 HOH 1208 14.681 35.351 -37.354 -ATOM 7440 H2 HOH 1208 13.644 36.337 -36.860 -ATOM 7441 O HOH 1209 13.923 35.425 -33.672 -ATOM 7442 H1 HOH 1209 13.648 35.998 -32.957 -ATOM 7443 H2 HOH 1209 13.245 35.531 -34.339 -ATOM 7444 O HOH 1210 13.923 35.425 -30.570 -ATOM 7445 H1 HOH 1210 14.207 35.122 -31.432 -ATOM 7446 H2 HOH 1210 14.503 36.161 -30.371 -ATOM 7447 O HOH 1211 13.923 35.425 -27.468 -ATOM 7448 H1 HOH 1211 13.560 34.749 -28.040 -ATOM 7449 H2 HOH 1211 13.347 36.179 -27.592 -ATOM 7450 O HOH 1212 13.923 35.425 -24.366 -ATOM 7451 H1 HOH 1212 14.267 34.646 -24.802 -ATOM 7452 H2 HOH 1212 14.650 35.739 -23.827 -ATOM 7453 O HOH 1213 13.923 35.425 -21.264 -ATOM 7454 H1 HOH 1213 13.105 35.809 -20.948 -ATOM 7455 H2 HOH 1213 14.554 35.592 -20.563 -ATOM 7456 O HOH 1214 13.923 35.425 -18.162 -ATOM 7457 H1 HOH 1214 14.260 35.372 -19.056 -ATOM 7458 H2 HOH 1214 14.513 36.036 -17.719 -ATOM 7459 O HOH 1215 13.923 38.527 -39.876 -ATOM 7460 H1 HOH 1215 14.665 39.103 -40.064 -ATOM 7461 H2 HOH 1215 13.351 38.617 -40.638 -ATOM 7462 O HOH 1216 13.923 38.527 -36.774 -ATOM 7463 H1 HOH 1216 14.082 37.767 -36.214 -ATOM 7464 H2 HOH 1216 14.795 38.804 -37.055 -ATOM 7465 O HOH 1217 13.923 38.527 -33.672 -ATOM 7466 H1 HOH 1217 13.805 37.598 -33.475 -ATOM 7467 H2 HOH 1217 13.042 38.845 -33.868 -ATOM 7468 O HOH 1218 13.923 38.527 -30.570 -ATOM 7469 H1 HOH 1218 14.466 39.315 -30.558 -ATOM 7470 H2 HOH 1218 14.460 37.874 -31.019 -ATOM 7471 O HOH 1219 13.923 38.527 -27.468 -ATOM 7472 H1 HOH 1219 13.450 38.553 -28.299 -ATOM 7473 H2 HOH 1219 13.636 37.714 -27.053 -ATOM 7474 O HOH 1220 13.923 38.527 -24.366 -ATOM 7475 H1 HOH 1220 13.664 39.345 -24.791 -ATOM 7476 H2 HOH 1220 14.880 38.558 -24.351 -ATOM 7477 O HOH 1221 13.923 38.527 -21.264 -ATOM 7478 H1 HOH 1221 14.569 37.880 -21.548 -ATOM 7479 H2 HOH 1221 13.637 38.951 -22.073 -ATOM 7480 O HOH 1222 13.923 41.629 -33.672 -ATOM 7481 H1 HOH 1222 14.445 41.089 -33.078 -ATOM 7482 H2 HOH 1222 13.255 42.025 -33.112 -ATOM 7483 O HOH 1223 13.923 41.629 -30.570 -ATOM 7484 H1 HOH 1223 14.703 41.312 -30.115 -ATOM 7485 H2 HOH 1223 14.261 42.238 -31.228 -ATOM 7486 O HOH 1224 13.923 41.629 -27.468 -ATOM 7487 H1 HOH 1224 13.122 41.858 -27.939 -ATOM 7488 H2 HOH 1224 13.621 41.349 -26.604 -ATOM 7489 O HOH 1225 17.025 16.813 -36.774 -ATOM 7490 H1 HOH 1225 16.912 17.439 -36.059 -ATOM 7491 H2 HOH 1225 16.996 15.955 -36.350 -ATOM 7492 O HOH 1226 17.025 16.813 -33.672 -ATOM 7493 H1 HOH 1226 17.016 16.054 -33.088 -ATOM 7494 H2 HOH 1226 17.829 17.280 -33.445 -ATOM 7495 O HOH 1227 17.025 16.813 -30.570 -ATOM 7496 H1 HOH 1227 17.772 16.978 -29.994 -ATOM 7497 H2 HOH 1227 17.411 16.722 -31.441 -ATOM 7498 O HOH 1228 17.025 16.813 -27.468 -ATOM 7499 H1 HOH 1228 17.750 16.439 -26.966 -ATOM 7500 H2 HOH 1228 16.410 17.125 -26.804 -ATOM 7501 O HOH 1229 17.025 16.813 -24.366 -ATOM 7502 H1 HOH 1229 16.545 16.442 -25.106 -ATOM 7503 H2 HOH 1229 16.377 16.874 -23.664 -ATOM 7504 O HOH 1230 17.025 19.915 -39.876 -ATOM 7505 H1 HOH 1230 16.835 20.052 -40.804 -ATOM 7506 H2 HOH 1230 16.576 20.632 -39.429 -ATOM 7507 O HOH 1231 17.025 19.915 -36.774 -ATOM 7508 H1 HOH 1231 17.741 19.768 -37.393 -ATOM 7509 H2 HOH 1231 16.289 20.190 -37.320 -ATOM 7510 O HOH 1232 17.025 19.915 -33.672 -ATOM 7511 H1 HOH 1232 17.677 19.892 -34.373 -ATOM 7512 H2 HOH 1232 16.455 20.650 -33.898 -ATOM 7513 O HOH 1233 17.025 19.915 -30.570 -ATOM 7514 H1 HOH 1233 17.384 20.123 -31.433 -ATOM 7515 H2 HOH 1233 16.670 19.031 -30.665 -ATOM 7516 O HOH 1234 17.025 19.915 -27.468 -ATOM 7517 H1 HOH 1234 16.339 20.332 -27.988 -ATOM 7518 H2 HOH 1234 16.558 19.299 -26.904 -ATOM 7519 O HOH 1235 17.025 19.915 -24.366 -ATOM 7520 H1 HOH 1235 16.833 20.648 -23.782 -ATOM 7521 H2 HOH 1235 16.611 19.160 -23.947 -ATOM 7522 O HOH 1236 17.025 19.915 -21.264 -ATOM 7523 H1 HOH 1236 16.442 19.400 -21.821 -ATOM 7524 H2 HOH 1236 17.880 19.492 -21.355 -ATOM 7525 O HOH 1237 17.025 23.017 -39.876 -ATOM 7526 H1 HOH 1237 16.694 22.582 -39.090 -ATOM 7527 H2 HOH 1237 17.265 22.301 -40.464 -ATOM 7528 O HOH 1238 17.025 23.017 -36.774 -ATOM 7529 H1 HOH 1238 16.622 23.878 -36.888 -ATOM 7530 H2 HOH 1238 16.869 22.567 -37.605 -ATOM 7531 O HOH 1239 17.025 23.017 -33.672 -ATOM 7532 H1 HOH 1239 17.292 23.712 -33.070 -ATOM 7533 H2 HOH 1239 16.721 22.310 -33.103 -ATOM 7534 O HOH 1240 17.025 23.017 -30.570 -ATOM 7535 H1 HOH 1240 16.234 23.394 -30.186 -ATOM 7536 H2 HOH 1240 17.048 22.119 -30.240 -ATOM 7537 O HOH 1241 17.025 23.017 -27.468 -ATOM 7538 H1 HOH 1241 16.453 23.746 -27.708 -ATOM 7539 H2 HOH 1241 17.664 23.401 -26.867 -ATOM 7540 O HOH 1242 17.025 23.017 -24.366 -ATOM 7541 H1 HOH 1242 17.137 22.809 -23.438 -ATOM 7542 H2 HOH 1242 16.449 23.781 -24.373 -ATOM 7543 O HOH 1243 17.025 23.017 -21.264 -ATOM 7544 H1 HOH 1243 16.207 23.424 -21.546 -ATOM 7545 H2 HOH 1243 17.297 23.527 -20.501 -ATOM 7546 O HOH 1244 17.025 26.119 -39.876 -ATOM 7547 H1 HOH 1244 17.633 26.858 -39.841 -ATOM 7548 H2 HOH 1244 17.370 25.495 -39.237 -ATOM 7549 O HOH 1245 17.025 26.119 -36.774 -ATOM 7550 H1 HOH 1245 17.006 25.414 -36.127 -ATOM 7551 H2 HOH 1245 17.530 26.816 -36.354 -ATOM 7552 O HOH 1246 17.025 26.119 -33.672 -ATOM 7553 H1 HOH 1246 17.368 26.641 -34.398 -ATOM 7554 H2 HOH 1246 16.352 26.672 -33.276 -ATOM 7555 O HOH 1247 17.025 26.119 -30.570 -ATOM 7556 H1 HOH 1247 16.729 25.445 -31.182 -ATOM 7557 H2 HOH 1247 17.558 26.709 -31.103 -ATOM 7558 O HOH 1248 17.025 26.119 -27.468 -ATOM 7559 H1 HOH 1248 16.595 25.759 -26.693 -ATOM 7560 H2 HOH 1248 16.385 26.011 -28.171 -ATOM 7561 O HOH 1249 17.025 26.119 -24.366 -ATOM 7562 H1 HOH 1249 17.966 25.970 -24.270 -ATOM 7563 H2 HOH 1249 16.869 26.065 -25.309 -ATOM 7564 O HOH 1250 17.025 26.119 -21.264 -ATOM 7565 H1 HOH 1250 17.707 25.967 -20.609 -ATOM 7566 H2 HOH 1250 16.790 27.040 -21.156 -ATOM 7567 O HOH 1251 17.025 29.221 -39.876 -ATOM 7568 H1 HOH 1251 16.567 29.607 -39.130 -ATOM 7569 H2 HOH 1251 16.596 29.600 -40.643 -ATOM 7570 O HOH 1252 17.025 29.221 -36.774 -ATOM 7571 H1 HOH 1252 17.049 28.265 -36.823 -ATOM 7572 H2 HOH 1252 17.449 29.513 -37.582 -ATOM 7573 O HOH 1253 17.025 29.221 -33.672 -ATOM 7574 H1 HOH 1253 16.403 29.747 -33.171 -ATOM 7575 H2 HOH 1253 17.873 29.398 -33.264 -ATOM 7576 O HOH 1254 17.025 29.221 -30.570 -ATOM 7577 H1 HOH 1254 17.700 29.632 -31.110 -ATOM 7578 H2 HOH 1254 16.351 29.893 -30.476 -ATOM 7579 O HOH 1255 17.025 29.221 -27.468 -ATOM 7580 H1 HOH 1255 16.591 29.870 -28.021 -ATOM 7581 H2 HOH 1255 17.710 28.851 -28.025 -ATOM 7582 O HOH 1256 17.025 29.221 -24.366 -ATOM 7583 H1 HOH 1256 16.379 29.318 -25.065 -ATOM 7584 H2 HOH 1256 16.508 29.020 -23.586 -ATOM 7585 O HOH 1257 17.025 29.221 -21.264 -ATOM 7586 H1 HOH 1257 17.400 28.598 -20.641 -ATOM 7587 H2 HOH 1257 17.485 30.042 -21.087 -ATOM 7588 O HOH 1258 17.025 32.323 -39.876 -ATOM 7589 H1 HOH 1258 16.284 31.722 -39.952 -ATOM 7590 H2 HOH 1258 16.980 32.648 -38.977 -ATOM 7591 O HOH 1259 17.025 32.323 -36.774 -ATOM 7592 H1 HOH 1259 16.395 31.610 -36.668 -ATOM 7593 H2 HOH 1259 17.025 32.772 -35.928 -ATOM 7594 O HOH 1260 17.025 32.323 -33.672 -ATOM 7595 H1 HOH 1260 16.522 32.965 -34.172 -ATOM 7596 H2 HOH 1260 17.878 32.296 -34.106 -ATOM 7597 O HOH 1261 17.025 32.323 -30.570 -ATOM 7598 H1 HOH 1261 17.280 33.136 -30.133 -ATOM 7599 H2 HOH 1261 16.190 32.528 -30.989 -ATOM 7600 O HOH 1262 17.025 32.323 -27.468 -ATOM 7601 H1 HOH 1262 16.766 33.116 -27.936 -ATOM 7602 H2 HOH 1262 17.393 32.641 -26.643 -ATOM 7603 O HOH 1263 17.025 32.323 -24.366 -ATOM 7604 H1 HOH 1263 16.515 32.015 -25.114 -ATOM 7605 H2 HOH 1263 17.739 31.690 -24.285 -ATOM 7606 O HOH 1264 17.025 32.323 -21.264 -ATOM 7607 H1 HOH 1264 17.039 33.207 -21.632 -ATOM 7608 H2 HOH 1264 17.843 31.925 -21.564 -ATOM 7609 O HOH 1265 17.025 35.425 -36.774 -ATOM 7610 H1 HOH 1265 16.473 35.465 -37.555 -ATOM 7611 H2 HOH 1265 16.415 35.256 -36.057 -ATOM 7612 O HOH 1266 17.025 35.425 -33.672 -ATOM 7613 H1 HOH 1266 16.569 34.652 -34.004 -ATOM 7614 H2 HOH 1266 16.547 35.664 -32.878 -ATOM 7615 O HOH 1267 17.025 35.425 -30.570 -ATOM 7616 H1 HOH 1267 17.408 36.025 -31.211 -ATOM 7617 H2 HOH 1267 16.627 35.997 -29.914 -ATOM 7618 O HOH 1268 17.025 35.425 -27.468 -ATOM 7619 H1 HOH 1268 16.328 35.328 -26.820 -ATOM 7620 H2 HOH 1268 16.830 34.764 -28.132 -ATOM 7621 O HOH 1269 17.025 35.425 -24.366 -ATOM 7622 H1 HOH 1269 16.143 35.393 -24.736 -ATOM 7623 H2 HOH 1269 17.217 36.359 -24.282 -ATOM 7624 O HOH 1270 20.128 26.119 -30.570 -ATOM 7625 H1 HOH 1270 19.499 26.805 -30.795 -ATOM 7626 H2 HOH 1270 20.522 25.870 -31.406 +ATOM 4667 O HOH 291 -29.506 26.119 -30.570 +ATOM 4668 H1 HOH 291 -28.725 25.862 -30.078 +ATOM 4669 H2 HOH 291 -29.679 25.377 -31.149 +ATOM 4670 O HOH 292 -26.403 16.813 -36.774 +ATOM 4671 H1 HOH 292 -26.037 16.197 -37.408 +ATOM 4672 H2 HOH 292 -26.045 16.533 -35.932 +ATOM 4673 O HOH 293 -26.403 16.813 -33.672 +ATOM 4674 H1 HOH 293 -26.568 17.215 -32.819 +ATOM 4675 H2 HOH 293 -27.204 16.974 -34.171 +ATOM 4676 O HOH 294 -26.403 16.813 -30.570 +ATOM 4677 H1 HOH 294 -26.463 17.436 -29.846 +ATOM 4678 H2 HOH 294 -25.646 16.268 -30.357 +ATOM 4679 O HOH 295 -26.403 19.915 -39.876 +ATOM 4680 H1 HOH 295 -26.703 20.631 -40.437 +ATOM 4681 H2 HOH 295 -26.045 19.268 -40.484 +ATOM 4682 O HOH 296 -26.403 19.915 -36.774 +ATOM 4683 H1 HOH 296 -25.999 19.816 -35.912 +ATOM 4684 H2 HOH 296 -26.014 19.219 -37.303 +ATOM 4685 O HOH 297 -26.403 19.915 -33.672 +ATOM 4686 H1 HOH 297 -26.842 20.499 -33.054 +ATOM 4687 H2 HOH 297 -25.992 19.248 -33.122 +ATOM 4688 O HOH 298 -26.403 23.017 -39.876 +ATOM 4689 H1 HOH 298 -26.028 22.649 -40.676 +ATOM 4690 H2 HOH 298 -27.121 23.571 -40.182 +ATOM 4691 O HOH 299 -26.403 23.017 -36.774 +ATOM 4692 H1 HOH 299 -27.136 22.405 -36.847 +ATOM 4693 H2 HOH 299 -26.732 23.832 -37.154 +ATOM 4694 O HOH 300 -26.403 23.017 -33.672 +ATOM 4695 H1 HOH 300 -25.719 22.661 -34.239 +ATOM 4696 H2 HOH 300 -25.978 23.735 -33.204 +ATOM 4697 O HOH 301 -26.403 23.017 -30.570 +ATOM 4698 H1 HOH 301 -26.564 23.884 -30.198 +ATOM 4699 H2 HOH 301 -27.238 22.768 -30.967 +ATOM 4700 O HOH 302 -26.403 23.017 -27.468 +ATOM 4701 H1 HOH 302 -26.783 22.234 -27.866 +ATOM 4702 H2 HOH 302 -25.885 23.414 -28.168 +ATOM 4703 O HOH 303 -26.403 26.119 -39.876 +ATOM 4704 H1 HOH 303 -25.966 25.864 -39.064 +ATOM 4705 H2 HOH 303 -27.295 26.343 -39.609 +ATOM 4706 O HOH 304 -26.403 26.119 -36.774 +ATOM 4707 H1 HOH 304 -27.246 26.005 -37.214 +ATOM 4708 H2 HOH 304 -25.784 25.623 -37.309 +ATOM 4709 O HOH 305 -26.403 26.119 -33.672 +ATOM 4710 H1 HOH 305 -26.758 26.586 -34.429 +ATOM 4711 H2 HOH 305 -25.500 26.427 -33.601 +ATOM 4712 O HOH 306 -26.403 26.119 -30.570 +ATOM 4713 H1 HOH 306 -25.808 26.376 -31.274 +ATOM 4714 H2 HOH 306 -26.296 26.798 -29.904 +ATOM 4715 O HOH 307 -26.403 26.119 -27.468 +ATOM 4716 H1 HOH 307 -26.015 25.589 -28.164 +ATOM 4717 H2 HOH 307 -27.343 26.106 -27.652 +ATOM 4718 O HOH 308 -26.403 26.119 -24.366 +ATOM 4719 H1 HOH 308 -25.772 26.690 -24.803 +ATOM 4720 H2 HOH 308 -26.100 25.232 -24.559 +ATOM 4721 O HOH 309 -26.403 29.221 -39.876 +ATOM 4722 H1 HOH 309 -25.688 29.849 -39.980 +ATOM 4723 H2 HOH 309 -27.068 29.694 -39.375 +ATOM 4724 O HOH 310 -26.403 29.221 -36.774 +ATOM 4725 H1 HOH 310 -26.555 28.999 -35.855 +ATOM 4726 H2 HOH 310 -27.280 29.287 -37.153 +ATOM 4727 O HOH 311 -26.403 29.221 -33.672 +ATOM 4728 H1 HOH 311 -25.726 28.590 -33.430 +ATOM 4729 H2 HOH 311 -27.023 28.718 -34.201 +ATOM 4730 O HOH 312 -26.403 29.221 -30.570 +ATOM 4731 H1 HOH 312 -25.798 29.914 -30.835 +ATOM 4732 H2 HOH 312 -26.739 28.868 -31.394 +ATOM 4733 O HOH 313 -26.403 29.221 -27.468 +ATOM 4734 H1 HOH 313 -25.878 28.820 -26.775 +ATOM 4735 H2 HOH 313 -26.009 28.906 -28.281 +ATOM 4736 O HOH 314 -26.403 29.221 -24.366 +ATOM 4737 H1 HOH 314 -26.920 29.597 -23.653 +ATOM 4738 H2 HOH 314 -26.868 29.481 -25.161 +ATOM 4739 O HOH 315 -26.403 32.323 -39.876 +ATOM 4740 H1 HOH 315 -25.836 31.838 -39.277 +ATOM 4741 H2 HOH 315 -25.802 32.847 -40.406 +ATOM 4742 O HOH 316 -26.403 32.323 -36.774 +ATOM 4743 H1 HOH 316 -26.202 32.938 -37.480 +ATOM 4744 H2 HOH 316 -27.074 31.747 -37.142 +ATOM 4745 O HOH 317 -26.403 32.323 -33.672 +ATOM 4746 H1 HOH 317 -25.631 32.288 -33.108 +ATOM 4747 H2 HOH 317 -26.869 33.111 -33.392 +ATOM 4748 O HOH 318 -26.403 32.323 -30.570 +ATOM 4749 H1 HOH 318 -27.003 31.642 -30.266 +ATOM 4750 H2 HOH 318 -26.878 33.142 -30.426 +ATOM 4751 O HOH 319 -26.403 32.323 -27.468 +ATOM 4752 H1 HOH 319 -26.569 32.407 -26.529 +ATOM 4753 H2 HOH 319 -26.118 31.417 -27.581 +ATOM 4754 O HOH 320 -26.403 35.425 -36.774 +ATOM 4755 H1 HOH 320 -27.256 35.756 -37.056 +ATOM 4756 H2 HOH 320 -26.610 34.707 -36.176 +ATOM 4757 O HOH 321 -26.403 35.425 -33.672 +ATOM 4758 H1 HOH 321 -26.452 36.237 -33.168 +ATOM 4759 H2 HOH 321 -26.938 35.592 -34.449 +ATOM 4760 O HOH 322 -26.403 35.425 -30.570 +ATOM 4761 H1 HOH 322 -26.050 34.714 -30.035 +ATOM 4762 H2 HOH 322 -25.966 35.328 -31.416 +ATOM 4763 O HOH 323 -26.403 35.425 -27.468 +ATOM 4764 H1 HOH 323 -25.859 34.726 -27.828 +ATOM 4765 H2 HOH 323 -25.833 35.877 -26.846 +ATOM 4766 O HOH 324 -26.403 35.425 -24.366 +ATOM 4767 H1 HOH 324 -26.596 34.725 -24.989 +ATOM 4768 H2 HOH 324 -25.745 35.052 -23.780 +ATOM 4769 O HOH 325 -23.301 10.609 -33.672 +ATOM 4770 H1 HOH 325 -22.994 11.356 -33.159 +ATOM 4771 H2 HOH 325 -23.218 10.892 -34.583 +ATOM 4772 O HOH 326 -23.301 10.609 -30.570 +ATOM 4773 H1 HOH 326 -23.468 10.027 -29.829 +ATOM 4774 H2 HOH 326 -24.171 10.882 -30.861 +ATOM 4775 O HOH 327 -23.301 10.609 -27.468 +ATOM 4776 H1 HOH 327 -23.905 11.176 -26.988 +ATOM 4777 H2 HOH 327 -22.439 10.996 -27.319 +ATOM 4778 O HOH 328 -23.301 13.711 -39.876 +ATOM 4779 H1 HOH 328 -23.286 13.008 -39.227 +ATOM 4780 H2 HOH 328 -22.401 13.760 -40.198 +ATOM 4781 O HOH 329 -23.301 13.711 -36.774 +ATOM 4782 H1 HOH 329 -23.793 13.274 -37.470 +ATOM 4783 H2 HOH 329 -23.833 14.473 -36.547 +ATOM 4784 O HOH 330 -23.301 13.711 -33.672 +ATOM 4785 H1 HOH 330 -22.713 14.156 -34.282 +ATOM 4786 H2 HOH 330 -24.125 13.626 -34.152 +ATOM 4787 O HOH 331 -23.301 16.813 -42.978 +ATOM 4788 H1 HOH 331 -23.567 17.368 -43.711 +ATOM 4789 H2 HOH 331 -23.910 16.075 -43.003 +ATOM 4790 O HOH 332 -23.301 16.813 -36.774 +ATOM 4791 H1 HOH 332 -22.621 16.349 -36.286 +ATOM 4792 H2 HOH 332 -23.469 17.602 -36.260 +ATOM 4793 O HOH 333 -23.301 16.813 -33.672 +ATOM 4794 H1 HOH 333 -23.739 17.653 -33.536 +ATOM 4795 H2 HOH 333 -23.387 16.648 -34.611 +ATOM 4796 O HOH 334 -23.301 19.915 -42.978 +ATOM 4797 H1 HOH 334 -23.261 20.847 -43.191 +ATOM 4798 H2 HOH 334 -23.675 19.886 -42.097 +ATOM 4799 O HOH 335 -23.301 19.915 -36.774 +ATOM 4800 H1 HOH 335 -24.033 19.852 -36.161 +ATOM 4801 H2 HOH 335 -23.089 20.848 -36.799 +ATOM 4802 O HOH 336 -23.301 23.017 -46.080 +ATOM 4803 H1 HOH 336 -22.735 22.261 -46.237 +ATOM 4804 H2 HOH 336 -24.186 22.652 -46.053 +ATOM 4805 O HOH 337 -23.301 23.017 -42.978 +ATOM 4806 H1 HOH 337 -23.665 23.733 -42.456 +ATOM 4807 H2 HOH 337 -23.496 22.228 -42.472 +ATOM 4808 O HOH 338 -23.301 23.017 -39.876 +ATOM 4809 H1 HOH 338 -23.308 22.181 -39.410 +ATOM 4810 H2 HOH 338 -22.683 22.886 -40.595 +ATOM 4811 O HOH 339 -23.301 23.017 -36.774 +ATOM 4812 H1 HOH 339 -22.899 23.670 -37.347 +ATOM 4813 H2 HOH 339 -22.596 22.745 -36.187 +ATOM 4814 O HOH 340 -23.301 26.119 -46.080 +ATOM 4815 H1 HOH 340 -23.011 25.799 -46.934 +ATOM 4816 H2 HOH 340 -22.841 25.567 -45.448 +ATOM 4817 O HOH 341 -23.301 26.119 -42.978 +ATOM 4818 H1 HOH 341 -24.109 25.999 -43.477 +ATOM 4819 H2 HOH 341 -22.824 25.297 -43.094 +ATOM 4820 O HOH 342 -23.301 26.119 -39.876 +ATOM 4821 H1 HOH 342 -23.487 25.180 -39.858 +ATOM 4822 H2 HOH 342 -23.827 26.452 -40.604 +ATOM 4823 O HOH 343 -23.301 26.119 -36.774 +ATOM 4824 H1 HOH 343 -24.124 26.347 -37.206 +ATOM 4825 H2 HOH 343 -23.121 25.223 -37.059 +ATOM 4826 O HOH 344 -23.301 26.119 -33.672 +ATOM 4827 H1 HOH 344 -23.642 26.815 -33.109 +ATOM 4828 H2 HOH 344 -24.023 25.495 -33.744 +ATOM 4829 O HOH 345 -23.301 26.119 -30.570 +ATOM 4830 H1 HOH 345 -23.112 26.912 -30.068 +ATOM 4831 H2 HOH 345 -23.119 26.361 -31.478 +ATOM 4832 O HOH 346 -23.301 29.221 -46.080 +ATOM 4833 H1 HOH 346 -22.625 28.679 -46.486 +ATOM 4834 H2 HOH 346 -24.126 28.814 -46.346 +ATOM 4835 O HOH 347 -23.301 29.221 -42.978 +ATOM 4836 H1 HOH 347 -23.714 28.922 -43.788 +ATOM 4837 H2 HOH 347 -23.672 30.090 -42.827 +ATOM 4838 O HOH 348 -23.301 29.221 -39.876 +ATOM 4839 H1 HOH 348 -24.015 28.889 -40.421 +ATOM 4840 H2 HOH 348 -22.827 28.437 -39.599 +ATOM 4841 O HOH 349 -23.301 29.221 -36.774 +ATOM 4842 H1 HOH 349 -23.808 29.326 -35.969 +ATOM 4843 H2 HOH 349 -23.892 29.514 -37.468 +ATOM 4844 O HOH 350 -23.301 29.221 -33.672 +ATOM 4845 H1 HOH 350 -23.891 28.784 -34.287 +ATOM 4846 H2 HOH 350 -22.785 28.512 -33.290 +ATOM 4847 O HOH 351 -23.301 29.221 -30.570 +ATOM 4848 H1 HOH 351 -22.724 28.619 -31.039 +ATOM 4849 H2 HOH 351 -24.184 28.898 -30.752 +ATOM 4850 O HOH 352 -23.301 32.323 -42.978 +ATOM 4851 H1 HOH 352 -24.131 32.091 -42.562 +ATOM 4852 H2 HOH 352 -23.194 33.256 -42.795 +ATOM 4853 O HOH 353 -23.301 32.323 -39.876 +ATOM 4854 H1 HOH 353 -22.809 33.119 -40.077 +ATOM 4855 H2 HOH 353 -23.268 32.255 -38.922 +ATOM 4856 O HOH 354 -23.301 32.323 -36.774 +ATOM 4857 H1 HOH 354 -22.873 33.009 -37.287 +ATOM 4858 H2 HOH 354 -23.548 32.754 -35.956 +ATOM 4859 O HOH 355 -23.301 32.323 -33.672 +ATOM 4860 H1 HOH 355 -22.442 32.743 -33.624 +ATOM 4861 H2 HOH 355 -23.881 32.907 -33.183 +ATOM 4862 O HOH 356 -23.301 32.323 -30.570 +ATOM 4863 H1 HOH 356 -22.691 31.773 -31.061 +ATOM 4864 H2 HOH 356 -22.751 32.790 -29.941 +ATOM 4865 O HOH 357 -23.301 35.425 -42.978 +ATOM 4866 H1 HOH 357 -22.729 36.016 -42.490 +ATOM 4867 H2 HOH 357 -23.424 35.854 -43.825 +ATOM 4868 O HOH 358 -23.301 35.425 -39.876 +ATOM 4869 H1 HOH 358 -22.856 35.433 -40.723 +ATOM 4870 H2 HOH 358 -24.213 35.634 -40.082 +ATOM 4871 O HOH 359 -23.301 35.425 -36.774 +ATOM 4872 H1 HOH 359 -24.057 35.031 -37.211 +ATOM 4873 H2 HOH 359 -22.549 34.935 -37.107 +ATOM 4874 O HOH 360 -23.301 35.425 -33.672 +ATOM 4875 H1 HOH 360 -22.945 36.268 -33.954 +ATOM 4876 H2 HOH 360 -23.464 35.535 -32.735 +ATOM 4877 O HOH 361 -23.301 35.425 -30.570 +ATOM 4878 H1 HOH 361 -23.187 36.015 -29.824 +ATOM 4879 H2 HOH 361 -23.564 34.592 -30.179 +ATOM 4880 O HOH 362 -23.301 35.425 -27.468 +ATOM 4881 H1 HOH 362 -23.985 34.958 -27.949 +ATOM 4882 H2 HOH 362 -22.487 34.998 -27.733 +ATOM 4883 O HOH 363 -23.301 35.425 -24.366 +ATOM 4884 H1 HOH 363 -22.391 35.186 -24.541 +ATOM 4885 H2 HOH 363 -23.272 35.880 -23.524 +ATOM 4886 O HOH 364 -23.301 35.425 -18.162 +ATOM 4887 H1 HOH 364 -23.882 35.684 -17.446 +ATOM 4888 H2 HOH 364 -23.879 35.011 -18.802 +ATOM 4889 O HOH 365 -23.301 38.527 -39.876 +ATOM 4890 H1 HOH 365 -24.035 38.113 -40.331 +ATOM 4891 H2 HOH 365 -23.699 39.246 -39.385 +ATOM 4892 O HOH 366 -23.301 38.527 -36.774 +ATOM 4893 H1 HOH 366 -23.494 38.877 -37.644 +ATOM 4894 H2 HOH 366 -23.734 37.674 -36.758 +ATOM 4895 O HOH 367 -23.301 38.527 -33.672 +ATOM 4896 H1 HOH 367 -23.798 37.898 -33.149 +ATOM 4897 H2 HOH 367 -23.848 39.313 -33.685 +ATOM 4898 O HOH 368 -23.301 38.527 -30.570 +ATOM 4899 H1 HOH 368 -23.574 39.385 -30.243 +ATOM 4900 H2 HOH 368 -22.422 38.402 -30.213 +ATOM 4901 O HOH 369 -23.301 38.527 -27.468 +ATOM 4902 H1 HOH 369 -22.581 39.082 -27.168 +ATOM 4903 H2 HOH 369 -24.017 38.713 -26.860 +ATOM 4904 O HOH 370 -23.301 38.527 -24.366 +ATOM 4905 H1 HOH 370 -23.083 39.010 -23.569 +ATOM 4906 H2 HOH 370 -24.258 38.534 -24.396 +ATOM 4907 O HOH 371 -23.301 38.527 -21.264 +ATOM 4908 H1 HOH 371 -23.069 38.904 -20.415 +ATOM 4909 H2 HOH 371 -22.507 38.614 -21.791 +ATOM 4910 O HOH 372 -23.301 41.629 -33.672 +ATOM 4911 H1 HOH 372 -22.444 41.433 -34.049 +ATOM 4912 H2 HOH 372 -23.396 41.005 -32.953 +ATOM 4913 O HOH 373 -23.301 41.629 -30.570 +ATOM 4914 H1 HOH 373 -24.201 41.376 -30.365 +ATOM 4915 H2 HOH 373 -22.959 41.986 -29.750 +ATOM 4916 O HOH 374 -23.301 41.629 -27.468 +ATOM 4917 H1 HOH 374 -22.929 41.591 -26.587 +ATOM 4918 H2 HOH 374 -23.397 40.713 -27.729 +ATOM 4919 O HOH 375 -20.199 10.609 -39.876 +ATOM 4920 H1 HOH 375 -19.447 10.151 -40.252 +ATOM 4921 H2 HOH 375 -19.833 11.124 -39.157 +ATOM 4922 O HOH 376 -20.199 13.711 -42.978 +ATOM 4923 H1 HOH 376 -20.756 14.488 -42.939 +ATOM 4924 H2 HOH 376 -19.392 14.014 -43.393 +ATOM 4925 O HOH 377 -20.199 16.813 -46.080 +ATOM 4926 H1 HOH 377 -20.709 16.254 -45.494 +ATOM 4927 H2 HOH 377 -19.322 16.827 -45.697 +ATOM 4928 O HOH 378 -20.199 16.813 -42.978 +ATOM 4929 H1 HOH 378 -20.071 17.405 -42.238 +ATOM 4930 H2 HOH 378 -21.066 16.432 -42.834 +ATOM 4931 O HOH 379 -20.199 19.915 -46.080 +ATOM 4932 H1 HOH 379 -20.542 19.271 -45.461 +ATOM 4933 H2 HOH 379 -19.580 20.434 -45.568 +ATOM 4934 O HOH 380 -20.199 19.915 -36.774 +ATOM 4935 H1 HOH 380 -19.649 20.424 -37.370 +ATOM 4936 H2 HOH 380 -19.773 19.059 -36.726 +ATOM 4937 O HOH 381 -20.199 23.017 -49.182 +ATOM 4938 H1 HOH 381 -19.538 22.610 -48.623 +ATOM 4939 H2 HOH 381 -20.873 22.345 -49.285 +ATOM 4940 O HOH 382 -20.199 23.017 -46.080 +ATOM 4941 H1 HOH 382 -19.508 22.527 -46.526 +ATOM 4942 H2 HOH 382 -19.739 23.723 -45.626 +ATOM 4943 O HOH 383 -20.199 23.017 -42.978 +ATOM 4944 H1 HOH 383 -19.843 22.626 -43.776 +ATOM 4945 H2 HOH 383 -19.429 23.251 -42.461 +ATOM 4946 O HOH 384 -20.199 23.017 -39.876 +ATOM 4947 H1 HOH 384 -20.221 23.947 -39.651 +ATOM 4948 H2 HOH 384 -20.138 22.567 -39.033 +ATOM 4949 O HOH 385 -20.199 23.017 -36.774 +ATOM 4950 H1 HOH 385 -19.651 22.387 -36.307 +ATOM 4951 H2 HOH 385 -20.821 22.478 -37.262 +ATOM 4952 O HOH 386 -20.199 26.119 -49.182 +ATOM 4953 H1 HOH 386 -19.960 25.393 -48.607 +ATOM 4954 H2 HOH 386 -19.363 26.456 -49.504 +ATOM 4955 O HOH 387 -20.199 26.119 -46.080 +ATOM 4956 H1 HOH 387 -19.902 25.653 -45.299 +ATOM 4957 H2 HOH 387 -21.154 26.125 -46.007 +ATOM 4958 O HOH 388 -20.199 26.119 -42.978 +ATOM 4959 H1 HOH 388 -19.346 25.695 -42.884 +ATOM 4960 H2 HOH 388 -20.798 25.567 -42.475 +ATOM 4961 O HOH 389 -20.199 26.119 -39.876 +ATOM 4962 H1 HOH 389 -19.792 25.578 -39.200 +ATOM 4963 H2 HOH 389 -20.806 25.528 -40.323 +ATOM 4964 O HOH 390 -20.199 26.119 -36.774 +ATOM 4965 H1 HOH 390 -20.639 25.282 -36.924 +ATOM 4966 H2 HOH 390 -19.299 25.881 -36.554 +ATOM 4967 O HOH 391 -20.199 29.221 -49.182 +ATOM 4968 H1 HOH 391 -20.099 29.983 -48.612 +ATOM 4969 H2 HOH 391 -20.535 28.533 -48.607 +ATOM 4970 O HOH 392 -20.199 29.221 -46.080 +ATOM 4971 H1 HOH 392 -20.626 28.415 -46.370 +ATOM 4972 H2 HOH 392 -19.506 28.927 -45.489 +ATOM 4973 O HOH 393 -20.199 29.221 -42.978 +ATOM 4974 H1 HOH 393 -20.294 29.717 -43.791 +ATOM 4975 H2 HOH 393 -20.004 28.328 -43.263 +ATOM 4976 O HOH 394 -20.199 29.221 -39.876 +ATOM 4977 H1 HOH 394 -21.096 28.910 -39.751 +ATOM 4978 H2 HOH 394 -19.677 28.698 -39.268 +ATOM 4979 O HOH 395 -20.199 29.221 -36.774 +ATOM 4980 H1 HOH 395 -19.942 30.141 -36.718 +ATOM 4981 H2 HOH 395 -19.405 28.766 -37.054 +ATOM 4982 O HOH 396 -20.199 32.323 -46.080 +ATOM 4983 H1 HOH 396 -19.580 32.972 -46.415 +ATOM 4984 H2 HOH 396 -19.939 31.504 -46.502 +ATOM 4985 O HOH 397 -20.199 32.323 -42.978 +ATOM 4986 H1 HOH 397 -19.846 32.271 -43.866 +ATOM 4987 H2 HOH 397 -20.458 33.239 -42.876 +ATOM 4988 O HOH 398 -20.199 32.323 -39.876 +ATOM 4989 H1 HOH 398 -21.001 32.595 -39.428 +ATOM 4990 H2 HOH 398 -20.457 31.554 -40.384 +ATOM 4991 O HOH 399 -20.199 32.323 -36.774 +ATOM 4992 H1 HOH 399 -19.810 32.844 -36.072 +ATOM 4993 H2 HOH 399 -20.490 31.519 -36.344 +ATOM 4994 O HOH 400 -20.199 32.323 -33.672 +ATOM 4995 H1 HOH 400 -20.373 31.452 -34.029 +ATOM 4996 H2 HOH 400 -20.755 32.909 -34.187 +ATOM 4997 O HOH 401 -20.199 35.425 -46.080 +ATOM 4998 H1 HOH 401 -19.498 34.968 -46.545 +ATOM 4999 H2 HOH 401 -20.225 36.295 -46.480 +ATOM 5000 O HOH 402 -20.199 35.425 -42.978 +ATOM 5001 H1 HOH 402 -20.234 36.300 -43.364 +ATOM 5002 H2 HOH 402 -20.691 35.504 -42.161 +ATOM 5003 O HOH 403 -20.199 35.425 -39.876 +ATOM 5004 H1 HOH 403 -19.811 36.052 -39.266 +ATOM 5005 H2 HOH 403 -19.499 35.232 -40.500 +ATOM 5006 O HOH 404 -20.199 35.425 -36.774 +ATOM 5007 H1 HOH 404 -20.711 34.819 -36.239 +ATOM 5008 H2 HOH 404 -19.697 34.861 -37.361 +ATOM 5009 O HOH 405 -20.199 35.425 -33.672 +ATOM 5010 H1 HOH 405 -19.449 35.115 -33.166 +ATOM 5011 H2 HOH 405 -20.913 34.834 -33.430 +ATOM 5012 O HOH 406 -20.199 35.425 -30.570 +ATOM 5013 H1 HOH 406 -20.935 35.194 -30.002 +ATOM 5014 H2 HOH 406 -20.352 36.342 -30.798 +ATOM 5015 O HOH 407 -20.199 35.425 -18.162 +ATOM 5016 H1 HOH 407 -20.646 35.265 -18.993 +ATOM 5017 H2 HOH 407 -20.192 34.573 -17.726 +ATOM 5018 O HOH 408 -20.199 38.527 -42.978 +ATOM 5019 H1 HOH 408 -20.122 39.477 -43.066 +ATOM 5020 H2 HOH 408 -19.598 38.176 -43.635 +ATOM 5021 O HOH 409 -20.199 38.527 -39.876 +ATOM 5022 H1 HOH 409 -19.532 38.061 -39.372 +ATOM 5023 H2 HOH 409 -20.508 39.216 -39.287 +ATOM 5024 O HOH 410 -20.199 38.527 -36.774 +ATOM 5025 H1 HOH 410 -21.012 38.933 -36.474 +ATOM 5026 H2 HOH 410 -20.003 37.865 -36.112 +ATOM 5027 O HOH 411 -20.199 38.527 -33.672 +ATOM 5028 H1 HOH 411 -20.181 37.573 -33.749 +ATOM 5029 H2 HOH 411 -20.459 38.689 -32.765 +ATOM 5030 O HOH 412 -20.199 38.527 -30.570 +ATOM 5031 H1 HOH 412 -19.663 38.302 -29.810 +ATOM 5032 H2 HOH 412 -19.567 38.755 -31.251 +ATOM 5033 O HOH 413 -20.199 38.527 -27.468 +ATOM 5034 H1 HOH 413 -19.599 39.269 -27.545 +ATOM 5035 H2 HOH 413 -20.821 38.646 -28.186 +ATOM 5036 O HOH 414 -20.199 38.527 -21.264 +ATOM 5037 H1 HOH 414 -20.708 39.335 -21.185 +ATOM 5038 H2 HOH 414 -19.635 38.672 -22.024 +ATOM 5039 O HOH 415 -20.199 38.527 -18.162 +ATOM 5040 H1 HOH 415 -19.358 38.959 -18.013 +ATOM 5041 H2 HOH 415 -20.080 37.643 -17.816 +ATOM 5042 O HOH 416 -20.199 41.629 -39.876 +ATOM 5043 H1 HOH 416 -20.647 42.108 -40.573 +ATOM 5044 H2 HOH 416 -20.323 42.170 -39.096 +ATOM 5045 O HOH 417 -20.199 41.629 -36.774 +ATOM 5046 H1 HOH 417 -19.802 40.761 -36.705 +ATOM 5047 H2 HOH 417 -19.517 42.230 -36.475 +ATOM 5048 O HOH 418 -20.199 41.629 -33.672 +ATOM 5049 H1 HOH 418 -19.625 41.969 -32.986 +ATOM 5050 H2 HOH 418 -20.456 40.761 -33.362 +ATOM 5051 O HOH 419 -20.199 41.629 -30.570 +ATOM 5052 H1 HOH 419 -20.224 40.740 -30.216 +ATOM 5053 H2 HOH 419 -19.687 42.127 -29.933 +ATOM 5054 O HOH 420 -20.199 41.629 -27.468 +ATOM 5055 H1 HOH 420 -20.768 42.120 -26.874 +ATOM 5056 H2 HOH 420 -19.616 41.138 -26.890 +ATOM 5057 O HOH 421 -20.199 41.629 -24.366 +ATOM 5058 H1 HOH 421 -20.064 41.991 -23.490 +ATOM 5059 H2 HOH 421 -19.316 41.507 -24.713 +ATOM 5060 O HOH 422 -20.199 41.629 -21.264 +ATOM 5061 H1 HOH 422 -20.746 41.119 -21.861 +ATOM 5062 H2 HOH 422 -19.402 41.109 -21.163 +ATOM 5063 O HOH 423 -20.199 44.731 -33.672 +ATOM 5064 H1 HOH 423 -19.921 44.872 -32.767 +ATOM 5065 H2 HOH 423 -20.779 43.971 -33.630 +ATOM 5066 O HOH 424 -20.199 44.731 -30.570 +ATOM 5067 H1 HOH 424 -19.262 44.896 -30.472 +ATOM 5068 H2 HOH 424 -20.282 44.321 -31.431 +ATOM 5069 O HOH 425 -20.199 44.731 -27.468 +ATOM 5070 H1 HOH 425 -19.499 44.469 -26.871 +ATOM 5071 H2 HOH 425 -21.002 44.617 -26.960 +ATOM 5072 O HOH 426 -17.097 7.507 -39.876 +ATOM 5073 H1 HOH 426 -16.952 7.554 -38.931 +ATOM 5074 H2 HOH 426 -16.334 7.940 -40.258 +ATOM 5075 O HOH 427 -17.097 10.609 -42.978 +ATOM 5076 H1 HOH 427 -17.609 9.951 -42.507 +ATOM 5077 H2 HOH 427 -17.516 10.669 -43.837 +ATOM 5078 O HOH 428 -17.097 13.711 -46.080 +ATOM 5079 H1 HOH 428 -16.556 13.750 -45.292 +ATOM 5080 H2 HOH 428 -16.808 12.917 -46.531 +ATOM 5081 O HOH 429 -17.097 13.711 -42.978 +ATOM 5082 H1 HOH 429 -18.025 13.915 -43.097 +ATOM 5083 H2 HOH 429 -16.871 14.105 -42.136 +ATOM 5084 O HOH 430 -17.097 16.813 -49.182 +ATOM 5085 H1 HOH 430 -16.387 16.172 -49.220 +ATOM 5086 H2 HOH 430 -17.387 16.796 -48.270 +ATOM 5087 O HOH 431 -17.097 16.813 -46.080 +ATOM 5088 H1 HOH 431 -17.778 16.542 -46.697 +ATOM 5089 H2 HOH 431 -17.136 16.163 -45.379 +ATOM 5090 O HOH 432 -17.097 16.813 -42.978 +ATOM 5091 H1 HOH 432 -17.870 16.965 -42.434 +ATOM 5092 H2 HOH 432 -16.769 17.689 -43.180 +ATOM 5093 O HOH 433 -17.097 19.915 -49.182 +ATOM 5094 H1 HOH 433 -16.158 19.953 -49.363 +ATOM 5095 H2 HOH 433 -17.170 19.353 -48.411 +ATOM 5096 O HOH 434 -17.097 19.915 -46.080 +ATOM 5097 H1 HOH 434 -16.175 20.059 -46.291 +ATOM 5098 H2 HOH 434 -17.083 19.275 -45.369 +ATOM 5099 O HOH 435 -17.097 23.017 -49.182 +ATOM 5100 H1 HOH 435 -16.374 22.398 -49.286 +ATOM 5101 H2 HOH 435 -17.361 22.926 -48.267 +ATOM 5102 O HOH 436 -17.097 23.017 -46.080 +ATOM 5103 H1 HOH 436 -16.400 23.469 -46.556 +ATOM 5104 H2 HOH 436 -16.761 22.928 -45.189 +ATOM 5105 O HOH 437 -17.097 26.119 -49.182 +ATOM 5106 H1 HOH 437 -17.219 25.855 -48.270 +ATOM 5107 H2 HOH 437 -16.923 27.059 -49.139 +ATOM 5108 O HOH 438 -17.097 26.119 -46.080 +ATOM 5109 H1 HOH 438 -17.516 25.538 -45.445 +ATOM 5110 H2 HOH 438 -16.544 25.541 -46.606 +ATOM 5111 O HOH 439 -17.097 26.119 -42.978 +ATOM 5112 H1 HOH 439 -17.937 26.155 -43.437 +ATOM 5113 H2 HOH 439 -16.656 25.353 -43.345 +ATOM 5114 O HOH 440 -17.097 26.119 -39.876 +ATOM 5115 H1 HOH 440 -16.492 26.837 -40.062 +ATOM 5116 H2 HOH 440 -17.529 26.374 -39.061 +ATOM 5117 O HOH 441 -17.097 26.119 -36.774 +ATOM 5118 H1 HOH 441 -16.460 26.629 -37.274 +ATOM 5119 H2 HOH 441 -17.937 26.309 -37.192 +ATOM 5120 O HOH 442 -17.097 29.221 -49.182 +ATOM 5121 H1 HOH 442 -17.358 29.942 -48.609 +ATOM 5122 H2 HOH 442 -17.677 29.295 -49.941 +ATOM 5123 O HOH 443 -17.097 29.221 -46.080 +ATOM 5124 H1 HOH 443 -17.527 28.832 -45.319 +ATOM 5125 H2 HOH 443 -17.431 30.118 -46.113 +ATOM 5126 O HOH 444 -17.097 29.221 -42.978 +ATOM 5127 H1 HOH 444 -16.832 28.370 -42.630 +ATOM 5128 H2 HOH 444 -16.298 29.585 -43.358 +ATOM 5129 O HOH 445 -17.097 29.221 -39.876 +ATOM 5130 H1 HOH 445 -17.096 28.329 -39.529 +ATOM 5131 H2 HOH 445 -17.412 29.128 -40.775 +ATOM 5132 O HOH 446 -17.097 29.221 -36.774 +ATOM 5133 H1 HOH 446 -16.703 28.591 -36.170 +ATOM 5134 H2 HOH 446 -17.965 29.393 -36.409 +ATOM 5135 O HOH 447 -17.097 32.323 -49.182 +ATOM 5136 H1 HOH 447 -16.644 31.728 -49.779 +ATOM 5137 H2 HOH 447 -17.486 31.751 -48.521 +ATOM 5138 O HOH 448 -17.097 32.323 -46.080 +ATOM 5139 H1 HOH 448 -17.007 32.887 -45.312 +ATOM 5140 H2 HOH 448 -17.822 32.705 -46.575 +ATOM 5141 O HOH 449 -17.097 32.323 -42.978 +ATOM 5142 H1 HOH 449 -16.686 32.669 -42.186 +ATOM 5143 H2 HOH 449 -17.694 33.016 -43.261 +ATOM 5144 O HOH 450 -17.097 32.323 -39.876 +ATOM 5145 H1 HOH 450 -18.027 32.505 -39.740 +ATOM 5146 H2 HOH 450 -16.851 31.763 -39.140 +ATOM 5147 O HOH 451 -17.097 32.323 -36.774 +ATOM 5148 H1 HOH 451 -16.897 31.740 -36.042 +ATOM 5149 H2 HOH 451 -17.915 32.752 -36.522 +ATOM 5150 O HOH 452 -17.097 32.323 -33.672 +ATOM 5151 H1 HOH 452 -16.765 32.948 -33.027 +ATOM 5152 H2 HOH 452 -17.996 32.606 -33.840 +ATOM 5153 O HOH 453 -17.097 32.323 -11.958 +ATOM 5154 H1 HOH 453 -17.753 31.687 -12.243 +ATOM 5155 H2 HOH 453 -17.022 32.182 -11.014 +ATOM 5156 O HOH 454 -17.097 35.425 -49.182 +ATOM 5157 H1 HOH 454 -17.459 36.220 -49.574 +ATOM 5158 H2 HOH 454 -17.708 35.205 -48.479 +ATOM 5159 O HOH 455 -17.097 35.425 -46.080 +ATOM 5160 H1 HOH 455 -17.516 35.590 -45.236 +ATOM 5161 H2 HOH 455 -16.784 34.523 -46.021 +ATOM 5162 O HOH 456 -17.097 35.425 -42.978 +ATOM 5163 H1 HOH 456 -16.159 35.258 -42.890 +ATOM 5164 H2 HOH 456 -17.285 36.097 -42.322 +ATOM 5165 O HOH 457 -17.097 35.425 -39.876 +ATOM 5166 H1 HOH 457 -17.129 34.510 -39.597 +ATOM 5167 H2 HOH 457 -17.063 35.383 -40.832 +ATOM 5168 O HOH 458 -17.097 35.425 -36.774 +ATOM 5169 H1 HOH 458 -17.673 36.185 -36.686 +ATOM 5170 H2 HOH 458 -17.312 34.873 -36.022 +ATOM 5171 O HOH 459 -17.097 35.425 -33.672 +ATOM 5172 H1 HOH 459 -17.782 35.479 -33.006 +ATOM 5173 H2 HOH 459 -16.445 34.833 -33.298 +ATOM 5174 O HOH 460 -17.097 35.425 -30.570 +ATOM 5175 H1 HOH 460 -16.601 36.187 -30.272 +ATOM 5176 H2 HOH 460 -17.807 35.792 -31.098 +ATOM 5177 O HOH 461 -17.097 35.425 -27.468 +ATOM 5178 H1 HOH 461 -16.895 36.115 -28.100 +ATOM 5179 H2 HOH 461 -17.463 34.716 -27.997 +ATOM 5180 O HOH 462 -17.097 35.425 -11.958 +ATOM 5181 H1 HOH 462 -16.888 35.622 -11.045 +ATOM 5182 H2 HOH 462 -18.054 35.411 -11.986 +ATOM 5183 O HOH 463 -17.097 38.527 -46.080 +ATOM 5184 H1 HOH 463 -17.125 39.222 -45.422 +ATOM 5185 H2 HOH 463 -17.004 38.990 -46.913 +ATOM 5186 O HOH 464 -17.097 38.527 -42.978 +ATOM 5187 H1 HOH 464 -16.314 38.004 -42.806 +ATOM 5188 H2 HOH 464 -17.628 38.434 -42.187 +ATOM 5189 O HOH 465 -17.097 38.527 -39.876 +ATOM 5190 H1 HOH 465 -16.808 37.787 -40.410 +ATOM 5191 H2 HOH 465 -17.158 38.173 -38.989 +ATOM 5192 O HOH 466 -17.097 38.527 -36.774 +ATOM 5193 H1 HOH 466 -16.373 38.280 -36.198 +ATOM 5194 H2 HOH 466 -17.804 37.924 -36.544 +ATOM 5195 O HOH 467 -17.097 38.527 -33.672 +ATOM 5196 H1 HOH 467 -17.822 37.981 -33.367 +ATOM 5197 H2 HOH 467 -16.341 38.227 -33.167 +ATOM 5198 O HOH 468 -17.097 38.527 -30.570 +ATOM 5199 H1 HOH 468 -16.346 39.117 -30.508 +ATOM 5200 H2 HOH 468 -17.850 39.073 -30.342 +ATOM 5201 O HOH 469 -17.097 38.527 -27.468 +ATOM 5202 H1 HOH 469 -17.831 38.550 -26.854 +ATOM 5203 H2 HOH 469 -16.533 39.251 -27.195 +ATOM 5204 O HOH 470 -17.097 38.527 -24.366 +ATOM 5205 H1 HOH 470 -17.326 39.354 -24.791 +ATOM 5206 H2 HOH 470 -16.204 38.660 -24.048 +ATOM 5207 O HOH 471 -17.097 38.527 -21.264 +ATOM 5208 H1 HOH 471 -17.745 39.094 -21.683 +ATOM 5209 H2 HOH 471 -17.599 38.021 -20.625 +ATOM 5210 O HOH 472 -17.097 38.527 -18.162 +ATOM 5211 H1 HOH 472 -17.587 38.450 -18.980 +ATOM 5212 H2 HOH 472 -16.193 38.680 -18.437 +ATOM 5213 O HOH 473 -17.097 38.527 -15.060 +ATOM 5214 H1 HOH 473 -16.971 39.265 -15.656 +ATOM 5215 H2 HOH 473 -17.641 38.879 -14.355 +ATOM 5216 O HOH 474 -17.097 41.629 -42.978 +ATOM 5217 H1 HOH 474 -16.492 41.539 -43.714 +ATOM 5218 H2 HOH 474 -16.623 41.264 -42.231 +ATOM 5219 O HOH 475 -17.097 41.629 -39.876 +ATOM 5220 H1 HOH 475 -16.835 40.928 -39.280 +ATOM 5221 H2 HOH 475 -16.417 41.640 -40.550 +ATOM 5222 O HOH 476 -17.097 41.629 -36.774 +ATOM 5223 H1 HOH 476 -17.107 40.695 -36.566 +ATOM 5224 H2 HOH 476 -17.724 41.722 -37.491 +ATOM 5225 O HOH 477 -17.097 41.629 -33.672 +ATOM 5226 H1 HOH 477 -16.759 41.075 -34.376 +ATOM 5227 H2 HOH 477 -16.845 42.518 -33.924 +ATOM 5228 O HOH 478 -17.097 41.629 -30.570 +ATOM 5229 H1 HOH 478 -17.729 40.952 -30.329 +ATOM 5230 H2 HOH 478 -17.367 42.398 -30.068 +ATOM 5231 O HOH 479 -17.097 41.629 -27.468 +ATOM 5232 H1 HOH 479 -17.194 42.209 -26.712 +ATOM 5233 H2 HOH 479 -17.428 40.783 -27.166 +ATOM 5234 O HOH 480 -17.097 41.629 -24.366 +ATOM 5235 H1 HOH 480 -17.039 40.762 -23.966 +ATOM 5236 H2 HOH 480 -16.502 41.589 -25.114 +ATOM 5237 O HOH 481 -17.097 41.629 -21.264 +ATOM 5238 H1 HOH 481 -17.109 40.704 -21.019 +ATOM 5239 H2 HOH 481 -16.358 41.709 -21.866 +ATOM 5240 O HOH 482 -17.097 41.629 -18.162 +ATOM 5241 H1 HOH 482 -17.693 42.178 -18.672 +ATOM 5242 H2 HOH 482 -17.595 41.401 -17.376 +ATOM 5243 O HOH 483 -17.097 44.731 -39.876 +ATOM 5244 H1 HOH 483 -17.955 44.487 -40.223 +ATOM 5245 H2 HOH 483 -17.183 44.628 -38.929 +ATOM 5246 O HOH 484 -17.097 44.731 -36.774 +ATOM 5247 H1 HOH 484 -16.350 44.938 -36.212 +ATOM 5248 H2 HOH 484 -17.035 45.357 -37.496 +ATOM 5249 O HOH 485 -17.097 44.731 -33.672 +ATOM 5250 H1 HOH 485 -17.689 44.915 -32.942 +ATOM 5251 H2 HOH 485 -17.575 45.026 -34.448 +ATOM 5252 O HOH 486 -17.097 44.731 -30.570 +ATOM 5253 H1 HOH 486 -16.500 45.044 -31.250 +ATOM 5254 H2 HOH 486 -16.561 44.695 -29.778 +ATOM 5255 O HOH 487 -17.097 44.731 -27.468 +ATOM 5256 H1 HOH 487 -16.559 44.795 -28.257 +ATOM 5257 H2 HOH 487 -17.780 45.391 -27.590 +ATOM 5258 O HOH 488 -17.097 44.731 -24.366 +ATOM 5259 H1 HOH 488 -16.150 44.796 -24.487 +ATOM 5260 H2 HOH 488 -17.204 44.439 -23.461 +ATOM 5261 O HOH 489 -17.097 44.731 -21.264 +ATOM 5262 H1 HOH 489 -17.043 44.105 -20.542 +ATOM 5263 H2 HOH 489 -16.261 44.644 -21.721 +ATOM 5264 O HOH 490 -13.995 7.507 -42.978 +ATOM 5265 H1 HOH 490 -13.892 6.821 -42.318 +ATOM 5266 H2 HOH 490 -13.106 7.674 -43.291 +ATOM 5267 O HOH 491 -13.995 10.609 -46.080 +ATOM 5268 H1 HOH 491 -14.575 11.367 -46.018 +ATOM 5269 H2 HOH 491 -13.194 10.951 -46.477 +ATOM 5270 O HOH 492 -13.995 13.711 -42.978 +ATOM 5271 H1 HOH 492 -13.779 12.821 -42.700 +ATOM 5272 H2 HOH 492 -13.732 14.263 -42.242 +ATOM 5273 O HOH 493 -13.995 13.711 -27.468 +ATOM 5274 H1 HOH 493 -13.941 12.927 -28.015 +ATOM 5275 H2 HOH 493 -13.737 13.413 -26.596 +ATOM 5276 O HOH 494 -13.995 19.915 -52.284 +ATOM 5277 H1 HOH 494 -13.538 19.360 -51.653 +ATOM 5278 H2 HOH 494 -14.372 20.619 -51.757 +ATOM 5279 O HOH 495 -13.995 19.915 -49.182 +ATOM 5280 H1 HOH 495 -14.473 19.255 -49.685 +ATOM 5281 H2 HOH 495 -14.274 20.750 -49.557 +ATOM 5282 O HOH 496 -13.995 19.915 -46.080 +ATOM 5283 H1 HOH 496 -14.180 19.008 -46.326 +ATOM 5284 H2 HOH 496 -13.081 20.049 -46.330 +ATOM 5285 O HOH 497 -13.995 23.017 -52.284 +ATOM 5286 H1 HOH 497 -14.649 22.416 -52.641 +ATOM 5287 H2 HOH 497 -13.426 23.219 -53.027 +ATOM 5288 O HOH 498 -13.995 23.017 -49.182 +ATOM 5289 H1 HOH 498 -14.605 22.389 -49.570 +ATOM 5290 H2 HOH 498 -13.666 23.522 -49.926 +ATOM 5291 O HOH 499 -13.995 23.017 -46.080 +ATOM 5292 H1 HOH 499 -13.770 22.967 -45.151 +ATOM 5293 H2 HOH 499 -14.647 22.327 -46.206 +ATOM 5294 O HOH 500 -13.995 26.119 -52.284 +ATOM 5295 H1 HOH 500 -13.761 26.728 -51.584 +ATOM 5296 H2 HOH 500 -14.945 26.026 -52.214 +ATOM 5297 O HOH 501 -13.995 26.119 -49.182 +ATOM 5298 H1 HOH 501 -13.363 25.761 -48.559 +ATOM 5299 H2 HOH 501 -14.813 26.178 -48.688 +ATOM 5300 O HOH 502 -13.995 26.119 -46.080 +ATOM 5301 H1 HOH 502 -13.535 25.320 -45.823 +ATOM 5302 H2 HOH 502 -14.843 26.060 -45.641 +ATOM 5303 O HOH 503 -13.995 26.119 -39.876 +ATOM 5304 H1 HOH 503 -14.187 25.182 -39.906 +ATOM 5305 H2 HOH 503 -13.059 26.179 -40.067 +ATOM 5306 O HOH 504 -13.995 29.221 -52.284 +ATOM 5307 H1 HOH 504 -14.932 29.037 -52.214 +ATOM 5308 H2 HOH 504 -13.751 29.556 -51.422 +ATOM 5309 O HOH 505 -13.995 29.221 -49.182 +ATOM 5310 H1 HOH 505 -14.639 29.095 -49.880 +ATOM 5311 H2 HOH 505 -13.416 29.909 -49.511 +ATOM 5312 O HOH 506 -13.995 29.221 -39.876 +ATOM 5313 H1 HOH 506 -14.676 28.643 -39.531 +ATOM 5314 H2 HOH 506 -13.550 29.558 -39.099 +ATOM 5315 O HOH 507 -13.995 29.221 -36.774 +ATOM 5316 H1 HOH 507 -14.515 28.643 -36.216 +ATOM 5317 H2 HOH 507 -14.301 29.036 -37.662 +ATOM 5318 O HOH 508 -13.995 32.323 -52.284 +ATOM 5319 H1 HOH 508 -13.222 32.441 -52.836 +ATOM 5320 H2 HOH 508 -13.789 32.796 -51.478 +ATOM 5321 O HOH 509 -13.995 32.323 -49.182 +ATOM 5322 H1 HOH 509 -13.263 31.738 -48.987 +ATOM 5323 H2 HOH 509 -13.969 32.980 -48.487 +ATOM 5324 O HOH 510 -13.995 32.323 -39.876 +ATOM 5325 H1 HOH 510 -13.117 32.657 -40.059 +ATOM 5326 H2 HOH 510 -14.578 33.052 -40.090 +ATOM 5327 O HOH 511 -13.995 32.323 -36.774 +ATOM 5328 H1 HOH 511 -13.216 32.061 -36.284 +ATOM 5329 H2 HOH 511 -13.940 33.278 -36.819 +ATOM 5330 O HOH 512 -13.995 32.323 -8.856 +ATOM 5331 H1 HOH 512 -13.258 32.619 -8.321 +ATOM 5332 H2 HOH 512 -13.589 31.865 -9.591 +ATOM 5333 O HOH 513 -13.995 35.425 -49.182 +ATOM 5334 H1 HOH 513 -13.335 35.341 -48.494 +ATOM 5335 H2 HOH 513 -14.598 34.698 -49.027 +ATOM 5336 O HOH 514 -13.995 35.425 -46.080 +ATOM 5337 H1 HOH 514 -14.377 34.864 -45.406 +ATOM 5338 H2 HOH 514 -14.511 36.231 -46.042 +ATOM 5339 O HOH 515 -13.995 35.425 -42.978 +ATOM 5340 H1 HOH 515 -14.380 36.275 -42.764 +ATOM 5341 H2 HOH 515 -14.269 35.259 -43.880 +ATOM 5342 O HOH 516 -13.995 35.425 -39.876 +ATOM 5343 H1 HOH 516 -13.382 34.783 -39.519 +ATOM 5344 H2 HOH 516 -14.462 34.953 -40.566 +ATOM 5345 O HOH 517 -13.995 35.425 -36.774 +ATOM 5346 H1 HOH 517 -13.370 36.044 -37.151 +ATOM 5347 H2 HOH 517 -13.489 34.940 -36.123 +ATOM 5348 O HOH 518 -13.995 35.425 -33.672 +ATOM 5349 H1 HOH 518 -13.980 34.614 -34.180 +ATOM 5350 H2 HOH 518 -13.680 35.171 -32.805 +ATOM 5351 O HOH 519 -13.995 35.425 -11.958 +ATOM 5352 H1 HOH 519 -13.454 36.037 -12.457 +ATOM 5353 H2 HOH 519 -14.843 35.437 -12.402 +ATOM 5354 O HOH 520 -13.995 38.527 -49.182 +ATOM 5355 H1 HOH 520 -13.979 37.842 -48.514 +ATOM 5356 H2 HOH 520 -14.834 38.970 -49.052 +ATOM 5357 O HOH 521 -13.995 38.527 -46.080 +ATOM 5358 H1 HOH 521 -13.487 39.294 -45.816 +ATOM 5359 H2 HOH 521 -14.671 38.444 -45.408 +ATOM 5360 O HOH 522 -13.995 38.527 -42.978 +ATOM 5361 H1 HOH 522 -14.146 37.653 -42.619 +ATOM 5362 H2 HOH 522 -13.115 38.485 -43.352 +ATOM 5363 O HOH 523 -13.995 38.527 -39.876 +ATOM 5364 H1 HOH 523 -13.319 37.876 -39.690 +ATOM 5365 H2 HOH 523 -13.760 38.878 -40.735 +ATOM 5366 O HOH 524 -13.995 38.527 -36.774 +ATOM 5367 H1 HOH 524 -13.644 37.872 -36.171 +ATOM 5368 H2 HOH 524 -13.608 38.305 -37.621 +ATOM 5369 O HOH 525 -13.995 38.527 -33.672 +ATOM 5370 H1 HOH 525 -13.442 39.250 -33.376 +ATOM 5371 H2 HOH 525 -13.778 38.423 -34.599 +ATOM 5372 O HOH 526 -13.995 38.527 -30.570 +ATOM 5373 H1 HOH 526 -14.702 38.630 -29.932 +ATOM 5374 H2 HOH 526 -13.454 39.309 -30.457 +ATOM 5375 O HOH 527 -13.995 38.527 -27.468 +ATOM 5376 H1 HOH 527 -14.796 38.557 -27.992 +ATOM 5377 H2 HOH 527 -14.000 37.656 -27.072 +ATOM 5378 O HOH 528 -13.995 38.527 -24.366 +ATOM 5379 H1 HOH 528 -13.982 38.335 -25.303 +ATOM 5380 H2 HOH 528 -13.775 39.457 -24.308 +ATOM 5381 O HOH 529 -13.995 38.527 -21.264 +ATOM 5382 H1 HOH 529 -13.866 38.529 -20.315 +ATOM 5383 H2 HOH 529 -14.909 38.787 -21.383 +ATOM 5384 O HOH 530 -13.995 38.527 -11.958 +ATOM 5385 H1 HOH 530 -13.812 39.242 -11.348 +ATOM 5386 H2 HOH 530 -13.152 38.090 -12.075 +ATOM 5387 O HOH 531 -13.995 41.629 -46.080 +ATOM 5388 H1 HOH 531 -14.376 42.462 -46.358 +ATOM 5389 H2 HOH 531 -14.600 40.966 -46.413 +ATOM 5390 O HOH 532 -13.995 41.629 -42.978 +ATOM 5391 H1 HOH 532 -13.959 41.288 -43.872 +ATOM 5392 H2 HOH 532 -14.512 42.432 -43.048 +ATOM 5393 O HOH 533 -13.995 41.629 -39.876 +ATOM 5394 H1 HOH 533 -14.546 42.223 -39.366 +ATOM 5395 H2 HOH 533 -13.441 42.207 -40.401 +ATOM 5396 O HOH 534 -13.995 41.629 -36.774 +ATOM 5397 H1 HOH 534 -14.377 40.882 -36.313 +ATOM 5398 H2 HOH 534 -13.482 41.238 -37.481 +ATOM 5399 O HOH 535 -13.995 41.629 -33.672 +ATOM 5400 H1 HOH 535 -13.546 41.503 -34.508 +ATOM 5401 H2 HOH 535 -14.924 41.526 -33.881 +ATOM 5402 O HOH 536 -13.995 41.629 -30.570 +ATOM 5403 H1 HOH 536 -14.418 41.300 -29.777 +ATOM 5404 H2 HOH 536 -13.061 41.627 -30.362 +ATOM 5405 O HOH 537 -13.995 41.629 -27.468 +ATOM 5406 H1 HOH 537 -14.924 41.709 -27.250 +ATOM 5407 H2 HOH 537 -13.549 41.631 -26.621 +ATOM 5408 O HOH 538 -13.995 41.629 -24.366 +ATOM 5409 H1 HOH 538 -14.838 41.207 -24.200 +ATOM 5410 H2 HOH 538 -13.972 41.753 -25.315 +ATOM 5411 O HOH 539 -13.995 41.629 -21.264 +ATOM 5412 H1 HOH 539 -14.223 42.286 -20.606 +ATOM 5413 H2 HOH 539 -13.749 42.138 -22.036 +ATOM 5414 O HOH 540 -13.995 41.629 -18.162 +ATOM 5415 H1 HOH 540 -14.403 41.458 -17.313 +ATOM 5416 H2 HOH 540 -14.331 40.939 -18.733 +ATOM 5417 O HOH 541 -13.995 41.629 -15.060 +ATOM 5418 H1 HOH 541 -14.252 41.716 -14.142 +ATOM 5419 H2 HOH 541 -13.228 42.194 -15.149 +ATOM 5420 O HOH 542 -13.995 44.731 -42.978 +ATOM 5421 H1 HOH 542 -13.369 44.343 -42.367 +ATOM 5422 H2 HOH 542 -14.001 44.136 -43.728 +ATOM 5423 O HOH 543 -13.995 44.731 -39.876 +ATOM 5424 H1 HOH 543 -14.277 43.828 -39.733 +ATOM 5425 H2 HOH 543 -14.788 45.189 -40.157 +ATOM 5426 O HOH 544 -13.995 44.731 -36.774 +ATOM 5427 H1 HOH 544 -14.719 44.184 -37.077 +ATOM 5428 H2 HOH 544 -13.209 44.223 -36.975 +ATOM 5429 O HOH 545 -13.995 44.731 -33.672 +ATOM 5430 H1 HOH 545 -13.565 44.223 -34.359 +ATOM 5431 H2 HOH 545 -13.635 44.385 -32.856 +ATOM 5432 O HOH 546 -13.995 44.731 -30.570 +ATOM 5433 H1 HOH 546 -13.059 44.753 -30.373 +ATOM 5434 H2 HOH 546 -14.408 45.154 -29.817 +ATOM 5435 O HOH 547 -13.995 44.731 -27.468 +ATOM 5436 H1 HOH 547 -14.744 45.017 -26.944 +ATOM 5437 H2 HOH 547 -13.612 45.543 -27.802 +ATOM 5438 O HOH 548 -13.995 44.731 -24.366 +ATOM 5439 H1 HOH 548 -14.895 44.797 -24.046 +ATOM 5440 H2 HOH 548 -14.082 44.417 -25.266 +ATOM 5441 O HOH 549 -13.995 44.731 -21.264 +ATOM 5442 H1 HOH 549 -14.123 44.110 -21.981 +ATOM 5443 H2 HOH 549 -13.366 45.367 -21.606 +ATOM 5444 O HOH 550 -13.995 44.731 -18.162 +ATOM 5445 H1 HOH 550 -13.605 45.605 -18.190 +ATOM 5446 H2 HOH 550 -13.429 44.235 -17.571 +ATOM 5447 O HOH 551 -13.995 47.833 -36.774 +ATOM 5448 H1 HOH 551 -13.429 47.160 -37.151 +ATOM 5449 H2 HOH 551 -14.090 48.485 -37.469 +ATOM 5450 O HOH 552 -13.995 47.833 -33.672 +ATOM 5451 H1 HOH 552 -14.188 48.668 -34.099 +ATOM 5452 H2 HOH 552 -14.339 47.933 -32.784 +ATOM 5453 O HOH 553 -13.995 47.833 -30.570 +ATOM 5454 H1 HOH 553 -13.295 48.486 -30.552 +ATOM 5455 H2 HOH 553 -14.496 47.997 -29.771 +ATOM 5456 O HOH 554 -13.995 47.833 -27.468 +ATOM 5457 H1 HOH 554 -14.066 47.828 -26.513 +ATOM 5458 H2 HOH 554 -14.329 48.692 -27.728 +ATOM 5459 O HOH 555 -13.995 47.833 -24.366 +ATOM 5460 H1 HOH 555 -14.189 48.552 -24.967 +ATOM 5461 H2 HOH 555 -13.082 47.971 -24.113 +ATOM 5462 O HOH 556 -10.893 4.405 -39.876 +ATOM 5463 H1 HOH 556 -10.521 4.845 -40.640 +ATOM 5464 H2 HOH 556 -11.832 4.586 -39.928 +ATOM 5465 O HOH 557 -10.893 7.507 -42.978 +ATOM 5466 H1 HOH 557 -10.963 6.977 -42.184 +ATOM 5467 H2 HOH 557 -9.988 7.389 -43.267 +ATOM 5468 O HOH 558 -10.893 16.813 -52.284 +ATOM 5469 H1 HOH 558 -11.140 17.712 -52.070 +ATOM 5470 H2 HOH 558 -11.341 16.278 -51.629 +ATOM 5471 O HOH 559 -10.893 19.915 -52.284 +ATOM 5472 H1 HOH 559 -10.161 19.873 -51.669 +ATOM 5473 H2 HOH 559 -10.560 19.502 -53.081 +ATOM 5474 O HOH 560 -10.893 23.017 -52.284 +ATOM 5475 H1 HOH 560 -10.325 23.196 -51.536 +ATOM 5476 H2 HOH 560 -10.572 22.187 -52.637 +ATOM 5477 O HOH 561 -10.893 23.017 -49.182 +ATOM 5478 H1 HOH 561 -10.927 22.193 -48.697 +ATOM 5479 H2 HOH 561 -10.242 23.543 -48.718 +ATOM 5480 O HOH 562 -10.893 26.119 -52.284 +ATOM 5481 H1 HOH 562 -10.655 26.747 -52.966 +ATOM 5482 H2 HOH 562 -10.775 25.263 -52.695 +ATOM 5483 O HOH 563 -10.893 26.119 -49.182 +ATOM 5484 H1 HOH 563 -10.133 26.000 -49.752 +ATOM 5485 H2 HOH 563 -10.728 25.539 -48.439 +ATOM 5486 O HOH 564 -10.893 26.119 -46.080 +ATOM 5487 H1 HOH 564 -11.453 25.427 -45.727 +ATOM 5488 H2 HOH 564 -10.081 25.672 -46.319 +ATOM 5489 O HOH 565 -10.893 29.221 -52.284 +ATOM 5490 H1 HOH 565 -11.641 29.818 -52.322 +ATOM 5491 H2 HOH 565 -11.124 28.591 -51.602 +ATOM 5492 O HOH 566 -10.893 29.221 -49.182 +ATOM 5493 H1 HOH 566 -10.521 28.866 -49.990 +ATOM 5494 H2 HOH 566 -11.379 29.997 -49.463 +ATOM 5495 O HOH 567 -10.893 32.323 -52.284 +ATOM 5496 H1 HOH 567 -10.071 32.137 -52.737 +ATOM 5497 H2 HOH 567 -11.009 31.586 -51.684 +ATOM 5498 O HOH 568 -10.893 32.323 -39.876 +ATOM 5499 H1 HOH 568 -10.705 33.218 -40.160 +ATOM 5500 H2 HOH 568 -11.367 32.427 -39.051 +ATOM 5501 O HOH 569 -10.893 32.323 -8.856 +ATOM 5502 H1 HOH 569 -10.384 31.873 -8.182 +ATOM 5503 H2 HOH 569 -11.499 32.880 -8.366 +ATOM 5504 O HOH 570 -10.893 35.425 -42.978 +ATOM 5505 H1 HOH 570 -10.920 34.811 -43.712 +ATOM 5506 H2 HOH 570 -11.781 35.411 -42.621 +ATOM 5507 O HOH 571 -10.893 35.425 -39.876 +ATOM 5508 H1 HOH 571 -11.712 35.113 -39.492 +ATOM 5509 H2 HOH 571 -10.433 35.846 -39.150 +ATOM 5510 O HOH 572 -10.893 35.425 -36.774 +ATOM 5511 H1 HOH 572 -10.716 35.811 -37.632 +ATOM 5512 H2 HOH 572 -11.621 34.823 -36.928 +ATOM 5513 O HOH 573 -10.893 35.425 -33.672 +ATOM 5514 H1 HOH 573 -11.107 35.674 -32.773 +ATOM 5515 H2 HOH 573 -11.609 34.848 -33.938 +ATOM 5516 O HOH 574 -10.893 35.425 -11.958 +ATOM 5517 H1 HOH 574 -11.161 36.285 -12.281 +ATOM 5518 H2 HOH 574 -10.178 35.610 -11.349 +ATOM 5519 O HOH 575 -10.893 35.425 -8.856 +ATOM 5520 H1 HOH 575 -10.304 35.375 -8.103 +ATOM 5521 H2 HOH 575 -10.758 36.305 -9.207 +ATOM 5522 O HOH 576 -10.893 38.527 -46.080 +ATOM 5523 H1 HOH 576 -11.377 37.795 -45.698 +ATOM 5524 H2 HOH 576 -10.463 38.946 -45.335 +ATOM 5525 O HOH 577 -10.893 38.527 -42.978 +ATOM 5526 H1 HOH 577 -11.566 37.864 -42.826 +ATOM 5527 H2 HOH 577 -10.280 38.419 -42.251 +ATOM 5528 O HOH 578 -10.893 38.527 -39.876 +ATOM 5529 H1 HOH 578 -11.677 38.935 -39.510 +ATOM 5530 H2 HOH 578 -11.196 37.682 -40.208 +ATOM 5531 O HOH 579 -10.893 38.527 -36.774 +ATOM 5532 H1 HOH 579 -11.141 39.169 -36.109 +ATOM 5533 H2 HOH 579 -10.918 37.686 -36.317 +ATOM 5534 O HOH 580 -10.893 38.527 -33.672 +ATOM 5535 H1 HOH 580 -11.461 37.927 -33.188 +ATOM 5536 H2 HOH 580 -11.489 39.187 -34.027 +ATOM 5537 O HOH 581 -10.893 38.527 -30.570 +ATOM 5538 H1 HOH 581 -10.583 37.622 -30.533 +ATOM 5539 H2 HOH 581 -11.274 38.615 -31.444 +ATOM 5540 O HOH 582 -10.893 38.527 -27.468 +ATOM 5541 H1 HOH 582 -10.797 37.620 -27.757 +ATOM 5542 H2 HOH 582 -10.010 38.893 -27.528 +ATOM 5543 O HOH 583 -10.893 38.527 -11.958 +ATOM 5544 H1 HOH 583 -11.393 38.020 -12.597 +ATOM 5545 H2 HOH 583 -11.003 39.437 -12.234 +ATOM 5546 O HOH 584 -10.893 41.629 -46.080 +ATOM 5547 H1 HOH 584 -11.411 42.394 -46.332 +ATOM 5548 H2 HOH 584 -10.820 41.114 -46.884 +ATOM 5549 O HOH 585 -10.893 41.629 -42.978 +ATOM 5550 H1 HOH 585 -10.793 41.967 -42.088 +ATOM 5551 H2 HOH 585 -11.815 41.379 -43.037 +ATOM 5552 O HOH 586 -10.893 41.629 -39.876 +ATOM 5553 H1 HOH 586 -10.042 41.780 -39.465 +ATOM 5554 H2 HOH 586 -10.684 41.382 -40.777 +ATOM 5555 O HOH 587 -10.893 41.629 -36.774 +ATOM 5556 H1 HOH 587 -9.937 41.593 -36.782 +ATOM 5557 H2 HOH 587 -11.160 40.832 -36.317 +ATOM 5558 O HOH 588 -10.893 41.629 -33.672 +ATOM 5559 H1 HOH 588 -10.123 41.598 -34.240 +ATOM 5560 H2 HOH 588 -11.606 41.901 -34.249 +ATOM 5561 O HOH 589 -10.893 41.629 -30.570 +ATOM 5562 H1 HOH 589 -11.111 40.699 -30.629 +ATOM 5563 H2 HOH 589 -11.717 42.079 -30.758 +ATOM 5564 O HOH 590 -10.893 41.629 -27.468 +ATOM 5565 H1 HOH 590 -11.604 42.249 -27.302 +ATOM 5566 H2 HOH 590 -10.303 41.735 -26.721 +ATOM 5567 O HOH 591 -10.893 41.629 -24.366 +ATOM 5568 H1 HOH 591 -10.468 41.498 -23.518 +ATOM 5569 H2 HOH 591 -10.725 40.819 -24.846 +ATOM 5570 O HOH 592 -10.893 41.629 -21.264 +ATOM 5571 H1 HOH 592 -10.979 40.763 -20.865 +ATOM 5572 H2 HOH 592 -11.668 42.107 -20.969 +ATOM 5573 O HOH 593 -10.893 41.629 -18.162 +ATOM 5574 H1 HOH 593 -10.388 41.221 -18.865 +ATOM 5575 H2 HOH 593 -11.807 41.484 -18.407 +ATOM 5576 O HOH 594 -10.893 41.629 -15.060 +ATOM 5577 H1 HOH 594 -11.121 41.000 -14.375 +ATOM 5578 H2 HOH 594 -11.508 41.444 -15.770 +ATOM 5579 O HOH 595 -10.893 44.731 -42.978 +ATOM 5580 H1 HOH 595 -11.605 44.235 -43.383 +ATOM 5581 H2 HOH 595 -10.207 44.083 -42.821 +ATOM 5582 O HOH 596 -10.893 44.731 -39.876 +ATOM 5583 H1 HOH 596 -11.506 45.463 -39.941 +ATOM 5584 H2 HOH 596 -10.887 44.345 -40.752 +ATOM 5585 O HOH 597 -10.893 44.731 -36.774 +ATOM 5586 H1 HOH 597 -11.641 45.319 -36.669 +ATOM 5587 H2 HOH 597 -11.282 43.886 -36.999 +ATOM 5588 O HOH 598 -10.893 44.731 -33.672 +ATOM 5589 H1 HOH 598 -11.188 44.041 -34.266 +ATOM 5590 H2 HOH 598 -10.045 44.426 -33.351 +ATOM 5591 O HOH 599 -10.893 44.731 -30.570 +ATOM 5592 H1 HOH 599 -11.619 44.997 -31.135 +ATOM 5593 H2 HOH 599 -10.613 45.541 -30.142 +ATOM 5594 O HOH 600 -10.893 44.731 -27.468 +ATOM 5595 H1 HOH 600 -11.013 45.491 -28.038 +ATOM 5596 H2 HOH 600 -10.006 44.426 -27.657 +ATOM 5597 O HOH 601 -10.893 44.731 -24.366 +ATOM 5598 H1 HOH 601 -11.693 44.207 -24.404 +ATOM 5599 H2 HOH 601 -10.883 45.090 -23.479 +ATOM 5600 O HOH 602 -10.893 44.731 -21.264 +ATOM 5601 H1 HOH 602 -10.068 44.901 -21.719 +ATOM 5602 H2 HOH 602 -11.305 44.029 -21.767 +ATOM 5603 O HOH 603 -10.893 44.731 -18.162 +ATOM 5604 H1 HOH 603 -10.968 45.248 -18.964 +ATOM 5605 H2 HOH 603 -10.729 43.838 -18.465 +ATOM 5606 O HOH 604 -10.893 47.833 -39.876 +ATOM 5607 H1 HOH 604 -10.538 46.959 -40.032 +ATOM 5608 H2 HOH 604 -10.254 48.426 -40.272 +ATOM 5609 O HOH 605 -10.893 47.833 -36.774 +ATOM 5610 H1 HOH 605 -11.497 48.469 -37.158 +ATOM 5611 H2 HOH 605 -11.328 47.542 -35.973 +ATOM 5612 O HOH 606 -10.893 47.833 -33.672 +ATOM 5613 H1 HOH 606 -10.732 48.524 -33.029 +ATOM 5614 H2 HOH 606 -10.022 47.584 -33.979 +ATOM 5615 O HOH 607 -10.893 47.833 -30.570 +ATOM 5616 H1 HOH 607 -11.289 47.566 -29.741 +ATOM 5617 H2 HOH 607 -11.133 47.141 -31.185 +ATOM 5618 O HOH 608 -10.893 47.833 -27.468 +ATOM 5619 H1 HOH 608 -10.345 48.605 -27.324 +ATOM 5620 H2 HOH 608 -11.784 48.135 -27.288 +ATOM 5621 O HOH 609 -10.893 47.833 -24.366 +ATOM 5622 H1 HOH 609 -10.801 47.009 -23.888 +ATOM 5623 H2 HOH 609 -11.219 47.576 -25.228 +ATOM 5624 O HOH 610 -10.893 47.833 -21.264 +ATOM 5625 H1 HOH 610 -11.287 47.041 -21.628 +ATOM 5626 H2 HOH 610 -10.326 47.519 -20.560 +ATOM 5627 O HOH 611 -7.791 4.405 -36.774 +ATOM 5628 H1 HOH 611 -8.468 5.050 -36.569 +ATOM 5629 H2 HOH 611 -7.735 3.858 -35.990 +ATOM 5630 O HOH 612 -7.791 4.405 -33.672 +ATOM 5631 H1 HOH 612 -7.186 4.841 -33.073 +ATOM 5632 H2 HOH 612 -8.229 5.120 -34.133 +ATOM 5633 O HOH 613 -7.791 7.507 -46.080 +ATOM 5634 H1 HOH 613 -7.519 8.083 -45.366 +ATOM 5635 H2 HOH 613 -7.162 6.786 -46.061 +ATOM 5636 O HOH 614 -7.791 10.609 -49.182 +ATOM 5637 H1 HOH 614 -7.981 10.251 -48.315 +ATOM 5638 H2 HOH 614 -7.680 11.548 -49.036 +ATOM 5639 O HOH 615 -7.791 35.425 -42.978 +ATOM 5640 H1 HOH 615 -7.403 34.737 -42.438 +ATOM 5641 H2 HOH 615 -8.678 35.115 -43.162 +ATOM 5642 O HOH 616 -7.791 35.425 -27.468 +ATOM 5643 H1 HOH 616 -8.001 34.755 -26.817 +ATOM 5644 H2 HOH 616 -6.869 35.277 -27.676 +ATOM 5645 O HOH 617 -7.791 35.425 -11.958 +ATOM 5646 H1 HOH 617 -8.597 35.495 -11.446 +ATOM 5647 H2 HOH 617 -7.090 35.496 -11.310 +ATOM 5648 O HOH 618 -7.791 35.425 -8.856 +ATOM 5649 H1 HOH 618 -8.404 36.103 -8.572 +ATOM 5650 H2 HOH 618 -6.927 35.824 -8.750 +ATOM 5651 O HOH 619 -7.791 38.527 -42.978 +ATOM 5652 H1 HOH 619 -7.646 39.472 -43.036 +ATOM 5653 H2 HOH 619 -7.324 38.261 -42.186 +ATOM 5654 O HOH 620 -7.791 38.527 -39.876 +ATOM 5655 H1 HOH 620 -8.298 37.733 -40.046 +ATOM 5656 H2 HOH 620 -6.878 38.240 -39.906 +ATOM 5657 O HOH 621 -7.791 38.527 -36.774 +ATOM 5658 H1 HOH 621 -8.276 39.336 -36.936 +ATOM 5659 H2 HOH 621 -8.095 38.233 -35.915 +ATOM 5660 O HOH 622 -7.791 38.527 -33.672 +ATOM 5661 H1 HOH 622 -7.510 38.441 -34.583 +ATOM 5662 H2 HOH 622 -7.026 38.879 -33.217 +ATOM 5663 O HOH 623 -7.791 38.527 -30.570 +ATOM 5664 H1 HOH 623 -8.300 37.734 -30.739 +ATOM 5665 H2 HOH 623 -7.163 38.270 -29.895 +ATOM 5666 O HOH 624 -7.791 38.527 -27.468 +ATOM 5667 H1 HOH 624 -8.390 38.143 -28.108 +ATOM 5668 H2 HOH 624 -7.698 39.439 -27.743 +ATOM 5669 O HOH 625 -7.791 38.527 -15.060 +ATOM 5670 H1 HOH 625 -8.179 39.049 -15.762 +ATOM 5671 H2 HOH 625 -8.158 37.651 -15.181 +ATOM 5672 O HOH 626 -7.791 38.527 -11.958 +ATOM 5673 H1 HOH 626 -7.094 38.446 -12.608 +ATOM 5674 H2 HOH 626 -7.429 39.110 -11.290 +ATOM 5675 O HOH 627 -7.791 41.629 -49.182 +ATOM 5676 H1 HOH 627 -8.367 41.296 -48.494 +ATOM 5677 H2 HOH 627 -7.109 40.963 -49.268 +ATOM 5678 O HOH 628 -7.791 41.629 -46.080 +ATOM 5679 H1 HOH 628 -7.492 42.199 -45.372 +ATOM 5680 H2 HOH 628 -7.966 40.790 -45.655 +ATOM 5681 O HOH 629 -7.791 41.629 -42.978 +ATOM 5682 H1 HOH 629 -7.288 42.386 -42.678 +ATOM 5683 H2 HOH 629 -7.184 41.143 -43.536 +ATOM 5684 O HOH 630 -7.791 41.629 -39.876 +ATOM 5685 H1 HOH 630 -8.416 42.138 -39.359 +ATOM 5686 H2 HOH 630 -7.843 42.008 -40.754 +ATOM 5687 O HOH 631 -7.791 41.629 -36.774 +ATOM 5688 H1 HOH 631 -8.269 41.446 -35.965 +ATOM 5689 H2 HOH 631 -8.363 41.304 -37.470 +ATOM 5690 O HOH 632 -7.791 41.629 -33.672 +ATOM 5691 H1 HOH 632 -8.506 42.090 -34.110 +ATOM 5692 H2 HOH 632 -7.921 41.814 -32.742 +ATOM 5693 O HOH 633 -7.791 41.629 -30.570 +ATOM 5694 H1 HOH 633 -8.384 40.999 -30.161 +ATOM 5695 H2 HOH 633 -6.926 41.225 -30.502 +ATOM 5696 O HOH 634 -7.791 41.629 -27.468 +ATOM 5697 H1 HOH 634 -7.587 40.699 -27.375 +ATOM 5698 H2 HOH 634 -7.892 41.944 -26.570 +ATOM 5699 O HOH 635 -7.791 41.629 -24.366 +ATOM 5700 H1 HOH 635 -7.516 40.814 -23.948 +ATOM 5701 H2 HOH 635 -8.563 41.903 -23.871 +ATOM 5702 O HOH 636 -7.791 41.629 -21.264 +ATOM 5703 H1 HOH 636 -7.114 41.268 -20.692 +ATOM 5704 H2 HOH 636 -8.616 41.346 -20.869 +ATOM 5705 O HOH 637 -7.791 41.629 -18.162 +ATOM 5706 H1 HOH 637 -8.429 41.395 -18.836 +ATOM 5707 H2 HOH 637 -7.000 41.146 -18.401 +ATOM 5708 O HOH 638 -7.791 41.629 -15.060 +ATOM 5709 H1 HOH 638 -7.588 40.972 -15.725 +ATOM 5710 H2 HOH 638 -8.461 42.181 -15.464 +ATOM 5711 O HOH 639 -7.791 41.629 -11.958 +ATOM 5712 H1 HOH 639 -6.991 41.385 -12.424 +ATOM 5713 H2 HOH 639 -8.489 41.516 -12.603 +ATOM 5714 O HOH 640 -7.791 44.731 -46.080 +ATOM 5715 H1 HOH 640 -7.150 45.018 -45.429 +ATOM 5716 H2 HOH 640 -8.638 44.843 -45.649 +ATOM 5717 O HOH 641 -7.791 44.731 -42.978 +ATOM 5718 H1 HOH 641 -7.137 45.002 -42.334 +ATOM 5719 H2 HOH 641 -8.420 44.212 -42.477 +ATOM 5720 O HOH 642 -7.791 44.731 -39.876 +ATOM 5721 H1 HOH 642 -8.370 44.739 -40.638 +ATOM 5722 H2 HOH 642 -8.043 45.508 -39.376 +ATOM 5723 O HOH 643 -7.791 44.731 -36.774 +ATOM 5724 H1 HOH 643 -7.705 45.447 -37.405 +ATOM 5725 H2 HOH 643 -8.361 45.082 -36.090 +ATOM 5726 O HOH 644 -7.791 44.731 -33.672 +ATOM 5727 H1 HOH 644 -7.349 44.047 -33.170 +ATOM 5728 H2 HOH 644 -8.364 44.256 -34.274 +ATOM 5729 O HOH 645 -7.791 44.731 -30.570 +ATOM 5730 H1 HOH 645 -8.039 44.375 -29.717 +ATOM 5731 H2 HOH 645 -8.323 45.522 -30.664 +ATOM 5732 O HOH 646 -7.791 44.731 -27.468 +ATOM 5733 H1 HOH 646 -8.406 44.948 -28.168 +ATOM 5734 H2 HOH 646 -8.346 44.535 -26.713 +ATOM 5735 O HOH 647 -7.791 44.731 -24.366 +ATOM 5736 H1 HOH 647 -8.560 44.255 -24.053 +ATOM 5737 H2 HOH 647 -7.516 44.254 -25.148 +ATOM 5738 O HOH 648 -7.791 44.731 -21.264 +ATOM 5739 H1 HOH 648 -6.853 44.896 -21.171 +ATOM 5740 H2 HOH 648 -7.908 44.530 -22.192 +ATOM 5741 O HOH 649 -7.791 44.731 -18.162 +ATOM 5742 H1 HOH 649 -7.467 45.573 -18.482 +ATOM 5743 H2 HOH 649 -7.086 44.398 -17.607 +ATOM 5744 O HOH 650 -7.791 44.731 -15.060 +ATOM 5745 H1 HOH 650 -7.285 44.953 -15.841 +ATOM 5746 H2 HOH 650 -7.597 43.808 -14.902 +ATOM 5747 O HOH 651 -7.791 47.833 -39.876 +ATOM 5748 H1 HOH 651 -8.308 47.304 -40.484 +ATOM 5749 H2 HOH 651 -7.257 47.199 -39.399 +ATOM 5750 O HOH 652 -7.791 47.833 -36.774 +ATOM 5751 H1 HOH 652 -8.309 48.380 -37.365 +ATOM 5752 H2 HOH 652 -7.400 47.169 -37.342 +ATOM 5753 O HOH 653 -7.791 47.833 -33.672 +ATOM 5754 H1 HOH 653 -8.251 47.331 -34.345 +ATOM 5755 H2 HOH 653 -8.217 47.581 -32.853 +ATOM 5756 O HOH 654 -7.791 47.833 -30.570 +ATOM 5757 H1 HOH 654 -8.003 48.038 -31.481 +ATOM 5758 H2 HOH 654 -7.092 47.182 -30.627 +ATOM 5759 O HOH 655 -7.791 47.833 -27.468 +ATOM 5760 H1 HOH 655 -8.470 47.936 -28.135 +ATOM 5761 H2 HOH 655 -6.977 48.063 -27.916 +ATOM 5762 O HOH 656 -7.791 47.833 -24.366 +ATOM 5763 H1 HOH 656 -7.255 47.253 -24.906 +ATOM 5764 H2 HOH 656 -8.007 48.566 -24.943 +ATOM 5765 O HOH 657 -7.791 47.833 -21.264 +ATOM 5766 H1 HOH 657 -7.398 48.137 -20.445 +ATOM 5767 H2 HOH 657 -7.192 47.159 -21.582 +ATOM 5768 O HOH 658 -4.689 7.507 -46.080 +ATOM 5769 H1 HOH 658 -5.298 7.934 -46.683 +ATOM 5770 H2 HOH 658 -5.123 7.552 -45.228 +ATOM 5771 O HOH 659 -4.689 10.609 -49.182 +ATOM 5772 H1 HOH 659 -4.384 9.936 -49.791 +ATOM 5773 H2 HOH 659 -4.490 11.436 -49.620 +ATOM 5774 O HOH 660 -4.689 13.711 -49.182 +ATOM 5775 H1 HOH 660 -4.010 14.341 -49.422 +ATOM 5776 H2 HOH 660 -5.512 14.152 -49.394 +ATOM 5777 O HOH 661 -4.689 23.017 -30.570 +ATOM 5778 H1 HOH 661 -5.368 23.621 -30.271 +ATOM 5779 H2 HOH 661 -3.926 23.573 -30.727 +ATOM 5780 O HOH 662 -4.689 26.119 -30.570 +ATOM 5781 H1 HOH 662 -3.767 25.866 -30.607 +ATOM 5782 H2 HOH 662 -4.780 26.793 -31.243 +ATOM 5783 O HOH 663 -4.689 29.221 -30.570 +ATOM 5784 H1 HOH 663 -5.244 29.816 -31.074 +ATOM 5785 H2 HOH 663 -5.256 28.476 -30.372 +ATOM 5786 O HOH 664 -4.689 32.323 -30.570 +ATOM 5787 H1 HOH 664 -3.922 32.884 -30.686 +ATOM 5788 H2 HOH 664 -4.362 31.435 -30.714 +ATOM 5789 O HOH 665 -4.689 32.323 -27.468 +ATOM 5790 H1 HOH 665 -4.497 31.900 -26.631 +ATOM 5791 H2 HOH 665 -5.259 33.057 -27.240 +ATOM 5792 O HOH 666 -4.689 35.425 -42.978 +ATOM 5793 H1 HOH 666 -5.277 36.181 -42.999 +ATOM 5794 H2 HOH 666 -4.211 35.516 -42.154 +ATOM 5795 O HOH 667 -4.689 35.425 -30.570 +ATOM 5796 H1 HOH 667 -5.228 35.186 -29.816 +ATOM 5797 H2 HOH 667 -4.822 34.713 -31.195 +ATOM 5798 O HOH 668 -4.689 35.425 -27.468 +ATOM 5799 H1 HOH 668 -5.020 34.724 -28.029 +ATOM 5800 H2 HOH 668 -5.397 35.587 -26.844 +ATOM 5801 O HOH 669 -4.689 35.425 -24.366 +ATOM 5802 H1 HOH 669 -4.629 34.543 -24.732 +ATOM 5803 H2 HOH 669 -4.081 35.945 -24.891 +ATOM 5804 O HOH 670 -4.689 35.425 -11.958 +ATOM 5805 H1 HOH 670 -3.976 35.014 -12.447 +ATOM 5806 H2 HOH 670 -5.478 35.206 -12.453 +ATOM 5807 O HOH 671 -4.689 35.425 -8.856 +ATOM 5808 H1 HOH 671 -5.299 35.691 -8.168 +ATOM 5809 H2 HOH 671 -4.318 36.247 -9.178 +ATOM 5810 O HOH 672 -4.689 38.527 -42.978 +ATOM 5811 H1 HOH 672 -4.408 39.380 -43.310 +ATOM 5812 H2 HOH 672 -4.680 37.956 -43.746 +ATOM 5813 O HOH 673 -4.689 38.527 -39.876 +ATOM 5814 H1 HOH 673 -4.725 39.018 -39.055 +ATOM 5815 H2 HOH 673 -4.205 37.731 -39.658 +ATOM 5816 O HOH 674 -4.689 38.527 -36.774 +ATOM 5817 H1 HOH 674 -4.350 38.282 -35.913 +ATOM 5818 H2 HOH 674 -5.549 38.109 -36.822 +ATOM 5819 O HOH 675 -4.689 38.527 -33.672 +ATOM 5820 H1 HOH 675 -4.799 39.471 -33.560 +ATOM 5821 H2 HOH 675 -4.026 38.284 -33.026 +ATOM 5822 O HOH 676 -4.689 38.527 -30.570 +ATOM 5823 H1 HOH 676 -5.043 39.039 -29.843 +ATOM 5824 H2 HOH 676 -5.453 38.305 -31.102 +ATOM 5825 O HOH 677 -4.689 38.527 -27.468 +ATOM 5826 H1 HOH 677 -3.867 38.963 -27.693 +ATOM 5827 H2 HOH 677 -5.023 39.018 -26.717 +ATOM 5828 O HOH 678 -4.689 38.527 -24.366 +ATOM 5829 H1 HOH 678 -4.708 39.244 -25.000 +ATOM 5830 H2 HOH 678 -3.808 38.561 -23.992 +ATOM 5831 O HOH 679 -4.689 38.527 -15.060 +ATOM 5832 H1 HOH 679 -3.899 38.771 -15.542 +ATOM 5833 H2 HOH 679 -5.405 38.686 -15.675 +ATOM 5834 O HOH 680 -4.689 38.527 -11.958 +ATOM 5835 H1 HOH 680 -4.918 38.154 -11.106 +ATOM 5836 H2 HOH 680 -5.397 38.249 -12.539 +ATOM 5837 O HOH 681 -4.689 41.629 -46.080 +ATOM 5838 H1 HOH 681 -5.285 41.135 -45.517 +ATOM 5839 H2 HOH 681 -3.883 41.706 -45.569 +ATOM 5840 O HOH 682 -4.689 41.629 -42.978 +ATOM 5841 H1 HOH 682 -5.101 41.750 -43.834 +ATOM 5842 H2 HOH 682 -4.725 40.685 -42.826 +ATOM 5843 O HOH 683 -4.689 41.629 -39.876 +ATOM 5844 H1 HOH 683 -3.894 41.785 -40.386 +ATOM 5845 H2 HOH 683 -5.286 42.328 -40.143 +ATOM 5846 O HOH 684 -4.689 41.629 -36.774 +ATOM 5847 H1 HOH 684 -4.945 40.822 -37.220 +ATOM 5848 H2 HOH 684 -4.550 41.368 -35.864 +ATOM 5849 O HOH 685 -4.689 41.629 -33.672 +ATOM 5850 H1 HOH 685 -4.158 41.352 -34.418 +ATOM 5851 H2 HOH 685 -4.356 41.115 -32.936 +ATOM 5852 O HOH 686 -4.689 41.629 -30.570 +ATOM 5853 H1 HOH 686 -4.127 41.976 -29.877 +ATOM 5854 H2 HOH 686 -5.188 42.387 -30.875 +ATOM 5855 O HOH 687 -4.689 41.629 -27.468 +ATOM 5856 H1 HOH 687 -4.369 40.823 -27.872 +ATOM 5857 H2 HOH 687 -4.748 41.424 -26.535 +ATOM 5858 O HOH 688 -4.689 41.629 -24.366 +ATOM 5859 H1 HOH 688 -3.804 41.349 -24.131 +ATOM 5860 H2 HOH 688 -4.573 42.145 -25.164 +ATOM 5861 O HOH 689 -4.689 41.629 -21.264 +ATOM 5862 H1 HOH 689 -4.895 42.536 -21.035 +ATOM 5863 H2 HOH 689 -5.525 41.169 -21.196 +ATOM 5864 O HOH 690 -4.689 41.629 -18.162 +ATOM 5865 H1 HOH 690 -3.870 41.942 -17.776 +ATOM 5866 H2 HOH 690 -4.622 41.862 -19.088 +ATOM 5867 O HOH 691 -4.689 41.629 -15.060 +ATOM 5868 H1 HOH 691 -5.085 41.332 -14.241 +ATOM 5869 H2 HOH 691 -5.344 42.211 -15.446 +ATOM 5870 O HOH 692 -4.689 41.629 -11.958 +ATOM 5871 H1 HOH 692 -3.924 42.000 -11.517 +ATOM 5872 H2 HOH 692 -5.304 42.360 -12.026 +ATOM 5873 O HOH 693 -4.689 44.731 -46.080 +ATOM 5874 H1 HOH 693 -3.975 45.218 -46.491 +ATOM 5875 H2 HOH 693 -4.264 43.971 -45.683 +ATOM 5876 O HOH 694 -4.689 44.731 -42.978 +ATOM 5877 H1 HOH 694 -5.071 44.091 -42.378 +ATOM 5878 H2 HOH 694 -3.788 44.432 -43.104 +ATOM 5879 O HOH 695 -4.689 44.731 -39.876 +ATOM 5880 H1 HOH 695 -4.818 44.484 -38.961 +ATOM 5881 H2 HOH 695 -4.838 43.923 -40.366 +ATOM 5882 O HOH 696 -4.689 44.731 -36.774 +ATOM 5883 H1 HOH 696 -3.781 44.604 -37.048 +ATOM 5884 H2 HOH 696 -5.053 45.333 -37.424 +ATOM 5885 O HOH 697 -4.689 44.731 -33.672 +ATOM 5886 H1 HOH 697 -5.188 44.666 -32.858 +ATOM 5887 H2 HOH 697 -4.206 45.554 -33.592 +ATOM 5888 O HOH 698 -4.689 44.731 -30.570 +ATOM 5889 H1 HOH 698 -4.361 44.237 -31.321 +ATOM 5890 H2 HOH 698 -5.126 45.491 -30.955 +ATOM 5891 O HOH 699 -4.689 44.731 -27.468 +ATOM 5892 H1 HOH 699 -5.384 44.086 -27.598 +ATOM 5893 H2 HOH 699 -4.887 45.129 -26.620 +ATOM 5894 O HOH 700 -4.689 44.731 -24.366 +ATOM 5895 H1 HOH 700 -4.261 44.172 -25.014 +ATOM 5896 H2 HOH 700 -4.842 45.557 -24.825 +ATOM 5897 O HOH 701 -4.689 44.731 -21.264 +ATOM 5898 H1 HOH 701 -4.252 43.989 -21.681 +ATOM 5899 H2 HOH 701 -4.002 45.154 -20.748 +ATOM 5900 O HOH 702 -4.689 44.731 -18.162 +ATOM 5901 H1 HOH 702 -5.247 44.326 -18.825 +ATOM 5902 H2 HOH 702 -3.955 44.125 -18.061 +ATOM 5903 O HOH 703 -4.689 44.731 -15.060 +ATOM 5904 H1 HOH 703 -5.567 45.043 -14.839 +ATOM 5905 H2 HOH 703 -4.812 44.207 -15.851 +ATOM 5906 O HOH 704 -4.689 47.833 -39.876 +ATOM 5907 H1 HOH 704 -3.768 48.050 -39.732 +ATOM 5908 H2 HOH 704 -4.996 47.514 -39.028 +ATOM 5909 O HOH 705 -4.689 47.833 -36.774 +ATOM 5910 H1 HOH 705 -4.002 48.327 -37.222 +ATOM 5911 H2 HOH 705 -5.375 47.724 -37.433 +ATOM 5912 O HOH 706 -4.689 47.833 -33.672 +ATOM 5913 H1 HOH 706 -4.178 48.637 -33.767 +ATOM 5914 H2 HOH 706 -4.035 47.145 -33.556 +ATOM 5915 O HOH 707 -4.689 47.833 -30.570 +ATOM 5916 H1 HOH 707 -4.500 46.914 -30.385 +ATOM 5917 H2 HOH 707 -3.932 48.308 -30.227 +ATOM 5918 O HOH 708 -4.689 47.833 -27.468 +ATOM 5919 H1 HOH 708 -4.687 46.878 -27.525 +ATOM 5920 H2 HOH 708 -4.231 48.123 -28.257 +ATOM 5921 O HOH 709 -4.689 47.833 -24.366 +ATOM 5922 H1 HOH 709 -5.346 48.269 -24.909 +ATOM 5923 H2 HOH 709 -5.106 47.016 -24.094 +ATOM 5924 O HOH 710 -4.689 47.833 -21.264 +ATOM 5925 H1 HOH 710 -4.205 47.212 -21.808 +ATOM 5926 H2 HOH 710 -4.165 47.913 -20.467 +ATOM 5927 O HOH 711 -4.689 50.936 -30.570 +ATOM 5928 H1 HOH 711 -5.227 50.786 -29.792 +ATOM 5929 H2 HOH 711 -5.277 51.369 -31.189 +ATOM 5930 O HOH 712 -1.587 7.507 -46.080 +ATOM 5931 H1 HOH 712 -1.298 6.901 -46.763 +ATOM 5932 H2 HOH 712 -0.904 7.459 -45.412 +ATOM 5933 O HOH 713 -1.587 7.507 -42.978 +ATOM 5934 H1 HOH 713 -1.763 6.988 -42.193 +ATOM 5935 H2 HOH 713 -1.808 6.924 -43.705 +ATOM 5936 O HOH 714 -1.587 7.507 -30.570 +ATOM 5937 H1 HOH 714 -0.727 7.464 -30.989 +ATOM 5938 H2 HOH 714 -2.193 7.182 -31.236 +ATOM 5939 O HOH 715 -1.587 10.609 -49.182 +ATOM 5940 H1 HOH 715 -1.791 11.498 -49.471 +ATOM 5941 H2 HOH 715 -1.243 10.717 -48.296 +ATOM 5942 O HOH 716 -1.587 19.915 -30.570 +ATOM 5943 H1 HOH 716 -0.966 19.579 -29.923 +ATOM 5944 H2 HOH 716 -2.428 19.537 -30.314 +ATOM 5945 O HOH 717 -1.587 23.017 -27.468 +ATOM 5946 H1 HOH 717 -1.268 23.859 -27.792 +ATOM 5947 H2 HOH 717 -2.432 22.898 -27.901 +ATOM 5948 O HOH 718 -1.587 26.119 -27.468 +ATOM 5949 H1 HOH 718 -0.897 26.240 -26.815 +ATOM 5950 H2 HOH 718 -2.278 25.649 -27.002 +ATOM 5951 O HOH 719 -1.587 26.119 -24.366 +ATOM 5952 H1 HOH 719 -1.473 27.047 -24.160 +ATOM 5953 H2 HOH 719 -1.177 26.011 -25.224 +ATOM 5954 O HOH 720 -1.587 26.119 -15.060 +ATOM 5955 H1 HOH 720 -1.863 25.458 -15.694 +ATOM 5956 H2 HOH 720 -1.564 25.654 -14.223 +ATOM 5957 O HOH 721 -1.587 29.221 -18.162 +ATOM 5958 H1 HOH 721 -0.963 29.261 -18.887 +ATOM 5959 H2 HOH 721 -2.438 29.103 -18.584 +ATOM 5960 O HOH 722 -1.587 32.323 -30.570 +ATOM 5961 H1 HOH 722 -1.415 32.824 -29.772 +ATOM 5962 H2 HOH 722 -0.930 32.633 -31.194 +ATOM 5963 O HOH 723 -1.587 32.323 -27.468 +ATOM 5964 H1 HOH 723 -2.515 32.152 -27.627 +ATOM 5965 H2 HOH 723 -1.559 32.702 -26.589 +ATOM 5966 O HOH 724 -1.587 32.323 -24.366 +ATOM 5967 H1 HOH 724 -0.774 32.438 -24.858 +ATOM 5968 H2 HOH 724 -1.520 31.444 -23.993 +ATOM 5969 O HOH 725 -1.587 32.323 -18.162 +ATOM 5970 H1 HOH 725 -2.018 32.898 -18.794 +ATOM 5971 H2 HOH 725 -0.661 32.357 -18.400 +ATOM 5972 O HOH 726 -1.587 32.323 -15.060 +ATOM 5973 H1 HOH 726 -2.178 31.634 -15.362 +ATOM 5974 H2 HOH 726 -2.150 32.928 -14.577 +ATOM 5975 O HOH 727 -1.587 35.425 -46.080 +ATOM 5976 H1 HOH 727 -2.112 35.139 -45.333 +ATOM 5977 H2 HOH 727 -2.197 35.922 -46.626 +ATOM 5978 O HOH 728 -1.587 35.425 -30.570 +ATOM 5979 H1 HOH 728 -1.779 36.023 -31.292 +ATOM 5980 H2 HOH 728 -2.009 35.825 -29.809 +ATOM 5981 O HOH 729 -1.587 35.425 -27.468 +ATOM 5982 H1 HOH 729 -1.133 36.253 -27.311 +ATOM 5983 H2 HOH 729 -1.690 35.384 -28.419 +ATOM 5984 O HOH 730 -1.587 35.425 -24.366 +ATOM 5985 H1 HOH 730 -2.168 35.141 -23.660 +ATOM 5986 H2 HOH 730 -1.065 36.128 -23.979 +ATOM 5987 O HOH 731 -1.587 35.425 -15.060 +ATOM 5988 H1 HOH 731 -1.251 36.192 -14.595 +ATOM 5989 H2 HOH 731 -2.315 35.762 -15.582 +ATOM 5990 O HOH 732 -1.587 35.425 -11.958 +ATOM 5991 H1 HOH 732 -2.390 35.433 -11.436 +ATOM 5992 H2 HOH 732 -1.123 36.221 -11.696 +ATOM 5993 O HOH 733 -1.587 35.425 -8.856 +ATOM 5994 H1 HOH 733 -1.288 36.244 -9.250 +ATOM 5995 H2 HOH 733 -2.197 35.698 -8.170 +ATOM 5996 O HOH 734 -1.587 38.527 -49.182 +ATOM 5997 H1 HOH 734 -0.949 38.036 -48.665 +ATOM 5998 H2 HOH 734 -2.200 37.864 -49.499 +ATOM 5999 O HOH 735 -1.587 38.527 -46.080 +ATOM 6000 H1 HOH 735 -1.997 39.132 -46.699 +ATOM 6001 H2 HOH 735 -2.175 37.773 -46.057 +ATOM 6002 O HOH 736 -1.587 38.527 -42.978 +ATOM 6003 H1 HOH 736 -2.332 38.637 -43.569 +ATOM 6004 H2 HOH 736 -1.581 37.593 -42.770 +ATOM 6005 O HOH 737 -1.587 38.527 -39.876 +ATOM 6006 H1 HOH 737 -1.456 39.279 -40.455 +ATOM 6007 H2 HOH 737 -1.797 37.804 -40.466 +ATOM 6008 O HOH 738 -1.587 38.527 -36.774 +ATOM 6009 H1 HOH 738 -2.237 37.824 -36.762 +ATOM 6010 H2 HOH 738 -1.082 38.401 -35.971 +ATOM 6011 O HOH 739 -1.587 38.527 -33.672 +ATOM 6012 H1 HOH 739 -2.054 39.219 -34.142 +ATOM 6013 H2 HOH 739 -0.835 38.324 -34.229 +ATOM 6014 O HOH 740 -1.587 38.527 -30.570 +ATOM 6015 H1 HOH 740 -1.623 38.904 -29.691 +ATOM 6016 H2 HOH 740 -1.044 39.137 -31.070 +ATOM 6017 O HOH 741 -1.587 38.527 -27.468 +ATOM 6018 H1 HOH 741 -1.468 38.101 -26.619 +ATOM 6019 H2 HOH 741 -2.323 38.064 -27.868 +ATOM 6020 O HOH 742 -1.587 38.527 -24.366 +ATOM 6021 H1 HOH 742 -0.966 38.742 -23.670 +ATOM 6022 H2 HOH 742 -2.425 38.866 -24.052 +ATOM 6023 O HOH 743 -1.587 38.527 -21.264 +ATOM 6024 H1 HOH 743 -1.032 39.276 -21.048 +ATOM 6025 H2 HOH 743 -1.319 37.844 -20.649 +ATOM 6026 O HOH 744 -1.587 38.527 -18.162 +ATOM 6027 H1 HOH 744 -1.039 38.033 -18.772 +ATOM 6028 H2 HOH 744 -1.748 39.361 -18.605 +ATOM 6029 O HOH 745 -1.587 38.527 -15.060 +ATOM 6030 H1 HOH 745 -1.949 38.472 -15.944 +ATOM 6031 H2 HOH 745 -0.794 37.992 -15.091 +ATOM 6032 O HOH 746 -1.587 38.527 -11.958 +ATOM 6033 H1 HOH 746 -1.274 37.870 -12.580 +ATOM 6034 H2 HOH 746 -2.373 38.139 -11.573 +ATOM 6035 O HOH 747 -1.587 41.629 -49.182 +ATOM 6036 H1 HOH 747 -2.200 40.907 -49.047 +ATOM 6037 H2 HOH 747 -1.268 41.841 -48.305 +ATOM 6038 O HOH 748 -1.587 41.629 -46.080 +ATOM 6039 H1 HOH 748 -0.921 42.309 -45.974 +ATOM 6040 H2 HOH 748 -1.343 41.179 -46.889 +ATOM 6041 O HOH 749 -1.587 41.629 -42.978 +ATOM 6042 H1 HOH 749 -1.711 40.688 -42.855 +ATOM 6043 H2 HOH 749 -2.130 41.846 -43.736 +ATOM 6044 O HOH 750 -1.587 41.629 -39.876 +ATOM 6045 H1 HOH 750 -1.932 41.439 -40.748 +ATOM 6046 H2 HOH 750 -0.964 40.923 -39.705 +ATOM 6047 O HOH 751 -1.587 41.629 -36.774 +ATOM 6048 H1 HOH 751 -2.252 42.080 -36.254 +ATOM 6049 H2 HOH 751 -2.081 41.191 -37.467 +ATOM 6050 O HOH 752 -1.587 41.629 -33.672 +ATOM 6051 H1 HOH 752 -2.312 41.097 -34.000 +ATOM 6052 H2 HOH 752 -1.925 42.026 -32.869 +ATOM 6053 O HOH 753 -1.587 41.629 -30.570 +ATOM 6054 H1 HOH 753 -2.146 41.084 -30.016 +ATOM 6055 H2 HOH 753 -1.012 41.008 -31.017 +ATOM 6056 O HOH 754 -1.587 41.629 -27.468 +ATOM 6057 H1 HOH 754 -2.302 41.213 -26.988 +ATOM 6058 H2 HOH 754 -1.914 41.710 -28.364 +ATOM 6059 O HOH 755 -1.587 41.629 -24.366 +ATOM 6060 H1 HOH 755 -0.837 41.808 -24.934 +ATOM 6061 H2 HOH 755 -2.092 42.442 -24.373 +ATOM 6062 O HOH 756 -1.587 41.629 -21.264 +ATOM 6063 H1 HOH 756 -0.910 41.332 -21.872 +ATOM 6064 H2 HOH 756 -1.426 41.129 -20.464 +ATOM 6065 O HOH 757 -1.587 41.629 -18.162 +ATOM 6066 H1 HOH 757 -2.387 41.676 -18.685 +ATOM 6067 H2 HOH 757 -1.188 40.794 -18.406 +ATOM 6068 O HOH 758 -1.587 41.629 -15.060 +ATOM 6069 H1 HOH 758 -1.074 40.879 -15.359 +ATOM 6070 H2 HOH 758 -2.149 41.276 -14.371 +ATOM 6071 O HOH 759 -1.587 41.629 -11.958 +ATOM 6072 H1 HOH 759 -1.979 41.858 -11.115 +ATOM 6073 H2 HOH 759 -1.129 42.424 -12.232 +ATOM 6074 O HOH 760 -1.587 44.731 -46.080 +ATOM 6075 H1 HOH 760 -0.855 45.175 -45.653 +ATOM 6076 H2 HOH 760 -1.175 44.079 -46.647 +ATOM 6077 O HOH 761 -1.587 44.731 -42.978 +ATOM 6078 H1 HOH 761 -1.388 44.995 -43.877 +ATOM 6079 H2 HOH 761 -2.270 45.339 -42.695 +ATOM 6080 O HOH 762 -1.587 44.731 -39.876 +ATOM 6081 H1 HOH 762 -0.969 45.361 -40.248 +ATOM 6082 H2 HOH 762 -2.169 45.260 -39.331 +ATOM 6083 O HOH 763 -1.587 44.731 -36.774 +ATOM 6084 H1 HOH 763 -1.810 44.178 -36.025 +ATOM 6085 H2 HOH 763 -2.100 44.373 -37.498 +ATOM 6086 O HOH 764 -1.587 44.731 -33.672 +ATOM 6087 H1 HOH 764 -0.994 44.522 -32.951 +ATOM 6088 H2 HOH 764 -1.646 45.687 -33.664 +ATOM 6089 O HOH 765 -1.587 44.731 -30.570 +ATOM 6090 H1 HOH 765 -2.523 44.910 -30.654 +ATOM 6091 H2 HOH 765 -1.297 45.299 -29.856 +ATOM 6092 O HOH 766 -1.587 44.731 -27.468 +ATOM 6093 H1 HOH 766 -1.238 45.537 -27.849 +ATOM 6094 H2 HOH 766 -2.416 44.588 -27.925 +ATOM 6095 O HOH 767 -1.587 44.731 -24.366 +ATOM 6096 H1 HOH 767 -2.188 44.172 -24.857 +ATOM 6097 H2 HOH 767 -0.715 44.437 -24.629 +ATOM 6098 O HOH 768 -1.587 44.731 -21.264 +ATOM 6099 H1 HOH 768 -2.256 44.499 -20.621 +ATOM 6100 H2 HOH 768 -1.610 45.688 -21.299 +ATOM 6101 O HOH 769 -1.587 44.731 -18.162 +ATOM 6102 H1 HOH 769 -1.251 44.705 -17.266 +ATOM 6103 H2 HOH 769 -0.972 45.294 -18.632 +ATOM 6104 O HOH 770 -1.587 44.731 -15.060 +ATOM 6105 H1 HOH 770 -1.013 44.470 -14.340 +ATOM 6106 H2 HOH 770 -0.995 44.881 -15.797 +ATOM 6107 O HOH 771 -1.587 47.833 -39.876 +ATOM 6108 H1 HOH 771 -1.784 47.968 -38.949 +ATOM 6109 H2 HOH 771 -0.883 48.454 -40.064 +ATOM 6110 O HOH 772 -1.587 47.833 -36.774 +ATOM 6111 H1 HOH 772 -1.589 46.918 -36.496 +ATOM 6112 H2 HOH 772 -0.660 48.062 -36.841 +ATOM 6113 O HOH 773 -1.587 47.833 -33.672 +ATOM 6114 H1 HOH 773 -1.091 47.350 -33.012 +ATOM 6115 H2 HOH 773 -1.072 47.741 -34.474 +ATOM 6116 O HOH 774 -1.587 47.833 -30.570 +ATOM 6117 H1 HOH 774 -2.214 47.825 -29.847 +ATOM 6118 H2 HOH 774 -1.267 48.735 -30.600 +ATOM 6119 O HOH 775 -1.587 47.833 -27.468 +ATOM 6120 H1 HOH 775 -1.154 47.890 -26.616 +ATOM 6121 H2 HOH 775 -1.378 48.662 -27.899 +ATOM 6122 O HOH 776 -1.587 47.833 -24.366 +ATOM 6123 H1 HOH 776 -0.904 47.723 -25.027 +ATOM 6124 H2 HOH 776 -1.638 48.780 -24.230 +ATOM 6125 O HOH 777 -1.587 47.833 -21.264 +ATOM 6126 H1 HOH 777 -2.194 47.192 -20.894 +ATOM 6127 H2 HOH 777 -0.718 47.503 -21.033 +ATOM 6128 O HOH 778 1.515 4.405 -30.570 +ATOM 6129 H1 HOH 778 1.286 4.753 -29.708 +ATOM 6130 H2 HOH 778 2.471 4.443 -30.598 +ATOM 6131 O HOH 779 1.515 4.405 -24.366 +ATOM 6132 H1 HOH 779 1.059 5.135 -23.948 +ATOM 6133 H2 HOH 779 1.687 3.789 -23.653 +ATOM 6134 O HOH 780 1.515 7.507 -27.468 +ATOM 6135 H1 HOH 780 1.440 8.338 -26.999 +ATOM 6136 H2 HOH 780 0.736 7.014 -27.209 +ATOM 6137 O HOH 781 1.515 7.507 -24.366 +ATOM 6138 H1 HOH 781 1.661 7.255 -25.278 +ATOM 6139 H2 HOH 781 0.799 8.141 -24.403 +ATOM 6140 O HOH 782 1.515 16.813 -21.264 +ATOM 6141 H1 HOH 782 0.728 17.099 -21.728 +ATOM 6142 H2 HOH 782 1.801 16.030 -21.735 +ATOM 6143 O HOH 783 1.515 16.813 -18.162 +ATOM 6144 H1 HOH 783 1.131 17.238 -18.928 +ATOM 6145 H2 HOH 783 0.948 17.070 -17.435 +ATOM 6146 O HOH 784 1.515 19.915 -24.366 +ATOM 6147 H1 HOH 784 1.517 18.991 -24.115 +ATOM 6148 H2 HOH 784 0.625 20.213 -24.178 +ATOM 6149 O HOH 785 1.515 19.915 -18.162 +ATOM 6150 H1 HOH 785 0.745 20.069 -18.709 +ATOM 6151 H2 HOH 785 1.403 19.022 -17.836 +ATOM 6152 O HOH 786 1.515 23.017 -24.366 +ATOM 6153 H1 HOH 786 1.384 22.069 -24.394 +ATOM 6154 H2 HOH 786 2.310 23.164 -24.879 +ATOM 6155 O HOH 787 1.515 23.017 -21.264 +ATOM 6156 H1 HOH 787 2.170 22.923 -20.572 +ATOM 6157 H2 HOH 787 0.718 22.637 -20.893 +ATOM 6158 O HOH 788 1.515 23.017 -15.060 +ATOM 6159 H1 HOH 788 2.063 22.439 -14.529 +ATOM 6160 H2 HOH 788 0.631 22.894 -14.714 +ATOM 6161 O HOH 789 1.515 26.119 -24.366 +ATOM 6162 H1 HOH 789 1.477 27.011 -24.710 +ATOM 6163 H2 HOH 789 1.866 25.598 -25.088 +ATOM 6164 O HOH 790 1.515 26.119 -15.060 +ATOM 6165 H1 HOH 790 1.306 26.953 -14.638 +ATOM 6166 H2 HOH 790 1.941 26.366 -15.881 +ATOM 6167 O HOH 791 1.515 29.221 -24.366 +ATOM 6168 H1 HOH 791 2.280 29.583 -23.919 +ATOM 6169 H2 HOH 791 1.868 28.527 -24.923 +ATOM 6170 O HOH 792 1.515 29.221 -21.264 +ATOM 6171 H1 HOH 792 0.730 28.846 -20.866 +ATOM 6172 H2 HOH 792 1.725 28.629 -21.986 +ATOM 6173 O HOH 793 1.515 29.221 -18.162 +ATOM 6174 H1 HOH 793 0.884 28.870 -18.790 +ATOM 6175 H2 HOH 793 2.165 29.672 -18.701 +ATOM 6176 O HOH 794 1.515 32.323 -27.468 +ATOM 6177 H1 HOH 794 1.524 31.410 -27.183 +ATOM 6178 H2 HOH 794 0.640 32.637 -27.240 +ATOM 6179 O HOH 795 1.515 32.323 -24.366 +ATOM 6180 H1 HOH 795 0.762 32.410 -23.782 +ATOM 6181 H2 HOH 795 1.490 33.112 -24.908 +ATOM 6182 O HOH 796 1.515 32.323 -18.162 +ATOM 6183 H1 HOH 796 2.285 32.352 -18.730 +ATOM 6184 H2 HOH 796 1.611 31.508 -17.670 +ATOM 6185 O HOH 797 1.515 32.323 -15.060 +ATOM 6186 H1 HOH 797 0.671 31.874 -15.111 +ATOM 6187 H2 HOH 797 1.869 32.073 -14.206 +ATOM 6188 O HOH 798 1.515 32.323 -8.856 +ATOM 6189 H1 HOH 798 1.274 32.741 -9.682 +ATOM 6190 H2 HOH 798 2.095 31.606 -9.110 +ATOM 6191 O HOH 799 1.515 35.425 -46.080 +ATOM 6192 H1 HOH 799 1.809 34.558 -45.801 +ATOM 6193 H2 HOH 799 1.088 35.274 -46.923 +ATOM 6194 O HOH 800 1.515 35.425 -30.570 +ATOM 6195 H1 HOH 800 2.310 35.684 -30.104 +ATOM 6196 H2 HOH 800 1.746 35.497 -31.496 +ATOM 6197 O HOH 801 1.515 35.425 -27.468 +ATOM 6198 H1 HOH 801 2.098 35.570 -28.213 +ATOM 6199 H2 HOH 801 1.893 35.949 -26.762 +ATOM 6200 O HOH 802 1.515 35.425 -24.366 +ATOM 6201 H1 HOH 802 1.791 34.535 -24.583 +ATOM 6202 H2 HOH 802 1.643 35.920 -25.175 +ATOM 6203 O HOH 803 1.515 35.425 -18.162 +ATOM 6204 H1 HOH 803 0.809 35.008 -18.655 +ATOM 6205 H2 HOH 803 2.220 34.778 -18.160 +ATOM 6206 O HOH 804 1.515 35.425 -15.060 +ATOM 6207 H1 HOH 804 2.197 35.438 -14.388 +ATOM 6208 H2 HOH 804 1.750 34.689 -15.625 +ATOM 6209 O HOH 805 1.515 35.425 -11.958 +ATOM 6210 H1 HOH 805 1.323 34.714 -12.568 +ATOM 6211 H2 HOH 805 2.143 35.978 -12.423 +ATOM 6212 O HOH 806 1.515 35.425 -8.856 +ATOM 6213 H1 HOH 806 1.120 35.915 -9.577 +ATOM 6214 H2 HOH 806 1.768 34.589 -9.247 +ATOM 6215 O HOH 807 1.515 38.527 -49.182 +ATOM 6216 H1 HOH 807 0.911 37.924 -48.750 +ATOM 6217 H2 HOH 807 2.337 38.041 -49.245 +ATOM 6218 O HOH 808 1.515 38.527 -46.080 +ATOM 6219 H1 HOH 808 1.973 39.148 -45.513 +ATOM 6220 H2 HOH 808 0.966 39.075 -46.641 +ATOM 6221 O HOH 809 1.515 38.527 -42.978 +ATOM 6222 H1 HOH 809 1.994 37.806 -43.387 +ATOM 6223 H2 HOH 809 2.112 38.862 -42.309 +ATOM 6224 O HOH 810 1.515 38.527 -39.876 +ATOM 6225 H1 HOH 810 1.115 39.000 -40.606 +ATOM 6226 H2 HOH 810 2.295 39.038 -39.659 +ATOM 6227 O HOH 811 1.515 38.527 -36.774 +ATOM 6228 H1 HOH 811 0.652 38.158 -36.586 +ATOM 6229 H2 HOH 811 2.061 38.247 -36.039 +ATOM 6230 O HOH 812 1.515 38.527 -33.672 +ATOM 6231 H1 HOH 812 0.822 38.168 -34.226 +ATOM 6232 H2 HOH 812 1.975 39.149 -34.236 +ATOM 6233 O HOH 813 1.515 38.527 -30.570 +ATOM 6234 H1 HOH 813 0.560 38.542 -30.504 +ATOM 6235 H2 HOH 813 1.791 37.885 -29.917 +ATOM 6236 O HOH 814 1.515 38.527 -27.468 +ATOM 6237 H1 HOH 814 0.580 38.703 -27.360 +ATOM 6238 H2 HOH 814 1.645 37.666 -27.071 +ATOM 6239 O HOH 815 1.515 38.527 -24.366 +ATOM 6240 H1 HOH 815 0.945 38.414 -25.126 +ATOM 6241 H2 HOH 815 0.967 38.292 -23.617 +ATOM 6242 O HOH 816 1.515 38.527 -21.264 +ATOM 6243 H1 HOH 816 1.446 39.471 -21.118 +ATOM 6244 H2 HOH 816 0.720 38.300 -21.746 +ATOM 6245 O HOH 817 1.515 38.527 -18.162 +ATOM 6246 H1 HOH 817 2.297 38.151 -17.757 +ATOM 6247 H2 HOH 817 0.963 38.785 -17.423 +ATOM 6248 O HOH 818 1.515 38.527 -15.060 +ATOM 6249 H1 HOH 818 2.045 38.348 -15.837 +ATOM 6250 H2 HOH 818 1.281 39.452 -15.136 +ATOM 6251 O HOH 819 1.515 38.527 -11.958 +ATOM 6252 H1 HOH 819 2.168 37.828 -11.980 +ATOM 6253 H2 HOH 819 1.555 38.921 -12.829 +ATOM 6254 O HOH 820 1.515 41.629 -46.080 +ATOM 6255 H1 HOH 820 2.407 41.530 -45.747 +ATOM 6256 H2 HOH 820 0.986 41.806 -45.302 +ATOM 6257 O HOH 821 1.515 41.629 -42.978 +ATOM 6258 H1 HOH 821 2.128 42.350 -42.832 +ATOM 6259 H2 HOH 821 2.058 40.918 -43.318 +ATOM 6260 O HOH 822 1.515 41.629 -39.876 +ATOM 6261 H1 HOH 822 1.283 40.750 -39.579 +ATOM 6262 H2 HOH 822 1.779 41.512 -40.789 +ATOM 6263 O HOH 823 1.515 41.629 -36.774 +ATOM 6264 H1 HOH 823 0.838 42.301 -36.692 +ATOM 6265 H2 HOH 823 1.055 40.867 -37.125 +ATOM 6266 O HOH 824 1.515 41.629 -33.672 +ATOM 6267 H1 HOH 824 0.978 40.851 -33.818 +ATOM 6268 H2 HOH 824 2.287 41.496 -34.222 +ATOM 6269 O HOH 825 1.515 41.629 -30.570 +ATOM 6270 H1 HOH 825 1.953 40.934 -30.079 +ATOM 6271 H2 HOH 825 1.899 42.439 -30.234 +ATOM 6272 O HOH 826 1.515 41.629 -27.468 +ATOM 6273 H1 HOH 826 2.290 42.056 -27.103 +ATOM 6274 H2 HOH 826 0.942 42.352 -27.724 +ATOM 6275 O HOH 827 1.515 41.629 -24.366 +ATOM 6276 H1 HOH 827 0.787 41.978 -24.881 +ATOM 6277 H2 HOH 827 1.734 42.331 -23.753 +ATOM 6278 O HOH 828 1.515 41.629 -21.264 +ATOM 6279 H1 HOH 828 1.704 40.691 -21.248 +ATOM 6280 H2 HOH 828 0.719 41.723 -20.741 +ATOM 6281 O HOH 829 1.515 41.629 -18.162 +ATOM 6282 H1 HOH 829 1.101 41.676 -17.300 +ATOM 6283 H2 HOH 829 0.974 41.012 -18.654 +ATOM 6284 O HOH 830 1.515 41.629 -15.060 +ATOM 6285 H1 HOH 830 0.808 41.055 -14.765 +ATOM 6286 H2 HOH 830 1.088 42.470 -15.224 +ATOM 6287 O HOH 831 1.515 44.731 -42.978 +ATOM 6288 H1 HOH 831 2.054 44.927 -42.212 +ATOM 6289 H2 HOH 831 2.066 44.167 -43.521 +ATOM 6290 O HOH 832 1.515 44.731 -39.876 +ATOM 6291 H1 HOH 832 0.892 45.171 -39.298 +ATOM 6292 H2 HOH 832 1.408 43.801 -39.679 +ATOM 6293 O HOH 833 1.515 44.731 -36.774 +ATOM 6294 H1 HOH 833 2.379 44.359 -36.949 +ATOM 6295 H2 HOH 833 1.664 45.363 -36.070 +ATOM 6296 O HOH 834 1.515 44.731 -33.672 +ATOM 6297 H1 HOH 834 1.986 44.068 -34.176 +ATOM 6298 H2 HOH 834 1.709 45.555 -34.119 +ATOM 6299 O HOH 835 1.515 44.731 -30.570 +ATOM 6300 H1 HOH 835 0.865 45.169 -30.021 +ATOM 6301 H2 HOH 835 2.353 45.103 -30.293 +ATOM 6302 O HOH 836 1.515 44.731 -27.468 +ATOM 6303 H1 HOH 836 0.981 44.166 -26.910 +ATOM 6304 H2 HOH 836 1.828 45.421 -26.882 +ATOM 6305 O HOH 837 1.515 44.731 -24.366 +ATOM 6306 H1 HOH 837 1.449 45.494 -24.941 +ATOM 6307 H2 HOH 837 1.665 43.995 -24.959 +ATOM 6308 O HOH 838 1.515 44.731 -21.264 +ATOM 6309 H1 HOH 838 1.068 45.522 -20.961 +ATOM 6310 H2 HOH 838 1.213 44.615 -22.165 +ATOM 6311 O HOH 839 1.515 44.731 -18.162 +ATOM 6312 H1 HOH 839 2.156 44.204 -17.685 +ATOM 6313 H2 HOH 839 0.787 44.836 -17.549 +ATOM 6314 O HOH 840 1.515 47.833 -39.876 +ATOM 6315 H1 HOH 840 1.066 47.766 -40.719 +ATOM 6316 H2 HOH 840 2.257 47.233 -39.951 +ATOM 6317 O HOH 841 1.515 47.833 -36.774 +ATOM 6318 H1 HOH 841 0.628 47.511 -36.930 +ATOM 6319 H2 HOH 841 1.747 48.296 -37.580 +ATOM 6320 O HOH 842 1.515 47.833 -33.672 +ATOM 6321 H1 HOH 842 1.286 48.202 -32.819 +ATOM 6322 H2 HOH 842 0.860 47.152 -33.823 +ATOM 6323 O HOH 843 1.515 47.833 -30.570 +ATOM 6324 H1 HOH 843 1.054 47.220 -31.142 +ATOM 6325 H2 HOH 843 2.427 47.790 -30.857 +ATOM 6326 O HOH 844 1.515 47.833 -27.468 +ATOM 6327 H1 HOH 844 0.874 47.699 -28.166 +ATOM 6328 H2 HOH 844 1.026 47.677 -26.660 +ATOM 6329 O HOH 845 1.515 47.833 -24.366 +ATOM 6330 H1 HOH 845 1.948 48.107 -23.557 +ATOM 6331 H2 HOH 845 0.810 47.254 -24.077 +ATOM 6332 O HOH 846 1.515 47.833 -21.264 +ATOM 6333 H1 HOH 846 0.837 48.453 -20.994 +ATOM 6334 H2 HOH 846 1.626 47.255 -20.509 +ATOM 6335 O HOH 847 4.617 7.507 -27.468 +ATOM 6336 H1 HOH 847 5.259 8.180 -27.241 +ATOM 6337 H2 HOH 847 4.804 6.785 -26.867 +ATOM 6338 O HOH 848 4.617 10.609 -39.876 +ATOM 6339 H1 HOH 848 3.895 10.734 -39.261 +ATOM 6340 H2 HOH 848 5.284 10.143 -39.371 +ATOM 6341 O HOH 849 4.617 10.609 -27.468 +ATOM 6342 H1 HOH 849 5.170 11.112 -26.870 +ATOM 6343 H2 HOH 849 5.221 10.278 -28.133 +ATOM 6344 O HOH 850 4.617 13.711 -15.060 +ATOM 6345 H1 HOH 850 4.793 13.622 -15.996 +ATOM 6346 H2 HOH 850 5.279 14.329 -14.749 +ATOM 6347 O HOH 851 4.617 16.813 -24.366 +ATOM 6348 H1 HOH 851 4.060 16.314 -23.768 +ATOM 6349 H2 HOH 851 5.197 16.159 -24.756 +ATOM 6350 O HOH 852 4.617 16.813 -21.264 +ATOM 6351 H1 HOH 852 5.310 17.349 -20.879 +ATOM 6352 H2 HOH 852 4.955 16.563 -22.124 +ATOM 6353 O HOH 853 4.617 16.813 -18.162 +ATOM 6354 H1 HOH 853 4.008 16.448 -18.804 +ATOM 6355 H2 HOH 853 5.342 17.154 -18.685 +ATOM 6356 O HOH 854 4.617 16.813 -15.060 +ATOM 6357 H1 HOH 854 4.149 16.523 -14.277 +ATOM 6358 H2 HOH 854 5.530 16.888 -14.780 +ATOM 6359 O HOH 855 4.617 19.915 -24.366 +ATOM 6360 H1 HOH 855 4.302 19.271 -23.731 +ATOM 6361 H2 HOH 855 4.720 19.420 -25.179 +ATOM 6362 O HOH 856 4.617 19.915 -21.264 +ATOM 6363 H1 HOH 856 4.046 20.582 -20.884 +ATOM 6364 H2 HOH 856 5.428 20.381 -21.466 +ATOM 6365 O HOH 857 4.617 19.915 -18.162 +ATOM 6366 H1 HOH 857 5.040 20.553 -18.737 +ATOM 6367 H2 HOH 857 3.682 20.103 -18.241 +ATOM 6368 O HOH 858 4.617 19.915 -15.060 +ATOM 6369 H1 HOH 858 5.260 19.739 -15.746 +ATOM 6370 H2 HOH 858 4.918 19.399 -14.311 +ATOM 6371 O HOH 859 4.617 23.017 -52.284 +ATOM 6372 H1 HOH 859 5.144 23.507 -52.915 +ATOM 6373 H2 HOH 859 5.257 22.531 -51.764 +ATOM 6374 O HOH 860 4.617 23.017 -39.876 +ATOM 6375 H1 HOH 860 5.211 22.523 -40.441 +ATOM 6376 H2 HOH 860 3.921 23.315 -40.462 +ATOM 6377 O HOH 861 4.617 23.017 -24.366 +ATOM 6378 H1 HOH 861 5.215 23.229 -25.082 +ATOM 6379 H2 HOH 861 3.894 23.635 -24.467 +ATOM 6380 O HOH 862 4.617 23.017 -21.264 +ATOM 6381 H1 HOH 862 3.985 23.492 -20.724 +ATOM 6382 H2 HOH 862 4.435 22.093 -21.090 +ATOM 6383 O HOH 863 4.617 23.017 -18.162 +ATOM 6384 H1 HOH 863 4.035 22.261 -18.086 +ATOM 6385 H2 HOH 863 4.254 23.528 -18.885 +ATOM 6386 O HOH 864 4.617 23.017 -15.060 +ATOM 6387 H1 HOH 864 4.896 23.852 -14.685 +ATOM 6388 H2 HOH 864 5.341 22.418 -14.877 +ATOM 6389 O HOH 865 4.617 23.017 -11.958 +ATOM 6390 H1 HOH 865 3.774 23.149 -12.391 +ATOM 6391 H2 HOH 865 4.740 22.068 -11.955 +ATOM 6392 O HOH 866 4.617 23.017 -8.856 +ATOM 6393 H1 HOH 866 4.006 22.640 -8.223 +ATOM 6394 H2 HOH 866 4.583 23.959 -8.691 +ATOM 6395 O HOH 867 4.617 26.119 -46.080 +ATOM 6396 H1 HOH 867 5.150 25.368 -45.820 +ATOM 6397 H2 HOH 867 3.748 25.751 -46.243 +ATOM 6398 O HOH 868 4.617 26.119 -27.468 +ATOM 6399 H1 HOH 868 5.439 26.581 -27.302 +ATOM 6400 H2 HOH 868 4.145 26.682 -28.082 +ATOM 6401 O HOH 869 4.617 26.119 -24.366 +ATOM 6402 H1 HOH 869 3.957 26.625 -24.840 +ATOM 6403 H2 HOH 869 4.161 25.800 -23.587 +ATOM 6404 O HOH 870 4.617 26.119 -21.264 +ATOM 6405 H1 HOH 870 5.340 26.154 -20.638 +ATOM 6406 H2 HOH 870 3.997 25.500 -20.879 +ATOM 6407 O HOH 871 4.617 26.119 -18.162 +ATOM 6408 H1 HOH 871 5.121 25.542 -17.588 +ATOM 6409 H2 HOH 871 5.116 26.139 -18.979 +ATOM 6410 O HOH 872 4.617 26.119 -15.060 +ATOM 6411 H1 HOH 872 4.127 26.095 -14.238 +ATOM 6412 H2 HOH 872 3.958 26.313 -15.726 +ATOM 6413 O HOH 873 4.617 26.119 -11.958 +ATOM 6414 H1 HOH 873 4.605 26.863 -12.560 +ATOM 6415 H2 HOH 873 5.374 26.279 -11.394 +ATOM 6416 O HOH 874 4.617 26.119 -8.856 +ATOM 6417 H1 HOH 874 4.393 26.729 -9.558 +ATOM 6418 H2 HOH 874 3.788 25.956 -8.405 +ATOM 6419 O HOH 875 4.617 29.221 -52.284 +ATOM 6420 H1 HOH 875 4.654 28.869 -51.395 +ATOM 6421 H2 HOH 875 3.902 29.857 -52.262 +ATOM 6422 O HOH 876 4.617 29.221 -49.182 +ATOM 6423 H1 HOH 876 4.866 30.109 -48.925 +ATOM 6424 H2 HOH 876 5.432 28.822 -49.489 +ATOM 6425 O HOH 877 4.617 29.221 -30.570 +ATOM 6426 H1 HOH 877 5.252 28.848 -31.182 +ATOM 6427 H2 HOH 877 3.820 29.331 -31.088 +ATOM 6428 O HOH 878 4.617 29.221 -27.468 +ATOM 6429 H1 HOH 878 5.028 29.756 -26.789 +ATOM 6430 H2 HOH 878 3.779 28.955 -27.090 +ATOM 6431 O HOH 879 4.617 29.221 -24.366 +ATOM 6432 H1 HOH 879 3.958 29.890 -24.552 +ATOM 6433 H2 HOH 879 4.374 28.877 -23.506 +ATOM 6434 O HOH 880 4.617 29.221 -21.264 +ATOM 6435 H1 HOH 880 4.195 28.363 -21.301 +ATOM 6436 H2 HOH 880 5.481 29.048 -20.891 +ATOM 6437 O HOH 881 4.617 29.221 -18.162 +ATOM 6438 H1 HOH 881 4.442 29.327 -17.227 +ATOM 6439 H2 HOH 881 5.537 28.959 -18.205 +ATOM 6440 O HOH 882 4.617 29.221 -15.060 +ATOM 6441 H1 HOH 882 4.663 28.455 -15.632 +ATOM 6442 H2 HOH 882 5.451 29.220 -14.590 +ATOM 6443 O HOH 883 4.617 29.221 -11.958 +ATOM 6444 H1 HOH 883 3.981 29.820 -12.348 +ATOM 6445 H2 HOH 883 4.147 28.391 -11.876 +ATOM 6446 O HOH 884 4.617 29.221 -8.856 +ATOM 6447 H1 HOH 884 4.779 29.922 -9.486 +ATOM 6448 H2 HOH 884 4.492 29.673 -8.021 +ATOM 6449 O HOH 885 4.617 32.323 -52.284 +ATOM 6450 H1 HOH 885 3.788 32.130 -52.721 +ATOM 6451 H2 HOH 885 4.644 33.278 -52.231 +ATOM 6452 O HOH 886 4.617 32.323 -49.182 +ATOM 6453 H1 HOH 886 5.530 32.535 -48.988 +ATOM 6454 H2 HOH 886 4.297 31.894 -48.389 +ATOM 6455 O HOH 887 4.617 32.323 -46.080 +ATOM 6456 H1 HOH 887 4.488 32.197 -47.020 +ATOM 6457 H2 HOH 887 5.009 31.503 -45.780 +ATOM 6458 O HOH 888 4.617 32.323 -30.570 +ATOM 6459 H1 HOH 888 4.819 33.025 -29.951 +ATOM 6460 H2 HOH 888 4.121 31.686 -30.056 +ATOM 6461 O HOH 889 4.617 32.323 -27.468 +ATOM 6462 H1 HOH 889 5.200 32.781 -26.862 +ATOM 6463 H2 HOH 889 4.368 31.524 -27.003 +ATOM 6464 O HOH 890 4.617 32.323 -24.366 +ATOM 6465 H1 HOH 890 4.239 31.731 -25.016 +ATOM 6466 H2 HOH 890 5.502 31.988 -24.222 +ATOM 6467 O HOH 891 4.617 32.323 -21.264 +ATOM 6468 H1 HOH 891 4.348 32.136 -22.163 +ATOM 6469 H2 HOH 891 5.106 31.546 -20.993 +ATOM 6470 O HOH 892 4.617 32.323 -18.162 +ATOM 6471 H1 HOH 892 5.382 32.881 -18.017 +ATOM 6472 H2 HOH 892 3.879 32.839 -17.836 +ATOM 6473 O HOH 893 4.617 32.323 -15.060 +ATOM 6474 H1 HOH 893 4.789 31.555 -15.604 +ATOM 6475 H2 HOH 893 4.069 31.995 -14.347 +ATOM 6476 O HOH 894 4.617 32.323 -11.958 +ATOM 6477 H1 HOH 894 3.946 32.516 -12.612 +ATOM 6478 H2 HOH 894 5.346 31.960 -12.461 +ATOM 6479 O HOH 895 4.617 32.323 -8.856 +ATOM 6480 H1 HOH 895 3.883 32.645 -9.379 +ATOM 6481 H2 HOH 895 4.312 31.488 -8.501 +ATOM 6482 O HOH 896 4.617 35.425 -49.182 +ATOM 6483 H1 HOH 896 4.048 34.922 -48.600 +ATOM 6484 H2 HOH 896 4.227 35.318 -50.050 +ATOM 6485 O HOH 897 4.617 35.425 -46.080 +ATOM 6486 H1 HOH 897 5.026 34.849 -46.726 +ATOM 6487 H2 HOH 897 4.999 36.286 -46.252 +ATOM 6488 O HOH 898 4.617 35.425 -33.672 +ATOM 6489 H1 HOH 898 3.850 35.385 -34.243 +ATOM 6490 H2 HOH 898 4.292 35.813 -32.860 +ATOM 6491 O HOH 899 4.617 35.425 -30.570 +ATOM 6492 H1 HOH 899 5.010 34.932 -29.850 +ATOM 6493 H2 HOH 899 5.039 35.079 -31.356 +ATOM 6494 O HOH 900 4.617 35.425 -27.468 +ATOM 6495 H1 HOH 900 3.972 34.862 -27.041 +ATOM 6496 H2 HOH 900 4.489 35.271 -28.404 +ATOM 6497 O HOH 901 4.617 35.425 -24.366 +ATOM 6498 H1 HOH 901 4.377 34.718 -23.768 +ATOM 6499 H2 HOH 901 3.831 35.572 -24.891 +ATOM 6500 O HOH 902 4.617 35.425 -21.264 +ATOM 6501 H1 HOH 902 5.238 35.526 -21.986 +ATOM 6502 H2 HOH 902 3.757 35.426 -21.685 +ATOM 6503 O HOH 903 4.617 35.425 -18.162 +ATOM 6504 H1 HOH 903 4.821 35.064 -19.025 +ATOM 6505 H2 HOH 903 3.821 34.967 -17.892 +ATOM 6506 O HOH 904 4.617 35.425 -15.060 +ATOM 6507 H1 HOH 904 4.735 36.334 -15.337 +ATOM 6508 H2 HOH 904 5.393 35.232 -14.533 +ATOM 6509 O HOH 905 4.617 35.425 -11.958 +ATOM 6510 H1 HOH 905 4.976 35.924 -11.223 +ATOM 6511 H2 HOH 905 5.381 35.023 -12.371 +ATOM 6512 O HOH 906 4.617 38.527 -49.182 +ATOM 6513 H1 HOH 906 5.178 38.766 -49.921 +ATOM 6514 H2 HOH 906 4.058 37.828 -49.522 +ATOM 6515 O HOH 907 4.617 38.527 -46.080 +ATOM 6516 H1 HOH 907 5.429 39.010 -46.237 +ATOM 6517 H2 HOH 907 4.397 38.718 -45.169 +ATOM 6518 O HOH 908 4.617 38.527 -42.978 +ATOM 6519 H1 HOH 908 5.232 38.553 -42.245 +ATOM 6520 H2 HOH 908 3.927 37.930 -42.691 +ATOM 6521 O HOH 909 4.617 38.527 -39.876 +ATOM 6522 H1 HOH 909 4.280 37.638 -39.768 +ATOM 6523 H2 HOH 909 4.038 38.926 -40.526 +ATOM 6524 O HOH 910 4.617 38.527 -36.774 +ATOM 6525 H1 HOH 910 4.869 37.888 -37.440 +ATOM 6526 H2 HOH 910 3.780 38.207 -36.438 +ATOM 6527 O HOH 911 4.617 38.527 -33.672 +ATOM 6528 H1 HOH 911 5.175 38.397 -32.905 +ATOM 6529 H2 HOH 911 5.108 38.135 -34.394 +ATOM 6530 O HOH 912 4.617 38.527 -30.570 +ATOM 6531 H1 HOH 912 4.019 38.068 -31.160 +ATOM 6532 H2 HOH 912 4.638 37.986 -29.781 +ATOM 6533 O HOH 913 4.617 38.527 -27.468 +ATOM 6534 H1 HOH 913 4.582 38.896 -26.585 +ATOM 6535 H2 HOH 913 3.700 38.450 -27.732 +ATOM 6536 O HOH 914 4.617 38.527 -24.366 +ATOM 6537 H1 HOH 914 4.784 39.005 -25.178 +ATOM 6538 H2 HOH 914 5.484 38.250 -24.069 +ATOM 6539 O HOH 915 4.617 38.527 -21.264 +ATOM 6540 H1 HOH 915 4.116 39.065 -21.877 +ATOM 6541 H2 HOH 915 5.186 39.148 -20.809 +ATOM 6542 O HOH 916 4.617 38.527 -18.162 +ATOM 6543 H1 HOH 916 3.996 37.989 -17.672 +ATOM 6544 H2 HOH 916 4.244 39.408 -18.136 +ATOM 6545 O HOH 917 4.617 38.527 -15.060 +ATOM 6546 H1 HOH 917 5.271 38.439 -15.753 +ATOM 6547 H2 HOH 917 4.056 39.247 -15.349 +ATOM 6548 O HOH 918 4.617 38.527 -11.958 +ATOM 6549 H1 HOH 918 5.111 38.076 -12.642 +ATOM 6550 H2 HOH 918 5.287 38.888 -11.377 +ATOM 6551 O HOH 919 4.617 41.629 -46.080 +ATOM 6552 H1 HOH 919 4.560 41.592 -47.035 +ATOM 6553 H2 HOH 919 5.556 41.621 -45.896 +ATOM 6554 O HOH 920 4.617 41.629 -42.978 +ATOM 6555 H1 HOH 920 5.475 41.920 -43.288 +ATOM 6556 H2 HOH 920 4.086 42.426 -42.958 +ATOM 6557 O HOH 921 4.617 41.629 -39.876 +ATOM 6558 H1 HOH 921 5.079 41.870 -39.073 +ATOM 6559 H2 HOH 921 4.208 42.443 -40.170 +ATOM 6560 O HOH 922 4.617 41.629 -36.774 +ATOM 6561 H1 HOH 922 3.675 41.520 -36.646 +ATOM 6562 H2 HOH 922 4.987 40.766 -36.588 +ATOM 6563 O HOH 923 4.617 41.629 -33.672 +ATOM 6564 H1 HOH 923 4.256 42.268 -33.058 +ATOM 6565 H2 HOH 923 5.452 42.008 -33.949 +ATOM 6566 O HOH 924 4.617 41.629 -30.570 +ATOM 6567 H1 HOH 924 3.939 41.147 -30.098 +ATOM 6568 H2 HOH 924 4.388 41.523 -31.493 +ATOM 6569 O HOH 925 4.617 41.629 -27.468 +ATOM 6570 H1 HOH 925 5.306 41.524 -28.124 +ATOM 6571 H2 HOH 925 4.634 40.813 -26.969 +ATOM 6572 O HOH 926 4.617 41.629 -24.366 +ATOM 6573 H1 HOH 926 5.201 41.099 -24.909 +ATOM 6574 H2 HOH 926 5.156 42.368 -24.084 +ATOM 6575 O HOH 927 4.617 41.629 -21.264 +ATOM 6576 H1 HOH 927 4.360 41.136 -20.485 +ATOM 6577 H2 HOH 927 4.098 41.248 -21.972 +ATOM 6578 O HOH 928 4.617 41.629 -18.162 +ATOM 6579 H1 HOH 928 3.888 41.211 -18.618 +ATOM 6580 H2 HOH 928 5.375 41.470 -18.724 +ATOM 6581 O HOH 929 4.617 41.629 -15.060 +ATOM 6582 H1 HOH 929 5.097 41.827 -14.255 +ATOM 6583 H2 HOH 929 5.266 41.728 -15.756 +ATOM 6584 O HOH 930 4.617 44.731 -42.978 +ATOM 6585 H1 HOH 930 5.404 44.637 -43.515 +ATOM 6586 H2 HOH 930 3.935 44.274 -43.470 +ATOM 6587 O HOH 931 4.617 44.731 -39.876 +ATOM 6588 H1 HOH 931 4.469 44.014 -40.492 +ATOM 6589 H2 HOH 931 5.566 44.857 -39.878 +ATOM 6590 O HOH 932 4.617 44.731 -36.774 +ATOM 6591 H1 HOH 932 4.420 44.586 -37.699 +ATOM 6592 H2 HOH 932 3.821 44.466 -36.314 +ATOM 6593 O HOH 933 4.617 44.731 -33.672 +ATOM 6594 H1 HOH 933 5.139 44.869 -34.462 +ATOM 6595 H2 HOH 933 5.177 45.036 -32.958 +ATOM 6596 O HOH 934 4.617 44.731 -30.570 +ATOM 6597 H1 HOH 934 5.161 44.981 -31.317 +ATOM 6598 H2 HOH 934 4.192 45.545 -30.301 +ATOM 6599 O HOH 935 4.617 44.731 -27.468 +ATOM 6600 H1 HOH 935 5.469 44.565 -27.065 +ATOM 6601 H2 HOH 935 4.138 43.909 -27.365 +ATOM 6602 O HOH 936 4.617 44.731 -24.366 +ATOM 6603 H1 HOH 936 5.376 45.148 -24.774 +ATOM 6604 H2 HOH 936 4.006 44.585 -25.088 +ATOM 6605 O HOH 937 4.617 44.731 -21.264 +ATOM 6606 H1 HOH 937 5.184 45.357 -20.812 +ATOM 6607 H2 HOH 937 3.801 44.743 -20.763 +ATOM 6608 O HOH 938 4.617 44.731 -18.162 +ATOM 6609 H1 HOH 938 4.975 43.994 -18.656 +ATOM 6610 H2 HOH 938 4.918 45.507 -18.636 +ATOM 6611 O HOH 939 4.617 47.833 -36.774 +ATOM 6612 H1 HOH 939 5.013 47.672 -35.918 +ATOM 6613 H2 HOH 939 4.225 48.703 -36.697 +ATOM 6614 O HOH 940 4.617 47.833 -33.672 +ATOM 6615 H1 HOH 940 4.246 47.028 -33.313 +ATOM 6616 H2 HOH 940 4.108 48.535 -33.265 +ATOM 6617 O HOH 941 4.617 47.833 -30.570 +ATOM 6618 H1 HOH 941 4.973 48.632 -30.180 +ATOM 6619 H2 HOH 941 4.389 47.281 -29.822 +ATOM 6620 O HOH 942 4.617 47.833 -27.468 +ATOM 6621 H1 HOH 942 4.513 48.106 -26.556 +ATOM 6622 H2 HOH 942 5.302 48.407 -27.813 +ATOM 6623 O HOH 943 4.617 47.833 -24.366 +ATOM 6624 H1 HOH 943 4.907 46.924 -24.435 +ATOM 6625 H2 HOH 943 3.911 47.812 -23.720 +ATOM 6626 O HOH 944 7.719 7.507 -27.468 +ATOM 6627 H1 HOH 944 8.325 7.999 -28.022 +ATOM 6628 H2 HOH 944 8.081 6.620 -27.447 +ATOM 6629 O HOH 945 7.719 13.711 -30.570 +ATOM 6630 H1 HOH 945 7.454 14.142 -29.758 +ATOM 6631 H2 HOH 945 7.701 12.776 -30.363 +ATOM 6632 O HOH 946 7.719 13.711 -27.468 +ATOM 6633 H1 HOH 946 6.965 14.194 -27.131 +ATOM 6634 H2 HOH 946 7.418 12.804 -27.522 +ATOM 6635 O HOH 947 7.719 13.711 -15.060 +ATOM 6636 H1 HOH 947 7.766 14.409 -14.407 +ATOM 6637 H2 HOH 947 8.621 13.400 -15.143 +ATOM 6638 O HOH 948 7.719 16.813 -30.570 +ATOM 6639 H1 HOH 948 8.284 16.836 -31.342 +ATOM 6640 H2 HOH 948 7.185 17.604 -30.639 +ATOM 6641 O HOH 949 7.719 16.813 -27.468 +ATOM 6642 H1 HOH 949 7.791 17.043 -26.542 +ATOM 6643 H2 HOH 949 6.977 17.326 -27.786 +ATOM 6644 O HOH 950 7.719 16.813 -24.366 +ATOM 6645 H1 HOH 950 7.005 17.406 -24.131 +ATOM 6646 H2 HOH 950 7.566 16.606 -25.288 +ATOM 6647 O HOH 951 7.719 16.813 -21.264 +ATOM 6648 H1 HOH 951 8.594 17.114 -21.018 +ATOM 6649 H2 HOH 951 7.148 17.144 -20.571 +ATOM 6650 O HOH 952 7.719 16.813 -18.162 +ATOM 6651 H1 HOH 952 8.446 17.384 -18.409 +ATOM 6652 H2 HOH 952 7.306 17.257 -17.421 +ATOM 6653 O HOH 953 7.719 16.813 -15.060 +ATOM 6654 H1 HOH 953 7.030 16.421 -14.524 +ATOM 6655 H2 HOH 953 7.527 16.520 -15.950 +ATOM 6656 O HOH 954 7.719 16.813 -11.958 +ATOM 6657 H1 HOH 954 7.564 16.110 -11.327 +ATOM 6658 H2 HOH 954 7.157 16.597 -12.701 +ATOM 6659 O HOH 955 7.719 19.915 -36.774 +ATOM 6660 H1 HOH 955 7.504 20.846 -36.716 +ATOM 6661 H2 HOH 955 8.405 19.868 -37.441 +ATOM 6662 O HOH 956 7.719 19.915 -33.672 +ATOM 6663 H1 HOH 956 7.408 19.093 -34.052 +ATOM 6664 H2 HOH 956 6.966 20.503 -33.725 +ATOM 6665 O HOH 957 7.719 19.915 -27.468 +ATOM 6666 H1 HOH 957 8.238 20.689 -27.249 +ATOM 6667 H2 HOH 957 7.069 20.232 -28.094 +ATOM 6668 O HOH 958 7.719 19.915 -24.366 +ATOM 6669 H1 HOH 958 8.379 19.355 -24.774 +ATOM 6670 H2 HOH 958 8.162 20.294 -23.607 +ATOM 6671 O HOH 959 7.719 19.915 -21.264 +ATOM 6672 H1 HOH 959 7.211 20.664 -20.952 +ATOM 6673 H2 HOH 959 7.593 19.243 -20.594 +ATOM 6674 O HOH 960 7.719 19.915 -18.162 +ATOM 6675 H1 HOH 960 8.368 19.272 -17.875 +ATOM 6676 H2 HOH 960 7.294 19.507 -18.916 +ATOM 6677 O HOH 961 7.719 19.915 -15.060 +ATOM 6678 H1 HOH 961 8.365 20.603 -14.901 +ATOM 6679 H2 HOH 961 7.740 19.379 -14.267 +ATOM 6680 O HOH 962 7.719 19.915 -11.958 +ATOM 6681 H1 HOH 962 8.243 20.150 -12.724 +ATOM 6682 H2 HOH 962 8.119 19.108 -11.632 +ATOM 6683 O HOH 963 7.719 23.017 -49.182 +ATOM 6684 H1 HOH 963 7.168 22.977 -48.401 +ATOM 6685 H2 HOH 963 7.110 22.903 -49.912 +ATOM 6686 O HOH 964 7.719 23.017 -39.876 +ATOM 6687 H1 HOH 964 8.321 23.036 -40.621 +ATOM 6688 H2 HOH 964 7.837 22.147 -39.495 +ATOM 6689 O HOH 965 7.719 23.017 -24.366 +ATOM 6690 H1 HOH 965 6.884 22.612 -24.597 +ATOM 6691 H2 HOH 965 8.317 22.749 -25.063 +ATOM 6692 O HOH 966 7.719 23.017 -21.264 +ATOM 6693 H1 HOH 966 8.168 22.495 -20.599 +ATOM 6694 H2 HOH 966 8.369 23.663 -21.540 +ATOM 6695 O HOH 967 7.719 23.017 -18.162 +ATOM 6696 H1 HOH 967 7.101 23.186 -17.450 +ATOM 6697 H2 HOH 967 8.452 22.567 -17.741 +ATOM 6698 O HOH 968 7.719 23.017 -15.060 +ATOM 6699 H1 HOH 968 8.406 22.566 -15.551 +ATOM 6700 H2 HOH 968 8.118 23.846 -14.794 +ATOM 6701 O HOH 969 7.719 23.017 -11.958 +ATOM 6702 H1 HOH 969 8.471 22.522 -12.283 +ATOM 6703 H2 HOH 969 7.880 23.107 -11.018 +ATOM 6704 O HOH 970 7.719 26.119 -49.182 +ATOM 6705 H1 HOH 970 7.398 26.699 -49.873 +ATOM 6706 H2 HOH 970 7.252 26.401 -48.396 +ATOM 6707 O HOH 971 7.719 26.119 -46.080 +ATOM 6708 H1 HOH 971 7.573 25.440 -45.422 +ATOM 6709 H2 HOH 971 8.286 26.756 -45.646 +ATOM 6710 O HOH 972 7.719 26.119 -42.978 +ATOM 6711 H1 HOH 972 8.236 26.916 -43.094 +ATOM 6712 H2 HOH 972 7.487 26.117 -42.050 +ATOM 6713 O HOH 973 7.719 26.119 -30.570 +ATOM 6714 H1 HOH 973 7.519 27.046 -30.444 +ATOM 6715 H2 HOH 973 8.404 26.110 -31.239 +ATOM 6716 O HOH 974 7.719 26.119 -27.468 +ATOM 6717 H1 HOH 974 6.881 26.326 -27.880 +ATOM 6718 H2 HOH 974 8.364 26.615 -27.972 +ATOM 6719 O HOH 975 7.719 26.119 -24.366 +ATOM 6720 H1 HOH 975 8.600 25.753 -24.290 +ATOM 6721 H2 HOH 975 7.792 26.777 -25.057 +ATOM 6722 O HOH 976 7.719 26.119 -21.264 +ATOM 6723 H1 HOH 976 8.281 25.702 -21.917 +ATOM 6724 H2 HOH 976 8.102 26.987 -21.137 +ATOM 6725 O HOH 977 7.719 26.119 -18.162 +ATOM 6726 H1 HOH 977 7.808 26.056 -17.211 +ATOM 6727 H2 HOH 977 6.821 26.421 -18.299 +ATOM 6728 O HOH 978 7.719 26.119 -15.060 +ATOM 6729 H1 HOH 978 8.434 26.665 -15.387 +ATOM 6730 H2 HOH 978 7.319 26.640 -14.364 +ATOM 6731 O HOH 979 7.719 26.119 -11.958 +ATOM 6732 H1 HOH 979 8.449 25.562 -12.228 +ATOM 6733 H2 HOH 979 7.646 25.978 -11.014 +ATOM 6734 O HOH 980 7.719 29.221 -49.182 +ATOM 6735 H1 HOH 980 8.271 29.189 -49.964 +ATOM 6736 H2 HOH 980 8.245 29.694 -48.537 +ATOM 6737 O HOH 981 7.719 29.221 -46.080 +ATOM 6738 H1 HOH 981 8.292 29.549 -45.387 +ATOM 6739 H2 HOH 981 8.260 28.595 -46.563 +ATOM 6740 O HOH 982 7.719 29.221 -42.978 +ATOM 6741 H1 HOH 982 8.397 28.546 -43.019 +ATOM 6742 H2 HOH 982 8.083 29.957 -43.471 +ATOM 6743 O HOH 983 7.719 29.221 -30.570 +ATOM 6744 H1 HOH 983 7.012 28.668 -30.902 +ATOM 6745 H2 HOH 983 7.961 28.825 -29.733 +ATOM 6746 O HOH 984 7.719 29.221 -27.468 +ATOM 6747 H1 HOH 984 7.675 28.265 -27.478 +ATOM 6748 H2 HOH 984 8.257 29.444 -28.228 +ATOM 6749 O HOH 985 7.719 29.221 -24.366 +ATOM 6750 H1 HOH 985 7.432 30.118 -24.193 +ATOM 6751 H2 HOH 985 8.631 29.201 -24.074 +ATOM 6752 O HOH 986 7.719 29.221 -21.264 +ATOM 6753 H1 HOH 986 7.009 29.022 -21.874 +ATOM 6754 H2 HOH 986 7.849 30.166 -21.347 +ATOM 6755 O HOH 987 7.719 29.221 -18.162 +ATOM 6756 H1 HOH 987 7.705 28.596 -18.887 +ATOM 6757 H2 HOH 987 7.928 28.691 -17.392 +ATOM 6758 O HOH 988 7.719 29.221 -15.060 +ATOM 6759 H1 HOH 988 6.783 29.025 -15.033 +ATOM 6760 H2 HOH 988 7.772 30.089 -15.459 +ATOM 6761 O HOH 989 7.719 29.221 -11.958 +ATOM 6762 H1 HOH 989 6.808 29.053 -11.719 +ATOM 6763 H2 HOH 989 8.231 28.771 -11.285 +ATOM 6764 O HOH 990 7.719 32.323 -49.182 +ATOM 6765 H1 HOH 990 7.417 31.647 -48.576 +ATOM 6766 H2 HOH 990 7.882 31.855 -50.001 +ATOM 6767 O HOH 991 7.719 32.323 -46.080 +ATOM 6768 H1 HOH 991 8.442 32.504 -46.682 +ATOM 6769 H2 HOH 991 6.935 32.369 -46.627 +ATOM 6770 O HOH 992 7.719 32.323 -42.978 +ATOM 6771 H1 HOH 992 7.255 31.544 -43.283 +ATOM 6772 H2 HOH 992 8.054 32.081 -42.115 +ATOM 6773 O HOH 993 7.719 32.323 -39.876 +ATOM 6774 H1 HOH 993 7.117 32.736 -40.495 +ATOM 6775 H2 HOH 993 7.413 31.419 -39.810 +ATOM 6776 O HOH 994 7.719 32.323 -36.774 +ATOM 6777 H1 HOH 994 8.386 31.687 -37.033 +ATOM 6778 H2 HOH 994 7.807 33.035 -37.408 +ATOM 6779 O HOH 995 7.719 32.323 -33.672 +ATOM 6780 H1 HOH 995 7.627 32.847 -34.468 +ATOM 6781 H2 HOH 995 7.225 32.805 -33.008 +ATOM 6782 O HOH 996 7.719 32.323 -30.570 +ATOM 6783 H1 HOH 996 8.245 32.651 -31.299 +ATOM 6784 H2 HOH 996 8.061 31.445 -30.404 +ATOM 6785 O HOH 997 7.719 32.323 -27.468 +ATOM 6786 H1 HOH 997 7.325 31.672 -26.888 +ATOM 6787 H2 HOH 997 7.085 32.428 -28.177 +ATOM 6788 O HOH 998 7.719 32.323 -24.366 +ATOM 6789 H1 HOH 998 7.965 32.646 -23.499 +ATOM 6790 H2 HOH 998 6.852 32.696 -24.524 +ATOM 6791 O HOH 999 7.719 32.323 -21.264 +ATOM 6792 H1 HOH 999 7.317 32.845 -21.957 +ATOM 6793 H2 HOH 999 8.661 32.440 -21.392 +ATOM 6794 O HOH 1000 7.719 32.323 -18.162 +ATOM 6795 H1 HOH 1000 7.113 33.061 -18.102 +ATOM 6796 H2 HOH 1000 8.338 32.461 -17.444 +ATOM 6797 O HOH 1001 7.719 32.323 -15.060 +ATOM 6798 H1 HOH 1001 7.168 31.902 -14.400 +ATOM 6799 H2 HOH 1001 7.797 31.673 -15.758 +ATOM 6800 O HOH 1002 7.719 32.323 -11.958 +ATOM 6801 H1 HOH 1002 7.391 31.692 -11.317 +ATOM 6802 H2 HOH 1002 8.559 32.613 -11.600 +ATOM 6803 O HOH 1003 7.719 35.425 -49.182 +ATOM 6804 H1 HOH 1003 7.836 36.369 -49.289 +ATOM 6805 H2 HOH 1003 8.182 35.041 -49.927 +ATOM 6806 O HOH 1004 7.719 35.425 -46.080 +ATOM 6807 H1 HOH 1004 8.264 36.003 -46.615 +ATOM 6808 H2 HOH 1004 7.782 34.572 -46.509 +ATOM 6809 O HOH 1005 7.719 35.425 -42.978 +ATOM 6810 H1 HOH 1005 8.073 36.008 -43.651 +ATOM 6811 H2 HOH 1005 7.586 35.990 -42.217 +ATOM 6812 O HOH 1006 7.719 35.425 -39.876 +ATOM 6813 H1 HOH 1006 7.673 35.319 -38.926 +ATOM 6814 H2 HOH 1006 7.428 36.324 -40.031 +ATOM 6815 O HOH 1007 7.719 35.425 -36.774 +ATOM 6816 H1 HOH 1007 8.473 35.993 -36.613 +ATOM 6817 H2 HOH 1007 7.000 35.841 -36.298 +ATOM 6818 O HOH 1008 7.719 35.425 -33.672 +ATOM 6819 H1 HOH 1008 7.792 36.367 -33.828 +ATOM 6820 H2 HOH 1008 7.440 35.354 -32.759 +ATOM 6821 O HOH 1009 7.719 35.425 -30.570 +ATOM 6822 H1 HOH 1009 8.191 36.155 -30.971 +ATOM 6823 H2 HOH 1009 7.385 35.779 -29.746 +ATOM 6824 O HOH 1010 7.719 35.425 -27.468 +ATOM 6825 H1 HOH 1010 7.154 35.898 -26.857 +ATOM 6826 H2 HOH 1010 8.330 34.947 -26.908 +ATOM 6827 O HOH 1011 7.719 35.425 -24.366 +ATOM 6828 H1 HOH 1011 6.986 36.039 -24.406 +ATOM 6829 H2 HOH 1011 7.345 34.630 -23.987 +ATOM 6830 O HOH 1012 7.719 35.425 -21.264 +ATOM 6831 H1 HOH 1012 7.916 36.102 -20.616 +ATOM 6832 H2 HOH 1012 6.911 35.020 -20.949 +ATOM 6833 O HOH 1013 7.719 35.425 -18.162 +ATOM 6834 H1 HOH 1013 8.246 35.858 -18.834 +ATOM 6835 H2 HOH 1013 8.352 34.926 -17.645 +ATOM 6836 O HOH 1014 7.719 35.425 -15.060 +ATOM 6837 H1 HOH 1014 6.850 35.727 -14.797 +ATOM 6838 H2 HOH 1014 8.286 36.186 -14.931 +ATOM 6839 O HOH 1015 7.719 35.425 -11.958 +ATOM 6840 H1 HOH 1015 7.314 34.637 -12.319 +ATOM 6841 H2 HOH 1015 8.023 35.911 -12.724 +ATOM 6842 O HOH 1016 7.719 38.527 -46.080 +ATOM 6843 H1 HOH 1016 7.840 38.832 -45.181 +ATOM 6844 H2 HOH 1016 7.935 37.595 -46.049 +ATOM 6845 O HOH 1017 7.719 38.527 -42.978 +ATOM 6846 H1 HOH 1017 7.462 38.486 -43.899 +ATOM 6847 H2 HOH 1017 6.893 38.605 -42.501 +ATOM 6848 O HOH 1018 7.719 38.527 -39.876 +ATOM 6849 H1 HOH 1018 8.395 38.088 -40.392 +ATOM 6850 H2 HOH 1018 8.202 38.988 -39.190 +ATOM 6851 O HOH 1019 7.719 38.527 -36.774 +ATOM 6852 H1 HOH 1019 7.564 37.632 -36.474 +ATOM 6853 H2 HOH 1019 7.029 38.688 -37.418 +ATOM 6854 O HOH 1020 7.719 38.527 -33.672 +ATOM 6855 H1 HOH 1020 8.566 38.925 -33.471 +ATOM 6856 H2 HOH 1020 7.083 39.068 -33.204 +ATOM 6857 O HOH 1021 7.719 38.527 -30.570 +ATOM 6858 H1 HOH 1021 8.376 38.001 -31.026 +ATOM 6859 H2 HOH 1021 7.244 37.900 -30.026 +ATOM 6860 O HOH 1022 7.719 38.527 -27.468 +ATOM 6861 H1 HOH 1022 7.685 39.462 -27.264 +ATOM 6862 H2 HOH 1022 8.570 38.240 -27.135 +ATOM 6863 O HOH 1023 7.719 38.527 -24.366 +ATOM 6864 H1 HOH 1023 8.275 37.819 -24.691 +ATOM 6865 H2 HOH 1023 6.893 38.418 -24.836 +ATOM 6866 O HOH 1024 7.719 38.527 -21.264 +ATOM 6867 H1 HOH 1024 8.094 39.005 -20.523 +ATOM 6868 H2 HOH 1024 6.859 38.925 -21.395 +ATOM 6869 O HOH 1025 7.719 38.527 -18.162 +ATOM 6870 H1 HOH 1025 7.741 37.820 -18.807 +ATOM 6871 H2 HOH 1025 8.582 38.501 -17.749 +ATOM 6872 O HOH 1026 7.719 38.527 -15.060 +ATOM 6873 H1 HOH 1026 7.323 37.687 -14.830 +ATOM 6874 H2 HOH 1026 6.992 39.054 -15.390 +ATOM 6875 O HOH 1027 7.719 41.629 -42.978 +ATOM 6876 H1 HOH 1027 7.699 40.939 -42.315 +ATOM 6877 H2 HOH 1027 7.316 42.385 -42.551 +ATOM 6878 O HOH 1028 7.719 41.629 -39.876 +ATOM 6879 H1 HOH 1028 7.115 42.346 -40.070 +ATOM 6880 H2 HOH 1028 8.355 41.651 -40.592 +ATOM 6881 O HOH 1029 7.719 41.629 -36.774 +ATOM 6882 H1 HOH 1029 8.535 41.136 -36.863 +ATOM 6883 H2 HOH 1029 7.646 41.805 -35.836 +ATOM 6884 O HOH 1030 7.719 41.629 -33.672 +ATOM 6885 H1 HOH 1030 7.307 40.876 -33.250 +ATOM 6886 H2 HOH 1030 6.989 42.200 -33.911 +ATOM 6887 O HOH 1031 7.719 41.629 -30.570 +ATOM 6888 H1 HOH 1031 8.019 42.266 -29.921 +ATOM 6889 H2 HOH 1031 6.894 41.297 -30.217 +ATOM 6890 O HOH 1032 7.719 41.629 -27.468 +ATOM 6891 H1 HOH 1032 6.835 41.976 -27.589 +ATOM 6892 H2 HOH 1032 7.591 40.800 -27.007 +ATOM 6893 O HOH 1033 7.719 41.629 -24.366 +ATOM 6894 H1 HOH 1033 7.352 41.716 -25.246 +ATOM 6895 H2 HOH 1033 7.278 42.308 -23.854 +ATOM 6896 O HOH 1034 7.719 41.629 -21.264 +ATOM 6897 H1 HOH 1034 8.097 42.503 -21.363 +ATOM 6898 H2 HOH 1034 7.024 41.741 -20.616 +ATOM 6899 O HOH 1035 7.719 41.629 -18.162 +ATOM 6900 H1 HOH 1035 7.157 42.202 -18.684 +ATOM 6901 H2 HOH 1035 7.190 41.406 -17.396 +ATOM 6902 O HOH 1036 7.719 44.731 -39.876 +ATOM 6903 H1 HOH 1036 7.692 45.003 -40.794 +ATOM 6904 H2 HOH 1036 6.800 44.658 -39.620 +ATOM 6905 O HOH 1037 7.719 44.731 -36.774 +ATOM 6906 H1 HOH 1037 7.819 44.381 -37.659 +ATOM 6907 H2 HOH 1037 7.697 43.958 -36.211 +ATOM 6908 O HOH 1038 7.719 44.731 -33.672 +ATOM 6909 H1 HOH 1038 7.875 45.388 -34.351 +ATOM 6910 H2 HOH 1038 6.867 44.964 -33.304 +ATOM 6911 O HOH 1039 7.719 44.731 -30.570 +ATOM 6912 H1 HOH 1039 8.062 45.281 -29.866 +ATOM 6913 H2 HOH 1039 8.060 45.128 -31.372 +ATOM 6914 O HOH 1040 7.719 44.731 -27.468 +ATOM 6915 H1 HOH 1040 7.069 44.480 -28.124 +ATOM 6916 H2 HOH 1040 7.850 43.940 -26.945 +ATOM 6917 O HOH 1041 7.719 44.731 -24.366 +ATOM 6918 H1 HOH 1041 6.961 45.295 -24.212 +ATOM 6919 H2 HOH 1041 8.040 44.991 -25.230 +ATOM 6920 O HOH 1042 7.719 44.731 -21.264 +ATOM 6921 H1 HOH 1042 6.895 44.272 -21.422 +ATOM 6922 H2 HOH 1042 7.933 44.534 -20.352 +ATOM 6923 O HOH 1043 10.821 7.507 -27.468 +ATOM 6924 H1 HOH 1043 10.077 7.698 -26.897 +ATOM 6925 H2 HOH 1043 11.564 7.940 -27.047 +ATOM 6926 O HOH 1044 10.821 10.609 -27.468 +ATOM 6927 H1 HOH 1044 11.620 10.459 -26.962 +ATOM 6928 H2 HOH 1044 10.278 11.158 -26.902 +ATOM 6929 O HOH 1045 10.821 10.609 -24.366 +ATOM 6930 H1 HOH 1045 10.515 11.516 -24.368 +ATOM 6931 H2 HOH 1045 10.205 10.148 -23.796 +ATOM 6932 O HOH 1046 10.821 10.609 -21.264 +ATOM 6933 H1 HOH 1046 9.931 10.566 -20.915 +ATOM 6934 H2 HOH 1046 11.276 11.222 -20.686 +ATOM 6935 O HOH 1047 10.821 13.711 -27.468 +ATOM 6936 H1 HOH 1047 11.461 14.213 -27.972 +ATOM 6937 H2 HOH 1047 11.348 13.203 -26.850 +ATOM 6938 O HOH 1048 10.821 13.711 -24.366 +ATOM 6939 H1 HOH 1048 11.316 14.512 -24.196 +ATOM 6940 H2 HOH 1048 11.369 13.011 -24.010 +ATOM 6941 O HOH 1049 10.821 13.711 -21.264 +ATOM 6942 H1 HOH 1049 11.370 14.295 -21.788 +ATOM 6943 H2 HOH 1049 11.093 12.830 -21.523 +ATOM 6944 O HOH 1050 10.821 13.711 -18.162 +ATOM 6945 H1 HOH 1050 10.967 12.828 -17.821 +ATOM 6946 H2 HOH 1050 10.481 14.203 -17.415 +ATOM 6947 O HOH 1051 10.821 16.813 -27.468 +ATOM 6948 H1 HOH 1051 10.048 17.343 -27.274 +ATOM 6949 H2 HOH 1051 11.282 16.744 -26.632 +ATOM 6950 O HOH 1052 10.821 16.813 -24.366 +ATOM 6951 H1 HOH 1052 11.135 17.712 -24.463 +ATOM 6952 H2 HOH 1052 10.773 16.677 -23.420 +ATOM 6953 O HOH 1053 10.821 16.813 -21.264 +ATOM 6954 H1 HOH 1053 10.241 17.007 -20.527 +ATOM 6955 H2 HOH 1053 10.555 17.427 -21.948 +ATOM 6956 O HOH 1054 10.821 16.813 -18.162 +ATOM 6957 H1 HOH 1054 10.255 16.748 -18.930 +ATOM 6958 H2 HOH 1054 10.729 15.967 -17.724 +ATOM 6959 O HOH 1055 10.821 16.813 -15.060 +ATOM 6960 H1 HOH 1055 10.491 16.235 -14.372 +ATOM 6961 H2 HOH 1055 10.853 17.678 -14.652 +ATOM 6962 O HOH 1056 10.821 19.915 -42.978 +ATOM 6963 H1 HOH 1056 9.943 20.063 -43.329 +ATOM 6964 H2 HOH 1056 10.677 19.671 -42.064 +ATOM 6965 O HOH 1057 10.821 19.915 -36.774 +ATOM 6966 H1 HOH 1057 11.338 19.109 -36.773 +ATOM 6967 H2 HOH 1057 10.867 20.231 -35.872 +ATOM 6968 O HOH 1058 10.821 19.915 -33.672 +ATOM 6969 H1 HOH 1058 10.404 20.611 -34.179 +ATOM 6970 H2 HOH 1058 11.594 19.675 -34.184 +ATOM 6971 O HOH 1059 10.821 19.915 -30.570 +ATOM 6972 H1 HOH 1059 11.758 19.815 -30.399 +ATOM 6973 H2 HOH 1059 10.598 19.166 -31.123 +ATOM 6974 O HOH 1060 10.821 19.915 -27.468 +ATOM 6975 H1 HOH 1060 10.996 20.565 -28.149 +ATOM 6976 H2 HOH 1060 11.298 19.135 -27.753 +ATOM 6977 O HOH 1061 10.821 19.915 -24.366 +ATOM 6978 H1 HOH 1061 11.413 19.163 -24.376 +ATOM 6979 H2 HOH 1061 10.630 20.082 -25.289 +ATOM 6980 O HOH 1062 10.821 19.915 -21.264 +ATOM 6981 H1 HOH 1062 11.303 19.233 -21.733 +ATOM 6982 H2 HOH 1062 10.567 20.540 -21.943 +ATOM 6983 O HOH 1063 10.821 19.915 -18.162 +ATOM 6984 H1 HOH 1063 10.055 19.964 -17.590 +ATOM 6985 H2 HOH 1063 10.599 20.470 -18.909 +ATOM 6986 O HOH 1064 10.821 19.915 -15.060 +ATOM 6987 H1 HOH 1064 11.382 20.662 -15.267 +ATOM 6988 H2 HOH 1064 11.342 19.384 -14.457 +ATOM 6989 O HOH 1065 10.821 23.017 -49.182 +ATOM 6990 H1 HOH 1065 10.600 23.845 -48.756 +ATOM 6991 H2 HOH 1065 11.178 23.273 -50.033 +ATOM 6992 O HOH 1066 10.821 23.017 -46.080 +ATOM 6993 H1 HOH 1066 10.249 22.819 -45.339 +ATOM 6994 H2 HOH 1066 10.791 22.230 -46.624 +ATOM 6995 O HOH 1067 10.821 23.017 -42.978 +ATOM 6996 H1 HOH 1067 11.459 22.461 -43.426 +ATOM 6997 H2 HOH 1067 10.028 22.947 -43.509 +ATOM 6998 O HOH 1068 10.821 23.017 -39.876 +ATOM 6999 H1 HOH 1068 11.399 23.589 -39.372 +ATOM 7000 H2 HOH 1068 9.941 23.236 -39.571 +ATOM 7001 O HOH 1069 10.821 23.017 -36.774 +ATOM 7002 H1 HOH 1069 11.536 23.490 -37.200 +ATOM 7003 H2 HOH 1069 10.245 22.756 -37.493 +ATOM 7004 O HOH 1070 10.821 23.017 -33.672 +ATOM 7005 H1 HOH 1070 10.342 23.598 -34.262 +ATOM 7006 H2 HOH 1070 11.523 22.654 -34.212 +ATOM 7007 O HOH 1071 10.821 23.017 -30.570 +ATOM 7008 H1 HOH 1071 10.347 22.224 -30.819 +ATOM 7009 H2 HOH 1071 10.588 23.159 -29.653 +ATOM 7010 O HOH 1072 10.821 23.017 -27.468 +ATOM 7011 H1 HOH 1072 10.269 22.896 -28.240 +ATOM 7012 H2 HOH 1072 11.491 22.338 -27.544 +ATOM 7013 O HOH 1073 10.821 23.017 -24.366 +ATOM 7014 H1 HOH 1073 11.007 22.581 -25.198 +ATOM 7015 H2 HOH 1073 10.777 22.305 -23.727 +ATOM 7016 O HOH 1074 10.821 23.017 -21.264 +ATOM 7017 H1 HOH 1074 10.048 23.576 -21.345 +ATOM 7018 H2 HOH 1074 10.815 22.482 -22.057 +ATOM 7019 O HOH 1075 10.821 23.017 -18.162 +ATOM 7020 H1 HOH 1075 11.492 23.109 -17.485 +ATOM 7021 H2 HOH 1075 11.187 23.465 -18.925 +ATOM 7022 O HOH 1076 10.821 23.017 -15.060 +ATOM 7023 H1 HOH 1076 11.001 22.154 -14.686 +ATOM 7024 H2 HOH 1076 11.339 23.622 -14.528 +ATOM 7025 O HOH 1077 10.821 23.017 -11.958 +ATOM 7026 H1 HOH 1077 10.421 23.621 -12.583 +ATOM 7027 H2 HOH 1077 10.118 22.806 -11.344 +ATOM 7028 O HOH 1078 10.821 26.119 -49.182 +ATOM 7029 H1 HOH 1078 11.522 26.650 -49.561 +ATOM 7030 H2 HOH 1078 10.438 26.675 -48.505 +ATOM 7031 O HOH 1079 10.821 26.119 -46.080 +ATOM 7032 H1 HOH 1079 10.673 25.198 -46.295 +ATOM 7033 H2 HOH 1079 10.032 26.567 -46.385 +ATOM 7034 O HOH 1080 10.821 26.119 -42.978 +ATOM 7035 H1 HOH 1080 10.012 25.682 -43.243 +ATOM 7036 H2 HOH 1080 10.991 26.753 -43.675 +ATOM 7037 O HOH 1081 10.821 26.119 -39.876 +ATOM 7038 H1 HOH 1081 11.457 26.732 -40.246 +ATOM 7039 H2 HOH 1081 10.388 26.613 -39.180 +ATOM 7040 O HOH 1082 10.821 26.119 -36.774 +ATOM 7041 H1 HOH 1082 11.401 25.958 -37.519 +ATOM 7042 H2 HOH 1082 10.263 26.843 -37.057 +ATOM 7043 O HOH 1083 10.821 26.119 -33.672 +ATOM 7044 H1 HOH 1083 11.037 26.175 -32.741 +ATOM 7045 H2 HOH 1083 11.562 26.533 -34.115 +ATOM 7046 O HOH 1084 10.821 26.119 -30.570 +ATOM 7047 H1 HOH 1084 10.561 25.612 -31.339 +ATOM 7048 H2 HOH 1084 11.772 26.203 -30.648 +ATOM 7049 O HOH 1085 10.821 26.119 -27.468 +ATOM 7050 H1 HOH 1085 10.757 26.881 -26.893 +ATOM 7051 H2 HOH 1085 10.865 26.487 -28.351 +ATOM 7052 O HOH 1086 10.821 26.119 -24.366 +ATOM 7053 H1 HOH 1086 10.083 25.961 -24.954 +ATOM 7054 H2 HOH 1086 10.475 26.715 -23.701 +ATOM 7055 O HOH 1087 10.821 26.119 -21.264 +ATOM 7056 H1 HOH 1087 11.688 26.018 -20.870 +ATOM 7057 H2 HOH 1087 10.601 27.040 -21.127 +ATOM 7058 O HOH 1088 10.821 26.119 -18.162 +ATOM 7059 H1 HOH 1088 11.120 26.754 -17.510 +ATOM 7060 H2 HOH 1088 10.378 25.442 -17.651 +ATOM 7061 O HOH 1089 10.821 26.119 -15.060 +ATOM 7062 H1 HOH 1089 10.724 25.423 -15.709 +ATOM 7063 H2 HOH 1089 11.721 26.425 -15.170 +ATOM 7064 O HOH 1090 10.821 26.119 -11.958 +ATOM 7065 H1 HOH 1090 10.957 27.017 -11.654 +ATOM 7066 H2 HOH 1090 11.122 25.573 -11.231 +ATOM 7067 O HOH 1091 10.821 29.221 -49.182 +ATOM 7068 H1 HOH 1091 10.717 28.677 -48.402 +ATOM 7069 H2 HOH 1091 10.104 29.853 -49.132 +ATOM 7070 O HOH 1092 10.821 29.221 -46.080 +ATOM 7071 H1 HOH 1092 10.458 28.860 -46.889 +ATOM 7072 H2 HOH 1092 10.255 28.878 -45.389 +ATOM 7073 O HOH 1093 10.821 29.221 -42.978 +ATOM 7074 H1 HOH 1093 10.988 29.665 -42.147 +ATOM 7075 H2 HOH 1093 11.664 28.834 -43.217 +ATOM 7076 O HOH 1094 10.821 29.221 -39.876 +ATOM 7077 H1 HOH 1094 10.008 29.703 -40.025 +ATOM 7078 H2 HOH 1094 11.399 29.852 -39.447 +ATOM 7079 O HOH 1095 10.821 29.221 -36.774 +ATOM 7080 H1 HOH 1095 10.237 29.911 -37.089 +ATOM 7081 H2 HOH 1095 11.485 29.137 -37.459 +ATOM 7082 O HOH 1096 10.821 29.221 -33.672 +ATOM 7083 H1 HOH 1096 10.113 29.330 -33.037 +ATOM 7084 H2 HOH 1096 11.202 30.095 -33.759 +ATOM 7085 O HOH 1097 10.821 29.221 -30.570 +ATOM 7086 H1 HOH 1097 11.039 28.411 -30.109 +ATOM 7087 H2 HOH 1097 11.245 29.910 -30.057 +ATOM 7088 O HOH 1098 10.821 29.221 -27.468 +ATOM 7089 H1 HOH 1098 10.197 28.527 -27.680 +ATOM 7090 H2 HOH 1098 11.458 29.197 -28.182 +ATOM 7091 O HOH 1099 10.821 29.221 -24.366 +ATOM 7092 H1 HOH 1099 10.363 29.836 -24.938 +ATOM 7093 H2 HOH 1099 10.346 28.397 -24.469 +ATOM 7094 O HOH 1100 10.821 29.221 -21.264 +ATOM 7095 H1 HOH 1100 11.058 29.882 -20.614 +ATOM 7096 H2 HOH 1100 11.632 29.056 -21.745 +ATOM 7097 O HOH 1101 10.821 29.221 -18.162 +ATOM 7098 H1 HOH 1101 10.695 28.885 -17.275 +ATOM 7099 H2 HOH 1101 11.078 30.135 -18.037 +ATOM 7100 O HOH 1102 10.821 29.221 -15.060 +ATOM 7101 H1 HOH 1102 11.146 29.863 -15.691 +ATOM 7102 H2 HOH 1102 11.592 28.705 -14.823 +ATOM 7103 O HOH 1103 10.821 29.221 -11.958 +ATOM 7104 H1 HOH 1103 10.195 28.709 -12.470 +ATOM 7105 H2 HOH 1103 11.042 29.963 -12.521 +ATOM 7106 O HOH 1104 10.821 32.323 -46.080 +ATOM 7107 H1 HOH 1104 10.154 32.437 -45.404 +ATOM 7108 H2 HOH 1104 10.334 32.041 -46.854 +ATOM 7109 O HOH 1105 10.821 32.323 -42.978 +ATOM 7110 H1 HOH 1105 10.537 31.432 -42.775 +ATOM 7111 H2 HOH 1105 11.547 32.209 -43.592 +ATOM 7112 O HOH 1106 10.821 32.323 -39.876 +ATOM 7113 H1 HOH 1106 11.666 32.206 -40.312 +ATOM 7114 H2 HOH 1106 10.865 33.202 -39.501 +ATOM 7115 O HOH 1107 10.821 32.323 -36.774 +ATOM 7116 H1 HOH 1107 10.069 32.044 -37.297 +ATOM 7117 H2 HOH 1107 10.442 32.625 -35.949 +ATOM 7118 O HOH 1108 10.821 32.323 -33.672 +ATOM 7119 H1 HOH 1108 11.596 32.877 -33.571 +ATOM 7120 H2 HOH 1108 10.898 31.673 -32.973 +ATOM 7121 O HOH 1109 10.821 32.323 -30.570 +ATOM 7122 H1 HOH 1109 9.897 32.298 -30.817 +ATOM 7123 H2 HOH 1109 10.964 31.507 -30.091 +ATOM 7124 O HOH 1110 10.821 32.323 -27.468 +ATOM 7125 H1 HOH 1110 10.613 31.963 -26.606 +ATOM 7126 H2 HOH 1110 11.451 31.705 -27.840 +ATOM 7127 O HOH 1111 10.821 32.323 -24.366 +ATOM 7128 H1 HOH 1111 10.176 31.884 -23.812 +ATOM 7129 H2 HOH 1111 11.257 31.613 -24.837 +ATOM 7130 O HOH 1112 10.821 32.323 -21.264 +ATOM 7131 H1 HOH 1112 10.707 31.584 -21.861 +ATOM 7132 H2 HOH 1112 9.931 32.574 -21.019 +ATOM 7133 O HOH 1113 10.821 32.323 -18.162 +ATOM 7134 H1 HOH 1113 10.211 32.675 -17.513 +ATOM 7135 H2 HOH 1113 10.995 31.429 -17.867 +ATOM 7136 O HOH 1114 10.821 32.323 -15.060 +ATOM 7137 H1 HOH 1114 11.757 32.514 -14.996 +ATOM 7138 H2 HOH 1114 10.622 32.410 -15.992 +ATOM 7139 O HOH 1115 10.821 35.425 -46.080 +ATOM 7140 H1 HOH 1115 10.867 34.571 -45.650 +ATOM 7141 H2 HOH 1115 11.539 35.414 -46.714 +ATOM 7142 O HOH 1116 10.821 35.425 -42.978 +ATOM 7143 H1 HOH 1116 9.894 35.657 -42.920 +ATOM 7144 H2 HOH 1116 11.270 36.260 -43.115 +ATOM 7145 O HOH 1117 10.821 35.425 -39.876 +ATOM 7146 H1 HOH 1117 11.627 34.911 -39.930 +ATOM 7147 H2 HOH 1117 11.119 36.322 -39.722 +ATOM 7148 O HOH 1118 10.821 35.425 -36.774 +ATOM 7149 H1 HOH 1118 11.625 35.937 -36.864 +ATOM 7150 H2 HOH 1118 10.546 35.566 -35.868 +ATOM 7151 O HOH 1119 10.821 35.425 -33.672 +ATOM 7152 H1 HOH 1119 11.127 35.781 -32.838 +ATOM 7153 H2 HOH 1119 9.948 35.800 -33.787 +ATOM 7154 O HOH 1120 10.821 35.425 -30.570 +ATOM 7155 H1 HOH 1120 10.762 36.147 -31.196 +ATOM 7156 H2 HOH 1120 11.303 34.742 -31.036 +ATOM 7157 O HOH 1121 10.821 35.425 -27.468 +ATOM 7158 H1 HOH 1121 10.463 34.745 -28.038 +ATOM 7159 H2 HOH 1121 10.661 35.104 -26.581 +ATOM 7160 O HOH 1122 10.821 35.425 -24.366 +ATOM 7161 H1 HOH 1122 11.565 35.306 -23.775 +ATOM 7162 H2 HOH 1122 10.273 36.079 -23.933 +ATOM 7163 O HOH 1123 10.821 35.425 -21.264 +ATOM 7164 H1 HOH 1123 11.179 35.587 -20.391 +ATOM 7165 H2 HOH 1123 9.916 35.731 -21.213 +ATOM 7166 O HOH 1124 10.821 35.425 -18.162 +ATOM 7167 H1 HOH 1124 11.096 35.432 -19.079 +ATOM 7168 H2 HOH 1124 11.192 36.227 -17.794 +ATOM 7169 O HOH 1125 10.821 35.425 -15.060 +ATOM 7170 H1 HOH 1125 11.280 36.185 -14.702 +ATOM 7171 H2 HOH 1125 11.513 34.887 -15.444 +ATOM 7172 O HOH 1126 10.821 38.527 -42.978 +ATOM 7173 H1 HOH 1126 10.349 38.230 -43.756 +ATOM 7174 H2 HOH 1126 11.587 37.956 -42.929 +ATOM 7175 O HOH 1127 10.821 38.527 -39.876 +ATOM 7176 H1 HOH 1127 11.147 37.878 -40.500 +ATOM 7177 H2 HOH 1127 10.328 38.017 -39.235 +ATOM 7178 O HOH 1128 10.821 38.527 -36.774 +ATOM 7179 H1 HOH 1128 11.329 39.010 -36.122 +ATOM 7180 H2 HOH 1128 10.442 39.205 -37.333 +ATOM 7181 O HOH 1129 10.821 38.527 -33.672 +ATOM 7182 H1 HOH 1129 11.219 38.497 -34.542 +ATOM 7183 H2 HOH 1129 11.496 38.911 -33.112 +ATOM 7184 O HOH 1130 10.821 38.527 -30.570 +ATOM 7185 H1 HOH 1130 10.784 37.951 -31.334 +ATOM 7186 H2 HOH 1130 10.329 38.062 -29.894 +ATOM 7187 O HOH 1131 10.821 38.527 -27.468 +ATOM 7188 H1 HOH 1131 10.948 38.885 -26.589 +ATOM 7189 H2 HOH 1131 11.493 38.954 -28.000 +ATOM 7190 O HOH 1132 10.821 38.527 -24.366 +ATOM 7191 H1 HOH 1132 11.357 38.292 -25.123 +ATOM 7192 H2 HOH 1132 10.037 37.986 -24.450 +ATOM 7193 O HOH 1133 10.821 38.527 -21.264 +ATOM 7194 H1 HOH 1133 11.081 38.017 -20.497 +ATOM 7195 H2 HOH 1133 10.370 39.290 -20.903 +ATOM 7196 O HOH 1134 10.821 38.527 -18.162 +ATOM 7197 H1 HOH 1134 10.787 39.271 -18.763 +ATOM 7198 H2 HOH 1134 10.554 38.889 -17.317 +ATOM 7199 O HOH 1135 10.821 41.629 -39.876 +ATOM 7200 H1 HOH 1135 11.443 41.686 -40.602 +ATOM 7201 H2 HOH 1135 11.050 42.363 -39.306 +ATOM 7202 O HOH 1136 10.821 41.629 -36.774 +ATOM 7203 H1 HOH 1136 11.589 42.143 -37.025 +ATOM 7204 H2 HOH 1136 10.112 41.978 -37.315 +ATOM 7205 O HOH 1137 10.821 41.629 -33.672 +ATOM 7206 H1 HOH 1137 11.293 41.610 -34.505 +ATOM 7207 H2 HOH 1137 10.542 40.724 -33.534 +ATOM 7208 O HOH 1138 10.821 41.629 -30.570 +ATOM 7209 H1 HOH 1138 11.082 41.251 -31.410 +ATOM 7210 H2 HOH 1138 11.596 42.104 -30.270 +ATOM 7211 O HOH 1139 10.821 41.629 -27.468 +ATOM 7212 H1 HOH 1139 10.948 42.156 -28.257 +ATOM 7213 H2 HOH 1139 11.557 41.864 -26.902 +ATOM 7214 O HOH 1140 10.821 41.629 -24.366 +ATOM 7215 H1 HOH 1140 11.579 42.175 -24.577 +ATOM 7216 H2 HOH 1140 10.693 41.751 -23.425 +ATOM 7217 O HOH 1141 10.821 41.629 -21.264 +ATOM 7218 H1 HOH 1141 11.159 40.946 -21.843 +ATOM 7219 H2 HOH 1141 10.113 41.205 -20.779 +ATOM 7220 O HOH 1142 10.821 44.731 -33.672 +ATOM 7221 H1 HOH 1142 10.878 45.439 -34.314 +ATOM 7222 H2 HOH 1142 10.327 44.043 -34.117 +ATOM 7223 O HOH 1143 10.821 44.731 -30.570 +ATOM 7224 H1 HOH 1143 11.010 44.001 -31.159 +ATOM 7225 H2 HOH 1143 9.870 44.717 -30.467 +ATOM 7226 O HOH 1144 10.821 44.731 -27.468 +ATOM 7227 H1 HOH 1144 10.382 44.020 -27.934 +ATOM 7228 H2 HOH 1144 10.683 45.501 -28.020 +ATOM 7229 O HOH 1145 13.923 10.609 -30.570 +ATOM 7230 H1 HOH 1145 14.385 11.447 -30.605 +ATOM 7231 H2 HOH 1145 13.757 10.465 -29.638 +ATOM 7232 O HOH 1146 13.923 10.609 -27.468 +ATOM 7233 H1 HOH 1146 13.237 11.272 -27.399 +ATOM 7234 H2 HOH 1146 14.621 10.924 -26.894 +ATOM 7235 O HOH 1147 13.923 13.711 -27.468 +ATOM 7236 H1 HOH 1147 13.376 14.488 -27.356 +ATOM 7237 H2 HOH 1147 14.648 14.005 -28.020 +ATOM 7238 O HOH 1148 13.923 13.711 -24.366 +ATOM 7239 H1 HOH 1148 14.590 13.449 -25.000 +ATOM 7240 H2 HOH 1148 13.586 12.885 -24.018 +ATOM 7241 O HOH 1149 13.923 13.711 -21.264 +ATOM 7242 H1 HOH 1149 14.654 13.567 -21.865 +ATOM 7243 H2 HOH 1149 13.321 14.276 -21.748 +ATOM 7244 O HOH 1150 13.923 16.813 -42.978 +ATOM 7245 H1 HOH 1150 13.461 17.519 -43.430 +ATOM 7246 H2 HOH 1150 14.646 16.586 -43.564 +ATOM 7247 O HOH 1151 13.923 16.813 -27.468 +ATOM 7248 H1 HOH 1151 13.839 17.647 -27.006 +ATOM 7249 H2 HOH 1151 13.025 16.494 -27.553 +ATOM 7250 O HOH 1152 13.923 16.813 -24.366 +ATOM 7251 H1 HOH 1152 14.050 16.281 -23.580 +ATOM 7252 H2 HOH 1152 14.084 17.711 -24.077 +ATOM 7253 O HOH 1153 13.923 16.813 -21.264 +ATOM 7254 H1 HOH 1153 14.671 16.768 -21.859 +ATOM 7255 H2 HOH 1153 14.304 17.058 -20.421 +ATOM 7256 O HOH 1154 13.923 16.813 -18.162 +ATOM 7257 H1 HOH 1154 14.545 16.112 -17.964 +ATOM 7258 H2 HOH 1154 14.259 17.212 -18.964 +ATOM 7259 O HOH 1155 13.923 19.915 -42.978 +ATOM 7260 H1 HOH 1155 14.609 20.340 -43.494 +ATOM 7261 H2 HOH 1155 14.372 19.606 -42.191 +ATOM 7262 O HOH 1156 13.923 19.915 -39.876 +ATOM 7263 H1 HOH 1156 13.479 19.073 -39.775 +ATOM 7264 H2 HOH 1156 13.430 20.366 -40.561 +ATOM 7265 O HOH 1157 13.923 19.915 -36.774 +ATOM 7266 H1 HOH 1157 13.415 20.404 -36.127 +ATOM 7267 H2 HOH 1157 14.834 20.143 -36.586 +ATOM 7268 O HOH 1158 13.923 19.915 -33.672 +ATOM 7269 H1 HOH 1158 13.630 19.029 -33.460 +ATOM 7270 H2 HOH 1158 13.164 20.469 -33.491 +ATOM 7271 O HOH 1159 13.923 19.915 -30.570 +ATOM 7272 H1 HOH 1159 14.550 20.481 -30.119 +ATOM 7273 H2 HOH 1159 13.152 20.467 -30.700 +ATOM 7274 O HOH 1160 13.923 19.915 -27.468 +ATOM 7275 H1 HOH 1160 13.702 19.021 -27.208 +ATOM 7276 H2 HOH 1160 13.362 20.469 -26.926 +ATOM 7277 O HOH 1161 13.923 19.915 -24.366 +ATOM 7278 H1 HOH 1161 13.558 19.229 -23.807 +ATOM 7279 H2 HOH 1161 13.372 20.680 -24.200 +ATOM 7280 O HOH 1162 13.923 19.915 -21.264 +ATOM 7281 H1 HOH 1162 13.739 19.230 -20.621 +ATOM 7282 H2 HOH 1162 14.487 19.491 -21.911 +ATOM 7283 O HOH 1163 13.923 19.915 -18.162 +ATOM 7284 H1 HOH 1163 14.799 19.841 -17.781 +ATOM 7285 H2 HOH 1163 13.914 19.270 -18.869 +ATOM 7286 O HOH 1164 13.923 23.017 -46.080 +ATOM 7287 H1 HOH 1164 13.296 22.855 -46.785 +ATOM 7288 H2 HOH 1164 14.772 22.780 -46.455 +ATOM 7289 O HOH 1165 13.923 23.017 -42.978 +ATOM 7290 H1 HOH 1165 14.506 22.572 -43.594 +ATOM 7291 H2 HOH 1165 13.473 23.676 -43.507 +ATOM 7292 O HOH 1166 13.923 23.017 -39.876 +ATOM 7293 H1 HOH 1166 14.497 22.398 -40.328 +ATOM 7294 H2 HOH 1166 13.072 22.580 -39.852 +ATOM 7295 O HOH 1167 13.923 23.017 -36.774 +ATOM 7296 H1 HOH 1167 13.804 22.781 -37.694 +ATOM 7297 H2 HOH 1167 14.755 22.612 -36.529 +ATOM 7298 O HOH 1168 13.923 23.017 -33.672 +ATOM 7299 H1 HOH 1168 14.825 23.221 -33.921 +ATOM 7300 H2 HOH 1168 13.542 23.863 -33.438 +ATOM 7301 O HOH 1169 13.923 23.017 -30.570 +ATOM 7302 H1 HOH 1169 13.685 23.216 -29.665 +ATOM 7303 H2 HOH 1169 14.820 22.687 -30.515 +ATOM 7304 O HOH 1170 13.923 23.017 -27.468 +ATOM 7305 H1 HOH 1170 13.926 23.955 -27.279 +ATOM 7306 H2 HOH 1170 13.381 22.635 -26.778 +ATOM 7307 O HOH 1171 13.923 23.017 -24.366 +ATOM 7308 H1 HOH 1171 13.488 23.138 -23.522 +ATOM 7309 H2 HOH 1171 13.769 23.836 -24.836 +ATOM 7310 O HOH 1172 13.923 23.017 -21.264 +ATOM 7311 H1 HOH 1172 13.704 22.160 -20.899 +ATOM 7312 H2 HOH 1172 14.663 23.320 -20.737 +ATOM 7313 O HOH 1173 13.923 23.017 -18.162 +ATOM 7314 H1 HOH 1173 13.294 23.642 -17.803 +ATOM 7315 H2 HOH 1173 14.517 23.550 -18.690 +ATOM 7316 O HOH 1174 13.923 23.017 -15.060 +ATOM 7317 H1 HOH 1174 14.620 22.419 -14.789 +ATOM 7318 H2 HOH 1174 13.665 23.464 -14.254 +ATOM 7319 O HOH 1175 13.923 26.119 -46.080 +ATOM 7320 H1 HOH 1175 13.474 26.897 -45.750 +ATOM 7321 H2 HOH 1175 14.002 25.546 -45.318 +ATOM 7322 O HOH 1176 13.923 26.119 -42.978 +ATOM 7323 H1 HOH 1176 14.103 25.664 -43.801 +ATOM 7324 H2 HOH 1176 12.968 26.151 -42.925 +ATOM 7325 O HOH 1177 13.923 26.119 -39.876 +ATOM 7326 H1 HOH 1177 14.744 26.599 -39.986 +ATOM 7327 H2 HOH 1177 14.051 25.605 -39.079 +ATOM 7328 O HOH 1178 13.923 26.119 -36.774 +ATOM 7329 H1 HOH 1178 14.761 26.484 -37.058 +ATOM 7330 H2 HOH 1178 14.038 25.956 -35.838 +ATOM 7331 O HOH 1179 13.923 26.119 -33.672 +ATOM 7332 H1 HOH 1179 14.329 26.364 -32.840 +ATOM 7333 H2 HOH 1179 14.221 25.223 -33.830 +ATOM 7334 O HOH 1180 13.923 26.119 -30.570 +ATOM 7335 H1 HOH 1180 13.027 26.266 -30.267 +ATOM 7336 H2 HOH 1180 14.381 26.935 -30.369 +ATOM 7337 O HOH 1181 13.923 26.119 -27.468 +ATOM 7338 H1 HOH 1181 14.074 25.412 -26.841 +ATOM 7339 H2 HOH 1181 14.669 26.707 -27.349 +ATOM 7340 O HOH 1182 13.923 26.119 -24.366 +ATOM 7341 H1 HOH 1182 14.350 25.433 -23.853 +ATOM 7342 H2 HOH 1182 14.644 26.658 -24.692 +ATOM 7343 O HOH 1183 13.923 26.119 -21.264 +ATOM 7344 H1 HOH 1183 14.401 26.212 -20.439 +ATOM 7345 H2 HOH 1183 14.020 25.195 -21.494 +ATOM 7346 O HOH 1184 13.923 26.119 -18.162 +ATOM 7347 H1 HOH 1184 13.398 25.553 -17.597 +ATOM 7348 H2 HOH 1184 14.652 25.566 -18.444 +ATOM 7349 O HOH 1185 13.923 26.119 -15.060 +ATOM 7350 H1 HOH 1185 13.932 26.226 -16.011 +ATOM 7351 H2 HOH 1185 13.409 25.325 -14.912 +ATOM 7352 O HOH 1186 13.923 29.221 -46.080 +ATOM 7353 H1 HOH 1186 14.730 29.577 -45.708 +ATOM 7354 H2 HOH 1186 13.236 29.502 -45.477 +ATOM 7355 O HOH 1187 13.923 29.221 -42.978 +ATOM 7356 H1 HOH 1187 14.575 29.141 -43.674 +ATOM 7357 H2 HOH 1187 13.115 28.886 -43.366 +ATOM 7358 O HOH 1188 13.923 29.221 -39.876 +ATOM 7359 H1 HOH 1188 13.172 29.028 -40.437 +ATOM 7360 H2 HOH 1188 13.946 28.500 -39.247 +ATOM 7361 O HOH 1189 13.923 29.221 -36.774 +ATOM 7362 H1 HOH 1189 14.685 29.660 -37.152 +ATOM 7363 H2 HOH 1189 13.849 28.403 -37.265 +ATOM 7364 O HOH 1190 13.923 29.221 -33.672 +ATOM 7365 H1 HOH 1190 14.736 29.337 -33.179 +ATOM 7366 H2 HOH 1190 14.175 28.693 -34.430 +ATOM 7367 O HOH 1191 13.923 29.221 -30.570 +ATOM 7368 H1 HOH 1191 14.735 28.842 -30.908 +ATOM 7369 H2 HOH 1191 13.567 28.547 -29.991 +ATOM 7370 O HOH 1192 13.923 29.221 -27.468 +ATOM 7371 H1 HOH 1192 14.809 28.940 -27.238 +ATOM 7372 H2 HOH 1192 13.650 29.775 -26.737 +ATOM 7373 O HOH 1193 13.923 29.221 -24.366 +ATOM 7374 H1 HOH 1193 13.173 29.691 -24.002 +ATOM 7375 H2 HOH 1193 14.189 28.619 -23.671 +ATOM 7376 O HOH 1194 13.923 29.221 -21.264 +ATOM 7377 H1 HOH 1194 14.145 29.413 -22.175 +ATOM 7378 H2 HOH 1194 13.477 30.009 -20.954 +ATOM 7379 O HOH 1195 13.923 29.221 -18.162 +ATOM 7380 H1 HOH 1195 13.545 28.608 -18.791 +ATOM 7381 H2 HOH 1195 13.817 28.790 -17.313 +ATOM 7382 O HOH 1196 13.923 29.221 -15.060 +ATOM 7383 H1 HOH 1196 13.324 28.778 -15.660 +ATOM 7384 H2 HOH 1196 13.728 28.842 -14.203 +ATOM 7385 O HOH 1197 13.923 32.323 -42.978 +ATOM 7386 H1 HOH 1197 14.531 31.705 -42.572 +ATOM 7387 H2 HOH 1197 13.921 33.078 -42.390 +ATOM 7388 O HOH 1198 13.923 32.323 -39.876 +ATOM 7389 H1 HOH 1198 14.478 32.757 -40.525 +ATOM 7390 H2 HOH 1198 13.728 33.004 -39.233 +ATOM 7391 O HOH 1199 13.923 32.323 -36.774 +ATOM 7392 H1 HOH 1199 14.531 31.586 -36.838 +ATOM 7393 H2 HOH 1199 13.188 31.985 -36.264 +ATOM 7394 O HOH 1200 13.923 32.323 -33.672 +ATOM 7395 H1 HOH 1200 14.309 31.817 -34.387 +ATOM 7396 H2 HOH 1200 14.398 33.154 -33.683 +ATOM 7397 O HOH 1201 13.923 32.323 -30.570 +ATOM 7398 H1 HOH 1201 13.344 31.998 -29.881 +ATOM 7399 H2 HOH 1201 14.509 31.589 -30.757 +ATOM 7400 O HOH 1202 13.923 32.323 -27.468 +ATOM 7401 H1 HOH 1202 13.376 33.091 -27.303 +ATOM 7402 H2 HOH 1202 13.655 32.020 -28.335 +ATOM 7403 O HOH 1203 13.923 32.323 -24.366 +ATOM 7404 H1 HOH 1203 14.567 32.678 -24.979 +ATOM 7405 H2 HOH 1203 13.522 33.095 -23.966 +ATOM 7406 O HOH 1204 13.923 32.323 -21.264 +ATOM 7407 H1 HOH 1204 14.522 32.602 -20.571 +ATOM 7408 H2 HOH 1204 13.156 32.885 -21.158 +ATOM 7409 O HOH 1205 13.923 32.323 -18.162 +ATOM 7410 H1 HOH 1205 14.497 33.007 -17.815 +ATOM 7411 H2 HOH 1205 14.261 32.150 -19.041 +ATOM 7412 O HOH 1206 13.923 35.425 -42.978 +ATOM 7413 H1 HOH 1206 14.696 35.310 -43.531 +ATOM 7414 H2 HOH 1206 13.611 36.306 -43.184 +ATOM 7415 O HOH 1207 13.923 35.425 -39.876 +ATOM 7416 H1 HOH 1207 14.759 34.963 -39.945 +ATOM 7417 H2 HOH 1207 13.666 35.322 -38.960 +ATOM 7418 O HOH 1208 13.923 35.425 -36.774 +ATOM 7419 H1 HOH 1208 14.681 35.351 -37.354 +ATOM 7420 H2 HOH 1208 13.644 36.337 -36.860 +ATOM 7421 O HOH 1209 13.923 35.425 -33.672 +ATOM 7422 H1 HOH 1209 13.648 35.998 -32.957 +ATOM 7423 H2 HOH 1209 13.245 35.531 -34.339 +ATOM 7424 O HOH 1210 13.923 35.425 -30.570 +ATOM 7425 H1 HOH 1210 14.207 35.122 -31.432 +ATOM 7426 H2 HOH 1210 14.503 36.161 -30.371 +ATOM 7427 O HOH 1211 13.923 35.425 -27.468 +ATOM 7428 H1 HOH 1211 13.560 34.749 -28.040 +ATOM 7429 H2 HOH 1211 13.347 36.179 -27.592 +ATOM 7430 O HOH 1212 13.923 35.425 -24.366 +ATOM 7431 H1 HOH 1212 14.267 34.646 -24.802 +ATOM 7432 H2 HOH 1212 14.650 35.739 -23.827 +ATOM 7433 O HOH 1213 13.923 35.425 -21.264 +ATOM 7434 H1 HOH 1213 13.105 35.809 -20.948 +ATOM 7435 H2 HOH 1213 14.554 35.592 -20.563 +ATOM 7436 O HOH 1214 13.923 35.425 -18.162 +ATOM 7437 H1 HOH 1214 14.260 35.372 -19.056 +ATOM 7438 H2 HOH 1214 14.513 36.036 -17.719 +ATOM 7439 O HOH 1215 13.923 38.527 -39.876 +ATOM 7440 H1 HOH 1215 14.665 39.103 -40.064 +ATOM 7441 H2 HOH 1215 13.351 38.617 -40.638 +ATOM 7442 O HOH 1216 13.923 38.527 -36.774 +ATOM 7443 H1 HOH 1216 14.082 37.767 -36.214 +ATOM 7444 H2 HOH 1216 14.795 38.804 -37.055 +ATOM 7445 O HOH 1217 13.923 38.527 -33.672 +ATOM 7446 H1 HOH 1217 13.805 37.598 -33.475 +ATOM 7447 H2 HOH 1217 13.042 38.845 -33.868 +ATOM 7448 O HOH 1218 13.923 38.527 -30.570 +ATOM 7449 H1 HOH 1218 14.466 39.315 -30.558 +ATOM 7450 H2 HOH 1218 14.460 37.874 -31.019 +ATOM 7451 O HOH 1219 13.923 38.527 -27.468 +ATOM 7452 H1 HOH 1219 13.450 38.553 -28.299 +ATOM 7453 H2 HOH 1219 13.636 37.714 -27.053 +ATOM 7454 O HOH 1220 13.923 38.527 -24.366 +ATOM 7455 H1 HOH 1220 13.664 39.345 -24.791 +ATOM 7456 H2 HOH 1220 14.880 38.558 -24.351 +ATOM 7457 O HOH 1221 13.923 38.527 -21.264 +ATOM 7458 H1 HOH 1221 14.569 37.880 -21.548 +ATOM 7459 H2 HOH 1221 13.637 38.951 -22.073 +ATOM 7460 O HOH 1222 13.923 41.629 -33.672 +ATOM 7461 H1 HOH 1222 14.445 41.089 -33.078 +ATOM 7462 H2 HOH 1222 13.255 42.025 -33.112 +ATOM 7463 O HOH 1223 13.923 41.629 -30.570 +ATOM 7464 H1 HOH 1223 14.703 41.312 -30.115 +ATOM 7465 H2 HOH 1223 14.261 42.238 -31.228 +ATOM 7466 O HOH 1224 13.923 41.629 -27.468 +ATOM 7467 H1 HOH 1224 13.122 41.858 -27.939 +ATOM 7468 H2 HOH 1224 13.621 41.349 -26.604 +ATOM 7469 O HOH 1225 17.025 16.813 -36.774 +ATOM 7470 H1 HOH 1225 16.912 17.439 -36.059 +ATOM 7471 H2 HOH 1225 16.996 15.955 -36.350 +ATOM 7472 O HOH 1226 17.025 16.813 -33.672 +ATOM 7473 H1 HOH 1226 17.016 16.054 -33.088 +ATOM 7474 H2 HOH 1226 17.829 17.280 -33.445 +ATOM 7475 O HOH 1227 17.025 16.813 -30.570 +ATOM 7476 H1 HOH 1227 17.772 16.978 -29.994 +ATOM 7477 H2 HOH 1227 17.411 16.722 -31.441 +ATOM 7478 O HOH 1228 17.025 16.813 -27.468 +ATOM 7479 H1 HOH 1228 17.750 16.439 -26.966 +ATOM 7480 H2 HOH 1228 16.410 17.125 -26.804 +ATOM 7481 O HOH 1229 17.025 16.813 -24.366 +ATOM 7482 H1 HOH 1229 16.545 16.442 -25.106 +ATOM 7483 H2 HOH 1229 16.377 16.874 -23.664 +ATOM 7484 O HOH 1230 17.025 19.915 -39.876 +ATOM 7485 H1 HOH 1230 16.835 20.052 -40.804 +ATOM 7486 H2 HOH 1230 16.576 20.632 -39.429 +ATOM 7487 O HOH 1231 17.025 19.915 -36.774 +ATOM 7488 H1 HOH 1231 17.741 19.768 -37.393 +ATOM 7489 H2 HOH 1231 16.289 20.190 -37.320 +ATOM 7490 O HOH 1232 17.025 19.915 -33.672 +ATOM 7491 H1 HOH 1232 17.677 19.892 -34.373 +ATOM 7492 H2 HOH 1232 16.455 20.650 -33.898 +ATOM 7493 O HOH 1233 17.025 19.915 -30.570 +ATOM 7494 H1 HOH 1233 17.384 20.123 -31.433 +ATOM 7495 H2 HOH 1233 16.670 19.031 -30.665 +ATOM 7496 O HOH 1234 17.025 19.915 -27.468 +ATOM 7497 H1 HOH 1234 16.339 20.332 -27.988 +ATOM 7498 H2 HOH 1234 16.558 19.299 -26.904 +ATOM 7499 O HOH 1235 17.025 19.915 -24.366 +ATOM 7500 H1 HOH 1235 16.833 20.648 -23.782 +ATOM 7501 H2 HOH 1235 16.611 19.160 -23.947 +ATOM 7502 O HOH 1236 17.025 19.915 -21.264 +ATOM 7503 H1 HOH 1236 16.442 19.400 -21.821 +ATOM 7504 H2 HOH 1236 17.880 19.492 -21.355 +ATOM 7505 O HOH 1237 17.025 23.017 -39.876 +ATOM 7506 H1 HOH 1237 16.694 22.582 -39.090 +ATOM 7507 H2 HOH 1237 17.265 22.301 -40.464 +ATOM 7508 O HOH 1238 17.025 23.017 -36.774 +ATOM 7509 H1 HOH 1238 16.622 23.878 -36.888 +ATOM 7510 H2 HOH 1238 16.869 22.567 -37.605 +ATOM 7511 O HOH 1239 17.025 23.017 -33.672 +ATOM 7512 H1 HOH 1239 17.292 23.712 -33.070 +ATOM 7513 H2 HOH 1239 16.721 22.310 -33.103 +ATOM 7514 O HOH 1240 17.025 23.017 -30.570 +ATOM 7515 H1 HOH 1240 16.234 23.394 -30.186 +ATOM 7516 H2 HOH 1240 17.048 22.119 -30.240 +ATOM 7517 O HOH 1241 17.025 23.017 -27.468 +ATOM 7518 H1 HOH 1241 16.453 23.746 -27.708 +ATOM 7519 H2 HOH 1241 17.664 23.401 -26.867 +ATOM 7520 O HOH 1242 17.025 23.017 -24.366 +ATOM 7521 H1 HOH 1242 17.137 22.809 -23.438 +ATOM 7522 H2 HOH 1242 16.449 23.781 -24.373 +ATOM 7523 O HOH 1243 17.025 23.017 -21.264 +ATOM 7524 H1 HOH 1243 16.207 23.424 -21.546 +ATOM 7525 H2 HOH 1243 17.297 23.527 -20.501 +ATOM 7526 O HOH 1244 17.025 26.119 -39.876 +ATOM 7527 H1 HOH 1244 17.633 26.858 -39.841 +ATOM 7528 H2 HOH 1244 17.370 25.495 -39.237 +ATOM 7529 O HOH 1245 17.025 26.119 -36.774 +ATOM 7530 H1 HOH 1245 17.006 25.414 -36.127 +ATOM 7531 H2 HOH 1245 17.530 26.816 -36.354 +ATOM 7532 O HOH 1246 17.025 26.119 -33.672 +ATOM 7533 H1 HOH 1246 17.368 26.641 -34.398 +ATOM 7534 H2 HOH 1246 16.352 26.672 -33.276 +ATOM 7535 O HOH 1247 17.025 26.119 -30.570 +ATOM 7536 H1 HOH 1247 16.729 25.445 -31.182 +ATOM 7537 H2 HOH 1247 17.558 26.709 -31.103 +ATOM 7538 O HOH 1248 17.025 26.119 -27.468 +ATOM 7539 H1 HOH 1248 16.595 25.759 -26.693 +ATOM 7540 H2 HOH 1248 16.385 26.011 -28.171 +ATOM 7541 O HOH 1249 17.025 26.119 -24.366 +ATOM 7542 H1 HOH 1249 17.966 25.970 -24.270 +ATOM 7543 H2 HOH 1249 16.869 26.065 -25.309 +ATOM 7544 O HOH 1250 17.025 26.119 -21.264 +ATOM 7545 H1 HOH 1250 17.707 25.967 -20.609 +ATOM 7546 H2 HOH 1250 16.790 27.040 -21.156 +ATOM 7547 O HOH 1251 17.025 29.221 -39.876 +ATOM 7548 H1 HOH 1251 16.567 29.607 -39.130 +ATOM 7549 H2 HOH 1251 16.596 29.600 -40.643 +ATOM 7550 O HOH 1252 17.025 29.221 -36.774 +ATOM 7551 H1 HOH 1252 17.049 28.265 -36.823 +ATOM 7552 H2 HOH 1252 17.449 29.513 -37.582 +ATOM 7553 O HOH 1253 17.025 29.221 -33.672 +ATOM 7554 H1 HOH 1253 16.403 29.747 -33.171 +ATOM 7555 H2 HOH 1253 17.873 29.398 -33.264 +ATOM 7556 O HOH 1254 17.025 29.221 -30.570 +ATOM 7557 H1 HOH 1254 17.700 29.632 -31.110 +ATOM 7558 H2 HOH 1254 16.351 29.893 -30.476 +ATOM 7559 O HOH 1255 17.025 29.221 -27.468 +ATOM 7560 H1 HOH 1255 16.591 29.870 -28.021 +ATOM 7561 H2 HOH 1255 17.710 28.851 -28.025 +ATOM 7562 O HOH 1256 17.025 29.221 -24.366 +ATOM 7563 H1 HOH 1256 16.379 29.318 -25.065 +ATOM 7564 H2 HOH 1256 16.508 29.020 -23.586 +ATOM 7565 O HOH 1257 17.025 29.221 -21.264 +ATOM 7566 H1 HOH 1257 17.400 28.598 -20.641 +ATOM 7567 H2 HOH 1257 17.485 30.042 -21.087 +ATOM 7568 O HOH 1258 17.025 32.323 -39.876 +ATOM 7569 H1 HOH 1258 16.284 31.722 -39.952 +ATOM 7570 H2 HOH 1258 16.980 32.648 -38.977 +ATOM 7571 O HOH 1259 17.025 32.323 -36.774 +ATOM 7572 H1 HOH 1259 16.395 31.610 -36.668 +ATOM 7573 H2 HOH 1259 17.025 32.772 -35.928 +ATOM 7574 O HOH 1260 17.025 32.323 -33.672 +ATOM 7575 H1 HOH 1260 16.522 32.965 -34.172 +ATOM 7576 H2 HOH 1260 17.878 32.296 -34.106 +ATOM 7577 O HOH 1261 17.025 32.323 -30.570 +ATOM 7578 H1 HOH 1261 17.280 33.136 -30.133 +ATOM 7579 H2 HOH 1261 16.190 32.528 -30.989 +ATOM 7580 O HOH 1262 17.025 32.323 -27.468 +ATOM 7581 H1 HOH 1262 16.766 33.116 -27.936 +ATOM 7582 H2 HOH 1262 17.393 32.641 -26.643 +ATOM 7583 O HOH 1263 17.025 32.323 -24.366 +ATOM 7584 H1 HOH 1263 16.515 32.015 -25.114 +ATOM 7585 H2 HOH 1263 17.739 31.690 -24.285 +ATOM 7586 O HOH 1264 17.025 32.323 -21.264 +ATOM 7587 H1 HOH 1264 17.039 33.207 -21.632 +ATOM 7588 H2 HOH 1264 17.843 31.925 -21.564 +ATOM 7589 O HOH 1265 17.025 35.425 -36.774 +ATOM 7590 H1 HOH 1265 16.473 35.465 -37.555 +ATOM 7591 H2 HOH 1265 16.415 35.256 -36.057 +ATOM 7592 O HOH 1266 17.025 35.425 -33.672 +ATOM 7593 H1 HOH 1266 16.569 34.652 -34.004 +ATOM 7594 H2 HOH 1266 16.547 35.664 -32.878 +ATOM 7595 O HOH 1267 17.025 35.425 -30.570 +ATOM 7596 H1 HOH 1267 17.408 36.025 -31.211 +ATOM 7597 H2 HOH 1267 16.627 35.997 -29.914 +ATOM 7598 O HOH 1268 17.025 35.425 -27.468 +ATOM 7599 H1 HOH 1268 16.328 35.328 -26.820 +ATOM 7600 H2 HOH 1268 16.830 34.764 -28.132 +ATOM 7601 O HOH 1269 17.025 35.425 -24.366 +ATOM 7602 H1 HOH 1269 16.143 35.393 -24.736 +ATOM 7603 H2 HOH 1269 17.217 36.359 -24.282 +ATOM 7604 O HOH 1270 20.128 26.119 -30.570 +ATOM 7605 H1 HOH 1270 19.499 26.805 -30.795 +ATOM 7606 H2 HOH 1270 20.522 25.870 -31.406